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T C 607.19 PASS AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0462137;FXX=0.0302984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.6404;QD=37.9492;RBI=0.0550158;REFB=0;REVB=-0.0298502;RO=0;SAF=39;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30166e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00134857;OID=.;OPOS=901023;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:64:64:0:0:64:64:25:39:0:0:25:39:0:0 chr1 901046 . ACC A 461.04 PASS AO=55;DP=67;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0792168;FXX=0.0937354;HRUN=4;LEN=2;MLLD=38.4333;QD=31.7959;RBI=0.0904004;REFB=0;REVB=-0.0435536;RO=0;SAF=32;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.49259e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.000806556;OID=.;OPOS=901047;OREF=CC;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:55:62:58:58:0:34:24:0:0:40:0:32:23:0:0 chr1 909238 . G C 210.66 PASS AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0530283;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.094;QD=36.6368;RBI=0.0530358;REFB=0;REVB=-0.000889966;RO=0;SAF=6;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.9951e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000270816;OID=.;OPOS=909238;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:0:0:23:23:17:6:0:0:17:6:0:0 chr1 909309 . T C 13.39 PASS AO=4;DP=20;FAO=5;FDP=21;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.0159721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.329;QD=2.5507;RBI=0.0268183;REFB=-0.0153413;REVB=-0.0215432;RO=16;SAF=3;SAR=1;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.46666;STB=0.708338;TYPE=snp;VARB=0.0500731;OID=.;OPOS=909309;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:20:21:16:16:4:5:1:3:5:11:2:3:5:11 chr1 909768 . A G 1198.74 PASS AO=117;DP=117;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00841465;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.193;QD=38.3597;RBI=0.0527567;REFB=0;REVB=0.0520813;RO=0;SAF=41;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000558101;OID=.;OPOS=909768;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:117:125:0:0:117:125:76:41:0:0:84:41:0:0 chr1 911595 . A G 116.62 PASS AO=30;DP=69;FAO=30;FDP=69;FR=.;FRO=39;FSAF=7;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=-0.0337573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.658;QD=6.76029;RBI=0.0500199;REFB=-0.0393205;REVB=-0.0369112;RO=39;SAF=7;SAR=23;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.358489;STB=0.704184;TYPE=snp;VARB=0.0919816;OID=.;OPOS=911595;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:39:39:30:30:23:7:22:17:23:7:22:17 chr1 911916 . C T 177.27 PASS AO=33;DP=59;FAO=34;FDP=60;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=0.0156156;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0464;QD=11.8181;RBI=0.165492;REFB=-0.0167498;REVB=0.164754;RO=26;SAF=14;SAR=19;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0644989;STB=0.529635;TYPE=snp;VARB=0.0169508;OID=.;OPOS=911916;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:60:26:26:33:34:19:14:9:17:20:14:9:17 chr1 914333 . C G 52.32 PASS AO=9;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.00761704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.055;QD=13.9508;RBI=0.00825091;REFB=-0.0346033;REVB=-0.00317147;RO=6;SAF=1;SAR=8;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.409156;STB=0.743518;TYPE=snp;VARB=0.0298472;OID=.;OPOS=914333;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:15:15:6:6:9:9:8:1:3:3:8:1:3:3 chr1 914527 . G A 45.6 PASS AO=17;DP=55;FAO=17;FDP=56;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=32;FSRR=7;FWDB=-0.0065461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.015;QD=3.25744;RBI=0.014127;REFB=-0.0145044;REVB=-0.0125188;RO=37;SAF=13;SAR=4;SRF=31;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128123;STB=0.557213;TYPE=snp;VARB=0.0547231;OID=.;OPOS=914527;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:55:56:37:39:17:17:4:13:31:6:4:13:32:7 chr1 914852 . G C 10.38 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0108958;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1272;QD=5.93121;RBI=0.0108958;REFB=-0.041804;REVB=0;RO=5;SAF=2;SAR=0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0902916;OID=.;OPOS=914852;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:5:5:2:2:0:2:5:0:0:2:5:0 chr1 914876 . T C 252 PASS AO=27;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0268464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.62;QD=34.7584;RBI=0.0268464;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=27;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00298185;OID=.;OPOS=914876;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:29:29:0:0:27:29:0:27:0:0:0:29:0:0 chr1 915227 . A G 183.14 PASS AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0114824;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.375;QD=38.5547;RBI=0.0114824;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=19;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000105168;OID=.;OPOS=915227;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:19:19:0:0:19:19:0:19:0:0:0:19:0:0 chr1 915869 . TG T 116.57 PASS AO=21;DP=38;FAO=24;FDP=31;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=23;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0861015;FXX=0.0312402;HRUN=4;LEN=1;MLLD=16.0725;QD=15.0408;RBI=0.130864;REFB=-0.105492;REVB=0.0985488;RO=8;SAF=1;SAR=20;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.537688;STB=0.815226;TYPE=del;VARB=0.0567596;OID=.;OPOS=915870;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:21:32:24:31:7:1:23:4:3:7:8:1:20:4:4 chr1 916549 . A G 723.3 PASS AO=76;DP=77;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=54;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0157588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.8491;QD=37.0924;RBI=0.0357248;REFB=-0.0842337;REVB=-0.0320612;RO=1;SAF=23;SAR=53;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0201268;STB=0.510635;TYPE=snp;VARB=0.000935348;OID=.;OPOS=916549;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:77:78:1:1:76:77:53:23:1:0:54:23:1:0 chr1 917492 . C T 65.42 PASS AO=7;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=16;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.199216;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.9566;QD=8.72211;RBI=0.19926;REFB=-0.0178767;REVB=0.00418162;RO=7;SAF=6;SAR=1;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.439386;STB=0.679494;TYPE=snp;VARB=0.039192;OID=.;OPOS=917492;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:25:30:7:16:7:14:1:6:3:4:3:11:8:8 chr1 948921 . T C 138.9 PASS AO=21;DP=30;FAO=21;FDP=30;FR=.;FRO=9;FSAF=17;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=0;FWDB=-0.0209276;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.3507;QD=18.5201;RBI=0.031258;REFB=-0.00412155;REVB=0.0232184;RO=9;SAF=17;SAR=4;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19266;STB=0.604566;TYPE=snp;VARB=0.00195412;OID=.;OPOS=948921;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:30:30:9:9:21:21:4:17:9:0:4:17:9:0 chr1 949608 . G A 70.48 PASS AO=26;DP=81;FAO=26;FDP=81;FR=.;FRO=55;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=33;FWDB=0.0304001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.165;QD=3.48032;RBI=0.0305691;REFB=-0.0116372;REVB=0.00320945;RO=55;SAF=9;SAR=17;SRF=22;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0670238;STB=0.539375;TYPE=snp;VARB=0.0180625;OID=.;OPOS=949608;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:81:81:55:55:26:26:17:9:22:33:17:9:22:33 chr1 949654 . A G 116.25 PASS AO=35;DP=91;FAO=35;FDP=91;FR=.;FRO=56;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=37;FWDB=-0.0169719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.841;QD=5.11002;RBI=0.0272626;REFB=-0.0124443;REVB=0.0213356;RO=56;SAF=17;SAR=18;SRF=19;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159599;STB=0.590601;TYPE=snp;VARB=0.0150842;OID=.;OPOS=949654;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:56:56:35:35:18:17:19:37:18:17:19:37 chr1 981931 . A G 43.28 PASS AO=11;DP=28;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.0505646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.4837;QD=6.18244;RBI=0.0543915;REFB=-0.0363602;REVB=-0.0200412;RO=17;SAF=9;SAR=2;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.495621;STB=0.795357;TYPE=snp;VARB=0.059028;OID=.;OPOS=981931;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:28:28:17:17:11:11:2:9:6:11:2:9:6:11 chr1 982994 . T C 24.68 PASS AO=17;DP=68;FAO=10;FDP=39;FR=.;FRO=29;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=21;FWDB=-0.0982797;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=41.9554;QD=2.5308;RBI=0.202131;REFB=0.0228598;REVB=-0.17663;RO=51;SAF=1;SAR=16;SRF=12;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.443571;STB=0.729156;TYPE=snp;VARB=-0.092188;OID=.;OPOS=982994;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:68:39:51:29:17:10:16:1:12:39:9:1:8:21 chr1 986443 . C T 18.71 PASS AO=5;DP=17;FAO=5;FDP=17;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=11;FWDB=-0.0383657;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.1892;QD=4.40256;RBI=0.0394142;REFB=-0.00676564;REVB=0.00903065;RO=12;SAF=1;SAR=4;SRF=1;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246799;STB=0.651703;TYPE=snp;VARB=0.0115146;OID=.;OPOS=986443;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:17:17:12:12:5:5:4:1:1:11:4:1:1:11 chr1 987200 . C T 204.91 PASS AO=41;DP=74;FAO=41;FDP=73;FR=.;FRO=32;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=0.030077;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.843;QD=11.2277;RBI=0.0508812;REFB=-0.00256088;REVB=0.0410398;RO=32;SAF=21;SAR=20;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0151949;STB=0.508357;TYPE=snp;VARB=0.00278596;OID=.;OPOS=987200;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:73:32:32:41:41:20:21:17:15:20:21:17:15 chr1 990280 . C T 51.04 PASS AO=15;DP=42;FAO=15;FDP=42;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.00857824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.331;QD=4.86125;RBI=0.00946002;REFB=-0.0387601;REVB=0.00398821;RO=26;SAF=10;SAR=5;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154342;STB=0.52628;TYPE=snp;VARB=0.0503121;OID=.;OPOS=990280;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:42:42:26:27:15:15:5:10:17:9:5:10:17:10 chr1 1021346 . A G 131.37 PASS AO=29;DP=58;FAO=29;FDP=58;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=5;FSRR=24;FWDB=-0.0401871;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.017;QD=9.05971;RBI=0.0448021;REFB=-0.00963455;REVB=-0.0198048;RO=29;SAF=8;SAR=21;SRF=5;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12387;STB=0.568677;TYPE=snp;VARB=0.0100116;OID=.;OPOS=1021346;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:29:29:29:29:21:8:5:24:21:8:5:24 chr1 1026707 . C A 224.62 PASS AO=47;DP=87;FAO=47;FDP=87;FR=.;FRO=40;FSAF=30;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=28;FWDB=-0.0144837;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=183.184;QD=10.3272;RBI=0.0210736;REFB=-0.0148414;REVB=0.0153074;RO=38;SAF=30;SAR=17;SRF=10;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.300731;STB=0.654005;TYPE=snp;VARB=0.00721683;OID=.;OPOS=1026707;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:38:40:47:47:17:30:10:28:17:30:12:28 chr1 1156131 . T C 85.94 PASS AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.00740363;FXX=0.0526177;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.147;QD=9.54846;RBI=0.0349372;REFB=-0.00838381;REVB=-0.0341437;RO=18;SAF=13;SAR=5;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114369;STB=0.565142;TYPE=snp;VARB=0.00764036;OID=.;OPOS=1156131;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:37:36:18:18:18:18:5:13:11:7:5:13:11:7 chr1 1158631 . A G 738.83 PASS AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018427;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.867;QD=38.3808;RBI=0.0225292;REFB=0;REVB=-0.012962;RO=0;SAF=64;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.12413e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.10687e-05;OID=.;OPOS=1158631;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:77:77:0:0:77:77:13:64:0:0:13:64:0:0 chr1 1196863 . T C 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0139557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.176;QD=33.022;RBI=0.025199;REFB=0;REVB=0.0209816;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000370112;OID=.;OPOS=1196863;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:3:3:0:0:3:3:0:0 chr1 1223376 . G C 126.96 PASS AO=24;DP=50;FAO=27;FDP=53;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=0.013092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.129;QD=9.5821;RBI=0.0306021;REFB=-0.0205088;REVB=0.0276602;RO=26;SAF=8;SAR=16;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0132254;STB=0.52862;TYPE=snp;VARB=0.0142272;OID=.;OPOS=1223376;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:53:26:26:24:27:16:8:9:17:19:8:9:17 chr1 1246004 . A G 711.8 PASS AO=70;DP=72;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0739132;FXX=0.0365809;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.505;QD=36.0406;RBI=0.0739599;REFB=0;REVB=0.00262724;RO=0;SAF=41;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00144667;OID=.;OPOS=1246004;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:72:79:0:0:70:79:29:41:0:0:32:47:0:0 chr1 1247494 . T C 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.426;QD=35.0875;RBI=0.0209353;REFB=0;REVB=0.0209353;RO=0;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000598343;OID=.;OPOS=1247494;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:7:0:0:0:7:0:0:0 chr1 1249187 . G A 1528.09 PASS AO=149;DP=151;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0328746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.21;QD=37.7306;RBI=0.0402377;REFB=0;REVB=0.023202;RO=0;SAF=59;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00143025;OID=.;OPOS=1249187;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:151:162:0:0:149:162:90:59:0:0:95:67:0:0 chr1 1254436 . A G 568.24 PASS AO=58;DP=58;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0270997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.389;QD=38.5244;RBI=0.0271844;REFB=0;REVB=-0.00214354;RO=0;SAF=18;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000141214;OID=.;OPOS=1254436;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:58:59:0:0:58:59:40:18:0:0:41:18:0:0 chr1 1254443 . G A 527.68 PASS AO=59;DP=61;FAO=59;FDP=61;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00787815;FXX=0.0161264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.153;QD=34.6016;RBI=0.0113517;REFB=0.0267571;REVB=0.00817282;RO=1;SAF=20;SAR=39;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119466;STB=0.512496;TYPE=snp;VARB=-0.00108537;OID=.;OPOS=1254443;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:61:61:1:2:59:59:39:20:0:1:39:20:0:2 chr1 1254841 . C G 197.29 PASS AO=18;DP=26;FAO=23;FDP=24;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=3;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.095724;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=37.1841;QD=32.8818;RBI=0.0957242;REFB=-0.0185714;REVB=0.000167735;RO=1;SAF=2;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0278586;STB=0.512185;TYPE=snp;VARB=0.00800008;OID=.;OPOS=1254841;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:23:24:1:1:18:23:16:2:0:1:20:3:0:1 chr1 1262966 . C T 101.96 PASS AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0258969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.3278;QD=37.075;RBI=0.0379734;REFB=0;REVB=0.0277728;RO=0;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.97587e-05;OID=.;OPOS=1262966;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:11:11:7:4:0:0:7:4:0:0 chr1 1263144 . G A 339.48 PASS AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0022232;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=218.929;QD=35.7348;RBI=0.00253696;REFB=0.0580707;REVB=-0.00122209;RO=1;SAF=16;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0283678;STB=0.515143;TYPE=snp;VARB=-9.28533e-06;OID=.;OPOS=1263144;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:38:38:1:1:37:37:21:16:1:0:21:16:1:0 chr1 1269554 . T C 168.34 PASS AO=17;DP=17;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.435;QD=37.4096;RBI=0.099815;REFB=0;REVB=0.0983777;RO=0;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.126e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00126469;OID=.;OPOS=1269554;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:17:18:0:0:17:18:9:8:0:0:9:9:0:0 chr1 1273116 . A G 910.41 PASS AO=95;DP=97;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0411177;FXX=0.0206164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.5828;QD=38.3328;RBI=0.07117;REFB=0;REVB=-0.0580905;RO=0;SAF=28;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000308285;OID=.;OPOS=1273116;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:97:95:0:0:95:95:67:28:0:0:67:28:0:0 chr1 1277533 . T C 78.09 PASS AO=17;DP=46;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=24;FWDB=0.0316908;FXX=0.0227221;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.2144;QD=7.26395;RBI=0.036984;REFB=-0.0199886;REVB=-0.0190659;RO=0;SAF=13;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.852661;TYPE=snp;VARB=0.0250629;OID=.;OPOS=1277533;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:18:43:0:24:17:19:4:13:0:0:5:14:0:24 chr1 1288666 . C T 110.9 PASS AO=21;DP=40;FAO=22;FDP=41;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=20;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.13491;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.2373;QD=10.8193;RBI=0.143025;REFB=-0.0123418;REVB=0.0474905;RO=19;SAF=2;SAR=19;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.404615;STB=0.737431;TYPE=snp;VARB=0.0171017;OID=.;OPOS=1288666;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:40:41:19:19:21:22:19:2:7:12:20:2:7:12 chr1 1309820 . G C 10.37 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.2435;QD=5.92394;RBI=0.000322858;REFB=0.0366613;REVB=-0.000322858;RO=5;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0697603;OID=.;OPOS=1309820;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:5:5:2:2:2:0:0:5:2:0:0:5 chr1 1310074 . C G 147.02 PASS AO=15;DP=15;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0512116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.875;QD=36.7552;RBI=0.0522096;REFB=0;REVB=0.0101593;RO=0;SAF=9;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000200464;OID=.;OPOS=1310074;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:16:0:0:15:16:6:9:0:0:6:10:0:0 chr1 1558792 . T C 101.96 PASS AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0812115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.796;QD=37.0753;RBI=0.0879837;REFB=0;REVB=0.0338501;RO=0;SAF=3;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00110777;OID=.;OPOS=1558792;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:11:11:8:3:0:0:8:3:0:0 chr1 1562437 . C G 132.5 PASS AO=26;DP=48;FAO=27;FDP=48;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=4;FWDB=-0.0183436;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.5085;QD=11.0417;RBI=0.0386834;REFB=-0.0147967;REVB=-0.0340576;RO=22;SAF=12;SAR=14;SRF=18;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.290182;STB=0.642104;TYPE=snp;VARB=0.0209387;OID=.;OPOS=1562437;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:48:48:22:21:26:27:14:12:18:4:14:13:17:4 chr1 1562536 . G A 203.19 PASS AO=32;DP=48;FAO=33;FDP=49;FR=.;FRO=16;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=-0.0190732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.298;QD=16.5871;RBI=0.0586771;REFB=0.030551;REVB=0.0554907;RO=16;SAF=16;SAR=16;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152838;STB=0.586156;TYPE=snp;VARB=-0.0144469;OID=.;OPOS=1562536;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:48:49:16:16:32:33:16:16:12:4:17:16:12:4 chr1 1588670 . G A 197.31 PASS AO=126;DP=483;FAO=106;FDP=384;FR=.;FRO=278;FSAF=52;FSAR=54;FSRF=119;FSRR=159;FWDB=-0.0267337;FXX=0.039999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.22;QD=2.05529;RBI=0.0374822;REFB=-0.00878685;REVB=-0.0262721;RO=275;SAF=59;SAR=67;SRF=130;SRR=145;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00534888;STB=0.545339;TYPE=snp;VARB=0.0280627;OID=.;OPOS=1588670;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:483:384:275:278:126:106:67:59:130:145:54:52:119:159 chr1 1588717 . G A 287.59 PASS AO=148;DP=507;FAO=126;FDP=400;FR=.;FRO=274;FSAF=65;FSAR=61;FSRF=118;FSRR=156;FWDB=-0.00676737;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.427;QD=2.87585;RBI=0.0273401;REFB=-0.00554626;REVB=0.0264893;RO=359;SAF=73;SAR=75;SRF=143;SRR=216;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116302;STB=0.558207;TYPE=snp;VARB=0.0096902;OID=.;OPOS=1588717;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:507:400:359:274:148:126:75:73:143:216:61:65:118:156 chr1 1588737 . C T 227.35 PASS AO=132;DP=471;FAO=115;FDP=399;FR=.;FRO=284;FSAF=55;FSAR=60;FSRF=107;FSRR=177;FWDB=0.0160374;FXX=0.00249994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.049;QD=2.27919;RBI=0.0161277;REFB=-0.0152406;REVB=0.00170401;RO=338;SAF=63;SAR=69;SRF=131;SRR=207;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111697;STB=0.572829;TYPE=snp;VARB=0.00884935;OID=.;OPOS=1588737;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:471:399:338:284:132:115:69:63:131:207:60:55:107:177 chr1 1588743 . A T 124.06 PASS AO=108;DP=449;FAO=93;FDP=399;FR=.;FRO=306;FSAF=39;FSAR=54;FSRF=117;FSRR=189;FWDB=0.0148818;FXX=0.00249994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.61;QD=1.24369;RBI=0.0168963;REFB=-0.000767738;REVB=-0.00800095;RO=338;SAF=46;SAR=62;SRF=130;SRR=208;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0541912;STB=0.529406;TYPE=snp;VARB=0.00413753;OID=.;OPOS=1588743;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:449:399:338:306:108:93:62:46:130:208:54:39:117:189 chr1 1588744 . AGCG A 160.97 PASS AO=104;DP=449;FAO=100;FDP=390;FR=.;FRO=290;FSAF=41;FSAR=59;FSRF=111;FSRR=179;FWDB=-0.00756384;FXX=0.0249994;HRUN=1;LEN=3;MLLD=287.184;QD=1.65096;RBI=0.00828923;REFB=0.00136068;REVB=-0.00339113;RO=300;SAF=44;SAR=60;SRF=100;SRR=200;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118463;STB=0.521089;TYPE=del;VARB=-0.00684385;OID=.;OPOS=1588745;OREF=GCG;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:104:431:100:390:290:41:59:111:179:99:300:44:60:100:200 chr1 1599812 . C T 89.04 PASS AO=19;DP=38;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0160106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.214;QD=9.37225;RBI=0.0567999;REFB=-0.02529;REVB=-0.0544967;RO=19;SAF=10;SAR=9;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.046477;STB=0.526288;TYPE=snp;VARB=0.0291118;OID=.;OPOS=1599812;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:38:38:19:19:19:19:9:10:9:10:9:10:9:10 chr1 1599888 . A G 405.42 PASS AO=62;DP=84;FAO=62;FDP=84;FR=.;FRO=22;FSAF=27;FSAR=35;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.0109284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9092;QD=19.3056;RBI=0.0550917;REFB=-0.0317018;REVB=0.0539969;RO=22;SAF=27;SAR=35;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0131082;STB=0.50704;TYPE=snp;VARB=0.0104944;OID=.;OPOS=1599888;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:84:84:22:22:62:62:35:27:9:13:35:27:9:13 chr1 1604499 . G A 192.86 PASS AO=58;DP=148;FAO=58;FDP=147;FR=.;FRO=89;FSAF=24;FSAR=34;FSRF=48;FSRR=41;FWDB=0.0254683;FXX=0.0264883;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.1481;QD=5.24782;RBI=0.0277165;REFB=-0.00754794;REVB=0.0109349;RO=84;SAF=24;SAR=34;SRF=47;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153208;STB=0.576245;TYPE=snp;VARB=0.017207;OID=.;OPOS=1604499;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:147:84:89:58:58:34:24:47:37:34:24:48:41 chr1 1635022 . A G 224.82 PASS AO=66;DP=158;FAO=66;FDP=159;FR=.;FRO=93;FSAF=49;FSAR=17;FSRF=56;FSRR=37;FWDB=-0.00928235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5228;QD=5.65593;RBI=0.0644122;REFB=0.0128472;REVB=-0.0637398;RO=91;SAF=49;SAR=17;SRF=56;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156154;STB=0.597125;TYPE=snp;VARB=-0.0178916;OID=.;OPOS=1635022;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:159:91:93:66:66:17:49:56:35:17:49:56:37 chr1 1647814 . T C 259.05 PASS AO=168;DP=538;FAO=121;FDP=400;FR=.;FRO=279;FSAF=53;FSAR=68;FSRF=129;FSRR=150;FWDB=0.0142409;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=288.95;QD=2.59053;RBI=0.0154695;REFB=0.00184045;REVB=0.00604157;RO=367;SAF=68;SAR=100;SRF=174;SRR=193;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0841926;STB=0.517172;TYPE=snp;VARB=-0.00405534;OID=.;OPOS=1647814;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:538:400:367:279:168:121:100:68:174:193:68:53:129:150 chr1 1647871 . T C 478.86 PASS AO=190;DP=506;FAO=155;FDP=399;FR=.;FRO=244;FSAF=55;FSAR=100;FSRF=93;FSRR=151;FWDB=0.025452;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.0127;QD=4.80058;RBI=0.0274531;REFB=-0.0184158;REVB=-0.0102894;RO=314;SAF=69;SAR=121;SRF=127;SRR=187;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0486444;STB=0.51739;TYPE=snp;VARB=0.0276904;OID=.;OPOS=1647871;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:506:399:314:244:190:155:121:69:127:187:100:55:93:151 chr1 1647893 . C CTTTCTT 222.45 PASS AO=103;DP=430;FAO=113;FDP=384;FR=.;FRO=271;FSAF=31;FSAR=82;FSRF=121;FSRR=150;FWDB=0.00423768;FXX=0.039999;HRUN=3;LEN=6;MLLD=167.44;QD=2.31716;RBI=0.0168259;REFB=-0.008198;REVB=0.0162835;RO=289;SAF=23;SAR=80;SRF=127;SRR=162;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.306113;STB=0.634082;TYPE=ins;VARB=0.0176826;OID=.;OPOS=1647894;OREF=-;OALT=TTTCTT;OMAPALT=CTTTCTT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:103:430:113:384:271:31:82:121:150:99:289:23:80:127:162 chr1 1650787 . T C 224.44 PASS AO=66;DP=162;FAO=66;FDP=162;FR=.;FRO=96;FSAF=47;FSAR=19;FSRF=61;FSRR=35;FWDB=-0.00500176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.635;QD=5.5418;RBI=0.010731;REFB=-0.0223566;REVB=0.009494;RO=90;SAF=47;SAR=19;SRF=61;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0422049;STB=0.552925;TYPE=snp;VARB=0.0263261;OID=.;OPOS=1650787;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:162:90:96:66:66:19:47:61:29:19:47:61:35 chr1 1650797 . A G 267.52 PASS AO=73;DP=171;FAO=74;FDP=172;FR=.;FRO=98;FSAF=54;FSAR=20;FSRF=60;FSRR=38;FWDB=0.00678061;FXX=0.00578001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.345;QD=6.2214;RBI=0.007845;REFB=-0.00370787;REVB=0.00394555;RO=89;SAF=53;SAR=20;SRF=55;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125111;STB=0.578692;TYPE=snp;VARB=0.00207362;OID=.;OPOS=1650797;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:172:89:98:73:74:20:53:55:34:20:54:60:38 chr1 1650801 . T C 238.48 PASS AO=72;DP=180;FAO=72;FDP=180;FR=.;FRO=108;FSAF=52;FSAR=20;FSRF=65;FSRR=43;FWDB=0.00444644;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=250.182;QD=5.29948;RBI=0.00623514;REFB=-0.00261658;REVB=0.00437106;RO=105;SAF=52;SAR=20;SRF=62;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158718;STB=0.583309;TYPE=snp;VARB=0.00283664;OID=.;OPOS=1650801;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:180:105:108:72:72:20:52:62:43:20:52:65:43 chr1 1650807 . T C 387.63 PASS AO=93;DP=187;FAO=92;FDP=185;FR=.;FRO=93;FSAF=53;FSAR=39;FSRF=67;FSRR=26;FWDB=-0.0464208;FXX=0.0106946;HRUN=4;LEN=1;MLLD=43.3374;QD=8.38111;RBI=0.0643431;REFB=-0.0271169;REVB=-0.044555;RO=86;SAF=54;SAR=39;SRF=63;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140678;STB=0.575984;TYPE=snp;VARB=0.0225886;OID=.;OPOS=1650807;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:185:86:93:93:92:39:54:63:23:39:53:67:26 chr1 1650832 . A G 324.43 PASS AO=93;DP=222;FAO=93;FDP=221;FR=.;FRO=128;FSAF=69;FSAR=24;FSRF=73;FSRR=55;FWDB=-0.00195765;FXX=0.00896821;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.815;QD=5.8721;RBI=0.0124533;REFB=-0.0117853;REVB=-0.0122984;RO=125;SAF=69;SAR=24;SRF=73;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189001;STB=0.61528;TYPE=snp;VARB=0.0172738;OID=.;OPOS=1650832;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:221:125:128:93:93:24:69:73:52:24:69:73:55 chr1 1650845 . G A 660.9 PASS AO=135;DP=239;FAO=135;FDP=239;FR=.;FRO=104;FSAF=67;FSAR=68;FSRF=75;FSRR=29;FWDB=0.0269498;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.302;QD=11.0611;RBI=0.0277807;REFB=-0.00388099;REVB=0.00674338;RO=99;SAF=67;SAR=68;SRF=75;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20422;STB=0.597696;TYPE=snp;VARB=0.00109477;OID=.;OPOS=1650845;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:239:239:99:104:135:135:68:67:75:24:68:67:75:29 chr1 1654038 . G A 132.44 PASS AO=18;DP=22;FAO=18;FDP=22;FR=.;FRO=4;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.00927507;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.651;QD=24.0798;RBI=0.0470167;REFB=0.0276237;REVB=0.0460927;RO=4;SAF=8;SAR=10;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0185841;STB=0.510193;TYPE=snp;VARB=-0.00502449;OID=.;OPOS=1654038;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:22:22:4:4:18:18:10:8:2:2:10:8:2:2 chr1 1654058 . C T 220.5 PASS AO=30;DP=37;FAO=30;FDP=37;FR=.;FRO=7;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0244481;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.555;QD=23.8378;RBI=0.0399712;REFB=0.0281762;REVB=0.0316226;RO=7;SAF=14;SAR=16;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0366878;STB=0.519842;TYPE=snp;VARB=-0.00137426;OID=.;OPOS=1654058;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:37:37:7:7:30:30:16:14:4:3:16:14:4:3 chr1 1654064 . A T 187.15 PASS AO=29;DP=41;FAO=29;FDP=41;FR=.;FRO=12;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.00136933;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.042;QD=18.2588;RBI=0.0416302;REFB=0.00199981;REVB=0.0416077;RO=12;SAF=14;SAR=15;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0538962;STB=0.529392;TYPE=snp;VARB=-0.000596178;OID=.;OPOS=1654064;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:41:41:12:12:29:29:15:14:7:5:15:14:7:5 chr1 1654065 . AGCG A 200.39 PASS AO=29;DP=42;FAO=29;FDP=38;FR=.;FRO=9;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.00901368;FXX=0.0952154;HRUN=1;LEN=3;MLLD=248.889;QD=21.0935;RBI=0.0105682;REFB=0.00173083;REVB=0.00551736;RO=9;SAF=14;SAR=15;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0317299;STB=0.517229;TYPE=del;VARB=-0.000717392;OID=.;OPOS=1654066;OREF=GCG;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:29:42:29:38:9:14:15:5:4:20:9:14:15:5:4 chr1 1666175 . C T 232.46 PASS AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.048183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.32;QD=34.4391;RBI=0.0487362;REFB=-0.052752;REVB=-0.00732249;RO=1;SAF=4;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0206567;STB=0.511103;TYPE=snp;VARB=0.00148461;OID=.;OPOS=1666175;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:27:27:1:1:26:26:22:4:0:1:22:4:0:1 chr1 1666251 . G A 69.68 PASS AO=21;DP=58;FAO=21;FDP=57;FR=.;FRO=36;FSAF=4;FSAR=17;FSRF=7;FSRR=29;FWDB=0.0707394;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.8301;QD=4.88999;RBI=0.0719815;REFB=-0.00593203;REVB=0.0133143;RO=36;SAF=4;SAR=17;SRF=7;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00695698;STB=0.504039;TYPE=snp;VARB=0.0105529;OID=.;OPOS=1666251;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:58:57:36:36:21:21:17:4:7:29:17:4:7:29 chr1 1684472 . C T 280.71 PASS AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.117512;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3071;QD=37.4283;RBI=0.132171;REFB=0;REVB=0.0604992;RO=0;SAF=12;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00181909;OID=.;OPOS=1684472;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:31:30:0:0:30:30:18:12:0:0:18:12:0:0 chr1 1686081 . G A 244.85 PASS AO=42;DP=63;FAO=42;FDP=64;FR=.;FRO=22;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=17;FSRR=5;FWDB=0.0174863;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.998;QD=15.3033;RBI=0.017883;REFB=-0.00463664;REVB=-0.00374567;RO=21;SAF=16;SAR=26;SRF=16;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232771;STB=0.633615;TYPE=snp;VARB=0.000849272;OID=.;OPOS=1686081;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:63:64:21:22:42:42:26:16:16:5:26:16:17:5 chr1 1823922 . A G 748.28 PASS AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0219378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.644;QD=38.3734;RBI=0.0313446;REFB=0;REVB=-0.0223879;RO=0;SAF=21;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.68657e-06;OID=.;OPOS=1823922;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:78:78:0:0:78:78:57:21:0:0:57:21:0:0 chr1 1846765 . G A 379.54 PASS AO=68;DP=108;FAO=68;FDP=108;FR=.;FRO=40;FSAF=36;FSAR=32;FSRF=25;FSRR=15;FWDB=0.0269348;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=241.193;QD=14.0568;RBI=0.0360794;REFB=0.00649668;REVB=-0.024005;RO=39;SAF=36;SAR=32;SRF=25;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0757864;STB=0.535665;TYPE=snp;VARB=-0.00378341;OID=.;OPOS=1846765;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:39:40:68:68:32:36:25:14:32:36:25:15 chr1 1849529 . A G 175.06 PASS AO=51;DP=125;FAO=51;FDP=125;FR=.;FRO=74;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=41;FSRR=33;FWDB=-0.0174211;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.453;QD=5.6019;RBI=0.0261105;REFB=-0.0190004;REVB=0.019449;RO=73;SAF=20;SAR=31;SRF=40;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163863;STB=0.596304;TYPE=snp;VARB=0.0209926;OID=.;OPOS=1849529;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:73:74:51:51:31:20:40:33:31:20:41:33 chr1 1849923 . C A 128.4 PASS AO=29;DP=61;FAO=30;FDP=63;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=0.017535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.979;QD=8.15225;RBI=0.0175541;REFB=-0.0154919;REVB=0.00081784;RO=32;SAF=12;SAR=17;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0816066;STB=0.527254;TYPE=snp;VARB=0.0148556;OID=.;OPOS=1849923;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:63:32:33:29:30:17:12:16:16:17:13:16:17 chr1 1854109 . A G 48.61 PASS AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.0233315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.586;QD=5.71845;RBI=0.071161;REFB=0.000459748;REVB=-0.0672274;RO=18;SAF=6;SAR=7;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202481;STB=0.596268;TYPE=snp;VARB=-0.00279941;OID=.;OPOS=1854109;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:33:34:18:21:13:13:7:6:12:6:7:6:13:8 chr1 1859131 . C T 336.07 PASS AO=60;DP=99;FAO=61;FDP=98;FR=.;FRO=37;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=0.0113841;FXX=0.019998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.02;QD=13.7172;RBI=0.0114584;REFB=-0.0183111;REVB=0.0013022;RO=37;SAF=32;SAR=28;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0707705;STB=0.54097;TYPE=snp;VARB=0.010808;OID=.;OPOS=1859131;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:98:37:37:60:61:28:32:16:21:28:33:16:21 chr1 1861582 . C T 202.91 PASS AO=30;DP=72;FAO=33;FDP=68;FR=.,HEALED;FRO=25;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=-0.00230524;FXX=0.0422476;HRUN=4;LEN=1;MLLD=227.853;QD=11.9359;RBI=0.0170585;REFB=-0.0455437;REVB=-0.016902;RO=18;SAF=19;SAR=11;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109948;STB=0.510723;TYPE=snp;VARB=0.0406223;OID=.;OPOS=1861582;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:67:68:18:25:30:33:11:19:14:4:14:19:15:10 chr1 1873514 . A G 79.95 PASS AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=-0.0544879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1934;QD=10.3165;RBI=0.0862217;REFB=-0.00492636;REVB=-0.0668225;RO=15;SAF=8;SAR=8;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199849;STB=0.612769;TYPE=snp;VARB=-0.000341039;OID=.;OPOS=1873514;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:31:31:15:15:16:16:8:8:11:4:8:8:11:4 chr1 1873525 . T C 66.03 PASS AO=14;DP=29;FAO=14;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=-0.0523008;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4837;QD=9.10715;RBI=0.0524315;REFB=0.0186347;REVB=0.00369917;RO=15;SAF=6;SAR=8;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.269488;STB=0.653638;TYPE=snp;VARB=-0.0207416;OID=.;OPOS=1873525;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:29:29:15:15:14:14:8:6:11:4:8:6:11:4 chr1 1886859 . C T 70.65 PASS AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=0.00391113;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.215;QD=10.0923;RBI=0.0407847;REFB=-0.0540738;REVB=0.0405968;RO=14;SAF=4;SAR=10;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.373859;STB=0.713979;TYPE=snp;VARB=0.0310217;OID=.;OPOS=1886859;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:28:28:14:14:14:14:10:4:10:4:10:4:10:4 chr1 1887019 . A G 170.86 PASS AO=16;DP=16;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0221937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.544;QD=37.9686;RBI=0.0227715;REFB=0;REVB=0.00509723;RO=0;SAF=9;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.01041e-05;OID=.;OPOS=1887019;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:16:18:0:0:16:18:7:9:0:0:7:11:0:0 chr1 1887245 . G A 303.94 PASS AO=61;DP=107;FAO=61;FDP=108;FR=.;FRO=47;FSAF=46;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=30;FWDB=0.0100453;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.2474;QD=11.2571;RBI=0.016091;REFB=-0.0226637;REVB=-0.0125703;RO=46;SAF=46;SAR=15;SRF=17;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.330667;STB=0.686502;TYPE=snp;VARB=0.0127167;OID=.;OPOS=1887245;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:108:46:47:61:61:15:46:17:29:15:46:17:30 chr1 1888193 . C A 398.08 PASS AO=86;DP=162;FAO=86;FDP=161;FR=.;FRO=75;FSAF=25;FSAR=61;FSRF=30;FSRR=45;FWDB=0.0294381;FXX=0.00617246;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.546;QD=9.89025;RBI=0.0324653;REFB=-0.0263654;REVB=0.0136891;RO=75;SAF=25;SAR=61;SRF=30;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106912;STB=0.558687;TYPE=snp;VARB=0.0201636;OID=.;OPOS=1888193;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:161:75:75:86:86:61:25:30:45:61:25:30:45 chr1 1900186 . T C 279.63 PASS AO=79;DP=190;FAO=80;FDP=191;FR=.;FRO=111;FSAF=54;FSAR=26;FSRF=54;FSRR=57;FWDB=-0.00454803;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=202.142;QD=5.85621;RBI=0.00477997;REFB=0.00119658;REVB=-0.0014709;RO=111;SAF=54;SAR=25;SRF=54;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215746;STB=0.614785;TYPE=snp;VARB=-0.00205047;OID=.;OPOS=1900186;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:191:111:111:79:80:25:54:54:57:26:54:54:57 chr1 1900232 . T C 182.46 PASS AO=56;DP=146;FAO=59;FDP=155;FR=.;FRO=96;FSAF=20;FSAR=39;FSRF=18;FSRR=78;FWDB=-0.0126925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.971;QD=4.70861;RBI=0.0202618;REFB=-0.0197891;REVB=0.0157936;RO=89;SAF=19;SAR=37;SRF=11;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.294724;STB=0.612211;TYPE=snp;VARB=0.0354476;OID=.;OPOS=1900232;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:155:89:96:56:59:37:19:11:78:39:20:18:78 chr1 1957037 . T C 259.23 PASS AO=28;DP=28;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00923163;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.23;QD=38.404;RBI=0.00927569;REFB=0;REVB=0.000902993;RO=0;SAF=16;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000302106;OID=.;OPOS=1957037;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:28:27:0:0:28:27:12:16:0:0:12:15:0:0 chr1 1987993 . T C 76.9 PASS AO=15;DP=28;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.0123713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.319;QD=10.9861;RBI=0.0179868;REFB=-0.0354678;REVB=-0.0130567;RO=13;SAF=9;SAR=6;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235988;STB=0.633628;TYPE=snp;VARB=0.0285053;OID=.;OPOS=1987993;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:28:28:13:13:15:15:6:9:4:9:6:9:4:9 chr1 1991014 . A G 227.07 PASS AO=61;DP=140;FAO=61;FDP=140;FR=.;FRO=79;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=37;FSRR=42;FWDB=-0.00858476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.88;QD=6.48757;RBI=0.0173942;REFB=-0.0083171;REVB=-0.0151281;RO=79;SAF=31;SAR=30;SRF=37;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0402166;STB=0.522465;TYPE=snp;VARB=0.00913595;OID=.;OPOS=1991014;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:79:79:61:61:30:31:37:42:30:31:37:42 chr1 2005740 . T C 210.67 PASS AO=22;DP=22;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.864;QD=36.639;RBI=0.0544876;REFB=0;REVB=0.0476021;RO=0;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00078908;OID=.;OPOS=2005740;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:22:23:0:0:22:23:12:10:0:0:13:10:0:0 chr1 2113565 . T G 241.33 PASS AO=56;DP=113;FAO=56;FDP=113;FR=.;FRO=57;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=38;FSRR=19;FWDB=0.00270132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.579;QD=8.54249;RBI=0.0115778;REFB=-0.00204689;REVB=0.0112582;RO=55;SAF=32;SAR=24;SRF=37;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0943764;STB=0.549721;TYPE=snp;VARB=0.0022653;OID=.;OPOS=2113565;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:55:57:56:56:24:32:37:18:24:32:38:19 chr1 2337277 . C T 95.99 PASS AO=24;DP=58;FAO=25;FDP=59;FR=.;FRO=34;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=11;FWDB=0.0578467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1643;QD=6.50799;RBI=0.0585926;REFB=-0.0228525;REVB=-0.00931949;RO=33;SAF=7;SAR=17;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.378037;STB=0.701573;TYPE=snp;VARB=0.0173321;OID=.;OPOS=2337277;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:58:59:33:34:24:25:17:7:22:11:17:8:23:11 chr1 2340200 . T C 57.71 PASS AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.0556104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.4969;QD=6.99457;RBI=0.0575179;REFB=-0.0290976;REVB=-0.0146901;RO=19;SAF=10;SAR=4;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150708;STB=0.588103;TYPE=snp;VARB=0.0343598;OID=.;OPOS=2340200;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:33:33:19:19:14:14:4:10:11:8:4:10:11:8 chr1 2399119 . A G 31.5 PASS AO=11;DP=42;FAO=12;FDP=43;FR=.;FRO=31;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=24;FSRR=7;FWDB=-0.018036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.503;QD=2.93045;RBI=0.0186901;REFB=-0.00503036;REVB=-0.00490135;RO=30;SAF=5;SAR=6;SRF=24;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.408498;STB=0.743253;TYPE=snp;VARB=0.0167186;OID=.;OPOS=2399119;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:42:43:30:31:11:12:6:5:24:6:7:5:24:7 chr1 2430617 . C T 39.13 PASS AO=16;DP=59;FAO=16;FDP=58;FR=.;FRO=42;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=-0.0254214;FXX=0.0333278;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.268;QD=2.69866;RBI=0.0264975;REFB=-0.00537632;REVB=-0.00747438;RO=41;SAF=6;SAR=10;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107965;STB=0.540489;TYPE=snp;VARB=0.011846;OID=.;OPOS=2430617;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:59:58:41:42:16:16:10:6:19:22:10:6:18:24 chr1 2444414 . G A 270.31 PASS AO=51;DP=85;FAO=51;FDP=85;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=37;FSRF=8;FSRR=26;FWDB=0.0212111;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.109;QD=12.7206;RBI=0.0778907;REFB=-0.0659824;REVB=0.0749469;RO=34;SAF=14;SAR=37;SRF=8;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0367888;STB=0.520039;TYPE=snp;VARB=0.0354125;OID=.;OPOS=2444414;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:34:34:51:51:37:14:8:26:37:14:8:26 chr1 2451308 . TG T 26.82 PASS AO=50;DP=155;FAO=41;FDP=152;FR=.;FRO=111;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=47;FSRR=64;FWDB=-0.0558006;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.0346;QD=0.705699;RBI=0.0574423;REFB=-0.0633239;REVB=-0.0136349;RO=96;SAF=24;SAR=26;SRF=37;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109257;STB=0.544205;TYPE=del;VARB=0.0569982;OID=.;OPOS=2451309;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:50:152:41:152:111:15:26:47:64:26:96:24:26:37:59 chr1 2452569 . T C 171.5 PASS AO=52;DP=136;FAO=53;FDP=136;FR=.;FRO=83;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=38;FSRR=45;FWDB=-0.0177369;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.0758;QD=5.04419;RBI=0.0649603;REFB=-0.0310914;REVB=-0.0624919;RO=84;SAF=25;SAR=27;SRF=39;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0179902;STB=0.519992;TYPE=snp;VARB=0.0441866;OID=.;OPOS=2452569;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:84:83:52:53:27:25:39:45:27:26:38:45 chr1 2460608 . A G 328.28 PASS AO=67;DP=111;FAO=64;FDP=110;FR=.;FRO=46;FSAF=26;FSAR=38;FSRF=17;FSRR=29;FWDB=0.0133771;FXX=0.0090082;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9779;QD=11.9376;RBI=0.0133807;REFB=0.0207678;REVB=-0.00030858;RO=44;SAF=27;SAR=40;SRF=17;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126282;STB=0.51599;TYPE=snp;VARB=-0.0212687;OID=.;OPOS=2460608;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:110:44:46:67:64:40:27:17:27:38:26:17:29 chr1 2488153 . A G 137.85 PASS AO=40;DP=99;FAO=40;FDP=100;FR=.;FRO=60;FSAF=7;FSAR=33;FSRF=22;FSRR=38;FWDB=-0.026297;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=161.289;QD=5.51389;RBI=0.0274994;REFB=-0.0120395;REVB=-0.00804255;RO=59;SAF=7;SAR=33;SRF=21;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.261271;STB=0.658095;TYPE=snp;VARB=0.0125112;OID=.;OPOS=2488153;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:100:59:60:40:40:33:7:21:38:33:7:22:38 chr1 2491205 . C T 131.93 PASS AO=26;DP=48;FAO=26;FDP=47;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0247314;FXX=0.020829;HRUN=3;LEN=1;MLLD=144.039;QD=11.2283;RBI=0.0269907;REFB=-0.0289122;REVB=-0.01081;RO=20;SAF=10;SAR=16;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126735;STB=0.520532;TYPE=snp;VARB=0.0235193;OID=.;OPOS=2491205;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:48:47:20:21:26:26:16:10:8:12:16:10:9:12 chr1 2526746 . A G 17.4 PASS AO=4;DP=13;FAO=4;FDP=13;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.0211435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.061;QD=5.35307;RBI=0.0662044;REFB=-0.0223581;REVB=-0.0627374;RO=8;SAF=3;SAR=1;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.32623e-08;STB=0.571052;TYPE=snp;VARB=0.0331136;OID=.;OPOS=2526746;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:13:13:8:9:4:4:1:3:6:2:1:3:6:3 chr1 2535613 . C A 29.48 PASS AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0266798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.1702;QD=8.42245;RBI=0.0275199;REFB=-0.00754609;REVB=0.00674786;RO=8;SAF=3;SAR=3;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116777;STB=0.571195;TYPE=snp;VARB=0.0125577;OID=.;OPOS=2535613;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:14:14:8:8:6:6:3:3:5:3:3:3:5:3 chr1 2541269 . A G 80.4 PASS AO=25;DP=71;FAO=26;FDP=73;FR=.;FRO=47;FSAF=2;FSAR=24;FSRF=10;FSRR=37;FWDB=0.0152129;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.9927;QD=4.40539;RBI=0.0616971;REFB=-0.00810204;REVB=-0.0597921;RO=45;SAF=1;SAR=24;SRF=10;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.516454;STB=0.702241;TYPE=snp;VARB=0.0159032;OID=.;OPOS=2541269;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:71:73:45:47:25:26:24:1:10:35:24:2:10:37 chr1 2560882 . G A 16.77 PASS AO=5;DP=19;FAO=5;FDP=19;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=2;FWDB=-0.0188906;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.6821;QD=3.52957;RBI=0.0609823;REFB=-0.0177462;REVB=0.0579826;RO=14;SAF=4;SAR=1;SRF=12;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110572;STB=0.57117;TYPE=snp;VARB=0.0336269;OID=.;OPOS=2560882;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:19:19:14:14:5:5:1:4:12:2:1:4:12:2 chr1 2573199 . A G 28.19 PASS AO=11;DP=41;FAO=11;FDP=41;FR=.;FRO=30;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=25;FWDB=-0.100211;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.834;QD=2.75042;RBI=0.101014;REFB=-0.00599709;REVB=-0.0127075;RO=30;SAF=1;SAR=10;SRF=5;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204585;STB=0.631295;TYPE=snp;VARB=0.012546;OID=.;OPOS=2573199;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:41:41:30:30:11:11:10:1:5:25:10:1:5:25 chr1 2576777 . GC G 617.45 PASS AO=76;DP=108;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.334129;FXX=0.010203;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.0352;QD=25.462;RBI=0.385752;REFB=-0.0230206;REVB=0.192774;RO=15;SAF=11;SAR=65;SRF=6;SRR=9;SSEN=0.300885;SSEP=0;SSSB=-0.141553;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0159223;OID=.;OPOS=2576778;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:76:96:97:97:0:21:76:0:0:52:15:11:65:6:9 chr1 2938989 . G A 622.61 PASS AO=119;DP=171;FAO=121;FDP=209;FR=.;FRO=88;FSAF=81;FSAR=40;FSRF=51;FSRR=37;FWDB=0.0323854;FXX=0.0233634;HRUN=3;LEN=1;MLLD=91.7491;QD=11.9159;RBI=0.0324519;REFB=-0.0975048;REVB=0.00207725;RO=46;SAF=79;SAR=40;SRF=38;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0982497;STB=0.54154;TYPE=snp;VARB=0.033616;OID=.;OPOS=2938989;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:209:46:88:119:121:40:79:38:8:40:81:51:37 chr1 2983963 . G A 99.91 PASS AO=28;DP=70;FAO=28;FDP=70;FR=.;FRO=42;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=-0.00252864;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.7402;QD=5.70901;RBI=0.0189656;REFB=-0.01918;REVB=-0.0187963;RO=41;SAF=19;SAR=9;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183033;STB=0.59884;TYPE=snp;VARB=0.0375516;OID=.;OPOS=2983963;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:41:42:28:28:9:19:21:20:9:19:22:20 chr1 2984087 . C A 18.62 PASS AO=4;DP=12;FAO=4;FDP=12;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.139115;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.774;QD=6.20779;RBI=0.139274;REFB=-0.00966296;REVB=-0.00665337;RO=8;SAF=1;SAR=3;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197909;STB=0.624475;TYPE=snp;VARB=0.0202405;OID=.;OPOS=2984087;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:12:12:8:8:4:4:3:1:1:7:3:1:1:7 chr1 3301721 . C T 137.14 PASS AO=24;DP=39;FAO=24;FDP=39;FR=.;FRO=15;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=3;FWDB=0.0417669;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.955;QD=14.0661;RBI=0.0685848;REFB=-0.0115095;REVB=0.0544005;RO=15;SAF=16;SAR=8;SRF=12;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108974;STB=0.559953;TYPE=snp;VARB=0.0112252;OID=.;OPOS=3301721;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:39:39:15:15:24:24:8:16:12:3:8:16:12:3 chr1 3312914 . T G 249.46 PASS AO=53;DP=100;FAO=53;FDP=100;FR=.;FRO=47;FSAF=34;FSAR=19;FSRF=31;FSRR=16;FWDB=0.00780768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.074;QD=9.97847;RBI=0.0132524;REFB=-0.00360274;REVB=-0.0107083;RO=46;SAF=34;SAR=19;SRF=30;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00982482;STB=0.509275;TYPE=snp;VARB=0.00356365;OID=.;OPOS=3312914;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:46:47:53:53:19:34:30:16:19:34:31:16 chr1 3328358 . T C 86.76 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.0109;QD=38.5586;RBI=0.030782;REFB=0;REVB=0.0286605;RO=0;SAF=1;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00213883;OID=.;OPOS=3328358;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:8:1:0:0:8:1:0:0 chr1 3329204 . C A 10.28 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9051;QD=5.87285;RBI=0.0116426;REFB=-0.0176677;REVB=-0.0116426;RO=5;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0118003;OID=.;OPOS=3329204;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:5:5:2:2:2:0:0:5:2:0:0:5 chr1 3353890 . A G 796.91 PASS AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0052737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.7425;QD=37.9479;RBI=0.0364896;REFB=0;REVB=0.0361064;RO=0;SAF=32;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000209846;OID=.;OPOS=3353890;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:84:84:0:0:84:84:52:32:0:0:52:32:0:0 chr1 3353949 . A G 827.08 PASS AO=92;DP=97;FAO=92;FDP=96;FR=.;FRO=4;FSAF=51;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0270803;FXX=0.0204061;HRUN=3;LEN=1;MLLD=88.2247;QD=34.4615;RBI=0.0360234;REFB=0.11278;REVB=0.0237559;RO=4;SAF=51;SAR=41;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.044028;STB=0.523251;TYPE=snp;VARB=-0.00167306;OID=.;OPOS=3353949;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:97:96:4:4:92:92:41:51:0:4:41:51:0:4 chr1 3354595 . T C 1909.67 PASS AO=224;DP=244;FAO=225;FDP=242;FR=.;FRO=17;FSAF=95;FSAR=130;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=-0.0408399;FXX=0.00819639;HRUN=4;LEN=1;MLLD=91.6066;QD=31.5648;RBI=0.0491977;REFB=-0.0973131;REVB=-0.027432;RO=7;SAF=94;SAR=130;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0173954;STB=0.509248;TYPE=snp;VARB=0.00399528;OID=.;OPOS=3354595;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:244:242:7:17:224:225:130:94:5:2:130:95:5:12 chr1 3354615 . T C 1999.6 PASS AO=221;DP=229;FAO=221;FDP=229;FR=.;FRO=8;FSAF=86;FSAR=135;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.0193329;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=245.919;QD=34.9276;RBI=0.0193737;REFB=-0.000689697;REVB=0.00125758;RO=8;SAF=86;SAR=135;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0077376;STB=0.504065;TYPE=snp;VARB=-3.94518e-05;OID=.;OPOS=3354615;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:229:229:8:8:221:221:135:86:4:4:135:86:4:4 chr1 3354772 . C T 247.23 PASS AO=73;DP=179;FAO=73;FDP=179;FR=.;FRO=106;FSAF=55;FSAR=18;FSRF=63;FSRR=43;FWDB=-0.0196812;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6684;QD=5.52466;RBI=0.0210933;REFB=0.0163735;REVB=-0.00758791;RO=106;SAF=55;SAR=18;SRF=63;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198575;STB=0.612305;TYPE=snp;VARB=-0.0256595;OID=.;OPOS=3354772;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:179:106:106:73:73:18:55:63:43:18:55:63:43 chr1 3380057 . G A 223.85 PASS AO=54;DP=112;FAO=54;FDP=113;FR=.;FRO=59;FSAF=33;FSAR=21;FSRF=33;FSRR=26;FWDB=-0.00402928;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8363;QD=7.92385;RBI=0.0207083;REFB=-0.012823;REVB=0.0203125;RO=58;SAF=33;SAR=21;SRF=32;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0574412;STB=0.528079;TYPE=snp;VARB=0.0137405;OID=.;OPOS=3380057;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:113:58:59:54:54:21:33:32:26:21:33:33:26 chr1 3383898 . A G 778.88 PASS AO=82;DP=82;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0489056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.342;QD=37.5362;RBI=0.051395;REFB=0;REVB=-0.0158014;RO=0;SAF=37;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.55731e-05;OID=.;OPOS=3383898;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:82:83:0:0:82:83:45:37:0:0:45:38:0:0 chr1 3389727 . C T 151.46 PASS AO=28;DP=47;FAO=28;FDP=47;FR=.;FRO=19;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0289876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.221;QD=12.8899;RBI=0.0433705;REFB=0.0110918;REVB=0.0322602;RO=19;SAF=19;SAR=9;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0387666;STB=0.521425;TYPE=snp;VARB=-0.009793;OID=.;OPOS=3389727;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:47:47:19:19:28:28:9:19:12:7:9:19:12:7 chr1 3394456 . T C 673.06 PASS AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00266538;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.091;QD=37.9189;RBI=0.0311931;REFB=0;REVB=-0.031079;RO=0;SAF=47;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.69237e-05;OID=.;OPOS=3394456;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:71:71:0:0:71:71:24:47:0:0:24:47:0:0 chr1 3394511 . CT C 30.76 PASS AO=34;DP=102;FAO=34;FDP=101;FR=.;FRO=67;FSAF=28;FSAR=6;FSRF=45;FSRR=22;FWDB=-0.217897;FXX=0.0194156;HRUN=5;LEN=1;MLLD=9.76743;QD=1.21815;RBI=0.220974;REFB=-0.0764979;REVB=-0.0367496;RO=55;SAF=30;SAR=4;SRF=33;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.436104;STB=0.641477;TYPE=del;VARB=0.00914329;OID=.;OPOS=3394512;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:34:99:34:101:67:28:6:45:22:30:55:30:4:33:22 chr1 3395039 . G A 80.87 PASS AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=19;FWDB=0.000553312;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.402;QD=7.70216;RBI=0.00975043;REFB=-0.00905247;REVB=0.00973471;RO=23;SAF=6;SAR=13;SRF=4;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170722;STB=0.596182;TYPE=snp;VARB=0.00972969;OID=.;OPOS=3395039;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:42:42:23:23:19:19:13:6:4:19:13:6:4:19 chr1 3414105 . C T 79.86 PASS AO=6;DP=11;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0990534;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=58.9981;QD=31.9459;RBI=0.110234;REFB=-0.14903;REVB=0.0483725;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.545355;TYPE=snp;VARB=0.0276918;OID=.;OPOS=3414105;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:7:10:0:1:6:9:1:5:0:0:4:5:1:0 chr1 3416449 . C A 99.27 PASS AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0240054;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.112;QD=39.7066;RBI=0.0341783;REFB=0;REVB=0.024329;RO=0;SAF=2;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.7564e-06;OID=.;OPOS=3416449;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:8:2:0:0:8:2:0:0 chr1 3428160 . T G 129.31 PASS AO=29;DP=59;FAO=29;FDP=59;FR=.;FRO=30;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=8;FWDB=-0.0367237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.199;QD=8.76651;RBI=0.0520017;REFB=-0.0267143;REVB=-0.0368177;RO=30;SAF=21;SAR=8;SRF=22;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0105091;STB=0.505878;TYPE=snp;VARB=0.0309762;OID=.;OPOS=3428160;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:30:30:29:29:8:21:22:8:8:21:22:8 chr1 3428608 . G A 154.95 PASS AO=18;DP=43;FAO=28;FDP=46;FR=.;FRO=18;FSAF=23;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.00475498;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.642;QD=13.474;RBI=0.0263803;REFB=-0.0401733;REVB=-0.0259482;RO=11;SAF=18;SAR=0;SRF=10;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.816398;STB=0.618739;TYPE=snp;VARB=0.0287558;OID=.;OPOS=3428608;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:35:46:11:18:18:28:0:18:10:1:5:23:11:7 chr1 3496479 . T C 42.66 PASS AO=11;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.00349801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.847;QD=7.10946;RBI=0.0171667;REFB=-0.0346603;REVB=-0.0168065;RO=13;SAF=4;SAR=7;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0947925;STB=0.624739;TYPE=snp;VARB=0.049851;OID=.;OPOS=3496479;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:24:24:13:14:11:10:7:4:6:7:7:3:7:7 chr1 3545592 . G A 183.45 PASS AO=40;DP=79;FAO=40;FDP=78;FR=.;FRO=38;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=-0.0134863;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.8156;QD=9.40755;RBI=0.0157881;REFB=-0.0231437;REVB=0.00820888;RO=39;SAF=20;SAR=20;SRF=14;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125687;STB=0.564071;TYPE=snp;VARB=0.0153872;OID=.;OPOS=3545592;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:78:39:38:40:40:20:20:14:25:20:20:14:24 chr1 3545612 . A G 166.42 PASS AO=41;DP=89;FAO=41;FDP=89;FR=.;FRO=48;FSAF=13;FSAR=28;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=-0.0272957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.223;QD=7.47936;RBI=0.0316496;REFB=-0.00733698;REVB=-0.0160202;RO=48;SAF=13;SAR=28;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187312;STB=0.605087;TYPE=snp;VARB=0.006359;OID=.;OPOS=3545612;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:48:48:41:41:28:13:24:24:28:13:24:24 chr1 3548136 . T C 162.73 PASS AO=14;DP=19;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0634028;FXX=0.0555247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.57;QD=38.2882;RBI=0.108411;REFB=0;REVB=0.0879381;RO=0;SAF=11;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00351499;OID=.;OPOS=3548136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:15:17:0:0:14:17:3:11:0:0:3:14:0:0 chr1 3548832 . G C 324.24 PASS AO=74;DP=179;FAO=86;FDP=190;FR=.;FRO=104;FSAF=36;FSAR=50;FSRF=47;FSRR=57;FWDB=0.0181458;FXX=0.0104161;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.948;QD=6.82616;RBI=0.0181605;REFB=-0.0108875;REVB=0.000730632;RO=105;SAF=24;SAR=50;SRF=48;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148729;STB=0.518616;TYPE=snp;VARB=0.00992424;OID=.;OPOS=3548832;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:190:105:104:74:86:50:24:48:57:50:36:47:57 chr1 3549991 . GC G 235.25 PASS AO=27;DP=57;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.109789;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=11.0538;QD=20.0214;RBI=0.366535;REFB=-0.0633707;REVB=0.349706;RO=10;SAF=13;SAR=14;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00918014;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0354353;OID=.;OPOS=3549992;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:27:44:47:47:0:24:23:0:0:18:10:13:14:5:5 chr1 3607532 . G A 241.78 PASS AO=60;DP=135;FAO=62;FDP=136;FR=.;FRO=74;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=24;FSRR=50;FWDB=0.0579291;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.8141;QD=7.11126;RBI=0.0733653;REFB=0.00122839;REVB=0.0450187;RO=75;SAF=30;SAR=30;SRF=24;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179981;STB=0.587365;TYPE=snp;VARB=-0.000186156;OID=.;OPOS=3607532;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:136:75:74:60:62:30:30:24:51:32:30:24:50 chr1 3638593 . G A 121.63 PASS AO=28;DP=61;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=-0.00285372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.731;QD=7.9757;RBI=0.00396252;REFB=-0.020308;REVB=-0.00274915;RO=32;SAF=12;SAR=16;SRF=11;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0833225;STB=0.538345;TYPE=snp;VARB=0.0220158;OID=.;OPOS=3638593;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:32:32:28:29:16:12:11:21:17:12:11:21 chr1 3638674 . C T 604.61 PASS AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0765616;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.629;QD=37.7881;RBI=0.0772283;REFB=0;REVB=0.0101253;RO=0;SAF=15;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000206578;OID=.;OPOS=3638674;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:64:64:0:0:64:64:49:15:0:0:49:15:0:0 chr1 3669201 . A G 1291.8 PASS AO=133;DP=134;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0237856;FXX=0.0073524;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.384;QD=38.2754;RBI=0.0623916;REFB=0;REVB=0.0576798;RO=0;SAF=54;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000190498;OID=.;OPOS=3669201;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:134:135:0:0:133:135:79:54:0:0:81:54:0:0 chr1 3669205 . C G 1232.41 PASS AO=131;DP=132;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0649619;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7037;QD=37.631;RBI=0.0907462;REFB=-0.0606003;REVB=0.0633626;RO=0;SAF=53;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00120203;OID=.;OPOS=3669205;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:132:131:0:0:131:131:78:53:0:0:78:53:0:0 chr1 3677933 . T C 832.22 PASS AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0160239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.132;QD=38.263;RBI=0.052951;REFB=0;REVB=0.0504682;RO=0;SAF=45;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.519e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.74802e-05;OID=.;OPOS=3677933;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:87:87:0:0:87:87:42:45:0:0:42:45:0:0 chr1 3679775 . C T 95.43 PASS AO=7;DP=12;FAO=11;FDP=11;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.058869;FXX=0.0832639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.1612;QD=34.7007;RBI=0.0658238;REFB=0;REVB=-0.0294484;RO=0;SAF=5;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.27427e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00125592;OID=.;OPOS=3679775;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:10:11:0:0:7:11:2:5:0:0:6:5:0:0 chr1 3683159 . A C 539.02 PASS AO=121;DP=239;FAO=125;FDP=244;FR=.;FRO=119;FSAF=47;FSAR=78;FSRF=35;FSRR=84;FWDB=0.0421918;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.4898;QD=8.83638;RBI=0.0572419;REFB=0.00335736;REVB=-0.0386844;RO=117;SAF=45;SAR=76;SRF=36;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0628425;STB=0.543462;TYPE=snp;VARB=-0.00591368;OID=.;OPOS=3683159;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:239:244:117:119:121:125:76:45:36:81:78:47:35:84 chr1 3731757 . TG T 31.33 PASS AO=8;DP=18;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0.134438;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=16.6973;QD=6.59494;RBI=0.134443;REFB=-0.092068;REVB=-0.00112647;RO=9;SAF=6;SAR=2;SRF=1;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.531713;STB=0.749604;TYPE=del;VARB=0.114167;OID=.;OPOS=3731758;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:8:18:11:19:8:7:4:0:8:25:9:6:2:1:8 chr1 3743319 . G A 192.31 PASS AO=47;DP=123;FAO=55;FDP=129;FR=.;FRO=74;FSAF=23;FSAR=32;FSRF=26;FSRR=48;FWDB=0.0173915;FXX=0.0300729;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.174;QD=5.96299;RBI=0.030598;REFB=-0.0221922;REVB=0.0251749;RO=74;SAF=17;SAR=30;SRF=27;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00368807;STB=0.539892;TYPE=snp;VARB=0.0295095;OID=.;OPOS=3743319;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:129:74:74:47:55:30:17:27:47:32:23:26:48 chr1 3753136 . A T 291.65 PASS AO=69;DP=154;FAO=76;FDP=168;FR=.;FRO=92;FSAF=46;FSAR=30;FSRF=36;FSRR=56;FWDB=0.00136867;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.04;QD=6.94414;RBI=0.0123838;REFB=-0.00767177;REVB=0.0123079;RO=83;SAF=45;SAR=24;SRF=36;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218568;STB=0.616553;TYPE=snp;VARB=0.0207061;OID=.;OPOS=3753136;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:168:83:92:69:76:24:45:36:47:30:46:36:56 chr1 3755675 . T C 822.75 PASS AO=86;DP=87;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0513349;FXX=0.0114929;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.73;QD=38.2675;RBI=0.0597699;REFB=0;REVB=0.0306133;RO=0;SAF=33;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.98109e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000166876;OID=.;OPOS=3755675;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:87:86:0:0:86:86:53:33:0:0:53:33:0:0 chr1 3759784 . A G 1148.56 PASS AO=134;DP=148;FAO=136;FDP=147;FR=.;FRO=11;FSAF=59;FSAR=77;FSRF=11;FSRR=0;FWDB=0.00952383;FXX=0.0067563;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.355;QD=31.2533;RBI=0.0133016;REFB=-0.0492856;REVB=0.00928599;RO=11;SAF=57;SAR=77;SRF=11;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0833666;STB=0.542629;TYPE=snp;VARB=0.00189205;OID=.;OPOS=3759784;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:148:147:11:11:134:136:77:57:11:0:77:59:11:0 chr1 3761479 . C T 315.06 PASS AO=77;DP=164;FAO=78;FDP=164;FR=.;FRO=86;FSAF=19;FSAR=59;FSRF=26;FSRR=60;FWDB=0.00415282;FXX=0.00606024;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.75;QD=7.68426;RBI=0.00415287;REFB=-0.00624991;REVB=-2.09847e-05;RO=85;SAF=19;SAR=58;SRF=26;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0721375;STB=0.540063;TYPE=snp;VARB=0.00757698;OID=.;OPOS=3761479;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:164:85:86:77:78:58:19:26:59:59:19:26:60 chr1 3786189 . G A 154.11 PASS AO=35;DP=73;FAO=36;FDP=73;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.0104075;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.704;QD=8.44423;RBI=0.0128147;REFB=-0.000802518;REVB=0.00747663;RO=37;SAF=15;SAR=20;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0539251;STB=0.535943;TYPE=snp;VARB=0.00147135;OID=.;OPOS=3786189;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:37:37:35:36:20:15:18:19:21:15:18:19 chr1 3800242 . A G 315.45 PASS AO=55;DP=84;FAO=55;FDP=84;FR=.;FRO=29;FSAF=21;FSAR=34;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=0.0119509;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.308;QD=15.0216;RBI=0.014531;REFB=-0.0154926;REVB=-0.00826591;RO=29;SAF=21;SAR=34;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154605;STB=0.583853;TYPE=snp;VARB=0.00880193;OID=.;OPOS=3800242;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:84:84:29:29:55:55:34:21:18:11:34:21:18:11 chr1 4772053 . T C 26.13 PASS AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=9;FWDB=0.0836266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.5875;QD=6.53236;RBI=0.0872467;REFB=-0.0165293;REVB=-0.0248712;RO=9;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.46249;STB=0.683735;TYPE=snp;VARB=0.0213407;OID=.;OPOS=4772053;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:16:16:9:10:6:6:4:2:0:9:4:2:1:9 chr1 4772717 . G A 97.93 PASS AO=27;DP=66;FAO=27;FDP=66;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=-0.0219309;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=196.579;QD=5.93523;RBI=0.0521531;REFB=-0.00451689;REVB=0.0473178;RO=38;SAF=12;SAR=15;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00303724;STB=0.510197;TYPE=snp;VARB=0.00570404;OID=.;OPOS=4772717;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:66:66:38:39:27:27:15:12:17:21:15:12:18:21 chr1 4834606 . T C 192.07 PASS AO=50;DP=115;FAO=51;FDP=116;FR=.;FRO=65;FSAF=17;FSAR=34;FSRF=21;FSRR=44;FWDB=-0.018146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.9036;QD=6.62295;RBI=0.0238589;REFB=-0.0232206;REVB=0.015491;RO=64;SAF=16;SAR=34;SRF=21;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00932011;STB=0.506491;TYPE=snp;VARB=0.030002;OID=.;OPOS=4834606;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:116:64:65:50:51:34:16:21:43:34:17:21:44 chr1 4842981 . G A 431.46 PASS AO=113;DP=254;FAO=114;FDP=252;FR=.;FRO=138;FSAF=89;FSAR=25;FSRF=103;FSRR=35;FWDB=0.0037544;FXX=0.0117642;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.829;QD=6.84851;RBI=0.0385938;REFB=0.00605236;REVB=0.0384108;RO=136;SAF=89;SAR=24;SRF=102;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0533895;STB=0.526622;TYPE=snp;VARB=-0.00805265;OID=.;OPOS=4842981;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:254:252:136:138:113:114:24:89:102:34:25:89:103:35 chr1 4847594 . C T 137.38 PASS AO=41;DP=104;FAO=41;FDP=104;FR=.;FRO=63;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=46;FSRR=17;FWDB=-0.00361422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.1761;QD=5.28365;RBI=0.0322041;REFB=-0.00606749;REVB=-0.0320006;RO=63;SAF=20;SAR=21;SRF=46;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.259409;STB=0.645787;TYPE=snp;VARB=0.00629969;OID=.;OPOS=4847594;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:63:63:41:41:21:20:46:17:21:20:46:17 chr1 5926507 . T C 151.96 PASS AO=28;DP=47;FAO=28;FDP=47;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=4;FWDB=-0.00403388;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.749;QD=12.9326;RBI=0.0176694;REFB=-0.011932;REVB=-0.0172028;RO=18;SAF=10;SAR=18;SRF=15;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.330635;STB=0.671522;TYPE=snp;VARB=0.0116638;OID=.;OPOS=5926507;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:47:47:18:19:28:28:18:10:15:3:18:10:15:4 chr1 5935162 . A T 107.82 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.97;QD=35.9384;RBI=0.0755517;REFB=0;REVB=0.0755517;RO=0;SAF=0;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00170512;OID=.;OPOS=5935162;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:12:0:0:0:12:0:0:0 chr1 5948677 . G A 172.48 PASS AO=45;DP=102;FAO=45;FDP=102;FR=.;FRO=57;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=33;FSRR=24;FWDB=-0.0105671;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=207.851;QD=6.76392;RBI=0.0131427;REFB=0.00103432;REVB=0.00781446;RO=57;SAF=21;SAR=24;SRF=33;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111589;STB=0.562472;TYPE=snp;VARB=-0.0014817;OID=.;OPOS=5948677;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:57:57:45:45:24:21:33:24:24:21:33:24 chr1 6142308 . T C 872.46 PASS AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.178;QD=37.9331;RBI=0.0747793;REFB=0;REVB=-0.0734726;RO=0;SAF=64;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000333136;OID=.;OPOS=6142308;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:92:92:0:0:92:92:28:64:0:0:28:64:0:0 chr1 6157434 . C T 200.09 PASS AO=31;DP=88;FAO=45;FDP=87;FR=.;FRO=42;FSAF=29;FSAR=16;FSRF=30;FSRR=12;FWDB=0.0548365;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.6349;QD=9.1995;RBI=0.0557464;REFB=-0.00934229;REVB=-0.0100312;RO=29;SAF=20;SAR=11;SRF=25;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223007;STB=0.537569;TYPE=snp;VARB=0.0086895;OID=.;OPOS=6157434;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:87:29:42:31:45:11:20:25:4:16:29:30:12 chr1 6158562 . A G 226.55 PASS AO=54;DP=111;FAO=54;FDP=111;FR=.;FRO=57;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=27;FSRR=30;FWDB=-0.0127736;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.2911;QD=8.16398;RBI=0.0368293;REFB=-0.0219472;REVB=-0.0345432;RO=54;SAF=24;SAR=30;SRF=25;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0169155;STB=0.515146;TYPE=snp;VARB=0.0297273;OID=.;OPOS=6158562;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:54:57:54:54:30:24:25:29:30:24:27:30 chr1 6162054 . T C 14.25 PASS AO=4;DP=16;FAO=4;FDP=16;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.0776201;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.4537;QD=3.56268;RBI=0.142121;REFB=0.00668267;REVB=-0.119053;RO=12;SAF=1;SAR=3;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110794;STB=0.576517;TYPE=snp;VARB=-0.0266994;OID=.;OPOS=6162054;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:16:16:12:12:4:4:3:1:4:8:3:1:4:8 chr1 6163135 . C T 208.62 PASS AO=48;DP=97;FAO=48;FDP=97;FR=.;FRO=49;FSAF=1;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=49;FWDB=0.0228843;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.5997;QD=8.60289;RBI=0.0264542;REFB=-0.000615246;REVB=0.0132716;RO=48;SAF=1;SAR=47;SRF=0;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.315286;STB=0.67128;TYPE=snp;VARB=0.00319759;OID=.;OPOS=6163135;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:48:49:48:48:47:1:0:48:47:1:0:49 chr1 6163141 . C T 224.45 PASS AO=50;DP=98;FAO=50;FDP=98;FR=.;FRO=48;FSAF=1;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=48;FWDB=-0.0409409;FXX=0.0101;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.887;QD=9.16102;RBI=0.0410321;REFB=-0.0230194;REVB=0.00273383;RO=48;SAF=1;SAR=49;SRF=0;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.306856;STB=0.664338;TYPE=snp;VARB=0.0228471;OID=.;OPOS=6163141;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:48:48:50:50:49:1:0:48:49:1:0:48 chr1 6184092 . A G 36.5 PASS AO=9;DP=26;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=0.0117691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.389;QD=5.21434;RBI=0.0187577;REFB=-0.00818159;REVB=-0.0146062;RO=17;SAF=8;SAR=1;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.32543;STB=0.571275;TYPE=snp;VARB=0.0242724;OID=.;OPOS=6184092;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:26:28:17:18:9:10:1:8:12:5:2:8:13:5 chr1 6196869 . A G 188.68 PASS AO=35;DP=59;FAO=35;FDP=59;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=25;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=0.00935227;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.1314;QD=12.7917;RBI=0.0223411;REFB=-0.00376964;REVB=-0.0202894;RO=24;SAF=10;SAR=25;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0777406;STB=0.542832;TYPE=snp;VARB=0.00206293;OID=.;OPOS=6196869;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:59:59:24:24:35:35:25:10:9:15:25:10:9:15 chr1 6204161 . G A 242.02 PASS AO=59;DP=124;FAO=59;FDP=124;FR=.;FRO=65;FSAF=40;FSAR=19;FSRF=32;FSRR=33;FWDB=0.0131852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.661;QD=7.80713;RBI=0.0214567;REFB=-0.022925;REVB=0.0169275;RO=65;SAF=40;SAR=19;SRF=32;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185535;STB=0.603212;TYPE=snp;VARB=0.0172962;OID=.;OPOS=6204161;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:65:65:59:59:19:40:32:33:19:40:32:33 chr1 6313938 . C T 280.05 PASS AO=30;DP=32;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147123;FXX=0.0624805;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.566;QD=37.3394;RBI=0.0257371;REFB=0;REVB=0.0211174;RO=0;SAF=19;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000514622;OID=.;OPOS=6313938;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:32:30:0:0:30:30:11:19:0:0:11:19:0:0 chr1 6314822 . T C 531.29 PASS AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.03859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.1722;QD=37.949;RBI=0.0591882;REFB=0;REVB=0.0448782;RO=0;SAF=36;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.57266e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.20772e-05;OID=.;OPOS=6314822;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:56:56:0:0:56:56:20:36:0:0:20:36:0:0 chr1 6508712 . T C 16.08 PASS AO=3;DP=6;FAO=3;FDP=6;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0490961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.871;QD=10.7182;RBI=0.138037;REFB=-0.0538009;REVB=-0.129011;RO=3;SAF=2;SAR=1;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.352427;STB=0.713247;TYPE=snp;VARB=0.00783045;OID=.;OPOS=6508712;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:6:6:3:3:3:3:1:2:3:0:1:2:3:0 chr1 6614230 . G A 97.48 PASS AO=16;DP=24;FAO=16;FDP=24;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.014545;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.5393;QD=16.246;RBI=0.0146163;REFB=0.00128426;REVB=-0.00144214;RO=8;SAF=3;SAR=13;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161363;STB=0.590785;TYPE=snp;VARB=-0.000105735;OID=.;OPOS=6614230;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:24:24:8:8:16:16:13:3:3:5:13:3:3:5 chr1 6635231 . A G 339.52 PASS AO=35;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.011357;FXX=0.0270197;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2534;QD=37.7247;RBI=0.0238287;REFB=0;REVB=-0.0209481;RO=1;SAF=22;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0207916;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000882924;OID=.;OPOS=6635231;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:36:36:1:0:35:36:13:22:1:0:13:23:0:0 chr1 6635306 . G A 203.13 PASS AO=45;DP=88;FAO=45;FDP=88;FR=.;FRO=43;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=25;FSRR=18;FWDB=-0.0844385;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.183;QD=9.23315;RBI=0.0850973;REFB=-0.0160177;REVB=-0.0105685;RO=43;SAF=18;SAR=27;SRF=25;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160823;STB=0.589001;TYPE=snp;VARB=0.0134115;OID=.;OPOS=6635306;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:43:43:45:45:27:18:25:18:27:18:25:18 chr1 6654589 . C T 35.02 PASS AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=-0.00972758;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.297;QD=9.33875;RBI=0.0147136;REFB=0.0019708;REVB=0.0110392;RO=8;SAF=1;SAR=6;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0334227;STB=0.519944;TYPE=snp;VARB=-0.0043545;OID=.;OPOS=6654589;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:15:15:8:8:7:7:6:1:1:7:6:1:1:7 chr1 6704635 . A G 107.37 PASS AO=30;DP=76;FAO=30;FDP=75;FR=.;FRO=45;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=-0.00366519;FXX=0.0740649;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.0286;QD=5.72664;RBI=0.0495268;REFB=-0.00971792;REVB=-0.049391;RO=43;SAF=9;SAR=21;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185348;STB=0.60862;TYPE=snp;VARB=0.00921665;OID=.;OPOS=6704635;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:75:43:45:30:30:21:9:20:23:21:9:21:24 chr1 6705874 . G C 196.9 PASS AO=46;DP=94;FAO=46;FDP=94;FR=.;FRO=48;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=-0.00199152;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.044;QD=8.37885;RBI=0.018416;REFB=-0.0180753;REVB=-0.018308;RO=42;SAF=25;SAR=21;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00360706;STB=0.532887;TYPE=snp;VARB=0.0149632;OID=.;OPOS=6705874;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:42:48:46:46:21:25:23:19:21:25:23:25 chr1 7723588 . C T 25.44 PASS AO=7;DP=22;FAO=7;FDP=22;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.01908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.319;QD=4.62556;RBI=0.0190866;REFB=-0.00287591;REVB=-0.000504241;RO=15;SAF=3;SAR=4;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185114;STB=0.615062;TYPE=snp;VARB=0.016971;OID=.;OPOS=7723588;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:22:22:15:15:7:7:4:3:9:6:4:3:9:6 chr1 7723930 . G GC 11.03 PASS AO=2;DP=9;FAO=2;FDP=9;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=56.3066;QD=4.90036;RBI=0.0283412;REFB=-0.00847883;REVB=-0.0283412;RO=7;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.0430883;OID=.;OPOS=7723931;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:2:9:2:9:7:0:2:0:7:11:7:0:2:0:7 chr1 7723957 . G A 99.27 PASS AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.48;QD=39.7067;RBI=0.0276088;REFB=0;REVB=0.0276088;RO=0;SAF=0;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000663333;OID=.;OPOS=7723957;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:10:0:0:0:10:0:0:0 chr1 7811014 . G A 339.24 PASS AO=92;DP=234;FAO=100;FDP=239;FR=.;FRO=139;FSAF=52;FSAR=48;FSRF=72;FSRR=67;FWDB=0.0153979;FXX=0.0164602;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.084;QD=5.67773;RBI=0.0278949;REFB=-0.010291;REVB=0.02326;RO=141;SAF=45;SAR=47;SRF=73;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.030788;STB=0.501173;TYPE=snp;VARB=0.0128314;OID=.;OPOS=7811014;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:234:239:141:139:92:100:47:45:73:68:48:52:72:67 chr1 7870048 . T C 723.06 PASS AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.04735;FXX=0.0384566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.3485;QD=38.5629;RBI=0.0499195;REFB=0;REVB=-0.0158093;RO=0;SAF=40;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71047e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00547819;OID=.;OPOS=7870048;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:75:75:0:0:75:75:35:40:0:0:35:40:0:0 chr1 7887248 . G A 139.51 PASS AO=24;DP=38;FAO=24;FDP=38;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.0080549;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.751;QD=14.6856;RBI=0.0210638;REFB=-0.0312187;REVB=-0.0194628;RO=14;SAF=7;SAR=17;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203602;STB=0.612882;TYPE=snp;VARB=0.0180684;OID=.;OPOS=7887248;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:38:38:14:14:24:24:17:7:8:6:17:7:8:6 chr1 7887493 . T C 543.52 PASS AO=56;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0257239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.7929;QD=38.142;RBI=0.0371186;REFB=0;REVB=0.0267596;RO=0;SAF=15;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000301773;OID=.;OPOS=7887493;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:57:57:0:0:56:57:41:15:0:0:42:15:0:0 chr1 7889941 . C T 473.86 PASS AO=98;DP=177;FAO=98;FDP=176;FR=.;FRO=78;FSAF=61;FSAR=37;FSRF=49;FSRR=29;FWDB=0.0285055;FXX=0.0056494;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.829;QD=10.7695;RBI=0.0289134;REFB=-0.0196918;REVB=0.00483935;RO=75;SAF=61;SAR=37;SRF=47;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00357739;STB=0.502717;TYPE=snp;VARB=0.0176124;OID=.;OPOS=7889941;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:176:75:78:98:98:37:61:47:28:37:61:49:29 chr1 7890064 . A G 128.34 PASS AO=24;DP=41;FAO=24;FDP=41;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=19;FSRF=3;FSRR=14;FWDB=-0.000883848;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.5879;QD=12.521;RBI=0.0116942;REFB=-0.0162553;REVB=-0.0116608;RO=17;SAF=5;SAR=19;SRF=3;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0370168;STB=0.520488;TYPE=snp;VARB=0.00508308;OID=.;OPOS=7890064;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:41:41:17:17:24:24:19:5:3:14:19:5:3:14 chr1 7906476 . G T 580.78 PASS AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0398301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.44;QD=38.7184;RBI=0.0605399;REFB=0;REVB=0.0455921;RO=0;SAF=42;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41114e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000921497;OID=.;OPOS=7906476;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:60:60:0:0:60:60:18:42:0:0:18:42:0:0 chr1 7913430 . G A 1135.76 PASS AO=119;DP=120;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00335755;FXX=0.0165276;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.4739;QD=38.1769;RBI=0.0288537;REFB=0;REVB=0.0286577;RO=0;SAF=58;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.93668e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000303553;OID=.;OPOS=7913430;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:120:119:0:0:119:119:61:58:0:0:61:58:0:0 chr1 7990367 . G A 581.22 PASS AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0118248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.9482;QD=36.326;RBI=0.0263668;REFB=-0.064687;REVB=0.0235666;RO=0;SAF=34;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508472;TYPE=snp;VARB=0.00116557;OID=.;OPOS=7990367;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:64:64:0:1:63:63:29:34:0:0:29:34:0:1 chr1 8412935 . C T 277.35 PASS AO=82;DP=214;FAO=86;FDP=218;FR=.;FRO=132;FSAF=24;FSAR=62;FSRF=50;FSRR=82;FWDB=-0.00216429;FXX=0.004566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.578;QD=5.08898;RBI=0.00377441;REFB=-0.00997956;REVB=0.00309225;RO=126;SAF=25;SAR=57;SRF=46;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0737587;STB=0.570346;TYPE=snp;VARB=0.0142281;OID=.;OPOS=8412935;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:218:126:132:82:86:57:25:46:80:62:24:50:82 chr1 8412989 . A G 1736 PASS AO=180;DP=180;FAO=180;FDP=180;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=128;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00613268;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.785;QD=38.5777;RBI=0.0105036;REFB=0;REVB=-0.0085273;RO=0;SAF=52;SAR=128;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.35148e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.6766e-06;OID=.;OPOS=8412989;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:180:180:0:0:180:180:128:52:0:0:128:52:0:0 chr1 8413317 . A C 84.16 PASS AO=14;DP=22;FAO=14;FDP=22;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=0.00601854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.108;QD=15.3013;RBI=0.0405241;REFB=-0.0110867;REVB=-0.0400747;RO=8;SAF=3;SAR=11;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.44784;STB=0.753045;TYPE=snp;VARB=0.0250145;OID=.;OPOS=8413317;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:22:22:8:8:14:14:11:3:7:1:11:3:7:1 chr1 8418644 . C A 108.06 PASS AO=10;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.043909;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=181.093;QD=36.0186;RBI=0.0541385;REFB=0;REVB=-0.0316698;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000168823;OID=.;OPOS=8418644;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:10:12:5:5:0:0:7:5:0:0 chr1 8418650 . T C 107.82 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0431585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.251;QD=35.9384;RBI=0.0781883;REFB=0;REVB=0.0651978;RO=0;SAF=5;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00154683;OID=.;OPOS=8418650;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:7:5:0:0:7:5:0:0 chr1 8425900 . T C 198.37 PASS AO=34;DP=177;FAO=64;FDP=169;FR=.;FRO=105;FSAF=27;FSAR=37;FSRF=58;FSRR=47;FWDB=-0.00895118;FXX=0.0174408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.097;QD=4.69505;RBI=0.0224032;REFB=-0.00801322;REVB=-0.0205372;RO=95;SAF=2;SAR=32;SRF=53;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.692016;STB=0.580983;TYPE=snp;VARB=0.0121111;OID=.;OPOS=8425900;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:169:95:105:34:64:32:2:53:42:37:27:58:47 chr1 9039704 . G A 423.68 PASS AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0283877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.988;QD=37.6608;RBI=0.0485191;REFB=0;REVB=-0.0393477;RO=0;SAF=18;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.50121e-05;OID=.;OPOS=9039704;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:45:45:0:0:45:45:27:18:0:0:27:18:0:0 chr1 9165685 . G A 183.76 PASS AO=34;DP=58;FAO=34;FDP=57;FR=.;FRO=23;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=-0.0171069;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.227;QD=12.8953;RBI=0.0406036;REFB=-0.0302837;REVB=0.036824;RO=23;SAF=19;SAR=15;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103418;STB=0.556701;TYPE=snp;VARB=0.0244763;OID=.;OPOS=9165685;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:58:57:23:23:34:34:15:19:16:7:15:19:16:7 chr1 9171238 . G T 472.05 PASS AO=124;DP=277;FAO=126;FDP=275;FR=.;FRO=149;FSAF=43;FSAR=83;FSRF=51;FSRR=98;FWDB=0.0084122;FXX=0.00721996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.0315;QD=6.86614;RBI=0.0135472;REFB=-0.0285714;REVB=0.0106189;RO=149;SAF=43;SAR=81;SRF=51;SRR=98;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00489908;STB=0.500609;TYPE=snp;VARB=0.0587178;OID=.;OPOS=9171238;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:277:275:149:149:124:126:81:43:51:98:83:43:51:98 chr1 9323910 . G A 115.59 PASS AO=25;DP=52;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=3;FSAR=23;FSRF=3;FSRR=24;FWDB=0.0429869;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=112.648;QD=8.72349;RBI=0.0522431;REFB=-0.0169214;REVB=0.0296896;RO=26;SAF=3;SAR=22;SRF=3;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0100001;STB=0.505372;TYPE=snp;VARB=0.0148863;OID=.;OPOS=9323910;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:53:26:27:25:26:22:3:3:23:23:3:3:24 chr1 9324571 . T C 14.26 PASS AO=4;DP=16;FAO=4;FDP=16;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=11;FWDB=-0.0100295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.6073;QD=3.5642;RBI=0.0239618;REFB=0.0111276;REVB=0.0217618;RO=11;SAF=2;SAR=2;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.488976;STB=0.811543;TYPE=snp;VARB=-0.0266559;OID=.;OPOS=9324571;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:16:16:11:12:4:4:2:2:1:10:2:2:1:11 chr1 9324670 . A G 126.61 PASS AO=30;DP=66;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=9;FSRR=26;FWDB=-0.0111985;FXX=0.0579626;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.977;QD=7.79139;RBI=0.0112235;REFB=-0.0198334;REVB=0.00074814;RO=35;SAF=10;SAR=20;SRF=9;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0850091;STB=0.547589;TYPE=snp;VARB=0.0268889;OID=.;OPOS=9324670;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:65:35:35:30:30:20:10:9:26:20:10:9:26 chr1 9427869 . G A 212.71 PASS AO=54;DP=115;FAO=53;FDP=114;FR=.;FRO=61;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=21;FSRR=40;FWDB=-0.104108;FXX=0.0172399;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.4;QD=7.46344;RBI=0.10553;REFB=-0.00133869;REVB=0.0172655;RO=57;SAF=23;SAR=31;SRF=17;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123866;STB=0.539536;TYPE=snp;VARB=0.00155142;OID=.;OPOS=9427869;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:114:57:61:54:53:31:23:17:40:31:22:21:40 chr1 9670834 . C T 820.09 PASS AO=86;DP=87;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0521311;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.4784;QD=38.1435;RBI=0.0590822;REFB=0;REVB=0.0278038;RO=1;SAF=23;SAR=63;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0201497;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000233591;OID=.;OPOS=9670834;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:87:86:1:0:86:86:63:23:1:0:63:23:0:0 chr1 9784932 . GC G 29.97 PASS AO=17;DP=47;FAO=16;FDP=46;FR=.;FRO=30;FSAF=1;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.0563853;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.353;QD=2.606;RBI=0.137253;REFB=-0.0674527;REVB=-0.125136;RO=27;SAF=1;SAR=16;SRF=11;SRR=16;SSEN=0.487603;SSEP=0;SSSB=-0.58659;STB=0.854682;TYPE=del;VARB=0.0870965;OID=.;OPOS=9784933;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:17:45:16:46:30:1:15:12:18:29:27:1:16:11:16 chr1 9888202 . C T 1094.13 PASS AO=109;DP=109;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0492016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.142;QD=38.0568;RBI=0.0545219;REFB=0;REVB=0.0234912;RO=0;SAF=36;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.98939e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000235379;OID=.;OPOS=9888202;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:109:115:0:0:109:115:73:36:0:0:78:37:0:0 chr1 9910469 . AT A 33.82 PASS AO=8;DP=47;FAO=23;FDP=37;FR=.;FRO=14;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.101808;FXX=0.0512689;HRUN=6;LEN=1;MLLD=5.86583;QD=3.65598;RBI=0.255313;REFB=-0.0153904;REVB=0.234137;RO=11;SAF=8;SAR=0;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.796512;STB=0.54606;TYPE=del;VARB=0.116571;OID=.;OPOS=9910470;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:8:34:23:37:14:12:11:9:5:15:11:8:0:4:7 chr1 10001235 . TTTCG T 25 PASS AO=28;DP=64;LEN=4;RO=36;SAF=22;SAR=7;SRF=24;SRR=11;TYPE=del;FR=.;OID=.;OPOS=10001236;OREF=TTCG;OALT=-;OMAPALT=T GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR 0/1:99:64:36:28:7:22:24:11 chr1 10318652 . C G 482.06 PASS AO=127;DP=280;FAO=127;FDP=280;FR=.;FRO=153;FSAF=48;FSAR=79;FSRF=83;FSRR=70;FWDB=-0.0265422;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.67;QD=6.88652;RBI=0.0291813;REFB=-0.00735357;REVB=-0.0121267;RO=152;SAF=48;SAR=79;SRF=83;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167877;STB=0.591323;TYPE=snp;VARB=0.0161144;OID=.;OPOS=10318652;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:280:280:152:153:127:127:79:48:83:69:79:48:83:70 chr1 10339209 . CAT C 352.96 PASS AO=87;DP=221;FAO=95;FDP=212;FR=.;FRO=117;FSAF=37;FSAR=58;FSRF=41;FSRR=76;FWDB=-0.0131741;FXX=0.036362;HRUN=1;LEN=2;MLLD=250.633;QD=6.65962;RBI=0.0170862;REFB=-0.0139811;REVB=0.0108803;RO=106;SAF=32;SAR=55;SRF=38;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00995166;STB=0.522881;TYPE=del;VARB=0.0190933;OID=.;OPOS=10339210;OREF=AT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:87:213:95:212:117:37:58:41:76:99:106:32:55:38:68 chr1 10366692 . C G 378.78 PASS AO=88;DP=185;FAO=91;FDP=188;FR=.;FRO=97;FSAF=41;FSAR=50;FSRF=46;FSRR=51;FWDB=0.00278943;FXX=0.0105258;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.682;QD=8.05918;RBI=0.00332503;REFB=-0.00964903;REVB=0.00180968;RO=96;SAF=39;SAR=49;SRF=45;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0243948;STB=0.512304;TYPE=snp;VARB=0.0103348;OID=.;OPOS=10366692;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:188:96:97:88:91:49:39:45:51:50:41:46:51 chr1 10435324 . C A 538.82 PASS AO=119;DP=230;FAO=119;FDP=227;FR=.;FRO=108;FSAF=74;FSAR=45;FSRF=53;FSRR=55;FWDB=-0.00814243;FXX=0.0130429;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.77;QD=9.49469;RBI=0.00820663;REFB=-0.00219662;REVB=0.00102452;RO=107;SAF=74;SAR=45;SRF=52;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120921;STB=0.564228;TYPE=snp;VARB=0.00189122;OID=.;OPOS=10435324;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:230:227:107:108:119:119:45:74:52:55:45:74:53:55 chr1 10460485 . T C 405.68 PASS AO=87;DP=162;FAO=87;FDP=162;FR=.;FRO=75;FSAF=61;FSAR=26;FSRF=54;FSRR=21;FWDB=-0.0148062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.88;QD=10.0168;RBI=0.0233107;REFB=-0.027085;REVB=-0.0180046;RO=75;SAF=61;SAR=26;SRF=54;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192101;STB=0.510498;TYPE=snp;VARB=0.0191533;OID=.;OPOS=10460485;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:162:75:75:87:87:26:61:54:21:26:61:54:21 chr1 10473196 . C T 215.76 PASS AO=47;DP=91;FAO=47;FDP=91;FR=.;FRO=44;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=29;FSRR=15;FWDB=0.0128621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.589;QD=9.48414;RBI=0.0451771;REFB=-0.00297612;REVB=-0.0433075;RO=44;SAF=25;SAR=22;SRF=29;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112865;STB=0.562208;TYPE=snp;VARB=0.00308503;OID=.;OPOS=10473196;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:44:44:47:47:22:25:29:15:22:25:29:15 chr1 10511544 . C T 112.85 PASS AO=25;DP=52;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=20;FWDB=-0.000696915;FXX=0.0192271;HRUN=3;LEN=1;MLLD=209.474;QD=8.85125;RBI=0.0126142;REFB=-0.0123531;REVB=0.0125949;RO=25;SAF=16;SAR=9;SRF=5;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.377856;STB=0.700754;TYPE=snp;VARB=0.0113421;OID=.;OPOS=10511544;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:51:25:26:25:25:9:16:5:20:9:16:6:20 chr1 10511589 . T C 375.38 PASS AO=38;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0227449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.938;QD=38.5001;RBI=0.0235117;REFB=0;REVB=-0.00595554;RO=0;SAF=18;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.51048e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00011038;OID=.;OPOS=10511589;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:38:39:0:0:38:39:20:18:0:0:20:19:0:0 chr1 10596341 . C T 80.01 PASS AO=20;DP=46;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.0260722;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.8538;QD=6.9573;RBI=0.0357503;REFB=0.00087605;REVB=0.0244607;RO=26;SAF=5;SAR=15;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199898;STB=0.615261;TYPE=snp;VARB=0.000438908;OID=.;OPOS=10596341;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:46:46:26:26:20:20:15:5:11:15:15:5:11:15 chr1 10709441 . C T 36.92 PASS AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.00403834;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=275.937;QD=13.4271;RBI=0.0308209;REFB=-0.0276458;REVB=0.0305552;RO=5;SAF=4;SAR=2;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.333798;STB=0.691819;TYPE=snp;VARB=0.0155843;OID=.;OPOS=10709441;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:11:11:5:5:6:6:2:4:5:0:2:4:5:0 chr1 10725498 . G A 31.62 PASS AO=7;DP=17;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.0418512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.065;QD=7.44089;RBI=0.0422036;REFB=-0.0097307;REVB=0.00544255;RO=9;SAF=1;SAR=6;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.371799;STB=0.765078;TYPE=snp;VARB=0.00555609;OID=.;OPOS=10725498;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:17:17:9:10:7:7:6:1:4:5:6:1:5:5 chr1 11017128 . GC G 666.49 PASS AO=88;DP=98;FAO=97;FDP=98;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.181747;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=19.1598;QD=27.2035;RBI=0.268618;REFB=0.00293438;REVB=0.197797;RO=8;SAF=45;SAR=43;SRF=4;SRR=4;SSEN=0.305723;SSEP=0;SSSB=0.00178962;STB=0.505049;TYPE=del;VARB=0.00810024;OID=.;OPOS=11017129;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:88:97:97:98:1:49:48:1:0:46:8:45:43:4:4 chr1 11087524 . G A 1784.78 PASS AO=184;DP=186;FAO=191;FDP=191;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0662483;FXX=0.00520806;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.365;QD=37.3776;RBI=0.0732167;REFB=-0.0647243;REVB=0.0311745;RO=1;SAF=78;SAR=106;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0044708;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000139704;OID=.;OPOS=11087524;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:186:191:1:0:184:191:106:78:0:1:113:78:0:0 chr1 11090916 . C A 1239.73 PASS AO=116;DP=117;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0308135;FXX=0.00751823;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.385;QD=37.5677;RBI=0.0659236;REFB=0.0483859;REVB=-0.058279;RO=1;SAF=66;SAR=50;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00940323;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000133431;OID=.;OPOS=11090916;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:117:132:1:0:116:132:50:66:0:1:63:69:0:0 chr1 11132217 . G A 305.06 PASS AO=86;DP=202;FAO=86;FDP=202;FR=.;FRO=116;FSAF=33;FSAR=53;FSRF=32;FSRR=84;FWDB=-0.0267612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.444;QD=6.04069;RBI=0.0297177;REFB=-0.00385474;REVB=-0.0129221;RO=115;SAF=33;SAR=53;SRF=32;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118406;STB=0.567522;TYPE=snp;VARB=0.00598744;OID=.;OPOS=11132217;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:202:115:116:86:86:53:33:32:83:53:33:32:84 chr1 11141187 . C G 80.17 PASS AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=0.0980042;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.9601;QD=8.43905;RBI=0.100125;REFB=0.00462875;REVB=-0.0204996;RO=20;SAF=6;SAR=12;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.035158;STB=0.519978;TYPE=snp;VARB=-0.00170018;OID=.;OPOS=11141187;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:38:38:20:20:18:18:12:6:6:14:12:6:6:14 chr1 11181327 . C T 161.2 PASS AO=34;DP=64;FAO=34;FDP=64;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=7;FSRR=23;FWDB=-0.00684072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.5147;QD=10.0747;RBI=0.0432139;REFB=0.0134108;REVB=-0.042669;RO=30;SAF=11;SAR=23;SRF=7;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0905452;STB=0.549972;TYPE=snp;VARB=-0.0141711;OID=.;OPOS=11181327;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:30:30:34:34:23:11:7:23:23:11:7:23 chr1 11190646 . G A 309.43 PASS AO=67;DP=126;FAO=67;FDP=126;FR=.;FRO=59;FSAF=19;FSAR=48;FSRF=28;FSRR=31;FWDB=0.057743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.2162;QD=9.82311;RBI=0.0701034;REFB=-0.0414393;REVB=0.0397522;RO=58;SAF=19;SAR=48;SRF=27;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172999;STB=0.600448;TYPE=snp;VARB=0.037883;OID=.;OPOS=11190646;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:58:59:67:67:48:19:27:31:48:19:28:31 chr1 11205058 . C T 184.48 PASS AO=48;DP=107;FAO=48;FDP=108;FR=.;FRO=60;FSAF=10;FSAR=38;FSRF=26;FSRR=34;FWDB=-0.0381719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8453;QD=6.8325;RBI=0.0431909;REFB=-0.0285183;REVB=0.020208;RO=59;SAF=10;SAR=38;SRF=26;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280097;STB=0.655101;TYPE=snp;VARB=0.0332541;OID=.;OPOS=11205058;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:108:59:60:48:48:38:10:26:33:38:10:26:34 chr1 11212458 . A G 126.83 PASS AO=32;DP=72;FAO=32;FDP=72;FR=.;FRO=40;FSAF=25;FSAR=7;FSRF=28;FSRR=12;FWDB=0.000331205;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.381;QD=7.0461;RBI=0.0358504;REFB=0.00189115;REVB=-0.0358488;RO=40;SAF=25;SAR=7;SRF=28;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108323;STB=0.561425;TYPE=snp;VARB=-0.00221615;OID=.;OPOS=11212458;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:40:40:32:32:7:25:28:12:7:25:28:12 chr1 11288758 . G A 185.38 PASS AO=53;DP=130;FAO=54;FDP=131;FR=.;FRO=77;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=49;FSRR=28;FWDB=-0.0139323;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.558;QD=5.66037;RBI=0.0197642;REFB=-0.00486502;REVB=0.0140184;RO=77;SAF=26;SAR=27;SRF=49;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153282;STB=0.590519;TYPE=snp;VARB=0.00954724;OID=.;OPOS=11288758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:131:77:77:53:54:27:26:49:28:28:26:49:28 chr1 11301714 . A G 619.51 PASS AO=114;DP=189;FAO=116;FDP=190;FR=.;FRO=74;FSAF=53;FSAR=63;FSRF=35;FSRR=39;FWDB=0.0283018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.997;QD=13.0424;RBI=0.0467506;REFB=-0.00780259;REVB=-0.0372105;RO=75;SAF=52;SAR=62;SRF=36;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0175969;STB=0.5063;TYPE=snp;VARB=0.00454781;OID=.;OPOS=11301714;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:190:75:74:114:116:62:52:36:39:63:53:35:39 chr1 11579504 . G C 127.37 PASS AO=30;DP=56;FAO=29;FDP=57;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=-0.000443692;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=39.3317;QD=8.93798;RBI=0.0232416;REFB=-0.0353939;REVB=0.0232374;RO=25;SAF=14;SAR=16;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.021978;STB=0.526681;TYPE=snp;VARB=0.0562209;OID=.;OPOS=11579504;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:57:25:28:30:29:16:14:11:14:15:14:12:16 chr1 11589911 . G A 111.04 PASS AO=29;DP=70;FAO=29;FDP=68;FR=.;FRO=39;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=-0.0149209;FXX=0.0285673;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.876;QD=6.5316;RBI=0.0158326;REFB=0.00688132;REVB=-0.00529513;RO=39;SAF=11;SAR=18;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13772;STB=0.578184;TYPE=snp;VARB=-0.00741523;OID=.;OPOS=11589911;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:68:39:39:29:29:18:11:20:19:18:11:20:19 chr1 11733846 . C A 246.12 PASS AO=37;DP=88;FAO=48;FDP=93;FR=.,HEALED;FRO=39;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=0.0164484;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.747;QD=10.5858;RBI=0.016744;REFB=-0.0540331;REVB=0.0031324;RO=29;SAF=18;SAR=19;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161642;STB=0.553575;TYPE=snp;VARB=0.0367613;OID=.;OPOS=11733846;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:93:29:39:37:48:19:18:20:9:29:19:20:19 chr1 11771988 . A G 155.53 PASS AO=31;DP=89;FAO=39;FDP=84;FR=.;FRO=45;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=11;FSRR=34;FWDB=-0.000711697;FXX=0.0561735;HRUN=4;LEN=1;MLLD=72.7766;QD=7.40637;RBI=0.0589256;REFB=-0.0447205;REVB=-0.0589213;RO=34;SAF=5;SAR=26;SRF=2;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208111;STB=0.555528;TYPE=snp;VARB=0.0282434;OID=.;OPOS=11771988;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:84:34:45:31:39:26:5:2:32:26:13:11:34 chr1 11810674 . G A 127.03 PASS AO=35;DP=84;FAO=35;FDP=84;FR=.;FRO=49;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=0.0121992;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.316;QD=6.04896;RBI=0.0362617;REFB=-0.0198238;REVB=0.034148;RO=48;SAF=18;SAR=17;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0359076;STB=0.514278;TYPE=snp;VARB=0.033367;OID=.;OPOS=11810674;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:48:49:35:35:17:18:23:25:17:18:24:25 chr1 11810691 . C T 156.09 PASS AO=42;DP=97;FAO=42;FDP=98;FR=.;FRO=56;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=24;FSRR=32;FWDB=-0.0317301;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=77.9791;QD=6.37101;RBI=0.0362772;REFB=-0.0139154;REVB=-0.0175852;RO=54;SAF=19;SAR=23;SRF=23;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0268276;STB=0.513759;TYPE=snp;VARB=0.0292553;OID=.;OPOS=11810691;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:98:54:56:42:42:23:19:23:31:23:19:24:32 chr1 11810765 . T A 1406.75 PASS AO=147;DP=153;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00159093;FXX=0.0387072;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.019;QD=37.765;RBI=0.0141187;REFB=-0.0407775;REVB=0.0140288;RO=1;SAF=68;SAR=79;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00694287;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.84983e-05;OID=.;OPOS=11810765;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:153:149:1:0:147:149:79:68:1:0:81:68:0:0 chr1 11810844 . A G 253.08 PASS AO=56;DP=113;FAO=57;FDP=112;FR=.;FRO=55;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=30;FSRR=25;FWDB=-0.00209838;FXX=0.00884877;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.814;QD=9.03845;RBI=0.0108137;REFB=-0.0186033;REVB=0.0106082;RO=53;SAF=28;SAR=28;SRF=29;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0415965;STB=0.526603;TYPE=snp;VARB=0.0119718;OID=.;OPOS=11810844;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:112:53:55:56:57:28:28:29:24:29:28:30:25 chr1 11826085 . G A 114.99 PASS AO=24;DP=46;FAO=24;FDP=46;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.00523803;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.5504;QD=9.99912;RBI=0.0108695;REFB=-0.0225563;REVB=0.00952418;RO=20;SAF=11;SAR=13;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00683815;STB=0.519983;TYPE=snp;VARB=0.0288383;OID=.;OPOS=11826085;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:46:46:20:22:24:24:13:11:9:11:13:11:11:11 chr1 11827304 . A G 136.78 PASS AO=17;DP=17;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0361964;FXX=0.117578;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.9153;QD=36.4754;RBI=0.0361964;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=17;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00292587;OID=.;OPOS=11827304;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:17:15:0:0:17:15:0:17:0:0:0:15:0:0 chr1 11828238 . G A 41.12 PASS AO=4;DP=10;FAO=6;FDP=9;FR=.,HEALED;FRO=3;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0111435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.931;QD=18.2749;RBI=0.165737;REFB=-0.0121272;REVB=0.165362;RO=3;SAF=3;SAR=1;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0725463;STB=0.58791;TYPE=snp;VARB=0.0228513;OID=.;OPOS=11828238;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:9:9:3:3:4:6:1:3:2:1:1:5:2:1 chr1 11828319 . G A 52.62 PASS AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=0.017012;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.804;QD=7.79522;RBI=0.0186581;REFB=-0.0327438;REVB=-0.00766274;RO=14;SAF=7;SAR=5;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.333238;STB=0.670392;TYPE=snp;VARB=0.0374546;OID=.;OPOS=11828319;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:26:27:14:15:12:12:5:7:3:11:5:7:4:11 chr1 11828364 . G A 61.23 PASS AO=15;DP=35;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0214026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.411;QD=6.99751;RBI=0.0224321;REFB=-0.0214963;REVB=0.00671778;RO=19;SAF=3;SAR=12;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.405441;STB=0.726942;TYPE=snp;VARB=0.0153821;OID=.;OPOS=11828364;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:35:35:19:20:15:15:12:3:11:8:12:3:11:9 chr1 11831615 . C T 497.84 PASS AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0105998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.022;QD=37.573;RBI=0.0123279;REFB=0;REVB=0.00629466;RO=0;SAF=28;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.59475e-05;OID=.;OPOS=11831615;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:53:53:0:0:53:53:25:28:0:0:25:28:0:0 chr1 11832311 . G C 134.02 PASS AO=35;DP=82;FAO=36;FDP=82;FR=.;FRO=46;FSAF=25;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=0.0534111;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.2955;QD=6.53754;RBI=0.0771424;REFB=-0.0212712;REVB=0.0556615;RO=46;SAF=25;SAR=10;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233011;STB=0.616768;TYPE=snp;VARB=0.0327393;OID=.;OPOS=11832311;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:46:46:35:36:10:25:23:23:11:25:23:23 chr1 11835556 . C T 80.51 PASS AO=26;DP=73;FAO=26;FDP=73;FR=.;FRO=47;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=28;FSRR=19;FWDB=-0.00891284;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.532;QD=4.41158;RBI=0.0129543;REFB=-0.0271509;REVB=-0.00940086;RO=47;SAF=18;SAR=8;SRF=28;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118671;STB=0.569032;TYPE=snp;VARB=0.0498198;OID=.;OPOS=11835556;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:73:73:47:47:26:26:8:18:28:19:8:18:28:19 chr1 11836628 . T C 212.6 PASS AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0402878;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.063;QD=36.9739;RBI=0.0419505;REFB=0;REVB=-0.0116934;RO=0;SAF=4;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000755753;OID=.;OPOS=11836628;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:24:23:0:0:23:23:19:4:0:0:19:4:0:0 chr1 11836670 . C A 73.17 PASS AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=26;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=-0.00904266;FXX=0.0714031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.946;QD=11.2575;RBI=0.0346678;REFB=-0.0392828;REVB=0.0334677;RO=12;SAF=3;SAR=11;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0416551;STB=0.523775;TYPE=snp;VARB=0.0159743;OID=.;OPOS=11836670;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:27:26:12:12:14:14:11:3:3:9:11:3:3:9 chr1 11836682 . C T 68.41 PASS AO=12;DP=21;FAO=12;FDP=21;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0133435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.5159;QD=13.0301;RBI=0.0177998;REFB=-0.0309662;REVB=-0.0117806;RO=9;SAF=3;SAR=9;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0791542;STB=0.545376;TYPE=snp;VARB=0.0702037;OID=.;OPOS=11836682;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:21:21:9:9:12:12:9:3:3:6:9:3:3:6 chr1 11838778 . AG A 401.53 PASS AO=50;DP=76;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.141639;FXX=0.0147037;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.5393;QD=23.9718;RBI=0.147519;REFB=-0.0632431;REVB=0.041233;RO=7;SAF=29;SAR=21;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0.299398;SSSB=-0.0318846;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.013571;OID=.;OPOS=11838779;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:50:66:67:67:0:40:27:0:0:29:7:29:21:5:2 chr1 11838841 . A G 75.51 PASS AO=18;DP=55;FAO=22;FDP=58;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=-0.00564761;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.585;QD=5.20746;RBI=0.010086;REFB=-0.0305722;REVB=0.00835656;RO=36;SAF=5;SAR=13;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.295202;STB=0.603738;TYPE=snp;VARB=0.024355;OID=.;OPOS=11838841;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:55:58:36:36:18:22:13:5:19:17:14:8:19:17 chr1 11838848 . G T 182.49 PASS AO=34;DP=57;FAO=34;FDP=57;FR=.;FRO=23;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.050907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.621;QD=12.8065;RBI=0.0551372;REFB=-0.0267531;REVB=-0.0211798;RO=23;SAF=18;SAR=16;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0693769;STB=0.538122;TYPE=snp;VARB=0.0377568;OID=.;OPOS=11838848;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:57:57:23:23:34:34:16:18:10:13:16:18:10:13 chr1 11839923 . C T 98.94 PASS AO=20;DP=39;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=0.00424524;FXX=0.0256345;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.0237;QD=10.4149;RBI=0.00581795;REFB=-0.0128847;REVB=0.00397826;RO=18;SAF=4;SAR=16;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0950562;STB=0.553789;TYPE=snp;VARB=0.0250793;OID=.;OPOS=11839923;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:39:38:18:18:20:20:16:4:5:13:16:4:5:13 chr1 11839966 . G A 114.14 PASS AO=24;DP=46;FAO=24;FDP=46;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=20;FWDB=0.0475185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.934;QD=9.92519;RBI=0.0576255;REFB=-0.0372836;REVB=0.032599;RO=22;SAF=12;SAR=12;SRF=2;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.355138;STB=0.695514;TYPE=snp;VARB=0.0297667;OID=.;OPOS=11839966;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:46:46:22:22:24:24:12:12:2:20:12:12:2:20 chr1 11839998 . T C 378.17 PASS AO=42;DP=44;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00766142;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.834;QD=35.1787;RBI=0.0212162;REFB=0.0273774;REVB=0.0197846;RO=0;SAF=19;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512814;TYPE=snp;VARB=0.000120347;OID=.;OPOS=11839998;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:44:43:0:1:42:42:23:19:0:0:23:19:1:0 chr1 11844330 . C T 189.8 PASS AO=48;DP=105;FAO=48;FDP=105;FR=.;FRO=57;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=27;FSRR=30;FWDB=0.019581;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.854;QD=7.23039;RBI=0.0204086;REFB=-0.00711916;REVB=-0.00575296;RO=56;SAF=20;SAR=28;SRF=26;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0468483;STB=0.531489;TYPE=snp;VARB=0.00775054;OID=.;OPOS=11844330;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:56:57:48:48:28:20:26:30:28:20:27:30 chr1 11845222 . T C 41.69 PASS AO=13;DP=39;FAO=13;FDP=39;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.0126005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.0329;QD=4.27594;RBI=0.0365769;REFB=-0.0430754;REVB=-0.034338;RO=26;SAF=9;SAR=4;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.302392;STB=0.680993;TYPE=snp;VARB=0.0975019;OID=.;OPOS=11845222;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:39:39:26:26:13:13:4:9:11:15:4:9:11:15 chr1 11847449 . G A 116.91 PASS AO=24;DP=46;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=5;FWDB=0.0628042;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.8713;QD=10.3917;RBI=0.0835338;REFB=-0.00175792;REVB=0.0550776;RO=21;SAF=15;SAR=9;SRF=16;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12689;STB=0.570496;TYPE=snp;VARB=0.00373915;OID=.;OPOS=11847449;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:46:45:21:21:24:24:9:15:16:5:9:15:16:5 chr1 11848068 . G C 58.6 PASS AO=17;DP=50;FAO=18;FDP=51;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=-0.0157773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.655;QD=4.59598;RBI=0.021816;REFB=-0.00304641;REVB=0.015067;RO=32;SAF=8;SAR=9;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101664;STB=0.548966;TYPE=snp;VARB=0.00928953;OID=.;OPOS=11848068;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:50:51:32:33:17:18:9:8:18:14:9:9:19:14 chr1 11849447 . A G 147.34 PASS AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00958699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.673;QD=36.8349;RBI=0.0136658;REFB=0;REVB=0.00973875;RO=0;SAF=4;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07465e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.01668e-05;OID=.;OPOS=11849447;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:16:0:0:16:16:12:4:0:0:12:4:0:0 chr1 11850927 . C T 499.3 PASS AO=134;DP=305;FAO=136;FDP=307;FR=.;FRO=171;FSAF=58;FSAR=78;FSRF=70;FSRR=101;FWDB=0.000149323;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.886;QD=6.50553;RBI=0.0405454;REFB=-0.0226325;REVB=0.0405452;RO=168;SAF=56;SAR=78;SRF=68;SRR=100;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0135988;STB=0.50977;TYPE=snp;VARB=0.025671;OID=.;OPOS=11850927;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:305:307:168:171:134:136:78:56:68:100:78:58:70:101 chr1 11854457 . G A 920.84 PASS AO=96;DP=97;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199251;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.936;QD=38.3685;RBI=0.0205882;REFB=0;REVB=-0.00518292;RO=0;SAF=49;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.53995e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000136525;OID=.;OPOS=11854457;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:97:96:0:0:96:96:47:49:0:0:47:49:0:0 chr1 11854476 . T G 183.86 PASS AO=47;DP=109;FAO=47;FDP=105;FR=.;FRO=58;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=34;FSRR=24;FWDB=-0.00388745;FXX=0.0366939;HRUN=3;LEN=1;MLLD=193.707;QD=7.00406;RBI=0.00585427;REFB=-0.00143958;REVB=-0.00437723;RO=52;SAF=22;SAR=25;SRF=31;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120449;STB=0.564944;TYPE=snp;VARB=0.00151312;OID=.;OPOS=11854476;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:105:52:58:47:47:25:22:31:21:25:22:34:24 chr1 11854896 . G A 238.34 PASS AO=56;DP=116;FAO=56;FDP=115;FR=.;FRO=59;FSAF=35;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=35;FWDB=-0.081266;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.3894;QD=8.29001;RBI=0.0843998;REFB=-0.0261546;REVB=0.0227851;RO=58;SAF=35;SAR=21;SRF=24;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195703;STB=0.612651;TYPE=snp;VARB=0.0317924;OID=.;OPOS=11854896;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:115:58:59:56:56:21:35:24:34:21:35:24:35 chr1 11856378 . G A 349.02 PASS AO=73;DP=132;FAO=73;FDP=133;FR=.;FRO=60;FSAF=43;FSAR=30;FSRF=23;FSRR=37;FWDB=0.0302185;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.662;QD=10.4967;RBI=0.0374655;REFB=0.00500384;REVB=0.0221473;RO=59;SAF=43;SAR=30;SRF=23;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162876;STB=0.592651;TYPE=snp;VARB=-0.00394011;OID=.;OPOS=11856378;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:133:59:60:73:73:30:43:23:36:30:43:23:37 chr1 11863057 . G A 233.53 PASS AO=55;DP=118;FAO=63;FDP=131;FR=.;FRO=68;FSAF=42;FSAR=21;FSRF=30;FSRR=38;FWDB=0.0094854;FXX=0.0150365;HRUN=4;LEN=1;MLLD=186.062;QD=7.13076;RBI=0.0416359;REFB=-0.0141675;REVB=-0.040541;RO=62;SAF=42;SAR=13;SRF=30;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.301363;STB=0.621013;TYPE=snp;VARB=0.0112674;OID=.;OPOS=11863057;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:131:62:68:55:63:13:42:30:32:21:42:30:38 chr1 11884555 . A G 614.58 PASS AO=60;DP=60;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00782667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.01;QD=37.8205;RBI=0.0159462;REFB=0;REVB=0.0138933;RO=0;SAF=30;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.48774e-06;OID=.;OPOS=11884555;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:60:65:0:0:60:65:30:30:0:0:32:33:0:0 chr1 11897082 . C T 160.14 PASS AO=44;DP=102;FAO=44;FDP=103;FR=.;FRO=59;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=27;FSRR=32;FWDB=0.0833296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.08;QD=6.21919;RBI=0.111139;REFB=-0.0510256;REVB=0.0735396;RO=56;SAF=25;SAR=19;SRF=26;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103991;STB=0.563383;TYPE=snp;VARB=0.0767509;OID=.;OPOS=11897082;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:103:56:59:44:44:19:25:26:30:19:25:27:32 chr1 11898789 . G T 109.57 PASS AO=18;DP=28;FAO=18;FDP=28;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.00313332;FXX=0.0344709;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.679;QD=15.6531;RBI=0.0247616;REFB=-0.0425724;REVB=0.0245625;RO=9;SAF=5;SAR=13;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0425014;STB=0.509793;TYPE=snp;VARB=0.00583192;OID=.;OPOS=11898789;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:28:28:9:10:18:18:13:5:2:7:13:5:3:7 chr1 11899033 . G T 149.17 PASS AO=28;DP=48;FAO=28;FDP=48;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=25;FSRF=2;FSRR=18;FWDB=-0.0105578;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=158.106;QD=12.4307;RBI=0.0395309;REFB=0.0134223;REVB=0.0380949;RO=20;SAF=3;SAR=25;SRF=2;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0142511;STB=0.507868;TYPE=snp;VARB=-0.0145042;OID=.;OPOS=11899033;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:48:48:20:20:28:28:25:3:2:18:25:3:2:18 chr1 11907282 . CT C 51.96 PASS AO=23;DP=59;FAO=24;FDP=56;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=0.0176217;FXX=0.0344768;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.2443;QD=3.71158;RBI=0.0300246;REFB=-0.0661232;REVB=0.0243095;RO=29;SAF=18;SAR=5;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.27092;STB=0.661024;TYPE=del;VARB=0.0748753;OID=.;OPOS=11907283;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:23:58:24:56:32:19:5:18:14:51:29:18:5:16:13 chr1 11907648 . C T 303.87 PASS AO=80;DP=179;FAO=80;FDP=179;FR=.;FRO=99;FSAF=15;FSAR=65;FSRF=16;FSRR=83;FWDB=-0.00140562;FXX=0.0164826;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.28;QD=6.79033;RBI=0.0215888;REFB=-0.0241186;REVB=-0.021543;RO=97;SAF=15;SAR=65;SRF=16;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0375674;STB=0.524197;TYPE=snp;VARB=0.0285919;OID=.;OPOS=11907648;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:179:97:99:80:80:65:15:16:81:65:15:16:83 chr1 11968216 . G A 147.24 PASS AO=50;DP=129;FAO=50;FDP=140;FR=.;FRO=90;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=46;FSRR=44;FWDB=-0.0579437;FXX=0.0140835;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.485;QD=4.20673;RBI=0.0580627;REFB=-0.0116703;REVB=0.00371607;RO=76;SAF=26;SAR=24;SRF=32;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105335;STB=0.505719;TYPE=snp;VARB=0.0294105;OID=.;OPOS=11968216;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:140:76:90:50:50:24:26:32:44:24:26:46:44 chr1 11968235 . T C 115.33 PASS AO=49;DP=157;FAO=48;FDP=155;FR=.;FRO=107;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=59;FSRR=48;FWDB=-0.00463542;FXX=0.0189861;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.77;QD=2.97637;RBI=0.00643146;REFB=-0.00205838;REVB=-0.00445832;RO=102;SAF=25;SAR=24;SRF=55;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0339356;STB=0.521167;TYPE=snp;VARB=0.00800107;OID=.;OPOS=11968235;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:155:102:107:49:48:24:25:55:47:23:25:59:48 chr1 11968273 . A G 185.59 PASS AO=66;DP=183;FAO=65;FDP=182;FR=.;FRO=117;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=57;FSRR=60;FWDB=0.0229636;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.5368;QD=4.07892;RBI=0.0231735;REFB=0.00512643;REVB=0.00311193;RO=117;SAF=33;SAR=33;SRF=57;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0144005;STB=0.513181;TYPE=snp;VARB=-0.00842923;OID=.;OPOS=11968273;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:182:117:117:66:65:33:33:57:60:32:33:57:60 chr1 11969917 . A G 173.74 PASS AO=43;DP=93;FAO=43;FDP=93;FR=.;FRO=50;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=17;FSRR=33;FWDB=0.0299256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.3871;QD=7.47265;RBI=0.0309222;REFB=-0.010044;REVB=-0.00778735;RO=49;SAF=16;SAR=27;SRF=17;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0259004;STB=0.51863;TYPE=snp;VARB=0.0198271;OID=.;OPOS=11969917;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:49:50:43:43:27:16:17:32:27:16:17:33 chr1 11983206 . A G 18.57 PASS AO=9;DP=40;FAO=9;FDP=41;FR=.;FRO=32;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=23;FWDB=-0.0129637;FXX=0.0238039;HRUN=3;LEN=1;MLLD=197.067;QD=1.81199;RBI=0.0129874;REFB=-0.00162215;REVB=-0.000784406;RO=30;SAF=4;SAR=5;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182742;STB=0.632502;TYPE=snp;VARB=0.00438656;OID=.;OPOS=11983206;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:40:41:30:32:9:9:5:4:9:21:5:4:9:23 chr1 11985735 . A C 10.47 PASS AO=2;DP=6;FAO=2;FDP=6;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.543;QD=6.97935;RBI=0.0237185;REFB=-0.029553;REVB=0.0237185;RO=4;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0211181;OID=.;OPOS=11985735;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:4:4:2:2:2:0:0:4:2:0:0:4 chr1 12009956 . G A 209.99 PASS AO=45;DP=85;FAO=45;FDP=85;FR=.;FRO=40;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=0.0257695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.0997;QD=9.88197;RBI=0.0782195;REFB=-0.0026033;REVB=0.0738527;RO=40;SAF=23;SAR=22;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0307828;STB=0.516981;TYPE=snp;VARB=0.00362395;OID=.;OPOS=12009956;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:40:40:45:45:22:23:19:21:22:23:19:21 chr1 12010469 . G T 149.67 PASS AO=50;DP=137;FAO=50;FDP=137;FR=.;FRO=87;FSAF=48;FSAR=2;FSRF=39;FSRR=48;FWDB=0.00965925;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.1;QD=4.37005;RBI=0.02013;REFB=-0.00502232;REVB=-0.0176611;RO=82;SAF=48;SAR=2;SRF=37;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.734888;STB=0.932188;TYPE=snp;VARB=0.006196;OID=.;OPOS=12010469;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:82:87:50:50:2:48:37:45:2:48:39:48 chr1 12026355 . A C 186.24 PASS AO=34;DP=57;FAO=34;FDP=56;FR=.;FRO=22;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=-0.00793772;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.949;QD=13.3029;RBI=0.0190229;REFB=-0.0136804;REVB=0.0172877;RO=22;SAF=18;SAR=16;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150389;STB=0.582416;TYPE=snp;VARB=0.00666931;OID=.;OPOS=12026355;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:57:56:22:22:34:34:16:18:7:15:16:18:7:15 chr1 12082926 . A G 86.87 PASS AO=25;DP=63;FAO=25;FDP=64;FR=.;FRO=39;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=28;FWDB=-0.00948898;FXX=0.0153822;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.983;QD=5.42958;RBI=0.0399208;REFB=-0.0172444;REVB=-0.0387767;RO=37;SAF=9;SAR=16;SRF=11;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0728533;STB=0.553032;TYPE=snp;VARB=0.037719;OID=.;OPOS=12082926;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:63:64:37:39:25:25:16:9:11:26:16:9:11:28 chr1 12175729 . C T 405.9 PASS AO=54;DP=64;FAO=54;FDP=64;FR=.;FRO=10;FSAF=12;FSAR=42;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.060237;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=132.091;QD=25.3684;RBI=0.0602522;REFB=-0.116104;REVB=0.00135149;RO=3;SAF=12;SAR=42;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10422;STB=0.538447;TYPE=snp;VARB=0.00297033;OID=.;OPOS=12175729;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:64:64:3:10:54:54:42:12:3:0:42:12:4:6 chr1 12339619 . A T 310.16 PASS AO=72;DP=144;FAO=72;FDP=144;FR=.;FRO=72;FSAF=27;FSAR=45;FSRF=29;FSRR=43;FWDB=0.0311206;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.289;QD=8.61548;RBI=0.031464;REFB=-0.0152914;REVB=0.00463596;RO=72;SAF=27;SAR=45;SRF=29;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0266673;STB=0.514702;TYPE=snp;VARB=0.0123443;OID=.;OPOS=12339619;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:144:72:72:72:72:45:27:29:43:45:27:29:43 chr1 12401868 . A C 850.73 PASS AO=54;DP=96;FAO=87;FDP=91;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=52;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0386581;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.337;QD=37.3945;RBI=0.0569497;REFB=0;REVB=0.0418188;RO=0;SAF=34;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.77753e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00445491;OID=.;OPOS=12401868;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:91:91:0:0:54:87:20:34:0:0:35:52:0:0 chr1 12638964 . T C 270.12 PASS AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0476931;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.0486;QD=38.5891;RBI=0.0531717;REFB=0;REVB=0.0235076;RO=0;SAF=7;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000712307;OID=.;OPOS=12638964;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:29:28:0:0:28:28:21:7:0:0:21:7:0:0 chr1 12639168 . A G 381.49 PASS AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0142832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.6692;QD=37.2185;RBI=0.0242414;REFB=0;REVB=0.0195866;RO=0;SAF=30;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000518897;OID=.;OPOS=12639168;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:40:41:0:0:40:41:10:30:0:0:10:31:0:0 chr1 12776344 . A T 1428.36 PASS AO=149;DP=149;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00157945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.257;QD=38.3452;RBI=0.0309107;REFB=0;REVB=0.0308703;RO=0;SAF=104;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.50494e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.11824e-05;OID=.;OPOS=12776344;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:149:149:0:0:149:149:45:104:0:0:45:104:0:0 chr1 12779560 . T C 477.61 PASS AO=104;DP=209;FAO=109;FDP=214;FR=.;FRO=105;FSAF=37;FSAR=72;FSRF=39;FSRR=66;FWDB=0.0142509;FXX=0.00465095;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.909;QD=8.92727;RBI=0.0144667;REFB=-0.0103273;REVB=0.00248937;RO=88;SAF=33;SAR=71;SRF=25;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0326431;STB=0.517297;TYPE=snp;VARB=0.00949072;OID=.;OPOS=12779560;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:214:88:105:104:109:71:33:25:63:72:37:39:66 chr1 12779618 . T C 520.1 PASS AO=74;DP=211;FAO=77;FDP=209;FR=.,HEALED;FRO=94;FSAF=4;FSAR=73;FSRF=34;FSRR=60;FWDB=0.0244074;FXX=0.00947822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.067;QD=9.95407;RBI=0.0251087;REFB=-0.0267519;REVB=-0.00589301;RO=94;SAF=1;SAR=73;SRF=34;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.767308;STB=0.838959;TYPE=snp;VARB=0.0237993;OID=.;OPOS=12779618;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:209:94:94:74:77:73:1:34:60:73:4:34:60 chr1 12785494 . G T 310.94 PASS AO=47;DP=112;FAO=74;FDP=140;FR=.;FRO=66;FSAF=29;FSAR=45;FSRF=41;FSRR=25;FWDB=0.00560487;FXX=0.0140835;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.511;QD=8.88412;RBI=0.00751336;REFB=-0.000562558;REVB=0.0050036;RO=48;SAF=19;SAR=28;SRF=30;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200049;STB=0.608079;TYPE=snp;VARB=0.00126157;OID=.;OPOS=12785494;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:140:48:66:47:74:28:19:30:18:45:29:41:25 chr1 12799736 . C T 485.09 PASS AO=119;DP=247;FAO=119;FDP=247;FR=.;FRO=128;FSAF=67;FSAR=52;FSRF=53;FSRR=75;FWDB=0.0176267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.882;QD=7.85565;RBI=0.0250141;REFB=-0.0275794;REVB=0.0177485;RO=127;SAF=67;SAR=52;SRF=52;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143522;STB=0.576908;TYPE=snp;VARB=0.0286088;OID=.;OPOS=12799736;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:247:247:127:128:119:119:52:67:52:75:52:67:53:75 chr1 12820870 . T C 127.12 PASS AO=26;DP=49;FAO=26;FDP=49;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=-0.00235199;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=152.166;QD=10.3774;RBI=0.00247076;REFB=-0.0117465;REVB=0.000756811;RO=23;SAF=14;SAR=12;SRF=17;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173191;STB=0.596084;TYPE=snp;VARB=0.00770663;OID=.;OPOS=12820870;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:23:23:26:26:12:14:17:6:12:14:17:6 chr1 12835868 . T C 688.14 PASS AO=154;DP=292;FAO=154;FDP=294;FR=.;FRO=140;FSAF=64;FSAR=90;FSRF=60;FSRR=80;FWDB=-0.0213371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.406;QD=9.36246;RBI=0.0214401;REFB=-0.00847125;REVB=0.00209893;RO=138;SAF=64;SAR=90;SRF=59;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106309;STB=0.506351;TYPE=snp;VARB=0.00784777;OID=.;OPOS=12835868;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:292:294:138:140:154:154:90:64:59:79:90:64:60:80 chr1 12837634 . T A 703.72 PASS AO=142;DP=245;FAO=141;FDP=244;FR=.;FRO=103;FSAF=61;FSAR=80;FSRF=34;FSRR=69;FWDB=-0.0336199;FXX=0.00408147;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.3056;QD=11.5364;RBI=0.0674589;REFB=-0.0114128;REVB=-0.0584842;RO=102;SAF=61;SAR=81;SRF=34;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0767368;STB=0.544604;TYPE=snp;VARB=0.0108272;OID=.;OPOS=12837634;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:245:244:102:103:142:141:81:61:34:68:80:61:34:69 chr1 12854530 . C G 422.6 PASS AO=119;DP=281;FAO=120;FDP=281;FR=.;FRO=161;FSAF=68;FSAR=52;FSRF=69;FSRR=92;FWDB=0.000882361;FXX=0.00354597;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.277;QD=6.01565;RBI=0.0123656;REFB=-0.00376153;REVB=0.0123341;RO=160;SAF=68;SAR=51;SRF=68;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150357;STB=0.578847;TYPE=snp;VARB=0.00646648;OID=.;OPOS=12854530;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:281:281:160:161:119:120:51:68:68:92:52:68:69:92 chr1 12855648 . A T 15.36 PASS AO=3;DP=9;FAO=3;FDP=9;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.00270428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.1505;QD=6.82584;RBI=0.0358445;REFB=0.0237496;REVB=-0.0357423;RO=6;SAF=2;SAR=1;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167835;STB=0.614596;TYPE=snp;VARB=-0.0488655;OID=.;OPOS=12855648;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:9:9:6:6:3:3:1:2:3:3:1:2:3:3 chr1 12855667 . A T 17.09 PASS AO=3;DP=11;FAO=4;FDP=11;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0237263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.449;QD=6.21453;RBI=0.0237458;REFB=-0.0205662;REVB=-0.000960958;RO=6;SAF=3;SAR=0;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.754726;STB=0.781267;TYPE=snp;VARB=0.0188085;OID=.;OPOS=12855667;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:11:11:6:7:3:4:0:3:1:5:1:3:2:5 chr1 12855835 . C G 633.31 PASS AO=42;DP=68;FAO=66;FDP=66;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=36;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.179967;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.8118;QD=38.3825;RBI=0.260176;REFB=0;REVB=-0.187893;RO=0;SAF=28;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.15284e-05;OID=.;OPOS=12855835;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:52:66:0:0:42:66:14:28:0:0:30:36:0:0 chr1 12855845 . G C 602.4 PASS AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0173525;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.5412;QD=36.5091;RBI=0.0301712;REFB=-0.0562737;REVB=-0.0246819;RO=0;SAF=36;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508472;TYPE=snp;VARB=-0.000279562;OID=.;OPOS=12855845;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:66:66:0:1:65:65:29:36:0:0:29:36:0:1 chr1 12855893 . T G 21.54 PASS AO=19;DP=95;FAO=18;FDP=95;FR=.;FRO=77;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=45;FSRR=32;FWDB=0.00213676;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.1067;QD=0.906822;RBI=0.0628995;REFB=0.00230317;REVB=-0.0628632;RO=76;SAF=8;SAR=11;SRF=45;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213047;STB=0.611888;TYPE=snp;VARB=-0.0142289;OID=.;OPOS=12855893;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:95:95:76:77:19:18:11:8:45:31:10:8:45:32 chr1 12855962 . C T 16.58 PASS AO=13;DP=71;FAO=13;FDP=71;FR=.;FRO=58;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=42;FSRR=16;FWDB=0.00321513;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=177.893;QD=0.934055;RBI=0.0196111;REFB=0.000318486;REVB=-0.0193458;RO=58;SAF=7;SAR=6;SRF=42;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.245412;STB=0.656038;TYPE=snp;VARB=-0.00135947;OID=.;OPOS=12855962;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:71:71:58:58:13:13:6:7:42:16:6:7:42:16 chr1 12856010 . C G 104.71 PASS AO=38;DP=109;FAO=38;FDP=113;FR=.;FRO=75;FSAF=31;FSAR=7;FSRF=61;FSRR=14;FWDB=-0.00598078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.6763;QD=3.70668;RBI=0.094775;REFB=0.00109944;REVB=-0.0945861;RO=70;SAF=31;SAR=7;SRF=58;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0244397;STB=0.502701;TYPE=snp;VARB=-0.00496718;OID=.;OPOS=12856010;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:113:70:75:38:38:7:31:58:12:7:31:61:14 chr1 12856106 . A G 13.26 PASS AO=14;DP=85;FAO=14;FDP=86;FR=.;FRO=72;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=44;FSRR=28;FWDB=-0.0690144;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.9467;QD=0.616737;RBI=0.0845667;REFB=-0.00192268;REVB=-0.0488726;RO=71;SAF=9;SAR=5;SRF=43;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0496198;STB=0.528429;TYPE=snp;VARB=0.0081614;OID=.;OPOS=12856106;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:85:86:71:72:14:14:5:9:43:28:5:9:44:28 chr1 12856111 . C T 48.9 PASS AO=22;DP=80;FAO=22;FDP=80;FR=.;FRO=58;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=38;FSRR=20;FWDB=-0.0274202;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.184;QD=2.44523;RBI=0.0301367;REFB=-0.0113476;REVB=0.0125042;RO=58;SAF=9;SAR=13;SRF=38;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.290651;STB=0.67276;TYPE=snp;VARB=0.0282173;OID=.;OPOS=12856111;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:80:80:58:58:22:22:13:9:38:20:13:9:38:20 chr1 12887549 . T C 2109.16 PASS AO=229;DP=233;FAO=229;FDP=233;FR=.;FRO=4;FSAF=108;FSAR=121;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0128016;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1957;QD=36.2087;RBI=0.0689239;REFB=0.0325143;REVB=-0.0677246;RO=4;SAF=108;SAR=121;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00912888;STB=0.504792;TYPE=snp;VARB=-0.0010784;OID=.;OPOS=12887549;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:233:233:4:4:229:229:121:108:3:1:121:108:3:1 chr1 12888601 . G GC 126.25 PASS AO=11;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.24953;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.4523;QD=24.0482;RBI=0.265543;REFB=0;REVB=0.0908183;RO=8;SAF=2;SAR=9;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.300156;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.024192;OID=.;OPOS=12888602;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:11:21:21:21:0:6:15:0:0:12:8:2:9:4:4 chr1 12907379 . T C 568.72 PASS AO=100;DP=153;FAO=100;FDP=154;FR=.;FRO=54;FSAF=68;FSAR=32;FSRF=34;FSRR=20;FWDB=0.00520643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.809;QD=14.772;RBI=0.00769392;REFB=-0.0150386;REVB=-0.00566476;RO=53;SAF=67;SAR=33;SRF=34;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0205427;STB=0.519996;TYPE=snp;VARB=0.0101837;OID=.;OPOS=12907379;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:154:53:54:100:100:33:67:34:19:32:68:34:20 chr1 12907449 . C G 145.37 PASS AO=53;DP=154;FAO=53;FDP=154;FR=.;FRO=101;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=53;FSRR=48;FWDB=-0.00778617;FXX=0.0064512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.945;QD=3.77589;RBI=0.00964614;REFB=-0.0229466;REVB=-0.00569416;RO=86;SAF=28;SAR=25;SRF=39;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0814587;STB=0.502334;TYPE=snp;VARB=0.0444115;OID=.;OPOS=12907449;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:154:86:101:53:53:25:28:39:47:25:28:53:48 chr1 12907496 . T C 63.23 PASS AO=32;DP=119;FAO=32;FDP=120;FR=.;FRO=88;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=46;FSRR=42;FWDB=-0.0278265;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=184.999;QD=2.10779;RBI=0.0278413;REFB=-0.00328143;REVB=-0.000906503;RO=86;SAF=18;SAR=14;SRF=45;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0483264;STB=0.529393;TYPE=snp;VARB=0.00918319;OID=.;OPOS=12907496;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:119:120:86:88:32:32:14:18:45:41:14:18:46:42 chr1 12907533 . T C 33.11 PASS AO=22;DP=100;FAO=23;FDP=104;FR=.;FRO=81;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=41;FSRR=40;FWDB=-0.0159012;FXX=0.0280348;HRUN=6;LEN=1;MLLD=198.896;QD=1.27359;RBI=0.0273831;REFB=0.00515546;REVB=-0.0222932;RO=76;SAF=13;SAR=9;SRF=38;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114492;STB=0.580793;TYPE=snp;VARB=-0.0196885;OID=.;OPOS=12907533;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:100:104:76:81:22:23:9:13:38:38:9:14:41:40 chr1 12907633 . G A 78.07 PASS AO=56;DP=242;FAO=56;FDP=242;FR=.;FRO=186;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=98;FSRR=88;FWDB=0.00445879;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.057;QD=1.29049;RBI=0.0141419;REFB=-0.00336341;REVB=0.0134206;RO=186;SAF=23;SAR=33;SRF=98;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147449;STB=0.589254;TYPE=snp;VARB=0.0111789;OID=.;OPOS=12907633;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:242:242:186:186:56:56:33:23:98:88:33:23:98:88 chr1 12907777 . T C 312.5 PASS AO=148;DP=484;FAO=130;FDP=399;FR=.;FRO=269;FSAF=50;FSAR=80;FSRF=142;FSRR=127;FWDB=-0.0257549;FXX=0.00249994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.5464;QD=3.13287;RBI=0.0436178;REFB=0.0159708;REVB=0.0352022;RO=323;SAF=58;SAR=90;SRF=188;SRR=135;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224915;STB=0.597418;TYPE=snp;VARB=-0.0306671;OID=.;OPOS=12907777;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:484:399:323:269:148:130:90:58:188:135:80:50:142:127 chr1 12907781 . T C 57.64 PASS AO=93;DP=493;FAO=74;FDP=399;FR=.;FRO=325;FSAF=36;FSAR=38;FSRF=168;FSRR=157;FWDB=0.00383279;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.087;QD=0.577818;RBI=0.0384279;REFB=-0.000349899;REVB=-0.0382363;RO=394;SAF=45;SAR=48;SRF=208;SRR=186;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0571202;STB=0.52477;TYPE=snp;VARB=0.000956706;OID=.;OPOS=12907781;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:493:399:394:325:93:74:48:45:208:186:38:36:168:157 chr1 12907798 . A C 145.46 PASS AO=115;DP=476;FAO=97;FDP=395;FR=.;FRO=298;FSAF=57;FSAR=40;FSRF=145;FSRR=153;FWDB=-0.0344499;FXX=0.0124997;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.457;QD=1.47302;RBI=0.0435891;REFB=-0.00742995;REVB=0.026706;RO=360;SAF=66;SAR=49;SRF=182;SRR=178;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0872192;STB=0.576526;TYPE=snp;VARB=0.0211653;OID=.;OPOS=12907798;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:476:395:360:298:115:97:49:66:182:178:40:57:145:153 chr1 12907802 . C T 180.92 PASS AO=124;DP=465;FAO=105;FDP=396;FR=.;FRO=291;FSAF=63;FSAR=42;FSRF=138;FSRR=153;FWDB=-0.0152644;FXX=0.00999975;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.616;QD=1.8275;RBI=0.016395;REFB=-0.0137815;REVB=0.0059828;RO=338;SAF=72;SAR=52;SRF=166;SRR=172;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111865;STB=0.592687;TYPE=snp;VARB=0.0222895;OID=.;OPOS=12907802;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:465:396:338:291:124:105:52:72:166:172:42:63:138:153 chr1 12907803 . C T 205.69 PASS AO=127;DP=465;FAO=111;FDP=399;FR=.;FRO=288;FSAF=61;FSAR=50;FSRF=138;FSRR=150;FWDB=0.00990205;FXX=0.00249994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.843;QD=2.06201;RBI=0.0287761;REFB=-0.00658188;REVB=0.0270187;RO=334;SAF=73;SAR=54;SRF=164;SRR=170;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104022;STB=0.550781;TYPE=snp;VARB=0.00924078;OID=.;OPOS=12907803;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:465:399:334:288:127:111:54:73:164:170:50:61:138:150 chr1 12907837 . C T 387.13 PASS AO=171;DP=489;FAO=142;FDP=400;FR=.;FRO=258;FSAF=84;FSAR=58;FSRF=126;FSRR=132;FWDB=-0.00445142;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.897;QD=3.87133;RBI=0.00650191;REFB=-0.0181936;REVB=0.00473916;RO=318;SAF=104;SAR=67;SRF=161;SRR=157;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118785;STB=0.567155;TYPE=snp;VARB=0.0410514;OID=.;OPOS=12907837;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:489:400:318:258:171:142:67:104:161:157:58:84:126:132 chr1 12907885 . T C 876.95 PASS AO=248;DP=504;FAO=205;FDP=400;FR=.;FRO=195;FSAF=108;FSAR=97;FSRF=106;FSRR=89;FWDB=-0.0144252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.443;QD=8.76947;RBI=0.0159012;REFB=-0.00954471;REVB=-0.0066905;RO=256;SAF=137;SAR=111;SRF=131;SRR=125;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0379796;STB=0.508201;TYPE=snp;VARB=0.00636338;OID=.;OPOS=12907885;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:504:400:256:195:248:205:111:137:131:125:97:108:106:89 chr1 12918891 . A C 26.3 PASS AO=19;DP=105;FAO=21;FDP=106;FR=.;FRO=85;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=68;FSRR=17;FWDB=-0.000560212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.985;QD=0.992431;RBI=0.0457827;REFB=-0.00700419;REVB=-0.0457793;RO=83;SAF=14;SAR=5;SRF=66;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102676;STB=0.59067;TYPE=snp;VARB=0.0468606;OID=.;OPOS=12918891;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:105:106:83:85:19:21:5:14:66:17:6:15:68:17 chr1 12918963 . G T 52.39 PASS AO=37;DP=170;FAO=38;FDP=170;FR=.;FRO=132;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=63;FSRR=69;FWDB=-0.0384719;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=199.351;QD=1.23277;RBI=0.0384738;REFB=-0.00646962;REVB=0.000381096;RO=132;SAF=18;SAR=19;SRF=63;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0117188;STB=0.517638;TYPE=snp;VARB=0.0214642;OID=.;OPOS=12918963;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:170:170:132:132:37:38:19:18:63:69:19:19:63:69 chr1 12919064 . T G 432.74 PASS AO=98;DP=207;FAO=105;FDP=213;FR=.;FRO=108;FSAF=42;FSAR=63;FSRF=42;FSRR=66;FWDB=0.0257529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.266;QD=8.12651;RBI=0.0286538;REFB=-0.0166957;REVB=0.012563;RO=108;SAF=39;SAR=59;SRF=42;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00900986;STB=0.505881;TYPE=snp;VARB=0.0157487;OID=.;OPOS=12919064;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:213:108:108:98:105:59:39:42:66:63:42:42:66 chr1 12919079 . C G 92.18 PASS AO=53;DP=205;FAO=53;FDP=205;FR=.;FRO=152;FSAF=19;FSAR=34;FSRF=60;FSRR=92;FWDB=-0.0197196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.692;QD=1.79862;RBI=0.0366081;REFB=-0.00887803;REVB=-0.030843;RO=151;SAF=19;SAR=34;SRF=60;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0515068;STB=0.528729;TYPE=snp;VARB=0.0278622;OID=.;OPOS=12919079;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:205:205:151:152:53:53:34:19:60:91:34:19:60:92 chr1 12919111 . G A 88.11 PASS AO=31;DP=170;FAO=46;FDP=170;FR=.;FRO=124;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=55;FSRR=69;FWDB=0.00271289;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.8333;QD=2.07316;RBI=0.0100115;REFB=0.00146517;REVB=0.00963695;RO=139;SAF=10;SAR=21;SRF=70;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236091;STB=0.572488;TYPE=snp;VARB=-0.00347367;OID=.;OPOS=12919111;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:170:170:139:124:31:46:21:10:70:69:21:25:55:69 chr1 12919587 . T C 14.25 PASS AO=12;DP=69;FAO=12;FDP=69;FR=.;FRO=57;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=33;FSRR=24;FWDB=-0.0265341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.054;QD=0.826019;RBI=0.03376;REFB=-0.00920538;REVB=0.020873;RO=56;SAF=4;SAR=8;SRF=32;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.29197;STB=0.697793;TYPE=snp;VARB=0.034214;OID=.;OPOS=12919587;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:69:69:56:57:12:12:8:4:32:24:8:4:33:24 chr1 12919623 . C T 28.65 PASS AO=20;DP=94;FAO=20;FDP=95;FR=.;FRO=75;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=31;FSRR=44;FWDB=0.0068117;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=145.56;QD=1.20621;RBI=0.0157591;REFB=-0.0026954;REVB=0.0142109;RO=74;SAF=9;SAR=11;SRF=31;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.039668;STB=0.529383;TYPE=snp;VARB=0.0118289;OID=.;OPOS=12919623;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:94:95:74:75:20:20:11:9:31:43:11:9:31:44 chr1 12919624 . C G 28.13 PASS AO=20;DP=95;FAO=20;FDP=96;FR=.;FRO=76;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=31;FSRR=45;FWDB=-0.0240218;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=100.092;QD=1.17197;RBI=0.0297593;REFB=0.00132562;REVB=-0.0175661;RO=75;SAF=9;SAR=11;SRF=31;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0469059;STB=0.533865;TYPE=snp;VARB=-0.00592891;OID=.;OPOS=12919624;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:95:96:75:76:20:20:11:9:31:44:11:9:31:45 chr1 12919872 . T G 300.79 PASS AO=131;DP=428;FAO=128;FDP=399;FR=.;FRO=271;FSAF=32;FSAR=96;FSRF=75;FSRR=196;FWDB=-0.0101311;FXX=0.00249994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.267;QD=3.01542;RBI=0.0203576;REFB=-0.0102319;REVB=-0.0176576;RO=294;SAF=32;SAR=99;SRF=78;SRR=216;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0333963;STB=0.52365;TYPE=snp;VARB=0.0238375;OID=.;OPOS=12919872;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:428:399:294:271:131:128:99:32:78:216:96:32:75:196 chr1 12919891 . G T 259.46 PASS AO=121;DP=409;FAO=120;FDP=395;FR=.;FRO=275;FSAF=33;FSAR=87;FSRF=85;FSRR=190;FWDB=-0.00459194;FXX=0.0124997;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.655;QD=2.6274;RBI=0.0171971;REFB=-0.00348039;REVB=-0.0165727;RO=268;SAF=33;SAR=88;SRF=83;SRR=185;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0539365;STB=0.528979;TYPE=snp;VARB=0.0103085;OID=.;OPOS=12919891;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:409:395:268:275:121:120:88:33:83:185:87:33:85:190 chr1 12919928 . A G 225.02 PASS AO=120;DP=416;FAO=115;FDP=400;FR=.;FRO=285;FSAF=41;FSAR=74;FSRF=87;FSRR=198;FWDB=0.0117189;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.9886;QD=2.2502;RBI=0.0240616;REFB=-0.00784016;REVB=-0.0210149;RO=295;SAF=43;SAR=77;SRF=90;SRR=205;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0727087;STB=0.540722;TYPE=snp;VARB=0.0186596;OID=.;OPOS=12919928;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:416:400:295:285:120:115:77:43:90:205:74:41:87:198 chr1 12919934 . A G 1303.47 PASS AO=250;DP=410;FAO=244;FDP=397;FR=.;FRO=153;FSAF=80;FSAR=164;FSRF=48;FSRR=105;FWDB=0.0224244;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.4266;QD=13.1332;RBI=0.0237639;REFB=-0.00453303;REVB=0.00786587;RO=157;SAF=82;SAR=168;SRF=48;SRR=109;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0182185;STB=0.506209;TYPE=snp;VARB=0.00221119;OID=.;OPOS=12919934;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:410:397:157:153:250:244:168:82:48:109:164:80:48:105 chr1 12919963 . T G 135.78 PASS AO=104;DP=437;FAO=96;FDP=400;FR=.;FRO=304;FSAF=30;FSAR=66;FSRF=105;FSRR=199;FWDB=-0.0314584;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.0322;QD=1.35778;RBI=0.0404811;REFB=-0.0150126;REVB=-0.0254772;RO=327;SAF=31;SAR=73;SRF=117;SRR=210;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0862619;STB=0.528464;TYPE=snp;VARB=0.0498557;OID=.;OPOS=12919963;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:437:400:327:304:104:96:73:31:117:210:66:30:105:199 chr1 12920067 . C G 107.27 PASS AO=68;DP=273;FAO=68;FDP=273;FR=.;FRO=205;FSAF=29;FSAR=39;FSRF=93;FSRR=112;FWDB=-0.00200894;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=261.489;QD=1.57174;RBI=0.0152782;REFB=-0.000910723;REVB=-0.0151456;RO=205;SAF=29;SAR=39;SRF=93;SRR=112;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0346989;STB=0.520734;TYPE=snp;VARB=0.00276443;OID=.;OPOS=12920067;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:273:273:205:205:68:68:39:29:93:112:39:29:93:112 chr1 12921110 . A G 81.69 PASS AO=42;DP=155;FAO=42;FDP=155;FR=.;FRO=113;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=52;FSRR=61;FWDB=0.0163306;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.678;QD=2.10814;RBI=0.0190332;REFB=-0.00043465;REVB=0.00977607;RO=112;SAF=19;SAR=23;SRF=52;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.014705;STB=0.505727;TYPE=snp;VARB=0.00277381;OID=.;OPOS=12921110;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:155:155:112:113:42:42:23:19:52:60:23:19:52:61 chr1 12921127 . A G 459.93 PASS AO=92;DP=161;FAO=92;FDP=161;FR=.;FRO=69;FSAF=31;FSAR=61;FSRF=36;FSRR=33;FWDB=-0.0187468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.5623;QD=11.4269;RBI=0.0211425;REFB=-0.00456505;REVB=0.00977564;RO=69;SAF=31;SAR=61;SRF=36;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153585;STB=0.583755;TYPE=snp;VARB=0.00265071;OID=.;OPOS=12921127;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:161:69:69:92:92:61:31:36:33:61:31:36:33 chr1 12921132 . A G 77.6 PASS AO=35;DP=157;FAO=42;FDP=163;FR=.;FRO=121;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=50;FSRR=71;FWDB=0.00389984;FXX=0.0180712;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.478;QD=1.90431;RBI=0.00517477;REFB=-0.00867756;REVB=-0.00340139;RO=119;SAF=16;SAR=19;SRF=47;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0800619;STB=0.506498;TYPE=snp;VARB=0.0223848;OID=.;OPOS=12921132;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:157:163:119:121:35:42:19:16:47:72:25:17:50:71 chr1 12921332 . T C 286.82 PASS AO=64;DP=125;FAO=64;FDP=125;FR=.;FRO=61;FSAF=11;FSAR=53;FSRF=12;FSRR=49;FWDB=0.026463;FXX=0.0157468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.423;QD=9.17811;RBI=0.0397711;REFB=-0.0115505;REVB=0.0296892;RO=60;SAF=11;SAR=53;SRF=11;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0174501;STB=0.520711;TYPE=snp;VARB=0.00407339;OID=.;OPOS=12921332;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:60:61:64:64:53:11:11:49:53:11:12:49 chr1 12921333 . G A 303.44 PASS AO=66;DP=126;FAO=66;FDP=125;FR=.;FRO=59;FSAF=13;FSAR=53;FSRF=10;FSRR=49;FWDB=0.0246885;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.966;QD=9.71009;RBI=0.0456284;REFB=-0.0078595;REVB=-0.0383723;RO=59;SAF=13;SAR=53;SRF=10;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0383671;STB=0.521015;TYPE=snp;VARB=0.0152225;OID=.;OPOS=12921333;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:125:59:59:66:66:53:13:10:49:53:13:10:49 chr1 12921600 . C T 35.39 PASS AO=10;DP=29;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0430063;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.741;QD=4.88088;RBI=0.0499854;REFB=-0.0150714;REVB=0.0254753;RO=19;SAF=1;SAR=9;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.480245;STB=0.801238;TYPE=snp;VARB=0.035183;OID=.;OPOS=12921600;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:29:29:19:19:10:10:9:1:8:11:9:1:8:11 chr1 12939467 . C T 10.3 PASS AO=2;DP=8;FAO=2;FDP=8;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.0247651;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=207.507;QD=5.1483;RBI=0.0397206;REFB=0.0050546;REVB=0.031055;RO=6;SAF=1;SAR=1;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.359974;STB=0.748118;TYPE=snp;VARB=-0.0165612;OID=.;OPOS=12939467;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:8:6:6:2:2:1:1:5:1:1:1:5:1 chr1 12939664 . A T 15.55 PASS AO=3;DP=8;FAO=3;FDP=8;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.00713842;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=242.459;QD=7.77511;RBI=0.0203631;REFB=-0.0110189;REVB=0.0190709;RO=5;SAF=2;SAR=1;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152533;STB=0.599397;TYPE=snp;VARB=0.0242558;OID=.;OPOS=12939664;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:8:8:5:5:3:3:1:2:4:1:1:2:4:1 chr1 12939674 . C G 15.55 PASS AO=3;DP=8;FAO=3;FDP=8;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.0062905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0244;QD=7.77512;RBI=0.104766;REFB=-0.0039069;REVB=-0.104577;RO=5;SAF=2;SAR=1;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152533;STB=0.599397;TYPE=snp;VARB=-0.0145647;OID=.;OPOS=12939674;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:8:8:5:5:3:3:1:2:4:1:1:2:4:1 chr1 13001312 . C G 2467.99 PASS AO=296;DP=329;FAO=301;FDP=333;FR=.;FRO=32;FSAF=136;FSAR=165;FSRF=23;FSRR=9;FWDB=0.0421912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.05;QD=29.6455;RBI=0.0421945;REFB=-0.0298066;REVB=-0.00052836;RO=32;SAF=132;SAR=164;SRF=23;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0508381;STB=0.52576;TYPE=snp;VARB=0.00481434;OID=.;OPOS=13001312;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:329:333:32:32:296:301:164:132:23:9:165:136:23:9 chr1 13036587 . C T 59.67 PASS AO=10;DP=16;FAO=10;FDP=16;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0279713;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.574;QD=14.9173;RBI=0.0280273;REFB=-0.00857709;REVB=0.00177198;RO=6;SAF=6;SAR=4;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.066985;STB=0.538384;TYPE=snp;VARB=0.0124775;OID=.;OPOS=13036587;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:16:16:6:6:10:10:4:6:3:3:4:6:3:3 chr1 13052789 . G A 696.59 PASS AO=427;DP=915;FAO=183;FDP=399;FR=.;FRO=216;FSAF=112;FSAR=71;FSRF=106;FSRR=110;FWDB=-0.00379364;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.9127;QD=6.98338;RBI=0.00471304;REFB=-0.00525617;REVB=0.0027966;RO=479;SAF=270;SAR=157;SRF=224;SRR=255;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162189;STB=0.567042;TYPE=snp;VARB=0.00565979;OID=.;OPOS=13052789;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:915:399:479:216:427:183:157:270:224:255:71:112:106:110 chr1 13052871 . C T 882.19 PASS AO=481;DP=1013;FAO=204;FDP=400;FR=.;FRO=196;FSAF=117;FSAR=87;FSRF=79;FSRR=117;FWDB=0.0186359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.482;QD=8.82191;RBI=0.0208625;REFB=-0.0117186;REVB=-0.00937798;RO=531;SAF=281;SAR=200;SRF=241;SRR=290;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125263;STB=0.583276;TYPE=snp;VARB=0.0112296;OID=.;OPOS=13052871;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:1013:400:531:196:481:204:200:281:241:290:87:117:79:117 chr1 13052907 . T C 1740.85 PASS AO=711;DP=989;FAO=281;FDP=399;FR=.;FRO=118;FSAF=154;FSAR=127;FSRF=59;FSRR=59;FWDB=-0.00401159;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.825;QD=17.4522;RBI=0.0224255;REFB=0.000406937;REVB=-0.0220638;RO=274;SAF=372;SAR=339;SRF=119;SRR=155;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0464723;STB=0.5143;TYPE=snp;VARB=-0.000207446;OID=.;OPOS=13052907;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:989:399:274:118:711:281:339:372:119:155:127:154:59:59 chr1 13183225 . T C 14.59 PASS AO=18;DP=109;FAO=18;FDP=112;FR=.;FRO=94;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=48;FSRR=46;FWDB=-0.0278749;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=182.718;QD=0.520985;RBI=0.0292299;REFB=-0.00478608;REVB=-0.00879643;RO=90;SAF=6;SAR=12;SRF=45;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213941;STB=0.650433;TYPE=snp;VARB=0.0189724;OID=.;OPOS=13183225;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:109:112:90:94:18:18:12:6:45:45:12:6:48:46 chr1 13183243 . T C 58.61 PASS AO=26;DP=88;FAO=26;FDP=92;FR=.;FRO=66;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=35;FWDB=-0.0284305;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=111.452;QD=2.54841;RBI=0.0429842;REFB=-0.0190165;REVB=0.032239;RO=62;SAF=10;SAR=16;SRF=27;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0626781;STB=0.562558;TYPE=snp;VARB=0.0412218;OID=.;OPOS=13183243;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:88:92:62:66:26:26:16:10:27:35:16:10:31:35 chr1 13183248 . T A 77.69 PASS AO=29;DP=88;FAO=29;FDP=90;FR=.;FRO=61;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=30;FSRR=31;FWDB=-0.0185001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.06;QD=3.45299;RBI=0.0213195;REFB=-0.0106896;REVB=-0.0105957;RO=59;SAF=13;SAR=16;SRF=28;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0304539;STB=0.529618;TYPE=snp;VARB=0.0144255;OID=.;OPOS=13183248;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:88:90:59:61:29:29:16:13:28:31:16:13:30:31 chr1 13183249 . C A 77.69 PASS AO=29;DP=88;FAO=29;FDP=90;FR=.;FRO=61;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=30;FSRR=31;FWDB=0.0108661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.8807;QD=3.45308;RBI=0.0407713;REFB=0.00429092;REVB=-0.0392967;RO=59;SAF=13;SAR=16;SRF=28;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0304539;STB=0.529618;TYPE=snp;VARB=-0.00230805;OID=.;OPOS=13183249;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:88:90:59:61:29:29:16:13:28:31:16:13:30:31 chr1 13183439 . T C 3793.51 PASS AO=555;DP=558;FAO=398;FDP=398;FR=.;FRO=0;FSAF=147;FSAR=251;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0273092;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.01;QD=38.1258;RBI=0.0291996;REFB=-0.0278308;REVB=0.0103354;RO=1;SAF=195;SAR=360;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00132465;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.76189e-05;OID=.;OPOS=13183439;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:558:398:1:0:555:398:360:195:0:1:251:147:0:0 chr1 13183511 . T C 544.43 PASS AO=200;DP=511;FAO=164;FDP=399;FR=.;FRO=235;FSAF=47;FSAR=117;FSRF=103;FSRR=132;FWDB=0.00482144;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.897;QD=5.45791;RBI=0.0208123;REFB=-0.00595791;REVB=-0.0202461;RO=307;SAF=62;SAR=138;SRF=136;SRR=171;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156309;STB=0.599926;TYPE=snp;VARB=0.0076126;OID=.;OPOS=13183511;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:511:399:307:235:200:164:138:62:136:171:117:47:103:132 chr1 13183528 . A C 387.54 PASS AO=167;DP=451;FAO=141;FDP=396;FR=.;FRO=255;FSAF=42;FSAR=99;FSRF=112;FSRR=143;FWDB=-0.0406935;FXX=0.00999975;HRUN=3;LEN=1;MLLD=174.336;QD=3.91455;RBI=0.0414179;REFB=0.000556259;REVB=0.00771231;RO=282;SAF=52;SAR=115;SRF=123;SRR=159;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151049;STB=0.599985;TYPE=snp;VARB=-0.00170404;OID=.;OPOS=13183528;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:451:396:282:255:167:141:115:52:123:159:99:42:112:143 chr1 13183532 . C T 378.31 PASS AO=158;DP=449;FAO=139;FDP=393;FR=.;FRO=254;FSAF=38;FSAR=101;FSRF=113;FSRR=141;FWDB=-0.022034;FXX=0.0174996;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.847;QD=3.85048;RBI=0.022078;REFB=-0.0160554;REVB=-0.00139249;RO=284;SAF=48;SAR=110;SRF=122;SRR=162;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156206;STB=0.62382;TYPE=snp;VARB=0.0132767;OID=.;OPOS=13183532;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:449:393:284:254:158:139:110:48:122:162:101:38:113:141 chr1 13183533 . C T 388.67 PASS AO=165;DP=452;FAO=142;FDP=399;FR=.;FRO=257;FSAF=38;FSAR=104;FSRF=115;FSRR=142;FWDB=-0.00060872;FXX=0.00249994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.817;QD=3.89643;RBI=0.0119948;REFB=-0.0126128;REVB=0.0119794;RO=282;SAF=48;SAR=117;SRF=120;SRR=162;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167122;STB=0.629909;TYPE=snp;VARB=0.00812941;OID=.;OPOS=13183533;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:452:399:282:257:165:142:117:48:120:162:104:38:115:142 chr1 13183567 . C T 196.36 PASS AO=104;DP=362;FAO=101;FDP=357;FR=.;FRO=256;FSAF=37;FSAR=64;FSRF=134;FSRR=122;FWDB=-0.0395249;FXX=0.00557088;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.6927;QD=2.2001;RBI=0.0400603;REFB=-0.0163747;REVB=0.00652791;RO=254;SAF=39;SAR=65;SRF=132;SRR=122;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178083;STB=0.613912;TYPE=snp;VARB=0.0362412;OID=.;OPOS=13183567;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:362:357:254:256:104:101:65:39:132:122:64:37:134:122 chr1 13183573 . G T 160.97 PASS AO=96;DP=353;FAO=93;FDP=351;FR=.;FRO=258;FSAF=35;FSAR=58;FSRF=137;FSRR=121;FWDB=0.00207627;FXX=0.00566556;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.841;QD=1.83444;RBI=0.014385;REFB=-0.0126;REVB=0.0142343;RO=257;SAF=37;SAR=59;SRF=136;SRR=121;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178753;STB=0.614223;TYPE=snp;VARB=0.031964;OID=.;OPOS=13183573;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:353:351:257:258:96:93:59:37:136:121:58:35:137:121 chr1 13219149 . G A 110.89 PASS AO=59;DP=217;FAO=59;FDP=217;FR=.;FRO=158;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=48;FSRR=110;FWDB=0.0400955;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=193.688;QD=2.04407;RBI=0.0509259;REFB=-0.0121553;REVB=-0.0313975;RO=156;SAF=31;SAR=28;SRF=47;SRR=109;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275658;STB=0.659119;TYPE=snp;VARB=0.0380285;OID=.;OPOS=13219149;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:217:217:156:158:59:59:28:31:47:109:28:31:48:110 chr1 13448283 . A G 568.24 PASS AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00056981;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.719;QD=38.5248;RBI=0.0285542;REFB=0;REVB=0.0285486;RO=0;SAF=27;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.96591e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000112275;OID=.;OPOS=13448283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:59:59:0:0:59:59:32:27:0:0:32:27:0:0 chr1 13448351 . T C 378.96 PASS AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.034412;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.763;QD=38.8674;RBI=0.0345957;REFB=0;REVB=0.00356072;RO=0;SAF=19;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3303e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000357925;OID=.;OPOS=13448351;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:39:39:0:0:39:39:20:19:0:0:20:19:0:0 chr1 13474934 . G A 42.74 PASS AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0366391;FXX=0.076864;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.2452;QD=14.246;RBI=0.115629;REFB=-0.0515293;REVB=0.109671;RO=4;SAF=4;SAR=3;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115856;STB=0.51216;TYPE=snp;VARB=0.0454694;OID=.;OPOS=13474934;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:13:12:4:5:7:7:3:4:3:1:3:4:3:2 chr1 13474951 . C G 46.05 PASS AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.00870556;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.045;QD=10.2331;RBI=0.056021;REFB=-0.0317795;REVB=-0.0553405;RO=9;SAF=5;SAR=4;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.015401;OID=.;OPOS=13474951;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:18:18:9:9:9:9:4:5:5:4:4:5:5:4 chr1 13474974 . G A 56.14 PASS AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.00871536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.215;QD=7.48592;RBI=0.0252612;REFB=-0.0280944;REVB=0.0237101;RO=17;SAF=8;SAR=5;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198112;STB=0.615207;TYPE=snp;VARB=0.0300779;OID=.;OPOS=13474974;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:30:30:17:17:13:13:5:8:7:10:5:8:7:10 chr1 13695787 . C G 423.68 PASS AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0268222;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=270.545;QD=37.6609;RBI=0.0300316;REFB=0;REVB=-0.0135081;RO=0;SAF=28;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.14369e-05;OID=.;OPOS=13695787;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:45:45:0:0:45:45:17:28:0:0:17:28:0:0 chr1 13695816 . G A 676.81 PASS AO=54;DP=73;FAO=71;FDP=71;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0240692;FXX=0.0273935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.015;QD=38.13;RBI=0.0531319;REFB=0;REVB=0.0473674;RO=0;SAF=35;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.86274e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00115588;OID=.;OPOS=13695816;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:73:71:0:0:54:71:19:35:0:0:35:36:0:0 chr1 13716842 . G A 12.53 PASS AO=3;DP=12;FAO=3;FDP=12;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.00649132;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=219.526;QD=4.17566;RBI=0.00682527;REFB=-0.00108795;REVB=0.00210883;RO=9;SAF=1;SAR=2;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.448805;STB=0.798399;TYPE=snp;VARB=0.00767;OID=.;OPOS=13716842;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:12:12:9:9:3:3:2:1:7:2:2:1:7:2 chr1 13716855 . T C 34.87 PASS AO=8;DP=23;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=3;FWDB=0.0199836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.581;QD=5.81201;RBI=0.0297102;REFB=-0.0158891;REVB=0.0219853;RO=15;SAF=4;SAR=4;SRF=12;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.328342;STB=0.659885;TYPE=snp;VARB=0.0247822;OID=.;OPOS=13716855;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:23:24:15:15:8:9:4:4:12:3:4:5:12:3 chr1 13718602 . G A 10.3 PASS AO=2;DP=8;FAO=2;FDP=8;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.0863873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.54;QD=5.1475;RBI=0.0863873;REFB=-0.00356393;REVB=0;RO=6;SAF=2;SAR=0;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0551059;OID=.;OPOS=13718602;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:8:6:6:2:2:0:2:6:0:0:2:6:0 chr1 13940864 . C G 2544.43 PASS AO=261;DP=264;FAO=265;FDP=265;FR=.;FRO=0;FSAF=133;FSAR=132;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00175342;FXX=0.00375926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.662;QD=38.4064;RBI=0.0149068;REFB=0;REVB=0.0148033;RO=0;SAF=130;SAR=131;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.98415e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000184687;OID=.;OPOS=13940864;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:264:265:0:0:261:265:131:130:0:0:132:133:0:0 chr1 13944236 . C CTT 596.38 PASS AO=71;DP=81;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153244;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=2;MLLD=36.6147;QD=31.3886;RBI=0.0599323;REFB=0;REVB=0.05794;RO=4;SAF=40;SAR=31;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0449707;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-8.48342e-06;OID=.;OPOS=13944237;OREF=-;OALT=TT;OMAPALT=CTT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:71:81:76:76:0:45:31:0:0:53:4:40:31:4:0 chr1 14105139 . T A 155.14 PASS AO=41;DP=93;FAO=41;FDP=94;FR=.;FRO=53;FSAF=4;FSAR=37;FSRF=18;FSRR=35;FWDB=0.0148943;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.104;QD=6.60158;RBI=0.0193878;REFB=-0.0351435;REVB=0.0124116;RO=50;SAF=4;SAR=37;SRF=17;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.408443;STB=0.738511;TYPE=snp;VARB=0.036801;OID=.;OPOS=14105139;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:94:50:53:41:41:37:4:17:33:37:4:18:35 chr1 14105298 . G A 197.42 PASS AO=46;DP=98;FAO=47;FDP=98;FR=.;FRO=51;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=23;FSRR=28;FWDB=-0.0688285;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.6921;QD=8.0579;RBI=0.0693097;REFB=0.0115403;REVB=0.00815319;RO=52;SAF=18;SAR=28;SRF=24;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0689438;STB=0.524989;TYPE=snp;VARB=-0.0147434;OID=.;OPOS=14105298;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:52:51:46:47:28:18:24:28:28:19:23:28 chr1 14106394 . A ACTC 296.5 PASS AO=68;DP=150;FAO=71;FDP=147;FR=.;FRO=76;FSAF=34;FSAR=37;FSRF=40;FSRR=36;FWDB=-0.00418458;FXX=0.0134219;HRUN=1;LEN=3;MLLD=167.398;QD=8.0681;RBI=0.00868204;REFB=-0.0212057;REVB=0.00760704;RO=78;SAF=34;SAR=34;SRF=40;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0123458;STB=0.524514;TYPE=ins;VARB=0.0244124;OID=.;OPOS=14106395;OREF=-;OALT=CTC;OMAPALT=ACTC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:68:150:71:147:76:34:37:40:36:99:78:34:34:40:38 chr1 14108059 . AAAG A 156.71 PASS AO=47;DP=107;FAO=52;FDP=104;FR=.;FRO=52;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=31;FWDB=0.0104718;FXX=0;HRUN=3;LEN=3;MLLD=239.682;QD=6.02741;RBI=0.0131138;REFB=0.00548254;REVB=0.00789381;RO=39;SAF=29;SAR=18;SRF=12;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.25251;STB=0.576554;TYPE=del;VARB=-0.0062835;OID=.;OPOS=14108060;OREF=AAG;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:47:95:52:104:52:29:23:21:31:99:39:29:18:12:27 chr1 14109114 . A G 686.5 PASS AO=152;DP=288;FAO=152;FDP=288;FR=.;FRO=136;FSAF=74;FSAR=78;FSRF=52;FSRR=84;FWDB=0.0157552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8668;QD=9.53475;RBI=0.0192123;REFB=-0.0169227;REVB=-0.0109948;RO=136;SAF=74;SAR=78;SRF=52;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0908019;STB=0.549498;TYPE=snp;VARB=0.014603;OID=.;OPOS=14109114;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:288:288:136:136:152:152:78:74:52:84:78:74:52:84 chr1 14142973 . C G 257.01 PASS AO=59;DP=118;FAO=59;FDP=118;FR=.;FRO=59;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=25;FSRR=34;FWDB=-0.0307435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.355;QD=8.71208;RBI=0.0307905;REFB=-0.00266051;REVB=0.00170132;RO=59;SAF=25;SAR=34;SRF=25;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00260123;OID=.;OPOS=14142973;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:59:59:59:59:34:25:25:34:34:25:25:34 chr1 14143003 . A G 833.12 PASS AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0129127;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.033;QD=38.3044;RBI=0.0176608;REFB=0;REVB=0.0120485;RO=0;SAF=37;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.37373e-06;OID=.;OPOS=14143003;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:87:87:0:0:87:87:50:37:0:0:51:36:0:0 chr1 14149622 . T C 848.58 PASS AO=87;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0219714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.724;QD=38.1383;RBI=0.0223055;REFB=0;REVB=-0.00384614;RO=0;SAF=30;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.04997e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.19399e-05;OID=.;OPOS=14149622;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:89:89:0:0:87:89:57:30:0:0:58:31:0:0 chr1 14150709 . C T 1921.22 PASS AO=205;DP=209;FAO=207;FDP=210;FR=.;FRO=3;FSAF=137;FSAR=70;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.00505798;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=189.867;QD=36.5947;RBI=0.0322105;REFB=0.0157254;REVB=0.0318109;RO=4;SAF=136;SAR=69;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00353727;STB=0.500077;TYPE=snp;VARB=-2.37409e-05;OID=.;OPOS=14150709;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:209:210:4:3:205:207:69:136:3:1:70:137:2:1 chr1 14150714 . G A 1408.43 PASS AO=187;DP=221;FAO=190;FDP=222;FR=.;FRO=32;FSAF=141;FSAR=49;FSRF=3;FSRR=29;FWDB=0.0103082;FXX=0.0044841;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.8204;QD=25.3771;RBI=0.0358091;REFB=-0.103132;REVB=0.0342933;RO=23;SAF=141;SAR=46;SRF=3;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158998;STB=0.60916;TYPE=snp;VARB=0.0130715;OID=.;OPOS=14150714;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:221:222:23:32:187:190:46:141:3:20:49:141:3:29 chr1 14150740 . G T 2047.61 PASS AO=211;DP=211;FAO=214;FDP=214;FR=.;FRO=0;FSAF=143;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00425514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.481;QD=38.2731;RBI=0.0695222;REFB=0;REVB=0.0693919;RO=0;SAF=143;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.35552e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.4486e-05;OID=.;OPOS=14150740;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:97:211:214:0:0:211:214:68:143:0:0:71:143:0:0 chr1 14150992 . T C 3246.45 PASS AO=337;DP=349;FAO=340;FDP=340;FR=.;FRO=0;FSAF=159;FSAR=181;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0195454;FXX=0.0684913;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.687;QD=38.1935;RBI=0.0428191;REFB=-0.0417709;REVB=0.038098;RO=0;SAF=157;SAR=180;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.00943e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.14131e-05;OID=.;OPOS=14150992;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:349:340:0:0:337:340:180:157:0:0:181:159:0:0 chr1 14220186 . A G 182.72 PASS AO=60;DP=162;FAO=60;FDP=161;FR=.;FRO=101;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=42;FSRR=59;FWDB=-0.0061144;FXX=0.00617246;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.659;QD=4.53961;RBI=0.0085982;REFB=-0.00749666;REVB=0.0060451;RO=100;SAF=26;SAR=34;SRF=42;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149907;STB=0.511201;TYPE=snp;VARB=0.00914375;OID=.;OPOS=14220186;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:161:100:101:60:60:34:26:42:58:34:26:42:59 chr1 14507057 . A G 152.18 PASS AO=44;DP=110;FAO=44;FDP=109;FR=.;FRO=65;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=26;FSRR=39;FWDB=0.020874;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.446;QD=5.58442;RBI=0.0210273;REFB=-0.00216615;REVB=0.00253502;RO=64;SAF=16;SAR=28;SRF=26;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0475111;STB=0.523121;TYPE=snp;VARB=0.00606934;OID=.;OPOS=14507057;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:109:64:65:44:44:28:16:26:38:28:16:26:39 chr1 15438990 . G A 651.39 PASS AO=70;DP=73;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0148135;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=68.2302;QD=35.2102;RBI=0.0981029;REFB=-0.131359;REVB=0.096978;RO=2;SAF=13;SAR=57;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0163019;STB=0.504131;TYPE=snp;VARB=0.00267087;OID=.;OPOS=15438990;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:73:74:2:1:70:73:57:13:0:2:60:13:0:1 chr1 15490865 . T A 2647.38 PASS AO=273;DP=274;FAO=276;FDP=276;FR=.;FRO=0;FSAF=144;FSAR=132;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0239329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.409;QD=38.3679;RBI=0.0239765;REFB=0;REVB=0.00144478;RO=1;SAF=141;SAR=132;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00336973;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.44834e-05;OID=.;OPOS=15490865;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:274:276:1:0:273:276:132:141:1:0:132:144:0:0 chr1 15497727 . T C 580.76 PASS AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0725535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.088;QD=38.7173;RBI=0.0725705;REFB=0;REVB=0.00156736;RO=0;SAF=38;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000338673;OID=.;OPOS=15497727;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:60:60:0:0:60:60:22:38:0:0:22:38:0:0 chr1 15653563 . C T 534.82 PASS AO=56;DP=58;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0486265;FXX=0.0338926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.4362;QD=37.531;RBI=0.135633;REFB=0;REVB=0.126617;RO=0;SAF=29;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00455469;OID=.;OPOS=15653563;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:58:57:0:0:56:57:27:29:0:0:28:29:0:0 chr1 15668276 . G A 773.36 PASS AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0177663;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9881;QD=38.6681;RBI=0.0719442;REFB=0;REVB=0.069716;RO=0;SAF=28;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000546368;OID=.;OPOS=15668276;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:80:80:0:0:80:80:52:28:0:0:52:28:0:0 chr1 15687059 . A G 240.73 PASS AO=57;DP=113;FAO=56;FDP=112;FR=.;FRO=56;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=25;FSRR=31;FWDB=-0.0082511;FXX=0.00884877;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.0905;QD=8.59746;RBI=0.0245012;REFB=0.029238;REVB=-0.0230701;RO=56;SAF=24;SAR=33;SRF=25;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0232542;STB=0.518318;TYPE=snp;VARB=-0.0322254;OID=.;OPOS=15687059;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:112:56:56:57:56:33:24:25:31:33:23:25:31 chr1 15714831 . C T 73.8 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0700089;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=43.892;QD=36.8999;RBI=0.0965948;REFB=0;REVB=0.0665531;RO=0;SAF=6;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.58669e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0100348;OID=.;OPOS=15714831;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:2:6:0:0:2:6:0:0 chr1 15723843 . G A 473.72 PASS AO=107;DP=213;FAO=109;FDP=216;FR=.;FRO=107;FSAF=32;FSAR=77;FSRF=18;FSRR=89;FWDB=0.00795939;FXX=0.013698;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.853;QD=8.77266;RBI=0.0270702;REFB=-0.0157538;REVB=0.0258736;RO=106;SAF=34;SAR=73;SRF=17;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177689;STB=0.579773;TYPE=snp;VARB=0.0151134;OID=.;OPOS=15723843;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:213:216:106:107:107:109:73:34:17:89:77:32:18:89 chr1 15754484 . T C 484.13 PASS AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.000912393;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=203.994;QD=35.8618;RBI=0.0181024;REFB=-0.145651;REVB=0.0180794;RO=0;SAF=22;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76368e-08;STB=0.507934;TYPE=snp;VARB=0.000547414;OID=.;OPOS=15754484;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:54:54:0:1:53:53:31:22:0:0:31:22:0:1 chr1 15788269 . A C 289.9 PASS AO=66;DP=128;FAO=65;FDP=127;FR=.;FRO=62;FSAF=30;FSAR=35;FSRF=34;FSRR=28;FWDB=-0.00639282;FXX=0.00781189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.9089;QD=9.13069;RBI=0.00800358;REFB=-0.0279002;REVB=0.00481552;RO=62;SAF=31;SAR=35;SRF=34;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0692114;STB=0.54236;TYPE=snp;VARB=0.0301257;OID=.;OPOS=15788269;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:127:62:62:66:65:35:31:34:28:35:30:34:28 chr1 15788630 . G A 397.01 PASS AO=100;DP=213;FAO=100;FDP=213;FR=.;FRO=113;FSAF=52;FSAR=48;FSRF=52;FSRR=61;FWDB=-0.04508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.997;QD=7.45558;RBI=0.0525376;REFB=-0.0107528;REVB=-0.0269813;RO=111;SAF=52;SAR=48;SRF=52;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0490816;STB=0.531701;TYPE=snp;VARB=0.0131076;OID=.;OPOS=15788630;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:213:213:111:113:100:100:48:52:52:59:48:52:52:61 chr1 15788693 . C T 395.69 PASS AO=106;DP=241;FAO=106;FDP=238;FR=.;FRO=132;FSAF=53;FSAR=53;FSRF=54;FSRR=78;FWDB=-0.0227895;FXX=0.0124476;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.162;QD=6.65028;RBI=0.0269992;REFB=0.00550673;REVB=0.0144774;RO=129;SAF=53;SAR=53;SRF=54;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0806774;STB=0.550411;TYPE=snp;VARB=-0.00693929;OID=.;OPOS=15788693;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:241:238:129:132:106:106:53:53:54:75:53:53:54:78 chr1 15789297 . A C 134.14 PASS AO=34;DP=81;FAO=35;FDP=81;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=30;FSRR=16;FWDB=-0.0261383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.723;QD=6.62439;RBI=0.0378193;REFB=-0.0393484;REVB=-0.027333;RO=46;SAF=16;SAR=18;SRF=30;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183726;STB=0.594049;TYPE=snp;VARB=0.0386801;OID=.;OPOS=15789297;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:46:46:34:35:18:16:30:16:18:17:30:16 chr1 15812432 . A G 1350.94 PASS AO=141;DP=141;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00241437;FXX=0.00699252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.509;QD=38.0546;RBI=0.0135511;REFB=0;REVB=-0.0133343;RO=0;SAF=75;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.2556e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.41824e-05;OID=.;OPOS=15812432;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:141:142:0:0:141:142:66:75:0:0:68:74:0:0 chr1 16096932 . G GT 88.29 PASS AO=6;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0965238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=16.0955;QD=23.5451;RBI=0.186389;REFB=0;REVB=0.15945;RO=9;SAF=5;SAR=1;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.426681;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.0351629;OID=.;OPOS=16096933;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:6:15:15:15:0:9:6:0:0:8:9:5:1:4:5 chr1 16096934 . C T 51.9 PASS AO=7;DP=13;FAO=10;FDP=15;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0103772;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=24.859;QD=13.8387;RBI=0.0537008;REFB=-0.109049;REVB=0.0526886;RO=6;SAF=3;SAR=4;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.308536;STB=0.599808;TYPE=snp;VARB=0.0672405;OID=.;OPOS=16096934;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:13:15:6:5:7:10:4:3:5:1:5:5:4:1 chr1 16133987 . T C 544.81 PASS AO=143;DP=317;FAO=144;FDP=316;FR=.;FRO=172;FSAF=55;FSAR=89;FSRF=101;FSRR=71;FWDB=-0.0238082;FXX=0.00315447;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.799;QD=6.89632;RBI=0.025387;REFB=0.00779835;REVB=-0.00881291;RO=171;SAF=55;SAR=88;SRF=100;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197742;STB=0.612046;TYPE=snp;VARB=-0.0103123;OID=.;OPOS=16133987;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:317:316:171:172:143:144:88:55:100:71:89:55:101:71 chr1 16134072 . C T 550.91 PASS AO=131;DP=259;FAO=129;FDP=258;FR=.;FRO=129;FSAF=31;FSAR=98;FSRF=66;FSRR=63;FWDB=0.0575825;FXX=0.0114938;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.6518;QD=8.5413;RBI=0.0577719;REFB=-0.01023;REVB=-0.00467452;RO=128;SAF=33;SAR=98;SRF=65;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.26083;STB=0.655696;TYPE=snp;VARB=0.00966826;OID=.;OPOS=16134072;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:259:258:128:129:131:129:98:33:65:63:98:31:66:63 chr1 16256007 . T C 198.54 PASS AO=39;DP=71;FAO=40;FDP=72;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=-0.00277699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.634;QD=11.0301;RBI=0.00923702;REFB=-0.0236474;REVB=-0.00880971;RO=31;SAF=15;SAR=24;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00210485;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0186875;OID=.;OPOS=16256007;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:72:31:32:39:40:24:15:12:19:25:15:12:20 chr1 16259813 . A G 213.37 PASS AO=50;DP=112;FAO=54;FDP=119;FR=.;FRO=65;FSAF=14;FSAR=40;FSRF=30;FSRR=35;FWDB=0.00599997;FXX=0.00833264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.966;QD=7.17202;RBI=0.0174328;REFB=-0.00302449;REVB=-0.0163677;RO=61;SAF=14;SAR=36;SRF=28;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196127;STB=0.626285;TYPE=snp;VARB=0.00407308;OID=.;OPOS=16259813;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:119:61:65:50:54:36:14:28:33:40:14:30:35 chr1 16265904 . T A 185.45 PASS AO=45;DP=95;FAO=45;FDP=95;FR=.;FRO=50;FSAF=8;FSAR=37;FSRF=18;FSRR=32;FWDB=0.00784625;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.958;QD=7.80856;RBI=0.0143166;REFB=-0.0110629;REVB=0.011975;RO=50;SAF=8;SAR=37;SRF=18;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.240086;STB=0.635335;TYPE=snp;VARB=0.0122381;OID=.;OPOS=16265904;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:50:50:45:45:37:8:18:32:37:8:18:32 chr1 16341649 . C T 965.91 PASS AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146499;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=232.683;QD=38.6364;RBI=0.0493312;REFB=0;REVB=0.0471057;RO=0;SAF=69;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.50794e-05;OID=.;OPOS=16341649;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:100:100:0:0:100:100:31:69:0:0:31:69:0:0 chr1 16341733 . T C 967.94 PASS AO=99;DP=100;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0763996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.4;QD=37.9585;RBI=0.0766088;REFB=0;REVB=0.00565748;RO=0;SAF=21;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19376e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00012021;OID=.;OPOS=16341733;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:100:102:0:0:99:102:78:21:0:0:79:23:0:0 chr1 16342237 . A G 203.21 PASS AO=23;DP=23;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00760757;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.819;QD=36.9467;RBI=0.0262833;REFB=0;REVB=0.0251582;RO=0;SAF=5;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00236363;OID=.;OPOS=16342237;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:22:0:0:23:22:18:5:0:0:17:5:0:0 chr1 16344360 . A G 747.39 PASS AO=65;DP=80;FAO=77;FDP=77;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=70;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02271;FXX=0.0374953;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.523;QD=38.8253;RBI=0.0356769;REFB=0;REVB=0.0275154;RO=0;SAF=58;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000226533;OID=.;OPOS=16344360;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:78:77:0:0:65:77:7:58:0:0:7:70:0:0 chr1 16344402 . G A 1225.82 PASS AO=128;DP=129;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167555;FXX=0.00757518;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.3528;QD=37.4296;RBI=0.0454074;REFB=0.0566831;REVB=0.0422029;RO=1;SAF=58;SAR=70;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00812287;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000128582;OID=.;OPOS=16344402;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:129:131:1:0:128:131:70:58:1:0:71:60:0:0 chr1 16344494 . G A 452.19 PASS AO=49;DP=54;FAO=54;FDP=56;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=32;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0209695;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=38.9045;QD=32.2994;RBI=0.103561;REFB=-0.181615;REVB=0.101415;RO=5;SAF=22;SAR=27;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00860355;STB=0.521731;TYPE=snp;VARB=0.0154801;OID=.;OPOS=16344494;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:54:56:5:2:49:54:27:22:2:3:32:22:2:0 chr1 16344625 . C G 351.11 PASS AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.2171;QD=37.9574;RBI=0.0214202;REFB=0;REVB=-0.00518193;RO=0;SAF=11;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000208715;OID=.;OPOS=16344625;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:37:37:0:0:37:37:26:11:0:0:26:11:0:0 chr1 16344664 . G A 102.51 PASS AO=18;DP=31;FAO=18;FDP=30;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.00342016;FXX=0.0624805;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.173;QD=13.6675;RBI=0.0162925;REFB=-0.0201704;REVB=0.0159294;RO=12;SAF=10;SAR=8;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0992905;STB=0.555494;TYPE=snp;VARB=0.0110938;OID=.;OPOS=16344664;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:31:30:12:12:18:18:8:10:5:7:8:10:5:7 chr1 16351275 . A G 383.66 PASS AO=35;DP=36;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109574;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.859;QD=37.4302;RBI=0.0436637;REFB=0;REVB=0.0422665;RO=0;SAF=17;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11116e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000324177;OID=.;OPOS=16351275;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:36:41:0:0:35:41:18:17:0:0:23:18:0:0 chr1 16354590 . A T 99.15 PASS AO=28;DP=76;FAO=30;FDP=78;FR=.;FRO=48;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=-0.00161367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.1406;QD=5.08477;RBI=0.0100422;REFB=-0.0239883;REVB=-0.00991169;RO=47;SAF=10;SAR=18;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102488;STB=0.56876;TYPE=snp;VARB=0.0328037;OID=.;OPOS=16354590;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:78:47:48:28:30:18:10:21:26:20:10:21:27 chr1 16356497 . C G 19.94 PASS AO=10;DP=39;FAO=9;FDP=39;FR=.;FRO=30;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.0154594;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.4618;QD=2.04522;RBI=0.0219005;REFB=-0.00521032;REVB=-0.0155126;RO=29;SAF=5;SAR=5;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102398;STB=0.508651;TYPE=snp;VARB=0.0206127;OID=.;OPOS=16356497;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:39:39:29:30:10:9:5:5:17:12:4:5:17:13 chr1 16356501 . G A 353.16 PASS AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.081079;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.1516;QD=38.1798;RBI=0.0867418;REFB=0;REVB=0.0308274;RO=0;SAF=20;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71161e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00173823;OID=.;OPOS=16356501;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:37:37:0:0:37:37:17:20:0:0:17:20:0:0 chr1 16356533 . T C 11.39 PASS AO=6;DP=33;FAO=6;FDP=33;FR=.;FRO=27;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.0295122;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.961;QD=1.38088;RBI=0.036018;REFB=-0.0034575;REVB=-0.0206476;RO=26;SAF=4;SAR=2;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242818;STB=0.679407;TYPE=snp;VARB=0.0220152;OID=.;OPOS=16356533;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:33:33:26:27:6:6:2:4:12:14:2:4:12:15 chr1 16357147 . C T 211.45 PASS AO=39;DP=64;FAO=39;FDP=64;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=0.0136844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.602;QD=13.2153;RBI=0.0267414;REFB=-0.00746814;REVB=-0.0229747;RO=24;SAF=16;SAR=23;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17811;STB=0.604727;TYPE=snp;VARB=0.00282377;OID=.;OPOS=16357147;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:64:64:24:25:39:39:23:16:16:8:23:16:17:8 chr1 16358932 . T C 86.76 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.383;QD=38.5593;RBI=0.0180932;REFB=0;REVB=0.0129191;RO=0;SAF=2;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000180984;OID=.;OPOS=16358932;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:7:2:0:0:7:2:0:0 chr1 16361916 . G A 73.84 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00986464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.653;QD=36.9199;RBI=0.0273841;REFB=0;REVB=0.0255456;RO=0;SAF=7;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.78849e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00014183;OID=.;OPOS=16361916;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:7:0:0:1:7:0:0 chr1 16362807 . T A 10.89 PASS AO=3;DP=14;FAO=3;FDP=14;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.0467046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.1934;QD=3.11162;RBI=0.0488239;REFB=-0.014872;REVB=-0.0142285;RO=11;SAF=2;SAR=1;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.318673;STB=0.725859;TYPE=snp;VARB=0.0755792;OID=.;OPOS=16362807;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:14:14:11:11:3:3:1:2:4:7:1:2:4:7 chr1 16371067 . G T 450.15 PASS AO=32;DP=48;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0896376;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.518;QD=38.3102;RBI=0.0925766;REFB=0;REVB=0.0231413;RO=0;SAF=9;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02243e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000228449;OID=.;OPOS=16371067;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:34:47:0:0:32:47:23:9:0:0:33:14:0:0 chr1 16373124 . A G 444.16 PASS AO=42;DP=42;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.137887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.967;QD=37.8011;RBI=0.137934;REFB=0;REVB=-0.0036292;RO=0;SAF=4;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000361176;OID=.;OPOS=16373124;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:42:47:0:0:42:47:38:4:0:0:39:8:0:0 chr1 16374533 . G C 581.38 PASS AO=67;DP=71;FAO=67;FDP=71;FR=.;FRO=4;FSAF=6;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0017436;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=272.089;QD=32.7537;RBI=0.00714115;REFB=0.0423475;REVB=-0.00692502;RO=2;SAF=6;SAR=61;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0152442;STB=0.515868;TYPE=snp;VARB=-0.000235029;OID=.;OPOS=16374533;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:71:71:2:4:67:67:61:6:0:2:61:6:0:4 chr1 16374994 . C T 148.66 PASS AO=20;DP=24;FAO=20;FDP=24;FR=.;FRO=4;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0194293;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=182.475;QD=24.7759;RBI=0.0297835;REFB=0.0422577;REVB=-0.0225734;RO=4;SAF=14;SAR=6;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151952;STB=0.583246;TYPE=snp;VARB=-0.00174425;OID=.;OPOS=16374994;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:24:24:4:4:20:20:6:14:1:3:6:14:1:3 chr1 16375064 . A C 74.27 PASS AO=17;DP=21;FAO=13;FDP=17;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0959347;FXX=0.227169;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.592;QD=17.4742;RBI=0.115611;REFB=-0.104931;REVB=0.0645174;RO=4;SAF=3;SAR=14;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11448;STB=0.583218;TYPE=snp;VARB=0.0598687;OID=.;OPOS=16375064;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:21:17:4:4:17:13:14:3:0:4:10:3:0:4 chr1 16376191 . C T 220.86 PASS AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.6318;QD=36.8101;RBI=0.0199485;REFB=0;REVB=-0.0147797;RO=0;SAF=23;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.66402e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.83113e-05;OID=.;OPOS=16376191;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:24:24:0:0:24:24:1:23:0:0:1:23:0:0 chr1 16376319 . T C 1101.52 PASS AO=113;DP=120;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00148695;FXX=0.0333306;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.3775;QD=37.9834;RBI=0.0274006;REFB=0;REVB=0.0273602;RO=0;SAF=31;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0005537;OID=.;OPOS=16376319;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:120:116:0:0:113:116:82:31:0:0:85:31:0:0 chr1 16380196 . T C 567.04 PASS AO=57;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00233977;FXX=0.0476115;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.647;QD=37.8029;RBI=0.0174016;REFB=0;REVB=0.0172436;RO=0;SAF=28;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.02961e-05;OID=.;OPOS=16380196;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:60:60:0:0:57:60:29:28:0:0:32:28:0:0 chr1 16380243 . A G 82.07 PASS AO=25;DP=64;FAO=25;FDP=67;FR=.;FRO=42;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=0.00360397;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.811;QD=4.8996;RBI=0.038872;REFB=0.00314137;REVB=-0.0387046;RO=39;SAF=10;SAR=15;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0941553;STB=0.533715;TYPE=snp;VARB=-0.00760102;OID=.;OPOS=16380243;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:64:67:39:42:25:25:15:10:19:20:15:10:19:23 chr1 16380252 . C T 106 PASS AO=28;DP=62;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=0.0526043;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=39.6645;QD=6.52297;RBI=0.0555666;REFB=0.0409756;REVB=-0.0179007;RO=34;SAF=10;SAR=18;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143705;STB=0.561156;TYPE=snp;VARB=-0.0485766;OID=.;OPOS=16380252;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:65:34:37:28:28:18:10:17:17:18:10:17:20 chr1 16383682 . G C 146.75 PASS AO=48;DP=130;FAO=48;FDP=130;FR=.;FRO=82;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=32;FSRR=50;FWDB=-0.0319438;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.9215;QD=4.51538;RBI=0.0949912;REFB=-0.0142304;REVB=0.089459;RO=79;SAF=17;SAR=31;SRF=30;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0302457;STB=0.524506;TYPE=snp;VARB=0.0323502;OID=.;OPOS=16383682;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:79:82:48:48:31:17:30:49:31:17:32:50 chr1 16383742 . C G 370.64 PASS AO=75;DP=148;FAO=85;FDP=165;FR=.;FRO=80;FSAF=32;FSAR=53;FSRF=22;FSRR=58;FWDB=0.108166;FXX=0.00602373;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.3855;QD=8.98525;RBI=0.108386;REFB=-0.0815359;REVB=-0.00690978;RO=73;SAF=26;SAR=49;SRF=24;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0178262;STB=0.553776;TYPE=snp;VARB=0.0755322;OID=.;OPOS=16383742;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:165:73:80:75:85:49:26:24:49:53:32:22:58 chr1 16385175 . G A 91.62 PASS AO=15;DP=24;FAO=16;FDP=24;FR=.;FRO=8;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.0229031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.403;QD=15.2697;RBI=0.0262409;REFB=-0.00432363;REVB=0.0128075;RO=7;SAF=12;SAR=3;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.346254;STB=0.683952;TYPE=snp;VARB=0.00122996;OID=.;OPOS=16385175;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:24:24:7:8:15:16:3:12:2:5:3:13:3:5 chr1 16386008 . T C 271.77 PASS AO=18;DP=30;FAO=29;FDP=29;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0913836;FXX=0.0333222;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.3531;QD=37.486;RBI=0.176033;REFB=0;REVB=0.150455;RO=0;SAF=11;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0119205;OID=.;OPOS=16386008;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:27:29:0:0:18:29:7:11:0:0:15:14:0:0 chr1 16386416 . G A 149.91 PASS AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0991228;FXX=0.0587889;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.785;QD=37.477;RBI=0.103576;REFB=0;REVB=-0.0300456;RO=0;SAF=7;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0015158;OID=.;OPOS=16386416;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:16:0:0:16:16:9:7:0:0:9:7:0:0 chr1 16386447 . G C 102.31 PASS AO=8;DP=12;FAO=11;FDP=11;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.25024;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.7008;QD=37.2049;RBI=0.287073;REFB=0;REVB=0.140681;RO=0;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.58669e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0283964;OID=.;OPOS=16386447;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:8:11:6:2:0:0:7:4:0:0 chr1 16388614 . AG A 482.3 PASS AO=69;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0867613;FXX=0.0112347;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.5881;QD=21.9227;RBI=0.205473;REFB=-0.0121944;REVB=0.186256;RO=12;SAF=39;SAR=30;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0.328704;SSSB=0.0650152;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0126221;OID=.;OPOS=16388615;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:69:87:88:88:0:45:43:0:0:39:12:39:30:4:8 chr1 16388646 . T C 415.43 PASS AO=66;DP=92;FAO=66;FDP=93;FR=.;FRO=27;FSAF=38;FSAR=28;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.00914386;FXX=0.0210504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.919;QD=17.868;RBI=0.0113155;REFB=-0.0285908;REVB=-0.00666563;RO=26;SAF=37;SAR=29;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0726331;STB=0.549262;TYPE=snp;VARB=0.0126942;OID=.;OPOS=16388646;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:92:93:26:27:66:66:29:37:11:15:28:38:11:16 chr1 16451767 . G A 231.77 PASS AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.354;QD=37.0829;RBI=0.0322939;REFB=0;REVB=0.0322939;RO=0;SAF=0;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000868838;OID=.;OPOS=16451767;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:25:25:0:0:25:25:25:0:0:0:25:0:0:0 chr1 16456891 . GC G 112.65 PASS AO=15;DP=22;FAO=19;FDP=22;FR=.;FRO=3;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0269572;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=17.5437;QD=20.4823;RBI=0.191398;REFB=-0.0949264;REVB=0.18949;RO=5;SAF=6;SAR=9;SRF=3;SRR=2;SSEN=0.338473;SSEP=0;SSSB=-0.0917426;STB=0.588141;TYPE=del;VARB=0.0373418;OID=.;OPOS=16456892;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:15:21:19:22:3:7:12:3:0:3:5:6:9:3:2 chr1 16464489 . C T 54.17 PASS AO=14;DP=37;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=18;FWDB=0.0284582;FXX=0.0270197;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.591;QD=6.0191;RBI=0.0419933;REFB=-0.0506963;REVB=0.0308799;RO=21;SAF=4;SAR=10;SRF=4;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128834;STB=0.583225;TYPE=snp;VARB=0.0449949;OID=.;OPOS=16464489;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:37:36:21:22:14:14:10:4:4:17:10:4:4:18 chr1 16464673 . G A 172.4 PASS AO=15;DP=16;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.179788;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=31.0365;QD=32.8374;RBI=0.181779;REFB=-0.0366807;REVB=-0.0268314;RO=1;SAF=13;SAR=2;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180145;STB=0.599885;TYPE=snp;VARB=0.00834957;OID=.;OPOS=16464673;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:21:1:1:15:20:2:13:0:1:2:18:0:1 chr1 16475123 . C T 423.68 PASS AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0507164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.907;QD=37.6604;RBI=0.0559549;REFB=0;REVB=0.0236388;RO=0;SAF=13;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000432071;OID=.;OPOS=16475123;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:45:45:0:0:45:45:32:13:0:0:32:13:0:0 chr1 16475126 . C T 412.46 PASS AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.157935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.226;QD=37.4966;RBI=0.159285;REFB=0;REVB=0.0206971;RO=0;SAF=13;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00155392;OID=.;OPOS=16475126;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:44:44:0:0:44:44:31:13:0:0:31:13:0:0 chr1 16532803 . G A 125.82 PASS AO=16;DP=22;FAO=18;FDP=23;FR=.;FRO=5;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0843348;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.9818;QD=21.8821;RBI=0.0843473;REFB=-0.123709;REVB=0.00145117;RO=6;SAF=11;SAR=5;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102299;STB=0.580911;TYPE=snp;VARB=0.0424186;OID=.;OPOS=16532803;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:22:23:6:5:16:18:5:11:3:3:5:13:2:3 chr1 16532848 . A G 146.74 PASS AO=21;DP=24;FAO=21;FDP=27;FR=.;FRO=6;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0415817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.5551;QD=21.7387;RBI=0.0978573;REFB=-0.0588388;REVB=-0.0885834;RO=3;SAF=13;SAR=8;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116317;STB=0.527649;TYPE=snp;VARB=0.012928;OID=.;OPOS=16532848;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:24:27:3:6:21:21:8:13:2:1:8:13:3:3 chr1 16533022 . C T 99.17 PASS AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.5384;QD=39.6695;RBI=0.0952463;REFB=0;REVB=0.0952463;RO=0;SAF=0;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0061456;OID=.;OPOS=16533022;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:10:0:0:0:10:0:0:0 chr1 16534255 . C G 156.87 PASS AO=28;DP=45;FAO=28;FDP=45;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=21;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.0518231;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.966;QD=13.944;RBI=0.0596179;REFB=-0.020879;REVB=-0.0294731;RO=17;SAF=7;SAR=21;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136096;STB=0.575286;TYPE=snp;VARB=0.0127151;OID=.;OPOS=16534255;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:45:45:17:17:28:28:21:7:7:10:21:7:7:10 chr1 16534646 . C G 75.49 PASS AO=20;DP=49;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=0.0252657;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.8762;QD=6.16269;RBI=0.0523766;REFB=-0.0188849;REVB=-0.0458798;RO=29;SAF=9;SAR=11;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0377983;STB=0.521718;TYPE=snp;VARB=0.0218053;OID=.;OPOS=16534646;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:49:49:29:29:20:20:11:9:12:17:11:9:12:17 chr1 16641899 . C T 400.88 PASS AO=95;DP=194;FAO=96;FDP=196;FR=.;FRO=100;FSAF=22;FSAR=74;FSRF=37;FSRR=63;FWDB=0.0301466;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.855;QD=8.18113;RBI=0.0325993;REFB=-0.00242828;REVB=0.0124056;RO=98;SAF=21;SAR=74;SRF=36;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173625;STB=0.591578;TYPE=snp;VARB=0.00365593;OID=.;OPOS=16641899;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:196:98:100:95:96:74:21:36:62:74:22:37:63 chr1 16723084 . G A 137.52 PASS AO=46;DP=138;FAO=46;FDP=127;FR=.;FRO=81;FSAF=6;FSAR=40;FSRF=11;FSRR=70;FWDB=-0.0361083;FXX=0.0863247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.4868;QD=4.33139;RBI=0.0361704;REFB=-0.00473484;REVB=0.00211829;RO=79;SAF=6;SAR=40;SRF=11;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0210687;STB=0.507459;TYPE=snp;VARB=0.00722959;OID=.;OPOS=16723084;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:127:79:81:46:46:40:6:11:68:40:6:11:70 chr1 16731510 . C G 237.57 PASS AO=64;DP=145;FAO=64;FDP=146;FR=.;FRO=82;FSAF=48;FSAR=16;FSRF=33;FSRR=49;FWDB=0.0549215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.693;QD=6.50878;RBI=0.0582398;REFB=-0.0144733;REVB=-0.0193779;RO=80;SAF=48;SAR=16;SRF=31;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.378079;STB=0.706454;TYPE=snp;VARB=0.0277404;OID=.;OPOS=16731510;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:146:80:82:64:64:16:48:31:49:16:48:33:49 chr1 16736138 . A G 40.84 PASS AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=0.0262783;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.625;QD=6.53435;RBI=0.0494178;REFB=-0.00463966;REVB=-0.0418518;RO=15;SAF=3;SAR=7;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0409094;STB=0.524224;TYPE=snp;VARB=0.0178284;OID=.;OPOS=16736138;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:25:25:15:15:10:10:7:3:4:11:7:3:4:11 chr1 16840730 . C T 136.61 PASS AO=44;DP=122;FAO=45;FDP=123;FR=.;FRO=78;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=34;FSRR=44;FWDB=0.00612923;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=274.277;QD=4.44245;RBI=0.00614095;REFB=0.0022387;REVB=-0.000379093;RO=78;SAF=18;SAR=26;SRF=34;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0307538;STB=0.523479;TYPE=snp;VARB=-0.00356413;OID=.;OPOS=16840730;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:123:78:78:44:45:26:18:34:44:27:18:34:44 chr1 16858909 . G C 1974.83 PASS AO=206;DP=206;FAO=206;FDP=206;FR=.;FRO=0;FSAF=115;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0103867;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.224;QD=38.3461;RBI=0.0196236;REFB=0;REVB=-0.0166494;RO=0;SAF=115;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.04607e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.46938e-05;OID=.;OPOS=16858909;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:206:206:0:0:206:206:91:115:0:0:91:115:0:0 chr1 16860633 . G A 70.38 PASS AO=64;DP=342;FAO=67;FDP=340;FR=.,HEALED;FRO=272;FSAF=11;FSAR=56;FSRF=104;FSRR=168;FWDB=0.0932021;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=38.2295;QD=0.827974;RBI=0.162527;REFB=-0.0259137;REVB=-0.133148;RO=206;SAF=10;SAR=54;SRF=102;SRR=104;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.478151;STB=0.723194;TYPE=snp;VARB=0.0901898;OID=.;OPOS=16860633;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:338:340:206:272:64:67:54:10:102:104:56:11:104:168 chr1 16860652 . A C 161.22 PASS AO=95;DP=362;FAO=95;FDP=361;FR=.;FRO=266;FSAF=23;FSAR=72;FSRF=102;FSRR=164;FWDB=-0.0103982;FXX=0.0136608;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.9061;QD=1.78631;RBI=0.0198927;REFB=-0.0173393;REVB=-0.0169587;RO=263;SAF=23;SAR=72;SRF=102;SRR=161;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212421;STB=0.623759;TYPE=snp;VARB=0.0502707;OID=.;OPOS=16860652;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:362:361:263:266:95:95:72:23:102:161:72:23:102:164 chr1 16861772 . A G 194.77 PASS AO=54;DP=126;FAO=54;FDP=127;FR=.;FRO=73;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=37;FSRR=36;FWDB=-0.00516622;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.003;QD=6.13456;RBI=0.0213873;REFB=0.000677355;REVB=-0.0207539;RO=72;SAF=29;SAR=25;SRF=37;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0236767;STB=0.517396;TYPE=snp;VARB=-0.000719832;OID=.;OPOS=16861772;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:127:72:73:54:54:25:29:37:35:25:29:37:36 chr1 16861804 . G A 38.63 PASS AO=24;DP=103;FAO=24;FDP=105;FR=.;FRO=81;FSAF=4;FSAR=20;FSRF=12;FSRR=69;FWDB=-0.0162142;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.724;QD=1.47172;RBI=0.0187116;REFB=-0.0035002;REVB=-0.00933927;RO=79;SAF=4;SAR=20;SRF=12;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0342929;STB=0.526606;TYPE=snp;VARB=0.0142626;OID=.;OPOS=16861804;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:103:105:79:81:24:24:20:4:12:67:20:4:12:69 chr1 16861847 . A T 39.22 PASS AO=38;DP=194;FAO=38;FDP=194;FR=.;FRO=156;FSAF=6;FSAR=32;FSRF=37;FSRR=119;FWDB=-0.00688012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.179;QD=0.808645;RBI=0.018939;REFB=-0.00216617;REVB=-0.0176451;RO=154;SAF=6;SAR=32;SRF=37;SRR=117;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165801;STB=0.60292;TYPE=snp;VARB=0.0181285;OID=.;OPOS=16861847;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:194:194:154:156:38:38:32:6:37:117:32:6:37:119 chr1 16861849 . A G 36.52 PASS AO=37;DP=193;FAO=37;FDP=193;FR=.;FRO=156;FSAF=6;FSAR=31;FSRF=37;FSRR=119;FWDB=0.0188424;FXX=0.00515437;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.388;QD=0.756898;RBI=0.0395977;REFB=-0.000757026;REVB=-0.0348273;RO=153;SAF=6;SAR=31;SRF=37;SRR=116;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158574;STB=0.596897;TYPE=snp;VARB=0.00382344;OID=.;OPOS=16861849;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:193:193:153:156:37:37:31:6:37:116:31:6:37:119 chr1 16862282 . G A 36.7 PASS AO=20;DP=83;FAO=20;FDP=83;FR=.;FRO=63;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=54;FSRR=9;FWDB=-0.046103;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.4518;QD=1.76854;RBI=0.0569087;REFB=-0.0112225;REVB=0.0333633;RO=63;SAF=12;SAR=8;SRF=54;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.378564;STB=0.721148;TYPE=snp;VARB=0.020541;OID=.;OPOS=16862282;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:83:83:63:63:20:20:8:12:54:9:8:12:54:9 chr1 16862296 . G C 29.77 PASS AO=18;DP=75;FAO=18;FDP=81;FR=.;FRO=63;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=50;FSRR=13;FWDB=-0.0856065;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.2295;QD=1.47029;RBI=0.0856092;REFB=-0.00595755;REVB=0.000673201;RO=57;SAF=13;SAR=5;SRF=47;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17612;STB=0.573695;TYPE=snp;VARB=0.0152783;OID=.;OPOS=16862296;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:75:81:57:63:18:18:5:13:47:10:5:13:50:13 chr1 16862340 . G A 53.04 PASS AO=31;DP=138;FAO=33;FDP=139;FR=.;FRO=106;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=57;FSRR=49;FWDB=-0.0430904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.852;QD=1.52629;RBI=0.0476818;REFB=-0.00703159;REVB=-0.020415;RO=106;SAF=17;SAR=14;SRF=57;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0135327;STB=0.505925;TYPE=snp;VARB=0.0167748;OID=.;OPOS=16862340;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:138:139:106:106:31:33:14:17:57:49:15:18:57:49 chr1 16862454 . T G 699.79 PASS AO=300;DP=648;FAO=183;FDP=400;FR=.;FRO=217;FSAF=84;FSAR=99;FSRF=119;FSRR=98;FWDB=-0.000450966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.124;QD=6.99792;RBI=0.00330666;REFB=-0.00414854;REVB=0.00327576;RO=339;SAF=138;SAR=162;SRF=163;SRR=176;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0201873;STB=0.548419;TYPE=snp;VARB=0.0108893;OID=.;OPOS=16862454;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:648:400:339:217:300:183:162:138:163:176:99:84:119:98 chr1 16862461 . T A 1144.1 PASS AO=335;DP=665;FAO=218;FDP=365;FR=.;FRO=147;FSAF=103;FSAR=115;FSRF=77;FSRR=70;FWDB=0.00341256;FXX=0.0874978;HRUN=6;LEN=1;MLLD=176.88;QD=12.5381;RBI=0.0167193;REFB=-0.0200454;REVB=-0.0163673;RO=139;SAF=159;SAR=176;SRF=68;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00803389;STB=0.520687;TYPE=snp;VARB=0.00599131;OID=.;OPOS=16862461;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:568:365:139:147:335:218:176:159:68:71:115:103:77:70 chr1 16862472 . G C 12.71 PASS AO=111;DP=707;FAO=53;FDP=400;FR=.;FRO=347;FSAF=19;FSAR=34;FSRF=174;FSRR=173;FWDB=-0.049192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.3699;QD=0.127073;RBI=0.0826514;REFB=-0.00796658;REVB=-0.0664184;RO=595;SAF=45;SAR=66;SRF=283;SRR=312;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0923559;STB=0.625202;TYPE=snp;VARB=0.0569701;OID=.;OPOS=16862472;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:707:400:595:347:111:53:66:45:283:312:34:19:174:173 chr1 16862502 . A G 1743.32 PASS AO=530;DP=764;FAO=280;FDP=396;FR=.;FRO=116;FSAF=117;FSAR=163;FSRF=58;FSRR=58;FWDB=-0.0384064;FXX=0.00999975;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.7065;QD=17.6093;RBI=0.0821759;REFB=0.00148144;REVB=-0.0726486;RO=232;SAF=242;SAR=288;SRF=117;SRR=115;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0273622;STB=0.524528;TYPE=snp;VARB=-0.000783717;OID=.;OPOS=16862502;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:764:396:232:116:530:280:288:242:117:115:163:117:58:58 chr1 16862566 . G A 23.79 PASS AO=122;DP=784;FAO=60;FDP=400;FR=.;FRO=340;FSAF=29;FSAR=31;FSRF=196;FSRR=144;FWDB=0.0124789;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.036;QD=0.237918;RBI=0.0190621;REFB=-0.00738638;REVB=-0.0144097;RO=661;SAF=62;SAR=60;SRF=336;SRR=325;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000161276;STB=0.578812;TYPE=snp;VARB=0.036698;OID=.;OPOS=16862566;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:784:400:661:340:122:60:60:62:336:325:31:29:196:144 chr1 16863304 . T C 43.37 PASS AO=36;DP=178;FAO=37;FDP=179;FR=.;FRO=142;FSAF=11;FSAR=26;FSRF=68;FSRR=74;FWDB=-0.000805035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.254;QD=0.969134;RBI=0.0116545;REFB=-0.00398712;REVB=-0.0116266;RO=141;SAF=10;SAR=26;SRF=68;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.273779;STB=0.651152;TYPE=snp;VARB=0.0131874;OID=.;OPOS=16863304;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:178:179:141:142:36:37:26:10:68:73:26:11:68:74 chr1 16863308 . G T 46.75 PASS AO=39;DP=183;FAO=39;FDP=185;FR=.;FRO=146;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=68;FSRR=78;FWDB=0.00627453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.906;QD=1.01081;RBI=0.0354463;REFB=-0.00617204;REVB=0.0348866;RO=144;SAF=12;SAR=27;SRF=68;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21902;STB=0.587011;TYPE=snp;VARB=0.0141611;OID=.;OPOS=16863308;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:183:185:144:146:39:39:27:12:68:76:25:14:68:78 chr1 16863314 . A G 64.47 PASS AO=41;DP=189;FAO=44;FDP=189;FR=.;FRO=145;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=69;FSRR=76;FWDB=0.00617041;FXX=0.0104707;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.053;QD=1.36446;RBI=0.0256202;REFB=-0.00367165;REVB=-0.0248661;RO=144;SAF=14;SAR=27;SRF=68;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171611;STB=0.588485;TYPE=snp;VARB=0.0145186;OID=.;OPOS=16863314;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:189:189:144:145:41:44:27:14:68:76:28:16:69:76 chr1 16863328 . T G 104.6 PASS AO=54;DP=201;FAO=55;FDP=202;FR=.;FRO=147;FSAF=18;FSAR=37;FSRF=70;FSRR=77;FWDB=-0.0145532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.928;QD=2.07133;RBI=0.0146871;REFB=-0.00889004;REVB=-0.00197882;RO=146;SAF=17;SAR=37;SRF=69;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204217;STB=0.613371;TYPE=snp;VARB=0.0304409;OID=.;OPOS=16863328;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:202:146:147:54:55:37:17:69:77:37:18:70:77 chr1 16863352 . C T 181.13 PASS AO=61;DP=197;FAO=70;FDP=211;FR=.;FRO=141;FSAF=20;FSAR=50;FSRF=66;FSRR=75;FWDB=0.0413886;FXX=0.00938923;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.4117;QD=3.43373;RBI=0.0415416;REFB=-0.0191917;REVB=-0.00356225;RO=134;SAF=20;SAR=41;SRF=65;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194299;STB=0.632313;TYPE=snp;VARB=0.033195;OID=.;OPOS=16863352;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:211:134:141:61:70:41:20:65:69:50:20:66:75 chr1 16874206 . A C 832.84 PASS AO=92;DP=93;FAO=92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=62;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0065588;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9242;QD=35.8211;RBI=0.0144489;REFB=-0.00620729;REVB=0.0128745;RO=1;SAF=30;SAR=62;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.015538;STB=0.508195;TYPE=snp;VARB=0.000649622;OID=.;OPOS=16874206;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:93:93:1:1:92:92:62:30:1:0:62:30:1:0 chr1 16890441 . C T 412.55 PASS AO=189;DP=515;FAO=146;FDP=400;FR=.;FRO=254;FSAF=74;FSAR=72;FSRF=160;FSRR=94;FWDB=-0.0112222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.192;QD=4.12546;RBI=0.0243421;REFB=-0.000804603;REVB=0.0216009;RO=321;SAF=91;SAR=98;SRF=203;SRR=118;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168166;STB=0.578323;TYPE=snp;VARB=0.00145017;OID=.;OPOS=16890441;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:515:400:321:254:189:146:98:91:203:118:72:74:160:94 chr1 16890484 . G C 485.42 PASS AO=264;DP=645;FAO=156;FDP=399;FR=.;FRO=243;FSAF=81;FSAR=75;FSRF=146;FSRR=97;FWDB=-0.00768588;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.0587;QD=4.86637;RBI=0.0304278;REFB=-0.00452608;REVB=0.0294411;RO=373;SAF=137;SAR=127;SRF=226;SRR=147;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0921364;STB=0.54995;TYPE=snp;VARB=0.00832231;OID=.;OPOS=16890484;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:645:399:373:243:264:156:127:137:226:147:75:81:146:97 chr1 16890598 . T A 1371.23 PASS AO=245;DP=381;FAO=245;FDP=381;FR=.;FRO=136;FSAF=132;FSAR=113;FSRF=84;FSRR=52;FWDB=-0.0233039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.948;QD=14.3961;RBI=0.0233072;REFB=-0.0012024;REVB=0.000390339;RO=134;SAF=132;SAR=113;SRF=82;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0486972;STB=0.528447;TYPE=snp;VARB=0.000515961;OID=.;OPOS=16890598;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:381:381:134:136:245:245:113:132:82:52:113:132:84:52 chr1 16890639 . C T 788.28 PASS AO=149;DP=244;FAO=149;FDP=244;FR=.;FRO=95;FSAF=106;FSAR=43;FSRF=57;FSRR=38;FWDB=-0.00205972;FXX=0.00408147;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.442;QD=12.9226;RBI=0.0340268;REFB=-0.00218077;REVB=-0.0339644;RO=93;SAF=106;SAR=43;SRF=55;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0990887;STB=0.550554;TYPE=snp;VARB=0.00173982;OID=.;OPOS=16890639;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:244:93:95:149:149:43:106:55:38:43:106:57:38 chr1 16890644 . C T 49.31 PASS AO=47;DP=213;FAO=47;FDP=232;FR=.;FRO=185;FSAF=30;FSAR=17;FSRF=127;FSRR=58;FWDB=0.00217826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.205;QD=0.850165;RBI=0.111439;REFB=-0.00873031;REVB=-0.111418;RO=164;SAF=29;SAR=18;SRF=125;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211484;STB=0.542572;TYPE=snp;VARB=0.0307791;OID=.;OPOS=16890644;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:213:232:164:185:47:47:18:29:125:39:17:30:127:58 chr1 16890671 . T C 748.59 PASS AO=110;DP=143;FAO=110;FDP=143;FR=.;FRO=33;FSAF=70;FSAR=40;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=-0.00114539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.162;QD=20.9396;RBI=0.0274863;REFB=-0.0125129;REVB=0.0274624;RO=32;SAF=70;SAR=40;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00518187;STB=0.507523;TYPE=snp;VARB=0.00419802;OID=.;OPOS=16890671;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:143:143:32:33:110:110:40:70:20:12:40:70:20:13 chr1 16890672 . G A 748.89 PASS AO=110;DP=143;FAO=110;FDP=143;FR=.;FRO=33;FSAF=70;FSAR=40;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=-0.0173037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.265;QD=20.948;RBI=0.018121;REFB=-0.0172506;REVB=0.00538068;RO=31;SAF=70;SAR=40;SRF=20;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00392653;STB=0.507523;TYPE=snp;VARB=0.00701397;OID=.;OPOS=16890672;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:143:143:31:33:110:110:40:70:20:11:40:70:20:13 chr1 16905718 . A C 30.76 PASS AO=10;DP=38;FAO=11;FDP=38;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=19;FSRR=8;FWDB=0.00221096;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.627;QD=3.23835;RBI=0.0154408;REFB=-0.0196144;REVB=-0.0152817;RO=28;SAF=8;SAR=2;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138665;STB=0.616203;TYPE=snp;VARB=0.0473531;OID=.;OPOS=16905718;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:38:38:28:27:10:11:2:8:20:8:2:9:19:8 chr1 16907328 . G T 1269.65 PASS AO=1239;DP=2008;FAO=242;FDP=400;FR=.;FRO=158;FSAF=132;FSAR=110;FSRF=72;FSRR=86;FWDB=0.00894903;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.858;QD=12.6965;RBI=0.0106373;REFB=0.0102282;REVB=-0.00575032;RO=764;SAF=679;SAR=560;SRF=402;SRR=362;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0156317;STB=0.535516;TYPE=snp;VARB=-0.00542183;OID=.;OPOS=16907328;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:2008:400:764:158:1239:242:560:679:402:362:110:132:72:86 chr1 16909052 . C T 1672.96 PASS AO=133;DP=192;FAO=174;FDP=174;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=103;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0577485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.242;QD=38.4589;RBI=0.081008;REFB=0;REVB=0.0568103;RO=0;SAF=62;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.78083e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000193141;OID=.;OPOS=16909052;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:172:174:0:0:133:174:71:62:0:0:71:103:0:0 chr1 16909100 . G C 115.53 PASS AO=27;DP=57;FAO=27;FDP=57;FR=.;FRO=30;FSAF=5;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.0223264;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.568;QD=8.10741;RBI=0.0223487;REFB=0.00668257;REVB=-0.000996883;RO=30;SAF=5;SAR=22;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.357609;STB=0.70383;TYPE=snp;VARB=-0.00595444;OID=.;OPOS=16909100;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:30:30:27:27:22:5:15:15:22:5:15:15 chr1 16909129 . T C 31.01 PASS AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0309976;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.956;QD=13.7802;RBI=0.031429;REFB=-0.0232494;REVB=0.00518909;RO=4;SAF=2;SAR=3;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118169;STB=0.571155;TYPE=snp;VARB=0.0102454;OID=.;OPOS=16909129;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:9:9:4:4:5:5:3:2:1:3:3:2:1:3 chr1 16912014 . A C 141.22 PASS AO=28;DP=41;FAO=25;FDP=41;FR=.;FRO=16;FSAF=24;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.00242081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.266;QD=13.7774;RBI=0.0268424;REFB=-0.0100292;REVB=-0.0267331;RO=12;SAF=25;SAR=3;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.422017;STB=0.885178;TYPE=snp;VARB=0.0076943;OID=.;OPOS=16912014;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:41:41:12:16:28:25:3:25:5:7:1:24:7:9 chr1 16918502 . A G 293.85 PASS AO=142;DP=481;FAO=128;FDP=399;FR=.;FRO=271;FSAF=62;FSAR=66;FSRF=132;FSRR=139;FWDB=0.0262423;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.874;QD=2.94583;RBI=0.0306436;REFB=-0.00727154;REVB=0.0158231;RO=335;SAF=73;SAR=69;SRF=161;SRR=174;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0405855;STB=0.501842;TYPE=snp;VARB=0.0186714;OID=.;OPOS=16918502;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:481:399:335:271:142:128:69:73:161:174:66:62:132:139 chr1 17004770 . G T 531.47 PASS AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.014381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.39;QD=37.9624;RBI=0.0306325;REFB=0;REVB=-0.0270469;RO=0;SAF=30;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.29784e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000247729;OID=.;OPOS=17004770;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:56:56:0:0:56:56:26:30:0:0:26:30:0:0 chr1 17004850 . C A 376.9 PASS AO=42;DP=47;FAO=45;FDP=50;FR=.;FRO=5;FSAF=13;FSAR=32;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0619252;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=44.0537;QD=30.1521;RBI=0.0896989;REFB=-0.107263;REVB=-0.0648934;RO=5;SAF=13;SAR=29;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108807;STB=0.559068;TYPE=snp;VARB=0.00898362;OID=.;OPOS=17004850;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:47:50:5:5:42:45:29:13:4:1:32:13:4:1 chr1 17022952 . C A 447.67 PASS AO=47;DP=48;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0308828;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.8925;QD=36.5441;RBI=0.0356985;REFB=-0.167466;REVB=0.0179064;RO=0;SAF=21;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511623;TYPE=snp;VARB=0.00373198;OID=.;OPOS=17022952;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:48:49:0:1:47:48:26:21:0:0:27:21:1:0 chr1 17023376 . C T 39.13 PASS AO=19;DP=74;FAO=19;FDP=74;FR=.;FRO=55;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=49;FWDB=-0.0135585;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.29;QD=2.1152;RBI=0.0387328;REFB=-0.0132122;REVB=0.0362821;RO=55;SAF=7;SAR=12;SRF=6;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.403046;STB=0.732247;TYPE=snp;VARB=0.0368019;OID=.;OPOS=17023376;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:74:74:55:55:19:19:12:7:6:49:12:7:6:49 chr1 17023403 . G A 60.82 PASS AO=21;DP=67;FAO=21;FDP=64;FR=.;FRO=43;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=38;FWDB=0.0087049;FXX=0.0447694;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.1862;QD=3.8011;RBI=0.0359838;REFB=-0.0118042;REVB=0.034915;RO=43;SAF=7;SAR=14;SRF=5;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.324289;STB=0.684075;TYPE=snp;VARB=0.0385328;OID=.;OPOS=17023403;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:67:64:43:43:21:21:14:7:5:38:14:7:5:38 chr1 17026087 . G A 21.5 PASS AO=6;DP=20;FAO=6;FDP=20;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=13;FSRR=1;FWDB=0.0103077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.065;QD=4.29963;RBI=0.0391783;REFB=-0.000770644;REVB=0.037798;RO=14;SAF=5;SAR=1;SRF=13;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235288;STB=0.642486;TYPE=snp;VARB=0.00972783;OID=.;OPOS=17026087;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:20:20:14:14:6:6:1:5:13:1:1:5:13:1 chr1 17029257 . T C 404.67 PASS AO=80;DP=139;FAO=80;FDP=139;FR=.;FRO=59;FSAF=16;FSAR=64;FSRF=12;FSRR=47;FWDB=0.0255683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.841;QD=11.6452;RBI=0.0438032;REFB=-0.0313744;REVB=-0.0355665;RO=59;SAF=16;SAR=64;SRF=12;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00411625;STB=0.502242;TYPE=snp;VARB=0.0233204;OID=.;OPOS=17029257;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:59:59:80:80:64:16:12:47:64:16:12:47 chr1 17029358 . T G 10.22 PASS AO=3;DP=9;FAO=2;FDP=9;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=0.0114394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=333.674;QD=4.5413;RBI=0.0114394;REFB=0.000434115;REVB=0;RO=5;SAF=3;SAR=0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0012109;OID=.;OPOS=17029358;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:5:7:3:2:0:3:5:0:0:2:7:0 chr1 17029462 . A G 14.55 PASS AO=23;DP=145;FAO=23;FDP=150;FR=.;FRO=127;FSAF=19;FSAR=4;FSRF=67;FSRR=60;FWDB=-0.105869;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.3076;QD=0.388119;RBI=0.213549;REFB=-0.00682483;REVB=-0.185459;RO=122;SAF=19;SAR=4;SRF=67;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.391752;STB=0.779225;TYPE=snp;VARB=0.0229296;OID=.;OPOS=17029462;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:145:150:122:127:23:23:4:19:67:55:4:19:67:60 chr1 17033854 . C T 10.83 PASS AO=12;DP=78;FAO=12;FDP=78;FR=.;FRO=66;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=47;FWDB=0.0145224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.405;QD=0.555306;RBI=0.0303887;REFB=-0.00686846;REVB=-0.0266941;RO=66;SAF=3;SAR=9;SRF=19;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0595813;STB=0.540913;TYPE=snp;VARB=0.0340311;OID=.;OPOS=17033854;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:78:78:66:66:12:12:9:3:19:47:9:3:19:47 chr1 17046456 . T C 17.43 PASS AO=31;DP=201;FAO=31;FDP=201;FR=.;FRO=170;FSAF=2;FSAR=29;FSRF=66;FSRR=104;FWDB=0.00343561;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.3977;QD=0.34686;RBI=0.0786619;REFB=-0.000926765;REVB=-0.0785869;RO=169;SAF=2;SAR=29;SRF=66;SRR=103;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.54647;STB=0.880838;TYPE=snp;VARB=0.00814823;OID=.;OPOS=17046456;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:201:201:169:170:31:31:29:2:66:103:29:2:66:104 chr1 17052075 . G C 76.22 PASS AO=224;DP=1220;FAO=80;FDP=399;FR=.;FRO=319;FSAF=35;FSAR=45;FSRF=143;FSRR=176;FWDB=-0.00856964;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.743;QD=0.764152;RBI=0.0158182;REFB=-0.00594254;REVB=0.0132957;RO=983;SAF=100;SAR=124;SRF=439;SRR=544;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00021574;STB=0.508731;TYPE=snp;VARB=0.024612;OID=.;OPOS=17052075;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:1220:399:983:319:224:80:124:100:439:544:45:35:143:176 chr1 17053766 . G A 2267.3 PASS AO=291;DP=340;FAO=291;FDP=336;FR=.;FRO=45;FSAF=140;FSAR=151;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=0.00360146;FXX=0.0146623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.401;QD=26.9917;RBI=0.00436923;REFB=0.0580783;REVB=0.00247379;RO=45;SAF=140;SAR=151;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00366919;STB=0.501936;TYPE=snp;VARB=-0.00416622;OID=.;OPOS=17053766;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:340:336:45:45:291:291:151:140:21:24:151:140:21:24 chr1 17053782 . C G 1257.66 PASS AO=205;DP=377;FAO=207;FDP=298;FR=.;FRO=91;FSAF=85;FSAR=122;FSRF=38;FSRR=53;FWDB=0.0464629;FXX=0.209544;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.1516;QD=16.8813;RBI=0.0466713;REFB=-0.0360709;REVB=-0.0044059;RO=85;SAF=83;SAR=122;SRF=35;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00391744;STB=0.502192;TYPE=snp;VARB=0.0225356;OID=.;OPOS=17053782;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:377:298:85:91:205:207:122:83:35:50:122:85:38:53 chr1 17053826 . C T 633.31 PASS AO=153;DP=313;FAO=153;FDP=312;FR=.;FRO=159;FSAF=41;FSAR=112;FSRF=46;FSRR=113;FWDB=-0.00465891;FXX=0.00319479;HRUN=3;LEN=1;MLLD=232.023;QD=8.11939;RBI=0.0111294;REFB=0.00388474;REVB=-0.0101073;RO=158;SAF=41;SAR=112;SRF=46;SRR=112;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0269197;STB=0.513678;TYPE=snp;VARB=-0.003364;OID=.;OPOS=17053826;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:313:312:158:159:153:153:112:41:46:112:112:41:46:113 chr1 17053834 . A AC 284.31 PASS AO=128;DP=305;FAO=128;FDP=300;FR=.;FRO=172;FSAF=32;FSAR=96;FSRF=47;FSRR=125;FWDB=0.00718478;FXX=0.0131575;HRUN=0;LEN=1;MLLD=265.226;QD=3.79076;RBI=0.0225405;REFB=0.00220681;REVB=-0.0213647;RO=174;SAF=32;SAR=96;SRF=49;SRR=125;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0424794;STB=0.517464;TYPE=ins;VARB=-0.00172619;OID=.;OPOS=17053835;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:128:305:128:300:172:32:96:47:125:99:174:32:96:49:125 chr1 17053861 . C T 759.8 PASS AO=146;DP=269;FAO=161;FDP=284;FR=.;FRO=123;FSAF=34;FSAR=127;FSRF=34;FSRR=89;FWDB=-0.00638397;FXX=0.00350865;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.822;QD=10.7014;RBI=0.0248461;REFB=-0.000867328;REVB=0.0240119;RO=122;SAF=32;SAR=114;SRF=34;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0693641;STB=0.54042;TYPE=snp;VARB=0.00189217;OID=.;OPOS=17053861;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:269:284:122:123:146:161:114:32:34:88:127:34:34:89 chr1 17083778 . C T 19.23 PASS AO=17;DP=94;FAO=17;FDP=93;FR=.;FRO=76;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=57;FSRR=19;FWDB=0.0214339;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.0176;QD=0.827185;RBI=0.0236161;REFB=-0.00903919;REVB=-0.00991499;RO=75;SAF=9;SAR=8;SRF=56;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.290519;STB=0.684641;TYPE=snp;VARB=0.0347535;OID=.;OPOS=17083778;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:94:93:75:76:17:17:8:9:56:19:8:9:57:19 chr1 17083872 . G A 252.86 PASS AO=36;DP=46;FAO=36;FDP=46;FR=.;FRO=10;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0224338;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=73.9828;QD=21.9881;RBI=0.0230712;REFB=-0.010348;REVB=0.00538579;RO=10;SAF=20;SAR=16;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102865;STB=0.555525;TYPE=snp;VARB=0.00264696;OID=.;OPOS=17083872;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:46:46:10:10:36:36:16:20:3:7:16:20:3:7 chr1 17084021 . C G 20.72 PASS AO=5;DP=21;FAO=6;FDP=21;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=14;FWDB=0.0898116;FXX=0.0454339;HRUN=5;LEN=1;MLLD=33.7107;QD=3.94679;RBI=0.100186;REFB=-0.00820302;REVB=0.0443961;RO=16;SAF=2;SAR=3;SRF=1;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.501657;STB=0.808885;TYPE=snp;VARB=0.0347362;OID=.;OPOS=17084021;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:21:21:16:15:5:6:3:2:1:15:3:3:1:14 chr1 17084968 . G C 199.13 PASS AO=45;DP=103;FAO=50;FDP=108;FR=.;FRO=58;FSAF=32;FSAR=18;FSRF=43;FSRR=15;FWDB=0.00124249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.374;QD=7.37531;RBI=0.0125311;REFB=-0.0214536;REVB=0.0124693;RO=56;SAF=27;SAR=18;SRF=43;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181611;STB=0.561074;TYPE=snp;VARB=0.0245702;OID=.;OPOS=17084968;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:108:56:58:45:50:18:27:43:13:18:32:43:15 chr1 17085006 . C T 66.88 PASS AO=39;DP=151;FAO=38;FDP=150;FR=.;FRO=112;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=71;FSRR=41;FWDB=0.00591465;FXX=0.00662208;HRUN=5;LEN=1;MLLD=238.951;QD=1.78336;RBI=0.0115221;REFB=-0.00870266;REVB=0.00988816;RO=111;SAF=23;SAR=16;SRF=70;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0530159;STB=0.522598;TYPE=snp;VARB=0.0251748;OID=.;OPOS=17085006;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:151:150:111:112:39:38:16:23:70:41:15:23:71:41 chr1 17085165 . G C 807.81 PASS AO=90;DP=97;FAO=95;FDP=97;FR=.;FRO=2;FSAF=67;FSAR=28;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0284398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.9588;QD=33.3119;RBI=0.0364677;REFB=-0.162686;REVB=-0.0228269;RO=6;SAF=62;SAR=28;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0436901;STB=0.507351;TYPE=snp;VARB=0.00324049;OID=.;OPOS=17085165;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:97:97:6:2:90:95:28:62:6:0:28:67:2:0 chr1 17085412 . C T 51.97 PASS AO=31;DP=128;FAO=31;FDP=128;FR=.;FRO=97;FSAF=6;FSAR=25;FSRF=37;FSRR=60;FWDB=0.0901775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.5;QD=1.62398;RBI=0.0915791;REFB=-0.0155735;REVB=0.015961;RO=97;SAF=6;SAR=25;SRF=37;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.287706;STB=0.678105;TYPE=snp;VARB=0.0420688;OID=.;OPOS=17085412;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:128:128:97:97:31:31:25:6:37:60:25:6:37:60 chr1 17085427 . T C 355.38 PASS AO=68;DP=116;FAO=68;FDP=115;FR=.;FRO=47;FSAF=22;FSAR=46;FSRF=13;FSRR=34;FWDB=-0.0375111;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9552;QD=12.3611;RBI=0.0378537;REFB=-0.0410642;REVB=0.00508168;RO=47;SAF=22;SAR=46;SRF=13;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.040937;STB=0.522249;TYPE=snp;VARB=0.0319123;OID=.;OPOS=17085427;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:115:47:47:68:68:46:22:13:34:46:22:13:34 chr1 17085502 . T C 380.21 PASS AO=39;DP=42;FAO=44;FDP=47;FR=.;FRO=3;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0925046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.935;QD=32.3585;RBI=0.0927617;REFB=-0.0579096;REVB=-0.00690125;RO=3;SAF=11;SAR=28;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111937;STB=0.545433;TYPE=snp;VARB=0.000559557;OID=.;OPOS=17085502;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:42:47:3:3:39:44:28:11:3:0:29:15:3:0 chr1 17085834 . G T 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0417863;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=237.106;QD=33.022;RBI=0.0467632;REFB=0;REVB=0.020993;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00132425;OID=.;OPOS=17085834;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:5:1:0:0:5:1:0:0 chr1 17086941 . C T 23.55 PASS AO=22;DP=122;FAO=22;FDP=122;FR=.;FRO=100;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=50;FSRR=50;FWDB=0.00254983;FXX=0.0542594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.869;QD=0.772221;RBI=0.0147597;REFB=-0.00197611;REVB=-0.0145378;RO=92;SAF=13;SAR=9;SRF=48;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0887171;STB=0.574894;TYPE=snp;VARB=0.00880698;OID=.;OPOS=17086941;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:122:122:92:100:22:22:9:13:48:44:9:13:50:50 chr1 17087072 . G A 241.03 PASS AO=113;DP=383;FAO=115;FDP=383;FR=.;FRO=268;FSAF=57;FSAR=58;FSRF=116;FSRR=152;FWDB=0.0211086;FXX=0.0026041;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.124;QD=2.51732;RBI=0.029906;REFB=0.00224404;REVB=0.0211848;RO=264;SAF=55;SAR=58;SRF=114;SRR=150;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0666097;STB=0.543984;TYPE=snp;VARB=-0.00645834;OID=.;OPOS=17087072;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:383:383:264:268:113:115:58:55:114:150:58:57:116:152 chr1 17087133 . C T 34.74 PASS AO=45;DP=247;FAO=46;FDP=260;FR=.;FRO=214;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=85;FSRR=129;FWDB=0.0342476;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=91.8342;QD=0.53448;RBI=0.0528835;REFB=-0.0119819;REVB=-0.040296;RO=202;SAF=18;SAR=27;SRF=82;SRR=120;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00796455;STB=0.513508;TYPE=snp;VARB=0.0841949;OID=.;OPOS=17087133;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:247:260:202:214:45:46:27:18:82:120:27:19:85:129 chr1 17087262 . C T 113.79 PASS AO=39;DP=111;FAO=39;FDP=111;FR=.;FRO=72;FSAF=5;FSAR=34;FSRF=17;FSRR=55;FWDB=0.0609785;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.972;QD=4.10046;RBI=0.108845;REFB=0.0252561;REVB=0.0901599;RO=72;SAF=5;SAR=34;SRF=17;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216477;STB=0.626916;TYPE=snp;VARB=-0.0467202;OID=.;OPOS=17087262;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:72:72:39:39:34:5:17:55:34:5:17:55 chr1 17087365 . C G 480.21 PASS AO=57;DP=72;FAO=66;FDP=81;FR=.;FRO=15;FSAF=28;FSAR=38;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.0394547;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.926;QD=23.7143;RBI=0.0400367;REFB=-0.0688805;REVB=0.00680156;RO=14;SAF=28;SAR=29;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0558138;STB=0.545303;TYPE=snp;VARB=0.0187471;OID=.;OPOS=17087365;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:72:81:14:15:57:66:29:28:9:5:38:28:10:5 chr1 17087459 . A G 108.06 PASS AO=40;DP=120;FAO=40;FDP=120;FR=.;FRO=80;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=47;FSRR=33;FWDB=0.0160117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.681;QD=3.60209;RBI=0.0226218;REFB=-0.00250077;REVB=-0.0159804;RO=76;SAF=22;SAR=18;SRF=47;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0795011;STB=0.525368;TYPE=snp;VARB=0.00971655;OID=.;OPOS=17087459;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:76:80:40:40:18:22:47:29:18:22:47:33 chr1 17087521 . G A 57.5 PASS AO=22;DP=76;FAO=24;FDP=82;FR=.;FRO=58;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=36;FSRR=22;FWDB=-0.0267134;FXX=0.088879;HRUN=3;LEN=1;MLLD=78.7803;QD=2.80479;RBI=0.0457121;REFB=-0.0173189;REVB=-0.0370944;RO=42;SAF=12;SAR=10;SRF=34;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.316035;STB=0.556772;TYPE=snp;VARB=0.045821;OID=.;OPOS=17087521;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:76:82:42:58:22:24:10:12:34:8:11:13:36:22 chr1 17087582 . G A 36.24 PASS AO=22;DP=100;FAO=24;FDP=108;FR=.;FRO=84;FSAF=19;FSAR=5;FSRF=34;FSRR=50;FWDB=0.0110589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.851;QD=1.34209;RBI=0.0128275;REFB=-0.00180135;REVB=-0.0064997;RO=77;SAF=18;SAR=4;SRF=34;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.48471;STB=0.797465;TYPE=snp;VARB=0.0124347;OID=.;OPOS=17087582;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:100:108:77:84:22:24:4:18:34:43:5:19:34:50 chr1 17186685 . T C 66.7 PASS AO=92;DP=477;FAO=77;FDP=400;FR=.;FRO=323;FSAF=34;FSAR=43;FSRF=155;FSRR=168;FWDB=-0.0131777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.3856;QD=0.667004;RBI=0.0207618;REFB=-0.00937628;REVB=0.0160437;RO=381;SAF=41;SAR=51;SRF=181;SRR=200;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0383662;STB=0.531134;TYPE=snp;VARB=0.0460405;OID=.;OPOS=17186685;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:477:400:381:323:92:77:51:41:181:200:43:34:155:168 chr1 17186719 . T G 202.38 PASS AO=141;DP=506;FAO=110;FDP=399;FR=.;FRO=289;FSAF=44;FSAR=66;FSRF=130;FSRR=159;FWDB=-0.00562577;FXX=0.00249994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.6858;QD=2.02886;RBI=0.0339394;REFB=0.0103087;REVB=0.0334699;RO=365;SAF=59;SAR=82;SRF=164;SRR=201;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0388265;STB=0.53703;TYPE=snp;VARB=-0.027923;OID=.;OPOS=17186719;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:506:399:365:289:141:110:82:59:164:201:66:44:130:159 chr1 17197563 . G T 85.46 PASS AO=47;DP=178;FAO=47;FDP=178;FR=.;FRO=131;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=70;FSRR=61;FWDB=0.0298739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.8578;QD=1.92055;RBI=0.0300115;REFB=-0.0178466;REVB=0.0028705;RO=126;SAF=27;SAR=20;SRF=68;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0433711;STB=0.529912;TYPE=snp;VARB=0.0624169;OID=.;OPOS=17197563;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:178:178:126:131:47:47:20:27:68:58:20:27:70:61 chr1 17199074 . T C 66.89 PASS AO=19;DP=50;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=26;FSRR=5;FWDB=-0.0147972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.615;QD=5.35081;RBI=0.0176314;REFB=-0.00681841;REVB=0.00958688;RO=31;SAF=11;SAR=8;SRF=26;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.307185;STB=0.674107;TYPE=snp;VARB=0.0156908;OID=.;OPOS=17199074;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:50:50:31:31:19:19:8:11:26:5:8:11:26:5 chr1 17199076 . T A 66.9 PASS AO=19;DP=50;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=26;FSRR=5;FWDB=-0.0139629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.535;QD=5.3522;RBI=0.0147729;REFB=-0.0175082;REVB=-0.00482479;RO=27;SAF=11;SAR=8;SRF=22;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.26257;STB=0.674107;TYPE=snp;VARB=0.0173131;OID=.;OPOS=17199076;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:50:50:27:31:19:19:8:11:22:5:8:11:26:5 chr1 17200206 . C CT 119.74 PASS AO=144;DP=580;FAO=118;FDP=394;FR=.;FRO=276;FSAF=68;FSAR=50;FSRF=162;FSRR=114;FWDB=0.0414422;FXX=0.0149996;HRUN=2;LEN=1;MLLD=20.2707;QD=1.21565;RBI=0.0892163;REFB=-0.0215354;REVB=0.0790069;RO=415;SAF=90;SAR=54;SRF=244;SRR=171;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0488318;STB=0.50768;TYPE=ins;VARB=0.0430643;OID=.;OPOS=17200207;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:144:580:118:394:276:68:50:162:114:99:415:90:54:244:171 chr1 17200217 . G A 36.83 PASS AO=106;DP=624;FAO=66;FDP=400;FR=.;FRO=334;FSAF=37;FSAR=29;FSRF=193;FSRR=141;FWDB=-0.0168456;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.2493;QD=0.368322;RBI=0.0271247;REFB=-0.00920703;REVB=0.0212597;RO=518;SAF=58;SAR=48;SRF=301;SRR=217;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0448654;STB=0.514656;TYPE=snp;VARB=0.0522114;OID=.;OPOS=17200217;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:624:400:518:334:106:66:48:58:301:217:29:37:193:141 chr1 17200270 . T G 1491.82 PASS AO=722;DP=1089;FAO=261;FDP=399;FR=.;FRO=138;FSAF=154;FSAR=107;FSRF=79;FSRR=59;FWDB=-0.00249047;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.704;QD=14.9556;RBI=0.0538352;REFB=-0.0652332;REVB=0.0537775;RO=359;SAF=415;SAR=307;SRF=187;SRR=172;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0340546;STB=0.506267;TYPE=snp;VARB=0.031045;OID=.;OPOS=17200270;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:1089:399:359:138:722:261:307:415:187:172:107:154:79:59 chr1 17200289 . C T 1194.53 PASS AO=626;DP=1117;FAO=234;FDP=398;FR=.;FRO=164;FSAF=140;FSAR=94;FSRF=88;FSRR=76;FWDB=0.00350635;FXX=0.00499988;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.3129;QD=12.0053;RBI=0.157443;REFB=-0.0697834;REVB=0.157404;RO=490;SAF=401;SAR=225;SRF=232;SRR=258;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140682;STB=0.526174;TYPE=snp;VARB=0.0445834;OID=.;OPOS=17200289;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:1117:398:490:164:626:234:225:401:232:258:94:140:88:76 chr1 17248531 . GA G,GG 84.63 PASS AO=2,6;DP=9;FAO=2,7;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=1,6;FSAR=1,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0356237,0.0274063;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=192.884,201.365;QD=37.6115;RBI=0.0531878,0.0482869;REFB=0,0;REVB=0.0394954,0.0397558;RO=0;SAF=1,5;SAR=1,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.18042e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.00679498,0.00283194;OID=.,.;OPOS=17248532,17248532;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:2,6:8:2,7:9:0:1,6:1,1:0:0:10:0:1,5:1,1:0:0 chr1 17250836 . A G 30.37 PASS AO=8;DP=25;FAO=9;FDP=26;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=-0.0411095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.79;QD=4.67165;RBI=0.0450008;REFB=-0.0183492;REVB=-0.0183052;RO=17;SAF=4;SAR=4;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22957;STB=0.601558;TYPE=snp;VARB=0.0419861;OID=.;OPOS=17250836;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:25:26:17:17:8:9:4:4:5:12:5:4:5:12 chr1 17264920 . C T 178.88 PASS AO=43;DP=92;FAO=43;FDP=91;FR=.;FRO=48;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=0.0181925;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.6028;QD=7.86285;RBI=0.019351;REFB=-0.0450627;REVB=-0.00659522;RO=48;SAF=25;SAR=18;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.097532;STB=0.554384;TYPE=snp;VARB=0.0248004;OID=.;OPOS=17264920;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:91:48:48:43:43:18:25:23:25:18:25:23:25 chr1 17264939 . T C 178.37 PASS AO=42;DP=87;FAO=42;FDP=87;FR=.;FRO=45;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=-0.00224653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.982;QD=8.20073;RBI=0.0198736;REFB=-0.0198656;REVB=-0.0197462;RO=43;SAF=26;SAR=16;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183911;STB=0.591521;TYPE=snp;VARB=0.0176206;OID=.;OPOS=17264939;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:43:45:42:42:16:26:18:25:16:26:20:25 chr1 17267302 . A G 140.42 PASS AO=32;DP=65;FAO=32;FDP=65;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=9;FWDB=-0.00459879;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.859;QD=8.64137;RBI=0.0265627;REFB=-0.0429716;REVB=0.0261615;RO=32;SAF=18;SAR=14;SRF=23;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145798;STB=0.586775;TYPE=snp;VARB=0.0345299;OID=.;OPOS=17267302;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:32:33:32:32:14:18:23:9:14:18:24:9 chr1 17272844 . GC G 23.19 PASS AO=17;DP=48;FAO=16;FDP=49;FR=.;FRO=33;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=0.0349423;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=18.4075;QD=1.89305;RBI=0.232759;REFB=-0.0350086;REVB=-0.230121;RO=30;SAF=2;SAR=15;SRF=16;SRR=14;SSEN=0.327103;SSEP=0;SSSB=-0.539263;STB=0.802109;TYPE=del;VARB=0.0414709;OID=.;OPOS=17272845;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:17:49:16:49:33:2:14:16:17:23:30:2:15:16:14 chr1 17295679 . T C 364.21 PASS AO=35;DP=35;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00846684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.273;QD=38.3378;RBI=0.108864;REFB=0;REVB=0.108534;RO=0;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00041778;OID=.;OPOS=17295679;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:35:38:0:0:35:38:15:20:0:0:18:20:0:0 chr1 17296882 . G A 1835.18 PASS AO=198;DP=202;FAO=199;FDP=199;FR=.;FRO=0;FSAF=111;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00313081;FXX=0.0197035;HRUN=3;LEN=1;MLLD=216.404;QD=36.888;RBI=0.0384183;REFB=-0.05444;REVB=0.0382905;RO=4;SAF=110;SAR=88;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00742887;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.452e-05;OID=.;OPOS=17296882;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:202:199:4:0:198:199:88:110:3:1:88:111:0:0 chr1 17301780 . A G 266.96 PASS AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00746908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.827;QD=38.1366;RBI=0.0195282;REFB=0;REVB=0.0180433;RO=0;SAF=16;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.09828e-05;OID=.;OPOS=17301780;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:28:28:0:0:28:28:12:16:0:0:12:16:0:0 chr1 17312743 . C T 195.71 PASS AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0384576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.101;QD=39.1418;RBI=0.0402158;REFB=0;REVB=0.011761;RO=0;SAF=1;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97126e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00163205;OID=.;OPOS=17312743;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:20:20:0:0:20:20:19:1:0:0:19:1:0:0 chr1 17313343 . G A 210.67 PASS AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0471378;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.6453;QD=36.6381;RBI=0.0612194;REFB=0;REVB=0.039062;RO=0;SAF=4;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00251365;OID=.;OPOS=17313343;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:0:0:23:23:19:4:0:0:19:4:0:0 chr1 17314942 . G A 613.76 PASS AO=66;DP=66;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105269;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1978;QD=37.7698;RBI=0.0544241;REFB=0;REVB=0.0533963;RO=0;SAF=21;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.47552e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000612958;OID=.;OPOS=17314942;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:66:65:0:0:66:65:45:21:0:0:44:21:0:0 chr1 17319011 . G A 86.45 PASS AO=12;DP=15;FAO=12;FDP=15;FR=.;FRO=3;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0435597;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=181.272;QD=23.0546;RBI=0.0441717;REFB=0.0906877;REVB=-0.00732705;RO=3;SAF=10;SAR=2;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0986653;STB=0.555456;TYPE=snp;VARB=-0.00220702;OID=.;OPOS=17319011;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:15:15:3:3:12:12:2:10:2:1:2:10:2:1 chr1 17319012 . G A 10.23 PASS AO=3;DP=15;FAO=3;FDP=15;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=10;FSRR=2;FWDB=-0.0329668;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=66.0081;QD=2.72743;RBI=0.0641005;REFB=-0.0643613;REVB=0.0549733;RO=12;SAF=2;SAR=1;SRF=10;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.241822;STB=0.665776;TYPE=snp;VARB=0.0266458;OID=.;OPOS=17319012;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:15:15:12:12:3:3:1:2:10:2:1:2:10:2 chr1 17331578 . G C 15.77 PASS AO=3;DP=7;FAO=3;FDP=7;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=38.1143;QD=9.01303;RBI=0.0246979;REFB=-0.00115307;REVB=0.0246979;RO=4;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00677058;OID=.;OPOS=17331578;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:7:7:4:4:3:3:3:0:0:4:3:0:0:4 chr1 17380497 . G T 312.86 PASS AO=34;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0625562;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=181.46;QD=34.7616;RBI=0.0625587;REFB=-0.162245;REVB=-0.000560369;RO=0;SAF=26;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.529394;TYPE=snp;VARB=0.00183999;OID=.;OPOS=17380497;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:36:36:0:1:34:35:8:26:0:0:8:27:0:1 chr1 17394613 . T C 1257.49 PASS AO=131;DP=131;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0122757;FXX=0.00751823;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.117;QD=38.1057;RBI=0.0166072;REFB=0;REVB=0.011185;RO=0;SAF=62;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=9.83631e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.88179e-05;OID=.;OPOS=17394613;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:131:132:0:0:131:132:69:62:0:0:70:62:0:0 chr1 17394623 . C T 1257.56 PASS AO=132;DP=133;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00346343;FXX=0.00751823;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.6565;QD=38.108;RBI=0.0115224;REFB=0;REVB=0.0109896;RO=0;SAF=62;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84852e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.35488e-05;OID=.;OPOS=17394623;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:133:132:0:0:132:132:70:62:0:0:70:62:0:0 chr1 17395480 . G A 901.26 PASS AO=98;DP=101;FAO=98;FDP=100;FR=.;FRO=2;FSAF=74;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0123312;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.7876;QD=36.0503;RBI=0.0139465;REFB=0.0407982;REVB=-0.00651506;RO=1;SAF=74;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00636752;STB=0.506848;TYPE=snp;VARB=-0.000125577;OID=.;OPOS=17395480;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:101:100:1:2:98:98:24:74:1:0:24:74:1:1 chr1 17395521 . G A 959.06 PASS AO=105;DP=108;FAO=105;FDP=108;FR=.;FRO=3;FSAF=70;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.000589563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.469;QD=35.5206;RBI=0.132201;REFB=0.0421891;REVB=0.132199;RO=1;SAF=70;SAR=35;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0133646;STB=0.510343;TYPE=snp;VARB=-0.000302017;OID=.;OPOS=17395521;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:108:108:1:3:105:105:35:70:0:1:35:70:1:2 chr1 17396703 . T C 735.97 PASS AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0154381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.331;QD=38.2322;RBI=0.0186269;REFB=0;REVB=-0.0104224;RO=0;SAF=24;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.08692e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.90158e-05;OID=.;OPOS=17396703;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:77:77:0:0:77:77:53:24:0:0:53:24:0:0 chr1 17402255 . C T 463.97 PASS AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.101165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.489;QD=35.69;RBI=0.101219;REFB=-0.0515817;REVB=0.00328833;RO=0;SAF=7;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505616;TYPE=snp;VARB=0.000355006;OID=.;OPOS=17402255;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:52:52:0:1:51:51:44:7:0:0:44:7:0:1 chr1 17405809 . G A 639.75 PASS AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.472;QD=38.1942;RBI=0.0226087;REFB=0;REVB=0.0141113;RO=0;SAF=35;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.62221e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.93236e-05;OID=.;OPOS=17405809;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:67:67:0:0:67:67:32:35:0:0:32:35:0:0 chr1 17419024 . G A 603.04 PASS AO=63;DP=64;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0141093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1809;QD=36.5478;RBI=0.0944382;REFB=-0.0855183;REVB=0.0933782;RO=0;SAF=39;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51964e-08;STB=0.509431;TYPE=snp;VARB=0.00223555;OID=.;OPOS=17419024;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:64:66:0:1:63:65:24:39:0:0:26:39:0:1 chr1 17557133 . A C 177.6 PASS AO=26;DP=94;FAO=39;FDP=93;FR=.,HEALED;FRO=49;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=12;FSRR=37;FWDB=-0.00100091;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.813;QD=7.63853;RBI=0.00497284;REFB=-0.00473887;REVB=-0.00487106;RO=46;SAF=3;SAR=23;SRF=11;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.2517;STB=0.57177;TYPE=snp;VARB=0.0107809;OID=.;OPOS=17557133;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:46:49:26:39:23:3:11:35:25:14:12:37 chr1 17597655 . C T 132.91 PASS AO=34;DP=77;FAO=34;FDP=77;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=26;FWDB=-0.00083447;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.077;QD=6.90421;RBI=0.0072721;REFB=-0.00828797;REVB=-0.00722407;RO=41;SAF=13;SAR=21;SRF=16;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0081063;STB=0.507651;TYPE=snp;VARB=0.00971249;OID=.;OPOS=17597655;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:41:43:34:34:21:13:16:25:21:13:17:26 chr1 17601165 . C T 223.61 PASS AO=55;DP=117;FAO=55;FDP=117;FR=.;FRO=62;FSAF=21;FSAR=34;FSRF=28;FSRR=34;FWDB=0.0126258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.2707;QD=7.64491;RBI=0.0499567;REFB=-0.0314055;REVB=-0.0483349;RO=62;SAF=21;SAR=34;SRF=28;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0691205;STB=0.538447;TYPE=snp;VARB=0.0302985;OID=.;OPOS=17601165;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:62:62:55:55:34:21:28:34:34:21:28:34 chr1 17609448 . G T 209.56 PASS AO=42;DP=77;FAO=43;FDP=79;FR=.;FRO=36;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.00981959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.0126;QD=10.6107;RBI=0.00997336;REFB=-0.0340763;REVB=0.0017446;RO=33;SAF=20;SAR=22;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.055361;STB=0.515931;TYPE=snp;VARB=0.0279883;OID=.;OPOS=17609448;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:79:33:36:42:43:22:20:18:15:23:20:18:18 chr1 17657534 . G A 961.33 PASS AO=101;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124325;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.493;QD=38.0723;RBI=0.0208935;REFB=0;REVB=-0.016792;RO=0;SAF=31;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.82367e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.08073e-05;OID=.;OPOS=17657534;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:101:101:0:0:101:101:70:31:0:0:70:31:0:0 chr1 17657616 . T C 883.3 PASS AO=92;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00235971;FXX=0.0210504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.98;QD=37.9913;RBI=0.0227232;REFB=0;REVB=0.0226004;RO=0;SAF=26;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.04346e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00023174;OID=.;OPOS=17657616;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:93:93:0:0:92:93:66:26:0:0:66:27:0:0 chr1 17660499 . G C 228.92 PASS AO=46;DP=168;FAO=68;FDP=168;FR=.;FRO=100;FSAF=14;FSAR=54;FSRF=1;FSRR=99;FWDB=-0.025357;FXX=0.00591681;HRUN=4;LEN=1;MLLD=229.759;QD=5.45051;RBI=0.0258003;REFB=0.000615271;REVB=0.00476235;RO=0;SAF=12;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.12678e-08;STB=0.725568;TYPE=snp;VARB=-0.00120385;OID=.;OPOS=17660499;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:168:0:100:46:68:34:12:0:0:54:14:1:99 chr1 17661128 . A C 327.77 PASS AO=35;DP=37;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0350751;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.9932;QD=36.4185;RBI=0.0350821;REFB=0;REVB=-0.000700346;RO=1;SAF=21;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0217573;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00178134;OID=.;OPOS=17661128;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:37:36:1:0:35:36:14:21:1:0:14:22:0:0 chr1 17662639 . T C 524.1 PASS AO=61;DP=63;FAO=60;FDP=63;FR=.;FRO=3;FSAF=21;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0098851;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0621;QD=33.2763;RBI=0.0407308;REFB=0.0758631;REVB=-0.0395131;RO=2;SAF=21;SAR=40;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0230178;STB=0.518512;TYPE=snp;VARB=-0.0131108;OID=.;OPOS=17662639;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:63:63:2:3:61:60:40:21:0:2:39:21:0:3 chr1 17662662 . T C 715.32 PASS AO=74;DP=85;FAO=80;FDP=83;FR=.;FRO=3;FSAF=23;FSAR=57;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0243201;FXX=0.0348797;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.3717;QD=34.4733;RBI=0.0885964;REFB=-0.0680185;REVB=-0.085193;RO=9;SAF=17;SAR=57;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196205;STB=0.530604;TYPE=snp;VARB=0.00712086;OID=.;OPOS=17662662;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:85:83:9:3:74:80:57:17:9:0:57:23:3:0 chr1 17668563 . G A 350.34 PASS AO=76;DP=141;FAO=75;FDP=140;FR=.;FRO=65;FSAF=45;FSAR=30;FSRF=26;FSRR=39;FWDB=0.0324668;FXX=0.0140835;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.856;QD=10.0096;RBI=0.0337566;REFB=0.00210277;REVB=0.00924195;RO=65;SAF=44;SAR=32;SRF=26;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150511;STB=0.593098;TYPE=snp;VARB=-0.00382142;OID=.;OPOS=17668563;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:140:65:65:76:75:32:44:26:39:30:45:26:39 chr1 17674537 . C A 218.26 PASS AO=53;DP=112;FAO=53;FDP=112;FR=.;FRO=59;FSAF=44;FSAR=9;FSRF=35;FSRR=24;FWDB=-0.0076916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.9142;QD=7.79482;RBI=0.0234828;REFB=-0.00489964;REVB=-0.0221874;RO=58;SAF=44;SAR=9;SRF=35;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.292138;STB=0.671216;TYPE=snp;VARB=0.0127758;OID=.;OPOS=17674537;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:58:59:53:53:9:44:35:23:9:44:35:24 chr1 17707601 . T C 216.04 PASS AO=58;DP=134;FAO=59;FDP=135;FR=.;FRO=76;FSAF=15;FSAR=44;FSRF=39;FSRR=37;FWDB=-0.0317889;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.219;QD=6.40108;RBI=0.0368713;REFB=-0.0173317;REVB=0.0186806;RO=76;SAF=15;SAR=43;SRF=39;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.282812;STB=0.661596;TYPE=snp;VARB=0.0390515;OID=.;OPOS=17707601;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:135:76:76:58:59:43:15:39:37:44:15:39:37 chr1 17718671 . AG A 926.83 PASS AO=114;DP=123;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0960743;FXX=0.00812942;HRUN=3;LEN=1;MLLD=23.2045;QD=30.3879;RBI=0.161631;REFB=0;REVB=0.129978;RO=2;SAF=61;SAR=53;SRF=1;SRR=1;SSEN=0.445205;SSEP=0;SSSB=0.00115422;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00290992;OID=.;OPOS=17718672;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:114:122:122:122:0:67:55:0:0:83:2:61:53:1:1 chr1 17733267 . ATGT A 551.26 PASS AO=159;DP=470;FAO=164;FDP=383;FR=.;FRO=219;FSAF=70;FSAR=94;FSRF=100;FSRR=119;FWDB=-0.0131122;FXX=0.0424989;HRUN=1;LEN=3;MLLD=156.763;QD=5.75729;RBI=0.013141;REFB=0.00737163;REVB=0.000869985;RO=204;SAF=70;SAR=89;SRF=93;SRR=111;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.016035;STB=0.517317;TYPE=del;VARB=-0.00701087;OID=.;OPOS=17733268;OREF=TGT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:159:415:164:383:219:70:94:100:119:99:204:70:89:93:111 chr1 17733996 . G A 66.48 PASS AO=22;DP=63;FAO=22;FDP=64;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=32;FWDB=0.00944678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.7466;QD=4.15487;RBI=0.0191343;REFB=-0.0134436;REVB=0.0166397;RO=41;SAF=11;SAR=11;SRF=10;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.29032;STB=0.671737;TYPE=snp;VARB=0.0229479;OID=.;OPOS=17733996;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:63:64:41:42:22:22:11:11:10:31:11:11:10:32 chr1 17949562 . C T 99.03 PASS AO=24;DP=53;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.0390205;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.5203;QD=7.47434;RBI=0.053855;REFB=-0.00404806;REVB=0.0371183;RO=29;SAF=12;SAR=12;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0166439;STB=0.509426;TYPE=snp;VARB=0.00664245;OID=.;OPOS=17949562;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:29:29:24:24:12:12:14:15:12:12:14:15 chr1 17961345 . C T 66.81 PASS AO=18;DP=50;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=0.0321811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.9034;QD=5.34507;RBI=0.0464275;REFB=-0.0130812;REVB=-0.0334648;RO=31;SAF=9;SAR=9;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15802;STB=0.605321;TYPE=snp;VARB=0.0188852;OID=.;OPOS=17961345;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:50:50:31:31:18:19:9:9:11:20:9:10:11:20 chr1 17991052 . T C 41.47 PASS AO=6;DP=9;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0384773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4651;QD=18.4313;RBI=0.039349;REFB=-0.0903561;REVB=0.00823618;RO=3;SAF=3;SAR=3;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.28674;STB=0.66617;TYPE=snp;VARB=0.00702742;OID=.;OPOS=17991052;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:9:9:3:3:6:6:3:3:3:0:3:3:3:0 chr1 18021406 . T C 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00556518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.692;QD=35.0874;RBI=0.115653;REFB=0;REVB=0.115519;RO=0;SAF=6;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00334859;OID=.;OPOS=18021406;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:6:0:0:1:6:0:0 chr1 18023365 . C T 379.59 PASS AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0061809;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.7;QD=37.0327;RBI=0.0181247;REFB=0;REVB=0.0170382;RO=0;SAF=28;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000423107;OID=.;OPOS=18023365;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:40:41:0:0:40:41:12:28:0:0:13:28:0:0 chr1 18023459 . CG C,CC 256.85 PASS AO=6,15;DP=39;FAO=22,18;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=8,8;FSAR=14,10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.488506,0.127441;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=12.4504,15.9951;QD=25.685;RBI=0.602554,0.356189;REFB=0,0;REVB=0.352751,0.33261;RO=14;SAF=0,8;SAR=6,7;SRF=7;SRR=7;SSEN=0.456078,0;SSEP=0.278689,0;SSSB=-0.734683,0.0282995;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.139083,-0.014405;OID=.,.;OPOS=18023460,18023460;OREF=G,G;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:6,15:38:22,18:40:0:8,8:14,10:0:0:53:14:0,8:6,7:7:7 chr1 18023509 . T C 339.21 PASS AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0200341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.581;QD=37.6899;RBI=0.040789;REFB=0;REVB=-0.03553;RO=0;SAF=17;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000131716;OID=.;OPOS=18023509;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:36:36:0:0:36:36:19:17:0:0:19:17:0:0 chr1 18023690 . A G 201.65 PASS AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0402504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.473;QD=36.6634;RBI=0.0437637;REFB=0;REVB=-0.0171802;RO=0;SAF=12;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.79347e-05;OID=.;OPOS=18023690;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:22:22:0:0:22:22:10:12:0:0:10:12:0:0 chr1 18149510 . G T 57.41 PASS AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=0.00355362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.692;QD=6.95883;RBI=0.0655056;REFB=-0.0424416;REVB=0.0654091;RO=19;SAF=6;SAR=8;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173577;STB=0.599867;TYPE=snp;VARB=0.0331576;OID=.;OPOS=18149510;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:33:33:19:19:14:14:8:6:5:14:8:6:5:14 chr1 18149566 . C A 173.45 PASS AO=39;DP=76;FAO=39;FDP=79;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=0.0332556;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.136;QD=8.78237;RBI=0.0336262;REFB=-0.0187087;REVB=0.00497872;RO=34;SAF=16;SAR=23;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0267601;STB=0.505374;TYPE=snp;VARB=0.0195627;OID=.;OPOS=18149566;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:79:34:40:39:39:23:16:15:19:23:16:16:24 chr1 18807897 . C G 189.45 PASS AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0227719;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=213.519;QD=32.9469;RBI=0.0268201;REFB=0.0248174;REVB=-0.0141689;RO=0;SAF=8;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517226;TYPE=snp;VARB=-0.000181554;OID=.;OPOS=18807897;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:23:23:0:1:22:22:14:8:0:0:14:8:0:1 chr1 18807953 . C A 175.82 PASS AO=20;DP=22;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0205499;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=141.514;QD=31.9663;RBI=0.0456721;REFB=-0.119496;REVB=0.0407877;RO=0;SAF=12;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.519981;TYPE=snp;VARB=0.00232225;OID=.;OPOS=18807953;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:22:0:1:20:21:8:12:0:0:9:12:1:0 chr1 18808292 . C A 423.98 PASS AO=42;DP=42;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.036991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.871;QD=37.687;RBI=0.0388549;REFB=0;REVB=0.01189;RO=0;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000179168;OID=.;OPOS=18808292;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:42:45:0:0:42:45:21:21:0:0:22:23:0:0 chr1 18808465 . T A 195.71 PASS AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.038719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0871;QD=39.1415;RBI=0.0626714;REFB=0;REVB=0.0492802;RO=0;SAF=18;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.19193e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00185033;OID=.;OPOS=18808465;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:20:20:0:0:20:20:2:18:0:0:2:18:0:0 chr1 18808526 . A C 378.18 PASS AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260559;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.592;QD=37.8182;RBI=0.0262756;REFB=0;REVB=0.00339068;RO=0;SAF=9;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.68708e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.93161e-05;OID=.;OPOS=18808526;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:39:40:0:0:39:40:30:9:0:0:30:10:0:0 chr1 18809896 . A T 463.96 PASS AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0102753;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=177.531;QD=35.6894;RBI=0.0204234;REFB=0.0016502;REVB=-0.0176503;RO=1;SAF=14;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125594;STB=0.506664;TYPE=snp;VARB=-3.04083e-05;OID=.;OPOS=18809896;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:52:52:1:1:51:51:37:14:0:1:37:14:0:1 chr1 18809916 . G A 484.58 PASS AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0623506;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.489;QD=38.7662;RBI=0.0624054;REFB=0;REVB=0.0026145;RO=0;SAF=16;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000306481;OID=.;OPOS=18809916;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:50:50:0:0:50:50:34:16:0:0:34:16:0:0 chr1 18810344 . G T 658.73 PASS AO=69;DP=71;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131277;FXX=0.0140825;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.227;QD=37.6414;RBI=0.0228379;REFB=0;REVB=0.0186879;RO=0;SAF=30;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.02717e-05;OID=.;OPOS=18810344;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:71:70:0:0:69:70:39:30:0:0:39:31:0:0 chr1 18811668 . T C 171.71 PASS AO=15;DP=19;FAO=18;FDP=18;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0549877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.676;QD=38.1573;RBI=0.0712957;REFB=0;REVB=0.0453809;RO=0;SAF=13;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000144716;OID=.;OPOS=18811668;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:18:0:0:15:18:2:13:0:0:5:13:0:0 chr1 18812176 . G A 1855.1 PASS AO=194;DP=194;FAO=194;FDP=194;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0143687;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=108.152;QD=38.2495;RBI=0.0188878;REFB=0;REVB=0.0122592;RO=0;SAF=81;SAR=113;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.47559e-06;OID=.;OPOS=18812176;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:194:194:0:0:194:194:113:81:0:0:113:81:0:0 chr1 18812316 . C T 1647.62 PASS AO=174;DP=178;FAO=175;FDP=175;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0105553;FXX=0.016853;HRUN=3;LEN=1;MLLD=113.007;QD=37.6599;RBI=0.016234;REFB=-0.04321;REVB=0.0123341;RO=2;SAF=74;SAR=100;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00165258;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000185476;OID=.;OPOS=18812316;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:178:175:2:0:174:175:100:74:1:1:100:75:0:0 chr1 19166294 . G A 83.25 PASS AO=21;DP=49;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.0151756;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.633;QD=6.79624;RBI=0.0480718;REFB=-0.00586978;REVB=0.0456136;RO=28;SAF=12;SAR=9;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0366753;STB=0.520938;TYPE=snp;VARB=0.00724275;OID=.;OPOS=19166294;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:49:49:28:28:21:21:9:12:17:11:9:12:17:11 chr1 19175846 . T C 54.24 PASS AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.02323;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.501;QD=6.99826;RBI=0.0330974;REFB=-0.0102589;REVB=0.0235756;RO=18;SAF=3;SAR=10;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.301131;STB=0.67767;TYPE=snp;VARB=0.0265419;OID=.;OPOS=19175846;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:32:31:18:18:13:13:10:3:9:9:10:3:9:9 chr1 19186129 . G C 123.53 PASS AO=34;DP=81;FAO=35;FDP=86;FR=.;FRO=51;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=14;FSRR=37;FWDB=-0.00983072;FXX=0.0114929;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.2066;QD=5.74551;RBI=0.0164724;REFB=-0.00117828;REVB=-0.0132172;RO=45;SAF=11;SAR=23;SRF=14;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0144012;STB=0.527915;TYPE=snp;VARB=0.00311918;OID=.;OPOS=19186129;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:86:45:51:34:35:23:11:14:31:24:11:14:37 chr1 19201928 . C T 96.27 PASS AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=51;FR=.;FRO=28;FSAF=3;FSAR=20;FSRF=7;FSRR=21;FWDB=0.0375236;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.249;QD=7.55055;RBI=0.0384358;REFB=-0.00985072;REVB=-0.00832389;RO=28;SAF=3;SAR=20;SRF=7;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206377;STB=0.619076;TYPE=snp;VARB=0.0120642;OID=.;OPOS=19201928;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:51:51:28:28:23:23:20:3:7:21:20:3:7:21 chr1 19201956 . A G 128.21 PASS AO=29;DP=59;FAO=29;FDP=58;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=8;FSRR=21;FWDB=0.0121053;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.6519;QD=8.84198;RBI=0.0132852;REFB=-0.0102492;REVB=0.00547356;RO=28;SAF=8;SAR=21;SRF=7;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0289265;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0117127;OID=.;OPOS=19201956;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:58:28:29:29:29:21:8:7:21:21:8:8:21 chr1 19202917 . T C 89.09 PASS AO=27;DP=72;FAO=27;FDP=72;FR=.;FRO=45;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=-0.121582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.09;QD=4.94958;RBI=0.12228;REFB=0.00409053;REVB=-0.0130445;RO=44;SAF=15;SAR=12;SRF=18;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156974;STB=0.582761;TYPE=snp;VARB=-0.00973576;OID=.;OPOS=19202917;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:72:72:44:45:27:27:12:15:18:26:12:15:19:26 chr1 19202926 . T C 76.67 PASS AO=24;DP=66;FAO=24;FDP=66;FR=.;FRO=42;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=0.0399423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.51;QD=4.64673;RBI=0.0399507;REFB=-0.0298559;REVB=-0.000823446;RO=42;SAF=13;SAR=11;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123768;STB=0.571549;TYPE=snp;VARB=0.0440282;OID=.;OPOS=19202926;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:66:66:42:42:24:24:11:13:18:24:11:13:18:24 chr1 19203997 . C G 748.35 PASS AO=77;DP=77;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.208;QD=38.3771;RBI=0.0747399;REFB=0;REVB=0.0717222;RO=0;SAF=50;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00012108;OID=.;OPOS=19203997;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:77:78:0:0:77:78:27:50:0:0:27:51:0:0 chr1 19401405 . G A 284.19 PASS AO=42;DP=53;FAO=43;FDP=57;FR=.;FRO=14;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.00729854;FXX=0.065563;HRUN=3;LEN=1;MLLD=152.074;QD=19.9433;RBI=0.011903;REFB=-0.0267019;REVB=-0.00940285;RO=11;SAF=16;SAR=26;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170789;STB=0.568628;TYPE=snp;VARB=0.010407;OID=.;OPOS=19401405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:53:57:11:14:42:43:26:16:9:2:27:16:9:5 chr1 19408294 . G GC 31.26 PASS AO=23;DP=64;FAO=24;FDP=62;FR=.;FRO=38;FSAF=3;FSAR=21;FSRF=9;FSRR=29;FWDB=-0.00520409;FXX=0.0312451;HRUN=4;LEN=1;MLLD=13.8699;QD=2.0166;RBI=0.0192013;REFB=-0.0251471;REVB=0.0184826;RO=35;SAF=3;SAR=20;SRF=9;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230022;STB=0.626743;TYPE=ins;VARB=0.00136292;OID=.;OPOS=19408295;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:23:64:24:62:38:3:21:9:29:31:35:3:20:9:26 chr1 19411129 . A G 156.17 PASS AO=44;DP=106;FAO=44;FDP=106;FR=.;FRO=62;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=23;FSRR=39;FWDB=-0.00628459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.73;QD=5.89306;RBI=0.0645617;REFB=-0.016701;REVB=-0.0642551;RO=61;SAF=19;SAR=25;SRF=23;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0581375;STB=0.536612;TYPE=snp;VARB=0.0217456;OID=.;OPOS=19411129;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:61:62:44:44:25:19:23:38:25:19:23:39 chr1 19413261 . T A 314.48 PASS AO=77;DP=163;FAO=78;FDP=165;FR=.;FRO=87;FSAF=29;FSAR=49;FSRF=41;FSRR=46;FWDB=-0.00747184;FXX=0.00602373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.359;QD=7.62386;RBI=0.0238776;REFB=-0.0142088;REVB=-0.0226785;RO=86;SAF=28;SAR=49;SRF=42;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123447;STB=0.554553;TYPE=snp;VARB=0.0163561;OID=.;OPOS=19413261;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:165:86:87:77:78:49:28:42:44:49:29:41:46 chr1 19415268 . GC G 48.8 PASS AO=29;DP=101;FAO=35;FDP=96;FR=.;FRO=61;FSAF=7;FSAR=28;FSRF=30;FSRR=31;FWDB=-0.0957318;FXX=0.0303;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.0992;QD=2.03345;RBI=0.130073;REFB=-0.105691;REVB=0.0880589;RO=40;SAF=3;SAR=26;SRF=13;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.382506;STB=0.714841;TYPE=del;VARB=0.157315;OID=.;OPOS=19415269;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:29:83:35:96:61:7:28:30:31:48:40:3:26:13:27 chr1 19415304 . C T 294.57 PASS AO=62;DP=117;FAO=63;FDP=118;FR=.;FRO=55;FSAF=22;FSAR=41;FSRF=18;FSRR=37;FWDB=0.0269578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.0581;QD=9.98532;RBI=0.0273382;REFB=-0.0226381;REVB=-0.00454477;RO=55;SAF=21;SAR=41;SRF=18;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0109678;STB=0.511319;TYPE=snp;VARB=0.0232421;OID=.;OPOS=19415304;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:118:55:55:62:63:41:21:18:37:41:22:18:37 chr1 19426996 . GC G 1208.73 PASS AO=196;DP=246;FAO=232;FDP=241;FR=.;FRO=9;FSAF=120;FSAR=112;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.0579033;FXX=0.00413206;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.7173;QD=20.0619;RBI=0.121883;REFB=-0.0574685;REVB=0.10725;RO=33;SAF=99;SAR=97;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0302965;STB=0.506872;TYPE=del;VARB=0.019809;OID=.;OPOS=19426997;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:196:242:232:241:9:120:112:3:6:51:33:99:97:13:20 chr1 19433449 . A G 172.28 PASS AO=42;DP=95;FAO=44;FDP=98;FR=.;FRO=54;FSAF=14;FSAR=30;FSRF=9;FSRR=45;FWDB=0.023614;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.232;QD=7.03194;RBI=0.0239838;REFB=-0.0100551;REVB=0.00419512;RO=53;SAF=12;SAR=30;SRF=9;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153043;STB=0.603406;TYPE=snp;VARB=0.0173027;OID=.;OPOS=19433449;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:98:53:54:42:44:30:12:9:44:30:14:9:45 chr1 19447843 . C G 67.6 PASS AO=23;DP=68;FAO=23;FDP=68;FR=.;FRO=45;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=-0.0298857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.1655;QD=3.97632;RBI=0.0396905;REFB=-0.0125058;REVB=-0.0261186;RO=44;SAF=10;SAR=13;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00339498;STB=0.508467;TYPE=snp;VARB=0.0181501;OID=.;OPOS=19447843;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:68:68:44:45:23:23:13:10:19:25:13:10:19:26 chr1 19468217 . C G 172.04 PASS AO=54;DP=141;FAO=54;FDP=141;FR=.;FRO=87;FSAF=18;FSAR=36;FSRF=36;FSRR=51;FWDB=-0.00723464;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.91;QD=4.88054;RBI=0.0108669;REFB=-0.0268306;REVB=0.00810858;RO=86;SAF=18;SAR=36;SRF=36;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0997906;STB=0.553826;TYPE=snp;VARB=0.0395352;OID=.;OPOS=19468217;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:86:87:54:54:36:18:36:50:36:18:36:51 chr1 19510394 . A G 328.4 PASS AO=78;DP=156;FAO=78;FDP=160;FR=.;FRO=82;FSAF=44;FSAR=34;FSRF=36;FSRR=46;FWDB=0.00721979;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=161.914;QD=8.20987;RBI=0.0109488;REFB=-0.00437426;REVB=-0.00823115;RO=78;SAF=44;SAR=34;SRF=36;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0934075;STB=0.564086;TYPE=snp;VARB=0.00420888;OID=.;OPOS=19510394;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:160:78:82:78:78:34:44:36:42:34:44:36:46 chr1 19549964 . GC G 1091.46 PASS AO=139;DP=196;FAO=177;FDP=177;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.195785;FXX=0.0220982;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.8156;QD=24.6658;RBI=0.353148;REFB=-0.0184187;REVB=0.293909;RO=33;SAF=60;SAR=79;SRF=10;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0.363036;SSSB=0.0477076;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00745409;OID=.;OPOS=19549965;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:139:181:177:177:0:73:104:0:0:84:33:60:79:10:23 chr1 19565344 . C G 253.87 PASS AO=61;DP=131;FAO=63;FDP=133;FR=.;FRO=70;FSAF=17;FSAR=46;FSRF=26;FSRR=44;FWDB=0.0609657;FXX=0.0431624;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.4581;QD=7.63525;RBI=0.0663657;REFB=-0.0216808;REVB=0.0262218;RO=67;SAF=16;SAR=45;SRF=24;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109717;STB=0.563833;TYPE=snp;VARB=0.0258656;OID=.;OPOS=19565344;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:133:67:70:61:63:45:16:24:43:46:17:26:44 chr1 19583636 . C T 229.08 PASS AO=46;DP=82;FAO=46;FDP=82;FR=.;FRO=36;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=26;FWDB=-0.00232865;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.761;QD=11.1745;RBI=0.00338835;REFB=-0.0133294;REVB=-0.00246136;RO=35;SAF=26;SAR=20;SRF=10;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217433;STB=0.624165;TYPE=snp;VARB=0.00862102;OID=.;OPOS=19583636;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:35:36:46:46:20:26:10:25:20:26:10:26 chr1 19595137 . C T 575.28 PASS AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0258974;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.2861;QD=37.7232;RBI=0.0296309;REFB=0;REVB=0.0143984;RO=0;SAF=20;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.14674e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.3081e-05;OID=.;OPOS=19595137;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:61:61:0:0:61:61:41:20:0:0:41:20:0:0 chr1 19596124 . C T 1797.27 PASS AO=187;DP=190;FAO=190;FDP=190;FR=.;FRO=0;FSAF=120;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00802796;FXX=0.0104161;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.845;QD=37.8372;RBI=0.0155817;REFB=-0.024803;REVB=-0.0133544;RO=0;SAF=117;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.88739e-05;OID=.;OPOS=19596124;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:190:190:0:0:187:190:70:117:0:0:70:120:0:0 chr1 19596156 . G T 1569.37 PASS AO=165;DP=167;FAO=167;FDP=167;FR=.;FRO=0;FSAF=107;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01581;FXX=0.0118336;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.8948;QD=37.5896;RBI=0.0161594;REFB=-0.0790265;REVB=0.00334245;RO=2;SAF=105;SAR=60;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00335419;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00149221;OID=.;OPOS=19596156;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:167:167:2:0:165:167:60:105:1:1:60:107:0:0 chr1 19609254 . T C 555.77 PASS AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00657141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.304;QD=38.3288;RBI=0.0895793;REFB=0;REVB=0.089338;RO=0;SAF=26;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.09576e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000200345;OID=.;OPOS=19609254;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:58:58:0:0:58:58:32:26:0:0:32:26:0:0 chr1 19611241 . T C 759.39 PASS AO=78;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0389583;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.2497;QD=38.4501;RBI=0.064998;REFB=0;REVB=-0.0520288;RO=1;SAF=20;SAR=58;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0230741;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000857769;OID=.;OPOS=19611241;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:79:79:1:0:78:79:58:20:1:0:58:21:0:0 chr1 19612477 . C T 472.41 PASS AO=47;DP=47;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.101301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.9866;QD=38.5641;RBI=0.101889;REFB=0;REVB=0.0109287;RO=0;SAF=33;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00145673;OID=.;OPOS=19612477;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:47:49:0:0:47:49:14:33:0:0:14:35:0:0 chr1 19652063 . G A 80.19 PASS AO=21;DP=51;FAO=21;FDP=51;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=22;FWDB=-0.0308795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.8347;QD=6.28942;RBI=0.0311583;REFB=-0.000976093;REVB=-0.00415885;RO=30;SAF=7;SAR=14;SRF=8;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0795469;STB=0.545413;TYPE=snp;VARB=0.00284766;OID=.;OPOS=19652063;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:51:51:30:30:21:21:14:7:8:22:14:7:8:22 chr1 19726907 . A T 742.42 PASS AO=81;DP=83;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0254578;FXX=0.0240935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.61;QD=36.6628;RBI=0.0324461;REFB=-0.198592;REVB=0.0201159;RO=1;SAF=44;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106407;STB=0.505746;TYPE=snp;VARB=0.000329185;OID=.;OPOS=19726907;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:83:81:1:1:81:80:37:44:1:0:37:43:1:0 chr1 19750909 . G T 953.14 PASS AO=103;DP=108;FAO=104;FDP=107;FR=.;FRO=3;FSAF=56;FSAR=48;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00630026;FXX=0.0183469;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.994;QD=35.6315;RBI=0.0379252;REFB=-0.00535163;REVB=0.0373982;RO=1;SAF=56;SAR=47;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0099887;STB=0.503617;TYPE=snp;VARB=0.0004099;OID=.;OPOS=19750909;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:108:107:1:3:103:104:47:56:0:1:48:56:2:1 chr1 19953118 . G T 376.09 PASS AO=96;DP=207;FAO=96;FDP=207;FR=.;FRO=111;FSAF=58;FSAR=38;FSRF=69;FSRR=42;FWDB=-0.0324603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0989;QD=7.26744;RBI=0.0439314;REFB=-0.00903501;REVB=-0.0296023;RO=109;SAF=58;SAR=38;SRF=68;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0198948;STB=0.509823;TYPE=snp;VARB=0.0124339;OID=.;OPOS=19953118;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:207:109:111:96:96:38:58:68:41:38:58:69:42 chr1 19983534 . A C 15.78 PASS AO=3;DP=6;FAO=3;FDP=7;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.096;QD=9.01894;RBI=0.00903986;REFB=0.0110905;REVB=-0.00903986;RO=3;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00605532;OID=.;OPOS=19983534;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:6:7:3:4:3:3:3:0:0:3:3:0:0:4 chr1 19992513 . C T 99.12 PASS AO=24;DP=53;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=0.022394;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.624;QD=7.48068;RBI=0.0225027;REFB=-0.0499612;REVB=0.00220951;RO=25;SAF=8;SAR=16;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141118;STB=0.547904;TYPE=snp;VARB=0.0571608;OID=.;OPOS=19992513;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:25:29:24:24:16:8:12:13:16:8:12:17 chr1 20009737 . G A 32.76 PASS AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0018934;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.963;QD=5.95684;RBI=0.0258107;REFB=-0.0132718;REVB=0.0257412;RO=13;SAF=4;SAR=4;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118061;STB=0.590689;TYPE=snp;VARB=0.0244882;OID=.;OPOS=20009737;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:22:22:13:14:8:8:4:4:5:8:4:4:5:9 chr1 20020993 . A G 117.67 PASS AO=25;DP=49;FAO=25;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=0.00200021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.7;QD=9.60581;RBI=0.081395;REFB=-0.0224838;REVB=-0.0813704;RO=24;SAF=12;SAR=13;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198956;STB=0.610936;TYPE=snp;VARB=0.0370386;OID=.;OPOS=20020993;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:24:24:25:25:13:12:17:7:13:12:17:7 chr1 20297752 . A T 91.42 PASS AO=19;DP=37;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.0453611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.9239;QD=9.88326;RBI=0.0497239;REFB=-0.0226635;REVB=0.0203675;RO=18;SAF=6;SAR=13;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0704921;STB=0.539893;TYPE=snp;VARB=0.0175422;OID=.;OPOS=20297752;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:37:37:18:18:19:19:13:6:7:11:13:6:7:11 chr1 20442054 . T C 970.97 PASS AO=101;DP=102;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00785425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.994;QD=37.7077;RBI=0.0556756;REFB=0;REVB=0.0551188;RO=0;SAF=32;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000225272;OID=.;OPOS=20442054;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:102:103:0:0:101:103:69:32:0:0:70:33:0:0 chr1 20490518 . T C 151.96 PASS AO=17;DP=53;FAO=23;FDP=57;FR=.,HEALED;FRO=23;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=0;FWDB=0.0248963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.248;QD=10.6635;RBI=0.0364677;REFB=-0.0134396;REVB=0.026647;RO=21;SAF=11;SAR=6;SRF=21;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.444561;STB=0.725348;TYPE=snp;VARB=0.0141994;OID=.;OPOS=20490518;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:53:57:21:23:17:23:6:11:21:0:9:14:23:0 chr1 20501670 . G A 33.96 PASS AO=15;DP=62;FAO=16;FDP=63;FR=.;FRO=47;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=25;FWDB=-0.0214143;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8591;QD=2.15643;RBI=0.0605889;REFB=-0.00348109;REVB=-0.0566784;RO=47;SAF=8;SAR=7;SRF=22;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0795658;STB=0.52378;TYPE=snp;VARB=0.0014117;OID=.;OPOS=20501670;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:62:63:47:47:15:16:7:8:22:25:8:8:22:25 chr1 20518226 . G A 461.64 PASS AO=122;DP=270;FAO=122;FDP=270;FR=.;FRO=148;FSAF=72;FSAR=50;FSRF=67;FSRR=81;FWDB=0.0141793;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.4244;QD=6.83906;RBI=0.0157285;REFB=-0.00292702;REVB=-0.00680683;RO=148;SAF=72;SAR=50;SRF=67;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136764;STB=0.575741;TYPE=snp;VARB=0.00370394;OID=.;OPOS=20518226;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:270:270:148:148:122:122:50:72:67:81:50:72:67:81 chr1 20656824 . A G 201.27 PASS AO=51;DP=112;FAO=51;FDP=112;FR=.;FRO=61;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=25;FSRR=36;FWDB=0.0160107;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.547;QD=7.18815;RBI=0.0169638;REFB=-0.0113734;REVB=0.00560617;RO=61;SAF=27;SAR=24;SRF=25;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116361;STB=0.564828;TYPE=snp;VARB=0.0101073;OID=.;OPOS=20656824;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:61:61:51:51:24:27:25:36:24:27:25:36 chr1 20664217 . TG T 395 PASS AO=42;DP=59;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.25548;FXX=0.0666556;HRUN=2;LEN=1;MLLD=18.1341;QD=28.2144;RBI=0.398388;REFB=0;REVB=0.305684;RO=10;SAF=12;SAR=30;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0.524211;SSSB=-0.00624019;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0145614;OID=.;OPOS=20664218;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:42:60:56:56:0:16:40:0:0:35:10:12:30:3:7 chr1 20671961 . G A 50.37 PASS AO=21;DP=73;FAO=21;FDP=73;FR=.;FRO=52;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=36;FSRR=16;FWDB=-0.00109135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.182;QD=2.76025;RBI=0.00507135;REFB=0.00337187;REVB=-0.00495253;RO=52;SAF=8;SAR=13;SRF=36;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.358578;STB=0.711259;TYPE=snp;VARB=-0.0126619;OID=.;OPOS=20671961;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:73:73:52:52:21:21:13:8:36:16:13:8:36:16 chr1 20680718 . G A 49.28 PASS AO=8;DP=15;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.131989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.4284;QD=12.3209;RBI=0.134541;REFB=-0.00845644;REVB=0.0260802;RO=7;SAF=0;SAR=8;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.75121;STB=0.533255;TYPE=snp;VARB=0.0298427;OID=.;OPOS=20680718;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:15:16:7:7:8:9:8:0:1:6:8:1:1:6 chr1 20827216 . C T 584.33 PASS AO=112;DP=190;FAO=114;FDP=192;FR=.;FRO=78;FSAF=57;FSAR=57;FSRF=35;FSRR=43;FWDB=0.012571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.9526;QD=12.1736;RBI=0.0125919;REFB=-0.00711066;REVB=-0.000725517;RO=77;SAF=56;SAR=56;SRF=34;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0439362;STB=0.52083;TYPE=snp;VARB=0.00467789;OID=.;OPOS=20827216;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:192:77:78:112:114:56:56:34:43:57:57:35:43 chr1 20972048 . G A 580.83 PASS AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0164982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.4173;QD=38.7222;RBI=0.0223967;REFB=0;REVB=0.0151467;RO=0;SAF=38;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.67515e-05;OID=.;OPOS=20972048;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:60:60:0:0:60:60:22:38:0:0:22:38:0:0 chr1 20982631 . G A 940.81 PASS AO=99;DP=101;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0433801;FXX=0.0198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.634;QD=38.0127;RBI=0.057169;REFB=0;REVB=-0.0372353;RO=0;SAF=39;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.47126e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.63646e-05;OID=.;OPOS=20982631;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:101:99:0:0:99:99:60:39:0:0:60:39:0:0 chr1 20987873 . G C 552.02 PASS AO=56;DP=56;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0641233;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.226;QD=38.0703;RBI=0.0683194;REFB=0;REVB=-0.0235741;RO=0;SAF=23;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000168457;OID=.;OPOS=20987873;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:56:58:0:0:56:58:33:23:0:0:34:24:0:0 chr1 20992719 . TG T 96.81 PASS AO=31;DP=58;FAO=33;FDP=57;FR=.;FRO=24;FSAF=32;FSAR=1;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.166561;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=15.668;QD=6.79382;RBI=0.202201;REFB=-0.0740523;REVB=-0.114643;RO=21;SAF=30;SAR=1;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0.432203;SSSB=0.599734;STB=0.85682;TYPE=del;VARB=0.0261015;OID=.;OPOS=20992720;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:31:56:33:57:24:32:1:16:8:51:21:30:1:14:7 chr1 20992819 . G C 562.28 PASS AO=57;DP=58;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0227698;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.9305;QD=36.8705;RBI=0.191894;REFB=0;REVB=0.190538;RO=1;SAF=32;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184904;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00532067;OID=.;OPOS=20992819;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:58:61:1:0:57:61:25:32:0:1:29:32:0:0 chr1 21024901 . C T 19.18 PASS AO=8;DP=34;FAO=8;FDP=34;FR=.;FRO=26;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.023639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.457;QD=2.25588;RBI=0.039072;REFB=-0.0113023;REVB=-0.0311098;RO=25;SAF=3;SAR=5;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126229;STB=0.568009;TYPE=snp;VARB=0.0232636;OID=.;OPOS=21024901;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:34:34:25:26:8:8:5:3:12:13:5:3:12:14 chr1 21044161 . A G 50.51 PASS AO=10;DP=22;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.0167974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.2171;QD=8.41907;RBI=0.0414987;REFB=-0.0517446;REVB=-0.0379472;RO=12;SAF=1;SAR=9;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.370239;STB=0.649179;TYPE=snp;VARB=0.0211535;OID=.;OPOS=21044161;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:22:24:12:13:10:11:9:1:4:8:9:2:5:8 chr1 21050958 . C T 50.62 PASS AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=0.0167728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.063;QD=8.43698;RBI=0.0235316;REFB=-0.0217371;REVB=0.0165048;RO=13;SAF=10;SAR=1;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.276261;STB=0.666295;TYPE=snp;VARB=0.0232212;OID=.;OPOS=21050958;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:24:24:13:13:11:11:1:10:10:3:1:10:10:3 chr1 21167404 . A G 1199.59 PASS AO=128;DP=136;FAO=129;FDP=131;FR=.;FRO=2;FSAF=59;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0131494;FXX=0.036762;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.007;QD=36.6287;RBI=0.0131546;REFB=-0.0551113;REVB=-0.000368411;RO=0;SAF=59;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507041;TYPE=snp;VARB=3.21527e-05;OID=.;OPOS=21167404;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:136:131:0:2:128:129:69:59:0:0:70:59:0:2 chr1 21268338 . A G 437.66 PASS AO=103;DP=207;FAO=103;FDP=207;FR=.;FRO=104;FSAF=42;FSAR=61;FSRF=37;FSRR=67;FWDB=-0.00251627;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.754;QD=8.45723;RBI=0.0241613;REFB=-0.00599082;REVB=-0.0240299;RO=102;SAF=42;SAR=61;SRF=36;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0520245;STB=0.527312;TYPE=snp;VARB=0.00704049;OID=.;OPOS=21268338;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:207:102:104:103:103:61:42:36:66:61:42:37:67 chr1 21325360 . C A 106.55 PASS AO=32;DP=88;FAO=34;FDP=90;FR=.;FRO=56;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=39;FSRR=17;FWDB=0.00015194;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.855;QD=4.73548;RBI=0.0113088;REFB=-0.00984813;REVB=0.0113078;RO=49;SAF=13;SAR=19;SRF=33;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.277944;STB=0.671641;TYPE=snp;VARB=0.0322022;OID=.;OPOS=21325360;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:90:49:56:32:34:19:13:33:16:20:14:39:17 chr1 21573722 . G A 352.75 PASS AO=73;DP=132;FAO=73;FDP=132;FR=.;FRO=59;FSAF=51;FSAR=22;FSRF=38;FSRR=21;FWDB=0.00432412;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.582;QD=10.6893;RBI=0.0167219;REFB=-0.00610232;REVB=-0.0161531;RO=59;SAF=51;SAR=22;SRF=38;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0516918;STB=0.528299;TYPE=snp;VARB=0.00437386;OID=.;OPOS=21573722;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:59:59:73:73:22:51:38:21:22:51:38:21 chr1 21625357 . G A 153.77 PASS AO=24;DP=101;FAO=35;FDP=100;FR=.,HEALED;FRO=54;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=34;FWDB=-0.0477994;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=27.1569;QD=6.15064;RBI=0.346936;REFB=0.00825813;REVB=-0.343627;RO=22;SAF=23;SAR=1;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.594854;STB=0.672076;TYPE=snp;VARB=0.00332465;OID=.;OPOS=21625357;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:100:22:54:24:35:1:23:14:8:12:23:20:34 chr1 21795388 . A G 326.33 PASS AO=82;DP=175;FAO=82;FDP=175;FR=.;FRO=93;FSAF=20;FSAR=62;FSRF=51;FSRR=42;FWDB=-0.0301124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.221;QD=7.4589;RBI=0.0304224;REFB=-0.00872051;REVB=0.00433196;RO=93;SAF=20;SAR=62;SRF=51;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.321504;STB=0.679065;TYPE=snp;VARB=0.00785733;OID=.;OPOS=21795388;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:175:93:93:82:82:62:20:51:42:62:20:51:42 chr1 21808159 . G A 130.69 PASS AO=24;DP=41;FAO=24;FDP=41;FR=.;FRO=17;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=-0.0215362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.5594;QD=12.7503;RBI=0.022521;REFB=0.00606922;REVB=0.00658682;RO=17;SAF=17;SAR=7;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0523037;STB=0.528944;TYPE=snp;VARB=-0.00478271;OID=.;OPOS=21808159;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:41:41:17:17:24:24:7:17:13:4:7:17:13:4 chr1 21808207 . A C 46.05 PASS AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0599328;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.568;QD=10.233;RBI=0.060813;REFB=-0.00780952;REVB=0.0103088;RO=9;SAF=2;SAR=7;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22915;STB=0.636033;TYPE=snp;VARB=0.00727813;OID=.;OPOS=21808207;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:18:18:9:9:9:9:7:2:4:5:7:2:4:5 chr1 21808223 . T C 35.02 PASS AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.0297887;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.106;QD=9.33862;RBI=0.0451419;REFB=-0.0203166;REVB=-0.0339179;RO=8;SAF=1;SAR=6;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.300057;STB=0.68509;TYPE=snp;VARB=0.0198296;OID=.;OPOS=21808223;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:15:15:8:8:7:7:6:1:3:5:6:1:3:5 chr1 21809750 . T C 296.57 PASS AO=30;DP=30;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00464342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.2744;QD=37.0707;RBI=0.00984809;REFB=0;REVB=-0.00868467;RO=0;SAF=10;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.67072e-05;OID=.;OPOS=21809750;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:30:32:0:0:30:32:20:10:0:0:20:12:0:0 chr1 21889635 . T C 125.97 PASS AO=24;DP=42;FAO=24;FDP=42;FR=.;FRO=18;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.0262174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.0618;QD=11.9968;RBI=0.03677;REFB=-0.0325763;REVB=-0.0257815;RO=18;SAF=15;SAR=9;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183917;STB=0.602323;TYPE=snp;VARB=0.0313995;OID=.;OPOS=21889635;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:42:42:18:18:24:24:9:15:7:11:9:15:7:11 chr1 21904267 . A G 78.88 PASS AO=24;DP=79;FAO=27;FDP=79;FR=.;FRO=52;FSAF=22;FSAR=5;FSRF=48;FSRR=4;FWDB=-0.00680647;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.0669;QD=3.99368;RBI=0.0388149;REFB=-0.010893;REVB=-0.0382135;RO=55;SAF=19;SAR=5;SRF=51;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.302795;STB=0.638605;TYPE=snp;VARB=0.0111333;OID=.;OPOS=21904267;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:79:79:55:52:24:27:5:19:51:4:5:22:48:4 chr1 21943820 . G A 196.28 PASS AO=38;DP=68;FAO=39;FDP=68;FR=.;FRO=29;FSAF=30;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=0.0335655;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.097;QD=11.546;RBI=0.0670379;REFB=-0.0160616;REVB=0.0580297;RO=29;SAF=30;SAR=8;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109161;STB=0.54543;TYPE=snp;VARB=0.0278502;OID=.;OPOS=21943820;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:29:29:38:39:8:30:20:9:9:30:20:9 chr1 22050649 . C A 250.29 PASS AO=49;DP=92;FAO=52;FDP=95;FR=.;FRO=43;FSAF=11;FSAR=41;FSRF=16;FSRR=27;FWDB=0.00461929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.956;QD=10.5384;RBI=0.00496492;REFB=-0.029387;REVB=-0.00182007;RO=43;SAF=10;SAR=39;SRF=16;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190299;STB=0.596725;TYPE=snp;VARB=0.0245789;OID=.;OPOS=22050649;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:95:43:43:49:52:39:10:16:27:41:11:16:27 chr1 22149935 . T C 200.84 PASS AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.954;QD=36.5162;RBI=0.0323058;REFB=0;REVB=0.0223678;RO=0;SAF=15;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000279238;OID=.;OPOS=22149935;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:21:22:0:0:21:22:6:15:0:0:6:16:0:0 chr1 22191454 . G A 147.37 PASS AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0377743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.344;QD=36.8434;RBI=0.156325;REFB=0;REVB=0.151693;RO=0;SAF=10;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00264118;OID=.;OPOS=22191454;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:16:0:0:16:16:6:10:0:0:6:10:0:0 chr1 22199245 . C T 97.97 PASS AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0707902;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.6004;QD=30.145;RBI=0.0709496;REFB=-0.0923296;REVB=-0.00475252;RO=0;SAF=5;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.533278;TYPE=snp;VARB=0.00363479;OID=.;OPOS=22199245;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:13:13:0:1:12:12:7:5:0:0:7:5:0:1 chr1 22206649 . T C 459.75 PASS AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00560755;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.5222;QD=36.7803;RBI=0.01458;REFB=0.0287326;REVB=0.0134585;RO=1;SAF=29;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0229468;STB=0.51219;TYPE=snp;VARB=-0.000703389;OID=.;OPOS=22206649;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:50:50:1:1:49:49:20:29:0:1:20:29:0:1 chr1 22206942 . G A 553.25 PASS AO=58;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0627232;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.727;QD=36.8833;RBI=0.0757965;REFB=-0.0369174;REVB=0.0425548;RO=0;SAF=28;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508472;TYPE=snp;VARB=0.000301346;OID=.;OPOS=22206942;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:60:60:0:1:58:59:30:28:0:0:30:29:1:0 chr1 22207235 . T C 379.84 PASS AO=38;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0353184;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.618;QD=38.9579;RBI=0.0353458;REFB=0;REVB=0.00139066;RO=0;SAF=23;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000587855;OID=.;OPOS=22207235;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:39:39:0:0:38:39:15:23:0:0:16:23:0:0 chr1 22216574 . C A 290.01 PASS AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0387697;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=160.412;QD=37.4205;RBI=0.0572369;REFB=0;REVB=0.0421066;RO=0;SAF=4;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000418187;OID=.;OPOS=22216574;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:31:31:0:0:31:31:27:4:0:0:27:4:0:0 chr1 22216604 . C G 170.86 PASS AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214548;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.622;QD=37.9679;RBI=0.0474233;REFB=0;REVB=0.0422926;RO=0;SAF=4;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00088877;OID=.;OPOS=22216604;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:18:0:0:18:18:14:4:0:0:14:4:0:0 chr1 22217108 . G A 665.06 PASS AO=75;DP=80;FAO=76;FDP=80;FR=.;FRO=4;FSAF=21;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0531491;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.8726;QD=33.253;RBI=0.0907607;REFB=-0.101307;REVB=0.0735709;RO=5;SAF=21;SAR=54;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0418216;STB=0.517539;TYPE=snp;VARB=0.00808742;OID=.;OPOS=22217108;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:80:80:5:4:75:76:54:21:0:5:55:21:0:4 chr1 22304463 . A G 86.76 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0362335;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=186.787;QD=38.5593;RBI=0.0621074;REFB=0;REVB=-0.0504427;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000324232;OID=.;OPOS=22304463;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:5:4:0:0:5:4:0:0 chr1 22307538 . C T 764.49 PASS AO=82;DP=86;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0144888;FXX=0.0348797;HRUN=3;LEN=1;MLLD=223.687;QD=36.8429;RBI=0.0169411;REFB=-0.0313012;REVB=0.00877916;RO=1;SAF=52;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0155226;STB=0.508195;TYPE=snp;VARB=0.000146966;OID=.;OPOS=22307538;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:86:83:1:1:82:82:30:52:0:1:30:52:0:1 chr1 22310262 . G C 566.17 PASS AO=56;DP=58;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185752;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0852;QD=37.7449;RBI=0.0403495;REFB=0;REVB=-0.0358196;RO=2;SAF=36;SAR=20;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0100749;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.58549e-05;OID=.;OPOS=22310262;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:58:60:2:0:56:60:20:36:1:1:20:40:0:0 chr1 22310725 . G C 995.68 PASS AO=104;DP=105;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0328259;FXX=0.0092584;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.5518;QD=37.2216;RBI=0.0754282;REFB=-0.0674258;REVB=0.0679108;RO=1;SAF=52;SAR=52;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00903847;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00371932;OID=.;OPOS=22310725;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:105:107:1:0:104:107:52:52:0:1:54:53:0:0 chr1 22310824 . T C 857.01 PASS AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0352778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.683;QD=38.5172;RBI=0.0537703;REFB=0;REVB=0.0405798;RO=0;SAF=37;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000132966;OID=.;OPOS=22310824;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:89:89:0:0:89:89:52:37:0:0:52:37:0:0 chr1 22313161 . T C 529.46 PASS AO=59;DP=61;FAO=59;FDP=61;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=33;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.044732;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.121;QD=34.7184;RBI=0.0499782;REFB=0.0936841;REVB=0.0222904;RO=2;SAF=26;SAR=33;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0349148;STB=0.518512;TYPE=snp;VARB=-0.000541537;OID=.;OPOS=22313161;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:61:61:2:2:59:59:33:26:2:0:33:26:2:0 chr1 22314240 . A T 296.78 PASS AO=31;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.028804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.744;QD=37.0978;RBI=0.0471788;REFB=0;REVB=0.0373654;RO=0;SAF=4;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0007668;OID=.;OPOS=22314240;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:31:32:0:0:31:32:27:4:0:0:28:4:0:0 chr1 22315738 . C T 178.39 PASS AO=32;DP=48;FAO=30;FDP=45;FR=.;FRO=15;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=0.0303071;FXX=0.062487;HRUN=7;LEN=1;MLLD=115.063;QD=15.8566;RBI=0.0305473;REFB=-0.0464952;REVB=-0.00382325;RO=14;SAF=18;SAR=14;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0872644;STB=0.567524;TYPE=snp;VARB=0.00646301;OID=.;OPOS=22315738;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:48:45:14:15:32:30:14:18:10:4:14:16:11:4 chr1 22332008 . T C 14.41 PASS AO=20;DP=111;FAO=18;FDP=113;FR=.;FRO=95;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=39;FSRR=56;FWDB=-0.00906228;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.434;QD=0.509952;RBI=0.00912772;REFB=-0.00212088;REVB=-0.00109104;RO=91;SAF=4;SAR=16;SRF=37;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.303481;STB=0.682319;TYPE=snp;VARB=0.0131713;OID=.;OPOS=22332008;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:111:113:91:95:20:18:16:4:37:54:14:4:39:56 chr1 22336277 . C G 913.55 PASS AO=97;DP=100;FAO=100;FDP=101;FR=.;FRO=1;FSAF=53;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0204615;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.4141;QD=36.1802;RBI=0.0206517;REFB=-0.163687;REVB=0.0027959;RO=1;SAF=52;SAR=45;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0104228;STB=0.505262;TYPE=snp;VARB=0.00339451;OID=.;OPOS=22336277;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:100:101:1:1:97:100:45:52:0:1:47:53:0:1 chr1 22337181 . T C 244.93 PASS AO=30;DP=33;FAO=30;FDP=33;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=28;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0248528;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.5921;QD=29.6881;RBI=0.0262503;REFB=-0.00868362;REVB=-0.00845084;RO=3;SAF=2;SAR=28;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.390019;STB=0.714099;TYPE=snp;VARB=-2.79906e-05;OID=.;OPOS=22337181;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:33:33:3:3:30:30:28:2:3:0:28:2:3:0 chr1 22337182 . G C 208.86 PASS AO=28;DP=34;FAO=28;FDP=34;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=26;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.121248;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=40.9617;QD=24.5714;RBI=0.176671;REFB=-0.108218;REVB=0.128497;RO=6;SAF=2;SAR=26;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.346364;STB=0.691315;TYPE=snp;VARB=0.0343632;OID=.;OPOS=22337182;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:34:34:6:6:28:28:26:2:3:3:26:2:3:3 chr1 22337430 . G C 268.72 PASS AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0426527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.654;QD=35.8293;RBI=0.0546625;REFB=-0.134292;REVB=-0.0341869;RO=1;SAF=7;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.02071;STB=0.511104;TYPE=snp;VARB=0.00420464;OID=.;OPOS=22337430;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:30:30:1:1:29:29:22:7:0:1:22:7:0:1 chr1 22443887 . G T 1260.99 PASS AO=135;DP=140;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00396036;FXX=0.021427;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.989;QD=36.8172;RBI=0.00399502;REFB=-0.117523;REVB=0.000525066;RO=5;SAF=88;SAR=47;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00386893;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.7921e-05;OID=.;OPOS=22443887;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:140:137:5:0:135:137:47:88:3:2:47:90:0:0 chr1 22445991 . C T 2295.19 PASS AO=238;DP=239;FAO=242;FDP=242;FR=.;FRO=0;FSAF=120;FSAR=122;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185457;FXX=0.00411506;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.522;QD=37.937;RBI=0.0189993;REFB=0.0182686;REVB=-0.00412686;RO=1;SAF=119;SAR=119;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00398833;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.08394e-05;OID=.;OPOS=22445991;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:239:242:1:0:238:242:119:119:0:1:122:120:0:0 chr1 22835677 . A G 2979.45 PASS AO=308;DP=309;FAO=309;FDP=309;FR=.;FRO=0;FSAF=157;FSAR=152;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0103166;FXX=0.0032257;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.853;QD=38.5689;RBI=0.0326626;REFB=0;REVB=0.0309906;RO=0;SAF=157;SAR=151;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.58513e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000144034;OID=.;OPOS=22835677;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:309:309:0:0:308:309:151:157:0:0:152:157:0:0 chr1 22846653 . ACC AC,ACT 476.03 PASS AO=20,52;DP=118;FAO=33,53;FDP=109;FR=.;FRO=23;FSAF=33,18;FSAR=0,35;FSRF=5;FSRR=18;FWDB=-0.180545,-0.0197394;FXX=0.00909008;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=14.7082,225.913;QD=17.469;RBI=0.180779,0.0204698;REFB=-0.0164359,-0.0118591;REVB=0.00919722,-0.0054194;RO=20;SAF=20,17;SAR=0,35;SRF=2;SRR=18;SSEN=0,0;SSEP=0.692308,0;SSSB=0.874523,0.140468;STB=0.999588,0.542338;TYPE=del,snp;VARB=-0.121833,0.0130771;OID=.,.;OPOS=22846654,22846655;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=AC,ACT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:20,52:107:33,53:109:23:33,18:0,35:5:18:89:20:20,17:0,35:2:18 chr1 22846709 . G A 762.52 PASS AO=82;DP=84;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.000903507;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.249;QD=36.748;RBI=0.0204079;REFB=-0.0773579;REVB=0.0203879;RO=1;SAF=42;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116923;STB=0.506171;TYPE=snp;VARB=0.000262787;OID=.;OPOS=22846709;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:84:83:1:1:82:82:40:42:0:1:40:42:0:1 chr1 22915753 . T C 194.56 PASS AO=20;DP=20;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0205103;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.775;QD=37.0595;RBI=0.0271538;REFB=0;REVB=-0.0177948;RO=0;SAF=15;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.023e-05;OID=.;OPOS=22915753;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:20:21:0:0:20:21:5:15:0:0:5:16:0:0 chr1 22923873 . G C 351.7 PASS AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.847;QD=36.0714;RBI=0.0212003;REFB=-0.0197908;REVB=0.0212003;RO=1;SAF=0;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000283219;OID=.;OPOS=22923873;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:39:39:1:1:38:38:38:0:0:1:38:0:0:1 chr1 22928813 . A G 150.24 PASS AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0286818;FXX=0.0587889;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.906;QD=37.559;RBI=0.0338319;REFB=0;REVB=-0.0179431;RO=0;SAF=15;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000385486;OID=.;OPOS=22928813;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:16:0:0:16:16:1:15:0:0:1:15:0:0 chr1 22970642 . C T 452.68 PASS AO=51;DP=58;FAO=52;FDP=55;FR=.;FRO=3;FSAF=31;FSAR=21;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0122052;FXX=0.0517152;HRUN=3;LEN=1;MLLD=119.189;QD=32.922;RBI=0.0339494;REFB=-0.033614;REVB=0.0316795;RO=2;SAF=31;SAR=20;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00801538;STB=0.503998;TYPE=snp;VARB=0.000488167;OID=.;OPOS=22970642;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:58:55:2:3:51:52:20:31:1:1:21:31:2:1 chr1 23101688 . T G 1835.45 PASS AO=203;DP=211;FAO=204;FDP=210;FR=.;FRO=6;FSAF=38;FSAR=166;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0489964;FXX=0.00473911;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3346;QD=34.9609;RBI=0.0505652;REFB=-0.153862;REVB=0.0124977;RO=7;SAF=38;SAR=165;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0046353;STB=0.500925;TYPE=snp;VARB=0.00223051;OID=.;OPOS=23101688;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:211:210:7:6:203:204:165:38:1:6:166:38:1:5 chr1 23208925 . G A 158.87 PASS AO=39;DP=84;FAO=39;FDP=84;FR=.;FRO=45;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=30;FWDB=-0.0128428;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.715;QD=7.56539;RBI=0.017477;REFB=-0.00387046;REVB=0.0118536;RO=44;SAF=17;SAR=22;SRF=15;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0930807;STB=0.556647;TYPE=snp;VARB=0.00571103;OID=.;OPOS=23208925;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:44:45:39:39:22:17:15:29:22:17:15:30 chr1 23219493 . T C 385.45 PASS AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0536467;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.468;QD=37.6046;RBI=0.0748709;REFB=0;REVB=0.0522272;RO=0;SAF=21;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02085e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.00536e-06;OID=.;OPOS=23219493;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:41:41:0:0:41:41:20:21:0:0:20:21:0:0 chr1 23233346 . G A 185.44 PASS AO=34;DP=60;FAO=36;FDP=63;FR=.;FRO=27;FSAF=25;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.00188035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.7963;QD=11.7742;RBI=0.092924;REFB=-0.0167423;REVB=0.092905;RO=25;SAF=24;SAR=10;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0236776;STB=0.531897;TYPE=snp;VARB=0.0183461;OID=.;OPOS=23233346;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:63:25:27:34:36:10:24:17:8:11:25:17:10 chr1 23280424 . G T 67.85 PASS AO=12;DP=25;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.01131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.574;QD=10.0522;RBI=0.0780583;REFB=-0.0263998;REVB=-0.0772346;RO=10;SAF=11;SAR=1;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228989;STB=0.631363;TYPE=snp;VARB=0.0204866;OID=.;OPOS=23280424;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:25:27:10:13:12:14:1:11:8:2:2:12:9:4 chr1 23413027 . T C 188.89 PASS AO=49;DP=116;FAO=51;FDP=118;FR=.;FRO=67;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=28;FSRR=39;FWDB=-0.0112028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.041;QD=6.40303;RBI=0.0121594;REFB=-0.00517122;REVB=-0.00472754;RO=67;SAF=20;SAR=29;SRF=28;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0103409;STB=0.503596;TYPE=snp;VARB=0.00615482;OID=.;OPOS=23413027;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:118:67:67:49:51:29:20:28:39:30:21:28:39 chr1 23418153 . C T 445.62 PASS AO=90;DP=159;FAO=90;FDP=159;FR=.;FRO=69;FSAF=46;FSAR=44;FSRF=39;FSRR=30;FWDB=0.0256612;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3103;QD=11.2106;RBI=0.0441423;REFB=-0.000952824;REVB=-0.0359172;RO=69;SAF=46;SAR=44;SRF=39;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0431851;STB=0.523511;TYPE=snp;VARB=0.000621287;OID=.;OPOS=23418153;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:159:69:69:90:90:44:46:39:30:44:46:39:30 chr1 23419261 . G A 228.78 PASS AO=53;DP=110;FAO=53;FDP=108;FR=.;FRO=55;FSAF=18;FSAR=35;FSRF=16;FSRR=39;FWDB=-0.00474808;FXX=0.0181802;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.5678;QD=8.47329;RBI=0.011142;REFB=0.010486;REVB=0.0100797;RO=55;SAF=18;SAR=35;SRF=16;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0509217;STB=0.528142;TYPE=snp;VARB=-0.0116148;OID=.;OPOS=23419261;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:108:55:55:53:53:35:18:16:39:35:18:16:39 chr1 23419374 . G T 420.81 PASS AO=83;DP=134;FAO=88;FDP=159;FR=.;FRO=71;FSAF=37;FSAR=51;FSRF=18;FSRR=53;FWDB=-0.0327368;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=39.6277;QD=10.5864;RBI=0.0756709;REFB=-0.0510995;REVB=-0.068223;RO=51;SAF=33;SAR=50;SRF=18;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0330112;STB=0.578369;TYPE=snp;VARB=0.0307708;OID=.;OPOS=23419374;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:159:51:71:83:88:50:33:18:33:51:37:18:53 chr1 23419383 . C T 246.56 PASS AO=68;DP=169;FAO=71;FDP=171;FR=.;FRO=100;FSAF=40;FSAR=31;FSRF=26;FSRR=74;FWDB=0.00730295;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.8182;QD=5.76751;RBI=0.0858245;REFB=-0.00278332;REVB=-0.0855132;RO=97;SAF=37;SAR=31;SRF=25;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.296229;STB=0.672386;TYPE=snp;VARB=0.00251484;OID=.;OPOS=23419383;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:171:97:100:68:71:31:37:25:72:31:40:26:74 chr1 23419855 . T C 131 PASS AO=30;DP=62;FAO=30;FDP=62;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.0851297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.9574;QD=8.45172;RBI=0.0863559;REFB=-0.0207909;REVB=0.0145013;RO=32;SAF=19;SAR=11;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126936;STB=0.571221;TYPE=snp;VARB=0.0189001;OID=.;OPOS=23419855;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:32:32:30:30:11:19:16:16:11:19:16:16 chr1 23519633 . A G 234.73 PASS AO=54;DP=109;FAO=54;FDP=109;FR=.;FRO=55;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=32;FWDB=-0.00409322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.765;QD=8.61395;RBI=0.00793687;REFB=-0.0023485;REVB=0.00679995;RO=55;SAF=30;SAR=24;SRF=23;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12492;STB=0.56908;TYPE=snp;VARB=0.00172063;OID=.;OPOS=23519633;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:55:55:54:54:24:30:23:32:24:30:23:32 chr1 23687827 . T C 289.29 PASS AO=76;DP=172;FAO=77;FDP=173;FR=.;FRO=96;FSAF=26;FSAR=51;FSRF=37;FSRR=59;FWDB=-0.0263632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.916;QD=6.68876;RBI=0.0316614;REFB=0.00273585;REVB=-0.0175335;RO=95;SAF=26;SAR=50;SRF=37;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0514935;STB=0.529055;TYPE=snp;VARB=-0.00373549;OID=.;OPOS=23687827;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:173:95:96:76:77:50:26:37:58:51:26:37:59 chr1 23688933 . A G 131.87 PASS AO=40;DP=104;FAO=40;FDP=103;FR=.;FRO=63;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=43;FWDB=-0.023577;FXX=0.00961446;HRUN=3;LEN=1;MLLD=128.541;QD=5.12096;RBI=0.0302569;REFB=-0.012262;REVB=0.0189632;RO=61;SAF=20;SAR=20;SRF=19;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20187;STB=0.611597;TYPE=snp;VARB=0.0178654;OID=.;OPOS=23688933;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:103:61:63:40:40:20:20:19:42:20:20:20:43 chr1 23689083 . G A 214.85 PASS AO=48;DP=94;FAO=48;FDP=94;FR=.;FRO=46;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=-0.0144519;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.0873;QD=9.14243;RBI=0.0627796;REFB=-0.00369574;REVB=0.0610936;RO=46;SAF=24;SAR=24;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192399;STB=0.510634;TYPE=snp;VARB=0.00543294;OID=.;OPOS=23689083;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:46:46:48:48:24:24:22:24:24:24:22:24 chr1 23696152 . G A 210.01 PASS AO=22;DP=22;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0328728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.928;QD=36.524;RBI=0.0515159;REFB=0;REVB=0.0396644;RO=0;SAF=7;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.79751e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000628879;OID=.;OPOS=23696152;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:22:23:0:0:22:23:15:7:0:0:16:7:0:0 chr1 23697617 . T C 159.94 PASS AO=29;DP=58;FAO=32;FDP=58;FR=.;FRO=26;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.0534493;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.5738;QD=11.0305;RBI=0.0582733;REFB=-0.0221346;REVB=0.0232153;RO=29;SAF=16;SAR=13;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0618617;STB=0.576958;TYPE=snp;VARB=0.0175387;OID=.;OPOS=23697617;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:29:26:29:32:13:16:14:15:13:19:11:15 chr1 23698120 . C G 495.31 PASS AO=97;DP=168;FAO=98;FDP=168;FR=.;FRO=70;FSAF=27;FSAR=71;FSRF=19;FSRR=51;FWDB=0.0287938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.842;QD=11.793;RBI=0.0322322;REFB=-0.0156918;REVB=-0.0144855;RO=70;SAF=27;SAR=70;SRF=19;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00666904;STB=0.502134;TYPE=snp;VARB=0.0112231;OID=.;OPOS=23698120;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:70:70:97:98:70:27:19:51:71:27:19:51 chr1 23710805 . A G 905.67 PASS AO=95;DP=95;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0576727;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.5913;QD=37.7364;RBI=0.0611478;REFB=0;REVB=0.0203205;RO=0;SAF=58;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.87092e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000127829;OID=.;OPOS=23710805;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:95:96:0:0:95:96:37:58:0:0:38:58:0:0 chr1 23833611 . G T 312.99 PASS AO=84;DP=194;FAO=85;FDP=193;FR=.;FRO=108;FSAF=41;FSAR=44;FSRF=65;FSRR=43;FWDB=0.0356303;FXX=0.00515437;HRUN=6;LEN=1;MLLD=194.39;QD=6.48688;RBI=0.0375775;REFB=0.00163019;REVB=-0.0119393;RO=104;SAF=39;SAR=45;SRF=63;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14017;STB=0.566623;TYPE=snp;VARB=-0.00135774;OID=.;OPOS=23833611;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:193:104:108:84:85:45:39:63:41:44:41:65:43 chr1 23835794 . A G 277.7 PASS AO=55;DP=96;FAO=55;FDP=96;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=41;FSRF=14;FSRR=27;FWDB=0.0282685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.567;QD=11.5707;RBI=0.0283083;REFB=-0.00162139;REVB=-0.00149957;RO=41;SAF=14;SAR=41;SRF=14;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0850227;STB=0.546649;TYPE=snp;VARB=0.0015;OID=.;OPOS=23835794;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:41:41:55:55:41:14:14:27:41:14:14:27 chr1 23836364 . A G 49.72 PASS AO=9;DP=20;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.0215005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.9044;QD=9.47017;RBI=0.146751;REFB=0.0107478;REVB=0.145167;RO=11;SAF=6;SAR=3;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0311955;STB=0.51996;TYPE=snp;VARB=-0.00598458;OID=.;OPOS=23836364;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:20:21:11:11:9:10:3:6:7:4:4:6:7:4 chr1 23847464 . C A 238.45 PASS AO=49;DP=90;FAO=49;FDP=90;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=35;FSRF=6;FSRR=35;FWDB=0.0197106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.673;QD=10.5977;RBI=0.0318314;REFB=-0.0172723;REVB=0.0249947;RO=41;SAF=14;SAR=35;SRF=6;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152799;STB=0.583302;TYPE=snp;VARB=0.00963924;OID=.;OPOS=23847464;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:41:41:49:49:35:14:6:35:35:14:6:35 chr1 23885498 . T C 1999.35 PASS AO=211;DP=215;FAO=213;FDP=213;FR=.;FRO=0;FSAF=119;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0414729;FXX=0.0229347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.243;QD=37.5465;RBI=0.0469194;REFB=-0.0341862;REVB=0.0219416;RO=0;SAF=118;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.8594e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000750322;OID=.;OPOS=23885498;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:215:213:0:0:211:213:93:118:0:0:94:119:0:0 chr1 23965704 . A C 406.11 PASS AO=110;DP=249;FAO=110;FDP=249;FR=.;FRO=139;FSAF=53;FSAR=57;FSRF=65;FSRR=74;FWDB=-0.0285362;FXX=0.00399984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.4496;QD=6.52386;RBI=0.0287229;REFB=-0.00941862;REVB=-0.00326952;RO=139;SAF=53;SAR=57;SRF=65;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0142988;STB=0.507936;TYPE=snp;VARB=0.00982845;OID=.;OPOS=23965704;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:249:249:139:139:110:110:57:53:65:74:57:53:65:74 chr1 23966894 . T TAAG 74.83 PASS AO=23;DP=80;FAO=26;FDP=77;FR=.;FRO=51;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=36;FSRR=15;FWDB=-0.0126063;FXX=0.0253133;HRUN=2;LEN=3;MLLD=150.232;QD=3.88715;RBI=0.012638;REFB=-0.00145973;REVB=0.000893324;RO=54;SAF=7;SAR=16;SRF=37;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.430999;STB=0.77421;TYPE=ins;VARB=0.00494395;OID=.;OPOS=23966895;OREF=-;OALT=AAG;OMAPALT=TAAG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:23:80:26:77:51:7:19:36:15:74:54:7:16:37:17 chr1 24018277 . C G 1075.05 PASS AO=114;DP=115;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.016121;FXX=0.0172399;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.4966;QD=37.721;RBI=0.0276219;REFB=-0.0751306;REVB=0.0224295;RO=1;SAF=41;SAR=73;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00646095;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000498179;OID=.;OPOS=24018277;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:115:114:1:0:114:114:73:41:0:1:73:41:0:0 chr1 24121601 . C T 276.36 PASS AO=19;DP=40;FAO=33;FDP=36;FR=.;FRO=3;FSAF=9;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.00895795;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=208.231;QD=30.7067;RBI=0.0305769;REFB=-0.113104;REVB=0.0292353;RO=0;SAF=3;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506325;TYPE=snp;VARB=0.000582905;OID=.;OPOS=24121601;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:20:36:0:3:19:33:16:3:0:0:24:9:1:2 chr1 24134721 . T C 1385.67 PASS AO=145;DP=145;FAO=145;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00703997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1426;QD=38.2253;RBI=0.0232238;REFB=0;REVB=0.0221311;RO=0;SAF=84;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11288e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000129077;OID=.;OPOS=24134721;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:145:145:0:0:145:145:61:84:0:0:61:84:0:0 chr1 24201094 . G C 1081.67 PASS AO=114;DP=116;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0177576;FXX=0.00861995;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6558;QD=37.6234;RBI=0.0383784;REFB=-0.0149049;REVB=-0.0340231;RO=1;SAF=64;SAR=50;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0094022;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000377707;OID=.;OPOS=24201094;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:116:115:1:0:114:115:50:64:0:1:50:65:0:0 chr1 24201109 . C T 1015.09 PASS AO=92;DP=102;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0120511;FXX=0.0363603;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.453;QD=38.3051;RBI=0.0129108;REFB=0;REVB=-0.00463253;RO=0;SAF=50;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0093508;OID=.;OPOS=24201109;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:102:106:0:0:92:106:42:50:0:0:48:58:0:0 chr1 24201262 . A G 453.27 PASS AO=55;DP=62;FAO=57;FDP=63;FR=.;FRO=6;FSAF=17;FSAR=40;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.0421945;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.1226;QD=28.7788;RBI=0.0796641;REFB=-0.101872;REVB=-0.0675722;RO=6;SAF=15;SAR=40;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155999;STB=0.574973;TYPE=snp;VARB=0.0153964;OID=.;OPOS=24201262;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:62:63:6:6:55:57:40:15:6:0:40:17:6:0 chr1 24201357 . A G 313.5 PASS AO=33;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0423414;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.741;QD=36.8827;RBI=0.0424111;REFB=0;REVB=-0.00243157;RO=0;SAF=11;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0035787;OID=.;OPOS=24201357;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:34:0:0:33:34:22:11:0:0:22:12:0:0 chr1 24201448 . C T 495.06 PASS AO=53;DP=54;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00480836;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.275;QD=36.0041;RBI=0.079897;REFB=0.122074;REVB=-0.0797522;RO=0;SAF=33;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.88914e-08;STB=0.512191;TYPE=snp;VARB=-0.00424891;OID=.;OPOS=24201448;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:54:55:0:1:53:54:20:33:0:0:20:34:0:1 chr1 24201643 . G A 723.86 PASS AO=75;DP=75;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.539;QD=38.0977;RBI=0.0654301;REFB=0;REVB=0.0645082;RO=0;SAF=25;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000165167;OID=.;OPOS=24201643;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:75:76:0:0:75:76:50:25:0:0:50:26:0:0 chr1 24201919 . T C 649.59 PASS AO=63;DP=64;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0413342;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.135;QD=36.0884;RBI=0.0919873;REFB=-0.142029;REVB=0.0821775;RO=1;SAF=45;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0255073;STB=0.509431;TYPE=snp;VARB=0.00233314;OID=.;OPOS=24201919;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:64:72:1:1:63:71:18:45:0:1:26:45:0:1 chr1 24201920 . T C 712.12 PASS AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0298634;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.437;QD=37.9799;RBI=0.0692525;REFB=0;REVB=0.0624827;RO=0;SAF=48;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.00823e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.55507e-05;OID=.;OPOS=24201920;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:75:75:0:0:75:75:27:48:0:0:27:48:0:0 chr1 24288476 . T C 1774.23 PASS AO=114;DP=198;FAO=190;FDP=190;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0527702;FXX=0.0155432;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.702;QD=37.3523;RBI=0.117198;REFB=-0.042975;REVB=0.104645;RO=0;SAF=46;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000348308;OID=.;OPOS=24288476;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:117:190:0:0:114:190:68:46:0:0:119:71:0:0 chr1 24288529 . TAAAC T 1372.57 PASS AO=163;DP=184;FAO=175;FDP=175;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=138;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0261946;FXX=0.0691453;HRUN=3;LEN=4;MLLD=254.669;QD=31.3731;RBI=0.0271176;REFB=0;REVB=0.00701476;RO=0;SAF=28;SAR=135;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0010972;OID=.;OPOS=24288530;OREF=AAAC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:163:171:175:175:0:37:138:0:0:99:0:28:135:0:0 chr1 24289057 . G C 174.29 PASS AO=35;DP=65;FAO=36;FDP=66;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.0248275;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.112;QD=10.5634;RBI=0.025219;REFB=-0.03526;REVB=0.0044268;RO=29;SAF=16;SAR=19;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0493651;STB=0.527762;TYPE=snp;VARB=0.0246206;OID=.;OPOS=24289057;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:66:29:30:35:36:19:16:15:14:19:17:16:14 chr1 24383919 . T C 403.65 PASS AO=81;DP=142;FAO=81;FDP=142;FR=.;FRO=61;FSAF=32;FSAR=49;FSRF=29;FSRR=32;FWDB=-0.0180819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.587;QD=11.3705;RBI=0.0401013;REFB=-0.0179604;REVB=0.0357933;RO=61;SAF=32;SAR=49;SRF=29;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0652213;STB=0.535558;TYPE=snp;VARB=0.0174782;OID=.;OPOS=24383919;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:61:61:81:81:49:32:29:32:49:32:29:32 chr1 24416059 . T C 524.57 PASS AO=41;DP=43;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.119855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.3107;QD=36.8116;RBI=0.127059;REFB=0;REVB=0.0421749;RO=0;SAF=19;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0021568;OID=.;OPOS=24416059;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:43:57:0:0:41:57:22:19:0:0:28:29:0:0 chr1 24416070 . G C 87.46 PASS AO=26;DP=66;FAO=26;FDP=68;FR=.;FRO=42;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=28;FWDB=0.0256027;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=182.526;QD=5.1448;RBI=0.0257813;REFB=-0.00655717;REVB=-0.0030296;RO=40;SAF=13;SAR=13;SRF=14;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159282;STB=0.602865;TYPE=snp;VARB=0.0127002;OID=.;OPOS=24416070;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:66:68:40:42:26:26:13:13:14:26:13:13:14:28 chr1 24417415 . T C 162.95 PASS AO=39;DP=85;FAO=40;FDP=86;FR=.;FRO=46;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=31;FWDB=-0.0280618;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0898;QD=7.57918;RBI=0.0764531;REFB=0.00967143;REVB=-0.0711169;RO=45;SAF=19;SAR=20;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148573;STB=0.592978;TYPE=snp;VARB=-0.0144043;OID=.;OPOS=24417415;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:86:45:46:39:40:20:19:15:30:20:20:15:31 chr1 24418768 . T C 23.02 PASS AO=7;DP=24;FAO=7;FDP=24;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.139902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.1415;QD=3.83643;RBI=0.139917;REFB=0.00539073;REVB=-0.00205308;RO=14;SAF=4;SAR=3;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0795555;STB=0.530034;TYPE=snp;VARB=-0.0157511;OID=.;OPOS=24418768;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:24:24:14:17:7:7:3:4:9:5:3:4:9:8 chr1 24419496 . A G 182.03 PASS AO=37;DP=69;FAO=37;FDP=68;FR=.;FRO=31;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.02402;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.804;QD=10.7075;RBI=0.0292713;REFB=0.0129867;REVB=0.0167287;RO=31;SAF=20;SAR=17;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00651972;STB=0.503601;TYPE=snp;VARB=-0.0142761;OID=.;OPOS=24419496;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:68:31:31:37:37:17:20:17:14:17:20:17:14 chr1 24421474 . G A 126.67 PASS AO=39;DP=103;FAO=39;FDP=102;FR=.;FRO=63;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=31;FSRR=32;FWDB=0.00322362;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.291;QD=4.96756;RBI=0.00627799;REFB=-0.014562;REVB=-0.00538716;RO=63;SAF=15;SAR=24;SRF=31;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118962;STB=0.567866;TYPE=snp;VARB=0.0221133;OID=.;OPOS=24421474;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:102:63:63:39:39:24:15:31:32:24:15:31:32 chr1 24421950 . C G 171.57 PASS AO=41;DP=86;FAO=41;FDP=86;FR=.;FRO=45;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=-0.0110146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.7823;QD=7.97986;RBI=0.0354612;REFB=-0.0127581;REVB=0.0337072;RO=45;SAF=17;SAR=24;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0707595;STB=0.539462;TYPE=snp;VARB=0.014306;OID=.;OPOS=24421950;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:45:45:41:41:24:17:22:23:24:17:22:23 chr1 24448084 . G A 133.59 PASS AO=31;DP=61;FAO=31;FDP=65;FR=.;FRO=34;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=-2.37492e-05;FXX=0.0151492;HRUN=3;LEN=1;MLLD=138.255;QD=8.22095;RBI=0.0210251;REFB=-0.0498168;REVB=0.0210251;RO=30;SAF=22;SAR=9;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.338235;STB=0.663093;TYPE=snp;VARB=0.0378472;OID=.;OPOS=24448084;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:65:30:34:31:31:9:22:10:20:9:22:14:20 chr1 24454688 . C T 212.57 PASS AO=57;DP=131;FAO=57;FDP=131;FR=.;FRO=74;FSAF=20;FSAR=37;FSRF=35;FSRR=39;FWDB=-0.0239541;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.395;QD=6.49077;RBI=0.0239814;REFB=-0.00753177;REVB=-0.00114479;RO=73;SAF=20;SAR=37;SRF=34;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121241;STB=0.572407;TYPE=snp;VARB=0.00717699;OID=.;OPOS=24454688;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:73:74:57:57:37:20:34:39:37:20:35:39 chr1 24460797 . T G 1156.68 PASS AO=141;DP=153;FAO=141;FDP=154;FR=.;FRO=13;FSAF=70;FSAR=71;FSRF=1;FSRR=12;FWDB=-0.0651343;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.794;QD=30.0437;RBI=0.074008;REFB=-0.0526755;REVB=-0.0351384;RO=12;SAF=70;SAR=71;SRF=1;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0614644;STB=0.53543;TYPE=snp;VARB=0.0196846;OID=.;OPOS=24460797;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:153:154:12:13:141:141:71:70:1:11:71:70:1:12 chr1 24480905 . C T 385.33 PASS AO=84;DP=161;FAO=84;FDP=160;FR=.;FRO=76;FSAF=45;FSAR=39;FSRF=35;FSRR=41;FWDB=0.0238575;FXX=0.00621079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.838;QD=9.63326;RBI=0.0368105;REFB=-0.0436969;REVB=-0.0280327;RO=76;SAF=45;SAR=39;SRF=35;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0651537;STB=0.535706;TYPE=snp;VARB=0.0278416;OID=.;OPOS=24480905;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:160:76:76:84:84:39:45:35:41:39:45:35:41 chr1 24658063 . C G 399.75 PASS AO=95;DP=194;FAO=95;FDP=193;FR=.;FRO=98;FSAF=24;FSAR=71;FSRF=37;FSRR=61;FWDB=-0.000154108;FXX=0.00515437;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.716;QD=8.285;RBI=0.0172004;REFB=-0.0026518;REVB=-0.0171997;RO=96;SAF=24;SAR=71;SRF=37;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146968;STB=0.577526;TYPE=snp;VARB=0.00170674;OID=.;OPOS=24658063;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:193:96:98:95:95:71:24:37:59:71:24:37:61 chr1 24663184 . T C 83.49 PASS AO=25;DP=66;FAO=25;FDP=66;FR=.;FRO=41;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=-0.022143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.963;QD=5.06007;RBI=0.0233491;REFB=-0.0182551;REVB=-0.00740708;RO=41;SAF=7;SAR=18;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.314237;STB=0.681668;TYPE=snp;VARB=0.02335;OID=.;OPOS=24663184;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:66:66:41:41:25:25:18:7:23:18:18:7:23:18 chr1 24671418 . A G 125.83 PASS AO=30;DP=65;FAO=30;FDP=64;FR=.;FRO=34;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=25;FWDB=0.0645908;FXX=0.0153822;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.109;QD=7.86433;RBI=0.0647289;REFB=-0.01962;REVB=0.00422632;RO=33;SAF=20;SAR=10;SRF=8;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.383883;STB=0.706938;TYPE=snp;VARB=0.032066;OID=.;OPOS=24671418;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:64:33:34:30:30:10:20:8:25:10:20:9:25 chr1 24680915 . C T 253.02 PASS AO=58;DP=113;FAO=57;FDP=112;FR=.;FRO=55;FSAF=21;FSAR=36;FSRF=23;FSRR=32;FWDB=0.0800569;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.183;QD=9.03647;RBI=0.0806472;REFB=0.00904318;REVB=-0.00973981;RO=54;SAF=21;SAR=37;SRF=23;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0593216;STB=0.525887;TYPE=snp;VARB=-0.00893329;OID=.;OPOS=24680915;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:112:54:55:58:57:37:21:23:31:36:21:23:32 chr1 24706113 . G A 331.19 PASS AO=108;DP=282;FAO=108;FDP=282;FR=.;FRO=174;FSAF=79;FSAR=29;FSRF=101;FSRR=73;FWDB=-0.0222299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.0105;QD=4.69776;RBI=0.025982;REFB=-0.00354559;REVB=0.0134497;RO=170;SAF=79;SAR=29;SRF=101;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171917;STB=0.606848;TYPE=snp;VARB=0.00864561;OID=.;OPOS=24706113;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:282:282:170:174:108:108:29:79:101:69:29:79:101:73 chr1 24706269 . A G 335.05 PASS AO=99;DP=240;FAO=99;FDP=241;FR=.;FRO=142;FSAF=39;FSAR=60;FSRF=65;FSRR=77;FWDB=0.00257427;FXX=0.00413206;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.956;QD=5.56099;RBI=0.0163117;REFB=-0.0217219;REVB=-0.0161073;RO=141;SAF=39;SAR=60;SRF=64;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0648723;STB=0.538713;TYPE=snp;VARB=0.0296319;OID=.;OPOS=24706269;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:240:241:141:142:99:99:60:39:64:77:60:39:65:77 chr1 24706292 . T C 312.42 PASS AO=75;DP=208;FAO=79;FDP=185;FR=.,HEALED;FRO=98;FSAF=26;FSAR=53;FSRF=43;FSRR=55;FWDB=0.0171071;FXX=0.0263144;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.964;QD=6.75512;RBI=0.0192255;REFB=-0.0157735;REVB=-0.00877311;RO=77;SAF=26;SAR=49;SRF=43;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199798;STB=0.565644;TYPE=snp;VARB=0.0122619;OID=.;OPOS=24706292;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:185:77:98:75:79:49:26:43:34:53:26:43:55 chr1 24718075 . T C 174.77 PASS AO=57;DP=155;FAO=58;FDP=156;FR=.;FRO=98;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=70;FSRR=28;FWDB=-0.0194839;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.4602;QD=4.48139;RBI=0.0458226;REFB=0.00778351;REVB=0.0414739;RO=98;SAF=29;SAR=28;SRF=70;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231525;STB=0.62496;TYPE=snp;VARB=-0.012509;OID=.;OPOS=24718075;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:156:98:98:57:58:28:29:70:28:28:30:70:28 chr1 24785393 . C T 477.42 PASS AO=110;DP=212;FAO=109;FDP=212;FR=.;FRO=103;FSAF=56;FSAR=53;FSRF=45;FSRR=58;FWDB=0.0087259;FXX=0.00469462;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.3085;QD=9.00793;RBI=0.0089481;REFB=-0.029442;REVB=-0.00198169;RO=101;SAF=57;SAR=53;SRF=44;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0720952;STB=0.537291;TYPE=snp;VARB=0.0271406;OID=.;OPOS=24785393;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:212:101:103:110:109:53:57:44:57:53:56:45:58 chr1 25255982 . C T 90.04 PASS AO=11;DP=12;FAO=11;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0173728;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.079;QD=30.0129;RBI=0.0173873;REFB=-0.125154;REVB=0.000708585;RO=0;SAF=2;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.526269;TYPE=snp;VARB=0.00372538;OID=.;OPOS=25255982;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:12:12:0:1:11:11:9:2:0:0:9:2:0:1 chr1 25291010 . A T 656.02 PASS AO=69;DP=69;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0122524;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.9794;QD=38.5895;RBI=0.0131575;REFB=0;REVB=-0.00479577;RO=0;SAF=44;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000791347;OID=.;OPOS=25291010;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:69:68:0:0:69:68:25:44:0:0:25:43:0:0 chr1 25554719 . G A 119.1 PASS AO=24;DP=44;FAO=24;FDP=44;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=17;FWDB=0.0235549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.589;QD=10.8273;RBI=0.0661382;REFB=-0.0217889;REVB=-0.0618015;RO=20;SAF=12;SAR=12;SRF=3;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.288047;STB=0.658972;TYPE=snp;VARB=0.00545687;OID=.;OPOS=25554719;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:44:44:20:20:24:24:12:12:3:17:12:12:3:17 chr1 25570081 . T C 364.39 PASS AO=104;DP=232;FAO=101;FDP=230;FR=.;FRO=129;FSAF=27;FSAR=74;FSRF=50;FSRR=79;FWDB=-0.0158083;FXX=0.00862032;HRUN=5;LEN=1;MLLD=45.1536;QD=6.33721;RBI=0.0742262;REFB=0.00667848;REVB=-0.0725233;RO=120;SAF=29;SAR=75;SRF=43;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0911512;STB=0.579696;TYPE=snp;VARB=-0.00807747;OID=.;OPOS=25570081;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:230:120:129:104:101:75:29:43:77:74:27:50:79 chr1 25722206 . T C 139.09 PASS AO=29;DP=63;FAO=32;FDP=64;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=23;FWDB=0.0508156;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.8332;QD=8.69289;RBI=0.0851099;REFB=-0.0272755;REVB=0.068275;RO=30;SAF=12;SAR=17;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109123;STB=0.580923;TYPE=snp;VARB=0.028607;OID=.;OPOS=25722206;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:64:30:32:29:32:17:12:9:21:18:14:9:23 chr1 25890189 . A G 279.36 PASS AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00043141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.4492;QD=38.5329;RBI=0.0100535;REFB=0;REVB=0.0100442;RO=0;SAF=10;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.03846e-05;OID=.;OPOS=25890189;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:29:29:0:0:29:29:19:10:0:0:19:10:0:0 chr1 25893546 . G A 275.05 PASS AO=48;DP=72;FAO=48;FDP=75;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=33;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.0341007;FXX=0.0259707;HRUN=5;LEN=1;MLLD=148.27;QD=14.6695;RBI=0.0546676;REFB=-0.0566981;REVB=0.0427281;RO=22;SAF=15;SAR=33;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147458;STB=0.594554;TYPE=snp;VARB=0.0218725;OID=.;OPOS=25893546;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:72:75:22:27:48:48:33:15:12:10:33:15:15:12 chr1 26073242 . G A 52.87 PASS AO=10;DP=28;FAO=11;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=15;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.0311238;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7233;QD=7.55316;RBI=0.0494662;REFB=-0.02225;REVB=0.0384475;RO=11;SAF=3;SAR=7;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.443089;STB=0.67093;TYPE=snp;VARB=0.0399856;OID=.;OPOS=26073242;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:27:28:11:15:10:11:7:3:9:2:7:4:10:5 chr1 26131654 . G A 1321.92 PASS AO=137;DP=139;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00171021;FXX=0.00719373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.101;QD=38.3166;RBI=0.0208193;REFB=0;REVB=0.0207489;RO=0;SAF=72;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000217772;OID=.;OPOS=26131654;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:139:138:0:0:137:138:65:72:0:0:66:72:0:0 chr1 26138260 . CCT C,CC,CCC 273.79 PASS AO=14,9,9;DP=35;FAO=0,26,6;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=0,17,6;FSAR=0,9,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.384465,-0.117263,0.258995;FXX=0;HRUN=2,2,2;LEN=2,1,1;MLLD=6.35674,16.8962,12.0171;QD=34.2231;RBI=0.526657,0.16113,0.352827;REFB=0,0,0;REVB=0.359936,0.110509,-0.239602;RO=0;SAF=14,8,1;SAR=0,1,8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.232698,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=del,del,snp;VARB=0,0.00114749,0.0315001;OID=.,.,.;OPOS=26138261,26138262,26138262;OREF=CT,T,T;OALT=-,-,C;OMAPALT=C,CC,CCC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/3:14,9,9:32:0,26,6:32:0:0,17,6:0,9,0:0:0:12:0:14,8,1:0,1,8:0:0 chr1 26140573 . C A 768.88 PASS AO=79;DP=79;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.10912;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.3822;QD=37.9695;RBI=0.109302;REFB=0;REVB=0.0063021;RO=0;SAF=40;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33478e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00101682;OID=.;OPOS=26140573;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:79:81:0:0:79:81:39:40:0:0:39:42:0:0 chr1 26143417 . TA T 29.71 PASS AO=11;DP=66;FAO=24;FDP=60;FR=.;FRO=36;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=6;FSRR=30;FWDB=-0.137026;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.0369;QD=1.98048;RBI=0.137084;REFB=-0.0718268;REVB=-0.00395829;RO=32;SAF=1;SAR=10;SRF=5;SRR=27;SSEN=0.308411;SSEP=0;SSSB=-0.183457;STB=0.571374;TYPE=del;VARB=0.103705;OID=.;OPOS=26143418;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:11:54:24:60:36:6:18:6:30:29:32:1:10:5:27 chr1 26158962 . A G 473.59 PASS AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0376719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.332;QD=35.7429;RBI=0.0484026;REFB=-0.0871713;REVB=0.0303915;RO=1;SAF=13;SAR=39;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119271;STB=0.506327;TYPE=snp;VARB=0.000889523;OID=.;OPOS=26158962;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:53:53:1:1:52:52:39:13:0:1:39:13:0:1 chr1 26290745 . G C 616.64 PASS AO=59;DP=59;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0224207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.362;QD=37.947;RBI=0.0711384;REFB=0;REVB=0.0675128;RO=0;SAF=42;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.68559e-05;OID=.;OPOS=26290745;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:59:65:0:0:59:65:17:42:0:0:23:42:0:0 chr1 26357656 . C A 1182.01 PASS AO=123;DP=123;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137789;FXX=0.0314936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.758;QD=38.4395;RBI=0.0178191;REFB=0;REVB=0.0112988;RO=0;SAF=65;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000228096;OID=.;OPOS=26357656;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:123:123:0:0:123:123:58:65:0:0:57:66:0:0 chr1 26378002 . C T 820.09 PASS AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00485983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.117;QD=38.1438;RBI=0.00740727;REFB=0;REVB=-0.00559014;RO=0;SAF=50;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.49291e-05;OID=.;OPOS=26378002;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:86:86:0:0:86:86:36:50:0:0:36:50:0:0 chr1 26449335 . CAA C 794.5 PASS AO=98;DP=103;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00494925;FXX=0.0660315;HRUN=2;LEN=2;MLLD=121.271;QD=32.1009;RBI=0.0160813;REFB=0;REVB=0.0153007;RO=0;SAF=36;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-3.99326e-05;OID=.;OPOS=26449336;OREF=AA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:98:102:99:99:0:35:64:0:0:69:0:36:62:0:0 chr1 26526375 . G A 139.84 PASS AO=39;DP=94;FAO=39;FDP=94;FR=.;FRO=55;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=25;FSRR=30;FWDB=0.0270246;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8893;QD=5.95066;RBI=0.0921578;REFB=0.00315268;REVB=0.0881063;RO=53;SAF=14;SAR=25;SRF=25;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120021;STB=0.558709;TYPE=snp;VARB=-0.00384516;OID=.;OPOS=26526375;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:53:55:39:39:25:14:25:28:25:14:25:30 chr1 26527951 . G A 186.24 PASS AO=40;DP=80;FAO=41;FDP=81;FR=.;FRO=40;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=27;FWDB=-0.0716261;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.1729;QD=9.19685;RBI=0.100312;REFB=0.0220678;REVB=0.0702294;RO=38;SAF=21;SAR=19;SRF=13;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160048;STB=0.592038;TYPE=snp;VARB=-0.023251;OID=.;OPOS=26527951;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:81:38:40:40:41:19:21:13:25:20:21:13:27 chr1 26582091 . G A 168.95 PASS AO=47;DP=120;FAO=50;FDP=123;FR=.;FRO=73;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=37;FSRR=36;FWDB=0.0304604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.372;QD=5.49429;RBI=0.0341436;REFB=-0.00957248;REVB=-0.0154258;RO=72;SAF=21;SAR=26;SRF=37;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0718573;STB=0.551997;TYPE=snp;VARB=0.0183385;OID=.;OPOS=26582091;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:123:72:73:47:50:26:21:37:35:29:21:37:36 chr1 26596080 . G A 306.94 PASS AO=61;DP=107;FAO=61;FDP=106;FR=.;FRO=45;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=0.0185296;FXX=0.0185168;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.688;QD=11.5825;RBI=0.0192165;REFB=-0.00197724;REVB=0.0050919;RO=45;SAF=31;SAR=30;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0150081;STB=0.508194;TYPE=snp;VARB=0.00140493;OID=.;OPOS=26596080;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:106:45:45:61:61:30:31:22:23:30:31:22:23 chr1 26607726 . T G 137.82 PASS AO=40;DP=100;FAO=40;FDP=100;FR=.;FRO=60;FSAF=3;FSAR=37;FSRF=5;FSRR=55;FWDB=0.00424684;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.901;QD=5.51283;RBI=0.00500815;REFB=-0.00207717;REVB=-0.00265443;RO=60;SAF=3;SAR=37;SRF=5;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0307287;STB=0.517474;TYPE=snp;VARB=0.00343142;OID=.;OPOS=26607726;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:60:60:40:40:37:3:5:55:37:3:5:55 chr1 26608782 . C T 41.73 PASS AO=4;DP=17;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=0;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=0.00158899;FXX=0.0587889;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.0571;QD=10.432;RBI=0.00158899;REFB=-0.0318444;REVB=0;RO=7;SAF=4;SAR=0;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0318049;OID=.;OPOS=26608782;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:12:16:7:8:4:8:0:4:7:0:0:8:8:0 chr1 26608814 . A G 186.26 PASS AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00593951;FXX=0.049975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.507;QD=39.2134;RBI=0.00593951;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=19;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.44921e-05;OID=.;OPOS=26608814;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:19:19:0:0:19:19:0:19:0:0:0:19:0:0 chr1 26608843 . C A 12.53 PASS AO=3;DP=11;FAO=3;FDP=12;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=9;FSRR=0;FWDB=-0.0190068;FXX=0.076864;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.588;QD=4.17532;RBI=0.0190068;REFB=-0.00720055;REVB=0;RO=8;SAF=3;SAR=0;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0843978;OID=.;OPOS=26608843;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:11:12:8:9:3:3:0:3:8:0:0:3:9:0 chr1 26608849 . T A 17.42 PASS AO=3;DP=10;FAO=3;FDP=9;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.00705314;FXX=0.307456;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.548;QD=7.744;RBI=0.00705314;REFB=-0.0269672;REVB=0;RO=6;SAF=3;SAR=0;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0314026;OID=.;OPOS=26608849;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:10:9:6:6:3:3:0:3:6:0:0:3:6:0 chr1 26608853 . G A 15.51 PASS AO=3;DP=10;FAO=3;FDP=10;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=-0.0209238;FXX=0.230592;HRUN=4;LEN=1;MLLD=113.665;QD=6.20379;RBI=0.0209238;REFB=-0.0199024;REVB=0;RO=6;SAF=3;SAR=0;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0502356;OID=.;OPOS=26608853;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:10:10:6:7:3:3:0:3:6:0:0:3:7:0 chr1 26608855 . C T 12.15 PASS AO=3;DP=12;FAO=3;FDP=13;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=10;FSRR=0;FWDB=-0.00818439;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.011;QD=3.73764;RBI=0.00818439;REFB=-0.0261612;REVB=0;RO=8;SAF=3;SAR=0;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0341801;OID=.;OPOS=26608855;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:12:13:8:10:3:3:0:3:8:0:0:3:10:0 chr1 26608873 . T A 33.2 PASS AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=0;FWDB=-0.00549468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.553;QD=8.29999;RBI=0.0164321;REFB=-0.00631812;REVB=0.0154862;RO=9;SAF=5;SAR=2;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.41721;STB=0.736402;TYPE=snp;VARB=0.00904427;OID=.;OPOS=26608873;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:16:16:9:9:7:7:2:5:9:0:2:5:9:0 chr1 26609259 . C T 40.03 PASS AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.0316786;FXX=0.0713776;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.0622;QD=12.3177;RBI=0.0768717;REFB=-0.0227588;REVB=-0.0700408;RO=6;SAF=6;SAR=1;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.637124;STB=0.873989;TYPE=snp;VARB=0.00871195;OID=.;OPOS=26609259;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:14:13:6:6:7:7:1:6:0:6:1:6:0:6 chr1 26610891 . A C 375.61 PASS AO=38;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00999827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.913;QD=38.5237;RBI=0.0186391;REFB=0;REVB=-0.0157305;RO=0;SAF=15;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.53689e-05;OID=.;OPOS=26610891;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:38:39:0:0:38:39:23:15:0:0:23:16:0:0 chr1 26612460 . G A 134.01 PASS AO=34;DP=76;FAO=34;FDP=76;FR=.;FRO=42;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=30;FWDB=0.0533426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.535;QD=7.05329;RBI=0.0533435;REFB=-0.0130789;REVB=0.000298787;RO=42;SAF=15;SAR=19;SRF=12;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158983;STB=0.588893;TYPE=snp;VARB=0.017574;OID=.;OPOS=26612460;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:42:42:34:34:19:15:12:30:19:15:12:30 chr1 26646726 . A G 57.95 PASS AO=15;DP=41;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.00327659;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.8587;QD=5.51873;RBI=0.0103032;REFB=-0.0310197;REVB=0.0097683;RO=26;SAF=11;SAR=4;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.308481;STB=0.692054;TYPE=snp;VARB=0.06037;OID=.;OPOS=26646726;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:41:42:26:26:15:16:4:11:12:14:4:12:12:14 chr1 26646730 . A G 65.24 PASS AO=16;DP=41;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.00572381;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.529;QD=6.21377;RBI=0.00572674;REFB=-0.0232563;REVB=-0.00018314;RO=25;SAF=11;SAR=5;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.265318;STB=0.664523;TYPE=snp;VARB=0.0096582;OID=.;OPOS=26646730;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:41:42:25:25:16:17:5:11:11:14:5:12:11:14 chr1 26648381 . C T 100.35 PASS AO=33;DP=92;FAO=33;FDP=92;FR=.;FRO=59;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=34;FWDB=0.019493;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.466;QD=4.36283;RBI=0.0229828;REFB=-0.000191563;REVB=0.0121751;RO=56;SAF=11;SAR=22;SRF=25;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132013;STB=0.562461;TYPE=snp;VARB=0.000385569;OID=.;OPOS=26648381;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:56:59:33:33:22:11:25:31:22:11:25:34 chr1 26648551 . G C 119.08 PASS AO=24;DP=44;FAO=24;FDP=44;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.00258499;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=176.552;QD=10.8258;RBI=0.00598998;REFB=-0.0216383;REVB=0.00540349;RO=20;SAF=9;SAR=15;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223933;STB=0.624896;TYPE=snp;VARB=0.0208151;OID=.;OPOS=26648551;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:44:44:20:20:24:24:15:9:13:7:15:9:13:7 chr1 26663362 . C T 45.7 PASS AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0250051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.918;QD=13.057;RBI=0.0333958;REFB=-0.00166394;REVB=0.0221365;RO=6;SAF=4;SAR=4;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122361;STB=0.571253;TYPE=snp;VARB=0.00988346;OID=.;OPOS=26663362;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:14:14:6:6:8:8:4:4:4:2:4:4:4:2 chr1 26664968 . C T 295.95 PASS AO=57;DP=100;FAO=58;FDP=101;FR=.;FRO=43;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=32;FSRR=11;FWDB=0.00829428;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.429;QD=11.7208;RBI=0.0158911;REFB=0.00399468;REVB=-0.0135548;RO=42;SAF=28;SAR=29;SRF=32;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210179;STB=0.603926;TYPE=snp;VARB=-0.00232387;OID=.;OPOS=26664968;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:101:42:43:57:58:29:28:32:10:29:29:32:11 chr1 26670444 . G T 225.05 PASS AO=61;DP=141;FAO=61;FDP=141;FR=.;FRO=80;FSAF=20;FSAR=41;FSRF=28;FSRR=52;FWDB=0.0210877;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=171.012;QD=6.38434;RBI=0.0228723;REFB=0.00909929;REVB=0.00885727;RO=79;SAF=20;SAR=41;SRF=28;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0300404;STB=0.514102;TYPE=snp;VARB=-0.00984108;OID=.;OPOS=26670444;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:79:80:61:61:41:20:28:51:41:20:28:52 chr1 26670609 . C T 97.46 PASS AO=16;DP=24;FAO=16;FDP=24;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.0903261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.023;QD=16.2432;RBI=0.0906533;REFB=-0.0154281;REVB=0.00769539;RO=8;SAF=6;SAR=10;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168034;STB=0.592916;TYPE=snp;VARB=0.015993;OID=.;OPOS=26670609;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:24:24:8:8:16:16:10:6:1:7:10:6:1:7 chr1 26671318 . GA G 12.09 PASS AO=3;DP=18;FAO=3;FDP=14;FR=.;FRO=11;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=-0.0799088;FXX=0.0666222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.777;QD=3.45289;RBI=0.0799659;REFB=-0.0189504;REVB=-0.00301953;RO=9;SAF=1;SAR=2;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145032;STB=0.555203;TYPE=del;VARB=0.0544343;OID=.;OPOS=26671319;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:3:15:3:14:11:1:2:3:8:12:9:1:2:2:7 chr1 26671658 . G A 27.72 PASS AO=7;DP=18;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.0109217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.9252;QD=5.54436;RBI=0.179105;REFB=-0.0237958;REVB=-0.178772;RO=11;SAF=4;SAR=3;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0263346;STB=0.571224;TYPE=snp;VARB=0.132394;OID=.;OPOS=26671658;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:18:20:11:13:7:7:3:4:6:5:3:4:6:7 chr1 26671690 . A G 23.9 PASS AO=8;DP=19;FAO=6;FDP=19;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.0653395;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.6562;QD=5.03221;RBI=0.220077;REFB=-0.0590167;REVB=-0.210154;RO=11;SAF=5;SAR=3;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249111;STB=0.846342;TYPE=snp;VARB=0.10086;OID=.;OPOS=26671690;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:19:19:11:13:8:6:3:5:4:7:1:5:4:9 chr1 26691174 . C A 41.22 PASS AO=16;DP=60;FAO=17;FDP=61;FR=.;FRO=44;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=0.0178406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.613;QD=2.70324;RBI=0.0251228;REFB=-0.00487268;REVB=-0.017688;RO=42;SAF=10;SAR=6;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205785;STB=0.63937;TYPE=snp;VARB=0.0257315;OID=.;OPOS=26691174;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:60:61:42:44:16:17:6:10:19:23:6:11:20:24 chr1 26694245 . T C 59.05 PASS AO=19;DP=56;FAO=19;FDP=55;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=25;FSRR=11;FWDB=-0.0236881;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.902;QD=4.29471;RBI=0.0249975;REFB=-0.0104356;REVB=-0.00798431;RO=36;SAF=10;SAR=9;SRF=25;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191986;STB=0.61154;TYPE=snp;VARB=0.014862;OID=.;OPOS=26694245;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:56:55:36:36:19:19:9:10:25:11:9:10:25:11 chr1 26694260 . T C 54.29 PASS AO=18;DP=50;FAO=17;FDP=49;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=23;FSRR=9;FWDB=-0.0435621;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.5256;QD=4.43222;RBI=0.0612939;REFB=-0.0388333;REVB=0.0431194;RO=32;SAF=12;SAR=6;SRF=23;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0660103;STB=0.552786;TYPE=snp;VARB=0.0545794;OID=.;OPOS=26694260;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:50:49:32:32:18:17:6:12:23:9:6:11:23:9 chr1 26700795 . T C 479.26 PASS AO=49;DP=49;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0750894;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.097;QD=37.5893;RBI=0.0751115;REFB=0;REVB=0.00182184;RO=0;SAF=4;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000293777;OID=.;OPOS=26700795;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:49:51:0:0:49:51:45:4:0:0:46:5:0:0 chr1 26755919 . A G 278.47 PASS AO=81;DP=203;FAO=84;FDP=208;FR=.;FRO=124;FSAF=64;FSAR=20;FSRF=112;FSRR=12;FWDB=-0.0207446;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=219.716;QD=5.35509;RBI=0.0221875;REFB=-0.00817281;REVB=-0.00787056;RO=122;SAF=64;SAR=17;SRF=112;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243529;STB=0.632158;TYPE=snp;VARB=0.0142027;OID=.;OPOS=26755919;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:208:122:124:81:84:17:64:112:10:20:64:112:12 chr1 26879920 . T C 463.92 PASS AO=49;DP=49;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0276113;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.867;QD=38.6599;RBI=0.0473911;REFB=0;REVB=0.0385167;RO=0;SAF=15;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.01675e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.01546e-05;OID=.;OPOS=26879920;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:49:48:0:0:49:48:34:15:0:0:34:14:0:0 chr1 26883511 . A C 124.66 PASS AO=37;DP=96;FAO=37;FDP=94;FR=.;FRO=57;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=26;FSRR=31;FWDB=-0.0205125;FXX=0.0208312;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.678;QD=5.30454;RBI=0.0255943;REFB=-0.0197981;REVB=0.0153071;RO=57;SAF=13;SAR=24;SRF=26;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117366;STB=0.566892;TYPE=snp;VARB=0.0312878;OID=.;OPOS=26883511;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:94:57:57:37:37:24:13:26:31:24:13:26:31 chr1 26900708 . G A 40.08 PASS AO=19;DP=72;FAO=20;FDP=75;FR=.;FRO=55;FSAF=1;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=39;FWDB=-0.0100413;FXX=0.0259707;HRUN=3;LEN=1;MLLD=159.106;QD=2.13741;RBI=0.0121846;REFB=-0.00631447;REVB=0.00690179;RO=53;SAF=0;SAR=19;SRF=14;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.743015;STB=0.847289;TYPE=snp;VARB=0.0149799;OID=.;OPOS=26900708;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:72:75:53:55:19:20:19:0:14:39:19:1:16:39 chr1 26900735 . C G 820.12 PASS AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0103414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.6859;QD=38.1451;RBI=0.0789064;REFB=0;REVB=0.0782258;RO=0;SAF=30;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.10353e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000431057;OID=.;OPOS=26900735;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:86:86:0:0:86:86:56:30:0:0:56:30:0:0 chr1 26900805 . G A 150.15 PASS AO=40;DP=96;FAO=40;FDP=93;FR=.;FRO=53;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=28;FWDB=0.0187412;FXX=0.0412329;HRUN=4;LEN=1;MLLD=163.671;QD=6.45823;RBI=0.0187416;REFB=-0.0176893;REVB=-0.000128241;RO=49;SAF=17;SAR=23;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0643452;STB=0.526991;TYPE=snp;VARB=0.0211224;OID=.;OPOS=26900805;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:93:49:53:40:40:23:17:24:25:23:17:25:28 chr1 26900920 . A T 240.82 PASS AO=47;DP=82;FAO=47;FDP=82;FR=.;FRO=35;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=-0.0112938;FXX=0.0120467;HRUN=3;LEN=1;MLLD=174.46;QD=11.7472;RBI=0.0174249;REFB=0.0176673;REVB=-0.0132694;RO=33;SAF=18;SAR=29;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0326087;STB=0.507655;TYPE=snp;VARB=-0.0101623;OID=.;OPOS=26900920;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:33:35:47:47:29:18:14:19:29:18:14:21 chr1 26901319 . G A 205.02 PASS AO=48;DP=100;FAO=48;FDP=99;FR=.;FRO=51;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=11;FSRR=40;FWDB=0.0695122;FXX=0.0294089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.6129;QD=8.28349;RBI=0.0695361;REFB=-0.0131567;REVB=0.00182497;RO=51;SAF=22;SAR=26;SRF=11;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233517;STB=0.628522;TYPE=snp;VARB=0.0117697;OID=.;OPOS=26901319;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:99:51:51:48:48:26:22:11:40:26:22:11:40 chr1 27099012 . GGC G,GCC 396.38 PASS AO=20,9;DP=45;FAO=52,0;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=34,0;FSAR=18,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.167269,-0.145361;FXX=0.086192;HRUN=4,4;LEN=2,1;MLLD=21.4383,9.82101;QD=29.9153;RBI=0.37663,1.87662;REFB=-0.122346,0.0827776;REVB=-0.337448,-1.87098;RO=7;SAF=20,0;SAR=0,9;SRF=6;SRR=1;SSEN=0.625,0;SSEP=0,0;SSSB=0.838372,-0.830498;STB=0.507244,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.00112968,0;OID=.,.;OPOS=27099013,27099013;OREF=GC,G;OALT=-,C;OMAPALT=G,GCC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:20,9:39:52,0:53:1:34,0:18,0:1:0:13:7:20,0:0,9:6:1 chr1 27120623 . TC T 94.65 PASS AO=24;DP=42;FAO=26;FDP=39;FR=.;FRO=13;FSAF=21;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.184334;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.3222;QD=9.70758;RBI=0.184364;REFB=0.0722073;REVB=-0.00333642;RO=12;SAF=20;SAR=4;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0.664894;SSSB=0.428297;STB=0.677267;TYPE=del;VARB=-0.0338166;OID=.;OPOS=27120624;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:24:38:26:39:13:21:5:5:8:21:12:20:4:3:9 chr1 27210721 . T C 882.27 PASS AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0281739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.547;QD=37.9473;RBI=0.0295078;REFB=0;REVB=-0.00877164;RO=0;SAF=27;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.59196e-05;OID=.;OPOS=27210721;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:93:93:0:0:93:93:66:27:0:0:66:27:0:0 chr1 27278521 . G A 125.84 PASS AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.035996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.268;QD=35.9532;RBI=0.0543079;REFB=0;REVB=0.0406649;RO=0;SAF=2;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000759681;OID=.;OPOS=27278521;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:14:14:0:0:14:14:12:2:0:0:12:2:0:0 chr1 27278553 . G A 48.69 PASS AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0169584;FXX=0.124844;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.4565;QD=27.8213;RBI=0.0752579;REFB=-0.0748189;REVB=0.0733224;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.666027;TYPE=snp;VARB=0.024837;OID=.;OPOS=27278553;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:7:7:0:1:6:6:5:1:0:0:5:1:1:0 chr1 27426796 . T C 287.24 PASS AO=30;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00176592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.4101;QD=37.0633;RBI=0.0503704;REFB=0;REVB=-0.0503394;RO=0;SAF=21;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00103786;OID=.;OPOS=27426796;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:31:31:0:0:30:31:9:21:0:0:9:22:0:0 chr1 27427041 . T C 530.57 PASS AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0124257;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0737;QD=36.591;RBI=0.0574912;REFB=0.065186;REVB=-0.0561324;RO=1;SAF=7;SAR=50;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00934182;STB=0.504949;TYPE=snp;VARB=-0.0113362;OID=.;OPOS=27427041;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:58:58:1:1:57:57:50:7:0:1:50:7:0:1 chr1 27480757 . A G 267.75 PASS AO=62;DP=126;FAO=63;FDP=127;FR=.;FRO=64;FSAF=48;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=40;FWDB=0.0226233;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.2649;QD=8.4332;RBI=0.0310457;REFB=-0.0141047;REVB=-0.0212609;RO=64;SAF=48;SAR=14;SRF=24;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.395631;STB=0.709607;TYPE=snp;VARB=0.010434;OID=.;OPOS=27480757;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:127:64:64:62:63:14:48:24:40:15:48:24:40 chr1 27676925 . G A 1470.24 PASS AO=151;DP=151;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.056668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.725;QD=38.1882;RBI=0.0578723;REFB=0;REVB=0.0117451;RO=0;SAF=54;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.02583e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.76523e-05;OID=.;OPOS=27676925;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:151:154:0:0:151:154:97:54:0:0:99:55:0:0 chr1 27679797 . A G 517.46 PASS AO=56;DP=56;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0254313;FXX=0.0526223;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.557;QD=38.3305;RBI=0.0403008;REFB=0;REVB=0.0312635;RO=0;SAF=47;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.04056e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00652668;OID=.;OPOS=27679797;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:56:54:0:0:56:54:9:47:0:0:9:45:0:0 chr1 27679954 . G A 73.85 PASS AO=10;DP=14;FAO=11;FDP=15;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0957935;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=217.021;QD=19.6943;RBI=0.097384;REFB=-0.0818768;REVB=-0.0175288;RO=2;SAF=0;SAR=10;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.811911;STB=0.605836;TYPE=snp;VARB=0.00222351;OID=.;OPOS=27679954;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:14:15:2:4:10:11:10:0:1:1:10:1:1:3 chr1 27680292 . A G 514.33 PASS AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149581;FXX=0.0526223;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0442;QD=38.0988;RBI=0.0413284;REFB=0;REVB=0.0385265;RO=0;SAF=35;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.86274e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00127453;OID=.;OPOS=27680292;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:54:54:0:0:54:54:19:35:0:0:19:35:0:0 chr1 27683943 . TG T 161.05 PASS AO=18;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0265739;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=19.5488;QD=23.8587;RBI=0.336443;REFB=-0.0422538;REVB=0.335392;RO=4;SAF=12;SAR=6;SRF=1;SRR=3;SSEN=0.300628;SSEP=0;SSSB=0.146515;STB=0.517228;TYPE=del;VARB=0.0283236;OID=.;OPOS=27683944;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:18:25:26:27:1:14:12:1:0:10:4:12:6:1:3 chr1 27686446 . AG A 307.21 PASS AO=40;DP=62;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.288527;FXX=0.0163908;HRUN=4;LEN=1;MLLD=9.82029;QD=20.4804;RBI=0.333149;REFB=0;REVB=-0.166555;RO=2;SAF=16;SAR=24;SRF=2;SRR=0;SSEN=0.404762;SSEP=0;SSSB=-0.055073;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.00579471;OID=.;OPOS=27686447;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:40:56:60:60:0:25:35:0:0:28:2:16:24:2:0 chr1 27688633 . G A 940.44 PASS AO=106;DP=111;FAO=107;FDP=111;FR=.;FRO=4;FSAF=57;FSAR=50;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.00176138;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=195.971;QD=33.8898;RBI=0.0344445;REFB=0.0478703;REVB=0.0343995;RO=4;SAF=56;SAR=50;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0153494;STB=0.507871;TYPE=snp;VARB=-5.48341e-05;OID=.;OPOS=27688633;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:111:111:4:4:106:107:50:56:3:1:50:57:3:1 chr1 27875668 . AG A 166.56 PASS AO=27;DP=40;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.111456;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=9.74844;QD=17.0835;RBI=0.292552;REFB=-0.0534555;REVB=0.270489;RO=11;SAF=14;SAR=13;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0.255319;SSSB=0.0338799;STB=0.513506;TYPE=del;VARB=0.0342718;OID=.;OPOS=27875669;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:27:38:38:39:1:18:20:1:0:11:11:14:13:5:6 chr1 27876482 . C A 27.16 PASS AO=16;DP=71;FAO=16;FDP=72;FR=.;FRO=56;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=56;FWDB=0.0474741;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.7631;QD=1.50911;RBI=0.0497067;REFB=-0.00156592;REVB=-0.0147297;RO=43;SAF=5;SAR=11;SRF=0;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.602436;STB=0.858802;TYPE=snp;VARB=0.006161;OID=.;OPOS=27876482;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:71:72:43:56:16:16:11:5:0:43:11:5:0:56 chr1 28020307 . G C 468.32 PASS AO=55;DP=62;FAO=57;FDP=63;FR=.;FRO=6;FSAF=22;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.00706428;FXX=0.0156226;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.0247;QD=29.7344;RBI=0.0178252;REFB=0.00321303;REVB=-0.0163656;RO=6;SAF=21;SAR=34;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0425768;STB=0.522247;TYPE=snp;VARB=-0.00109822;OID=.;OPOS=28020307;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:62:63:6:6:55:57:34:21:1:5:35:22:1:5 chr1 28209305 . A G 197.55 PASS AO=44;DP=89;FAO=45;FDP=90;FR=.;FRO=45;FSAF=14;FSAR=31;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=0.0104001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.363;QD=8.78011;RBI=0.0104048;REFB=-0.0193897;REVB=0.000312972;RO=45;SAF=14;SAR=30;SRF=19;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10427;STB=0.561751;TYPE=snp;VARB=0.0198296;OID=.;OPOS=28209305;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:90:45:45:44:45:30:14:19:26:31:14:19:26 chr1 28209362 . T C 104.53 PASS AO=24;DP=51;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=2;FSAR=22;FSRF=5;FSRR=22;FWDB=-0.046072;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.143;QD=8.1986;RBI=0.0466414;REFB=0.012052;REVB=-0.00726572;RO=27;SAF=2;SAR=22;SRF=5;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236018;STB=0.636227;TYPE=snp;VARB=-0.020254;OID=.;OPOS=28209362;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:27:27:24:24:22:2:5:22:22:2:5:22 chr1 28209366 . A G 104.57 PASS AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=2;FSAR=22;FSRF=5;FSRR=22;FWDB=-0.123828;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.2422;QD=8.20144;RBI=0.144546;REFB=-0.0408654;REVB=-0.074565;RO=24;SAF=2;SAR=22;SRF=5;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265082;STB=0.636227;TYPE=snp;VARB=0.0418981;OID=.;OPOS=28209366;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:51:24:27:24:24:22:2:5:19:22:2:5:22 chr1 28268835 . A C 332.38 PASS AO=37;DP=39;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0391985;FXX=0.0238039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.3299;QD=32.4275;RBI=0.0451187;REFB=0.0107129;REVB=-0.0223422;RO=2;SAF=14;SAR=23;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0389977;STB=0.510199;TYPE=snp;VARB=-0.0062572;OID=.;OPOS=28268835;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:39:41:2:1:37:40:23:14:0:2:24:16:0:1 chr1 28282206 . C T 186.56 PASS AO=66;DP=191;FAO=68;FDP=195;FR=.;FRO=127;FSAF=32;FSAR=36;FSRF=59;FSRR=68;FWDB=0.00333823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.8783;QD=3.82682;RBI=0.0309325;REFB=-0.0105246;REVB=-0.0307519;RO=124;SAF=30;SAR=36;SRF=58;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0151657;STB=0.503936;TYPE=snp;VARB=0.0187553;OID=.;OPOS=28282206;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:191:195:124:127:66:68:36:30:58:66:36:32:59:68 chr1 28422847 . C T 186.41 PASS AO=40;DP=81;FAO=41;FDP=81;FR=.;FRO=40;FSAF=12;FSAR=29;FSRF=14;FSRR=26;FWDB=0.0228668;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.4915;QD=9.20563;RBI=0.0736417;REFB=0.0339573;REVB=0.0700015;RO=41;SAF=11;SAR=29;SRF=15;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0981852;STB=0.533222;TYPE=snp;VARB=-0.0250829;OID=.;OPOS=28422847;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:41:40:40:41:29:11:15:26:29:12:14:26 chr1 28527011 . A G 700.76 PASS AO=71;DP=71;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00665234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.039;QD=37.8787;RBI=0.039826;REFB=0;REVB=0.0392665;RO=0;SAF=27;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00010682;OID=.;OPOS=28527011;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:71:74:0:0:71:74:44:27:0:0:45:29:0:0 chr1 28564252 . A G 1535.73 PASS AO=157;DP=157;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00367507;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.0939;QD=37.9194;RBI=0.0444484;REFB=0;REVB=-0.0442962;RO=0;SAF=88;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.47484e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000209483;OID=.;OPOS=28564252;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:157:162:0:0:157:162:69:88:0:0:69:93:0:0 chr1 28564279 . A G 1924.93 PASS AO=193;DP=193;FAO=200;FDP=200;FR=.;FRO=0;FSAF=102;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0074634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.383;QD=38.4985;RBI=0.0300686;REFB=0;REVB=0.0291276;RO=0;SAF=102;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.12092e-05;OID=.;OPOS=28564279;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:193:200:0:0:193:200:91:102:0:0:98:102:0:0 chr1 28586376 . C G 25.89 PASS AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0265594;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2384;QD=8.6306;RBI=0.0664472;REFB=0.0246404;REVB=0.0609083;RO=7;SAF=3;SAR=2;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.286688;STB=0.676751;TYPE=snp;VARB=-0.0237329;OID=.;OPOS=28586376;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:12:12:7:7:5:5:2:3:2:5:2:3:2:5 chr1 28599945 . AG A 32.03 PASS AO=14;DP=42;FAO=15;FDP=39;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=18;FWDB=-0.0533012;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=17.6661;QD=3.28521;RBI=0.0713559;REFB=-0.0304689;REVB=0.0474409;RO=22;SAF=12;SAR=2;SRF=5;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0.545455;SSSB=0.635063;STB=0.823119;TYPE=del;VARB=0.045055;OID=.;OPOS=28599946;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:14:39:15:39:24:12:3:6:18:32:22:12:2:5:17 chr1 28638859 . A T 343.57 PASS AO=158;DP=450;FAO=135;FDP=396;FR=.;FRO=261;FSAF=53;FSAR=82;FSRF=126;FSRR=135;FWDB=-0.00315479;FXX=0.00999975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.834;QD=3.47043;RBI=0.0117255;REFB=-0.00956659;REVB=-0.0112931;RO=286;SAF=64;SAR=94;SRF=137;SRR=149;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0855446;STB=0.560669;TYPE=snp;VARB=0.018954;OID=.;OPOS=28638859;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:450:396:286:261:158:135:94:64:137:149:82:53:126:135 chr1 28733993 . G T 574 PASS AO=120;DP=233;FAO=126;FDP=237;FR=.;FRO=111;FSAF=47;FSAR=79;FSRF=54;FSRR=57;FWDB=-0.00254052;FXX=0.0124995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.687;QD=9.68776;RBI=0.0103273;REFB=-0.0166504;REVB=0.0100099;RO=108;SAF=46;SAR=74;SRF=55;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111978;STB=0.555206;TYPE=snp;VARB=0.0136513;OID=.;OPOS=28733993;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:233:237:108:111:120:126:74:46:55:53:79:47:54:57 chr1 28800380 . C A 225.43 PASS AO=64;DP=155;FAO=65;FDP=155;FR=.;FRO=90;FSAF=7;FSAR=58;FSRF=17;FSRR=73;FWDB=-0.00586823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.089;QD=5.81749;RBI=0.0209663;REFB=-0.00648144;REVB=0.0201283;RO=89;SAF=7;SAR=57;SRF=17;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179849;STB=0.602822;TYPE=snp;VARB=0.00697895;OID=.;OPOS=28800380;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:89:90:64:65:57:7:17:72:58:7:17:73 chr1 28861636 . G A 189.54 PASS AO=43;DP=89;FAO=44;FDP=90;FR=.;FRO=46;FSAF=30;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=29;FWDB=0.0427469;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.22;QD=8.42401;RBI=0.0478627;REFB=-0.0156748;REVB=0.02153;RO=44;SAF=29;SAR=14;SRF=16;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.286133;STB=0.662143;TYPE=snp;VARB=0.0221054;OID=.;OPOS=28861636;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:90:44:46:43:44:14:29:16:28:14:30:17:29 chr1 28920817 . TG T 41.21 PASS AO=16;DP=43;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=18;FWDB=-0.304406;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=16.4469;QD=4.22634;RBI=0.306761;REFB=-0.0581247;REVB=-0.0379394;RO=24;SAF=14;SAR=2;SRF=7;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0.43026;SSSB=0.622146;STB=0.880037;TYPE=del;VARB=0.0532541;OID=.;OPOS=28920818;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:16:42:16:39:23:14:2:5:18:41:24:14:2:7:17 chr1 28921199 . A C 136.87 PASS AO=36;DP=83;FAO=36;FDP=83;FR=.;FRO=47;FSAF=10;FSAR=26;FSRF=10;FSRR=37;FWDB=-0.0206753;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.459;QD=6.59605;RBI=0.0233732;REFB=-0.0101225;REVB=-0.0109012;RO=47;SAF=10;SAR=26;SRF=10;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0853308;STB=0.547801;TYPE=snp;VARB=0.0137804;OID=.;OPOS=28921199;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:47:47:36:36:26:10:10:37:26:10:10:37 chr1 28975209 . A G 748.28 PASS AO=163;DP=306;FAO=163;FDP=304;FR=.;FRO=141;FSAF=54;FSAR=109;FSRF=58;FSRR=83;FWDB=0.0250688;FXX=0.00977167;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.712;QD=9.84574;RBI=0.0262653;REFB=0.000844094;REVB=-0.00783704;RO=139;SAF=54;SAR=109;SRF=57;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0729891;STB=0.540746;TYPE=snp;VARB=-0.000681712;OID=.;OPOS=28975209;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:306:304:139:141:163:163:109:54:57:82:109:54:58:83 chr1 29189593 . TGGGC TGGC,TGGGT 182.57 PASS AO=12,12;DP=40;FAO=23,14;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=12,10;FSAR=11,4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00191641,0.0232851;FXX=0.0256345;HRUN=3,1;LEN=1,1;MLLD=11.3654,91.7757;QD=19.2176;RBI=0.501717,0.0542288;REFB=-0.159792,-0.0179858;REVB=0.501713,0.0489751;RO=11;SAF=11,10;SAR=1,2;SRF=0;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.738741,0.645248;STB=0.52172,0.555473;TYPE=del,snp;VARB=0.223455,-0.0144497;OID=.,.;OPOS=29189594,29189597;OREF=G,C;OALT=-,T;OMAPALT=TGGC,TGGGT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:12,12:37:23,14:38:1:12,10:11,4:0:1:52:11:11,10:1,2:0:11 chr1 29446332 . AT A 739.32 PASS AO=114;DP=212;FAO=195;FDP=195;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=124;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.140212;FXX=0.0151508;HRUN=8;LEN=1;MLLD=7.71806;QD=15.1655;RBI=0.166518;REFB=0.0190413;REVB=-0.0898273;RO=13;SAF=43;SAR=71;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0172903;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-3.43871e-05;OID=.;OPOS=29446333;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:114:175:195:195:0:71:124:0:0:59:13:43:71:6:7 chr1 29446809 . GAA GA,GAG 713.22 PASS AO=20,54;DP=83;FAO=78,2;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=34,2;FSAR=44,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0583045,-0.259021;FXX=0.0123442;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=22.7761,17.1872;QD=35.6611;RBI=0.0821157,0.364572;REFB=0,0;REVB=0.0578237,-0.256555;RO=0;SAF=12,23;SAR=8,31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.6027e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.00137376,0.0115474;OID=.,.;OPOS=29446810,29446811;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=GA,GAG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:20,54:80:78,2:80:0:34,2:44,0:0:0:8:0:12,23:8,31:0:0 chr1 29475341 . C T 344.01 PASS AO=38;DP=40;FAO=38;FDP=40;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0140326;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.44;QD=34.4013;RBI=0.0406418;REFB=-0.126949;REVB=0.0381424;RO=2;SAF=23;SAR=15;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0102816;STB=0.505492;TYPE=snp;VARB=0.00121917;OID=.;OPOS=29475341;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:40:40:2:2:38:38:15:23:1:1:15:23:1:1 chr1 29475394 . C G 309.88 PASS AO=38;DP=42;FAO=38;FDP=42;FR=.;FRO=4;FSAF=27;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.040732;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=204.864;QD=29.512;RBI=0.047221;REFB=-0.0538876;REVB=0.02389;RO=3;SAF=27;SAR=11;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00726669;STB=0.504585;TYPE=snp;VARB=0.00355364;OID=.;OPOS=29475394;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:42:42:3:4:38:38:11:27:2:1:11:27:3:1 chr1 29475648 . T G 376.69 PASS AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00236079;FXX=0.0243843;HRUN=4;LEN=1;MLLD=235.768;QD=37.6686;RBI=0.0191135;REFB=0;REVB=0.0189671;RO=0;SAF=10;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.95772e-05;OID=.;OPOS=29475648;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:41:40:0:0:40:40:30:10:0:0:30:10:0:0 chr1 29529699 . T C 639.68 PASS AO=64;DP=64;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00470132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.015;QD=38.1897;RBI=0.0545102;REFB=0;REVB=0.0543071;RO=0;SAF=33;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000218213;OID=.;OPOS=29529699;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:64:67:0:0:64:67:31:33:0:0:34:33:0:0 chr1 29542637 . A G 1379.66 PASS AO=153;DP=159;FAO=153;FDP=159;FR=.;FRO=6;FSAF=47;FSAR=106;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.0434363;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.4329;QD=34.7085;RBI=0.0441984;REFB=-0.0514434;REVB=-0.008172;RO=6;SAF=47;SAR=106;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0161283;STB=0.50849;TYPE=snp;VARB=0.00524361;OID=.;OPOS=29542637;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:159:159:6:6:153:153:106:47:3:3:106:47:3:3 chr1 29630554 . T C 89.2 PASS AO=19;DP=41;FAO=20;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.0577142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.645;QD=8.49552;RBI=0.058231;REFB=-0.00945216;REVB=-0.0077405;RO=22;SAF=7;SAR=12;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0847374;STB=0.558021;TYPE=snp;VARB=0.00828783;OID=.;OPOS=29630554;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:41:42:22:22:19:20:12:7:10:12:13:7:10:12 chr1 31653733 . T C 1254.68 PASS AO=129;DP=129;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=99;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000224687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.787;QD=38.6056;RBI=0.0299583;REFB=0;REVB=0.0299575;RO=0;SAF=98;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.51285e-05;OID=.;OPOS=31653733;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:129:130:0:0:129:130:31:98:0:0:31:99:0:0 chr1 31733926 . A G 1388.75 PASS AO=145;DP=146;FAO=145;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226594;FXX=0.0202689;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.118;QD=38.3103;RBI=0.0417477;REFB=0;REVB=-0.0350631;RO=0;SAF=77;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.02491e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.95295e-05;OID=.;OPOS=31733926;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:146:145:0:0:145:145:68:77:0:0:67:78:0:0 chr1 31837320 . T C 2835.97 PASS AO=293;DP=293;FAO=302;FDP=302;FR=.;FRO=0;FSAF=120;FSAR=182;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131544;FXX=0.00657873;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.8786;QD=37.5626;RBI=0.0162531;REFB=-0.0290917;REVB=0.00954587;RO=0;SAF=113;SAR=180;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00318191;OID=.;OPOS=31837320;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:293:302:0:0:293:302:180:113:0:0:182:120:0:0 chr1 31898234 . T C 344.33 PASS AO=47;DP=57;FAO=47;FDP=58;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=44;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=-0.00649814;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.6205;QD=23.7469;RBI=0.0540879;REFB=-0.00411628;REVB=-0.0536961;RO=10;SAF=3;SAR=44;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.507168;STB=0.792625;TYPE=snp;VARB=0.00583933;OID=.;OPOS=31898234;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:57:58:10:11:47:47:44:3:8:2:44:3:9:2 chr1 31898639 . C T 1359.58 PASS AO=144;DP=145;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00365573;FXX=0.00689608;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.4102;QD=37.7661;RBI=0.00969532;REFB=-0.0748325;REVB=0.00897969;RO=0;SAF=40;SAR=104;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00016527;OID=.;OPOS=31898639;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:145:144:0:0:144:144:104:40:0:0:104:40:0:0 chr1 31905889 . A ACAG 586.55 PASS AO=81;DP=115;FAO=83;FDP=106;FR=.;FRO=23;FSAF=21;FSAR=62;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=0.0350223;FXX=0.0363603;HRUN=1;LEN=3;MLLD=212.01;QD=22.1339;RBI=0.066434;REFB=-0.122705;REVB=0.0564528;RO=26;SAF=20;SAR=61;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235904;STB=0.612848;TYPE=ins;VARB=0.0150179;OID=.;OPOS=31905890;OREF=-;OALT=CAG;OMAPALT=ACAG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:81:115:83:106:23:21:62:16:7:32:26:20:61:18:8 chr1 31907457 . A C 551.74 PASS AO=52;DP=52;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0644285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.974;QD=38.051;RBI=0.0649587;REFB=0;REVB=0.00828301;RO=0;SAF=18;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.19096e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.35096e-05;OID=.;OPOS=31907457;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:52:58:0:0:52:58:34:18:0:0:37:21:0:0 chr1 31973122 . GTGGAGTCTGTC G 31.55 PASS AO=14;DP=67;FAO=14;FDP=54;FR=.;FRO=40;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=-0.0452243;FXX=0.0689536;HRUN=1;LEN=11;MLLD=279.977;QD=2.33717;RBI=0.0488448;REFB=-0.0108859;REVB=-0.0184547;RO=34;SAF=4;SAR=10;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230675;STB=0.682792;TYPE=del;VARB=0.0279503;OID=.;OPOS=31973123;OREF=TGGAGTCTGTC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:14:56:14:54:40:4:10:21:19:31:34:4:10:16:18 chr1 31973138 . T C 48.34 PASS AO=18;DP=59;FAO=18;FDP=59;FR=.;FRO=41;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=0.0145513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.808;QD=3.27712;RBI=0.0242781;REFB=-0.00936356;REVB=0.0194341;RO=39;SAF=6;SAR=12;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267046;STB=0.643516;TYPE=snp;VARB=0.0162776;OID=.;OPOS=31973138;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:59:59:39:41:18:18:12:6:22:17:12:6:22:19 chr1 31973348 . A C 71.27 PASS AO=25;DP=76;FAO=25;FDP=75;FR=.;FRO=50;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=32;FWDB=0.0157433;FXX=0.0131562;HRUN=3;LEN=1;MLLD=132.065;QD=3.80095;RBI=0.104309;REFB=-0.0217324;REVB=-0.103114;RO=50;SAF=11;SAR=14;SRF=18;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0941639;STB=0.554782;TYPE=snp;VARB=0.0360024;OID=.;OPOS=31973348;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:76:75:50:50:25:25:14:11:18:32:14:11:18:32 chr1 31973409 . G A 100.96 PASS AO=34;DP=99;FAO=35;FDP=99;FR=.;FRO=64;FSAF=10;FSAR=25;FSRF=21;FSRR=43;FWDB=-0.0137086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.093;QD=4.0793;RBI=0.0193281;REFB=-0.00818575;REVB=0.0136253;RO=63;SAF=10;SAR=24;SRF=21;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.051717;STB=0.532627;TYPE=snp;VARB=0.0148661;OID=.;OPOS=31973409;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:63:64:34:35:24:10:21:42:25:10:21:43 chr1 31973440 . G A 88.67 PASS AO=34;DP=104;FAO=33;FDP=101;FR=.;FRO=68;FSAF=9;FSAR=24;FSRF=19;FSRR=49;FWDB=-0.00646775;FXX=0.0288434;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.601;QD=3.51167;RBI=0.0129127;REFB=-0.0210291;REVB=0.0111761;RO=69;SAF=10;SAR=24;SRF=18;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0473869;STB=0.50564;TYPE=snp;VARB=0.0399985;OID=.;OPOS=31973440;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:104:101:69:68:34:33:24:10:18:51:24:9:19:49 chr1 32127953 . G A 618.33 PASS AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110269;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.099;QD=38.0511;RBI=0.0111046;REFB=0;REVB=-0.0013107;RO=0;SAF=24;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.25588e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.82719e-05;OID=.;OPOS=32127953;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:66:65:0:0:65:65:41:24:0:0:41:24:0:0 chr1 32148570 . CA C,CG 371.26 PASS AO=10,30;DP=42;FAO=4,36;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=2,11;FSAR=2,25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0478213,-0.0737458;FXX=0.0476077;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=109.145,120.556;QD=37.1258;RBI=0.0486215,0.0772092;REFB=0,0;REVB=0.00878526,0.0228651;RO=0;SAF=0,13;SAR=10,17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-5.63861e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.0344477,0.00591775;OID=.,.;OPOS=32148571,32148571;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:10,30:42:4,36:40:0:2,11:2,25:0:0:3:0:0,13:10,17:0:0 chr1 32157630 . GC G 85.07 PASS AO=16;DP=24;FAO=18;FDP=24;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=16;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.294186;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.1615;QD=14.1781;RBI=0.350397;REFB=-0.09583;REVB=0.190348;RO=8;SAF=1;SAR=15;SRF=5;SRR=3;SSEN=0.333333;SSEP=0;SSSB=-0.577232;STB=0.726962;TYPE=del;VARB=0.10104;OID=.;OPOS=32157631;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:16:24:18:24:6:2:16:4:2:6:8:1:15:5:3 chr1 32201501 . TG T,GG 26.55 PASS AO=3,3;DP=17;FAO=5,3;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=2,1;FSAR=3,2;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.128819,0.00852203;FXX=0;HRUN=5,1;LEN=1,1;MLLD=12.7705,152.676;QD=5.90055;RBI=0.166391,0.00859652;REFB=-0.0752229,-0.00434465;REVB=-0.105316,-0.00112925;RO=9;SAF=1,1;SAR=2,2;SRF=6;SRR=3;SSEN=0.407407,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.341307,-0.341307;STB=0.631062,0.69871;TYPE=del,snp;VARB=0.0659277,-0.024818;OID=.,.;OPOS=32201502,32201501;OREF=G,T;OALT=-,G;OMAPALT=T,GG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:16:18:9:10:3,3:5,3:2,2:1,1:6:3:3,2:2,1:6:4 chr1 32279629 . G A 393.63 PASS AO=99;DP=212;FAO=99;FDP=211;FR=.;FRO=112;FSAF=44;FSAR=55;FSRF=70;FSRR=42;FWDB=-0.0127993;FXX=0.00471676;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.89;QD=7.46219;RBI=0.0158836;REFB=-0.00289825;REVB=-0.0094057;RO=112;SAF=44;SAR=55;SRF=70;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172154;STB=0.594971;TYPE=snp;VARB=0.00251591;OID=.;OPOS=32279629;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:211:112:112:99:99:55:44:70:42:55:44:70:42 chr1 32280610 . T C 1440.58 PASS AO=149;DP=149;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00494576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.643;QD=38.4153;RBI=0.0384345;REFB=0;REVB=-0.038115;RO=0;SAF=53;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.74128e-05;OID=.;OPOS=32280610;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:149:150:0:0:149:150:96:53:0:0:96:54:0:0 chr1 32373837 . G T 24.67 PASS AO=13;DP=42;FAO=11;FDP=42;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=26;FSRR=5;FWDB=0.0207783;FXX=0.0869376;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.158;QD=2.34993;RBI=0.0298572;REFB=-0.00109099;REVB=-0.0214409;RO=21;SAF=11;SAR=2;SRF=20;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.269149;STB=0.624732;TYPE=snp;VARB=0.0039565;OID=.;OPOS=32373837;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:42:42:21:31:13:11:2:11:20:1:1:10:26:5 chr1 32831583 . C T 168.85 PASS AO=49;DP=121;FAO=49;FDP=121;FR=.;FRO=72;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=51;FSRR=21;FWDB=-0.0317236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.915;QD=5.58175;RBI=0.037447;REFB=-0.028366;REVB=-0.019897;RO=62;SAF=31;SAR=18;SRF=41;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0310558;STB=0.549701;TYPE=snp;VARB=0.0447403;OID=.;OPOS=32831583;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:62:72:49:49:18:31:41:21:18:31:51:21 chr1 33065947 . G C 1111.45 PASS AO=116;DP=117;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00323141;FXX=0.00854628;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.097;QD=38.3258;RBI=0.0276488;REFB=0;REVB=0.0274593;RO=0;SAF=44;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31343e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.13138e-05;OID=.;OPOS=33065947;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:117:116:0:0:116:116:72:44:0:0:72:44:0:0 chr1 33133968 . T C 1083.63 PASS AO=126;DP=135;FAO=127;FDP=135;FR=.;FRO=8;FSAF=43;FSAR=84;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=-0.00318074;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=213.61;QD=32.1075;RBI=0.0103239;REFB=-0.202492;REVB=-0.00982171;RO=7;SAF=43;SAR=83;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0221996;STB=0.514257;TYPE=snp;VARB=0.00104282;OID=.;OPOS=33133968;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:135:135:7:8:126:127:83:43:1:6:84:43:1:7 chr1 33160878 . C T 568.24 PASS AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0158014;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=231.342;QD=38.5248;RBI=0.0301453;REFB=0;REVB=0.0256721;RO=0;SAF=47;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56963e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.69641e-05;OID=.;OPOS=33160878;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:59:59:0:0:59:59:12:47:0:0:12:47:0:0 chr1 33161212 . T C 471.97 PASS AO=126;DP=131;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.151;QD=38.5281;RBI=0.051311;REFB=0;REVB=0.0499536;RO=5;SAF=91;SAR=35;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0253908;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0003211;OID=.;OPOS=33161212;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:131:49:5:0:126:49:35:91:5:0:18:31:0:0 chr1 33235789 . C T 230.55 PASS AO=48;DP=84;FAO=49;FDP=92;FR=.;FRO=43;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=25;FSRR=18;FWDB=0.0238314;FXX=0.0212743;HRUN=4;LEN=1;MLLD=130.008;QD=10.0241;RBI=0.0238725;REFB=-0.063369;REVB=0.00140062;RO=35;SAF=22;SAR=26;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0651345;STB=0.552191;TYPE=snp;VARB=0.0360759;OID=.;OPOS=33235789;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:92:35:43:48:49:26:22:19:16:26:23:25:18 chr1 33328165 . G A 412.05 PASS AO=110;DP=246;FAO=111;FDP=248;FR=.;FRO=137;FSAF=56;FSAR=55;FSRF=58;FSRR=79;FWDB=0.00285658;FXX=0.00799968;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.863;QD=6.64597;RBI=0.00352027;REFB=-0.000563352;REVB=-0.00205725;RO=136;SAF=55;SAR=55;SRF=57;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0806964;STB=0.544787;TYPE=snp;VARB=0.000750317;OID=.;OPOS=33328165;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:246:248:136:137:110:111:55:55:57:79:55:56:58:79 chr1 33475750 . A G 22.11 PASS AO=31;DP=202;FAO=34;FDP=206;FR=.;FRO=172;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=86;FSRR=86;FWDB=0.0128236;FXX=0.00483068;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.609;QD=0.429355;RBI=0.0144017;REFB=-0.00674169;REVB=0.00655484;RO=167;SAF=15;SAR=16;SRF=85;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0321625;STB=0.549198;TYPE=snp;VARB=0.0259731;OID=.;OPOS=33475750;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:202:206:167:172:31:34:16:15:85:82:19:15:86:86 chr1 33475767 . G A 57.76 PASS AO=47;DP=220;FAO=47;FDP=220;FR=.;FRO=173;FSAF=15;FSAR=32;FSRF=81;FSRR=92;FWDB=-0.0172352;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=154.489;QD=1.05017;RBI=0.0191125;REFB=-0.00903075;REVB=-0.00826042;RO=172;SAF=15;SAR=32;SRF=81;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201848;STB=0.622817;TYPE=snp;VARB=0.0329353;OID=.;OPOS=33475767;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:220:220:172:173:47:47:32:15:81:91:32:15:81:92 chr1 33476396 . G A 23.21 PASS AO=8;DP=33;FAO=9;FDP=35;FR=.;FRO=26;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.0767392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.5488;QD=2.65307;RBI=0.0842164;REFB=-0.038637;REVB=-0.0346913;RO=25;SAF=1;SAR=7;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.542516;STB=0.869873;TYPE=snp;VARB=0.0501273;OID=.;OPOS=33476396;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:33:35:25:26:8:9:7:1:14:11:8:1:15:11 chr1 33476404 . T G 15.69 PASS AO=8;DP=41;FAO=9;FDP=41;FR=.;FRO=32;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=-0.044531;FXX=0.0238039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.3207;QD=1.53107;RBI=0.0450094;REFB=-0.0355113;REVB=-0.0065449;RO=32;SAF=2;SAR=6;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211737;STB=0.668381;TYPE=snp;VARB=0.139195;OID=.;OPOS=33476404;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:41:41:32:32:8:9:6:2:13:19:7:2:13:19 chr1 33789588 . T C 57.68 PASS AO=7;DP=35;FAO=13;FDP=30;FR=.,HEALED;FRO=17;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.0333683;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=226.607;QD=7.69049;RBI=0.0402004;REFB=-0.0402271;REVB=-0.0224193;RO=9;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.519097;TYPE=snp;VARB=0.050599;OID=.;OPOS=33789588;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:23:30:9:17:7:13:7:0:0:9:8:5:6:11 chr1 33802351 . C T 149.32 PASS AO=34;DP=71;FAO=35;FDP=73;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.0372203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.9586;QD=8.18182;RBI=0.0449859;REFB=-0.0173024;REVB=-0.0252662;RO=37;SAF=13;SAR=21;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149684;STB=0.566628;TYPE=snp;VARB=0.0533929;OID=.;OPOS=33802351;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:73:37:38:34:35:21:13:20:17:21:14:20:18 chr1 33832865 . A G 117.93 PASS AO=21;DP=102;FAO=21;FDP=93;FR=.,HEALED;FRO=56;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=39;FWDB=-0.0111887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.822;QD=5.07223;RBI=0.017654;REFB=-0.0200095;REVB=-0.0136557;RO=48;SAF=11;SAR=10;SRF=16;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222852;STB=0.688009;TYPE=snp;VARB=0.0251322;OID=.;OPOS=33832865;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:94:93:48:56:21:21:10:11:16:32:9:12:17:39 chr1 33957152 . T G 566.39 PASS AO=48;DP=58;FAO=59;FDP=59;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=47;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00677397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.6025;QD=38.3995;RBI=0.127149;REFB=0;REVB=0.126968;RO=0;SAF=46;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0117824;OID=.;OPOS=33957152;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:57:59:0:0:48:59:2:46:0:0:12:47:0:0 chr1 33960062 . A G 844.65 PASS AO=87;DP=87;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00495655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.28;QD=38.393;RBI=0.0287629;REFB=0;REVB=0.0283326;RO=0;SAF=43;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.25576e-05;OID=.;OPOS=33960062;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:87:88:0:0:87:88:44:43:0:0:45:43:0:0 chr1 33961722 . C T 567.07 PASS AO=56;DP=60;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0378546;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.5875;QD=36.0042;RBI=0.0728022;REFB=-0.0233552;REVB=0.0621867;RO=4;SAF=21;SAR=35;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0817308;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00249539;OID=.;OPOS=33961722;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:60:63:4:0:56:63:35:21:4:0:35:28:0:0 chr1 34038214 . T C 72.45 PASS AO=27;DP=84;FAO=27;FDP=84;FR=.;FRO=57;FSAF=2;FSAR=25;FSRF=9;FSRR=48;FWDB=-0.00339437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.1352;QD=3.45017;RBI=0.0136271;REFB=-0.0173876;REVB=-0.0131976;RO=57;SAF=2;SAR=25;SRF=9;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253206;STB=0.653067;TYPE=snp;VARB=0.0369241;OID=.;OPOS=34038214;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:84:84:57:57:27:27:25:2:9:48:25:2:9:48 chr1 34090679 . T C 123.68 PASS AO=34;DP=79;FAO=34;FDP=82;FR=.;FRO=48;FSAF=32;FSAR=2;FSRF=43;FSRR=5;FWDB=-0.0211291;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.606;QD=6.03336;RBI=0.0219528;REFB=-0.0140993;REVB=-0.00595707;RO=40;SAF=32;SAR=2;SRF=35;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219052;STB=0.598863;TYPE=snp;VARB=0.0236578;OID=.;OPOS=34090679;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:82:40:48:34:34:2:32:35:5:2:32:43:5 chr1 34238283 . T C 233.8 PASS AO=53;DP=105;FAO=53;FDP=105;FR=.;FRO=52;FSAF=11;FSAR=42;FSRF=14;FSRR=38;FWDB=-0.103912;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.9635;QD=8.90682;RBI=0.110692;REFB=-0.0386384;REVB=-0.0381439;RO=52;SAF=11;SAR=42;SRF=14;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0793367;STB=0.544024;TYPE=snp;VARB=0.0342139;OID=.;OPOS=34238283;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:52:52:53:53:42:11:14:38:42:11:14:38 chr1 34270498 . G A 167.32 PASS AO=52;DP=149;FAO=55;FDP=149;FR=.;FRO=94;FSAF=21;FSAR=34;FSRF=28;FSRR=66;FWDB=-0.000771871;FXX=0.00666622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.625;QD=4.4919;RBI=0.00651741;REFB=-0.0098806;REVB=0.00647154;RO=91;SAF=21;SAR=31;SRF=27;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128368;STB=0.557601;TYPE=snp;VARB=0.0276238;OID=.;OPOS=34270498;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:91:94:52:55:31:21:27:64:34:21:28:66 chr1 34329897 . T C 1447.22 PASS AO=150;DP=150;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00235526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.118;QD=38.5925;RBI=0.0115998;REFB=0;REVB=-0.0113582;RO=0;SAF=78;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.65657e-06;OID=.;OPOS=34329897;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:150:150:0:0:150:150:72:78:0:0:72:78:0:0 chr1 34330067 . A C 124.69 PASS AO=36;DP=91;FAO=36;FDP=91;FR=.;FRO=55;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=-0.0168883;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.748;QD=5.48075;RBI=0.0168895;REFB=-0.0058513;REVB=-0.000195581;RO=55;SAF=14;SAR=22;SRF=29;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14872;STB=0.584625;TYPE=snp;VARB=0.0122879;OID=.;OPOS=34330067;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:55:55:36:36:22:14:29:26:22:14:29:26 chr1 35184033 . C T 800.04 PASS AO=78;DP=80;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00981596;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.83;QD=37.2113;RBI=0.0099636;REFB=-0.080889;REVB=0.0017089;RO=1;SAF=40;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116869;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000313648;OID=.;OPOS=35184033;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:80:86:1:0:78:86:38:40:1:0:45:41:0:0 chr1 35223345 . G A 212.33 PASS AO=30;DP=41;FAO=31;FDP=41;FR=.,HEALED;FRO=10;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=1;FWDB=-0.0819112;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.9147;QD=20.715;RBI=0.0874632;REFB=-0.138277;REVB=0.0306653;RO=4;SAF=18;SAR=12;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0343894;STB=0.582039;TYPE=snp;VARB=0.0422386;OID=.;OPOS=35223345;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:41:41:4:10:30:31:12:18:3:1:13:18:9:1 chr1 35223881 . G A 140.45 PASS AO=35;DP=77;FAO=35;FDP=77;FR=.;FRO=42;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=14;FSRR=28;FWDB=-0.0241885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.817;QD=7.29595;RBI=0.0431699;REFB=-0.0332701;REVB=0.0357569;RO=42;SAF=13;SAR=22;SRF=14;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0401422;STB=0.522495;TYPE=snp;VARB=0.0354725;OID=.;OPOS=35223881;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:42:42:35:35:22:13:14:28:22:13:14:28 chr1 35228604 . C T 121.4 PASS AO=25;DP=46;FAO=25;FDP=47;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=21;FSRF=3;FSRR=19;FWDB=0.0431619;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=198.851;QD=10.3318;RBI=0.0499456;REFB=-0.00598834;REVB=0.0251319;RO=21;SAF=4;SAR=21;SRF=3;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.026686;STB=0.521156;TYPE=snp;VARB=0.00569452;OID=.;OPOS=35228604;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:46:47:21:22:25:25:21:4:3:18:21:4:3:19 chr1 35228765 . C T 93.06 PASS AO=17;DP=30;FAO=17;FDP=30;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=13;FWDB=0.0765333;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.099;QD=12.408;RBI=0.0765374;REFB=-0.0339344;REVB=0.000797622;RO=13;SAF=2;SAR=15;SRF=0;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.276593;STB=0.65103;TYPE=snp;VARB=0.0124494;OID=.;OPOS=35228765;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:30:30:13:13:17:17:15:2:0:13:15:2:0:13 chr1 35229142 . G A 58.29 PASS AO=11;DP=32;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=21;FWDB=0.245345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=44.3448;QD=6.30177;RBI=0.245346;REFB=-0.0291642;REVB=0.000532696;RO=21;SAF=0;SAR=11;SRF=1;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.71735;STB=0.635373;TYPE=snp;VARB=0.0574646;OID=.;OPOS=35229142;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:32:37:21:22:11:15:11:0:1:20:13:2:1:21 chr1 35562965 . G A 869.66 PASS AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0171426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.845;QD=38.6515;RBI=0.0241069;REFB=0;REVB=0.0169492;RO=0;SAF=50;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.21981e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.37086e-07;OID=.;OPOS=35562965;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:90:90:0:0:90:90:40:50:0:0:40:50:0:0 chr1 35563206 . C G 813.71 PASS AO=85;DP=88;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.039048;FXX=0.0224694;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.672;QD=37.4122;RBI=0.0406936;REFB=-0.0265605;REVB=-0.0114554;RO=1;SAF=23;SAR=62;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00758071;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000124443;OID=.;OPOS=35563206;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:88:87:1:0:85:87:62:23:0:1:62:25:0:0 chr1 35758076 . TGG TG,T 328.44 PASS AO=36,12;DP=52;FAO=50,0;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=10,0;FSAR=40,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.143306,0.076792;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,2;MLLD=17.1054,9.34145;QD=25.7597;RBI=0.382982,0.195714;REFB=-0.0412545,-0.0373258;REVB=-0.35516,-0.18002;RO=2;SAF=9,0;SAR=27,12;SRF=2;SRR=0;SSEN=0.446809,0.446809;SSEP=0,0;SSSB=-0.0932112,-0.836514;STB=0.5238,0.5;TYPE=del,del;VARB=-0.00143905,0;OID=.,.;OPOS=35758077,35758077;OREF=G,GG;OALT=-,-;OMAPALT=TG,T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:36,12:50:50,0:51:1:10,0:40,0:1:0:20:2:9,0:27,12:2:0 chr1 36316571 . A C 1504.15 PASS AO=156;DP=156;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.836;QD=38.3223;RBI=0.0159039;REFB=0;REVB=0.0054631;RO=0;SAF=71;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.99165e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.22992e-05;OID=.;OPOS=36316571;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:156:157:0:0:156:157:85:71:0:0:85:72:0:0 chr1 36553673 . A G 488.01 PASS AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.027798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.466;QD=37.5393;RBI=0.0375146;REFB=0;REVB=0.0251915;RO=0;SAF=27;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000211662;OID=.;OPOS=36553673;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:52:52:0:0:52:52:25:27:0:0:25:27:0:0 chr1 36564867 . GC G 144.5 PASS AO=17;DP=29;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.215648;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.7545;QD=23.1202;RBI=0.26899;REFB=-0.00540542;REVB=0.160784;RO=6;SAF=5;SAR=12;SRF=5;SRR=1;SSEN=0.408163;SSEP=0;SSSB=-0.26767;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0249202;OID=.;OPOS=36564868;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:17:24:25:25:0:12:13:0:0:12:6:5:12:5:1 chr1 36642420 . T C 286.13 PASS AO=30;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00287364;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.845;QD=36.9196;RBI=0.0164851;REFB=0;REVB=-0.0162327;RO=0;SAF=3;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.84607e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00018022;OID=.;OPOS=36642420;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:31:31:0:0:30:31:27:3:0:0:28:3:0:0 chr1 36752152 . C T 455.57 PASS AO=113;DP=236;FAO=113;FDP=237;FR=.;FRO=124;FSAF=65;FSAR=48;FSRF=67;FSRR=57;FWDB=0.00771426;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.542;QD=7.68896;RBI=0.00787497;REFB=-0.00504521;REVB=-0.00158282;RO=123;SAF=65;SAR=48;SRF=67;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0293641;STB=0.518574;TYPE=snp;VARB=0.00571439;OID=.;OPOS=36752152;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:236:237:123:124:113:113:48:65:67:56:48:65:67:57 chr1 36752433 . C T 545.77 PASS AO=44;DP=63;FAO=61;FDP=63;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0180188;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.668;QD=34.6519;RBI=0.0570894;REFB=-0.0340996;REVB=0.0541713;RO=0;SAF=13;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.514281;TYPE=snp;VARB=0.000652633;OID=.;OPOS=36752433;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:46:63:0:2:44:61:31:13:0:0:34:27:0:2 chr1 36770200 . TAAAAAC TAAAAC,TAAAA 57.08 PASS AO=20,15;DP=115;FAO=39,0;FDP=89;FR=.;FRO=50;FSAF=12,0;FSAR=27,0;FSRF=23;FSRR=27;FWDB=-0.0684803,-0.202151;FXX=0.0219756;HRUN=5,5;LEN=1,2;MLLD=11.2412,20.4325;QD=2.56519;RBI=0.0982649,0.255585;REFB=-0.109607,-0.031966;REVB=-0.070473,-0.156392;RO=48;SAF=4,5;SAR=16,10;SRF=22;SRR=26;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.349726,-0.159815;STB=0.593171,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.109133,0;OID=.,.;OPOS=36770201,36770205;OREF=A,AC;OALT=-,-;OMAPALT=TAAAAC,TAAAA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:20,15:92:39,0:89:50:12,0:27,0:23:27:56:48:4,5:16,10:22:26 chr1 36772005 . AG A 187.87 PASS AO=23;DP=36;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.212767;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.6602;QD=22.102;RBI=0.273195;REFB=0.00155724;REVB=0.171365;RO=5;SAF=13;SAR=10;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0.310078;SSSB=0.119766;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0241669;OID=.;OPOS=36772006;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:23:34:34:34:0:15:19:0:0:16:5:13:10:1:4 chr1 36773405 . T G 363.06 PASS AO=71;DP=180;FAO=97;FDP=206;FR=.;FRO=109;FSAF=42;FSAR=55;FSRF=65;FSRR=44;FWDB=0.000349905;FXX=0.00483068;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.726;QD=7.04971;RBI=0.043147;REFB=-0.0166449;REVB=0.0431456;RO=109;SAF=39;SAR=32;SRF=65;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.051395;STB=0.585963;TYPE=snp;VARB=0.0244424;OID=.;OPOS=36773405;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:206:109:109:71:97:32:39:65:44:55:42:65:44 chr1 36785636 . GC G 20.47 PASS AO=22;DP=61;FAO=18;FDP=55;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=28;FWDB=-0.0851303;FXX=0.0833194;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.1083;QD=1.48842;RBI=0.135494;REFB=-0.103967;REVB=-0.105411;RO=32;SAF=14;SAR=8;SRF=8;SRR=24;SSEN=0.352941;SSEP=0;SSSB=0.383721;STB=0.795628;TYPE=del;VARB=0.122109;OID=.;OPOS=36785637;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:22:60:18:55:37:13:5:9:28:20:32:14:8:8:24 chr1 36794192 . C T 279.43 PASS AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00141324;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.4104;QD=38.5419;RBI=0.0126816;REFB=0;REVB=-0.0126026;RO=0;SAF=4;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.10829e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000184391;OID=.;OPOS=36794192;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:29:29:0:0:29:29:25:4:0:0:25:4:0:0 chr1 36807481 . C T 25.53 PASS AO=10;DP=38;FAO=10;FDP=38;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=23;FSRR=5;FWDB=0.0285823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.8077;QD=2.6876;RBI=0.028646;REFB=-0.0216553;REVB=-0.00190956;RO=28;SAF=7;SAR=3;SRF=23;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191246;STB=0.616237;TYPE=snp;VARB=0.035649;OID=.;OPOS=36807481;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:38:38:28:28:10:10:3:7:23:5:3:7:23:5 chr1 36927733 . G A 711.96 PASS AO=73;DP=73;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.017311;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.8335;QD=37.9713;RBI=0.0183121;REFB=0;REVB=0.00597177;RO=0;SAF=34;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000112162;OID=.;OPOS=36927733;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:73:75:0:0:73:75:39:34:0:0:39:36:0:0 chr1 36933743 . AG A 49.18 PASS AO=12;DP=20;FAO=13;FDP=22;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=-0.03298;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=15.9048;QD=8.94156;RBI=0.107725;REFB=-0.0785034;REVB=0.102552;RO=7;SAF=5;SAR=7;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0.461538;SSSB=0.191213;STB=0.599854;TYPE=del;VARB=0.0658593;OID=.;OPOS=36933744;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:12:21:13:22:9:6:7:2:7:21:7:5:7:1:6 chr1 36937059 . A G 126.14 PASS AO=36;DP=103;FAO=40;FDP=105;FR=.;FRO=65;FSAF=34;FSAR=6;FSRF=28;FSRR=37;FWDB=0.00814034;FXX=0.0277752;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.46;QD=4.8053;RBI=0.0265173;REFB=-0.0217996;REVB=-0.025237;RO=67;SAF=34;SAR=2;SRF=28;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.709824;STB=0.797;TYPE=snp;VARB=0.023317;OID=.;OPOS=36937059;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:105:67:65:36:40:2:34:28:39:6:34:28:37 chr1 36937065 . A G 153.57 PASS AO=46;DP=115;FAO=46;FDP=116;FR=.;FRO=70;FSAF=38;FSAR=8;FSRF=29;FSRR=41;FWDB=-0.00987286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.326;QD=5.29557;RBI=0.0708562;REFB=-0.0253334;REVB=-0.0701651;RO=68;SAF=38;SAR=8;SRF=29;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.471127;STB=0.77635;TYPE=snp;VARB=0.0260555;OID=.;OPOS=36937065;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:116:68:70:46:46:8:38:29:39:8:38:29:41 chr1 37325477 . A C 288.71 PASS AO=56;DP=124;FAO=68;FDP=136;FR=.;FRO=68;FSAF=21;FSAR=47;FSRF=37;FSRR=31;FWDB=-0.00658592;FXX=0.00729874;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.174;QD=8.49131;RBI=0.0310271;REFB=-0.0300134;REVB=0.0303201;RO=67;SAF=19;SAR=37;SRF=37;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213878;STB=0.624618;TYPE=snp;VARB=0.024175;OID=.;OPOS=37325477;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:136:67:68:56:68:37:19:37:30:47:21:37:31 chr1 37948212 . C G 115.52 PASS AO=25;DP=52;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.00443037;FXX=0.0192271;HRUN=3;LEN=1;MLLD=186.831;QD=9.06023;RBI=0.0116715;REFB=-0.0300205;REVB=-0.0107979;RO=25;SAF=9;SAR=16;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0381485;STB=0.50793;TYPE=snp;VARB=0.0247859;OID=.;OPOS=37948212;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:51:25:25:25:26:16:9:10:15:16:10:10:15 chr1 38006163 . G A 98.65 PASS AO=23;DP=58;FAO=25;FDP=59;FR=.;FRO=34;FSAF=19;FSAR=6;FSRF=23;FSRR=11;FWDB=0.0357145;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.5017;QD=6.68831;RBI=0.0471214;REFB=-0.0454122;REVB=0.0307392;RO=30;SAF=17;SAR=6;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12606;STB=0.561687;TYPE=snp;VARB=0.0454938;OID=.;OPOS=38006163;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:58:59:30:34:23:25:6:17:19:11:6:19:23:11 chr1 38006359 . A G 248.4 PASS AO=54;DP=102;FAO=54;FDP=103;FR=.;FRO=49;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=19;FSRR=30;FWDB=-0.0420493;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=81.3736;QD=9.64654;RBI=0.0551675;REFB=-0.0270564;REVB=-0.0357115;RO=48;SAF=25;SAR=29;SRF=18;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.076177;STB=0.536155;TYPE=snp;VARB=0.0178478;OID=.;OPOS=38006359;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:103:48:49:54:54:29:25:18:30:29:25:19:30 chr1 38023316 . C T 104.93 PASS AO=30;DP=75;FAO=30;FDP=75;FR=.;FRO=45;FSAF=6;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=28;FWDB=-0.00719157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.339;QD=5.59622;RBI=0.0084355;REFB=-0.0167111;REVB=-0.00440896;RO=45;SAF=6;SAR=24;SRF=17;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24037;STB=0.638786;TYPE=snp;VARB=0.0244609;OID=.;OPOS=38023316;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:45:45:30:30:24:6:17:28:24:6:17:28 chr1 38148765 . A G 1933.99 PASS AO=183;DP=189;FAO=209;FDP=209;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.159252;FXX=0.04566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.513;QD=37.0142;RBI=0.159256;REFB=0;REVB=0.00111139;RO=0;SAF=70;SAR=113;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.34565e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0201385;OID=.;OPOS=38148765;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:189:209:0:0:183:209:113:70:0:0:115:94:0:0 chr1 38171111 . AG A 1497.72 PASS AO=202;DP=283;FAO=256;FDP=256;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=168;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0280948;FXX=0.0038909;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.987;QD=23.4018;RBI=0.233769;REFB=0;REVB=0.232074;RO=34;SAF=74;SAR=128;SRF=5;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0656388;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00215402;OID=.;OPOS=38171112;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:202:255:256:256:0:88:168:0:0:99:34:74:128:5:29 chr1 38227086 . A T 96.84 PASS AO=22;DP=47;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=0;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=24;FWDB=0;FXX=0.0212721;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.124;QD=8.42124;RBI=0.000269023;REFB=0.00979108;REVB=-0.000269023;RO=24;SAF=0;SAR=22;SRF=0;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0157005;OID=.;OPOS=38227086;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:47:46:24:24:22:22:22:0:0:24:22:0:0:24 chr1 38266725 . AACTG A 421.57 PASS AO=151;DP=326;FAO=155;FDP=319;FR=.;FRO=164;FSAF=92;FSAR=63;FSRF=85;FSRR=79;FWDB=0.0152688;FXX=0.0391554;HRUN=2;LEN=4;MLLD=230.805;QD=5.28612;RBI=0.0197669;REFB=-0.0225721;REVB=-0.0125537;RO=99;SAF=91;SAR=60;SRF=42;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132398;STB=0.539495;TYPE=del;VARB=0.0199159;OID=.;OPOS=38266726;OREF=ACTG;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:151:293:155:319:164:92:63:85:79:99:99:91:60:42:57 chr1 38327935 . CAG C 329.74 PASS AO=136;DP=324;FAO=106;FDP=273;FR=.;FRO=167;FSAF=72;FSAR=34;FSRF=119;FSRR=48;FWDB=0.00328884;FXX=0.14687;HRUN=1;LEN=2;MLLD=228.556;QD=4.83138;RBI=0.0301794;REFB=-0.00806407;REVB=-0.0299997;RO=168;SAF=71;SAR=65;SRF=118;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182759;STB=0.52379;TYPE=del;VARB=0.0122486;OID=.;OPOS=38327936;OREF=AG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:136:319:106:273:167:72:34:119:48:99:168:71:65:118:50 chr1 38327982 . G T 2735.84 PASS AO=295;DP=305;FAO=301;FDP=305;FR=.;FRO=4;FSAF=158;FSAR=143;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0558349;FXX=0.00326787;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.1569;QD=35.8798;RBI=0.0572736;REFB=-0.145589;REVB=0.0127564;RO=9;SAF=154;SAR=141;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00189489;STB=0.503613;TYPE=snp;VARB=0.00297533;OID=.;OPOS=38327982;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:305:305:9:4:295:301:141:154:5:4:143:158:1:3 chr1 38329999 . C G 160.07 PASS AO=44;DP=110;FAO=45;FDP=109;FR=.;FRO=64;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=40;FWDB=-0.0017169;FXX=0.00909008;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.053;QD=5.87417;RBI=0.00270021;REFB=-0.00713589;REVB=-0.00208408;RO=63;SAF=22;SAR=22;SRF=24;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124448;STB=0.57964;TYPE=snp;VARB=0.00693433;OID=.;OPOS=38329999;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:109:63:64:44:45:22:22:24:39:22:23:24:40 chr1 38338795 . A G 1204.19 PASS AO=128;DP=130;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170396;FXX=0.022899;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.84;QD=37.6309;RBI=0.0175618;REFB=-0.0668262;REVB=-0.00425038;RO=1;SAF=27;SAR=101;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0172714;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.19501e-05;OID=.;OPOS=38338795;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:130:128:1:0:128:128:101:27:1:0:101:27:0:0 chr1 38348506 . G A 303.74 PASS AO=67;DP=147;FAO=75;FDP=154;FR=.;FRO=79;FSAF=56;FSAR=19;FSRF=53;FSRR=26;FWDB=0.0339807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.501;QD=7.88946;RBI=0.0350599;REFB=-0.0134234;REVB=0.00863179;RO=78;SAF=49;SAR=18;SRF=52;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0763319;STB=0.548886;TYPE=snp;VARB=0.0106296;OID=.;OPOS=38348506;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:154:78:79:67:75:18:49:52:26:19:56:53:26 chr1 38397369 . C T 73.82 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0435277;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.7045;QD=36.9093;RBI=0.101654;REFB=0;REVB=0.0918638;RO=0;SAF=7;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.78849e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00263097;OID=.;OPOS=38397369;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:7:0:0:1:7:0:0 chr1 38411445 . G A 172.42 PASS AO=27;DP=39;FAO=27;FDP=39;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=21;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=-0.0441073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.5188;QD=17.6837;RBI=0.0503335;REFB=-0.0420072;REVB=0.0242489;RO=12;SAF=6;SAR=21;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0852863;STB=0.546839;TYPE=snp;VARB=0.0317002;OID=.;OPOS=38411445;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:39:39:12:12:27:27:21:6:4:8:21:6:4:8 chr1 38423853 . G C 455.48 PASS AO=132;DP=313;FAO=132;FDP=313;FR=.;FRO=181;FSAF=55;FSAR=77;FSRF=76;FSRR=105;FWDB=0.0130108;FXX=0.00318461;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.465;QD=5.8208;RBI=0.0229927;REFB=-0.00432911;REVB=0.0189575;RO=175;SAF=55;SAR=77;SRF=73;SRR=102;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000502121;STB=0.501915;TYPE=snp;VARB=0.00783297;OID=.;OPOS=38423853;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:313:313:175:181:132:132:77:55:73:102:77:55:76:105 chr1 38442547 . G A 115.28 PASS AO=30;DP=70;FAO=30;FDP=70;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=-0.0108265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.259;QD=6.58749;RBI=0.0173218;REFB=-0.0162511;REVB=-0.0135216;RO=40;SAF=16;SAR=14;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0839318;STB=0.547497;TYPE=snp;VARB=0.0254657;OID=.;OPOS=38442547;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:40:40:30:30:14:16:18:22:14:16:18:22 chr1 38450367 . A G 134.42 PASS AO=35;DP=98;FAO=39;FDP=97;FR=.,HEALED;FRO=58;FSAF=30;FSAR=9;FSRF=46;FSRR=12;FWDB=0.00856891;FXX=0.029997;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.4963;QD=5.5431;RBI=0.104594;REFB=-0.0364719;REVB=0.104242;RO=34;SAF=26;SAR=9;SRF=24;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0418038;STB=0.520538;TYPE=snp;VARB=0.0575553;OID=.;OPOS=38450367;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:97:34:58:35:39:9:26:24:10:9:30:46:12 chr1 38462897 . G GA 141.4 PASS AO=4;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0256205;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=260.501;QD=29.7689;RBI=0.0256205;REFB=0;REVB=0;RO=15;SAF=4;SAR=0;SRF=15;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00424002;OID=.;OPOS=38462898;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:4:19:19:19:0:19:0:0:0:8:15:4:0:15:0 chr1 38462898 . T A 111.98 PASS AO=15;DP=19;FAO=15;FDP=19;FR=.;FRO=4;FSAF=15;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.00148451;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=291.144;QD=23.5751;RBI=0.00148451;REFB=0.103345;REVB=0;RO=4;SAF=15;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00138757;OID=.;OPOS=38462898;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:19:19:4:4:15:15:0:15:4:0:0:15:4:0 chr1 38462905 . C G 175.79 PASS AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0399038;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.0004;QD=33.4839;RBI=0.0399038;REFB=-0.11458;REVB=0;RO=1;SAF=20;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00772258;OID=.;OPOS=38462905;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:21:21:1:1:20:20:0:20:1:0:0:20:1:0 chr1 38862336 . T A 880.6 PASS AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.04674;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.4655;QD=37.8751;RBI=0.112537;REFB=0;REVB=-0.102371;RO=0;SAF=54;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.96098e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00118932;OID=.;OPOS=38862336;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:93:93:0:0:93:93:39:54:0:0:39:54:0:0 chr1 38862373 . AG A 211.82 PASS AO=57;DP=99;FAO=58;FDP=96;FR=.;FRO=38;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=0.0442231;FXX=0.0204061;HRUN=3;LEN=1;MLLD=18.7033;QD=8.8256;RBI=0.105403;REFB=-0.0114087;REVB=-0.0956776;RO=37;SAF=30;SAR=27;SRF=21;SRR=16;SSEN=0.659794;SSEP=0;SSSB=-0.0299566;STB=0.524487;TYPE=del;VARB=-0.00333379;OID=.;OPOS=38862374;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:57:97:58:96:38:30:28:22:16:66:37:30:27:21:16 chr1 39329700 . G T 401.89 PASS AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0538618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.1895;QD=37.3854;RBI=0.0541375;REFB=0;REVB=-0.00545658;RO=0;SAF=30;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000580203;OID=.;OPOS=39329700;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:43:43:0:0:43:43:13:30:0:0:13:30:0:0 chr1 39340607 . A G 629.42 PASS AO=125;DP=215;FAO=125;FDP=215;FR=.;FRO=90;FSAF=72;FSAR=53;FSRF=32;FSRR=58;FWDB=0.0249943;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.891;QD=11.71;RBI=0.0261596;REFB=-0.00502878;REVB=-0.00772075;RO=87;SAF=72;SAR=53;SRF=32;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157267;STB=0.59181;TYPE=snp;VARB=0.0064841;OID=.;OPOS=39340607;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:215:87:90:125:125:53:72:32:55:53:72:32:58 chr1 39748921 . G A 1673.31 PASS AO=184;DP=189;FAO=186;FDP=189;FR=.;FRO=3;FSAF=88;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.000422745;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.4061;QD=35.414;RBI=0.0588273;REFB=-0.0964857;REVB=0.0588258;RO=5;SAF=87;SAR=97;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0137851;STB=0.507537;TYPE=snp;VARB=0.00519752;OID=.;OPOS=39748921;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:189:189:5:3:184:186:97:87:1:4:98:88:0:3 chr1 39806610 . C T 937.9 PASS AO=100;DP=102;FAO=102;FDP=104;FR=.;FRO=2;FSAF=60;FSAR=42;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0311112;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.658;QD=36.0731;RBI=0.0311149;REFB=-0.0191204;REVB=0.000478119;RO=2;SAF=60;SAR=40;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0155493;STB=0.508195;TYPE=snp;VARB=5.64447e-05;OID=.;OPOS=39806610;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:102:104:2:2:100:102:40:60:2:0:42:60:2:0 chr1 39812822 . C A 1016.13 PASS AO=116;DP=122;FAO=116;FDP=122;FR=.;FRO=6;FSAF=50;FSAR=66;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0144552;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.327;QD=33.3156;RBI=0.0184916;REFB=-0.225131;REVB=-0.011532;RO=5;SAF=50;SAR=66;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0346236;STB=0.5133;TYPE=snp;VARB=0.00394627;OID=.;OPOS=39812822;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:122:122:5:6:116:116:66:50:0:5:66:50:1:5 chr1 39881196 . A T 15.72 PASS AO=2;DP=7;FAO=3;FDP=8;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.00919927;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.048;QD=7.85801;RBI=0.00919927;REFB=0.231411;REVB=0;RO=5;SAF=2;SAR=0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00117607;OID=.;OPOS=39881196;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:7:8:5:5:2:3:0:2:5:0:0:3:5:0 chr1 39988084 . G A 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.4478;QD=35.0875;RBI=0.0243246;REFB=0;REVB=-0.0124568;RO=0;SAF=5;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.27427e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000782052;OID=.;OPOS=39988084;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:2:5:0:0:2:5:0:0 chr1 40098328 . T C 543.52 PASS AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00536016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.735;QD=38.142;RBI=0.0092774;REFB=0;REVB=-0.00757224;RO=0;SAF=5;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.95004e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.28922e-05;OID=.;OPOS=40098328;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:57:57:0:0:57:57:52:5:0:0:52:5:0:0 chr1 40145297 . C T 153.27 PASS AO=41;DP=96;FAO=41;FDP=95;FR=.;FRO=54;FSAF=6;FSAR=35;FSRF=13;FSRR=41;FWDB=0.0188388;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.273;QD=6.45363;RBI=0.0189144;REFB=-0.0266835;REVB=0.00168912;RO=51;SAF=6;SAR=35;SRF=12;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152639;STB=0.59317;TYPE=snp;VARB=0.0309572;OID=.;OPOS=40145297;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:95:51:54:41:41:35:6:12:39:35:6:13:41 chr1 40149642 . G T 1176.2 PASS AO=120;DP=121;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.809;QD=37.942;RBI=0.0479427;REFB=0;REVB=0.0460383;RO=0;SAF=71;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.03829e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.68358e-05;OID=.;OPOS=40149642;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:121:124:0:0:120:124:49:71:0:0:52:72:0:0 chr1 40150156 . G A 164.37 PASS AO=41;DP=91;FAO=41;FDP=90;FR=.;FRO=49;FSAF=33;FSAR=8;FSRF=35;FSRR=14;FWDB=0.0168182;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.6909;QD=7.30549;RBI=0.0359429;REFB=-0.0302595;REVB=0.0317655;RO=49;SAF=33;SAR=8;SRF=35;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127012;STB=0.571616;TYPE=snp;VARB=0.0185163;OID=.;OPOS=40150156;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:90:49:49:41:41:8:33:35:14:8:33:35:14 chr1 40230336 . C G 61.24 PASS AO=15;DP=35;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=0.0204107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.124;QD=6.99897;RBI=0.0212401;REFB=-0.0208943;REVB=-0.00587744;RO=17;SAF=9;SAR=6;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.32801;STB=0.666455;TYPE=snp;VARB=0.017072;OID=.;OPOS=40230336;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:35:35:17:20:15:15:6:9:4:13:6:9:6:14 chr1 40236074 . A C 271.22 PASS AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00566946;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.015;QD=38.7456;RBI=0.01628;REFB=0;REVB=0.0152609;RO=0;SAF=11;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31638e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.001194;OID=.;OPOS=40236074;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:29:28:0:0:28:28:17:11:0:0:17:11:0:0 chr1 40349131 . G A 78.5 PASS AO=15;DP=27;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.00873312;FXX=0.0344709;HRUN=3;LEN=1;MLLD=149.282;QD=11.2138;RBI=0.0257816;REFB=-0.0159849;REVB=0.0242574;RO=12;SAF=6;SAR=9;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0135688;STB=0.507453;TYPE=snp;VARB=0.00668626;OID=.;OPOS=40349131;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:27:28:12:13:15:15:9:6:5:7:9:6:5:8 chr1 40363054 . G C 257.92 PASS AO=61;DP=127;FAO=61;FDP=125;FR=.;FRO=64;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=31;FSRR=33;FWDB=0.0548405;FXX=0.0157468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.1805;QD=8.25332;RBI=0.0787028;REFB=-0.0106413;REVB=0.0564503;RO=63;SAF=30;SAR=31;SRF=31;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00023923;STB=0.503804;TYPE=snp;VARB=0.0117198;OID=.;OPOS=40363054;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:125:63:64:61:61:31:30:31:32:31:30:31:33 chr1 40366768 . G A 117.09 PASS AO=19;DP=29;FAO=19;FDP=29;FR=.;FRO=10;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=0.0141977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.6557;QD=16.1499;RBI=0.0844642;REFB=-0.00965527;REVB=0.0832624;RO=10;SAF=10;SAR=9;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172976;STB=0.595492;TYPE=snp;VARB=0.0133406;OID=.;OPOS=40366768;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:29:29:10:10:19:19:9:10:8:2:9:10:8:2 chr1 40533266 . T G 327.64 PASS AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.688;QD=37.4449;RBI=0.0344303;REFB=0;REVB=-0.0292115;RO=0;SAF=4;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.12362e-05;OID=.;OPOS=40533266;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:35:35:0:0:35:35:31:4:0:0:31:4:0:0 chr1 40533287 . T G 227.9 PASS AO=23;DP=23;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5279;QD=36.4638;RBI=0.0204698;REFB=0;REVB=-0.0204698;RO=0;SAF=0;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000302511;OID=.;OPOS=40533287;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:23:25:0:0:23:25:23:0:0:0:25:0:0:0 chr1 40533315 . T G 265.92 PASS AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0348861;FXX=0.0312402;HRUN=3;LEN=1;MLLD=108.605;QD=34.3127;RBI=0.0435961;REFB=-0.0415751;REVB=-0.0261454;RO=1;SAF=1;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.015813;STB=0.508469;TYPE=snp;VARB=0.00147104;OID=.;OPOS=40533315;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:31:31:1:1:30:30:29:1:0:1:29:1:0:1 chr1 40533320 . T G 291.74 PASS AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0940594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.5176;QD=38.8983;RBI=0.0942653;REFB=0;REVB=0.00622589;RO=0;SAF=2;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.56306e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00100693;OID=.;OPOS=40533320;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:30:30:0:0:30:30:28:2:0:0:28:2:0:0 chr1 40533326 . T G 292.01 PASS AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.137457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.4555;QD=38.9342;RBI=0.138161;REFB=0;REVB=-0.0139246;RO=0;SAF=2;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.56306e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00246316;OID=.;OPOS=40533326;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:30:30:0:0:30:30:28:2:0:0:28:2:0:0 chr1 40533347 . T G 243.16 PASS AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.127427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.828;QD=37.4097;RBI=0.127578;REFB=0;REVB=0.00621305;RO=0;SAF=2;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.21284e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000934755;OID=.;OPOS=40533347;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:26:26:0:0:26:26:24:2:0:0:24:2:0:0 chr1 40703244 . G A 428.3 PASS AO=152;DP=402;FAO=148;FDP=399;FR=.;FRO=251;FSAF=59;FSAR=89;FSRF=104;FSRR=147;FWDB=-0.00658775;FXX=0.00249994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.791;QD=4.29369;RBI=0.0144251;REFB=-0.0248853;REVB=-0.012833;RO=198;SAF=63;SAR=89;SRF=97;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0779628;STB=0.510252;TYPE=snp;VARB=0.0349176;OID=.;OPOS=40703244;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:402:399:198:251:152:148:89:63:97:101:89:59:104:147 chr1 40769588 . C T 16.12 PASS AO=3;DP=6;FAO=3;FDP=6;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0805342;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.2735;QD=10.7462;RBI=0.125074;REFB=-0.0584886;REVB=-0.0956964;RO=3;SAF=1;SAR=2;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.352427;STB=0.713247;TYPE=snp;VARB=0.015273;OID=.;OPOS=40769588;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:6:6:3:3:3:3:2:1:0:3:2:1:0:3 chr1 40773149 . T C 274.03 PASS AO=60;DP=120;FAO=62;FDP=122;FR=.;FRO=60;FSAF=25;FSAR=37;FSRF=34;FSRR=26;FWDB=-0.00739251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.986;QD=8.98464;RBI=0.00759156;REFB=-0.0166826;REVB=0.00172698;RO=60;SAF=24;SAR=36;SRF=34;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151833;STB=0.580868;TYPE=snp;VARB=0.0212197;OID=.;OPOS=40773149;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:122:60:60:60:62:36:24:34:26:37:25:34:26 chr1 40777800 . T G 30.41 PASS AO=9;DP=29;FAO=10;FDP=30;FR=.;FRO=20;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=0.0670269;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.1382;QD=4.0546;RBI=0.0965352;REFB=0.014147;REVB=0.0694725;RO=20;SAF=1;SAR=8;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.616441;STB=0.886509;TYPE=snp;VARB=-0.0142564;OID=.;OPOS=40777800;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:29:30:20:20:9:10:8:1:13:7:9:1:13:7 chr1 40840353 . A G 141.57 PASS AO=40;DP=86;FAO=38;FDP=86;FR=.;FRO=48;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=33;FWDB=-0.0381425;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.9762;QD=6.58454;RBI=0.0790776;REFB=-0.00896965;REVB=-0.0692706;RO=46;SAF=17;SAR=23;SRF=14;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120975;STB=0.563348;TYPE=snp;VARB=0.00882427;OID=.;OPOS=40840353;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:46:48:40:38:23:17:14:32:22:16:15:33 chr1 40881041 . C G 3443.92 PASS AO=236;DP=374;FAO=354;FDP=360;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=154;FSAR=200;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021043;FXX=0.0109887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.8955;QD=38.2658;RBI=0.251431;REFB=0;REVB=0.250549;RO=0;SAF=144;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.20056e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000445537;OID=.;OPOS=40881041;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:361:360:0:0:236:354:92:144:0:0:200:154:0:0 chr1 41087734 . C T 20.04 PASS AO=5;DP=17;FAO=5;FDP=16;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=0;FSRF=11;FSRR=0;FWDB=-0.0104284;FXX=0.0587889;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.665;QD=5.01011;RBI=0.0104284;REFB=0.00715715;REVB=0;RO=11;SAF=5;SAR=0;SRF=11;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0115212;OID=.;OPOS=41087734;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:17:16:11:11:5:5:0:5:11:0:0:5:11:0 chr1 41204569 . C T 1245.1 PASS AO=132;DP=138;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00137741;FXX=0.0289834;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.936;QD=37.1671;RBI=0.0127618;REFB=-0.0354452;REVB=-0.0126872;RO=2;SAF=58;SAR=74;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00174443;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.50008e-05;OID=.;OPOS=41204569;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:138:134:2:0:132:134:74:58:1:1:76:58:0:0 chr1 41454328 . A G 349.36 PASS AO=93;DP=208;FAO=93;FDP=208;FR=.;FRO=115;FSAF=51;FSAR=42;FSRF=61;FSRR=54;FWDB=-0.00895452;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.641;QD=6.71841;RBI=0.0110884;REFB=8.5697e-05;REVB=0.00653981;RO=113;SAF=51;SAR=42;SRF=59;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0261364;STB=0.509998;TYPE=snp;VARB=-0.000113826;OID=.;OPOS=41454328;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:208:113:115:93:93:42:51:59:54:42:51:61:54 chr1 41485902 . C G 195.69 PASS AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0435847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.314;QD=39.1387;RBI=0.0506536;REFB=0;REVB=-0.02581;RO=0;SAF=18;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.19193e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000240259;OID=.;OPOS=41485902;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:20:20:0:0:20:20:2:18:0:0:2:18:0:0 chr1 41486245 . C T 216.35 PASS AO=39;DP=64;FAO=39;FDP=63;FR=.;FRO=24;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.00217828;FXX=0.0307645;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.479;QD=13.7364;RBI=0.0195515;REFB=-0.0506496;REVB=0.0194298;RO=23;SAF=20;SAR=19;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0234626;STB=0.504883;TYPE=snp;VARB=0.0236032;OID=.;OPOS=41486245;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:64:63:23:24:39:39:19:20:11:12:19:20:12:12 chr1 41945040 . C T 277.9 PASS AO=61;DP=116;FAO=61;FDP=117;FR=.;FRO=56;FSAF=21;FSAR=40;FSRF=28;FSRR=28;FWDB=-0.0065679;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=158.896;QD=9.50068;RBI=0.0225399;REFB=-0.0285841;REVB=0.0215617;RO=54;SAF=21;SAR=40;SRF=26;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124047;STB=0.578486;TYPE=snp;VARB=0.0166138;OID=.;OPOS=41945040;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:117:54:56:61:61:40:21:26:28:40:21:28:28 chr1 41946398 . T A 79.3 PASS AO=22;DP=60;FAO=23;FDP=61;FR=.;FRO=38;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=-0.027948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.034;QD=5.20023;RBI=0.0614362;REFB=-0.0229447;REVB=0.0547112;RO=37;SAF=10;SAR=12;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0053617;STB=0.507953;TYPE=snp;VARB=0.0301123;OID=.;OPOS=41946398;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:60:61:37:38:22:23:12:10:17:20:13:10:17:21 chr1 41950287 . G A 105.97 PASS AO=20;DP=37;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=-0.0029315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.232;QD=10.8688;RBI=0.0741489;REFB=-0.0337699;REVB=0.0740909;RO=17;SAF=10;SAR=10;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169061;STB=0.587297;TYPE=snp;VARB=0.0358525;OID=.;OPOS=41950287;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:37:39:17:18:20:21:10:10:12:5:11:10:12:6 chr1 41978566 . T G 572.95 PASS AO=58;DP=59;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00769362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.1817;QD=36.9642;RBI=0.0560333;REFB=0;REVB=0.0555026;RO=0;SAF=39;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.47594e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0005241;OID=.;OPOS=41978566;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:59:62:0:0:58:62:19:39:0:0:20:42:0:0 chr1 41978825 . C G 326.19 PASS AO=31;DP=31;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.031204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.663;QD=37.2793;RBI=0.0574965;REFB=0;REVB=0.0482924;RO=0;SAF=24;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71661e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.45425e-05;OID=.;OPOS=41978825;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:31:35:0:0:31:35:7:24:0:0:8:27:0:0 chr1 41979156 . A G 58.92 PASS AO=8;DP=12;FAO=9;FDP=13;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.00705739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.7112;QD=18.1297;RBI=0.0187142;REFB=-0.0325237;REVB=-0.0173325;RO=4;SAF=0;SAR=8;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.791634;STB=0.705321;TYPE=snp;VARB=0.0501731;OID=.;OPOS=41979156;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:12:13:4:4:8:9:8:0:2:2:8:1:2:2 chr1 42046812 . C T 106.2 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0404962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.093;QD=35.3982;RBI=0.0404962;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=12;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00477546;OID=.;OPOS=42046812;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:0:12:0:0:0:12:0:0 chr1 42048745 . T C 645.76 PASS AO=61;DP=64;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0544377;FXX=0.0422476;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.853;QD=37.986;RBI=0.0573282;REFB=0;REVB=0.0179738;RO=0;SAF=4;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000236066;OID=.;OPOS=42048745;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:64:68:0:0:61:68:57:4:0:0:64:4:0:0 chr1 42049032 . G A 1470.38 PASS AO=154;DP=154;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0453341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.864;QD=38.1918;RBI=0.0658589;REFB=0;REVB=0.0477726;RO=0;SAF=82;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000215547;OID=.;OPOS=42049032;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:154:154:0:0:154:154:72:82:0:0:72:82:0:0 chr1 42049140 . C G 968.33 PASS AO=102;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0227922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.975;QD=37.9738;RBI=0.0594152;REFB=0;REVB=0.0548696;RO=0;SAF=52;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.70062e-05;OID=.;OPOS=42049140;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:102:102:0:0:102:102:50:52:0:0:50:52:0:0 chr1 42050366 . C T 137.32 PASS AO=35;DP=79;FAO=35;FDP=79;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=-0.00595234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.394;QD=6.95279;RBI=0.0494636;REFB=-0.00638714;REVB=-0.0491042;RO=44;SAF=14;SAR=21;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100628;STB=0.556668;TYPE=snp;VARB=0.0106453;OID=.;OPOS=42050366;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:44:44:35:35:21:14:22:22:21:14:22:22 chr1 42619152 . C A 173.39 PASS AO=42;DP=91;FAO=42;FDP=90;FR=.;FRO=48;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=32;FWDB=-0.00857695;FXX=0.0109878;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.682;QD=7.70624;RBI=0.0192295;REFB=-0.0254663;REVB=0.0172107;RO=48;SAF=26;SAR=16;SRF=16;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.269214;STB=0.64993;TYPE=snp;VARB=0.0188168;OID=.;OPOS=42619152;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:90:48:48:42:42:16:26:16:32:16:26:16:32 chr1 42630364 . G A 119.51 PASS AO=26;DP=53;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=-0.00397843;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.3602;QD=8.69201;RBI=0.0105674;REFB=0.0146373;REVB=-0.00978992;RO=27;SAF=13;SAR=13;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117794;STB=0.563712;TYPE=snp;VARB=-0.0169802;OID=.;OPOS=42630364;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:55:27:28:26:27:13:13:17:10:14:13:17:11 chr1 42643525 . T C 94.53 PASS AO=22;DP=47;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.0261526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7417;QD=8.04476;RBI=0.0261528;REFB=-0.00155899;REVB=-9.73593e-05;RO=25;SAF=8;SAR=14;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0364213;STB=0.520642;TYPE=snp;VARB=0.00187155;OID=.;OPOS=42643525;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:47:47:25:25:22:22:14:8:10:15:14:8:10:15 chr1 42657196 . T G 260.62 PASS AO=52;DP=118;FAO=63;FDP=128;FR=.;FRO=65;FSAF=43;FSAR=20;FSRF=38;FSRR=27;FWDB=-0.0113699;FXX=0.0153834;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.962;QD=8.14422;RBI=0.0476245;REFB=-0.0306;REVB=0.0462474;RO=64;SAF=41;SAR=11;SRF=38;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240648;STB=0.555049;TYPE=snp;VARB=0.0289179;OID=.;OPOS=42657196;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:128:64:65:52:63:11:41:38:26:20:43:38:27 chr1 42693597 . A G 465.37 PASS AO=113;DP=238;FAO=114;FDP=235;FR=.;FRO=121;FSAF=58;FSAR=56;FSRF=53;FSRR=68;FWDB=0.0044782;FXX=0.0126045;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.012;QD=7.9212;RBI=0.0153855;REFB=-0.0035882;REVB=0.0147193;RO=122;SAF=58;SAR=55;SRF=53;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0742266;STB=0.53639;TYPE=snp;VARB=0.00348438;OID=.;OPOS=42693597;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:238:235:122:121:113:114:55:58:53:69:56:58:53:68 chr1 42880516 . T C 113.49 PASS AO=27;DP=57;FAO=27;FDP=57;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=9;FWDB=-0.0525526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.8851;QD=7.96386;RBI=0.0527123;REFB=-0.000732176;REVB=0.00409891;RO=30;SAF=8;SAR=19;SRF=21;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.375156;STB=0.710813;TYPE=snp;VARB=0.00180664;OID=.;OPOS=42880516;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:30:30:27:27:19:8:21:9:19:8:21:9 chr1 42898843 . A G 303.68 PASS AO=76;DP=164;FAO=76;FDP=162;FR=.;FRO=86;FSAF=46;FSAR=30;FSRF=52;FSRR=34;FWDB=-0.0099431;FXX=0.0121944;HRUN=4;LEN=1;MLLD=207.59;QD=7.49815;RBI=0.0100241;REFB=-0.0167678;REVB=0.00127179;RO=83;SAF=46;SAR=30;SRF=49;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0146664;STB=0.50034;TYPE=snp;VARB=0.0205446;OID=.;OPOS=42898843;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:162:83:86:76:76:30:46:49:34:30:46:52:34 chr1 42925376 . G A 650.37 PASS AO=175;DP=390;FAO=175;FDP=390;FR=.;FRO=215;FSAF=72;FSAR=103;FSRF=84;FSRR=131;FWDB=0.0208773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.103;QD=6.67046;RBI=0.0255902;REFB=-0.0131747;REVB=0.0147984;RO=214;SAF=72;SAR=103;SRF=83;SRR=131;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0243495;STB=0.511847;TYPE=snp;VARB=0.0167138;OID=.;OPOS=42925376;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:390:390:214:215:175:175:103:72:83:131:103:72:84:131 chr1 42925688 . T G 322.98 PASS AO=93;DP=226;FAO=93;FDP=223;FR=.;FRO=130;FSAF=44;FSAR=49;FSRF=41;FSRR=89;FWDB=0.0037338;FXX=0.0510617;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.6243;QD=5.79329;RBI=0.00740518;REFB=-0.0150153;REVB=0.00639495;RO=113;SAF=44;SAR=49;SRF=34;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173354;STB=0.593123;TYPE=snp;VARB=0.029296;OID=.;OPOS=42925688;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:226:223:113:130:93:93:49:44:34:79:49:44:41:89 chr1 42986956 . T C 57.92 PASS AO=15;DP=37;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.0115115;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=266.694;QD=6.26117;RBI=0.0116357;REFB=-0.00938405;REVB=-0.00169506;RO=22;SAF=6;SAR=9;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00964467;STB=0.50561;TYPE=snp;VARB=0.012056;OID=.;OPOS=42986956;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:37:37:22:22:15:15:9:6:9:13:9:6:9:13 chr1 43034740 . T C 161.09 PASS AO=38;DP=81;FAO=38;FDP=80;FR=.;FRO=42;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=28;FWDB=0.0119153;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.7432;QD=8.05447;RBI=0.0173211;REFB=-0.0333133;REVB=0.0125717;RO=42;SAF=23;SAR=15;SRF=14;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252211;STB=0.640472;TYPE=snp;VARB=0.0449953;OID=.;OPOS=43034740;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:80:42:42:38:38:15:23:14:28:15:23:14:28 chr1 43212430 . GA G,GG 1727.65 PASS AO=101,103;DP=207;FAO=24,172;FDP=196;FR=.;FRO=0;FSAF=14,124;FSAR=10,48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02475,-0.00594833;FXX=0.0576895;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=52.4807,58.9018;QD=35.2581;RBI=0.0301496,0.020803;REFB=0,0;REVB=0.0172173,0.0199345;RO=0;SAF=80,68;SAR=21,35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.39991e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.00349588,0.012344;OID=.,.;OPOS=43212431,43212431;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:101,103:205:24,172:196:0:14,124:10,48:0:0:8:0:80,68:21,35:0:0 chr1 43212432 . C G 115.02 PASS AO=57;DP=183;FAO=64;FDP=206;FR=.;FRO=142;FSAF=62;FSAR=2;FSRF=85;FSRR=57;FWDB=-0.0360361;FXX=0.00961492;HRUN=3;LEN=1;MLLD=20.9508;QD=2.23338;RBI=0.0710355;REFB=-0.0841817;REVB=-0.0612163;RO=126;SAF=56;SAR=1;SRF=74;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.749607;STB=0.925426;TYPE=snp;VARB=0.160136;OID=.;OPOS=43212432;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:206:126:142:57:64:1:56:74:52:2:62:85:57 chr1 43215571 . A G 1928.91 PASS AO=203;DP=207;FAO=203;FDP=203;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=138;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00701228;FXX=0.0424508;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9421;QD=38.0081;RBI=0.0149896;REFB=-0.143574;REVB=0.0132482;RO=1;SAF=65;SAR=138;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00343933;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00193624;OID=.;OPOS=43215571;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:207:203:1:0:203:203:138:65:0:1:138:65:0:0 chr1 43309842 . G C 1484.31 PASS AO=155;DP=156;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00865578;FXX=0.00640985;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.062;QD=38.3048;RBI=0.0261489;REFB=0;REVB=0.0246747;RO=0;SAF=61;SAR=94;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.67899e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.17894e-05;OID=.;OPOS=43309842;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:156:155:0:0:155:155:94:61:0:0:94:61:0:0 chr1 43317793 . G A 649.37 PASS AO=159;DP=338;FAO=161;FDP=336;FR=.;FRO=175;FSAF=91;FSAR=70;FSRF=111;FSRR=64;FWDB=0.00352185;FXX=0.0088493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.495;QD=7.73059;RBI=0.0410953;REFB=-0.022049;REVB=0.0409441;RO=174;SAF=89;SAR=70;SRF=110;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.070534;STB=0.536944;TYPE=snp;VARB=0.0140719;OID=.;OPOS=43317793;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:338:336:174:175:159:161:70:89:110:64:70:91:111:64 chr1 43395635 . C T 128.77 PASS AO=25;DP=44;FAO=25;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.00655207;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.869;QD=11.7061;RBI=0.0345523;REFB=-0.0226612;REVB=0.0339254;RO=16;SAF=9;SAR=16;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232519;STB=0.618688;TYPE=snp;VARB=0.0150257;OID=.;OPOS=43395635;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:44:44:16:19:25:25:16:9:11:5:16:9:12:7 chr1 43396414 . G A 156.71 PASS AO=30;DP=52;FAO=30;FDP=52;FR=.;FRO=22;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.0183722;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.798;QD=12.0547;RBI=0.0521633;REFB=-0.028473;REVB=0.0488209;RO=22;SAF=17;SAR=13;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0164876;STB=0.509109;TYPE=snp;VARB=0.0391969;OID=.;OPOS=43396414;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:52:52:22:22:30:30:13:17:12:10:13:17:12:10 chr1 43408966 . G A 341.29 PASS AO=76;DP=148;FAO=76;FDP=147;FR=.;FRO=71;FSAF=34;FSAR=42;FSRF=40;FSRR=31;FWDB=-0.0195092;FXX=0.0067563;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.351;QD=9.28692;RBI=0.0420573;REFB=-0.00800384;REVB=0.0372587;RO=71;SAF=34;SAR=42;SRF=40;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101936;STB=0.555978;TYPE=snp;VARB=0.00676938;OID=.;OPOS=43408966;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:147:71:71:76:76:42:34:40:31:42:34:40:31 chr1 43457145 . C T 99.6 PASS AO=18;DP=31;FAO=18;FDP=31;FR=.;FRO=13;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.00652708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.84;QD=12.8518;RBI=0.050041;REFB=-0.0326437;REVB=-0.0496135;RO=13;SAF=13;SAR=5;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215387;STB=0.621371;TYPE=snp;VARB=0.0186482;OID=.;OPOS=43457145;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:31:31:13:13:18:18:5:13:6:7:5:13:6:7 chr1 43457170 . T C 382.19 PASS AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0034058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.022;QD=37.2873;RBI=0.00398985;REFB=0;REVB=0.00207832;RO=0;SAF=26;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000244518;OID=.;OPOS=43457170;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:40:41:0:0:40:41:14:26:0:0:15:26:0:0 chr1 43610910 . T G 192.69 PASS AO=44;DP=89;FAO=44;FDP=89;FR=.;FRO=45;FSAF=30;FSAR=14;FSRF=33;FSRR=12;FWDB=0.00108964;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.6;QD=8.66038;RBI=0.00508224;REFB=-0.0155672;REVB=-0.00496406;RO=45;SAF=30;SAR=14;SRF=33;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0554131;STB=0.530672;TYPE=snp;VARB=0.0136615;OID=.;OPOS=43610910;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:45:45:44:44:14:30:33:12:14:30:33:12 chr1 43649336 . T C 866.35 PASS AO=171;DP=311;FAO=179;FDP=317;FR=.;FRO=138;FSAF=93;FSAR=86;FSRF=89;FSRR=49;FWDB=-0.0457664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.7577;QD=10.9319;RBI=0.0596433;REFB=0.00763451;REVB=0.0382461;RO=138;SAF=93;SAR=78;SRF=89;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.084481;STB=0.554892;TYPE=snp;VARB=-0.00514585;OID=.;OPOS=43649336;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:311:317:138:138:171:179:78:93:89:49:86:93:89:49 chr1 43649393 . T C 721.64 PASS AO=167;DP=330;FAO=168;FDP=331;FR=.;FRO=163;FSAF=89;FSAR=79;FSRF=94;FSRR=69;FWDB=0.00401507;FXX=0.00301196;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.787;QD=8.72075;RBI=0.019209;REFB=-0.00755249;REVB=-0.0187847;RO=162;SAF=87;SAR=80;SRF=94;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0536005;STB=0.523252;TYPE=snp;VARB=0.00993867;OID=.;OPOS=43649393;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:330:331:162:163:167:168:80:87:94:68:79:89:94:69 chr1 43649508 . A G 358.21 PASS AO=86;DP=180;FAO=87;FDP=181;FR=.;FRO=94;FSAF=36;FSAR=51;FSRF=30;FSRR=64;FWDB=0.0138942;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.9355;QD=7.91621;RBI=0.0153193;REFB=-0.0178815;REVB=0.00645246;RO=93;SAF=35;SAR=51;SRF=29;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0948243;STB=0.551547;TYPE=snp;VARB=0.0212031;OID=.;OPOS=43649508;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:181:93:94:86:87:51:35:29:64:51:36:30:64 chr1 43652442 . G C 354.91 PASS AO=80;DP=164;FAO=84;FDP=168;FR=.;FRO=84;FSAF=38;FSAR=46;FSRF=33;FSRR=51;FWDB=-0.00919309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.74;QD=8.45014;RBI=0.0327903;REFB=-0.0174761;REVB=0.0314752;RO=84;SAF=37;SAR=43;SRF=33;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0654383;STB=0.5302;TYPE=snp;VARB=0.0146974;OID=.;OPOS=43652442;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:168:84:84:80:84:43:37:33:51:46:38:33:51 chr1 43662106 . G C 145.69 PASS AO=35;DP=78;FAO=36;FDP=79;FR=.;FRO=43;FSAF=2;FSAR=34;FSRF=12;FSRR=31;FWDB=0.0121008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.118;QD=7.3768;RBI=0.0133963;REFB=-0.00228305;REVB=-0.0057473;RO=43;SAF=1;SAR=34;SRF=12;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.626957;STB=0.785261;TYPE=snp;VARB=0.00210015;OID=.;OPOS=43662106;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:79:43:43:35:36:34:1:12:31:34:2:12:31 chr1 43675467 . G A 233.27 PASS AO=53;DP=105;FAO=53;FDP=105;FR=.;FRO=52;FSAF=18;FSAR=35;FSRF=20;FSRR=32;FWDB=-0.0046316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1709;QD=8.88664;RBI=0.0797855;REFB=-0.0272469;REVB=0.079651;RO=52;SAF=18;SAR=35;SRF=20;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0441776;STB=0.524439;TYPE=snp;VARB=0.0331954;OID=.;OPOS=43675467;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:52:52:53:53:35:18:20:32:35:18:20:32 chr1 43784956 . A G 767.8 PASS AO=67;DP=83;FAO=74;FDP=83;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=35;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0374413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.205;QD=37.0023;RBI=0.0409985;REFB=0;REVB=0.0167041;RO=0;SAF=29;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000928804;OID=.;OPOS=43784956;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:82:83:0:0:67:74:38:29:0:0:39:35:0:0 chr1 43787292 . AG A 220.13 PASS AO=35;DP=62;FAO=42;FDP=63;FR=.;FRO=21;FSAF=1;FSAR=41;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=0.0348322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=36.8041;QD=13.9762;RBI=0.115845;REFB=-0.115428;REVB=0.110485;RO=27;SAF=0;SAR=35;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.864409;STB=0.927307;TYPE=del;VARB=0.171548;OID=.;OPOS=43787293;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:35:62:42:63:21:1:41:14:7:55:27:0:35:15:12 chr1 43825644 . T C 341.3 PASS AO=67;DP=114;FAO=66;FDP=112;FR=.;FRO=46;FSAF=30;FSAR=36;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=-0.00345471;FXX=0.0175423;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.29;QD=12.1893;RBI=0.00487783;REFB=-0.0292986;REVB=0.00344357;RO=45;SAF=31;SAR=36;SRF=16;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0801669;STB=0.526308;TYPE=snp;VARB=0.0187652;OID=.;OPOS=43825644;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:112:45:46:67:66:36:31:16:29:36:30:18:28 chr1 43886494 . C T 265.25 PASS AO=78;DP=191;FAO=78;FDP=190;FR=.;FRO=112;FSAF=55;FSAR=23;FSRF=65;FSRR=47;FWDB=-0.00147755;FXX=0.0155432;HRUN=3;LEN=1;MLLD=238.477;QD=5.5841;RBI=0.00163716;REFB=-0.0042723;REVB=0.000705094;RO=108;SAF=55;SAR=23;SRF=64;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131357;STB=0.582429;TYPE=snp;VARB=0.00639923;OID=.;OPOS=43886494;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:191:190:108:112:78:78:23:55:64:44:23:55:65:47 chr1 43906896 . A G 161.6 PASS AO=35;DP=68;FAO=35;FDP=68;FR=.;FRO=33;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=0.0375008;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.641;QD=9.50604;RBI=0.0379259;REFB=-0.00561012;REVB=0.0056625;RO=33;SAF=22;SAR=13;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0486504;STB=0.527047;TYPE=snp;VARB=0.00748108;OID=.;OPOS=43906896;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:33:33:35:35:13:22:19:14:13:22:19:14 chr1 43909265 . T C 85.3 PASS AO=26;DP=70;FAO=26;FDP=70;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=31;FSRR=13;FWDB=-0.0206252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.1;QD=4.87426;RBI=0.0210343;REFB=-0.0104478;REVB=0.00412817;RO=43;SAF=16;SAR=10;SRF=30;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0969568;STB=0.560814;TYPE=snp;VARB=0.0249089;OID=.;OPOS=43909265;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:70:70:43:44:26:26:10:16:30:13:10:16:31:13 chr1 43917637 . G A 125.43 PASS AO=36;DP=114;FAO=42;FDP=117;FR=.;FRO=75;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=40;FSRR=35;FWDB=0.00325865;FXX=0.00847386;HRUN=5;LEN=1;MLLD=110.016;QD=4.28805;RBI=0.00383682;REFB=-0.020137;REVB=0.00202544;RO=47;SAF=17;SAR=19;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0386191;STB=0.551826;TYPE=snp;VARB=0.0269788;OID=.;OPOS=43917637;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:117:47:75:36:42:19:17:24:23:23:19:40:35 chr1 44058265 . C A 99.31 PASS AO=27;DP=67;FAO=30;FDP=79;FR=.;FRO=49;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=33;FWDB=-0.0231099;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=244.496;QD=5.02822;RBI=0.0266373;REFB=-0.0213551;REVB=0.0132468;RO=40;SAF=13;SAR=14;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0857156;STB=0.568635;TYPE=snp;VARB=0.0323808;OID=.;OPOS=44058265;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:79:40:49:27:30:14:13:16:24:17:13:16:33 chr1 44071221 . G A 396.53 PASS AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0394884;FXX=0.0454442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.982;QD=37.7649;RBI=0.0594142;REFB=0;REVB=0.0443927;RO=0;SAF=27;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.13648e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0010955;OID=.;OPOS=44071221;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:42:42:0:0:42:42:15:27:0:0:15:27:0:0 chr1 44083507 . T C 510.77 PASS AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00737885;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.994;QD=37.835;RBI=0.0190705;REFB=0;REVB=0.0175852;RO=0;SAF=23;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6027e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.76318e-05;OID=.;OPOS=44083507;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:55:54:0:0:54:54:31:23:0:0:31:23:0:0 chr1 44083519 . G A 424.57 PASS AO=51;DP=54;FAO=50;FDP=53;FR=.;FRO=3;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0639043;FXX=0.0185151;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5431;QD=32.0429;RBI=0.0732383;REFB=-0.0312018;REVB=0.0357783;RO=2;SAF=21;SAR=30;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00645825;STB=0.514258;TYPE=snp;VARB=0.0139261;OID=.;OPOS=44083519;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:54:53:2:3:51:50:30:21:1:1:29:21:2:1 chr1 44084739 . C T 158.92 PASS AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.4817;QD=37.3922;RBI=0.0289415;REFB=0;REVB=0.0289415;RO=0;SAF=0;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00141704;OID=.;OPOS=44084739;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:17:17:0:0:17:17:17:0:0:0:17:0:0:0 chr1 44086831 . C T 48.47 PASS AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.0121963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.397;QD=5.70287;RBI=0.15887;REFB=-0.0203226;REVB=-0.158401;RO=20;SAF=12;SAR=1;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.554829;STB=0.832679;TYPE=snp;VARB=0.0284214;OID=.;OPOS=44086831;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:33:34:20:21:13:13:1:12:11:9:1:12:12:9 chr1 44137257 . C A 1250.86 PASS AO=132;DP=132;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0186853;FXX=0.00751823;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.616;QD=37.9049;RBI=0.0201515;REFB=0;REVB=0.00754604;RO=0;SAF=50;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.13233e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.55275e-05;OID=.;OPOS=44137257;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:132:132:0:0:132:132:82:50:0:0:82:50:0:0 chr1 44171211 . C T 316.75 PASS AO=58;DP=108;FAO=66;FDP=118;FR=.;FRO=52;FSAF=37;FSAR=29;FSRF=29;FSRR=23;FWDB=0.0210316;FXX=0.00840265;HRUN=3;LEN=1;MLLD=74.7724;QD=10.7373;RBI=0.0223288;REFB=-0.0191822;REVB=-0.00749988;RO=49;SAF=29;SAR=29;SRF=26;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0255398;STB=0.501302;TYPE=snp;VARB=0.0220017;OID=.;OPOS=44171211;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:118:49:52:58:66:29:29:26:23:29:37:29:23 chr1 44290530 . A G 426.47 PASS AO=113;DP=251;FAO=113;FDP=251;FR=.;FRO=138;FSAF=40;FSAR=73;FSRF=65;FSRR=73;FWDB=0.0392209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5556;QD=6.79638;RBI=0.0468676;REFB=-0.0200391;REVB=-0.0256571;RO=138;SAF=40;SAR=73;SRF=65;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121676;STB=0.567555;TYPE=snp;VARB=0.0284613;OID=.;OPOS=44290530;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:251:251:138:138:113:113:73:40:65:73:73:40:65:73 chr1 44395786 . C T 946.19 PASS AO=88;DP=88;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0672715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.537;QD=37.4729;RBI=0.097974;REFB=0;REVB=0.0712282;RO=0;SAF=22;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.59293e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00113419;OID=.;OPOS=44395786;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:88:101:0:0:88:101:66:22:0:0:69:32:0:0 chr1 44401384 . A G 539.95 PASS AO=43;DP=56;FAO=56;FDP=57;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0935739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.055;QD=37.8911;RBI=0.132034;REFB=0;REVB=0.0931504;RO=0;SAF=22;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00211051;OID=.;OPOS=44401384;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:58:57:0:0:43:56:21:22:0:0:33:23:0:0 chr1 44415415 . C T 960.17 PASS AO=101;DP=103;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00173293;FXX=0.0194156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.161;QD=38.0267;RBI=0.0278548;REFB=0;REVB=0.0278009;RO=0;SAF=27;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.23892e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.32959e-06;OID=.;OPOS=44415415;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:103:101:0:0:101:101:74:27:0:0:74:27:0:0 chr1 44433119 . GC G 83.56 PASS AO=11;DP=19;FAO=16;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0574731;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.1691;QD=19.662;RBI=0.151154;REFB=-0.078865;REVB=0.139801;RO=3;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0.294525;SSSB=0.158276;STB=0.521712;TYPE=del;VARB=0.035042;OID=.;OPOS=44433120;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:11:17:16:17:1:5:11:0:1:4:3:4:7:0:3 chr1 44451234 . C T 72.36 PASS AO=19;DP=45;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.0149943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.4462;QD=6.29245;RBI=0.0402004;REFB=-0.0122511;REVB=-0.0372994;RO=25;SAF=8;SAR=11;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0986702;STB=0.535925;TYPE=snp;VARB=0.0198253;OID=.;OPOS=44451234;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:45:46:25:27:19:19:11:8:13:12:11:8:13:14 chr1 44457305 . G A 254.95 PASS AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276693;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.54;QD=37.7707;RBI=0.0656715;REFB=0;REVB=0.0595579;RO=0;SAF=9;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00100185;OID=.;OPOS=44457305;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:27:27:0:0:27:27:18:9:0:0:18:9:0:0 chr1 44595047 . T A 217.52 PASS AO=57;DP=128;FAO=57;FDP=128;FR=.;FRO=71;FSAF=39;FSAR=18;FSRF=38;FSRR=33;FWDB=-0.0146647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.258;QD=6.79748;RBI=0.0149574;REFB=-0.014148;REVB=0.00294459;RO=71;SAF=39;SAR=18;SRF=38;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159439;STB=0.589301;TYPE=snp;VARB=0.0176605;OID=.;OPOS=44595047;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:71:71:57:57:18:39:38:33:18:39:38:33 chr1 44595113 . G C 1387.65 PASS AO=114;DP=150;FAO=145;FDP=145;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=86;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.144438;FXX=0.0136045;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1934;QD=38.2799;RBI=0.150434;REFB=0;REVB=0.0420507;RO=0;SAF=67;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3323e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0097123;OID=.;OPOS=44595113;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:146:145:0:0:114:145:47:67:0:0:59:86:0:0 chr1 44595410 . A G 15.91 PASS AO=5;DP=21;FAO=5;FDP=20;FR=.;FRO=15;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0188132;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.0025;QD=3.18285;RBI=0.0222021;REFB=-0.000936669;REVB=0.0117896;RO=15;SAF=1;SAR=4;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267058;STB=0.682116;TYPE=snp;VARB=0.0171937;OID=.;OPOS=44595410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:21:20:15:15:5:5:4:1:6:9:4:1:6:9 chr1 44595426 . G A 263.84 PASS AO=44;DP=68;FAO=47;FDP=72;FR=.;FRO=25;FSAF=2;FSAR=45;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=-0.00605927;FXX=0.0270234;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3804;QD=14.6578;RBI=0.00902282;REFB=-0.0470367;REVB=0.00668554;RO=23;SAF=2;SAR=42;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.510417;STB=0.783801;TYPE=snp;VARB=0.0594656;OID=.;OPOS=44595426;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:68:72:23:25:44:47:42:2:8:15:45:2:8:17 chr1 44788398 . A T 450.6 PASS AO=40;DP=41;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00716931;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.428;QD=38.3487;RBI=0.032621;REFB=0;REVB=0.0318235;RO=0;SAF=21;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17587e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000275844;OID=.;OPOS=44788398;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:41:47:0:0:40:47:19:21:0:0:19:28:0:0 chr1 45119965 . C T 193.95 PASS AO=43;DP=87;FAO=44;FDP=88;FR=.;FRO=44;FSAF=13;FSAR=31;FSRF=14;FSRR=30;FWDB=0.0654162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2795;QD=8.81567;RBI=0.0929756;REFB=-0.0214791;REVB=0.0660695;RO=44;SAF=13;SAR=30;SRF=14;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0169739;STB=0.513491;TYPE=snp;VARB=0.0265017;OID=.;OPOS=45119965;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:88:44:44:43:44:30:13:14:30:31:13:14:30 chr1 45238341 . A G 327.65 PASS AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00782036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.839;QD=37.4458;RBI=0.020573;REFB=0;REVB=-0.0190287;RO=0;SAF=14;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.27896e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.14532e-05;OID=.;OPOS=45238341;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:35:35:0:0:35:35:21:14:0:0:21:14:0:0 chr1 45285615 . G A 161.36 PASS AO=54;DP=144;FAO=53;FDP=143;FR=.;FRO=90;FSAF=16;FSAR=37;FSRF=20;FSRR=70;FWDB=0.0541947;FXX=0.00694396;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.8623;QD=4.51368;RBI=0.0758326;REFB=-0.00306843;REVB=0.0530425;RO=86;SAF=17;SAR=37;SRF=17;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158617;STB=0.562396;TYPE=snp;VARB=0.0125502;OID=.;OPOS=45285615;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:143:86:90:54:53:37:17:17:69:37:16:20:70 chr1 45469215 . C T 114.35 PASS AO=34;DP=88;FAO=35;FDP=92;FR=.;FRO=57;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=34;FSRR=23;FWDB=0.0186423;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.569;QD=4.97182;RBI=0.0195259;REFB=-0.0215325;REVB=0.00580735;RO=53;SAF=19;SAR=15;SRF=31;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0283883;STB=0.515914;TYPE=snp;VARB=0.0376004;OID=.;OPOS=45469215;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:92:53:57:34:35:15:19:31:22:15:20:34:23 chr1 45469972 . C T 40.56 PASS AO=15;DP=54;FAO=16;FDP=54;FR=.;FRO=38;FSAF=1;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.021893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.347;QD=3.00481;RBI=0.0237636;REFB=-0.0191993;REVB=0.00924142;RO=39;SAF=0;SAR=15;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.79042;STB=0.904575;TYPE=snp;VARB=0.0198034;OID=.;OPOS=45469972;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:54:54:39:38:15:16:15:0:21:18:15:1:20:18 chr1 45504720 . G C 566.88 PASS AO=63;DP=65;FAO=63;FDP=65;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=58;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0322848;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.0723;QD=34.8848;RBI=0.0335158;REFB=0.0190798;REVB=-0.00900005;RO=2;SAF=5;SAR=58;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0774923;STB=0.541199;TYPE=snp;VARB=-0.000790445;OID=.;OPOS=45504720;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:65:65:2:2:63:63:58:5:1:1:58:5:1:1 chr1 45805566 . G C 477.36 PASS AO=48;DP=48;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.100289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.008;QD=38.1889;RBI=0.100404;REFB=0;REVB=-0.00481126;RO=0;SAF=5;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000106463;OID=.;OPOS=45805566;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:48:50:0:0:48:50:43:5:0:0:44:6:0:0 chr1 45973928 . G A 508.29 PASS AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0500931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.589;QD=37.6512;RBI=0.0507158;REFB=0;REVB=0.00792296;RO=0;SAF=19;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.86274e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00027131;OID=.;OPOS=45973928;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:54:54:0:0:54:54:35:19:0:0:35:19:0:0 chr1 46073489 . G A 715.31 PASS AO=78;DP=80;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=54;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0240044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.2381;QD=34.8932;RBI=0.0354443;REFB=-0.0538337;REVB=0.0260784;RO=2;SAF=25;SAR=53;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0363636;STB=0.509089;TYPE=snp;VARB=0.000998548;OID=.;OPOS=46073489;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:80:82:2:1:78:81:53:25:2:0:54:27:1:0 chr1 46078854 . A G 725.92 PASS AO=74;DP=75;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0029978;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.799;QD=38.2061;RBI=0.0160645;REFB=0;REVB=0.0157823;RO=0;SAF=33;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.56027e-05;OID=.;OPOS=46078854;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:75:76:0:0:74:76:41:33:0:0:42:34:0:0 chr1 46078884 . C T 543.52 PASS AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00198294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=248.967;QD=38.1417;RBI=0.031086;REFB=0;REVB=0.0310227;RO=0;SAF=32;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.48354e-05;OID=.;OPOS=46078884;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:57:57:0:0:57:57:25:32:0:0:25:32:0:0 chr1 46086077 . C T 530.76 PASS AO=55;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00784215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.107;QD=37.9116;RBI=0.0454486;REFB=0;REVB=0.0447669;RO=0;SAF=17;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.97918e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000191792;OID=.;OPOS=46086077;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:55:56:0:0:55:56:38:17:0:0:39:17:0:0 chr1 46087577 . G A 728.6 PASS AO=80;DP=84;FAO=80;FDP=82;FR=.;FRO=2;FSAF=56;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0325396;FXX=0.0238067;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.053;QD=35.5416;RBI=0.0444821;REFB=-0.120398;REVB=0.0303287;RO=2;SAF=56;SAR=24;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0109377;STB=0.505779;TYPE=snp;VARB=0.000725958;OID=.;OPOS=46087577;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:84:82:2:2:80:80:24:56:1:1:24:56:1:1 chr1 46379518 . A G 1897.5 PASS AO=202;DP=204;FAO=202;FDP=202;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=116;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121195;FXX=0.00980344;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.5977;QD=37.5743;RBI=0.0718652;REFB=-0.109554;REVB=-0.0708359;RO=1;SAF=86;SAR=116;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0055063;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000350156;OID=.;OPOS=46379518;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:204:202:1:0:202:202:116:86:1:0:116:86:0:0 chr1 46476587 . T G 1446.05 PASS AO=149;DP=149;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=139;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0146474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.4504;QD=38.5613;RBI=0.0146589;REFB=0;REVB=0.000579208;RO=0;SAF=11;SAR=138;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.47218e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.75974e-05;OID=.;OPOS=46476587;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:149:150:0:0:149:150:138:11:0:0:139:11:0:0 chr1 46493460 . T G 1930.55 PASS AO=148;DP=204;FAO=209;FDP=209;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=116;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0181677;FXX=0.0233634;HRUN=2;LEN=1;MLLD=35.5139;QD=36.9483;RBI=0.263906;REFB=0;REVB=0.26328;RO=0;SAF=113;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0165148;OID=.;OPOS=46493460;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:200:209:0:0:148:209:35:113:0:0:93:116:0:0 chr1 46496709 . A G 1147.43 PASS AO=121;DP=122;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.119;QD=37.6208;RBI=0.0285642;REFB=0;REVB=-0.0139506;RO=1;SAF=40;SAR=81;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0117268;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00013736;OID=.;OPOS=46496709;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:122:122:1:0:121:122:81:40:1:0:81:41:0:0 chr1 46498375 . A G 488.27 PASS AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0111667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.7072;QD=37.5588;RBI=0.0748853;REFB=0;REVB=-0.074048;RO=0;SAF=35;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.31071e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000572737;OID=.;OPOS=46498375;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:52:52:0:0:52:52:17:35:0:0:17:35:0:0 chr1 46521517 . G A 1111.74 PASS AO=116;DP=117;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130673;FXX=0.00854628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.685;QD=38.3359;RBI=0.0158123;REFB=0;REVB=0.00890359;RO=0;SAF=51;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000435852;OID=.;OPOS=46521517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:117:116:0:0:116:116:65:51:0:0:65:51:0:0 chr1 46521559 . A T 832.21 PASS AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00724997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.673;QD=38.2625;RBI=0.00924122;REFB=0;REVB=-0.00573046;RO=0;SAF=26;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.1496e-06;OID=.;OPOS=46521559;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:87:87:0:0:87:87:61:26:0:0:61:26:0:0 chr1 46655158 . T C 1449.17 PASS AO=152;DP=152;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0063743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.774;QD=38.1359;RBI=0.00647978;REFB=0;REVB=-0.00116444;RO=0;SAF=84;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.69211e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.49894e-06;OID=.;OPOS=46655158;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:152:152:0:0:152:152:68:84:0:0:68:84:0:0 chr1 46660295 . T C 167.15 PASS AO=27;DP=39;FAO=29;FDP=43;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.104244;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.2814;QD=15.5488;RBI=0.110333;REFB=-0.04323;REVB=0.0361468;RO=10;SAF=9;SAR=18;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140611;STB=0.600594;TYPE=snp;VARB=0.030782;OID=.;OPOS=46660295;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:39:43:10:14:27:29:18:9:6:4:19:10:9:5 chr1 46726463 . TG T 1154.5 PASS AO=153;DP=190;FAO=182;FDP=182;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=144;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.241769;FXX=0.0215042;HRUN=2;LEN=1;MLLD=15.8119;QD=25.3736;RBI=0.254014;REFB=0.0677483;REVB=-0.0779169;RO=14;SAF=23;SAR=130;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0.455837;SSSB=-0.137013;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00243536;OID=.;OPOS=46726464;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:153:184:182:182:0:38:144:0:0:85:14:23:130:9:5 chr1 46743520 . G A 210.95 PASS AO=48;DP=99;FAO=49;FDP=99;FR=.;FRO=50;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=-0.0342081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.816;QD=8.52308;RBI=0.0417164;REFB=-0.0441824;REVB=-0.0238761;RO=49;SAF=27;SAR=21;SRF=23;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0851496;STB=0.546493;TYPE=snp;VARB=0.0500365;OID=.;OPOS=46743520;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:49:50:48:49:21:27:23:26:21:28:24:26 chr1 46751448 . G A 190.42 PASS AO=40;DP=80;FAO=41;FDP=80;FR=.;FRO=39;FSAF=27;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=0.00148672;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.115;QD=9.521;RBI=0.05752;REFB=-0.0100921;REVB=0.0575008;RO=40;SAF=26;SAR=14;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163265;STB=0.59995;TYPE=snp;VARB=0.0100017;OID=.;OPOS=46751448;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:40:39:40:41:14:26:19:21:14:27:18:21 chr1 46807597 . G A 290.28 PASS AO=79;DP=182;FAO=79;FDP=181;FR=.;FRO=102;FSAF=29;FSAR=50;FSRF=42;FSRR=60;FWDB=-0.00447466;FXX=0.0054942;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.819;QD=6.41491;RBI=0.0107068;REFB=-0.0171888;REVB=0.00972697;RO=102;SAF=29;SAR=50;SRF=42;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0478684;STB=0.526699;TYPE=snp;VARB=0.0183687;OID=.;OPOS=46807597;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:181:102:102:79:79:50:29:42:60:50:29:42:60 chr1 46810530 . A G 235.45 PASS AO=50;DP=95;FAO=51;FDP=97;FR=.;FRO=46;FSAF=32;FSAR=19;FSRF=29;FSRR=17;FWDB=-0.045591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.7395;QD=9.70938;RBI=0.0467922;REFB=-0.0306364;REVB=-0.0105344;RO=45;SAF=32;SAR=18;SRF=29;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00414947;STB=0.501514;TYPE=snp;VARB=0.0352866;OID=.;OPOS=46810530;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:97:45:46:50:51:18:32:29:16:19:32:29:17 chr1 46870761 . C A 143.55 PASS AO=31;DP=61;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=1;FSAR=30;FSRF=2;FSRR=28;FWDB=-0.0181327;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=232.914;QD=9.413;RBI=0.0197868;REFB=-0.0108319;REVB=-0.00791979;RO=29;SAF=1;SAR=30;SRF=2;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197465;STB=0.608024;TYPE=snp;VARB=0.00879351;OID=.;OPOS=46870761;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:29:30:31:31:30:1:2:27:30:1:2:28 chr1 46871986 . T C 471.95 PASS AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0160064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.5631;QD=38.5266;RBI=0.0161118;REFB=0;REVB=0.00184028;RO=0;SAF=15;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.01675e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000204467;OID=.;OPOS=46871986;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:49:49:0:0:49:49:34:15:0:0:34:15:0:0 chr1 46976837 . C T 62.13 PASS AO=14;DP=40;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=19;FSRR=4;FWDB=0.0473156;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=61.3953;QD=6.37237;RBI=0.0566715;REFB=-0.0144577;REVB=0.0311912;RO=15;SAF=11;SAR=3;SRF=13;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117773;STB=0.563563;TYPE=snp;VARB=0.00900057;OID=.;OPOS=46976837;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:35:39:15:23:14:16:3:11:13:2:4:12:19:4 chr1 46977767 . G A 124.65 PASS AO=33;DP=74;FAO=34;FDP=83;FR=.;FRO=49;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=26;FWDB=-0.00652021;FXX=0.0348797;HRUN=3;LEN=1;MLLD=91.3431;QD=6.00714;RBI=0.0285157;REFB=-0.0392444;REVB=-0.0277602;RO=40;SAF=18;SAR=15;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200469;STB=0.53539;TYPE=snp;VARB=0.0698012;OID=.;OPOS=46977767;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:83:40:49:33:34:15:18:21:19:16:18:23:26 chr1 46978497 . C T 276.92 PASS AO=77;DP=180;FAO=77;FDP=180;FR=.;FRO=103;FSAF=5;FSAR=72;FSRF=13;FSRR=90;FWDB=-0.00466408;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=157.382;QD=6.15374;RBI=0.00943062;REFB=0.000343707;REVB=0.00819652;RO=102;SAF=5;SAR=72;SRF=12;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179257;STB=0.615349;TYPE=snp;VARB=-0.000407695;OID=.;OPOS=46978497;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:180:102:103:77:77:72:5:12:90:72:5:13:90 chr1 47013180 . A G 35.92 PASS AO=13;DP=44;FAO=13;FDP=44;FR=.;FRO=31;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=0.105802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.6919;QD=3.26573;RBI=0.10607;REFB=-0.00259609;REVB=-0.00753218;RO=31;SAF=5;SAR=8;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0780667;STB=0.547099;TYPE=snp;VARB=0.0121434;OID=.;OPOS=47013180;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:44:44:31:31:13:13:8:5:10:21:8:5:10:21 chr1 47013364 . T C 143.51 PASS AO=9;DP=18;FAO=16;FDP=16;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=1;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0687785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.079;QD=35.8767;RBI=0.0688467;REFB=0;REVB=-0.00306323;RO=0;SAF=1;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000576663;OID=.;OPOS=47013364;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:16:0:0:9:16:8:1:0:0:15:1:0:0 chr1 47059934 . T C 2485.25 PASS AO=264;DP=268;FAO=264;FDP=264;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=186;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203712;FXX=0.0149248;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.231;QD=37.6554;RBI=0.0450101;REFB=0.0614397;REVB=0.0401363;RO=3;SAF=78;SAR=186;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00950903;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000562761;OID=.;OPOS=47059934;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:268:264:3:0:264:264:186:78:2:1:186:78:0:0 chr1 47078637 . T C 121.48 PASS AO=30;DP=78;FAO=34;FDP=83;FR=.;FRO=49;FSAF=8;FSAR=26;FSRF=14;FSRR=35;FWDB=0.0130076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.727;QD=5.8543;RBI=0.0257068;REFB=-0.0070535;REVB=0.022173;RO=48;SAF=5;SAR=25;SRF=13;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172305;STB=0.539598;TYPE=snp;VARB=0.00773506;OID=.;OPOS=47078637;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:83:48:49:30:34:25:5:13:35:26:8:14:35 chr1 47080679 . G A 205.51 PASS AO=45;DP=87;FAO=45;FDP=87;FR=.;FRO=42;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=16;FWDB=0.000381596;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.6903;QD=9.44891;RBI=0.076102;REFB=-0.0317139;REVB=0.076101;RO=41;SAF=27;SAR=18;SRF=26;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.030929;STB=0.509611;TYPE=snp;VARB=0.0214843;OID=.;OPOS=47080679;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:41:42:45:45:18:27:26:15:18:27:26:16 chr1 47101015 . C A 1684.76 PASS AO=180;DP=183;FAO=180;FDP=180;FR=.;FRO=0;FSAF=106;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00806894;FXX=0.0163925;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.365;QD=37.4391;RBI=0.00838734;REFB=-0.078664;REVB=-0.00228903;RO=2;SAF=106;SAR=74;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012691;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000156357;OID=.;OPOS=47101015;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:183:180:2:0:180:180:74:106:0:2:74:106:0:0 chr1 47395973 . G A 815.81 PASS AO=84;DP=84;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0281658;FXX=0.0229859;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.73;QD=38.3911;RBI=0.0391438;REFB=0;REVB=0.0271832;RO=0;SAF=34;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.06517e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00193418;OID=.;OPOS=47395973;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:84:85:0:0:84:85:50:34:0:0:53:32:0:0 chr1 47682017 . T G 64.47 PASS AO=25;DP=81;FAO=25;FDP=81;FR=.;FRO=56;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=36;FSRR=20;FWDB=-0.000663568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.6514;QD=3.1839;RBI=0.0548957;REFB=-0.0253773;REVB=0.0548917;RO=56;SAF=14;SAR=11;SRF=36;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10036;STB=0.558897;TYPE=snp;VARB=0.0324566;OID=.;OPOS=47682017;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:81:81:56:56:25:25:11:14:36:20:11:14:36:20 chr1 47685455 . T C 70.65 PASS AO=9;DP=11;FAO=9;FDP=11;FR=.,HEALED;FRO=2;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0392874;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=161.508;QD=25.6894;RBI=0.074873;REFB=-0.0975111;REVB=-0.0637375;RO=0;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.599781;TYPE=snp;VARB=0.00211453;OID=.;OPOS=47685455;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:11:11:0:2:9:9:4:5:0:0:4:5:0:2 chr1 47726087 . T C 701.02 PASS AO=156;DP=302;FAO=158;FDP=304;FR=.;FRO=146;FSAF=82;FSAR=76;FSRF=61;FSRR=85;FWDB=0.00337447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.0928;QD=9.224;RBI=0.0206379;REFB=-0.0211875;REVB=0.0203602;RO=141;SAF=81;SAR=75;SRF=61;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0752142;STB=0.548477;TYPE=snp;VARB=0.0130057;OID=.;OPOS=47726087;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:302:304:141:146:156:158:75:81:61:80:76:82:61:85 chr1 47746675 . C G 807.99 PASS AO=175;DP=325;FAO=175;FDP=324;FR=.;FRO=149;FSAF=92;FSAR=83;FSRF=65;FSRR=84;FWDB=-0.0231365;FXX=0.00917403;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8591;QD=9.97517;RBI=0.0323386;REFB=-0.0224949;REVB=0.022594;RO=147;SAF=92;SAR=83;SRF=64;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0756846;STB=0.541076;TYPE=snp;VARB=0.0220156;OID=.;OPOS=47746675;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:325:324:147:149:175:175:83:92:64:83:83:92:65:84 chr1 47767914 . G A 1634.6 PASS AO=171;DP=171;FAO=171;FDP=171;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00401418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.003;QD=38.2363;RBI=0.00966085;REFB=0;REVB=0.0087874;RO=0;SAF=94;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.54638e-05;OID=.;OPOS=47767914;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:171:171:0:0:171:171:77:94:0:0:77:94:0:0 chr1 47799639 . G C 114.11 PASS AO=12;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0789701;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=33.9009;QD=35.1114;RBI=0.103172;REFB=0;REVB=-0.0663945;RO=1;SAF=5;SAR=7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0818676;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00101082;OID=.;OPOS=47799639;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:13:1:0:12:13:7:5:1:0:7:6:0:0 chr1 47842431 . G A 2300.5 PASS AO=240;DP=247;FAO=247;FDP=247;FR=.;FRO=0;FSAF=152;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0468038;FXX=0.0237145;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.272;QD=37.255;RBI=0.07153;REFB=-0.0666521;REVB=0.054092;RO=4;SAF=149;SAR=91;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122621;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00551781;OID=.;OPOS=47842431;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:247:247:4:0:240:247:91:149:1:3:95:152:0:0 chr1 47842666 . A T 1643.48 PASS AO=170;DP=198;FAO=219;FDP=234;FR=.;FRO=15;FSAF=120;FSAR=99;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=0.0435656;FXX=0.00425514;HRUN=4;LEN=1;MLLD=33.5331;QD=28.0936;RBI=0.051742;REFB=-0.0229363;REVB=0.0279155;RO=28;SAF=81;SAR=89;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0635324;STB=0.512021;TYPE=snp;VARB=0.00291039;OID=.;OPOS=47842666;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:198:234:28:15:170:219:89:81:20:8:99:120:11:4 chr1 47883024 . A G 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.9652;QD=35.0857;RBI=0.0381635;REFB=0;REVB=-0.0381635;RO=0;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0052227;OID=.;OPOS=47883024;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:7:0:0:0:7:0:0:0 chr1 47906338 . G A 2599 PASS AO=262;DP=263;FAO=270;FDP=270;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=172;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.043;QD=38.5037;RBI=0.0190846;REFB=0;REVB=-0.000407879;RO=0;SAF=93;SAR=169;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.4007e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.31643e-05;OID=.;OPOS=47906338;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:263:270:0:0:262:270:169:93:0:0:172:98:0:0 chr1 48697733 . T G 825.14 PASS AO=87;DP=89;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0323615;FXX=0.0112347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=284.615;QD=37.5064;RBI=0.0338624;REFB=0;REVB=0.00996968;RO=1;SAF=37;SAR=50;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0093831;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.42697e-05;OID=.;OPOS=48697733;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:89:88:1:0:87:88:50:37:0:1:51:37:0:0 chr1 48697751 . C T 69.26 PASS AO=23;DP=69;FAO=23;FDP=68;FR=.;FRO=45;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=33;FWDB=-0.00343852;FXX=0.0810701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.7119;QD=4.07409;RBI=0.018409;REFB=0.00806866;REVB=-0.0180851;RO=42;SAF=14;SAR=9;SRF=12;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.347723;STB=0.71516;TYPE=snp;VARB=-0.00639102;OID=.;OPOS=48697751;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:69:68:42:45:23:23:9:14:12:30:9:14:12:33 chr1 48713394 . C T 1194.02 PASS AO=127;DP=129;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209176;FXX=0.00775134;HRUN=3;LEN=1;MLLD=178.248;QD=37.313;RBI=0.0455971;REFB=-0.0619965;REVB=0.040516;RO=2;SAF=81;SAR=46;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00438697;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00066402;OID=.;OPOS=48713394;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:129:128:2:0:127:128:46:81:1:1:47:81:0:0 chr1 48764419 . C T 498.92 PASS AO=100;DP=175;FAO=100;FDP=174;FR=.;FRO=74;FSAF=17;FSAR=83;FSRF=25;FSRR=49;FWDB=0.0124923;FXX=0.00571396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.301;QD=11.4694;RBI=0.0216515;REFB=0.00750033;REVB=-0.0176842;RO=73;SAF=17;SAR=83;SRF=25;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200951;STB=0.608353;TYPE=snp;VARB=-0.00873729;OID=.;OPOS=48764419;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:174:73:74:100:100:83:17:25:48:83:17:25:49 chr1 49005323 . G A 632.56 PASS AO=96;DP=141;FAO=103;FDP=143;FR=.;FRO=40;FSAF=1;FSAR=102;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=-0.0500971;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.0145;QD=17.6939;RBI=0.152586;REFB=-0.0410011;REVB=0.144128;RO=45;SAF=1;SAR=95;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.795624;STB=0.948696;TYPE=snp;VARB=0.0297038;OID=.;OPOS=49005323;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:141:143:45:40:96:103:95:1:21:24:102:1:21:19 chr1 49113319 . T C 223.93 PASS AO=45;DP=81;FAO=45;FDP=81;FR=.;FRO=36;FSAF=31;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=0.0182424;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.609;QD=11.0583;RBI=0.0216684;REFB=0.0036713;REVB=-0.0116933;RO=35;SAF=31;SAR=14;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0546605;STB=0.539113;TYPE=snp;VARB=-0.00340067;OID=.;OPOS=49113319;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:35:36:45:45:14:31:22:13:14:31:22:14 chr1 49224584 . G T 69.49 PASS AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.00169996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.537;QD=10.2953;RBI=0.0309288;REFB=-0.0406141;REVB=-0.030882;RO=13;SAF=10;SAR=4;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165626;STB=0.595095;TYPE=snp;VARB=0.052339;OID=.;OPOS=49224584;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:27:27:13:13:14:14:4:10:7:6:4:10:7:6 chr1 49511424 . A G 642.15 PASS AO=120;DP=197;FAO=120;FDP=196;FR=.;FRO=76;FSAF=49;FSAR=71;FSRF=33;FSRR=43;FWDB=0.0638401;FXX=0.00507588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.1059;QD=13.1051;RBI=0.0640112;REFB=-0.00904367;REVB=0.00467726;RO=75;SAF=49;SAR=71;SRF=33;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.02321;STB=0.510342;TYPE=snp;VARB=0.00546393;OID=.;OPOS=49511424;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:196:75:76:120:120:71:49:33:42:71:49:33:43 chr1 50661411 . C T 578.83 PASS AO=69;DP=77;FAO=70;FDP=76;FR=.;FRO=6;FSAF=17;FSAR=53;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.033761;FXX=0.0129853;HRUN=5;LEN=1;MLLD=139.965;QD=30.4647;RBI=0.0355811;REFB=-0.14135;REVB=0.0112344;RO=5;SAF=17;SAR=52;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0259704;STB=0.509613;TYPE=snp;VARB=0.0013606;OID=.;OPOS=50661411;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:77:76:5:6:69:70:52:17:2:3:53:17:2:4 chr1 50666515 . C T 345.35 PASS AO=90;DP=202;FAO=94;FDP=214;FR=.;FRO=120;FSAF=34;FSAR=60;FSRF=34;FSRR=86;FWDB=0.0472774;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=37.2745;QD=6.45515;RBI=0.0637252;REFB=-0.033284;REVB=0.0427287;RO=112;SAF=30;SAR=60;SRF=30;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0758303;STB=0.548862;TYPE=snp;VARB=0.044122;OID=.;OPOS=50666515;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:214:112:120:90:94:60:30:30:82:60:34:34:86 chr1 51525592 . C T 152.88 PASS AO=36;DP=83;FAO=37;FDP=80;FR=.,HEALED;FRO=43;FSAF=11;FSAR=26;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=-0.0240296;FXX=0.0243873;HRUN=4;LEN=1;MLLD=41.7999;QD=7.64376;RBI=0.0866466;REFB=-0.077257;REVB=-0.0832479;RO=29;SAF=11;SAR=25;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.036743;STB=0.573343;TYPE=snp;VARB=0.0714421;OID=.;OPOS=51525592;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:29:43:36:37:25:11:10:19:26:11:18:25 chr1 51753812 . G A 137.45 PASS AO=42;DP=108;FAO=42;FDP=109;FR=.;FRO=67;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=35;FSRR=32;FWDB=0.00957031;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.681;QD=5.04416;RBI=0.0134712;REFB=0.00175589;REVB=0.00948068;RO=66;SAF=22;SAR=20;SRF=34;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00932925;STB=0.500875;TYPE=snp;VARB=-0.00274643;OID=.;OPOS=51753812;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:109:66:67:42:42:20:22:34:32:20:22:35:32 chr1 51767352 . G A 26.33 PASS AO=11;DP=43;FAO=11;FDP=43;FR=.;FRO=32;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=22;FWDB=-0.00185145;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.7411;QD=2.44916;RBI=0.028132;REFB=0.0018151;REVB=-0.028071;RO=32;SAF=4;SAR=7;SRF=10;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0676989;STB=0.541982;TYPE=snp;VARB=-0.00809014;OID=.;OPOS=51767352;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:43:43:32:32:11:11:7:4:10:22:7:4:10:22 chr1 51873951 . G A 517.1 PASS AO=136;DP=306;FAO=138;FDP=307;FR=.;FRO=169;FSAF=36;FSAR=102;FSRF=64;FSRR=105;FWDB=-0.00152882;FXX=0.00647228;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.325;QD=6.7375;RBI=0.0216546;REFB=-0.0121197;REVB=0.0216006;RO=164;SAF=34;SAR=102;SRF=61;SRR=103;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146733;STB=0.577826;TYPE=snp;VARB=0.0144905;OID=.;OPOS=51873951;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:306:307:164:169:136:138:102:34:61:103:102:36:64:105 chr1 52266242 . G A 307.67 PASS AO=73;DP=154;FAO=76;FDP=158;FR=.;FRO=82;FSAF=10;FSAR=66;FSRF=30;FSRR=52;FWDB=-0.00379894;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=173.463;QD=7.78922;RBI=0.0188689;REFB=-0.0191434;REVB=-0.0184825;RO=81;SAF=10;SAR=63;SRF=30;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.334714;STB=0.69104;TYPE=snp;VARB=0.0217001;OID=.;OPOS=52266242;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:158:81:82:73:76:63:10:30:51:66:10:30:52 chr1 52290984 . T G 318.57 PASS AO=93;DP=248;FAO=100;FDP=253;FR=.;FRO=153;FSAF=49;FSAR=51;FSRF=65;FSRR=88;FWDB=0.0525763;FXX=0.00393685;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.1311;QD=5.03674;RBI=0.0585265;REFB=-0.0259176;REVB=0.0257115;RO=152;SAF=46;SAR=47;SRF=64;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0810635;STB=0.539477;TYPE=snp;VARB=0.0371987;OID=.;OPOS=52290984;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:248:253:152:153:93:100:47:46:64:88:51:49:65:88 chr1 52306063 . ATCT A 55.64 PASS AO=15;DP=64;FAO=15;FDP=40;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=-0.0397613;FXX=0.0476077;HRUN=1;LEN=3;MLLD=135.585;QD=5.56439;RBI=0.066573;REFB=-0.0321737;REVB=-0.0533948;RO=20;SAF=7;SAR=8;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.277923;STB=0.655546;TYPE=del;VARB=0.0491035;OID=.;OPOS=52306064;OREF=TCT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:15:38:15:40:25:7:8:18:7:55:20:7:8:15:5 chr1 52439128 . G GT 2803.64 PASS AO=282;DP=302;FAO=293;FDP=293;FR=.;FRO=0;FSAF=169;FSAR=124;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0450341;FXX=0.0134676;HRUN=0;LEN=1;MLLD=183.813;QD=38.2749;RBI=0.0453155;REFB=0;REVB=-0.00504178;RO=13;SAF=159;SAR=123;SRF=12;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0307748;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-1.77112e-05;OID=.;OPOS=52439129;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:282:302:293:293:0:169:124:0:0:99:13:159:123:12:1 chr1 52499397 . C T 14.36 PASS AO=3;DP=10;FAO=3;FDP=10;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.3382;QD=5.74589;RBI=0.0436509;REFB=-0.0216528;REVB=-0.0436509;RO=7;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0557497;OID=.;OPOS=52499397;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:10:10:7:7:3:3:3:0:0:7:3:0:0:7 chr1 52882406 . A G 538.37 PASS AO=137;DP=292;FAO=138;FDP=294;FR=.;FRO=156;FSAF=50;FSAR=88;FSRF=70;FSRR=86;FWDB=-0.0149521;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.537;QD=7.32473;RBI=0.0164312;REFB=-7.31429e-06;REVB=0.00681318;RO=155;SAF=49;SAR=88;SRF=69;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0889333;STB=0.548279;TYPE=snp;VARB=-3.20497e-05;OID=.;OPOS=52882406;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:292:294:155:156:137:138:88:49:69:86:88:50:70:86 chr1 52882970 . A G 210.7 PASS AO=60;DP=156;FAO=60;FDP=146;FR=.;FRO=86;FSAF=20;FSAR=40;FSRF=20;FSRR=66;FWDB=-0.000660398;FXX=0.0987593;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.085;QD=5.77259;RBI=0.00863332;REFB=-0.00408566;REVB=0.00860802;RO=64;SAF=20;SAR=40;SRF=16;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0906614;STB=0.569871;TYPE=snp;VARB=0.00542605;OID=.;OPOS=52882970;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:146:64:86:60:60:40:20:16:48:40:20:20:66 chr1 53072454 . T C 126.62 PASS AO=33;DP=81;FAO=34;FDP=81;FR=.;FRO=47;FSAF=6;FSAR=28;FSRF=14;FSRR=33;FWDB=-0.117791;FXX=0.0121936;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.172;QD=6.25261;RBI=0.11784;REFB=-0.0013186;REVB=0.00341769;RO=45;SAF=6;SAR=27;SRF=13;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160262;STB=0.604683;TYPE=snp;VARB=0.000784411;OID=.;OPOS=53072454;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:45:47:33:34:27:6:13:32:28:6:14:33 chr1 53180156 . C G 116.56 PASS AO=26;DP=54;FAO=27;FDP=54;FR=.;FRO=27;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=0.00278736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.5904;QD=8.63437;RBI=0.00544977;REFB=0.00427085;REVB=-0.00468301;RO=28;SAF=18;SAR=8;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.283345;STB=0.671722;TYPE=snp;VARB=-0.00260368;OID=.;OPOS=53180156;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:28:27:26:27:8:18:11:17:8:19:10:17 chr1 53250650 . G A 1744.64 PASS AO=188;DP=195;FAO=193;FDP=193;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0674271;FXX=0.0102559;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.6531;QD=36.1583;RBI=0.0737573;REFB=-0.111311;REVB=0.0298953;RO=6;SAF=87;SAR=101;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00220266;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00203429;OID=.;OPOS=53250650;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:195:193:6:0:188:193:101:87:3:3:103:90:0:0 chr1 53320274 . G T 909.84 PASS AO=229;DP=443;FAO=206;FDP=397;FR=.;FRO=191;FSAF=92;FSAR=114;FSRF=90;FSRR=101;FWDB=0.0303891;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.157;QD=9.16715;RBI=0.0305407;REFB=-0.00618016;REVB=-0.00303976;RO=209;SAF=102;SAR=127;SRF=100;SRR=109;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0291672;STB=0.511941;TYPE=snp;VARB=0.00530874;OID=.;OPOS=53320274;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:443:397:209:191:229:206:127:102:100:109:114:92:90:101 chr1 53326421 . A G 287.87 PASS AO=77;DP=183;FAO=78;FDP=179;FR=.;FRO=101;FSAF=32;FSAR=46;FSRF=42;FSRR=59;FWDB=-0.000230507;FXX=0.0218567;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.807;QD=6.43279;RBI=0.00787127;REFB=-0.00769864;REVB=0.00786789;RO=99;SAF=32;SAR=45;SRF=42;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00897918;STB=0.503252;TYPE=snp;VARB=0.00761511;OID=.;OPOS=53326421;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:179:99:101:77:78:45:32:42:57:46:32:42:59 chr1 53364908 . CAA C 96.55 PASS AO=36;DP=91;FAO=38;FDP=86;FR=.;FRO=48;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=30;FSRR=18;FWDB=-0.0279755;FXX=0.0227247;HRUN=5;LEN=2;MLLD=29.4553;QD=4.49076;RBI=0.0696986;REFB=-0.00870675;REVB=-0.0638378;RO=38;SAF=15;SAR=21;SRF=26;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.242626;STB=0.612532;TYPE=del;VARB=0.00686959;OID=.;OPOS=53364909;OREF=AA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:36:87:38:86:48:16:22:30:18:96:38:15:21:26:12 chr1 53519270 . C T 557.07 PASS AO=126;DP=244;FAO=126;FDP=244;FR=.;FRO=118;FSAF=59;FSAR=67;FSRF=63;FSRR=55;FWDB=0.0106229;FXX=0.00408147;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.6345;QD=9.13233;RBI=0.0495367;REFB=-0.00788377;REVB=-0.0483843;RO=114;SAF=59;SAR=67;SRF=62;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0656772;STB=0.531741;TYPE=snp;VARB=0.00567301;OID=.;OPOS=53519270;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:244:114:118:126:126:67:59:62:52:67:59:63:55 chr1 53535478 . G A 55.25 PASS AO=10;DP=18;FAO=10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=-0.036128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.399;QD=12.2782;RBI=0.0576094;REFB=-0.00307917;REVB=0.0448733;RO=7;SAF=5;SAR=5;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.365629;STB=0.721864;TYPE=snp;VARB=0.00450253;OID=.;OPOS=53535478;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:18:18:7:8:10:10:5:5:7:0:5:5:8:0 chr1 53537266 . G A 156.79 PASS AO=31;DP=55;FAO=31;FDP=55;FR=.;FRO=24;FSAF=26;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=0.0762759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.6757;QD=11.4032;RBI=0.119499;REFB=0.0228612;REVB=0.0919889;RO=24;SAF=26;SAR=5;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208632;STB=0.616704;TYPE=snp;VARB=-0.0095918;OID=.;OPOS=53537266;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:55:55:24:24:31:31:5:26:16:8:5:26:16:8 chr1 53543382 . CG C 22.32 PASS AO=8;DP=57;FAO=20;FDP=57;FR=.;FRO=37;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=27;FWDB=-0.0855421;FXX=0.136343;HRUN=5;LEN=1;MLLD=9.4432;QD=1.56617;RBI=0.125892;REFB=-0.0501718;REVB=-0.0923654;RO=29;SAF=0;SAR=8;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.681558;STB=0.523381;TYPE=del;VARB=-0.0155769;OID=.;OPOS=53543383;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:8:51:20:57:37:6:14:10:27:22:29:0:8:9:20 chr1 53544439 . G A 316.54 PASS AO=18;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0672108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.221;QD=37.2399;RBI=0.0762743;REFB=0;REVB=0.0360621;RO=0;SAF=0;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000631376;OID=.;OPOS=53544439;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:19:34:0:0:18:34:18:0:0:0:18:16:0:0 chr1 53544597 . T C 139.1 PASS AO=14;DP=15;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0289706;FXX=0.0587889;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.838;QD=34.7746;RBI=0.0558956;REFB=0;REVB=0.0478019;RO=0;SAF=9;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00351068;OID=.;OPOS=53544597;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:16:0:0:14:16:5:9:0:0:6:10:0:0 chr1 53553702 . A G 147.36 PASS AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0495579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.7566;QD=36.8397;RBI=0.0501789;REFB=0;REVB=0.00787041;RO=0;SAF=4;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07465e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0013317;OID=.;OPOS=53553702;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:16:0:0:16:16:12:4:0:0:12:4:0:0 chr1 53553754 . T C 366.92 PASS AO=26;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0704813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.272;QD=38.6232;RBI=0.0745517;REFB=0;REVB=0.0242968;RO=0;SAF=8;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.28381e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000703666;OID=.;OPOS=53553754;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:38:38:0:0:26:38:18:8:0:0:19:19:0:0 chr1 53555783 . A C 116.18 PASS AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0195582;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.118;QD=35.7488;RBI=0.0195582;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=13;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000165984;OID=.;OPOS=53555783;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:13:0:0:13:13:0:13:0:0:0:13:0:0 chr1 53558270 . A G 341.74 PASS AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0481765;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.0221;QD=37.9706;RBI=0.0542898;REFB=0;REVB=0.0250282;RO=0;SAF=16;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.9376e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000526896;OID=.;OPOS=53558270;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:37:36:0:0:36:36:20:16:0:0:20:16:0:0 chr1 53676448 . G A 119.16 PASS AO=22;DP=39;FAO=22;FDP=38;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=-0.0441303;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.61;QD=12.5431;RBI=0.0539676;REFB=-0.0247981;REVB=-0.0310648;RO=14;SAF=8;SAR=14;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0601851;STB=0.553145;TYPE=snp;VARB=0.0143354;OID=.;OPOS=53676448;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:39:38:14:16:22:22:14:8:4:10:14:8:4:12 chr1 53679229 . A G 365.87 PASS AO=81;DP=157;FAO=82;FDP=160;FR=.;FRO=78;FSAF=39;FSAR=43;FSRF=45;FSRR=33;FWDB=0.0360143;FXX=0.00621079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.15;QD=9.14686;RBI=0.036055;REFB=-0.00802943;REVB=0.00171173;RO=75;SAF=39;SAR=42;SRF=45;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10361;STB=0.549258;TYPE=snp;VARB=0.00678238;OID=.;OPOS=53679229;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:160:75:78:81:82:42:39:45:30:43:39:45:33 chr1 53681699 . T G 157.47 PASS AO=49;DP=114;FAO=45;FDP=110;FR=.;FRO=65;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=38;FSRR=27;FWDB=-0.00952893;FXX=0.0350846;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.052;QD=5.72616;RBI=0.0139047;REFB=0.00165875;REVB=0.0101262;RO=64;SAF=30;SAR=19;SRF=38;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0195666;STB=0.504144;TYPE=snp;VARB=-0.0035092;OID=.;OPOS=53681699;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:110:64:65:49:45:19:30:38:26:19:26:38:27 chr1 53684525 . C G 50.76 PASS AO=20;DP=80;FAO=24;FDP=83;FR=.;FRO=59;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=36;FSRR=23;FWDB=-0.00995265;FXX=0.0348797;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.665;QD=2.44621;RBI=0.016664;REFB=-0.00185486;REVB=0.0133654;RO=55;SAF=11;SAR=9;SRF=34;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0845761;STB=0.57825;TYPE=snp;VARB=0.00623638;OID=.;OPOS=53684525;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:80:83:55:59:20:24:9:11:34:21:12:12:36:23 chr1 53712727 . C T 132.53 PASS AO=40;DP=106;FAO=41;FDP=107;FR=.;FRO=66;FSAF=11;FSAR=30;FSRF=22;FSRR=44;FWDB=-0.0511027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.239;QD=4.9542;RBI=0.0563802;REFB=-0.0108489;REVB=-0.0238169;RO=64;SAF=11;SAR=29;SRF=21;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0691956;STB=0.548756;TYPE=snp;VARB=0.0181438;OID=.;OPOS=53712727;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:107:64:66:40:41:29:11:21:43:30:11:22:44 chr1 53716416 . G A 376.17 PASS AO=105;DP=246;FAO=105;FDP=243;FR=.;FRO=138;FSAF=65;FSAR=40;FSRF=79;FSRR=59;FWDB=-0.0150431;FXX=0.0121946;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.13;QD=6.19209;RBI=0.0330371;REFB=-0.016027;REVB=0.0294135;RO=132;SAF=65;SAR=40;SRF=78;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.029669;STB=0.52767;TYPE=snp;VARB=0.0154599;OID=.;OPOS=53716416;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:246:243:132:138:105:105:40:65:78:54:40:65:79:59 chr1 53732315 . G T 426.34 PASS AO=85;DP=165;FAO=93;FDP=173;FR=.;FRO=80;FSAF=46;FSAR=47;FSRF=47;FSRR=33;FWDB=-0.00529939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.187;QD=9.85746;RBI=0.0112125;REFB=-0.0121927;REVB=0.00988114;RO=78;SAF=42;SAR=43;SRF=47;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.094608;STB=0.542905;TYPE=snp;VARB=0.00863903;OID=.;OPOS=53732315;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:173:78:80:85:93:43:42:47:31:47:46:47:33 chr1 53792651 . A C 366.86 PASS AO=42;DP=44;FAO=42;FDP=44;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0414157;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.149;QD=33.3504;RBI=0.0414176;REFB=-0.0426786;REVB=0.000406228;RO=2;SAF=18;SAR=24;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00620919;STB=0.50331;TYPE=snp;VARB=0.00416779;OID=.;OPOS=53792651;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:44:44:2:2:42:42:24:18:1:1:24:18:1:1 chr1 54258880 . C T 145.08 PASS AO=33;DP=67;FAO=33;FDP=67;FR=.;FRO=34;FSAF=4;FSAR=29;FSRF=3;FSRR=31;FWDB=0.00959108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.775;QD=8.66138;RBI=0.0181306;REFB=0.0091734;REVB=0.0153861;RO=34;SAF=4;SAR=29;SRF=3;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.075315;STB=0.541737;TYPE=snp;VARB=-0.0075494;OID=.;OPOS=54258880;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:34:34:33:33:29:4:3:31:29:4:3:31 chr1 54354658 . T G 43.99 PASS AO=9;DP=34;FAO=14;FDP=39;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.0570495;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.821;QD=4.51229;RBI=0.0687304;REFB=-0.0212064;REVB=-0.0383306;RO=25;SAF=5;SAR=4;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134386;STB=0.51877;TYPE=snp;VARB=0.120572;OID=.;OPOS=54354658;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:34:39:25:25:9:14:4:5:11:14:8:6:10:15 chr1 54359922 . C T 433.02 PASS AO=92;DP=213;FAO=107;FDP=224;FR=.;FRO=117;FSAF=74;FSAR=33;FSRF=59;FSRR=58;FWDB=-0.0127911;FXX=0.00444425;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.438;QD=7.73241;RBI=0.0486935;REFB=-0.00607265;REVB=0.0469834;RO=119;SAF=74;SAR=18;SRF=60;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.359986;STB=0.605392;TYPE=snp;VARB=0.00583822;OID=.;OPOS=54359922;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:213:224:119:117:92:107:18:74:60:59:33:74:59:58 chr1 54606804 . C T 451.17 PASS AO=51;DP=53;FAO=51;FDP=53;FR=.;FRO=2;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0336496;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.731;QD=34.0507;RBI=0.0456731;REFB=-0.00869188;REVB=0.0308827;RO=2;SAF=30;SAR=21;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00645825;STB=0.503431;TYPE=snp;VARB=0.000294693;OID=.;OPOS=54606804;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:53:53:2:2:51:51:21:30:1:1:21:30:1:1 chr1 54607051 . A G 288.19 PASS AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0341996;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.992;QD=37.1863;RBI=0.0414452;REFB=0;REVB=0.0234114;RO=0;SAF=9;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000460956;OID=.;OPOS=54607051;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:30:31:0:0:30:31:21:9:0:0:23:8:0:0 chr1 54636977 . T C 42.12 PASS AO=11;DP=29;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=17;FSRR=1;FWDB=0.00820418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.637;QD=5.80988;RBI=0.0423919;REFB=0.00631859;REVB=-0.0415905;RO=17;SAF=9;SAR=2;SRF=16;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.261434;STB=0.658011;TYPE=snp;VARB=-0.031142;OID=.;OPOS=54636977;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:29:29:17:18:11:11:2:9:16:1:2:9:17:1 chr1 54637167 . T C 171.5 PASS AO=35;DP=66;FAO=35;FDP=64;FR=.;FRO=29;FSAF=27;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.0288024;FXX=0.0302984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.189;QD=10.7185;RBI=0.0289995;REFB=-0.0154093;REVB=-0.00337522;RO=29;SAF=27;SAR=8;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189116;STB=0.605316;TYPE=snp;VARB=0.0174066;OID=.;OPOS=54637167;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:64:29:29:35:35:8:27:17:12:8:27:17:12 chr1 54637417 . G A 383.97 PASS AO=73;DP=186;FAO=91;FDP=184;FR=.;FRO=93;FSAF=62;FSAR=29;FSRF=48;FSRR=45;FWDB=-0.0514878;FXX=0.00540511;HRUN=3;LEN=1;MLLD=108.043;QD=8.34727;RBI=0.0515677;REFB=-0.0313369;REVB=-0.00286855;RO=76;SAF=61;SAR=12;SRF=47;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.283658;STB=0.589848;TYPE=snp;VARB=0.0474162;OID=.;OPOS=54637417;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:184:76:93:73:91:12:61:47:29:29:62:48:45 chr1 54637697 . A G 508.51 PASS AO=95;DP=160;FAO=96;FDP=159;FR=.;FRO=63;FSAF=31;FSAR=65;FSRF=28;FSRR=35;FWDB=0.0217701;FXX=0.00624961;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.77;QD=12.7927;RBI=0.0218508;REFB=-0.0148026;REVB=-0.00187582;RO=63;SAF=31;SAR=64;SRF=28;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0950728;STB=0.552981;TYPE=snp;VARB=0.00879215;OID=.;OPOS=54637697;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:159:63:63:95:96:64:31:28:35:65:31:28:35 chr1 54637915 . C T 65.54 PASS AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.0247981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.0504;QD=7.94417;RBI=0.0362446;REFB=-0.0148534;REVB=0.0264334;RO=17;SAF=9;SAR=6;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0668581;STB=0.555481;TYPE=snp;VARB=0.0243641;OID=.;OPOS=54637915;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:33:33:17:18:15:15:6:9:9:8:6:9:9:9 chr1 54681920 . G C 1409.57 PASS AO=147;DP=147;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0519608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.821;QD=38.3556;RBI=0.053367;REFB=0;REVB=0.0121703;RO=0;SAF=38;SAR=109;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.08904e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.34321e-05;OID=.;OPOS=54681920;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:147:147:0:0:147:147:109:38:0:0:109:38:0:0 chr1 54686374 . T C 189.91 PASS AO=43;DP=92;FAO=46;FDP=96;FR=.;FRO=50;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=31;FSRR=19;FWDB=-0.00677365;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.3547;QD=7.9128;RBI=0.0347354;REFB=-0.0177575;REVB=-0.0340686;RO=49;SAF=19;SAR=24;SRF=30;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16159;STB=0.573458;TYPE=snp;VARB=0.0198585;OID=.;OPOS=54686374;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:96:49:50:43:46:24:19:30:19:24:22:31:19 chr1 54690954 . T C 234.03 PASS AO=62;DP=140;FAO=63;FDP=144;FR=.;FRO=81;FSAF=4;FSAR=59;FSRF=15;FSRR=66;FWDB=-0.0518179;FXX=0.0136977;HRUN=3;LEN=1;MLLD=66.504;QD=6.5007;RBI=0.0634125;REFB=-0.0496231;REVB=-0.036552;RO=78;SAF=4;SAR=58;SRF=14;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.316407;STB=0.691471;TYPE=snp;VARB=0.0410065;OID=.;OPOS=54690954;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:144:78:81:62:63:58:4:14:64:59:4:15:66 chr1 54704567 . A G 254.73 PASS AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.351;QD=37.7382;RBI=0.141807;REFB=0;REVB=-0.140395;RO=0;SAF=12;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000745107;OID=.;OPOS=54704567;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:27:27:0:0:27:27:15:12:0:0:15:12:0:0 chr1 54704629 . C T 91.41 PASS AO=24;DP=58;FAO=24;FDP=57;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=32;FWDB=0.0184748;FXX=0.0172384;HRUN=3;LEN=1;MLLD=114.829;QD=6.41508;RBI=0.0365245;REFB=0.000543334;REVB=-0.0315075;RO=33;SAF=8;SAR=16;SRF=1;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.414212;STB=0.727142;TYPE=snp;VARB=-0.000838282;OID=.;OPOS=54704629;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:58:57:33:33:24:24:16:8:1:32:16:8:1:32 chr1 55075452 . G A 54.03 PASS AO=15;DP=40;FAO=15;FDP=40;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.0244909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.292;QD=5.40334;RBI=0.0554976;REFB=0.00321185;REVB=0.0498014;RO=25;SAF=7;SAR=8;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0142432;STB=0.50835;TYPE=snp;VARB=-0.00206228;OID=.;OPOS=55075452;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:40:40:25:25:15:15:8:7:12:13:8:7:12:13 chr1 55118566 . C G 1149.94 PASS AO=93;DP=120;FAO=120;FDP=120;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=61;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0581229;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.835;QD=38.3313;RBI=0.0627018;REFB=0;REVB=0.0235213;RO=0;SAF=40;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.92821e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00127003;OID=.;OPOS=55118566;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:119:120:0:0:93:120:53:40:0:0:59:61:0:0 chr1 55119289 . G C 120.68 PASS AO=32;DP=76;FAO=32;FDP=75;FR=.;FRO=43;FSAF=23;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=-0.0379636;FXX=0.0259707;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.3667;QD=6.43633;RBI=0.0586646;REFB=-0.0052265;REVB=-0.0447247;RO=42;SAF=23;SAR=9;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.238099;STB=0.642828;TYPE=snp;VARB=0.00511528;OID=.;OPOS=55119289;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:75:42:43:32:32:9:23:21:21:9:23:21:22 chr1 55119515 . T G 208.68 PASS AO=56;DP=128;FAO=56;FDP=129;FR=.;FRO=73;FSAF=35;FSAR=21;FSRF=56;FSRR=17;FWDB=-0.00511281;FXX=0.00769172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.533;QD=6.47073;RBI=0.0101073;REFB=-0.0209143;REVB=0.00871873;RO=69;SAF=35;SAR=21;SRF=54;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175908;STB=0.589603;TYPE=snp;VARB=0.0242335;OID=.;OPOS=55119515;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:129:69:73:56:56:21:35:54:15:21:35:56:17 chr1 55119534 . C T 236.56 PASS AO=56;DP=115;FAO=56;FDP=115;FR=.;FRO=59;FSAF=42;FSAR=14;FSRF=32;FSRR=27;FWDB=0.0305393;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.8899;QD=8.22813;RBI=0.0309175;REFB=-0.00176219;REVB=0.00482077;RO=59;SAF=42;SAR=14;SRF=32;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222963;STB=0.624318;TYPE=snp;VARB=0.00313937;OID=.;OPOS=55119534;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:59:59:56:56:14:42:32:27:14:42:32:27 chr1 55119545 . GA G,GG 920.6 PASS AO=39,49;DP=92;FAO=42,56;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=29,28;FSAR=13,28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0525352,0.0583521;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=175.036,178.028;QD=37.5754;RBI=0.0528781,0.0587502;REFB=0,0;REVB=-0.00601158,0.00682801;RO=0;SAF=25,23;SAR=14,26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0100793,-0.0106619;OID=.,.;OPOS=55119546,55119546;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:39,49:88:42,56:98:0:29,28:13,28:0:0:99:0:25,23:14,26:0:0 chr1 55139741 . A G 707.8 PASS AO=150;DP=273;FAO=150;FDP=273;FR=.;FRO=123;FSAF=81;FSAR=69;FSRF=57;FSRR=66;FWDB=0.00280333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.445;QD=10.3707;RBI=0.0381444;REFB=-0.000544931;REVB=-0.0380412;RO=122;SAF=81;SAR=69;SRF=57;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0600847;STB=0.534531;TYPE=snp;VARB=0.000334439;OID=.;OPOS=55139741;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:273:273:122:123:150:150:69:81:57:65:69:81:57:66 chr1 55152104 . T C 144.97 PASS AO=26;DP=48;FAO=29;FDP=51;FR=.;FRO=22;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.0143959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.562;QD=11.3702;RBI=0.0210795;REFB=-0.0251352;REVB=-0.0153981;RO=20;SAF=15;SAR=11;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0999618;STB=0.553808;TYPE=snp;VARB=0.0177997;OID=.;OPOS=55152104;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:48:51:20:22:26:29:11:15:9:11:11:18:11:11 chr1 55166839 . GCCC GCC,GCCT 519.09 PASS AO=39,58;DP=131;FAO=36,60;FDP=129;FR=.;FRO=33;FSAF=32,34;FSAR=4,26;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=-0.0256629,0.0592048;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=17.6685,34.816;QD=16.0959;RBI=0.173209,0.0610915;REFB=-0.13847,-0.0795819;REVB=-0.171298,-0.0150655;RO=26;SAF=33,32;SAR=6,26;SRF=9;SRR=17;SSEN=0.38206,0;SSEP=0,0;SSSB=0.451584,0.117592;STB=0.809922,0.561358;TYPE=del,snp;VARB=0.0759756,0.0143387;OID=.,.;OPOS=55166840,55166842;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=GCC,GCCT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:39,58:125:36,60:129:33:32,34:4,26:13:20:88:26:33,32:6,26:9:17 chr1 55167773 . T A 398.67 PASS AO=91;DP=184;FAO=91;FDP=179;FR=.;FRO=88;FSAF=38;FSAR=53;FSRF=29;FSRR=59;FWDB=0.008729;FXX=0.0427785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3629;QD=8.90878;RBI=0.0518511;REFB=-0.0201798;REVB=0.051111;RO=84;SAF=38;SAR=53;SRF=28;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.077022;STB=0.545142;TYPE=snp;VARB=0.0182679;OID=.;OPOS=55167773;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:179:84:88:91:91:53:38:28:56:53:38:29:59 chr1 55182300 . T A 257.65 PASS AO=87;DP=236;FAO=87;FDP=235;FR=.;FRO=148;FSAF=44;FSAR=43;FSRF=46;FSRR=102;FWDB=0.00760753;FXX=0.0167357;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.592;QD=4.38546;RBI=0.0078615;REFB=-0.00936259;REVB=0.00198205;RO=144;SAF=44;SAR=43;SRF=46;SRR=98;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206225;STB=0.622413;TYPE=snp;VARB=0.0118524;OID=.;OPOS=55182300;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:236:235:144:148:87:87:43:44:46:98:43:44:46:102 chr1 55224131 . T C 99.86 PASS AO=31;DP=83;FAO=31;FDP=83;FR=.;FRO=52;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=43;FSRR=9;FWDB=-0.00747126;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.2445;QD=4.81251;RBI=0.0327931;REFB=-0.00874371;REVB=-0.0319306;RO=52;SAF=17;SAR=14;SRF=43;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.324575;STB=0.682273;TYPE=snp;VARB=0.0191688;OID=.;OPOS=55224131;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:52:52:31:31:14:17:43:9:14:17:43:9 chr1 55224751 . C A 190.12 PASS AO=37;DP=66;FAO=38;FDP=67;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.0450862;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1885;QD=11.3504;RBI=0.047521;REFB=0.0133417;REVB=0.0150162;RO=29;SAF=15;SAR=22;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0630365;STB=0.539187;TYPE=snp;VARB=-0.00638297;OID=.;OPOS=55224751;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:67:29:29:37:38:22:15:14:15:23:15:14:15 chr1 55251689 . T C 1070.43 PASS AO=114;DP=115;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00142649;FXX=0.0086949;HRUN=2;LEN=1;MLLD=273.257;QD=37.559;RBI=0.0340216;REFB=0.0127317;REVB=0.0339917;RO=1;SAF=54;SAR=60;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00784876;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.0094e-05;OID=.;OPOS=55251689;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:115:114:1:0:114:114:60:54:0:1:60:54:0:0 chr1 55253433 . C T 96.17 PASS AO=16;DP=27;FAO=16;FDP=25;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.0613688;FXX=0.0740466;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.617;QD=15.3879;RBI=0.066623;REFB=-0.0428207;REVB=0.0259324;RO=9;SAF=5;SAR=11;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237771;STB=0.633335;TYPE=snp;VARB=0.0168525;OID=.;OPOS=55253433;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:27:25:9:9:16:16:11:5:6:3:11:5:6:3 chr1 55266796 . AG A,AC 152.46 PASS AO=7,8;DP=23;FAO=13,9;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=8,5;FSAR=5,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.205555,-0.057428;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=16.8526,41.7992;QD=27.7196;RBI=0.427342,0.203042;REFB=0,0;REVB=0.374657,0.194751;RO=5;SAF=7,4;SAR=0,4;SRF=0;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0.478659,0;SSSB=0.826071,0.33733;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.11888,-0.0536613;OID=.,.;OPOS=55266797,55266797;OREF=G,G;OALT=-,C;OMAPALT=A,AC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:7,8:21:13,9:22:0:8,5:5,4:0:0:37:5:7,4:0,4:0:5 chr1 55273580 . G T 108.84 PASS AO=29;DP=68;FAO=29;FDP=69;FR=.;FRO=40;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=28;FSRR=12;FWDB=0.00575495;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.837;QD=6.30933;RBI=0.0705244;REFB=-0.00187283;REVB=-0.0702892;RO=39;SAF=19;SAR=10;SRF=28;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0722944;STB=0.52926;TYPE=snp;VARB=0.00220256;OID=.;OPOS=55273580;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:69:39:40:29:29:10:19:28:11:10:19:28:12 chr1 55277599 . T C 463.89 PASS AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0316713;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.9976;QD=35.6839;RBI=0.0316739;REFB=-0.00632508;REVB=-0.00040126;RO=1;SAF=25;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184631;STB=0.5098;TYPE=snp;VARB=-7.13384e-05;OID=.;OPOS=55277599;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:52:52:1:1:51:51:26:25:1:0:26:25:1:0 chr1 55307501 . A G 259.43 PASS AO=54;DP=101;FAO=56;FDP=103;FR=.;FRO=47;FSAF=21;FSAR=35;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=-0.0417987;FXX=0.00961446;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.4444;QD=10.0748;RBI=0.0640941;REFB=0.0100891;REVB=-0.0485892;RO=47;SAF=21;SAR=33;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136266;STB=0.514134;TYPE=snp;VARB=-0.00803923;OID=.;OPOS=55307501;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:103:47:47:54:56:33:21:19:28:35:21:19:28 chr1 55319902 . A G 201.26 PASS AO=51;DP=112;FAO=51;FDP=112;FR=.;FRO=61;FSAF=17;FSAR=34;FSRF=42;FSRR=19;FWDB=-0.0091733;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.503;QD=7.18783;RBI=0.00989899;REFB=-0.00536831;REVB=0.00372029;RO=61;SAF=17;SAR=34;SRF=42;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.341399;STB=0.689985;TYPE=snp;VARB=0.0132852;OID=.;OPOS=55319902;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:61:61:51:51:34:17:42:19:34:17:42:19 chr1 55446697 . G A 283.86 PASS AO=33;DP=35;FAO=33;FDP=35;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0456706;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.031;QD=32.4412;RBI=0.0457579;REFB=0.00297868;REVB=0.00282516;RO=2;SAF=22;SAR=11;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0406014;STB=0.521726;TYPE=snp;VARB=0.000229255;OID=.;OPOS=55446697;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:35:35:2:2:33:33:11:22:2:0:11:22:2:0 chr1 55457710 . G A 961.32 PASS AO=101;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0355698;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.476;QD=38.0719;RBI=0.0411586;REFB=0;REVB=0.020708;RO=0;SAF=25;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.9231e-05;OID=.;OPOS=55457710;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:101:101:0:0:101:101:76:25:0:0:76:25:0:0 chr1 55523033 . A G 890.21 PASS AO=99;DP=100;FAO=97;FDP=100;FR=.;FRO=3;FSAF=46;FSAR=51;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.00585369;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.4904;QD=35.6084;RBI=0.0621675;REFB=0.0810342;REVB=-0.0618913;RO=1;SAF=47;SAR=52;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00903516;STB=0.504239;TYPE=snp;VARB=-0.0147734;OID=.;OPOS=55523033;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:100:100:1:3:99:97:52:47:0:1:51:46:1:2 chr1 55524197 . A G 580.87 PASS AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00632505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.146;QD=38.7245;RBI=0.0105425;REFB=0;REVB=-0.00843428;RO=0;SAF=30;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.32282e-05;OID=.;OPOS=55524197;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:60:60:0:0:60:60:30:30:0:0:30:30:0:0 chr1 55524237 . G A 690.1 PASS AO=72;DP=72;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00585202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.055;QD=37.8135;RBI=0.0201042;REFB=0;REVB=0.0192337;RO=0;SAF=42;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1178e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.38112e-05;OID=.;OPOS=55524237;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:72:73:0:0:72:73:30:42:0:0:31:42:0:0 chr1 55529112 . TG T 43.41 PASS AO=14;DP=41;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.113563;FXX=0.0243843;HRUN=5;LEN=1;MLLD=8.73607;QD=4.34055;RBI=0.27163;REFB=-0.0784476;REVB=0.246752;RO=16;SAF=5;SAR=9;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112676;STB=0.506323;TYPE=del;VARB=0.155987;OID=.;OPOS=55529113;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:14:41:21:40:19:8:13:7:12:29:16:5:9:4:12 chr1 55529187 . G A 204.14 PASS AO=24;DP=27;FAO=24;FDP=26;FR=.;FRO=2;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0512788;FXX=0.0370233;HRUN=4;LEN=1;MLLD=204.221;QD=31.4055;RBI=0.0589192;REFB=-0.111468;REVB=0.0290166;RO=2;SAF=7;SAR=17;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115254;STB=0.562446;TYPE=snp;VARB=0.00447886;OID=.;OPOS=55529187;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:27:26:2:2:24:24:17:7:2:0:17:7:2:0 chr1 55541174 . A G 885.79 PASS AO=95;DP=98;FAO=97;FDP=98;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=60;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0401512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.892;QD=36.1545;RBI=0.0444556;REFB=-0.0965223;REVB=0.0190835;RO=1;SAF=35;SAR=60;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133545;STB=0.506665;TYPE=snp;VARB=0.00112312;OID=.;OPOS=55541174;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:98:98:1:1:95:97:60:35:1:0:60:37:1:0 chr1 55638075 . G A 1721.68 PASS AO=194;DP=197;FAO=200;FDP=200;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0864221;FXX=0.0099005;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120;QD=34.4336;RBI=0.0886641;REFB=0;REVB=-0.0198128;RO=0;SAF=91;SAR=103;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00730469;OID=.;OPOS=55638075;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:197:200:0:0:194:200:103:91:0:0:107:93:0:0 chr1 55839117 . G T 215.89 PASS AO=73;DP=190;FAO=71;FDP=190;FR=.;FRO=119;FSAF=42;FSAR=29;FSRF=64;FSRR=55;FWDB=-0.000317081;FXX=0.00523533;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.907;QD=4.54508;RBI=0.00611896;REFB=-0.00776941;REVB=-0.00611074;RO=114;SAF=43;SAR=30;SRF=63;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0402995;STB=0.534374;TYPE=snp;VARB=0.0150358;OID=.;OPOS=55839117;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:190:114:119:73:71:30:43:63:51:29:42:64:55 chr1 55842312 . G C 231.7 PASS AO=63;DP=146;FAO=64;FDP=150;FR=.;FRO=86;FSAF=27;FSAR=37;FSRF=45;FSRR=41;FWDB=-0.00640505;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=157.361;QD=6.17858;RBI=0.00754283;REFB=0.00864926;REVB=0.00398368;RO=82;SAF=26;SAR=37;SRF=42;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101723;STB=0.558472;TYPE=snp;VARB=-0.0131415;OID=.;OPOS=55842312;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:150:82:86:63:64:37:26:42:40:37:27:45:41 chr1 55864258 . C T 1145.8 PASS AO=119;DP=119;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0484582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2;QD=38.5142;RBI=0.0486829;REFB=0;REVB=-0.00467142;RO=0;SAF=38;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41195e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000262886;OID=.;OPOS=55864258;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:119:119:0:0:119:119:81:38:0:0:81:38:0:0 chr1 57180867 . A G 1353.4 PASS AO=141;DP=141;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00569564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.941;QD=38.1239;RBI=0.0200024;REFB=0;REVB=0.0191744;RO=0;SAF=44;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.93562e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.0277e-05;OID=.;OPOS=57180867;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:141:142:0:0:141:142:97:44:0:0:98:44:0:0 chr1 57209695 . T C 307.46 PASS AO=88;DP=218;FAO=91;FDP=222;FR=.;FRO=131;FSAF=37;FSAR=54;FSRF=65;FSRR=66;FWDB=0.0379563;FXX=0.0044841;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.0716;QD=5.53988;RBI=0.042828;REFB=-0.00570166;REVB=0.0198382;RO=130;SAF=34;SAR=54;SRF=64;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115105;STB=0.553667;TYPE=snp;VARB=0.00844463;OID=.;OPOS=57209695;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:218:222:130:131:88:91:54:34:64:66:54:37:65:66 chr1 57383358 . C T 111.56 PASS AO=29;DP=67;FAO=29;FDP=67;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=0.00291223;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.29;QD=6.66038;RBI=0.0159385;REFB=-0.0120358;REVB=-0.0156701;RO=38;SAF=12;SAR=17;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0473255;STB=0.526748;TYPE=snp;VARB=0.0259857;OID=.;OPOS=57383358;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:38:38:29:29:17:12:14:24:17:12:14:24 chr1 57422484 . C T 1738.23 PASS AO=182;DP=182;FAO=182;FDP=182;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0326223;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.8;QD=38.2029;RBI=0.0329215;REFB=0;REVB=0.00442805;RO=0;SAF=75;SAR=107;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.26869e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.83851e-05;OID=.;OPOS=57422484;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:82:182:182:0:0:182:182:107:75:0:0:107:75:0:0 chr1 59125683 . C T 146.55 PASS AO=46;DP=125;FAO=47;FDP=125;FR=.;FRO=78;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=44;FSRR=34;FWDB=0.0197353;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.9838;QD=4.68944;RBI=0.0233209;REFB=0.00929395;REVB=-0.0124251;RO=79;SAF=19;SAR=27;SRF=45;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172802;STB=0.586124;TYPE=snp;VARB=-0.0189962;OID=.;OPOS=59125683;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:79:78:46:47:27:19:45:34:27:20:44:34 chr1 59127086 . G A 209.98 PASS AO=57;DP=132;FAO=57;FDP=132;FR=.;FRO=75;FSAF=22;FSAR=35;FSRF=44;FSRR=31;FWDB=-0.0107404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.823;QD=6.36298;RBI=0.0137495;REFB=-0.00346865;REVB=-0.00858451;RO=74;SAF=22;SAR=35;SRF=44;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210356;STB=0.613995;TYPE=snp;VARB=0.00426037;OID=.;OPOS=59127086;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:74:75:57:57:35:22:44:30:35:22:44:31 chr1 59142713 . T C 562.86 PASS AO=150;DP=332;FAO=150;FDP=332;FR=.;FRO=182;FSAF=79;FSAR=71;FSRF=59;FSRR=123;FWDB=-0.0236653;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=102.743;QD=6.78143;RBI=0.0272993;REFB=-0.0148171;REVB=-0.013609;RO=178;SAF=79;SAR=71;SRF=58;SRR=120;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196224;STB=0.61;TYPE=snp;VARB=0.0224764;OID=.;OPOS=59142713;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:332:332:178:182:150:150:71:79:58:120:71:79:59:123 chr1 59147926 . T C 367.8 PASS AO=88;DP=180;FAO=88;FDP=180;FR=.;FRO=92;FSAF=44;FSAR=44;FSRF=40;FSRR=52;FWDB=0.00566059;FXX=0.0322563;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.6497;QD=8.17327;RBI=0.0473705;REFB=-0.0144831;REVB=0.0470311;RO=91;SAF=44;SAR=44;SRF=39;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0659503;STB=0.533326;TYPE=snp;VARB=0.0180648;OID=.;OPOS=59147926;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:180:91:92:88:88:44:44:39:52:44:44:40:52 chr1 59148118 . A T 348.68 PASS AO=87;DP=181;FAO=86;FDP=181;FR=.;FRO=95;FSAF=38;FSAR=48;FSRF=44;FSRR=51;FWDB=-0.069228;FXX=0.0054942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.508;QD=7.70574;RBI=0.0699966;REFB=0.0101742;REVB=-0.0103446;RO=94;SAF=39;SAR=48;SRF=43;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00871246;STB=0.511299;TYPE=snp;VARB=-0.00751745;OID=.;OPOS=59148118;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:181:94:95:87:86:48:39:43:51:48:38:44:51 chr1 59160885 . A G 290.65 PASS AO=64;DP=123;FAO=64;FDP=123;FR=.;FRO=59;FSAF=28;FSAR=36;FSRF=30;FSRR=29;FWDB=-0.0103172;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.647;QD=9.452;RBI=0.0291646;REFB=-0.016777;REVB=0.0272787;RO=57;SAF=28;SAR=36;SRF=29;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0615424;STB=0.534278;TYPE=snp;VARB=0.018285;OID=.;OPOS=59160885;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:57:59:64:64:36:28:29:28:36:28:30:29 chr1 59213743 . G A 80.13 PASS AO=16;DP=30;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.00595377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.651;QD=10.3394;RBI=0.011408;REFB=-0.00339078;REVB=-0.00973109;RO=13;SAF=8;SAR=8;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.030493;STB=0.516109;TYPE=snp;VARB=0.00193911;OID=.;OPOS=59213743;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:30:31:13:15:16:16:8:8:6:7:8:8:7:8 chr1 59248812 . T TC 78.03 PASS AO=4;DP=22;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00691254;FXX=0.499773;HRUN=0;LEN=1;MLLD=132.097;QD=28.3728;RBI=0.0069796;REFB=0;REVB=-0.000965235;RO=18;SAF=4;SAR=0;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.609289;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-0.00443964;OID=.;OPOS=59248813;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:4:22:11:11:0:11:0:0:0:4:18:4:0:12:6 chr1 59248813 . G C 144.84 PASS AO=18;DP=22;FAO=19;FDP=21;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0119908;FXX=0.0454339;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.2338;QD=27.5891;RBI=0.0764528;REFB=-0.016334;REVB=0.0755066;RO=3;SAF=12;SAR=6;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101866;STB=0.535678;TYPE=snp;VARB=0.00152236;OID=.;OPOS=59248813;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:22:21:3:2:18:19:6:12:3:0:6:13:2:0 chr1 59249031 . T G 775.69 PASS AO=73;DP=73;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.582;QD=37.8383;RBI=0.0600934;REFB=0;REVB=0.0589224;RO=0;SAF=34;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000110179;OID=.;OPOS=59249031;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:73:82:0:0:73:82:39:34:0:0:45:37:0:0 chr1 59249347 . G C 952.6 PASS AO=102;DP=103;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.03392;FXX=0.0097078;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.338;QD=37.3568;RBI=0.0361036;REFB=-0.034306;REVB=0.0123653;RO=1;SAF=63;SAR=39;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0120095;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.9872e-06;OID=.;OPOS=59249347;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:103:102:1:0:102:102:39:63:0:1:39:63:0:0 chr1 59364918 . G A 197.54 PASS AO=56;DP=134;FAO=56;FDP=134;FR=.;FRO=78;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=32;FSRR=46;FWDB=-0.0126923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.6954;QD=5.8967;RBI=0.0294;REFB=-0.0148042;REVB=0.0265191;RO=78;SAF=22;SAR=34;SRF=32;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0188058;STB=0.510563;TYPE=snp;VARB=0.023326;OID=.;OPOS=59364918;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:78:78:56:56:34:22:32:46:34:22:32:46 chr1 59787350 . T G 293.38 PASS AO=73;DP=155;FAO=73;FDP=155;FR=.;FRO=82;FSAF=27;FSAR=46;FSRF=41;FSRR=41;FWDB=0.00951119;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.799;QD=7.57117;RBI=0.0127373;REFB=0.0130551;REVB=-0.00847203;RO=82;SAF=27;SAR=46;SRF=41;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128185;STB=0.571096;TYPE=snp;VARB=-0.0246034;OID=.;OPOS=59787350;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:82:82:73:73:46:27:41:41:46:27:41:41 chr1 59844471 . G A 396.57 PASS AO=124;DP=314;FAO=124;FDP=312;FR=.;FRO=188;FSAF=42;FSAR=82;FSRF=88;FSRR=100;FWDB=8.93542e-05;FXX=0.00636922;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.86;QD=5.08428;RBI=0.000786856;REFB=0.00985487;REVB=0.000781766;RO=188;SAF=42;SAR=82;SRF=88;SRR=100;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146553;STB=0.582373;TYPE=snp;VARB=-0.0121167;OID=.;OPOS=59844471;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:314:312:188:188:124:124:82:42:88:100:82:42:88:100 chr1 60073526 . GC G 2192.01 PASS AO=285;DP=319;FAO=311;FDP=311;FR=.;FRO=0;FSAF=128;FSAR=183;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.187743;FXX=0.00638957;HRUN=2;LEN=1;MLLD=22.1208;QD=28.1931;RBI=0.233279;REFB=-0.0586477;REVB=0.138462;RO=22;SAF=113;SAR=172;SRF=14;SRR=8;SSEN=0.552795;SSEP=0;SSSB=-0.0338856;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.007031;OID=.;OPOS=60073527;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:285:313:311:311:0:128:183:0:0:99:22:113:172:14:8 chr1 60392271 . G A 41.71 PASS AO=11;DP=33;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.0449761;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0891;QD=4.90743;RBI=0.0750851;REFB=-0.017266;REVB=-0.0601243;RO=21;SAF=6;SAR=5;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126972;STB=0.639198;TYPE=snp;VARB=0.0286569;OID=.;OPOS=60392271;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:33:34:21:22:11:12:5:6:9:12:5:7:8:14 chr1 60466814 . T C 248.2 PASS AO=58;DP=117;FAO=58;FDP=117;FR=.;FRO=59;FSAF=10;FSAR=48;FSRF=13;FSRR=46;FWDB=0.00494302;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.204;QD=8.48538;RBI=0.0282648;REFB=0.0322844;REVB=0.0278292;RO=59;SAF=10;SAR=48;SRF=13;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0722269;STB=0.540103;TYPE=snp;VARB=-0.0308135;OID=.;OPOS=60466814;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:59:59:58:58:48:10:13:46:48:10:13:46 chr1 60474375 . C T 82.34 PASS AO=25;DP=68;FAO=25;FDP=67;FR=.;FRO=42;FSAF=3;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=-0.120573;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.917;QD=4.91569;RBI=0.121281;REFB=0.0138386;REVB=0.0130906;RO=42;SAF=3;SAR=22;SRF=17;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.433942;STB=0.757066;TYPE=snp;VARB=-0.0206962;OID=.;OPOS=60474375;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:68:67:42:42:25:25:22:3:17:25:22:3:17:25 chr1 60505783 . G C 283.66 PASS AO=61;DP=115;FAO=61;FDP=114;FR=.;FRO=53;FSAF=21;FSAR=40;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=-0.0118235;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.4739;QD=9.95294;RBI=0.0153224;REFB=-0.0222986;REVB=-0.00974576;RO=52;SAF=21;SAR=40;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121236;STB=0.571926;TYPE=snp;VARB=0.012869;OID=.;OPOS=60505783;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:114:52:53:61:61:40:21:25:27:40:21:26:27 chr1 60506744 . G A 304.77 PASS AO=48;DP=68;FAO=48;FDP=68;FR=.;FRO=20;FSAF=39;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.0139624;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.0417;QD=17.9277;RBI=0.0170358;REFB=-0.0041768;REVB=0.00976054;RO=18;SAF=39;SAR=9;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184995;STB=0.590868;TYPE=snp;VARB=0.00198061;OID=.;OPOS=60506744;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:68:68:18:20:48:48:9:39:10:8:9:39:12:8 chr1 61869783 . G A 315.5 PASS AO=76;DP=161;FAO=77;FDP=161;FR=.;FRO=84;FSAF=46;FSAR=31;FSRF=35;FSRR=49;FWDB=-0.00732905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.9327;QD=7.83857;RBI=0.00734821;REFB=-0.0318355;REVB=-0.000530395;RO=85;SAF=46;SAR=30;SRF=35;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184778;STB=0.594387;TYPE=snp;VARB=0.0335372;OID=.;OPOS=61869783;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:161:85:84:76:77:30:46:35:50:31:46:35:49 chr1 62232031 . C T 3755.74 PASS AO=393;DP=395;FAO=395;FDP=395;FR=.;FRO=0;FSAF=138;FSAR=257;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0290677;FXX=0.00503766;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.441;QD=38.0328;RBI=0.0342507;REFB=-0.0587029;REVB=0.0181157;RO=1;SAF=137;SAR=256;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00186074;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.7575e-05;OID=.;OPOS=62232031;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:395:395:1:0:393:395:256:137:0:1:257:138:0:0 chr1 62257036 . A C 269.3 PASS AO=88;DP=224;FAO=88;FDP=232;FR=.;FRO=144;FSAF=34;FSAR=54;FSRF=62;FSRR=82;FWDB=-0.033972;FXX=0.0169484;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.015;QD=4.64303;RBI=0.0343241;REFB=-0.0143052;REVB=-0.0049038;RO=131;SAF=34;SAR=54;SRF=52;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0118545;STB=0.528542;TYPE=snp;VARB=0.0204306;OID=.;OPOS=62257036;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:224:232:131:144:88:88:54:34:52:79:54:34:62:82 chr1 62318192 . G A 375.62 PASS AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.030687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.041;QD=38.5253;RBI=0.0307643;REFB=0;REVB=0.00217953;RO=0;SAF=23;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43889e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000213791;OID=.;OPOS=62318192;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:39:39:0:0:39:39:16:23:0:0:16:23:0:0 chr1 62330080 . T G 1267.06 PASS AO=133;DP=133;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018847;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.963;QD=38.1069;RBI=0.0188583;REFB=0;REVB=0.000653041;RO=0;SAF=72;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.79172e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.26071e-05;OID=.;OPOS=62330080;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:133:133:0:0:133:133:61:72:0:0:61:72:0:0 chr1 62380270 . C T 577.08 PASS AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0304686;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.654;QD=37.8414;RBI=0.0315916;REFB=0;REVB=0.0083483;RO=0;SAF=8;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.04283e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000127145;OID=.;OPOS=62380270;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:61:61:0:0:61:61:53:8:0:0:53:8:0:0 chr1 62380298 . G A 143.54 PASS AO=31;DP=61;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=25;FSRF=2;FSRR=28;FWDB=0.000904051;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=283.778;QD=9.41249;RBI=0.00257226;REFB=-0.0155211;REVB=-0.00240816;RO=30;SAF=6;SAR=25;SRF=2;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207855;STB=0.613838;TYPE=snp;VARB=0.0147259;OID=.;OPOS=62380298;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:30:30:31:31:25:6:2:28:25:6:2:28 chr1 62456014 . G A 1452.34 PASS AO=158;DP=160;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0160446;FXX=0.012738;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.968;QD=37.4798;RBI=0.0211276;REFB=-0.108715;REVB=0.0137458;RO=0;SAF=69;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4361e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000543251;OID=.;OPOS=62456014;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:160:155:0:0:158:155:89:69:0:0:88:67:0:0 chr1 62483599 . G A 210.51 PASS AO=45;DP=114;FAO=59;FDP=128;FR=.;FRO=69;FSAF=36;FSAR=23;FSRF=38;FSRR=31;FWDB=0.0869913;FXX=0.00775134;HRUN=2;LEN=1;MLLD=31.1432;QD=6.57839;RBI=0.102588;REFB=-0.0617016;REVB=0.0543769;RO=69;SAF=22;SAR=23;SRF=38;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0660069;STB=0.533176;TYPE=snp;VARB=0.0885192;OID=.;OPOS=62483599;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:128:69:69:45:59:23:22:38:31:23:36:38:31 chr1 62483623 . A G 197.01 PASS AO=52;DP=118;FAO=52;FDP=118;FR=.;FRO=66;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=33;FSRR=33;FWDB=-0.00745852;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4248;QD=6.67833;RBI=0.0084194;REFB=-0.00162068;REVB=-0.00390599;RO=66;SAF=30;SAR=22;SRF=33;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0776744;STB=0.543461;TYPE=snp;VARB=0.00188397;OID=.;OPOS=62483623;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:66:66:52:52:22:30:33:33:22:30:33:33 chr1 62516683 . G C 2452.96 PASS AO=243;DP=243;FAO=256;FDP=256;FR=.;FRO=0;FSAF=115;FSAR=141;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.001095;FXX=0.0115826;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.81;QD=38.3275;RBI=0.0561607;REFB=0;REVB=0.05615;RO=0;SAF=113;SAR=130;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00144156;OID=.;OPOS=62516683;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:243:256:0:0:243:256:130:113:0:0:141:115:0:0 chr1 62538252 . G A 352.58 PASS AO=66;DP=110;FAO=66;FDP=110;FR=.;FRO=44;FSAF=23;FSAR=43;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=0.00292941;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.831;QD=12.8211;RBI=0.0299572;REFB=0.00393358;REVB=0.0298136;RO=44;SAF=23;SAR=43;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0659067;STB=0.535894;TYPE=snp;VARB=-0.00218685;OID=.;OPOS=62538252;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:44:44:66:66:43:23:19:25:43:23:19:25 chr1 62538372 . A G 580.85 PASS AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0373759;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.991;QD=38.7231;RBI=0.0455636;REFB=0;REVB=0.0260592;RO=0;SAF=19;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.31043e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000135642;OID=.;OPOS=62538372;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:60:60:0:0:60:60:41:19:0:0:41:19:0:0 chr1 62579823 . G A 272.65 PASS AO=84;DP=189;FAO=83;FDP=205;FR=.;FRO=122;FSAF=57;FSAR=26;FSRF=87;FSRR=35;FWDB=-0.0637297;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.7303;QD=5.32005;RBI=0.0651708;REFB=-0.0273049;REVB=-0.0136293;RO=104;SAF=63;SAR=21;SRF=73;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.061435;STB=0.518483;TYPE=snp;VARB=0.0397919;OID=.;OPOS=62579823;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:205:104:122:84:83:21:63:73:31:26:57:87:35 chr1 62594593 . C T 1444.19 PASS AO=147;DP=148;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00254218;FXX=0.0379723;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9546;QD=38.0051;RBI=0.00294334;REFB=0;REVB=0.00148344;RO=0;SAF=58;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00138603;OID=.;OPOS=62594593;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:148:152:0:0:147:152:89:58:0:0:93:59:0:0 chr1 62603421 . C T 279.43 PASS AO=102;DP=292;FAO=102;FDP=289;FR=.;FRO=187;FSAF=49;FSAR=53;FSRF=95;FSRR=92;FWDB=0.00387108;FXX=0.0102736;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.23;QD=3.86753;RBI=0.0177548;REFB=-0.00427789;REVB=-0.0173277;RO=187;SAF=49;SAR=53;SRF=95;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0314554;STB=0.517877;TYPE=snp;VARB=0.0080598;OID=.;OPOS=62603421;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:292:289:187:187:102:102:53:49:95:92:53:49:95:92 chr1 62603544 . C T 231.41 PASS AO=81;DP=219;FAO=80;FDP=220;FR=.;FRO=140;FSAF=40;FSAR=40;FSRF=52;FSRR=88;FWDB=0.0681443;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.7579;QD=4.20737;RBI=0.0742765;REFB=-0.00407151;REVB=0.0295526;RO=138;SAF=41;SAR=40;SRF=50;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160254;STB=0.581798;TYPE=snp;VARB=0.00830657;OID=.;OPOS=62603544;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:219:220:138:140:81:80:40:41:50:88:40:40:52:88 chr1 62644118 . A G 241.05 PASS AO=49;DP=90;FAO=50;FDP=91;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=35;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=0.0146468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.283;QD=10.5957;RBI=0.0244255;REFB=-0.0113282;REVB=-0.0195468;RO=41;SAF=14;SAR=35;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165441;STB=0.581873;TYPE=snp;VARB=0.0154616;OID=.;OPOS=62644118;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:91:41:41:49:50:35:14:19:22:35:15:19:22 chr1 62672389 . T TAACAGA 148.8 PASS AO=46;DP=145;FAO=51;FDP=140;FR=.;FRO=89;FSAF=13;FSAR=38;FSRF=29;FSRR=60;FWDB=-0.0101237;FXX=0.0140835;HRUN=2;LEN=6;MLLD=241.537;QD=4.25139;RBI=0.0110376;REFB=-0.0178528;REVB=-0.00439758;RO=93;SAF=11;SAR=35;SRF=33;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16423;STB=0.556075;TYPE=ins;VARB=0.0275229;OID=.;OPOS=62672390;OREF=-;OALT=AACAGA;OMAPALT=TAACAGA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:46:145:51:140:89:13:38:29:60:99:93:11:35:33:60 chr1 62672546 . G A 675.39 PASS AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0106059;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=295.154;QD=36.5078;RBI=0.0200667;REFB=-0.00194764;REVB=0.0170349;RO=1;SAF=24;SAR=49;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.009557;STB=0.505049;TYPE=snp;VARB=-1.5679e-06;OID=.;OPOS=62672546;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:74:74:1:1:73:73:49:24:0:1:49:24:0:1 chr1 62673037 . T C 885.26 PASS AO=59;DP=92;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00612519;FXX=0.0210504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.199;QD=38.0756;RBI=0.00626135;REFB=0;REVB=0.00129869;RO=0;SAF=18;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.49224e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.57757e-05;OID=.;OPOS=62673037;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:61:93:0:0:59:93:41:18:0:0:41:52:0:0 chr1 62673225 . G A 1376.21 PASS AO=144;DP=145;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00488079;FXX=0.00689608;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.252;QD=38.2281;RBI=0.01423;REFB=0;REVB=0.0133668;RO=0;SAF=53;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.3691e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.8545e-05;OID=.;OPOS=62673225;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:145:144:0:0:144:144:91:53:0:0:91:53:0:0 chr1 62675619 . C T 667.22 PASS AO=255;DP=563;FAO=179;FDP=394;FR=.;FRO=215;FSAF=93;FSAR=86;FSRF=103;FSRR=112;FWDB=0.020566;FXX=0.0149996;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.8254;QD=6.77379;RBI=0.0241243;REFB=-0.00276799;REVB=0.0126105;RO=304;SAF=125;SAR=130;SRF=141;SRR=163;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0260443;STB=0.522084;TYPE=snp;VARB=0.00481626;OID=.;OPOS=62675619;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:563:394:304:215:255:179:130:125:141:163:86:93:103:112 chr1 62675892 . A G 199.28 PASS AO=48;DP=97;FAO=47;FDP=97;FR=.;FRO=50;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=0.000648806;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.8533;QD=8.2178;RBI=0.058059;REFB=0.00156239;REVB=-0.0580554;RO=49;SAF=23;SAR=25;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0282928;STB=0.526766;TYPE=snp;VARB=-0.00351378;OID=.;OPOS=62675892;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:49:50:48:47:25:23:25:24:25:22:26:24 chr1 62676284 . C T 25.44 PASS AO=7;DP=22;FAO=7;FDP=22;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.0189537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.318;QD=4.62557;RBI=0.0218697;REFB=-0.00245303;REVB=-0.0109105;RO=15;SAF=2;SAR=5;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211684;STB=0.633402;TYPE=snp;VARB=0.00698958;OID=.;OPOS=62676284;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:22:22:15:15:7:7:5:2:7:8:5:2:7:8 chr1 62713224 . C G 1178.04 PASS AO=131;DP=135;FAO=130;FDP=134;FR=.;FRO=4;FSAF=66;FSAR=64;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0103258;FXX=0.00740686;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.229;QD=35.1653;RBI=0.0103714;REFB=-0.0536003;REVB=0.000971349;RO=4;SAF=67;SAR=64;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0134357;STB=0.507235;TYPE=snp;VARB=0.00126929;OID=.;OPOS=62713224;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:135:134:4:4:131:130:64:67:3:1:64:66:3:1 chr1 62713246 . G A 327.81 PASS AO=72;DP=135;FAO=72;FDP=139;FR=.;FRO=67;FSAF=31;FSAR=41;FSRF=40;FSRR=27;FWDB=0.0128345;FXX=0.00714235;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.9992;QD=9.43329;RBI=0.0413885;REFB=-0.0168563;REVB=0.0393482;RO=63;SAF=31;SAR=41;SRF=36;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120017;STB=0.579974;TYPE=snp;VARB=0.0158509;OID=.;OPOS=62713246;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:139:63:67:72:72:41:31:36:27:41:31:40:27 chr1 62738904 . T C 119.45 PASS AO=35;DP=89;FAO=35;FDP=89;FR=.;FRO=54;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=19;FSRR=35;FWDB=-0.0253923;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.484;QD=5.36862;RBI=0.0317828;REFB=-0.0294706;REVB=0.0191149;RO=46;SAF=11;SAR=24;SRF=18;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0863998;STB=0.525916;TYPE=snp;VARB=0.0437528;OID=.;OPOS=62738904;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:46:54:35:35:24:11:18:28:24:11:19:35 chr1 62739198 . G A 187.57 PASS AO=37;DP=65;FAO=37;FDP=65;FR=.;FRO=28;FSAF=30;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.0365505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.6443;QD=11.5428;RBI=0.0809912;REFB=-0.0162976;REVB=0.0722747;RO=26;SAF=30;SAR=7;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.26863;STB=0.655643;TYPE=snp;VARB=0.0196482;OID=.;OPOS=62739198;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:26:28:37:37:7:30:14:12:7:30:15:13 chr1 62740065 . A G 55.23 PASS AO=18;DP=73;FAO=18;FDP=57;FR=.,HEALED;FRO=39;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=25;FWDB=0.00575759;FXX=0.136343;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.077;QD=3.8761;RBI=0.0417702;REFB=-0.006606;REVB=-0.0413714;RO=38;SAF=13;SAR=5;SRF=13;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.423999;STB=0.704326;TYPE=snp;VARB=0.0125434;OID=.;OPOS=62740065;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:71:57:38:39:18:18:5:13:13:25:6:12:14:25 chr1 62740446 . T C 46.67 PASS AO=17;DP=56;FAO=17;FDP=55;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=33;FWDB=0.0131792;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.773;QD=3.39434;RBI=0.0235948;REFB=-0.00427812;REVB=-0.0195711;RO=38;SAF=11;SAR=6;SRF=5;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.55511;STB=0.816869;TYPE=snp;VARB=0.0408191;OID=.;OPOS=62740446;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:56:55:38:38:17:17:6:11:5:33:6:11:5:33 chr1 62740449 . T C 52.67 PASS AO=18;DP=55;FAO=18;FDP=55;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=32;FWDB=-0.0101872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.2135;QD=3.83056;RBI=0.0272363;REFB=-0.00694211;REVB=-0.0252594;RO=37;SAF=11;SAR=7;SRF=5;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.51471;STB=0.79273;TYPE=snp;VARB=0.0296125;OID=.;OPOS=62740449;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:55:55:37:37:18:18:7:11:5:32:7:11:5:32 chr1 63789334 . TC T 65.79 PASS AO=10;DP=33;FAO=18;FDP=26;FR=.;FRO=8;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.0482288;FXX=0.0714031;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.9647;QD=10.1218;RBI=0.184139;REFB=-0.0853888;REVB=0.177711;RO=11;SAF=8;SAR=2;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.483458;STB=0.63143;TYPE=del;VARB=0.0831248;OID=.;OPOS=63789335;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:10:27:18:26:8:12:6:2:6:13:11:8:2:3:8 chr1 63872032 . T C 413.23 PASS AO=114;DP=266;FAO=115;FDP=264;FR=.;FRO=149;FSAF=51;FSAR=64;FSRF=61;FSRR=88;FWDB=0.00282374;FXX=0.00751851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.7231;QD=6.26111;RBI=0.00795695;REFB=-0.0225093;REVB=0.00743905;RO=145;SAF=51;SAR=63;SRF=61;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0272996;STB=0.519568;TYPE=snp;VARB=0.027809;OID=.;OPOS=63872032;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:266:264:145:149:114:115:63:51:61:84:64:51:61:88 chr1 63881552 . C T 641.43 PASS AO=65;DP=65;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131115;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.018;QD=38.2941;RBI=0.0315709;REFB=0;REVB=0.0287195;RO=0;SAF=45;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000152848;OID=.;OPOS=63881552;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:65:67:0:0:65:67:20:45:0:0:20:47:0:0 chr1 63912546 . G T 43.94 PASS AO=25;DP=69;FAO=23;FDP=71;FR=.;FRO=48;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=30;FWDB=-0.129672;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=20.452;QD=2.47543;RBI=0.142191;REFB=-0.0187112;REVB=-0.0583409;RO=22;SAF=8;SAR=17;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0412452;STB=0.553968;TYPE=snp;VARB=0.0183329;OID=.;OPOS=63912546;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:69:71:22:48:25:23:17:8:8:14:16:7:18:30 chr1 63991267 . T C 548.41 PASS AO=128;DP=254;FAO=128;FDP=254;FR=.;FRO=126;FSAF=84;FSAR=44;FSRF=82;FSRR=44;FWDB=-0.0219968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.4291;QD=8.63643;RBI=0.0333009;REFB=-0.00587945;REVB=0.0250018;RO=125;SAF=84;SAR=44;SRF=81;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00821597;STB=0.502994;TYPE=snp;VARB=0.00571233;OID=.;OPOS=63991267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:254:254:125:126:128:128:44:84:81:44:44:84:82:44 chr1 63997633 . A T 242.25 PASS AO=84;DP=233;FAO=85;FDP=233;FR=.;FRO=148;FSAF=35;FSAR=50;FSRF=64;FSRR=84;FWDB=0.00248624;FXX=0.00851028;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.171;QD=4.15882;RBI=0.015623;REFB=-0.012142;REVB=-0.0154239;RO=139;SAF=34;SAR=50;SRF=58;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0142603;STB=0.513482;TYPE=snp;VARB=0.0205802;OID=.;OPOS=63997633;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:233:233:139:148:84:85:50:34:58:81:50:35:64:84 chr1 63999826 . C T 195.05 PASS AO=63;DP=166;FAO=63;FDP=166;FR=.;FRO=103;FSAF=24;FSAR=39;FSRF=55;FSRR=48;FWDB=0.0187083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.0242;QD=4.69993;RBI=0.020735;REFB=-0.0124949;REVB=-0.00894071;RO=103;SAF=24;SAR=39;SRF=55;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16941;STB=0.596023;TYPE=snp;VARB=0.0124334;OID=.;OPOS=63999826;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:166:103:103:63:63:39:24:55:48:39:24:55:48 chr1 63999868 . T C 164.68 PASS AO=53;DP=142;FAO=53;FDP=141;FR=.;FRO=88;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=44;FSRR=44;FWDB=-0.00552178;FXX=0.00704176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.352;QD=4.67163;RBI=0.00845846;REFB=-0.00191942;REVB=-0.00640746;RO=88;SAF=22;SAR=31;SRF=44;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0942119;STB=0.553551;TYPE=snp;VARB=0.00306933;OID=.;OPOS=63999868;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:141:88:88:53:53:31:22:44:44:31:22:44:44 chr1 64015217 . G A 1573.17 PASS AO=167;DP=170;FAO=169;FDP=169;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0269852;FXX=0.0174408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.6587;QD=37.2348;RBI=0.0270288;REFB=0.0351413;REVB=0.00153558;RO=2;SAF=76;SAR=91;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0103437;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00050081;OID=.;OPOS=64015217;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:170:169:2:0:167:169:91:76:0:2:91:78:0:0 chr1 64021096 . G A 243.78 PASS AO=65;DP=146;FAO=65;FDP=147;FR=.;FRO=82;FSAF=26;FSAR=39;FSRF=45;FSRR=37;FWDB=-0.0336654;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5334;QD=6.63356;RBI=0.0504657;REFB=-0.0176866;REVB=-0.0375956;RO=81;SAF=26;SAR=39;SRF=44;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143643;STB=0.583536;TYPE=snp;VARB=0.0226196;OID=.;OPOS=64021096;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:147:81:82:65:65:39:26:44:37:39:26:45:37 chr1 64038107 . G T 607.22 PASS AO=213;DP=499;FAO=172;FDP=399;FR=.;FRO=227;FSAF=81;FSAR=91;FSRF=110;FSRR=117;FWDB=0.00379873;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.557;QD=6.08746;RBI=0.00728522;REFB=-0.00781525;REVB=0.00621643;RO=286;SAF=103;SAR=110;SRF=136;SRR=150;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00831576;STB=0.507785;TYPE=snp;VARB=0.00942714;OID=.;OPOS=64038107;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:499:399:286:227:213:172:110:103:136:150:91:81:110:117 chr1 64121441 . G A 67.11 PASS AO=20;DP=54;FAO=20;FDP=54;FR=.;FRO=34;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=27;FWDB=-0.0123976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.945;QD=4.97116;RBI=0.0487471;REFB=-0.00932563;REVB=0.0471443;RO=34;SAF=7;SAR=13;SRF=7;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185083;STB=0.605965;TYPE=snp;VARB=0.0112997;OID=.;OPOS=64121441;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:54:54:34:34:20:20:13:7:7:27:13:7:7:27 chr1 64125544 . C T 194.95 PASS AO=73;DP=220;FAO=75;FDP=224;FR=.;FRO=149;FSAF=24;FSAR=51;FSRF=64;FSRR=85;FWDB=0.00772912;FXX=0.103996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1002;QD=3.48135;RBI=0.046762;REFB=-0.0319652;REVB=-0.0461188;RO=125;SAF=24;SAR=49;SRF=57;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150448;STB=0.578926;TYPE=snp;VARB=0.0281847;OID=.;OPOS=64125544;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:220:224:125:149:73:75:49:24:57:68:51:24:64:85 chr1 64515379 . C T 916.44 PASS AO=100;DP=105;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0484905;FXX=0.0373797;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.2586;QD=35.59;RBI=0.0786657;REFB=-0.0453762;REVB=0.0619433;RO=5;SAF=64;SAR=36;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.061454;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0176284;OID=.;OPOS=64515379;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:105:103:5:0:100:103:36:64:0:5:41:62:0:0 chr1 64608329 . G T 639.75 PASS AO=66;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0537705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.376;QD=38.194;RBI=0.0541917;REFB=0;REVB=-0.00674303;RO=0;SAF=13;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.1713e-05;OID=.;OPOS=64608329;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:66:67:0:0:66:67:53:13:0:0:54:13:0:0 chr1 64624824 . C T 345.63 PASS AO=89;DP=197;FAO=90;FDP=198;FR=.;FRO=108;FSAF=23;FSAR=67;FSRF=50;FSRR=58;FWDB=0.047446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.59;QD=6.98243;RBI=0.0482155;REFB=-0.0117527;REVB=-0.00857947;RO=106;SAF=22;SAR=67;SRF=48;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233483;STB=0.629766;TYPE=snp;VARB=0.0131098;OID=.;OPOS=64624824;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:198:106:108:89:90:67:22:48:58:67:23:50:58 chr1 64624842 . A G 323.67 PASS AO=82;DP=176;FAO=82;FDP=176;FR=.;FRO=94;FSAF=22;FSAR=60;FSRF=40;FSRR=54;FWDB=0.00456636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.882;QD=7.35602;RBI=0.00489914;REFB=-0.0055786;REVB=0.00177479;RO=94;SAF=22;SAR=60;SRF=40;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174734;STB=0.597277;TYPE=snp;VARB=0.00869183;OID=.;OPOS=64624842;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:176:94:94:82:82:60:22:40:54:60:22:40:54 chr1 64643277 . C T 383.51 PASS AO=103;DP=232;FAO=103;FDP=232;FR=.;FRO=129;FSAF=42;FSAR=61;FSRF=46;FSRR=83;FWDB=0.0139214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2528;QD=6.61225;RBI=0.0223673;REFB=-0.000237768;REVB=0.0175069;RO=128;SAF=42;SAR=61;SRF=46;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0506054;STB=0.529777;TYPE=snp;VARB=0.000775281;OID=.;OPOS=64643277;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:232:128:129:103:103:61:42:46:82:61:42:46:83 chr1 65016349 . A T 191.43 PASS AO=43;DP=85;FAO=43;FDP=85;FR=.;FRO=42;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=15;FSRR=27;FWDB=0.0283191;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.0563;QD=9.00836;RBI=0.0314244;REFB=-0.0347023;REVB=0.0136206;RO=42;SAF=17;SAR=26;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0359474;STB=0.519898;TYPE=snp;VARB=0.0226101;OID=.;OPOS=65016349;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:42:42:43:43:26:17:15:27:26:17:15:27 chr1 65113568 . T C 3410.9 PASS AO=352;DP=356;FAO=356;FDP=356;FR=.;FRO=0;FSAF=170;FSAR=186;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0951676;FXX=0.01385;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.7615;QD=38.3247;RBI=0.103495;REFB=0;REVB=0.0406732;RO=0;SAF=166;SAR=186;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.7124e-05;OID=.;OPOS=65113568;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:356:356:0:0:352:356:186:166:0:0:186:170:0:0 chr1 65158724 . C T 267.17 PASS AO=75;DP=176;FAO=75;FDP=176;FR=.;FRO=101;FSAF=39;FSAR=36;FSRF=55;FSRR=46;FWDB=-0.0123563;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.196;QD=6.07204;RBI=0.0143445;REFB=-0.0110979;REVB=-0.00728595;RO=98;SAF=39;SAR=36;SRF=53;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0211943;STB=0.514126;TYPE=snp;VARB=0.0133635;OID=.;OPOS=65158724;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:176:98:101:75:75:36:39:53:45:36:39:55:46 chr1 65311262 . G A 389.9 PASS AO=107;DP=244;FAO=107;FDP=244;FR=.;FRO=137;FSAF=48;FSAR=59;FSRF=61;FSRR=76;FWDB=0.0380376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.135;QD=6.39183;RBI=0.0380412;REFB=-0.00756622;REVB=-0.000518666;RO=136;SAF=48;SAR=59;SRF=60;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0075652;STB=0.501897;TYPE=snp;VARB=0.0113585;OID=.;OPOS=65311262;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:244:136:137:107:107:59:48:60:76:59:48:61:76 chr1 65591719 . GC G 592 PASS AO=72;DP=82;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0898557;FXX=0.0121936;HRUN=3;LEN=1;MLLD=18.9348;QD=29.2344;RBI=0.284018;REFB=0;REVB=-0.26943;RO=1;SAF=44;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0.374101;SSSB=-0.0106287;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.00253885;OID=.;OPOS=65591720;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:72:80:81:81:0:47:34:0:0:53:1:44:28:1:0 chr1 65849887 . G A 392.93 PASS AO=98;DP=209;FAO=99;FDP=211;FR=.;FRO=112;FSAF=52;FSAR=47;FSRF=34;FSRR=78;FWDB=-0.0106399;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.734;QD=7.4489;RBI=0.0318489;REFB=-0.000231176;REVB=0.0300191;RO=110;SAF=51;SAR=47;SRF=33;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210248;STB=0.616559;TYPE=snp;VARB=0.000361403;OID=.;OPOS=65849887;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:211:110:112:98:99:47:51:33:77:47:52:34:78 chr1 65858145 . G A 1735.64 PASS AO=177;DP=180;FAO=180;FDP=180;FR=.;FRO=0;FSAF=117;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00843994;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5959;QD=38.5697;RBI=0.0509415;REFB=0;REVB=0.0502375;RO=0;SAF=114;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000290917;OID=.;OPOS=65858145;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:180:180:0:0:177:180:63:114:0:0:63:117:0:0 chr1 65860687 . A C 2411.79 PASS AO=242;DP=248;FAO=262;FDP=262;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=165;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0466237;FXX=0.0187259;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.0682;QD=36.8212;RBI=0.0528607;REFB=-0.0919508;REVB=-0.0249096;RO=5;SAF=79;SAR=163;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.020602;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00369345;OID=.;OPOS=65860687;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:248:262:5:0:242:262:163:79:4:1:165:97:0:0 chr1 65879252 . A G 664.6 PASS AO=67;DP=67;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00714622;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9319;QD=38.5272;RBI=0.0159924;REFB=0;REVB=0.0143069;RO=0;SAF=31;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.39283e-05;OID=.;OPOS=65879252;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:67:69:0:0:67:69:36:31:0:0:37:32:0:0 chr1 65886398 . T C 210.68 PASS AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00332231;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.745;QD=36.6392;RBI=0.00596288;REFB=0;REVB=0.00495158;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.49515e-06;OID=.;OPOS=65886398;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:0:0:23:23:12:11:0:0:12:11:0:0 chr1 65886448 . T C 267.06 PASS AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00948722;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.909;QD=38.1517;RBI=0.0728659;REFB=0;REVB=-0.0722456;RO=0;SAF=11;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31638e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000638065;OID=.;OPOS=65886448;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:28:28:0:0:28:28:17:11:0:0:17:11:0:0 chr1 65897747 . A G 521.46 PASS AO=107;DP=193;FAO=108;FDP=193;FR=.;FRO=85;FSAF=20;FSAR=88;FSRF=15;FSRR=70;FWDB=0.0341949;FXX=0.00515437;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.3255;QD=10.8075;RBI=0.0349692;REFB=-0.0278839;REVB=-0.00731785;RO=85;SAF=20;SAR=87;SRF=15;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141129;STB=0.506409;TYPE=snp;VARB=0.015658;OID=.;OPOS=65897747;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:193:85:85:107:108:87:20:15:70:88:20:15:70 chr1 66074455 . C G 382.3 PASS AO=98;DP=213;FAO=98;FDP=212;FR=.;FRO=114;FSAF=56;FSAR=42;FSRF=62;FSRR=52;FWDB=-0.00628789;FXX=0.00469462;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.561;QD=7.21325;RBI=0.0154555;REFB=-0.00358504;REVB=0.0141186;RO=112;SAF=56;SAR=42;SRF=61;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0262591;STB=0.515065;TYPE=snp;VARB=0.00412809;OID=.;OPOS=66074455;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:213:212:112:114:98:98:42:56:61:51:42:56:62:52 chr1 66100979 . TA T,TT 326.04 PASS AO=26,36;DP=149;FAO=60,19;FDP=156;FR=.;FRO=77;FSAF=26,9;FSAR=34,10;FSRF=32;FSRR=45;FWDB=0.0118841,0.0120317;FXX=0.0249984;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=233.171,234.81;QD=8.36007;RBI=0.0120669,0.0122449;REFB=-0.00258715,-0.00150634;REVB=0.0020922,0.00227534;RO=77;SAF=11,16;SAR=15,20;SRF=33;SRR=44;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.006936,0.0188498;STB=0.51018,0.546913;TYPE=del,snp;VARB=-0.00657508,0.0087842;OID=.,.;OPOS=66100980,66100980;OREF=A,A;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:26,36:141:60,19:156:77:26,9:34,10:32:45:99:77:11,16:15,20:33:44 chr1 66713209 . TGG TG,T 699.01 PASS AO=83,27;DP=131;FAO=122,4;FDP=130;FR=.;FRO=4;FSAF=65,0;FSAR=57,4;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.255268,0.126443;FXX=0.00763301;HRUN=3,3;LEN=1,2;MLLD=13.8878,12.3162;QD=21.5079;RBI=0.396687,0.199028;REFB=0.0352456,0.0222667;REVB=-0.303643,-0.153702;RO=17;SAF=51,0;SAR=32,27;SRF=13;SRR=4;SSEN=0.754237,0.754237;SSEP=0,0;SSSB=-0.051321,-0.872753;STB=0.516946,0.5;TYPE=del,del;VARB=-0.0140682,0.0562624;OID=.,.;OPOS=66713210,66713210;OREF=G,GG;OALT=-,-;OMAPALT=TG,T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:83,27:129:122,4:130:4:65,0:57,4:0:4:36:17:51,0:32,27:13:4 chr1 66831370 . G A 2641.16 PASS AO=264;DP=265;FAO=278;FDP=278;FR=.;FRO=0;FSAF=141;FSAR=137;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0404462;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.587;QD=38.0023;RBI=0.0415121;REFB=0;REVB=0.00934691;RO=0;SAF=140;SAR=124;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.88988e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000341593;OID=.;OPOS=66831370;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:265:278:0:0:264:278:124:140:0:0:137:141:0:0 chr1 67266756 . T A 1177.95 PASS AO=123;DP=125;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00959714;FXX=0.0159987;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.8934;QD=38.3073;RBI=0.0100195;REFB=0;REVB=0.00287842;RO=0;SAF=98;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.93827e-05;OID=.;OPOS=67266756;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:125:123:0:0:123:123:25:98:0:0:25:98:0:0 chr1 67288045 . C T 695.77 PASS AO=112;DP=164;FAO=113;FDP=162;FR=.;FRO=49;FSAF=42;FSAR=71;FSRF=49;FSRR=0;FWDB=0.0196016;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=142.591;QD=17.1796;RBI=0.0209265;REFB=-0.0424947;REVB=0.00732768;RO=0;SAF=42;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.56796e-08;STB=0.684179;TYPE=snp;VARB=0.00373688;OID=.;OPOS=67288045;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:162:0:49:112:113:70:42:0:0:71:42:49:0 chr1 67390416 . G C 729.44 PASS AO=76;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0387864;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.241;QD=37.8932;RBI=0.0419998;REFB=0;REVB=0.0161121;RO=0;SAF=35;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.67506e-06;OID=.;OPOS=67390416;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:77:77:0:0:76:77:41:35:0:0:42:35:0:0 chr1 67390468 . C G 626.7 PASS AO=66;DP=67;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00916639;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.166;QD=36.8648;RBI=0.0119009;REFB=-0.127954;REVB=0.00759006;RO=1;SAF=26;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.011667;STB=0.506171;TYPE=snp;VARB=0.000325272;OID=.;OPOS=67390468;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:67:68:1:1:66:67:40:26:0:1:40:27:0:1 chr1 67558739 . C T 748.17 PASS AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00363398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.4585;QD=38.3679;RBI=0.0306662;REFB=0;REVB=0.0304501;RO=0;SAF=42;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43944e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000350936;OID=.;OPOS=67558739;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:78:78:0:0:78:78:36:42:0:0:36:42:0:0 chr1 67558756 . C T 146.88 PASS AO=41;DP=98;FAO=41;FDP=99;FR=.;FRO=58;FSAF=27;FSAR=14;FSRF=29;FSRR=29;FWDB=0.0221074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.167;QD=5.93458;RBI=0.0227652;REFB=-0.0329966;REVB=-0.00543299;RO=57;SAF=27;SAR=14;SRF=28;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178934;STB=0.596867;TYPE=snp;VARB=0.0448705;OID=.;OPOS=67558756;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:99:57:58:41:41:14:27:28:29:14:27:29:29 chr1 67558763 . A G 193.33 PASS AO=49;DP=109;FAO=49;FDP=108;FR=.;FRO=59;FSAF=33;FSAR=16;FSRF=29;FSRR=30;FWDB=0.00287409;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.341;QD=7.16053;RBI=0.0324496;REFB=-0.0192425;REVB=-0.032322;RO=57;SAF=33;SAR=16;SRF=28;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184914;STB=0.604737;TYPE=snp;VARB=0.0132396;OID=.;OPOS=67558763;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:108:57:59:49:49:16:33:28:29:16:33:29:30 chr1 67560956 . C T 3396.33 PASS AO=356;DP=358;FAO=355;FDP=355;FR=.;FRO=0;FSAF=200;FSAR=155;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0322439;FXX=0.00837965;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.342;QD=38.2685;RBI=0.0463356;REFB=0.0293231;REVB=-0.0332764;RO=1;SAF=201;SAR=155;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00306843;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000145299;OID=.;OPOS=67560956;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:358:355:1:0:356:355:155:201:0:1:155:200:0:0 chr1 67561090 . T C 482.67 PASS AO=115;DP=233;FAO=115;FDP=233;FR=.;FRO=118;FSAF=51;FSAR=64;FSRF=50;FSRR=68;FWDB=0.0208451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.9666;QD=8.28618;RBI=0.021626;REFB=0.00204085;REVB=-0.00575895;RO=117;SAF=51;SAR=64;SRF=50;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0150263;STB=0.510153;TYPE=snp;VARB=-0.00205137;OID=.;OPOS=67561090;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:233:233:117:118:115:115:64:51:50:67:64:51:50:68 chr1 67568351 . C T 347.41 PASS AO=68;DP=117;FAO=68;FDP=117;FR=.;FRO=49;FSAF=26;FSAR=42;FSRF=7;FSRR=42;FWDB=0.00777348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.501;QD=11.8774;RBI=0.00777841;REFB=-0.00929168;REVB=-0.000276777;RO=49;SAF=26;SAR=42;SRF=7;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206706;STB=0.611735;TYPE=snp;VARB=0.00768251;OID=.;OPOS=67568351;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:49:49:68:68:42:26:7:42:42:26:7:42 chr1 67579386 . A G 659.72 PASS AO=70;DP=72;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105545;FXX=0.0277739;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.7101;QD=37.6984;RBI=0.0277632;REFB=0;REVB=0.0256787;RO=0;SAF=32;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.39413e-05;OID=.;OPOS=67579386;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:72:70:0:0:70:70:38:32:0:0:38:32:0:0 chr1 67579395 . C T 134 PASS AO=34;DP=76;FAO=34;FDP=76;FR=.;FRO=42;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=0.0135518;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.305;QD=7.0528;RBI=0.0368862;REFB=-0.00658693;REVB=-0.0343065;RO=41;SAF=17;SAR=17;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0118626;STB=0.51315;TYPE=snp;VARB=0.0097212;OID=.;OPOS=67579395;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:41:42:34:34:17:17:20:21:17:17:20:22 chr1 67685387 . T C 1030.82 PASS AO=108;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0030471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.654;QD=37.1465;RBI=0.0265299;REFB=-0.112108;REVB=0.0263543;RO=2;SAF=50;SAR=58;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00128492;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000307382;OID=.;OPOS=67685387;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:111:111:2:0:108:111:58:50:1:1:60:51:0:0 chr1 67733346 . G A 907.45 PASS AO=95;DP=96;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000519025;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.589;QD=38.2085;RBI=0.00538226;REFB=0;REVB=-0.00535717;RO=0;SAF=39;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.42957e-05;OID=.;OPOS=67733346;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:96:95:0:0:95:95:56:39:0:0:56:39:0:0 chr1 67795319 . T C 2263.99 PASS AO=239;DP=239;FAO=238;FDP=238;FR=.;FRO=0;FSAF=123;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0278169;FXX=0.00418393;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.415;QD=38.0502;RBI=0.0418092;REFB=-0.06753;REVB=0.0312126;RO=0;SAF=123;SAR=116;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.36448e-05;OID=.;OPOS=67795319;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:239:238:0:0:239:238:116:123:0:0:115:123:0:0 chr1 67852335 . G A 952.08 PASS AO=100;DP=101;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122679;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.975;QD=38.0834;RBI=0.0460425;REFB=0;REVB=0.044378;RO=0;SAF=55;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.70143e-05;OID=.;OPOS=67852335;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:101:100:0:0:100:100:45:55:0:0:45:55:0:0 chr1 67861520 . C A 195.15 PASS AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0704314;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=109.468;QD=37.1716;RBI=0.0704684;REFB=0;REVB=-0.00228458;RO=0;SAF=14;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0007433;OID=.;OPOS=67861520;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:21:21:0:0:21:21:7:14:0:0:7:14:0:0 chr1 68006815 . T C 651.34 PASS AO=72;DP=74;FAO=72;FDP=74;FR=.;FRO=2;FSAF=58;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0419907;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.9144;QD=35.2073;RBI=0.0420316;REFB=-0.0433191;REVB=0.00185471;RO=2;SAF=58;SAR=14;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0160305;STB=0.508472;TYPE=snp;VARB=0.000708944;OID=.;OPOS=68006815;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:74:74:2:2:72:72:14:58:2:0:14:58:2:0 chr1 68462247 . A G 1039.87 PASS AO=107;DP=110;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0246656;FXX=0.0181802;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.853;QD=38.5138;RBI=0.0250504;REFB=0;REVB=-0.00437374;RO=0;SAF=65;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000276722;OID=.;OPOS=68462247;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:110:108:0:0:107:108:42:65:0:0:43:65:0:0 chr1 68462394 . A C 268.24 PASS AO=70;DP=155;FAO=70;FDP=155;FR=.;FRO=85;FSAF=43;FSAR=27;FSRF=34;FSRR=51;FWDB=0.0258968;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.15;QD=6.92224;RBI=0.0269578;REFB=-0.00867435;REVB=-0.00748861;RO=85;SAF=43;SAR=27;SRF=34;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211012;STB=0.617305;TYPE=snp;VARB=0.0124552;OID=.;OPOS=68462394;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:85:85:70:70:27:43:34:51:27:43:34:51 chr1 68512994 . AG A 232.04 PASS AO=32;DP=44;FAO=39;FDP=41;FR=.;FRO=2;FSAF=11;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.212463;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=15.8327;QD=22.6378;RBI=0.233432;REFB=-0.044732;REVB=0.0966954;RO=4;SAF=8;SAR=24;SRF=1;SRR=3;SSEN=0.492355;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.51297;TYPE=del;VARB=0.0217162;OID=.;OPOS=68512995;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:32:41:39:41:2:11:28:1:1:12:4:8:24:1:3 chr1 68591253 . C T 147.79 PASS AO=55;DP=161;FAO=55;FDP=162;FR=.;FRO=107;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=56;FSRR=51;FWDB=0.0148471;FXX=0.00613459;HRUN=3;LEN=1;MLLD=128.445;QD=3.64901;RBI=0.0205355;REFB=-0.0125102;REVB=-0.014187;RO=105;SAF=28;SAR=27;SRF=55;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0168541;STB=0.509431;TYPE=snp;VARB=0.0236628;OID=.;OPOS=68591253;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:162:105:107:55:55:27:28:55:50:27:28:56:51 chr1 68603586 . C T 290.96 PASS AO=77;DP=175;FAO=78;FDP=176;FR=.;FRO=98;FSAF=24;FSAR=54;FSRF=32;FSRR=66;FWDB=0.0211523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.207;QD=6.61264;RBI=0.0531136;REFB=0.00231179;REVB=0.04872;RO=98;SAF=23;SAR=54;SRF=32;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0328552;STB=0.512192;TYPE=snp;VARB=-0.00247271;OID=.;OPOS=68603586;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:176:98:98:77:78:54:23:32:66:54:24:32:66 chr1 68624878 . C T 393.75 PASS AO=107;DP=243;FAO=107;FDP=242;FR=.;FRO=135;FSAF=53;FSAR=54;FSRF=74;FSRR=61;FWDB=-0.055889;FXX=0.00411506;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.6897;QD=6.50821;RBI=0.0596725;REFB=-0.0173949;REVB=0.02091;RO=134;SAF=53;SAR=54;SRF=74;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0570042;STB=0.529447;TYPE=snp;VARB=0.0168011;OID=.;OPOS=68624878;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:243:242:134:135:107:107:54:53:74:60:54:53:74:61 chr1 68940883 . T TTA 735.49 PASS AO=232;DP=541;FAO=186;FDP=390;FR=.;FRO=204;FSAF=84;FSAR=102;FSRF=107;FSRR=97;FWDB=0.0212995;FXX=0.0249994;HRUN=3;LEN=2;MLLD=202.612;QD=7.54351;RBI=0.0213129;REFB=-0.00475063;REVB=-0.000753296;RO=295;SAF=116;SAR=116;SRF=160;SRR=135;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.04287;STB=0.538202;TYPE=ins;VARB=0.00499186;OID=.;OPOS=68940884;OREF=-;OALT=TA;OMAPALT=TTA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:232:541:186:390:204:84:102:107:97:99:295:116:116:160:135 chr1 68940982 . T C 834.19 PASS AO=251;DP=504;FAO=198;FDP=397;FR=.;FRO=199;FSAF=117;FSAR=81;FSRF=112;FSRR=87;FWDB=0.013236;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.294;QD=8.40499;RBI=0.0202673;REFB=-0.0257263;REVB=0.0153483;RO=243;SAF=145;SAR=106;SRF=140;SRR=103;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0014366;STB=0.514486;TYPE=snp;VARB=0.0214722;OID=.;OPOS=68940982;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:504:397:243:199:251:198:106:145:140:103:81:117:112:87 chr1 68948280 . A C 306.41 PASS AO=72;DP=149;FAO=73;FDP=149;FR=.;FRO=76;FSAF=46;FSAR=27;FSRF=41;FSRR=35;FWDB=-0.00817956;FXX=0.00666622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.579;QD=8.22588;RBI=0.0127879;REFB=-0.015189;REVB=0.00982978;RO=74;SAF=45;SAR=27;SRF=40;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0807995;STB=0.548343;TYPE=snp;VARB=0.0156789;OID=.;OPOS=68948280;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:74:76:72:73:27:45:40:34:27:46:41:35 chr1 68952604 . C T 14.04 PASS AO=16;DP=50;FAO=9;FDP=50;FR=.;FRO=41;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=28;FWDB=-0.0503284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=36.8675;QD=1.12316;RBI=0.10755;REFB=-0.0605794;REVB=-0.0950475;RO=34;SAF=10;SAR=6;SRF=8;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.425073;STB=0.689279;TYPE=snp;VARB=0.294658;OID=.;OPOS=68952604;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:50:50:34:41:16:9:6:10:8:26:4:5:13:28 chr1 68960349 . T C 131.05 PASS AO=58;DP=131;FAO=26;FDP=47;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.0163173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.455;QD=11.1527;RBI=0.0163178;REFB=-0.0356879;REVB=0.000132182;RO=73;SAF=16;SAR=42;SRF=17;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0553486;STB=0.506347;TYPE=snp;VARB=0.027786;OID=.;OPOS=68960349;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:131:47:73:21:58:26:42:16:17:56:17:9:7:14 chr1 70034372 . G A 63.59 PASS AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=-0.00102382;FXX=0.208247;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.77;QD=13.3879;RBI=0.0084699;REFB=-0.0195585;REVB=-0.00840779;RO=8;SAF=1;SAR=10;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.257513;STB=0.642659;TYPE=snp;VARB=0.00705814;OID=.;OPOS=70034372;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:24:19:8:8:11:11:10:1:0:8:10:1:0:8 chr1 70345344 . A G 226.01 PASS AO=37;DP=87;FAO=48;FDP=90;FR=.;FRO=42;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=0.00788564;FXX=0.0217368;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.3109;QD=10.0447;RBI=0.0430328;REFB=-0.0337321;REVB=-0.0423041;RO=31;SAF=19;SAR=18;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0775862;STB=0.505723;TYPE=snp;VARB=0.0227487;OID=.;OPOS=70345344;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:90:31:42:37:48:18:19:13:18:28:20:17:25 chr1 70611346 . CA C,CG 1176.21 PASS AO=53,72;DP=129;FAO=14,113;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=0,62;FSAR=14,51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00480132,-0.0116719;FXX=0.0155027;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=172.483,187.132;QD=37.0459;RBI=0.0243562,0.101012;REFB=0,0;REVB=0.0238782,0.100335;RO=2;SAF=0,60;SAR=53,12;SRF=0;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0.0725217;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0402166,0.000667971;OID=.,.;OPOS=70611347,70611347;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:53,72:127:14,113:127:0:0,62:14,51:0:0:3:2:0,60:53,12:0:2 chr1 70646053 . A G 143.73 PASS AO=27;DP=71;FAO=38;FDP=81;FR=.;FRO=43;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=0.0364424;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.2597;QD=7.09757;RBI=0.0374285;REFB=-0.0231791;REVB=-0.0085346;RO=35;SAF=19;SAR=8;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.257919;STB=0.540962;TYPE=snp;VARB=0.022977;OID=.;OPOS=70646053;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:81:35:43:27:38:8:19:16:19:14:24:24:19 chr1 70831841 . C T 405.89 PASS AO=99;DP=204;FAO=102;FDP=209;FR=.;FRO=107;FSAF=49;FSAR=53;FSRF=59;FSRR=48;FWDB=0.0245737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.1561;QD=7.76813;RBI=0.0322877;REFB=-0.0278856;REVB=-0.0209435;RO=104;SAF=46;SAR=53;SRF=59;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0952982;STB=0.536299;TYPE=snp;VARB=0.0294862;OID=.;OPOS=70831841;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:209:104:107:99:102:53:46:59:45:53:49:59:48 chr1 71331498 . A G 423.59 PASS AO=47;DP=49;FAO=51;FDP=55;FR=.;FRO=4;FSAF=47;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.00301445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.848;QD=30.8063;RBI=0.0254722;REFB=-0.0586243;REVB=0.0252932;RO=1;SAF=44;SAR=3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133398;STB=0.666586;TYPE=snp;VARB=0.00288392;OID=.;OPOS=71331498;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:49:55:1:4:47:51:3:44:0:1:4:47:0:4 chr1 71419499 . C T 965.61 PASS AO=96;DP=97;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00858631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.213;QD=37.4993;RBI=0.0841563;REFB=0;REVB=0.0837171;RO=0;SAF=39;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.70333e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000943343;OID=.;OPOS=71419499;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:97:103:0:0:96:103:57:39:0:0:59:44:0:0 chr1 71536574 . G C 437.43 PASS AO=117;DP=265;FAO=120;FDP=272;FR=.;FRO=152;FSAF=56;FSAR=64;FSRF=70;FSRR=82;FWDB=-0.0156713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.652;QD=6.43283;RBI=0.0161616;REFB=-0.00368;REVB=0.00395043;RO=147;SAF=55;SAR=62;SRF=69;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000702792;STB=0.503448;TYPE=snp;VARB=0.00378116;OID=.;OPOS=71536574;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:265:272:147:152:117:120:62:55:69:78:64:56:70:82 chr1 72058552 . G A 1632.13 PASS AO=170;DP=176;FAO=174;FDP=174;FR=.;FRO=0;FSAF=123;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011586;FXX=0.011363;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0436;QD=37.5202;RBI=0.0884577;REFB=-0.0526262;REVB=-0.0876956;RO=6;SAF=119;SAR=51;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0233895;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000105702;OID=.;OPOS=72058552;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:176:174:6:0:170:174:51:119:6:0:51:123:0:0 chr1 74575182 . C T 2682.92 PASS AO=275;DP=275;FAO=281;FDP=281;FR=.;FRO=0;FSAF=109;FSAR=172;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186216;FXX=0.00354597;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.53;QD=38.191;RBI=0.031118;REFB=0;REVB=0.0249312;RO=0;SAF=107;SAR=168;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.7704e-05;OID=.;OPOS=74575182;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:275:281:0:0:275:281:168:107:0:0:172:109:0:0 chr1 74665493 . G A 1107.88 PASS AO=115;DP=115;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0290582;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.539;QD=38.2029;RBI=0.0339303;REFB=0;REVB=0.0175182;RO=0;SAF=44;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.35954e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.65403e-05;OID=.;OPOS=74665493;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:115:116:0:0:115:116:71:44:0:0:72:44:0:0 chr1 74671519 . A G 1300.4 PASS AO=133;DP=134;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00906899;FXX=0.00729874;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.071;QD=38.247;RBI=0.0122462;REFB=0;REVB=0.00822934;RO=0;SAF=68;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.76136e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.12718e-06;OID=.;OPOS=74671519;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:134:136:0:0:133:136:65:68:0:0:65:71:0:0 chr1 74941210 . C T 346.38 PASS AO=86;DP=182;FAO=86;FDP=182;FR=.;FRO=96;FSAF=19;FSAR=67;FSRF=7;FSRR=89;FWDB=-0.013336;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.364;QD=7.61274;RBI=0.0138122;REFB=-0.0128299;REVB=-0.00359567;RO=96;SAF=19;SAR=67;SRF=7;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.239083;STB=0.62981;TYPE=snp;VARB=0.0147337;OID=.;OPOS=74941210;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:182:96:96:86:86:67:19:7:89:67:19:7:89 chr1 74941293 . G A 261.86 PASS AO=70;DP=169;FAO=73;FDP=171;FR=.;FRO=98;FSAF=16;FSAR=57;FSRF=16;FSRR=82;FWDB=0.0550191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.102;QD=6.12533;RBI=0.0550957;REFB=0.00467707;REVB=-0.00290319;RO=97;SAF=14;SAR=56;SRF=16;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0593238;STB=0.549394;TYPE=snp;VARB=-0.00579298;OID=.;OPOS=74941293;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:171:97:98:70:73:56:14:16:81:57:16:16:82 chr1 74946373 . C T 211.75 PASS AO=51;DP=95;FAO=47;FDP=91;FR=.;FRO=44;FSAF=15;FSAR=32;FSRF=16;FSRR=28;FWDB=-0.0163259;FXX=0.0520779;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.98;QD=9.30747;RBI=0.0421882;REFB=-0.00551132;REVB=0.0389013;RO=43;SAF=20;SAR=31;SRF=16;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0175871;STB=0.524302;TYPE=snp;VARB=0.00478188;OID=.;OPOS=74946373;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:91:43:44:51:47:31:20:16:27:32:15:16:28 chr1 75035240 . C T 365.62 PASS AO=73;DP=128;FAO=73;FDP=128;FR=.;FRO=55;FSAF=35;FSAR=38;FSRF=24;FSRR=31;FWDB=-0.012837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.735;QD=11.4256;RBI=0.0167961;REFB=0.000480398;REVB=-0.0108315;RO=54;SAF=35;SAR=38;SRF=24;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0273907;STB=0.518569;TYPE=snp;VARB=-0.000373548;OID=.;OPOS=75035240;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:54:55:73:73:38:35:24:30:38:35:24:31 chr1 75036812 . C T 1493.86 PASS AO=160;DP=162;FAO=160;FDP=160;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0024352;FXX=0.0123449;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.576;QD=37.3466;RBI=0.00419573;REFB=-0.0946081;REVB=-0.00341672;RO=1;SAF=59;SAR=101;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00468807;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.29775e-05;OID=.;OPOS=75036812;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:162:160:1:0:160:160:101:59:0:1:101:59:0:0 chr1 75037845 . A G 96.68 PASS AO=24;DP=54;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=6;FSRR=24;FWDB=-0.00382416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.4735;QD=7.16157;RBI=0.0039289;REFB=-0.0279683;REVB=0.000901136;RO=28;SAF=6;SAR=18;SRF=6;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0466582;STB=0.538431;TYPE=snp;VARB=0.0109915;OID=.;OPOS=75037845;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:54:54:28:30:24:24:18:6:6:22:18:6:6:24 chr1 75038228 . A C 80.15 PASS AO=32;DP=103;FAO=32;FDP=103;FR=.;FRO=71;FSAF=1;FSAR=31;FSRF=5;FSRR=66;FWDB=-0.0596807;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=99.3573;QD=3.11254;RBI=0.0723052;REFB=-0.0133751;REVB=-0.0408198;RO=71;SAF=1;SAR=31;SRF=5;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.257905;STB=0.657118;TYPE=snp;VARB=0.0280673;OID=.;OPOS=75038228;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:103:103:71:71:32:32:31:1:5:66:31:1:5:66 chr1 75097426 . G C 180.71 PASS AO=58;DP=153;FAO=58;FDP=153;FR=.;FRO=95;FSAF=37;FSAR=21;FSRF=71;FSRR=24;FWDB=-0.0243578;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.553;QD=4.72434;RBI=0.0252324;REFB=-0.0167645;REVB=0.00658569;RO=94;SAF=37;SAR=21;SRF=70;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132229;STB=0.576634;TYPE=snp;VARB=0.0258748;OID=.;OPOS=75097426;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:153:94:95:58:58:21:37:70:24:21:37:71:24 chr1 75172001 . T A 409.01 PASS AO=86;DP=252;FAO=111;FDP=251;FR=.;FRO=140;FSAF=71;FSAR=40;FSRF=71;FSRR=69;FWDB=-0.0171681;FXX=0.00790483;HRUN=5;LEN=1;MLLD=164.414;QD=6.51811;RBI=0.0197449;REFB=0.00384622;REVB=-0.00975273;RO=107;SAF=46;SAR=40;SRF=51;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0581247;STB=0.576705;TYPE=snp;VARB=-0.00434993;OID=.;OPOS=75172001;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:251:107:140:86:111:40:46:51:56:40:71:71:69 chr1 75175886 . T C 341.68 PASS AO=70;DP=127;FAO=69;FDP=123;FR=.;FRO=54;FSAF=32;FSAR=37;FSRF=28;FSRR=26;FWDB=0.00542048;FXX=0.0314936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.381;QD=11.1114;RBI=0.00620566;REFB=-0.00472327;REVB=-0.00302136;RO=53;SAF=33;SAR=37;SRF=28;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0449232;STB=0.524072;TYPE=snp;VARB=0.00342582;OID=.;OPOS=75175886;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:123:53:54:70:69:37:33:28:25:37:32:28:26 chr1 75190452 . C T 865.43 PASS AO=96;DP=100;FAO=96;FDP=99;FR=.;FRO=3;FSAF=53;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0165326;FXX=0.0388312;HRUN=3;LEN=1;MLLD=112.986;QD=34.9669;RBI=0.0391152;REFB=-0.0870624;REVB=-0.0354496;RO=3;SAF=53;SAR=43;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126818;STB=0.506691;TYPE=snp;VARB=-0.000158588;OID=.;OPOS=75190452;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:100:99:3:3:96:96:43:53:1:2:43:53:1:2 chr1 75214441 . A G 161.25 PASS AO=38;DP=80;FAO=38;FDP=80;FR=.;FRO=42;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=0.00271002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.13;QD=8.06257;RBI=0.00423839;REFB=-0.00869497;REVB=-0.00325879;RO=40;SAF=13;SAR=25;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129296;STB=0.561764;TYPE=snp;VARB=0.00863596;OID=.;OPOS=75214441;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:40:42:38:38:25:13:19:21:25:13:19:23 chr1 75596388 . C G 192.74 PASS AO=67;DP=186;FAO=67;FDP=186;FR=.;FRO=119;FSAF=34;FSAR=33;FSRF=62;FSRR=57;FWDB=-0.0487665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.9506;QD=4.14485;RBI=0.0579953;REFB=-0.0317207;REVB=0.0313893;RO=118;SAF=34;SAR=33;SRF=62;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0201524;STB=0.508668;TYPE=snp;VARB=0.0547926;OID=.;OPOS=75596388;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:186:118:119:67:67:33:34:62:56:33:34:62:57 chr1 75681511 . T C 241.11 PASS AO=79;DP=208;FAO=79;FDP=209;FR=.;FRO=130;FSAF=32;FSAR=47;FSRF=52;FSRR=78;FWDB=0.0247028;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.3004;QD=4.61451;RBI=0.0248876;REFB=-0.0166348;REVB=0.00302684;RO=128;SAF=32;SAR=47;SRF=51;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00753985;STB=0.50327;TYPE=snp;VARB=0.0195271;OID=.;OPOS=75681511;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:209:128:130:79:79:47:32:51:77:47:32:52:78 chr1 75716925 . C T 2305.38 PASS AO=241;DP=242;FAO=241;FDP=241;FR=.;FRO=0;FSAF=108;FSAR=133;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0848916;FXX=0.00413206;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.935;QD=38.2636;RBI=0.085583;REFB=0;REVB=-0.0108569;RO=0;SAF=108;SAR=133;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000111113;OID=.;OPOS=75716925;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:242:241:0:0:241:241:133:108:0:0:133:108:0:0 chr1 76143458 . T C 43.19 PASS AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0114762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.783;QD=11.5178;RBI=0.0175418;REFB=0.0314796;REVB=-0.0132669;RO=7;SAF=7;SAR=1;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.45905;STB=0.776953;TYPE=snp;VARB=-0.0455249;OID=.;OPOS=76143458;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:15:15:7:7:8:8:1:7:3:4:1:7:3:4 chr1 76143505 . T C 101.96 PASS AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0563766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=313.878;QD=37.0753;RBI=0.0576634;REFB=0;REVB=0.0121139;RO=0;SAF=6;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000609574;OID=.;OPOS=76143505;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:11:11:5:6:0:0:5:6:0:0 chr1 76198785 . G A 2572.67 PASS AO=265;DP=281;FAO=266;FDP=266;FR=.;FRO=0;FSAF=129;FSAR=137;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000856589;FXX=0.107379;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.873;QD=38.6868;RBI=0.0055135;REFB=0;REVB=-0.00544655;RO=0;SAF=128;SAR=137;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000128391;OID=.;OPOS=76198785;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:281:266:0:0:265:266:137:128:0:0:137:129:0:0 chr1 76227022 . A G 1725.44 PASS AO=165;DP=166;FAO=179;FDP=179;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00818614;FXX=0.00555525;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.158;QD=38.5573;RBI=0.0236452;REFB=0;REVB=0.0221829;RO=0;SAF=83;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.24858e-06;OID=.;OPOS=76227022;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:166:179:0:0:165:179:82:83:0:0:91:88:0:0 chr1 76255228 . G A 129.11 PASS AO=35;DP=105;FAO=41;FDP=109;FR=.;FRO=68;FSAF=9;FSAR=32;FSRF=37;FSRR=31;FWDB=-0.00156833;FXX=0.0267833;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.886;QD=4.73799;RBI=0.0131871;REFB=-0.0126647;REVB=0.0130935;RO=67;SAF=3;SAR=32;SRF=36;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.623131;STB=0.721807;TYPE=snp;VARB=0.0214778;OID=.;OPOS=76255228;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:109:67:68:35:41:32:3:36:31:32:9:37:31 chr1 76257892 . A T 1844.91 PASS AO=200;DP=204;FAO=200;FDP=204;FR=.;FRO=4;FSAF=102;FSAR=98;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.000912414;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.944;QD=36.1747;RBI=0.00114765;REFB=0.00322665;REVB=0.000696132;RO=3;SAF=102;SAR=98;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00497339;STB=0.500196;TYPE=snp;VARB=-0.00010275;OID=.;OPOS=76257892;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:204:204:3:4:200:200:98:102:1:2:98:102:2:2 chr1 76344705 . T C 117.17 PASS AO=47;DP=147;FAO=47;FDP=147;FR=.;FRO=100;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=41;FSRR=59;FWDB=0.00144073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.531;QD=3.18823;RBI=0.00510945;REFB=0.00371;REVB=-0.00490212;RO=100;SAF=24;SAR=23;SRF=41;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118051;STB=0.568265;TYPE=snp;VARB=-0.00281564;OID=.;OPOS=76344705;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:147:100:100:47:47:23:24:41:59:23:24:41:59 chr1 76344711 . A T 137.73 PASS AO=49;DP=145;FAO=50;FDP=145;FR=.;FRO=95;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=41;FSRR=54;FWDB=0.0170561;FXX=0.00684885;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.461;QD=3.79954;RBI=0.0182062;REFB=-0.00218611;REVB=0.00636829;RO=95;SAF=24;SAR=25;SRF=41;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0669794;STB=0.531843;TYPE=snp;VARB=0.00680263;OID=.;OPOS=76344711;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:95:95:49:50:25:24:41:54:26:24:41:54 chr1 76397972 . C T 27.18 PASS AO=9;DP=31;FAO=9;FDP=31;FR=.;FRO=22;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.0297382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.278;QD=3.50658;RBI=0.030066;REFB=-0.040339;REVB=-0.00442758;RO=22;SAF=3;SAR=6;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195702;STB=0.621944;TYPE=snp;VARB=0.0269797;OID=.;OPOS=76397972;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:31:31:22:22:9:9:6:3:11:11:6:3:11:11 chr1 77093180 . C A 81.57 PASS AO=22;DP=55;FAO=22;FDP=54;FR=.;FRO=32;FSAF=3;FSAR=19;FSRF=8;FSRR=24;FWDB=-0.0205945;FXX=0.0181785;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.5;QD=6.04254;RBI=0.0206346;REFB=-0.0252286;REVB=-0.00128614;RO=28;SAF=3;SAR=19;SRF=7;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194919;STB=0.61822;TYPE=snp;VARB=0.0348424;OID=.;OPOS=77093180;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:55:54:28:32:22:22:19:3:7:21:19:3:8:24 chr1 77095355 . A G 481.67 PASS AO=118;DP=244;FAO=118;FDP=246;FR=.;FRO=128;FSAF=65;FSAR=53;FSRF=66;FSRR=62;FWDB=0.00837383;FXX=0.00806419;HRUN=3;LEN=1;MLLD=97.8431;QD=7.83204;RBI=0.00887371;REFB=0.00164077;REVB=-0.00293627;RO=126;SAF=65;SAR=53;SRF=64;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0404812;STB=0.518446;TYPE=snp;VARB=-0.00332422;OID=.;OPOS=77095355;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:246:126:128:118:118:53:65:64:62:53:65:66:62 chr1 77555481 . C T 114.69 PASS AO=37;DP=101;FAO=37;FDP=101;FR=.;FRO=64;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=39;FSRR=25;FWDB=0.0121438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.069;QD=4.54233;RBI=0.0148557;REFB=-0.014671;REVB=-0.0085569;RO=64;SAF=15;SAR=22;SRF=39;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223143;STB=0.627508;TYPE=snp;VARB=0.0218103;OID=.;OPOS=77555481;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:64:64:37:37:22:15:39:25:22:15:39:25 chr1 77558057 . G C 90.75 PASS AO=26;DP=64;FAO=26;FDP=66;FR=.;FRO=40;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=27;FWDB=0.0104501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.8501;QD=5.50022;RBI=0.0321059;REFB=-0.0383814;REVB=0.0303576;RO=38;SAF=10;SAR=16;SRF=11;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107951;STB=0.538818;TYPE=snp;VARB=0.0286364;OID=.;OPOS=77558057;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:64:66:38:40:26:26:16:10:11:27:16:10:13:27 chr1 77634948 . G A 1256.42 PASS AO=130;DP=134;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0194133;FXX=0.0149243;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.247;QD=38.0734;RBI=0.0201396;REFB=0;REVB=0.00535958;RO=0;SAF=81;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000435527;OID=.;OPOS=77634948;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:134:132:0:0:130:132:49:81:0:0:51:81:0:0 chr1 77685042 . T C 310.86 PASS AO=79;DP=171;FAO=79;FDP=171;FR=.;FRO=92;FSAF=62;FSAR=17;FSRF=53;FSRR=39;FWDB=0.000444243;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.443;QD=7.2715;RBI=0.0630963;REFB=-0.0112859;REVB=-0.0630948;RO=92;SAF=62;SAR=17;SRF=53;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249751;STB=0.639725;TYPE=snp;VARB=0.0100517;OID=.;OPOS=77685042;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:171:92:92:79:79:17:62:53:39:17:62:53:39 chr1 77763542 . G A 2201.99 PASS AO=209;DP=220;FAO=229;FDP=229;FR=.;FRO=0;FSAF=116;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0428798;FXX=0.00434764;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.066;QD=38.4627;RBI=0.0604159;REFB=0;REVB=0.0425606;RO=0;SAF=106;SAR=103;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.54336e-05;OID=.;OPOS=77763542;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:220:229:0:0:209:229:103:106:0:0:113:116:0:0 chr1 78024284 . T C 1024.69 PASS AO=107;DP=107;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00388917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.87;QD=38.306;RBI=0.00485785;REFB=0;REVB=-0.00291085;RO=0;SAF=54;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.66183e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.97345e-07;OID=.;OPOS=78024284;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:107:107:0:0:107:107:53:54:0:0:53:54:0:0 chr1 78024345 . C CTAT 933.88 PASS AO=119;DP=152;FAO=125;FDP=150;FR=.;FRO=25;FSAF=42;FSAR=83;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=0.0131071;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=232.844;QD=24.9035;RBI=0.0146916;REFB=-0.0433287;REVB=0.00663681;RO=27;SAF=41;SAR=78;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0925355;STB=0.554727;TYPE=ins;VARB=0.0101378;OID=.;OPOS=78024346;OREF=-;OALT=TAT;OMAPALT=CTAT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:119:152:125:150:25:42:83:16:9:19:27:41:78:16:11 chr1 78111153 . A G 582.54 PASS AO=106;DP=185;FAO=115;FDP=195;FR=.;FRO=80;FSAF=35;FSAR=80;FSRF=36;FSRR=44;FWDB=0.0180004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.434;QD=11.9495;RBI=0.0384381;REFB=0.00592717;REVB=-0.0339628;RO=73;SAF=32;SAR=74;SRF=35;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147857;STB=0.566854;TYPE=snp;VARB=-0.00547899;OID=.;OPOS=78111153;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:195:73:80:106:115:74:32:35:38:80:35:36:44 chr1 78184325 . A G 516.5 PASS AO=146;DP=343;FAO=147;FDP=343;FR=.;FRO=196;FSAF=58;FSAR=89;FSRF=90;FSRR=106;FWDB=0.0338757;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.854;QD=6.02331;RBI=0.0339099;REFB=-0.0102792;REVB=-0.00152241;RO=194;SAF=58;SAR=88;SRF=89;SRR=105;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0648877;STB=0.538023;TYPE=snp;VARB=0.013285;OID=.;OPOS=78184325;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:343:343:194:196:146:147:88:58:89:105:89:58:90:106 chr1 78201745 . G T 538.49 PASS AO=113;DP=208;FAO=114;FDP=209;FR=.;FRO=95;FSAF=65;FSAR=49;FSRF=52;FSRR=43;FWDB=-0.0245366;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2739;QD=10.306;RBI=0.0404154;REFB=-0.0175037;REVB=-0.0321148;RO=95;SAF=64;SAR=49;SRF=52;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0161568;STB=0.510542;TYPE=snp;VARB=0.0133172;OID=.;OPOS=78201745;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:209:95:95:113:114:49:64:52:43:49:65:52:43 chr1 79095444 . GC G 1115.55 PASS AO=199;DP=284;FAO=250;FDP=272;FR=.;FRO=22;FSAF=148;FSAR=102;FSRF=16;FSRR=6;FWDB=0.00496624;FXX=0.0320273;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.3105;QD=16.4051;RBI=0.0856367;REFB=-0.102496;REVB=0.0854926;RO=46;SAF=110;SAR=89;SRF=30;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0.603448;SSSB=-0.0357636;STB=0.511371;TYPE=del;VARB=0.0786401;OID=.;OPOS=79095445;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:199:278:250:272:22:148:102:16:6:24:46:110:89:30:16 chr1 79128570 . G GT 249.58 PASS AO=95;DP=223;FAO=96;FDP=204;FR=.;FRO=108;FSAF=62;FSAR=34;FSRF=83;FSRR=25;FWDB=-0.00681233;FXX=0.0285701;HRUN=3;LEN=1;MLLD=209.768;QD=4.89367;RBI=0.0278953;REFB=0.00216485;REVB=-0.0270507;RO=126;SAF=62;SAR=33;SRF=98;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149476;STB=0.574042;TYPE=ins;VARB=-0.00253589;OID=.;OPOS=79128571;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:95:223:96:204:108:62:34:83:25:99:126:62:33:98:28 chr1 79357360 . G C 495.62 PASS AO=123;DP=259;FAO=123;FDP=258;FR=.;FRO=135;FSAF=69;FSAR=54;FSRF=63;FSRR=72;FWDB=-0.045135;FXX=0.00386085;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.7172;QD=7.68406;RBI=0.0666059;REFB=-0.0119363;REVB=0.0489814;RO=134;SAF=69;SAR=54;SRF=62;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.093243;STB=0.54948;TYPE=snp;VARB=0.0130141;OID=.;OPOS=79357360;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:259:258:134:135:123:123:54:69:62:72:54:69:63:72 chr1 79392756 . C A 147.65 PASS AO=38;DP=93;FAO=39;FDP=89;FR=.;FRO=50;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=9;FSRR=41;FWDB=-0.0142043;FXX=0.0531858;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.909;QD=6.63583;RBI=0.0157088;REFB=0.00127996;REVB=0.00670855;RO=55;SAF=14;SAR=24;SRF=13;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156368;STB=0.616358;TYPE=snp;VARB=-0.00170722;OID=.;OPOS=79392756;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:89:55:50:38:39:24:14:13:42:25:14:9:41 chr1 82421596 . C T 586.41 PASS AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126582;FXX=0.0156226;HRUN=3;LEN=1;MLLD=214.44;QD=37.2324;RBI=0.0127183;REFB=0;REVB=-0.00123582;RO=0;SAF=62;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.22983e-05;OID=.;OPOS=82421596;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:63:63:0:0:63:63:1:62:0:0:1:62:0:0 chr1 82457662 . G A 1790.12 PASS AO=195;DP=200;FAO=194;FDP=194;FR=.;FRO=0;FSAF=100;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0070067;FXX=0.0443328;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.332;QD=36.9097;RBI=0.0130569;REFB=0.0157498;REVB=-0.0110176;RO=4;SAF=100;SAR=95;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00908412;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00038279;OID=.;OPOS=82457662;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:200:194:4:0:195:194:95:100:3:1:94:100:0:0 chr1 84335412 . C T 404.9 PASS AO=87;DP=163;FAO=88;FDP=164;FR=.;FRO=76;FSAF=25;FSAR=63;FSRF=39;FSRR=37;FWDB=0.0150643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.79;QD=9.87565;RBI=0.0252072;REFB=-0.00233656;REVB=-0.0202106;RO=75;SAF=24;SAR=63;SRF=39;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228389;STB=0.617241;TYPE=snp;VARB=0.00258822;OID=.;OPOS=84335412;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:164:75:76:87:88:63:24:39:36:63:25:39:37 chr1 84640691 . T G 543.78 PASS AO=59;DP=61;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0071366;FXX=0.0163908;HRUN=4;LEN=1;MLLD=194.751;QD=36.2519;RBI=0.0236537;REFB=-0.0769623;REVB=0.0225514;RO=1;SAF=25;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136765;STB=0.507244;TYPE=snp;VARB=0.000165532;OID=.;OPOS=84640691;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:61:60:1:1:59:59:34:25:0:1:34:25:0:1 chr1 84810815 . A G 750.16 PASS AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0289402;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.618;QD=38.4695;RBI=0.029075;REFB=0;REVB=0.00279637;RO=0;SAF=60;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.83306e-05;OID=.;OPOS=84810815;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:78:78:0:0:78:78:18:60:0:0:18:60:0:0 chr1 84853957 . A T 1564.18 PASS AO=182;DP=192;FAO=181;FDP=192;FR=.;FRO=11;FSAF=88;FSAR=93;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=0.0306843;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.1424;QD=32.587;RBI=0.0500864;REFB=0.0198725;REVB=-0.0395868;RO=10;SAF=89;SAR=93;SRF=1;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0385603;STB=0.517466;TYPE=snp;VARB=-0.00821573;OID=.;OPOS=84853957;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:192:192:10:11:182:181:93:89:1:9:93:88:2:9 chr1 84878228 . C T 512.81 PASS AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0594257;FXX=0.0357079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.861;QD=37.9858;RBI=0.0628905;REFB=0;REVB=0.0205862;RO=0;SAF=20;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.77753e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000181208;OID=.;OPOS=84878228;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:55:54:0:0:54:54:34:20:0:0:34:20:0:0 chr1 84944989 . A G 963.49 PASS AO=98;DP=98;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0394829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.089;QD=38.5397;RBI=0.0407578;REFB=0;REVB=0.0101143;RO=0;SAF=48;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.35849e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00018573;OID=.;OPOS=84944989;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:98:100:0:0:98:100:50:48:0:0:51:49:0:0 chr1 85113203 . T C 1813.45 PASS AO=195;DP=199;FAO=195;FDP=199;FR=.;FRO=4;FSAF=86;FSAR=109;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0363624;FXX=0.00499975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.9983;QD=36.4514;RBI=0.0405221;REFB=-0.157335;REVB=0.0178836;RO=4;SAF=86;SAR=109;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119712;STB=0.506288;TYPE=snp;VARB=0.0012376;OID=.;OPOS=85113203;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:199:199:4:4:195:195:109:86:3:1:109:86:3:1 chr1 85113229 . A G 1659.27 PASS AO=172;DP=178;FAO=173;FDP=173;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0523448;FXX=0.0335177;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.319;QD=38.3646;RBI=0.0558306;REFB=0;REVB=0.0194184;RO=0;SAF=77;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.77593e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000125846;OID=.;OPOS=85113229;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:178:173:0:0:172:173:95:77:0:0:95:78:0:0 chr1 85121255 . A G 2354.66 PASS AO=255;DP=257;FAO=249;FDP=249;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=145;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0237739;FXX=0.0311272;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.313;QD=37.8258;RBI=0.0258696;REFB=-0.0210355;REVB=0.0102;RO=2;SAF=110;SAR=145;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00858751;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.53951e-05;OID=.;OPOS=85121255;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:257:249:2:0:255:249:145:110:2:0:145:104:0:0 chr1 85488030 . G A 1221 PASS AO=131;DP=133;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00725271;FXX=0.00751823;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.3885;QD=37;RBI=0.0100449;REFB=-0.0644337;REVB=-0.00694962;RO=1;SAF=67;SAR=64;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00704115;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00013305;OID=.;OPOS=85488030;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:133:132:1:0:131:132:64:67:1:0:64:68:0:0 chr1 85559452 . A G 347.87 PASS AO=99;DP=233;FAO=99;FDP=233;FR=.;FRO=134;FSAF=58;FSAR=41;FSRF=73;FSRR=61;FWDB=0.0231916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.3776;QD=5.97208;RBI=0.0340055;REFB=-0.0289802;REVB=-0.0248702;RO=133;SAF=58;SAR=41;SRF=73;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0388811;STB=0.524138;TYPE=snp;VARB=0.0440283;OID=.;OPOS=85559452;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:233:233:133:134:99:99:41:58:73:60:41:58:73:61 chr1 85624549 . C T 2016.46 PASS AO=208;DP=208;FAO=209;FDP=209;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=108;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00983573;FXX=0.00476168;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.009;QD=38.5924;RBI=0.0129658;REFB=0;REVB=0.00844806;RO=0;SAF=101;SAR=107;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.91844e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000218265;OID=.;OPOS=85624549;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:208:209:0:0:208:209:107:101:0:0:108:101:0:0 chr1 85624864 . G A 1578.26 PASS AO=164;DP=164;FAO=166;FDP=166;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=112;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136088;FXX=0.0119041;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.281;QD=38.0304;RBI=0.0138861;REFB=-0.0631024;REVB=0.00276141;RO=0;SAF=52;SAR=112;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.62501e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.19528e-06;OID=.;OPOS=85624864;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:164:166:0:0:164:166:112:52:0:0:112:54:0:0 chr1 85648620 . C T 1481.34 PASS AO=153;DP=153;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0347112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.555;QD=38.2281;RBI=0.0347507;REFB=0;REVB=0.00165471;RO=0;SAF=58;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.80755e-05;OID=.;OPOS=85648620;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:153:155:0:0:153:155:95:58:0:0:97:58:0:0 chr1 85729987 . A G 352.5 PASS AO=78;DP=152;FAO=79;FDP=153;FR=.;FRO=74;FSAF=31;FSAR=48;FSRF=35;FSRR=39;FWDB=0.000995635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.7398;QD=9.21572;RBI=0.021808;REFB=-0.0111835;REVB=0.0217853;RO=74;SAF=31;SAR=47;SRF=35;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0687156;STB=0.540143;TYPE=snp;VARB=0.0129835;OID=.;OPOS=85729987;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:153:74:74:78:79:47:31:35:39:48:31:35:39 chr1 85741968 . G C 51.06 PASS AO=7;DP=10;FAO=7;FDP=10;FR=.;FRO=3;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0296734;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.682;QD=20.4255;RBI=0.0509955;REFB=-0.0393896;REVB=0.0414733;RO=3;SAF=6;SAR=1;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.506482;STB=0.799037;TYPE=snp;VARB=0.00344099;OID=.;OPOS=85741968;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:10:10:3:3:7:7:1:6:0:3:1:6:0:3 chr1 85742012 . G C 33.21 PASS AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=-0.0790853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.339;QD=8.30356;RBI=0.0814745;REFB=-0.0032634;REVB=-0.019586;RO=9;SAF=1;SAR=6;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.64763;STB=0.88425;TYPE=snp;VARB=-0.000481152;OID=.;OPOS=85742012;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:16:16:9:9:7:7:6:1:8:1:6:1:8:1 chr1 85816215 . G A 105.39 PASS AO=35;DP=96;FAO=35;FDP=95;FR=.;FRO=60;FSAF=8;FSAR=27;FSRF=15;FSRR=45;FWDB=-0.0625177;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6099;QD=4.43749;RBI=0.071544;REFB=-0.0244868;REVB=0.0347862;RO=61;SAF=8;SAR=27;SRF=16;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0510533;STB=0.518786;TYPE=snp;VARB=0.0471241;OID=.;OPOS=85816215;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:95:61:60:35:35:27:8:16:45:27:8:15:45 chr1 86202016 . C T 2186.02 PASS AO=229;DP=230;FAO=230;FDP=230;FR=.;FRO=0;FSAF=115;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00652284;FXX=0.0170933;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.385;QD=38.0177;RBI=0.0360008;REFB=-0.0465432;REVB=0.0354049;RO=1;SAF=115;SAR=114;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00412592;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.88899e-05;OID=.;OPOS=86202016;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:230:230:1:0:229:230:114:115:1:0:115:115:0:0 chr1 86282500 . T A 14.25 PASS AO=28;DP=169;FAO=26;FDP=170;FR=.,HEALED;FRO=144;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=73;FSRR=71;FWDB=-0.02458;FXX=0.00584761;HRUN=5;LEN=1;MLLD=33.0662;QD=0.335304;RBI=0.256404;REFB=-0.0426127;REVB=-0.255223;RO=100;SAF=14;SAR=14;SRF=68;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230882;STB=0.505878;TYPE=snp;VARB=0.198018;OID=.;OPOS=86282500;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:169:170:100:144:28:26:14:14:68:32:13:13:73:71 chr1 86487914 . C A 467.31 PASS AO=111;DP=234;FAO=115;FDP=237;FR=.;FRO=122;FSAF=49;FSAR=66;FSRF=67;FSRR=55;FWDB=0.0162398;FXX=0.0124995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.418;QD=7.88705;RBI=0.0183111;REFB=0.00300578;REVB=-0.0084596;RO=111;SAF=48;SAR=63;SRF=61;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106876;STB=0.563552;TYPE=snp;VARB=-0.00183519;OID=.;OPOS=86487914;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:234:237:111:122:111:115:63:48:61:50:66:49:67:55 chr1 86487981 . G A 1618.82 PASS AO=165;DP=165;FAO=169;FDP=169;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=138;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0563627;FXX=0.0116952;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.06;QD=38.3154;RBI=0.0621274;REFB=0;REVB=0.0261354;RO=0;SAF=31;SAR=134;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.08276e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.21739e-05;OID=.;OPOS=86487981;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:165:169:0:0:165:169:134:31:0:0:138:31:0:0 chr1 86487992 . A AACAG 933.76 PASS AO=120;DP=157;FAO=126;FDP=151;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=114;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0213933;FXX=0.0320492;HRUN=2;LEN=4;MLLD=235.876;QD=24.7353;RBI=0.0213949;REFB=-0.0186429;REVB=-0.000261335;RO=29;SAF=11;SAR=109;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.308982;STB=0.653341;TYPE=ins;VARB=0.00431396;OID=.;OPOS=86487993;OREF=-;OALT=ACAG;OMAPALT=AACAG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:120:157:126:151:25:12:114:13:12:17:29:11:109:14:15 chr1 86488232 . G A 201.13 PASS AO=51;DP=112;FAO=51;FDP=112;FR=.;FRO=61;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=19;FSRR=42;FWDB=-0.0459928;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.5665;QD=7.18302;RBI=0.0495611;REFB=0.00177852;REVB=0.0184653;RO=61;SAF=28;SAR=23;SRF=19;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229283;STB=0.627322;TYPE=snp;VARB=-0.00279623;OID=.;OPOS=86488232;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:61:61:51:51:23:28:19:42:23:28:19:42 chr1 86512536 . C T 117.67 PASS AO=25;DP=49;FAO=25;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.00147181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.332;QD=9.60527;RBI=0.028546;REFB=-0.0171653;REVB=-0.028508;RO=24;SAF=15;SAR=10;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230609;STB=0.628931;TYPE=snp;VARB=0.0218372;OID=.;OPOS=86512536;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:24:24:25:25:10:15:8:16:10:15:8:16 chr1 86557967 . G A 339.65 PASS AO=70;DP=126;FAO=70;FDP=126;FR=.;FRO=56;FSAF=32;FSAR=38;FSRF=32;FSRR=24;FWDB=0.0156732;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.98;QD=10.7827;RBI=0.0208819;REFB=0.0138861;REVB=-0.0137987;RO=56;SAF=32;SAR=38;SRF=32;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0927912;STB=0.55071;TYPE=snp;VARB=-0.0100277;OID=.;OPOS=86557967;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:56:56:70:70:38:32:32:24:38:32:32:24 chr1 86590915 . G A 1069.77 PASS AO=112;DP=113;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00233905;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.297;QD=37.5359;RBI=0.0235649;REFB=0.0338867;REVB=0.0234485;RO=1;SAF=66;SAR=46;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0102093;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.53231e-05;OID=.;OPOS=86590915;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:113:114:1:0:112:114:46:66:0:1:48:66:0:0 chr1 86591502 . G C 448.46 PASS AO=99;DP=190;FAO=100;FDP=192;FR=.;FRO=92;FSAF=48;FSAR=52;FSRF=44;FSRR=48;FWDB=-0.00672257;FXX=0.00518108;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.827;QD=9.34297;RBI=0.00889905;REFB=-0.00731374;REVB=-0.00583096;RO=89;SAF=48;SAR=51;SRF=43;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.001474;STB=0.500835;TYPE=snp;VARB=0.0130477;OID=.;OPOS=86591502;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:192:89:92:99:100:51:48:43:46:52:48:44:48 chr1 86591837 . G A 461.17 PASS AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.001071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.957;QD=36.8936;RBI=0.0486903;REFB=-0.0665745;REVB=0.0486785;RO=0;SAF=10;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506327;TYPE=snp;VARB=0.00172526;OID=.;OPOS=86591837;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:50:50:0:1:49:49:39:10:0:0:39:10:0:1 chr1 86818572 . T C 721.73 PASS AO=77;DP=81;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288146;FXX=0.0123442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.305;QD=36.0867;RBI=0.0539765;REFB=-0.10309;REVB=0.0456419;RO=1;SAF=50;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0172042;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000679101;OID=.;OPOS=86818572;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:81:80:1:0:77:80:27:50:0:1:30:50:0:0 chr1 86820267 . C T 1975 PASS AO=206;DP=206;FAO=206;FDP=206;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0273171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.373;QD=38.3496;RBI=0.0281726;REFB=0;REVB=0.00688976;RO=0;SAF=104;SAR=102;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.91368e-05;OID=.;OPOS=86820267;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:206:206:0:0:206:206:102:104:0:0:102:104:0:0 chr1 86838158 . C T 3788.95 PASS AO=823;DP=826;FAO=398;FDP=398;FR=.;FRO=0;FSAF=185;FSAR=213;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188358;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.074;QD=38.0799;RBI=0.0210468;REFB=-0.0328663;REVB=-0.00939044;RO=1;SAF=382;SAR=441;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00108215;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.76437e-06;OID=.;OPOS=86838158;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:826:398:1:0:823:398:441:382:0:1:213:185:0:0 chr1 86847955 . G A 381.2 PASS AO=144;DP=405;FAO=140;FDP=396;FR=.;FRO=256;FSAF=52;FSAR=88;FSRF=110;FSRR=146;FWDB=-0.00159873;FXX=0.00999975;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.807;QD=3.85052;RBI=0.0222845;REFB=-0.00739719;REVB=0.022227;RO=256;SAF=53;SAR=91;SRF=108;SRR=148;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0640529;STB=0.539504;TYPE=snp;VARB=0.0164057;OID=.;OPOS=86847955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:405:396:256:256:144:140:91:53:108:148:88:52:110:146 chr1 86852621 . A G 568.05 PASS AO=123;DP=237;FAO=125;FDP=235;FR=.;FRO=110;FSAF=80;FSAR=45;FSRF=81;FSRR=29;FWDB=0.0027033;FXX=0.0126045;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.004;QD=9.66899;RBI=0.00283192;REFB=-0.0472788;REVB=0.000843774;RO=110;SAF=79;SAR=44;SRF=81;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0912477;STB=0.550315;TYPE=snp;VARB=0.0287804;OID=.;OPOS=86852621;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:237:235:110:110:123:125:44:79:81:29:45:80:81:29 chr1 86939130 . C T 1447.29 PASS AO=146;DP=146;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0289261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.365;QD=38.5944;RBI=0.0474632;REFB=0;REVB=0.0376303;RO=0;SAF=66;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99178e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00011712;OID=.;OPOS=86939130;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:146:150:0:0:146:150:80:66:0:0:81:69:0:0 chr1 86952324 . A G 2819.81 PASS AO=303;DP=309;FAO=305;FDP=311;FR=.;FRO=6;FSAF=151;FSAR=154;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.00771475;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=70.4738;QD=36.2676;RBI=0.0209368;REFB=-0.181001;REVB=0.0194636;RO=0;SAF=151;SAR=152;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509553;TYPE=snp;VARB=0.00110498;OID=.;OPOS=86952324;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:309:311:0:6:303:305:152:151:0:0:154:151:0:6 chr1 86959173 . T C 664.71 PASS AO=210;DP=465;FAO=179;FDP=399;FR=.;FRO=220;FSAF=71;FSAR=108;FSRF=113;FSRR=107;FWDB=0.0200496;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.577;QD=6.66371;RBI=0.0266256;REFB=0.00162837;REVB=0.0175196;RO=253;SAF=89;SAR=121;SRF=131;SRR=122;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0936824;STB=0.56555;TYPE=snp;VARB=-0.00274972;OID=.;OPOS=86959173;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:465:399:253:220:210:179:121:89:131:122:108:71:113:107 chr1 86961210 . C T 742.32 PASS AO=155;DP=276;FAO=155;FDP=276;FR=.;FRO=121;FSAF=76;FSAR=79;FSRF=76;FSRR=45;FWDB=0.00403576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.148;QD=10.7582;RBI=0.0277461;REFB=-0.0229914;REVB=-0.027451;RO=114;SAF=76;SAR=79;SRF=73;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117168;STB=0.560276;TYPE=snp;VARB=0.0167732;OID=.;OPOS=86961210;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:276:276:114:121:155:155:79:76:73:41:79:76:76:45 chr1 87045895 . ATCCTACACCTAC A 50 PASS AO=57;DP=181;LEN=12;RO=124;SAF=45;SAR=24;SRF=43;SRR=69;TYPE=del;FR=.;OID=.;OPOS=87045896;OREF=TCCTACACCTAC;OALT=-;OMAPALT=A GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR 0/1:99:181:124:57:24:45:43:69 chr1 87045896 . TCCTACA T,TCCTACACCTACT 627.28 PASS AO=61,42;DP=137;FAO=65,50;FDP=123;FR=.;FRO=8;FSAF=45,27;FSAR=20,23;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=-0.00218374,0.0168171;FXX=0.0955812;HRUN=2,2;LEN=6,6;MLLD=232.144,67.9968;QD=20.3992;RBI=0.0208847,0.0171265;REFB=-0.013762,0.00144594;REVB=0.0207702,0.00324071;RO=3;SAF=42,21;SAR=19,21;SRF=3;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0325305,-0.0624621;STB=0.569065,0.557061;TYPE=del,ins;VARB=0.0052041,0.022499;OID=.,.;OPOS=87045897,87045903;OREF=CCTACA,-;OALT=-,CCTACT;OMAPALT=T,TCCTACACCTACT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:61,42:110:65,50:123:8:45,27:20,23:1:7:99:3:42,21:19,21:3:0 chr1 87045929 . T TACTCCT 50 PASS AO=65;DP=181;LEN=6;RO=116;SAF=45;SAR=24;SRF=43;SRR=69;TYPE=ins;FR=.;OID=.;OPOS=87045929;OREF=-;OALT=TACTCC;OMAPALT=TACTCCT GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR 0/1:99:181:116:65:24:45:43:69 chr1 87101375 . C G 162.84 PASS AO=39;DP=84;FAO=39;FDP=82;FR=.;FRO=43;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=28;FWDB=-0.0166489;FXX=0.03529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.207;QD=7.94346;RBI=0.0542388;REFB=-0.00693773;REVB=-0.0516203;RO=39;SAF=23;SAR=16;SRF=15;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183782;STB=0.624629;TYPE=snp;VARB=0.00594224;OID=.;OPOS=87101375;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:82:39:43:39:39:16:23:15:24:16:23:15:28 chr1 87102593 . T C 197.53 PASS AO=54;DP=126;FAO=54;FDP=126;FR=.;FRO=72;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=33;FSRR=39;FWDB=0.00653173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.9696;QD=6.27082;RBI=0.0505781;REFB=-0.0355608;REVB=0.0501546;RO=71;SAF=28;SAR=26;SRF=32;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0686853;STB=0.534338;TYPE=snp;VARB=0.0562941;OID=.;OPOS=87102593;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:71:72:54:54:26:28:32:39:26:28:33:39 chr1 87208953 . T A 405.87 PASS AO=98;DP=201;FAO=98;FDP=202;FR=.;FRO=104;FSAF=42;FSAR=56;FSRF=54;FSRR=50;FWDB=-0.0334907;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=159.69;QD=8.03707;RBI=0.0354308;REFB=-0.027505;REVB=-0.0115635;RO=103;SAF=42;SAR=56;SRF=53;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0805978;STB=0.546999;TYPE=snp;VARB=0.025378;OID=.;OPOS=87208953;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:202:103:104:98:98:56:42:53:50:56:42:54:50 chr1 87599697 . G A 212.73 PASS AO=53;DP=114;FAO=53;FDP=114;FR=.;FRO=61;FSAF=20;FSAR=33;FSRF=28;FSRR=33;FWDB=-0.00748549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.2014;QD=7.46411;RBI=0.00748735;REFB=-0.00138024;REVB=0.000166815;RO=61;SAF=20;SAR=33;SRF=28;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0815516;STB=0.545437;TYPE=snp;VARB=0.00207179;OID=.;OPOS=87599697;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:61:61:53:53:33:20:28:33:33:20:28:33 chr1 89225976 . T C 1631.57 PASS AO=168;DP=174;FAO=178;FDP=181;FR=.;FRO=3;FSAF=69;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.00501384;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.8461;QD=36.0568;RBI=0.0632298;REFB=-0.0711169;REVB=0.0630307;RO=4;SAF=64;SAR=104;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00557472;STB=0.506787;TYPE=snp;VARB=0.00438034;OID=.;OPOS=89225976;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:174:181:4:3:168:178:104:64:2:2:109:69:0:3 chr1 89271574 . T C 1811.57 PASS AO=193;DP=195;FAO=193;FDP=193;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0431014;FXX=0.0203035;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.782;QD=37.5455;RBI=0.0888597;REFB=-0.114673;REVB=0.0777066;RO=0;SAF=89;SAR=104;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.57119e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000609094;OID=.;OPOS=89271574;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:195:193:0:0:193:193:104:89:0:0:104:89:0:0 chr1 89271620 . C A 430.34 PASS AO=99;DP=195;FAO=99;FDP=195;FR=.;FRO=96;FSAF=48;FSAR=51;FSRF=52;FSRR=44;FWDB=-0.00580195;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=273.71;QD=8.82749;RBI=0.00596409;REFB=-0.00120929;REVB=-0.00138122;RO=96;SAF=48;SAR=51;SRF=52;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0509269;STB=0.527945;TYPE=snp;VARB=0.0011608;OID=.;OPOS=89271620;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:195:96:96:99:99:51:48:52:44:51:48:52:44 chr1 89301123 . C T 2222.85 PASS AO=225;DP=227;FAO=235;FDP=235;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=147;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0467321;FXX=0.00843846;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.2594;QD=37.8358;RBI=0.0630773;REFB=-0.0525106;REVB=0.0423657;RO=1;SAF=84;SAR=141;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00563878;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000885943;OID=.;OPOS=89301123;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:97:227:235:1:0:225:235:141:84:1:0:147:88:0:0 chr1 89322982 . G A 1087.6 PASS AO=114;DP=115;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142588;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.679;QD=38.1615;RBI=0.0177757;REFB=0;REVB=0.0106142;RO=0;SAF=58;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.23074e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.5189e-05;OID=.;OPOS=89322982;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:115:114:0:0:114:114:56:58:0:0:56:58:0:0 chr1 89474818 . A G 271.95 PASS AO=68;DP=147;FAO=68;FDP=146;FR=.;FRO=78;FSAF=16;FSAR=52;FSRF=36;FSRR=42;FWDB=-0.000577972;FXX=0.00680226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.238;QD=7.45057;RBI=0.00304441;REFB=-0.0150131;REVB=0.00298905;RO=74;SAF=16;SAR=52;SRF=33;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235417;STB=0.64254;TYPE=snp;VARB=0.0134826;OID=.;OPOS=89474818;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:146:74:78:68:68:52:16:33:41:52:16:36:42 chr1 89475135 . C T 381.4 PASS AO=81;DP=151;FAO=81;FDP=151;FR=.;FRO=70;FSAF=42;FSAR=39;FSRF=34;FSRR=36;FWDB=-0.00418577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.098;QD=10.1034;RBI=0.0150974;REFB=-0.016414;REVB=0.0145055;RO=69;SAF=42;SAR=39;SRF=33;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0338468;STB=0.515207;TYPE=snp;VARB=0.0123316;OID=.;OPOS=89475135;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:151:69:70:81:81:39:42:33:36:39:42:34:36 chr1 89479063 . G A 684.46 PASS AO=163;DP=329;FAO=163;FDP=329;FR=.;FRO=166;FSAF=64;FSAR=99;FSRF=91;FSRR=75;FWDB=-0.0104767;FXX=0.00303021;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.343;QD=8.32167;RBI=0.0199062;REFB=-0.0059195;REVB=0.0169262;RO=165;SAF=64;SAR=99;SRF=90;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141958;STB=0.579462;TYPE=snp;VARB=0.00416034;OID=.;OPOS=89479063;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:329:329:165:166:163:163:99:64:90:75:99:64:91:75 chr1 89479074 . C T 596.84 PASS AO=125;DP=292;FAO=145;FDP=298;FR=.;FRO=153;FSAF=54;FSAR=91;FSRF=85;FSRR=68;FWDB=-0.0175147;FXX=0.0197362;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.433;QD=8.01124;RBI=0.0202691;REFB=-0.0174476;REVB=0.0102016;RO=142;SAF=47;SAR=78;SRF=79;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176079;STB=0.595654;TYPE=snp;VARB=0.0227987;OID=.;OPOS=89479074;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:292:298:142:153:125:145:78:47:79:63:91:54:85:68 chr1 89479758 . T C 1838.25 PASS AO=185;DP=185;FAO=194;FDP=194;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00733628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.231;QD=37.9021;RBI=0.00827965;REFB=0;REVB=0.00383817;RO=0;SAF=95;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000158271;OID=.;OPOS=89479758;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:87:185:194:0:0:185:194:90:95:0:0:91:103:0:0 chr1 89486037 . C T 1050.6 PASS AO=114;DP=118;FAO=118;FDP=120;FR=.;FRO=2;FSAF=41;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00414685;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.2414;QD=35.0198;RBI=0.0277335;REFB=0.0435416;REVB=-0.0274217;RO=4;SAF=39;SAR=75;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011235;STB=0.506409;TYPE=snp;VARB=0.000390924;OID=.;OPOS=89486037;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:118:120:4:2:114:118:75:39:2:2:77:41:0:2 chr1 89518623 . C T 396.77 PASS AO=93;DP=187;FAO=93;FDP=187;FR=.;FRO=94;FSAF=31;FSAR=62;FSRF=57;FSRR=37;FWDB=0.00127655;FXX=0.00531887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.649;QD=8.48699;RBI=0.00533485;REFB=-0.00803145;REVB=-0.00517987;RO=94;SAF=31;SAR=62;SRF=57;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254118;STB=0.639969;TYPE=snp;VARB=0.00986924;OID=.;OPOS=89518623;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:187:94:94:93:93:62:31:57:37:62:31:57:37 chr1 89521841 . G C 621.17 PASS AO=168;DP=366;FAO=165;FDP=364;FR=.;FRO=199;FSAF=82;FSAR=83;FSRF=108;FSRR=91;FWDB=-0.0249175;FXX=0.0108693;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.086;QD=6.82607;RBI=0.0249203;REFB=-0.00329621;REVB=0.000371907;RO=198;SAF=86;SAR=82;SRF=108;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0329365;STB=0.524999;TYPE=snp;VARB=0.00365232;OID=.;OPOS=89521841;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:366:364:198:199:168:165:82:86:108:90:83:82:108:91 chr1 89522646 . G C 354.83 PASS AO=82;DP=207;FAO=94;FDP=210;FR=.;FRO=116;FSAF=37;FSAR=57;FSRF=72;FSRR=44;FWDB=-0.0196753;FXX=0.00473911;HRUN=3;LEN=1;MLLD=180.098;QD=6.75869;RBI=0.0215984;REFB=-0.030424;REVB=-0.00890898;RO=73;SAF=32;SAR=50;SRF=56;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.315871;STB=0.624396;TYPE=snp;VARB=0.0232148;OID=.;OPOS=89522646;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:210:73:116:82:94:50:32:56:17:57:37:72:44 chr1 89579941 . T C 393.72 PASS AO=94;DP=198;FAO=97;FDP=201;FR=.;FRO=104;FSAF=33;FSAR=64;FSRF=46;FSRR=58;FWDB=-0.0299132;FXX=0.00495025;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.356;QD=7.83527;RBI=0.0359377;REFB=-0.0227556;REVB=-0.0199177;RO=99;SAF=31;SAR=63;SRF=43;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10546;STB=0.556694;TYPE=snp;VARB=0.0208039;OID=.;OPOS=89579941;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:201:99:104:94:97:63:31:43:56:64:33:46:58 chr1 89582690 . G C 600.23 PASS AO=138;DP=271;FAO=138;FDP=271;FR=.;FRO=133;FSAF=71;FSAR=67;FSRF=68;FSRR=65;FWDB=-0.0147306;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.427;QD=8.85953;RBI=0.0152759;REFB=-0.0109969;REVB=0.0040449;RO=130;SAF=71;SAR=67;SRF=67;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000791428;STB=0.501579;TYPE=snp;VARB=0.00853889;OID=.;OPOS=89582690;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:271:271:130:133:138:138:67:71:67:63:67:71:68:65 chr1 89618115 . GC G 1118.16 PASS AO=118;DP=150;FAO=167;FDP=167;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=130;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0189105;FXX=0.00595203;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.4863;QD=26.7822;RBI=0.222067;REFB=-0.00983933;REVB=0.221261;RO=14;SAF=16;SAR=102;SRF=3;SRR=11;SSEN=0.435071;SSEP=0;SSSB=-0.0327645;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00338885;OID=.;OPOS=89618116;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:118:145:167:167:0:37:130:0:0:92:14:16:102:3:11 chr1 89637578 . G A 464.32 PASS AO=122;DP=268;FAO=122;FDP=269;FR=.;FRO=147;FSAF=44;FSAR=78;FSRF=49;FSRR=98;FWDB=0.0323684;FXX=0.00370357;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.514;QD=6.90437;RBI=0.0331359;REFB=0.000316953;REVB=0.00709054;RO=145;SAF=45;SAR=77;SRF=47;SRR=98;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0478766;STB=0.516333;TYPE=snp;VARB=-0.000200925;OID=.;OPOS=89637578;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:268:269:145:147:122:122:77:45:47:98:78:44:49:98 chr1 89849742 . A T 820.14 PASS AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0089613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.882;QD=38.1459;RBI=0.0404624;REFB=0;REVB=0.0394576;RO=0;SAF=36;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.78821e-05;OID=.;OPOS=89849742;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:86:86:0:0:86:86:50:36:0:0:50:36:0:0 chr1 90048248 . C T 1857.92 PASS AO=202;DP=210;FAO=203;FDP=203;FR=.;FRO=0;FSAF=106;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00340701;FXX=0.0333317;HRUN=3;LEN=1;MLLD=206.712;QD=36.6092;RBI=0.0356077;REFB=-0.0127604;REVB=0.0354444;RO=5;SAF=105;SAR=97;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00551591;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.56124e-06;OID=.;OPOS=90048248;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:210:203:5:0:202:203:97:105:2:3:97:106:0:0 chr1 90171835 . C T 2132.54 PASS AO=223;DP=225;FAO=223;FDP=223;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=130;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109437;FXX=0.0132737;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.5203;QD=38.2518;RBI=0.0117627;REFB=0;REVB=0.00431255;RO=0;SAF=94;SAR=129;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.49476e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.3599e-05;OID=.;OPOS=90171835;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:225:223:0:0:223:223:129:94:0:0:130:93:0:0 chr1 90178743 . A G 1110.25 PASS AO=110;DP=110;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.117808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.2176;QD=37.9572;RBI=0.120884;REFB=0;REVB=-0.0270998;RO=0;SAF=57;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000500867;OID=.;OPOS=90178743;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:110:117:0:0:110:117:53:57:0:0:53:64:0:0 chr1 90179936 . C T 97.87 PASS AO=31;DP=85;FAO=31;FDP=84;FR=.;FRO=53;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=42;FSRR=11;FWDB=-0.00848484;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.114;QD=4.6606;RBI=0.0273946;REFB=-0.0191993;REVB=0.0260475;RO=53;SAF=18;SAR=13;SRF=42;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253895;STB=0.643483;TYPE=snp;VARB=0.0302643;OID=.;OPOS=90179936;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:85:84:53:53:31:31:13:18:42:11:13:18:42:11 chr1 90460797 . G GT 28.6 PASS AO=5;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=0.169172;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=19.2599;QD=7.627;RBI=0.169172;REFB=-0.122427;REVB=0;RO=10;SAF=5;SAR=0;SRF=10;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.224218;OID=.;OPOS=90460798;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:5:15:7:15:8:7:0:8:0:28:10:5:0:10:0 chr1 91406081 . T A 223.33 PASS AO=71;DP=185;FAO=71;FDP=184;FR=.;FRO=113;FSAF=16;FSAR=55;FSRF=49;FSRR=64;FWDB=-0.015396;FXX=0.00540511;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.089;QD=4.85509;RBI=0.0159085;REFB=0.0022515;REVB=-0.0040054;RO=113;SAF=16;SAR=55;SRF=49;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267318;STB=0.652445;TYPE=snp;VARB=-0.00383241;OID=.;OPOS=91406081;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:184:113:113:71:71:55:16:49:64:55:16:49:64 chr1 91728053 . G A 1319.25 PASS AO=137;DP=139;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118261;FXX=0.0143875;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.979;QD=38.5183;RBI=0.031547;REFB=0;REVB=0.0292465;RO=0;SAF=75;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.52807e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.68488e-05;OID=.;OPOS=91728053;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:139:137:0:0:137:137:62:75:0:0:62:75:0:0 chr1 91781413 . T G 2765.56 PASS AO=291;DP=297;FAO=294;FDP=294;FR=.;FRO=0;FSAF=145;FSAR=149;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0451734;FXX=0.023255;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.795;QD=37.6267;RBI=0.0463008;REFB=-0.0192359;REVB=0.0101553;RO=1;SAF=144;SAR=147;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00330033;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000406821;OID=.;OPOS=91781413;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:297:294:1:0:291:294:147:144:1:0:149:145:0:0 chr1 91844031 . AT A 49.32 PASS AO=62;DP=270;FAO=78;FDP=242;FR=.;FRO=164;FSAF=13;FSAR=65;FSRF=52;FSRR=112;FWDB=-0.0185308;FXX=0.0202421;HRUN=5;LEN=1;MLLD=9.92241;QD=0.815181;RBI=0.0919009;REFB=-0.103107;REVB=-0.0900132;RO=144;SAF=16;SAR=46;SRF=45;SRR=99;SSEN=0.333333;SSEP=0;SSSB=-0.0809941;STB=0.647367;TYPE=del;VARB=0.107666;OID=.;OPOS=91844032;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:62:240:78:242:164:13:65:52:112:49:144:16:46:45:99 chr1 91851253 . T C 1082.98 PASS AO=117;DP=120;FAO=117;FDP=120;FR=.;FRO=3;FSAF=49;FSAR=68;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00684582;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=257.219;QD=36.0995;RBI=0.0134208;REFB=-0.210841;REVB=0.0115435;RO=0;SAF=49;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.15086e-08;STB=0.50635;TYPE=snp;VARB=0.000314646;OID=.;OPOS=91851253;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:120:120:0:3:117:117:68:49:0:0:68:49:2:1 chr1 91853111 . A C 2784.39 PASS AO=283;DP=292;FAO=294;FDP=294;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=204;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113427;FXX=0.0101007;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.641;QD=37.8829;RBI=0.0285424;REFB=-0.0189477;REVB=0.0261919;RO=2;SAF=86;SAR=197;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0048165;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00039905;OID=.;OPOS=91853111;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:292:294:2:0:283:294:197:86:0:2:204:90:0:0 chr1 91859795 . T C 2358.28 PASS AO=250;DP=253;FAO=252;FDP=252;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=190;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0374841;FXX=0.00395241;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.3879;QD=37.433;RBI=0.0412434;REFB=-0.0313911;REVB=0.0172036;RO=2;SAF=62;SAR=188;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00504397;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000459246;OID=.;OPOS=91859795;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:253:252:2:0:250:252:188:62:0:2:190:62:0:0 chr1 91870410 . G C 166.77 PASS AO=39;DP=80;FAO=39;FDP=81;FR=.;FRO=42;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=28;FSRR=14;FWDB=-0.0620291;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.023;QD=8.2357;RBI=0.0666856;REFB=-0.0176725;REVB=0.0244819;RO=40;SAF=25;SAR=14;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00890007;STB=0.514556;TYPE=snp;VARB=0.0169325;OID=.;OPOS=91870410;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:81:40:42:39:39:14:25:26:14:14:25:28:14 chr1 92107937 . C T 295.89 PASS AO=88;DP=216;FAO=88;FDP=215;FR=.;FRO=127;FSAF=38;FSAR=50;FSRF=63;FSRR=64;FWDB=0.0234073;FXX=0.00462942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.4315;QD=5.50485;RBI=0.024705;REFB=0.00654859;REVB=0.00790176;RO=126;SAF=38;SAR=50;SRF=61;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0555439;STB=0.538256;TYPE=snp;VARB=-0.00454796;OID=.;OPOS=92107937;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:216:215:126:127:88:88:50:38:61:65:50:38:63:64 chr1 92108119 . A G 136.09 PASS AO=39;DP=96;FAO=39;FDP=96;FR=.;FRO=57;FSAF=12;FSAR=27;FSRF=15;FSRR=42;FWDB=-0.00625375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.884;QD=5.67037;RBI=0.0127333;REFB=-0.00782035;REVB=-0.0110917;RO=57;SAF=12;SAR=27;SRF=15;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.056319;STB=0.531776;TYPE=snp;VARB=0.0108505;OID=.;OPOS=92108119;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:57:57:39:39:27:12:15:42:27:12:15:42 chr1 92108899 . C T 1497.94 PASS AO=151;DP=151;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0302471;FXX=0.00632871;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.425;QD=38.164;RBI=0.0379743;REFB=0;REVB=-0.0229599;RO=0;SAF=66;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000620263;OID=.;OPOS=92108899;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:151:157:0:0:151:157:85:66:0:0:85:72:0:0 chr1 92174260 . A G 1530.31 PASS AO=158;DP=158;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0159978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.409;QD=38.4985;RBI=0.0198709;REFB=0;REVB=-0.0117865;RO=0;SAF=70;SAR=88;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.42551e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.34315e-05;OID=.;OPOS=92174260;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:158:159:0:0:158:159:88:70:0:0:88:71:0:0 chr1 92177938 . A G 305.74 PASS AO=94;DP=237;FAO=95;FDP=241;FR=.;FRO=146;FSAF=63;FSAR=32;FSRF=87;FSRR=59;FWDB=-0.0347043;FXX=0.00413206;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.9625;QD=5.07451;RBI=0.053565;REFB=-0.00799202;REVB=0.0408021;RO=143;SAF=62;SAR=32;SRF=86;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0677489;STB=0.54428;TYPE=snp;VARB=0.0101959;OID=.;OPOS=92177938;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:237:241:143:146:94:95:32:62:86:57:32:63:87:59 chr1 92262874 . T C 109.84 PASS AO=24;DP=63;FAO=30;FDP=69;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=0.0491794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.883;QD=6.36744;RBI=0.0519589;REFB=-0.0352189;REVB=0.0167663;RO=39;SAF=8;SAR=16;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145633;STB=0.51615;TYPE=snp;VARB=0.0399233;OID=.;OPOS=92262874;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:69:39:39:24:30:16:8:18:21:17:13:18:21 chr1 92295565 . C T 246.06 PASS AO=36;DP=117;FAO=45;FDP=92;FR=.,HEALED;FRO=31;FSAF=12;FSAR=33;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=0.00487597;FXX=0.185824;HRUN=3;LEN=1;MLLD=123.47;QD=10.698;RBI=0.00579016;REFB=-0.0348491;REVB=0.00312265;RO=21;SAF=10;SAR=26;SRF=16;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.338286;STB=0.666589;TYPE=snp;VARB=0.0492228;OID=.;OPOS=92295565;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:82:92:21:31:36:45:26:10:16:5:33:12:20:11 chr1 92428495 . C A 2685.44 PASS AO=277;DP=277;FAO=279;FDP=279;FR=.;FRO=0;FSAF=125;FSAR=154;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.675;QD=38.5009;RBI=0.0244733;REFB=0;REVB=-0.0185826;RO=0;SAF=123;SAR=154;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.88234e-07;OID=.;OPOS=92428495;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:277:279:0:0:277:279:154:123:0:0:154:125:0:0 chr1 92457843 . C T 2863.37 PASS AO=297;DP=300;FAO=297;FDP=297;FR=.;FRO=0;FSAF=113;FSAR=184;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012484;FXX=0.00999967;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.379;QD=38.5639;RBI=0.0147857;REFB=0;REVB=0.00792258;RO=0;SAF=113;SAR=184;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.62093e-07;OID=.;OPOS=92457843;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:300:297:0:0:297:297:184:113:0:0:184:113:0:0 chr1 92646021 . G A 848.1 PASS AO=82;DP=82;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0341262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.1;QD=37.2792;RBI=0.0345279;REFB=0;REVB=-0.00525112;RO=0;SAF=43;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.10525e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000147524;OID=.;OPOS=92646021;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:82:91:0:0:82:91:39:43:0:0:39:52:0:0 chr1 92647223 . A G 590.78 PASS AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0112736;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=247.082;QD=36.356;RBI=0.0121474;REFB=-0.104267;REVB=0.0045239;RO=1;SAF=22;SAR=42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111145;STB=0.505881;TYPE=snp;VARB=0.000203898;OID=.;OPOS=92647223;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:65:65:1:1:64:64:42:22:0:1:42:22:0:1 chr1 92647532 . C A 1006.36 PASS AO=90;DP=94;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00295724;FXX=0.0272702;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.6194;QD=37.6211;RBI=0.0605075;REFB=0;REVB=0.0604352;RO=0;SAF=46;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.15792e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00153465;OID=.;OPOS=92647532;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:94:107:0:0:90:107:44:46:0:0:59:48:0:0 chr1 92756989 . C T 81.87 PASS AO=35;DP=130;FAO=38;FDP=133;FR=.;FRO=95;FSAF=10;FSAR=28;FSRF=37;FSRR=58;FWDB=0.0054452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.184;QD=2.46214;RBI=0.00546257;REFB=-0.00411052;REVB=0.000435322;RO=90;SAF=10;SAR=25;SRF=36;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155324;STB=0.604721;TYPE=snp;VARB=0.0123196;OID=.;OPOS=92756989;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:130:133:90:95:35:38:25:10:36:54:28:10:37:58 chr1 92762982 . A C 240.92 PASS AO=65;DP=149;FAO=65;FDP=149;FR=.;FRO=84;FSAF=41;FSAR=24;FSRF=50;FSRR=34;FWDB=-0.0112231;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.382;QD=6.46757;RBI=0.0117408;REFB=-0.00177026;REVB=-0.00344807;RO=82;SAF=41;SAR=24;SRF=48;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0480101;STB=0.521256;TYPE=snp;VARB=0.00241636;OID=.;OPOS=92762982;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:82:84:65:65:24:41:48:34:24:41:50:34 chr1 92889408 . C T 944.73 PASS AO=100;DP=101;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0415396;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.0372;QD=37.0483;RBI=0.0425686;REFB=-0.00663909;REVB=0.00930294;RO=1;SAF=35;SAR=65;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133598;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000423332;OID=.;OPOS=92889408;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:101:102:1:0:100:102:65:35:1:0:66:36:0:0 chr1 92974595 . G A 1877.32 PASS AO=204;DP=212;FAO=208;FDP=208;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00966457;FXX=0.0370353;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.026;QD=36.1022;RBI=0.0113648;REFB=-0.0832321;REVB=0.0059795;RO=7;SAF=95;SAR=109;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0205086;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000137347;OID=.;OPOS=92974595;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:212:208:7:0:204:208:109:95:1:6:113:95:0:0 chr1 92979124 . G A 311.7 PASS AO=34;DP=35;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0198857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.0514;QD=34.6336;RBI=0.0337568;REFB=-0.148632;REVB=0.0272778;RO=0;SAF=22;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.75716e-08;STB=0.511105;TYPE=snp;VARB=0.00476912;OID=.;OPOS=92979124;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:35:36:0:1:34:35:12:22:0:0:13:22:1:0 chr1 92979354 . A G 660.41 PASS AO=130;DP=140;FAO=80;FDP=89;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=0.0349911;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.621;QD=29.6812;RBI=0.0364291;REFB=-0.0259957;REVB=-0.0101342;RO=9;SAF=10;SAR=120;SRF=0;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0343195;STB=0.529025;TYPE=snp;VARB=0.00234152;OID=.;OPOS=92979354;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:140:89:9:9:130:80:120:10:0:9:73:7:0:9 chr1 93089823 . T C 1219.14 PASS AO=119;DP=121;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.10471;FXX=0.00763301;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2261;QD=37.512;RBI=0.10472;REFB=-0.0729769;REVB=-0.00148718;RO=2;SAF=68;SAR=51;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00228818;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00129672;OID=.;OPOS=93089823;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:121:130:2:0:119:130:51:68:1:1:51:79:0:0 chr1 93160902 . T C 306.06 PASS AO=31;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0823962;FXX=0.0285633;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.118;QD=36.0068;RBI=0.0860866;REFB=0;REVB=0.0249353;RO=0;SAF=12;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.47712e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00113992;OID=.;OPOS=93160902;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:34:0:0:31:34:19:12:0:0:19:15:0:0 chr1 93306317 . G A 2315.45 PASS AO=228;DP=230;FAO=243;FDP=243;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=201;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196552;FXX=0.00409819;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.6372;QD=38.1144;RBI=0.058321;REFB=0;REVB=0.0549091;RO=0;SAF=41;SAR=187;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.52848e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.01112e-05;OID=.;OPOS=93306317;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:230:243:0:0:228:243:187:41:0:0:201:42:0:0 chr1 93307908 . T A 1710.32 PASS AO=181;DP=182;FAO=181;FDP=181;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0065413;FXX=0.0109284;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.007;QD=37.797;RBI=0.0698412;REFB=-0.00605614;REVB=-0.0695342;RO=1;SAF=79;SAR=102;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00464492;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.69208e-05;OID=.;OPOS=93307908;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:182:181:1:0:181:181:102:79:0:1:102:79:0:0 chr1 93311708 . G A 1502.83 PASS AO=161;DP=164;FAO=161;FDP=161;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=126;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00315937;FXX=0.0182916;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.4879;QD=37.3373;RBI=0.00678733;REFB=-0.021957;REVB=-0.00600718;RO=2;SAF=35;SAR=126;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0264079;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.95668e-05;OID=.;OPOS=93311708;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:164:161:2:0:161:161:126:35:2:0:126:35:0:0 chr1 93440474 . T C 637.28 PASS AO=59;DP=60;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0460098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.427;QD=35.9033;RBI=0.0479167;REFB=-0.0183925;REVB=0.0133831;RO=1;SAF=26;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.017801;STB=0.50704;TYPE=snp;VARB=0.000494119;OID=.;OPOS=93440474;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:60:71:1:1:59:70:33:26:1:0:35:35:1:0 chr1 93580581 . G C 1822.7 PASS AO=191;DP=191;FAO=191;FDP=191;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00523805;FXX=0.00520806;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.538;QD=38.1716;RBI=0.0255048;REFB=0;REVB=0.0249612;RO=0;SAF=93;SAR=98;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.67357e-05;OID=.;OPOS=93580581;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:191:191:0:0:191:191:98:93:0:0:99:92:0:0 chr1 93581024 . T C 132.65 PASS AO=36;DP=86;FAO=36;FDP=85;FR=.;FRO=49;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=34;FSRR=15;FWDB=-0.0091614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.392;QD=6.24211;RBI=0.0241254;REFB=-0.0200958;REVB=0.0223182;RO=50;SAF=15;SAR=21;SRF=35;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.285312;STB=0.655749;TYPE=snp;VARB=0.0353911;OID=.;OPOS=93581024;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:85:50:49:36:36:21:15:35:15:21:15:34:15 chr1 93603183 . C CAT,T 1905.35 PASS AO=153,51;DP=217;FAO=158,47;FDP=205;FR=.;FRO=0;FSAF=97,25;FSAR=61,22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0160286,-0.0158774;FXX=0.055297;HRUN=0,1;LEN=2,1;MLLD=95.4885,44.1743;QD=37.1777;RBI=0.0335952,0.0819102;REFB=0,0;REVB=-0.029525,-0.0803566;RO=12;SAF=96,25;SAR=57,26;SRF=9;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0181742,-0.0922391;STB=0.5,0.5;TYPE=ins,snp;VARB=0.0160392,0.0019177;OID=.,.;OPOS=93603184,93603183;OREF=-,C;OALT=AT,T;OMAPALT=CAT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:64:217:205:12:0:153,51:158,47:57,26:96,25:9:3:61,22:97,25:0:0 chr1 93617546 . T C 1334.42 PASS AO=142;DP=147;FAO=145;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0198741;FXX=0.0136045;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.8299;QD=36.8116;RBI=0.103051;REFB=-0.0249526;REVB=0.101117;RO=1;SAF=67;SAR=75;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0062981;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00114431;OID=.;OPOS=93617546;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:147:145:1:0:142:145:75:67:0:1:78:67:0:0 chr1 93620393 . G A 206.86 PASS AO=47;DP=99;FAO=48;FDP=98;FR=.;FRO=50;FSAF=12;FSAR=36;FSRF=18;FSRR=32;FWDB=0.0180264;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.656;QD=8.44321;RBI=0.0183659;REFB=-0.00502653;REVB=-0.0035148;RO=47;SAF=12;SAR=35;SRF=18;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139213;STB=0.56959;TYPE=snp;VARB=0.00469119;OID=.;OPOS=93620393;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:98:47:50:47:48:35:12:18:29:36:12:18:32 chr1 93672688 . C T 372.34 PASS AO=78;DP=146;FAO=78;FDP=143;FR=.;FRO=65;FSAF=58;FSAR=20;FSRF=54;FSRR=11;FWDB=0.00364811;FXX=0.0205465;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.611;QD=10.4152;RBI=0.00890314;REFB=-0.0121222;REVB=-0.0081214;RO=64;SAF=58;SAR=20;SRF=54;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115632;STB=0.554717;TYPE=snp;VARB=0.0119149;OID=.;OPOS=93672688;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:143:64:65:78:78:20:58:54:10:20:58:54:11 chr1 93672723 . A C 1469.06 PASS AO=161;DP=170;FAO=163;FDP=168;FR=.;FRO=5;FSAF=106;FSAR=57;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0306999;FXX=0.011764;HRUN=5;LEN=1;MLLD=94.1534;QD=34.9777;RBI=0.0432405;REFB=-0.0656973;REVB=0.0304508;RO=5;SAF=105;SAR=56;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0158309;STB=0.508149;TYPE=snp;VARB=0.000981775;OID=.;OPOS=93672723;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:170:168:5:5:161:163:56:105:2:3:57:106:2:3 chr1 93720070 . C G 250.45 PASS AO=46;DP=101;FAO=55;FDP=105;FR=.;FRO=50;FSAF=40;FSAR=15;FSRF=31;FSRR=19;FWDB=-0.00673207;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.834;QD=9.54085;RBI=0.023296;REFB=0.00799418;REVB=-0.0223021;RO=40;SAF=33;SAR=13;SRF=29;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00794878;STB=0.560802;TYPE=snp;VARB=-0.00363815;OID=.;OPOS=93720070;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:105:40:50:46:55:13:33:29:11:15:40:31:19 chr1 93826178 . A T 824.73 PASS AO=185;DP=353;FAO=185;FDP=353;FR=.;FRO=168;FSAF=71;FSAR=114;FSRF=54;FSRR=114;FWDB=0.0155337;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.007;QD=9.3454;RBI=0.0155343;REFB=-0.0153779;REVB=-0.00013006;RO=166;SAF=71;SAR=114;SRF=54;SRR=112;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.05443;STB=0.531832;TYPE=snp;VARB=0.0111757;OID=.;OPOS=93826178;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:353:353:166:168:185:185:114:71:54:112:114:71:54:114 chr1 93851295 . T C 1106.92 PASS AO=122;DP=127;FAO=122;FDP=126;FR=.;FRO=4;FSAF=51;FSAR=71;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.012977;FXX=0.0078734;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.783;QD=35.1403;RBI=0.0177935;REFB=-0.123855;REVB=0.0121739;RO=4;SAF=51;SAR=71;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0204811;STB=0.51079;TYPE=snp;VARB=0.00436817;OID=.;OPOS=93851295;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:127:126:4:4:122:122:71:51:3:1:71:51:3:1 chr1 94341267 . A G 355.61 PASS AO=73;DP=130;FAO=73;FDP=131;FR=.;FRO=58;FSAF=20;FSAR=53;FSRF=19;FSRR=39;FWDB=-0.00520359;FXX=0.0150365;HRUN=4;LEN=1;MLLD=161.834;QD=10.8582;RBI=0.0398979;REFB=-0.0323003;REVB=-0.0395571;RO=55;SAF=20;SAR=53;SRF=17;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0341408;STB=0.529042;TYPE=snp;VARB=0.0267451;OID=.;OPOS=94341267;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:131:55:58:73:73:53:20:17:38:53:20:19:39 chr1 94341984 . AAT A 60.08 PASS AO=39;DP=180;FAO=52;FDP=161;FR=.;FRO=109;FSAF=31;FSAR=21;FSRF=59;FSRR=50;FWDB=-0.0130282;FXX=0;HRUN=5;LEN=2;MLLD=19.9889;QD=1.49266;RBI=0.228115;REFB=-0.0656557;REVB=-0.227742;RO=89;SAF=19;SAR=20;SRF=55;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155471;STB=0.537996;TYPE=del;VARB=0.102543;OID=.;OPOS=94341985;OREF=AT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:39:168:52:161:109:31:21:59:50:60:89:19:20:55:34 chr1 94343023 . A G 269.92 PASS AO=66;DP=150;FAO=70;FDP=153;FR=.;FRO=83;FSAF=18;FSAR=52;FSRF=33;FSRR=50;FWDB=-0.0134159;FXX=0.00649309;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.333;QD=7.05661;RBI=0.0161542;REFB=0.00341757;REVB=-0.00899845;RO=81;SAF=18;SAR=48;SRF=32;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140925;STB=0.590882;TYPE=snp;VARB=-0.0029593;OID=.;OPOS=94343023;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:153:81:83:66:70:48:18:32:49:52:18:33:50 chr1 94343233 . T C 2380.26 PASS AO=261;DP=269;FAO=261;FDP=269;FR=.;FRO=8;FSAF=119;FSAR=142;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.0185753;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=216.87;QD=35.3942;RBI=0.0192022;REFB=-0.0417177;REVB=0.00486635;RO=7;SAF=119;SAR=142;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0057885;STB=0.50132;TYPE=snp;VARB=0.000180932;OID=.;OPOS=94343233;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:269:269:7:8:261:261:142:119:4:3:142:119:4:4 chr1 94387597 . C T 568.87 PASS AO=128;DP=270;FAO=138;FDP=278;FR=.;FRO=140;FSAF=54;FSAR=84;FSRF=63;FSRR=77;FWDB=0.0283899;FXX=0.0071426;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.633;QD=8.18515;RBI=0.0283923;REFB=-0.0137196;REVB=0.000366807;RO=142;SAF=50;SAR=78;SRF=65;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0661288;STB=0.530608;TYPE=snp;VARB=0.0135599;OID=.;OPOS=94387597;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:270:278:142:140:128:138:78:50:65:77:84:54:63:77 chr1 94399559 . GCT G 529.99 PASS AO=84;DP=212;FAO=111;FDP=196;FR=.;FRO=85;FSAF=55;FSAR=56;FSRF=37;FSRR=48;FWDB=-0.00677787;FXX=0.0248744;HRUN=1;LEN=2;MLLD=250.176;QD=10.8162;RBI=0.0210238;REFB=0.0101011;REVB=-0.0199013;RO=67;SAF=36;SAR=48;SRF=28;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0088621;STB=0.526117;TYPE=del;VARB=-0.00723504;OID=.;OPOS=94399560;OREF=CT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:84:191:111:196:85:55:56:37:48:99:67:36:48:28:39 chr1 94471075 . A G 1701.62 PASS AO=177;DP=179;FAO=179;FDP=179;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000839663;FXX=0.00555525;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.1746;QD=38.0249;RBI=0.0211713;REFB=-0.0138811;REVB=0.0211547;RO=1;SAF=67;SAR=110;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00705188;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.73529e-05;OID=.;OPOS=94471075;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:179:179:1:0:177:179:110:67:1:0:111:68:0:0 chr1 94473845 . T C 76.98 PASS AO=15;DP=31;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.00439865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.533;QD=9.62293;RBI=0.0714422;REFB=-0.0108196;REVB=0.0713067;RO=16;SAF=12;SAR=3;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141365;STB=0.539948;TYPE=snp;VARB=0.00735553;OID=.;OPOS=94473845;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:31:32:16:16:15:16:3:12:11:5:4:12:11:5 chr1 94473864 . C T 64.83 PASS AO=13;DP=29;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=0.0032464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.46;QD=8.64348;RBI=0.0177266;REFB=0.0152702;REVB=-0.0174268;RO=16;SAF=11;SAR=2;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151575;STB=0.59984;TYPE=snp;VARB=-0.00584485;OID=.;OPOS=94473864;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:29:30:16:16:13:14:2:11:12:4:2:12:12:4 chr1 94474328 . T C 64.61 PASS AO=29;DP=102;FAO=29;FDP=102;FR=.;FRO=73;FSAF=6;FSAR=23;FSRF=30;FSRR=43;FWDB=-0.0497343;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.082;QD=2.53367;RBI=0.0546133;REFB=-0.00692131;REVB=0.0225636;RO=72;SAF=6;SAR=23;SRF=30;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.298295;STB=0.676336;TYPE=snp;VARB=0.0195705;OID=.;OPOS=94474328;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:102:102:72:73:29:29:23:6:30:42:23:6:30:43 chr1 94476203 . CT C 231.03 PASS AO=65;DP=167;FAO=67;FDP=163;FR=.;FRO=96;FSAF=51;FSAR=16;FSRF=43;FSRR=53;FWDB=-0.00864257;FXX=0.0121205;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.9278;QD=5.66951;RBI=0.0103595;REFB=-0.00657726;REVB=-0.00571191;RO=96;SAF=50;SAR=15;SRF=43;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.368966;STB=0.700514;TYPE=del;VARB=0.00761396;OID=.;OPOS=94476204;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:65:165:67:163:96:51:16:43:53:99:96:50:15:43:53 chr1 94476388 . C G 200.88 PASS AO=38;DP=64;FAO=38;FDP=64;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=31;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=0.00287058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.8;QD=12.555;RBI=0.0180556;REFB=-0.0390054;REVB=0.0178259;RO=26;SAF=7;SAR=31;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208706;STB=0.615587;TYPE=snp;VARB=0.022723;OID=.;OPOS=94476388;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:64:64:26:26:38:38:31:7:10:16:31:7:10:16 chr1 94484123 . T C 177.93 PASS AO=60;DP=164;FAO=60;FDP=164;FR=.;FRO=104;FSAF=38;FSAR=22;FSRF=61;FSRR=43;FWDB=-0.0026199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.977;QD=4.33974;RBI=0.0100658;REFB=-0.018207;REVB=0.00971886;RO=104;SAF=38;SAR=22;SRF=61;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.055124;STB=0.531401;TYPE=snp;VARB=0.0141035;OID=.;OPOS=94484123;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:164:104:104:60:60:22:38:61:43:22:38:61:43 chr1 94564521 . C T 225.62 PASS AO=45;DP=86;FAO=47;FDP=88;FR=.;FRO=41;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=14;FSRR=27;FWDB=0.0753879;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.1469;QD=10.2555;RBI=0.075423;REFB=-0.0641461;REVB=-0.00230178;RO=40;SAF=24;SAR=21;SRF=14;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155487;STB=0.578559;TYPE=snp;VARB=0.0409377;OID=.;OPOS=94564521;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:88:40:41:45:47:21:24:14:26:23:24:14:27 chr1 94578548 . T C 734.92 PASS AO=33;DP=83;FAO=82;FDP=82;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=28;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0838672;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.5648;QD=35.8496;RBI=0.0862656;REFB=0;REVB=0.0202005;RO=0;SAF=26;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.44409e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00127803;OID=.;OPOS=94578548;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:81:82:0:0:33:82:7:26:0:0:54:28:0:0 chr1 94639337 . A G 383.17 PASS AO=44;DP=48;FAO=47;FDP=52;FR=.;FRO=5;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0204721;FXX=0.0545355;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.946;QD=29.475;RBI=0.0308584;REFB=-0.0868015;REVB=0.0230897;RO=4;SAF=22;SAR=22;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0780849;STB=0.548999;TYPE=snp;VARB=0.00242681;OID=.;OPOS=94639337;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:48:52:4:5:44:47:22:22:4:0:24:23:5:0 chr1 94639447 . C T 479.47 PASS AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00549624;FXX=0.0192271;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.972;QD=37.6056;RBI=0.0311322;REFB=0;REVB=0.0306432;RO=0;SAF=29;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.78765e-05;OID=.;OPOS=94639447;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:52:51:0:0:51:51:22:29:0:0:22:29:0:0 chr1 94643531 . T C 210.01 PASS AO=74;DP=207;FAO=74;FDP=207;FR=.;FRO=133;FSAF=47;FSAR=27;FSRF=69;FSRR=64;FWDB=-0.00650134;FXX=0.00956892;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.171;QD=4.05808;RBI=0.0131355;REFB=-0.00350433;REVB=-0.0114138;RO=132;SAF=47;SAR=27;SRF=68;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139249;STB=0.57725;TYPE=snp;VARB=0.00463642;OID=.;OPOS=94643531;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:207:132:133:74:74:27:47:68:64:27:47:69:64 chr1 95001600 . A C 1714.33 PASS AO=144;DP=194;FAO=191;FDP=191;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=112;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00439336;FXX=0.0103622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.008;QD=35.9023;RBI=0.00488654;REFB=0;REVB=0.00213931;RO=0;SAF=109;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000494178;OID=.;OPOS=95001600;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:194:191:0:0:144:191:35:109:0:0:79:112:0:0 chr1 95330372 . G A 1249.73 PASS AO=133;DP=135;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0197235;FXX=0.0148137;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.635;QD=37.5858;RBI=0.0203742;REFB=-0.00514896;REVB=0.00510796;RO=0;SAF=59;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.54694e-05;OID=.;OPOS=95330372;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:135:133:0:0:133:133:74:59:0:0:74:59:0:0 chr1 95709821 . T C 1185.4 PASS AO=124;DP=125;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0220757;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.8007;QD=38.2386;RBI=0.024585;REFB=0;REVB=0.0108206;RO=0;SAF=51;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.64592e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.43719e-05;OID=.;OPOS=95709821;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:125:124:0:0:124:124:73:51:0:0:73:51:0:0 chr1 95709939 . T G 2426.37 PASS AO=258;DP=262;FAO=259;FDP=259;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=172;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173858;FXX=0.0226407;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.873;QD=37.4728;RBI=0.0173887;REFB=-0.00299909;REVB=0.000317886;RO=3;SAF=86;SAR=172;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000111893;OID=.;OPOS=95709939;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:91:262:259:3:0:258:259:172:86:1:2:172:87:0:0 chr1 97770920 . C T 172.28 PASS AO=41;DP=87;FAO=41;FDP=86;FR=.;FRO=45;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=-0.00358559;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2869;QD=8.01304;RBI=0.0674609;REFB=-0.0391245;REVB=-0.0673656;RO=45;SAF=23;SAR=18;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0680149;STB=0.537916;TYPE=snp;VARB=0.0338793;OID=.;OPOS=97770920;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:86:45:45:41:41:18:23:22:23:18:23:22:23 chr1 97981421 . C T 352.14 PASS AO=83;DP=170;FAO=84;FDP=172;FR=.;FRO=88;FSAF=49;FSAR=35;FSRF=25;FSRR=63;FWDB=0.00657331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5667;QD=8.18929;RBI=0.0330583;REFB=0.00208234;REVB=0.0323982;RO=87;SAF=49;SAR=34;SRF=25;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.27577;STB=0.649587;TYPE=snp;VARB=-0.00223823;OID=.;OPOS=97981421;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:172:87:88:83:84:34:49:25:62:35:49:25:63 chr1 98165091 . T C 474.03 PASS AO=123;DP=270;FAO=124;FDP=271;FR=.;FRO=147;FSAF=33;FSAR=91;FSRF=43;FSRR=104;FWDB=0.0348975;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.7994;QD=6.99677;RBI=0.0374963;REFB=-0.00370513;REVB=0.0137164;RO=147;SAF=32;SAR=91;SRF=43;SRR=104;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0403909;STB=0.518011;TYPE=snp;VARB=0.00477746;OID=.;OPOS=98165091;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:270:271:147:147:123:124:91:32:43:104:91:33:43:104 chr1 98348885 . G A 312.83 PASS AO=88;DP=207;FAO=88;FDP=206;FR=.;FRO=118;FSAF=34;FSAR=54;FSRF=44;FSRR=74;FWDB=-0.0225509;FXX=0.00483068;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.895;QD=6.07435;RBI=0.0225518;REFB=-0.0141246;REVB=0.00019649;RO=118;SAF=34;SAR=54;SRF=44;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0146581;STB=0.508172;TYPE=snp;VARB=0.0143983;OID=.;OPOS=98348885;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:206:118:118:88:88:54:34:44:74:54:34:44:74 chr1 98510679 . G GAAAC 177.55 PASS AO=29;DP=131;FAO=46;FDP=100;FR=.;FRO=54;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=32;FSRR=22;FWDB=-0.00853432;FXX=0.0565984;HRUN=3;LEN=4;MLLD=184.677;QD=7.10205;RBI=0.00985064;REFB=0.0212663;REVB=-0.00491941;RO=94;SAF=13;SAR=16;SRF=46;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0516301;STB=0.549978;TYPE=ins;VARB=-0.0248507;OID=.;OPOS=98510680;OREF=-;OALT=AAAC;OMAPALT=GAAAC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:29:131:46:100:54:23:23:32:22:99:94:13:16:46:48 chr1 98510847 . C T 408.72 PASS AO=84;DP=151;FAO=84;FDP=151;FR=.;FRO=67;FSAF=51;FSAR=33;FSRF=22;FSRR=45;FWDB=0.0556911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.495;QD=10.8269;RBI=0.0557557;REFB=-0.0188407;REVB=0.00268225;RO=67;SAF=51;SAR=33;SRF=22;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22523;STB=0.622799;TYPE=snp;VARB=0.0249324;OID=.;OPOS=98510847;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:151:67:67:84:84:33:51:22:45:33:51:22:45 chr1 99225627 . G A 2391.71 PASS AO=247;DP=248;FAO=250;FDP=250;FR=.;FRO=0;FSAF=146;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.027052;FXX=0.0234366;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.29;QD=38.2674;RBI=0.0278988;REFB=0;REVB=0.00682155;RO=0;SAF=149;SAR=98;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.57513e-05;OID=.;OPOS=99225627;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:248:250:0:0:247:250:98:149:0:0:104:146:0:0 chr1 100318245 . T G 137.08 PASS AO=30;DP=60;FAO=30;FDP=60;FR=.;FRO=30;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.00707613;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.232;QD=9.13846;RBI=0.0142604;REFB=-0.0326872;REVB=0.0123809;RO=29;SAF=19;SAR=11;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0755164;STB=0.55229;TYPE=snp;VARB=0.0107321;OID=.;OPOS=100318245;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:29:30:30:30:11:19:16:13:11:19:16:14 chr1 100327183 . T C 531.8 PASS AO=132;DP=264;FAO=128;FDP=260;FR=.;FRO=132;FSAF=45;FSAR=83;FSRF=49;FSRR=83;FWDB=0.00636563;FXX=0.0225555;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.2976;QD=8.18156;RBI=0.0178702;REFB=0.00494518;REVB=0.016698;RO=129;SAF=47;SAR=85;SRF=49;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0232031;STB=0.510868;TYPE=snp;VARB=-0.00442247;OID=.;OPOS=100327183;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:264:260:129:132:132:128:85:47:49:80:83:45:49:83 chr1 100336361 . C T 1517.29 PASS AO=157;DP=158;FAO=161;FDP=161;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000596034;FXX=0.00617246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.69;QD=37.6966;RBI=0.0216863;REFB=-0.141144;REVB=0.0216781;RO=1;SAF=95;SAR=62;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00761159;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.45936e-05;OID=.;OPOS=100336361;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:158:161:1:0:157:161:62:95:0:1:65:96:0:0 chr1 100340782 . G T 121.76 PASS AO=38;DP=101;FAO=38;FDP=101;FR=.;FRO=63;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=39;FWDB=-0.0218332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.587;QD=4.82214;RBI=0.0224167;REFB=-0.00720989;REVB=-0.00508114;RO=63;SAF=23;SAR=15;SRF=24;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242052;STB=0.637833;TYPE=snp;VARB=0.0156579;OID=.;OPOS=100340782;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:63:63:38:38:15:23:24:39:15:23:24:39 chr1 100377973 . T C 663.49 PASS AO=142;DP=268;FAO=144;FDP=269;FR=.;FRO=125;FSAF=67;FSAR=77;FSRF=39;FSRR=86;FWDB=-0.0157406;FXX=0.00370357;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.019;QD=9.86596;RBI=0.0595882;REFB=-0.0309592;REVB=0.0574716;RO=125;SAF=67;SAR=75;SRF=39;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139114;STB=0.57228;TYPE=snp;VARB=0.021593;OID=.;OPOS=100377973;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:268:269:125:125:142:144:75:67:39:86:77:67:39:86 chr1 100466279 . G A 151.29 PASS AO=38;DP=86;FAO=38;FDP=85;FR=.;FRO=47;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=22;FSRR=25;FWDB=-0.0357486;FXX=0.0449388;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2159;QD=7.11972;RBI=0.0443645;REFB=0.00220833;REVB=-0.0262726;RO=44;SAF=14;SAR=24;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130085;STB=0.557389;TYPE=snp;VARB=-0.00302531;OID=.;OPOS=100466279;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:85:44:47:38:38:24:14:22:22:24:14:22:25 chr1 100472604 . A G 196.04 PASS AO=70;DP=194;FAO=70;FDP=200;FR=.;FRO=130;FSAF=42;FSAR=28;FSRF=67;FSRR=63;FWDB=-0.0248528;FXX=0.0521302;HRUN=5;LEN=1;MLLD=73.8821;QD=3.9208;RBI=0.034216;REFB=-0.0248837;REVB=-0.0235175;RO=124;SAF=42;SAR=28;SRF=62;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113882;STB=0.555992;TYPE=snp;VARB=0.017906;OID=.;OPOS=100472604;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:200:124:130:70:70:28:42:62:62:28:42:67:63 chr1 100488177 . C T 253.33 PASS AO=64;DP=139;FAO=64;FDP=139;FR=.;FRO=75;FSAF=31;FSAR=33;FSRF=41;FSRR=34;FWDB=-0.00178613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.67;QD=7.28999;RBI=0.010012;REFB=-0.00537766;REVB=-0.00985137;RO=73;SAF=31;SAR=33;SRF=40;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0609757;STB=0.533562;TYPE=snp;VARB=0.00662994;OID=.;OPOS=100488177;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:73:75:64:64:33:31:40:33:33:31:41:34 chr1 100503875 . G A 22.75 PASS AO=4;DP=8;FAO=4;FDP=8;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0288739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.704;QD=11.3733;RBI=0.0371551;REFB=0.00325079;REVB=0.0233838;RO=4;SAF=2;SAR=2;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.418587;STB=0.749055;TYPE=snp;VARB=-0.00327448;OID=.;OPOS=100503875;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:8:8:4:4:4:4:2:2:0:4:2:2:0:4 chr1 100535250 . CT C 261.55 PASS AO=90;DP=226;FAO=140;FDP=221;FR=.;FRO=81;FSAF=80;FSAR=60;FSRF=38;FSRR=43;FWDB=0.235305;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.98837;QD=4.7339;RBI=0.275783;REFB=-0.0137688;REVB=0.143832;RO=83;SAF=46;SAR=44;SRF=42;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00445346;STB=0.537854;TYPE=del;VARB=0.0686701;OID=.;OPOS=100535251;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:90:213:140:221:81:80:60:38:43:63:83:46:44:42:41 chr1 100547994 . T C 527.69 PASS AO=126;DP=255;FAO=126;FDP=255;FR=.;FRO=129;FSAF=40;FSAR=86;FSRF=60;FSRR=69;FWDB=0.0109778;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.558;QD=8.27744;RBI=0.0399344;REFB=-0.00423562;REVB=0.0383959;RO=129;SAF=40;SAR=86;SRF=60;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147159;STB=0.581068;TYPE=snp;VARB=0.00580616;OID=.;OPOS=100547994;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:255:255:129:129:126:126:86:40:60:69:86:40:60:69 chr1 100575933 . G A 684.79 PASS AO=159;DP=313;FAO=159;FDP=313;FR=.;FRO=154;FSAF=98;FSAR=61;FSRF=74;FSRR=80;FWDB=0.00266661;FXX=0.00318461;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2941;QD=8.75127;RBI=0.00507874;REFB=-0.0272724;REVB=0.00432236;RO=149;SAF=98;SAR=61;SRF=73;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114699;STB=0.568399;TYPE=snp;VARB=0.0330204;OID=.;OPOS=100575933;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:313:313:149:154:159:159:61:98:73:76:61:98:74:80 chr1 100575974 . T C 557.93 PASS AO=143;DP=308;FAO=143;FDP=307;FR=.;FRO=164;FSAF=64;FSAR=79;FSRF=98;FSRR=66;FWDB=-0.00339773;FXX=0.00324665;HRUN=4;LEN=1;MLLD=232.877;QD=7.2695;RBI=0.00552398;REFB=-0.0138326;REVB=-0.00435543;RO=162;SAF=64;SAR=79;SRF=98;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150781;STB=0.579661;TYPE=snp;VARB=0.0146879;OID=.;OPOS=100575974;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:308:307:162:164:143:143:79:64:98:64:79:64:98:66 chr1 100598866 . G A 319.41 PASS AO=71;DP=143;FAO=73;FDP=144;FR=.;FRO=71;FSAF=35;FSAR=38;FSRF=19;FSRR=52;FWDB=-0.00663346;FXX=0.00689608;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.823;QD=8.87236;RBI=0.00859783;REFB=-0.0180932;REVB=0.00546991;RO=71;SAF=35;SAR=36;SRF=19;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206148;STB=0.605509;TYPE=snp;VARB=0.0103834;OID=.;OPOS=100598866;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:144:71:71:71:73:36:35:19:52:38:35:19:52 chr1 100598867 . C T 319.59 PASS AO=71;DP=143;FAO=73;FDP=144;FR=.;FRO=71;FSAF=35;FSAR=38;FSRF=19;FSRR=52;FWDB=-0.0112484;FXX=0.00689608;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.3857;QD=8.8774;RBI=0.0157071;REFB=-0.00278627;REVB=0.0109629;RO=71;SAF=35;SAR=36;SRF=19;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206148;STB=0.605509;TYPE=snp;VARB=0.00125236;OID=.;OPOS=100598867;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:144:71:71:71:73:36:35:19:52:38:35:19:52 chr1 100671866 . T A 131.01 PASS AO=49;DP=135;FAO=53;FDP=144;FR=.;FRO=91;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=51;FSRR=40;FWDB=0.00562828;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=76.2442;QD=3.63907;RBI=0.0240064;REFB=-0.0045481;REVB=-0.0233373;RO=64;SAF=29;SAR=20;SRF=35;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0465157;STB=0.540968;TYPE=snp;VARB=0.018922;OID=.;OPOS=100671866;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:144:64:91:49:53:20:29:35:29:20:33:51:40 chr1 100672060 . T C 3652.12 PASS AO=367;DP=367;FAO=381;FDP=381;FR=.;FRO=0;FSAF=173;FSAR=208;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121462;FXX=0.00261773;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.311;QD=38.3425;RBI=0.0565824;REFB=0;REVB=0.0552634;RO=0;SAF=163;SAR=204;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.11809e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.527e-05;OID=.;OPOS=100672060;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:367:381:0:0:367:381:204:163:0:0:208:173:0:0 chr1 100681587 . A G 507.44 PASS AO=129;DP=257;FAO=124;FDP=250;FR=.;FRO=126;FSAF=63;FSAR=61;FSRF=73;FSRR=53;FWDB=0.00208663;FXX=0.0384601;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.93;QD=8.11899;RBI=0.0024125;REFB=-0.0165402;REVB=0.00121085;RO=125;SAF=69;SAR=60;SRF=73;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0445029;STB=0.535981;TYPE=snp;VARB=0.0155603;OID=.;OPOS=100681587;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:257:250:125:126:129:124:60:69:73:52:61:63:73:53 chr1 100736221 . C T 50.63 PASS AO=30;DP=118;FAO=29;FDP=118;FR=.;FRO=89;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=44;FSRR=45;FWDB=-0.033028;FXX=0.00840265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.9809;QD=1.71622;RBI=0.0682113;REFB=-0.00952662;REVB=-0.0596819;RO=88;SAF=11;SAR=19;SRF=44;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167555;STB=0.588174;TYPE=snp;VARB=0.023967;OID=.;OPOS=100736221;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:118:118:88:89:30:29:19:11:44:44:18:11:44:45 chr1 100817384 . A G 408.02 PASS AO=77;DP=128;FAO=77;FDP=128;FR=.;FRO=51;FSAF=30;FSAR=47;FSRF=16;FSRR=35;FWDB=-0.0452558;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.9417;QD=12.7505;RBI=0.0633764;REFB=-0.0164134;REVB=-0.0443675;RO=51;SAF=30;SAR=47;SRF=16;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0594462;STB=0.532229;TYPE=snp;VARB=0.0100445;OID=.;OPOS=100817384;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:51:51:77:77:47:30:16:35:47:30:16:35 chr1 100856479 . C T 278.54 PASS AO=51;DP=84;FAO=51;FDP=83;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=38;FSRF=9;FSRR=23;FWDB=0.019934;FXX=0.0235266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.564;QD=13.4237;RBI=0.0203755;REFB=-0.0171097;REVB=-0.0042183;RO=32;SAF=13;SAR=38;SRF=9;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.024196;STB=0.513193;TYPE=snp;VARB=0.0256746;OID=.;OPOS=100856479;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:83:32:32:51:51:38:13:9:23:38:13:9:23 chr1 100949860 . G A 215.8 PASS AO=61;DP=145;FAO=61;FDP=145;FR=.;FRO=84;FSAF=32;FSAR=29;FSRF=44;FSRR=40;FWDB=-0.00497863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.356;QD=5.95314;RBI=0.013925;REFB=-0.00199906;REVB=-0.0130045;RO=84;SAF=32;SAR=29;SRF=44;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00080845;STB=0.500453;TYPE=snp;VARB=0.00228447;OID=.;OPOS=100949860;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:84:84:61:61:29:32:44:40:29:32:44:40 chr1 101005855 . T C 710.47 PASS AO=77;DP=79;FAO=77;FDP=79;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00784513;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=245.191;QD=35.9733;RBI=0.0114125;REFB=-0.0624104;REVB=0.00828846;RO=2;SAF=36;SAR=41;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0225254;STB=0.511902;TYPE=snp;VARB=0.000681575;OID=.;OPOS=101005855;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:79:79:2:2:77:77:41:36:0:2:41:36:0:2 chr1 101007055 . C T 1037.99 PASS AO=106;DP=107;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00154902;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.882;QD=38.444;RBI=0.00876879;REFB=0;REVB=0.00863089;RO=0;SAF=56;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.52815e-05;OID=.;OPOS=101007055;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:107:108:0:0:106:108:50:56:0:0:51:57:0:0 chr1 101203827 . G A 2548.25 PASS AO=256;DP=258;FAO=266;FDP=266;FR=.;FRO=0;FSAF=117;FSAR=149;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023016;FXX=0.011152;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.514;QD=38.3195;RBI=0.0369054;REFB=0;REVB=0.0288491;RO=0;SAF=114;SAR=142;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2425e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000319108;OID=.;OPOS=101203827;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:258:266:0:0:256:266:142:114:0:0:149:117:0:0 chr1 102296279 . T C 586.95 PASS AO=137;DP=272;FAO=137;FDP=272;FR=.;FRO=135;FSAF=62;FSAR=75;FSRF=54;FSRR=81;FWDB=-0.00648868;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=83.9226;QD=8.63163;RBI=0.00663012;REFB=-0.0284194;REVB=-0.00136218;RO=135;SAF=62;SAR=75;SRF=54;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0482949;STB=0.52645;TYPE=snp;VARB=0.0249364;OID=.;OPOS=102296279;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:272:272:135:135:137:137:75:62:54:81:75:62:54:81 chr1 103352451 . A G 267.75 PASS AO=67;DP=145;FAO=68;FDP=147;FR=.;FRO=79;FSAF=38;FSAR=30;FSRF=36;FSRR=43;FWDB=0.00290888;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.4436;QD=7.28583;RBI=0.0141341;REFB=-0.0190313;REVB=0.0138315;RO=78;SAF=38;SAR=29;SRF=35;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114842;STB=0.55545;TYPE=snp;VARB=0.0246615;OID=.;OPOS=103352451;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:147:78:79:67:68:29:38:35:43:30:38:36:43 chr1 103354115 . T C 518.68 PASS AO=113;DP=211;FAO=113;FDP=212;FR=.;FRO=99;FSAF=59;FSAR=54;FSRF=46;FSRR=53;FWDB=0.0250996;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.5219;QD=9.78637;RBI=0.0347902;REFB=0.0412905;REVB=-0.0240908;RO=98;SAF=59;SAR=54;SRF=45;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.053504;STB=0.526825;TYPE=snp;VARB=-0.0360683;OID=.;OPOS=103354115;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:212:98:99:113:113:54:59:45:53:54:59:46:53 chr1 103354138 . A G 417.02 PASS AO=100;DP=247;FAO=115;FDP=261;FR=.;FRO=146;FSAF=55;FSAR=60;FSRF=84;FSRR=62;FWDB=0.000938564;FXX=0.00381665;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.236;QD=6.39115;RBI=0.0093364;REFB=-0.00593905;REVB=-0.0092891;RO=138;SAF=41;SAR=59;SRF=77;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153917;STB=0.554143;TYPE=snp;VARB=0.00870383;OID=.;OPOS=103354138;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:247:261:138:146:100:115:59:41:77:61:60:55:84:62 chr1 103354428 . A G 692.54 PASS AO=132;DP=220;FAO=132;FDP=220;FR=.;FRO=88;FSAF=71;FSAR=61;FSRF=38;FSRR=50;FWDB=0.0205479;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=127.951;QD=12.5917;RBI=0.0210997;REFB=-0.0156715;REVB=0.00479383;RO=86;SAF=71;SAR=61;SRF=37;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0784977;STB=0.542389;TYPE=snp;VARB=0.00955822;OID=.;OPOS=103354428;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:220:220:86:88:132:132:61:71:37:49:61:71:38:50 chr1 103379918 . G A 236.83 PASS AO=68;DP=169;FAO=69;FDP=168;FR=.;FRO=99;FSAF=31;FSAR=38;FSRF=34;FSRR=65;FWDB=-0.0791536;FXX=0.011764;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.0911;QD=5.63889;RBI=0.0800113;REFB=0.0174197;REVB=-0.0116836;RO=99;SAF=31;SAR=37;SRF=34;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121418;STB=0.563818;TYPE=snp;VARB=-0.0268586;OID=.;OPOS=103379918;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:168:99:99:68:69:37:31:34:65:38:31:34:65 chr1 103444679 . T G 202.59 PASS AO=62;DP=157;FAO=62;FDP=157;FR=.;FRO=95;FSAF=29;FSAR=33;FSRF=49;FSRR=46;FWDB=0.0505248;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=135.48;QD=5.16164;RBI=0.0560986;REFB=-0.0112703;REVB=-0.0243782;RO=95;SAF=29;SAR=33;SRF=49;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0515547;STB=0.529076;TYPE=snp;VARB=0.0165253;OID=.;OPOS=103444679;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:157:95:95:62:62:33:29:49:46:33:29:49:46 chr1 103469989 . A G 229.7 PASS AO=49;DP=96;FAO=50;FDP=96;FR=.;FRO=46;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=15;FSRR=31;FWDB=0.00396159;FXX=0.0103082;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.951;QD=9.57071;RBI=0.0141134;REFB=0.0111921;REVB=0.013546;RO=45;SAF=23;SAR=26;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119705;STB=0.565229;TYPE=snp;VARB=-0.014403;OID=.;OPOS=103469989;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:45:46:49:50:26:23:15:30:27:23:15:31 chr1 103487244 . T C 275.08 PASS AO=63;DP=125;FAO=63;FDP=125;FR=.;FRO=62;FSAF=39;FSAR=24;FSRF=30;FSRR=32;FWDB=-0.0153171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.209;QD=8.80256;RBI=0.0155085;REFB=-0.0138465;REVB=0.00242879;RO=61;SAF=39;SAR=24;SRF=29;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131048;STB=0.568728;TYPE=snp;VARB=0.0142794;OID=.;OPOS=103487244;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:61:62:63:63:24:39:29:32:24:39:30:32 chr1 103491461 . T G 217.99 PASS AO=58;DP=134;FAO=59;FDP=134;FR=.;FRO=75;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=21;FSRR=54;FWDB=0.00768682;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=104.479;QD=6.50723;RBI=0.00834689;REFB=-0.0132858;REVB=-0.00325321;RO=76;SAF=25;SAR=33;SRF=21;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164923;STB=0.584457;TYPE=snp;VARB=0.0129539;OID=.;OPOS=103491461;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:76:75:58:59:33:25:21:55:34:25:21:54 chr1 103496792 . A G 161.58 PASS AO=36;DP=79;FAO=38;FDP=79;FR=.;FRO=41;FSAF=11;FSAR=27;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=-0.0273071;FXX=0.0246883;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.0412;QD=8.1811;RBI=0.0273435;REFB=0.0238643;REVB=-0.0014099;RO=43;SAF=10;SAR=26;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224563;STB=0.600389;TYPE=snp;VARB=-0.0239275;OID=.;OPOS=103496792;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:43:41:36:38:26:10:21:22:27:11:19:22 chr1 104076462 . C T 872.5 PASS AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0168066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.476;QD=37.9348;RBI=0.0179698;REFB=0;REVB=0.00636011;RO=0;SAF=42;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.93497e-06;OID=.;OPOS=104076462;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:92:92:0:0:92:92:50:42:0:0:50:42:0:0 chr1 104116413 . T C 667.31 PASS AO=153;DP=333;FAO=167;FDP=347;FR=.;FRO=180;FSAF=92;FSAR=75;FSRF=91;FSRR=89;FWDB=0.0392128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.304;QD=7.69235;RBI=0.0580833;REFB=-0.0466975;REVB=0.0428489;RO=180;SAF=79;SAR=74;SRF=91;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0105645;STB=0.52365;TYPE=snp;VARB=0.0518635;OID=.;OPOS=104116413;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:333:347:180:180:153:167:74:79:91:89:75:92:91:89 chr1 104166496 . T C 119.55 PASS AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021934;FXX=0.0713776;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.5221;QD=36.7843;RBI=0.0372441;REFB=0;REVB=0.0301002;RO=0;SAF=4;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00450736;OID=.;OPOS=104166496;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:13:0:0:13:13:9:4:0:0:9:4:0:0 chr1 104297389 . C T 19.47 PASS AO=36;DP=232;FAO=36;FDP=232;FR=.;FRO=196;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=86;FSRR=110;FWDB=-0.0262975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.747;QD=0.335755;RBI=0.0346364;REFB=-0.00763084;REVB=-0.0225416;RO=194;SAF=20;SAR=16;SRF=86;SRR=108;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143468;STB=0.59767;TYPE=snp;VARB=0.0435278;OID=.;OPOS=104297389;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:232:232:194:196:36:36:16:20:86:108:16:20:86:110 chr1 107600042 . G A 61.44 PASS AO=17;DP=49;FAO=18;FDP=49;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.00562197;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.867;QD=5.01536;RBI=0.00801621;REFB=-0.012724;REVB=0.00571429;RO=32;SAF=10;SAR=7;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166646;STB=0.601254;TYPE=snp;VARB=0.0228361;OID=.;OPOS=107600042;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:49:49:32:31:17:18:7:10:14:18:7:11:14:17 chr1 107600869 . G A 416.66 PASS AO=106;DP=233;FAO=108;FDP=235;FR=.;FRO=127;FSAF=40;FSAR=68;FSRF=59;FSRR=68;FWDB=0.0120794;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=270.028;QD=7.09203;RBI=0.0135668;REFB=-0.0112692;REVB=-0.00617608;RO=120;SAF=40;SAR=66;SRF=58;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105153;STB=0.553063;TYPE=snp;VARB=0.0103501;OID=.;OPOS=107600869;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:233:235:120:127:106:108:66:40:58:62:68:40:59:68 chr1 107979396 . A C 2667.14 PASS AO=274;DP=276;FAO=282;FDP=282;FR=.;FRO=0;FSAF=142;FSAR=140;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0200446;FXX=0.00704201;HRUN=3;LEN=1;MLLD=179.345;QD=37.8318;RBI=0.0269009;REFB=-0.115871;REVB=0.0179408;RO=2;SAF=141;SAR=133;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000201915;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000133275;OID=.;OPOS=107979396;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:276:282:2:0:274:282:133:141:1:1:140:142:0:0 chr1 108113139 . G C 131.12 PASS AO=30;DP=61;FAO=30;FDP=62;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=10;FWDB=0.00196186;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.972;QD=8.4592;RBI=0.00256144;REFB=-0.0122604;REVB=0.00164683;RO=30;SAF=15;SAR=15;SRF=20;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14956;STB=0.596712;TYPE=snp;VARB=0.0106139;OID=.;OPOS=108113139;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:62:30:32:30:30:15:15:20:10:15:15:22:10 chr1 108113329 . C T 115.38 PASS AO=20;DP=32;FAO=20;FDP=32;FR=.;FRO=12;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0663464;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.927;QD=14.4229;RBI=0.0689086;REFB=-0.0550639;REVB=0.018616;RO=12;SAF=13;SAR=7;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163157;STB=0.590816;TYPE=snp;VARB=0.0284768;OID=.;OPOS=108113329;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:32:32:12:12:20:20:7:13:5:7:7:13:5:7 chr1 108113500 . T G 10.16 PASS AO=3;DP=15;FAO=3;FDP=15;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=-0.0432662;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=89.3846;QD=2.70965;RBI=0.0463442;REFB=-0.00159277;REVB=-0.0166079;RO=12;SAF=2;SAR=1;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109789;STB=0.57846;TYPE=snp;VARB=-0.00139989;OID=.;OPOS=108113500;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:15:15:12:12:3:3:1:2:9:3:1:2:9:3 chr1 108113510 . G T 21.28 PASS AO=4;DP=14;FAO=5;FDP=15;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0540585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.278;QD=5.67378;RBI=0.0550332;REFB=0.00475318;REVB=0.0103118;RO=10;SAF=2;SAR=2;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217427;STB=0.571156;TYPE=snp;VARB=-0.00944728;OID=.;OPOS=108113510;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:14:15:10:10:4:5:2:2:7:3:2:3:7:3 chr1 108113526 . C G 139.05 PASS AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0390759;FXX=0.062461;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5435;QD=37.0792;RBI=0.0982268;REFB=0;REVB=0.0901198;RO=0;SAF=8;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00645054;OID=.;OPOS=108113526;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:15:0:0:15:15:7:8:0:0:7:8:0:0 chr1 108113856 . G A 1962.31 PASS AO=205;DP=205;FAO=205;FDP=205;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00806809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.709;QD=38.2889;RBI=0.00811595;REFB=0;REVB=0.000880081;RO=0;SAF=85;SAR=120;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.15097e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.03295e-05;OID=.;OPOS=108113856;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:205:205:0:0:205:205:120:85:0:0:120:85:0:0 chr1 108113865 . G A 1959.39 PASS AO=196;DP=197;FAO=206;FDP=206;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.012577;FXX=0.00483068;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.164;QD=38.0464;RBI=0.0343144;REFB=-0.0511671;REVB=-0.0319264;RO=1;SAF=85;SAR=111;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00427143;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.84748e-05;OID=.;OPOS=108113865;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:197:206:1:0:196:206:111:85:0:1:119:87:0:0 chr1 108115145 . T C 1609.41 PASS AO=170;DP=175;FAO=178;FDP=183;FR=.;FRO=5;FSAF=86;FSAR=92;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.00301235;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.2436;QD=35.1783;RBI=0.0164555;REFB=-0.012223;REVB=0.0161774;RO=4;SAF=82;SAR=88;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.010178;STB=0.507748;TYPE=snp;VARB=0.00376153;OID=.;OPOS=108115145;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:175:183:4:5:170:178:88:82:1:3:92:86:1:4 chr1 108307727 . T A 543.2 PASS AO=135;DP=287;FAO=135;FDP=283;FR=.;FRO=148;FSAF=62;FSAR=73;FSRF=85;FSRR=63;FWDB=-0.0337756;FXX=0.0207605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.534;QD=7.67776;RBI=0.0346013;REFB=-0.0086884;REVB=0.00751381;RO=148;SAF=62;SAR=73;SRF=85;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108976;STB=0.559977;TYPE=snp;VARB=0.0131655;OID=.;OPOS=108307727;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:287:283:148:148:135:135:73:62:85:63:73:62:85:63 chr1 108313258 . C T 1015.75 PASS AO=126;DP=138;FAO=124;FDP=137;FR=.;FRO=13;FSAF=66;FSAR=58;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=3.99501e-05;FXX=0.00724585;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.1963;QD=29.6568;RBI=0.00250918;REFB=-0.0189695;REVB=0.00250886;RO=12;SAF=68;SAR=58;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0203469;STB=0.506732;TYPE=snp;VARB=0.00898699;OID=.;OPOS=108313258;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:138:137:12:13:126:124:58:68:5:7:58:66:6:7 chr1 108728484 . T C 219.45 PASS AO=54;DP=117;FAO=55;FDP=120;FR=.;FRO=65;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=27;FSRR=38;FWDB=-0.0163398;FXX=0.00826378;HRUN=3;LEN=1;MLLD=171.94;QD=7.31487;RBI=0.0176044;REFB=-0.00628026;REVB=-0.00655172;RO=63;SAF=25;SAR=29;SRF=25;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0647268;STB=0.531248;TYPE=snp;VARB=0.0109614;OID=.;OPOS=108728484;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:120:63:65:54:55:29:25:25:38:29:26:27:38 chr1 109192990 . C T 308.57 PASS AO=78;DP=168;FAO=78;FDP=168;FR=.;FRO=90;FSAF=28;FSAR=50;FSRF=26;FSRR=64;FWDB=0.0266219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.1252;QD=7.34678;RBI=0.0453469;REFB=0.0130924;REVB=0.0367098;RO=88;SAF=28;SAR=50;SRF=24;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.092655;STB=0.541741;TYPE=snp;VARB=-0.0141717;OID=.;OPOS=109192990;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:88:90:78:78:50:28:24:64:50:28:26:64 chr1 109265029 . G T 626.59 PASS AO=163;DP=259;FAO=126;FDP=221;FR=.;FRO=95;FSAF=63;FSAR=63;FSRF=61;FSRR=34;FWDB=-0.0051314;FXX=0.0221229;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.6384;QD=11.341;RBI=0.0501132;REFB=-0.0364079;REVB=-0.0498498;RO=94;SAF=88;SAR=75;SRF=84;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.248596;STB=0.561076;TYPE=snp;VARB=0.0121264;OID=.;OPOS=109265029;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:259:221:94:95:163:126:75:88:84:10:63:63:61:34 chr1 109268441 . G A 665.61 PASS AO=135;DP=241;FAO=137;FDP=243;FR=.;FRO=106;FSAF=61;FSAR=76;FSRF=43;FSRR=63;FWDB=-0.0319586;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0494;QD=10.9566;RBI=0.038988;REFB=-0.00303017;REVB=-0.0223319;RO=106;SAF=59;SAR=76;SRF=43;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0258962;STB=0.517546;TYPE=snp;VARB=0.00194785;OID=.;OPOS=109268441;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:241:243:106:106:135:137:76:59:43:63:76:61:43:63 chr1 109268573 . T C 1869.63 PASS AO=159;DP=199;FAO=187;FDP=204;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=63;FSAR=124;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00677571;FXX=0.00487781;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6057;QD=36.6594;RBI=0.0333317;REFB=0;REVB=0.0326358;RO=0;SAF=59;SAR=100;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00639652;OID=.;OPOS=109268573;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:193:204:0:0:159:187:100:59:0:0:124:63:0:0 chr1 109271348 . G A 147.23 PASS AO=40;DP=94;FAO=40;FDP=94;FR=.;FRO=54;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=0.00484958;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.67;QD=6.26518;RBI=0.0194901;REFB=-0.00263669;REVB=0.0188771;RO=53;SAF=21;SAR=19;SRF=24;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0729607;STB=0.535583;TYPE=snp;VARB=0.00338758;OID=.;OPOS=109271348;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:53:54:40:40:19:21:24:29:19:21:25:29 chr1 109273456 . A G 183.39 PASS AO=43;DP=114;FAO=53;FDP=123;FR=.;FRO=70;FSAF=14;FSAR=39;FSRF=27;FSRR=43;FWDB=0.0154266;FXX=0.0159987;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.64;QD=5.96379;RBI=0.0286229;REFB=-0.0436026;REVB=0.02411;RO=67;SAF=12;SAR=31;SRF=26;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134696;STB=0.582057;TYPE=snp;VARB=0.0489814;OID=.;OPOS=109273456;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:123:67:70:43:53:31:12:26:41:39:14:27:43 chr1 109276094 . G T 309.69 PASS AO=72;DP=130;FAO=66;FDP=124;FR=.;FRO=58;FSAF=51;FSAR=15;FSRF=40;FSRR=18;FWDB=-0.0274084;FXX=0.0461503;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.2697;QD=9.99008;RBI=0.0341418;REFB=-0.022069;REVB=0.0203579;RO=52;SAF=57;SAR=15;SRF=34;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145007;STB=0.552149;TYPE=snp;VARB=0.0292482;OID=.;OPOS=109276094;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:124:52:58:72:66:15:57:34:18:15:51:40:18 chr1 109289353 . C G 50.06 PASS AO=7;DP=14;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.0729877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.14;QD=12.5159;RBI=0.159848;REFB=-0.0189698;REVB=0.142212;RO=5;SAF=7;SAR=0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.538372;TYPE=snp;VARB=0.0433155;OID=.;OPOS=109289353;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:14:16:5:7:7:9:0:7:5:0:2:7:5:2 chr1 109338861 . G C 398.89 PASS AO=103;DP=226;FAO=104;FDP=228;FR=.;FRO=124;FSAF=58;FSAR=46;FSRF=62;FSRR=62;FWDB=-0.0607861;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.694;QD=6.99807;RBI=0.060861;REFB=-0.0208229;REVB=-0.00301829;RO=123;SAF=57;SAR=46;SRF=62;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0487408;STB=0.531562;TYPE=snp;VARB=0.025497;OID=.;OPOS=109338861;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:226:228:123:124:103:104:46:57:62:61:46:58:62:62 chr1 109351501 . A G 318.61 PASS AO=81;DP=186;FAO=82;FDP=180;FR=.;FRO=98;FSAF=40;FSAR=42;FSRF=48;FSRR=50;FWDB=0.00540204;FXX=0.0374312;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.927;QD=7.08031;RBI=0.046574;REFB=-0.00301477;REVB=0.0462596;RO=96;SAF=40;SAR=41;SRF=48;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0060359;STB=0.501084;TYPE=snp;VARB=0.00398188;OID=.;OPOS=109351501;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:180:96:98:81:82:41:40:48:48:42:40:48:50 chr1 109363232 . T C 222.38 PASS AO=57;DP=128;FAO=57;FDP=128;FR=.;FRO=71;FSAF=36;FSAR=21;FSRF=30;FSRR=41;FWDB=0.0137692;FXX=0.0153834;HRUN=3;LEN=1;MLLD=79.7414;QD=6.94936;RBI=0.0139205;REFB=-0.0236266;REVB=-0.00204685;RO=70;SAF=36;SAR=21;SRF=30;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202517;STB=0.616874;TYPE=snp;VARB=0.0441543;OID=.;OPOS=109363232;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:70:71:57:57:21:36:30:40:21:36:30:41 chr1 109366286 . C T 143.8 PASS AO=54;DP=164;FAO=55;FDP=165;FR=.;FRO=110;FSAF=21;FSAR=34;FSRF=71;FSRR=39;FWDB=-0.0545076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.9362;QD=3.4861;RBI=0.0650327;REFB=0.0166972;REVB=-0.0354708;RO=110;SAF=21;SAR=33;SRF=71;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.292166;STB=0.671041;TYPE=snp;VARB=-0.0349775;OID=.;OPOS=109366286;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:165:110:110:54:55:33:21:71:39:34:21:71:39 chr1 109391662 . G C 347.54 PASS AO=76;DP=144;FAO=76;FDP=144;FR=.;FRO=68;FSAF=46;FSAR=30;FSRF=27;FSRR=41;FWDB=-0.0274863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.0249;QD=9.65378;RBI=0.0277611;REFB=-0.0142109;REVB=0.00389643;RO=67;SAF=46;SAR=30;SRF=27;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173609;STB=0.598581;TYPE=snp;VARB=0.013529;OID=.;OPOS=109391662;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:144:67:68:76:76:30:46:27:40:30:46:27:41 chr1 109394978 . G A 164.57 PASS AO=49;DP=123;FAO=49;FDP=123;FR=.;FRO=74;FSAF=18;FSAR=31;FSRF=30;FSRR=44;FWDB=-0.017545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.694;QD=5.3519;RBI=0.0299589;REFB=-0.0123215;REVB=-0.0242839;RO=73;SAF=18;SAR=31;SRF=30;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0488978;STB=0.524303;TYPE=snp;VARB=0.0139421;OID=.;OPOS=109394978;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:73:74:49:49:31:18:30:43:31:18:30:44 chr1 109395105 . C T 1832.83 PASS AO=192;DP=192;FAO=192;FDP=192;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180155;FXX=0.00518108;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.913;QD=38.1839;RBI=0.0191437;REFB=0;REVB=0.00647464;RO=0;SAF=96;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000207575;OID=.;OPOS=109395105;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:87:192:192:0:0:192:192:96:96:0:0:97:95:0:0 chr1 109465165 . ACTT A 352.14 PASS AO=92;DP=240;FAO=98;FDP=224;FR=.;FRO=126;FSAF=63;FSAR=35;FSRF=62;FSRR=64;FWDB=0.0100063;FXX=0.0627589;HRUN=1;LEN=3;MLLD=211.334;QD=6.28826;RBI=0.010028;REFB=0.00234381;REVB=-0.00065918;RO=104;SAF=59;SAR=33;SRF=51;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149745;STB=0.587713;TYPE=del;VARB=-0.00260477;OID=.;OPOS=109465166;OREF=CTT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:92:228:98:224:126:63:35:62:64:99:104:59:33:51:53 chr1 109466858 . G A 116.2 PASS AO=33;DP=82;FAO=33;FDP=82;FR=.;FRO=49;FSAF=9;FSAR=24;FSRF=12;FSRR=37;FWDB=-0.0219577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.19;QD=5.66823;RBI=0.022092;REFB=0.00403283;REVB=0.00243275;RO=49;SAF=9;SAR=24;SRF=12;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0376658;STB=0.521355;TYPE=snp;VARB=-0.00633612;OID=.;OPOS=109466858;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:49:49:33:33:24:9:12:37:24:9:12:37 chr1 109479978 . G T 42.23 PASS AO=21;DP=89;FAO=23;FDP=92;FR=.;FRO=69;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=55;FWDB=-0.0421756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.9906;QD=1.836;RBI=0.0422133;REFB=-0.00293441;REVB=-0.00178421;RO=67;SAF=5;SAR=16;SRF=14;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0517475;STB=0.516252;TYPE=snp;VARB=0.0079817;OID=.;OPOS=109479978;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:89:92:67:69:21:23:16:5:14:53:18:5:14:55 chr1 109486196 . A G 253.68 PASS AO=59;DP=120;FAO=59;FDP=120;FR=.;FRO=61;FSAF=24;FSAR=35;FSRF=25;FSRR=36;FWDB=0.0220257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.605;QD=8.45597;RBI=0.0223399;REFB=-0.0233957;REVB=0.00373409;RO=61;SAF=24;SAR=35;SRF=25;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00290818;STB=0.501608;TYPE=snp;VARB=0.0288997;OID=.;OPOS=109486196;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:61:61:59:59:35:24:25:36:35:24:25:36 chr1 109656946 . T C 639.16 PASS AO=69;DP=71;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0226051;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.458;QD=36.5237;RBI=0.0758303;REFB=-0.106833;REVB=0.0723826;RO=1;SAF=21;SAR=48;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00974824;STB=0.505153;TYPE=snp;VARB=0.00169959;OID=.;OPOS=109656946;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:71:70:1:1:69:69:48:21:0:1:48:21:0:1 chr1 109704618 . A G 86.76 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0336212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.332;QD=38.5592;RBI=0.0561851;REFB=0;REVB=-0.0450153;RO=0;SAF=2;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00030318;OID=.;OPOS=109704618;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:7:2:0:0:7:2:0:0 chr1 109735298 . T C 322.19 PASS AO=67;DP=122;FAO=67;FDP=122;FR=.;FRO=55;FSAF=26;FSAR=41;FSRF=21;FSRR=34;FWDB=0.000733684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.756;QD=10.5637;RBI=0.00868932;REFB=-0.00562175;REVB=0.00865829;RO=55;SAF=26;SAR=41;SRF=21;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00541876;STB=0.502965;TYPE=snp;VARB=0.00407927;OID=.;OPOS=109735298;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:55:55:67:67:41:26:21:34:41:26:21:34 chr1 109735416 . A C 150.16 PASS AO=35;DP=92;FAO=42;FDP=99;FR=.;FRO=57;FSAF=12;FSAR=30;FSRF=20;FSRR=37;FWDB=0.0364747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.07;QD=6.06721;RBI=0.0386297;REFB=-0.00721115;REVB=0.012722;RO=57;SAF=10;SAR=25;SRF=20;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0827045;STB=0.544196;TYPE=snp;VARB=0.0104621;OID=.;OPOS=109735416;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:99:57:57:35:42:25:10:20:37:30:12:20:37 chr1 109737063 . C T 150.38 PASS AO=37;DP=81;FAO=37;FDP=81;FR=.;FRO=44;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=-0.0190351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.644;QD=7.42619;RBI=0.0468784;REFB=-0.0185688;REVB=0.0428398;RO=43;SAF=17;SAR=20;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0054619;STB=0.502687;TYPE=snp;VARB=0.0208328;OID=.;OPOS=109737063;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:43:44:37:37:20:17:20:23:20:17:20:24 chr1 109737090 . G A 147.24 PASS AO=40;DP=93;FAO=40;FDP=94;FR=.;FRO=54;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=31;FWDB=0.0180223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.503;QD=6.26536;RBI=0.0181636;REFB=-0.00874912;REVB=-0.00226055;RO=53;SAF=20;SAR=20;SRF=22;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0860392;STB=0.542532;TYPE=snp;VARB=0.0124066;OID=.;OPOS=109737090;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:94:53:54:40:40:20:20:22:31:20:20:23:31 chr1 109737132 . T C 183.02 PASS AO=48;DP=105;FAO=48;FDP=109;FR=.;FRO=61;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=26;FSRR=35;FWDB=-0.0124218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.496;QD=6.71626;RBI=0.0380848;REFB=-0.00995907;REVB=-0.0360021;RO=57;SAF=23;SAR=25;SRF=26;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0224606;STB=0.529738;TYPE=snp;VARB=0.0106406;OID=.;OPOS=109737132;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:109:57:61:48:48:25:23:26:31:25:23:26:35 chr1 109737172 . C T 323.28 PASS AO=32;DP=109;FAO=43;FDP=103;FR=.,HEALED;FRO=33;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=26;FSRR=7;FWDB=0.0176008;FXX=0.0884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.211;QD=12.5545;RBI=0.0215658;REFB=-0.0231809;REVB=-0.0124617;RO=30;SAF=23;SAR=9;SRF=26;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17436;STB=0.603513;TYPE=snp;VARB=0.0267096;OID=.;OPOS=109737172;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:103:30:33:32:43:9:23:26:4:19:24:26:7 chr1 109742485 . G A 799.59 PASS AO=89;DP=93;FAO=89;FDP=92;FR=.;FRO=3;FSAF=54;FSAR=35;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0376932;FXX=0.0107515;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.384;QD=34.7649;RBI=0.0481863;REFB=-0.161669;REVB=0.0300191;RO=2;SAF=54;SAR=35;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0172283;STB=0.51351;TYPE=snp;VARB=0.000902553;OID=.;OPOS=109742485;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:93:92:2:3:89:89:35:54:2:0:35:54:3:0 chr1 109745618 . T C 1532.07 PASS AO=167;DP=167;FAO=164;FDP=164;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=116;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0507775;FXX=0.029584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7174;QD=37.3676;RBI=0.057526;REFB=0;REVB=0.0270349;RO=0;SAF=52;SAR=115;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53131e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00337625;OID=.;OPOS=109745618;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:167:164:0:0:167:164:115:52:0:0:116:48:0:0 chr1 109756663 . GC G 666.31 PASS AO=67;DP=100;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.285883;FXX=0.0202;HRUN=3;LEN=1;MLLD=17.6915;QD=27.4767;RBI=0.287011;REFB=0;REVB=-0.0254213;RO=21;SAF=51;SAR=16;SRF=21;SRR=0;SSEN=0.505976;SSEP=0;SSSB=-0.160464;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00646894;OID=.;OPOS=109756664;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:67:97:97:97:0:74:23:0:0:61:21:51:16:21:0 chr1 109794252 . T C 1505.88 PASS AO=157;DP=157;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0216073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.3892;QD=38.3664;RBI=0.0293748;REFB=0;REVB=0.0198998;RO=0;SAF=48;SAR=109;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.61699e-06;OID=.;OPOS=109794252;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:157:157:0:0:157:157:109:48:0:0:109:48:0:0 chr1 109795608 . T C 314.45 PASS AO=34;DP=36;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.134901;FXX=0.0277701;HRUN=3;LEN=1;MLLD=38.9905;QD=35.9372;RBI=0.134969;REFB=0;REVB=-0.00428543;RO=1;SAF=9;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0183382;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000995307;OID=.;OPOS=109795608;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:36:35:1:0:34:35:25:9:0:1:26:9:0:0 chr1 109806306 . AC A 25.23 PASS AO=11;DP=27;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=0.0342918;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=24.7542;QD=3.73798;RBI=0.0567775;REFB=-0.0435062;REVB=-0.0452522;RO=16;SAF=8;SAR=3;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0.396318;SSSB=0.459799;STB=0.76877;TYPE=del;VARB=0.063434;OID=.;OPOS=109806307;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:11:27:11:27:16:8:3:4:12:25:16:8:3:4:12 chr1 109806834 . C T 34.43 PASS AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0164296;FXX=0.110988;HRUN=3;LEN=1;MLLD=160.372;QD=17.2145;RBI=0.0164536;REFB=-0.0371285;REVB=-0.000888885;RO=3;SAF=3;SAR=2;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165639;STB=0.599599;TYPE=snp;VARB=0.0109068;OID=.;OPOS=109806834;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:9:8:3:3:5:5:2:3:1:2:2:3:1:2 chr1 109807099 . G A 140.24 PASS AO=33;DP=72;FAO=34;FDP=73;FR=.;FRO=39;FSAF=28;FSAR=6;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=0.000987742;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.152;QD=7.68432;RBI=0.0417236;REFB=0.00640022;REVB=-0.0417119;RO=38;SAF=28;SAR=5;SRF=24;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.300803;STB=0.653231;TYPE=snp;VARB=-0.00670947;OID=.;OPOS=109807099;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:73:38:39:33:34:5:28:24:14:6:28:24:15 chr1 109810544 . C A 161.85 PASS AO=42;DP=104;FAO=46;FDP=111;FR=.;FRO=65;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=22;FSRR=43;FWDB=0.0094444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.21;QD=5.83254;RBI=0.0162618;REFB=-0.0191423;REVB=-0.0132382;RO=58;SAF=21;SAR=21;SRF=20;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160225;STB=0.582574;TYPE=snp;VARB=0.0278593;OID=.;OPOS=109810544;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:111:58:65:42:46:21:21:20:38:24:22:22:43 chr1 109816176 . A C 245.24 PASS AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.151576;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.766;QD=37.7292;RBI=0.153582;REFB=0;REVB=0.0247427;RO=0;SAF=1;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.08431e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000612439;OID=.;OPOS=109816176;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:27:26:0:0:26:26:25:1:0:0:25:1:0:0 chr1 109818263 . G A 2800.69 PASS AO=292;DP=295;FAO=295;FDP=295;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=197;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0160955;FXX=0.0100668;HRUN=2;LEN=1;MLLD=254.149;QD=37.9754;RBI=0.0193386;REFB=-0.0243588;REVB=0.01072;RO=2;SAF=96;SAR=196;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00484137;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.96266e-06;OID=.;OPOS=109818263;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:295:295:2:0:292:295:196:96:0:2:197:98:0:0 chr1 109824250 . G A 349.89 PASS AO=80;DP=158;FAO=80;FDP=158;FR=.;FRO=78;FSAF=44;FSAR=36;FSRF=32;FSRR=46;FWDB=-0.00900425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.6281;QD=8.85789;RBI=0.0206913;REFB=-0.000994192;REVB=0.0186294;RO=77;SAF=44;SAR=36;SRF=32;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119589;STB=0.568709;TYPE=snp;VARB=0.000617696;OID=.;OPOS=109824250;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:158:77:78:80:80:36:44:32:45:36:44:32:46 chr1 109825360 . C T 628.24 PASS AO=67;DP=69;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0460601;FXX=0.0144907;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.401;QD=36.9554;RBI=0.0555309;REFB=-0.101823;REVB=0.0310186;RO=1;SAF=8;SAR=59;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0079444;STB=0.5042;TYPE=snp;VARB=0.000574854;OID=.;OPOS=109825360;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:69:68:1:1:67:67:59:8:0:1:59:8:0:1 chr1 109836835 . A G 270.15 PASS AO=53;DP=92;FAO=53;FDP=92;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=39;FSRF=12;FSRR=27;FWDB=0.00998722;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=298.641;QD=11.7454;RBI=0.0111539;REFB=-0.0123544;REVB=-0.00496643;RO=39;SAF=14;SAR=39;SRF=12;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0423682;STB=0.523211;TYPE=snp;VARB=0.00688653;OID=.;OPOS=109836835;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:39:39:53:53:39:14:12:27:39:14:12:27 chr1 109836842 . C G 138.67 PASS AO=38;DP=91;FAO=38;FDP=91;FR=.;FRO=53;FSAF=12;FSAR=26;FSRF=14;FSRR=39;FWDB=0.0317469;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.3569;QD=6.09531;RBI=0.0563241;REFB=-0.00287006;REVB=-0.0465246;RO=53;SAF=12;SAR=26;SRF=14;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.063425;STB=0.535696;TYPE=snp;VARB=0.00275411;OID=.;OPOS=109836842;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:53:53:38:38:26:12:14:39:26:12:14:39 chr1 109838918 . C T 955.04 PASS AO=103;DP=109;FAO=104;FDP=106;FR=.;FRO=2;FSAF=81;FSAR=23;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.021122;FXX=0.0275204;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.4156;QD=36.0394;RBI=0.0316828;REFB=-2.24614e-05;REVB=0.0236148;RO=2;SAF=79;SAR=24;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0118612;STB=0.506096;TYPE=snp;VARB=-0.000176744;OID=.;OPOS=109838918;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:109:106:2:2:103:104:24:79:2:0:23:81:2:0 chr1 109839433 . A G 1648.22 PASS AO=167;DP=168;FAO=173;FDP=173;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00711095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.5815;QD=38.1091;RBI=0.0594656;REFB=0;REVB=0.0590389;RO=0;SAF=57;SAR=110;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.36798e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00022915;OID=.;OPOS=109839433;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:168:173:0:0:167:173:110:57:0:0:115:58:0:0 chr1 109856306 . G A 245.3 PASS AO=77;DP=200;FAO=77;FDP=198;FR=.;FRO=121;FSAF=40;FSAR=37;FSRF=67;FSRR=54;FWDB=0.00147772;FXX=0.0149246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.4944;QD=4.9555;RBI=0.0177932;REFB=-0.0251292;REVB=0.0177317;RO=109;SAF=40;SAR=37;SRF=60;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0325102;STB=0.520984;TYPE=snp;VARB=0.0367384;OID=.;OPOS=109856306;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:200:198:109:121:77:77:37:40:60:49:37:40:67:54 chr1 109856384 . CAA C 89.5 PASS AO=33;DP=112;FAO=43;FDP=104;FR=.;FRO=61;FSAF=8;FSAR=35;FSRF=24;FSRR=37;FWDB=0.0532605;FXX=0.0545405;HRUN=6;LEN=2;MLLD=26.2433;QD=3.44229;RBI=0.0825847;REFB=0.0100351;REVB=-0.0631153;RO=34;SAF=4;SAR=29;SRF=8;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198803;STB=0.660294;TYPE=del;VARB=-0.0108953;OID=.;OPOS=109856385;OREF=AA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:33:94:43:104:61:8:35:24:37:89:34:4:29:8:26 chr1 109884775 . T G 451 PASS AO=117;DP=259;FAO=118;FDP=259;FR=.;FRO=141;FSAF=57;FSAR=61;FSRF=55;FSRR=86;FWDB=-0.0349412;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.63;QD=6.96527;RBI=0.0416518;REFB=0.0212794;REVB=0.0226713;RO=141;SAF=56;SAR=61;SRF=55;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0880642;STB=0.550843;TYPE=snp;VARB=-0.0282083;OID=.;OPOS=109884775;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:259:259:141:141:117:118:61:56:55:86:61:57:55:86 chr1 109897100 . T C 466.88 PASS AO=109;DP=221;FAO=111;FDP=223;FR=.;FRO=112;FSAF=59;FSAR=52;FSRF=67;FSRR=45;FWDB=-0.00547492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.592;QD=8.37452;RBI=0.019951;REFB=-0.00978887;REVB=-0.0191851;RO=109;SAF=59;SAR=50;SRF=65;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0507241;STB=0.533762;TYPE=snp;VARB=0.00747947;OID=.;OPOS=109897100;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:223:109:112:109:111:50:59:65:44:52:59:67:45 chr1 109897103 . A G 445.63 PASS AO=107;DP=218;FAO=108;FDP=222;FR=.;FRO=114;FSAF=66;FSAR=42;FSRF=60;FSRR=54;FWDB=-0.0209112;FXX=0.0044841;HRUN=3;LEN=1;MLLD=120.135;QD=8.02933;RBI=0.0230981;REFB=-0.00656143;REVB=0.0098104;RO=110;SAF=66;SAR=41;SRF=56;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102149;STB=0.544883;TYPE=snp;VARB=0.0112624;OID=.;OPOS=109897103;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:218:222:110:114:107:108:41:66:56:54:42:66:60:54 chr1 109910100 . T C 296.17 PASS AO=65;DP=124;FAO=65;FDP=124;FR=.;FRO=59;FSAF=31;FSAR=34;FSRF=30;FSRR=29;FWDB=-0.0232636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.5233;QD=9.55371;RBI=0.0341725;REFB=-0.0187155;REVB=0.0250312;RO=58;SAF=31;SAR=34;SRF=30;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0346249;STB=0.515019;TYPE=snp;VARB=0.0179247;OID=.;OPOS=109910100;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:58:59:65:65:34:31:30:28:34:31:30:29 chr1 109954808 . TAGA T 390.26 PASS AO=78;DP=154;FAO=79;FDP=140;FR=.;FRO=61;FSAF=43;FSAR=36;FSRF=30;FSRR=31;FWDB=-0.014816;FXX=0.0410931;HRUN=1;LEN=3;MLLD=161.059;QD=11.1504;RBI=0.0177424;REFB=-0.004967;REVB=-0.00976107;RO=55;SAF=43;SAR=35;SRF=28;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0322917;STB=0.522957;TYPE=del;VARB=0.00465907;OID=.;OPOS=109954809;OREF=AGA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:78:139:79:140:61:43:36:30:31:99:55:43:35:28:27 chr1 110019439 . A G 326.1 PASS AO=52;DP=192;FAO=85;FDP=190;FR=.,HEALED;FRO=104;FSAF=34;FSAR=51;FSRF=56;FSRR=48;FWDB=0.0165589;FXX=0.00523533;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.959;QD=6.86531;RBI=0.036603;REFB=-0.0173724;REVB=0.0326432;RO=104;SAF=20;SAR=32;SRF=56;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178986;STB=0.576905;TYPE=snp;VARB=0.0272762;OID=.;OPOS=110019439;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:190:104:104:52:85:32:20:56:48:51:34:56:48 chr1 110050184 . GC G 26.44 PASS AO=20;DP=59;FAO=21;FDP=57;FR=.;FRO=36;FSAF=19;FSAR=2;FSRF=23;FSRR=13;FWDB=-0.0678139;FXX=0.0172384;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.6679;QD=1.85515;RBI=0.106224;REFB=-0.0830138;REVB=0.0817607;RO=36;SAF=19;SAR=1;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.610777;STB=0.772031;TYPE=del;VARB=0.143746;OID=.;OPOS=110050185;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:20:58:21:57:36:19:2:23:13:26:36:19:1:22:14 chr1 110088657 . G A 60.15 PASS AO=14;DP=37;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.00285172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.797;QD=6.16967;RBI=0.0073143;REFB=-0.0185029;REVB=0.00673548;RO=22;SAF=5;SAR=9;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198983;STB=0.549777;TYPE=snp;VARB=0.031047;OID=.;OPOS=110088657;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:37:39:22:23:14:16:9:5:12:10:9:7:12:11 chr1 110134183 . C T 335.24 PASS AO=70;DP=128;FAO=70;FDP=128;FR=.;FRO=58;FSAF=29;FSAR=41;FSRF=30;FSRR=28;FWDB=0.0302247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.213;QD=10.4761;RBI=0.0328558;REFB=-0.01429;REVB=-0.0128831;RO=57;SAF=29;SAR=41;SRF=30;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0929854;STB=0.547271;TYPE=snp;VARB=0.0139379;OID=.;OPOS=110134183;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:57:58:70:70:41:29:30:27:41:29:30:28 chr1 110134217 . C T 341.16 PASS AO=74;DP=142;FAO=75;FDP=143;FR=.;FRO=68;FSAF=33;FSAR=42;FSRF=33;FSRR=35;FWDB=0.0405858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.217;QD=9.5428;RBI=0.0420698;REFB=-0.0157741;REVB=0.0110752;RO=68;SAF=32;SAR=42;SRF=33;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0466133;STB=0.521733;TYPE=snp;VARB=0.0130645;OID=.;OPOS=110134217;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:143:68:68:74:75:42:32:33:35:42:33:33:35 chr1 110170896 . T C 783.77 PASS AO=82;DP=84;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0589819;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0655;QD=37.7719;RBI=0.0922361;REFB=0;REVB=0.0709128;RO=0;SAF=41;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00107629;OID=.;OPOS=110170896;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:84:83:0:0:82:83:41:41:0:0:41:42:0:0 chr1 110173775 . G T 297.45 PASS AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0778803;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.227;QD=37.1815;RBI=0.0852883;REFB=0;REVB=0.034767;RO=0;SAF=7;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00071109;OID=.;OPOS=110173775;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:33:32:0:0:32:32:25:7:0:0:25:7:0:0 chr1 110201699 . T C 437.19 PASS AO=128;DP=304;FAO=128;FDP=304;FR=.;FRO=176;FSAF=39;FSAR=89;FSRF=89;FSRR=87;FWDB=-0.062582;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.7882;QD=5.75246;RBI=0.0990486;REFB=-0.000884872;REVB=-0.0767731;RO=170;SAF=38;SAR=90;SRF=85;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223283;STB=0.623994;TYPE=snp;VARB=0.00131818;OID=.;OPOS=110201699;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:304:304:170:176:128:128:90:38:85:85:89:39:89:87 chr1 110201809 . G T 443.85 PASS AO=114;DP=251;FAO=115;FDP=251;FR=.;FRO=136;FSAF=36;FSAR=79;FSRF=41;FSRR=95;FWDB=-0.0258053;FXX=0.00790483;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.398;QD=7.07337;RBI=0.0260022;REFB=-0.0162749;REVB=-0.0031942;RO=129;SAF=36;SAR=78;SRF=36;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0416204;STB=0.507328;TYPE=snp;VARB=0.0261989;OID=.;OPOS=110201809;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:251:251:129:136:114:115:78:36:36:93:79:36:41:95 chr1 110201812 . A G 425.81 PASS AO=112;DP=248;FAO=112;FDP=247;FR=.;FRO=135;FSAF=37;FSAR=75;FSRF=41;FSRR=94;FWDB=-0.0215005;FXX=0.0040321;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.119;QD=6.89569;RBI=0.0304119;REFB=-0.0269499;REVB=-0.0215085;RO=134;SAF=37;SAR=75;SRF=40;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0359458;STB=0.516646;TYPE=snp;VARB=0.042913;OID=.;OPOS=110201812;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:248:247:134:135:112:112:75:37:40:94:75:37:41:94 chr1 110282972 . G T 463 PASS AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.058808;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.34;QD=38.5833;RBI=0.0588237;REFB=0;REVB=0.0013592;RO=0;SAF=7;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000106181;OID=.;OPOS=110282972;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:48:48:0:0:48:48:41:7:0:0:41:7:0:0 chr1 110295772 . T C 488.65 PASS AO=50;DP=53;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0183501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.165;QD=35.5379;RBI=0.131225;REFB=-0.0566611;REVB=0.129936;RO=1;SAF=35;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0132627;STB=0.506847;TYPE=snp;VARB=0.00115418;OID=.;OPOS=110295772;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:53:55:1:1:50:54:15:35:1:0:18:36:1:0 chr1 110300441 . G A 278.27 PASS AO=70;DP=152;FAO=70;FDP=151;FR=.;FRO=81;FSAF=63;FSAR=7;FSRF=66;FSRR=15;FWDB=-0.00550119;FXX=0.00657851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.34;QD=7.37135;RBI=0.04774;REFB=-0.0103214;REVB=-0.047422;RO=81;SAF=63;SAR=7;SRF=66;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187377;STB=0.60547;TYPE=snp;VARB=0.0129105;OID=.;OPOS=110300441;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:151:81:81:70:70:7:63:66:15:7:63:66:15 chr1 110300504 . A G 1397.43 PASS AO=145;DP=145;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=122;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0495449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.8529;QD=38.2857;RBI=0.0584965;REFB=0;REVB=0.0310988;RO=0;SAF=121;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000360725;OID=.;OPOS=110300504;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:145:146:0:0:145:146:24:121:0:0:24:122:0:0 chr1 110301260 . C T 177.69 PASS AO=35;DP=62;FAO=35;FDP=62;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=8;FSRR=19;FWDB=0.0616457;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.9625;QD=11.4636;RBI=0.0892095;REFB=-0.0261001;REVB=-0.0644836;RO=27;SAF=12;SAR=23;SRF=8;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0414266;STB=0.522809;TYPE=snp;VARB=0.0197333;OID=.;OPOS=110301260;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:27:27:35:35:23:12:8:19:23:12:8:19 chr1 110466338 . C A 115.99 PASS AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.364;QD=35.6887;RBI=0.0081279;REFB=0;REVB=0.0081279;RO=0;SAF=0;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.26684e-05;OID=.;OPOS=110466338;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:13:0:0:13:13:13:0:0:0:13:0:0:0 chr1 110466709 . T C 1394.03 PASS AO=156;DP=159;FAO=153;FDP=158;FR=.;FRO=5;FSAF=85;FSAR=68;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.0418352;FXX=0.00628891;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.4567;QD=35.2918;RBI=0.0425404;REFB=0.0399163;REVB=0.00771364;RO=2;SAF=88;SAR=68;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0015691;STB=0.507845;TYPE=snp;VARB=-0.00655443;OID=.;OPOS=110466709;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:159:158:2:5:156:153:68:88:1:1:68:85:4:1 chr1 110467745 . A G 1234 PASS AO=129;DP=132;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0095457;FXX=0.0444412;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.71;QD=38.2636;RBI=0.0308899;REFB=0;REVB=-0.029378;RO=0;SAF=83;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.32062e-05;OID=.;OPOS=110467745;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:132:129:0:0:129:129:46:83:0:0:46:83:0:0 chr1 110656011 . G A 89.03 PASS AO=24;DP=61;FAO=24;FDP=59;FR=.;FRO=35;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.0672011;FXX=0.0327815;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.1389;QD=6.03622;RBI=0.085047;REFB=-0.000861236;REVB=0.0521249;RO=31;SAF=6;SAR=18;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.319737;STB=0.687908;TYPE=snp;VARB=0.000509606;OID=.;OPOS=110656011;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:61:59:31:35:24:24:18:6:17:14:18:6:19:16 chr1 110884840 . AG A 697.91 PASS AO=78;DP=105;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.150132;FXX=0.00980296;HRUN=2;LEN=1;MLLD=17.0408;QD=27.6401;RBI=0.354231;REFB=-0.0048112;REVB=0.320843;RO=18;SAF=13;SAR=65;SRF=0;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0.285418;SSSB=0.114688;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00340348;OID=.;OPOS=110884841;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:78:101:101:101:0:14:87:0:0:58:18:13:65:0:18 chr1 110949720 . C T 207.84 PASS AO=71;DP=193;FAO=71;FDP=194;FR=.;FRO=123;FSAF=24;FSAR=47;FSRF=56;FSRR=67;FWDB=-0.0187478;FXX=0.00512794;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.0822;QD=4.28527;RBI=0.0308537;REFB=-0.0100654;REVB=-0.0245045;RO=122;SAF=24;SAR=47;SRF=56;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142188;STB=0.578795;TYPE=snp;VARB=0.0227393;OID=.;OPOS=110949720;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:194:122:123:71:71:47:24:56:66:47:24:56:67 chr1 110950439 . C T 186.69 PASS AO=32;DP=64;FAO=41;FDP=74;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=10;FSRR=23;FWDB=0.05053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.8962;QD=10.0914;RBI=0.05177;REFB=-0.0414637;REVB=-0.0112629;RO=31;SAF=18;SAR=14;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209492;STB=0.56247;TYPE=snp;VARB=0.100888;OID=.;OPOS=110950439;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:74:31:33:32:41:14:18:10:21:23:18:10:23 chr1 111060669 . T C 1164.85 PASS AO=107;DP=108;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0531812;FXX=0.00799936;HRUN=3;LEN=1;MLLD=190.945;QD=37.5757;RBI=0.0616414;REFB=-0.071744;REVB=0.0311677;RO=1;SAF=47;SAR=60;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00784535;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.54163e-05;OID=.;OPOS=111060669;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:108:124:1:0:107:124:60:47:0:1:77:47:0:0 chr1 111061062 . T C 1530.84 PASS AO=181;DP=196;FAO=181;FDP=196;FR=.;FRO=15;FSAF=101;FSAR=80;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.0159629;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=290.118;QD=31.2417;RBI=0.0159858;REFB=0.00437473;REVB=-0.000853529;RO=8;SAF=101;SAR=80;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00472915;STB=0.512222;TYPE=snp;VARB=-0.000281917;OID=.;OPOS=111061062;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:196:196:8:15:181:181:80:101:4:4:80:101:6:9 chr1 111061653 . A G 726.11 PASS AO=197;DP=418;FAO=186;FDP=398;FR=.;FRO=212;FSAF=79;FSAR=107;FSRF=95;FSRR=117;FWDB=-1.00147e-05;FXX=0.00499988;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.468;QD=7.29759;RBI=0.00877398;REFB=-0.00268952;REVB=-0.00877397;RO=218;SAF=84;SAR=113;SRF=95;SRR=123;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00914685;STB=0.512693;TYPE=snp;VARB=0.002792;OID=.;OPOS=111061653;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:418:398:218:212:197:186:113:84:95:123:107:79:95:117 chr1 111441829 . C T 2039.41 PASS AO=214;DP=215;FAO=215;FDP=215;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=133;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0461093;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.9529;QD=37.9426;RBI=0.091991;REFB=0;REVB=-0.0796007;RO=1;SAF=82;SAR=132;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00359578;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000377057;OID=.;OPOS=111441829;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:215:215:1:0:214:215:132:82:0:1:133:82:0:0 chr1 111494767 . G T 453.34 PASS AO=102;DP=209;FAO=106;FDP=211;FR=.;FRO=105;FSAF=68;FSAR=38;FSRF=60;FSRR=45;FWDB=0.0190278;FXX=0.00471676;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.354;QD=8.59418;RBI=0.0209531;REFB=-0.00810661;REVB=-0.00877364;RO=99;SAF=64;SAR=38;SRF=56;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0582805;STB=0.537107;TYPE=snp;VARB=0.00707175;OID=.;OPOS=111494767;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:211:99:105:102:106:38:64:56:43:38:68:60:45 chr1 111584463 . G GT 137.23 PASS AO=62;DP=152;FAO=63;FDP=152;FR=.;FRO=89;FSAF=22;FSAR=41;FSRF=44;FSRR=45;FWDB=-0.0740654;FXX=0.00653552;HRUN=1;LEN=1;MLLD=27.0805;QD=3.61123;RBI=0.0852096;REFB=0.00592327;REVB=0.0421307;RO=89;SAF=22;SAR=40;SRF=42;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128164;STB=0.588488;TYPE=ins;VARB=-0.0119223;OID=.;OPOS=111584464;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:62:152:63:152:89:22:41:44:45:99:89:22:40:42:47 chr1 111584509 . G A 193.87 PASS AO=61;DP=153;FAO=60;FDP=154;FR=.;FRO=94;FSAF=12;FSAR=48;FSRF=37;FSRR=57;FWDB=-0.0324049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.0211;QD=5.03546;RBI=0.0354465;REFB=-0.0154544;REVB=0.014366;RO=91;SAF=12;SAR=49;SRF=36;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.268779;STB=0.651107;TYPE=snp;VARB=0.0241247;OID=.;OPOS=111584509;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:154:91:94:61:60:49:12:36:55:48:12:37:57 chr1 111726869 . G A 137.88 PASS AO=49;DP=141;FAO=49;FDP=141;FR=.;FRO=92;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=49;FSRR=43;FWDB=-0.00138425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.9634;QD=3.91145;RBI=0.00340308;REFB=-0.0172229;REVB=-0.00310882;RO=88;SAF=26;SAR=23;SRF=48;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0167569;STB=0.501307;TYPE=snp;VARB=0.0524473;OID=.;OPOS=111726869;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:88:92:49:49:23:26:48:40:23:26:49:43 chr1 111773568 . G C 199.3 PASS AO=50;DP=109;FAO=50;FDP=110;FR=.;FRO=60;FSAF=7;FSAR=43;FSRF=13;FSRR=47;FWDB=-0.0212653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.3701;QD=7.24718;RBI=0.0224343;REFB=-0.0264064;REVB=-0.0071474;RO=59;SAF=7;SAR=43;SRF=12;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114868;STB=0.577147;TYPE=snp;VARB=0.0195072;OID=.;OPOS=111773568;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:110:59:60:50:50:43:7:12:47:43:7:13:47 chr1 111783982 . C A 403.62 PASS AO=99;DP=208;FAO=99;FDP=207;FR=.;FRO=108;FSAF=53;FSAR=46;FSRF=40;FSRR=68;FWDB=0.00967786;FXX=0.0235838;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.41;QD=7.7995;RBI=0.0265137;REFB=-0.0235875;REVB=-0.0246843;RO=100;SAF=53;SAR=46;SRF=40;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123237;STB=0.585448;TYPE=snp;VARB=0.0194191;OID=.;OPOS=111783982;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:207:100:108:99:99:46:53:40:60:46:53:40:68 chr1 111783996 . A G 1973.38 PASS AO=213;DP=223;FAO=215;FDP=215;FR=.;FRO=0;FSAF=102;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0067649;FXX=0.0358728;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.187;QD=36.714;RBI=0.00978162;REFB=-0.0863145;REVB=0.00706514;RO=2;SAF=101;SAR=112;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00045886;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000173052;OID=.;OPOS=111783996;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:223:215:2:0:213:215:112:101:1:1:113:102:0:0 chr1 111833488 . C CCT 323.73 PASS AO=109;DP=320;FAO=114;FDP=313;FR=.;FRO=199;FSAF=50;FSAR=64;FSRF=75;FSRR=124;FWDB=-0.0132804;FXX=0.006349;HRUN=2;LEN=2;MLLD=244.067;QD=4.13711;RBI=0.0203782;REFB=-0.00955516;REVB=0.0154565;RO=205;SAF=48;SAR=61;SRF=79;SRR=126;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0646628;STB=0.540223;TYPE=ins;VARB=0.0135267;OID=.;OPOS=111833489;OREF=-;OALT=CT;OMAPALT=CCT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:109:320:114:313:199:50:64:75:124:99:205:48:61:79:126 chr1 111833517 . G A 350.56 PASS AO=119;DP=320;FAO=119;FDP=319;FR=.;FRO=200;FSAF=55;FSAR=64;FSRF=70;FSRR=130;FWDB=-0.00709932;FXX=0.0031249;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.418;QD=4.39573;RBI=0.0419056;REFB=0.00788247;REVB=0.0412999;RO=198;SAF=55;SAR=64;SRF=69;SRR=129;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128485;STB=0.571493;TYPE=snp;VARB=-0.016965;OID=.;OPOS=111833517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:320:319:198:200:119:119:64:55:69:129:64:55:70:130 chr1 111857154 . T C 330.27 PASS AO=82;DP=225;FAO=94;FDP=223;FR=.;FRO=129;FSAF=44;FSAR=50;FSRF=52;FSRR=77;FWDB=-0.0113795;FXX=0.00888849;HRUN=4;LEN=1;MLLD=228.018;QD=5.92419;RBI=0.0116107;REFB=-0.00900849;REVB=0.00230548;RO=87;SAF=34;SAR=48;SRF=23;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149176;STB=0.53792;TYPE=snp;VARB=0.0109246;OID=.;OPOS=111857154;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:223:87:129:82:94:48:34:23:64:50:44:52:77 chr1 111858444 . C T 176.6 PASS AO=42;DP=88;FAO=42;FDP=88;FR=.;FRO=46;FSAF=13;FSAR=29;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=-0.00959473;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.139;QD=8.02744;RBI=0.0576832;REFB=-0.0132556;REVB=-0.0568796;RO=46;SAF=13;SAR=29;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230648;STB=0.628932;TYPE=snp;VARB=0.0224319;OID=.;OPOS=111858444;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:46:46:42:42:29:13:25:21:29:13:25:21 chr1 111861841 . A G 262.67 PASS AO=83;DP=215;FAO=83;FDP=213;FR=.;FRO=130;FSAF=13;FSAR=70;FSRF=33;FSRR=97;FWDB=-0.00708816;FXX=0.00930189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.276;QD=4.93281;RBI=0.00717001;REFB=-0.00646986;REVB=-0.00108029;RO=128;SAF=13;SAR=70;SRF=32;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1641;STB=0.597266;TYPE=snp;VARB=0.00926006;OID=.;OPOS=111861841;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:213:128:130:83:83:70:13:32:96:70:13:33:97 chr1 111861974 . T C 373.57 PASS AO=81;DP=153;FAO=81;FDP=152;FR=.;FRO=71;FSAF=32;FSAR=49;FSRF=31;FSRR=40;FWDB=-0.00451184;FXX=0.00653552;HRUN=3;LEN=1;MLLD=227.096;QD=9.83079;RBI=0.00938814;REFB=-0.0111145;REVB=-0.00823289;RO=71;SAF=32;SAR=49;SRF=31;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0367411;STB=0.52013;TYPE=snp;VARB=0.0105171;OID=.;OPOS=111861974;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:152:71:71:81:81:49:32:31:40:49:32:31:40 chr1 111862952 . T G 167.41 PASS AO=46;DP=109;FAO=46;FDP=109;FR=.;FRO=63;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=31;FSRR=32;FWDB=-0.0835093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.3181;QD=6.1434;RBI=0.100327;REFB=-0.0200897;REVB=-0.0556033;RO=62;SAF=26;SAR=20;SRF=30;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0834365;STB=0.542518;TYPE=snp;VARB=0.0172225;OID=.;OPOS=111862952;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:62:63:46:46:20:26:30:32:20:26:31:32 chr1 111893958 . A G 353.58 PASS AO=70;DP=127;FAO=72;FDP=128;FR=.;FRO=56;FSAF=28;FSAR=44;FSRF=25;FSRR=31;FWDB=0.00722126;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.723;QD=11.0495;RBI=0.00735323;REFB=0.00109797;REVB=0.00138682;RO=56;SAF=27;SAR=43;SRF=25;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0513642;STB=0.526166;TYPE=snp;VARB=-0.000824358;OID=.;OPOS=111893958;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:128:56:56:70:72:43:27:25:31:44:28:25:31 chr1 112029193 . A G 87.27 PASS AO=27;DP=73;FAO=27;FDP=73;FR=.;FRO=46;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=36;FWDB=0.0174536;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.1344;QD=4.78186;RBI=0.0191946;REFB=-0.00248093;REVB=0.00798772;RO=46;SAF=9;SAR=18;SRF=10;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152552;STB=0.586897;TYPE=snp;VARB=0.00515522;OID=.;OPOS=112029193;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:73:73:46:46:27:27:18:9:10:36:18:9:10:36 chr1 112042632 . A G 276.7 PASS AO=76;DP=176;FAO=76;FDP=175;FR=.;FRO=99;FSAF=37;FSAR=39;FSRF=44;FSRR=55;FWDB=0.0200737;FXX=0.0056815;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.1776;QD=6.32454;RBI=0.0401993;REFB=-0.0245027;REVB=0.0348286;RO=99;SAF=37;SAR=39;SRF=44;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.043106;STB=0.524026;TYPE=snp;VARB=0.0406214;OID=.;OPOS=112042632;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:175:99:99:76:76:39:37:44:55:39:37:44:55 chr1 112269872 . G A 142.74 PASS AO=26;DP=45;FAO=27;FDP=45;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.0133807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.567;QD=12.6878;RBI=0.0143474;REFB=-0.0143666;REVB=0.00517731;RO=18;SAF=10;SAR=16;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0879023;STB=0.537787;TYPE=snp;VARB=0.0285866;OID=.;OPOS=112269872;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:45:45:18:18:26:27:16:10:9:9:16:11:9:9 chr1 112298378 . T C 109.99 PASS AO=21;DP=37;FAO=21;FDP=37;FR=.;FRO=16;FSAF=21;FSAR=0;FSRF=16;FSRR=0;FWDB=-0.0128414;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=158.167;QD=11.891;RBI=0.0128414;REFB=-0.00138547;REVB=0;RO=16;SAF=21;SAR=0;SRF=16;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00107736;OID=.;OPOS=112298378;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:37:37:16:16:21:21:0:21:16:0:0:21:16:0 chr1 112308953 . T C 112.16 PASS AO=30;DP=73;FAO=30;FDP=72;FR=.;FRO=42;FSAF=26;FSAR=4;FSRF=35;FSRR=7;FWDB=0.0369854;FXX=0.0136968;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.4546;QD=6.23085;RBI=0.0432439;REFB=0.0033521;REVB=0.022408;RO=42;SAF=26;SAR=4;SRF=35;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.069304;STB=0.539595;TYPE=snp;VARB=-0.00223268;OID=.;OPOS=112308953;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:72:42:42:30:30:4:26:35:7:4:26:35:7 chr1 112308972 . G A 129.27 PASS AO=36;DP=87;FAO=36;FDP=87;FR=.;FRO=51;FSAF=32;FSAR=4;FSRF=44;FSRR=7;FWDB=-0.0159861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2671;QD=5.94336;RBI=0.0183367;REFB=-0.00956505;REVB=-0.0089823;RO=51;SAF=32;SAR=4;SRF=44;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.064209;STB=0.536564;TYPE=snp;VARB=0.0139385;OID=.;OPOS=112308972;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:51:51:36:36:4:32:44:7:4:32:44:7 chr1 112913681 . G A 215.07 PASS AO=63;DP=154;FAO=63;FDP=154;FR=.;FRO=91;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=30;FSRR=61;FWDB=0.00100121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3632;QD=5.58622;RBI=0.0243094;REFB=-0.0250136;REVB=-0.0242888;RO=91;SAF=30;SAR=33;SRF=30;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15635;STB=0.587473;TYPE=snp;VARB=0.0316309;OID=.;OPOS=112913681;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:154:91:91:63:63:33:30:30:61:33:30:30:61 chr1 112913714 . C T 348.33 PASS AO=70;DP=123;FAO=70;FDP=123;FR=.;FRO=53;FSAF=18;FSAR=52;FSRF=25;FSRR=28;FWDB=0.0138326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.015;QD=11.3278;RBI=0.0140325;REFB=-0.00245168;REVB=0.00235986;RO=52;SAF=18;SAR=52;SRF=24;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187202;STB=0.608237;TYPE=snp;VARB=0.00338565;OID=.;OPOS=112913714;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:52:53:70:70:52:18:24:28:52:18:25:28 chr1 112991698 . T C 234.6 PASS AO=44;DP=81;FAO=47;FDP=83;FR=.;FRO=36;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=0.0303803;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.949;QD=11.3059;RBI=0.031434;REFB=-0.0101121;REVB=0.00807068;RO=35;SAF=24;SAR=20;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0940574;STB=0.559115;TYPE=snp;VARB=0.00651558;OID=.;OPOS=112991698;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:83:35:36:44:47:20:24:15:20:21:26:15:21 chr1 112999227 . G A 1260.86 PASS AO=133;DP=134;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0599701;FXX=0.00740686;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.8429;QD=37.6377;RBI=0.101595;REFB=-0.0253324;REVB=-0.0820067;RO=1;SAF=62;SAR=71;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00760493;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000352994;OID=.;OPOS=112999227;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:134:134:1:0:133:134:71:62:1:0:71:63:0:0 chr1 113000565 . A G 376.22 PASS AO=99;DP=207;FAO=99;FDP=219;FR=.;FRO=120;FSAF=35;FSAR=64;FSRF=60;FSRR=60;FWDB=-0.0140071;FXX=0.00454525;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.257;QD=6.87161;RBI=0.0193797;REFB=-0.0193262;REVB=0.013393;RO=108;SAF=35;SAR=64;SRF=48;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0911042;STB=0.583476;TYPE=snp;VARB=0.0325271;OID=.;OPOS=113000565;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:219:108:120:99:99:64:35:48:60:64:35:60:60 chr1 113000946 . GGTCA G 625.34 PASS AO=93;DP=116;FAO=96;FDP=108;FR=.;FRO=12;FSAF=36;FSAR=60;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0164314;FXX=0.0357111;HRUN=2;LEN=4;MLLD=247.125;QD=23.1607;RBI=0.0197798;REFB=-0.0547022;REVB=0.0110114;RO=0;SAF=35;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.524385;TYPE=del;VARB=0.00611456;OID=.;OPOS=113000947;OREF=GTCA;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:93:98:96:108:12:36:60:7:5:9:0:35:58:0:0 chr1 113063125 . A G 1339.03 PASS AO=142;DP=143;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168805;FXX=0.0138879;HRUN=3;LEN=1;MLLD=275.214;QD=37.7192;RBI=0.0283552;REFB=-0.0644677;REVB=0.022783;RO=0;SAF=84;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000132794;OID=.;OPOS=113063125;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:143:142:0:0:142:142:58:84:0:0:58:84:0:0 chr1 113083439 . C T 435.79 PASS AO=40;DP=42;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.178818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=44.3448;QD=37.0884;RBI=0.182492;REFB=0;REVB=0.0364338;RO=0;SAF=4;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.3999e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00238257;OID=.;OPOS=113083439;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:42:47:0:0:40:47:36:4:0:0:40:7:0:0 chr1 113098534 . C T 243.33 PASS AO=80;DP=216;FAO=82;FDP=221;FR=.;FRO=139;FSAF=50;FSAR=32;FSRF=60;FSRR=79;FWDB=0.0549097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.334;QD=4.40417;RBI=0.0560315;REFB=-0.02493;REVB=-0.0111559;RO=135;SAF=46;SAR=34;SRF=60;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14452;STB=0.61188;TYPE=snp;VARB=0.0451807;OID=.;OPOS=113098534;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:216:221:135:139:80:82:34:46:60:75:32:50:60:79 chr1 113236681 . C T 222.16 PASS AO=56;DP=123;FAO=56;FDP=122;FR=.;FRO=66;FSAF=40;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=35;FWDB=-0.00825508;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.86;QD=7.28399;RBI=0.0178604;REFB=0.00230496;REVB=0.0158382;RO=66;SAF=40;SAR=16;SRF=31;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.254396;STB=0.642264;TYPE=snp;VARB=-0.00279602;OID=.;OPOS=113236681;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:122:66:66:56:56:16:40:31:35:16:40:31:35 chr1 113239382 . G A 295.62 PASS AO=71;DP=150;FAO=72;FDP=151;FR=.;FRO=79;FSAF=32;FSAR=40;FSRF=29;FSRR=50;FWDB=-0.0292671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.261;QD=7.83108;RBI=0.036796;REFB=-0.00341044;REVB=-0.0223021;RO=78;SAF=31;SAR=40;SRF=29;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0629496;STB=0.541342;TYPE=snp;VARB=0.0039387;OID=.;OPOS=113239382;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:151:78:79:71:72:40:31:29:49:40:32:29:50 chr1 113241052 . T C 181.6 PASS AO=42;DP=88;FAO=43;FDP=89;FR=.;FRO=46;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=30;FSRR=16;FWDB=-0.00701378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.468;QD=8.16174;RBI=0.0070227;REFB=-0.0165015;REVB=-0.000353695;RO=45;SAF=25;SAR=17;SRF=30;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0700297;STB=0.538026;TYPE=snp;VARB=0.0178355;OID=.;OPOS=113241052;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:89:45:46:42:43:17:25:30:15:18:25:30:16 chr1 113243048 . C T 276.11 PASS AO=66;DP=140;FAO=67;FDP=140;FR=.;FRO=73;FSAF=24;FSAR=43;FSRF=36;FSRR=37;FWDB=0.0295671;FXX=0.0140835;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.253;QD=7.88885;RBI=0.0296439;REFB=-0.0194942;REVB=0.00213297;RO=73;SAF=23;SAR=43;SRF=36;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143371;STB=0.573311;TYPE=snp;VARB=0.0257763;OID=.;OPOS=113243048;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:73:73:66:67:43:23:36:37:43:24:36:37 chr1 113255389 . C T 746.31 PASS AO=77;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0121907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=307.616;QD=38.2724;RBI=0.0168345;REFB=0;REVB=-0.0116098;RO=0;SAF=46;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.64555e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.10787e-05;OID=.;OPOS=113255389;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:78:78:0:0:77:78:31:46:0:0:32:46:0:0 chr1 113456546 . A T 3814.03 PASS AO=405;DP=406;FAO=396;FDP=396;FR=.;FRO=0;FSAF=210;FSAR=186;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183584;FXX=0.00999975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.531;QD=38.5255;RBI=0.0350444;REFB=0;REVB=-0.0298509;RO=0;SAF=216;SAR=189;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000183422;OID=.;OPOS=113456546;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:406:396:0:0:405:396:189:216:0:0:186:210:0:0 chr1 113657092 . A C 945.76 PASS AO=99;DP=99;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0085272;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.842;QD=38.6026;RBI=0.00878209;REFB=0;REVB=0.00210047;RO=0;SAF=54;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000162303;OID=.;OPOS=113657092;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:99:98:0:0:99:98:45:54:0:0:45:53:0:0 chr1 114196495 . A G 266.06 PASS AO=71;DP=161;FAO=71;FDP=161;FR=.;FRO=90;FSAF=31;FSAR=40;FSRF=51;FSRR=39;FWDB=-0.00621481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.183;QD=6.6102;RBI=0.00622032;REFB=-0.020648;REVB=-0.000261719;RO=90;SAF=31;SAR=40;SRF=51;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130176;STB=0.572505;TYPE=snp;VARB=0.0189947;OID=.;OPOS=114196495;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:161:90:90:71:71:40:31:51:39:40:31:51:39 chr1 114240319 . T TA 1199.31 PASS AO=141;DP=159;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0728779;FXX=0.0064512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=28.0202;QD=31.1509;RBI=0.109894;REFB=0;REVB=-0.0822526;RO=5;SAF=67;SAR=74;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0341645;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-0.00179059;OID=.;OPOS=114240320;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:141:159:154:154:0:72:82:0:0:99:5:67:74:5:0 chr1 114377568 . A G 587.25 PASS AO=60;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0416266;FXX=0.0312451;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.351;QD=37.887;RBI=0.0444823;REFB=0;REVB=0.0156812;RO=0;SAF=24;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.9695e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.9633e-05;OID=.;OPOS=114377568;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:61:62:0:0:60:62:36:24:0:0:36:26:0:0 chr1 114424601 . C T 362.08 PASS AO=39;DP=40;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0576121;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.6033;QD=35.3249;RBI=0.074676;REFB=0.00957284;REVB=0.0475116;RO=1;SAF=27;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0374593;STB=0.51999;TYPE=snp;VARB=0.000685958;OID=.;OPOS=114424601;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:40:41:1:1:39:40:12:27:0:1:12:28:0:1 chr1 114438951 . A G 149.6 PASS AO=33;DP=64;FAO=33;FDP=65;FR=.;FRO=32;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=7;FSRR=25;FWDB=0.0298368;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=133.284;QD=9.20641;RBI=0.0311609;REFB=-0.036653;REVB=-0.0089873;RO=31;SAF=16;SAR=17;SRF=7;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229157;STB=0.632099;TYPE=snp;VARB=0.0184862;OID=.;OPOS=114438951;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:65:31:32:33:33:17:16:7:24:17:16:7:25 chr1 114444444 . T G 450.64 PASS AO=108;DP=229;FAO=111;FDP=232;FR=.;FRO=121;FSAF=48;FSAR=63;FSRF=52;FSRR=69;FWDB=-0.000663901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.226;QD=7.76964;RBI=0.0100476;REFB=-0.00617403;REVB=0.0100256;RO=118;SAF=47;SAR=61;SRF=51;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00287328;STB=0.501424;TYPE=snp;VARB=0.00610121;OID=.;OPOS=114444444;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:229:232:118:121:108:111:61:47:51:67:63:48:52:69 chr1 114514619 . G A 440.36 PASS AO=133;DP=331;FAO=134;FDP=330;FR=.;FRO=196;FSAF=44;FSAR=90;FSRF=79;FSRR=117;FWDB=0.0247685;FXX=0.00900874;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.917;QD=5.33764;RBI=0.0277461;REFB=-0.0167194;REVB=0.0125047;RO=195;SAF=43;SAR=90;SRF=79;SRR=116;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0953764;STB=0.54861;TYPE=snp;VARB=0.021836;OID=.;OPOS=114514619;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:331:330:195:196:133:134:90:43:79:116:90:44:79:117 chr1 114515717 . G A 35.25 PASS AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.00263141;FXX=0.062461;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.701;QD=9.40092;RBI=0.0406067;REFB=-0.00575068;REVB=0.0405213;RO=7;SAF=3;SAR=4;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.529329;TYPE=snp;VARB=0.0152165;OID=.;OPOS=114515717;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:16:15:7:8:7:7:4:3:3:4:4:3:3:5 chr1 114632115 . TA T 49.26 PASS AO=15;DP=90;FAO=36;FDP=70;FR=.;FRO=34;FSAF=7;FSAR=29;FSRF=8;FSRR=26;FWDB=0.184775;FXX=0.222198;HRUN=7;LEN=1;MLLD=6.87357;QD=2.81464;RBI=0.191378;REFB=-0.0335904;REVB=-0.049834;RO=31;SAF=1;SAR=14;SRF=8;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.434604;STB=0.53047;TYPE=del;VARB=0.0615298;OID=.;OPOS=114632116;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:15:67:36:70:34:7:29:8:26:36:31:1:14:8:23 chr1 114633581 . A T 107.77 PASS AO=45;DP=144;FAO=45;FDP=144;FR=.;FRO=99;FSAF=37;FSAR=8;FSRF=52;FSRR=47;FWDB=0.00385125;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.202;QD=2.99352;RBI=0.047739;REFB=-0.00746578;REVB=0.0475834;RO=98;SAF=37;SAR=8;SRF=51;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.411534;STB=0.740689;TYPE=snp;VARB=0.0105651;OID=.;OPOS=114633581;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:144:98:99:45:45:8:37:51:47:8:37:52:47 chr1 114680310 . G A 433.5 PASS AO=77;DP=121;FAO=77;FDP=121;FR=.;FRO=44;FSAF=53;FSAR=24;FSRF=37;FSRR=7;FWDB=0.00227422;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.228;QD=14.3305;RBI=0.0240127;REFB=-0.00794225;REVB=0.0239048;RO=44;SAF=53;SAR=24;SRF=37;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126277;STB=0.567956;TYPE=snp;VARB=0.00473795;OID=.;OPOS=114680310;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:44:44:77:77:24:53:37:7:24:53:37:7 chr1 114680540 . C T 242.61 PASS AO=54;DP=103;FAO=54;FDP=103;FR=.;FRO=49;FSAF=10;FSAR=44;FSRF=9;FSRR=40;FWDB=-0.0282887;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.614;QD=9.42164;RBI=0.0305778;REFB=0.00122911;REVB=-0.0116081;RO=49;SAF=10;SAR=44;SRF=9;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00216656;STB=0.501193;TYPE=snp;VARB=-0.00120555;OID=.;OPOS=114680540;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:49:49:54:54:44:10:9:40:44:10:9:40 chr1 114948281 . A G 1673.21 PASS AO=201;DP=224;FAO=203;FDP=222;FR=.;FRO=19;FSAF=95;FSAR=108;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0283496;FXX=0.00892817;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.529;QD=30.1478;RBI=0.0330365;REFB=-0.0405359;REVB=0.0169621;RO=18;SAF=93;SAR=108;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00286277;STB=0.50049;TYPE=snp;VARB=0.00489547;OID=.;OPOS=114948281;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:224:222:18:19:201:203:108:93:8:10:108:95:9:10 chr1 114973429 . T C 439.76 PASS AO=90;DP=161;FAO=90;FDP=161;FR=.;FRO=71;FSAF=50;FSAR=40;FSRF=38;FSRR=33;FWDB=0.0501308;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.6364;QD=10.9257;RBI=0.0691186;REFB=-0.0092531;REVB=0.0475845;RO=71;SAF=50;SAR=40;SRF=38;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0166257;STB=0.509064;TYPE=snp;VARB=0.00787696;OID=.;OPOS=114973429;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:161:71:71:90:90:40:50:38:33:40:50:38:33 chr1 115168097 . T C 619.26 PASS AO=142;DP=275;FAO=141;FDP=275;FR=.;FRO=134;FSAF=55;FSAR=86;FSRF=51;FSRR=83;FWDB=0.032025;FXX=0.010791;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.2986;QD=9.00738;RBI=0.0320257;REFB=-0.023296;REVB=-0.000217702;RO=129;SAF=56;SAR=86;SRF=47;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0275773;STB=0.504861;TYPE=snp;VARB=0.015304;OID=.;OPOS=115168097;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:275:275:129:134:142:141:86:56:47:82:86:55:51:83 chr1 115168600 . A T 117.1 PASS AO=44;DP=134;FAO=44;FDP=133;FR=.;FRO=89;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=44;FSRR=45;FWDB=-0.000647877;FXX=0.00746213;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.4689;QD=3.52189;RBI=0.00116982;REFB=-0.00731226;REVB=-0.000974031;RO=87;SAF=21;SAR=23;SRF=44;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0327879;STB=0.526737;TYPE=snp;VARB=0.0101246;OID=.;OPOS=115168600;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:133:87:89:44:44:23:21:44:43:24:20:44:45 chr1 115419439 . A T 112.5 PASS AO=32;DP=214;FAO=71;FDP=199;FR=.,HEALED;FRO=128;FSAF=5;FSAR=66;FSRF=48;FSRR=80;FWDB=0.0352111;FXX=0.0613179;HRUN=6;LEN=1;MLLD=14.5103;QD=2.26122;RBI=0.213771;REFB=-0.01361;REVB=-0.210851;RO=69;SAF=0;SAR=32;SRF=31;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.810353;STB=0.827221;TYPE=snp;VARB=-0.10448;OID=.;OPOS=115419439;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:199:69:128:32:71:32:0:31:38:66:5:48:80 chr1 115537933 . A G 339 PASS AO=74;DP=133;FAO=72;FDP=133;FR=.;FRO=61;FSAF=42;FSAR=30;FSRF=27;FSRR=34;FWDB=-0.00749103;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7562;QD=10.1956;RBI=0.00765788;REFB=-0.017248;REVB=0.00158985;RO=59;SAF=43;SAR=31;SRF=26;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114652;STB=0.564925;TYPE=snp;VARB=0.0195715;OID=.;OPOS=115537933;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:59:61:74:72:31:43:26:33:30:42:27:34 chr1 115576023 . A G 1717.9 PASS AO=178;DP=181;FAO=182;FDP=182;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026279;FXX=0.010869;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.1483;QD=37.7561;RBI=0.0309503;REFB=-0.0800281;REVB=0.0163504;RO=1;SAF=62;SAR=116;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00761594;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.39328e-05;OID=.;OPOS=115576023;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:181:182:1:0:178:182:116:62:1:0:120:62:0:0 chr1 115590998 . T C 621.95 PASS AO=190;DP=440;FAO=174;FDP=400;FR=.;FRO=226;FSAF=91;FSAR=83;FSRF=98;FSRR=128;FWDB=-0.000267035;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.2616;QD=6.21946;RBI=0.0115129;REFB=-0.0112258;REVB=0.0115098;RO=249;SAF=98;SAR=92;SRF=107;SRR=142;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0878859;STB=0.550355;TYPE=snp;VARB=0.0166121;OID=.;OPOS=115590998;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:440:400:249:226:190:174:92:98:107:142:83:91:98:128 chr1 115591058 . T C 662.17 PASS AO=165;DP=544;FAO=117;FDP=374;FR=.,HEALED;FRO=196;FSAF=2;FSAR=115;FSRF=75;FSRR=121;FWDB=0.00513404;FXX=0.0649984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.392;QD=7.08205;RBI=0.0176018;REFB=-0.0179539;REVB=0.0168364;RO=282;SAF=7;SAR=158;SRF=108;SRR=174;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.65736;STB=0.949282;TYPE=snp;VARB=0.0230035;OID=.;OPOS=115591058;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:539:374:282:196:165:117:158:7:108:174:115:2:75:121 chr1 115604798 . C T 295.43 PASS AO=53;DP=83;FAO=53;FDP=84;FR=.;FRO=31;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.0027556;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=104.561;QD=14.0681;RBI=0.0241915;REFB=-0.0188061;REVB=-0.0240341;RO=29;SAF=29;SAR=24;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0196332;STB=0.523457;TYPE=snp;VARB=0.0122554;OID=.;OPOS=115604798;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:83:84:29:31:53:53:24:29:15:14:24:29:15:16 chr1 116149152 . G A 1611.15 PASS AO=172;DP=175;FAO=173;FDP=173;FR=.;FRO=0;FSAF=106;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.014396;FXX=0.0057468;HRUN=3;LEN=1;MLLD=110.581;QD=37.252;RBI=0.0422157;REFB=0.0066564;REVB=0.0396853;RO=2;SAF=106;SAR=66;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00268766;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.49251e-05;OID=.;OPOS=116149152;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:175:173:2:0:172:173:66:106:1:1:67:106:0:0 chr1 116164595 . G A 595.44 PASS AO=124;DP=227;FAO=126;FDP=229;FR=.;FRO=103;FSAF=59;FSAR=67;FSRF=46;FSRR=57;FWDB=-0.00220181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.928;QD=10.4007;RBI=0.00383266;REFB=0.0216867;REVB=-0.00313708;RO=103;SAF=57;SAR=67;SRF=46;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0109707;STB=0.509789;TYPE=snp;VARB=-0.0155611;OID=.;OPOS=116164595;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:227:229:103:103:124:126:67:57:46:57:67:59:46:57 chr1 116234313 . A G 299.17 PASS AO=77;DP=169;FAO=77;FDP=169;FR=.;FRO=92;FSAF=22;FSAR=55;FSRF=22;FSRR=70;FWDB=0.035234;FXX=0.00588201;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.015;QD=7.08103;RBI=0.0371045;REFB=-0.000748728;REVB=-0.0116324;RO=91;SAF=22;SAR=55;SRF=22;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0540625;STB=0.531907;TYPE=snp;VARB=0.000808037;OID=.;OPOS=116234313;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:169:91:92:77:77:55:22:22:69:55:22:22:70 chr1 116234505 . A G 435.62 PASS AO=85;DP=149;FAO=85;FDP=146;FR=.;FRO=61;FSAF=37;FSAR=48;FSRF=37;FSRR=24;FWDB=0.00411748;FXX=0.0266649;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.41;QD=11.9348;RBI=0.0160232;REFB=-0.023024;REVB=-0.0154851;RO=58;SAF=37;SAR=48;SRF=35;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125491;STB=0.571412;TYPE=snp;VARB=0.0216286;OID=.;OPOS=116234505;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:146:58:61:85:85:48:37:35:23:48:37:37:24 chr1 116236351 . T G 191.29 PASS AO=60;DP=155;FAO=60;FDP=155;FR=.;FRO=95;FSAF=12;FSAR=48;FSRF=41;FSRR=54;FWDB=-0.00307699;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=274.605;QD=4.93663;RBI=0.0132871;REFB=-0.0191832;REVB=-0.0129259;RO=94;SAF=12;SAR=48;SRF=40;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.298701;STB=0.675094;TYPE=snp;VARB=0.0262963;OID=.;OPOS=116236351;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:94:95:60:60:48:12:40:54:48:12:41:54 chr1 116239751 . A G 478.69 PASS AO=141;DP=338;FAO=141;FDP=338;FR=.;FRO=197;FSAF=58;FSAR=83;FSRF=89;FSRR=108;FWDB=-0.0233722;FXX=0.00294977;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.203;QD=5.66499;RBI=0.0356301;REFB=-0.00365327;REVB=-0.0268932;RO=191;SAF=59;SAR=82;SRF=84;SRR=107;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0225775;STB=0.524117;TYPE=snp;VARB=0.0048221;OID=.;OPOS=116239751;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:338:338:191:197:141:141:82:59:84:107:83:58:89:108 chr1 116243868 . A G 166.96 PASS AO=31;DP=52;FAO=31;FDP=52;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=5;FSRR=16;FWDB=0.0185457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.624;QD=12.8432;RBI=0.0519205;REFB=-0.00597727;REVB=-0.0484954;RO=21;SAF=13;SAR=18;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140404;STB=0.576976;TYPE=snp;VARB=0.00351036;OID=.;OPOS=116243868;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:52:52:21:21:31:31:18:13:5:16:18:13:5:16 chr1 116243877 . G A 73.78 PASS AO=22;DP=59;FAO=22;FDP=59;FR=.;FRO=37;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=24;FWDB=0.0347867;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4358;QD=5.00177;RBI=0.0474874;REFB=-0.00827578;REVB=0.0323255;RO=34;SAF=5;SAR=17;SRF=11;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131272;STB=0.598729;TYPE=snp;VARB=0.016568;OID=.;OPOS=116243877;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:59:59:34:37:22:22:17:5:11:23:17:5:13:24 chr1 116260532 . A T 387.82 PASS AO=96;DP=204;FAO=97;FDP=204;FR=.;FRO=107;FSAF=31;FSAR=66;FSRF=59;FSRR=48;FWDB=-0.00319335;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.737;QD=7.60432;RBI=0.00860777;REFB=-0.0153423;REVB=-0.0079935;RO=104;SAF=30;SAR=66;SRF=60;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.25829;STB=0.626952;TYPE=snp;VARB=0.0168865;OID=.;OPOS=116260532;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:204:104:107:96:97:66:30:60:44:66:31:59:48 chr1 116382318 . A G 395.44 PASS AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249111;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.7769;QD=36.7848;RBI=0.0383433;REFB=0;REVB=0.0291487;RO=0;SAF=29;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.36943e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000643994;OID=.;OPOS=116382318;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:42:43:0:0:42:43:13:29:0:0:13:30:0:0 chr1 116382511 . A T 1088.3 PASS AO=115;DP=119;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0251289;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.3582;QD=36.5816;RBI=0.0422405;REFB=-0.0290406;REVB=0.0339529;RO=0;SAF=42;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.42309e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00146134;OID=.;OPOS=116382511;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:119:119:0:0:115:119:73:42:0:0:76:43:0:0 chr1 116382778 . T C 1722.28 PASS AO=182;DP=184;FAO=182;FDP=182;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0497311;FXX=0.010869;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.208;QD=37.8523;RBI=0.0652278;REFB=-0.061812;REVB=0.0422076;RO=0;SAF=84;SAR=98;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.1362e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000453975;OID=.;OPOS=116382778;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:184:182:0:0:182:182:98:84:0:0:98:84:0:0 chr1 116383300 . T C 482.53 PASS AO=57;DP=61;FAO=59;FDP=64;FR=.;FRO=5;FSAF=16;FSAR=43;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0360669;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=43.1032;QD=30.1584;RBI=0.0695876;REFB=-0.0320139;REVB=-0.0595115;RO=4;SAF=16;SAR=41;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0329656;STB=0.512578;TYPE=snp;VARB=0.0105741;OID=.;OPOS=116383300;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:61:64:4:5:57:59:41:16:2:2:43:16:2:3 chr1 116384090 . G A 1674.99 PASS AO=127;DP=180;FAO=164;FDP=177;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=93;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.041055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.646;QD=37.8529;RBI=0.0425479;REFB=0;REVB=-0.0111716;RO=0;SAF=57;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0183493;OID=.;OPOS=116384090;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:176:177:0:0:127:164:70:57:0:0:71:93:0:0 chr1 116384773 . A G 1545.8 PASS AO=161;DP=161;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0129599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.8924;QD=38.1679;RBI=0.0129627;REFB=0;REVB=-0.000267977;RO=0;SAF=68;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33755e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.51529e-05;OID=.;OPOS=116384773;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:161:162:0:0:161:162:93:68:0:0:94:68:0:0 chr1 116385171 . C T 380.09 PASS AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00595071;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.458;QD=38.9831;RBI=0.00626655;REFB=0;REVB=0.00196437;RO=0;SAF=20;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3303e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.44206e-05;OID=.;OPOS=116385171;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:40:39:0:0:39:39:19:20:0:0:19:20:0:0 chr1 116385309 . C A 500.37 PASS AO=54;DP=55;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212616;FXX=0.036357;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1287;QD=37.7635;RBI=0.0581127;REFB=0;REVB=0.0540835;RO=0;SAF=44;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00114031;OID=.;OPOS=116385309;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:55:53:0:0:54:53:10:44:0:0:11:42:0:0 chr1 116386139 . G A 3792.49 PASS AO=525;DP=526;FAO=399;FDP=399;FR=.;FRO=0;FSAF=225;FSAR=174;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.116474;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.0988;QD=38.02;RBI=0.143015;REFB=0;REVB=0.0829895;RO=0;SAF=283;SAR=242;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000319065;OID=.;OPOS=116386139;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:526:399:0:0:525:399:242:283:0:0:174:225:0:0 chr1 116386244 . C T 3782.36 PASS AO=709;DP=717;FAO=397;FDP=397;FR=.;FRO=0;FSAF=149;FSAR=248;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0139952;FXX=0.00749981;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.027;QD=38.1094;RBI=0.0144291;REFB=-0.0150802;REVB=0.00351193;RO=3;SAF=255;SAR=454;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00268057;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.67014e-06;OID=.;OPOS=116386244;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:717:397:3:0:709:397:454:255:2:1:248:149:0:0 chr1 116569530 . G C 2124.71 PASS AO=222;DP=224;FAO=223;FDP=223;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=139;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00097571;FXX=0.00446409;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.1992;QD=38.1114;RBI=0.031275;REFB=0;REVB=0.0312598;RO=0;SAF=84;SAR=138;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000247022;OID=.;OPOS=116569530;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:224:223:0:0:222:223:138:84:0:0:139:84:0:0 chr1 116610388 . A G 833.82 PASS AO=87;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00673413;FXX=0.0222198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.6581;QD=37.9009;RBI=0.0156179;REFB=-0.0116181;REVB=-0.0140915;RO=1;SAF=36;SAR=51;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129795;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.90496e-05;OID=.;OPOS=116610388;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:88:88:1:0:87:88:51:36:1:0:51:37:0:0 chr1 116948712 . G A 271.55 PASS AO=61;DP=130;FAO=65;FDP=134;FR=.;FRO=69;FSAF=16;FSAR=49;FSRF=25;FSRR=44;FWDB=0.0301052;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=254.117;QD=8.10595;RBI=0.0342315;REFB=-0.00760099;REVB=0.0162933;RO=69;SAF=16;SAR=45;SRF=25;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115454;STB=0.574468;TYPE=snp;VARB=0.00785695;OID=.;OPOS=116948712;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:134:69:69:61:65:45:16:25:44:49:16:25:44 chr1 117041471 . A G 208.69 PASS AO=55;DP=128;FAO=57;FDP=130;FR=.;FRO=73;FSAF=35;FSAR=22;FSRF=31;FSRR=42;FWDB=-0.0339083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.616;QD=6.4213;RBI=0.0483253;REFB=0.00618149;REVB=-0.0344319;RO=72;SAF=33;SAR=22;SRF=31;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171819;STB=0.60668;TYPE=snp;VARB=-0.0099338;OID=.;OPOS=117041471;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:130:72:73:55:57:22:33:31:41:22:35:31:42 chr1 117122130 . T C 96.14 PASS AO=36;DP=112;FAO=36;FDP=110;FR=.;FRO=74;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=26;FSRR=48;FWDB=0.0129286;FXX=0.0178555;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.495;QD=3.49583;RBI=0.0330494;REFB=-0.00214058;REVB=-0.0304157;RO=63;SAF=11;SAR=25;SRF=22;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0554712;STB=0.535281;TYPE=snp;VARB=0.0034594;OID=.;OPOS=117122130;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:112:110:63:74:36:36:25:11:22:41:25:11:26:48 chr1 117122288 . G C 89.91 PASS AO=21;DP=45;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=2;FSAR=19;FSRF=5;FSRR=19;FWDB=-0.0991963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8234;QD=7.99243;RBI=0.103271;REFB=-0.0307759;REVB=0.028724;RO=24;SAF=2;SAR=19;SRF=5;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23498;STB=0.636209;TYPE=snp;VARB=0.0248007;OID=.;OPOS=117122288;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:45:45:24:24:21:21:19:2:5:19:19:2:5:19 chr1 117142641 . G A 18.41 PASS AO=19;DP=109;FAO=19;FDP=109;FR=.;FRO=90;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=56;FSRR=34;FWDB=0.0025535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.872;QD=0.675511;RBI=0.0191075;REFB=-0.00676014;REVB=-0.0189361;RO=90;SAF=10;SAR=9;SRF=56;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123836;STB=0.579997;TYPE=snp;VARB=0.0425066;OID=.;OPOS=117142641;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:109:109:90:90:19:19:9:10:56:34:9:10:56:34 chr1 117142700 . C A 66.62 PASS AO=35;DP=133;FAO=35;FDP=133;FR=.;FRO=98;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=61;FSRR=37;FWDB=0.0029003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.201;QD=2.00374;RBI=0.0465709;REFB=-0.0121046;REVB=0.0464805;RO=97;SAF=18;SAR=17;SRF=60;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129531;STB=0.580085;TYPE=snp;VARB=0.039088;OID=.;OPOS=117142700;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:133:133:97:98:35:35:17:18:60:37:17:18:61:37 chr1 117142736 . A G 88.29 PASS AO=39;DP=131;FAO=39;FDP=132;FR=.;FRO=93;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=51;FSRR=42;FWDB=0.00325259;FXX=0.00751823;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.5987;QD=2.67532;RBI=0.03945;REFB=-0.0128048;REVB=-0.0393157;RO=91;SAF=19;SAR=20;SRF=51;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0874101;STB=0.543035;TYPE=snp;VARB=0.0268741;OID=.;OPOS=117142736;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:131:132:91:93:39:39:20:19:51:40:20:19:51:42 chr1 117142855 . C T 153.04 PASS AO=40;DP=94;FAO=41;FDP=95;FR=.;FRO=54;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=34;FSRR=20;FWDB=0.0319518;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.8205;QD=6.4436;RBI=0.0319903;REFB=-0.0238292;REVB=0.00156912;RO=54;SAF=20;SAR=20;SRF=34;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132474;STB=0.58031;TYPE=snp;VARB=0.0325271;OID=.;OPOS=117142855;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:95:54:54:40:41:20:20:34:20:21:20:34:20 chr1 117142865 . ACCCA ACCA,ACCTG 316.27 PASS AO=21,24;DP=80;FAO=25,35;FDP=80;FR=.;FRO=20;FSAF=25,20;FSAR=0,15;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=-0.106258,-0.0122993;FXX=0.0361402;HRUN=3,3;LEN=1,2;MLLD=14.4466,102.445;QD=15.8135;RBI=0.106261,0.0157461;REFB=-0.122056,-0.0297629;REVB=-0.000813973,0.00983193;RO=19;SAF=21,20;SAR=0,4;SRF=3;SRR=16;SSEN=0,0;SSEP=0.360656,0;SSSB=0.870268,0.559203;STB=0.999466,0.61532;TYPE=del,mnp;VARB=0.0459983,0.0263589;OID=.,.;OPOS=117142866,117142868;OREF=C,CA;OALT=-,TG;OMAPALT=ACCA,ACCTG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:21,24:70:25,35:80:20:25,20:0,15:5:15:86:19:21,20:0,4:3:16 chr1 117146504 . G A 22.03 PASS AO=15;DP=73;FAO=15;FDP=74;FR=.;FRO=59;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=35;FWDB=-0.00458242;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.243;QD=1.19101;RBI=0.0102189;REFB=-0.00598707;REVB=0.00913391;RO=58;SAF=4;SAR=11;SRF=23;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181863;STB=0.625838;TYPE=snp;VARB=0.0202169;OID=.;OPOS=117146504;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:73:74:58:59:15:15:11:4:23:35:11:4:24:35 chr1 117146563 . G A 27.76 PASS AO=10;DP=40;FAO=11;FDP=41;FR=.;FRO=30;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=21;FWDB=-0.0362336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.616;QD=2.70837;RBI=0.0457836;REFB=-0.00721103;REVB=0.0279867;RO=30;SAF=1;SAR=9;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.377047;STB=0.622393;TYPE=snp;VARB=0.00971161;OID=.;OPOS=117146563;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:40:41:30:30:10:11:9:1:9:21:9:2:9:21 chr1 117146571 . A G 17.65 PASS AO=8;DP=36;FAO=8;FDP=36;FR=.;FRO=28;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=20;FWDB=-0.0521651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.0787;QD=1.96143;RBI=0.0708826;REFB=-0.017644;REVB=-0.0479911;RO=28;SAF=1;SAR=7;SRF=8;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.293369;STB=0.6994;TYPE=snp;VARB=0.0594916;OID=.;OPOS=117146571;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:36:36:28:28:8:8:7:1:8:20:7:1:8:20 chr1 117150928 . C T 85.72 PASS AO=24;DP=71;FAO=27;FDP=74;FR=.;FRO=47;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=37;FSRR=10;FWDB=0.0247771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.838;QD=4.63339;RBI=0.0371651;REFB=-0.0195089;REVB=0.027701;RO=47;SAF=14;SAR=10;SRF=37;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253896;STB=0.613561;TYPE=snp;VARB=0.0286712;OID=.;OPOS=117150928;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:71:74:47:47:24:27:10:14:37:10:10:17:37:10 chr1 117150933 . G A 79.83 PASS AO=26;DP=71;FAO=25;FDP=71;FR=.;FRO=46;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=37;FSRR=9;FWDB=0.0071046;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.992;QD=4.49736;RBI=0.0343627;REFB=-0.0482928;REVB=0.0336202;RO=44;SAF=16;SAR=10;SRF=36;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253653;STB=0.645862;TYPE=snp;VARB=0.0169645;OID=.;OPOS=117150933;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:71:71:44:46:26:25:10:16:36:8:10:15:37:9 chr1 117156459 . C T 38.04 PASS AO=19;DP=76;FAO=19;FDP=75;FR=.;FRO=56;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=39;FSRR=17;FWDB=0.0701511;FXX=0.0131562;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.8871;QD=2.02861;RBI=0.0733333;REFB=-0.0174652;REVB=0.0213681;RO=57;SAF=12;SAR=7;SRF=40;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0959641;STB=0.553434;TYPE=snp;VARB=0.0568008;OID=.;OPOS=117156459;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:76:75:57:56:19:19:7:12:40:17:7:12:39:17 chr1 117156490 . T C 22.06 PASS AO=14;DP=66;FAO=14;FDP=67;FR=.;FRO=53;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=34;FSRR=19;FWDB=-0.0157018;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.708;QD=1.31683;RBI=0.0522468;REFB=-0.00291818;REVB=-0.0498316;RO=52;SAF=10;SAR=4;SRF=33;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1124;STB=0.566404;TYPE=snp;VARB=0.0154646;OID=.;OPOS=117156490;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:66:67:52:53:14:14:4:10:33:19:4:10:34:19 chr1 117487710 . A G 664.55 PASS AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0398468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.5678;QD=36.4136;RBI=0.0732723;REFB=-0.0134605;REVB=-0.0614903;RO=1;SAF=17;SAR=55;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00852305;STB=0.504503;TYPE=snp;VARB=0.000268732;OID=.;OPOS=117487710;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:73:73:1:1:72:72:55:17:0:1:55:17:0:1 chr1 117487711 . T A 214.51 PASS AO=72;DP=73;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0856742;FXX=0.424599;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.3509;QD=20.4291;RBI=0.12696;REFB=0;REVB=0.0936952;RO=0;SAF=17;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.54913e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0968165;OID=.;OPOS=117487711;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:73:42:0:0:72:42:55:17:0:0:33:9:0:0 chr1 117529458 . G A 319.58 PASS AO=70;DP=136;FAO=71;FDP=137;FR=.;FRO=66;FSAF=56;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=37;FWDB=-0.0170988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.07;QD=9.33082;RBI=0.0225597;REFB=-0.0162405;REVB=0.0147165;RO=66;SAF=55;SAR=15;SRF=29;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.350149;STB=0.695426;TYPE=snp;VARB=0.0139594;OID=.;OPOS=117529458;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:137:66:66:70:71:15:55:29:37:15:56:29:37 chr1 117530273 . A G 155.55 PASS AO=48;DP=121;FAO=47;FDP=120;FR=.;FRO=73;FSAF=36;FSAR=11;FSRF=33;FSRR=40;FWDB=0.0429906;FXX=0.00826378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.391;QD=5.185;RBI=0.047345;REFB=-0.00456346;REVB=-0.0198334;RO=73;SAF=37;SAR=11;SRF=33;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.368697;STB=0.707421;TYPE=snp;VARB=0.0146905;OID=.;OPOS=117530273;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:120:73:73:48:47:11:37:33:40:11:36:33:40 chr1 117532291 . A G 502.92 PASS AO=133;DP=295;FAO=133;FDP=293;FR=.;FRO=160;FSAF=39;FSAR=94;FSRF=75;FSRR=85;FWDB=0.00215073;FXX=0.00677943;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.957;QD=6.86575;RBI=0.00514576;REFB=-0.0119114;REVB=-0.00467474;RO=159;SAF=39;SAR=94;SRF=74;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186187;STB=0.60551;TYPE=snp;VARB=0.0149315;OID=.;OPOS=117532291;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:295:293:159:160:133:133:94:39:74:85:94:39:75:85 chr1 117532790 . C T 162.67 PASS AO=52;DP=133;FAO=51;FDP=133;FR=.;FRO=82;FSAF=12;FSAR=39;FSRF=28;FSRR=54;FWDB=-0.0192248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.035;QD=4.89241;RBI=0.0197997;REFB=-0.00447136;REVB=0.00473639;RO=78;SAF=12;SAR=40;SRF=26;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139333;STB=0.582925;TYPE=snp;VARB=0.00550323;OID=.;OPOS=117532790;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:78:82:52:51:40:12:26:52:39:12:28:54 chr1 117532798 . C G 124.48 PASS AO=43;DP=131;FAO=43;FDP=123;FR=.;FRO=80;FSAF=10;FSAR=33;FSRF=28;FSRR=52;FWDB=-0.00558472;FXX=0.0751823;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.587;QD=4.04824;RBI=0.0140767;REFB=0.00183008;REVB=-0.0129215;RO=72;SAF=10;SAR=33;SRF=26;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174808;STB=0.59596;TYPE=snp;VARB=-0.00697435;OID=.;OPOS=117532798;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:123:72:80:43:43:33:10:26:46:33:10:28:52 chr1 117554421 . A G 272.41 PASS AO=78;DP=187;FAO=78;FDP=186;FR=.;FRO=108;FSAF=49;FSAR=29;FSRF=67;FSRR=41;FWDB=0.00256567;FXX=0.00534731;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.323;QD=5.85827;RBI=0.0138759;REFB=-0.00988011;REVB=-0.0136366;RO=106;SAF=49;SAR=29;SRF=67;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00427617;STB=0.504856;TYPE=snp;VARB=0.0147692;OID=.;OPOS=117554421;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:186:106:108:78:78:29:49:67:39:29:49:67:41 chr1 117559726 . A G 1028.32 PASS AO=106;DP=106;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00611745;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.264;QD=38.4419;RBI=0.0106552;REFB=0;REVB=-0.0087241;RO=0;SAF=50;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.29603e-05;OID=.;OPOS=117559726;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:106:107:0:0:106:107:56:50:0:0:56:51:0:0 chr1 117560818 . A G 297.49 PASS AO=61;DP=109;FAO=60;FDP=107;FR=.;FRO=47;FSAF=21;FSAR=39;FSRF=16;FSRR=31;FWDB=-0.0205308;FXX=0.0183469;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0275;QD=11.121;RBI=0.0268049;REFB=0.0265435;REVB=-0.0172334;RO=46;SAF=22;SAR=39;SRF=16;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0109817;STB=0.504633;TYPE=snp;VARB=-0.0213156;OID=.;OPOS=117560818;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:107:46:47:61:60:39:22:16:30:39:21:16:31 chr1 117560929 . C A 500.25 PASS AO=114;DP=229;FAO=115;FDP=228;FR=.;FRO=113;FSAF=50;FSAR=65;FSRF=33;FSRR=80;FWDB=-0.0248687;FXX=0.00869527;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.96;QD=8.77639;RBI=0.0287511;REFB=-0.0221309;REVB=-0.0144282;RO=111;SAF=50;SAR=64;SRF=32;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140375;STB=0.573337;TYPE=snp;VARB=0.0237626;OID=.;OPOS=117560929;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:229:228:111:113:114:115:64:50:32:79:65:50:33:80 chr1 117561134 . AG A 481.77 PASS AO=63;DP=107;FAO=84;FDP=87;FR=.;FRO=3;FSAF=38;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.149406;FXX=0.1386;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.999;QD=22.1502;RBI=0.21956;REFB=0.0706374;REVB=-0.160886;RO=9;SAF=29;SAR=34;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0.397173;SSSB=-0.022459;STB=0.515786;TYPE=del;VARB=0.0140381;OID=.;OPOS=117561135;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:63:95:84:87:3:38:46:0:3:26:9:29:34:5:4 chr1 117602960 . C A 208.28 PASS AO=52;DP=120;FAO=54;FDP=121;FR=.;FRO=67;FSAF=31;FSAR=23;FSRF=34;FSRR=33;FWDB=0.0548169;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.3789;QD=6.88527;RBI=0.0970913;REFB=-0.0413166;REVB=0.0801363;RO=66;SAF=29;SAR=23;SRF=33;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0580044;STB=0.537281;TYPE=snp;VARB=0.0388535;OID=.;OPOS=117602960;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:121:66:67:52:54:23:29:33:33:23:31:34:33 chr1 117603156 . G T 470.1 PASS AO=74;DP=105;FAO=75;FDP=106;FR=.;FRO=31;FSAF=27;FSAR=48;FSRF=3;FSRR=28;FWDB=0.013895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.789;QD=17.7396;RBI=0.0145025;REFB=-0.0214715;REVB=-0.00415357;RO=31;SAF=27;SAR=47;SRF=3;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167376;STB=0.587607;TYPE=snp;VARB=0.00639421;OID=.;OPOS=117603156;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:105:106:31:31:74:75:47:27:3:28:48:27:3:28 chr1 117617705 . A G 1151.46 PASS AO=120;DP=120;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.035602;FXX=0.00819605;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.7568;QD=38.0648;RBI=0.0449467;REFB=0;REVB=-0.0274355;RO=0;SAF=52;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000266189;OID=.;OPOS=117617705;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:120:121:0:0:120:121:68:52:0:0:70:51:0:0 chr1 117618067 . C T 384.5 PASS AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.042;QD=38.4499;RBI=0.0229833;REFB=0;REVB=0.0197187;RO=0;SAF=25;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000557352;OID=.;OPOS=117618067;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:39:40:0:0:39:40:14:25:0:0:15:25:0:0 chr1 117659352 . C T 527.93 PASS AO=116;DP=219;FAO=116;FDP=220;FR=.;FRO=104;FSAF=47;FSAR=69;FSRF=43;FSRR=61;FWDB=0.0529904;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.099;QD=9.59876;RBI=0.0529928;REFB=0.00467654;REVB=0.000508612;RO=96;SAF=47;SAR=69;SRF=42;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0276885;STB=0.504058;TYPE=snp;VARB=-0.00306479;OID=.;OPOS=117659352;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:219:220:96:104:116:116:69:47:42:54:69:47:43:61 chr1 117715026 . C T 842.78 PASS AO=91;DP=94;FAO=92;FDP=94;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0272577;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=181.731;QD=35.8628;RBI=0.028522;REFB=-0.05468;REVB=0.00839791;RO=1;SAF=34;SAR=57;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0082444;STB=0.508619;TYPE=snp;VARB=5.37409e-05;OID=.;OPOS=117715026;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:94:94:1:2:91:92:57:34:0:1:57:35:0:2 chr1 117785931 . G A 84.71 PASS AO=27;DP=98;FAO=29;FDP=92;FR=.,HEALED;FRO=63;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=38;FWDB=-0.00245586;FXX=0.079992;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.2799;QD=3.68294;RBI=0.0649301;REFB=0.00638877;REVB=0.0648836;RO=39;SAF=15;SAR=12;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0178837;STB=0.604822;TYPE=snp;VARB=-0.0115534;OID=.;OPOS=117785931;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:98:92:39:63:27:29:12:15:21:18:13:16:25:38 chr1 117785979 . T C 743.39 PASS AO=82;DP=84;FAO=82;FDP=84;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=58;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0642609;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.2473;QD=35.3997;RBI=0.0656624;REFB=0.0385834;REVB=-0.0134938;RO=2;SAF=24;SAR=58;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0112267;STB=0.50593;TYPE=snp;VARB=-0.00664019;OID=.;OPOS=117785979;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:84:84:2:2:82:82:58:24:1:1:58:24:1:1 chr1 118065841 . A G 691.06 PASS AO=172;DP=357;FAO=171;FDP=355;FR=.;FRO=184;FSAF=71;FSAR=100;FSRF=95;FSRR=89;FWDB=-0.00681793;FXX=0.00280891;HRUN=3;LEN=1;MLLD=191.665;QD=7.78658;RBI=0.0137102;REFB=-0.0172097;REVB=-0.0118948;RO=184;SAF=71;SAR=101;SRF=95;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0984702;STB=0.552977;TYPE=snp;VARB=0.0184875;OID=.;OPOS=118065841;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:357:355:184:184:172:171:101:71:95:89:100:71:95:89 chr1 118166385 . G A 195.59 PASS AO=40;DP=77;FAO=42;FDP=79;FR=.;FRO=37;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=0.0170784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.073;QD=9.90309;RBI=0.030762;REFB=-0.00639809;REVB=0.0255857;RO=36;SAF=26;SAR=14;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0861431;STB=0.550434;TYPE=snp;VARB=0.00591051;OID=.;OPOS=118166385;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:79:36:37:40:42:14:26:20:16:14:28:21:16 chr1 118166853 . C A 410.62 PASS AO=97;DP=192;FAO=96;FDP=192;FR=.;FRO=96;FSAF=32;FSAR=64;FSRF=28;FSRR=68;FWDB=0.00227595;FXX=0.00518108;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.105;QD=8.55462;RBI=0.0026957;REFB=-0.0162118;REVB=-0.00144459;RO=90;SAF=33;SAR=64;SRF=28;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0287721;STB=0.523805;TYPE=snp;VARB=0.0140406;OID=.;OPOS=118166853;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:192:90:96:97:96:64:33:28:62:64:32:28:68 chr1 118166877 . C T 493.21 PASS AO=110;DP=211;FAO=110;FDP=211;FR=.;FRO=101;FSAF=38;FSAR=72;FSRF=30;FSRR=71;FWDB=-0.00254438;FXX=0.00471676;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.708;QD=9.34992;RBI=0.0083312;REFB=-0.0140223;REVB=-0.00793316;RO=101;SAF=38;SAR=72;SRF=30;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0476548;STB=0.526036;TYPE=snp;VARB=0.0112399;OID=.;OPOS=118166877;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:211:101:101:110:110:72:38:30:71:72:38:30:71 chr1 118167199 . A G 338.11 PASS AO=98;DP=234;FAO=98;FDP=234;FR=.;FRO=136;FSAF=51;FSAR=47;FSRF=72;FSRR=64;FWDB=0.010603;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=149.792;QD=5.77963;RBI=0.0119548;REFB=0.00137963;REVB=0.00552194;RO=134;SAF=51;SAR=47;SRF=71;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00979548;STB=0.505243;TYPE=snp;VARB=-0.00205041;OID=.;OPOS=118167199;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:234:234:134:136:98:98:47:51:71:63:47:51:72:64 chr1 118167653 . C T 282.8 PASS AO=61;DP=126;FAO=66;FDP=131;FR=.;FRO=65;FSAF=31;FSAR=35;FSRF=33;FSRR=32;FWDB=0.0162345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.375;QD=8.63497;RBI=0.016239;REFB=-0.0110231;REVB=0.000381421;RO=63;SAF=27;SAR=34;SRF=32;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0603363;STB=0.518873;TYPE=snp;VARB=0.0124924;OID=.;OPOS=118167653;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:131:63:65:61:66:34:27:32:31:35:31:33:32 chr1 118482149 . C T 139.23 PASS AO=51;DP=146;FAO=51;FDP=150;FR=.;FRO=99;FSAF=10;FSAR=41;FSRF=47;FSRR=52;FWDB=-0.028006;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.2825;QD=3.71271;RBI=0.0294058;REFB=-0.0284467;REVB=-0.00896482;RO=95;SAF=10;SAR=41;SRF=44;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.355378;STB=0.715242;TYPE=snp;VARB=0.0329922;OID=.;OPOS=118482149;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:150:95:99:51:51:41:10:44:51:41:10:47:52 chr1 118509355 . C G 483.1 PASS AO=113;DP=225;FAO=113;FDP=225;FR=.;FRO=112;FSAF=41;FSAR=72;FSRF=42;FSRR=70;FWDB=0.00936523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.202;QD=8.58851;RBI=0.0271056;REFB=-0.00996903;REVB=0.0254363;RO=111;SAF=41;SAR=72;SRF=42;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0151086;STB=0.506525;TYPE=snp;VARB=0.00932605;OID=.;OPOS=118509355;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:225:225:111:112:113:113:72:41:42:69:72:41:42:70 chr1 118530796 . C T 317.66 PASS AO=82;DP=181;FAO=82;FDP=180;FR=.;FRO=98;FSAF=52;FSAR=30;FSRF=55;FSRR=43;FWDB=-0.00921866;FXX=0.00552456;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.307;QD=7.05903;RBI=0.00934138;REFB=0.00397644;REVB=0.00150915;RO=99;SAF=52;SAR=30;SRF=55;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.08128;STB=0.541811;TYPE=snp;VARB=-0.00360142;OID=.;OPOS=118530796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:180:99:98:82:82:30:52:55:44:30:52:55:43 chr1 118537074 . A G 440.74 PASS AO=122;DP=337;FAO=142;FDP=356;FR=.;FRO=214;FSAF=74;FSAR=68;FSRF=94;FSRR=120;FWDB=0.0259445;FXX=0.00558644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.086;QD=4.95212;RBI=0.0279743;REFB=-0.0107263;REVB=-0.0104617;RO=209;SAF=65;SAR=57;SRF=93;SRR=116;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0978941;STB=0.549093;TYPE=snp;VARB=0.0142034;OID=.;OPOS=118537074;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:337:356:209:214:122:142:57:65:93:116:68:74:94:120 chr1 118624123 . C T 270.27 PASS AO=69;DP=151;FAO=69;FDP=151;FR=.;FRO=82;FSAF=21;FSAR=48;FSRF=34;FSRR=48;FWDB=-0.0590177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.213;QD=7.15944;RBI=0.0602994;REFB=0.014363;REVB=-0.0123665;RO=81;SAF=21;SAR=48;SRF=34;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124833;STB=0.56699;TYPE=snp;VARB=-0.0159173;OID=.;OPOS=118624123;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:151:81:82:69:69:48:21:34:47:48:21:34:48 chr1 118629599 . G A 388.95 PASS AO=86;DP=162;FAO=87;FDP=166;FR=.;FRO=79;FSAF=44;FSAR=43;FSRF=39;FSRR=40;FWDB=4.40953e-05;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=144.486;QD=9.37236;RBI=0.00482389;REFB=-0.0295133;REVB=-0.00482369;RO=75;SAF=43;SAR=43;SRF=39;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170237;STB=0.505746;TYPE=snp;VARB=0.0232992;OID=.;OPOS=118629599;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:166:75:79:86:87:43:43:39:36:43:44:39:40 chr1 118644430 . A G 172.99 PASS AO=53;DP=147;FAO=54;FDP=141;FR=.;FRO=87;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=45;FSRR=42;FWDB=-0.00299985;FXX=0.059996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.9744;QD=4.90757;RBI=0.0162168;REFB=-0.0277445;REVB=-0.0159369;RO=85;SAF=27;SAR=26;SRF=43;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00386009;STB=0.500789;TYPE=snp;VARB=0.0362483;OID=.;OPOS=118644430;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:141:85:87:53:54:26:27:43:42:26:28:45:42 chr1 118657952 . C T 702.77 PASS AO=156;DP=300;FAO=157;FDP=300;FR=.;FRO=143;FSAF=75;FSAR=82;FSRF=68;FSRR=75;FWDB=0.03153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.268;QD=9.37025;RBI=0.0345554;REFB=-0.00571935;REVB=0.0141398;RO=142;SAF=75;SAR=81;SRF=68;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00165712;STB=0.501042;TYPE=snp;VARB=0.00417015;OID=.;OPOS=118657952;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:300:300:142:143:156:157:81:75:68:74:82:75:68:75 chr1 118693217 . T C 177.84 PASS AO=61;DP=163;FAO=60;FDP=164;FR=.;FRO=104;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=31;FSRR=73;FWDB=-0.0223995;FXX=0.00606024;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.022;QD=4.33753;RBI=0.0320295;REFB=-0.0207774;REVB=-0.0228943;RO=96;SAF=25;SAR=36;SRF=31;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0995298;STB=0.579374;TYPE=snp;VARB=0.0249513;OID=.;OPOS=118693217;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:164:96:104:61:60:36:25:31:65:35:25:31:73 chr1 118807059 . T C 157.76 PASS AO=44;DP=105;FAO=44;FDP=105;FR=.;FRO=61;FSAF=29;FSAR=15;FSRF=45;FSRR=16;FWDB=-0.0146101;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.849;QD=6.00972;RBI=0.0315811;REFB=-0.0217899;REVB=-0.0279984;RO=61;SAF=29;SAR=15;SRF=45;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0936511;STB=0.552491;TYPE=snp;VARB=0.0217053;OID=.;OPOS=118807059;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:61:61:44:44:15:29:45:16:15:29:45:16 chr1 119923724 . T C 728.46 PASS AO=170;DP=336;FAO=170;FDP=336;FR=.;FRO=166;FSAF=90;FSAR=80;FSRF=84;FSRR=82;FWDB=0.0215326;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=248.041;QD=8.67218;RBI=0.0216233;REFB=-0.0118603;REVB=-0.00197891;RO=166;SAF=90;SAR=80;SRF=84;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0211535;STB=0.511578;TYPE=snp;VARB=0.011299;OID=.;OPOS=119923724;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:336:336:166:166:170:170:80:90:84:82:80:90:84:82 chr1 120057158 . C T 481.88 PASS AO=105;DP=200;FAO=106;FDP=200;FR=.;FRO=94;FSAF=49;FSAR=57;FSRF=49;FSRR=45;FWDB=-0.00694848;FXX=0.00497488;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.281;QD=9.63753;RBI=0.00958506;REFB=-0.00684366;REVB=0.00660242;RO=94;SAF=48;SAR=57;SRF=49;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0554976;STB=0.527773;TYPE=snp;VARB=0.00691439;OID=.;OPOS=120057158;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:200:200:94:94:105:106:57:48:49:45:57:49:49:45 chr1 120057246 . C A 939.23 PASS AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00666547;FXX=0.009999;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.3428;QD=37.9488;RBI=0.0351081;REFB=0.0617178;REVB=-0.0344696;RO=0;SAF=46;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0011915;OID=.;OPOS=120057246;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:99:99:0:0:99:99:53:46:0:0:53:46:0:0 chr1 120164738 . C T 268.4 PASS AO=59;DP=155;FAO=76;FDP=180;FR=.;FRO=104;FSAF=24;FSAR=52;FSRF=28;FSRR=76;FWDB=0.0200111;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=38.6155;QD=5.96442;RBI=0.0633579;REFB=-0.0301249;REVB=0.0601147;RO=96;SAF=7;SAR=52;SRF=22;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226754;STB=0.531848;TYPE=snp;VARB=0.0456619;OID=.;OPOS=120164738;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:180:96:104:59:76:52:7:22:74:52:24:28:76 chr1 120166453 . G C 88.3 PASS AO=24;DP=59;FAO=24;FDP=59;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=0.00922241;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.4283;QD=5.98611;RBI=0.0646266;REFB=0.0072972;REVB=0.0639652;RO=35;SAF=16;SAR=8;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165723;STB=0.595156;TYPE=snp;VARB=-0.00712886;OID=.;OPOS=120166453;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:59:59:35:35:24:24:8:16:18:17:8:16:18:17 chr1 120267431 . G A 317.94 PASS AO=79;DP=171;FAO=80;FDP=171;FR=.;FRO=91;FSAF=30;FSAR=50;FSRF=24;FSRR=67;FWDB=0.0128513;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.277;QD=7.43713;RBI=0.0165687;REFB=-0.0138662;REVB=0.0104577;RO=92;SAF=30;SAR=49;SRF=24;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127231;STB=0.565202;TYPE=snp;VARB=0.0118021;OID=.;OPOS=120267431;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:171:92:91:79:80:49:30:24:68:50:30:24:67 chr1 120267544 . C T 313.05 PASS AO=72;DP=143;FAO=72;FDP=143;FR=.;FRO=71;FSAF=13;FSAR=59;FSRF=26;FSRR=45;FWDB=0.040916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.1031;QD=8.75652;RBI=0.040969;REFB=-0.0186983;REVB=0.00208277;RO=71;SAF=13;SAR=59;SRF=26;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233283;STB=0.629853;TYPE=snp;VARB=0.0220023;OID=.;OPOS=120267544;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:71:71:72:72:59:13:26:45:59:13:26:45 chr1 120267597 . GC G 161.44 PASS AO=49;DP=90;FAO=48;FDP=88;FR=.;FRO=40;FSAF=11;FSAR=37;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=-0.145119;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=24.7301;QD=7.33794;RBI=0.161065;REFB=-0.0245976;REVB=-0.0698724;RO=39;SAF=12;SAR=37;SRF=15;SRR=24;SSEN=0.298411;SSEP=0;SSSB=-0.139715;STB=0.59816;TYPE=del;VARB=0.00949489;OID=.;OPOS=120267598;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:49:88:48:88:40:11:37:16:24:98:39:12:37:15:24 chr1 120336785 . C T 1037.01 PASS AO=108;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0437674;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=66.9029;QD=38.4078;RBI=0.046118;REFB=0;REVB=0.0145356;RO=0;SAF=49;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.62579e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000111912;OID=.;OPOS=120336785;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:108:108:0:0:108:108:59:49:0:0:59:49:0:0 chr1 120378678 . C T 2178.18 PASS AO=234;DP=238;FAO=234;FDP=238;FR=.;FRO=4;FSAF=96;FSAR=138;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0255291;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.291;QD=36.608;RBI=0.0487469;REFB=-0.027285;REVB=-0.0415274;RO=4;SAF=96;SAR=138;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00296763;STB=0.501558;TYPE=snp;VARB=0.000790429;OID=.;OPOS=120378678;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:238:238:4:4:234:234:138:96:2:2:138:96:2:2 chr1 120381846 . A G 1088.05 PASS AO=222;DP=399;FAO=226;FDP=400;FR=.;FRO=174;FSAF=133;FSAR=93;FSRF=94;FSRR=80;FWDB=0.00676048;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.9989;QD=10.8805;RBI=0.0278834;REFB=0.027648;REVB=0.0270514;RO=177;SAF=136;SAR=86;SRF=95;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0642644;STB=0.521508;TYPE=snp;VARB=-0.0195817;OID=.;OPOS=120381846;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:399:400:177:174:222:226:86:136:95:82:93:133:94:80 chr1 120384205 . A G 1374.74 PASS AO=161;DP=166;FAO=158;FDP=167;FR=.;FRO=9;FSAF=82;FSAR=76;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.00521819;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.5691;QD=32.9279;RBI=0.0212015;REFB=-0.00146258;REVB=-0.0205494;RO=5;SAF=85;SAR=76;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00734692;STB=0.507974;TYPE=snp;VARB=0.00135923;OID=.;OPOS=120384205;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:166:167:5:9:161:158:76:85:2:3:76:82:6:3 chr1 120387120 . G A 1848.37 PASS AO=191;DP=195;FAO=195;FDP=195;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=153;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0863644;FXX=0.0101518;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.7211;QD=37.9153;RBI=0.0869092;REFB=-0.0421108;REVB=0.00971643;RO=3;SAF=39;SAR=152;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0352226;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00078317;OID=.;OPOS=120387120;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:195:195:3:0:191:195:152:39:3:0:153:42:0:0 chr1 120458791 . GC G 221.52 PASS AO=25;DP=37;FAO=35;FDP=37;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.131857;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=18.031;QD=23.9482;RBI=0.387886;REFB=-0.00258117;REVB=0.364787;RO=8;SAF=9;SAR=16;SRF=4;SRR=4;SSEN=0.420382;SSEP=0;SSSB=-0.0660409;STB=0.531232;TYPE=del;VARB=0.0366192;OID=.;OPOS=120458792;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:25:37:35:37:2:15:20:2:0:12:8:9:16:4:4 chr1 120459122 . C T 515.04 PASS AO=136;DP=309;FAO=136;FDP=300;FR=.;FRO=164;FSAF=70;FSAR=66;FSRF=88;FSRR=76;FWDB=0.00618564;FXX=0.0291253;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.183;QD=6.86714;RBI=0.0221725;REFB=-0.0133346;REVB=0.0212922;RO=159;SAF=70;SAR=66;SRF=85;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0194363;STB=0.511978;TYPE=snp;VARB=0.017433;OID=.;OPOS=120459122;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:309:300:159:164:136:136:66:70:85:74:66:70:88:76 chr1 120539331 . C T 248.34 PASS AO=88;DP=245;FAO=88;FDP=245;FR=.;FRO=157;FSAF=59;FSAR=29;FSRF=91;FSRR=66;FWDB=-0.0167893;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=239.031;QD=4.05459;RBI=0.0235245;REFB=-0.0133446;REVB=0.0164779;RO=157;SAF=59;SAR=29;SRF=91;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110613;STB=0.563019;TYPE=snp;VARB=0.0204194;OID=.;OPOS=120539331;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:245:245:157:157:88:88:29:59:91:66:29:59:91:66 chr1 121116688 . A G 496.45 PASS AO=83;DP=127;FAO=84;FDP=125;FR=.;FRO=41;FSAF=51;FSAR=33;FSRF=27;FSRR=14;FWDB=0.0171883;FXX=0.0157468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.854;QD=15.8865;RBI=0.0514172;REFB=-0.013178;REVB=0.0484591;RO=42;SAF=50;SAR=33;SRF=28;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0422239;STB=0.517799;TYPE=snp;VARB=0.00447945;OID=.;OPOS=121116688;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:125:42:41:83:84:33:50:28:14:33:51:27:14 chr1 144014051 . G A 164.76 PASS AO=70;DP=225;FAO=71;FDP=226;FR=.;FRO=155;FSAF=40;FSAR=31;FSRF=81;FSRR=74;FWDB=0.046497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.6876;QD=2.9161;RBI=0.0471177;REFB=-0.00802046;REVB=0.00762297;RO=155;SAF=39;SAR=31;SRF=81;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0414261;STB=0.528227;TYPE=snp;VARB=0.0156538;OID=.;OPOS=144014051;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:225:226:155:155:70:71:31:39:81:74:31:40:81:74 chr1 144014068 . T C 533.06 PASS AO=106;DP=182;FAO=106;FDP=183;FR=.;FRO=77;FSAF=57;FSAR=49;FSRF=41;FSRR=36;FWDB=-0.0303799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.61;QD=11.6515;RBI=0.0369903;REFB=-0.0220595;REVB=0.0211031;RO=75;SAF=57;SAR=49;SRF=39;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.013604;STB=0.502228;TYPE=snp;VARB=0.0148036;OID=.;OPOS=144014068;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:183:75:77:106:106:49:57:39:36:49:57:41:36 chr1 144534038 . A G 154.31 PASS AO=124;DP=494;FAO=100;FDP=399;FR=.;FRO=299;FSAF=81;FSAR=19;FSRF=265;FSRR=34;FWDB=-0.0151158;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.3714;QD=1.54693;RBI=0.0170815;REFB=-0.00217907;REVB=-0.00795538;RO=367;SAF=101;SAR=23;SRF=322;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148174;STB=0.604933;TYPE=snp;VARB=0.00638648;OID=.;OPOS=144534038;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:494:399:367:299:124:100:23:101:322:45:19:81:265:34 chr1 144534045 . T C 1658.65 PASS AO=368;DP=535;FAO=275;FDP=400;FR=.;FRO=125;FSAF=231;FSAR=44;FSRF=112;FSRR=13;FWDB=0.00195912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.464;QD=16.5865;RBI=0.0325739;REFB=-0.0194744;REVB=0.0325149;RO=166;SAF=307;SAR=61;SRF=148;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0632283;STB=0.534058;TYPE=snp;VARB=0.00889602;OID=.;OPOS=144534045;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:535:400:166:125:368:275:61:307:148:18:44:231:112:13 chr1 144534076 . G A 125.47 PASS AO=149;DP=692;FAO=93;FDP=397;FR=.;FRO=304;FSAF=71;FSAR=22;FSRF=248;FSRR=56;FWDB=0.0119673;FXX=0.00749981;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.794;QD=1.26422;RBI=0.018622;REFB=0.00163904;REVB=0.0142675;RO=534;SAF=112;SAR=37;SRF=421;SRR=113;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0664133;STB=0.558924;TYPE=snp;VARB=-0.00461099;OID=.;OPOS=144534076;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:692:397:534:304:149:93:37:112:421:113:22:71:248:56 chr1 144534083 . C T 1665.18 PASS AO=579;DP=670;FAO=276;FDP=395;FR=.;FRO=119;FSAF=217;FSAR=59;FSRF=79;FSRR=40;FWDB=0.00267541;FXX=0.0124997;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.9134;QD=16.8625;RBI=0.0142017;REFB=-0.00407948;REVB=0.0139474;RO=69;SAF=434;SAR=145;SRF=52;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0010936;STB=0.551592;TYPE=snp;VARB=0.0151305;OID=.;OPOS=144534083;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:670:395:69:119:579:276:145:434:52:17:59:217:79:40 chr1 144534092 . G A 1938.51 PASS AO=549;DP=781;FAO=296;FDP=397;FR=.;FRO=101;FSAF=201;FSAR=95;FSRF=76;FSRR=25;FWDB=0.0130513;FXX=0.00749981;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.58;QD=19.5316;RBI=0.0163358;REFB=-0.00825496;REVB=0.00982458;RO=188;SAF=386;SAR=163;SRF=147;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0462871;STB=0.521759;TYPE=snp;VARB=0.00814278;OID=.;OPOS=144534092;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:781:397:188:101:549:296:163:386:147:41:95:201:76:25 chr1 144534096 . T C 1857.01 PASS AO=567;DP=815;FAO=292;FDP=399;FR=.;FRO=107;FSAF=201;FSAR=91;FSRF=79;FSRR=28;FWDB=-0.0062012;FXX=0.00249994;HRUN=5;LEN=1;MLLD=196.778;QD=18.6167;RBI=0.00850372;REFB=-0.000537093;REVB=0.00581879;RO=225;SAF=403;SAR=164;SRF=169;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0265128;STB=0.515799;TYPE=snp;VARB=0.000395771;OID=.;OPOS=144534096;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:815:399:225:107:567:292:164:403:169:56:91:201:79:28 chr1 144534186 . TCG T 190.86 PASS AO=262;DP=1278;FAO=98;FDP=342;FR=.;FRO=244;FSAF=54;FSAR=44;FSRF=100;FSRR=144;FWDB=-0.0276977;FXX=0.144996;HRUN=1;LEN=2;MLLD=148.045;QD=2.23223;RBI=0.0283516;REFB=-0.001276;REVB=-0.00605419;RO=678;SAF=138;SAR=124;SRF=332;SRR=346;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0458187;STB=0.599696;TYPE=del;VARB=0.00230004;OID=.;OPOS=144534187;OREF=CG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:262:1183:98:342:244:54:44:100:144:99:678:138:124:332:346 chr1 144615138 . T G 52.85 PASS AO=8;DP=12;FAO=8;FDP=12;FR=.;FRO=4;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0121062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.141;QD=17.6151;RBI=0.0125597;REFB=-0.0235612;REVB=-0.00334454;RO=4;SAF=5;SAR=3;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215906;STB=0.624687;TYPE=snp;VARB=0.0153974;OID=.;OPOS=144615138;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:12:12:4:4:8:8:3:5:1:3:3:5:1:3 chr1 144617251 . A G 99.31 PASS AO=29;DP=73;FAO=29;FDP=74;FR=.;FRO=45;FSAF=23;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=-0.00920066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.111;QD=5.36826;RBI=0.00945932;REFB=-0.00799142;REVB=-0.00219698;RO=43;SAF=23;SAR=6;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.383574;STB=0.734121;TYPE=snp;VARB=0.0113685;OID=.;OPOS=144617251;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:74:43:45:29:29:6:23:20:23:6:23:20:25 chr1 144618144 . A G 2039.89 PASS AO=198;DP=202;FAO=222;FDP=222;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=137;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0213021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.649;QD=36.7547;RBI=0.0454696;REFB=0;REVB=0.0401709;RO=2;SAF=84;SAR=114;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00828176;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000236327;OID=.;OPOS=144618144;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:91:202:222:2:0:198:222:114:84:0:2:137:85:0:0 chr1 144619346 . G A 1750.58 PASS AO=155;DP=191;FAO=188;FDP=189;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=101;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000382214;FXX=0.0156242;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.461;QD=37.0494;RBI=0.104078;REFB=-0.0268235;REVB=0.104078;RO=2;SAF=94;SAR=61;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0100137;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00163958;OID=.;OPOS=144619346;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:191:189:2:0:155:188:61:94:2:0:87:101:0:0 chr1 144619354 . C T 461.11 PASS AO=110;DP=229;FAO=111;FDP=229;FR=.;FRO=118;FSAF=47;FSAR=64;FSRF=73;FSRR=45;FWDB=0.00882725;FXX=0.00434764;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.811;QD=8.0543;RBI=0.0125588;REFB=-0.0135069;REVB=-0.00893332;RO=112;SAF=47;SAR=63;SRF=73;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204026;STB=0.599842;TYPE=snp;VARB=0.00853079;OID=.;OPOS=144619354;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:229:229:112:118:110:111:63:47:73:39:64:47:73:45 chr1 144811836 . G A 154.14 PASS AO=73;DP=248;FAO=73;FDP=248;FR=.;FRO=175;FSAF=41;FSAR=32;FSRF=66;FSRR=109;FWDB=0.00439143;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.315;QD=2.48606;RBI=0.020217;REFB=-0.00138259;REVB=0.0197343;RO=175;SAF=41;SAR=32;SRF=66;SRR=109;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220768;STB=0.627994;TYPE=snp;VARB=0.0024554;OID=.;OPOS=144811836;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:248:248:175:175:73:73:32:41:66:109:32:41:66:109 chr1 144811924 . T G 3764.29 PASS AO=399;DP=412;FAO=395;FDP=395;FR=.;FRO=0;FSAF=186;FSAR=209;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00346444;FXX=0.0124997;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.2358;QD=38.1193;RBI=0.0376929;REFB=0;REVB=-0.0375334;RO=1;SAF=180;SAR=219;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00217438;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.3818e-06;OID=.;OPOS=144811924;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:412:395:1:0:399:395:219:180:0:1:209:186:0:0 chr1 144852390 . C T 133.32 PASS AO=50;DP=149;FAO=50;FDP=149;FR=.;FRO=99;FSAF=33;FSAR=17;FSRF=36;FSRR=63;FWDB=5.85107e-05;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=183.991;QD=3.57894;RBI=0.0231347;REFB=-0.00299364;REVB=0.0231346;RO=99;SAF=33;SAR=17;SRF=36;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.33529;STB=0.692293;TYPE=snp;VARB=0.00307584;OID=.;OPOS=144852390;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:99:99:50:50:17:33:36:63:17:33:36:63 chr1 144852476 . T C 269.67 PASS AO=73;DP=163;FAO=72;FDP=163;FR=.;FRO=91;FSAF=42;FSAR=30;FSRF=23;FSRR=68;FWDB=-0.0202054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.561;QD=6.61772;RBI=0.0347144;REFB=-0.019315;REVB=0.0282282;RO=75;SAF=43;SAR=30;SRF=23;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.255212;STB=0.67849;TYPE=snp;VARB=0.0147144;OID=.;OPOS=144852476;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:163:75:91:73:72:30:43:23:52:30:42:23:68 chr1 144854180 . T C 107.59 PASS AO=136;DP=599;FAO=89;FDP=400;FR=.;FRO=311;FSAF=53;FSAR=36;FSRF=150;FSRR=161;FWDB=0.0175191;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.3263;QD=1.07587;RBI=0.0233532;REFB=-0.00565244;REVB=-0.0154419;RO=461;SAF=85;SAR=51;SRF=223;SRR=238;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182203;STB=0.588239;TYPE=snp;VARB=0.0200144;OID=.;OPOS=144854180;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:599:400:461:311:136:89:51:85:223:238:36:53:150:161 chr1 144854597 . T C 70.6 PASS AO=226;DP=472;FAO=54;FDP=262;FR=.;FRO=208;FSAF=19;FSAR=35;FSRF=65;FSRR=143;FWDB=-0.00731279;FXX=0.344991;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.616;QD=1.07784;RBI=0.0154858;REFB=-0.0212144;REVB=-0.0136504;RO=242;SAF=48;SAR=178;SRF=72;SRR=170;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110838;STB=0.534945;TYPE=snp;VARB=0.0717689;OID=.;OPOS=144854597;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:472:262:242:208:226:54:178:48:72:170:35:19:65:143 chr1 144855812 . T C 51.76 PASS AO=23;DP=97;FAO=26;FDP=100;FR=.;FRO=74;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=37;FSRR=37;FWDB=-0.0417437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.16;QD=2.07047;RBI=0.0547709;REFB=-0.0270122;REVB=0.0354586;RO=73;SAF=7;SAR=16;SRF=37;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.258622;STB=0.680637;TYPE=snp;VARB=0.0823835;OID=.;OPOS=144855812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:97:100:73:74:23:26:16:7:37:36:19:7:37:37 chr1 144855866 . A G 22.89 PASS AO=14;DP=65;FAO=14;FDP=66;FR=.;FRO=52;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=37;FWDB=-0.0727378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.578;QD=1.38736;RBI=0.0745771;REFB=-0.0166919;REVB=-0.016461;RO=50;SAF=2;SAR=12;SRF=15;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.281544;STB=0.675203;TYPE=snp;VARB=0.0505224;OID=.;OPOS=144855866;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:65:66:50:52:14:14:12:2:15:35:12:2:15:37 chr1 144859849 . C T 48.83 PASS AO=35;DP=158;FAO=35;FDP=157;FR=.;FRO=122;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=38;FSRR=84;FWDB=-0.0616091;FXX=0.00632871;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.13;QD=1.24409;RBI=0.0703476;REFB=-0.0128166;REVB=-0.0339574;RO=119;SAF=15;SAR=20;SRF=36;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16945;STB=0.595369;TYPE=snp;VARB=0.0509547;OID=.;OPOS=144859849;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:158:157:119:122:35:35:20:15:36:83:20:15:38:84 chr1 144863401 . T C 93.46 PASS AO=28;DP=75;FAO=29;FDP=76;FR=.;FRO=47;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=-0.0136487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.314;QD=4.91877;RBI=0.0142074;REFB=-0.0133965;REVB=0.00394497;RO=47;SAF=16;SAR=12;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0668115;STB=0.52553;TYPE=snp;VARB=0.0182726;OID=.;OPOS=144863401;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:75:76:47:47:28:29:12:16:24:23:13:16:24:23 chr1 144865850 . G T 633.47 PASS AO=223;DP=506;FAO=175;FDP=397;FR=.;FRO=222;FSAF=79;FSAR=96;FSRF=89;FSRR=133;FWDB=0.0173254;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.746;QD=6.38259;RBI=0.0237185;REFB=-0.0102402;REVB=0.0161986;RO=283;SAF=94;SAR=129;SRF=106;SRR=177;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0491324;STB=0.52868;TYPE=snp;VARB=0.0137265;OID=.;OPOS=144865850;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:506:397:283:222:223:175:129:94:106:177:96:79:89:133 chr1 144866643 . G A 655.2 PASS AO=122;DP=204;FAO=123;FDP=201;FR=.;FRO=78;FSAF=45;FSAR=78;FSRF=44;FSRR=34;FWDB=-0.00784547;FXX=0.0195112;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.12;QD=13.0389;RBI=0.0278431;REFB=-0.0467779;REVB=0.0267149;RO=78;SAF=45;SAR=77;SRF=44;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144851;STB=0.579356;TYPE=snp;VARB=0.017537;OID=.;OPOS=144866643;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:201:78:78:122:123:77:45:44:34:78:45:44:34 chr1 144866662 . T C 580.64 PASS AO=109;DP=181;FAO=111;FDP=185;FR=.;FRO=74;FSAF=43;FSAR=68;FSRF=42;FSRR=32;FWDB=-0.0183288;FXX=0.00537606;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.435;QD=12.5543;RBI=0.0221242;REFB=-0.019811;REVB=0.012391;RO=72;SAF=43;SAR=66;SRF=41;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130397;STB=0.573399;TYPE=snp;VARB=0.0127852;OID=.;OPOS=144866662;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:185:72:74:109:111:66:43:41:31:68:43:42:32 chr1 144868170 . C T 272.66 PASS AO=67;DP=143;FAO=68;FDP=145;FR=.;FRO=77;FSAF=23;FSAR=45;FSRF=30;FSRR=47;FWDB=0.0297171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.319;QD=7.52171;RBI=0.0368029;REFB=-0.0112909;REVB=-0.0217106;RO=76;SAF=23;SAR=44;SRF=30;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0535778;STB=0.529873;TYPE=snp;VARB=0.0235551;OID=.;OPOS=144868170;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:145:76:77:67:68:44:23:30:46:45:23:30:47 chr1 144871738 . C A 66.47 PASS AO=23;DP=67;FAO=23;FDP=69;FR=.;FRO=46;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=39;FSRR=7;FWDB=-0.0390563;FXX=0.0142837;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.345;QD=3.85322;RBI=0.0633983;REFB=-0.0185108;REVB=-0.0499394;RO=44;SAF=13;SAR=10;SRF=37;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.340789;STB=0.701615;TYPE=snp;VARB=0.0476215;OID=.;OPOS=144871738;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:67:69:44:46:23:23:10:13:37:7:10:13:39:7 chr1 144873887 . C T 689.02 PASS AO=190;DP=414;FAO=181;FDP=396;FR=.;FRO=215;FSAF=146;FSAR=35;FSRF=174;FSRR=41;FWDB=-0.0051876;FXX=0.00999975;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.472;QD=6.95975;RBI=0.0594793;REFB=-0.0110321;REVB=-0.0592526;RO=221;SAF=153;SAR=37;SRF=180;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0144834;STB=0.502332;TYPE=snp;VARB=0.0131281;OID=.;OPOS=144873887;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:414:396:221:215:190:181:37:153:180:41:35:146:174:41 chr1 144874760 . T C 415.67 PASS AO=104;DP=216;FAO=104;FDP=221;FR=.;FRO=117;FSAF=56;FSAR=48;FSRF=69;FSRR=48;FWDB=-0.00432038;FXX=0.0045043;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.724;QD=7.52337;RBI=0.0118531;REFB=-0.020203;REVB=-0.0110377;RO=111;SAF=56;SAR=48;SRF=67;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0617863;STB=0.527421;TYPE=snp;VARB=0.0204506;OID=.;OPOS=144874760;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:216:221:111:117:104:104:48:56:67:44:48:56:69:48 chr1 144874815 . T C 390.08 PASS AO=91;DP=187;FAO=92;FDP=186;FR=.;FRO=94;FSAF=56;FSAR=36;FSRF=55;FSRR=39;FWDB=-0.0321673;FXX=0.0106377;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.605;QD=8.38875;RBI=0.0329413;REFB=-0.0202496;REVB=0.00709919;RO=90;SAF=55;SAR=36;SRF=52;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0250189;STB=0.512442;TYPE=snp;VARB=0.0188014;OID=.;OPOS=144874815;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:186:90:94:91:92:36:55:52:38:36:56:55:39 chr1 144875979 . G C 29.4 PASS AO=40;DP=231;FAO=40;FDP=231;FR=.;FRO=191;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=70;FSRR=121;FWDB=-0.0312167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.201;QD=0.509122;RBI=0.0312462;REFB=-0.000680337;REVB=-0.00135781;RO=188;SAF=18;SAR=22;SRF=70;SRR=118;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103096;STB=0.570698;TYPE=snp;VARB=0.00292864;OID=.;OPOS=144875979;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:231:231:188:191:40:40:22:18:70:118:22:18:70:121 chr1 144877176 . C T 143.95 PASS AO=85;DP=325;FAO=85;FDP=325;FR=.;FRO=240;FSAF=50;FSAR=35;FSRF=140;FSRR=100;FWDB=0.018095;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.16;QD=1.77166;RBI=0.020946;REFB=-0.00282946;REVB=-0.0105503;RO=235;SAF=50;SAR=35;SRF=139;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00418191;STB=0.50373;TYPE=snp;VARB=0.00854779;OID=.;OPOS=144877176;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:325:325:235:240:85:85:35:50:139:96:35:50:140:100 chr1 144879264 . A G 2525.99 PASS AO=218;DP=285;FAO=269;FDP=269;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=84;FSAR=185;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.041111;FXX=0.0427031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.816;QD=37.5612;RBI=0.0615417;REFB=0;REVB=0.0457959;RO=0;SAF=66;SAR=152;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.22325e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000184579;OID=.;OPOS=144879264;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:280:269:0:0:218:269:152:66:0:0:185:84:0:0 chr1 144879375 . T C 542.16 PASS AO=141;DP=306;FAO=141;FDP=306;FR=.;FRO=165;FSAF=57;FSAR=84;FSRF=56;FSRR=109;FWDB=-0.0695128;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.638;QD=7.08705;RBI=0.0780857;REFB=-0.0219937;REVB=-0.0355717;RO=165;SAF=57;SAR=84;SRF=56;SRR=109;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0667913;STB=0.536812;TYPE=snp;VARB=0.0240161;OID=.;OPOS=144879375;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:306:306:165:165:141:141:84:57:56:109:84:57:56:109 chr1 144880832 . T C 37.75 PASS AO=28;DP=131;FAO=28;FDP=131;FR=.;FRO=103;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=65;FSRR=38;FWDB=-0.0179493;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.815;QD=1.15279;RBI=0.0309126;REFB=-0.0139164;REVB=-0.0251677;RO=103;SAF=12;SAR=16;SRF=65;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252842;STB=0.655214;TYPE=snp;VARB=0.0541676;OID=.;OPOS=144880832;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:131:131:103:103:28:28:16:12:65:38:16:12:65:38 chr1 144882581 . A G 650.35 PASS AO=184;DP=413;FAO=177;FDP=398;FR=.;FRO=221;FSAF=76;FSAR=101;FSRF=67;FSRR=154;FWDB=0.00266489;FXX=0.00499988;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.1138;QD=6.53618;RBI=0.0129719;REFB=-0.0165069;REVB=-0.0126953;RO=226;SAF=77;SAR=107;SRF=68;SRR=158;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123587;STB=0.572975;TYPE=snp;VARB=0.0193046;OID=.;OPOS=144882581;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:413:398:226:221:184:177:107:77:68:158:101:76:67:154 chr1 144882823 . C T 504.67 PASS AO=144;DP=342;FAO=146;FDP=344;FR=.;FRO=198;FSAF=21;FSAR=125;FSRF=40;FSRR=158;FWDB=-0.0210749;FXX=0.00289847;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.509;QD=5.86824;RBI=0.0212057;REFB=-0.0169344;REVB=-0.00235174;RO=195;SAF=19;SAR=125;SRF=39;SRR=156;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135056;STB=0.561975;TYPE=snp;VARB=0.0210655;OID=.;OPOS=144882823;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:342:344:195:198:144:146:125:19:39:156:125:21:40:158 chr1 144886197 . A T 584.17 PASS AO=146;DP=309;FAO=146;FDP=308;FR=.;FRO=162;FSAF=62;FSAR=84;FSRF=73;FSRR=89;FWDB=-0.0168703;FXX=0.00323614;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.212;QD=7.58662;RBI=0.028637;REFB=-0.015491;REVB=0.0231402;RO=162;SAF=62;SAR=84;SRF=73;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0252532;STB=0.513911;TYPE=snp;VARB=0.0159587;OID=.;OPOS=144886197;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:309:308:162:162:146:146:84:62:73:89:84:62:73:89 chr1 144892089 . G T 150.27 PASS AO=43;DP=105;FAO=43;FDP=105;FR=.;FRO=62;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=13;FSRR=49;FWDB=0.0243376;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.1883;QD=5.72441;RBI=0.0436652;REFB=-0.00743209;REVB=-0.0362537;RO=61;SAF=18;SAR=25;SRF=12;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.251025;STB=0.632124;TYPE=snp;VARB=0.00926423;OID=.;OPOS=144892089;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:61:62:43:43:25:18:12:49:25:18:13:49 chr1 144892149 . G A 234.82 PASS AO=58;DP=129;FAO=59;FDP=126;FR=.;FRO=67;FSAF=22;FSAR=37;FSRF=10;FSRR=57;FWDB=0.0120455;FXX=0.0307669;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.28;QD=7.4547;RBI=0.0155697;REFB=-0.0176698;REVB=-0.00986514;RO=67;SAF=21;SAR=37;SRF=10;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.241538;STB=0.635876;TYPE=snp;VARB=0.0158772;OID=.;OPOS=144892149;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:126:67:67:58:59:37:21:10:57:37:22:10:57 chr1 144912153 . A G 2224.57 PASS AO=317;DP=405;FAO=315;FDP=395;FR=.;FRO=80;FSAF=159;FSAR=156;FSRF=40;FSRR=40;FWDB=-0.000151173;FXX=0.0124997;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.364;QD=22.5273;RBI=0.0123533;REFB=0.00352658;REVB=0.0123524;RO=88;SAF=171;SAR=146;SRF=44;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0162339;STB=0.500964;TYPE=snp;VARB=-0.000755438;OID=.;OPOS=144912153;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:405:395:88:80:317:315:146:171:44:44:156:159:40:40 chr1 144912233 . C T 703.45 PASS AO=174;DP=362;FAO=174;FDP=360;FR=.;FRO=186;FSAF=56;FSAR=118;FSRF=77;FSRR=109;FWDB=0.0212277;FXX=0.00552471;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.606;QD=7.81605;RBI=0.0215987;REFB=-0.00264756;REVB=0.00398606;RO=184;SAF=56;SAR=118;SRF=75;SRR=109;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0885522;STB=0.552483;TYPE=snp;VARB=0.00269689;OID=.;OPOS=144912233;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:362:360:184:186:174:174:118:56:75:109:118:56:77:109 chr1 144915561 . G A 605.78 PASS AO=244;DP=571;FAO=172;FDP=400;FR=.;FRO=228;FSAF=74;FSAR=98;FSRF=98;FSRR=130;FWDB=-0.00729259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.051;QD=6.0578;RBI=0.0284702;REFB=-0.01797;REVB=-0.0275203;RO=327;SAF=104;SAR=140;SRF=141;SRR=186;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00523147;STB=0.500237;TYPE=snp;VARB=0.0255016;OID=.;OPOS=144915561;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:571:400:327:228:244:172:140:104:141:186:98:74:98:130 chr1 144915624 . G A 513.28 PASS AO=96;DP=453;FAO=90;FDP=397;FR=.,HEALED;FRO=230;FSAF=41;FSAR=49;FSRF=98;FSRR=132;FWDB=0.0146631;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.582;QD=5.17163;RBI=0.027657;REFB=-0.00146384;REVB=-0.02345;RO=252;SAF=43;SAR=53;SRF=104;SRR=148;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0442374;STB=0.521426;TYPE=snp;VARB=0.0124067;OID=.;OPOS=144915624;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:445:397:252:230:96:90:53:43:104:148:49:41:98:132 chr1 144916748 . C G 801.98 PASS AO=171;DP=320;FAO=174;FDP=322;FR=.;FRO=148;FSAF=48;FSAR=126;FSRF=60;FSRR=88;FWDB=0.072271;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.4776;QD=9.96249;RBI=0.072275;REFB=-0.0456763;REVB=0.00076009;RO=149;SAF=46;SAR=125;SRF=61;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141038;STB=0.569841;TYPE=snp;VARB=0.0429951;OID=.;OPOS=144916748;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:320:322:149:148:171:174:125:46:61:88:126:48:60:88 chr1 144917546 . A G 383.05 PASS AO=124;DP=314;FAO=123;FDP=314;FR=.;FRO=191;FSAF=49;FSAR=74;FSRF=100;FSRR=91;FWDB=0.0052399;FXX=0.0031745;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.5355;QD=4.87965;RBI=0.0235147;REFB=-0.0214068;REVB=-0.0229235;RO=189;SAF=48;SAR=76;SRF=100;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154674;STB=0.576933;TYPE=snp;VARB=0.0346436;OID=.;OPOS=144917546;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:314:314:189:191:124:123:76:48:100:89:74:49:100:91 chr1 144917841 . T C 537.43 PASS AO=133;DP=278;FAO=133;FDP=278;FR=.;FRO=145;FSAF=70;FSAR=63;FSRF=83;FSRR=62;FWDB=0.00811535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.822;QD=7.73275;RBI=0.00869287;REFB=-0.0191919;REVB=0.00311562;RO=145;SAF=70;SAR=63;SRF=83;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0439216;STB=0.524168;TYPE=snp;VARB=0.0164866;OID=.;OPOS=144917841;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:278:278:145:145:133:133:63:70:83:62:63:70:83:62 chr1 144918957 . T A 282.95 PASS AO=82;DP=197;FAO=82;FDP=197;FR=.;FRO=115;FSAF=29;FSAR=53;FSRF=28;FSRR=87;FWDB=-0.0116914;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.265;QD=5.74521;RBI=0.0130083;REFB=-0.00282303;REVB=0.0057031;RO=115;SAF=29;SAR=53;SRF=28;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131973;STB=0.573349;TYPE=snp;VARB=0.00477832;OID=.;OPOS=144918957;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:197:115:115:82:82:53:29:28:87:53:29:28:87 chr1 144921924 . G A 23.95 PASS AO=86;DP=465;FAO=58;FDP=385;FR=.;FRO=327;FSAF=21;FSAR=37;FSRF=155;FSRR=172;FWDB=-0.019584;FXX=0.0374991;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.2392;QD=0.248873;RBI=0.0452956;REFB=-0.00333434;REVB=-0.040843;RO=371;SAF=44;SAR=42;SRF=182;SRR=189;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0273281;STB=0.597342;TYPE=snp;VARB=0.0211268;OID=.;OPOS=144921924;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:465:385:371:327:86:58:42:44:182:189:37:21:155:172 chr1 144922583 . G A 510.48 PASS AO=150;DP=364;FAO=152;FDP=367;FR=.;FRO=215;FSAF=77;FSAR=75;FSRF=122;FSRR=93;FWDB=0.0251316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3426;QD=5.56385;RBI=0.0276176;REFB=-0.015408;REVB=-0.0114513;RO=212;SAF=75;SAR=75;SRF=122;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0793318;STB=0.53569;TYPE=snp;VARB=0.0210004;OID=.;OPOS=144922583;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:364:367:212:215:150:152:75:75:122:90:75:77:122:93 chr1 144923728 . GT G 25.72 PASS AO=150;DP=697;FAO=86;FDP=399;FR=.;FRO=313;FSAF=29;FSAR=57;FSRF=140;FSRR=173;FWDB=0.0530746;FXX=0.00249994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=23.0114;QD=0.257878;RBI=0.0571604;REFB=0.00230911;REVB=-0.0212225;RO=528;SAF=50;SAR=100;SRF=237;SRR=291;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155813;STB=0.590851;TYPE=del;VARB=-0.005307;OID=.;OPOS=144923729;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:150:697:86:399:313:29:57:140:173:25:528:50:100:237:291 chr1 144923823 . TAGGAAGAAACGGCA T 982.76 PASS AO=177;DP=485;FAO=182;FDP=291;FR=.;FRO=109;FSAF=78;FSAR=104;FSRF=50;FSRR=59;FWDB=-0.0104737;FXX=0.211376;HRUN=1;LEN=14;MLLD=338.108;QD=13.5087;RBI=0.0119067;REFB=-0.00114647;REVB=-0.0056632;RO=172;SAF=75;SAR=102;SRF=86;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0694872;STB=0.511487;TYPE=del;VARB=0.00077102;OID=.;OPOS=144923824;OREF=AGGAAGAAACGGCA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:177:400:182:291:109:78:104:50:59:99:172:75:102:86:86 chr1 144930596 . C A 329.44 PASS AO=114;DP=311;FAO=114;FDP=310;FR=.;FRO=196;FSAF=67;FSAR=47;FSRF=120;FSRR=76;FWDB=-0.00645338;FXX=0.00958436;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.303;QD=4.25084;RBI=0.00725884;REFB=-0.0095591;REVB=-0.00332334;RO=161;SAF=67;SAR=47;SRF=120;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177711;STB=0.516086;TYPE=snp;VARB=0.0165819;OID=.;OPOS=144930596;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:311:310:161:196:114:114:47:67:120:41:47:67:120:76 chr1 144930940 . T C 380.87 PASS AO=100;DP=217;FAO=99;FDP=216;FR=.;FRO=117;FSAF=38;FSAR=61;FSRF=55;FSRR=62;FWDB=-0.0638368;FXX=0.00460808;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.1751;QD=7.05316;RBI=0.0645907;REFB=-0.0102237;REVB=-0.00983955;RO=117;SAF=39;SAR=61;SRF=55;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0802953;STB=0.548265;TYPE=snp;VARB=0.0123602;OID=.;OPOS=144930940;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:217:216:117:117:100:99:61:39:55:62:61:38:55:62 chr1 144931087 . T C 22.99 PASS AO=27;DP=154;FAO=27;FDP=153;FR=.;FRO=126;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=47;FSRR=79;FWDB=-0.0828236;FXX=0.00649309;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.6817;QD=0.600973;RBI=0.0855422;REFB=-0.0146638;REVB=-0.0213942;RO=117;SAF=13;SAR=14;SRF=46;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114168;STB=0.58998;TYPE=snp;VARB=0.107163;OID=.;OPOS=144931087;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:154:153:117:126:27:27:14:13:46:71:14:13:47:79 chr1 144931330 . C T 461.79 PASS AO=126;DP=284;FAO=126;FDP=285;FR=.;FRO=159;FSAF=90;FSAR=36;FSRF=102;FSRR=57;FWDB=0.0135759;FXX=0.00349638;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.011;QD=6.48126;RBI=0.0525162;REFB=-0.0122722;REVB=0.0507311;RO=156;SAF=90;SAR=36;SRF=99;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.092804;STB=0.547695;TYPE=snp;VARB=0.0157018;OID=.;OPOS=144931330;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:284:285:156:159:126:126:36:90:99:57:36:90:102:57 chr1 144931392 . G A 411.52 PASS AO=117;DP=278;FAO=118;FDP=278;FR=.;FRO=160;FSAF=79;FSAR=39;FSRF=107;FSRR=53;FWDB=-0.00812381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.0508;QD=5.92118;RBI=0.00921539;REFB=-0.00739471;REVB=-0.00435053;RO=160;SAF=79;SAR=38;SRF=107;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00761192;STB=0.500482;TYPE=snp;VARB=0.00997614;OID=.;OPOS=144931392;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:278:278:160:160:117:118:38:79:107:53:39:79:107:53 chr1 144931461 . A T 31.6 PASS AO=36;DP=199;FAO=36;FDP=197;FR=.;FRO=161;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=121;FSRR=40;FWDB=-0.0384062;FXX=0.0100497;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.0976;QD=0.641577;RBI=0.0456592;REFB=-0.00652036;REVB=-0.0246926;RO=161;SAF=20;SAR=16;SRF=122;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.282619;STB=0.668167;TYPE=snp;VARB=0.0254705;OID=.;OPOS=144931461;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:199:197:161:161:36:36:16:20:122:39:16:20:121:40 chr1 144944655 . T G 84.3 PASS AO=53;DP=217;FAO=53;FDP=216;FR=.;FRO=163;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=69;FSRR=94;FWDB=0.000148748;FXX=0.0313887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.389;QD=1.56119;RBI=0.0189918;REFB=-0.00296193;REVB=0.0189913;RO=156;SAF=30;SAR=23;SRF=68;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161605;STB=0.606492;TYPE=snp;VARB=0.00640289;OID=.;OPOS=144944655;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:217:216:156:163:53:53:23:30:68:88:23:30:69:94 chr1 144994658 . C A 142.87 PASS AO=58;DP=185;FAO=59;FDP=186;FR=.;FRO=127;FSAF=35;FSAR=24;FSRF=91;FSRR=36;FWDB=0.00731051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.826;QD=3.07246;RBI=0.0165725;REFB=-0.0240187;REVB=0.014873;RO=127;SAF=35;SAR=23;SRF=91;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146023;STB=0.590135;TYPE=snp;VARB=0.0433769;OID=.;OPOS=144994658;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:186:127:127:58:59:23:35:91:36:24:35:91:36 chr1 145014103 . G C 115.37 PASS AO=42;DP=123;FAO=42;FDP=124;FR=.;FRO=82;FSAF=30;FSAR=12;FSRF=51;FSRR=31;FWDB=0.0102836;FXX=0.00799936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.93;QD=3.72175;RBI=0.0271107;REFB=-0.0139634;REVB=0.0250847;RO=81;SAF=30;SAR=12;SRF=50;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12652;STB=0.570257;TYPE=snp;VARB=0.0359465;OID=.;OPOS=145014103;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:124:81:82:42:42:12:30:50:31:12:30:51:31 chr1 145014263 . C T 215.52 PASS AO=66;DP=172;FAO=67;FDP=171;FR=.;FRO=104;FSAF=27;FSAR=40;FSRF=37;FSRR=67;FWDB=0.0364452;FXX=0.01156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.6631;QD=5.04133;RBI=0.0371587;REFB=-0.0278567;REVB=-0.00724692;RO=105;SAF=27;SAR=39;SRF=39;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0427498;STB=0.53018;TYPE=snp;VARB=0.050202;OID=.;OPOS=145014263;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:171:105:104:66:67:39:27:39:66:40:27:37:67 chr1 145018023 . G T 252.79 PASS AO=55;DP=109;FAO=57;FDP=110;FR=.;FRO=53;FSAF=22;FSAR=35;FSRF=15;FSRR=38;FWDB=-0.00599753;FXX=0.0090082;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.8951;QD=9.19228;RBI=0.105361;REFB=-0.0173832;REVB=0.10519;RO=54;SAF=22;SAR=33;SRF=16;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0993063;STB=0.553584;TYPE=snp;VARB=0.0188173;OID=.;OPOS=145018023;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:110:54:53:55:57:33:22:16:38:35:22:15:38 chr1 145038952 . C T 144.52 PASS AO=73;DP=259;FAO=73;FDP=258;FR=.;FRO=185;FSAF=36;FSAR=37;FSRF=89;FSRR=96;FWDB=-0.00237513;FXX=0.00386085;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.629;QD=2.24056;RBI=0.0111793;REFB=-0.00358881;REVB=0.0109241;RO=186;SAF=36;SAR=37;SRF=90;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0113722;STB=0.508656;TYPE=snp;VARB=0.0102389;OID=.;OPOS=145038952;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:259:258:186:185:73:73:37:36:90:96:37:36:89:96 chr1 145039562 . C T 122.45 PASS AO=28;DP=58;FAO=28;FDP=58;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=6;FSRR=24;FWDB=0.0203571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.836;QD=8.44503;RBI=0.0203664;REFB=-0.0353029;REVB=-0.000614712;RO=29;SAF=12;SAR=16;SRF=5;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249721;STB=0.624919;TYPE=snp;VARB=0.0329384;OID=.;OPOS=145039562;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:29:30:28:28:16:12:5:24:16:12:6:24 chr1 145075683 . C T 31.65 PASS AO=7;DP=17;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.0512465;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=140.403;QD=7.44735;RBI=0.0523985;REFB=-0.00317414;REVB=0.0109266;RO=10;SAF=1;SAR=6;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.341391;STB=0.713564;TYPE=snp;VARB=0.00383317;OID=.;OPOS=145075683;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:17:17:10:10:7:7:6:1:4:6:6:1:4:6 chr1 145103947 . T C 189.46 PASS AO=104;DP=385;FAO=104;FDP=379;FR=.;FRO=275;FSAF=61;FSAR=43;FSRF=171;FSRR=104;FWDB=-0.0237653;FXX=0.0282044;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.993;QD=1.99962;RBI=0.0241647;REFB=-0.0070081;REVB=0.0043751;RO=269;SAF=61;SAR=43;SRF=171;SRR=98;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0633784;STB=0.526627;TYPE=snp;VARB=0.0170989;OID=.;OPOS=145103947;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:385:379:269:275:104:104:43:61:171:98:43:61:171:104 chr1 145109549 . G T 76.52 PASS AO=216;DP=1043;FAO=80;FDP=399;FR=.;FRO=319;FSAF=40;FSAR=40;FSRF=137;FSRR=182;FWDB=-0.0244483;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.187;QD=0.767097;RBI=0.0269034;REFB=0.000908684;REVB=0.0112284;RO=822;SAF=101;SAR=115;SRF=343;SRR=479;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0659583;STB=0.556377;TYPE=snp;VARB=-0.00498373;OID=.;OPOS=145109549;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:1043:399:822:319:216:80:115:101:343:479:40:40:137:182 chr1 145109583 . C A 530.5 PASS AO=460;DP=1070;FAO=160;FDP=388;FR=.;FRO=228;FSAF=54;FSAR=106;FSRF=97;FSRR=131;FWDB=-0.01982;FXX=0.0299992;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.2974;QD=5.46903;RBI=0.0233076;REFB=-0.00896727;REVB=0.0122642;RO=515;SAF=148;SAR=312;SRF=217;SRR=298;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104993;STB=0.55568;TYPE=snp;VARB=0.0114907;OID=.;OPOS=145109583;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:1070:388:515:228:460:160:312:148:217:298:106:54:97:131 chr1 145109661 . G A 52.49 PASS AO=200;DP=923;FAO=72;FDP=398;FR=.;FRO=326;FSAF=12;FSAR=60;FSRF=80;FSRR=246;FWDB=-0.0128716;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.032;QD=0.527529;RBI=0.0129978;REFB=0.00147203;REVB=-0.00180671;RO=712;SAF=38;SAR=162;SRF=185;SRR=527;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129896;STB=0.600491;TYPE=snp;VARB=-0.00549975;OID=.;OPOS=145109661;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:923:398:712:326:200:72:162:38:185:527:60:12:80:246 chr1 145112414 . T C 38.33 PASS AO=42;DP=224;FAO=42;FDP=223;FR=.;FRO=181;FSAF=11;FSAR=31;FSRF=61;FSRR=120;FWDB=-0.0368304;FXX=0.00446409;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.679;QD=0.687519;RBI=0.0439657;REFB=-0.0124919;REVB=-0.0240106;RO=181;SAF=11;SAR=31;SRF=61;SRR=120;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115091;STB=0.5733;TYPE=snp;VARB=0.0448938;OID=.;OPOS=145112414;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:224:223:181:181:42:42:31:11:61:120:31:11:61:120 chr1 145112420 . C T 119 PASS AO=61;DP=215;FAO=60;FDP=214;FR=.;FRO=154;FSAF=12;FSAR=48;FSRF=56;FSRR=98;FWDB=-0.021673;FXX=0.00465095;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1364;QD=2.22435;RBI=0.0221277;REFB=-0.0130069;REVB=0.00446258;RO=151;SAF=13;SAR=48;SRF=55;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228126;STB=0.650662;TYPE=snp;VARB=0.0327442;OID=.;OPOS=145112420;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:214:151:154:61:60:48:13:55:96:48:12:56:98 chr1 145112428 . C T 42.97 PASS AO=43;DP=217;FAO=43;FDP=220;FR=.;FRO=177;FSAF=10;FSAR=33;FSRF=56;FSRR=121;FWDB=-0.0689455;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.4908;QD=0.781238;RBI=0.0692526;REFB=-0.00327509;REVB=-0.00651385;RO=174;SAF=10;SAR=33;SRF=53;SRR=121;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117833;STB=0.585756;TYPE=snp;VARB=0.021739;OID=.;OPOS=145112428;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:217:220:174:177:43:43:33:10:53:121:33:10:56:121 chr1 145112485 . C T 55.26 PASS AO=48;DP=230;FAO=48;FDP=229;FR=.;FRO=181;FSAF=12;FSAR=36;FSRF=54;FSRR=127;FWDB=0.000964269;FXX=0.00434764;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.4692;QD=0.965264;RBI=0.00102487;REFB=-0.00604939;REVB=0.00034719;RO=180;SAF=12;SAR=36;SRF=53;SRR=127;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0719723;STB=0.548455;TYPE=snp;VARB=0.0362653;OID=.;OPOS=145112485;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:230:229:180:181:48:48:36:12:53:127:36:12:54:127 chr1 145115810 . A G 764.5 PASS AO=484;DP=985;FAO=191;FDP=400;FR=.;FRO=209;FSAF=79;FSAR=112;FSRF=90;FSRR=119;FWDB=-0.0101743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.912;QD=7.64496;RBI=0.0102015;REFB=-0.0118054;REVB=-0.000744286;RO=497;SAF=203;SAR=281;SRF=208;SRR=289;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000865996;STB=0.509131;TYPE=snp;VARB=0.0100953;OID=.;OPOS=145115810;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:985:400:497:209:484:191:281:203:208:289:112:79:90:119 chr1 145115820 . T C 181.88 PASS AO=249;DP=979;FAO=106;FDP=400;FR=.;FRO=294;FSAF=53;FSAR=53;FSRF=117;FSRR=177;FWDB=-0.00435537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.349;QD=1.81878;RBI=0.0127533;REFB=-0.00291059;REVB=0.0119865;RO=729;SAF=102;SAR=147;SRF=304;SRR=425;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00958933;STB=0.574986;TYPE=snp;VARB=0.0205169;OID=.;OPOS=145115820;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:979:400:729:294:249:106:147:102:304:425:53:53:117:177 chr1 145116192 . TG T 48.47 PASS AO=98;DP=557;FAO=99;FDP=394;FR=.;FRO=295;FSAF=50;FSAR=49;FSRF=171;FSRR=124;FWDB=-0.0825621;FXX=0.0149996;HRUN=4;LEN=1;MLLD=14.4144;QD=0.492034;RBI=0.128877;REFB=0.0536139;REVB=-0.0989579;RO=357;SAF=85;SAR=13;SRF=206;SRR=151;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.456818;STB=0.555921;TYPE=del;VARB=-0.257096;OID=.;OPOS=145116193;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:98:548:99:394:295:50:49:171:124:48:357:85:13:206:151 chr1 145116311 . G T 473.36 PASS AO=54;DP=92;FAO=81;FDP=119;FR=.;FRO=38;FSAF=58;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=0.00903934;FXX=0.0245881;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.875;QD=15.9112;RBI=0.0243085;REFB=0.00199302;REVB=0.0225653;RO=34;SAF=39;SAR=15;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111664;STB=0.541912;TYPE=snp;VARB=-0.000969771;OID=.;OPOS=145116311;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:92:119:34:38:54:81:15:39:20:14:23:58:23:15 chr1 145116319 . G T 222.16 PASS AO=27;DP=74;FAO=50;FDP=95;FR=.;FRO=45;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=0.00851598;FXX=0.049995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.298;QD=9.35417;RBI=0.0152849;REFB=-0.00317527;REVB=0.0126928;RO=43;SAF=10;SAR=17;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154348;STB=0.504214;TYPE=snp;VARB=0.00169742;OID=.;OPOS=145116319;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:95:43:45:27:50:17:10:22:21:24:26:23:22 chr1 145116327 . G T 397.17 PASS AO=71;DP=100;FAO=73;FDP=112;FR=.;FRO=39;FSAF=34;FSAR=39;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=0.0116027;FXX=0.0175423;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.66;QD=14.1848;RBI=0.0202426;REFB=-0.00848488;REVB=0.0165874;RO=12;SAF=32;SAR=39;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0135015;STB=0.516425;TYPE=snp;VARB=0.00522862;OID=.;OPOS=145116327;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:112:12:39:71:73:39:32:6:6:39:34:20:19 chr1 145273302 . A G 77.09 PASS AO=85;DP=424;FAO=80;FDP=398;FR=.;FRO=318;FSAF=55;FSAR=25;FSRF=132;FSRR=186;FWDB=-0.0108006;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.937;QD=0.774789;RBI=0.0670177;REFB=-0.00922636;REVB=-0.0661417;RO=336;SAF=57;SAR=28;SRF=141;SRR=195;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.319362;STB=0.712786;TYPE=snp;VARB=0.0295237;OID=.;OPOS=145273302;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:424:398:336:318:85:80:28:57:141:195:25:55:132:186 chr1 145273345 . T C 92.76 PASS AO=122;DP=617;FAO=85;FDP=400;FR=.;FRO=315;FSAF=50;FSAR=35;FSRF=117;FSRR=198;FWDB=-0.014418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.248;QD=0.927583;RBI=0.0563008;REFB=-0.00836421;REVB=0.0544234;RO=494;SAF=70;SAR=52;SRF=188;SRR=306;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.247115;STB=0.665868;TYPE=snp;VARB=0.0213633;OID=.;OPOS=145273345;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:617:400:494:315:122:85:52:70:188:306:35:50:117:198 chr1 145277398 . A G 26.58 PASS AO=48;DP=305;FAO=49;FDP=306;FR=.;FRO=257;FSAF=47;FSAR=2;FSRF=126;FSRR=131;FWDB=-0.00655287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.043;QD=0.347421;RBI=0.00667113;REFB=-4.07295e-05;REVB=-0.00125051;RO=257;SAF=47;SAR=1;SRF=126;SRR=131;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.70324;STB=0.947348;TYPE=snp;VARB=0.000104657;OID=.;OPOS=145277398;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:305:306:257:257:48:49:1:47:126:131:2:47:126:131 chr1 145277402 . A G 26.29 PASS AO=46;DP=306;FAO=48;FDP=299;FR=.,HEALED;FRO=251;FSAF=46;FSAR=2;FSRF=121;FSRR=130;FWDB=-0.0497337;FXX=0.00333322;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.14;QD=0.351768;RBI=0.0520934;REFB=-0.0231376;REVB=-0.0155011;RO=193;SAF=44;SAR=2;SRF=67;SRR=126;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.746912;STB=0.947655;TYPE=snp;VARB=0.0584871;OID=.;OPOS=145277402;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:298:299:193:251:46:48:2:44:67:126:2:46:121:130 chr1 145277457 . A G 134.79 PASS AO=70;DP=249;FAO=70;FDP=252;FR=.;FRO=182;FSAF=67;FSAR=3;FSRF=80;FSRR=102;FWDB=-0.00492529;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=168.242;QD=2.13957;RBI=0.0281583;REFB=-0.00479491;REVB=-0.0277242;RO=179;SAF=67;SAR=3;SRF=80;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.731724;STB=0.940867;TYPE=snp;VARB=0.010918;OID=.;OPOS=145277457;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:249:252:179:182:70:70:3:67:80:99:3:67:80:102 chr1 145281543 . C T 204.95 PASS AO=105;DP=368;FAO=105;FDP=368;FR=.;FRO=263;FSAF=24;FSAR=81;FSRF=89;FSRR=174;FWDB=-0.014374;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.992;QD=2.22776;RBI=0.0144814;REFB=-0.00777919;REVB=-0.00176047;RO=263;SAF=24;SAR=81;SRF=89;SRR=174;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168301;STB=0.599272;TYPE=snp;VARB=0.0188522;OID=.;OPOS=145281543;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:368:368:263:263:105:105:81:24:89:174:81:24:89:174 chr1 145281613 . C A 38.27 PASS AO=48;DP=263;FAO=48;FDP=265;FR=.;FRO=217;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=88;FSRR=129;FWDB=-0.00522901;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.9783;QD=0.57761;RBI=0.0179662;REFB=-0.0109856;REVB=-0.0171884;RO=215;SAF=23;SAR=25;SRF=87;SRR=128;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.097292;STB=0.560684;TYPE=snp;VARB=0.0420688;OID=.;OPOS=145281613;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:263:265:215:217:48:48:25:23:87:128:25:23:88:129 chr1 145281633 . C A 47.99 PASS AO=48;DP=243;FAO=48;FDP=243;FR=.;FRO=195;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=82;FSRR=113;FWDB=-0.0164913;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=201.119;QD=0.789937;RBI=0.0166305;REFB=-0.00667928;REVB=-0.00214698;RO=195;SAF=24;SAR=24;SRF=82;SRR=113;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102617;STB=0.56376;TYPE=snp;VARB=0.0309726;OID=.;OPOS=145281633;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:243:243:195:195:48:48:24:24:82:113:24:24:82:113 chr1 145281656 . A T 54.44 PASS AO=45;DP=212;FAO=45;FDP=211;FR=.;FRO=166;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=79;FSRR=87;FWDB=-0.0473657;FXX=0.00471676;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.2409;QD=1.03206;RBI=0.0747701;REFB=-0.0205023;REVB=-0.0578538;RO=164;SAF=22;SAR=23;SRF=77;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0247731;STB=0.510221;TYPE=snp;VARB=0.0627102;OID=.;OPOS=145281656;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:212:211:164:166:45:45:23:22:77:87:23:22:79:87 chr1 145293420 . C T 38.56 PASS AO=63;DP=375;FAO=63;FDP=374;FR=.;FRO=311;FSAF=53;FSAR=10;FSRF=271;FSRR=40;FWDB=-0.0201085;FXX=0.00531901;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.333;QD=0.412401;RBI=0.027639;REFB=-0.00311085;REVB=-0.0189621;RO=301;SAF=53;SAR=10;SRF=267;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126243;STB=0.55007;TYPE=snp;VARB=0.0233601;OID=.;OPOS=145293420;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:375:374:301:311:63:63:10:53:267:34:10:53:271:40 chr1 145293515 . A G 115.39 PASS AO=307;DP=1195;FAO=91;FDP=400;FR=.;FRO=309;FSAF=64;FSAR=27;FSRF=172;FSRR=137;FWDB=0.000529047;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=205.584;QD=1.15393;RBI=0.0119231;REFB=-0.00730187;REVB=-0.0119114;RO=880;SAF=197;SAR=110;SRF=512;SRR=368;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0795137;STB=0.622215;TYPE=snp;VARB=0.0261167;OID=.;OPOS=145293515;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:1195:400:880:309:307:91:110:197:512:368:27:64:172:137 chr1 145293566 . G A 253.48 PASS AO=252;DP=850;FAO=120;FDP=400;FR=.;FRO=280;FSAF=57;FSAR=63;FSRF=185;FSRR=95;FWDB=-0.0238813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.677;QD=2.53481;RBI=0.0657849;REFB=-0.00568716;REVB=0.0612971;RO=594;SAF=119;SAR=133;SRF=374;SRR=220;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190421;STB=0.628629;TYPE=snp;VARB=0.0154542;OID=.;OPOS=145293566;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:850:400:594:280:252:120:133:119:374:220:63:57:185:95 chr1 145296372 . A G 680.41 PASS AO=77;DP=77;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0684883;FXX=0.123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.955;QD=38.3331;RBI=0.0692235;REFB=0;REVB=0.0100626;RO=0;SAF=12;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33241e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000656425;OID=.;OPOS=145296372;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:77:71:0:0:77:71:65:12:0:0:58:13:0:0 chr1 145296478 . G T 73.84 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0815674;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.242;QD=36.9199;RBI=0.0832949;REFB=0;REVB=-0.0168759;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00224249;OID=.;OPOS=145296478;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:5:3:0:0:5:3:0:0 chr1 145298186 . C G 29.49 PASS AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0283667;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=184.059;QD=11.7975;RBI=0.0350138;REFB=0.0371101;REVB=0.0205255;RO=5;SAF=2;SAR=3;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162496;STB=0.599599;TYPE=snp;VARB=-0.0151695;OID=.;OPOS=145298186;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:10:10:5:5:5:5:3:2:3:2:3:2:3:2 chr1 145311083 . A C 1104.96 PASS AO=284;DP=512;FAO=226;FDP=398;FR=.;FRO=172;FSAF=206;FSAR=20;FSRF=160;FSRR=12;FWDB=-0.00317182;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.871;QD=11.1051;RBI=0.0243823;REFB=0.0029663;REVB=0.0241751;RO=226;SAF=261;SAR=23;SRF=211;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0417585;STB=0.526162;TYPE=snp;VARB=-0.00180952;OID=.;OPOS=145311083;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:512:398:226:172:284:226:23:261:211:15:20:206:160:12 chr1 145311828 . C G 518.27 PASS AO=56;DP=59;FAO=57;FDP=59;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00654289;FXX=0.0166639;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.543;QD=35.1368;RBI=0.00783353;REFB=-0.091529;REVB=0.00430753;RO=2;SAF=28;SAR=28;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0324906;STB=0.517235;TYPE=snp;VARB=0.0064829;OID=.;OPOS=145311828;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:59:59:2:2:56:57:28:28:0:2:28:29:0:2 chr1 145368461 . A C 531.64 PASS AO=152;DP=354;FAO=153;FDP=360;FR=.;FRO=207;FSAF=87;FSAR=66;FSRF=117;FSRR=90;FWDB=-0.0211958;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.759;QD=5.90714;RBI=0.0226029;REFB=-0.0100987;REVB=-0.00785043;RO=201;SAF=87;SAR=65;SRF=112;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0158227;STB=0.501997;TYPE=snp;VARB=0.0124506;OID=.;OPOS=145368461;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:354:360:201:207:152:153:65:87:112:89:66:87:117:90 chr1 145382802 . T C 249.08 PASS AO=50;DP=124;FAO=61;FDP=125;FR=.;FRO=64;FSAF=34;FSAR=27;FSRF=47;FSRR=17;FWDB=-0.128065;FXX=0.00793588;HRUN=5;LEN=1;MLLD=38.894;QD=7.97044;RBI=0.169703;REFB=0.0453927;REVB=-0.111348;RO=45;SAF=30;SAR=20;SRF=33;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123067;STB=0.59378;TYPE=snp;VARB=-0.0494854;OID=.;OPOS=145382802;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:125:45:64:50:61:20:30:33:12:27:34:47:17 chr1 145382807 . A G 299.59 PASS AO=66;DP=130;FAO=67;FDP=131;FR=.;FRO=64;FSAF=38;FSAR=29;FSRF=46;FSRR=18;FWDB=0.0205861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.968;QD=9.1477;RBI=0.0227219;REFB=0.00196336;REVB=0.0096174;RO=64;SAF=37;SAR=29;SRF=46;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146828;STB=0.576956;TYPE=snp;VARB=-0.00134305;OID=.;OPOS=145382807;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:131:64:64:66:67:29:37:46:18:29:38:46:18 chr1 145382813 . T G 326.15 PASS AO=71;DP=136;FAO=72;FDP=137;FR=.;FRO=65;FSAF=41;FSAR=31;FSRF=46;FSRR=19;FWDB=0.0134653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.565;QD=9.52265;RBI=0.0141019;REFB=-0.0172218;REVB=-0.00418917;RO=65;SAF=40;SAR=31;SRF=46;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130371;STB=0.56813;TYPE=snp;VARB=0.0134414;OID=.;OPOS=145382813;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:137:65:65:71:72:31:40:46:19:31:41:46:19 chr1 145397942 . A T 890.13 PASS AO=95;DP=96;FAO=95;FDP=96;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=86;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0191473;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=191.642;QD=37.0887;RBI=0.031782;REFB=-0.00146883;REVB=-0.0253668;RO=0;SAF=9;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.37629e-08;STB=0.52631;TYPE=snp;VARB=-1.35161e-05;OID=.;OPOS=145397942;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:96:96:0:1:95:95:86:9:0:0:86:9:1:0 chr1 145397947 . A G 868.42 PASS AO=93;DP=95;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0464129;FXX=0.0210504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.5997;QD=37.3514;RBI=0.048501;REFB=-0.115995;REVB=0.014078;RO=0;SAF=10;SAR=83;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.29386e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00159327;OID=.;OPOS=145397947;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:95:93:0:0:93:93:83:10:0:0:83:10:0:0 chr1 145399229 . C T 676.9 PASS AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00759238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.11;QD=38.6798;RBI=0.0292915;REFB=0;REVB=0.0282904;RO=0;SAF=26;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.47576e-05;OID=.;OPOS=145399229;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:70:70:0:0:70:70:44:26:0:0:44:26:0:0 chr1 145442254 . G C 1289.85 PASS AO=106;DP=109;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0709324;FXX=0.00704176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.5559;QD=36.5916;RBI=0.0741358;REFB=-0.0439253;REVB=0.0215573;RO=1;SAF=51;SAR=55;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00921514;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000780101;OID=.;OPOS=145442254;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:109:141:1:0:106:141:55:51:1:0:58:83:0:0 chr1 145532549 . T C 2248.49 PASS AO=248;DP=256;FAO=248;FDP=256;FR=.;FRO=8;FSAF=137;FSAR=111;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.00327537;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=205.154;QD=35.1326;RBI=0.00352305;REFB=-0.12096;REVB=-0.00129762;RO=7;SAF=137;SAR=111;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00654253;STB=0.505599;TYPE=snp;VARB=0.000313773;OID=.;OPOS=145532549;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:256:256:7:8:248:248:111:137:3:4:111:137:3:5 chr1 145536082 . G A 190.72 PASS AO=53;DP=125;FAO=53;FDP=125;FR=.;FRO=72;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=49;FSRR=23;FWDB=0.000644892;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.442;QD=6.1032;RBI=0.0241103;REFB=-0.0178966;REVB=0.0241017;RO=72;SAF=24;SAR=29;SRF=49;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231144;STB=0.629077;TYPE=snp;VARB=0.0320122;OID=.;OPOS=145536082;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:72:72:53:53:29:24:49:23:29:24:49:23 chr1 145542281 . G A 200.33 PASS AO=44;DP=85;FAO=44;FDP=85;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=30;FSRF=8;FSRR=33;FWDB=-0.0146607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.8121;QD=9.42732;RBI=0.0163667;REFB=-0.0241432;REVB=-0.00727549;RO=41;SAF=14;SAR=30;SRF=8;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131021;STB=0.571954;TYPE=snp;VARB=0.03787;OID=.;OPOS=145542281;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:41:41:44:44:30:14:8:33:30:14:8:33 chr1 145561594 . C T 152.48 PASS AO=17;DP=19;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0159214;FXX=0.0526039;HRUN=4;LEN=1;MLLD=120.974;QD=33.8837;RBI=0.0159214;REFB=-0.120318;REVB=0;RO=1;SAF=17;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00257957;OID=.;OPOS=145561594;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:19:18:1:1:17:17:0:17:1:0:0:17:1:0 chr1 145562881 . T C 743.56 PASS AO=79;DP=80;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=53;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0331551;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.3615;QD=36.719;RBI=0.0346244;REFB=-0.016812;REVB=0.00997929;RO=1;SAF=26;SAR=53;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0178571;STB=0.509089;TYPE=snp;VARB=-0.000137817;OID=.;OPOS=145562881;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:80:81:1:1:79:80:53:26:1:0:53:27:1:0 chr1 145586309 . C T 3300.91 PASS AO=344;DP=345;FAO=344;FDP=344;FR=.;FRO=0;FSAF=201;FSAR=143;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00281526;FXX=0.00289847;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.971;QD=38.3827;RBI=0.0144915;REFB=0;REVB=0.0142154;RO=0;SAF=201;SAR=143;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.08034e-05;OID=.;OPOS=145586309;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:345:344:0:0:344:344:143:201:0:0:143:201:0:0 chr1 145586403 . G T 3531.59 PASS AO=361;DP=366;FAO=368;FDP=368;FR=.;FRO=0;FSAF=203;FSAR=165;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00540336;FXX=0.00808604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.309;QD=38.3868;RBI=0.0247722;REFB=0;REVB=0.0241757;RO=0;SAF=198;SAR=163;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.27264e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.38877e-05;OID=.;OPOS=145586403;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:366:368:0:0:361:368:163:198:0:0:165:203:0:0 chr1 146215138 . A G 116.31 PASS AO=15;DP=18;FAO=15;FDP=18;FR=.;FRO=3;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.00071734;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=201.927;QD=25.8463;RBI=0.0342304;REFB=-0.161779;REVB=0.0342228;RO=1;SAF=7;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0536101;STB=0.578846;TYPE=snp;VARB=0.00253603;OID=.;OPOS=146215138;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:18:18:1:3:15:15:8:7:0:1:8:7:0:3 chr1 146215223 . G C 111.98 PASS AO=15;DP=19;FAO=15;FDP=19;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0146988;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.029;QD=23.5751;RBI=0.0375838;REFB=0.00955097;REVB=-0.0345903;RO=4;SAF=4;SAR=11;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106638;STB=0.559239;TYPE=snp;VARB=-0.00913161;OID=.;OPOS=146215223;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:19:19:4:4:15:15:11:4:2:2:11:4:2:2 chr1 146215232 . A C 111.98 PASS AO=15;DP=19;FAO=15;FDP=19;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0133986;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=340.151;QD=23.5751;RBI=0.0136513;REFB=0.00804886;REVB=0.00261447;RO=4;SAF=4;SAR=11;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106638;STB=0.559239;TYPE=snp;VARB=-0.00156703;OID=.;OPOS=146215232;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:19:19:4:4:15:15:11:4:2:2:11:4:2:2 chr1 146215276 . C T 90.35 PASS AO=15;DP=23;FAO=15;FDP=23;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.00787015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.744;QD=15.7135;RBI=0.047035;REFB=-0.00709906;REVB=-0.0463719;RO=8;SAF=4;SAR=11;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167763;STB=0.594461;TYPE=snp;VARB=0.00504953;OID=.;OPOS=146215276;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:23:23:8:8:15:15:11:4:4:4:11:4:4:4 chr1 146250855 . C T 12.37 PASS AO=9;DP=52;FAO=9;FDP=52;FR=.;FRO=43;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=37;FSRR=6;FWDB=-0.0121058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.975;QD=0.951645;RBI=0.0191533;REFB=0.00587582;REVB=-0.0148424;RO=43;SAF=7;SAR=2;SRF=37;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171295;STB=0.610902;TYPE=snp;VARB=-0.0154543;OID=.;OPOS=146250855;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:52:52:43:43:9:9:2:7:37:6:2:7:37:6 chr1 146395447 . A G 325.4 PASS AO=106;DP=281;FAO=107;FDP=281;FR=.;FRO=174;FSAF=74;FSAR=33;FSRF=117;FSRR=57;FWDB=-0.00343421;FXX=0.00354597;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.805;QD=4.63207;RBI=0.0179944;REFB=-0.0147189;REVB=-0.0176636;RO=175;SAF=74;SAR=32;SRF=117;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0379628;STB=0.513767;TYPE=snp;VARB=0.018691;OID=.;OPOS=146395447;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:281:281:175:174:106:107:32:74:117:58:33:74:117:57 chr1 146408086 . A G 532.94 PASS AO=125;DP=252;FAO=126;FDP=253;FR=.;FRO=127;FSAF=82;FSAR=44;FSRF=63;FSRR=64;FWDB=0.00359895;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.473;QD=8.42599;RBI=0.0369238;REFB=-0.00577968;REVB=0.036748;RO=127;SAF=82;SAR=43;SRF=63;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153688;STB=0.581242;TYPE=snp;VARB=0.00627535;OID=.;OPOS=146408086;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:252:253:127:127:125:126:43:82:63:64:44:82:63:64 chr1 146493279 . C T 61.34 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0305214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.8912;QD=35.0488;RBI=0.077152;REFB=0;REVB=-0.0708581;RO=0;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.27427e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00985342;OID=.;OPOS=146493279;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:5:2:0:0:5:2:0:0 chr1 146493280 . A G 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.128408;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3527;QD=35.0852;RBI=0.129515;REFB=0;REVB=-0.0168952;RO=0;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.27427e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0141598;OID=.;OPOS=146493280;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:5:2:0:0:5:2:0:0 chr1 146494502 . C G 371.23 PASS AO=48;DP=56;FAO=48;FDP=56;FR=.;FRO=8;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.0132238;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2148;QD=26.5165;RBI=0.0481088;REFB=0.0338381;REVB=-0.0462557;RO=8;SAF=29;SAR=19;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0630475;STB=0.533728;TYPE=snp;VARB=-0.00719526;OID=.;OPOS=146494502;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:56:56:8:8:48:48:19:29:3:5:19:29:3:5 chr1 146494510 . T C 488.26 PASS AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0152388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.465;QD=37.5586;RBI=0.0554918;REFB=0;REVB=0.0533584;RO=0;SAF=29;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.84538e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000271152;OID=.;OPOS=146494510;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:52:52:0:0:52:52:23:29:0:0:23:29:0:0 chr1 146495752 . C T 59.57 PASS AO=27;DP=96;FAO=27;FDP=96;FR=.;FRO=69;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=31;FSRR=38;FWDB=-0.024931;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.791;QD=2.48193;RBI=0.0252101;REFB=0.00183293;REVB=0.00374065;RO=69;SAF=12;SAR=15;SRF=31;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00589511;STB=0.50351;TYPE=snp;VARB=-0.00327057;OID=.;OPOS=146495752;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:96:96:69:69:27:27:15:12:31:38:15:12:31:38 chr1 146551375 . G T 17.15 PASS AO=12;DP=63;FAO=12;FDP=63;FR=.;FRO=51;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=35;FWDB=-0.00834377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.736;QD=1.08899;RBI=0.0117246;REFB=-0.00459463;REVB=0.00823703;RO=49;SAF=4;SAR=8;SRF=16;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00952107;STB=0.518043;TYPE=snp;VARB=0.0233306;OID=.;OPOS=146551375;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:63:63:49:51:12:12:8:4:16:33:8:4:16:35 chr1 146626890 . G A 129.68 PASS AO=43;DP=141;FAO=51;FDP=148;FR=.;FRO=97;FSAF=13;FSAR=38;FSRF=37;FSRR=60;FWDB=0.0418093;FXX=0.0133324;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.973;QD=3.50497;RBI=0.044811;REFB=-0.00737219;REVB=0.0161249;RO=98;SAF=10;SAR=33;SRF=37;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207557;STB=0.598573;TYPE=snp;VARB=0.0145378;OID=.;OPOS=146626890;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:148:98:97:43:51:33:10:37:61:38:13:37:60 chr1 146672906 . C T 3341.51 PASS AO=347;DP=349;FAO=347;FDP=347;FR=.;FRO=0;FSAF=151;FSAR=196;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00844182;FXX=0.00573049;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.971;QD=38.5189;RBI=0.00978294;REFB=0;REVB=0.00494383;RO=0;SAF=151;SAR=196;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.25277e-05;OID=.;OPOS=146672906;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:349:347:0:0:347:347:196:151:0:0:196:151:0:0 chr1 146728162 . T TA 732.43 PASS AO=92;DP=97;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0402436;FXX=0.0510152;HRUN=1;LEN=1;MLLD=29.1143;QD=31.5024;RBI=0.126619;REFB=0;REVB=-0.120053;RO=1;SAF=46;SAR=46;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101945;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-0.00235171;OID=.;OPOS=146728163;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:92:97:93:93:0:45:48:0:0:65:1:46:46:0:1 chr1 146736092 . C T 270.15 PASS AO=54;DP=112;FAO=61;FDP=119;FR=.;FRO=58;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=28;FSRR=30;FWDB=0.0196468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.657;QD=9.08062;RBI=0.0215616;REFB=-0.0329764;REVB=0.0088828;RO=57;SAF=28;SAR=26;SRF=27;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0415272;STB=0.504409;TYPE=snp;VARB=0.0295854;OID=.;OPOS=146736092;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:119:57:58:54:61:26:28:27:30:31:30:28:30 chr1 146740502 . C G 401.1 PASS AO=104;DP=228;FAO=104;FDP=227;FR=.;FRO=123;FSAF=67;FSAR=37;FSRF=93;FSRR=30;FWDB=0.00750242;FXX=0.00438577;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.417;QD=7.06783;RBI=0.00820969;REFB=-0.00555411;REVB=-0.00333357;RO=123;SAF=67;SAR=37;SRF=93;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124858;STB=0.568726;TYPE=snp;VARB=0.00776402;OID=.;OPOS=146740502;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:228:227:123:123:104:104:37:67:93:30:37:67:93:30 chr1 146751782 . A C 1899.92 PASS AO=201;DP=201;FAO=201;FDP=201;FR=.;FRO=0;FSAF=102;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144748;FXX=0.00495025;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.251;QD=37.8093;RBI=0.0479324;REFB=-0.0076257;REVB=0.0456946;RO=0;SAF=103;SAR=98;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000112886;OID=.;OPOS=146751782;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:82:201:201:0:0:201:201:98:103:0:0:99:102:0:0 chr1 146767149 . G T 2364.07 PASS AO=245;DP=246;FAO=246;FDP=246;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=150;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0280759;FXX=0.00404842;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.888;QD=38.4401;RBI=0.0283772;REFB=0;REVB=0.00412462;RO=0;SAF=95;SAR=150;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.84801e-05;OID=.;OPOS=146767149;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:246:246:0:0:245:246:150:95:0:0:150:96:0:0 chr1 147091972 . C T 161.19 PASS AO=47;DP=115;FAO=47;FDP=116;FR=.;FRO=69;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=36;FSRR=33;FWDB=0.0161993;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.463;QD=5.55818;RBI=0.021636;REFB=0.0101892;REVB=-0.0143422;RO=68;SAF=18;SAR=29;SRF=36;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155478;STB=0.583857;TYPE=snp;VARB=-0.0146837;OID=.;OPOS=147091972;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:116:68:69:47:47:29:18:36:32:29:18:36:33 chr1 147096112 . G A 166.48 PASS AO=30;DP=52;FAO=32;FDP=54;FR=.;FRO=22;FSAF=25;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=3;FWDB=-0.00574777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.997;QD=12.3319;RBI=0.0172005;REFB=-0.00273095;REVB=0.0162117;RO=21;SAF=24;SAR=6;SRF=18;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0700126;STB=0.551941;TYPE=snp;VARB=0.0033442;OID=.;OPOS=147096112;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:52:54:21:22:30:32:6:24:18:3:7:25:19:3 chr1 147119273 . G A 332.87 PASS AO=73;DP=140;FAO=73;FDP=140;FR=.;FRO=67;FSAF=53;FSAR=20;FSRF=38;FSRR=29;FWDB=-0.028126;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.191;QD=9.51052;RBI=0.0289814;REFB=-0.0176924;REVB=-0.00698951;RO=63;SAF=53;SAR=20;SRF=35;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165448;STB=0.58793;TYPE=snp;VARB=0.0230548;OID=.;OPOS=147119273;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:63:67:73:73:20:53:35:28:20:53:38:29 chr1 147121977 . C T 1775.18 PASS AO=189;DP=194;FAO=189;FDP=189;FR=.;FRO=0;FSAF=118;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000868797;FXX=0.0257719;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.509;QD=37.5699;RBI=0.0132099;REFB=-0.0883024;REVB=0.0131813;RO=1;SAF=118;SAR=71;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00665931;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00130528;OID=.;OPOS=147121977;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:194:189:1:0:189:189:71:118:0:1:71:118:0:0 chr1 147124310 . T G 509.35 PASS AO=108;DP=190;FAO=108;FDP=199;FR=.;FRO=91;FSAF=56;FSAR=52;FSRF=39;FSRR=52;FWDB=-0.0337857;FXX=0.00499975;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.4779;QD=10.2381;RBI=0.0377522;REFB=-0.023117;REVB=0.0168451;RO=82;SAF=56;SAR=52;SRF=30;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120864;STB=0.541055;TYPE=snp;VARB=0.0207477;OID=.;OPOS=147124310;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:199:82:91:108:108:52:56:30:52:52:56:39:52 chr1 147126437 . G A 55.23 PASS AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=39;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=2;FSRF=19;FSRR=5;FWDB=-0.0127776;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.485;QD=5.66472;RBI=0.0138528;REFB=-0.0105353;REVB=0.00535103;RO=23;SAF=13;SAR=2;SRF=18;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159572;STB=0.586967;TYPE=snp;VARB=0.00942891;OID=.;OPOS=147126437;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:38:39:23:24:15:15:2:13:18:5:2:13:19:5 chr1 147229299 . G A 243.13 PASS AO=24;DP=27;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0463946;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.7918;QD=34.7326;RBI=0.108824;REFB=-0.107536;REVB=0.0984386;RO=3;SAF=22;SAR=2;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144374;STB=0.57137;TYPE=snp;VARB=0.00856367;OID=.;OPOS=147229299;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:27:28:3:1:24:27:2:22:2:1:3:24:0:1 chr1 147229697 . CCT C,CC 20.16 PASS AO=4,3;DP=21;FAO=0,9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=0,7;FSAR=0,2;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.061395,0.0336262;FXX=0.049975;HRUN=3,5;LEN=2,1;MLLD=16.4584,10.222;QD=4.2452;RBI=0.0949738,0.0449119;REFB=-0.0514501,-0.126555;REVB=-0.0724615,-0.0297718;RO=10;SAF=2,3;SAR=2,0;SRF=6;SRR=4;SSEN=0.22249,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.107009,0.622111;STB=0.5,0.617362;TYPE=del,del;VARB=0.0220588,0.152187;OID=.,.;OPOS=147229698,147229699;OREF=CT,T;OALT=-,-;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:4,3:18:0,9:19:10:0,7:0,2:6:4:19:10:2,3:2,0:6:4 chr1 147716794 . C T 380.96 PASS AO=79;DP=151;FAO=82;FDP=153;FR=.;FRO=71;FSAF=42;FSAR=40;FSRF=32;FSRR=39;FWDB=0.00569445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.211;QD=9.95985;RBI=0.0168274;REFB=0.00318062;REVB=0.0158346;RO=71;SAF=41;SAR=38;SRF=31;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0710147;STB=0.528505;TYPE=snp;VARB=-0.00459887;OID=.;OPOS=147716794;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:153:71:71:79:82:38:41:31:40:40:42:32:39 chr1 147735828 . C T 604.58 PASS AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0202148;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5084;QD=37.7862;RBI=0.0396348;REFB=0;REVB=-0.0340922;RO=0;SAF=41;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000598169;OID=.;OPOS=147735828;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:64:64:0:0:64:64:23:41:0:0:23:41:0:0 chr1 147781062 . A G 1371.89 PASS AO=143;DP=143;FAO=145;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0325456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.443;QD=37.8453;RBI=0.0384561;REFB=0;REVB=-0.0204855;RO=0;SAF=50;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.19122e-05;OID=.;OPOS=147781062;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:143:145:0:0:143:145:93:50:0:0:95:50:0:0 chr1 147802471 . A AT 41.64 PASS AO=48;DP=142;FAO=56;FDP=131;FR=.;FRO=75;FSAF=18;FSAR=38;FSRF=25;FSRR=50;FWDB=0.0664679;FXX=0.00757518;HRUN=7;LEN=1;MLLD=6.01019;QD=1.27141;RBI=0.195956;REFB=-0.110424;REVB=-0.184339;RO=76;SAF=14;SAR=34;SRF=31;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141057;STB=0.507766;TYPE=ins;VARB=0.0653868;OID=.;OPOS=147802472;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:48:142:56:131:75:18:38:25:50:41:76:14:34:31:45 chr1 147806874 . G C 1300.66 PASS AO=132;DP=132;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0185612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.674;QD=38.2546;RBI=0.0377227;REFB=0;REVB=-0.0328403;RO=0;SAF=45;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.34555e-05;OID=.;OPOS=147806874;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:132:136:0:0:132:136:87:45:0:0:90:46:0:0 chr1 147806880 . T C 1168.68 PASS AO=121;DP=122;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00898422;FXX=0.0158718;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.9908;QD=37.6994;RBI=0.0305035;REFB=-0.0619847;REVB=0.0291504;RO=1;SAF=42;SAR=79;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00597584;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000375187;OID=.;OPOS=147806880;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:122:124:1:0:121:124:79:42:0:1:82:42:0:0 chr1 148009510 . G A 174.97 PASS AO=65;DP=191;FAO=65;FDP=190;FR=.;FRO=125;FSAF=27;FSAR=38;FSRF=75;FSRR=50;FWDB=-0.0178908;FXX=0.00523533;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.994;QD=3.68347;RBI=0.0200226;REFB=0.00853594;REVB=-0.00899026;RO=124;SAF=27;SAR=38;SRF=74;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205945;STB=0.619925;TYPE=snp;VARB=-0.0100372;OID=.;OPOS=148009510;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:191:190:124:125:65:65:38:27:74:50:38:27:75:50 chr1 148252048 . T A 219 PASS AO=64;DP=156;FAO=64;FDP=156;FR=.;FRO=92;FSAF=36;FSAR=28;FSRF=46;FSRR=46;FWDB=-0.0322758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.8181;QD=5.61547;RBI=0.03263;REFB=0.0102219;REVB=0.00479489;RO=92;SAF=36;SAR=28;SRF=46;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0660067;STB=0.537085;TYPE=snp;VARB=-0.0161339;OID=.;OPOS=148252048;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:156:92:92:64:64:28:36:46:46:28:36:46:46 chr1 148341981 . T C 11.92 PASS AO=9;DP=53;FAO=9;FDP=53;FR=.;FRO=44;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=27;FSRR=17;FWDB=0.00695009;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.007;QD=0.899976;RBI=0.00736793;REFB=-0.00832693;REVB=0.00244596;RO=43;SAF=1;SAR=8;SRF=27;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.606556;STB=0.898751;TYPE=snp;VARB=0.0122939;OID=.;OPOS=148341981;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:53:53:43:44:9:9:8:1:27:16:8:1:27:17 chr1 149146793 . G A 22.49 PASS AO=6;DP=19;FAO=6;FDP=19;FR=.;FRO=13;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.00625351;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.85;QD=4.73398;RBI=0.00890522;REFB=-0.00560917;REVB=0.00634008;RO=13;SAF=1;SAR=5;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.439476;STB=0.783281;TYPE=snp;VARB=0.0217757;OID=.;OPOS=149146793;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:19:19:13:13:6:6:5:1:7:6:5:1:7:6 chr1 149155848 . C T 195.71 PASS AO=39;DP=70;FAO=39;FDP=70;FR=.;FRO=31;FSAF=28;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.0354776;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.0889;QD=11.1835;RBI=0.0357135;REFB=-0.00732368;REVB=-0.00409781;RO=30;SAF=28;SAR=11;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218172;STB=0.629144;TYPE=snp;VARB=0.00881985;OID=.;OPOS=149155848;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:30:31:39:39:11:28:14:16:11:28:14:17 chr1 149211947 . C G 15.49 PASS AO=28;DP=183;FAO=28;FDP=185;FR=.;FRO=157;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=61;FSRR=96;FWDB=0.0385403;FXX=0.0106946;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8689;QD=0.334965;RBI=0.0776049;REFB=0.000523317;REVB=-0.0673585;RO=155;SAF=12;SAR=16;SRF=61;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0462032;STB=0.535007;TYPE=snp;VARB=-0.00447244;OID=.;OPOS=149211947;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:183:185:155:157:28:28:16:12:61:94:16:12:61:96 chr1 149211967 . G A 57.42 PASS AO=51;DP=242;FAO=53;FDP=254;FR=.;FRO=201;FSAF=35;FSAR=18;FSRF=67;FSRR=134;FWDB=-0.0214055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.226;QD=0.904302;RBI=0.0227372;REFB=-0.0233189;REVB=0.00766715;RO=172;SAF=34;SAR=17;SRF=53;SRR=119;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.43286;STB=0.743349;TYPE=snp;VARB=0.040198;OID=.;OPOS=149211967;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:242:254:172:201:51:53:17:34:53:119:18:35:67:134 chr1 149211975 . C A 81.41 PASS AO=61;DP=288;FAO=65;FDP=290;FR=.;FRO=225;FSAF=45;FSAR=20;FSRF=78;FSRR=147;FWDB=-0.00783694;FXX=0.00343631;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.2186;QD=1.12289;RBI=0.0190592;REFB=-0.02419;REVB=0.0173734;RO=227;SAF=39;SAR=22;SRF=81;SRR=146;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.351176;STB=0.753311;TYPE=snp;VARB=0.0649484;OID=.;OPOS=149211975;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:288:290:227:225:61:65:22:39:81:146:20:45:78:147 chr1 149211992 . G A 91.43 PASS AO=78;DP=355;FAO=77;FDP=355;FR=.;FRO=278;FSAF=51;FSAR=26;FSRF=89;FSRR=189;FWDB=-0.0172367;FXX=0.0111418;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.153;QD=1.03019;RBI=0.0402662;REFB=-0.0065844;REVB=-0.0363904;RO=268;SAF=51;SAR=27;SRF=88;SRR=180;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.39877;STB=0.750712;TYPE=snp;VARB=0.0149059;OID=.;OPOS=149211992;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:355:355:268:278:78:77:27:51:88:180:26:51:89:189 chr1 149211998 . T G 114.92 PASS AO=88;DP=378;FAO=87;FDP=376;FR=.;FRO=289;FSAF=59;FSAR=28;FSRF=93;FSRR=196;FWDB=-0.00690785;FXX=0.00265245;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.3725;QD=1.2225;RBI=0.00697883;REFB=-0.00700043;REVB=0.000992793;RO=289;SAF=59;SAR=29;SRF=93;SRR=196;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.423421;STB=0.756357;TYPE=snp;VARB=0.017316;OID=.;OPOS=149211998;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:378:376:289:289:88:87:29:59:93:196:28:59:93:196 chr1 149215180 . T C 1835.92 PASS AO=195;DP=203;FAO=196;FDP=196;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000804499;FXX=0.0344811;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.923;QD=37.4678;RBI=0.0276854;REFB=-0.0650534;REVB=0.0276737;RO=1;SAF=89;SAR=106;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00447186;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000132061;OID=.;OPOS=149215180;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:203:196:1:0:195:196:106:89:0:1:107:89:0:0 chr1 149224123 . G A 29.8 PASS AO=59;DP=368;FAO=59;FDP=370;FR=.;FRO=311;FSAF=35;FSAR=24;FSRF=117;FSRR=194;FWDB=-0.0284709;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=272.405;QD=0.32211;RBI=0.0336925;REFB=-0.00439018;REVB=-0.0180165;RO=308;SAF=35;SAR=24;SRF=116;SRR=192;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275336;STB=0.676482;TYPE=snp;VARB=0.0262363;OID=.;OPOS=149224123;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:368:370:308:311:59:59:24:35:116:192:24:35:117:194 chr1 149224135 . G C 245.3 PASS AO=111;DP=359;FAO=111;FDP=361;FR=.;FRO=250;FSAF=33;FSAR=78;FSRF=113;FSRR=137;FWDB=-0.014533;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=178.845;QD=2.71801;RBI=0.0148278;REFB=-0.00250482;REVB=-0.00294198;RO=247;SAF=33;SAR=78;SRF=112;SRR=135;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201094;STB=0.616112;TYPE=snp;VARB=0.00446993;OID=.;OPOS=149224135;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:359:361:247:250:111:111:78:33:112:135:78:33:113:137 chr1 149224148 . G A 248.22 PASS AO=111;DP=356;FAO=111;FDP=358;FR=.;FRO=247;FSAF=33;FSAR=78;FSRF=107;FSRR=140;FWDB=0.00950399;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=285.248;QD=2.77344;RBI=0.0117416;REFB=-0.00476784;REVB=-0.00689489;RO=245;SAF=33;SAR=78;SRF=107;SRR=138;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181117;STB=0.602829;TYPE=snp;VARB=0.0117598;OID=.;OPOS=149224148;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:356:358:245:247:111:111:78:33:107:138:78:33:107:140 chr1 149287392 . T G 173.89 PASS AO=43;DP=97;FAO=44;FDP=97;FR=.;FRO=53;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=8;FSRR=45;FWDB=-0.0242023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.471;QD=7.17065;RBI=0.0311481;REFB=-0.0331434;REVB=0.0196075;RO=53;SAF=15;SAR=28;SRF=8;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234895;STB=0.624599;TYPE=snp;VARB=0.0192735;OID=.;OPOS=149287392;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:53:53:43:44:28:15:8:45:29:15:8:45 chr1 149287441 . G A 72.7 PASS AO=25;DP=86;FAO=28;FDP=88;FR=.;FRO=60;FSAF=5;FSAR=23;FSRF=17;FSRR=43;FWDB=0.0605477;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.7267;QD=3.3046;RBI=0.0613484;REFB=-0.00525378;REVB=-0.00987967;RO=60;SAF=4;SAR=21;SRF=17;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218994;STB=0.60518;TYPE=snp;VARB=0.0118761;OID=.;OPOS=149287441;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:86:88:60:60:25:28:21:4:17:43:23:5:17:43 chr1 149294658 . G A 1580.93 PASS AO=150;DP=150;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0198535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.438;QD=37.6412;RBI=0.024734;REFB=0;REVB=-0.0147516;RO=0;SAF=69;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.40358e-05;OID=.;OPOS=149294658;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:150:168:0:0:150:168:81:69:0:0:91:77:0:0 chr1 149294693 . G C 1269.2 PASS AO=129;DP=134;FAO=144;FDP=146;FR=.;FRO=2;FSAF=41;FSAR=103;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0437734;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.152;QD=34.7726;RBI=0.0437789;REFB=-0.0872162;REVB=-0.000696163;RO=5;SAF=26;SAR=103;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0830628;STB=0.511903;TYPE=snp;VARB=0.00059775;OID=.;OPOS=149294693;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:134:146:5:2:129:144:103:26:5:0:103:41:2:0 chr1 149294742 . C T 188.95 PASS AO=53;DP=126;FAO=53;FDP=126;FR=.;FRO=73;FSAF=14;FSAR=39;FSRF=17;FSRR=56;FWDB=-0.0089802;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=228.928;QD=5.99849;RBI=0.0090445;REFB=-0.0082906;REVB=-0.00107654;RO=73;SAF=14;SAR=39;SRF=17;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0425336;STB=0.52382;TYPE=snp;VARB=0.0135519;OID=.;OPOS=149294742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:73:73:53:53:39:14:17:56:39:14:17:56 chr1 149294744 . C T 190.85 PASS AO=53;DP=126;FAO=53;FDP=125;FR=.;FRO=72;FSAF=14;FSAR=39;FSRF=16;FSRR=56;FWDB=0.00935868;FXX=0.00793588;HRUN=4;LEN=1;MLLD=157.848;QD=6.10719;RBI=0.010564;REFB=-0.00513161;REVB=0.00490031;RO=72;SAF=14;SAR=39;SRF=16;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0572197;STB=0.531988;TYPE=snp;VARB=0.0132834;OID=.;OPOS=149294744;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:125:72:72:53:53:39:14:16:56:39:14:16:56 chr1 149298542 . C A 37.26 PASS AO=20;DP=65;FAO=20;FDP=72;FR=.;FRO=52;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=31;FSRR=21;FWDB=0.019684;FXX=0.0270234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.901;QD=2.06972;RBI=0.0269826;REFB=-0.00162896;REVB=0.0184554;RO=32;SAF=16;SAR=4;SRF=22;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163375;STB=0.680072;TYPE=snp;VARB=0.00572962;OID=.;OPOS=149298542;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:65:72:32:52:20:20:4:16:22:10:4:16:31:21 chr1 149298554 . C A 29.23 PASS AO=19;DP=87;FAO=19;FDP=86;FR=.;FRO=67;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=37;FSRR=30;FWDB=0.0371116;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.3035;QD=1.35934;RBI=0.118806;REFB=0.0181101;REVB=0.11286;RO=67;SAF=11;SAR=8;SRF=37;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0339271;STB=0.521175;TYPE=snp;VARB=-0.057192;OID=.;OPOS=149298554;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:87:86:67:67:19:19:8:11:37:30:8:11:37:30 chr1 149298562 . G A 26.65 PASS AO=19;DP=93;FAO=19;FDP=92;FR=.;FRO=73;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=42;FSRR=31;FWDB=-0.00822601;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.4436;QD=1.15848;RBI=0.0425047;REFB=0.00155873;REVB=0.0417011;RO=65;SAF=8;SAR=11;SRF=34;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126973;STB=0.620643;TYPE=snp;VARB=-0.0100059;OID=.;OPOS=149298562;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:93:92:65:73:19:19:11:8:34:31:11:8:42:31 chr1 149298563 . C T 27.92 PASS AO=19;DP=84;FAO=19;FDP=90;FR=.;FRO=71;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=40;FSRR=31;FWDB=-0.00686429;FXX=0.0109878;HRUN=3;LEN=1;MLLD=153.764;QD=1.24069;RBI=0.0576737;REFB=-0.00646506;REVB=0.0572637;RO=64;SAF=8;SAR=11;SRF=33;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117695;STB=0.610996;TYPE=snp;VARB=0.0257984;OID=.;OPOS=149298563;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:84:90:64:71:19:19:11:8:33:31:11:8:40:31 chr1 149298603 . G A 87.89 PASS AO=37;DP=122;FAO=37;FDP=122;FR=.;FRO=85;FSAF=10;FSAR=27;FSRF=49;FSRR=36;FWDB=0.0224939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.834;QD=2.88157;RBI=0.0229966;REFB=-0.00784812;REVB=-0.00478235;RO=85;SAF=10;SAR=27;SRF=49;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.368891;STB=0.71648;TYPE=snp;VARB=0.0144821;OID=.;OPOS=149298603;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:122:122:85:85:37:37:27:10:49:36:27:10:49:36 chr1 149334339 . G C 503.22 PASS AO=60;DP=466;FAO=159;FDP=391;FR=.,HEALED;FRO=232;FSAF=80;FSAR=79;FSRF=142;FSRR=90;FWDB=-0.193404;FXX=0.0224994;HRUN=4;LEN=1;MLLD=107.532;QD=5.14802;RBI=0.193857;REFB=-0.00757662;REVB=-0.0132505;RO=194;SAF=0;SAR=60;SRF=123;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.82468;STB=0.564677;TYPE=snp;VARB=0.00504041;OID=.;OPOS=149334339;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:313:391:194:232:60:159:60:0:123:71:79:80:142:90 chr1 149334350 . G A 78.18 PASS AO=158;DP=729;FAO=81;FDP=399;FR=.;FRO=318;FSAF=18;FSAR=63;FSRF=101;FSRR=217;FWDB=0.00742119;FXX=0.00249994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.952;QD=0.783742;RBI=0.0476541;REFB=-0.00663257;REVB=-0.0470727;RO=568;SAF=38;SAR=120;SRF=191;SRR=377;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150848;STB=0.597964;TYPE=snp;VARB=0.0358523;OID=.;OPOS=149334350;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:729:399:568:318:158:81:120:38:191:377:63:18:101:217 chr1 149514093 . A G 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0377728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.561;QD=33.022;RBI=0.0548359;REFB=0;REVB=0.0397516;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000922038;OID=.;OPOS=149514093;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:4:2:0:0:4:2:0:0 chr1 149514101 . G A 34.5 PASS AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.109234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5822;QD=22.9989;RBI=0.164344;REFB=-0.107998;REVB=-0.122788;RO=1;SAF=2;SAR=3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121807;STB=0.571154;TYPE=snp;VARB=-0.00161541;OID=.;OPOS=149514101;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:6:6:1:1:5:5:3:2:0:1:3:2:0:1 chr1 149514121 . C T 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0684126;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.539;QD=33.022;RBI=0.0768713;REFB=0;REVB=0.0350559;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00137396;OID=.;OPOS=149514121;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:4:2:0:0:4:2:0:0 chr1 149664423 . A G 1450.87 PASS AO=213;DP=291;FAO=221;FDP=298;FR=.;FRO=77;FSAF=71;FSAR=150;FSRF=31;FSRR=46;FWDB=0.012633;FXX=0.00334437;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.087;QD=19.4747;RBI=0.0230158;REFB=-0.0242383;REVB=-0.0192389;RO=75;SAF=63;SAR=150;SRF=30;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0594918;STB=0.523683;TYPE=snp;VARB=0.00737804;OID=.;OPOS=149664423;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:291:298:75:77:213:221:150:63:30:45:150:71:31:46 chr1 149676401 . A G 228.35 PASS AO=59;DP=134;FAO=60;FDP=134;FR=.;FRO=74;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=43;FSRR=31;FWDB=-0.032565;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.68;QD=6.81642;RBI=0.0460706;REFB=-0.000822017;REVB=-0.0325886;RO=74;SAF=30;SAR=29;SRF=43;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0725586;STB=0.544761;TYPE=snp;VARB=0.000858178;OID=.;OPOS=149676401;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:74:74:59:60:29:30:43:31:30:30:43:31 chr1 149680227 . A G 1093.85 PASS AO=122;DP=130;FAO=124;FDP=129;FR=.;FRO=5;FSAF=59;FSAR=65;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0246837;FXX=0.00769172;HRUN=3;LEN=1;MLLD=138.343;QD=33.9178;RBI=0.051348;REFB=-0.20272;REVB=-0.045026;RO=7;SAF=58;SAR=64;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00989846;STB=0.504822;TYPE=snp;VARB=0.00158657;OID=.;OPOS=149680227;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:130:129:7:5:122:124:64:58:4:3:65:59:3:2 chr1 149680262 . A G 148.25 PASS AO=52;DP=145;FAO=52;FDP=147;FR=.;FRO=95;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=40;FSRR=55;FWDB=0.0107116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.3477;QD=4.0339;RBI=0.023054;REFB=-0.0104755;REVB=-0.0204144;RO=88;SAF=22;SAR=30;SRF=34;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0418904;STB=0.50134;TYPE=snp;VARB=0.0156976;OID=.;OPOS=149680262;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:147:88:95:52:52:30:22:34:54:30:22:40:55 chr1 149680293 . A C 18.6 PASS AO=20;DP=117;FAO=20;FDP=116;FR=.;FRO=96;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=31;FSRR=65;FWDB=0.0561685;FXX=0.00854628;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9303;QD=0.641299;RBI=0.0614848;REFB=0.0045557;REVB=-0.0250097;RO=96;SAF=6;SAR=14;SRF=30;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0186593;STB=0.522155;TYPE=snp;VARB=-0.0282132;OID=.;OPOS=149680293;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:117:116:96:96:20:20:14:6:30:66:14:6:31:65 chr1 149684085 . T C 21.57 PASS AO=10;DP=43;FAO=10;FDP=43;FR=.;FRO=33;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=25;FWDB=-0.0115854;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0708;QD=2.00649;RBI=0.0193512;REFB=0.00162481;REVB=-0.0154999;RO=33;SAF=3;SAR=7;SRF=8;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0871629;STB=0.554809;TYPE=snp;VARB=-0.00900242;OID=.;OPOS=149684085;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:43:43:33:33:10:10:7:3:8:25:7:3:8:25 chr1 149684119 . TA T 794.67 PASS AO=81;DP=86;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00228214;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.044;QD=37.396;RBI=0.00230994;REFB=0;REVB=-0.000357305;RO=0;SAF=22;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=9.20666e-05;OID=.;OPOS=149684120;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:81:86:85:85:0:24:61:0:0:38:0:22:59:0:0 chr1 149684166 . G A 24.93 PASS AO=30;DP=104;FAO=9;FDP=33;FR=.;FRO=24;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.0625681;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.5396;QD=3.02165;RBI=0.126709;REFB=-0.0400533;REVB=-0.110184;RO=74;SAF=8;SAR=22;SRF=23;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0650265;STB=0.6032;TYPE=snp;VARB=0.0894994;OID=.;OPOS=149684166;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:104:33:74:24:30:9:22:8:23:51:7:2:8:16 chr1 149684169 . G A 19.18 PASS AO=28;DP=109;FAO=8;FDP=34;FR=.;FRO=26;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.0554897;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.509;QD=2.25628;RBI=0.060037;REFB=-0.0128724;REVB=-0.0229201;RO=81;SAF=6;SAR=22;SRF=23;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115877;STB=0.743946;TYPE=snp;VARB=0.0356356;OID=.;OPOS=149684169;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:109:34:81:26:28:8:22:6:23:58:7:1:9:17 chr1 149684171 . A T 18.45 PASS AO=28;DP=112;FAO=8;FDP=35;FR=.;FRO=27;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=-0.0169566;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.068;QD=2.10907;RBI=0.026152;REFB=-0.0203602;REVB=-0.0199099;RO=84;SAF=6;SAR=22;SRF=25;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136801;STB=0.73613;TYPE=snp;VARB=0.0564353;OID=.;OPOS=149684171;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:112:35:84:27:28:8:22:6:25:59:7:1:9:18 chr1 149711815 . G A 30.68 PASS AO=25;DP=122;FAO=25;FDP=124;FR=.;FRO=99;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=57;FSRR=42;FWDB=0.00425278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.928;QD=0.989682;RBI=0.00977113;REFB=0.000204484;REVB=-0.00879709;RO=96;SAF=9;SAR=16;SRF=56;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.278601;STB=0.669069;TYPE=snp;VARB=-0.00221012;OID=.;OPOS=149711815;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:122:124:96:99:25:25:16:9:56:40:16:9:57:42 chr1 149719835 . T C 263.97 PASS AO=75;DP=178;FAO=75;FDP=178;FR=.;FRO=103;FSAF=57;FSAR=18;FSRF=62;FSRR=41;FWDB=0.0147029;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=252.469;QD=5.93192;RBI=0.0214644;REFB=-0.00492719;REVB=-0.015638;RO=102;SAF=57;SAR=18;SRF=61;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200347;STB=0.610867;TYPE=snp;VARB=0.00649837;OID=.;OPOS=149719835;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:178:102:103:75:75:18:57:61:41:18:57:62:41 chr1 149876124 . T C 257.16 PASS AO=73;DP=174;FAO=73;FDP=173;FR=.;FRO=100;FSAF=36;FSAR=37;FSRF=34;FSRR=66;FWDB=-0.00240895;FXX=0.0057468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.717;QD=5.9459;RBI=0.00727155;REFB=-0.00637739;REVB=-0.00686094;RO=101;SAF=36;SAR=37;SRF=35;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152931;STB=0.588735;TYPE=snp;VARB=0.00920456;OID=.;OPOS=149876124;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:173:101:100:73:73:37:36:35:66:37:36:34:66 chr1 149905310 . AG A 468.72 PASS AO=56;DP=81;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.247905;FXX=0.0129853;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.2987;QD=24.6694;RBI=0.269552;REFB=0;REVB=-0.105836;RO=9;SAF=53;SAR=3;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0.290445;SSSB=-0.0736676;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00308452;OID=.;OPOS=149905311;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:56:77:76:76:0:68:8:0:0:45:9:53:3:9:0 chr1 149906413 . T C 328.56 PASS AO=85;DP=187;FAO=85;FDP=186;FR=.;FRO=101;FSAF=36;FSAR=49;FSRF=36;FSRR=65;FWDB=0.00400204;FXX=0.00534731;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.091;QD=7.06583;RBI=0.0193545;REFB=-0.00713842;REVB=0.0189363;RO=100;SAF=36;SAR=49;SRF=36;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0642275;STB=0.537727;TYPE=snp;VARB=0.00774234;OID=.;OPOS=149906413;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:186:100:101:85:85:49:36:36:64:49:36:36:65 chr1 149914216 . GA G 92.01 PASS AO=31;DP=105;FAO=57;FDP=97;FR=.;FRO=40;FSAF=22;FSAR=35;FSRF=13;FSRR=27;FWDB=-0.0737184;FXX=0.0673012;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.38655;QD=3.79436;RBI=0.142641;REFB=-0.101458;REVB=-0.122115;RO=33;SAF=8;SAR=23;SRF=9;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0174479;STB=0.526835;TYPE=del;VARB=0.0844679;OID=.;OPOS=149914217;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:31:89:57:97:40:22:35:13:27:36:33:8:23:9:24 chr1 149914683 . G A 451.69 PASS AO=54;DP=60;FAO=54;FDP=60;FR=.;FRO=6;FSAF=18;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0119903;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=34.0813;QD=30.1125;RBI=0.0181336;REFB=-0.0819431;REVB=-0.0136037;RO=6;SAF=18;SAR=36;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0356753;STB=0.51898;TYPE=snp;VARB=0.0216517;OID=.;OPOS=149914683;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:60:60:6:6:54:54:36:18:1:5:36:18:1:5 chr1 150115074 . AC A 762.57 PASS AO=100;DP=146;FAO=143;FDP=144;FR=.;FRO=1;FSAF=111;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.144937;FXX=0.00689608;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.9845;QD=21.1825;RBI=0.245623;REFB=-0.0907867;REVB=0.198303;RO=24;SAF=88;SAR=12;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0.477876;SSSB=0.131228;STB=0.502242;TYPE=del;VARB=0.0236764;OID=.;OPOS=150115075;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:100:143:143:144:1:111:32:1:0:46:24:88:12:17:7 chr1 150190915 . GT G 49.67 PASS AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=1;FSAR=16;FSRF=4;FSRR=14;FWDB=0.118262;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=14.0021;QD=5.67646;RBI=0.124594;REFB=-0.0157943;REVB=-0.0392141;RO=17;SAF=1;SAR=16;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.395735;STB=0.726917;TYPE=del;VARB=0.0299538;OID=.;OPOS=150190916;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:17:34:17:35:18:1:16:4:14:43:17:1:16:4:13 chr1 150276554 . C G 75.97 PASS AO=10;DP=12;FAO=10;FDP=12;FR=.;FRO=2;FSAF=0;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.18;QD=25.3245;RBI=0.0264599;REFB=0.0468719;REVB=0.0264599;RO=2;SAF=0;SAR=10;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00338971;OID=.;OPOS=150276554;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:12:12:2:2:10:10:10:0:0:2:10:0:0:2 chr1 150278741 . G GTC 110.36 PASS AO=35;DP=108;FAO=37;FDP=104;FR=.;FRO=67;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=29;FSRR=38;FWDB=0.00602813;FXX=0.0188661;HRUN=1;LEN=2;MLLD=233.037;QD=4.24461;RBI=0.0104479;REFB=-0.0023998;REVB=-0.00853345;RO=67;SAF=13;SAR=22;SRF=31;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107288;STB=0.536605;TYPE=ins;VARB=0.0043115;OID=.;OPOS=150278742;OREF=-;OALT=TC;OMAPALT=GTC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:35:108:37:104:67:14:23:29:38:99:67:13:22:31:36 chr1 150280550 . G A 211.23 PASS AO=46;DP=89;FAO=46;FDP=89;FR=.;FRO=43;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=26;FSRR=17;FWDB=-0.0767431;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.702;QD=9.4933;RBI=0.0770848;REFB=-0.00782731;REVB=-0.00724974;RO=43;SAF=27;SAR=19;SRF=26;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0160023;STB=0.508839;TYPE=snp;VARB=0.006449;OID=.;OPOS=150280550;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:43:43:46:46:19:27:26:17:19:27:26:17 chr1 150481982 . C T 181.95 PASS AO=41;DP=82;FAO=41;FDP=82;FR=.;FRO=41;FSAF=31;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=-0.0125539;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=196.97;QD=8.87561;RBI=0.0126559;REFB=-0.0285843;REVB=-0.0016035;RO=41;SAF=31;SAR=10;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208218;STB=0.616416;TYPE=snp;VARB=0.0344938;OID=.;OPOS=150481982;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:41:41:41:41:10:31:23:18:10:31:23:18 chr1 150483355 . C T 33.95 PASS AO=15;DP=57;FAO=15;FDP=57;FR=.;FRO=42;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=-0.0249215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.352;QD=2.38214;RBI=0.027363;REFB=-0.00923052;REVB=-0.0112982;RO=39;SAF=4;SAR=11;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.250633;STB=0.666433;TYPE=snp;VARB=0.0204535;OID=.;OPOS=150483355;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:57:57:39:42:15:15:11:4:18:21:11:4:20:22 chr1 150484004 . G A 294.97 PASS AO=72;DP=152;FAO=72;FDP=151;FR=.;FRO=79;FSAF=28;FSAR=44;FSRF=44;FSRR=35;FWDB=-0.00974206;FXX=0.00657851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.1158;QD=7.81368;RBI=0.0488727;REFB=-0.0126281;REVB=0.0478919;RO=78;SAF=28;SAR=44;SRF=44;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166113;STB=0.588823;TYPE=snp;VARB=0.0161393;OID=.;OPOS=150484004;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:151:78:79:72:72:44:28:44:34:44:28:44:35 chr1 150484987 . G A 291.73 PASS AO=68;DP=136;FAO=68;FDP=137;FR=.;FRO=69;FSAF=14;FSAR=54;FSRF=17;FSRR=52;FWDB=0.00492276;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.46;QD=8.51774;RBI=0.0107375;REFB=0.000490842;REVB=-0.00954258;RO=68;SAF=14;SAR=54;SRF=17;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0586384;STB=0.530073;TYPE=snp;VARB=-0.00063062;OID=.;OPOS=150484987;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:137:68:69:68:68:54:14:17:51:54:14:17:52 chr1 150525425 . G A 114.01 PASS AO=30;DP=115;FAO=36;FDP=98;FR=.,HEALED;FRO=62;FSAF=10;FSAR=26;FSRF=21;FSRR=41;FWDB=-0.00450002;FXX=0.0392118;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.55;QD=4.65333;RBI=0.0106803;REFB=-0.00947803;REVB=0.00968599;RO=48;SAF=8;SAR=22;SRF=17;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11231;STB=0.546044;TYPE=snp;VARB=0.0191775;OID=.;OPOS=150525425;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:98:48:62:30:36:22:8:17:31:26:10:21:41 chr1 150531008 . T C 379.22 PASS AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000547973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.754;QD=36.9971;RBI=0.0399651;REFB=0;REVB=0.0399613;RO=0;SAF=21;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17587e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000675689;OID=.;OPOS=150531008;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:40:41:0:0:40:41:19:21:0:0:19:22:0:0 chr1 150531043 . GCCCCCCG GCCCCCG,GCCCCCCA 141.04 PASS AO=4,6;DP=32;FAO=6,14;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=1,7;FSAR=5,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.696433,-0.0307854;FXX=0.0908678;HRUN=6,1;LEN=1,1;MLLD=8.64149,42.927;QD=28.2083;RBI=0.699325,0.106243;REFB=0.0754998,-0.0302044;REVB=-0.0635326,0.101685;RO=0;SAF=0,1;SAR=4,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.578947,0;SSEP=0.525,0;SSSB=0,3.18042e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.188041,0.00850508;OID=.,.;OPOS=150531044,150531050;OREF=C,G;OALT=-,A;OMAPALT=GCCCCCG,GCCCCCCA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:4,6:13:6,14:20:0:1,7:5,7:0:0:17:0:0,1:4,5:0:0 chr1 150531170 . C T 459.52 PASS AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0261134;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.305;QD=38.2934;RBI=0.0265436;REFB=0;REVB=0.00475942;RO=0;SAF=5;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.77201e-05;OID=.;OPOS=150531170;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:48:48:0:0:48:48:43:5:0:0:43:5:0:0 chr1 150547096 . T C 377.2 PASS AO=88;DP=174;FAO=88;FDP=176;FR=.;FRO=88;FSAF=40;FSAR=48;FSRF=26;FSRR=62;FWDB=0.00299433;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=98.9426;QD=8.57263;RBI=0.0170536;REFB=-0.0194687;REVB=0.0167886;RO=86;SAF=40;SAR=48;SRF=25;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151391;STB=0.581378;TYPE=snp;VARB=0.0241329;OID=.;OPOS=150547096;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:176:86:88:88:88:48:40:25:61:48:40:26:62 chr1 150547747 . G A 411.3 PASS AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0225294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.498;QD=37.391;RBI=0.0357764;REFB=0;REVB=-0.0277917;RO=0;SAF=35;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.54187e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000568489;OID=.;OPOS=150547747;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:43:44:0:0:43:44:8:35:0:0:8:36:0:0 chr1 150548887 . C CCTAT 219.82 PASS AO=24;DP=30;FAO=26;FDP=29;FR=.;FRO=3;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.00725486;FXX=0.0333222;HRUN=2;LEN=4;MLLD=316.445;QD=30.3198;RBI=0.00743986;REFB=-0.0430433;REVB=-0.00164877;RO=3;SAF=8;SAR=16;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145412;STB=0.571372;TYPE=ins;VARB=0.000822226;OID=.;OPOS=150548888;OREF=-;OALT=CTAT;OMAPALT=CCTAT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:24:30:26:29:3:9:17:3:0:3:3:8:16:3:0 chr1 150597890 . G A 151.21 PASS AO=41;DP=94;FAO=41;FDP=96;FR=.;FRO=55;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=32;FWDB=-0.0336761;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=139.503;QD=6.30039;RBI=0.0362362;REFB=-0.00961171;REVB=-0.0133784;RO=53;SAF=18;SAR=23;SRF=21;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0438886;STB=0.512151;TYPE=snp;VARB=0.0137623;OID=.;OPOS=150597890;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:96:53:55:41:41:23:18:21:32:23:18:23:32 chr1 150771703 . T C 1883.67 PASS AO=211;DP=215;FAO=213;FDP=213;FR=.;FRO=0;FSAF=109;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.126323;FXX=0.0138882;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.528;QD=35.3742;RBI=0.126485;REFB=0;REVB=-0.00639335;RO=1;SAF=107;SAR=104;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00443163;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00117363;OID=.;OPOS=150771703;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:87:215:213:1:0:211:213:104:107:1:0:104:109:0:0 chr1 150779755 . C T 2581.1 PASS AO=284;DP=292;FAO=282;FDP=289;FR=.;FRO=7;FSAF=139;FSAR=143;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.0276508;FXX=0.0102736;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.6692;QD=35.7246;RBI=0.0508222;REFB=0.0202331;REVB=-0.0426419;RO=7;SAF=140;SAR=144;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101466;STB=0.505362;TYPE=snp;VARB=-0.00159963;OID=.;OPOS=150779755;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:292:289:7:7:284:282:144:140:5:2:143:139:5:2 chr1 150782797 . C T 181.77 PASS AO=51;DP=122;FAO=51;FDP=122;FR=.;FRO=71;FSAF=19;FSAR=32;FSRF=27;FSRR=44;FWDB=-0.0198641;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.6312;QD=5.95954;RBI=0.0327657;REFB=0.00251239;REVB=-0.0260578;RO=71;SAF=19;SAR=32;SRF=27;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0085353;STB=0.504799;TYPE=snp;VARB=-0.00413571;OID=.;OPOS=150782797;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:71:71:51:51:32:19:27:44:32:19:27:44 chr1 150937771 . T A 1273.23 PASS AO=288;DP=394;FAO=251;FDP=399;FR=.;FRO=148;FSAF=204;FSAR=47;FSRF=108;FSRR=40;FWDB=0.000492739;FXX=0.00249994;HRUN=5;LEN=1;MLLD=27.0202;QD=12.7642;RBI=0.0835914;REFB=-0.0689434;REVB=-0.08359;RO=90;SAF=237;SAR=51;SRF=61;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103269;STB=0.547571;TYPE=snp;VARB=0.0225109;OID=.;OPOS=150937771;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:394:399:90:148:288:251:51:237:61:29:47:204:108:40 chr1 150960350 . A C 130.01 PASS AO=43;DP=115;FAO=43;FDP=115;FR=.;FRO=72;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=44;FSRR=28;FWDB=-0.010826;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.573;QD=4.52207;RBI=0.0123341;REFB=-0.0175807;REVB=0.00590991;RO=72;SAF=27;SAR=16;SRF=44;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0196063;STB=0.504235;TYPE=snp;VARB=0.0332755;OID=.;OPOS=150960350;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:72:72:43:43:16:27:44:28:17:26:44:28 chr1 150969521 . C T 205.84 PASS AO=47;DP=96;FAO=48;FDP=96;FR=.;FRO=48;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=16;FSRR=32;FWDB=0.0136728;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.345;QD=8.57648;RBI=0.0193597;REFB=0.00918448;REVB=0.0137059;RO=49;SAF=19;SAR=28;SRF=17;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0554421;STB=0.54346;TYPE=snp;VARB=-0.00674375;OID=.;OPOS=150969521;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:49:48:47:48:28:19:17:32:28:20:16:32 chr1 150969567 . A G 894.76 PASS AO=92;DP=93;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00110845;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.959;QD=38.075;RBI=0.0268602;REFB=0;REVB=0.0268373;RO=0;SAF=23;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.29085e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.31017e-05;OID=.;OPOS=150969567;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:93:94:0:0:92:94:69:23:0:0:71:23:0:0 chr1 150969992 . T C 196.17 PASS AO=15;DP=24;FAO=21;FDP=21;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0684477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.439;QD=37.3654;RBI=0.0863042;REFB=0;REVB=0.0525673;RO=0;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000746623;OID=.;OPOS=150969992;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:20:21:0:0:15:21:10:5:0:0:12:9:0:0 chr1 150970577 . G T 948.54 PASS AO=89;DP=91;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0577249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.5238;QD=36.8366;RBI=0.139934;REFB=-0.04338;REVB=0.127473;RO=0;SAF=52;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00262482;OID=.;OPOS=150970577;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:91:103:0:0:89:103:37:52:0:0:44:59:0:0 chr1 150973013 . C T 293.28 PASS AO=64;DP=125;FAO=65;FDP=125;FR=.;FRO=60;FSAF=29;FSAR=36;FSRF=22;FSRR=38;FWDB=-0.00455513;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.246;QD=9.38499;RBI=0.00585124;REFB=-0.00948121;REVB=0.00367257;RO=60;SAF=29;SAR=35;SRF=22;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0774008;STB=0.538913;TYPE=snp;VARB=0.00958282;OID=.;OPOS=150973013;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:60:60:64:65:35:29:22:38:36:29:22:38 chr1 150975108 . T C 115.79 PASS AO=33;DP=85;FAO=33;FDP=82;FR=.;FRO=49;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=34;FWDB=0.0192252;FXX=0.03529;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.732;QD=5.64825;RBI=0.0192438;REFB=-0.00429218;REVB=0.000845902;RO=45;SAF=16;SAR=17;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156074;STB=0.607533;TYPE=snp;VARB=0.00908988;OID=.;OPOS=150975108;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:82:45:49:33:33:17:16:15:30:17:16:15:34 chr1 150995236 . G A 147.38 PASS AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00868694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.442;QD=36.8441;RBI=0.0136598;REFB=0;REVB=0.0105417;RO=0;SAF=10;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.93143e-05;OID=.;OPOS=150995236;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:16:0:0:16:16:6:10:0:0:6:10:0:0 chr1 151006539 . C A 583.76 PASS AO=60;DP=60;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00201199;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.6212;QD=37.6616;RBI=0.176248;REFB=0;REVB=0.176236;RO=0;SAF=28;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00180207;OID=.;OPOS=151006539;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:60:62:0:0:60:62:32:28:0:0:34:28:0:0 chr1 151015868 . G A 606.57 PASS AO=145;DP=305;FAO=152;FDP=316;FR=.;FRO=164;FSAF=81;FSAR=71;FSRF=89;FSRR=75;FWDB=0.00433903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.586;QD=7.67808;RBI=0.00480169;REFB=-0.0318727;REVB=-0.00205647;RO=144;SAF=74;SAR=71;SRF=71;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0157176;STB=0.505105;TYPE=snp;VARB=0.0314038;OID=.;OPOS=151015868;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:305:316:144:164:145:152:71:74:71:73:71:81:89:75 chr1 151019180 . A G 889.77 PASS AO=111;DP=122;FAO=110;FDP=122;FR=.;FRO=12;FSAF=28;FSAR=82;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.0240265;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=40.0766;QD=29.173;RBI=0.0319024;REFB=-0.142927;REVB=0.0209879;RO=8;SAF=28;SAR=83;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0608028;STB=0.520581;TYPE=snp;VARB=0.0134852;OID=.;OPOS=151019180;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:122:122:8:12:111:110:83:28:5:3:82:28:5:7 chr1 151040435 . G A 1916.94 PASS AO=187;DP=187;FAO=203;FDP=203;FR=.;FRO=0;FSAF=100;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0279573;FXX=0.00490172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.0514;QD=37.7722;RBI=0.107964;REFB=0;REVB=0.104281;RO=0;SAF=91;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84148e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00176035;OID=.;OPOS=151040435;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:91:187:203:0:0:187:203:96:91:0:0:103:100:0:0 chr1 151062957 . G A 343.84 PASS AO=80;DP=159;FAO=79;FDP=158;FR=.;FRO=79;FSAF=47;FSAR=32;FSRF=55;FSRR=24;FWDB=-0.0283368;FXX=0.00628891;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.2989;QD=8.70491;RBI=0.0416081;REFB=-0.0116267;REVB=-0.0304673;RO=77;SAF=47;SAR=33;SRF=55;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119797;STB=0.553583;TYPE=snp;VARB=0.0158896;OID=.;OPOS=151062957;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:158:77:79:80:79:33:47:55:22:32:47:55:24 chr1 151104950 . G A 67.16 PASS AO=13;DP=24;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=-0.0202287;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=186.365;QD=11.1931;RBI=0.0266749;REFB=-0.0122473;REVB=0.0173881;RO=11;SAF=3;SAR=10;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.471088;STB=0.768816;TYPE=snp;VARB=0.0188421;OID=.;OPOS=151104950;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:24:24:11:11:13:13:10:3:9:2:10:3:9:2 chr1 151108137 . T G 858.58 PASS AO=86;DP=87;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161275;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.9478;QD=37.3296;RBI=0.0418694;REFB=0;REVB=-0.0386387;RO=0;SAF=39;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00102467;OID=.;OPOS=151108137;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:87:92:0:0:86:92:47:39:0:0:48:44:0:0 chr1 151115017 . G A 62.47 PASS AO=10;DP=15;FAO=10;FDP=15;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.0134334;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=250.196;QD=16.6591;RBI=0.0134335;REFB=-0.0111933;REVB=-5.09501e-05;RO=5;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.262037;STB=0.646804;TYPE=snp;VARB=0.00593586;OID=.;OPOS=151115017;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:15:15:5:5:10:10:6:4:0:5:6:4:0:5 chr1 151140732 . G A 65.57 PASS AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=0.104252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.818;QD=9.36753;RBI=0.104255;REFB=-0.0124094;REVB=0.0007768;RO=14;SAF=2;SAR=12;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113979;STB=0.565935;TYPE=snp;VARB=0.0114913;OID=.;OPOS=151140732;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:28:28:14:14:14:14:12:2:3:11:12:2:3:11 chr1 151143016 . T C 200.86 PASS AO=46;DP=93;FAO=46;FDP=92;FR=.;FRO=46;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=0.0239597;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.3174;QD=8.73324;RBI=0.028325;REFB=0.010181;REVB=0.0151075;RO=46;SAF=25;SAR=21;SRF=24;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0197199;STB=0.510927;TYPE=snp;VARB=-0.00748757;OID=.;OPOS=151143016;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:92:46:46:46:46:21:25:24:22:21:25:24:22 chr1 151209063 . C T 1198.04 PASS AO=125;DP=127;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00528444;FXX=0.0157468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.793;QD=38.3372;RBI=0.00528456;REFB=0;REVB=3.47776e-05;RO=0;SAF=60;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.48709e-07;OID=.;OPOS=151209063;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:127:125:0:0:125:125:65:60:0:0:65:60:0:0 chr1 151239051 . T C 639.75 PASS AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0375033;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.912;QD=38.1939;RBI=0.0377932;REFB=0;REVB=-0.00467265;RO=0;SAF=18;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.48338e-05;OID=.;OPOS=151239051;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:67:67:0:0:67:67:49:18:0:0:49:18:0:0 chr1 151254041 . T C 183.18 PASS AO=45;DP=95;FAO=45;FDP=95;FR=.;FRO=50;FSAF=15;FSAR=30;FSRF=17;FSRR=33;FWDB=-0.0268312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.562;QD=7.71285;RBI=0.0308452;REFB=-0.0188698;REVB=0.0152155;RO=50;SAF=15;SAR=30;SRF=17;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00706652;STB=0.503935;TYPE=snp;VARB=0.0382356;OID=.;OPOS=151254041;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:50:50:45:45:30:15:17:33:30:15:17:33 chr1 151263476 . GCCCT GCCT,GCC 158.88 PASS AO=15,5;DP=30;FAO=24,0;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=13,0;FSAR=11,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0654665,-0.0187318;FXX=0.0768935;HRUN=3,3;LEN=1,2;MLLD=16.224,83.5757;QD=26.4793;RBI=0.123384,0.0429001;REFB=0,0;REVB=0.104584,0.0385946;RO=1;SAF=5,4;SAR=10,1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0.393258,0.393258;SSSB=-0.0826301,-0.0951258;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.0138105,0;OID=.,.;OPOS=151263477,151263479;OREF=C,CT;OALT=-,-;OMAPALT=GCCT,GCC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:15,5:24:24,0:24:0:13,0:11,0:0:0:14:1:5,4:10,1:1:0 chr1 151288172 . G A 45.81 PASS AO=16;DP=51;FAO=16;FDP=51;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=0.0869875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.059;QD=3.59279;RBI=0.0875989;REFB=-0.025095;REVB=-0.0103319;RO=35;SAF=9;SAR=7;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0782627;STB=0.546542;TYPE=snp;VARB=0.0345469;OID=.;OPOS=151288172;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:51:51:35:35:16:16:7:9:22:13:7:9:22:13 chr1 151288391 . A G 1353.39 PASS AO=142;DP=142;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.207;QD=38.1237;RBI=0.0155642;REFB=0;REVB=0.00140035;RO=0;SAF=81;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.26383e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.4518e-05;OID=.;OPOS=151288391;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:142:142:0:0:142:142:61:81:0:0:61:81:0:0 chr1 151316161 . G A 210.4 PASS AO=23;DP=24;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00540217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.665;QD=33.6634;RBI=0.0501692;REFB=0.0596518;REVB=0.0498775;RO=0;SAF=15;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.516116;TYPE=snp;VARB=-0.000555661;OID=.;OPOS=151316161;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:24:25:0:1:23:24:8:15:0:0:9:15:1:0 chr1 151372138 . G A 1139.61 PASS AO=118;DP=120;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00250918;FXX=0.0166653;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.801;QD=38.6309;RBI=0.0223298;REFB=0;REVB=0.0221883;RO=0;SAF=53;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.00074e-05;OID=.;OPOS=151372138;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:120:118:0:0:118:118:65:53:0:0:65:53:0:0 chr1 151377022 . G A 12.69 PASS AO=3;DP=12;FAO=3;FDP=12;FR=.;FRO=9;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=0;FXX=0.076864;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.964;QD=4.23047;RBI=0.018023;REFB=-0.021283;REVB=0.018023;RO=9;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0096588;OID=.;OPOS=151377022;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:12:12:9:9:3:3:3:0:0:9:3:0:0:9 chr1 151377023 . T A 17.4 PASS AO=3;DP=12;FAO=4;FDP=13;FR=.;FRO=9;FSAF=0;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.954;QD=5.35477;RBI=0.00816686;REFB=-0.00637661;REVB=0.00816686;RO=9;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00150032;OID=.;OPOS=151377023;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:12:13:9:9:3:4:3:0:0:9:4:0:0:9 chr1 151377024 . C A 17.05 PASS AO=3;DP=12;FAO=4;FDP=13;FR=.;FRO=9;FSAF=0;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.402;QD=5.24476;RBI=0.0327797;REFB=-0.0480434;REVB=0.0327797;RO=8;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00121119;OID=.;OPOS=151377024;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:12:13:8:9:3:4:3:0:0:8:4:0:0:9 chr1 151377026 . C A 13.43 PASS AO=3;DP=11;FAO=3;FDP=11;FR=.;FRO=8;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.446;QD=4.88263;RBI=7.31263e-05;REFB=0.0127395;REVB=7.31263e-05;RO=6;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00669713;OID=.;OPOS=151377026;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:11:11:6:8:3:3:3:0:0:6:3:0:0:8 chr1 151497243 . GC G 508.2 PASS AO=58;DP=90;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.163151;FXX=0.0229859;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.3651;QD=23.9153;RBI=0.38543;REFB=-0.000853315;REVB=0.349197;RO=20;SAF=17;SAR=41;SRF=3;SRR=17;SSEN=0.421687;SSEP=0;SSSB=0.085767;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0181622;OID=.;OPOS=151497244;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:58:87:85:85:0:26:59:0:0:42:20:17:41:3:17 chr1 151675414 . A G 240.02 PASS AO=33;DP=41;FAO=33;FDP=41;FR=.;FRO=8;FSAF=25;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.0404495;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.8905;QD=23.4161;RBI=0.0462011;REFB=-0.00743905;REVB=-0.0223244;RO=8;SAF=25;SAR=8;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217902;STB=0.618297;TYPE=snp;VARB=0.00738112;OID=.;OPOS=151675414;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:41:41:8:8:33:33:8:25:2:6:8:25:2:6 chr1 151675657 . AC A 41.21 PASS AO=7;DP=27;FAO=15;FDP=25;FR=.;FRO=10;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.332317;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=11.9146;QD=6.59281;RBI=0.353636;REFB=-0.0300029;REVB=0.120928;RO=12;SAF=7;SAR=0;SRF=6;SRR=6;SSEN=0.317919;SSEP=0;SSSB=0.759704;STB=0.60721;TYPE=del;VARB=0.0836731;OID=.;OPOS=151675658;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:7:25:15:25:10:11:4:5:5:24:12:7:0:6:6 chr1 151740666 . T C 1179.28 PASS AO=114;DP=116;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0835777;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.3161;QD=37.4375;RBI=0.0838049;REFB=0;REVB=0.00616722;RO=2;SAF=72;SAR=42;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0130069;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000836521;OID=.;OPOS=151740666;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:116:126:2:0:114:126:42:72:2:0:42:84:0:0 chr1 151746235 . C T 2060.81 PASS AO=217;DP=220;FAO=219;FDP=219;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=126;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0377797;FXX=0.00904936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.6017;QD=37.6404;RBI=0.0412017;REFB=-0.00722845;REVB=-0.0164402;RO=3;SAF=91;SAR=126;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154443;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000337467;OID=.;OPOS=151746235;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:220:219:3:0:217:219:126:91:3:0:126:93:0:0 chr1 151774095 . A T 70.14 PASS AO=12;DP=17;FAO=12;FDP=17;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7172;QD=16.5045;RBI=0.017933;REFB=-0.21701;REVB=0.017933;RO=5;SAF=0;SAR=12;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.177089;OID=.;OPOS=151774095;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:17:17:5:5:12:12:12:0:0:5:12:0:0:5 chr1 151803449 . G T 298.28 PASS AO=86;DP=190;FAO=86;FDP=202;FR=.;FRO=116;FSAF=33;FSAR=53;FSRF=61;FSRR=55;FWDB=-0.103193;FXX=0.0334912;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.2672;QD=5.90657;RBI=0.113062;REFB=-0.0472094;REVB=-0.0461973;RO=97;SAF=33;SAR=53;SRF=47;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.099388;STB=0.582943;TYPE=snp;VARB=0.0728255;OID=.;OPOS=151803449;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:202:97:116:86:86:53:33:47:50:53:33:61:55 chr1 151814234 . A G 959.37 PASS AO=101;DP=102;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0248203;FXX=0.00980296;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.321;QD=37.9948;RBI=0.0541962;REFB=0;REVB=0.0481786;RO=0;SAF=51;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.10484e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.25399e-05;OID=.;OPOS=151814234;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:102:101:0:0:101:101:50:51:0:0:50:51:0:0 chr1 151820298 . G C 918.74 PASS AO=97;DP=98;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0279533;FXX=0.0202;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.3618;QD=37.886;RBI=0.0664122;REFB=-0.0983365;REVB=0.0602428;RO=1;SAF=49;SAR=48;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00977841;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00159417;OID=.;OPOS=151820298;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:98:97:1:0:97:97:48:49:0:1:48:49:0:0 chr1 151820324 . T C 48.06 PASS AO=18;DP=80;FAO=22;FDP=84;FR=.;FRO=62;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=30;FSRR=32;FWDB=0.0108284;FXX=0.0561735;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.2042;QD=2.28862;RBI=0.0338989;REFB=-0.0219354;REVB=-0.0321229;RO=62;SAF=6;SAR=12;SRF=30;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19266;STB=0.55587;TYPE=snp;VARB=0.117264;OID=.;OPOS=151820324;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:80:84:62:62:18:22:12:6:30:32:13:9:30:32 chr1 151825991 . G T 103.79 PASS AO=28;DP=67;FAO=28;FDP=67;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=-0.00678456;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.427;QD=6.19662;RBI=0.0138055;REFB=-0.014344;REVB=0.0120233;RO=35;SAF=14;SAR=14;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140354;STB=0.522372;TYPE=snp;VARB=0.0162738;OID=.;OPOS=151825991;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:35:39:28:28:14:14:18:17:14:14:18:21 chr1 151845569 . A G 940.79 PASS AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249662;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.874;QD=38.3995;RBI=0.0422203;REFB=0;REVB=-0.0340477;RO=0;SAF=92;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.23708e-05;OID=.;OPOS=151845569;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:98:98:0:0:98:98:6:92:0:0:6:92:0:0 chr1 151845650 . G C 156.32 PASS AO=34;DP=66;FAO=34;FDP=66;FR=.;FRO=32;FSAF=29;FSAR=5;FSRF=28;FSRR=4;FWDB=0.0753453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.5068;QD=9.47378;RBI=0.080899;REFB=-0.00864506;REVB=0.0294573;RO=32;SAF=29;SAR=5;SRF=28;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0396602;STB=0.521965;TYPE=snp;VARB=0.0107814;OID=.;OPOS=151845650;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:32:32:34:34:5:29:28:4:5:29:28:4 chr1 151862661 . G A 35.57 PASS AO=9;DP=24;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.036834;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.6304;QD=5.9282;RBI=0.0476035;REFB=0.0123244;REVB=-0.0301554;RO=15;SAF=6;SAR=3;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0750523;STB=0.545351;TYPE=snp;VARB=-0.0453917;OID=.;OPOS=151862661;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:24:24:15:15:9:9:3:6:9:6:3:6:9:6 chr1 151867560 . G A 2054.93 PASS AO=214;DP=214;FAO=215;FDP=215;FR=.;FRO=0;FSAF=106;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00317515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.382;QD=38.2313;RBI=0.00331449;REFB=0;REVB=0.000950941;RO=0;SAF=106;SAR=108;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.70016e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.17266e-05;OID=.;OPOS=151867560;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:97:214:215:0:0:214:215:108:106:0:0:109:106:0:0 chr1 152079989 . T G 119.45 PASS AO=25;DP=48;FAO=25;FDP=48;FR=.;FRO=23;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.00545869;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=179.077;QD=9.95415;RBI=0.0234165;REFB=-0.0305607;REVB=-0.0227714;RO=23;SAF=16;SAR=9;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0287996;STB=0.516116;TYPE=snp;VARB=0.0361064;OID=.;OPOS=152079989;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:23:23:25:25:9:16:14:9:9:16:14:9 chr1 152081921 . G C 194.94 PASS AO=44;DP=93;FAO=46;FDP=95;FR=.;FRO=49;FSAF=31;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=28;FWDB=-0.00802009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.8079;QD=8.20789;RBI=0.0198442;REFB=-0.0502225;REVB=0.0181513;RO=49;SAF=30;SAR=14;SRF=21;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.247499;STB=0.630798;TYPE=snp;VARB=0.0462743;OID=.;OPOS=152081921;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:95:49:49:44:46:14:30:21:28:15:31:21:28 chr1 152085505 . A C 1619.17 PASS AO=171;DP=173;FAO=172;FDP=172;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173507;FXX=0.00578001;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.751;QD=37.6551;RBI=0.0297344;REFB=-0.0366279;REVB=0.0241472;RO=1;SAF=94;SAR=77;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00614128;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000224274;OID=.;OPOS=152085505;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:173:172:1:0:171:172:77:94:0:1:77:95:0:0 chr1 152185762 . C G 735.96 PASS AO=75;DP=75;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0514315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.2305;QD=38.2315;RBI=0.0530604;REFB=0;REVB=0.0130464;RO=0;SAF=34;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000580449;OID=.;OPOS=152185762;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:75:77:0:0:75:77:41:34:0:0:43:34:0:0 chr1 152185768 . T G 547.64 PASS AO=55;DP=55;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0284191;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.022;QD=38.4305;RBI=0.0285603;REFB=0;REVB=0.00283659;RO=0;SAF=25;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000108898;OID=.;OPOS=152185768;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:55:57:0:0:55:57:30:25:0:0:32:25:0:0 chr1 152185774 . A G 455.89 PASS AO=47;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00145892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.309;QD=37.9904;RBI=0.00764837;REFB=0;REVB=-0.00750794;RO=0;SAF=20;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.67931e-06;OID=.;OPOS=152185774;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:47:48:0:0:47:48:27:20:0:0:28:20:0:0 chr1 152185780 . G A 351.11 PASS AO=36;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0537324;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.849;QD=37.9582;RBI=0.0538069;REFB=0;REVB=-0.00282977;RO=0;SAF=11;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58193e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000209469;OID=.;OPOS=152185780;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:36:37:0:0:36:37:25:11:0:0:26:11:0:0 chr1 152185790 . T C 201.65 PASS AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=8.50199e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.148;QD=36.6634;RBI=0.0698525;REFB=0;REVB=0.0698525;RO=0;SAF=6;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000877429;OID=.;OPOS=152185790;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:21:22:0:0:21:22:15:6:0:0:16:6:0:0 chr1 152185792 . G A 136.31 PASS AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0389068;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.8748;QD=36.3482;RBI=0.0393046;REFB=0;REVB=0.00557751;RO=0;SAF=6;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000917323;OID=.;OPOS=152185792;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:15:0:0:15:15:9:6:0:0:9:6:0:0 chr1 152185796 . A G 107.71 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0465349;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.9707;QD=35.9047;RBI=0.0870859;REFB=0;REVB=-0.0736102;RO=0;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00155188;OID=.;OPOS=152185796;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:6:6:0:0:6:6:0:0 chr1 152186766 . G A 40.67 PASS AO=5;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00146541;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.2745;QD=23.2407;RBI=0.156251;REFB=0.0231714;REVB=0.156244;RO=2;SAF=1;SAR=4;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190062;STB=0.666027;TYPE=snp;VARB=0.016641;OID=.;OPOS=152186766;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:7:7:2:1:5:6:4:1:1:1:5:1:1:0 chr1 152188109 . T A 26.29 PASS AO=29;DP=171;FAO=31;FDP=175;FR=.;FRO=144;FSAF=4;FSAR=27;FSRF=72;FSRR=72;FWDB=-0.0118869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.6962;QD=0.600805;RBI=0.0577734;REFB=-0.00707986;REVB=-0.0565373;RO=141;SAF=4;SAR=25;SRF=72;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.508987;STB=0.837998;TYPE=snp;VARB=0.0633042;OID=.;OPOS=152188109;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:171:175:141:144:29:31:25:4:72:69:27:4:72:72 chr1 152188118 . C T 25.17 PASS AO=32;DP=182;FAO=32;FDP=185;FR=.;FRO=153;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=69;FSRR=84;FWDB=-0.00398896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.63;QD=0.544221;RBI=0.0166278;REFB=-0.0142322;REVB=-0.0161423;RO=150;SAF=13;SAR=19;SRF=69;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0701623;STB=0.537774;TYPE=snp;VARB=0.0616225;OID=.;OPOS=152188118;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:182:185:150:153:32:32:19:13:69:81:19:13:69:84 chr1 152191033 . A G 271.41 PASS AO=44;DP=162;FAO=69;FDP=151;FR=.;FRO=82;FSAF=32;FSAR=37;FSRF=33;FSRR=49;FWDB=0.0378898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.844;QD=7.18973;RBI=0.038881;REFB=-0.00736269;REVB=-0.00872341;RO=48;SAF=9;SAR=35;SRF=5;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161769;STB=0.533634;TYPE=snp;VARB=0.0158807;OID=.;OPOS=152191033;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:151:48:82:44:69:35:9:5:43:37:32:33:49 chr1 152191709 . C G 1308.29 PASS AO=138;DP=139;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00182468;FXX=0.00719373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.6175;QD=37.9215;RBI=0.00205377;REFB=-0.0495061;REVB=0.000942624;RO=0;SAF=63;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000130045;OID=.;OPOS=152191709;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:139:138:0:0:138:138:75:63:0:0:75:63:0:0 chr1 152191879 . G A 1105.92 PASS AO=117;DP=119;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00542417;FXX=0.00840265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.025;QD=37.4888;RBI=0.0272508;REFB=-0.0854782;REVB=-0.0267056;RO=1;SAF=49;SAR=68;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00959372;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000212807;OID=.;OPOS=152191879;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:119:118:1:0:117:118:68:49:1:0:69:49:0:0 chr1 152192098 . A G 17.35 PASS AO=21;DP=113;FAO=20;FDP=119;FR=.;FRO=99;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=52;FSRR=47;FWDB=-0.0339618;FXX=0.00833264;HRUN=4;LEN=1;MLLD=157.108;QD=0.583328;RBI=0.0386491;REFB=-0.00300383;REVB=-0.0184485;RO=91;SAF=17;SAR=4;SRF=48;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.39027;STB=0.749732;TYPE=snp;VARB=0.0111156;OID=.;OPOS=152192098;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:113:119:91:99:21:20:4:17:48:43:4:16:52:47 chr1 152192099 . A G 17.34 PASS AO=21;DP=121;FAO=20;FDP=119;FR=.;FRO=99;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=53;FSRR=46;FWDB=-0.0315599;FXX=0.00833264;HRUN=4;LEN=1;MLLD=239.476;QD=0.582749;RBI=0.034595;REFB=0.00127593;REVB=-0.01417;RO=99;SAF=17;SAR=4;SRF=53;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.381099;STB=0.743232;TYPE=snp;VARB=-0.0593082;OID=.;OPOS=152192099;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:121:119:99:99:21:20:4:17:53:46:4:16:53:46 chr1 152192114 . C T 620.11 PASS AO=89;DP=132;FAO=99;FDP=140;FR=.;FRO=41;FSAF=54;FSAR=45;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=0.0192119;FXX=0.0070917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.784;QD=17.7173;RBI=0.0308878;REFB=-0.0073292;REVB=-0.0241859;RO=38;SAF=45;SAR=44;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0115358;STB=0.504586;TYPE=snp;VARB=0.00285448;OID=.;OPOS=152192114;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:132:140:38:41:89:99:44:45:20:18:45:54:23:18 chr1 152192163 . G T 158.15 PASS AO=67;DP=208;FAO=66;FDP=208;FR=.;FRO=142;FSAF=48;FSAR=18;FSRF=75;FSRR=67;FWDB=0.0227908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.0472;QD=3.04138;RBI=0.0228071;REFB=-0.0199973;REVB=-0.000860502;RO=140;SAF=49;SAR=18;SRF=75;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.250817;STB=0.648189;TYPE=snp;VARB=0.0505623;OID=.;OPOS=152192163;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:208:140:142:67:66:18:49:75:65:18:48:75:67 chr1 152192219 . G C 89.42 PASS AO=66;DP=279;FAO=65;FDP=280;FR=.;FRO=215;FSAF=46;FSAR=19;FSRF=108;FSRR=107;FWDB=0.00154183;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.265;QD=1.2774;RBI=0.00506963;REFB=-0.00898562;REVB=-0.00482948;RO=212;SAF=47;SAR=19;SRF=105;SRR=107;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.284503;STB=0.664474;TYPE=snp;VARB=0.035941;OID=.;OPOS=152192219;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:279:280:212:215:66:65:19:47:105:107:19:46:108:107 chr1 152192259 . T C 24.85 PASS AO=52;DP=328;FAO=51;FDP=327;FR=.;FRO=276;FSAF=37;FSAR=14;FSRF=122;FSRR=154;FWDB=-0.0137222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.05;QD=0.30393;RBI=0.0213387;REFB=-0.00618925;REVB=0.0163414;RO=275;SAF=38;SAR=14;SRF=122;SRR=153;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.368271;STB=0.736227;TYPE=snp;VARB=0.0313531;OID=.;OPOS=152192259;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:328:327:275:276:52:51:14:38:122:153:14:37:122:154 chr1 152192293 . C T 2829.3 PASS AO=296;DP=299;FAO=298;FDP=298;FR=.;FRO=0;FSAF=125;FSAR=173;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.036349;FXX=0.00666644;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.703;QD=37.9771;RBI=0.0577081;REFB=-0.0264322;REVB=0.0448215;RO=1;SAF=124;SAR=172;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00383065;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.69039e-05;OID=.;OPOS=152192293;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:299:298:1:0:296:298:172:124:1:0:173:125:0:0 chr1 152192395 . G A 519.46 PASS AO=115;DP=221;FAO=115;FDP=220;FR=.;FRO=105;FSAF=53;FSAR=62;FSRF=51;FSRR=54;FWDB=0.0201234;FXX=0.00452468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.501;QD=9.44472;RBI=0.0356694;REFB=-0.0164228;REVB=0.0294508;RO=102;SAF=53;SAR=62;SRF=51;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0337646;STB=0.511906;TYPE=snp;VARB=0.0159196;OID=.;OPOS=152192395;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:220:102:105:115:115:62:53:51:51:62:53:51:54 chr1 152192631 . C T 1428.98 PASS AO=153;DP=155;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0385445;FXX=0.0129024;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.762;QD=37.359;RBI=0.0692053;REFB=-0.0751955;REVB=0.0574777;RO=0;SAF=51;SAR=102;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000484411;OID=.;OPOS=152192631;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:155:153:0:0:153:153:102:51:0:0:102:51:0:0 chr1 152192687 . T C 1493.56 PASS AO=147;DP=147;FAO=156;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00523744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.173;QD=38.2965;RBI=0.0300159;REFB=0;REVB=0.0295555;RO=0;SAF=50;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000100008;OID=.;OPOS=152192687;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:147:156:0:0:147:156:97:50:0:0:102:54:0:0 chr1 152192825 . C T 450.98 PASS AO=50;DP=52;FAO=51;FDP=53;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.039736;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.0001;QD=34.0363;RBI=0.0424966;REFB=-0.0590152;REVB=-0.0150669;RO=1;SAF=21;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0159576;STB=0.516123;TYPE=snp;VARB=0.000155063;OID=.;OPOS=152192825;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:52:53:1:2:50:51:29:21:0:1:30:21:0:2 chr1 152192978 . T C 1418.42 PASS AO=155;DP=160;FAO=156;FDP=160;FR=.;FRO=4;FSAF=77;FSAR=79;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0263144;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.747;QD=35.4606;RBI=0.0269236;REFB=-0.0415924;REVB=0.00569513;RO=5;SAF=77;SAR=78;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0180103;STB=0.512657;TYPE=snp;VARB=0.000693996;OID=.;OPOS=152192978;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:160:160:5:4:155:156:78:77:4:1:79:77:4:0 chr1 152193052 . A G 1432.76 PASS AO=150;DP=151;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0284207;FXX=0.00662208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.4431;QD=38.2069;RBI=0.0382876;REFB=0;REVB=0.0256554;RO=0;SAF=90;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000201772;OID=.;OPOS=152193052;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:151:150:0:0:150:150:60:90:0:0:60:90:0:0 chr1 152193121 . G T 1076.1 PASS AO=113;DP=114;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011536;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.749;QD=38.0921;RBI=0.0598825;REFB=0;REVB=0.0587608;RO=0;SAF=62;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31804e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.07184e-05;OID=.;OPOS=152193121;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:114:113:0:0:113:113:51:62:0:0:51:62:0:0 chr1 152193286 . G T 828.12 PASS AO=86;DP=86;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00227235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.6;QD=38.0744;RBI=0.0121539;REFB=0;REVB=0.0119396;RO=0;SAF=49;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.43937e-05;OID=.;OPOS=152193286;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:86:87:0:0:86:87:37:49:0:0:37:50:0:0 chr1 152193291 . G T 830.08 PASS AO=84;DP=85;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0716784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.2475;QD=38.1644;RBI=0.0919249;REFB=0;REVB=0.0575534;RO=0;SAF=46;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.981e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000505314;OID=.;OPOS=152193291;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:85:87:0:0:84:87:38:46:0:0:38:49:0:0 chr1 152193544 . A G 1535.29 PASS AO=156;DP=156;FAO=160;FDP=160;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0215526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.9899;QD=38.3822;RBI=0.0294962;REFB=0;REVB=-0.0201373;RO=0;SAF=86;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00809611;OID=.;OPOS=152193544;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:156:160:0:0:156:160:70:86:0:0:74:86:0:0 chr1 152193547 . G A 1467.53 PASS AO=152;DP=155;FAO=156;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0178362;FXX=0.0188667;HRUN=3;LEN=1;MLLD=232.188;QD=37.629;RBI=0.0318341;REFB=0.00598957;REVB=0.0263682;RO=1;SAF=83;SAR=69;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00569688;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.11321e-05;OID=.;OPOS=152193547;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:155:156:1:0:152:156:69:83:1:0:73:83:0:0 chr1 152193851 . C T 926.81 PASS AO=98;DP=99;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.883;QD=37.8292;RBI=0.00664168;REFB=0.0735744;REVB=0.00664168;RO=1;SAF=0;SAR=98;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.2653e-05;OID=.;OPOS=152193851;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:99:98:1:0:98:98:98:0:0:1:98:0:0:0 chr1 152276671 . C A 500.27 PASS AO=101;DP=189;FAO=106;FDP=193;FR=.;FRO=87;FSAF=77;FSAR=29;FSRF=48;FSRR=39;FWDB=0.0031738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.999;QD=10.3684;RBI=0.0379085;REFB=-0.0221941;REVB=0.0377754;RO=84;SAF=72;SAR=29;SRF=45;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16548;STB=0.590886;TYPE=snp;VARB=0.015584;OID=.;OPOS=152276671;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:193:84:87:101:106:29:72:45:39:29:77:48:39 chr1 152323132 . G T 376.64 PASS AO=103;DP=257;FAO=109;FDP=260;FR=.;FRO=151;FSAF=67;FSAR=42;FSRF=66;FSRR=85;FWDB=-0.00335;FXX=0.00383127;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.371;QD=5.79438;RBI=0.0280796;REFB=-0.0226669;REVB=-0.027879;RO=146;SAF=64;SAR=39;SRF=63;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200047;STB=0.60367;TYPE=snp;VARB=0.0274183;OID=.;OPOS=152323132;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:257:260:146:151:103:109:39:64:63:83:42:67:66:85 chr1 152325732 . G A 623.99 PASS AO=132;DP=267;FAO=143;FDP=278;FR=.;FRO=135;FSAF=68;FSAR=75;FSRF=67;FSRR=68;FWDB=-0.00586521;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.196;QD=8.97824;RBI=0.00588014;REFB=-0.00667017;REVB=-0.000418764;RO=132;SAF=62;SAR=70;SRF=64;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0138475;STB=0.5101;TYPE=snp;VARB=0.00488922;OID=.;OPOS=152325732;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:267:278:132:135:132:143:70:62:64:68:75:68:67:68 chr1 152327469 . C T 26.8 PASS AO=20;DP=104;FAO=21;FDP=105;FR=.;FRO=84;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=27;FSRR=57;FWDB=0.000702284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.336;QD=1.02088;RBI=0.00577727;REFB=-0.0315028;REVB=-0.00573443;RO=84;SAF=7;SAR=13;SRF=27;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0404879;STB=0.551677;TYPE=snp;VARB=0.0719351;OID=.;OPOS=152327469;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:104:105:84:84:20:21:13:7:27:57:13:8:27:57 chr1 152328411 . A G 41.86 PASS AO=19;DP=71;FAO=19;FDP=71;FR=.;FRO=52;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=30;FSRR=22;FWDB=-0.00861486;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.553;QD=2.35854;RBI=0.0252294;REFB=-0.0120401;REVB=-0.023713;RO=50;SAF=9;SAR=10;SRF=28;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103369;STB=0.575143;TYPE=snp;VARB=0.0508395;OID=.;OPOS=152328411;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:71:71:50:52:19:19:10:9:28:22:10:9:30:22 chr1 152329435 . C T 246.49 PASS AO=57;DP=121;FAO=60;FDP=125;FR=.;FRO=65;FSAF=35;FSAR=25;FSRF=38;FSRR=27;FWDB=-0.00759479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.004;QD=7.88782;RBI=0.0133395;REFB=-0.0309368;REVB=-0.0109664;RO=64;SAF=32;SAR=25;SRF=38;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0314282;STB=0.500686;TYPE=snp;VARB=0.0253446;OID=.;OPOS=152329435;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:125:64:65:57:60:25:32:38:26:25:35:38:27 chr1 152331240 . G A 282.39 PASS AO=88;DP=230;FAO=90;FDP=232;FR=.;FRO=142;FSAF=37;FSAR=53;FSRF=54;FSRR=88;FWDB=-0.0128997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.837;QD=4.86881;RBI=0.0155341;REFB=-0.00415848;REVB=-0.0086549;RO=139;SAF=36;SAR=52;SRF=54;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0232859;STB=0.519617;TYPE=snp;VARB=0.00582721;OID=.;OPOS=152331240;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:230:232:139:142:88:90:52:36:54:85:53:37:54:88 chr1 152382120 . C T 155.99 PASS AO=34;DP=66;FAO=34;FDP=66;FR=.;FRO=32;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.0279552;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.7288;QD=9.45364;RBI=0.0487979;REFB=-0.0144509;REVB=-0.0399967;RO=31;SAF=23;SAR=11;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147693;STB=0.591373;TYPE=snp;VARB=0.017206;OID=.;OPOS=152382120;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:31:32:34:34:11:23:16:15:11:23:16:16 chr1 152484505 . C T 53.82 PASS AO=14;DP=35;FAO=14;FDP=35;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=18;FWDB=0.046285;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=295.862;QD=6.15137;RBI=0.0468485;REFB=-0.0235252;REVB=0.00724461;RO=21;SAF=3;SAR=11;SRF=3;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118892;STB=0.568538;TYPE=snp;VARB=0.0419192;OID=.;OPOS=152484505;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:35:35:21:21:14:14:11:3:3:18:11:3:3:18 chr1 152488063 . C T 27.79 PASS AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=11;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.021786;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.0546;QD=10.106;RBI=0.0388055;REFB=-0.0151901;REVB=0.0321129;RO=6;SAF=3;SAR=2;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231195;STB=0.639509;TYPE=snp;VARB=0.0284364;OID=.;OPOS=152488063;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:11:11:6:6:5:5:2:3:5:1:2:3:5:1 chr1 152488428 . T C 171.37 PASS AO=51;DP=125;FAO=51;FDP=126;FR=.;FRO=75;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=32;FSRR=43;FWDB=-0.00696797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.3486;QD=5.44021;RBI=0.0360899;REFB=-0.00668775;REVB=0.0354108;RO=74;SAF=23;SAR=28;SRF=31;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0341469;STB=0.514649;TYPE=snp;VARB=0.0181622;OID=.;OPOS=152488428;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:126:74:75:51:51:28:23:31:43:28:23:32:43 chr1 152692074 . G C 232.08 PASS AO=55;DP=108;FAO=54;FDP=108;FR=.;FRO=54;FSAF=19;FSAR=35;FSRF=15;FSRR=39;FWDB=-0.0218575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.289;QD=8.59571;RBI=0.0221209;REFB=-0.018488;REVB=0.00340345;RO=52;SAF=20;SAR=35;SRF=13;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112298;STB=0.541588;TYPE=snp;VARB=0.0236307;OID=.;OPOS=152692074;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:52:54:55:54:35:20:13:39:35:19:15:39 chr1 152692472 . A C 138.91 PASS AO=27;DP=48;FAO=27;FDP=48;FR=.;FRO=21;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.00201555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.739;QD=11.5756;RBI=0.00631567;REFB=-0.017177;REVB=-0.00598542;RO=21;SAF=19;SAR=8;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157163;STB=0.587561;TYPE=snp;VARB=0.0125663;OID=.;OPOS=152692472;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:48:48:21:21:27:27:8:19:11:10:8:19:11:10 chr1 152692588 . A G 291.08 PASS AO=50;DP=75;FAO=50;FDP=77;FR=.;FRO=27;FSAF=32;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.00306745;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.8055;QD=15.121;RBI=0.0652666;REFB=-0.0322189;REVB=-0.0651945;RO=24;SAF=32;SAR=18;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138753;STB=0.571399;TYPE=snp;VARB=0.0214637;OID=.;OPOS=152692588;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:75:77:24:27:50:50:18:32:10:14:18:32:12:15 chr1 152692781 . G T 156.4 PASS AO=35;DP=91;FAO=42;FDP=98;FR=.;FRO=56;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=32;FWDB=-0.0124071;FXX=0.019998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.235;QD=6.38364;RBI=0.012409;REFB=0.00232224;REVB=0.00021467;RO=43;SAF=10;SAR=25;SRF=14;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0467051;STB=0.528442;TYPE=snp;VARB=-0.00343153;OID=.;OPOS=152692781;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:98:43:56:35:42:25:10:14:29:26:16:24:32 chr1 152692862 . G C 79.69 PASS AO=23;DP=60;FAO=23;FDP=60;FR=.;FRO=37;FSAF=2;FSAR=21;FSRF=9;FSRR=28;FWDB=0.00212456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.86;QD=5.31271;RBI=0.00391594;REFB=-0.00818875;REVB=-0.00328951;RO=31;SAF=2;SAR=21;SRF=6;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24971;STB=0.701907;TYPE=snp;VARB=0.00726227;OID=.;OPOS=152692862;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:60:60:31:37:23:23:21:2:6:25:21:2:9:28 chr1 152732436 . G C 324.73 PASS AO=60;DP=101;FAO=62;FDP=103;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=48;FSRF=14;FSRR=27;FWDB=-0.00972165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.604;QD=12.6108;RBI=0.0110949;REFB=-0.0526885;REVB=0.00534658;RO=41;SAF=14;SAR=46;SRF=14;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105193;STB=0.561383;TYPE=snp;VARB=0.0241624;OID=.;OPOS=152732436;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:103:41:41:60:62:46:14:14:27:48:14:14:27 chr1 152733301 . T A 65.24 PASS AO=15;DP=36;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0109509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.161;QD=7.05295;RBI=0.0523912;REFB=-0.0115278;REVB=0.0512339;RO=21;SAF=7;SAR=8;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.057395;STB=0.549091;TYPE=snp;VARB=0.0138283;OID=.;OPOS=152733301;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:36:37:21:21:15:16:8:7:11:10:9:7:11:10 chr1 152734187 . G A 256.77 PASS AO=58;DP=115;FAO=58;FDP=114;FR=.;FRO=56;FSAF=14;FSAR=44;FSRF=5;FSRR=51;FWDB=-0.00625542;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.664;QD=9.00948;RBI=0.00910234;REFB=-0.0277539;REVB=-0.00661229;RO=56;SAF=14;SAR=44;SRF=5;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209691;STB=0.614002;TYPE=snp;VARB=0.0267342;OID=.;OPOS=152734187;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:114:56:56:58:58:44:14:5:51:44:14:5:51 chr1 152770828 . A G 90.07 PASS AO=38;DP=125;FAO=38;FDP=125;FR=.;FRO=87;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=39;FSRR=48;FWDB=-0.0100608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.69;QD=2.88235;RBI=0.0234857;REFB=-0.0195291;REVB=-0.0212216;RO=85;SAF=14;SAR=24;SRF=39;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110673;STB=0.557864;TYPE=snp;VARB=0.0574699;OID=.;OPOS=152770828;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:125:125:85:87:38:38:24:14:39:46:24:14:39:48 chr1 152771293 . A G 433.26 PASS AO=97;DP=190;FAO=98;FDP=190;FR=.;FRO=92;FSAF=52;FSAR=46;FSRF=55;FSRR=37;FWDB=0.0348803;FXX=0.00523533;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.949;QD=9.12121;RBI=0.0419909;REFB=-0.0118929;REVB=0.0233796;RO=90;SAF=52;SAR=45;SRF=55;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0666455;STB=0.532793;TYPE=snp;VARB=0.0105404;OID=.;OPOS=152771293;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:190:90:92:97:98:45:52:55:35:46:52:55:37 chr1 152777868 . A G 52.2 PASS AO=9;DP=18;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=10;FSAR=0;FSRF=9;FSRR=0;FWDB=0.0108642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=43.2521;QD=10.989;RBI=0.0108642;REFB=-0.041697;REVB=0;RO=8;SAF=9;SAR=0;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.126958;OID=.;OPOS=152777868;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:18:19:8:9:9:10:0:9:8:0:0:10:9:0 chr1 152777964 . G A 61.32 PASS AO=15;DP=39;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.011021;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.675;QD=6.13235;RBI=0.0662469;REFB=0.00151095;REVB=-0.0653237;RO=24;SAF=13;SAR=2;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.40384;STB=0.675753;TYPE=snp;VARB=-0.0112452;OID=.;OPOS=152777964;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:39:40:24:24:15:16:2:13:14:10:3:13:14:10 chr1 152883055 . GA G 11.34 PASS AO=3;DP=15;FAO=3;FDP=14;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=0;FWDB=-0.0431306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.8669;QD=3.23933;RBI=0.0529004;REFB=-0.0683628;REVB=-0.0306302;RO=11;SAF=3;SAR=0;SRF=11;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.865739;TYPE=del;VARB=0.0837654;OID=.;OPOS=152883056;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:3:15:3:14:11:2:1:11:0:11:11:3:0:11:0 chr1 152883076 . A AG 42.37 PASS AO=2;DP=8;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00823204;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=30.3665;QD=21.1848;RBI=0.0591634;REFB=-0.138162;REVB=0.0585879;RO=6;SAF=2;SAR=0;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.524163;STB=0.538356;TYPE=ins;VARB=0.131479;OID=.;OPOS=152883077;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:2:8:7:8:1:6:1:1:0:7:6:2:0:5:1 chr1 152883077 . C G 33.03 PASS AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.191356;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.9253;QD=16.5136;RBI=0.197809;REFB=-0.238933;REVB=0.0501139;RO=3;SAF=4;SAR=1;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23409;STB=0.635921;TYPE=snp;VARB=0.0967367;OID=.;OPOS=152883077;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:8:8:3:3:5:5:1:4:3:0:1:4:3:0 chr1 152883767 . A AG 23.16 PASS AO=4;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=90.5777;QD=9.2628;RBI=0.0147376;REFB=-0.0200292;REVB=-0.0147376;RO=6;SAF=0;SAR=4;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.171533;OID=.;OPOS=152883768;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:4:10:5:10:5:0:5:0:5:21:6:0:4:0:6 chr1 152957887 . G A 103.56 PASS AO=18;DP=30;FAO=18;FDP=30;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=15;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.0305816;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.744;QD=13.8074;RBI=0.0362135;REFB=-0.0177314;REVB=0.0193954;RO=12;SAF=3;SAR=15;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0985911;STB=0.55549;TYPE=snp;VARB=0.0058544;OID=.;OPOS=152957887;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:30:30:12:12:18:18:15:3:3:9:15:3:3:9 chr1 152958238 . A G 257.39 PASS AO=89;DP=224;FAO=85;FDP=225;FR=.;FRO=140;FSAF=29;FSAR=56;FSRF=77;FSRR=63;FWDB=-0.0262908;FXX=0.00442458;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.8611;QD=4.57579;RBI=0.0412989;REFB=-0.000366259;REVB=-0.0318496;RO=133;SAF=33;SAR=56;SRF=71;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176671;STB=0.632332;TYPE=snp;VARB=0.00095105;OID=.;OPOS=152958238;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:224:225:133:140:89:85:56:33:71:62:56:29:77:63 chr1 152958267 . T C 291.22 PASS AO=80;DP=184;FAO=80;FDP=184;FR=.;FRO=104;FSAF=28;FSAR=52;FSRF=51;FSRR=53;FWDB=-0.0607894;FXX=0.00540511;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.7075;QD=6.33086;RBI=0.0764899;REFB=0.00539785;REVB=-0.0464259;RO=104;SAF=28;SAR=52;SRF=51;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148301;STB=0.582839;TYPE=snp;VARB=-0.00832978;OID=.;OPOS=152958267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:184:104:104:80:80:52:28:51:53:52:28:51:53 chr1 152975495 . G A 153.64 PASS AO=49;DP=132;FAO=50;FDP=133;FR=.;FRO=83;FSAF=16;FSAR=34;FSRF=50;FSRR=33;FWDB=-0.0250702;FXX=0.0148137;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.4881;QD=4.6207;RBI=0.0271069;REFB=-0.03598;REVB=0.0103088;RO=83;SAF=18;SAR=31;SRF=50;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.257724;STB=0.676648;TYPE=snp;VARB=0.027964;OID=.;OPOS=152975495;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:133:83:83:49:50:31:18:50:33:34:16:50:33 chr1 152975715 . C T 26.14 PASS AO=8;DP=28;FAO=9;FDP=30;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=16;FWDB=0.0140273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.179;QD=3.48579;RBI=0.0143979;REFB=-0.0114659;REVB=0.00324563;RO=20;SAF=2;SAR=6;SRF=4;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0805494;STB=0.578785;TYPE=snp;VARB=0.0226101;OID=.;OPOS=152975715;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:28:30:20:21:8:9:6:2:4:16:6:3:5:16 chr1 152975829 . A G 16.28 PASS AO=8;DP=38;FAO=8;FDP=38;FR=.;FRO=30;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=-0.0166954;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.0259;QD=1.71402;RBI=0.0457337;REFB=-0.0146248;REVB=-0.0425774;RO=28;SAF=4;SAR=4;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128752;STB=0.605012;TYPE=snp;VARB=0.033405;OID=.;OPOS=152975829;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:38:38:28:30:8:8:4:4:11:17:4:4:11:19 chr1 152975941 . C G 174.95 PASS AO=42;DP=89;FAO=42;FDP=89;FR=.;FRO=47;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=-0.00205881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.991;QD=7.86312;RBI=0.00241093;REFB=-0.0309822;REVB=0.00125455;RO=47;SAF=17;SAR=25;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101667;STB=0.556735;TYPE=snp;VARB=0.0351865;OID=.;OPOS=152975941;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:47:47:42:42:25:17:24:23:25:17:24:23 chr1 152976108 . C T 310.68 PASS AO=65;DP=120;FAO=65;FDP=120;FR=.;FRO=55;FSAF=34;FSAR=31;FSRF=27;FSRR=28;FWDB=-0.017234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.449;QD=10.3559;RBI=0.0211061;REFB=-0.0153243;REVB=-0.0121843;RO=55;SAF=34;SAR=31;SRF=27;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0269131;STB=0.51475;TYPE=snp;VARB=0.00820635;OID=.;OPOS=152976108;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:55:55:65:65:31:34:27:28:31:34:27:28 chr1 152976114 . G C 294.95 PASS AO=63;DP=118;FAO=63;FDP=118;FR=.;FRO=55;FSAF=34;FSAR=29;FSRF=26;FSRR=29;FWDB=0.002518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.739;QD=9.99833;RBI=0.00366464;REFB=-0.0425681;REVB=-0.00266257;RO=55;SAF=34;SAR=29;SRF=26;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0569134;STB=0.53124;TYPE=snp;VARB=0.0165323;OID=.;OPOS=152976114;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:55:55:63:63:29:34:26:29:29:34:26:29 chr1 152976306 . T G 165.96 PASS AO=61;DP=177;FAO=61;FDP=177;FR=.;FRO=116;FSAF=10;FSAR=51;FSRF=57;FSRR=59;FWDB=-0.00198494;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.033;QD=3.75058;RBI=0.00862283;REFB=-0.0129132;REVB=-0.00839126;RO=112;SAF=10;SAR=51;SRF=55;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.438273;STB=0.756381;TYPE=snp;VARB=0.01922;OID=.;OPOS=152976306;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:177:112:116:61:61:51:10:55:57:51:10:57:59 chr1 152976307 . C G 17.97 PASS AO=28;DP=173;FAO=28;FDP=176;FR=.;FRO=148;FSAF=24;FSAR=4;FSRF=42;FSRR=106;FWDB=0.00707502;FXX=0.0056494;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.44;QD=0.408299;RBI=0.0236031;REFB=-0.0105355;REVB=-0.0225178;RO=145;SAF=24;SAR=4;SRF=41;SRR=104;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.65569;STB=0.908859;TYPE=snp;VARB=0.0229906;OID=.;OPOS=152976307;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:173:176:145:148:28:28:4:24:41:104:4:24:42:106 chr1 153005156 . C T 88.91 PASS AO=20;DP=42;FAO=20;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=16;FWDB=0.0146325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.9155;QD=8.4677;RBI=0.0978254;REFB=0.00277644;REVB=0.0967249;RO=21;SAF=5;SAR=15;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0144865;STB=0.515609;TYPE=snp;VARB=-0.00015831;OID=.;OPOS=153005156;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:42:42:21:22:20:20:15:5:5:16:15:5:6:16 chr1 153029128 . T G 11.52 PASS AO=3;DP=10;FAO=3;FDP=11;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=-0.0275652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.817;QD=4.18832;RBI=0.0275652;REFB=-0.0283719;REVB=0;RO=7;SAF=3;SAR=0;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.2743;OID=.;OPOS=153029128;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:10:11:7:8:3:3:0:3:7:0:0:3:8:0 chr1 153066072 . T C 223.09 PASS AO=57;DP=125;FAO=57;FDP=125;FR=.;FRO=68;FSAF=49;FSAR=8;FSRF=56;FSRR=12;FWDB=0.0413487;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=118.25;QD=7.13872;RBI=0.0429589;REFB=-0.0152337;REVB=-0.0116513;RO=66;SAF=49;SAR=8;SRF=54;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.077283;STB=0.538447;TYPE=snp;VARB=0.0337031;OID=.;OPOS=153066072;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:66:68:57:57:8:49:54:12:8:49:56:12 chr1 153191512 . T A 259.08 PASS AO=66;DP=143;FAO=66;FDP=144;FR=.;FRO=78;FSAF=34;FSAR=32;FSRF=31;FSRR=47;FWDB=0.00263082;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=107.456;QD=7.19673;RBI=0.0184117;REFB=-0.0129382;REVB=0.0182228;RO=77;SAF=34;SAR=32;SRF=31;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108936;STB=0.563556;TYPE=snp;VARB=0.0162538;OID=.;OPOS=153191512;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:144:77:78:66:66:32:34:31:46:32:34:31:47 chr1 153233510 . A G 21.11 PASS AO=4;DP=10;FAO=4;FDP=10;FR=.;FRO=6;FSAF=0;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.6107;QD=8.44497;RBI=0.000799236;REFB=-0.00793099;REVB=0.000799236;RO=6;SAF=0;SAR=4;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0189615;OID=.;OPOS=153233510;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:10:10:6:6:4:4:4:0:0:6:4:0:0:6 chr1 153234295 . G A 86.08 PASS AO=18;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=2;FWDB=0.0718072;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.7585;QD=10.7605;RBI=0.0720495;REFB=0.016946;REVB=-0.00590367;RO=14;SAF=12;SAR=6;SRF=13;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.255355;STB=0.597983;TYPE=snp;VARB=-0.0144055;OID=.;OPOS=153234295;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:32:32:14:15:18:17:6:12:13:1:5:12:13:2 chr1 153304140 . AG A 1107.98 PASS AO=115;DP=118;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0189446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.629;QD=38.2063;RBI=0.0269182;REFB=0;REVB=0.019123;RO=1;SAF=44;SAR=71;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106699;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-2.43828e-06;OID=.;OPOS=153304141;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:115:117:116:116:0:44:72:0:0:52:1:44:71:1:0 chr1 153314153 . C A 1224.32 PASS AO=130;DP=134;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0119472;FXX=0.0223864;HRUN=3;LEN=1;MLLD=259.108;QD=37.3839;RBI=0.0146621;REFB=-0.0393967;REVB=0.00849937;RO=1;SAF=77;SAR=53;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00613268;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.84658e-05;OID=.;OPOS=153314153;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:134:131:1:0:130:131:53:77:1:0:54:77:0:0 chr1 153315579 . A G 1980.88 PASS AO=207;DP=209;FAO=208;FDP=208;FR=.;FRO=0;FSAF=130;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0213279;FXX=0.00952336;HRUN=3;LEN=1;MLLD=127.908;QD=38.0939;RBI=0.029389;REFB=0.0395508;REVB=-0.0202196;RO=1;SAF=130;SAR=77;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0061461;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.88886e-05;OID=.;OPOS=153315579;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:209:208:1:0:207:208:77:130:0:1:78:130:0:0 chr1 153320334 . T C 236.41 PASS AO=29;DP=32;FAO=29;FDP=32;FR=.;FRO=3;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0119822;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=249.264;QD=29.5506;RBI=0.0202377;REFB=-0.0117918;REVB=-0.0163093;RO=3;SAF=16;SAR=13;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0382566;STB=0.520593;TYPE=snp;VARB=0.000275546;OID=.;OPOS=153320334;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:32:32:3:3:29:29:13:16:1:2:13:16:1:2 chr1 153320372 . T G 339.2 PASS AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0040843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.2454;QD=37.6892;RBI=0.0438677;REFB=0;REVB=-0.0436772;RO=0;SAF=17;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11116e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000949523;OID=.;OPOS=153320372;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:35:36:0:0:35:36:18:17:0:0:19:17:0:0 chr1 153410822 . C A 1018.35 PASS AO=106;DP=107;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00483591;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=261.332;QD=38.0691;RBI=0.00536226;REFB=0;REVB=-0.00231685;RO=0;SAF=32;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.42488e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.63233e-05;OID=.;OPOS=153410822;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:107:107:0:0:106:107:74:32:0:0:74:33:0:0 chr1 153412392 . T G 568.36 PASS AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0090002;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.614;QD=37.8907;RBI=0.0687756;REFB=0;REVB=0.0681842;RO=0;SAF=39;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000194134;OID=.;OPOS=153412392;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:61:60:0:0:60:60:21:39:0:0:21:39:0:0 chr1 153431406 . C G 1590.45 PASS AO=164;DP=166;FAO=166;FDP=166;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0458454;FXX=0.0292381;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.4127;QD=38.3241;RBI=0.0563571;REFB=0;REVB=-0.0327768;RO=0;SAF=64;SAR=100;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.3133e-05;OID=.;OPOS=153431406;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:166:166:0:0:164:166:100:64:0:0:102:64:0:0 chr1 153509890 . T C 200.84 PASS AO=47;DP=95;FAO=47;FDP=96;FR=.;FRO=49;FSAF=13;FSAR=34;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=-0.0956074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3028;QD=8.36844;RBI=0.0965761;REFB=-0.0430456;REVB=0.0136443;RO=46;SAF=13;SAR=34;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181747;STB=0.600056;TYPE=snp;VARB=0.0514719;OID=.;OPOS=153509890;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:96:46:49:47:47:34:13:21:25:34:13:22:27 chr1 153588279 . G A 892.78 PASS AO=88;DP=89;FAO=97;FDP=99;FR=.;FRO=2;FSAF=47;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0287219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.013;QD=36.0718;RBI=0.0965931;REFB=-0.119269;REVB=0.092224;RO=1;SAF=46;SAR=42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111493;STB=0.509802;TYPE=snp;VARB=0.000439904;OID=.;OPOS=153588279;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:89:99:1:2:88:97:42:46:0:1:50:47:0:2 chr1 153604029 . C T 1017.17 PASS AO=118;DP=124;FAO=116;FDP=122;FR=.;FRO=6;FSAF=53;FSAR=63;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0672221;FXX=0.0161277;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.4889;QD=33.3498;RBI=0.0996666;REFB=-0.0997364;REVB=0.0735841;RO=5;SAF=55;SAR=63;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00512295;STB=0.502135;TYPE=snp;VARB=0.0176588;OID=.;OPOS=153604029;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:124:122:5:6:118:116:63:55:2:3:63:53:3:3 chr1 153643803 . G GT 876.73 PASS AO=147;DP=225;FAO=215;FDP=215;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=117;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0412602;FXX=0.00921617;HRUN=6;LEN=1;MLLD=8.00467;QD=16.3113;RBI=0.19411;REFB=0.150443;REVB=0.189674;RO=56;SAF=73;SAR=74;SRF=19;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0813351;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.0112336;OID=.;OPOS=153643804;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:147:225:215:215:0:98:117:0:0:68:56:73:74:19:37 chr1 153676713 . C A 2258.01 PASS AO=237;DP=237;FAO=235;FDP=235;FR=.;FRO=0;FSAF=118;FSAR=117;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0102031;FXX=0.00843846;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.477;QD=38.4342;RBI=0.012431;REFB=0;REVB=0.00710115;RO=0;SAF=119;SAR=118;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.01971e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.7453e-05;OID=.;OPOS=153676713;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:237:235:0:0:237:235:118:119:0:0:117:118:0:0 chr1 153777496 . C T 17.48 PASS AO=4;DP=17;FAO=5;FDP=18;FR=.;FRO=13;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=13;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.5776;QD=3.88415;RBI=0.0896447;REFB=0.028309;REVB=0.0896447;RO=13;SAF=0;SAR=4;SRF=0;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0721052;OID=.;OPOS=153777496;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:17:18:13:13:4:5:4:0:0:13:5:0:0:13 chr1 153780298 . C T 140.24 PASS AO=32;DP=70;FAO=33;FDP=70;FR=.;FRO=37;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=0.0245476;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.269;QD=8.0134;RBI=0.0284413;REFB=-0.0127319;REVB=-0.0143641;RO=37;SAF=22;SAR=10;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178022;STB=0.605197;TYPE=snp;VARB=0.00993393;OID=.;OPOS=153780298;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:37:37:32:33:10:22:19:18:10:23:19:18 chr1 153909069 . G C 138.78 PASS AO=30;DP=59;FAO=30;FDP=59;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=5;FSRR=24;FWDB=-0.022916;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.2117;QD=9.40886;RBI=0.024525;REFB=-0.0246187;REVB=-0.00873683;RO=29;SAF=8;SAR=22;SRF=5;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113163;STB=0.562652;TYPE=snp;VARB=0.0239247;OID=.;OPOS=153909069;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:29:29:30:30:22:8:5:24:22:8:5:24 chr1 153913699 . T G 130.82 PASS AO=33;DP=79;FAO=33;FDP=76;FR=.;FRO=43;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=26;FWDB=0.00389948;FXX=0.0379699;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.493;QD=6.88502;RBI=0.021865;REFB=-0.0164576;REVB=-0.0215145;RO=42;SAF=12;SAR=21;SRF=17;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.043479;STB=0.51917;TYPE=snp;VARB=0.0212251;OID=.;OPOS=153913699;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:76:42:43:33:33:21:12:17:25:21:12:17:26 chr1 153913770 . A G 127.23 PASS AO=36;DP=94;FAO=38;FDP=96;FR=.;FRO=58;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=30;FSRR=28;FWDB=-0.0597521;FXX=0.0103082;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.826;QD=5.30129;RBI=0.0623131;REFB=-0.0211859;REVB=-0.0176808;RO=51;SAF=22;SAR=14;SRF=30;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0247448;STB=0.57139;TYPE=snp;VARB=0.0470321;OID=.;OPOS=153913770;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:96:51:58:36:38:14:22:30:21:14:24:30:28 chr1 153926078 . T C 42.13 PASS AO=15;DP=49;FAO=15;FDP=49;FR=.;FRO=34;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.00757645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.001;QD=3.43915;RBI=0.00905074;REFB=-0.0214379;REVB=-0.00495109;RO=34;SAF=7;SAR=8;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0723881;STB=0.54342;TYPE=snp;VARB=0.0479996;OID=.;OPOS=153926078;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:49:49:34:34:15:15:8:7:18:16:8:7:18:16 chr1 153932212 . G C 182.35 PASS AO=50;DP=115;FAO=50;FDP=115;FR=.;FRO=65;FSAF=16;FSAR=34;FSRF=36;FSRR=29;FWDB=-0.00693334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.699;QD=6.34242;RBI=0.0204665;REFB=-0.0226014;REVB=0.0192563;RO=62;SAF=16;SAR=34;SRF=34;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234527;STB=0.636831;TYPE=snp;VARB=0.0253241;OID=.;OPOS=153932212;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:62:65:50:50:34:16:34:28:34:16:36:29 chr1 153941514 . C T 171.88 PASS AO=22;DP=64;FAO=25;FDP=61;FR=.,HEALED;FRO=21;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=3;FSRR=18;FWDB=-0.00428624;FXX=0.061529;HRUN=4;LEN=1;MLLD=197.565;QD=11.2706;RBI=0.0415207;REFB=-0.0141143;REVB=0.0412989;RO=19;SAF=4;SAR=18;SRF=3;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0341501;STB=0.583273;TYPE=snp;VARB=0.023344;OID=.;OPOS=153941514;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:61:61:19:21:22:25:18:4:3:16:18:7:3:18 chr1 153941536 . C T 194.78 PASS AO=38;DP=69;FAO=39;FDP=70;FR=.;FRO=31;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.0161721;FXX=0.0140825;HRUN=5;LEN=1;MLLD=45.6282;QD=11.1302;RBI=0.0212081;REFB=-0.00894084;REVB=-0.0137203;RO=31;SAF=19;SAR=19;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0393992;STB=0.504422;TYPE=snp;VARB=0.00963383;OID=.;OPOS=153941536;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:70:31:31:38:39:19:19:14:17:21:18:14:17 chr1 153994647 . C T 548.2 PASS AO=145;DP=321;FAO=145;FDP=320;FR=.;FRO=175;FSAF=64;FSAR=81;FSRF=81;FSRR=94;FWDB=-0.0112678;FXX=0.0214061;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.262;QD=6.85251;RBI=0.0174164;REFB=-0.00196867;REVB=-0.0132804;RO=159;SAF=64;SAR=81;SRF=78;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0470821;STB=0.511875;TYPE=snp;VARB=0.00168137;OID=.;OPOS=153994647;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:321:320:159:175:145:145:81:64:78:81:81:64:81:94 chr1 154089438 . T C 631.42 PASS AO=168;DP=379;FAO=168;FDP=371;FR=.;FRO=203;FSAF=75;FSAR=93;FSRF=102;FSRR=101;FWDB=0.0306352;FXX=0.0211076;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.9518;QD=6.80779;RBI=0.0325588;REFB=-0.0190726;REVB=0.0110253;RO=201;SAF=75;SAR=93;SRF=102;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0604365;STB=0.530808;TYPE=snp;VARB=0.0230008;OID=.;OPOS=154089438;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:379:371:201:203:168:168:93:75:102:99:93:75:102:101 chr1 154108387 . G A 2188.88 PASS AO=225;DP=233;FAO=231;FDP=231;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=144;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00417791;FXX=0.00858332;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.413;QD=37.9027;RBI=0.011169;REFB=0;REVB=-0.0103582;RO=0;SAF=81;SAR=144;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.26702e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.81887e-06;OID=.;OPOS=154108387;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:233:231:0:0:225:231:144:81:0:0:144:87:0:0 chr1 154229889 . AG A 2291.69 PASS AO=272;DP=393;FAO=388;FDP=388;FR=.;FRO=0;FSAF=184;FSAR=204;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.254439;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.5583;QD=23.6256;RBI=0.388644;REFB=0;REVB=0.293777;RO=93;SAF=147;SAR=125;SRF=30;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0.328704;SSSB=0.104107;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00454495;OID=.;OPOS=154229890;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:272:383:388:388:0:184:204:0:0:99:93:147:125:30:63 chr1 154242897 . C T 12.53 PASS AO=3;DP=12;FAO=3;FDP=12;FR=.;FRO=9;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=0;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=215.588;QD=4.17566;RBI=0.0250504;REFB=0.0143404;REVB=0.0250504;RO=9;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0340896;OID=.;OPOS=154242897;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:12:12:9:9:3:3:3:0:0:9:3:0:0:9 chr1 154243246 . G T 29.65 PASS AO=18;DP=43;FAO=11;FDP=38;FR=.;FRO=27;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.0178573;FXX=0.155521;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.921;QD=3.12119;RBI=0.024774;REFB=-0.000717769;REVB=0.0171717;RO=15;SAF=10;SAR=8;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125134;STB=0.660091;TYPE=snp;VARB=0.0029295;OID=.;OPOS=154243246;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:43:38:15:27:18:11:8:10:6:9:7:4:16:11 chr1 154293675 . G A 508.06 PASS AO=56;DP=58;FAO=56;FDP=58;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-4.44207e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.024;QD=35.0384;RBI=0.0406801;REFB=-0.00592573;REVB=0.0406801;RO=2;SAF=26;SAR=30;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0348923;STB=0.518512;TYPE=snp;VARB=-1.31009e-05;OID=.;OPOS=154293675;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:58:58:2:2:56:56:30:26:2:0:30:26:2:0 chr1 154295592 . C T 1884.31 PASS AO=199;DP=202;FAO=199;FDP=199;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.038836;FXX=0.0148508;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.556;QD=37.8756;RBI=0.0460021;REFB=0.0225423;REVB=0.0246569;RO=1;SAF=90;SAR=109;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00526266;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.3367e-05;OID=.;OPOS=154295592;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:202:199:1:0:199:199:109:90:1:0:109:90:0:0 chr1 154303976 . T C 2286.3 PASS AO=233;DP=236;FAO=239;FDP=239;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=194;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0225728;FXX=0.00829841;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.9411;QD=38.2644;RBI=0.0292871;REFB=0;REVB=0.0186602;RO=0;SAF=44;SAR=189;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.63571e-05;OID=.;OPOS=154303976;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:236:239:0:0:233:239:189:44:0:0:194:45:0:0 chr1 154323772 . A G 3061.78 PASS AO=355;DP=380;FAO=357;FDP=382;FR=.;FRO=25;FSAF=167;FSAR=190;FSRF=6;FSRR=19;FWDB=0.0068221;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.0396;QD=32.0605;RBI=0.0358342;REFB=-0.0107719;REVB=0.0351788;RO=25;SAF=166;SAR=189;SRF=6;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0286756;STB=0.514998;TYPE=snp;VARB=0.00149645;OID=.;OPOS=154323772;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:380:382:25:25:355:357:189:166:6:19:190:167:6:19 chr1 154426970 . A C 115.72 PASS AO=30;DP=71;FAO=30;FDP=69;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=29;FSRR=10;FWDB=-0.0269286;FXX=0.0416609;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.21;QD=6.70826;RBI=0.0289196;REFB=-0.0150989;REVB=0.0105449;RO=34;SAF=16;SAR=14;SRF=26;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225362;STB=0.621227;TYPE=snp;VARB=0.0238831;OID=.;OPOS=154426970;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:69:34:39:30:30:14:16:26:8:14:16:29:10 chr1 154437896 . T C 110.28 PASS AO=36;DP=101;FAO=36;FDP=100;FR=.;FRO=64;FSAF=8;FSAR=28;FSRF=12;FSRR=52;FWDB=-0.0101736;FXX=0.0476145;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.843;QD=4.41123;RBI=0.0177665;REFB=-0.012503;REVB=-0.0145652;RO=60;SAF=8;SAR=28;SRF=9;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124523;STB=0.533316;TYPE=snp;VARB=0.0201997;OID=.;OPOS=154437896;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:100:60:64:36:36:28:8:9:51:28:8:12:52 chr1 154438880 . T C 210.54 PASS AO=51;DP=113;FAO=53;FDP=115;FR=.;FRO=62;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=30;FSRR=32;FWDB=-0.0238963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.329;QD=7.32297;RBI=0.0358773;REFB=-0.0392256;REVB=0.0267609;RO=61;SAF=29;SAR=22;SRF=30;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0755209;STB=0.544538;TYPE=snp;VARB=0.020508;OID=.;OPOS=154438880;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:115:61:62:51:53:22:29:30:31:23:30:30:32 chr1 154474131 . C G 231.77 PASS AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0332621;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=217.516;QD=37.0834;RBI=0.0390775;REFB=0;REVB=0.0205106;RO=0;SAF=4;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.661e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000217606;OID=.;OPOS=154474131;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:25:25:0:0:25:25:21:4:0:0:21:4:0:0 chr1 154516571 . T C 282.54 PASS AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0233638;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.767;QD=38.9708;RBI=0.0239629;REFB=0;REVB=0.00532449;RO=0;SAF=6;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000116999;OID=.;OPOS=154516571;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:30:29:0:0:29:29:23:6:0:0:23:6:0:0 chr1 154516578 . G A 255.09 PASS AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0587394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.208;QD=37.7914;RBI=0.069985;REFB=0;REVB=0.0380472;RO=0;SAF=5;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000837737;OID=.;OPOS=154516578;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:26:27:0:0:26:27:21:5:0:0:21:6:0:0 chr1 154556663 . G A 181.97 PASS AO=41;DP=85;FAO=42;FDP=85;FR=.;FRO=43;FSAF=30;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=26;FWDB=0.0700853;FXX=0.0116266;HRUN=3;LEN=1;MLLD=259.493;QD=8.56321;RBI=0.0708816;REFB=-0.00993654;REVB=0.0105947;RO=42;SAF=30;SAR=11;SRF=16;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.334831;STB=0.668931;TYPE=snp;VARB=0.0101752;OID=.;OPOS=154556663;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:42:43:41:42:11:30:16:26:12:30:17:26 chr1 154561925 . C T 73.7 PASS AO=23;DP=67;FAO=24;FDP=68;FR=.;FRO=44;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=29;FWDB=-0.00330634;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.697;QD=4.33502;RBI=0.0108882;REFB=0.0113209;REVB=-0.0103741;RO=44;SAF=7;SAR=16;SRF=15;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0473886;STB=0.50549;TYPE=snp;VARB=-0.0269028;OID=.;OPOS=154561925;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:67:68:44:44:23:24:16:7:15:29:16:8:15:29 chr1 154573967 . T C 146.67 PASS AO=41;DP=99;FAO=41;FDP=99;FR=.;FRO=58;FSAF=8;FSAR=33;FSRF=8;FSRR=50;FWDB=-0.00856199;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=189.776;QD=5.92622;RBI=0.0320974;REFB=-0.0148928;REVB=-0.0309343;RO=58;SAF=8;SAR=33;SRF=8;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101911;STB=0.557021;TYPE=snp;VARB=0.0215347;OID=.;OPOS=154573967;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:58:58:41:41:33:8:8:50:33:8:8:50 chr1 154574820 . T C 1150.87 PASS AO=118;DP=119;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123167;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.246;QD=38.0452;RBI=0.0124579;REFB=0;REVB=0.00187055;RO=0;SAF=71;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.14664e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000151864;OID=.;OPOS=154574820;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:119:121:0:0:118:121:47:71:0:0:47:74:0:0 chr1 154575040 . C T 1062.58 PASS AO=134;DP=155;FAO=135;FDP=155;FR=.;FRO=20;FSAF=61;FSAR=74;FSRF=17;FSRR=3;FWDB=0.0864972;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.494;QD=27.4213;RBI=0.108105;REFB=-0.193825;REVB=0.0648456;RO=16;SAF=60;SAR=74;SRF=13;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.073814;STB=0.551334;TYPE=snp;VARB=0.00861502;OID=.;OPOS=154575040;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:155:155:16:20:134:135:74:60:13:3:74:61:17:3 chr1 154600372 . A G 86.76 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.864;QD=38.5592;RBI=0.0208586;REFB=0;REVB=-0.00284945;RO=0;SAF=3;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0002358;OID=.;OPOS=154600372;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:6:3:0:0:6:3:0:0 chr1 154744807 . C G 686.6 PASS AO=67;DP=68;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0631362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.579;QD=36.6189;RBI=0.0637405;REFB=-0.0911939;REVB=0.00875591;RO=1;SAF=34;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136967;STB=0.50704;TYPE=snp;VARB=0.00114675;OID=.;OPOS=154744807;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:68:75:1:1:67:74:33:34:1:0:39:35:1:0 chr1 154744852 . A G 519.72 PASS AO=51;DP=51;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.106756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.574;QD=37.7979;RBI=0.106928;REFB=0;REVB=0.00604974;RO=0;SAF=27;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000454058;OID=.;OPOS=154744852;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:51:55:0:0:51:55:24:27:0:0:28:27:0:0 chr1 154917314 . G A 268.18 PASS AO=63;DP=130;FAO=63;FDP=129;FR=.;FRO=66;FSAF=23;FSAR=40;FSRF=29;FSRR=37;FWDB=-0.01564;FXX=0.00769172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.596;QD=8.31568;RBI=0.0379685;REFB=-0.0201901;REVB=-0.0345977;RO=66;SAF=23;SAR=40;SRF=29;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0724401;STB=0.540107;TYPE=snp;VARB=0.0225129;OID=.;OPOS=154917314;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:129:66:66:63:63:40:23:29:37:40:23:29:37 chr1 154919080 . C T 166.78 PASS AO=26;DP=61;FAO=32;FDP=57;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=25;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.0296801;FXX=0.0806322;HRUN=5;LEN=1;MLLD=131.222;QD=11.704;RBI=0.0412073;REFB=-0.0183824;REVB=0.0285856;RO=14;SAF=6;SAR=20;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0477177;STB=0.602767;TYPE=snp;VARB=0.0169668;OID=.;OPOS=154919080;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:48:57:14:25:26:32:20:6:4:10:25:7:10:15 chr1 154932027 . TG T 70.57 PASS AO=6;DP=17;FAO=16;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.128081;FXX=0.149925;HRUN=7;LEN=1;MLLD=11.3371;QD=16.6048;RBI=0.191664;REFB=0.0509852;REVB=-0.142585;RO=4;SAF=3;SAR=3;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168827;STB=0.52378;TYPE=del;VARB=0.00283013;OID=.;OPOS=154932028;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:6:15:16:17:1:10:6:1:0:3:4:3:3:3:1 chr1 154987526 . C T 94.86 PASS AO=20;DP=39;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.0217225;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.4342;QD=9.48627;RBI=0.0573918;REFB=-0.0297269;REVB=0.053122;RO=19;SAF=11;SAR=9;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0660691;STB=0.5251;TYPE=snp;VARB=0.0283308;OID=.;OPOS=154987526;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:39:40:19:20:20:20:9:11:9:10:9:11:10:10 chr1 154988957 . A G 46.05 PASS AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=-0.00822937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.24;QD=10.2329;RBI=0.0259015;REFB=0.0369817;REVB=0.0245594;RO=9;SAF=1;SAR=8;SRF=0;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.321841;STB=0.679722;TYPE=snp;VARB=-0.0378043;OID=.;OPOS=154988957;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:18:18:9:9:9:9:8:1:0:9:8:1:0:9 chr1 155007121 . GC G 646.92 PASS AO=86;DP=121;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0225479;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.2565;QD=21.5639;RBI=0.214774;REFB=0;REVB=0.213587;RO=18;SAF=41;SAR=45;SRF=8;SRR=10;SSEN=0.28481;SSEP=0;SSSB=0.0105327;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00441155;OID=.;OPOS=155007122;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:86:119:120:120:0:57:63:0:0:57:18:41:45:8:10 chr1 155026942 . A C 401.9 PASS AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00999745;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.557;QD=37.3855;RBI=0.0275561;REFB=0;REVB=0.0256786;RO=0;SAF=10;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.90247e-05;OID=.;OPOS=155026942;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:43:43:0:0:43:43:33:10:0:0:33:10:0:0 chr1 155030557 . A C 40.9 PASS AO=11;DP=33;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=-0.000621598;FXX=0.0605877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.514;QD=5.27684;RBI=0.0186919;REFB=-0.00921498;REVB=-0.0186816;RO=20;SAF=9;SAR=2;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.582413;STB=0.844718;TYPE=snp;VARB=0.0210138;OID=.;OPOS=155030557;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:33:31:20:20:11:11:2:9:5:15:2:9:5:15 chr1 155033317 . T C 101.96 PASS AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00854382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.135;QD=37.0753;RBI=0.0152667;REFB=0;REVB=0.0126521;RO=0;SAF=9;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.06691e-05;OID=.;OPOS=155033317;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:11:11:2:9:0:0:2:9:0:0 chr1 155033918 . C T 39.29 PASS AO=8;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0285119;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=264.556;QD=9.24568;RBI=0.0365827;REFB=-0.00810114;REVB=-0.0229208;RO=9;SAF=5;SAR=3;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162764;STB=0.596769;TYPE=snp;VARB=0.00775993;OID=.;OPOS=155033918;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:17:17:9:9:8:8:3:5:4:5:3:5:4:5 chr1 155059851 . A G 91.35 PASS AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=-0.0147999;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.057;QD=7.45704;RBI=0.0152083;REFB=-0.0122776;REVB=0.00350077;RO=27;SAF=12;SAR=10;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0831127;STB=0.547128;TYPE=snp;VARB=0.0275977;OID=.;OPOS=155059851;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:49:49:27:27:22:22:10:12:17:10:10:12:17:10 chr1 155106697 . G A 823.22 PASS AO=87;DP=87;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0128657;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.607;QD=38.2893;RBI=0.0236177;REFB=0;REVB=0.0198058;RO=0;SAF=37;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.16947e-05;OID=.;OPOS=155106697;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:87:86:0:0:87:86:50:37:0:0:50:36:0:0 chr1 155149718 . G A 138.61 PASS AO=37;DP=86;FAO=37;FDP=86;FR=.;FRO=49;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=-0.0047782;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.31;QD=6.44691;RBI=0.0135947;REFB=-0.0151597;REVB=0.0127273;RO=49;SAF=20;SAR=17;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.03077;STB=0.517341;TYPE=snp;VARB=0.0172187;OID=.;OPOS=155149718;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:49:49:37:37:17:20:25:24:17:20:25:24 chr1 155162067 . C T 54.11 PASS AO=14;DP=40;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.0190759;FXX=0.0499875;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.593;QD=5.69591;RBI=0.0237311;REFB=-0.00602253;REVB=0.0141164;RO=22;SAF=6;SAR=8;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168078;STB=0.585254;TYPE=snp;VARB=0.00831237;OID=.;OPOS=155162067;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:40:38:22:23:14:15:8:6:13:9:8:7:14:9 chr1 155162218 . C T 244.28 PASS AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.7665;QD=34.8968;RBI=0.132974;REFB=-0.286199;REVB=0.132974;RO=1;SAF=0;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0316405;OID=.;OPOS=155162218;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:28:28:1:1:27:27:27:0:0:1:27:0:0:1 chr1 155172725 . T C 109.91 PASS AO=24;DP=51;FAO=25;FDP=52;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=21;FWDB=-0.0150134;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.987;QD=8.45425;RBI=0.0152123;REFB=-0.00899957;REVB=0.00245161;RO=26;SAF=10;SAR=14;SRF=6;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183891;STB=0.599926;TYPE=snp;VARB=0.0223732;OID=.;OPOS=155172725;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:52:26:27:24:25:14:10:6:20:15:10:6:21 chr1 155178782 . A T 27.78 PASS AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=11;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=5.16918e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.0242;QD=10.1034;RBI=0.000880752;REFB=-0.0533676;REVB=-0.000879234;RO=6;SAF=1;SAR=4;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0477139;STB=0.529298;TYPE=snp;VARB=0.0577474;OID=.;OPOS=155178782;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:11:11:6:6:5:5:4:1:1:5:4:1:1:5 chr1 155186729 . T C 548.03 PASS AO=125;DP=254;FAO=130;FDP=259;FR=.;FRO=129;FSAF=48;FSAR=82;FSRF=53;FSRR=76;FWDB=-0.000761486;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.4524;QD=8.46383;RBI=0.00444239;REFB=0.00173977;REVB=-0.00437664;RO=129;SAF=45;SAR=80;SRF=52;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0426175;STB=0.521993;TYPE=snp;VARB=-0.00123285;OID=.;OPOS=155186729;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:254:259:129:129:125:130:80:45:52:77:82:48:53:76 chr1 155206111 . G A 373.31 PASS AO=60;DP=175;FAO=90;FDP=198;FR=.,HEALED;FRO=98;FSAF=48;FSAR=42;FSRF=56;FSRR=42;FWDB=0.00438176;FXX=0.0149246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.57;QD=7.5416;RBI=0.0415659;REFB=-0.0663109;REVB=0.0413343;RO=58;SAF=26;SAR=34;SRF=19;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0975622;STB=0.519996;TYPE=snp;VARB=0.0732905;OID=.;OPOS=155206111;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:198:58:98:60:90:34:26:19:39:42:48:56:42 chr1 155217437 . G T 68.11 PASS AO=22;DP=63;FAO=22;FDP=63;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=26;FWDB=0.000232331;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.22;QD=4.32467;RBI=0.00200689;REFB=0.000298283;REVB=0.0019934;RO=40;SAF=10;SAR=12;SRF=14;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118782;STB=0.558771;TYPE=snp;VARB=-0.00108555;OID=.;OPOS=155217437;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:63:63:40:41:22:22:12:10:14:26:12:10:15:26 chr1 155217438 . A T 72.36 PASS AO=21;DP=58;FAO=22;FDP=58;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=-0.00682049;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3714;QD=4.99061;RBI=0.0182399;REFB=-0.00719756;REVB=-0.0169167;RO=36;SAF=9;SAR=12;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.04444;STB=0.541364;TYPE=snp;VARB=0.00352043;OID=.;OPOS=155217438;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:58:58:36:36:21:22:12:9:14:22:12:10:14:22 chr1 155230131 . C T 39.28 PASS AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.0152486;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=182.724;QD=7.14218;RBI=0.0206291;REFB=-0.00966595;REVB=-0.0138939;RO=13;SAF=4;SAR=5;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0604717;STB=0.536003;TYPE=snp;VARB=0.0109669;OID=.;OPOS=155230131;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:22:22:13:13:9:9:5:4:5:8:5:4:5:8 chr1 155232977 . TAA T 125.9 PASS AO=38;DP=80;FAO=40;FDP=78;FR=.;FRO=38;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=-0.0264065;FXX=0.0126566;HRUN=4;LEN=2;MLLD=44.7228;QD=6.45643;RBI=0.0667276;REFB=-0.0149272;REVB=-0.0612803;RO=36;SAF=21;SAR=17;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0273174;STB=0.501295;TYPE=del;VARB=0.0134928;OID=.;OPOS=155232978;OREF=AA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:38:78:40:78:38:22:18:21:17:99:36:21:17:21:15 chr1 155258752 . G A 422.19 PASS AO=75;DP=120;FAO=76;FDP=121;FR=.;FRO=45;FSAF=32;FSAR=44;FSRF=15;FSRR=30;FWDB=-0.0372066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.4781;QD=13.9566;RBI=0.0376783;REFB=-0.0202764;REVB=0.0059437;RO=45;SAF=32;SAR=43;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0668015;STB=0.533805;TYPE=snp;VARB=0.0214297;OID=.;OPOS=155258752;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:121:45:45:75:76:43:32:15:30:44:32:15:30 chr1 155258756 . C T 399.21 PASS AO=73;DP=118;FAO=73;FDP=118;FR=.;FRO=45;FSAF=32;FSAR=41;FSRF=14;FSRR=31;FWDB=0.00263606;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.47;QD=13.5324;RBI=0.00436368;REFB=-0.0015373;REVB=0.00347749;RO=45;SAF=32;SAR=41;SRF=14;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0921358;STB=0.549867;TYPE=snp;VARB=0.00124821;OID=.;OPOS=155258756;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:45:45:73:73:41:32:14:31:41:32:14:31 chr1 155260383 . G T 111.66 PASS AO=28;DP=63;FAO=28;FDP=63;FR=.;FRO=35;FSAF=4;FSAR=24;FSRF=4;FSRR=31;FWDB=0.0525655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.359;QD=7.0894;RBI=0.0527371;REFB=-0.00344318;REVB=0.00425071;RO=35;SAF=4;SAR=24;SRF=4;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0604463;STB=0.533957;TYPE=snp;VARB=0.00447076;OID=.;OPOS=155260383;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:35:35:28:28:24:4:4:31:24:4:4:31 chr1 155290231 . T C 105.61 PASS AO=23;DP=50;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.0437492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.032;QD=8.44856;RBI=0.0574268;REFB=-0.041551;REVB=0.0372;RO=24;SAF=15;SAR=8;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106017;STB=0.546835;TYPE=snp;VARB=0.0655962;OID=.;OPOS=155290231;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:24:26:23:24:8:15:13:11:9:15:14:12 chr1 155294274 . A G 73.84 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00364939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.219;QD=36.9193;RBI=0.00804935;REFB=0;REVB=0.00717453;RO=0;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.58669e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.87714e-05;OID=.;OPOS=155294274;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:6:2:0:0:6:2:0:0 chr1 155306151 . T C 20.62 PASS AO=12;DP=57;FAO=12;FDP=57;FR=.;FRO=45;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=35;FSRR=10;FWDB=-0.0351888;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.5458;QD=1.44714;RBI=0.039677;REFB=-0.0456279;REVB=-0.0183306;RO=34;SAF=5;SAR=7;SRF=24;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.337278;STB=0.766774;TYPE=snp;VARB=0.159284;OID=.;OPOS=155306151;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:57:57:34:45:12:12:7:5:24:10:7:5:35:10 chr1 155385563 . GC G 110.51 PASS AO=74;DP=245;FAO=90;FDP=237;FR=.;FRO=147;FSAF=85;FSAR=5;FSRF=71;FSRR=76;FWDB=-0.301197;FXX=0.00836785;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.0673;QD=1.86511;RBI=0.301751;REFB=0.0311196;REVB=-0.0182639;RO=131;SAF=70;SAR=4;SRF=58;SRR=73;SSEN=0.227976;SSEP=0;SSSB=0.709345;STB=0.898128;TYPE=del;VARB=-0.0807712;OID=.;OPOS=155385564;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:74:237:90:237:147:85:5:71:76:99:131:70:4:58:73 chr1 155408635 . T C 1573.55 PASS AO=164;DP=167;FAO=166;FDP=166;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147673;FXX=0.0119041;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.7214;QD=37.9169;RBI=0.0981588;REFB=0.0132926;REVB=0.0970417;RO=0;SAF=61;SAR=103;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.36019e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000439754;OID=.;OPOS=155408635;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:167:166:0:0:164:166:103:61:0:0:104:62:0:0 chr1 155581311 . T C 132.89 PASS AO=34;DP=84;FAO=36;FDP=85;FR=.;FRO=49;FSAF=25;FSAR=11;FSRF=29;FSRR=20;FWDB=-0.00686039;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.178;QD=6.25364;RBI=0.00926707;REFB=-0.00322487;REVB=0.00623007;RO=46;SAF=23;SAR=11;SRF=27;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.099526;STB=0.566069;TYPE=snp;VARB=0.00467972;OID=.;OPOS=155581311;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:85:46:49:34:36:11:23:27:19:11:25:29:20 chr1 155583937 . A G 50.98 PASS AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=0;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=16;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=200.409;QD=7.28282;RBI=0.00412026;REFB=-0.0146496;REVB=-0.00412026;RO=16;SAF=0;SAR=12;SRF=0;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0164547;OID=.;OPOS=155583937;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:28:28:16:16:12:12:12:0:0:16:12:0:0:16 chr1 155735012 . T C 502.69 PASS AO=111;DP=213;FAO=112;FDP=214;FR=.;FRO=102;FSAF=50;FSAR=62;FSRF=56;FSRR=46;FWDB=0.000714237;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.42;QD=9.39608;RBI=0.000816368;REFB=-0.0116412;REVB=0.000395376;RO=102;SAF=50;SAR=61;SRF=56;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0862818;STB=0.548939;TYPE=snp;VARB=0.00922543;OID=.;OPOS=155735012;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:213:214:102:102:111:112:61:50:56:46:62:50:56:46 chr1 155755097 . G A 1374.18 PASS AO=144;DP=144;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.603;QD=38.1715;RBI=0.010685;REFB=0;REVB=0.00288137;RO=0;SAF=57;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.98703e-05;OID=.;OPOS=155755097;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:144:144:0:0:144:144:87:57:0:0:87:57:0:0 chr1 155783535 . GCC G,GCG 81.64 PASS AO=3,2;DP=16;FAO=4,8;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=3,0;FSAR=1,8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0355787,-0.00488707;FXX=0.249844;HRUN=4,4;LEN=2,1;MLLD=21.3065,106.577;QD=27.213;RBI=0.133104,0.0313485;REFB=-0.139887,-0.0445122;REVB=-0.128261,0.0309652;RO=0;SAF=3,0;SAR=0,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.373984,0;SSEP=0.347518,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.0565001,0.0248932;OID=.,.;OPOS=155783536,155783537;OREF=CC,C;OALT=-,G;OMAPALT=G,GCG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:3,2:7:4,8:12:0:3,0:1,8:0:0:19:0:3,0:0,2:0:0 chr1 155837865 . G C 742.08 PASS AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.046935;FXX=0.0253133;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.5533;QD=38.5497;RBI=0.076833;REFB=0;REVB=0.0608311;RO=0;SAF=38;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5078e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000727949;OID=.;OPOS=155837865;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:78:77:0:0:77:77:39:38:0:0:39:38:0:0 chr1 155838267 . T C 842.75 PASS AO=77;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=15;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0009443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.179;QD=35.484;RBI=0.0220387;REFB=0;REVB=0.0220185;RO=0;SAF=15;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.58984e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000800283;OID=.;OPOS=155838267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:95:95:0:0:77:95:62:15:0:0:80:15:0:0 chr1 155880573 . C G 943.4 PASS AO=103;DP=103;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142842;FXX=0.0288434;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.941;QD=37.3624;RBI=0.0179813;REFB=-0.0530694;REVB=0.0109219;RO=0;SAF=31;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.69166e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000257854;OID=.;OPOS=155880573;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:103:101:0:0:103:101:72:31:0:0:72:29:0:0 chr1 155904177 . T C 869.41 PASS AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00139643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.191;QD=38.6404;RBI=0.00832224;REFB=0;REVB=-0.00820424;RO=0;SAF=31;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.5299e-05;OID=.;OPOS=155904177;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:90:90:0:0:90:90:59:31:0:0:59:31:0:0 chr1 155912486 . T C 316.55 PASS AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0241259;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.4548;QD=37.2411;RBI=0.0245308;REFB=0;REVB=0.00443856;RO=0;SAF=5;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000273711;OID=.;OPOS=155912486;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:34:0:0:34:34:29:5:0:0:29:5:0:0 chr1 155917389 . G C 317.42 PASS AO=101;DP=251;FAO=101;FDP=259;FR=.;FRO=158;FSAF=47;FSAR=54;FSRF=86;FSRR=72;FWDB=0.000980706;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6506;QD=4.90228;RBI=0.0424998;REFB=0.00106241;REVB=0.0424885;RO=139;SAF=50;SAR=51;SRF=78;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.068592;STB=0.548067;TYPE=snp;VARB=-0.00305927;OID=.;OPOS=155917389;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:251:259:139:158:101:101:51:50:78:61:54:47:86:72 chr1 155922491 . TG T 240.1 PASS AO=30;DP=44;FAO=43;FDP=48;FR=.;FRO=5;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.169193;FXX=0.020404;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.2454;QD=20.0087;RBI=0.2617;REFB=0.0201639;REVB=-0.199651;RO=7;SAF=15;SAR=15;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0749516;STB=0.547148;TYPE=del;VARB=0.0134178;OID=.;OPOS=155922492;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:30:43:43:48:5:19:24:0:5:8:7:15:15:2:5 chr1 156011444 . T C 83.91 PASS AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.00141465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.139;QD=9.32309;RBI=0.0638778;REFB=-0.0225197;REVB=-0.0638621;RO=18;SAF=9;SAR=9;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0246036;OID=.;OPOS=156011444;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:36:36:18:18:18:18:9:9:9:9:9:9:9:9 chr1 156013965 . G A 10.22 PASS AO=2;DP=9;FAO=2;FDP=9;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=0.016571;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.0933;QD=4.54128;RBI=0.016571;REFB=-0.00113799;REVB=0;RO=7;SAF=2;SAR=0;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00826499;OID=.;OPOS=156013965;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:7:7:2:2:0:2:7:0:0:2:7:0 chr1 156025096 . C T 164.22 PASS AO=51;DP=135;FAO=51;FDP=133;FR=.;FRO=82;FSAF=36;FSAR=15;FSRF=58;FSRR=24;FWDB=-0.00799704;FXX=0.0362293;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.741;QD=4.93893;RBI=0.0297108;REFB=-0.0121997;REVB=0.0286143;RO=73;SAF=36;SAR=15;SRF=52;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00814772;STB=0.501066;TYPE=snp;VARB=0.0193907;OID=.;OPOS=156025096;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:133:73:82:51:51:15:36:52:21:15:36:58:24 chr1 156096376 . G A 172.67 PASS AO=46;DP=110;FAO=47;FDP=111;FR=.;FRO=64;FSAF=17;FSAR=30;FSRF=39;FSRR=25;FWDB=-0.00170922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.0213;QD=6.2222;RBI=0.00692593;REFB=-0.00920584;REVB=-0.00671171;RO=63;SAF=17;SAR=29;SRF=38;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.239451;STB=0.642387;TYPE=snp;VARB=0.0237878;OID=.;OPOS=156096376;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:111:63:64:46:47:29:17:38:25:30:17:39:25 chr1 156096417 . T G 266.04 PASS AO=62;DP=125;FAO=62;FDP=125;FR=.;FRO=63;FSAF=21;FSAR=41;FSRF=35;FSRR=28;FWDB=-0.000737669;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.206;QD=8.51333;RBI=0.00622635;REFB=-0.0233368;REVB=0.0061825;RO=63;SAF=21;SAR=41;SRF=35;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204262;STB=0.613047;TYPE=snp;VARB=0.0215351;OID=.;OPOS=156096417;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:63:63:62:62:41:21:35:28:41:21:35:28 chr1 156099669 . T G 74.01 PASS AO=24;DP=72;FAO=25;FDP=73;FR=.;FRO=48;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=37;FSRR=11;FWDB=-0.0135937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.316;QD=4.05535;RBI=0.0360647;REFB=-0.00298396;REVB=-0.0334046;RO=46;SAF=11;SAR=13;SRF=35;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.338134;STB=0.688517;TYPE=snp;VARB=0.0091426;OID=.;OPOS=156099669;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:72:73:46:48:24:25:13:11:35:11:13:12:37:11 chr1 156105028 . T C 35.75 PASS AO=11;DP=30;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.061551;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.6755;QD=4.93111;RBI=0.0631816;REFB=-0.0138582;REVB=0.0142613;RO=19;SAF=2;SAR=9;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.315314;STB=0.801238;TYPE=snp;VARB=0.0409506;OID=.;OPOS=156105028;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:30:29:19:19:11:10:9:2:8:11:9:1:8:11 chr1 156106185 . T C 75.82 PASS AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=-0.0405872;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.794;QD=8.42458;RBI=0.0418534;REFB=-0.0692455;REVB=-0.010217;RO=19;SAF=8;SAR=9;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145576;STB=0.582688;TYPE=snp;VARB=0.0667279;OID=.;OPOS=156106185;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:37:36:19:19:17:17:9:8:6:13:9:8:6:13 chr1 156107534 . C T 181.48 PASS AO=32;DP=52;FAO=32;FDP=51;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=28;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=0.000587255;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.3128;QD=14.2337;RBI=0.00415609;REFB=-0.00448703;REVB=-0.00411439;RO=19;SAF=4;SAR=28;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234768;STB=0.630536;TYPE=snp;VARB=0.00129429;OID=.;OPOS=156107534;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:52:51:19:19:32:32:28:4:6:13:28:4:6:13 chr1 156142627 . GC G 28.5 PASS AO=28;DP=92;FAO=26;FDP=91;FR=.;FRO=65;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=46;FSRR=19;FWDB=-0.0534473;FXX=0.0215031;HRUN=4;LEN=1;MLLD=16.2834;QD=1.25268;RBI=0.112299;REFB=-0.030099;REVB=-0.0987651;RO=58;SAF=9;SAR=19;SRF=42;SRR=16;SSEN=0.341463;SSEP=0;SSSB=-0.441931;STB=0.790842;TYPE=del;VARB=0.0181638;OID=.;OPOS=156142628;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:28:92:26:91:65:7:19:46:19:28:58:9:19:42:16 chr1 156146640 . G A 35.34 PASS AO=20;DP=80;FAO=20;FDP=85;FR=.;FRO=65;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=48;FSRR=17;FWDB=-0.0258536;FXX=0.034087;HRUN=4;LEN=1;MLLD=157.658;QD=1.66282;RBI=0.0261974;REFB=-0.00948523;REVB=-0.00423019;RO=60;SAF=11;SAR=9;SRF=44;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23841;STB=0.649806;TYPE=snp;VARB=0.0368219;OID=.;OPOS=156146640;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:80:85:60:65:20:20:9:11:44:16:9:11:48:17 chr1 156202173 . A G 107.54 PASS AO=33;DP=89;FAO=34;FDP=93;FR=.;FRO=59;FSAF=9;FSAR=25;FSRF=25;FSRR=34;FWDB=-0.0137167;FXX=0.0106372;HRUN=3;LEN=1;MLLD=75.8244;QD=4.62523;RBI=0.0217188;REFB=-0.0267881;REVB=0.0168392;RO=55;SAF=9;SAR=24;SRF=22;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159293;STB=0.615424;TYPE=snp;VARB=0.0456004;OID=.;OPOS=156202173;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:93:55:59:33:34:24:9:22:33:25:9:25:34 chr1 156215899 . G A 104.57 PASS AO=30;DP=79;FAO=31;FDP=81;FR=.;FRO=50;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=41;FSRR=9;FWDB=0.0028545;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.208;QD=5.16378;RBI=0.0172885;REFB=-0.00246077;REVB=0.0170512;RO=49;SAF=22;SAR=8;SRF=41;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156984;STB=0.588733;TYPE=snp;VARB=0.00471665;OID=.;OPOS=156215899;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:81:49:50:30:31:8:22:41:8:9:22:41:9 chr1 156220056 . T C 44.02 PASS AO=15;DP=46;FAO=15;FDP=47;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.0529915;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.824;QD=3.74661;RBI=0.0778913;REFB=-0.00577592;REVB=-0.0570872;RO=31;SAF=7;SAR=8;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0921767;STB=0.564886;TYPE=snp;VARB=0.012841;OID=.;OPOS=156220056;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:46:47:31:32:15:15:8:7:17:14:8:7:18:14 chr1 156233189 . C T 59.76 PASS AO=16;DP=41;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=-0.0161523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.595;QD=5.83032;RBI=0.0256546;REFB=-0.0216638;REVB=0.0199314;RO=25;SAF=9;SAR=7;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0401239;STB=0.523336;TYPE=snp;VARB=0.0458551;OID=.;OPOS=156233189;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:41:41:25:25:16:16:7:9:15:10:7:9:15:10 chr1 156255456 . G A 51.82 PASS AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=10;FWDB=0.0196509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.725;QD=10.3648;RBI=0.0220533;REFB=-0.0125949;REVB=0.0100096;RO=10;SAF=1;SAR=9;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.320847;STB=0.678324;TYPE=snp;VARB=0.0323993;OID=.;OPOS=156255456;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:20:20:10:10:10:10:9:1:0:10:9:1:0:10 chr1 156263940 . T C 205.73 PASS AO=45;DP=84;FAO=44;FDP=84;FR=.;FRO=40;FSAF=12;FSAR=32;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=-0.0327188;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.544;QD=9.79674;RBI=0.0330312;REFB=-0.0153072;REVB=0.00453148;RO=39;SAF=13;SAR=32;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18478;STB=0.621301;TYPE=snp;VARB=0.00600998;OID=.;OPOS=156263940;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:39:40:45:44:32:13:19:20:32:12:20:20 chr1 156264000 . G A 208.31 PASS AO=39;DP=70;FAO=41;FDP=72;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=22;FSRR=9;FWDB=-0.0172159;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.396;QD=11.5726;RBI=0.0454074;REFB=-0.0173255;REVB=0.0420172;RO=31;SAF=17;SAR=22;SRF=22;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217372;STB=0.625191;TYPE=snp;VARB=0.0237143;OID=.;OPOS=156264000;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:72:31:31:39:41:22:17:22:9:24:17:22:9 chr1 156264555 . TA T 35.95 PASS AO=14;DP=44;FAO=19;FDP=44;FR=.;FRO=25;FSAF=17;FSAR=2;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.0619874;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=14.0282;QD=3.26853;RBI=0.0901119;REFB=-0.0819869;REVB=-0.0654042;RO=25;SAF=12;SAR=2;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.332643;STB=0.738818;TYPE=del;VARB=0.0987498;OID=.;OPOS=156264556;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:14:43:19:44:25:17:2:16:9:35:25:12:2:16:9 chr1 156265400 . GCC GC,G 655.59 PASS AO=81,39;DP=222;FAO=183,0;FDP=183;FR=.;FRO=0;FSAF=55,0;FSAR=128,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.14791,0.0760432;FXX=0.0317444;HRUN=5,5;LEN=1,2;MLLD=7.68182,9.23919;QD=14.3298;RBI=0.26106,0.130444;REFB=-0.0301729,-0.0368245;REVB=-0.215116,-0.105986;RO=25;SAF=27,0;SAR=54,39;SRF=8;SRR=17;SSEN=0.366667,0.366667;SSEP=0,0;SSSB=0.00663226,-0.857193;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=-0.0169825,-0.0545526;OID=.,.;OPOS=156265401,156265401;OREF=C,CC;OALT=-,-;OMAPALT=GC,G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:81,39:186:183,0:183:0:55,0:128,0:0:0:48:25:27,0:54,39:8:17 chr1 156280969 . G A 36.57 PASS AO=12;DP=38;FAO=12;FDP=38;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.0207986;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.2806;QD=3.8494;RBI=0.102445;REFB=0.00267758;REVB=0.100311;RO=26;SAF=7;SAR=5;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180068;STB=0.608517;TYPE=snp;VARB=-0.000518616;OID=.;OPOS=156280969;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:38:38:26:26:12:12:5:7:11:15:5:7:11:15 chr1 156280971 . G A 37.86 PASS AO=12;DP=38;FAO=12;FDP=37;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.0717559;FXX=0.0263089;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.7853;QD=4.09247;RBI=0.0722412;REFB=-0.0185665;REVB=0.00835941;RO=25;SAF=7;SAR=5;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203412;STB=0.622023;TYPE=snp;VARB=0.038931;OID=.;OPOS=156280971;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:38:37:25:25:12:12:5:7:10:15:5:7:10:15 chr1 156306918 . G A 22.75 PASS AO=4;DP=8;FAO=4;FDP=8;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.00870252;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=211.9;QD=11.3734;RBI=0.0198132;REFB=0.00774231;REVB=-0.0177997;RO=4;SAF=3;SAR=1;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0200642;OID=.;OPOS=156306918;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:8:8:4:4:4:4:1:3:3:1:1:3:3:1 chr1 156351699 . G A 3121.39 PASS AO=342;DP=361;FAO=359;FDP=371;FR=.;FRO=12;FSAF=168;FSAR=191;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=0.0611012;FXX=0.0106664;HRUN=3;LEN=1;MLLD=231.173;QD=33.6538;RBI=0.0788769;REFB=-0.123466;REVB=0.0498821;RO=7;SAF=156;SAR=186;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00444189;STB=0.509149;TYPE=snp;VARB=0.0013639;OID=.;OPOS=156351699;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:361:371:7:12:342:359:186:156:4:3:191:168:9:3 chr1 156354293 . A G 900.43 PASS AO=94;DP=97;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0241089;FXX=0.0309246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.136;QD=38.3161;RBI=0.0269339;REFB=0;REVB=-0.0120083;RO=0;SAF=25;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.26084e-05;OID=.;OPOS=156354293;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:97:94:0:0:94:94:69:25:0:0:69:25:0:0 chr1 156354367 . A G 641.84 PASS AO=68;DP=69;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0938235;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.3571;QD=36.6764;RBI=0.0953585;REFB=-0.102139;REVB=-0.0170412;RO=0;SAF=23;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510635;TYPE=snp;VARB=0.00405045;OID=.;OPOS=156354367;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:69:70:0:1:68:69:45:23:0:0:46:23:1:0 chr1 156446903 . T C 375.05 PASS AO=40;DP=42;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0303997;FXX=0.0476077;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.375;QD=37.5047;RBI=0.033703;REFB=0;REVB=0.0145518;RO=0;SAF=25;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000238731;OID=.;OPOS=156446903;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:42:40:0:0:40:40:15:25:0:0:15:25:0:0 chr1 156499969 . T C 146.65 PASS AO=39;DP=92;FAO=40;FDP=94;FR=.;FRO=54;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=33;FWDB=-0.0324138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.966;QD=6.2404;RBI=0.0362867;REFB=-0.00177771;REVB=-0.0163116;RO=53;SAF=21;SAR=18;SRF=21;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144549;STB=0.591727;TYPE=snp;VARB=0.00381499;OID=.;OPOS=156499969;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:94:53:54:39:40:18:21:21:32:18:22:21:33 chr1 156518379 . G A 108.28 PASS AO=26;DP=58;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.0272297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.169;QD=7.34075;RBI=0.0274224;REFB=-0.0227916;REVB=0.00324525;RO=32;SAF=15;SAR=11;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0143575;STB=0.503814;TYPE=snp;VARB=0.0350488;OID=.;OPOS=156518379;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:59:32:32:26:27:11:15:18:14:12:15:18:14 chr1 156518433 . C T 130.39 PASS AO=12;DP=47;FAO=26;FDP=47;FR=.,HEALED;FRO=21;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0532506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.638;QD=11.0966;RBI=0.0699878;REFB=-0.0216183;REVB=0.0454166;RO=11;SAF=12;SAR=0;SRF=11;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.51063;TYPE=snp;VARB=0.0164628;OID=.;OPOS=156518433;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:34:47:11:21:12:26:0:12:11:0:13:13:11:10 chr1 156526387 . C G 271.72 PASS AO=64;DP=131;FAO=64;FDP=131;FR=.;FRO=67;FSAF=38;FSAR=26;FSRF=35;FSRR=32;FWDB=-0.029971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.6351;QD=8.29672;RBI=0.0450896;REFB=-0.0235941;REVB=-0.033687;RO=66;SAF=38;SAR=26;SRF=34;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0736468;STB=0.537287;TYPE=snp;VARB=0.0224599;OID=.;OPOS=156526387;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:66:67:64:64:26:38:34:32:26:38:35:32 chr1 156526444 . T C 695.84 PASS AO=63;DP=63;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.051184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.928;QD=37.6131;RBI=0.0661754;REFB=0;REVB=0.041945;RO=0;SAF=28;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000240051;OID=.;OPOS=156526444;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:63:74:0:0:63:74:35:28:0:0:40:34:0:0 chr1 156532977 . T C 439.43 PASS AO=48;DP=53;FAO=51;FDP=54;FR=.;FRO=3;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.00235034;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.6945;QD=32.5502;RBI=0.0503469;REFB=-0.0707656;REVB=0.050292;RO=3;SAF=27;SAR=21;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0256271;STB=0.513269;TYPE=snp;VARB=0.00464192;OID=.;OPOS=156532977;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:53:54:3:3:48:51:21:27:1:2:22:29:1:2 chr1 156536221 . G C 1205.47 PASS AO=127;DP=129;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00737388;FXX=0.0155027;HRUN=3;LEN=1;MLLD=178.578;QD=37.9676;RBI=0.0228449;REFB=-0.0483017;REVB=-0.0216221;RO=0;SAF=63;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.21543e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.73037e-05;OID=.;OPOS=156536221;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:129:127:0:0:127:127:64:63:0:0:64:63:0:0 chr1 156536251 . T C 1279.7 PASS AO=129;DP=133;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00559431;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.538;QD=38.1999;RBI=0.00817818;REFB=0;REVB=-0.00596542;RO=0;SAF=60;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.645e-06;OID=.;OPOS=156536251;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:133:134:0:0:129:134:69:60:0:0:69:65:0:0 chr1 156556321 . G A 101.96 PASS AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00307291;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=157.179;QD=37.075;RBI=0.0201942;REFB=0;REVB=0.019959;RO=0;SAF=3;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000310059;OID=.;OPOS=156556321;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:11:11:8:3:0:0:8:3:0:0 chr1 156561651 . G C 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0677367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.946;QD=33.0219;RBI=0.0677367;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00077607;OID=.;OPOS=156561651;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:0:6:0:0:0:6:0:0 chr1 156563375 . G A 503.73 PASS AO=55;DP=59;FAO=56;FDP=58;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0285704;FXX=0.0169463;HRUN=5;LEN=1;MLLD=209.934;QD=34.7401;RBI=0.0488825;REFB=-0.0783565;REVB=0.039664;RO=2;SAF=43;SAR=12;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0214235;STB=0.51136;TYPE=snp;VARB=0.00038116;OID=.;OPOS=156563375;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:59:58:2:2:55:56:12:43:2:0:13:43:2:0 chr1 156563726 . A C 2111.98 PASS AO=222;DP=223;FAO=223;FDP=223;FR=.;FRO=0;FSAF=108;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00126168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.5446;QD=37.883;RBI=0.00609304;REFB=0;REVB=0.00596098;RO=0;SAF=108;SAR=114;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.05255e-05;OID=.;OPOS=156563726;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:96:223:223:0:0:222:223:114:108:0:0:115:108:0:0 chr1 156563813 . G A 1899.47 PASS AO=166;DP=207;FAO=199;FDP=199;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=75;FSAR=124;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0645161;FXX=0.00994975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.765;QD=38.1802;RBI=0.0729041;REFB=0;REVB=0.0339511;RO=0;SAF=54;SAR=112;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000260323;OID=.;OPOS=156563813;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:206:199:0:0:166:199:112:54:0:0:124:75:0:0 chr1 156563852 . C T 1803.9 PASS AO=192;DP=194;FAO=193;FDP=193;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=134;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00751825;FXX=0.00515437;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.85;QD=37.3865;RBI=0.0110017;REFB=-0.0749073;REVB=-0.00803204;RO=1;SAF=58;SAR=134;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00813904;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000251469;OID=.;OPOS=156563852;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:194:193:1:0:192:193:134:58:1:0:134:59:0:0 chr1 156564922 . C T 144.79 PASS AO=33;DP=69;FAO=33;FDP=68;FR=.;FRO=35;FSAF=8;FSAR=25;FSRF=2;FSRR=33;FWDB=0.00204489;FXX=0.0144907;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.338;QD=8.51688;RBI=0.0133179;REFB=0.00965302;REVB=0.01316;RO=33;SAF=8;SAR=25;SRF=2;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.259652;STB=0.649788;TYPE=snp;VARB=-0.0111601;OID=.;OPOS=156564922;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:68:33:35:33:33:25:8:2:31:25:8:2:33 chr1 156565049 . A AAC 713.88 PASS AO=64;DP=91;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00901256;FXX=0.0581328;HRUN=4;LEN=2;MLLD=221.7;QD=35.2532;RBI=0.0133191;REFB=-0.0448022;REVB=0.00980678;RO=10;SAF=32;SAR=32;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0507564;STB=0.506665;TYPE=ins;VARB=0.000386266;OID=.;OPOS=156565050;OREF=-;OALT=AC;OMAPALT=AAC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:64:91:80:81:1:43:37:0:1:28:10:32:32:7:3 chr1 156594477 . C G 10.22 PASS AO=2;DP=9;FAO=2;FDP=9;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=71.8339;QD=4.54295;RBI=0.0103344;REFB=-0.0250562;REVB=-0.0103344;RO=7;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00761934;OID=.;OPOS=156594477;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:7:7:2:2:2:0:0:7:2:0:0:7 chr1 156595447 . G A 500.94 PASS AO=63;DP=71;FAO=63;FDP=71;FR=.;FRO=8;FSAF=63;FSAR=0;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=0.00464014;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=206.748;QD=28.2218;RBI=0.00464014;REFB=-0.10415;REVB=0;RO=6;SAF=63;SAR=0;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000749954;OID=.;OPOS=156595447;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:71:71:6:8:63:63:0:63:6:0:0:63:8:0 chr1 156639753 . G A 195.16 PASS AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000446406;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=254.344;QD=37.1733;RBI=0.00412516;REFB=0;REVB=-0.00410093;RO=0;SAF=13;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.40934e-05;OID=.;OPOS=156639753;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:21:21:0:0:21:21:8:13:0:0:8:13:0:0 chr1 156640156 . G A 231.77 PASS AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0419191;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=229.63;QD=37.0834;RBI=0.0435844;REFB=0;REVB=-0.0119328;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.44764e-05;OID=.;OPOS=156640156;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:25:25:0:0:25:25:13:12:0:0:13:12:0:0 chr1 156640678 . G A 252.2 PASS AO=26;DP=29;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0210308;FXX=0.103413;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.3808;QD=38.8006;RBI=0.0213386;REFB=0;REVB=-0.00361132;RO=0;SAF=1;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.08431e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000628986;OID=.;OPOS=156640678;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:29:26:0:0:26:26:25:1:0:0:25:1:0:0 chr1 156642571 . AG A 42.63 PASS AO=13;DP=35;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.0583277;FXX=0.0302939;HRUN=4;LEN=1;MLLD=14.4793;QD=5.3291;RBI=0.0946414;REFB=-0.104839;REVB=-0.0745311;RO=15;SAF=2;SAR=11;SRF=10;SRR=5;SSEN=0.352941;SSEP=0;SSSB=-0.520566;STB=0.74002;TYPE=del;VARB=0.144391;OID=.;OPOS=156642572;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:13:32:14:32:18:3:11:11:7:35:15:2:11:10:5 chr1 156642964 . G T 10.38 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0688506;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=35.7219;QD=5.9324;RBI=0.0688506;REFB=0.0589022;REVB=0;RO=5;SAF=2;SAR=0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0958096;OID=.;OPOS=156642964;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:5:5:2:2:0:2:5:0:0:2:5:0 chr1 156705593 . G C 1164.74 PASS AO=117;DP=117;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0693521;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.671;QD=37.8777;RBI=0.07137;REFB=0;REVB=-0.0168515;RO=0;SAF=57;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.7553e-05;OID=.;OPOS=156705593;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:117:123:0:0:117:123:60:57:0:0:60:63:0:0 chr1 156713512 . C T 423.32 PASS AO=45;DP=46;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0691079;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1981;QD=36.0268;RBI=0.0766163;REFB=-0.0858128;REVB=0.033078;RO=0;SAF=26;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.15971e-08;STB=0.51219;TYPE=snp;VARB=0.00285223;OID=.;OPOS=156713512;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:46:47:0:1:45:46:19:26:0:0:20:26:0:1 chr1 156713558 . G A 94.3 PASS AO=31;DP=91;FAO=32;FDP=92;FR=.;FRO=60;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=35;FWDB=-0.0103333;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=164.595;QD=4.09984;RBI=0.0218912;REFB=-0.00348327;REVB=0.019299;RO=59;SAF=19;SAR=12;SRF=24;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.231415;STB=0.614484;TYPE=snp;VARB=0.0050614;OID=.;OPOS=156713558;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:91:92:59:60:31:32:12:19:24:35:13:19:25:35 chr1 156714813 . GC G 856.92 PASS AO=107;DP=149;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0371694;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=14.0041;QD=23.4773;RBI=0.32496;REFB=-0.0230864;REVB=0.322827;RO=21;SAF=47;SAR=60;SRF=2;SRR=19;SSEN=0.32026;SSEP=0;SSSB=0.10958;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0112614;OID=.;OPOS=156714814;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:107:144:146:146:0:66:80:0:0:65:21:47:60:2:19 chr1 156752048 . C G 1004.25 PASS AO=107;DP=113;FAO=113;FDP=117;FR=.;FRO=4;FSAF=61;FSAR=52;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0536693;FXX=0.00847386;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.979;QD=34.3333;RBI=0.0603408;REFB=0.061646;REVB=-0.0275794;RO=6;SAF=57;SAR=50;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00330407;STB=0.50137;TYPE=snp;VARB=-0.00948874;OID=.;OPOS=156752048;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:113:117:6:4:107:113:50:57:3:3:52:61:2:2 chr1 156760887 . C A 1556.92 PASS AO=163;DP=164;FAO=163;FDP=163;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00690491;FXX=0.00609719;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.78;QD=38.2065;RBI=0.0356361;REFB=0;REVB=0.0349608;RO=0;SAF=61;SAR=102;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.78569e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.80604e-05;OID=.;OPOS=156760887;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:164:163:0:0:163:163:102:61:0:0:102:61:0:0 chr1 156784982 . T C 327.57 PASS AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0682832;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.16;QD=37.4365;RBI=0.0705227;REFB=0;REVB=-0.0176313;RO=0;SAF=3;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000301879;OID=.;OPOS=156784982;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:35:35:0:0:35:35:32:3:0:0:32:3:0:0 chr1 156785617 . G A 543.52 PASS AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.076351;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=258.362;QD=38.1421;RBI=0.0824225;REFB=0;REVB=0.0310481;RO=0;SAF=26;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19358e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000188439;OID=.;OPOS=156785617;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:57:57:0:0:57:57:31:26:0:0:31:26:0:0 chr1 156785810 . C G 95.24 PASS AO=19;DP=35;FAO=19;FDP=35;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=0.0148766;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=166.326;QD=10.885;RBI=0.0325213;REFB=-0.00806235;REVB=0.0289193;RO=14;SAF=10;SAR=9;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144517;STB=0.603555;TYPE=snp;VARB=0.00742513;OID=.;OPOS=156785810;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:35:35:14:16:19:19:9:10:10:4:9:10:12:4 chr1 156814027 . G A 351.54 PASS AO=66;DP=97;FAO=66;FDP=111;FR=.;FRO=45;FSAF=41;FSAR=25;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=0.00583092;FXX=0.00892777;HRUN=4;LEN=1;MLLD=41.0352;QD=12.668;RBI=0.0552363;REFB=-0.107525;REVB=-0.0549277;RO=31;SAF=41;SAR=25;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0452547;STB=0.582264;TYPE=snp;VARB=0.041299;OID=.;OPOS=156814027;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:111:31:45:66:66:25:41:17:14:25:41:19:26 chr1 156848995 . C T 316.55 PASS AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0281282;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.832;QD=37.2408;RBI=0.0400624;REFB=0;REVB=0.0285272;RO=0;SAF=20;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.48532e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000410833;OID=.;OPOS=156848995;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:34:0:0:34:34:14:20:0:0:14:20:0:0 chr1 156877457 . T C 566.74 PASS AO=58;DP=64;FAO=63;FDP=65;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0288379;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.5235;QD=34.876;RBI=0.0311303;REFB=-0.0473785;REVB=0.0117248;RO=6;SAF=21;SAR=37;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0874839;STB=0.50331;TYPE=snp;VARB=0.00137426;OID=.;OPOS=156877457;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:64:65:6:2:58:63:37:21:5:1:38:25:1:1 chr1 156877797 . C A 31.59 PASS AO=6;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.898;QD=9.719;RBI=0.0257252;REFB=0.00306833;REVB=0.0257252;RO=7;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00102897;OID=.;OPOS=156877797;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:13:13:7:7:6:6:6:0:0:7:6:0:0:7 chr1 156878531 . T C 30.32 PASS AO=4;DP=9;FAO=5;FDP=10;FR=.,HEALED;FRO=5;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0189544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.1112;QD=12.1295;RBI=0.031089;REFB=-0.0275208;REVB=-0.0246426;RO=3;SAF=4;SAR=0;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.74182;STB=0.798798;TYPE=snp;VARB=0.0257177;OID=.;OPOS=156878531;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:9:10:3:5:4:5:0:4:1:2:1:4:1:4 chr1 156878737 . T C 29.61 PASS AO=9;DP=28;FAO=9;FDP=29;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=3;FWDB=-0.0533441;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.242;QD=4.08468;RBI=0.0560716;REFB=-0.0152232;REVB=-0.0172753;RO=19;SAF=4;SAR=5;SRF=16;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.437537;STB=0.765972;TYPE=snp;VARB=0.0224726;OID=.;OPOS=156878737;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:28:29:19:20:9:9:5:4:16:3:5:4:17:3 chr1 156879580 . C T 92.29 PASS AO=20;DP=41;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=21;FWDB=0.0772129;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=184.009;QD=9.00421;RBI=0.0773066;REFB=-0.0162049;REVB=0.00380514;RO=21;SAF=5;SAR=15;SRF=0;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.377273;STB=0.70574;TYPE=snp;VARB=0.0190953;OID=.;OPOS=156879580;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:41:41:21:21:20:20:15:5:0:21:15:5:0:21 chr1 156882996 . G C 97.49 PASS AO=20;DP=61;FAO=29;FDP=68;FR=.;FRO=39;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=-0.036237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.5626;QD=5.73477;RBI=0.0436323;REFB=-0.0321917;REVB=0.0243035;RO=39;SAF=8;SAR=12;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119905;STB=0.540453;TYPE=snp;VARB=0.0645092;OID=.;OPOS=156882996;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:61:68:39:39:20:29:12:8:16:23:19:10:16:23 chr1 156883215 . C A 130.36 PASS AO=25;DP=52;FAO=30;FDP=59;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=9;FSRR=20;FWDB=0.0585475;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=35.4091;QD=8.8382;RBI=0.0869605;REFB=-0.0453536;REVB=0.0642987;RO=27;SAF=8;SAR=17;SRF=7;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0662893;STB=0.512812;TYPE=snp;VARB=0.0445256;OID=.;OPOS=156883215;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:59:27:29:25:30:17:8:7:20:20:10:9:20 chr1 156883735 . AGGGGGC AGGGGC,AGGG,AGGGG 181.57 PASS AO=8,10,6;DP=32;FAO=5,23,0;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=0,13,0;FSAR=5,10,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.388261,0.193419,0.261232;FXX=0.0666445;HRUN=5,5,5;LEN=1,3,2;MLLD=14.394,30.1904,21.5735;QD=25.9389;RBI=0.409383,0.21297,0.301953;REFB=-0.0642461,-0.0608979,-0.0317843;REVB=0.129799,0.0891365,0.151438;RO=2;SAF=4,5,4;SAR=4,5,2;SRF=0;SRR=2;SSEN=0.30137,0.30137,0.30137;SSEP=0,0,0;SSSB=0.175673,0.148436,0.284202;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=del,del,del;VARB=0.0458661,0.0198464,-0.0547603;OID=.,.,.;OPOS=156883736,156883739,156883740;OREF=G,GGC,GC;OALT=-,-,-;OMAPALT=AGGGGC,AGGG,AGGGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:8,10,6:29:5,23,0:28:0:0,13,0:5,10,0:0:0:5:2:4,5,4:4,5,2:0:2 chr1 156884584 . C T 43.32 PASS AO=12;DP=33;FAO=12;FDP=33;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.017738;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.549;QD=5.25049;RBI=0.0319494;REFB=-0.0141348;REVB=0.026573;RO=21;SAF=6;SAR=6;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179503;STB=0.605892;TYPE=snp;VARB=0.0116944;OID=.;OPOS=156884584;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:33:33:21:21:12:12:6:6:14:7:6:6:14:7 chr1 156890672 . T C 214.87 PASS AO=56;DP=123;FAO=56;FDP=125;FR=.;FRO=69;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=26;FSRR=43;FWDB=0.00327973;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.5205;QD=6.87592;RBI=0.0264994;REFB=-0.00144736;REVB=-0.0262957;RO=66;SAF=30;SAR=26;SRF=25;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151666;STB=0.587037;TYPE=snp;VARB=0.00677153;OID=.;OPOS=156890672;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:125:66:69:56:56:26:30:25:41:26:30:26:43 chr1 156902222 . G A 163.2 PASS AO=26;DP=38;FAO=26;FDP=38;FR=.;FRO=12;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=1;FWDB=0.0528982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.155;QD=17.1785;RBI=0.0547961;REFB=-0.0616986;REVB=0.0142966;RO=12;SAF=13;SAR=13;SRF=11;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.241414;STB=0.631485;TYPE=snp;VARB=0.0074152;OID=.;OPOS=156902222;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:38:38:12:12:26:26:13:13:11:1:13:13:11:1 chr1 156902259 . G A 169.91 PASS AO=29;DP=47;FAO=30;FDP=47;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0712626;FXX=0.040808;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.5129;QD=14.4605;RBI=0.091506;REFB=-0.0790489;REVB=0.057402;RO=17;SAF=7;SAR=22;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18667;STB=0.586606;TYPE=snp;VARB=0.0384444;OID=.;OPOS=156902259;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:47:47:17:17:29:30:22:7:8:9:22:8:8:9 chr1 156902281 . T G 163 PASS AO=31;DP=53;FAO=31;FDP=53;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=22;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=-5.16787e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.571;QD=12.3016;RBI=0.0054077;REFB=-0.0236852;REVB=-0.00540745;RO=22;SAF=9;SAR=22;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0647593;STB=0.535793;TYPE=snp;VARB=0.0170346;OID=.;OPOS=156902281;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:53:53:22:22:31:31:22:9:8:14:22:9:8:14 chr1 156904644 . A G 382.19 PASS AO=78;DP=140;FAO=78;FDP=140;FR=.;FRO=62;FSAF=31;FSAR=47;FSRF=22;FSRR=40;FWDB=0.0434697;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.753;QD=10.9196;RBI=0.0443553;REFB=-0.0131026;REVB=-0.00881916;RO=62;SAF=31;SAR=47;SRF=22;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0363898;STB=0.519848;TYPE=snp;VARB=0.00999175;OID=.;OPOS=156904644;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:62:62:78:78:47:31:22:40:47:31:22:40 chr1 156904818 . G A 161.2 PASS AO=52;DP=132;FAO=50;FDP=130;FR=.;FRO=80;FSAF=32;FSAR=18;FSRF=53;FSRR=27;FWDB=0.00956306;FXX=0.0151504;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.2262;QD=4.96001;RBI=0.145251;REFB=0.0292275;REVB=0.144935;RO=79;SAF=34;SAR=18;SRF=51;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00971952;STB=0.515146;TYPE=snp;VARB=-0.0464097;OID=.;OPOS=156904818;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:130:79:80:52:50:18:34:51:28:18:32:53:27 chr1 156907081 . T C 101.11 PASS AO=19;DP=33;FAO=19;FDP=33;FR=.;FRO=14;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=-0.0041488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.568;QD=12.2556;RBI=0.0370715;REFB=-0.00769752;REVB=0.0368386;RO=14;SAF=12;SAR=7;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131062;STB=0.572881;TYPE=snp;VARB=0.00571334;OID=.;OPOS=156907081;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:33:33:14:14:19:19:7:12:11:3:7:12:11:3 chr1 156909695 . G A 112.38 PASS AO=38;DP=88;FAO=31;FDP=75;FR=.;FRO=44;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=19;FWDB=0.00307146;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.005;QD=5.99343;RBI=0.0296236;REFB=0.00937238;REVB=0.029464;RO=48;SAF=14;SAR=24;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154863;STB=0.587068;TYPE=snp;VARB=-0.0162038;OID=.;OPOS=156909695;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:75:48:44:38:31:24:14:25:23:18:13:25:19 chr1 156939067 . G A 203 PASS AO=48;DP=103;FAO=49;FDP=103;FR=.;FRO=54;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=43;FSRR=11;FWDB=-0.000659223;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.3563;QD=7.88365;RBI=0.0354692;REFB=0.0250604;REVB=-0.0354631;RO=55;SAF=25;SAR=23;SRF=44;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.274256;STB=0.642198;TYPE=snp;VARB=-0.030513;OID=.;OPOS=156939067;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:55:54:48:49:23:25:44:11:23:26:43:11 chr1 157062696 . G T 18.55 PASS AO=9;DP=41;FAO=9;FDP=42;FR=.;FRO=33;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=0.0892426;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=84.0445;QD=1.76644;RBI=0.0912683;REFB=0.00292664;REVB=-0.0191226;RO=32;SAF=5;SAR=4;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178706;STB=0.624732;TYPE=snp;VARB=-0.0080224;OID=.;OPOS=157062696;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:41:42:32:33:9:9:4:5:13:19:4:5:13:20 chr1 157062739 . C G 185.17 PASS AO=16;DP=35;FAO=28;FDP=39;FR=.;FRO=11;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=-0.0266241;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=215.964;QD=18.9918;RBI=0.02828;REFB=-0.0256926;REVB=0.00953479;RO=10;SAF=3;SAR=13;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.460516;STB=0.598842;TYPE=snp;VARB=0.00438979;OID=.;OPOS=157062739;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:26:39:10:11:16:28:13:3:8:2:15:13:9:2 chr1 157095470 . A G 321.49 PASS AO=77;DP=158;FAO=77;FDP=160;FR=.;FRO=83;FSAF=37;FSAR=40;FSRF=28;FSRR=55;FWDB=-0.000523571;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=123.239;QD=8.0372;RBI=0.0222062;REFB=-0.0275811;REVB=0.0222;RO=81;SAF=37;SAR=40;SRF=28;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126408;STB=0.574797;TYPE=snp;VARB=0.0286071;OID=.;OPOS=157095470;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:160:81:83:77:77:40:37:28:53:40:37:28:55 chr1 157508882 . C T 615.92 PASS AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0160099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.2;QD=37.903;RBI=0.0160877;REFB=0;REVB=-0.0015801;RO=0;SAF=42;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.35381e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.14748e-05;OID=.;OPOS=157508882;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:65:65:0:0:65:65:23:42:0:0:23:42:0:0 chr1 157509025 . C T 965.03 PASS AO=110;DP=116;FAO=110;FDP=116;FR=.;FRO=6;FSAF=63;FSAR=47;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.0159562;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=151.001;QD=33.2769;RBI=0.0159906;REFB=0.00461477;REVB=0.00104706;RO=6;SAF=63;SAR=47;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0262094;STB=0.513824;TYPE=snp;VARB=-0.000184846;OID=.;OPOS=157509025;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:116:116:6:6:110:110:47:63:5:1:47:63:5:1 chr1 157514091 . C T 465.55 PASS AO=109;DP=218;FAO=109;FDP=218;FR=.;FRO=109;FSAF=48;FSAR=61;FSRF=51;FSRR=58;FWDB=-0.0240277;FXX=0.004566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.4563;QD=8.54212;RBI=0.0370297;REFB=-0.0256246;REVB=-0.0281757;RO=108;SAF=48;SAR=61;SRF=50;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0207193;STB=0.513911;TYPE=snp;VARB=0.0271689;OID=.;OPOS=157514091;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:218:218:108:109:109:109:61:48:50:58:61:48:51:58 chr1 157514097 . A G 2086.8 PASS AO=218;DP=219;FAO=220;FDP=220;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=124;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0345468;FXX=0.00452468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.89;QD=37.9418;RBI=0.0356195;REFB=0.0335493;REVB=0.00867538;RO=1;SAF=96;SAR=122;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00388951;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.07424e-05;OID=.;OPOS=157514097;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:219:220:1:0:218:220:122:96:0:1:124:96:0:0 chr1 157517127 . C T 223.25 PASS AO=54;DP=119;FAO=56;FDP=121;FR=.;FRO=65;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=39;FSRR=26;FWDB=0.021817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.466;QD=7.38003;RBI=0.0218318;REFB=0.00104942;REVB=-0.000806134;RO=65;SAF=23;SAR=31;SRF=39;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169599;STB=0.58196;TYPE=snp;VARB=-0.00116279;OID=.;OPOS=157517127;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:121:65:65:54:56:31:23:39:26:31:25:39:26 chr1 157557701 . G A 140.2 PASS AO=29;DP=54;FAO=29;FDP=54;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=25;FWDB=0.00117916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.3;QD=10.3854;RBI=0.0217671;REFB=-0.0172639;REVB=-0.0217351;RO=25;SAF=14;SAR=15;SRF=0;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.417914;STB=0.72715;TYPE=snp;VARB=0.0231816;OID=.;OPOS=157557701;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:25:25:29:29:15:14:0:25:15:14:0:25 chr1 157559122 . C T 494.55 PASS AO=131;DP=291;FAO=131;FDP=290;FR=.;FRO=159;FSAF=70;FSAR=61;FSRF=93;FSRR=66;FWDB=-0.00089908;FXX=0.00343631;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.256;QD=6.82138;RBI=0.00509676;REFB=-0.00394522;REVB=0.00501684;RO=155;SAF=70;SAR=61;SRF=91;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0522029;STB=0.527952;TYPE=snp;VARB=0.00461441;OID=.;OPOS=157559122;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:291:290:155:159:131:131:61:70:91:64:61:70:93:66 chr1 157567751 . A G 237.07 PASS AO=16;DP=24;FAO=25;FDP=25;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0205642;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.939;QD=37.9303;RBI=0.174316;REFB=0;REVB=0.173099;RO=0;SAF=16;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0310172;OID=.;OPOS=157567751;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:24:25:0:0:16:25:0:16:0:0:9:16:0:0 chr1 157738449 . CCG C,CC 78.21 PASS AO=18,16;DP=100;FAO=26,15;FDP=86;FR=.;FRO=45;FSAF=3,0;FSAR=23,15;FSRF=9;FSRR=36;FWDB=-0.242007,-0.0883985;FXX=0.054939;HRUN=5,5;LEN=2,1;MLLD=20.0449,12.3673;QD=3.6375;RBI=0.242732,0.0885965;REFB=-0.00852849,-0.0109641;REVB=0.0187461,0.0059188;RO=38;SAF=1,0;SAR=17,16;SRF=9;SRR=29;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.457616,-0.746842;STB=0.609175,0.998866;TYPE=del,del;VARB=0.0253374,0.0799605;OID=.,.;OPOS=157738450,157738451;OREF=CG,G;OALT=-,-;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:18,16:95:26,15:86:45:3,0:23,15:9:36:33:38:1,0:17,16:9:29 chr1 157771880 . C T 776.68 PASS AO=81;DP=81;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0982075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.152;QD=37.8868;RBI=0.104589;REFB=0;REVB=0.0359739;RO=0;SAF=31;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.35858e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000305865;OID=.;OPOS=157771880;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:81:82:0:0:81:82:50:31:0:0:50:32:0:0 chr1 157802979 . C T 1151.35 PASS AO=119;DP=120;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162876;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.554;QD=38.7007;RBI=0.051714;REFB=0;REVB=0.0490821;RO=0;SAF=63;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000161748;OID=.;OPOS=157802979;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:120:119:0:0:119:119:56:63:0:0:55:64:0:0 chr1 158057633 . C G 453.16 PASS AO=48;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00363778;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=40.7581;QD=36.9927;RBI=0.0085915;REFB=0;REVB=0.00778334;RO=0;SAF=18;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.73384e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00256949;OID=.;OPOS=158057633;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:49:49:0:0:48:49:30:18:0:0:30:19:0:0 chr1 158323253 . T C 330.24 PASS AO=59;DP=93;FAO=59;FDP=93;FR=.;FRO=34;FSAF=48;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=10;FWDB=0.00170335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.4434;QD=14.2038;RBI=0.0281476;REFB=-0.0409504;REVB=0.028096;RO=34;SAF=48;SAR=11;SRF=24;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10999;STB=0.559978;TYPE=snp;VARB=0.0295581;OID=.;OPOS=158323253;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:34:34:59:59:11:48:24:10:11:48:24:10 chr1 158324425 . A G 374.76 PASS AO=80;DP=149;FAO=80;FDP=149;FR=.;FRO=69;FSAF=37;FSAR=43;FSRF=27;FSRR=42;FWDB=0.0262438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.324;QD=10.0608;RBI=0.0274058;REFB=-0.0196689;REVB=0.00789563;RO=69;SAF=37;SAR=43;SRF=27;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0609192;STB=0.533314;TYPE=snp;VARB=0.0187682;OID=.;OPOS=158324425;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:69:69:80:80:43:37:27:42:43:37:27:42 chr1 158368309 . T G 56.73 PASS AO=17;DP=47;FAO=17;FDP=47;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=24;FWDB=0.00428649;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=271.692;QD=4.82782;RBI=0.00451496;REFB=0.00125666;REVB=-0.00141805;RO=28;SAF=9;SAR=8;SRF=6;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.335723;STB=0.705676;TYPE=snp;VARB=-0.00383371;OID=.;OPOS=158368309;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:47:47:28:30:17:17:8:9:6:22:8:9:6:24 chr1 158368541 . A G 183.92 PASS AO=44;DP=102;FAO=48;FDP=108;FR=.;FRO=60;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=38;FSRR=22;FWDB=-0.0034802;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.197;QD=6.81186;RBI=0.00411256;REFB=-0.0260383;REVB=-0.0021912;RO=58;SAF=17;SAR=27;SRF=38;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267952;STB=0.642143;TYPE=snp;VARB=0.043872;OID=.;OPOS=158368541;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:108:58:60:44:48:27:17:38:20:30:18:38:22 chr1 158368555 . GC G 440.49 PASS AO=60;DP=82;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.161622;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.7515;QD=22.8826;RBI=0.18578;REFB=0;REVB=0.0916116;RO=10;SAF=19;SAR=41;SRF=7;SRR=3;SSEN=0.303743;SSEP=0;SSSB=-0.113171;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00724813;OID=.;OPOS=158368556;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:60:77:77:77:0:33:44:0:0:38:10:19:41:7:3 chr1 158368846 . T C 118.98 PASS AO=38;DP=102;FAO=38;FDP=103;FR=.;FRO=65;FSAF=10;FSAR=28;FSRF=27;FSRR=38;FWDB=-0.0520529;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=82.084;QD=4.62038;RBI=0.0579297;REFB=-0.00199329;REVB=-0.0254233;RO=64;SAF=10;SAR=28;SRF=27;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198669;STB=0.610787;TYPE=snp;VARB=0.00333917;OID=.;OPOS=158368846;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:103:64:65:38:38:28:10:27:37:28:10:27:38 chr1 158368964 . C T 119.73 PASS AO=30;DP=69;FAO=30;FDP=68;FR=.;FRO=38;FSAF=29;FSAR=1;FSRF=29;FSRR=9;FWDB=0.034918;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.219;QD=7.04301;RBI=0.0356487;REFB=-0.0144774;REVB=-0.00718074;RO=38;SAF=29;SAR=1;SRF=29;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.559766;STB=0.833006;TYPE=snp;VARB=0.00792764;OID=.;OPOS=158368964;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:68:38:38:30:30:1:29:29:9:1:29:29:9 chr1 158368974 . A G 80.39 PASS AO=30;DP=72;FAO=26;FDP=72;FR=.;FRO=46;FSAF=25;FSAR=1;FSRF=37;FSRR=9;FWDB=0.0150455;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0544;QD=4.46586;RBI=0.0202982;REFB=0.017109;REVB=-0.0136253;RO=41;SAF=29;SAR=1;SRF=32;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.544847;STB=0.800949;TYPE=snp;VARB=-0.0546407;OID=.;OPOS=158368974;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:72:72:41:46:30:26:1:29:32:9:1:25:37:9 chr1 158369064 . A G 223.74 PASS AO=42;DP=68;FAO=41;FDP=67;FR=.;FRO=26;FSAF=29;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.00831925;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.2874;QD=13.3573;RBI=0.0252776;REFB=-0.0164023;REVB=-0.0238693;RO=26;SAF=29;SAR=13;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199954;STB=0.619891;TYPE=snp;VARB=0.0154595;OID=.;OPOS=158369064;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:68:67:26:26:42:41:13:29:11:15:12:29:11:15 chr1 158390252 . T G 1725.91 PASS AO=178;DP=179;FAO=179;FDP=179;FR=.;FRO=0;FSAF=106;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0838602;FXX=0.00555525;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.867;QD=38.5678;RBI=0.0844826;REFB=0;REVB=0.0102358;RO=0;SAF=106;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.51111e-05;OID=.;OPOS=158390252;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:179:179:0:0:178:179:72:106:0:0:73:106:0:0 chr1 158390501 . G A 357.22 PASS AO=40;DP=42;FAO=41;FDP=43;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0486131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.074;QD=33.2295;RBI=0.0530384;REFB=-0.122354;REVB=0.0212094;RO=2;SAF=6;SAR=34;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0267986;STB=0.513882;TYPE=snp;VARB=0.000385856;OID=.;OPOS=158390501;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:42:43:2:2:40:41:34:6:0:2:35:6:0:2 chr1 158436299 . T C 1247.5 PASS AO=136;DP=139;FAO=138;FDP=142;FR=.;FRO=4;FSAF=68;FSAR=70;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.00186593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.072;QD=35.1407;RBI=0.0526575;REFB=-0.105425;REVB=0.0526244;RO=3;SAF=70;SAR=66;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00744347;STB=0.507245;TYPE=snp;VARB=0.00041499;OID=.;OPOS=158436299;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:139:142:3:4:136:138:66:70:1:2:70:68:3:1 chr1 158449749 . A G 180.87 PASS AO=40;DP=79;FAO=40;FDP=79;FR=.;FRO=39;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=13;FWDB=0.0289173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.08;QD=9.15783;RBI=0.0461667;REFB=-0.0301226;REVB=-0.0359883;RO=39;SAF=23;SAR=17;SRF=26;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0847808;STB=0.546924;TYPE=snp;VARB=0.0313953;OID=.;OPOS=158449749;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:39:39:40:40:17:23:26:13:17:23:26:13 chr1 158450238 . G A 167.2 PASS AO=43;DP=100;FAO=43;FDP=97;FR=.;FRO=54;FSAF=13;FSAR=30;FSRF=14;FSRR=40;FWDB=-0.0290687;FXX=0.029997;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.4856;QD=6.89467;RBI=0.0688047;REFB=-0.0200226;REVB=0.0623626;RO=54;SAF=13;SAR=30;SRF=14;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0519904;STB=0.529057;TYPE=snp;VARB=0.0235515;OID=.;OPOS=158450238;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:97:54:54:43:43:30:13:14:40:30:13:14:40 chr1 158450314 . A G 184.07 PASS AO=43;DP=95;FAO=45;FDP=96;FR=.;FRO=51;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=15;FSRR=36;FWDB=0.0156954;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.6196;QD=7.66946;RBI=0.0624664;REFB=0.0305532;REVB=-0.0604625;RO=50;SAF=20;SAR=23;SRF=15;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162476;STB=0.593181;TYPE=snp;VARB=-0.0293399;OID=.;OPOS=158450314;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:96:50:51:43:45:23:20:15:35:24:21:15:36 chr1 158450382 . C T 357.19 PASS AO=75;DP=141;FAO=77;FDP=143;FR=.;FRO=66;FSAF=48;FSAR=29;FSRF=33;FSRR=33;FWDB=0.0156291;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.015;QD=9.99119;RBI=0.0164614;REFB=-0.028691;REVB=-0.00516791;RO=65;SAF=46;SAR=29;SRF=33;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0921081;STB=0.558858;TYPE=snp;VARB=0.023554;OID=.;OPOS=158450382;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:143:65:66:75:77:29:46:33:32:29:48:33:33 chr1 158533140 . A G 1099.62 PASS AO=120;DP=123;FAO=121;FDP=123;FR=.;FRO=2;FSAF=71;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0099687;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.132;QD=35.7601;RBI=0.020286;REFB=0.00176216;REVB=-0.0176676;RO=3;SAF=71;SAR=49;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0281913;STB=0.509802;TYPE=snp;VARB=-0.000110431;OID=.;OPOS=158533140;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:123:123:3:2:120:121:49:71:0:3:50:71:0:2 chr1 158533224 . A G 994.88 PASS AO=98;DP=102;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0847;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.6623;QD=36.8473;RBI=0.0896037;REFB=-0.0200007;REVB=0.0292357;RO=4;SAF=52;SAR=46;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00228272;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000775616;OID=.;OPOS=158533224;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:102:108:4:0:98:108:46:52:2:2:53:55:0:0 chr1 158549264 . G A 844.54 PASS AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0273185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.627;QD=38.3881;RBI=0.028457;REFB=0;REVB=0.0079687;RO=0;SAF=50;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.49151e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.6243e-05;OID=.;OPOS=158549264;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:88:88:0:0:88:88:38:50:0:0:38:50:0:0 chr1 158549420 . C T 655.78 PASS AO=79;DP=85;FAO=79;FDP=87;FR=.;FRO=8;FSAF=19;FSAR=60;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.0302836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.1709;QD=30.151;RBI=0.0315847;REFB=-0.0348726;REVB=0.00897176;RO=1;SAF=19;SAR=60;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0242587;STB=0.514756;TYPE=snp;VARB=0.00267494;OID=.;OPOS=158549420;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:85:87:1:8:79:79:60:19:1:0:60:19:1:7 chr1 158549492 . C T 1034.79 PASS AO=112;DP=116;FAO=113;FDP=116;FR=.;FRO=3;FSAF=36;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.00140021;FXX=0.00854628;HRUN=3;LEN=1;MLLD=267.511;QD=35.6826;RBI=0.0229367;REFB=-0.0345223;REVB=0.0228939;RO=2;SAF=36;SAR=76;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0123301;STB=0.509552;TYPE=snp;VARB=0.00044071;OID=.;OPOS=158549492;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:116:116:2:3:112:113:76:36:0:2:77:36:0:3 chr1 158549511 . A G 943.26 PASS AO=100;DP=100;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110829;FXX=0.0198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.201;QD=38.1116;RBI=0.0114953;REFB=0;REVB=0.00305152;RO=0;SAF=36;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.52424e-05;OID=.;OPOS=158549511;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:100:99:0:0:100:99:64:36:0:0:63:36:0:0 chr1 158582646 . T C 286.77 PASS AO=82;DP=199;FAO=83;FDP=200;FR=.;FRO=117;FSAF=47;FSAR=36;FSRF=43;FSRR=74;FWDB=-0.0107687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.86;QD=5.7354;RBI=0.02323;REFB=-0.00765414;REVB=-0.0205833;RO=116;SAF=46;SAR=36;SRF=42;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205919;STB=0.614717;TYPE=snp;VARB=0.0116251;OID=.;OPOS=158582646;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:199:200:116:117:82:83:36:46:42:74:36:47:43:74 chr1 158584091 . A G 76.08 PASS AO=30;DP=96;FAO=30;FDP=96;FR=.;FRO=66;FSAF=22;FSAR=8;FSRF=31;FSRR=35;FWDB=0.000819269;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.873;QD=3.1701;RBI=0.000821327;REFB=-0.00336338;REVB=-5.8109e-05;RO=65;SAF=22;SAR=8;SRF=30;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.330538;STB=0.690379;TYPE=snp;VARB=0.00603325;OID=.;OPOS=158584091;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:96:96:65:66:30:30:8:22:30:35:8:22:31:35 chr1 158587390 . C T 356.55 PASS AO=69;DP=119;FAO=69;FDP=118;FR=.;FRO=49;FSAF=29;FSAR=40;FSRF=34;FSRR=15;FWDB=0.00536454;FXX=0.00840265;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.073;QD=12.0865;RBI=0.0367551;REFB=-0.00443635;REVB=-0.0363615;RO=49;SAF=29;SAR=40;SRF=34;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206575;STB=0.612362;TYPE=snp;VARB=0.00465332;OID=.;OPOS=158587390;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:118:49:49:69:69:40:29:34:15:40:29:34:15 chr1 158587400 . T G 142.58 PASS AO=44;DP=117;FAO=45;FDP=117;FR=.;FRO=72;FSAF=32;FSAR=13;FSRF=31;FSRR=41;FWDB=0.00805284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.13;QD=4.87439;RBI=0.0212574;REFB=-0.00226096;REVB=0.019673;RO=72;SAF=32;SAR=12;SRF=31;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.335428;STB=0.678364;TYPE=snp;VARB=0.00394935;OID=.;OPOS=158587400;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:72:72:44:45:12:32:31:41:13:32:31:41 chr1 158587858 . G A 188.79 PASS AO=38;DP=72;FAO=39;FDP=72;FR=.;FRO=33;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=9;FWDB=-0.00598449;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2601;QD=10.4882;RBI=0.0377574;REFB=0.00186596;REVB=-0.0372801;RO=33;SAF=19;SAR=19;SRF=24;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191818;STB=0.609443;TYPE=snp;VARB=-0.00241389;OID=.;OPOS=158587858;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:33:33:38:39:19:19:24:9:20:19:24:9 chr1 158592781 . G A 202.33 PASS AO=61;DP=160;FAO=63;FDP=162;FR=.;FRO=99;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=49;FSRR=50;FWDB=0.00588414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.324;QD=4.99568;RBI=0.025812;REFB=-0.0108216;REVB=-0.0251324;RO=99;SAF=34;SAR=27;SRF=49;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0684797;STB=0.547054;TYPE=snp;VARB=0.0152379;OID=.;OPOS=158592781;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:162:99:99:61:63:27:34:49:50:27:36:49:50 chr1 158592847 . G A 147.3 PASS AO=50;DP=139;FAO=50;FDP=139;FR=.;FRO=89;FSAF=19;FSAR=31;FSRF=40;FSRR=49;FWDB=-0.0164768;FXX=0.00714235;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.0256;QD=4.23888;RBI=0.0259235;REFB=-0.0269901;REVB=0.0200135;RO=85;SAF=19;SAR=31;SRF=36;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0502969;STB=0.546114;TYPE=snp;VARB=0.0262067;OID=.;OPOS=158592847;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:85:89:50:50:31:19:36:49:31:19:40:49 chr1 158592901 . C G 176.99 PASS AO=48;DP=111;FAO=48;FDP=112;FR=.;FRO=64;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=33;FSRR=31;FWDB=0.0138915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.363;QD=6.32099;RBI=0.0211944;REFB=-0.0149292;REVB=-0.0160071;RO=63;SAF=23;SAR=25;SRF=33;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0451486;STB=0.520825;TYPE=snp;VARB=0.0234854;OID=.;OPOS=158592901;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:112:63:64:48:48:25:23:33:30:25:23:33:31 chr1 158592935 . G A 746.79 PASS AO=82;DP=84;FAO=82;FDP=84;FR=.;FRO=2;FSAF=44;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00680394;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=191.276;QD=35.5613;RBI=0.0424905;REFB=0.075843;REVB=0.0419422;RO=2;SAF=44;SAR=38;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00165769;STB=0.500875;TYPE=snp;VARB=-0.000221281;OID=.;OPOS=158592935;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:84:84:2:2:82:82:38:44:1:1:38:44:1:1 chr1 158597507 . G C 373.59 PASS AO=87;DP=174;FAO=87;FDP=174;FR=.;FRO=87;FSAF=32;FSAR=55;FSRF=32;FSRR=55;FWDB=-0.028499;FXX=0.00571396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.013;QD=8.58828;RBI=0.0285049;REFB=-0.00379113;REVB=0.000577183;RO=85;SAF=32;SAR=55;SRF=31;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00300951;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00293527;OID=.;OPOS=158597507;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:174:85:87:87:87:55:32:31:54:55:32:32:55 chr1 158604391 . T C 324.57 PASS AO=63;DP=108;FAO=63;FDP=109;FR=.;FRO=46;FSAF=23;FSAR=40;FSRF=20;FSRR=26;FWDB=-0.0298864;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.08;QD=11.9108;RBI=0.0299727;REFB=-0.0200979;REVB=0.00227287;RO=44;SAF=23;SAR=40;SRF=18;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0354126;STB=0.531182;TYPE=snp;VARB=0.00995312;OID=.;OPOS=158604391;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:109:44:46:63:63:40:23:18:26:40:23:20:26 chr1 158606449 . G T 2063.8 PASS AO=219;DP=222;FAO=220;FDP=220;FR=.;FRO=0;FSAF=130;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0279193;FXX=0.0090086;HRUN=3;LEN=1;MLLD=197.058;QD=37.5237;RBI=0.0281928;REFB=0.0113404;REVB=-0.00391764;RO=2;SAF=129;SAR=90;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00732922;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000130905;OID=.;OPOS=158606449;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:222:220:2:0:219:220:90:129:2:0:90:130:0:0 chr1 158612236 . A G 3773.76 PASS AO=584;DP=590;FAO=399;FDP=399;FR=.;FRO=0;FSAF=201;FSAR=198;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121423;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.583;QD=37.8322;RBI=0.0406586;REFB=0;REVB=0.0388032;RO=4;SAF=279;SAR=305;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0029652;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000387728;OID=.;OPOS=158612236;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:590:399:4:0:584:399:305:279:1:3:198:201:0:0 chr1 158619728 . A C 2223.79 PASS AO=104;DP=271;FAO=254;FDP=269;FR=.;FRO=15;FSAF=100;FSAR=154;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.0156955;FXX=0.00370357;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.532;QD=33.0675;RBI=0.0169153;REFB=-0.0470946;REVB=0.00630716;RO=0;SAF=93;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.11922e-08;STB=0.500368;TYPE=snp;VARB=0.00359859;OID=.;OPOS=158619728;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:123:269:0:15:104:254:11:93:0:0:154:100:6:9 chr1 158647495 . A T 832.23 PASS AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00402923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.902;QD=38.2633;RBI=0.0105336;REFB=0;REVB=0.00973252;RO=0;SAF=50;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.26001e-05;OID=.;OPOS=158647495;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:87:87:0:0:87:87:37:50:0:0:37:50:0:0 chr1 158647522 . A G 829.23 PASS AO=82;DP=86;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0990504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.2136;QD=37.2688;RBI=0.102627;REFB=0;REVB=0.0268577;RO=1;SAF=40;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116923;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000999563;OID=.;OPOS=158647522;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:86:89:1:0:82:89:42:40:1:0:42:47:0:0 chr1 158655036 . G A 1289.08 PASS AO=123;DP=123;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=117;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0602688;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.0869;QD=38.1949;RBI=0.0735242;REFB=0;REVB=-0.0421128;RO=0;SAF=6;SAR=117;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.97458e-05;OID=.;OPOS=158655036;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:123:135:0:0:123:135:117:6:0:0:117:18:0:0 chr1 158656281 . T C 1860.56 PASS AO=195;DP=199;FAO=195;FDP=195;FR=.;FRO=0;FSAF=122;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00356139;FXX=0.0200995;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.303;QD=38.1654;RBI=0.0217591;REFB=-0.0619343;REVB=0.0214657;RO=0;SAF=122;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.2338e-05;OID=.;OPOS=158656281;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:199:195:0:0:195:195:73:122:0:0:73:122:0:0 chr1 158687163 . G A 196.97 PASS AO=61;DP=165;FAO=64;FDP=170;FR=.;FRO=106;FSAF=42;FSAR=22;FSRF=48;FSRR=58;FWDB=0.00211641;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=249.521;QD=4.63458;RBI=0.0104268;REFB=0.00650392;REVB=0.0102098;RO=104;SAF=42;SAR=19;SRF=48;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.259903;STB=0.629173;TYPE=snp;VARB=-0.0091332;OID=.;OPOS=158687163;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:170:104:106:61:64:19:42:48:56:22:42:48:58 chr1 158687224 . G A 128.91 PASS AO=41;DP=110;FAO=41;FDP=110;FR=.;FRO=69;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=33;FSRR=36;FWDB=0.066874;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.5263;QD=4.68773;RBI=0.0786667;REFB=-0.00110431;REVB=-0.0414285;RO=68;SAF=18;SAR=23;SRF=32;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0348628;STB=0.52482;TYPE=snp;VARB=0.00124081;OID=.;OPOS=158687224;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:68:69:41:41:23:18:32:36:23:18:33:36 chr1 158687896 . C T 145.06 PASS AO=24;DP=36;FAO=24;FDP=36;FR=.;FRO=12;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.00652956;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.332;QD=16.1181;RBI=0.00796415;REFB=-0.0174485;REVB=0.00455988;RO=12;SAF=16;SAR=8;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159856;STB=0.58816;TYPE=snp;VARB=0.0116605;OID=.;OPOS=158687896;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:36:36:12:12:24:24:8:16:5:7:8:16:5:7 chr1 158736215 . G A 140.85 PASS AO=31;DP=67;FAO=33;FDP=69;FR=.;FRO=36;FSAF=28;FSAR=5;FSRF=24;FSRR=12;FWDB=0.0698008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.5723;QD=8.16543;RBI=0.0726007;REFB=-0.0322562;REVB=-0.0199679;RO=35;SAF=26;SAR=5;SRF=24;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218932;STB=0.646637;TYPE=snp;VARB=0.0335065;OID=.;OPOS=158736215;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:69:35:36:31:33:5:26:24:11:5:28:24:12 chr1 158746847 . A G 160.45 PASS AO=43;DP=104;FAO=45;FDP=106;FR=.;FRO=61;FSAF=13;FSAR=32;FSRF=31;FSRR=30;FWDB=0.0287256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.38;QD=6.05481;RBI=0.029373;REFB=-0.00563852;REVB=-0.00613308;RO=60;SAF=11;SAR=32;SRF=31;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.294104;STB=0.63589;TYPE=snp;VARB=0.00703651;OID=.;OPOS=158746847;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:106:60:61:43:45:32:11:31:29:32:13:31:30 chr1 158813819 . A G 281.13 PASS AO=55;DP=90;FAO=54;FDP=91;FR=.;FRO=37;FSAF=31;FSAR=23;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.00591949;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.453;QD=12.3574;RBI=0.0129979;REFB=0.0106968;REVB=0.0115717;RO=35;SAF=32;SAR=23;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0899697;STB=0.546966;TYPE=snp;VARB=-0.0120757;OID=.;OPOS=158813819;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:91:35:37:55:54:23:32:16:19:23:31:17:20 chr1 158813873 . G C 13.03 PASS AO=12;DP=65;FAO=12;FDP=66;FR=.;FRO=54;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=35;FWDB=-0.0969226;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.809;QD=0.789847;RBI=0.0972403;REFB=-0.0052509;REVB=-0.00785416;RO=53;SAF=0;SAR=12;SRF=19;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.69285;STB=0.826383;TYPE=snp;VARB=0.215255;OID=.;OPOS=158813873;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:65:66:53:54:12:12:12:0:19:34:11:1:19:35 chr1 158986477 . G C 329.07 PASS AO=71;DP=134;FAO=72;FDP=135;FR=.;FRO=63;FSAF=22;FSAR=50;FSRF=20;FSRR=43;FWDB=-0.0501178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.6328;QD=9.75017;RBI=0.0501309;REFB=-0.0133553;REVB=0.00114741;RO=61;SAF=21;SAR=50;SRF=20;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0319815;STB=0.50651;TYPE=snp;VARB=0.00703671;OID=.;OPOS=158986477;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:135:61:63:71:72:50:21:20:41:50:22:20:43 chr1 158990247 . A G 369.2 PASS AO=97;DP=214;FAO=97;FDP=214;FR=.;FRO=117;FSAF=43;FSAR=54;FSRF=53;FSRR=64;FWDB=0.00160256;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.259;QD=6.90096;RBI=0.00209183;REFB=-0.00329262;REVB=-0.00134445;RO=113;SAF=43;SAR=54;SRF=50;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000808858;STB=0.505361;TYPE=snp;VARB=0.00429047;OID=.;OPOS=158990247;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:214:113:117:97:97:54:43:50:63:54:43:53:64 chr1 159002377 . C A 173.84 PASS AO=52;DP=131;FAO=52;FDP=131;FR=.;FRO=79;FSAF=16;FSAR=36;FSRF=38;FSRR=41;FWDB=0.0578264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.2805;QD=5.30805;RBI=0.0578721;REFB=-0.00650765;REVB=0.00229994;RO=79;SAF=16;SAR=36;SRF=38;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197463;STB=0.612046;TYPE=snp;VARB=0.00958681;OID=.;OPOS=159002377;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:79:79:52:52:36:16:38:41:36:16:38:41 chr1 159002389 . T A 209.29 PASS AO=59;DP=135;FAO=59;FDP=141;FR=.;FRO=82;FSAF=22;FSAR=37;FSRF=37;FSRR=45;FWDB=0.0112002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.957;QD=5.93745;RBI=0.0242488;REFB=0.00409658;REVB=-0.0215072;RO=75;SAF=22;SAR=37;SRF=36;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110945;STB=0.547513;TYPE=snp;VARB=-0.0044896;OID=.;OPOS=159002389;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:141:75:82:59:59:37:22:36:39:37:22:37:45 chr1 159015250 . C T 143.67 PASS AO=41;DP=101;FAO=41;FDP=101;FR=.;FRO=60;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=21;FSRR=39;FWDB=0.0327858;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.31;QD=5.68986;RBI=0.0340527;REFB=-0.0112254;REVB=-0.00920184;RO=60;SAF=17;SAR=24;SRF=21;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.07101;STB=0.540072;TYPE=snp;VARB=0.0192543;OID=.;OPOS=159015250;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:60:60:41:41:24:17:21:39:24:17:21:39 chr1 159024668 . A T 140.58 PASS AO=20;DP=77;FAO=26;FDP=62;FR=.,HEALED;FRO=26;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.0508369;FXX=0.0746157;HRUN=3;LEN=1;MLLD=150.048;QD=9.06974;RBI=0.0556237;REFB=-0.0115291;REVB=0.0225745;RO=21;SAF=2;SAR=18;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.257979;STB=0.522167;TYPE=snp;VARB=-0.0114284;OID=.;OPOS=159024668;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:62:21:26:20:26:18:2:5:16:18:8:9:17 chr1 159169641 . T C 233.92 PASS AO=51;DP=98;FAO=51;FDP=98;FR=.;FRO=47;FSAF=16;FSAR=35;FSRF=16;FSRR=31;FWDB=0.0101855;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.317;QD=9.54766;RBI=0.0156992;REFB=-0.0109775;REVB=0.0119465;RO=46;SAF=16;SAR=35;SRF=16;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0335587;STB=0.5147;TYPE=snp;VARB=0.00883624;OID=.;OPOS=159169641;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:46:47:51:51:35:16:16:30:35:16:16:31 chr1 159175354 . G A 1211.94 PASS AO=132;DP=136;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208767;FXX=0.0294096;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.867;QD=36.7256;RBI=0.0319242;REFB=-0.111512;REVB=0.0241519;RO=3;SAF=60;SAR=72;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0193893;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.91673e-05;OID=.;OPOS=159175354;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:136:132:3:0:132:132:72:60:0:3:72:60:0:0 chr1 159175548 . GC G 72.36 PASS AO=13;DP=26;FAO=17;FDP=23;FR=.;FRO=6;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.263344;FXX=0.0416493;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.2827;QD=12.5841;RBI=0.272078;REFB=-0.0200702;REVB=0.068381;RO=7;SAF=8;SAR=5;SRF=4;SRR=3;SSEN=0.243808;SSEP=0;SSSB=0.0285713;STB=0.540934;TYPE=del;VARB=0.0190883;OID=.;OPOS=159175549;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:13:24:17:23:6:11:6:3:3:9:7:8:5:4:3 chr1 159283746 . T C 112.14 PASS AO=32;DP=84;FAO=33;FDP=84;FR=.;FRO=51;FSAF=29;FSAR=4;FSRF=32;FSRR=19;FWDB=-0.0662187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.952;QD=5.33992;RBI=0.0662603;REFB=-0.00612346;REVB=0.00234714;RO=51;SAF=28;SAR=4;SRF=32;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.38983;STB=0.731992;TYPE=snp;VARB=0.0143177;OID=.;OPOS=159283746;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:51:51:32:33:4:28:32:19:4:29:32:19 chr1 159409734 . G T 1686.24 PASS AO=176;DP=176;FAO=176;FDP=176;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0537418;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.3951;QD=38.3237;RBI=0.0576436;REFB=0;REVB=-0.0208471;RO=0;SAF=77;SAR=99;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000350671;OID=.;OPOS=159409734;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:176:176:0:0:176:176:99:77:0:0:99:77:0:0 chr1 159409857 . A G 247.36 PASS AO=59;DP=122;FAO=59;FDP=122;FR=.;FRO=63;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=32;FSRR=31;FWDB=-0.031744;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.431;QD=8.11024;RBI=0.0410794;REFB=0.00425337;REVB=-0.0260736;RO=63;SAF=28;SAR=31;SRF=32;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0311257;STB=0.517236;TYPE=snp;VARB=-0.0096116;OID=.;OPOS=159409857;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:63:63:59:59:31:28:32:31:31:28:32:31 chr1 159505101 . G A 136.91 PASS AO=42;DP=111;FAO=42;FDP=110;FR=.;FRO=68;FSAF=34;FSAR=8;FSRF=58;FSRR=10;FWDB=-0.019875;FXX=0.0090082;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.2504;QD=4.97847;RBI=0.0277276;REFB=-0.000157862;REVB=-0.019334;RO=68;SAF=34;SAR=8;SRF=58;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0814169;STB=0.545974;TYPE=snp;VARB=-0.000340852;OID=.;OPOS=159505101;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:110:68:68:42:42:8:34:58:10:8:34:58:10 chr1 159505297 . C T 249.6 PASS AO=66;DP=151;FAO=66;FDP=149;FR=.;FRO=83;FSAF=37;FSAR=29;FSRF=25;FSRR=58;FWDB=-0.0093589;FXX=0.0132442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.556;QD=6.70072;RBI=0.0316476;REFB=-0.0120394;REVB=-0.0302321;RO=81;SAF=37;SAR=29;SRF=25;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.245775;STB=0.641578;TYPE=snp;VARB=0.0121573;OID=.;OPOS=159505297;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:149:81:83:66:66:29:37:25:56:29:37:25:58 chr1 159558258 . A G 1629.48 PASS AO=168;DP=169;FAO=171;FDP=171;FR=.;FRO=0;FSAF=109;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0311028;FXX=0.00581362;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.169;QD=38.1165;RBI=0.0314983;REFB=0;REVB=-0.00497552;RO=0;SAF=109;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.28392e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.28722e-05;OID=.;OPOS=159558258;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:169:171:0:0:168:171:59:109:0:0:62:109:0:0 chr1 159778983 . T C 205.1 PASS AO=39;DP=81;FAO=45;FDP=86;FR=.;FRO=41;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=-0.0119453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.659;QD=9.53934;RBI=0.0119865;REFB=-0.0259972;REVB=0.000992897;RO=41;SAF=19;SAR=20;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0902413;STB=0.535458;TYPE=snp;VARB=0.017403;OID=.;OPOS=159778983;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:86:41:41:39:45:20:19:24:17:22:23:24:17 chr1 159785370 . T C 238.77 PASS AO=80;DP=215;FAO=80;FDP=214;FR=.;FRO=134;FSAF=24;FSAR=56;FSRF=41;FSRR=93;FWDB=0.00587971;FXX=0.00465095;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7005;QD=4.46298;RBI=0.0146165;REFB=-0.0136143;REVB=-0.0133817;RO=134;SAF=24;SAR=56;SRF=41;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00783291;STB=0.504433;TYPE=snp;VARB=0.024484;OID=.;OPOS=159785370;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:214:134:134:80:80:56:24:41:93:56:24:41:93 chr1 159785425 . A G 250.83 PASS AO=68;DP=158;FAO=69;FDP=161;FR=.;FRO=92;FSAF=18;FSAR=51;FSRF=26;FSRR=66;FWDB=-0.00665505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.061;QD=6.23177;RBI=0.0130398;REFB=-0.00144939;REVB=-0.0112136;RO=90;SAF=18;SAR=50;SRF=26;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0310933;STB=0.515857;TYPE=snp;VARB=0.0016538;OID=.;OPOS=159785425;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:161:90:92:68:69:50:18:26:64:51:18:26:66 chr1 159799910 . G A 356.97 PASS AO=62;DP=97;FAO=63;FDP=99;FR=.;FRO=36;FSAF=21;FSAR=42;FSRF=12;FSRR=24;FWDB=0.00344955;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.9707;QD=14.4231;RBI=0.0216189;REFB=-0.0239677;REVB=0.021342;RO=35;SAF=21;SAR=41;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00307764;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.015631;OID=.;OPOS=159799910;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:99:35:36:62:63:41:21:12:23:42:21:12:24 chr1 159824967 . G C 531.51 PASS AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0458295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.465;QD=37.9647;RBI=0.0658908;REFB=0;REVB=0.047342;RO=0;SAF=14;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000523774;OID=.;OPOS=159824967;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:56:56:0:0:56:56:42:14:0:0:42:14:0:0 chr1 159850401 . C G 293.4 PASS AO=75;DP=162;FAO=75;FDP=162;FR=.;FRO=87;FSAF=29;FSAR=46;FSRF=25;FSRR=62;FWDB=-0.00225147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.616;QD=7.24439;RBI=0.00390274;REFB=-0.000486927;REVB=-0.00318783;RO=87;SAF=29;SAR=46;SRF=25;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104431;STB=0.557678;TYPE=snp;VARB=0.000587182;OID=.;OPOS=159850401;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:162:87:87:75:75:46:29:25:62:46:29:25:62 chr1 159898043 . GC G 120.7 PASS AO=11;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0949616;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=14.478;QD=26.8211;RBI=0.347644;REFB=0;REVB=0.334423;RO=3;SAF=6;SAR=5;SRF=0;SRR=3;SSEN=0.319864;SSEP=0;SSSB=0.205996;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0363395;OID=.;OPOS=159898044;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:11:16:18:18:0:9:9:0:0:11:3:6:5:0:3 chr1 159898100 . A G 243.17 PASS AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0425904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.141;QD=37.4103;RBI=0.043005;REFB=0;REVB=-0.00595718;RO=0;SAF=15;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000371779;OID=.;OPOS=159898100;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:25:26:0:0:25:26:10:15:0:0:10:16:0:0 chr1 159923111 . T G 1366.76 PASS AO=143;DP=145;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0255961;FXX=0.0137922;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.932;QD=38.2309;RBI=0.0401948;REFB=0;REVB=0.0309914;RO=0;SAF=75;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.13135e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000164035;OID=.;OPOS=159923111;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:145:143:0:0:143:143:68:75:0:0:68:75:0:0 chr1 160124875 . G A 764 PASS AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0221009;FXX=0.0124984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.731;QD=38.6835;RBI=0.0240227;REFB=0;REVB=0.00941498;RO=0;SAF=38;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.82996e-05;OID=.;OPOS=160124875;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:80:79:0:0:79:79:41:38:0:0:41:38:0:0 chr1 160134205 . C T 301.15 PASS AO=79;DP=175;FAO=79;FDP=175;FR=.;FRO=96;FSAF=35;FSAR=44;FSRF=44;FSRR=52;FWDB=-0.00426349;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.183;QD=6.88343;RBI=0.0844048;REFB=-0.0036407;REVB=-0.084297;RO=94;SAF=35;SAR=44;SRF=44;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0247627;STB=0.508482;TYPE=snp;VARB=0.00469999;OID=.;OPOS=160134205;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:175:94:96:79:79:44:35:44:50:44:35:44:52 chr1 160136350 . G A 257.29 PASS AO=67;DP=149;FAO=67;FDP=149;FR=.;FRO=82;FSAF=30;FSAR=37;FSRF=31;FSRR=51;FWDB=-0.0122371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7712;QD=6.90709;RBI=0.0146272;REFB=-0.0218697;REVB=0.00801312;RO=82;SAF=30;SAR=37;SRF=31;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0703549;STB=0.539094;TYPE=snp;VARB=0.017199;OID=.;OPOS=160136350;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:82:82:67:67:37:30:31:51:37:30:31:51 chr1 160141196 . C T 2213.31 PASS AO=227;DP=228;FAO=232;FDP=232;FR=.;FRO=0;FSAF=111;FSAR=121;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0546024;FXX=0.00429166;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2834;QD=38.1606;RBI=0.0701576;REFB=0;REVB=0.0440529;RO=0;SAF=107;SAR=120;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.30101e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000198945;OID=.;OPOS=160141196;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:228:232:0:0:227:232:120:107:0:0:121:111:0:0 chr1 160268981 . G A 537.53 PASS AO=132;DP=273;FAO=133;FDP=278;FR=.;FRO=145;FSAF=46;FSAR=87;FSRF=55;FSRR=90;FWDB=-0.0304527;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5198;QD=7.73428;RBI=0.0309233;REFB=-0.0176924;REVB=0.00537452;RO=141;SAF=46;SAR=86;SRF=51;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0135966;STB=0.519047;TYPE=snp;VARB=0.0178388;OID=.;OPOS=160268981;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:273:278:141:145:132:133:86:46:51:90:87:46:55:90 chr1 160303416 . G A 958.05 PASS AO=99;DP=99;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.72;QD=37.9426;RBI=0.0421523;REFB=0;REVB=0.0408445;RO=0;SAF=47;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.28099e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.50629e-05;OID=.;OPOS=160303416;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:99:101:0:0:99:101:52:47:0:0:54:47:0:0 chr1 160321499 . C T 229.63 PASS AO=81;DP=218;FAO=83;FDP=233;FR=.;FRO=150;FSAF=40;FSAR=43;FSRF=74;FSRR=76;FWDB=0.0109285;FXX=0.0604814;HRUN=5;LEN=1;MLLD=163.412;QD=3.94213;RBI=0.0168028;REFB=-0.00368171;REVB=-0.0127633;RO=134;SAF=38;SAR=43;SRF=63;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00112137;STB=0.507347;TYPE=snp;VARB=0.00423021;OID=.;OPOS=160321499;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:218:233:134:150:81:83:43:38:63:71:43:40:74:76 chr1 160341876 . G A 621.64 PASS AO=57;DP=59;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00235569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.863;QD=36.0368;RBI=0.0512547;REFB=0;REVB=0.0512006;RO=0;SAF=31;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19358e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000657728;OID=.;OPOS=160341876;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:59:69:0:0:57:69:26:31:0:0:31:38:0:0 chr1 160342015 . T G 1128.59 PASS AO=117;DP=119;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014724;FXX=0.0168053;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.314;QD=38.5843;RBI=0.0832999;REFB=0;REVB=0.0819882;RO=0;SAF=52;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.10611e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000273934;OID=.;OPOS=160342015;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:119:117:0:0:117:117:65:52:0:0:65:52:0:0 chr1 160342162 . C CTTAT,T 101.77 PASS AO=6,5;DP=24;FAO=9,5;FDP=16;FR=.;FRO=2;FSAF=1,4;FSAR=8,1;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.000570401,0.0451898;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=4,1;MLLD=212.647,81.4495;QD=25.4434;RBI=0.0132918,0.0623582;REFB=0.0123958,0.0768471;REVB=-0.0132796,-0.0429701;RO=11;SAF=1,4;SAR=5,1;SRF=3;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.165502,0.531405;STB=0.555441,0.748924;TYPE=ins,snp;VARB=0.00192408,0.00535818;OID=.,.;OPOS=160342163,160342162;OREF=-,C;OALT=TTAT,T;OMAPALT=CTTAT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:19:24:16:11:2:6,5:9,5:5,1:1,4:3:8:8,1:1,4:0:2 chr1 160393905 . A G 312.25 PASS AO=42;DP=51;FAO=42;FDP=51;FR=.;FRO=9;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=0;FWDB=-0.00536098;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=176.004;QD=24.4901;RBI=0.0110586;REFB=-0.0101547;REVB=0.00967227;RO=7;SAF=24;SAR=18;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118994;STB=0.578911;TYPE=snp;VARB=0.000563686;OID=.;OPOS=160393905;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:51:51:7:9:42:42:18:24:7:0:18:24:9:0 chr1 160394937 . A C 178.4 PASS AO=39;DP=81;FAO=41;FDP=83;FR=.;FRO=42;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=0.004745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.887;QD=8.59734;RBI=0.00489307;REFB=-0.0120663;REVB=-0.0011946;RO=41;SAF=25;SAR=14;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0309278;STB=0.507689;TYPE=snp;VARB=0.0193619;OID=.;OPOS=160394937;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:83:41:42:39:41:14:25:25:16:16:25:25:17 chr1 160395003 . G A 268.49 PASS AO=62;DP=124;FAO=62;FDP=124;FR=.;FRO=62;FSAF=41;FSAR=21;FSRF=37;FSRR=25;FWDB=-0.000965073;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.8188;QD=8.66101;RBI=0.013482;REFB=-0.0174817;REVB=0.0134474;RO=62;SAF=41;SAR=21;SRF=37;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0636335;STB=0.535176;TYPE=snp;VARB=0.0134058;OID=.;OPOS=160395003;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:62:62:62:62:21:41:37:25:21:41:37:25 chr1 160397254 . G T 124.89 PASS AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.6016;QD=35.6817;RBI=0.0483448;REFB=0;REVB=0.0483448;RO=0;SAF=0;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000328357;OID=.;OPOS=160397254;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:14:14:0:0:14:14:14:0:0:0:14:0:0:0 chr1 160518115 . T C 310.79 PASS AO=73;DP=148;FAO=73;FDP=148;FR=.;FRO=75;FSAF=6;FSAR=67;FSRF=12;FSRR=63;FWDB=-0.00843993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.774;QD=8.39984;RBI=0.0183651;REFB=-0.0265201;REVB=-0.0163109;RO=74;SAF=6;SAR=67;SRF=12;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194868;STB=0.607217;TYPE=snp;VARB=0.0306051;OID=.;OPOS=160518115;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:74:75:73:73:67:6:12:62:67:6:12:63 chr1 160585496 . A G 195.09 PASS AO=43;DP=83;FAO=43;FDP=83;FR=.;FRO=40;FSAF=33;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=14;FWDB=0.00599875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.162;QD=9.40169;RBI=0.00609627;REFB=-0.00407653;REVB=0.00108608;RO=40;SAF=33;SAR=10;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131312;STB=0.573046;TYPE=snp;VARB=0.00420234;OID=.;OPOS=160585496;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:40:40:43:43:10:33:26:14:10:33:26:14 chr1 160585524 . G A 144.3 PASS AO=42;DP=97;FAO=40;FDP=96;FR=.;FRO=56;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=39;FSRR=17;FWDB=-0.0196197;FXX=0.0103082;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.8048;QD=6.01248;RBI=0.0368303;REFB=-0.0199848;REVB=-0.0311695;RO=53;SAF=24;SAR=18;SRF=37;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131902;STB=0.574039;TYPE=snp;VARB=0.030217;OID=.;OPOS=160585524;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:96:53:56:42:40:18:24:37:16:17:23:39:17 chr1 160585554 . C G 1037.04 PASS AO=108;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0356872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.302;QD=38.409;RBI=0.049661;REFB=0;REVB=0.0345346;RO=0;SAF=56;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.59964e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.12061e-06;OID=.;OPOS=160585554;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:108:108:0:0:108:108:52:56:0:0:52:56:0:0 chr1 160616703 . G T 129.67 PASS AO=29;DP=59;FAO=29;FDP=59;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=8;FWDB=0.0666662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.189;QD=8.79084;RBI=0.0666964;REFB=-0.0126339;REVB=0.00200703;RO=29;SAF=6;SAR=23;SRF=22;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.502395;STB=0.775708;TYPE=snp;VARB=0.00998228;OID=.;OPOS=160616703;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:29:30:29:29:23:6:22:7:23:6:22:8 chr1 160650913 . A G 677.13 PASS AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0211847;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.9856;QD=38.6932;RBI=0.0270657;REFB=0;REVB=0.0168452;RO=0;SAF=40;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.39833e-05;OID=.;OPOS=160650913;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:70:70:0:0:70:70:30:40:0:0:30:40:0:0 chr1 160793442 . A G 282.67 PASS AO=73;DP=161;FAO=73;FDP=161;FR=.;FRO=88;FSAF=42;FSAR=31;FSRF=59;FSRR=29;FWDB=0.0322234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.4627;QD=7.02287;RBI=0.038367;REFB=-0.013855;REVB=0.020825;RO=86;SAF=42;SAR=31;SRF=59;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112829;STB=0.554047;TYPE=snp;VARB=0.0112412;OID=.;OPOS=160793442;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:161:86:88:73:73:31:42:59:27:31:42:59:29 chr1 160793560 . A G 301.86 PASS AO=65;DP=119;FAO=64;FDP=119;FR=.;FRO=55;FSAF=43;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=27;FWDB=-0.0579731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.621;QD=10.1465;RBI=0.0586792;REFB=-0.0136602;REVB=0.00907559;RO=54;SAF=44;SAR=21;SRF=27;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15684;STB=0.580565;TYPE=snp;VARB=0.0148648;OID=.;OPOS=160793560;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:54:55:65:64:21:44:27:27:21:43:28:27 chr1 160793962 . G C 440.05 PASS AO=92;DP=167;FAO=92;FDP=167;FR=.;FRO=75;FSAF=37;FSAR=55;FSRF=22;FSRR=53;FWDB=-0.0120957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.194;QD=10.5402;RBI=0.0227772;REFB=-0.00381812;REVB=-0.0193001;RO=74;SAF=37;SAR=55;SRF=21;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103107;STB=0.551847;TYPE=snp;VARB=0.00244847;OID=.;OPOS=160793962;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:167:74:75:92:92:55:37:21:53:55:37:22:53 chr1 160851826 . A T 360.04 PASS AO=84;DP=169;FAO=84;FDP=169;FR=.;FRO=85;FSAF=24;FSAR=60;FSRF=21;FSRR=64;FWDB=-0.00322535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.7954;QD=8.52176;RBI=0.0061088;REFB=-0.00938689;REVB=-0.00518792;RO=83;SAF=24;SAR=60;SRF=20;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0508393;STB=0.524307;TYPE=snp;VARB=0.0150347;OID=.;OPOS=160851826;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:169:83:85:84:84:60:24:20:63:60:24:21:64 chr1 160851894 . G A 227.95 PASS AO=50;DP=97;FAO=51;FDP=99;FR=.;FRO=48;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=10;FSRR=38;FWDB=0.0242563;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.9216;QD=9.21018;RBI=0.0258176;REFB=-0.0334706;REVB=-0.00884191;RO=47;SAF=22;SAR=28;SRF=10;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209421;STB=0.621578;TYPE=snp;VARB=0.0337075;OID=.;OPOS=160851894;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:99:47:48:50:51:28:22:10:37:28:23:10:38 chr1 160920966 . C T 301.24 PASS AO=71;DP=144;FAO=71;FDP=144;FR=.;FRO=73;FSAF=21;FSAR=50;FSRF=17;FSRR=56;FWDB=0.0293297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.76;QD=8.36783;RBI=0.0294766;REFB=-0.0106288;REVB=0.00293962;RO=73;SAF=21;SAR=50;SRF=17;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0718404;STB=0.539495;TYPE=snp;VARB=0.00872844;OID=.;OPOS=160920966;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:144:73:73:71:71:50:21:17:56:50:21:17:56 chr1 160968609 . G A 144.15 PASS AO=36;DP=80;FAO=36;FDP=80;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=33;FSRR=11;FWDB=0.00368528;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.741;QD=7.20738;RBI=0.00369557;REFB=-0.013431;REVB=0.000275566;RO=44;SAF=16;SAR=20;SRF=33;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.294264;STB=0.663872;TYPE=snp;VARB=0.0174092;OID=.;OPOS=160968609;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:44:44:36:36:20:16:33:11:20:16:33:11 chr1 160971146 . A G 508.51 PASS AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0259516;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.805;QD=37.6672;RBI=0.0353118;REFB=0;REVB=0.0239466;RO=0;SAF=18;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000233491;OID=.;OPOS=160971146;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:54:54:0:0:54:54:36:18:0:0:36:18:0:0 chr1 160971155 . G C 100.11 PASS AO=23;DP=51;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=4;FSAR=20;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=-0.032146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.281;QD=7.70069;RBI=0.0324375;REFB=-0.0296078;REVB=0.00433905;RO=27;SAF=4;SAR=19;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.296236;STB=0.669481;TYPE=snp;VARB=0.0208476;OID=.;OPOS=160971155;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:52:27:28:23:24:19:4:11:16:20:4:11:17 chr1 160990876 . C A 346.2 PASS AO=51;DP=69;FAO=51;FDP=68;FR=.;FRO=17;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.0274192;FXX=0.0144907;HRUN=3;LEN=1;MLLD=216.707;QD=20.3649;RBI=0.0313808;REFB=-0.0148302;REVB=0.0152624;RO=17;SAF=18;SAR=33;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0296136;STB=0.515941;TYPE=snp;VARB=0.00154767;OID=.;OPOS=160990876;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:69:68:17:17:51:51:33:18:7:10:33:18:7:10 chr1 160990878 . C T 355.67 PASS AO=51;DP=68;FAO=51;FDP=66;FR=.;FRO=15;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0101593;FXX=0.0294074;HRUN=3;LEN=1;MLLD=144.337;QD=21.5556;RBI=0.0529334;REFB=0.0291365;REVB=0.0519493;RO=14;SAF=18;SAR=33;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00184417;STB=0.511623;TYPE=snp;VARB=-0.00800986;OID=.;OPOS=160990878;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:68:66:14:15:51:51:33:18:5:9:33:18:6:9 chr1 161009095 . AG A 22.61 PASS AO=3;DP=8;FAO=4;FDP=9;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.6574;QD=10.051;RBI=0.0612248;REFB=0.025906;REVB=-0.0612248;RO=4;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.0241979;OID=.;OPOS=161009096;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:3:7:4:9:5:0:4:0:5:21:4:0:3:0:4 chr1 161009523 . G A 331.72 PASS AO=60;DP=109;FAO=66;FDP=115;FR=.;FRO=49;FSAF=25;FSAR=41;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=-0.00591239;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.732;QD=11.5382;RBI=0.0595548;REFB=-0.0193292;REVB=0.0592606;RO=47;SAF=25;SAR=35;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110378;STB=0.566493;TYPE=snp;VARB=0.0205629;OID=.;OPOS=161009523;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:115:47:49:60:66:35:25:26:21:41:25:26:23 chr1 161017556 . C T 217.66 PASS AO=44;DP=80;FAO=44;FDP=80;FR=.;FRO=36;FSAF=38;FSAR=6;FSRF=31;FSRR=5;FWDB=0.0311804;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.742;QD=10.8832;RBI=0.0313999;REFB=-0.0161535;REVB=-0.00370569;RO=36;SAF=38;SAR=6;SRF=31;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00436523;STB=0.502403;TYPE=snp;VARB=0.0130311;OID=.;OPOS=161017556;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:36:36:44:44:6:38:31:5:6:38:31:5 chr1 161019040 . G C 549.42 PASS AO=61;DP=63;FAO=61;FDP=63;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0083258;FXX=0.0156226;HRUN=3;LEN=1;MLLD=157.061;QD=34.884;RBI=0.0220269;REFB=0.0248166;REVB=0.0203928;RO=2;SAF=23;SAR=38;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00782079;STB=0.504145;TYPE=snp;VARB=-8.73897e-05;OID=.;OPOS=161019040;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:63:63:2:2:61:61:38:23:1:1:38:23:1:1 chr1 161068831 . ACCCCA ACCCA,ACCCC 247.6 PASS AO=11,11;DP=65;FAO=22,23;FDP=54;FR=.;FRO=9;FSAF=9,4;FSAR=13,19;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.0472165,0.0707178;FXX=0.129011;HRUN=4,1;LEN=1,1;MLLD=10.6932,55.2202;QD=18.3409;RBI=0.233401,0.0732596;REFB=-0.210182,0.00206927;REVB=0.228575,-0.0191302;RO=13;SAF=7,3;SAR=4,8;SRF=2;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0.283951,0;SSSB=0.426146,0.152167;STB=0.522915,0.570749;TYPE=del,del;VARB=0.10613,0.0114373;OID=.,.;OPOS=161068832,161068836;OREF=C,A;OALT=-,-;OMAPALT=ACCCA,ACCCC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:11,11:54:22,23:54:9:9,4:13,19:3:6:88:13:7,3:4,8:2:11 chr1 161141432 . C G 94.06 PASS AO=26;DP=64;FAO=26;FDP=64;FR=.;FRO=38;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=9;FSRR=29;FWDB=0.00612233;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.3317;QD=5.87866;RBI=0.0124447;REFB=-0.0110142;REVB=-0.0108345;RO=37;SAF=7;SAR=19;SRF=9;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0346962;STB=0.524981;TYPE=snp;VARB=0.0251893;OID=.;OPOS=161141432;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:64:64:37:38:26:26:19:7:9:28:19:7:9:29 chr1 161160456 . ATTTT ATTT,ATTTTCA 121.71 PASS AO=12,10;DP=70;FAO=4,25;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=0,4;FSAR=4,21;FSRF=4;FSRR=28;FWDB=0.0376312,0.0592845;FXX=0.102926;HRUN=4,1;LEN=1,2;MLLD=8.67307,75.5323;QD=7.98095;RBI=0.0726127,0.145214;REFB=-0.182024,-0.0508114;REVB=-0.0621007,0.132561;RO=17;SAF=1,4;SAR=11,6;SRF=2;SRR=15;SSEN=0.319444,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0996084,0.346115;STB=0.995569,0.538432;TYPE=del,ins;VARB=0.200703,0.122078;OID=.,.;OPOS=161160457,161160461;OREF=T,-;OALT=-,CA;OMAPALT=ATTT,ATTTTCA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:12,10:52:4,25:61:32:0,4:4,21:4:28:99:17:1,4:11,6:2:15 chr1 161161229 . AG A 196 PASS AO=23;DP=37;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.270602;FXX=0.0270197;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.3486;QD=21.7776;RBI=0.375219;REFB=-0.00848969;REVB=0.25993;RO=9;SAF=19;SAR=4;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0.299398;SSSB=0.0417001;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0267247;OID=.;OPOS=161161230;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:23:37:36:36:0:27:9:0:0:16:9:19:4:7:2 chr1 161166070 . G A 94.79 PASS AO=20;DP=40;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=-0.0423683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.804;QD=9.47893;RBI=0.0610576;REFB=-0.0176123;REVB=0.0439655;RO=20;SAF=4;SAR=16;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.467669;STB=0.765677;TYPE=snp;VARB=0.0291816;OID=.;OPOS=161166070;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:40:40:20:20:20:20:16:4:14:6:16:4:14:6 chr1 161168184 . AGGGGC AGGGC,AGGGGT 309.49 PASS AO=7,12;DP=49;FAO=14,28;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=8,6;FSAR=6,22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.173511,0.108994;FXX=0.0454442;HRUN=4,1;LEN=1,1;MLLD=9.32114,88.2415;QD=29.4747;RBI=0.242823,0.119843;REFB=0,0;REVB=-0.169873,0.0498279;RO=4;SAF=4,3;SAR=3,9;SRF=4;SRR=0;SSEN=0.333333,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.290716,-0.354427;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.150818,0.0222536;OID=.,.;OPOS=161168185,161168189;OREF=G,C;OALT=-,T;OMAPALT=AGGGC,AGGGGT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:7,12:27:14,28:42:0:8,6:6,22:0:0:41:4:4,3:3,9:4:0 chr1 161182208 . C G 234.31 PASS AO=45;DP=83;FAO=47;FDP=83;FR=.;FRO=36;FSAF=30;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.00944892;FXX=0.0119033;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.5124;QD=11.2922;RBI=0.0177347;REFB=0.00340964;REVB=0.0150079;RO=37;SAF=29;SAR=16;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0671913;STB=0.538027;TYPE=snp;VARB=-0.00257225;OID=.;OPOS=161182208;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:37:36:45:47:16:29:21:16:17:30:20:16 chr1 161202605 . G A 156.38 PASS AO=34;DP=66;FAO=34;FDP=66;FR=.;FRO=32;FSAF=28;FSAR=6;FSRF=25;FSRR=7;FWDB=0.0284402;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=258.68;QD=9.47763;RBI=0.0309298;REFB=0.0109445;REVB=0.0121575;RO=32;SAF=28;SAR=6;SRF=25;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0604126;STB=0.533704;TYPE=snp;VARB=-0.00953155;OID=.;OPOS=161202605;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:32:32:34:34:6:28:25:7:6:28:25:7 chr1 161479745 . A G 1748.01 PASS AO=183;DP=187;FAO=184;FDP=184;FR=.;FRO=0;FSAF=99;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0286625;FXX=0.0264536;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.082;QD=38.0003;RBI=0.0322559;REFB=-0.0441853;REVB=-0.0147954;RO=0;SAF=99;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000119876;OID=.;OPOS=161479745;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:187:184:0:0:183:184:84:99:0:0:85:99:0:0 chr1 161495477 . A T 113.2 PASS AO=26;DP=54;FAO=26;FDP=54;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-8.13878e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.1845;QD=8.38547;RBI=0.0363366;REFB=-0.00346227;REVB=0.0363365;RO=28;SAF=11;SAR=15;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136733;STB=0.576864;TYPE=snp;VARB=0.00461231;OID=.;OPOS=161495477;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:28:28:26:26:15:11:16:12:15:11:16:12 chr1 161495885 . T C 293.07 PASS AO=36;DP=38;FAO=36;FDP=40;FR=.;FRO=4;FSAF=25;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0204294;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.0877;QD=29.3069;RBI=0.0222671;REFB=-0.125756;REVB=-0.00885792;RO=2;SAF=26;SAR=10;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.084785;STB=0.522495;TYPE=snp;VARB=0.0092613;OID=.;OPOS=161495885;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:38:40:2:4:36:36:10:26:0:2:11:25:2:2 chr1 161496530 . C G 322.53 PASS AO=79;DP=178;FAO=85;FDP=184;FR=.;FRO=99;FSAF=55;FSAR=30;FSRF=59;FSRR=40;FWDB=0.00831549;FXX=0.0107521;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.347;QD=7.0115;RBI=0.00983605;REFB=-0.00847878;REVB=0.00525362;RO=90;SAF=55;SAR=24;SRF=53;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115437;STB=0.529567;TYPE=snp;VARB=0.00994374;OID=.;OPOS=161496530;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:184:90:99:79:85:24:55:53:37:30:55:59:40 chr1 161500130 . A G 93.36 PASS AO=29;DP=78;FAO=29;FDP=78;FR=.;FRO=49;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=28;FSRR=21;FWDB=0.0136038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.5652;QD=4.7876;RBI=0.0276241;REFB=0.011854;REVB=-0.0240422;RO=48;SAF=13;SAR=16;SRF=28;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145834;STB=0.576904;TYPE=snp;VARB=-0.0200612;OID=.;OPOS=161500130;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:78:78:48:49:29:29:16:13:28:20:16:13:28:21 chr1 161500975 . A G 197.27 PASS AO=46;DP=97;FAO=47;FDP=95;FR=.;FRO=48;FSAF=33;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=-0.0326733;FXX=0.0206164;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.1659;QD=8.30607;RBI=0.0362804;REFB=-0.0192746;REVB=-0.0157708;RO=49;SAF=33;SAR=13;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.26622;STB=0.631521;TYPE=snp;VARB=0.0191792;OID=.;OPOS=161500975;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:95:49:48:46:47:13:33:22:27:14:33:22:26 chr1 161501904 . A T 230.33 PASS AO=78;DP=243;FAO=87;FDP=252;FR=.;FRO=165;FSAF=49;FSAR=38;FSRF=50;FSRR=115;FWDB=0.00907787;FXX=0.00395241;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.899;QD=3.65604;RBI=0.0366774;REFB=0.00159769;REVB=0.0355362;RO=165;SAF=48;SAR=30;SRF=49;SRR=116;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.362621;STB=0.665832;TYPE=snp;VARB=-0.00508347;OID=.;OPOS=161501904;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:243:252:165:165:78:87:30:48:49:116:38:49:50:115 chr1 161514542 . A C 473.96 PASS AO=125;DP=275;FAO=125;FDP=275;FR=.;FRO=150;FSAF=84;FSAR=41;FSRF=69;FSRR=81;FWDB=-0.00278547;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=290.391;QD=6.89401;RBI=0.00441409;REFB=0.00995788;REVB=0.00342423;RO=150;SAF=84;SAR=41;SRF=69;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216865;STB=0.620282;TYPE=snp;VARB=-0.0111247;OID=.;OPOS=161514542;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:275:275:150:150:125:125:41:84:69:81:41:84:69:81 chr1 161565761 . AT A 156.49 PASS AO=36;DP=77;FAO=40;FDP=62;FR=.;FRO=22;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=4;FSRR=18;FWDB=-0.280718;FXX=0.0746157;HRUN=4;LEN=1;MLLD=17.4681;QD=10.0958;RBI=0.299704;REFB=0.000394462;REVB=-0.104977;RO=20;SAF=13;SAR=23;SRF=3;SRR=17;SSEN=0.347639;SSEP=0;SSSB=0.157598;STB=0.583294;TYPE=del;VARB=-0.0165717;OID=.;OPOS=161565762;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:36:66:40:62:22:16:24:4:18:34:20:13:23:3:17 chr1 161569569 . C T 179.89 PASS AO=52;DP=127;FAO=52;FDP=127;FR=.;FRO=75;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=44;FSRR=31;FWDB=0.00216511;FXX=0.00781189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.5063;QD=5.66597;RBI=0.028092;REFB=-0.0449975;REVB=-0.0280084;RO=74;SAF=22;SAR=30;SRF=43;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164159;STB=0.59599;TYPE=snp;VARB=0.0648297;OID=.;OPOS=161569569;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:74:75:52:52:30:22:43:31:30:22:44:31 chr1 161574628 . A G 526.5 PASS AO=118;DP=229;FAO=118;FDP=227;FR=.;FRO=109;FSAF=33;FSAR=85;FSRF=37;FSRR=72;FWDB=0.0343283;FXX=0.00873324;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.8169;QD=9.27754;RBI=0.0377941;REFB=-0.0179481;REVB=-0.0158103;RO=107;SAF=33;SAR=85;SRF=36;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0594035;STB=0.534537;TYPE=snp;VARB=0.0173836;OID=.;OPOS=161574628;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:229:227:107:109:118:118:85:33:36:71:85:33:37:72 chr1 161574654 . G A 1485.49 PASS AO=159;DP=162;FAO=160;FDP=160;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=131;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0257134;FXX=0.116016;HRUN=4;LEN=1;MLLD=170.318;QD=37.1373;RBI=0.0280732;REFB=-0.0804629;REVB=-0.0112663;RO=1;SAF=29;SAR=130;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00364635;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00102397;OID=.;OPOS=161574654;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:162:160:1:0:159:160:130:29:0:1:131:29:0:0 chr1 161581803 . T C 279.34 PASS AO=56;DP=100;FAO=56;FDP=100;FR=.;FRO=44;FSAF=20;FSAR=36;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=-0.0209242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.09;QD=11.1737;RBI=0.0270547;REFB=-0.010296;REVB=0.0171504;RO=44;SAF=20;SAR=36;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120014;STB=0.565844;TYPE=snp;VARB=0.00914512;OID=.;OPOS=161581803;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:44:44:56:56:36:20:22:22:36:20:22:22 chr1 161591548 . C T 386.85 PASS AO=40;DP=40;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0565795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.357;QD=35.1681;RBI=0.0588402;REFB=-0.0495313;REVB=-0.0161535;RO=0;SAF=14;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50943;TYPE=snp;VARB=0.00064059;OID=.;OPOS=161591548;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:40:44:0:1:40:43:26:14:0:0:26:17:0:1 chr1 161599693 . T C 1153.13 PASS AO=122;DP=124;FAO=124;FDP=126;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=88;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00500576;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.3928;QD=36.6073;RBI=0.0657116;REFB=-0.0828797;REVB=0.0655206;RO=2;SAF=36;SAR=86;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0256562;STB=0.513511;TYPE=snp;VARB=0.00119753;OID=.;OPOS=161599693;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:124:126:2:2:122:124:86:36:2:0:88:36:2:0 chr1 161643269 . C T 65.24 PASS AO=17;DP=41;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=1;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=0.0125222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.999;QD=6.21345;RBI=0.0637359;REFB=-0.0355105;REVB=-0.0624937;RO=24;SAF=16;SAR=1;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.55808;STB=0.849692;TYPE=snp;VARB=0.0374929;OID=.;OPOS=161643269;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:41:42:24:25:17:17:1:16:15:9:1:16:15:10 chr1 161680258 . G A 563.14 PASS AO=125;DP=242;FAO=126;FDP=241;FR=.;FRO=115;FSAF=81;FSAR=45;FSRF=61;FSRR=54;FWDB=0.00878301;FXX=0.0122946;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3583;QD=9.34664;RBI=0.0143173;REFB=-0.0182347;REVB=0.0113068;RO=114;SAF=81;SAR=44;SRF=60;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111921;STB=0.556518;TYPE=snp;VARB=0.015497;OID=.;OPOS=161680258;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:242:241:114:115:125:126:44:81:60:54:45:81:61:54 chr1 161680518 . T A 159.56 PASS AO=40;DP=88;FAO=40;FDP=88;FR=.;FRO=48;FSAF=13;FSAR=27;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=-0.00563171;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=257.063;QD=7.25285;RBI=0.0167749;REFB=-0.00489721;REVB=0.0158013;RO=48;SAF=13;SAR=27;SRF=27;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23826;STB=0.633734;TYPE=snp;VARB=0.00635934;OID=.;OPOS=161680518;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:48:48:40:40:27:13:27:21:27:13:27:21 chr1 161681848 . C T 185.32 PASS AO=43;DP=88;FAO=43;FDP=88;FR=.;FRO=45;FSAF=15;FSAR=28;FSRF=11;FSRR=34;FWDB=0.0686832;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3245;QD=8.42359;RBI=0.0686856;REFB=-0.019374;REVB=-0.000580635;RO=45;SAF=15;SAR=28;SRF=11;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110129;STB=0.56089;TYPE=snp;VARB=0.0258866;OID=.;OPOS=161681848;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:45:45:43:43:28:15:11:34:28:15:11:34 chr1 161683136 . G A 78.51 PASS AO=39;DP=142;FAO=39;FDP=142;FR=.;FRO=103;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=52;FSRR=51;FWDB=0.0104446;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.796;QD=2.21159;RBI=0.0171319;REFB=-0.00586222;REVB=0.0135798;RO=103;SAF=15;SAR=24;SRF=52;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148727;STB=0.588319;TYPE=snp;VARB=0.0150291;OID=.;OPOS=161683136;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:142:142:103:103:39:39:24:15:52:51:24:15:52:51 chr1 161695639 . G T 65.55 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.119464;FXX=0.124844;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1874;QD=37.4598;RBI=0.129954;REFB=0;REVB=0.0511508;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0173466;OID=.;OPOS=161695639;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:7:7:0:0:7:7:3:4:0:0:3:4:0:0 chr1 161696088 . T C 195.71 PASS AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0397796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.78;QD=39.1419;RBI=0.039798;REFB=0;REVB=-0.00121118;RO=0;SAF=8;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000143904;OID=.;OPOS=161696088;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:20:20:0:0:20:20:12:8:0:0:12:8:0:0 chr1 161696782 . G C 56.31 PASS AO=9;DP=15;FAO=10;FDP=17;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0426834;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.5379;QD=13.2493;RBI=0.0437327;REFB=-0.00549955;REVB=-0.00952243;RO=6;SAF=0;SAR=9;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.772566;STB=0.545356;TYPE=snp;VARB=0.00879707;OID=.;OPOS=161696782;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:15:17:6:7:9:10:9:0:1:5:9:1:1:6 chr1 161705871 . C G 170.98 PASS AO=29;DP=44;FAO=29;FDP=44;FR=.;FRO=15;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.0233866;FXX=0.0222173;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.011;QD=15.5432;RBI=0.0576344;REFB=-0.00737644;REVB=-0.0526763;RO=15;SAF=15;SAR=14;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0100238;STB=0.505491;TYPE=snp;VARB=0.00212553;OID=.;OPOS=161705871;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:44:44:15:15:29:29:14:15:8:7:14:15:8:7 chr1 161751741 . A G 335.77 PASS AO=92;DP=204;FAO=91;FDP=203;FR=.;FRO=112;FSAF=53;FSAR=38;FSRF=59;FSRR=53;FWDB=0.0382033;FXX=0.0145624;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.249;QD=6.61616;RBI=0.0383658;REFB=-0.0211475;REVB=0.00352711;RO=111;SAF=54;SAR=38;SRF=58;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0646442;STB=0.531219;TYPE=snp;VARB=0.0258969;OID=.;OPOS=161751741;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:203:111:112:92:91:38:54:58:53:38:53:59:53 chr1 161823011 . T A 886.33 PASS AO=97;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.728;QD=36.5498;RBI=0.0510276;REFB=0;REVB=0.0474051;RO=0;SAF=39;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00186076;OID=.;OPOS=161823011;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:97:97:0:0:97:97:58:39:0:0:58:39:0:0 chr1 161928327 . A G 1642.05 PASS AO=171;DP=171;FAO=172;FDP=172;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0205182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.435;QD=38.1871;RBI=0.025925;REFB=0;REVB=-0.0158464;RO=0;SAF=85;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.77944e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.13416e-06;OID=.;OPOS=161928327;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:171:172:0:0:171:172:86:85:0:0:86:86:0:0 chr1 161967681 . A G 86.38 PASS AO=23;DP=82;FAO=32;FDP=88;FR=.;FRO=56;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=38;FSRR=18;FWDB=-0.00955874;FXX=0.0329634;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.9931;QD=3.92628;RBI=0.0281661;REFB=-0.0378226;REVB=0.0264945;RO=53;SAF=21;SAR=2;SRF=37;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.428746;STB=0.515888;TYPE=snp;VARB=0.0439386;OID=.;OPOS=161967681;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:82:88:53:56:23:32:2:21:37:16:11:21:38:18 chr1 161976234 . A G 56.08 PASS AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=-0.0150386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.033;QD=7.4773;RBI=0.0285861;REFB=-0.00988078;REVB=-0.0243106;RO=17;SAF=6;SAR=7;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167528;STB=0.596717;TYPE=snp;VARB=0.00888702;OID=.;OPOS=161976234;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:30:30:17:17:13:13:7:6:5:12:7:6:5:12 chr1 162313735 . C T 388.57 PASS AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0452563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.029;QD=35.3245;RBI=0.102127;REFB=0.00838081;REVB=0.0915519;RO=1;SAF=28;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0302739;STB=0.516121;TYPE=snp;VARB=0.000916531;OID=.;OPOS=162313735;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:44:44:1:1:43:43:15:28:0:1:15:28:0:1 chr1 162345091 . G A 2314.44 PASS AO=240;DP=243;FAO=241;FDP=241;FR=.;FRO=0;FSAF=138;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026937;FXX=0.0242905;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.784;QD=38.4139;RBI=0.0655948;REFB=0;REVB=0.0598086;RO=0;SAF=137;SAR=103;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.01061e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000121178;OID=.;OPOS=162345091;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:243:241:0:0:240:241:103:137:0:0:103:138:0:0 chr1 162354803 . G C 478.36 PASS AO=124;DP=270;FAO=124;FDP=270;FR=.;FRO=146;FSAF=79;FSAR=45;FSRF=63;FSRR=83;FWDB=-0.0125613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.273;QD=7.08685;RBI=0.0219382;REFB=-0.0122035;REVB=-0.0179861;RO=146;SAF=79;SAR=45;SRF=63;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203779;STB=0.612756;TYPE=snp;VARB=0.0120765;OID=.;OPOS=162354803;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:270:270:146:146:124:124:45:79:63:83:45:79:63:83 chr1 162467944 . GC G 134.06 PASS AO=39;DP=85;FAO=61;FDP=84;FR=.;FRO=23;FSAF=25;FSAR=36;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.123714;FXX=0.0117633;HRUN=3;LEN=1;MLLD=9.24144;QD=6.38399;RBI=0.124411;REFB=-0.0361224;REVB=-0.0131524;RO=27;SAF=9;SAR=30;SRF=14;SRR=13;SSEN=0.327103;SSEP=0;SSSB=-0.254405;STB=0.50704;TYPE=del;VARB=0.0979727;OID=.;OPOS=162467945;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:39:84:61:84:23:25:36:10:13:24:27:9:30:14:13 chr1 162740327 . T C 2259.35 PASS AO=235;DP=239;FAO=236;FDP=236;FR=.;FRO=0;FSAF=120;FSAR=116;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000381603;FXX=0.016666;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.005;QD=38.2941;RBI=0.0774388;REFB=0;REVB=0.0774379;RO=0;SAF=120;SAR=115;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000179608;OID=.;OPOS=162740327;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:239:236:0:0:235:236:115:120:0:0:116:120:0:0 chr1 162765475 . G C 498.6 PASS AO=53;DP=54;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00444682;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.3172;QD=36.2621;RBI=0.0204585;REFB=0.00780092;REVB=0.0199693;RO=1;SAF=23;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200431;STB=0.510634;TYPE=snp;VARB=0.000538103;OID=.;OPOS=162765475;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:54:55:1:1:53:54:30:23:1:0:31:23:1:0 chr1 162775267 . C T 94.68 PASS AO=25;DP=60;FAO=25;FDP=60;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=0.0534469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.6502;QD=6.31216;RBI=0.0685288;REFB=-0.0140155;REVB=-0.042891;RO=35;SAF=11;SAR=14;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0118765;STB=0.50677;TYPE=snp;VARB=0.0220944;OID=.;OPOS=162775267;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:60:60:35:35:25:25:14:11:15:20:14:11:15:20 chr1 162824553 . G A 226.7 PASS AO=52;DP=104;FAO=52;FDP=104;FR=.;FRO=52;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=23;FSRR=29;FWDB=-0.0318613;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.825;QD=8.71925;RBI=0.035881;REFB=-0.00735886;REVB=0.0165016;RO=52;SAF=24;SAR=28;SRF=23;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.017512;STB=0.509683;TYPE=snp;VARB=0.00715864;OID=.;OPOS=162824553;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:52:52:52:52:28:24:23:29:28:24:23:29 chr1 162825457 . C A 622.8 PASS AO=150;DP=306;FAO=150;FDP=306;FR=.;FRO=156;FSAF=64;FSAR=86;FSRF=81;FSRR=75;FWDB=-0.0449553;FXX=0.00970842;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.3;QD=8.14116;RBI=0.0519759;REFB=-0.0270335;REVB=-0.0260866;RO=144;SAF=64;SAR=86;SRF=71;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0601074;STB=0.547548;TYPE=snp;VARB=0.0265189;OID=.;OPOS=162825457;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:306:306:144:156:150:150:86:64:71:73:86:64:81:75 chr1 163142316 . G A 441.8 PASS AO=99;DP=192;FAO=99;FDP=191;FR=.;FRO=92;FSAF=65;FSAR=34;FSRF=43;FSRR=49;FWDB=-0.022644;FXX=0.00520806;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.3095;QD=9.2524;RBI=0.0226596;REFB=-0.0211402;REVB=0.000840503;RO=90;SAF=65;SAR=34;SRF=41;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181367;STB=0.594995;TYPE=snp;VARB=0.0185086;OID=.;OPOS=163142316;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:191:90:92:99:99:34:65:41:49:34:65:43:49 chr1 163172574 . G C 207.73 PASS AO=43;DP=80;FAO=43;FDP=80;FR=.;FRO=37;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=11;FWDB=-0.0200367;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=287.804;QD=10.3865;RBI=0.0200812;REFB=-0.000709157;REVB=-0.00133561;RO=37;SAF=26;SAR=17;SRF=26;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0879479;STB=0.548365;TYPE=snp;VARB=0.000616347;OID=.;OPOS=163172574;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:37:37:43:43:17:26:26:11:17:26:26:11 chr1 163297322 . A C 520.07 PASS AO=128;DP=263;FAO=128;FDP=264;FR=.;FRO=136;FSAF=43;FSAR=85;FSRF=72;FSRR=64;FWDB=-0.0145901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.8654;QD=7.87985;RBI=0.0571323;REFB=-0.0330096;REVB=0.0552379;RO=134;SAF=43;SAR=85;SRF=70;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181209;STB=0.60405;TYPE=snp;VARB=0.0341211;OID=.;OPOS=163297322;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:263:264:134:136:128:128:85:43:70:64:85:43:72:64 chr1 163313539 . C T 3800.78 PASS AO=513;DP=520;FAO=398;FDP=398;FR=.;FRO=0;FSAF=174;FSAR=224;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000318775;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.3902;QD=38.1988;RBI=0.00117225;REFB=0;REVB=0.00112807;RO=1;SAF=231;SAR=282;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00169025;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000113541;OID=.;OPOS=163313539;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:520:398:1:0:513:398:282:231:0:1:224:174:0:0 chr1 163893042 . G A 494.53 PASS AO=110;DP=216;FAO=112;FDP=215;FR=.;FRO=103;FSAF=43;FSAR=69;FSRF=53;FSRR=50;FWDB=-0.00516407;FXX=0.00921617;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.3688;QD=9.20047;RBI=0.0259138;REFB=-0.0234461;REVB=-0.0253941;RO=102;SAF=43;SAR=67;SRF=53;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11535;STB=0.564165;TYPE=snp;VARB=0.00962929;OID=.;OPOS=163893042;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:216:215:102:103:110:112:67:43:53:49:69:43:53:50 chr1 164608825 . G A 1463.28 PASS AO=153;DP=153;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00132731;FXX=0.0129024;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.975;QD=38.2557;RBI=0.0289015;REFB=0;REVB=0.028871;RO=0;SAF=74;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60783e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.141e-05;OID=.;OPOS=164608825;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:153:153:0:0:153:153:79:74:0:0:79:74:0:0 chr1 165173216 . A G 664.48 PASS AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0607504;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.7511;QD=38.5208;RBI=0.0607504;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=69;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000457078;OID=.;OPOS=165173216;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:69:69:0:0:69:69:0:69:0:0:0:69:0:0 chr1 165218679 . C T 70.37 PASS AO=12;DP=22;FAO=13;FDP=23;FR=.;FRO=10;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0552802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.87;QD=12.2382;RBI=0.0569897;REFB=-0.0411404;REVB=-0.0138539;RO=10;SAF=9;SAR=3;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.302688;STB=0.63359;TYPE=snp;VARB=0.0146358;OID=.;OPOS=165218679;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:22:23:10:10:12:13:3:9:4:6:4:9:4:6 chr1 165218792 . G A 80.89 PASS AO=32;DP=98;FAO=31;FDP=98;FR=.;FRO=67;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=45;FWDB=-0.059273;FXX=0.0101;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.7249;QD=3.30154;RBI=0.0659168;REFB=-0.00339097;REVB=0.0288399;RO=65;SAF=15;SAR=17;SRF=22;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153285;STB=0.607101;TYPE=snp;VARB=0.00609314;OID=.;OPOS=165218792;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:98:98:65:67:32:31:17:15:22:43:16:15:22:45 chr1 165377552 . G A 406.07 PASS AO=95;DP=191;FAO=95;FDP=191;FR=.;FRO=96;FSAF=35;FSAR=60;FSRF=34;FSRR=62;FWDB=-0.0554659;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0342;QD=8.50409;RBI=0.0561935;REFB=0.013608;REVB=-0.00901344;RO=96;SAF=35;SAR=60;SRF=34;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.014058;STB=0.507727;TYPE=snp;VARB=-0.0152111;OID=.;OPOS=165377552;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:191:191:96:96:95:95:60:35:34:62:60:35:34:62 chr1 165533005 . C A 139.13 PASS AO=26;DP=45;FAO=26;FDP=44;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=17;FWDB=-0.00857506;FXX=0.0222173;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.313;QD=12.6481;RBI=0.00895546;REFB=-0.016306;REVB=0.00258237;RO=17;SAF=6;SAR=20;SRF=0;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.2754;STB=0.613186;TYPE=snp;VARB=0.00989968;OID=.;OPOS=165533005;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:45:44:17:18:26:26:20:6:0:17:20:6:1:17 chr1 165601466 . G A 254.87 PASS AO=66;DP=145;FAO=66;FDP=146;FR=.;FRO=80;FSAF=29;FSAR=37;FSRF=37;FSRR=43;FWDB=-0.00489759;FXX=0.0135126;HRUN=4;LEN=1;MLLD=238.81;QD=6.98268;RBI=0.0158737;REFB=-0.00216152;REVB=-0.0150993;RO=78;SAF=29;SAR=37;SRF=35;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00921041;STB=0.512806;TYPE=snp;VARB=0.00276239;OID=.;OPOS=165601466;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:146:78:80:66:66:37:29:35:43:37:29:37:43 chr1 165601538 . T TC 82.9 PASS AO=47;DP=142;FAO=51;FDP=138;FR=.;FRO=87;FSAF=10;FSAR=41;FSRF=37;FSRR=50;FWDB=-0.00899706;FXX=0.028167;HRUN=2;LEN=1;MLLD=23.0604;QD=2.40287;RBI=0.0476539;REFB=0.000137271;REVB=0.0467968;RO=89;SAF=9;SAR=38;SRF=38;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.326435;STB=0.67916;TYPE=ins;VARB=-0.00311609;OID=.;OPOS=165601539;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:47:142:51:138:87:10:41:37:50:82:89:9:38:38:51 chr1 165619079 . C T 330.71 PASS AO=88;DP=194;FAO=87;FDP=193;FR=.;FRO=106;FSAF=42;FSAR=45;FSRF=55;FSRR=51;FWDB=0.00397856;FXX=0.0102559;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.703;QD=6.85415;RBI=0.0553419;REFB=-0.00403873;REVB=-0.0551987;RO=105;SAF=42;SAR=46;SRF=55;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0456497;STB=0.519824;TYPE=snp;VARB=0.00420907;OID=.;OPOS=165619079;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:193:105:106:88:87:46:42:55:50:45:42:55:51 chr1 165630698 . A G 281.86 PASS AO=58;DP=108;FAO=59;FDP=109;FR=.;FRO=50;FSAF=18;FSAR=41;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=0.0536282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8009;QD=10.3436;RBI=0.0536315;REFB=-0.00432451;REVB=-0.000595997;RO=50;SAF=17;SAR=41;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207954;STB=0.606553;TYPE=snp;VARB=0.00409449;OID=.;OPOS=165630698;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:109:50:50:58:59:41:17:26:24:41:18:26:24 chr1 165652273 . A G 167.81 PASS AO=54;DP=146;FAO=55;FDP=146;FR=.;FRO=91;FSAF=31;FSAR=24;FSRF=54;FSRR=37;FWDB=-0.0195603;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.9271;QD=4.59763;RBI=0.0248507;REFB=0.00850473;REVB=-0.0153282;RO=92;SAF=30;SAR=24;SRF=55;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0477344;STB=0.518945;TYPE=snp;VARB=-0.0183179;OID=.;OPOS=165652273;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:92:91:54:55:24:30:55:37:24:31:54:37 chr1 165737704 . C G 776.48 PASS AO=88;DP=92;FAO=88;FDP=92;FR=.;FRO=4;FSAF=43;FSAR=45;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0254349;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=275.625;QD=33.7601;RBI=0.02693;REFB=-0.030124;REVB=0.0088481;RO=3;SAF=43;SAR=45;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111162;STB=0.500494;TYPE=snp;VARB=0.00144272;OID=.;OPOS=165737704;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:92:92:3:4:88:88:45:43:2:1:45:43:2:2 chr1 165865478 . G A 215.07 PASS AO=59;DP=133;FAO=58;FDP=133;FR=.;FRO=75;FSAF=9;FSAR=49;FSRF=32;FSRR=43;FWDB=0.0515052;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.8323;QD=6.46813;RBI=0.0885312;REFB=-0.029967;REVB=0.0720068;RO=72;SAF=9;SAR=50;SRF=32;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.382553;STB=0.708059;TYPE=snp;VARB=0.0403798;OID=.;OPOS=165865478;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:72:75:59:58:50:9:32:40:49:9:32:43 chr1 166818566 . A G 472.74 PASS AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00292733;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.594;QD=37.8188;RBI=0.00503594;REFB=0;REVB=-0.00409773;RO=0;SAF=34;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.84962e-05;OID=.;OPOS=166818566;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:50:50:0:0:50:50:16:34:0:0:16:34:0:0 chr1 166958601 . T C 519.79 PASS AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00485628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.02;QD=37.8028;RBI=0.0269153;REFB=0;REVB=0.0264736;RO=0;SAF=38;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97918e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000160328;OID=.;OPOS=166958601;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:55:55:0:0:55:55:17:38:0:0:17:38:0:0 chr1 166958710 . T G 329.99 PASS AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.132978;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.5002;QD=37.7125;RBI=0.133478;REFB=0;REVB=0.011545;RO=0;SAF=23;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00103605;OID=.;OPOS=166958710;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:36:35:0:0:35:35:12:23:0:0:12:23:0:0 chr1 167095163 . G C 1767.45 PASS AO=189;DP=193;FAO=191;FDP=191;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0413646;FXX=0.0154631;HRUN=3;LEN=1;MLLD=80.8727;QD=37.0147;RBI=0.0560532;REFB=-0.113151;REVB=0.0378276;RO=4;SAF=79;SAR=110;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00681861;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.70547e-05;OID=.;OPOS=167095163;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:193:191:4:0:189:191:110:79:1:3:111:80:0:0 chr1 167097567 . G A 436.43 PASS AO=46;DP=49;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0504024;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.249;QD=34.9143;RBI=0.16206;REFB=-0.0312627;REVB=0.154023;RO=3;SAF=17;SAR=29;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0461894;STB=0.507933;TYPE=snp;VARB=0.00756631;OID=.;OPOS=167097567;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:49:50:3:1:46:49:29:17:0:3:31:18:0:1 chr1 167097739 . C A 306.48 PASS AO=29;DP=29;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00948379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.826;QD=37.1484;RBI=0.089268;REFB=0;REVB=0.0887628;RO=0;SAF=16;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000594989;OID=.;OPOS=167097739;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:29:33:0:0:29:33:13:16:0:0:17:16:0:0 chr1 167510996 . G A 808.33 PASS AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0119728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.8784;QD=38.0389;RBI=0.024869;REFB=0;REVB=0.0217972;RO=0;SAF=74;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.2017e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.59026e-05;OID=.;OPOS=167510996;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:85:85:0:0:85:85:11:74:0:0:11:74:0:0 chr1 167515428 . G A 388.86 PASS AO=102;DP=227;FAO=103;FDP=229;FR=.;FRO=126;FSAF=37;FSAR=66;FSRF=53;FSRR=73;FWDB=-0.00981737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.787;QD=6.79227;RBI=0.00992992;REFB=-0.0171545;REVB=-0.00149079;RO=123;SAF=37;SAR=65;SRF=52;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0627209;STB=0.535949;TYPE=snp;VARB=0.0208396;OID=.;OPOS=167515428;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:227:229:123:126:102:103:65:37:52:71:66:37:53:73 chr1 167802294 . T A 451.26 PASS AO=100;DP=202;FAO=103;FDP=200;FR=.;FRO=97;FSAF=60;FSAR=43;FSRF=39;FSRR=58;FWDB=0.00850143;FXX=0.0196069;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.756;QD=9.02513;RBI=0.0242776;REFB=-0.00241492;REVB=0.0227404;RO=99;SAF=58;SAR=42;SRF=41;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150098;STB=0.587363;TYPE=snp;VARB=0.00299585;OID=.;OPOS=167802294;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:200:99:97:100:103:42:58:41:58:43:60:39:58 chr1 167817639 . A G 156.58 PASS AO=40;DP=90;FAO=40;FDP=90;FR=.;FRO=50;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=-0.02202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.635;QD=6.95899;RBI=0.0388136;REFB=-0.0232497;REVB=-0.0319627;RO=47;SAF=24;SAR=16;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0880033;STB=0.534229;TYPE=snp;VARB=0.0267327;OID=.;OPOS=167817639;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:47:50:40:40:16:24:24:23:16:24:27:23 chr1 167906239 . A C 201.65 PASS AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0214238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.666;QD=36.6634;RBI=0.0484867;REFB=0;REVB=0.043497;RO=0;SAF=9;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2029e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000252887;OID=.;OPOS=167906239;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:22:22:0:0:22:22:13:9:0:0:13:9:0:0 chr1 168013850 . T C 1451.59 PASS AO=152;DP=154;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143774;FXX=0.0129862;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.633;QD=38.1997;RBI=0.0502834;REFB=0;REVB=0.0481841;RO=0;SAF=78;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.65373e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.29259e-05;OID=.;OPOS=168013850;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:154:152:0:0:152:152:74:78:0:0:74:78:0:0 chr1 168511284 . T C 27.55 PASS AO=26;DP=137;FAO=26;FDP=137;FR=.;FRO=111;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=60;FSRR=51;FWDB=-0.00561391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.519;QD=0.804272;RBI=0.0148055;REFB=-0.00722454;REVB=-0.0136998;RO=108;SAF=15;SAR=11;SRF=58;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0514467;STB=0.529891;TYPE=snp;VARB=0.0429141;OID=.;OPOS=168511284;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:137:137:108:111:26:26:11:15:58:50:11:15:60:51 chr1 168513129 . C T 414.97 PASS AO=71;DP=114;FAO=74;FDP=116;FR=.;FRO=42;FSAF=52;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=0.0032982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.034;QD=14.3092;RBI=0.02759;REFB=0.00209916;REVB=0.0273921;RO=42;SAF=49;SAR=22;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108867;STB=0.563705;TYPE=snp;VARB=-0.00123654;OID=.;OPOS=168513129;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:116:42:42:71:74:22:49:23:19:22:52:23:19 chr1 168545949 . G A 193.77 PASS AO=68;DP=201;FAO=71;FDP=204;FR=.;FRO=133;FSAF=26;FSAR=45;FSRF=45;FSRR=88;FWDB=-4.39548e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.947;QD=3.79943;RBI=0.00390398;REFB=-0.00495074;REVB=-0.00390373;RO=132;SAF=26;SAR=42;SRF=44;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0609266;STB=0.51976;TYPE=snp;VARB=0.00888102;OID=.;OPOS=168545949;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:204:132:133:68:71:42:26:44:88:45:26:45:88 chr1 168698173 . C T 378.65 PASS AO=63;DP=96;FAO=64;FDP=96;FR=.;FRO=32;FSAF=35;FSAR=29;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=0.093813;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.0906;QD=15.7771;RBI=0.112786;REFB=-0.0656117;REVB=0.0626085;RO=32;SAF=34;SAR=29;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0143237;STB=0.505258;TYPE=snp;VARB=0.0327171;OID=.;OPOS=168698173;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:96:96:32:32:63:64:29:34:18:14:29:35:18:14 chr1 169101935 . C T 684.24 PASS AO=145;DP=264;FAO=146;FDP=266;FR=.;FRO=120;FSAF=76;FSAR=70;FSRF=50;FSRR=70;FWDB=0.0109837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.454;QD=10.2893;RBI=0.0116092;REFB=-0.0164041;REVB=-0.00375925;RO=119;SAF=76;SAR=69;SRF=50;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0859572;STB=0.546756;TYPE=snp;VARB=0.0120132;OID=.;OPOS=169101935;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:264:266:119:120:145:146:69:76:50:69:70:76:50:70 chr1 169256524 . T C 318.45 PASS AO=92;DP=222;FAO=92;FDP=220;FR=.;FRO=128;FSAF=35;FSAR=57;FSRF=56;FSRR=72;FWDB=-0.00297632;FXX=0.0090086;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.597;QD=5.79004;RBI=0.0272605;REFB=-0.0150091;REVB=-0.0270976;RO=126;SAF=35;SAR=57;SRF=55;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0604995;STB=0.534624;TYPE=snp;VARB=0.0230881;OID=.;OPOS=169256524;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:220:126:128:92:92:57:35:55:71:57:35:56:72 chr1 169272451 . A T 2394.82 PASS AO=260;DP=267;FAO=260;FDP=266;FR=.;FRO=6;FSAF=99;FSAR=161;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.108405;FXX=0.00374518;HRUN=5;LEN=1;MLLD=113.5;QD=36.0124;RBI=0.108631;REFB=-0.0605428;REVB=0.00700766;RO=3;SAF=99;SAR=161;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00109399;STB=0.501135;TYPE=snp;VARB=0.000132853;OID=.;OPOS=169272451;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:267:266:3:6:260:260:161:99:1:2:161:99:2:4 chr1 169272453 . G A 2411.16 PASS AO=257;DP=262;FAO=258;FDP=258;FR=.;FRO=0;FSAF=99;FSAR=159;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0070679;FXX=0.0190107;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.3515;QD=37.3823;RBI=0.00834765;REFB=-0.113975;REVB=0.00444162;RO=3;SAF=98;SAR=159;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0011189;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000190263;OID=.;OPOS=169272453;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:92:262:258:3:0:257:258:159:98:1:2:159:99:0:0 chr1 169345868 . A G 300.66 PASS AO=82;DP=188;FAO=82;FDP=188;FR=.;FRO=106;FSAF=45;FSAR=37;FSRF=62;FSRR=44;FWDB=0.0453006;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.4786;QD=6.39695;RBI=0.0458585;REFB=-0.00152705;REVB=0.00713134;RO=106;SAF=45;SAR=37;SRF=62;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0370835;STB=0.520642;TYPE=snp;VARB=0.00193912;OID=.;OPOS=169345868;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:188:106:106:82:82:37:45:62:44:37:45:62:44 chr1 169366516 . G A 491.02 PASS AO=164;DP=438;FAO=157;FDP=392;FR=.;FRO=235;FSAF=76;FSAR=81;FSRF=103;FSRR=132;FWDB=0.0295902;FXX=0.0199995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.525;QD=5.01045;RBI=0.0339736;REFB=-0.0147922;REVB=0.0166922;RO=269;SAF=77;SAR=87;SRF=119;SRR=150;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0301508;STB=0.527516;TYPE=snp;VARB=0.0228695;OID=.;OPOS=169366516;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:438:392:269:235:164:157:87:77:119:150:81:76:103:132 chr1 169391154 . A G 629.31 PASS AO=145;DP=284;FAO=145;FDP=284;FR=.;FRO=139;FSAF=58;FSAR=87;FSRF=73;FSRR=66;FWDB=-0.0210777;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=197.473;QD=8.86352;RBI=0.0269332;REFB=-0.0102903;REVB=-0.016767;RO=138;SAF=58;SAR=87;SRF=73;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116583;STB=0.562223;TYPE=snp;VARB=0.0118957;OID=.;OPOS=169391154;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:284:284:138:139:145:145:87:58:73:65:87:58:73:66 chr1 169435027 . C T 1267.26 PASS AO=134;DP=137;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0228617;FXX=0.0218962;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.8863;QD=37.8286;RBI=0.0333789;REFB=0.00956098;REVB=-0.0243207;RO=1;SAF=59;SAR=75;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00798857;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.74742e-05;OID=.;OPOS=169435027;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:137:134:1:0:134:134:75:59:1:0:75:59:0:0 chr1 169437890 . C T 136.22 PASS AO=40;DP=100;FAO=40;FDP=101;FR=.;FRO=61;FSAF=31;FSAR=9;FSRF=45;FSRR=16;FWDB=0.0467612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.2516;QD=5.39503;RBI=0.0518195;REFB=-0.0138997;REVB=-0.0223304;RO=60;SAF=31;SAR=9;SRF=45;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0369588;STB=0.53117;TYPE=snp;VARB=0.0217333;OID=.;OPOS=169437890;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:101:60:61:40:40:9:31:45:15:9:31:45:16 chr1 169509760 . A G 444.49 PASS AO=114;DP=251;FAO=115;FDP=250;FR=.;FRO=135;FSAF=59;FSAR=56;FSRF=87;FSRR=48;FWDB=0.0171502;FXX=0.00793619;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.217;QD=7.11187;RBI=0.0364357;REFB=-0.0161819;REVB=0.0321471;RO=133;SAF=59;SAR=55;SRF=87;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134241;STB=0.571257;TYPE=snp;VARB=0.0225611;OID=.;OPOS=169509760;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:251:250:133:135:114:115:55:59:87:46:56:59:87:48 chr1 169510233 . G A 183.42 PASS AO=42;DP=90;FAO=43;FDP=89;FR=.;FRO=46;FSAF=37;FSAR=6;FSRF=41;FSRR=5;FWDB=0.00347583;FXX=0.0111099;HRUN=3;LEN=1;MLLD=130.213;QD=8.24362;RBI=0.0440666;REFB=-0.116609;REVB=0.0439293;RO=38;SAF=36;SAR=6;SRF=33;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0201267;STB=0.534842;TYPE=snp;VARB=0.0570107;OID=.;OPOS=169510233;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:89:38:46:42:43:6:36:33:5:6:37:41:5 chr1 169519049 . T C 1505.91 PASS AO=158;DP=161;FAO=160;FDP=160;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301581;FXX=0.00621079;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.618;QD=37.6478;RBI=0.0446872;REFB=-0.0490953;REVB=0.0329762;RO=1;SAF=68;SAR=90;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00525741;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.49734e-05;OID=.;OPOS=169519049;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:161:160:1:0:158:160:90:68:0:1:92:68:0:0 chr1 169580885 . C T 77.14 PASS AO=24;DP=70;FAO=25;FDP=71;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=29;FSRR=17;FWDB=0.0047765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.9307;QD=4.34612;RBI=0.00691346;REFB=-0.00765399;REVB=0.0049981;RO=46;SAF=17;SAR=7;SRF=29;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100494;STB=0.53591;TYPE=snp;VARB=0.00620258;OID=.;OPOS=169580885;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:70:71:46:46:24:25:7:17:29:17:8:17:29:17 chr1 169582317 . C T 152.54 PASS AO=34;DP=67;FAO=34;FDP=68;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=0.00761904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.0629;QD=8.97282;RBI=0.0275488;REFB=-0.0270785;REVB=0.0264743;RO=31;SAF=13;SAR=21;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0552285;STB=0.515674;TYPE=snp;VARB=0.0268917;OID=.;OPOS=169582317;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:68:31:34:34:34:21:13:10:21:21:13:12:22 chr1 169673838 . G A 1716.5 PASS AO=183;DP=185;FAO=183;FDP=183;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0162284;FXX=0.0108102;HRUN=3;LEN=1;MLLD=232.884;QD=37.5192;RBI=0.0162564;REFB=-0.0285978;REVB=0.000953782;RO=2;SAF=76;SAR=107;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00881549;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000154184;OID=.;OPOS=169673838;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:185:183:2:0:183:183:107:76:0:2:107:76:0:0 chr1 169677709 . A G 1888.78 PASS AO=201;DP=207;FAO=201;FDP=201;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0361703;FXX=0.0289841;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.341;QD=37.5877;RBI=0.0366093;REFB=0.0605646;REVB=0.00565255;RO=2;SAF=81;SAR=120;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00189105;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.52596e-05;OID=.;OPOS=169677709;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:207:201:2:0:201:201:120:81:1:1:120:81:0:0 chr1 169692522 . T C 965.92 PASS AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.25;QD=38.6368;RBI=0.0138082;REFB=0;REVB=-0.00672575;RO=0;SAF=54;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21299e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.18164e-05;OID=.;OPOS=169692522;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:100:100:0:0:100:100:46:54:0:0:46:54:0:0 chr1 169694918 . A G 3144.8 PASS AO=326;DP=327;FAO=327;FDP=327;FR=.;FRO=0;FSAF=171;FSAR=156;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00577319;FXX=0.00304869;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.209;QD=38.4685;RBI=0.0290955;REFB=0;REVB=0.0285169;RO=0;SAF=171;SAR=155;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.20797e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.12134e-05;OID=.;OPOS=169694918;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:327:327:0:0:326:327:155:171:0:0:156:171:0:0 chr1 169696946 . G A 1894.68 PASS AO=196;DP=197;FAO=197;FDP=197;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=114;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00331897;FXX=0.00505025;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.077;QD=38.4707;RBI=0.0291157;REFB=0;REVB=0.0289259;RO=0;SAF=83;SAR=113;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.41274e-05;OID=.;OPOS=169696946;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:89:197:197:0:0:196:197:113:83:0:0:114:83:0:0 chr1 169702705 . G A 935.19 PASS AO=100;DP=101;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230529;FXX=0.00990001;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.9051;QD=37.4075;RBI=0.0294537;REFB=-0.0242328;REVB=0.0183327;RO=1;SAF=51;SAR=49;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00958321;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000934677;OID=.;OPOS=169702705;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:101:100:1:0:100:100:49:51:0:1:49:51:0:0 chr1 169768033 . T C 305.55 PASS AO=65;DP=122;FAO=65;FDP=121;FR=.;FRO=56;FSAF=28;FSAR=37;FSRF=26;FSRR=30;FWDB=-0.0108692;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.2125;QD=10.1008;RBI=0.0557479;REFB=-0.01476;REVB=0.0546781;RO=56;SAF=28;SAR=37;SRF=26;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.028695;STB=0.515741;TYPE=snp;VARB=0.0101193;OID=.;OPOS=169768033;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:121:56:56:65:65:37:28:26:30:37:28:26:30 chr1 169768080 . C A 346.35 PASS AO=71;DP=135;FAO=74;FDP=138;FR=.;FRO=64;FSAF=29;FSAR=45;FSRF=31;FSRR=33;FWDB=-0.0138277;FXX=0.0142847;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.837;QD=10.0391;RBI=0.0224455;REFB=-0.012827;REVB=0.0176804;RO=64;SAF=30;SAR=41;SRF=31;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0541854;STB=0.544123;TYPE=snp;VARB=0.0129592;OID=.;OPOS=169768080;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:138:64:64:71:74:41:30:31:33:45:29:31:33 chr1 169773317 . G A 414.26 PASS AO=96;DP=193;FAO=97;FDP=194;FR=.;FRO=97;FSAF=22;FSAR=75;FSRF=39;FSRR=58;FWDB=-0.0364755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.936;QD=8.54147;RBI=0.0384439;REFB=-0.00602576;REVB=0.0121437;RO=97;SAF=22;SAR=74;SRF=39;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195904;STB=0.609894;TYPE=snp;VARB=0.00557979;OID=.;OPOS=169773317;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:194:97:97:96:97:74:22:39:58:75:22:39:58 chr1 169795276 . A C 10.3 PASS AO=2;DP=8;FAO=2;FDP=8;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0741792;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=133.865;QD=5.14865;RBI=0.0838352;REFB=0.00066084;REVB=0.0390613;RO=6;SAF=1;SAR=1;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168213;STB=0.623829;TYPE=snp;VARB=0.0108753;OID=.;OPOS=169795276;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:8:6:6:2:2:1:1:2:4:1:1:2:4 chr1 169822369 . T TCTAA 184.15 PASS AO=56;DP=148;FAO=57;FDP=145;FR=.;FRO=88;FSAF=20;FSAR=37;FSRF=38;FSRR=50;FWDB=-0.0039123;FXX=0.0202689;HRUN=1;LEN=4;MLLD=230.84;QD=5.08001;RBI=0.00505276;REFB=-0.0178404;REVB=0.00319755;RO=89;SAF=20;SAR=36;SRF=39;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0926096;STB=0.55222;TYPE=ins;VARB=0.0290458;OID=.;OPOS=169822370;OREF=-;OALT=CTAA;OMAPALT=TCTAA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:56:148:57:145:88:20:37:38:50:99:89:20:36:39:50 chr1 169823718 . T C 507.24 PASS AO=119;DP=237;FAO=119;FDP=239;FR=.;FRO=120;FSAF=69;FSAR=50;FSRF=50;FSRR=70;FWDB=-0.0284191;FXX=0.00416649;HRUN=4;LEN=1;MLLD=86.3626;QD=8.48935;RBI=0.0368092;REFB=-0.0136014;REVB=-0.0233938;RO=99;SAF=69;SAR=50;SRF=43;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121711;STB=0.581856;TYPE=snp;VARB=0.0189629;OID=.;OPOS=169823718;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:237:239:99:120:119:119:50:69:43:56:50:69:50:70 chr1 169927228 . T TG 681.53 PASS AO=86;DP=104;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.183236;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=19.0154;QD=27.5364;RBI=0.278234;REFB=0;REVB=0.209377;RO=16;SAF=46;SAR=40;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0656108;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.0078793;OID=.;OPOS=169927229;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:86:104:99:99:0:49:50:0:0:55:16:46:40:5:11 chr1 170501385 . A C 150.78 PASS AO=16;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0831838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.881;QD=35.4772;RBI=0.0954425;REFB=0;REVB=0.0467945;RO=0;SAF=6;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00115501;OID=.;OPOS=170501385;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:17:17:0:0:16:17:10:6:0:0:11:6:0:0 chr1 170521376 . G A 432.79 PASS AO=108;DP=232;FAO=109;FDP=232;FR=.;FRO=123;FSAF=54;FSAR=55;FSRF=61;FSRR=62;FWDB=-0.00561072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.587;QD=7.4619;RBI=0.00674608;REFB=-0.00749688;REVB=0.00374557;RO=119;SAF=54;SAR=54;SRF=60;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00399346;STB=0.500277;TYPE=snp;VARB=0.0070885;OID=.;OPOS=170521376;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:232:119:123:108:109:54:54:60:59:55:54:61:62 chr1 170705685 . CTATATA C 50 PASS AO=37;DP=174;LEN=6;RO=137;SAF=32;SAR=88;SRF=35;SRR=19;TYPE=del;FR=.;OID=.;OPOS=170705686;OREF=TATATA;OALT=-;OMAPALT=C GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR 0/1:99:174:137:37:88:32:35:19 chr1 170916646 . G T 271.56 PASS AO=66;DP=139;FAO=66;FDP=139;FR=.;FRO=73;FSAF=39;FSAR=27;FSRF=46;FSRR=27;FWDB=0.026584;FXX=0.0141834;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.139;QD=7.8146;RBI=0.0266077;REFB=-0.001289;REVB=0.00112215;RO=67;SAF=39;SAR=27;SRF=46;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0921984;STB=0.521466;TYPE=snp;VARB=0.00267097;OID=.;OPOS=170916646;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:67:73:66:66:27:39:46:21:27:39:46:27 chr1 170928671 . T C 160.58 PASS AO=45;DP=110;FAO=46;FDP=113;FR=.;FRO=67;FSAF=9;FSAR=37;FSRF=13;FSRR=54;FWDB=0.0305439;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1201;QD=5.68419;RBI=0.050834;REFB=-0.0454455;REVB=-0.0406345;RO=65;SAF=8;SAR=37;SRF=13;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0385405;STB=0.50153;TYPE=snp;VARB=0.0581241;OID=.;OPOS=170928671;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:113:65:67:45:46:37:8:13:52:37:9:13:54 chr1 170934394 . T C 130.64 PASS AO=34;DP=78;FAO=34;FDP=78;FR=.;FRO=44;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=14;FSRR=30;FWDB=0.000291863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.124;QD=6.69934;RBI=0.00664086;REFB=-0.0107959;REVB=0.00663444;RO=43;SAF=11;SAR=23;SRF=13;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0242697;STB=0.503452;TYPE=snp;VARB=0.0211426;OID=.;OPOS=170934394;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:43:44:34:34:23:11:13:30:23:11:14:30 chr1 170959029 . C T 240.9 PASS AO=69;DP=165;FAO=69;FDP=165;FR=.;FRO=96;FSAF=40;FSAR=29;FSRF=51;FSRR=45;FWDB=-0.0302168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.066;QD=5.84;RBI=0.0302297;REFB=-0.00371106;REVB=-0.000883947;RO=96;SAF=40;SAR=29;SRF=51;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0511317;STB=0.528657;TYPE=snp;VARB=0.00461173;OID=.;OPOS=170959029;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:165:96:96:69:69:29:40:51:45:29:40:51:45 chr1 170959088 . C T 255.76 PASS AO=66;DP=149;FAO=67;FDP=150;FR=.;FRO=83;FSAF=38;FSAR=29;FSRF=40;FSRR=43;FWDB=0.00209048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.244;QD=6.82026;RBI=0.00465763;REFB=-0.00344112;REVB=0.00416213;RO=82;SAF=37;SAR=29;SRF=39;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0847797;STB=0.547405;TYPE=snp;VARB=0.00617055;OID=.;OPOS=170959088;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:150:82:83:66:67:29:37:39:43:29:38:40:43 chr1 171076935 . C T 498.69 PASS AO=133;DP=308;FAO=141;FDP=328;FR=.;FRO=187;FSAF=70;FSAR=71;FSRF=82;FSRR=105;FWDB=-0.00712404;FXX=0.00303942;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.607;QD=6.08162;RBI=0.00781496;REFB=-0.00529512;REVB=0.00321273;RO=174;SAF=70;SAR=63;SRF=82;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0561384;STB=0.533052;TYPE=snp;VARB=0.00812118;OID=.;OPOS=171076935;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:308:328:174:187:133:141:63:70:82:92:71:70:82:105 chr1 171077274 . G T 497.51 PASS AO=126;DP=268;FAO=126;FDP=268;FR=.;FRO=142;FSAF=72;FSAR=54;FSRF=75;FSRR=67;FWDB=0.0251738;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4094;QD=7.42558;RBI=0.0286775;REFB=-0.00933854;REVB=-0.0137361;RO=140;SAF=72;SAR=54;SRF=73;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0483412;STB=0.52324;TYPE=snp;VARB=0.0106934;OID=.;OPOS=171077274;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:268:268:140:142:126:126:54:72:73:67:54:72:75:67 chr1 171083174 . C T 536.99 PASS AO=141;DP=309;FAO=141;FDP=309;FR=.;FRO=168;FSAF=64;FSAR=77;FSRF=107;FSRR=61;FWDB=-0.0285143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.643;QD=6.95131;RBI=0.0330503;REFB=-0.00484985;REVB=-0.0167109;RO=165;SAF=64;SAR=77;SRF=104;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170999;STB=0.598513;TYPE=snp;VARB=0.0058764;OID=.;OPOS=171083174;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:309:309:165:168:141:141:77:64:104:61:77:64:107:61 chr1 171107688 . T C 206.44 PASS AO=52;DP=114;FAO=52;FDP=113;FR=.;FRO=61;FSAF=15;FSAR=37;FSRF=27;FSRR=34;FWDB=0.00706179;FXX=0.00877116;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.9313;QD=7.30744;RBI=0.0267302;REFB=-0.0137207;REVB=-0.0257805;RO=61;SAF=15;SAR=37;SRF=27;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166722;STB=0.593319;TYPE=snp;VARB=0.0306017;OID=.;OPOS=171107688;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:113:61:61:52:52:37:15:27:34:37:15:27:34 chr1 171107737 . G T 371.52 PASS AO=48;DP=104;FAO=51;FDP=103;FR=.,HEALED;FRO=30;FSAF=14;FSAR=37;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=0.0474589;FXX=0.00961446;HRUN=3;LEN=1;MLLD=203.14;QD=14.4279;RBI=0.0621713;REFB=-0.0220751;REVB=-0.0401612;RO=28;SAF=12;SAR=36;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.272594;STB=0.6331;TYPE=snp;VARB=0.0211037;OID=.;OPOS=171107737;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:99:103:28:30:48:51:36:12:17:11:37:14:18:12 chr1 171112490 . C T 808.3 PASS AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00873053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.569;QD=38.0376;RBI=0.017297;REFB=0;REVB=0.0149319;RO=0;SAF=41;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.27834e-05;OID=.;OPOS=171112490;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:85:85:0:0:85:85:44:41:0:0:44:41:0:0 chr1 171121206 . A T 496.68 PASS AO=130;DP=284;FAO=130;FDP=284;FR=.;FRO=154;FSAF=57;FSAR=73;FSRF=73;FSRR=81;FWDB=0.00255333;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.962;QD=6.99546;RBI=0.00378966;REFB=-0.0326992;REVB=-0.00280036;RO=151;SAF=57;SAR=73;SRF=70;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0247225;STB=0.519485;TYPE=snp;VARB=0.0414358;OID=.;OPOS=171121206;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:284:284:151:154:130:130:73:57:70:81:73:57:73:81 chr1 171154959 . A G 694.13 PASS AO=199;DP=444;FAO=182;FDP=397;FR=.;FRO=215;FSAF=99;FSAR=83;FSRF=78;FSRR=137;FWDB=-0.0308788;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.018;QD=6.99373;RBI=0.0525684;REFB=-0.0136856;REVB=-0.0425434;RO=240;SAF=105;SAR=94;SRF=85;SRR=155;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170884;STB=0.597176;TYPE=snp;VARB=0.0119963;OID=.;OPOS=171154959;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:444:397:240:215:199:182:94:105:85:155:83:99:78:137 chr1 171168584 . C T 1748.55 PASS AO=176;DP=177;FAO=184;FDP=184;FR=.;FRO=0;FSAF=112;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.013013;FXX=0.0160419;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.437;QD=38.0118;RBI=0.0151457;REFB=-0.0363849;REVB=-0.00774947;RO=0;SAF=112;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.9608e-05;OID=.;OPOS=171168584;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:177:184:0:0:176:184:64:112:0:0:72:112:0:0 chr1 171168585 . A G 1702.27 PASS AO=175;DP=185;FAO=182;FDP=182;FR=.;FRO=0;FSAF=112;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0360718;FXX=0.0162153;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.96;QD=37.4124;RBI=0.0368265;REFB=-0.0893722;REVB=-0.00741747;RO=0;SAF=113;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.03203e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000154557;OID=.;OPOS=171168585;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:185:182:0:0:175:182:62:113:0:0:70:112:0:0 chr1 171223134 . G A 149.16 PASS AO=41;DP=99;FAO=41;FDP=98;FR=.;FRO=57;FSAF=8;FSAR=33;FSRF=26;FSRR=31;FWDB=-0.0351233;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.0028;QD=6.08825;RBI=0.0362626;REFB=-0.00665906;REVB=0.00901829;RO=56;SAF=8;SAR=33;SRF=26;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.332874;STB=0.686557;TYPE=snp;VARB=0.00665783;OID=.;OPOS=171223134;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:98:56:57:41:41:33:8:26:30:33:8:26:31 chr1 171235742 . A G 310.01 PASS AO=55;DP=91;FAO=57;FDP=92;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=40;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=0.0254731;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.946;QD=13.4787;RBI=0.0324803;REFB=-0.0151778;REVB=-0.0201517;RO=35;SAF=15;SAR=40;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0610788;STB=0.519939;TYPE=snp;VARB=0.00982842;OID=.;OPOS=171235742;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:92:35:35:55:57:40:15:12:23:40:17:12:23 chr1 171250044 . C T 348.38 PASS AO=85;DP=174;FAO=85;FDP=177;FR=.;FRO=92;FSAF=20;FSAR=65;FSRF=21;FSRR=71;FWDB=-0.014968;FXX=0.00561766;HRUN=4;LEN=1;MLLD=263.838;QD=7.87293;RBI=0.015511;REFB=0.00440658;REVB=-0.00406836;RO=89;SAF=20;SAR=65;SRF=18;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0437951;STB=0.505106;TYPE=snp;VARB=-0.008789;OID=.;OPOS=171250044;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:177:89:92:85:85:65:20:18:71:65:20:21:71 chr1 171252287 . A G 136.37 PASS AO=38;DP=92;FAO=38;FDP=92;FR=.;FRO=54;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=32;FWDB=-0.0173596;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=158.307;QD=5.92891;RBI=0.0226732;REFB=0.00408266;REVB=0.0145849;RO=54;SAF=21;SAR=17;SRF=22;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149849;STB=0.584615;TYPE=snp;VARB=-0.00715939;OID=.;OPOS=171252287;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:54:54:38:38:17:21:22:32:17:21:22:32 chr1 171461787 . G A 907.82 PASS AO=95;DP=96;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191792;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.511;QD=38.2238;RBI=0.0517008;REFB=0;REVB=0.0480117;RO=0;SAF=49;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000869863;OID=.;OPOS=171461787;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:96:95:0:0:95:95:46:49:0:0:46:49:0:0 chr1 171483717 . A C 481.29 PASS AO=107;DP=219;FAO=113;FDP=225;FR=.;FRO=112;FSAF=61;FSAR=52;FSRF=49;FSRR=63;FWDB=0.0714097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.904;QD=8.55635;RBI=0.0718753;REFB=-0.0119504;REVB=0.00816839;RO=112;SAF=55;SAR=52;SRF=49;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0710313;STB=0.550835;TYPE=snp;VARB=0.0194314;OID=.;OPOS=171483717;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:219:225:112:112:107:113:52:55:49:63:52:61:49:63 chr1 171509327 . G A 820.12 PASS AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0237523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.6289;QD=38.1453;RBI=0.0312557;REFB=0;REVB=0.0203162;RO=0;SAF=35;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.95834e-05;OID=.;OPOS=171509327;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:86:86:0:0:86:86:51:35:0:0:51:35:0:0 chr1 171511039 . C G 1010.36 PASS AO=116;DP=120;FAO=114;FDP=120;FR=.;FRO=6;FSAF=53;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=-0.0423284;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.858;QD=33.6785;RBI=0.0442501;REFB=-0.166174;REVB=-0.0128989;RO=4;SAF=53;SAR=63;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0291971;STB=0.523433;TYPE=snp;VARB=0.0077425;OID=.;OPOS=171511039;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:120:120:4:6:116:114:63:53:0:4:61:53:0:6 chr1 171514731 . C G 1171.55 PASS AO=120;DP=124;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0103389;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.42;QD=38.0992;RBI=0.0118401;REFB=0;REVB=0.00577015;RO=0;SAF=67;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.40902e-06;OID=.;OPOS=171514731;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:124:123:0:0:120:123:53:67:0:0:56:67:0:0 chr1 171526570 . G A 201.65 PASS AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0318867;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.837;QD=36.6634;RBI=0.0327607;REFB=0;REVB=-0.00751652;RO=0;SAF=3;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000190815;OID=.;OPOS=171526570;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:22:22:0:0:22:22:19:3:0:0:19:3:0:0 chr1 171526919 . A AC 16.64 PASS AO=3;DP=8;FAO=3;FDP=7;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0.124844;HRUN=0;LEN=1;MLLD=48.4764;QD=9.5101;RBI=0.0446241;REFB=-0.0261501;REVB=0.0446241;RO=5;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.183103;OID=.;OPOS=171526920;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:3:8:3:7:4:0:3:0:4:16:5:0:3:0:5 chr1 171535907 . A G 12.71 PASS AO=3;DP=13;FAO=3;FDP=12;FR=.;FRO=9;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=0;FXX=0.076864;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.5147;QD=4.23551;RBI=0.0753867;REFB=0.021814;REVB=-0.0753867;RO=9;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0812721;OID=.;OPOS=171535907;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:13:12:9:9:3:3:3:0:0:9:3:0:0:9 chr1 171556165 . G C 1297.14 PASS AO=134;DP=134;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0401482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.45;QD=38.1511;RBI=0.0406625;REFB=0;REVB=-0.00644687;RO=0;SAF=54;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.87219e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.16632e-05;OID=.;OPOS=171556165;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:134:136:0:0:134:136:80:54:0:0:80:56:0:0 chr1 171558516 . C T 436.11 PASS AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0427618;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=184.763;QD=36.3423;RBI=0.0485838;REFB=-0.0944616;REVB=0.023061;RO=1;SAF=26;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218674;STB=0.511623;TYPE=snp;VARB=0.000763306;OID=.;OPOS=171558516;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:48:48:1:1:47:47:21:26:0:1:21:26:0:1 chr1 171751236 . T C 1697.39 PASS AO=182;DP=187;FAO=183;FDP=186;FR=.;FRO=3;FSAF=93;FSAR=90;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0264461;FXX=0.0312484;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.733;QD=36.5029;RBI=0.0288006;REFB=0.00897156;REVB=0.0114051;RO=3;SAF=93;SAR=89;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0151075;STB=0.507936;TYPE=snp;VARB=0.00083221;OID=.;OPOS=171751236;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:187:186:3:3:182:183:89:93:3:0:90:93:3:0 chr1 171753039 . A G 435.1 PASS AO=101;DP=203;FAO=102;FDP=204;FR=.;FRO=102;FSAF=29;FSAR=73;FSRF=47;FSRR=55;FWDB=0.0071277;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.009;QD=8.53129;RBI=0.00815264;REFB=-0.0132698;REVB=-0.00395745;RO=102;SAF=29;SAR=72;SRF=47;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176947;STB=0.599116;TYPE=snp;VARB=0.0111767;OID=.;OPOS=171753039;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:204:102:102:101:102:72:29:47:55:73:29:47:55 chr1 171755071 . A G 190.67 PASS AO=45;DP=95;FAO=45;FDP=93;FR=.;FRO=48;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=-0.0297727;FXX=0.0210504;HRUN=3;LEN=1;MLLD=200.115;QD=8.20069;RBI=0.0301247;REFB=-0.00222557;REVB=-0.00459164;RO=48;SAF=23;SAR=22;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0103171;STB=0.505734;TYPE=snp;VARB=0.00357227;OID=.;OPOS=171755071;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:93:48:48:45:45:22:23:24:24:22:23:24:24 chr1 171755170 . G A 232.52 PASS AO=39;DP=65;FAO=42;FDP=66;FR=.;FRO=24;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.0191188;FXX=0.0294074;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.579;QD=14.0919;RBI=0.0508356;REFB=-0.0481032;REVB=-0.0471034;RO=24;SAF=18;SAR=21;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0268808;STB=0.517408;TYPE=snp;VARB=0.049354;OID=.;OPOS=171755170;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:65:66:24:24:39:42:21:18:12:12:23:19:12:12 chr1 171755182 . G A 84.46 PASS AO=25;DP=64;FAO=25;FDP=66;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=0.0292513;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.344;QD=5.11857;RBI=0.0303934;REFB=-0.0187711;REVB=-0.00825358;RO=37;SAF=10;SAR=15;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0635555;STB=0.555511;TYPE=snp;VARB=0.0284639;OID=.;OPOS=171755182;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:64:66:37:41:25:25:15:10:17:20:15:10:20:21 chr1 171763549 . C T 585.81 PASS AO=121;DP=218;FAO=121;FDP=217;FR=.;FRO=96;FSAF=68;FSAR=53;FSRF=42;FSRR=54;FWDB=0.0123224;FXX=0.00458695;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.108;QD=10.7984;RBI=0.0273503;REFB=-0.017258;REVB=-0.0244172;RO=95;SAF=68;SAR=53;SRF=42;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0971348;STB=0.555156;TYPE=snp;VARB=0.0109453;OID=.;OPOS=171763549;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:218:217:95:96:121:121:53:68:42:53:53:68:42:54 chr1 171810960 . A G 243.16 PASS AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260019;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.963;QD=37.4086;RBI=0.0291655;REFB=0;REVB=-0.0132109;RO=0;SAF=7;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.63811e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000102834;OID=.;OPOS=171810960;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:26:26:0:0:26:26:19:7:0:0:19:7:0:0 chr1 172157585 . C A 118.33 PASS AO=30;DP=85;FAO=37;FDP=93;FR=.;FRO=56;FSAF=12;FSAR=25;FSRF=16;FSRR=40;FWDB=0.0586185;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.947;QD=5.08934;RBI=0.0587184;REFB=-0.0177858;REVB=0.00342352;RO=53;SAF=6;SAR=24;SRF=15;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129445;STB=0.527013;TYPE=snp;VARB=0.043426;OID=.;OPOS=172157585;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:93:53:56:30:37:24:6:15:38:25:12:16:40 chr1 172356437 . A G 723.84 PASS AO=72;DP=72;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00440732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.778;QD=38.0971;RBI=0.00898247;REFB=0;REVB=0.0078269;RO=0;SAF=21;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84448e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.73975e-05;OID=.;OPOS=172356437;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:72:76:0:0:72:76:51:21:0:0:53:23:0:0 chr1 172410967 . G A 944.74 PASS AO=112;DP=122;FAO=112;FDP=121;FR=.;FRO=9;FSAF=75;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=-0.0649751;FXX=0.00819605;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3457;QD=31.2311;RBI=0.0652185;REFB=-0.0529552;REVB=-0.00562877;RO=10;SAF=76;SAR=36;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115213;STB=0.54549;TYPE=snp;VARB=0.00850596;OID=.;OPOS=172410967;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:122:121:10:9:112:112:36:76:0:10:37:75:1:8 chr1 172411496 . A G 158.87 PASS AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0267606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.267;QD=37.3817;RBI=0.0391113;REFB=0;REVB=-0.0285231;RO=0;SAF=4;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.12705e-05;OID=.;OPOS=172411496;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:17:17:0:0:17:17:13:4:0:0:13:4:0:0 chr1 172412995 . T C 158.91 PASS AO=16;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.111948;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.2763;QD=37.3898;RBI=0.117738;REFB=0;REVB=0.0364661;RO=1;SAF=14;SAR=2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.031564;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00315927;OID=.;OPOS=172412995;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:17:17:1:0:16:17:2:14:1:0:2:15:0:0 chr1 172434812 . C T 568.19 PASS AO=67;DP=72;FAO=67;FDP=72;FR=.;FRO=5;FSAF=27;FSAR=40;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0169905;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=200.231;QD=31.5661;RBI=0.0255493;REFB=-0.0477608;REVB=0.0190811;RO=4;SAF=27;SAR=40;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0169577;STB=0.500215;TYPE=snp;VARB=0.00121158;OID=.;OPOS=172434812;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:72:72:4:5:67:67:40:27:1:3:40:27:2:3 chr1 172437592 . G A 1928.33 PASS AO=190;DP=190;FAO=202;FDP=202;FR=.;FRO=0;FSAF=110;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0464029;FXX=0.0146334;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.113;QD=38.1847;RBI=0.0572088;REFB=0;REVB=0.0334606;RO=0;SAF=108;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000836344;OID=.;OPOS=172437592;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:91:190:202:0:0:190:202:82:108:0:0:92:110:0:0 chr1 172502479 . T C 177.26 PASS AO=32;DP=54;FAO=33;FDP=55;FR=.;FRO=22;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.0202958;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.3796;QD=12.8918;RBI=0.0790986;REFB=0.00529558;REVB=-0.0764505;RO=22;SAF=22;SAR=10;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116015;STB=0.552599;TYPE=snp;VARB=-0.00517555;OID=.;OPOS=172502479;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:54:55:22:22:32:33:10:22:12:10:11:22:12:10 chr1 172558524 . A G 131.99 PASS AO=50;DP=163;FAO=54;FDP=169;FR=.;FRO=115;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=48;FSRR=67;FWDB=0.0155611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.096;QD=3.12403;RBI=0.0162629;REFB=-0.00428636;REVB=-0.00472576;RO=112;SAF=24;SAR=26;SRF=47;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0721828;STB=0.543797;TYPE=snp;VARB=0.0081851;OID=.;OPOS=172558524;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:169:112:115:50:54:26:24:47:65:28:26:48:67 chr1 173429995 . G A 94.71 PASS AO=29;DP=77;FAO=29;FDP=77;FR=.;FRO=48;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=0.0063572;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=233.018;QD=4.92006;RBI=0.0123004;REFB=-0.00255036;REVB=0.0105303;RO=48;SAF=9;SAR=20;SRF=20;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126741;STB=0.57307;TYPE=snp;VARB=0.00525872;OID=.;OPOS=173429995;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:77:77:48:48:29:29:20:9:20:28:20:9:20:28 chr1 173457017 . C T 507.18 PASS AO=131;DP=286;FAO=132;FDP=287;FR=.;FRO=155;FSAF=58;FSAR=74;FSRF=89;FSRR=66;FWDB=-0.00415258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.223;QD=7.06874;RBI=0.00595435;REFB=0.000705187;REVB=0.00426736;RO=155;SAF=58;SAR=73;SRF=89;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128516;STB=0.572576;TYPE=snp;VARB=-0.000878814;OID=.;OPOS=173457017;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:286:287:155:155:131:132:73:58:89:66:74:58:89:66 chr1 173474429 . T C 255.54 PASS AO=69;DP=146;FAO=70;FDP=155;FR=.;FRO=85;FSAF=21;FSAR=49;FSRF=23;FSRR=62;FWDB=0.01638;FXX=0.00640985;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.593;QD=6.59467;RBI=0.0188659;REFB=-0.0299962;REVB=-0.0093604;RO=77;SAF=21;SAR=48;SRF=23;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00636647;STB=0.519495;TYPE=snp;VARB=0.0410797;OID=.;OPOS=173474429;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:155:77:85:69:70:48:21:23:54:49:21:23:62 chr1 173516871 . G C 247.9 PASS AO=71;DP=171;FAO=71;FDP=169;FR=.;FRO=98;FSAF=35;FSAR=36;FSRF=50;FSRR=48;FWDB=0.0163284;FXX=0.028734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.173;QD=5.86736;RBI=0.0377786;REFB=-0.0205752;REVB=0.0340677;RO=98;SAF=36;SAR=35;SRF=48;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.017862;STB=0.509997;TYPE=snp;VARB=0.0332194;OID=.;OPOS=173516871;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:169:98:98:71:71:35:36:48:50:36:35:50:48 chr1 173516903 . A G 229.63 PASS AO=68;DP=169;FAO=68;FDP=168;FR=.;FRO=100;FSAF=31;FSAR=37;FSRF=49;FSRR=51;FWDB=0.00149258;FXX=0.00591681;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.5684;QD=5.46733;RBI=0.0298844;REFB=-0.0138659;REVB=-0.0298471;RO=99;SAF=31;SAR=37;SRF=49;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.041366;STB=0.520388;TYPE=snp;VARB=0.0198954;OID=.;OPOS=173516903;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:168:99:100:68:68:37:31:49:50:37:31:49:51 chr1 173878832 . T C 232.44 PASS AO=60;DP=132;FAO=61;FDP=134;FR=.;FRO=73;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=35;FSRR=38;FWDB=-0.0424673;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2716;QD=6.93854;RBI=0.0425364;REFB=0.00916827;REVB=-0.00242389;RO=72;SAF=31;SAR=29;SRF=34;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0435206;STB=0.51565;TYPE=snp;VARB=-0.0109335;OID=.;OPOS=173878832;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:134:72:73:60:61:29:31:34:38:30:31:35:38 chr1 173878862 . T C 232.76 PASS AO=51;DP=106;FAO=52;FDP=102;FR=.;FRO=50;FSAF=20;FSAR=32;FSRF=23;FSRR=27;FWDB=0.0064449;FXX=0.0467246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.318;QD=9.12773;RBI=0.0285149;REFB=-0.0163827;REVB=-0.027777;RO=55;SAF=20;SAR=31;SRF=28;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111422;STB=0.538326;TYPE=snp;VARB=0.00956018;OID=.;OPOS=173878862;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:102:55:50:51:52:31:20:28:27:32:20:23:27 chr1 173903737 . G A 291.57 PASS AO=69;DP=144;FAO=70;FDP=144;FR=.;FRO=74;FSAF=34;FSAR=36;FSRF=42;FSRR=32;FWDB=0.0504909;FXX=0.0136977;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.5421;QD=8.0992;RBI=0.050491;REFB=0.00976799;REVB=0.000101985;RO=75;SAF=33;SAR=36;SRF=43;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0893182;STB=0.541985;TYPE=snp;VARB=-0.0107215;OID=.;OPOS=173903737;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:144:75:74:69:70:36:33:43:32:36:34:42:32 chr1 175046789 . A G 450.99 PASS AO=35;DP=46;FAO=45;FDP=48;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=14;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.101908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.492;QD=37.5822;RBI=0.114603;REFB=0;REVB=0.0524265;RO=0;SAF=15;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0360054;OID=.;OPOS=175046789;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:46:48:0:0:35:45:20:15:0:0:31:14:0:0 chr1 175054548 . C T 641 PASS AO=72;DP=75;FAO=72;FDP=75;FR=.;FRO=3;FSAF=40;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0173832;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=103.005;QD=34.1865;RBI=0.0199526;REFB=-0.153665;REVB=-0.00979437;RO=3;SAF=40;SAR=32;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0169688;STB=0.50898;TYPE=snp;VARB=0.0013644;OID=.;OPOS=175054548;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:75:75:3:3:72:72:32:40:1:2:32:40:1:2 chr1 175087729 . T C 913.14 PASS AO=92;DP=99;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0020134;FXX=0.029997;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.525;QD=37.6554;RBI=0.025048;REFB=0;REVB=0.0249669;RO=0;SAF=46;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00129383;OID=.;OPOS=175087729;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:99:97:0:0:92:97:46:46:0:0:50:47:0:0 chr1 175092674 . C T 863.83 PASS AO=91;DP=93;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0166342;FXX=0.0215031;HRUN=2;LEN=1;MLLD=247.626;QD=37.9705;RBI=0.0220766;REFB=0;REVB=0.0145148;RO=0;SAF=60;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.895e-05;OID=.;OPOS=175092674;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:93:91:0:0:91:91:31:60:0:0:31:60:0:0 chr1 175092707 . C T 824.33 PASS AO=88;DP=89;FAO=89;FDP=90;FR=.;FRO=1;FSAF=53;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0145257;FXX=0.0322546;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.77;QD=36.6367;RBI=0.0699651;REFB=-0.0467264;REVB=0.0684407;RO=1;SAF=53;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00885804;STB=0.504672;TYPE=snp;VARB=0.000466415;OID=.;OPOS=175092707;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:89:90:1:1:88:89:35:53:1:0:36:53:1:0 chr1 175113578 . T C 2190.63 PASS AO=228;DP=228;FAO=228;FDP=228;FR=.;FRO=0;FSAF=112;FSAR=116;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.044;QD=38.4321;RBI=0.0323662;REFB=0;REVB=0.0274677;RO=0;SAF=112;SAR=116;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.99004e-05;OID=.;OPOS=175113578;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:228:228:0:0:228:228:116:112:0:0:116:112:0:0 chr1 175129946 . C T 802.24 PASS AO=50;DP=276;FAO=149;FDP=235;FR=.;FRO=86;FSAF=87;FSAR=62;FSRF=50;FSRR=36;FWDB=0.0227345;FXX=0.0289244;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.011;QD=13.6552;RBI=0.0300348;REFB=-0.0145555;REVB=0.0196273;RO=0;SAF=29;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.20481e-08;STB=0.50094;TYPE=snp;VARB=0.0143686;OID=.;OPOS=175129946;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:235:0:86:50:149:21:29:0:0:62:87:50:36 chr1 175299301 . T C 69.91 PASS AO=17;DP=40;FAO=17;FDP=40;FR=.;FRO=23;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.00277655;FXX=0.0243843;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.4868;QD=6.99109;RBI=0.0317442;REFB=0.00264677;REVB=0.0316226;RO=23;SAF=3;SAR=14;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237076;STB=0.63882;TYPE=snp;VARB=-0.00347503;OID=.;OPOS=175299301;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:40:40:23:23:17:17:14:3:8:15:14:3:8:15 chr1 175324651 . A G 199.32 PASS AO=46;DP=94;FAO=46;FDP=93;FR=.;FRO=47;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=-0.0187263;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.642;QD=8.57287;RBI=0.0307197;REFB=-0.00240844;REVB=-0.0243522;RO=46;SAF=24;SAR=22;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.058785;STB=0.537799;TYPE=snp;VARB=0.00268719;OID=.;OPOS=175324651;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:93:46:47:46:46:22:24:21:25:22:24:21:26 chr1 175348699 . GC G 136.33 PASS AO=94;DP=258;FAO=100;FDP=252;FR=.;FRO=152;FSAF=46;FSAR=54;FSRF=88;FSRR=64;FWDB=0.0227868;FXX=0.0156244;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.7258;QD=2.16398;RBI=0.0472075;REFB=-0.0782613;REVB=-0.0413438;RO=137;SAF=38;SAR=56;SRF=80;SRR=57;SSEN=0.348568;SSEP=0;SSSB=-0.189535;STB=0.571369;TYPE=del;VARB=0.105052;OID=.;OPOS=175348700;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:94:248:100:252:152:46:54:88:64:99:137:38:56:80:57 chr1 175348723 . C T 2312.13 PASS AO=248;DP=256;FAO=253;FDP=259;FR=.;FRO=6;FSAF=133;FSAR=120;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.00353428;FXX=0.00766254;HRUN=4;LEN=1;MLLD=51.0906;QD=35.7086;RBI=0.0885909;REFB=0.0556131;REVB=-0.0885204;RO=8;SAF=131;SAR=117;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0132512;STB=0.503275;TYPE=snp;VARB=-0.00122227;OID=.;OPOS=175348723;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:256:259:8:6:248:253:117:131:6:2:120:133:4:2 chr1 175355391 . A G 1442.62 PASS AO=154;DP=160;FAO=158;FDP=161;FR=.;FRO=3;FSAF=88;FSAR=70;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.00493377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.0751;QD=35.8415;RBI=0.0527278;REFB=-0.104076;REVB=0.0524965;RO=2;SAF=88;SAR=66;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141951;STB=0.508379;TYPE=snp;VARB=0.00102028;OID=.;OPOS=175355391;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:160:161:2:3:154:158:66:88:0:2:70:88:3:0 chr1 175375469 . C A 454.72 PASS AO=83;DP=135;FAO=84;FDP=136;FR=.;FRO=52;FSAF=51;FSAR=33;FSRF=46;FSRR=6;FWDB=-0.00467248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.419;QD=13.3742;RBI=0.0190626;REFB=-0.00670893;REVB=0.0184811;RO=51;SAF=51;SAR=32;SRF=45;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210545;STB=0.616738;TYPE=snp;VARB=0.00636688;OID=.;OPOS=175375469;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:136:51:52:83:84:32:51:45:6:33:51:46:6 chr1 175375683 . T C 1582.04 PASS AO=165;DP=166;FAO=165;FDP=165;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0184663;FXX=0.00602373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.815;QD=38.3525;RBI=0.0185347;REFB=0;REVB=0.00159118;RO=0;SAF=76;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.1215e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.27705e-06;OID=.;OPOS=175375683;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:166:165:0:0:165:165:89:76:0:0:89:76:0:0 chr1 175375802 . T C 885.65 PASS AO=93;DP=95;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113826;FXX=0.0210504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.143;QD=38.0924;RBI=0.0135328;REFB=0;REVB=0.00731927;RO=0;SAF=40;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.92821e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.39618e-05;OID=.;OPOS=175375802;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:95:93:0:0:93:93:53:40:0:0:53:40:0:0 chr1 176102974 . T C 313.4 PASS AO=86;DP=199;FAO=87;FDP=202;FR=.;FRO=115;FSAF=42;FSAR=45;FSRF=45;FSRR=70;FWDB=0.00894118;FXX=0.00492587;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.47;QD=6.20585;RBI=0.0160638;REFB=-0.000419252;REVB=0.0133454;RO=113;SAF=42;SAR=44;SRF=43;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110448;STB=0.552304;TYPE=snp;VARB=0.000776473;OID=.;OPOS=176102974;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:199:202:113:115:86:87:44:42:43:70:45:42:45:70 chr1 176659463 . C T 246.34 PASS AO=60;DP=126;FAO=60;FDP=126;FR=.;FRO=66;FSAF=29;FSAR=31;FSRF=31;FSRR=35;FWDB=0.0297683;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=152.268;QD=7.82045;RBI=0.0307057;REFB=-0.0011097;REVB=0.00752881;RO=65;SAF=29;SAR=31;SRF=31;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00602356;STB=0.507152;TYPE=snp;VARB=0.00122742;OID=.;OPOS=176659463;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:65:66:60:60:31:29:31:34:31:29:31:35 chr1 176833497 . G C 237.94 PASS AO=58;DP=128;FAO=61;FDP=132;FR=.;FRO=71;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=36;FSRR=35;FWDB=-0.0442318;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0815;QD=7.21042;RBI=0.0443941;REFB=-0.00316966;REVB=0.00379355;RO=70;SAF=30;SAR=28;SRF=36;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00290408;STB=0.500621;TYPE=snp;VARB=0.00631005;OID=.;OPOS=176833497;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:132:70:71:58:61:28:30:36:34:30:31:36:35 chr1 176863836 . G C 361.89 PASS AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0710652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.1067;QD=35.3067;RBI=0.086962;REFB=0.0607377;REVB=0.0501211;RO=1;SAF=25;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0183934;STB=0.509799;TYPE=snp;VARB=-1.20991e-05;OID=.;OPOS=176863836;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:41:41:1:1:40:40:15:25:1:0:15:25:1:0 chr1 176863842 . C T 174.37 PASS AO=28;DP=40;FAO=27;FDP=39;FR=.;FRO=12;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.0332533;FXX=0.0487686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.1772;QD=17.8839;RBI=0.0344827;REFB=-0.0127496;REVB=0.00912541;RO=12;SAF=19;SAR=9;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107351;STB=0.588166;TYPE=snp;VARB=0.00988563;OID=.;OPOS=176863842;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:40:39:12:12:28:27:9:19:6:6:7:20:6:6 chr1 176863867 . T C 378.91 PASS AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0919911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9602;QD=35.2474;RBI=0.0974758;REFB=-0.0899968;REVB=0.0322363;RO=0;SAF=31;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.72514e-08;STB=0.521729;TYPE=snp;VARB=0.00282451;OID=.;OPOS=176863867;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:43:43:0:1:42:42:11:31:0:0:11:31:0:1 chr1 177902388 . G A 389.27 PASS AO=73;DP=116;FAO=75;FDP=127;FR=.;FRO=52;FSAF=36;FSAR=39;FSRF=33;FSRR=19;FWDB=-0.00702016;FXX=0.030532;HRUN=5;LEN=1;MLLD=155.31;QD=12.2606;RBI=0.0256651;REFB=-0.0278828;REVB=-0.0246863;RO=40;SAF=35;SAR=38;SRF=30;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176396;STB=0.563072;TYPE=snp;VARB=0.0149775;OID=.;OPOS=177902388;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:127:40:52:73:75:38:35:30:10:39:36:33:19 chr1 177915474 . A C 374.8 PASS AO=57;DP=106;FAO=67;FDP=106;FR=.;FRO=39;FSAF=47;FSAR=20;FSRF=29;FSRR=10;FWDB=-0.031797;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=118.577;QD=14.1433;RBI=0.0444256;REFB=-0.032142;REVB=0.0310256;RO=26;SAF=40;SAR=17;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0582104;STB=0.518766;TYPE=snp;VARB=0.00781028;OID=.;OPOS=177915474;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:106:26:39:57:67:17:40:16:10:20:47:29:10 chr1 177915498 . G A 110.02 PASS AO=37;DP=104;FAO=37;FDP=104;FR=.;FRO=67;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=50;FSRR=17;FWDB=-0.00300786;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=129.555;QD=4.23149;RBI=0.0106804;REFB=-0.00815325;REVB=0.0102481;RO=65;SAF=24;SAR=13;SRF=48;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114482;STB=0.571902;TYPE=snp;VARB=0.00811446;OID=.;OPOS=177915498;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:65:67:37:37:13:24:48:17:13:24:50:17 chr1 177929940 . G A 712.78 PASS AO=70;DP=70;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.853;QD=38.0149;RBI=0.0740887;REFB=0;REVB=0.0720956;RO=0;SAF=37;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000397755;OID=.;OPOS=177929940;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:70:75:0:0:70:75:33:37:0:0:35:40:0:0 chr1 177929987 . T C 831.94 PASS AO=87;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0021216;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.095;QD=37.8157;RBI=0.140628;REFB=-0.0973572;REVB=0.140612;RO=0;SAF=45;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.519e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00150424;OID=.;OPOS=177929987;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:88:88:0:0:87:88:42:45:0:0:42:46:0:0 chr1 178062359 . G A 293.62 PASS AO=59;DP=104;FAO=59;FDP=104;FR=.;FRO=45;FSAF=20;FSAR=39;FSRF=9;FSRR=36;FWDB=-0.0567297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.267;QD=11.293;RBI=0.0572689;REFB=0.0176524;REVB=0.00784033;RO=45;SAF=20;SAR=39;SRF=9;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128899;STB=0.570103;TYPE=snp;VARB=-0.0142531;OID=.;OPOS=178062359;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:45:45:59:59:39:20:9:36:39:20:9:36 chr1 178483231 . G A 96.7 PASS AO=24;DP=54;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=0.000583961;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.326;QD=7.16264;RBI=0.0158907;REFB=-0.0324064;REVB=-0.01588;RO=30;SAF=15;SAR=9;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280982;STB=0.658961;TYPE=snp;VARB=0.0198234;OID=.;OPOS=178483231;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:54:54:30:30:24:24:9:15:10:20:9:15:10:20 chr1 178489903 . C G 176.44 PASS AO=34;DP=82;FAO=44;FDP=91;FR=.;FRO=47;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=0.119543;FXX=0.0108684;HRUN=2;LEN=1;MLLD=37.6855;QD=7.75555;RBI=0.134544;REFB=-0.0592625;REVB=0.0617386;RO=47;SAF=16;SAR=18;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192852;STB=0.540998;TYPE=snp;VARB=0.0717972;OID=.;OPOS=178489903;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:91:47:47:34:44:18:16:23:24:19:25:23:24 chr1 178489978 . T G 177.29 PASS AO=38;DP=85;FAO=44;FDP=95;FR=.;FRO=51;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=28;FWDB=-0.0360351;FXX=0.0206164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.584;QD=7.46492;RBI=0.0470411;REFB=-0.0114758;REVB=-0.0302381;RO=42;SAF=15;SAR=23;SRF=14;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0613906;STB=0.50193;TYPE=snp;VARB=0.0094523;OID=.;OPOS=178489978;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:95:42:51:38:44:23:15:14:28:24:20:23:28 chr1 178492447 . T A 189.75 PASS AO=59;DP=152;FAO=59;FDP=152;FR=.;FRO=93;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=45;FSRR=48;FWDB=-0.0118894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.9431;QD=4.9934;RBI=0.0160342;REFB=-0.0220856;REVB=0.0107582;RO=92;SAF=28;SAR=31;SRF=44;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00398202;STB=0.505696;TYPE=snp;VARB=0.040725;OID=.;OPOS=178492447;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:152:92:93:59:59:31:28:44:48:31:28:45:48 chr1 178514165 . C T 126.04 PASS AO=24;DP=42;FAO=24;FDP=42;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=2;FWDB=-0.0216943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.335;QD=12.0039;RBI=0.0224399;REFB=-0.00832591;REVB=-0.00573641;RO=18;SAF=13;SAR=11;SRF=16;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.279593;STB=0.653575;TYPE=snp;VARB=0.00187848;OID=.;OPOS=178514165;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:42:42:18:18:24:24:11:13:16:2:11:13:16:2 chr1 178514560 . A AT 151.36 PASS AO=47;DP=94;FAO=51;FDP=95;FR=.;FRO=44;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=27;FSRR=17;FWDB=0.0233026;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=18.2417;QD=6.37319;RBI=0.0512894;REFB=0.0744367;REVB=0.0456902;RO=45;SAF=27;SAR=20;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0029949;STB=0.521363;TYPE=ins;VARB=-0.0639457;OID=.;OPOS=178514561;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:47:94:51:95:44:29:22:27:17:99:45:27:20:26:19 chr1 178514619 . TCCC TC,TCCT 756.93 PASS AO=43,73;DP=168;FAO=43,77;FDP=160;FR=.;FRO=40;FSAF=43,51;FSAR=0,26;FSRF=3;FSRR=37;FWDB=-0.100945,-0.0698769;FXX=0.0184038;HRUN=3,3;LEN=2,1;MLLD=29.0379,42.4594;QD=18.9232;RBI=0.101444,0.0748156;REFB=0.00899754,0.0107047;REVB=-0.0100526,-0.0267316;RO=39;SAF=43,48;SAR=0,25;SRF=2;SRR=37;SSEN=0,0;SSEP=0.516854,0;SSSB=0.896238,0.379104;STB=0.999742,0.695857;TYPE=del,snp;VARB=-0.0167874,0.000249279;OID=.,.;OPOS=178514620,178514622;OREF=CC,C;OALT=-,T;OMAPALT=TC,TCCT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:43,73:159:43,77:160:40:43,51:0,26:3:37:99:39:43,48:0,25:2:37 chr1 178745947 . T G 240.07 PASS AO=61;DP=134;FAO=62;FDP=136;FR=.;FRO=74;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=23;FSRR=51;FWDB=-0.0129219;FXX=0.00729874;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.634;QD=7.06076;RBI=0.0378007;REFB=-0.00662194;REVB=-0.0355235;RO=73;SAF=27;SAR=34;SRF=23;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129064;STB=0.561829;TYPE=snp;VARB=0.00785218;OID=.;OPOS=178745947;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:136:73:74:61:62:34:27:23:50:36:26:23:51 chr1 178820159 . C A 1928.18 PASS AO=200;DP=200;FAO=200;FDP=200;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0387313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.1819;QD=38.5636;RBI=0.0506976;REFB=0;REVB=0.032713;RO=0;SAF=105;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.24343e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000264989;OID=.;OPOS=178820159;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:200:200:0:0:200:200:95:105:0:0:95:105:0:0 chr1 178858759 . G A 2052.27 PASS AO=218;DP=221;FAO=218;FDP=218;FR=.;FRO=0;FSAF=115;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0137318;FXX=0.013574;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.9607;QD=37.6564;RBI=0.0174218;REFB=-0.0181861;REVB=0.0107218;RO=2;SAF=116;SAR=102;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000558492;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000467566;OID=.;OPOS=178858759;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:82:221:218:2:0:218:218:102:116:1:1:103:115:0:0 chr1 179055020 . C T 233.3 PASS AO=58;DP=120;FAO=56;FDP=118;FR=.;FRO=62;FSAF=9;FSAR=47;FSRF=35;FSRR=27;FWDB=-0.016988;FXX=0.0166653;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1816;QD=7.90829;RBI=0.0177475;REFB=-0.0113988;REVB=0.00513628;RO=62;SAF=11;SAR=47;SRF=35;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.404605;STB=0.756297;TYPE=snp;VARB=0.00842021;OID=.;OPOS=179055020;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:118:62:62:58:56:47:11:35:27:47:9:35:27 chr1 179065125 . C T 122.06 PASS AO=40;DP=114;FAO=41;FDP=114;FR=.;FRO=73;FSAF=38;FSAR=3;FSRF=70;FSRR=3;FWDB=0.0154137;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0009;QD=4.2828;RBI=0.0240482;REFB=0.020646;REVB=0.018459;RO=74;SAF=37;SAR=3;SRF=71;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166081;STB=0.586921;TYPE=snp;VARB=-0.0153264;OID=.;OPOS=179065125;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:74:73:40:41:3:37:71:3:3:38:70:3 chr1 179068851 . A G 623.42 PASS AO=71;DP=72;FAO=70;FDP=72;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=31;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0435112;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.1641;QD=34.6346;RBI=0.0435294;REFB=-0.0330963;REVB=0.00125857;RO=1;SAF=40;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116761;STB=0.512496;TYPE=snp;VARB=0.000399405;OID=.;OPOS=179068851;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:72:72:1:2:71:70:31:40:1:0:31:39:2:0 chr1 179072728 . T C 2058.44 PASS AO=223;DP=230;FAO=226;FDP=232;FR=.;FRO=6;FSAF=144;FSAR=82;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0111918;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.212;QD=35.4903;RBI=0.015733;REFB=0.0115587;REVB=0.0110576;RO=6;SAF=141;SAR=82;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00708184;STB=0.508457;TYPE=snp;VARB=-0.000134115;OID=.;OPOS=179072728;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:230:232:6:6:223:226:82:141:3:3:82:144:2:4 chr1 179307047 . T A 187.68 PASS AO=59;DP=153;FAO=59;FDP=153;FR=.;FRO=94;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=35;FSRR=59;FWDB=-0.00967916;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.292;QD=4.90656;RBI=0.0121817;REFB=0.00355037;REVB=-0.00739645;RO=93;SAF=25;SAR=34;SRF=35;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0530489;STB=0.532635;TYPE=snp;VARB=-0.00491982;OID=.;OPOS=179307047;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:153:93:94:59:59:34:25:35:58:34:25:35:59 chr1 179310262 . C T 403.55 PASS AO=109;DP=248;FAO=109;FDP=246;FR=.;FRO=137;FSAF=41;FSAR=68;FSRF=42;FSRR=95;FWDB=0.0151223;FXX=0.00806419;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.9105;QD=6.56176;RBI=0.0861686;REFB=0.0207813;REVB=0.0848312;RO=137;SAF=41;SAR=68;SRF=42;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0761331;STB=0.542136;TYPE=snp;VARB=-0.0270026;OID=.;OPOS=179310262;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:248:246:137:137:109:109:68:41:42:95:68:41:42:95 chr1 179347832 . T C 189.63 PASS AO=78;DP=242;FAO=78;FDP=242;FR=.;FRO=164;FSAF=33;FSAR=45;FSRF=72;FSRR=92;FWDB=0.0134984;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.264;QD=3.13429;RBI=0.0143158;REFB=-0.00249395;REVB=-0.00476831;RO=164;SAF=33;SAR=45;SRF=72;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0191527;STB=0.511029;TYPE=snp;VARB=0.00501508;OID=.;OPOS=179347832;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:242:242:164:164:78:78:45:33:72:92:45:33:72:92 chr1 179414105 . A C 312.82 PASS AO=71;DP=145;FAO=73;FDP=147;FR=.;FRO=74;FSAF=49;FSAR=24;FSRF=40;FSRR=34;FWDB=0.015246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.774;QD=8.51215;RBI=0.0159663;REFB=-0.0175859;REVB=-0.00474158;RO=73;SAF=48;SAR=23;SRF=39;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140159;STB=0.570892;TYPE=snp;VARB=0.0178116;OID=.;OPOS=179414105;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:147:73:74:71:73:23:48:39:34:24:49:40:34 chr1 179504025 . AAAG A 50.08 PASS AO=32;DP=154;FAO=40;FDP=132;FR=.;FRO=92;FSAF=3;FSAR=37;FSRF=31;FSRR=61;FWDB=-0.0647862;FXX=0.0833275;HRUN=4;LEN=3;MLLD=181.391;QD=1.51765;RBI=0.0648087;REFB=-0.0147556;REVB=0.00170723;RO=58;SAF=1;SAR=31;SRF=21;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.672559;STB=0.810365;TYPE=del;VARB=0.0400772;OID=.;OPOS=179504026;OREF=AAG;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:32:112:40:132:92:3:37:31:61:50:58:1:31:21:37 chr1 179504043 . C G 220.35 PASS AO=47;DP=104;FAO=55;FDP=111;FR=.;FRO=56;FSAF=8;FSAR=47;FSRF=12;FSRR=44;FWDB=-0.0762015;FXX=0.0263135;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.8254;QD=7.94068;RBI=0.0783616;REFB=-0.0293435;REVB=-0.0182721;RO=49;SAF=6;SAR=41;SRF=8;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0689213;STB=0.563524;TYPE=snp;VARB=0.044659;OID=.;OPOS=179504043;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:111:49:56:47:55:41:6:8:41:47:8:12:44 chr1 179504130 . G A 354.23 PASS AO=77;DP=145;FAO=77;FDP=145;FR=.;FRO=68;FSAF=29;FSAR=48;FSRF=26;FSRR=42;FWDB=-0.0211342;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.63;QD=9.77186;RBI=0.0226399;REFB=-0.0144677;REVB=-0.00811855;RO=68;SAF=29;SAR=48;SRF=26;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00521219;STB=0.502856;TYPE=snp;VARB=0.0150678;OID=.;OPOS=179504130;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:68:68:77:77:48:29:26:42:48:29:26:42 chr1 179520151 . C T 1993.55 PASS AO=210;DP=212;FAO=211;FDP=211;FR=.;FRO=0;FSAF=113;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0449145;FXX=0.00471676;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.323;QD=37.7924;RBI=0.0454538;REFB=-0.0523588;REVB=0.00698139;RO=1;SAF=112;SAR=98;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00483632;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000269204;OID=.;OPOS=179520151;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:212:211:1:0:210:211:98:112:0:1:98:113:0:0 chr1 179520506 . G A 122.38 PASS AO=26;DP=51;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0227363;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.6468;QD=9.59869;RBI=0.0266544;REFB=-0.0266017;REVB=0.013911;RO=25;SAF=8;SAR=18;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198564;STB=0.611561;TYPE=snp;VARB=0.0160595;OID=.;OPOS=179520506;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:25:25:26:26:18:8:13:12:18:8:13:12 chr1 179604864 . C T 430.84 PASS AO=96;DP=184;FAO=96;FDP=184;FR=.;FRO=88;FSAF=73;FSAR=23;FSRF=51;FSRR=37;FWDB=-0.00609293;FXX=0.00540511;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.379;QD=9.36611;RBI=0.0632385;REFB=-0.00171541;REVB=-0.0629443;RO=87;SAF=73;SAR=23;SRF=51;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184422;STB=0.605618;TYPE=snp;VARB=0.00123814;OID=.;OPOS=179604864;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:184:87:88:96:96:23:73:51:36:23:73:51:37 chr1 179609589 . G T 540.58 PASS AO=120;DP=245;FAO=128;FDP=253;FR=.;FRO=125;FSAF=35;FSAR=93;FSRF=45;FSRR=80;FWDB=0.00900216;FXX=0.00393685;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.281;QD=8.54666;RBI=0.0247254;REFB=-0.00704958;REVB=0.0230284;RO=124;SAF=29;SAR=91;SRF=45;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139929;STB=0.551307;TYPE=snp;VARB=0.0073844;OID=.;OPOS=179609589;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:245:253:124:125:120:128:91:29:45:79:93:35:45:80 chr1 179631242 . G A 330.98 PASS AO=83;DP=182;FAO=85;FDP=184;FR=.;FRO=99;FSAF=50;FSAR=35;FSRF=51;FSRR=48;FWDB=0.000794306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.721;QD=7.19515;RBI=0.0114175;REFB=-0.0151941;REVB=0.0113898;RO=95;SAF=49;SAR=34;SRF=50;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0629684;STB=0.540004;TYPE=snp;VARB=0.0174975;OID=.;OPOS=179631242;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:184:95:99:83:85:34:49:50:45:35:50:51:48 chr1 179852074 . T C 459.54 PASS AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0335795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.1858;QD=38.2946;RBI=0.0376872;REFB=0;REVB=0.0171097;RO=0;SAF=6;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.07197e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000188777;OID=.;OPOS=179852074;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:48:48:0:0:48:48:42:6:0:0:42:6:0:0 chr1 179858444 . G A 3240.38 PASS AO=337;DP=341;FAO=339;FDP=339;FR=.;FRO=0;FSAF=182;FSAR=157;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0335753;FXX=0.00877167;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.035;QD=38.2345;RBI=0.0352309;REFB=0;REVB=0.010673;RO=0;SAF=181;SAR=156;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.02398e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000146776;OID=.;OPOS=179858444;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:341:339:0:0:337:339:156:181:0:0:157:182:0:0 chr1 179876988 . C G 2522.82 PASS AO=266;DP=276;FAO=267;FDP=267;FR=.;FRO=0;FSAF=176;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00509147;FXX=0.0326075;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.787;QD=37.795;RBI=0.00686072;REFB=-0.0636781;REVB=0.00459851;RO=0;SAF=175;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.62028e-05;OID=.;OPOS=179876988;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:276:267:0:0:266:267:91:175:0:0:91:176:0:0 chr1 179887125 . G A 1498.59 PASS AO=157;DP=158;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0187097;FXX=0.0187488;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.8268;QD=38.1806;RBI=0.0310326;REFB=0.0315914;REVB=0.0247582;RO=1;SAF=75;SAR=82;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0063014;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000526106;OID=.;OPOS=179887125;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:158:157:1:0:157:157:82:75:1:0:82:75:0:0 chr1 179989742 . G C 691.14 PASS AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0348147;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.2059;QD=37.8708;RBI=0.0381487;REFB=0;REVB=0.0155967;RO=0;SAF=49;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.41374e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000138591;OID=.;OPOS=179989742;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:74:73:0:0:73:73:24:49:0:0:24:49:0:0 chr1 180145088 . A G 773.08 PASS AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00763949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.0867;QD=38.6539;RBI=0.00785019;REFB=0;REVB=0.00180659;RO=0;SAF=41;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.38009e-05;OID=.;OPOS=180145088;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:80:80:0:0:80:80:39:41:0:0:39:41:0:0 chr1 180167380 . A T 168.26 PASS AO=35;DP=74;FAO=36;FDP=69;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=-0.0066542;FXX=0.0920931;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.165;QD=9.754;RBI=0.0381776;REFB=-0.00768275;REVB=0.0375932;RO=24;SAF=15;SAR=20;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114766;STB=0.54836;TYPE=snp;VARB=0.0138473;OID=.;OPOS=180167380;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:69:24:33:35:36:20:15:14:10:20:16:18:15 chr1 180235728 . C T 99.71 PASS AO=21;DP=42;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=17;FWDB=0.0153535;FXX=0.10636;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.7688;QD=9.49655;RBI=0.0171524;REFB=0.00205655;REVB=0.0076468;RO=21;SAF=10;SAR=11;SRF=4;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260103;STB=0.645036;TYPE=snp;VARB=0.000468632;OID=.;OPOS=180235728;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:42:42:21:21:21:21:11:10:4:17:11:10:4:17 chr1 180243524 . A G 1385.11 PASS AO=146;DP=147;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0116862;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.917;QD=37.69;RBI=0.0311601;REFB=-0.054221;REVB=0.0288857;RO=1;SAF=62;SAR=84;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00562843;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000195364;OID=.;OPOS=180243524;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:147:147:1:0:146:147:84:62:0:1:85:62:0:0 chr1 180727915 . G GGCCCCTGCGCA 49.04 PASS AO=5;DP=14;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=11;MLLD=289.35;QD=15.0897;RBI=0.0281399;REFB=-0.0273991;REVB=0.0281399;RO=6;SAF=0;SAR=5;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.694502;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.0231233;OID=.;OPOS=180727916;OREF=-;OALT=GCCCCTGCGCA;OMAPALT=GGCCCCTGCGCA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:5:14:8:13:5:0:8:0:5:23:6:0:5:1:5 chr1 180854067 . A G 1434.58 PASS AO=149;DP=149;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0139681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.863;QD=38.5122;RBI=0.0160722;REFB=0;REVB=-0.00795031;RO=0;SAF=65;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.05563e-05;OID=.;OPOS=180854067;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:149:149:0:0:149:149:84:65:0:0:84:65:0:0 chr1 180885429 . CT C,CC 311.55 PASS AO=9,25;DP=35;FAO=6,28;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=6,11;FSAR=0,17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00895454,-0.00739147;FXX=0.0285633;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=117.035,129.204;QD=36.6534;RBI=0.0124683,0.0119657;REFB=0,0;REVB=-0.0086761,-0.00940974;RO=0;SAF=9,8;SAR=0,17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0491174,0.00339871;OID=.,.;OPOS=180885430,180885430;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:9,25:35:6,28:34:0:6,11:0,17:0:0:6:0:9,8:0,17:0:0 chr1 180897569 . C T 83.7 PASS AO=15;DP=25;FAO=15;FDP=25;FR=.;FRO=10;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.00646451;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=221.585;QD=13.3922;RBI=0.0198071;REFB=-0.0108449;REVB=-0.0187225;RO=9;SAF=12;SAR=3;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126109;STB=0.558057;TYPE=snp;VARB=0.00782218;OID=.;OPOS=180897569;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:25:25:9:10:15:15:3:12:6:3:3:12:7:3 chr1 180905352 . C T 351.7 PASS AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00314089;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.994;QD=36.0714;RBI=0.00318011;REFB=-0.107102;REVB=0.000497849;RO=1;SAF=8;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0153672;STB=0.508192;TYPE=snp;VARB=0.00127062;OID=.;OPOS=180905352;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:39:39:1:1:38:38:30:8:0:1:30:8:0:1 chr1 180905448 . G T 385.46 PASS AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.802;QD=37.6057;RBI=0.0270945;REFB=0;REVB=0.0232674;RO=0;SAF=25;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.1719e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.33241e-05;OID=.;OPOS=180905448;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:41:41:0:0:41:41:16:25:0:0:16:25:0:0 chr1 180913597 . A G 437.38 PASS AO=42;DP=47;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0752884;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.9252;QD=35.7042;RBI=0.093985;REFB=-0.0022969;REVB=-0.0562569;RO=2;SAF=27;SAR=15;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0132029;STB=0.508471;TYPE=snp;VARB=0.000421617;OID=.;OPOS=180913597;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:47:49:2:1:42:48:15:27:1:1:19:29:1:0 chr1 180944532 . T TAA 121.82 PASS AO=35;DP=98;FAO=44;FDP=92;FR=.;FRO=48;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=0.0587775;FXX=0.0212743;HRUN=3;LEN=2;MLLD=31.038;QD=5.29653;RBI=0.0589254;REFB=0.0192049;REVB=-0.00417266;RO=51;SAF=11;SAR=24;SRF=28;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253304;STB=0.584482;TYPE=ins;VARB=-0.0195437;OID=.;OPOS=180944533;OREF=-;OALT=AA;OMAPALT=TAA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:35:98:44:92:48:16:28:25:23:99:51:11:24:28:23 chr1 180953853 . A G 312.53 PASS AO=75;DP=154;FAO=75;FDP=154;FR=.;FRO=79;FSAF=33;FSAR=42;FSRF=37;FSRR=42;FWDB=0.0418799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.174;QD=8.11777;RBI=0.0448235;REFB=-0.00676682;REVB=0.0159755;RO=77;SAF=33;SAR=42;SRF=36;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0255661;STB=0.514702;TYPE=snp;VARB=0.00505327;OID=.;OPOS=180953853;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:154:77:79:75:75:42:33:36:41:42:33:37:42 chr1 181018236 . A G 95.48 PASS AO=35;DP=105;FAO=35;FDP=105;FR=.;FRO=70;FSAF=29;FSAR=6;FSRF=59;FSRR=11;FWDB=0.0011345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.4363;QD=3.63746;RBI=0.0140771;REFB=0.00500241;REVB=-0.0140313;RO=70;SAF=29;SAR=6;SRF=59;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0296573;STB=0.51713;TYPE=snp;VARB=-0.017967;OID=.;OPOS=181018236;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:105:105:70:70:35:35:6:29:59:11:6:29:59:11 chr1 181024404 . G A 281.73 PASS AO=78;DP=195;FAO=82;FDP=198;FR=.;FRO=116;FSAF=23;FSAR=59;FSRF=50;FSRR=66;FWDB=-0.0668967;FXX=0.00502487;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.307;QD=5.69148;RBI=0.0670318;REFB=-0.0156971;REVB=-0.00425395;RO=116;SAF=23;SAR=55;SRF=50;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160509;STB=0.599668;TYPE=snp;VARB=0.0202445;OID=.;OPOS=181024404;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:198:116:116:78:82:55:23:50:66:59:23:50:66 chr1 181391978 . G A 1625.18 PASS AO=170;DP=171;FAO=170;FDP=170;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133948;FXX=0.0116272;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.206;QD=38.2396;RBI=0.0135324;REFB=0;REVB=-0.00192473;RO=0;SAF=76;SAR=94;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.91328e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000381407;OID=.;OPOS=181391978;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:171:170:0:0:170:170:94:76:0:0:94:76:0:0 chr1 181548341 . A G 659.68 PASS AO=163;DP=341;FAO=163;FDP=339;FR=.;FRO=176;FSAF=79;FSAR=84;FSRF=73;FSRR=103;FWDB=0.000594791;FXX=0.00586493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.638;QD=7.78382;RBI=0.0116705;REFB=-0.0215736;REVB=-0.0116553;RO=176;SAF=79;SAR=84;SRF=73;SRR=103;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0662528;STB=0.536396;TYPE=snp;VARB=0.02337;OID=.;OPOS=181548341;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:341:339:176:176:163:163:84:79:73:103:84:79:73:103 chr1 181701799 . T A 135.79 PASS AO=26;DP=45;FAO=26;FDP=45;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=0.0221792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.2165;QD=12.0706;RBI=0.0398595;REFB=-0.00782625;REVB=0.033119;RO=18;SAF=6;SAR=20;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.047404;STB=0.547907;TYPE=snp;VARB=0.0091327;OID=.;OPOS=181701799;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:45:45:18:19:26:26:20:6:5:13:20:6:6:13 chr1 181702616 . G A 134.15 PASS AO=38;DP=78;FAO=37;FDP=88;FR=.;FRO=51;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=28;FWDB=-0.112589;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.668;QD=6.09791;RBI=0.114922;REFB=-0.00926403;REVB=0.0230412;RO=35;SAF=22;SAR=16;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20234;STB=0.599945;TYPE=snp;VARB=0.0190904;OID=.;OPOS=181702616;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:88:35:51:38:37:16:22:12:23:14:23:23:28 chr1 181706685 . C T 75.51 PASS AO=19;DP=48;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=22;FWDB=0.0547651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.081;QD=6.16379;RBI=0.0618122;REFB=-0.0107869;REVB=-0.0286623;RO=29;SAF=6;SAR=13;SRF=7;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0941531;STB=0.573701;TYPE=snp;VARB=0.0149648;OID=.;OPOS=181706685;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:48:49:29:29:19:20:13:6:7:22:13:7:7:22 chr1 181725110 . T C 479.43 PASS AO=95;DP=165;FAO=95;FDP=164;FR=.;FRO=69;FSAF=54;FSAR=41;FSRF=41;FSRR=28;FWDB=-0.0149245;FXX=0.0120475;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.636;QD=11.6933;RBI=0.0200631;REFB=-0.0254037;REVB=0.0134084;RO=69;SAF=54;SAR=41;SRF=41;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0204051;STB=0.511085;TYPE=snp;VARB=0.0200672;OID=.;OPOS=181725110;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:164:69:69:95:95:41:54:41:28:41:54:41:28 chr1 181740743 . A G 165.92 PASS AO=47;DP=117;FAO=48;FDP=117;FR=.;FRO=69;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=30;FSRR=39;FWDB=-0.00147486;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.466;QD=5.67243;RBI=0.00364931;REFB=-0.0106132;REVB=-0.00333801;RO=70;SAF=22;SAR=25;SRF=31;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0268734;STB=0.526267;TYPE=snp;VARB=0.0166952;OID=.;OPOS=181740743;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:70:69:47:48:25:22:31:39:25:23:30:39 chr1 181741301 . C T 342.95 PASS AO=83;DP=175;FAO=85;FDP=180;FR=.;FRO=95;FSAF=35;FSAR=50;FSRF=48;FSRR=47;FWDB=0.0241494;FXX=0.00552456;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.434;QD=7.62114;RBI=0.0681933;REFB=-0.00934607;REVB=-0.0637741;RO=91;SAF=35;SAR=48;SRF=48;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100799;STB=0.550021;TYPE=snp;VARB=0.0118135;OID=.;OPOS=181741301;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:180:91:95:83:85:48:35:48:43:50:35:48:47 chr1 181752923 . AAGCTT A 50 PASS AO=84;DP=235;LEN=5;RO=151;SAF=62;SAR=30;SRF=73;SRR=70;TYPE=del;FR=.;OID=.;OPOS=181752924;OREF=AGCTT;OALT=-;OMAPALT=A GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR 0/1:99:235:151:84:30:62:73:70 chr1 182356399 . A G 2105.37 PASS AO=222;DP=223;FAO=220;FDP=220;FR=.;FRO=0;FSAF=100;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0608266;FXX=0.0134523;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.0525;QD=38.2795;RBI=0.0617261;REFB=0;REVB=-0.0104995;RO=0;SAF=102;SAR=120;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.46205e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.55503e-05;OID=.;OPOS=182356399;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:223:220:0:0:222:220:120:102:0:0:120:100:0:0 chr1 182369078 . G A 1285.71 PASS AO=138;DP=140;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0035494;FXX=0.0211253;HRUN=3;LEN=1;MLLD=247.192;QD=36.9987;RBI=0.0329126;REFB=-0.114618;REVB=0.0327206;RO=2;SAF=76;SAR=62;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0150871;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000175269;OID=.;OPOS=182369078;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:140:139:2:0:138:139:62:76:0:2:62:77:0:0 chr1 182369233 . A G 1023.56 PASS AO=110;DP=112;FAO=111;FDP=113;FR=.;FRO=2;FSAF=81;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0190004;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.1476;QD=36.2323;RBI=0.0421222;REFB=-0.151317;REVB=0.0375934;RO=2;SAF=80;SAR=30;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0305933;STB=0.516126;TYPE=snp;VARB=0.0032612;OID=.;OPOS=182369233;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:112:113:2:2:110:111:30:80:0:2:30:81:0:2 chr1 182369738 . G A,C 96.39 PASS AO=7,2;DP=9;FAO=8,2;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0;FSAR=8,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0,0;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=227.54,198.244;QD=38.5553;RBI=0.0175943,0.0283234;REFB=0,0;REVB=0.0175943,0.0283234;RO=0;SAF=0,0;SAR=7,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=snp,snp;VARB=-0.0185647,0.0549127;OID=.,.;OPOS=182369738,182369738;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:9:10:0:0:7,2:8,2:7,2:0,0:0:0:8,2:0,0:0:0 chr1 182443014 . G C 94.8 PASS AO=14;DP=40;FAO=15;FDP=36;FR=.,HEALED;FRO=16;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.119538;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.6208;QD=10.5336;RBI=0.119627;REFB=-0.0280257;REVB=0.0046179;RO=16;SAF=5;SAR=9;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247787;STB=0.615232;TYPE=snp;VARB=0.0216771;OID=.;OPOS=182443014;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:36:36:16:16:14:15:9:5:10:6:9:6:10:6 chr1 182443462 . T C 200.56 PASS AO=48;DP=101;FAO=48;FDP=101;FR=.;FRO=53;FSAF=12;FSAR=36;FSRF=19;FSRR=34;FWDB=0.0105601;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.2705;QD=7.9431;RBI=0.0314789;REFB=0.0168368;REVB=0.0296547;RO=53;SAF=12;SAR=36;SRF=19;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126133;STB=0.570521;TYPE=snp;VARB=-0.0196476;OID=.;OPOS=182443462;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:53:53:48:48:36:12:19:34:36:12:19:34 chr1 182496829 . A G 353.89 PASS AO=83;DP=168;FAO=83;FDP=168;FR=.;FRO=85;FSAF=37;FSAR=46;FSRF=46;FSRR=39;FWDB=-0.0199609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.0177;QD=8.42586;RBI=0.0293504;REFB=-0.00323559;REVB=0.0215176;RO=84;SAF=37;SAR=46;SRF=46;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0930771;STB=0.548315;TYPE=snp;VARB=0.00755907;OID=.;OPOS=182496829;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:84:85:83:83:46:37:46:38:46:37:46:39 chr1 182551337 . A C 2096.85 PASS AO=221;DP=223;FAO=221;FDP=221;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=144;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106372;FXX=0.00896821;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.124;QD=37.9521;RBI=0.01706;REFB=-0.0210176;REVB=0.0133377;RO=1;SAF=77;SAR=144;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00614749;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.97728e-05;OID=.;OPOS=182551337;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:91:223:221:1:0:221:221:144:77:1:0:144:77:0:0 chr1 182554557 . C T 3169 PASS AO=226;DP=360;FAO=350;FDP=350;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=162;FSAR=188;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00625294;FXX=0.00568166;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.823;QD=36.2171;RBI=0.0573082;REFB=0;REVB=0.056966;RO=1;SAF=159;SAR=67;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00705852;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00144795;OID=.;OPOS=182554557;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:354:350:1:0:226:350:67:159:0:1:188:162:0:0 chr1 182568204 . G C 1219.04 PASS AO=125;DP=125;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00701563;FXX=0.00781189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.52;QD=38.3949;RBI=0.00711268;REFB=0;REVB=0.00117092;RO=0;SAF=54;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.48324e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.06518e-06;OID=.;OPOS=182568204;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:125:127:0:0:125:127:71:54:0:0:72:55:0:0 chr1 182569626 . T C 213.42 PASS AO=23;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00215529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.258;QD=35.5696;RBI=0.0180957;REFB=0;REVB=-0.0179669;RO=1;SAF=7;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0615783;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000304115;OID=.;OPOS=182569626;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:24:24:1:0:23:24:16:7:1:0:16:8:0:0 chr1 182640851 . T G 551.29 PASS AO=140;DP=300;FAO=140;FDP=299;FR=.;FRO=159;FSAF=63;FSAR=77;FSRF=77;FSRR=82;FWDB=0.011064;FXX=0.00333322;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.106;QD=7.3751;RBI=0.0120914;REFB=2.84688e-05;REVB=0.00487748;RO=157;SAF=63;SAR=77;SRF=77;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0390071;STB=0.518341;TYPE=snp;VARB=6.93699e-05;OID=.;OPOS=182640851;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:300:299:157:159:140:140:77:63:77:80:77:63:77:82 chr1 182640864 . T C 494.89 PASS AO=130;DP=288;FAO=131;FDP=290;FR=.;FRO=159;FSAF=52;FSAR=79;FSRF=75;FSRR=84;FWDB=-0.0200363;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.7803;QD=6.82605;RBI=0.0237375;REFB=-0.0174514;REVB=-0.0127284;RO=158;SAF=51;SAR=79;SRF=75;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.083812;STB=0.542054;TYPE=snp;VARB=0.0164108;OID=.;OPOS=182640864;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:288:290:158:159:130:131:79:51:75:83:79:52:75:84 chr1 182778367 . G A 808.33 PASS AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208683;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.039;QD=38.0393;RBI=0.0248792;REFB=0;REVB=0.0135458;RO=0;SAF=48;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.59073e-05;OID=.;OPOS=182778367;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:85:85:0:0:85:85:37:48:0:0:37:48:0:0 chr1 182850727 . T C 2128.64 PASS AO=223;DP=240;FAO=238;FDP=247;FR=.;FRO=9;FSAF=87;FSAR=151;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=-0.033693;FXX=0.0119995;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.9377;QD=34.4718;RBI=0.117802;REFB=-0.123132;REVB=0.112881;RO=14;SAF=82;SAR=141;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00733343;STB=0.510047;TYPE=snp;VARB=0.021529;OID=.;OPOS=182850727;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:240:247:14:9:223:238:141:82:6:8:151:87:1:8 chr1 183184690 . C T 57.01 PASS AO=23;DP=77;FAO=23;FDP=77;FR=.;FRO=54;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=30;FSRR=24;FWDB=0.0348206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.216;QD=2.96172;RBI=0.0349723;REFB=-0.013009;REVB=-0.00325396;RO=53;SAF=12;SAR=11;SRF=30;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0524195;STB=0.523789;TYPE=snp;VARB=0.0371991;OID=.;OPOS=183184690;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:77:77:53:54:23:23:11:12:30:23:11:12:30:24 chr1 183486859 . G A 806.65 PASS AO=163;DP=287;FAO=164;FDP=288;FR=.;FRO=124;FSAF=80;FSAR=84;FSRF=43;FSRR=81;FWDB=0.010284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.951;QD=11.2035;RBI=0.03509;REFB=-0.0071973;REVB=0.0335492;RO=124;SAF=80;SAR=83;SRF=43;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115158;STB=0.560931;TYPE=snp;VARB=0.00428798;OID=.;OPOS=183486859;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:287:288:124:124:163:164:83:80:43:81:84:80:43:81 chr1 183592570 . C T 129.43 PASS AO=43;DP=123;FAO=43;FDP=119;FR=.;FRO=76;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=41;FSRR=35;FWDB=-0.0250218;FXX=0.0325177;HRUN=3;LEN=1;MLLD=166.277;QD=4.35053;RBI=0.0251672;REFB=0.00451204;REVB=0.00270121;RO=71;SAF=24;SAR=19;SRF=39;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00978633;STB=0.512045;TYPE=snp;VARB=-0.00636309;OID=.;OPOS=183592570;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:119:71:76:43:43:19:24:39:32:19:24:41:35 chr1 183616926 . T C 982.16 PASS AO=185;DP=304;FAO=185;FDP=302;FR=.;FRO=117;FSAF=103;FSAR=82;FSRF=74;FSRR=43;FWDB=-0.00982038;FXX=0.00657873;HRUN=2;LEN=1;MLLD=270.734;QD=13.0087;RBI=0.0182692;REFB=-0.00998845;REVB=0.0154053;RO=109;SAF=103;SAR=82;SRF=71;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0666135;STB=0.529918;TYPE=snp;VARB=0.00623358;OID=.;OPOS=183616926;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:304:302:109:117:185:185:82:103:71:38:82:103:74:43 chr1 183617105 . A G 463.97 PASS AO=104;DP=201;FAO=104;FDP=201;FR=.;FRO=97;FSAF=44;FSAR=60;FSRF=43;FSRR=54;FWDB=-0.00594514;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=283.406;QD=9.23322;RBI=0.00803354;REFB=-0.0099696;REVB=0.00540305;RO=95;SAF=44;SAR=60;SRF=43;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0262731;STB=0.509963;TYPE=snp;VARB=0.00889096;OID=.;OPOS=183617105;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:201:95:97:104:104:60:44:43:52:60:44:43:54 chr1 183617266 . C G 57.7 PASS AO=21;DP=65;FAO=21;FDP=66;FR=.;FRO=45;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=0.0305665;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=152.739;QD=3.49686;RBI=0.0403718;REFB=-0.00989217;REVB=-0.0263737;RO=44;SAF=15;SAR=6;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235481;STB=0.633669;TYPE=snp;VARB=0.0132914;OID=.;OPOS=183617266;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:65:66:44:45:21:21:6:15:23:21:6:15:24:21 chr1 183876182 . C T 324.26 PASS AO=57;DP=90;FAO=57;FDP=90;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=39;FSRF=5;FSRR=28;FWDB=0.0357314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.467;QD=14.4116;RBI=0.0364201;REFB=-0.0226618;REVB=-0.00704929;RO=33;SAF=18;SAR=39;SRF=5;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136073;STB=0.573443;TYPE=snp;VARB=0.0156733;OID=.;OPOS=183876182;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:33:33:57:57:39:18:5:28:39:18:5:28 chr1 183909717 . G A 378.24 PASS AO=77;DP=138;FAO=77;FDP=138;FR=.;FRO=61;FSAF=39;FSAR=38;FSRF=20;FSRR=41;FWDB=-0.00460499;FXX=0.0142847;HRUN=3;LEN=1;MLLD=129.167;QD=10.9634;RBI=0.00549784;REFB=-0.0269787;REVB=0.00300339;RO=60;SAF=39;SAR=38;SRF=20;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138957;STB=0.578789;TYPE=snp;VARB=0.0183459;OID=.;OPOS=183909717;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:60:61:77:77:38:39:20:40:38:39:20:41 chr1 184039735 . T A 397.85 PASS AO=104;DP=236;FAO=108;FDP=240;FR=.;FRO=132;FSAF=57;FSAR=51;FSRF=71;FSRR=61;FWDB=0.0108392;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2796;QD=6.6309;RBI=0.0108417;REFB=-0.0222856;REVB=0.000235482;RO=132;SAF=55;SAR=49;SRF=71;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0091308;STB=0.505575;TYPE=snp;VARB=0.017635;OID=.;OPOS=184039735;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:236:240:132:132:104:108:49:55:71:61:51:57:71:61 chr1 184304863 . TG T 666.04 PASS AO=87;DP=104;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0347351;FXX=0.0097078;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.6173;QD=26.1192;RBI=0.0576866;REFB=-0.0161944;REVB=0.0460567;RO=5;SAF=41;SAR=46;SRF=3;SRR=2;SSEN=0.394366;SSEP=0;SSSB=-0.0132664;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00481381;OID=.;OPOS=184304864;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:87:100:102:102:0:49:53:0:0:54:5:41:46:3:2 chr1 184660205 . T A 106.16 PASS AO=34;DP=94;FAO=34;FDP=95;FR=.;FRO=61;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=35;FWDB=0.0002206;FXX=0.0206164;HRUN=5;LEN=1;MLLD=220.578;QD=4.46975;RBI=0.000560571;REFB=0.00341596;REVB=-0.00051534;RO=59;SAF=13;SAR=21;SRF=26;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.066889;STB=0.529394;TYPE=snp;VARB=-0.0055291;OID=.;OPOS=184660205;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:95:59:61:34:34:21:13:26:33:21:13:26:35 chr1 184662181 . C T 387.21 PASS AO=70;DP=135;FAO=81;FDP=143;FR=.;FRO=62;FSAF=33;FSAR=48;FSRF=27;FSRR=35;FWDB=-0.018404;FXX=0.0205465;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.973;QD=10.8312;RBI=0.0440025;REFB=-0.0366311;REVB=0.039969;RO=65;SAF=33;SAR=37;SRF=27;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0494334;STB=0.512544;TYPE=snp;VARB=0.032559;OID=.;OPOS=184662181;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:143:65:62:70:81:37:33:27:38:48:33:27:35 chr1 184663581 . T C 170.44 PASS AO=38;DP=75;FAO=38;FDP=75;FR=.;FRO=37;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=0.00362651;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.964;QD=9.09009;RBI=0.0214205;REFB=0.00483334;REVB=0.0211113;RO=37;SAF=16;SAR=22;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0103446;STB=0.505744;TYPE=snp;VARB=-0.00469218;OID=.;OPOS=184663581;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:37:37:38:38:22:16:16:21:22:16:16:21 chr1 184677464 . G A 458.3 PASS AO=96;DP=174;FAO=96;FDP=174;FR=.;FRO=78;FSAF=43;FSAR=53;FSRF=31;FSRR=47;FWDB=-0.0505418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.6926;QD=10.5357;RBI=0.0525233;REFB=-0.0229829;REVB=-0.0142906;RO=76;SAF=43;SAR=53;SRF=29;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0547573;STB=0.522982;TYPE=snp;VARB=0.0183516;OID=.;OPOS=184677464;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:174:76:78:96:96:53:43:29:47:53:43:31:47 chr1 184706212 . GT G 219.13 PASS AO=65;DP=134;FAO=73;FDP=130;FR=.;FRO=57;FSAF=27;FSAR=46;FSRF=16;FSRR=41;FWDB=-0.0464146;FXX=0.0298485;HRUN=2;LEN=1;MLLD=19.857;QD=6.7423;RBI=0.0626011;REFB=-0.0270042;REVB=-0.042007;RO=59;SAF=22;SAR=43;SRF=17;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.04959;STB=0.542859;TYPE=del;VARB=0.0223114;OID=.;OPOS=184706213;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:65:134:73:130:57:27:46:16:41:99:59:22:43:17:42 chr1 184777177 . C A 358.64 PASS AO=86;DP=207;FAO=97;FDP=216;FR=.;FRO=119;FSAF=51;FSAR=46;FSRF=80;FSRR=39;FWDB=0.0235463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.863;QD=6.64154;RBI=0.0243735;REFB=-0.0442312;REVB=0.00629611;RO=119;SAF=41;SAR=45;SRF=80;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202239;STB=0.581588;TYPE=snp;VARB=0.0471563;OID=.;OPOS=184777177;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:216:119:119:86:97:45:41:80:39:46:51:80:39 chr1 185135745 . A G 712.12 PASS AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.658;QD=37.9798;RBI=0.020495;REFB=0;REVB=-0.00903208;RO=0;SAF=29;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.89405e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.79037e-05;OID=.;OPOS=185135745;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:75:75:0:0:75:75:46:29:0:0:46:29:0:0 chr1 185137461 . A T 1255.53 PASS AO=134;DP=134;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0290279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.313;QD=37.4784;RBI=0.0298518;REFB=0;REVB=0.00696501;RO=0;SAF=86;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.42803e-06;OID=.;OPOS=185137461;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:134:134:0:0:134:134:48:86:0:0:48:86:0:0 chr1 185137463 . T A 26.38 PASS AO=33;DP=140;FAO=29;FDP=140;FR=.;FRO=111;FSAF=23;FSAR=6;FSRF=69;FSRR=42;FWDB=-0.0144353;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=152.07;QD=0.753777;RBI=0.0156956;REFB=-0.000814919;REVB=0.0061624;RO=104;SAF=24;SAR=9;SRF=65;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146725;STB=0.66654;TYPE=snp;VARB=0.111258;OID=.;OPOS=185137463;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:140:140:104:111:33:29:9:24:65:39:6:23:69:42 chr1 185143721 . A G 778.89 PASS AO=90;DP=97;FAO=90;FDP=96;FR=.;FRO=6;FSAF=58;FSAR=32;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.0318625;FXX=0.0103082;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.487;QD=32.4538;RBI=0.0329603;REFB=-0.024556;REVB=0.00843545;RO=3;SAF=58;SAR=32;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0238836;STB=0.524585;TYPE=snp;VARB=0.00635064;OID=.;OPOS=185143721;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:97:96:3:6:90:90:32:58:3:0:32:58:6:0 chr1 185171869 . A G 3071.76 PASS AO=328;DP=333;FAO=328;FDP=328;FR=.;FRO=0;FSAF=122;FSAR=206;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0399783;FXX=0.0150146;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.33;QD=37.4604;RBI=0.0410792;REFB=-0.0970726;REVB=0.00944672;RO=4;SAF=122;SAR=206;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0030019;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.37457e-05;OID=.;OPOS=185171869;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:333:328:4:0:328:328:206:122:1:3:206:122:0:0 chr1 185240474 . A G 2288.25 PASS AO=247;DP=252;FAO=248;FDP=248;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=145;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0255486;FXX=0.0158724;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.95;QD=36.9072;RBI=0.0290615;REFB=0.00475475;REVB=-0.0138505;RO=5;SAF=103;SAR=144;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0162593;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.19109e-07;OID=.;OPOS=185240474;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:252:248:5:0:247:248:144:103:0:5:145:103:0:0 chr1 185704020 . G A 418.35 PASS AO=88;DP=190;FAO=98;FDP=198;FR=.;FRO=100;FSAF=57;FSAR=41;FSRF=43;FSRR=57;FWDB=0.00212551;FXX=0.019801;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.111;QD=8.45155;RBI=0.0143025;REFB=-0.00268753;REVB=0.0141437;RO=98;SAF=48;SAR=40;SRF=41;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120747;STB=0.576693;TYPE=snp;VARB=0.00286245;OID=.;OPOS=185704020;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:198:98:100:88:98:40:48:41:57:41:57:43:57 chr1 186026474 . T C 1977.78 PASS AO=205;DP=206;FAO=206;FDP=206;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0345709;FXX=0.00483068;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7041;QD=38.4034;RBI=0.0558161;REFB=0;REVB=0.0438211;RO=0;SAF=95;SAR=110;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.05166e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000159656;OID=.;OPOS=186026474;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:206:206:0:0:205:206:110:95:0:0:111:95:0:0 chr1 186031041 . C T 961.32 PASS AO=101;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00518353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.247;QD=38.0721;RBI=0.00518377;REFB=0;REVB=-4.98434e-05;RO=0;SAF=47;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.52491e-05;OID=.;OPOS=186031041;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:101:101:0:0:101:101:54:47:0:0:54:47:0:0 chr1 186050417 . A G 2506.7 PASS AO=260;DP=260;FAO=263;FDP=263;FR=.;FRO=0;FSAF=138;FSAR=125;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0169922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.032;QD=38.1247;RBI=0.0265146;REFB=0;REVB=-0.0203541;RO=0;SAF=138;SAR=122;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.19657e-05;OID=.;OPOS=186050417;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:260:263:0:0:260:263:122:138:0:0:125:138:0:0 chr1 186101539 . A G 1167.77 PASS AO=123;DP=125;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0345703;FXX=0.0158718;HRUN=3;LEN=1;MLLD=183.838;QD=37.6699;RBI=0.0582758;REFB=-0.110061;REVB=0.0469144;RO=1;SAF=61;SAR=62;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00760137;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000202136;OID=.;OPOS=186101539;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:125:124:1:0:123:124:62:61:0:1:62:62:0:0 chr1 186273994 . C T 194 PASS AO=43;DP=85;FAO=43;FDP=84;FR=.;FRO=41;FSAF=3;FSAR=40;FSRF=8;FSRR=33;FWDB=-0.0151075;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.705;QD=9.23787;RBI=0.0198738;REFB=-0.00743082;REVB=0.0129124;RO=42;SAF=3;SAR=40;SRF=9;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.328172;STB=0.667581;TYPE=snp;VARB=0.00768197;OID=.;OPOS=186273994;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:84:42:41:43:43:40:3:9:33:40:3:8:33 chr1 186277088 . G C 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.043338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.8601;QD=35.0872;RBI=0.0544909;REFB=0;REVB=-0.0330315;RO=0;SAF=1;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00503319;OID=.;OPOS=186277088;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:6:1:0:0:6:1:0:0 chr1 186277989 . A G 128.75 PASS AO=25;DP=44;FAO=25;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.00859175;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=85.2265;QD=11.7043;RBI=0.0118364;REFB=-0.00203794;REVB=-0.00814142;RO=19;SAF=9;SAR=16;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134053;STB=0.574608;TYPE=snp;VARB=0.00274101;OID=.;OPOS=186277989;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:44:44:19:19:25:25:16:9:10:9:16:9:10:9 chr1 186292884 . TG T 900.36 PASS AO=102;DP=131;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=109;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.115009;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=17.7745;QD=27.7033;RBI=0.118306;REFB=0;REVB=-0.0277364;RO=5;SAF=93;SAR=9;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0.25641;SSSB=0.0299069;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0013264;OID=.;OPOS=186292885;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:102:128:130:130:0:109:21:0:0:82:5:93:9:4:1 chr1 186321242 . C T 502.42 PASS AO=110;DP=205;FAO=110;FDP=205;FR=.;FRO=95;FSAF=56;FSAR=54;FSRF=38;FSRR=57;FWDB=0.021325;FXX=0.00485413;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.4962;QD=9.80329;RBI=0.0213469;REFB=-0.0267799;REVB=-0.000968722;RO=94;SAF=56;SAR=54;SRF=38;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0884245;STB=0.550469;TYPE=snp;VARB=0.0144311;OID=.;OPOS=186321242;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:205:94:95:110:110:54:56:38:56:54:56:38:57 chr1 186363119 . C G 323.03 PASS AO=53;DP=205;FAO=93;FDP=205;FR=.,HEALED;FRO=112;FSAF=40;FSAR=53;FSRF=35;FSRR=77;FWDB=-0.00468158;FXX=0.0144224;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.2488;QD=6.30308;RBI=0.0134139;REFB=-0.00419435;REVB=0.0125705;RO=111;SAF=37;SAR=16;SRF=36;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.422468;STB=0.566744;TYPE=snp;VARB=0.00736701;OID=.;OPOS=186363119;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:206:205:111:112:53:93:16:37:36:75:53:40:35:77 chr1 186363120 . T G 43.59 PASS AO=41;DP=203;FAO=41;FDP=207;FR=.;FRO=166;FSAF=2;FSAR=39;FSRF=74;FSRR=92;FWDB=0.00538274;FXX=0.00480746;HRUN=4;LEN=1;MLLD=78.5414;QD=0.842372;RBI=0.00860811;REFB=-0.0714314;REVB=0.00671756;RO=162;SAF=2;SAR=39;SRF=74;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.649359;STB=0.918535;TYPE=snp;VARB=0.0386447;OID=.;OPOS=186363120;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:203:207:162:166:41:41:39:2:74:88:39:2:74:92 chr1 186645847 . TAAAAAAAT TAAAAAAT,TAAA,TAAAA 79.43 PASS AO=7,8,11;DP=52;FAO=7,2,18;FDP=50;FR=.;FRO=23;FSAF=6,1,14;FSAR=1,1,4;FSRF=20;FSRR=3;FWDB=-0.280637,-0.00395664,0.012644;FXX=0.019604;HRUN=7,7,7;LEN=1,5,4;MLLD=6.76923,190.855,192.795;QD=6.35401;RBI=0.297075,0.0274419,0.0278291;REFB=-0.00703986,-0.00767935,-0.0056939;REVB=-0.0974519,-0.0271551,-0.024791;RO=5;SAF=7,7,8;SAR=0,1,3;SRF=5;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,-0.233315,-0.213785;STB=0.519944,0.838171,0.581116;TYPE=del,del,del;VARB=0.0980651,0.00880004,0.00297161;OID=.,.,.;OPOS=186645848,186645851,186645852;OREF=A,AAAAT,AAAT;OALT=-,-,-;OMAPALT=TAAAAAAT,TAAA,TAAAA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/3:7,8,11:36:7,2,18:50:23:6,1,14:1,1,4:20:3:44:5:7,7,8:0,1,3:5:0 chr1 186648197 . C G 223.6 PASS AO=55;DP=117;FAO=55;FDP=117;FR=.;FRO=62;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=32;FSRR=30;FWDB=-0.0257385;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.289;QD=7.64454;RBI=0.0318463;REFB=-0.00175745;REVB=0.0187542;RO=62;SAF=30;SAR=25;SRF=32;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0281101;STB=0.515619;TYPE=snp;VARB=0.00127723;OID=.;OPOS=186648197;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:62:62:55:55:25:30:32:30:25:30:32:30 chr1 186839882 . A T 488.51 PASS AO=137;DP=317;FAO=137;FDP=317;FR=.;FRO=180;FSAF=35;FSAR=102;FSRF=59;FSRR=121;FWDB=-0.0567972;FXX=0.0062694;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.156;QD=6.16413;RBI=0.0571918;REFB=0.00751197;REVB=-0.00670681;RO=180;SAF=35;SAR=102;SRF=59;SRR=121;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0918726;STB=0.551248;TYPE=snp;VARB=-0.00383044;OID=.;OPOS=186839882;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:317:317:180:180:137:137:102:35:59:121:102:35:59:121 chr1 186839883 . GTGC G,GTG 1714.57 PASS AO=131,106;DP=318;FAO=133,153;FDP=304;FR=.;FRO=18;FSAF=34,48;FSAR=99,105;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0178595,0.0935613;FXX=0.0225073;HRUN=1,3;LEN=3,1;MLLD=153.935,13.3975;QD=22.5601;RBI=0.0198678,0.094059;REFB=-0.0422272,-0.251019;REVB=-0.00870447,0.0096626;RO=43;SAF=34,22;SAR=97,84;SRF=19;SRR=24;SSEN=0,0.39666;SSEP=0,0;SSSB=-0.103755,-0.170306;STB=0.528734,0.515787;TYPE=del,del;VARB=0.00458925,0.0593112;OID=.,.;OPOS=186839884,186839886;OREF=TGC,C;OALT=-,-;OMAPALT=G,GTG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:131,106:309:133,153:304:18:34,48:99,105:8:10:99:43:34,22:97,84:19:24 chr1 186946912 . G A 1698.3 PASS AO=176;DP=176;FAO=179;FDP=179;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=147;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0245044;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.079;QD=37.9509;RBI=0.0864479;REFB=-0.0215052;REVB=-0.0829022;RO=0;SAF=32;SAR=144;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000190205;OID=.;OPOS=186946912;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:176:179:0:0:176:179:144:32:0:0:147:32:0:0 chr1 190950209 . G A 264.82 PASS AO=89;DP=238;FAO=89;FDP=237;FR=.;FRO=148;FSAF=31;FSAR=58;FSRF=53;FSRR=95;FWDB=-0.00548565;FXX=0.0042015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4171;QD=4.46954;RBI=0.0102984;REFB=-0.0155258;REVB=0.00871582;RO=148;SAF=31;SAR=58;SRF=53;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011865;STB=0.506707;TYPE=snp;VARB=0.0278491;OID=.;OPOS=190950209;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:238:237:148:148:89:89:58:31:53:95:58:31:53:95 chr1 192781172 . C G 2066.67 PASS AO=207;DP=208;FAO=217;FDP=217;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00738565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.319;QD=38.0953;RBI=0.0275229;REFB=0;REVB=0.0265135;RO=0;SAF=98;SAR=109;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.96409e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000157704;OID=.;OPOS=192781172;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:208:217:0:0:207:217:109:98:0:0:119:98:0:0 chr1 192844886 . G A 518.57 PASS AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00669028;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.056;QD=36.3909;RBI=0.0555212;REFB=-0.0111667;REVB=0.0551167;RO=1;SAF=30;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177894;STB=0.509431;TYPE=snp;VARB=0.000323178;OID=.;OPOS=192844886;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:57:57:1:1:56:56:26:30:0:1:26:30:0:1 chr1 192844931 . T C 117.85 PASS AO=31;DP=75;FAO=32;FDP=76;FR=.;FRO=44;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=-0.0360429;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.9987;QD=6.2026;RBI=0.0366347;REFB=-0.00779171;REVB=-0.00655796;RO=43;SAF=13;SAR=18;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0715794;STB=0.555057;TYPE=snp;VARB=0.00726107;OID=.;OPOS=192844931;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:76:43:44:31:32:18:13:21:22:19:13:22:22 chr1 193074651 . T A 101.54 PASS AO=27;DP=64;FAO=27;FDP=64;FR=.;FRO=37;FSAF=21;FSAR=6;FSRF=26;FSRR=11;FWDB=0.00260333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.1426;QD=6.34644;RBI=0.0339925;REFB=-0.0377698;REVB=0.0338927;RO=36;SAF=21;SAR=6;SRF=26;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0765371;STB=0.55864;TYPE=snp;VARB=0.0491155;OID=.;OPOS=193074651;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:36:37:27:27:6:21:26:10:6:21:26:11 chr1 193150484 . G T 199.44 PASS AO=53;DP=135;FAO=56;FDP=133;FR=.;FRO=77;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=49;FSRR=28;FWDB=0.0024829;FXX=0.0431624;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.177;QD=5.99818;RBI=0.0121308;REFB=0.00650627;REVB=-0.011874;RO=82;SAF=26;SAR=27;SRF=51;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141094;STB=0.57892;TYPE=snp;VARB=-0.00606755;OID=.;OPOS=193150484;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:133:82:77:53:56:27:26:51:31:28:28:49:28 chr1 193701055 . G C 223.49 PASS AO=62;DP=145;FAO=63;FDP=146;FR=.;FRO=83;FSAF=40;FSAR=23;FSRF=36;FSRR=47;FWDB=-0.0286375;FXX=0.00680226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.0733;QD=6.12303;RBI=0.0287222;REFB=-0.032869;REVB=-0.00220479;RO=82;SAF=40;SAR=22;SRF=36;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212991;STB=0.615618;TYPE=snp;VARB=0.043696;OID=.;OPOS=193701055;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:146:82:83:62:63:22:40:36:46:23:40:36:47 chr1 193701480 . G A 138.65 PASS AO=56;DP=187;FAO=61;FDP=200;FR=.;FRO=139;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=78;FSRR=61;FWDB=-0.03355;FXX=0.00497488;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.905;QD=2.77309;RBI=0.0347498;REFB=-0.0104504;REVB=0.00905239;RO=130;SAF=24;SAR=32;SRF=70;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131616;STB=0.581881;TYPE=snp;VARB=0.0328659;OID=.;OPOS=193701480;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:200:130:139:56:61:32:24:70:60:34:27:78:61 chr1 193701489 . C T 138.29 PASS AO=53;DP=183;FAO=62;FDP=203;FR=.;FRO=141;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=75;FSRR=66;FWDB=-0.00169057;FXX=0.00490172;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.5875;QD=2.72486;RBI=0.0255826;REFB=-0.021793;REVB=0.0255267;RO=130;SAF=22;SAR=31;SRF=65;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103669;STB=0.555679;TYPE=snp;VARB=0.0551167;OID=.;OPOS=193701489;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:203:130:141:53:62:31:22:65:65:34:28:75:66 chr1 194457292 . T C 365.48 PASS AO=84;DP=166;FAO=84;FDP=166;FR=.;FRO=82;FSAF=46;FSAR=38;FSRF=51;FSRR=31;FWDB=-0.0180618;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=164.332;QD=8.80674;RBI=0.0192859;REFB=-0.0239591;REVB=0.00676157;RO=81;SAF=46;SAR=38;SRF=50;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0632859;STB=0.537309;TYPE=snp;VARB=0.0203014;OID=.;OPOS=194457292;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:166:81:82:84:84:38:46:50:31:38:46:51:31 chr1 196227526 . A G 2614.01 PASS AO=256;DP=256;FAO=273;FDP=273;FR=.;FRO=0;FSAF=116;FSAR=157;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0121207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.634;QD=38.3005;RBI=0.0305921;REFB=0;REVB=-0.0280886;RO=0;SAF=114;SAR=142;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2425e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.41725e-05;OID=.;OPOS=196227526;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:256:273:0:0:256:273:142:114:0:0:157:116:0:0 chr1 196654324 . A C 2159.3 PASS AO=225;DP=228;FAO=230;FDP=230;FR=.;FRO=0;FSAF=115;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0528223;FXX=0.00432882;HRUN=4;LEN=1;MLLD=53.2435;QD=37.553;RBI=0.0531332;REFB=0.0219939;REVB=-0.00573878;RO=3;SAF=114;SAR=111;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00401213;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.03647e-05;OID=.;OPOS=196654324;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:228:230:3:0:225:230:111:114:2:1:115:115:0:0 chr1 196659237 . C T 1857.31 PASS AO=203;DP=205;FAO=200;FDP=200;FR=.;FRO=0;FSAF=114;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171166;FXX=0.0243891;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.9966;QD=37.1462;RBI=0.0468399;REFB=-0.125188;REVB=0.0436004;RO=2;SAF=116;SAR=87;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00814096;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000563881;OID=.;OPOS=196659237;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:205:200:2:0:203:200:87:116:2:0:86:114:0:0 chr1 196695742 . A G 3002.75 PASS AO=319;DP=322;FAO=319;FDP=319;FR=.;FRO=0;FSAF=165;FSAR=154;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0229216;FXX=0.00931648;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.831;QD=37.6521;RBI=0.0270841;REFB=-0.024573;REVB=0.0144274;RO=2;SAF=165;SAR=154;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000205158;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.81003e-05;OID=.;OPOS=196695742;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:322:319:2:0:319:319:154:165:1:1:154:165:0:0 chr1 196709774 . G T 3066.38 PASS AO=320;DP=323;FAO=320;FDP=320;FR=.;FRO=0;FSAF=162;FSAR=158;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000149462;FXX=0.00928764;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.3061;QD=38.3298;RBI=0.0183345;REFB=0;REVB=0.0183339;RO=0;SAF=162;SAR=158;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.32146e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.39356e-06;OID=.;OPOS=196709774;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:323:320:0:0:320:320:158:162:0:0:158:162:0:0 chr1 196712586 . C T 75.21 PASS AO=80;DP=405;FAO=80;FDP=399;FR=.;FRO=319;FSAF=40;FSAR=40;FSRF=124;FSRR=195;FWDB=0.00289714;FXX=0.00249994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.6965;QD=0.753993;RBI=0.014033;REFB=0.00760221;REVB=-0.0137306;RO=323;SAF=40;SAR=40;SRF=126;SRR=197;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143021;STB=0.588951;TYPE=snp;VARB=-0.027016;OID=.;OPOS=196712586;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:405:399:323:319:80:80:40:40:126:197:40:40:124:195 chr1 196757392 . C T 2072.76 PASS AO=218;DP=230;FAO=220;FDP=220;FR=.;FRO=0;FSAF=118;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127604;FXX=0.0434764;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.414;QD=37.6866;RBI=0.013291;REFB=-0.0030189;REVB=-0.0037177;RO=2;SAF=116;SAR=102;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00924942;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.43445e-06;OID=.;OPOS=196757392;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:82:230:220:2:0:218:220:102:116:0:2:102:118:0:0 chr1 196757874 . G A 1312.99 PASS AO=135;DP=135;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0315384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.8422;QD=38.3356;RBI=0.0413723;REFB=0;REVB=-0.0267769;RO=0;SAF=54;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.26537e-05;OID=.;OPOS=196757874;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:135:137:0:0:135:137:81:54:0:0:82:55:0:0 chr1 196757881 . G T 1336.27 PASS AO=135;DP=135;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0453867;FXX=0.00714235;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.111;QD=38.4538;RBI=0.0505951;REFB=0;REVB=0.0223586;RO=0;SAF=47;SAR=88;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000444666;OID=.;OPOS=196757881;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:135:139:0:0:135:139:88:47:0:0:88:51:0:0 chr1 196763707 . T C 168.6 PASS AO=19;DP=24;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0847597;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=37.7462;QD=29.3211;RBI=0.097124;REFB=-0.0614935;REVB=-0.0474222;RO=4;SAF=10;SAR=9;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0715858;STB=0.526292;TYPE=snp;VARB=0.0101903;OID=.;OPOS=196763707;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:24:23:4:1:19:22:9:10:3:1:9:13:0:1 chr1 196799691 . G A 515.19 PASS AO=143;DP=330;FAO=143;FDP=328;FR=.;FRO=185;FSAF=54;FSAR=89;FSRF=59;FSRR=126;FWDB=-0.00185829;FXX=0.00606042;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1041;QD=6.28281;RBI=0.0677306;REFB=0.00837889;REVB=-0.0677051;RO=185;SAF=54;SAR=89;SRF=59;SRR=126;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0647154;STB=0.535833;TYPE=snp;VARB=-0.0108198;OID=.;OPOS=196799691;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:330:328:185:185:143:143:89:54:59:126:89:54:59:126 chr1 196801042 . G T 441.89 PASS AO=200;DP=517;FAO=150;FDP=400;FR=.;FRO=250;FSAF=76;FSAR=74;FSRF=115;FSRR=135;FWDB=0.00421248;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=230.667;QD=4.41893;RBI=0.00891955;REFB=0.002285;REVB=-0.00786215;RO=316;SAF=102;SAR=98;SRF=142;SRR=174;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0661816;STB=0.529145;TYPE=snp;VARB=-0.004311;OID=.;OPOS=196801042;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:517:400:316:250:200:150:98:102:142:174:74:76:115:135 chr1 196801078 . A T 485.25 PASS AO=197;DP=493;FAO=156;FDP=399;FR=.;FRO=243;FSAF=70;FSAR=86;FSRF=111;FSRR=132;FWDB=0.0120607;FXX=0.00249994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.586;QD=4.86462;RBI=0.0139247;REFB=0.00333697;REVB=-0.00695971;RO=294;SAF=87;SAR=110;SRF=134;SRR=160;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0153487;STB=0.504963;TYPE=snp;VARB=-0.0042303;OID=.;OPOS=196801078;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:493:399:294:243:197:156:110:87:134:160:86:70:111:132 chr1 196874356 . G T 3709.86 PASS AO=449;DP=456;FAO=395;FDP=395;FR=.;FRO=0;FSAF=165;FSAR=230;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0169029;FXX=0.0124997;HRUN=3;LEN=1;MLLD=150.133;QD=37.5682;RBI=0.0197529;REFB=0.0324926;REVB=-0.0102211;RO=6;SAF=186;SAR=263;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00642791;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.03943e-05;OID=.;OPOS=196874356;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:456:395:6:0:449:395:263:186:1:5:230:165:0:0 chr1 196876458 . A G 438.37 PASS AO=124;DP=289;FAO=124;FDP=289;FR=.;FRO=165;FSAF=57;FSAR=67;FSRF=73;FSRR=92;FWDB=-0.00402724;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=102.069;QD=6.06733;RBI=0.00849618;REFB=-0.0260256;REVB=-0.00748106;RO=160;SAF=57;SAR=67;SRF=70;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0226969;STB=0.509929;TYPE=snp;VARB=0.0269754;OID=.;OPOS=196876458;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:289:289:160:165:124:124:67:57:70:90:67:57:73:92 chr1 196884258 . A T 158.62 PASS AO=34;DP=65;FAO=34;FDP=65;FR=.;FRO=31;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=0.0156501;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.669;QD=9.7611;RBI=0.0278851;REFB=-0.00353404;REVB=-0.0230792;RO=31;SAF=21;SAR=13;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.224998;STB=0.624814;TYPE=snp;VARB=0.00369609;OID=.;OPOS=196884258;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:31:31:34:34:13:21:11:20:13:21:11:20 chr1 196918741 . G A 537.33 PASS AO=143;DP=320;FAO=144;FDP=320;FR=.;FRO=176;FSAF=40;FSAR=104;FSRF=63;FSRR=113;FWDB=-0.00744272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.4597;QD=6.71665;RBI=0.0484503;REFB=-0.0255557;REVB=0.0478752;RO=172;SAF=40;SAR=103;SRF=63;SRR=109;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100481;STB=0.552385;TYPE=snp;VARB=0.0304252;OID=.;OPOS=196918741;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:320:320:172:176:143:144:103:40:63:109:104:40:63:113 chr1 197009798 . A G 1620.5 PASS AO=173;DP=182;FAO=179;FDP=179;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.197341;FXX=0.0218567;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.0419;QD=36.2123;RBI=0.197633;REFB=-0.0818556;REVB=0.010735;RO=5;SAF=71;SAR=102;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0323399;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00326428;OID=.;OPOS=197009798;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:182:179:5:0:173:179:102:71:5:0:102:77:0:0 chr1 197030201 . T C 869.66 PASS AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.054;QD=38.6515;RBI=0.0177435;REFB=0;REVB=0.0144711;RO=0;SAF=43;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.16558e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.82232e-05;OID=.;OPOS=197030201;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:90:90:0:0:90:90:47:43:0:0:47:43:0:0 chr1 197031021 . C T 2432.74 PASS AO=254;DP=254;FAO=254;FDP=254;FR=.;FRO=0;FSAF=107;FSAR=147;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.005294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.019;QD=38.3109;RBI=0.00830064;REFB=0;REVB=-0.0063933;RO=0;SAF=107;SAR=147;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.09649e-05;OID=.;OPOS=197031021;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:254:254:0:0:254:254:147:107:0:0:147:107:0:0 chr1 197070815 . T C 682.21 PASS AO=72;DP=74;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00640604;FXX=0.0270234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.462;QD=37.9006;RBI=0.0445664;REFB=0;REVB=0.0441036;RO=0;SAF=33;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.79377e-05;OID=.;OPOS=197070815;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:74:72:0:0:72:72:39:33:0:0:39:33:0:0 chr1 197070901 . A G 1397.86 PASS AO=150;DP=152;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176908;FXX=0.013157;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.7167;QD=37.2762;RBI=0.0191814;REFB=-0.128733;REVB=0.00741375;RO=2;SAF=86;SAR=64;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0109322;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000842203;OID=.;OPOS=197070901;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:152:150:2:0:150:150:64:86:2:0:64:86:0:0 chr1 197091537 . A T 1134.35 PASS AO=121;DP=122;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0693244;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.065;QD=37.4992;RBI=0.070413;REFB=-0.104444;REVB=0.0123334;RO=1;SAF=72;SAR=49;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00959571;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000533369;OID=.;OPOS=197091537;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:122:121:1:0:121:121:49:72:0:1:49:72:0:0 chr1 197094030 . C T 1840.34 PASS AO=196;DP=203;FAO=198;FDP=198;FR=.;FRO=0;FSAF=124;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00526864;FXX=0.0246293;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.83;QD=37.1785;RBI=0.00530013;REFB=-0.0359315;REVB=-0.000576817;RO=2;SAF=124;SAR=72;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00274308;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.24625e-05;OID=.;OPOS=197094030;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:203:198:2:0:196:198:72:124:1:1:74:124:0:0 chr1 197111665 . G A 619.3 PASS AO=148;DP=303;FAO=149;FDP=303;FR=.;FRO=154;FSAF=57;FSAR=92;FSRF=79;FSRR=75;FWDB=0.0100143;FXX=0.00655716;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.238;QD=8.17559;RBI=0.0133559;REFB=-0.00743002;REVB=0.00883701;RO=151;SAF=57;SAR=91;SRF=78;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123573;STB=0.567918;TYPE=snp;VARB=0.00769485;OID=.;OPOS=197111665;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:303:303:151:154:148:149:91:57:78:73:92:57:79:75 chr1 197112533 . G A 1506.54 PASS AO=158;DP=160;FAO=158;FDP=158;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0391483;FXX=0.0124992;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.801;QD=38.1403;RBI=0.0394246;REFB=-0.0759802;REVB=0.00465972;RO=1;SAF=74;SAR=84;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00563063;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000341362;OID=.;OPOS=197112533;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:160:158:1:0:158:158:84:74:0:1:84:74:0:0 chr1 197127041 . CA C 345.36 PASS AO=50;DP=91;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=58;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0029179;FXX=0.03571;HRUN=7;LEN=1;MLLD=9.90153;QD=17.0547;RBI=0.394058;REFB=-0.0227978;REVB=0.394048;RO=27;SAF=16;SAR=34;SRF=4;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134919;STB=0.511108;TYPE=del;VARB=0.035198;OID=.;OPOS=197127042;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:50:84:80:81:1:22:58:1:0:20:27:16:34:4:23 chr1 197390368 . A G 1669.19 PASS AO=174;DP=176;FAO=174;FDP=174;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00134783;FXX=0.011363;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.272;QD=38.3723;RBI=0.00399746;REFB=0;REVB=0.00376338;RO=0;SAF=77;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000103953;OID=.;OPOS=197390368;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:176:174:0:0:174:174:97:77:0:0:97:77:0:0 chr1 197480005 . AG A 641.42 PASS AO=75;DP=99;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.301016;FXX=0.0196059;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.5547;QD=25.6569;RBI=0.362566;REFB=0;REVB=0.202097;RO=19;SAF=34;SAR=41;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0.335196;SSSB=-0.00776603;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0099051;OID=.;OPOS=197480006;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:75:99:100:100:0:45:55:0:0:57:19:34:41:9:10 chr1 197480927 . C T 534.65 PASS AO=123;DP=242;FAO=123;FDP=241;FR=.;FRO=118;FSAF=65;FSAR=58;FSRF=48;FSRR=70;FWDB=0.0584546;FXX=0.00413206;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.1795;QD=8.87381;RBI=0.0653371;REFB=-0.0163969;REVB=0.0291891;RO=116;SAF=65;SAR=58;SRF=45;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12413;STB=0.559356;TYPE=snp;VARB=0.0141123;OID=.;OPOS=197480927;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:242:241:116:118:123:123:58:65:45:71:58:65:48:70 chr1 197742171 . C T 968.63 PASS AO=102;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0199611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9248;QD=37.9853;RBI=0.0201635;REFB=0;REVB=-0.00285001;RO=0;SAF=61;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.18616e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.46369e-05;OID=.;OPOS=197742171;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:102:102:0:0:102:102:41:61:0:0:41:61:0:0 chr1 197872019 . G T 71.86 PASS AO=11;DP=19;FAO=12;FDP=20;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0190281;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.799;QD=14.3726;RBI=0.0252898;REFB=-0.0584125;REVB=0.0166585;RO=8;SAF=3;SAR=8;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0212942;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0476789;OID=.;OPOS=197872019;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:19:20:8:8:11:12:8:3:2:6:9:3:2:6 chr1 197896728 . T C 319 PASS AO=74;DP=158;FAO=77;FDP=159;FR=.;FRO=82;FSAF=41;FSAR=36;FSRF=31;FSRR=51;FWDB=0.0216742;FXX=0.00624961;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.552;QD=8.02524;RBI=0.0387497;REFB=-0.0306242;REVB=0.0321211;RO=83;SAF=41;SAR=33;SRF=31;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171114;STB=0.579132;TYPE=snp;VARB=0.0224115;OID=.;OPOS=197896728;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:159:83:82:74:77:33:41:31:52:36:41:31:51 chr1 198201701 . G T 189.14 PASS AO=60;DP=151;FAO=58;FDP=149;FR=.;FRO=91;FSAF=23;FSAR=35;FSRF=31;FSRR=60;FWDB=-0.00138522;FXX=0.0261421;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.861;QD=5.07767;RBI=0.0483733;REFB=-0.0151847;REVB=-0.0483534;RO=90;SAF=25;SAR=35;SRF=30;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0931313;STB=0.536184;TYPE=snp;VARB=0.0178926;OID=.;OPOS=198201701;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:149:90:91:60:58:35:25:30:60:35:23:31:60 chr1 199977636 . C A 2655.68 PASS AO=270;DP=272;FAO=281;FDP=281;FR=.;FRO=0;FSAF=121;FSAR=160;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00975502;FXX=0.00354597;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.225;QD=37.8032;RBI=0.0284419;REFB=-0.0730959;REVB=0.0267166;RO=1;SAF=119;SAR=151;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00314723;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.55428e-05;OID=.;OPOS=199977636;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:272:281:1:0:270:281:151:119:0:1:160:121:0:0 chr1 199977724 . G T 1324.35 PASS AO=140;DP=146;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0331484;FXX=0.0342442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.8318;QD=37.5703;RBI=0.0382016;REFB=-0.0273907;REVB=0.0189881;RO=1;SAF=86;SAR=54;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00549705;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000294491;OID=.;OPOS=199977724;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:146:141:1:0:140:141:54:86:1:0:54:87:0:0 chr1 200089965 . C T 458.5 PASS AO=107;DP=214;FAO=107;FDP=213;FR=.;FRO=106;FSAF=50;FSAR=57;FSRF=49;FSRR=57;FWDB=-0.00484319;FXX=0.00467268;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.42;QD=8.61034;RBI=0.0062612;REFB=0.00913204;REVB=0.00396815;RO=105;SAF=50;SAR=57;SRF=48;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00920247;STB=0.502512;TYPE=snp;VARB=-0.0113909;OID=.;OPOS=200089965;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:213:105:106:107:107:57:50:48:57:57:50:49:57 chr1 200182834 . A G 172.08 PASS AO=41;DP=91;FAO=43;FDP=93;FR=.;FRO=50;FSAF=30;FSAR=13;FSRF=33;FSRR=17;FWDB=0.0540417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.2175;QD=7.40146;RBI=0.0772759;REFB=-0.0398868;REVB=0.0552364;RO=50;SAF=30;SAR=11;SRF=33;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0852284;STB=0.523549;TYPE=snp;VARB=0.0293277;OID=.;OPOS=200182834;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:93:50:50:41:43:11:30:33:17:13:30:33:17 chr1 200183398 . C A 113.51 PASS AO=34;DP=91;FAO=35;FDP=92;FR=.;FRO=57;FSAF=8;FSAR=27;FSRF=29;FSRR=28;FWDB=0.0347814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.562;QD=4.93508;RBI=0.0359617;REFB=-0.00110256;REVB=0.00913742;RO=57;SAF=8;SAR=26;SRF=29;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.328944;STB=0.694113;TYPE=snp;VARB=0.00361899;OID=.;OPOS=200183398;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:92:57:57:34:35:26:8:29:28:27:8:29:28 chr1 200311868 . C G 1182 PASS AO=122;DP=122;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0600275;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.0868;QD=38.1289;RBI=0.0604368;REFB=0;REVB=-0.0070224;RO=0;SAF=46;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000167544;OID=.;OPOS=200311868;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:122:124:0:0:122:124:76:46:0:0:76:48:0:0 chr1 200522566 . G C 897.47 PASS AO=185;DP=330;FAO=185;FDP=329;FR=.;FRO=144;FSAF=91;FSAR=94;FSRF=86;FSRR=58;FWDB=-0.00425652;FXX=0.00303021;HRUN=4;LEN=1;MLLD=254.763;QD=10.9115;RBI=0.0202113;REFB=-0.0102799;REVB=0.019758;RO=144;SAF=91;SAR=94;SRF=86;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.084901;STB=0.54604;TYPE=snp;VARB=0.00896228;OID=.;OPOS=200522566;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:330:329:144:144:185:185:94:91:86:58:94:91:86:58 chr1 200534248 . C T 105.9 PASS AO=46;DP=148;FAO=45;FDP=147;FR=.;FRO=102;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=42;FSRR=60;FWDB=-0.0115179;FXX=0.0067563;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.477;QD=2.88165;RBI=0.0128793;REFB=-0.0147213;REVB=-0.00576321;RO=101;SAF=28;SAR=18;SRF=41;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.236978;STB=0.628976;TYPE=snp;VARB=0.0217899;OID=.;OPOS=200534248;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:147:101:102:46:45:18:28:41:60:18:27:42:60 chr1 200558363 . T C 304.86 PASS AO=81;DP=178;FAO=81;FDP=181;FR=.;FRO=100;FSAF=52;FSAR=29;FSRF=59;FSRR=41;FWDB=-0.0121025;FXX=0.0163035;HRUN=3;LEN=1;MLLD=219.577;QD=6.73713;RBI=0.0228135;REFB=-0.0190038;REVB=-0.0193387;RO=95;SAF=52;SAR=29;SRF=59;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0219886;STB=0.530682;TYPE=snp;VARB=0.0200846;OID=.;OPOS=200558363;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:181:95:100:81:81:29:52:59:36:29:52:59:41 chr1 200574959 . T C 666.9 PASS AO=155;DP=313;FAO=158;FDP=315;FR=.;FRO=157;FSAF=83;FSAR=75;FSRF=81;FSRR=76;FWDB=0.0106353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.639;QD=8.46862;RBI=0.0106354;REFB=-0.0150044;REVB=-5.12239e-05;RO=156;SAF=82;SAR=73;SRF=81;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00899241;STB=0.504691;TYPE=snp;VARB=0.0161095;OID=.;OPOS=200574959;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:313:315:156:157:155:158:73:82:81:75:75:83:81:76 chr1 200618238 . T C 2359.13 PASS AO=237;DP=237;FAO=246;FDP=246;FR=.;FRO=0;FSAF=116;FSAR=130;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0245964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.092;QD=38.3598;RBI=0.0333927;REFB=0;REVB=0.0225851;RO=0;SAF=113;SAR=124;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02618e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.19366e-05;OID=.;OPOS=200618238;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:237:246:0:0:237:246:124:113:0:0:130:116:0:0 chr1 200635617 . G A 345.73 PASS AO=72;DP=132;FAO=72;FDP=131;FR=.;FRO=59;FSAF=44;FSAR=28;FSRF=49;FSRR=10;FWDB=0.0256828;FXX=0.00757518;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.699;QD=10.5566;RBI=0.0257558;REFB=0.00515249;REVB=0.00193785;RO=58;SAF=44;SAR=28;SRF=49;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21273;STB=0.608953;TYPE=snp;VARB=-0.0022095;OID=.;OPOS=200635617;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:131:58:59:72:72:28:44:49:9:28:44:49:10 chr1 200776641 . C T 225.41 PASS AO=57;DP=123;FAO=57;FDP=124;FR=.;FRO=67;FSAF=12;FSAR=45;FSRF=20;FSRR=47;FWDB=-0.0344518;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.06;QD=7.27142;RBI=0.0395384;REFB=-0.0243793;REVB=-0.0193999;RO=64;SAF=12;SAR=45;SRF=17;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.074792;STB=0.566013;TYPE=snp;VARB=0.0266238;OID=.;OPOS=200776641;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:124:64:67:57:57:45:12:17:47:45:12:20:47 chr1 200867492 . C G 182.59 PASS AO=51;DP=121;FAO=52;FDP=125;FR=.;FRO=73;FSAF=16;FSAR=36;FSRF=17;FSRR=56;FWDB=-0.0401841;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=46.8494;QD=5.84301;RBI=0.0435235;REFB=-0.0128666;REVB=0.0167192;RO=63;SAF=15;SAR=36;SRF=12;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13193;STB=0.553364;TYPE=snp;VARB=0.0300817;OID=.;OPOS=200867492;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:125:63:73:51:52:36:15:12:51:36:16:17:56 chr1 200940180 . G A 251.92 PASS AO=54;DP=103;FAO=56;FDP=106;FR=.;FRO=50;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=0.013725;FXX=0.0275204;HRUN=3;LEN=1;MLLD=157.539;QD=9.50639;RBI=0.0142358;REFB=-0.00570653;REVB=0.0037793;RO=48;SAF=28;SAR=26;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0198354;STB=0.508426;TYPE=snp;VARB=0.0073889;OID=.;OPOS=200940180;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:106:48:50:54:56:26:28:26:22:27:29:25:25 chr1 200941716 . G A 31.01 PASS AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=5;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0229763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.095;QD=13.7803;RBI=0.0229763;REFB=-0.0158933;REVB=0;RO=4;SAF=5;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00170971;OID=.;OPOS=200941716;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:9:9:4:4:5:5:0:5:4:0:0:5:4:0 chr1 200942385 . G A 57.54 PASS AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=0.0201554;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=200.018;QD=7.93604;RBI=0.0230074;REFB=-0.0158533;REVB=-0.0110951;RO=16;SAF=5;SAR=8;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.337047;STB=0.693599;TYPE=snp;VARB=0.0175673;OID=.;OPOS=200942385;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:29:29:16:16:13:13:8:5:12:4:8:5:12:4 chr1 201016296 . G A 154.57 PASS AO=42;DP=99;FAO=42;FDP=99;FR=.;FRO=57;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=39;FWDB=-0.0142893;FXX=0.0388312;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.944;QD=6.24538;RBI=0.030153;REFB=-0.0125489;REVB=0.0265522;RO=53;SAF=22;SAR=20;SRF=17;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201083;STB=0.618631;TYPE=snp;VARB=0.0140997;OID=.;OPOS=201016296;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:53:57:42:42:20:22:17:36:20:22:18:39 chr1 201038687 . A G 55.68 PASS AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=16;FSRR=4;FWDB=-0.059438;FXX=0.0285633;HRUN=3;LEN=1;MLLD=87.2768;QD=6.55112;RBI=0.0598092;REFB=0.0043031;REVB=0.00665308;RO=18;SAF=12;SAR=2;SRF=15;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0451563;STB=0.562403;TYPE=snp;VARB=-0.0116653;OID=.;OPOS=201038687;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:33:34:18:20:14:14:2:12:15:3:2:12:16:4 chr1 201047075 . A G 44.48 PASS AO=11;DP=31;FAO=12;FDP=33;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.00575355;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.6018;QD=5.39158;RBI=0.0428585;REFB=-0.0295049;REVB=-0.0424706;RO=14;SAF=9;SAR=2;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0498728;STB=0.599822;TYPE=snp;VARB=0.0256559;OID=.;OPOS=201047075;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:31:33:14:21:11:12:2:9:11:3:3:9:13:8 chr1 201047111 . A G 22.5 PASS AO=11;DP=52;FAO=12;FDP=54;FR=.;FRO=42;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=32;FSRR=10;FWDB=-0.010483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.032;QD=1.66671;RBI=0.0595662;REFB=-0.00631907;REVB=-0.0586365;RO=41;SAF=8;SAR=3;SRF=31;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0459911;STB=0.588101;TYPE=snp;VARB=0.0358733;OID=.;OPOS=201047111;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:52:54:41:42:11:12:3:8:31:10:4:8:32:10 chr1 201052310 . A T 204.31 PASS AO=43;DP=81;FAO=43;FDP=81;FR=.;FRO=38;FSAF=31;FSAR=12;FSRF=27;FSRR=11;FWDB=-0.0681618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.8358;QD=10.0893;RBI=0.100169;REFB=-0.00941386;REVB=-0.0734013;RO=38;SAF=31;SAR=12;SRF=27;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0109191;STB=0.50603;TYPE=snp;VARB=0.00804482;OID=.;OPOS=201052310;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:38:38:43:43:12:31:27:11:12:31:27:11 chr1 201052312 . A C 197.34 PASS AO=41;DP=80;FAO=41;FDP=77;FR=.;FRO=36;FSAF=32;FSAR=9;FSRF=26;FSRR=10;FWDB=0.0137927;FXX=0.0374953;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.9197;QD=10.2514;RBI=0.0412772;REFB=-0.0196047;REVB=-0.0389046;RO=36;SAF=32;SAR=9;SRF=26;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0686192;STB=0.538034;TYPE=snp;VARB=0.0207201;OID=.;OPOS=201052312;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:77:36:36:41:41:9:32:26:10:9:32:26:10 chr1 201058532 . GC G 118.29 PASS AO=22;DP=31;FAO=22;FDP=27;FR=.;FRO=5;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.0223468;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=17.5629;QD=17.5243;RBI=0.133555;REFB=-0.0431613;REVB=0.131672;RO=5;SAF=8;SAR=14;SRF=4;SRR=1;SSEN=0.333333;SSEP=0;SSSB=-0.152532;STB=0.583256;TYPE=del;VARB=0.0188293;OID=.;OPOS=201058533;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:22:27:22:27:5:8:14:4:1:5:5:8:14:4:1 chr1 201060865 . G A 893.09 PASS AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00908906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.8831;QD=38.0036;RBI=0.0182369;REFB=0;REVB=-0.0158106;RO=0;SAF=60;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.12276e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.5308e-05;OID=.;OPOS=201060865;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:94:94:0:0:94:94:34:60:0:0:34:60:0:0 chr1 201112981 . A G 100.31 PASS AO=28;DP=69;FAO=28;FDP=69;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=27;FWDB=-0.0382996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1047;QD=5.81533;RBI=0.0498557;REFB=-0.0133003;REVB=-0.0319175;RO=41;SAF=14;SAR=14;SRF=14;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165883;STB=0.594138;TYPE=snp;VARB=0.0257379;OID=.;OPOS=201112981;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:41:41:28:28:14:14:14:27:14:14:14:27 chr1 201115827 . C T 211.94 PASS AO=52;DP=112;FAO=52;FDP=111;FR=.;FRO=59;FSAF=20;FSAR=32;FSRF=34;FSRR=25;FWDB=0.00258281;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.6469;QD=7.63748;RBI=0.00379976;REFB=-0.0162351;REVB=0.00278698;RO=58;SAF=20;SAR=32;SRF=33;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176212;STB=0.602471;TYPE=snp;VARB=0.0172174;OID=.;OPOS=201115827;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:111:58:59:52:52:32:20:33:25:32:20:34:25 chr1 201122947 . T G 524.95 PASS AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0338672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.0238;QD=37.4966;RBI=0.0537711;REFB=0;REVB=0.0417653;RO=0;SAF=29;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000146569;OID=.;OPOS=201122947;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:56:56:0:0:56:56:27:29:0:0:27:29:0:0 chr1 201166383 . G A 1245.2 PASS AO=132;DP=134;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216836;FXX=0.00746213;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.2968;QD=37.4495;RBI=0.0220141;REFB=-0.0789981;REVB=-0.00380043;RO=1;SAF=74;SAR=58;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00638009;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00123431;OID=.;OPOS=201166383;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:134:133:1:0:132:133:58:74:1:0:58:75:0:0 chr1 201166435 . T C 1021.31 PASS AO=108;DP=111;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00259512;FXX=0.0180164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.869;QD=37.4793;RBI=0.00270462;REFB=-0.0632556;REVB=-0.000761785;RO=1;SAF=71;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126548;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000103574;OID=.;OPOS=201166435;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:111:109:1:0:108:109:37:71:0:1:37:72:0:0 chr1 201175227 . C A 350.38 PASS AO=66;DP=117;FAO=68;FDP=116;FR=.;FRO=48;FSAF=59;FSAR=9;FSRF=38;FSRR=10;FWDB=0.0156004;FXX=0.00854628;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7229;QD=12.0819;RBI=0.0462243;REFB=-0.0140432;REVB=0.0435122;RO=51;SAF=57;SAR=9;SRF=41;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.093048;STB=0.562167;TYPE=snp;VARB=0.0139504;OID=.;OPOS=201175227;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:116:51:48:66:68:9:57:41:10:9:59:38:10 chr1 201175274 . A G 191.6 PASS AO=33;DP=178;FAO=64;FDP=169;FR=.,HEALED;FRO=105;FSAF=47;FSAR=17;FSRF=88;FSRR=17;FWDB=-0.00886761;FXX=0.0231201;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.296;QD=4.53492;RBI=0.0274687;REFB=-0.0289753;REVB=0.0259979;RO=80;SAF=26;SAR=7;SRF=65;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0457804;STB=0.589495;TYPE=snp;VARB=0.0556805;OID=.;OPOS=201175274;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:169:80:105:33:64:7:26:65:15:17:47:88:17 chr1 201175715 . G T 168.81 PASS AO=48;DP=119;FAO=49;FDP=121;FR=.;FRO=72;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=35;FSRR=37;FWDB=0.00473705;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.037;QD=5.58041;RBI=0.0128422;REFB=-0.0182525;REVB=0.0119366;RO=71;SAF=21;SAR=27;SRF=34;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0441017;STB=0.534592;TYPE=snp;VARB=0.0263874;OID=.;OPOS=201175715;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:121:71:72:48:49:27:21:34:37:28:21:35:37 chr1 201176018 . A G 34.05 PASS AO=8;DP=22;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=-0.0165069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.878;QD=5.4475;RBI=0.12156;REFB=-0.0261571;REVB=-0.120434;RO=13;SAF=4;SAR=4;SRF=11;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.364734;STB=0.689278;TYPE=snp;VARB=0.032118;OID=.;OPOS=201176018;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:22:25:13:16:8:9:4:4:11:2:5:4:12:4 chr1 201176108 . G A 93 PASS AO=27;DP=71;FAO=27;FDP=70;FR=.;FRO=43;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=0.0206125;FXX=0.0140825;HRUN=4;LEN=1;MLLD=146.186;QD=5.31454;RBI=0.0212052;REFB=-0.0292254;REVB=0.00497863;RO=40;SAF=12;SAR=15;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00587332;STB=0.512811;TYPE=snp;VARB=0.027059;OID=.;OPOS=201176108;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:71:70:40:43:27:27:15:12:18:22:15:12:20:23 chr1 201176968 . A G 189 PASS AO=47;DP=102;FAO=47;FDP=102;FR=.;FRO=55;FSAF=31;FSAR=16;FSRF=39;FSRR=16;FWDB=-0.0205243;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=124.35;QD=7.41158;RBI=0.0222716;REFB=-0.0280745;REVB=-0.00864737;RO=55;SAF=31;SAR=16;SRF=39;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0544379;STB=0.53029;TYPE=snp;VARB=0.0276839;OID=.;OPOS=201176968;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:55:55:47:47:16:31:39:16:16:31:39:16 chr1 201177246 . T C 253.19 PASS AO=50;DP=97;FAO=54;FDP=101;FR=.;FRO=47;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=-0.00990111;FXX=0.0194156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.462;QD=10.0274;RBI=0.020838;REFB=-0.0337362;REVB=-0.0183355;RO=44;SAF=27;SAR=23;SRF=16;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149048;STB=0.561541;TYPE=snp;VARB=0.0183711;OID=.;OPOS=201177246;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:101:44:47:50:54:23:27:16:28:25:29:19:28 chr1 201177278 . C T 194.76 PASS AO=47;DP=128;FAO=48;FDP=107;FR=.;FRO=59;FSAF=32;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=40;FWDB=0.0545021;FXX=0.16405;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2129;QD=7.28089;RBI=0.055379;REFB=-0.0194634;REVB=-0.0098161;RO=40;SAF=31;SAR=16;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22203;STB=0.68704;TYPE=snp;VARB=0.0307174;OID=.;OPOS=201177278;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:107:40:59:47:48:16:31:16:24:16:32:19:40 chr1 201177538 . G T 122.37 PASS AO=25;DP=44;FAO=24;FDP=43;FR=.;FRO=19;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.014299;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.69;QD=11.3836;RBI=0.016114;REFB=-0.0100698;REVB=-0.00742968;RO=19;SAF=18;SAR=7;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211464;STB=0.613489;TYPE=snp;VARB=0.00567812;OID=.;OPOS=201177538;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:44:43:19:19:25:24:7:18:9:10:7:17:9:10 chr1 201178470 . G A 16.08 PASS AO=3;DP=6;FAO=3;FDP=6;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0205904;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=205.772;QD=10.7196;RBI=0.0402561;REFB=-0.0292201;REVB=-0.0345917;RO=3;SAF=2;SAR=1;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0414553;OID=.;OPOS=201178470;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:6:6:3:3:3:3:1:2:2:1:1:2:2:1 chr1 201178819 . G A 61.72 PASS AO=13;DP=32;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=0.0951134;FXX=0.0555401;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.444;QD=7.26125;RBI=0.0993866;REFB=-0.0773308;REVB=0.0288293;RO=19;SAF=7;SAR=6;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17127;STB=0.654973;TYPE=snp;VARB=0.0720613;OID=.;OPOS=201178819;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:32:34:19:19:13:15:6:7:7:12:6:9:6:13 chr1 201180084 . G T 35.08 PASS AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.00171436;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=183.065;QD=7.01552;RBI=0.0265948;REFB=-0.03499;REVB=0.0265395;RO=11;SAF=3;SAR=5;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0117224;STB=0.526249;TYPE=snp;VARB=0.0250961;OID=.;OPOS=201180084;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:20:20:11:12:8:8:5:3:4:7:5:3:5:7 chr1 201180501 . T C 12.53 PASS AO=3;DP=12;FAO=3;FDP=12;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0599161;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=102.044;QD=4.17575;RBI=0.138471;REFB=-0.0230253;REVB=-0.124837;RO=9;SAF=2;SAR=1;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23456;STB=0.665558;TYPE=snp;VARB=0.0126028;OID=.;OPOS=201180501;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:12:12:9:9:3:3:1:2:4:5:1:2:4:5 chr1 201181217 . A G 154.2 PASS AO=36;DP=78;FAO=37;FDP=79;FR=.;FRO=42;FSAF=27;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=16;FWDB=-0.00393787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.1164;QD=7.80746;RBI=0.0281594;REFB=-0.0217058;REVB=0.0278827;RO=42;SAF=27;SAR=9;SRF=26;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15232;STB=0.569766;TYPE=snp;VARB=0.0215795;OID=.;OPOS=201181217;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:79:42:42:36:37:9:27:26:16:10:27:26:16 chr1 201181223 . A G 607.65 PASS AO=70;DP=74;FAO=70;FDP=74;FR=.;FRO=4;FSAF=49;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0169589;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.994;QD=32.846;RBI=0.017056;REFB=-0.100982;REVB=0.00181753;RO=4;SAF=49;SAR=21;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0819374;STB=0.543465;TYPE=snp;VARB=0.00536175;OID=.;OPOS=201181223;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:74:74:4:4:70:70:21:49:0:4:21:49:0:4 chr1 201181920 . G T 83.36 PASS AO=21;DP=51;FAO=21;FDP=51;FR=.;FRO=30;FSAF=18;FSAR=3;FSRF=24;FSRR=6;FWDB=0.0900273;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=34.3712;QD=6.53774;RBI=0.13566;REFB=-0.0437132;REVB=0.101482;RO=28;SAF=18;SAR=3;SRF=22;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128662;STB=0.562436;TYPE=snp;VARB=0.0468274;OID=.;OPOS=201181920;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:51:51:28:30:21:21:3:18:22:6:3:18:24:6 chr1 201183363 . C T 156.68 PASS AO=43;DP=102;FAO=43;FDP=102;FR=.;FRO=59;FSAF=30;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=35;FWDB=-0.0127662;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.757;QD=6.14413;RBI=0.0285361;REFB=-0.0258726;REVB=-0.0255212;RO=59;SAF=30;SAR=13;SRF=24;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.305097;STB=0.672187;TYPE=snp;VARB=0.0215414;OID=.;OPOS=201183363;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:59:59:43:43:13:30:24:35:13:30:24:35 chr1 201183402 . T C 199.68 PASS AO=50;DP=142;FAO=62;FDP=155;FR=.;FRO=93;FSAF=36;FSAR=26;FSRF=42;FSRR=51;FWDB=0.0159097;FXX=0.031248;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.598;QD=5.15301;RBI=0.0166212;REFB=-0.0116471;REVB=-0.00481104;RO=89;SAF=24;SAR=26;SRF=40;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.034372;STB=0.577475;TYPE=snp;VARB=0.0180435;OID=.;OPOS=201183402;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:155:89:93:50:62:26:24:40:49:26:36:42:51 chr1 201184275 . C T 211.23 PASS AO=35;DP=52;FAO=35;FDP=52;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=32;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0343066;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.321;QD=16.2483;RBI=0.0360316;REFB=0.00906373;REVB=-0.0110149;RO=16;SAF=3;SAR=32;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.39951;STB=0.740876;TYPE=snp;VARB=-0.00354124;OID=.;OPOS=201184275;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:52:52:16:17:35:35:32:3:7:9:32:3:8:9 chr1 201185637 . C T 196.7 PASS AO=49;DP=108;FAO=50;FDP=108;FR=.;FRO=58;FSAF=36;FSAR=14;FSRF=39;FSRR=19;FWDB=0.0356803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.7009;QD=7.28523;RBI=0.0731453;REFB=-0.00629869;REVB=0.0638526;RO=58;SAF=35;SAR=14;SRF=39;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0485696;STB=0.530818;TYPE=snp;VARB=0.00938846;OID=.;OPOS=201185637;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:58:58:49:50:14:35:39:19:14:36:39:19 chr1 201187764 . T C 519.8 PASS AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00266836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.407;QD=37.8036;RBI=0.0211306;REFB=0;REVB=0.0209615;RO=0;SAF=30;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.39413e-05;OID=.;OPOS=201187764;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:55:55:0:0:55:55:25:30:0:0:25:30:0:0 chr1 201190732 . G A 224.3 PASS AO=44;DP=91;FAO=50;FDP=99;FR=.,HEALED;FRO=49;FSAF=4;FSAR=46;FSRF=20;FSRR=29;FWDB=-0.128143;FXX=0.0198;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.732;QD=9.06259;RBI=0.128522;REFB=-0.0182991;REVB=-0.00987316;RO=30;SAF=0;SAR=44;SRF=4;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.847949;STB=0.786176;TYPE=snp;VARB=0.0255063;OID=.;OPOS=201190732;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:99:30:49:44:50:44:0:4:26:46:4:20:29 chr1 201195119 . C T 188.12 PASS AO=42;DP=84;FAO=43;FDP=84;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=30;FSRF=12;FSRR=29;FWDB=0.0334494;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.988;QD=8.95814;RBI=0.0573228;REFB=-0.0298599;REVB=0.0465515;RO=41;SAF=13;SAR=29;SRF=12;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0176929;STB=0.505601;TYPE=snp;VARB=0.0233114;OID=.;OPOS=201195119;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:41:41:42:43:29:13:12:29:30:13:12:29 chr1 201252866 . C T 159.84 PASS AO=33;DP=61;FAO=33;FDP=61;FR=.;FRO=28;FSAF=26;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.00860922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.2506;QD=10.4813;RBI=0.0538772;REFB=-0.00133115;REVB=0.0531849;RO=27;SAF=26;SAR=7;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237209;STB=0.626819;TYPE=snp;VARB=0.00235323;OID=.;OPOS=201252866;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:27:28:33:33:7:26:15:12:7:26:16:12 chr1 201285759 . A G 865.26 PASS AO=94;DP=96;FAO=94;FDP=96;FR=.;FRO=2;FSAF=46;FSAR=48;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00928147;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.448;QD=36.0523;RBI=0.010706;REFB=0.0483193;REVB=0.00533596;RO=2;SAF=46;SAR=48;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0201665;STB=0.510636;TYPE=snp;VARB=1.87919e-05;OID=.;OPOS=201285759;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:96:96:2:2:94:94:48:46:2:0:48:46:2:0 chr1 201299263 . A G 1108.73 PASS AO=116;DP=116;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0289636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.7371;QD=38.2321;RBI=0.0348335;REFB=0;REVB=-0.0193515;RO=0;SAF=83;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.17109e-05;OID=.;OPOS=201299263;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:116:116:0:0:116:116:33:83:0:0:33:83:0:0 chr1 201331554 . T G 769.11 PASS AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00369569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.3321;QD=37.9808;RBI=0.0311768;REFB=0;REVB=-0.030957;RO=0;SAF=23;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000184151;OID=.;OPOS=201331554;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:81:81:0:0:81:81:58:23:0:0:58:23:0:0 chr1 201334382 . G A 677.11 PASS AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.1577;QD=38.6917;RBI=0.027395;REFB=0;REVB=-0.0220538;RO=0;SAF=32;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.18172e-05;OID=.;OPOS=201334382;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:70:70:0:0:70:70:38:32:0:0:38:32:0:0 chr1 201334795 . C T 85.45 PASS AO=23;DP=57;FAO=23;FDP=56;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=0.0140133;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.048;QD=6.10327;RBI=0.0256751;REFB=-0.00128097;REVB=0.0215137;RO=33;SAF=13;SAR=10;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174917;STB=0.599914;TYPE=snp;VARB=0.00220611;OID=.;OPOS=201334795;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:57:56:33:33:23:23:10:13:13:20:10:13:13:20 chr1 201341175 . CAGAAG C 599.99 PASS AO=64;DP=73;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=59;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0150002;FXX=0.0833218;HRUN=1;LEN=5;MLLD=232.824;QD=36.3628;RBI=0.0629329;REFB=0.047732;REVB=0.0611191;RO=0;SAF=59;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.38061e-08;STB=0.5042;TYPE=del;VARB=-0.00063013;OID=.;OPOS=201341176;OREF=AGAAG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:64:69:65:66:1:59:6:1:0:22:0:59:5:0:0 chr1 201350983 . C T 277.01 PASS AO=45;DP=65;FAO=45;FDP=65;FR=.;FRO=20;FSAF=35;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=3;FWDB=0.0350677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.3246;QD=17.0467;RBI=0.0455697;REFB=-0.0142279;REVB=0.0291007;RO=20;SAF=35;SAR=10;SRF=17;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0617179;STB=0.533319;TYPE=snp;VARB=0.00584422;OID=.;OPOS=201350983;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:65:65:20:20:45:45:10:35:17:3:10:35:17:3 chr1 201355522 . T C 195.66 PASS AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00722443;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.543;QD=39.1321;RBI=0.00722443;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=20;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.94461e-05;OID=.;OPOS=201355522;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:20:20:0:0:20:20:0:20:0:0:0:20:0:0 chr1 201355669 . T C 85.63 PASS AO=17;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=15;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.0477399;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.5143;QD=10.7035;RBI=0.104738;REFB=-0.0132158;REVB=-0.0932256;RO=15;SAF=15;SAR=2;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.306469;STB=0.677168;TYPE=snp;VARB=0.0110054;OID=.;OPOS=201355669;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:32:32:15:15:17:17:2:15:10:5:2:15:10:5 chr1 201355943 . C T 1395.52 PASS AO=143;DP=146;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=108;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0324283;FXX=0.0134219;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.814;QD=37.9734;RBI=0.11614;REFB=-0.134591;REVB=0.11152;RO=1;SAF=106;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126766;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000318231;OID=.;OPOS=201355943;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:146:147:1:0:143:147:37:106:0:1:39:108:0:0 chr1 201383643 . A C 107.82 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00939743;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=250.422;QD=35.9384;RBI=0.0445286;REFB=0;REVB=-0.0435257;RO=0;SAF=11;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.23983e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000426285;OID=.;OPOS=201383643;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:1:11:0:0:1:11:0:0 chr1 201386883 . GGCC G,GG 283.73 PASS AO=6,18;DP=35;FAO=36,0;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=29,0;FSAR=7,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.241625,0.109873;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=3,2;MLLD=33.7547,24.4969;QD=31.5251;RBI=0.254262,0.612114;REFB=0,0;REVB=0.0791627,0.602172;RO=0;SAF=6,18;SAR=0,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.445946,0.435897;SSEP=0,0.466667;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.00384988,-0.0459356;OID=.,.;OPOS=201386884,201386885;OREF=GCC,CC;OALT=-,-;OMAPALT=G,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:6,18:28:36,0:36:0:29,0:7,0:0:0:25:0:6,18:0,0:0:0 chr1 201434740 . G A 192 PASS AO=48;DP=104;FAO=48;FDP=104;FR=.;FRO=56;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=22;FSRR=34;FWDB=-0.00999291;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.575;QD=7.38462;RBI=0.0143231;REFB=-0.0104447;REVB=0.0102612;RO=56;SAF=18;SAR=30;SRF=22;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0182877;STB=0.5102;TYPE=snp;VARB=0.0114984;OID=.;OPOS=201434740;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:56:56:48:48:30:18:22:34:30:18:22:34 chr1 201435069 . C A 148.49 PASS AO=31;DP=57;FAO=31;FDP=59;FR=.;FRO=28;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=0.00422207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.738;QD=10.0671;RBI=0.0238814;REFB=-0.028814;REVB=0.0235052;RO=25;SAF=16;SAR=15;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0291155;STB=0.541458;TYPE=snp;VARB=0.0295094;OID=.;OPOS=201435069;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:59:25:28:31:31:15:16:12:13:15:16:12:16 chr1 201618264 . C T 116.38 PASS AO=18;DP=28;FAO=19;FDP=29;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.0255551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.2631;QD=16.0518;RBI=0.0546103;REFB=-0.0454214;REVB=0.048262;RO=10;SAF=8;SAR=10;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0997564;STB=0.561978;TYPE=snp;VARB=0.0140466;OID=.;OPOS=201618264;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:28:29:10:10:18:19:10:8:6:4:11:8:6:4 chr1 201754412 . T C 61.58 PASS AO=14;DP=23;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=12;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.00154255;FXX=0.0768935;HRUN=17;LEN=1;MLLD=89.9887;QD=10.2639;RBI=0.00365921;REFB=-0.0142165;REVB=-0.00331819;RO=9;SAF=13;SAR=1;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.601724;STB=0.831031;TYPE=snp;VARB=0.00293739;OID=.;OPOS=201754412;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:23:24:9:11:14:13:1:13:3:6:1:12:5:6 chr1 201860626 . A G 488.12 PASS AO=51;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.297182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.027;QD=37.5474;RBI=0.297244;REFB=0;REVB=-0.00608451;RO=0;SAF=1;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.20352e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00149569;OID=.;OPOS=201860626;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:52:52:0:0:51:52:50:1:0:0:50:2:0:0 chr1 201861016 . C G 567.72 PASS AO=63;DP=66;FAO=63;FDP=65;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0568264;FXX=0.0151492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=262.209;QD=34.9366;RBI=0.0568388;REFB=-0.0395157;REVB=-0.0011845;RO=2;SAF=15;SAR=48;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192711;STB=0.510201;TYPE=snp;VARB=0.000631777;OID=.;OPOS=201861016;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:66:65:2:2:63:63:48:15:0:2:48:15:0:2 chr1 201865763 . A G 576.42 PASS AO=55;DP=55;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.282279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.4111;QD=38.4283;RBI=0.285684;REFB=0;REVB=0.0439782;RO=0;SAF=21;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00285243;OID=.;OPOS=201865763;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:55:60:0:0:55:60:34:21:0:0:37:23:0:0 chr1 201934578 . G A 521.08 PASS AO=133;DP=298;FAO=136;FDP=293;FR=.;FRO=157;FSAF=66;FSAR=70;FSRF=73;FSRR=84;FWDB=-0.00847313;FXX=0.016778;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.08;QD=7.11372;RBI=0.0213417;REFB=-0.0124809;REVB=0.0195876;RO=154;SAF=66;SAR=67;SRF=71;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0342277;STB=0.510906;TYPE=snp;VARB=0.0147935;OID=.;OPOS=201934578;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:298:293:154:157:133:136:67:66:71:83:70:66:73:84 chr1 201969082 . G A 469.32 PASS AO=96;DP=169;FAO=95;FDP=168;FR=.;FRO=73;FSAF=38;FSAR=57;FSRF=26;FSRR=47;FWDB=0.0257698;FXX=0.00591681;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3088;QD=11.1742;RBI=0.0287644;REFB=-0.0197616;REVB=0.0127792;RO=73;SAF=38;SAR=58;SRF=26;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0331824;STB=0.519996;TYPE=snp;VARB=0.0146213;OID=.;OPOS=201969082;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:168:73:73:96:95:58:38:26:47:57:38:26:47 chr1 201970562 . T C 2997.19 PASS AO=310;DP=313;FAO=312;FDP=312;FR=.;FRO=0;FSAF=166;FSAR=146;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0083182;FXX=0.0157724;HRUN=3;LEN=1;MLLD=150.496;QD=38.4255;RBI=0.0101338;REFB=0;REVB=-0.00578811;RO=0;SAF=164;SAR=146;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.97291e-06;OID=.;OPOS=201970562;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:313:312:0:0:310:312:146:164:0:0:146:166:0:0 chr1 201981218 . C G 205.32 PASS AO=56;DP=130;FAO=56;FDP=130;FR=.;FRO=74;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=26;FSRR=48;FWDB=0.00422964;FXX=0.00763301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.504;QD=6.31746;RBI=0.00611787;REFB=0.00287809;REVB=-0.00442024;RO=74;SAF=21;SAR=35;SRF=26;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0258469;STB=0.52502;TYPE=snp;VARB=-0.00364599;OID=.;OPOS=201981218;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:74:74:56:56:35:21:26:48:34:22:26:48 chr1 201981298 . G A 178.46 PASS AO=40;DP=77;FAO=39;FDP=76;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=-0.0145258;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.486;QD=9.3927;RBI=0.0189501;REFB=-0.00315798;REVB=0.0121699;RO=36;SAF=14;SAR=26;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204263;STB=0.61812;TYPE=snp;VARB=0.00419309;OID=.;OPOS=201981298;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:76:36:37:40:39:26:14:21:15:26:13:21:16 chr1 201981862 . T C 134.87 PASS AO=11;DP=16;FAO=14;FDP=15;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.111759;FXX=0.062461;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.568;QD=35.9654;RBI=0.113365;REFB=0;REVB=0.019017;RO=0;SAF=1;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0067359;OID=.;OPOS=201981862;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:16:15:0:0:11:14:10:1:0:0:10:4:0:0 chr1 202155543 . A C 889.68 PASS AO=75;DP=99;FAO=94;FDP=94;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=58;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0773373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.545;QD=37.8586;RBI=0.0949135;REFB=0;REVB=0.0550228;RO=0;SAF=40;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71047e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000559822;OID=.;OPOS=202155543;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:94:94:0:0:75:94:35:40:0:0:36:58:0:0 chr1 202156628 . A C 210.67 PASS AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00283702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.186;QD=36.6389;RBI=0.00288131;REFB=0;REVB=-0.000503292;RO=0;SAF=4;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.01429e-05;OID=.;OPOS=202156628;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:0:0:23:23:19:4:0:0:19:4:0:0 chr1 202183327 . C T 142.52 PASS AO=26;DP=42;FAO=26;FDP=43;FR=.;FRO=17;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=3;FWDB=0.00146151;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.756;QD=13.2574;RBI=0.00421722;REFB=-0.0209531;REVB=0.00395587;RO=16;SAF=15;SAR=11;SRF=13;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172407;STB=0.602951;TYPE=snp;VARB=0.0139174;OID=.;OPOS=202183327;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:42:43:16:17:26:26:11:15:13:3:11:15:14:3 chr1 202200799 . G A 164.89 PASS AO=41;DP=90;FAO=41;FDP=90;FR=.;FRO=49;FSAF=13;FSAR=28;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=-0.0193788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.998;QD=7.3282;RBI=0.0219747;REFB=-0.00495277;REVB=0.010361;RO=49;SAF=13;SAR=28;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178997;STB=0.600529;TYPE=snp;VARB=0.00501248;OID=.;OPOS=202200799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:49:49:41:41:28:13:24:25:28:13:24:25 chr1 202287156 . C T 246.29 PASS AO=51;DP=93;FAO=51;FDP=93;FR=.;FRO=42;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=0.0159182;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.311;QD=10.593;RBI=0.0356591;REFB=-0.0419627;REVB=0.031909;RO=36;SAF=25;SAR=26;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0980585;STB=0.517089;TYPE=snp;VARB=0.0396266;OID=.;OPOS=202287156;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:36:42:51:51:26:25:13:23:26:25:19:23 chr1 202287206 . T C 156.64 PASS AO=18;DP=60;FAO=27;FDP=59;FR=.,HEALED;FRO=26;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=0.00196826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.001;QD=10.6195;RBI=0.00664757;REFB=-0.019196;REVB=-0.0063495;RO=24;SAF=8;SAR=10;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0706433;STB=0.584084;TYPE=snp;VARB=0.0172344;OID=.;OPOS=202287206;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:59:24:26:18:27:10:8:9:15:13:14:9:17 chr1 202287754 . G A 36.23 PASS AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.0347661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.991;QD=7.24667;RBI=0.036118;REFB=-0.00984968;REVB=-0.00978918;RO=12;SAF=5;SAR=3;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206895;STB=0.624687;TYPE=snp;VARB=0.0271682;OID=.;OPOS=202287754;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:20:20:12:12:8:8:3:5:5:7:3:5:5:7 chr1 202287813 . T C 48.81 PASS AO=8;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0423367;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=129.277;QD=15.0171;RBI=0.0444529;REFB=-0.0146761;REVB=0.0135523;RO=5;SAF=5;SAR=3;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0175135;STB=0.510178;TYPE=snp;VARB=0.0190009;OID=.;OPOS=202287813;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:13:13:5:5:8:8:3:5:3:2:3:5:3:2 chr1 202288293 . C T 45.68 PASS AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.118273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.136;QD=13.0522;RBI=0.125811;REFB=-0.0168051;REVB=-0.0428926;RO=5;SAF=4;SAR=4;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0661115;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0319226;OID=.;OPOS=202288293;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:14:14:5:6:8:8:4:4:3:2:4:4:3:3 chr1 202304868 . T C 316.12 PASS AO=80;DP=172;FAO=80;FDP=172;FR=.;FRO=92;FSAF=43;FSAR=37;FSRF=39;FSRR=53;FWDB=-0.0145195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.79;QD=7.35155;RBI=0.0185353;REFB=0.000615637;REVB=0.0115212;RO=92;SAF=43;SAR=37;SRF=39;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109351;STB=0.56053;TYPE=snp;VARB=-0.000580617;OID=.;OPOS=202304868;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:172:92:92:80:80:37:43:39:53:37:43:39:53 chr1 202531741 . C T 484.08 PASS AO=132;DP=294;FAO=131;FDP=291;FR=.;FRO=160;FSAF=81;FSAR=50;FSRF=98;FSRR=62;FWDB=-0.00532043;FXX=0.0135589;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.403;QD=6.65402;RBI=0.0208829;REFB=0.0013184;REVB=0.0201938;RO=162;SAF=81;SAR=51;SRF=100;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00383147;STB=0.503384;TYPE=snp;VARB=-0.00146458;OID=.;OPOS=202531741;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:294:291:162:160:132:131:51:81:100:62:50:81:98:62 chr1 202544196 . AG A 203.99 PASS AO=29;DP=59;FAO=48;FDP=52;FR=.;FRO=4;FSAF=13;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.277756;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.3883;QD=15.6919;RBI=0.345824;REFB=-0.0779495;REVB=-0.206023;RO=9;SAF=6;SAR=23;SRF=4;SRR=5;SSEN=0.392593;SSEP=0;SSSB=-0.142503;STB=0.527016;TYPE=del;VARB=0.0371908;OID=.;OPOS=202544197;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:29:49:48:52:4:13:35:0:4:6:9:6:23:4:5 chr1 202553896 . A G 134.25 PASS AO=45;DP=125;FAO=45;FDP=124;FR=.;FRO=79;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=29;FSRR=50;FWDB=0.0212633;FXX=0.00799936;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.7179;QD=4.3306;RBI=0.032033;REFB=-0.00391144;REVB=-0.023958;RO=78;SAF=24;SAR=21;SRF=28;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192421;STB=0.604854;TYPE=snp;VARB=0.00710212;OID=.;OPOS=202553896;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:124:78:79:45:45:21:24:28:50:21:24:29:50 chr1 202555044 . C G 271.77 PASS AO=84;DP=217;FAO=85;FDP=216;FR=.;FRO=131;FSAF=42;FSAR=43;FSRF=56;FSRR=75;FWDB=0.0260855;FXX=0.00460808;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.1723;QD=5.03281;RBI=0.0332328;REFB=-0.0154908;REVB=0.0205905;RO=131;SAF=42;SAR=42;SRF=55;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0868298;STB=0.540449;TYPE=snp;VARB=0.0263549;OID=.;OPOS=202555044;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:217:216:131:131:84:85:42:42:55:76:43:42:56:75 chr1 202569600 . C T 59.48 PASS AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=0.03851;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.85;QD=6.6092;RBI=0.0521486;REFB=-0.00534177;REVB=0.0351633;RO=21;SAF=9;SAR=6;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.071126;STB=0.541123;TYPE=snp;VARB=0.00675417;OID=.;OPOS=202569600;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:36:36:21:21:15:15:6:9:14:7:6:9:14:7 chr1 202574784 . G A 890.13 PASS AO=95;DP=96;FAO=95;FDP=96;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=61;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.077384;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.681;QD=37.0887;RBI=0.0926227;REFB=-0.0161558;REVB=0.0508986;RO=1;SAF=34;SAR=61;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0137413;STB=0.507245;TYPE=snp;VARB=0.000225867;OID=.;OPOS=202574784;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:96:96:1:1:95:95:61:34:1:0:61:34:1:0 chr1 202705455 . G C 397.25 PASS AO=106;DP=244;FAO=109;FDP=247;FR=.;FRO=138;FSAF=54;FSAR=55;FSRF=57;FSRR=81;FWDB=0.0441333;FXX=0.0040321;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.105;QD=6.43321;RBI=0.0898927;REFB=-0.0370725;REVB=0.0783132;RO=138;SAF=52;SAR=54;SRF=58;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.071652;STB=0.546055;TYPE=snp;VARB=0.0392136;OID=.;OPOS=202705455;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:247:138:138:106:109:54:52:58:80:55:54:57:81 chr1 202715284 . G A 344.42 PASS AO=75;DP=142;FAO=75;FDP=142;FR=.;FRO=67;FSAF=30;FSAR=45;FSRF=35;FSRR=32;FWDB=-0.00256629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.23;QD=9.70209;RBI=0.00766302;REFB=-0.00191767;REVB=-0.00722053;RO=67;SAF=30;SAR=45;SRF=35;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107003;STB=0.558723;TYPE=snp;VARB=0.00200804;OID=.;OPOS=202715284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:67:67:75:75:45:30:35:32:45:30:35:32 chr1 202718202 . G A 306.65 PASS AO=64;DP=115;FAO=64;FDP=117;FR=.;FRO=53;FSAF=31;FSAR=33;FSRF=35;FSRR=18;FWDB=-0.0187578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.2714;QD=10.4838;RBI=0.0607453;REFB=-0.0146583;REVB=0.0577766;RO=51;SAF=31;SAR=33;SRF=33;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131569;STB=0.579385;TYPE=snp;VARB=0.00806351;OID=.;OPOS=202718202;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:117:51:53:64:64:33:31:33:18:33:31:35:18 chr1 202733238 . C T 203.01 PASS AO=49;DP=103;FAO=49;FDP=103;FR=.;FRO=54;FSAF=7;FSAR=42;FSRF=4;FSRR=50;FWDB=-0.0485428;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.285;QD=7.88385;RBI=0.0494436;REFB=-0.0049511;REVB=0.00939501;RO=54;SAF=7;SAR=42;SRF=4;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149923;STB=0.582249;TYPE=snp;VARB=0.00565027;OID=.;OPOS=202733238;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:54:54:49:49:42:7:4:50:42:7:4:50 chr1 202861342 . A G 604.3 PASS AO=110;DP=175;FAO=110;FDP=175;FR=.;FRO=65;FSAF=59;FSAR=51;FSRF=31;FSRR=34;FWDB=0.00107024;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.952;QD=13.8126;RBI=0.00180404;REFB=0.00436906;REVB=-0.0014523;RO=64;SAF=59;SAR=51;SRF=31;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.035519;STB=0.52212;TYPE=snp;VARB=-0.00224192;OID=.;OPOS=202861342;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:175:64:65:110:110:51:59:31:33:51:59:31:34 chr1 202884063 . C T 156.25 PASS AO=39;DP=85;FAO=39;FDP=85;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=26;FWDB=0.0136972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.057;QD=7.35304;RBI=0.0154212;REFB=-0.00379115;REVB=-0.00708538;RO=45;SAF=17;SAR=22;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00831215;STB=0.500613;TYPE=snp;VARB=0.00402367;OID=.;OPOS=202884063;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:45:46:39:39:22:17:20:25:22:17:20:26 chr1 202888947 . T C 175.43 PASS AO=44;DP=96;FAO=44;FDP=96;FR=.;FRO=52;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=42;FSRR=10;FWDB=0.00440958;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.7;QD=7.30965;RBI=0.0101794;REFB=-0.0144468;REVB=0.00917475;RO=52;SAF=27;SAR=17;SRF=42;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211143;STB=0.616672;TYPE=snp;VARB=0.0210295;OID=.;OPOS=202888947;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:52:52:44:44:17:27:42:10:17:27:42:10 chr1 202977809 . G A 137.55 PASS AO=28;DP=54;FAO=29;FDP=55;FR=.;FRO=26;FSAF=2;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=26;FWDB=0.0499711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.629;QD=10.0039;RBI=0.0501406;REFB=-0.0303904;REVB=0.00411996;RO=26;SAF=1;SAR=27;SRF=0;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.300966;STB=0.662421;TYPE=snp;VARB=0.0511844;OID=.;OPOS=202977809;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:55:26:26:28:29:27:1:0:26:27:2:0:26 chr1 203003870 . G A 580.31 PASS AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00580247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.0377;QD=36.2691;RBI=0.0229205;REFB=-0.0960122;REVB=0.0221738;RO=0;SAF=36;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51662e-08;STB=0.509088;TYPE=snp;VARB=0.000921736;OID=.;OPOS=203003870;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:62:64:0:1:62:63:26:36:0:0:27:36:0:1 chr1 203008174 . G C 216.02 PASS AO=9;DP=25;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.018942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.688;QD=36.0025;RBI=0.0389034;REFB=0;REVB=0.0339805;RO=0;SAF=6;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.76931e-05;OID=.;OPOS=203008174;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:10:24:0:0:9:24:3:6:0:0:6:18:0:0 chr1 203023240 . G GGC 92.11 PASS AO=29;DP=81;FAO=29;FDP=79;FR=.;FRO=50;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=30;FWDB=0.0176845;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=45.3915;QD=4.66385;RBI=0.0182977;REFB=-0.0248869;REVB=-0.00469737;RO=50;SAF=12;SAR=17;SRF=20;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0156803;STB=0.509019;TYPE=ins;VARB=0.038689;OID=.;OPOS=203023241;OREF=-;OALT=GC;OMAPALT=GGC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:29:81:29:79:50:12:17:20:30:92:50:12:17:20:30 chr1 203040816 . G C 168.86 PASS AO=49;DP=121;FAO=49;FDP=121;FR=.;FRO=72;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=34;FSRR=38;FWDB=-0.0124574;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.755;QD=5.58214;RBI=0.0222169;REFB=-0.0211719;REVB=-0.0183957;RO=72;SAF=20;SAR=29;SRF=34;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0688269;STB=0.538869;TYPE=snp;VARB=0.0342474;OID=.;OPOS=203040816;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:72:72:49:49:29:20:34:38:29:20:34:38 chr1 203053768 . T C 684.38 PASS AO=72;DP=75;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000512355;FXX=0.0399947;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.622;QD=38.0211;RBI=0.0365055;REFB=0;REVB=0.0365019;RO=0;SAF=47;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.05907e-07;OID=.;OPOS=203053768;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:75:72:0:0:72:72:25:47:0:0:25:47:0:0 chr1 203135840 . CT C 955.15 PASS AO=112;DP=130;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0736393;FXX=0.0294096;HRUN=2;LEN=1;MLLD=19.002;QD=28.944;RBI=0.10847;REFB=-0.00608409;REVB=0.0796427;RO=2;SAF=56;SAR=56;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00274853;OID=.;OPOS=203135841;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:112:118:132:132:0:60:72:0:0:82:2:56:56:1:1 chr1 203137784 . A ACT 985.55 PASS AO=106;DP=112;FAO=107;FDP=109;FR=.;FRO=2;FSAF=65;FSAR=42;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00775399;FXX=0.0180164;HRUN=1;LEN=2;MLLD=274.453;QD=36.1671;RBI=0.0170213;REFB=-0.0453732;REVB=0.0151525;RO=3;SAF=65;SAR=41;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0213986;STB=0.507574;TYPE=ins;VARB=0.000362562;OID=.;OPOS=203137785;OREF=-;OALT=CT;OMAPALT=ACT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:106:112:107:109:2:65:42:2:0:33:3:65:41:3:0 chr1 203143725 . G C 76.84 PASS AO=15;DP=28;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.0830745;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.9198;QD=10.9772;RBI=0.0884381;REFB=-0.0552164;REVB=0.0303305;RO=13;SAF=7;SAR=8;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.058655;STB=0.533289;TYPE=snp;VARB=0.0464304;OID=.;OPOS=203143725;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:28:28:13:13:15:15:8:7:7:6:8:7:7:6 chr1 203148633 . A G 201.65 PASS AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00422909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.506;QD=36.6629;RBI=0.0362747;REFB=0;REVB=0.0360274;RO=0;SAF=11;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000755479;OID=.;OPOS=203148633;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:22:22:0:0:22:22:11:11:0:0:11:11:0:0 chr1 203152801 . T C 670.6 PASS AO=64;DP=64;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0304377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.812;QD=37.7804;RBI=0.0419242;REFB=0;REVB=0.0288303;RO=0;SAF=21;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.72439e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000110708;OID=.;OPOS=203152801;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:64:71:0:0:64:71:43:21:0:0:43:28:0:0 chr1 203186093 . G C 227.27 PASS AO=40;DP=74;FAO=45;FDP=78;FR=.;FRO=33;FSAF=36;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=0.0186703;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.823;QD=11.6551;RBI=0.0230632;REFB=-0.0263956;REVB=0.01354;RO=33;SAF=32;SAR=8;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182466;STB=0.579672;TYPE=snp;VARB=0.0234415;OID=.;OPOS=203186093;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:78:33:33:40:45:8:32:21:12:9:36:22:11 chr1 203194186 . C T 59.36 PASS AO=20;DP=60;FAO=20;FDP=60;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=28;FSRR=12;FWDB=0.00209651;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.703;QD=3.95726;RBI=0.0104231;REFB=-0.0155958;REVB=0.01021;RO=40;SAF=16;SAR=4;SRF=28;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155393;STB=0.592492;TYPE=snp;VARB=0.0222932;OID=.;OPOS=203194186;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:60:60:40:40:20:20:4:16:28:12:4:16:28:12 chr1 203309880 . G A 217.18 PASS AO=23;DP=181;FAO=68;FDP=172;FR=.,HEALED;FRO=101;FSAF=58;FSAR=10;FSRF=64;FSRR=37;FWDB=-0.011682;FXX=0.0171419;HRUN=5;LEN=1;MLLD=202.734;QD=5.05062;RBI=0.0523454;REFB=-0.0321898;REVB=0.0510252;RO=51;SAF=13;SAR=10;SRF=25;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0878078;STB=0.690761;TYPE=snp;VARB=0.0282848;OID=.;OPOS=203309880;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:172:51:101:23:68:10:13:25:26:10:58:64:37 chr1 203309966 . G C 99.69 PASS AO=40;DP=136;FAO=43;FDP=139;FR=.;FRO=96;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=67;FSRR=29;FWDB=0.0436204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.8985;QD=2.86888;RBI=0.0440644;REFB=-0.0159411;REVB=0.00623948;RO=96;SAF=22;SAR=18;SRF=67;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185231;STB=0.584915;TYPE=snp;VARB=0.0351054;OID=.;OPOS=203309966;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:139:96:96:40:43:18:22:67:29:18:25:67:29 chr1 203317162 . C T 374.52 PASS AO=35;DP=38;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00852736;FXX=0.0476077;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.11;QD=37.4517;RBI=0.0828037;REFB=0;REVB=0.0823634;RO=0;SAF=33;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00014599;OID=.;OPOS=203317162;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:38:40:0:0:35:40:2:33:0:0:2:38:0:0 chr1 203455861 . A G 225.62 PASS AO=60;DP=136;FAO=60;FDP=136;FR=.;FRO=76;FSAF=14;FSAR=46;FSRF=27;FSRR=49;FWDB=0.0210808;FXX=0.00729874;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.7874;QD=6.636;RBI=0.0338902;REFB=0.00770516;REVB=0.0265357;RO=74;SAF=14;SAR=46;SRF=27;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163081;STB=0.586412;TYPE=snp;VARB=-0.00898972;OID=.;OPOS=203455861;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:74:76:60:60:46:14:27:47:46:14:27:49 chr1 203652444 . A G 1507.54 PASS AO=159;DP=162;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00819342;FXX=0.0181807;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.126;QD=37.2231;RBI=0.010346;REFB=0.00269048;REVB=0.00631716;RO=2;SAF=79;SAR=80;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.43289e-05;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.09456e-05;OID=.;OPOS=203652444;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:162:162:2:0:159:162:80:79:1:1:83:79:0:0 chr1 203667409 . T C 2253.05 PASS AO=239;DP=241;FAO=239;FDP=239;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=150;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0322209;FXX=0.00829841;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.4401;QD=37.7079;RBI=0.0339527;REFB=-0.0685221;REVB=-0.0107052;RO=1;SAF=89;SAR=150;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00316697;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000338254;OID=.;OPOS=203667409;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:241:239:1:0:239:239:150:89:0:1:150:89:0:0 chr1 203712996 . T C 2123.09 PASS AO=220;DP=222;FAO=222;FDP=222;FR=.;FRO=0;FSAF=135;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217766;FXX=0.0044841;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.8228;QD=38.2539;RBI=0.0280418;REFB=0;REVB=0.0176669;RO=0;SAF=133;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000528177;OID=.;OPOS=203712996;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:222:222:0:0:220:222:87:133:0:0:87:135:0:0 chr1 203713133 . G A 878.33 PASS AO=89;DP=90;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.267;QD=37.7778;RBI=0.0209337;REFB=0;REVB=0.00270215;RO=0;SAF=73;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.4678e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000285875;OID=.;OPOS=203713133;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:90:93:0:0:89:93:16:73:0:0:16:77:0:0 chr1 203743122 . G A 275.87 PASS AO=66;DP=136;FAO=66;FDP=136;FR=.;FRO=70;FSAF=37;FSAR=29;FSRF=41;FSRR=29;FWDB=-0.00224816;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.931;QD=8.11388;RBI=0.0246607;REFB=-0.0150137;REVB=0.024558;RO=70;SAF=37;SAR=29;SRF=41;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0238021;STB=0.513154;TYPE=snp;VARB=0.0176436;OID=.;OPOS=203743122;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:70:70:66:66:29:37:41:29:29:37:41:29 chr1 203743653 . C T 465.91 PASS AO=65;DP=110;FAO=83;FDP=126;FR=.;FRO=43;FSAF=40;FSAR=43;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=0.00998066;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3601;QD=14.7906;RBI=0.172538;REFB=-0.0575782;REVB=0.172249;RO=42;SAF=38;SAR=27;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0448019;STB=0.518068;TYPE=snp;VARB=0.0146013;OID=.;OPOS=203743653;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:126:42:43:65:83:27:38:22:20:43:40:23:20 chr1 203766895 . C T 116.94 PASS AO=39;DP=114;FAO=40;FDP=113;FR=.;FRO=73;FSAF=6;FSAR=34;FSRF=26;FSRR=47;FWDB=-0.0210852;FXX=0.0173898;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.154;QD=4.13955;RBI=0.0235161;REFB=-0.000478291;REVB=0.0104126;RO=72;SAF=6;SAR=33;SRF=26;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.323899;STB=0.691121;TYPE=snp;VARB=0.000633473;OID=.;OPOS=203766895;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:113:72:73:39:40:33:6:26:46:34:6:26:47 chr1 203767822 . T G 382.52 PASS AO=83;DP=160;FAO=85;FDP=163;FR=.;FRO=78;FSAF=37;FSAR=48;FSRF=35;FSRR=43;FWDB=-0.00190126;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.745;QD=9.38688;RBI=0.0361518;REFB=-0.00670093;REVB=-0.0361018;RO=75;SAF=37;SAR=46;SRF=35;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.018256;STB=0.506521;TYPE=snp;VARB=0.00682251;OID=.;OPOS=203767822;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:163:75:78:83:85:46:37:35:40:48:37:35:43 chr1 203787700 . T C 1364.75 PASS AO=143;DP=143;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0394982;FXX=0.00694396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.18;QD=38.1747;RBI=0.0422637;REFB=0;REVB=-0.0150371;RO=0;SAF=96;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.66974e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.72817e-05;OID=.;OPOS=203787700;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:143:143:0:0:143:143:47:96:0:0:47:96:0:0 chr1 203818973 . C A 292.82 PASS AO=69;DP=141;FAO=69;FDP=140;FR=.;FRO=71;FSAF=37;FSAR=32;FSRF=39;FSRR=32;FWDB=-0.0304958;FXX=0.0070917;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.233;QD=8.3662;RBI=0.0313953;REFB=-0.0177724;REVB=0.00746132;RO=71;SAF=37;SAR=32;SRF=39;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0120781;STB=0.506665;TYPE=snp;VARB=0.0192496;OID=.;OPOS=203818973;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:140:71:71:69:69:32:37:39:32:32:37:39:32 chr1 203821314 . G A 424.35 PASS AO=109;DP=241;FAO=109;FDP=238;FR=.;FRO=129;FSAF=53;FSAR=56;FSRF=71;FSRR=58;FWDB=-0.0445752;FXX=0.0165282;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.06;QD=7.13196;RBI=0.0458135;REFB=0.000381572;REVB=0.0105798;RO=125;SAF=53;SAR=56;SRF=71;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0789532;STB=0.534723;TYPE=snp;VARB=-0.00027827;OID=.;OPOS=203821314;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:241:238:125:129:109:109:56:53:71:54:56:53:71:58 chr1 204110334 . A G 647.95 PASS AO=69;DP=72;FAO=72;FDP=74;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0514606;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8932;QD=35.0243;RBI=0.10395;REFB=-0.124847;REVB=0.0903184;RO=2;SAF=28;SAR=41;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.022501;STB=0.511108;TYPE=snp;VARB=0.00494041;OID=.;OPOS=204110334;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:72:74:2:2:69:72:41:28:0:2:44:28:0:2 chr1 204172090 . G A 95.38 PASS AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=-0.0484881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.9081;QD=8.47851;RBI=0.0502042;REFB=-0.0539466;REVB=0.0130144;RO=23;SAF=15;SAR=7;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0305004;STB=0.517226;TYPE=snp;VARB=0.0790511;OID=.;OPOS=204172090;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:45:45:23:23:22:22:7:15:15:8:7:15:15:8 chr1 204190412 . C G 96.18 PASS AO=28;DP=71;FAO=28;FDP=72;FR=.;FRO=44;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=27;FSRR=17;FWDB=-0.00633585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.711;QD=5.34332;RBI=0.0092222;REFB=-0.00711657;REVB=-0.0067012;RO=41;SAF=10;SAR=18;SRF=26;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.285527;STB=0.655402;TYPE=snp;VARB=0.00652062;OID=.;OPOS=204190412;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:71:72:41:44:28:28:18:10:26:15:18:10:27:17 chr1 204198209 . A G 113.41 PASS AO=25;DP=51;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=3;FSAR=22;FSRF=4;FSRR=22;FWDB=-0.0377046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.742;QD=8.8949;RBI=0.0525846;REFB=-0.0266562;REVB=-0.0366538;RO=26;SAF=3;SAR=22;SRF=4;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0679769;STB=0.538429;TYPE=snp;VARB=0.0259496;OID=.;OPOS=204198209;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:26:26:25:25:22:3:4:22:22:3:4:22 chr1 204199614 . C T 107.77 PASS AO=21;DP=38;FAO=21;FDP=38;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=0.010535;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.8596;QD=11.3446;RBI=0.0204133;REFB=-0.0153608;REVB=-0.0174847;RO=16;SAF=7;SAR=14;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.276324;STB=0.666508;TYPE=snp;VARB=0.0142657;OID=.;OPOS=204199614;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:38:38:16:17:21:21:14:7:11:5:14:7:12:5 chr1 204230581 . G A 192.78 PASS AO=44;DP=88;FAO=44;FDP=89;FR=.;FRO=45;FSAF=11;FSAR=33;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=-0.00715635;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=178.911;QD=8.66438;RBI=0.0101757;REFB=-0.00583407;REVB=0.00723409;RO=44;SAF=11;SAR=33;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.25576;STB=0.638642;TYPE=snp;VARB=0.0108193;OID=.;OPOS=204230581;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:89:44:45:44:44:33:11:22:22:33:11:22:23 chr1 204237416 . C T 236.41 PASS AO=59;DP=127;FAO=59;FDP=127;FR=.;FRO=68;FSAF=19;FSAR=40;FSRF=23;FSRR=45;FWDB=-0.00517672;FXX=0.0155027;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.179;QD=7.44583;RBI=0.0233716;REFB=-0.0157556;REVB=-0.0227911;RO=63;SAF=19;SAR=40;SRF=21;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0120001;STB=0.50986;TYPE=snp;VARB=0.0271519;OID=.;OPOS=204237416;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:63:68:59:59:40:19:21:42:40:19:23:45 chr1 204379617 . T C 2120.75 PASS AO=229;DP=233;FAO=229;FDP=233;FR=.;FRO=4;FSAF=124;FSAR=105;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0105868;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.479;QD=36.4078;RBI=0.0106208;REFB=-0.0173275;REVB=-0.0008492;RO=4;SAF=124;SAR=105;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00687113;STB=0.503606;TYPE=snp;VARB=0.000136886;OID=.;OPOS=204379617;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:233:233:4:4:229:229:105:124:3:1:105:124:3:1 chr1 204438334 . C T 577.07 PASS AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.030547;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=178.673;QD=37.8409;RBI=0.032657;REFB=0;REVB=0.011548;RO=0;SAF=37;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000101537;OID=.;OPOS=204438334;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:61:61:0:0:61:61:24:37:0:0:24:37:0:0 chr1 204438643 . G T 782.09 PASS AO=85;DP=87;FAO=85;FDP=87;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0191738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.712;QD=35.9583;RBI=0.028718;REFB=-0.102879;REVB=0.0213796;RO=2;SAF=39;SAR=46;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00180469;STB=0.500953;TYPE=snp;VARB=0.00016312;OID=.;OPOS=204438643;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:87:87:2:2:85:85:46:39:1:1:46:39:1:1 chr1 204531567 . C T 484.54 PASS AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00921527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.8213;QD=38.7635;RBI=0.104472;REFB=0;REVB=0.104065;RO=0;SAF=36;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000556274;OID=.;OPOS=204531567;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:50:50:0:0:50:50:14:36:0:0:14:36:0:0 chr1 204587240 . G A 102.58 PASS AO=30;DP=78;FAO=30;FDP=78;FR=.;FRO=48;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=0.0131695;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.801;QD=5.2605;RBI=0.0134292;REFB=-0.00488569;REVB=-0.00262849;RO=48;SAF=14;SAR=16;SRF=27;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10273;STB=0.558734;TYPE=snp;VARB=0.00677903;OID=.;OPOS=204587240;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:48:48:30:30:16:14:27:21:16:14:27:21 chr1 204588135 . CGGGGG CGGGG,CGGGGA 93.17 PASS AO=2,8;DP=24;FAO=2,10;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=0,1;FSAR=2,9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.108559,-0.110584;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=12.1506,126.945;QD=28.6689;RBI=0.108598,0.113265;REFB=-0.0145745,-0.0313063;REVB=0.00292234,0.0245007;RO=1;SAF=0,1;SAR=2,7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0.650794,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.697199,-0.286738;STB=0.993266,0.666259;TYPE=del,snp;VARB=0.0476284,0.00775015;OID=.,.;OPOS=204588136,204588140;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=CGGGG,CGGGGA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:2,8:11:2,10:13:1:0,1:2,9:1:0:7:1:0,1:2,7:1:0 chr1 204590044 . G A 234.5 PASS AO=86;DP=248;FAO=87;FDP=250;FR=.;FRO=163;FSAF=45;FSAR=42;FSRF=88;FSRR=75;FWDB=-0.00636653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.794;QD=3.75204;RBI=0.0163156;REFB=-0.0159196;REVB=0.0150222;RO=158;SAF=45;SAR=41;SRF=85;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.016797;STB=0.514788;TYPE=snp;VARB=0.0269217;OID=.;OPOS=204590044;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:248:250:158:163:86:87:41:45:85:73:42:45:88:75 chr1 204591237 . A G 66.69 PASS AO=18;DP=45;FAO=18;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=-0.00177139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.369;QD=5.9284;RBI=0.00290411;REFB=-0.0019191;REVB=-0.0023013;RO=27;SAF=9;SAR=9;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134803;STB=0.577693;TYPE=snp;VARB=0.00251864;OID=.;OPOS=204591237;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:45:45:27:27:18:18:9:9:17:10:9:9:17:10 chr1 204957768 . G C 237.99 PASS AO=59;DP=127;FAO=59;FDP=126;FR=.;FRO=67;FSAF=17;FSAR=42;FSRF=33;FSRR=34;FWDB=-0.0163958;FXX=0.0078734;HRUN=3;LEN=1;MLLD=250.361;QD=7.55519;RBI=0.0164842;REFB=-0.00679639;REVB=0.00170464;RO=67;SAF=17;SAR=42;SRF=33;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213384;STB=0.619061;TYPE=snp;VARB=0.00574912;OID=.;OPOS=204957768;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:126:67:67:59:59:42:17:33:34:42:17:33:34 chr1 204966428 . C G 85.52 PASS AO=17;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=0;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=15;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2001;QD=10.6898;RBI=0.0285045;REFB=0.0110226;REVB=-0.0285045;RO=15;SAF=0;SAR=17;SRF=0;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00522806;OID=.;OPOS=204966428;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:32:32:15:15:17:17:17:0:0:15:17:0:0:15 chr1 204966690 . G A 620.74 PASS AO=65;DP=67;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00641019;FXX=0.0298463;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.52;QD=38.1992;RBI=0.0567078;REFB=0;REVB=0.0563444;RO=0;SAF=38;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.04073e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000212323;OID=.;OPOS=204966690;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:67:65:0:0:65:65:27:38:0:0:27:38:0:0 chr1 204970297 . GCCCCT GCCCT,GCCCC,GCCCCC 804.52 PASS AO=29,28,55;DP=167;FAO=50,2,86;FDP=153;FR=.;FRO=15;FSAF=24,0,27;FSAR=26,2,59;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=-0.544985,0.0295543,0.120835;FXX=0.00649309;HRUN=4,1,1;LEN=1,1,1;MLLD=9.6969,142.262,151.777;QD=21.0331;RBI=0.545941,0.0320964,0.121386;REFB=-0.235514,-0.043249,-0.0339699;REVB=0.0323028,0.012519,0.0115499;RO=18;SAF=10,18,7;SAR=19,10,48;SRF=1;SRR=17;SSEN=0.665025,0,0;SSEP=0.414013,0,0;SSSB=0.244175,0.3998,0.0790856;STB=0.56503,0.991836,0.51993;TYPE=del,del,snp;VARB=0.133116,-0.0128216,0.0108833;OID=.,.,.;OPOS=204970298,204970302,204970302;OREF=C,T,T;OALT=-,-,C;OMAPALT=GCCCT,GCCCC,GCCCCC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/3:29,28,55:148:50,2,86:153:15:24,0,27:26,2,59:3:12:99:18:10,18,7:19,10,48:1:17 chr1 204978533 . A G 1072.29 PASS AO=106;DP=106;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.344;QD=37.957;RBI=0.0232772;REFB=0;REVB=0.0209534;RO=0;SAF=33;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.53708e-05;OID=.;OPOS=204978533;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:106:113:0:0:106:113:73:33:0:0:77:36:0:0 chr1 205027737 . G A 306.56 PASS AO=84;DP=225;FAO=95;FDP=236;FR=.;FRO=141;FSAF=33;FSAR=62;FSRF=69;FSRR=72;FWDB=0.0164431;FXX=0.0125518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.303;QD=5.19594;RBI=0.0233891;REFB=-0.0203588;REVB=0.0166336;RO=140;SAF=31;SAR=53;SRF=68;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13272;STB=0.588479;TYPE=snp;VARB=0.0282761;OID=.;OPOS=205027737;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:225:236:140:141:84:95:53:31:68:72:62:33:69:72 chr1 205031116 . C T 1621.1 PASS AO=180;DP=185;FAO=178;FDP=183;FR=.;FRO=5;FSAF=130;FSAR=48;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.049826;FXX=0.0108102;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.409;QD=35.434;RBI=0.0750569;REFB=-0.0862448;REVB=-0.0561329;RO=3;SAF=131;SAR=49;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0024033;STB=0.504501;TYPE=snp;VARB=0.00724526;OID=.;OPOS=205031116;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:185:183:3:5:180:178:49:131:2:1:48:130:3:2 chr1 205042939 . C T 127.56 PASS AO=28;DP=56;FAO=28;FDP=56;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=0.0196622;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.3442;QD=9.11167;RBI=0.0327973;REFB=-0.0363379;REVB=0.0262499;RO=27;SAF=11;SAR=17;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133476;STB=0.518554;TYPE=snp;VARB=0.0333749;OID=.;OPOS=205042939;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:27:28:28:28:17:11:11:16:17:11:12:16 chr1 205052939 . G A 1035.53 PASS AO=112;DP=115;FAO=112;FDP=114;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00288921;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.274;QD=36.3345;RBI=0.00655894;REFB=-0.0311776;REVB=-0.00588831;RO=2;SAF=36;SAR=76;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0123301;STB=0.506492;TYPE=snp;VARB=5.74677e-05;OID=.;OPOS=205052939;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:115:114:2:2:112:112:76:36:0:2:76:36:0:2 chr1 205053219 . C T 1786.68 PASS AO=193;DP=198;FAO=194;FDP=199;FR=.;FRO=5;FSAF=97;FSAR=97;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.000763635;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.556;QD=35.9133;RBI=0.0199283;REFB=-0.170159;REVB=0.0199136;RO=3;SAF=97;SAR=96;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00493274;STB=0.507537;TYPE=snp;VARB=0.000821332;OID=.;OPOS=205053219;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:198:199:3:5:193:194:96:97:1:2:97:97:1:4 chr1 205053407 . C A 117.52 PASS AO=29;DP=63;FAO=29;FDP=64;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=-0.0241278;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.0878;QD=7.34517;RBI=0.0452851;REFB=-0.0140371;REVB=0.0383222;RO=34;SAF=11;SAR=18;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00309292;STB=0.504584;TYPE=snp;VARB=0.0187978;OID=.;OPOS=205053407;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:64:34:35:29:29:18:11:13:21:18:11:13:22 chr1 205056844 . T TTA 296.65 PASS AO=34;DP=57;FAO=39;FDP=46;FR=.;FRO=7;FSAF=26;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.0191438;FXX=0.09802;HRUN=5;LEN=2;MLLD=239.725;QD=25.7959;RBI=0.0250415;REFB=-0.0121089;REVB=0.0161428;RO=12;SAF=26;SAR=8;SRF=10;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0472038;STB=0.508193;TYPE=ins;VARB=0.0020084;OID=.;OPOS=205056845;OREF=-;OALT=TA;OMAPALT=TTA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:34:57:39:46:7:26:13:5:2:8:12:26:8:10:2 chr1 205129319 . G A 302.58 PASS AO=71;DP=143;FAO=71;FDP=143;FR=.;FRO=72;FSAF=28;FSAR=43;FSRF=40;FSRR=32;FWDB=-0.000340064;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.0216;QD=8.4637;RBI=0.00578814;REFB=-0.0190008;REVB=0.00577814;RO=70;SAF=28;SAR=43;SRF=39;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148138;STB=0.581983;TYPE=snp;VARB=0.0193834;OID=.;OPOS=205129319;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:70:72:71:71:43:28:39:31:43:28:40:32 chr1 205130413 . A G 1985.05 PASS AO=210;DP=213;FAO=213;FDP=213;FR=.;FRO=0;FSAF=108;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0457743;FXX=0.00467268;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.8715;QD=37.278;RBI=0.0461137;REFB=0;REVB=-0.00558438;RO=0;SAF=108;SAR=102;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.84449e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000361263;OID=.;OPOS=205130413;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:213:213:0:0:210:213:102:108:0:0:105:108:0:0 chr1 205138321 . G C 502.32 PASS AO=111;DP=212;FAO=111;FDP=211;FR=.;FRO=100;FSAF=38;FSAR=73;FSRF=26;FSRR=74;FWDB=-0.0399418;FXX=0.00471676;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.8007;QD=9.52264;RBI=0.0399648;REFB=-0.0191004;REVB=0.00135465;RO=99;SAF=38;SAR=73;SRF=26;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0786188;STB=0.544543;TYPE=snp;VARB=0.0141022;OID=.;OPOS=205138321;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:211:99:100:111:111:73:38:26:73:73:38:26:74 chr1 205225457 . G A 200.42 PASS AO=49;DP=103;FAO=49;FDP=104;FR=.;FRO=55;FSAF=38;FSAR=11;FSRF=39;FSRR=16;FWDB=-0.0122192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.054;QD=7.70859;RBI=0.0143557;REFB=-0.0138016;REVB=-0.00753506;RO=53;SAF=38;SAR=11;SRF=37;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0972267;STB=0.547764;TYPE=snp;VARB=0.0215709;OID=.;OPOS=205225457;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:104:53:55:49:49:11:38:37:16:11:38:39:16 chr1 205238275 . A G 26.14 PASS AO=9;DP=32;FAO=9;FDP=32;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=18;FSRR=5;FWDB=0.0335096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.397;QD=3.26759;RBI=0.0384523;REFB=-0.011017;REVB=0.0188598;RO=23;SAF=6;SAR=3;SRF=18;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163444;STB=0.5998;TYPE=snp;VARB=0.0182495;OID=.;OPOS=205238275;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:32:32:23:23:9:9:3:6:18:5:3:6:18:5 chr1 205240251 . C T 138.88 PASS AO=35;DP=77;FAO=35;FDP=78;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=27;FSRR=16;FWDB=-0.0232085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.349;QD=7.122;RBI=0.0393673;REFB=-0.0196099;REVB=-0.0317986;RO=42;SAF=16;SAR=19;SRF=26;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156325;STB=0.593266;TYPE=snp;VARB=0.0188173;OID=.;OPOS=205240251;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:78:42:43:35:35:19:16:26:16:19:16:27:16 chr1 205272926 . C T 65.36 PASS AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0193879;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.722;QD=14.5242;RBI=0.0196231;REFB=-0.00203465;REVB=-0.00302929;RO=7;SAF=9;SAR=2;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.41657;STB=0.74069;TYPE=snp;VARB=0.00181846;OID=.;OPOS=205272926;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:18:18:7:7:11:11:2:9:2:5:2:9:2:5 chr1 205272983 . C G 89.69 PASS AO=14;DP=21;FAO=14;FDP=21;FR=.;FRO=7;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0173686;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.612;QD=17.084;RBI=0.0257071;REFB=-0.0532619;REVB=0.0189522;RO=7;SAF=12;SAR=2;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.266493;STB=0.651921;TYPE=snp;VARB=0.0255732;OID=.;OPOS=205272983;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:21:21:7:7:14:14:2:12:4:3:2:12:4:3 chr1 205275421 . A G 1183.83 PASS AO=115;DP=116;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0158637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.898;QD=37.8826;RBI=0.0665606;REFB=0;REVB=0.0646425;RO=0;SAF=78;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.63659e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000173382;OID=.;OPOS=205275421;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:116:125:0:0:115:125:37:78:0:0:38:87:0:0 chr1 205306590 . G A 211.17 PASS AO=53;DP=112;FAO=53;FDP=115;FR=.;FRO=62;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=24;FSRR=38;FWDB=8.74999e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.245;QD=7.34508;RBI=0.0102203;REFB=-0.0208969;REVB=0.0102199;RO=59;SAF=24;SAR=29;SRF=24;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.044282;STB=0.535987;TYPE=snp;VARB=0.0216476;OID=.;OPOS=205306590;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:115:59:62:53:53:29:24:24:35:29:24:24:38 chr1 205492756 . A G 16.29 PASS AO=5;DP=21;FAO=5;FDP=20;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=-0.0517598;FXX=0.0475964;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.0681;QD=3.25758;RBI=0.0550188;REFB=-0.00784054;REVB=-0.0186547;RO=14;SAF=3;SAR=2;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139653;STB=0.608299;TYPE=snp;VARB=0.0167514;OID=.;OPOS=205492756;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:21:20:14:15:5:5:2:3:10:4:2:3:11:4 chr1 205501843 . A G 114.42 PASS AO=29;DP=65;FAO=29;FDP=65;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=-0.027606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.5947;QD=7.04123;RBI=0.0961606;REFB=-0.008453;REVB=-0.0921128;RO=36;SAF=14;SAR=15;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0651105;STB=0.536716;TYPE=snp;VARB=0.0357113;OID=.;OPOS=205501843;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:36:36:29:29:15:14:15:21:15:14:15:21 chr1 205564196 . T A 375.71 PASS AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0166233;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.137;QD=38.5341;RBI=0.0496012;REFB=0;REVB=0.0467327;RO=0;SAF=21;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34792e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.32132e-05;OID=.;OPOS=205564196;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:39:39:0:0:39:39:18:21:0:0:18:21:0:0 chr1 205738166 . T C 991.74 PASS AO=105;DP=107;FAO=107;FDP=109;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=76;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.000782928;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.503;QD=36.3942;RBI=0.00104834;REFB=0.02109;REVB=-0.00069716;RO=2;SAF=31;SAR=74;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0296291;STB=0.515622;TYPE=snp;VARB=-3.59103e-05;OID=.;OPOS=205738166;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:107:109:2:2:105:107:74:31:2:0:76:31:2:0 chr1 205801872 . A G 212.33 PASS AO=46;DP=92;FAO=47;FDP=92;FR=.;FRO=45;FSAF=2;FSAR=45;FSRF=4;FSRR=41;FWDB=0.15455;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.8194;QD=9.23152;RBI=0.158315;REFB=-0.0236917;REVB=0.0343226;RO=45;SAF=1;SAR=45;SRF=4;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.38854;STB=0.610803;TYPE=snp;VARB=0.012997;OID=.;OPOS=205801872;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:45:45:46:47:45:1:4:41:45:2:4:41 chr1 205810947 . C T 499.22 PASS AO=129;DP=270;FAO=125;FDP=266;FR=.;FRO=141;FSAF=74;FSAR=51;FSRF=72;FSRR=69;FWDB=0.005941;FXX=0.0148143;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.3323;QD=7.50711;RBI=0.0196021;REFB=0.016428;REVB=-0.0186802;RO=141;SAF=78;SAR=51;SRF=72;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0911717;STB=0.543911;TYPE=snp;VARB=-0.0163086;OID=.;OPOS=205810947;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:270:266:141:141:129:125:51:78:72:69:51:74:72:69 chr1 205811828 . A T 226.27 PASS AO=70;DP=178;FAO=70;FDP=178;FR=.;FRO=108;FSAF=32;FSAR=38;FSRF=46;FSRR=62;FWDB=-0.00275838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.3345;QD=5.08469;RBI=0.00284022;REFB=-0.0119069;REVB=0.000676869;RO=108;SAF=32;SAR=38;SRF=46;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0339823;STB=0.519138;TYPE=snp;VARB=0.023307;OID=.;OPOS=205811828;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:178:108:108:70:70:38:32:46:62:38:32:46:62 chr1 205812912 . A G 144.62 PASS AO=15;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.183784;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.5106;QD=36.1554;RBI=0.18521;REFB=0;REVB=0.0229415;RO=1;SAF=0;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.844787;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00875606;OID=.;OPOS=205812912;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:16:1:0:15:16:15:0:1:0:15:1:0:0 chr1 205814485 . G A 238.83 PASS AO=45;DP=72;FAO=44;FDP=71;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=7;FSRR=20;FWDB=0.00838984;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.687;QD=13.4555;RBI=0.0491094;REFB=-0.0439894;REVB=-0.0483874;RO=27;SAF=16;SAR=29;SRF=7;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0741121;STB=0.535308;TYPE=snp;VARB=0.0239301;OID=.;OPOS=205814485;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:72:71:27:27:45:44:29:16:7:20:29:15:7:20 chr1 205814497 . T C 796.89 PASS AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00853972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.077;QD=37.9469;RBI=0.020924;REFB=0;REVB=0.019102;RO=0;SAF=39;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.93822e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.11176e-05;OID=.;OPOS=205814497;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:84:84:0:0:84:84:45:39:0:0:45:39:0:0 chr1 205817018 . T C 52.65 PASS AO=15;DP=41;FAO=15;FDP=41;FR=.;FRO=26;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=0.00595726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.4658;QD=5.13684;RBI=0.0361926;REFB=-0.0267978;REVB=-0.0356989;RO=26;SAF=4;SAR=11;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147931;STB=0.587663;TYPE=snp;VARB=0.0426516;OID=.;OPOS=205817018;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:41:41:26:26:15:15:11:4:10:16:11:4:10:16 chr1 205819039 . C T 94.46 PASS AO=22;DP=47;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=17;FSAR=5;FSRF=21;FSRR=4;FWDB=-0.0114617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.9718;QD=8.03896;RBI=0.0742154;REFB=-0.0286992;REVB=0.073325;RO=25;SAF=17;SAR=5;SRF=21;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0959366;STB=0.55389;TYPE=snp;VARB=0.03627;OID=.;OPOS=205819039;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:47:47:25:25:22:22:5:17:21:4:5:17:21:4 chr1 205819104 . G A 80.89 PASS AO=23;DP=59;FAO=23;FDP=59;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.0227346;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.323;QD=5.48427;RBI=0.0239274;REFB=-0.0131382;REVB=0.00746051;RO=35;SAF=9;SAR=14;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189124;STB=0.600504;TYPE=snp;VARB=0.0171535;OID=.;OPOS=205819104;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:59:59:35:36:23:23:14:9:20:15:14:9:20:16 chr1 205890801 . TG T 69.72 PASS AO=25;DP=53;FAO=28;FDP=56;FR=.;FRO=28;FSAF=22;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.11466;FXX=0.0175408;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.258;QD=4.98033;RBI=0.128807;REFB=-0.05518;REVB=-0.0586887;RO=26;SAF=17;SAR=8;SRF=14;SRR=12;SSEN=0.291999;SSEP=0;SSSB=0.138603;STB=0.670598;TYPE=del;VARB=0.0491462;OID=.;OPOS=205890802;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:25:55:28:56:28:22:6:14:14:66:26:17:8:14:12 chr1 206225112 . T C 178.79 PASS AO=34;DP=56;FAO=34;FDP=59;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=-0.0230145;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.1553;QD=12.1213;RBI=0.0406304;REFB=-0.0214115;REVB=0.0334837;RO=22;SAF=12;SAR=22;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206787;STB=0.639196;TYPE=snp;VARB=0.00932721;OID=.;OPOS=206225112;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:56:59:22:25:34:34:22:12:14:8:22:12:17:8 chr1 206230986 . G A 50.28 PASS AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.0201927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.119;QD=8.37965;RBI=0.0239866;REFB=-0.000270306;REVB=-0.0129466;RO=13;SAF=3;SAR=8;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0398606;STB=0.523321;TYPE=snp;VARB=0.00106866;OID=.;OPOS=206230986;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:24:24:13:13:11:11:8:3:4:9:8:3:4:9 chr1 206317568 . G A 113.93 PASS AO=24;DP=47;FAO=24;FDP=46;FR=.;FRO=22;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=0.0112034;FXX=0.0212721;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.31;QD=9.90725;RBI=0.0420764;REFB=-0.0216266;REVB=0.0405574;RO=22;SAF=15;SAR=9;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0526104;STB=0.529388;TYPE=snp;VARB=0.021289;OID=.;OPOS=206317568;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:47:46:22:22:24:24:9:15:15:7:9:15:15:7 chr1 206327510 . T C 412.08 PASS AO=110;DP=255;FAO=111;FDP=249;FR=.;FRO=138;FSAF=69;FSAR=42;FSRF=70;FSRR=68;FWDB=-0.0446642;FXX=0.0235285;HRUN=5;LEN=1;MLLD=54.4678;QD=6.61981;RBI=0.0490022;REFB=-0.00475075;REVB=-0.0201576;RO=133;SAF=69;SAR=41;SRF=67;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125659;STB=0.565225;TYPE=snp;VARB=0.00510744;OID=.;OPOS=206327510;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:255:249:133:138:110:111:41:69:67:66:42:69:70:68 chr1 206328803 . T C 293.18 PASS AO=52;DP=93;FAO=57;FDP=96;FR=.;FRO=39;FSAF=37;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=-0.00755667;FXX=0.0103082;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.8375;QD=12.2157;RBI=0.014988;REFB=-0.0270534;REVB=-0.0129436;RO=40;SAF=35;SAR=17;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0853551;STB=0.547917;TYPE=snp;VARB=0.0312897;OID=.;OPOS=206328803;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:96:40:39:52:57:17:35:23:17:20:37:21:18 chr1 206516261 . C T 410.04 PASS AO=94;DP=188;FAO=94;FDP=186;FR=.;FRO=92;FSAF=26;FSAR=68;FSRF=30;FSRR=62;FWDB=0.00683174;FXX=0.0210515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.9191;QD=8.81815;RBI=0.0153946;REFB=-0.0164411;REVB=0.0137957;RO=89;SAF=26;SAR=68;SRF=30;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0647046;STB=0.529765;TYPE=snp;VARB=0.0138663;OID=.;OPOS=206516261;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:186:89:92:94:94:68:26:30:59:68:26:30:62 chr1 206566195 . C T 41.77 PASS AO=46;DP=248;FAO=47;FDP=250;FR=.;FRO=203;FSAF=10;FSAR=37;FSRF=49;FSRR=154;FWDB=0.0157547;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.143;QD=0.668275;RBI=0.0204256;REFB=-0.00360834;REVB=-0.0129997;RO=199;SAF=10;SAR=36;SRF=47;SRR=152;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0345524;STB=0.533335;TYPE=snp;VARB=0.0289374;OID=.;OPOS=206566195;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:248:250:199:203:46:47:36:10:47:152:37:10:49:154 chr1 206566904 . T C 1011.39 PASS AO=210;DP=382;FAO=215;FDP=388;FR=.;FRO=173;FSAF=93;FSAR=122;FSRF=74;FSRR=99;FWDB=-0.010203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.093;QD=10.4267;RBI=0.0535922;REFB=-0.0121919;REVB=0.052612;RO=168;SAF=93;SAR=117;SRF=72;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0118694;STB=0.502187;TYPE=snp;VARB=0.0140963;OID=.;OPOS=206566904;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:382:388:168:173:210:215:117:93:72:96:122:93:74:99 chr1 206579936 . A G 13.38 PASS AO=4;DP=17;FAO=4;FDP=17;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.00203881;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.181;QD=3.14789;RBI=0.0159187;REFB=0.00205223;REVB=-0.0157876;RO=13;SAF=3;SAR=1;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.327008;STB=0.726108;TYPE=snp;VARB=-0.00926516;OID=.;OPOS=206579936;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:17:17:13:13:4:4:1:3:6:7:1:3:6:7 chr1 206626607 . G A 796.55 PASS AO=83;DP=85;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0240729;FXX=0.0232531;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.2489;QD=37.9307;RBI=0.0241404;REFB=0;REVB=-0.00180426;RO=0;SAF=39;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03564e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.38477e-05;OID=.;OPOS=206626607;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:85:84:0:0:83:84:44:39:0:0:45:39:0:0 chr1 206637395 . C T 865.2 PASS AO=92;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00502009;FXX=0.0210504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.001;QD=37.2131;RBI=0.00755602;REFB=-0.0748339;REVB=-0.0056473;RO=0;SAF=61;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000201205;OID=.;OPOS=206637395;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:93:93:0:0:92:93:31:61:0:0:32:61:0:0 chr1 206637595 . C T 360.51 PASS AO=103;DP=243;FAO=103;FDP=243;FR=.;FRO=140;FSAF=45;FSAR=58;FSRF=68;FSRR=72;FWDB=0.0272282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.0998;QD=5.93436;RBI=0.0291576;REFB=-0.00541719;REVB=0.0104303;RO=140;SAF=45;SAR=58;SRF=68;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0508721;STB=0.528372;TYPE=snp;VARB=0.00837266;OID=.;OPOS=206637595;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:243:243:140:140:103:103:58:45:68:72:58:45:68:72 chr1 206647742 . A G 1336.76 PASS AO=148;DP=152;FAO=147;FDP=151;FR=.;FRO=4;FSAF=69;FSAR=78;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0403064;FXX=0.00657851;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7812;QD=35.4107;RBI=0.0577687;REFB=-0.0791059;REVB=-0.0413838;RO=3;SAF=70;SAR=78;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00529201;STB=0.500814;TYPE=snp;VARB=0.00375785;OID=.;OPOS=206647742;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:152:151:3:4:148:147:78:70:1:2:78:69:2:2 chr1 206647787 . T C 1572.61 PASS AO=164;DP=166;FAO=164;FDP=164;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0110735;FXX=0.0120475;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.709;QD=38.3563;RBI=0.0293357;REFB=0;REVB=0.0271655;RO=0;SAF=75;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.32571e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.50231e-05;OID=.;OPOS=206647787;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:166:164:0:0:164:164:89:75:0:0:89:75:0:0 chr1 206651107 . G A 134.94 PASS AO=24;DP=40;FAO=24;FDP=40;FR=.;FRO=16;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.0143594;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.958;QD=13.4941;RBI=0.0161202;REFB=-0.0157299;REVB=0.00732598;RO=16;SAF=15;SAR=9;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0119233;OID=.;OPOS=206651107;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:40:40:16:16:24:24:9:15:10:6:9:15:10:6 chr1 206665896 . C G 1034.88 PASS AO=111;DP=118;FAO=115;FDP=117;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=78;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0321049;FXX=0.0168053;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.439;QD=35.3804;RBI=0.0350286;REFB=-0.0724977;REVB=-0.01401;RO=5;SAF=33;SAR=78;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0666776;STB=0.513156;TYPE=snp;VARB=0.000452839;OID=.;OPOS=206665896;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:118:117:5:2:111:115:78:33:5:0:78:37:2:0 chr1 206666423 . GC G 111.02 PASS AO=13;DP=22;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.230706;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=10.2218;QD=21.1463;RBI=0.247918;REFB=0;REVB=0.0907625;RO=3;SAF=9;SAR=4;SRF=3;SRR=0;SSEN=0.320755;SSEP=0;SSSB=-0.129286;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0352464;OID=.;OPOS=206666424;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:13:21:21:21:0:13:8:0:0:11:3:9:4:3:0 chr1 206669465 . C T 55.01 PASS AO=20;DP=66;FAO=21;FDP=66;FR=.;FRO=45;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=0.0495372;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.8261;QD=3.33375;RBI=0.107622;REFB=-0.0222434;REVB=-0.0955432;RO=46;SAF=13;SAR=7;SRF=27;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0786022;STB=0.565154;TYPE=snp;VARB=0.0524457;OID=.;OPOS=206669465;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:66:66:46:45:20:21:7:13:27:19:7:14:26:19 chr1 206758077 . T A 392.38 PASS AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0182363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.0568;QD=37.3691;RBI=0.0426666;REFB=0;REVB=0.038573;RO=0;SAF=13;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.36943e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000179363;OID=.;OPOS=206758077;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:42:42:0:0:42:42:29:13:0:0:29:13:0:0 chr1 206773658 . CA C,CG 1573.27 PASS AO=64,76;DP=145;FAO=163,3;FDP=166;FR=.;FRO=0;FSAF=116,1;FSAR=47,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0751022,-0.0781926;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=110.235,98.4507;QD=37.9101;RBI=0.105461,0.0955852;REFB=0,0;REVB=0.0740379,0.0549769;RO=0;SAF=30,65;SAR=34,11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.000371317,0.0221156;OID=.,.;OPOS=206773659,206773659;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:64,76:144:163,3:166:0:116,1:47,2:0:0:27:0:30,65:34,11:0:0 chr1 206784683 . C T 483.15 PASS AO=99;DP=213;FAO=112;FDP=219;FR=.;FRO=107;FSAF=44;FSAR=68;FSRF=60;FSRR=47;FWDB=0.0458163;FXX=0.00454525;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.1629;QD=8.82469;RBI=0.0937427;REFB=-0.0260022;REVB=0.0817836;RO=111;SAF=37;SAR=62;SRF=63;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187569;STB=0.582906;TYPE=snp;VARB=0.0248674;OID=.;OPOS=206784683;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:213:219:111:107:99:112:62:37:63:48:68:44:60:47 chr1 207015957 . T C 2361.88 PASS AO=255;DP=257;FAO=251;FDP=251;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=155;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0548291;FXX=0.0233454;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9771;QD=37.6395;RBI=0.0583758;REFB=0.0211673;REVB=0.0200376;RO=2;SAF=99;SAR=156;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00174472;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000138339;OID=.;OPOS=207015957;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:257:251:2:0:255:251:156:99:1:1:155:96:0:0 chr1 207074905 . T C 143.03 PASS AO=48;DP=120;FAO=45;FDP=117;FR=.;FRO=72;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=38;FSRR=34;FWDB=-0.00143639;FXX=0.0409802;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.4;QD=4.88995;RBI=0.00489184;REFB=-0.00556029;REVB=0.00467621;RO=69;SAF=23;SAR=25;SRF=35;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0293774;STB=0.537569;TYPE=snp;VARB=0.00698513;OID=.;OPOS=207074905;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:117:69:72:48:45:25:23:35:34:24:21:38:34 chr1 207087435 . C T 159.69 PASS AO=16;DP=66;FAO=35;FDP=69;FR=.;FRO=34;FSAF=7;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=33;FWDB=0.0421327;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=175.32;QD=9.25753;RBI=0.0437098;REFB=0.00244153;REVB=-0.0116355;RO=31;SAF=1;SAR=15;SRF=0;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.464488;STB=0.655846;TYPE=snp;VARB=-0.0021009;OID=.;OPOS=207087435;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:69:31:34:16:35:15:1:0:31:28:7:1:33 chr1 207109116 . C T 41.52 PASS AO=6;DP=9;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.9947;QD=18.4517;RBI=0.0097129;REFB=-0.117674;REVB=0.0097129;RO=3;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0603972;OID=.;OPOS=207109116;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:9:9:3:3:6:6:6:0:0:3:6:0:0:3 chr1 207110936 . T C 315.65 PASS AO=64;DP=114;FAO=64;FDP=113;FR=.;FRO=49;FSAF=21;FSAR=43;FSRF=27;FSRR=22;FWDB=-0.0169615;FXX=0.00877116;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.933;QD=11.1736;RBI=0.0225921;REFB=-0.0165699;REVB=-0.0149235;RO=48;SAF=21;SAR=43;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17691;STB=0.601892;TYPE=snp;VARB=0.0106047;OID=.;OPOS=207110936;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:113:48:49:64:64:43:21:26:22:43:21:27:22 chr1 207132345 . A G 69.16 PASS AO=20;DP=53;FAO=20;FDP=53;FR=.;FRO=33;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=-0.0254712;FXX=0.0185151;HRUN=3;LEN=1;MLLD=119.817;QD=5.21944;RBI=0.027808;REFB=-0.00953809;REVB=0.0111581;RO=33;SAF=4;SAR=16;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190887;STB=0.612122;TYPE=snp;VARB=0.0211646;OID=.;OPOS=207132345;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:53:53:33:33:20:20:16:4:11:22:16:4:11:22 chr1 207140440 . C T 369.57 PASS AO=81;DP=158;FAO=82;FDP=158;FR=.;FRO=76;FSAF=40;FSAR=42;FSRF=43;FSRR=33;FWDB=0.00991649;FXX=0.00628891;HRUN=3;LEN=1;MLLD=134.798;QD=9.35627;RBI=0.0145891;REFB=0.00153089;REVB=-0.0107007;RO=75;SAF=40;SAR=41;SRF=43;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0696239;STB=0.537456;TYPE=snp;VARB=-0.00227425;OID=.;OPOS=207140440;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:158:75:76:81:82:41:40:43:32:42:40:43:33 chr1 207143422 . A G 694.85 PASS AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209292;FXX=0.0266631;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.558;QD=38.0741;RBI=0.0450025;REFB=0;REVB=-0.0398396;RO=0;SAF=28;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1195e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.61979e-05;OID=.;OPOS=207143422;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:74:73:0:0:73:73:45:28:0:0:45:28:0:0 chr1 207195779 . A G 171.46 PASS AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=23;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0780769;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.7746;QD=29.8182;RBI=0.0840094;REFB=-0.195578;REVB=-0.0310094;RO=1;SAF=5;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0279913;STB=0.529385;TYPE=snp;VARB=0.0240083;OID=.;OPOS=207195779;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:22:23:1:2:21:21:16:5:0:1:16:5:0:2 chr1 207196138 . C T 96.08 PASS AO=30;DP=83;FAO=30;FDP=81;FR=.;FRO=51;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=11;FSRR=40;FWDB=-0.0258184;FXX=0.0240935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.942;QD=4.74447;RBI=0.0343128;REFB=-0.0213144;REVB=-0.0226005;RO=49;SAF=10;SAR=20;SRF=11;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14089;STB=0.588181;TYPE=snp;VARB=0.0635704;OID=.;OPOS=207196138;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:83:81:49:51:30:30:20:10:11:38:20:10:11:40 chr1 207217359 . T C 58.21 PASS AO=20;DP=61;FAO=20;FDP=61;FR=.;FRO=41;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=26;FWDB=-0.0331608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.185;QD=3.81702;RBI=0.0421468;REFB=-0.0157413;REVB=-0.0260137;RO=40;SAF=7;SAR=13;SRF=14;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.2508e-08;STB=0.511616;TYPE=snp;VARB=0.0294367;OID=.;OPOS=207217359;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:61:61:40:41:20:20:13:7:14:26:13:7:15:26 chr1 207221612 . C T 150.13 PASS AO=41;DP=102;FAO=42;FDP=102;FR=.;FRO=60;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=37;FSRR=23;FWDB=-0.0112363;FXX=0.0192289;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.929;QD=5.88731;RBI=0.0213527;REFB=-0.00120525;REVB=0.0181571;RO=60;SAF=17;SAR=24;SRF=37;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210012;STB=0.623211;TYPE=snp;VARB=0.00267183;OID=.;OPOS=207221612;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:60:60:41:42:24:17:37:23:25:17:37:23 chr1 207263829 . A G 316.79 PASS AO=77;DP=161;FAO=77;FDP=161;FR=.;FRO=84;FSAF=24;FSAR=53;FSRF=42;FSRR=42;FWDB=-0.00703461;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.438;QD=7.87067;RBI=0.0284201;REFB=-0.0109903;REVB=-0.0275357;RO=84;SAF=24;SAR=53;SRF=42;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189967;STB=0.605371;TYPE=snp;VARB=0.0159478;OID=.;OPOS=207263829;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:161:84:84:77:77:53:24:42:42:53:24:42:42 chr1 207268779 . A G 39.99 PASS AO=7;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.0781795;FXX=0.0555247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.623;QD=9.40983;RBI=0.0782325;REFB=-0.0461664;REVB=-0.00288163;RO=9;SAF=4;SAR=3;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.318742;STB=0.703751;TYPE=snp;VARB=0.0565677;OID=.;OPOS=207268779;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:17:17:9:9:7:8:3:4:2:7:3:5:2:7 chr1 207297680 . T C 796.92 PASS AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0169732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.04;QD=37.9485;RBI=0.0179771;REFB=0;REVB=-0.00592343;RO=0;SAF=31;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17151e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.87772e-05;OID=.;OPOS=207297680;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:84:84:0:0:84:84:53:31:0:0:53:31:0:0 chr1 207304900 . T C 433.13 PASS AO=113;DP=254;FAO=115;FDP=255;FR=.;FRO=140;FSAF=64;FSAR=51;FSRF=84;FSRR=56;FWDB=-0.00188622;FXX=0.0039061;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.704;QD=6.79413;RBI=0.046672;REFB=-0.00131915;REVB=0.0466338;RO=140;SAF=64;SAR=49;SRF=84;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0343546;STB=0.524308;TYPE=snp;VARB=0.0020164;OID=.;OPOS=207304900;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:254:255:140:140:113:115:49:64:84:56:51:64:84:56 chr1 207495575 . C G 134.6 PASS AO=25;DP=53;FAO=29;FDP=57;FR=.;FRO=28;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=0.0293585;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.6904;QD=9.4455;RBI=0.0324645;REFB=-0.0206841;REVB=-0.0138571;RO=26;SAF=17;SAR=8;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0653606;STB=0.506662;TYPE=snp;VARB=0.0141328;OID=.;OPOS=207495575;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:57:26:28:25:29:8:17:16:10:10:19:18:10 chr1 207646322 . G A 377.19 PASS AO=82;DP=154;FAO=82;FDP=153;FR=.;FRO=71;FSAF=29;FSAR=53;FSRF=17;FSRR=54;FWDB=0.0117082;FXX=0.00649309;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.9216;QD=9.86115;RBI=0.0317587;REFB=-0.0249352;REVB=0.0295217;RO=70;SAF=29;SAR=53;SRF=17;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105865;STB=0.559993;TYPE=snp;VARB=0.0334975;OID=.;OPOS=207646322;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:153:70:71:82:82:53:29:17:53:53:29:17:54 chr1 207646462 . G A 315.64 PASS AO=66;DP=125;FAO=68;FDP=128;FR=.;FRO=60;FSAF=32;FSAR=36;FSRF=26;FSRR=34;FWDB=0.00932078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.4098;QD=9.86376;RBI=0.0238512;REFB=0.0122468;REVB=0.0219545;RO=59;SAF=32;SAR=34;SRF=26;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0380538;STB=0.517555;TYPE=snp;VARB=-0.0116769;OID=.;OPOS=207646462;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:128:59:60:66:68:34:32:26:33:36:32:26:34 chr1 207646898 . T C 356.35 PASS AO=77;DP=147;FAO=78;FDP=148;FR=.;FRO=70;FSAF=51;FSAR=27;FSRF=42;FSRR=28;FWDB=-0.00502678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.415;QD=9.63115;RBI=0.00951198;REFB=-0.00575428;REVB=-0.00807523;RO=70;SAF=51;SAR=26;SRF=42;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0591099;STB=0.527645;TYPE=snp;VARB=0.00474146;OID=.;OPOS=207646898;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:148:70:70:77:78:26:51:42:28:27:51:42:28 chr1 207646923 . G A 495.43 PASS AO=101;DP=182;FAO=102;FDP=183;FR=.;FRO=81;FSAF=66;FSAR=36;FSRF=47;FSRR=34;FWDB=-0.0396565;FXX=0.0317444;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.8276;QD=10.829;RBI=0.0462958;REFB=-0.0286012;REVB=0.0238885;RO=76;SAF=66;SAR=35;SRF=45;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0524808;STB=0.531762;TYPE=snp;VARB=0.0246539;OID=.;OPOS=207646923;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:183:76:81:101:102:35:66:45:31:36:66:47:34 chr1 207653395 . C A 1461.71 PASS AO=152;DP=152;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0281309;FXX=0.0129024;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.861;QD=38.2146;RBI=0.0306253;REFB=0;REVB=0.0121064;RO=0;SAF=71;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.66707e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.01757e-05;OID=.;OPOS=207653395;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:152:153:0:0:152:153:81:71:0:0:83:70:0:0 chr1 207782916 . A T 1707.96 PASS AO=151;DP=160;FAO=185;FDP=185;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0564485;FXX=0.00537606;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.3237;QD=36.9289;RBI=0.0650918;REFB=0;REVB=0.0324116;RO=0;SAF=65;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.77232e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00240563;OID=.;OPOS=207782916;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:82:160:185:0:0:151:185:86:65:0:0:107:78:0:0 chr1 207888626 . C T 3441.05 PASS AO=375;DP=385;FAO=377;FDP=385;FR=.;FRO=8;FSAF=208;FSAR=169;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.0575239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.0258;QD=35.7512;RBI=0.0658421;REFB=0.0186422;REVB=-0.032034;RO=9;SAF=208;SAR=167;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.015012;STB=0.506329;TYPE=snp;VARB=-0.000852813;OID=.;OPOS=207888626;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:385:385:9:8:375:377:167:208:2:7:169:208:2:6 chr1 207888704 . T C 3760.16 PASS AO=459;DP=463;FAO=396;FDP=396;FR=.;FRO=0;FSAF=163;FSAR=233;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0436621;FXX=0.00999975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.7815;QD=37.9814;RBI=0.0436678;REFB=0.000637399;REVB=-0.00070079;RO=4;SAF=190;SAR=269;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0070449;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.06486e-06;OID=.;OPOS=207888704;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:463:396:4:0:459:396:269:190:0:4:233:163:0:0 chr1 207890866 . T C 3374.5 PASS AO=340;DP=353;FAO=371;FDP=379;FR=.;FRO=8;FSAF=157;FSAR=214;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.0359701;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.867;QD=35.6148;RBI=0.0371457;REFB=0.00148111;REVB=0.00927094;RO=11;SAF=142;SAR=198;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.013396;STB=0.504357;TYPE=snp;VARB=-0.000135394;OID=.;OPOS=207890866;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:353:379:11:8:340:371:198:142:7:4:214:157:5:3 chr1 207941191 . G T 204.14 PASS AO=67;DP=204;FAO=74;FDP=211;FR=.;FRO=137;FSAF=19;FSAR=55;FSRF=51;FSRR=86;FWDB=-0.00717287;FXX=0.014018;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.33;QD=3.86995;RBI=0.0108099;REFB=-0.012519;REVB=0.00808725;RO=130;SAF=18;SAR=49;SRF=49;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145363;STB=0.589651;TYPE=snp;VARB=0.0281609;OID=.;OPOS=207941191;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:211:130:137:67:74:49:18:49:81:55:19:51:86 chr1 208063067 . G A 84.8 PASS AO=19;DP=42;FAO=20;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.0537765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.4241;QD=8.07651;RBI=0.0550681;REFB=0.00728793;REVB=-0.011857;RO=23;SAF=11;SAR=8;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0294338;STB=0.504946;TYPE=snp;VARB=-0.010691;OID=.;OPOS=208063067;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:42:42:23:22:19:20:8:11:14:9:8:12:13:9 chr1 208202237 . G A 199.95 PASS AO=59;DP=152;FAO=61;FDP=154;FR=.;FRO=93;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=31;FSRR=62;FWDB=-0.00801317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.25;QD=5.19339;RBI=0.00977272;REFB=-0.00536092;REVB=0.00559421;RO=91;SAF=29;SAR=30;SRF=29;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18743;STB=0.60523;TYPE=snp;VARB=0.0113233;OID=.;OPOS=208202237;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:154:91:93:59:61:30:29:29:62:30:31:31:62 chr1 208315786 . TG T 71.8 PASS AO=44;DP=148;FAO=61;FDP=129;FR=.;FRO=68;FSAF=8;FSAR=53;FSRF=13;FSRR=55;FWDB=-0.00556535;FXX=0.015266;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.62754;QD=2.22647;RBI=0.163244;REFB=-0.0331329;REVB=0.163149;RO=60;SAF=7;SAR=37;SRF=10;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0143312;STB=0.562952;TYPE=del;VARB=0.0876092;OID=.;OPOS=208315787;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:44:130:61:129:68:8:53:13:55:71:60:7:37:10:50 chr1 208390155 . C T 85.79 PASS AO=25;DP=69;FAO=26;FDP=70;FR=.;FRO=44;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=36;FWDB=0.00495773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.711;QD=4.90225;RBI=0.00836841;REFB=-0.0113531;REVB=-0.00674176;RO=42;SAF=10;SAR=15;SRF=8;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.255408;STB=0.643469;TYPE=snp;VARB=0.0205965;OID=.;OPOS=208390155;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:69:70:42:44:25:26:15:10:8:34:16:10:8:36 chr1 208390162 . T C 88.69 PASS AO=21;DP=69;FAO=28;FDP=76;FR=.;FRO=48;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=36;FWDB=0.0277619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.133;QD=4.66815;RBI=0.0286259;REFB=-0.0284232;REVB=0.00697983;RO=46;SAF=6;SAR=15;SRF=12;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0360703;STB=0.576872;TYPE=snp;VARB=0.0416263;OID=.;OPOS=208390162;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:69:76:46:48:21:28:15:6:12:34:18:10:12:36 chr1 208390469 . C T 190.93 PASS AO=35;DP=58;FAO=35;FDP=58;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.0403593;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0603;QD=13.1675;RBI=0.0814905;REFB=-0.0185705;REVB=-0.0707943;RO=23;SAF=13;SAR=22;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143564;STB=0.578902;TYPE=snp;VARB=0.0112436;OID=.;OPOS=208390469;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:58:58:23:23:35:35:22:13:13:10:22:13:13:10 chr1 209605636 . TAGCAGCAGCAGC T 34.8 PASS AO=2;DP=8;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0490807;FXX=0.142653;HRUN=1;LEN=12;MLLD=327.891;QD=23.1987;RBI=0.0755038;REFB=-0.0992806;REVB=0.0573751;RO=0;SAF=1;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.555346;TYPE=del;VARB=0.0247518;OID=.;OPOS=209605637;OREF=AGCAGCAGCAGC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:2:4:5:6:1:1:4:0:1:7:0:1:1:0:0 chr1 209782343 . A G 1787.13 PASS AO=188;DP=191;FAO=189;FDP=189;FR=.;FRO=0;FSAF=124;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0357561;FXX=0.0207243;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.208;QD=37.8228;RBI=0.0360245;REFB=0;REVB=-0.00438962;RO=1;SAF=123;SAR=65;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00385587;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000376672;OID=.;OPOS=209782343;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:191:189:1:0:188:189:65:123:1:0:65:124:0:0 chr1 209788703 . T C 69.41 PASS AO=21;DP=57;FAO=21;FDP=57;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=12;FWDB=-0.0488119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.813;QD=4.87063;RBI=0.0756632;REFB=-0.00645521;REVB=-0.0578129;RO=36;SAF=11;SAR=10;SRF=24;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157978;STB=0.591133;TYPE=snp;VARB=0.00964821;OID=.;OPOS=209788703;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:57:57:36:36:21:21:10:11:24:12:10:11:24:12 chr1 209795909 . T C 87.86 PASS AO=28;DP=77;FAO=28;FDP=77;FR=.;FRO=49;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=37;FSRR=12;FWDB=-0.00266105;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.734;QD=4.56419;RBI=0.0258448;REFB=-0.0334336;REVB=0.0257075;RO=47;SAF=11;SAR=17;SRF=36;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.39125;STB=0.718803;TYPE=snp;VARB=0.0374791;OID=.;OPOS=209795909;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:77:77:47:49:28:28:17:11:36:11:17:11:37:12 chr1 209796329 . T A 68.07 PASS AO=19;DP=49;FAO=19;FDP=49;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.0646652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.27;QD=5.55672;RBI=0.0649616;REFB=-0.00343531;REVB=0.00619892;RO=30;SAF=6;SAR=13;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237857;STB=0.638243;TYPE=snp;VARB=0.00503841;OID=.;OPOS=209796329;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:49:49:30:30:19:19:13:6:16:14:13:6:16:14 chr1 209799253 . A G 53.45 PASS AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.00978071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.191;QD=11.2517;RBI=0.07399;REFB=0.00409373;REVB=-0.0733407;RO=9;SAF=4;SAR=6;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215579;STB=0.624753;TYPE=snp;VARB=-0.00622518;OID=.;OPOS=209799253;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:19:19:9:9:10:10:6:4:6:3:6:4:6:3 chr1 209811886 . T A 247.43 PASS AO=30;DP=39;FAO=34;FDP=38;FR=.;FRO=4;FSAF=34;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.175318;FXX=0.0952154;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0733;QD=26.0449;RBI=0.175318;REFB=-0.382898;REVB=0;RO=8;SAF=30;SAR=0;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0543906;OID=.;OPOS=209811886;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:39:38:8:4:30:34:0:30:8:0:0:34:4:0 chr1 209823354 . G A 192.74 PASS AO=40;DP=75;FAO=41;FDP=75;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=29;FSRF=6;FSRR=28;FWDB=0.0230696;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.8694;QD=10.2794;RBI=0.0610763;REFB=-0.018463;REVB=-0.0565518;RO=35;SAF=12;SAR=28;SRF=6;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138106;STB=0.567134;TYPE=snp;VARB=0.0173476;OID=.;OPOS=209823354;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:35:34:40:41:28:12:6:29:29:12:6:28 chr1 209849399 . AG A 158.16 PASS AO=16;DP=19;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0539411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.436;QD=37.2147;RBI=0.143909;REFB=0;REVB=0.133417;RO=1;SAF=16;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00080114;OID=.;OPOS=209849400;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:16:18:17:17:0:16:1:0:0:8:1:16:0:1:0 chr1 209849406 . T G 162.05 PASS AO=16;DP=16;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00838732;FXX=0.0555247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.242;QD=38.1292;RBI=0.169449;REFB=0;REVB=0.169242;RO=0;SAF=16;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00381365;OID=.;OPOS=209849406;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:16:17:0:0:16:17:0:16:0:0:1:16:0:0 chr1 209936914 . C T 314.89 PASS AO=68;DP=143;FAO=72;FDP=139;FR=.,HEALED;FRO=67;FSAF=29;FSAR=43;FSRF=32;FSRR=35;FWDB=-0.0455824;FXX=0.0279701;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.1394;QD=9.06167;RBI=0.0861437;REFB=-0.0311591;REVB=-0.0730957;RO=36;SAF=27;SAR=41;SRF=4;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200972;STB=0.53694;TYPE=snp;VARB=0.0252669;OID=.;OPOS=209936914;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:36:67:68:72:41:27:4:32:43:29:32:35 chr1 209948711 . A C 357.88 PASS AO=41;DP=44;FAO=41;FDP=43;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00856311;FXX=0.0227221;HRUN=2;LEN=1;MLLD=274.665;QD=33.2913;RBI=0.0104249;REFB=-0.00831414;REVB=-0.00594571;RO=2;SAF=22;SAR=19;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00320586;STB=0.50171;TYPE=snp;VARB=0.000846891;OID=.;OPOS=209948711;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:44:43:2:2:41:41:19:22:1:1:19:22:1:1 chr1 209950760 . C G 3215 PASS AO=331;DP=332;FAO=335;FDP=335;FR=.;FRO=0;FSAF=167;FSAR=168;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.81;QD=38.3881;RBI=0.0411533;REFB=0;REVB=0.0363316;RO=0;SAF=166;SAR=165;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.10464e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.86563e-05;OID=.;OPOS=209950760;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:332:335:0:0:331:335:165:166:0:0:168:167:0:0 chr1 209956542 . C A 1052.53 PASS AO=108;DP=108;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.56;QD=37.9289;RBI=0.0126832;REFB=0;REVB=0.00745022;RO=0;SAF=38;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.50696e-05;OID=.;OPOS=209956542;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:108:111:0:0:108:111:70:38:0:0:72:39:0:0 chr1 209968684 . C A 1345.99 PASS AO=141;DP=141;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=100;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0256898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.889;QD=38.184;RBI=0.0649147;REFB=0;REVB=0.059615;RO=0;SAF=100;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.13786e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.97573e-05;OID=.;OPOS=209968684;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:141:141:0:0:141:141:41:100:0:0:41:100:0:0 chr1 210003489 . A G 350.64 PASS AO=110;DP=280;FAO=110;FDP=279;FR=.;FRO=169;FSAF=46;FSAR=64;FSRF=71;FSRR=98;FWDB=0.00835095;FXX=0.0035713;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.794;QD=5.02713;RBI=0.0110742;REFB=-0.0202984;REVB=0.00727324;RO=168;SAF=46;SAR=64;SRF=70;SRR=98;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00167712;STB=0.501205;TYPE=snp;VARB=0.0310402;OID=.;OPOS=210003489;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:280:279:168:169:110:110:64:46:70:98:64:46:71:98 chr1 210004199 . C G 247.08 PASS AO=63;DP=139;FAO=63;FDP=138;FR=.;FRO=75;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=33;FSRR=42;FWDB=-0.013355;FXX=0.00719373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.047;QD=7.16183;RBI=0.0147949;REFB=-0.000601736;REVB=-0.00636664;RO=71;SAF=36;SAR=27;SRF=32;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115517;STB=0.571406;TYPE=snp;VARB=0.000786258;OID=.;OPOS=210004199;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:138:71:75:63:63:27:36:32:39:27:36:33:42 chr1 210004332 . G A 180.92 PASS AO=55;DP=141;FAO=55;FDP=140;FR=.;FRO=85;FSAF=21;FSAR=34;FSRF=36;FSRR=49;FWDB=0.00295454;FXX=0.0070917;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.596;QD=5.16922;RBI=0.0126628;REFB=-0.020366;REVB=-0.0123133;RO=83;SAF=21;SAR=34;SRF=34;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0311125;STB=0.526478;TYPE=snp;VARB=0.0306455;OID=.;OPOS=210004332;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:140:83:85:55:55:34:21:34:49:34:21:36:49 chr1 210006603 . C T 447.58 PASS AO=98;DP=208;FAO=109;FDP=225;FR=.;FRO=116;FSAF=54;FSAR=55;FSRF=64;FSRR=52;FWDB=0.00601998;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=201.777;QD=7.95695;RBI=0.0122377;REFB=-0.0129282;REVB=0.0106546;RO=103;SAF=54;SAR=44;SRF=58;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0113791;STB=0.529013;TYPE=snp;VARB=0.012679;OID=.;OPOS=210006603;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:225:103:116:98:109:44:54:58:45:55:54:64:52 chr1 210027654 . T C 207.19 PASS AO=63;DP=159;FAO=63;FDP=159;FR=.;FRO=96;FSAF=44;FSAR=19;FSRF=42;FSRR=54;FWDB=0.0266349;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.596;QD=5.21225;RBI=0.0290457;REFB=-0.0107329;REVB=0.011586;RO=93;SAF=44;SAR=19;SRF=41;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.282012;STB=0.662762;TYPE=snp;VARB=0.0230163;OID=.;OPOS=210027654;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:159:93:96:63:63:19:44:41:52:19:44:42:54 chr1 210027669 . TGA T 170.65 PASS AO=33;DP=154;FAO=52;FDP=131;FR=.;FRO=79;FSAF=33;FSAR=19;FSRF=34;FSRR=45;FWDB=-0.00893983;FXX=0.0642811;HRUN=1;LEN=2;MLLD=212.921;QD=5.21053;RBI=0.0148193;REFB=-0.00562406;REVB=-0.0118191;RO=60;SAF=19;SAR=14;SRF=33;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0293444;STB=0.623881;TYPE=del;VARB=0.00913162;OID=.;OPOS=210027670;OREF=GA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:33:131:52:131:79:33:19:34:45:99:60:19:14:33:27 chr1 210336584 . CTAAT C 175.91 PASS AO=46;DP=111;FAO=46;FDP=105;FR=.;FRO=59;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=28;FSRR=31;FWDB=-0.00230157;FXX=0.086949;HRUN=1;LEN=4;MLLD=223.248;QD=6.70139;RBI=0.0054998;REFB=0.00735302;REVB=0.00499506;RO=57;SAF=18;SAR=28;SRF=26;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0661238;STB=0.548064;TYPE=del;VARB=-0.00860379;OID=.;OPOS=210336585;OREF=TAAT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:46:109:46:105:59:18:28:28:31:99:57:18:28:26:31 chr1 210337043 . A G 102.18 PASS AO=31;DP=83;FAO=31;FDP=80;FR=.;FRO=49;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=34;FWDB=0.00511512;FXX=0.0361402;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.797;QD=5.10886;RBI=0.00849462;REFB=-0.00515039;REVB=-0.0067819;RO=49;SAF=11;SAR=20;SRF=15;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0582677;STB=0.533193;TYPE=snp;VARB=0.00805012;OID=.;OPOS=210337043;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:80:49:49:31:31:20:11:15:34:20:11:15:34 chr1 210407031 . G T 13.42 PASS AO=3;DP=11;FAO=3;FDP=11;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.0176713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.453;QD=4.88172;RBI=0.0342997;REFB=-0.0162643;REVB=0.0293972;RO=8;SAF=2;SAR=1;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.296653;STB=0.704562;TYPE=snp;VARB=0.0387404;OID=.;OPOS=210407031;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:11:11:8:8:3:3:1:2:3:5:1:2:3:5 chr1 210536278 . C A 292.17 PASS AO=62;DP=112;FAO=61;FDP=112;FR=.;FRO=51;FSAF=24;FSAR=37;FSRF=16;FSRR=35;FWDB=-0.0026399;FXX=0.0175423;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.781;QD=10.4347;RBI=0.0124146;REFB=-0.00650766;REVB=0.0121306;RO=49;SAF=25;SAR=37;SRF=15;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0829866;STB=0.538641;TYPE=snp;VARB=0.00611488;OID=.;OPOS=210536278;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:49:51:62:61:37:25:15:34:37:24:16:35 chr1 210547505 . C G 2312.04 PASS AO=243;DP=245;FAO=243;FDP=243;FR=.;FRO=0;FSAF=128;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00272676;FXX=0.00816293;HRUN=4;LEN=1;MLLD=232.595;QD=38.0583;RBI=0.0123375;REFB=0.0177722;REVB=0.0120324;RO=0;SAF=128;SAR=115;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.7346e-06;OID=.;OPOS=210547505;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:245:243:0:0:243:243:115:128:0:0:115:128:0:0 chr1 210547610 . GT G 530.06 PASS AO=115;DP=238;FAO=119;FDP=227;FR=.;FRO=108;FSAF=50;FSAR=69;FSRF=48;FSRR=60;FWDB=-0.0400695;FXX=0.0130429;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.305;QD=9.34024;RBI=0.0404803;REFB=-0.00391513;REVB=0.00575261;RO=105;SAF=48;SAR=67;SRF=44;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00148519;STB=0.511805;TYPE=del;VARB=0.00322982;OID=.;OPOS=210547611;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:115:231:119:227:108:50:69:48:60:99:105:48:67:44:61 chr1 210577831 . C T 260.48 PASS AO=64;DP=135;FAO=64;FDP=135;FR=.;FRO=71;FSAF=26;FSAR=38;FSRF=13;FSRR=58;FWDB=0.0272372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.677;QD=7.71784;RBI=0.0277376;REFB=0.00219052;REVB=0.00524512;RO=71;SAF=26;SAR=38;SRF=13;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232377;STB=0.627415;TYPE=snp;VARB=-0.00246499;OID=.;OPOS=210577831;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:71:71:64:64:38:26:13:58:38:26:13:58 chr1 210577873 . G C 1543.43 PASS AO=160;DP=160;FAO=160;FDP=160;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.935;QD=38.5857;RBI=0.0270316;REFB=0;REVB=0.0249817;RO=0;SAF=49;SAR=111;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.83896e-05;OID=.;OPOS=210577873;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:160:160:0:0:160:160:111:49:0:0:111:49:0:0 chr1 210577901 . T C 418.07 PASS AO=86;DP=156;FAO=87;FDP=157;FR=.;FRO=70;FSAF=30;FSAR=57;FSRF=18;FSRR=52;FWDB=0.0122553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.1365;QD=10.6516;RBI=0.0122843;REFB=-0.0191047;REVB=0.000842905;RO=70;SAF=30;SAR=56;SRF=18;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0855341;STB=0.544446;TYPE=snp;VARB=0.0196409;OID=.;OPOS=210577901;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:157:70:70:86:87:56:30:18:52:57:30:18:52 chr1 210804430 . G A 350.89 PASS AO=90;DP=195;FAO=90;FDP=195;FR=.;FRO=105;FSAF=48;FSAR=42;FSRF=54;FSRR=51;FWDB=-0.0235716;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.02;QD=7.19768;RBI=0.0293883;REFB=-0.00499867;REVB=0.0175514;RO=105;SAF=48;SAR=42;SRF=54;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0185758;STB=0.510286;TYPE=snp;VARB=0.00666161;OID=.;OPOS=210804430;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:195:105:105:90:90:42:48:54:51:42:48:54:51 chr1 210857026 . GC G 116.62 PASS AO=14;DP=20;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.136848;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=19.5253;QD=24.5507;RBI=0.348576;REFB=0;REVB=-0.32059;RO=2;SAF=13;SAR=1;SRF=1;SRR=1;SSEN=0.302763;SSEP=0;SSSB=0.265818;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.0133353;OID=.;OPOS=210857027;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:14:17:19:19:0:14:5:0:0:10:2:13:1:1:1 chr1 210857457 . A G 174.57 PASS AO=20;DP=22;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0584653;FXX=0.0454339;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.8319;QD=33.2504;RBI=0.0589298;REFB=-0.0760352;REVB=-0.00738428;RO=1;SAF=7;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0341449;STB=0.5185;TYPE=snp;VARB=0.00303699;OID=.;OPOS=210857457;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:21:1:1:20:20:13:7:0:1:13:7:0:1 chr1 211380770 . T C 467.08 PASS AO=119;DP=273;FAO=125;FDP=278;FR=.;FRO=153;FSAF=71;FSAR=54;FSRF=89;FSRR=64;FWDB=-0.0168897;FXX=0.0035841;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.716;QD=6.72058;RBI=0.0169075;REFB=-0.0143431;REVB=0.000775791;RO=153;SAF=68;SAR=51;SRF=89;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106387;STB=0.507697;TYPE=snp;VARB=0.019665;OID=.;OPOS=211380770;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:273:278:153:153:119:125:51:68:89:64:54:71:89:64 chr1 211447625 . G A 462.27 PASS AO=137;DP=340;FAO=141;FDP=345;FR=.;FRO=204;FSAF=53;FSAR=88;FSRF=82;FSRR=122;FWDB=0.00238249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.5051;QD=5.35959;RBI=0.0063066;REFB=0.000777349;REVB=-0.00583926;RO=202;SAF=52;SAR=85;SRF=82;SRR=120;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.029578;STB=0.516295;TYPE=snp;VARB=-0.000738569;OID=.;OPOS=211447625;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:340:345:202:204:137:141:85:52:82:120:88:53:82:122 chr1 211836789 . T C 207.73 PASS AO=43;DP=80;FAO=43;FDP=80;FR=.;FRO=37;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.00194954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.766;QD=10.3865;RBI=0.00332245;REFB=-0.00130137;REVB=0.00269034;RO=37;SAF=19;SAR=24;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149254;STB=0.508231;TYPE=snp;VARB=0.00127023;OID=.;OPOS=211836789;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:37:37:43:43:24:19:17:20:24:19:17:20 chr1 211840498 . T C 241.05 PASS AO=57;DP=117;FAO=57;FDP=117;FR=.;FRO=60;FSAF=25;FSAR=32;FSRF=23;FSRR=37;FWDB=-0.0135076;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.877;QD=8.24098;RBI=0.0156114;REFB=-0.00459405;REVB=0.00782688;RO=60;SAF=25;SAR=32;SRF=23;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0523812;STB=0.528969;TYPE=snp;VARB=0.00543381;OID=.;OPOS=211840498;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:60:60:57:57:32:25:23:37:32:25:23:37 chr1 211846876 . A G 318.07 PASS AO=84;DP=187;FAO=84;FDP=187;FR=.;FRO=103;FSAF=37;FSAR=47;FSRF=45;FSRR=58;FWDB=0.0258127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.5628;QD=6.80363;RBI=0.0260592;REFB=-0.00144375;REVB=-0.00357622;RO=103;SAF=37;SAR=47;SRF=45;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0036059;STB=0.502002;TYPE=snp;VARB=0.00198335;OID=.;OPOS=211846876;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:187:103:103:84:84:47:37:45:58:47:37:45:58 chr1 211922603 . G A 422.82 PASS AO=103;DP=217;FAO=105;FDP=221;FR=.;FRO=116;FSAF=51;FSAR=54;FSRF=41;FSRR=75;FWDB=-0.0112114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.293;QD=7.65282;RBI=0.01715;REFB=-0.00395825;REVB=-0.012978;RO=110;SAF=51;SAR=52;SRF=40;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123665;STB=0.569745;TYPE=snp;VARB=0.0031461;OID=.;OPOS=211922603;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:217:221:110:116:103:105:52:51:40:70:54:51:41:75 chr1 212273639 . C T 876.98 PASS AO=91;DP=92;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0336804;FXX=0.0210504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.432;QD=37.7193;RBI=0.0336981;REFB=0;REVB=-0.00109104;RO=0;SAF=59;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.53094e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.42703e-05;OID=.;OPOS=212273639;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:92:93:0:0:91:93:32:59:0:0:34:59:0:0 chr1 212274413 . A C 651.43 PASS AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00986069;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.196;QD=37.2248;RBI=0.0121061;REFB=-0.0652925;REVB=0.00702317;RO=0;SAF=30;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508194;TYPE=snp;VARB=0.00017083;OID=.;OPOS=212274413;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:70:70:0:1:69:69:39:30:0:0:39:30:1:0 chr1 212526288 . C T 1796.99 PASS AO=194;DP=198;FAO=194;FDP=194;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00370388;FXX=0.020201;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.161;QD=37.0513;RBI=0.0152206;REFB=-0.11617;REVB=-0.014763;RO=3;SAF=84;SAR=110;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00689264;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.62218e-05;OID=.;OPOS=212526288;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:198:194:3:0:194:194:110:84:2:1:110:84:0:0 chr1 212534448 . T C 221.08 PASS AO=59;DP=134;FAO=59;FDP=134;FR=.;FRO=75;FSAF=33;FSAR=26;FSRF=49;FSRR=26;FWDB=0.0370469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.7796;QD=6.59951;RBI=0.0381482;REFB=-0.00914224;REVB=0.00910011;RO=74;SAF=33;SAR=26;SRF=48;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0916235;STB=0.554036;TYPE=snp;VARB=0.0123126;OID=.;OPOS=212534448;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:74:75:59:59:26:33:48:26:26:33:49:26 chr1 212560327 . A G 568.86 PASS AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0667465;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.7583;QD=36.1181;RBI=0.0939415;REFB=0.0503611;REVB=-0.0661054;RO=1;SAF=22;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116587;STB=0.506171;TYPE=snp;VARB=-0.00276753;OID=.;OPOS=212560327;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:63:63:1:1:62:62:40:22:0:1:40:22:0:1 chr1 212619339 . T C 130.44 PASS AO=39;DP=100;FAO=39;FDP=100;FR=.;FRO=61;FSAF=8;FSAR=31;FSRF=21;FSRR=40;FWDB=-0.0269229;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.305;QD=5.21763;RBI=0.0302079;REFB=-0.0100632;REVB=-0.0136994;RO=61;SAF=8;SAR=31;SRF=21;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196136;STB=0.612752;TYPE=snp;VARB=0.0124534;OID=.;OPOS=212619339;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:61:61:39:39:31:8:21:40:31:8:21:40 chr1 212799870 . A G 387.2 PASS AO=77;DP=140;FAO=79;FDP=140;FR=.;FRO=61;FSAF=32;FSAR=47;FSRF=29;FSRR=32;FWDB=0.0084368;FXX=0.0209776;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.7475;QD=11.063;RBI=0.00952342;REFB=0.0233187;REVB=-0.00441769;RO=63;SAF=32;SAR=45;SRF=31;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0640037;STB=0.53141;TYPE=snp;VARB=-0.0142817;OID=.;OPOS=212799870;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:63:61:77:79:45:32:31:32:47:32:29:32 chr1 212799949 . C T 286.44 PASS AO=59;DP=110;FAO=59;FDP=108;FR=.;FRO=49;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=15;FSRR=34;FWDB=0.00129114;FXX=0.0181802;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.884;QD=10.6089;RBI=0.00891175;REFB=-0.0108512;REVB=-0.00881772;RO=46;SAF=34;SAR=25;SRF=15;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198485;STB=0.62082;TYPE=snp;VARB=0.00951959;OID=.;OPOS=212799949;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:108:46:49:59:59:25:34:15:31:25:34:15:34 chr1 212900487 . A G 152.75 PASS AO=33;DP=71;FAO=36;FDP=75;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=0.0200129;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=198.308;QD=8.14669;RBI=0.0201258;REFB=-0.0176142;REVB=0.00212846;RO=38;SAF=18;SAR=15;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0685377;STB=0.519989;TYPE=snp;VARB=0.0173276;OID=.;OPOS=212900487;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:75:38:39:33:36:15:18:18:20:18:18:18:21 chr1 212911836 . T C 581.15 PASS AO=134;DP=263;FAO=134;FDP=263;FR=.;FRO=129;FSAF=82;FSAR=52;FSRF=54;FSRR=75;FWDB=0.004407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.598;QD=8.83871;RBI=0.0197042;REFB=-0.0098672;REVB=0.019205;RO=129;SAF=82;SAR=52;SRF=54;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17439;STB=0.595548;TYPE=snp;VARB=0.010959;OID=.;OPOS=212911836;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:263:263:129:129:134:134:52:82:54:75:52:82:54:75 chr1 213009469 . A G 489.37 PASS AO=90;DP=148;FAO=90;FDP=146;FR=.;FRO=56;FSAF=7;FSAR=83;FSRF=11;FSRR=45;FWDB=-0.0104184;FXX=0.0135126;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.808;QD=13.4075;RBI=0.0105535;REFB=-0.016506;REVB=-0.00168334;RO=56;SAF=7;SAR=83;SRF=11;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227791;STB=0.625072;TYPE=snp;VARB=0.0108305;OID=.;OPOS=213009469;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:146:56:56:90:90:83:7:11:45:83:7:11:45 chr1 213031948 . G C 36.52 PASS AO=5;DP=10;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0219929;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=31.245;QD=13.2807;RBI=0.0248796;REFB=-0.0792342;REVB=-0.0116321;RO=5;SAF=1;SAR=4;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20967;STB=0.651594;TYPE=snp;VARB=0.0545815;OID=.;OPOS=213031948;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:10:11:5:5:5:6:4:1:2:3:5:1:2:3 chr1 213032268 . GC G 164.44 PASS AO=19;DP=35;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166488;FXX=0.0302939;HRUN=4;LEN=1;MLLD=10.4954;QD=20.5548;RBI=0.150374;REFB=0;REVB=0.14945;RO=9;SAF=5;SAR=14;SRF=1;SRR=8;SSEN=0.787709;SSEP=0;SSSB=0.121884;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00981957;OID=.;OPOS=213032269;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:19:32:32:32:0:8:24:0:0:15:9:5:14:1:8 chr1 213180441 . G A 17.03 PASS AO=6;DP=27;FAO=6;FDP=26;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.00861146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.894;QD=2.62053;RBI=0.066264;REFB=0.00642517;REVB=-0.0657021;RO=7;SAF=5;SAR=1;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0392853;STB=0.72495;TYPE=snp;VARB=-0.0308108;OID=.;OPOS=213180441;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:24:26:7:20:6:6:1:5:6:1:1:5:12:8 chr1 214492286 . G A 1366 PASS AO=147;DP=150;FAO=145;FDP=147;FR=.;FRO=2;FSAF=50;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0807803;FXX=0.0199987;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6672;QD=37.1701;RBI=0.0833611;REFB=-0.0736211;REVB=0.020582;RO=2;SAF=52;SAR=95;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00990685;STB=0.505208;TYPE=snp;VARB=0.000590911;OID=.;OPOS=214492286;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:150:147:2:2:147:145:95:52:0:2:95:50:0:2 chr1 214542819 . T C 1321.6 PASS AO=137;DP=139;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0165063;FXX=0.00719373;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.557;QD=38.3073;RBI=0.0207378;REFB=0;REVB=0.0125538;RO=0;SAF=66;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.49328e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.88591e-05;OID=.;OPOS=214542819;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:139:138:0:0:137:138:71:66:0:0:72:66:0:0 chr1 214542891 . G A 832.64 PASS AO=186;DP=357;FAO=186;FDP=354;FR=.;FRO=168;FSAF=89;FSAR=97;FSRF=90;FSRR=78;FWDB=-0.0211857;FXX=0.00840313;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.381;QD=9.4083;RBI=0.0271667;REFB=-0.00412265;REVB=0.0170058;RO=167;SAF=89;SAR=97;SRF=89;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.047211;STB=0.527139;TYPE=snp;VARB=0.00334487;OID=.;OPOS=214542891;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:357:354:167:168:186:186:97:89:89:78:97:89:90:78 chr1 214564340 . T C 916.32 PASS AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00453428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.873;QD=38.18;RBI=0.0170367;REFB=0;REVB=0.0164222;RO=0;SAF=60;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.16217e-05;OID=.;OPOS=214564340;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:96:96:0:0:96:96:36:60:0:0:36:60:0:0 chr1 214571251 . A C 241.56 PASS AO=35;DP=55;FAO=41;FDP=61;FR=.;FRO=20;FSAF=27;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.0740295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.5756;QD=15.8402;RBI=0.08189;REFB=-0.064377;REVB=0.0350085;RO=18;SAF=22;SAR=13;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152639;STB=0.604927;TYPE=snp;VARB=0.0265995;OID=.;OPOS=214571251;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:55:61:18:20:35:41:13:22:7:11:14:27:7:13 chr1 214787130 . G A 110.61 PASS AO=31;DP=76;FAO=31;FDP=76;FR=.;FRO=45;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=30;FSRR=15;FWDB=0.0375567;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.7636;QD=5.82179;RBI=0.0446501;REFB=0.00147593;REVB=-0.024148;RO=43;SAF=21;SAR=10;SRF=28;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0303538;STB=0.507242;TYPE=snp;VARB=-0.00153907;OID=.;OPOS=214787130;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:43:45:31:31:10:21:28:15:10:21:30:15 chr1 214814571 . C T 104 PASS AO=26;DP=59;FAO=26;FDP=59;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=0.00194556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.932;QD=7.05059;RBI=0.0131869;REFB=-0.0154153;REVB=-0.0130426;RO=33;SAF=8;SAR=18;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0292652;STB=0.516603;TYPE=snp;VARB=0.0143102;OID=.;OPOS=214814571;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:33:33:26:26:18:8:11:22:18:8:11:22 chr1 214820099 . A G 43.09 PASS AO=14;DP=43;FAO=14;FDP=43;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=1;FSRF=21;FSRR=8;FWDB=-0.0130962;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=211.802;QD=4.00797;RBI=0.0189714;REFB=-0.00334906;REVB=-0.013726;RO=28;SAF=13;SAR=1;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.446324;STB=0.774316;TYPE=snp;VARB=0.0121525;OID=.;OPOS=214820099;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:43:43:28:29:14:14:1:13:20:8:1:13:21:8 chr1 214826196 . G A 205.29 PASS AO=48;DP=101;FAO=48;FDP=99;FR=.;FRO=51;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=20;FSRR=31;FWDB=-0.0275795;FXX=0.0198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.3126;QD=8.29458;RBI=0.028966;REFB=-0.00289493;REVB=0.0088544;RO=52;SAF=18;SAR=30;SRF=19;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00962405;STB=0.509379;TYPE=snp;VARB=0.00475925;OID=.;OPOS=214826196;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:99:52:51:48:48:30:18:19:33:30:18:20:31 chr1 214830617 . A G 289.68 PASS AO=64;DP=127;FAO=66;FDP=131;FR=.;FRO=65;FSAF=49;FSAR=17;FSRF=42;FSRR=23;FWDB=0.00168758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.337;QD=8.84505;RBI=0.00398486;REFB=3.35694e-05;REVB=0.00360987;RO=63;SAF=47;SAR=17;SRF=40;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107795;STB=0.558864;TYPE=snp;VARB=-1.15898e-05;OID=.;OPOS=214830617;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:131:63:65:64:66:17:47:40:23:17:49:42:23 chr1 214837110 . C G 184.07 PASS AO=41;DP=83;FAO=42;FDP=84;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=31;FSRF=6;FSRR=36;FWDB=0.000153904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.741;QD=8.76535;RBI=0.00817021;REFB=-0.0367919;REVB=-0.00816876;RO=42;SAF=11;SAR=30;SRF=6;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158839;STB=0.583034;TYPE=snp;VARB=0.0211081;OID=.;OPOS=214837110;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:84:42:42:41:42:30:11:6:36:31:11:6:36 chr1 215741053 . T G 16.08 PASS AO=3;DP=6;FAO=3;FDP=6;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0237777;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.233;QD=10.7188;RBI=0.0788926;REFB=-0.122137;REVB=0.0752241;RO=3;SAF=2;SAR=1;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.352427;STB=0.713247;TYPE=snp;VARB=0.0204951;OID=.;OPOS=215741053;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:6:6:3:3:3:3:1:2:3:0:1:2:3:0 chr1 215793834 . G A 322.5 PASS AO=79;DP=164;FAO=78;FDP=162;FR=.;FRO=84;FSAF=46;FSAR=32;FSRF=32;FSRR=52;FWDB=-0.00836591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.18;QD=7.96291;RBI=0.0330851;REFB=-0.0147494;REVB=0.0320099;RO=85;SAF=47;SAR=32;SRF=33;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193156;STB=0.60752;TYPE=snp;VARB=0.0131637;OID=.;OPOS=215793834;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:162:85:84:79:78:32:47:33:52:32:46:32:52 chr1 215848587 . T C 429.19 PASS AO=86;DP=151;FAO=86;FDP=151;FR=.;FRO=65;FSAF=44;FSAR=42;FSRF=32;FSRR=33;FWDB=0.022606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.803;QD=11.3691;RBI=0.0248349;REFB=0.00728696;REVB=-0.010283;RO=65;SAF=43;SAR=43;SRF=32;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00607961;STB=0.508316;TYPE=snp;VARB=-0.00587495;OID=.;OPOS=215848587;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:151:65:65:86:86:43:43:32:33:42:44:32:33 chr1 215848641 . T C 1571.24 PASS AO=169;DP=172;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00593072;FXX=0.0175428;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.7087;QD=37.4105;RBI=0.00624987;REFB=-0.0125864;REVB=0.00197165;RO=2;SAF=88;SAR=81;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106927;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000174818;OID=.;OPOS=215848641;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:172:168:2:0:169:168:81:88:2:0:80:88:0:0 chr1 215914826 . T C 146.03 PASS AO=51;DP=146;FAO=51;FDP=144;FR=.;FRO=93;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=43;FSRR=50;FWDB=0.0134622;FXX=0.0136977;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.1122;QD=4.05636;RBI=0.0136008;REFB=-0.0206488;REVB=-0.00193667;RO=93;SAF=30;SAR=21;SRF=43;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142382;STB=0.581459;TYPE=snp;VARB=0.0229872;OID=.;OPOS=215914826;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:144:93:93:51:51:21:30:43:50:21:30:43:50 chr1 215916563 . G A 161.23 PASS AO=48;DP=123;FAO=50;FDP=126;FR=.;FRO=76;FSAF=31;FSAR=19;FSRF=49;FSRR=27;FWDB=-0.00140323;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.906;QD=5.11836;RBI=0.0120577;REFB=-0.0249623;REVB=0.0119758;RO=73;SAF=28;SAR=20;SRF=47;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0673429;STB=0.515948;TYPE=snp;VARB=0.0529698;OID=.;OPOS=215916563;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:126:73:76:48:50:20:28:47:26:19:31:49:27 chr1 215960167 . T G 373.2 PASS AO=108;DP=256;FAO=108;FDP=257;FR=.;FRO=149;FSAF=22;FSAR=86;FSRF=75;FSRR=74;FWDB=-0.00126855;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.394;QD=5.80854;RBI=0.00413808;REFB=-0.00674525;REVB=0.00393885;RO=148;SAF=22;SAR=86;SRF=74;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.356873;STB=0.703213;TYPE=snp;VARB=0.00663048;OID=.;OPOS=215960167;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:256:257:148:149:108:108:86:22:74:74:86:22:75:74 chr1 216172380 . A G 247.51 PASS AO=58;DP=124;FAO=58;FDP=118;FR=.;FRO=60;FSAF=19;FSAR=39;FSRF=23;FSRR=37;FWDB=0.000361532;FXX=0.0483832;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.623;QD=8.39013;RBI=0.0182843;REFB=-0.0115962;REVB=-0.0182807;RO=45;SAF=19;SAR=39;SRF=18;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0639051;STB=0.531462;TYPE=snp;VARB=0.0107256;OID=.;OPOS=216172380;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:118:45:60:58:58:39:19:18:27:39:19:23:37 chr1 216219781 . A G 3091.05 PASS AO=324;DP=326;FAO=325;FDP=325;FR=.;FRO=0;FSAF=190;FSAR=135;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0123789;FXX=0.00306739;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1239;QD=38.0437;RBI=0.0796699;REFB=-0.0362345;REVB=0.0787024;RO=1;SAF=190;SAR=134;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00250419;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00064634;OID=.;OPOS=216219781;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:326:325:1:0:324:325:134:190:1:0:135:190:0:0 chr1 216348764 . C T 2567.63 PASS AO=293;DP=295;FAO=285;FDP=295;FR=.;FRO=10;FSAF=112;FSAR=173;FSRF=9;FSRR=1;FWDB=-0.0254735;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.9126;QD=34.8154;RBI=0.0534318;REFB=0.0513162;REVB=-0.0469687;RO=1;SAF=120;SAR=173;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00274885;STB=0.517873;TYPE=snp;VARB=-0.0141773;OID=.;OPOS=216348764;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:295:295:1:10:293:285:173:120:0:1:173:112:9:1 chr1 216592003 . T C 338.22 PASS AO=74;DP=169;FAO=86;FDP=180;FR=.;FRO=94;FSAF=30;FSAR=56;FSRF=38;FSRR=56;FWDB=0.0177825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.707;QD=7.51594;RBI=0.01883;REFB=-0.00687683;REVB=0.00619297;RO=93;SAF=19;SAR=55;SRF=38;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178438;STB=0.531243;TYPE=snp;VARB=0.00663945;OID=.;OPOS=216592003;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:180:93:94:74:86:55:19:38:55:56:30:38:56 chr1 216595306 . C T 355.55 PASS AO=92;DP=202;FAO=92;FDP=201;FR=.;FRO=109;FSAF=53;FSAR=39;FSRF=69;FSRR=40;FWDB=0.0159079;FXX=0.00985173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.896;QD=7.07559;RBI=0.0345686;REFB=0.00276263;REVB=-0.0306909;RO=109;SAF=53;SAR=39;SRF=69;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0576783;STB=0.53191;TYPE=snp;VARB=-0.0036626;OID=.;OPOS=216595306;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:201:109:109:92:92:39:53:69:40:39:53:69:40 chr1 216692669 . C T 1892.21 PASS AO=201;DP=206;FAO=201;FDP=201;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.029644;FXX=0.0242707;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.439;QD=37.6559;RBI=0.0306445;REFB=-0.0207078;REVB=-0.00776657;RO=2;SAF=82;SAR=119;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00793728;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.4409e-05;OID=.;OPOS=216692669;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:206:201:2:0:201:201:119:82:0:2:119:82:0:0 chr1 217480756 . G A 2079.47 PASS AO=217;DP=217;FAO=219;FDP=219;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=149;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0289898;FXX=0.00904936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.448;QD=37.9812;RBI=0.0339583;REFB=-0.0443052;REVB=0.0176849;RO=0;SAF=70;SAR=147;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000151497;OID=.;OPOS=217480756;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:217:219:0:0:217:219:147:70:0:0:149:70:0:0 chr1 217604654 . T C 310.67 PASS AO=64;DP=119;FAO=65;FDP=120;FR=.;FRO=55;FSAF=1;FSAR=64;FSRF=5;FSRR=50;FWDB=-0.0154624;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.9618;QD=10.3558;RBI=0.0154665;REFB=-0.0106672;REVB=-0.000353829;RO=55;SAF=1;SAR=63;SRF=5;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.471603;STB=0.77096;TYPE=snp;VARB=0.0135156;OID=.;OPOS=217604654;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:120:55:55:64:65:63:1:5:50:64:1:5:50 chr1 217947738 . G A 2176.38 PASS AO=223;DP=224;FAO=227;FDP=227;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=123;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0202049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.855;QD=38.3502;RBI=0.0263238;REFB=0;REVB=0.0168732;RO=0;SAF=102;SAR=121;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.1499e-05;OID=.;OPOS=217947738;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:224:227:0:0:223:227:121:102:0:0:123:104:0:0 chr1 218614825 . AT A,AA 216.21 PASS AO=33,28;DP=214;FAO=78,26;FDP=217;FR=.;FRO=113;FSAF=22,4;FSAR=56,22;FSRF=40;FSRR=73;FWDB=0.083443,0.138859;FXX=0.0482435;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=10.5408,13.5907;QD=3.98551;RBI=0.139789,0.138863;REFB=-0.0881937,-0.0924502;REVB=-0.112153,-0.0010957;RO=80;SAF=5,3;SAR=28,25;SRF=30;SRR=50;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.355961,-0.457229;STB=0.550224,0.717906;TYPE=del,snp;VARB=0.0922243,-0.0479358;OID=.,.;OPOS=218614826,218614826;OREF=T,T;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:33,28:183:78,26:217:113:22,4:56,22:40:73:99:80:5,3:28,25:30:50 chr1 219383867 . T C 341.57 PASS AO=44;DP=53;FAO=45;FDP=53;FR=.;FRO=8;FSAF=31;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.00515349;FXX=0.0185151;HRUN=5;LEN=1;MLLD=205.078;QD=25.779;RBI=0.011234;REFB=-0.173756;REVB=-0.00998224;RO=9;SAF=31;SAR=13;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169191;STB=0.572979;TYPE=snp;VARB=0.00136965;OID=.;OPOS=219383867;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:53:53:9:8:44:45:13:31:2:7:14:31:2:6 chr1 219383905 . A G 664.5 PASS AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.008021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.566;QD=38.5219;RBI=0.0119472;REFB=0;REVB=0.00885428;RO=0;SAF=32;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.61907e-05;OID=.;OPOS=219383905;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:69:69:0:0:69:69:37:32:0:0:37:32:0:0 chr1 220136115 . A G 2027.7 PASS AO=211;DP=215;FAO=214;FDP=214;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.035087;FXX=0.00925883;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9131;QD=37.9009;RBI=0.0710074;REFB=0;REVB=0.0617329;RO=0;SAF=104;SAR=107;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.80599e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000429987;OID=.;OPOS=220136115;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:215:214:0:0:211:214:107:104:0:0:110:104:0:0 chr1 220197625 . G T 1803.12 PASS AO=187;DP=188;FAO=191;FDP=191;FR=.;FRO=0;FSAF=110;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0325075;FXX=0.0103622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8589;QD=37.7616;RBI=0.104266;REFB=-0.0261735;REVB=0.0990685;RO=0;SAF=111;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.01365e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000194653;OID=.;OPOS=220197625;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:188:191:0:0:187:191:76:111:0:0:81:110:0:0 chr1 220239448 . T C 1242.9 PASS AO=143;DP=152;FAO=143;FDP=152;FR=.;FRO=9;FSAF=33;FSAR=110;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0282048;FXX=0.0193536;HRUN=5;LEN=1;MLLD=178.554;QD=32.7079;RBI=0.0317631;REFB=-0.115766;REVB=-0.0146077;RO=9;SAF=33;SAR=110;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0331423;STB=0.51748;TYPE=snp;VARB=0.000888641;OID=.;OPOS=220239448;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:152:152:9:9:143:143:110:33:4:5:110:33:4:5 chr1 220578893 . AACACACACACACACACACACACACACAC AACACACACACACACACACACACACAC,AACACACACACACACACACACACACA,AACAACACACACACACACACACACACAC 349.51 PASS AO=11,4,5;DP=64;FAO=38,0,0;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=24,0,0;FSAR=14,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000103568,-0.0165512,-0.000263627;FXX=0.224444;HRUN=1,1,1;LEN=2,3,1;MLLD=113.592,100.404,98.22;QD=36.7903;RBI=0.0152401,0.0233487,0.0381719;REFB=0,0,0;REVB=-0.0152398,-0.0164688,-0.038171;RO=0;SAF=4,4,0;SAR=7,0,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=del,del,del;VARB=0.00101444,0,0;OID=.,.,.;OPOS=220578894,220578919,220578897;OREF=AC,CAC,C;OALT=-,-,-;OMAPALT=AACACACACACACACACACACACACAC,AACACACACACACACACACACACACA,AACAACACACACACACACACACACACAC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:11,4,5:26:38,0,0:38:0:24,0,0:14,0,0:0:0:17:0:4,4,0:7,0,5:0:0 chr1 220603310 . TGTGA T,TGTGT 65.46 PASS AO=3,7;DP=18;FAO=8,0;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=8,0;FSAR=0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0450032,0.00778009;FXX=0.27248;HRUN=1,1;LEN=4,1;MLLD=46.0466,77.5902;QD=32.7297;RBI=0.0450032,0.00778009;REFB=0,0;REVB=0,0;RO=4;SAF=3,2;SAR=0,5;SRF=3;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.642277,-0.298189;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0574006,0;OID=.,.;OPOS=220603311,220603314;OREF=GTGA,A;OALT=-,T;OMAPALT=T,TGTGT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:3,7:18:8,0:8:0:8,0:0,0:0:0:3:4:3,2:0,5:3:1 chr1 220789355 . ATTTTTTT ATTTTTAA 1606.74 PASS AO=38;DP=239;FAO=192;FDP=192;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=61;FSAR=131;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.225345;FXX=0.0447739;HRUN=7;LEN=2;MLLD=25.3413;QD=33.4739;RBI=0.260911;REFB=-0.143961;REVB=0.131508;RO=1;SAF=9;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0158876;STB=0.5;TYPE=mnp;VARB=-0.000985575;OID=.;OPOS=220789361;OREF=TT;OALT=AA;OMAPALT=ATTTTTAA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:38:95:192:192:0:61:131:0:0:65:1:9:29:0:1 chr1 220935081 . G A 181.57 PASS AO=47;DP=105;FAO=47;FDP=105;FR=.;FRO=58;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=30;FSRR=28;FWDB=-0.0241337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.895;QD=6.91688;RBI=0.025783;REFB=-0.00402433;REVB=-0.00907372;RO=57;SAF=26;SAR=21;SRF=30;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0265648;STB=0.519991;TYPE=snp;VARB=0.00434562;OID=.;OPOS=220935081;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:57:58:47:47:21:26:30:27:21:26:30:28 chr1 220935113 . AG A 356.54 PASS AO=51;DP=93;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.218833;FXX=0.0114929;HRUN=3;LEN=1;MLLD=8.38831;QD=16.5835;RBI=0.229098;REFB=-0.017298;REVB=0.0678082;RO=19;SAF=28;SAR=23;SRF=12;SRR=7;SSEN=0.239362;SSEP=0;SSSB=-0.0421783;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0221326;OID=.;OPOS=220935114;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:51:82:86:86:0:44:42:0:0:28:19:28:23:12:7 chr1 220970028 . A G 232.43 PASS AO=36;DP=50;FAO=36;FDP=50;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=33;FSRF=2;FSRR=12;FWDB=0.0135198;FXX=0.0384541;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.8923;QD=18.5941;RBI=0.0137443;REFB=-0.0200868;REVB=-0.00247409;RO=14;SAF=3;SAR=33;SRF=2;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.091566;STB=0.54997;TYPE=snp;VARB=0.00669077;OID=.;OPOS=220970028;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:50:50:14:14:36:36:33:3:2:12:33:3:2:12 chr1 221058267 . T C 87.41 PASS AO=32;DP=93;FAO=31;FDP=92;FR=.;FRO=61;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=35;FWDB=0.00423093;FXX=0.0107515;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.4786;QD=3.80054;RBI=0.00455044;REFB=0.0153049;REVB=-0.00167503;RO=61;SAF=12;SAR=20;SRF=26;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0607373;STB=0.550153;TYPE=snp;VARB=-0.035803;OID=.;OPOS=221058267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:93:92:61:61:32:31:20:12:26:35:20:11:26:35 chr1 221879569 . C T 262.69 PASS AO=76;DP=186;FAO=77;FDP=187;FR=.;FRO=110;FSAF=30;FSAR=47;FSRF=41;FSRR=69;FWDB=0.012411;FXX=0.00531887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.804;QD=5.61909;RBI=0.015077;REFB=-0.01433;REVB=-0.00856051;RO=109;SAF=30;SAR=46;SRF=41;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0205513;STB=0.510486;TYPE=snp;VARB=0.0229619;OID=.;OPOS=221879569;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:187:109:110:76:77:46:30:41:68:47:30:41:69 chr1 221912361 . T C 323.46 PASS AO=69;DP=128;FAO=69;FDP=129;FR=.;FRO=60;FSAF=36;FSAR=33;FSRF=38;FSRR=22;FWDB=0.00943861;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.569;QD=10.0298;RBI=0.00943887;REFB=0.0100328;REVB=-7.04296e-05;RO=59;SAF=36;SAR=33;SRF=37;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0892797;STB=0.552224;TYPE=snp;VARB=-0.00510181;OID=.;OPOS=221912361;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:129:59:60:69:69:33:36:37:22:33:36:38:22 chr1 221912808 . T C 203.59 PASS AO=53;DP=119;FAO=53;FDP=119;FR=.;FRO=66;FSAF=17;FSAR=36;FSRF=27;FSRR=39;FWDB=0.00208999;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=276.058;QD=6.84326;RBI=0.0241356;REFB=-0.0094599;REVB=-0.024045;RO=66;SAF=17;SAR=36;SRF=27;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0964375;STB=0.554019;TYPE=snp;VARB=0.0105085;OID=.;OPOS=221912808;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:66:66:53:53:36:17:27:39:36:17:27:39 chr1 222522870 . GC G 625.66 PASS AO=78;DP=105;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0712223;FXX=0.0297;HRUN=3;LEN=1;MLLD=17.6867;QD=25.5369;RBI=0.214831;REFB=0;REVB=0.202681;RO=15;SAF=14;SAR=64;SRF=7;SRR=8;SSEN=0.303743;SSEP=0;SSSB=-0.133555;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0106272;OID=.;OPOS=222522871;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:78:100:98:98:0:25:73:0:0:52:15:14:64:7:8 chr1 222649341 . A C 319.41 PASS AO=24;DP=32;FAO=34;FDP=34;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0798396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.1823;QD=37.5776;RBI=0.363092;REFB=0;REVB=0.354205;RO=0;SAF=23;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.66402e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00576483;OID=.;OPOS=222649341;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:32:34:0:0:24:34:1:23:0:0:11:23:0:0 chr1 222649491 . C G 27.96 PASS AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=9;FSRR=0;FWDB=-0.0736215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.5878;QD=7.45559;RBI=0.0736215;REFB=0.0177212;REVB=0;RO=8;SAF=6;SAR=0;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0329377;OID=.;OPOS=222649491;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:15:15:8:9:6:6:0:6:8:0:0:6:9:0 chr1 222713503 . C G 254.34 PASS AO=55;DP=112;FAO=58;FDP=114;FR=.;FRO=56;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=12;FSRR=44;FWDB=0.00246499;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.898;QD=8.92426;RBI=0.0106844;REFB=-0.0327171;REVB=-0.0103961;RO=50;SAF=22;SAR=33;SRF=12;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149619;STB=0.611853;TYPE=snp;VARB=0.0206698;OID=.;OPOS=222713503;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:114:50:56:55:58:33:22:12:38:33:25:12:44 chr1 222713631 . G C 188.89 PASS AO=51;DP=118;FAO=51;FDP=118;FR=.;FRO=67;FSAF=40;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=43;FWDB=-0.0114077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4683;QD=6.40288;RBI=0.016796;REFB=-0.0229391;REVB=-0.0123275;RO=67;SAF=40;SAR=11;SRF=24;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.451353;STB=0.754086;TYPE=snp;VARB=0.0290918;OID=.;OPOS=222713631;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:67:67:51:51:11:40:24:43:11:40:24:43 chr1 222721288 . C T 71.98 PASS AO=12;DP=20;FAO=12;FDP=20;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0100787;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=115.611;QD=14.3969;RBI=0.0201586;REFB=-0.0169187;REVB=0.0174582;RO=8;SAF=6;SAR=6;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0879115;STB=0.549917;TYPE=snp;VARB=0.00579284;OID=.;OPOS=222721288;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:20:20:8:8:12:12:6:6:3:5:6:6:3:5 chr1 222734803 . G C 188.96 PASS AO=59;DP=153;FAO=60;FDP=154;FR=.;FRO=94;FSAF=34;FSAR=26;FSRF=52;FSRR=42;FWDB=0.00279887;FXX=0.0064512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.295;QD=4.90811;RBI=0.00282161;REFB=0.0010479;REVB=-0.000357525;RO=94;SAF=33;SAR=26;SRF=52;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00674446;STB=0.508353;TYPE=snp;VARB=-0.00144253;OID=.;OPOS=222734803;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:154:94:94:59:60:26:33:52:42:26:34:52:42 chr1 222798106 . G A 1527.48 PASS AO=160;DP=162;FAO=160;FDP=160;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00367833;FXX=0.0123449;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.81;QD=38.1871;RBI=0.0280226;REFB=0;REVB=0.0277802;RO=0;SAF=67;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.38707e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.06911e-05;OID=.;OPOS=222798106;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:162:160:0:0:160:160:93:67:0:0:93:67:0:0 chr1 222802006 . A G 1096.69 PASS AO=117;DP=120;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00532174;FXX=0.0249979;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.635;QD=37.4936;RBI=0.0228486;REFB=0.0153055;REVB=0.0222202;RO=2;SAF=28;SAR=89;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011351;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000126354;OID=.;OPOS=222802006;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:120:117:2:0:117:117:89:28:1:1:89:28:0:0 chr1 222802803 . T G 90.94 PASS AO=12;DP=73;FAO=24;FDP=68;FR=.,HEALED;FRO=40;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=0.014482;FXX=0.0555478;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.043;QD=5.34964;RBI=0.0146686;REFB=-0.0159036;REVB=-0.00233244;RO=21;SAF=5;SAR=7;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213959;STB=0.531224;TYPE=snp;VARB=0.0213355;OID=.;OPOS=222802803;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:58:68:21:40:12:24:7:5:13:8:12:12:22:18 chr1 222802926 . C T 96.1 PASS AO=27;DP=77;FAO=29;FDP=75;FR=.;FRO=46;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=28;FSRR=18;FWDB=0.0156529;FXX=0.0259707;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.172;QD=5.12528;RBI=0.0167794;REFB=-0.013409;REVB=0.00604418;RO=45;SAF=10;SAR=17;SRF=27;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24784;STB=0.618102;TYPE=snp;VARB=0.0226853;OID=.;OPOS=222802926;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:77:75:45:46:27:29:17:10:27:18:17:12:28:18 chr1 222823529 . A C 190.18 PASS AO=56;DP=155;FAO=56;FDP=142;FR=.;FRO=86;FSAF=38;FSAR=18;FSRF=47;FSRR=39;FWDB=0.0111461;FXX=0.106912;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2704;QD=5.35722;RBI=0.0505628;REFB=-0.0218832;REVB=0.049319;RO=71;SAF=38;SAR=18;SRF=39;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139469;STB=0.586007;TYPE=snp;VARB=0.0114989;OID=.;OPOS=222823529;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:142:71:86:56:56:18:38:39:32:18:38:47:39 chr1 222825403 . G A 534.62 PASS AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0765028;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.162;QD=38.1872;RBI=0.0814043;REFB=0;REVB=0.0278207;RO=0;SAF=11;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000322987;OID=.;OPOS=222825403;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:57:56:0:0:56:56:45:11:0:0:45:11:0:0 chr1 222833601 . T C 1779.37 PASS AO=184;DP=185;FAO=188;FDP=188;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.025962;FXX=0.00529073;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.8557;QD=37.859;RBI=0.0259622;REFB=-0.0337665;REVB=0.000102626;RO=1;SAF=84;SAR=100;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0056345;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000214611;OID=.;OPOS=222833601;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:185:188:1:0:184:188:100:84:1:0:101:87:0:0 chr1 222838215 . TC T,TT 551.9 PASS AO=16,45;DP=62;FAO=8,52;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=4,26;FSAR=4,26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00216198,-0.000634857;FXX=0.0163908;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=177.406,183.57;QD=36.7936;RBI=0.0471893,0.0503761;REFB=0,0;REVB=0.0471397,0.0503721;RO=1;SAF=10,21;SAR=6,24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0701691,0.0191802;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.00129598,0.0030346;OID=.,.;OPOS=222838216,222838216;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:16,45:62:8,52:60:0:4,26:4,26:0:0:7:1:10,21:6,24:0:1 chr1 222843138 . C T 191.26 PASS AO=41;DP=90;FAO=45;FDP=93;FR=.;FRO=48;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=-0.0060758;FXX=0.0210504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.682;QD=8.22636;RBI=0.0234631;REFB=0.00164813;REVB=0.0226628;RO=48;SAF=16;SAR=25;SRF=20;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0265824;STB=0.544926;TYPE=snp;VARB=-0.00175905;OID=.;OPOS=222843138;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:93:48:48:41:45:25:16:20:28:29:16:21:27 chr1 222886119 . A G 391.45 PASS AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0153528;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.4368;QD=37.2812;RBI=0.0344445;REFB=0;REVB=-0.0308337;RO=0;SAF=15;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.13648e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000482528;OID=.;OPOS=222886119;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:43:42:0:0:42:42:27:15:0:0:27:15:0:0 chr1 222923351 . A G 1643.16 PASS AO=173;DP=176;FAO=176;FDP=179;FR=.;FRO=3;FSAF=61;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.013485;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.1054;QD=36.7186;RBI=0.0602534;REFB=-0.0586818;REVB=0.058725;RO=3;SAF=61;SAR=112;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125774;STB=0.506437;TYPE=snp;VARB=0.00168625;OID=.;OPOS=222923351;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:176:179:3:3:173:176:112:61:0:3:115:61:0:3 chr1 223176858 . GA G 135.05 PASS AO=40;DP=137;FAO=62;FDP=114;FR=.;FRO=52;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=11;FSRR=41;FWDB=-0.208035;FXX=0.179843;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.0642;QD=4.73869;RBI=0.209101;REFB=-0.0285635;REVB=0.0210892;RO=48;SAF=18;SAR=22;SRF=10;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246855;STB=0.625319;TYPE=del;VARB=-0.0339512;OID=.;OPOS=223176859;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:40:119:62:114:52:30:32:11:41:76:48:18:22:10:38 chr1 223178561 . A C 793.69 PASS AO=44;DP=86;FAO=85;FDP=85;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=32;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0484748;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.243;QD=37.3503;RBI=0.0959615;REFB=0;REVB=0.0828179;RO=0;SAF=24;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30465e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00079301;OID=.;OPOS=223178561;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:86:85:0:0:44:85:20:24:0:0:53:32:0:0 chr1 223283910 . A G 1172.66 PASS AO=128;DP=131;FAO=128;FDP=131;FR=.;FRO=3;FSAF=70;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.00751141;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=162.576;QD=35.8063;RBI=0.0123663;REFB=-0.0158511;REVB=0.00982364;RO=3;SAF=70;SAR=58;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239417;STB=0.512603;TYPE=snp;VARB=0.000248221;OID=.;OPOS=223283910;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:131:131:3:3:128:128:58:70:0:3:58:70:0:3 chr1 223284528 . A G 2240.35 PASS AO=234;DP=234;FAO=234;FDP=234;FR=.;FRO=0;FSAF=112;FSAR=122;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.003381;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.555;QD=38.2966;RBI=0.00589278;REFB=0;REVB=-0.00482636;RO=0;SAF=112;SAR=122;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.74509e-06;OID=.;OPOS=223284528;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:234:234:0:0:234:234:122:112:0:0:122:112:0:0 chr1 223567773 . G A 142.89 PASS AO=32;DP=64;FAO=32;FDP=64;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=26;FWDB=0.0243369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.557;QD=8.93086;RBI=0.0244058;REFB=-0.0293705;REVB=-0.00183245;RO=32;SAF=18;SAR=14;SRF=6;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.328941;STB=0.681715;TYPE=snp;VARB=0.0189607;OID=.;OPOS=223567773;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:32:32:32:32:14:18:6:26:14:18:6:26 chr1 223715248 . GT G 919.8 PASS AO=119;DP=138;FAO=128;FDP=130;FR=.;FRO=2;FSAF=48;FSAR=80;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0602198;FXX=0.0225547;HRUN=2;LEN=1;MLLD=22.8564;QD=28.3015;RBI=0.0679344;REFB=-0.0545318;REVB=-0.0314431;RO=1;SAF=42;SAR=77;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111741;STB=0.510202;TYPE=del;VARB=0.0117656;OID=.;OPOS=223715249;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:119:131:128:130:2:48:80:2:0:63:1:42:77:1:0 chr1 223717484 . G A 628.04 PASS AO=65;DP=65;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.036143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.1592;QD=38.0629;RBI=0.0421994;REFB=0;REVB=0.0217823;RO=0;SAF=36;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000569854;OID=.;OPOS=223717484;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:65:66:0:0:65:66:29:36:0:0:30:36:0:0 chr1 223718651 . G A 1608.58 PASS AO=166;DP=168;FAO=167;FDP=167;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0271687;FXX=0.0118336;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.437;QD=38.529;RBI=0.0275429;REFB=0;REVB=0.00452468;RO=0;SAF=53;SAR=113;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.93193e-05;OID=.;OPOS=223718651;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:168:167:0:0:166:167:113:53:0:0:113:54:0:0 chr1 223718670 . G A 1515.21 PASS AO=161;DP=164;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00861723;FXX=0.0181807;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.652;QD=37.4127;RBI=0.0249743;REFB=-0.0261943;REVB=0.0234405;RO=2;SAF=50;SAR=111;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00849596;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000141667;OID=.;OPOS=223718670;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:164:162:2:0:161:162:111:50:0:2:111:51:0:0 chr1 223722780 . G A 1170.84 PASS AO=123;DP=123;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163295;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.321;QD=38.0761;RBI=0.0172076;REFB=0;REVB=0.00542661;RO=0;SAF=64;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.99587e-05;OID=.;OPOS=223722780;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:123:123:0:0:123:123:59:64:0:0:59:64:0:0 chr1 223877789 . T C 1371.33 PASS AO=147;DP=152;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=108;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167537;FXX=0.0392131;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.529;QD=37.3152;RBI=0.0266139;REFB=-0.110787;REVB=0.0206788;RO=0;SAF=39;SAR=108;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000702154;OID=.;OPOS=223877789;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:152:147:0:0:147:147:108:39:0:0:108:39:0:0 chr1 223877829 . A T 52.32 PASS AO=21;DP=55;FAO=18;FDP=53;FR=.;FRO=35;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=24;FWDB=-0.0412581;FXX=0.036357;HRUN=10;LEN=1;MLLD=229.146;QD=3.94871;RBI=0.041361;REFB=0.00224121;REVB=-0.00291557;RO=29;SAF=4;SAR=17;SRF=6;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0263766;STB=0.580015;TYPE=snp;VARB=-0.0057539;OID=.;OPOS=223877829;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:55:53:29:35:21:18:17:4:6:23:14:4:11:24 chr1 223900408 . C G 357.56 PASS AO=37;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.9293;QD=37.6374;RBI=0.0479105;REFB=0;REVB=0.0465685;RO=0;SAF=35;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.50694e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000943637;OID=.;OPOS=223900408;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:38:38:0:0:37:38:2:35:0:0:2:36:0:0 chr1 223905532 . G A 254.96 PASS AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0257254;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=129.624;QD=37.7722;RBI=0.0353718;REFB=0;REVB=0.0242769;RO=0;SAF=23;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00046109;OID=.;OPOS=223905532;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:27:27:0:0:27:27:4:23:0:0:4:23:0:0 chr1 223934720 . G A 1585.09 PASS AO=167;DP=169;FAO=169;FDP=169;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.892;QD=37.5168;RBI=0.0244169;REFB=-0.0239493;REVB=-0.0208696;RO=2;SAF=94;SAR=73;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0100172;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.8111e-05;OID=.;OPOS=223934720;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:169:169:2:0:167:169:73:94:2:0:73:96:0:0 chr1 223951841 . T C 1330.5 PASS AO=138;DP=138;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000727062;FXX=0.00719373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.857;QD=38.5652;RBI=0.0396019;REFB=0;REVB=-0.0395953;RO=0;SAF=69;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000135428;OID=.;OPOS=223951841;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:138:138:0:0:138:138:69:69:0:0:69:69:0:0 chr1 224346959 . G A 525.83 PASS AO=113;DP=282;FAO=126;FDP=262;FR=.,HEALED;FRO=134;FSAF=72;FSAR=54;FSRF=67;FSRR=67;FWDB=-0.00472791;FXX=0.0113203;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.7901;QD=8.02789;RBI=0.00734897;REFB=-0.0248034;REVB=-0.00562621;RO=99;SAF=70;SAR=43;SRF=68;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0622045;STB=0.537175;TYPE=snp;VARB=0.0158127;OID=.;OPOS=224346959;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:260:262:99:134:113:126:43:70:68:31:54:72:67:67 chr1 224377724 . C T 220.98 PASS AO=58;DP=132;FAO=59;FDP=134;FR=.;FRO=75;FSAF=22;FSAR=37;FSRF=39;FSRR=36;FWDB=-0.00675612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.848;QD=6.59647;RBI=0.00677232;REFB=-0.00436527;REVB=-0.000468184;RO=74;SAF=21;SAR=37;SRF=39;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169456;STB=0.584232;TYPE=snp;VARB=0.00553126;OID=.;OPOS=224377724;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:134:74:75:58:59:37:21:39:35:37:22:39:36 chr1 224463074 . C T 244.36 PASS AO=56;DP=112;FAO=56;FDP=112;FR=.;FRO=56;FSAF=33;FSAR=23;FSRF=38;FSRR=18;FWDB=-0.0244105;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.105;QD=8.72717;RBI=0.0267293;REFB=-0.0172958;REVB=-0.0108895;RO=55;SAF=33;SAR=23;SRF=37;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0786905;STB=0.546869;TYPE=snp;VARB=0.0259018;OID=.;OPOS=224463074;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:55:56:56:56:23:33:37:18:23:33:38:18 chr1 224492746 . C T 809.43 PASS AO=79;DP=80;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.113733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.268;QD=38.091;RBI=0.128978;REFB=0;REVB=-0.0608297;RO=1;SAF=36;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129683;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000351968;OID=.;OPOS=224492746;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:80:85:1:0:79:85:43:36:1:0:43:42:0:0 chr1 224495852 . C T 3823.15 PASS AO=403;DP=404;FAO=399;FDP=399;FR=.;FRO=0;FSAF=204;FSAR=195;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=9.36402e-06;FXX=0.00249994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7511;QD=38.3273;RBI=0.0318436;REFB=-0.0255717;REVB=-0.0318436;RO=1;SAF=206;SAR=197;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00231131;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.70781e-06;OID=.;OPOS=224495852;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:404:399:1:0:403:399:197:206:1:0:195:204:0:0 chr1 224505570 . T TAA 900.96 PASS AO=97;DP=127;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0748337;FXX=0.0583285;HRUN=2;LEN=2;MLLD=34.2984;QD=31.8925;RBI=0.104129;REFB=0;REVB=0.0724064;RO=13;SAF=32;SAR=65;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0327858;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-0.000641318;OID=.;OPOS=224505571;OREF=-;OALT=AA;OMAPALT=TAA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:97:127:113:113:0:44:69:0:0:79:13:32:65:6:7 chr1 224517842 . C T 291.55 PASS AO=28;DP=28;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.101405;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2087;QD=38.8727;RBI=0.10154;REFB=0;REVB=-0.00521612;RO=0;SAF=7;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00231377;OID=.;OPOS=224517842;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:28:30:0:0:28:30:21:7:0:0:21:9:0:0 chr1 224575373 . G A 2829.41 PASS AO=295;DP=295;FAO=295;FDP=295;FR=.;FRO=0;FSAF=135;FSAR=160;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00276948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.625;QD=38.3648;RBI=0.0693523;REFB=0;REVB=0.069297;RO=0;SAF=135;SAR=160;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.7422e-05;OID=.;OPOS=224575373;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:295:295:0:0:295:295:160:135:0:0:160:135:0:0 chr1 224585958 . A C 154.73 PASS AO=29;DP=52;FAO=29;FDP=50;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=24;FSRF=3;FSRR=18;FWDB=0.0985624;FXX=0.0384541;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.755;QD=12.3786;RBI=0.0985741;REFB=0.00559638;REVB=0.00151934;RO=21;SAF=5;SAR=24;SRF=3;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0406078;STB=0.522373;TYPE=snp;VARB=-0.00174708;OID=.;OPOS=224585958;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:52:50:21:21:29:29:24:5:3:18:24:5:3:18 chr1 225230608 . C T 1060.76 PASS AO=106;DP=106;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00334041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.692;QD=38.5731;RBI=0.0384276;REFB=0;REVB=0.0382821;RO=0;SAF=69;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.10424e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000118826;OID=.;OPOS=225230608;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:106:110:0:0:106:110:37:69:0:0:38:72:0:0 chr1 225266966 . C G 1537.68 PASS AO=160;DP=169;FAO=166;FDP=166;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.067587;FXX=0.0177504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.7942;QD=37.0526;RBI=0.088004;REFB=-0.0806132;REVB=0.0563622;RO=2;SAF=66;SAR=94;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0141976;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0038677;OID=.;OPOS=225266966;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:169:166:2:0:160:166:94:66:2:0:96:70:0:0 chr1 225268343 . A G 710.42 PASS AO=78;DP=79;FAO=77;FDP=79;FR=.;FRO=2;FSAF=12;FSAR=65;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0282924;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8351;QD=35.9707;RBI=0.0782842;REFB=-0.0082214;REVB=-0.0729928;RO=1;SAF=13;SAR=65;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00722805;STB=0.516184;TYPE=snp;VARB=0.000283417;OID=.;OPOS=225268343;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:79:79:1:2:78:77:65:13:0:1:65:12:1:1 chr1 225268346 . G A 723.9 PASS AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0257153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.085;QD=38.1;RBI=0.0331144;REFB=0;REVB=0.0208635;RO=0;SAF=13;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.24791e-05;OID=.;OPOS=225268346;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:76:76:0:0:76:76:63:13:0:0:63:13:0:0 chr1 225270409 . A T 820.97 PASS AO=97;DP=106;FAO=97;FDP=105;FR=.;FRO=8;FSAF=40;FSAR=57;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0120579;FXX=0.00943307;HRUN=5;LEN=1;MLLD=164.592;QD=31.2749;RBI=0.0120586;REFB=-0.149431;REVB=0.000132919;RO=5;SAF=40;SAR=57;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0204196;STB=0.50294;TYPE=snp;VARB=0.00115423;OID=.;OPOS=225270409;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:106:105:5:8:97:97:57:40:1:4:57:40:3:5 chr1 225273248 . G T 1285.57 PASS AO=131;DP=131;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00350432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.377;QD=37.811;RBI=0.052451;REFB=0;REVB=0.0523338;RO=0;SAF=78;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.2388e-05;OID=.;OPOS=225273248;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:131:136:0:0:131:136:53:78:0:0:56:80:0:0 chr1 225328430 . T G 761.79 PASS AO=168;DP=332;FAO=174;FDP=331;FR=.;FRO=157;FSAF=93;FSAR=81;FSRF=76;FSRR=81;FWDB=0.0302908;FXX=0.00301196;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.9602;QD=9.20592;RBI=0.086584;REFB=-0.0605338;REVB=0.0811126;RO=161;SAF=93;SAR=75;SRF=76;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0731385;STB=0.523941;TYPE=snp;VARB=0.0595487;OID=.;OPOS=225328430;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:332:331:161:157:168:174:75:93:76:85:81:93:76:81 chr1 225506294 . A G 371.27 PASS AO=95;DP=207;FAO=96;FDP=210;FR=.;FRO=114;FSAF=64;FSAR=32;FSRF=74;FSRR=40;FWDB=0.0178578;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.7518;QD=7.07189;RBI=0.0178601;REFB=-0.00323328;REVB=0.000284122;RO=112;SAF=64;SAR=31;SRF=74;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0143228;STB=0.510636;TYPE=snp;VARB=0.0024674;OID=.;OPOS=225506294;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:210:112:114:95:96:31:64:74:38:32:64:74:40 chr1 225528183 . C A 177.72 PASS AO=65;DP=195;FAO=67;FDP=197;FR=.;FRO=130;FSAF=23;FSAR=44;FSRF=73;FSRR=57;FWDB=0.00537239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=314.038;QD=3.60852;RBI=0.00826941;REFB=-0.00155814;REVB=0.00628654;RO=128;SAF=21;SAR=44;SRF=72;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.279918;STB=0.645137;TYPE=snp;VARB=0.00432037;OID=.;OPOS=225528183;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:197:128:130:65:67:44:21:72:56:44:23:73:57 chr1 225528340 . C T 185.86 PASS AO=61;DP=161;FAO=61;FDP=162;FR=.;FRO=101;FSAF=18;FSAR=43;FSRF=54;FSRR=47;FWDB=0.0715917;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.0855;QD=4.58912;RBI=0.0776937;REFB=-0.0388567;REVB=0.0301817;RO=96;SAF=18;SAR=43;SRF=51;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267702;STB=0.656435;TYPE=snp;VARB=0.0521954;OID=.;OPOS=225528340;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:162:96:101:61:61:43:18:51:45:43:18:54:47 chr1 225533684 . A G 377.71 PASS AO=102;DP=227;FAO=102;FDP=231;FR=.;FRO=129;FSAF=59;FSAR=43;FSRF=64;FSRR=65;FWDB=0.00857283;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=149.683;QD=6.54035;RBI=0.0280568;REFB=-0.0244196;REVB=-0.0267149;RO=125;SAF=59;SAR=43;SRF=60;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0984298;STB=0.546428;TYPE=snp;VARB=0.0270968;OID=.;OPOS=225533684;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:227:231:125:129:102:102:43:59:60:65:43:59:64:65 chr1 225533731 . T A 565.49 PASS AO=119;DP=216;FAO=119;FDP=216;FR=.;FRO=97;FSAF=45;FSAR=74;FSRF=46;FSRR=51;FWDB=0.0117382;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=252.467;QD=10.4721;RBI=0.0168514;REFB=-0.0173774;REVB=-0.0120907;RO=96;SAF=45;SAR=74;SRF=46;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0859537;STB=0.544858;TYPE=snp;VARB=0.0142957;OID=.;OPOS=225533731;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:216:216:96:97:119:119:74:45:46:50:74:45:46:51 chr1 225534219 . T C 383.57 PASS AO=87;DP=168;FAO=86;FDP=167;FR=.;FRO=81;FSAF=28;FSAR=58;FSRF=39;FSRR=42;FWDB=-0.00692289;FXX=0.0118336;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.678;QD=9.18735;RBI=0.0130156;REFB=-0.0257773;REVB=0.0110218;RO=79;SAF=29;SAR=58;SRF=39;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147772;STB=0.581195;TYPE=snp;VARB=0.0314107;OID=.;OPOS=225534219;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:167:79:81:87:86:58:29:39:40:58:28:39:42 chr1 225534348 . G A 173.16 PASS AO=44;DP=103;FAO=46;FDP=105;FR=.;FRO=59;FSAF=15;FSAR=31;FSRF=34;FSRR=25;FWDB=-0.00914995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.425;QD=6.59655;RBI=0.0120132;REFB=-0.0195418;REVB=0.00778424;RO=59;SAF=15;SAR=29;SRF=34;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243109;STB=0.643853;TYPE=snp;VARB=0.0266915;OID=.;OPOS=225534348;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:105:59:59:44:46:29:15:34:25:31:15:34:25 chr1 225539363 . G A 390.71 PASS AO=78;DP=133;FAO=78;FDP=136;FR=.;FRO=58;FSAF=45;FSAR=33;FSRF=34;FSRR=24;FWDB=0.023856;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.8369;QD=11.4915;RBI=0.0247353;REFB=-0.038149;REVB=-0.00653623;RO=55;SAF=45;SAR=33;SRF=33;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0180276;STB=0.504059;TYPE=snp;VARB=0.0268973;OID=.;OPOS=225539363;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:136:55:58:78:78:33:45:33:22:33:45:34:24 chr1 225541899 . C T 240 PASS AO=86;DP=242;FAO=86;FDP=242;FR=.;FRO=156;FSAF=37;FSAR=49;FSRF=75;FSRR=81;FWDB=0.0146805;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.243;QD=3.96686;RBI=0.0156641;REFB=-0.013951;REVB=-0.00546317;RO=156;SAF=37;SAR=49;SRF=75;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0578481;STB=0.532911;TYPE=snp;VARB=0.0289618;OID=.;OPOS=225541899;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:242:242:156:156:86:86:49:37:75:81:49:37:75:81 chr1 225555512 . C T 150.14 PASS AO=45;DP=111;FAO=44;FDP=111;FR=.;FRO=67;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=52;FSRR=15;FWDB=-0.00312668;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.26;QD=5.41034;RBI=0.0458796;REFB=-0.000153795;REVB=0.045773;RO=66;SAF=29;SAR=16;SRF=51;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156097;STB=0.595863;TYPE=snp;VARB=0.0004611;OID=.;OPOS=225555512;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:66:67:45:44:16:29:51:15:16:28:52:15 chr1 225555602 . T G 256.73 PASS AO=69;DP=157;FAO=69;FDP=157;FR=.;FRO=88;FSAF=40;FSAR=29;FSRF=53;FSRR=35;FWDB=-0.0023955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.965;QD=6.54087;RBI=0.00320576;REFB=-0.0160708;REVB=-0.00213037;RO=87;SAF=40;SAR=29;SRF=52;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0185409;STB=0.513026;TYPE=snp;VARB=0.0196029;OID=.;OPOS=225555602;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:157:87:88:69:69:29:40:52:35:29:40:53:35 chr1 225565015 . T C 178.36 PASS AO=57;DP=155;FAO=59;FDP=156;FR=.;FRO=97;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=56;FSRR=41;FWDB=-0.0335221;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.8248;QD=4.57326;RBI=0.0346932;REFB=0.00334078;REVB=0.00893762;RO=98;SAF=28;SAR=29;SRF=57;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100425;STB=0.553248;TYPE=snp;VARB=-0.00493232;OID=.;OPOS=225565015;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:156:98:97:57:59:29:28:57:41:30:29:56:41 chr1 225565073 . C T 125.91 PASS AO=46;DP=135;FAO=46;FDP=135;FR=.;FRO=89;FSAF=17;FSAR=29;FSRF=54;FSRR=35;FWDB=0.0133701;FXX=0.0073524;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.322;QD=3.73069;RBI=0.0207303;REFB=-0.00134626;REVB=0.0158425;RO=89;SAF=17;SAR=29;SRF=54;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.268604;STB=0.654208;TYPE=snp;VARB=0.00350994;OID=.;OPOS=225565073;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:89:89:46:46:29:17:54:35:29:17:54:35 chr1 225569241 . T G 317.25 PASS AO=112;DP=308;FAO=112;FDP=309;FR=.;FRO=197;FSAF=73;FSAR=39;FSRF=118;FSRR=79;FWDB=0.000746957;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=204.347;QD=4.10683;RBI=0.00582578;REFB=-0.00594144;REVB=-0.0057777;RO=192;SAF=73;SAR=39;SRF=117;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0511837;STB=0.536257;TYPE=snp;VARB=0.0107366;OID=.;OPOS=225569241;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:308:309:192:197:112:112:39:73:117:75:39:73:118:79 chr1 225590887 . G A 83.68 PASS AO=35;DP=191;FAO=35;FDP=191;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=149;FSAF=27;FSAR=8;FSRF=71;FSRR=78;FWDB=0.00697833;FXX=0.0304553;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.072;QD=1.75238;RBI=0.0207012;REFB=-0.00253283;REVB=-0.0194895;RO=70;SAF=27;SAR=8;SRF=29;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.424157;STB=0.747439;TYPE=snp;VARB=-0.0175172;OID=.;OPOS=225590887;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:185:191:70:149:35:35:8:27:29:41:8:27:71:78 chr1 225601647 . C T 534.98 PASS AO=36;DP=57;FAO=56;FDP=56;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=15;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.605;QD=38.213;RBI=0.100865;REFB=0;REVB=0.100091;RO=0;SAF=15;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0010262;OID=.;OPOS=225601647;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:57:56:0:0:36:56:21:15:0:0:41:15:0:0 chr1 225607144 . C T 770.41 PASS AO=83;DP=83;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0261878;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.812;QD=37.581;RBI=0.0274441;REFB=0;REVB=0.00820846;RO=0;SAF=19;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.28385e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.00154e-05;OID=.;OPOS=225607144;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:83:82:0:0:83:82:64:19:0:0:63:19:0:0 chr1 225609884 . A G 2065.86 PASS AO=213;DP=214;FAO=219;FDP=219;FR=.;FRO=0;FSAF=110;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00396979;FXX=0.00904936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.596;QD=37.7326;RBI=0.0603317;REFB=-0.00303406;REVB=0.0602009;RO=1;SAF=110;SAR=103;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00431147;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.25993e-05;OID=.;OPOS=225609884;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:214:219:1:0:213:219:103:110:1:0:109:110:0:0 chr1 225611661 . C T 2555.69 PASS AO=258;DP=260;FAO=267;FDP=267;FR=.;FRO=0;FSAF=119;FSAR=148;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0435792;FXX=0.00743467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.316;QD=38.2875;RBI=0.0625388;REFB=0;REVB=0.0448548;RO=0;SAF=110;SAR=148;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000691786;OID=.;OPOS=225611661;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:260:267:0:0:258:267:148:110:0:0:148:119:0:0 chr1 225682560 . G A 870.74 PASS AO=92;DP=93;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136489;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.5513;QD=37.8583;RBI=0.0182333;REFB=0;REVB=0.0120897;RO=0;SAF=32;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.44018e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.527e-05;OID=.;OPOS=225682560;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:93:92:0:0:92:92:60:32:0:0:60:32:0:0 chr1 226019633 . T C 525.44 PASS AO=115;DP=217;FAO=116;FDP=218;FR=.;FRO=102;FSAF=52;FSAR=64;FSRF=28;FSRR=74;FWDB=-0.00604479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.4781;QD=9.64111;RBI=0.00607245;REFB=-0.00134904;REVB=0.000578935;RO=100;SAF=51;SAR=64;SRF=26;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162145;STB=0.583591;TYPE=snp;VARB=0.000873366;OID=.;OPOS=226019633;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:217:218:100:102:115:116:64:51:26:74:64:52:28:74 chr1 226026406 . A G 31.54 PASS AO=9;DP=26;FAO=9;FDP=27;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=16;FWDB=0.0385782;FXX=0.0689417;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.935;QD=4.67276;RBI=0.0392304;REFB=0.0140523;REVB=-0.00712389;RO=11;SAF=1;SAR=8;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141412;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0398314;OID=.;OPOS=226026406;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:26:27:11:18:9:9:8:1:2:9:8:1:2:16 chr1 226027548 . C T 190.35 PASS AO=52;DP=125;FAO=53;FDP=125;FR=.;FRO=72;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=46;FSRR=26;FWDB=0.0123768;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.847;QD=6.09126;RBI=0.0172771;REFB=-0.020255;REVB=0.0120546;RO=72;SAF=25;SAR=27;SRF=46;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162927;STB=0.595531;TYPE=snp;VARB=0.0326083;OID=.;OPOS=226027548;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:72:72:52:53:27:25:46:26:28:25:46:26 chr1 226074563 . T G 121.47 PASS AO=23;DP=53;FAO=29;FDP=59;FR=.;FRO=30;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=21;FWDB=0.0625669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.6065;QD=8.23517;RBI=0.133731;REFB=-0.0220303;REVB=-0.118192;RO=30;SAF=13;SAR=10;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.259367;STB=0.67767;TYPE=snp;VARB=0.0168757;OID=.;OPOS=226074563;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:59:30:30:23:29:10:13:9:21:10:19:9:21 chr1 226352498 . T G 328.4 PASS AO=100;DP=235;FAO=96;FDP=231;FR=.;FRO=135;FSAF=53;FSAR=43;FSRF=74;FSRR=61;FWDB=0.00675375;FXX=0.0170206;HRUN=9;LEN=1;MLLD=192.941;QD=5.68666;RBI=0.0213788;REFB=0.0127196;REVB=0.0202839;RO=122;SAF=53;SAR=47;SRF=67;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0191034;STB=0.502323;TYPE=snp;VARB=-0.0152391;OID=.;OPOS=226352498;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:235:231:122:135:100:96:47:53:67:55:43:53:74:61 chr1 226474132 . G A 385.77 PASS AO=105;DP=249;FAO=109;FDP=254;FR=.;FRO=145;FSAF=46;FSAR=63;FSRF=75;FSRR=70;FWDB=-0.00764274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.983;QD=6.07511;RBI=0.0194848;REFB=-0.00764187;REVB=-0.0179234;RO=140;SAF=43;SAR=62;SRF=75;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130269;STB=0.554753;TYPE=snp;VARB=0.00981527;OID=.;OPOS=226474132;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:249:254:140:145:105:109:62:43:75:65:63:46:75:70 chr1 226555302 . A G 415.24 PASS AO=112;DP=259;FAO=113;FDP=262;FR=.;FRO=149;FSAF=53;FSAR=60;FSRF=73;FSRR=76;FWDB=0.0425807;FXX=0.0507228;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.7585;QD=6.3396;RBI=0.0471481;REFB=-0.0320758;REVB=-0.0202441;RO=147;SAF=53;SAR=59;SRF=71;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0100007;STB=0.511916;TYPE=snp;VARB=0.0474285;OID=.;OPOS=226555302;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:259:262:147:149:112:113:59:53:71:76:60:53:73:76 chr1 226570840 . T C 149.56 PASS AO=37;DP=83;FAO=38;FDP=86;FR=.;FRO=48;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=28;FSRR=20;FWDB=-0.000533077;FXX=0.0444395;HRUN=6;LEN=1;MLLD=165.465;QD=6.95608;RBI=0.00292023;REFB=-0.00709258;REVB=0.00287116;RO=46;SAF=13;SAR=24;SRF=27;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234656;STB=0.620626;TYPE=snp;VARB=0.00595337;OID=.;OPOS=226570840;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:86:46:48:37:38:24:13:27:19:24:14:28:20 chr1 226573364 . A G 125.63 PASS AO=31;DP=62;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=-0.0010082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.781;QD=8.23811;RBI=0.00426085;REFB=-0.024441;REVB=-0.00413985;RO=31;SAF=17;SAR=14;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0866523;STB=0.578177;TYPE=snp;VARB=0.0232589;OID=.;OPOS=226573364;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:61:31:32:31:29:14:17:14:17:12:17:14:18 chr1 226589958 . G A 338.29 PASS AO=62;DP=101;FAO=62;FDP=101;FR=.;FRO=39;FSAF=40;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=-0.0130363;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.875;QD=13.3975;RBI=0.02476;REFB=-0.0128516;REVB=0.0210503;RO=39;SAF=40;SAR=22;SRF=24;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0229202;STB=0.512461;TYPE=snp;VARB=0.00941827;OID=.;OPOS=226589958;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:39:39:62:62:22:40:24:15:22:40:24:15 chr1 226613233 . T C 113.64 PASS AO=31;DP=78;FAO=32;FDP=79;FR=.;FRO=47;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=29;FWDB=0.00176967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.92;QD=5.75377;RBI=0.00854222;REFB=-0.0047695;REVB=-0.00835691;RO=46;SAF=11;SAR=20;SRF=18;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0411478;STB=0.505047;TYPE=snp;VARB=0.00612834;OID=.;OPOS=226613233;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:79:46:47:31:32:20:11:18:28:20:12:18:29 chr1 226613287 . A G 157.95 PASS AO=22;DP=60;FAO=33;FDP=60;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=25;FSRF=6;FSRR=21;FWDB=-0.0506209;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.5577;QD=10.5302;RBI=0.124328;REFB=-0.00155554;REVB=-0.113556;RO=21;SAF=5;SAR=17;SRF=3;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112463;STB=0.512527;TYPE=snp;VARB=-0.00105186;OID=.;OPOS=226613287;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:60:21:27:22:33:17:5:3:18:25:8:6:21 chr1 226633767 . C T 218.95 PASS AO=54;DP=115;FAO=54;FDP=115;FR=.;FRO=61;FSAF=21;FSAR=33;FSRF=21;FSRR=40;FWDB=0.0848296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.4086;QD=7.61576;RBI=0.0848706;REFB=-0.00867437;REVB=0.00264051;RO=61;SAF=21;SAR=33;SRF=21;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0453548;STB=0.525171;TYPE=snp;VARB=0.00574473;OID=.;OPOS=226633767;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:61:61:54:54:33:21:21:40:33:21:21:40 chr1 226819524 . CGG CG,C 304.87 PASS AO=48,13;DP=81;FAO=70,0;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=36,0;FSAR=34,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.126587,-0.0658855;FXX=0;HRUN=8,8;LEN=1,2;MLLD=9.63538,8.67651;QD=17.4213;RBI=0.303486,0.15526;REFB=0.0299472,0.0282169;REVB=-0.275825,-0.140587;RO=6;SAF=28,5;SAR=20,8;SRF=2;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0529889,0.0306968;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.0343449,0;OID=.,.;OPOS=226819525,226819525;OREF=G,GG;OALT=-,-;OMAPALT=CG,C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:48,13:70:70,0:70:0:36,0:34,0:0:0:22:6:28,5:20,8:2:4 chr1 226819833 . A G 43.25 PASS AO=12;DP=33;FAO=12;FDP=33;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.00376305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.1559;QD=5.24294;RBI=0.017237;REFB=-0.0120435;REVB=0.0168212;RO=21;SAF=5;SAR=7;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11507;STB=0.568413;TYPE=snp;VARB=0.024898;OID=.;OPOS=226819833;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:33:33:21:21:12:12:7:5:11:10:7:5:11:10 chr1 226923264 . G A 137.05 PASS AO=17;DP=55;FAO=31;FDP=62;FR=.,HEALED;FRO=30;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=6;FSRR=24;FWDB=0.0101098;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=27.3868;QD=8.84209;RBI=0.0703227;REFB=-0.113522;REVB=0.0695922;RO=21;SAF=8;SAR=9;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182072;STB=0.572475;TYPE=snp;VARB=0.109671;OID=.;OPOS=226923264;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:62:21:30:17:31:9:8:6:15:21:10:6:24 chr1 226923505 . G T 850.34 PASS AO=88;DP=90;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115349;FXX=0.0222198;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.142;QD=38.6517;RBI=0.0321761;REFB=0;REVB=0.0300374;RO=0;SAF=43;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.39218e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.02605e-05;OID=.;OPOS=226923505;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:90:88:0:0:88:88:45:43:0:0:45:43:0:0 chr1 226923938 . A C 15.65 PASS AO=8;DP=38;FAO=8;FDP=39;FR=.;FRO=31;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.0498845;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.197;QD=1.60522;RBI=0.0498847;REFB=-0.00836773;REVB=0.000152293;RO=30;SAF=2;SAR=6;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.242176;STB=0.675589;TYPE=snp;VARB=0.0312924;OID=.;OPOS=226923938;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:38:39:30:31:8:8:6:2:13:17:6:2:14:17 chr1 227069677 . T C 316.55 PASS AO=33;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0119913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.485;QD=37.2412;RBI=0.0143856;REFB=0;REVB=-0.00794693;RO=0;SAF=18;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.64315e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.18287e-05;OID=.;OPOS=227069677;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:34:0:0:33:34:15:18:0:0:15:19:0:0 chr1 227069737 . C T 32.04 PASS AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0149118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.838;QD=5.82527;RBI=0.014917;REFB=-0.0150781;REVB=0.0003932;RO=14;SAF=5;SAR=3;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204846;STB=0.624687;TYPE=snp;VARB=0.0238776;OID=.;OPOS=227069737;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:22:22:14:14:8:8:3:5:6:8:3:5:6:8 chr1 227071525 . C T 182.4 PASS AO=41;DP=84;FAO=42;FDP=85;FR=.;FRO=43;FSAF=7;FSAR=35;FSRF=12;FSRR=31;FWDB=-0.0174676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.0996;QD=8.58336;RBI=0.0193862;REFB=-0.013126;REVB=-0.00840891;RO=43;SAF=7;SAR=34;SRF=12;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154398;STB=0.590015;TYPE=snp;VARB=0.00739617;OID=.;OPOS=227071525;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:85:43:43:41:42:34:7:12:31:35:7:12:31 chr1 227149203 . G A 92.78 PASS AO=24;DP=56;FAO=24;FDP=56;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=-0.0503072;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.0473;QD=6.62711;RBI=0.0516752;REFB=-0.0296745;REVB=0.0118119;RO=32;SAF=7;SAR=17;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129786;STB=0.57426;TYPE=snp;VARB=0.028392;OID=.;OPOS=227149203;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:56:56:32:32:24:24:17:7:13:19:17:7:13:19 chr1 227172290 . C T 885.78 PASS AO=91;DP=92;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0453388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2007;QD=37.6929;RBI=0.071548;REFB=0;REVB=0.0553489;RO=1;SAF=33;SAR=58;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0141463;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000521902;OID=.;OPOS=227172290;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:92:94:1:0:91:94:58:33:1:0:60:34:0:0 chr1 227174210 . T C 785.89 PASS AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.398;QD=37.8742;RBI=0.0221144;REFB=0;REVB=0.0036859;RO=0;SAF=53;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.73622e-05;OID=.;OPOS=227174210;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:83:83:0:0:83:83:30:53:0:0:30:53:0:0 chr1 227177731 . A T 2159.95 PASS AO=244;DP=257;FAO=245;FDP=258;FR=.;FRO=13;FSAF=113;FSAR=132;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.0113174;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=233.832;QD=33.4876;RBI=0.0113439;REFB=-0.0761422;REVB=-0.000775523;RO=12;SAF=112;SAR=132;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00380431;STB=0.503886;TYPE=snp;VARB=0.00058972;OID=.;OPOS=227177731;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:257:258:12:13:244:245:132:112:5:7:132:113:5:8 chr1 227178127 . A G 519.78 PASS AO=49;DP=51;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0160228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.079;QD=37.8024;RBI=0.022616;REFB=0;REVB=0.0159609;RO=0;SAF=24;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.88657e-07;OID=.;OPOS=227178127;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:51:55:0:0:49:55:25:24:0:0:27:28:0:0 chr1 227178948 . G A 804.28 PASS AO=86;DP=90;FAO=90;FDP=93;FR=.;FRO=3;FSAF=32;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.000398171;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.3088;QD=34.5928;RBI=0.0357142;REFB=-0.0332398;REVB=-0.035712;RO=4;SAF=31;SAR=55;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101061;STB=0.512602;TYPE=snp;VARB=0.000758588;OID=.;OPOS=227178948;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:90:93:4:3:86:90:55:31:1:3:58:32:0:3 chr1 227178962 . T C 654.12 PASS AO=79;DP=89;FAO=81;FDP=91;FR=.;FRO=10;FSAF=19;FSAR=62;FSRF=10;FSRR=0;FWDB=-0.00595795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.6663;QD=28.7525;RBI=0.0116009;REFB=-0.101465;REVB=0.00995411;RO=10;SAF=19;SAR=60;SRF=10;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195449;STB=0.604139;TYPE=snp;VARB=0.00516306;OID=.;OPOS=227178962;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:89:91:10:10:79:81:60:19:10:0:62:19:10:0 chr1 227182033 . G A 199.18 PASS AO=19;DP=19;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0420132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.101;QD=36.2139;RBI=0.0660315;REFB=0;REVB=0.0509416;RO=0;SAF=17;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.41729e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000205461;OID=.;OPOS=227182033;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:19:22:0:0:19:22:2:17:0:0:5:17:0:0 chr1 227182575 . A G 785.3 PASS AO=82;DP=82;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.825;QD=37.8457;RBI=0.028737;REFB=0;REVB=-0.00909301;RO=0;SAF=40;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.14435e-05;OID=.;OPOS=227182575;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:82:83:0:0:82:83:42:40:0:0:42:41:0:0 chr1 227216662 . T C 329.54 PASS AO=81;DP=166;FAO=80;FDP=167;FR=.;FRO=87;FSAF=54;FSAR=26;FSRF=39;FSRR=48;FWDB=-0.0328338;FXX=0.0118336;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.999;QD=7.89304;RBI=0.0343311;REFB=0.0248655;REVB=-0.0100282;RO=85;SAF=55;SAR=26;SRF=37;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234752;STB=0.622981;TYPE=snp;VARB=-0.0359765;OID=.;OPOS=227216662;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:167:85:87:81:80:26:55:37:48:26:54:39:48 chr1 227216775 . C T 258.51 PASS AO=74;DP=177;FAO=74;FDP=177;FR=.;FRO=103;FSAF=46;FSAR=28;FSRF=53;FSRR=50;FWDB=0.0223529;FXX=0.00561766;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.001;QD=5.84209;RBI=0.0349099;REFB=0.0143283;REVB=0.0268151;RO=102;SAF=46;SAR=28;SRF=53;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10879;STB=0.564133;TYPE=snp;VARB=-0.0208317;OID=.;OPOS=227216775;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:177:102:103:74:74:28:46:53:49:28:46:53:50 chr1 227221123 . G A 238.99 PASS AO=50;DP=95;FAO=51;FDP=96;FR=.;FRO=45;FSAF=16;FSAR=35;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=0.00135343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.403;QD=9.95778;RBI=0.0167658;REFB=-0.0295248;REVB=0.016711;RO=41;SAF=16;SAR=34;SRF=16;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0643645;STB=0.56754;TYPE=snp;VARB=0.0184473;OID=.;OPOS=227221123;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:96:41:45:50:51:34:16:16:25:35:16:20:25 chr1 227681475 . T C 2171.36 PASS AO=228;DP=231;FAO=231;FDP=231;FR=.;FRO=0;FSAF=147;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222657;FXX=0.0454527;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.17;QD=37.5993;RBI=0.0745209;REFB=-0.021703;REVB=0.0711169;RO=2;SAF=144;SAR=84;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00657217;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00350135;OID=.;OPOS=227681475;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:92:231:231:2:0:228:231:84:144:2:0:84:147:0:0 chr1 227920665 . A G 209.22 PASS AO=56;DP=128;FAO=56;FDP=128;FR=.;FRO=72;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=23;FSRR=49;FWDB=0.00893801;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.493;QD=6.53811;RBI=0.0309874;REFB=0.00247711;REVB=-0.0296704;RO=70;SAF=30;SAR=26;SRF=22;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218553;STB=0.620135;TYPE=snp;VARB=-0.00406181;OID=.;OPOS=227920665;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:70:72:56:56:26:30:22:48:26:30:23:49 chr1 227935444 . A G 61.53 PASS AO=20;DP=58;FAO=20;FDP=58;FR=.;FRO=38;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=25;FWDB=0.0148542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.5;QD=4.24372;RBI=0.0155312;REFB=-0.0108248;REVB=0.00453528;RO=30;SAF=8;SAR=12;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0364741;STB=0.540107;TYPE=snp;VARB=0.0183799;OID=.;OPOS=227935444;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:58:58:30:38:20:20:12:8:11:19:12:8:13:25 chr1 228033197 . A G 497.96 PASS AO=52;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0178426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.433;QD=37.5819;RBI=0.0515518;REFB=0;REVB=0.0483656;RO=0;SAF=23;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.84538e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000387766;OID=.;OPOS=228033197;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:53:53:0:0:52:53:29:23:0:0:30:23:0:0 chr1 228113163 . A G 54.24 PASS AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.0409833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.3068;QD=8.34428;RBI=0.0586114;REFB=-0.0173414;REVB=-0.0419006;RO=14;SAF=5;SAR=7;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0113119;STB=0.506568;TYPE=snp;VARB=0.0306393;OID=.;OPOS=228113163;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:26:26:14:14:12:12:7:5:6:8:7:5:6:8 chr1 228347352 . A G 267.06 PASS AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0143081;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=269.987;QD=38.152;RBI=0.0143607;REFB=0;REVB=0.00122824;RO=0;SAF=23;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.54973e-05;OID=.;OPOS=228347352;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:27:28:0:0:27:28:4:23:0:0:4:24:0:0 chr1 228352160 . T C 304.67 PASS AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00932321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.956;QD=34.8196;RBI=0.0210109;REFB=-0.140389;REVB=0.0188292;RO=0;SAF=6;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.73777e-08;STB=0.508767;TYPE=snp;VARB=0.00272592;OID=.;OPOS=228352160;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:35:35:0:1:34:34:28:6:0:0:28:6:0:1 chr1 228362682 . G A 82.07 PASS AO=17;DP=33;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.0341812;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=145.809;QD=9.94817;RBI=0.0342317;REFB=0.00173509;REVB=0.00185844;RO=13;SAF=3;SAR=14;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226441;STB=0.598802;TYPE=snp;VARB=-0.00141263;OID=.;OPOS=228362682;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:33:33:13:16:17:17:14:3:5:8:14:3:5:11 chr1 228399482 . C G 68.43 PASS AO=12;DP=21;FAO=12;FDP=21;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.0430108;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=132.636;QD=13.0336;RBI=0.0489972;REFB=-0.0593231;REVB=-0.023469;RO=8;SAF=8;SAR=4;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0677961;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0399208;OID=.;OPOS=228399482;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:21:21:8:9:12:12:4:8:6:2:4:8:6:3 chr1 228399766 . T C 41.09 PASS AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=-0.0243198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.125;QD=10.2735;RBI=0.0309972;REFB=-0.0477264;REVB=0.0192192;RO=8;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.323155;STB=0.681501;TYPE=snp;VARB=0.0245323;OID=.;OPOS=228399766;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:16:16:8:8:8:8:7:1:0:8:7:1:0:8 chr1 228402047 . A G 101.07 PASS AO=28;DP=68;FAO=28;FDP=69;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=-0.00407413;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.5488;QD=5.85911;RBI=0.112109;REFB=-0.00471512;REVB=-0.112035;RO=40;SAF=17;SAR=11;SRF=25;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.019434;STB=0.501628;TYPE=snp;VARB=0.0089255;OID=.;OPOS=228402047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:69:40:41:28:28:11:17:25:15:11:17:25:16 chr1 228402121 . A G 85.12 PASS AO=26;DP=66;FAO=25;FDP=65;FR=.;FRO=40;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=-0.0676865;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.019;QD=5.23815;RBI=0.0687608;REFB=-0.00507502;REVB=-0.0121074;RO=40;SAF=15;SAR=11;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0820445;STB=0.537099;TYPE=snp;VARB=0.00925637;OID=.;OPOS=228402121;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:66:65:40:40:26:25:11:15:20:20:11:14:20:20 chr1 228402508 . C T 155.29 PASS AO=35;DP=71;FAO=35;FDP=71;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=0.0209531;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=37.6134;QD=8.74888;RBI=0.0820934;REFB=-0.047437;REVB=0.0793744;RO=35;SAF=14;SAR=21;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505879;TYPE=snp;VARB=0.0496415;OID=.;OPOS=228402508;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:35:36:35:35:21:14:14:21:21:14:14:22 chr1 228412227 . T C 97.96 PASS AO=21;DP=42;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0155594;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.1702;QD=9.32934;RBI=0.0294761;REFB=-0.0433552;REVB=-0.0250348;RO=21;SAF=11;SAR=10;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0842361;STB=0.547466;TYPE=snp;VARB=0.0225614;OID=.;OPOS=228412227;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:42:42:21:21:21:21:10:11:9:12:10:11:9:12 chr1 228412228 . G A 97.3 PASS AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0440682;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.322;QD=9.26676;RBI=0.112619;REFB=-0.0445464;REVB=0.103638;RO=20;SAF=11;SAR=10;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0638654;STB=0.547466;TYPE=snp;VARB=0.0165795;OID=.;OPOS=228412228;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:43:42:20:21:21:21:10:11:9:11:10:11:9:12 chr1 228412308 . G A 92.42 PASS AO=22;DP=48;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.00104965;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.452;QD=7.54434;RBI=0.0241611;REFB=-0.0213486;REVB=0.0241383;RO=24;SAF=11;SAR=11;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0384446;STB=0.510195;TYPE=snp;VARB=0.0272727;OID=.;OPOS=228412308;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:48:49:24:27:22:22:11:11:13:11:11:11:13:14 chr1 228431095 . A G 147.24 PASS AO=33;DP=66;FAO=33;FDP=66;FR=.;FRO=33;FSAF=24;FSAR=9;FSRF=26;FSRR=7;FWDB=-0.00774837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.742;QD=8.92335;RBI=0.0143096;REFB=-0.0136219;REVB=-0.0120302;RO=33;SAF=24;SAR=9;SRF=26;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0712569;STB=0.539545;TYPE=snp;VARB=0.0108197;OID=.;OPOS=228431095;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:33:33:33:33:9:24:26:7:9:24:26:7 chr1 228433217 . A G 140.53 PASS AO=32;DP=63;FAO=32;FDP=65;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=23;FSRF=5;FSRR=28;FWDB=-0.00751537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.799;QD=8.64803;RBI=0.0348026;REFB=-0.00736024;REVB=-0.0339814;RO=27;SAF=9;SAR=23;SRF=5;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103569;STB=0.587659;TYPE=snp;VARB=0.00869515;OID=.;OPOS=228433217;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:65:27:33:32:32:23:9:5:22:23:9:5:28 chr1 228434395 . T C 70.2 PASS AO=19;DP=40;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.00297853;FXX=0.0749813;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.221;QD=7.58967;RBI=0.0080694;REFB=-0.0267206;REVB=0.00749958;RO=21;SAF=15;SAR=4;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.409547;STB=0.718027;TYPE=snp;VARB=0.0732088;OID=.;OPOS=228434395;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:40:37:21:21:19:16:4:15:8:13:4:12:8:13 chr1 228434467 . T C 37.78 PASS AO=14;DP=52;FAO=15;FDP=51;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=0.00543293;FXX=0.0377287;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.075;QD=2.96309;RBI=0.0331079;REFB=-0.00254302;REVB=0.0326591;RO=24;SAF=10;SAR=4;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0603055;STB=0.583219;TYPE=snp;VARB=0.0139068;OID=.;OPOS=228434467;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:52:51:24:36:14:15:4:10:16:8:5:10:20:16 chr1 228444565 . T A 194.91 PASS AO=20;DP=20;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0262745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.745;QD=37.1264;RBI=0.0975438;REFB=0;REVB=0.0939385;RO=0;SAF=7;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0011587;OID=.;OPOS=228444565;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:20:21:0:0:20:21:13:7:0:0:14:7:0:0 chr1 228456147 . T C 67.22 PASS AO=28;DP=94;FAO=28;FDP=94;FR=.;FRO=66;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=46;FSRR=20;FWDB=-0.0230232;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.0667;QD=2.86023;RBI=0.0237125;REFB=-0.0327869;REVB=0.00567602;RO=66;SAF=12;SAR=16;SRF=46;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.312768;STB=0.682234;TYPE=snp;VARB=0.038978;OID=.;OPOS=228456147;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:94:94:66:66:28:28:16:12:46:20:16:12:46:20 chr1 228461129 . A G 67.37 PASS AO=17;DP=41;FAO=17;FDP=41;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.0392094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.838;QD=6.57285;RBI=0.0417998;REFB=-0.0216862;REVB=0.014486;RO=24;SAF=7;SAR=10;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0481477;STB=0.527826;TYPE=snp;VARB=0.0138161;OID=.;OPOS=228461129;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:41:41:24:24:17:17:10:7:11:13:10:7:11:13 chr1 228464248 . T G 24.31 PASS AO=5;DP=16;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=-0.0138185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.565;QD=5.72046;RBI=0.0171383;REFB=-0.0229888;REVB=-0.0101376;RO=11;SAF=3;SAR=2;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148611;STB=0.646611;TYPE=snp;VARB=0.0520167;OID=.;OPOS=228464248;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:16:17:11:11:5:6:2:3:8:3:3:3:8:3 chr1 228471379 . G C 49.59 PASS AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.0850625;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.5111;QD=6.84011;RBI=0.0850675;REFB=0.012219;REVB=0.000918512;RO=17;SAF=5;SAR=7;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113103;STB=0.566363;TYPE=snp;VARB=-0.0239275;OID=.;OPOS=228471379;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:29:29:17:17:12:12:7:5:9:8:7:5:9:8 chr1 228480282 . A G 230.78 PASS AO=50;DP=95;FAO=50;FDP=95;FR=.;FRO=45;FSAF=30;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=28;FWDB=-0.0304852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.085;QD=9.71683;RBI=0.0338162;REFB=-0.00121922;REVB=-0.0146352;RO=44;SAF=30;SAR=20;SRF=17;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181543;STB=0.605;TYPE=snp;VARB=0.00173847;OID=.;OPOS=228480282;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:44:45:50:50:20:30:17:27:20:30:17:28 chr1 228482028 . G C 160.9 PASS AO=45;DP=118;FAO=48;FDP=121;FR=.;FRO=73;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=39;FSRR=34;FWDB=-0.000881495;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.599;QD=5.3189;RBI=0.0738619;REFB=-0.0267496;REVB=0.0738566;RO=72;SAF=20;SAR=25;SRF=39;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105221;STB=0.571201;TYPE=snp;VARB=0.0467186;OID=.;OPOS=228482028;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:121:72:73:45:48:25:20:39:33:28:20:39:34 chr1 228486404 . C T 211.12 PASS AO=58;DP=135;FAO=58;FDP=135;FR=.;FRO=77;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=33;FSRR=44;FWDB=-0.0327858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9048;QD=6.25531;RBI=0.0695038;REFB=-0.0100595;REVB=-0.0612852;RO=76;SAF=26;SAR=32;SRF=33;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0144383;STB=0.511383;TYPE=snp;VARB=0.010511;OID=.;OPOS=228486404;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:76:77:58:58:32:26:33:43:32:26:33:44 chr1 228494696 . G A 98.65 PASS AO=17;DP=36;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.0170456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.373;QD=10.3837;RBI=0.0476145;REFB=-0.0147953;REVB=0.0444589;RO=18;SAF=12;SAR=5;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0978135;STB=0.505489;TYPE=snp;VARB=0.0117674;OID=.;OPOS=228494696;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:36:38:18:18:17:20:5:12:11:7:8:12:11:7 chr1 228496014 . G A 43.4 PASS AO=11;DP=28;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=15;FWDB=0.00332469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.136;QD=6.20034;RBI=0.032049;REFB=0.0084967;REVB=0.0318761;RO=16;SAF=1;SAR=10;SRF=1;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0953942;STB=0.545365;TYPE=snp;VARB=-0.0104877;OID=.;OPOS=228496014;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:28:28:16:17:11:11:10:1:1:15:10:1:2:15 chr1 228503677 . A G 59.48 PASS AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.0228794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.073;QD=6.60925;RBI=0.072886;REFB=-0.0256754;REVB=-0.0692019;RO=21;SAF=10;SAR=5;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0400554;OID=.;OPOS=228503677;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:36:36:21:21:15:15:5:10:14:7:5:10:14:7 chr1 228504472 . T C 20.22 PASS AO=6;DP=22;FAO=6;FDP=21;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.0539036;FXX=0.0454339;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.9809;QD=3.85185;RBI=0.0631989;REFB=-0.031975;REVB=-0.0329925;RO=15;SAF=3;SAR=3;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0370512;STB=0.52373;TYPE=snp;VARB=0.0434432;OID=.;OPOS=228504472;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:22:21:15:15:6:6:3:3:7:8:3:3:7:8 chr1 228504591 . C A 34.58 PASS AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0104865;FXX=0.0587889;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.3337;QD=8.64564;RBI=0.0173083;REFB=-0.0182254;REVB=-0.0137699;RO=9;SAF=2;SAR=5;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163877;STB=0.531821;TYPE=snp;VARB=0.0276763;OID=.;OPOS=228504591;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:16:16:9:9:7:7:5:2:4:5:5:2:3:6 chr1 228504669 . G A 49.9 PASS AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.0322523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.21;QD=12.474;RBI=0.0430581;REFB=-0.00457047;REVB=0.0285271;RO=7;SAF=3;SAR=6;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186168;STB=0.608447;TYPE=snp;VARB=0.0102764;OID=.;OPOS=228504669;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:16:16:7:7:9:9:6:3:4:3:6:3:4:3 chr1 228505204 . G A 128.88 PASS AO=22;DP=34;FAO=22;FDP=34;FR=.;FRO=12;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.0685691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.9245;QD=15.1621;RBI=0.0777907;REFB=-0.0631719;REVB=-0.0367378;RO=11;SAF=15;SAR=7;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202733;STB=0.628371;TYPE=snp;VARB=0.0392181;OID=.;OPOS=228505204;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:34:34:11:12:22:22:7:15:4:7:7:15:4:8 chr1 228505668 . C G 106.99 PASS AO=24;DP=50;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=23;FSAR=1;FSRF=22;FSRR=4;FWDB=0.012724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.304;QD=8.55891;RBI=0.0879301;REFB=-0.00882923;REVB=-0.0870046;RO=26;SAF=23;SAR=1;SRF=22;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.37307;STB=0.718503;TYPE=snp;VARB=0.013351;OID=.;OPOS=228505668;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:26:26:24:24:1:23:22:4:1:23:22:4 chr1 228505739 . G A 16.18 PASS AO=3;DP=13;FAO=4;FDP=14;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0352264;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.912;QD=4.62356;RBI=0.0425599;REFB=-0.00786672;REVB=-0.023884;RO=10;SAF=1;SAR=2;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0411706;STB=0.545218;TYPE=snp;VARB=0.0472385;OID=.;OPOS=228505739;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:13:14:10:10:3:4:2:1:3:7:3:1:3:7 chr1 228509427 . A G 174.63 PASS AO=27;DP=56;FAO=35;FDP=63;FR=.;FRO=28;FSAF=25;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=0.0388567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.2895;QD=11.0873;RBI=0.0529527;REFB=-0.0626766;REVB=-0.0359743;RO=28;SAF=19;SAR=8;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0640739;STB=0.537612;TYPE=snp;VARB=0.0656667;OID=.;OPOS=228509427;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:63:28:28:27:35:8:19:18:10:10:25:18:10 chr1 228525008 . G A 198.62 PASS AO=47;DP=99;FAO=47;FDP=98;FR=.;FRO=51;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=30;FSRR=21;FWDB=0.0121469;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.589;QD=8.10709;RBI=0.0343591;REFB=-0.0152295;REVB=0.0321403;RO=49;SAF=21;SAR=26;SRF=29;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132858;STB=0.57325;TYPE=snp;VARB=0.0262722;OID=.;OPOS=228525008;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:98:49:51:47:47:26:21:29:20:26:21:30:21 chr1 228526011 . C T 110.36 PASS AO=25;DP=53;FAO=25;FDP=52;FR=.;FRO=27;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.00687389;FXX=0.0188644;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.872;QD=8.4889;RBI=0.0109391;REFB=-0.0199741;REVB=0.0085096;RO=25;SAF=16;SAR=9;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111642;STB=0.546304;TYPE=snp;VARB=0.0184539;OID=.;OPOS=228526011;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:52:25:27:25:25:9:16:13:12:9:16:15:12 chr1 228547901 . C T 108.75 PASS AO=26;DP=56;FAO=26;FDP=56;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=0.00151442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.6;QD=7.76776;RBI=0.0468226;REFB=-0.00536707;REVB=0.0467981;RO=30;SAF=16;SAR=10;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0481806;STB=0.5272;TYPE=snp;VARB=0.0109188;OID=.;OPOS=228547901;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:30:30:26:26:10:16:17:13:10:16:17:13 chr1 228559994 . C T 471.62 PASS AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.066;QD=38.4999;RBI=0.030845;REFB=0;REVB=0.0143926;RO=0;SAF=19;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.48867e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000289676;OID=.;OPOS=228559994;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:49:49:0:0:49:49:30:19:0:0:30:19:0:0 chr1 228560139 . A G 183.12 PASS AO=18;DP=18;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.306;QD=38.5523;RBI=0.0261774;REFB=0;REVB=0.0141566;RO=0;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000628179;OID=.;OPOS=228560139;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:18:19:0:0:18:19:9:9:0:0:10:9:0:0 chr1 228560700 . T C 774.4 PASS AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0364534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9596;QD=37.7755;RBI=0.0580071;REFB=0;REVB=-0.0451218;RO=0;SAF=50;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000565618;OID=.;OPOS=228560700;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:82:82:0:0:82:82:32:50:0:0:32:50:0:0 chr1 228612838 . G T 385.46 PASS AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0154401;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.663;QD=37.6055;RBI=0.0156458;REFB=0;REVB=0.00252859;RO=0;SAF=11;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.72835e-05;OID=.;OPOS=228612838;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:41:41:0:0:41:41:30:11:0:0:30:11:0:0 chr1 228612892 . G A 174.61 PASS AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108957;FXX=0.0526039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.063;QD=38.8014;RBI=0.033685;REFB=0;REVB=0.0318741;RO=0;SAF=4;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000853112;OID=.;OPOS=228612892;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:18:0:0:18:18:14:4:0:0:14:4:0:0 chr1 228699477 . T C 116.23 PASS AO=33;DP=82;FAO=33;FDP=82;FR=.;FRO=49;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=28;FSRR=21;FWDB=-0.0675296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.4733;QD=5.66959;RBI=0.0682006;REFB=-0.0196268;REVB=-0.00954297;RO=46;SAF=17;SAR=16;SRF=28;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.096705;STB=0.533708;TYPE=snp;VARB=0.0314674;OID=.;OPOS=228699477;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:46:49:33:33:16:17:28:18:16:17:28:21 chr1 228743499 . C A 598.16 PASS AO=65;DP=65;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.024762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.389;QD=37.3849;RBI=0.0336065;REFB=0;REVB=-0.0227208;RO=0;SAF=51;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.42226e-05;OID=.;OPOS=228743499;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:65:64:0:0:65:64:14:51:0:0:14:50:0:0 chr1 228743576 . G A 76.55 PASS AO=29;DP=92;FAO=29;FDP=91;FR=.;FRO=62;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=38;FSRR=24;FWDB=0.00283667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.1518;QD=3.36497;RBI=0.0723181;REFB=-0.00912587;REVB=0.0722624;RO=61;SAF=14;SAR=15;SRF=39;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181452;STB=0.588176;TYPE=snp;VARB=0.0227197;OID=.;OPOS=228743576;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:92:91:61:62:29:29:15:14:39:22:15:14:38:24 chr1 229611468 . AC A 392.02 PASS AO=55;DP=77;FAO=70;FDP=76;FR=.;FRO=6;FSAF=16;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.337818;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.7393;QD=20.6327;RBI=0.361604;REFB=0.0747457;REVB=-0.128983;RO=12;SAF=9;SAR=46;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0.492308;SSSB=-0.177935;STB=0.526308;TYPE=del;VARB=-0.00108403;OID=.;OPOS=229611469;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:55:74:70:76:6:16:54:0:6:13:12:9:46:6:6 chr1 229623292 . G A 398.49 PASS AO=106;DP=236;FAO=106;FDP=237;FR=.;FRO=131;FSAF=46;FSAR=60;FSRF=59;FSRR=72;FWDB=-0.0132073;FXX=0.0165968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.785;QD=6.72549;RBI=0.0156499;REFB=0.000175343;REVB=0.00839572;RO=125;SAF=46;SAR=60;SRF=57;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218561;STB=0.509213;TYPE=snp;VARB=-0.000393555;OID=.;OPOS=229623292;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:236:237:125:131:106:106:60:46:57:68:60:46:59:72 chr1 229663064 . GAGGAA G 436.77 PASS AO=56;DP=87;FAO=60;FDP=75;FR=.;FRO=15;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.0305336;FXX=0.137915;HRUN=1;LEN=5;MLLD=168.612;QD=23.2944;RBI=0.0306218;REFB=-0.0291997;REVB=-0.00232296;RO=0;SAF=25;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506773;TYPE=del;VARB=0.00986029;OID=.;OPOS=229663065;OREF=AGGAA;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:56:73:60:75:15:26:34:7:8:20:0:25:31:0:0 chr1 229730452 . G A 519.57 PASS AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00358793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.326;QD=37.7866;RBI=0.0410097;REFB=0;REVB=0.0408525;RO=0;SAF=26;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40922e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000373441;OID=.;OPOS=229730452;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:55:55:0:0:55:55:29:26:0:0:29:26:0:0 chr1 229730691 . T C 175.6 PASS AO=56;DP=143;FAO=55;FDP=143;FR=.;FRO=88;FSAF=24;FSAR=31;FSRF=58;FSRR=30;FWDB=0.00963414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.4349;QD=4.91175;RBI=0.0097308;REFB=0.0021051;REVB=0.00136814;RO=87;SAF=25;SAR=31;SRF=57;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22211;STB=0.634501;TYPE=snp;VARB=-0.00440387;OID=.;OPOS=229730691;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:87:88:56:55:31:25:57:30:31:24:58:30 chr1 229738170 . T G 2165.41 PASS AO=226;DP=228;FAO=228;FDP=228;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=147;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162409;FXX=0.0129865;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.055;QD=37.9896;RBI=0.0253274;REFB=-0.0316782;REVB=0.0194347;RO=0;SAF=80;SAR=146;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.62869e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.92073e-05;OID=.;OPOS=229738170;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:94:228:228:0:0:226:228:146:80:0:0:147:81:0:0 chr1 229738236 . G A 1169.47 PASS AO=146;DP=169;FAO=153;FDP=174;FR=.;FRO=21;FSAF=63;FSAR=90;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.00108929;FXX=0.0491776;HRUN=6;LEN=1;MLLD=112.567;QD=26.8843;RBI=0.0161749;REFB=-0.0650033;REVB=0.0161382;RO=21;SAF=63;SAR=83;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0355271;STB=0.509803;TYPE=snp;VARB=0.00118761;OID=.;OPOS=229738236;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:169:174:21:21:146:153:83:63:6:15:90:63:7:14 chr1 229772692 . GT G,GG 559.64 PASS AO=12,45;DP=61;FAO=8,52;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=0,19;FSAR=8,33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124481,0.0589049;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=122.908,135.505;QD=37.3092;RBI=0.0400388,0.070954;REFB=0,0;REVB=0.0380545,0.0395561;RO=1;SAF=1,18;SAR=11,27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0393232,0.0170902;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0280565,0.00444484;OID=.,.;OPOS=229772693,229772693;OREF=T,T;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:12,45:60:8,52:60:0:0,19:8,33:0:0:5:1:1,18:11,27:0:1 chr1 229790048 . A G 3814.01 PASS AO=425;DP=429;FAO=398;FDP=398;FR=.;FRO=0;FSAF=191;FSAR=207;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00252898;FXX=0.00499988;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.4671;QD=38.3318;RBI=0.00829542;REFB=-0.0134904;REVB=-0.00790053;RO=3;SAF=207;SAR=218;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00205838;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.38157e-05;OID=.;OPOS=229790048;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:429:398:3:0:425:398:218:207:1:2:207:191:0:0 chr1 230841687 . T C 151.34 PASS AO=41;DP=96;FAO=41;FDP=96;FR=.;FRO=55;FSAF=32;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=34;FWDB=-0.0341155;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.2652;QD=6.3059;RBI=0.10373;REFB=-0.0232698;REVB=-0.0979594;RO=55;SAF=32;SAR=9;SRF=21;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.428362;STB=0.742455;TYPE=snp;VARB=0.0178071;OID=.;OPOS=230841687;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:55:55:41:41:9:32:21:34:9:32:21:34 chr1 230845794 . A G 219.64 PASS AO=46;DP=86;FAO=46;FDP=85;FR=.;FRO=39;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=-0.0131962;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.898;QD=10.336;RBI=0.0132099;REFB=-0.00218712;REVB=-0.000601982;RO=38;SAF=21;SAR=25;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0358846;STB=0.525899;TYPE=snp;VARB=0.00177647;OID=.;OPOS=230845794;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:85:38:39:46:46:25:21:19:19:25:21:20:19 chr1 230845797 . AG A 53.77 PASS AO=31;DP=87;FAO=33;FDP=86;FR=.;FRO=53;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=30;FSRR=23;FWDB=0.0953505;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.8074;QD=2.50106;RBI=0.0953902;REFB=-0.0684623;REVB=0.00275458;RO=44;SAF=9;SAR=22;SRF=29;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.37903;STB=0.64558;TYPE=del;VARB=0.129745;OID=.;OPOS=230845798;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:31:86:33:86:53:11:22:30:23:53:44:9:22:29:15 chr1 230914729 . A C 371.79 PASS AO=79;DP=149;FAO=80;FDP=148;FR=.;FRO=68;FSAF=37;FSAR=43;FSRF=40;FSRR=28;FWDB=-0.0064011;FXX=0.00671096;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.556;QD=10.0484;RBI=0.0263732;REFB=-0.012112;REVB=-0.0255846;RO=68;SAF=37;SAR=42;SRF=40;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101038;STB=0.557581;TYPE=snp;VARB=0.0124815;OID=.;OPOS=230914729;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:148:68:68:79:80:42:37:40:28:43:37:40:28 chr1 230923313 . C T 144.83 PASS AO=42;DP=105;FAO=42;FDP=104;FR=.;FRO=62;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=31;FSRR=31;FWDB=-0.00502177;FXX=0.0188661;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.161;QD=5.57053;RBI=0.0211793;REFB=-0.0027287;REVB=0.0205753;RO=61;SAF=20;SAR=22;SRF=30;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0163754;STB=0.5142;TYPE=snp;VARB=0.0037196;OID=.;OPOS=230923313;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:104:61:62:42:42:22:20:30:31:22:20:31:31 chr1 230937375 . G A 10.38 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.174;QD=5.93131;RBI=0.0458036;REFB=-0.0177391;REVB=-0.0458036;RO=5;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0290836;OID=.;OPOS=230937375;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:5:5:2:2:2:0:0:5:2:0:0:5 chr1 231042732 . T A 357.36 PASS AO=75;DP=150;FAO=79;FDP=151;FR=.;FRO=72;FSAF=50;FSAR=29;FSRF=36;FSRR=36;FWDB=0.00222257;FXX=0.013071;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.771;QD=9.46658;RBI=0.0156764;REFB=-0.0221962;REVB=0.015518;RO=74;SAF=50;SAR=25;SRF=37;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158812;STB=0.565791;TYPE=snp;VARB=0.0217822;OID=.;OPOS=231042732;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:151:74:72:75:79:25:50:37:37:29:50:36:36 chr1 231353589 . A G 1072.46 PASS AO=92;DP=115;FAO=112;FDP=112;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=59;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0180136;FXX=0.0260847;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.334;QD=38.3022;RBI=0.0480529;REFB=0;REVB=0.0445487;RO=0;SAF=57;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.61895e-06;OID=.;OPOS=231353589;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:113:112:0:0:92:112:35:57:0:0:53:59:0:0 chr1 231355917 . GC G,GG 1072.47 PASS AO=32,96;DP=140;FAO=132,4;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=54,4;FSAR=78,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0420734,-0.0271643;FXX=0.0354585;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=196.238,190.212;QD=31.5432;RBI=0.0455952,0.0326388;REFB=0,0;REVB=0.0175712,0.0180939;RO=0;SAF=6,43;SAR=26,53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.0019935,0.00572013;OID=.,.;OPOS=231355918,231355918;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:32,96:133:132,4:136:0:54,4:78,0:0:0:16:0:6,43:26,53:0:0 chr1 231357102 . G C 564.48 PASS AO=141;DP=296;FAO=141;FDP=296;FR=.;FRO=155;FSAF=112;FSAR=29;FSRF=73;FSRR=82;FWDB=-0.00499302;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=274.185;QD=7.62811;RBI=0.011232;REFB=0.00456471;REVB=-0.0100612;RO=155;SAF=112;SAR=29;SRF=73;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.35732;STB=0.698514;TYPE=snp;VARB=-0.00284219;OID=.;OPOS=231357102;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:296:296:155:155:141:141:29:112:73:82:29:112:73:82 chr1 231401902 . G A 509.31 PASS AO=111;DP=215;FAO=113;FDP=215;FR=.;FRO=102;FSAF=36;FSAR=77;FSRF=39;FSRR=63;FWDB=0.00894107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.315;QD=9.4755;RBI=0.00895448;REFB=-0.0110758;REVB=0.000489826;RO=101;SAF=33;SAR=78;SRF=39;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0886888;STB=0.533974;TYPE=snp;VARB=0.0145952;OID=.;OPOS=231401902;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:215:101:102:111:113:78:33:39:62:77:36:39:63 chr1 231488524 . C T 400.83 PASS AO=105;DP=222;FAO=103;FDP=223;FR=.;FRO=120;FSAF=51;FSAR=52;FSRF=56;FSRR=64;FWDB=-0.0131947;FXX=0.00446409;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.6942;QD=7.1897;RBI=0.0255877;REFB=-0.020255;REVB=-0.0219233;RO=116;SAF=53;SAR=52;SRF=53;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0455269;STB=0.515328;TYPE=snp;VARB=0.0249433;OID=.;OPOS=231488524;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:223:116:120:105:103:52:53:53:63:52:51:56:64 chr1 231489054 . GA G 415.54 PASS AO=46;DP=73;FAO=70;FDP=73;FR=.;FRO=3;FSAF=0;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=17.434;QD=22.7692;RBI=0.211312;REFB=-0.188378;REVB=0.211312;RO=26;SAF=0;SAR=46;SRF=0;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.212788;OID=.;OPOS=231489055;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:46:73:70:73:3:0:70:0:3:8:26:0:46:0:26 chr1 231664607 . C T 122.45 PASS AO=28;DP=58;FAO=28;FDP=58;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=0.03718;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.764;QD=8.44507;RBI=0.0379842;REFB=-0.0199524;REVB=-0.00777472;RO=30;SAF=12;SAR=16;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127236;STB=0.571378;TYPE=snp;VARB=0.0233704;OID=.;OPOS=231664607;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:30:30:28:28:16:12:17:13:16:12:17:13 chr1 231906589 . C T 192.85 PASS AO=37;DP=66;FAO=38;FDP=67;FR=.;FRO=29;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.0239832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.926;QD=11.5134;RBI=0.0347214;REFB=-0.0357969;REVB=-0.0251075;RO=29;SAF=19;SAR=18;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00297307;STB=0.503935;TYPE=snp;VARB=0.0204689;OID=.;OPOS=231906589;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:67:29:29:37:38:18:19:15:14:18:20:15:14 chr1 231931048 . T C 403.26 PASS AO=100;DP=211;FAO=100;FDP=211;FR=.;FRO=111;FSAF=40;FSAR=60;FSRF=45;FSRR=66;FWDB=0.00240831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.474;QD=7.64464;RBI=0.00512622;REFB=-0.000177836;REVB=-0.00452528;RO=110;SAF=40;SAR=60;SRF=45;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00896959;STB=0.502958;TYPE=snp;VARB=0.000193347;OID=.;OPOS=231931048;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:211:110:111:100:100:60:40:45:65:60:40:45:66 chr1 231954101 . C T 1226.73 PASS AO=137;DP=141;FAO=137;FDP=141;FR=.;FRO=4;FSAF=83;FSAR=54;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.00172506;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3438;QD=34.8009;RBI=0.0201475;REFB=-0.129514;REVB=0.0200735;RO=4;SAF=84;SAR=53;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0205222;STB=0.503139;TYPE=snp;VARB=0.00538689;OID=.;OPOS=231954101;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:141:141:4:4:137:137:53:84:1:3:54:83:2:2 chr1 232534957 . T C 64.9 PASS AO=28;DP=96;FAO=28;FDP=96;FR=.;FRO=68;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=48;FWDB=-0.0374148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.59;QD=2.70397;RBI=0.0397892;REFB=-0.015808;REVB=-0.0135393;RO=68;SAF=10;SAR=18;SRF=20;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0848982;STB=0.549966;TYPE=snp;VARB=0.0373888;OID=.;OPOS=232534957;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:96:96:68:68:28:28:18:10:20:48:18:10:20:48 chr1 232564297 . T A 359.16 PASS AO=85;DP=178;FAO=88;FDP=182;FR=.;FRO=94;FSAF=28;FSAR=60;FSRF=40;FSRR=54;FWDB=-0.0322667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.129;QD=7.89364;RBI=0.0410105;REFB=-0.00154881;REVB=-0.0253123;RO=93;SAF=25;SAR=60;SRF=39;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133417;STB=0.561042;TYPE=snp;VARB=0.00107019;OID=.;OPOS=232564297;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:182:93:94:85:88:60:25:39:54:60:28:40:54 chr1 232650750 . A G 1918.17 PASS AO=191;DP=191;FAO=202;FDP=202;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00215278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.55;QD=37.9835;RBI=0.00736484;REFB=0;REVB=-0.00704318;RO=0;SAF=76;SAR=115;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.91729e-06;OID=.;OPOS=232650750;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:91:191:202:0:0:191:202:115:76:0:0:120:82:0:0 chr1 232941153 . C T 107.82 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.869;QD=35.9384;RBI=0.0384446;REFB=0;REVB=0.0384446;RO=0;SAF=0;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000259216;OID=.;OPOS=232941153;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:12:0:0:0:12:0:0:0 chr1 232944569 . C T 978.6 PASS AO=102;DP=102;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.592;QD=38.0039;RBI=0.0132456;REFB=0;REVB=0.00377037;RO=0;SAF=51;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.03617e-05;OID=.;OPOS=232944569;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:102:103:0:0:102:103:51:51:0:0:52:51:0:0 chr1 232967889 . T C 1034.57 PASS AO=113;DP=118;FAO=115;FDP=120;FR=.;FRO=5;FSAF=40;FSAR=75;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.0449214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.156;QD=34.4856;RBI=0.0514357;REFB=-0.103031;REVB=0.0250539;RO=1;SAF=39;SAR=74;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00637395;STB=0.506815;TYPE=snp;VARB=0.0004221;OID=.;OPOS=232967889;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:118:120:1:5:113:115:74:39:0:1:75:40:1:4 chr1 233134115 . GGC G 430.62 PASS AO=46;DP=80;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.196461;FXX=0;HRUN=4;LEN=2;MLLD=17.9566;QD=23.9234;RBI=0.302055;REFB=-0.116941;REVB=0.229435;RO=20;SAF=15;SAR=31;SRF=1;SRR=19;SSEN=0.445946;SSEP=0;SSSB=0.189803;STB=0.504761;TYPE=del;VARB=0.00719153;OID=.;OPOS=233134116;OREF=GC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:46:71:71:72:1:19:52:0:1:31:20:15:31:1:19 chr1 233515413 . G A 169.12 PASS AO=43;DP=94;FAO=43;FDP=95;FR=.;FRO=52;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=33;FWDB=0.0346419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.355;QD=7.12077;RBI=0.0346902;REFB=-0.00549563;REVB=0.00182882;RO=51;SAF=23;SAR=20;SRF=19;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156675;STB=0.591993;TYPE=snp;VARB=0.00749798;OID=.;OPOS=233515413;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:95:51:52:43:43:20:23:19:32:20:23:19:33 chr1 233518983 . G GT 179.69 PASS AO=130;DP=460;FAO=132;FDP=384;FR=.;FRO=252;FSAF=55;FSAR=77;FSRF=104;FSRR=148;FWDB=0.0181668;FXX=0.039999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=20.2135;QD=1.87173;RBI=0.0307351;REFB=0.00715659;REVB=-0.0247914;RO=307;SAF=46;SAR=84;SRF=129;SRR=178;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0851642;STB=0.502681;TYPE=ins;VARB=-0.0155654;OID=.;OPOS=233518984;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:130:460:132:384:252:55:77:104:148:99:307:46:84:129:178 chr1 233518998 . C T 351.31 PASS AO=160;DP=446;FAO=136;FDP=396;FR=.;FRO=260;FSAF=55;FSAR=81;FSRF=108;FSRR=152;FWDB=0.00378152;FXX=0.00999975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.3493;QD=3.54855;RBI=0.0759174;REFB=-0.0172008;REVB=-0.0758232;RO=282;SAF=64;SAR=96;SRF=116;SRR=166;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0132949;STB=0.507455;TYPE=snp;VARB=0.0348462;OID=.;OPOS=233518998;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:446:396:282:260:160:136:96:64:116:166:81:55:108:152 chr1 233520845 . T C 205.36 PASS AO=49;DP=102;FAO=49;FDP=102;FR=.;FRO=53;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=27;FSRR=26;FWDB=-0.00111859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.936;QD=8.05342;RBI=0.0037956;REFB=0.00758635;REVB=0.00362703;RO=53;SAF=25;SAR=24;SRF=27;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000720551;STB=0.5004;TYPE=snp;VARB=-0.00994682;OID=.;OPOS=233520845;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:53:53:49:49:24:25:27:26:24:25:27:26 chr1 233759918 . T C 180.32 PASS AO=45;DP=98;FAO=45;FDP=98;FR=.;FRO=53;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=27;FSRR=26;FWDB=0.00163185;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=179.288;QD=7.36015;RBI=0.00571418;REFB=-0.0129234;REVB=-0.00547621;RO=53;SAF=19;SAR=26;SRF=27;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0852087;STB=0.547598;TYPE=snp;VARB=0.0254384;OID=.;OPOS=233759918;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:53:53:45:45:26:19:27:26:26:19:27:26 chr1 233759939 . C T 141.81 PASS AO=34;DP=81;FAO=38;FDP=87;FR=.;FRO=49;FSAF=9;FSAR=29;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=0.0162381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.827;QD=6.52017;RBI=0.0230052;REFB=-0.0282472;REVB=0.0162961;RO=46;SAF=6;SAR=28;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.394593;STB=0.684319;TYPE=snp;VARB=0.0221631;OID=.;OPOS=233759939;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:87:46:49:34:38:28:6:23:23:29:9:26:23 chr1 234041422 . G C 582.02 PASS AO=62;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0314692;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6938;QD=36.3761;RBI=0.0517538;REFB=0;REVB=-0.0410871;RO=0;SAF=35;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.46408e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000483987;OID=.;OPOS=234041422;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:64:64:0:0:62:64:27:35:0:0:28:36:0:0 chr1 234509259 . G C 436.74 PASS AO=45;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.161592;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.4428;QD=37.9772;RBI=0.166725;REFB=0;REVB=0.0410536;RO=0;SAF=14;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00150255;OID=.;OPOS=234509259;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:46:46:0:0:45:46:31:14:0:0:32:14:0:0 chr1 234509972 . A G 519.19 PASS AO=122;DP=245;FAO=122;FDP=244;FR=.;FRO=122;FSAF=63;FSAR=59;FSRF=66;FSRR=56;FWDB=0.0108553;FXX=0.00408147;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.662;QD=8.51135;RBI=0.0198962;REFB=-0.0196081;REVB=0.016674;RO=122;SAF=63;SAR=59;SRF=66;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0224479;STB=0.512316;TYPE=snp;VARB=0.0172541;OID=.;OPOS=234509972;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:245:244:122:122:122:122:59:63:66:56:59:63:66:56 chr1 234529519 . C T 1604.62 PASS AO=167;DP=170;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00128303;FXX=0.0289001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.165;QD=38.2053;RBI=0.00656095;REFB=0;REVB=0.00643427;RO=0;SAF=53;SAR=114;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.49507e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.15599e-05;OID=.;OPOS=234529519;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:170:168:0:0:167:168:114:53:0:0:115:53:0:0 chr1 234529540 . G A 1296.88 PASS AO=133;DP=134;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0258579;FXX=0.0287749;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.722;QD=38.4261;RBI=0.0274411;REFB=0;REVB=-0.00918597;RO=0;SAF=39;SAR=94;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.74065e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000178296;OID=.;OPOS=234529540;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:134:135:0:0:133:135:94:39:0:0:94:41:0:0 chr1 234529552 . C T 1249.79 PASS AO=131;DP=131;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0317568;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.009;QD=38.1617;RBI=0.0318378;REFB=0;REVB=-0.00226996;RO=0;SAF=42;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.62864e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.18996e-05;OID=.;OPOS=234529552;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:131:131:0:0:131:131:89:42:0:0:89:42:0:0 chr1 234529570 . G A 1142.15 PASS AO=117;DP=117;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00611351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.895;QD=38.3916;RBI=0.0260552;REFB=0;REVB=-0.0253278;RO=0;SAF=32;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.8598e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.25453e-05;OID=.;OPOS=234529570;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:117:119:0:0:117:119:85:32:0:0:85:34:0:0 chr1 234541801 . A G 314.83 PASS AO=63;DP=115;FAO=64;FDP=115;FR=.;FRO=51;FSAF=28;FSAR=36;FSRF=35;FSRR=16;FWDB=-0.0214494;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=133.558;QD=10.9505;RBI=0.0261796;REFB=-0.00122757;REVB=-0.0150098;RO=51;SAF=28;SAR=35;SRF=35;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195671;STB=0.608989;TYPE=snp;VARB=0.000624484;OID=.;OPOS=234541801;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:51:51:63:64:35:28:35:16:36:28:35:16 chr1 234546245 . C T 151.35 PASS AO=39;DP=88;FAO=39;FDP=88;FR=.;FRO=49;FSAF=29;FSAR=10;FSRF=29;FSRR=20;FWDB=-0.00297695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.7348;QD=6.87952;RBI=0.00415084;REFB=-0.0135629;REVB=0.00289262;RO=49;SAF=29;SAR=10;SRF=29;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176807;STB=0.599945;TYPE=snp;VARB=0.0099464;OID=.;OPOS=234546245;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:49:49:39:39:10:29:29:20:10:29:29:20 chr1 234565176 . C T 506.16 PASS AO=99;DP=195;FAO=111;FDP=205;FR=.;FRO=94;FSAF=65;FSAR=46;FSRF=42;FSRR=52;FWDB=0.0194432;FXX=0.00485413;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.8008;QD=9.87635;RBI=0.0832724;REFB=-0.0330382;REVB=0.0809707;RO=94;SAF=64;SAR=35;SRF=42;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182253;STB=0.564105;TYPE=snp;VARB=0.0223013;OID=.;OPOS=234565176;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:205:94:94:99:111:35:64:42:52:46:65:42:52 chr1 234569192 . T C 1485.25 PASS AO=158;DP=160;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00605258;FXX=0.0124216;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.578;QD=37.3648;RBI=0.0206861;REFB=-0.0281012;REVB=0.0197809;RO=1;SAF=90;SAR=68;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00694532;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.64992e-05;OID=.;OPOS=234569192;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:160:159:1:0:158:159:68:90:0:1:68:91:0:0 chr1 234582720 . C T 222.07 PASS AO=64;DP=163;FAO=66;FDP=163;FR=.;FRO=97;FSAF=30;FSAR=36;FSRF=34;FSRR=63;FWDB=0.0174376;FXX=0.0121205;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.6993;QD=5.44968;RBI=0.0204051;REFB=-0.020799;REVB=-0.0105972;RO=97;SAF=28;SAR=36;SRF=34;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0960117;STB=0.563121;TYPE=snp;VARB=0.0336253;OID=.;OPOS=234582720;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:163:97:97:64:66:36:28:34:63:36:30:34:63 chr1 234584288 . G A 138.62 PASS AO=37;DP=86;FAO=37;FDP=86;FR=.;FRO=49;FSAF=12;FSAR=25;FSRF=16;FSRR=33;FWDB=-0.0307825;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.288;QD=6.4473;RBI=0.0326759;REFB=-0.00769447;REVB=0.0109614;RO=49;SAF=12;SAR=25;SRF=16;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00254099;STB=0.501432;TYPE=snp;VARB=0.0109787;OID=.;OPOS=234584288;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:49:49:37:37:25:12:16:33:25:12:16:33 chr1 234740141 . G A 165.64 PASS AO=48;DP=118;FAO=48;FDP=118;FR=.;FRO=70;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=37;FSRR=33;FWDB=-0.114888;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.6829;QD=5.61502;RBI=0.116248;REFB=-0.0109696;REVB=0.017729;RO=69;SAF=25;SAR=23;SRF=37;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0161472;STB=0.504598;TYPE=snp;VARB=0.0187318;OID=.;OPOS=234740141;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:69:70:48:48:23:25:37:32:23:25:37:33 chr1 234740880 . C T 216.31 PASS AO=68;DP=175;FAO=68;FDP=175;FR=.;FRO=107;FSAF=41;FSAR=27;FSRF=69;FSRR=38;FWDB=0.00500353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4196;QD=4.94418;RBI=0.0163401;REFB=-0.0132881;REVB=-0.0155552;RO=105;SAF=41;SAR=27;SRF=67;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0399328;STB=0.527055;TYPE=snp;VARB=0.0237077;OID=.;OPOS=234740880;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:175:105:107:68:68:27:41:67:38:27:41:69:38 chr1 234740917 . C CAGTTATAAT 184.98 PASS AO=68;DP=215;FAO=71;FDP=210;FR=.;FRO=139;FSAF=45;FSAR=26;FSRF=89;FSRR=50;FWDB=-0.0185374;FXX=0.0277765;HRUN=3;LEN=9;MLLD=260.206;QD=3.52345;RBI=0.0236181;REFB=-0.0030165;REVB=-0.0146349;RO=137;SAF=44;SAR=24;SRF=87;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.01522;STB=0.504634;TYPE=ins;VARB=0.00574261;OID=.;OPOS=234740918;OREF=-;OALT=AGTTATAAT;OMAPALT=CAGTTATAAT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:68:215:71:210:139:45:26:89:50:99:137:44:24:87:50 chr1 234743237 . G A 79.01 PASS AO=25;DP=71;FAO=25;FDP=70;FR=.;FRO=45;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=0.0152194;FXX=0.0140825;HRUN=4;LEN=1;MLLD=111.156;QD=4.51501;RBI=0.0203106;REFB=-0.00319658;REVB=0.0134495;RO=42;SAF=15;SAR=10;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0584081;STB=0.529388;TYPE=snp;VARB=0.00541736;OID=.;OPOS=234743237;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:71:70:42:45:25:25:10:15:23:19:10:15:25:20 chr1 235040004 . G A 358.15 PASS AO=21;DP=42;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0184199;FXX=0.0238039;HRUN=3;LEN=1;MLLD=229.878;QD=34.9418;RBI=0.0256008;REFB=-0.032365;REVB=0.0177795;RO=0;SAF=1;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.78928e-08;STB=0.509799;TYPE=snp;VARB=0.000126471;OID=.;OPOS=235040004;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:23:41:0:1:21:40:20:1:0:0:25:15:0:1 chr1 235285711 . T A 745.45 PASS AO=185;DP=384;FAO=185;FDP=384;FR=.;FRO=199;FSAF=71;FSAR=114;FSRF=77;FSRR=122;FWDB=-0.0236477;FXX=0.00259734;HRUN=3;LEN=1;MLLD=250.953;QD=7.7651;RBI=0.02511;REFB=-0.00649794;REVB=-0.0084438;RO=199;SAF=71;SAR=114;SRF=77;SRR=122;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00313914;STB=0.501725;TYPE=snp;VARB=0.00754957;OID=.;OPOS=235285711;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:384:384:199:199:185:185:114:71:77:122:114:71:77:122 chr1 235323651 . G C 146.76 PASS AO=36;DP=82;FAO=37;FDP=82;FR=.;FRO=45;FSAF=30;FSAR=7;FSRF=38;FSRR=7;FWDB=0.00495162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.13;QD=7.15888;RBI=0.0533851;REFB=-0.0156243;REVB=0.053155;RO=45;SAF=29;SAR=7;SRF=38;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0643518;STB=0.531234;TYPE=snp;VARB=0.0205032;OID=.;OPOS=235323651;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:45:45:36:37:7:29:38:7:7:30:38:7 chr1 235324298 . T C 316.91 PASS AO=65;DP=116;FAO=65;FDP=117;FR=.;FRO=52;FSAF=25;FSAR=40;FSRF=12;FSRR=40;FWDB=0.00175317;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=254.28;QD=10.8344;RBI=0.0064873;REFB=-0.00817778;REVB=0.00624591;RO=51;SAF=25;SAR=40;SRF=11;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149644;STB=0.574691;TYPE=snp;VARB=0.00590504;OID=.;OPOS=235324298;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:117:51:52:65:65:40:25:11:40:40:25:12:40 chr1 235331289 . T C 495.42 PASS AO=135;DP=304;FAO=135;FDP=304;FR=.;FRO=169;FSAF=59;FSAR=76;FSRF=71;FSRR=98;FWDB=0.0411717;FXX=0.00327858;HRUN=3;LEN=1;MLLD=95.3246;QD=6.51871;RBI=0.0433079;REFB=-0.00572748;REVB=-0.0134337;RO=163;SAF=59;SAR=76;SRF=67;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0262221;STB=0.509579;TYPE=snp;VARB=0.00636357;OID=.;OPOS=235331289;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:304:304:163:169:135:135:76:59:67:96:76:59:71:98 chr1 235340261 . C T 273.34 PASS AO=62;DP=121;FAO=62;FDP=122;FR=.;FRO=60;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=19;FSRR=41;FWDB=-0.00374751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.453;QD=8.96189;RBI=0.0104884;REFB=-0.0180972;REVB=0.0097961;RO=59;SAF=26;SAR=36;SRF=19;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0900597;STB=0.552717;TYPE=snp;VARB=0.0176353;OID=.;OPOS=235340261;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:122:59:60:62:62:36:26:19:40:36:26:19:41 chr1 235505379 . T C 144.27 PASS AO=43;DP=109;FAO=43;FDP=109;FR=.;FRO=66;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=34;FSRR=32;FWDB=-0.0168856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.053;QD=5.29419;RBI=0.0226559;REFB=-0.00670436;REVB=0.0151052;RO=66;SAF=23;SAR=20;SRF=34;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0211347;STB=0.511981;TYPE=snp;VARB=0.00989425;OID=.;OPOS=235505379;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:66:66:43:43:20:23:34:32:20:23:34:32 chr1 235506184 . A G 668.62 PASS AO=166;DP=370;FAO=174;FDP=377;FR=.;FRO=203;FSAF=98;FSAR=76;FSRF=93;FSRR=110;FWDB=-0.000904924;FXX=0.00264543;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.022;QD=7.09411;RBI=0.000992519;REFB=-0.0111481;REVB=-0.000407684;RO=202;SAF=98;SAR=68;SRF=93;SRR=109;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129863;STB=0.556676;TYPE=snp;VARB=0.0127577;OID=.;OPOS=235506184;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:370:377:202:203:166:174:68:98:93:109:76:98:93:110 chr1 235600723 . A G 428.3 PASS AO=94;DP=180;FAO=94;FDP=179;FR=.;FRO=85;FSAF=41;FSAR=53;FSRF=36;FSRR=49;FWDB=0.0168668;FXX=0.00555525;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.6162;QD=9.57092;RBI=0.050332;REFB=0.00280214;REVB=-0.0474217;RO=86;SAF=41;SAR=53;SRF=36;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0156094;STB=0.50611;TYPE=snp;VARB=-0.00343848;OID=.;OPOS=235600723;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:179:86:85:94:94:53:41:36:50:53:41:36:49 chr1 235612070 . G A 209.11 PASS AO=66;DP=172;FAO=67;FDP=175;FR=.;FRO=108;FSAF=27;FSAR=40;FSRF=48;FSRR=60;FWDB=-0.0521902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.497;QD=4.77974;RBI=0.0526829;REFB=-0.0233648;REVB=-0.00718787;RO=105;SAF=26;SAR=40;SRF=46;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0495934;STB=0.526308;TYPE=snp;VARB=0.0379227;OID=.;OPOS=235612070;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:175:105:108:66:67:40:26:46:59:40:27:48:60 chr1 235652513 . T C 361.41 PASS AO=87;DP=195;FAO=93;FDP=201;FR=.;FRO=108;FSAF=26;FSAR=67;FSRF=53;FSRR=55;FWDB=0.0455149;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2144;QD=7.19225;RBI=0.0585612;REFB=0.000750083;REVB=0.0368484;RO=108;SAF=20;SAR=67;SRF=53;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.298341;STB=0.625252;TYPE=snp;VARB=-0.00011888;OID=.;OPOS=235652513;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:201:108:108:87:93:67:20:53:55:67:26:53:55 chr1 235705001 . G T 1935.29 PASS AO=205;DP=209;FAO=207;FDP=207;FR=.;FRO=0;FSAF=100;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0267855;FXX=0.00956892;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.3875;QD=37.3969;RBI=0.0364953;REFB=-0.0839926;REVB=0.024788;RO=4;SAF=98;SAR=107;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000801477;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0033144;OID=.;OPOS=235705001;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:209:207:4:0:205:207:107:98:2:2:107:100:0:0 chr1 235715523 . A G 156.55 PASS AO=47;DP=125;FAO=49;FDP=127;FR=.;FRO=78;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=37;FSRR=41;FWDB=0.0297929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.456;QD=4.93073;RBI=0.0536984;REFB=-0.0278349;REVB=0.0446755;RO=78;SAF=23;SAR=24;SRF=37;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0164652;STB=0.503062;TYPE=snp;VARB=0.0450893;OID=.;OPOS=235715523;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:127:78:78:47:49:24:23:37:41:26:23:37:41 chr1 235910542 . C T 508.64 PASS AO=123;DP=250;FAO=123;FDP=252;FR=.;FRO=129;FSAF=54;FSAR=69;FSRF=69;FSRR=60;FWDB=-0.00100921;FXX=0.00395241;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.129;QD=8.07356;RBI=0.0290092;REFB=-0.0258943;REVB=-0.0289917;RO=126;SAF=54;SAR=69;SRF=69;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100166;STB=0.549206;TYPE=snp;VARB=0.0283011;OID=.;OPOS=235910542;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:250:252:126:129:123:123:69:54:69:57:69:54:69:60 chr1 235940450 . C T 441.39 PASS AO=80;DP=227;FAO=119;FDP=264;FR=.,HEALED;FRO=145;FSAF=62;FSAR=57;FSRF=62;FSRR=83;FWDB=-0.000663423;FXX=0.00751851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.189;QD=6.68769;RBI=0.0821232;REFB=-0.00177391;REVB=0.0821205;RO=99;SAF=57;SAR=23;SRF=60;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121282;STB=0.551173;TYPE=snp;VARB=0.00220551;OID=.;OPOS=235940450;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:264:99:145:80:119:23:57:60:39:57:62:62:83 chr1 235945294 . T C 419.86 PASS AO=98;DP=190;FAO=98;FDP=196;FR=.;FRO=98;FSAF=44;FSAR=54;FSRF=50;FSRR=48;FWDB=-0.0125389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.2819;QD=8.56856;RBI=0.0194137;REFB=-0.00622975;REVB=0.0148213;RO=92;SAF=45;SAR=53;SRF=49;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0649012;STB=0.530734;TYPE=snp;VARB=0.00519256;OID=.;OPOS=235945294;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:196:92:98:98:98:53:45:49:43:54:44:50:48 chr1 235972435 . T C 412.37 PASS AO=95;DP=188;FAO=95;FDP=188;FR=.;FRO=93;FSAF=49;FSAR=46;FSRF=42;FSRR=51;FWDB=0.00658927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.166;QD=8.77375;RBI=0.0321675;REFB=-0.0400047;REVB=-0.0314854;RO=93;SAF=49;SAR=46;SRF=42;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0577492;STB=0.531708;TYPE=snp;VARB=0.030252;OID=.;OPOS=235972435;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:188:93:93:95:95:46:49:42:51:46:49:42:51 chr1 235972867 . T C 241.92 PASS AO=62;DP=137;FAO=62;FDP=136;FR=.;FRO=74;FSAF=18;FSAR=44;FSRF=44;FSRR=30;FWDB=-0.00934561;FXX=0.00729874;HRUN=3;LEN=1;MLLD=195.339;QD=7.11538;RBI=0.0318618;REFB=-0.0102585;REVB=-0.0304604;RO=72;SAF=18;SAR=44;SRF=42;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.295282;STB=0.671864;TYPE=snp;VARB=0.0129493;OID=.;OPOS=235972867;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:136:72:74:62:62:44:18:42:30:44:18:44:30 chr1 236175339 . T C 172.57 PASS AO=43;DP=128;FAO=54;FDP=138;FR=.;FRO=84;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=27;FSRR=57;FWDB=0.0418866;FXX=0.00719373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.737;QD=5.0021;RBI=0.0421144;REFB=-0.0152725;REVB=-0.00437373;RO=81;SAF=15;SAR=28;SRF=24;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.06748;STB=0.587722;TYPE=snp;VARB=0.0307881;OID=.;OPOS=236175339;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:138:81:84:43:54:28:15:24:57:29:25:27:57 chr1 236208773 . C T 1542.4 PASS AO=159;DP=159;FAO=160;FDP=160;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0150622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.089;QD=38.56;RBI=0.01665;REFB=0;REVB=0.00709597;RO=0;SAF=77;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.51659e-06;OID=.;OPOS=236208773;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:159:160:0:0:159:160:82:77:0:0:83:77:0:0 chr1 236212038 . G A 331.93 PASS AO=79;DP=167;FAO=81;FDP=170;FR=.;FRO=89;FSAF=48;FSAR=33;FSRF=57;FSRR=32;FWDB=0.0570032;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.8834;QD=7.8101;RBI=0.07422;REFB=0.00254882;REVB=0.0475315;RO=88;SAF=48;SAR=31;SRF=57;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0405137;STB=0.52619;TYPE=snp;VARB=-0.00215414;OID=.;OPOS=236212038;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:170:88:89:79:81:31:48:57:31:33:48:57:32 chr1 236381825 . G C 332.32 PASS AO=85;DP=185;FAO=85;FDP=184;FR=.;FRO=99;FSAF=28;FSAR=57;FSRF=38;FSRR=61;FWDB=-0.0333136;FXX=0.00540511;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.3409;QD=7.22438;RBI=0.0411802;REFB=-0.0293795;REVB=0.0242077;RO=98;SAF=28;SAR=57;SRF=38;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0622354;STB=0.532401;TYPE=snp;VARB=0.0315895;OID=.;OPOS=236381825;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:184:98:99:85:85:57:28:38:60:57:28:38:61 chr1 236413230 . T A 159.32 PASS AO=43;DP=101;FAO=43;FDP=101;FR=.;FRO=58;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=26;FSRR=32;FWDB=0.0508085;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.925;QD=6.30983;RBI=0.0514307;REFB=0.00407626;REVB=0.00797581;RO=57;SAF=24;SAR=19;SRF=25;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120937;STB=0.562988;TYPE=snp;VARB=-0.0071556;OID=.;OPOS=236413230;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:57:58:43:43:19:24:25:32:19:24:26:32 chr1 236415347 . T C 83.92 PASS AO=26;DP=71;FAO=26;FDP=71;FR=.;FRO=45;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=-0.00223039;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.954;QD=4.72767;RBI=0.027398;REFB=0.00759529;REVB=0.0273071;RO=44;SAF=10;SAR=16;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103542;STB=0.567575;TYPE=snp;VARB=-0.0124752;OID=.;OPOS=236415347;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:71:71:44:45:26:26:16:10:21:23:16:10:22:23 chr1 236557770 . TG T,TA 675.73 PASS AO=33,75;DP=152;FAO=37,87;FDP=153;FR=.;FRO=29;FSAF=1,39;FSAR=36,48;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=0.100309,0.00409155;FXX=0.00649309;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=13.3448,162.376;QD=17.6663;RBI=0.108276,0.03108;REFB=-0.134839,-0.0221098;REVB=-0.0407658,-0.0308095;RO=28;SAF=0,30;SAR=33,45;SRF=19;SRR=9;SSEN=0.390625,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.870177,-0.14243;STB=0.939627,0.551712;TYPE=del,snp;VARB=0.205148,0.0106503;OID=.,.;OPOS=236557771,236557771;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=T,TA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:33,75:151:37,87:153:29:1,39:36,48:19:10:64:28:0,30:33,45:19:9 chr1 236645670 . C T 750.53 PASS AO=159;DP=290;FAO=159;FDP=290;FR=.;FRO=131;FSAF=70;FSAR=89;FSRF=56;FSRR=75;FWDB=0.00308101;FXX=0.00343631;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.334;QD=10.3522;RBI=0.00479097;REFB=-0.0241346;REVB=-0.0036689;RO=129;SAF=70;SAR=89;SRF=55;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.011631;STB=0.50586;TYPE=snp;VARB=0.0211762;OID=.;OPOS=236645670;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:290:290:129:131:159:159:89:70:55:74:89:70:56:75 chr1 236721731 . T C 2377.34 PASS AO=259;DP=267;FAO=260;FDP=266;FR=.;FRO=6;FSAF=121;FSAR=139;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0964312;FXX=0.00374518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.6016;QD=35.7495;RBI=0.105315;REFB=-0.168215;REVB=0.0423349;RO=4;SAF=120;SAR=139;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0156221;STB=0.508329;TYPE=snp;VARB=0.00433559;OID=.;OPOS=236721731;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:267:266:4:6:259:260:139:120:4:0:139:121:5:1 chr1 236729956 . T C 1402.13 PASS AO=162;DP=179;FAO=172;FDP=177;FR=.;FRO=5;FSAF=77;FSAR=95;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0104187;FXX=0.0111726;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.162;QD=31.6865;RBI=0.059231;REFB=-0.140657;REVB=0.0583075;RO=7;SAF=77;SAR=85;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.02627;STB=0.507084;TYPE=snp;VARB=0.0101916;OID=.;OPOS=236729956;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:179:177:7:5:162:172:85:77:1:6:95:77:1:4 chr1 236738141 . G C 310.7 PASS AO=74;DP=145;FAO=75;FDP=152;FR=.;FRO=77;FSAF=43;FSAR=32;FSRF=37;FSRR=40;FWDB=0.00832043;FXX=0.0256394;HRUN=3;LEN=1;MLLD=89.1523;QD=8.17639;RBI=0.0463775;REFB=-0.012411;REVB=-0.0456251;RO=71;SAF=43;SAR=31;SRF=36;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.066842;STB=0.547371;TYPE=snp;VARB=0.0184722;OID=.;OPOS=236738141;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:152:71:77:74:75:31:43:36:35:32:43:37:40 chr1 236882303 . T C 1264.94 PASS AO=134;DP=137;FAO=138;FDP=141;FR=.;FRO=3;FSAF=58;FSAR=80;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0125959;FXX=0.00704176;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.413;QD=35.8847;RBI=0.0583459;REFB=-0.0836098;REVB=0.05697;RO=2;SAF=58;SAR=76;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0161064;STB=0.512603;TYPE=snp;VARB=0.000716618;OID=.;OPOS=236882303;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:137:141:2:3:134:138:76:58:2:0:80:58:3:0 chr1 236883421 . C T 1470.41 PASS AO=154;DP=154;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0064275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.085;QD=38.1925;RBI=0.0112211;REFB=0;REVB=-0.00919782;RO=0;SAF=89;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.1795e-05;OID=.;OPOS=236883421;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:154:154:0:0:154:154:65:89:0:0:65:89:0:0 chr1 236899899 . TCC TC,T 1326.04 PASS AO=152,34;DP=195;FAO=190,0;FDP=190;FR=.;FRO=0;FSAF=69,0;FSAR=121,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.248035,-0.130881;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,2;MLLD=16.8153,8.50553;QD=27.9167;RBI=0.294729,0.152661;REFB=0,0;REVB=-0.159196,-0.078586;RO=1;SAF=50,16;SAR=102,18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.00464119,0.0252651;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=-0.00262156,0;OID=.,.;OPOS=236899900,236899900;OREF=C,CC;OALT=-,-;OMAPALT=TC,T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:152,34:189:190,0:190:0:69,0:121,0:0:0:99:1:50,16:102,18:0:1 chr1 236926445 . T C 1539.25 PASS AO=165;DP=169;FAO=166;FDP=166;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00669203;FXX=0.0177504;HRUN=3;LEN=1;MLLD=160.272;QD=37.0903;RBI=0.0168179;REFB=-0.0749759;REVB=0.0154291;RO=4;SAF=82;SAR=83;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000136454;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.48275e-05;OID=.;OPOS=236926445;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:169:166:4:0:165:166:83:82:2:2:83:83:0:0 chr1 237433625 . C T 903.47 PASS AO=196;DP=363;FAO=196;FDP=363;FR=.;FRO=167;FSAF=90;FSAR=106;FSRF=86;FSRR=81;FWDB=0.00477696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.885;QD=9.95557;RBI=0.00567477;REFB=-0.00625036;REVB=-0.00306328;RO=167;SAF=90;SAR=106;SRF=86;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0472725;STB=0.525726;TYPE=snp;VARB=0.00852671;OID=.;OPOS=237433625;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:363:363:167:167:196:196:106:90:86:81:106:90:86:81 chr1 237516111 . G C 109.18 PASS AO=26;DP=59;FAO=26;FDP=57;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=0.0179222;FXX=0.0499917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.563;QD=7.66193;RBI=0.0336646;REFB=-0.00104429;REVB=0.0284974;RO=30;SAF=15;SAR=11;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0554586;STB=0.520151;TYPE=snp;VARB=0.00135706;OID=.;OPOS=237516111;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:57:30:31:26:26:11:15:19:11:11:15:19:12 chr1 237617757 . C T 1871.75 PASS AO=201;DP=206;FAO=203;FDP=207;FR=.;FRO=4;FSAF=100;FSAR=103;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0396246;FXX=0.00480746;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.069;QD=36.1691;RBI=0.0396343;REFB=-0.167961;REVB=0.000875638;RO=4;SAF=98;SAR=103;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0190396;STB=0.509803;TYPE=snp;VARB=0.000923663;OID=.;OPOS=237617757;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:206:207:4:4:201:203:103:98:4:0:103:100:4:0 chr1 237711797 . A G 1756.61 PASS AO=186;DP=190;FAO=186;FDP=186;FR=.;FRO=0;FSAF=130;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0299229;FXX=0.0261766;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.9929;QD=37.7766;RBI=0.02993;REFB=0.00445294;REVB=-0.000652431;RO=1;SAF=130;SAR=56;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00842595;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000278575;OID=.;OPOS=237711797;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:190:186:1:0:186:186:56:130:0:1:56:130:0:0 chr1 237801770 . T C 1738.58 PASS AO=187;DP=191;FAO=189;FDP=193;FR=.;FRO=4;FSAF=16;FSAR=173;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0265757;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.7078;QD=36.0328;RBI=0.0385637;REFB=-0.171222;REVB=0.0279445;RO=2;SAF=16;SAR=171;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0055367;STB=0.505714;TYPE=snp;VARB=0.00199736;OID=.;OPOS=237801770;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:191:193:2:4:187:189:171:16:0:2:173:16:0:4 chr1 237814783 . C T 65.48 PASS AO=23;DP=70;FAO=23;FDP=70;FR=.;FRO=47;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=34;FSRR=13;FWDB=-0.0645515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.3595;QD=3.74177;RBI=0.0681502;REFB=-0.0104585;REVB=-0.021853;RO=47;SAF=12;SAR=11;SRF=34;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237015;STB=0.63717;TYPE=snp;VARB=0.0194626;OID=.;OPOS=237814783;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:70:70:47:47:23:23:11:12:34:13:11:12:34:13 chr1 237841390 . A G 234.63 PASS AO=68;DP=168;FAO=69;FDP=169;FR=.;FRO=100;FSAF=31;FSAR=38;FSRF=41;FSRR=59;FWDB=-0.000320708;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.84;QD=5.55335;RBI=0.000524407;REFB=-0.00440605;REVB=0.000414908;RO=100;SAF=30;SAR=38;SRF=41;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0336448;STB=0.523587;TYPE=snp;VARB=0.00668822;OID=.;OPOS=237841390;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:169:100:100:68:69:38:30:41:59:38:31:41:59 chr1 237863718 . T G 878.33 PASS AO=94;DP=95;FAO=94;FDP=95;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.105801;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.8;QD=36.9822;RBI=0.106266;REFB=-0.0304052;REVB=0.00993537;RO=1;SAF=19;SAR=75;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00628114;STB=0.503311;TYPE=snp;VARB=0.000360274;OID=.;OPOS=237863718;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:95:95:1:1:94:94:75:19:0:1:75:19:0:1 chr1 237881770 . C T 2721.11 PASS AO=286;DP=292;FAO=288;FDP=288;FR=.;FRO=0;FSAF=155;FSAR=133;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0215869;FXX=0.0170643;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.933;QD=37.7932;RBI=0.0233027;REFB=0.00503922;REVB=-0.00877618;RO=1;SAF=154;SAR=132;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00359899;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000136355;OID=.;OPOS=237881770;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:292:288:1:0:286:288:132:154:0:1:133:155:0:0 chr1 237890437 . C T 2198.74 PASS AO=234;DP=239;FAO=234;FDP=234;FR=.;FRO=0;FSAF=99;FSAR=135;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00256085;FXX=0.0209196;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.325;QD=37.5854;RBI=0.00416101;REFB=-0.0247866;REVB=-0.00327963;RO=2;SAF=99;SAR=135;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0012723;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.80705e-05;OID=.;OPOS=237890437;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:239:234:2:0:234:234:135:99:1:1:135:99:0:0 chr1 238107035 . C G 1313.46 PASS AO=137;DP=137;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0226926;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=287.39;QD=38.3493;RBI=0.0266825;REFB=0;REVB=-0.0140358;RO=0;SAF=77;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.74038e-05;OID=.;OPOS=238107035;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:137:137:0:0:137:137:60:77:0:0:60:77:0:0 chr1 238109695 . A G 19.32 PASS AO=11;DP=52;FAO=11;FDP=53;FR=.;FRO=42;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=38;FSRR=4;FWDB=-0.0220418;FXX=0.0535619;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2235;QD=1.45796;RBI=0.0361145;REFB=-0.015656;REVB=-0.0286079;RO=41;SAF=6;SAR=5;SRF=37;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.509383;STB=0.802589;TYPE=snp;VARB=0.0302886;OID=.;OPOS=238109695;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:52:53:41:42:11:11:5:6:37:4:5:6:38:4 chr1 238114860 . G A 1017.21 PASS AO=103;DP=104;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00771134;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.523;QD=38.3852;RBI=0.029482;REFB=0;REVB=0.0284557;RO=0;SAF=62;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.58455e-05;OID=.;OPOS=238114860;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:104:106:0:0:103:106:41:62:0:0:44:62:0:0 chr1 238114934 . G A 1022.32 PASS AO=108;DP=109;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00603293;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.054;QD=37.8637;RBI=0.0298122;REFB=-0.00153367;REVB=-0.0291954;RO=1;SAF=59;SAR=49;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00797772;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.35409e-05;OID=.;OPOS=238114934;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:109:108:1:0:108:108:49:59:1:0:49:59:0:0 chr1 238114936 . A G 882.23 PASS AO=104;DP=104;FAO=102;FDP=108;FR=.;FRO=6;FSAF=55;FSAR=47;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.000714713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.522;QD=32.6752;RBI=0.0558337;REFB=-0.0222914;REVB=0.0558291;RO=0;SAF=57;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.51648;TYPE=snp;VARB=0.00185968;OID=.;OPOS=238114936;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:104:108:0:6:104:102:47:57:0:0:47:55:5:1 chr1 240073226 . C T 378.41 PASS AO=90;DP=182;FAO=90;FDP=183;FR=.;FRO=93;FSAF=41;FSAR=49;FSRF=41;FSRR=52;FWDB=-0.0194072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.056;QD=8.27134;RBI=0.0200049;REFB=-0.0253338;REVB=-0.00485349;RO=91;SAF=41;SAR=49;SRF=41;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00461277;STB=0.507536;TYPE=snp;VARB=0.0194412;OID=.;OPOS=240073226;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:183:91:93:90:90:49:41:41:50:49:41:41:52 chr1 240073619 . G A 60.34 PASS AO=51;DP=220;FAO=48;FDP=220;FR=.;FRO=172;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=109;FSRR=63;FWDB=-0.00913856;FXX=0.00452468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.2166;QD=1.09714;RBI=0.0408016;REFB=-0.0359473;REVB=-0.039765;RO=164;SAF=21;SAR=30;SRF=107;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.297594;STB=0.649941;TYPE=snp;VARB=0.0472967;OID=.;OPOS=240073619;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:220:220:164:172:51:48:30:21:107:57:27:21:109:63 chr1 240075733 . G A 219.12 PASS AO=57;DP=126;FAO=57;FDP=127;FR=.;FRO=70;FSAF=25;FSAR=32;FSRF=24;FSRR=46;FWDB=-0.0104838;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.968;QD=6.90132;RBI=0.0118317;REFB=-0.00577279;REVB=0.00548454;RO=68;SAF=25;SAR=32;SRF=24;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.08612;STB=0.554274;TYPE=snp;VARB=0.00741583;OID=.;OPOS=240075733;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:127:68:70:57:57:32:25:24:44:32:25:24:46 chr1 240075793 . G C 116.21 PASS AO=41;DP=109;FAO=39;FDP=109;FR=.;FRO=70;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=52;FWDB=-0.025783;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.6413;QD=4.26472;RBI=0.0347886;REFB=-0.000157367;REVB=-0.0233557;RO=68;SAF=25;SAR=16;SRF=16;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.393808;STB=0.70441;TYPE=snp;VARB=-0.000349763;OID=.;OPOS=240075793;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:68:70:41:39:16:25:16:52:16:23:18:52 chr1 240255523 . G A 10.47 PASS AO=2;DP=6;FAO=2;FDP=6;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=42.5328;QD=6.97991;RBI=0.18624;REFB=-0.0325493;REVB=0.18624;RO=4;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0875892;OID=.;OPOS=240255523;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:4:4:2:2:2:0:0:4:2:0:0:4 chr1 240256822 . C A 171.75 PASS AO=21;DP=23;FAO=21;FDP=23;FR=.;FRO=2;FSAF=0;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=295.165;QD=29.8699;RBI=0.0118807;REFB=-0.0876617;REVB=0.0118807;RO=1;SAF=0;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000454934;OID=.;OPOS=240256822;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:23:23:1:2:21:21:21:0:0:1:21:0:0:2 chr1 240492734 . G A 305.37 PASS AO=91;DP=230;FAO=93;FDP=231;FR=.;FRO=138;FSAF=38;FSAR=55;FSRF=79;FSRR=59;FWDB=0.00555617;FXX=0.00431016;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.846;QD=5.28781;RBI=0.0059092;REFB=-0.0131774;REVB=-0.00201186;RO=138;SAF=37;SAR=54;SRF=79;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177571;STB=0.597639;TYPE=snp;VARB=0.0153415;OID=.;OPOS=240492734;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:230:231:138:138:91:93:54:37:79:59:55:38:79:59 chr1 240497265 . A C 2560.29 PASS AO=266;DP=269;FAO=266;FDP=266;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=182;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02447;FXX=0.011152;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.352;QD=38.5006;RBI=0.0370235;REFB=0;REVB=-0.0277841;RO=0;SAF=84;SAR=182;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.72225e-05;OID=.;OPOS=240497265;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:269:266:0:0:266:266:182:84:0:0:182:84:0:0 chr1 241712134 . C T 430.55 PASS AO=126;DP=304;FAO=127;FDP=305;FR=.;FRO=178;FSAF=68;FSAR=59;FSRF=103;FSRR=75;FWDB=-0.00512962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.69;QD=5.64654;RBI=0.00838841;REFB=-0.00331473;REVB=-0.00663721;RO=177;SAF=68;SAR=58;SRF=102;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0387059;STB=0.525437;TYPE=snp;VARB=0.00532519;OID=.;OPOS=241712134;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:304:305:177:178:126:127:58:68:102:75:59:68:103:75 chr1 241798631 . C T 1726.47 PASS AO=179;DP=180;FAO=179;FDP=179;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0248788;FXX=0.00555525;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.734;QD=38.5804;RBI=0.0286261;REFB=0;REVB=0.0141599;RO=0;SAF=82;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.62745e-05;OID=.;OPOS=241798631;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:180:179:0:0:179:179:97:82:0:0:97:82:0:0 chr1 241799219 . AT A 26.21 PASS AO=18;DP=72;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=19;FSRF=5;FSRR=19;FWDB=0.180286;FXX=0.111091;HRUN=8;LEN=1;MLLD=7.02854;QD=2.18449;RBI=0.185964;REFB=-0.0693286;REVB=0.0456008;RO=18;SAF=4;SAR=14;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0432362;OID=.;OPOS=241799220;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:18:53:24:48:24:5:19:5:19:26:18:4:14:4:14 chr1 241907817 . T C 286.28 PASS AO=83;DP=200;FAO=83;FDP=200;FR=.;FRO=117;FSAF=48;FSAR=35;FSRF=69;FSRR=48;FWDB=-0.0124335;FXX=0.00497488;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.861;QD=5.72557;RBI=0.019067;REFB=-0.00950667;REVB=-0.0144554;RO=114;SAF=48;SAR=35;SRF=67;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0100037;STB=0.506868;TYPE=snp;VARB=0.0121028;OID=.;OPOS=241907817;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:200:200:114:117:83:83:35:48:67:47:35:48:69:48 chr1 242030151 . A G 276.23 PASS AO=62;DP=120;FAO=62;FDP=120;FR=.;FRO=58;FSAF=36;FSAR=26;FSRF=29;FSRR=29;FWDB=0.0057573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.684;QD=9.20774;RBI=0.0639586;REFB=-0.00189842;REVB=0.0636989;RO=57;SAF=36;SAR=26;SRF=29;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0634823;STB=0.539497;TYPE=snp;VARB=0.00242487;OID=.;OPOS=242030151;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:57:58:62:62:26:36:29:28:26:36:29:29 chr1 242042545 . A G 2152.84 PASS AO=219;DP=219;FAO=226;FDP=226;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=141;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0223307;FXX=0.00440509;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.721;QD=38.1033;RBI=0.0253131;REFB=0;REVB=-0.0119202;RO=0;SAF=79;SAR=140;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.83089e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000296491;OID=.;OPOS=242042545;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:219:226:0:0:219:226:140:79:0:0:141:85:0:0 chr1 242045275 . C T 2870.11 PASS AO=299;DP=305;FAO=302;FDP=302;FR=.;FRO=0;FSAF=149;FSAR=153;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000879063;FXX=0.0130715;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.72;QD=38.0147;RBI=0.0111595;REFB=0;REVB=-0.0111248;RO=0;SAF=147;SAR=152;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.80298e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000132866;OID=.;OPOS=242045275;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:305:302:0:0:299:302:152:147:0:0:153:149:0:0 chr1 242053042 . A G 1041.17 PASS AO=109;DP=111;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000569778;FXX=0.0178555;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.388;QD=37.8607;RBI=0.0129197;REFB=0;REVB=0.0129071;RO=0;SAF=43;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.69419e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.79635e-05;OID=.;OPOS=242053042;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:111:110:0:0:109:110:66:43:0:0:67:43:0:0 chr1 242222754 . A G 1577.75 PASS AO=163;DP=163;FAO=165;FDP=165;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00954909;FXX=0.0119753;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.688;QD=38.2485;RBI=0.0103159;REFB=0;REVB=-0.00390296;RO=0;SAF=56;SAR=107;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00024263;OID=.;OPOS=242222754;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:163:165:0:0:163:165:107:56:0:0:109:56:0:0 chr1 242253024 . T C 178.72 PASS AO=58;DP=154;FAO=58;FDP=154;FR=.;FRO=96;FSAF=44;FSAR=14;FSRF=48;FSRR=48;FWDB=-0.0402574;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.524;QD=4.64217;RBI=0.0402841;REFB=0.00071647;REVB=0.00146478;RO=95;SAF=44;SAR=14;SRF=48;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.307347;STB=0.679217;TYPE=snp;VARB=-0.00148045;OID=.;OPOS=242253024;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:154:95:96:58:58:14:44:48:47:14:44:48:48 chr1 243328887 . G T 13.07 PASS AO=15;DP=94;FAO=15;FDP=94;FR=.;FRO=79;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=31;FSRR=48;FWDB=0.00109857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.7432;QD=0.556136;RBI=0.0255637;REFB=-0.0230383;REVB=0.0255401;RO=77;SAF=10;SAR=5;SRF=31;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.323803;STB=0.72081;TYPE=snp;VARB=0.0473627;OID=.;OPOS=243328887;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:94:94:77:79:15:15:5:10:31:46:5:10:31:48 chr1 243329049 . G A 53.49 PASS AO=47;DP=238;FAO=49;FDP=239;FR=.;FRO=190;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=93;FSRR=97;FWDB=0.00326536;FXX=0.00416649;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.47;QD=0.895212;RBI=0.00349642;REFB=-0.000849674;REVB=-0.00124996;RO=181;SAF=28;SAR=19;SRF=88;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140902;STB=0.581657;TYPE=snp;VARB=0.00336775;OID=.;OPOS=243329049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:238:239:181:190:47:49:19:28:88:93:20:29:93:97 chr1 243329075 . T C 25.28 PASS AO=39;DP=242;FAO=41;FDP=249;FR=.;FRO=208;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=115;FSRR=93;FWDB=-0.0317953;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.1242;QD=0.406116;RBI=0.0823327;REFB=-0.00832399;REVB=-0.0759456;RO=203;SAF=23;SAR=16;SRF=111;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0562751;STB=0.548818;TYPE=snp;VARB=0.0447808;OID=.;OPOS=243329075;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:242:249:203:208:39:41:16:23:111:92:16:25:115:93 chr1 243493907 . A T 482.57 PASS AO=120;DP=252;FAO=120;FDP=252;FR=.;FRO=132;FSAF=39;FSAR=81;FSRF=31;FSRR=101;FWDB=0.0931284;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.108;QD=7.65981;RBI=0.0939092;REFB=0.0109409;REVB=0.012085;RO=129;SAF=39;SAR=81;SRF=30;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103546;STB=0.555912;TYPE=snp;VARB=-0.0138599;OID=.;OPOS=243493907;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:252:252:129:132:120:120:81:39:30:99:81:39:31:101 chr1 243579112 . G A 178.2 PASS AO=41;DP=86;FAO=42;FDP=87;FR=.;FRO=45;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=11;FSRR=34;FWDB=-0.0203817;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6324;QD=8.19318;RBI=0.0475402;REFB=-0.0197205;REVB=0.0429495;RO=45;SAF=14;SAR=27;SRF=11;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105521;STB=0.565833;TYPE=snp;VARB=0.0241953;OID=.;OPOS=243579112;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:87:45:45:41:42:27:14:11:34:27:15:11:34 chr1 244219563 . A G 1191.22 PASS AO=127;DP=130;FAO=127;FDP=129;FR=.;FRO=2;FSAF=101;FSAR=26;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.000136123;FXX=0.00769172;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.135;QD=36.937;RBI=0.00771768;REFB=0.0287819;REVB=0.00771647;RO=2;SAF=101;SAR=26;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00931688;STB=0.504901;TYPE=snp;VARB=-0.00210317;OID=.;OPOS=244219563;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:130:129:2:2:127:127:26:101:2:0:26:101:2:0 chr1 244773784 . T C 287 PASS AO=67;DP=135;FAO=67;FDP=135;FR=.;FRO=68;FSAF=27;FSAR=40;FSRF=40;FSRR=28;FWDB=-0.00877217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.819;QD=8.50368;RBI=0.0361615;REFB=-0.0109239;REVB=0.0350813;RO=66;SAF=27;SAR=40;SRF=39;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169412;STB=0.593418;TYPE=snp;VARB=0.00422971;OID=.;OPOS=244773784;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:66:68:67:67:40:27:39:27:40:27:40:28 chr1 244773803 . T C 251.36 PASS AO=61;DP=128;FAO=61;FDP=128;FR=.;FRO=67;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=36;FSRR=31;FWDB=0.00156944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.709;QD=7.85511;RBI=0.0124741;REFB=-0.0197849;REVB=-0.0123749;RO=65;SAF=29;SAR=32;SRF=35;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0587124;STB=0.532367;TYPE=snp;VARB=0.0133952;OID=.;OPOS=244773803;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:65:67:61:61:32:29:35:30:32:29:36:31 chr1 245006439 . C T 250.77 PASS AO=60;DP=123;FAO=59;FDP=121;FR=.;FRO=62;FSAF=21;FSAR=38;FSRF=15;FSRR=47;FWDB=0.0152814;FXX=0.0162588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.5689;QD=8.28981;RBI=0.0369816;REFB=-0.00137023;REVB=0.0336766;RO=62;SAF=22;SAR=38;SRF=16;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111455;STB=0.566106;TYPE=snp;VARB=0.000669612;OID=.;OPOS=245006439;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:121:62:62:60:59:38:22:16:46:38:21:15:47 chr1 245027349 . C T 204.55 PASS AO=42;DP=78;FAO=42;FDP=77;FR=.;FRO=35;FSAF=2;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=35;FWDB=-7.93139e-05;FXX=0.0128189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.0197;QD=10.6259;RBI=0.00729818;REFB=-0.00631515;REVB=0.00729775;RO=36;SAF=2;SAR=40;SRF=0;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.289195;STB=0.652122;TYPE=snp;VARB=0.00628917;OID=.;OPOS=245027349;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:77:36:35:42:42:40:2:0:36:40:2:0:35 chr1 245107400 . G C 190.91 PASS AO=44;DP=106;FAO=52;FDP=113;FR=.;FRO=61;FSAF=31;FSAR=21;FSRF=38;FSRR=23;FWDB=0.00983292;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.7217;QD=6.75802;RBI=0.0160769;REFB=-0.0111261;REVB=-0.0127193;RO=61;SAF=25;SAR=19;SRF=39;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0757892;STB=0.515103;TYPE=snp;VARB=0.00660383;OID=.;OPOS=245107400;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:113:61:61:44:52:19:25:39:22:21:31:38:23 chr1 245118184 . T C 227.12 PASS AO=45;DP=94;FAO=47;FDP=86;FR=.;FRO=39;FSAF=30;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=-0.00938266;FXX=0.11339;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.6936;QD=10.5635;RBI=0.02561;REFB=-0.0160013;REVB=0.0238294;RO=36;SAF=29;SAR=16;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0763585;STB=0.523522;TYPE=snp;VARB=0.0239451;OID=.;OPOS=245118184;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:86:36:39:45:47:16:29:20:16:17:30:23:16 chr1 245245378 . T C 99.76 PASS AO=45;DP=157;FAO=46;FDP=159;FR=.;FRO=113;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=60;FSRR=53;FWDB=0.00809722;FXX=0.0124216;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.295;QD=2.50971;RBI=0.0104199;REFB=-0.00652028;REVB=-0.00655812;RO=110;SAF=23;SAR=22;SRF=57;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00854969;STB=0.522003;TYPE=snp;VARB=0.0140907;OID=.;OPOS=245245378;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:159:110:113:45:46:22:23:57:53:23:23:60:53 chr1 245245402 . C T 109.5 PASS AO=45;DP=155;FAO=47;FDP=155;FR=.;FRO=108;FSAF=17;FSAR=30;FSRF=53;FSRR=55;FWDB=0.0166733;FXX=0.012738;HRUN=3;LEN=1;MLLD=127.072;QD=2.8258;RBI=0.0343621;REFB=-0.00212307;REVB=-0.0300459;RO=108;SAF=16;SAR=29;SRF=53;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167014;STB=0.592344;TYPE=snp;VARB=0.0120383;OID=.;OPOS=245245402;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:108:108:45:47:29:16:53:55:30:17:53:55 chr1 245297243 . G A 225.88 PASS AO=68;DP=168;FAO=68;FDP=168;FR=.;FRO=100;FSAF=40;FSAR=28;FSRF=45;FSRR=55;FWDB=0.00861651;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3217;QD=5.37798;RBI=0.0375696;REFB=0.0213226;REVB=0.0365681;RO=94;SAF=41;SAR=27;SRF=43;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151769;STB=0.582432;TYPE=snp;VARB=-0.029931;OID=.;OPOS=245297243;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:94:100:68:68:27:41:43:51:28:40:45:55 chr1 245703990 . G T 582.03 PASS AO=154;DP=349;FAO=159;FDP=352;FR=.;FRO=193;FSAF=81;FSAR=78;FSRF=109;FSRR=84;FWDB=-0.0246952;FXX=0.0140052;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.566;QD=6.61398;RBI=0.025976;REFB=-0.00269112;REVB=0.008056;RO=188;SAF=74;SAR=80;SRF=103;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.06686;STB=0.530381;TYPE=snp;VARB=0.00304792;OID=.;OPOS=245703990;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:349:352:188:193:154:159:80:74:103:85:78:81:109:84 chr1 245848791 . AGGGC AGGC,AGG 184.23 PASS AO=13,7;DP=50;FAO=42,0;FDP=46;FR=.;FRO=4;FSAF=16,0;FSAR=26,0;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.251825,-0.186672;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,2;MLLD=10.6258,9.59;QD=16.0203;RBI=0.33463,0.344757;REFB=0.13191,0.0126902;REVB=0.220367,0.289846;RO=8;SAF=3,7;SAR=10,0;SRF=2;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0.348568,0.348568;SSSB=-0.0180069,0.804335;STB=0.512136,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.0162283,0;OID=.,.;OPOS=245848792,245848794;OREF=G,GC;OALT=-,-;OMAPALT=AGGC,AGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:13,7:41:42,0:46:4:16,0:26,0:1:3:6:8:3,7:10,0:2:6 chr1 245861571 . C T 144.64 PASS AO=30;DP=56;FAO=30;FDP=56;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=23;FSRF=2;FSRR=24;FWDB=0.0497785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.315;QD=10.3315;RBI=0.0498038;REFB=-0.00248386;REVB=0.00158713;RO=26;SAF=7;SAR=23;SRF=2;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207997;STB=0.613742;TYPE=snp;VARB=0.00275759;OID=.;OPOS=245861571;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:26:26:30:30:23:7:2:24:23:7:2:24 chr1 246021941 . T C 275.72 PASS AO=68;DP=147;FAO=69;FDP=148;FR=.;FRO=79;FSAF=33;FSAR=36;FSRF=50;FSRR=29;FWDB=-0.0401623;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.445;QD=7.45193;RBI=0.0430522;REFB=-0.0223771;REVB=0.0155075;RO=78;SAF=33;SAR=35;SRF=49;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137374;STB=0.582092;TYPE=snp;VARB=0.0209084;OID=.;OPOS=246021941;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:148:78:79:68:69:35:33:49:29:36:33:50:29 chr1 246670481 . C G 741.73 PASS AO=77;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0178095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3679;QD=38.0372;RBI=0.0544955;REFB=0;REVB=0.0515032;RO=0;SAF=27;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000457564;OID=.;OPOS=246670481;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:78:78:0:0:77:78:50:27:0:0:50:28:0:0 chr1 246707858 . A G 380.6 PASS AO=47;DP=215;FAO=90;FDP=185;FR=.,HEALED;FRO=95;FSAF=46;FSAR=44;FSRF=55;FSRR=40;FWDB=-0.0137853;FXX=0.0263144;HRUN=4;LEN=1;MLLD=86.9482;QD=8.22927;RBI=0.0330502;REFB=-0.000185328;REVB=-0.030038;RO=55;SAF=35;SAR=12;SRF=45;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0990604;STB=0.534898;TYPE=snp;VARB=0.000463348;OID=.;OPOS=246707858;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:185:55:95:47:90:12:35:45:10:44:46:55:40 chr1 246714587 . G A 102.69 PASS AO=35;DP=100;FAO=35;FDP=100;FR=.;FRO=65;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=34;FSRR=31;FWDB=0.000849757;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=238.614;QD=4.10771;RBI=0.003775;REFB=-0.00132327;REVB=-0.00367812;RO=65;SAF=16;SAR=19;SRF=34;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0743363;STB=0.542833;TYPE=snp;VARB=0.00297255;OID=.;OPOS=246714587;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:65:65:35:35:19:16:34:31:19:16:34:31 chr1 246720798 . G A 1221.63 PASS AO=132;DP=132;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.038723;FXX=0.0151504;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.2144;QD=37.5885;RBI=0.0781967;REFB=-0.0101835;REVB=-0.0679356;RO=0;SAF=55;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000462975;OID=.;OPOS=246720798;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:132:130:0:0:132:130:77:55:0:0:77:53:0:0 chr1 246755124 . T C 536.85 PASS AO=60;DP=62;FAO=60;FDP=62;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0391349;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.0892;QD=34.6355;RBI=0.0465875;REFB=-0.0811349;REVB=0.0252755;RO=1;SAF=25;SAR=35;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0132943;STB=0.513884;TYPE=snp;VARB=-0.000109103;OID=.;OPOS=246755124;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:62:62:1:2:60:60:35:25:0:1:35:25:0:2 chr1 246829616 . T C 793.88 PASS AO=180;DP=347;FAO=180;FDP=347;FR=.;FRO=167;FSAF=103;FSAR=77;FSRF=96;FSRR=71;FWDB=-0.0114043;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=173.72;QD=9.15129;RBI=0.0114048;REFB=-0.0135735;REVB=-0.000106364;RO=167;SAF=103;SAR=77;SRF=96;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00236641;STB=0.501292;TYPE=snp;VARB=0.0116474;OID=.;OPOS=246829616;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:347:347:167:167:180:180:77:103:96:71:77:103:96:71 chr1 246939856 . G A 439.24 PASS AO=111;DP=262;FAO=118;FDP=262;FR=.;FRO=144;FSAF=50;FSAR=68;FSRF=38;FSRR=106;FWDB=-0.00912666;FXX=0.0113203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2957;QD=6.70601;RBI=0.0116953;REFB=-0.0139199;REVB=-0.0073132;RO=133;SAF=45;SAR=66;SRF=36;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142376;STB=0.592467;TYPE=snp;VARB=0.0283369;OID=.;OPOS=246939856;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:262:262:133:144:111:118:66:45:36:97:68:50:38:106 chr1 246939943 . T C 491.31 PASS AO=128;DP=277;FAO=128;FDP=276;FR=.;FRO=148;FSAF=50;FSAR=78;FSRF=42;FSRR=106;FWDB=0.0153286;FXX=0.00360998;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.6157;QD=7.12046;RBI=0.0374254;REFB=-0.0115223;REVB=0.0341423;RO=149;SAF=50;SAR=78;SRF=43;SRR=106;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107448;STB=0.561788;TYPE=snp;VARB=0.0139634;OID=.;OPOS=246939943;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:277:276:149:148:128:128:78:50:43:106:78:50:42:106 chr1 247004031 . T C 761.23 PASS AO=302;DP=666;FAO=191;FDP=399;FR=.;FRO=208;FSAF=64;FSAR=127;FSRF=94;FSRR=114;FWDB=-0.0413063;FXX=0.00249994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.8755;QD=7.63139;RBI=0.0707627;REFB=0.0277327;REVB=-0.0574556;RO=353;SAF=90;SAR=212;SRF=162;SRR=191;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172955;STB=0.565392;TYPE=snp;VARB=-0.0503708;OID=.;OPOS=247004031;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:666:399:353:208:302:191:212:90:162:191:127:64:94:114 chr1 247006051 . G C 98.98 PASS AO=25;DP=57;FAO=25;FDP=57;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=-0.014772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.48;QD=6.9457;RBI=0.0179336;REFB=-0.00360134;REVB=0.0101686;RO=31;SAF=15;SAR=10;SRF=20;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0464912;STB=0.514694;TYPE=snp;VARB=0.00492542;OID=.;OPOS=247006051;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:57:57:31:32:25:25:10:15:20:11:10:15:20:12 chr1 247007232 . TAA TA,T 405.76 PASS AO=47,23;DP=184;FAO=106,39;FDP=172;FR=.;FRO=27;FSAF=17,0;FSAR=89,39;FSRF=3;FSRR=24;FWDB=-0.0641788,-0.0332819;FXX=0.039104;HRUN=7,7;LEN=1,2;MLLD=8.20746,12.948;QD=9.43634;RBI=0.148871,0.0754504;REFB=0.0941129,0.0498049;REVB=0.134327,0.0677132;RO=22;SAF=9,1;SAR=38,22;SRF=1;SRR=21;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.154332,-0.0102192;STB=0.519045,0.999507;TYPE=del,del;VARB=0.0726231,-0.0256481;OID=.,.;OPOS=247007233,247007233;OREF=A,AA;OALT=-,-;OMAPALT=TA,T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:47,23:119:106,39:172:27:17,0:89,39:3:24:21:22:9,1:38,22:1:21 chr1 247021085 . G C 154.64 PASS AO=43;DP=102;FAO=43;FDP=102;FR=.;FRO=59;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=29;FSRR=30;FWDB=-0.000726584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.525;QD=6.06411;RBI=0.00760585;REFB=-0.0132104;REVB=-0.00757107;RO=59;SAF=23;SAR=20;SRF=29;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0445749;STB=0.525102;TYPE=snp;VARB=0.0235982;OID=.;OPOS=247021085;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:59:59:43:43:20:23:29:30:20:23:29:30 chr1 247048834 . T C 173.99 PASS AO=52;DP=131;FAO=52;FDP=131;FR=.;FRO=79;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=46;FSRR=33;FWDB=0.0138774;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.536;QD=5.31257;RBI=0.0574237;REFB=0.00744253;REVB=0.0557216;RO=79;SAF=28;SAR=24;SRF=46;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0472695;STB=0.52668;TYPE=snp;VARB=-0.0120517;OID=.;OPOS=247048834;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:79:79:52:52:24:28:46:33:24:28:46:33 chr1 247150740 . T C 199.73 PASS AO=51;DP=111;FAO=51;FDP=112;FR=.;FRO=61;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=23;FSRR=38;FWDB=-0.010749;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=42.0587;QD=7.13305;RBI=0.0348793;REFB=-0.0477004;REVB=-0.0331818;RO=60;SAF=26;SAR=25;SRF=23;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122558;STB=0.572099;TYPE=snp;VARB=0.0593822;OID=.;OPOS=247150740;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:112:60:61:51:51:25:26:23:37:25:26:23:38 chr1 247151557 . A G 55.52 PASS AO=11;DP=22;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=0;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=11;FWDB=0;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=131.949;QD=10.0945;RBI=0.00773677;REFB=0.00138956;REVB=-0.00773677;RO=10;SAF=0;SAR=11;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000892593;OID=.;OPOS=247151557;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:22:22:10:11:11:11:11:0:0:10:11:0:0:11 chr1 247162658 . C T 317.49 PASS AO=68;DP=136;FAO=72;FDP=141;FR=.;FRO=69;FSAF=25;FSAR=47;FSRF=24;FSRR=45;FWDB=0.0105856;FXX=0.00704176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.208;QD=9.00681;RBI=0.0166449;REFB=-0.00268489;REVB=-0.0128452;RO=68;SAF=22;SAR=46;SRF=24;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0300751;STB=0.500326;TYPE=snp;VARB=0.00357256;OID=.;OPOS=247162658;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:141:68:69:68:72:46:22:24:44:47:25:24:45 chr1 247241850 . G C 244.66 PASS AO=50;DP=91;FAO=50;FDP=91;FR=.;FRO=41;FSAF=43;FSAR=7;FSRF=33;FSRR=8;FWDB=-0.056556;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.9127;QD=10.7544;RBI=0.0597602;REFB=0.0388905;REVB=-0.0193052;RO=41;SAF=43;SAR=7;SRF=33;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0868604;STB=0.547983;TYPE=snp;VARB=-0.0323967;OID=.;OPOS=247241850;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:41:41:50:50:7:43:33:8:7:43:33:8 chr1 247267274 . C A 178 PASS AO=21;DP=27;FAO=21;FDP=23;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0247427;FXX=0.148093;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.165;QD=30.9566;RBI=0.0351637;REFB=-0.069935;REVB=0.0249857;RO=2;SAF=6;SAR=15;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0411632;STB=0.522366;TYPE=snp;VARB=0.000870632;OID=.;OPOS=247267274;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:27:23:2:2:21:21:15:6:1:1:15:6:1:1 chr1 247322298 . G T 1660.58 PASS AO=179;DP=182;FAO=179;FDP=182;FR=.;FRO=3;FSAF=82;FSAR=97;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0352949;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.727;QD=36.4964;RBI=0.0356651;REFB=-0.121259;REVB=-0.00512557;RO=3;SAF=82;SAR=97;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170949;STB=0.508981;TYPE=snp;VARB=0.000266377;OID=.;OPOS=247322298;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:182:182:3:3:179:179:97:82:3:0:97:82:3:0 chr1 247419509 . T C 1201.67 PASS AO=126;DP=131;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168851;FXX=0.0300729;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.8779;QD=37.2612;RBI=0.0194591;REFB=0;REVB=-0.00967204;RO=0;SAF=41;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000500404;OID=.;OPOS=247419509;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:131:129:0:0:126:129:85:41:0:0:86:43:0:0 chr1 247419664 . C T 508.51 PASS AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00410087;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=183.102;QD=37.6675;RBI=0.00547873;REFB=0;REVB=0.00363309;RO=0;SAF=19;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.86274e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.41094e-05;OID=.;OPOS=247419664;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:54:54:0:0:54:54:35:19:0:0:35:19:0:0 chr1 247587477 . G A 414.44 PASS AO=63;DP=85;FAO=63;FDP=85;FR=.;FRO=22;FSAF=42;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=6;FWDB=-0.00532807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.064;QD=19.5032;RBI=0.00532817;REFB=-0.0222473;REVB=-3.23043e-05;RO=22;SAF=42;SAR=21;SRF=16;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0332781;STB=0.517852;TYPE=snp;VARB=0.00658094;OID=.;OPOS=247587477;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:85:85:22:22:63:63:21:42:16:6:21:42:16:6 chr1 247587531 . A G 386.9 PASS AO=56;DP=76;FAO=58;FDP=78;FR=.;FRO=20;FSAF=23;FSAR=35;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=0.0440117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.651;QD=19.8412;RBI=0.0485783;REFB=-0.045415;REVB=-0.0205627;RO=20;SAF=21;SAR=35;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0664832;STB=0.539893;TYPE=snp;VARB=0.0151038;OID=.;OPOS=247587531;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:76:78:20:20:56:58:35:21:5:15:35:23:5:15 chr1 247588053 . C T 115.79 PASS AO=30;DP=72;FAO=30;FDP=70;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=0.00443027;FXX=0.0277739;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.527;QD=6.61632;RBI=0.0365212;REFB=-0.00952558;REVB=0.0362515;RO=38;SAF=15;SAR=15;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0260339;STB=0.514276;TYPE=snp;VARB=0.0146818;OID=.;OPOS=247588053;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:70:38:40:30:30:15:15:20:18:15:15:21:19 chr1 247614386 . T C 167.48 PASS AO=52;DP=130;FAO=51;FDP=129;FR=.;FRO=78;FSAF=34;FSAR=17;FSRF=47;FSRR=31;FWDB=0.00245429;FXX=0.00769172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.798;QD=5.19319;RBI=0.018914;REFB=-0.0022923;REVB=0.0187541;RO=77;SAF=34;SAR=18;SRF=47;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0498199;STB=0.542356;TYPE=snp;VARB=0.00258819;OID=.;OPOS=247614386;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:129:77:78:52:51:18:34:47:30:17:34:47:31 chr1 247614407 . G A 188.96 PASS AO=50;DP=113;FAO=50;FDP=113;FR=.;FRO=63;FSAF=31;FSAR=19;FSRF=28;FSRR=35;FWDB=0.00568628;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.764;QD=6.68892;RBI=0.0117555;REFB=-0.038983;REVB=-0.0102888;RO=62;SAF=31;SAR=19;SRF=27;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184147;STB=0.598887;TYPE=snp;VARB=0.0181923;OID=.;OPOS=247614407;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:62:63:50:50:19:31:27:35:19:31:28:35 chr1 247614553 . C T 229.73 PASS AO=53;DP=108;FAO=53;FDP=107;FR=.;FRO=54;FSAF=36;FSAR=17;FSRF=33;FSRR=21;FWDB=0.00572632;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.409;QD=8.58792;RBI=0.00582458;REFB=-0.0135794;REVB=0.0010654;RO=52;SAF=36;SAR=17;SRF=31;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0824378;STB=0.538356;TYPE=snp;VARB=0.0183083;OID=.;OPOS=247614553;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:107:52:54:53:53:17:36:31:21:17:36:33:21 chr1 247614693 . C T 189.8 PASS AO=20;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.041696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.2393;QD=36.1525;RBI=0.0416963;REFB=0;REVB=0.00016455;RO=1;SAF=18;SAR=2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0249352;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0010395;OID=.;OPOS=247614693;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:21:21:1:0:20:21:2:18:1:0:2:19:0:0 chr1 247615261 . GA G 350.1 PASS AO=132;DP=276;FAO=132;FDP=274;FR=.;FRO=142;FSAF=41;FSAR=91;FSRF=74;FSRR=68;FWDB=0.104228;FXX=0.00724611;HRUN=2;LEN=1;MLLD=25.2809;QD=5.11089;RBI=0.12467;REFB=-0.00914389;REVB=-0.0684048;RO=139;SAF=39;SAR=93;SRF=72;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223296;STB=0.61615;TYPE=del;VARB=0.00878673;OID=.;OPOS=247615262;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:132:277:132:274:142:41:91:74:68:99:139:39:93:72:67 chr1 247654993 . T C 214.63 PASS AO=54;DP=117;FAO=54;FDP=117;FR=.;FRO=63;FSAF=14;FSAR=40;FSRF=44;FSRR=19;FWDB=-0.0755243;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4609;QD=7.33761;RBI=0.0976942;REFB=-0.0115932;REVB=-0.0619696;RO=63;SAF=14;SAR=40;SRF=44;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.426285;STB=0.737356;TYPE=snp;VARB=0.0115956;OID=.;OPOS=247654993;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:63:63:54:54:40:14:44:19:40:14:44:19 chr1 247655275 . T C 125.82 PASS AO=42;DP=113;FAO=42;FDP=116;FR=.;FRO=74;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=29;FSRR=45;FWDB=-0.00198616;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.8738;QD=4.33853;RBI=0.0498285;REFB=-0.0154008;REVB=-0.0497889;RO=71;SAF=18;SAR=24;SRF=29;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0227044;STB=0.524039;TYPE=snp;VARB=0.0439793;OID=.;OPOS=247655275;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:116:71:74:42:42:24:18:29:42:24:18:29:45 chr1 247690320 . C T 648.24 PASS AO=173;DP=379;FAO=174;FDP=384;FR=.;FRO=210;FSAF=72;FSAR=102;FSRF=98;FSRR=112;FWDB=0.0150681;FXX=0.00259734;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.1927;QD=6.75248;RBI=0.0494768;REFB=-0.0454377;REVB=-0.0471265;RO=205;SAF=71;SAR=102;SRF=93;SRR=112;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0434988;STB=0.529495;TYPE=snp;VARB=0.0534223;OID=.;OPOS=247690320;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:379:384:205:210:173:174:102:71:93:112:102:72:98:112 chr1 247694958 . G A 211.41 PASS AO=68;DP=185;FAO=70;FDP=187;FR=.;FRO=117;FSAF=43;FSAR=27;FSRF=48;FSRR=69;FWDB=-0.0147919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.66;QD=4.52205;RBI=0.0206147;REFB=0.00157518;REVB=0.0143585;RO=115;SAF=43;SAR=25;SRF=48;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237867;STB=0.626843;TYPE=snp;VARB=-0.00298377;OID=.;OPOS=247694958;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:187:115:117:68:70:25:43:48:67:27:43:48:69 chr1 247695612 . G A 1487.6 PASS AO=155;DP=158;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000346654;FXX=0.00632871;HRUN=4;LEN=1;MLLD=288.244;QD=37.9006;RBI=0.00128348;REFB=-0.015309;REVB=-0.00123578;RO=1;SAF=81;SAR=74;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00638551;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.11242e-05;OID=.;OPOS=247695612;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:158:157:1:0:155:157:74:81:0:1:76:81:0:0 chr1 247695756 . T C 606.59 PASS AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00266988;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.43;QD=37.9121;RBI=0.0181114;REFB=0;REVB=0.0179135;RO=0;SAF=26;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.73391e-05;OID=.;OPOS=247695756;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:65:64:0:0:64:64:38:26:0:0:38:26:0:0 chr1 247751731 . C G 375.06 PASS AO=82;DP=154;FAO=82;FDP=155;FR=.;FRO=73;FSAF=25;FSAR=57;FSRF=33;FSRR=40;FWDB=0.00350555;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.412;QD=9.67894;RBI=0.00861436;REFB=-0.00602494;REVB=-0.00786882;RO=72;SAF=25;SAR=57;SRF=33;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144469;STB=0.576843;TYPE=snp;VARB=0.00527773;OID=.;OPOS=247751731;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:155:72:73:82:82:57:25:33:39:57:25:33:40 chr1 247752019 . G C 1453.17 PASS AO=154;DP=156;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=114;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012311;FXX=0.012738;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.479;QD=37.5013;RBI=0.0123968;REFB=-0.115647;REVB=-0.00145532;RO=1;SAF=41;SAR=113;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114598;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000777166;OID=.;OPOS=247752019;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:156:155:1:0:154:155:113:41:1:0:114:41:0:0 chr1 247752367 . A G 499.36 PASS AO=126;DP=280;FAO=130;FDP=283;FR=.;FRO=153;FSAF=50;FSAR=80;FSRF=72;FSRR=81;FWDB=-0.0152452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.877;QD=7.05805;RBI=0.0205085;REFB=0.000155229;REVB=-0.0137179;RO=150;SAF=50;SAR=76;SRF=72;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0836536;STB=0.547999;TYPE=snp;VARB=-0.000271729;OID=.;OPOS=247752367;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:280:283:150:153:126:130:76:50:72:78:80:50:72:81 chr1 247769062 . A G 295.64 PASS AO=69;DP=140;FAO=69;FDP=140;FR=.;FRO=71;FSAF=7;FSAR=62;FSRF=7;FSRR=64;FWDB=0.0105837;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.2822;QD=8.44671;RBI=0.0230962;REFB=-0.0148455;REVB=0.0205285;RO=70;SAF=7;SAR=62;SRF=7;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00364083;STB=0.503999;TYPE=snp;VARB=0.0156085;OID=.;OPOS=247769062;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:70:71:69:69:62:7:7:63:62:7:7:64 chr1 247769752 . A G 476.79 PASS AO=103;DP=202;FAO=106;FDP=202;FR=.;FRO=96;FSAF=38;FSAR=68;FSRF=36;FSRR=60;FWDB=0.0328609;FXX=0.00492587;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.807;QD=9.44131;RBI=0.0338945;REFB=-0.0221347;REVB=-0.00830632;RO=97;SAF=37;SAR=66;SRF=35;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00153826;STB=0.508487;TYPE=snp;VARB=0.0194898;OID=.;OPOS=247769752;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:202:97:96:103:106:66:37:35:62:68:38:36:60 chr1 247835674 . G A 286.93 PASS AO=70;DP=149;FAO=71;FDP=151;FR=.;FRO=80;FSAF=27;FSAR=44;FSRF=36;FSRR=44;FWDB=-0.0335734;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.0189;QD=7.60091;RBI=0.0347177;REFB=-0.026333;REVB=0.00884025;RO=79;SAF=27;SAR=43;SRF=36;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0693185;STB=0.538451;TYPE=snp;VARB=0.0241928;OID=.;OPOS=247835674;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:151:79:80:70:71:43:27:36:43:44:27:36:44 chr1 247835779 . C G 187.23 PASS AO=42;DP=86;FAO=43;FDP=87;FR=.;FRO=44;FSAF=13;FSAR=30;FSRF=13;FSRR=31;FWDB=-0.0115886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.7782;QD=8.60803;RBI=0.0172339;REFB=-0.00892469;REVB=0.0127559;RO=44;SAF=13;SAR=29;SRF=13;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0152477;STB=0.50413;TYPE=snp;VARB=0.00821753;OID=.;OPOS=247835779;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:87:44:44:42:43:29:13:13:31:30:13:13:31 chr1 247835908 . T A 97.33 PASS AO=27;DP=65;FAO=27;FDP=65;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.00986646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.546;QD=5.98952;RBI=0.0128298;REFB=-0.0108865;REVB=0.00820095;RO=38;SAF=14;SAR=13;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0190167;STB=0.510824;TYPE=snp;VARB=0.00999579;OID=.;OPOS=247835908;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:65:65:38:38:27:27:13:14:19:19:13:14:19:19 chr1 247836008 . G A 148.63 PASS AO=35;DP=77;FAO=36;FDP=77;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=27;FWDB=0.0333984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.614;QD=7.72127;RBI=0.0434616;REFB=-0.0445894;REVB=-0.0278111;RO=41;SAF=15;SAR=20;SRF=14;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0869347;STB=0.541738;TYPE=snp;VARB=0.0540044;OID=.;OPOS=247836008;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:41:41:35:36:20:15:14:27:21:15:14:27 chr1 247836207 . T A 205.95 PASS AO=49;DP=102;FAO=49;FDP=102;FR=.;FRO=53;FSAF=17;FSAR=32;FSRF=21;FSRR=32;FWDB=-0.0225334;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=228.378;QD=8.0764;RBI=0.024626;REFB=-0.0235651;REVB=-0.00993399;RO=51;SAF=17;SAR=32;SRF=20;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0451142;STB=0.527766;TYPE=snp;VARB=0.0250156;OID=.;OPOS=247836207;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:51:53:49:49:32:17:20:31:32:17:21:32 chr1 247875314 . C A 137.31 PASS AO=34;DP=77;FAO=35;FDP=79;FR=.;FRO=44;FSAF=25;FSAR=10;FSRF=36;FSRR=8;FWDB=-0.0259597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.46;QD=6.95244;RBI=0.0259755;REFB=0.00336043;REVB=-0.000907925;RO=43;SAF=24;SAR=10;SRF=35;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138497;STB=0.575432;TYPE=snp;VARB=-0.00618881;OID=.;OPOS=247875314;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:79:43:44:34:35:10:24:35:8:10:25:36:8 chr1 247875415 . A G 621.06 PASS AO=77;DP=82;FAO=76;FDP=82;FR=.;FRO=6;FSAF=56;FSAR=20;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.0913496;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.1463;QD=30.2956;RBI=0.130176;REFB=-0.0361483;REVB=0.0927424;RO=5;SAF=58;SAR=19;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0817619;STB=0.521874;TYPE=snp;VARB=0.00304784;OID=.;OPOS=247875415;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:82:5:6:77:76:19:58:1:4:20:56:3:3 chr1 247875583 . G C 93.6 PASS AO=23;DP=50;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=-0.0663148;FXX=0.019996;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.7394;QD=7.64104;RBI=0.0696532;REFB=-0.0392618;REVB=0.0213052;RO=27;SAF=9;SAR=14;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0160338;STB=0.525668;TYPE=snp;VARB=0.0416007;OID=.;OPOS=247875583;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:50:49:27:27:23:22:14:9:11:16:14:8:11:16 chr1 247875608 . C G 543.51 PASS AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00145963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.031;QD=38.1413;RBI=0.00366061;REFB=0;REVB=-0.00335701;RO=0;SAF=26;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19358e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.64448e-06;OID=.;OPOS=247875608;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:57:57:0:0:57:57:31:26:0:0:31:26:0:0 chr1 247875689 . A G 204.5 PASS AO=47;DP=97;FAO=48;FDP=99;FR=.;FRO=51;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=0.0046674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.696;QD=8.26272;RBI=0.0722897;REFB=-0.0381908;REVB=-0.0721389;RO=49;SAF=18;SAR=29;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101047;STB=0.52829;TYPE=snp;VARB=0.0335573;OID=.;OPOS=247875689;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:99:49:51:47:48:29:18:24:25:28:20:24:27 chr1 247875975 . A G 368.12 PASS AO=95;DP=208;FAO=95;FDP=207;FR=.;FRO=112;FSAF=47;FSAR=48;FSRF=53;FSRR=59;FWDB=0.0169182;FXX=0.00480746;HRUN=3;LEN=1;MLLD=166.71;QD=7.11342;RBI=0.0204481;REFB=-0.0307602;REVB=-0.0114847;RO=112;SAF=47;SAR=48;SRF=53;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0210354;STB=0.511647;TYPE=snp;VARB=0.0297895;OID=.;OPOS=247875975;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:207:112:112:95:95:48:47:53:59:48:47:53:59 chr1 247886493 . G A 148.07 PASS AO=41;DP=98;FAO=41;FDP=98;FR=.;FRO=57;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=28;FSRR=29;FWDB=-0.00237708;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=188.705;QD=6.04346;RBI=0.00537487;REFB=-0.00328634;REVB=-0.00482065;RO=57;SAF=21;SAR=20;SRF=28;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0216141;STB=0.512189;TYPE=snp;VARB=0.00488428;OID=.;OPOS=247886493;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:57:57:41:41:20:21:28:29:20:21:28:29 chr1 247886615 . G A 191.95 PASS AO=40;DP=77;FAO=41;FDP=78;FR=.;FRO=37;FSAF=14;FSAR=27;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=0.0132496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.009;QD=9.84382;RBI=0.013836;REFB=-0.00552472;REVB=-0.00398544;RO=37;SAF=13;SAR=27;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101745;STB=0.546535;TYPE=snp;VARB=0.00326814;OID=.;OPOS=247886615;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:78:37:37:40:41:27:13:16:21:27:14:16:21 chr1 247886648 . G A 126.04 PASS AO=35;DP=81;FAO=34;FDP=81;FR=.;FRO=47;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=29;FWDB=0.0125937;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2277;QD=6.22413;RBI=0.0546385;REFB=-0.00256689;REVB=-0.0531673;RO=46;SAF=17;SAR=18;SRF=18;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0955676;STB=0.567862;TYPE=snp;VARB=0.00267458;OID=.;OPOS=247886648;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:46:47:35:34:18:17:18:28:17:17:18:29 chr1 247921100 . T G 54.7 PASS AO=18;DP=55;FAO=18;FDP=54;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=-0.0318263;FXX=0.0526223;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.565;QD=4.05186;RBI=0.0377341;REFB=-0.0152976;REVB=-0.0202718;RO=36;SAF=10;SAR=8;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0940995;STB=0.555494;TYPE=snp;VARB=0.016333;OID=.;OPOS=247921100;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:55:54:36:36:18:18:8:10:17:19:8:10:17:19 chr1 247921352 . C T 179.23 PASS AO=44;DP=97;FAO=45;FDP=98;FR=.;FRO=53;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=31;FWDB=-0.00649925;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.947;QD=7.31536;RBI=0.0174225;REFB=-0.0247079;REVB=0.0161649;RO=52;SAF=25;SAR=19;SRF=22;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140305;STB=0.587665;TYPE=snp;VARB=0.0311102;OID=.;OPOS=247921352;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:98:52:53:44:45:19:25:22:30:19:26:22:31 chr1 247921412 . G C 203.64 PASS AO=45;DP=88;FAO=45;FDP=88;FR=.;FRO=43;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=9;FSRR=34;FWDB=0.0203886;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=166.321;QD=9.25644;RBI=0.0207706;REFB=-0.00440847;REVB=0.00396527;RO=43;SAF=20;SAR=25;SRF=9;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217492;STB=0.619374;TYPE=snp;VARB=0.00429067;OID=.;OPOS=247921412;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:43:43:45:45:25:20:9:34:25:20:9:34 chr1 247921717 . C A 216.75 PASS AO=50;DP=117;FAO=57;FDP=125;FR=.;FRO=68;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=28;FSRR=40;FWDB=0.0274633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=304.674;QD=6.93609;RBI=0.0295588;REFB=0.00341422;REVB=0.0109312;RO=59;SAF=23;SAR=27;SRF=22;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0859022;STB=0.552672;TYPE=snp;VARB=-0.00399111;OID=.;OPOS=247921717;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:125:59:68:50:57:27:23:22:37:28:29:28:40 chr1 247921888 . C T 664.39 PASS AO=67;DP=67;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.129973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.8397;QD=38.5151;RBI=0.131124;REFB=0;REVB=-0.0173313;RO=0;SAF=12;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000593524;OID=.;OPOS=247921888;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:67:69:0:0:67:69:55:12:0:0:55:14:0:0 chr1 247978319 . A G 1876.8 PASS AO=202;DP=208;FAO=205;FDP=208;FR=.;FRO=3;FSAF=71;FSAR=134;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.00819908;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=218.494;QD=36.0924;RBI=0.0327253;REFB=-0.125363;REVB=0.0316815;RO=4;SAF=71;SAR=131;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0143191;STB=0.505535;TYPE=snp;VARB=0.00026153;OID=.;OPOS=247978319;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:208:208:4:3:202:205:131:71:0:4:134:71:0:3 chr1 247978339 . G A 349.98 PASS AO=90;DP=195;FAO=90;FDP=195;FR=.;FRO=105;FSAF=36;FSAR=54;FSRF=32;FSRR=73;FWDB=0.0271993;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.5089;QD=7.17904;RBI=0.0302835;REFB=-0.00880231;REVB=0.013315;RO=98;SAF=36;SAR=54;SRF=31;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0840394;STB=0.554573;TYPE=snp;VARB=0.0155538;OID=.;OPOS=247978339;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:195:98:105:90:90:54:36:31:67:54:36:32:73 chr1 247978924 . G A 10.18 PASS AO=7;DP=45;FAO=7;FDP=42;FR=.,HEALED;FRO=35;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.0948595;FXX=0.0232504;HRUN=3;LEN=1;MLLD=177.971;QD=0.969799;RBI=0.108194;REFB=-0.015365;REVB=-0.0520356;RO=24;SAF=1;SAR=6;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.307772;STB=0.785955;TYPE=snp;VARB=0.0464092;OID=.;OPOS=247978924;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:41:42:24:35:7:7:6:1:8:16:6:1:15:20 chr1 248004296 . A G 134.45 PASS AO=49;DP=143;FAO=49;FDP=144;FR=.;FRO=95;FSAF=39;FSAR=10;FSRF=73;FSRR=22;FWDB=-0.0198379;FXX=0.0136977;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.475;QD=3.73473;RBI=0.0281592;REFB=-0.0101928;REVB=-0.019985;RO=94;SAF=39;SAR=10;SRF=73;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0331562;STB=0.527016;TYPE=snp;VARB=0.0196095;OID=.;OPOS=248004296;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:144:94:95:49:49:10:39:73:21:10:39:73:22 chr1 248004614 . G A 97.73 PASS AO=34;DP=84;FAO=29;FDP=75;FR=.;FRO=46;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=0.0287042;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.374;QD=5.21205;RBI=0.0353139;REFB=-0.0218033;REVB=-0.0205704;RO=50;SAF=15;SAR=19;SRF=24;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0410104;STB=0.54906;TYPE=snp;VARB=0.0324228;OID=.;OPOS=248004614;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:84:75:50:46:34:29:19:15:24:26:18:11:21:25 chr1 248004687 . C G 109.78 PASS AO=20;DP=48;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.0429819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.752;QD=9.9797;RBI=0.0480088;REFB=-0.0176384;REVB=-0.0213868;RO=28;SAF=11;SAR=9;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0870393;STB=0.609282;TYPE=snp;VARB=0.0133755;OID=.;OPOS=248004687;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:48:44:28:21:20:23:9:11:13:15:10:13:7:14 chr1 248004775 . C T 88.03 PASS AO=22;DP=52;FAO=21;FDP=46;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=0.00970373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.119;QD=7.65457;RBI=0.0175373;REFB=-0.0152409;REVB=-0.0146081;RO=30;SAF=7;SAR=15;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0213502;STB=0.508189;TYPE=snp;VARB=0.0325224;OID=.;OPOS=248004775;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:52:46:30:25:22:21:15:7:9:21:14:7:8:17 chr1 248004848 . G C 77.24 PASS AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=0.0395152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9455;QD=7.72439;RBI=0.0434581;REFB=-0.00238403;REVB=-0.0180875;RO=22;SAF=5;SAR=13;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0470828;STB=0.526996;TYPE=snp;VARB=0.00404367;OID=.;OPOS=248004848;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:40:40:22:22:18:18:13:5:7:15:13:5:7:15 chr1 248004877 . C T 67.68 PASS AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0191335;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.367;QD=9.66806;RBI=0.023526;REFB=-0.0403517;REVB=0.0136888;RO=14;SAF=5;SAR=9;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0448684;OID=.;OPOS=248004877;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:28:28:14:14:14:14:9:5:5:9:9:5:5:9 chr1 248004884 . T C 231.77 PASS AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00517529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.355;QD=37.0834;RBI=0.0248104;REFB=0;REVB=0.0242646;RO=0;SAF=9;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000127423;OID=.;OPOS=248004884;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:25:25:0:0:25:25:16:9:0:0:16:9:0:0 chr1 248005213 . G C 99.61 PASS AO=27;DP=92;FAO=29;FDP=89;FR=.,HEALED;FRO=54;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=33;FWDB=0.0217295;FXX=0.0531858;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.7552;QD=4.47685;RBI=0.023321;REFB=-0.00591522;REVB=-0.00846761;RO=43;SAF=10;SAR=17;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0543702;STB=0.531087;TYPE=snp;VARB=0.0151437;OID=.;OPOS=248005213;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:91:89:43:54:27:29:17:10:18:25:19:10:21:33 chr1 248028219 . G A 45.01 PASS AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.457;QD=25.7186;RBI=0.0193355;REFB=-0.0257008;REVB=0.0193355;RO=0;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00753198;OID=.;OPOS=248028219;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:7:7:0:1:6:6:6:0:0:0:6:0:0:1 chr1 248039451 . C T 211.03 PASS AO=56;DP=126;FAO=56;FDP=127;FR=.;FRO=71;FSAF=46;FSAR=10;FSRF=57;FSRR=14;FWDB=-0.0158571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.311;QD=6.64671;RBI=0.0224046;REFB=0.00200178;REVB=-0.0158278;RO=70;SAF=46;SAR=10;SRF=57;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119966;STB=0.517332;TYPE=snp;VARB=-0.00231498;OID=.;OPOS=248039451;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:127:70:71:56:56:10:46:57:13:10:46:57:14 chr1 248039713 . A G 391.88 PASS AO=90;DP=180;FAO=91;FDP=181;FR=.;FRO=90;FSAF=46;FSAR=45;FSRF=44;FSRR=46;FWDB=-0.0308128;FXX=0.0054942;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.7095;QD=8.66042;RBI=0.0331564;REFB=-0.0121019;REVB=-0.0122441;RO=90;SAF=45;SAR=45;SRF=44;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101011;STB=0.508255;TYPE=snp;VARB=0.0107479;OID=.;OPOS=248039713;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:181:90:90:90:91:45:45:44:46:45:46:44:46 chr1 248059423 . C T 111.07 PASS AO=37;DP=103;FAO=37;FDP=103;FR=.;FRO=66;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=40;FSRR=26;FWDB=0.0468416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.566;QD=4.31329;RBI=0.046914;REFB=-0.0149018;REVB=0.0026059;RO=66;SAF=17;SAR=20;SRF=40;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162601;STB=0.593083;TYPE=snp;VARB=0.0234287;OID=.;OPOS=248059423;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:66:66:37:37:20:17:40:26:20:17:40:26 chr1 248059456 . G A 178.85 PASS AO=53;DP=145;FAO=58;FDP=154;FR=.;FRO=96;FSAF=32;FSAR=26;FSRF=60;FSRR=36;FWDB=-0.012327;FXX=0.0064512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.608;QD=4.64531;RBI=0.0160367;REFB=-0.0062149;REVB=0.0102576;RO=92;SAF=32;SAR=21;SRF=60;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.057196;STB=0.546602;TYPE=snp;VARB=0.0129991;OID=.;OPOS=248059456;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:154:92:96:53:58:21:32:60:32:26:32:60:36 chr1 248059476 . A C 320.4 PASS AO=90;DP=222;FAO=95;FDP=230;FR=.;FRO=135;FSAF=59;FSAR=36;FSRF=93;FSRR=42;FWDB=-0.0246844;FXX=0.00432882;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.6681;QD=5.57212;RBI=0.027108;REFB=-0.0210174;REVB=-0.0112038;RO=129;SAF=59;SAR=31;SRF=91;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0594494;STB=0.543172;TYPE=snp;VARB=0.028203;OID=.;OPOS=248059476;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:230:129:135:90:95:31:59:91:38:36:59:93:42 chr1 248059703 . T A 261.89 PASS AO=67;DP=150;FAO=68;FDP=151;FR=.;FRO=83;FSAF=14;FSAR=54;FSRF=24;FSRR=59;FWDB=0.0108244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.995;QD=6.93744;RBI=0.0137835;REFB=0.000659111;REVB=0.00853335;RO=83;SAF=13;SAR=54;SRF=24;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135899;STB=0.564647;TYPE=snp;VARB=-0.000977637;OID=.;OPOS=248059703;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:151:83:83:67:68:54:13:24:59:54:14:24:59 chr1 248059712 . T C 258.78 PASS AO=66;DP=147;FAO=67;FDP=148;FR=.;FRO=81;FSAF=15;FSAR=52;FSRF=23;FSRR=58;FWDB=0.00563734;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.626;QD=6.99416;RBI=0.00659434;REFB=-0.00489082;REVB=0.00342136;RO=80;SAF=14;SAR=52;SRF=23;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103063;STB=0.544939;TYPE=snp;VARB=0.00396165;OID=.;OPOS=248059712;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:148:80:81:66:67:52:14:23:57:52:15:23:58 chr1 248059804 . C T 411.29 PASS AO=72;DP=146;FAO=87;FDP=158;FR=.;FRO=71;FSAF=42;FSAR=45;FSRF=36;FSRR=35;FWDB=-0.00990574;FXX=0.0186324;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.107;QD=10.4125;RBI=0.0376822;REFB=-0.0231601;REVB=0.0363569;RO=72;SAF=41;SAR=31;SRF=34;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0886838;STB=0.510915;TYPE=snp;VARB=0.0196565;OID=.;OPOS=248059804;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:158:72:71:72:87:31:41:34:38:45:42:36:35 chr1 248059856 . T C 295.32 PASS AO=80;DP=180;FAO=80;FDP=182;FR=.;FRO=102;FSAF=43;FSAR=37;FSRF=43;FSRR=59;FWDB=-0.0299261;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.504;QD=6.49051;RBI=0.0299729;REFB=-0.0250647;REVB=-0.00167428;RO=100;SAF=43;SAR=37;SRF=43;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107066;STB=0.56469;TYPE=snp;VARB=0.0264631;OID=.;OPOS=248059856;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:182:100:102:80:80:37:43:43:57:37:43:43:59 chr1 248060029 . A G 580.86 PASS AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0417888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.772;QD=38.7238;RBI=0.0487815;REFB=0;REVB=0.0251659;RO=0;SAF=22;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000186622;OID=.;OPOS=248060029;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:60:60:0:0:60:60:38:22:0:0:38:22:0:0 chr1 248060246 . TA T 68.8 PASS AO=17;DP=30;FAO=19;FDP=30;FR=.;FRO=11;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=0;FWDB=-0.0538685;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=14.4478;QD=9.173;RBI=0.067749;REFB=0.0269049;REVB=0.0410867;RO=10;SAF=13;SAR=4;SRF=10;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253741;STB=0.640905;TYPE=del;VARB=-0.0243445;OID=.;OPOS=248060247;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:17:29:19:30:11:14:5:11:0:22:10:13:4:10:0 chr1 248060279 . C T 83.94 PASS AO=27;DP=76;FAO=27;FDP=75;FR=.;FRO=48;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=29;FWDB=0.00849148;FXX=0.0259707;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.6295;QD=4.47672;RBI=0.0668074;REFB=-0.040139;REVB=-0.0662656;RO=48;SAF=18;SAR=9;SRF=19;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.298705;STB=0.672439;TYPE=snp;VARB=0.0646723;OID=.;OPOS=248060279;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:76:75:48:48:27:27:9:18:19:29:9:18:19:29 chr1 248060380 . C G 160.52 PASS AO=49;DP=129;FAO=49;FDP=126;FR=.;FRO=77;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=29;FSRR=48;FWDB=-0.0134409;FXX=0.0307669;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.8032;QD=5.09596;RBI=0.0148648;REFB=-0.00974107;REVB=-0.00634867;RO=77;SAF=22;SAR=27;SRF=29;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0797269;STB=0.545076;TYPE=snp;VARB=0.0377573;OID=.;OPOS=248060380;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:126:77:77:49:49:27:22:29:48:27:22:29:48 chr1 248084434 . G A 299.48 PASS AO=76;DP=163;FAO=76;FDP=164;FR=.;FRO=88;FSAF=42;FSAR=34;FSRF=36;FSRR=52;FWDB=-0.0129685;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.671;QD=7.30444;RBI=0.0146371;REFB=-0.0153018;REVB=0.00678687;RO=87;SAF=42;SAR=34;SRF=35;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144091;STB=0.576608;TYPE=snp;VARB=0.0186399;OID=.;OPOS=248084434;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:164:87:88:76:76:34:42:35:52:34:42:36:52 chr1 248084464 . T C 1153.54 PASS AO=135;DP=153;FAO=136;FDP=147;FR=.;FRO=11;FSAF=70;FSAR=66;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0161426;FXX=0.0392131;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.688;QD=31.3888;RBI=0.0213481;REFB=-0.000364979;REVB=-0.0139699;RO=11;SAF=69;SAR=66;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00490735;STB=0.502303;TYPE=snp;VARB=-3.75228e-05;OID=.;OPOS=248084464;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:153:147:11:11:135:136:66:69:6:5:66:70:6:5 chr1 248084511 . T C 324.74 PASS AO=62;DP=104;FAO=62;FDP=104;FR=.;FRO=42;FSAF=22;FSAR=40;FSRF=26;FSRR=16;FWDB=-0.00767569;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=290.171;QD=12.4901;RBI=0.00901058;REFB=0.000924651;REVB=-0.00471956;RO=42;SAF=22;SAR=40;SRF=26;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200096;STB=0.609101;TYPE=snp;VARB=-0.000598062;OID=.;OPOS=248084511;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:42:42:62:62:40:22:26:16:40:22:26:16 chr1 248084825 . C T 12.57 PASS AO=4;DP=18;FAO=4;FDP=18;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=13;FSRR=1;FWDB=0.00749999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.03;QD=2.79323;RBI=0.0534034;REFB=-0.00342073;REVB=-0.0528741;RO=14;SAF=2;SAR=2;SRF=13;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.547384;STB=0.832403;TYPE=snp;VARB=0.00776448;OID=.;OPOS=248084825;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:18:18:14:14:4:4:2:2:13:1:2:2:13:1 chr1 248085011 . C G 70.18 PASS AO=13;DP=23;FAO=13;FDP=23;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0978005;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.9683;QD=12.2059;RBI=0.0986552;REFB=-0.0257392;REVB=0.0129583;RO=10;SAF=5;SAR=8;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0696635;STB=0.539509;TYPE=snp;VARB=0.0301989;OID=.;OPOS=248085011;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:23:23:10:10:13:13:8:5:3:7:8:5:3:7 chr1 248085108 . C T 356.97 PASS AO=90;DP=193;FAO=90;FDP=192;FR=.;FRO=102;FSAF=46;FSAR=44;FSRF=51;FSRR=51;FWDB=0.014403;FXX=0.00518108;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4992;QD=7.43695;RBI=0.0336228;REFB=-0.0113665;REVB=0.0303817;RO=100;SAF=46;SAR=44;SRF=50;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0105864;STB=0.505903;TYPE=snp;VARB=0.0128471;OID=.;OPOS=248085108;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:192:100:102:90:90:44:46:50:50:44:46:51:51 chr1 248085124 . G A 409.21 PASS AO=102;DP=214;FAO=102;FDP=215;FR=.;FRO=113;FSAF=55;FSAR=47;FSRF=50;FSRR=63;FWDB=-0.00505844;FXX=0.00462942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.8109;QD=7.61325;RBI=0.0188114;REFB=0.0140889;REVB=0.0181186;RO=111;SAF=55;SAR=47;SRF=50;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0837977;STB=0.550741;TYPE=snp;VARB=-0.0226353;OID=.;OPOS=248085124;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:215:111:113:102:102:47:55:50:61:47:55:50:63 chr1 248112627 . T C 432.66 PASS AO=120;DP=275;FAO=120;FDP=275;FR=.;FRO=155;FSAF=46;FSAR=74;FSRF=86;FSRR=69;FWDB=-0.140678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.892;QD=6.29318;RBI=0.143433;REFB=-0.021279;REVB=0.027974;RO=154;SAF=46;SAR=74;SRF=85;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172276;STB=0.597561;TYPE=snp;VARB=0.017364;OID=.;OPOS=248112627;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:275:275:154:155:120:120:74:46:85:69:74:46:86:69 chr1 248112745 . G T 1223.36 PASS AO=132;DP=136;FAO=134;FDP=138;FR=.;FRO=4;FSAF=71;FSAR=63;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.00812322;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=116.041;QD=35.4597;RBI=0.00847735;REFB=-0.0109722;REVB=0.00242461;RO=4;SAF=71;SAR=61;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0260217;STB=0.513697;TYPE=snp;VARB=0.000562155;OID=.;OPOS=248112745;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:136:138:4:4:132:134:61:71:4:0:63:71:4:0 chr1 248112762 . T C 1105.05 PASS AO=121;DP=126;FAO=123;FDP=128;FR=.;FRO=5;FSAF=67;FSAR=56;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.00480359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.649;QD=34.5329;RBI=0.0146291;REFB=0.0174091;REVB=-0.013818;RO=3;SAF=67;SAR=54;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0102299;STB=0.513539;TYPE=snp;VARB=-6.16225e-05;OID=.;OPOS=248112762;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:126:128:3:5:121:123:54:67:1:2:56:67:1:4 chr1 248112763 . G A 1158.15 PASS AO=124;DP=127;FAO=126;FDP=129;FR=.;FRO=3;FSAF=68;FSAR=58;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0109569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.369;QD=35.9117;RBI=0.0231988;REFB=-0.116441;REVB=-0.0204482;RO=3;SAF=68;SAR=56;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00972862;STB=0.504825;TYPE=snp;VARB=-1.4606e-05;OID=.;OPOS=248112763;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:127:129:3:3:124:126:56:68:1:2:58:68:1:2 chr1 248112771 . C T 1248.47 PASS AO=130;DP=133;FAO=135;FDP=138;FR=.;FRO=3;FSAF=65;FSAR=70;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00555472;FXX=0.00719373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.744;QD=36.1876;RBI=0.0269731;REFB=-0.00307788;REVB=-0.026395;RO=3;SAF=64;SAR=66;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00681463;STB=0.503225;TYPE=snp;VARB=5.15076e-05;OID=.;OPOS=248112771;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:133:138:3:3:130:135:66:64:1:2:70:65:1:2 chr1 248112809 . A G 1396.77 PASS AO=148;DP=151;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.119872;FXX=0.0196066;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7919;QD=37.2471;RBI=0.119889;REFB=-0.0526441;REVB=0.00201121;RO=2;SAF=65;SAR=83;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00156487;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00198036;OID=.;OPOS=248112809;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:151:150:2:0:148:150:83:65:1:1:85:65:0:0 chr1 248112836 . A G 1331.78 PASS AO=140;DP=142;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207997;FXX=0.00699252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1386;QD=37.5148;RBI=0.026342;REFB=-0.00965997;REVB=0.0161639;RO=1;SAF=64;SAR=76;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00737137;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000773945;OID=.;OPOS=248112836;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:142:142:1:0:140:142:76:64:1:0:78:64:0:0 chr1 248112915 . A G 248.46 PASS AO=49;DP=85;FAO=50;FDP=90;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=34;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=0.0253912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.524;QD=11.0425;RBI=0.0272314;REFB=0.00137015;REVB=0.00984042;RO=36;SAF=16;SAR=33;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12182;STB=0.551601;TYPE=snp;VARB=-0.000721153;OID=.;OPOS=248112915;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:90:36:40:49:50:33:16:17:19:34:16:17:23 chr1 248113026 . T A 983.95 PASS AO=95;DP=135;FAO=116;FDP=135;FR=.,HEALED;FRO=13;FSAF=45;FSAR=71;FSRF=12;FSRR=1;FWDB=0.0375907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.091;QD=29.154;RBI=0.0377737;REFB=-0.050523;REVB=0.00371317;RO=13;SAF=25;SAR=70;SRF=12;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17552;STB=0.555363;TYPE=snp;VARB=0.00787564;OID=.;OPOS=248113026;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:135:135:13:13:95:116:70:25:12:1:71:45:12:1 chr1 248113040 . A G 851.89 PASS AO=113;DP=134;FAO=113;FDP=134;FR=.;FRO=21;FSAF=47;FSAR=66;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.0068202;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7464;QD=25.4295;RBI=0.0109946;REFB=0.00525966;REVB=0.00862357;RO=20;SAF=48;SAR=65;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0646421;STB=0.539888;TYPE=snp;VARB=-0.00202783;OID=.;OPOS=248113040;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:134:134:20:21:113:113:65:48:13:7:66:47:14:7 chr1 248128929 . G A 366.08 PASS AO=69;DP=116;FAO=70;FDP=118;FR=.;FRO=48;FSAF=24;FSAR=46;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=0.0130931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.171;QD=12.4095;RBI=0.0236084;REFB=-0.0395866;REVB=-0.0196451;RO=47;SAF=23;SAR=46;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124511;STB=0.567881;TYPE=snp;VARB=0.0272372;OID=.;OPOS=248128929;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:118:47:48:69:70:46:23:23:24:46:24:24:24 chr1 248129240 . G A 481.95 PASS AO=117;DP=239;FAO=117;FDP=239;FR=.;FRO=122;FSAF=66;FSAR=51;FSRF=52;FSRR=70;FWDB=-0.0208665;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.1908;QD=8.06603;RBI=0.0525025;REFB=-0.0188906;REVB=0.0481778;RO=121;SAF=66;SAR=51;SRF=52;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124128;STB=0.570254;TYPE=snp;VARB=0.0204385;OID=.;OPOS=248129240;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:239:239:121:122:117:117:51:66:52:69:51:66:52:70 chr1 248202344 . G C 343.91 PASS AO=107;DP=270;FAO=107;FDP=270;FR=.;FRO=163;FSAF=50;FSAR=57;FSRF=83;FSRR=80;FWDB=-0.00334452;FXX=0.0036899;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.4936;QD=5.09495;RBI=0.00677208;REFB=-0.028483;REVB=-0.00588857;RO=163;SAF=50;SAR=57;SRF=83;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0451283;STB=0.525323;TYPE=snp;VARB=0.0426761;OID=.;OPOS=248202344;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:270:270:163:163:107:107:57:50:83:80:57:50:83:80 chr1 248264018 . C T 2517.54 PASS AO=263;DP=263;FAO=263;FDP=263;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=195;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0257441;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.926;QD=38.2896;RBI=0.0296065;REFB=0;REVB=-0.0146215;RO=0;SAF=68;SAR=195;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.20082e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.11581e-05;OID=.;OPOS=248264018;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:263:263:0:0:263:263:195:68:0:0:195:68:0:0 chr1 248343543 . C T 2707.21 PASS AO=292;DP=300;FAO=299;FDP=304;FR=.;FRO=5;FSAF=127;FSAR=172;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0527002;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.7545;QD=35.6212;RBI=0.0970548;REFB=-0.204121;REVB=0.0815004;RO=2;SAF=119;SAR=173;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00548116;STB=0.503786;TYPE=snp;VARB=0.00374626;OID=.;OPOS=248343543;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:300:304:2:5:292:299:173:119:0:2:172:127:1:4 chr1 248343945 . C G 3842.59 PASS AO=460;DP=461;FAO=399;FDP=399;FR=.;FRO=0;FSAF=149;FSAR=250;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235953;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.2321;QD=38.5223;RBI=0.0661009;REFB=0;REVB=0.0617462;RO=0;SAF=169;SAR=291;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.92981e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.15434e-05;OID=.;OPOS=248343945;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:461:399:0:0:460:399:291:169:0:0:250:149:0:0 chr1 248343990 . T C 3751.31 PASS AO=453;DP=459;FAO=395;FDP=395;FR=.;FRO=0;FSAF=153;FSAR=242;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195341;FXX=0.0124997;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.163;QD=37.988;RBI=0.0387368;REFB=-0.044278;REVB=0.0334508;RO=1;SAF=176;SAR=277;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00172036;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.04682e-05;OID=.;OPOS=248343990;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:459:395:1:0:453:395:277:176:0:1:242:153:0:0 chr1 248366702 . G A 3245.46 PASS AO=334;DP=336;FAO=339;FDP=339;FR=.;FRO=0;FSAF=145;FSAR=194;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0222024;FXX=0.00294109;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.308;QD=38.2945;RBI=0.0247213;REFB=-0.0031179;REVB=0.0108717;RO=1;SAF=145;SAR=189;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00251764;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.3129e-05;OID=.;OPOS=248366702;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:336:339:1:0:334:339:189:145:0:1:194:145:0:0 chr1 248402758 . C T 1326.42 PASS AO=108;DP=144;FAO=140;FDP=142;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=37;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0651676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.073;QD=37.3638;RBI=0.0652065;REFB=0;REVB=0.00225348;RO=0;SAF=16;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.12102e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00111285;OID=.;OPOS=248402758;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:131:142:0:0:108:140:92:16:0:0:103:37:0:0 chr1 248436611 . G A 598.02 PASS AO=62;DP=63;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.656;QD=37.3765;RBI=0.054499;REFB=0;REVB=0.0526057;RO=0;SAF=40;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000424896;OID=.;OPOS=248436611;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:63:64:0:0:62:64:22:40:0:0:23:41:0:0 chr1 248436616 . A G 590.86 PASS AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00296279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.473;QD=36.3603;RBI=0.027381;REFB=-0.0736108;REVB=-0.0272203;RO=1;SAF=41;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200902;STB=0.510635;TYPE=snp;VARB=-0.000112783;OID=.;OPOS=248436616;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:65:65:1:1:64:64:23:41:0:1:23:41:0:1 chr1 248436805 . T G 356.52 PASS AO=24;DP=40;FAO=38;FDP=38;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0097617;FXX=0.0499875;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.91;QD=37.5287;RBI=0.10367;REFB=0.0545791;REVB=0.10321;RO=3;SAF=20;SAR=4;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0587342;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000188634;OID=.;OPOS=248436805;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:40:38:3:0:24:38:4:20:2:1:17:21:0:0 chr1 248457979 . C A 2055.67 PASS AO=220;DP=224;FAO=220;FDP=220;FR=.;FRO=0;FSAF=112;FSAR=108;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00372947;FXX=0.0178563;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.069;QD=37.3759;RBI=0.0164688;REFB=-0.00554443;REVB=0.016041;RO=3;SAF=112;SAR=108;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00450567;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000121834;OID=.;OPOS=248457979;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:224:220:3:0:220:220:108:112:1:2:108:112:0:0 chr1 248457993 . C G 475.5 PASS AO=118;DP=253;FAO=119;FDP=251;FR=.;FRO=132;FSAF=63;FSAR=56;FSRF=59;FSRR=73;FWDB=0.0099918;FXX=0.00790483;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.7755;QD=7.57761;RBI=0.034762;REFB=-0.00239261;REVB=0.0332951;RO=131;SAF=62;SAR=56;SRF=59;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0715075;STB=0.543278;TYPE=snp;VARB=0.00339595;OID=.;OPOS=248457993;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:253:251:131:132:118:119:56:62:59:72:56:63:59:73 chr1 248458676 . T C 1221.72 PASS AO=128;DP=130;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000835386;FXX=0.00769172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.643;QD=37.8827;RBI=0.0640344;REFB=-0.0469795;REVB=0.0640289;RO=1;SAF=60;SAR=68;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00693745;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000620025;OID=.;OPOS=248458676;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:130:129:1:0:128:129:68:60:0:1:69:60:0:0 chr1 248458689 . A G 1432.46 PASS AO=152;DP=153;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0133235;FXX=0.00653552;HRUN=3;LEN=1;MLLD=257.04;QD=37.6963;RBI=0.0133235;REFB=0.0405254;REVB=3.18187e-05;RO=1;SAF=68;SAR=84;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00562956;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000100284;OID=.;OPOS=248458689;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:153:152:1:0:152:152:84:68:0:1:84:68:0:0 chr1 248458717 . C G 1891.06 PASS AO=196;DP=200;FAO=196;FDP=196;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243497;FXX=0.019999;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.5802;QD=38.593;RBI=0.0265647;REFB=0;REVB=-0.0106196;RO=0;SAF=81;SAR=115;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00047819;OID=.;OPOS=248458717;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:89:200:196:0:0:196:196:115:81:0:0:115:81:0:0 chr1 248458736 . A G 588.5 PASS AO=126;DP=232;FAO=126;FDP=231;FR=.;FRO=105;FSAF=58;FSAR=68;FSRF=42;FSRR=63;FWDB=-0.00203182;FXX=0.00431016;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.749;QD=10.1905;RBI=0.00493848;REFB=-0.00839286;REVB=-0.00450115;RO=105;SAF=58;SAR=68;SRF=42;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0508866;STB=0.527708;TYPE=snp;VARB=0.0072422;OID=.;OPOS=248458736;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:231:105:105:126:126:68:58:42:63:68:58:42:63 chr1 248458760 . C A 2398.04 PASS AO=252;DP=253;FAO=250;FDP=250;FR=.;FRO=0;FSAF=106;FSAR=144;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0445663;FXX=0.0196071;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.474;QD=38.3687;RBI=0.0451716;REFB=0;REVB=-0.00737049;RO=0;SAF=109;SAR=143;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000131426;OID=.;OPOS=248458760;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:253:250:0:0:252:250:143:109:0:0:144:106:0:0 chr1 248458875 . CT C 309.07 PASS AO=74;DP=157;FAO=74;FDP=152;FR=.;FRO=78;FSAF=22;FSAR=52;FSRF=30;FSRR=48;FWDB=5.77553e-05;FXX=0.0129862;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.101;QD=8.13339;RBI=0.00132839;REFB=0.0034609;REVB=0.00132713;RO=78;SAF=22;SAR=52;SRF=30;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0927731;STB=0.551372;TYPE=del;VARB=-0.00409641;OID=.;OPOS=248458876;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:74:152:74:152:78:22:52:30:48:99:78:22:52:30:48 chr1 248487016 . C T 550.15 PASS AO=113;DP=212;FAO=118;FDP=215;FR=.;FRO=97;FSAF=51;FSAR=67;FSRF=55;FSRR=42;FWDB=0.00640849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.39;QD=10.2354;RBI=0.0187039;REFB=-0.0230489;REVB=0.0175718;RO=97;SAF=48;SAR=65;SRF=55;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120676;STB=0.560925;TYPE=snp;VARB=0.012328;OID=.;OPOS=248487016;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:215:97:97:113:118:65:48:55:42:67:51:55:42 chr1 248487300 . C T 608.14 PASS AO=210;DP=485;FAO=172;FDP=399;FR=.;FRO=227;FSAF=99;FSAR=73;FSRF=133;FSRR=94;FWDB=-0.0102697;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.723;QD=6.09667;RBI=0.0447116;REFB=-0.00320744;REVB=0.0435162;RO=273;SAF=127;SAR=83;SRF=157;SRR=116;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.031398;STB=0.50602;TYPE=snp;VARB=0.00387223;OID=.;OPOS=248487300;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:485:399:273:227:210:172:83:127:157:116:73:99:133:94 chr1 248487338 . C A 3853.45 PASS AO=505;DP=505;FAO=400;FDP=400;FR=.;FRO=0;FSAF=234;FSAR=166;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0268581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.792;QD=38.5345;RBI=0.0433862;REFB=0;REVB=0.0340736;RO=0;SAF=297;SAR=208;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51916e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.54868e-06;OID=.;OPOS=248487338;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:505:400:0:0:505:400:208:297:0:0:166:234:0:0 chr1 248487638 . A G 3586.74 PASS AO=370;DP=372;FAO=375;FDP=375;FR=.;FRO=0;FSAF=230;FSAR=145;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204278;FXX=0.0053049;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.453;QD=38.2586;RBI=0.0206309;REFB=0.0179869;REVB=0.0028874;RO=1;SAF=230;SAR=140;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00339625;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000138658;OID=.;OPOS=248487638;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:372:375:1:0:370:375:140:230:0:1:145:230:0:0 chr1 248487768 . A G 1832.62 PASS AO=197;DP=197;FAO=194;FDP=194;FR=.;FRO=0;FSAF=153;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0609191;FXX=0.0152277;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.6786;QD=37.7859;RBI=0.0727363;REFB=-0.00631159;REVB=-0.0397421;RO=0;SAF=156;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3084e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000283232;OID=.;OPOS=248487768;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:197:194:0:0:197:194:41:156:0:0:41:153:0:0 chr1 248512094 . C T 345.85 PASS AO=105;DP=260;FAO=105;FDP=260;FR=.;FRO=155;FSAF=54;FSAR=51;FSRF=81;FSRR=74;FWDB=0.00118364;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.177;QD=5.32083;RBI=0.029123;REFB=-0.0312622;REVB=-0.0290989;RO=155;SAF=54;SAR=51;SRF=81;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00883767;STB=0.50495;TYPE=snp;VARB=0.0295287;OID=.;OPOS=248512094;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:260:260:155:155:105:105:51:54:81:74:51:54:81:74 chr1 248512498 . A G 193.56 PASS AO=45;DP=99;FAO=47;FDP=100;FR=.;FRO=53;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=29;FSRR=24;FWDB=-0.00764994;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.757;QD=7.74236;RBI=0.00894619;REFB=-0.0203897;REVB=-0.00463819;RO=54;SAF=26;SAR=19;SRF=29;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.04043;STB=0.503224;TYPE=snp;VARB=0.0201121;OID=.;OPOS=248512498;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:100:54:53:45:47:19:26:29:25:21:26:29:24 chr1 248512637 . C T 355.35 PASS AO=85;DP=176;FAO=86;FDP=177;FR=.;FRO=91;FSAF=46;FSAR=40;FSRF=65;FSRR=26;FWDB=-0.0493389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.695;QD=8.03049;RBI=0.0493475;REFB=-0.0221587;REVB=-0.000922857;RO=90;SAF=45;SAR=40;SRF=65;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183416;STB=0.59388;TYPE=snp;VARB=0.025995;OID=.;OPOS=248512637;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:177:90:91:85:86:40:45:65:25:40:46:65:26 chr1 248512749 . G A 434.46 PASS AO=79;DP=124;FAO=79;FDP=127;FR=.;FRO=48;FSAF=33;FSAR=46;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=0.0147283;FXX=0.0155027;HRUN=3;LEN=1;MLLD=143.963;QD=13.6839;RBI=0.0173525;REFB=-0.02614;REVB=0.00917528;RO=45;SAF=33;SAR=46;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0636477;STB=0.547386;TYPE=snp;VARB=0.0180259;OID=.;OPOS=248512749;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:127:45:48:79:79:46:33:23:22:46:33:26:22 chr1 248512767 . G T 397.3 PASS AO=75;DP=124;FAO=75;FDP=124;FR=.;FRO=49;FSAF=26;FSAR=49;FSRF=23;FSRR=26;FWDB=-0.0185543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.2361;QD=12.8162;RBI=0.0348453;REFB=-0.00900814;REVB=-0.0294946;RO=49;SAF=26;SAR=49;SRF=23;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0952809;STB=0.551813;TYPE=snp;VARB=0.00563057;OID=.;OPOS=248512767;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:49:49:75:75:49:26:23:26:49:26:23:26 chr1 248524971 . C A 32.1 PASS AO=21;DP=87;FAO=23;FDP=94;FR=.;FRO=71;FSAF=1;FSAR=22;FSRF=36;FSRR=35;FWDB=0.0314791;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=35.507;QD=1.3661;RBI=0.0324041;REFB=-0.0712891;REVB=-0.00768734;RO=66;SAF=0;SAR=21;SRF=36;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.789905;STB=0.93411;TYPE=snp;VARB=0.257303;OID=.;OPOS=248524971;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:87:94:66:71:21:23:21:0:36:30:22:1:36:35 chr1 248525638 . CA C 1709.23 PASS AO=175;DP=182;FAO=178;FDP=178;FR=.;FRO=0;FSAF=108;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173436;FXX=0.0111105;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.076;QD=38.4097;RBI=0.019788;REFB=0;REVB=-0.00952706;RO=0;SAF=106;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.77801e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-6.30092e-06;OID=.;OPOS=248525639;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:175:180:178:178:0:108:70:0:0:80:0:106:69:0:0 chr1 248550976 . T G 1972.21 PASS AO=205;DP=206;FAO=209;FDP=209;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0546945;FXX=0.0141503;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.692;QD=37.7456;RBI=0.0667263;REFB=0;REVB=0.0382218;RO=0;SAF=94;SAR=111;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000899281;OID=.;OPOS=248550976;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:94:206:209:0:0:205:209:111:94:0:0:111:98:0:0 chr1 248569369 . A G 1881.5 PASS AO=190;DP=194;FAO=198;FDP=198;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=133;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.044406;FXX=0.0099995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.7553;QD=38.0102;RBI=0.0645947;REFB=0;REVB=0.0469104;RO=2;SAF=63;SAR=127;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00743968;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00051852;OID=.;OPOS=248569369;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:194:198:2:0:190:198:127:63:0:2:133:65:0:0 chr1 248616401 . G A 97.28 PASS AO=144;DP=645;FAO=86;FDP=396;FR=.;FRO=310;FSAF=14;FSAR=72;FSRF=96;FSRR=214;FWDB=0.00194969;FXX=0.00999975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.672;QD=0.982674;RBI=0.0121933;REFB=0.00168882;REVB=0.0120364;RO=489;SAF=23;SAR=121;SRF=151;SRR=338;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.268606;STB=0.664163;TYPE=snp;VARB=-0.00544202;OID=.;OPOS=248616401;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:645:396:489:310:144:86:121:23:151:338:72:14:96:214 chr1 248616408 . C T 123.37 PASS AO=145;DP=635;FAO=93;FDP=400;FR=.;FRO=307;FSAF=22;FSAR=71;FSRF=101;FSRR=206;FWDB=0.00962617;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.1649;QD=1.23372;RBI=0.0171258;REFB=0.00200005;REVB=-0.0141643;RO=490;SAF=24;SAR=121;SRF=160;SRR=330;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280067;STB=0.588973;TYPE=snp;VARB=-0.00696993;OID=.;OPOS=248616408;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:635:400:490:307:145:93:121:24:160:330:71:22:101:206 chr1 248637046 . G A 71.55 PASS AO=10;DP=29;FAO=14;FDP=26;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=1;FWDB=0.0101072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.1299;QD=11.0081;RBI=0.0210459;REFB=-0.0086494;REVB=0.0184601;RO=11;SAF=6;SAR=4;SRF=10;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.317553;STB=0.626712;TYPE=snp;VARB=0.00471977;OID=.;OPOS=248637046;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:22:26:11:12:10:14:4:6:10:1:4:10:11:1 chr1 248637362 . C T 142.71 PASS AO=49;DP=137;FAO=49;FDP=137;FR=.;FRO=88;FSAF=45;FSAR=4;FSRF=52;FSRR=36;FWDB=-0.028883;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.8869;QD=4.16675;RBI=0.0322058;REFB=-0.0192222;REVB=-0.0142472;RO=86;SAF=45;SAR=4;SRF=51;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.543057;STB=0.822502;TYPE=snp;VARB=0.0242584;OID=.;OPOS=248637362;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:86:88:49:49:4:45:51:35:4:45:52:36 chr1 248637543 . C T 86.33 PASS AO=82;DP=393;FAO=82;FDP=393;FR=.;FRO=311;FSAF=39;FSAR=43;FSRF=152;FSRR=159;FWDB=0.00939757;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.539;QD=0.878653;RBI=0.0158025;REFB=-0.0020074;REVB=0.0127045;RO=307;SAF=39;SAR=43;SRF=148;SRR=159;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00835352;STB=0.510407;TYPE=snp;VARB=0.00840857;OID=.;OPOS=248637543;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:393:393:307:311:82:82:43:39:148:159:43:39:152:159 chr1 248685253 . T C 1316.02 PASS AO=138;DP=140;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00335735;FXX=0.0142847;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.843;QD=38.1456;RBI=0.0339917;REFB=-0.0963748;REVB=0.0338255;RO=1;SAF=62;SAR=76;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00621491;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000231558;OID=.;OPOS=248685253;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:140:138:1:0:138:138:76:62:0:1:76:62:0:0 chr1 248737259 . C G 78.48 PASS AO=6;DP=9;FAO=8;FDP=8;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.104963;FXX=0.110988;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.6535;QD=39.2398;RBI=0.109914;REFB=0;REVB=0.0326157;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00775407;OID=.;OPOS=248737259;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:8:0:0:6:8:0:6:0:0:2:6:0:0 chr1 248737595 . A G 18.77 PASS AO=12;DP=60;FAO=12;FDP=60;FR=.;FRO=48;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=39;FWDB=-0.0332933;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=144.364;QD=1.25121;RBI=0.0390733;REFB=-0.00176356;REVB=-0.0204518;RO=48;SAF=3;SAR=9;SRF=9;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112582;STB=0.57132;TYPE=snp;VARB=0.00605054;OID=.;OPOS=248737595;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:60:60:48:48:12:12:9:3:9:39:9:3:9:39 chr1 248789504 . T C 896.32 PASS AO=97;DP=97;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018296;FXX=0.0510152;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.352;QD=38.5516;RBI=0.0203827;REFB=0;REVB=0.0089838;RO=0;SAF=74;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07226e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000424503;OID=.;OPOS=248789504;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:97:93:0:0:97:93:23:74:0:0:23:70:0:0 chr1 248790075 . A G 712.02 PASS AO=72;DP=72;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0479328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.635;QD=37.9746;RBI=0.0647927;REFB=0;REVB=0.0435952;RO=0;SAF=37;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000293289;OID=.;OPOS=248790075;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:72:75:0:0:72:75:35:37:0:0:38:37:0:0 chr1 248801592 . C T 974.4 PASS AO=107;DP=108;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0377206;FXX=0.0095229;HRUN=3;LEN=1;MLLD=128.879;QD=37.477;RBI=0.0465723;REFB=-0.0669196;REVB=0.0273156;RO=1;SAF=74;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0063716;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000525034;OID=.;OPOS=248801592;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:108:104:1:0:107:104:33:74:1:0:32:72:0:0 chr1 248801602 . T TCA 848.06 PASS AO=101;DP=108;FAO=98;FDP=104;FR=.;FRO=6;FSAF=69;FSAR=29;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0183303;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=2;MLLD=289.16;QD=32.6177;RBI=0.0579415;REFB=-0.0244662;REVB=0.0549656;RO=6;SAF=71;SAR=30;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00460581;STB=0.502584;TYPE=ins;VARB=0.000885984;OID=.;OPOS=248801603;OREF=-;OALT=CA;OMAPALT=TCA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:101:108:98:104:6:69:29:4:2:12:6:71:30:4:2 chr1 248801610 . G A 953.62 PASS AO=105;DP=107;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0035423;FXX=0.0192289;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.826;QD=37.3968;RBI=0.123142;REFB=-0.0497416;REVB=0.123091;RO=0;SAF=72;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000654234;OID=.;OPOS=248801610;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:107:102:0:0:105:102:33:72:0:0:32:70:0:0 chr1 248801611 . C T 964.33 PASS AO=106;DP=107;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145202;FXX=0.00961446;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.053;QD=37.4498;RBI=0.072144;REFB=-0.107091;REVB=0.0706677;RO=1;SAF=73;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0064578;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000768121;OID=.;OPOS=248801611;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:107:103:1:0:106:103:33:73:1:0:32:71:0:0 chr1 248801633 . A G 868.9 PASS AO=97;DP=103;FAO=97;FDP=100;FR=.;FRO=3;FSAF=67;FSAR=30;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0401603;FXX=0.00990001;HRUN=2;LEN=1;MLLD=283.873;QD=34.7559;RBI=0.0417628;REFB=-0.0584322;REVB=0.0114577;RO=4;SAF=66;SAR=31;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0278767;STB=0.510947;TYPE=snp;VARB=0.000496374;OID=.;OPOS=248801633;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:103:100:4:3:97:97:31:66:4:0:30:67:3:0 chr1 248801778 . A T 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0973113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.033;QD=33.0202;RBI=0.114512;REFB=0;REVB=-0.0603616;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000959963;OID=.;OPOS=248801778;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:5:1:0:0:5:1:0:0 chr1 248801897 . G A 64.34 PASS AO=33;DP=127;FAO=34;FDP=130;FR=.;FRO=96;FSAF=7;FSAR=27;FSRF=6;FSRR=90;FWDB=-0.0326987;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.822;QD=1.97979;RBI=0.0330388;REFB=0.0188703;REVB=-0.00472791;RO=93;SAF=7;SAR=26;SRF=6;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.35348;STB=0.69992;TYPE=snp;VARB=-0.0546818;OID=.;OPOS=248801897;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:127:130:93:96:33:34:26:7:6:87:27:7:6:90 chr1 248801944 . TCAGCACG T 351.82 PASS AO=58;DP=101;FAO=58;FDP=85;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=52;FSRF=8;FSRR=19;FWDB=-0.00649098;FXX=0.105252;HRUN=1;LEN=7;MLLD=299.641;QD=16.5563;RBI=0.00649507;REFB=-0.0295953;REVB=-0.000230547;RO=26;SAF=6;SAR=52;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207695;STB=0.630796;TYPE=del;VARB=0.0148324;OID=.;OPOS=248801945;OREF=CAGCACG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:58:88:58:85:27:6:52:8:19:71:26:6:52:7:19 chr1 248814052 . T A 210.32 PASS AO=28;DP=35;FAO=29;FDP=36;FR=.;FRO=7;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0065668;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.175;QD=23.3689;RBI=0.0222347;REFB=-0.0255784;REVB=0.0212429;RO=7;SAF=13;SAR=15;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120476;STB=0.560744;TYPE=snp;VARB=0.00716631;OID=.;OPOS=248814052;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:35:36:7:7:28:29:15:13:1:6:16:13:1:6 chr1 248814080 . A C 316.7 PASS AO=36;DP=40;FAO=38;FDP=40;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0147954;FXX=0.0243843;HRUN=5;LEN=1;MLLD=205.37;QD=31.6703;RBI=0.0171144;REFB=-0.158925;REVB=0.00860221;RO=2;SAF=15;SAR=21;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0583921;STB=0.531233;TYPE=snp;VARB=0.00123353;OID=.;OPOS=248814080;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:40:40:2:2:36:38:21:15:2:0:23:15:2:0 chr1 248814126 . G A 462.74 PASS AO=51;DP=53;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0287549;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.4177;QD=35.5955;RBI=0.0287549;REFB=-0.158605;REVB=9.76839e-06;RO=1;SAF=14;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0324419;STB=0.517235;TYPE=snp;VARB=0.00225581;OID=.;OPOS=248814126;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:53:52:1:1:51:51:37:14:1:0:37:14:1:0 chr1 248845097 . C T 279.43 PASS AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0370908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.051;QD=38.5421;RBI=0.0568438;REFB=0;REVB=0.0430754;RO=0;SAF=5;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000765955;OID=.;OPOS=248845097;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:29:29:0:0:29:29:24:5:0:0:24:5:0:0 chr1 248845411 . G A 814.81 PASS AO=94;DP=103;FAO=97;FDP=104;FR=.;FRO=7;FSAF=75;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0.00414316;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.133;QD=31.3388;RBI=0.0468684;REFB=-0.0536596;REVB=0.0466849;RO=5;SAF=73;SAR=21;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.075751;STB=0.568612;TYPE=snp;VARB=0.00209927;OID=.;OPOS=248845411;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:103:104:5:7:94:97:21:73:1:4:22:75:0:7 chr1 248845458 . C T 1184.55 PASS AO=120;DP=120;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0237165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.8138;QD=37.9055;RBI=0.0633565;REFB=0;REVB=0.0587501;RO=0;SAF=75;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.11218e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0008615;OID=.;OPOS=248845458;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:120:125:0:0:120:125:45:75:0:0:47:78:0:0 chr1 248845471 . T C 1109.38 PASS AO=116;DP=119;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0183694;FXX=0.0245881;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.127;QD=37.2902;RBI=0.0506814;REFB=-0.0202093;REVB=0.0472353;RO=1;SAF=76;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00620844;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000216963;OID=.;OPOS=248845471;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:119:119:1:0:116:119:40:76:1:0:41:78:0:0 chr1 248845499 . A G 1054.17 PASS AO=114;DP=117;FAO=115;FDP=117;FR=.;FRO=2;FSAF=74;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0206805;FXX=0.0168053;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.959;QD=36.0401;RBI=0.0941471;REFB=-0.150671;REVB=0.0918477;RO=2;SAF=72;SAR=42;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0130069;STB=0.502668;TYPE=snp;VARB=0.00188052;OID=.;OPOS=248845499;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:117:117:2:2:114:115:42:72:2:0:41:74:1:1 chr1 249168516 . A G 1017.59 PASS AO=106;DP=109;FAO=113;FDP=114;FR=.;FRO=1;FSAF=66;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0381692;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=38.774;QD=35.705;RBI=0.0386412;REFB=-0.0753207;REVB=-0.00602138;RO=3;SAF=62;SAR=44;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0224084;STB=0.503759;TYPE=snp;VARB=0.00201244;OID=.;OPOS=249168516;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:109:114:3:1:106:113:44:62:3:0:47:66:1:0 chr2 224919 . A G 263.83 PASS AO=65;DP=138;FAO=65;FDP=139;FR=.;FRO=74;FSAF=27;FSAR=38;FSRF=34;FSRR=40;FWDB=-0.0279076;FXX=0.00714235;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.104;QD=7.59226;RBI=0.0279525;REFB=-0.0152638;REVB=0.00158382;RO=72;SAF=27;SAR=38;SRF=32;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.028209;STB=0.523953;TYPE=snp;VARB=0.0227444;OID=.;OPOS=224919;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:139:72:74:65:65:38:27:32:40:38:27:34:40 chr2 242793 . G C 60 PASS AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0109232;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.0181;QD=6.66721;RBI=0.0452225;REFB=-0.0040076;REVB=0.0438835;RO=21;SAF=6;SAR=9;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0296633;STB=0.517218;TYPE=snp;VARB=0.00716336;OID=.;OPOS=242793;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:36:36:21:21:15:15:9:6:9:12:9:6:9:12 chr2 264019 . C A 64.47 PASS AO=12;DP=22;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=0;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=10;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.293;QD=11.7226;RBI=0.00417868;REFB=0.00514033;REVB=-0.00417868;RO=10;SAF=0;SAR=12;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00508086;OID=.;OPOS=264019;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:22:22:10:10:12:12:12:0:0:10:12:0:0:10 chr2 272203 . C T 527.52 PASS AO=111;DP=203;FAO=111;FDP=202;FR=.;FRO=91;FSAF=25;FSAR=86;FSRF=24;FSRR=67;FWDB=0.0258647;FXX=0.00492587;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.163;QD=10.4459;RBI=0.0346262;REFB=-0.00919147;REVB=-0.0230215;RO=89;SAF=25;SAR=86;SRF=23;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0379146;STB=0.52419;TYPE=snp;VARB=0.00886891;OID=.;OPOS=272203;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:202:89:91:111:111:86:25:23:66:86:25:24:67 chr2 277003 . A G 382.78 PASS AO=81;DP=150;FAO=81;FDP=150;FR=.;FRO=69;FSAF=36;FSAR=45;FSRF=40;FSRR=29;FWDB=0.0376301;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.296;QD=10.2074;RBI=0.037765;REFB=-0.00203997;REVB=-0.00318977;RO=69;SAF=36;SAR=45;SRF=40;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113573;STB=0.562115;TYPE=snp;VARB=0.00272904;OID=.;OPOS=277003;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:150:69:69:81:81:45:36:40:29:45:36:40:29 chr2 676124 . T C 132.49 PASS AO=41;DP=107;FAO=41;FDP=107;FR=.;FRO=66;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=30;FSRR=36;FWDB=-0.0194157;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.3154;QD=4.95302;RBI=0.0468898;REFB=0.00173312;REVB=-0.0426813;RO=66;SAF=17;SAR=24;SRF=30;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0441321;STB=0.525127;TYPE=snp;VARB=-0.00428109;OID=.;OPOS=676124;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:66:66:41:41:24:17:30:36:24:17:30:36 chr2 676177 . C G 786.12 PASS AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0656447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.106;QD=37.8852;RBI=0.0660394;REFB=0;REVB=0.00720879;RO=0;SAF=21;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000141326;OID=.;OPOS=676177;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:83:83:0:0:83:83:62:21:0:0:62:21:0:0 chr2 1079320 . C T 1953.83 PASS AO=110;DP=218;FAO=204;FDP=204;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=129;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0588877;FXX=0.00487781;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.309;QD=38.3104;RBI=0.0624643;REFB=0;REVB=-0.0208333;RO=0;SAF=63;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.54139e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000380855;OID=.;OPOS=1079320;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:92:111:204:0:0:110:204:47:63:0:0:129:75:0:0 chr2 1099077 . A T 20.39 PASS AO=92;DP=247;FAO=41;FDP=239;FR=.;FRO=198;FSAF=13;FSAR=28;FSRF=101;FSRR=97;FWDB=0.014837;FXX=0.0590528;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.943;QD=0.341307;RBI=0.0214635;REFB=-0.00333555;REVB=0.0155095;RO=106;SAF=41;SAR=51;SRF=60;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116241;STB=0.662573;TYPE=snp;VARB=0.0175774;OID=.;OPOS=1099077;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:247:239:106:198:92:41:51:41:60:46:28:13:101:97 chr2 1320143 . C T 543.29 PASS AO=140;DP=302;FAO=140;FDP=302;FR=.;FRO=162;FSAF=53;FSAR=87;FSRF=72;FSRR=90;FWDB=0.0326255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.7282;QD=7.19592;RBI=0.0541503;REFB=-0.0328659;REVB=-0.0432184;RO=159;SAF=53;SAR=87;SRF=70;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0620819;STB=0.536873;TYPE=snp;VARB=0.0432978;OID=.;OPOS=1320143;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:302:302:159:162:140:140:87:53:70:89:87:53:72:90 chr2 1418192 . C G 1997.45 PASS AO=207;DP=207;FAO=208;FDP=208;FR=.;FRO=0;FSAF=112;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0235968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.0289;QD=38.4125;RBI=0.0236149;REFB=0;REVB=0.000924366;RO=0;SAF=111;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.01583e-05;OID=.;OPOS=1418192;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:94:207:208:0:0:207:208:96:111:0:0:96:112:0:0 chr2 1460004 . G T 1540.48 PASS AO=165;DP=170;FAO=169;FDP=169;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0244758;FXX=0.0174408;HRUN=4;LEN=1;MLLD=124.361;QD=36.4611;RBI=0.0244815;REFB=-0.0791973;REVB=0.000532244;RO=2;SAF=65;SAR=100;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0144148;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.7795e-05;OID=.;OPOS=1460004;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:170:169:2:0:165:169:100:65:2:0:100:69:0:0 chr2 1497803 . C T 872.5 PASS AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0364051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.531;QD=37.9346;RBI=0.0370274;REFB=0;REVB=0.00675976;RO=0;SAF=34;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.3789e-05;OID=.;OPOS=1497803;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:92:92:0:0:92:92:58:34:0:0:58:34:0:0 chr2 1499899 . C T 1579.32 PASS AO=166;DP=171;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0404043;FXX=0.0175428;HRUN=4;LEN=1;MLLD=146.84;QD=37.6028;RBI=0.040831;REFB=-0.0677249;REVB=0.00588754;RO=0;SAF=88;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000110973;OID=.;OPOS=1499899;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:171:168:0:0:166:168:78:88:0:0:79:89:0:0 chr2 1499927 . A C 1636.55 PASS AO=167;DP=167;FAO=172;FDP=172;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0310101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.446;QD=38.0594;RBI=0.0436375;REFB=0;REVB=0.0307019;RO=0;SAF=89;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.04195e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000175368;OID=.;OPOS=1499927;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:167:172:0:0:167:172:78:89:0:0:83:89:0:0 chr2 1520676 . T C 447.31 PASS AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00243753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.7359;QD=38.0686;RBI=0.0571229;REFB=0;REVB=0.0570709;RO=0;SAF=22;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00066614;OID=.;OPOS=1520676;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:47:47:0:0:47:47:25:22:0:0:25:22:0:0 chr2 1544617 . G A 735.65 PASS AO=78;DP=81;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147275;FXX=0.0243873;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.988;QD=36.7824;RBI=0.0441713;REFB=-0.0522754;REVB=0.0416438;RO=1;SAF=33;SAR=45;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0104034;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00049102;OID=.;OPOS=1544617;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:81:80:1:0:78:80:45:33:0:1:47:33:0:0 chr2 1546361 . G T 349.47 PASS AO=83;DP=169;FAO=83;FDP=169;FR=.;FRO=86;FSAF=41;FSAR=42;FSRF=26;FSRR=60;FWDB=0.0376695;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.4214;QD=8.27152;RBI=0.0394356;REFB=-0.00279323;REVB=0.0116693;RO=85;SAF=41;SAR=42;SRF=26;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173781;STB=0.597748;TYPE=snp;VARB=0.00364338;OID=.;OPOS=1546361;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:169:85:86:83:83:42:41:26:59:42:41:26:60 chr2 1637648 . T C 604.24 PASS AO=63;DP=63;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00610238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.311;QD=37.7648;RBI=0.0185034;REFB=0;REVB=0.0174682;RO=0;SAF=40;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.14147e-05;OID=.;OPOS=1637648;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:63:64:0:0:63:64:23:40:0:0:23:41:0:0 chr2 1647171 . T C 678.12 PASS AO=73;DP=73;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00757445;FXX=0.0270234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.667;QD=37.6735;RBI=0.0126041;REFB=0;REVB=-0.0100743;RO=0;SAF=32;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000151788;OID=.;OPOS=1647171;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:73:72:0:0:73:72:41:32:0:0:41:31:0:0 chr2 1652191 . GC G 277.49 PASS AO=32;DP=52;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0297355;FXX=0.019604;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.2152;QD=22.1993;RBI=0.327973;REFB=-0.0367598;REVB=0.326622;RO=12;SAF=18;SAR=14;SRF=3;SRR=9;SSEN=0.461538;SSEP=0;SSSB=0.155979;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0120287;OID=.;OPOS=1652192;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:32:50:50:50:0:26:24:0:0:22:12:18:14:3:9 chr2 1652822 . T G 383.94 PASS AO=43;DP=46;FAO=43;FDP=45;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0100843;FXX=0.0425441;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.627;QD=34.1276;RBI=0.0182855;REFB=-0.118304;REVB=0.0152534;RO=2;SAF=27;SAR=16;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0335232;STB=0.517849;TYPE=snp;VARB=0.000118972;OID=.;OPOS=1652822;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:46:45:2:2:43:43:16:27:2:0:16:27:2:0 chr2 1793809 . T C 325.41 PASS AO=95;DP=226;FAO=95;FDP=228;FR=.;FRO=133;FSAF=55;FSAR=40;FSRF=64;FSRR=69;FWDB=-0.0436906;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=183.632;QD=5.70904;RBI=0.0437381;REFB=-0.00157152;REVB=-0.0020389;RO=131;SAF=55;SAR=40;SRF=64;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0945781;STB=0.557403;TYPE=snp;VARB=0.00249968;OID=.;OPOS=1793809;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:226:228:131:133:95:95:40:55:64:67:40:55:64:69 chr2 1842968 . T C 493.01 PASS AO=50;DP=50;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0265934;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.914;QD=37.2079;RBI=0.0268317;REFB=0;REVB=0.0035676;RO=0;SAF=24;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.10374e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.50585e-05;OID=.;OPOS=1842968;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:50:53:0:0:50:53:26:24:0:0:25:28:0:0 chr2 1926437 . G T 1091.33 PASS AO=119;DP=128;FAO=121;FDP=126;FR=.;FRO=5;FSAF=64;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.00822106;FXX=0.0307669;HRUN=4;LEN=1;MLLD=211.753;QD=34.6455;RBI=0.0324872;REFB=-0.107945;REVB=0.0314297;RO=5;SAF=64;SAR=55;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0412396;STB=0.521005;TYPE=snp;VARB=0.00035387;OID=.;OPOS=1926437;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:128:126:5:5:119:121:55:64:0:5:57:64:0:5 chr2 3212704 . C A 50.75 PASS AO=14;DP=37;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.0202206;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.757;QD=5.48699;RBI=0.0307463;REFB=-0.0227339;REVB=0.0231617;RO=21;SAF=7;SAR=7;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122488;STB=0.540483;TYPE=snp;VARB=0.0344432;OID=.;OPOS=3212704;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:37:37:21:23:14:14:7:7:13:8:7:7:13:10 chr2 3322700 . G A 521.15 PASS AO=120;DP=236;FAO=121;FDP=237;FR=.;FRO=116;FSAF=38;FSAR=83;FSRF=44;FSRR=72;FWDB=0.0250366;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.104;QD=8.79576;RBI=0.0250891;REFB=-0.00993426;REVB=0.00162272;RO=115;SAF=37;SAR=83;SRF=43;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0665989;STB=0.536068;TYPE=snp;VARB=0.0110066;OID=.;OPOS=3322700;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:236:237:115:116:120:121:83:37:43:72:83:38:44:72 chr2 3392075 . T C 158.92 PASS AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0138358;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=228.973;QD=37.393;RBI=0.0158494;REFB=0;REVB=0.00773138;RO=0;SAF=1;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.07215e-05;OID=.;OPOS=3392075;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:17:17:0:0:17:17:16:1:0:0:16:1:0:0 chr2 3392295 . A G 77.65 PASS AO=16;DP=34;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0315287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.687;QD=8.87378;RBI=0.0478011;REFB=-0.0150502;REVB=-0.0359289;RO=17;SAF=11;SAR=5;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206431;STB=0.606768;TYPE=snp;VARB=0.011865;OID=.;OPOS=3392295;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:34:35:17:18:16:17:5:11:8:9:6:11:8:10 chr2 3392513 . T C 181.82 PASS AO=22;DP=29;FAO=26;FDP=33;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0.00967592;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=97.5595;QD=22.039;RBI=0.0290664;REFB=-0.00561013;REVB=0.0274086;RO=7;SAF=6;SAR=16;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165388;STB=0.574416;TYPE=snp;VARB=0.00935667;OID=.;OPOS=3392513;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:29:33:7:7:22:26:16:6:0:7:20:6:0:7 chr2 3392514 . T A,C 205.37 PASS AO=22,7;DP=33;FAO=21,7;FDP=33;FR=.;FRO=5;FSAF=6,0;FSAR=15,7;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0247144,0.0401788;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=142.764,142.694;QD=24.893;RBI=0.0513769,0.0657203;REFB=-0.24685,-0.00279696;REVB=0.0450421,0.0520079;RO=4;SAF=6,0;SAR=16,7;SRF=0;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.102546,0;STB=0.571366,0.5;TYPE=snp,snp;VARB=0.0141697,-0.0593627;OID=.,.;OPOS=3392514,3392514;OREF=T,T;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:18:33:33:4:5:22,7:21,7:16,7:6,0:0:4:15,7:6,0:0:5 chr2 3425514 . G C 1924.41 PASS AO=201;DP=202;FAO=204;FDP=204;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=112;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00140299;FXX=0.00487781;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.427;QD=37.7335;RBI=0.0175908;REFB=0.0125426;REVB=0.0175348;RO=1;SAF=90;SAR=111;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00427188;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.0283e-05;OID=.;OPOS=3425514;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:202:204:1:0:201:204:111:90:0:1:112:92:0:0 chr2 3466665 . G A 198.54 PASS AO=40;DP=72;FAO=40;FDP=72;FR=.;FRO=32;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=0.029404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.106;QD=11.03;RBI=0.116229;REFB=-0.0179474;REVB=0.112449;RO=32;SAF=24;SAR=16;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107567;STB=0.559292;TYPE=snp;VARB=0.00860738;OID=.;OPOS=3466665;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:32:32:40:40:16:24:15:17:16:24:15:17 chr2 3469463 . G C 265.48 PASS AO=62;DP=121;FAO=61;FDP=122;FR=.;FRO=61;FSAF=26;FSAR=35;FSRF=25;FSRR=36;FWDB=-0.0252264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.389;QD=8.70414;RBI=0.0252675;REFB=-0.014325;REVB=0.00143994;RO=57;SAF=27;SAR=35;SRF=21;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0599478;STB=0.508397;TYPE=snp;VARB=0.0164121;OID=.;OPOS=3469463;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:122:57:61:62:61:35:27:21:36:35:26:25:36 chr2 3470115 . T C 75.02 PASS AO=26;DP=78;FAO=26;FDP=78;FR=.;FRO=52;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=34;FSRR=18;FWDB=-0.0164432;FXX=0.0370325;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8217;QD=3.84743;RBI=0.0306713;REFB=-0.00583056;REVB=-0.0258911;RO=49;SAF=15;SAR=11;SRF=32;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0894047;STB=0.553348;TYPE=snp;VARB=0.0161034;OID=.;OPOS=3470115;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:78:78:49:52:26:26:11:15:32:17:11:15:34:18 chr2 3470124 . G A 110.23 PASS AO=26;DP=77;FAO=28;FDP=72;FR=.,HEALED;FRO=42;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=28;FSRR=14;FWDB=-0.0495655;FXX=0.0270234;HRUN=4;LEN=1;MLLD=55.1794;QD=6.12367;RBI=0.0705674;REFB=-0.0922947;REVB=-0.0502297;RO=32;SAF=12;SAR=14;SRF=26;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.338711;STB=0.619877;TYPE=snp;VARB=0.0611275;OID=.;OPOS=3470124;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:72:32:42:26:28:14:12:26:6:15:13:28:14 chr2 3481531 . T C 295.14 PASS AO=65;DP=130;FAO=67;FDP=132;FR=.;FRO=65;FSAF=23;FSAR=44;FSRF=30;FSRR=35;FWDB=0.0193351;FXX=0.00751823;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.7338;QD=8.94368;RBI=0.0444658;REFB=-0.0203679;REVB=0.0400419;RO=64;SAF=22;SAR=43;SRF=29;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110394;STB=0.562044;TYPE=snp;VARB=0.0259752;OID=.;OPOS=3481531;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:132:64:65:65:67:43:22:29:35:44:23:30:35 chr2 3488502 . A G 137.99 PASS AO=36;DP=80;FAO=35;FDP=79;FR=.;FRO=44;FSAF=28;FSAR=7;FSRF=27;FSRR=17;FWDB=0.0232857;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.806;QD=6.98666;RBI=0.031883;REFB=-0.027911;REVB=-0.0217785;RO=44;SAF=29;SAR=7;SRF=27;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.24569;STB=0.635676;TYPE=snp;VARB=0.0376632;OID=.;OPOS=3488502;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:79:44:44:36:35:7:29:27:17:7:28:27:17 chr2 3504687 . A G 246.03 PASS AO=67;DP=154;FAO=67;FDP=154;FR=.;FRO=87;FSAF=24;FSAR=43;FSRF=48;FSRR=39;FWDB=-0.0109595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.645;QD=6.3904;RBI=0.029602;REFB=-0.00510895;REVB=0.0274985;RO=87;SAF=24;SAR=43;SRF=48;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199175;STB=0.611341;TYPE=snp;VARB=0.00942443;OID=.;OPOS=3504687;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:154:87:87:67:67:43:24:48:39:43:24:48:39 chr2 3605468 . A G 816.16 PASS AO=86;DP=89;FAO=88;FDP=89;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0678073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.283;QD=36.6815;RBI=0.0764678;REFB=-0.0536707;REVB=0.0353482;RO=1;SAF=44;SAR=42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111471;STB=0.505617;TYPE=snp;VARB=0.00066866;OID=.;OPOS=3605468;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:89:89:1:1:86:88:42:44:0:1:44:44:0:1 chr2 3652616 . G C 2508.33 PASS AO=258;DP=259;FAO=261;FDP=261;FR=.;FRO=0;FSAF=200;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0177942;FXX=0.0187963;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.4043;QD=38.4419;RBI=0.0435612;REFB=0;REVB=0.0397611;RO=0;SAF=199;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.74728e-05;OID=.;OPOS=3652616;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:259:261:0:0:258:261:59:199:0:0:61:200:0:0 chr2 3653844 . T C 590.5 PASS AO=61;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.382;QD=37.4922;RBI=0.0266448;REFB=0;REVB=0.0146738;RO=0;SAF=14;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.92147e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000111276;OID=.;OPOS=3653844;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:63:63:0:0:61:63:47:14:0:0:45:18:0:0 chr2 3685163 . T C 546.37 PASS AO=157;DP=365;FAO=156;FDP=365;FR=.;FRO=209;FSAF=71;FSAR=85;FSRF=82;FSRR=127;FWDB=-0.0074647;FXX=0.00273217;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.742;QD=5.98756;RBI=0.0333215;REFB=-0.00637816;REVB=-0.0324746;RO=207;SAF=72;SAR=85;SRF=80;SRR=127;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0749863;STB=0.536475;TYPE=snp;VARB=0.00805066;OID=.;OPOS=3685163;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:365:365:207:209:157:156:85:72:80:127:85:71:82:127 chr2 3688861 . G A 297.74 PASS AO=51;DP=80;FAO=51;FDP=79;FR=.;FRO=28;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=8;FSRR=20;FWDB=0.0226892;FXX=0.0124984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.457;QD=15.0755;RBI=0.0262506;REFB=-0.010148;REVB=0.013202;RO=28;SAF=27;SAR=24;SRF=8;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158218;STB=0.585766;TYPE=snp;VARB=0.00819347;OID=.;OPOS=3688861;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:80:79:28:28:51:51:24:27:8:20:24:27:8:20 chr2 3691548 . A G 127.88 PASS AO=34;DP=80;FAO=34;FDP=80;FR=.;FRO=46;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=28;FSRR=18;FWDB=-0.0170924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.5193;QD=6.39413;RBI=0.0439078;REFB=-0.0185849;REVB=-0.0404443;RO=46;SAF=22;SAR=12;SRF=28;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0420561;STB=0.523795;TYPE=snp;VARB=0.0427589;OID=.;OPOS=3691548;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:46:46:34:34:12:22:28:18:12:22:28:18 chr2 3721729 . A G 325.8 PASS AO=86;DP=197;FAO=89;FDP=198;FR=.;FRO=109;FSAF=44;FSAR=45;FSRF=45;FSRR=64;FWDB=0.00493287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.4909;QD=6.5818;RBI=0.0381602;REFB=0.00368389;REVB=-0.0378401;RO=108;SAF=43;SAR=43;SRF=44;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0928039;STB=0.544928;TYPE=snp;VARB=-0.00871631;OID=.;OPOS=3721729;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:198:108:109:86:89:43:43:44:64:45:44:45:64 chr2 3749151 . GGAA G 206.61 PASS AO=105;DP=284;FAO=109;FDP=280;FR=.;FRO=171;FSAF=73;FSAR=36;FSRF=69;FSRR=102;FWDB=-0.0283512;FXX=0.0175432;HRUN=2;LEN=3;MLLD=200.923;QD=2.95151;RBI=0.0286146;REFB=0.0135759;REVB=-0.00387378;RO=72;SAF=72;SAR=33;SRF=57;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0961222;STB=0.663344;TYPE=del;VARB=-0.0203499;OID=.;OPOS=3749152;OREF=GAA;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:105:255:109:280:171:73:36:69:102:99:72:72:33:57:15 chr2 3800383 . C T 2036.25 PASS AO=212;DP=216;FAO=212;FDP=212;FR=.;FRO=0;FSAF=120;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109309;FXX=0.0230404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.033;QD=38.4197;RBI=0.0122234;REFB=0;REVB=-0.00547068;RO=0;SAF=120;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000134864;OID=.;OPOS=3800383;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:96:216:212:0:0:212:212:92:120:0:0:92:120:0:0 chr2 3826387 . T C 209 PASS AO=42;DP=76;FAO=42;FDP=75;FR=.;FRO=33;FSAF=35;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=0.00357417;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.972;QD=11.1465;RBI=0.00737001;REFB=-0.00584745;REVB=-0.00644534;RO=32;SAF=35;SAR=7;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.369741;STB=0.701644;TYPE=snp;VARB=0.00214001;OID=.;OPOS=3826387;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:75:32:33:42:42:7:35:15:17:7:35:16:17 chr2 5837271 . T C 12.57 PASS AO=4;DP=18;FAO=4;FDP=18;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=0;FSRF=14;FSRR=0;FWDB=-0.00785779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.246;QD=2.79324;RBI=0.00785779;REFB=-0.00430677;REVB=0;RO=14;SAF=4;SAR=0;SRF=14;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0118456;OID=.;OPOS=5837271;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:18:18:14:14:4:4:0:4:14:0:0:4:14:0 chr2 5838030 . G A 233.58 PASS AO=54;DP=122;FAO=59;FDP=127;FR=.;FRO=68;FSAF=24;FSAR=35;FSRF=29;FSRR=39;FWDB=0.026924;FXX=0.00781189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.96;QD=7.35687;RBI=0.0331834;REFB=-0.017555;REVB=0.0193968;RO=68;SAF=21;SAR=33;SRF=29;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0390124;STB=0.510875;TYPE=snp;VARB=0.0262701;OID=.;OPOS=5838030;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:127:68:68:54:59:33:21:29:39:35:24:29:39 chr2 5839686 . A G 116.14 PASS AO=33;DP=80;FAO=33;FDP=80;FR=.;FRO=47;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=-0.00354353;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.0794;QD=5.80675;RBI=0.0263227;REFB=-0.0251475;REVB=-0.0260831;RO=46;SAF=21;SAR=12;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16616;STB=0.58873;TYPE=snp;VARB=0.0341237;OID=.;OPOS=5839686;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:46:47:33:33:12:21:22:24:12:21:23:24 chr2 7137067 . A G 250.65 PASS AO=72;DP=175;FAO=72;FDP=173;FR=.;FRO=101;FSAF=44;FSAR=28;FSRF=47;FSRR=54;FWDB=0.00112034;FXX=0.0114279;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.415;QD=5.79544;RBI=0.0236318;REFB=-0.00832229;REVB=0.0236052;RO=100;SAF=44;SAR=28;SRF=47;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148274;STB=0.586071;TYPE=snp;VARB=0.0108886;OID=.;OPOS=7137067;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:173:100:101:72:72:28:44:47:53:28:44:47:54 chr2 7154632 . T C 1941.52 PASS AO=196;DP=197;FAO=203;FDP=203;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00981414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.176;QD=38.2566;RBI=0.068668;REFB=0;REVB=0.0679631;RO=0;SAF=101;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.41048e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.52778e-05;OID=.;OPOS=7154632;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:92:197:203:0:0:196:203:95:101:0:0:102:101:0:0 chr2 7164578 . A G 111.18 PASS AO=30;DP=72;FAO=30;FDP=72;FR=.;FRO=42;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=32;FSRR=10;FWDB=0.0538383;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.5533;QD=6.1766;RBI=0.0808539;REFB=-0.0172444;REVB=-0.0603224;RO=41;SAF=21;SAR=9;SRF=31;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0704624;STB=0.544492;TYPE=snp;VARB=0.0249256;OID=.;OPOS=7164578;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:41:42:30:30:9:21:31:10:9:21:32:10 chr2 7181560 . G A 131.54 PASS AO=45;DP=126;FAO=45;FDP=126;FR=.;FRO=81;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=41;FSRR=40;FWDB=-0.00483135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.3851;QD=4.17578;RBI=0.00769785;REFB=0.00108414;REVB=-0.00599292;RO=80;SAF=23;SAR=22;SRF=40;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0124301;STB=0.503174;TYPE=snp;VARB=-0.0022084;OID=.;OPOS=7181560;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:80:81:45:45:22:23:40:40:22:23:41:40 chr2 8822511 . C T 250.72 PASS AO=47;DP=78;FAO=47;FDP=79;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=32;FSRF=6;FSRR=26;FWDB=0.0349081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.078;QD=12.6948;RBI=0.0356767;REFB=-0.0480498;REVB=0.00736576;RO=31;SAF=16;SAR=31;SRF=5;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153836;STB=0.564177;TYPE=snp;VARB=0.023503;OID=.;OPOS=8822511;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:79:31:32:47:47:31:16:5:26:32:15:6:26 chr2 8871342 . C A 304.54 PASS AO=59;DP=105;FAO=60;FDP=104;FR=.;FRO=44;FSAF=45;FSAR=15;FSRF=37;FSRR=7;FWDB=0.00393415;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.854;QD=11.7132;RBI=0.013439;REFB=0.00939064;REVB=0.0128503;RO=44;SAF=44;SAR=15;SRF=37;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104083;STB=0.554037;TYPE=snp;VARB=-0.00769846;OID=.;OPOS=8871342;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:104:44:44:59:60:15:44:37:7:15:45:37:7 chr2 9491017 . C T 1184.63 PASS AO=123;DP=125;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00684178;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.057;QD=37.6075;RBI=0.00705581;REFB=-0.0634603;REVB=-0.00172471;RO=1;SAF=79;SAR=44;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106744;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000250655;OID=.;OPOS=9491017;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:125:126:1:0:123:126:44:79:0:1:47:79:0:0 chr2 9528536 . G C 1066.63 PASS AO=113;DP=114;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0315167;FXX=0.0172399;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.577;QD=37.4256;RBI=0.0318134;REFB=0.0246798;REVB=-0.00433477;RO=1;SAF=31;SAR=82;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00575608;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.14585e-05;OID=.;OPOS=9528536;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:114:114:1:0:113:114:82:31:0:1:83:31:0:0 chr2 9630016 . T C 1165.37 PASS AO=124;DP=127;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000557425;FXX=0.0236202;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.0976;QD=37.5925;RBI=0.0371613;REFB=-0.0274019;REVB=-0.0371571;RO=1;SAF=33;SAR=91;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0141776;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.75776e-05;OID=.;OPOS=9630016;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:127:124:1:0:124:124:91:33:1:0:91:33:0:0 chr2 9630231 . C T 1573.03 PASS AO=163;DP=164;FAO=164;FDP=164;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0521092;FXX=0.017963;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2868;QD=38.3667;RBI=0.0619104;REFB=0;REVB=0.0334295;RO=0;SAF=86;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.1879e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000208843;OID=.;OPOS=9630231;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:164:164:0:0:163:164:77:86:0:0:77:87:0:0 chr2 9630244 . AT A 1265.31 PASS AO=158;DP=166;FAO=161;FDP=161;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0328102;FXX=0.0122692;HRUN=3;LEN=1;MLLD=28.1042;QD=31.4362;RBI=0.0342914;REFB=0;REVB=-0.00996952;RO=0;SAF=85;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40066e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00018128;OID=.;OPOS=9630245;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:158:162:161:161:0:86:75:0:0:99:0:85:73:0:0 chr2 9634856 . A G 919.87 PASS AO=96;DP=97;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000971702;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.666;QD=38.328;RBI=0.0137083;REFB=0;REVB=0.0136738;RO=0;SAF=66;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.56369e-05;OID=.;OPOS=9634856;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:97:96:0:0:96:96:30:66:0:0:30:66:0:0 chr2 9880827 . A G 326.58 PASS AO=78;DP=182;FAO=88;FDP=189;FR=.;FRO=101;FSAF=44;FSAR=44;FSRF=39;FSRR=62;FWDB=-0.0377049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.3329;QD=6.91173;RBI=0.0526997;REFB=-0.0225496;REVB=-0.0368184;RO=95;SAF=42;SAR=36;SRF=38;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136206;STB=0.560833;TYPE=snp;VARB=0.0455974;OID=.;OPOS=9880827;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:189:95:101:78:88:36:42:38:57:44:44:39:62 chr2 9880897 . G A 303.96 PASS AO=61;DP=108;FAO=61;FDP=108;FR=.;FRO=47;FSAF=10;FSAR=51;FSRF=7;FSRR=40;FWDB=0.0289027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.0739;QD=11.2577;RBI=0.0355866;REFB=-0.0212045;REVB=0.0207615;RO=47;SAF=10;SAR=51;SRF=7;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0221544;STB=0.512095;TYPE=snp;VARB=0.0141306;OID=.;OPOS=9880897;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:47:47:61:61:51:10:7:40:51:10:7:40 chr2 9983686 . G T 260.7 PASS AO=25;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0281642;FXX=0.0689417;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.955;QD=38.6218;RBI=0.0535627;REFB=0;REVB=-0.0455603;RO=0;SAF=1;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.20334e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000303952;OID=.;OPOS=9983686;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:27:27:0:0:25:27:24:1:0:0:26:1:0:0 chr2 9983715 . CA C,CC 109.16 PASS AO=4,9;DP=12;FAO=12,0;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=1,0;FSAR=11,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.10829,-0.137244;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=214.809,203.394;QD=36.3859;RBI=0.135217,0.169168;REFB=0,0;REVB=-0.0809737,-0.0989023;RO=0;SAF=0,1;SAR=4,8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.00187412,0;OID=.,.;OPOS=9983716,9983716;OREF=A,A;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:4,9:13:12,0:12:0:1,0:11,0:0:0:5:0:0,1:4,8:0:0 chr2 9992078 . G A 171.71 PASS AO=61;DP=173;FAO=61;FDP=173;FR=.;FRO=112;FSAF=34;FSAR=27;FSRF=65;FSRR=47;FWDB=0.00781195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.459;QD=3.97023;RBI=0.0170399;REFB=-0.00134196;REVB=-0.0151437;RO=112;SAF=34;SAR=27;SRF=65;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0265012;STB=0.515123;TYPE=snp;VARB=0.00178601;OID=.;OPOS=9992078;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:173:112:112:61:61:27:34:65:47:27:34:65:47 chr2 10045014 . C T 2744.89 PASS AO=216;DP=271;FAO=286;FDP=286;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=177;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010268;FXX=0.0171815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.6813;QD=38.3901;RBI=0.0586065;REFB=0;REVB=-0.0577;RO=0;SAF=136;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.15473e-05;OID=.;OPOS=10045014;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:271:286:0:0:216:286:80:136:0:0:109:177:0:0 chr2 10045024 . G A 2895.59 PASS AO=302;DP=302;FAO=306;FDP=306;FR=.;FRO=0;FSAF=180;FSAR=126;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00285769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.805;QD=37.8508;RBI=0.0568843;REFB=0;REVB=0.0568124;RO=0;SAF=180;SAR=122;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.28887e-05;OID=.;OPOS=10045024;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:302:306:0:0:302:306:122:180:0:0:126:180:0:0 chr2 10050947 . T C 784.21 PASS AO=159;DP=380;FAO=193;FDP=397;FR=.;FRO=204;FSAF=84;FSAR=109;FSRF=96;FSRR=108;FWDB=0.0155595;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.902;QD=7.90133;RBI=0.0168809;REFB=-0.0284622;REVB=-0.00654716;RO=198;SAF=63;SAR=96;SRF=91;SRR=107;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0652835;STB=0.518387;TYPE=snp;VARB=0.0397823;OID=.;OPOS=10050947;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:380:397:198:204:159:193:96:63:91:107:109:84:96:108 chr2 10050960 . A G 508.9 PASS AO=173;DP=439;FAO=159;FDP=400;FR=.;FRO=241;FSAF=83;FSAR=76;FSRF=103;FSRR=138;FWDB=-0.0600268;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=62.2109;QD=5.08899;RBI=0.0685337;REFB=-0.0466066;REVB=-0.0330703;RO=225;SAF=91;SAR=82;SRF=105;SRR=120;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0604444;STB=0.55683;TYPE=snp;VARB=0.0402102;OID=.;OPOS=10050960;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:439:400:225:241:173:159:82:91:105:120:76:83:103:138 chr2 10053412 . C T 511.84 PASS AO=124;DP=244;FAO=121;FDP=243;FR=.;FRO=122;FSAF=58;FSAR=63;FSRF=36;FSRR=86;FWDB=-0.0297075;FXX=0.00409819;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.6994;QD=8.42535;RBI=0.0298035;REFB=-0.0126642;REVB=0.00238991;RO=119;SAF=58;SAR=66;SRF=36;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150365;STB=0.593366;TYPE=snp;VARB=0.0162608;OID=.;OPOS=10053412;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:243:119:122:124:121:66:58:36:83:63:58:36:86 chr2 10059770 . G T 194.55 PASS AO=49;DP=118;FAO=53;FDP=121;FR=.;FRO=68;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=32;FSRR=36;FWDB=0.0220975;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.8134;QD=6.43138;RBI=0.0351377;REFB=-0.0189011;REVB=0.0273196;RO=68;SAF=25;SAR=24;SRF=32;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0409114;STB=0.500626;TYPE=snp;VARB=0.0230281;OID=.;OPOS=10059770;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:121:68:68:49:53:24:25:32:36:28:25:32:36 chr2 10094992 . A G 176.79 PASS AO=57;DP=140;FAO=56;FDP=140;FR=.;FRO=84;FSAF=31;FSAR=25;FSRF=46;FSRR=38;FWDB=-0.0397654;FXX=0.0070917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.0973;QD=5.05128;RBI=0.051814;REFB=-0.0553025;REVB=-0.0332176;RO=83;SAF=32;SAR=25;SRF=45;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0205023;STB=0.503609;TYPE=snp;VARB=0.0729617;OID=.;OPOS=10094992;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:83:84:57:56:25:32:45:38:25:31:46:38 chr2 10186419 . A G 370.76 PASS AO=85;DP=197;FAO=95;FDP=205;FR=.;FRO=110;FSAF=53;FSAR=42;FSRF=62;FSRR=48;FWDB=0.00374954;FXX=0.0144224;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.453;QD=7.2343;RBI=0.00388257;REFB=-0.0106111;REVB=0.0010076;RO=110;SAF=52;SAR=33;SRF=62;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0506129;STB=0.503124;TYPE=snp;VARB=0.00996022;OID=.;OPOS=10186419;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:205:110:110:85:95:33:52:62:48:42:53:62:48 chr2 10188649 . A T 236.28 PASS AO=56;DP=115;FAO=56;FDP=115;FR=.;FRO=59;FSAF=11;FSAR=45;FSRF=29;FSRR=30;FWDB=-0.000352891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.638;QD=8.21854;RBI=0.0125605;REFB=-0.0193085;REVB=0.0125555;RO=59;SAF=11;SAR=45;SRF=29;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.331613;STB=0.68564;TYPE=snp;VARB=0.0166481;OID=.;OPOS=10188649;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:59:59:56:56:45:11:29:30:45:11:29:30 chr2 10262920 . T G 166.05 PASS AO=16;DP=17;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0758729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.143;QD=36.8995;RBI=0.0769745;REFB=0;REVB=0.0129759;RO=0;SAF=5;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.36667e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00148436;OID=.;OPOS=10262920;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:17:18:0:0:16:18:11:5:0:0:11:7:0:0 chr2 10595578 . T C 774.13 PASS AO=215;DP=453;FAO=192;FDP=400;FR=.;FRO=208;FSAF=83;FSAR=109;FSRF=86;FSRR=122;FWDB=-0.013532;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8798;QD=7.74134;RBI=0.0497816;REFB=-0.00714891;REVB=-0.0479071;RO=237;SAF=92;SAR=123;SRF=105;SRR=132;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0147023;STB=0.510001;TYPE=snp;VARB=0.00756195;OID=.;OPOS=10595578;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:453:400:237:208:215:192:123:92:105:132:109:83:86:122 chr2 10717806 . C T 200.77 PASS AO=65;DP=174;FAO=66;FDP=175;FR=.;FRO=109;FSAF=39;FSAR=27;FSRF=53;FSRR=56;FWDB=0.0495093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.613;QD=4.58892;RBI=0.0496332;REFB=-0.00457762;REVB=-0.00350476;RO=108;SAF=38;SAR=27;SRF=52;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114309;STB=0.56579;TYPE=snp;VARB=0.0104055;OID=.;OPOS=10717806;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:175:108:109:65:66:27:38:52:56:27:39:53:56 chr2 10808776 . C CAA 2789.17 PASS AO=279;DP=338;FAO=291;FDP=291;FR=.;FRO=0;FSAF=113;FSAR=178;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0585479;FXX=0.118178;HRUN=0;LEN=2;MLLD=170.187;QD=38.3391;RBI=0.0632883;REFB=0;REVB=0.0240323;RO=15;SAF=111;SAR=168;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136869;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=3.72469e-05;OID=.;OPOS=10808777;OREF=-;OALT=AA;OMAPALT=CAA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:279:338:291:291:0:113:178:0:0:99:15:111:168:8:7 chr2 10908893 . A G 45.4 PASS AO=13;DP=40;FAO=14;FDP=42;FR=.;FRO=28;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=-0.0496431;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.4059;QD=4.3235;RBI=0.0581422;REFB=-0.00407427;REVB=-0.0302668;RO=27;SAF=3;SAR=10;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190822;STB=0.621549;TYPE=snp;VARB=0.00871919;OID=.;OPOS=10908893;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:40:42:27:28:13:14:10:3:10:17:11:3:10:18 chr2 10928906 . T C 85.15 PASS AO=29;DP=84;FAO=29;FDP=84;FR=.;FRO=55;FSAF=3;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=31;FWDB=0.0145089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.822;QD=4.05483;RBI=0.0148111;REFB=-0.00314834;REVB=0.00297703;RO=53;SAF=3;SAR=26;SRF=24;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.52071;STB=0.803868;TYPE=snp;VARB=0.0228327;OID=.;OPOS=10928906;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:84:84:53:55:29:29:26:3:24:29:26:3:24:31 chr2 10930903 . T C 432.02 PASS AO=85;DP=146;FAO=85;FDP=146;FR=.;FRO=61;FSAF=37;FSAR=48;FSRF=29;FSRR=32;FWDB=-0.00994938;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=227.329;QD=11.8362;RBI=0.0148325;REFB=-0.016945;REVB=-0.0110006;RO=61;SAF=37;SAR=48;SRF=29;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0311983;STB=0.516967;TYPE=snp;VARB=0.0107022;OID=.;OPOS=10930903;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:61:61:85:85:48:37:29:32:48:37:29:32 chr2 10933249 . C T 100.21 PASS AO=32;DP=90;FAO=33;FDP=92;FR=.;FRO=59;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=31;FSRR=28;FWDB=0.0482131;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.4224;QD=4.35685;RBI=0.0482276;REFB=0.00657505;REVB=0.00118006;RO=58;SAF=20;SAR=12;SRF=30;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123623;STB=0.552901;TYPE=snp;VARB=-0.0127326;OID=.;OPOS=10933249;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:92:58:59:32:33:12:20:30:28:13:20:31:28 chr2 10942687 . C T 340.93 PASS AO=83;DP=187;FAO=89;FDP=194;FR=.;FRO=105;FSAF=33;FSAR=56;FSRF=59;FSRR=46;FWDB=0.00203169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.966;QD=7.02947;RBI=0.0901086;REFB=-0.0255377;REVB=0.0900856;RO=102;SAF=32;SAR=51;SRF=57;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173336;STB=0.604813;TYPE=snp;VARB=0.0332149;OID=.;OPOS=10942687;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:194:102:105:83:89:51:32:57:45:56:33:59:46 chr2 11053020 . A G 125.79 PASS AO=12;DP=12;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0354502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.1098;QD=35.9404;RBI=0.0588891;REFB=0;REVB=-0.0470235;RO=0;SAF=8;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00030774;OID=.;OPOS=11053020;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:12:14:0:0:12:14:4:8:0:0:5:9:0:0 chr2 11053740 . C T 820.87 PASS AO=85;DP=87;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0293927;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.886;QD=38.1802;RBI=0.0294248;REFB=0;REVB=0.00137372;RO=0;SAF=50;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00021227;OID=.;OPOS=11053740;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:87:86:0:0:85:86:35:50:0:0:36:50:0:0 chr2 11264830 . G A 213.51 PASS AO=49;DP=99;FAO=49;FDP=99;FR=.;FRO=50;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=30;FSRR=20;FWDB=0.00995776;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.7039;QD=8.6265;RBI=0.011374;REFB=-0.0481965;REVB=0.00549652;RO=50;SAF=27;SAR=22;SRF=30;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0453706;STB=0.525115;TYPE=snp;VARB=0.0510249;OID=.;OPOS=11264830;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:50:50:49:49:22:27:30:20:22:27:30:20 chr2 11323276 . T C 400.56 PASS AO=124;DP=306;FAO=124;FDP=307;FR=.;FRO=183;FSAF=53;FSAR=71;FSRF=71;FSRR=112;FWDB=-0.0152697;FXX=0.00324665;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.085;QD=5.21901;RBI=0.0239235;REFB=-0.0134308;REVB=0.0184166;RO=181;SAF=53;SAR=71;SRF=70;SRR=111;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0444613;STB=0.524181;TYPE=snp;VARB=0.0222555;OID=.;OPOS=11323276;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:306:307:181:183:124:124:71:53:70:111:71:53:71:112 chr2 11359120 . G T 40.76 PASS AO=14;DP=49;FAO=15;FDP=50;FR=.;FRO=35;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=-0.0140713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.971;QD=3.26051;RBI=0.0227471;REFB=-0.00563101;REVB=0.0178726;RO=31;SAF=8;SAR=6;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208819;STB=0.611993;TYPE=snp;VARB=0.0144837;OID=.;OPOS=11359120;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:49:50:31:35:14:15:6:8:12:19:7:8:13:22 chr2 11374200 . C G 701.1 PASS AO=178;DP=379;FAO=178;FDP=378;FR=.;FRO=200;FSAF=68;FSAR=110;FSRF=94;FSRR=106;FWDB=-0.0318665;FXX=0.00263845;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9609;QD=7.41905;RBI=0.0342311;REFB=-0.0208683;REVB=-0.0125018;RO=200;SAF=68;SAR=110;SRF=94;SRR=106;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.087385;STB=0.548167;TYPE=snp;VARB=0.0222698;OID=.;OPOS=11374200;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:379:378:200:200:178:178:110:68:94:106:110:68:94:106 chr2 11701843 . G A 825.28 PASS AO=87;DP=87;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00351042;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.201;QD=37.0914;RBI=0.0477132;REFB=0;REVB=0.0475839;RO=0;SAF=35;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000634745;OID=.;OPOS=11701843;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:87:89:0:0:87:89:52:35:0:0:53:36:0:0 chr2 11725049 . T C 656.04 PASS AO=69;DP=71;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301882;FXX=0.028165;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.31;QD=38.0313;RBI=0.0302154;REFB=0;REVB=0.00128198;RO=0;SAF=27;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56939e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000554653;OID=.;OPOS=11725049;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:71:69:0:0:69:69:42:27:0:0:42:27:0:0 chr2 11727507 . G A 882.21 PASS AO=92;DP=92;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0530285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.3908;QD=37.9446;RBI=0.0532761;REFB=0;REVB=0.00513058;RO=0;SAF=29;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000390731;OID=.;OPOS=11727507;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:92:93:0:0:92:93:63:29:0:0:63:30:0:0 chr2 11738091 . T C 947.01 PASS AO=98;DP=100;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183346;FXX=0.019998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.3223;QD=38.6535;RBI=0.0230017;REFB=0;REVB=0.0138895;RO=0;SAF=29;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.09603e-06;OID=.;OPOS=11738091;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:100:98:0:0:98:98:69:29:0:0:69:29:0:0 chr2 11750875 . GC G 155.13 PASS AO=19;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.213624;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.8615;QD=24.8201;RBI=0.23116;REFB=0.0247678;REVB=0.0883159;RO=5;SAF=5;SAR=14;SRF=3;SRR=2;SSEN=0.515625;SSEP=0;SSSB=-0.151063;STB=0.515139;TYPE=del;VARB=0.020333;OID=.;OPOS=11750876;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:19:24:24:25:1:8:16:0:1:10:5:5:14:3:2 chr2 11752635 . T C 1863.2 PASS AO=200;DP=204;FAO=201;FDP=201;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0146108;FXX=0.0195112;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.8692;QD=37.0785;RBI=0.0400177;REFB=-0.025724;REVB=0.037255;RO=2;SAF=86;SAR=114;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00134624;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00115095;OID=.;OPOS=11752635;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:204:201:2:0:200:201:114:86:1:1:115:86:0:0 chr2 11817812 . G C 843.38 PASS AO=89;DP=90;FAO=89;FDP=90;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0371648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2794;QD=37.4835;RBI=0.0374082;REFB=-0.0871683;REVB=-0.00426009;RO=1;SAF=56;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141437;STB=0.507461;TYPE=snp;VARB=0.00494347;OID=.;OPOS=11817812;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:90:90:1:1:89:89:33:56:0:1:33:56:0:1 chr2 11853913 . G A 436.14 PASS AO=87;DP=163;FAO=93;FDP=171;FR=.;FRO=78;FSAF=40;FSAR=53;FSRF=36;FSRR=42;FWDB=0.0652641;FXX=0.00581362;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.7667;QD=10.202;RBI=0.0668595;REFB=-0.0397592;REVB=0.0145183;RO=71;SAF=38;SAR=49;SRF=33;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0233455;STB=0.51456;TYPE=snp;VARB=0.0384682;OID=.;OPOS=11853913;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:171:71:78:87:93:49:38:33:38:53:40:36:42 chr2 11943082 . C T 37.43 PASS AO=13;DP=43;FAO=13;FDP=43;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=25;FWDB=0.0965395;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.1628;QD=3.48172;RBI=0.0981146;REFB=-0.0166635;REVB=-0.01751;RO=30;SAF=8;SAR=5;SRF=5;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.493182;STB=0.786544;TYPE=snp;VARB=0.0432263;OID=.;OPOS=11943082;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:43:43:30:30:13:13:5:8:5:25:5:8:5:25 chr2 11965541 . A G 295.26 PASS AO=88;DP=225;FAO=89;FDP=220;FR=.;FRO=131;FSAF=32;FSAR=57;FSRF=49;FSRR=82;FWDB=-0.020932;FXX=0.0392996;HRUN=3;LEN=1;MLLD=91.1658;QD=5.36833;RBI=0.0237545;REFB=-0.00897331;REVB=-0.0112305;RO=109;SAF=32;SAR=56;SRF=40;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00358545;STB=0.509319;TYPE=snp;VARB=0.00777736;OID=.;OPOS=11965541;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:225:220:109:131:88:89:56:32:40:69:57:32:49:82 chr2 12858444 . A G 99.79 PASS AO=23;DP=49;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=0.0142267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.2414;QD=8.14632;RBI=0.0347575;REFB=-0.00608476;REVB=-0.0317126;RO=26;SAF=13;SAR=10;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203315;STB=0.614614;TYPE=snp;VARB=0.00574808;OID=.;OPOS=12858444;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:26:26:23:23:10:13:9:17:10:13:9:17 chr2 14774127 . C A 144.78 PASS AO=23;DP=49;FAO=30;FDP=56;FR=.;FRO=26;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=0.0429047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.167;QD=10.3416;RBI=0.0432103;REFB=-0.027738;REVB=0.0051301;RO=25;SAF=14;SAR=9;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22758;STB=0.650501;TYPE=snp;VARB=0.030723;OID=.;OPOS=14774127;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:56:25:26:23:30:9:14:9:16:10:20:9:17 chr2 14777095 . ATTTTTTA ATTTTTA,ATTTTT 46.53 PASS AO=8,10;DP=56;FAO=5,17;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=4,9;FSAR=1,8;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=-0.124358,-0.0690611;FXX=0.0212721;HRUN=6,6;LEN=1,2;MLLD=9.4864,17.0922;QD=4.04648;RBI=0.374179,0.219262;REFB=-0.0628931,0.015314;REVB=0.35291,0.208102;RO=15;SAF=6,7;SAR=2,3;SRF=11;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0232378,-0.0409094;STB=0.603321,0.606296;TYPE=del,del;VARB=0.127307,-0.0577649;OID=.,.;OPOS=14777096,14777101;OREF=T,TA;OALT=-,-;OMAPALT=ATTTTTA,ATTTTT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:8,10:45:5,17:46:24:4,9:1,8:17:7:30:15:6,7:2,3:11:4 chr2 14779829 . A G 289.51 PASS AO=66;DP=133;FAO=67;FDP=134;FR=.;FRO=67;FSAF=55;FSAR=12;FSRF=49;FSRR=18;FWDB=0.0136819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.204;QD=8.6422;RBI=0.0195788;REFB=-0.0166541;REVB=-0.0140048;RO=66;SAF=54;SAR=12;SRF=48;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125317;STB=0.569336;TYPE=snp;VARB=0.0130381;OID=.;OPOS=14779829;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:134:66:67:66:67:12:54:48:18:12:55:49:18 chr2 14780038 . T G 408.21 PASS AO=102;DP=233;FAO=108;FDP=238;FR=.;FRO=130;FSAF=60;FSAR=48;FSRF=49;FSRR=81;FWDB=0.0497024;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.3747;QD=6.86072;RBI=0.0611182;REFB=0.00052771;REVB=0.0355684;RO=131;SAF=58;SAR=44;SRF=50;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187477;STB=0.596652;TYPE=snp;VARB=-0.00016037;OID=.;OPOS=14780038;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:233:238:131:130:102:108:44:58:50:81:48:60:49:81 chr2 15533779 . G A 388.32 PASS AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.026412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.926;QD=38.8319;RBI=0.0340872;REFB=0;REVB=0.0215486;RO=0;SAF=15;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.71637e-05;OID=.;OPOS=15533779;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:40:40:0:0:40:40:25:15:0:0:25:15:0:0 chr2 15601441 . C T 2452.14 PASS AO=262;DP=266;FAO=263;FDP=263;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=167;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.059596;FXX=0.0112778;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.624;QD=37.2949;RBI=0.0620383;REFB=-0.0325617;REVB=0.0172357;RO=2;SAF=95;SAR=167;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00992941;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00028707;OID=.;OPOS=15601441;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:266:263:2:0:262:263:167:95:2:0:167:96:0:0 chr2 15607842 . T C 1609.82 PASS AO=184;DP=201;FAO=192;FDP=207;FR=.;FRO=15;FSAF=105;FSAR=87;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.037632;FXX=0.014285;HRUN=5;LEN=1;MLLD=37.958;QD=31.1076;RBI=0.100062;REFB=-0.180546;REVB=-0.0927159;RO=17;SAF=100;SAR=84;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00227401;STB=0.505857;TYPE=snp;VARB=0.0123518;OID=.;OPOS=15607842;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:201:207:17:15:184:192:84:100:9:8:87:105:7:8 chr2 15614404 . T C 2542.18 PASS AO=203;DP=269;FAO=265;FDP=265;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=92;FSAR=173;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0950941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.11;QD=38.3726;RBI=0.0968735;REFB=0;REVB=-0.0184821;RO=0;SAF=29;SAR=174;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.19493e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000124963;OID=.;OPOS=15614404;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:264:265:0:0:203:265:174:29:0:0:173:92:0:0 chr2 15615910 . A G 1202.27 PASS AO=126;DP=128;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186573;FXX=0.00781189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.911;QD=37.8667;RBI=0.0394365;REFB=-0.0271928;REVB=0.0347439;RO=1;SAF=59;SAR=67;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00798567;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.15134e-05;OID=.;OPOS=15615910;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:128:127:1:0:126:127:67:59:1:0:67:60:0:0 chr2 15618339 . G A 1064.82 PASS AO=112;DP=112;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00585906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.201;QD=38.0293;RBI=0.0415316;REFB=0;REVB=0.0411162;RO=0;SAF=57;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34603e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.14494e-05;OID=.;OPOS=15618339;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:112:112:0:0:112:112:55:57:0:0:55:57:0:0 chr2 15674686 . T C 3061.82 PASS AO=318;DP=319;FAO=318;FDP=318;FR=.;FRO=0;FSAF=156;FSAR=162;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00274855;FXX=0.0031347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.797;QD=38.5134;RBI=0.0205481;REFB=0;REVB=0.0203635;RO=0;SAF=156;SAR=162;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.86466e-05;OID=.;OPOS=15674686;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:319:318:0:0:318:318:162:156:0:0:162:156:0:0 chr2 15735648 . T C 550.5 PASS AO=136;DP=284;FAO=136;FDP=283;FR=.;FRO=147;FSAF=63;FSAR=73;FSRF=75;FSRR=72;FWDB=-0.00339009;FXX=0.003521;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.211;QD=7.78095;RBI=0.00509122;REFB=-0.0102336;REVB=0.00379841;RO=147;SAF=63;SAR=73;SRF=75;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0444093;STB=0.524438;TYPE=snp;VARB=0.0102253;OID=.;OPOS=15735648;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:284:283:147:147:136:136:73:63:75:72:73:63:75:72 chr2 15747393 . C T 301.73 PASS AO=89;DP=216;FAO=89;FDP=216;FR=.;FRO=127;FSAF=40;FSAR=49;FSRF=45;FSRR=82;FWDB=0.00201051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.316;QD=5.58757;RBI=0.0181853;REFB=-0.00826954;REVB=-0.0180739;RO=126;SAF=40;SAR=49;SRF=45;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0990072;STB=0.557138;TYPE=snp;VARB=0.0110237;OID=.;OPOS=15747393;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:216:216:126:127:89:89:49:40:45:81:49:40:45:82 chr2 15768981 . C G 688.92 PASS AO=179;DP=389;FAO=179;FDP=388;FR=.;FRO=209;FSAF=85;FSAR=94;FSRF=81;FSRR=128;FWDB=-0.00802436;FXX=0.00512807;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.805;QD=7.10222;RBI=0.0111239;REFB=-0.00526078;REVB=-0.00770396;RO=209;SAF=85;SAR=94;SRF=81;SRR=128;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0859916;STB=0.547364;TYPE=snp;VARB=0.00789797;OID=.;OPOS=15768981;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:389:388:209:209:179:179:94:85:81:128:94:85:81:128 chr2 15840522 . G T 1585.93 PASS AO=176;DP=183;FAO=176;FDP=182;FR=.;FRO=6;FSAF=93;FSAR=83;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0113497;FXX=0.00546418;HRUN=3;LEN=1;MLLD=236.787;QD=34.8556;RBI=0.0286588;REFB=-0.0835602;REVB=0.0263156;RO=5;SAF=93;SAR=83;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00676661;STB=0.506446;TYPE=snp;VARB=0.00123317;OID=.;OPOS=15840522;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:183:182:5:6:176:176:83:93:2:3:83:93:2:4 chr2 15840645 . T C 2234.77 PASS AO=227;DP=233;FAO=237;FDP=237;FR=.;FRO=0;FSAF=108;FSAR=129;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0386129;FXX=0.00836785;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.7918;QD=37.7177;RBI=0.0904463;REFB=-0.0227058;REVB=0.0817898;RO=4;SAF=101;SAR=126;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101743;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00123016;OID=.;OPOS=15840645;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:91:233:237:4:0:227:237:126:101:3:1:129:108:0:0 chr2 16090820 . T C 65.49 PASS AO=20;DP=55;FAO=20;FDP=55;FR=.;FRO=35;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=26;FWDB=-0.0708039;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.2753;QD=4.76261;RBI=0.085396;REFB=0.015948;REVB=-0.0477418;RO=35;SAF=8;SAR=12;SRF=9;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170788;STB=0.598334;TYPE=snp;VARB=-0.0320864;OID=.;OPOS=16090820;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:55:55:35:35:20:20:12:8:9:26:12:8:9:26 chr2 16380485 . A G 318.22 PASS AO=38;DP=42;FAO=39;FDP=43;FR=.;FRO=4;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0177144;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.0699;QD=29.6016;RBI=0.0177156;REFB=-0.113073;REVB=-0.000204641;RO=4;SAF=22;SAR=16;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0593674;STB=0.555527;TYPE=snp;VARB=0.0489933;OID=.;OPOS=16380485;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:42:43:4:4:38:39:16:22:1:3:16:23:0:4 chr2 16380540 . TC T,TT 380.18 PASS AO=16,25;DP=43;FAO=10,32;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=0,21;FSAR=10,11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0715486,-0.0584293;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=37.5489,40.8002;QD=36.2077;RBI=0.0729999,0.0630126;REFB=0,0;REVB=0.0144837,0.0235924;RO=0;SAF=0,20;SAR=16,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.00197234,0.106183;OID=.,.;OPOS=16380541,16380541;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:16,25:41:10,32:42:0:0,21:10,11:0:0:14:0:0,20:16,5:0:0 chr2 16734284 . T C 1878.37 PASS AO=195;DP=198;FAO=195;FDP=195;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=130;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0266779;FXX=0.0200995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.112;QD=38.5306;RBI=0.0277036;REFB=0;REVB=0.00746869;RO=0;SAF=65;SAR=130;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.23997e-05;OID=.;OPOS=16734284;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:198:195:0:0:195:195:130:65:0:0:130:65:0:0 chr2 17696573 . C T 582.14 PASS AO=178;DP=422;FAO=169;FDP=400;FR=.;FRO=231;FSAF=61;FSAR=108;FSRF=83;FSRR=148;FWDB=0.0121048;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.946;QD=5.82139;RBI=0.0275092;REFB=-0.0110295;REVB=-0.0247029;RO=244;SAF=62;SAR=116;SRF=88;SRR=156;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140563;STB=0.501027;TYPE=snp;VARB=0.0120198;OID=.;OPOS=17696573;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:422:400:244:231:178:169:116:62:88:156:108:61:83:148 chr2 17697216 . C T 287.4 PASS AO=73;DP=161;FAO=74;FDP=162;FR=.;FRO=88;FSAF=34;FSAR=40;FSRF=44;FSRR=44;FWDB=0.0347789;FXX=0.0121944;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.631;QD=7.09636;RBI=0.0351234;REFB=-0.00927799;REVB=0.00490745;RO=86;SAF=33;SAR=40;SRF=43;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0469045;STB=0.522082;TYPE=snp;VARB=0.00913126;OID=.;OPOS=17697216;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:162:86:88:73:74:40:33:43:43:40:34:44:44 chr2 17698678 . A G 447.68 PASS AO=123;DP=285;FAO=125;FDP=286;FR=.;FRO=161;FSAF=46;FSAR=79;FSRF=74;FSRR=87;FWDB=0.0087957;FXX=0.0069442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.761;QD=6.26127;RBI=0.012165;REFB=-0.0301538;REVB=0.00840371;RO=158;SAF=45;SAR=78;SRF=74;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108042;STB=0.553859;TYPE=snp;VARB=0.0455282;OID=.;OPOS=17698678;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:285:286:158:161:123:125:78:45:74:84:79:46:74:87 chr2 17942775 . T A 1062.26 PASS AO=116;DP=119;FAO=116;FDP=119;FR=.;FRO=3;FSAF=44;FSAR=72;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0774439;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.14;QD=35.7062;RBI=0.0898207;REFB=-0.0949022;REVB=0.0454993;RO=2;SAF=44;SAR=72;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0210934;STB=0.507663;TYPE=snp;VARB=0.00163703;OID=.;OPOS=17942775;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:119:119:2:3:116:116:72:44:2:0:72:44:2:1 chr2 17954027 . G A 1589.08 PASS AO=166;DP=166;FAO=166;FDP=166;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00895542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.2114;QD=38.2911;RBI=0.0424285;REFB=0;REVB=-0.0414727;RO=0;SAF=65;SAR=101;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000101884;OID=.;OPOS=17954027;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:166:166:0:0:166:166:101:65:0:0:101:65:0:0 chr2 17954421 . C G 2163.69 PASS AO=224;DP=229;FAO=225;FDP=225;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=132;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0462747;FXX=0.0174665;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.4432;QD=38.4657;RBI=0.0690716;REFB=0;REVB=0.051279;RO=0;SAF=93;SAR=131;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.47856e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000103739;OID=.;OPOS=17954421;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:229:225:0:0:224:225:131:93:0:0:132:93:0:0 chr2 17962450 . A G 916.24 PASS AO=108;DP=109;FAO=104;FDP=109;FR=.;FRO=5;FSAF=56;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0126864;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6809;QD=33.6233;RBI=0.0241391;REFB=-0.0567163;REVB=-0.0205365;RO=1;SAF=57;SAR=51;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00921638;STB=0.515578;TYPE=snp;VARB=0.00204476;OID=.;OPOS=17962450;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:109:109:1:5:108:104:51:57:0:1:48:56:1:4 chr2 17962518 . C T 678.12 PASS AO=69;DP=76;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013141;FXX=0.077912;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.531;QD=38.2042;RBI=0.0842188;REFB=0;REVB=0.0831873;RO=0;SAF=35;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00095232;OID=.;OPOS=17962518;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:76:71:0:0:69:71:34:35:0:0:35:36:0:0 chr2 17998025 . A T 303.36 PASS AO=58;DP=102;FAO=58;FDP=99;FR=.;FRO=41;FSAF=22;FSAR=36;FSRF=14;FSRR=27;FWDB=-0.00139162;FXX=0.0294089;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.229;QD=12.2568;RBI=0.00867972;REFB=-0.0287104;REVB=0.00856743;RO=39;SAF=22;SAR=36;SRF=13;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0363946;STB=0.516773;TYPE=snp;VARB=0.0216741;OID=.;OPOS=17998025;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:99:39:41:58:58:36:22:13:26:36:22:14:27 chr2 17998095 . C T 278.18 PASS AO=44;DP=61;FAO=44;FDP=62;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=30;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0265647;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=168.304;QD=17.9471;RBI=0.0281096;REFB=-0.0115716;REVB=0.00919072;RO=17;SAF=14;SAR=30;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0872509;STB=0.540964;TYPE=snp;VARB=0.00505908;OID=.;OPOS=17998095;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:61:62:17:18:44:44:30:14:8:9:30:14:8:10 chr2 17998331 . T C 173.65 PASS AO=41;DP=85;FAO=41;FDP=85;FR=.;FRO=44;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=0.00244999;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.849;QD=8.17164;RBI=0.0268218;REFB=0.000351716;REVB=-0.0267096;RO=44;SAF=22;SAR=19;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0761879;STB=0.54241;TYPE=snp;VARB=-0.000505657;OID=.;OPOS=17998331;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:44:44:41:41:19:22:20:24:19:22:20:24 chr2 18112473 . G A 3388.06 PASS AO=336;DP=338;FAO=357;FDP=357;FR=.;FRO=0;FSAF=141;FSAR=216;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0257801;FXX=0.0083331;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.2954;QD=37.9615;RBI=0.134752;REFB=-0.153646;REVB=0.132263;RO=2;SAF=139;SAR=197;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00481866;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00187718;OID=.;OPOS=18112473;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:338:357:2:0:336:357:197:139:0:2:216:141:0:0 chr2 18113623 . A G 146.17 PASS AO=46;DP=123;FAO=46;FDP=121;FR=.;FRO=75;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=34;FSRR=41;FWDB=0.0186601;FXX=0.0162588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.668;QD=4.83221;RBI=0.0360106;REFB=-4.98745e-05;REVB=-0.0307987;RO=74;SAF=23;SAR=23;SRF=34;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0440166;STB=0.528913;TYPE=snp;VARB=-3.91717e-05;OID=.;OPOS=18113623;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:121:74:75:46:46:23:23:34:40:23:23:34:41 chr2 20135283 . T C 2339.37 PASS AO=221;DP=225;FAO=257;FDP=257;FR=.;FRO=0;FSAF=133;FSAR=124;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0337243;FXX=0.0153251;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.8023;QD=36.4105;RBI=0.0881683;REFB=-0.0447951;REVB=0.0814637;RO=4;SAF=123;SAR=98;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0190462;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00516696;OID=.;OPOS=20135283;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:225:257:4:0:221:257:98:123:0:4:124:133:0:0 chr2 20192931 . G A 2546.7 PASS AO=268;DP=270;FAO=268;FDP=268;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=164;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00431714;FXX=0.00740713;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.578;QD=38.0104;RBI=0.00496325;REFB=-0.0502013;REVB=0.00244871;RO=2;SAF=104;SAR=164;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0016639;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.98063e-06;OID=.;OPOS=20192931;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:270:268:2:0:268:268:164:104:1:1:164:104:0:0 chr2 20202929 . C T 604.58 PASS AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00191316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.174;QD=37.7864;RBI=0.00395326;REFB=0;REVB=-0.00345949;RO=0;SAF=36;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.96753e-06;OID=.;OPOS=20202929;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:64:64:0:0:64:64:28:36:0:0:28:36:0:0 chr2 20205680 . C T 1032.42 PASS AO=118;DP=121;FAO=116;FDP=121;FR=.;FRO=5;FSAF=44;FSAR=72;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.00705563;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.1999;QD=34.1295;RBI=0.0341118;REFB=-0.0840941;REVB=-0.0333741;RO=3;SAF=44;SAR=74;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0147223;STB=0.500907;TYPE=snp;VARB=0.00328623;OID=.;OPOS=20205680;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:121:121:3:5:118:116:74:44:2:1:72:44:2:3 chr2 20205848 . G A 806.29 PASS AO=85;DP=87;FAO=86;FDP=87;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.038001;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.515;QD=37.0706;RBI=0.0404796;REFB=0.0461927;REVB=-0.0139471;RO=1;SAF=25;SAR=60;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00783125;STB=0.504131;TYPE=snp;VARB=-0.000586489;OID=.;OPOS=20205848;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:87:87:1:1:85:86:60:25:0:1:60:26:0:1 chr2 20240668 . C A 577.02 PASS AO=108;DP=178;FAO=108;FDP=177;FR=.;FRO=69;FSAF=54;FSAR=54;FSRF=29;FSRR=40;FWDB=0.0268104;FXX=0.00561766;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.3077;QD=13.04;RBI=0.0389048;REFB=0.0171984;REVB=-0.028192;RO=70;SAF=54;SAR=54;SRF=30;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0519111;STB=0.531068;TYPE=snp;VARB=-0.00696239;OID=.;OPOS=20240668;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:177:70:69:108:108:54:54:30:40:54:54:29:40 chr2 20375110 . G A 250.17 PASS AO=46;DP=75;FAO=46;FDP=75;FR=.;FRO=29;FSAF=34;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=0.00425763;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=180.076;QD=13.3423;RBI=0.0161524;REFB=-0.0154755;REVB=0.0155812;RO=29;SAF=34;SAR=12;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0443104;STB=0.524218;TYPE=snp;VARB=0.00930472;OID=.;OPOS=20375110;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:75:75:29:29:46:46:12:34:20:9:12:34:20:9 chr2 20375332 . A G 207.19 PASS AO=40;DP=70;FAO=40;FDP=70;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=29;FSRF=6;FSRR=24;FWDB=-0.00564015;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.965;QD=11.8393;RBI=0.0308412;REFB=-0.0238742;REVB=-0.0303211;RO=30;SAF=11;SAR=29;SRF=6;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0763588;STB=0.541802;TYPE=snp;VARB=0.0144922;OID=.;OPOS=20375332;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:30:30:40:40:29:11:6:24:29:11:6:24 chr2 20403794 . A T 380.12 PASS AO=29;DP=45;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00548027;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7754;QD=35.3603;RBI=0.0432869;REFB=-0.00323683;REVB=-0.0429386;RO=0;SAF=28;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.55046e-08;STB=0.517233;TYPE=snp;VARB=-0.000376412;OID=.;OPOS=20403794;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:31:43:0:1:29:42:1:28:0:0:14:28:0:1 chr2 20403949 . C T 73.68 PASS AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=3;FWDB=0.0449431;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3113;QD=8.9309;RBI=0.0469689;REFB=-0.0510053;REVB=0.0136456;RO=16;SAF=7;SAR=9;SRF=13;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.322636;STB=0.692092;TYPE=snp;VARB=0.0845385;OID=.;OPOS=20403949;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:32:33:16:17:16:16:9:7:13:3:9:7:14:3 chr2 20448521 . C T 97.97 PASS AO=30;DP=80;FAO=30;FDP=80;FR=.;FRO=50;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=30;FSRR=20;FWDB=0.00322304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.736;QD=4.89867;RBI=0.0110751;REFB=-0.001055;REVB=0.0105957;RO=49;SAF=17;SAR=13;SRF=29;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0278605;STB=0.521317;TYPE=snp;VARB=0.00225151;OID=.;OPOS=20448521;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:80:80:49:50:30:30:13:17:29:20:13:17:30:20 chr2 20798006 . CT C 933.79 PASS AO=195;DP=395;FAO=201;FDP=370;FR=.;FRO=169;FSAF=118;FSAR=83;FSRF=81;FSRR=88;FWDB=0.0245669;FXX=0.0632895;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.75;QD=10.095;RBI=0.0252469;REFB=-0.0010305;REVB=0.00581989;RO=167;SAF=114;SAR=81;SRF=81;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0854739;STB=0.549879;TYPE=del;VARB=0.000949074;OID=.;OPOS=20798007;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:195:393:201:370:169:118:83:81:88:99:167:114:81:81:86 chr2 20818454 . T A 195.16 PASS AO=19;DP=19;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0449909;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.435;QD=37.1732;RBI=0.068092;REFB=0;REVB=0.0511111;RO=0;SAF=12;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000404745;OID=.;OPOS=20818454;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:19:21:0:0:19:21:7:12:0:0:8:13:0:0 chr2 20818458 . G A 20.74 PASS AO=6;DP=20;FAO=6;FDP=21;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.0199601;FXX=0.0454339;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.54;QD=3.95033;RBI=0.0813998;REFB=-0.00432538;REVB=-0.0789147;RO=13;SAF=2;SAR=4;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.373394;STB=0.726564;TYPE=snp;VARB=0.0130578;OID=.;OPOS=20818458;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:20:21:13:15:6:6:4:2:9:4:4:2:10:5 chr2 20823691 . G A 10.46 PASS AO=2;DP=6;FAO=2;FDP=6;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0145491;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.7273;QD=6.97208;RBI=0.0145491;REFB=-0.0231425;REVB=0;RO=4;SAF=2;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.222658;OID=.;OPOS=20823691;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:4:4:2:2:0:2:4:0:0:2:4:0 chr2 20823724 . T C 54.27 PASS AO=7;DP=7;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00342502;FXX=0.142653;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.445;QD=36.1785;RBI=0.0738449;REFB=0;REVB=0.0737654;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00209709;OID=.;OPOS=20823724;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:6:0:0:7:6:3:4:0:0:3:3:0:0 chr2 20824559 . C T 122.47 PASS AO=22;DP=118;FAO=43;FDP=111;FR=.,HEALED;FRO=68;FSAF=27;FSAR=16;FSRF=30;FSRR=38;FWDB=-0.107536;FXX=0.0263135;HRUN=4;LEN=1;MLLD=32.6083;QD=4.41327;RBI=0.27881;REFB=0.00478521;REVB=-0.257238;RO=31;SAF=9;SAR=13;SRF=21;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.268907;STB=0.615136;TYPE=snp;VARB=-0.0387838;OID=.;OPOS=20824559;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:111:31:68:22:43:13:9:21:10:16:27:30:38 chr2 20838318 . G A 308.28 PASS AO=71;DP=156;FAO=78;FDP=163;FR=.;FRO=85;FSAF=32;FSAR=46;FSRF=41;FSRR=44;FWDB=0.00972582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.243;QD=7.56504;RBI=0.0361861;REFB=-0.0179773;REVB=0.0348546;RO=75;SAF=25;SAR=46;SRF=40;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173795;STB=0.538304;TYPE=snp;VARB=0.01619;OID=.;OPOS=20838318;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:163:75:85:71:78:46:25:40:35:46:32:41:44 chr2 21225281 . C T 1447.83 PASS AO=152;DP=152;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.486;QD=38.1008;RBI=0.0346104;REFB=0;REVB=-0.0172502;RO=0;SAF=61;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.7992e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.66512e-05;OID=.;OPOS=21225281;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:152:152:0:0:152:152:91:61:0:0:91:61:0:0 chr2 21228827 . C T 631.39 PASS AO=129;DP=230;FAO=129;FDP=229;FR=.;FRO=100;FSAF=63;FSAR=66;FSRF=59;FSRR=41;FWDB=-0.0093082;FXX=0.00434764;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.565;QD=11.0286;RBI=0.00934525;REFB=-0.00749123;REVB=-0.000831345;RO=100;SAF=63;SAR=66;SRF=59;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0815643;STB=0.544305;TYPE=snp;VARB=0.00657485;OID=.;OPOS=21228827;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:230:229:100:100:129:129:66:63:59:41:66:63:59:41 chr2 21229055 . AG A 88 PASS AO=40;DP=93;FAO=43;FDP=84;FR=.;FRO=41;FSAF=6;FSAR=37;FSRF=30;FSRR=11;FWDB=0.0634366;FXX=0.0344788;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.1318;QD=4.19041;RBI=0.210183;REFB=-0.0378181;REVB=-0.200381;RO=39;SAF=6;SAR=34;SRF=30;SRR=9;SSEN=0.549261;SSEP=0;SSSB=-0.583902;STB=0.822058;TYPE=del;VARB=-0.00134889;OID=.;OPOS=21229056;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:40:86:43:84:41:6:37:30:11:87:39:6:34:30:9 chr2 21232195 . G A 723.77 PASS AO=230;DP=503;FAO=186;FDP=399;FR=.;FRO=213;FSAF=97;FSAR=89;FSRF=124;FSRR=89;FWDB=-0.014226;FXX=0.00249994;HRUN=3;LEN=1;MLLD=201.749;QD=7.25581;RBI=0.0144478;REFB=-0.00548777;REVB=0.00252206;RO=272;SAF=122;SAR=108;SRF=153;SRR=119;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0317035;STB=0.532527;TYPE=snp;VARB=0.00609247;OID=.;OPOS=21232195;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:503:399:272:213:230:186:108:122:153:119:89:97:124:89 chr2 21232803 . T C 1089.74 PASS AO=115;DP=116;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0259137;FXX=0.0254216;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.11;QD=37.904;RBI=0.0264221;REFB=-0.0383703;REVB=0.00515828;RO=0;SAF=52;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.20366e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000308737;OID=.;OPOS=21232803;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:116:115:0:0:115:115:63:52:0:0:63:52:0:0 chr2 21232804 . G A 307.42 PASS AO=65;DP=122;FAO=65;FDP=120;FR=.;FRO=55;FSAF=35;FSAR=30;FSRF=20;FSRR=35;FWDB=0.0183906;FXX=0.0163921;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.155;QD=10.2472;RBI=0.022662;REFB=-0.00101838;REVB=0.013242;RO=55;SAF=35;SAR=30;SRF=20;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145399;STB=0.579594;TYPE=snp;VARB=0.0010574;OID=.;OPOS=21232804;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:120:55:55:65:65:30:35:20:35:30:35:20:35 chr2 21235475 . T C 2554.11 PASS AO=273;DP=278;FAO=273;FDP=273;FR=.;FRO=0;FSAF=115;FSAR=158;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00278278;FXX=0.017985;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.716;QD=37.4228;RBI=0.0530428;REFB=-0.0920044;REVB=0.0529698;RO=2;SAF=115;SAR=158;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00821915;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000450047;OID=.;OPOS=21235475;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:89:278:273:2:0:273:273:158:115:2:0:158:115:0:0 chr2 21237786 . T G 389.18 PASS AO=83;DP=159;FAO=85;FDP=159;FR=.;FRO=74;FSAF=50;FSAR=35;FSRF=33;FSRR=41;FWDB=0.0544256;FXX=0.00624961;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3298;QD=9.79065;RBI=0.0550708;REFB=-0.00185238;REVB=-0.00840568;RO=74;SAF=49;SAR=34;SRF=34;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113715;STB=0.566725;TYPE=snp;VARB=0.00186011;OID=.;OPOS=21237786;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:159:74:74:83:85:34:49:34:40:35:50:33:41 chr2 21263900 . G A 385.63 PASS AO=104;DP=234;FAO=104;FDP=234;FR=.;FRO=130;FSAF=42;FSAR=62;FSRF=66;FSRR=64;FWDB=0.0117667;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=110.612;QD=6.59195;RBI=0.0122755;REFB=-0.0146137;REVB=-0.00349757;RO=130;SAF=42;SAR=62;SRF=66;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105402;STB=0.558547;TYPE=snp;VARB=0.0125087;OID=.;OPOS=21263900;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:234:234:130:130:104:104:62:42:66:64:62:42:66:64 chr2 23865260 . T C 326.95 PASS AO=69;DP=129;FAO=69;FDP=128;FR=.;FRO=59;FSAF=37;FSAR=32;FSRF=20;FSRR=39;FWDB=0.0104272;FXX=0.00775134;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.167;QD=10.2171;RBI=0.013036;REFB=-0.010084;REVB=0.00782384;RO=57;SAF=37;SAR=32;SRF=20;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152338;STB=0.590179;TYPE=snp;VARB=0.0105199;OID=.;OPOS=23865260;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:128:57:59:69:69:32:37:20:37:32:37:20:39 chr2 23865601 . TCCCCA TCCCA,TCCCCAC 22.68 PASS AO=8,3;DP=17;FAO=9,0;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=7,0;FSAR=2,0;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.0464497,-0.0366179;FXX=0.0555247;HRUN=4,0;LEN=1,1;MLLD=14.5111,104.267;QD=5.33761;RBI=0.246544,0.396923;REFB=-0.107621,0.0164687;REVB=0.242129,-0.39523;RO=5;SAF=7,0;SAR=1,3;SRF=2;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0.342857,0;SSSB=0.428999,-0.658479;STB=0.756168,0.5;TYPE=del,ins;VARB=0.113655,0;OID=.,.;OPOS=23865602,23865607;OREF=C,-;OALT=-,C;OMAPALT=TCCCA,TCCCCAC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:8,3:17:9,0:17:8:7,0:2,0:2:6:22:5:7,0:1,3:2:3 chr2 23926233 . C T 314.27 PASS AO=57;DP=91;FAO=58;FDP=92;FR=.;FRO=34;FSAF=24;FSAR=34;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=0.0554088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.5281;QD=13.6638;RBI=0.0560182;REFB=-0.0109437;REVB=0.00824001;RO=34;SAF=24;SAR=33;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00655748;STB=0.500773;TYPE=snp;VARB=0.00370319;OID=.;OPOS=23926233;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:92:34:34:57:58:33:24:14:20:34:24:14:20 chr2 24055058 . G C 700.72 PASS AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.5471;QD=37.8769;RBI=0.0282022;REFB=0;REVB=-0.0223191;RO=0;SAF=55;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.56387e-05;OID=.;OPOS=24055058;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:74:74:0:0:74:74:19:55:0:0:19:55:0:0 chr2 24108652 . T C 1624.15 PASS AO=167;DP=169;FAO=170;FDP=170;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0261943;FXX=0.00584761;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.628;QD=38.2153;RBI=0.0263389;REFB=0;REVB=0.00275584;RO=0;SAF=95;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.17463e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.32448e-05;OID=.;OPOS=24108652;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:169:170:0:0:167:170:72:95:0:0:73:97:0:0 chr2 24181159 . G T 250.2 PASS AO=63;DP=137;FAO=63;FDP=137;FR=.;FRO=74;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=25;FSRR=49;FWDB=0.000455133;FXX=0.00724585;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.41;QD=7.30523;RBI=0.0238643;REFB=-0.010356;REVB=0.0238599;RO=73;SAF=36;SAR=27;SRF=25;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218565;STB=0.624192;TYPE=snp;VARB=0.0109367;OID=.;OPOS=24181159;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:73:74:63:63:27:36:25:48:27:36:25:49 chr2 24223086 . G A 215.88 PASS AO=59;DP=138;FAO=59;FDP=137;FR=.;FRO=78;FSAF=39;FSAR=20;FSRF=37;FSRR=41;FWDB=0.00466419;FXX=0.00724585;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.285;QD=6.30305;RBI=0.0101492;REFB=0.000453722;REVB=-0.00901395;RO=78;SAF=39;SAR=20;SRF=37;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196313;STB=0.610118;TYPE=snp;VARB=-0.000545787;OID=.;OPOS=24223086;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:137:78:78:59:59:20:39:37:41:20:39:37:41 chr2 24246568 . GC G 102.36 PASS AO=18;DP=32;FAO=21;FDP=27;FR=.;FRO=6;FSAF=17;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.15237;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=19.3169;QD=15.1648;RBI=0.157189;REFB=-0.0526376;REVB=0.038625;RO=7;SAF=14;SAR=4;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0.492492;SSSB=0.292498;STB=0.679808;TYPE=del;VARB=0.037738;OID=.;OPOS=24246569;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:18:27:21:27:6:17:4:1:5:9:7:14:4:2:5 chr2 24262060 . G A 215.15 PASS AO=52;DP=110;FAO=52;FDP=110;FR=.;FRO=58;FSAF=47;FSAR=5;FSRF=51;FSRR=7;FWDB=-0.0183897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.8068;QD=7.82352;RBI=0.0191186;REFB=-0.0150608;REVB=0.00522867;RO=58;SAF=47;SAR=5;SRF=51;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0628027;STB=0.53509;TYPE=snp;VARB=0.0141753;OID=.;OPOS=24262060;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:58:58:52:52:5:47:51:7:5:47:51:7 chr2 24268721 . C T 75.09 PASS AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.0166538;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.979;QD=10.3572;RBI=0.0714229;REFB=0.0112938;REVB=-0.0694541;RO=14;SAF=11;SAR=4;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221099;STB=0.626763;TYPE=snp;VARB=-0.00974687;OID=.;OPOS=24268721;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:29:29:14:14:15:15:4:11:7:7:4:11:7:7 chr2 24268751 . C T 73.99 PASS AO=19;DP=45;FAO=19;FDP=45;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=4;FWDB=-0.0300113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.786;QD=6.57694;RBI=0.0443503;REFB=-0.000922642;REVB=0.0326538;RO=26;SAF=11;SAR=8;SRF=22;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.295976;STB=0.666518;TYPE=snp;VARB=0.001422;OID=.;OPOS=24268751;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:45:45:26:26:19:19:8:11:22:4:8:11:22:4 chr2 24300563 . T C 508.96 PASS AO=132;DP=291;FAO=134;FDP=294;FR=.;FRO=160;FSAF=59;FSAR=75;FSRF=85;FSRR=75;FWDB=0.0104658;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.316;QD=6.92458;RBI=0.0237873;REFB=3.71734e-05;REVB=0.0213612;RO=159;SAF=59;SAR=73;SRF=85;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0866274;STB=0.549611;TYPE=snp;VARB=-3.62427e-05;OID=.;OPOS=24300563;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:291:294:159:160:132:134:73:59:85:74:75:59:85:75 chr2 24338428 . T G 89.68 PASS AO=29;DP=81;FAO=29;FDP=81;FR=.;FRO=52;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=27;FSRR=25;FWDB=0.0183097;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.3578;QD=4.42881;RBI=0.0399703;REFB=-0.00257061;REVB=-0.03553;RO=52;SAF=15;SAR=14;SRF=27;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0022147;STB=0.501278;TYPE=snp;VARB=0.00683197;OID=.;OPOS=24338428;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:81:81:52:52:29:29:14:15:27:25:14:15:27:25 chr2 24342505 . T C 1347.04 PASS AO=138;DP=139;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0093573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.296;QD=38.4868;RBI=0.0222945;REFB=0;REVB=0.0202357;RO=0;SAF=47;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.92354e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.75813e-05;OID=.;OPOS=24342505;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:139:140:0:0:138:140:91:47:0:0:92:48:0:0 chr2 24342532 . G A 176.33 PASS AO=48;DP=114;FAO=49;FDP=116;FR=.;FRO=67;FSAF=12;FSAR=37;FSRF=18;FSRR=49;FWDB=0.00352493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.4526;QD=6.08042;RBI=0.0462799;REFB=0.0012681;REVB=0.0461455;RO=64;SAF=12;SAR=36;SRF=18;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0413195;STB=0.5182;TYPE=snp;VARB=-0.00079717;OID=.;OPOS=24342532;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:116:64:67:48:49:36:12:18:46:37:12:18:49 chr2 24344060 . T G 617.66 PASS AO=135;DP=318;FAO=160;FDP=343;FR=.;FRO=183;FSAF=81;FSAR=79;FSRF=78;FSRR=105;FWDB=0.000849397;FXX=0.00290689;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.591;QD=7.20301;RBI=0.0486774;REFB=-0.0254487;REVB=0.04867;RO=183;SAF=66;SAR=69;SRF=78;SRR=105;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0649674;STB=0.542649;TYPE=snp;VARB=0.0256318;OID=.;OPOS=24344060;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:318:343:183:183:135:160:69:66:78:105:79:81:78:105 chr2 24358001 . G C 63.24 PASS AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0608589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.563;QD=7.44002;RBI=0.0674201;REFB=-0.0232923;REVB=0.0290115;RO=18;SAF=12;SAR=3;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.380983;STB=0.7365;TYPE=snp;VARB=0.027585;OID=.;OPOS=24358001;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:34:34:18:19:15:15:3:12:8:10:3:12:8:11 chr2 24369674 . C T 290.25 PASS AO=79;DP=181;FAO=79;FDP=181;FR=.;FRO=102;FSAF=44;FSAR=35;FSRF=63;FSRR=39;FWDB=0.00811098;FXX=0.0054942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.401;QD=6.41431;RBI=0.0480272;REFB=0.0103828;REVB=-0.0473374;RO=101;SAF=44;SAR=35;SRF=62;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0585776;STB=0.534915;TYPE=snp;VARB=-0.0135403;OID=.;OPOS=24369674;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:181:101:102:79:79:35:44:62:39:35:44:63:39 chr2 24384424 . T C 111.62 PASS AO=28;DP=66;FAO=29;FDP=68;FR=.;FRO=39;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=0.0603833;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.8809;QD=6.56603;RBI=0.0626282;REFB=-0.0131568;REVB=-0.016618;RO=37;SAF=15;SAR=13;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.087456;STB=0.556537;TYPE=snp;VARB=0.0179935;OID=.;OPOS=24384424;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:68:37:39:28:29:13:15:23:14:14:15:24:15 chr2 24387178 . G GC 582.48 PASS AO=71;DP=89;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0634942;FXX=0.0595167;HRUN=1;LEN=1;MLLD=23.6411;QD=29.4926;RBI=0.318382;REFB=0;REVB=0.311987;RO=17;SAF=43;SAR=28;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0286726;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.0076097;OID=.;OPOS=24387179;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:71:89:79:79:0:44:35:0:0:48:17:43:28:9:8 chr2 24402127 . C CAA 609.94 PASS AO=63;DP=86;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144635;FXX=0.238067;HRUN=0;LEN=2;MLLD=151.757;QD=38.1214;RBI=0.0346214;REFB=0;REVB=0.0314556;RO=18;SAF=16;SAR=47;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0709352;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=9.12801e-05;OID=.;OPOS=24402128;OREF=-;OALT=AA;OMAPALT=CAA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:63:86:64:64:0:17:47:0:0:29:18:16:47:7:11 chr2 24402128 . G A 16.14 PASS AO=16;DP=86;FAO=15;FDP=86;FR=.;FRO=71;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=54;FWDB=-0.00274108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.741;QD=0.75082;RBI=0.0203643;REFB=-0.00540777;REVB=0.020179;RO=70;SAF=5;SAR=11;SRF=18;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0852818;STB=0.645985;TYPE=snp;VARB=0.0280749;OID=.;OPOS=24402128;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:86:86:70:71:16:15:11:5:18:52:9:6:17:54 chr2 24413298 . A G 372.98 PASS AO=72;DP=122;FAO=72;FDP=122;FR=.;FRO=50;FSAF=45;FSAR=27;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=0.0200072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.034;QD=12.2289;RBI=0.0211335;REFB=-0.0110467;REVB=-0.00680716;RO=49;SAF=45;SAR=27;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0888627;STB=0.553176;TYPE=snp;VARB=0.00702139;OID=.;OPOS=24413298;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:49:50:72:72:27:45:25:24:27:45:25:25 chr2 24431184 . C T 195.41 PASS AO=58;DP=146;FAO=58;FDP=147;FR=.;FRO=89;FSAF=20;FSAR=38;FSRF=34;FSRR=55;FWDB=0.00877197;FXX=0.119753;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.235;QD=5.31735;RBI=0.0276502;REFB=-0.0174254;REVB=0.0262218;RO=79;SAF=20;SAR=38;SRF=34;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0939412;STB=0.524531;TYPE=snp;VARB=0.0201257;OID=.;OPOS=24431184;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:147:79:89:58:58:38:20:34:45:38:20:34:55 chr2 24432839 . A G 422.1 PASS AO=104;DP=217;FAO=104;FDP=218;FR=.;FRO=114;FSAF=40;FSAR=64;FSRF=55;FSRR=59;FWDB=-0.000476425;FXX=0.004566;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.7397;QD=7.74495;RBI=0.0375604;REFB=-0.0199873;REVB=-0.0375574;RO=111;SAF=40;SAR=64;SRF=54;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0981906;STB=0.552717;TYPE=snp;VARB=0.0252677;OID=.;OPOS=24432839;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:217:218:111:114:104:104:64:40:54:57:64:40:55:59 chr2 24524958 . C T 144.19 PASS AO=35;DP=75;FAO=35;FDP=75;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=-0.0214335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.092;QD=7.69036;RBI=0.0266624;REFB=-0.0182818;REVB=0.0158585;RO=37;SAF=15;SAR=20;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103444;STB=0.577902;TYPE=snp;VARB=0.0116689;OID=.;OPOS=24524958;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:37:40:35:35:20:15:20:17:20:15:23:17 chr2 24587571 . A G 1204.4 PASS AO=126;DP=131;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0517464;FXX=0.00751823;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.506;QD=36.4971;RBI=0.0517464;REFB=-0.0539833;REVB=2.69163e-05;RO=3;SAF=32;SAR=94;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00461396;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000826414;OID=.;OPOS=24587571;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:131:132:3:0:126:132:94:32:1:2:98:34:0:0 chr2 24905927 . G C 1549.47 PASS AO=162;DP=163;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=132;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00814568;FXX=0.0121944;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.904;QD=38.2586;RBI=0.0102027;REFB=0;REVB=0.00614348;RO=0;SAF=30;SAR=132;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.26155e-05;OID=.;OPOS=24905927;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:163:162:0:0:162:162:132:30:0:0:132:30:0:0 chr2 24974945 . T G 1145.85 PASS AO=121;DP=123;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000760737;FXX=0.0161277;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.204;QD=37.5687;RBI=0.00279327;REFB=-0.0301822;REVB=-0.00268768;RO=1;SAF=17;SAR=104;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00454656;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.05094e-05;OID=.;OPOS=24974945;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:123:122:1:0:121:122:104:17:0:1:105:17:0:0 chr2 24991569 . C G 209.43 PASS AO=74;DP=207;FAO=74;FDP=207;FR=.;FRO=133;FSAF=25;FSAR=49;FSRF=64;FSRR=69;FWDB=0.014104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.1102;QD=4.04694;RBI=0.0199086;REFB=-0.00778496;REVB=-0.014051;RO=130;SAF=25;SAR=49;SRF=62;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163268;STB=0.596472;TYPE=snp;VARB=0.0140693;OID=.;OPOS=24991569;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:207:130:133:74:74:49:25:62:68:49:25:64:69 chr2 25022598 . A G 205.1 PASS AO=51;DP=118;FAO=53;FDP=118;FR=.;FRO=65;FSAF=23;FSAR=30;FSRF=36;FSRR=29;FWDB=0.0374312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.419;QD=6.95261;RBI=0.0412729;REFB=0.00458804;REVB=-0.0173883;RO=64;SAF=23;SAR=28;SRF=36;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110735;STB=0.566013;TYPE=snp;VARB=-0.00433431;OID=.;OPOS=25022598;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:64:65:51:53:28:23:36:28:30:23:36:29 chr2 25042371 . A C 170.43 PASS AO=42;DP=94;FAO=44;FDP=96;FR=.;FRO=52;FSAF=13;FSAR=31;FSRF=26;FSRR=26;FWDB=-0.0512994;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.9096;QD=7.10115;RBI=0.0518975;REFB=0.000101314;REVB=0.0078568;RO=51;SAF=12;SAR=30;SRF=25;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218292;STB=0.619943;TYPE=snp;VARB=-0.000282058;OID=.;OPOS=25042371;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:96:51:52:42:44:30:12:25:26:31:13:26:26 chr2 25044417 . G A 103.74 PASS AO=27;DP=63;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=0.021441;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.267;QD=6.58693;RBI=0.0544817;REFB=-0.0100748;REVB=0.0500853;RO=35;SAF=14;SAR=13;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0816209;STB=0.537163;TYPE=snp;VARB=0.0114093;OID=.;OPOS=25044417;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:35:36:27:27:13:14:21:14:13:14:21:15 chr2 25046090 . T C 95.34 PASS AO=14;DP=20;FAO=14;FDP=20;FR=.;FRO=6;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.00698311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.459;QD=19.068;RBI=0.0278543;REFB=-0.00449848;REVB=0.0269648;RO=6;SAF=7;SAR=7;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0894563;STB=0.549929;TYPE=snp;VARB=0.00171323;OID=.;OPOS=25046090;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:20:20:6:6:14:14:7:7:4:2:7:7:4:2 chr2 25048987 . AG A 21.75 PASS AO=13;DP=39;FAO=12;FDP=33;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0357226;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=14.2226;QD=2.63606;RBI=0.0362939;REFB=-0.0476594;REVB=0.00641397;RO=19;SAF=9;SAR=4;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0.505495;SSSB=0.180198;STB=0.66073;TYPE=del;VARB=0.0796026;OID=.;OPOS=25048988;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:13:33:12:33:21:9:3:11:10:21:19:9:4:10:9 chr2 25050977 . T C 75 PASS AO=22;DP=58;FAO=22;FDP=58;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=31;FWDB=0.00790376;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=193.139;QD=5.17226;RBI=0.0492736;REFB=-0.0157889;REVB=-0.0486356;RO=36;SAF=12;SAR=10;SRF=5;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.432433;STB=0.743026;TYPE=snp;VARB=0.0267965;OID=.;OPOS=25050977;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:58:58:36:36:22:22:10:12:5:31:10:12:5:31 chr2 25059787 . TG T 27.5 PASS AO=19;DP=45;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=16;FSAR=1;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.0475544;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.0956;QD=2.50005;RBI=0.0668487;REFB=-0.107323;REVB=0.0469822;RO=25;SAF=17;SAR=2;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0.401631;SSSB=0.441971;STB=0.856586;TYPE=del;VARB=0.12642;OID=.;OPOS=25059788;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:19:44:17:44:27:16:1:16:11:27:25:17:2:15:10 chr2 25064193 . G A 154.87 PASS AO=37;DP=76;FAO=37;FDP=79;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=26;FSRF=31;FSRR=11;FWDB=0.0105542;FXX=0.0246883;HRUN=3;LEN=1;MLLD=134.438;QD=7.84163;RBI=0.0181454;REFB=-0.0100579;REVB=0.0147602;RO=36;SAF=11;SAR=26;SRF=28;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.416168;STB=0.728366;TYPE=snp;VARB=0.0140901;OID=.;OPOS=25064193;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:79:36:42:37:37:26:11:28:8:26:11:31:11 chr2 25141538 . A G 60.38 PASS AO=21;DP=67;FAO=23;FDP=71;FR=.;FRO=48;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=-0.0381753;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.541;QD=3.40166;RBI=0.0792876;REFB=-0.0211338;REVB=-0.0694922;RO=46;SAF=12;SAR=9;SRF=24;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.058234;STB=0.500613;TYPE=snp;VARB=0.0392254;OID=.;OPOS=25141538;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:67:71:46:48:21:23:9:12:24:22:11:12:25:23 chr2 25194741 . G A 315.87 PASS AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0342533;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.356;QD=35.0966;RBI=0.0694585;REFB=-0.0384071;REVB=0.0604251;RO=1;SAF=24;SAR=11;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0406249;STB=0.521726;TYPE=snp;VARB=0.000793046;OID=.;OPOS=25194741;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:36:36:1:1:35:35:11:24:0:1:11:24:0:1 chr2 25359422 . G A 73.66 PASS AO=24;DP=69;FAO=25;FDP=73;FR=.;FRO=48;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=0.0187625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.5921;QD=4.0359;RBI=0.038313;REFB=-0.0234115;REVB=0.0334044;RO=45;SAF=11;SAR=13;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00939187;STB=0.513147;TYPE=snp;VARB=0.0195421;OID=.;OPOS=25359422;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:69:73:45:48:24:25:13:11:21:24:13:12:24:24 chr2 25377176 . T C 112.98 PASS AO=27;DP=60;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=9;FSRR=23;FWDB=0.00359983;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.578;QD=7.65979;RBI=0.0306302;REFB=-0.0154505;REVB=0.0304179;RO=31;SAF=10;SAR=17;SRF=9;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0836622;STB=0.553212;TYPE=snp;VARB=0.019271;OID=.;OPOS=25377176;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:59:31:32:27:27:17:10:9:22:17:10:9:23 chr2 25602142 . G A 41.31 PASS AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=2;FWDB=0.0215779;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.2662;QD=7.86815;RBI=0.185688;REFB=-0.0133117;REVB=0.18443;RO=12;SAF=7;SAR=2;SRF=10;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0820699;STB=0.548286;TYPE=snp;VARB=0.0186931;OID=.;OPOS=25602142;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:21:21:12:12:9:9:2:7:10:2:2:7:10:2 chr2 25655772 . T C 64.05 PASS AO=20;DP=56;FAO=20;FDP=56;FR=.;FRO=36;FSAF=3;FSAR=17;FSRF=6;FSRR=30;FWDB=-0.036124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.9833;QD=4.57497;RBI=0.0362051;REFB=-0.0112948;REVB=-0.00242207;RO=36;SAF=3;SAR=17;SRF=6;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0348283;STB=0.520387;TYPE=snp;VARB=0.0203117;OID=.;OPOS=25655772;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:56:56:36:36:20:20:17:3:6:30:17:3:6:30 chr2 25919967 . A G 383.71 PASS AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0521748;FXX=0.0238039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.9886;QD=37.4355;RBI=0.0523693;REFB=0;REVB=-0.00450954;RO=0;SAF=18;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000323211;OID=.;OPOS=25919967;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:42:41:0:0:41:41:23:18:0:0:23:18:0:0 chr2 26149968 . C T 1027.09 PASS AO=105;DP=105;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0207534;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6216;QD=38.3959;RBI=0.0339693;REFB=0;REVB=0.0268925;RO=0;SAF=43;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.33041e-05;OID=.;OPOS=26149968;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:105:107:0:0:105:107:62:43:0:0:64:43:0:0 chr2 26149988 . G C 334.39 PASS AO=56;DP=106;FAO=60;FDP=95;FR=.;FRO=35;FSAF=34;FSAR=26;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=0.011447;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=216.647;QD=14.0797;RBI=0.0151175;REFB=-0.00708985;REVB=-0.00987452;RO=0;SAF=33;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.571805;TYPE=snp;VARB=0.000952734;OID=.;OPOS=26149988;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:95:0:35:56:60:23:33:0:0:26:34:13:22 chr2 26321526 . T C 161.02 PASS AO=52;DP=140;FAO=52;FDP=139;FR=.;FRO=87;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=35;FSRR=52;FWDB=-0.00562483;FXX=0.00714235;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.541;QD=4.63375;RBI=0.0159907;REFB=-0.00592415;REVB=0.0149688;RO=87;SAF=24;SAR=28;SRF=35;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.066067;STB=0.5375;TYPE=snp;VARB=0.011277;OID=.;OPOS=26321526;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:139:87:87:52:52:28:24:35:52:28:24:35:52 chr2 26350787 . G T 523.14 PASS AO=102;DP=178;FAO=106;FDP=185;FR=.;FRO=79;FSAF=30;FSAR=76;FSRF=19;FSRR=60;FWDB=-0.0101846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.723;QD=11.3111;RBI=0.0466269;REFB=-0.0211965;REVB=0.045501;RO=75;SAF=30;SAR=72;SRF=17;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0653501;STB=0.522805;TYPE=snp;VARB=0.0181029;OID=.;OPOS=26350787;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:185:75:79:102:106:72:30:17:58:76:30:19:60 chr2 26358110 . G C 89.25 PASS AO=21;DP=52;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.0354096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.8459;QD=6.61104;RBI=0.0382497;REFB=-0.0347022;REVB=0.0144637;RO=31;SAF=13;SAR=8;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0416544;STB=0.509023;TYPE=snp;VARB=0.0265612;OID=.;OPOS=26358110;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:52:54:31:31:21:23:8:13:18:13:10:13:18:13 chr2 26399214 . G A 316.24 PASS AO=78;DP=164;FAO=78;FDP=164;FR=.;FRO=86;FSAF=38;FSAR=40;FSRF=37;FSRR=49;FWDB=-0.00197916;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=179.406;QD=7.71309;RBI=0.00606809;REFB=-0.0109703;REVB=0.00573625;RO=86;SAF=38;SAR=40;SRF=37;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0541433;STB=0.52992;TYPE=snp;VARB=0.019551;OID=.;OPOS=26399214;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:164:86:86:78:78:40:38:37:49:40:38:37:49 chr2 26455127 . G A 44.1 PASS AO=15;DP=48;FAO=15;FDP=47;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.133087;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.2628;QD=3.75322;RBI=0.133238;REFB=-0.0215075;REVB=-0.00633313;RO=31;SAF=8;SAR=7;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0195002;STB=0.522697;TYPE=snp;VARB=0.0413817;OID=.;OPOS=26455127;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:48:47:31:32:15:15:7:8:16:15:7:8:16:16 chr2 26477125 . G GACT 1326.46 PASS AO=150;DP=179;FAO=159;FDP=173;FR=.;FRO=14;FSAF=87;FSAR=72;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=-0.00966706;FXX=0.0388867;HRUN=1;LEN=3;MLLD=235.384;QD=30.6696;RBI=0.0239823;REFB=-0.0613418;REVB=0.0219476;RO=16;SAF=83;SAR=67;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0364828;STB=0.513679;TYPE=ins;VARB=0.00223798;OID=.;OPOS=26477126;OREF=-;OALT=ACT;OMAPALT=GACT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:150:179:159:173:14:87:72:10:4:8:16:83:67:12:4 chr2 26502875 . T C 325.35 PASS AO=69;DP=128;FAO=69;FDP=128;FR=.;FRO=59;FSAF=35;FSAR=34;FSRF=12;FSRR=47;FWDB=-0.0133275;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.2597;QD=10.167;RBI=0.0339044;REFB=-0.00619327;REVB=-0.0311751;RO=59;SAF=35;SAR=34;SRF=12;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.256237;STB=0.639484;TYPE=snp;VARB=0.00496129;OID=.;OPOS=26502875;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:59:59:69:69:34:35:12:47:34:35:12:47 chr2 26505858 . A G 320.98 PASS AO=93;DP=241;FAO=95;FDP=231;FR=.;FRO=136;FSAF=40;FSAR=55;FSRF=60;FSRR=76;FWDB=0.0323908;FXX=0.0647747;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9679;QD=5.55803;RBI=0.035316;REFB=-0.00374492;REVB=-0.0140732;RO=102;SAF=40;SAR=53;SRF=47;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0295009;STB=0.512102;TYPE=snp;VARB=0.00368272;OID=.;OPOS=26505858;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:241:231:102:136:93:95:53:40:47:55:55:40:60:76 chr2 26512957 . G C 1566.03 PASS AO=163;DP=168;FAO=164;FDP=164;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00235575;FXX=0.0409333;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2371;QD=38.1959;RBI=0.0111772;REFB=0;REVB=-0.0109261;RO=0;SAF=76;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19272e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0020232;OID=.;OPOS=26512957;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:168:164:0:0:163:164:87:76:0:0:87:77:0:0 chr2 26534801 . G A 80.87 PASS AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=-0.0158871;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.285;QD=7.70224;RBI=0.0171337;REFB=-0.0202986;REVB=-0.00641605;RO=23;SAF=8;SAR=11;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218988;STB=0.624563;TYPE=snp;VARB=0.0396585;OID=.;OPOS=26534801;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:42:42:23:23:19:19:11:8:15:8:11:8:15:8 chr2 26536694 . C T 104.79 PASS AO=20;DP=35;FAO=20;FDP=35;FR=.;FRO=15;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=0;FWDB=0.0665865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.5519;QD=11.9756;RBI=0.0711866;REFB=-0.0176098;REVB=0.025175;RO=15;SAF=16;SAR=4;SRF=15;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.292911;STB=0.659454;TYPE=snp;VARB=0.00853378;OID=.;OPOS=26536694;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:35:35:15:15:20:20:4:16:15:0:4:16:15:0 chr2 26590084 . T G 793.21 PASS AO=166;DP=298;FAO=167;FDP=303;FR=.;FRO=136;FSAF=85;FSAR=82;FSRF=44;FSRR=92;FWDB=0.00360184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.886;QD=10.4714;RBI=0.0142216;REFB=-0.0115264;REVB=0.0137579;RO=129;SAF=84;SAR=82;SRF=38;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170403;STB=0.583008;TYPE=snp;VARB=0.00683161;OID=.;OPOS=26590084;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:298:303:129:136:166:167:82:84:38:91:82:85:44:92 chr2 26597965 . C T 315.8 PASS AO=93;DP=221;FAO=93;FDP=226;FR=.;FRO=133;FSAF=40;FSAR=53;FSRF=39;FSRR=94;FWDB=0.0104572;FXX=0.00877155;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.953;QD=5.58931;RBI=0.0158648;REFB=0.00161936;REVB=0.0119305;RO=127;SAF=40;SAR=53;SRF=35;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168285;STB=0.584069;TYPE=snp;VARB=-0.00299761;OID=.;OPOS=26597965;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:226:127:133:93:93:53:40:35:92:53:40:39:94 chr2 26607992 . T C 1692.39 PASS AO=177;DP=181;FAO=183;FDP=183;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=134;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0329063;FXX=0.0213892;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.1923;QD=36.9922;RBI=0.0373973;REFB=-0.0259044;REVB=-0.0177688;RO=3;SAF=46;SAR=131;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00302319;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000374803;OID=.;OPOS=26607992;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:181:183:3:0:177:183:131:46:1:2:134:49:0:0 chr2 26612465 . G A 404.27 PASS AO=103;DP=229;FAO=105;FDP=230;FR=.;FRO=125;FSAF=46;FSAR=59;FSRF=52;FSRR=73;FWDB=-0.00707051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.0199;QD=7.03075;RBI=0.0235699;REFB=-0.00863147;REVB=-0.0224844;RO=122;SAF=44;SAR=59;SRF=50;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0174133;STB=0.51223;TYPE=snp;VARB=0.00897467;OID=.;OPOS=26612465;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:229:230:122:125:103:105:59:44:50:72:59:46:52:73 chr2 26613056 . C T 1689.2 PASS AO=176;DP=178;FAO=176;FDP=176;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0158719;FXX=0.0112353;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.571;QD=38.3908;RBI=0.0603659;REFB=0;REVB=-0.058242;RO=0;SAF=96;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.18476e-05;OID=.;OPOS=26613056;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:178:176:0:0:176:176:80:96:0:0:80:96:0:0 chr2 26613329 . A G 646.95 PASS AO=146;DP=285;FAO=146;FDP=281;FR=.;FRO=135;FSAF=54;FSAR=92;FSRF=45;FSRR=90;FWDB=0.0111635;FXX=0.0140346;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.0376;QD=9.20918;RBI=0.0139943;REFB=-0.0177821;REVB=0.00843889;RO=134;SAF=54;SAR=92;SRF=45;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0323049;STB=0.519009;TYPE=snp;VARB=0.0195407;OID=.;OPOS=26613329;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:285:281:134:135:146:146:92:54:45:89:92:54:45:90 chr2 26614583 . T TA 662.5 PASS AO=108;DP=181;FAO=172;FDP=173;FR=.;FRO=1;FSAF=72;FSAR=100;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0108222;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=8.39199;QD=15.318;RBI=0.0766929;REFB=0.113185;REVB=-0.0759255;RO=50;SAF=48;SAR=60;SRF=30;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0917851;STB=0.503448;TYPE=ins;VARB=0.0158747;OID=.;OPOS=26614584;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:108:181:172:173:1:72:100:1:0:39:50:48:60:30:20 chr2 26647277 . T G 933.34 PASS AO=92;DP=93;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00305945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.07;QD=38.0955;RBI=0.0421944;REFB=0;REVB=0.0420833;RO=0;SAF=31;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000543006;OID=.;OPOS=26647277;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:93:98:0:0:92:98:61:31:0:0:65:33:0:0 chr2 26653457 . G A 1918.58 PASS AO=197;DP=198;FAO=199;FDP=199;FR=.;FRO=0;FSAF=151;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0401932;FXX=0.00499975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.172;QD=38.5645;RBI=0.0402673;REFB=0;REVB=-0.00244179;RO=0;SAF=150;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.00149e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.07541e-05;OID=.;OPOS=26653457;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:198:199:0:0:197:199:47:150:0:0:48:151:0:0 chr2 26667615 . T C 1235.26 PASS AO=139;DP=151;FAO=140;FDP=147;FR=.;FRO=7;FSAF=83;FSAR=57;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.00602407;FXX=0.0328926;HRUN=4;LEN=1;MLLD=53.1693;QD=33.6126;RBI=0.0395048;REFB=-0.150211;REVB=0.0390428;RO=3;SAF=83;SAR=56;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0247848;STB=0.522009;TYPE=snp;VARB=-0.00094544;OID=.;OPOS=26667615;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:151:147:3:7:139:140:56:83:0:3:57:83:1:6 chr2 26676322 . A G 880.13 PASS AO=94;DP=98;FAO=96;FDP=99;FR=.;FRO=3;FSAF=53;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0693914;FXX=0.009999;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3793;QD=35.5608;RBI=0.0702283;REFB=0.0319316;REVB=-0.0108095;RO=4;SAF=53;SAR=41;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0245764;STB=0.506691;TYPE=snp;VARB=-0.00567765;OID=.;OPOS=26676322;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:98:99:4:3:94:96:41:53:1:3:43:53:1:2 chr2 26699126 . C G 137.52 PASS AO=22;DP=32;FAO=22;FDP=32;FR=.;FRO=10;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.0390515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2481;QD=17.1893;RBI=0.101208;REFB=-0.0436018;REVB=0.0933709;RO=9;SAF=10;SAR=12;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0650302;STB=0.517226;TYPE=snp;VARB=0.0151283;OID=.;OPOS=26699126;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:32:32:9:10:22:22:12:10:3:6:12:10:4:6 chr2 26699855 . G C 115.79 PASS AO=12;DP=34;FAO=12;FDP=33;FR=.,HEALED;FRO=12;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.00269987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.773;QD=14.0358;RBI=0.0348607;REFB=-0.0323539;REVB=0.034756;RO=14;SAF=9;SAR=3;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.319896;STB=0.642602;TYPE=snp;VARB=0.0275006;OID=.;OPOS=26699855;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:33:33:14:12:12:12:3:9:6:8:3:9:6:6 chr2 26700700 . G A 308.81 PASS AO=73;DP=153;FAO=74;FDP=152;FR=.;FRO=78;FSAF=31;FSAR=43;FSRF=31;FSRR=47;FWDB=-0.0165461;FXX=0.00653552;HRUN=4;LEN=1;MLLD=182.803;QD=8.12648;RBI=0.0231395;REFB=-0.00500179;REVB=0.016176;RO=78;SAF=31;SAR=42;SRF=31;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0261634;STB=0.511361;TYPE=snp;VARB=0.00493507;OID=.;OPOS=26700700;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:152:78:78:73:74:42:31:31:47:43:31:31:47 chr2 26739423 . T C 677.1 PASS AO=69;DP=69;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.037067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.422;QD=38.6914;RBI=0.0423889;REFB=0;REVB=-0.0205635;RO=0;SAF=26;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.33535e-05;OID=.;OPOS=26739423;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:69:70:0:0:69:70:43:26:0:0:43:27:0:0 chr2 26798893 . A T 119.08 PASS AO=24;DP=44;FAO=24;FDP=44;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.0273701;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.267;QD=10.8258;RBI=0.029134;REFB=0.00447747;REVB=-0.00998347;RO=20;SAF=4;SAR=20;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.35294;STB=0.699809;TYPE=snp;VARB=-0.00234141;OID=.;OPOS=26798893;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:44:44:20:20:24:24:20:4:10:10:20:4:10:10 chr2 26800422 . G A 182.72 PASS AO=46;DP=100;FAO=46;FDP=101;FR=.;FRO=55;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=31;FSRR=24;FWDB=-0.0121468;FXX=0.0194156;HRUN=3;LEN=1;MLLD=133.646;QD=7.23641;RBI=0.0155981;REFB=-0.0236579;REVB=0.00978548;RO=54;SAF=23;SAR=23;SRF=30;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0537615;STB=0.534638;TYPE=snp;VARB=0.026223;OID=.;OPOS=26800422;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:101:54:55:46:46:23:23:30:24:23:23:31:24 chr2 26804218 . G A 713.09 PASS AO=131;DP=133;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201368;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.998;QD=37.531;RBI=0.0224077;REFB=0;REVB=0.00982926;RO=1;SAF=38;SAR=93;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00508371;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.72746e-05;OID=.;OPOS=26804218;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:133:76:1:0:131:76:93:38:0:1:59:17:0:0 chr2 26846282 . T C 416.38 PASS AO=83;DP=158;FAO=90;FDP=168;FR=.;FRO=78;FSAF=40;FSAR=50;FSRF=31;FSRR=47;FWDB=0.0185758;FXX=0.0175428;HRUN=4;LEN=1;MLLD=41.0682;QD=9.91384;RBI=0.0301187;REFB=-0.0393485;REVB=-0.0237082;RO=75;SAF=37;SAR=46;SRF=30;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0403321;STB=0.522202;TYPE=snp;VARB=0.0326888;OID=.;OPOS=26846282;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:168:75:78:83:90:46:37:30:45:50:40:31:47 chr2 26951449 . G A 89.76 PASS AO=9;DP=14;FAO=12;FDP=14;FR=.;FRO=2;FSAF=12;FSAR=0;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0812026;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=174.522;QD=25.6444;RBI=0.0812026;REFB=0.0248016;REVB=0;RO=0;SAF=9;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000161333;OID=.;OPOS=26951449;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:10:14:0:2:9:12:0:9:0:0:0:12:2:0 chr2 27246285 . C T 1062.07 PASS AO=113;DP=115;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132594;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.127;QD=37.2657;RBI=0.0168229;REFB=0.121044;REVB=-0.0103537;RO=1;SAF=52;SAR=61;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00772076;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000154559;OID=.;OPOS=27246285;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:115:114:1:0:113:114:61:52:0:1:61:53:0:0 chr2 27246501 . AG A 450.24 PASS AO=51;DP=70;FAO=66;FDP=68;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=51;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.197078;FXX=0.0144907;HRUN=2;LEN=1;MLLD=19.2745;QD=26.4849;RBI=0.392958;REFB=-0.0843549;REVB=0.339965;RO=15;SAF=13;SAR=38;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0.287776;SSSB=0.0311059;STB=0.53124;TYPE=del;VARB=0.0169071;OID=.;OPOS=27246502;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:51:67:66:68:2:15:51:2:0:28:15:13:38:3:12 chr2 27260469 . G A 657.24 PASS AO=65;DP=65;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.112404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.0829;QD=38.1011;RBI=0.113567;REFB=0;REVB=0.0162111;RO=0;SAF=34;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.90682e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00117882;OID=.;OPOS=27260469;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:65:69:0:0:65:69:31:34:0:0:31:38:0:0 chr2 27261329 . A G 239.17 PASS AO=22;DP=23;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.691;QD=36.795;RBI=0.0181283;REFB=0;REVB=-0.0146968;RO=0;SAF=8;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.85943e-05;OID=.;OPOS=27261329;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:23:26:0:0:22:26:14:8:0:0:15:11:0:0 chr2 27290595 . A G 14.95 PASS AO=36;DP=226;FAO=33;FDP=226;FR=.;FRO=193;FSAF=24;FSAR=9;FSRF=77;FSRR=116;FWDB=-0.00230236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.343;QD=0.264627;RBI=0.00530541;REFB=-0.00454211;REVB=0.0047798;RO=184;SAF=27;SAR=9;SRF=69;SRR=115;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.461462;STB=0.767307;TYPE=snp;VARB=0.0350085;OID=.;OPOS=27290595;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:226:226:184:193:36:33:9:27:69:115:9:24:77:116 chr2 27303755 . A G 147.29 PASS AO=15;DP=15;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0529778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.788;QD=36.822;RBI=0.0532162;REFB=0;REVB=0.005032;RO=0;SAF=6;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000361342;OID=.;OPOS=27303755;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:16:0:0:15:16:9:6:0:0:9:7:0:0 chr2 27306455 . C T 219.86 PASS AO=41;DP=69;FAO=41;FDP=69;FR=.;FRO=28;FSAF=39;FSAR=2;FSRF=27;FSRR=1;FWDB=0.0353597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.9028;QD=12.7452;RBI=0.0420849;REFB=-0.01324;REVB=0.0228217;RO=28;SAF=39;SAR=2;SRF=27;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0552238;STB=0.530106;TYPE=snp;VARB=0.00695276;OID=.;OPOS=27306455;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:28:28:41:41:2:39:27:1:2:39:27:1 chr2 27315252 . G A 283.94 PASS AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0264207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.938;QD=34.4165;RBI=0.0317841;REFB=-0.13608;REVB=0.0176685;RO=1;SAF=19;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0345573;STB=0.518507;TYPE=snp;VARB=0.000963616;OID=.;OPOS=27315252;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:33:33:1:1:32:32:13:19:0:1:13:19:0:1 chr2 27323385 . C T 1023.35 PASS AO=111;DP=115;FAO=112;FDP=115;FR=.;FRO=3;FSAF=35;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0175928;FXX=0.00861995;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.527;QD=35.5947;RBI=0.0191489;REFB=-0.0236293;REVB=-0.00756133;RO=3;SAF=34;SAR=77;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0181363;STB=0.509552;TYPE=snp;VARB=-2.96551e-05;OID=.;OPOS=27323385;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:115:115:3:3:111:112:77:34:0:3:77:35:0:3 chr2 27327369 . T C 369.48 PASS AO=50;DP=127;FAO=54;FDP=129;FR=.,HEALED;FRO=54;FSAF=15;FSAR=39;FSRF=16;FSRR=38;FWDB=0.00667104;FXX=0.00769172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.297;QD=11.4567;RBI=0.0211611;REFB=-0.0155549;REVB=-0.020082;RO=53;SAF=9;SAR=41;SRF=16;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166923;STB=0.511417;TYPE=snp;VARB=0.0217729;OID=.;OPOS=27327369;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:129:53:54:50:54:41:9:16:37:39:15:16:38 chr2 27347000 . GC G 640.66 PASS AO=93;DP=125;FAO=116;FDP=117;FR=.;FRO=1;FSAF=72;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.213823;FXX=0.00847386;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.6067;QD=21.903;RBI=0.242067;REFB=-0.0584182;REVB=0.113473;RO=16;SAF=55;SAR=38;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0.38835;SSSB=-0.0276418;STB=0.505617;TYPE=del;VARB=0.0120146;OID=.;OPOS=27347001;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:93:113:116:117:1:72:44:0:1:42:16:55:38:11:5 chr2 27351948 . T G 1032.51 PASS AO=107;DP=108;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0910573;FXX=0.0183469;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.1342;QD=38.5986;RBI=0.0960442;REFB=0;REVB=0.030546;RO=0;SAF=53;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.66183e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000421934;OID=.;OPOS=27351948;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:108:107:0:0:107:107:54:53:0:0:54:53:0:0 chr2 27361137 . TG T 227.51 PASS AO=30;DP=44;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.200653;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=13.1867;QD=23.9483;RBI=0.219714;REFB=-0.00220205;REVB=0.0895115;RO=4;SAF=26;SAR=4;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0526565;STB=0.507932;TYPE=del;VARB=0.0140835;OID=.;OPOS=27361138;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:30:37:37:38:1:31:6:1:0:17:4:26:4:3:1 chr2 27424636 . G A 281.56 PASS AO=62;DP=119;FAO=62;FDP=120;FR=.;FRO=58;FSAF=24;FSAR=38;FSRF=13;FSRR=45;FWDB=0.132908;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2465;QD=9.38542;RBI=0.14103;REFB=-0.0264367;REVB=0.0471685;RO=57;SAF=24;SAR=38;SRF=13;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152249;STB=0.586201;TYPE=snp;VARB=0.0300616;OID=.;OPOS=27424636;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:120:57:58:62:62:38:24:13:44:38:24:13:45 chr2 27428295 . A G 786.67 PASS AO=79;DP=80;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0177066;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.3311;QD=37.9119;RBI=0.0389936;REFB=0;REVB=0.0347416;RO=0;SAF=42;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.96546e-05;OID=.;OPOS=27428295;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:80:83:0:0:79:83:37:42:0:0:40:43:0:0 chr2 27435250 . A G 296.74 PASS AO=28;DP=29;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00111496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.051;QD=37.0926;RBI=0.00942445;REFB=0;REVB=0.00935826;RO=0;SAF=22;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.0008e-05;OID=.;OPOS=27435250;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:29:32:0:0:28:32:6:22:0:0:9:23:0:0 chr2 27440742 . C T 191.22 PASS AO=32;DP=49;FAO=32;FDP=49;FR=.;FRO=17;FSAF=26;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=3;FWDB=0.0297226;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.712;QD=15.6101;RBI=0.0297581;REFB=-0.0196489;REVB=0.00145356;RO=17;SAF=26;SAR=6;SRF=14;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0115733;STB=0.506325;TYPE=snp;VARB=0.0183436;OID=.;OPOS=27440742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:49:49:17:17:32:32:6:26:14:3:6:26:14:3 chr2 27440785 . C T 406.3 PASS AO=56;DP=77;FAO=61;FDP=77;FR=.;FRO=16;FSAF=48;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=15;FWDB=0.00404713;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.427;QD=21.1064;RBI=0.0177994;REFB=-0.18559;REVB=0.0173331;RO=20;SAF=48;SAR=8;SRF=1;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.492274;STB=0.678381;TYPE=snp;VARB=0.00953784;OID=.;OPOS=27440785;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:77:77:20:16:56:61:8:48:1:19:13:48:1:15 chr2 27460968 . A G 146.57 PASS AO=21;DP=53;FAO=30;FDP=53;FR=.,HEALED;FRO=23;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=5;FSRR=18;FWDB=7.86494e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.452;QD=11.0619;RBI=0.00555806;REFB=-0.00810703;REVB=0.00555751;RO=22;SAF=8;SAR=13;SRF=4;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203748;STB=0.528035;TYPE=snp;VARB=0.0215015;OID=.;OPOS=27460968;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:53:53:22:23:21:30:13:8:4:18:22:8:5:18 chr2 27462076 . C T 180.4 PASS AO=26;DP=53;FAO=33;FDP=54;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=24;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.000659054;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=176.822;QD=13.3628;RBI=0.00101145;REFB=-0.0249103;REVB=-0.000767252;RO=10;SAF=8;SAR=18;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0661937;STB=0.528908;TYPE=snp;VARB=0.0106865;OID=.;OPOS=27462076;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:44:54:10:21:26:33:18:8:2:8:24:9:7:14 chr2 27550980 . AC A 60.52 PASS AO=68;DP=196;FAO=70;FDP=205;FR=.;FRO=135;FSAF=4;FSAR=66;FSRF=20;FSRR=115;FWDB=0.0686438;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=11.0188;QD=1.18096;RBI=0.13637;REFB=-0.0759061;REVB=-0.117834;RO=109;SAF=6;SAR=62;SRF=15;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0.472222;SSSB=-0.142629;STB=0.68624;TYPE=del;VARB=0.109574;OID=.;OPOS=27550981;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:68:197:70:205:135:4:66:20:115:60:109:6:62:15:94 chr2 27558252 . A G 39.46 PASS AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=-0.120068;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=161.404;QD=7.17519;RBI=0.129606;REFB=-0.0202288;REVB=-0.0487991;RO=12;SAF=6;SAR=3;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.453824;STB=0.777253;TYPE=snp;VARB=0.0532327;OID=.;OPOS=27558252;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:21:22:12:13:9:9:3:6:2:10:3:6:2:11 chr2 27587266 . G A 114.03 PASS AO=33;DP=85;FAO=33;FDP=83;FR=.;FRO=50;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=-0.0223914;FXX=0.0235266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.7306;QD=5.49533;RBI=0.041084;REFB=-0.0164618;REVB=0.0344459;RO=49;SAF=22;SAR=11;SRF=26;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151042;STB=0.593162;TYPE=snp;VARB=0.0363259;OID=.;OPOS=27587266;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:83:49:50:33:33:11:22:26:23:11:22:26:24 chr2 27590978 . TG T 318.99 PASS AO=38;DP=53;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0181004;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=15.1686;QD=25.5192;RBI=0.350718;REFB=-0.0118263;REVB=0.350251;RO=9;SAF=27;SAR=11;SRF=1;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0.508475;SSSB=0.231018;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0141616;OID=.;OPOS=27590979;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:38:50:50:50:0:28:22:0:0:26:9:27:11:1:8 chr2 27599875 . T G 71.2 PASS AO=22;DP=60;FAO=22;FDP=61;FR=.;FRO=39;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=28;FWDB=-0.0142999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.022;QD=4.66861;RBI=0.016306;REFB=0.00278834;REVB=0.00783583;RO=37;SAF=10;SAR=12;SRF=9;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.239639;STB=0.613401;TYPE=snp;VARB=-0.00776349;OID=.;OPOS=27599875;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:60:61:37:39:22:22:12:10:9:28:12:10:11:28 chr2 27601054 . A T 32.53 PASS AO=7;DP=23;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=0.00317766;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.052;QD=5.91449;RBI=0.0410824;REFB=-0.00184851;REVB=-0.0409593;RO=14;SAF=4;SAR=3;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.376308;STB=0.681423;TYPE=snp;VARB=0.00201289;OID=.;OPOS=27601054;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:23:22:14:14:7:8:3:4:3:11:4:4:3:11 chr2 27632211 . AG A 29.71 PASS AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=0.0123349;FXX=0.0384468;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.4982;QD=4.75309;RBI=0.0180021;REFB=-0.0645181;REVB=-0.013112;RO=12;SAF=5;SAR=7;SRF=1;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.322725;STB=0.612737;TYPE=del;VARB=0.0576828;OID=.;OPOS=27632212;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:12:26:12:25:13:4:8:2:11:29:12:5:7:1:11 chr2 27667297 . A G 232.07 PASS AO=54;DP=114;FAO=55;FDP=114;FR=.;FRO=59;FSAF=33;FSAR=22;FSRF=16;FSRR=43;FWDB=0.0143517;FXX=0.0086949;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.8312;QD=8.14262;RBI=0.0171011;REFB=-0.0133289;REVB=-0.00929925;RO=59;SAF=32;SAR=22;SRF=16;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.295565;STB=0.665472;TYPE=snp;VARB=0.0194196;OID=.;OPOS=27667297;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:59:59:54:55:22:32:16:43:22:33:16:43 chr2 27676287 . A T 108.92 PASS AO=26;DP=56;FAO=26;FDP=56;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=-0.00473201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.565;QD=7.78003;RBI=0.00689031;REFB=-0.00362206;REVB=-0.00500843;RO=30;SAF=10;SAR=16;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234422;STB=0.632052;TYPE=snp;VARB=0.00372263;OID=.;OPOS=27676287;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:30:30:26:26:16:10:19:11:16:10:19:11 chr2 27715016 . GGC G,GG 441.66 PASS AO=25,40;DP=136;FAO=0,110;FDP=111;FR=.;FRO=1;FSAF=0,53;FSAR=0,57;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.151324,-0.302055;FXX=0.0347796;HRUN=4,5;LEN=2,1;MLLD=9.11226,10.7331;QD=15.9156;RBI=0.509947,0.365179;REFB=0.106974,-0.0702613;REVB=-0.486977,-0.205229;RO=5;SAF=0,32;SAR=25,8;SRF=2;SRR=3;SSEN=0.6,0.334694;SSEP=0,0;SSSB=-0.862056,0.119189;STB=0.5,0.504672;TYPE=del,del;VARB=0,0.00939352;OID=.,.;OPOS=27715017,27715018;OREF=GC,C;OALT=-,-;OMAPALT=G,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:25,40:107:0,110:111:1:0,53:0,57:1:0:24:5:0,32:25,8:2:3 chr2 27715207 . T A 206.16 PASS AO=56;DP=145;FAO=63;FDP=153;FR=.;FRO=90;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=52;FSRR=38;FWDB=0.0300122;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.483;QD=5.38984;RBI=0.0606197;REFB=-0.0333494;REVB=0.0526689;RO=89;SAF=35;SAR=21;SRF=52;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0464262;STB=0.503816;TYPE=snp;VARB=0.0645872;OID=.;OPOS=27715207;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:153:89:90:56:63:21:35:52:37:27:36:52:38 chr2 27730940 . T C 94.69 PASS AO=23;DP=58;FAO=25;FDP=60;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=-0.0208909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.253;QD=6.31253;RBI=0.0505196;REFB=-0.0154789;REVB=-0.0459978;RO=34;SAF=12;SAR=11;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0695922;STB=0.530097;TYPE=snp;VARB=0.0239486;OID=.;OPOS=27730940;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:58:60:34:35:23:25:11:12:20:14:12:13:20:15 chr2 27802485 . C T 180.37 PASS AO=33;DP=54;FAO=33;FDP=54;FR=.;FRO=21;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=19;FWDB=0.015906;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.89;QD=13.3605;RBI=0.016159;REFB=0.00882364;REVB=0.00284865;RO=21;SAF=17;SAR=16;SRF=2;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.297197;STB=0.661758;TYPE=snp;VARB=-0.00896407;OID=.;OPOS=27802485;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:54:54:21:21:33:33:16:17:2:19:16:17:2:19 chr2 27873415 . G A 1672.52 PASS AO=178;DP=179;FAO=181;FDP=181;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00285851;FXX=0.0109284;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.9944;QD=36.9618;RBI=0.0156343;REFB=-0.0596228;REVB=-0.0153707;RO=1;SAF=87;SAR=91;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00544061;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000460763;OID=.;OPOS=27873415;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:179:181:1:0:178:181:91:87:1:0:94:87:0:0 chr2 27887034 . C A 664.69 PASS AO=85;DP=99;FAO=85;FDP=99;FR=.;FRO=14;FSAF=41;FSAR=44;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=0.0242431;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=222.597;QD=26.8562;RBI=0.0314702;REFB=-0.165473;REVB=0.020066;RO=1;SAF=41;SAR=44;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106453;STB=0.532756;TYPE=snp;VARB=0.00167808;OID=.;OPOS=27887034;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:99:99:1:14:85:85:44:41:0:1:44:41:10:4 chr2 28634790 . G A 456.35 PASS AO=117;DP=253;FAO=117;FDP=252;FR=.;FRO=135;FSAF=61;FSAR=56;FSRF=48;FSRR=87;FWDB=0.0131623;FXX=0.00395241;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.35;QD=7.24361;RBI=0.015417;REFB=-0.0138072;REVB=0.00802738;RO=130;SAF=61;SAR=56;SRF=48;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144721;STB=0.588304;TYPE=snp;VARB=0.0150076;OID=.;OPOS=28634790;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:253:252:130:135:117:117:56:61:48:82:56:61:48:87 chr2 28635740 . T C 166.3 PASS AO=53;DP=159;FAO=57;FDP=158;FR=.;FRO=101;FSAF=8;FSAR=49;FSRF=39;FSRR=62;FWDB=-0.052994;FXX=0.00628891;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.5119;QD=4.21006;RBI=0.0666066;REFB=-0.00484704;REVB=-0.0403493;RO=104;SAF=6;SAR=47;SRF=40;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.447192;STB=0.721626;TYPE=snp;VARB=0.00756922;OID=.;OPOS=28635740;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:158:104:101:53:57:47:6:40:64:49:8:39:62 chr2 29001691 . A G 234.06 PASS AO=63;DP=145;FAO=63;FDP=144;FR=.;FRO=81;FSAF=45;FSAR=18;FSRF=54;FSRR=27;FWDB=-0.029613;FXX=0.00689608;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.955;QD=6.50168;RBI=0.0333606;REFB=-0.0155526;REVB=-0.0153623;RO=80;SAF=45;SAR=18;SRF=54;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0470564;STB=0.531905;TYPE=snp;VARB=0.022261;OID=.;OPOS=29001691;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:144:80:81:63:63:18:45:54:26:18:45:54:27 chr2 29023749 . A G 636.47 PASS AO=127;DP=233;FAO=133;FDP=235;FR=.;FRO=102;FSAF=76;FSAR=57;FSRF=51;FSRR=51;FWDB=-0.000773961;FXX=0.00423711;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.3402;QD=10.8335;RBI=0.0704225;REFB=0.000420936;REVB=-0.0704183;RO=103;SAF=74;SAR=53;SRF=52;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0650118;STB=0.531361;TYPE=snp;VARB=-0.000844454;OID=.;OPOS=29023749;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:233:235:103:102:127:133:53:74:52:51:57:76:51:51 chr2 29092679 . T C 359.83 PASS AO=76;DP=141;FAO=76;FDP=140;FR=.;FRO=64;FSAF=9;FSAR=67;FSRF=1;FSRR=63;FWDB=-0.0185163;FXX=0.0140835;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.342;QD=10.2808;RBI=0.0187302;REFB=-0.0166695;REVB=0.00282255;RO=63;SAF=9;SAR=67;SRF=1;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.250074;STB=0.635842;TYPE=snp;VARB=0.0100181;OID=.;OPOS=29092679;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:140:63:64:76:76:67:9:1:62:67:9:1:63 chr2 29092850 . G T 117.81 PASS AO=29;DP=87;FAO=35;FDP=90;FR=.;FRO=55;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=14;FSRR=41;FWDB=-0.0135897;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=180.096;QD=5.236;RBI=0.0136747;REFB=-0.0245966;REVB=0.00152265;RO=35;SAF=10;SAR=19;SRF=11;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0331988;STB=0.543702;TYPE=snp;VARB=0.0328012;OID=.;OPOS=29092850;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:90:35:55:29:35:19:10:11:24:24:11:14:41 chr2 29135468 . C G 1128.54 PASS AO=110;DP=110;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0298435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.218;QD=38.2555;RBI=0.0298447;REFB=0;REVB=0.000268872;RO=0;SAF=40;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.74501e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.6277e-05;OID=.;OPOS=29135468;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:110:118:0:0:110:118:70:40:0:0:78:40:0:0 chr2 29152456 . A G 1510.49 PASS AO=163;DP=166;FAO=163;FDP=166;FR=.;FRO=3;FSAF=90;FSAR=73;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0445334;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.9828;QD=36.3973;RBI=0.0454933;REFB=0.0237868;REVB=-0.00929576;RO=3;SAF=90;SAR=73;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00759907;STB=0.503994;TYPE=snp;VARB=-0.00193711;OID=.;OPOS=29152456;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:166:166:3:3:163:163:73:90:1:2:73:90:1:2 chr2 29169612 . T C 195.16 PASS AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0419973;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=92.8395;QD=37.1725;RBI=0.044585;REFB=0;REVB=-0.0149682;RO=0;SAF=1;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.78928e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000434637;OID=.;OPOS=29169612;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:21:21:0:0:21:21:20:1:0:0:20:1:0:0 chr2 29221040 . C T 298.12 PASS AO=73;DP=160;FAO=74;FDP=158;FR=.;FRO=84;FSAF=19;FSAR=55;FSRF=15;FSRR=69;FWDB=0.075629;FXX=0.122215;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.6407;QD=7.54737;RBI=0.0761484;REFB=-0.0157792;REVB=-0.00887871;RO=76;SAF=19;SAR=54;SRF=14;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0964361;STB=0.557487;TYPE=snp;VARB=0.016704;OID=.;OPOS=29221040;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:158:76:84:73:74:54:19:14:62:55:19:15:69 chr2 29222070 . GC G,AC 244.09 PASS AO=22,10;DP=50;FAO=25,19;FDP=46;FR=.;FRO=2;FSAF=25,11;FSAR=0,8;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.134055,0.0367745;FXX=0.079984;HRUN=3,1;LEN=1,1;MLLD=11.1084,196.677;QD=21.2252;RBI=0.141794,0.0372534;REFB=-0.0406038,-0.0966099;REVB=0.0462045,0.00595428;RO=5;SAF=22,2;SAR=0,8;SRF=3;SRR=2;SSEN=0.276995,0;SSEP=0.444816,0;SSSB=0.855796,-0.287934;STB=0.999251,0.555497;TYPE=del,snp;VARB=0.0274644,0.0578603;OID=.,.;OPOS=29222071,29222070;OREF=C,G;OALT=-,A;OMAPALT=G,AC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:63:40:46:5:2:22,10:25,19:0,8:22,2:3:2:0,8:25,11:0:2 chr2 29226498 . G A 256.86 PASS AO=18;DP=28;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.089996;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.6112;QD=38.053;RBI=0.0918302;REFB=0;REVB=0.018262;RO=0;SAF=0;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0015641;OID=.;OPOS=29226498;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:19:27:0:0:18:27:18:0:0:0:26:1:0:0 chr2 29226512 . A G 239.09 PASS AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.162;QD=36.7838;RBI=0.0124529;REFB=0;REVB=-0.0124529;RO=0;SAF=0;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000478493;OID=.;OPOS=29226512;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:25:26:0:0:25:26:25:0:0:0:26:0:0:0 chr2 29240060 . A G 355.7 PASS AO=117;DP=305;FAO=117;FDP=306;FR=.;FRO=189;FSAF=67;FSAR=50;FSRF=80;FSRR=109;FWDB=-0.0144957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.958;QD=4.64964;RBI=0.0236781;REFB=-0.0215434;REVB=0.0187224;RO=188;SAF=67;SAR=50;SRF=80;SRR=108;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160416;STB=0.591719;TYPE=snp;VARB=0.0330071;OID=.;OPOS=29240060;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:305:306:188:189:117:117:50:67:80:108:50:67:80:109 chr2 29240673 . G A 240.28 PASS AO=87;DP=243;FAO=88;FDP=251;FR=.;FRO=163;FSAF=9;FSAR=79;FSRF=24;FSRR=139;FWDB=-0.0337775;FXX=0.0456256;HRUN=4;LEN=1;MLLD=149.393;QD=3.82911;RBI=0.0343188;REFB=-0.0176042;REVB=-0.00607114;RO=150;SAF=8;SAR=79;SRF=17;SRR=133;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.066595;STB=0.570567;TYPE=snp;VARB=0.033767;OID=.;OPOS=29240673;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:243:251:150:163:87:88:79:8:17:133:79:9:24:139 chr2 29240686 . A C 236.42 PASS AO=81;DP=225;FAO=82;FDP=224;FR=.;FRO=142;FSAF=10;FSAR=72;FSRF=21;FSRR=121;FWDB=0.00967772;FXX=0.0132153;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.286;QD=4.22178;RBI=0.0173983;REFB=0.0016025;REVB=-0.0144583;RO=141;SAF=9;SAR=72;SRF=21;SRR=120;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0969877;STB=0.536271;TYPE=snp;VARB=-0.00170392;OID=.;OPOS=29240686;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:225:224:141:142:81:82:72:9:21:120:72:10:21:121 chr2 29240783 . A G 124.68 PASS AO=27;DP=53;FAO=27;FDP=53;FR=.;FRO=26;FSAF=1;FSAR=26;FSRF=3;FSRR=23;FWDB=-0.0543131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.67;QD=9.40955;RBI=0.0584445;REFB=-0.0176094;REVB=-0.0215833;RO=26;SAF=1;SAR=26;SRF=3;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.311211;STB=0.679564;TYPE=snp;VARB=0.00822563;OID=.;OPOS=29240783;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:26:26:27:27:26:1:3:23:26:1:3:23 chr2 29246044 . T C 34.82 PASS AO=13;DP=45;FAO=13;FDP=45;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=-0.137835;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.926;QD=3.09526;RBI=0.141858;REFB=-0.0107349;REVB=-0.033544;RO=31;SAF=7;SAR=6;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137554;STB=0.59308;TYPE=snp;VARB=0.0357753;OID=.;OPOS=29246044;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:45:45:31:32:13:13:6:7:13:18:6:7:13:19 chr2 29286509 . T C 1900.95 PASS AO=199;DP=202;FAO=201;FDP=201;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=142;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0485776;FXX=0.0195112;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.923;QD=37.8299;RBI=0.0730995;REFB=-0.0653056;REVB=-0.0546238;RO=2;SAF=59;SAR=140;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00675522;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000618922;OID=.;OPOS=29286509;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:82:202:201:2:0:199:201:140:59:0:2:142:59:0:0 chr2 29287926 . C CGCT 168.26 PASS AO=21;DP=28;FAO=22;FDP=26;FR=.;FRO=4;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0245134;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=197.218;QD=25.8862;RBI=0.0334637;REFB=-0.0236187;REVB=0.0227796;RO=7;SAF=4;SAR=17;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233903;STB=0.556021;TYPE=ins;VARB=0.00471674;OID=.;OPOS=29287927;OREF=-;OALT=GCT;OMAPALT=CGCT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:21:28:22:26:4:5:17:2:2:7:7:4:17:4:3 chr2 29294629 . C T 1240.48 PASS AO=130;DP=131;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0304105;FXX=0.00763301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.789;QD=38.1687;RBI=0.0310585;REFB=0;REVB=0.00631116;RO=0;SAF=73;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.91806e-05;OID=.;OPOS=29294629;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:131:130:0:0:130:130:57:73:0:0:57:73:0:0 chr2 29294754 . G C 1037.77 PASS AO=139;DP=140;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00928773;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.865;QD=37.3972;RBI=0.0096653;REFB=-0.0150556;REVB=0.0026751;RO=1;SAF=65;SAR=74;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00638196;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.27647e-05;OID=.;OPOS=29294754;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:140:111:1:0:139:111:74:65:0:1:58:53:0:0 chr2 29295016 . A G 344.85 PASS AO=38;DP=41;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0819447;FXX=0.0487686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.509;QD=35.369;RBI=0.0822166;REFB=-0.0821954;REVB=0.00668073;RO=0;SAF=5;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.545429;TYPE=snp;VARB=0.00126117;OID=.;OPOS=29295016;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:41:39:0:1:38:38:33:5:0:0:33:5:1:0 chr2 29295676 . G A 1154.72 PASS AO=121;DP=121;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0720412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5877;QD=37.8597;RBI=0.0787831;REFB=0;REVB=-0.031888;RO=0;SAF=57;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.75944e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000264729;OID=.;OPOS=29295676;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:121:122:0:0:121:122:64:57:0:0:64:58:0:0 chr2 29295746 . A G 196.28 PASS AO=44;DP=87;FAO=44;FDP=87;FR=.;FRO=43;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=12;FSRR=31;FWDB=0.0114174;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.797;QD=9.02434;RBI=0.0139703;REFB=-0.00366871;REVB=-0.00805068;RO=43;SAF=18;SAR=26;SRF=12;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123415;STB=0.568077;TYPE=snp;VARB=0.00692582;OID=.;OPOS=29295746;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:43:43:44:44:26:18:12:31:26:18:12:31 chr2 29296870 . C T 1375.9 PASS AO=138;DP=153;FAO=157;FDP=165;FR=.;FRO=8;FSAF=77;FSAR=80;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.105286;FXX=0.0119753;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.3653;QD=33.3551;RBI=0.105874;REFB=-0.0123245;REVB=0.0111502;RO=15;SAF=58;SAR=80;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0340244;STB=0.511666;TYPE=snp;VARB=0.0121732;OID=.;OPOS=29296870;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:153:165:15:8:138:157:80:58:9:6:80:77:2:6 chr2 29297068 . C T 1055.95 PASS AO=108;DP=109;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0361724;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.254;QD=37.3789;RBI=0.0408529;REFB=0;REVB=0.0189873;RO=0;SAF=51;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60583e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.5348e-05;OID=.;OPOS=29297068;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:109:113:0:0:108:113:57:51:0:0:59:54:0:0 chr2 29356567 . G C 460.23 PASS AO=126;DP=285;FAO=126;FDP=286;FR=.;FRO=160;FSAF=63;FSAR=63;FSRF=90;FSRR=70;FWDB=0.0353172;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=65.2452;QD=6.43678;RBI=0.0404952;REFB=0.00807303;REVB=0.0198131;RO=159;SAF=63;SAR=63;SRF=90;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0664577;STB=0.534959;TYPE=snp;VARB=-0.0172776;OID=.;OPOS=29356567;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:285:286:159:160:126:126:63:63:90:69:63:63:90:70 chr2 29356669 . A G 350.93 PASS AO=76;DP=144;FAO=76;FDP=143;FR=.;FRO=67;FSAF=22;FSAR=54;FSRF=18;FSRR=49;FWDB=0.00519148;FXX=0.0205465;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.959;QD=9.81632;RBI=0.0265996;REFB=-0.0135092;REVB=-0.026088;RO=63;SAF=22;SAR=54;SRF=14;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0701431;STB=0.511972;TYPE=snp;VARB=0.016304;OID=.;OPOS=29356669;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:143:63:67:76:76:54:22:14:49:54:22:18:49 chr2 29383256 . G T 538.68 PASS AO=142;DP=315;FAO=143;FDP=316;FR=.;FRO=173;FSAF=66;FSAR=77;FSRF=90;FSRR=83;FWDB=0.0273132;FXX=0.00628911;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.617;QD=6.81875;RBI=0.0273298;REFB=-0.00196581;REVB=0.000952412;RO=165;SAF=66;SAR=76;SRF=88;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0667217;STB=0.532159;TYPE=snp;VARB=0.0017635;OID=.;OPOS=29383256;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:315:316:165:173:142:143:76:66:88:77:77:66:90:83 chr2 29416025 . C CATTG 380.27 PASS AO=127;DP=375;FAO=135;FDP=368;FR=.;FRO=233;FSAF=57;FSAR=78;FSRF=103;FSRR=130;FWDB=0.00813673;FXX=0.0186662;HRUN=1;LEN=4;MLLD=250.255;QD=4.13338;RBI=0.016173;REFB=0.00858746;REVB=-0.0139771;RO=232;SAF=56;SAR=71;SRF=102;SRR=130;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00148982;STB=0.512819;TYPE=ins;VARB=-0.016602;OID=.;OPOS=29416026;OREF=-;OALT=ATTG;OMAPALT=CATTG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:127:375:135:368:233:57:78:103:130:99:232:56:71:102:130 chr2 29416366 . G C 588.79 PASS AO=138;DP=276;FAO=139;FDP=279;FR=.;FRO=140;FSAF=80;FSAR=59;FSRF=71;FSRR=69;FWDB=-0.0365103;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5066;QD=8.44138;RBI=0.0439357;REFB=-0.0136332;REVB=0.0244406;RO=138;SAF=80;SAR=58;SRF=71;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0603317;STB=0.534749;TYPE=snp;VARB=0.0118711;OID=.;OPOS=29416366;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:276:279:138:140:138:139:58:80:71:67:59:80:71:69 chr2 29416481 . T C 328.79 PASS AO=68;DP=185;FAO=96;FDP=211;FR=.;FRO=115;FSAF=51;FSAR=45;FSRF=55;FSRR=60;FWDB=0.116651;FXX=0.0231471;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.882;QD=6.23304;RBI=0.119227;REFB=-0.0228411;REVB=0.0246528;RO=117;SAF=24;SAR=44;SRF=57;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154775;STB=0.528883;TYPE=snp;VARB=0.0329454;OID=.;OPOS=29416481;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:211:117:115:68:96:44:24:57:60:45:51:55:60 chr2 29416572 . T C 1090.39 PASS AO=114;DP=114;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0129399;FXX=0.0172399;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3268;QD=38.2593;RBI=0.0624012;REFB=0;REVB=0.0610448;RO=0;SAF=43;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43709e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000292389;OID=.;OPOS=29416572;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:114:114:0:0:114:114:71:43:0:0:71:43:0:0 chr2 29444095 . C T 987.96 PASS AO=109;DP=114;FAO=110;FDP=114;FR=.;FRO=4;FSAF=22;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.030844;FXX=0.0086949;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.887;QD=34.6652;RBI=0.0308653;REFB=0.00904421;REVB=-0.00114627;RO=4;SAF=22;SAR=87;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.021324;STB=0.511109;TYPE=snp;VARB=3.93511e-05;OID=.;OPOS=29444095;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:114:114:4:4:109:110:87:22:0:4:88:22:0:4 chr2 29449819 . C T 49.43 PASS AO=15;DP=43;FAO=15;FDP=43;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.00233676;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.253;QD=4.59795;RBI=0.00234051;REFB=-0.0120389;REVB=0.000132415;RO=27;SAF=8;SAR=7;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136651;STB=0.590651;TYPE=snp;VARB=0.018841;OID=.;OPOS=29449819;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:43:43:27:28:15:15:7:8:11:16:7:8:11:17 chr2 29455267 . A G 1555.71 PASS AO=162;DP=162;FAO=163;FDP=163;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0273036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.622;QD=38.1769;RBI=0.0277415;REFB=0;REVB=-0.00490927;RO=0;SAF=69;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.28947e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.81472e-05;OID=.;OPOS=29455267;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:162:163:0:0:162:163:93:69:0:0:93:70:0:0 chr2 29543663 . T C 1397.57 PASS AO=146;DP=146;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=131;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0028908;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.509;QD=38.2895;RBI=0.0153771;REFB=0;REVB=0.015103;RO=0;SAF=131;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.3046e-05;OID=.;OPOS=29543663;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:146:146:0:0:146:146:15:131:0:0:15:131:0:0 chr2 29903931 . T A 892.75 PASS AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0522232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.764;QD=37.9895;RBI=0.151451;REFB=0;REVB=0.142162;RO=0;SAF=62;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.26736e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00137995;OID=.;OPOS=29903931;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:94:94:0:0:94:94:32:62:0:0:32:62:0:0 chr2 29940529 . A T 865.64 PASS AO=94;DP=96;FAO=94;FDP=96;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=60;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00806061;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.744;QD=36.0683;RBI=0.0322701;REFB=-0.144216;REVB=-0.0312471;RO=1;SAF=34;SAR=60;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00783785;STB=0.503114;TYPE=snp;VARB=0.00150596;OID=.;OPOS=29940529;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:96:96:1:2:94:94:60:34:0:1:60:34:1:1 chr2 30381505 . T C 1836.75 PASS AO=195;DP=197;FAO=195;FDP=195;FR=.;FRO=0;FSAF=126;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000292872;FXX=0.0101518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5268;QD=37.6768;RBI=0.0334451;REFB=-0.100836;REVB=0.0334438;RO=0;SAF=126;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000640997;OID=.;OPOS=30381505;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:197:195:0:0:195:195:69:126:0:0:69:126:0:0 chr2 30482099 . G A 144.85 PASS AO=37;DP=81;FAO=37;FDP=83;FR=.;FRO=46;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=39;FSRR=7;FWDB=0.00177186;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=101.767;QD=6.98056;RBI=0.0132939;REFB=-0.0157709;REVB=0.0131753;RO=44;SAF=23;SAR=14;SRF=37;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24407;STB=0.642421;TYPE=snp;VARB=0.0279765;OID=.;OPOS=30482099;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:83:44:46:37:37:14:23:37:7:14:23:39:7 chr2 30863651 . A T 291.2 PASS AO=85;DP=195;FAO=86;FDP=195;FR=.;FRO=109;FSAF=41;FSAR=45;FSRF=44;FSRR=65;FWDB=0.0206645;FXX=0.00510178;HRUN=2;LEN=1;MLLD=37.9564;QD=5.97338;RBI=0.0293568;REFB=-0.0206519;REVB=-0.0208518;RO=73;SAF=41;SAR=44;SRF=29;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0722129;STB=0.541082;TYPE=snp;VARB=0.0263433;OID=.;OPOS=30863651;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:195:73:109:85:86:44:41:29:44:45:41:44:65 chr2 30864768 . T C 52.28 PASS AO=15;DP=46;FAO=16;FDP=46;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.00155152;FXX=0;HRUN=11;LEN=1;MLLD=152.43;QD=4.54601;RBI=0.00480363;REFB=0.00977728;REVB=0.00454617;RO=30;SAF=7;SAR=8;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148844;STB=0.543424;TYPE=snp;VARB=-0.0144818;OID=.;OPOS=30864768;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:46:46:30:30:15:16:8:7:18:12:8:8:17:13 chr2 30864789 . G A 97.45 PASS AO=29;DP=67;FAO=29;FDP=75;FR=.;FRO=46;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=30;FWDB=-0.00901954;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.7674;QD=5.19711;RBI=0.016237;REFB=-0.00437638;REVB=0.0135014;RO=35;SAF=20;SAR=9;SRF=10;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.383772;STB=0.706382;TYPE=snp;VARB=0.0220822;OID=.;OPOS=30864789;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:67:75:35:46:29:29:9:20:10:25:9:20:16:30 chr2 30975961 . G T 2043.67 PASS AO=204;DP=206;FAO=216;FDP=216;FR=.;FRO=0;FSAF=118;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0995922;FXX=0.00460808;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.7722;QD=37.8457;RBI=0.141807;REFB=0;REVB=0.100948;RO=2;SAF=107;SAR=97;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000454358;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000637436;OID=.;OPOS=30975961;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:206:216:2:0:204:216:97:107:1:1:98:118:0:0 chr2 31178818 . C T 96.11 PASS AO=26;DP=63;FAO=26;FDP=63;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.0352337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.427;QD=6.10212;RBI=0.0370747;REFB=-0.0092997;REVB=0.0115379;RO=37;SAF=11;SAR=15;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.066033;STB=0.537672;TYPE=snp;VARB=0.0141829;OID=.;OPOS=31178818;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:63:63:37:37:26:26:15:11:18:19:15:11:18:19 chr2 31414807 . C G 820.14 PASS AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0575926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.682;QD=38.1458;RBI=0.0597315;REFB=0;REVB=-0.0158414;RO=0;SAF=29;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000152162;OID=.;OPOS=31414807;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:86:86:0:0:86:86:57:29:0:0:57:29:0:0 chr2 31423443 . G A 668.27 PASS AO=145;DP=273;FAO=146;FDP=273;FR=.;FRO=127;FSAF=45;FSAR=101;FSRF=41;FSRR=86;FWDB=0.0030655;FXX=0.0036495;HRUN=3;LEN=1;MLLD=182.364;QD=9.79147;RBI=0.0184536;REFB=-0.00604972;REVB=-0.0181972;RO=125;SAF=45;SAR=100;SRF=41;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0173774;STB=0.507922;TYPE=snp;VARB=0.00433274;OID=.;OPOS=31423443;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:273:273:125:127:145:146:100:45:41:84:101:45:41:86 chr2 31451224 . G C 413.85 PASS AO=111;DP=255;FAO=113;FDP=257;FR=.;FRO=144;FSAF=52;FSAR=61;FSRF=58;FSRR=86;FWDB=0.0389237;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4176;QD=6.44122;RBI=0.0462638;REFB=-0.0170585;REVB=0.0250057;RO=141;SAF=50;SAR=61;SRF=56;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0546037;STB=0.532529;TYPE=snp;VARB=0.0241996;OID=.;OPOS=31451224;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:255:257:141:144:111:113:61:50:56:85:61:52:58:86 chr2 31490716 . C G 186.5 PASS AO=36;DP=67;FAO=38;FDP=69;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=27;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=0.141085;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.2741;QD=10.8115;RBI=0.143021;REFB=0.0294844;REVB=-0.0234547;RO=31;SAF=10;SAR=26;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136879;STB=0.566892;TYPE=snp;VARB=-0.0230621;OID=.;OPOS=31490716;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:69:31:31:36:38:26:10:13:18:27:11:13:18 chr2 31491075 . A G 338.95 PASS AO=72;DP=134;FAO=72;FDP=133;FR=.;FRO=61;FSAF=36;FSAR=36;FSRF=20;FSRR=41;FWDB=0.0240267;FXX=0.00746213;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.63;QD=10.194;RBI=0.0240286;REFB=-0.00699285;REVB=0.000301622;RO=60;SAF=36;SAR=36;SRF=20;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138689;STB=0.578926;TYPE=snp;VARB=0.005454;OID=.;OPOS=31491075;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:133:60:61:72:72:36:36:20:40:36:36:20:41 chr2 31571161 . GC G 126.42 PASS AO=32;DP=68;FAO=42;FDP=67;FR=.;FRO=25;FSAF=3;FSAR=39;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.228063;FXX=0.0147037;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.8473;QD=7.5476;RBI=0.247136;REFB=-0.036643;REVB=-0.0952024;RO=21;SAF=0;SAR=32;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0.396226;SSSB=-0.86289;STB=0.789292;TYPE=del;VARB=0.0592696;OID=.;OPOS=31571162;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:32:67:42:67:25:3:39:12:13:37:21:0:32:11:10 chr2 31571786 . A G 1293.33 PASS AO=132;DP=133;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00910755;FXX=0.0684885;HRUN=3;LEN=1;MLLD=184.473;QD=38.039;RBI=0.0175863;REFB=0;REVB=-0.0150443;RO=0;SAF=80;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00140386;OID=.;OPOS=31571786;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:133:136:0:0:132:136:52:80:0:0:52:84:0:0 chr2 31805706 . G C 101.96 PASS AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0693161;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.206;QD=37.0753;RBI=0.124177;REFB=0;REVB=0.103031;RO=0;SAF=6;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00358889;OID=.;OPOS=31805706;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:11:11:5:6:0:0:5:6:0:0 chr2 32475109 . G A 1681 PASS AO=183;DP=189;FAO=184;FDP=184;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180564;FXX=0.0264536;HRUN=3;LEN=1;MLLD=205.599;QD=36.5435;RBI=0.0285896;REFB=0.000651685;REVB=0.022166;RO=1;SAF=64;SAR=119;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0039845;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000102537;OID=.;OPOS=32475109;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:189:184:1:0:183:184:119:64:0:1:119:65:0:0 chr2 32476390 . T G 786.11 PASS AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0232207;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.906;QD=37.8848;RBI=0.0282842;REFB=0;REVB=0.0161491;RO=0;SAF=36;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.89853e-05;OID=.;OPOS=32476390;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:83:83:0:0:83:83:47:36:0:0:47:36:0:0 chr2 32481794 . T A 1315.85 PASS AO=9;DP=11;FAO=142;FDP=144;FR=.;FRO=2;FSAF=78;FSAR=64;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0568995;FXX=0.0204068;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.7563;QD=36.5515;RBI=0.0581962;REFB=-0.0571657;REVB=0.0122169;RO=2;SAF=7;SAR=2;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11124;STB=0.506328;TYPE=snp;VARB=0.00191712;OID=.;OPOS=32481794;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:11:144:2:2:9:142:2:7:2:0:64:78:2:0 chr2 32481795 . T A 1195.24 PASS AO=136;DP=143;FAO=137;FDP=144;FR=.;FRO=7;FSAF=73;FSAR=64;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=0.0454166;FXX=0.0136977;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.8476;QD=33.201;RBI=0.0466338;REFB=-0.0463914;REVB=0.010585;RO=6;SAF=72;SAR=64;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0245047;STB=0.515863;TYPE=snp;VARB=0.00738935;OID=.;OPOS=32481795;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:143:144:6:7:136:137:64:72:5:1:64:73:6:1 chr2 32667182 . G C 1858.47 PASS AO=195;DP=198;FAO=195;FDP=195;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=147;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194729;FXX=0.0200995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.227;QD=38.1226;RBI=0.0233631;REFB=-0.049832;REVB=0.0129089;RO=1;SAF=48;SAR=147;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00322899;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.28515e-05;OID=.;OPOS=32667182;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:198:195:1:0:195:195:147:48:0:1:147:48:0:0 chr2 32713706 . A T 379.74 PASS AO=97;DP=211;FAO=97;FDP=210;FR=.;FRO=113;FSAF=34;FSAR=63;FSRF=50;FSRR=63;FWDB=-0.022591;FXX=0.00473911;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.984;QD=7.2331;RBI=0.0260953;REFB=-0.00602499;REVB=0.0130619;RO=113;SAF=34;SAR=63;SRF=50;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0949083;STB=0.552621;TYPE=snp;VARB=0.00619103;OID=.;OPOS=32713706;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:210:113:113:97:97:63:34:50:63:63:34:50:63 chr2 32730262 . A G 159.56 PASS AO=53;DP=144;FAO=53;FDP=144;FR=.;FRO=91;FSAF=14;FSAR=39;FSRF=47;FSRR=44;FWDB=-0.011577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.102;QD=4.43231;RBI=0.0116274;REFB=-0.00639109;REVB=0.00108203;RO=90;SAF=14;SAR=39;SRF=47;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.304792;STB=0.671776;TYPE=snp;VARB=0.00963435;OID=.;OPOS=32730262;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:144:90:91:53:53:39:14:47:43:39:14:47:44 chr2 32843295 . A T 284.43 PASS AO=66;DP=127;FAO=68;FDP=137;FR=.;FRO=69;FSAF=30;FSAR=38;FSRF=30;FSRR=39;FWDB=0.0203137;FXX=0.0283668;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.171;QD=8.30449;RBI=0.0395131;REFB=0.000839445;REVB=0.0338916;RO=41;SAF=28;SAR=38;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0628377;STB=0.503267;TYPE=snp;VARB=-0.000990178;OID=.;OPOS=32843295;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:137:41:69:66:68:38:28:21:20:38:30:30:39 chr2 32855615 . A G 1312.93 PASS AO=138;DP=140;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.058242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.1014;QD=37.2463;RBI=0.0805439;REFB=-0.0445917;REVB=0.0556344;RO=2;SAF=70;SAR=68;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133883;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00102085;OID=.;OPOS=32855615;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:140:141:2:0:138:141:68:70:2:0:69:72:0:0 chr2 32983526 . C T 611.62 PASS AO=135;DP=255;FAO=135;FDP=255;FR=.;FRO=120;FSAF=42;FSAR=93;FSRF=29;FSRR=91;FWDB=0.0124406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.6537;QD=9.594;RBI=0.017505;REFB=-0.00127363;REVB=-0.0123149;RO=118;SAF=42;SAR=93;SRF=28;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0761478;STB=0.539245;TYPE=snp;VARB=0.00121314;OID=.;OPOS=32983526;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:255:255:118:120:135:135:93:42:28:90:93:42:29:91 chr2 33170513 . C T 246.13 PASS AO=57;DP=115;FAO=57;FDP=115;FR=.;FRO=58;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=20;FSRR=38;FWDB=0.00117473;FXX=0.0170926;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.545;QD=8.56119;RBI=0.0294868;REFB=-0.0308995;REVB=-0.0294634;RO=58;SAF=32;SAR=25;SRF=20;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195619;STB=0.607924;TYPE=snp;VARB=0.0180607;OID=.;OPOS=33170513;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:58:58:57:57:25:32:20:38:25:32:20:38 chr2 33412077 . G A 124.87 PASS AO=37;DP=99;FAO=38;FDP=99;FR=.;FRO=61;FSAF=3;FSAR=35;FSRF=7;FSRR=54;FWDB=-0.028368;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.739;QD=5.04525;RBI=0.0334323;REFB=0.00114963;REVB=-0.0176911;RO=61;SAF=3;SAR=34;SRF=7;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108793;STB=0.567222;TYPE=snp;VARB=-0.00197583;OID=.;OPOS=33412077;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:61:61:37:38:34:3:7:54:35:3:7:54 chr2 33447202 . C T 288.22 PASS AO=59;DP=106;FAO=59;FDP=106;FR=.;FRO=47;FSAF=36;FSAR=23;FSRF=29;FSRR=18;FWDB=0.0173144;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.858;QD=10.8763;RBI=0.022666;REFB=0.0322094;REVB=-0.0146273;RO=46;SAF=36;SAR=23;SRF=28;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00123949;STB=0.503196;TYPE=snp;VARB=-0.017606;OID=.;OPOS=33447202;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:46:47:59:59:23:36:28:18:23:36:29:18 chr2 33510890 . C G 327.8 PASS AO=74;DP=149;FAO=81;FDP=163;FR=.;FRO=82;FSAF=46;FSAR=35;FSRF=51;FSRR=31;FWDB=-0.0136474;FXX=0.0239507;HRUN=3;LEN=1;MLLD=36.2404;QD=8.04418;RBI=0.138147;REFB=-0.0352819;REVB=-0.137471;RO=74;SAF=42;SAR=32;SRF=49;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0887781;STB=0.527905;TYPE=snp;VARB=0.0313317;OID=.;OPOS=33510890;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:163:74:82:74:81:32:42:49:25:35:46:51:31 chr2 33540248 . G A 384.53 PASS AO=93;DP=192;FAO=93;FDP=192;FR=.;FRO=99;FSAF=54;FSAR=39;FSRF=59;FSRR=40;FWDB=-0.0481806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2022;QD=8.01095;RBI=0.0501041;REFB=-0.0186871;REVB=-0.0137495;RO=97;SAF=54;SAR=39;SRF=59;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0264023;STB=0.508127;TYPE=snp;VARB=0.0162103;OID=.;OPOS=33540248;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:192:97:99:93:93:39:54:59:38:39:54:59:40 chr2 33557974 . A G 832.57 PASS AO=86;DP=86;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112228;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.82;QD=38.279;RBI=0.0118943;REFB=0;REVB=0.00394005;RO=0;SAF=69;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.44495e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.55607e-05;OID=.;OPOS=33557974;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:86:87:0:0:86:87:17:69:0:0:17:70:0:0 chr2 33585796 . T C 2621.26 PASS AO=175;DP=289;FAO=286;FDP=286;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=135;FSAR=151;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0731639;FXX=0.0034842;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.521;QD=36.661;RBI=0.0802637;REFB=0;REVB=0.0330047;RO=0;SAF=123;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.30366e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000423312;OID=.;OPOS=33585796;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:277:286:0:0:175:286:52:123:0:0:151:135:0:0 chr2 33952456 . C G 339.48 PASS AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0157098;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=279.062;QD=35.7348;RBI=0.0189986;REFB=-0.058493;REVB=0.010684;RO=0;SAF=25;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.519989;TYPE=snp;VARB=6.40822e-05;OID=.;OPOS=33952456;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:38:38:0:1:37:37:12:25:0:0:12:25:0:1 chr2 36704144 . C T 625.04 PASS AO=126;DP=221;FAO=126;FDP=221;FR=.;FRO=95;FSAF=85;FSAR=41;FSRF=44;FSRR=51;FWDB=0.0161085;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.601;QD=11.3129;RBI=0.0300774;REFB=-0.00369294;REVB=-0.0254001;RO=94;SAF=85;SAR=41;SRF=44;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172513;STB=0.596521;TYPE=snp;VARB=0.00199472;OID=.;OPOS=36704144;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:221:94:95:126:126:41:85:44:50:41:85:44:51 chr2 36756288 . T C 2218.88 PASS AO=236;DP=239;FAO=236;FDP=236;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=131;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0479593;FXX=0.0125518;HRUN=4;LEN=1;MLLD=162.328;QD=37.6081;RBI=0.052892;REFB=0.0470043;REVB=0.0223038;RO=3;SAF=105;SAR=131;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0134193;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.97728e-05;OID=.;OPOS=36756288;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:239:236:3:0:236:236:131:105:3:0:131:105:0:0 chr2 36781401 . T C 1454.59 PASS AO=154;DP=155;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0202643;FXX=0.0064512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.7825;QD=37.7817;RBI=0.0202682;REFB=-0.0459847;REVB=0.000399508;RO=1;SAF=97;SAR=57;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00827241;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000472262;OID=.;OPOS=36781401;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:155:154:1:0:154:154:57:97:0:1:57:97:0:0 chr2 36783127 . T C 1057.48 PASS AO=111;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00333231;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.555;QD=38.1073;RBI=0.0361581;REFB=0;REVB=0.0360043;RO=0;SAF=51;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.42743e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.23809e-05;OID=.;OPOS=36783127;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:111:111:0:0:111:111:60:51:0:0:60:51:0:0 chr2 36808732 . T G 764.68 PASS AO=83;DP=89;FAO=84;FDP=87;FR=.;FRO=3;FSAF=28;FSAR=56;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0159312;FXX=0.0224694;HRUN=5;LEN=1;MLLD=131.143;QD=35.1575;RBI=0.0253125;REFB=-0.0544346;REVB=0.0196703;RO=3;SAF=28;SAR=55;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000296529;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00103611;OID=.;OPOS=36808732;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:89:87:3:3:83:84:55:28:1:2:56:28:1:2 chr2 36810586 . T C 876.18 PASS AO=91;DP=94;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00146028;FXX=0.0312467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.658;QD=37.6852;RBI=0.0134706;REFB=0;REVB=0.0133912;RO=0;SAF=45;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000488781;OID=.;OPOS=36810586;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:94:93:0:0:91:93:46:45:0:0:46:47:0:0 chr2 37094945 . A G 626.81 PASS AO=80;DP=94;FAO=81;FDP=93;FR=.;FRO=12;FSAF=37;FSAR=44;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.0125929;FXX=0.0106372;HRUN=6;LEN=1;MLLD=92.0694;QD=26.9597;RBI=0.0501711;REFB=-0.104822;REVB=0.048565;RO=3;SAF=37;SAR=43;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00888816;STB=0.505611;TYPE=snp;VARB=0.00803044;OID=.;OPOS=37094945;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:94:93:3:12:80:81:43:37:1:2:44:37:6:6 chr2 37306343 . G A 1608.62 PASS AO=346;DP=346;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=107;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0022843;FXX=0.011764;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.695;QD=38.3006;RBI=0.0168135;REFB=0;REVB=0.0166576;RO=0;SAF=169;SAR=177;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000134589;OID=.;OPOS=37306343;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:346:168:0:0:346:168:177:169:0:0:61:107:0:0 chr2 37317869 . C T 1913.83 PASS AO=199;DP=200;FAO=200;FDP=200;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=122;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136517;FXX=0.00497488;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.683;QD=38.2767;RBI=0.0229029;REFB=0;REVB=-0.0183895;RO=0;SAF=78;SAR=121;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.50688e-06;OID=.;OPOS=37317869;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:200:200:0:0:199:200:121:78:0:0:122:78:0:0 chr2 37438993 . G A 1341.15 PASS AO=139;DP=139;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149088;FXX=0.00714235;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.767;QD=38.5942;RBI=0.0324073;REFB=0;REVB=0.0287743;RO=0;SAF=74;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.37847e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.23149e-05;OID=.;OPOS=37438993;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:139:139:0:0:139:139:65:74:0:0:65:74:0:0 chr2 37456032 . C T 388.31 PASS AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0358189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.0882;QD=38.8311;RBI=0.0360307;REFB=0;REVB=0.00390108;RO=0;SAF=18;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.34792e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000353349;OID=.;OPOS=37456032;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:39:40:0:0:39:40:21:18:0:0:22:18:0:0 chr2 37458711 . G A 846.55 PASS AO=92;DP=93;FAO=91;FDP=92;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=57;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0115421;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.302;QD=36.8064;RBI=0.0449589;REFB=-0.0628512;REVB=0.0434521;RO=1;SAF=34;SAR=58;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0137378;STB=0.507245;TYPE=snp;VARB=0.000925844;OID=.;OPOS=37458711;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:93:92:1:1:92:91:58:34:1:0:57:34:1:0 chr2 37477794 . C A 673.94 PASS AO=69;DP=71;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0955107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.3714;QD=37.4411;RBI=0.096385;REFB=0;REVB=-0.0129529;RO=0;SAF=30;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000628661;OID=.;OPOS=37477794;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:71:72:0:0:69:72:39:30:0:0:41:31:0:0 chr2 37518045 . G C 1002.97 PASS AO=105;DP=106;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113788;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.796;QD=38.2082;RBI=0.0162823;REFB=0;REVB=0.0116463;RO=0;SAF=69;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21741e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.91644e-05;OID=.;OPOS=37518045;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:106:105:0:0:105:105:36:69:0:0:36:69:0:0 chr2 38178406 . A G 608.64 PASS AO=129;DP=234;FAO=129;FDP=235;FR=.;FRO=106;FSAF=77;FSAR=52;FSRF=46;FSRR=60;FWDB=0.00218808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.046;QD=10.3599;RBI=0.0303665;REFB=-0.00552725;REVB=-0.0302876;RO=104;SAF=76;SAR=53;SRF=46;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121392;STB=0.574156;TYPE=snp;VARB=0.00550099;OID=.;OPOS=38178406;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:234:235:104:106:129:129:53:76:46:58:52:77:46:60 chr2 38179134 . G A 1421.98 PASS AO=148;DP=148;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0327113;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.391;QD=38.4319;RBI=0.0368416;REFB=0;REVB=0.0169491;RO=0;SAF=88;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.44883e-05;OID=.;OPOS=38179134;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:148:148:0:0:148:148:60:88:0:0:60:88:0:0 chr2 38179414 . CTG C 110.86 PASS AO=34;DP=95;FAO=34;FDP=90;FR=.;FRO=56;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=34;FWDB=-0.0216265;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=2;MLLD=146.752;QD=4.92698;RBI=0.0530385;REFB=-0.0322416;REVB=-0.0484291;RO=54;SAF=16;SAR=18;SRF=20;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109223;STB=0.548784;TYPE=del;VARB=0.035548;OID=.;OPOS=38179415;OREF=TG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:34:92:34:90:56:16:18:22:34:99:54:16:18:20:34 chr2 38298150 . A G 117.87 PASS AO=41;DP=117;FAO=41;FDP=117;FR=.;FRO=76;FSAF=14;FSAR=27;FSRF=39;FSRR=37;FWDB=-0.00762141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.299;QD=4.02977;RBI=0.00762299;REFB=-0.00999483;REVB=-0.000155329;RO=76;SAF=14;SAR=27;SRF=39;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199437;STB=0.614898;TYPE=snp;VARB=0.0148594;OID=.;OPOS=38298150;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:76:76:41:41:27:14:39:37:27:14:39:37 chr2 38298203 . C G 126.95 PASS AO=40;DP=106;FAO=40;FDP=106;FR=.;FRO=66;FSAF=12;FSAR=28;FSRF=33;FSRR=33;FWDB=-0.00473432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.1711;QD=4.79054;RBI=0.00626765;REFB=-0.0103054;REVB=0.00410726;RO=66;SAF=12;SAR=28;SRF=33;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231211;STB=0.632461;TYPE=snp;VARB=0.0251886;OID=.;OPOS=38298203;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:66:66:40:40:28:12:33:33:28:12:33:33 chr2 38536626 . T G 1035.98 PASS AO=109;DP=110;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000140246;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.667;QD=38.0177;RBI=0.00117892;REFB=-0.0260654;REVB=0.00117055;RO=1;SAF=44;SAR=65;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.010666;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.82308e-05;OID=.;OPOS=38536626;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:110:109:1:0:109:109:65:44:1:0:65:44:0:0 chr2 38604351 . A G 99.25 PASS AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00607196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.0235;QD=39.7011;RBI=0.0221828;REFB=0;REVB=0.0213356;RO=0;SAF=1;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.8593e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00093371;OID=.;OPOS=38604351;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:9:1:0:0:9:1:0:0 chr2 39025555 . G A 1127.46 PASS AO=207;DP=330;FAO=208;FDP=333;FR=.;FRO=125;FSAF=75;FSAR=133;FSRF=58;FSRR=67;FWDB=-0.0243796;FXX=0.00299392;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.406;QD=13.5431;RBI=0.0307877;REFB=0.0101703;REVB=-0.0188021;RO=119;SAF=74;SAR=133;SRF=53;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0635979;STB=0.541126;TYPE=snp;VARB=-0.00510388;OID=.;OPOS=39025555;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:330:333:119:125:207:208:133:74:53:66:133:75:58:67 chr2 39046197 . C T 293.18 PASS AO=79;DP=180;FAO=79;FDP=180;FR=.;FRO=101;FSAF=35;FSAR=44;FSRF=42;FSRR=59;FWDB=-0.00121993;FXX=0.00552456;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.524;QD=6.51517;RBI=0.035098;REFB=-0.0235297;REVB=-0.0350768;RO=100;SAF=35;SAR=44;SRF=42;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0235027;STB=0.515512;TYPE=snp;VARB=0.0333623;OID=.;OPOS=39046197;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:180:100:101:79:79:44:35:42:58:44:35:42:59 chr2 39050141 . A C 287.52 PASS AO=62;DP=117;FAO=62;FDP=117;FR=.;FRO=55;FSAF=21;FSAR=41;FSRF=33;FSRR=22;FWDB=0.0150617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.835;QD=9.82977;RBI=0.0172809;REFB=-0.00367435;REVB=-0.00847194;RO=53;SAF=21;SAR=41;SRF=33;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.242901;STB=0.625913;TYPE=snp;VARB=0.00493882;OID=.;OPOS=39050141;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:53:55:62:62:41:21:33:20:41:21:33:22 chr2 39082344 . T C 2384.57 PASS AO=251;DP=253;FAO=251;FDP=251;FR=.;FRO=0;FSAF=102;FSAR=149;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00865588;FXX=0.00790483;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.235;QD=38.0012;RBI=0.0269068;REFB=0.0350642;REVB=-0.0254765;RO=1;SAF=102;SAR=149;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00318866;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.98679e-05;OID=.;OPOS=39082344;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:253:251:1:0:251:251:149:102:0:1:149:102:0:0 chr2 39209241 . A G 459.06 PASS AO=94;DP=169;FAO=94;FDP=168;FR=.;FRO=74;FSAF=40;FSAR=54;FSRF=33;FSRR=41;FWDB=0.000847241;FXX=0.00591681;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.492;QD=10.9299;RBI=0.0102998;REFB=-0.0010209;REVB=0.0102649;RO=74;SAF=40;SAR=54;SRF=33;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0168248;STB=0.509169;TYPE=snp;VARB=0.000937454;OID=.;OPOS=39209241;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:168:74:74:94:94:54:40:33:41:54:40:33:41 chr2 39209426 . A G 331.5 PASS AO=34;DP=36;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0430409;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.762;QD=35.8374;RBI=0.0668029;REFB=-0.0402654;REVB=0.0510892;RO=1;SAF=21;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0346006;STB=0.51612;TYPE=snp;VARB=0.00267768;OID=.;OPOS=39209426;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:36:37:1:1:34:36:13:21:0:1:15:21:0:1 chr2 39212637 . T C 497.85 PASS AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104567;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=214.273;QD=37.5735;RBI=0.0108345;REFB=0;REVB=-0.00283633;RO=0;SAF=12;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.42333e-05;OID=.;OPOS=39212637;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:53:53:0:0:53:53:41:12:0:0:41:12:0:0 chr2 39477170 . T C 818.8 PASS AO=91;DP=94;FAO=91;FDP=94;FR=.;FRO=3;FSAF=53;FSAR=38;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0497061;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=255.996;QD=34.8427;RBI=0.05122;REFB=-0.0368388;REVB=0.0123606;RO=3;SAF=53;SAR=38;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0260741;STB=0.513758;TYPE=snp;VARB=0.000203086;OID=.;OPOS=39477170;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:94:94:3:3:91:91:38:53:3:0:38:53:3:0 chr2 39507417 . T A 640.87 PASS AO=71;DP=73;FAO=71;FDP=73;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0459807;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.0562;QD=35.1162;RBI=0.0505301;REFB=-0.0184314;REVB=0.0209539;RO=1;SAF=38;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141139;STB=0.514702;TYPE=snp;VARB=0.000654009;OID=.;OPOS=39507417;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:73:73:1:2:71:71:33:38:0:1:33:38:0:2 chr2 39583446 . A G 1705.21 PASS AO=181;DP=183;FAO=182;FDP=182;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00740209;FXX=0.010869;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.3694;QD=37.4772;RBI=0.00749389;REFB=-0.032303;REVB=-0.00116938;RO=2;SAF=84;SAR=97;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011199;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.59842e-05;OID=.;OPOS=39583446;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:183:182:2:0:181:182:97:84:2:0:97:85:0:0 chr2 40403104 . A G 1048.55 PASS AO=109;DP=109;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00673101;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.501;QD=38.1289;RBI=0.0553296;REFB=0;REVB=0.0549186;RO=0;SAF=81;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000114352;OID=.;OPOS=40403104;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:109:110:0:0:109:110:28:81:0:0:28:82:0:0 chr2 42396722 . A G 37.61 PASS AO=10;DP=39;FAO=11;FDP=34;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=0;FSRF=23;FSRR=0;FWDB=-0.00992431;FXX=0.149963;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.867;QD=4.42506;RBI=0.00992431;REFB=-0.0344839;REVB=0;RO=20;SAF=10;SAR=0;SRF=20;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0620523;OID=.;OPOS=42396722;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:39:34:20:23:10:11:0:10:20:0:0:11:23:0 chr2 42396724 . GC G,AG 305.51 PASS AO=23,6;DP=36;FAO=33,6;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=33,6;FSAR=0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.263633,0.114307;FXX=0;HRUN=3,1;LEN=1,2;MLLD=15.3696,51.5151;QD=31.334;RBI=0.263633,0.114307;REFB=0,0;REVB=0,0;RO=5;SAF=23,6;SAR=0,0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0.32126,0;SSEP=0.512195,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,mnp;VARB=0.0172058,-0.0303677;OID=.,.;OPOS=42396725,42396724;OREF=C,GC;OALT=-,AG;OMAPALT=G,AG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:9:36:39:5:0:23,6:33,6:0,0:23,6:5:0:0,0:33,6:0:0 chr2 42510018 . A G 2169.71 PASS AO=230;DP=236;FAO=237;FDP=241;FR=.;FRO=4;FSAF=113;FSAR=124;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0628459;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.5183;QD=36.0118;RBI=0.113041;REFB=-0.031054;REVB=-0.0939605;RO=6;SAF=110;SAR=120;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0010545;STB=0.503773;TYPE=snp;VARB=-0.000171156;OID=.;OPOS=42510018;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:236:241:6:4:230:237:120:110:3:3:124:113:1:3 chr2 42515388 . A G 1656.5 PASS AO=173;DP=175;FAO=173;FDP=173;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.034954;FXX=0.0170445;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.391;QD=38.3005;RBI=0.0370809;REFB=0;REVB=0.0123778;RO=0;SAF=75;SAR=98;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.27525e-05;OID=.;OPOS=42515388;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:175:173:0:0:173:173:98:75:0:0:98:75:0:0 chr2 42515437 . A G 250.19 PASS AO=65;DP=147;FAO=66;FDP=148;FR=.;FRO=82;FSAF=36;FSAR=30;FSRF=29;FSRR=53;FWDB=0.00940585;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.1555;QD=6.76179;RBI=0.0389211;REFB=0.00702946;REVB=0.0377674;RO=82;SAF=35;SAR=30;SRF=29;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183532;STB=0.605072;TYPE=snp;VARB=-0.01175;OID=.;OPOS=42515437;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:148:82:82:65:66:30:35:29:53:30:36:29:53 chr2 42560975 . A G 1228.54 PASS AO=128;DP=128;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0521488;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6413;QD=37.5128;RBI=0.0541926;REFB=-0.0642845;REVB=0.0147426;RO=0;SAF=63;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.1359e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000713512;OID=.;OPOS=42560975;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:128:131:0:0:128:131:65:63:0:0:68:63:0:0 chr2 42577803 . T TAAATACACAC 511.03 PASS AO=63;DP=78;FAO=65;FDP=75;FR=.;FRO=10;FSAF=18;FSAR=47;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0182124;FXX=0.0259707;HRUN=2;LEN=10;MLLD=384.826;QD=27.2548;RBI=0.018894;REFB=-0.0225708;REVB=0.00502896;RO=11;SAF=18;SAR=45;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0561095;STB=0.520114;TYPE=ins;VARB=0.00345227;OID=.;OPOS=42577804;OREF=-;OALT=AAATACACAC;OMAPALT=TAAATACACAC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:63:78:65:75:10:18:47:4:6:7:11:18:45:5:6 chr2 42588195 . T C 88.72 PASS AO=24;DP=58;FAO=24;FDP=58;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=-0.0565495;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.3101;QD=6.11858;RBI=0.119204;REFB=-0.0137804;REVB=-0.104937;RO=34;SAF=12;SAR=12;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120938;STB=0.568909;TYPE=snp;VARB=0.0155452;OID=.;OPOS=42588195;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:58:58:34:34:24:24:12:12:13:21:12:12:13:21 chr2 43015704 . T A 165.04 PASS AO=40;DP=85;FAO=40;FDP=85;FR=.;FRO=45;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=14;FSRR=31;FWDB=0.00331868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.358;QD=7.76676;RBI=0.00540242;REFB=-0.00888964;REVB=-0.00426292;RO=45;SAF=15;SAR=25;SRF=14;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0659572;STB=0.536723;TYPE=snp;VARB=0.00699827;OID=.;OPOS=43015704;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:45:45:40:40:25:15:14:31:25:15:14:31 chr2 43015719 . T C 702.81 PASS AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000626705;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.272;QD=37.9896;RBI=0.0140265;REFB=0;REVB=-0.0140125;RO=0;SAF=28;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.78015e-05;OID=.;OPOS=43015719;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:75:74:0:0:74:74:46:28:0:0:46:28:0:0 chr2 43015757 . G A 679.17 PASS AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.22;QD=37.7317;RBI=0.0559882;REFB=0;REVB=0.0479892;RO=0;SAF=28;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21139e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000145183;OID=.;OPOS=43015757;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:72:72:0:0:72:72:44:28:0:0:44:28:0:0 chr2 43037672 . C T 235.69 PASS AO=55;DP=112;FAO=55;FDP=112;FR=.;FRO=57;FSAF=34;FSAR=21;FSRF=33;FSRR=24;FWDB=0.0211647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.1158;QD=8.4174;RBI=0.0377255;REFB=0.00813517;REVB=0.0312293;RO=57;SAF=34;SAR=21;SRF=33;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0377894;STB=0.520932;TYPE=snp;VARB=-0.00721286;OID=.;OPOS=43037672;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:57:57:55:55:21:34:33:24:21:34:33:24 chr2 43625184 . T A 2741.43 PASS AO=290;DP=292;FAO=290;FDP=290;FR=.;FRO=0;FSAF=146;FSAR=144;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0035848;FXX=0.00684908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.615;QD=37.8128;RBI=0.0256922;REFB=-0.0254378;REVB=0.0254409;RO=1;SAF=146;SAR=144;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00330034;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.49269e-05;OID=.;OPOS=43625184;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:292:290:1:0:290:290:144:146:0:1:144:146:0:0 chr2 43635506 . T C 1073.52 PASS AO=89;DP=120;FAO=110;FDP=114;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=47;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0393922;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.282;QD=37.6674;RBI=0.0500905;REFB=0;REVB=0.0309404;RO=6;SAF=35;SAR=54;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0746016;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000274538;OID=.;OPOS=43635506;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:119:114:6:0:89:110:54:35:6:0:63:47:0:0 chr2 43801712 . A G 223.74 PASS AO=42;DP=71;FAO=42;FDP=71;FR=.;FRO=29;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=8;FSRR=21;FWDB=0.110945;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.312;QD=12.6053;RBI=0.111507;REFB=-0.00991922;REVB=0.0111838;RO=28;SAF=22;SAR=20;SRF=8;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173191;STB=0.600486;TYPE=snp;VARB=0.00878305;OID=.;OPOS=43801712;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:28:29:42:42:20:22:8:20:20:22:8:21 chr2 43804227 . CTT CT,CTC 133.54 PASS AO=20,15;DP=76;FAO=20,16;FDP=75;FR=.;FRO=39;FSAF=19,1;FSAR=1,15;FSRF=28;FSRR=11;FWDB=-0.112016,-0.0845923;FXX=0.0131562;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=24.5813,34.7579;QD=7.12206;RBI=0.188311,0.158324;REFB=-0.0498081,-0.0464831;REVB=-0.151372,-0.133831;RO=37;SAF=19,1;SAR=1,14;SRF=27;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.517099,-0.739356;STB=0.828633,0.943073;TYPE=del,snp;VARB=0.0699288,0.0290081;OID=.,.;OPOS=43804228,43804229;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=CT,CTC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:20,15:74:20,16:75:39:19,1:1,15:28:11:51:37:19,1:1,14:27:10 chr2 43805739 . C T 175.81 PASS AO=50;DP=122;FAO=50;FDP=121;FR=.;FRO=71;FSAF=34;FSAR=16;FSRF=39;FSRR=32;FWDB=0.0137129;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.097;QD=5.81176;RBI=0.0186153;REFB=-0.00309514;REVB=-0.012589;RO=71;SAF=34;SAR=16;SRF=39;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146571;STB=0.582823;TYPE=snp;VARB=0.00447931;OID=.;OPOS=43805739;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:121:71:71:50:50:16:34:39:32:16:34:39:32 chr2 43819139 . A G 248.65 PASS AO=52;DP=94;FAO=52;FDP=94;FR=.;FRO=42;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=0.0192598;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.6368;QD=10.581;RBI=0.0412603;REFB=-0.0302776;REVB=0.0364894;RO=40;SAF=26;SAR=26;SRF=15;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0992772;STB=0.542537;TYPE=snp;VARB=0.0266284;OID=.;OPOS=43819139;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:40:42:52:52:26:26:15:25:26:26:17:25 chr2 43902511 . G C 87.81 PASS AO=42;DP=149;FAO=42;FDP=148;FR=.;FRO=106;FSAF=13;FSAR=29;FSRF=49;FSRR=57;FWDB=0.0262476;FXX=0.00671096;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6924;QD=2.3732;RBI=0.0624311;REFB=-0.00917881;REVB=0.0566455;RO=101;SAF=13;SAR=29;SRF=48;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21005;STB=0.61654;TYPE=snp;VARB=0.0447112;OID=.;OPOS=43902511;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:149:148:101:106:42:42:29:13:48:53:29:13:49:57 chr2 43903066 . A G 288.12 PASS AO=61;DP=115;FAO=61;FDP=113;FR=.;FRO=52;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=21;FSRR=31;FWDB=0.0372619;FXX=0.0173898;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.415;QD=10.1989;RBI=0.0401327;REFB=-0.0153745;REVB=-0.0149058;RO=52;SAF=30;SAR=31;SRF=21;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0739273;STB=0.540527;TYPE=snp;VARB=0.0152969;OID=.;OPOS=43903066;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:113:52:52:61:61:31:30:21:31:31:30:21:31 chr2 43903354 . T C 457.81 PASS AO=142;DP=354;FAO=142;FDP=354;FR=.;FRO=212;FSAF=68;FSAR=74;FSRF=113;FSRR=99;FWDB=0.00144086;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=222.807;QD=5.17304;RBI=0.00782946;REFB=-0.000951775;REVB=-0.00769573;RO=212;SAF=68;SAR=74;SRF=113;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0579039;STB=0.532391;TYPE=snp;VARB=0.00118901;OID=.;OPOS=43903354;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:354:354:212:212:142:142:74:68:113:99:74:68:113:99 chr2 43926943 . T A 169.44 PASS AO=51;DP=129;FAO=51;FDP=129;FR=.;FRO=78;FSAF=17;FSAR=34;FSRF=39;FSRR=39;FWDB=0.00615247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.174;QD=5.25382;RBI=0.0136492;REFB=0.000145971;REVB=0.012184;RO=76;SAF=17;SAR=34;SRF=37;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170685;STB=0.605363;TYPE=snp;VARB=-0.000129815;OID=.;OPOS=43926943;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:76:78:51:51:34:17:37:39:34:17:39:39 chr2 43931176 . T C 225.64 PASS AO=58;DP=128;FAO=58;FDP=128;FR=.;FRO=70;FSAF=33;FSAR=25;FSRF=27;FSRR=43;FWDB=-0.0248285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.284;QD=7.05134;RBI=0.025778;REFB=-0.00560845;REVB=0.00693186;RO=68;SAF=33;SAR=25;SRF=27;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165802;STB=0.599325;TYPE=snp;VARB=0.010387;OID=.;OPOS=43931176;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:68:70:58:58:25:33:27:41:25:33:27:43 chr2 43968167 . G A 368.47 PASS AO=79;DP=155;FAO=82;FDP=158;FR=.;FRO=76;FSAF=22;FSAR=60;FSRF=21;FSRR=55;FWDB=0.0269668;FXX=0.00628891;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.0073;QD=9.32827;RBI=0.0354992;REFB=0.000864127;REVB=0.0230865;RO=76;SAF=21;SAR=58;SRF=22;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0266188;STB=0.504891;TYPE=snp;VARB=-0.000335624;OID=.;OPOS=43968167;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:158:76:76:79:82:58:21:22:54:60:22:21:55 chr2 43993448 . G C 312.55 PASS AO=74;DP=152;FAO=74;FDP=151;FR=.;FRO=77;FSAF=26;FSAR=48;FSRF=41;FSRR=36;FWDB=-0.0387435;FXX=0.00657851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.339;QD=8.27948;RBI=0.0413591;REFB=-0.00502805;REVB=-0.0144746;RO=76;SAF=26;SAR=48;SRF=40;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166318;STB=0.595529;TYPE=snp;VARB=0.00310688;OID=.;OPOS=43993448;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:151:76:77:74:74:48:26:40:36:48:26:41:36 chr2 44004010 . T C 262.97 PASS AO=60;DP=120;FAO=60;FDP=120;FR=.;FRO=60;FSAF=35;FSAR=25;FSRF=26;FSRR=34;FWDB=0.0145066;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=267.546;QD=8.76575;RBI=0.0161779;REFB=-0.00977826;REVB=0.00716122;RO=60;SAF=35;SAR=25;SRF=26;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136157;STB=0.575184;TYPE=snp;VARB=0.010826;OID=.;OPOS=44004010;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:60:60:60:60:25:35:26:34:25:35:26:34 chr2 44014351 . G C 103.28 PASS AO=30;DP=76;FAO=30;FDP=76;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=-0.0144981;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.058;QD=5.43581;RBI=0.0246844;REFB=-0.00431728;REVB=-0.0199781;RO=45;SAF=17;SAR=13;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105381;STB=0.553661;TYPE=snp;VARB=0.0071724;OID=.;OPOS=44014351;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:45:46:30:30:13:17:21:24:13:17:22:24 chr2 44021826 . T A 454.33 PASS AO=110;DP=226;FAO=110;FDP=226;FR=.;FRO=116;FSAF=48;FSAR=62;FSRF=49;FSRR=67;FWDB=-0.0174226;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=227.897;QD=8.04124;RBI=0.0189195;REFB=-0.00350313;REVB=-0.00737555;RO=116;SAF=48;SAR=62;SRF=49;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0132496;STB=0.50729;TYPE=snp;VARB=0.00420957;OID=.;OPOS=44021826;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:226:226:116:116:110:110:62:48:49:67:62:48:49:67 chr2 44028013 . A T 300.17 PASS AO=70;DP=140;FAO=70;FDP=140;FR=.;FRO=70;FSAF=33;FSAR=37;FSRF=34;FSRR=36;FWDB=-0.0291253;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=41.2976;QD=8.57618;RBI=0.0321396;REFB=0.0137703;REVB=-0.0135894;RO=69;SAF=33;SAR=37;SRF=34;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192517;STB=0.507158;TYPE=snp;VARB=-0.0138481;OID=.;OPOS=44028013;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:69:70:70:70:37:33:34:35:37:33:34:36 chr2 44036922 . T C 76.7 PASS AO=32;DP=109;FAO=32;FDP=107;FR=.;FRO=75;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=50;FWDB=-0.00305393;FXX=0.0183469;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.636;QD=2.86723;RBI=0.0165896;REFB=-0.00173136;REVB=0.0163061;RO=74;SAF=13;SAR=19;SRF=24;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103675;STB=0.554013;TYPE=snp;VARB=0.00456035;OID=.;OPOS=44036922;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:109:107:74:75:32:32:19:13:24:50:19:13:25:50 chr2 44040401 . G C 316.78 PASS AO=84;DP=198;FAO=88;FDP=204;FR=.;FRO=116;FSAF=32;FSAR=56;FSRF=49;FSRR=67;FWDB=-0.00749939;FXX=0.00487781;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.576;QD=6.21128;RBI=0.0194405;REFB=-0.00994953;REVB=0.0179358;RO=113;SAF=32;SAR=52;SRF=49;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.056457;STB=0.535403;TYPE=snp;VARB=0.014054;OID=.;OPOS=44040401;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:204:113:116:84:88:52:32:49:64:56:32:49:67 chr2 44066174 . T G 534.73 PASS AO=33;DP=35;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.140313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=44.2114;QD=37.5252;RBI=0.247407;REFB=0;REVB=0.20377;RO=0;SAF=29;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00750533;OID=.;OPOS=44066174;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:35:57:0:0:33:57:4:29:0:0:9:48:0:0 chr2 44071743 . A G 689.32 PASS AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0323675;FXX=0.0526247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.078;QD=38.2957;RBI=0.0343085;REFB=0;REVB=0.0113762;RO=0;SAF=43;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.16073e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00106572;OID=.;OPOS=44071743;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:73:72:0:0:72:72:29:43:0:0:29:43:0:0 chr2 44101538 . C T 356.5 PASS AO=84;DP=202;FAO=100;FDP=217;FR=.;FRO=117;FSAF=66;FSAR=34;FSRF=60;FSRR=57;FWDB=0.0462363;FXX=0.0312486;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.3718;QD=6.57151;RBI=0.0571024;REFB=-0.0344008;REVB=0.0335095;RO=95;SAF=50;SAR=34;SRF=48;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0878159;STB=0.583656;TYPE=snp;VARB=0.0201713;OID=.;OPOS=44101538;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:217:95:117:84:100:34:50:48:47:34:66:60:57 chr2 44102491 . C T 89.63 PASS AO=17;DP=31;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=13;FWDB=0.0271795;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=191.899;QD=11.5655;RBI=0.0283492;REFB=-0.0222852;REVB=0.00805925;RO=14;SAF=2;SAR=15;SRF=1;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.097459;STB=0.554397;TYPE=snp;VARB=0.0136833;OID=.;OPOS=44102491;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:31:31:14:14:17:17:15:2:1:13:15:2:1:13 chr2 44104925 . T C 1311.27 PASS AO=133;DP=136;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=112;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.116666;FXX=0.00689608;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.9054;QD=36.424;RBI=0.117178;REFB=-0.0950565;REVB=0.0109342;RO=0;SAF=22;SAR=111;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0067679;OID=.;OPOS=44104925;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:136:144:0:0:133:144:111:22:0:0:112:32:0:0 chr2 44177701 . G C 157.62 PASS AO=45;DP=111;FAO=45;FDP=111;FR=.;FRO=66;FSAF=31;FSAR=14;FSRF=32;FSRR=34;FWDB=0.0119727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.1275;QD=5.68004;RBI=0.0132179;REFB=-0.00679636;REVB=-0.00560075;RO=65;SAF=31;SAR=14;SRF=32;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216821;STB=0.627789;TYPE=snp;VARB=0.00990068;OID=.;OPOS=44177701;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:65:66:45:45:14:31:32:33:14:31:32:34 chr2 44209477 . C T 956.61 PASS AO=100;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00983469;FXX=0.0288434;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.9528;QD=37.8856;RBI=0.010065;REFB=0;REVB=-0.00214074;RO=0;SAF=50;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000696423;OID=.;OPOS=44209477;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:101:101:0:0:100:101:50:50:0:0:50:51:0:0 chr2 44502788 . A C 263.07 PASS AO=86;DP=219;FAO=86;FDP=226;FR=.;FRO=140;FSAF=33;FSAR=53;FSRF=76;FSRR=64;FWDB=-0.067342;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.661;QD=4.65614;RBI=0.0674838;REFB=-0.0150743;REVB=-0.00437247;RO=132;SAF=33;SAR=53;SRF=69;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151751;STB=0.599375;TYPE=snp;VARB=0.0164799;OID=.;OPOS=44502788;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:219:226:132:140:86:86:53:33:69:63:53:33:76:64 chr2 44547574 . G A 404.63 PASS AO=102;DP=223;FAO=104;FDP=225;FR=.;FRO=121;FSAF=60;FSAR=44;FSRF=70;FSRR=51;FWDB=0.00125788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.674;QD=7.19336;RBI=0.0196813;REFB=-0.0051773;REVB=0.019641;RO=119;SAF=60;SAR=42;SRF=70;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.500875;TYPE=snp;VARB=0.00686398;OID=.;OPOS=44547574;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:225:119:121:102:104:42:60:70:49:44:60:70:51 chr2 45148830 . G A 182.91 PASS AO=37;DP=64;FAO=37;FDP=67;FR=.;FRO=30;FSAF=26;FSAR=11;FSRF=25;FSRR=5;FWDB=0.00328732;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.208;QD=10.9199;RBI=0.116138;REFB=0.0117308;REVB=-0.116092;RO=27;SAF=26;SAR=11;SRF=25;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228501;STB=0.57417;TYPE=snp;VARB=-0.0101508;OID=.;OPOS=45148830;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:67:27:30:37:37:11:26:25:2:11:26:25:5 chr2 45171842 . A G 296.14 PASS AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00232632;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.705;QD=37.017;RBI=0.0330317;REFB=0;REVB=0.0329497;RO=0;SAF=25;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000696329;OID=.;OPOS=45171842;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:32:32:0:0:32:32:7:25:0:0:7:25:0:0 chr2 45796481 . G A 524.01 PASS AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00669531;FXX=0.0350816;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.205;QD=38.11;RBI=0.0300265;REFB=0;REVB=-0.0292706;RO=0;SAF=24;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.51426e-05;OID=.;OPOS=45796481;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:56:55:0:0:55:55:31:24:0:0:31:24:0:0 chr2 46378209 . C T 177.48 PASS AO=46;DP=113;FAO=48;FDP=111;FR=.;FRO=63;FSAF=32;FSAR=16;FSRF=44;FSRR=19;FWDB=0.0259384;FXX=0.0176975;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.741;QD=6.39583;RBI=0.0270339;REFB=-0.00923541;REVB=-0.00761798;RO=63;SAF=31;SAR=15;SRF=43;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101252;STB=0.52054;TYPE=snp;VARB=0.0203506;OID=.;OPOS=46378209;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:111:63:63:46:48:15:31:43:20:16:32:44:19 chr2 46675586 . TGGG TGG,TGGC 611.34 PASS AO=25,23;DP=110;FAO=69,24;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=43,0;FSAR=26,24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.688161,0.284596;FXX=0.0312467;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=12.8883,14.9271;QD=26.294;RBI=0.699479,0.291961;REFB=-0.0218905,-0.0129602;REVB=0.125324,0.0651624;RO=38;SAF=8,0;SAR=17,23;SRF=32;SRR=6;SSEN=0.429379,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.510762,-0.87123;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.079779,-0.067582;OID=.,.;OPOS=46675587,46675589;OREF=G,G;OALT=-,C;OMAPALT=TGG,TGGC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:25,23:94:69,24:93:0:43,0:26,24:0:0:42:38:8,0:17,23:32:6 chr2 46803354 . C T 333.88 PASS AO=97;DP=233;FAO=97;FDP=232;FR=.;FRO=135;FSAF=30;FSAR=67;FSRF=55;FSRR=80;FWDB=-0.00715577;FXX=0.00429166;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.09;QD=5.75649;RBI=0.0279699;REFB=-0.010768;REVB=-0.027039;RO=134;SAF=30;SAR=67;SRF=54;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108284;STB=0.563569;TYPE=snp;VARB=0.0142752;OID=.;OPOS=46803354;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:233:232:134:135:97:97:67:30:54:80:67:30:55:80 chr2 46986416 . A G 306.02 PASS AO=81;DP=184;FAO=81;FDP=182;FR=.;FRO=101;FSAF=34;FSAR=47;FSRF=46;FSRR=55;FWDB=0.000324228;FXX=0.0267365;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.031;QD=6.72564;RBI=0.00429758;REFB=-0.0108688;REVB=0.00428534;RO=99;SAF=34;SAR=47;SRF=45;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0351169;STB=0.520194;TYPE=snp;VARB=0.00841398;OID=.;OPOS=46986416;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:182:99:101:81:81:47:34:45:54:47:34:46:55 chr2 46987139 . G A 156.81 PASS AO=42;DP=97;FAO=42;FDP=97;FR=.;FRO=55;FSAF=27;FSAR=15;FSRF=32;FSRR=23;FWDB=-0.0147048;FXX=0.010203;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.122;QD=6.46647;RBI=0.0289584;REFB=-0.0133969;REVB=0.024947;RO=55;SAF=27;SAR=15;SRF=32;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0655107;STB=0.536874;TYPE=snp;VARB=0.0211231;OID=.;OPOS=46987139;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:55:55:42:42:15:27:32:23:15:27:32:23 chr2 46987300 . T G 1403.58 PASS AO=137;DP=138;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165785;FXX=0.0067563;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.5268;QD=38.1928;RBI=0.0166438;REFB=0;REVB=-0.00147314;RO=1;SAF=54;SAR=83;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00569375;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000401794;OID=.;OPOS=46987300;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:138:147:1:0:137:147:83:54:0:1:93:54:0:0 chr2 46987767 . A G 204.51 PASS AO=49;DP=108;FAO=53;FDP=116;FR=.;FRO=63;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=39;FSRR=24;FWDB=0.00197734;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=36.7117;QD=7.05197;RBI=0.0866191;REFB=-0.0411352;REVB=-0.0865965;RO=59;SAF=23;SAR=26;SRF=40;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202798;STB=0.579531;TYPE=snp;VARB=0.0380935;OID=.;OPOS=46987767;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:116:59:63:49:53:26:23:40:19:28:25:39:24 chr2 46987935 . T G 1814.99 PASS AO=191;DP=195;FAO=192;FDP=192;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=125;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118612;FXX=0.0153838;HRUN=4;LEN=1;MLLD=224.438;QD=37.8123;RBI=0.0142941;REFB=-0.00484138;REVB=0.00797703;RO=1;SAF=66;SAR=125;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00716008;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.80454e-06;OID=.;OPOS=46987935;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:195:192:1:0:191:192:125:66:1:0:125:67:0:0 chr2 46988275 . G A 240.79 PASS AO=53;DP=121;FAO=59;FDP=124;FR=.;FRO=65;FSAF=26;FSAR=33;FSRF=44;FSRR=21;FWDB=-0.00451048;FXX=0.0312476;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.555;QD=7.76748;RBI=0.0139982;REFB=-0.0112401;REVB=0.0132516;RO=68;SAF=27;SAR=26;SRF=44;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139072;STB=0.621931;TYPE=snp;VARB=0.01503;OID=.;OPOS=46988275;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:124:68:65:53:59:26:27:44:24:33:26:44:21 chr2 46989869 . T G 263.43 PASS AO=66;DP=142;FAO=66;FDP=142;FR=.;FRO=76;FSAF=34;FSAR=32;FSRF=40;FSRR=36;FWDB=0.010501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.503;QD=7.42043;RBI=0.0105868;REFB=0.0063677;REVB=-0.00134488;RO=76;SAF=34;SAR=32;SRF=40;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.010779;STB=0.505981;TYPE=snp;VARB=-0.00747477;OID=.;OPOS=46989869;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:76:76:66:66:32:34:40:36:32:34:40:36 chr2 47045309 . C T 128.05 PASS AO=25;DP=49;FAO=26;FDP=49;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.096702;FXX=0.019996;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.3969;QD=10.4533;RBI=0.096849;REFB=-0.0113378;REVB=-0.00533526;RO=24;SAF=14;SAR=11;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0960444;STB=0.536558;TYPE=snp;VARB=0.0144571;OID=.;OPOS=47045309;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:24:23:25:26:11:14:16:8:11:15:15:8 chr2 47045321 . A G 120 PASS AO=25;DP=46;FAO=26;FDP=49;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.0593843;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=36.8486;QD=9.79594;RBI=0.0601203;REFB=0.00338713;REVB=-0.00937856;RO=21;SAF=14;SAR=11;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0689383;STB=0.526295;TYPE=snp;VARB=-0.00673913;OID=.;OPOS=47045321;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:49:21:23:25:26:11:14:10:11:11:15:12:11 chr2 47201797 . A T 562.45 PASS AO=84;DP=115;FAO=94;FDP=124;FR=.;FRO=30;FSAF=36;FSAR=58;FSRF=25;FSRR=5;FWDB=0.0323277;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=29.113;QD=18.1437;RBI=0.0324162;REFB=-0.109612;REVB=-0.00239379;RO=31;SAF=32;SAR=52;SRF=25;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214424;STB=0.609346;TYPE=snp;VARB=0.00873908;OID=.;OPOS=47201797;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:115:124:31:30:84:94:52:32:25:6:58:36:25:5 chr2 47220622 . G A 762.13 PASS AO=79;DP=80;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0510297;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.7685;QD=37.6359;RBI=0.0872944;REFB=0;REVB=-0.0708257;RO=1;SAF=30;SAR=49;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0155173;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000187819;OID=.;OPOS=47220622;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:80:81:1:0:79:81:49:30:1:0:50:31:0:0 chr2 47251510 . G C 564.44 PASS AO=60;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00173231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.112;QD=37.0127;RBI=0.013931;REFB=0;REVB=0.0138229;RO=0;SAF=23;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03034e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.87525e-05;OID=.;OPOS=47251510;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:60:61:0:0:60:61:37:23:0:0:38:23:0:0 chr2 47301624 . T TTGGGGCCTC,C 135.11 PASS AO=11,9;DP=35;FAO=14,9;FDP=34;FR=.;FRO=11;FSAF=8,7;FSAR=6,2;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=-0.0181329,-0.0071772;FXX=0.0285633;HRUN=3,3;LEN=9,1;MLLD=145.574,188.348;QD=15.8952;RBI=0.0236991,0.00791519;REFB=-0.0564322,0.0204077;REVB=-0.0152592,-0.00333738;RO=13;SAF=6,7;SAR=5,2;SRF=9;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.140078,0.111869;STB=0.57133,0.538373;TYPE=ins,snp;VARB=0.00640881,0.0221891;OID=.,.;OPOS=47301625,47301624;OREF=-,T;OALT=TGGGGCCTC,C;OMAPALT=TTGGGGCCTC,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:35:34:13:11:11,9:14,9:5,2:6,7:9:4:6,2:8,7:8:3 chr2 47601106 . T C 250.57 PASS AO=71;DP=170;FAO=71;FDP=169;FR=.;FRO=98;FSAF=43;FSAR=28;FSRF=55;FSRR=43;FWDB=0.00168771;FXX=0.00588201;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.0553;QD=5.93055;RBI=0.0190246;REFB=-0.00904382;REVB=-0.0189496;RO=97;SAF=43;SAR=28;SRF=55;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0412761;STB=0.526644;TYPE=snp;VARB=0.0131782;OID=.;OPOS=47601106;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:169:97:98:71:71:28:43:55:42:28:43:55:43 chr2 47604856 . T C 730.12 PASS AO=211;DP=450;FAO=187;FDP=400;FR=.;FRO=213;FSAF=75;FSAR=112;FSRF=93;FSRR=120;FWDB=-0.0115163;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=255.965;QD=7.30123;RBI=0.0205557;REFB=-0.0133862;REVB=-0.0170269;RO=238;SAF=89;SAR=122;SRF=95;SRR=143;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0224506;STB=0.519547;TYPE=snp;VARB=0.016391;OID=.;OPOS=47604856;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:450:400:238:213:211:187:122:89:95:143:112:75:93:120 chr2 47739551 . A G 455.86 PASS AO=92;DP=171;FAO=97;FDP=175;FR=.;FRO=78;FSAF=33;FSAR=64;FSRF=38;FSRR=40;FWDB=0.00571387;FXX=0.0112988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.769;QD=10.4197;RBI=0.00644137;REFB=-0.00938874;REVB=0.00297372;RO=60;SAF=30;SAR=62;SRF=24;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0597719;STB=0.569694;TYPE=snp;VARB=0.00758778;OID=.;OPOS=47739551;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:175:60:78:92:97:62:30:24:36:64:33:38:40 chr2 48010488 . G A 14.36 PASS AO=3;DP=10;FAO=3;FDP=10;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=173.752;QD=5.74589;RBI=0.0092831;REFB=-0.00945409;REVB=-0.0092831;RO=7;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0282867;OID=.;OPOS=48010488;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:10:10:7:7:3:3:3:0:0:7:3:0:0:7 chr2 48018081 . A G 875.29 PASS AO=225;DP=433;FAO=203;FDP=399;FR=.;FRO=196;FSAF=121;FSAR=82;FSRF=95;FSRR=101;FWDB=-0.0172156;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.7251;QD=8.77484;RBI=0.0362268;REFB=0.00120556;REVB=-0.0318748;RO=205;SAF=136;SAR=89;SRF=104;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0869565;STB=0.555583;TYPE=snp;VARB=-0.00132605;OID=.;OPOS=48018081;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:433:399:205:196:225:203:89:136:104:101:82:121:95:101 chr2 48023115 . T C 257.75 PASS AO=81;DP=207;FAO=81;FDP=207;FR=.;FRO=126;FSAF=55;FSAR=26;FSRF=94;FSRR=32;FWDB=0.0159774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.0136;QD=4.9806;RBI=0.0165322;REFB=-0.0174732;REVB=-0.00424705;RO=125;SAF=55;SAR=26;SRF=93;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0834322;STB=0.548403;TYPE=snp;VARB=0.0371026;OID=.;OPOS=48023115;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:207:125:126:81:81:26:55:93:32:26:55:94:32 chr2 48808594 . C T 247.64 PASS AO=65;DP=145;FAO=65;FDP=145;FR=.;FRO=80;FSAF=43;FSAR=22;FSRF=40;FSRR=40;FWDB=-0.002187;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.686;QD=6.8313;RBI=0.0107849;REFB=-0.0104658;REVB=-0.0105608;RO=78;SAF=43;SAR=22;SRF=39;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165829;STB=0.59347;TYPE=snp;VARB=0.0134562;OID=.;OPOS=48808594;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:78:80:65:65:22:43:39:39:22:43:40:40 chr2 48809593 . G T 347.3 PASS AO=106;DP=268;FAO=108;FDP=272;FR=.;FRO=164;FSAF=46;FSAR=62;FSRF=77;FSRR=87;FWDB=0.0317438;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.611;QD=5.10728;RBI=0.0359711;REFB=-0.0115992;REVB=-0.0169191;RO=162;SAF=45;SAR=61;SRF=76;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0487216;STB=0.526652;TYPE=snp;VARB=0.0199422;OID=.;OPOS=48809593;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:268:272:162:164:106:108:61:45:76:86:62:46:77:87 chr2 48822381 . G A 733.58 PASS AO=67;DP=67;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00643027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.641;QD=37.6196;RBI=0.0256862;REFB=0;REVB=0.0248683;RO=0;SAF=27;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.36992e-05;OID=.;OPOS=48822381;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:67:78:0:0:67:78:40:27:0:0:48:30:0:0 chr2 48825650 . C G 270.05 PASS AO=56;DP=108;FAO=58;FDP=109;FR=.;FRO=51;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=29;FSRR=22;FWDB=-0.0242903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.475;QD=9.91008;RBI=0.0336684;REFB=-0.025174;REVB=0.023314;RO=51;SAF=26;SAR=30;SRF=29;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0901543;STB=0.556239;TYPE=snp;VARB=0.0240022;OID=.;OPOS=48825650;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:109:51:51:56:58:30:26:29:22:32:26:29:22 chr2 48873978 . A G 191.71 PASS AO=74;DP=224;FAO=75;FDP=225;FR=.;FRO=150;FSAF=37;FSAR=38;FSRF=64;FSRR=86;FWDB=-0.0244559;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.9118;QD=3.40812;RBI=0.0260739;REFB=0.000400663;REVB=0.00904194;RO=150;SAF=37;SAR=37;SRF=64;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0856094;STB=0.544493;TYPE=snp;VARB=-0.00111366;OID=.;OPOS=48873978;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:224:225:150:150:74:75:37:37:64:86:38:37:64:86 chr2 48898798 . T A 2842.37 PASS AO=313;DP=320;FAO=311;FDP=320;FR=.;FRO=9;FSAF=120;FSAR=191;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.0476703;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2354;QD=35.5297;RBI=0.0485914;REFB=-0.0133251;REVB=-0.00941611;RO=7;SAF=120;SAR=193;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00431227;STB=0.504866;TYPE=snp;VARB=0.000943588;OID=.;OPOS=48898798;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:320:320:7:9:313:311:193:120:2:5:191:120:2:7 chr2 48915871 . A G 289.31 PASS AO=71;DP=151;FAO=71;FDP=150;FR=.;FRO=79;FSAF=30;FSAR=41;FSRF=32;FSRR=47;FWDB=0.0260583;FXX=0.00662208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.0712;QD=7.71488;RBI=0.033215;REFB=-0.0266147;REVB=-0.0205961;RO=79;SAF=30;SAR=41;SRF=32;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0170809;STB=0.509453;TYPE=snp;VARB=0.0346932;OID=.;OPOS=48915871;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:150:79:79:71:71:41:30:32:47:41:30:32:47 chr2 48921375 . T C 317.38 PASS AO=87;DP=199;FAO=87;FDP=201;FR=.;FRO=114;FSAF=29;FSAR=58;FSRF=73;FSRR=41;FWDB=0.0222331;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.505;QD=6.31593;RBI=0.0314284;REFB=-0.0206139;REVB=0.0222133;RO=111;SAF=29;SAR=58;SRF=71;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.307677;STB=0.673228;TYPE=snp;VARB=0.0228375;OID=.;OPOS=48921375;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:199:201:111:114:87:87:58:29:71:40:58:29:73:41 chr2 48960032 . G A 105.81 PASS AO=28;DP=67;FAO=28;FDP=66;FR=.;FRO=38;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=-0.0185222;FXX=0.0149231;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.428;QD=6.41252;RBI=0.0209031;REFB=0.000454954;REVB=0.00968846;RO=38;SAF=16;SAR=12;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0994809;STB=0.556481;TYPE=snp;VARB=-0.000430445;OID=.;OPOS=48960032;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:66:38:38:28:28:12:16:18:20:12:16:18:20 chr2 49003458 . C T 183.94 PASS AO=47;DP=111;FAO=48;FDP=109;FR=.;FRO=61;FSAF=13;FSAR=35;FSRF=21;FSRR=40;FWDB=0.00242298;FXX=0.0353951;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.324;QD=6.7502;RBI=0.0323224;REFB=-0.0236208;REVB=-0.0322315;RO=56;SAF=13;SAR=34;SRF=19;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0732235;STB=0.549632;TYPE=snp;VARB=0.0339344;OID=.;OPOS=49003458;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:109:56:61:47:48:34:13:19:37:35:13:21:40 chr2 49189921 . C T 520.66 PASS AO=108;DP=191;FAO=107;FDP=191;FR=.;FRO=84;FSAF=42;FSAR=65;FSRF=46;FSRR=38;FWDB=-0.00339558;FXX=0.00520806;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.517;QD=10.9039;RBI=0.00356088;REFB=-0.0270021;REVB=0.00107233;RO=83;SAF=42;SAR=66;SRF=46;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134291;STB=0.569368;TYPE=snp;VARB=0.0186798;OID=.;OPOS=49189921;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:191:191:83:84:108:107:66:42:46:37:65:42:46:38 chr2 49191041 . C T 210.02 PASS AO=46;DP=91;FAO=48;FDP=96;FR=.;FRO=48;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=15;FSRR=33;FWDB=0.00502666;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.572;QD=8.75098;RBI=0.0176085;REFB=-0.0195128;REVB=-0.0168757;RO=45;SAF=20;SAR=26;SRF=14;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114557;STB=0.554523;TYPE=snp;VARB=0.0137252;OID=.;OPOS=49191041;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:96:45:48:46:48:26:20:14:31:28:20:15:33 chr2 50148972 . C T 102.96 PASS AO=39;DP=119;FAO=39;FDP=119;FR=.;FRO=80;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=41;FSRR=39;FWDB=-0.00418001;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=211.845;QD=3.46088;RBI=0.00419114;REFB=-0.00289789;REVB=0.000305337;RO=80;SAF=19;SAR=20;SRF=41;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0293544;STB=0.51701;TYPE=snp;VARB=0.00531255;OID=.;OPOS=50148972;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:80:80:39:39:20:19:41:39:20:19:41:39 chr2 50201110 . A G 1163.99 PASS AO=124;DP=126;FAO=125;FDP=127;FR=.;FRO=2;FSAF=59;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0741922;FXX=0.00781189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.1006;QD=36.6611;RBI=0.0744455;REFB=-0.0674395;REVB=0.00613613;RO=2;SAF=58;SAR=66;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141782;STB=0.507461;TYPE=snp;VARB=0.000841839;OID=.;OPOS=50201110;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:126:127:2:2:124:125:66:58:0:2:66:59:0:2 chr2 52929680 . T C 764.27 PASS AO=559;DP=1087;FAO=190;FDP=397;FR=.;FRO=207;FSAF=108;FSAR=82;FSRF=90;FSRR=117;FWDB=-0.00437775;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.837;QD=7.70041;RBI=0.0447093;REFB=-0.00310936;REVB=0.0444945;RO=520;SAF=312;SAR=247;SRF=222;SRR=298;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115989;STB=0.569649;TYPE=snp;VARB=0.0024154;OID=.;OPOS=52929680;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:1087:397:520:207:559:190:247:312:222:298:82:108:90:117 chr2 54557360 . A G 345.24 PASS AO=72;DP=138;FAO=76;FDP=145;FR=.;FRO=69;FSAF=35;FSAR=41;FSRF=35;FSRR=34;FWDB=0.00926686;FXX=0.00684885;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.341;QD=9.52381;RBI=0.0100067;REFB=-0.0334009;REVB=0.00377612;RO=64;SAF=35;SAR=37;SRF=34;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0387069;STB=0.522287;TYPE=snp;VARB=0.0265438;OID=.;OPOS=54557360;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:145:64:69:72:76:37:35:34:30:41:35:35:34 chr2 54562012 . C A 184.11 PASS AO=49;DP=127;FAO=57;FDP=135;FR=.;FRO=78;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=36;FSRR=42;FWDB=0.00987429;FXX=0.0073524;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.553;QD=5.45499;RBI=0.0164172;REFB=-0.0224014;REVB=-0.0131157;RO=78;SAF=27;SAR=22;SRF=36;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0968212;STB=0.517164;TYPE=snp;VARB=0.0317426;OID=.;OPOS=54562012;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:135:78:78:49:57:22:27:36:42:29:28:36:42 chr2 54587596 . C T 924.73 PASS AO=102;DP=105;FAO=102;FDP=105;FR=.;FRO=3;FSAF=48;FSAR=54;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0232633;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3568;QD=35.2279;RBI=0.0287204;REFB=-0.031614;REVB=-0.0168429;RO=3;SAF=48;SAR=54;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00746548;STB=0.503936;TYPE=snp;VARB=0.00622879;OID=.;OPOS=54587596;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:105:105:3:3:102:102:54:48:1:2:54:48:1:2 chr2 54756740 . C T 559.36 PASS AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0109979;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.788;QD=36.088;RBI=0.0201211;REFB=-0.0393287;REVB=0.0168495;RO=1;SAF=46;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0304239;STB=0.516124;TYPE=snp;VARB=0.00115465;OID=.;OPOS=54756740;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:62:62:1:1:61:61:15:46:0:1:15:46:0:1 chr2 54844790 . C T 2246.05 PASS AO=234;DP=237;FAO=234;FDP=234;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=138;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00695707;FXX=0.0126577;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.764;QD=38.3941;RBI=0.0262358;REFB=0;REVB=-0.0252966;RO=0;SAF=96;SAR=138;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.09826e-05;OID=.;OPOS=54844790;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:237:234:0:0:234:234:138:96:0:0:138:96:0:0 chr2 55040426 . A G 450.78 PASS AO=99;DP=189;FAO=99;FDP=188;FR=.;FRO=89;FSAF=39;FSAR=60;FSRF=44;FSRR=45;FWDB=0.0219175;FXX=0.00529073;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.628;QD=9.59099;RBI=0.0337427;REFB=-0.0207436;REVB=0.0256552;RO=88;SAF=39;SAR=60;SRF=44;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0933683;STB=0.54875;TYPE=snp;VARB=0.0206251;OID=.;OPOS=55040426;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:188:88:89:99:99:60:39:44:44:60:39:44:45 chr2 55091029 . C T 193.38 PASS AO=35;DP=57;FAO=35;FDP=57;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=25;FSRF=4;FSRR=18;FWDB=-0.0216443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.646;QD=13.5703;RBI=0.0296741;REFB=-0.00595879;REVB=-0.0202996;RO=22;SAF=10;SAR=25;SRF=4;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0939358;STB=0.551254;TYPE=snp;VARB=0.0153358;OID=.;OPOS=55091029;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:57:57:22:22:35:35:25:10:4:18:25:10:4:18 chr2 55186394 . A C 1079 PASS AO=116;DP=120;FAO=118;FDP=120;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0121714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.195;QD=35.9666;RBI=0.0198404;REFB=-0.11126;REVB=-0.0156684;RO=4;SAF=34;SAR=82;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0156762;STB=0.506023;TYPE=snp;VARB=0.000789298;OID=.;OPOS=55186394;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:120:120:4:2:116:118:82:34:2:2:82:36:0:2 chr2 55407754 . C T 1273.16 PASS AO=135;DP=138;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.053635;FXX=0.0352088;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.976;QD=37.1725;RBI=0.0774313;REFB=-0.0953433;REVB=0.055847;RO=1;SAF=96;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00492655;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000349669;OID=.;OPOS=55407754;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:138:137:1:0:135:137:39:96:1:0:39:98:0:0 chr2 55436934 . G A 818.12 PASS AO=83;DP=84;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0342002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.18;QD=38.052;RBI=0.062771;REFB=0;REVB=0.052636;RO=0;SAF=38;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.04629e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000216454;OID=.;OPOS=55436934;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:84:86:0:0:83:86:45:38:0:0:46:40:0:0 chr2 55449412 . C A 253.67 PASS AO=76;DP=195;FAO=78;FDP=197;FR=.;FRO=119;FSAF=37;FSAR=41;FSRF=80;FSRR=39;FWDB=-0.014166;FXX=0.00505025;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.143;QD=5.15073;RBI=0.0141974;REFB=0.00420982;REVB=0.000943532;RO=118;SAF=35;SAR=41;SRF=79;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223626;STB=0.61838;TYPE=snp;VARB=-0.00419653;OID=.;OPOS=55449412;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:197:118:119:76:78:41:35:79:39:41:37:80:39 chr2 55449464 . T C 296.38 PASS AO=75;DP=162;FAO=75;FDP=162;FR=.;FRO=87;FSAF=24;FSAR=51;FSRF=55;FSRR=32;FWDB=0.00619552;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.802;QD=7.31812;RBI=0.00680066;REFB=-0.0301276;REVB=0.00280437;RO=87;SAF=24;SAR=51;SRF=55;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.304792;STB=0.669112;TYPE=snp;VARB=0.0245244;OID=.;OPOS=55449464;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:162:87:87:75:75:51:24:55:32:51:24:55:32 chr2 55470115 . C T 1423.38 PASS AO=148;DP=149;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.6074;QD=38.2115;RBI=0.0217805;REFB=0;REVB=-0.0130566;RO=1;SAF=78;SAR=70;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00674616;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000140128;OID=.;OPOS=55470115;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:149:149:1:0:148:149:70:78:0:1:71:78:0:0 chr2 55490819 . G T 1319.09 PASS AO=140;DP=141;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=108;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0122496;FXX=0.0070917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.295;QD=37.6884;RBI=0.0122864;REFB=-0.00224858;REVB=-0.000950695;RO=0;SAF=108;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.55418e-05;OID=.;OPOS=55490819;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:141:140:0:0:140:140:32:108:0:0:32:108:0:0 chr2 55516723 . C T 1251.24 PASS AO=132;DP=133;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00634675;FXX=0.00746213;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.018;QD=37.6313;RBI=0.00719551;REFB=-0.0679134;REVB=-0.0033903;RO=1;SAF=46;SAR=86;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0102198;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.06695e-05;OID=.;OPOS=55516723;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:133:133:1:0:132:133:86:46:1:0:86:47:0:0 chr2 55522422 . A G 2032.9 PASS AO=212;DP=215;FAO=218;FDP=218;FR=.;FRO=0;FSAF=135;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00897817;FXX=0.0224205;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.314;QD=37.3009;RBI=0.010128;REFB=-0.0861848;REVB=0.00468701;RO=2;SAF=135;SAR=77;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012211;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000255778;OID=.;OPOS=55522422;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:215:218:2:0:212:218:77:135:0:2:83:135:0:0 chr2 55771161 . A G 1481.57 PASS AO=174;DP=176;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0355816;FXX=0.031248;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.6098;QD=38.234;RBI=0.0504135;REFB=-0.0303053;REVB=-0.0357138;RO=1;SAF=76;SAR=98;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00622206;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000579974;OID=.;OPOS=55771161;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:176:155:1:0:174:155:98:76:1:0:88:67:0:0 chr2 55776641 . A G 160.63 PASS AO=46;DP=118;FAO=47;FDP=117;FR=.;FRO=70;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=36;FSRR=34;FWDB=0.0175048;FXX=0.0168053;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.694;QD=5.49153;RBI=0.0176812;REFB=0.0048746;REVB=-0.00249122;RO=69;SAF=26;SAR=20;SRF=35;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0619516;STB=0.536408;TYPE=snp;VARB=-0.00540717;OID=.;OPOS=55776641;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:117:69:70:46:47:20:26:35:34:20:27:36:34 chr2 55805440 . T C 1195.61 PASS AO=124;DP=126;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0556435;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9705;QD=38.2596;RBI=0.0904759;REFB=0;REVB=0.0713421;RO=1;SAF=61;SAR=63;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00748208;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000642964;OID=.;OPOS=55805440;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:126:125:1:0:124:125:63:61:0:1:64:61:0:0 chr2 55806543 . C CT,CTT 119.15 PASS AO=11,6;DP=36;FAO=30,4;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=12,1;FSAR=18,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.235332,0.183605;FXX=0.0285633;HRUN=8,8;LEN=1,2;MLLD=6.76099,8.00196;QD=14.0174;RBI=0.343198,0.251361;REFB=-0.0115522,-0.0145999;REVB=-0.249807,-0.171673;RO=9;SAF=3,1;SAR=8,5;SRF=9;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.529408,-0.698104;STB=0.5,0.5;TYPE=ins,ins;VARB=-0.0697792,0.0475856;OID=.,.;OPOS=55806544,55806544;OREF=-,-;OALT=T,TT;OMAPALT=CT,CTT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:11,6:36:30,4:34:0:12,1:18,3:0:0:4:9:3,1:8,5:9:0 chr2 55883317 . G T 147.52 PASS AO=51;DP=145;FAO=52;FDP=146;FR=.;FRO=94;FSAF=18;FSAR=34;FSRF=36;FSRR=58;FWDB=-0.00276469;FXX=0.00680226;HRUN=4;LEN=1;MLLD=179.544;QD=4.04159;RBI=0.00311719;REFB=-0.00734679;REVB=0.00143991;RO=92;SAF=18;SAR=33;SRF=35;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0334449;STB=0.525763;TYPE=snp;VARB=0.0124466;OID=.;OPOS=55883317;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:146:92:94:51:52:33:18:35:57:34:18:36:58 chr2 56094201 . GA G 193.72 PASS AO=86;DP=194;FAO=85;FDP=184;FR=.;FRO=99;FSAF=38;FSAR=47;FSRF=51;FSRR=48;FWDB=-0.161345;FXX=0.00540511;HRUN=4;LEN=1;MLLD=17.1937;QD=4.21137;RBI=0.169239;REFB=0.000834251;REVB=-0.0510853;RO=93;SAF=38;SAR=48;SRF=48;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0701945;STB=0.536755;TYPE=del;VARB=-0.010864;OID=.;OPOS=56094202;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:86:185:85:184:99:38:47:51:48:99:93:38:48:48:45 chr2 56144930 . T C 173.32 PASS AO=40;DP=82;FAO=40;FDP=82;FR=.;FRO=42;FSAF=27;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=0.000681446;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=217.894;QD=8.45484;RBI=0.03057;REFB=-0.0120901;REVB=-0.0305624;RO=42;SAF=27;SAR=13;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148809;STB=0.583072;TYPE=snp;VARB=0.013762;OID=.;OPOS=56144930;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:42:42:40:40:13:27:22:20:13:27:22:20 chr2 56179009 . C G 307.82 PASS AO=72;DP=145;FAO=72;FDP=145;FR=.;FRO=73;FSAF=27;FSAR=45;FSRF=44;FSRR=29;FWDB=-0.0297407;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=185.7;QD=8.49167;RBI=0.0299631;REFB=0.0038962;REVB=0.00364368;RO=73;SAF=27;SAR=45;SRF=44;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208908;STB=0.615219;TYPE=snp;VARB=-0.00431473;OID=.;OPOS=56179009;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:73:73:72:72:45:27:44:29:45:27:44:29 chr2 56420296 . C T 104.98 PASS AO=27;DP=62;FAO=27;FDP=62;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=0.00890682;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.6;QD=6.77285;RBI=0.0101362;REFB=-0.00998938;REVB=0.00483848;RO=35;SAF=11;SAR=16;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163286;STB=0.592524;TYPE=snp;VARB=0.0198916;OID=.;OPOS=56420296;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:35:35:27:27:16:11:20:15:16:11:20:15 chr2 56612594 . C T 533.63 PASS AO=128;DP=261;FAO=128;FDP=261;FR=.;FRO=133;FSAF=56;FSAR=72;FSRF=69;FSRR=64;FWDB=-0.0187874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9502;QD=8.17819;RBI=0.0317945;REFB=-0.0278216;REVB=-0.0256501;RO=133;SAF=56;SAR=72;SRF=69;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0757593;STB=0.54164;TYPE=snp;VARB=0.0237646;OID=.;OPOS=56612594;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:261:261:133:133:128:128:72:56:69:64:72:56:69:64 chr2 58316814 . A G 268.54 PASS AO=63;DP=129;FAO=63;FDP=129;FR=.;FRO=66;FSAF=28;FSAR=35;FSRF=38;FSRR=28;FWDB=0.00026274;FXX=0.00769172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.443;QD=8.32684;RBI=0.0194827;REFB=-0.017695;REVB=-0.0194809;RO=66;SAF=28;SAR=35;SRF=38;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121211;STB=0.566989;TYPE=snp;VARB=0.014029;OID=.;OPOS=58316814;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:66:66:63:63:35:28:38:28:35:28:38:28 chr2 58388696 . A G 89.07 PASS AO=16;DP=40;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.00176166;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.17;QD=7.74484;RBI=0.00391462;REFB=-0.0126305;REVB=-0.00349583;RO=24;SAF=8;SAR=8;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172932;STB=0.65611;TYPE=snp;VARB=0.0132728;OID=.;OPOS=58388696;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:40:46:24:24:16:22:8:8:16:8:14:8:16:8 chr2 60614572 . G A 178.72 PASS AO=27;DP=37;FAO=27;FDP=37;FR=.;FRO=10;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.0331861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.154;QD=19.3207;RBI=0.0442099;REFB=-0.0488061;REVB=0.0292095;RO=10;SAF=13;SAR=14;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00918014;STB=0.505006;TYPE=snp;VARB=0.0175184;OID=.;OPOS=60614572;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:37:37:10:10:27:27:14:13:5:5:14:13:5:5 chr2 60687959 . A G 54.43 PASS AO=16;DP=44;FAO=16;FDP=44;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=-0.0265021;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.561;QD=4.9483;RBI=0.0285208;REFB=0.00156833;REVB=0.0105391;RO=28;SAF=7;SAR=9;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131019;STB=0.576379;TYPE=snp;VARB=-0.00246838;OID=.;OPOS=60687959;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:44:44:28:28:16:16:9:7:9:19:9:7:9:19 chr2 60867976 . C T 77.76 PASS AO=22;DP=56;FAO=22;FDP=56;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.0484938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.8538;QD=5.55429;RBI=0.0544389;REFB=-0.0284578;REVB=0.0247374;RO=34;SAF=9;SAR=13;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0969754;STB=0.55587;TYPE=snp;VARB=0.0519995;OID=.;OPOS=60867976;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:56:56:34:34:22:22:13:9:17:17:13:9:17:17 chr2 61009813 . T A 13.01 PASS AO=3;DP=12;FAO=3;FDP=10;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0.223637;FXX=0.166528;HRUN=25;LEN=1;MLLD=18.2153;QD=5.20521;RBI=0.224035;REFB=-0.0304147;REVB=-0.0133484;RO=9;SAF=1;SAR=2;SRF=0;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.587597;STB=0.817119;TYPE=snp;VARB=0.0859307;OID=.;OPOS=61009813;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:12:10:9:7:3:3:2:1:0:9:2:1:0:7 chr2 61009909 . C T 93.99 PASS AO=26;DP=65;FAO=26;FDP=64;FR=.;FRO=38;FSAF=1;FSAR=25;FSRF=5;FSRR=33;FWDB=-0.0901127;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.028;QD=5.87452;RBI=0.0960382;REFB=-0.0090518;REVB=-0.0332118;RO=35;SAF=1;SAR=25;SRF=5;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.389849;STB=0.720922;TYPE=snp;VARB=0.0124344;OID=.;OPOS=61009909;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:65:64:35:38:26:26:25:1:5:30:25:1:5:33 chr2 61108959 . G C 22.51 PASS AO=5;DP=14;FAO=5;FDP=14;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=-0.00889732;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.544;QD=6.43158;RBI=0.0278327;REFB=-0.00828347;REVB=-0.0263723;RO=9;SAF=4;SAR=1;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0339569;STB=0.52165;TYPE=snp;VARB=0.0151505;OID=.;OPOS=61108959;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:14:14:9:9:5:5:1:4:7:2:1:4:7:2 chr2 61175312 . T C 285.53 PASS AO=65;DP=129;FAO=65;FDP=129;FR=.;FRO=64;FSAF=17;FSAR=48;FSRF=13;FSRR=51;FWDB=0.000532992;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=212.385;QD=8.85354;RBI=0.0201108;REFB=-0.00431687;REVB=-0.0201038;RO=64;SAF=17;SAR=48;SRF=13;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0708346;STB=0.538893;TYPE=snp;VARB=0.0040982;OID=.;OPOS=61175312;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:64:64:65:65:48:17:13:51:48:17:13:51 chr2 61304271 . A G 238.08 PASS AO=54;DP=107;FAO=54;FDP=107;FR=.;FRO=53;FSAF=21;FSAR=33;FSRF=22;FSRR=31;FWDB=-0.0562777;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.5147;QD=8.90019;RBI=0.0583966;REFB=-0.00533262;REVB=0.0155876;RO=53;SAF=21;SAR=33;SRF=22;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.02455;STB=0.513567;TYPE=snp;VARB=0.006512;OID=.;OPOS=61304271;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:53:53:54:54:33:21:22:31:33:21:22:31 chr2 61385100 . G A 251.31 PASS AO=61;DP=128;FAO=61;FDP=128;FR=.;FRO=67;FSAF=15;FSAR=46;FSRF=38;FSRR=29;FWDB=0.0579308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.4653;QD=7.85352;RBI=0.0665343;REFB=0.0118365;REVB=-0.0327236;RO=66;SAF=15;SAR=46;SRF=38;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.335789;STB=0.684191;TYPE=snp;VARB=-0.0125046;OID=.;OPOS=61385100;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:66:67:61:61:46:15:38:28:46:15:38:29 chr2 61385105 . G C 239.88 PASS AO=61;DP=133;FAO=61;FDP=133;FR=.;FRO=72;FSAF=15;FSAR=46;FSRF=42;FSRR=30;FWDB=-0.0123464;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.959;QD=7.21444;RBI=0.0247943;REFB=0.00170614;REVB=0.0215017;RO=71;SAF=15;SAR=46;SRF=42;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.357412;STB=0.696902;TYPE=snp;VARB=-0.00180816;OID=.;OPOS=61385105;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:71:72:61:61:46:15:42:29:46:15:42:30 chr2 61389737 . T G 368.07 PASS AO=99;DP=230;FAO=101;FDP=230;FR=.;FRO=129;FSAF=29;FSAR=72;FSRF=29;FSRR=100;FWDB=0.0408415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.4912;QD=6.40122;RBI=0.0462807;REFB=0.00070499;REVB=-0.0217686;RO=131;SAF=29;SAR=70;SRF=29;SRR=102;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.092559;STB=0.544295;TYPE=snp;VARB=-0.00297797;OID=.;OPOS=61389737;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:230:230:131:129:99:101:70:29:29:102:72:29:29:100 chr2 61415492 . A G 177.32 PASS AO=45;DP=105;FAO=47;FDP=107;FR=.;FRO=60;FSAF=31;FSAR=16;FSRF=36;FSRR=24;FWDB=0.00285368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.216;QD=6.62886;RBI=0.0101864;REFB=-0.0139749;REVB=0.00977848;RO=59;SAF=29;SAR=16;SRF=36;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.037279;STB=0.536316;TYPE=snp;VARB=0.0156302;OID=.;OPOS=61415492;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:107:59:60:45:47:16:29:36:23:16:31:36:24 chr2 61450454 . A G 323.17 PASS AO=84;DP=188;FAO=85;FDP=189;FR=.;FRO=104;FSAF=20;FSAR=65;FSRF=39;FSRR=65;FWDB=0.0234285;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=86.8587;QD=6.83965;RBI=0.0253874;REFB=-0.00414712;REVB=-0.00977891;RO=101;SAF=19;SAR=65;SRF=39;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19616;STB=0.595935;TYPE=snp;VARB=0.00593422;OID=.;OPOS=61450454;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:189:101:104:84:85:65:19:39:62:65:20:39:65 chr2 61522123 . T C 1541.23 PASS AO=158;DP=159;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226506;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.4897;QD=38.055;RBI=0.0230971;REFB=0;REVB=0.00451966;RO=0;SAF=85;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40066e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00028341;OID=.;OPOS=61522123;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:159:162:0:0:158:162:73:85:0:0:75:87:0:0 chr2 61575308 . A G 1151.5 PASS AO=117;DP=118;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0504374;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.36;QD=38.0662;RBI=0.065734;REFB=0;REVB=0.0421547;RO=0;SAF=43;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000221237;OID=.;OPOS=61575308;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:118:121:0:0:117:121:74:43:0:0:76:45:0:0 chr2 61577435 . T C 147.63 PASS AO=43;DP=108;FAO=43;FDP=107;FR=.;FRO=64;FSAF=30;FSAR=13;FSRF=30;FSRR=34;FWDB=-0.0023696;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.507;QD=5.51881;RBI=0.00358339;REFB=-0.0119794;REVB=-0.00268806;RO=64;SAF=30;SAR=13;SRF=30;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253093;STB=0.643766;TYPE=snp;VARB=0.0156897;OID=.;OPOS=61577435;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:107:64:64:43:43:13:30:30:34:13:30:30:34 chr2 62065759 . C T 421.22 PASS AO=98;DP=205;FAO=102;FDP=210;FR=.;FRO=108;FSAF=46;FSAR=56;FSRF=47;FSRR=61;FWDB=0.0128462;FXX=0.00473911;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.233;QD=8.02328;RBI=0.0214076;REFB=-0.0145991;REVB=-0.0171248;RO=107;SAF=43;SAR=55;SRF=47;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000457943;STB=0.508214;TYPE=snp;VARB=0.0159126;OID=.;OPOS=62065759;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:210:107:108:98:102:55:43:47:60:56:46:47:61 chr2 62066927 . A G 2442.45 PASS AO=256;DP=258;FAO=256;FDP=256;FR=.;FRO=0;FSAF=111;FSAR=145;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.016887;FXX=0.00775164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.8304;QD=38.1632;RBI=0.0177858;REFB=-0.00596665;REVB=0.00558248;RO=1;SAF=111;SAR=145;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00327646;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.1245e-05;OID=.;OPOS=62066927;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:258:256:1:0:256:256:145:111:0:1:145:111:0:0 chr2 62081012 . A C 377.34 PASS AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00926468;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.11;QD=37.7343;RBI=0.0152169;REFB=0;REVB=-0.0120714;RO=0;SAF=23;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.4817e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000453239;OID=.;OPOS=62081012;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:41:40:0:0:40:40:17:23:0:0:17:23:0:0 chr2 62112222 . G A 81 PASS AO=31;DP=78;FAO=31;FDP=82;FR=.;FRO=51;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=32;FWDB=-0.00609811;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=36.2237;QD=3.95131;RBI=0.0191268;REFB=-0.0158002;REVB=-0.0181286;RO=38;SAF=18;SAR=13;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105199;STB=0.62734;TYPE=snp;VARB=0.0465615;OID=.;OPOS=62112222;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:78:82:38:51:31:31:13:18:18:20:13:18:19:32 chr2 62729674 . T C 336.47 PASS AO=85;DP=186;FAO=86;FDP=186;FR=.;FRO=100;FSAF=47;FSAR=39;FSRF=41;FSRR=59;FWDB=0.000720681;FXX=0.0106377;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.659;QD=7.23594;RBI=0.0741094;REFB=-0.0257228;REVB=0.0741059;RO=96;SAF=47;SAR=38;SRF=39;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140007;STB=0.573011;TYPE=snp;VARB=0.0251117;OID=.;OPOS=62729674;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:186:96:100:85:86:38:47:39:57:39:47:41:59 chr2 62738931 . G C 275.6 PASS AO=93;DP=251;FAO=93;FDP=249;FR=.;FRO=156;FSAF=41;FSAR=52;FSRF=65;FSRR=91;FWDB=-0.0203222;FXX=0.00796781;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.3808;QD=4.42731;RBI=0.0506575;REFB=-0.0106869;REVB=-0.0464024;RO=148;SAF=41;SAR=52;SRF=57;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0622141;STB=0.515425;TYPE=snp;VARB=0.0153623;OID=.;OPOS=62738931;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:251:249:148:156:93:93:52:41:57:91:52:41:65:91 chr2 63170921 . C G 112.45 PASS AO=30;DP=80;FAO=33;FDP=83;FR=.;FRO=50;FSAF=9;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=27;FWDB=0.000189961;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.724;QD=5.41919;RBI=0.0137956;REFB=-0.00881011;REVB=-0.0137943;RO=50;SAF=9;SAR=21;SRF=23;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188284;STB=0.625836;TYPE=snp;VARB=0.0166604;OID=.;OPOS=63170921;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:83:50:50:30:33:21:9:23:27:24:9:23:27 chr2 63283178 . C G 31.01 PASS AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.02375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.828;QD=13.7804;RBI=0.0312717;REFB=-0.0152617;REVB=0.0203435;RO=4;SAF=2;SAR=3;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.422723;STB=0.749163;TYPE=snp;VARB=0.0213039;OID=.;OPOS=63283178;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:9:9:4:4:5:5:3:2:4:0:3:2:4:0 chr2 63380061 . G A 324.28 PASS AO=85;DP=192;FAO=86;FDP=192;FR=.;FRO=106;FSAF=40;FSAR=46;FSRF=44;FSRR=62;FWDB=-0.0254884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.5572;QD=6.75574;RBI=0.033006;REFB=-0.011791;REVB=-0.0209699;RO=105;SAF=39;SAR=46;SRF=43;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0496311;STB=0.527853;TYPE=snp;VARB=0.0133072;OID=.;OPOS=63380061;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:192:105:106:85:86:46:39:43:62:46:40:44:62 chr2 63395979 . G A 893.04 PASS AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2251;QD=38.0018;RBI=0.0320042;REFB=0;REVB=0.00607497;RO=0;SAF=37;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.95516e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000213847;OID=.;OPOS=63395979;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:94:94:0:0:94:94:57:37:0:0:57:37:0:0 chr2 63849491 . T C 542.49 PASS AO=133;DP=275;FAO=133;FDP=275;FR=.;FRO=142;FSAF=64;FSAR=69;FSRF=71;FSRR=71;FWDB=-0.0188918;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.704;QD=7.89077;RBI=0.0191632;REFB=-0.0198789;REVB=0.0032137;RO=142;SAF=64;SAR=69;SRF=71;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0176564;STB=0.509711;TYPE=snp;VARB=0.0243378;OID=.;OPOS=63849491;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:275:275:142:142:133:133:69:64:71:71:69:64:71:71 chr2 64069732 . G A 113.76 PASS AO=5;DP=20;FAO=16;FDP=21;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.0102856;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=103.391;QD=21.6676;RBI=0.020501;REFB=-0.0210824;REVB=0.017734;RO=0;SAF=3;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504848;TYPE=snp;VARB=0.0018098;OID=.;OPOS=64069732;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:9:21:0:5:5:16:2:3:0:0:13:3:1:4 chr2 64211078 . A G 595.09 PASS AO=119;DP=216;FAO=126;FDP=230;FR=.;FRO=104;FSAF=70;FSAR=56;FSRF=40;FSRR=64;FWDB=0.0225677;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=40.0859;QD=10.3494;RBI=0.0586452;REFB=-0.0290306;REVB=-0.0541291;RO=97;SAF=69;SAR=50;SRF=36;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171374;STB=0.576911;TYPE=snp;VARB=0.0225963;OID=.;OPOS=64211078;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:216:230:97:104:119:126:50:69:36:61:56:70:40:64 chr2 64860029 . CTTCAAA C 59.5 PASS AO=22;DP=61;FAO=22;FDP=50;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=0.0170425;FXX=0.0908926;HRUN=2;LEN=6;MLLD=235.146;QD=4.76005;RBI=0.0170427;REFB=-0.0159873;REVB=-9.01071e-05;RO=21;SAF=11;SAR=11;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186975;STB=0.579929;TYPE=del;VARB=0.0191276;OID=.;OPOS=64860030;OREF=TTCAAA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:22:49:22:50:28:11:11:10:18:59:21:11:11:6:15 chr2 65044680 . C T 324.66 PASS AO=63;DP=107;FAO=63;FDP=108;FR=.;FRO=45;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=16;FSRR=29;FWDB=0.0419713;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.269;QD=12.0245;RBI=0.0419851;REFB=-0.00507389;REVB=0.00107832;RO=44;SAF=30;SAR=33;SRF=16;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0855799;STB=0.550606;TYPE=snp;VARB=0.00403485;OID=.;OPOS=65044680;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:108:44:45:63:63:33:30:16:28:33:30:16:29 chr2 65245365 . G A 366.54 PASS AO=85;DP=173;FAO=86;FDP=173;FR=.;FRO=87;FSAF=31;FSAR=55;FSRF=29;FSRR=58;FWDB=-0.077878;FXX=0.0114279;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.977;QD=8.47484;RBI=0.0779841;REFB=-0.0105941;REVB=0.00406604;RO=86;SAF=31;SAR=54;SRF=28;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0390608;STB=0.514916;TYPE=snp;VARB=0.0103851;OID=.;OPOS=65245365;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:173:86:87:85:86:54:31:28:58:55:31:29:58 chr2 65296798 . G A 50.99 PASS AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.00114658;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.011;QD=7.28375;RBI=0.0249692;REFB=-0.00732384;REVB=-0.0249429;RO=15;SAF=9;SAR=3;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16979;STB=0.624777;TYPE=snp;VARB=0.00678229;OID=.;OPOS=65296798;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:28:28:15:16:12:12:3:9:9:6:3:9:9:7 chr2 65300752 . C T 766.79 PASS AO=201;DP=434;FAO=191;FDP=399;FR=.;FRO=208;FSAF=99;FSAR=92;FSRF=120;FSRR=88;FWDB=0.0096394;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.566;QD=7.68715;RBI=0.017595;REFB=-0.0126425;REVB=0.0147196;RO=228;SAF=105;SAR=96;SRF=129;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0420843;STB=0.530654;TYPE=snp;VARB=0.0157299;OID=.;OPOS=65300752;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:434:399:228:208:201:191:96:105:129:99:92:99:120:88 chr2 65311031 . A G 335.46 PASS AO=101;DP=250;FAO=101;FDP=249;FR=.;FRO=148;FSAF=43;FSAR=58;FSRF=55;FSRR=93;FWDB=-0.0313309;FXX=0.00399984;HRUN=4;LEN=1;MLLD=74.5961;QD=5.3889;RBI=0.0329001;REFB=-0.00492007;REVB=-0.0100393;RO=141;SAF=43;SAR=58;SRF=55;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0383264;STB=0.533212;TYPE=snp;VARB=0.00672507;OID=.;OPOS=65311031;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:250:249:141:148:101:101:58:43:55:86:58:43:55:93 chr2 65311555 . C T 242.14 PASS AO=48;DP=84;FAO=48;FDP=84;FR=.;FRO=36;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=0.00966708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.553;QD=11.5305;RBI=0.02567;REFB=-0.00602793;REVB=-0.0237802;RO=36;SAF=19;SAR=29;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0285806;STB=0.515651;TYPE=snp;VARB=0.00263327;OID=.;OPOS=65311555;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:36:36:48:48:29:19:13:23:29:19:13:23 chr2 65495887 . G A 3818.34 PASS AO=430;DP=433;FAO=397;FDP=397;FR=.;FRO=0;FSAF=196;FSAR=201;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012366;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.302;QD=38.4719;RBI=0.0199583;REFB=0;REVB=0.0156657;RO=0;SAF=214;SAR=216;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.68513e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.11697e-05;OID=.;OPOS=65495887;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:433:397:0:0:430:397:216:214:0:0:201:196:0:0 chr2 65496144 . A G 1844.98 PASS AO=192;DP=195;FAO=193;FDP=193;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00729736;FXX=0.0102559;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.124;QD=38.2379;RBI=0.0212483;REFB=0;REVB=0.0199559;RO=0;SAF=86;SAR=106;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.64112e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000121619;OID=.;OPOS=65496144;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:87:195:193:0:0:192:193:106:86:0:0:107:86:0:0 chr2 65497571 . C A 760.36 PASS AO=82;DP=83;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=68;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0372482;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=223.595;QD=36.6438;RBI=0.0373672;REFB=0.0118047;REVB=-0.00297995;RO=1;SAF=14;SAR=68;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0326201;STB=0.517237;TYPE=snp;VARB=-5.39011e-05;OID=.;OPOS=65497571;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:83:83:1:1:82:82:68:14:1:0:68:14:1:0 chr2 65539087 . A G 291.1 PASS AO=62;DP=116;FAO=62;FDP=116;FR=.;FRO=54;FSAF=23;FSAR=39;FSRF=13;FSRR=41;FWDB=0.00579097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.1811;QD=10.038;RBI=0.013426;REFB=-0.0365856;REVB=0.0121129;RO=53;SAF=23;SAR=39;SRF=12;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135747;STB=0.56718;TYPE=snp;VARB=0.020035;OID=.;OPOS=65539087;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:53:54:62:62:39:23:12:41:39:23:13:41 chr2 66795906 . T C 988.78 PASS AO=211;DP=391;FAO=212;FDP=389;FR=.;FRO=177;FSAF=71;FSAR=141;FSRF=77;FSRR=100;FWDB=-0.0298034;FXX=0.00511496;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.5635;QD=10.1674;RBI=0.0371048;REFB=-0.00155964;REVB=-0.0221026;RO=174;SAF=71;SAR=140;SRF=76;SRR=98;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0902273;STB=0.549457;TYPE=snp;VARB=0.00106212;OID=.;OPOS=66795906;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:391:389:174:177:211:212:140:71:76:98:141:71:77:100 chr2 67630980 . G A 210.07 PASS AO=48;DP=96;FAO=48;FDP=96;FR=.;FRO=48;FSAF=16;FSAR=32;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=-0.018741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.8794;QD=8.75274;RBI=0.0251559;REFB=0.00102765;REVB=-0.0167808;RO=47;SAF=16;SAR=32;SRF=22;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128711;STB=0.577744;TYPE=snp;VARB=-0.00115569;OID=.;OPOS=67630980;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:47:48:48:48:32:16:22:25:32:16:23:25 chr2 67632125 . C T 229.23 PASS AO=63;DP=152;FAO=65;FDP=154;FR=.;FRO=89;FSAF=24;FSAR=41;FSRF=42;FSRR=47;FWDB=-0.0218912;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.3851;QD=5.95393;RBI=0.0219054;REFB=-0.0127974;REVB=0.000789644;RO=89;SAF=23;SAR=40;SRF=42;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11573;STB=0.561625;TYPE=snp;VARB=0.0163348;OID=.;OPOS=67632125;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:154:89:89:63:65:40:23:42:47:41:24:42:47 chr2 68364478 . T C 298.54 PASS AO=66;DP=127;FAO=66;FDP=127;FR=.;FRO=61;FSAF=29;FSAR=37;FSRF=37;FSRR=24;FWDB=0.0209903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.1943;QD=9.40282;RBI=0.0240039;REFB=-0.0212979;REVB=-0.0116445;RO=61;SAF=29;SAR=37;SRF=37;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145398;STB=0.579886;TYPE=snp;VARB=0.0208351;OID=.;OPOS=68364478;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:61:61:66:66:37:29:37:24:37:29:37:24 chr2 68385097 . AGG AG,A,GGG 127.06 PASS AO=4,3,9;DP=21;FAO=7,0,12;FDP=23;FR=.;FRO=4;FSAF=0,0,1;FSAR=7,0,11;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0148801,-0.00964013,-0.01854;FXX=0;HRUN=3,3,1;LEN=1,2,1;MLLD=19.7125,31.5133,114.88;QD=22.098;RBI=0.197685,0.102828,0.0429936;REFB=-0.0329981,-0.020916,-0.0133447;REVB=-0.197124,-0.102375,0.0387907;RO=4;SAF=0,0,1;SAR=4,3,8;SRF=3;SRR=1;SSEN=0.364486,0.364486,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.755207,-0.729277,-0.476297;STB=0.997915,0.5,0.7851;TYPE=del,del,snp;VARB=-0.173695,0.06672,0.0130705;OID=.,.,.;OPOS=68385098,68385098,68385097;OREF=G,GG,A;OALT=-,-,G;OMAPALT=AG,A,GGG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/3:26:20:23:4:4:4,3,9:7,0,12:4,3,8:0,0,1:3:1:7,0,11:0,0,1:3:1 chr2 68546374 . T C 166.6 PASS AO=12;DP=56;FAO=30;FDP=54;FR=.,HEALED;FRO=15;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.023769;FXX=0.0181785;HRUN=3;LEN=1;MLLD=133.335;QD=12.3407;RBI=0.0264588;REFB=-0.064188;REVB=-0.0116232;RO=14;SAF=9;SAR=3;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121912;STB=0.53361;TYPE=snp;VARB=0.05304;OID=.;OPOS=68546374;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:39:54:14:15:12:30:3:9:9:5:17:13:8:7 chr2 68546449 . G A 193.88 PASS AO=32;DP=48;FAO=32;FDP=48;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=27;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.0103813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.776;QD=16.1566;RBI=0.0214043;REFB=-0.0202155;REVB=0.0187183;RO=16;SAF=5;SAR=27;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157743;STB=0.586897;TYPE=snp;VARB=0.0127184;OID=.;OPOS=68546449;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:48:48:16:16:32:32:27:5:5:11:27:5:5:11 chr2 68622914 . G A 160.72 PASS AO=36;DP=76;FAO=37;FDP=76;FR=.;FRO=39;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=26;FWDB=0.0231838;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.561;QD=8.45912;RBI=0.0238447;REFB=-0.0181213;REVB=0.00557496;RO=39;SAF=22;SAR=14;SRF=13;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.255336;STB=0.632025;TYPE=snp;VARB=0.0163574;OID=.;OPOS=68622914;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:39:39:36:37:14:22:13:26:15:22:13:26 chr2 69049941 . T C 97.08 PASS AO=17;DP=28;FAO=17;FDP=28;FR=.;FRO=11;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.013146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.334;QD=13.8687;RBI=0.013146;REFB=0.0074522;REVB=-2.25067e-06;RO=10;SAF=13;SAR=4;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.057364;STB=0.565136;TYPE=snp;VARB=-0.00357045;OID=.;OPOS=69049941;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:28:28:10:11:17:17:4:13:7:3:4:13:7:4 chr2 69093312 . A G 271.33 PASS AO=63;DP=128;FAO=63;FDP=128;FR=.;FRO=65;FSAF=32;FSAR=31;FSRF=38;FSRR=27;FWDB=0.0275413;FXX=0.0153834;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.4;QD=8.47907;RBI=0.0288515;REFB=-0.00693766;REVB=-0.00859567;RO=65;SAF=32;SAR=31;SRF=38;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0706128;STB=0.538984;TYPE=snp;VARB=0.00824597;OID=.;OPOS=69093312;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:65:65:63:63:31:32:38:27:31:32:38:27 chr2 69659126 . A T 2228.5 PASS AO=233;DP=248;FAO=248;FDP=248;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=173;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.101448;FXX=0.0040159;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.7215;QD=35.9436;RBI=0.101519;REFB=-0.0224454;REVB=0.00378311;RO=2;SAF=60;SAR=173;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0156166;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00465329;OID=.;OPOS=69659126;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:91:248:248:2:0:233:248:173:60:2:0:173:75:0:0 chr2 69693006 . C T 722.92 PASS AO=78;DP=80;FAO=78;FDP=80;FR=.;FRO=2;FSAF=45;FSAR=33;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00662897;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=243.517;QD=36.1462;RBI=0.0568669;REFB=0.0437576;REVB=0.0564792;RO=2;SAF=45;SAR=33;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0205715;STB=0.510867;TYPE=snp;VARB=-9.81683e-05;OID=.;OPOS=69693006;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:80:80:2:2:78:78:33:45:2:0:33:45:2:0 chr2 69736475 . GC G 835.46 PASS AO=114;DP=135;FAO=132;FDP=133;FR=.;FRO=1;FSAF=123;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.111201;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.0994;QD=25.1267;RBI=0.171263;REFB=-0.057617;REVB=0.130252;RO=11;SAF=106;SAR=8;SRF=10;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0130619;STB=0.502024;TYPE=del;VARB=0.0142319;OID=.;OPOS=69736476;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:114:131:132:133:1:123:9:1:0:57:11:106:8:10:1 chr2 69741609 . C T 37.24 PASS AO=9;DP=30;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=0.00742486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.808;QD=4.80491;RBI=0.00965151;REFB=-0.016425;REVB=-0.00616629;RO=19;SAF=7;SAR=2;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198373;STB=0.559328;TYPE=snp;VARB=0.0297099;OID=.;OPOS=69741609;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:30:31:19:20:9:11:2:7:12:7:3:8:13:7 chr2 69741753 . CTGT C 35.6 PASS AO=9;DP=61;FAO=13;FDP=45;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=25;FSRR=7;FWDB=-0.0146274;FXX=0.249958;HRUN=1;LEN=3;MLLD=90.3632;QD=3.1642;RBI=0.0182789;REFB=-0.0293634;REVB=-0.0109617;RO=30;SAF=6;SAR=3;SRF=23;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145861;STB=0.512177;TYPE=del;VARB=0.0650955;OID=.;OPOS=69741754;OREF=TGT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:9:46:13:45:32:10:3:25:7:35:30:6:3:23:7 chr2 69741854 . T G 769.12 PASS AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154185;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=154.822;QD=37.9812;RBI=0.0218947;REFB=0;REVB=0.0155451;RO=0;SAF=34;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.25769e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.40542e-05;OID=.;OPOS=69741854;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:81:81:0:0:81:81:47:34:0:0:47:34:0:0 chr2 70033584 . C T 539.17 PASS AO=125;DP=251;FAO=125;FDP=249;FR=.;FRO=124;FSAF=53;FSAR=72;FSRF=68;FSRR=56;FWDB=0.0236184;FXX=0.00796781;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.553;QD=8.66132;RBI=0.0589037;REFB=0.000192624;REVB=-0.0539612;RO=124;SAF=53;SAR=72;SRF=68;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113371;STB=0.5622;TYPE=snp;VARB=-0.000296266;OID=.;OPOS=70033584;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:251:249:124:124:125:125:72:53:68:56:72:53:68:56 chr2 70162534 . T G 209.54 PASS AO=62;DP=148;FAO=61;FDP=149;FR=.;FRO=88;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=32;FSRR=56;FWDB=0.014281;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.2318;QD=5.62512;RBI=0.0842383;REFB=-0.0089966;REVB=0.083019;RO=85;SAF=34;SAR=28;SRF=30;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199771;STB=0.603625;TYPE=snp;VARB=0.0161187;OID=.;OPOS=70162534;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:149:85:88:62:61:28:34:30:55:28:33:32:56 chr2 70408390 . TG T 569.45 PASS AO=77;DP=107;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.188896;FXX=0.010203;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.9086;QD=23.4824;RBI=0.1889;REFB=0.0255034;REVB=-0.00115781;RO=2;SAF=46;SAR=31;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0.339763;SSSB=0.029553;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00429231;OID=.;OPOS=70408391;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:77:95:97:97:0:61:36:0:0:47:2:46:31:0:2 chr2 70488470 . C T 652.51 PASS AO=225;DP=515;FAO=178;FDP=400;FR=.;FRO=222;FSAF=78;FSAR=100;FSRF=97;FSRR=125;FWDB=0.0296549;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.7248;QD=6.52514;RBI=0.046307;REFB=0.000820788;REVB=-0.0355657;RO=290;SAF=97;SAR=128;SRF=122;SRR=168;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108204;STB=0.500713;TYPE=snp;VARB=-0.00140455;OID=.;OPOS=70488470;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:515:400:290:222:225:178:128:97:122:168:100:78:97:125 chr2 70516458 . A C 30.67 PASS AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=26;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=-0.0352796;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=25.2847;QD=4.71777;RBI=0.0363193;REFB=-0.0404441;REVB=-0.00862788;RO=14;SAF=8;SAR=1;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.44622;STB=0.56307;TYPE=snp;VARB=0.0558479;OID=.;OPOS=70516458;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:25:26:14:17:9:9:1:8:8:6:2:7:12:5 chr2 70524577 . G A 214.68 PASS AO=48;DP=92;FAO=48;FDP=94;FR=.;FRO=46;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=19;FSRR=27;FWDB=0.00989225;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.519;QD=9.13527;RBI=0.0102634;REFB=-0.00945752;REVB=0.00273518;RO=43;SAF=22;SAR=26;SRF=16;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0750119;STB=0.522392;TYPE=snp;VARB=0.0127916;OID=.;OPOS=70524577;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:94:43:46:48:48:26:22:16:27:26:22:19:27 chr2 70528827 . G A 34.04 PASS AO=5;DP=10;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.024782;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=115.327;QD=11.3482;RBI=0.0248303;REFB=-0.0208997;REVB=-0.0015483;RO=5;SAF=1;SAR=4;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.363118;STB=0.780223;TYPE=snp;VARB=0.00609916;OID=.;OPOS=70528827;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:10:12:5:6:5:6:4:1:3:2:5:1:4:2 chr2 70674749 . G C 43.37 PASS AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0255771;FXX=0.0999001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.116;QD=19.2737;RBI=0.0257124;REFB=-0.0140064;REVB=-0.00263349;RO=3;SAF=1;SAR=5;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146968;STB=0.58791;TYPE=snp;VARB=0.00975898;OID=.;OPOS=70674749;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:10:9:3:3:6:6:5:1:1:2:5:1:1:2 chr2 70677994 . G A 93.48 PASS AO=26;DP=75;FAO=29;FDP=78;FR=.;FRO=49;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=33;FWDB=0.0421343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.477;QD=4.79374;RBI=0.042546;REFB=-0.0108911;REVB=-0.00590422;RO=48;SAF=10;SAR=16;SRF=15;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0875426;STB=0.578513;TYPE=snp;VARB=0.023266;OID=.;OPOS=70677994;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:75:78:48:49:26:29:16:10:15:33:16:13:16:33 chr2 71058184 . C T 1934 PASS AO=202;DP=205;FAO=202;FDP=202;FR=.;FRO=0;FSAF=129;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0405129;FXX=0.0146334;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.4427;QD=38.2971;RBI=0.0406348;REFB=0;REVB=-0.00314523;RO=0;SAF=129;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000143065;OID=.;OPOS=71058184;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:91:205:202:0:0:202:202:73:129:0:0:73:129:0:0 chr2 71060936 . G C 1449.59 PASS AO=152;DP=152;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=113;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0430085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.9232;QD=38.147;RBI=0.0600427;REFB=0;REVB=-0.0418974;RO=0;SAF=113;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.78542e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000377665;OID=.;OPOS=71060936;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:152:152:0:0:152:152:39:113:0:0:39:113:0:0 chr2 71062648 . G A 1539.42 PASS AO=163;DP=164;FAO=163;FDP=163;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181896;FXX=0.00609719;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.52;QD=37.7772;RBI=0.0263485;REFB=-0.0409239;REVB=0.0190625;RO=0;SAF=85;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000157198;OID=.;OPOS=71062648;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:164:163:0:0:163:163:78:85:0:0:78:85:0:0 chr2 71062833 . G GC 494.32 PASS AO=55;DP=87;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.112424;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=15.2426;QD=25.3499;RBI=0.211358;REFB=0;REVB=0.178978;RO=28;SAF=14;SAR=41;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.271058;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.01245;OID=.;OPOS=71062834;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:55:87:78:78:0:27:51:0:0:46:28:14:41:18:10 chr2 71190318 . TG T 224.11 PASS AO=25;DP=48;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.244039;FXX=0.078416;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.6076;QD=19.0734;RBI=0.399623;REFB=-0.0300039;REVB=0.316454;RO=12;SAF=12;SAR=13;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187631;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.043929;OID=.;OPOS=71190319;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:25:46:47:47:0:17:30:0:0:19:12:12:13:2:10 chr2 71190384 . C T 92.89 PASS AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=20;FWDB=0.0948705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.5241;QD=7.58298;RBI=0.0961271;REFB=-0.0282185;REVB=-0.0154921;RO=27;SAF=11;SAR=11;SRF=7;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235245;STB=0.632541;TYPE=snp;VARB=0.0370744;OID=.;OPOS=71190384;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:49:49:27:27:22:22:11:11:7:20:11:11:7:20 chr2 71211815 . G A 163.85 PASS AO=43;DP=98;FAO=43;FDP=98;FR=.;FRO=55;FSAF=15;FSAR=28;FSRF=10;FSRR=45;FWDB=-0.0282196;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.035;QD=6.68771;RBI=0.0284122;REFB=-0.025437;REVB=0.00330243;RO=55;SAF=15;SAR=28;SRF=10;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19838;STB=0.609982;TYPE=snp;VARB=0.0292316;OID=.;OPOS=71211815;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:55:55:43:43:28:15:10:45:28:15:10:45 chr2 71211989 . A G 39.81 PASS AO=11;DP=31;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=19;FWDB=-0.00420294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.573;QD=5.13619;RBI=0.00423679;REFB=-0.00721096;REVB=0.000534463;RO=19;SAF=2;SAR=9;SRF=0;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.46341;STB=0.674469;TYPE=snp;VARB=0.00416286;OID=.;OPOS=71211989;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:31:31:19:20:11:11:9:2:0:19:9:2:1:19 chr2 71212405 . T C 33.99 PASS AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=0;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=16;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.355;QD=5.43854;RBI=0.0196269;REFB=0.0188431;REVB=-0.0196269;RO=16;SAF=0;SAR=9;SRF=0;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00968957;OID=.;OPOS=71212405;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:25:25:16:16:9:9:9:0:0:16:9:0:0:16 chr2 71221822 . A G 43 PASS AO=6;DP=8;FAO=6;FDP=8;FR=.;FRO=2;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0317718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.197;QD=21.5015;RBI=0.0319399;REFB=-0.0508505;REVB=0.00327289;RO=2;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144764;STB=0.583085;TYPE=snp;VARB=0.0197339;OID=.;OPOS=71221822;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:8:2:2:6:6:5:1:0:2:5:1:0:2 chr2 71305456 . C T 158.94 PASS AO=33;DP=71;FAO=37;FDP=75;FR=.;FRO=38;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.0143968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.219;QD=8.47691;RBI=0.0185176;REFB=-0.0326308;REVB=-0.0116462;RO=38;SAF=18;SAR=15;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0435141;STB=0.534527;TYPE=snp;VARB=0.0395505;OID=.;OPOS=71305456;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:75:38:38:33:37:15:18:19:19:16:21:19:19 chr2 71360144 . A C 809.19 PASS AO=196;DP=399;FAO=193;FDP=389;FR=.;FRO=196;FSAF=76;FSAR=117;FSRF=70;FSRR=126;FWDB=-0.0133921;FXX=0.0274993;HRUN=4;LEN=1;MLLD=145.27;QD=8.32074;RBI=0.0143522;REFB=-0.0372482;REVB=-0.00516135;RO=195;SAF=76;SAR=120;SRF=64;SRR=131;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.058034;STB=0.519492;TYPE=snp;VARB=0.0307268;OID=.;OPOS=71360144;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:399:389:195:196:196:193:120:76:64:131:117:76:70:126 chr2 71360625 . G T 202.01 PASS AO=36;DP=59;FAO=36;FDP=59;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=5;FSRR=18;FWDB=0.00962903;FXX=0.0166639;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.142;QD=13.6958;RBI=0.00969643;REFB=-0.035665;REVB=0.00114124;RO=23;SAF=12;SAR=24;SRF=5;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0963551;STB=0.552604;TYPE=snp;VARB=0.0354629;OID=.;OPOS=71360625;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:59:59:23:23:36:36:24:12:5:18:24:12:5:18 chr2 71365676 . G A 336.84 PASS AO=68;DP=121;FAO=68;FDP=121;FR=.;FRO=53;FSAF=26;FSAR=42;FSRF=8;FSRR=45;FWDB=0.0190197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.175;QD=11.1351;RBI=0.0249248;REFB=0.00173908;REVB=0.016109;RO=51;SAF=26;SAR=42;SRF=7;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216902;STB=0.612978;TYPE=snp;VARB=-0.000753549;OID=.;OPOS=71365676;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:51:53:68:68:42:26:7:44:42:26:8:45 chr2 71376999 . G A 152.59 PASS AO=37;DP=80;FAO=37;FDP=80;FR=.;FRO=43;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=29;FSRR=14;FWDB=-0.0176114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.664;QD=7.62972;RBI=0.0426808;REFB=-0.00370134;REVB=-0.0388778;RO=42;SAF=25;SAR=12;SRF=29;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0161592;STB=0.50077;TYPE=snp;VARB=0.00396925;OID=.;OPOS=71376999;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:42:43:37:37:12:25:29:13:12:25:29:14 chr2 71413156 . G A 67.11 PASS AO=20;DP=54;FAO=20;FDP=54;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=-0.0588877;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.402;QD=4.97133;RBI=0.0621002;REFB=-0.00962712;REVB=-0.0197148;RO=34;SAF=12;SAR=8;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141084;STB=0.582007;TYPE=snp;VARB=0.0221006;OID=.;OPOS=71413156;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:54:54:34:34:20:20:8:12:16:18:8:12:16:18 chr2 71415479 . T C 177.18 PASS AO=37;DP=70;FAO=37;FDP=70;FR=.;FRO=33;FSAF=3;FSAR=34;FSRF=3;FSRR=30;FWDB=-0.0463997;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.5452;QD=10.1245;RBI=0.0567024;REFB=-0.0261506;REVB=-0.0325918;RO=32;SAF=3;SAR=34;SRF=2;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0551986;STB=0.515143;TYPE=snp;VARB=0.0331133;OID=.;OPOS=71415479;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:32:33:37:37:34:3:2:30:34:3:3:30 chr2 71417065 . G T 158.91 PASS AO=54;DP=148;FAO=54;FDP=150;FR=.;FRO=96;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=30;FSRR=66;FWDB=0.00203018;FXX=0.013157;HRUN=3;LEN=1;MLLD=174.757;QD=4.23768;RBI=0.016014;REFB=-0.00696007;REVB=-0.0158847;RO=93;SAF=25;SAR=29;SRF=30;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15982;STB=0.598202;TYPE=snp;VARB=0.011908;OID=.;OPOS=71417065;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:150:93:96:54:54:29:25:30:63:29:25:30:66 chr2 71417134 . C T 83.2 PASS AO=29;DP=81;FAO=28;FDP=81;FR=.;FRO=53;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=35;FWDB=0.00955255;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9703;QD=4.10843;RBI=0.0202546;REFB=0.000755992;REVB=0.0178605;RO=52;SAF=9;SAR=20;SRF=18;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0454681;STB=0.513504;TYPE=snp;VARB=-0.00139978;OID=.;OPOS=71417134;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:81:81:52:53:29:28:20:9:18:34:19:9:18:35 chr2 71615571 . C T 202.17 PASS AO=53;DP=119;FAO=53;FDP=120;FR=.;FRO=67;FSAF=19;FSAR=34;FSRF=24;FSRR=43;FWDB=-0.00496395;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.1361;QD=6.73911;RBI=0.00646097;REFB=0.00671273;REVB=-0.00413561;RO=66;SAF=19;SAR=34;SRF=24;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0055422;STB=0.500171;TYPE=snp;VARB=-0.0191254;OID=.;OPOS=71615571;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:120:66:67:53:53:34:19:24:42:34:19:24:43 chr2 71633275 . T C 484.77 PASS AO=149;DP=369;FAO=149;FDP=369;FR=.;FRO=220;FSAF=66;FSAR=83;FSRF=82;FSRR=138;FWDB=-0.00441539;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.248;QD=5.25493;RBI=0.00445936;REFB=-0.0104576;REVB=-0.000624709;RO=220;SAF=66;SAR=83;SRF=82;SRR=138;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0767609;STB=0.54283;TYPE=snp;VARB=0.0164833;OID=.;OPOS=71633275;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:369:369:220:220:149:149:83:66:82:138:83:66:82:138 chr2 71633389 . C T 327.73 PASS AO=109;DP=294;FAO=110;FDP=293;FR=.;FRO=183;FSAF=33;FSAR=77;FSRF=46;FSRR=137;FWDB=0.0288973;FXX=0.00677943;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.2;QD=4.47413;RBI=0.0353005;REFB=-0.0106187;REVB=-0.020275;RO=179;SAF=32;SAR=77;SRF=44;SRR=135;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0656679;STB=0.537232;TYPE=snp;VARB=0.0230127;OID=.;OPOS=71633389;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:294:293:179:183:109:110:77:32:44:135:77:33:46:137 chr2 71654175 . G A 601.62 PASS AO=169;DP=391;FAO=169;FDP=390;FR=.;FRO=221;FSAF=90;FSAR=79;FSRF=110;FSRR=111;FWDB=-0.027003;FXX=0.00255748;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.792;QD=6.17048;RBI=0.027003;REFB=-0.00714556;REVB=-1.07913e-05;RO=221;SAF=90;SAR=79;SRF=110;SRR=111;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.035602;STB=0.519755;TYPE=snp;VARB=0.00936281;OID=.;OPOS=71654175;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:391:390:221:221:169:169:79:90:110:111:79:90:110:111 chr2 71661855 . C CA 123.17 PASS AO=74;DP=189;FAO=78;FDP=187;FR=.;FRO=109;FSAF=44;FSAR=34;FSRF=60;FSRR=49;FWDB=0.136851;FXX=0.00531887;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.6341;QD=2.6347;RBI=0.159478;REFB=-0.0267104;REVB=0.0818841;RO=108;SAF=43;SAR=31;SRF=61;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0175952;STB=0.508067;TYPE=ins;VARB=0.04257;OID=.;OPOS=71661856;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:74:189:78:187:109:44:34:60:49:99:108:43:31:61:47 chr2 71747923 . C T 103.85 PASS AO=34;DP=94;FAO=34;FDP=94;FR=.;FRO=60;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=27;FSRR=33;FWDB=-0.0460516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.7267;QD=4.41904;RBI=0.0671489;REFB=-0.0163585;REVB=-0.0488695;RO=58;SAF=11;SAR=23;SRF=26;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146703;STB=0.586525;TYPE=snp;VARB=0.0270989;OID=.;OPOS=71747923;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:58:60:34:34:23:11:26:32:23:11:27:33 chr2 71762232 . C T 466 PASS AO=60;DP=71;FAO=60;FDP=70;FR=.;FRO=10;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=9;FWDB=0.0799195;FXX=0.0277739;HRUN=5;LEN=1;MLLD=55.3808;QD=26.6288;RBI=0.0881697;REFB=-0.119608;REVB=0.0372392;RO=10;SAF=25;SAR=35;SRF=1;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0887714;STB=0.547248;TYPE=snp;VARB=0.0153403;OID=.;OPOS=71762232;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:71:70:10:10:60:60:35:25:1:9:35:25:1:9 chr2 71780215 . T C 1121.06 PASS AO=116;DP=116;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.271;QD=38.327;RBI=0.0240693;REFB=0;REVB=0.0152673;RO=0;SAF=11;SAR=105;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.3085e-05;OID=.;OPOS=71780215;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:116:117:0:0:116:117:105:11:0:0:105:12:0:0 chr2 71795152 . A T 2842.22 PASS AO=296;DP=297;FAO=297;FDP=297;FR=.;FRO=0;FSAF=125;FSAR=172;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0396878;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.507;QD=38.2791;RBI=0.0414568;REFB=0;REVB=0.0119809;RO=1;SAF=124;SAR=172;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00383065;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.00681e-05;OID=.;OPOS=71795152;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:297:297:1:0:296:297:172:124:1:0:172:125:0:0 chr2 71838597 . C A 766.38 PASS AO=81;DP=82;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00307991;FXX=0.0121936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.745;QD=37.846;RBI=0.028296;REFB=0;REVB=0.0281279;RO=0;SAF=38;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18592e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.03911e-05;OID=.;OPOS=71838597;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:82:81:0:0:81:81:43:38:0:0:43:38:0:0 chr2 72692272 . A AAG 1921.11 PASS AO=191;DP=212;FAO=203;FDP=203;FR=.;FRO=0;FSAF=115;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105022;FXX=0.0193227;HRUN=2;LEN=2;MLLD=203.275;QD=37.8544;RBI=0.0151084;REFB=-0.00122364;REVB=0.0108613;RO=17;SAF=114;SAR=77;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0296425;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=8.29784e-05;OID=.;OPOS=72692273;OREF=-;OALT=AG;OMAPALT=AAG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:191:212:203:203:0:115:88:0:0:83:17:114:77:7:10 chr2 73114821 . C T 16.08 PASS AO=3;DP=6;FAO=3;FDP=6;FR=.;FRO=3;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=174.08;QD=10.7207;RBI=0.0100276;REFB=-0.0174978;REVB=-0.0100276;RO=3;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0180513;OID=.;OPOS=73114821;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:6:6:3:3:3:3:3:0:0:3:3:0:0:3 chr2 73137125 . G A 18.73 PASS AO=17;DP=43;FAO=10;FDP=43;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=24;FWDB=0.0185149;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.494;QD=1.74201;RBI=0.02824;REFB=-0.00457438;REVB=0.0213237;RO=20;SAF=13;SAR=4;SRF=3;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.54733;STB=0.796964;TYPE=snp;VARB=0.0207684;OID=.;OPOS=73137125;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:43:43:20:33:17:10:4:13:3:17:3:7:9:24 chr2 73339708 . G A 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0275188;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=73.6256;QD=33.0219;RBI=0.0292991;REFB=0;REVB=-0.0100574;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00074899;OID=.;OPOS=73339708;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:5:0:0:1:5:0:0 chr2 73492614 . A T 50.2 PASS AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=-0.0226423;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.484;QD=6.92377;RBI=0.0254201;REFB=-0.000848247;REVB=-0.0115545;RO=14;SAF=4;SAR=8;SRF=2;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219118;STB=0.526273;TYPE=snp;VARB=0.00203437;OID=.;OPOS=73492614;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:29:29:14:17:12:12:8:4:2:12:8:4:5:12 chr2 73518652 . GCCT GCT,GC 176.03 PASS AO=13,6;DP=26;FAO=25,0;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=12,0;FSAR=13,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.174155,-0.0828823;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,2;MLLD=19.5777,11.1209;QD=27.0817;RBI=0.367942,0.167438;REFB=-0.0479787,0.0714091;REVB=0.324116,0.145485;RO=6;SAF=5,6;SAR=8,0;SRF=2;SRR=4;SSEN=0.206434,0.206434;SSEP=0,0;SSSB=0.0306968,0.780801;STB=0.519984,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.0421509,0;OID=.,.;OPOS=73518653,73518654;OREF=C,CT;OALT=-,-;OMAPALT=GCT,GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:13,6:26:25,0:26:1:12,0:13,0:1:0:12:6:5,6:8,0:2:4 chr2 73519121 . G A 10.29 PASS AO=2;DP=9;FAO=2;FDP=9;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=-0.0100268;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.233;QD=4.57463;RBI=0.0100268;REFB=-0.0961908;REVB=0;RO=7;SAF=2;SAR=0;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.181518;OID=.;OPOS=73519121;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:7:7:2:2:0:2:7:0:0:2:7:0 chr2 73675227 . T TCTC 2305.05 PASS AO=237;DP=260;FAO=247;FDP=247;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=213;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0409816;FXX=0.0351549;HRUN=1;LEN=3;MLLD=280.833;QD=37.3288;RBI=0.0438754;REFB=-0.0185444;REVB=0.0156704;RO=18;SAF=32;SAR=205;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0688623;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.000805667;OID=.;OPOS=73675228;OREF=-;OALT=CTC;OMAPALT=TCTC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:237:260:247:247:0:34:213:0:0:93:18:32:205:7:11 chr2 73675669 . T G 375.71 PASS AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000632951;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.1893;QD=38.5339;RBI=0.0155902;REFB=0;REVB=-0.0155773;RO=0;SAF=9;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.68708e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000188339;OID=.;OPOS=73675669;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:39:39:0:0:39:39:30:9:0:0:30:9:0:0 chr2 73675844 . C T 531.22 PASS AO=52;DP=53;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0642473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.7865;QD=37.2788;RBI=0.0855496;REFB=0;REVB=0.0564891;RO=0;SAF=42;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.05342e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00139654;OID=.;OPOS=73675844;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:53:57:0:0:52:57:10:42:0:0:11:46:0:0 chr2 73828538 . G A 254.54 PASS AO=30;DP=32;FAO=30;FDP=32;FR=.;FRO=2;FSAF=7;FSAR=23;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0984984;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0954;QD=31.8171;RBI=0.117561;REFB=-0.00328392;REVB=0.064176;RO=2;SAF=7;SAR=23;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115888;STB=0.562456;TYPE=snp;VARB=0.00319976;OID=.;OPOS=73828538;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:32:32:2:2:30:30:23:7:2:0:23:7:2:0 chr2 73868565 . AG A 449.03 PASS AO=53;DP=81;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.212875;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.4673;QD=26.0308;RBI=0.38862;REFB=0;REVB=0.325131;RO=9;SAF=31;SAR=22;SRF=0;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0.411765;SSSB=0.158951;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00517901;OID=.;OPOS=73868566;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:53:68:69:69:0:37:32:0:0:40:9:31:22:0:9 chr2 73927931 . A G 1564.6 PASS AO=163;DP=163;FAO=165;FDP=165;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.956;QD=37.9296;RBI=0.0115878;REFB=0;REVB=0.00363414;RO=0;SAF=61;SAR=102;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.78569e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000257753;OID=.;OPOS=73927931;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:163:165:0:0:163:165:102:61:0:0:102:63:0:0 chr2 73928098 . C G 1171.44 PASS AO=124;DP=126;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00597096;FXX=0.00793588;HRUN=3;LEN=1;MLLD=229.169;QD=37.4862;RBI=0.0256061;REFB=-0.0403949;REVB=-0.0249002;RO=0;SAF=60;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.47389e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.59289e-05;OID=.;OPOS=73928098;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:126:125:0:0:124:125:64:60:0:0:64:61:0:0 chr2 73928366 . G C 285.72 PASS AO=25;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=7;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.217526;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=40.3377;QD=38.0958;RBI=0.236411;REFB=0;REVB=0.0925876;RO=0;SAF=4;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.661e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0112727;OID=.;OPOS=73928366;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:30:30:0:0:25:30:21:4:0:0:23:7:0:0 chr2 73957124 . A G 900.71 PASS AO=105;DP=114;FAO=105;FDP=112;FR=.;FRO=7;FSAF=55;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0.00858309;FXX=0.0175423;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.669;QD=32.168;RBI=0.0191463;REFB=0.0218876;REVB=0.0171146;RO=7;SAF=55;SAR=50;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0619417;STB=0.532704;TYPE=snp;VARB=-0.0023548;OID=.;OPOS=73957124;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:114:112:7:7:105:105:50:55:0:7:50:55:0:7 chr2 74007136 . T C 377.83 PASS AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.013682;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.054;QD=37.7834;RBI=0.0175341;REFB=0;REVB=0.0109658;RO=0;SAF=20;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.42628e-05;OID=.;OPOS=74007136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:40:40:0:0:40:40:20:20:0:0:19:21:0:0 chr2 74135797 . T C 1343.04 PASS AO=142;DP=145;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00804715;FXX=0.0137922;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.559;QD=37.5676;RBI=0.0436394;REFB=-0.0496288;REVB=0.042891;RO=1;SAF=85;SAR=57;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00826891;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000619735;OID=.;OPOS=74135797;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:145:143:1:0:142:143:57:85:0:1:58:85:0:0 chr2 74135898 . A G 1094.19 PASS AO=116;DP=117;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0009171;FXX=0.00854628;HRUN=4;LEN=1;MLLD=262.798;QD=37.7305;RBI=0.00893363;REFB=0.0243861;REVB=-0.00888643;RO=1;SAF=37;SAR=79;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0059742;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.27159e-06;OID=.;OPOS=74135898;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:117:116:1:0:116:116:79:37:0:1:79:37:0:0 chr2 74185876 . A T 329.56 PASS AO=71;DP=133;FAO=71;FDP=133;FR=.;FRO=62;FSAF=44;FSAR=27;FSRF=19;FSRR=43;FWDB=0.00784357;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=284.814;QD=9.9115;RBI=0.0198751;REFB=-0.0117655;REVB=-0.018262;RO=62;SAF=44;SAR=27;SRF=19;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.26337;STB=0.644177;TYPE=snp;VARB=0.0102546;OID=.;OPOS=74185876;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:62:62:71:71:27:44:19:43:27:44:19:43 chr2 74328890 . GC G 490.1 PASS AO=67;DP=83;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.340452;FXX=0.0124984;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.5117;QD=24.8151;RBI=0.360789;REFB=0;REVB=0.119419;RO=9;SAF=7;SAR=60;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171521;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0144285;OID=.;OPOS=74328891;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:67:79:79:79:0:13:66:0:0:38:9:7:60:4:5 chr2 74334462 . G A 3411.86 PASS AO=350;DP=353;FAO=356;FDP=356;FR=.;FRO=0;FSAF=183;FSAR=173;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00861952;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.702;QD=38.3355;RBI=0.019016;REFB=0;REVB=-0.0169503;RO=0;SAF=178;SAR=172;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.89783e-06;OID=.;OPOS=74334462;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:353:356:0:0:350:356:172:178:0:0:173:183:0:0 chr2 74362090 . A G 394.24 PASS AO=43;DP=44;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0236061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.661;QD=35.0436;RBI=0.0409454;REFB=-0.168256;REVB=-0.0334556;RO=1;SAF=8;SAR=35;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0132325;STB=0.507039;TYPE=snp;VARB=0.00342245;OID=.;OPOS=74362090;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:44:45:1:1:43:44:35:8:0:1:35:9:0:1 chr2 74362459 . T TAGC 139.72 PASS AO=45;DP=121;FAO=45;FDP=121;FR=.;FRO=76;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=31;FSRR=45;FWDB=-0.0133231;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=3;MLLD=258.788;QD=4.6187;RBI=0.0171844;REFB=-0.0112494;REVB=-0.0108534;RO=74;SAF=23;SAR=22;SRF=30;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115415;STB=0.564647;TYPE=ins;VARB=0.0181577;OID=.;OPOS=74362460;OREF=-;OALT=AGC;OMAPALT=TAGC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:45:121:45:121:76:23:22:31:45:99:74:23:22:30:44 chr2 74441799 . A G 177.44 PASS AO=56;DP=148;FAO=56;FDP=148;FR=.;FRO=92;FSAF=20;FSAR=36;FSRF=38;FSRR=54;FWDB=-0.00473496;FXX=0.0133324;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.673;QD=4.7956;RBI=0.00476253;REFB=-0.00569036;REVB=0.000511751;RO=85;SAF=22;SAR=34;SRF=35;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0210443;STB=0.537024;TYPE=snp;VARB=0.00984498;OID=.;OPOS=74441799;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:85:92:56:56:34:22:35:50:36:20:38:54 chr2 74460685 . C T 74 PASS AO=24;DP=68;FAO=24;FDP=68;FR=.;FRO=44;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=36;FWDB=0.04163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.145;QD=4.35304;RBI=0.0418193;REFB=-0.0162768;REVB=-0.00397467;RO=44;SAF=8;SAR=16;SRF=8;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208514;STB=0.618961;TYPE=snp;VARB=0.0373145;OID=.;OPOS=74460685;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:68:68:44:44:24:24:16:8:8:36:16:8:8:36 chr2 74596527 . C T 435.92 PASS AO=58;DP=142;FAO=72;FDP=125;FR=.,HEALED;FRO=40;FSAF=31;FSAR=41;FSRF=12;FSRR=28;FWDB=-0.136331;FXX=0.0157468;HRUN=3;LEN=1;MLLD=162.562;QD=13.9496;RBI=0.136425;REFB=-0.0488994;REVB=0.00506012;RO=32;SAF=19;SAR=39;SRF=1;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243097;STB=0.548167;TYPE=snp;VARB=0.0247419;OID=.;OPOS=74596527;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:125:32:40:58:72:39:19:1:31:41:31:12:28 chr2 74684948 . TG T 40.15 PASS AO=21;DP=61;FAO=25;FDP=54;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=20;FWDB=-0.0225883;FXX=0.0847314;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.70181;QD=2.97392;RBI=0.137414;REFB=-0.119784;REVB=-0.135545;RO=23;SAF=9;SAR=12;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0771839;STB=0.57181;TYPE=del;VARB=0.0890726;OID=.;OPOS=74684949;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:21:55:25:54:29:11:14:9:20:37:23:9:12:8:15 chr2 74717554 . G A 82.04 PASS AO=15;DP=27;FAO=15;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=11;FWDB=0.130162;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.0278;QD=12.6221;RBI=0.130205;REFB=0.0176255;REVB=-0.0033152;RO=11;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.322042;STB=0.677234;TYPE=snp;VARB=-0.00602608;OID=.;OPOS=74717554;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:27:26:11:11:15:15:10:5:0:11:10:5:0:11 chr2 74725144 . T C 288 PASS AO=21;DP=34;FAO=30;FDP=31;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0403929;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.8901;QD=37.1606;RBI=0.189807;REFB=0;REVB=0.185459;RO=0;SAF=15;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00433332;OID=.;OPOS=74725144;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:31:31:0:0:21:30:6:15:0:0:13:17:0:0 chr2 74763923 . GC G 41.84 PASS AO=17;DP=70;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.0196423;FXX=0.150915;HRUN=8;LEN=1;MLLD=7.58614;QD=3.71872;RBI=0.291522;REFB=-0.166902;REVB=0.290859;RO=15;SAF=15;SAR=2;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.306469;STB=0.660716;TYPE=del;VARB=0.199391;OID=.;OPOS=74763924;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:17:49:22:45:23:16:6:10:13:27:15:15:2:10:5 chr2 75113714 . CT C,CC 595.99 PASS AO=57,17;DP=88;FAO=75,12;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=71,12;FSAR=4,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0732318,-0.109406;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=17.8689,13.4353;QD=27.0904;RBI=0.435362,0.372731;REFB=-0.0513177,0.0204248;REVB=0.429159,0.356313;RO=9;SAF=57,17;SAR=0,0;SRF=6;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0.59901,0;SSSB=0.88698,0.830979;STB=0.503496,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.00060233,0.0607479;OID=.,.;OPOS=75113715,75113715;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:57,17:88:75,12:88:1:71,12:4,0:1:0:9:9:57,17:0,0:6:3 chr2 75113789 . C G 247.45 PASS AO=28;DP=136;FAO=62;FDP=135;FR=.;FRO=73;FSAF=40;FSAR=22;FSRF=31;FSRR=42;FWDB=0.152131;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=79.2113;QD=7.332;RBI=0.152139;REFB=-0.0843734;REVB=0.00159668;RO=54;SAF=6;SAR=22;SRF=18;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174758;STB=0.621018;TYPE=snp;VARB=0.0203513;OID=.;OPOS=75113789;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:135:54:73:28:62:22:6:18:36:22:40:31:42 chr2 75115108 . A G 324.58 PASS AO=66;DP=118;FAO=66;FDP=118;FR=.;FRO=52;FSAF=12;FSAR=54;FSRF=9;FSRR=43;FWDB=0.012183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.787;QD=11.0026;RBI=0.0123429;REFB=-0.0264956;REVB=-0.00198036;RO=52;SAF=12;SAR=54;SRF=9;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119461;STB=0.506525;TYPE=snp;VARB=0.0255049;OID=.;OPOS=75115108;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:52:52:66:66:54:12:9:43:54:12:9:43 chr2 75118737 . C T 92.81 PASS AO=22;DP=48;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=0.0336902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.22;QD=7.73411;RBI=0.0378481;REFB=-0.0133801;REVB=0.0172467;RO=26;SAF=13;SAR=9;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195574;STB=0.610802;TYPE=snp;VARB=0.016266;OID=.;OPOS=75118737;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:48:48:26:26:22:22:9:13:10:16:9:13:10:16 chr2 75124037 . C T 1394.93 PASS AO=147;DP=148;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=106;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0290326;FXX=0.0067563;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.528;QD=37.9573;RBI=0.0293488;REFB=-0.0333836;REVB=-0.00429711;RO=0;SAF=106;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.85017e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.60072e-05;OID=.;OPOS=75124037;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:148:147:0:0:147:147:41:106:0:0:41:106:0:0 chr2 75196731 . A G 309.31 PASS AO=87;DP=208;FAO=87;FDP=206;FR=.;FRO=119;FSAF=32;FSAR=55;FSRF=24;FSRR=95;FWDB=-0.00919312;FXX=0.0418585;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.307;QD=6.0061;RBI=0.0104697;REFB=-0.00835572;REVB=-0.00501011;RO=110;SAF=32;SAR=55;SRF=19;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.227245;STB=0.609114;TYPE=snp;VARB=0.0133613;OID=.;OPOS=75196731;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:206:110:119:87:87:55:32:19:91:55:32:24:95 chr2 75276429 . C G 253.79 PASS AO=65;DP=138;FAO=65;FDP=143;FR=.;FRO=78;FSAF=10;FSAR=55;FSRF=13;FSRR=65;FWDB=-0.0211154;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=321.118;QD=7.09894;RBI=0.0228474;REFB=-0.00835309;REVB=-0.00872603;RO=72;SAF=10;SAR=55;SRF=7;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113019;STB=0.51318;TYPE=snp;VARB=0.00749916;OID=.;OPOS=75276429;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:143:72:78:65:65:55:10:7:65:55:10:13:65 chr2 75425728 . A G 813.23 PASS AO=152;DP=259;FAO=160;FDP=268;FR=.;FRO=108;FSAF=76;FSAR=84;FSRF=63;FSRR=45;FWDB=-0.0653716;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.1954;QD=12.1377;RBI=0.0678905;REFB=-0.0536601;REVB=0.0183213;RO=107;SAF=73;SAR=79;SRF=64;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0897708;STB=0.54357;TYPE=snp;VARB=0.0344511;OID=.;OPOS=75425728;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:259:268:107:108:152:160:79:73:64:43:84:76:63:45 chr2 75646026 . A G 35.8 PASS AO=14;DP=54;FAO=15;FDP=55;FR=.;FRO=40;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=25;FWDB=0.0131476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.2271;QD=2.60328;RBI=0.015351;REFB=-0.0115379;REVB=-0.00792431;RO=39;SAF=9;SAR=5;SRF=15;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.303057;STB=0.705618;TYPE=snp;VARB=0.0194763;OID=.;OPOS=75646026;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:54:55:39:40:14:15:5:9:15:24:5:10:15:25 chr2 75720372 . C T 216.97 PASS AO=56;DP=124;FAO=56;FDP=124;FR=.;FRO=68;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=34;FSRR=34;FWDB=-0.0179225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.6417;QD=6.99914;RBI=0.0222385;REFB=-0.00100287;REVB=-0.0131656;RO=68;SAF=26;SAR=30;SRF=34;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0352009;STB=0.519623;TYPE=snp;VARB=0.000591576;OID=.;OPOS=75720372;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:68:68:56:56:30:26:34:34:30:26:34:34 chr2 75720568 . CGCTGTCGCT C 96.88 PASS AO=59;DP=257;FAO=59;FDP=237;FR=.;FRO=178;FSAF=21;FSAR=38;FSRF=84;FSRR=94;FWDB=-0.0164075;FXX=0.0481908;HRUN=1;LEN=9;MLLD=218.447;QD=1.63517;RBI=0.0179042;REFB=-0.0127633;REVB=0.0071661;RO=111;SAF=21;SAR=38;SRF=43;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0385768;STB=0.590031;TYPE=del;VARB=0.0449822;OID=.;OPOS=75720569;OREF=GCTGTCGCT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:59:190:59:237:178:21:38:84:94:96:111:21:38:43:68 chr2 75720664 . G A 306.43 PASS AO=67;DP=143;FAO=73;FDP=149;FR=.;FRO=76;FSAF=11;FSAR=62;FSRF=13;FSRR=63;FWDB=0.0160756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.971;QD=8.22621;RBI=0.0161067;REFB=-0.00740875;REVB=-0.00100044;RO=75;SAF=9;SAR=58;SRF=13;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0746285;STB=0.519729;TYPE=snp;VARB=0.0082882;OID=.;OPOS=75720664;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:149:75:76:67:73:58:9:13:62:62:11:13:63 chr2 75744918 . T C 250.24 PASS AO=46;DP=86;FAO=51;FDP=91;FR=.;FRO=40;FSAF=33;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=15;FWDB=0.0144512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.448;QD=10.9997;RBI=0.0168879;REFB=-0.00719126;REVB=0.00873874;RO=37;SAF=30;SAR=16;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0270337;STB=0.510544;TYPE=snp;VARB=0.00283713;OID=.;OPOS=75744918;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:91:37:40:46:51:16:30:23:14:18:33:25:15 chr2 75883829 . A G 521.9 PASS AO=124;DP=251;FAO=124;FDP=251;FR=.;FRO=127;FSAF=44;FSAR=80;FSRF=71;FSRR=56;FWDB=-0.00592256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.905;QD=8.31716;RBI=0.00750019;REFB=-0.00827093;REVB=-0.00460176;RO=126;SAF=44;SAR=80;SRF=71;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195757;STB=0.605884;TYPE=snp;VARB=0.00628927;OID=.;OPOS=75883829;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:251:251:126:127:124:124:80:44:71:55:80:44:71:56 chr2 75893101 . G C 480.24 PASS AO=106;DP=209;FAO=107;FDP=206;FR=.;FRO=99;FSAF=59;FSAR=48;FSRF=56;FSRR=43;FWDB=-0.0119169;FXX=0.0190467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.5;QD=9.32503;RBI=0.0463508;REFB=0.00124643;REVB=0.0447927;RO=96;SAF=59;SAR=47;SRF=55;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0143806;STB=0.506932;TYPE=snp;VARB=-0.000914631;OID=.;OPOS=75893101;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:206:96:99:106:107:47:59:55:41:48:59:56:43 chr2 75907351 . T C 280.02 PASS AO=92;DP=243;FAO=92;FDP=242;FR=.;FRO=150;FSAF=45;FSAR=47;FSRF=69;FSRR=81;FWDB=-0.0261677;FXX=0.00819639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.8498;QD=4.62841;RBI=0.0404271;REFB=0.00512755;REVB=-0.0308156;RO=144;SAF=45;SAR=47;SRF=66;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0334432;STB=0.518075;TYPE=snp;VARB=-0.0106946;OID=.;OPOS=75907351;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:243:242:144:150:92:92:47:45:66:78:47:45:69:81 chr2 75915035 . C T 793.91 PASS AO=180;DP=347;FAO=180;FDP=347;FR=.;FRO=167;FSAF=81;FSAR=99;FSRF=93;FSRR=74;FWDB=-0.00881731;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.031;QD=9.1517;RBI=0.00882314;REFB=0.000431645;REVB=-0.000320735;RO=167;SAF=81;SAR=99;SRF=93;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0941726;STB=0.55142;TYPE=snp;VARB=-0.000384196;OID=.;OPOS=75915035;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:347:347:167:167:180:180:99:81:93:74:99:81:93:74 chr2 75923413 . T C 697.38 PASS AO=74;DP=75;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.076042;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.4957;QD=36.7044;RBI=0.080695;REFB=-0.0517396;REVB=0.0270054;RO=1;SAF=32;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145539;STB=0.507461;TYPE=snp;VARB=0.000985085;OID=.;OPOS=75923413;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:75:76:1:1:74:75:42:32:1:0:42:33:1:0 chr2 76672457 . G T 195.69 PASS AO=35;DP=56;FAO=35;FDP=56;FR=.;FRO=21;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=0.0143799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.8448;QD=13.978;RBI=0.0177673;REFB=-0.0062182;REVB=0.0104353;RO=21;SAF=22;SAR=13;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234705;STB=0.628498;TYPE=snp;VARB=0.0050376;OID=.;OPOS=76672457;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:56:56:21:21:35:35:13:22:6:15:13:22:6:15 chr2 79254261 . T C 1889.37 PASS AO=196;DP=196;FAO=197;FDP=197;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235567;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.5973;QD=38.3629;RBI=0.0545636;REFB=0;REVB=-0.0492165;RO=0;SAF=94;SAR=102;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.16204e-05;OID=.;OPOS=79254261;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:89:196:197:0:0:196:197:102:94:0:0:102:95:0:0 chr2 79255325 . G C 104.77 PASS AO=33;DP=89;FAO=33;FDP=89;FR=.;FRO=56;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=24;FSRR=32;FWDB=-0.0038545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.281;QD=4.70867;RBI=0.00454109;REFB=-0.00535859;REVB=-0.00240089;RO=56;SAF=14;SAR=19;SRF=24;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00485597;STB=0.502784;TYPE=snp;VARB=0.0129818;OID=.;OPOS=79255325;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:56:56:33:33:19:14:24:32:19:14:24:32 chr2 79350347 . A G 944.05 PASS AO=98;DP=100;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0867248;FXX=0.019998;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.9277;QD=38.5324;RBI=0.0867258;REFB=0;REVB=0.000426023;RO=0;SAF=49;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000510704;OID=.;OPOS=79350347;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:100:98:0:0:98:98:49:49:0:0:49:49:0:0 chr2 79385786 . T C 41.14 PASS AO=38;DP=190;FAO=38;FDP=190;FR=.;FRO=152;FSAF=30;FSAR=8;FSRF=92;FSRR=60;FWDB=-0.0319565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.3;QD=0.8662;RBI=0.0322668;REFB=-0.0023569;REVB=0.00446464;RO=152;SAF=30;SAR=8;SRF=92;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.276963;STB=0.676291;TYPE=snp;VARB=0.0156526;OID=.;OPOS=79385786;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:190:190:152:152:38:38:8:30:92:60:8:30:92:60 chr2 79385787 . G A 41.65 PASS AO=38;DP=189;FAO=38;FDP=189;FR=.;FRO=151;FSAF=30;FSAR=8;FSRF=92;FSRR=59;FWDB=0.0242522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.371;QD=0.881487;RBI=0.0357386;REFB=-0.0163479;REVB=-0.0262503;RO=143;SAF=30;SAR=8;SRF=84;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.297931;STB=0.673041;TYPE=snp;VARB=0.0253599;OID=.;OPOS=79385787;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:189:189:143:151:38:38:8:30:84:59:8:30:92:59 chr2 80801346 . T C 811.68 PASS AO=93;DP=97;FAO=93;FDP=99;FR=.;FRO=6;FSAF=44;FSAR=49;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.00104529;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.6347;QD=32.7949;RBI=0.0630912;REFB=-0.0853155;REVB=-0.0630825;RO=4;SAF=45;SAR=48;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0182945;STB=0.508502;TYPE=snp;VARB=0.00724625;OID=.;OPOS=80801346;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:97:99:4:6:93:93:48:45:1:3:49:44:2:4 chr2 82194270 . A G 421.47 PASS AO=52;DP=59;FAO=52;FDP=59;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=47;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=0.0158133;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.664;QD=28.5744;RBI=0.0395594;REFB=-0.0328548;REVB=0.0362613;RO=7;SAF=5;SAR=47;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.338073;STB=0.682872;TYPE=snp;VARB=0.00636925;OID=.;OPOS=82194270;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:59:59:7:7:52:52:47:5:6:1:47:5:6:1 chr2 84756049 . G A 2333.36 PASS AO=255;DP=262;FAO=256;FDP=263;FR=.;FRO=7;FSAF=115;FSAR=141;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=-0.0122898;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.239;QD=35.4884;RBI=0.0152246;REFB=-0.0859017;REVB=-0.00898602;RO=6;SAF=114;SAR=141;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0198486;STB=0.508252;TYPE=snp;VARB=0.00266039;OID=.;OPOS=84756049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:262:263:6:7:255:256:141:114:0:6:141:115:1:6 chr2 84771480 . G A 2027.54 PASS AO=212;DP=213;FAO=212;FDP=212;FR=.;FRO=0;FSAF=109;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0151638;FXX=0.00469462;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.376;QD=38.2554;RBI=0.0304479;REFB=0;REVB=0.0264033;RO=0;SAF=109;SAR=103;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.22536e-05;OID=.;OPOS=84771480;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:96:213:212:0:0:212:212:103:109:0:0:103:109:0:0 chr2 84771567 . C T 1450.07 PASS AO=154;DP=157;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00276965;FXX=0.012738;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.448;QD=37.4212;RBI=0.00476445;REFB=-0.0649681;REVB=0.00387673;RO=1;SAF=68;SAR=86;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00694444;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000481562;OID=.;OPOS=84771567;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:157:155:1:0:154:155:86:68:1:0:87:68:0:0 chr2 84800605 . C A 1311.27 PASS AO=138;DP=139;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0270857;FXX=0.00719373;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.365;QD=38.0078;RBI=0.0271812;REFB=0.00400823;REVB=-0.00227577;RO=1;SAF=90;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0052537;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.80245e-05;OID=.;OPOS=84800605;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:139:138:1:0:138:138:48:90:1:0:48:90:0:0 chr2 84848596 . G A 231.59 PASS AO=60;DP=133;FAO=60;FDP=133;FR=.;FRO=73;FSAF=24;FSAR=36;FSRF=42;FSRR=31;FWDB=-0.0378561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.444;QD=6.96512;RBI=0.0403248;REFB=0.00467631;REVB=0.0138928;RO=73;SAF=24;SAR=36;SRF=42;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172965;STB=0.596353;TYPE=snp;VARB=-0.00619505;OID=.;OPOS=84848596;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:73:73:60:60:36:24:42:31:36:24:42:31 chr2 84897517 . A G 233.51 PASS AO=30;DP=36;FAO=30;FDP=35;FR=.;FRO=5;FSAF=23;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.00493066;FXX=0.0277701;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.907;QD=26.6865;RBI=0.0360965;REFB=-0.0861656;REVB=0.0357581;RO=5;SAF=23;SAR=7;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125299;STB=0.567853;TYPE=snp;VARB=0.00126855;OID=.;OPOS=84897517;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:36:35:5:5:30:30:7:23:2:3:7:23:2:3 chr2 85133216 . G A 108.77 PASS AO=27;DP=61;FAO=27;FDP=61;FR=.;FRO=34;FSAF=6;FSAR=21;FSRF=8;FSRR=26;FWDB=0.0161079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.529;QD=7.13271;RBI=0.0308378;REFB=0.00279141;REVB=-0.0262964;RO=34;SAF=6;SAR=21;SRF=8;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.018373;STB=0.510409;TYPE=snp;VARB=-0.00319332;OID=.;OPOS=85133216;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:34:34:27:27:21:6:8:26:21:6:8:26 chr2 85573033 . G A 468.7 PASS AO=80;DP=122;FAO=81;FDP=123;FR=.;FRO=42;FSAF=45;FSAR=36;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=0.0501313;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.9157;QD=15.2424;RBI=0.0586965;REFB=0.00673784;REVB=0.0305309;RO=42;SAF=45;SAR=35;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0706511;STB=0.535381;TYPE=snp;VARB=-0.00267741;OID=.;OPOS=85573033;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:123:42:42:80:81:35:45:19:23:36:45:19:23 chr2 85622059 . T C 420.13 PASS AO=46;DP=47;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00721707;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.532;QD=37.3452;RBI=0.0569463;REFB=0;REVB=0.0564871;RO=0;SAF=33;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.94744e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000243947;OID=.;OPOS=85622059;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:47:45:0:0:46:45:13:33:0:0:12:33:0:0 chr2 85662149 . A C 21.06 PASS AO=3;DP=8;FAO=3;FDP=8;FR=.,HEALED;FRO=4;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0183034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.493;QD=10.5293;RBI=0.0458839;REFB=0.00397431;REVB=0.0420752;RO=3;SAF=2;SAR=1;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.255936;STB=0.725852;TYPE=snp;VARB=0.157151;OID=.;OPOS=85662149;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:8:8:3:4:3:3:1:2:1:2:1:2:1:3 chr2 85769711 . C G 2291.44 PASS AO=216;DP=216;FAO=240;FDP=240;FR=.;FRO=0;FSAF=109;FSAR=131;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0241263;FXX=0.00414921;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.061;QD=38.1906;RBI=0.0250894;REFB=0;REVB=0.00688479;RO=0;SAF=104;SAR=112;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000125994;OID=.;OPOS=85769711;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:216:240:0:0:216:240:112:104:0:0:131:109:0:0 chr2 85780107 . G A 302.54 PASS AO=82;DP=186;FAO=82;FDP=187;FR=.;FRO=105;FSAF=39;FSAR=43;FSRF=50;FSRR=55;FWDB=-0.0171627;FXX=0.0105815;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.9543;QD=6.4715;RBI=0.0468723;REFB=-0.0223564;REVB=0.0436171;RO=104;SAF=40;SAR=42;SRF=50;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00707426;STB=0.500327;TYPE=snp;VARB=0.0289177;OID=.;OPOS=85780107;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:187:104:105:82:82:42:40:50:54:43:39:50:55 chr2 85780131 . G A 507.15 PASS AO=108;DP=202;FAO=109;FDP=202;FR=.;FRO=93;FSAF=45;FSAR=64;FSRF=44;FSRR=49;FWDB=0.0144616;FXX=0.00492587;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.061;QD=10.0427;RBI=0.0211035;REFB=-0.00242283;REVB=0.0153694;RO=92;SAF=45;SAR=63;SRF=43;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0435959;STB=0.528332;TYPE=snp;VARB=0.00201308;OID=.;OPOS=85780131;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:202:92:93:108:109:63:45:43:49:64:45:44:49 chr2 85780536 . C T 144.31 PASS AO=30;DP=71;FAO=35;FDP=76;FR=.;FRO=41;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=0.000443915;FXX=0.0256377;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.5443;QD=7.59542;RBI=0.0524643;REFB=-0.0196732;REVB=0.0524625;RO=36;SAF=19;SAR=11;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133124;STB=0.538257;TYPE=snp;VARB=0.0251893;OID=.;OPOS=85780536;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:76:36:41:30:35:11:19:18:18:13:22:23:18 chr2 85781318 . T G 450.94 PASS AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00238202;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.445;QD=38.3777;RBI=0.0446249;REFB=0;REVB=0.0445612;RO=0;SAF=32;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.87345e-05;OID=.;OPOS=85781318;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:48:47:0:0:47:47:15:32:0:0:15:32:0:0 chr2 85806266 . C T 242.79 PASS AO=48;DP=89;FAO=51;FDP=94;FR=.;FRO=43;FSAF=17;FSAR=34;FSRF=8;FSRR=35;FWDB=0.0949798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.4987;QD=10.3317;RBI=0.0955756;REFB=-0.0161554;REVB=0.0106553;RO=41;SAF=17;SAR=31;SRF=8;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153614;STB=0.579803;TYPE=snp;VARB=0.0178879;OID=.;OPOS=85806266;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:94:41:43:48:51:31:17:8:33:34:17:8:35 chr2 85808737 . A G 2455.18 PASS AO=255;DP=256;FAO=260;FDP=260;FR=.;FRO=0;FSAF=100;FSAR=160;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0431244;FXX=0.0076333;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.8618;QD=37.772;RBI=0.0628497;REFB=-0.00147433;REVB=-0.0457206;RO=1;SAF=96;SAR=159;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0049397;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00037072;OID=.;OPOS=85808737;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:256:260:1:0:255:260:159:96:1:0:160:100:0:0 chr2 85808982 . T C 2887.4 PASS AO=303;DP=305;FAO=303;FDP=303;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=234;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0549137;FXX=0.00655716;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.2109;QD=38.1174;RBI=0.0560125;REFB=-0.0201242;REVB=-0.0110402;RO=0;SAF=69;SAR=234;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.97111e-05;OID=.;OPOS=85808982;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:305:303:0:0:303:303:234:69:0:0:234:69:0:0 chr2 85843431 . C T 14.35 PASS AO=3;DP=10;FAO=3;FDP=10;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.00471642;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.2269;QD=5.74046;RBI=0.0511887;REFB=-0.00281064;REVB=-0.050971;RO=7;SAF=2;SAR=1;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240731;STB=0.665556;TYPE=snp;VARB=-0.00296133;OID=.;OPOS=85843431;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:10:10:7:7:3:3:1:2:3:4:1:2:3:4 chr2 85894308 . G T 813.52 PASS AO=94;DP=101;FAO=95;FDP=101;FR=.;FRO=6;FSAF=50;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.00216137;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=139.755;QD=32.2188;RBI=0.0208472;REFB=-0.00134384;REVB=0.0207348;RO=5;SAF=49;SAR=45;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0307291;STB=0.531243;TYPE=snp;VARB=0.000183963;OID=.;OPOS=85894308;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:101:101:5:6:94:95:45:49:1:4:45:50:0:6 chr2 85895338 . T G 472.04 PASS AO=43;DP=43;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0538162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.31;QD=38.534;RBI=0.0538605;REFB=0;REVB=0.00218567;RO=0;SAF=8;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.54187e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.00351e-05;OID=.;OPOS=85895338;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:43:49:0:0:43:49:35:8:0:0:35:14:0:0 chr2 85924729 . C T 342.37 PASS AO=88;DP=192;FAO=89;FDP=195;FR=.;FRO=106;FSAF=48;FSAR=41;FSRF=41;FSRR=65;FWDB=0.00626284;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=159.633;QD=7.02304;RBI=0.0409374;REFB=-0.000532543;REVB=-0.0404555;RO=104;SAF=48;SAR=40;SRF=41;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146991;STB=0.582333;TYPE=snp;VARB=0.00045795;OID=.;OPOS=85924729;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:195:104:106:88:89:40:48:41:63:41:48:41:65 chr2 85925529 . A G 142.04 PASS AO=43;DP=114;FAO=44;FDP=114;FR=.;FRO=70;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=42;FSRR=28;FWDB=0.00809789;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.455;QD=4.98396;RBI=0.0146655;REFB=-0.00997125;REVB=-0.0122271;RO=71;SAF=15;SAR=28;SRF=42;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265332;STB=0.659019;TYPE=snp;VARB=0.0216465;OID=.;OPOS=85925529;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:71:70:43:44:28:15:42:29:29:15:42:28 chr2 85925756 . C G 291.03 PASS AO=54;DP=90;FAO=54;FDP=90;FR=.;FRO=36;FSAF=34;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=-0.00390765;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.1092;QD=12.9346;RBI=0.0173345;REFB=0.00889787;REVB=0.0168883;RO=35;SAF=34;SAR=20;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1889;STB=0.608619;TYPE=snp;VARB=-0.00844748;OID=.;OPOS=85925756;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:35:36:54:54:20:34:13:22:20:34:13:23 chr2 85925848 . C G 317.54 PASS AO=73;DP=143;FAO=73;FDP=144;FR=.;FRO=71;FSAF=32;FSAR=41;FSRF=37;FSRR=34;FWDB=0.0402801;FXX=0.00689608;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.132;QD=8.82065;RBI=0.0402906;REFB=-0.0119928;REVB=-0.000918007;RO=70;SAF=31;SAR=42;SRF=37;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0931114;STB=0.54101;TYPE=snp;VARB=0.00990242;OID=.;OPOS=85925848;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:144:70:71:73:73:42:31:37:33:41:32:37:34 chr2 86259443 . C T 105.97 PASS AO=21;DP=39;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=17;FWDB=0.0158687;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=208.099;QD=10.869;RBI=0.017252;REFB=-0.000892312;REVB=-0.0067689;RO=18;SAF=5;SAR=16;SRF=1;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240402;STB=0.632081;TYPE=snp;VARB=0.000796478;OID=.;OPOS=86259443;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:39:39:18:18:21:21:16:5:1:17:16:5:1:17 chr2 86272758 . G A 136.17 PASS AO=29;DP=60;FAO=31;FDP=63;FR=.;FRO=32;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=0.0244712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.687;QD=8.64553;RBI=0.0459119;REFB=-0.0209169;REVB=-0.0388466;RO=31;SAF=20;SAR=9;SRF=20;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0468319;STB=0.529797;TYPE=snp;VARB=0.0196168;OID=.;OPOS=86272758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:63:31:32:29:31:9:20:20:11:10:21:20:12 chr2 86315741 . C T 231.31 PASS AO=56;DP=117;FAO=56;FDP=118;FR=.;FRO=62;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=29;FSRR=33;FWDB=0.00858684;FXX=0.00840265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.907;QD=7.84089;RBI=0.0151336;REFB=-0.00757714;REVB=-0.0124616;RO=60;SAF=32;SAR=24;SRF=29;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0827725;STB=0.554725;TYPE=snp;VARB=0.00966404;OID=.;OPOS=86315741;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:118:60:62:56:56:24:32:29:31:24:32:29:33 chr2 86317037 . G C 421.33 PASS AO=107;DP=230;FAO=107;FDP=230;FR=.;FRO=123;FSAF=47;FSAR=60;FSRF=61;FSRR=62;FWDB=0.00255214;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=262.988;QD=7.32748;RBI=0.0107165;REFB=0.00696372;REVB=0.0104081;RO=120;SAF=47;SAR=60;SRF=59;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.05058;STB=0.530533;TYPE=snp;VARB=-0.00745407;OID=.;OPOS=86317037;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:230:230:120:123:107:107:60:47:59:61:60:47:61:62 chr2 86335612 . T C 214.62 PASS AO=57;DP=130;FAO=57;FDP=130;FR=.;FRO=73;FSAF=16;FSAR=41;FSRF=39;FSRR=34;FWDB=0.00357043;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=290.63;QD=6.60361;RBI=0.00421207;REFB=-0.00376703;REVB=0.00223463;RO=73;SAF=16;SAR=41;SRF=39;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.271786;STB=0.652621;TYPE=snp;VARB=0.0050123;OID=.;OPOS=86335612;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:73:73:57:57:41:16:39:34:41:16:39:34 chr2 86363074 . A G 231.36 PASS AO=69;DP=171;FAO=69;FDP=171;FR=.;FRO=102;FSAF=39;FSAR=30;FSRF=65;FSRR=37;FWDB=0.0118297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.309;QD=5.41188;RBI=0.0124786;REFB=-0.0283282;REVB=0.00397159;RO=102;SAF=39;SAR=30;SRF=65;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0788111;STB=0.544205;TYPE=snp;VARB=0.0448897;OID=.;OPOS=86363074;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:171:102:102:69:69:30:39:65:37:30:39:65:37 chr2 86400824 . G A 491.13 PASS AO=116;DP=247;FAO=121;FDP=246;FR=.;FRO=125;FSAF=55;FSAR=66;FSRF=48;FSRR=77;FWDB=0.00907007;FXX=0.00404842;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.281;QD=7.98582;RBI=0.00990239;REFB=-0.00591086;REVB=0.00397381;RO=125;SAF=51;SAR=65;SRF=48;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0536188;STB=0.536378;TYPE=snp;VARB=0.00716254;OID=.;OPOS=86400824;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:247:246:125:125:116:121:65:51:48:77:66:55:48:77 chr2 86406556 . C T 266.35 PASS AO=62;DP=126;FAO=62;FDP=125;FR=.;FRO=63;FSAF=39;FSAR=23;FSRF=40;FSRR=23;FWDB=0.0225217;FXX=0.00793588;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.834;QD=8.52316;RBI=0.0268588;REFB=-0.0031374;REVB=0.0146346;RO=63;SAF=39;SAR=23;SRF=40;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00576624;STB=0.503184;TYPE=snp;VARB=0.0039069;OID=.;OPOS=86406556;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:125:63:63:62:62:23:39:40:23:23:39:40:23 chr2 86439550 . CGGC CGC,CG 263.99 PASS AO=21,16;DP=89;FAO=47,0;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=40,0;FSAR=7,0;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.255047,-0.0343753;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,2;MLLD=13.7381,48.8636;QD=21.9988;RBI=0.284211,0.048747;REFB=-0.0589643,-0.006598;REVB=0.125408,0.0345632;RO=8;SAF=17,15;SAR=4,1;SRF=6;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0467404,0.316784;STB=0.533319,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.0394687,0;OID=.,.;OPOS=86439551,86439552;OREF=G,GC;OALT=-,-;OMAPALT=CGC,CG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:21,16:46:47,0:48:1:40,0:7,0:0:1:18:8:17,15:4,1:6:2 chr2 86440718 . T C 518.38 PASS AO=100;DP=169;FAO=100;FDP=169;FR=.;FRO=69;FSAF=46;FSAR=54;FSRF=31;FSRR=38;FWDB=-0.00168308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.949;QD=12.2695;RBI=0.0149575;REFB=-0.00298904;REVB=0.0148626;RO=68;SAF=46;SAR=54;SRF=30;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141598;STB=0.504409;TYPE=snp;VARB=0.00176631;OID=.;OPOS=86440718;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:169:68:69:100:100:54:46:30:38:54:46:31:38 chr2 86441334 . C CTGTT 358.94 PASS AO=79;DP=158;FAO=79;FDP=151;FR=.;FRO=72;FSAF=42;FSAR=37;FSRF=29;FSRR=43;FWDB=0.0111289;FXX=0.0258048;HRUN=1;LEN=4;MLLD=235.452;QD=9.50823;RBI=0.0126209;REFB=-0.0102951;REVB=0.00595265;RO=75;SAF=42;SAR=37;SRF=30;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11629;STB=0.561201;TYPE=ins;VARB=0.00946488;OID=.;OPOS=86441335;OREF=-;OALT=TGTT;OMAPALT=CTGTT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:79:158:79:151:72:42:37:29:43:99:75:42:37:30:45 chr2 86481835 . C T 149.78 PASS AO=53;DP=151;FAO=53;FDP=151;FR=.;FRO=98;FSAF=23;FSAR=30;FSRF=51;FSRR=47;FWDB=0.00729678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.8;QD=3.96765;RBI=0.0288537;REFB=0.00512826;REVB=-0.0279159;RO=97;SAF=23;SAR=30;SRF=50;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0924292;STB=0.55623;TYPE=snp;VARB=-0.011202;OID=.;OPOS=86481835;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:151:97:98:53:53:30:23:50:47:30:23:51:47 chr2 86683642 . A G 464.31 PASS AO=50;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0255182;FXX=0.0377287;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.5545;QD=36.4164;RBI=0.02645;REFB=0;REVB=0.00695886;RO=0;SAF=16;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00524665;OID=.;OPOS=86683642;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:52:51:0:0:50:51:34:16:0:0:34:17:0:0 chr2 86691250 . G A 3178.8 PASS AO=338;DP=348;FAO=338;FDP=338;FR=.;FRO=0;FSAF=125;FSAR=213;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260363;FXX=0.0287348;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.131;QD=37.619;RBI=0.0523875;REFB=-0.100581;REVB=0.0454594;RO=4;SAF=125;SAR=213;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00287021;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000691774;OID=.;OPOS=86691250;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:348:338:4:0:338:338:213:125:1:3:213:125:0:0 chr2 86707313 . G A 177.19 PASS AO=46;DP=103;FAO=46;FDP=103;FR=.;FRO=57;FSAF=17;FSAR=29;FSRF=22;FSRR=35;FWDB=0.00455552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.2814;QD=6.8811;RBI=0.0129183;REFB=-0.0100432;REVB=0.0120884;RO=57;SAF=17;SAR=29;SRF=22;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0173019;STB=0.509685;TYPE=snp;VARB=0.0173352;OID=.;OPOS=86707313;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:57:57:46:46:29:17:22:35:29:17:22:35 chr2 86850978 . C T 86.46 PASS AO=12;DP=15;FAO=12;FDP=15;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0434733;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.739;QD=23.0552;RBI=0.044177;REFB=-0.0168068;REVB=0.00785362;RO=3;SAF=1;SAR=11;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225452;STB=0.628314;TYPE=snp;VARB=0.00557411;OID=.;OPOS=86850978;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:15:15:3:3:12:12:11:1:1:2:11:1:1:2 chr2 86979093 . G A 311.32 PASS AO=90;DP=214;FAO=90;FDP=215;FR=.;FRO=125;FSAF=58;FSAR=32;FSRF=80;FSRR=45;FWDB=0.0128707;FXX=0.00921617;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2593;QD=5.79204;RBI=0.0195281;REFB=-0.011529;REVB=-0.0146865;RO=123;SAF=58;SAR=32;SRF=81;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159931;STB=0.502814;TYPE=snp;VARB=0.0135811;OID=.;OPOS=86979093;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:215:123:125:90:90:32:58:81:42:32:58:80:45 chr2 87015633 . T TGA 364.07 PASS AO=45;DP=52;FAO=46;FDP=52;FR=.;FRO=6;FSAF=37;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0278378;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=245.976;QD=28.0056;RBI=0.0439677;REFB=-0.066205;REVB=0.0340326;RO=6;SAF=37;SAR=8;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.056142;STB=0.524474;TYPE=ins;VARB=0.00381918;OID=.;OPOS=87015634;OREF=-;OALT=GA;OMAPALT=TGA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:45:52:46:52:6:37:9:4:2:4:6:37:8:4:2 chr2 87016506 . A G 149.95 PASS AO=13;DP=38;FAO=19;FDP=37;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=11;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.0129154;FXX=0.0263089;HRUN=2;LEN=1;MLLD=33.4129;QD=16.2109;RBI=0.354722;REFB=0.10109;REVB=0.354486;RO=4;SAF=9;SAR=4;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164447;STB=0.540594;TYPE=snp;VARB=-0.0360691;OID=.;OPOS=87016506;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:37:37:4:11:13:19:4:9:4:0:10:9:4:7 chr2 87069379 . G A 502.06 PASS AO=54;DP=55;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0956138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.37;QD=35.8611;RBI=0.096784;REFB=-0.0604129;REVB=-0.0150044;RO=1;SAF=30;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192307;STB=0.5102;TYPE=snp;VARB=0.000107233;OID=.;OPOS=87069379;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:55:56:1:1:54:55:24:30:0:1:24:31:0:1 chr2 87069431 . C T 649.89 PASS AO=63;DP=63;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0469253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.5639;QD=38.229;RBI=0.109634;REFB=0;REVB=0.0990836;RO=0;SAF=26;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.001228;OID=.;OPOS=87069431;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:63:68:0:0:63:68:37:26:0:0:42:26:0:0 chr2 87276811 . T C 41.01 PASS AO=11;DP=30;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=15;FSRR=4;FWDB=-0.0074026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4585;QD=5.46824;RBI=0.071238;REFB=0.0193242;REVB=-0.0708523;RO=19;SAF=9;SAR=2;SRF=15;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0489507;STB=0.529356;TYPE=snp;VARB=-0.0277024;OID=.;OPOS=87276811;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:30:30:19:19:11:11:2:9:15:4:2:9:15:4 chr2 88037264 . G A 25.92 PASS AO=8;DP=25;FAO=8;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=17;FSRR=0;FWDB=-0.0251713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.726;QD=4.14671;RBI=0.0452915;REFB=-0.0468846;REVB=0.0376527;RO=17;SAF=6;SAR=2;SRF=17;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.522934;STB=0.792727;TYPE=snp;VARB=0.0857296;OID=.;OPOS=88037264;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:25:25:17:17:8:8:2:6:17:0:2:6:17:0 chr2 88045961 . A G 29.49 PASS AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0357222;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.791;QD=11.7975;RBI=0.035909;REFB=0.0210097;REVB=0.00365725;RO=5;SAF=3;SAR=2;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0738527;OID=.;OPOS=88045961;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:10:10:5:5:5:5:2:3:3:2:2:3:3:2 chr2 88315896 . T C 497.37 PASS AO=50;DP=52;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0315585;FXX=0.0999833;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2127;QD=36.8425;RBI=0.055127;REFB=0;REVB=0.0452001;RO=0;SAF=26;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.10374e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0124367;OID=.;OPOS=88315896;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:52:54:0:0:50:54:24:26:0:0:24:30:0:0 chr2 88315954 . C A 627.78 PASS AO=77;DP=86;FAO=77;FDP=86;FR=.;FRO=9;FSAF=34;FSAR=43;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0342187;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=216.471;QD=29.199;RBI=0.0405621;REFB=-0.149222;REVB=-0.0217799;RO=3;SAF=34;SAR=43;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0318772;STB=0.511511;TYPE=snp;VARB=0.00113271;OID=.;OPOS=88315954;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:86:86:3:9:77:77:43:34:0:3:43:34:3:6 chr2 88315993 . A G 773.2 PASS AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0937179;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.9479;QD=38.6599;RBI=0.100016;REFB=0;REVB=-0.0349308;RO=0;SAF=34;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3274e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00125845;OID=.;OPOS=88315993;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:80:80:0:0:80:80:46:34:0:0:46:34:0:0 chr2 88387403 . C A 172.1 PASS AO=18;DP=48;FAO=29;FDP=46;FR=.;FRO=17;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.0258242;FXX=0.09802;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6413;QD=14.9652;RBI=0.0295478;REFB=-0.0696062;REVB=0.014359;RO=11;SAF=17;SAR=1;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.283205;STB=0.521457;TYPE=snp;VARB=0.0278991;OID=.;OPOS=88387403;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:37:46:11:17:18:29:1:17:9:2:12:17:9:8 chr2 88387557 . A C 294.44 PASS AO=47;DP=74;FAO=50;FDP=76;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=35;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=-0.0294383;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.801;QD=15.4969;RBI=0.0324293;REFB=-0.0492249;REVB=0.0136032;RO=26;SAF=14;SAR=33;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0226626;STB=0.512653;TYPE=snp;VARB=0.0226327;OID=.;OPOS=88387557;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:74:76:26:26:47:50:33:14:7:19:35:15:7:19 chr2 88396120 . G A 107.33 PASS AO=28;DP=65;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=4;FSAR=24;FSRF=12;FSRR=25;FWDB=0.0127463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.705;QD=6.60475;RBI=0.0154135;REFB=-0.0138575;REVB=-0.00866641;RO=37;SAF=4;SAR=24;SRF=12;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280318;STB=0.661934;TYPE=snp;VARB=0.0216811;OID=.;OPOS=88396120;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:37:37:28:28:24:4:12:25:24:4:12:25 chr2 88396123 . C G 106.2 PASS AO=28;DP=68;FAO=28;FDP=66;FR=.;FRO=38;FSAF=6;FSAR=22;FSRF=12;FSRR=26;FWDB=-0.00804402;FXX=0.0294074;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.704;QD=6.43605;RBI=0.0102293;REFB=-0.00814021;REVB=0.0063192;RO=38;SAF=6;SAR=22;SRF=12;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137825;STB=0.578887;TYPE=snp;VARB=0.0110603;OID=.;OPOS=88396123;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:66:38:38:28:28:22:6:12:26:22:6:12:26 chr2 88396174 . T C 250.34 PASS AO=53;DP=102;FAO=53;FDP=99;FR=.;FRO=46;FSAF=10;FSAR=43;FSRF=12;FSRR=34;FWDB=-0.0379437;FXX=0.0294089;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.9547;QD=10.1146;RBI=0.0469385;REFB=-0.00270047;REVB=0.0276316;RO=45;SAF=10;SAR=43;SRF=11;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0720174;STB=0.551262;TYPE=snp;VARB=0.00269874;OID=.;OPOS=88396174;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:99:45:46:53:53:43:10:11:34:43:10:12:34 chr2 88407959 . T C 219.15 PASS AO=58;DP=136;FAO=59;FDP=133;FR=.;FRO=74;FSAF=35;FSAR=24;FSRF=41;FSRR=33;FWDB=0.0119804;FXX=0.0220572;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.5514;QD=6.59091;RBI=0.0148128;REFB=-0.0335431;REVB=-0.00871142;RO=70;SAF=35;SAR=23;SRF=41;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0181014;STB=0.52238;TYPE=snp;VARB=0.0400749;OID=.;OPOS=88407959;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:133:70:74:58:59:23:35:41:29:24:35:41:33 chr2 88411605 . A T 454.77 PASS AO=104;DP=203;FAO=104;FDP=203;FR=.;FRO=99;FSAF=54;FSAR=50;FSRF=58;FSRR=41;FWDB=0.00684489;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.4944;QD=8.961;RBI=0.0550102;REFB=-0.0393622;REVB=0.0545827;RO=95;SAF=54;SAR=50;SRF=56;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0615435;STB=0.532617;TYPE=snp;VARB=0.048399;OID=.;OPOS=88411605;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:203:95:99:104:104:50:54:56:39:50:54:58:41 chr2 88472791 . G A 1060.93 PASS AO=118;DP=122;FAO=118;FDP=122;FR=.;FRO=4;FSAF=45;FSAR=73;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0121463;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=243.026;QD=34.7846;RBI=0.0160411;REFB=-0.0766988;REVB=0.0104777;RO=4;SAF=45;SAR=73;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00780646;STB=0.504113;TYPE=snp;VARB=0.00307811;OID=.;OPOS=88472791;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:122:122:4:4:118:118:73:45:2:2:73:45:2:2 chr2 88874891 . C A 1572.57 PASS AO=164;DP=166;FAO=164;FDP=164;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157534;FXX=0.0120475;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.402;QD=38.3555;RBI=0.031373;REFB=0;REVB=0.027131;RO=0;SAF=57;SAR=107;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000135918;OID=.;OPOS=88874891;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:166:164:0:0:164:164:107:57:0:0:107:57:0:0 chr2 88895123 . T C 1548.81 PASS AO=171;DP=178;FAO=171;FDP=177;FR=.;FRO=6;FSAF=106;FSAR=65;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.00474522;FXX=0.00561766;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.307;QD=35.0012;RBI=0.0115713;REFB=-0.0380925;REVB=0.0105536;RO=6;SAF=106;SAR=65;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00818071;STB=0.504302;TYPE=snp;VARB=0.00185777;OID=.;OPOS=88895123;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:178:177:6:6:171:171:65:106:3:3:65:106:3:3 chr2 88895351 . T C 1049.53 PASS AO=109;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0413775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.878;QD=38.515;RBI=0.0458427;REFB=0;REVB=0.0197347;RO=0;SAF=46;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.61771e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.57214e-05;OID=.;OPOS=88895351;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:109:109:0:0:109:109:63:46:0:0:63:46:0:0 chr2 89161069 . G C 221.96 PASS AO=66;DP=178;FAO=69;FDP=176;FR=.;FRO=107;FSAF=39;FSAR=30;FSRF=71;FSRR=36;FWDB=-0.00793806;FXX=0.0167588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.8569;QD=5.04453;RBI=0.00911464;REFB=0.000353085;REVB=-0.00447927;RO=103;SAF=36;SAR=30;SRF=67;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116102;STB=0.56178;TYPE=snp;VARB=-0.000456629;OID=.;OPOS=89161069;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:176:103:107:66:69:30:36:67:36:30:39:71:36 chr2 89197190 . C T 700.2 PASS AO=240;DP=529;FAO=183;FDP=398;FR=.;FRO=215;FSAF=98;FSAR=85;FSRF=107;FSRR=108;FWDB=-0.0125487;FXX=0.00499988;HRUN=3;LEN=1;MLLD=210.459;QD=7.0372;RBI=0.0151039;REFB=-0.003003;REVB=0.00840583;RO=283;SAF=134;SAR=106;SRF=140;SRR=143;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0627949;STB=0.520485;TYPE=snp;VARB=0.00370521;OID=.;OPOS=89197190;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:529:398:283:215:240:183:106:134:140:143:85:98:107:108 chr2 89278103 . T C 18.1 PASS AO=10;DP=48;FAO=10;FDP=48;FR=.;FRO=38;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=-0.0119861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.683;QD=1.50841;RBI=0.0123696;REFB=0.000899152;REVB=-0.00305643;RO=38;SAF=4;SAR=6;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0912115;STB=0.559202;TYPE=snp;VARB=-0.00424397;OID=.;OPOS=89278103;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:48:48:38:38:10:10:6:4:18:20:6:4:18:20 chr2 89278489 . A C 286.31 PASS AO=73;DP=159;FAO=73;FDP=159;FR=.;FRO=86;FSAF=46;FSAR=27;FSRF=56;FSRR=30;FWDB=-0.0680372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.4908;QD=7.20284;RBI=0.0684142;REFB=-0.00868705;REVB=-0.00717246;RO=84;SAF=46;SAR=27;SRF=56;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.038275;STB=0.512273;TYPE=snp;VARB=0.00960708;OID=.;OPOS=89278489;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:159:84:86:73:73:27:46:56:28:27:46:56:30 chr2 89326825 . G A 137.49 PASS AO=21;DP=54;FAO=32;FDP=66;FR=.;FRO=34;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=0.012798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.382;QD=8.33271;RBI=0.0147846;REFB=-0.0389442;REVB=0.00740229;RO=25;SAF=11;SAR=10;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0799634;STB=0.556925;TYPE=snp;VARB=0.0461557;OID=.;OPOS=89326825;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:66:25:34:21:32:10:11:11:14:10:22:20:14 chr2 89513004 . A G 1309.76 PASS AO=144;DP=149;FAO=144;FDP=149;FR=.;FRO=5;FSAF=66;FSAR=78;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0221358;FXX=0.00666622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.4989;QD=35.1612;RBI=0.100798;REFB=-0.0764358;REVB=0.0983373;RO=5;SAF=66;SAR=78;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00374636;STB=0.501972;TYPE=snp;VARB=0.00230353;OID=.;OPOS=89513004;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:149:149:5:5:144:144:78:66:2:3:78:66:2:3 chr2 89533687 . T G 1031.61 PASS AO=114;DP=127;FAO=114;FDP=118;FR=.;FRO=4;FSAF=76;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0284255;FXX=0.0708606;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.775;QD=34.9699;RBI=0.0738859;REFB=-0.0545441;REVB=0.0681991;RO=4;SAF=76;SAR=38;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0298154;STB=0.51572;TYPE=snp;VARB=0.00242176;OID=.;OPOS=89533687;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:127:118:4:4:114:114:38:76:1:3:38:76:1:3 chr2 89533810 . C T 1751.41 PASS AO=191;DP=199;FAO=195;FDP=202;FR=.;FRO=7;FSAF=90;FSAR=105;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.0283755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.834;QD=34.6814;RBI=0.0411144;REFB=-0.0478932;REVB=0.0297528;RO=7;SAF=89;SAR=102;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0167562;STB=0.508798;TYPE=snp;VARB=0.00117619;OID=.;OPOS=89533810;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:199:202:7:7:191:195:102:89:5:2:105:90:5:2 chr2 89544473 . A G 136.31 PASS AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00728363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.374;QD=36.3484;RBI=0.0422489;REFB=0;REVB=0.0416163;RO=0;SAF=6;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000631672;OID=.;OPOS=89544473;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:15:0:0:15:15:9:6:0:0:9:6:0:0 chr2 89986921 . C T 530.96 PASS AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0222061;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.556;QD=36.618;RBI=0.030076;REFB=-0.113328;REVB=0.0202844;RO=1;SAF=29;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.016546;STB=0.508769;TYPE=snp;VARB=0.000913477;OID=.;OPOS=89986921;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:58:58:1:1:57:57:28:29:0:1:28:29:0:1 chr2 90008103 . G A 1459.2 PASS AO=153;DP=153;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.016096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.583;QD=38.149;RBI=0.0391286;REFB=0;REVB=0.0356647;RO=0;SAF=57;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.85442e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.09956e-05;OID=.;OPOS=90008103;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:153:153:0:0:153:153:96:57:0:0:96:57:0:0 chr2 90025275 . G C 531.62 PASS AO=75;DP=94;FAO=75;FDP=94;FR=.;FRO=19;FSAF=33;FSAR=42;FSRF=16;FSRR=3;FWDB=-0.0201749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.461;QD=22.6219;RBI=0.0350957;REFB=-0.0557901;REVB=0.0287173;RO=19;SAF=33;SAR=42;SRF=16;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151527;STB=0.580842;TYPE=snp;VARB=0.0206842;OID=.;OPOS=90025275;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:94:94:19:19:75:75:42:33:16:3:42:33:16:3 chr2 90121675 . T C 363.63 PASS AO=14;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.977;QD=38.277;RBI=0.0362723;REFB=0;REVB=0.0308499;RO=0;SAF=11;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000463335;OID=.;OPOS=90121675;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:15:38:0:0:14:38:3:11:0:0:21:17:0:0 chr2 90139116 . G A 223.79 PASS AO=49;DP=119;FAO=53;FDP=113;FR=.,HEALED;FRO=57;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=35;FSRR=22;FWDB=-0.0169175;FXX=0.00877116;HRUN=3;LEN=1;MLLD=200.464;QD=7.92166;RBI=0.0608085;REFB=-0.0370822;REVB=-0.0584078;RO=41;SAF=29;SAR=20;SRF=28;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0795008;STB=0.504732;TYPE=snp;VARB=0.0327404;OID=.;OPOS=90139116;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:113:41:57:49:53:20:29:28:13:20:33:35:22 chr2 90212050 . G A 254.96 PASS AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00223494;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=243.589;QD=37.7722;RBI=0.00360679;REFB=0;REVB=0.0028309;RO=0;SAF=12;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.71323e-06;OID=.;OPOS=90212050;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:27:27:0:0:27:27:15:12:0:0:15:12:0:0 chr2 90259760 . A T 17.89 PASS AO=16;DP=89;FAO=16;FDP=89;FR=.;FRO=73;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=42;FSRR=31;FWDB=0.00946671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.998;QD=0.803979;RBI=0.0178692;REFB=-0.00103772;REVB=-0.0151556;RO=71;SAF=12;SAR=4;SRF=41;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.239798;STB=0.660163;TYPE=snp;VARB=0.00151964;OID=.;OPOS=90259760;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:89:89:71:73:16:16:4:12:41:30:4:12:42:31 chr2 90259776 . G A 15.81 PASS AO=16;DP=94;FAO=16;FDP=94;FR=.;FRO=78;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=43;FSRR=35;FWDB=-0.020231;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.819;QD=0.67268;RBI=0.0264352;REFB=-0.00487977;REVB=0.0170154;RO=78;SAF=12;SAR=4;SRF=43;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.269564;STB=0.679994;TYPE=snp;VARB=0.0485232;OID=.;OPOS=90259776;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:94:94:78:78:16:16:4:12:43:35:4:12:43:35 chr2 92129749 . T C 771.68 PASS AO=84;DP=87;FAO=84;FDP=86;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.015044;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.9371;QD=35.8921;RBI=0.0190611;REFB=-0.0536201;REVB=0.0117049;RO=2;SAF=31;SAR=53;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0175385;STB=0.509257;TYPE=snp;VARB=0.000930506;OID=.;OPOS=92129749;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:87:86:2:2:84:84:53:31:0:2:53:31:0:2 chr2 95537568 . C T 109.57 PASS AO=18;DP=28;FAO=18;FDP=28;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=15;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0508548;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.46;QD=15.6523;RBI=0.0695727;REFB=-0.0654703;REVB=0.0474779;RO=9;SAF=3;SAR=15;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.315731;STB=0.666455;TYPE=snp;VARB=0.0249212;OID=.;OPOS=95537568;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:28:28:9:10:18:18:15:3:5:4:15:3:5:5 chr2 95537572 . C T 213.85 PASS AO=25;DP=27;FAO=25;FDP=27;FR=.;FRO=2;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0662035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.544;QD=31.6818;RBI=0.0671499;REFB=-0.0182518;REVB=0.0112342;RO=2;SAF=8;SAR=17;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0515236;STB=0.527756;TYPE=snp;VARB=0.00235215;OID=.;OPOS=95537572;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:27:27:2:2:25:25:17:8:0:2:17:8:0:2 chr2 95537622 . A G 91.81 PASS AO=12;DP=16;FAO=13;FDP=17;FR=.;FRO=4;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.118985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.9079;QD=21.6014;RBI=0.119707;REFB=-0.0728879;REVB=-0.0131332;RO=4;SAF=7;SAR=5;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0378887;STB=0.509077;TYPE=snp;VARB=0.0693085;OID=.;OPOS=95537622;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:16:17:4:4:12:13:5:7:2:2:6:7:2:2 chr2 95847040 . TGCG T 706.11 PASS AO=68;DP=83;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0134555;FXX=0.0632831;HRUN=1;LEN=3;MLLD=225.879;QD=38.1683;RBI=0.0264957;REFB=0;REVB=-0.0228247;RO=0;SAF=15;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.000254027;OID=.;OPOS=95847041;OREF=GCG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:68:70:74:74:0:18:56:0:0:33:0:15:53:0:0 chr2 95947099 . G A 134.76 PASS AO=32;DP=68;FAO=32;FDP=68;FR=.;FRO=36;FSAF=3;FSAR=29;FSRF=12;FSRR=24;FWDB=-0.00523167;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.3482;QD=7.92729;RBI=0.00784849;REFB=0.00320637;REVB=0.0058505;RO=35;SAF=3;SAR=29;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.409906;STB=0.73214;TYPE=snp;VARB=-0.00315479;OID=.;OPOS=95947099;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:35:36:32:32:29:3:12:23:29:3:12:24 chr2 96195632 . T C 2395.39 PASS AO=250;DP=252;FAO=252;FDP=252;FR=.;FRO=0;FSAF=131;FSAR=121;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0182747;FXX=0.00787371;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.873;QD=38.0221;RBI=0.0315615;REFB=-0.0447361;REVB=0.0257326;RO=1;SAF=131;SAR=119;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00362497;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000114792;OID=.;OPOS=96195632;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:252:252:1:0:250:252:119:131:1:0:121:131:0:0 chr2 96195730 . C T 370.83 PASS AO=88;DP=179;FAO=88;FDP=179;FR=.;FRO=91;FSAF=41;FSAR=47;FSRF=20;FSRR=71;FWDB=0.0714124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.6668;QD=8.28662;RBI=0.0718283;REFB=-0.0139428;REVB=-0.0077178;RO=91;SAF=41;SAR=47;SRF=20;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233942;STB=0.627877;TYPE=snp;VARB=0.0242494;OID=.;OPOS=96195730;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:179:91:91:88:88:47:41:20:71:47:41:20:71 chr2 96196322 . A G 347.83 PASS AO=71;DP=127;FAO=71;FDP=127;FR=.;FRO=56;FSAF=38;FSAR=33;FSRF=27;FSRR=29;FWDB=-0.0464081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.34;QD=10.9551;RBI=0.0464646;REFB=-0.017734;REVB=-0.00229162;RO=56;SAF=38;SAR=33;SRF=27;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0428943;STB=0.523433;TYPE=snp;VARB=0.0151907;OID=.;OPOS=96196322;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:56:56:71:71:33:38:27:29:33:38:27:29 chr2 96217197 . C G 166.41 PASS AO=50;DP=126;FAO=50;FDP=126;FR=.;FRO=76;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=41;FSRR=35;FWDB=-0.0189762;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=262.697;QD=5.28271;RBI=0.0244117;REFB=-0.00175022;REVB=-0.0153569;RO=76;SAF=27;SAR=23;SRF=41;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000565034;STB=0.500319;TYPE=snp;VARB=0.00238359;OID=.;OPOS=96217197;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:76:76:50:50:23:27:41:35:23:27:41:35 chr2 96217234 . C G 233.84 PASS AO=64;DP=147;FAO=64;FDP=149;FR=.;FRO=85;FSAF=25;FSAR=39;FSRF=39;FSRR=46;FWDB=-0.00497605;FXX=0.00666622;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.803;QD=6.27758;RBI=0.0133196;REFB=-0.0363191;REVB=-0.0123552;RO=82;SAF=25;SAR=39;SRF=39;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0877646;STB=0.54013;TYPE=snp;VARB=0.0473051;OID=.;OPOS=96217234;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:149:82:85:64:64:39:25:39:43:39:25:39:46 chr2 96514607 . T TA,A 176.85 PASS AO=30,21;DP=125;FAO=86,11;FDP=112;FR=.;FRO=15;FSAF=55,9;FSAR=31,2;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.0767846,0.00363083;FXX=0.0819605;HRUN=11,1;LEN=1,1;MLLD=5.19986,228.436;QD=6.31616;RBI=0.445232,0.0426191;REFB=-0.0598476,0.0075143;REVB=0.438561,0.0424642;RO=60;SAF=20,19;SAR=10,2;SRF=40;SRR=20;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0.441237;STB=0.506343,0.666324;TYPE=ins,snp;VARB=0.0412575,-0.00819807;OID=.,.;OPOS=96514608,96514607;OREF=-,T;OALT=A,A;OMAPALT=TA,A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:5:125:112:60:15:30,21:86,11:10,2:20,19:40:20:31,2:55,9:9:6 chr2 96517484 . T G 24.35 PASS AO=36;DP=218;FAO=36;FDP=219;FR=.;FRO=183;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=78;FSRR=105;FWDB=0.0253766;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.417;QD=0.444784;RBI=0.0617296;REFB=-0.00102134;REVB=0.0562723;RO=182;SAF=13;SAR=23;SRF=77;SRR=105;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0834036;STB=0.557061;TYPE=snp;VARB=0.00709209;OID=.;OPOS=96517484;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:218:219:182:183:36:36:23:13:77:105:23:13:78:105 chr2 96517502 . A C 29.64 PASS AO=38;DP=216;FAO=38;FDP=216;FR=.;FRO=178;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=74;FSRR=104;FWDB=-0.0133746;FXX=0.00460808;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.875;QD=0.548813;RBI=0.0147778;REFB=-0.00250797;REVB=0.00628511;RO=175;SAF=14;SAR=24;SRF=72;SRR=103;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0581426;STB=0.540962;TYPE=snp;VARB=0.024549;OID=.;OPOS=96517502;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:216:216:175:178:38:38:24:14:72:103:24:14:74:104 chr2 96517518 . A G 67.83 PASS AO=40;DP=191;FAO=48;FDP=202;FR=.;FRO=154;FSAF=16;FSAR=32;FSRF=68;FSRR=86;FWDB=0.0694009;FXX=0.00492587;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.3884;QD=1.34312;RBI=0.0769504;REFB=-0.0112704;REVB=-0.0332397;RO=148;SAF=7;SAR=33;SRF=65;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.389055;STB=0.587375;TYPE=snp;VARB=0.0731623;OID=.;OPOS=96517518;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:191:202:148:154:40:48:33:7:65:83:32:16:68:86 chr2 96517882 . G A 79.49 PASS AO=85;DP=436;FAO=81;FDP=398;FR=.;FRO=317;FSAF=57;FSAR=24;FSRF=154;FSRR=163;FWDB=-0.023271;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.209;QD=0.798904;RBI=0.0239103;REFB=-0.00676235;REVB=0.00549226;RO=334;SAF=58;SAR=27;SRF=157;SRR=177;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.276512;STB=0.677879;TYPE=snp;VARB=0.0268748;OID=.;OPOS=96517882;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:436:398:334:317:85:81:27:58:157:177:24:57:154:163 chr2 96517885 . G A 139.41 PASS AO=102;DP=425;FAO=96;FDP=395;FR=.;FRO=299;FSAF=48;FSAR=48;FSRF=155;FSRR=144;FWDB=-0.0436891;FXX=0.0124997;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.637;QD=1.41177;RBI=0.0466313;REFB=-0.00634792;REVB=-0.0163015;RO=268;SAF=51;SAR=51;SRF=151;SRR=117;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0784404;STB=0.513921;TYPE=snp;VARB=0.0337828;OID=.;OPOS=96517885;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:425:395:268:299:102:96:51:51:151:117:48:48:155:144 chr2 96521297 . T C 36.32 PASS AO=14;DP=49;FAO=14;FDP=49;FR=.;FRO=35;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=-0.042579;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.8;QD=2.96491;RBI=0.0427;REFB=0.000683611;REVB=0.00321211;RO=34;SAF=3;SAR=11;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.495966;STB=0.792094;TYPE=snp;VARB=-0.00140036;OID=.;OPOS=96521297;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:49:49:34:35:14:14:11:3:22:12:11:3:22:13 chr2 96521324 . A G 14.32 PASS AO=5;DP=22;FAO=5;FDP=22;FR=.;FRO=17;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.0189053;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.128;QD=2.60282;RBI=0.0216372;REFB=-0.00359667;REVB=0.0105242;RO=17;SAF=1;SAR=4;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.281448;STB=0.694787;TYPE=snp;VARB=0.0134102;OID=.;OPOS=96521324;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:22:22:17:17:5:5:4:1:7:10:4:1:7:10 chr2 96521455 . A G 12.37 PASS AO=26;DP=169;FAO=24;FDP=166;FR=.;FRO=142;FSAF=5;FSAR=19;FSRF=47;FSRR=95;FWDB=-0.0116894;FXX=0.00598767;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.062;QD=0.297986;RBI=0.0148338;REFB=-0.00699801;REVB=-0.00913241;RO=142;SAF=8;SAR=18;SRF=47;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0341338;STB=0.634023;TYPE=snp;VARB=0.0361656;OID=.;OPOS=96521455;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:169:166:142:142:26:24:18:8:47:95:19:5:47:95 chr2 96521481 . C T 11.08 PASS AO=36;DP=240;FAO=32;FDP=236;FR=.;FRO=204;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=68;FSRR=136;FWDB=-0.00532707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.285;QD=0.187797;RBI=0.00751531;REFB=-0.00359776;REVB=-0.00530116;RO=204;SAF=14;SAR=22;SRF=68;SRR=136;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.077238;STB=0.520618;TYPE=snp;VARB=0.00915866;OID=.;OPOS=96521481;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:240:236:204:204:36:32:22:14:68:136:22:10:68:136 chr2 96521512 . A C 71.62 PASS AO=79;DP=367;FAO=73;FDP=361;FR=.;FRO=288;FSAF=39;FSAR=34;FSRF=123;FSRR=165;FWDB=-0.0316036;FXX=0.00824153;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.1353;QD=0.793594;RBI=0.0553903;REFB=0.00653724;REVB=0.0454896;RO=279;SAF=44;SAR=35;SRF=122;SRR=157;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152469;STB=0.584874;TYPE=snp;VARB=-0.0249287;OID=.;OPOS=96521512;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:367:361:279:288:79:73:35:44:122:157:34:39:123:165 chr2 96521548 . G A 57.64 PASS AO=89;DP=477;FAO=74;FDP=399;FR=.;FRO=325;FSAF=36;FSAR=38;FSRF=149;FSRR=176;FWDB=-0.00584308;FXX=0.00249994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.949;QD=0.577807;RBI=0.0106933;REFB=0.000507787;REVB=0.00895567;RO=384;SAF=45;SAR=44;SRF=176;SRR=208;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0613963;STB=0.522866;TYPE=snp;VARB=-0.00289592;OID=.;OPOS=96521548;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:477:399:384:325:89:74:44:45:176:208:38:36:149:176 chr2 96521556 . T C 158.71 PASS AO=77;DP=493;FAO=69;FDP=388;FR=.,HEALED;FRO=282;FSAF=30;FSAR=39;FSRF=149;FSRR=133;FWDB=0.0209146;FXX=0.0299992;HRUN=5;LEN=1;MLLD=195.501;QD=1.63617;RBI=0.0268454;REFB=-0.0176685;REVB=-0.0168302;RO=268;SAF=33;SAR=44;SRF=156;SRR=112;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194536;STB=0.574972;TYPE=snp;VARB=0.00930596;OID=.;OPOS=96521556;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:466:388:268:282:77:69:44:33:156:112:39:30:149:133 chr2 96593016 . C A 51.49 PASS AO=67;DP=354;FAO=66;FDP=353;FR=.;FRO=287;FSAF=27;FSAR=39;FSRF=123;FSRR=164;FWDB=-0.0679011;FXX=0.00563364;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.5267;QD=0.583485;RBI=0.0900937;REFB=-0.0221665;REVB=-0.0592141;RO=270;SAF=27;SAR=40;SRF=119;SRR=151;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0499703;STB=0.516278;TYPE=snp;VARB=0.0753893;OID=.;OPOS=96593016;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:354:353:270:287:67:66:40:27:119:151:39:27:123:164 chr2 96593025 . C T 67.9 PASS AO=73;DP=366;FAO=73;FDP=367;FR=.;FRO=294;FSAF=28;FSAR=45;FSRF=126;FSRR=168;FWDB=-0.0423602;FXX=0.00271732;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.046;QD=0.74007;RBI=0.0551698;REFB=-0.00180546;REVB=-0.0353457;RO=291;SAF=28;SAR=45;SRF=123;SRR=168;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0525011;STB=0.537449;TYPE=snp;VARB=0.0177198;OID=.;OPOS=96593025;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:366:367:291:294:73:73:45:28:123:168:45:28:126:168 chr2 96593100 . G A 22.97 PASS AO=48;DP=320;FAO=50;FDP=323;FR=.;FRO=273;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=124;FSRR=149;FWDB=-0.000726556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.5062;QD=0.284483;RBI=0.00759983;REFB=-0.000211777;REVB=0.00756502;RO=269;SAF=18;SAR=30;SRF=122;SRR=147;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103817;STB=0.546817;TYPE=snp;VARB=0.00172524;OID=.;OPOS=96593100;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:320:323:269:273:48:50:30:18:122:147:30:20:124:149 chr2 96593108 . T G 27.19 PASS AO=49;DP=304;FAO=49;FDP=304;FR=.;FRO=255;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=120;FSRR=135;FWDB=-0.030495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.5503;QD=0.357753;RBI=0.0390254;REFB=-0.00414743;REVB=0.0243522;RO=255;SAF=20;SAR=29;SRF=120;SRR=135;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0816637;STB=0.553112;TYPE=snp;VARB=0.0247856;OID=.;OPOS=96593108;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:304:304:255:255:49:49:29:20:120:135:29:20:120:135 chr2 96594966 . T G 67.01 PASS AO=40;DP=159;FAO=40;FDP=159;FR=.;FRO=119;FSAF=29;FSAR=11;FSRF=60;FSRR=59;FWDB=-0.0240549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.0785;QD=1.6859;RBI=0.0284811;REFB=-0.0125671;REVB=0.0152491;RO=119;SAF=29;SAR=11;SRF=60;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.288784;STB=0.674552;TYPE=snp;VARB=0.0635863;OID=.;OPOS=96594966;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:159:159:119:119:40:40:11:29:60:59:11:29:60:59 chr2 96595032 . A T 348.82 PASS AO=52;DP=82;FAO=59;FDP=88;FR=.;FRO=29;FSAF=35;FSAR=24;FSRF=9;FSRR=20;FWDB=-0.00148575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.039;QD=15.8556;RBI=0.0150132;REFB=-0.0192035;REVB=0.0149395;RO=29;SAF=35;SAR=17;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246009;STB=0.593189;TYPE=snp;VARB=0.0155441;OID=.;OPOS=96595032;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:82:88:29:29:52:59:17:35:9:20:24:35:9:20 chr2 96601240 . G A 40.76 PASS AO=28;DP=126;FAO=28;FDP=126;FR=.;FRO=98;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=38;FSRR=60;FWDB=0.02265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.849;QD=1.29383;RBI=0.0280947;REFB=-0.00517623;REVB=0.016622;RO=96;SAF=8;SAR=20;SRF=38;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154382;STB=0.589676;TYPE=snp;VARB=0.0165361;OID=.;OPOS=96601240;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:126:126:96:98:28:28:20:8:38:58:20:8:38:60 chr2 96601345 . T C 418.83 PASS AO=99;DP=210;FAO=101;FDP=207;FR=.;FRO=106;FSAF=23;FSAR=78;FSRF=28;FSRR=78;FWDB=0.000249775;FXX=0.014285;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.58;QD=8.09331;RBI=0.106749;REFB=-0.0283862;REVB=0.106749;RO=104;SAF=23;SAR=76;SRF=28;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0466871;STB=0.525768;TYPE=snp;VARB=0.0428049;OID=.;OPOS=96601345;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:210:207:104:106:99:101:76:23:28:76:78:23:28:78 chr2 96601364 . C T 255.35 PASS AO=69;DP=159;FAO=69;FDP=158;FR=.;FRO=89;FSAF=19;FSAR=50;FSRF=28;FSRR=61;FWDB=0.00415199;FXX=0.00628891;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.108;QD=6.46445;RBI=0.0234919;REFB=-0.00988208;REVB=-0.0231221;RO=88;SAF=19;SAR=50;SRF=28;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0523792;STB=0.527016;TYPE=snp;VARB=0.0205976;OID=.;OPOS=96601364;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:158:88:89:69:69:50:19:28:60:50:19:28:61 chr2 96604591 . A G 928.94 PASS AO=342;DP=635;FAO=208;FDP=397;FR=.;FRO=189;FSAF=103;FSAR=105;FSRF=104;FSRR=85;FWDB=0.00491647;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.875;QD=9.35955;RBI=0.0200966;REFB=-0.0167968;REVB=-0.019486;RO=292;SAF=174;SAR=168;SRF=165;SRR=127;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0477926;STB=0.526205;TYPE=snp;VARB=0.0200308;OID=.;OPOS=96604591;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:635:397:292:189:342:208:168:174:165:127:105:103:104:85 chr2 96604632 . A T 597.16 PASS AO=280;DP=621;FAO=171;FDP=400;FR=.;FRO=229;FSAF=91;FSAR=80;FSRF=121;FSRR=108;FWDB=0.020309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.5168;QD=5.97155;RBI=0.0228663;REFB=-0.0140847;REVB=0.0105077;RO=334;SAF=146;SAR=134;SRF=177;SRR=157;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00841748;STB=0.502172;TYPE=snp;VARB=0.0340956;OID=.;OPOS=96604632;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:621:400:334:229:280:171:134:146:177:157:80:91:121:108 chr2 96604730 . T C 121.22 PASS AO=64;DP=231;FAO=64;FDP=234;FR=.;FRO=170;FSAF=26;FSAR=38;FSRF=58;FSRR=112;FWDB=-0.00151861;FXX=0.0126577;HRUN=3;LEN=1;MLLD=145.032;QD=2.07215;RBI=0.0335419;REFB=-0.0128037;REVB=-0.0335075;RO=165;SAF=26;SAR=38;SRF=55;SRR=110;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0950421;STB=0.5499;TYPE=snp;VARB=0.0295286;OID=.;OPOS=96604730;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:231:234:165:170:64:64:38:26:55:110:38:26:58:112 chr2 96604747 . C T 19.4 PASS AO=26;DP=158;FAO=26;FDP=157;FR=.;FRO=131;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=32;FSRR=99;FWDB=-0.0296549;FXX=0.00632871;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.296;QD=0.494345;RBI=0.0298812;REFB=-0.00098357;REVB=-0.00367052;RO=129;SAF=14;SAR=12;SRF=31;SRR=98;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.38727;STB=0.737745;TYPE=snp;VARB=0.00407211;OID=.;OPOS=96604747;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:158:157:129:131:26:26:12:14:31:98:12:14:32:99 chr2 96606944 . C T 185.64 PASS AO=48;DP=101;FAO=46;FDP=100;FR=.;FRO=54;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=31;FSRR=23;FWDB=0.0299901;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.6391;QD=7.42552;RBI=0.0311475;REFB=-0.00389361;REVB=0.00841193;RO=50;SAF=25;SAR=23;SRF=29;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0546712;STB=0.528372;TYPE=snp;VARB=0.0216992;OID=.;OPOS=96606944;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:100:50:54:48:46:23:25:29:21:22:24:31:23 chr2 96610899 . T C 1128.09 PASS AO=212;DP=340;FAO=210;FDP=338;FR=.;FRO=128;FSAF=106;FSAR=104;FSRF=69;FSRR=59;FWDB=-0.00833397;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.8554;QD=13.3502;RBI=0.0140302;REFB=-0.0237642;REVB=-0.0112868;RO=126;SAF=108;SAR=104;SRF=68;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0209703;STB=0.512993;TYPE=snp;VARB=0.0162698;OID=.;OPOS=96610899;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:340:338:126:128:212:210:104:108:68:58:104:106:69:59 chr2 96610921 . T G 1418.11 PASS AO=246;DP=369;FAO=244;FDP=367;FR=.;FRO=123;FSAF=120;FSAR=124;FSRF=64;FSRR=59;FWDB=0.0166037;FXX=0.00271732;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.216;QD=15.4563;RBI=0.0243055;REFB=-0.0137266;REVB=-0.0177504;RO=122;SAF=122;SAR=124;SRF=64;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177331;STB=0.509558;TYPE=snp;VARB=0.00927932;OID=.;OPOS=96610921;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:369:367:122:123:246:244:124:122:64:58:124:120:64:59 chr2 96610923 . C G 25.35 PASS AO=58;DP=371;FAO=57;FDP=369;FR=.;FRO=312;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=156;FSRR=156;FWDB=-0.0164363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.034;QD=0.274807;RBI=0.0209364;REFB=-0.00637902;REVB=-0.0129685;RO=311;SAF=30;SAR=28;SRF=155;SRR=156;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0243793;STB=0.507415;TYPE=snp;VARB=0.0268263;OID=.;OPOS=96610923;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:371:369:311:312:58:57:28:30:155:156:28:29:156:156 chr2 96617090 . A G 16.14 PASS AO=32;DP=200;FAO=30;FDP=198;FR=.;FRO=168;FSAF=26;FSAR=4;FSRF=93;FSRR=75;FWDB=-0.00275005;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.74;QD=0.32613;RBI=0.00494465;REFB=8.11007e-05;REVB=0.00410935;RO=165;SAF=28;SAR=4;SRF=92;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.471738;STB=0.811624;TYPE=snp;VARB=-0.0015597;OID=.;OPOS=96617090;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:200:198:165:168:32:30:4:28:92:73:4:26:93:75 chr2 96617106 . A C 15.38 PASS AO=33;DP=209;FAO=31;FDP=209;FR=.;FRO=178;FSAF=27;FSAR=4;FSRF=100;FSRR=78;FWDB=0.030913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.844;QD=0.294334;RBI=0.0311608;REFB=-0.00369701;REVB=-0.00392167;RO=175;SAF=29;SAR=4;SRF=100;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.465423;STB=0.813143;TYPE=snp;VARB=0.0249789;OID=.;OPOS=96617106;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:209:209:175:178:33:31:4:29:100:75:4:27:100:78 chr2 96619734 . C T 91.9 PASS AO=33;DP=100;FAO=33;FDP=99;FR=.;FRO=66;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=31;FSRR=35;FWDB=0.0382229;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.8117;QD=3.71321;RBI=0.0388796;REFB=-0.0120842;REVB=-0.0071154;RO=63;SAF=10;SAR=23;SRF=30;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.209121;STB=0.619098;TYPE=snp;VARB=0.0250043;OID=.;OPOS=96619734;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:100:99:63:66:33:33:23:10:30:33:23:10:31:35 chr2 96626292 . C T 604.61 PASS AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00858651;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.449;QD=37.7884;RBI=0.0361785;REFB=0;REVB=0.0351448;RO=0;SAF=24;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.3845e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000136436;OID=.;OPOS=96626292;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:64:64:0:0:64:64:40:24:0:0:40:24:0:0 chr2 96688929 . G A 47.36 PASS AO=7;DP=11;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.6012;QD=17.2233;RBI=0.00253828;REFB=-0.138392;REVB=0.00253828;RO=4;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0581775;OID=.;OPOS=96688929;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:11:11:4:4:7:7:7:0:0:4:7:0:0:4 chr2 96780716 . T G 254.96 PASS AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0320011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.759;QD=37.7721;RBI=0.0466248;REFB=0;REVB=-0.0339087;RO=0;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.26131e-06;OID=.;OPOS=96780716;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:26:27:0:0:26:27:12:14:0:0:13:14:0:0 chr2 96780763 . C T 48.48 PASS AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.028828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.531;QD=5.7034;RBI=0.0303986;REFB=-0.00269201;REVB=0.00964469;RO=20;SAF=6;SAR=7;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119826;STB=0.520516;TYPE=snp;VARB=0.00360111;OID=.;OPOS=96780763;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:33:34:20:21:13:13:7:6:9:11:7:6:9:12 chr2 96780986 . C T 59.67 PASS AO=10;DP=16;FAO=10;FDP=16;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.03559;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2685;QD=14.9182;RBI=0.149531;REFB=-0.0370832;REVB=0.145234;RO=4;SAF=6;SAR=4;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0802204;STB=0.538384;TYPE=snp;VARB=0.027589;OID=.;OPOS=96780986;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:16:16:4:6:10:10:4:6:3:1:4:6:3:3 chr2 96795857 . T C 457.48 PASS AO=46;DP=47;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0629885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.704;QD=35.8806;RBI=0.109943;REFB=-0.119667;REVB=0.0901102;RO=0;SAF=9;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.83101e-08;STB=0.506327;TYPE=snp;VARB=0.00524812;OID=.;OPOS=96795857;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:47:51:0:1:46:50:37:9:0:0:39:11:0:1 chr2 96809331 . T C 466.03 PASS AO=54;DP=60;FAO=55;FDP=60;FR=.;FRO=5;FSAF=47;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0837099;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.8367;QD=31.0683;RBI=0.0837155;REFB=-0.136841;REVB=-0.000966889;RO=5;SAF=47;SAR=7;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0475553;STB=0.525244;TYPE=snp;VARB=0.0150136;OID=.;OPOS=96809331;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:60:60:5:5:54:55:7:47:5:0:8:47:5:0 chr2 96937296 . G C 1782.49 PASS AO=185;DP=185;FAO=186;FDP=186;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0513792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.9404;QD=38.3331;RBI=0.0514051;REFB=0;REVB=0.00163179;RO=0;SAF=81;SAR=104;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00020926;OID=.;OPOS=96937296;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:185:186:0:0:185:186:104:81:0:0:105:81:0:0 chr2 96952833 . A G 580.93 PASS AO=63;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0133159;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.668;QD=35.7494;RBI=0.0356519;REFB=-0.00898564;REVB=-0.0330718;RO=2;SAF=40;SAR=23;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00842919;STB=0.510635;TYPE=snp;VARB=1.05301e-05;OID=.;OPOS=96952833;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:65:65:2:1:63:64:23:40:1:1:23:41:0:1 chr2 96993757 . C T 835.85 PASS AO=89;DP=90;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=53;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0407493;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.8205;QD=36.7406;RBI=0.042194;REFB=0.0551724;REVB=0.0109469;RO=0;SAF=36;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.47001e-08;STB=0.506665;TYPE=snp;VARB=5.03262e-06;OID=.;OPOS=96993757;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:90:91:0:1:89:90:53:36:0:0:53:37:1:0 chr2 96993884 . A G 997.88 PASS AO=109;DP=112;FAO=110;FDP=113;FR=.;FRO=3;FSAF=56;FSAR=54;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.056509;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.2747;QD=35.3231;RBI=0.0569999;REFB=0.0139914;REVB=-0.00746518;RO=3;SAF=55;SAR=54;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00870289;STB=0.504666;TYPE=snp;VARB=-0.00162418;OID=.;OPOS=96993884;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:112:113:3:3:109:110:54:55:1:2:54:56:1:2 chr2 97020049 . T C 1424.33 PASS AO=149;DP=150;FAO=151;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00866917;FXX=0.00657851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.359;QD=37.7306;RBI=0.0301101;REFB=-0.0996698;REVB=0.0288351;RO=1;SAF=63;SAR=86;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00748979;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00065304;OID=.;OPOS=97020049;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:150:151:1:0:149:151:86:63:1:0:88:63:0:0 chr2 97030247 . T C 2118.86 PASS AO=217;DP=221;FAO=221;FDP=221;FR=.;FRO=0;FSAF=132;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0227339;FXX=0.0221229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.951;QD=38.3504;RBI=0.0540561;REFB=0;REVB=0.0490432;RO=0;SAF=132;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.7759e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000271765;OID=.;OPOS=97030247;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:221:221:0:0:217:221:85:132:0:0:89:132:0:0 chr2 97166204 . A G 234.32 PASS AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0730602;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.547;QD=37.4909;RBI=0.0732335;REFB=0;REVB=0.00503523;RO=0;SAF=1;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.20334e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000302625;OID=.;OPOS=97166204;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:26:25:0:0:25:25:24:1:0:0:24:1:0:0 chr2 97351840 . A G 100.78 PASS AO=21;DP=41;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=3;FSRR=17;FWDB=-0.0318797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9806;QD=9.83175;RBI=0.0823798;REFB=0.00325695;REVB=-0.0759613;RO=20;SAF=7;SAR=14;SRF=3;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193882;STB=0.607752;TYPE=snp;VARB=-0.0042612;OID=.;OPOS=97351840;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:41:41:20:20:21:21:14:7:3:17:14:7:3:17 chr2 97359364 . A G 103.77 PASS AO=27;DP=63;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=13;FWDB=-0.0130413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.984;QD=6.58865;RBI=0.033233;REFB=-0.0097468;REVB=-0.0305672;RO=36;SAF=14;SAR=13;SRF=23;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122259;STB=0.569181;TYPE=snp;VARB=0.0181425;OID=.;OPOS=97359364;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:36:36:27:27:13:14:23:13:13:14:23:13 chr2 97360333 . T A 269.05 PASS AO=63;DP=128;FAO=63;FDP=128;FR=.;FRO=65;FSAF=24;FSAR=39;FSRF=28;FSRR=37;FWDB=-0.00617179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.94;QD=8.40771;RBI=0.00790509;REFB=-0.0304969;REVB=0.00493958;RO=64;SAF=24;SAR=39;SRF=28;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0538677;STB=0.526471;TYPE=snp;VARB=0.0217451;OID=.;OPOS=97360333;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:64:65:63:63:39:24:28:36:39:24:28:37 chr2 97366088 . T C 155.54 PASS AO=35;DP=69;FAO=34;FDP=68;FR=.;FRO=34;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=8;FWDB=-0.0995599;FXX=0.0144907;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.0583;QD=9.14961;RBI=0.106989;REFB=0.00141774;REVB=-0.0391735;RO=34;SAF=22;SAR=13;SRF=26;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134869;STB=0.580754;TYPE=snp;VARB=-0.00105326;OID=.;OPOS=97366088;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:68:34:34:35:34:13:22:26:8:13:21:26:8 chr2 97559759 . G A 106.26 PASS AO=21;DP=41;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.0162371;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.9265;QD=10.1203;RBI=0.0421935;REFB=0.00892832;REVB=0.0389442;RO=20;SAF=13;SAR=8;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106018;STB=0.567505;TYPE=snp;VARB=-0.0096436;OID=.;OPOS=97559759;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:41:42:20:20:21:22:8:13:10:10:8:14:10:10 chr2 97613616 . T C 470.46 PASS AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148913;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.659;QD=38.4045;RBI=0.0351333;REFB=0;REVB=-0.0318214;RO=0;SAF=24;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000178977;OID=.;OPOS=97613616;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:50:49:0:0:49:49:25:24:0:0:25:24:0:0 chr2 97617140 . T C 220.86 PASS AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.589;QD=36.8103;RBI=0.0406927;REFB=0;REVB=-0.0278387;RO=0;SAF=19;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.62975e-05;OID=.;OPOS=97617140;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:24:24:0:0:24:24:5:19:0:0:5:19:0:0 chr2 97637905 . T C 125.84 PASS AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0339763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.063;QD=35.9533;RBI=0.0636104;REFB=0;REVB=0.0537764;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000807617;OID=.;OPOS=97637905;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:14:14:0:0:14:14:8:6:0:0:8:6:0:0 chr2 97638038 . A G 116.19 PASS AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0419546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.8975;QD=35.7493;RBI=0.0528605;REFB=0;REVB=-0.0321565;RO=0;SAF=6;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000341379;OID=.;OPOS=97638038;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:13:0:0:13:13:7:6:0:0:7:6:0:0 chr2 97643576 . T C 1183.03 PASS AO=123;DP=125;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0470327;FXX=0.00781189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.7625;QD=37.2606;RBI=0.0471757;REFB=0.0484677;REVB=-0.00367122;RO=2;SAF=59;SAR=64;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000618763;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000478374;OID=.;OPOS=97643576;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:125:127:2:0:123:127:64:59:1:1:64:63:0:0 chr2 97766551 . G A 782.84 PASS AO=79;DP=80;FAO=84;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0273467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.536;QD=36.8397;RBI=0.0749642;REFB=-0.0718877;REVB=0.0697983;RO=0;SAF=33;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505153;TYPE=snp;VARB=0.00376212;OID=.;OPOS=97766551;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:80:85:0:1:79:84:46:33:0:0:48:36:0:1 chr2 97766574 . G A 769.11 PASS AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0095715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.996;QD=37.9808;RBI=0.0253272;REFB=0;REVB=0.023449;RO=0;SAF=30;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40248e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.0516e-05;OID=.;OPOS=97766574;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:81:81:0:0:81:81:51:30:0:0:51:30:0:0 chr2 97808349 . T C 109.04 PASS AO=35;DP=95;FAO=35;FDP=95;FR=.;FRO=60;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=13;FSRR=47;FWDB=-0.0301718;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.018;QD=4.59116;RBI=0.0503251;REFB=-0.00792514;REVB=-0.0402774;RO=60;SAF=12;SAR=23;SRF=13;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165215;STB=0.593591;TYPE=snp;VARB=0.0120637;OID=.;OPOS=97808349;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:60:60:35:35:23:12:13:47:23:12:13:47 chr2 97808394 . C G 100.82 PASS AO=41;DP=132;FAO=41;FDP=131;FR=.;FRO=90;FSAF=12;FSAR=29;FSRF=20;FSRR=70;FWDB=0.00917973;FXX=0.00757518;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.548;QD=3.07855;RBI=0.0125602;REFB=0.00218408;REVB=0.00857267;RO=90;SAF=12;SAR=29;SRF=20;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106408;STB=0.561409;TYPE=snp;VARB=-0.00479801;OID=.;OPOS=97808394;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:131:90:90:41:41:29:12:20:70:29:12:20:70 chr2 97827839 . G A 17.89 PASS AO=13;DP=73;FAO=14;FDP=75;FR=.;FRO=61;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=19;FSRR=42;FWDB=0.0325189;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.6713;QD=0.954338;RBI=0.0526617;REFB=-0.00960164;REVB=0.0414219;RO=60;SAF=9;SAR=4;SRF=19;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.444355;STB=0.798242;TYPE=snp;VARB=0.0467869;OID=.;OPOS=97827839;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:73:75:60:61:13:14:4:9:19:41:4:10:19:42 chr2 97828982 . C T 44.74 PASS AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=-0.0104169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.235;QD=7.78056;RBI=0.0384479;REFB=-0.0162427;REVB=-0.0370099;RO=13;SAF=6;SAR=4;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177933;STB=0.603583;TYPE=snp;VARB=0.0253867;OID=.;OPOS=97828982;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:23:23:13:13:10:10:4:6:10:3:4:6:10:3 chr2 97829003 . CAAAAATAA C,CAAAAAATAA,CAAAAATAAA 33.13 PASS AO=5,4,3;DP=25;FAO=6,0,7;FDP=23;FR=.;FRO=10;FSAF=2,0,3;FSAR=4,0,4;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=0.00569667,-0.0950133,-0.071735;FXX=0.0416493;HRUN=5,5,8;LEN=8,1,1;MLLD=199.834,9.20461,5.73419;QD=5.76152;RBI=0.00809683,0.117285,0.128148;REFB=0.0102099,-0.0351345,-0.100684;REVB=-0.00575383,0.0687629,-0.106189;RO=5;SAF=1,3,1;SAR=4,1,2;SRF=4;SRR=1;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.487487,-0.0609289,-0.414454;STB=0.768453,0.5,0.709151;TYPE=del,ins,ins;VARB=-0.00305522,0.0277931,0.125629;OID=.,.,.;OPOS=97829004,97829004,97829010;OREF=AAAAATAA,-,-;OALT=-,A,A;OMAPALT=C,CAAAAAATAA,CAAAAATAAA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:5,4,3:19:6,0,7:23:10:2,0,3:4,0,4:8:2:18:5:1,3,1:4,1,2:4:1 chr2 97829029 . G A 11.95 PASS AO=6;DP=32;FAO=6;FDP=32;FR=.;FRO=26;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=0.010526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.1;QD=1.49389;RBI=0.0158505;REFB=0.00316287;REVB=0.0118508;RO=26;SAF=2;SAR=4;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.366226;STB=0.744357;TYPE=snp;VARB=-0.0381889;OID=.;OPOS=97829029;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:32:32:26:26:6:6:4:2:17:9:4:2:17:9 chr2 97833466 . C T 87.62 PASS AO=42;DP=148;FAO=42;FDP=149;FR=.;FRO=107;FSAF=31;FSAR=11;FSRF=62;FSRR=45;FWDB=0.0223868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.141;QD=2.35218;RBI=0.0244219;REFB=-0.0148556;REVB=0.00976025;RO=105;SAF=31;SAR=11;SRF=60;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225677;STB=0.629148;TYPE=snp;VARB=0.0381958;OID=.;OPOS=97833466;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:148:149:105:107:42:42:11:31:60:45:11:31:62:45 chr2 97849219 . T C 1797.17 PASS AO=178;DP=181;FAO=187;FDP=187;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247366;FXX=0.00531887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.13;QD=38.4421;RBI=0.025319;REFB=0;REVB=0.00539916;RO=0;SAF=79;SAR=99;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.03982e-05;OID=.;OPOS=97849219;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:181:187:0:0:178:187:99:79:0:0:103:84:0:0 chr2 97851069 . A G 674.69 PASS AO=78;DP=85;FAO=78;FDP=83;FR=.;FRO=5;FSAF=20;FSAR=58;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0512392;FXX=0.0235266;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.473;QD=32.515;RBI=0.0590844;REFB=-0.0332702;REVB=0.0294196;RO=3;SAF=20;SAR=58;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00703755;STB=0.504474;TYPE=snp;VARB=0.00241834;OID=.;OPOS=97851069;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:85:83:3:5:78:78:58:20:1:2:58:20:1:4 chr2 97860487 . T C 1747.99 PASS AO=279;DP=393;FAO=280;FDP=393;FR=.;FRO=113;FSAF=123;FSAR=157;FSRF=48;FSRR=65;FWDB=0.00131653;FXX=0.00253801;HRUN=2;LEN=1;MLLD=247.096;QD=17.7912;RBI=0.00232104;REFB=0.00329799;REVB=-0.00191153;RO=113;SAF=123;SAR=156;SRF=48;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00882458;STB=0.504238;TYPE=snp;VARB=-0.00128181;OID=.;OPOS=97860487;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:393:393:113:113:279:280:156:123:48:65:157:123:48:65 chr2 97864333 . C A 1449.53 PASS AO=150;DP=155;FAO=151;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0225954;FXX=0.0320492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.505;QD=38.3982;RBI=0.0232372;REFB=0;REVB=-0.00542364;RO=0;SAF=105;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46248e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.7372e-05;OID=.;OPOS=97864333;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:155:151:0:0:150:151:45:105:0:0:46:105:0:0 chr2 97864334 . C T 1457.44 PASS AO=154;DP=156;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=106;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218337;FXX=0.0128197;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.118;QD=37.8555;RBI=0.0229362;REFB=-0.0431722;REVB=-0.0070254;RO=1;SAF=106;SAR=48;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00980669;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.38187e-05;OID=.;OPOS=97864334;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:156:154:1:0:154:154:48:106:0:1:48:106:0:0 chr2 97864374 . G T 796.77 PASS AO=86;DP=89;FAO=86;FDP=88;FR=.;FRO=2;FSAF=53;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0322226;FXX=0.0112347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.242;QD=36.2166;RBI=0.0323016;REFB=0.0025928;REVB=-0.0022577;RO=1;SAF=53;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141395;STB=0.514702;TYPE=snp;VARB=-4.82833e-05;OID=.;OPOS=97864374;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:89:88:1:2:86:86:33:53:0:1:33:53:0:2 chr2 97873515 . C T 747.43 PASS AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0740789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.3675;QD=38.3297;RBI=0.0910205;REFB=0;REVB=-0.0528872;RO=0;SAF=59;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.6391e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000197632;OID=.;OPOS=97873515;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:78:78:0:0:78:78:19:59:0:0:19:59:0:0 chr2 97877292 . C A 1615.04 PASS AO=171;DP=173;FAO=171;FDP=171;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00201247;FXX=0.01156;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.13;QD=37.7788;RBI=0.014278;REFB=0.0215872;REVB=0.0141355;RO=0;SAF=74;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.58171e-06;OID=.;OPOS=97877292;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:173:171:0:0:171:171:97:74:0:0:97:74:0:0 chr2 97877399 . T C 2397.29 PASS AO=247;DP=248;FAO=249;FDP=249;FR=.;FRO=0;FSAF=173;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.967;QD=38.5106;RBI=0.0361682;REFB=0;REVB=0.0330543;RO=0;SAF=172;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.32626e-05;OID=.;OPOS=97877399;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:248:249:0:0:247:249:75:172:0:0:76:173:0:0 chr2 97877440 . T C 777.84 PASS AO=140;DP=224;FAO=140;FDP=220;FR=.;FRO=80;FSAF=98;FSAR=42;FSRF=54;FSRR=26;FWDB=-0.00714353;FXX=0.0178563;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.832;QD=14.1425;RBI=0.00717425;REFB=-0.00185282;REVB=0.000663254;RO=78;SAF=98;SAR=42;SRF=52;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0260596;STB=0.510728;TYPE=snp;VARB=0.00110231;OID=.;OPOS=97877440;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:224:220:78:80:140:140:42:98:52:26:42:98:54:26 chr2 97877478 . G A 186.38 PASS AO=71;DP=221;FAO=73;FDP=220;FR=.;FRO=147;FSAF=48;FSAR=25;FSRF=95;FSRR=52;FWDB=0.0121047;FXX=0.00452468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.5356;QD=3.38873;RBI=0.0129871;REFB=-0.000328494;REVB=-0.00470538;RO=150;SAF=46;SAR=25;SRF=98;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00704547;STB=0.508318;TYPE=snp;VARB=0.000729089;OID=.;OPOS=97877478;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:220:150:147:71:73:25:46:98:52:25:48:95:52 chr2 97909726 . C T 15.21 PASS AO=13;DP=74;FAO=13;FDP=74;FR=.;FRO=61;FSAF=12;FSAR=1;FSRF=43;FSRR=18;FWDB=0.00872396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.632;QD=0.821961;RBI=0.0271794;REFB=-0.00459917;REVB=-0.0257412;RO=61;SAF=12;SAR=1;SRF=43;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.431655;STB=0.805044;TYPE=snp;VARB=0.00676827;OID=.;OPOS=97909726;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:74:74:61:61:13:13:1:12:43:18:1:12:43:18 chr2 97909727 . A G 21.46 PASS AO=15;DP=75;FAO=15;FDP=75;FR=.;FRO=60;FSAF=14;FSAR=1;FSRF=43;FSRR=17;FWDB=0.00778349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.719;QD=1.14446;RBI=0.00956451;REFB=0.0112727;REVB=-0.00555852;RO=59;SAF=14;SAR=1;SRF=42;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.464882;STB=0.814975;TYPE=snp;VARB=-0.00706467;OID=.;OPOS=97909727;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:75:75:59:60:15:15:1:14:42:17:1:14:43:17 chr2 97909739 . G A 17.93 PASS AO=14;DP=78;FAO=14;FDP=75;FR=.;FRO=61;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=43;FSRR=18;FWDB=-0.028813;FXX=0.0384566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.3604;QD=0.956331;RBI=0.0453493;REFB=-0.0171649;REVB=-0.0350196;RO=63;SAF=10;SAR=4;SRF=42;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0696004;STB=0.509246;TYPE=snp;VARB=0.0262877;OID=.;OPOS=97909739;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:78:75:63:61:14:14:4:10:42:21:4:10:43:18 chr2 98128143 . T C 11.95 PASS AO=7;DP=33;FAO=6;FDP=32;FR=.;FRO=26;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=-0.0212071;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=160.712;QD=1.49392;RBI=0.0250539;REFB=-0.00544575;REVB=0.0133401;RO=26;SAF=5;SAR=2;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0830257;STB=0.511589;TYPE=snp;VARB=0.0177229;OID=.;OPOS=98128143;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:33:32:26:26:7:6:2:5:17:9:2:4:17:9 chr2 98128150 . G A 12.93 PASS AO=8;DP=38;FAO=7;FDP=37;FR=.;FRO=30;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=0.0108567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.573;QD=1.3978;RBI=0.0197922;REFB=-0.00254924;REVB=-0.0165489;RO=30;SAF=6;SAR=2;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163707;STB=0.574997;TYPE=snp;VARB=0.0295298;OID=.;OPOS=98128150;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:38:37:30:30:8:7:2:6:19:11:2:5:19:11 chr2 98128172 . C A 125.87 PASS AO=28;DP=60;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=11;FWDB=0.0114042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.8668;QD=8.25406;RBI=0.03105;REFB=-0.0269529;REVB=0.0288799;RO=32;SAF=21;SAR=7;SRF=21;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110389;STB=0.520142;TYPE=snp;VARB=0.0184645;OID=.;OPOS=98128172;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:61:32:32:28:29:7:21:21:11:9:20:21:11 chr2 98128195 . G A 202.02 PASS AO=44;DP=83;FAO=44;FDP=83;FR=.;FRO=39;FSAF=34;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=13;FWDB=0.00265253;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.596;QD=9.73604;RBI=0.007999;REFB=-0.0145035;REVB=0.0075464;RO=39;SAF=34;SAR=10;SRF=26;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118617;STB=0.565815;TYPE=snp;VARB=0.0120725;OID=.;OPOS=98128195;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:39:39:44:44:10:34:26:13:10:34:26:13 chr2 98128196 . T C 193.46 PASS AO=43;DP=83;FAO=42;FDP=81;FR=.;FRO=39;FSAF=33;FSAR=9;FSRF=25;FSRR=14;FWDB=-0.00452451;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.0992;QD=9.55349;RBI=0.00467912;REFB=-0.0105857;REVB=-0.00119289;RO=38;SAF=34;SAR=9;SRF=25;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152505;STB=0.592458;TYPE=snp;VARB=0.0103134;OID=.;OPOS=98128196;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:81:38:39:43:42:9:34:25:13:9:33:25:14 chr2 98128228 . G A 12.64 PASS AO=12;DP=74;FAO=12;FDP=73;FR=.;FRO=61;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=42;FSRR=19;FWDB=-0.0150044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.399;QD=0.692834;RBI=0.0177791;REFB=-0.00576109;REVB=-0.0095375;RO=61;SAF=10;SAR=2;SRF=42;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242342;STB=0.668468;TYPE=snp;VARB=0.0289613;OID=.;OPOS=98128228;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:74:73:61:61:12:12:2:10:42:19:2:10:42:19 chr2 98128256 . C T 261.56 PASS AO=42;DP=59;FAO=41;FDP=58;FR=.;FRO=17;FSAF=31;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=2;FWDB=0.0307627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.169;QD=18.0386;RBI=0.0330323;REFB=-0.0187956;REVB=0.012033;RO=17;SAF=32;SAR=10;SRF=15;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0934172;STB=0.55286;TYPE=snp;VARB=0.00606948;OID=.;OPOS=98128256;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:59:58:17:17:42:41:10:32:15:2:10:31:15:2 chr2 98128258 . G C 261.7 PASS AO=42;DP=59;FAO=41;FDP=58;FR=.;FRO=17;FSAF=31;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=2;FWDB=0.0336695;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.787;QD=18.0482;RBI=0.0354109;REFB=-0.0282675;REVB=-0.0109681;RO=17;SAF=32;SAR=10;SRF=15;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0934172;STB=0.55286;TYPE=snp;VARB=0.00931565;OID=.;OPOS=98128258;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:59:58:17:17:42:41:10:32:15:2:10:31:15:2 chr2 98128300 . A G 49.56 PASS AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=14;FSRR=3;FWDB=-0.0283348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.3865;QD=6.83518;RBI=0.0672413;REFB=-0.0354682;REVB=-0.0609798;RO=17;SAF=10;SAR=2;SRF=14;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0173391;STB=0.510187;TYPE=snp;VARB=0.0478283;OID=.;OPOS=98128300;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:29:29:17:17:12:12:2:10:14:3:2:10:14:3 chr2 98128313 . G A 31.2 PASS AO=6;DP=17;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=1;FWDB=-0.00841513;FXX=0.0555247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.6855;QD=7.34178;RBI=0.0620619;REFB=-0.0146333;REVB=0.0614888;RO=10;SAF=4;SAR=2;SRF=9;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.309981;STB=0.650814;TYPE=snp;VARB=0.116507;OID=.;OPOS=98128313;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:17:17:10:10:6:7:2:4:9:1:2:5:9:1 chr2 98164084 . T A 326.82 PASS AO=104;DP=265;FAO=104;FDP=267;FR=.;FRO=163;FSAF=47;FSAR=57;FSRF=70;FSRR=93;FWDB=-0.0274335;FXX=0.0111107;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.175;QD=4.89615;RBI=0.0311715;REFB=0.00142102;REVB=-0.0148008;RO=158;SAF=47;SAR=57;SRF=67;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0303441;STB=0.513883;TYPE=snp;VARB=-0.00193281;OID=.;OPOS=98164084;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:265:267:158:163:104:104:57:47:67:91:57:47:70:93 chr2 98164184 . C G 425.19 PASS AO=115;DP=317;FAO=130;FDP=320;FR=.;FRO=190;FSAF=52;FSAR=78;FSRF=100;FSRR=90;FWDB=0.028421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.927;QD=5.31487;RBI=0.0284387;REFB=-0.0165883;REVB=0.00100431;RO=186;SAF=38;SAR=77;SRF=99;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227856;STB=0.575746;TYPE=snp;VARB=0.0174946;OID=.;OPOS=98164184;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:317:320:186:190:115:130:77:38:99:87:78:52:100:90 chr2 98177124 . T G 461.89 PASS AO=126;DP=288;FAO=127;FDP=290;FR=.;FRO=163;FSAF=64;FSAR=63;FSRF=94;FSRR=69;FWDB=0.0218918;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.617;QD=6.37093;RBI=0.0219068;REFB=-0.00425906;REVB=0.000809989;RO=162;SAF=64;SAR=62;SRF=94;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0734313;STB=0.540913;TYPE=snp;VARB=0.00506303;OID=.;OPOS=98177124;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:288:290:162:163:126:127:62:64:94:68:63:64:94:69 chr2 98274527 . G C 127.32 PASS AO=30;DP=65;FAO=31;FDP=68;FR=.;FRO=37;FSAF=9;FSAR=22;FSRF=26;FSRR=11;FWDB=-0.00648013;FXX=0.0285673;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.0991;QD=7.48923;RBI=0.023038;REFB=-0.0291874;REVB=0.0221078;RO=33;SAF=7;SAR=23;SRF=24;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.464617;STB=0.721508;TYPE=snp;VARB=0.0167941;OID=.;OPOS=98274527;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:68:33:37:30:31:23:7:24:9:22:9:26:11 chr2 98372980 . A G 81.78 PASS AO=27;DP=81;FAO=28;FDP=82;FR=.;FRO=54;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=30;FWDB=0.00538523;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.925;QD=3.98946;RBI=0.00788558;REFB=-0.0104457;REVB=0.00576036;RO=54;SAF=14;SAR=13;SRF=24;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0845628;STB=0.536559;TYPE=snp;VARB=0.0147337;OID=.;OPOS=98372980;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:81:82:54:54:27:28:13:14:24:30:14:14:24:30 chr2 98373006 . C T 113.12 PASS AO=34;DP=88;FAO=34;FDP=88;FR=.;FRO=54;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=30;FWDB=-0.015711;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.434;QD=5.14187;RBI=0.023462;REFB=-0.00760929;REVB=-0.017425;RO=49;SAF=13;SAR=21;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114531;STB=0.53956;TYPE=snp;VARB=0.0087859;OID=.;OPOS=98373006;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:49:54:34:34:21:13:24:25:21:13:24:30 chr2 98431740 . GA G 130.41 PASS AO=47;DP=129;FAO=55;FDP=115;FR=.;FRO=60;FSAF=49;FSAR=6;FSRF=24;FSRR=36;FWDB=-0.189361;FXX=0.0416632;HRUN=4;LEN=1;MLLD=16.012;QD=4.53603;RBI=0.222124;REFB=-0.0579772;REVB=-0.11611;RO=53;SAF=41;SAR=6;SRF=20;SRR=33;SSEN=0.428571;SSEP=0;SSSB=0.555432;STB=0.824381;TYPE=del;VARB=0.0458652;OID=.;OPOS=98431741;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:47:120:55:115:60:49:6:24:36:99:53:41:6:20:33 chr2 98525107 . T C 359.53 PASS AO=77;DP=142;FAO=77;FDP=143;FR=.;FRO=66;FSAF=33;FSAR=44;FSRF=37;FSRR=29;FWDB=-0.0201693;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.317;QD=10.0567;RBI=0.0262407;REFB=-0.0281074;REVB=0.016786;RO=64;SAF=33;SAR=44;SRF=35;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.098651;STB=0.561106;TYPE=snp;VARB=0.0326418;OID=.;OPOS=98525107;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:143:64:66:77:77:44:33:35:29:44:33:37:29 chr2 98795792 . C G 358.55 PASS AO=83;DP=165;FAO=83;FDP=165;FR=.;FRO=82;FSAF=19;FSAR=64;FSRF=37;FSRR=45;FWDB=-0.0148928;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.8505;QD=8.69214;RBI=0.0218087;REFB=-0.00389941;REVB=0.0159319;RO=82;SAF=19;SAR=64;SRF=37;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.241293;STB=0.63374;TYPE=snp;VARB=0.00393881;OID=.;OPOS=98795792;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:165:82:82:83:83:64:19:37:45:64:19:37:45 chr2 98833456 . A T 11.18 PASS AO=3;DP=17;FAO=3;FDP=14;FR=.;FRO=11;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=11;FWDB=0;FXX=0.176367;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.0853;QD=3.19398;RBI=0.0012695;REFB=0.000546372;REVB=-0.0012695;RO=10;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0328466;OID=.;OPOS=98833456;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:17:14:10:11:3:3:3:0:0:10:3:0:0:11 chr2 98833457 . C G 14.12 PASS AO=4;DP=15;FAO=4;FDP=16;FR=.;FRO=12;FSAF=0;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=12;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=114.837;QD=3.53102;RBI=0.00702852;REFB=0.000629819;REVB=0.00702852;RO=11;SAF=0;SAR=4;SRF=0;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0381992;OID=.;OPOS=98833457;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:15:16:11:12:4:4:4:0:0:11:4:0:0:12 chr2 98844674 . C G 968.65 PASS AO=102;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.03282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.7957;QD=37.9862;RBI=0.0624113;REFB=0;REVB=0.053085;RO=0;SAF=45;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.08171e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000136451;OID=.;OPOS=98844674;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:102:102:0:0:102:102:57:45:0:0:57:45:0:0 chr2 98853173 . G A 2610.08 PASS AO=273;DP=276;FAO=275;FDP=275;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=198;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0057704;FXX=0.00362306;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8795;QD=37.9648;RBI=0.0267873;REFB=-0.0204363;REVB=0.0261584;RO=2;SAF=76;SAR=197;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0038177;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00047622;OID=.;OPOS=98853173;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:276:275:2:0:273:275:197:76:1:1:198:77:0:0 chr2 98928494 . G A 442.42 PASS AO=55;DP=57;FAO=51;FDP=54;FR=.;FRO=3;FSAF=40;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.00130242;FXX=0.0357079;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.493;QD=32.7721;RBI=0.0101132;REFB=-0.0433769;REVB=0.010029;RO=2;SAF=43;SAR=12;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0214235;STB=0.518065;TYPE=snp;VARB=0.00669615;OID=.;OPOS=98928494;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:57:54:2:3:55:51:12:43:2:0:11:40:3:0 chr2 99778985 . T C 666.62 PASS AO=146;DP=278;FAO=147;FDP=278;FR=.;FRO=131;FSAF=69;FSAR=78;FSRF=55;FSRR=76;FWDB=0.0153252;FXX=0.0035841;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.5751;QD=9.59168;RBI=0.0663033;REFB=0.00932106;REVB=-0.0645079;RO=132;SAF=68;SAR=78;SRF=56;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0363756;STB=0.523497;TYPE=snp;VARB=-0.00970108;OID=.;OPOS=99778985;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:278:278:132:131:146:147:78:68:56:76:78:69:55:76 chr2 99779131 . T C 337.19 PASS AO=97;DP=230;FAO=99;FDP=235;FR=.;FRO=136;FSAF=40;FSAR=59;FSRF=51;FSRR=85;FWDB=-0.0106974;FXX=0.00423711;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.4296;QD=5.73943;RBI=0.0107405;REFB=0.00403183;REVB=-0.000961155;RO=133;SAF=38;SAR=59;SRF=50;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.017269;STB=0.517563;TYPE=snp;VARB=-0.00688687;OID=.;OPOS=99779131;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:230:235:133:136:97:99:59:38:50:83:59:40:51:85 chr2 99804642 . T C 1339.01 PASS AO=134;DP=135;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0238928;FXX=0.00704176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.252;QD=37.9861;RBI=0.068657;REFB=0;REVB=0.0643654;RO=0;SAF=59;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00010767;OID=.;OPOS=99804642;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:135:141:0:0:134:141:75:59:0:0:80:61:0:0 chr2 99812070 . G A 368.85 PASS AO=87;DP=177;FAO=87;FDP=176;FR=.;FRO=89;FSAF=51;FSAR=36;FSRF=43;FSRR=46;FWDB=-0.00466097;FXX=0.0056494;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.815;QD=8.38298;RBI=0.0455412;REFB=-0.016761;REVB=-0.0453021;RO=85;SAF=51;SAR=36;SRF=43;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.073349;STB=0.552724;TYPE=snp;VARB=0.0149182;OID=.;OPOS=99812070;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:176:85:89:87:87:36:51:43:42:36:51:43:46 chr2 99980757 . A G 394.44 PASS AO=88;DP=178;FAO=90;FDP=178;FR=.;FRO=88;FSAF=32;FSAR=58;FSRF=31;FSRR=57;FWDB=0.00948087;FXX=0.0219768;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.89;QD=8.86385;RBI=0.0182482;REFB=-0.0117534;REVB=0.0155919;RO=89;SAF=31;SAR=57;SRF=33;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.018412;STB=0.501772;TYPE=snp;VARB=0.00969878;OID=.;OPOS=99980757;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:178:89:88:88:90:57:31:33:56:58:32:31:57 chr2 100218080 . G A 153.98 PASS AO=28;DP=45;FAO=28;FDP=46;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=14;FWDB=-0.0152052;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.954;QD=13.3892;RBI=0.0327355;REFB=-0.0227458;REVB=0.0289899;RO=17;SAF=14;SAR=14;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182255;STB=0.608622;TYPE=snp;VARB=0.0180844;OID=.;OPOS=100218080;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:45:46:17:18:28:28:14:14:4:13:14:14:4:14 chr2 100343557 . C T 978.04 PASS AO=102;DP=102;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0156882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.203;QD=37.9823;RBI=0.0421507;REFB=0;REVB=0.0391224;RO=0;SAF=42;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.60755e-05;OID=.;OPOS=100343557;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:102:103:0:0:102:103:60:42:0:0:60:43:0:0 chr2 100623130 . G A 213.64 PASS AO=47;DP=94;FAO=48;FDP=92;FR=.;FRO=44;FSAF=31;FSAR=17;FSRF=28;FSRR=16;FWDB=0.0278311;FXX=0.0212743;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.885;QD=9.28864;RBI=0.0447251;REFB=-0.0237577;REVB=-0.0350109;RO=44;SAF=30;SAR=17;SRF=28;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00183141;STB=0.504934;TYPE=snp;VARB=0.0246933;OID=.;OPOS=100623130;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:92:44:44:47:48:17:30:28:16:17:31:28:16 chr2 100897573 . G A 230.19 PASS AO=54;DP=114;FAO=55;FDP=114;FR=.;FRO=59;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=22;FSRR=37;FWDB=-0.00121219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.779;QD=8.0767;RBI=0.00803947;REFB=-0.0132677;REVB=-0.00794755;RO=59;SAF=24;SAR=30;SRF=22;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0688291;STB=0.542934;TYPE=snp;VARB=0.0139185;OID=.;OPOS=100897573;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:59:59:54:55:30:24:22:37:30:25:22:37 chr2 100916306 . A G 340.33 PASS AO=103;DP=252;FAO=103;FDP=254;FR=.;FRO=151;FSAF=46;FSAR=57;FSRF=49;FSRR=102;FWDB=-0.00144092;FXX=0.00781219;HRUN=3;LEN=1;MLLD=134.689;QD=5.3596;RBI=0.0352171;REFB=-0.000841776;REVB=-0.0351876;RO=148;SAF=46;SAR=57;SRF=48;SRR=100;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132971;STB=0.57458;TYPE=snp;VARB=0.000814912;OID=.;OPOS=100916306;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:252:254:148:151:103:103:57:46:48:100:57:46:49:102 chr2 101086966 . C T 125.04 PASS AO=39;DP=106;FAO=41;FDP=110;FR=.;FRO=69;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=37;FSRR=32;FWDB=-0.00807256;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.0392;QD=4.54707;RBI=0.0482069;REFB=-0.0435829;REVB=0.0475262;RO=67;SAF=19;SAR=20;SRF=35;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0388789;STB=0.51509;TYPE=snp;VARB=0.117161;OID=.;OPOS=101086966;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:110:67:69:39:41:20:19:35:32:20:21:37:32 chr2 101096960 . C T 1520.94 PASS AO=155;DP=156;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0149052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.984;QD=38.2625;RBI=0.0357311;REFB=0;REVB=0.0324738;RO=1;SAF=81;SAR=74;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00583723;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.56114e-05;OID=.;OPOS=101096960;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:156:159:1:0:155:159:74:81:1:0:75:84:0:0 chr2 101186088 . C T 2405.18 PASS AO=242;DP=244;FAO=253;FDP=253;FR=.;FRO=0;FSAF=118;FSAR=135;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0359477;FXX=0.00393685;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.5931;QD=38.0266;RBI=0.0809199;REFB=0;REVB=0.0724969;RO=0;SAF=110;SAR=132;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00022545;OID=.;OPOS=101186088;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:244:253:0:0:242:253:132:110:0:0:135:118:0:0 chr2 101437561 . G A 307.35 PASS AO=61;DP=117;FAO=65;FDP=121;FR=.;FRO=56;FSAF=25;FSAR=40;FSRF=25;FSRR=31;FWDB=0.0235468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.921;QD=10.1604;RBI=0.0281805;REFB=0.00616036;REVB=0.015482;RO=56;SAF=23;SAR=38;SRF=25;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0630627;STB=0.529792;TYPE=snp;VARB=-0.00141959;OID=.;OPOS=101437561;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:121:56:56:61:65:38:23:25:31:40:25:25:31 chr2 101437601 . C G 346.85 PASS AO=76;DP=144;FAO=77;FDP=149;FR=.;FRO=72;FSAF=25;FSAR=52;FSRF=23;FSRR=49;FWDB=0.0251573;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.201;QD=9.31145;RBI=0.0283353;REFB=-0.0172121;REVB=-0.0130385;RO=68;SAF=24;SAR=52;SRF=22;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00768501;STB=0.502887;TYPE=snp;VARB=0.0129252;OID=.;OPOS=101437601;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:149:68:72:76:77:52:24:22:46:52:25:23:49 chr2 101609827 . C T 291.76 PASS AO=76;DP=168;FAO=76;FDP=168;FR=.;FRO=92;FSAF=19;FSAR=57;FSRF=27;FSRR=65;FWDB=0.011008;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.423;QD=6.94662;RBI=0.0172702;REFB=0.00135572;REVB=0.0133072;RO=90;SAF=19;SAR=57;SRF=26;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0491443;STB=0.530761;TYPE=snp;VARB=-0.001731;OID=.;OPOS=101609827;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:90:92:76:76:57:19:26:64:57:19:27:65 chr2 101611969 . G C 13.08 PASS AO=3;DP=10;FAO=3;FDP=10;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0.170366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.899;QD=5.23202;RBI=0.1749;REFB=-0.000824579;REVB=-0.0395636;RO=7;SAF=1;SAR=2;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.535261;STB=0.817119;TYPE=snp;VARB=0.000440797;OID=.;OPOS=101611969;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:10:10:7:7:3:3:2:1:0:7:2:1:0:7 chr2 101612568 . C T 119.72 PASS AO=30;DP=67;FAO=30;FDP=67;FR=.;FRO=37;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=0.00398004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.972;QD=7.1476;RBI=0.00703291;REFB=-0.00099653;REVB=-0.00579837;RO=36;SAF=9;SAR=21;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126227;STB=0.565611;TYPE=snp;VARB=0.00125674;OID=.;OPOS=101612568;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:36:37:30:30:21:9:15:21:21:9:15:22 chr2 101612584 . T A 34.81 PASS AO=15;DP=43;FAO=14;FDP=49;FR=.;FRO=35;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=26;FWDB=0.0779057;FXX=0.019996;HRUN=8;LEN=1;MLLD=27.1406;QD=2.84143;RBI=0.0903877;REFB=-0.0373158;REVB=-0.0458327;RO=14;SAF=7;SAR=8;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220407;STB=0.629463;TYPE=snp;VARB=0.0535981;OID=.;OPOS=101612584;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:43:49:14:35:15:14:8:7:3:11:8:6:9:26 chr2 101612615 . T C 676.03 PASS AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.000673168;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=82.4767;QD=36.5422;RBI=0.0238395;REFB=-0.127923;REVB=-0.02383;RO=0;SAF=26;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.2476e-08;STB=0.505262;TYPE=snp;VARB=0.00123644;OID=.;OPOS=101612615;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:74:74:0:1:73:73:47:26:0:0:47:26:0:1 chr2 101624471 . T C 460.32 PASS AO=46;DP=49;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0758309;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=36.5023;QD=34.0974;RBI=0.0949784;REFB=-0.0519567;REVB=0.0571889;RO=2;SAF=16;SAR=30;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0303164;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.010571;OID=.;OPOS=101624471;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:49:54:2:0:46:54:30:16:0:2:34:20:0:0 chr2 101638888 . A G 782.73 PASS AO=82;DP=82;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00415533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.494;QD=37.7219;RBI=0.0147122;REFB=0;REVB=0.0141132;RO=0;SAF=30;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000150504;OID=.;OPOS=101638888;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:82:83:0:0:82:83:52:30:0:0:53:30:0:0 chr2 101644855 . G A 127.99 PASS AO=27;DP=52;FAO=27;FDP=52;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.007982;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=179.781;QD=9.84534;RBI=0.0169864;REFB=-0.0134395;REVB=-0.0149942;RO=25;SAF=11;SAR=16;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0637919;STB=0.535636;TYPE=snp;VARB=0.0115061;OID=.;OPOS=101644855;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:25:25:27:27:16:11:12:13:16:11:12:13 chr2 101646144 . G A 256.65 PASS AO=60;DP=119;FAO=60;FDP=122;FR=.;FRO=62;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=28;FSRR=34;FWDB=-0.0363642;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.344;QD=8.41487;RBI=0.0383785;REFB=-0.0434979;REVB=-0.01227;RO=59;SAF=33;SAR=27;SRF=28;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0679209;STB=0.549983;TYPE=snp;VARB=0.0387782;OID=.;OPOS=101646144;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:122:59:62:60:60:27:33:28:31:27:33:28:34 chr2 101656726 . T C 2063.22 PASS AO=217;DP=220;FAO=217;FDP=217;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=114;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0270857;FXX=0.0136357;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.7234;QD=38.0316;RBI=0.0300394;REFB=-0.0644975;REVB=0.0129894;RO=1;SAF=103;SAR=114;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00460334;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000475578;OID=.;OPOS=101656726;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:220:217:1:0:217:217:114:103:1:0:114:103:0:0 chr2 101898412 . G C 391.47 PASS AO=70;DP=111;FAO=70;FDP=111;FR=.;FRO=41;FSAF=44;FSAR=26;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=0.00717573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.09;QD=14.1069;RBI=0.0258863;REFB=-0.0533253;REVB=-0.0248719;RO=41;SAF=44;SAR=26;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0486314;STB=0.526365;TYPE=snp;VARB=0.0274041;OID=.;OPOS=101898412;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:41:41:70:70:26:44:23:18:26:44:23:18 chr2 102018908 . A G 24.03 PASS AO=5;DP=13;FAO=5;FDP=13;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.00143948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.588;QD=7.39442;RBI=0.0101055;REFB=-0.011223;REVB=0.0100025;RO=8;SAF=2;SAR=3;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216847;STB=0.635829;TYPE=snp;VARB=0.0480772;OID=.;OPOS=102018908;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:13:13:8:8:5:5:3:2:5:3:3:2:5:3 chr2 102038849 . T A 1930.67 PASS AO=202;DP=202;FAO=202;FDP=202;FR=.;FRO=0;FSAF=106;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00951102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.659;QD=38.231;RBI=0.0109765;REFB=0;REVB=-0.0054795;RO=0;SAF=106;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.16008e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.45333e-06;OID=.;OPOS=102038849;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:91:202:202:0:0:202:202:96:106:0:0:96:106:0:0 chr2 102067083 . T C 2188.21 PASS AO=246;DP=277;FAO=266;FDP=277;FR=.;FRO=11;FSAF=116;FSAR=150;FSRF=0;FSRR=11;FWDB=0.00852038;FXX=0.00359699;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.044;QD=31.5987;RBI=0.0294743;REFB=-0.168208;REVB=0.0282159;RO=31;SAF=116;SAR=130;SRF=0;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101112;STB=0.517684;TYPE=snp;VARB=0.00247002;OID=.;OPOS=102067083;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:277:277:31:11:246:266:130:116:0:31:150:116:0:11 chr2 102068872 . T A 379.15 PASS AO=84;DP=162;FAO=84;FDP=161;FR=.;FRO=77;FSAF=24;FSAR=60;FSRF=35;FSRR=42;FWDB=0.0287323;FXX=0.024241;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.9924;QD=9.41984;RBI=0.0472351;REFB=-0.031853;REVB=-0.0374915;RO=77;SAF=24;SAR=60;SRF=35;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16555;STB=0.59116;TYPE=snp;VARB=0.0300911;OID=.;OPOS=102068872;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:161:77:77:84:84:60:24:35:42:60:24:35:42 chr2 102792875 . A C 337.82 PASS AO=75;DP=143;FAO=75;FDP=144;FR=.;FRO=69;FSAF=49;FSAR=26;FSRF=50;FSRR=19;FWDB=-0.00681218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.593;QD=9.38401;RBI=0.00753817;REFB=-0.0172138;REVB=0.00322771;RO=67;SAF=49;SAR=26;SRF=50;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0912658;STB=0.538596;TYPE=snp;VARB=0.0193605;OID=.;OPOS=102792875;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:144:67:69:75:75:26:49:50:17:26:49:50:19 chr2 102851482 . GC G 747.11 PASS AO=106;DP=148;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.205055;FXX=0.0206882;HRUN=3;LEN=1;MLLD=10.8499;QD=21.0452;RBI=0.301368;REFB=0;REVB=0.220851;RO=22;SAF=46;SAR=60;SRF=0;SRR=22;SSEN=0.647059;SSEP=0;SSSB=0.146181;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00515185;OID=.;OPOS=102851483;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:106:143:142:142:0:58:84:0:0:66:22:46:60:0:22 chr2 102851708 . T C 125.64 PASS AO=29;DP=61;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=22;FSRF=10;FSRR=22;FWDB=-0.0050724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.887;QD=8.23862;RBI=0.0175781;REFB=-0.0230554;REVB=-0.0168304;RO=32;SAF=7;SAR=22;SRF=10;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0857497;STB=0.548352;TYPE=snp;VARB=0.0195324;OID=.;OPOS=102851708;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:32:32:29:29:22:7:10:22:22:7:10:22 chr2 102955408 . C T 105.1 PASS AO=41;DP=127;FAO=41;FDP=127;FR=.;FRO=86;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=48;FSRR=38;FWDB=-0.0076431;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=203.875;QD=3.31007;RBI=0.00982241;REFB=0.000530278;REVB=-0.00616951;RO=86;SAF=16;SAR=25;SRF=48;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19562;STB=0.613442;TYPE=snp;VARB=-0.00150193;OID=.;OPOS=102955408;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:86:86:41:41:25:16:48:38:25:16:48:38 chr2 102955468 . C A 1085.52 PASS AO=114;DP=114;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00177846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.456;QD=38.0885;RBI=0.014692;REFB=0;REVB=0.0145839;RO=0;SAF=48;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31232e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.72277e-05;OID=.;OPOS=102955468;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:114:114:0:0:114:114:66:48:0:0:66:48:0:0 chr2 102957716 . C T 2350.98 PASS AO=251;DP=251;FAO=251;FDP=251;FR=.;FRO=0;FSAF=113;FSAR=138;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0298586;FXX=0.0118106;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.091;QD=37.4658;RBI=0.0303383;REFB=-0.0172642;REVB=0.00537367;RO=0;SAF=114;SAR=137;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000117788;OID=.;OPOS=102957716;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:87:251:251:0:0:251:251:137:114:0:0:138:113:0:0 chr2 103048738 . G A 2326.63 PASS AO=247;DP=257;FAO=257;FDP=262;FR=.;FRO=5;FSAF=141;FSAR=116;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0289368;FXX=0.00757547;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.522;QD=35.5211;RBI=0.0670573;REFB=-0.0657505;REVB=0.0604924;RO=5;SAF=139;SAR=108;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00143087;STB=0.50099;TYPE=snp;VARB=0.000782986;OID=.;OPOS=103048738;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:257:262:5:5:247:257:108:139:3:2:116:141:3:2 chr2 103095531 . T C 236.81 PASS AO=57;DP=125;FAO=59;FDP=125;FR=.;FRO=66;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=25;FSRR=41;FWDB=-0.0479249;FXX=0.00793588;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.988;QD=7.57775;RBI=0.0487173;REFB=-0.0083553;REVB=-0.00875085;RO=64;SAF=28;SAR=29;SRF=24;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111156;STB=0.568313;TYPE=snp;VARB=0.013377;OID=.;OPOS=103095531;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:64:66:57:59:29:28:24:40:29:30:25:41 chr2 103141583 . G A 395.49 PASS AO=82;DP=158;FAO=85;FDP=159;FR=.;FRO=74;FSAF=63;FSAR=22;FSRF=47;FSRR=27;FWDB=-0.0191182;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1858;QD=9.94953;RBI=0.0301767;REFB=0.00263938;REVB=0.023348;RO=75;SAF=61;SAR=21;SRF=48;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111187;STB=0.560544;TYPE=snp;VARB=-0.00226673;OID=.;OPOS=103141583;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:159:75:74:82:85:21:61:48:27:22:63:47:27 chr2 103149100 . G A 293.44 PASS AO=63;DP=121;FAO=64;FDP=122;FR=.;FRO=58;FSAF=19;FSAR=45;FSRF=30;FSRR=28;FWDB=0.0432776;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.098;QD=9.62083;RBI=0.0465193;REFB=-0.0338099;REVB=0.0170616;RO=58;SAF=19;SAR=44;SRF=30;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202456;STB=0.613827;TYPE=snp;VARB=0.0258462;OID=.;OPOS=103149100;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:122:58:58:63:64:44:19:30:28:45:19:30:28 chr2 103236398 . GC G 36.45 PASS AO=9;DP=18;FAO=10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.171266;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.6503;QD=8.10065;RBI=0.18422;REFB=-0.0865436;REVB=0.0678585;RO=8;SAF=6;SAR=3;SRF=4;SRR=4;SSEN=0.201149;SSEP=0;SSSB=0.14199;STB=0.545363;TYPE=del;VARB=0.127137;OID=.;OPOS=103236399;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:9:18:10:18:8:6:4:4:4:19:8:6:3:4:4 chr2 103317676 . A G 390.12 PASS AO=116;DP=285;FAO=117;FDP=287;FR=.;FRO=170;FSAF=31;FSAR=86;FSRF=71;FSRR=99;FWDB=-0.000224963;FXX=0.0137452;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.786;QD=5.43722;RBI=0.00587848;REFB=-0.00408185;REVB=-0.00587417;RO=162;SAF=31;SAR=85;SRF=65;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162519;STB=0.604655;TYPE=snp;VARB=0.00672565;OID=.;OPOS=103317676;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:285:287:162:170:116:117:85:31:65:97:86:31:71:99 chr2 103324575 . T C 180.29 PASS AO=42;DP=86;FAO=42;FDP=86;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=13;FSRR=31;FWDB=-0.0218887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.9959;QD=8.38554;RBI=0.0387543;REFB=-0.0213478;REVB=-0.0319809;RO=44;SAF=14;SAR=28;SRF=13;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0398451;STB=0.522114;TYPE=snp;VARB=0.0163732;OID=.;OPOS=103324575;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:44:44:42:42:28:14:13:31:28:14:13:31 chr2 103326908 . TAA T 375.21 PASS AO=157;DP=377;FAO=160;FDP=360;FR=.;FRO=200;FSAF=73;FSAR=87;FSRF=73;FSRR=127;FWDB=0.0139573;FXX=0.0348516;HRUN=3;LEN=2;MLLD=46.4628;QD=4.169;RBI=0.0240697;REFB=0.00917517;REVB=-0.0196097;RO=192;SAF=72;SAR=85;SRF=67;SRR=125;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111182;STB=0.55154;TYPE=del;VARB=-0.011594;OID=.;OPOS=103326909;OREF=AA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:157:369:160:360:200:73:87:73:127:99:192:72:85:67:125 chr2 103431404 . T C 2340.68 PASS AO=245;DP=247;FAO=245;FDP=245;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=166;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0760113;FXX=0.0160636;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.4583;QD=38.2152;RBI=0.0766265;REFB=-0.0316105;REVB=0.00969029;RO=0;SAF=79;SAR=166;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.46881e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.92956e-05;OID=.;OPOS=103431404;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:247:245:0:0:245:245:166:79:0:0:166:79:0:0 chr2 105149265 . A T 383.86 PASS AO=88;DP=177;FAO=89;FDP=177;FR=.;FRO=88;FSAF=48;FSAR=41;FSRF=54;FSRR=34;FWDB=0.00267801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.699;QD=8.67474;RBI=0.0122512;REFB=-0.0116848;REVB=-0.0119549;RO=86;SAF=47;SAR=41;SRF=52;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0641148;STB=0.537386;TYPE=snp;VARB=0.0162623;OID=.;OPOS=105149265;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:177:86:88:88:89:41:47:52:34:41:48:54:34 chr2 105149276 . T C 380.87 PASS AO=88;DP=177;FAO=88;FDP=175;FR=.;FRO=87;FSAF=49;FSAR=39;FSRF=53;FSRR=34;FWDB=0.00808578;FXX=0.016853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.01;QD=8.70556;RBI=0.0253213;REFB=-0.0144073;REVB=0.0239956;RO=86;SAF=49;SAR=39;SRF=52;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0438491;STB=0.526533;TYPE=snp;VARB=0.0113935;OID=.;OPOS=105149276;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:175:86:87:88:88:39:49:52:34:39:49:53:34 chr2 105149425 . A G 221.29 PASS AO=58;DP=133;FAO=59;FDP=134;FR=.;FRO=75;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=26;FSRR=49;FWDB=0.0122915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.026;QD=6.60552;RBI=0.0191236;REFB=-0.00238661;REVB=0.0146503;RO=75;SAF=25;SAR=33;SRF=26;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0881268;STB=0.544748;TYPE=snp;VARB=0.00269469;OID=.;OPOS=105149425;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:134:75:75:58:59:33:25:26:49:34:25:26:49 chr2 105654588 . C T 385.4 PASS AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0219412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.402;QD=37.6002;RBI=0.0283959;REFB=0;REVB=0.0180252;RO=0;SAF=20;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02085e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000135075;OID=.;OPOS=105654588;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:41:41:0:0:41:41:21:20:0:0:21:20:0:0 chr2 105709023 . T C 1651.95 PASS AO=173;DP=173;FAO=173;FDP=173;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=108;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00619058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.876;QD=38.1953;RBI=0.0278536;REFB=0;REVB=0.0271569;RO=0;SAF=65;SAR=108;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.25895e-05;OID=.;OPOS=105709023;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:173:173:0:0:173:173:108:65:0:0:108:65:0:0 chr2 105859249 . C T 51.2 PASS AO=23;DP=84;FAO=23;FDP=83;FR=.;FRO=60;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=31;FSRR=29;FWDB=0.0121313;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.041;QD=2.46732;RBI=0.015813;REFB=-0.0109073;REVB=0.010143;RO=61;SAF=9;SAR=14;SRF=31;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142621;STB=0.591261;TYPE=snp;VARB=0.0204715;OID=.;OPOS=105859249;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:84:83:61:60:23:23:14:9:31:30:14:9:31:29 chr2 105883624 . TTTCCATGTACATTCATAGAGCCTGGTCA T 50 PASS AO=39;DP=258;LEN=28;RO=219;SAF=16;SAR=49;SRF=88;SRR=105;TYPE=del;FR=.;OID=.;OPOS=105883625;OREF=TTCCATGTACATTCATAGAGCCTGGTCA;OALT=-;OMAPALT=T GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR 0/1:99:258:219:39:49:16:88:105 chr2 105885961 . T C 83.37 PASS AO=22;DP=53;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.034562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.2141;QD=6.29243;RBI=0.0383695;REFB=-0.0281926;REVB=-0.0166637;RO=31;SAF=12;SAR=10;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0700616;STB=0.540034;TYPE=snp;VARB=0.041865;OID=.;OPOS=105885961;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:53:53:31:31:22:22:10:12:19:12:10:12:19:12 chr2 105889349 . G A 162.58 PASS AO=52;DP=134;FAO=51;FDP=133;FR=.;FRO=82;FSAF=19;FSAR=32;FSRF=31;FSRR=51;FWDB=0.0522366;FXX=0.00746213;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.4466;QD=4.88972;RBI=0.0550033;REFB=0.0213008;REVB=0.0172252;RO=82;SAF=19;SAR=33;SRF=31;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0146782;STB=0.503618;TYPE=snp;VARB=-0.0303353;OID=.;OPOS=105889349;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:133:82:82:52:51:33:19:31:51:32:19:31:51 chr2 105953938 . G GC 119.66 PASS AO=33;DP=82;FAO=33;FDP=80;FR=.;FRO=47;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=-0.0154895;FXX=0.0243873;HRUN=0;LEN=1;MLLD=142.587;QD=5.98286;RBI=0.0442136;REFB=-0.0384682;REVB=0.0414116;RO=47;SAF=15;SAR=18;SRF=27;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123725;STB=0.557788;TYPE=ins;VARB=0.06857;OID=.;OPOS=105953939;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:33:82:33:80:47:15:18:26:21:99:47:15:18:27:20 chr2 105977761 . G A 134.17 PASS AO=53;DP=164;FAO=53;FDP=165;FR=.;FRO=112;FSAF=35;FSAR=18;FSRF=60;FSRR=52;FWDB=-0.0056243;FXX=0.0571396;HRUN=4;LEN=1;MLLD=164.221;QD=3.2525;RBI=0.00598828;REFB=0.00156006;REVB=-0.00205591;RO=110;SAF=35;SAR=18;SRF=58;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162306;STB=0.588908;TYPE=snp;VARB=-0.00346477;OID=.;OPOS=105977761;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:165:110:112:53:53:18:35:58:52:18:35:60:52 chr2 106015412 . G C 76.03 PASS AO=21;DP=53;FAO=21;FDP=53;FR=.;FRO=32;FSAF=1;FSAR=20;FSRF=2;FSRR=30;FWDB=-0.115008;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=171.572;QD=5.73776;RBI=0.116466;REFB=-0.006857;REVB=-0.0183754;RO=27;SAF=1;SAR=20;SRF=2;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123201;STB=0.545407;TYPE=snp;VARB=0.0128515;OID=.;OPOS=106015412;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:53:53:27:32:21:21:20:1:2:25:20:1:2:30 chr2 106510452 . C T 258.97 PASS AO=72;DP=171;FAO=72;FDP=169;FR=.;FRO=97;FSAF=49;FSAR=23;FSRF=61;FSRR=36;FWDB=-0.0302388;FXX=0.0174408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.314;QD=6.12949;RBI=0.0358793;REFB=-0.0174167;REVB=0.0193117;RO=92;SAF=49;SAR=23;SRF=59;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.044535;STB=0.533287;TYPE=snp;VARB=0.0250103;OID=.;OPOS=106510452;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:169:92:97:72:72:23:49:59:33:23:49:61:36 chr2 106510455 . G GCACA 219.78 PASS AO=48;DP=170;FAO=55;FDP=120;FR=.;FRO=65;FSAF=32;FSAR=23;FSRF=53;FSRR=12;FWDB=-0.0102422;FXX=0.17807;HRUN=1;LEN=4;MLLD=104.114;QD=7.32602;RBI=0.0932501;REFB=-0.0937123;REVB=0.0926859;RO=96;SAF=30;SAR=18;SRF=67;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.092763;STB=0.635729;TYPE=ins;VARB=0.0892542;OID=.;OPOS=106510456;OREF=-;OALT=CACA;OMAPALT=GCACA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:48:170:55:120:65:32:23:53:12:99:96:30:18:67:29 chr2 106710108 . C T 1169.52 PASS AO=113;DP=114;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0455191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.528;QD=37.4247;RBI=0.0500709;REFB=0;REVB=0.0208593;RO=0;SAF=58;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000397335;OID=.;OPOS=106710108;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:114:125:0:0:113:125:55:58:0:0:57:68:0:0 chr2 106742139 . C T 326.67 PASS AO=35;DP=36;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0492388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.084;QD=35.3157;RBI=0.0495582;REFB=-0.106001;REVB=0.00561765;RO=0;SAF=24;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.519989;TYPE=snp;VARB=0.00183858;OID=.;OPOS=106742139;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:36:37:0:1:35:36:11:24:0:0:12:24:0:1 chr2 107032417 . A G 62.21 PASS AO=26;DP=88;FAO=26;FDP=88;FR=.;FRO=62;FSAF=21;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=42;FWDB=-0.00612759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.624;QD=2.82777;RBI=0.00936693;REFB=-0.00080917;REVB=0.00708464;RO=62;SAF=21;SAR=5;SRF=20;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.557518;STB=0.827779;TYPE=snp;VARB=0.00422883;OID=.;OPOS=107032417;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:88:88:62:62:26:26:5:21:20:42:5:21:20:42 chr2 107049714 . C G 17.55 PASS AO=7;DP=37;FAO=8;FDP=37;FR=.,HEALED;FRO=29;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=0.0423171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.967;QD=1.89762;RBI=0.0423175;REFB=0.000946567;REVB=-0.000173113;RO=22;SAF=4;SAR=3;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0233486;STB=0.555422;TYPE=snp;VARB=-0.00171728;OID=.;OPOS=107049714;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:36:37:22:29:7:8:3:4:13:9:3:5:20:9 chr2 107073469 . T A 89.43 PASS AO=23;DP=54;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.0101031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.9733;QD=6.62434;RBI=0.0114135;REFB=-0.0114455;REVB=-0.00531;RO=31;SAF=13;SAR=10;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114268;STB=0.565161;TYPE=snp;VARB=0.014574;OID=.;OPOS=107073469;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:54:54:31:31:23:23:10:13:14:17:10:13:14:17 chr2 107073501 . C T 115.54 PASS AO=27;DP=57;FAO=27;FDP=57;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.0139994;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.096;QD=8.10779;RBI=0.0214908;REFB=-0.0195338;REVB=-0.0163056;RO=30;SAF=16;SAR=11;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149368;STB=0.584031;TYPE=snp;VARB=0.0250599;OID=.;OPOS=107073501;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:30:30:27:27:11:16:13:17:11:16:13:17 chr2 107107567 . G C 104.97 PASS AO=31;DP=79;FAO=31;FDP=80;FR=.;FRO=49;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=30;FWDB=0.0113136;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.1705;QD=5.24852;RBI=0.0250789;REFB=0.0179116;REVB=-0.022382;RO=48;SAF=13;SAR=18;SRF=18;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0489721;STB=0.519987;TYPE=snp;VARB=-0.0276123;OID=.;OPOS=107107567;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:80:48:49:31:31:18:13:18:30:18:13:19:30 chr2 107423188 . G A 672.42 PASS AO=67;DP=68;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0756537;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.0005;QD=37.3564;RBI=0.154592;REFB=0;REVB=0.134816;RO=0;SAF=42;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.93036e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00206237;OID=.;OPOS=107423188;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:68:72:0:0:67:72:25:42:0:0:29:43:0:0 chr2 107423395 . T G 768.1 PASS AO=83;DP=85;FAO=84;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00809623;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.7122;QD=36.1459;RBI=0.0325949;REFB=-0.109152;REVB=-0.0315734;RO=2;SAF=29;SAR=54;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00736069;STB=0.504586;TYPE=snp;VARB=0.00118907;OID=.;OPOS=107423395;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:85:85:2:1:83:84:54:29:1:1:54:30:0:1 chr2 108443511 . C G 796.81 PASS AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0691228;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.741;QD=37.9431;RBI=0.0930121;REFB=0;REVB=-0.0622357;RO=0;SAF=38;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.981e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00130889;OID=.;OPOS=108443511;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:84:84:0:0:84:84:46:38:0:0:46:38:0:0 chr2 108475958 . A G 2139.59 PASS AO=242;DP=251;FAO=240;FDP=250;FR=.;FRO=10;FSAF=97;FSAR=143;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=0.0250586;FXX=0.00793619;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.5523;QD=34.2334;RBI=0.0435715;REFB=-0.0141324;REVB=-0.0356446;RO=8;SAF=99;SAR=143;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0291893;STB=0.516333;TYPE=snp;VARB=0.00460766;OID=.;OPOS=108475958;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:251:250:8:10:242:240:143:99:7:1:143:97:8:2 chr2 108479432 . G A 147.35 PASS AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00955476;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=101.648;QD=36.8371;RBI=0.0715865;REFB=0;REVB=0.070946;RO=0;SAF=5;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.36667e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00159355;OID=.;OPOS=108479432;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:16:0:0:16:16:11:5:0:0:11:5:0:0 chr2 108496435 . T A 820.13 PASS AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.148;QD=38.1456;RBI=0.0149266;REFB=0;REVB=-0.00191524;RO=0;SAF=54;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.86567e-05;OID=.;OPOS=108496435;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:86:86:0:0:86:86:32:54:0:0:32:54:0:0 chr2 108863767 . A C 2070.82 PASS AO=218;DP=220;FAO=219;FDP=219;FR=.;FRO=0;FSAF=99;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00832463;FXX=0.00454525;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.7961;QD=37.8233;RBI=0.0148942;REFB=-0.0213135;REVB=0.0123506;RO=1;SAF=99;SAR=119;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00478837;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000519392;OID=.;OPOS=108863767;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:220:219:1:0:218:219:119:99:1:0:120:99:0:0 chr2 108875198 . G A 185.12 PASS AO=71;DP=209;FAO=72;FDP=216;FR=.;FRO=144;FSAF=60;FSAR=12;FSRF=105;FSRR=39;FWDB=0.00176294;FXX=0.00917389;HRUN=3;LEN=1;MLLD=161.902;QD=3.42817;RBI=0.0166883;REFB=-0.00927818;REVB=-0.016595;RO=137;SAF=59;SAR=12;SRF=99;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187331;STB=0.60711;TYPE=snp;VARB=0.015395;OID=.;OPOS=108875198;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:216:137:144:71:72:12:59:99:38:12:60:105:39 chr2 108875244 . T C 1618.81 PASS AO=171;DP=174;FAO=171;FDP=171;FR=.;FRO=0;FSAF=133;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0168443;FXX=0.0172404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.473;QD=37.8669;RBI=0.0367945;REFB=-0.00301337;REVB=0.0327125;RO=1;SAF=133;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00356562;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.37969e-05;OID=.;OPOS=108875244;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:174:171:1:0:171:171:38:133:1:0:38:133:0:0 chr2 108875471 . G T 2858.33 PASS AO=296;DP=300;FAO=298;FDP=298;FR=.;FRO=0;FSAF=174;FSAR=124;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0290952;FXX=0.00996645;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0426;QD=38.3669;RBI=0.0304623;REFB=0;REVB=-0.00902324;RO=0;SAF=173;SAR=123;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99301e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.82904e-05;OID=.;OPOS=108875471;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:300:298:0:0:296:298:123:173:0:0:124:174:0:0 chr2 108877062 . T A 1128.41 PASS AO=123;DP=126;FAO=123;FDP=126;FR=.;FRO=3;FSAF=67;FSAR=56;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0162097;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=297.56;QD=35.8225;RBI=0.0177624;REFB=0.00025153;REVB=0.00726273;RO=3;SAF=67;SAR=56;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00556146;STB=0.502928;TYPE=snp;VARB=9.00157e-07;OID=.;OPOS=108877062;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:126:126:3:3:123:123:56:67:2:1:56:67:2:1 chr2 109087563 . C G 114.27 PASS AO=28;DP=62;FAO=28;FDP=62;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.0388023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9128;QD=7.37241;RBI=0.0391701;REFB=-0.0139522;REVB=-0.00535471;RO=34;SAF=13;SAR=15;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0632489;STB=0.535689;TYPE=snp;VARB=0.0169664;OID=.;OPOS=109087563;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:34:34:28:28:15:13:18:16:15:13:18:16 chr2 109099572 . C G 459.37 PASS AO=48;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272878;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.433;QD=36.7498;RBI=0.0276333;REFB=0;REVB=-0.00435598;RO=0;SAF=27;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000843468;OID=.;OPOS=109099572;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:49:50:0:0:48:50:21:27:0:0:21:29:0:0 chr2 109106381 . A G 1605.83 PASS AO=168;DP=170;FAO=169;FDP=169;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00228693;FXX=0.00588201;HRUN=3;LEN=1;MLLD=181.593;QD=38.0078;RBI=0.00444925;REFB=-0.0279855;REVB=0.00381652;RO=1;SAF=85;SAR=83;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00556631;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.89846e-06;OID=.;OPOS=109106381;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:170:169:1:0:168:169:83:85:1:0:83:86:0:0 chr2 109124356 . C A 158.92 PASS AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0120502;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=208.376;QD=37.3931;RBI=0.0120502;REFB=0;REVB=9.1412e-06;RO=0;SAF=2;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.95117e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.68981e-05;OID=.;OPOS=109124356;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:17:17:0:0:17:17:15:2:0:0:15:2:0:0 chr2 109276099 . G A 15.36 PASS AO=3;DP=7;FAO=3;FDP=7;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.00810787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.49;QD=8.77803;RBI=0.00810787;REFB=-0.0216822;REVB=0;RO=4;SAF=3;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0956868;OID=.;OPOS=109276099;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:7:7:4:4:3:3:0:3:4:0:0:3:4:0 chr2 109276178 . C T 12.53 PASS AO=3;DP=12;FAO=3;FDP=12;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0529931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.322;QD=4.17566;RBI=0.0539182;REFB=-0.0116364;REVB=-0.00994508;RO=9;SAF=1;SAR=2;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0416419;OID=.;OPOS=109276178;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:12:12:9:9:3:3:2:1:3:6:2:1:3:6 chr2 109374952 . A G 81.14 PASS AO=25;DP=68;FAO=25;FDP=68;FR=.;FRO=43;FSAF=1;FSAR=24;FSRF=8;FSRR=35;FWDB=-0.0259286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.8;QD=4.77278;RBI=0.0424649;REFB=0.00784391;REVB=0.0336299;RO=43;SAF=1;SAR=24;SRF=8;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.467478;STB=0.78513;TYPE=snp;VARB=-0.0101267;OID=.;OPOS=109374952;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:68:68:43:43:25:25:24:1:8:35:24:1:8:35 chr2 109389463 . G A 1513.89 PASS AO=158;DP=158;FAO=158;FDP=158;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00631218;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4939;QD=38.3263;RBI=0.00639723;REFB=0;REVB=0.00103964;RO=0;SAF=69;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4361e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.5196e-05;OID=.;OPOS=109389463;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:158:158:0:0:158:158:89:69:0:0:89:69:0:0 chr2 109401259 . C T 171.36 PASS AO=58;DP=170;FAO=60;FDP=169;FR=.;FRO=109;FSAF=23;FSAR=37;FSRF=34;FSRR=75;FWDB=-0.00284606;FXX=0.00588201;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1705;QD=4.0559;RBI=0.028289;REFB=0.0116797;REVB=0.0281454;RO=112;SAF=21;SAR=37;SRF=37;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.039992;STB=0.549824;TYPE=snp;VARB=-0.0213097;OID=.;OPOS=109401259;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:169:112:109:58:60:37:21:37:75:37:23:34:75 chr2 109408208 . G A 176.42 PASS AO=36;DP=71;FAO=38;FDP=72;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=10;FSRR=24;FWDB=0.002084;FXX=0.0270234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.46;QD=9.80128;RBI=0.0216948;REFB=-0.0147526;REVB=0.0215945;RO=35;SAF=14;SAR=22;SRF=10;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0989232;STB=0.538442;TYPE=snp;VARB=0.0130861;OID=.;OPOS=109408208;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:72:35:34:36:38:22:14:10:25:24:14:10:24 chr2 109429146 . T A 314.32 PASS AO=81;DP=177;FAO=81;FDP=178;FR=.;FRO=97;FSAF=28;FSAR=53;FSRF=39;FSRR=58;FWDB=0.00028569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.6179;QD=7.06338;RBI=0.028949;REFB=-0.0102983;REVB=-0.0289476;RO=95;SAF=28;SAR=53;SRF=38;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0572173;STB=0.533255;TYPE=snp;VARB=0.0123131;OID=.;OPOS=109429146;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:178:95:97:81:81:53:28:38:57:53:28:39:58 chr2 109463228 . G A 149.64 PASS AO=20;DP=81;FAO=38;FDP=79;FR=.,HEALED;FRO=41;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=-0.0654224;FXX=0.0124984;HRUN=3;LEN=1;MLLD=99.2248;QD=7.57692;RBI=0.0654945;REFB=-0.0368882;REVB=-0.00307348;RO=27;SAF=13;SAR=7;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0222387;STB=0.5367;TYPE=snp;VARB=0.0416788;OID=.;OPOS=109463228;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:79:27:41:20:38:7:13:17:10:23:15:19:22 chr2 109510937 . G A 523.13 PASS AO=217;DP=531;FAO=161;FDP=399;FR=.;FRO=238;FSAF=61;FSAR=100;FSRF=67;FSRR=171;FWDB=-0.0157744;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.2628;QD=5.24437;RBI=0.0196254;REFB=-0.0219668;REVB=-0.0116758;RO=307;SAF=85;SAR=132;SRF=93;SRR=214;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100752;STB=0.563594;TYPE=snp;VARB=0.0280177;OID=.;OPOS=109510937;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:531:399:307:238:217:161:132:85:93:214:100:61:67:171 chr2 109512234 . T C 94.65 PASS AO=22;DP=47;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.0211159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.9472;QD=8.05527;RBI=0.0588854;REFB=-0.0159836;REVB=-0.0549692;RO=23;SAF=4;SAR=18;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.297137;STB=0.678209;TYPE=snp;VARB=0.0229391;OID=.;OPOS=109512234;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:47:47:23:25:22:22:18:4:10:13:18:4:11:14 chr2 109513654 . G A 651.41 PASS AO=128;DP=219;FAO=128;FDP=219;FR=.;FRO=91;FSAF=64;FSAR=64;FSRF=35;FSRR=56;FWDB=-0.0196693;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.794;QD=11.8979;RBI=0.0522471;REFB=-0.0096974;REVB=0.0484033;RO=91;SAF=64;SAR=64;SRF=35;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0885088;STB=0.547938;TYPE=snp;VARB=0.00528438;OID=.;OPOS=109513654;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:219:219:91:91:128:128:64:64:35:56:64:64:35:56 chr2 109526969 . G A 152.79 PASS AO=49;DP=129;FAO=49;FDP=131;FR=.;FRO=82;FSAF=36;FSAR=13;FSRF=45;FSRR=37;FWDB=0.00299218;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.815;QD=4.66543;RBI=0.0200017;REFB=-0.000724499;REVB=-0.0197766;RO=80;SAF=36;SAR=13;SRF=44;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225553;STB=0.630858;TYPE=snp;VARB=0.0007326;OID=.;OPOS=109526969;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:131:80:82:49:49:13:36:44:36:13:36:45:37 chr2 109527373 . A G 178.12 PASS AO=38;DP=73;FAO=38;FDP=72;FR=.;FRO=34;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.050008;FXX=0.0136968;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9585;QD=9.89548;RBI=0.0874641;REFB=-0.0124781;REVB=-0.0717577;RO=35;SAF=22;SAR=16;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0814803;STB=0.537758;TYPE=snp;VARB=0.0154597;OID=.;OPOS=109527373;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:72:35:34:38:38:16:22:17:18:16:22:17:17 chr2 109745176 . G A 593.74 PASS AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137932;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=130.808;QD=37.6978;RBI=0.0433747;REFB=0;REVB=0.0411232;RO=0;SAF=35;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000163365;OID=.;OPOS=109745176;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:63:63:0:0:63:63:28:35:0:0:28:35:0:0 chr2 109960882 . G A 57.71 PASS AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=3;FWDB=0.0095108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.583;QD=6.99568;RBI=0.107263;REFB=0.00182809;REVB=0.10684;RO=19;SAF=5;SAR=9;SRF=16;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.454429;STB=0.758718;TYPE=snp;VARB=-2.34331e-05;OID=.;OPOS=109960882;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:33:33:19:19:14:14:9:5:16:3:9:5:16:3 chr2 109964211 . G A 196.8 PASS AO=41;DP=76;FAO=41;FDP=76;FR=.;FRO=35;FSAF=28;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=11;FWDB=0.0919059;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=45.0279;QD=10.3579;RBI=0.12078;REFB=-0.0158318;REVB=0.0783659;RO=35;SAF=28;SAR=13;SRF=24;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00268821;STB=0.501483;TYPE=snp;VARB=0.0144282;OID=.;OPOS=109964211;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:35:35:41:41:13:28:24:11:13:28:24:11 chr2 110065720 . C T 35.61 PASS AO=7;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=0;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8186;QD=8.37898;RBI=0.0538204;REFB=-0.231821;REVB=0.0538204;RO=10;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.133042;OID=.;OPOS=110065720;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:17:17:10:9:7:8:7:0:0:10:8:0:0:9 chr2 110855123 . G T 292.03 PASS AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00688899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.927;QD=38.9374;RBI=0.00689423;REFB=0;REVB=0.000268777;RO=0;SAF=26;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.9955e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.66437e-05;OID=.;OPOS=110855123;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:30:30:0:0:30:30:4:26:0:0:4:26:0:0 chr2 110922703 . C T 518.89 PASS AO=92;DP=143;FAO=92;FDP=143;FR=.;FRO=51;FSAF=44;FSAR=48;FSRF=22;FSRR=29;FWDB=-0.0106847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.934;QD=14.5144;RBI=0.0143283;REFB=-0.0273959;REVB=-0.00954668;RO=51;SAF=44;SAR=48;SRF=22;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.031091;STB=0.516775;TYPE=snp;VARB=0.0115705;OID=.;OPOS=110922703;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:51:51:92:92:48:44:22:29:48:44:22:29 chr2 111881415 . GGC G 400.15 PASS AO=28;DP=84;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.289012;FXX=0.0151492;HRUN=4;LEN=2;MLLD=17.8131;QD=24.6246;RBI=0.392331;REFB=-0.0308403;REVB=0.265322;RO=18;SAF=5;SAR=23;SRF=3;SRR=15;SSEN=0.436937;SSEP=0;SSSB=0.014558;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00745736;OID=.;OPOS=111881416;OREF=GC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:28:64:65:65:0:25:40:0:0:34:18:5:23:3:15 chr2 111881504 . AG A 60.7 PASS AO=18;DP=42;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=20;FWDB=0.0517244;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=17.33;QD=5.64651;RBI=0.27596;REFB=-0.0160357;REVB=0.271069;RO=18;SAF=14;SAR=4;SRF=2;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0.286966;SSSB=0.558027;STB=0.792438;TYPE=del;VARB=0.0680052;OID=.;OPOS=111881505;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:18:42:21:43:22:15:6:2:20:54:18:14:4:2:16 chr2 111907691 . T C 471.86 PASS AO=109;DP=215;FAO=109;FDP=215;FR=.;FRO=106;FSAF=56;FSAR=53;FSRF=53;FSRR=53;FWDB=-0.00611062;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.1703;QD=8.77878;RBI=0.027827;REFB=-0.00678705;REVB=-0.0271478;RO=106;SAF=56;SAR=53;SRF=53;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0123722;STB=0.506786;TYPE=snp;VARB=0.00766483;OID=.;OPOS=111907691;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:215:106:106:109:109:53:56:53:53:53:56:53:53 chr2 111908262 . G A 2191.84 PASS AO=231;DP=232;FAO=231;FDP=231;FR=.;FRO=0;FSAF=107;FSAR=124;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0138349;FXX=0.00858332;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.765;QD=37.9539;RBI=0.0201938;REFB=0.0153709;REVB=0.01471;RO=1;SAF=107;SAR=124;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00443292;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.14169e-05;OID=.;OPOS=111908262;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:232:231:1:0:231:231:124:107:1:0:124:107:0:0 chr2 112526866 . G A 64.53 PASS AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.00711568;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.062;QD=8.60412;RBI=0.0264257;REFB=-0.0163214;REVB=0.0254497;RO=16;SAF=5;SAR=9;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247787;STB=0.642653;TYPE=snp;VARB=0.0288853;OID=.;OPOS=112526866;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:30:30:16:16:14:14:9:5:10:6:9:5:10:6 chr2 112536264 . G T 45.67 PASS AO=3;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0243116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.8606;QD=26.0987;RBI=0.157854;REFB=-0.0763067;REVB=0.155971;RO=1;SAF=2;SAR=1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163246;STB=0.599655;TYPE=snp;VARB=0.0389549;OID=.;OPOS=112536264;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:7:7:1:1:3:6:1:2:1:0:4:2:1:0 chr2 112552427 . C T 24.08 PASS AO=4;DP=6;FAO=4;FDP=6;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00315965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.6732;QD=16.0537;RBI=0.0206004;REFB=-0.0555508;REVB=-0.0203566;RO=2;SAF=3;SAR=1;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210252;STB=0.624469;TYPE=snp;VARB=0.0285395;OID=.;OPOS=112552427;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:2:2:4:4:1:3:2:0:1:3:2:0 chr2 112582766 . CTT C 212.81 PASS AO=64;DP=135;FAO=66;FDP=127;FR=.;FRO=61;FSAF=35;FSAR=31;FSRF=31;FSRR=30;FWDB=-0.00915721;FXX=0.0522349;HRUN=2;LEN=2;MLLD=263.312;QD=6.70277;RBI=0.0110268;REFB=-0.0101063;REVB=0.006143;RO=60;SAF=34;SAR=30;SRF=31;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0128587;STB=0.51064;TYPE=del;VARB=0.00956594;OID=.;OPOS=112582767;OREF=TT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:64:130:66:127:61:35:31:31:30:99:60:34:30:31:29 chr2 112605302 . C T 722.45 PASS AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00372975;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.711;QD=37.0486;RBI=0.00693437;REFB=-0.00262475;REVB=0.0058459;RO=1;SAF=51;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0178528;STB=0.509431;TYPE=snp;VARB=3.329e-05;OID=.;OPOS=112605302;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:78:78:1:1:77:77:26:51:0:1:26:51:0:1 chr2 112641149 . G C 147.84 PASS AO=18;DP=42;FAO=19;FDP=40;FR=.,HEALED;FRO=12;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=1;FWDB=0.0221944;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=161.534;QD=14.784;RBI=0.0226834;REFB=-0.0392037;REVB=-0.00468462;RO=12;SAF=9;SAR=9;SRF=11;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.301435;STB=0.668736;TYPE=snp;VARB=0.0207336;OID=.;OPOS=112641149;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:40:40:12:12:18:19:9:9:11:1:10:9:11:1 chr2 112641256 . G A 77.31 PASS AO=14;DP=16;FAO=14;FDP=16;FR=.;FRO=2;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.106761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1695;QD=19.3275;RBI=0.160233;REFB=-0.100576;REVB=0.119485;RO=1;SAF=8;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0698108;STB=0.509078;TYPE=snp;VARB=0.115796;OID=.;OPOS=112641256;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:16:16:1:2:14:14:6:8:0:1:6:8:1:1 chr2 112641266 . G C 15.36 PASS AO=3;DP=9;FAO=3;FDP=9;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.189988;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.2268;QD=6.82606;RBI=0.243783;REFB=-0.0508439;REVB=0.152757;RO=6;SAF=2;SAR=1;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.102452;OID=.;OPOS=112641266;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:9:9:6:6:3:3:1:2:4:2:1:2:4:2 chr2 112832535 . CAAT C 1043.75 PASS AO=130;DP=136;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0242121;FXX=0.0225547;HRUN=2;LEN=3;MLLD=237.109;QD=32.1154;RBI=0.0314697;REFB=0;REVB=0.0201026;RO=0;SAF=62;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.98983e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.000172866;OID=.;OPOS=112832536;OREF=AAT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:130:130:130:130:0:62:68:0:0:91:0:62:68:0:0 chr2 112940398 . AGGGGCGC AGGGCGC,AGGGGCG 39.58 PASS AO=9,6;DP=51;FAO=0,24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=0,8;FSAR=0,16;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.645318,0.283103;FXX=0.040808;HRUN=4,5;LEN=1,1;MLLD=11.4313,9.24657;QD=3.36815;RBI=0.843005,0.30139;REFB=0.0535533,-0.0716208;REVB=-0.542422,-0.103385;RO=9;SAF=6,0;SAR=3,6;SRF=2;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.36755,-0.70923;STB=0.5,0.617547;TYPE=del,del;VARB=0.0245546,0.106155;OID=.,.;OPOS=112940399,112940405;OREF=G,C;OALT=-,-;OMAPALT=AGGGCGC,AGGGGCG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:9,6:29:0,24:47:23:0,8:0,16:13:10:38:9:6,0:3,6:2:7 chr2 113089267 . T C 2949.46 PASS AO=307;DP=307;FAO=307;FDP=307;FR=.;FRO=0;FSAF=140;FSAR=167;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0158664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.6513;QD=38.4295;RBI=0.0213193;REFB=0;REVB=0.0142396;RO=0;SAF=140;SAR=167;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.69839e-05;OID=.;OPOS=113089267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:307:307:0:0:307:307:167:140:0:0:167:140:0:0 chr2 113090047 . T C 1579.64 PASS AO=166;DP=167;FAO=167;FDP=167;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0329844;FXX=0.00595203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.1507;QD=37.8358;RBI=0.0466478;REFB=-0.0607778;REVB=0.0329856;RO=1;SAF=72;SAR=94;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00656379;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000237804;OID=.;OPOS=113090047;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:167:167:1:0:166:167:94:72:1:0:95:72:0:0 chr2 113091685 . T G 301.87 PASS AO=74;DP=160;FAO=75;FDP=160;FR=.;FRO=85;FSAF=36;FSAR=39;FSRF=36;FSRR=49;FWDB=0.0418468;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.6655;QD=7.54683;RBI=0.0432179;REFB=-0.0387257;REVB=-0.0107996;RO=82;SAF=35;SAR=39;SRF=34;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0557955;STB=0.530113;TYPE=snp;VARB=0.0440917;OID=.;OPOS=113091685;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:160:82:85:74:75:39:35:34:48:39:36:36:49 chr2 113191010 . A C 10.3 PASS AO=2;DP=8;FAO=2;FDP=8;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.0122792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.729;QD=5.14827;RBI=0.0122792;REFB=0.000250434;REVB=0;RO=6;SAF=2;SAR=0;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000868016;OID=.;OPOS=113191010;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:8:6:6:2:2:0:2:6:0:0:2:6:0 chr2 113286282 . AG A 389.97 PASS AO=46;DP=63;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.135119;FXX=0.0322529;HRUN=2;LEN=1;MLLD=17.7086;QD=25.9982;RBI=0.171991;REFB=-0.0316942;REVB=0.106413;RO=4;SAF=12;SAR=34;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0.285418;SSSB=-0.0453657;STB=0.505745;TYPE=del;VARB=0.0115977;OID=.;OPOS=113286283;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:46:60:59:60:1:16:43:0:1:30:4:12:34:2:2 chr2 113308516 . T A 1576.24 PASS AO=166;DP=167;FAO=166;FDP=166;FR=.;FRO=0;FSAF=102;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00885944;FXX=0.00598767;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.4332;QD=37.9816;RBI=0.0719461;REFB=-0.0350083;REVB=0.0713985;RO=1;SAF=102;SAR=64;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0073776;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000772227;OID=.;OPOS=113308516;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:167:166:1:0:166:166:64:102:0:1:64:102:0:0 chr2 113309473 . C T 175.8 PASS AO=54;DP=146;FAO=56;FDP=147;FR=.;FRO=91;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=49;FSRR=42;FWDB=-0.00705349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.041;QD=4.78372;RBI=0.0138754;REFB=-0.000810326;REVB=0.0119488;RO=90;SAF=20;SAR=34;SRF=48;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181635;STB=0.590765;TYPE=snp;VARB=0.00123914;OID=.;OPOS=113309473;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:147:90:91:54:56:34:20:48:42:34:22:49:42 chr2 113344047 . T C 496.11 PASS AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.999;QD=37.4425;RBI=0.016011;REFB=0;REVB=-0.016011;RO=0;SAF=0;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.536e-05;OID=.;OPOS=113344047;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:52:53:0:0:52:53:52:0:0:0:53:0:0:0 chr2 113404974 . A C 676.66 PASS AO=249;DP=573;FAO=181;FDP=398;FR=.;FRO=217;FSAF=81;FSAR=100;FSRF=71;FSRR=146;FWDB=0.024663;FXX=0.00499988;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.5822;QD=6.80058;RBI=0.0254133;REFB=0.0083628;REVB=0.00612976;RO=321;SAF=115;SAR=134;SRF=115;SRR=206;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107177;STB=0.567265;TYPE=snp;VARB=-0.0114978;OID=.;OPOS=113404974;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:573:398:321:217:249:181:134:115:115:206:100:81:71:146 chr2 113482779 . A C 484.49 PASS AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.829;QD=38.7592;RBI=0.0256356;REFB=0;REVB=-0.0224499;RO=0;SAF=29;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.20481e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.84195e-05;OID=.;OPOS=113482779;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:50:50:0:0:50:50:21:29:0:0:21:29:0:0 chr2 113484319 . G A 351.11 PASS AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00359632;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.653;QD=37.9583;RBI=0.0401589;REFB=0;REVB=0.0399976;RO=0;SAF=11;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000115146;OID=.;OPOS=113484319;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:37:37:0:0:37:37:26:11:0:0:26:11:0:0 chr2 113498566 . A G 3026.15 PASS AO=323;DP=328;FAO=325;FDP=325;FR=.;FRO=0;FSAF=115;FSAR=210;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0244722;FXX=0.0210837;HRUN=3;LEN=1;MLLD=141.686;QD=37.2449;RBI=0.035625;REFB=-0.164297;REVB=0.0258892;RO=5;SAF=115;SAR=208;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140114;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000237535;OID=.;OPOS=113498566;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:328:325:5:0:323:325:208:115:4:1:210:115:0:0 chr2 113513825 . T C 2794.88 PASS AO=292;DP=294;FAO=294;FDP=294;FR=.;FRO=0;FSAF=138;FSAR=156;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218234;FXX=0.00675653;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.4915;QD=38.0256;RBI=0.059215;REFB=-0.0562392;REVB=0.0550468;RO=1;SAF=137;SAR=155;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00346832;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000453563;OID=.;OPOS=113513825;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:294:294:1:0:292:294:155:137:1:0:156:138:0:0 chr2 113671378 . G T 735.96 PASS AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0575181;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.2238;QD=38.2315;RBI=0.0590112;REFB=0;REVB=-0.0131903;RO=0;SAF=19;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000223765;OID=.;OPOS=113671378;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:77:77:0:0:77:77:58:19:0:0:58:19:0:0 chr2 113671410 . A G 682.34 PASS AO=41;DP=73;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0315936;FXX=0.0270234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.2178;QD=37.9076;RBI=0.0339773;REFB=0;REVB=-0.0125022;RO=0;SAF=12;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000171977;OID=.;OPOS=113671410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:42:72:0:0:41:72:29:12:0:0:55:17:0:0 chr2 113763463 . A C 355.23 PASS AO=102;DP=242;FAO=102;FDP=242;FR=.;FRO=140;FSAF=65;FSAR=37;FSRF=86;FSRR=54;FWDB=-0.05644;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=68.6476;QD=5.87164;RBI=0.0605571;REFB=-0.013422;REVB=0.0219474;RO=138;SAF=65;SAR=37;SRF=86;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0156083;STB=0.514256;TYPE=snp;VARB=0.0178414;OID=.;OPOS=113763463;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:242:242:138:140:102:102:37:65:86:52:37:65:86:54 chr2 113763575 . A G 283.6 PASS AO=50;DP=141;FAO=78;FDP=167;FR=.;FRO=89;FSAF=38;FSAR=40;FSRF=46;FSRR=43;FWDB=0.026949;FXX=0.0118336;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.0474;QD=6.79283;RBI=0.0316793;REFB=-0.0644416;REVB=-0.0166533;RO=70;SAF=29;SAR=21;SRF=41;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00608701;STB=0.515808;TYPE=snp;VARB=0.0778406;OID=.;OPOS=113763575;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:167:70:89:50:78:21:29:41:29:40:38:46:43 chr2 113789316 . C T 1371.19 PASS AO=143;DP=143;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00314362;FXX=0.0204068;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.6349;QD=38.0886;RBI=0.00671342;REFB=0;REVB=-0.00593191;RO=0;SAF=29;SAR=114;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18661e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000313242;OID=.;OPOS=113789316;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:143:144:0:0:143:144:114:29:0:0:115:29:0:0 chr2 113832312 . T C 1470.05 PASS AO=154;DP=154;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.4182;QD=38.1831;RBI=0.029685;REFB=0;REVB=-0.0187838;RO=0;SAF=91;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.02921e-05;OID=.;OPOS=113832312;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:154:154:0:0:154:154:63:91:0:0:63:91:0:0 chr2 113832333 . C A 1216.66 PASS AO=90;DP=153;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.12231;FXX=0.028167;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.063;QD=35.2656;RBI=0.125698;REFB=0;REVB=0.0289885;RO=0;SAF=29;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0102389;OID=.;OPOS=113832333;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:90:138:0:0:90:138:61:29:0:0:66:72:0:0 chr2 113875565 . A G 164.91 PASS AO=62;DP=183;FAO=62;FDP=183;FR=.;FRO=121;FSAF=25;FSAR=37;FSRF=51;FSRR=70;FWDB=-0.0215893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.706;QD=3.60459;RBI=0.0256068;REFB=-0.00819802;REVB=-0.0137699;RO=121;SAF=25;SAR=37;SRF=51;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0217495;STB=0.51248;TYPE=snp;VARB=0.0121804;OID=.;OPOS=113875565;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:183:121:121:62:62:37:25:51:70:37:25:51:70 chr2 113875584 . G C 168.07 PASS AO=63;DP=185;FAO=63;FDP=185;FR=.;FRO=122;FSAF=22;FSAR=41;FSRF=50;FSRR=72;FWDB=-0.00591465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.5612;QD=3.63399;RBI=0.0398657;REFB=-0.00408686;REVB=0.0394245;RO=121;SAF=22;SAR=41;SRF=50;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0784462;STB=0.542833;TYPE=snp;VARB=0.00915992;OID=.;OPOS=113875584;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:185:121:122:63:63:41:22:50:71:41:22:50:72 chr2 113875631 . T C 161.27 PASS AO=64;DP=174;FAO=59;FDP=172;FR=.;FRO=113;FSAF=16;FSAR=43;FSRF=53;FSRR=60;FWDB=-0.0347437;FXX=0.0114936;HRUN=6;LEN=1;MLLD=38.2933;QD=3.75045;RBI=0.042738;REFB=-0.00202648;REVB=0.024888;RO=105;SAF=18;SAR=46;SRF=48;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212064;STB=0.642852;TYPE=snp;VARB=0.00213365;OID=.;OPOS=113875631;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:172:105:113:64:59:46:18:48:57:43:16:53:60 chr2 113877713 . A C 324.62 PASS AO=79;DP=169;FAO=79;FDP=165;FR=.;FRO=86;FSAF=39;FSAR=40;FSRF=33;FSRR=53;FWDB=-0.0498575;FXX=0.0462401;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.385;QD=7.86964;RBI=0.0500135;REFB=-0.0053082;REVB=0.00394691;RO=78;SAF=39;SAR=40;SRF=31;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0870776;STB=0.557385;TYPE=snp;VARB=0.00792537;OID=.;OPOS=113877713;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:165:78:86:79:79:40:39:31:47:40:39:33:53 chr2 113887207 . T C 235.01 PASS AO=66;DP=159;FAO=67;FDP=158;FR=.;FRO=91;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=39;FSRR=52;FWDB=0.0263893;FXX=0.00628891;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.858;QD=5.94969;RBI=0.0286028;REFB=-0.011848;REVB=-0.0110328;RO=91;SAF=32;SAR=34;SRF=39;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0584306;STB=0.536879;TYPE=snp;VARB=0.0213041;OID=.;OPOS=113887207;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:158:91:91:66:67:34:32:39:52:34:33:39:52 chr2 113940681 . T C 254.96 PASS AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8955;QD=37.7721;RBI=0.0256059;REFB=0;REVB=0.0139435;RO=0;SAF=22;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000925447;OID=.;OPOS=113940681;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:27:27:0:0:27:27:5:22:0:0:5:22:0:0 chr2 113940730 . T C 86.57 PASS AO=13;DP=25;FAO=17;FDP=29;FR=.;FRO=12;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=0.00829522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.068;QD=11.9409;RBI=0.0588931;REFB=-0.0267639;REVB=0.058306;RO=12;SAF=12;SAR=1;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.330015;STB=0.50837;TYPE=snp;VARB=0.0211246;OID=.;OPOS=113940730;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:25:29:12:12:13:17:1:12:9:3:4:13:9:3 chr2 113940839 . G C 961.51 PASS AO=104;DP=107;FAO=105;FDP=108;FR=.;FRO=3;FSAF=35;FSAR=70;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0104134;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=273.8;QD=35.6114;RBI=0.0155123;REFB=-0.0715481;REVB=0.0114976;RO=2;SAF=35;SAR=69;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00653628;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.91081e-05;OID=.;OPOS=113940839;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:107:108:2:3:104:105:69:35:1:1:70:35:1:2 chr2 113955074 . G A 270.67 PASS AO=66;DP=139;FAO=66;FDP=139;FR=.;FRO=73;FSAF=43;FSAR=23;FSRF=37;FSRR=36;FWDB=0.00571291;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.507;QD=7.78917;RBI=0.0247373;REFB=-0.0272377;REVB=0.0240685;RO=72;SAF=43;SAR=23;SRF=37;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135948;STB=0.579596;TYPE=snp;VARB=0.0305168;OID=.;OPOS=113955074;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:72:73:66:66:23:43:37:35:23:43:37:36 chr2 113956371 . G C 15.55 PASS AO=3;DP=8;FAO=3;FDP=8;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.0320784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.133;QD=7.77509;RBI=0.0696836;REFB=-0.00594667;REVB=0.061861;RO=5;SAF=1;SAR=2;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.584388;STB=0.855601;TYPE=snp;VARB=0.0132119;OID=.;OPOS=113956371;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:8:8:5:5:3:3:2:1:5:0:2:1:5:0 chr2 113956495 . A C 48.11 PASS AO=5;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0234144;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.291;QD=32.0739;RBI=0.0413989;REFB=0;REVB=0.0341414;RO=0;SAF=3;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00028324;OID=.;OPOS=113956495;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:5:6:2:3:0:0:3:3:0:0 chr2 113975110 . A G 152.52 PASS AO=42;DP=101;FAO=42;FDP=101;FR=.;FRO=59;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=24;FSRR=35;FWDB=-0.0213165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.9159;QD=6.04041;RBI=0.0215683;REFB=-0.00630733;REVB=-0.00328618;RO=58;SAF=23;SAR=19;SRF=24;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137039;STB=0.581695;TYPE=snp;VARB=0.00987356;OID=.;OPOS=113975110;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:58:59:42:42:19:23:24:34:19:23:24:35 chr2 113999625 . GC G 132.33 PASS AO=15;DP=21;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.308865;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=22.3463;QD=27.8579;RBI=0.311824;REFB=0;REVB=0.0428564;RO=2;SAF=2;SAR=13;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.297839;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0291732;OID=.;OPOS=113999626;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:15:19:19:19:0:5:14:0:0:11:2:2:13:2:0 chr2 114035923 . A G 58.39 PASS AO=8;DP=11;FAO=8;FDP=11;FR=.;FRO=3;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0427735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.919;QD=21.2334;RBI=0.0428493;REFB=-0.0360002;REVB=-0.00254732;RO=3;SAF=5;SAR=3;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0212058;STB=0.512165;TYPE=snp;VARB=0.00978776;OID=.;OPOS=114035923;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:11:11:3:3:8:8:3:5:2:1:3:5:2:1 chr2 114355200 . A G 10.38 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.068005;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.7089;QD=5.93145;RBI=0.0701191;REFB=0.014611;REVB=0.0170883;RO=5;SAF=1;SAR=1;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.576642;STB=0.855362;TYPE=snp;VARB=-0.00981679;OID=.;OPOS=114355200;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:5:5:2:2:1:1:5:0:1:1:5:0 chr2 114358772 . G A 23.32 PASS AO=4;DP=7;FAO=4;FDP=7;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.021119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.811;QD=13.3246;RBI=0.0220272;REFB=0.00829241;REVB=0.00625959;RO=3;SAF=2;SAR=2;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115334;STB=0.571077;TYPE=snp;VARB=-0.00343162;OID=.;OPOS=114358772;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:7:7:3:3:4:4:2:2:2:1:2:2:2:1 chr2 114391721 . T C 169.85 PASS AO=49;DP=130;FAO=52;FDP=133;FR=.;FRO=81;FSAF=16;FSAR=36;FSRF=33;FSRR=48;FWDB=-0.0172032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.897;QD=5.10831;RBI=0.0173733;REFB=-0.00378711;REVB=-0.00242491;RO=81;SAF=16;SAR=33;SRF=33;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0965824;STB=0.567541;TYPE=snp;VARB=0.00620264;OID=.;OPOS=114391721;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:133:81:81:49:52:33:16:33:48:36:16:33:48 chr2 114392716 . C T 88.15 PASS AO=25;DP=63;FAO=25;FDP=63;FR=.;FRO=38;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=-0.0117499;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.355;QD=5.59709;RBI=0.0252923;REFB=-0.00795944;REVB=-0.0223973;RO=37;SAF=10;SAR=15;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228594;STB=0.637392;TYPE=snp;VARB=0.0166475;OID=.;OPOS=114392716;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:63:63:37:38:25:25:15:10:23:14:15:10:24:14 chr2 114763169 . C G 418.42 PASS AO=96;DP=190;FAO=96;FDP=190;FR=.;FRO=94;FSAF=46;FSAR=50;FSRF=35;FSRR=59;FWDB=0.037015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.355;QD=8.80876;RBI=0.0372884;REFB=-0.00824989;REVB=-0.00450689;RO=93;SAF=46;SAR=50;SRF=34;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102608;STB=0.553167;TYPE=snp;VARB=0.0100084;OID=.;OPOS=114763169;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:190:93:94:96:96:50:46:34:59:50:46:35:59 chr2 116099725 . A T 626.5 PASS AO=67;DP=68;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=51;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0386229;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.2591;QD=36.8527;RBI=0.0498375;REFB=0.0739841;REVB=0.0314969;RO=1;SAF=16;SAR=51;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.028614;STB=0.515147;TYPE=snp;VARB=-0.00312355;OID=.;OPOS=116099725;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:68:68:1:1:67:67:51:16:1:0:51:16:1:0 chr2 116525960 . G A 1478.17 PASS AO=154;DP=159;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0102994;FXX=0.031248;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.458;QD=38.1464;RBI=0.0142615;REFB=-0.0217246;REVB=0.00986473;RO=0;SAF=87;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.87467e-06;OID=.;OPOS=116525960;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:159:155:0:0:154:155:67:87:0:0:67:88:0:0 chr2 118575215 . C G 91.32 PASS AO=20;DP=42;FAO=20;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=17;FWDB=-0.00717273;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.095;QD=8.69729;RBI=0.018832;REFB=-0.0191058;REVB=-0.0174125;RO=21;SAF=8;SAR=12;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159197;STB=0.597847;TYPE=snp;VARB=0.0260061;OID=.;OPOS=118575215;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:42:42:21:22:20:20:12:8:5:16:12:8:5:17 chr2 118583100 . G A 549.06 PASS AO=140;DP=300;FAO=140;FDP=300;FR=.;FRO=160;FSAF=71;FSAR=69;FSRF=76;FSRR=84;FWDB=-0.0070197;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.135;QD=7.32086;RBI=0.0157061;REFB=-0.00348885;REVB=0.0140501;RO=160;SAF=71;SAR=69;SRF=76;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0310696;STB=0.517136;TYPE=snp;VARB=0.00437576;OID=.;OPOS=118583100;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:300:300:160:160:140:140:69:71:76:84:69:71:76:84 chr2 118589808 . C T 298.52 PASS AO=35;DP=38;FAO=35;FDP=38;FR=.;FRO=3;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0117962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.046;QD=31.4233;RBI=0.0128752;REFB=0.000788044;REVB=0.00515948;RO=3;SAF=21;SAR=14;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0622689;STB=0.533315;TYPE=snp;VARB=-0.000127478;OID=.;OPOS=118589808;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:3:3:35:35:14:21:3:0:14:21:3:0 chr2 118731573 . G A 280.48 PASS AO=54;DP=92;FAO=54;FDP=92;FR=.;FRO=38;FSAF=38;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=27;FWDB=0.00738443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.776;QD=12.1947;RBI=0.00903453;REFB=-0.00348149;REVB=-0.00520509;RO=38;SAF=38;SAR=16;SRF=11;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.321159;STB=0.675698;TYPE=snp;VARB=0.00318838;OID=.;OPOS=118731573;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:38:38:54:54:16:38:11:27:16:38:11:27 chr2 118753097 . C T 221.09 PASS AO=44;DP=78;FAO=44;FDP=78;FR=.;FRO=34;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=0.0100223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.2494;QD=11.338;RBI=0.030163;REFB=-0.0209601;REVB=0.0284493;RO=34;SAF=24;SAR=20;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0820601;STB=0.545004;TYPE=snp;VARB=0.0162758;OID=.;OPOS=118753097;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:34:34:44:44:20:24:22:12:20:24:22:12 chr2 118771566 . C A 301.06 PASS AO=53;DP=95;FAO=58;FDP=99;FR=.;FRO=41;FSAF=28;FSAR=30;FSRF=13;FSRR=28;FWDB=0.0809662;FXX=0.009999;HRUN=4;LEN=1;MLLD=42.5846;QD=12.1638;RBI=0.126846;REFB=-0.0630632;REVB=0.0976446;RO=41;SAF=27;SAR=26;SRF=14;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1336;STB=0.569003;TYPE=snp;VARB=0.0490498;OID=.;OPOS=118771566;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:99:41:41:53:58:26:27:14:27:30:28:13:28 chr2 118774082 . T C 725.67 PASS AO=84;DP=93;FAO=86;FDP=92;FR=.;FRO=6;FSAF=37;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=-0.0166488;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.4796;QD=31.5508;RBI=0.0345629;REFB=-0.124156;REVB=0.0302889;RO=2;SAF=37;SAR=47;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0197284;STB=0.52884;TYPE=snp;VARB=0.00332062;OID=.;OPOS=118774082;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:93:92:2:6:84:86:47:37:0:2:49:37:0:6 chr2 118774178 . G C 747 PASS AO=82;DP=84;FAO=82;FDP=84;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=45;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0180491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.6409;QD=35.5715;RBI=0.0197266;REFB=-0.0935939;REVB=0.00796037;RO=2;SAF=37;SAR=45;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0249076;STB=0.513155;TYPE=snp;VARB=-0.000134188;OID=.;OPOS=118774178;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:84:84:2:2:82:82:45:37:2:0:45:37:2:0 chr2 118866033 . G GA 28.26 PASS AO=26;DP=83;FAO=14;FDP=39;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=22;FWDB=0.0499062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=23.8481;QD=2.89872;RBI=0.148098;REFB=0.0347178;REVB=0.139436;RO=57;SAF=14;SAR=12;SRF=20;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217541;STB=0.71405;TYPE=ins;VARB=-0.0278867;OID=.;OPOS=118866034;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:26:83:14:39:25:6:8:3:22:28:57:14:12:20:37 chr2 119600067 . C CT 274.65 PASS AO=27;DP=34;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00554372;FXX=0.0624805;HRUN=0;LEN=1;MLLD=237.749;QD=36.6198;RBI=0.00554372;REFB=0;REVB=0;RO=1;SAF=27;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.000108201;OID=.;OPOS=119600068;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:27:34:30:30:0:30:0:0:0:13:1:27:0:1:0 chr2 119748143 . C G 78.44 PASS AO=32;DP=93;FAO=31;FDP=102;FR=.;FRO=71;FSAF=23;FSAR=8;FSRF=35;FSRR=36;FWDB=-0.0192852;FXX=0.0097078;HRUN=10;LEN=1;MLLD=146.234;QD=3.07594;RBI=0.0193797;REFB=-0.00500123;REVB=-0.00191199;RO=56;SAF=23;SAR=9;SRF=20;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.39669;STB=0.685511;TYPE=snp;VARB=0.00728584;OID=.;OPOS=119748143;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:93:102:56:71:32:31:9:23:20:36:8:23:35:36 chr2 119915249 . T C 640.83 PASS AO=66;DP=67;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0015035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.173;QD=37.696;RBI=0.0259327;REFB=0;REVB=0.0258891;RO=0;SAF=19;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000162112;OID=.;OPOS=119915249;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:67:68:0:0:66:68:47:19:0:0:48:20:0:0 chr2 119988565 . G A 769.89 PASS AO=80;DP=81;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00912302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.686;QD=37.5554;RBI=0.0811534;REFB=0;REVB=0.080639;RO=0;SAF=48;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000748429;OID=.;OPOS=119988565;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:81:82:0:0:80:82:32:48:0:0:33:49:0:0 chr2 120021785 . T C 2012.03 PASS AO=209;DP=209;FAO=209;FDP=209;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=140;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0248599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.4865;QD=38.5077;RBI=0.0375831;REFB=0;REVB=-0.0281864;RO=0;SAF=69;SAR=140;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.38393e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000131174;OID=.;OPOS=120021785;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:209:209:0:0:209:209:140:69:0:0:140:69:0:0 chr2 120060082 . T C 258.38 PASS AO=64;DP=136;FAO=64;FDP=136;FR=.;FRO=72;FSAF=26;FSAR=38;FSRF=40;FSRR=32;FWDB=0.0317128;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.9887;QD=7.59928;RBI=0.0329903;REFB=0.00220852;REVB=0.00909178;RO=72;SAF=26;SAR=38;SRF=40;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143232;STB=0.579458;TYPE=snp;VARB=-0.00205702;OID=.;OPOS=120060082;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:72:72:64:64:38:26:40:32:38:26:40:32 chr2 120078778 . T C 543.92 PASS AO=323;DP=787;FAO=164;FDP=400;FR=.;FRO=236;FSAF=75;FSAR=89;FSRF=117;FSRR=119;FWDB=0.0131566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.058;QD=5.43917;RBI=0.0230552;REFB=-0.00806621;REVB=0.0189327;RO=457;SAF=143;SAR=180;SRF=235;SRR=222;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0755684;STB=0.522758;TYPE=snp;VARB=0.011474;OID=.;OPOS=120078778;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:787:400:457:236:323:164:180:143:235:222:89:75:117:119 chr2 120194651 . A AGTGTGC 33.7 PASS AO=12;DP=61;FAO=14;FDP=52;FR=.;FRO=38;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=30;FWDB=-0.0558766;FXX=0.0714158;HRUN=0;LEN=6;MLLD=296.034;QD=2.59201;RBI=0.0571422;REFB=-0.00905213;REVB=-0.0119596;RO=42;SAF=1;SAR=11;SRF=12;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.410895;STB=0.588095;TYPE=ins;VARB=0.0231285;OID=.;OPOS=120194652;OREF=-;OALT=GTGTGC;OMAPALT=AGTGTGC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:12:61:14:52:38:2:12:8:30:33:42:1:11:12:30 chr2 120199140 . A G 104.34 PASS AO=9;DP=70;FAO=28;FDP=68;FR=.,HEALED;FRO=40;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=15;FWDB=0.0333565;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.9118;QD=6.13771;RBI=0.0378648;REFB=0.0071378;REVB=-0.0179189;RO=23;SAF=2;SAR=7;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.279278;STB=0.532445;TYPE=snp;VARB=-0.0107758;OID=.;OPOS=120199140;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:68:23:40:9:28:7:2:10:13:12:16:25:15 chr2 120303820 . A T 159.21 PASS AO=49;DP=128;FAO=50;FDP=131;FR=.;FRO=81;FSAF=19;FSAR=31;FSRF=31;FSRR=50;FWDB=-0.0446252;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.288;QD=4.86151;RBI=0.0460523;REFB=-0.0112112;REVB=-0.0113758;RO=79;SAF=19;SAR=30;SRF=29;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0238238;STB=0.50178;TYPE=snp;VARB=0.0256336;OID=.;OPOS=120303820;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:131:79:81:49:50:30:19:29:50:31:19:31:50 chr2 120369300 . T C 1496.49 PASS AO=160;DP=163;FAO=161;FDP=161;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0200719;FXX=0.0122692;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.366;QD=37.1798;RBI=0.0214156;REFB=-0.0582393;REVB=0.0074662;RO=1;SAF=60;SAR=100;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00786377;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.93657e-05;OID=.;OPOS=120369300;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:163:161:1:0:160:161:100:60:1:0:100:61:0:0 chr2 120388412 . G A 1915.22 PASS AO=197;DP=197;FAO=199;FDP=199;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=128;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0274035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.9322;QD=38.4969;RBI=0.0385958;REFB=0;REVB=-0.0271787;RO=0;SAF=69;SAR=128;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.79178e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.61919e-05;OID=.;OPOS=120388412;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:197:199:0:0:197:199:128:69:0:0:128:71:0:0 chr2 120409616 . G T 285.35 PASS AO=74;DP=185;FAO=82;FDP=192;FR=.;FRO=110;FSAF=38;FSAR=44;FSRF=42;FSRR=68;FWDB=0.0327924;FXX=0.00518108;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.852;QD=5.94478;RBI=0.0328102;REFB=0.00016277;REVB=0.00108016;RO=110;SAF=34;SAR=40;SRF=43;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0740025;STB=0.547314;TYPE=snp;VARB=0.000228399;OID=.;OPOS=120409616;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:192:110:110:74:82:40:34:43:67:44:38:42:68 chr2 120438515 . G C 417.15 PASS AO=79;DP=134;FAO=79;FDP=131;FR=.;FRO=52;FSAF=44;FSAR=35;FSRF=35;FSRR=17;FWDB=-0.000758493;FXX=0.0223864;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.268;QD=12.7374;RBI=0.00813469;REFB=-0.0150903;REVB=0.00809925;RO=52;SAF=44;SAR=35;SRF=35;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0870822;STB=0.547188;TYPE=snp;VARB=0.00900645;OID=.;OPOS=120438515;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:131:52:52:79:79:35:44:35:17:35:44:35:17 chr2 120438523 . A G 111.92 PASS AO=42;DP=126;FAO=42;FDP=126;FR=.;FRO=84;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=49;FSRR=35;FWDB=-0.0216928;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.806;QD=3.55313;RBI=0.0266813;REFB=-0.0241993;REVB=-0.0155343;RO=84;SAF=28;SAR=14;SRF=49;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103456;STB=0.559971;TYPE=snp;VARB=0.0455156;OID=.;OPOS=120438523;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:84:84:42:42:14:28:49:35:14:28:49:35 chr2 120438696 . A G 965.38 PASS AO=103;DP=105;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0455057;FXX=0.0190458;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.737;QD=37.4907;RBI=0.0466834;REFB=0.0292447;REVB=0.0104195;RO=1;SAF=54;SAR=49;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00870632;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.56395e-05;OID=.;OPOS=120438696;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:105:103:1:0:103:103:49:54:1:0:49:54:0:0 chr2 120438834 . AG A 35.81 PASS AO=22;DP=72;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=0.044446;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=17.2717;QD=7.16111;RBI=0.0731761;REFB=-0.0953204;REVB=-0.0581317;RO=50;SAF=0;SAR=22;SRF=45;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.877923;STB=0.817603;TYPE=del;VARB=0.119331;OID=.;OPOS=120438835;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:22:72:11:20:9:2:9:8:1:27:50:0:22:45:5 chr2 120439230 . C G 134.62 PASS AO=24;DP=97;FAO=39;FDP=95;FR=.,HEALED;FRO=52;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=20;FSRR=32;FWDB=-0.0489667;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=37.2369;QD=5.66806;RBI=0.119449;REFB=0.0172472;REVB=0.108951;RO=38;SAF=11;SAR=13;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0444893;STB=0.515769;TYPE=snp;VARB=0.0234769;OID=.;OPOS=120439230;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:95:38:52:24:39:13:11:19:19:25:14:20:32 chr2 120439459 . C A 220.81 PASS AO=49;DP=95;FAO=49;FDP=96;FR=.;FRO=47;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=25;FWDB=-0.0219474;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.392;QD=9.20031;RBI=0.0223594;REFB=0.0140467;REVB=0.0042722;RO=45;SAF=28;SAR=21;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0722236;STB=0.550877;TYPE=snp;VARB=-0.00475869;OID=.;OPOS=120439459;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:96:45:47:49:49:21:28:22:23:21:28:22:25 chr2 120704166 . G T 1035.05 PASS AO=108;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00230891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.169;QD=38.3351;RBI=0.00866421;REFB=0;REVB=0.00835089;RO=0;SAF=28;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.67953e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.40109e-06;OID=.;OPOS=120704166;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:108:108:0:0:108:108:80:28:0:0:80:28:0:0 chr2 120776677 . G A 375.91 PASS AO=88;DP=177;FAO=88;FDP=176;FR=.;FRO=88;FSAF=58;FSAR=30;FSRF=49;FSRR=39;FWDB=0.00881837;FXX=0.0056494;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.602;QD=8.54335;RBI=0.0269969;REFB=-0.00497131;REVB=-0.025516;RO=88;SAF=58;SAR=30;SRF=49;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0996;STB=0.554896;TYPE=snp;VARB=0.00428013;OID=.;OPOS=120776677;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:176:88:88:88:88:30:58:49:39:30:58:49:39 chr2 120830815 . A G 518.44 PASS AO=58;DP=62;FAO=58;FDP=60;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0797736;FXX=0.0322529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.607;QD=34.5626;RBI=0.0845593;REFB=-0.0391183;REVB=0.0280436;RO=2;SAF=34;SAR=24;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.037694;STB=0.519993;TYPE=snp;VARB=0.00148131;OID=.;OPOS=120830815;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:62:60:2:2:58:58:24:34:0:2:24:34:0:2 chr2 120885310 . G A 1668.69 PASS AO=179;DP=183;FAO=180;FDP=183;FR=.;FRO=3;FSAF=91;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.04767;FXX=0.00543449;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.194;QD=36.4741;RBI=0.0494673;REFB=-0.0398121;REVB=0.013213;RO=3;SAF=90;SAR=89;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0157736;STB=0.508286;TYPE=snp;VARB=0.000407327;OID=.;OPOS=120885310;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:183:183:3:3:179:180:89:90:0:3:89:91:0:3 chr2 120980428 . G C 462.9 PASS AO=30;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=32;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0208397;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.4594;QD=37.7879;RBI=0.37863;REFB=0;REVB=0.378056;RO=2;SAF=28;SAR=2;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.304917;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00642793;OID=.;OPOS=120980428;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:46:49:2:0:30:49:2:28:0:2:17:32:0:0 chr2 121051181 . C T 420.3 PASS AO=90;DP=167;FAO=90;FDP=167;FR=.;FRO=77;FSAF=41;FSAR=49;FSRF=21;FSRR=56;FWDB=-0.00313559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.927;QD=10.067;RBI=0.0101135;REFB=-0.00403229;REVB=-0.00961511;RO=75;SAF=41;SAR=49;SRF=19;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17322;STB=0.586254;TYPE=snp;VARB=0.00374901;OID=.;OPOS=121051181;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:167:75:77:90:90:49:41:19:56:49:41:21:56 chr2 121408892 . A T 91.04 PASS AO=31;DP=92;FAO=31;FDP=91;FR=.;FRO=60;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=42;FSRR=18;FWDB=0.00064916;FXX=0.0108684;HRUN=3;LEN=1;MLLD=122.13;QD=4.00164;RBI=0.0312735;REFB=-0.0117885;REVB=-0.0312667;RO=60;SAF=16;SAR=15;SRF=42;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21294;STB=0.622244;TYPE=snp;VARB=0.0190227;OID=.;OPOS=121408892;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:92:91:60:60:31:31:15:16:42:18:15:16:42:18 chr2 121726447 . G A 125.83 PASS AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0576156;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.508;QD=35.9526;RBI=0.0855014;REFB=0;REVB=0.0631738;RO=0;SAF=2;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00237833;OID=.;OPOS=121726447;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:14:14:0:0:14:14:12:2:0:0:12:2:0:0 chr2 121746956 . G T 456.04 PASS AO=50;DP=52;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0326128;FXX=0.0377287;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.182;QD=35.7678;RBI=0.148296;REFB=0.0371829;REVB=0.144665;RO=1;SAF=27;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200269;STB=0.510634;TYPE=snp;VARB=0.000214487;OID=.;OPOS=121746956;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:52:51:1:1:50:50:23:27:0:1:23:27:0:1 chr2 121747406 . G A 410.32 PASS AO=43;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0302224;FXX=0.0434688;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.5079;QD=37.3015;RBI=0.0754655;REFB=0;REVB=0.0691494;RO=0;SAF=20;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00217344;OID=.;OPOS=121747406;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:44:44:0:0:43:44:23:20:0:0:25:19:0:0 chr2 121747429 . A G 465.35 PASS AO=48;DP=50;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0283824;FXX=0.039992;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.0733;QD=38.7788;RBI=0.049191;REFB=0;REVB=0.040177;RO=0;SAF=22;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46901e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000749226;OID=.;OPOS=121747429;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:50:48:0:0:48:48:26:22:0:0:26:22:0:0 chr2 121749067 . G C 1161.05 PASS AO=122;DP=123;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0455066;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.946;QD=38.0671;RBI=0.0521654;REFB=0;REVB=-0.0255025;RO=0;SAF=56;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.54631e-05;OID=.;OPOS=121749067;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:123:122:0:0:122:122:66:56:0:0:66:56:0:0 chr2 121948235 . C G 192.93 PASS AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0332833;FXX=0.0454339;HRUN=3;LEN=1;MLLD=150.787;QD=36.7494;RBI=0.0417656;REFB=0;REVB=-0.0252306;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.49945e-06;OID=.;OPOS=121948235;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:22:21:0:0:21:21:12:9:0:0:12:9:0:0 chr2 121948239 . A C 173.13 PASS AO=21;DP=23;FAO=21;FDP=23;FR=.;FRO=2;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0111224;FXX=0.0416493;HRUN=7;LEN=1;MLLD=146.738;QD=30.1087;RBI=0.0179926;REFB=-0.0584237;REVB=-0.014143;RO=2;SAF=8;SAR=13;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10217;STB=0.555502;TYPE=snp;VARB=0.000566229;OID=.;OPOS=121948239;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:23:23:2:2:21:21:13:8:2:0:13:8:2:0 chr2 121948262 . A G 65.54 PASS AO=14;DP=32;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.0319511;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.049;QD=7.9438;RBI=0.0538301;REFB=-0.0258983;REVB=-0.0433222;RO=18;SAF=8;SAR=6;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17581;STB=0.57821;TYPE=snp;VARB=0.0442889;OID=.;OPOS=121948262;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:32:33:18:18:14:15:6:8:7:11:7:8:7:11 chr2 121948307 . A G 92.87 PASS AO=22;DP=47;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.0560596;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.8576;QD=7.73918;RBI=0.142291;REFB=0.0119557;REVB=-0.130783;RO=25;SAF=10;SAR=12;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13591;STB=0.565978;TYPE=snp;VARB=-0.0207747;OID=.;OPOS=121948307;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:47:48:25:26:22:22:12:10:15:10:12:10:15:11 chr2 121980405 . TC T 603.84 PASS AO=75;DP=78;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0643213;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=28.2622;QD=31.3681;RBI=0.111993;REFB=0;REVB=-0.0916799;RO=0;SAF=30;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.000524217;OID=.;OPOS=121980406;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:75:76:77:77:0:30:47:0:0:53:0:30:45:0:0 chr2 121981950 . A G 244.78 PASS AO=53;DP=101;FAO=53;FDP=101;FR=.;FRO=48;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=19;FSRR=29;FWDB=-0.0355785;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.3662;QD=9.69436;RBI=0.0437293;REFB=-0.0204914;REVB=-0.0254249;RO=48;SAF=29;SAR=24;SRF=19;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130016;STB=0.571561;TYPE=snp;VARB=0.0153666;OID=.;OPOS=121981950;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:48:48:53:53:24:29:19:29:24:29:19:29 chr2 121989489 . G A 255.86 PASS AO=65;DP=137;FAO=64;FDP=138;FR=.;FRO=74;FSAF=37;FSAR=27;FSRF=44;FSRR=30;FWDB=0.00575375;FXX=0.00719373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.3385;QD=7.41627;RBI=0.0630314;REFB=-0.00492102;REVB=0.0627682;RO=71;SAF=38;SAR=27;SRF=42;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00673827;STB=0.509075;TYPE=snp;VARB=0.00793256;OID=.;OPOS=121989489;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:138:71:74:65:64:27:38:42:29:27:37:44:30 chr2 122096257 . C T 259.03 PASS AO=59;DP=122;FAO=61;FDP=123;FR=.;FRO=62;FSAF=57;FSAR=4;FSRF=55;FSRR=7;FWDB=0.0110354;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.058;QD=8.42385;RBI=0.0263172;REFB=-0.0148444;REVB=-0.0238917;RO=63;SAF=55;SAR=4;SRF=55;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17776;STB=0.583225;TYPE=snp;VARB=0.0153316;OID=.;OPOS=122096257;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:123:63:62:59:61:4:55:55:8:4:57:55:7 chr2 122098360 . G A 481.2 PASS AO=119;DP=250;FAO=119;FDP=249;FR=.;FRO=130;FSAF=90;FSAR=29;FSRF=107;FSRR=23;FWDB=-0.00529391;FXX=0.00399984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.463;QD=7.73004;RBI=0.0176284;REFB=-0.00820319;REVB=0.0168147;RO=127;SAF=91;SAR=28;SRF=104;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0739742;STB=0.549689;TYPE=snp;VARB=0.0101591;OID=.;OPOS=122098360;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:250:249:127:130:119:119:28:91:104:23:29:90:107:23 chr2 122409207 . A G 272.54 PASS AO=73;DP=162;FAO=73;FDP=165;FR=.;FRO=92;FSAF=32;FSAR=41;FSRF=35;FSRR=57;FWDB=-0.00332722;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.409;QD=6.60697;RBI=0.00644058;REFB=-0.00940985;REVB=-0.00551459;RO=88;SAF=32;SAR=41;SRF=32;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0755265;STB=0.533052;TYPE=snp;VARB=0.0102244;OID=.;OPOS=122409207;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:165:88:92:73:73:41:32:32:56:41:32:35:57 chr2 122484976 . G A 353.51 PASS AO=73;DP=137;FAO=74;FDP=136;FR=.;FRO=62;FSAF=39;FSAR=35;FSRF=29;FSRR=33;FWDB=-0.00323957;FXX=0.0144917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.365;QD=10.3974;RBI=0.0129222;REFB=-0.00822315;REVB=-0.0125096;RO=60;SAF=38;SAR=35;SRF=29;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0307013;STB=0.52702;TYPE=snp;VARB=0.00704528;OID=.;OPOS=122484976;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:136:60:62:73:74:35:38:29:31:35:39:29:33 chr2 125192068 . T C 991.13 PASS AO=103;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00430493;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.656;QD=38.1203;RBI=0.0237509;REFB=0;REVB=0.0233575;RO=0;SAF=76;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000128989;OID=.;OPOS=125192068;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:104:104:0:0:103:104:27:76:0:0:27:77:0:0 chr2 125746817 . A G 138.08 PASS AO=44;DP=117;FAO=44;FDP=117;FR=.;FRO=73;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=31;FSRR=42;FWDB=0.0281511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.7155;QD=4.72068;RBI=0.0323767;REFB=0.00101808;REVB=-0.0159927;RO=73;SAF=20;SAR=24;SRF=31;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0331397;STB=0.518859;TYPE=snp;VARB=-0.00144068;OID=.;OPOS=125746817;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:73:73:44:44:24:20:31:42:24:20:31:42 chr2 127811042 . G A 159.98 PASS AO=34;DP=67;FAO=35;FDP=69;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=26;FSRF=6;FSRR=28;FWDB=0.0123184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.303;QD=9.27406;RBI=0.0135869;REFB=-0.0120333;REVB=-0.00573245;RO=32;SAF=8;SAR=26;SRF=5;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102207;STB=0.554765;TYPE=snp;VARB=0.0148456;OID=.;OPOS=127811042;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:69:32:34:34:35:26:8:5:27:26:9:6:28 chr2 127819777 . C T 22.94 PASS AO=9;DP=36;FAO=9;FDP=35;FR=.;FRO=26;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=6;FWDB=0.0769449;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.1593;QD=2.62132;RBI=0.0850909;REFB=-0.0122309;REVB=0.0363308;RO=25;SAF=2;SAR=7;SRF=20;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.606956;STB=0.85491;TYPE=snp;VARB=0.0443066;OID=.;OPOS=127819777;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:36:35:25:26:9:9:7:2:20:5:7:2:20:6 chr2 127821207 . G A 205.24 PASS AO=48;DP=101;FAO=48;FDP=99;FR=.;FRO=51;FSAF=14;FSAR=34;FSRF=17;FSRR=34;FWDB=-0.0103154;FXX=0.0198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.539;QD=8.2925;RBI=0.0266338;REFB=-0.0103786;REVB=0.024555;RO=50;SAF=14;SAR=34;SRF=16;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0310327;STB=0.525413;TYPE=snp;VARB=0.0109445;OID=.;OPOS=127821207;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:99:50:51:48:48:34:14:16:34:34:14:17:34 chr2 127826533 . A G 51.83 PASS AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=0.0149522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.678;QD=10.3668;RBI=0.0375635;REFB=-0.0296427;REVB=0.0344594;RO=10;SAF=3;SAR=7;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108107;STB=0.562382;TYPE=snp;VARB=0.0180279;OID=.;OPOS=127826533;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:20:20:10:10:10:10:7:3:2:8:7:3:2:8 chr2 128065066 . CT C 68.33 PASS AO=59;DP=231;FAO=71;FDP=168;FR=.;FRO=97;FSAF=17;FSAR=54;FSRF=15;FSRR=82;FWDB=0.00073695;FXX=0.188397;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.21645;QD=1.62702;RBI=0.0379025;REFB=-0.0871672;REVB=0.0378953;RO=77;SAF=15;SAR=44;SRF=9;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20713;STB=0.572259;TYPE=del;VARB=0.0810007;OID=.;OPOS=128065067;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:59:188:71:168:97:17:54:15:82:68:77:15:44:9:68 chr2 128065075 . TA T 72.51 PASS AO=52;DP=215;FAO=77;FDP=189;FR=.;FRO=112;FSAF=13;FSAR=64;FSRF=19;FSRR=93;FWDB=-0.166524;FXX=0.10426;HRUN=6;LEN=1;MLLD=8.44388;QD=1.5347;RBI=0.170811;REFB=-0.0372794;REVB=0.0380295;RO=82;SAF=6;SAR=46;SRF=12;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0.456311;SSSB=-0.0758957;STB=0.500856;TYPE=del;VARB=0.0044691;OID=.;OPOS=128065076;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:52:187:77:189:112:13:64:19:93:72:82:6:46:12:70 chr2 128079806 . A G 370.61 PASS AO=93;DP=203;FAO=95;FDP=206;FR=.;FRO=111;FSAF=44;FSAR=51;FSRF=64;FSRR=47;FWDB=0.0700588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.364;QD=7.1963;RBI=0.0702638;REFB=0.00991669;REVB=0.00536372;RO=110;SAF=44;SAR=49;SRF=63;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0971984;STB=0.560883;TYPE=snp;VARB=-0.0103708;OID=.;OPOS=128079806;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:206:110:111:93:95:49:44:63:47:51:44:64:47 chr2 128176040 . A T 131.26 PASS AO=29;DP=58;FAO=29;FDP=58;FR=.;FRO=29;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.0187423;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.108;QD=9.05256;RBI=0.0198725;REFB=-0.00929113;REVB=-0.00660639;RO=29;SAF=18;SAR=11;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0642495;STB=0.535955;TYPE=snp;VARB=0.0102955;OID=.;OPOS=128176040;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:29:29:29:29:11:18:16:13:11:18:16:13 chr2 128180872 . G T 201.62 PASS AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0371811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.146;QD=36.6577;RBI=0.0536457;REFB=0;REVB=0.0386708;RO=0;SAF=14;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000884194;OID=.;OPOS=128180872;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:22:22:0:0:22:22:8:14:0:0:8:14:0:0 chr2 128184770 . T C 142.2 PASS AO=26;DP=42;FAO=26;FDP=43;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.09839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2766;QD=13.2281;RBI=0.0989503;REFB=-0.015383;REVB=-0.0105159;RO=16;SAF=6;SAR=20;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.268432;STB=0.663764;TYPE=snp;VARB=0.0073278;OID=.;OPOS=128184770;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:42:43:16:17:26:26:20:6:9:7:20:6:10:7 chr2 128238687 . A G 226.72 PASS AO=59;DP=134;FAO=59;FDP=131;FR=.;FRO=72;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=39;FSRR=33;FWDB=-0.012583;FXX=0.0296274;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.9234;QD=6.92273;RBI=0.0158833;REFB=-0.00630971;REVB=-0.00969261;RO=66;SAF=28;SAR=31;SRF=39;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110355;STB=0.536819;TYPE=snp;VARB=0.00558969;OID=.;OPOS=128238687;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:131:66:72:59:59:31:28:39:27:31:28:39:33 chr2 128321770 . G A 1158.44 PASS AO=120;DP=120;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0363006;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.021;QD=38.6148;RBI=0.0441559;REFB=0;REVB=0.0251398;RO=0;SAF=45;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.11218e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.68455e-05;OID=.;OPOS=128321770;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:120:120:0:0:120:120:75:45:0:0:75:45:0:0 chr2 128367092 . G A 379 PASS AO=79;DP=156;FAO=84;FDP=161;FR=.;FRO=77;FSAF=78;FSAR=6;FSRF=54;FSRR=23;FWDB=0.0393102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.3534;QD=9.41624;RBI=0.0537352;REFB=-0.0235234;REVB=0.0366357;RO=75;SAF=73;SAR=6;SRF=53;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.407833;STB=0.740593;TYPE=snp;VARB=0.0534049;OID=.;OPOS=128367092;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:161:75:77:79:84:6:73:53:22:6:78:54:23 chr2 128379563 . C G 83.91 PASS AO=25;DP=66;FAO=25;FDP=66;FR=.;FRO=41;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=29;FWDB=0.0801449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.1139;QD=5.08558;RBI=0.0925721;REFB=-0.0148095;REVB=0.0463291;RO=41;SAF=9;SAR=16;SRF=12;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.081182;STB=0.546523;TYPE=snp;VARB=0.0267301;OID=.;OPOS=128379563;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:66:66:41:41:25:25:16:9:12:29:16:9:12:29 chr2 128381808 . C T 254.79 PASS AO=72;DP=176;FAO=73;FDP=176;FR=.;FRO=103;FSAF=56;FSAR=17;FSRF=53;FSRR=50;FWDB=0.0209636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.5591;QD=5.79078;RBI=0.0214962;REFB=-0.0128113;REVB=-0.00475532;RO=97;SAF=56;SAR=16;SRF=53;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280466;STB=0.669352;TYPE=snp;VARB=0.0224502;OID=.;OPOS=128381808;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:176:97:103:72:73:16:56:53:44:17:56:53:50 chr2 128385224 . C G 78.71 PASS AO=26;DP=73;FAO=26;FDP=74;FR=.;FRO=48;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=30;FSRR=18;FWDB=0.0771412;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.5424;QD=4.25445;RBI=0.12025;REFB=-0.0322007;REVB=-0.0922454;RO=47;SAF=16;SAR=10;SRF=32;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.078771;STB=0.506603;TYPE=snp;VARB=0.0583098;OID=.;OPOS=128385224;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:73:74:47:48:26:26:10:16:32:15:10:16:30:18 chr2 128385244 . T C 59.39 PASS AO=22;DP=70;FAO=22;FDP=70;FR=.;FRO=48;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=32;FSRR=16;FWDB=-0.00513751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.418;QD=3.39376;RBI=0.0145138;REFB=-3.76085e-05;REVB=-0.0135741;RO=47;SAF=14;SAR=8;SRF=31;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0292901;STB=0.522707;TYPE=snp;VARB=-1.86031e-05;OID=.;OPOS=128385244;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:70:70:47:48:22:22:8:14:31:16:8:14:32:16 chr2 128390835 . CGGGGC CGGC,CGGG 188.96 PASS AO=5,12;DP=28;FAO=0,26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=0,20;FSAR=0,6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.226721,0.258402;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=2,2;MLLD=8.56881,24.088;QD=29.0706;RBI=0.612381,0.26649;REFB=0,0;REVB=-0.568866,-0.0651573;RO=3;SAF=0,12;SAR=5,0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0.418605,0.418605;SSEP=0,0;SSSB=-0.794084,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=0,0.00556403;OID=.,.;OPOS=128390836,128390839;OREF=GG,GC;OALT=-,-;OMAPALT=CGGC,CGGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:5,12:27:0,26:26:0:0,20:0,6:0:0:17:3:0,12:5,0:3:0 chr2 128394758 . T C 34.08 PASS AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.0698783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.727;QD=11.36;RBI=0.0734631;REFB=-0.0304012;REVB=0.0226681;RO=5;SAF=1;SAR=5;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0435573;STB=0.624529;TYPE=snp;VARB=0.0272736;OID=.;OPOS=128394758;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:12:12:5:6:6:6:5:1:1:4:5:1:2:4 chr2 128394877 . C CT,CCT 106.1 PASS AO=10,5;DP=33;FAO=13,3;FDP=21;FR=.;FRO=5;FSAF=3,1;FSAR=10,2;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0132211,-0.0187791;FXX=0.249911;HRUN=0,7;LEN=1,2;MLLD=151.677,148.296;QD=20.2086;RBI=0.0133286,0.0188419;REFB=0.0263494,0.0301424;REVB=-0.00168938,-0.00153672;RO=17;SAF=2,1;SAR=8,4;SRF=6;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.208773,-0.217272;STB=0.599866,0.776677;TYPE=ins,ins;VARB=-0.0173241,0.00903683;OID=.,.;OPOS=128394878,128394878;OREF=-,-;OALT=T,CT;OMAPALT=CT,CCT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:10,5:33:13,3:21:5:3,1:10,2:0:5:20:17:2,1:8,4:6:11 chr2 128396037 . CAACA C,CAACAAACA 335.68 PASS AO=9,25;DP=48;FAO=9,30;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=2,7;FSAR=7,23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0163133,-0.0226039;FXX=0.0697512;HRUN=2,3;LEN=4,4;MLLD=143.187,136.742;QD=33.568;RBI=0.0191035,0.0380379;REFB=0.0168842,0.0991431;REVB=-0.00994077,0.0305932;RO=1;SAF=2,6;SAR=7,19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.175672,-0.0711625;STB=0.533262,0.510631;TYPE=del,ins;VARB=-0.0442935,-0.00611178;OID=.,.;OPOS=128396038,128396038;OREF=AACA,-;OALT=-,AACA;OMAPALT=C,CAACAAACA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:9,25:44:9,30:40:1:2,7:7,23:0:1:19:1:2,6:7,19:1:0 chr2 128400608 . C T 289.59 PASS AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0586759;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.3093;QD=37.3668;RBI=0.0806165;REFB=0;REVB=-0.0552825;RO=0;SAF=11;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00290157;OID=.;OPOS=128400608;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:31:31:0:0:31:31:20:11:0:0:20:11:0:0 chr2 128401091 . A G 626.32 PASS AO=64;DP=64;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177334;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.411;QD=37.9588;RBI=0.0343757;REFB=0;REVB=0.0294485;RO=0;SAF=30;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.37225e-05;OID=.;OPOS=128401091;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:64:66:0:0:64:66:34:30:0:0:36:30:0:0 chr2 128460956 . G A 1297.93 PASS AO=121;DP=122;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0409187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.853;QD=37.3504;RBI=0.0428634;REFB=0;REVB=0.0127642;RO=1;SAF=61;SAR=60;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00785179;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000398313;OID=.;OPOS=128460956;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:122:139:1:0:121:139:60:61:0:1:72:67:0:0 chr2 128495645 . G A 1038.39 PASS AO=111;DP=112;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0171951;FXX=0.00892777;HRUN=3;LEN=1;MLLD=237.106;QD=37.4195;RBI=0.0281544;REFB=-0.0153168;REVB=0.0222935;RO=1;SAF=54;SAR=57;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00871089;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.38656e-06;OID=.;OPOS=128495645;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:112:111:1:0:111:111:57:54:1:0:57:54:0:0 chr2 128526579 . TTAAA T 151.95 PASS AO=66;DP=220;FAO=72;FDP=177;FR=.;FRO=105;FSAF=34;FSAR=38;FSRF=25;FSRR=80;FWDB=0.01921;FXX=0.14077;HRUN=2;LEN=4;MLLD=151.714;QD=3.43398;RBI=0.0210806;REFB=-0.0205342;REVB=0.00868149;RO=0;SAF=30;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.641474;TYPE=del;VARB=0.0543636;OID=.;OPOS=128526580;OREF=TAAA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:66:99:72:177:105:34:38:25:80:99:0:30:36:0:0 chr2 128628863 . TG T 675.86 PASS AO=92;DP=117;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0583061;FXX=0.00961446;HRUN=2;LEN=1;MLLD=16.9546;QD=26.247;RBI=0.0930165;REFB=0;REVB=-0.0724739;RO=3;SAF=53;SAR=39;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0.35786;SSSB=-0.0260763;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.000768665;OID=.;OPOS=128628864;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:92:103:103:103:0:60:43:0:0:60:3:53:39:3:0 chr2 128849114 . T C 627.72 PASS AO=66;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0198419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.932;QD=37.4757;RBI=0.019842;REFB=0;REVB=-7.61823e-05;RO=0;SAF=38;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.38141e-05;OID=.;OPOS=128849114;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:66:67:0:0:66:67:28:38:0:0:28:39:0:0 chr2 128849147 . GC G 141.8 PASS AO=25;DP=42;FAO=33;FDP=36;FR=.;FRO=3;FSAF=9;FSAR=24;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.263293;FXX=0.0526177;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.6349;QD=15.7557;RBI=0.286188;REFB=-0.0626964;REVB=-0.112162;RO=8;SAF=7;SAR=18;SRF=4;SRR=4;SSEN=0.303743;SSEP=0;SSSB=-0.114141;STB=0.539852;TYPE=del;VARB=0.0193593;OID=.;OPOS=128849148;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:25:38:33:36:3:9:24:2:1:4:8:7:18:4:4 chr2 128870808 . T C 821.06 PASS AO=86;DP=90;FAO=87;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=62;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0157829;FXX=0.0222198;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.474;QD=37.3209;RBI=0.047597;REFB=-0.0646227;REVB=0.044904;RO=1;SAF=62;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0193282;STB=0.509802;TYPE=snp;VARB=0.000756169;OID=.;OPOS=128870808;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:90:88:1:1:86:87:24:62:0:1:25:62:0:1 chr2 128878014 . G A 1273.18 PASS AO=140;DP=144;FAO=140;FDP=144;FR=.;FRO=4;FSAF=52;FSAR=88;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0179169;FXX=0.00689608;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.072;QD=35.366;RBI=0.0349104;REFB=0.0625904;REVB=0.029962;RO=4;SAF=51;SAR=89;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00652451;STB=0.503618;TYPE=snp;VARB=-0.00232967;OID=.;OPOS=128878014;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:144:144:4:4:140:140:89:51:1:3:88:52:1:3 chr2 128934400 . T C 914.38 PASS AO=97;DP=98;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00819477;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.947;QD=37.7065;RBI=0.00863478;REFB=-0.0103699;REVB=0.00272125;RO=1;SAF=51;SAR=46;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0092091;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.75165e-05;OID=.;OPOS=128934400;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:98:97:1:0:97:97:46:51:1:0:46:51:0:0 chr2 128939817 . G A 465.59 PASS AO=108;DP=215;FAO=109;FDP=218;FR=.;FRO=109;FSAF=56;FSAR=53;FSRF=63;FSRR=46;FWDB=-0.0210786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.8384;QD=8.54299;RBI=0.0789129;REFB=-0.0462703;REVB=0.0760456;RO=107;SAF=56;SAR=52;SRF=61;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0469225;STB=0.532185;TYPE=snp;VARB=0.0450965;OID=.;OPOS=128939817;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:218:107:109:108:109:52:56:61:46:53:56:63:46 chr2 130738163 . G A 267.65 PASS AO=59;DP=119;FAO=62;FDP=124;FR=.;FRO=62;FSAF=36;FSAR=26;FSRF=40;FSRR=22;FWDB=-0.0289753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.168;QD=8.63393;RBI=0.0289809;REFB=0.00381672;REVB=0.000569465;RO=60;SAF=36;SAR=23;SRF=40;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0549783;STB=0.533467;TYPE=snp;VARB=-0.00303165;OID=.;OPOS=130738163;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:124:60:62:59:62:23:36:40:20:26:36:40:22 chr2 130739444 . TGAAGACG T 139.31 PASS AO=45;DP=130;FAO=45;FDP=120;FR=.;FRO=75;FSAF=13;FSAR=32;FSRF=37;FSRR=38;FWDB=0.0167253;FXX=0.0243883;HRUN=1;LEN=7;MLLD=259.531;QD=4.64355;RBI=0.0198651;REFB=-0.00644278;REVB=0.0107185;RO=58;SAF=14;SAR=31;SRF=28;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184414;STB=0.637386;TYPE=del;VARB=0.0103572;OID=.;OPOS=130739445;OREF=GAAGACG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:45:114:45:120:75:13:32:37:38:99:58:14:31:28:30 chr2 130739646 . TTAAC T 36.85 PASS AO=32;DP=131;FAO=35;FDP=125;FR=.;FRO=90;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=33;FSRR=57;FWDB=0.000581764;FXX=0.0234357;HRUN=3;LEN=4;MLLD=263.473;QD=1.17911;RBI=0.0170599;REFB=-0.00869715;REVB=-0.0170499;RO=85;SAF=19;SAR=13;SRF=32;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260372;STB=0.644216;TYPE=del;VARB=0.0202581;OID=.;OPOS=130739647;OREF=TAAC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:32:127:35:125:90:20:15:33:57:36:85:19:13:32:53 chr2 130739891 . T A 305.98 PASS AO=70;DP=153;FAO=76;FDP=158;FR=.;FRO=82;FSAF=26;FSAR=50;FSRF=27;FSRR=55;FWDB=0.00985113;FXX=0.030673;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.092;QD=7.74621;RBI=0.0105193;REFB=-0.00412906;REVB=0.00368941;RO=82;SAF=24;SAR=46;SRF=25;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0416106;STB=0.507433;TYPE=snp;VARB=0.00411193;OID=.;OPOS=130739891;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:158:82:82:70:76:46:24:25:57:50:26:27:55 chr2 130866805 . C G 47.99 PASS AO=23;DP=89;FAO=24;FDP=90;FR=.;FRO=66;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=32;FSRR=34;FWDB=0.00346785;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.1737;QD=2.13293;RBI=0.00607251;REFB=-0.0095456;REVB=0.00498492;RO=66;SAF=13;SAR=10;SRF=32;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0985431;STB=0.57243;TYPE=snp;VARB=0.0221372;OID=.;OPOS=130866805;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:89:90:66:66:23:24:10:13:32:34:10:14:32:34 chr2 130897234 . C T 18.48 PASS AO=6;DP=23;FAO=6;FDP=23;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=15;FWDB=-0.0811165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.7;QD=3.21426;RBI=0.0812646;REFB=-0.00997446;REVB=-0.00490451;RO=16;SAF=2;SAR=4;SRF=1;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.439648;STB=0.703203;TYPE=snp;VARB=0.0311062;OID=.;OPOS=130897234;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:23:23:16:17:6:6:4:2:1:15:4:2:2:15 chr2 130900188 . A G 118.48 PASS AO=32;DP=76;FAO=32;FDP=76;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=29;FWDB=-0.0215786;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.696;QD=6.23585;RBI=0.0383549;REFB=-0.0149492;REVB=-0.031709;RO=43;SAF=14;SAR=18;SRF=15;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0927067;STB=0.557592;TYPE=snp;VARB=0.0146751;OID=.;OPOS=130900188;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:43:44:32:32:18:14:15:28:18:14:15:29 chr2 130902067 . C T 26.71 PASS AO=7;DP=21;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.0125068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.17;QD=5.08679;RBI=0.0252579;REFB=-0.00523941;REVB=-0.0219441;RO=14;SAF=2;SAR=5;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.311218;STB=0.693879;TYPE=snp;VARB=0.0128133;OID=.;OPOS=130902067;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:21:21:14:14:7:7:5:2:8:6:5:2:8:6 chr2 130925088 . C T 560.96 PASS AO=125;DP=242;FAO=127;FDP=246;FR=.;FRO=119;FSAF=77;FSAR=50;FSRF=67;FSRR=52;FWDB=0.0171845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.333;QD=9.12121;RBI=0.0225201;REFB=-0.00726501;REVB=-0.014555;RO=116;SAF=75;SAR=50;SRF=66;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0282525;STB=0.521718;TYPE=snp;VARB=0.00618301;OID=.;OPOS=130925088;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:242:246:116:119:125:127:50:75:66:50:50:77:67:52 chr2 130939348 . G A 17.69 PASS AO=5;DP=18;FAO=5;FDP=18;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=0.00800657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.05;QD=3.93171;RBI=0.0348327;REFB=-0.00192689;REVB=-0.0339;RO=13;SAF=3;SAR=2;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.396358;STB=0.749166;TYPE=snp;VARB=0.0134466;OID=.;OPOS=130939348;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:18:18:13:13:5:5:2:3:3:10:2:3:3:10 chr2 130949491 . G A 76.14 PASS AO=30;DP=96;FAO=30;FDP=96;FR=.;FRO=66;FSAF=1;FSAR=29;FSRF=7;FSRR=59;FWDB=-0.01544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.1861;QD=3.1726;RBI=0.0184135;REFB=-0.00758107;REVB=-0.010033;RO=66;SAF=1;SAR=29;SRF=7;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.363731;STB=0.724793;TYPE=snp;VARB=0.0185905;OID=.;OPOS=130949491;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:96:96:66:66:30:30:29:1:7:59:29:1:7:59 chr2 130951548 . G A 1062.18 PASS AO=110;DP=110;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013257;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.135;QD=38.6248;RBI=0.0393001;REFB=0;REVB=0.0369967;RO=0;SAF=88;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000104818;OID=.;OPOS=130951548;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:110:110:0:0:110:110:22:88:0:0:22:88:0:0 chr2 130951566 . G A 1267.01 PASS AO=133;DP=133;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=110;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.9498;QD=38.1056;RBI=0.050391;REFB=0;REVB=0.0493039;RO=0;SAF=110;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000171133;OID=.;OPOS=130951566;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:133:133:0:0:133:133:23:110:0:0:23:110:0:0 chr2 130951581 . A G 145.46 PASS AO=41;DP=129;FAO=51;FDP=138;FR=.;FRO=87;FSAF=41;FSAR=10;FSRF=71;FSRR=16;FWDB=0.0163202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.147;QD=4.21633;RBI=0.0163373;REFB=-0.0258177;REVB=0.000747164;RO=86;SAF=32;SAR=9;SRF=69;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0382434;STB=0.512347;TYPE=snp;VARB=0.0344356;OID=.;OPOS=130951581;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:138:86:87:41:51:9:32:69:17:10:41:71:16 chr2 130951754 . G T 208.5 PASS AO=72;DP=203;FAO=74;FDP=205;FR=.;FRO=131;FSAF=42;FSAR=32;FSRF=78;FSRR=53;FWDB=-2.20519e-06;FXX=0.00485413;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.8353;QD=4.06838;RBI=0.0746802;REFB=0.00195937;REVB=0.0746802;RO=129;SAF=40;SAR=32;SRF=77;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0475392;STB=0.518214;TYPE=snp;VARB=-0.00365634;OID=.;OPOS=130951754;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:205:129:131:72:74:32:40:77:52:32:42:78:53 chr2 130951949 . G A 94.94 PASS AO=27;DP=68;FAO=27;FDP=68;FR=.;FRO=41;FSAF=4;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=-0.00353873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.916;QD=5.58445;RBI=0.0352607;REFB=-0.0254948;REVB=0.0350827;RO=41;SAF=4;SAR=23;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.482536;STB=0.780443;TYPE=snp;VARB=0.0177391;OID=.;OPOS=130951949;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:68:68:41:41:27:27:23:4:22:19:23:4:22:19 chr2 130955895 . TG T 162.52 PASS AO=20;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.133316;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.1194;QD=20.9707;RBI=0.39861;REFB=-0.0300368;REVB=0.375655;RO=10;SAF=9;SAR=11;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.092348;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0328419;OID=.;OPOS=130955896;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:20:31:31:31:0:13:18:0:0:12:10:9:11:3:7 chr2 131031142 . T G 202.21 PASS AO=52;DP=115;FAO=52;FDP=115;FR=.;FRO=63;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=33;FSRR=30;FWDB=-0.0145992;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.8743;QD=7.03324;RBI=0.0335798;REFB=-0.0111678;REVB=0.0302401;RO=61;SAF=28;SAR=24;SRF=33;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00245848;STB=0.508061;TYPE=snp;VARB=0.0116861;OID=.;OPOS=131031142;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:61:63:52:52:24:28:33:28:24:28:33:30 chr2 131033040 . C T 647.98 PASS AO=187;DP=431;FAO=176;FDP=394;FR=.;FRO=218;FSAF=80;FSAR=96;FSRF=114;FSRR=104;FWDB=-0.0369074;FXX=0.0149996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.789;QD=6.5785;RBI=0.0391746;REFB=0.0034672;REVB=-0.0131336;RO=236;SAF=87;SAR=100;SRF=123;SRR=113;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0564067;STB=0.537888;TYPE=snp;VARB=-0.00299468;OID=.;OPOS=131033040;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:431:394:236:218:187:176:100:87:123:113:96:80:114:104 chr2 131036000 . C T 339.68 PASS AO=92;DP=209;FAO=92;FDP=209;FR=.;FRO=117;FSAF=59;FSAR=33;FSRF=70;FSRR=47;FWDB=-0.0151697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.437;QD=6.50103;RBI=0.0305632;REFB=-0.014925;REVB=-0.0265329;RO=116;SAF=59;SAR=33;SRF=70;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0407063;STB=0.525782;TYPE=snp;VARB=0.0176925;OID=.;OPOS=131036000;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:209:116:117:92:92:33:59:70:46:33:59:70:47 chr2 131037784 . T C 125.2 PASS AO=53;DP=171;FAO=53;FDP=171;FR=.;FRO=118;FSAF=15;FSAR=38;FSRF=31;FSRR=87;FWDB=-0.00146423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.408;QD=2.92862;RBI=0.0420098;REFB=-0.00425157;REVB=0.0419842;RO=112;SAF=15;SAR=38;SRF=29;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.035539;STB=0.51752;TYPE=snp;VARB=0.0098124;OID=.;OPOS=131037784;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:171:112:118:53:53:38:15:29:83:38:15:31:87 chr2 131037817 . A C 163.11 PASS AO=59;DP=172;FAO=60;FDP=172;FR=.;FRO=112;FSAF=12;FSAR=48;FSRF=23;FSRR=89;FWDB=-0.0227785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.7729;QD=3.79331;RBI=0.0379102;REFB=-0.0307947;REVB=0.0303039;RO=111;SAF=12;SAR=47;SRF=22;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.009202;STB=0.505413;TYPE=snp;VARB=0.0634337;OID=.;OPOS=131037817;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:172:111:112:59:60:47:12:22:89:48:12:23:89 chr2 131037849 . G A 169.34 PASS AO=59;DP=165;FAO=59;FDP=165;FR=.;FRO=106;FSAF=9;FSAR=50;FSRF=15;FSRR=91;FWDB=0.0331097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.317;QD=4.10521;RBI=0.0355455;REFB=0.0160593;REVB=0.0129317;RO=105;SAF=9;SAR=50;SRF=14;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0433335;STB=0.513969;TYPE=snp;VARB=-0.0323175;OID=.;OPOS=131037849;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:165:105:106:59:59:50:9:14:91:50:9:15:91 chr2 131266530 . C A 40.27 PASS AO=12;DP=35;FAO=12;FDP=35;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.0570763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.489;QD=4.60238;RBI=0.0579086;REFB=0.00176822;REVB=0.00978271;RO=18;SAF=7;SAR=5;SRF=3;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.411763;STB=0.650922;TYPE=snp;VARB=-0.00190123;OID=.;OPOS=131266530;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:35:35:18:23:12:12:5:7:3:15:5:7:8:15 chr2 131414176 . C T 248.75 PASS AO=58;DP=119;FAO=58;FDP=118;FR=.;FRO=60;FSAF=42;FSAR=16;FSRF=42;FSRR=18;FWDB=0.0264301;FXX=0.00840265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9292;QD=8.43233;RBI=0.0638786;REFB=-0.0155612;REVB=-0.0581544;RO=59;SAF=42;SAR=16;SRF=41;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0327675;STB=0.515146;TYPE=snp;VARB=0.0260282;OID=.;OPOS=131414176;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:118:59:60:58:58:16:42:41:18:16:42:42:18 chr2 131487673 . A C 714.5 PASS AO=68;DP=68;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.615;QD=37.6054;RBI=0.044642;REFB=0;REVB=-0.0382264;RO=0;SAF=55;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00108474;OID=.;OPOS=131487673;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:68:76:0:0:68:76:13:55:0:0:13:63:0:0 chr2 131520006 . CCG C,CC 231.97 PASS AO=21,18;DP=82;FAO=0,56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=0,25;FSAR=0,31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.282269,0.288697;FXX=0.0338926;HRUN=4,3;LEN=2,1;MLLD=9.33386,10.1126;QD=16.2785;RBI=0.28233,0.298196;REFB=0.043758,-0.110374;REVB=-0.0058724,0.0746652;RO=22;SAF=19,0;SAR=2,18;SRF=12;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.491796,-0.831322;STB=0.5,0.507934;TYPE=del,del;VARB=0,0.035283;OID=.,.;OPOS=131520007,131520008;OREF=CG,G;OALT=-,-;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:21,18:67:0,56:57:1:0,25:0,31:0:1:11:22:19,0:2,18:12:10 chr2 131520178 . C G 234.93 PASS AO=35;DP=56;FAO=40;FDP=61;FR=.;FRO=21;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.0148565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.806;QD=15.4055;RBI=0.0161876;REFB=-0.0115855;REVB=0.00642839;RO=21;SAF=10;SAR=25;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0391399;STB=0.506326;TYPE=snp;VARB=0.0068386;OID=.;OPOS=131520178;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:56:61:21:21:35:40:25:10:7:14:26:14:7:14 chr2 131520663 . T C 201.65 PASS AO=20;DP=20;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.039663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.284;QD=36.6631;RBI=0.0414134;REFB=0;REVB=0.0119127;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000239066;OID=.;OPOS=131520663;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:20:22:0:0:20:22:10:10:0:0:10:12:0:0 chr2 131672950 . A G 52.42 PASS AO=14;DP=37;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=16;FWDB=0.014075;FXX=0.0270197;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.532;QD=5.82449;RBI=0.0180055;REFB=-0.0328622;REVB=0.0112292;RO=21;SAF=5;SAR=9;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0824005;STB=0.557956;TYPE=snp;VARB=0.0409458;OID=.;OPOS=131672950;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:37:36:21:22:14:14:9:5:6:15:9:5:6:16 chr2 131673316 . C T 16.48 PASS AO=2;DP=6;FAO=3;FDP=6;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0115262;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=170.794;QD=10.9862;RBI=0.0159086;REFB=-0.0102673;REVB=0.010965;RO=0;SAF=1;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.665552;TYPE=snp;VARB=0.0113927;OID=.;OPOS=131673316;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:4:6:0:3:2:3:1:1:0:0:1:2:1:2 chr2 131673702 . G A 39.21 PASS AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.00958863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.608;QD=7.12837;RBI=0.0468516;REFB=-0.0418285;REVB=0.0458599;RO=13;SAF=3;SAR=6;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13422;STB=0.580461;TYPE=snp;VARB=0.0865817;OID=.;OPOS=131673702;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:22:22:13:13:9:9:6:3:6:7:6:3:6:7 chr2 131674285 . A G 227.34 PASS AO=56;DP=119;FAO=56;FDP=120;FR=.;FRO=64;FSAF=45;FSAR=11;FSRF=54;FSRR=10;FWDB=-0.00438844;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.973;QD=7.57803;RBI=0.0289853;REFB=-0.0138622;REVB=-0.0286511;RO=63;SAF=45;SAR=11;SRF=54;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0860621;STB=0.535386;TYPE=snp;VARB=0.0171828;OID=.;OPOS=131674285;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:120:63:64:56:56:11:45:54:9:11:45:54:10 chr2 131688587 . G A 33.65 PASS AO=12;DP=41;FAO=12;FDP=41;FR=.;FRO=29;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=0.0100516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.892;QD=3.28341;RBI=0.0225043;REFB=0.00504979;REVB=0.0201347;RO=28;SAF=2;SAR=10;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.291138;STB=0.698545;TYPE=snp;VARB=-0.0133265;OID=.;OPOS=131688587;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:41:41:28:29:12:12:10:2:10:18:10:2:11:18 chr2 131688783 . G A 81.88 PASS AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0200937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.768;QD=7.27837;RBI=0.0305451;REFB=-0.00203553;REVB=0.0230053;RO=25;SAF=9;SAR=11;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0682441;STB=0.538936;TYPE=snp;VARB=0.00246859;OID=.;OPOS=131688783;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:45:45:25:25:20:20:11:9:13:12:11:9:13:12 chr2 131802045 . C T 178.15 PASS AO=34;DP=59;FAO=34;FDP=59;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=27;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.0386844;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=152.079;QD=12.0777;RBI=0.0387544;REFB=-0.0181883;REVB=0.00232908;RO=25;SAF=7;SAR=27;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.294992;STB=0.6641;TYPE=snp;VARB=0.0154128;OID=.;OPOS=131802045;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:59:59:25:25:34:34:27:7:13:12:27:7:13:12 chr2 131906250 . C G 295.89 PASS AO=79;DP=178;FAO=79;FDP=178;FR=.;FRO=99;FSAF=45;FSAR=34;FSRF=67;FSRR=32;FWDB=0.012538;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.337;QD=6.6491;RBI=0.0134824;REFB=-0.011697;REVB=-0.00495726;RO=99;SAF=45;SAR=34;SRF=67;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111467;STB=0.561803;TYPE=snp;VARB=0.0118739;OID=.;OPOS=131906250;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:178:99:99:79:79:34:45:67:32:34:45:67:32 chr2 132044992 . T C 256.47 PASS AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0044829;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.7114;QD=35.3754;RBI=0.0139092;REFB=-0.121541;REVB=-0.013167;RO=0;SAF=11;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31638e-08;STB=0.514276;TYPE=snp;VARB=0.00490155;OID=.;OPOS=132044992;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:29:29:0:1:28:28:17:11:0:0:17:11:0:1 chr2 132129774 . C T 56.81 PASS AO=56;DP=275;FAO=56;FDP=276;FR=.;FRO=220;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=111;FSRR=109;FWDB=-0.0118579;FXX=0.00360998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.7;QD=0.823353;RBI=0.0550918;REFB=-0.00588514;REVB=-0.0538005;RO=219;SAF=26;SAR=30;SRF=112;SRR=107;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0606275;STB=0.532096;TYPE=snp;VARB=0.0256361;OID=.;OPOS=132129774;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:275:276:219:220:56:56:30:26:112:107:30:26:111:109 chr2 132129810 . A C 113.41 PASS AO=69;DP=271;FAO=69;FDP=271;FR=.;FRO=202;FSAF=28;FSAR=41;FSRF=96;FSRR=106;FWDB=-0.00248862;FXX=0.00367634;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.663;QD=1.67402;RBI=0.0113403;REFB=-0.000934324;REVB=-0.0110638;RO=201;SAF=28;SAR=41;SRF=95;SRR=106;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0849471;STB=0.552593;TYPE=snp;VARB=0.00311697;OID=.;OPOS=132129810;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:271:271:201:202:69:69:41:28:95:106:41:28:96:106 chr2 132129841 . C A 188.28 PASS AO=86;DP=268;FAO=83;FDP=269;FR=.;FRO=186;FSAF=32;FSAR=51;FSRF=77;FSRR=109;FWDB=0.00303796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.3934;QD=2.79977;RBI=0.0294193;REFB=-0.00917688;REVB=-0.029262;RO=180;SAF=32;SAR=54;SRF=76;SRR=104;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0618593;STB=0.520549;TYPE=snp;VARB=0.0259068;OID=.;OPOS=132129841;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:268:269:180:186:86:83:54:32:76:104:51:32:77:109 chr2 132129844 . G A 190.63 PASS AO=80;DP=255;FAO=80;FDP=253;FR=.;FRO=173;FSAF=29;FSAR=51;FSRF=73;FSRR=100;FWDB=0.001638;FXX=0.0155636;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.002;QD=3.01385;RBI=0.00973072;REFB=-0.0115149;REVB=0.00959187;RO=154;SAF=29;SAR=51;SRF=61;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0412555;STB=0.542939;TYPE=snp;VARB=0.023476;OID=.;OPOS=132129844;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:255:253:154:173:80:80:51:29:61:93:51:29:73:100 chr2 132137239 . C T 2347.83 PASS AO=248;DP=254;FAO=249;FDP=249;FR=.;FRO=0;FSAF=131;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000117793;FXX=0.0311272;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.135;QD=37.7162;RBI=0.00147419;REFB=-0.0353119;REVB=-0.00146947;RO=1;SAF=130;SAR=118;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00365264;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.91862e-05;OID=.;OPOS=132137239;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:97:254:249:1:0:248:249:118:130:1:0:118:131:0:0 chr2 132140090 . A C 572.13 PASS AO=170;DP=412;FAO=168;FDP=399;FR=.;FRO=231;FSAF=106;FSAR=62;FSRF=134;FSRR=97;FWDB=0.0246033;FXX=0.00249994;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.172;QD=5.7356;RBI=0.0456161;REFB=-0.00936319;REVB=0.0384123;RO=235;SAF=106;SAR=64;SRF=135;SRR=100;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0536081;STB=0.531099;TYPE=snp;VARB=0.0114523;OID=.;OPOS=132140090;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:412:399:235:231:170:168:64:106:135:100:62:106:134:97 chr2 132140200 . C A 638.02 PASS AO=208;DP=474;FAO=176;FDP=400;FR=.;FRO=224;FSAF=69;FSAR=107;FSRF=92;FSRR=132;FWDB=-0.00166786;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=247.013;QD=6.38017;RBI=0.00281136;REFB=-0.00559911;REVB=-0.00226318;RO=265;SAF=81;SAR=127;SRF=106;SRR=159;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0112195;STB=0.510913;TYPE=snp;VARB=0.00599655;OID=.;OPOS=132140200;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:474:400:265:224:208:176:127:81:106:159:107:69:92:132 chr2 132141767 . A G 331.08 PASS AO=77;DP=154;FAO=77;FDP=154;FR=.;FRO=77;FSAF=30;FSAR=47;FSRF=41;FSRR=36;FWDB=0.00138817;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.057;QD=8.59935;RBI=0.0016692;REFB=-0.00572326;REVB=0.000926951;RO=77;SAF=30;SAR=47;SRF=41;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131824;STB=0.57266;TYPE=snp;VARB=0.00492351;OID=.;OPOS=132141767;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:154:77:77:77:77:47:30:41:36:47:30:41:36 chr2 132200256 . T C 20.73 PASS AO=11;DP=38;FAO=9;FDP=38;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.0161605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.142;QD=2.18188;RBI=0.0378829;REFB=-0.0076487;REVB=-0.034263;RO=26;SAF=7;SAR=4;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243363;STB=0.555432;TYPE=snp;VARB=0.0389778;OID=.;OPOS=132200256;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:38:38:26:29:11:9:4:7:11:15:4:5:14:15 chr2 132200307 . G A 173.42 PASS AO=43;DP=90;FAO=43;FDP=93;FR=.;FRO=50;FSAF=32;FSAR=11;FSRF=39;FSRR=11;FWDB=-0.00691921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.198;QD=7.45907;RBI=0.0122446;REFB=-0.00832566;REVB=-0.0101022;RO=47;SAF=32;SAR=11;SRF=36;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0272457;STB=0.525914;TYPE=snp;VARB=0.0218962;OID=.;OPOS=132200307;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:93:47:50:43:43:11:32:36:11:11:32:39:11 chr2 132200345 . C T 232.6 PASS AO=59;DP=126;FAO=59;FDP=129;FR=.;FRO=70;FSAF=44;FSAR=15;FSRF=61;FSRR=9;FWDB=0.00124552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.159;QD=7.21234;RBI=0.034992;REFB=-0.0261409;REVB=-0.0349699;RO=67;SAF=44;SAR=15;SRF=58;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16689;STB=0.598602;TYPE=snp;VARB=0.0234712;OID=.;OPOS=132200345;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:129:67:70:59:59:15:44:58:9:15:44:61:9 chr2 132200529 . A G 137.71 PASS AO=60;DP=188;FAO=60;FDP=194;FR=.;FRO=134;FSAF=24;FSAR=36;FSRF=45;FSRR=89;FWDB=-0.0821065;FXX=0.00512794;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.1217;QD=2.83927;RBI=0.127809;REFB=0.00302722;REVB=-0.097947;RO=128;SAF=24;SAR=36;SRF=43;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.080345;STB=0.547031;TYPE=snp;VARB=-0.00839924;OID=.;OPOS=132200529;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:194:128:134:60:60:36:24:43:85:36:24:45:89 chr2 132200568 . C T 621.02 PASS AO=112;DP=177;FAO=112;FDP=177;FR=.;FRO=65;FSAF=34;FSAR=78;FSRF=26;FSRR=39;FWDB=0.0318319;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.873;QD=14.0342;RBI=0.0646378;REFB=-0.00716659;REVB=0.0562563;RO=64;SAF=34;SAR=78;SRF=26;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0789579;STB=0.540533;TYPE=snp;VARB=0.00476103;OID=.;OPOS=132200568;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:177:64:65:112:112:78:34:26:38:78:34:26:39 chr2 132201288 . A G 14.85 PASS AO=16;DP=97;FAO=16;FDP=97;FR=.;FRO=81;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=61;FSRR=20;FWDB=-0.00950462;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.134;QD=0.612415;RBI=0.0269042;REFB=-0.00153403;REVB=-0.0251694;RO=81;SAF=11;SAR=5;SRF=61;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102565;STB=0.566851;TYPE=snp;VARB=0.0078808;OID=.;OPOS=132201288;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:97:97:81:81:16:16:5:11:61:20:5:11:61:20 chr2 132201468 . G A 271.95 PASS AO=76;DP=182;FAO=78;FDP=187;FR=.;FRO=109;FSAF=32;FSAR=46;FSRF=55;FSRR=54;FWDB=0.0329033;FXX=0.00531887;HRUN=4;LEN=1;MLLD=63.4745;QD=5.81711;RBI=0.0495795;REFB=-0.0113437;REVB=0.0370876;RO=103;SAF=32;SAR=44;SRF=54;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106875;STB=0.555665;TYPE=snp;VARB=0.0151878;OID=.;OPOS=132201468;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:187:103:109:76:78:44:32:54:49:46:32:55:54 chr2 132201582 . A G 235.77 PASS AO=53;DP=104;FAO=53;FDP=104;FR=.;FRO=51;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=19;FSRR=32;FWDB=-0.0149956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.4097;QD=9.06801;RBI=0.0754189;REFB=-0.0359456;REVB=-0.0739131;RO=51;SAF=25;SAR=28;SRF=19;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0889409;STB=0.54903;TYPE=snp;VARB=0.0335787;OID=.;OPOS=132201582;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:51:51:53:53:28:25:19:32:28:25:19:32 chr2 132201663 . T C 176.37 PASS AO=46;DP=106;FAO=47;FDP=108;FR=.;FRO=61;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=28;FSRR=33;FWDB=-0.0280374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.209;QD=6.53212;RBI=0.0295707;REFB=-0.00290317;REVB=-0.00939837;RO=60;SAF=18;SAR=28;SRF=27;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0611406;STB=0.544471;TYPE=snp;VARB=0.00351808;OID=.;OPOS=132201663;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:108:60:61:46:47:28:18:27:33:29:18:28:33 chr2 132201718 . T C 96.56 PASS AO=31;DP=84;FAO=31;FDP=85;FR=.;FRO=54;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=31;FSRR=23;FWDB=0.00558904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.839;QD=4.54394;RBI=0.0339713;REFB=-0.00676483;REVB=-0.0335084;RO=53;SAF=11;SAR=20;SRF=30;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23332;STB=0.639666;TYPE=snp;VARB=0.014001;OID=.;OPOS=132201718;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:84:85:53:54:31:31:20:11:30:23:20:11:31:23 chr2 132201736 . C G 80.97 PASS AO=32;DP=101;FAO=32;FDP=101;FR=.;FRO=69;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=38;FSRR=31;FWDB=0.0791172;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.4645;QD=3.20684;RBI=0.0890693;REFB=-0.0151704;REVB=-0.0409121;RO=68;SAF=13;SAR=19;SRF=37;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160612;STB=0.598456;TYPE=snp;VARB=0.0373708;OID=.;OPOS=132201736;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:101:101:68:69:32:32:19:13:37:31:19:13:38:31 chr2 132201862 . C G 267.34 PASS AO=76;DP=184;FAO=78;FDP=189;FR=.;FRO=111;FSAF=44;FSAR=34;FSRF=57;FSRR=54;FWDB=0.0029312;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=199.146;QD=5.65802;RBI=0.00570456;REFB=0.00450137;REVB=-0.00489389;RO=108;SAF=44;SAR=32;SRF=57;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0543995;STB=0.529968;TYPE=snp;VARB=-0.00863506;OID=.;OPOS=132201862;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:189:108:111:76:78:32:44:57:51:34:44:57:54 chr2 132201889 . C A 381.27 PASS AO=80;DP=164;FAO=89;FDP=178;FR=.;FRO=89;FSAF=37;FSAR=52;FSRF=37;FSRR=52;FWDB=-0.014392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.6979;QD=8.56791;RBI=0.0241367;REFB=0.00707089;REVB=0.0193765;RO=77;SAF=33;SAR=47;SRF=29;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0332543;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00728707;OID=.;OPOS=132201889;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:178:77:89:80:89:47:33:29:48:52:37:37:52 chr2 132201930 . T C 340.15 PASS AO=77;DP=151;FAO=78;FDP=154;FR=.;FRO=76;FSAF=30;FSAR=48;FSRF=27;FSRR=49;FWDB=-0.00833298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.0561;QD=8.83511;RBI=0.0496524;REFB=-0.0238103;REVB=0.0489481;RO=74;SAF=30;SAR=47;SRF=27;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0233287;STB=0.515405;TYPE=snp;VARB=0.0244159;OID=.;OPOS=132201930;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:154:74:76:77:78:47:30:27:47:48:30:27:49 chr2 132229720 . T C 99.2 PASS AO=32;DP=88;FAO=32;FDP=88;FR=.;FRO=56;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=27;FSRR=29;FWDB=-0.0107947;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.143;QD=4.50892;RBI=0.0111252;REFB=0.00416311;REVB=0.00269166;RO=55;SAF=14;SAR=18;SRF=26;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.039144;STB=0.528635;TYPE=snp;VARB=-0.00739208;OID=.;OPOS=132229720;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:55:56:32:32:18:14:26:29:18:14:27:29 chr2 132248584 . T C 181.31 PASS AO=12;DP=18;FAO=19;FDP=19;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.209225;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=35.0866;QD=38.1697;RBI=0.226309;REFB=0;REVB=0.0862586;RO=0;SAF=2;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0167838;OID=.;OPOS=132248584;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:19:0:0:12:19:10:2:0:0:15:4:0:0 chr2 132277215 . C T 106.12 PASS AO=26;DP=61;FAO=27;FDP=62;FR=.;FRO=35;FSAF=4;FSAR=23;FSRF=9;FSRR=26;FWDB=-0.039794;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5466;QD=6.84614;RBI=0.0430535;REFB=-0.0100175;REVB=-0.0164328;RO=35;SAF=4;SAR=22;SRF=9;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170553;STB=0.603954;TYPE=snp;VARB=0.0115751;OID=.;OPOS=132277215;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:62:35:35:26:27:22:4:9:26:23:4:9:26 chr2 133010783 . A T 13.93 PASS AO=13;DP=77;FAO=13;FDP=77;FR=.;FRO=64;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=34;FSRR=30;FWDB=-0.0286603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.71;QD=0.723871;RBI=0.0475228;REFB=-0.00119086;REVB=-0.0379078;RO=58;SAF=7;SAR=6;SRF=34;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0604292;STB=0.506015;TYPE=snp;VARB=0.00718772;OID=.;OPOS=133010783;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:77:77:58:64:13:13:6:7:34:24:6:7:34:30 chr2 133010802 . T C 11.88 PASS AO=15;DP=91;FAO=14;FDP=90;FR=.;FRO=76;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=38;FSRR=38;FWDB=-0.0304394;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.8263;QD=0.528008;RBI=0.0369386;REFB=0.00699893;REVB=0.0209262;RO=76;SAF=7;SAR=8;SRF=38;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0418942;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0194988;OID=.;OPOS=133010802;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:91:90:76:76:15:14:8:7:38:38:7:7:38:38 chr2 133012012 . C A 124.13 PASS AO=44;DP=128;FAO=45;FDP=132;FR=.;FRO=87;FSAF=15;FSAR=30;FSRF=53;FSRR=34;FWDB=-0.0110844;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.049;QD=3.76158;RBI=0.0544386;REFB=-0.0166918;REVB=0.0532982;RO=84;SAF=15;SAR=29;SRF=50;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.288839;STB=0.679921;TYPE=snp;VARB=0.0476133;OID=.;OPOS=133012012;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:132:84:87:44:45:29:15:50:34:30:15:53:34 chr2 133012032 . A G 13.99 PASS AO=46;DP=122;FAO=19;FDP=122;FR=.;FRO=103;FSAF=2;FSAR=17;FSRF=57;FSRR=46;FWDB=-0.0245063;FXX=0.0239981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.643;QD=0.458523;RBI=0.0276981;REFB=0.00455275;REVB=0.0129085;RO=73;SAF=20;SAR=26;SRF=38;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.092962;STB=0.887978;TYPE=snp;VARB=-0.0271958;OID=.;OPOS=133012032;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:122:122:73:103:46:19:26:20:38:35:17:2:57:46 chr2 133012034 . C G 107.37 PASS AO=28;DP=123;FAO=29;FDP=104;FR=.,HEALED;FRO=63;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=40;FSRR=23;FWDB=0.00546313;FXX=0.174589;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.395;QD=4.12951;RBI=0.0166362;REFB=0.00251369;REVB=-0.0157136;RO=44;SAF=16;SAR=12;SRF=27;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0463753;STB=0.534769;TYPE=snp;VARB=0.0150989;OID=.;OPOS=133012034;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:126:104:44:63:28:29:12:16:27:17:12:17:40:23 chr2 133012061 . C T 14.03 PASS AO=23;DP=145;FAO=22;FDP=144;FR=.;FRO=122;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=57;FSRR=65;FWDB=-0.0181757;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.647;QD=0.389759;RBI=0.0202852;REFB=-0.00218162;REVB=-0.00900737;RO=121;SAF=12;SAR=11;SRF=56;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0749405;STB=0.527753;TYPE=snp;VARB=0.0152057;OID=.;OPOS=133012061;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:145:144:121:122:23:22:11:12:56:65:11:11:57:65 chr2 133012078 . C T 17.7 PASS AO=24;DP=141;FAO=23;FDP=140;FR=.;FRO=117;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=54;FSRR=63;FWDB=0.0135131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.5075;QD=0.505656;RBI=0.0261892;REFB=0.000716024;REVB=-0.0224337;RO=117;SAF=13;SAR=11;SRF=54;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101943;STB=0.550142;TYPE=snp;VARB=-0.00666832;OID=.;OPOS=133012078;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:141:140:117:117:24:23:11:13:54:63:11:12:54:63 chr2 133012079 . G A 97.69 PASS AO=43;DP=141;FAO=42;FDP=139;FR=.;FRO=97;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=48;FSRR=49;FWDB=-0.0211464;FXX=0.00714235;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.746;QD=2.81128;RBI=0.0350864;REFB=-0.00294976;REVB=0.027998;RO=93;SAF=18;SAR=25;SRF=44;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0649947;STB=0.546562;TYPE=snp;VARB=0.0106372;OID=.;OPOS=133012079;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:141:139:93:97:43:42:25:18:44:49:24:18:48:49 chr2 133012080 . A AC 180.31 PASS AO=61;DP=141;FAO=61;FDP=122;FR=.;FRO=61;FSAF=26;FSAR=35;FSRF=31;FSRR=30;FWDB=-0.0101487;FXX=0.128562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=27.2826;QD=5.91188;RBI=0.0318361;REFB=0.0264965;REVB=0.0301752;RO=76;SAF=27;SAR=34;SRF=36;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0311734;STB=0.54137;TYPE=ins;VARB=-0.0246039;OID=.;OPOS=133012081;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:61:141:61:122:61:26:35:31:30:99:76:27:34:36:40 chr2 133012099 . G A 224.88 PASS AO=42;DP=143;FAO=42;FDP=137;FR=.,HEALED;FRO=66;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=50;FSRR=16;FWDB=-0.0031916;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=156.466;QD=6.56575;RBI=0.0454163;REFB=-0.00571968;REVB=-0.045304;RO=57;SAF=21;SAR=21;SRF=48;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.355914;STB=0.669493;TYPE=snp;VARB=0.0181752;OID=.;OPOS=133012099;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:137:57:66:42:42:21:21:48:9:22:20:50:16 chr2 133012125 . CA C 36.55 PASS AO=19;DP=113;FAO=24;FDP=107;FR=.;FRO=83;FSAF=20;FSAR=4;FSRF=47;FSRR=36;FWDB=-0.0093565;FXX=0.0854628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.606;QD=1.36624;RBI=0.0171641;REFB=0.00904369;REVB=-0.0143896;RO=83;SAF=19;SAR=0;SRF=48;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.726365;STB=0.74883;TYPE=del;VARB=-0.0524764;OID=.;OPOS=133012126;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:19:116:24:107:83:20:4:47:36:36:83:19:0:48:35 chr2 133012130 . C T 18.82 PASS AO=18;DP=120;FAO=21;FDP=122;FR=.;FRO=101;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=62;FSRR=39;FWDB=-0.0187475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.751;QD=0.617167;RBI=0.0203717;REFB=-0.00579748;REVB=0.00797091;RO=102;SAF=9;SAR=9;SRF=63;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149888;STB=0.536198;TYPE=snp;VARB=0.0243705;OID=.;OPOS=133012130;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:120:122:102:101:18:21:9:9:63:39:9:12:62:39 chr2 133012147 . A G 72.74 PASS AO=28;DP=98;FAO=30;FDP=100;FR=.;FRO=70;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=46;FSRR=24;FWDB=0.00782914;FXX=0.0196059;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.927;QD=2.9096;RBI=0.00782947;REFB=-0.00388655;REVB=7.2007e-05;RO=70;SAF=19;SAR=9;SRF=47;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00979726;STB=0.534699;TYPE=snp;VARB=0.00947359;OID=.;OPOS=133012147;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:98:100:70:70:28:30:9:19:47:23:9:21:46:24 chr2 133012170 . C A 87.89 PASS AO=28;DP=76;FAO=28;FDP=77;FR=.;FRO=49;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=39;FSRR=10;FWDB=0.00318375;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=178.161;QD=4.56549;RBI=0.0207549;REFB=-0.000535633;REVB=-0.0205093;RO=47;SAF=17;SAR=11;SRF=37;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219751;STB=0.63301;TYPE=snp;VARB=0.00487595;OID=.;OPOS=133012170;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:76:77:47:49:28:28:11:17:37:10:11:17:39:10 chr2 133012171 . C A 93.91 PASS AO=30;DP=77;FAO=29;FDP=78;FR=.;FRO=49;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=38;FSRR=11;FWDB=-0.00303695;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.409;QD=4.81572;RBI=0.0307481;REFB=-0.00249686;REVB=-0.0305977;RO=46;SAF=19;SAR=11;SRF=35;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15368;STB=0.608628;TYPE=snp;VARB=0.00434241;OID=.;OPOS=133012171;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:77:78:46:49:30:29:11:19:35:11:11:18:38:11 chr2 133012172 . T C 28.76 PASS AO=14;DP=74;FAO=17;FDP=76;FR=.;FRO=59;FSAF=15;FSAR=2;FSRF=39;FSRR=20;FWDB=-0.0318792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.154;QD=1.51387;RBI=0.0350176;REFB=-0.0167064;REVB=-0.0144894;RO=59;SAF=12;SAR=2;SRF=39;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.328742;STB=0.753063;TYPE=snp;VARB=0.0304105;OID=.;OPOS=133012172;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:74:76:59:59:14:17:2:12:39:20:2:15:39:20 chr2 133012182 . C T 85.59 PASS AO=25;DP=64;FAO=26;FDP=67;FR=.;FRO=41;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=32;FSRR=9;FWDB=-0.00999645;FXX=0.0289813;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.685;QD=5.11013;RBI=0.0273674;REFB=-0.03215;REVB=-0.0254763;RO=39;SAF=17;SAR=8;SRF=30;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114821;STB=0.566524;TYPE=snp;VARB=0.0535766;OID=.;OPOS=133012182;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:64:67:39:41:25:26:8:17:30:9:8:18:32:9 chr2 133012267 . T C 721.67 PASS AO=120;DP=205;FAO=134;FDP=213;FR=.;FRO=79;FSAF=72;FSAR=62;FSRF=42;FSRR=37;FWDB=0.0183757;FXX=0.00467268;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.092;QD=13.5525;RBI=0.0277474;REFB=-0.0355187;REVB=0.0207906;RO=78;SAF=64;SAR=56;SRF=42;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00375261;STB=0.502113;TYPE=snp;VARB=0.0197599;OID=.;OPOS=133012267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:213:78:79:120:134:56:64:42:36:62:72:42:37 chr2 133012274 . T C 669.22 PASS AO=128;DP=217;FAO=128;FDP=213;FR=.;FRO=85;FSAF=66;FSAR=62;FSRF=46;FSRR=39;FWDB=0.00587507;FXX=0.0138882;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.315;QD=12.5675;RBI=0.0237297;REFB=-0.0147362;REVB=-0.0229909;RO=85;SAF=66;SAR=62;SRF=46;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0188789;STB=0.510211;TYPE=snp;VARB=0.0100149;OID=.;OPOS=133012274;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:217:213:85:85:128:128:62:66:46:39:62:66:46:39 chr2 133012309 . A G 1004.46 PASS AO=148;DP=216;FAO=161;FDP=222;FR=.;FRO=61;FSAF=101;FSAR=60;FSRF=35;FSRR=26;FWDB=0.00643235;FXX=0.0133327;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.2342;QD=18.0984;RBI=0.0145253;REFB=-0.022474;REVB=-0.0130234;RO=63;SAF=88;SAR=60;SRF=37;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00421607;STB=0.51561;TYPE=snp;VARB=0.0135336;OID=.;OPOS=133012309;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:216:222:63:61:148:161:60:88:37:26:60:101:35:26 chr2 133012350 . T C 105.25 PASS AO=34;DP=95;FAO=34;FDP=93;FR=.;FRO=59;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=27;FSRR=32;FWDB=0.017311;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.226;QD=4.5268;RBI=0.0174441;REFB=-0.007783;REVB=0.0021512;RO=59;SAF=12;SAR=22;SRF=27;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121096;STB=0.569679;TYPE=snp;VARB=0.010185;OID=.;OPOS=133012350;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:93:59:59:34:34:22:12:27:32:22:12:27:32 chr2 133012354 . G A 13.18 PASS AO=13;DP=80;FAO=13;FDP=79;FR=.;FRO=66;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=33;FSRR=33;FWDB=-0.0246326;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.983;QD=0.667113;RBI=0.0246591;REFB=-0.000467436;REVB=-0.00114336;RO=66;SAF=8;SAR=5;SRF=33;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145055;STB=0.597099;TYPE=snp;VARB=0.00804514;OID=.;OPOS=133012354;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:80:79:66:66:13:13:5:8:33:33:5:8:33:33 chr2 133012358 . G A 78.34 PASS AO=26;DP=71;FAO=25;FDP=70;FR=.;FRO=45;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=0.00163918;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.166;QD=4.47653;RBI=0.013999;REFB=-0.0127474;REVB=-0.0139027;RO=45;SAF=11;SAR=15;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121224;STB=0.559952;TYPE=snp;VARB=0.0412314;OID=.;OPOS=133012358;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:71:70:45:45:26:25:15:11:24:21:14:11:24:21 chr2 133012361 . C T 13.28 PASS AO=11;DP=63;FAO=11;FDP=64;FR=.;FRO=53;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=27;FSRR=26;FWDB=0.0609937;FXX=0.0153822;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.8901;QD=0.82984;RBI=0.0616752;REFB=0.00871662;REVB=0.00914323;RO=52;SAF=3;SAR=8;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.268573;STB=0.701379;TYPE=snp;VARB=-0.0100644;OID=.;OPOS=133012361;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:63:64:52:53:11:11:8:3:25:27:8:3:27:26 chr2 133012362 . C G 80.73 PASS AO=26;DP=69;FAO=25;FDP=68;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=-0.00076379;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.129;QD=4.74891;RBI=0.0187855;REFB=0.0141155;REVB=-0.0187699;RO=42;SAF=13;SAR=13;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0255819;STB=0.534637;TYPE=snp;VARB=-0.00997736;OID=.;OPOS=133012362;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:69:68:42:43:26:25:13:13:20:22:12:13:20:23 chr2 133012363 . A G 98.81 PASS AO=30;DP=69;FAO=27;FDP=66;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=0.00248137;FXX=0.0294074;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.164;QD=5.98856;RBI=0.0132356;REFB=-0.00332733;REVB=-0.0130009;RO=36;SAF=15;SAR=15;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511802;TYPE=snp;VARB=0.00377927;OID=.;OPOS=133012363;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:69:66:36:39:30:27:15:15:18:18:14:13:18:21 chr2 133012369 . A G 117.6 PASS AO=34;DP=85;FAO=33;FDP=82;FR=.;FRO=49;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=30;FWDB=0.0221051;FXX=0.03529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3767;QD=5.73648;RBI=0.0722087;REFB=-0.0168691;REVB=0.068742;RO=49;SAF=15;SAR=19;SRF=19;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0568719;STB=0.540516;TYPE=snp;VARB=0.0173545;OID=.;OPOS=133012369;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:82:49:49:34:33:19:15:19:30:18:15:19:30 chr2 133012401 . G A 52.5 PASS AO=28;DP=106;FAO=27;FDP=104;FR=.;FRO=77;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=35;FSRR=42;FWDB=-0.0707626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.581;QD=2.01915;RBI=0.0708231;REFB=-0.00023236;REVB=-0.00292789;RO=75;SAF=12;SAR=16;SRF=34;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0305934;STB=0.507554;TYPE=snp;VARB=-7.3533e-05;OID=.;OPOS=133012401;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:106:104:75:77:28:27:16:12:34:41:15:12:35:42 chr2 133012414 . G A 117.17 PASS AO=43;DP=116;FAO=40;FDP=113;FR=.;FRO=73;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=34;FSRR=39;FWDB=-0.00202326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.596;QD=4.14753;RBI=0.00775872;REFB=-0.00910951;REVB=0.00749027;RO=73;SAF=14;SAR=29;SRF=34;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163781;STB=0.578273;TYPE=snp;VARB=0.0164316;OID=.;OPOS=133012414;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:113:73:73:43:40:29:14:34:39:26:14:34:39 chr2 133012439 . A AGAAC 43.14 PASS AO=32;DP=146;FAO=30;FDP=135;FR=.;FRO=105;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=47;FSRR=58;FWDB=-0.00914287;FXX=0.0357117;HRUN=2;LEN=4;MLLD=247.502;QD=1.27822;RBI=0.0250466;REFB=0.00143186;REVB=-0.0233182;RO=105;SAF=21;SAR=11;SRF=46;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.272571;STB=0.696748;TYPE=ins;VARB=-0.00334146;OID=.;OPOS=133012440;OREF=-;OALT=GAAC;OMAPALT=AGAAC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:32:146:30:135:105:21:9:47:58:43:105:21:11:46:59 chr2 133012458 . G A 876.72 PASS AO=178;DP=301;FAO=173;FDP=293;FR=.;FRO=120;FSAF=87;FSAR=86;FSRF=53;FSRR=67;FWDB=4.4206e-05;FXX=0.0134676;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.4008;QD=11.9689;RBI=0.0139508;REFB=0.0058558;REVB=-0.0139508;RO=118;SAF=90;SAR=88;SRF=52;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0479178;STB=0.525065;TYPE=snp;VARB=-0.00586385;OID=.;OPOS=133012458;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:301:293:118:120:178:173:88:90:52:66:86:87:53:67 chr2 133012459 . T C 886.35 PASS AO=179;DP=306;FAO=173;FDP=293;FR=.;FRO=120;FSAF=90;FSAR=83;FSRF=54;FSRR=66;FWDB=-0.00437076;FXX=0.0200662;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.846;QD=12.1004;RBI=0.00734851;REFB=-0.0269319;REVB=0.00590737;RO=119;SAF=93;SAR=86;SRF=54;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0486032;STB=0.52874;TYPE=snp;VARB=0.00706866;OID=.;OPOS=133012459;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:306:293:119:120:179:173:86:93:54:65:83:90:54:66 chr2 133012504 . A G 1944.15 PASS AO=351;DP=472;FAO=297;FDP=398;FR=.;FRO=101;FSAF=136;FSAR=161;FSRF=44;FSRR=57;FWDB=-0.00516767;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.873;QD=19.5392;RBI=0.0235631;REFB=-0.0103653;REVB=-0.0229895;RO=105;SAF=167;SAR=184;SRF=39;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0455031;STB=0.505697;TYPE=snp;VARB=0.00283327;OID=.;OPOS=133012504;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:472:398:105:101:351:297:184:167:39:66:161:136:44:57 chr2 133012508 . T C 2383.33 PASS AO=340;DP=427;FAO=321;FDP=387;FR=.;FRO=66;FSAF=162;FSAR=159;FSRF=30;FSRR=36;FWDB=-0.0129571;FXX=0.0324992;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.173;QD=24.6339;RBI=0.117088;REFB=0.0047924;REVB=0.116369;RO=75;SAF=189;SAR=151;SRF=36;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0261696;STB=0.508548;TYPE=snp;VARB=-0.000995566;OID=.;OPOS=133012508;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:427:387:75:66:340:321:151:189:36:39:159:162:30:36 chr2 133012516 . T G 1923.24 PASS AO=347;DP=475;FAO=296;FDP=399;FR=.;FRO=103;FSAF=156;FSAR=140;FSRF=41;FSRR=62;FWDB=-0.037052;FXX=0.00249994;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.1627;QD=19.2806;RBI=0.101443;REFB=-0.0113605;REVB=-0.0944348;RO=128;SAF=191;SAR=156;SRF=54;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.065281;STB=0.533268;TYPE=snp;VARB=0.00376588;OID=.;OPOS=133012516;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:475:399:128:103:347:296:156:191:54:74:140:156:41:62 chr2 133012523 . A G 2186.13 PASS AO=388;DP=502;FAO=312;FDP=396;FR=.;FRO=84;FSAF=163;FSAR=149;FSRF=35;FSRR=49;FWDB=0.00102085;FXX=0.00999975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.151;QD=22.0821;RBI=0.0133454;REFB=-0.0111538;REVB=0.0133063;RO=108;SAF=202;SAR=186;SRF=48;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.031298;STB=0.522434;TYPE=snp;VARB=0.00125876;OID=.;OPOS=133012523;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:502:396:108:84:388:312:186:202:48:60:149:163:35:49 chr2 133012542 . T C 2188.16 PASS AO=380;DP=483;FAO=311;FDP=392;FR=.;FRO=81;FSAF=162;FSAR=149;FSRF=29;FSRR=52;FWDB=0.0207866;FXX=0.0199995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.679;QD=22.3282;RBI=0.0236973;REFB=-0.00282515;REVB=-0.0113789;RO=99;SAF=203;SAR=177;SRF=40;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0508359;STB=0.533617;TYPE=snp;VARB=0.0014428;OID=.;OPOS=133012542;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:483:392:99:81:380:311:177:203:40:59:149:162:29:52 chr2 133012571 . T C 2219.87 PASS AO=393;DP=494;FAO=316;FDP=398;FR=.;FRO=82;FSAF=183;FSAR=133;FSRF=34;FSRR=48;FWDB=-0.00380774;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.983;QD=22.3103;RBI=0.00690641;REFB=0.0109914;REVB=-0.00576192;RO=99;SAF=220;SAR=173;SRF=39;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.063417;STB=0.534378;TYPE=snp;VARB=-0.00156456;OID=.;OPOS=133012571;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:494:398:99:82:393:316:173:220:39:60:133:183:34:48 chr2 133012612 . T C 1185.52 PASS AO=148;DP=208;FAO=181;FDP=240;FR=.;FRO=59;FSAF=106;FSAR=75;FSRF=21;FSRR=38;FWDB=0.0432091;FXX=0.00414921;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.797;QD=19.7587;RBI=0.0432092;REFB=-0.0129937;REVB=2.05025e-05;RO=59;SAF=80;SAR=68;SRF=21;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0982566;STB=0.557032;TYPE=snp;VARB=0.00403306;OID=.;OPOS=133012612;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:208:240:59:59:148:181:68:80:21:38:75:106:21:38 chr2 133012642 . T C 63.9 PASS AO=27;DP=78;FAO=24;FDP=76;FR=.;FRO=52;FSAF=5;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=41;FWDB=0.00397083;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.737;QD=3.36317;RBI=0.0373983;REFB=-0.027495;REVB=0.0371869;RO=51;SAF=6;SAR=21;SRF=11;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0107303;STB=0.503308;TYPE=snp;VARB=0.00906511;OID=.;OPOS=133012642;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:78:76:51:52:27:24:21:6:11:40:19:5:11:41 chr2 133012643 . T C 69.78 PASS AO=28;DP=79;FAO=25;FDP=76;FR=.;FRO=51;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=40;FWDB=-0.0140656;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.817;QD=3.67275;RBI=0.0258564;REFB=-0.0278831;REVB=0.0216959;RO=51;SAF=7;SAR=21;SRF=11;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.052843;STB=0.522877;TYPE=snp;VARB=0.0158284;OID=.;OPOS=133012643;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:79:76:51:51:28:25:21:7:11:40:19:6:11:40 chr2 133012655 . A G 447.36 PASS AO=85;DP=135;FAO=82;FDP=132;FR=.;FRO=50;FSAF=16;FSAR=66;FSRF=12;FSRR=38;FWDB=0.0413128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.492;QD=13.5563;RBI=0.0420829;REFB=-0.011299;REVB=0.00801387;RO=50;SAF=17;SAR=68;SRF=12;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0415588;STB=0.526189;TYPE=snp;VARB=0.00586553;OID=.;OPOS=133012655;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:132:50:50:85:82:68:17:12:38:66:16:12:38 chr2 133012674 . A G 1006.35 PASS AO=136;DP=169;FAO=133;FDP=158;FR=.;FRO=25;FSAF=31;FSAR=102;FSRF=7;FSRR=18;FWDB=0.0350671;FXX=0.0481899;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.9057;QD=25.4771;RBI=0.0359852;REFB=0.000685641;REVB=-0.0080769;RO=25;SAF=32;SAR=104;SRF=7;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0180077;STB=0.510267;TYPE=snp;VARB=-0.000206357;OID=.;OPOS=133012674;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:169:158:25:25:136:133:104:32:7:18:102:31:7:18 chr2 133012680 . A G 729.37 PASS AO=123;DP=177;FAO=120;FDP=174;FR=.;FRO=54;FSAF=30;FSAR=90;FSRF=21;FSRR=33;FWDB=-0.014421;FXX=0.00571396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.9396;QD=16.7671;RBI=0.0314691;REFB=-0.0236714;REVB=-0.0279704;RO=54;SAF=31;SAR=92;SRF=21;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.097637;STB=0.554338;TYPE=snp;VARB=0.0114859;OID=.;OPOS=133012680;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:174:54:54:123:120:92:31:21:33:90:30:21:33 chr2 133012688 . A G 790.74 PASS AO=112;DP=158;FAO=122;FDP=167;FR=.;FRO=45;FSAF=32;FSAR=90;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=0.0126166;FXX=0.00595203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.368;QD=18.94;RBI=0.0129;REFB=-0.0318031;REVB=0.00268927;RO=45;SAF=22;SAR=90;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198119;STB=0.566631;TYPE=snp;VARB=0.00971912;OID=.;OPOS=133012688;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:158:167:45:45:112:122:90:22:21:24:90:32:21:24 chr2 133012691 . T C 861.86 PASS AO=129;DP=169;FAO=127;FDP=166;FR=.;FRO=39;FSAF=27;FSAR=100;FSRF=29;FSRR=10;FWDB=0.0176087;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.072;QD=20.7676;RBI=0.0176105;REFB=-0.0189975;REVB=0.000257413;RO=37;SAF=28;SAR=101;SRF=28;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.275312;STB=0.653416;TYPE=snp;VARB=0.00283853;OID=.;OPOS=133012691;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:169:166:37:39:129:127:101:28:28:9:100:27:29:10 chr2 133012712 . T C 1366.9 PASS AO=170;DP=187;FAO=166;FDP=183;FR=.;FRO=17;FSAF=71;FSAR=95;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.00343101;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.857;QD=29.8776;RBI=0.0126327;REFB=-0.0485029;REVB=0.0121578;RO=17;SAF=72;SAR=98;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0289289;STB=0.515162;TYPE=snp;VARB=0.00461581;OID=.;OPOS=133012712;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:187:183:17:17:170:166:98:72:10:7:95:71:10:7 chr2 133012716 . A G 1085.8 PASS AO=155;DP=192;FAO=151;FDP=187;FR=.;FRO=36;FSAF=67;FSAR=84;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=0.00769973;FXX=0.00531887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.531;QD=23.2257;RBI=0.00799728;REFB=-0.00391185;REVB=-0.00216116;RO=36;SAF=68;SAR=87;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0418977;STB=0.521699;TYPE=snp;VARB=0.0011112;OID=.;OPOS=133012716;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:192:187:36:36:155:151:87:68:20:16:84:67:20:16 chr2 133012798 . T C 60.47 PASS AO=27;DP=76;FAO=23;FDP=74;FR=.;FRO=51;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=26;FSRR=25;FWDB=-0.0206963;FXX=0.0263123;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.671;QD=3.26853;RBI=0.0232982;REFB=-0.00228071;REVB=-0.010699;RO=47;SAF=17;SAR=10;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157343;STB=0.601368;TYPE=snp;VARB=0.00487102;OID=.;OPOS=133012798;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:76:74:47:51:27:23:10:17:23:24:8:15:26:25 chr2 133012799 . A C 31.61 PASS AO=17;DP=74;FAO=16;FDP=66;FR=.;FRO=50;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=-0.01324;FXX=0.119984;HRUN=3;LEN=1;MLLD=88.5569;QD=1.91593;RBI=0.0135722;REFB=-0.00138417;REVB=0.00298421;RO=50;SAF=12;SAR=5;SRF=25;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260196;STB=0.701349;TYPE=snp;VARB=0.0115938;OID=.;OPOS=133012799;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:74:66:50:50:17:16:5:12:25:25:4:12:25:25 chr2 133012800 . A T 36.14 PASS AO=19;DP=73;FAO=18;FDP=72;FR=.;FRO=54;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=28;FSRR=26;FWDB=-0.0128951;FXX=0.0270234;HRUN=3;LEN=1;MLLD=192.254;QD=2.00773;RBI=0.013214;REFB=-0.00144696;REVB=0.00288543;RO=54;SAF=13;SAR=6;SRF=28;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20981;STB=0.66264;TYPE=snp;VARB=0.0148097;OID=.;OPOS=133012800;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:73:72:54:54:19:18:6:13:28:26:5:13:28:26 chr2 133012801 . A T 33.03 PASS AO=18;DP=75;FAO=17;FDP=70;FR=.;FRO=53;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=27;FSRR=26;FWDB=-0.0147604;FXX=0.0540468;HRUN=3;LEN=1;MLLD=150.74;QD=1.88738;RBI=0.0199366;REFB=-0.00727006;REVB=-0.0134014;RO=52;SAF=14;SAR=4;SRF=26;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.362769;STB=0.767142;TYPE=snp;VARB=0.0286915;OID=.;OPOS=133012801;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:75:70:52:53:18:17:4:14:26:26:3:14:27:26 chr2 133012802 . C CTG,G 79.84 PASS AO=21,18;DP=74;FAO=21,1;FDP=54;FR=.;FRO=32;FSAF=13,0;FSAR=8,1;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=-0.0133186,-0.0333075;FXX=0.270234;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=175.972,55.0283;QD=5.91422;RBI=0.0134166,0.0458012;REFB=-0.00937644,-0.0167523;REVB=-0.00161855,-0.0314381;RO=30;SAF=13,14;SAR=8,4;SRF=13;SRR=17;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.191041,0.393769;STB=0.610003,0.988723;TYPE=ins,snp;VARB=0.013164,0.0907916;OID=.,.;OPOS=133012803,133012802;OREF=-,C;OALT=TG,G;OMAPALT=CTG,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:74:54:30:32:21,18:21,1:8,4:13,14:13:17:8,1:13,0:14:18 chr2 133012807 . A G 92.79 PASS AO=30;DP=83;FAO=29;FDP=79;FR=.;FRO=50;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=-0.0155199;FXX=0.0365809;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.194;QD=4.69803;RBI=0.0204112;REFB=-0.0140993;REVB=-0.013257;RO=49;SAF=15;SAR=15;SRF=23;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0331247;STB=0.523544;TYPE=snp;VARB=0.0237888;OID=.;OPOS=133012807;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:83:79:49:50:30:29:15:15:23:26:14:15:24:26 chr2 133012832 . T C 259.4 PASS AO=59;DP=115;FAO=58;FDP=113;FR=.;FRO=55;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=22;FSRR=33;FWDB=0.0240629;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.9539;QD=9.18227;RBI=0.024547;REFB=-0.029723;REVB=-0.00485107;RO=55;SAF=27;SAR=32;SRF=22;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0511208;STB=0.532173;TYPE=snp;VARB=0.0180291;OID=.;OPOS=133012832;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:113:55:55:59:58:32:27:22:33:31:27:22:33 chr2 133012839 . T C 302.58 PASS AO=65;DP=120;FAO=64;FDP=119;FR=.;FRO=55;FSAF=31;FSAR=33;FSRF=21;FSRR=34;FWDB=0.00168258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.992;QD=10.1709;RBI=0.0080795;REFB=-0.00217144;REVB=0.00790236;RO=53;SAF=31;SAR=34;SRF=21;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0666132;STB=0.547573;TYPE=snp;VARB=0.00461718;OID=.;OPOS=133012839;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:119:53:55:65:64:34:31:21:32:33:31:21:34 chr2 133012901 . T C 235.5 PASS AO=44;DP=70;FAO=42;FDP=67;FR=.;FRO=25;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=5;FSRR=20;FWDB=0.0014816;FXX=0.0289813;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.945;QD=14.0594;RBI=0.0286587;REFB=-0.0292739;REVB=-0.0286204;RO=25;SAF=17;SAR=27;SRF=5;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13566;STB=0.581712;TYPE=snp;VARB=0.0069438;OID=.;OPOS=133012901;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:70:67:25:25:44:42:27:17:5:20:25:17:5:20 chr2 133012903 . T C 131.95 PASS AO=31;DP=65;FAO=31;FDP=65;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=24;FWDB=0.050662;FXX=0.0441112;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.526;QD=8.12003;RBI=0.0507994;REFB=-0.00932894;REVB=0.00373277;RO=34;SAF=13;SAR=18;SRF=10;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123167;STB=0.55243;TYPE=snp;VARB=0.0222695;OID=.;OPOS=133012903;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:34:34:31:31:18:13:10:24:19:12:10:24 chr2 133012923 . A T 58.96 PASS AO=19;DP=56;FAO=19;FDP=55;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=25;FWDB=0.000333527;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.911;QD=4.28801;RBI=0.00819788;REFB=-0.0142142;REVB=0.00819109;RO=37;SAF=10;SAR=9;SRF=12;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226336;STB=0.642582;TYPE=snp;VARB=0.0169086;OID=.;OPOS=133012923;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:56:55:37:36:19:19:9:10:12:25:9:10:11:25 chr2 133012930 . A G 28.33 PASS AO=14;DP=59;FAO=14;FDP=58;FR=.;FRO=44;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=27;FWDB=-0.0230223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.145;QD=1.95409;RBI=0.027085;REFB=-0.0067581;REVB=0.0142678;RO=44;SAF=9;SAR=5;SRF=17;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.30583;STB=0.688736;TYPE=snp;VARB=0.0563233;OID=.;OPOS=133012930;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:59:58:44:44:14:14:5:9:17:27:5:9:17:27 chr2 133012945 . T C 29.93 PASS AO=14;DP=58;FAO=14;FDP=56;FR=.;FRO=42;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=0.00636828;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.13;QD=2.13776;RBI=0.0159824;REFB=-0.00108615;REVB=0.0146588;RO=42;SAF=10;SAR=4;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.345902;STB=0.728322;TYPE=snp;VARB=0.00607871;OID=.;OPOS=133012945;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:58:56:42:42:14:14:4:10:18:24:4:10:17:25 chr2 133012982 . G A 68.05 PASS AO=17;DP=34;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=15;FWDB=0.0117494;FXX=0.0588062;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.941;QD=8.50675;RBI=0.0253986;REFB=0.00608127;REVB=0.0225176;RO=17;SAF=13;SAR=4;SRF=2;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.540366;STB=0.80041;TYPE=snp;VARB=-0.011298;OID=.;OPOS=133012982;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:34:32:17:17:17:15:4:13:2:15:4:11:2:15 chr2 133012983 . T C 86.08 PASS AO=20;DP=37;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=15;FWDB=-0.000435793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.435;QD=9.8382;RBI=0.00406311;REFB=-0.00120922;REVB=-0.00403968;RO=17;SAF=16;SAR=4;SRF=2;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.550214;STB=0.805738;TYPE=snp;VARB=0.00229379;OID=.;OPOS=133012983;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:37:35:17:17:20:18:4:16:2:15:4:14:2:15 chr2 133012994 . A G 35.41 PASS AO=11;DP=36;FAO=11;FDP=34;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=-0.0160326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.532;QD=4.16627;RBI=0.026978;REFB=-0.00445078;REVB=-0.0216972;RO=25;SAF=7;SAR=4;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.265869;STB=0.688791;TYPE=snp;VARB=0.00868555;OID=.;OPOS=133012994;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:36:34:25:23:11:11:4:7:10:15:4:7:8:15 chr2 133013049 . G A 49.61 PASS AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=-0.0110218;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=199.948;QD=6.84275;RBI=0.0117513;REFB=-0.00146858;REVB=0.00407569;RO=19;SAF=8;SAR=4;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.256991;STB=0.681519;TYPE=snp;VARB=0.0017733;OID=.;OPOS=133013049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:31:29:19:17:12:12:4:8:8:11:4:8:6:11 chr2 133013074 . C T 62.67 PASS AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.0348097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.113;QD=8.087;RBI=0.035702;REFB=-0.0182065;REVB=0.00793204;RO=18;SAF=8;SAR=6;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22794;STB=0.648446;TYPE=snp;VARB=0.0126827;OID=.;OPOS=133013074;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:32:31:18:17:14:14:6:8:6:12:6:8:5:12 chr2 133013145 . C T 217.34 PASS AO=25;DP=73;FAO=38;FDP=55;FR=.,HEALED;FRO=17;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.00661183;FXX=0.214255;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.3778;QD=15.8064;RBI=0.00787624;REFB=-0.0459585;REVB=-0.00428006;RO=19;SAF=5;SAR=20;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225237;STB=0.500959;TYPE=snp;VARB=0.0271642;OID=.;OPOS=133013145;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:71:55:19:17:25:38:20:5:8:11:20:18:8:9 chr2 133013165 . G T 32.08 PASS AO=19;DP=102;FAO=22;FDP=103;FR=.;FRO=81;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=43;FSRR=38;FWDB=-0.00578008;FXX=0.0190458;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.53;QD=1.24594;RBI=0.0058686;REFB=-0.00633624;REVB=-0.00101544;RO=70;SAF=7;SAR=12;SRF=43;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.30117;STB=0.595508;TYPE=snp;VARB=0.0333612;OID=.;OPOS=133013165;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:102:103:70:81:19:22:12:7:43:27:13:9:43:38 chr2 133013175 . T G 541.07 PASS AO=81;DP=110;FAO=82;FDP=110;FR=.;FRO=28;FSAF=45;FSAR=37;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.0403217;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3001;QD=19.6752;RBI=0.0659409;REFB=-0.0127712;REVB=0.0521762;RO=28;SAF=45;SAR=36;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0782594;STB=0.53975;TYPE=snp;VARB=0.00463398;OID=.;OPOS=133013175;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:110:110:28:28:81:82:36:45:11:17:37:45:11:17 chr2 133013183 . A G 91.03 PASS AO=37;DP=119;FAO=37;FDP=119;FR=.;FRO=82;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=36;FSRR=46;FWDB=0.00497198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.773;QD=3.05973;RBI=0.0243488;REFB=-0.00749228;REVB=-0.0238358;RO=80;SAF=22;SAR=15;SRF=35;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183542;STB=0.606633;TYPE=snp;VARB=0.0163699;OID=.;OPOS=133013183;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:119:119:80:82:37:37:15:22:35:45:15:22:36:46 chr2 133013189 . A G 76.75 PASS AO=35;DP=122;FAO=35;FDP=122;FR=.;FRO=87;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=38;FSRR=49;FWDB=-0.0846513;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.1952;QD=2.51643;RBI=0.093384;REFB=-0.00593789;REVB=-0.0394302;RO=85;SAF=22;SAR=13;SRF=38;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218083;STB=0.636117;TYPE=snp;VARB=0.0130247;OID=.;OPOS=133013189;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:122:122:85:87:35:35:13:22:38:47:13:22:38:49 chr2 133013201 . C G 548.05 PASS AO=86;DP=124;FAO=88;FDP=125;FR=.;FRO=37;FSAF=44;FSAR=44;FSRF=14;FSRR=23;FWDB=0.0276682;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.448;QD=17.5376;RBI=0.0277192;REFB=-0.0093014;REVB=-0.00168073;RO=37;SAF=42;SAR=44;SRF=14;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0617417;STB=0.535992;TYPE=snp;VARB=0.00444743;OID=.;OPOS=133013201;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:124:125:37:37:86:88:44:42:14:23:44:44:14:23 chr2 133013224 . A C 241.07 PASS AO=54;DP=145;FAO=56;FDP=112;FR=.;FRO=56;FSAF=31;FSAR=25;FSRF=26;FSRR=30;FWDB=0.00908251;FXX=0.238079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.6137;QD=8.60946;RBI=0.00971298;REFB=-0.0183089;REVB=0.0034424;RO=55;SAF=29;SAR=25;SRF=27;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0421397;STB=0.544712;TYPE=snp;VARB=0.0225828;OID=.;OPOS=133013224;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:112:55:56:54:56:25:29:27:28:25:31:26:30 chr2 133013250 . C T 68.91 PASS AO=43;DP=175;FAO=43;FDP=176;FR=.;FRO=133;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=67;FSRR=66;FWDB=-0.01902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.3888;QD=1.56614;RBI=0.0194839;REFB=-0.00270047;REVB=-0.00422637;RO=132;SAF=19;SAR=24;SRF=67;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0824789;STB=0.529212;TYPE=snp;VARB=0.00702851;OID=.;OPOS=133013250;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:175:176:132:133:43:43:24:19:67:65:23:20:67:66 chr2 133013286 . A C 61.42 PASS AO=36;DP=161;FAO=39;FDP=163;FR=.;FRO=124;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=60;FSRR=64;FWDB=-0.00758605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.707;QD=1.50718;RBI=0.0180581;REFB=-0.0165935;REVB=-0.0163874;RO=122;SAF=14;SAR=22;SRF=61;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141766;STB=0.536736;TYPE=snp;VARB=0.0117114;OID=.;OPOS=133013286;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:161:163:122:124:36:39:22:14:61:61:22:17:60:64 chr2 133013318 . A G 211.83 PASS AO=59;DP=138;FAO=58;FDP=135;FR=.;FRO=77;FSAF=20;FSAR=38;FSRF=37;FSRR=40;FWDB=-0.000284174;FXX=0.0145975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.114;QD=6.27657;RBI=0.0179574;REFB=-0.0109409;REVB=-0.0179551;RO=75;SAF=21;SAR=38;SRF=37;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142912;STB=0.581292;TYPE=snp;VARB=0.0060481;OID=.;OPOS=133013318;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:135:75:77:59:58:38:21:37:38:38:20:37:40 chr2 133013324 . C A 58.02 PASS AO=33;DP=127;FAO=32;FDP=126;FR=.;FRO=94;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=43;FSRR=51;FWDB=0.0101799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.938;QD=1.84176;RBI=0.0102137;REFB=-0.00352061;REVB=0.000829808;RO=93;SAF=14;SAR=19;SRF=43;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0476111;STB=0.538982;TYPE=snp;VARB=0.013575;OID=.;OPOS=133013324;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:127:126:93:94:33:32:19:14:43:50:19:13:43:51 chr2 133013327 . G T 55.9 PASS AO=32;DP=124;FAO=31;FDP=123;FR=.;FRO=92;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=46;FSRR=46;FWDB=-0.0128195;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.885;QD=1.81793;RBI=0.0304637;REFB=-0.000374261;REVB=-0.027635;RO=90;SAF=14;SAR=18;SRF=45;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0772025;STB=0.560679;TYPE=snp;VARB=0.00101921;OID=.;OPOS=133013327;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:124:123:90:92:32:31:18:14:45:45:18:13:46:46 chr2 133013332 . T C 25.26 PASS AO=23;DP=122;FAO=23;FDP=121;FR=.;FRO=98;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=51;FSRR=47;FWDB=-0.0281903;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.6654;QD=0.83504;RBI=0.0425754;REFB=0.0025287;REVB=-0.0319056;RO=99;SAF=8;SAR=15;SRF=52;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226478;STB=0.640717;TYPE=snp;VARB=-0.0121197;OID=.;OPOS=133013332;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:122:121:99:98:23:23:15:8:52:47:15:8:51:47 chr2 133013343 . T C 17.21 PASS AO=19;DP=113;FAO=19;FDP=112;FR=.;FRO=93;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=48;FSRR=45;FWDB=0.0384403;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.028;QD=0.614722;RBI=0.0395768;REFB=0.00336149;REVB=0.00941636;RO=94;SAF=6;SAR=13;SRF=49;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.262345;STB=0.668392;TYPE=snp;VARB=-0.0152315;OID=.;OPOS=133013343;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:113:112:94:93:19:19:13:6:49:45:13:6:48:45 chr2 133013351 . G A 38.45 PASS AO=26;DP=112;FAO=25;FDP=111;FR=.;FRO=86;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=43;FSRR=43;FWDB=0.0318579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.632;QD=1.38549;RBI=0.0603664;REFB=-0.00561024;REVB=0.0512755;RO=86;SAF=11;SAR=15;SRF=43;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0967264;STB=0.578119;TYPE=snp;VARB=0.028364;OID=.;OPOS=133013351;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:112:111:86:86:26:25:15:11:43:43:15:10:43:43 chr2 133013378 . A G 125.85 PASS AO=36;DP=99;FAO=39;FDP=102;FR=.;FRO=63;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=33;FSRR=30;FWDB=0.0327718;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.025;QD=4.93518;RBI=0.0346227;REFB=-0.0346007;REVB=0.0111688;RO=63;SAF=12;SAR=24;SRF=33;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217222;STB=0.621558;TYPE=snp;VARB=0.0400333;OID=.;OPOS=133013378;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:102:63:63:36:39:24:12:33:30:26:13:33:30 chr2 133013388 . C T 15.42 PASS AO=16;DP=96;FAO=16;FDP=95;FR=.;FRO=79;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=44;FSRR=35;FWDB=-0.0266759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.6567;QD=0.649265;RBI=0.0373679;REFB=-0.00405174;REVB=-0.0261678;RO=79;SAF=3;SAR=13;SRF=44;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.467652;STB=0.808883;TYPE=snp;VARB=0.0212702;OID=.;OPOS=133013388;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:96:95:79:79:16:16:13:3:44:35:13:3:44:35 chr2 133013418 . A G 60.35 PASS AO=23;DP=69;FAO=22;FDP=69;FR=.;FRO=47;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=28;FSRR=19;FWDB=-0.038378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.416;QD=3.49833;RBI=0.0392828;REFB=0.00284534;REVB=-0.00838269;RO=44;SAF=8;SAR=15;SRF=26;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.272441;STB=0.687903;TYPE=snp;VARB=-0.00604551;OID=.;OPOS=133013418;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:69:69:44:47:23:22:15:8:26:18:15:7:28:19 chr2 133013449 . G A 11.37 PASS AO=8;DP=40;FAO=7;FDP=40;FR=.;FRO=33;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=-0.0327483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.703;QD=1.1371;RBI=0.0327514;REFB=0.00129222;REVB=0.000455295;RO=30;SAF=5;SAR=3;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112662;STB=0.521677;TYPE=snp;VARB=-0.00612556;OID=.;OPOS=133013449;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:40:40:30:33:8:7:3:5:16:14:3:4:18:15 chr2 133013475 . A G 15.16 PASS AO=6;DP=27;FAO=6;FDP=27;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=0.00300886;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0043;QD=2.24526;RBI=0.0215413;REFB=-0.00236346;REVB=0.0213301;RO=21;SAF=5;SAR=1;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.257551;STB=0.677287;TYPE=snp;VARB=0.0108987;OID=.;OPOS=133013475;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:27:27:21:21:6:6:1:5:14:7:1:5:14:7 chr2 133013504 . C T 14.01 PASS AO=4;DP=17;FAO=4;FDP=17;FR=.,HEALED;FRO=13;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0353004;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=124.81;QD=3.29726;RBI=0.123564;REFB=-0.00946576;REVB=-0.118415;RO=6;SAF=1;SAR=3;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.388047;STB=0.770116;TYPE=snp;VARB=0.0428056;OID=.;OPOS=133013504;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:17:17:6:13:4:4:3:1:4:2:3:1:8:5 chr2 133013513 . A C 44.38 PASS AO=8;DP=22;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.00816844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.297;QD=7.71911;RBI=0.0396517;REFB=-0.00319001;REVB=-0.0388012;RO=9;SAF=5;SAR=3;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153362;STB=0.535642;TYPE=snp;VARB=0.00664651;OID=.;OPOS=133013513;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:21:23:9:13:8:10:3:5:7:2:4:6:7:6 chr2 133013556 . C T 55.54 PASS AO=18;DP=53;FAO=18;FDP=53;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=-0.0238684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.249;QD=4.19133;RBI=0.0264333;REFB=-0.023231;REVB=0.0113585;RO=34;SAF=10;SAR=8;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104901;STB=0.549303;TYPE=snp;VARB=0.0265652;OID=.;OPOS=133013556;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:53:53:34:35:18:18:8:10:22:12:8:10:22:13 chr2 133013590 . A G 714.72 PASS AO=69;DP=69;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0291346;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.755;QD=38.1182;RBI=0.0416331;REFB=0;REVB=0.0297404;RO=0;SAF=41;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000157084;OID=.;OPOS=133013590;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:69:75:0:0:69:75:28:41:0:0:28:47:0:0 chr2 133013631 . G A 118.9 PASS AO=38;DP=105;FAO=39;FDP=107;FR=.;FRO=68;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=39;FSRR=29;FWDB=-0.0433062;FXX=0.0092584;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8154;QD=4.44486;RBI=0.0487368;REFB=0.0350495;REVB=-0.0223573;RO=66;SAF=25;SAR=13;SRF=36;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13132;STB=0.545385;TYPE=snp;VARB=-0.0623169;OID=.;OPOS=133013631;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:107:66:68:38:39:13:25:36:30:14:25:39:29 chr2 133013644 . G A 58.76 PASS AO=29;DP=105;FAO=29;FDP=108;FR=.;FRO=79;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=43;FSRR=36;FWDB=-0.0173055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.34;QD=2.17644;RBI=0.0254479;REFB=-0.00109358;REVB=0.0186578;RO=74;SAF=20;SAR=9;SRF=38;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222297;STB=0.613416;TYPE=snp;VARB=0.00218876;OID=.;OPOS=133013644;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:105:108:74:79:29:29:9:20:38:36:9:20:43:36 chr2 133013680 . G A 320.31 PASS AO=61;DP=102;FAO=62;FDP=104;FR=.;FRO=42;FSAF=42;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=27;FWDB=-0.0109115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.398;QD=12.3194;RBI=0.027006;REFB=-0.0270408;REVB=0.0247035;RO=40;SAF=42;SAR=19;SRF=13;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.273119;STB=0.633867;TYPE=snp;VARB=0.0179811;OID=.;OPOS=133013680;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:104:40:42:61:62:19:42:13:27:20:42:15:27 chr2 133013687 . T C 81.44 PASS AO=32;DP=100;FAO=32;FDP=102;FR=.;FRO=70;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=36;FSRR=34;FWDB=-0.0204749;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=158.772;QD=3.19371;RBI=0.0204761;REFB=-0.0127893;REVB=-0.000221166;RO=67;SAF=20;SAR=12;SRF=33;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156249;STB=0.57784;TYPE=snp;VARB=0.0353711;OID=.;OPOS=133013687;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:100:102:67:70:32:32:12:20:33:34:12:20:36:34 chr2 133013695 . C T 35.52 PASS AO=23;DP=101;FAO=23;FDP=103;FR=.;FRO=80;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=43;FSRR=37;FWDB=-0.00352138;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.244;QD=1.37946;RBI=0.0320487;REFB=3.90008e-05;REVB=-0.0318547;RO=72;SAF=13;SAR=10;SRF=36;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0811182;STB=0.521757;TYPE=snp;VARB=-0.000324677;OID=.;OPOS=133013695;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:101:103:72:80:23:23:10:13:36:36:10:13:43:37 chr2 133013696 . A G 317.68 PASS AO=53;DP=96;FAO=61;FDP=103;FR=.;FRO=42;FSAF=41;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=27;FWDB=0.00884221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.547;QD=12.337;RBI=0.0193961;REFB=-0.0187005;REVB=-0.0172633;RO=40;SAF=34;SAR=19;SRF=13;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249328;STB=0.632381;TYPE=snp;VARB=0.019078;OID=.;OPOS=133013696;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:103:40:42:53:61:19:34:13:27:20:41:15:27 chr2 133013704 . G A 95.56 PASS AO=35;DP=100;FAO=35;FDP=105;FR=.;FRO=70;FSAF=25;FSAR=10;FSRF=31;FSRR=39;FWDB=-0.0301159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.079;QD=3.64025;RBI=0.0418788;REFB=-0.0125089;REVB=-0.029101;RO=65;SAF=25;SAR=10;SRF=29;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.311838;STB=0.686165;TYPE=snp;VARB=0.0347552;OID=.;OPOS=133013704;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:100:105:65:70:35:35:10:25:29:36:10:25:31:39 chr2 133013756 . G A 58.6 PASS AO=24;DP=81;FAO=24;FDP=81;FR=.;FRO=57;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=31;FWDB=0.0163601;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.067;QD=2.89388;RBI=0.0163605;REFB=-0.0213024;REVB=-0.000104901;RO=57;SAF=14;SAR=10;SRF=26;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150542;STB=0.589248;TYPE=snp;VARB=0.0607941;OID=.;OPOS=133013756;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:81:81:57:57:24:24:10:14:26:31:10:14:26:31 chr2 133036280 . A C 10.81 PASS AO=11;DP=64;FAO=10;FDP=63;FR=.;FRO=53;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=34;FWDB=-0.0212237;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.2851;QD=0.686464;RBI=0.0440181;REFB=-0.00593668;REVB=-0.0385636;RO=53;SAF=3;SAR=8;SRF=19;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122188;STB=0.555841;TYPE=snp;VARB=0.0266431;OID=.;OPOS=133036280;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:64:63:53:53:11:10:8:3:19:34:7:3:19:34 chr2 133036505 . T C 13.56 PASS AO=5;DP=24;FAO=5;FDP=23;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.0317475;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.4004;QD=2.35798;RBI=0.0684707;REFB=-0.0157196;REVB=-0.0606658;RO=18;SAF=3;SAR=2;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133606;STB=0.509055;TYPE=snp;VARB=0.0315007;OID=.;OPOS=133036505;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:24:23:18:18:5:5:2:3:11:7:2:3:11:7 chr2 133036510 . C A 10.94 PASS AO=5;DP=27;FAO=5;FDP=27;FR=.;FRO=22;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=0.00525129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.604;QD=1.62002;RBI=0.0611238;REFB=-0.00804146;REVB=0.0608978;RO=22;SAF=3;SAR=2;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103425;STB=0.571157;TYPE=snp;VARB=0.0308664;OID=.;OPOS=133036510;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:27:27:22:22:5:5:2:3:15:7:2:3:15:7 chr2 133036571 . C T 54.79 PASS AO=19;DP=70;FAO=21;FDP=69;FR=.;FRO=48;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=36;FSRR=12;FWDB=0.00306833;FXX=0.0416609;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.848;QD=3.17634;RBI=0.00567999;REFB=-0.0119275;REVB=0.00477992;RO=47;SAF=12;SAR=7;SRF=36;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184161;STB=0.568121;TYPE=snp;VARB=0.0358592;OID=.;OPOS=133036571;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:70:69:47:48:19:21:7:12:36:11:7:14:36:12 chr2 133036619 . C T 95.79 PASS AO=31;DP=92;FAO=33;FDP=95;FR=.;FRO=62;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=48;FSRR=14;FWDB=-0.00375483;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.307;QD=4.03337;RBI=0.00933534;REFB=-0.00720643;REVB=0.00854692;RO=61;SAF=21;SAR=10;SRF=47;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129306;STB=0.562563;TYPE=snp;VARB=0.0430243;OID=.;OPOS=133036619;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:92:95:61:62:31:33:10:21:47:14:10:23:48:14 chr2 133036620 . C G 95.79 PASS AO=31;DP=93;FAO=33;FDP=95;FR=.;FRO=62;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=48;FSRR=14;FWDB=-0.0105405;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.353;QD=4.03313;RBI=0.0700983;REFB=-0.00726169;REVB=0.0693013;RO=62;SAF=21;SAR=10;SRF=48;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135429;STB=0.562563;TYPE=snp;VARB=0.0534123;OID=.;OPOS=133036620;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:93:95:62:62:31:33:10:21:48:14:10:23:48:14 chr2 133036630 . A G 57.23 PASS AO=40;DP=138;FAO=33;FDP=133;FR=.;FRO=100;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=76;FSRR=24;FWDB=-0.0138489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.986;QD=1.7211;RBI=0.033155;REFB=0.00533681;REVB=0.0301241;RO=96;SAF=15;SAR=25;SRF=74;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.452322;STB=0.756674;TYPE=snp;VARB=-0.0261581;OID=.;OPOS=133036630;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:138:133:96:100:40:33:25:15:74:22:20:13:76:24 chr2 133036632 . G A 72.8 PASS AO=44;DP=142;FAO=37;FDP=137;FR=.;FRO=100;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=76;FSRR=24;FWDB=-0.0219773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.442;QD=2.12544;RBI=0.0230985;REFB=-0.00428561;REVB=0.00710914;RO=98;SAF=19;SAR=25;SRF=74;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.374465;STB=0.713093;TYPE=snp;VARB=0.0122739;OID=.;OPOS=133036632;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:142:137:98:100:44:37:25:19:74:24:20:17:76:24 chr2 133036650 . T G 609.05 PASS AO=89;DP=173;FAO=106;FDP=163;FR=.,HEALED;FRO=57;FSAF=64;FSAR=42;FSRF=46;FSRR=11;FWDB=0.0844317;FXX=0.0121205;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.532;QD=14.9461;RBI=0.114919;REFB=-0.130718;REVB=0.0779593;RO=51;SAF=47;SAR=42;SRF=40;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175735;STB=0.576621;TYPE=snp;VARB=0.064136;OID=.;OPOS=133036650;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:163:51:57:89:106:42:47:40:11:42:64:46:11 chr2 133036661 . A AT 343.03 PASS AO=91;DP=196;FAO=84;FDP=171;FR=.;FRO=87;FSAF=46;FSAR=38;FSRF=67;FSRR=20;FWDB=-0.00366083;FXX=0.0284075;HRUN=0;LEN=1;MLLD=86.1604;QD=8.02414;RBI=0.0463012;REFB=-0.0100974;REVB=-0.0461562;RO=99;SAF=49;SAR=42;SRF=70;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16302;STB=0.616751;TYPE=ins;VARB=0.00619375;OID=.;OPOS=133036662;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:91:196:84:171:87:46:38:67:20:99:99:49:42:70:29 chr2 133036666 . AC A 472.99 PASS AO=113;DP=217;FAO=104;FDP=193;FR=.;FRO=89;FSAF=71;FSAR=33;FSRF=69;FSRR=20;FWDB=0.0200484;FXX=0.0676296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.3967;QD=9.80293;RBI=0.0356957;REFB=-0.00729342;REVB=0.0295338;RO=92;SAF=74;SAR=39;SRF=69;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0895682;STB=0.551106;TYPE=del;VARB=0.00206367;OID=.;OPOS=133036667;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:113:215:104:193:89:71:33:69:20:99:92:74:39:69:23 chr2 133036669 . G T 511.05 PASS AO=118;DP=214;FAO=111;FDP=208;FR=.;FRO=97;FSAF=71;FSAR=40;FSRF=72;FSRR=25;FWDB=0.00154109;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.106;QD=9.82784;RBI=0.00772778;REFB=-0.0180682;REVB=-0.00757256;RO=96;SAF=73;SAR=45;SRF=72;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118583;STB=0.55345;TYPE=snp;VARB=0.0141311;OID=.;OPOS=133036669;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:208:96:97:118:111:45:73:72:24:40:71:72:25 chr2 133036693 . T G 1529.85 PASS AO=227;DP=287;FAO=219;FDP=279;FR=.;FRO=60;FSAF=140;FSAR=79;FSRF=45;FSRR=15;FWDB=0.00535748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.526;QD=21.9333;RBI=0.0381428;REFB=-0.043297;REVB=0.0377647;RO=59;SAF=143;SAR=84;SRF=44;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0489981;STB=0.52619;TYPE=snp;VARB=0.00945462;OID=.;OPOS=133036693;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:287:279:59:60:227:219:84:143:44:15:79:140:45:15 chr2 133036697 . A G 1113.8 PASS AO=229;DP=290;FAO=190;FDP=283;FR=.;FRO=93;FSAF=121;FSAR=69;FSRF=68;FSRR=25;FWDB=0.00970175;FXX=0.003521;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.044;QD=15.7428;RBI=0.0104777;REFB=-0.0135607;REVB=-0.00395714;RO=61;SAF=146;SAR=83;SRF=46;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0507779;STB=0.534135;TYPE=snp;VARB=0.00464085;OID=.;OPOS=133036697;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:290:283:61:93:229:190:83:146:46:15:69:121:68:25 chr2 133036704 . T C 969.53 PASS AO=186;DP=291;FAO=179;FDP=285;FR=.;FRO=106;FSAF=122;FSAR=57;FSRF=71;FSRR=35;FWDB=-0.00623196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.774;QD=13.6074;RBI=0.0094855;REFB=-0.0249853;REVB=-0.00715105;RO=103;SAF=125;SAR=61;SRF=68;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00888014;STB=0.505016;TYPE=snp;VARB=0.010732;OID=.;OPOS=133036704;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:291:285:103:106:186:179:61:125:68:35:57:122:71:35 chr2 133036714 . A G 897.48 PASS AO=177;DP=289;FAO=170;FDP=280;FR=.;FRO=110;FSAF=116;FSAR=54;FSRF=71;FSRR=39;FWDB=0.0132811;FXX=0.00709195;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.3976;QD=12.8212;RBI=0.0397887;REFB=-0.00247118;REVB=0.0375067;RO=109;SAF=118;SAR=59;SRF=70;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0193152;STB=0.516516;TYPE=snp;VARB=0.00241255;OID=.;OPOS=133036714;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:289:280:109:110:177:170:59:118:70:39:54:116:71:39 chr2 133036716 . G T 850.84 PASS AO=83;DP=289;FAO=169;FDP=272;FR=.,HEALED;FRO=103;FSAF=116;FSAR=53;FSRF=66;FSRR=37;FWDB=0.0520885;FXX=0.0250887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.444;QD=12.5123;RBI=0.0593113;REFB=-0.0917428;REVB=0.0283658;RO=106;SAF=24;SAR=59;SRF=68;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.358606;STB=0.519763;TYPE=snp;VARB=0.0346774;OID=.;OPOS=133036716;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:288:272:106:103:83:169:59:24:68:38:53:116:66:37 chr2 133036742 . T C 649.59 PASS AO=142;DP=250;FAO=135;FDP=241;FR=.;FRO=106;FSAF=99;FSAR=36;FSRF=61;FSRR=45;FWDB=0.0121416;FXX=0.00823011;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.6149;QD=10.7815;RBI=0.025339;REFB=-0.0236861;REVB=0.0222407;RO=106;SAF=101;SAR=41;SRF=61;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122493;STB=0.58196;TYPE=snp;VARB=0.0199264;OID=.;OPOS=133036742;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:250:241:106:106:142:135:41:101:61:45:36:99:61:45 chr2 133036757 . A G 301.92 PASS AO=90;DP=195;FAO=82;FDP=187;FR=.;FRO=105;FSAF=68;FSAR=14;FSRF=65;FSRR=40;FWDB=0.0442232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.9313;QD=6.45819;RBI=0.0445429;REFB=-0.0159068;REVB=-0.0053269;RO=104;SAF=71;SAR=19;SRF=64;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215233;STB=0.663489;TYPE=snp;VARB=0.0236183;OID=.;OPOS=133036757;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:187:104:105:90:82:19:71:64:40:14:68:65:40 chr2 133036777 . A G 30.34 PASS AO=22;DP=104;FAO=22;FDP=105;FR=.;FRO=83;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=53;FSRR=30;FWDB=-0.0103048;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.293;QD=1.15592;RBI=0.0213642;REFB=0.00067889;REVB=-0.0187147;RO=81;SAF=11;SAR=11;SRF=51;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164509;STB=0.609429;TYPE=snp;VARB=-0.00297513;OID=.;OPOS=133036777;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:104:105:81:83:22:22:11:11:51:30:11:11:53:30 chr2 133036787 . C A 67.95 PASS AO=24;DP=80;FAO=26;FDP=81;FR=.;FRO=55;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=31;FSRR=24;FWDB=0.0141745;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.336;QD=3.35545;RBI=0.0191101;REFB=-0.00469408;REVB=-0.0128171;RO=56;SAF=13;SAR=11;SRF=32;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0355556;STB=0.543177;TYPE=snp;VARB=0.0148309;OID=.;OPOS=133036787;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:80:81:56:55:24:26:11:13:32:24:13:13:31:24 chr2 133036812 . T C 12.23 PASS AO=10;DP=60;FAO=10;FDP=60;FR=.;FRO=50;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=20;FSRR=30;FWDB=0.0566056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.662;QD=0.815597;RBI=0.0590046;REFB=0.000430476;REVB=0.0166537;RO=49;SAF=6;SAR=4;SRF=20;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233066;STB=0.662027;TYPE=snp;VARB=-0.00898158;OID=.;OPOS=133036812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:60:60:49:50:10:10:4:6:20:29:4:6:20:30 chr2 133037140 . G A 25.89 PASS AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.0130893;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.92;QD=8.63103;RBI=0.0365826;REFB=0.00660269;REVB=0.0341608;RO=7;SAF=4;SAR=1;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.478981;STB=0.798799;TYPE=snp;VARB=-0.00648514;OID=.;OPOS=133037140;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:12:12:7:7:5:5:1:4:2:5:1:4:2:5 chr2 133037153 . C T 30.22 PASS AO=7;DP=18;FAO=7;FDP=18;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.0438958;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.9529;QD=6.71517;RBI=0.045569;REFB=0.00101045;REVB=-0.0122348;RO=11;SAF=6;SAR=1;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.312896;STB=0.69701;TYPE=snp;VARB=0.000485541;OID=.;OPOS=133037153;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:18:18:11:11:7:7:1:6:7:4:1:6:7:4 chr2 133037226 . T C 40.05 PASS AO=13;DP=44;FAO=14;FDP=44;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=0.0100365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.138;QD=3.64077;RBI=0.0117419;REFB=0.00163613;REVB=-0.00609444;RO=23;SAF=8;SAR=5;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.04243;STB=0.503307;TYPE=snp;VARB=-0.00172706;OID=.;OPOS=133037226;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:44:44:23:30:13:14:5:8:15:8:6:8:17:13 chr2 133037311 . C A 123.94 PASS AO=41;DP=112;FAO=41;FDP=112;FR=.;FRO=71;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=35;FSRR=36;FWDB=-0.00403894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.77;QD=4.42645;RBI=0.00406771;REFB=-0.00840657;REVB=-0.000482893;RO=71;SAF=23;SAR=18;SRF=35;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.075682;STB=0.543286;TYPE=snp;VARB=0.0226786;OID=.;OPOS=133037311;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:71:71:41:41:18:23:35:36:18:23:35:36 chr2 133037397 . C T 232.31 PASS AO=50;DP=101;FAO=52;FDP=102;FR=.;FRO=50;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=-0.00246518;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.152;QD=9.11007;RBI=0.0165961;REFB=-0.0024756;REVB=0.016412;RO=49;SAF=20;SAR=30;SRF=23;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0637089;STB=0.52832;TYPE=snp;VARB=0.00234324;OID=.;OPOS=133037397;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:102:49:50:50:52:30:20:23:26:30:22:24:26 chr2 133037812 . A G 355.13 PASS AO=36;DP=39;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0296518;FXX=0.0749813;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.554;QD=38.3919;RBI=0.0445426;REFB=0;REVB=0.0332388;RO=0;SAF=12;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0024719;OID=.;OPOS=133037812;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:39:37:0:0:36:37:24:12:0:0:25:12:0:0 chr2 133038166 . T C 41.74 PASS AO=13;DP=35;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.0180353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0289;QD=4.91018;RBI=0.0189712;REFB=0.000924719;REVB=-0.00588522;RO=22;SAF=9;SAR=4;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260252;STB=0.639763;TYPE=snp;VARB=-0.00166951;OID=.;OPOS=133038166;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:35:34:22:22:13:12:4:9:10:12:4:8:10:12 chr2 133038179 . A C 35.55 PASS AO=13;DP=40;FAO=12;FDP=39;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.0486879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.1758;QD=3.64607;RBI=0.0842942;REFB=-0.0241687;REVB=-0.0688113;RO=27;SAF=9;SAR=4;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.283347;STB=0.654912;TYPE=snp;VARB=0.0637731;OID=.;OPOS=133038179;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:40:39:27:27:13:12:4:9:12:15:4:8:12:15 chr2 133038180 . G T 18.49 PASS AO=8;DP=40;FAO=8;FDP=35;FR=.;FRO=27;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.0120909;FXX=0.102538;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.491;QD=2.11341;RBI=0.0137574;REFB=-0.0162399;REVB=0.00656328;RO=27;SAF=4;SAR=4;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0661942;STB=0.542751;TYPE=snp;VARB=0.0672438;OID=.;OPOS=133038180;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:40:35:27:27:8:8:4:4:12:15:4:4:12:15 chr2 133038188 . T C 53.99 PASS AO=16;DP=45;FAO=17;FDP=47;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.0197936;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.1896;QD=4.59478;RBI=0.0502608;REFB=-0.0207171;REVB=-0.0461991;RO=29;SAF=12;SAR=4;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280271;STB=0.706264;TYPE=snp;VARB=0.0222879;OID=.;OPOS=133038188;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:45:47:29:30:16:17:4:12:15:14:4:13:14:16 chr2 133038228 . C T 78.13 PASS AO=26;DP=67;FAO=24;FDP=65;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=26;FWDB=0.0210374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.822;QD=4.80823;RBI=0.0424529;REFB=-0.00845453;REVB=-0.0368738;RO=41;SAF=18;SAR=8;SRF=15;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.346286;STB=0.686716;TYPE=snp;VARB=0.0155514;OID=.;OPOS=133038228;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:67:65:41:41:26:24:8:18:15:26:8:16:15:26 chr2 133038234 . C T 56.75 PASS AO=21;DP=66;FAO=21;FDP=67;FR=.;FRO=46;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=26;FWDB=0.00532839;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.434;QD=3.38807;RBI=0.0562085;REFB=-0.0181407;REVB=-0.0559553;RO=44;SAF=13;SAR=8;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164389;STB=0.625943;TYPE=snp;VARB=0.0219848;OID=.;OPOS=133038234;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:66:67:44:46:21:21:8:13:21:23:8:13:20:26 chr2 133038264 . G A 66.53 PASS AO=23;DP=70;FAO=23;FDP=69;FR=.;FRO=46;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=30;FWDB=0.0380858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9184;QD=3.85683;RBI=0.042085;REFB=0.0214162;REVB=0.0179059;RO=47;SAF=12;SAR=11;SRF=17;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182787;STB=0.614904;TYPE=snp;VARB=-0.0179331;OID=.;OPOS=133038264;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:70:69:47:46:23:23:11:12:17:30:11:12:16:30 chr2 133038275 . C T 55.47 PASS AO=21;DP=69;FAO=21;FDP=68;FR=.;FRO=47;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=32;FWDB=0.000186881;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=246.891;QD=3.26311;RBI=0.0198228;REFB=0.00456391;REVB=0.0198219;RO=46;SAF=10;SAR=11;SRF=16;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151494;STB=0.60983;TYPE=snp;VARB=-0.00685627;OID=.;OPOS=133038275;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:69:68:46:47:21:21:11:10:16:30:11:10:15:32 chr2 133038280 . A C 53.01 PASS AO=21;DP=66;FAO=20;FDP=65;FR=.;FRO=45;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=34;FWDB=-0.00610161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.187;QD=3.26185;RBI=0.0161865;REFB=-0.00367337;REVB=-0.0149924;RO=44;SAF=11;SAR=10;SRF=10;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.342133;STB=0.676768;TYPE=snp;VARB=0.00344172;OID=.;OPOS=133038280;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:66:65:44:45:21:20:10:11:10:34:10:10:11:34 chr2 133038366 . C T 183.44 PASS AO=28;DP=61;FAO=31;FDP=48;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=23;FSRF=2;FSRR=15;FWDB=0.0255113;FXX=0.058812;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6664;QD=15.2864;RBI=0.0283318;REFB=-0.0334359;REVB=0.0123233;RO=0;SAF=7;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.569247;TYPE=snp;VARB=0.017651;OID=.;OPOS=133038366;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:33:48:0:17:28:31:21:7:0:0:23:8:2:15 chr2 133038383 . G A 46.51 PASS AO=15;DP=45;FAO=15;FDP=45;FR=.;FRO=30;FSAF=1;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=-0.0669345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.379;QD=4.1338;RBI=0.0669392;REFB=-0.0257824;REVB=0.000801574;RO=29;SAF=1;SAR=14;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.519099;STB=0.818584;TYPE=snp;VARB=0.00823214;OID=.;OPOS=133038383;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:45:45:29:30:15:15:14:1:10:19:14:1:10:20 chr2 133038384 . C T 53.43 PASS AO=16;DP=44;FAO=16;FDP=45;FR=.;FRO=29;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=20;FWDB=-0.0335066;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=177.019;QD=4.74947;RBI=0.0335365;REFB=-0.0185992;REVB=-0.001417;RO=28;SAF=2;SAR=14;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.330708;STB=0.693403;TYPE=snp;VARB=0.0136412;OID=.;OPOS=133038384;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:44:45:28:29:16:16:14:2:9:19:14:2:9:20 chr2 133038400 . GA G 40.26 PASS AO=17;DP=59;FAO=19;FDP=47;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.114809;FXX=0.020829;HRUN=5;LEN=1;MLLD=16.7293;QD=3.426;RBI=0.137199;REFB=0.0997617;REVB=-0.0751163;RO=25;SAF=7;SAR=10;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0997197;STB=0.515497;TYPE=del;VARB=-0.125494;OID=.;OPOS=133038401;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:17:48:19:47:28:7:12:11:17:40:25:7:10:8:17 chr2 133038419 . AGG AG,AGC 419.68 PASS AO=25,20;DP=61;FAO=40,20;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=23,7;FSAR=17,13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.337314,0.00533582;FXX=0.0769112;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=13.516,198.416;QD=27.979;RBI=0.345994,0.0112281;REFB=-0.0270798,-0.0219213;REVB=0.077017,0.00987925;RO=10;SAF=12,7;SAR=13,13;SRF=8;SRR=2;SSEN=0.331522,0;SSEP=0.346804,0;SSSB=-0.16641,-0.270967;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.133091,-0.00214802;OID=.,.;OPOS=133038420,133038421;OREF=G,G;OALT=-,C;OMAPALT=AG,AGC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:25,20:60:40,20:60:0:23,7:17,13:0:0:59:10:12,7:13,13:8:2 chr2 133038491 . T C 26.02 PASS AO=24;DP=120;FAO=24;FDP=124;FR=.;FRO=100;FSAF=19;FSAR=5;FSRF=59;FSRR=41;FWDB=-0.0378629;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.499;QD=0.839215;RBI=0.0378725;REFB=-0.00612196;REVB=0.00084911;RO=96;SAF=18;SAR=6;SRF=56;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235924;STB=0.69128;TYPE=snp;VARB=0.0321591;OID=.;OPOS=133038491;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:120:124:96:100:24:24:6:18:56:40:5:19:59:41 chr2 133038543 . A G 21.45 PASS AO=29;DP=165;FAO=28;FDP=166;FR=.;FRO=138;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=86;FSRR=52;FWDB=-0.00526861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.975;QD=0.516859;RBI=0.0141175;REFB=0.00375528;REVB=0.0130976;RO=132;SAF=18;SAR=11;SRF=82;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000710621;STB=0.517613;TYPE=snp;VARB=-0.0263849;OID=.;OPOS=133038543;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:165:166:132:138:29:28:11:18:82:50:10:18:86:52 chr2 133038569 . T C 40.38 PASS AO=39;DP=193;FAO=38;FDP=193;FR=.;FRO=155;FSAF=27;FSAR=11;FSRF=91;FSRR=64;FWDB=-0.0117214;FXX=0.0153053;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.166;QD=0.836859;RBI=0.020309;REFB=-0.00398369;REVB=-0.016585;RO=152;SAF=27;SAR=12;SRF=90;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139328;STB=0.609329;TYPE=snp;VARB=0.0182747;OID=.;OPOS=133038569;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:193:193:152:155:39:38:12:27:90:62:11:27:91:64 chr2 133038580 . C T 41.46 PASS AO=40;DP=197;FAO=39;FDP=196;FR=.;FRO=157;FSAF=26;FSAR=13;FSRF=85;FSRR=72;FWDB=0.0267514;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=135.772;QD=0.846192;RBI=0.0438133;REFB=0.00322167;REVB=0.0346982;RO=153;SAF=26;SAR=14;SRF=82;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150612;STB=0.604927;TYPE=snp;VARB=-0.00843063;OID=.;OPOS=133038580;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:197:196:153:157:40:39:14:26:82:71:13:26:85:72 chr2 133038625 . G A 42.77 PASS AO=35;DP=170;FAO=35;FDP=167;FR=.;FRO=132;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=54;FSRR=78;FWDB=0.00754288;FXX=0.0118336;HRUN=3;LEN=1;MLLD=245.644;QD=1.02453;RBI=0.0126615;REFB=-0.00929047;REVB=-0.0101695;RO=129;SAF=18;SAR=17;SRF=52;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141577;STB=0.582776;TYPE=snp;VARB=0.0348985;OID=.;OPOS=133038625;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:170:167:129:132:35:35:17:18:52:77:17:18:54:78 chr2 133038686 . A G 634.62 PASS AO=117;DP=185;FAO=115;FDP=182;FR=.;FRO=67;FSAF=5;FSAR=110;FSRF=14;FSRR=53;FWDB=-0.0209616;FXX=0.00546418;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.994;QD=13.9477;RBI=0.0212648;REFB=-0.029826;REVB=0.00357823;RO=63;SAF=5;SAR=112;SRF=13;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.386836;STB=0.719398;TYPE=snp;VARB=0.0112059;OID=.;OPOS=133038686;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:182:63:67:117:115:112:5:13:50:110:5:14:53 chr2 133038693 . A T 377.12 PASS AO=89;DP=178;FAO=88;FDP=176;FR=.;FRO=88;FSAF=1;FSAR=87;FSRF=17;FSRR=71;FWDB=-0.0240008;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=230.231;QD=8.5708;RBI=0.024632;REFB=-0.00866325;REVB=-0.00554062;RO=89;SAF=1;SAR=88;SRF=17;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.700687;STB=0.9082;TYPE=snp;VARB=0.00700379;OID=.;OPOS=133038693;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:176:89:88:89:88:88:1:17:72:87:1:17:71 chr2 133038724 . T C 141.07 PASS AO=44;DP=116;FAO=44;FDP=115;FR=.;FRO=71;FSAF=1;FSAR=43;FSRF=11;FSRR=60;FWDB=-0.0702822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.372;QD=4.90677;RBI=0.0725058;REFB=-0.0300204;REVB=-0.0178185;RO=59;SAF=1;SAR=43;SRF=11;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.587427;STB=0.833371;TYPE=snp;VARB=0.0398945;OID=.;OPOS=133038724;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:115:59:71:44:44:43:1:11:48:43:1:11:60 chr2 133038728 . C G 53.54 PASS AO=22;DP=71;FAO=21;FDP=70;FR=.;FRO=49;FSAF=2;FSAR=19;FSRF=7;FSRR=42;FWDB=0.0702862;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.4603;QD=3.05956;RBI=0.0704694;REFB=-0.00759404;REVB=0.00507749;RO=48;SAF=2;SAR=20;SRF=7;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159102;STB=0.583528;TYPE=snp;VARB=0.0154095;OID=.;OPOS=133038728;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:71:70:48:49:22:21:20:2:7:41:19:2:7:42 chr2 133038729 . T G 615.94 PASS AO=66;DP=66;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.175;QD=37.9038;RBI=0.0557013;REFB=0;REVB=0.0492381;RO=0;SAF=9;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.04324e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000195259;OID=.;OPOS=133038729;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:66:65:0:0:66:65:57:9:0:0:56:9:0:0 chr2 133038740 . G A 39.82 PASS AO=17;DP=63;FAO=17;FDP=62;FR=.;FRO=45;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=5;FSRR=40;FWDB=-0.101498;FXX=0.0158705;HRUN=3;LEN=1;MLLD=93.1961;QD=2.56871;RBI=0.102943;REFB=-0.00327858;REVB=0.0171882;RO=46;SAF=2;SAR=15;SRF=5;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0266531;STB=0.511614;TYPE=snp;VARB=0.0129243;OID=.;OPOS=133038740;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:63:62:46:45:17:17:15:2:5:41:15:2:5:40 chr2 133038745 . T C 35.66 PASS AO=16;DP=62;FAO=16;FDP=61;FR=.;FRO=45;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=40;FWDB=-0.0370616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.109;QD=2.33833;RBI=0.0397821;REFB=0.0199045;REVB=0.0144588;RO=45;SAF=2;SAR=14;SRF=5;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0399504;STB=0.524243;TYPE=snp;VARB=-0.0380618;OID=.;OPOS=133038745;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:62:61:45:45:16:16:14:2:5:40:14:2:5:40 chr2 133038886 . A G 170.86 PASS AO=19;DP=19;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.082;QD=37.9677;RBI=0.032178;REFB=0;REVB=0.0248535;RO=0;SAF=15;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.00629e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000431688;OID=.;OPOS=133038886;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:19:18:0:0:19:18:4:15:0:0:4:14:0:0 chr2 133039014 . A G 48.51 PASS AO=19;DP=64;FAO=19;FDP=64;FR=.;FRO=45;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=-0.0197444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.242;QD=3.03186;RBI=0.030642;REFB=-0.00199672;REVB=0.0234326;RO=45;SAF=10;SAR=9;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00828337;STB=0.504945;TYPE=snp;VARB=0.00935171;OID=.;OPOS=133039014;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:64:64:45:45:19:19:9:10:24:21:9:10:24:21 chr2 133039048 . A G 41.63 PASS AO=23;DP=79;FAO=20;FDP=76;FR=.;FRO=56;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=31;FSRR=25;FWDB=0.00543425;FXX=0.0731618;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.804;QD=2.19117;RBI=0.00559419;REFB=-0.0111151;REVB=0.00132814;RO=54;SAF=14;SAR=9;SRF=29;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0866965;STB=0.575841;TYPE=snp;VARB=0.0395644;OID=.;OPOS=133039048;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:79:76:54:56:23:20:9:14:29:25:11:9:31:25 chr2 133039061 . A G 17.11 PASS AO=14;DP=83;FAO=15;FDP=84;FR=.;FRO=69;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=39;FSRR=30;FWDB=-0.0125518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.524;QD=0.814731;RBI=0.032385;REFB=0.00515725;REVB=0.0298536;RO=65;SAF=7;SAR=7;SRF=38;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106444;STB=0.580336;TYPE=snp;VARB=-0.0228871;OID=.;OPOS=133039061;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:83:84:65:69:14:15:7:7:38:27:8:7:39:30 chr2 133039063 . T C 17.93 PASS AO=15;DP=82;FAO=15;FDP=82;FR=.;FRO=67;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=38;FSRR=29;FWDB=0.0196219;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.579;QD=0.874538;RBI=0.0205653;REFB=0.000502597;REVB=0.00615731;RO=67;SAF=7;SAR=8;SRF=38;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125747;STB=0.581476;TYPE=snp;VARB=-0.00129911;OID=.;OPOS=133039063;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:82:82:67:67:15:15:8:7:38:29:8:7:38:29 chr2 133039074 . A G 13.16 PASS AO=12;DP=74;FAO=12;FDP=73;FR=.;FRO=61;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=38;FSRR=23;FWDB=0.000198349;FXX=0.0394685;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.0423;QD=0.720924;RBI=0.0286073;REFB=-0.00163186;REVB=-0.0286066;RO=61;SAF=7;SAR=5;SRF=38;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0514748;STB=0.534385;TYPE=snp;VARB=0.00658646;OID=.;OPOS=133039074;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:74:73:61:61:12:12:5:7:38:23:5:7:38:23 chr2 133039075 . T C 16.71 PASS AO=12;DP=75;FAO=14;FDP=75;FR=.;FRO=61;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=38;FSRR=23;FWDB=-0.00545895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.8;QD=0.891187;RBI=0.00607129;REFB=-0.00118624;REVB=-0.00265715;RO=60;SAF=7;SAR=5;SRF=37;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0431975;STB=0.517429;TYPE=snp;VARB=0.00663472;OID=.;OPOS=133039075;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:75:75:60:61:12:14:5:7:37:23:5:9:38:23 chr2 133039082 . C A 12.26 PASS AO=13;DP=75;FAO=12;FDP=74;FR=.;FRO=62;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=38;FSRR=24;FWDB=0.00943381;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=233.928;QD=0.662702;RBI=0.0104651;REFB=0.00114537;REVB=0.00453014;RO=62;SAF=9;SAR=4;SRF=38;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108852;STB=0.548936;TYPE=snp;VARB=-0.01049;OID=.;OPOS=133039082;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:75:74:62:62:13:12:4:9:38:24:4:8:38:24 chr2 133039083 . C T 17.96 PASS AO=15;DP=77;FAO=14;FDP=75;FR=.;FRO=61;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=37;FSRR=24;FWDB=0.00581445;FXX=0.0131562;HRUN=3;LEN=1;MLLD=184.773;QD=0.958042;RBI=0.0141419;REFB=-0.000688081;REVB=0.0128913;RO=60;SAF=11;SAR=4;SRF=36;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186349;STB=0.598143;TYPE=snp;VARB=0.00890083;OID=.;OPOS=133039083;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:77:75:60:61:15:14:4:11:36:24:4:10:37:24 chr2 133039090 . T C 110.28 PASS AO=32;DP=80;FAO=31;FDP=78;FR=.;FRO=47;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=28;FSRR=19;FWDB=-0.0124991;FXX=0.0126566;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.981;QD=5.65548;RBI=0.0175205;REFB=0.00286217;REVB=0.0122776;RO=47;SAF=21;SAR=11;SRF=28;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0682824;STB=0.531894;TYPE=snp;VARB=-0.0051977;OID=.;OPOS=133039090;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:78:47:47:32:31:11:21:28:19:11:20:28:19 chr2 133039101 . A G 39.6 PASS AO=14;DP=79;FAO=18;FDP=74;FR=.,HEALED;FRO=55;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=32;FSRR=23;FWDB=-0.0235876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.8793;QD=2.14054;RBI=0.0447707;REFB=-0.00774432;REVB=-0.0380532;RO=24;SAF=3;SAR=11;SRF=1;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.353637;STB=0.643022;TYPE=snp;VARB=0.0347009;OID=.;OPOS=133039101;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:71:74:24:55:14:18:11:3:1:23:11:7:32:23 chr2 133039105 . T C 37.36 PASS AO=19;DP=77;FAO=19;FDP=76;FR=.;FRO=57;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=32;FSRR=25;FWDB=-0.0645712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9164;QD=1.96643;RBI=0.0802072;REFB=-0.0213936;REVB=0.0475791;RO=58;SAF=6;SAR=13;SRF=33;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.309722;STB=0.684017;TYPE=snp;VARB=0.0711992;OID=.;OPOS=133039105;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:77:76:58:57:19:19:13:6:33:25:13:6:32:25 chr2 133039128 . A G 29.1 PASS AO=16;DP=74;FAO=17;FDP=75;FR=.;FRO=58;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=34;FSRR=24;FWDB=-0.00270995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9747;QD=1.55201;RBI=0.0203893;REFB=-0.00546434;REVB=-0.0202084;RO=57;SAF=3;SAR=13;SRF=34;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.504382;STB=0.769156;TYPE=snp;VARB=0.0338069;OID=.;OPOS=133039128;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:74:75:57:58:16:17:13:3:34:23:13:4:34:24 chr2 133039132 . T C 34.14 PASS AO=18;DP=74;FAO=18;FDP=74;FR=.;FRO=56;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=34;FSRR=22;FWDB=-0.0131118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.041;QD=1.84538;RBI=0.0188809;REFB=-0.00353146;REVB=-0.0135856;RO=56;SAF=5;SAR=13;SRF=34;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.3972;STB=0.743138;TYPE=snp;VARB=0.0146738;OID=.;OPOS=133039132;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:74:74:56:56:18:18:13:5:34:22:13:5:34:22 chr2 133039135 . G T 27.47 PASS AO=17;DP=72;FAO=16;FDP=72;FR=.;FRO=56;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=34;FSRR=22;FWDB=0.00518214;FXX=0.0270234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.164;QD=1.52631;RBI=0.0210046;REFB=-0.0041589;REVB=-0.0203553;RO=53;SAF=4;SAR=13;SRF=32;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.44657;STB=0.820425;TYPE=snp;VARB=0.0224687;OID=.;OPOS=133039135;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:72:72:53:56:17:16:13:4:32:21:13:3:34:22 chr2 133039137 . A G 23.78 PASS AO=17;DP=75;FAO=15;FDP=73;FR=.;FRO=58;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=35;FSRR=23;FWDB=0.0457095;FXX=0.0135117;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.3736;QD=1.30309;RBI=0.0459578;REFB=0.00375618;REVB=0.00477091;RO=48;SAF=5;SAR=12;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.281828;STB=0.812428;TYPE=snp;VARB=-0.0213873;OID=.;OPOS=133039137;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:75:73:48:58:17:15:12:5:25:23:12:3:35:23 chr2 133039143 . C T 35.12 PASS AO=21;DP=85;FAO=20;FDP=85;FR=.;FRO=65;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=33;FSRR=32;FWDB=-0.0168145;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.5544;QD=1.65282;RBI=0.0225457;REFB=-0.00594273;REVB=-0.0150194;RO=64;SAF=13;SAR=8;SRF=32;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148436;STB=0.571357;TYPE=snp;VARB=0.0304582;OID=.;OPOS=133039143;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:85:85:64:65:21:20:8:13:32:32:8:12:33:32 chr2 133039156 . T C 244.19 PASS AO=49;DP=80;FAO=47;FDP=81;FR=.;FRO=34;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=-0.00323216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.614;QD=12.059;RBI=0.00989774;REFB=-0.0166177;REVB=-0.00935513;RO=31;SAF=26;SAR=23;SRF=21;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10562;STB=0.557405;TYPE=snp;VARB=0.0130818;OID=.;OPOS=133039156;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:81:31:34:49:47:23:26:21:10:23:24:22:12 chr2 133039157 . G A 25.54 PASS AO=18;DP=82;FAO=17;FDP=81;FR=.;FRO=64;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=37;FSRR=27;FWDB=-0.0476497;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.439;QD=1.26117;RBI=0.0485984;REFB=-0.01426;REVB=0.00955567;RO=64;SAF=10;SAR=8;SRF=37;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0286348;STB=0.538754;TYPE=snp;VARB=0.0274222;OID=.;OPOS=133039157;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:82:81:64:64:18:17:8:10:37:27:8:9:37:27 chr2 133039164 . C T 32.33 PASS AO=20;DP=84;FAO=19;FDP=83;FR=.;FRO=64;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=36;FSRR=28;FWDB=0.00970849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.798;QD=1.55804;RBI=0.0188933;REFB=-0.0119737;REVB=-0.0162081;RO=62;SAF=13;SAR=7;SRF=34;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130437;STB=0.555496;TYPE=snp;VARB=0.040561;OID=.;OPOS=133039164;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:84:83:62:64:20:19:7:13:34:28:7:12:36:28 chr2 133039166 . T C 77.41 PASS AO=27;DP=77;FAO=26;FDP=75;FR=.;FRO=49;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=32;FSRR=17;FWDB=-0.0319436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.5461;QD=4.1284;RBI=0.0891864;REFB=-0.00338008;REVB=-0.0832695;RO=50;SAF=15;SAR=12;SRF=33;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12085;STB=0.576144;TYPE=snp;VARB=0.0098393;OID=.;OPOS=133039166;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:77:75:50:49:27:26:12:15:33:17:12:14:32:17 chr2 133039171 . C G 60.37 PASS AO=24;DP=77;FAO=23;FDP=74;FR=.;FRO=51;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=34;FSRR=17;FWDB=0.0117473;FXX=0.0133316;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.96;QD=3.26323;RBI=0.0245717;REFB=-0.00762606;REVB=0.0215817;RO=51;SAF=14;SAR=10;SRF=35;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12635;STB=0.572412;TYPE=snp;VARB=0.0124882;OID=.;OPOS=133039171;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:77:74:51:51:24:23:10:14:35:16:10:13:34:17 chr2 133039176 . A G 54.04 PASS AO=24;DP=78;FAO=22;FDP=75;FR=.;FRO=53;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=36;FSRR=17;FWDB=0.00106724;FXX=0.0259707;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.878;QD=2.88203;RBI=0.0224339;REFB=0.000406195;REVB=0.0224085;RO=53;SAF=13;SAR=11;SRF=37;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189156;STB=0.566053;TYPE=snp;VARB=-0.00107849;OID=.;OPOS=133039176;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:78:75:53:53:24:22:11:13:37:16:9:13:36:17 chr2 133039221 . C T 57.33 PASS AO=20;DP=58;FAO=19;FDP=56;FR=.;FRO=37;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=27;FSRR=10;FWDB=-0.0126802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.0024;QD=4.0948;RBI=0.013525;REFB=-0.0089365;REVB=-0.00470513;RO=37;SAF=15;SAR=5;SRF=28;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0100676;STB=0.506018;TYPE=snp;VARB=0.0599214;OID=.;OPOS=133039221;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:58:56:37:37:20:19:5:15:28:9:5:14:27:10 chr2 133039222 . G A 94.63 PASS AO=24;DP=57;FAO=24;FDP=55;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=25;FSRR=6;FWDB=0.00463053;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.831;QD=6.88194;RBI=0.0132534;REFB=-0.0144823;REVB=0.0124182;RO=33;SAF=15;SAR=9;SRF=27;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225671;STB=0.615299;TYPE=snp;VARB=0.0074817;OID=.;OPOS=133039222;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:57:55:33:31:24:24:9:15:27:6:9:15:25:6 chr2 133429702 . T C 95.49 PASS AO=45;DP=152;FAO=44;FDP=153;FR=.;FRO=109;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=47;FSRR=62;FWDB=-0.000994398;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.3687;QD=2.49646;RBI=0.0090858;REFB=-0.00690438;REVB=-0.00903122;RO=103;SAF=17;SAR=28;SRF=44;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.061427;STB=0.550538;TYPE=snp;VARB=0.0095629;OID=.;OPOS=133429702;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:152:153:103:109:45:44:28:17:44:59:28:16:47:62 chr2 133489401 . A G 1738.2 PASS AO=182;DP=182;FAO=182;FDP=182;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00369532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.7487;QD=38.2022;RBI=0.0333174;REFB=0;REVB=-0.0331118;RO=0;SAF=94;SAR=88;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.11137e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00013231;OID=.;OPOS=133489401;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:82:182:182:0:0:182:182:88:94:0:0:88:94:0:0 chr2 133539566 . G A 2998.97 PASS AO=314;DP=317;FAO=314;FDP=314;FR=.;FRO=0;FSAF=109;FSAR=205;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222903;FXX=0.00946342;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.187;QD=38.2034;RBI=0.0239573;REFB=0.00406213;REVB=0.00878025;RO=1;SAF=109;SAR=205;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00435588;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.33484e-06;OID=.;OPOS=133539566;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:317:314:1:0:314:314:205:109:1:0:205:109:0:0 chr2 133540550 . G A 709.5 PASS AO=130;DP=292;FAO=168;FDP=329;FR=.;FRO=161;FSAF=94;FSAR=74;FSRF=99;FSRR=62;FWDB=0.0408717;FXX=0.00303021;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.454;QD=8.62619;RBI=0.0495578;REFB=-0.0521238;REVB=0.0280263;RO=130;SAF=59;SAR=71;SRF=67;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.056236;STB=0.52767;TYPE=snp;VARB=0.0490557;OID=.;OPOS=133540550;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:292:329:130:161:130:168:71:59:67:63:74:94:99:62 chr2 133540605 . G T 1941.2 PASS AO=197;DP=203;FAO=207;FDP=207;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0408575;FXX=0.014285;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.3472;QD=37.5112;RBI=0.055475;REFB=-0.108325;REVB=0.0375253;RO=6;SAF=94;SAR=103;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106756;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00139224;OID=.;OPOS=133540605;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:203:207:6:0:197:207:103:94:4:2:106:101:0:0 chr2 133541444 . T C 2292.3 PASS AO=237;DP=242;FAO=240;FDP=240;FR=.;FRO=0;FSAF=124;FSAR=116;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0258029;FXX=0.0123452;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.759;QD=38.205;RBI=0.0314623;REFB=0;REVB=0.0180025;RO=0;SAF=122;SAR=115;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.56135e-05;OID=.;OPOS=133541444;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:242:240:0:0:237:240:115:122:0:0:116:124:0:0 chr2 133541454 . A G 2123.82 PASS AO=228;DP=232;FAO=230;FDP=233;FR=.;FRO=3;FSAF=120;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0169664;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.403;QD=36.4604;RBI=0.0204119;REFB=-0.089692;REVB=-0.0113485;RO=3;SAF=120;SAR=108;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0130504;STB=0.506726;TYPE=snp;VARB=0.000134009;OID=.;OPOS=133541454;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:232:233:3:3:228:230:108:120:0:3:110:120:0:3 chr2 133541575 . C T 697.35 PASS AO=71;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0419454;FXX=0.0519413;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.123;QD=38.2107;RBI=0.0426757;REFB=0;REVB=0.00786092;RO=0;SAF=32;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.41183e-05;OID=.;OPOS=133541575;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:73:73:0:0:71:73:39:32:0:0:40:33:0:0 chr2 133542014 . T C 1316.24 PASS AO=99;DP=145;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.122334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.7878;QD=37.0772;RBI=0.1344;REFB=-0.0250217;REVB=0.0556576;RO=1;SAF=75;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00628369;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000784751;OID=.;OPOS=133542014;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:101:142:1:0:99:142:24:75:1:0:64:78:0:0 chr2 133542545 . G A 471.98 PASS AO=48;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00722872;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.043;QD=38.5292;RBI=0.00901384;REFB=0;REVB=-0.00538469;RO=0;SAF=17;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.94521e-05;OID=.;OPOS=133542545;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:48:49:0:0:48:49:31:17:0:0:32:17:0:0 chr2 133542585 . C G 412.77 PASS AO=45;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.047635;FXX=0.0961354;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.829;QD=35.1297;RBI=0.0597907;REFB=-0.141447;REVB=-0.0361364;RO=1;SAF=28;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0268394;STB=0.514279;TYPE=snp;VARB=0.00178844;OID=.;OPOS=133542585;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:47:47:1:1:45:46:17:28:0:1:17:29:0:1 chr2 133554288 . A G 1204.4 PASS AO=123;DP=126;FAO=134;FDP=136;FR=.;FRO=2;FSAF=60;FSAR=74;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.122941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.0107;QD=35.4236;RBI=0.125157;REFB=-0.054318;REVB=0.0234516;RO=3;SAF=51;SAR=72;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0117118;STB=0.500776;TYPE=snp;VARB=0.00949891;OID=.;OPOS=133554288;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:126:136:3:2:123:134:72:51:2:1:74:60:1:1 chr2 134353706 . C T 300.96 PASS AO=80;DP=186;FAO=83;FDP=191;FR=.;FRO=108;FSAF=40;FSAR=43;FSRF=55;FSRR=53;FWDB=-0.00202033;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.842;QD=6.30279;RBI=0.00888153;REFB=-0.00367445;REVB=0.00864869;RO=106;SAF=39;SAR=41;SRF=53;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0127707;STB=0.515454;TYPE=snp;VARB=0.0040739;OID=.;OPOS=134353706;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:191:106:108:80:83:41:39:53:53:43:40:55:53 chr2 134353884 . C T 208.37 PASS AO=38;DP=64;FAO=39;FDP=65;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=27;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.00676152;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=274.367;QD=12.8227;RBI=0.00776949;REFB=0.00557265;REVB=0.00382711;RO=26;SAF=12;SAR=26;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118481;STB=0.568385;TYPE=snp;VARB=-0.00346359;OID=.;OPOS=134353884;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:64:65:26:26:38:39:26:12:12:14:27:12:12:14 chr2 134884700 . G A 680.27 PASS AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0171888;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.567;QD=37.7926;RBI=0.0188239;REFB=0;REVB=-0.00767344;RO=0;SAF=15;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.03417e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.97687e-05;OID=.;OPOS=134884700;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:72:72:0:0:72:72:57:15:0:0:57:15:0:0 chr2 135214259 . G A 182.29 PASS AO=39;DP=74;FAO=40;FDP=76;FR=.;FRO=36;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=-0.0115268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.3691;QD=9.59425;RBI=0.012432;REFB=-0.000771069;REVB=-0.0046571;RO=34;SAF=17;SAR=22;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0295789;STB=0.510605;TYPE=snp;VARB=-0.00057826;OID=.;OPOS=135214259;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:76:34:36:39:40:22:17:16:18:22:18:17:19 chr2 135710322 . A G 165.6 PASS AO=45;DP=105;FAO=45;FDP=105;FR=.;FRO=60;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=23;FSRR=37;FWDB=0.0258805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.5604;QD=6.30875;RBI=0.0264918;REFB=-0.0110579;REVB=0.00565802;RO=60;SAF=26;SAR=19;SRF=23;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195975;STB=0.609923;TYPE=snp;VARB=0.0161664;OID=.;OPOS=135710322;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:60:60:45:45:19:26:23:37:19:26:23:37 chr2 135711516 . C T 19.85 PASS AO=6;DP=25;FAO=6;FDP=22;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.0119151;FXX=0.119952;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.874;QD=3.60873;RBI=0.0192674;REFB=-0.000120394;REVB=-0.0151415;RO=13;SAF=2;SAR=4;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144953;STB=0.580369;TYPE=snp;VARB=0.00396848;OID=.;OPOS=135711516;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:25:22:13:16:6:6:4:2:6:7:4:2:7:9 chr2 135711657 . G A 368.27 PASS AO=62;DP=103;FAO=67;FDP=107;FR=.;FRO=40;FSAF=26;FSAR=41;FSRF=11;FSRR=29;FWDB=0.0196881;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.464;QD=13.767;RBI=0.0205305;REFB=-0.0142172;REVB=0.0058206;RO=39;SAF=25;SAR=37;SRF=11;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0913528;STB=0.545387;TYPE=snp;VARB=0.00961666;OID=.;OPOS=135711657;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:107:39:40:62:67:37:25:11:28:41:26:11:29 chr2 135740863 . C A 91.04 PASS AO=29;DP=80;FAO=29;FDP=80;FR=.;FRO=51;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=27;FSRR=24;FWDB=-0.0233292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.474;QD=4.55208;RBI=0.0242337;REFB=-0.00696327;REVB=-0.00655917;RO=51;SAF=11;SAR=18;SRF=27;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167758;STB=0.596791;TYPE=snp;VARB=0.00883629;OID=.;OPOS=135740863;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:80:80:51:51:29:29:18:11:27:24:18:11:27:24 chr2 135744007 . T C 146.97 PASS AO=28;DP=49;FAO=28;FDP=49;FR=.;FRO=21;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=2;FWDB=-0.0488805;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.746;QD=11.9974;RBI=0.0557074;REFB=0.0066864;REVB=0.0267209;RO=21;SAF=20;SAR=8;SRF=19;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19995;STB=0.609307;TYPE=snp;VARB=-0.00692571;OID=.;OPOS=135744007;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:49:49:21:21:28:28:8:20:19:2:8:20:19:2 chr2 135744416 . C G 253.72 PASS AO=46;DP=75;FAO=46;FDP=74;FR=.;FRO=28;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=22;FSRR=6;FWDB=-0.0241064;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.7804;QD=13.7143;RBI=0.0244696;REFB=-0.0160153;REVB=0.00420029;RO=28;SAF=24;SAR=22;SRF=22;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185877;STB=0.600908;TYPE=snp;VARB=0.012601;OID=.;OPOS=135744416;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:75:74:28:28:46:46:22:24:22:6:22:24:22:6 chr2 135745129 . G A 292.41 PASS AO=92;DP=235;FAO=92;FDP=235;FR=.;FRO=143;FSAF=48;FSAR=44;FSRF=60;FSRR=83;FWDB=0.00338722;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9125;QD=4.97713;RBI=0.0103824;REFB=-0.00843952;REVB=0.00981429;RO=138;SAF=48;SAR=44;SRF=60;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0927749;STB=0.561934;TYPE=snp;VARB=0.0112175;OID=.;OPOS=135745129;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:235:235:138:143:92:92:44:48:60:78:44:48:60:83 chr2 135745545 . C T 280.09 PASS AO=67;DP=144;FAO=70;FDP=150;FR=.;FRO=80;FSAF=43;FSAR=27;FSRF=54;FSRR=26;FWDB=0.0551241;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.2392;QD=7.46905;RBI=0.0551625;REFB=-0.027585;REVB=-0.00205791;RO=77;SAF=40;SAR=27;SRF=51;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0664678;STB=0.534698;TYPE=snp;VARB=0.0303575;OID=.;OPOS=135745545;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:150:77:80:67:70:27:40:51:26:27:43:54:26 chr2 135745722 . A G 93.08 PASS AO=22;DP=53;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=22;FSAR=1;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=-0.0325224;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.305;QD=7.16033;RBI=0.0618528;REFB=0.00681707;REVB=-0.0526124;RO=30;SAF=21;SAR=1;SRF=21;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.554305;STB=0.839275;TYPE=snp;VARB=-0.0113458;OID=.;OPOS=135745722;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:53:52:30:29:22:23:1:21:21:9:1:22:20:9 chr2 135893372 . A G 183.85 PASS AO=45;DP=96;FAO=45;FDP=96;FR=.;FRO=51;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=33;FWDB=-0.0306545;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=143.646;QD=7.66058;RBI=0.037986;REFB=-0.0346725;REVB=-0.022433;RO=50;SAF=24;SAR=21;SRF=18;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162882;STB=0.595;TYPE=snp;VARB=0.0418222;OID=.;OPOS=135893372;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:50:51:45:45:21:24:18:32:21:24:18:33 chr2 135911422 . T C 1831.15 PASS AO=193;DP=196;FAO=195;FDP=195;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=122;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0800393;FXX=0.0101518;HRUN=3;LEN=1;MLLD=80.7029;QD=37.562;RBI=0.0888089;REFB=-0.0587814;REVB=0.0384803;RO=3;SAF=72;SAR=121;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0194244;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000452623;OID=.;OPOS=135911422;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:196:195:3:0:193:195:121:72:3:0:122:73:0:0 chr2 135926522 . G A 288.94 PASS AO=64;DP=123;FAO=64;FDP=123;FR=.;FRO=59;FSAF=28;FSAR=36;FSRF=13;FSRR=46;FWDB=-0.00742258;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.351;QD=9.39628;RBI=0.0225037;REFB=-0.016193;REVB=0.0212444;RO=58;SAF=28;SAR=36;SRF=13;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193632;STB=0.608664;TYPE=snp;VARB=0.0208593;OID=.;OPOS=135926522;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:58:59:64:64:36:28:13:45:36:28:13:46 chr2 136262011 . A G 322.96 PASS AO=73;DP=143;FAO=73;FDP=143;FR=.;FRO=70;FSAF=44;FSAR=29;FSRF=23;FSRR=47;FWDB=0.0314539;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.35;QD=9.03391;RBI=0.0391931;REFB=0.0111682;REVB=-0.0233827;RO=70;SAF=44;SAR=29;SRF=23;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.241218;STB=0.632459;TYPE=snp;VARB=-0.00545548;OID=.;OPOS=136262011;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:70:70:73:73:29:44:23:47:29:44:23:47 chr2 136393658 . A G 285.1 PASS AO=76;DP=174;FAO=77;FDP=175;FR=.;FRO=98;FSAF=33;FSAR=44;FSRF=42;FSRR=56;FWDB=0.00730074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.321;QD=6.51646;RBI=0.00915029;REFB=-0.017133;REVB=0.00551607;RO=97;SAF=33;SAR=43;SRF=41;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0118314;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.02359;OID=.;OPOS=136393658;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:175:97:98:76:77:43:33:41:56:44:33:42:56 chr2 136396300 . T C 380.2 PASS AO=92;DP=196;FAO=94;FDP=197;FR=.;FRO=103;FSAF=43;FSAR=51;FSRF=26;FSRR=77;FWDB=0.00869202;FXX=0.0100497;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1308;QD=7.71985;RBI=0.0300585;REFB=-0.00690517;REVB=0.0287743;RO=102;SAF=42;SAR=50;SRF=25;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208198;STB=0.609975;TYPE=snp;VARB=0.00586038;OID=.;OPOS=136396300;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:197:102:103:92:94:50:42:25:77:51:43:26:77 chr2 136407479 . A G 989.5 PASS AO=103;DP=103;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0516698;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.808;QD=38.0576;RBI=0.0538498;REFB=0;REVB=0.0151669;RO=0;SAF=77;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.23066e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000130833;OID=.;OPOS=136407479;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:103:104:0:0:103:104:26:77:0:0:26:78:0:0 chr2 136409574 . A C 129.93 PASS AO=28;DP=64;FAO=31;FDP=65;FR=.;FRO=34;FSAF=5;FSAR=26;FSRF=11;FSRR=23;FWDB=-0.0147767;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.156;QD=7.99589;RBI=0.0195775;REFB=-0.0174252;REVB=0.0128424;RO=31;SAF=4;SAR=24;SRF=8;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184297;STB=0.629255;TYPE=snp;VARB=0.0176756;OID=.;OPOS=136409574;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:65:31:34:28:31:24:4:8:23:26:5:11:23 chr2 136473163 . C T 233.47 PASS AO=58;DP=124;FAO=58;FDP=124;FR=.;FRO=66;FSAF=9;FSAR=49;FSRF=12;FSRR=54;FWDB=-0.0117311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.989;QD=7.53128;RBI=0.0310301;REFB=-0.00423813;REVB=-0.0287271;RO=66;SAF=9;SAR=49;SRF=12;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0467664;STB=0.526064;TYPE=snp;VARB=0.00470932;OID=.;OPOS=136473163;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:66:66:58:58:49:9:12:54:49:9:12:54 chr2 136546110 . A G 262.84 PASS AO=53;DP=94;FAO=53;FDP=94;FR=.;FRO=41;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=-0.0111756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.841;QD=11.1848;RBI=0.011401;REFB=-0.00468381;REVB=0.00225568;RO=41;SAF=27;SAR=26;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0172166;STB=0.50943;TYPE=snp;VARB=0.00424263;OID=.;OPOS=136546110;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:41:41:53:53:26:27:20:21:26:27:20:21 chr2 136555659 . T C 150.71 PASS AO=34;DP=69;FAO=34;FDP=69;FR=.;FRO=35;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=0.0508973;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.482;QD=8.73668;RBI=0.0534562;REFB=-0.005822;REVB=0.016341;RO=35;SAF=20;SAR=14;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0157167;STB=0.508767;TYPE=snp;VARB=0.00672589;OID=.;OPOS=136555659;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:35:35:34:34:14:20:20:15:14:20:20:15 chr2 136561557 . G A 1591.71 PASS AO=162;DP=163;FAO=172;FDP=175;FR=.;FRO=3;FSAF=85;FSAR=87;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0291313;FXX=0.0056815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.0595;QD=36.3819;RBI=0.04228;REFB=-0.0757199;REVB=-0.0306426;RO=0;SAF=86;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.22958e-08;STB=0.502957;TYPE=snp;VARB=0.000527118;OID=.;OPOS=136561557;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:163:175:0:3:162:172:76:86:0:0:87:85:2:1 chr2 136562472 . G A 283.26 PASS AO=63;DP=156;FAO=74;FDP=164;FR=.,HEALED;FRO=90;FSAF=34;FSAR=40;FSRF=24;FSRR=66;FWDB=0.0210832;FXX=0.0120475;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.484;QD=6.90868;RBI=0.0245693;REFB=0.00271093;REVB=0.0126154;RO=64;SAF=34;SAR=29;SRF=24;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149443;STB=0.608345;TYPE=snp;VARB=-0.00478724;OID=.;OPOS=136562472;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:164:64:90:63:74:29:34:24:40:40:34:24:66 chr2 136566321 . GC G 617.39 PASS AO=78;DP=110;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.275307;FXX=0.0288434;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.7269;QD=24.4511;RBI=0.380616;REFB=0;REVB=-0.26282;RO=12;SAF=33;SAR=45;SRF=12;SRR=0;SSEN=0.494118;SSEP=0;SSSB=-0.144751;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0119706;OID=.;OPOS=136566322;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:78:102:101:101:0:47:54:0:0:51:12:33:45:12:0 chr2 136575534 . T C 270.22 PASS AO=27;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0.0344709;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.797;QD=38.6022;RBI=0.0062268;REFB=0;REVB=0.0062268;RO=0;SAF=0;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000247453;OID=.;OPOS=136575534;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:28:28:0:0:27:28:27:0:0:0:28:0:0:0 chr2 136594158 . G A 309.29 PASS AO=103;DP=273;FAO=103;FDP=273;FR=.;FRO=170;FSAF=47;FSAR=56;FSRF=83;FSRR=87;FWDB=0.0159461;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=241.92;QD=4.53171;RBI=0.0161153;REFB=-0.00843296;REVB=0.0023297;RO=169;SAF=47;SAR=56;SRF=83;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0384918;STB=0.519959;TYPE=snp;VARB=0.0122247;OID=.;OPOS=136594158;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:273:273:169:170:103:103:56:47:83:86:56:47:83:87 chr2 137814138 . T C 376.11 PASS AO=94;DP=201;FAO=94;FDP=200;FR=.;FRO=106;FSAF=42;FSAR=52;FSRF=32;FSRR=74;FWDB=0.00199774;FXX=0.00497488;HRUN=3;LEN=1;MLLD=183.501;QD=7.52219;RBI=0.00615807;REFB=-0.0138714;REVB=-0.00582502;RO=105;SAF=42;SAR=52;SRF=31;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149602;STB=0.578977;TYPE=snp;VARB=0.0178133;OID=.;OPOS=137814138;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:200:105:106:94:94:52:42:31:74:52:42:32:74 chr2 137814258 . T C 412.04 PASS AO=103;DP=218;FAO=103;FDP=218;FR=.;FRO=115;FSAF=43;FSAR=60;FSRF=56;FSRR=59;FWDB=0.0134475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.774;QD=7.56044;RBI=0.0289841;REFB=-0.0158299;REVB=-0.0256757;RO=115;SAF=43;SAR=60;SRF=56;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0673674;STB=0.537209;TYPE=snp;VARB=0.0168152;OID=.;OPOS=137814258;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:218:218:115:115:103:103:60:43:56:59:60:43:56:59 chr2 137852467 . A G 420.23 PASS AO=106;DP=230;FAO=106;FDP=227;FR=.;FRO=121;FSAF=71;FSAR=35;FSRF=51;FSRR=70;FWDB=0.0153542;FXX=0.0130429;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.517;QD=7.40488;RBI=0.0242006;REFB=0.0124352;REVB=0.018706;RO=118;SAF=71;SAR=35;SRF=48;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.256084;STB=0.635795;TYPE=snp;VARB=-0.0159214;OID=.;OPOS=137852467;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:230:227:118:121:106:106:35:71:48:70:35:71:51:70 chr2 137917922 . T A 412.99 PASS AO=85;DP=163;FAO=90;FDP=169;FR=.;FRO=79;FSAF=9;FSAR=81;FSRF=15;FSRR=64;FWDB=3.70861e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.992;QD=9.77501;RBI=0.00530485;REFB=-0.0199931;REVB=0.00530472;RO=75;SAF=9;SAR=76;SRF=14;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156078;STB=0.598313;TYPE=snp;VARB=0.0261856;OID=.;OPOS=137917922;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:169:75:79:85:90:76:9:14:61:81:9:15:64 chr2 138237038 . C T 402.47 PASS AO=47;DP=48;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0853102;FXX=0.062487;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.8807;QD=35.7747;RBI=0.10132;REFB=-0.077198;REVB=-0.0546615;RO=1;SAF=28;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.016502;STB=0.509799;TYPE=snp;VARB=0.00180512;OID=.;OPOS=138237038;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:48:45:1:1:47:44:19:28:1:0:19:25:1:0 chr2 138420996 . A G 1880.78 PASS AO=206;DP=212;FAO=207;FDP=213;FR=.;FRO=6;FSAF=101;FSAR=106;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.00180683;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.953;QD=35.3198;RBI=0.00315687;REFB=-0.0104703;REVB=0.00258867;RO=6;SAF=101;SAR=105;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000523155;STB=0.50034;TYPE=snp;VARB=8.17423e-05;OID=.;OPOS=138420996;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:212:213:6:6:206:207:105:101:3:3:106:101:3:3 chr2 138759649 . C T 172.99 PASS AO=61;DP=174;FAO=61;FDP=172;FR=.;FRO=111;FSAF=25;FSAR=36;FSRF=40;FSRR=71;FWDB=-0.00923727;FXX=0.0114936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.9934;QD=4.02296;RBI=0.0367367;REFB=-0.00321361;REVB=-0.0355564;RO=110;SAF=25;SAR=36;SRF=40;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0545558;STB=0.533389;TYPE=snp;VARB=0.00589573;OID=.;OPOS=138759649;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:172:110:111:61:61:36:25:40:70:36:25:40:71 chr2 138773229 . G A 476.32 PASS AO=90;DP=150;FAO=90;FDP=150;FR=.;FRO=60;FSAF=44;FSAR=46;FSRF=29;FSRR=31;FWDB=0.00813308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.712;QD=12.7019;RBI=0.0726397;REFB=-0.00527958;REVB=-0.072183;RO=58;SAF=44;SAR=46;SRF=28;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00443593;STB=0.502223;TYPE=snp;VARB=0.00385975;OID=.;OPOS=138773229;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:150:58:60:90:90:46:44:28:30:46:44:29:31 chr2 139045972 . T C 167.39 PASS AO=51;DP=127;FAO=51;FDP=127;FR=.;FRO=76;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=34;FSRR=42;FWDB=0.0348958;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.7139;QD=5.27213;RBI=0.0381586;REFB=-0.0184707;REVB=0.0154391;RO=76;SAF=30;SAR=21;SRF=34;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149496;STB=0.584382;TYPE=snp;VARB=0.031616;OID=.;OPOS=139045972;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:76:76:51:51:21:30:34:42:21:30:34:42 chr2 139326879 . G C 1186.83 PASS AO=125;DP=129;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.013295;FXX=0.0310053;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.304;QD=37.9784;RBI=0.0260916;REFB=-0.0562771;REVB=0.0224503;RO=1;SAF=79;SAR=46;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0102166;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.97831e-05;OID=.;OPOS=139326879;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:129:125:1:0:125:125:46:79:0:1:46:79:0:0 chr2 139429068 . G A 1354.62 PASS AO=133;DP=134;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00546349;FXX=0.00699252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.39;QD=38.1582;RBI=0.0149405;REFB=0;REVB=0.0139057;RO=0;SAF=57;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.85809e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00021628;OID=.;OPOS=139429068;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:134:142:0:0:133:142:76:57:0:0:85:57:0:0 chr2 139621308 . C T 334.6 PASS AO=79;DP=165;FAO=81;FDP=168;FR=.;FRO=87;FSAF=24;FSAR=57;FSRF=34;FSRR=53;FWDB=0.0379106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.5651;QD=7.9667;RBI=0.0379481;REFB=-0.0181164;REVB=-0.00168712;RO=83;SAF=22;SAR=57;SRF=32;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116167;STB=0.55599;TYPE=snp;VARB=0.0230108;OID=.;OPOS=139621308;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:168:83:87:79:81:57:22:32:51:57:24:34:53 chr2 139621319 . A ATCT 241.62 PASS AO=62;DP=157;FAO=66;FDP=152;FR=.;FRO=86;FSAF=19;FSAR=47;FSRF=35;FSRR=51;FWDB=-0.0311495;FXX=0.0193536;HRUN=1;LEN=3;MLLD=202.388;QD=6.3583;RBI=0.031448;REFB=-0.00325987;REVB=0.00432324;RO=87;SAF=18;SAR=44;SRF=37;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156942;STB=0.576794;TYPE=ins;VARB=0.00375109;OID=.;OPOS=139621320;OREF=-;OALT=TCT;OMAPALT=ATCT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:62:157:66:152:86:19:47:35:51:99:87:18:44:37:50 chr2 139621326 . G A 279.09 PASS AO=69;DP=149;FAO=69;FDP=147;FR=.;FRO=78;FSAF=21;FSAR=48;FSRF=30;FSRR=48;FWDB=0.023969;FXX=0.0134219;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.4278;QD=7.59438;RBI=0.0240618;REFB=-0.00750342;REVB=-0.00211125;RO=78;SAF=21;SAR=48;SRF=31;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100301;STB=0.548373;TYPE=snp;VARB=0.00838439;OID=.;OPOS=139621326;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:147:78:78:69:69:48:21:31:47:48:21:30:48 chr2 140975131 . G C 365.56 PASS AO=81;DP=155;FAO=81;FDP=155;FR=.;FRO=74;FSAF=37;FSAR=44;FSRF=35;FSRR=39;FWDB=-0.0111477;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.654;QD=9.43367;RBI=0.0232808;REFB=-0.0100343;REVB=0.0204383;RO=74;SAF=37;SAR=44;SRF=35;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0141704;STB=0.507772;TYPE=snp;VARB=0.00945966;OID=.;OPOS=140975131;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:74:74:81:81:44:37:35:39:44:37:35:39 chr2 141032088 . C T 1951.4 PASS AO=206;DP=210;FAO=208;FDP=208;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=129;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130559;FXX=0.0142173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.139;QD=37.527;RBI=0.0175402;REFB=-0.0477089;REVB=0.0117133;RO=2;SAF=78;SAR=128;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00236068;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000443736;OID=.;OPOS=141032088;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:210:208:2:0:206:208:128:78:1:1:129:79:0:0 chr2 141130695 . C T 128.51 PASS AO=36;DP=91;FAO=37;FDP=92;FR=.;FRO=55;FSAF=9;FSAR=28;FSRF=22;FSRR=33;FWDB=-0.00482104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.473;QD=5.58734;RBI=0.0176683;REFB=-0.00981611;REVB=-0.0169978;RO=55;SAF=8;SAR=28;SRF=22;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230525;STB=0.612496;TYPE=snp;VARB=0.0127693;OID=.;OPOS=141130695;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:92:55:55:36:37:28:8:22:33:28:9:22:33 chr2 141260668 . A G 552.91 PASS AO=137;DP=287;FAO=137;FDP=287;FR=.;FRO=150;FSAF=63;FSAR=74;FSRF=62;FSRR=88;FWDB=0.0852474;FXX=0.0034721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.3998;QD=7.70611;RBI=0.0856357;REFB=-0.022675;REVB=-0.0081466;RO=149;SAF=63;SAR=74;SRF=62;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.04185;STB=0.524565;TYPE=snp;VARB=0.0261213;OID=.;OPOS=141260668;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:287:287:149:150:137:137:74:63:62:87:74:63:62:88 chr2 141274576 . T C 143.78 PASS AO=48;DP=132;FAO=48;FDP=132;FR=.;FRO=84;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=51;FSRR=33;FWDB=-0.00483595;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=189.123;QD=4.35698;RBI=0.0153279;REFB=-0.00931113;REVB=-0.0145451;RO=84;SAF=18;SAR=30;SRF=51;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.256237;STB=0.646007;TYPE=snp;VARB=0.0157674;OID=.;OPOS=141274576;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:84:84:48:48:30:18:51:33:30:18:51:33 chr2 141571329 . T C 401.55 PASS AO=94;DP=201;FAO=101;FDP=214;FR=.;FRO=113;FSAF=40;FSAR=61;FSRF=40;FSRR=73;FWDB=0.00315032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.769;QD=7.50568;RBI=0.00517705;REFB=-0.00988337;REVB=0.0041082;RO=106;SAF=40;SAR=54;SRF=39;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0570958;STB=0.523433;TYPE=snp;VARB=0.011061;OID=.;OPOS=141571329;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:214:106:113:94:101:54:40:39:67:61:40:40:73 chr2 141707868 . G T 522.2 PASS AO=130;DP=270;FAO=130;FDP=274;FR=.;FRO=144;FSAF=61;FSAR=69;FSRF=50;FSRR=94;FWDB=-0.0221511;FXX=0.00724611;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.68;QD=7.62334;RBI=0.0268799;REFB=-0.0187225;REVB=-0.0152269;RO=139;SAF=61;SAR=69;SRF=48;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11801;STB=0.564869;TYPE=snp;VARB=0.0237176;OID=.;OPOS=141707868;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:270:274:139:144:130:130:69:61:48:91:69:61:50:94 chr2 141751592 . G A 1481.92 PASS AO=155;DP=155;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0266491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.284;QD=38.2431;RBI=0.0267099;REFB=0;REVB=-0.00180216;RO=0;SAF=76;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.51355e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.06822e-05;OID=.;OPOS=141751592;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:155:155:0:0:155:155:79:76:0:0:79:76:0:0 chr2 141816621 . A G 1741.87 PASS AO=183;DP=184;FAO=184;FDP=184;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=134;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0302035;FXX=0.0107521;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.469;QD=37.8666;RBI=0.033037;REFB=0;REVB=0.0133863;RO=0;SAF=49;SAR=134;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000264021;OID=.;OPOS=141816621;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:184:184:0:0:183:184:134:49:0:0:134:50:0:0 chr2 143849094 . G A 195.41 PASS AO=56;DP=137;FAO=56;FDP=136;FR=.;FRO=80;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=49;FSRR=31;FWDB=-0.0306127;FXX=0.00729874;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.6459;QD=5.74735;RBI=0.0311245;REFB=-0.024785;REVB=0.00562122;RO=80;SAF=23;SAR=33;SRF=49;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.209154;STB=0.617422;TYPE=snp;VARB=0.0389825;OID=.;OPOS=143849094;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:136:80:80:56:56:33:23:49:31:33:23:49:31 chr2 143856012 . A T 144.94 PASS AO=40;DP=95;FAO=40;FDP=95;FR=.;FRO=55;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=31;FSRR=24;FWDB=-0.0045017;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5357;QD=6.10281;RBI=0.017347;REFB=-0.00929453;REVB=-0.0167527;RO=55;SAF=25;SAR=15;SRF=31;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.065827;STB=0.537171;TYPE=snp;VARB=0.0149672;OID=.;OPOS=143856012;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:55:55:40:40:15:25:31:24:15:25:31:24 chr2 144194565 . C T 217.85 PASS AO=49;DP=98;FAO=49;FDP=97;FR=.;FRO=48;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=14;FSRR=34;FWDB=0.011382;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.318;QD=8.98332;RBI=0.013008;REFB=-0.0124137;REVB=-0.00629759;RO=48;SAF=24;SAR=25;SRF=14;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178728;STB=0.59844;TYPE=snp;VARB=0.0274864;OID=.;OPOS=144194565;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:97:48:48:49:49:25:24:14:34:25:24:14:34 chr2 144899559 . C A 231.82 PASS AO=70;DP=169;FAO=69;FDP=169;FR=.;FRO=100;FSAF=19;FSAR=50;FSRF=31;FSRR=69;FWDB=0.0644389;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.9194;QD=5.48693;RBI=0.0699421;REFB=0.0116299;REVB=0.0271943;RO=94;SAF=19;SAR=51;SRF=27;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0202509;STB=0.525092;TYPE=snp;VARB=-0.0130205;OID=.;OPOS=144899559;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:169:94:100:70:69:51:19:27:67:50:19:31:69 chr2 145145719 . CT C 29.99 PASS AO=32;DP=134;FAO=37;FDP=110;FR=.;FRO=73;FSAF=29;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=51;FWDB=-0.214049;FXX=0.0677909;HRUN=5;LEN=1;MLLD=8.49585;QD=1.09062;RBI=0.261004;REFB=-0.103715;REVB=0.149352;RO=67;SAF=26;SAR=6;SRF=16;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.617815;STB=0.807298;TYPE=del;VARB=0.13925;OID=.;OPOS=145145720;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:32:111:37:110:73:29:8:22:51:29:67:26:6:16:51 chr2 145145728 . TA T 33.07 PASS AO=33;DP=117;FAO=35;FDP=94;FR=.;FRO=59;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=43;FWDB=-0.207618;FXX=0.0208312;HRUN=6;LEN=1;MLLD=7.85247;QD=1.40739;RBI=0.207676;REFB=-0.0777806;REVB=-0.0049127;RO=47;SAF=20;SAR=13;SRF=13;SRR=34;SSEN=0.368071;SSEP=0;SSSB=0.331531;STB=0.697856;TYPE=del;VARB=0.0374965;OID=.;OPOS=145145729;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:33:95:35:94:59:21:14:16:43:33:47:20:13:13:34 chr2 148657117 . G A 424.18 PASS AO=95;DP=183;FAO=95;FDP=183;FR=.;FRO=88;FSAF=44;FSAR=51;FSRF=34;FSRR=54;FWDB=-0.00199901;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=258.402;QD=9.27162;RBI=0.0161552;REFB=-0.0254422;REVB=-0.0160311;RO=88;SAF=44;SAR=51;SRF=34;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0681833;STB=0.537327;TYPE=snp;VARB=0.0289938;OID=.;OPOS=148657117;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:183:88:88:95:95:51:44:34:54:51:44:34:54 chr2 148716428 . T C 222.52 PASS AO=47;DP=86;FAO=47;FDP=88;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=31;FSRF=15;FSRR=26;FWDB=-0.0178352;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=124.223;QD=10.1147;RBI=0.039073;REFB=-0.0253931;REVB=-0.0347651;RO=39;SAF=16;SAR=31;SRF=13;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00652479;STB=0.513075;TYPE=snp;VARB=0.0239556;OID=.;OPOS=148716428;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:88:39:41:47:47:31:16:13:26:31:16:15:26 chr2 149449185 . G A 2102.78 PASS AO=218;DP=219;FAO=218;FDP=218;FR=.;FRO=0;FSAF=121;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139913;FXX=0.0090905;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.618;QD=38.5831;RBI=0.0145724;REFB=0;REVB=-0.00407408;RO=0;SAF=121;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60975e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.51712e-05;OID=.;OPOS=149449185;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:219:218:0:0:218:218:97:121:0:0:97:121:0:0 chr2 150432976 . C T 616.06 PASS AO=62;DP=62;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.957;QD=37.9115;RBI=0.0420964;REFB=0;REVB=0.0407298;RO=0;SAF=37;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000142798;OID=.;OPOS=150432976;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:62:65:0:0:62:65:25:37:0:0:27:38:0:0 chr2 151219274 . G A 73.46 PASS AO=34;DP=120;FAO=34;FDP=120;FR=.;FRO=86;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=32;FSRR=54;FWDB=-0.00661343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4986;QD=2.4488;RBI=0.0077323;REFB=0.00378571;REVB=0.00400638;RO=85;SAF=22;SAR=12;SRF=31;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.332538;STB=0.69132;TYPE=snp;VARB=-0.00914308;OID=.;OPOS=151219274;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:120:120:85:86:34:34:12:22:31:54:12:22:32:54 chr2 151219315 . C T 1074.65 PASS AO=113;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00468692;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.798;QD=38.0406;RBI=0.00478493;REFB=0;REVB=0.000963495;RO=0;SAF=54;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.29304e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.16742e-05;OID=.;OPOS=151219315;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:113:113:0:0:113:113:59:54:0:0:59:54:0:0 chr2 152132130 . A G 713.76 PASS AO=174;DP=365;FAO=174;FDP=358;FR=.;FRO=184;FSAF=78;FSAR=96;FSRF=78;FSRR=106;FWDB=0.0161123;FXX=0.0191776;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.518;QD=7.975;RBI=0.0161522;REFB=0.00391772;REVB=0.00113489;RO=180;SAF=78;SAR=96;SRF=76;SRR=104;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0244846;STB=0.512689;TYPE=snp;VARB=-0.00468009;OID=.;OPOS=152132130;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:365:358:180:184:174:174:96:78:76:104:96:78:78:106 chr2 152138522 . T C 269.19 PASS AO=65;DP=135;FAO=65;FDP=135;FR=.;FRO=70;FSAF=20;FSAR=45;FSRF=33;FSRR=37;FWDB=-0.0216046;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.626;QD=7.97606;RBI=0.0216273;REFB=-0.00480833;REVB=0.000990115;RO=70;SAF=20;SAR=45;SRF=33;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16657;STB=0.592517;TYPE=snp;VARB=0.00589371;OID=.;OPOS=152138522;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:70:70:65:65:45:20:33:37:45:20:33:37 chr2 152311570 . G A 235.17 PASS AO=62;DP=138;FAO=62;FDP=140;FR=.;FRO=78;FSAF=21;FSAR=41;FSRF=38;FSRR=40;FWDB=-0.0323967;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.743;QD=6.71916;RBI=0.0411073;REFB=-0.0167041;REVB=0.0253035;RO=76;SAF=21;SAR=41;SRF=36;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140948;STB=0.587107;TYPE=snp;VARB=0.0164959;OID=.;OPOS=152311570;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:140:76:78:62:62:41:21:36:40:41:21:38:40 chr2 152317669 . G A 248.77 PASS AO=82;DP=218;FAO=82;FDP=218;FR=.;FRO=136;FSAF=35;FSAR=47;FSRF=66;FSRR=70;FWDB=-0.00860978;FXX=0.0090905;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.773;QD=4.56465;RBI=0.0205105;REFB=-0.00404688;REVB=0.0186159;RO=136;SAF=35;SAR=47;SRF=66;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0651666;STB=0.53686;TYPE=snp;VARB=0.00806063;OID=.;OPOS=152317669;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:218:218:136:136:82:82:47:35:66:70:47:35:66:70 chr2 152320118 . G A 280.09 PASS AO=55;DP=95;FAO=55;FDP=95;FR=.;FRO=40;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=-0.0045408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.148;QD=11.7932;RBI=0.0112994;REFB=-0.0224465;REVB=-0.0103469;RO=40;SAF=28;SAR=27;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0647315;STB=0.53536;TYPE=snp;VARB=0.019267;OID=.;OPOS=152320118;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:40:40:55:55:27:28:17:23:27:28:17:23 chr2 152322095 . A T 187.93 PASS AO=24;DP=25;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0538575;FXX=0.039984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.685;QD=31.3208;RBI=0.0846479;REFB=-0.0784372;REVB=0.0653041;RO=1;SAF=21;SAR=3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0215721;STB=0.512185;TYPE=snp;VARB=0.022366;OID=.;OPOS=152322095;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:25:24:1:1:24:23:3:21:1:0:3:20:1:0 chr2 152331418 . C G 1233.36 PASS AO=128;DP=129;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0223755;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.26;QD=38.5426;RBI=0.0226123;REFB=0;REVB=0.00326369;RO=0;SAF=57;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000234175;OID=.;OPOS=152331418;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:129:128:0:0:128:128:71:57:0:0:71:57:0:0 chr2 152346494 . A C 307.07 PASS AO=69;DP=154;FAO=77;FDP=163;FR=.;FRO=86;FSAF=48;FSAR=29;FSRF=69;FSRR=17;FWDB=-0.013487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.162;QD=7.53546;RBI=0.0343718;REFB=-0.0260677;REVB=0.0316153;RO=85;SAF=48;SAR=21;SRF=69;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145747;STB=0.60576;TYPE=snp;VARB=0.0383761;OID=.;OPOS=152346494;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:163:85:86:69:77:21:48:69:16:29:48:69:17 chr2 152346979 . T C 63.32 PASS AO=20;DP=57;FAO=20;FDP=55;FR=.;FRO=35;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=0.00411186;FXX=0.0350816;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.623;QD=4.60505;RBI=0.00688129;REFB=-0.00270997;REVB=-0.00551767;RO=35;SAF=8;SAR=12;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0328041;STB=0.519065;TYPE=snp;VARB=0.00259793;OID=.;OPOS=152346979;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:57:55:35:35:20:20:12:8:13:22:12:8:13:22 chr2 152427032 . GGC G,GG 319.01 PASS AO=19,14;DP=47;FAO=0,44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=0,22;FSAR=0,22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.314247,0.0396269;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=2,1;MLLD=5.79929,18.4948;QD=29.0007;RBI=0.335714,0.335253;REFB=0,0;REVB=0.11812,0.332903;RO=9;SAF=19,1;SAR=0,13;SRF=0;SRR=9;SSEN=0,0.228763;SSEP=0.383747,0;SSSB=0.872337,0.233973;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=0,0.0108706;OID=.,.;OPOS=152427033,152427034;OREF=GC,C;OALT=-,-;OMAPALT=G,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:19,14:44:0,44:44:0:0,22:0,22:0:0:29:9:19,1:0,13:0:9 chr2 152432311 . T C 271.69 PASS AO=75;DP=175;FAO=75;FDP=174;FR=.;FRO=99;FSAF=18;FSAR=57;FSRF=41;FSRR=58;FWDB=0.00584363;FXX=0.00571396;HRUN=3;LEN=1;MLLD=150.483;QD=6.24572;RBI=0.0190818;REFB=-0.0060963;REVB=0.018165;RO=97;SAF=18;SAR=57;SRF=40;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208238;STB=0.618961;TYPE=snp;VARB=0.00696597;OID=.;OPOS=152432311;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:174:97:99:75:75:57:18:40:57:57:18:41:58 chr2 152490458 . A G 3546.71 PASS AO=368;DP=369;FAO=370;FDP=370;FR=.;FRO=0;FSAF=163;FSAR=207;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00118728;FXX=0.00269535;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.303;QD=38.3429;RBI=0.0160251;REFB=0;REVB=0.0159811;RO=0;SAF=161;SAR=207;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.38903e-06;OID=.;OPOS=152490458;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:369:370:0:0:368:370:207:161:0:0:207:163:0:0 chr2 152500449 . C G 299.23 PASS AO=93;DP=235;FAO=93;FDP=235;FR=.;FRO=142;FSAF=49;FSAR=44;FSRF=98;FSRR=44;FWDB=-0.00603576;FXX=0.0289244;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1731;QD=5.09328;RBI=0.00793396;REFB=-0.0145254;REVB=0.0051495;RO=141;SAF=49;SAR=44;SRF=97;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176087;STB=0.59998;TYPE=snp;VARB=0.0148872;OID=.;OPOS=152500449;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:235:235:141:142:93:93:44:49:97:44:44:49:98:44 chr2 152527572 . C T 3078.83 PASS AO=322;DP=323;FAO=323;FDP=323;FR=.;FRO=0;FSAF=159;FSAR=164;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00040798;FXX=0.00308632;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.575;QD=38.1279;RBI=0.019076;REFB=0.0196528;REVB=0.0190716;RO=1;SAF=158;SAR=164;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00289987;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.30144e-05;OID=.;OPOS=152527572;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:323:323:1:0:322:323:164:158:0:1:164:159:0:0 chr2 152531077 . A G 1599.97 PASS AO=167;DP=170;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0110139;FXX=0.0175428;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.938;QD=38.0944;RBI=0.0129826;REFB=0;REVB=-0.00687328;RO=0;SAF=58;SAR=109;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34028e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.52237e-07;OID=.;OPOS=152531077;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:170:168:0:0:167:168:109:58:0:0:109:59:0:0 chr2 152536498 . T A 2370.97 PASS AO=248;DP=255;FAO=254;FDP=254;FR=.;FRO=0;FSAF=126;FSAR=128;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000444256;FXX=0.0116727;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.8499;QD=37.3382;RBI=0.0335351;REFB=-0.0931901;REVB=-0.0335322;RO=7;SAF=120;SAR=128;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0120548;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000332428;OID=.;OPOS=152536498;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:255:254:7:0:248:254:128:120:5:2:128:126:0:0 chr2 152573981 . A G 2392.51 PASS AO=251;DP=251;FAO=250;FDP=250;FR=.;FRO=0;FSAF=135;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00654304;FXX=0.00793619;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.652;QD=38.2802;RBI=0.0132694;REFB=0;REVB=-0.011544;RO=0;SAF=136;SAR=115;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.21502e-05;OID=.;OPOS=152573981;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:251:250:0:0:251:250:115:136:0:0:115:135:0:0 chr2 153378459 . T C 236.57 PASS AO=64;DP=166;FAO=73;FDP=171;FR=.;FRO=98;FSAF=28;FSAR=45;FSRF=47;FSRR=51;FWDB=0.0230966;FXX=0.01156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.933;QD=5.53379;RBI=0.0243489;REFB=-0.016464;REVB=-0.00770812;RO=98;SAF=21;SAR=43;SRF=47;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171369;STB=0.556639;TYPE=snp;VARB=0.0205913;OID=.;OPOS=153378459;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:171:98:98:64:73:43:21:47:51:45:28:47:51 chr2 153405594 . G A 337.13 PASS AO=98;DP=231;FAO=97;FDP=231;FR=.;FRO=134;FSAF=47;FSAR=50;FSRF=48;FSRR=86;FWDB=-0.000909551;FXX=0.00431016;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.479;QD=5.8377;RBI=0.0031213;REFB=-0.00331492;REVB=0.00298584;RO=132;SAF=49;SAR=49;SRF=47;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148589;STB=0.57367;TYPE=snp;VARB=0.00512307;OID=.;OPOS=153405594;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:231:231:132:134:98:97:49:49:47:85:50:47:48:86 chr2 153476069 . C A 105.72 PASS AO=18;DP=29;FAO=18;FDP=29;FR=.;FRO=11;FSAF=0;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=11;FWDB=0;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=196.642;QD=14.5818;RBI=0.00618452;REFB=-0.0140089;REVB=0.00618452;RO=11;SAF=0;SAR=18;SRF=0;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00529908;OID=.;OPOS=153476069;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:29:29:11:11:18:18:18:0:0:11:18:0:0:11 chr2 153476072 . T C 38.7 PASS AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=0;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=10;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.837;QD=8.14829;RBI=0.024199;REFB=-0.0253072;REVB=0.024199;RO=10;SAF=0;SAR=9;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0650734;OID=.;OPOS=153476072;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:19:19:10:10:9:9:9:0:0:10:9:0:0:10 chr2 153476078 . A T 16.26 PASS AO=4;DP=14;FAO=4;FDP=14;FR=.;FRO=10;FSAF=0;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=10;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.124;QD=4.64557;RBI=0.0030371;REFB=0.0150964;REVB=0.0030371;RO=10;SAF=0;SAR=4;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00507757;OID=.;OPOS=153476078;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:14:14:10:10:4:4:4:0:0:10:4:0:0:10 chr2 153511027 . T C 495.02 PASS AO=133;DP=298;FAO=133;FDP=297;FR=.;FRO=164;FSAF=45;FSAR=88;FSRF=59;FSRR=105;FWDB=-0.0142274;FXX=0.00335559;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.627;QD=6.66689;RBI=0.0477801;REFB=-0.0138707;REVB=0.0456127;RO=161;SAF=45;SAR=88;SRF=59;SRR=102;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0307005;STB=0.513089;TYPE=snp;VARB=0.0213901;OID=.;OPOS=153511027;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:298:297:161:164:133:133:88:45:59:102:88:45:59:105 chr2 153577013 . G A 1280 PASS AO=134;DP=135;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00627951;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.597;QD=38.2089;RBI=0.0167417;REFB=0;REVB=0.0155194;RO=0;SAF=63;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.33783e-05;OID=.;OPOS=153577013;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:135:134:0:0:134:134:71:63:0:0:71:63:0:0 chr2 154334982 . GC G 102.11 PASS AO=12;DP=23;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.190615;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=11.1392;QD=21.497;RBI=0.387576;REFB=0;REVB=0.337462;RO=7;SAF=5;SAR=7;SRF=2;SRR=5;SSEN=0.492958;SSEP=0;SSSB=0.0892086;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.042988;OID=.;OPOS=154334983;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:12:19:19:19:0:7:12:0:0:9:7:5:7:2:5 chr2 155265623 . G A 1200.4 PASS AO=124;DP=129;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0710693;FXX=0.0522349;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.087;QD=37.8078;RBI=0.0722114;REFB=0;REVB=-0.012792;RO=0;SAF=61;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00105509;OID=.;OPOS=155265623;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:129:127:0:0:124:127:63:61:0:0:64:63:0:0 chr2 155307336 . G C 2135.98 PASS AO=221;DP=227;FAO=221;FDP=221;FR=.;FRO=0;FSAF=110;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00476853;FXX=0.0391287;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.558;QD=38.6603;RBI=0.0281653;REFB=0;REVB=0.0277587;RO=0;SAF=110;SAR=111;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000278233;OID=.;OPOS=155307336;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:227:221:0:0:221:221:111:110:0:0:111:110:0:0 chr2 155711357 . T C 1625.16 PASS AO=170;DP=171;FAO=170;FDP=170;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00218633;FXX=0.00584761;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.9803;QD=38.2392;RBI=0.0909088;REFB=0;REVB=0.0908825;RO=0;SAF=94;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.91328e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000130752;OID=.;OPOS=155711357;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:171:170:0:0:170:170:76:94:0:0:76:94:0:0 chr2 156186970 . G A 373.17 PASS AO=72;DP=123;FAO=73;FDP=125;FR=.;FRO=52;FSAF=32;FSAR=41;FSRF=20;FSRR=32;FWDB=-0.000302358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.536;QD=11.9416;RBI=0.0509097;REFB=-0.0172215;REVB=0.0509088;RO=51;SAF=31;SAR=41;SRF=19;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0453853;STB=0.522823;TYPE=snp;VARB=0.0131198;OID=.;OPOS=156186970;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:125:51:52:72:73:41:31:19:32:41:32:20:32 chr2 157182196 . GC G 44.95 PASS AO=22;DP=55;FAO=24;FDP=55;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=-0.0177089;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.4425;QD=3.26904;RBI=0.0331771;REFB=-0.0755434;REVB=0.0280556;RO=28;SAF=8;SAR=14;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0.323944;SSSB=-0.103197;STB=0.607503;TYPE=del;VARB=0.103316;OID=.;OPOS=157182197;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:22:54:24:55:31:8:16:16:15:44:28:8:14:13:15 chr2 157189011 . G C 375.68 PASS AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0080207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.179;QD=38.5307;RBI=0.031079;REFB=0;REVB=0.0300262;RO=0;SAF=24;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000365919;OID=.;OPOS=157189011;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:39:39:0:0:39:39:15:24:0:0:15:24:0:0 chr2 157257361 . G A 1190.89 PASS AO=125;DP=125;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0402207;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9716;QD=38.1086;RBI=0.0561566;REFB=0;REVB=-0.03919;RO=0;SAF=21;SAR=104;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.8129e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.76405e-06;OID=.;OPOS=157257361;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:125:125:0:0:125:125:104:21:0:0:105:20:0:0 chr2 157369945 . G T 683.38 PASS AO=162;DP=333;FAO=165;FDP=335;FR=.;FRO=170;FSAF=61;FSAR=104;FSRF=72;FSRR=98;FWDB=-0.00112604;FXX=0.0117991;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.574;QD=8.15973;RBI=0.0146553;REFB=-0.0118754;REVB=0.014612;RO=154;SAF=59;SAR=103;SRF=57;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00569716;STB=0.528864;TYPE=snp;VARB=0.0113635;OID=.;OPOS=157369945;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:333:335:154:170:162:165:103:59:57:97:104:61:72:98 chr2 157406249 . G A 1141.22 PASS AO=121;DP=123;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.036822;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.2036;QD=37.4172;RBI=0.0403765;REFB=-0.0692905;REVB=0.0165649;RO=2;SAF=62;SAR=59;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0158287;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000309963;OID=.;OPOS=157406249;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:123:122:2:0:121:122:59:62:0:2:60:62:0:0 chr2 158155446 . ACGGAAGACCGGAAGACCGGAAGACCG ACGGAAGACCGGAAGACCG,ACGGAAGACCGGAAGACCGGAAGACCA 718.55 PASS AO=34,14;DP=108;FAO=48,31;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=14,20;FSAR=34,11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0383043,0.0563914;FXX=0.0919435;HRUN=2,2;LEN=8,1;MLLD=168.007,201.354;QD=36.3822;RBI=0.0422424,0.0564396;REFB=0,0;REVB=-0.0178101,-0.00233122;RO=0;SAF=10,5;SAR=24,9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.00265841,-0.0173181;OID=.,.;OPOS=158155447,158155472;OREF=CGGAAGAC,G;OALT=-,A;OMAPALT=ACGGAAGACCGGAAGACCG,ACGGAAGACCGGAAGACCGGAAGACCA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:34,14:58:48,31:79:0:14,20:34,11:0:0:99:0:10,5:24,9:0:0 chr2 158155480 . A G 24.2 PASS AO=17;DP=82;FAO=17;FDP=83;FR=.;FRO=66;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=47;FWDB=-0.0120197;FXX=0.0235266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.741;QD=1.1665;RBI=0.0121803;REFB=0.00105471;REVB=-0.00197106;RO=64;SAF=9;SAR=8;SRF=19;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.292307;STB=0.688262;TYPE=snp;VARB=-0.00458858;OID=.;OPOS=158155480;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:82:83:64:66:17:17:8:9:19:45:8:9:19:47 chr2 158155576 . G A 416 PASS AO=47;DP=50;FAO=47;FDP=50;FR=.;FRO=3;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00950994;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=201.362;QD=33.2802;RBI=0.0335185;REFB=0.0049621;REVB=0.0321411;RO=3;SAF=22;SAR=25;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0224245;STB=0.51194;TYPE=snp;VARB=3.72509e-05;OID=.;OPOS=158155576;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:50:50:3:3:47:47:25:22:2:1:25:22:2:1 chr2 158157361 . C T 3689.07 PASS AO=387;DP=394;FAO=388;FDP=388;FR=.;FRO=0;FSAF=177;FSAR=211;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118017;FXX=0.0202015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.53;QD=38.0316;RBI=0.0135997;REFB=-0.0562128;REVB=-0.00675816;RO=1;SAF=177;SAR=210;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00226712;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.16653e-05;OID=.;OPOS=158157361;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:394:388:1:0:387:388:210:177:0:1:211:177:0:0 chr2 158291188 . A C 446.49 PASS AO=53;DP=58;FAO=53;FDP=58;FR=.;FRO=5;FSAF=13;FSAR=40;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.00953734;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=230.405;QD=30.7925;RBI=0.00959837;REFB=-0.0386221;REVB=0.00108068;RO=5;SAF=13;SAR=40;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0742695;STB=0.539613;TYPE=snp;VARB=0.00135982;OID=.;OPOS=158291188;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:58:58:5:5:53:53:40:13:3:2:40:13:3:2 chr2 158386938 . C T 1364.63 PASS AO=143;DP=144;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000304048;FXX=0.00694396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.997;QD=38.1715;RBI=0.0265469;REFB=0;REVB=-0.0265452;RO=0;SAF=30;SAR=113;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.10765e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.98907e-05;OID=.;OPOS=158386938;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:144:143:0:0:143:143:113:30:0:0:113:30:0:0 chr2 158443889 . G A 396.05 PASS AO=103;DP=224;FAO=103;FDP=225;FR=.;FRO=122;FSAF=35;FSAR=68;FSRF=47;FSRR=75;FWDB=0.00126334;FXX=0.00442458;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.906;QD=7.04083;RBI=0.0102253;REFB=-0.000557661;REVB=0.0101469;RO=120;SAF=36;SAR=67;SRF=47;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0443676;STB=0.526977;TYPE=snp;VARB=0.000664985;OID=.;OPOS=158443889;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:224:225:120:122:103:103:67:36:47:73:68:35:47:75 chr2 158626980 . C T 1514.79 PASS AO=153;DP=153;FAO=158;FDP=158;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-9.15583e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.038;QD=38.3491;RBI=0.00858601;REFB=0;REVB=0.00858552;RO=0;SAF=39;SAR=114;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.7439e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.11884e-05;OID=.;OPOS=158626980;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:153:158:0:0:153:158:114:39:0:0:119:39:0:0 chr2 158636910 . G A 387.62 PASS AO=95;DP=195;FAO=95;FDP=199;FR=.;FRO=104;FSAF=45;FSAR=50;FSRF=57;FSRR=47;FWDB=-0.0114103;FXX=0.00499975;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.109;QD=7.79143;RBI=0.0335238;REFB=-0.00624648;REVB=0.0315222;RO=99;SAF=45;SAR=50;SRF=52;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0477843;STB=0.538819;TYPE=snp;VARB=0.00562495;OID=.;OPOS=158636910;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:199:99:104:95:95:50:45:52:47:50:45:57:47 chr2 158958551 . G GA 187.77 PASS AO=47;DP=113;FAO=49;FDP=111;FR=.;FRO=62;FSAF=14;FSAR=35;FSRF=24;FSRR=38;FWDB=-0.0192923;FXX=0.0176975;HRUN=0;LEN=1;MLLD=276.503;QD=6.76657;RBI=0.0200495;REFB=-0.00226861;REVB=0.00545818;RO=63;SAF=14;SAR=33;SRF=24;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0964263;STB=0.565448;TYPE=ins;VARB=0.00295842;OID=.;OPOS=158958552;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:47:113:49:111:62:14:35:24:38:99:63:14:33:24:39 chr2 158958605 . G T 174.37 PASS AO=49;DP=113;FAO=48;FDP=113;FR=.;FRO=65;FSAF=11;FSAR=37;FSRF=27;FSRR=38;FWDB=0.0236181;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.223;QD=6.17228;RBI=0.0271689;REFB=-0.0358953;REVB=0.0134287;RO=64;SAF=12;SAR=37;SRF=26;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194158;STB=0.630152;TYPE=snp;VARB=0.0504633;OID=.;OPOS=158958605;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:64:65:49:48:37:12:26:38:37:11:27:38 chr2 159166069 . T C 1048.03 PASS AO=111;DP=113;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0414136;FXX=0.00884877;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.973;QD=37.4298;RBI=0.0435795;REFB=0.0854679;REVB=-0.0135677;RO=1;SAF=5;SAR=106;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00445864;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00556655;OID=.;OPOS=159166069;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:113:112:1:0:111:112:106:5:0:1:107:5:0:0 chr2 159537868 . A G 508.51 PASS AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0306156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.549;QD=37.6675;RBI=0.0429907;REFB=0;REVB=0.0301809;RO=0;SAF=22;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.64875e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000304427;OID=.;OPOS=159537868;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:54:54:0:0:54:54:32:22:0:0:32:22:0:0 chr2 159663616 . G A 201.83 PASS AO=55;DP=125;FAO=55;FDP=127;FR=.;FRO=72;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=23;FSRR=49;FWDB=-0.0216514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.915;QD=6.3567;RBI=0.0332127;REFB=-0.0180039;REVB=-0.0251853;RO=70;SAF=25;SAR=30;SRF=23;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129362;STB=0.578304;TYPE=snp;VARB=0.0275774;OID=.;OPOS=159663616;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:127:70:72:55:55:30:25:23:47:30:25:23:49 chr2 159738198 . T A 2418.66 PASS AO=251;DP=253;FAO=254;FDP=254;FR=.;FRO=0;FSAF=119;FSAR=135;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00847752;FXX=0.00781219;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.666;QD=38.0892;RBI=0.0873927;REFB=-0.0106896;REVB=0.0869805;RO=1;SAF=116;SAR=135;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00409169;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000165259;OID=.;OPOS=159738198;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:253:254:1:0:251:254:135:116:1:0:135:119:0:0 chr2 159738206 . C T 781.01 PASS AO=149;DP=250;FAO=151;FDP=253;FR=.;FRO=102;FSAF=69;FSAR=82;FSRF=47;FSRR=55;FWDB=0.0136079;FXX=0.00393685;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.7579;QD=12.348;RBI=0.0152539;REFB=-0.0335719;REVB=-0.00689269;RO=101;SAF=68;SAR=81;SRF=45;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00815901;STB=0.501555;TYPE=snp;VARB=0.0234585;OID=.;OPOS=159738206;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:250:253:101:102:149:151:81:68:45:56:82:69:47:55 chr2 159954175 . C T 191.9 PASS AO=44;DP=95;FAO=46;FDP=97;FR=.;FRO=51;FSAF=35;FSAR=11;FSRF=29;FSRR=22;FWDB=0.0807801;FXX=0.010203;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.38;QD=7.91342;RBI=0.0932907;REFB=0.0151819;REVB=0.0466662;RO=51;SAF=33;SAR=11;SRF=29;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204324;STB=0.621245;TYPE=snp;VARB=-0.0143752;OID=.;OPOS=159954175;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:97:51:51:44:46:11:33:29:22:11:35:29:22 chr2 160019863 . A G 937.85 PASS AO=77;DP=108;FAO=102;FDP=104;FR=.;FRO=2;FSAF=44;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0691418;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=93.6008;QD=36.071;RBI=0.0730783;REFB=0.0181429;REVB=-0.0236612;RO=0;SAF=19;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508473;TYPE=snp;VARB=6.37295e-06;OID=.;OPOS=160019863;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:77:104:0:2:77:102:58:19:0:0:58:44:0:2 chr2 160035207 . T C 918.6 PASS AO=94;DP=94;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.079739;FXX=0.0303;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.119;QD=38.275;RBI=0.0841939;REFB=0;REVB=0.0270239;RO=0;SAF=11;SAR=83;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.83125e-05;OID=.;OPOS=160035207;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:94:96:0:0:94:96:83:11:0:0:85:11:0:0 chr2 160086395 . A C 243.76 PASS AO=62;DP=138;FAO=63;FDP=138;FR=.;FRO=75;FSAF=29;FSAR=34;FSRF=19;FSRR=56;FWDB=0.0229323;FXX=0.00719373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.886;QD=7.06556;RBI=0.0288958;REFB=-0.00810323;REVB=0.0175806;RO=74;SAF=28;SAR=34;SRF=19;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197768;STB=0.615242;TYPE=snp;VARB=0.0123313;OID=.;OPOS=160086395;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:74:75:62:63:34:28:19:55:34:29:19:56 chr2 160088607 . A G 327.24 PASS AO=77;DP=158;FAO=77;FDP=157;FR=.;FRO=80;FSAF=30;FSAR=47;FSRF=40;FSRR=40;FWDB=0.00125081;FXX=0.0125778;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.886;QD=8.33727;RBI=0.027939;REFB=-0.0248432;REVB=-0.0279109;RO=78;SAF=30;SAR=47;SRF=40;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114842;STB=0.557612;TYPE=snp;VARB=0.028077;OID=.;OPOS=160088607;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:157:78:80:77:77:47:30:40:38:47:30:40:40 chr2 160112881 . G T 405.05 PASS AO=98;DP=202;FAO=97;FDP=199;FR=.;FRO=102;FSAF=44;FSAR=53;FSRF=50;FSRR=52;FWDB=-0.00762729;FXX=0.00994975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.1611;QD=8.14174;RBI=0.0185631;REFB=-0.0289032;REVB=-0.0169238;RO=101;SAF=44;SAR=54;SRF=50;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0427186;STB=0.518846;TYPE=snp;VARB=0.0315167;OID=.;OPOS=160112881;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:199:101:102:98:97:54:44:50:51:53:44:50:52 chr2 160114437 . G A 243.33 PASS AO=67;DP=155;FAO=67;FDP=156;FR=.;FRO=89;FSAF=8;FSAR=59;FSRF=20;FSRR=69;FWDB=-0.0368239;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.5109;QD=6.2392;RBI=0.044613;REFB=-0.0200445;REVB=-0.0251858;RO=88;SAF=8;SAR=59;SRF=20;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.209987;STB=0.617299;TYPE=snp;VARB=0.021824;OID=.;OPOS=160114437;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:156:88:89:67:67:59:8:20:68:59:8:20:69 chr2 160136337 . G A 713.82 PASS AO=76;DP=78;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0121598;FXX=0.0128189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.731;QD=37.0815;RBI=0.0649599;REFB=-0.00920185;REVB=0.0638116;RO=1;SAF=39;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012618;STB=0.506665;TYPE=snp;VARB=0.000359353;OID=.;OPOS=160136337;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:78:77:1:1:76:76:37:39:0:1:37:39:0:1 chr2 160261387 . T C 165.2 PASS AO=39;DP=77;FAO=39;FDP=82;FR=.;FRO=43;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=0.0156088;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=42.3826;QD=8.05834;RBI=0.0156873;REFB=0.00943292;REVB=-0.00156759;RO=38;SAF=21;SAR=18;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12723;STB=0.562585;TYPE=snp;VARB=-0.0170052;OID=.;OPOS=160261387;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:82:38:43:39:39:18:21:15:23:18:21:18:25 chr2 160604452 . C T 140.41 PASS AO=46;DP=129;FAO=47;FDP=130;FR=.;FRO=83;FSAF=30;FSAR=17;FSRF=50;FSRR=33;FWDB=0.00815138;FXX=0.00763301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.87;QD=4.3204;RBI=0.00855632;REFB=-0.000168931;REVB=-0.00260108;RO=82;SAF=30;SAR=16;SRF=49;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0657056;STB=0.524465;TYPE=snp;VARB=4.4731e-05;OID=.;OPOS=160604452;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:130:82:83:46:47:16:30:49:33:17:30:50:33 chr2 160605268 . T C 208.63 PASS AO=52;DP=141;FAO=64;FDP=156;FR=.;FRO=92;FSAF=26;FSAR=38;FSRF=45;FSRR=47;FWDB=-0.0297613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.102;QD=5.3495;RBI=0.0300979;REFB=-0.015653;REVB=0.00448902;RO=89;SAF=26;SAR=26;SRF=45;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00622699;STB=0.549699;TYPE=snp;VARB=0.0207278;OID=.;OPOS=160605268;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:156:89:92:52:64:26:26:45:44:38:26:45:47 chr2 160673526 . A G 135.81 PASS AO=42;DP=110;FAO=42;FDP=110;FR=.;FRO=68;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=36;FSRR=32;FWDB=0.0367556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.5167;QD=4.9386;RBI=0.0457984;REFB=-0.00917085;REVB=-0.0273225;RO=67;SAF=25;SAR=17;SRF=35;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0801995;STB=0.541536;TYPE=snp;VARB=0.0164744;OID=.;OPOS=160673526;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:67:68:42:42:17:25:35:32:17:25:36:32 chr2 160676427 . C A 1281.8 PASS AO=134;DP=134;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0282312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.285;QD=37.9792;RBI=0.0284688;REFB=0;REVB=-0.00367043;RO=0;SAF=65;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.18173e-05;OID=.;OPOS=160676427;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:134:135:0:0:134:135:69:65:0:0:69:66:0:0 chr2 160710922 . T C 441.68 PASS AO=170;DP=467;FAO=150;FDP=400;FR=.;FRO=250;FSAF=97;FSAR=53;FSRF=164;FSRR=86;FWDB=0.00571593;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.2647;QD=4.41679;RBI=0.0135417;REFB=-0.0155731;REVB=0.0122762;RO=287;SAF=108;SAR=62;SRF=190;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0324975;STB=0.506406;TYPE=snp;VARB=0.0247504;OID=.;OPOS=160710922;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:467:400:287:250:170:150:62:108:190:97:53:97:164:86 chr2 160711045 . G C 866.83 PASS AO=196;DP=379;FAO=196;FDP=378;FR=.;FRO=182;FSAF=74;FSAR=122;FSRF=57;FSRR=125;FWDB=0.0250435;FXX=0.00526302;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.051;QD=9.1728;RBI=0.0282457;REFB=-0.0166174;REVB=0.013063;RO=181;SAF=74;SAR=122;SRF=57;SRR=124;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.059641;STB=0.533505;TYPE=snp;VARB=0.0168564;OID=.;OPOS=160711045;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:379:378:181:182:196:196:122:74:57:124:122:74:57:125 chr2 160737621 . C T 559.22 PASS AO=120;DP=221;FAO=120;FDP=222;FR=.;FRO=102;FSAF=46;FSAR=74;FSRF=32;FSRR=70;FWDB=-0.00189182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.656;QD=10.076;RBI=0.0215204;REFB=0.00211473;REVB=0.0214371;RO=100;SAF=46;SAR=74;SRF=30;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.07505;STB=0.53436;TYPE=snp;VARB=-0.00231345;OID=.;OPOS=160737621;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:222:100:102:120:120:74:46:30:70:74:46:32:70 chr2 160738677 . G A 254.24 PASS AO=76;DP=194;FAO=78;FDP=195;FR=.;FRO=117;FSAF=44;FSAR=34;FSRF=69;FSRR=48;FWDB=-0.00634139;FXX=0.00510178;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.141;QD=5.21525;RBI=0.0176072;REFB=-0.000332736;REVB=0.0164256;RO=118;SAF=43;SAR=33;SRF=70;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0302905;STB=0.515701;TYPE=snp;VARB=0.000436796;OID=.;OPOS=160738677;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:195:118:117:76:78:33:43:70:48:34:44:69:48 chr2 160808075 . C T 288.72 PASS AO=64;DP=127;FAO=65;FDP=127;FR=.;FRO=62;FSAF=23;FSAR=42;FSRF=30;FSRR=32;FWDB=-0.0279791;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.5354;QD=9.09353;RBI=0.0319094;REFB=-0.0216625;REVB=0.0153421;RO=62;SAF=22;SAR=42;SRF=30;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132017;STB=0.56668;TYPE=snp;VARB=0.0159538;OID=.;OPOS=160808075;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:62:62:64:65:42:22:30:32:42:23:30:32 chr2 160833188 . A G 3285.86 PASS AO=334;DP=344;FAO=343;FDP=343;FR=.;FRO=0;FSAF=172;FSAR=171;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00359268;FXX=0.0255675;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.969;QD=38.319;RBI=0.0152992;REFB=0;REVB=0.0148714;RO=0;SAF=164;SAR=170;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.10053e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.89329e-05;OID=.;OPOS=160833188;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:344:343:0:0:334:343:170:164:0:0:171:172:0:0 chr2 160885418 . G C 95.94 PASS AO=36;DP=109;FAO=36;FDP=110;FR=.;FRO=74;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=41;FSRR=33;FWDB=-0.0220701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.375;QD=3.48858;RBI=0.0222514;REFB=-0.00851631;REVB=0.00283512;RO=72;SAF=11;SAR=25;SRF=39;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.278779;STB=0.670698;TYPE=snp;VARB=0.0196899;OID=.;OPOS=160885418;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:109:110:72:74:36:36:25:11:39:33:25:11:41:33 chr2 160885442 . T C 49.3 PASS AO=24;DP=94;FAO=25;FDP=96;FR=.;FRO=71;FSAF=2;FSAR=23;FSRF=40;FSRR=31;FWDB=0.0108303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.773;QD=2.05435;RBI=0.0346177;REFB=-0.00422174;REVB=-0.03288;RO=69;SAF=1;SAR=23;SRF=39;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.720887;STB=0.89909;TYPE=snp;VARB=0.0235044;OID=.;OPOS=160885442;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:94:96:69:71:24:25:23:1:39:30:23:2:40:31 chr2 160901517 . A G 413.02 PASS AO=92;DP=178;FAO=92;FDP=177;FR=.;FRO=85;FSAF=22;FSAR=70;FSRF=32;FSRR=53;FWDB=-0.0367732;FXX=0.00561766;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.7051;QD=9.33385;RBI=0.0367827;REFB=0.0177202;REVB=-0.000837292;RO=85;SAF=22;SAR=70;SRF=32;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150184;STB=0.582775;TYPE=snp;VARB=-0.0136555;OID=.;OPOS=160901517;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:177:85:85:92:92:70:22:32:53:70:22:32:53 chr2 160968628 . A G 224.49 PASS AO=50;DP=103;FAO=52;FDP=103;FR=.;FRO=51;FSAF=31;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=0.00541202;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.415;QD=8.71812;RBI=0.0118418;REFB=-0.00734698;REVB=-0.0105328;RO=51;SAF=30;SAR=20;SRF=24;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119499;STB=0.562972;TYPE=snp;VARB=0.00654548;OID=.;OPOS=160968628;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:51:51:50:52:20:30:24:27:21:31:24:27 chr2 161174693 . C T 107.98 PASS AO=18;DP=28;FAO=18;FDP=28;FR=.;FRO=10;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0521344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.89;QD=15.4263;RBI=0.0548514;REFB=0.00066395;REVB=0.0170493;RO=10;SAF=12;SAR=6;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.024289;STB=0.513499;TYPE=snp;VARB=0.000244553;OID=.;OPOS=161174693;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:28:28:10:10:18:18:6:12:7:3:6:12:7:3 chr2 163124051 . C T 1739.76 PASS AO=170;DP=170;FAO=183;FDP=183;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0293502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.198;QD=38.0276;RBI=0.0497206;REFB=0;REVB=0.0401336;RO=0;SAF=74;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000403166;OID=.;OPOS=163124051;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:170:183:0:0:170:183:96:74:0:0:98:85:0:0 chr2 163128824 . T C 968.52 PASS AO=102;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.072442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7083;QD=37.981;RBI=0.0859098;REFB=0;REVB=-0.0461807;RO=0;SAF=50;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000109292;OID=.;OPOS=163128824;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:102:102:0:0:102:102:52:50:0:0:52:50:0:0 chr2 164145582 . C A 135.08 PASS AO=27;DP=50;FAO=27;FDP=50;FR=.;FRO=23;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.0168469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.476;QD=10.8065;RBI=0.0201097;REFB=-0.0104633;REVB=-0.0109811;RO=23;SAF=17;SAR=10;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0928247;STB=0.551738;TYPE=snp;VARB=0.00893717;OID=.;OPOS=164145582;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:50:50:23:23:27:27:10:17:12:11:10:17:12:11 chr2 164465716 . G A 254.26 PASS AO=56;DP=103;FAO=55;FDP=103;FR=.;FRO=48;FSAF=23;FSAR=32;FSRF=19;FSRR=29;FWDB=-0.00365691;FXX=0.0190458;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.494;QD=9.87434;RBI=0.00454972;REFB=-0.00343249;REVB=0.00270684;RO=46;SAF=24;SAR=32;SRF=18;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0314423;STB=0.510735;TYPE=snp;VARB=0.00338844;OID=.;OPOS=164465716;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:46:48:56:55:32:24:18:28:32:23:19:29 chr2 165353712 . C T 2108.2 PASS AO=219;DP=219;FAO=219;FDP=219;FR=.;FRO=0;FSAF=137;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0339237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.0549;QD=38.5059;RBI=0.0469718;REFB=0;REVB=-0.0324889;RO=0;SAF=137;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.77155e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.99622e-06;OID=.;OPOS=165353712;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:219:219:0:0:219:219:82:137:0:0:82:137:0:0 chr2 165476253 . A T 1460.85 PASS AO=161;DP=165;FAO=161;FDP=166;FR=.;FRO=5;FSAF=84;FSAR=77;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.0852028;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.7007;QD=35.2012;RBI=0.0870015;REFB=0.011041;REVB=-0.0175993;RO=3;SAF=84;SAR=77;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0181741;STB=0.5097;TYPE=snp;VARB=-0.0009637;OID=.;OPOS=165476253;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:165:166:3:5:161:161:77:84:0:3:77:84:1:4 chr2 165586466 . T C 393.4 PASS AO=117;DP=284;FAO=116;FDP=281;FR=.;FRO=165;FSAF=60;FSAR=56;FSRF=93;FSRR=72;FWDB=0.00899973;FXX=0.00706689;HRUN=5;LEN=1;MLLD=105.657;QD=5.60001;RBI=0.0204307;REFB=-0.00533644;REVB=-0.0183417;RO=151;SAF=60;SAR=57;SRF=86;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0576843;STB=0.527322;TYPE=snp;VARB=0.00944749;OID=.;OPOS=165586466;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:284:281:151:165:117:116:57:60:86:65:56:60:93:72 chr2 165947079 . C A 3222.87 PASS AO=366;DP=386;FAO=366;FDP=385;FR=.;FRO=19;FSAF=187;FSAR=179;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=0.00350187;FXX=0.00259061;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.802;QD=33.4844;RBI=0.0150584;REFB=-0.0156225;REVB=0.0146455;RO=18;SAF=187;SAR=179;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0188845;STB=0.511159;TYPE=snp;VARB=0.00159734;OID=.;OPOS=165947079;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:386:385:18:19:366:366:179:187:13:5:179:187:14:5 chr2 166170127 . T C 3694.76 PASS AO=385;DP=385;FAO=385;FDP=385;FR=.;FRO=0;FSAF=228;FSAR=157;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000109117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.9848;QD=38.3871;RBI=0.0815789;REFB=0;REVB=0.0815788;RO=0;SAF=228;SAR=157;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000132209;OID=.;OPOS=166170127;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:385:385:0:0:385:385:157:228:0:0:157:228:0:0 chr2 166248047 . G A 403.19 PASS AO=114;DP=270;FAO=114;FDP=267;FR=.;FRO=153;FSAF=60;FSAR=54;FSRF=65;FSRR=88;FWDB=0.0193595;FXX=0.0111107;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.6437;QD=6.04029;RBI=0.0281483;REFB=-0.00286711;REVB=-0.0204336;RO=153;SAF=60;SAR=54;SRF=65;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104162;STB=0.557947;TYPE=snp;VARB=0.00328739;OID=.;OPOS=166248047;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:270:267:153:153:114:114:54:60:65:88:54:60:65:88 chr2 166788336 . T C 1450.04 PASS AO=152;DP=152;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00294017;FXX=0.00653552;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.907;QD=38.159;RBI=0.0249683;REFB=0;REVB=0.0247946;RO=0;SAF=71;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.66707e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.41884e-05;OID=.;OPOS=166788336;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:152:152:0:0:152:152:81:71:0:0:81:71:0:0 chr2 166797646 . C T 1644.99 PASS AO=171;DP=178;FAO=172;FDP=172;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018535;FXX=0.033706;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.643;QD=38.2556;RBI=0.0283698;REFB=0;REVB=0.0214778;RO=0;SAF=65;SAR=106;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.06587e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000190914;OID=.;OPOS=166797646;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:178:172:0:0:171:172:106:65:0:0:106:66:0:0 chr2 166892788 . C T 234.08 PASS AO=74;DP=205;FAO=78;FDP=209;FR=.;FRO=131;FSAF=29;FSAR=49;FSRF=52;FSRR=79;FWDB=0.0293693;FXX=0.00476168;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.609;QD=4.47999;RBI=0.0295049;REFB=-0.030289;REVB=-0.0028261;RO=130;SAF=26;SAR=48;SRF=51;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0494631;STB=0.516725;TYPE=snp;VARB=0.0408335;OID=.;OPOS=166892788;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:209:130:131:74:78:48:26:51:79:49:29:52:79 chr2 166897864 . A G 282.77 PASS AO=78;DP=185;FAO=80;FDP=189;FR=.;FRO=109;FSAF=36;FSAR=44;FSRF=48;FSRR=61;FWDB=0.00908642;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.0305;QD=5.98455;RBI=0.0122309;REFB=0.00296183;REVB=0.0081873;RO=106;SAF=36;SAR=42;SRF=47;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0188474;STB=0.505617;TYPE=snp;VARB=-0.00376972;OID=.;OPOS=166897864;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:189:106:109:78:80:42:36:47:59:44:36:48:61 chr2 166903445 . T C 566.66 PASS AO=133;DP=265;FAO=133;FDP=265;FR=.;FRO=132;FSAF=63;FSAR=70;FSRF=51;FSRR=81;FWDB=0.0448962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.6788;QD=8.55336;RBI=0.0483446;REFB=0.00417994;REVB=0.0179312;RO=129;SAF=63;SAR=70;SRF=50;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0780114;STB=0.543811;TYPE=snp;VARB=-0.00266437;OID=.;OPOS=166903445;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:265:265:129:132:133:133:70:63:50:79:70:63:51:81 chr2 167099158 . A G 568.24 PASS AO=116;DP=206;FAO=116;FDP=205;FR=.;FRO=89;FSAF=42;FSAR=74;FSRF=35;FSRR=54;FWDB=0.00255867;FXX=0.00485413;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.974;QD=11.0876;RBI=0.00259745;REFB=-0.00788971;REVB=0.000447163;RO=88;SAF=42;SAR=74;SRF=35;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0303345;STB=0.514536;TYPE=snp;VARB=0.00613474;OID=.;OPOS=167099158;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:206:205:88:89:116:116:74:42:35:53:74:42:35:54 chr2 167108385 . C T 508.98 PASS AO=116;DP=226;FAO=116;FDP=226;FR=.;FRO=110;FSAF=41;FSAR=75;FSRF=48;FSRR=62;FWDB=0.0114241;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.42;QD=9.00846;RBI=0.0167988;REFB=0.00246314;REVB=0.0123163;RO=108;SAF=41;SAR=75;SRF=48;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0851368;STB=0.543029;TYPE=snp;VARB=-0.00247249;OID=.;OPOS=167108385;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:226:226:108:110:116:116:75:41:48:60:75:41:48:62 chr2 167144974 . A T 2310.17 PASS AO=241;DP=243;FAO=243;FDP=243;FR=.;FRO=0;FSAF=124;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0267904;FXX=0.00816293;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.987;QD=38.0275;RBI=0.0268329;REFB=-0.0345878;REVB=-0.00150811;RO=1;SAF=122;SAR=119;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00398847;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.81516e-05;OID=.;OPOS=167144974;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:243:243:1:0:241:243:119:122:0:1:119:124:0:0 chr2 167144995 . T C 2319.63 PASS AO=245;DP=250;FAO=248;FDP=248;FR=.;FRO=0;FSAF=134;FSAR=114;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00286169;FXX=0.00799968;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.135;QD=37.4134;RBI=0.0129761;REFB=-0.0386686;REVB=0.0126567;RO=2;SAF=134;SAR=111;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00850981;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000144213;OID=.;OPOS=167144995;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:94:250:248:2:0:245:248:111:134:0:2:114:134:0:0 chr2 167145142 . A G 882.27 PASS AO=92;DP=92;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0597951;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.769;QD=37.9472;RBI=0.0613309;REFB=0;REVB=0.0136391;RO=0;SAF=22;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.82535e-05;OID=.;OPOS=167145142;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:92:93:0:0:92:93:70:22:0:0:70:23:0:0 chr2 167163043 . T C 226.44 PASS AO=63;DP=148;FAO=63;FDP=148;FR=.;FRO=85;FSAF=17;FSAR=46;FSRF=41;FSRR=44;FWDB=0.000132253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.9761;QD=6.11987;RBI=0.0456582;REFB=0.0086651;REVB=0.045658;RO=79;SAF=17;SAR=46;SRF=40;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.257937;STB=0.635495;TYPE=snp;VARB=-0.0117815;OID=.;OPOS=167163043;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:79:85:63:63:46:17:40:39:46:17:41:44 chr2 167266440 . C T 294.98 PASS AO=78;DP=174;FAO=78;FDP=174;FR=.;FRO=96;FSAF=31;FSAR=47;FSRF=40;FSRR=56;FWDB=-0.0441914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.782;QD=6.78124;RBI=0.0446923;REFB=-0.00528511;REVB=0.00667257;RO=96;SAF=31;SAR=47;SRF=40;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.019825;STB=0.511023;TYPE=snp;VARB=0.00656179;OID=.;OPOS=167266440;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:174:96:96:78:78:47:31:40:56:47:31:40:56 chr2 167269170 . A T 235.7 PASS AO=55;DP=112;FAO=55;FDP=112;FR=.;FRO=57;FSAF=12;FSAR=43;FSRF=14;FSRR=43;FWDB=0.00739248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.064;QD=8.4177;RBI=0.0333632;REFB=-0.00809647;REVB=0.0325339;RO=57;SAF=12;SAR=43;SRF=14;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0360475;STB=0.519993;TYPE=snp;VARB=0.00801201;OID=.;OPOS=167269170;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:57:57:55:55:43:12:14:43:43:12:14:43 chr2 167279922 . C A 132.57 PASS AO=43;DP=115;FAO=43;FDP=116;FR=.;FRO=73;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=27;FSRR=46;FWDB=-0.0875647;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6646;QD=4.5714;RBI=0.095664;REFB=0.0049451;REVB=0.0385231;RO=72;SAF=21;SAR=22;SRF=27;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125318;STB=0.574845;TYPE=snp;VARB=-0.00990029;OID=.;OPOS=167279922;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:116:72:73:43:43:22:21:27:45:22:21:27:46 chr2 167334085 . G T 631.12 PASS AO=136;DP=281;FAO=147;FDP=291;FR=.;FRO=144;FSAF=80;FSAR=67;FSRF=58;FSRR=86;FWDB=-0.00791568;FXX=0.00682571;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.71;QD=8.67514;RBI=0.0079462;REFB=0.00516348;REVB=0.000695777;RO=139;SAF=80;SAR=56;SRF=54;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183172;STB=0.569664;TYPE=snp;VARB=-0.00334858;OID=.;OPOS=167334085;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:281:291:139:144:136:147:56:80:54:85:67:80:58:86 chr2 168099738 . T C 149.04 PASS AO=35;DP=73;FAO=35;FDP=73;FR=.;FRO=38;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=-0.00657392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1151;QD=8.16671;RBI=0.0279214;REFB=-0.0159931;REVB=-0.0271365;RO=38;SAF=24;SAR=11;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.254858;STB=0.642773;TYPE=snp;VARB=0.023384;OID=.;OPOS=168099738;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:38:38:35:35:11:24:16:22:11:24:16:22 chr2 168099775 . C G 133.23 PASS AO=23;DP=53;FAO=24;FDP=49;FR=.,HEALED;FRO=21;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.0167215;FXX=0.039208;HRUN=3;LEN=1;MLLD=86.0597;QD=10.8759;RBI=0.0205963;REFB=-0.0460848;REVB=0.0120249;RO=13;SAF=16;SAR=7;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216579;STB=0.548345;TYPE=snp;VARB=0.026831;OID=.;OPOS=168099775;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:51:49:13:21:23:24:7:16:5:8:7:17:13:8 chr2 168099796 . T C 100.72 PASS AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=-0.00230201;FXX=0.039208;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.375;QD=8.22162;RBI=0.0441795;REFB=0.00322941;REVB=-0.0441195;RO=26;SAF=17;SAR=6;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0550657;STB=0.531222;TYPE=snp;VARB=-0.00782255;OID=.;OPOS=168099796;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:49:26:26:23:23:6:17:18:8:6:17:18:8 chr2 168103304 . G A 252.02 PASS AO=68;DP=155;FAO=68;FDP=155;FR=.;FRO=87;FSAF=18;FSAR=50;FSRF=16;FSRR=71;FWDB=-0.0205538;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.434;QD=6.50383;RBI=0.0278288;REFB=-0.00578838;REVB=0.0187612;RO=87;SAF=18;SAR=50;SRF=16;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111283;STB=0.561613;TYPE=snp;VARB=0.00716494;OID=.;OPOS=168103304;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:87:87:68:68:50:18:16:71:50:18:16:71 chr2 168103863 . G A 110.52 PASS AO=25;DP=50;FAO=25;FDP=52;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.0462818;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.329;QD=8.50131;RBI=0.0462961;REFB=-0.035977;REVB=0.0011521;RO=25;SAF=14;SAR=11;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106875;STB=0.540925;TYPE=snp;VARB=0.0288141;OID=.;OPOS=168103863;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:52:25:27:25:25:11:14:11:14:11:14:13:14 chr2 168103925 . A G 195.28 PASS AO=38;DP=66;FAO=38;FDP=66;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=19;FSRR=9;FWDB=0.00385343;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.5456;QD=11.8352;RBI=0.0139041;REFB=-0.0384889;REVB=0.0133595;RO=27;SAF=14;SAR=24;SRF=18;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226311;STB=0.63151;TYPE=snp;VARB=0.025719;OID=.;OPOS=168103925;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:27:28:38:38:24:14:18:9:24:14:19:9 chr2 168104199 . C T 199.54 PASS AO=36;DP=60;FAO=36;FDP=59;FR=.;FRO=23;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=3;FWDB=0.0203559;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.89;QD=13.5284;RBI=0.0280295;REFB=-0.0174679;REVB=-0.0192689;RO=23;SAF=24;SAR=12;SRF=20;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173924;STB=0.594547;TYPE=snp;VARB=0.00849487;OID=.;OPOS=168104199;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:60:59:23:23:36:36:12:24:20:3:12:24:20:3 chr2 168104370 . A C 85.06 PASS AO=30;DP=123;FAO=40;FDP=133;FR=.;FRO=93;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=73;FSRR=20;FWDB=0.00382982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.311;QD=2.55817;RBI=0.00870161;REFB=-0.0186675;REVB=0.00781348;RO=93;SAF=16;SAR=14;SRF=73;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.333466;STB=0.610523;TYPE=snp;VARB=0.0478231;OID=.;OPOS=168104370;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:123:133:93:93:30:40:14:16:73:20:14:26:73:20 chr2 168104627 . G A 104.01 PASS AO=30;DP=79;FAO=31;FDP=81;FR=.;FRO=50;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=29;FWDB=0.0042184;FXX=0.0121936;HRUN=3;LEN=1;MLLD=111.663;QD=5.13609;RBI=0.00471544;REFB=-0.0117151;REVB=-0.00210726;RO=49;SAF=17;SAR=13;SRF=20;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170315;STB=0.598512;TYPE=snp;VARB=0.0324358;OID=.;OPOS=168104627;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:81:49:50:30:31:13:17:20:29:13:18:21:29 chr2 168104988 . G T 95.59 PASS AO=28;DP=75;FAO=28;FDP=72;FR=.;FRO=44;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=0.00274997;FXX=0.0399947;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.352;QD=5.31081;RBI=0.0191439;REFB=-0.00454219;REVB=-0.0189454;RO=45;SAF=10;SAR=18;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192735;STB=0.590098;TYPE=snp;VARB=0.00775181;OID=.;OPOS=168104988;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:75:72:45:44:28:28:18:10:24:21:18:10:22:22 chr2 168106085 . G A 91.06 PASS AO=23;DP=53;FAO=23;FDP=53;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=25;FWDB=-0.0126487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.52;QD=6.87259;RBI=0.0177608;REFB=0.000383915;REVB=-0.0124682;RO=30;SAF=13;SAR=10;SRF=5;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.386633;STB=0.716373;TYPE=snp;VARB=-0.00145066;OID=.;OPOS=168106085;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:53:53:30:30:23:23:10:13:5:25:10:13:5:25 chr2 168106246 . G A 314.25 PASS AO=63;DP=114;FAO=64;FDP=114;FR=.;FRO=50;FSAF=53;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=31;FWDB=-0.0108162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.529;QD=11.0264;RBI=0.0188565;REFB=-0.0148917;REVB=0.0154459;RO=50;SAF=52;SAR=11;SRF=19;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.427872;STB=0.737491;TYPE=snp;VARB=0.0211498;OID=.;OPOS=168106246;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:50:50:63:64:11:52:19:31:11:53:19:31 chr2 168107155 . G A 222.28 PASS AO=45;DP=75;FAO=43;FDP=74;FR=.;FRO=31;FSAF=28;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=9;FWDB=-0.0177231;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.761;QD=12.0153;RBI=0.0178652;REFB=-0.0185547;REVB=0.00224837;RO=29;SAF=29;SAR=16;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0358212;STB=0.527414;TYPE=snp;VARB=0.0130323;OID=.;OPOS=168107155;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:74:29:31:45:43:16:29:20:9:15:28:22:9 chr2 168107491 . A G 200.61 PASS AO=62;DP=159;FAO=62;FDP=158;FR=.;FRO=96;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=40;FSRR=56;FWDB=0.00832955;FXX=0.00628891;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.597;QD=5.0787;RBI=0.0111325;REFB=-0.0301112;REVB=-0.00738589;RO=95;SAF=26;SAR=36;SRF=40;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00186898;STB=0.501677;TYPE=snp;VARB=0.0262765;OID=.;OPOS=168107491;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:158:95:96:62:62:36:26:40:55:36:26:40:56 chr2 168108357 . A G 52.2 PASS AO=14;DP=36;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.0278939;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.8615;QD=5.79969;RBI=0.0355204;REFB=2.63675e-05;REVB=-0.0219915;RO=21;SAF=7;SAR=7;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0733535;STB=0.527738;TYPE=snp;VARB=0.000291177;OID=.;OPOS=168108357;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:36:36:21:22:14:14:7:7:12:9:7:7:12:10 chr2 168115710 . T G 274.18 PASS AO=72;DP=161;FAO=72;FDP=161;FR=.;FRO=89;FSAF=44;FSAR=28;FSRF=49;FSRR=40;FWDB=-0.00284353;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9114;QD=6.81198;RBI=0.0147438;REFB=0.0130927;REVB=-0.014467;RO=89;SAF=44;SAR=28;SRF=49;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0622283;STB=0.534658;TYPE=snp;VARB=-0.0150514;OID=.;OPOS=168115710;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:161:89:89:72:72:28:44:49:40:28:44:49:40 chr2 168115769 . G C 165.58 PASS AO=52;DP=136;FAO=52;FDP=136;FR=.;FRO=84;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=41;FSRR=43;FWDB=0.0289868;FXX=0.00729874;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3075;QD=4.8701;RBI=0.0310725;REFB=-0.0168702;REVB=0.0111922;RO=81;SAF=23;SAR=29;SRF=40;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0557557;STB=0.528463;TYPE=snp;VARB=0.020877;OID=.;OPOS=168115769;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:81:84:52:52:29:23:40:41:29:23:41:43 chr2 168115797 . G C 126.29 PASS AO=43;DP=121;FAO=43;FDP=121;FR=.;FRO=78;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=36;FSRR=42;FWDB=0.0467984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.727;QD=4.17487;RBI=0.0475242;REFB=-0.0109416;REVB=-0.00827388;RO=78;SAF=19;SAR=24;SRF=36;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0223512;STB=0.512815;TYPE=snp;VARB=0.0165524;OID=.;OPOS=168115797;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:78:78:43:43:24:19:36:42:24:19:36:42 chr2 168116187 . C A 53.59 PASS AO=22;DP=74;FAO=22;FDP=75;FR=.;FRO=53;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=29;FSRR=24;FWDB=-0.0312098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.949;QD=2.85815;RBI=0.031211;REFB=-0.0205897;REVB=0.000276446;RO=51;SAF=15;SAR=7;SRF=28;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166151;STB=0.601457;TYPE=snp;VARB=0.0580355;OID=.;OPOS=168116187;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:74:75:51:53:22:22:7:15:28:23:7:15:29:24 chr2 168116189 . G A 49.71 PASS AO=22;DP=79;FAO=22;FDP=79;FR=.;FRO=57;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=33;FSRR=24;FWDB=-0.0377119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.885;QD=2.51685;RBI=0.0395926;REFB=-0.00945255;REVB=-0.0120574;RO=56;SAF=15;SAR=7;SRF=32;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142166;STB=0.580449;TYPE=snp;VARB=0.0434703;OID=.;OPOS=168116189;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:79:79:56:57:22:22:7:15:32:24:7:15:33:24 chr2 169707428 . C T 2700.25 PASS AO=278;DP=278;FAO=282;FDP=282;FR=.;FRO=0;FSAF=139;FSAR=143;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0138352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.6925;QD=38.3013;RBI=0.0255125;REFB=0;REVB=-0.0214354;RO=0;SAF=139;SAR=139;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.59844e-05;OID=.;OPOS=169707428;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:278:282:0:0:278:282:139:139:0:0:143:139:0:0 chr2 169721377 . G A 1346.47 PASS AO=155;DP=161;FAO=154;FDP=162;FR=.;FRO=8;FSAF=94;FSAR=60;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=-0.00355944;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.034;QD=33.2462;RBI=0.0241816;REFB=-0.0405614;REVB=0.0239182;RO=6;SAF=95;SAR=60;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0452249;STB=0.524918;TYPE=snp;VARB=0.02643;OID=.;OPOS=169721377;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:161:162:6:8:155:154:60:95:0:6:60:94:1:7 chr2 169789016 . T C 435.9 PASS AO=94;DP=175;FAO=94;FDP=175;FR=.;FRO=81;FSAF=42;FSAR=52;FSRF=32;FSRR=49;FWDB=-0.0410001;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.558;QD=9.96344;RBI=0.0438115;REFB=-0.0201852;REVB=0.0154415;RO=81;SAF=42;SAR=52;SRF=32;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0445735;STB=0.524346;TYPE=snp;VARB=0.0188136;OID=.;OPOS=169789016;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:175:81:81:94:94:52:42:32:49:52:42:32:49 chr2 169826877 . C T 707.28 PASS AO=74;DP=74;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0733634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.022;QD=37.7216;RBI=0.0761717;REFB=0;REVB=0.0204925;RO=0;SAF=31;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000128839;OID=.;OPOS=169826877;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:74:75:0:0:74:75:43:31:0:0:44:31:0:0 chr2 169830328 . A G 1710.64 PASS AO=177;DP=178;FAO=181;FDP=181;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0754329;FXX=0.0054942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.0254;QD=37.8041;RBI=0.0879362;REFB=0.0216568;REVB=-0.0451957;RO=1;SAF=73;SAR=104;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0045556;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.09192e-05;OID=.;OPOS=169830328;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:178:181:1:0:177:181:104:73:0:1:106:75:0:0 chr2 170010985 . T C 37.85 PASS AO=21;DP=122;FAO=23;FDP=103;FR=.,HEALED;FRO=80;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=45;FSRR=35;FWDB=-0.0254057;FXX=0.201535;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.536;QD=1.46998;RBI=0.0606243;REFB=-0.00818104;REVB=-0.0550442;RO=46;SAF=3;SAR=18;SRF=26;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.534976;STB=0.772292;TYPE=snp;VARB=0.0332759;OID=.;OPOS=170010985;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:95:103:46:80:21:23:18:3:26:20:18:5:45:35 chr2 170031734 . AG A 325.03 PASS AO=42;DP=87;FAO=83;FDP=85;FR=.;FRO=2;FSAF=47;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.338549;FXX=0.0116266;HRUN=3;LEN=1;MLLD=9.66424;QD=15.2955;RBI=0.363578;REFB=-0.0362395;REVB=-0.132567;RO=26;SAF=21;SAR=21;SRF=20;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0.487603;SSSB=-0.189086;STB=0.51351;TYPE=del;VARB=0.00131092;OID=.;OPOS=170031735;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:42:84:83:85:2:47:36:0:2:15:26:21:21:20:6 chr2 170053505 . C T 298.64 PASS AO=52;DP=81;FAO=52;FDP=81;FR=.;FRO=29;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=0.00803857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.463;QD=14.7475;RBI=0.0191237;REFB=-0.0104192;REVB=-0.0173521;RO=29;SAF=23;SAR=29;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0657244;STB=0.535649;TYPE=snp;VARB=0.00609447;OID=.;OPOS=170053505;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:81:81:29:29:52:52:29:23:10:19:29:23:10:19 chr2 170063471 . A G 603.22 PASS AO=135;DP=259;FAO=135;FDP=259;FR=.;FRO=124;FSAF=66;FSAR=69;FSRF=44;FSRR=80;FWDB=0.00823308;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.291;QD=9.31612;RBI=0.00909199;REFB=-0.012886;REVB=0.00385754;RO=124;SAF=66;SAR=69;SRF=44;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117994;STB=0.564385;TYPE=snp;VARB=0.0133908;OID=.;OPOS=170063471;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:259:259:124:124:135:135:69:66:44:80:69:66:44:80 chr2 170092395 . A G 515.42 PASS AO=117;DP=232;FAO=118;FDP=230;FR=.;FRO=112;FSAF=46;FSAR=72;FSRF=43;FSRR=69;FWDB=-0.00706507;FXX=0.00862032;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4093;QD=8.96379;RBI=0.0261102;REFB=-0.00625874;REVB=-0.0251362;RO=110;SAF=46;SAR=71;SRF=41;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.019041;STB=0.503024;TYPE=snp;VARB=0.00691183;OID=.;OPOS=170092395;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:230:110:112:117:118:71:46:41:69:72:46:43:69 chr2 170097707 . T G 506.26 PASS AO=106;DP=201;FAO=111;FDP=205;FR=.;FRO=94;FSAF=67;FSAR=44;FSRF=39;FSRR=55;FWDB=0.00867646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.019;QD=9.87824;RBI=0.0167979;REFB=-0.014754;REVB=-0.0143836;RO=90;SAF=62;SAR=44;SRF=36;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155537;STB=0.587131;TYPE=snp;VARB=0.0170937;OID=.;OPOS=170097707;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:205:90:94:106:111:44:62:36:54:44:67:39:55 chr2 170099473 . T C 282.85 PASS AO=56;DP=137;FAO=74;FDP=155;FR=.;FRO=81;FSAF=37;FSAR=37;FSRF=37;FSRR=44;FWDB=0.030666;FXX=0.00640985;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7625;QD=7.2994;RBI=0.0787334;REFB=-0.0433341;REVB=0.0725159;RO=81;SAF=37;SAR=19;SRF=37;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219385;STB=0.522575;TYPE=snp;VARB=0.0310073;OID=.;OPOS=170099473;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:155:81:81:56:74:19:37:37:44:37:37:37:44 chr2 170103336 . T C 538.45 PASS AO=137;DP=296;FAO=138;FDP=296;FR=.;FRO=158;FSAF=61;FSAR=77;FSRF=67;FSRR=91;FWDB=-0.0257217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.285;QD=7.27638;RBI=0.0272584;REFB=-0.000642375;REVB=-0.00902297;RO=157;SAF=60;SAR=77;SRF=67;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.011032;STB=0.509748;TYPE=snp;VARB=0.000738017;OID=.;OPOS=170103336;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:296:296:157:158:137:138:77:60:67:90:77:61:67:91 chr2 170103351 . G T 582.22 PASS AO=143;DP=297;FAO=143;FDP=296;FR=.;FRO=153;FSAF=64;FSAR=79;FSRF=65;FSRR=88;FWDB=0.0202287;FXX=0.00336689;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0305;QD=7.8679;RBI=0.0604232;REFB=-0.018919;REVB=0.0569364;RO=153;SAF=64;SAR=79;SRF=65;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0216492;STB=0.5119;TYPE=snp;VARB=0.0215378;OID=.;OPOS=170103351;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:297:296:153:153:143:143:79:64:65:88:79:64:65:88 chr2 170115588 . T C 617.03 PASS AO=150;DP=307;FAO=150;FDP=308;FR=.;FRO=158;FSAF=76;FSAR=74;FSRF=76;FSRR=82;FWDB=0.0161216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.235;QD=8.01332;RBI=0.01651;REFB=-0.00090984;REVB=-0.00356016;RO=157;SAF=76;SAR=74;SRF=75;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0269592;STB=0.513156;TYPE=snp;VARB=0.000961856;OID=.;OPOS=170115588;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:307:308:157:158:150:150:74:76:75:82:74:76:76:82 chr2 170129528 . G A 521.53 PASS AO=119;DP=229;FAO=118;FDP=229;FR=.;FRO=111;FSAF=68;FSAR=50;FSRF=72;FSRR=39;FWDB=-0.00073952;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0056;QD=9.10976;RBI=0.0448514;REFB=0.0178719;REVB=-0.0448453;RO=110;SAF=69;SAR=50;SRF=71;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0598066;STB=0.53631;TYPE=snp;VARB=-0.0185077;OID=.;OPOS=170129528;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:229:229:110:111:119:118:50:69:71:39:50:68:72:39 chr2 170175334 . T C 280.08 PASS AO=64;DP=126;FAO=64;FDP=127;FR=.;FRO=63;FSAF=25;FSAR=39;FSRF=25;FSRR=38;FWDB=-0.00749338;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.684;QD=8.82142;RBI=0.0153647;REFB=-0.00439712;REVB=-0.0134135;RO=62;SAF=25;SAR=39;SRF=24;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00331144;STB=0.503225;TYPE=snp;VARB=0.00409624;OID=.;OPOS=170175334;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:127:62:63:64:64:39:25:24:38:39:25:25:38 chr2 170218847 . C G 96.81 PASS AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0429511;FXX=0.0908265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.532;QD=38.7259;RBI=0.044041;REFB=0;REVB=0.00973726;RO=0;SAF=8;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00250059;OID=.;OPOS=170218847;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:10:10:0:0:10:10:2:8:0:0:2:8:0:0 chr2 170402752 . T C 194.41 PASS AO=44;DP=88;FAO=44;FDP=88;FR=.;FRO=44;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=37;FSRR=7;FWDB=0.00599482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.771;QD=8.83703;RBI=0.026098;REFB=-0.00689547;REVB=0.0254001;RO=43;SAF=17;SAR=27;SRF=36;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.386611;STB=0.716021;TYPE=snp;VARB=0.0113185;OID=.;OPOS=170402752;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:43:44:44:44:27:17:36:7:27:17:37:7 chr2 170441001 . G A 120.56 PASS AO=23;DP=41;FAO=23;FDP=41;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=3;FSRR=15;FWDB=0.00806462;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.58;QD=11.7614;RBI=0.0115018;REFB=0.00778418;REVB=0.00820075;RO=18;SAF=10;SAR=13;SRF=3;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223726;STB=0.62351;TYPE=snp;VARB=-0.0109873;OID=.;OPOS=170441001;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:41:41:18:18:23:23:13:10:3:15:13:10:3:15 chr2 170493103 . T A 83.52 PASS AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0325238;FXX=0.0999001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.016;QD=37.1207;RBI=0.0556621;REFB=-0.0603911;REVB=0.0451716;RO=0;SAF=6;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00104791;OID=.;OPOS=170493103;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:10:9:0:0:9:9:3:6:0:0:3:6:0:0 chr2 170493863 . A G 128.74 PASS AO=22;DP=34;FAO=22;FDP=34;FR=.;FRO=12;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.0928736;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.6713;QD=15.1458;RBI=0.109995;REFB=0.002021;REVB=0.0589353;RO=12;SAF=13;SAR=9;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164406;STB=0.590826;TYPE=snp;VARB=0.00146253;OID=.;OPOS=170493863;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:34:34:12:12:22:22:9:13:4:8:9:13:4:8 chr2 170502401 . G A 223.49 PASS AO=60;DP=136;FAO=60;FDP=137;FR=.;FRO=77;FSAF=39;FSAR=21;FSRF=40;FSRR=37;FWDB=-0.011777;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.358;QD=6.52527;RBI=0.0363597;REFB=-0.00289554;REVB=-0.0343996;RO=76;SAF=39;SAR=21;SRF=39;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142938;STB=0.576867;TYPE=snp;VARB=0.00526685;OID=.;OPOS=170502401;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:137:76:77:60:60:21:39:39:37:21:39:40:37 chr2 170550839 . A G 223.03 PASS AO=51;DP=103;FAO=51;FDP=102;FR=.;FRO=51;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=25;FSRR=26;FWDB=-0.0115017;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.439;QD=8.74611;RBI=0.0152843;REFB=-0.0104042;REVB=0.0100658;RO=52;SAF=21;SAR=30;SRF=26;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0816247;STB=0.53989;TYPE=snp;VARB=0.0102877;OID=.;OPOS=170550839;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:102:52:51:51:51:30:21:26:26:30:21:25:26 chr2 170605981 . C T 1713.37 PASS AO=181;DP=183;FAO=181;FDP=181;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150813;FXX=0.0163035;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.4965;QD=37.8645;RBI=0.0763459;REFB=-0.045762;REVB=-0.0748415;RO=1;SAF=76;SAR=105;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00451281;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.03302e-05;OID=.;OPOS=170605981;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:183:181:1:0:181:181:105:76:0:1:105:76:0:0 chr2 170632969 . C A 141.57 PASS AO=29;DP=56;FAO=30;FDP=57;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=0.0235443;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9339;QD=9.93483;RBI=0.0396673;REFB=-0.0125834;REVB=-0.0319243;RO=27;SAF=12;SAR=17;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0728466;STB=0.533311;TYPE=snp;VARB=0.0026866;OID=.;OPOS=170632969;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:57:27:27:29:30:17:12:9:18:18:12:9:18 chr2 170672843 . G A 555.27 PASS AO=55;DP=57;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.161269;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=40.2503;QD=35.824;RBI=0.178563;REFB=0;REVB=0.0766616;RO=1;SAF=26;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177852;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00786197;OID=.;OPOS=170672843;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:57:62:1:0:55:62:29:26:1:0:33:29:0:0 chr2 170762566 . A T 223.84 PASS AO=56;DP=115;FAO=54;FDP=114;FR=.;FRO=60;FSAF=31;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=35;FWDB=-0.00682426;FXX=0.0086949;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.4183;QD=7.85392;RBI=0.0660683;REFB=-0.0112629;REVB=-0.0657149;RO=59;SAF=31;SAR=25;SRF=25;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119963;STB=0.582601;TYPE=snp;VARB=0.00784351;OID=.;OPOS=170762566;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:114:59:60:56:54:25:31:25:34:23:31:25:35 chr2 170917648 . A G 906.43 PASS AO=86;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.208306;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.3261;QD=35.201;RBI=0.208386;REFB=0;REVB=0.00579249;RO=10;SAF=42;SAR=44;SRF=10;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100396;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00516582;OID=.;OPOS=170917648;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:103:103:10:0:86:103:44:42:10:0:44:59:0:0 chr2 170938659 . G A 659.74 PASS AO=68;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0244029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.8107;QD=38.2458;RBI=0.0289755;REFB=0;REVB=0.0156229;RO=0;SAF=42;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000795283;OID=.;OPOS=170938659;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:69:69:0:0:68:69:26:42:0:0:27:42:0:0 chr2 170976590 . A G 545.7 PASS AO=60;DP=65;FAO=61;FDP=63;FR=.;FRO=2;FSAF=16;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00856441;FXX=0.0454477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.65;QD=34.6478;RBI=0.00973812;REFB=-0.0496741;REVB=0.00463486;RO=0;SAF=16;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6631e-08;STB=0.509657;TYPE=snp;VARB=3.18185e-05;OID=.;OPOS=170976590;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:65:63:0:2:60:61:44:16:0:0:45:16:1:1 chr2 171225841 . A G 177.42 PASS AO=65;DP=190;FAO=65;FDP=188;FR=.;FRO=123;FSAF=28;FSAR=37;FSRF=62;FSRR=61;FWDB=0.0255165;FXX=0.0105258;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.346;QD=3.77493;RBI=0.0337694;REFB=-0.00330013;REVB=0.0221196;RO=122;SAF=28;SAR=37;SRF=62;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0887789;STB=0.548223;TYPE=snp;VARB=0.00967848;OID=.;OPOS=171225841;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:188:122:123:65:65:37:28:62:60:37:28:62:61 chr2 171240249 . C T 410.92 PASS AO=100;DP=207;FAO=100;FDP=207;FR=.;FRO=107;FSAF=18;FSAR=82;FSRF=26;FSRR=81;FWDB=-0.015921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.547;QD=7.94054;RBI=0.0429735;REFB=-0.029512;REVB=-0.0399154;RO=105;SAF=18;SAR=82;SRF=24;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0722883;STB=0.551502;TYPE=snp;VARB=0.02121;OID=.;OPOS=171240249;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:207:105:107:100:100:82:18:24:81:82:18:26:81 chr2 171260787 . G A 1153.41 PASS AO=121;DP=121;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0101935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.3198;QD=38.1292;RBI=0.0346022;REFB=0;REVB=0.0330667;RO=0;SAF=97;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.58363e-05;OID=.;OPOS=171260787;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:121:121:0:0:121:121:24:97:0:0:24:97:0:0 chr2 171260797 . A G 235.73 PASS AO=50;DP=118;FAO=57;FDP=120;FR=.;FRO=63;FSAF=40;FSAR=17;FSRF=55;FSRR=8;FWDB=0.00175327;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.48;QD=7.85757;RBI=0.0459925;REFB=-0.0130155;REVB=-0.0459591;RO=68;SAF=33;SAR=17;SRF=60;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.285343;STB=0.617555;TYPE=snp;VARB=0.0137696;OID=.;OPOS=171260797;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:120:68:63:50:57:17:33:60:8:17:40:55:8 chr2 171260820 . T C 936.63 PASS AO=103;DP=106;FAO=103;FDP=106;FR=.;FRO=3;FSAF=88;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.00962529;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3069;QD=35.3447;RBI=0.0191796;REFB=-0.0370435;REVB=-0.0165895;RO=3;SAF=88;SAR=15;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0538148;STB=0.528429;TYPE=snp;VARB=0.00584393;OID=.;OPOS=171260820;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:106:106:3:3:103:103:15:88:1:2:15:88:1:2 chr2 171355198 . A G 623.38 PASS AO=65;DP=68;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0681359;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.994;QD=36.6696;RBI=0.0684779;REFB=-0.113675;REVB=-0.00683465;RO=2;SAF=11;SAR=54;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0784496;STB=0.519994;TYPE=snp;VARB=0.000628663;OID=.;OPOS=171355198;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:68:68:2:1:65:67:54:11:2:0:55:12:1:0 chr2 171356274 . G A 2346.6 PASS AO=240;DP=249;FAO=266;FDP=266;FR=.;FRO=0;FSAF=128;FSAR=138;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194881;FXX=0.00746241;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.1646;QD=35.2872;RBI=0.079266;REFB=-0.0282833;REVB=0.0768331;RO=9;SAF=121;SAR=119;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0188318;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00349729;OID=.;OPOS=171356274;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:249:266:9:0:240:266:119:121:7:2:138:128:0:0 chr2 171400449 . T C 393.82 PASS AO=62;DP=152;FAO=80;FDP=149;FR=.,HEALED;FRO=66;FSAF=58;FSAR=22;FSRF=43;FSRR=23;FWDB=0.0206201;FXX=0.0197355;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.253;QD=10.5722;RBI=0.0513078;REFB=-0.0363714;REVB=0.0469819;RO=63;SAF=40;SAR=22;SRF=42;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.021591;STB=0.540139;TYPE=snp;VARB=0.0318149;OID=.;OPOS=171400449;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:149:63:66:62:80:22:40:42:21:22:58:43:23 chr2 171572940 . G A 22.28 PASS AO=4;DP=9;FAO=4;FDP=9;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.0289922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.928;QD=9.90321;RBI=0.0339995;REFB=-0.020301;REVB=-0.01776;RO=4;SAF=2;SAR=2;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.418587;STB=0.665923;TYPE=snp;VARB=0.108738;OID=.;OPOS=171572940;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:9:9:4:5:4:4:2:2:4:0:2:2:4:1 chr2 171649402 . C T 308.46 PASS AO=71;DP=145;FAO=72;FDP=147;FR=.;FRO=75;FSAF=16;FSAR=56;FSRF=31;FSRR=44;FWDB=-0.0322284;FXX=0.0134219;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.5591;QD=8.39355;RBI=0.0482507;REFB=-0.00603577;REVB=-0.0359091;RO=73;SAF=16;SAR=55;SRF=30;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211015;STB=0.621891;TYPE=snp;VARB=0.00613748;OID=.;OPOS=171649402;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:147:73:75:71:72:55:16:30:43:56:16:31:44 chr2 171678625 . T C 49.59 PASS AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=16;FWDB=0.0235172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.722;QD=6.8402;RBI=0.0235182;REFB=-0.0148984;REVB=-0.000213731;RO=17;SAF=7;SAR=5;SRF=1;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.506427;STB=0.785741;TYPE=snp;VARB=0.0221629;OID=.;OPOS=171678625;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:29:29:17:17:12:12:5:7:1:16:5:7:1:16 chr2 171822466 . C T 220.87 PASS AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0388921;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.307;QD=36.8114;RBI=0.0389448;REFB=0;REVB=0.00202545;RO=0;SAF=11;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000206279;OID=.;OPOS=171822466;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:24:24:0:0:24:24:13:11:0:0:13:11:0:0 chr2 171910313 . C T 100.41 PASS AO=32;DP=87;FAO=32;FDP=87;FR=.;FRO=55;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=27;FSRR=28;FWDB=-0.0431322;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.2462;QD=4.61646;RBI=0.0602767;REFB=0.0168272;REVB=0.0421057;RO=55;SAF=21;SAR=11;SRF=27;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187498;STB=0.607949;TYPE=snp;VARB=-0.0274641;OID=.;OPOS=171910313;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:55:55:32:32:11:21:27:28:11:21:27:28 chr2 172174150 . A G 129.24 PASS AO=34;DP=79;FAO=34;FDP=79;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=30;FWDB=0.013875;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.628;QD=6.54359;RBI=0.0145637;REFB=-0.0118729;REVB=0.00442543;RO=45;SAF=18;SAR=16;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196715;STB=0.610557;TYPE=snp;VARB=0.010632;OID=.;OPOS=172174150;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:45:45:34:34:16:18:15:30:16:18:15:30 chr2 172174151 . A C 129.27 PASS AO=34;DP=79;FAO=34;FDP=79;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=30;FWDB=0.0183381;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.0933;QD=6.54535;RBI=0.0394378;REFB=0.0129963;REVB=-0.0349149;RO=45;SAF=18;SAR=16;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196715;STB=0.610557;TYPE=snp;VARB=-0.0171283;OID=.;OPOS=172174151;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:45:45:34:34:16:18:15:30:16:18:15:30 chr2 172180771 . A G 2850.1 PASS AO=298;DP=298;FAO=297;FDP=297;FR=.;FRO=0;FSAF=163;FSAR=134;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00133579;FXX=0.00335559;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.332;QD=38.3852;RBI=0.0116563;REFB=0;REVB=0.0115795;RO=0;SAF=164;SAR=134;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.86656e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.52592e-05;OID=.;OPOS=172180771;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:298:297:0:0:298:297:134:164:0:0:134:163:0:0 chr2 172188368 . C T 206.35 PASS AO=48;DP=98;FAO=48;FDP=98;FR=.;FRO=50;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=17;FSRR=33;FWDB=0.0364491;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=270.856;QD=8.4224;RBI=0.0394596;REFB=-0.0100608;REVB=0.015117;RO=49;SAF=20;SAR=28;SRF=16;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0860261;STB=0.540763;TYPE=snp;VARB=0.010865;OID=.;OPOS=172188368;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:49:50:48:48:28:20:16:33:28:20:17:33 chr2 172216969 . T C 157.8 PASS AO=39;DP=86;FAO=40;FDP=89;FR=.;FRO=49;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=-0.0699434;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.1725;QD=7.09205;RBI=0.113704;REFB=-0.0056736;REVB=-0.0896464;RO=47;SAF=16;SAR=23;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119542;STB=0.561613;TYPE=snp;VARB=0.00345202;OID=.;OPOS=172216969;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:89:47:49:39:40:23:16:25:22:24:16:25:24 chr2 172291616 . C T 348.87 PASS AO=86;DP=189;FAO=88;FDP=188;FR=.;FRO=100;FSAF=28;FSAR=60;FSRF=33;FSRR=67;FWDB=-0.0156068;FXX=0.0105258;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.705;QD=7.42274;RBI=0.0220109;REFB=-0.00473318;REVB=0.0155212;RO=103;SAF=28;SAR=58;SRF=35;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0158045;STB=0.507205;TYPE=snp;VARB=0.00516341;OID=.;OPOS=172291616;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:188:103:100:86:88:58:28:35:68:60:28:33:67 chr2 172329458 . G T 264.43 PASS AO=68;DP=150;FAO=68;FDP=150;FR=.;FRO=82;FSAF=33;FSAR=35;FSRF=39;FSRR=43;FWDB=-0.000820831;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.622;QD=7.05137;RBI=0.00559556;REFB=-0.0183886;REVB=-0.00553503;RO=79;SAF=33;SAR=35;SRF=37;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0164234;STB=0.505299;TYPE=snp;VARB=0.0163088;OID=.;OPOS=172329458;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:150:79:82:68:68:35:33:37:42:35:33:39:43 chr2 172330393 . A G 300.36 PASS AO=68;DP=137;FAO=69;FDP=137;FR=.;FRO=68;FSAF=51;FSAR=18;FSRF=31;FSRR=37;FWDB=-0.00118052;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.7082;QD=8.76968;RBI=0.0105687;REFB=0.000873527;REVB=0.0105026;RO=69;SAF=50;SAR=18;SRF=32;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.271659;STB=0.655173;TYPE=snp;VARB=-0.00657508;OID=.;OPOS=172330393;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:69:68:68:69:18:50:32:37:18:51:31:37 chr2 172378818 . A G 84.71 PASS AO=21;DP=47;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.0472339;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.139;QD=7.05902;RBI=0.0624123;REFB=-0.0109642;REVB=-0.0407952;RO=26;SAF=5;SAR=16;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132096;STB=0.592498;TYPE=snp;VARB=0.0152177;OID=.;OPOS=172378818;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:47:48:26:27:21:21:16:5:9:17:16:5:10:17 chr2 172379781 . G A 90.9 PASS AO=21;DP=47;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=19;FSRR=6;FWDB=0.0210102;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.344;QD=7.73625;RBI=0.0216816;REFB=-0.0139968;REVB=0.00535392;RO=25;SAF=15;SAR=6;SRF=20;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106305;STB=0.522368;TYPE=snp;VARB=0.0139287;OID=.;OPOS=172379781;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:47:47:25:25:21:22:6:15:20:5:6:16:19:6 chr2 172411273 . G A 427.46 PASS AO=77;DP=122;FAO=77;FDP=122;FR=.;FRO=45;FSAF=31;FSAR=46;FSRF=16;FSRR=29;FWDB=-0.0458331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.938;QD=14.0152;RBI=0.0464626;REFB=-0.0112973;REVB=-0.00762192;RO=44;SAF=31;SAR=46;SRF=16;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0273917;STB=0.518159;TYPE=snp;VARB=0.00605426;OID=.;OPOS=172411273;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:44:45:77:77:46:31:16:28:46:31:16:29 chr2 172693780 . G A 346.87 PASS AO=79;DP=155;FAO=79;FDP=155;FR=.;FRO=76;FSAF=38;FSAR=41;FSRF=30;FSRR=46;FWDB=-0.0119719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7773;QD=8.95147;RBI=0.0148841;REFB=0.00525173;REVB=0.0088436;RO=76;SAF=38;SAR=41;SRF=30;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0773807;STB=0.54249;TYPE=snp;VARB=-0.00557996;OID=.;OPOS=172693780;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:76:76:79:79:41:38:30:46:41:38:30:46 chr2 172709215 . G C 641.9 PASS AO=63;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00957554;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.444;QD=38.3221;RBI=0.0149206;REFB=0;REVB=-0.0114427;RO=0;SAF=29;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.01123e-05;OID=.;OPOS=172709215;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:66:67:0:0:63:67:34:29:0:0:34:33:0:0 chr2 172725301 . A G 1697.48 PASS AO=178;DP=180;FAO=179;FDP=179;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0551471;FXX=0.00555525;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.7047;QD=37.9325;RBI=0.059993;REFB=-0.0134141;REVB=-0.0236211;RO=1;SAF=75;SAR=103;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00630499;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.4249e-05;OID=.;OPOS=172725301;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:180:179:1:0:178:179:103:75:1:0:103:76:0:0 chr2 172841168 . GTTTTTC GTTTTC,GTTTT 54.34 PASS AO=23,18;DP=141;FAO=47,0;FDP=112;FR=.;FRO=65;FSAF=23,0;FSAR=24,0;FSRF=43;FSRR=22;FWDB=-0.0308456,-0.134278;FXX=0.0508431;HRUN=5,5;LEN=1,2;MLLD=10.1387,17.4438;QD=1.94073;RBI=0.133612,0.210558;REFB=-0.110989,-0.0312933;REVB=-0.130003,-0.162185;RO=53;SAF=7,12;SAR=16,6;SRF=33;SRR=20;SSEN=0.375,0.375;SSEP=0,0;SSSB=-0.368297,0.0587476;STB=0.599505,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.114488,0;OID=.,.;OPOS=172841169,172841173;OREF=T,TC;OALT=-,-;OMAPALT=GTTTTC,GTTTT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:23,18:110:47,0:112:65:23,0:24,0:43:22:53:53:7,12:16,6:33:20 chr2 172964638 . C A 455.81 PASS AO=45;DP=45;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.487;QD=37.9845;RBI=0.0199863;REFB=0;REVB=0.0166208;RO=0;SAF=27;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.35612e-05;OID=.;OPOS=172964638;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:45:48:0:0:45:48:18:27:0:0:20:28:0:0 chr2 172966250 . T C 124.33 PASS AO=33;DP=77;FAO=33;FDP=77;FR=.;FRO=44;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=0.00910591;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.058;QD=6.45856;RBI=0.00926267;REFB=-0.0111861;REVB=-0.00169689;RO=44;SAF=15;SAR=18;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0461028;STB=0.526051;TYPE=snp;VARB=0.0151106;OID=.;OPOS=172966250;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:44:44:33:33:18:15:22:22:18:15:22:22 chr2 173339808 . G A 314.87 PASS AO=83;DP=196;FAO=86;FDP=198;FR=.;FRO=112;FSAF=25;FSAR=61;FSRF=51;FSRR=61;FWDB=0.0290723;FXX=0.0099995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.194;QD=6.36097;RBI=0.0308476;REFB=-0.021952;REVB=0.0103139;RO=112;SAF=25;SAR=58;SRF=51;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173044;STB=0.603149;TYPE=snp;VARB=0.025234;OID=.;OPOS=173339808;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:198:112:112:83:86:58:25:51:61:61:25:51:61 chr2 173460640 . T C 476.57 PASS AO=115;DP=243;FAO=118;FDP=246;FR=.;FRO=128;FSAF=40;FSAR=78;FSRF=54;FSRR=74;FWDB=-0.0951851;FXX=0.00806419;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.404;QD=7.74907;RBI=0.0954295;REFB=-0.030535;REVB=0.00682497;RO=126;SAF=40;SAR=75;SRF=52;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0661995;STB=0.546667;TYPE=snp;VARB=0.032586;OID=.;OPOS=173460640;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:243:246:126:128:115:118:75:40:52:74:78:40:54:74 chr2 173917425 . G A 1813.01 PASS AO=189;DP=191;FAO=193;FDP=193;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00330463;FXX=0.0102559;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.7472;QD=37.5754;RBI=0.0114593;REFB=0.0364821;REVB=0.0109725;RO=2;SAF=93;SAR=96;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000158312;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000223751;OID=.;OPOS=173917425;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:191:193:2:0:189:193:96:93:1:1:100:93:0:0 chr2 174068513 . G C 1066.54 PASS AO=112;DP=113;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301821;FXX=0.0260847;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.7391;QD=38.0907;RBI=0.0426563;REFB=0;REVB=0.030143;RO=0;SAF=79;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.02371e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000418504;OID=.;OPOS=174068513;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:113:112:0:0:112:112:33:79:0:0:33:79:0:0 chr2 174091088 . T C 436.66 PASS AO=108;DP=226;FAO=108;FDP=226;FR=.;FRO=118;FSAF=63;FSAR=45;FSRF=63;FSRR=55;FWDB=-0.0184122;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.5034;QD=7.72841;RBI=0.0186365;REFB=-0.0176197;REVB=-0.00288253;RO=117;SAF=63;SAR=45;SRF=62;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0513212;STB=0.526311;TYPE=snp;VARB=0.0211579;OID=.;OPOS=174091088;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:226:226:117:118:108:108:45:63:62:55:45:63:63:55 chr2 174091200 . A G 547.6 PASS AO=148;DP=319;FAO=145;FDP=319;FR=.;FRO=174;FSAF=54;FSAR=91;FSRF=66;FSRR=108;FWDB=0.0457247;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.102;QD=6.86639;RBI=0.0463975;REFB=0.0175384;REVB=-0.00787316;RO=171;SAF=56;SAR=92;SRF=64;SRR=107;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00424876;STB=0.504015;TYPE=snp;VARB=-0.020176;OID=.;OPOS=174091200;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:319:319:171:174:148:145:92:56:64:107:91:54:66:108 chr2 174128513 . C T 184.77 PASS AO=56;DP=150;FAO=59;FDP=154;FR=.;FRO=95;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=42;FSRR=53;FWDB=0.0188633;FXX=0.0128197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.8216;QD=4.79915;RBI=0.0630246;REFB=-0.0241952;REVB=0.0601355;RO=92;SAF=30;SAR=26;SRF=42;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0866274;STB=0.561629;TYPE=snp;VARB=0.0333982;OID=.;OPOS=174128513;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:154:92:95:56:59:26:30:42:50:27:32:42:53 chr2 174946760 . T C 1308.95 PASS AO=136;DP=137;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.459;QD=38.2174;RBI=0.0339929;REFB=0;REVB=0.0219215;RO=0;SAF=53;SAR=83;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.78586e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000671858;OID=.;OPOS=174946760;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:137:137:0:0:136:137:83:53:0:0:84:53:0:0 chr2 175104996 . T G 520.95 PASS AO=111;DP=208;FAO=112;FDP=209;FR=.;FRO=97;FSAF=57;FSAR=55;FSRF=39;FSRR=58;FWDB=0.0259029;FXX=0.00476168;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.16;QD=9.9704;RBI=0.0267277;REFB=-0.000305311;REVB=0.00658863;RO=95;SAF=57;SAR=54;SRF=39;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.086894;STB=0.549518;TYPE=snp;VARB=0.000441466;OID=.;OPOS=175104996;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:209:95:97:111:112:54:57:39:56:55:57:39:58 chr2 175287778 . G A 1721.64 PASS AO=183;DP=186;FAO=185;FDP=185;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00853856;FXX=0.0106946;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.855;QD=37.2246;RBI=0.0149801;REFB=-0.00140491;REVB=-0.0123084;RO=2;SAF=77;SAR=106;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.012204;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.22546e-05;OID=.;OPOS=175287778;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:186:185:2:0:183:185:106:77:2:0:106:79:0:0 chr2 175292580 . TTCAAATTTATCAG T 589.55 PASS AO=100;DP=149;FAO=105;FDP=129;FR=.;FRO=24;FSAF=40;FSAR=65;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.00715304;FXX=0.0719373;HRUN=2;LEN=13;MLLD=301.995;QD=18.2806;RBI=0.0305001;REFB=-0.0124445;REVB=0.0296494;RO=23;SAF=36;SAR=64;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107719;STB=0.554867;TYPE=del;VARB=0.00308253;OID=.;OPOS=175292581;OREF=TCAAATTTATCAG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:100:133:105:129:24:40:65:16:8:8:23:36:64:15:8 chr2 175300997 . G A 2578.18 PASS AO=269;DP=270;FAO=269;FDP=269;FR=.;FRO=0;FSAF=127;FSAR=142;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132352;FXX=0.0073798;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.092;QD=38.3372;RBI=0.0170423;REFB=0;REVB=0.0107363;RO=0;SAF=127;SAR=142;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.70788e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.42448e-05;OID=.;OPOS=175300997;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:270:269:0:0:269:269:142:127:0:0:142:127:0:0 chr2 175424779 . T G 325.01 PASS AO=74;DP=148;FAO=74;FDP=146;FR=.;FRO=72;FSAF=22;FSAR=52;FSRF=34;FSRR=38;FWDB=0.00622287;FXX=0.0135126;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.485;QD=8.90441;RBI=0.0175984;REFB=-0.00605081;REVB=0.0164615;RO=65;SAF=22;SAR=52;SRF=30;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155439;STB=0.595231;TYPE=snp;VARB=0.00512037;OID=.;OPOS=175424779;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:146:65:72:74:74:52:22:30:35:52:22:34:38 chr2 175425476 . G A 1683.35 PASS AO=169;DP=170;FAO=181;FDP=181;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=108;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0219485;FXX=0.0054942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.377;QD=37.2011;RBI=0.0440217;REFB=-0.0353198;REVB=0.0381598;RO=0;SAF=68;SAR=101;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07522e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000254767;OID=.;OPOS=175425476;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:170:181:0:0:169:181:101:68:0:0:108:73:0:0 chr2 175426274 . C G 1220.61 PASS AO=127;DP=127;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00398054;FXX=0.0303007;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.573;QD=38.144;RBI=0.00728119;REFB=0;REVB=0.00609681;RO=0;SAF=44;SAR=83;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.75811e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000127901;OID=.;OPOS=175426274;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:127:128:0:0:127:128:83:44:0:0:84:44:0:0 chr2 175436940 . G A 243.17 PASS AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0290463;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.511;QD=37.4115;RBI=0.0694078;REFB=0;REVB=0.0630377;RO=0;SAF=23;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000536694;OID=.;OPOS=175436940;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:26:26:0:0:26:26:3:23:0:0:3:23:0:0 chr2 176964904 . G A 177.72 PASS AO=36;DP=65;FAO=36;FDP=65;FR=.;FRO=29;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=0.0101709;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.916;QD=10.9367;RBI=0.0135212;REFB=-0.0439421;REVB=0.00890929;RO=29;SAF=20;SAR=16;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0536848;STB=0.5296;TYPE=snp;VARB=0.0354641;OID=.;OPOS=176964904;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:29:29:36:36:16:20:18:11:16:20:18:11 chr2 176965086 . G A 164.79 PASS AO=45;DP=90;FAO=39;FDP=83;FR=.;FRO=44;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=27;FWDB=-0.00272933;FXX=0.0777691;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.792;QD=7.94168;RBI=0.0564839;REFB=-0.000859261;REVB=0.0564179;RO=43;SAF=19;SAR=26;SRF=17;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0244288;STB=0.540317;TYPE=snp;VARB=-0.00036736;OID=.;OPOS=176965086;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:83:43:44:45:39:26:19:17:26:21:18:17:27 chr2 177016728 . T C 36.67 PASS AO=11;DP=37;FAO=12;FDP=38;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.010107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.927;QD=3.85968;RBI=0.0101163;REFB=-0.00229168;REVB=-0.000433523;RO=26;SAF=7;SAR=4;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159583;STB=0.557426;TYPE=snp;VARB=0.00445448;OID=.;OPOS=177016728;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:37:38:26:26:11:12:4:7:13:13:5:7:13:13 chr2 177034121 . G T 26.79 PASS AO=4;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0430209;FXX=0.110988;HRUN=3;LEN=1;MLLD=113.876;QD=13.3958;RBI=0.104247;REFB=-0.0376038;REVB=-0.094956;RO=3;SAF=1;SAR=3;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.490704;STB=0.713517;TYPE=snp;VARB=0.0466049;OID=.;OPOS=177034121;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:8:8:3:3:4:5:3:1:3:0:3:2:3:0 chr2 177036754 . T C 10.3 PASS AO=2;DP=8;FAO=2;FDP=8;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.00308741;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.6438;QD=5.14915;RBI=0.00308741;REFB=-0.0153849;REVB=0;RO=6;SAF=2;SAR=0;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0327015;OID=.;OPOS=177036754;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:8:6:6:2:2:0:2:6:0:0:2:6:0 chr2 177054411 . T C 227.43 PASS AO=56;DP=120;FAO=56;FDP=120;FR=.;FRO=64;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=33;FSRR=31;FWDB=-0.00101836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.388;QD=7.58087;RBI=0.00444435;REFB=0.00765952;REVB=0.00432611;RO=61;SAF=23;SAR=33;SRF=33;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123301;STB=0.556606;TYPE=snp;VARB=-0.0106785;OID=.;OPOS=177054411;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:61:64:56:56:33:23:33:28:33:23:33:31 chr2 177054769 . G A 202.7 PASS AO=45;DP=90;FAO=45;FDP=89;FR=.;FRO=44;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=0.00490559;FXX=0.0111099;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.5163;QD=9.11009;RBI=0.0348764;REFB=-0.0115296;REVB=0.0345297;RO=42;SAF=18;SAR=27;SRF=16;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0173968;STB=0.504671;TYPE=snp;VARB=0.0136312;OID=.;OPOS=177054769;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:89:42:44:45:45:27:18:16:26:27:18:18:26 chr2 178085137 . G A 159.92 PASS AO=52;DP=139;FAO=52;FDP=140;FR=.;FRO=88;FSAF=33;FSAR=19;FSRF=55;FSRR=33;FWDB=0.0113535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.496;QD=4.569;RBI=0.0185393;REFB=0.00301234;REVB=-0.0146562;RO=85;SAF=33;SAR=19;SRF=55;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0147361;STB=0.506491;TYPE=snp;VARB=-0.0050944;OID=.;OPOS=178085137;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:140:85:88:52:52:19:33:55:30:19:33:55:33 chr2 178417142 . C T 753.37 PASS AO=82;DP=86;FAO=82;FDP=84;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=59;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.013004;FXX=0.0232531;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.172;QD=35.8746;RBI=0.034344;REFB=-0.116981;REVB=0.0317869;RO=2;SAF=23;SAR=59;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0394056;STB=0.520828;TYPE=snp;VARB=0.00135226;OID=.;OPOS=178417142;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:86:84:2:2:82:82:59:23:2:0:59:23:2:0 chr2 178417225 . C T 497.84 PASS AO=50;DP=50;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.130022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.212;QD=37.5727;RBI=0.131106;REFB=0;REVB=0.0168233;RO=0;SAF=19;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000667788;OID=.;OPOS=178417225;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:50:53:0:0:50:53:31:19:0:0:34:19:0:0 chr2 178481818 . G T 1688.9 PASS AO=175;DP=180;FAO=175;FDP=175;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0210949;FXX=0.0277762;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.463;QD=38.6035;RBI=0.0244046;REFB=0;REVB=0.0122715;RO=0;SAF=85;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.9722e-05;OID=.;OPOS=178481818;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:180:175:0:0:175:175:90:85:0:0:90:85:0:0 chr2 178482094 . C T 220.87 PASS AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0278747;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.616;QD=36.811;RBI=0.0392443;REFB=0;REVB=-0.0276246;RO=0;SAF=22;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.48349e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.20393e-06;OID=.;OPOS=178482094;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:24:24:0:0:24:24:2:22:0:0:2:22:0:0 chr2 178482594 . G T 219.78 PASS AO=45;DP=183;FAO=71;FDP=174;FR=.,HEALED;FRO=103;FSAF=18;FSAR=53;FSRF=45;FSRR=58;FWDB=-0.0245016;FXX=0.011363;HRUN=3;LEN=1;MLLD=215.31;QD=5.05235;RBI=0.0250396;REFB=-0.00896872;REVB=-0.00516279;RO=72;SAF=3;SAR=42;SRF=20;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.463848;STB=0.625595;TYPE=snp;VARB=0.013705;OID=.;OPOS=178482594;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:174:72:103:45:71:42:3:20:52:53:18:45:58 chr2 178483577 . A T 243.23 PASS AO=79;DP=195;FAO=79;FDP=195;FR=.;FRO=116;FSAF=30;FSAR=49;FSRF=56;FSRR=60;FWDB=0.00484732;FXX=0.00510178;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.118;QD=4.9893;RBI=0.0282595;REFB=-0.0183331;REVB=0.0278407;RO=115;SAF=29;SAR=50;SRF=56;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130709;STB=0.563052;TYPE=snp;VARB=0.00951;OID=.;OPOS=178483577;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:195:115:116:79:79:50:29:56:59:49:30:56:60 chr2 178491217 . G A 1394.04 PASS AO=146;DP=146;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.013;QD=38.1928;RBI=0.0349658;REFB=0;REVB=0.031127;RO=0;SAF=54;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000118013;OID=.;OPOS=178491217;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:146:146:0:0:146:146:92:54:0:0:92:54:0:0 chr2 178493301 . G T 584.24 PASS AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0294593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.43;QD=37.6927;RBI=0.0297664;REFB=0;REVB=0.00426524;RO=0;SAF=28;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.74992e-05;OID=.;OPOS=178493301;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:62:62:0:0:62:62:34:28:0:0:34:28:0:0 chr2 178494173 . G GGA,GGGA 2147.89 PASS AO=56,195;DP=299;FAO=0,263;FDP=288;FR=.;FRO=25;FSAF=0,140;FSAR=0,123;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=0.0122901,0.0247188;FXX=0.00689631;HRUN=4,4;LEN=2,3;MLLD=213.016,228.99;QD=29.8318;RBI=0.0357328,0.0452439;REFB=-0.0582203,-0.057719;REVB=0.0335527,0.0378945;RO=45;SAF=6,125;SAR=50,70;SRF=31;SRR=14;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.589384,-0.0185015;STB=0.5,0.512894;TYPE=ins,ins;VARB=0,0.00401677;OID=.,.;OPOS=178494174,178494174;OREF=-,-;OALT=GA,GGA;OMAPALT=GGA,GGGA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:56,195:299:0,263:288:25:0,140:0,123:17:8:7:45:6,125:50,70:31:14 chr2 178682603 . T C 174.85 PASS AO=65;DP=190;FAO=65;FDP=190;FR=.;FRO=125;FSAF=22;FSAR=43;FSRF=47;FSRR=78;FWDB=-0.00516351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.747;QD=3.68111;RBI=0.0247896;REFB=-0.00786343;REVB=0.0242458;RO=125;SAF=22;SAR=43;SRF=47;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.047214;STB=0.527083;TYPE=snp;VARB=0.0218811;OID=.;OPOS=178682603;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:190:125:125:65:65:43:22:47:78:43:22:47:78 chr2 178682655 . A G 151.45 PASS AO=57;DP=169;FAO=57;FDP=169;FR=.;FRO=112;FSAF=15;FSAR=42;FSRF=38;FSRR=74;FWDB=0.0482489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.501;QD=3.58459;RBI=0.0492138;REFB=-0.00386513;REVB=-0.00969712;RO=112;SAF=15;SAR=42;SRF=38;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106012;STB=0.561248;TYPE=snp;VARB=0.0071049;OID=.;OPOS=178682655;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:169:112:112:57:57:42:15:38:74:42:15:38:74 chr2 178936373 . T G 895.32 PASS AO=86;DP=86;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0327719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.219;QD=37.6977;RBI=0.052346;REFB=0;REVB=0.040818;RO=0;SAF=65;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.63946e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000673753;OID=.;OPOS=178936373;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:86:95:0:0:86:95:21:65:0:0:28:67:0:0 chr2 178936614 . C T 586.71 PASS AO=64;DP=66;FAO=65;FDP=67;FR=.;FRO=2;FSAF=52;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00408639;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.291;QD=35.0276;RBI=0.0174146;REFB=-0.102476;REVB=0.0169283;RO=0;SAF=51;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509431;TYPE=snp;VARB=0.00171626;OID=.;OPOS=178936614;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:66:67:0:2:64:65:13:51:0:0:13:52:2:0 chr2 179203797 . G A 627.7 PASS AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0130847;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.9227;QD=38.0422;RBI=0.0399727;REFB=0;REVB=0.0377704;RO=0;SAF=18;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.99443e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000190994;OID=.;OPOS=179203797;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:66:66:0:0:66:66:48:18:0:0:48:18:0:0 chr2 179413452 . G A 683.01 PASS AO=164;DP=351;FAO=175;FDP=374;FR=.;FRO=199;FSAF=81;FSAR=94;FSRF=110;FSRR=89;FWDB=-0.0315292;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.341;QD=7.30493;RBI=0.0345618;REFB=0.00864372;REVB=0.0141573;RO=184;SAF=81;SAR=83;SRF=108;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0893132;STB=0.547757;TYPE=snp;VARB=-0.00845583;OID=.;OPOS=179413452;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:351:374:184:199:164:175:83:81:108:76:94:81:110:89 chr2 179444768 . C G 2980.53 PASS AO=302;DP=303;FAO=311;FDP=311;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=210;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0240644;FXX=0.00320503;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.821;QD=38.3348;RBI=0.0455618;REFB=0;REVB=-0.0386882;RO=0;SAF=97;SAR=205;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.12417e-06;OID=.;OPOS=179444768;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:303:311:0:0:302:311:205:97:0:0:210:101:0:0 chr2 179446381 . C T 631.42 PASS AO=158;DP=332;FAO=158;FDP=332;FR=.;FRO=174;FSAF=61;FSAR=97;FSRF=93;FSRR=81;FWDB=-0.00698391;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.557;QD=7.60747;RBI=0.0107595;REFB=0.00337456;REVB=-0.00818489;RO=174;SAF=61;SAR=97;SRF=93;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143542;STB=0.579072;TYPE=snp;VARB=-0.00434233;OID=.;OPOS=179446381;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:332:332:174:174:158:158:97:61:93:81:97:61:93:81 chr2 179547591 . AGG AG,A 1044.62 PASS AO=54,75;DP=167;FAO=0,139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=0,52;FSAR=0,87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.161343,0.0808899;FXX=0.0211253;HRUN=3,3;LEN=1,2;MLLD=12.1492,23.3248;QD=30.061;RBI=0.703357,0.340816;REFB=0,0;REVB=0.684602,0.331077;RO=3;SAF=3,48;SAR=51,27;SRF=0;SRR=3;SSEN=0.322917,0.322917;SSEP=0,0;SSSB=0.0269235,0.0497112;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.0210906,0.00912551;OID=.,.;OPOS=179547592,179547592;OREF=G,GG;OALT=-,-;OMAPALT=AG,A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:54,75:134:0,139:139:0:0,52:0,87:0:0:92:3:3,48:51,27:0:3 chr2 179558419 . TA T 24.91 PASS AO=47;DP=161;FAO=44;FDP=144;FR=.;FRO=100;FSAF=30;FSAR=14;FSRF=33;FSRR=67;FWDB=-0.287367;FXX=0.0270252;HRUN=7;LEN=1;MLLD=6.54333;QD=0.691859;RBI=0.314973;REFB=-0.125379;REVB=0.12895;RO=67;SAF=33;SAR=14;SRF=12;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.509342;STB=0.733596;TYPE=del;VARB=0.101728;OID=.;OPOS=179558420;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:47:145:44:144:100:30:14:33:67:24:67:33:14:12:55 chr2 179584437 . C G 679.34 PASS AO=163;DP=336;FAO=164;FDP=334;FR=.;FRO=170;FSAF=122;FSAR=42;FSRF=124;FSRR=46;FWDB=-0.00775111;FXX=0.011834;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.951;QD=8.13586;RBI=0.0095644;REFB=-0.0255232;REVB=0.00560339;RO=168;SAF=122;SAR=41;SRF=123;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0198164;STB=0.509587;TYPE=snp;VARB=0.0259467;OID=.;OPOS=179584437;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:336:334:168:170:163:164:41:122:123:45:42:122:124:46 chr2 179585266 . C T 1716.19 PASS AO=184;DP=185;FAO=183;FDP=183;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224561;FXX=0.0108102;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.4898;QD=37.5124;RBI=0.0415084;REFB=-0.0102477;REVB=-0.0349095;RO=1;SAF=94;SAR=90;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00503839;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.68998e-05;OID=.;OPOS=179585266;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:185:183:1:0:184:183:90:94:1:0:90:93:0:0 chr2 179600563 . G A 2213.5 PASS AO=233;DP=234;FAO=235;FDP=235;FR=.;FRO=0;FSAF=162;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0344605;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.196;QD=37.6765;RBI=0.0344951;REFB=0;REVB=0.0015456;RO=1;SAF=161;SAR=72;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.002951;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.13929e-05;OID=.;OPOS=179600563;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:234:235:1:0:233:235:72:161:1:0:73:162:0:0 chr2 179612383 . C T 87.61 PASS AO=26;DP=68;FAO=26;FDP=68;FR=.;FRO=42;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=3;FSRR=39;FWDB=-0.00943566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.2562;QD=5.1536;RBI=0.00990011;REFB=-0.0153973;REVB=-0.00299674;RO=42;SAF=8;SAR=18;SRF=3;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.355448;STB=0.697136;TYPE=snp;VARB=0.0471241;OID=.;OPOS=179612383;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:68:68:42:42:26:26:18:8:3:39:18:8:3:39 chr2 179614952 . A G 1955.77 PASS AO=211;DP=216;FAO=211;FDP=215;FR=.;FRO=4;FSAF=105;FSAR=106;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0100951;FXX=0.00462942;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.34;QD=36.3865;RBI=0.0130187;REFB=-0.0355577;REVB=-0.00822039;RO=0;SAF=105;SAR=106;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504607;TYPE=snp;VARB=0.000406117;OID=.;OPOS=179614952;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:216:215:0:4:211:211:106:105:0:0:106:105:1:3 chr2 179615887 . T C 603.38 PASS AO=57;DP=57;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0295526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.2915;QD=37.7114;RBI=0.0634879;REFB=0;REVB=0.0561904;RO=0;SAF=34;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000829263;OID=.;OPOS=179615887;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:57:64:0:0:57:64:23:34:0:0:30:34:0:0 chr2 179615931 . C G 970.64 PASS AO=100;DP=100;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00888603;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.632;QD=38.0643;RBI=0.0253226;REFB=0;REVB=0.0237123;RO=0;SAF=60;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.23111e-05;OID=.;OPOS=179615931;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:100:102:0:0:100:102:40:60:0:0:40:62:0:0 chr2 179615994 . T C 1063.56 PASS AO=111;DP=112;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00494462;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.867;QD=37.9844;RBI=0.0240922;REFB=0;REVB=-0.0235794;RO=0;SAF=69;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.61903e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.1016e-05;OID=.;OPOS=179615994;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:112:112:0:0:111:112:42:69:0:0:42:70:0:0 chr2 179620951 . C T 1319.92 PASS AO=145;DP=150;FAO=145;FDP=150;FR=.;FRO=5;FSAF=90;FSAR=55;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.000615531;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.545;QD=35.198;RBI=0.0123089;REFB=-0.0193311;REVB=-0.0122936;RO=5;SAF=90;SAR=55;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0147831;STB=0.507781;TYPE=snp;VARB=0.000777009;OID=.;OPOS=179620951;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:150:150:5:5:145:145:55:90:2:3:55:90:2:3 chr2 179621477 . C T 1854.99 PASS AO=192;DP=194;FAO=194;FDP=194;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0256582;FXX=0.0102036;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.359;QD=38.2472;RBI=0.0275857;REFB=0;REVB=0.0101305;RO=0;SAF=84;SAR=108;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.66363e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.39217e-06;OID=.;OPOS=179621477;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:194:194:0:0:192:194:108:84:0:0:110:84:0:0 chr2 179623758 . C T 3022.14 PASS AO=312;DP=312;FAO=315;FDP=315;FR=.;FRO=0;FSAF=129;FSAR=186;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0339961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.307;QD=38.3764;RBI=0.0455994;REFB=0;REVB=-0.0303902;RO=0;SAF=127;SAR=185;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.23563e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.16986e-05;OID=.;OPOS=179623758;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:312:315:0:0:312:315:185:127:0:0:186:129:0:0 chr2 179629363 . T C 1180.02 PASS AO=125;DP=130;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0205813;FXX=0.0153834;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.202;QD=36.8755;RBI=0.0304106;REFB=-0.101416;REVB=0.0223878;RO=3;SAF=54;SAR=71;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106256;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000848831;OID=.;OPOS=179629363;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:130:128:3:0:125:128:71:54:2:1:72:56:0:0 chr2 179629461 . C T 952.62 PASS AO=99;DP=99;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00756438;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.857;QD=38.1049;RBI=0.00756705;REFB=0;REVB=0.000201061;RO=0;SAF=50;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.88803e-05;OID=.;OPOS=179629461;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:99:100:0:0:99:100:49:50:0:0:50:50:0:0 chr2 179644035 . G A 1518.16 PASS AO=160;DP=160;FAO=160;FDP=160;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0401567;FXX=0.0184038;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.934;QD=37.954;RBI=0.0577504;REFB=0;REVB=0.0415036;RO=0;SAF=80;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.35515e-05;OID=.;OPOS=179644035;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:160:160:0:0:160:160:80:80:0:0:82:78:0:0 chr2 179644855 . T C 1829.28 PASS AO=200;DP=206;FAO=201;FDP=206;FR=.;FRO=5;FSAF=121;FSAR=80;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.00964588;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=145.577;QD=35.52;RBI=0.0192693;REFB=-0.194071;REVB=0.0166812;RO=1;SAF=121;SAR=79;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00392028;STB=0.505104;TYPE=snp;VARB=0.000693551;OID=.;OPOS=179644855;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:206:206:1:5:200:201:79:121:1:0:80:121:2:3 chr2 179650408 . G A 3052.37 PASS AO=326;DP=332;FAO=326;FDP=326;FR=.;FRO=0;FSAF=141;FSAR=185;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119793;FXX=0.0180717;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.876;QD=37.4524;RBI=0.011983;REFB=-0.0642867;REVB=0.000296995;RO=4;SAF=141;SAR=185;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0102008;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.62445e-05;OID=.;OPOS=179650408;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:332:326:4:0:326:326:185:141:0:4:185:141:0:0 chr2 179702268 . A G 763.56 PASS AO=72;DP=72;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000711991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.168;QD=37.7066;RBI=0.0272724;REFB=0;REVB=0.0272631;RO=0;SAF=33;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.38567e-05;OID=.;OPOS=179702268;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:72:81:0:0:72:81:39:33:0:0:45:36:0:0 chr2 179770175 . C A 282.89 PASS AO=96;DP=260;FAO=96;FDP=259;FR=.;FRO=163;FSAF=35;FSAR=61;FSRF=65;FSRR=98;FWDB=-0.0221903;FXX=0.00384601;HRUN=3;LEN=1;MLLD=231.013;QD=4.36896;RBI=0.0227287;REFB=0.00509415;REVB=0.00491777;RO=163;SAF=35;SAR=61;SRF=65;SRR=98;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0404959;STB=0.522927;TYPE=snp;VARB=-0.0079575;OID=.;OPOS=179770175;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:260:259:163:163:96:96:61:35:65:98:61:35:65:98 chr2 179783470 . C T 334.75 PASS AO=98;DP=227;FAO=96;FDP=226;FR=.;FRO=130;FSAF=50;FSAR=46;FSRF=56;FSRR=74;FWDB=0.0426707;FXX=0.00877155;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6359;QD=5.9247;RBI=0.0430206;REFB=-0.00601586;REVB=-0.00547591;RO=122;SAF=51;SAR=47;SRF=52;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0938854;STB=0.551663;TYPE=snp;VARB=0.0101788;OID=.;OPOS=179783470;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:227:226:122:130:98:96:47:51:52:70:46:50:56:74 chr2 179839833 . A G 286.32 PASS AO=60;DP=111;FAO=60;FDP=111;FR=.;FRO=51;FSAF=8;FSAR=52;FSRF=23;FSRR=28;FWDB=-0.0181296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.192;QD=10.3178;RBI=0.0195576;REFB=-0.0251142;REVB=-0.00733582;RO=51;SAF=8;SAR=52;SRF=23;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.386667;STB=0.715723;TYPE=snp;VARB=0.0299934;OID=.;OPOS=179839833;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:51:51:60:60:52:8:23:28:52:8:23:28 chr2 180047908 . T C 149.82 PASS AO=40;DP=95;FAO=41;FDP=96;FR=.;FRO=55;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=30;FSRR=25;FWDB=-0.0264796;FXX=0.0103082;HRUN=4;LEN=1;MLLD=40.7538;QD=6.24252;RBI=0.0498078;REFB=-0.0176398;REVB=-0.0421858;RO=55;SAF=18;SAR=22;SRF=30;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0978744;STB=0.546908;TYPE=snp;VARB=0.0254696;OID=.;OPOS=180047908;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:96:55:55:40:41:22:18:30:25:22:19:30:25 chr2 180810180 . C T 1214.4 PASS AO=128;DP=128;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00165976;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.207;QD=37.9501;RBI=0.00592218;REFB=-0.0278138;REVB=0.00568484;RO=0;SAF=49;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.43309e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.24306e-05;OID=.;OPOS=180810180;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:128:128:0:0:128:128:79:49:0:0:78:50:0:0 chr2 180810264 . A T 713.13 PASS AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260194;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.755;QD=37.5331;RBI=0.0625677;REFB=-0.0400396;REVB=-0.0569008;RO=0;SAF=19;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.84741e-05;OID=.;OPOS=180810264;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:77:76:0:0:76:76:57:19:0:0:57:19:0:0 chr2 180835792 . T A 1866.71 PASS AO=190;DP=190;FAO=195;FDP=195;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=123;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0629158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.959;QD=38.2915;RBI=0.0634274;REFB=0;REVB=0.00803917;RO=0;SAF=69;SAR=121;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.06676e-05;OID=.;OPOS=180835792;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:190:195:0:0:190:195:121:69:0:0:123:72:0:0 chr2 181854692 . C T 370.69 PASS AO=64;DP=99;FAO=66;FDP=102;FR=.;FRO=36;FSAF=32;FSAR=34;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=0.00168845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.553;QD=14.5368;RBI=0.0187642;REFB=-0.0141974;REVB=-0.0186881;RO=34;SAF=31;SAR=33;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0477042;STB=0.524933;TYPE=snp;VARB=0.00566474;OID=.;OPOS=181854692;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:102:34:36:64:66:33:31:19:15:34:32:20:16 chr2 182374534 . A G 1550.46 PASS AO=169;DP=174;FAO=169;FDP=173;FR=.;FRO=4;FSAF=67;FSAR=102;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0179131;FXX=0.0057468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.911;QD=35.8488;RBI=0.0191063;REFB=-0.294573;REVB=-0.00664606;RO=1;SAF=67;SAR=102;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00705036;STB=0.503543;TYPE=snp;VARB=0.000457361;OID=.;OPOS=182374534;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:174:173:1:4:169:169:102:67:1:0:102:67:1:3 chr2 182395345 . G A 1716.5 PASS AO=183;DP=185;FAO=183;FDP=183;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0171198;FXX=0.0108102;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.729;QD=37.5191;RBI=0.0391725;REFB=0.0264095;REVB=-0.0352335;RO=2;SAF=105;SAR=78;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00155187;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.83305e-05;OID=.;OPOS=182395345;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:185:183:2:0:183:183:78:105:1:1:78:105:0:0 chr2 182399097 . T C 652.87 PASS AO=70;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0573519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.433;QD=36.7813;RBI=0.0575123;REFB=-0.0700022;REVB=0.00429341;RO=1;SAF=26;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0178357;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00242377;OID=.;OPOS=182399097;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:71:71:1:0:70:71:44:26:1:0:44:27:0:0 chr2 182399638 . A G 2398.75 PASS AO=259;DP=272;FAO=260;FDP=260;FR=.;FRO=0;FSAF=132;FSAR=128;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0296757;FXX=0.051093;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.839;QD=36.9038;RBI=0.0300776;REFB=-0.117267;REVB=0.00490045;RO=4;SAF=131;SAR=128;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.014331;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00135121;OID=.;OPOS=182399638;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:272:260:4:0:259:260:128:131:4:0:128:132:0:0 chr2 182400905 . T G 2238.19 PASS AO=242;DP=247;FAO=242;FDP=247;FR=.;FRO=5;FSAF=109;FSAR=133;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0352363;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.881;QD=36.246;RBI=0.0364267;REFB=-0.0833597;REVB=-0.00923622;RO=3;SAF=109;SAR=133;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00509397;STB=0.503056;TYPE=snp;VARB=0.000819909;OID=.;OPOS=182400905;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:247:247:3:5:242:242:133:109:2:1:133:109:3:2 chr2 182403851 . G A 1467.87 PASS AO=149;DP=149;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0625158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.135;QD=38.1264;RBI=0.0644255;REFB=0;REVB=0.0155697;RO=0;SAF=61;SAR=88;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.92755e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.80723e-05;OID=.;OPOS=182403851;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:149:154:0:0:149:154:88:61:0:0:92:62:0:0 chr2 182413259 . A G 1159.61 PASS AO=114;DP=116;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147379;FXX=0.0159987;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.296;QD=37.7109;RBI=0.0172932;REFB=0;REVB=0.00904704;RO=0;SAF=70;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.40696e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000250128;OID=.;OPOS=182413259;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:116:123:0:0:114:123:44:70:0:0:46:77:0:0 chr2 182521578 . G A 195.46 PASS AO=19;DP=19;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0412736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.489;QD=39.0929;RBI=0.0720802;REFB=0;REVB=0.0590936;RO=0;SAF=7;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00166376;OID=.;OPOS=182521578;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:19:20:0:0:19:20:12:7:0:0:12:8:0:0 chr2 182543455 . T C 884.98 PASS AO=94;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00501294;FXX=0.0104156;HRUN=3;LEN=1;MLLD=193.815;QD=37.2624;RBI=0.0270826;REFB=-0.0593759;REVB=0.0266146;RO=1;SAF=58;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129878;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000362482;OID=.;OPOS=182543455;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:95:95:1:0:94:95:36:58:0:1:37:58:0:0 chr2 182756900 . C G 22.8 PASS AO=4;DP=12;FAO=5;FDP=13;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.0702388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.81;QD=7.01531;RBI=0.0716503;REFB=-0.010915;REVB=0.0141517;RO=8;SAF=2;SAR=2;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260267;STB=0.59963;TYPE=snp;VARB=0.0188242;OID=.;OPOS=182756900;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:12:13:8:8:4:5:2:2:2:6:3:2:2:6 chr2 182792965 . G A 285.94 PASS AO=59;DP=107;FAO=59;FDP=107;FR=.;FRO=48;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=0.00147309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.9856;QD=10.6893;RBI=0.0026781;REFB=-0.0218109;REVB=0.00223657;RO=48;SAF=29;SAR=30;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101201;STB=0.505545;TYPE=snp;VARB=0.0162149;OID=.;OPOS=182792965;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:48:48:59:59:30:29:23:25:30:29:23:25 chr2 182794650 . T A 300.68 PASS AO=66;DP=126;FAO=66;FDP=126;FR=.;FRO=60;FSAF=32;FSAR=34;FSRF=27;FSRR=33;FWDB=-0.0180058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.534;QD=9.54533;RBI=0.0183603;REFB=-0.0114661;REVB=0.0035906;RO=60;SAF=32;SAR=34;SRF=27;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0302599;STB=0.516621;TYPE=snp;VARB=0.0125344;OID=.;OPOS=182794650;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:60:60:66:66:34:32:27:33:34:32:27:33 chr2 182925120 . T C 832.23 PASS AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00163118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.354;QD=38.2633;RBI=0.00242379;REFB=0;REVB=0.00179276;RO=0;SAF=43;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.78623e-07;OID=.;OPOS=182925120;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:87:87:0:0:87:87:44:43:0:0:44:43:0:0 chr2 182981968 . A G 398.25 PASS AO=102;DP=223;FAO=103;FDP=224;FR=.;FRO=121;FSAF=50;FSAR=53;FSRF=71;FSRR=50;FWDB=0.00921974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.3164;QD=7.11165;RBI=0.0352569;REFB=-0.0221274;REVB=0.0340301;RO=118;SAF=50;SAR=52;SRF=69;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.091625;STB=0.554603;TYPE=snp;VARB=0.031014;OID=.;OPOS=182981968;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:224:118:121:102:103:52:50:69:49:53:50:71:50 chr2 183738620 . T C 201.58 PASS AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.048608;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.8363;QD=36.6512;RBI=0.0486378;REFB=0;REVB=0.00170125;RO=0;SAF=4;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00155444;OID=.;OPOS=183738620;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:22:22:0:0:22:22:18:4:0:0:18:4:0:0 chr2 183789649 . C A 868.54 PASS AO=89;DP=89;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0327936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.195;QD=38.602;RBI=0.0350172;REFB=0;REVB=0.0122793;RO=0;SAF=54;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000184261;OID=.;OPOS=183789649;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:89:90:0:0:89:90:35:54:0:0:35:55:0:0 chr2 183799558 . G C 2816.18 PASS AO=296;DP=298;FAO=298;FDP=298;FR=.;FRO=0;FSAF=127;FSAR=171;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0580712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.792;QD=37.8011;RBI=0.0584511;REFB=0;REVB=-0.0066538;RO=2;SAF=125;SAR=171;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00756872;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000387572;OID=.;OPOS=183799558;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:298:298:2:0:296:298:171:125:2:0:171:127:0:0 chr2 183961650 . A C 2358.88 PASS AO=250;DP=254;FAO=250;FDP=250;FR=.;FRO=0;FSAF=113;FSAR=137;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0465554;FXX=0.0157474;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.14;QD=37.7421;RBI=0.0541061;REFB=-0.0383626;REVB=0.0275692;RO=3;SAF=113;SAR=137;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0103222;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0001308;OID=.;OPOS=183961650;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:254:250:3:0:250:250:137:113:0:3:137:113:0:0 chr2 183961668 . A G 475.07 PASS AO=111;DP=223;FAO=111;FDP=221;FR=.;FRO=110;FSAF=50;FSAR=61;FSRF=43;FSRR=67;FWDB=0.0136091;FXX=0.00896821;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.835;QD=8.59858;RBI=0.0173042;REFB=-0.00390739;REVB=-0.0106878;RO=102;SAF=50;SAR=61;SRF=42;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0343269;STB=0.530103;TYPE=snp;VARB=0.003213;OID=.;OPOS=183961668;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:221:102:110:111:111:61:50:42:60:61:50:43:67 chr2 184814072 . T C 228.9 PASS AO=57;DP=124;FAO=57;FDP=122;FR=.;FRO=65;FSAF=37;FSAR=20;FSRF=28;FSRR=37;FWDB=-0.0264942;FXX=0.0161277;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.788;QD=7.50484;RBI=0.0265384;REFB=-0.0064386;REVB=-0.00153231;RO=65;SAF=37;SAR=20;SRF=28;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21316;STB=0.618614;TYPE=snp;VARB=0.00836581;OID=.;OPOS=184814072;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:122:65:65:57:57:20:37:28:37:20:37:28:37 chr2 185243700 . C T 42.66 PASS AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=-0.0106724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.368;QD=7.10942;RBI=0.0545356;REFB=-0.00365814;REVB=-0.0534812;RO=14;SAF=3;SAR=7;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.396837;STB=0.733421;TYPE=snp;VARB=0.0150221;OID=.;OPOS=185243700;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:24:24:14:14:10:10:7:3:10:4:7:3:10:4 chr2 185469503 . C T 1582.73 PASS AO=165;DP=166;FAO=165;FDP=165;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.025287;FXX=0.00602373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.06;QD=38.3692;RBI=0.0357084;REFB=0;REVB=0.0252123;RO=0;SAF=87;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.11138e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.47187e-05;OID=.;OPOS=185469503;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:166:165:0:0:165:165:78:87:0:0:78:87:0:0 chr2 185802724 . G A 106.59 PASS AO=30;DP=76;FAO=30;FDP=75;FR=.;FRO=45;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=18;FSRR=27;FWDB=-0.00722054;FXX=0.0131562;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.5917;QD=5.68457;RBI=0.0184284;REFB=0.0065112;REVB=0.0169549;RO=43;SAF=8;SAR=22;SRF=17;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155198;STB=0.593295;TYPE=snp;VARB=-0.021356;OID=.;OPOS=185802724;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:75:43:45:30:30:22:8:17:26:22:8:18:27 chr2 186526579 . G A 2444.93 PASS AO=255;DP=257;FAO=256;FDP=256;FR=.;FRO=0;FSAF=116;FSAR=140;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00900428;FXX=0.0038909;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.6909;QD=38.202;RBI=0.0093081;REFB=0;REVB=-0.00235876;RO=1;SAF=115;SAR=140;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0041273;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.95184e-05;OID=.;OPOS=186526579;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:257:256:1:0:255:256:140:115:1:0:140:116:0:0 chr2 186625770 . A G 664.83 PASS AO=84;DP=96;FAO=84;FDP=96;FR=.;FRO=12;FSAF=38;FSAR=46;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.00532059;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=192.879;QD=27.7012;RBI=0.0115272;REFB=-0.0891484;REVB=0.0102258;RO=12;SAF=38;SAR=46;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011303;STB=0.505999;TYPE=snp;VARB=0.00114802;OID=.;OPOS=186625770;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:96:96:12:12:84:84:46:38:6:6:46:38:6:6 chr2 186627943 . T C 1522.8 PASS AO=163;DP=166;FAO=164;FDP=167;FR=.;FRO=3;FSAF=88;FSAR=76;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.00243954;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=94.7682;QD=36.4741;RBI=0.0228496;REFB=-0.00392417;REVB=-0.022719;RO=3;SAF=88;SAR=75;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159431;STB=0.508379;TYPE=snp;VARB=-1.00741e-05;OID=.;OPOS=186627943;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:166:167:3:3:163:164:75:88:3:0:76:88:3:0 chr2 186654592 . A G 1576.58 PASS AO=168;DP=174;FAO=173;FDP=176;FR=.;FRO=3;FSAF=57;FSAR=116;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.00968163;FXX=0.0056494;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.8766;QD=35.8313;RBI=0.0842361;REFB=-0.177868;REVB=0.0836779;RO=2;SAF=57;SAR=111;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0084976;STB=0.506382;TYPE=snp;VARB=0.00233552;OID=.;OPOS=186654592;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:174:176:2:3:168:173:111:57:0:2:116:57:0:3 chr2 186655726 . G A 1651.76 PASS AO=170;DP=170;FAO=173;FDP=173;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0363733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.0441;QD=38.191;RBI=0.0587251;REFB=0;REVB=-0.0461045;RO=0;SAF=73;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.98294e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.83675e-05;OID=.;OPOS=186655726;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:170:173:0:0:170:173:97:73:0:0:100:73:0:0 chr2 186656657 . C T 1347.35 PASS AO=139;DP=139;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.5166;QD=38.4956;RBI=0.0496765;REFB=0;REVB=-0.0486288;RO=0;SAF=57;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.14668e-05;OID=.;OPOS=186656657;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:139:140:0:0:139:140:82:57:0:0:82:58:0:0 chr2 186656840 . T C 459.17 PASS AO=47;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00607374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.911;QD=38.2645;RBI=0.0388738;REFB=0;REVB=0.0383964;RO=0;SAF=31;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000202775;OID=.;OPOS=186656840;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:48:48:0:0:47:48:16:31:0:0:17:31:0:0 chr2 186656956 . T C 497.49 PASS AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0254416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.231;QD=37.5465;RBI=0.0275472;REFB=0;REVB=0.0105629;RO=0;SAF=24;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000147021;OID=.;OPOS=186656956;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:53:53:0:0:53:53:29:24:0:0:29:24:0:0 chr2 186657089 . C A 1476.65 PASS AO=159;DP=162;FAO=160;FDP=163;FR=.;FRO=3;FSAF=88;FSAR=72;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0184317;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=193.198;QD=36.2368;RBI=0.0216081;REFB=-0.0363085;REVB=0.0112776;RO=3;SAF=87;SAR=72;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00759396;STB=0.504024;TYPE=snp;VARB=8.84932e-05;OID=.;OPOS=186657089;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:162:163:3:3:159:160:72:87:1:2:72:88:1:2 chr2 186658056 . G A 874.73 PASS AO=84;DP=85;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00381353;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.664;QD=38.0318;RBI=0.0215709;REFB=0;REVB=-0.0212311;RO=0;SAF=43;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.27155e-05;OID=.;OPOS=186658056;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:85:92:0:0:84:92:41:43:0:0:47:45:0:0 chr2 186658438 . C T 473.99 PASS AO=51;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0178458;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.903;QD=36.4604;RBI=0.0178492;REFB=0;REVB=0.000351897;RO=0;SAF=21;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.86329e-05;OID=.;OPOS=186658438;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:52:52:0:0:51:52:30:21:0:0:30:22:0:0 chr2 186658565 . G T 1186.84 PASS AO=122;DP=123;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.517;QD=37.9789;RBI=0.0398597;REFB=0;REVB=-0.0323342;RO=0;SAF=60;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.64881e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.96018e-05;OID=.;OPOS=186658565;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:123:125:0:0:122:125:62:60:0:0:63:62:0:0 chr2 186659359 . G T 1009.45 PASS AO=108;DP=110;FAO=108;FDP=110;FR=.;FRO=2;FSAF=45;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00817758;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=120.716;QD=36.7073;RBI=0.00847591;REFB=-0.124759;REVB=-0.00222894;RO=2;SAF=45;SAR=63;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0148291;STB=0.507811;TYPE=snp;VARB=0.000702415;OID=.;OPOS=186659359;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:110:110:2:2:108:108:63:45:0:2:63:45:0:2 chr2 186661673 . A G 1204.49 PASS AO=128;DP=131;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000772878;FXX=0.022899;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.398;QD=37.6404;RBI=0.00572789;REFB=-0.0602984;REVB=0.0056755;RO=1;SAF=65;SAR=63;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00725512;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000237933;OID=.;OPOS=186661673;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:131:128:1:0:128:128:63:65:1:0:63:65:0:0 chr2 186664473 . T C 2465.77 PASS AO=253;DP=256;FAO=258;FDP=258;FR=.;FRO=0;FSAF=132;FSAR=126;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133692;FXX=0.0114938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.303;QD=38.229;RBI=0.0159835;REFB=0;REVB=-0.00876004;RO=0;SAF=130;SAR=123;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.85893e-05;OID=.;OPOS=186664473;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:256:258:0:0:253:258:123:130:0:0:126:132:0:0 chr2 186664963 . C A 937.21 PASS AO=106;DP=112;FAO=109;FDP=112;FR=.;FRO=3;FSAF=63;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0199562;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=106.52;QD=33.4719;RBI=0.0207752;REFB=-0.10607;REVB=0.00577556;RO=1;SAF=61;SAR=45;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0104297;STB=0.506701;TYPE=snp;VARB=0.00177609;OID=.;OPOS=186664963;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:112:112:1:3:106:109:45:61:0:1:46:63:1:2 chr2 186665432 . G A 738.46 PASS AO=109;DP=135;FAO=106;FDP=135;FR=.;FRO=29;FSAF=64;FSAR=42;FSRF=7;FSRR=22;FWDB=0.0578506;FXX=0.0073524;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3991;QD=21.8802;RBI=0.0625724;REFB=-0.00661105;REVB=0.0238456;RO=26;SAF=65;SAR=44;SRF=5;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147293;STB=0.57868;TYPE=snp;VARB=0.00416851;OID=.;OPOS=186665432;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:135:135:26:29:109:106:44:65:5:21:42:64:7:22 chr2 186665824 . A G 759.81 PASS AO=82;DP=84;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0244414;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.712;QD=36.1813;RBI=0.0265984;REFB=-0.041137;REVB=0.0104925;RO=1;SAF=35;SAR=47;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133379;STB=0.506848;TYPE=snp;VARB=0.000459628;OID=.;OPOS=186665824;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:84:84:1:1:82:83:47:35:1:0:47:36:1:0 chr2 186667121 . T C 664.48 PASS AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122665;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=246.44;QD=38.5205;RBI=0.017634;REFB=0;REVB=0.0126684;RO=0;SAF=31;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.81895e-05;OID=.;OPOS=186667121;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:69:69:0:0:69:69:38:31:0:0:38:31:0:0 chr2 186670104 . A C 1633.52 PASS AO=180;DP=184;FAO=180;FDP=184;FR=.;FRO=4;FSAF=67;FSAR=113;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0233341;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3851;QD=35.5114;RBI=0.0234653;REFB=-0.064286;REVB=0.00247806;RO=4;SAF=68;SAR=112;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0166961;STB=0.502846;TYPE=snp;VARB=0.00470971;OID=.;OPOS=186670104;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:184:184:4:4:180:180:112:68:0:4:113:67:1:3 chr2 186670780 . T A 857.33 PASS AO=85;DP=85;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00646533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.374;QD=38.5319;RBI=0.0218887;REFB=0;REVB=0.0209121;RO=0;SAF=25;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.47492e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.00348e-05;OID=.;OPOS=186670780;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:85:89:0:0:85:89:60:25:0:0:64:25:0:0 chr2 186670979 . T C 658.05 PASS AO=70;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000564831;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.665;QD=37.0734;RBI=0.0528409;REFB=0;REVB=0.0528378;RO=0;SAF=27;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000182855;OID=.;OPOS=186670979;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:71:71:0:0:70:71:43:27:0:0:43:28:0:0 chr2 186671357 . G A 772.86 PASS AO=79;DP=79;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.935;QD=38.6428;RBI=0.0304607;REFB=0;REVB=-0.0279588;RO=0;SAF=59;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.28703e-05;OID=.;OPOS=186671357;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:79:80:0:0:79:80:20:59:0:0:20:60:0:0 chr2 186671912 . G A 2079.66 PASS AO=219;DP=221;FAO=219;FDP=219;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=142;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0329947;FXX=0.00904936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.848;QD=37.9847;RBI=0.0480991;REFB=-0.0533567;REVB=0.0349982;RO=1;SAF=77;SAR=142;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00334377;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.50381e-05;OID=.;OPOS=186671912;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:221:219:1:0:219:219:142:77:0:1:142:77:0:0 chr2 186672527 . T A 530.78 PASS AO=55;DP=55;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0266978;FXX=0.0847314;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.447;QD=39.317;RBI=0.0305888;REFB=0;REVB=-0.0149298;RO=0;SAF=26;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40922e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000723994;OID=.;OPOS=186672527;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:55:54:0:0:55:54:29:26:0:0:32:22:0:0 chr2 186697876 . A G 1589.59 PASS AO=172;DP=176;FAO=173;FDP=176;FR=.;FRO=3;FSAF=76;FSAR=97;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0802091;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.2456;QD=36.1271;RBI=0.0846679;REFB=-0.145808;REVB=0.0271138;RO=1;SAF=75;SAR=97;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00630407;STB=0.509676;TYPE=snp;VARB=0.00179469;OID=.;OPOS=186697876;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:176:176:1:3:172:173:97:75:1:0:97:76:3:0 chr2 187365374 . A G 69.27 PASS AO=22;DP=65;FAO=22;FDP=62;FR=.;FRO=40;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=0.0122194;FXX=0.0461467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.039;QD=4.46873;RBI=0.0429853;REFB=-0.00651399;REVB=-0.0412119;RO=39;SAF=12;SAR=10;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0360461;STB=0.513262;TYPE=snp;VARB=0.0141561;OID=.;OPOS=187365374;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:65:62:39:40:22:22:10:12:20:19:10:12:21:19 chr2 187370673 . G C 115.53 PASS AO=27;DP=57;FAO=27;FDP=57;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=21;FWDB=0.00294353;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=187.184;QD=8.10733;RBI=0.0124525;REFB=-0.0161077;REVB=-0.0120996;RO=30;SAF=9;SAR=18;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0355944;STB=0.519985;TYPE=snp;VARB=0.0196688;OID=.;OPOS=187370673;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:30:30:27:27:18:9:9:21:18:9:9:21 chr2 187487160 . G A 1990.93 PASS AO=209;DP=209;FAO=210;FDP=210;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=117;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0217667;FXX=0.00943352;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176;QD=37.9224;RBI=0.0245837;REFB=-0.0241111;REVB=0.0114267;RO=0;SAF=94;SAR=115;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.79884e-05;OID=.;OPOS=187487160;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:209:210:0:0:209:210:115:94:0:0:117:93:0:0 chr2 187532417 . G A 2139.97 PASS AO=225;DP=226;FAO=225;FDP=225;FR=.;FRO=0;FSAF=207;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0368879;FXX=0.00442458;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.7391;QD=38.044;RBI=0.0571907;REFB=-0.0573776;REVB=0.0437042;RO=1;SAF=207;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0022966;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000295351;OID=.;OPOS=187532417;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:226:225:1:0:225:225:18:207:1:0:18:207:0:0 chr2 187559047 . G GCAA,A 315.89 PASS AO=18,20;DP=55;FAO=30,14;FDP=49;FR=.;FRO=5;FSAF=18,6;FSAR=12,8;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0186018,-0.00293664;FXX=0.039208;HRUN=1,1;LEN=3,1;MLLD=75.7736,90.1583;QD=25.7872;RBI=0.0228264,0.0226044;REFB=-0.0102088,-0.0307212;REVB=0.0132294,0.0224128;RO=17;SAF=13,7;SAR=5,13;SRF=16;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.271661,-0.456834;STB=0.560936,0.646858;TYPE=ins,snp;VARB=1.65544e-05,0.0408379;OID=.,.;OPOS=187559048,187559047;OREF=-,G;OALT=CAA,A;OMAPALT=GCAA,A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:33:55:49:17:5:18,20:30,14:5,13:13,7:16:1:12,8:18,6:5:0 chr2 188250301 . T A 2297.62 PASS AO=242;DP=243;FAO=242;FDP=242;FR=.;FRO=0;FSAF=133;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0098311;FXX=0.00411506;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.437;QD=37.9772;RBI=0.0184086;REFB=-0.00517793;REVB=0.0155636;RO=0;SAF=133;SAR=109;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.85102e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.26895e-06;OID=.;OPOS=188250301;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:243:242:0:0:242:242:109:133:0:0:109:133:0:0 chr2 188343497 . T C 1152.06 PASS AO=121;DP=123;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195634;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.146;QD=37.1634;RBI=0.0323173;REFB=0;REVB=0.0257232;RO=0;SAF=75;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.04499e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000130059;OID=.;OPOS=188343497;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:123:124:0:0:121:124:46:75:0:0:47:77:0:0 chr2 189460553 . T C 2625.72 PASS AO=285;DP=292;FAO=286;FDP=286;FR=.;FRO=0;FSAF=124;FSAR=162;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00922317;FXX=0.0305074;HRUN=3;LEN=1;MLLD=107.138;QD=36.7234;RBI=0.025671;REFB=-0.124513;REVB=0.0239569;RO=7;SAF=124;SAR=161;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0195582;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.47486e-05;OID=.;OPOS=189460553;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:292:286:7:0:285:286:161:124:6:1:162:124:0:0 chr2 189863389 . C T 317.25 PASS AO=64;DP=119;FAO=67;FDP=123;FR=.;FRO=56;FSAF=49;FSAR=18;FSRF=42;FSRR=14;FWDB=0.00338314;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.72;QD=10.317;RBI=0.00653058;REFB=-0.0204032;REVB=0.00558595;RO=54;SAF=46;SAR=18;SRF=42;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0629548;STB=0.510914;TYPE=snp;VARB=0.0131079;OID=.;OPOS=189863389;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:123:54:56:64:67:18:46:42:12:18:49:42:14 chr2 189864080 . G A 378.65 PASS AO=73;DP=135;FAO=78;FDP=141;FR=.;FRO=63;FSAF=30;FSAR=48;FSRF=28;FSRR=35;FWDB=-0.0212412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.079;QD=10.7418;RBI=0.0242583;REFB=-0.0160148;REVB=0.0117165;RO=56;SAF=29;SAR=44;SRF=23;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111435;STB=0.527865;TYPE=snp;VARB=0.0141694;OID=.;OPOS=189864080;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:141:56:63:73:78:44:29:23:33:48:30:28:35 chr2 189866199 . T A 3754.05 PASS AO=429;DP=431;FAO=397;FDP=397;FR=.;FRO=0;FSAF=192;FSAR=205;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00723767;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.371;QD=37.8242;RBI=0.0252983;REFB=-0.0176384;REVB=0.0242409;RO=2;SAF=208;SAR=221;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0045673;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.16775e-05;OID=.;OPOS=189866199;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:431:397:2:0:429:397:221:208:2:0:205:192:0:0 chr2 189875421 . T G 1724.07 PASS AO=173;DP=177;FAO=181;FDP=181;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0038761;FXX=0.0163035;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.297;QD=38.1009;RBI=0.0605401;REFB=0;REVB=0.0604159;RO=0;SAF=93;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000236636;OID=.;OPOS=189875421;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:82:177:181:0:0:173:181:80:93:0:0:83:98:0:0 chr2 189907937 . A G 1328 PASS AO=139;DP=141;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0897365;FXX=0.0347198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.3782;QD=38.2158;RBI=0.0897726;REFB=0;REVB=0.0025447;RO=0;SAF=67;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.36576e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000253952;OID=.;OPOS=189907937;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:141:139:0:0:139:139:72:67:0:0:72:67:0:0 chr2 189932831 . T C 1529.66 PASS AO=155;DP=155;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00360038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.051;QD=38.4821;RBI=0.00600768;REFB=0;REVB=0.00480931;RO=0;SAF=83;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53001e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.97989e-07;OID=.;OPOS=189932831;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:155:159:0:0:155:159:72:83:0:0:73:86:0:0 chr2 189974958 . G T 749.75 PASS AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0448075;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.3784;QD=37.0249;RBI=0.0476014;REFB=0;REVB=0.0160682;RO=0;SAF=41;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17427e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00185608;OID=.;OPOS=189974958;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:81:81:0:0:81:81:40:41:0:0:40:41:0:0 chr2 189997838 . G A 508.1 PASS AO=53;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.1046;QD=37.6372;RBI=0.0280561;REFB=0;REVB=0.0174017;RO=0;SAF=43;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.98469e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000203069;OID=.;OPOS=189997838;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:53:54:0:0:53:54:10:43:0:0:11:43:0:0 chr2 190323530 . A G 1580.62 PASS AO=165;DP=166;FAO=165;FDP=165;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00207895;FXX=0.00602373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.318;QD=38.3181;RBI=0.0036698;REFB=0;REVB=0.00302414;RO=0;SAF=80;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.10497e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.99022e-05;OID=.;OPOS=190323530;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:166:165:0:0:165:165:85:80:0:0:85:80:0:0 chr2 190425474 . T C 384.24 PASS AO=106;DP=243;FAO=106;FDP=243;FR=.;FRO=137;FSAF=58;FSAR=48;FSRF=80;FSRR=57;FWDB=-0.00979587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.1932;QD=6.32496;RBI=0.0110427;REFB=0.000288126;REVB=0.00509718;RO=136;SAF=58;SAR=48;SRF=79;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0345385;STB=0.520997;TYPE=snp;VARB=-0.000508213;OID=.;OPOS=190425474;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:243:243:136:137:106:106:48:58:79:57:48:58:80:57 chr2 190430177 . A G 3334.16 PASS AO=345;DP=347;FAO=350;FDP=350;FR=.;FRO=0;FSAF=189;FSAR=161;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00838696;FXX=0.00284892;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4779;QD=38.1046;RBI=0.0212489;REFB=-0.00550114;REVB=-0.0195236;RO=2;SAF=186;SAR=159;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000432999;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.02752e-05;OID=.;OPOS=190430177;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:347:350:2:0:345:350:159:186:1:1:161:189:0:0 chr2 190531426 . G A 2235.29 PASS AO=236;DP=239;FAO=237;FDP=237;FR=.;FRO=0;FSAF=122;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00575601;FXX=0.00836785;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.986;QD=37.7265;RBI=0.0147393;REFB=0.00247459;REVB=0.0135689;RO=2;SAF=122;SAR=114;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00774809;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.69366e-06;OID=.;OPOS=190531426;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:89:239:237:2:0:236:237:114:122:2:0:115:122:0:0 chr2 190595258 . G T 2164.51 PASS AO=226;DP=228;FAO=230;FDP=230;FR=.;FRO=0;FSAF=115;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0282304;FXX=0.00432882;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0744;QD=37.6437;RBI=0.0316344;REFB=0.0111994;REVB=0.0142751;RO=2;SAF=111;SAR=115;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00850755;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.32976e-05;OID=.;OPOS=190595258;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:228:230:2:0:226:230:115:111:2:0:115:115:0:0 chr2 190602513 . T C 1073.81 PASS AO=122;DP=129;FAO=122;FDP=129;FR=.;FRO=7;FSAF=86;FSAR=36;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.012437;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=47.5205;QD=33.2965;RBI=0.0360942;REFB=-0.0222988;REVB=-0.0338838;RO=4;SAF=86;SAR=36;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0147422;STB=0.508643;TYPE=snp;VARB=0.00166968;OID=.;OPOS=190602513;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:129:129:4:7:122:122:36:86:2:2:36:86:4:3 chr2 190606152 . A C 154.49 PASS AO=36;DP=72;FAO=35;FDP=71;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=9;FSRR=27;FWDB=0.0962691;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3229;QD=8.70345;RBI=0.0966714;REFB=-0.00299663;REVB=0.00880973;RO=36;SAF=13;SAR=23;SRF=9;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112445;STB=0.568206;TYPE=snp;VARB=0.00575977;OID=.;OPOS=190606152;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:71:36:36:36:35:23:13:9:27:22:13:9:27 chr2 190617643 . A G 1484.61 PASS AO=156;DP=180;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0594175;FXX=0.12154;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.852;QD=37.3488;RBI=0.0663681;REFB=-0.0504436;REVB=0.0295683;RO=2;SAF=62;SAR=94;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00257696;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00128039;OID=.;OPOS=190617643;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:180:159:2:0:156:159:94:62:1:1:96:63:0:0 chr2 190618249 . T A 1112.59 PASS AO=117;DP=117;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00551195;FXX=0.00854628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.804;QD=38.3653;RBI=0.0384404;REFB=0;REVB=-0.0380431;RO=0;SAF=65;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.10611e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.35233e-05;OID=.;OPOS=190618249;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:117:116:0:0:117:116:52:65:0:0:52:64:0:0 chr2 190636411 . C G 273.87 PASS AO=74;DP=169;FAO=74;FDP=169;FR=.;FRO=95;FSAF=37;FSAR=37;FSRF=55;FSRR=40;FWDB=0.0276054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.751;QD=6.48222;RBI=0.0285767;REFB=-0.0190146;REVB=-0.00738696;RO=95;SAF=37;SAR=37;SRF=55;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0796779;STB=0.544367;TYPE=snp;VARB=0.022716;OID=.;OPOS=190636411;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:169:95:95:74:74:37:37:55:40:37:37:55:40 chr2 190788844 . T TC 420.73 PASS AO=32;DP=49;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00351114;FXX=0.0425441;HRUN=0;LEN=1;MLLD=39.6965;QD=37.398;RBI=0.175636;REFB=0;REVB=0.175601;RO=10;SAF=32;SAR=0;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.867486;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00130812;OID=.;OPOS=190788845;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:32:49:45:45:0:41:4:0:0:20:10:32:0:6:4 chr2 190788845 . G C 19.92 PASS AO=10;DP=47;FAO=10;FDP=47;FR=.;FRO=37;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=37;FSRR=0;FWDB=0.0249217;FXX=0.040808;HRUN=6;LEN=1;MLLD=48.025;QD=1.6954;RBI=0.0783334;REFB=-0.00403796;REVB=0.0742633;RO=37;SAF=6;SAR=4;SRF=37;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.680582;STB=0.877268;TYPE=snp;VARB=0.0280334;OID=.;OPOS=190788845;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:47:47:37:37:10:10:4:6:37:0:4:6:37:0 chr2 190815211 . G A 939.44 PASS AO=99;DP=100;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000899846;FXX=0.009999;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.981;QD=37.9572;RBI=0.00160368;REFB=-0.00344053;REVB=0.00132743;RO=1;SAF=33;SAR=66;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0141557;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.46354e-05;OID=.;OPOS=190815211;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:100:99:1:0:99:99:66:33:1:0:66:33:0:0 chr2 191064753 . C T 113.08 PASS AO=34;DP=88;FAO=34;FDP=88;FR=.;FRO=54;FSAF=6;FSAR=28;FSRF=5;FSRR=49;FWDB=0.0277893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.0611;QD=5.13993;RBI=0.0372738;REFB=-0.0300809;REVB=-0.0248413;RO=54;SAF=6;SAR=28;SRF=5;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178533;STB=0.59995;TYPE=snp;VARB=0.0281454;OID=.;OPOS=191064753;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:54:54:34:34:28:6:5:49:28:6:5:49 chr2 191065236 . TTTTG T 151.77 PASS AO=46;DP=134;FAO=58;FDP=127;FR=.;FRO=69;FSAF=39;FSAR=19;FSRF=45;FSRR=24;FWDB=0.00744058;FXX=0.00781189;HRUN=5;LEN=4;MLLD=263.467;QD=4.78002;RBI=0.0108692;REFB=0.00440363;REVB=0.00792314;RO=51;SAF=31;SAR=15;SRF=33;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0285025;STB=0.51237;TYPE=del;VARB=-0.00434636;OID=.;OPOS=191065237;OREF=TTTG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:46:119:58:127:69:39:19:45:24:99:51:31:15:33:18 chr2 191065595 . G T 231.85 PASS AO=45;DP=88;FAO=50;FDP=95;FR=.;FRO=45;FSAF=3;FSAR=47;FSRF=5;FSRR=40;FWDB=-0.0327407;FXX=0.0206164;HRUN=4;LEN=1;MLLD=73.605;QD=9.76224;RBI=0.0371484;REFB=-0.00138231;REVB=-0.0175514;RO=43;SAF=3;SAR=42;SRF=5;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148616;STB=0.590225;TYPE=snp;VARB=0.00480201;OID=.;OPOS=191065595;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:95:43:45:45:50:42:3:5:38:47:3:5:40 chr2 191065782 . A AGAT 94.56 PASS AO=33;DP=106;FAO=33;FDP=97;FR=.;FRO=64;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=27;FSRR=37;FWDB=-0.00313005;FXX=0.0848977;HRUN=1;LEN=3;MLLD=237.244;QD=3.89948;RBI=0.0109492;REFB=-0.0142047;REVB=-0.0104922;RO=64;SAF=13;SAR=20;SRF=27;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0330271;STB=0.519132;TYPE=ins;VARB=0.0258325;OID=.;OPOS=191065783;OREF=-;OALT=GAT;OMAPALT=AGAT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:33:106:33:97:64:13:20:27:37:94:64:13:20:27:37 chr2 191066683 . C T 517.52 PASS AO=118;DP=252;FAO=130;FDP=274;FR=.;FRO=144;FSAF=39;FSAR=91;FSRF=69;FSRR=75;FWDB=-0.00817719;FXX=0.00724611;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.331;QD=7.55507;RBI=0.00875382;REFB=-0.00793947;REVB=-0.00312457;RO=133;SAF=39;SAR=79;SRF=69;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189254;STB=0.602854;TYPE=snp;VARB=0.00901;OID=.;OPOS=191066683;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:252:274:133:144:118:130:79:39:69:64:91:39:69:75 chr2 191066769 . C T 1489.37 PASS AO=131;DP=131;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=117;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00026485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.813;QD=37.4685;RBI=0.0691479;REFB=0;REVB=0.0691474;RO=0;SAF=36;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.076e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00120151;OID=.;OPOS=191066769;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:131:159:0:0:131:159:95:36:0:0:117:42:0:0 chr2 191066913 . T C 296.41 PASS AO=55;DP=91;FAO=55;FDP=91;FR=.;FRO=36;FSAF=20;FSAR=35;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=0.0262277;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.809;QD=13.0289;RBI=0.0262712;REFB=-0.00101928;REVB=-0.00151181;RO=36;SAF=20;SAR=35;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0019817;STB=0.50108;TYPE=snp;VARB=0.000729322;OID=.;OPOS=191066913;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:36:36:55:55:35:20:13:23:35:20:13:23 chr2 191066970 . C T 291.4 PASS AO=56;DP=110;FAO=62;FDP=115;FR=.;FRO=53;FSAF=22;FSAR=40;FSRF=24;FSRR=29;FWDB=0.0419877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.321;QD=10.1357;RBI=0.0420619;REFB=-0.00014577;REVB=0.00249681;RO=53;SAF=18;SAR=38;SRF=24;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125815;STB=0.547929;TYPE=snp;VARB=0.000430017;OID=.;OPOS=191066970;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:115:53:53:56:62:38:18:24:29:40:22:24:29 chr2 191067233 . T C 236.03 PASS AO=58;DP=123;FAO=58;FDP=123;FR=.;FRO=65;FSAF=16;FSAR=42;FSRF=37;FSRR=28;FWDB=0.010941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.839;QD=7.67579;RBI=0.0134043;REFB=-0.0142018;REVB=0.00774408;RO=64;SAF=16;SAR=42;SRF=36;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.288856;STB=0.665212;TYPE=snp;VARB=0.0178919;OID=.;OPOS=191067233;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:64:65:58:58:42:16:36:28:42:16:37:28 chr2 191067728 . GA G 33.83 PASS AO=18;DP=63;FAO=27;FDP=69;FR=.;FRO=42;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=26;FWDB=0.0591795;FXX=0.028165;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.9372;QD=1.96123;RBI=0.072181;REFB=-0.0887636;REVB=-0.0413266;RO=35;SAF=8;SAR=10;SRF=10;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186473;STB=0.506876;TYPE=del;VARB=0.0750936;OID=.;OPOS=191067729;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:18:61:27:69:42:10:17:16:26:33:35:8:10:10:25 chr2 191067766 . T TTC 160.09 PASS AO=34;DP=92;FAO=40;FDP=87;FR=.;FRO=47;FSAF=11;FSAR=29;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=-0.00478536;FXX=0.0744602;HRUN=3;LEN=2;MLLD=134.648;QD=7.36056;RBI=0.0251755;REFB=-0.0170107;REVB=0.0247165;RO=52;SAF=8;SAR=26;SRF=27;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.3316;STB=0.639498;TYPE=ins;VARB=0.0168814;OID=.;OPOS=191067767;OREF=-;OALT=TC;OMAPALT=TTC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:34:92:40:87:47:11:29:24:23:99:52:8:26:27:25 chr2 191068061 . A T 144.71 PASS AO=42;DP=104;FAO=42;FDP=104;FR=.;FRO=62;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=41;FSRR=21;FWDB=-0.0456519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.0154;QD=5.56562;RBI=0.0457744;REFB=-0.0128749;REVB=0.00334631;RO=62;SAF=17;SAR=25;SRF=41;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265478;STB=0.649573;TYPE=snp;VARB=0.0230881;OID=.;OPOS=191068061;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:62:62:42:42:25:17:41:21:25:17:41:21 chr2 191161622 . T C 166.64 PASS AO=56;DP=157;FAO=57;FDP=157;FR=.;FRO=100;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=60;FSRR=40;FWDB=0.035061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.0607;QD=4.24568;RBI=0.0498033;REFB=-0.00413323;REVB=0.0353708;RO=99;SAF=32;SAR=24;SRF=60;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0399002;STB=0.525105;TYPE=snp;VARB=0.0117863;OID=.;OPOS=191161622;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:157:99:100:56:57:24:32:60:39:25:32:60:40 chr2 191184475 . A G 49.44 PASS AO=14;DP=38;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=6;FWDB=-0.00080922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.844;QD=5.20418;RBI=0.0138242;REFB=-0.00739252;REVB=-0.0138005;RO=23;SAF=8;SAR=6;SRF=18;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.240982;STB=0.618892;TYPE=snp;VARB=0.0116016;OID=.;OPOS=191184475;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:38:38:23:24:14:14:6:8:18:5:6:8:18:6 chr2 191224981 . G T 334.68 PASS AO=82;DP=181;FAO=85;FDP=183;FR=.;FRO=98;FSAF=21;FSAR=64;FSRF=38;FSRR=60;FWDB=0.00873431;FXX=0.00543449;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.291;QD=7.3155;RBI=0.0459672;REFB=-0.00557584;REVB=0.0451298;RO=98;SAF=21;SAR=61;SRF=38;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154365;STB=0.591826;TYPE=snp;VARB=0.00786888;OID=.;OPOS=191224981;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:183:98:98:82:85:61:21:38:60:64:21:38:60 chr2 191231458 . G A 2651.83 PASS AO=279;DP=284;FAO=283;FDP=283;FR=.;FRO=0;FSAF=130;FSAR=153;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00578504;FXX=0.0104891;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.0502;QD=37.4817;RBI=0.00589743;REFB=0.0442106;REVB=0.00114585;RO=3;SAF=128;SAR=151;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00937809;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.93202e-05;OID=.;OPOS=191231458;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:284:283:3:0:279:283:151:128:0:3:153:130:0:0 chr2 191231503 . G A 687.47 PASS AO=165;DP=331;FAO=164;FDP=331;FR=.;FRO=167;FSAF=68;FSAR=96;FSRF=74;FSRR=93;FWDB=-0.0269654;FXX=0.00301196;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.4457;QD=8.30778;RBI=0.0284858;REFB=-0.0187074;REVB=-0.00918178;RO=165;SAF=68;SAR=97;SRF=74;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0339997;STB=0.514724;TYPE=snp;VARB=0.0210372;OID=.;OPOS=191231503;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:331:331:165:167:165:164:97:68:74:91:96:68:74:93 chr2 191235901 . A C 2140.27 PASS AO=216;DP=216;FAO=232;FDP=232;FR=.;FRO=0;FSAF=137;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301245;FXX=0.0169484;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.9844;QD=36.9012;RBI=0.113633;REFB=0;REVB=0.109567;RO=0;SAF=136;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00578558;OID=.;OPOS=191235901;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:216:232:0:0:216:232:80:136:0:0:95:137:0:0 chr2 191402654 . A G 29.52 PASS AO=14;DP=38;FAO=10;FDP=34;FR=.;FRO=24;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=0.0259085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.7206;QD=3.47292;RBI=0.149647;REFB=0.0318268;REVB=-0.147387;RO=22;SAF=7;SAR=7;SRF=16;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23952;STB=0.768743;TYPE=snp;VARB=-0.0114143;OID=.;OPOS=191402654;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:38:34:22:24:14:10:7:7:16:6:7:3:17:7 chr2 191402685 . A C 384.6 PASS AO=68;DP=98;FAO=64;FDP=94;FR=.;FRO=30;FSAF=50;FSAR=14;FSRF=26;FSRR=4;FWDB=-0.0459189;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.5158;QD=16.3659;RBI=0.123117;REFB=0.0318681;REVB=-0.114233;RO=29;SAF=54;SAR=14;SRF=25;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0600612;STB=0.541739;TYPE=snp;VARB=-0.0140545;OID=.;OPOS=191402685;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:98:94:29:30:68:64:14:54:25:4:14:50:26:4 chr2 191402698 . A C 425.16 PASS AO=76;DP=108;FAO=70;FDP=102;FR=.;FRO=32;FSAF=55;FSAR=15;FSRF=27;FSRR=5;FWDB=-0.065916;FXX=0.0097078;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.3576;QD=16.673;RBI=0.0729261;REFB=0.0405375;REVB=0.0311977;RO=32;SAF=60;SAR=16;SRF=27;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0463876;STB=0.527889;TYPE=snp;VARB=-0.0173765;OID=.;OPOS=191402698;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:108:102:32:32:76:70:16:60:27:5:15:55:27:5 chr2 191402702 . T C 448.38 PASS AO=78;DP=110;FAO=73;FDP=105;FR=.;FRO=32;FSAF=58;FSAR=15;FSRF=27;FSRR=5;FWDB=-0.0168281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.9964;QD=17.081;RBI=0.0190269;REFB=-0.0110981;REVB=-0.0088791;RO=31;SAF=62;SAR=16;SRF=26;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0364817;STB=0.523608;TYPE=snp;VARB=0.00824617;OID=.;OPOS=191402702;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:110:105:31:32:78:73:16:62:26:5:15:58:27:5 chr2 191402710 . T C 485.92 PASS AO=82;DP=114;FAO=77;FDP=109;FR=.;FRO=32;FSAF=62;FSAR=15;FSRF=28;FSRR=4;FWDB=-0.0179244;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=221.566;QD=17.8321;RBI=0.0278891;REFB=-0.0221723;REVB=0.0213662;RO=32;SAF=66;SAR=16;SRF=28;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.060892;STB=0.534011;TYPE=snp;VARB=0.0133205;OID=.;OPOS=191402710;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:114:109:32:32:82:77:16:66:28:4:15:62:28:4 chr2 191402712 . T C 447.98 PASS AO=82;DP=122;FAO=77;FDP=117;FR=.;FRO=40;FSAF=62;FSAR=15;FSRF=36;FSRR=4;FWDB=-0.0378857;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=103.891;QD=15.3156;RBI=0.0496669;REFB=-0.0167952;REVB=-0.0321165;RO=39;SAF=66;SAR=16;SRF=35;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0940631;STB=0.555123;TYPE=snp;VARB=0.024489;OID=.;OPOS=191402712;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:117:39:40:82:77:16:66:35:4:15:62:36:4 chr2 191402713 . A G 447.99 PASS AO=82;DP=122;FAO=77;FDP=117;FR=.;FRO=40;FSAF=62;FSAR=15;FSRF=36;FSRR=4;FWDB=0.00813049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.748;QD=15.3158;RBI=0.0351875;REFB=0.00556699;REVB=-0.0342353;RO=40;SAF=66;SAR=16;SRF=36;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0985879;STB=0.555123;TYPE=snp;VARB=-0.00346693;OID=.;OPOS=191402713;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:117:40:40:82:77:16:66:36:4:15:62:36:4 chr2 191402748 . A T 430.45 PASS AO=83;DP=129;FAO=78;FDP=124;FR=.;FRO=46;FSAF=63;FSAR=15;FSRF=36;FSRR=10;FWDB=0.00386095;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.515;QD=13.8854;RBI=0.00389415;REFB=-0.0133678;REVB=-0.000507446;RO=46;SAF=67;SAR=16;SRF=36;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.025632;STB=0.514702;TYPE=snp;VARB=0.0127841;OID=.;OPOS=191402748;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:124:46:46:83:78:16:67:36:10:15:63:36:10 chr2 191402761 . G A 403.35 PASS AO=74;DP=118;FAO=74;FDP=119;FR=.;FRO=45;FSAF=62;FSAR=12;FSRF=35;FSRR=10;FWDB=0.0424302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.49;QD=13.5581;RBI=0.0427466;REFB=-0.0137582;REVB=-0.00519112;RO=43;SAF=62;SAR=12;SRF=33;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0822599;STB=0.539546;TYPE=snp;VARB=0.00471416;OID=.;OPOS=191402761;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:119:43:45:74:74:12:62:33:10:12:62:35:10 chr2 191402775 . T C 275.34 PASS AO=60;DP=102;FAO=55;FDP=97;FR=.;FRO=42;FSAF=52;FSAR=3;FSRF=31;FSRR=11;FWDB=0.0148983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.872;QD=11.3544;RBI=0.0166717;REFB=-0.0268921;REVB=0.00748224;RO=41;SAF=56;SAR=4;SRF=30;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.375186;STB=0.745018;TYPE=snp;VARB=0.00261135;OID=.;OPOS=191402775;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:97:41:42:60:55:4:56:30:11:3:52:31:11 chr2 191402778 . T C 260.01 PASS AO=58;DP=100;FAO=53;FDP=95;FR=.;FRO=42;FSAF=52;FSAR=1;FSRF=31;FSRR=11;FWDB=-0.0215915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.816;QD=10.9478;RBI=0.0519896;REFB=-0.00713893;REVB=-0.0472941;RO=41;SAF=56;SAR=2;SRF=30;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.545116;STB=0.882375;TYPE=snp;VARB=0.00295421;OID=.;OPOS=191402778;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:95:41:42:58:53:2:56:30:11:1:52:31:11 chr2 191535127 . GC G 1564.22 PASS AO=169;DP=241;FAO=248;FDP=248;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=160;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.315329;FXX=0.0040159;HRUN=2;LEN=1;MLLD=14.1271;QD=25.2294;RBI=0.353223;REFB=0;REVB=0.159168;RO=28;SAF=46;SAR=123;SRF=20;SRR=8;SSEN=0.268635;SSEP=0;SSSB=-0.139449;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00324444;OID=.;OPOS=191535128;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:169:230:248:248:0:88:160:0:0:99:28:46:123:20:8 chr2 191828203 . A T 393.15 PASS AO=87;DP=167;FAO=87;FDP=167;FR=.;FRO=80;FSAF=34;FSAR=53;FSRF=34;FSRR=46;FWDB=-0.000309847;FXX=0.017646;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0923;QD=9.41676;RBI=0.00274937;REFB=-0.0283366;REVB=0.00273186;RO=65;SAF=34;SAR=53;SRF=24;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0178775;STB=0.517069;TYPE=snp;VARB=0.0356411;OID=.;OPOS=191828203;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:167:65:80:87:87:53:34:24:41:53:34:34:46 chr2 191828205 . C A 358.22 PASS AO=84;DP=170;FAO=84;FDP=170;FR=.;FRO=86;FSAF=31;FSAR=53;FSRF=39;FSRR=47;FWDB=0.00237352;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=142.058;QD=8.42858;RBI=0.0255028;REFB=-0.0132802;REVB=0.0253921;RO=85;SAF=31;SAR=53;SRF=38;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0747546;STB=0.544776;TYPE=snp;VARB=0.0140333;OID=.;OPOS=191828205;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:170:85:86:84:84:53:31:38:47:53:31:39:47 chr2 192160839 . A T 400.44 PASS AO=103;DP=222;FAO=103;FDP=223;FR=.;FRO=120;FSAF=45;FSAR=58;FSRF=79;FSRR=41;FWDB=0.0103318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.473;QD=7.18276;RBI=0.0150967;REFB=-0.00925823;REVB=0.0110075;RO=117;SAF=45;SAR=58;SRF=77;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210551;STB=0.617476;TYPE=snp;VARB=0.0075789;OID=.;OPOS=192160839;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:223:117:120:103:103:58:45:77:40:58:45:79:41 chr2 192160875 . C T 390.86 PASS AO=99;DP=213;FAO=99;FDP=212;FR=.;FRO=113;FSAF=40;FSAR=59;FSRF=72;FSRR=41;FWDB=-0.00680389;FXX=0.00469462;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.322;QD=7.3747;RBI=0.00758456;REFB=0.00568831;REVB=-0.00335152;RO=113;SAF=40;SAR=59;SRF=72;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222663;STB=0.622902;TYPE=snp;VARB=-0.0052624;OID=.;OPOS=192160875;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:213:212:113:113:99:99:59:40:72:41:59:40:72:41 chr2 192214966 . T C 272.78 PASS AO=72;DP=157;FAO=71;FDP=157;FR=.;FRO=86;FSAF=28;FSAR=43;FSRF=36;FSRR=50;FWDB=-0.0052407;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7625;QD=6.94972;RBI=0.0113683;REFB=0.0194832;REVB=-0.0100883;RO=82;SAF=28;SAR=44;SRF=34;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0258369;STB=0.513812;TYPE=snp;VARB=-0.0295182;OID=.;OPOS=192214966;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:157:82:86:72:71:44:28:34:48:43:28:36:50 chr2 192250726 . G A 952.89 PASS AO=92;DP=92;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0321775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.182;QD=38.5005;RBI=0.0493978;REFB=0;REVB=0.03748;RO=0;SAF=39;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.40458e-05;OID=.;OPOS=192250726;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:92:99:0:0:92:99:53:39:0:0:60:39:0:0 chr2 192279327 . T C 1891.23 PASS AO=198;DP=200;FAO=198;FDP=198;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=116;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00358536;FXX=0.0099995;HRUN=2;LEN=1;MLLD=282.749;QD=38.2066;RBI=0.0212835;REFB=0.0227605;REVB=0.0209793;RO=1;SAF=82;SAR=116;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00577275;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.11825e-05;OID=.;OPOS=192279327;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:200:198:1:0:198:198:116:82:1:0:116:82:0:0 chr2 192711385 . G A 221.58 PASS AO=49;DP=94;FAO=49;FDP=95;FR=.;FRO=46;FSAF=19;FSAR=30;FSRF=17;FSRR=29;FWDB=0.0218018;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.982;QD=9.3295;RBI=0.0389554;REFB=0.00100268;REVB=0.0322832;RO=45;SAF=19;SAR=30;SRF=17;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00913683;STB=0.50931;TYPE=snp;VARB=-0.000961371;OID=.;OPOS=192711385;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:95:45:46:49:49:30:19:17:28:30:19:17:29 chr2 195523141 . G T 223.98 PASS AO=61;DP=135;FAO=59;FDP=133;FR=.;FRO=74;FSAF=22;FSAR=37;FSRF=30;FSRR=44;FWDB=-0.0720449;FXX=0.0220572;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.1038;QD=6.7362;RBI=0.0786621;REFB=-0.0451223;REVB=0.0315794;RO=74;SAF=21;SAR=40;SRF=30;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0650145;STB=0.519152;TYPE=snp;VARB=0.0374644;OID=.;OPOS=195523141;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:133:74:74:61:59:40:21:30:44:37:22:30:44 chr2 196602089 . T TATCA 174.27 PASS AO=63;DP=213;FAO=66;FDP=196;FR=.;FRO=130;FSAF=31;FSAR=35;FSRF=46;FSRR=84;FWDB=-0.0209149;FXX=0.0392138;HRUN=1;LEN=4;MLLD=151.153;QD=3.55652;RBI=0.0210999;REFB=-0.0105056;REVB=-0.00278802;RO=141;SAF=33;SAR=30;SRF=50;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201026;STB=0.577828;TYPE=ins;VARB=0.063394;OID=.;OPOS=196602090;OREF=-;OALT=ATCA;OMAPALT=TATCA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:63:213:66:196:130:31:35:46:84:99:141:33:30:50:91 chr2 196602132 . GTGAT G 337.12 PASS AO=79;DP=198;FAO=83;FDP=174;FR=.;FRO=91;FSAF=41;FSAR=42;FSRF=45;FSRR=46;FWDB=-0.0127758;FXX=0.0279314;HRUN=1;LEN=4;MLLD=227.148;QD=7.74991;RBI=0.022285;REFB=-0.0242936;REVB=0.0182592;RO=83;SAF=39;SAR=40;SRF=42;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114704;STB=0.500277;TYPE=del;VARB=0.0279758;OID=.;OPOS=196602133;OREF=TGAT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:79:176:83:174:91:41:42:45:46:99:83:39:40:42:41 chr2 196673533 . A G 196.61 PASS AO=81;DP=102;FAO=40;FDP=65;FR=.;FRO=25;FSAF=29;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=24;FWDB=0.0254842;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=35.8546;QD=12.0993;RBI=0.153628;REFB=-0.0733718;REVB=0.1515;RO=20;SAF=75;SAR=6;SRF=0;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.575016;STB=0.754524;TYPE=snp;VARB=0.0625889;OID=.;OPOS=196673533;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:102:65:20:25:81:40:6:75:0:20:11:29:1:24 chr2 196791276 . T G 1259.59 PASS AO=141;DP=145;FAO=140;FDP=145;FR=.;FRO=5;FSAF=52;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0297758;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.5015;QD=34.7472;RBI=0.0297792;REFB=-0.0328881;REVB=-0.000448005;RO=2;SAF=52;SAR=89;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0105647;STB=0.51381;TYPE=snp;VARB=-0.000309486;OID=.;OPOS=196791276;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:145:145:2:5:141:140:89:52:0:2:88:52:0:5 chr2 196851911 . G A 1074.6 PASS AO=113;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0687405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.835;QD=38.0389;RBI=0.0703084;REFB=0;REVB=0.0147656;RO=0;SAF=40;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.59302e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00015815;OID=.;OPOS=196851911;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:113:113:0:0:113:113:73:40:0:0:73:40:0:0 chr2 196866420 . C T 2710.95 PASS AO=282;DP=283;FAO=283;FDP=283;FR=.;FRO=0;FSAF=153;FSAR=130;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0250643;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=255.734;QD=38.3173;RBI=0.0252699;REFB=0;REVB=0.00321655;RO=0;SAF=153;SAR=129;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30333e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.60575e-06;OID=.;OPOS=196866420;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:283:283:0:0:282:283:129:153:0:0:130:153:0:0 chr2 196892695 . T C 304.79 PASS AO=76;DP=162;FAO=76;FDP=162;FR=.;FRO=86;FSAF=34;FSAR=42;FSRF=43;FSRR=43;FWDB=-0.051165;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.6083;QD=7.52574;RBI=0.0662007;REFB=0.0157631;REVB=0.0420081;RO=86;SAF=34;SAR=42;SRF=43;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0506998;STB=0.528079;TYPE=snp;VARB=-0.01831;OID=.;OPOS=196892695;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:162:86:86:76:76:42:34:43:43:42:34:43:43 chr2 196915991 . A G 2084.92 PASS AO=241;DP=255;FAO=248;FDP=262;FR=.;FRO=14;FSAF=67;FSAR=181;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.0135599;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.4949;QD=31.8308;RBI=0.0548473;REFB=0.0392606;REVB=-0.0531447;RO=14;SAF=62;SAR=179;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0512432;STB=0.524676;TYPE=snp;VARB=-0.0315104;OID=.;OPOS=196915991;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:255:262:14:14:241:248:179:62:9:5:181:67:9:5 chr2 197004439 . A G 3587.55 PASS AO=376;DP=380;FAO=380;FDP=380;FR=.;FRO=0;FSAF=174;FSAR=206;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0106399;FXX=0.00783269;HRUN=3;LEN=1;MLLD=231.878;QD=37.7637;RBI=0.0108565;REFB=0.00452175;REVB=-0.0021578;RO=3;SAF=171;SAR=205;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00185016;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.89613e-06;OID=.;OPOS=197004439;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:380:380:3:0:376:380:205:171:1:2:206:174:0:0 chr2 197021276 . T C 1803.3 PASS AO=182;DP=182;FAO=188;FDP=188;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0547931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.003;QD=38.368;RBI=0.0559784;REFB=0;REVB=-0.0114582;RO=0;SAF=90;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.65896e-05;OID=.;OPOS=197021276;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:182:188:0:0:182:188:92:90:0:0:93:95:0:0 chr2 197021372 . T A 1091.22 PASS AO=120;DP=125;FAO=121;FDP=124;FR=.;FRO=3;FSAF=40;FSAR=81;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.00472669;FXX=0.00799936;HRUN=4;LEN=1;MLLD=217.411;QD=35.2006;RBI=0.00504308;REFB=-0.120052;REVB=0.00175812;RO=2;SAF=40;SAR=80;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00582558;STB=0.509127;TYPE=snp;VARB=0.000234884;OID=.;OPOS=197021372;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:125:124:2:3:120:121:80:40:1:1:81:40:2:1 chr2 197065221 . A G 2039.07 PASS AO=225;DP=232;FAO=225;FDP=232;FR=.;FRO=7;FSAF=115;FSAR=110;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0156106;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.148;QD=35.1564;RBI=0.0252916;REFB=-0.0324923;REVB=0.0198991;RO=7;SAF=115;SAR=110;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00346682;STB=0.501821;TYPE=snp;VARB=0.000459925;OID=.;OPOS=197065221;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:232:232:7:7:225:225:110:115:4:3:110:115:4:3 chr2 197118729 . C T 769.46 PASS AO=79;DP=79;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.12;QD=37.9982;RBI=0.0151645;REFB=0;REVB=0.0106133;RO=0;SAF=48;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.70148e-05;OID=.;OPOS=197118729;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:79:81:0:0:79:81:31:48:0:0:31:50:0:0 chr2 197154234 . A G 274.07 PASS AO=69;DP=149;FAO=69;FDP=149;FR=.;FRO=80;FSAF=31;FSAR=38;FSRF=40;FSRR=40;FWDB=-0.0201871;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.467;QD=7.3575;RBI=0.0212691;REFB=-0.00632857;REVB=0.0066974;RO=80;SAF=31;SAR=38;SRF=40;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0492944;STB=0.527357;TYPE=snp;VARB=0.00978358;OID=.;OPOS=197154234;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:80:80:69:69:38:31:40:40:38:31:40:40 chr2 197154370 . G T 132.54 PASS AO=41;DP=107;FAO=41;FDP=107;FR=.;FRO=66;FSAF=12;FSAR=29;FSRF=25;FSRR=41;FWDB=0.00348646;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=176.11;QD=4.95459;RBI=0.00361597;REFB=-0.0156812;REVB=0.000959104;RO=65;SAF=12;SAR=29;SRF=24;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0948077;STB=0.560868;TYPE=snp;VARB=0.0177766;OID=.;OPOS=197154370;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:65:66:41:41:29:12:24:41:29:12:25:41 chr2 197154386 . C T 138.62 PASS AO=38;DP=91;FAO=38;FDP=91;FR=.;FRO=53;FSAF=11;FSAR=27;FSRF=20;FSRR=33;FWDB=0.0190268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.321;QD=6.09306;RBI=0.020736;REFB=-0.0193442;REVB=0.0082439;RO=53;SAF=11;SAR=27;SRF=20;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104166;STB=0.559086;TYPE=snp;VARB=0.0356019;OID=.;OPOS=197154386;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:53:53:38:38:27:11:20:33:27:11:20:33 chr2 197184321 . C T 247.81 PASS AO=58;DP=116;FAO=58;FDP=118;FR=.;FRO=60;FSAF=14;FSAR=44;FSRF=24;FSRR=36;FWDB=0.021164;FXX=0.00840265;HRUN=4;LEN=1;MLLD=177.637;QD=8.4002;RBI=0.021869;REFB=-0.00863667;REVB=-0.00550776;RO=56;SAF=14;SAR=44;SRF=24;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200016;STB=0.598817;TYPE=snp;VARB=0.00936593;OID=.;OPOS=197184321;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:118:56:60:58:58:44:14:24:32:44:14:24:36 chr2 197504545 . C G 56.17 PASS AO=20;DP=59;FAO=19;FDP=59;FR=.;FRO=40;FSAF=2;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=28;FWDB=-0.0103055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.396;QD=3.8078;RBI=0.0113816;REFB=-0.0258842;REVB=-0.00483089;RO=38;SAF=2;SAR=18;SRF=12;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.397073;STB=0.725316;TYPE=snp;VARB=0.0720158;OID=.;OPOS=197504545;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:59:59:38:40:20:19:18:2:12:26:17:2:12:28 chr2 197541296 . G A 148 PASS AO=38;DP=89;FAO=39;FDP=90;FR=.;FRO=51;FSAF=29;FSAR=10;FSRF=31;FSRR=20;FWDB=-0.00423733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.491;QD=6.57755;RBI=0.026758;REFB=-0.0151346;REVB=-0.0264204;RO=51;SAF=28;SAR=10;SRF=31;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154024;STB=0.591787;TYPE=snp;VARB=0.0245965;OID=.;OPOS=197541296;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:90:51:51:38:39:10:28:31:20:10:29:31:20 chr2 198257795 . T C 488.04 PASS AO=81;DP=120;FAO=81;FDP=120;FR=.;FRO=39;FSAF=53;FSAR=28;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=-0.0145655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.268;QD=16.268;RBI=0.016139;REFB=-0.00442767;REVB=-0.00695091;RO=36;SAF=53;SAR=28;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142879;STB=0.566395;TYPE=snp;VARB=0.00111837;OID=.;OPOS=198257795;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:36:39:81:81:28:53:15:21:28:53:18:21 chr2 198265526 . A G 356.54 PASS AO=85;DP=178;FAO=85;FDP=176;FR=.;FRO=91;FSAF=38;FSAR=47;FSRF=48;FSRR=43;FWDB=0.0109246;FXX=0.0537606;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.634;QD=8.10317;RBI=0.0183512;REFB=-0.010754;REVB=-0.0147452;RO=87;SAF=38;SAR=47;SRF=46;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0751777;STB=0.541668;TYPE=snp;VARB=0.010565;OID=.;OPOS=198265526;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:176:87:91:85:85:47:38:46:41:47:38:48:43 chr2 198283305 . T C 110.78 PASS AO=35;DP=99;FAO=36;FDP=99;FR=.;FRO=63;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=34;FWDB=-0.00522682;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=215.724;QD=4.47596;RBI=0.0066828;REFB=0.00908408;REVB=-0.00416414;RO=62;SAF=21;SAR=14;SRF=28;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165369;STB=0.578371;TYPE=snp;VARB=-0.018379;OID=.;OPOS=198283305;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:62:63:35:36:14:21:28:34:15:21:29:34 chr2 198362018 . T C 165.48 PASS AO=43;DP=97;FAO=43;FDP=97;FR=.;FRO=54;FSAF=9;FSAR=34;FSRF=11;FSRR=43;FWDB=0.0145827;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=177.834;QD=6.82387;RBI=0.0165004;REFB=0.000873277;REVB=-0.00772051;RO=51;SAF=9;SAR=34;SRF=11;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00929567;STB=0.504732;TYPE=snp;VARB=-0.000985171;OID=.;OPOS=198362018;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:51:54:43:43:34:9:11:40:34:9:11:43 chr2 198508951 . G A 468.52 PASS AO=110;DP=221;FAO=110;FDP=221;FR=.;FRO=111;FSAF=36;FSAR=74;FSRF=36;FSRR=75;FWDB=-0.0153708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.7429;QD=8.4799;RBI=0.0262318;REFB=0.00325949;REVB=0.0212567;RO=111;SAF=36;SAR=74;SRF=36;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00306463;STB=0.501683;TYPE=snp;VARB=-0.00323721;OID=.;OPOS=198508951;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:221:111:111:110:110:74:36:36:75:74:36:36:75 chr2 198572076 . A ATTC 29.83 PASS AO=19;DP=88;FAO=19;FDP=87;FR=.;FRO=68;FSAF=2;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=45;FWDB=0.0251796;FXX=0.0113623;HRUN=2;LEN=3;MLLD=159.463;QD=1.37145;RBI=0.0252652;REFB=-0.00470133;REVB=0.00207861;RO=67;SAF=2;SAR=17;SRF=23;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.424168;STB=0.773779;TYPE=ins;VARB=0.0184351;OID=.;OPOS=198572077;OREF=-;OALT=TTC;OMAPALT=ATTC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:19:88:19:87:68:2:17:23:45:29:67:2:17:23:44 chr2 198950240 . G A 290.41 PASS AO=75;DP=165;FAO=75;FDP=164;FR=.;FRO=89;FSAF=27;FSAR=48;FSRF=51;FSRR=38;FWDB=-0.0218489;FXX=0.00606024;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.554;QD=7.08313;RBI=0.0320288;REFB=-0.0176359;REVB=0.0234195;RO=87;SAF=27;SAR=48;SRF=49;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199996;STB=0.617179;TYPE=snp;VARB=0.0139135;OID=.;OPOS=198950240;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:164:87:89:75:75:48:27:49:38:48:27:51:38 chr2 200136583 . T A 2261.34 PASS AO=235;DP=236;FAO=235;FDP=235;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=130;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0337896;FXX=0.0126045;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.03;QD=38.4909;RBI=0.0348827;REFB=0;REVB=0.00866425;RO=0;SAF=108;SAR=127;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.87511e-05;OID=.;OPOS=200136583;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:236:235:0:0:235:235:127:108:0:0:130:105:0:0 chr2 200792881 . C T 2059.08 PASS AO=215;DP=215;FAO=215;FDP=215;FR=.;FRO=0;FSAF=113;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00852718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.836;QD=38.3085;RBI=0.048175;REFB=0;REVB=0.0474143;RO=0;SAF=113;SAR=102;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6753e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.03139e-05;OID=.;OPOS=200792881;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:97:215:215:0:0:215:215:102:113:0:0:102:113:0:0 chr2 201215968 . GT G 45.08 PASS AO=46;DP=151;FAO=49;FDP=143;FR=.;FRO=94;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=41;FSRR=53;FWDB=-0.0730862;FXX=0.027209;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.7392;QD=1.26094;RBI=0.0845494;REFB=-0.105391;REVB=-0.0425088;RO=83;SAF=18;SAR=28;SRF=37;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0631561;STB=0.518913;TYPE=del;VARB=0.115862;OID=.;OPOS=201215969;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:46:146:49:143:94:20:29:41:53:45:83:18:28:37:46 chr2 201253956 . A G 214.81 PASS AO=50;DP=102;FAO=50;FDP=102;FR=.;FRO=52;FSAF=18;FSAR=32;FSRF=19;FSRR=33;FWDB=-0.0017758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.423;QD=8.42392;RBI=0.0121023;REFB=-0.0192125;REVB=-0.0119713;RO=50;SAF=18;SAR=32;SRF=19;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0194723;STB=0.502972;TYPE=snp;VARB=0.0341519;OID=.;OPOS=201253956;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:50:52:50:50:32:18:19:31:32:18:19:33 chr2 201343285 . C T 440.05 PASS AO=131;DP=309;FAO=129;FDP=310;FR=.;FRO=181;FSAF=65;FSAR=64;FSRF=74;FSRR=107;FWDB=-0.0675643;FXX=0.00641005;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.6309;QD=5.6781;RBI=0.0680639;REFB=0.00386501;REVB=-0.0082315;RO=178;SAF=66;SAR=65;SRF=72;SRR=106;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102811;STB=0.555436;TYPE=snp;VARB=-0.00611317;OID=.;OPOS=201343285;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:309:310:178:181:131:129:65:66:72:106:64:65:74:107 chr2 201344434 . A G 37.9 PASS AO=17;DP=64;FAO=17;FDP=64;FR=.;FRO=47;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=34;FSRR=13;FWDB=-0.0375226;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.4211;QD=2.36863;RBI=0.0381757;REFB=-0.00971644;REVB=-0.00703134;RO=45;SAF=12;SAR=5;SRF=33;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0405124;STB=0.515677;TYPE=snp;VARB=0.0183194;OID=.;OPOS=201344434;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:64:64:45:47:17:17:5:12:33:12:5:12:34:13 chr2 201344491 . G A 92.38 PASS AO=31;DP=89;FAO=31;FDP=90;FR=.;FRO=59;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=33;FSRR=26;FWDB=-0.0336209;FXX=0.0109878;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.8063;QD=4.10567;RBI=0.0469671;REFB=-0.0171345;REVB=-0.0327955;RO=55;SAF=13;SAR=18;SRF=33;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198722;STB=0.59137;TYPE=snp;VARB=0.0233783;OID=.;OPOS=201344491;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:89:90:55:59:31:31:18:13:33:22:18:13:33:26 chr2 201344732 . C T 309.34 PASS AO=71;DP=145;FAO=75;FDP=153;FR=.;FRO=78;FSAF=40;FSAR=35;FSRF=41;FSRR=37;FWDB=0.0371719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.774;QD=8.08734;RBI=0.0371723;REFB=-0.016594;REVB=0.000163273;RO=74;SAF=39;SAR=32;SRF=39;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0207339;STB=0.503936;TYPE=snp;VARB=0.0117455;OID=.;OPOS=201344732;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:153:74:78:71:75:32:39:39:35:35:40:41:37 chr2 201354825 . A G 124.68 PASS AO=27;DP=53;FAO=27;FDP=53;FR=.;FRO=26;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=-0.0180105;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.2047;QD=9.40945;RBI=0.0799279;REFB=-0.0267813;REVB=-0.0778723;RO=26;SAF=19;SAR=8;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.290058;STB=0.662666;TYPE=snp;VARB=0.0417179;OID=.;OPOS=201354825;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:26:26:27:27:8:19:10:16:8:19:10:16 chr2 201355106 . G A 214.49 PASS AO=53;DP=124;FAO=54;FDP=118;FR=.;FRO=64;FSAF=44;FSAR=10;FSRF=45;FSRR=19;FWDB=-0.000659371;FXX=0.0247913;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.9521;QD=7.27099;RBI=0.0318112;REFB=-0.00201452;REVB=0.0318044;RO=42;SAF=44;SAR=9;SRF=25;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.267011;STB=0.589068;TYPE=snp;VARB=0.00237001;OID=.;OPOS=201355106;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:118:42:64:53:54:9:44:25:17:10:44:45:19 chr2 201437214 . A G 227.43 PASS AO=57;DP=123;FAO=57;FDP=123;FR=.;FRO=66;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=34;FSRR=32;FWDB=0.039259;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.5081;QD=7.39613;RBI=0.0542564;REFB=-0.0359889;REVB=0.0374497;RO=63;SAF=29;SAR=28;SRF=34;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0292707;STB=0.503423;TYPE=snp;VARB=0.0425088;OID=.;OPOS=201437214;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:63:66:57:57:28:29:34:29:28:29:34:32 chr2 201437328 . C A 314.66 PASS AO=64;DP=114;FAO=64;FDP=114;FR=.;FRO=50;FSAF=28;FSAR=36;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=-0.0190155;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.9083;QD=11.0406;RBI=0.0353022;REFB=-0.0201801;REVB=-0.0297431;RO=46;SAF=28;SAR=36;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0147839;STB=0.518841;TYPE=snp;VARB=0.0101548;OID=.;OPOS=201437328;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:46:50:64:64:36:28:21:25:36:28:24:26 chr2 201437334 . T C 984.07 PASS AO=97;DP=99;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0341838;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.333;QD=37.8488;RBI=0.0347843;REFB=0;REVB=0.00643584;RO=0;SAF=37;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.7108e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.33721e-05;OID=.;OPOS=201437334;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:99:104:0:0:97:104:60:37:0:0:62:42:0:0 chr2 201526330 . A G 199.79 PASS AO=61;DP=155;FAO=61;FDP=154;FR=.;FRO=93;FSAF=26;FSAR=35;FSRF=53;FSRR=40;FWDB=-0.00731508;FXX=0.0064512;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.855;QD=5.18923;RBI=0.019071;REFB=-0.00929916;REVB=0.0176123;RO=91;SAF=26;SAR=35;SRF=51;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142391;STB=0.586398;TYPE=snp;VARB=0.0130642;OID=.;OPOS=201526330;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:154:91:93:61:61:35:26:51:40:35:26:53:40 chr2 201526368 . C G 219.42 PASS AO=63;DP=152;FAO=63;FDP=152;FR=.;FRO=89;FSAF=32;FSAR=31;FSRF=39;FSRR=50;FWDB=-0.00868173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.8255;QD=5.77415;RBI=0.0189336;REFB=-0.0198881;REVB=0.0168259;RO=89;SAF=32;SAR=31;SRF=39;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0727088;STB=0.540776;TYPE=snp;VARB=0.0268188;OID=.;OPOS=201526368;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:152:89:89:63:63:31:32:39:50:31:32:39:50 chr2 201736166 . A C 389.27 PASS AO=104;DP=237;FAO=106;FDP=238;FR=.;FRO=132;FSAF=58;FSAR=48;FSRF=68;FSRR=64;FWDB=0.0072218;FXX=0.00418393;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.517;QD=6.54235;RBI=0.0105534;REFB=-0.019639;REVB=0.00769546;RO=133;SAF=58;SAR=46;SRF=69;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0395918;STB=0.517854;TYPE=snp;VARB=0.0271822;OID=.;OPOS=201736166;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:237:238:133:132:104:106:46:58:69:64:48:58:68:64 chr2 201768238 . C T 302.09 PASS AO=83;DP=217;FAO=93;FDP=228;FR=.;FRO=135;FSAF=38;FSAR=55;FSRF=69;FSRR=66;FWDB=0.0129599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.921;QD=5.29983;RBI=0.0458046;REFB=-0.0128513;REVB=0.043933;RO=125;SAF=35;SAR=48;SRF=64;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0972697;STB=0.561372;TYPE=snp;VARB=0.0182433;OID=.;OPOS=201768238;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:217:228:125:135:83:93:48:35:64:61:55:38:69:66 chr2 201785837 . G A 383.88 PASS AO=98;DP=216;FAO=100;FDP=218;FR=.;FRO=118;FSAF=30;FSAR=70;FSRF=55;FSRR=63;FWDB=-0.0304131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.234;QD=7.0436;RBI=0.036303;REFB=-0.0023772;REVB=0.019823;RO=118;SAF=29;SAR=69;SRF=55;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183648;STB=0.598571;TYPE=snp;VARB=0.00342622;OID=.;OPOS=201785837;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:216:218:118:118:98:100:69:29:55:63:70:30:55:63 chr2 202006096 . G A 278.81 PASS AO=55;DP=103;FAO=58;FDP=106;FR=.;FRO=48;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=0.031051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.526;QD=10.521;RBI=0.0419192;REFB=-0.0365069;REVB=0.0281612;RO=48;SAF=27;SAR=28;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00770488;STB=0.50781;TYPE=snp;VARB=0.0271947;OID=.;OPOS=202006096;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:106:48:48:55:58:28:27:24:24:28:30:24:24 chr2 202025621 . A G 74.19 PASS AO=20;DP=51;FAO=20;FDP=50;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=24;FSRR=6;FWDB=0.0133106;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.181;QD=5.93517;RBI=0.0133141;REFB=-0.0169214;REVB=-0.000301821;RO=30;SAF=11;SAR=9;SRF=24;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.275495;STB=0.656113;TYPE=snp;VARB=0.0204584;OID=.;OPOS=202025621;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:51:50:30:30:20:20:9:11:24:6:9:11:24:6 chr2 202050677 . A G 2018.27 PASS AO=212;DP=213;FAO=212;FDP=212;FR=.;FRO=0;FSAF=109;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0239782;FXX=0.00469462;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.396;QD=38.0806;RBI=0.0288231;REFB=0;REVB=-0.0159944;RO=0;SAF=109;SAR=103;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.69714e-05;OID=.;OPOS=202050677;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:96:213:212:0:0:212:212:103:109:0:0:103:109:0:0 chr2 202082459 . T A 2034.8 PASS AO=214;DP=217;FAO=216;FDP=216;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=158;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235712;FXX=0.013698;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.9356;QD=37.6815;RBI=0.0380547;REFB=-0.0540299;REVB=0.0298757;RO=3;SAF=57;SAR=157;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133945;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00138448;OID=.;OPOS=202082459;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:217:216:3:0:214:216:157:57:2:1:158:58:0:0 chr2 202122995 . A G 156.99 PASS AO=55;DP=155;FAO=55;FDP=155;FR=.;FRO=100;FSAF=36;FSAR=19;FSRF=69;FSRR=31;FWDB=-0.00686409;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=287.609;QD=4.05128;RBI=0.00968496;REFB=-0.00131763;REVB=0.00683248;RO=100;SAF=36;SAR=19;SRF=69;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0450595;STB=0.525683;TYPE=snp;VARB=0.00331984;OID=.;OPOS=202122995;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:100:100:55:55:19:36:69:31:19:36:69:31 chr2 202154477 . AG A 866.95 PASS AO=132;DP=157;FAO=156;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.19511;FXX=0.00636902;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.571;QD=22.2294;RBI=0.205871;REFB=0.0394458;REVB=0.0656884;RO=14;SAF=52;SAR=80;SRF=1;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0.48834;SSSB=0.0622181;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.000588023;OID=.;OPOS=202154478;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:132:157:156:156:0:57:99:0:0:72:14:52:80:1:13 chr2 202215492 . C G 121.17 PASS AO=36;DP=94;FAO=36;FDP=92;FR=.;FRO=56;FSAF=8;FSAR=28;FSRF=15;FSRR=41;FWDB=-0.0490911;FXX=0.0212743;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.141;QD=5.26804;RBI=0.0515198;REFB=-0.00784758;REVB=-0.0156317;RO=54;SAF=8;SAR=28;SRF=14;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0544246;STB=0.538439;TYPE=snp;VARB=0.0138407;OID=.;OPOS=202215492;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:92:54:56:36:36:28:8:14:40:28:8:15:41 chr2 202245244 . A G 313.21 PASS AO=75;DP=154;FAO=75;FDP=154;FR=.;FRO=79;FSAF=44;FSAR=31;FSRF=43;FSRR=36;FWDB=-0.00425766;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=204.701;QD=8.13521;RBI=0.00451424;REFB=-0.00167683;REVB=-0.00150023;RO=78;SAF=44;SAR=31;SRF=42;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0454887;STB=0.522226;TYPE=snp;VARB=0.00172643;OID=.;OPOS=202245244;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:154:78:79:75:75:31:44:42:36:31:44:43:36 chr2 202252539 . G A 345.71 PASS AO=90;DP=198;FAO=90;FDP=198;FR=.;FRO=108;FSAF=46;FSAR=44;FSRF=45;FSRR=63;FWDB=0.00527408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.0585;QD=6.98406;RBI=0.00894712;REFB=-0.0202662;REVB=0.00722738;RO=106;SAF=46;SAR=44;SRF=43;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102828;STB=0.551412;TYPE=snp;VARB=0.0166879;OID=.;OPOS=202252539;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:198:106:108:90:90:44:46:43:63:44:46:45:63 chr2 202260049 . G A 568.23 PASS AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0337914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.712;QD=38.5238;RBI=0.0337995;REFB=0;REVB=0.00073818;RO=0;SAF=31;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.58817e-05;OID=.;OPOS=202260049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:59:59:0:0:59:59:28:31:0:0:28:31:0:0 chr2 202264156 . C T 558.13 PASS AO=124;DP=236;FAO=124;FDP=236;FR=.;FRO=112;FSAF=61;FSAR=63;FSRF=59;FSRR=53;FWDB=0.0283314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.195;QD=9.45981;RBI=0.0284155;REFB=-0.00480956;REVB=-0.00218544;RO=111;SAF=61;SAR=63;SRF=59;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0342211;STB=0.516532;TYPE=snp;VARB=0.00415448;OID=.;OPOS=202264156;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:236:236:111:112:124:124:63:61:59:52:63:61:59:53 chr2 202337730 . A G 369.6 PASS AO=97;DP=214;FAO=97;FDP=214;FR=.;FRO=117;FSAF=58;FSAR=39;FSRF=47;FSRR=70;FWDB=-0.0581807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.918;QD=6.90848;RBI=0.0592308;REFB=0.00212355;REVB=-0.0111036;RO=114;SAF=58;SAR=39;SRF=46;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189259;STB=0.606871;TYPE=snp;VARB=-0.00347017;OID=.;OPOS=202337730;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:214:114:117:97:97:39:58:46:68:39:58:47:70 chr2 202342381 . C T 302.13 PASS AO=77;DP=157;FAO=77;FDP=167;FR=.;FRO=90;FSAF=33;FSAR=44;FSRF=57;FSRR=33;FWDB=-0.038608;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.87;QD=7.23668;RBI=0.0519766;REFB=-0.0507943;REVB=-0.0347993;RO=80;SAF=33;SAR=44;SRF=53;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21362;STB=0.609109;TYPE=snp;VARB=0.0634342;OID=.;OPOS=202342381;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:167:80:90:77:77:44:33:53:27:44:33:57:33 chr2 202342402 . G T 340.81 PASS AO=74;DP=143;FAO=76;FDP=145;FR=.;FRO=69;FSAF=48;FSAR=28;FSRF=31;FSRR=38;FWDB=0.00597945;FXX=0.00684885;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.419;QD=9.40165;RBI=0.0107749;REFB=-0.00266229;REVB=0.00896349;RO=69;SAF=46;SAR=28;SRF=31;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154061;STB=0.588824;TYPE=snp;VARB=0.00254444;OID=.;OPOS=202342402;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:145:69:69:74:76:28:46:31:38:28:48:31:38 chr2 202357949 . A C 992.31 PASS AO=112;DP=117;FAO=113;FDP=118;FR=.;FRO=5;FSAF=76;FSAR=37;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.00361797;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.2678;QD=33.6377;RBI=0.0650591;REFB=-0.143958;REVB=0.0649584;RO=5;SAF=76;SAR=36;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011329;STB=0.515921;TYPE=snp;VARB=0.00559767;OID=.;OPOS=202357949;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:117:118:5:5:112:113:36:76:4:1:37:76:5:0 chr2 202400872 . G A 150.34 PASS AO=37;DP=81;FAO=37;FDP=81;FR=.;FRO=44;FSAF=9;FSAR=28;FSRF=16;FSRR=28;FWDB=0.026509;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.207;QD=7.42413;RBI=0.0279003;REFB=0.00275771;REVB=0.00870071;RO=44;SAF=9;SAR=28;SRF=16;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144201;STB=0.581349;TYPE=snp;VARB=-0.00161386;OID=.;OPOS=202400872;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:44:44:37:37:28:9:16:28:28:9:16:28 chr2 202410300 . A T 391.99 PASS AO=85;DP=163;FAO=87;FDP=165;FR=.;FRO=78;FSAF=40;FSAR=47;FSRF=46;FSRR=32;FWDB=0.0639252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.783;QD=9.50269;RBI=0.0663774;REFB=0.0137562;REVB=-0.0178754;RO=77;SAF=38;SAR=47;SRF=46;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129923;STB=0.561219;TYPE=snp;VARB=-0.0144016;OID=.;OPOS=202410300;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:165:77:78:85:87:47:38:46:31:47:40:46:32 chr2 202469361 . C T 508.51 PASS AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0106788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.667;QD=37.667;RBI=0.0238817;REFB=0;REVB=0.0213612;RO=0;SAF=6;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.82534e-05;OID=.;OPOS=202469361;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:54:54:0:0:54:54:48:6:0:0:48:6:0:0 chr2 202528830 . A AT 145.68 PASS AO=108;DP=323;FAO=129;FDP=314;FR=.;FRO=185;FSAF=56;FSAR=73;FSRF=93;FSRR=92;FWDB=0.165213;FXX=0.0031745;HRUN=5;LEN=1;MLLD=9.25686;QD=1.85584;RBI=0.210659;REFB=-0.0247451;REVB=0.130698;RO=182;SAF=44;SAR=64;SRF=97;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140156;STB=0.540681;TYPE=ins;VARB=0.0393725;OID=.;OPOS=202528831;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:108:323:129:314:185:56:73:93:92:99:182:44:64:97:85 chr2 202557702 . C T 498.27 PASS AO=56;DP=59;FAO=56;FDP=59;FR=.;FRO=3;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0294362;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.4532;QD=33.7807;RBI=0.0674558;REFB=-0.114282;REVB=0.0606942;RO=3;SAF=27;SAR=29;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0495519;STB=0.526306;TYPE=snp;VARB=0.00484628;OID=.;OPOS=202557702;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:59:59:3:3:56:56:29:27:3:0:29:27:3:0 chr2 202575821 . G A 470.75 PASS AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0275857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.9939;QD=37.6599;RBI=0.0290426;REFB=0;REVB=-0.00908277;RO=0;SAF=19;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00228408;OID=.;OPOS=202575821;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:50:50:0:0:50:50:31:19:0:0:31:19:0:0 chr2 202598113 . C T 1617.56 PASS AO=162;DP=162;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00953543;FXX=0.00591681;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.318;QD=38.5133;RBI=0.0133636;REFB=0;REVB=0.00936273;RO=0;SAF=85;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00054207;OID=.;OPOS=202598113;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:162:168:0:0:162:168:77:85:0:0:80:88:0:0 chr2 202625615 . C T 2074.23 PASS AO=214;DP=214;FAO=216;FDP=216;FR=.;FRO=0;FSAF=134;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00275333;FXX=0.00460808;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.536;QD=38.4116;RBI=0.00675815;REFB=0;REVB=-0.00617185;RO=0;SAF=135;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.961e-06;OID=.;OPOS=202625615;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:214:216:0:0:214:216:79:135:0:0:82:134:0:0 chr2 202741256 . A T 1982.52 PASS AO=207;DP=209;FAO=209;FDP=209;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00246455;FXX=0.00947822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.153;QD=37.943;RBI=0.0374083;REFB=-0.0284272;REVB=-0.0373271;RO=1;SAF=103;SAR=104;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00460251;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.24916e-05;OID=.;OPOS=202741256;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:209:209:1:0:207:209:104:103:1:0:104:105:0:0 chr2 202741269 . G A 1817.03 PASS AO=192;DP=193;FAO=192;FDP=192;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010824;FXX=0.00518108;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.219;QD=37.8549;RBI=0.044586;REFB=-0.0395491;REVB=0.0432521;RO=0;SAF=97;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.91465e-05;OID=.;OPOS=202741269;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:193:192:0:0:192:192:95:97:0:0:95:97:0:0 chr2 202939654 . T C 297.51 PASS AO=78;DP=172;FAO=78;FDP=173;FR=.;FRO=95;FSAF=31;FSAR=47;FSRF=46;FSRR=49;FWDB=-0.0480042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.4152;QD=6.87878;RBI=0.0538705;REFB=-0.0186669;REVB=-0.0244463;RO=92;SAF=31;SAR=47;SRF=44;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0807095;STB=0.548736;TYPE=snp;VARB=0.0209601;OID=.;OPOS=202939654;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:173:92:95:78:78:47:31:44:48:47:31:46:49 chr2 202957848 . T C 174.28 PASS AO=42;DP=86;FAO=41;FDP=85;FR=.;FRO=44;FSAF=4;FSAR=37;FSRF=9;FSRR=35;FWDB=-0.00363067;FXX=0.0229859;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.532;QD=8.20138;RBI=0.0105695;REFB=0.0017749;REVB=-0.00992637;RO=44;SAF=4;SAR=38;SRF=9;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226932;STB=0.625416;TYPE=snp;VARB=-0.00277214;OID=.;OPOS=202957848;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:85:44:44:42:41:38:4:9:35:37:4:9:35 chr2 202964380 . G A 273.92 PASS AO=76;DP=187;FAO=79;FDP=190;FR=.;FRO=111;FSAF=37;FSAR=42;FSRF=42;FSRR=69;FWDB=-0.00549552;FXX=0.00523533;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.156;QD=5.76666;RBI=0.00695563;REFB=-0.0113106;REVB=0.00426379;RO=111;SAF=36;SAR=40;SRF=42;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101884;STB=0.553118;TYPE=snp;VARB=0.0169982;OID=.;OPOS=202964380;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:190:111:111:76:79:40:36:42:69:42:37:42:69 chr2 203072675 . GC G 204.49 PASS AO=26;DP=40;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.208769;FXX=0.0270197;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.0597;QD=22.7215;RBI=0.208775;REFB=-0.0658026;REVB=-0.00162394;RO=6;SAF=23;SAR=3;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10704;STB=0.508192;TYPE=del;VARB=0.024153;OID=.;OPOS=203072676;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:26:37:35:36:1:30:5:1:0:13:6:23:3:6:0 chr2 203139844 . T C 16.95 PASS AO=8;DP=37;FAO=8;FDP=37;FR=.;FRO=29;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=21;FWDB=0.00895707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.02;QD=1.83217;RBI=0.0157951;REFB=-0.00180002;REVB=-0.0130098;RO=29;SAF=3;SAR=5;SRF=8;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134362;STB=0.586265;TYPE=snp;VARB=0.00757734;OID=.;OPOS=203139844;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:37:37:29:29:8:8:5:3:8:21:5:3:8:21 chr2 203155936 . A C 248.86 PASS AO=63;DP=143;FAO=65;FDP=145;FR=.;FRO=80;FSAF=53;FSAR=12;FSRF=49;FSRR=31;FWDB=-0.0238366;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2357;QD=6.86523;RBI=0.0282218;REFB=-0.0221275;REVB=0.0151091;RO=76;SAF=51;SAR=12;SRF=46;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.262608;STB=0.650533;TYPE=snp;VARB=0.0278699;OID=.;OPOS=203155936;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:145:76:80:63:65:12:51:46:30:12:53:49:31 chr2 203421199 . G A 385.46 PASS AO=36;DP=36;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135105;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.248;QD=37.6057;RBI=0.0505822;REFB=0;REVB=0.0487445;RO=0;SAF=20;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.9376e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00047438;OID=.;OPOS=203421199;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:36:41:0:0:36:41:16:20:0:0:18:23:0:0 chr2 203640713 . T C 723.83 PASS AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0305048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.264;QD=38.096;RBI=0.0306645;REFB=0;REVB=-0.00312622;RO=0;SAF=24;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.16397e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.21492e-05;OID=.;OPOS=203640713;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:76:76:0:0:76:76:52:24:0:0:52:24:0:0 chr2 204062061 . A G 3188.76 PASS AO=331;DP=331;FAO=332;FDP=332;FR=.;FRO=0;FSAF=185;FSAR=147;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00130718;FXX=0.00895496;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.813;QD=38.4188;RBI=0.00605304;REFB=0;REVB=-0.00591021;RO=0;SAF=185;SAR=146;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.14832e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.45637e-07;OID=.;OPOS=204062061;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:331:332:0:0:331:332:146:185:0:0:147:185:0:0 chr2 204090887 . C G 2353.12 PASS AO=245;DP=247;FAO=245;FDP=245;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=150;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00739231;FXX=0.00809684;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.26;QD=38.4183;RBI=0.0177602;REFB=0;REVB=0.0161486;RO=0;SAF=95;SAR=150;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.69484e-05;OID=.;OPOS=204090887;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:247:245:0:0:245:245:150:95:0:0:150:95:0:0 chr2 204116690 . C T 1915.85 PASS AO=199;DP=199;FAO=199;FDP=199;FR=.;FRO=0;FSAF=129;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0131178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.911;QD=38.5095;RBI=0.042624;REFB=0;REVB=-0.0405552;RO=0;SAF=129;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.65475e-05;OID=.;OPOS=204116690;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:199:199:0:0:199:199:70:129:0:0:70:129:0:0 chr2 204154552 . C T 2199.11 PASS AO=228;DP=230;FAO=232;FDP=232;FR=.;FRO=0;FSAF=102;FSAR=130;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0402383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.3122;QD=37.9157;RBI=0.0825059;REFB=0;REVB=0.0720285;RO=1;SAF=101;SAR=127;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00373755;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000600824;OID=.;OPOS=204154552;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:230:232:1:0:228:232:127:101:0:1:130:102:0:0 chr2 204206977 . C T 808.37 PASS AO=88;DP=91;FAO=89;FDP=90;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=51;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00560636;FXX=0.0109878;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.877;QD=35.9276;RBI=0.0110906;REFB=-0.150377;REVB=0.0095692;RO=0;SAF=38;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.49151e-08;STB=0.506492;TYPE=snp;VARB=0.000979849;OID=.;OPOS=204206977;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:91:90:0:1:88:89:50:38:0:0:51:38:1:0 chr2 204298783 . A C 547.36 PASS AO=93;DP=143;FAO=95;FDP=143;FR=.;FRO=48;FSAF=31;FSAR=64;FSRF=8;FSRR=40;FWDB=0.0717479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.5441;QD=15.3107;RBI=0.088365;REFB=-0.135046;REVB=0.0515811;RO=49;SAF=31;SAR=62;SRF=7;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145037;STB=0.563624;TYPE=snp;VARB=0.0468591;OID=.;OPOS=204298783;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:49:48:93:95:62:31:7:42:64:31:8:40 chr2 204305093 . T C 106.96 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0192355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=42.6334;QD=35.6538;RBI=0.0520696;REFB=0;REVB=-0.0483863;RO=0;SAF=11;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.23983e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00448383;OID=.;OPOS=204305093;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:1:11:0:0:1:11:0:0 chr2 204322298 . T C 960.65 PASS AO=102;DP=107;FAO=107;FDP=111;FR=.;FRO=4;FSAF=36;FSAR=71;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0859156;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=41.0542;QD=34.6179;RBI=0.0877761;REFB=-0.0976671;REVB=-0.017976;RO=5;SAF=35;SAR=67;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0441759;STB=0.516505;TYPE=snp;VARB=0.00251492;OID=.;OPOS=204322298;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:107:111:5:4:102:107:67:35:4:1:71:36:3:1 chr2 204824283 . T G 177.89 PASS AO=44;DP=99;FAO=44;FDP=97;FR=.;FRO=53;FSAF=31;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=36;FWDB=-0.0165695;FXX=0.029997;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.0604;QD=7.33571;RBI=0.0175756;REFB=-0.0125548;REVB=0.00586113;RO=52;SAF=31;SAR=13;SRF=16;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.381789;STB=0.708725;TYPE=snp;VARB=0.00985774;OID=.;OPOS=204824283;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:97:52:53:44:44:13:31:16:36:13:31:17:36 chr2 204824324 . A C 255.25 PASS AO=53;DP=97;FAO=53;FDP=97;FR=.;FRO=44;FSAF=34;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=28;FWDB=0.00626534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.441;QD=10.5259;RBI=0.0114843;REFB=0.00378892;REVB=-0.00962471;RO=41;SAF=34;SAR=19;SRF=13;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.258249;STB=0.62711;TYPE=snp;VARB=-0.00307006;OID=.;OPOS=204824324;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:41:44:53:53:19:34:13:28:19:34:16:28 chr2 204825286 . T C 205.25 PASS AO=51;DP=112;FAO=51;FDP=110;FR=.;FRO=59;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=31;FWDB=0.013256;FXX=0.0265463;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.014;QD=7.46359;RBI=0.0204075;REFB=0.00188421;REVB=0.0155159;RO=57;SAF=30;SAR=21;SRF=28;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0932143;STB=0.561531;TYPE=snp;VARB=-0.00185476;OID=.;OPOS=204825286;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:110:57:59:51:51:21:30:28:29:21:30:28:31 chr2 205829991 . C T 2366.03 PASS AO=246;DP=247;FAO=247;FDP=247;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=168;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247907;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.921;QD=38.3163;RBI=0.0340069;REFB=0;REVB=0.0232786;RO=0;SAF=78;SAR=168;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.237e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.78485e-05;OID=.;OPOS=205829991;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:247:247:0:0:246:247:168:78:0:0:168:79:0:0 chr2 205912403 . T C 1160.99 PASS AO=120;DP=122;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00686243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.526;QD=38.0654;RBI=0.0220278;REFB=0;REVB=0.0209316;RO=0;SAF=60;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.3255e-05;OID=.;OPOS=205912403;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:122:122:0:0:120:122:60:60:0:0:61:61:0:0 chr2 206166580 . G A 299.65 PASS AO=84;DP=198;FAO=86;FDP=204;FR=.;FRO=118;FSAF=47;FSAR=39;FSRF=58;FSRR=60;FWDB=0.00858634;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.1272;QD=5.87539;RBI=0.0105854;REFB=0.00644631;REVB=-0.00619082;RO=114;SAF=45;SAR=39;SRF=54;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.063953;STB=0.531886;TYPE=snp;VARB=-0.00864871;OID=.;OPOS=206166580;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:204:114:118:84:86:39:45:54:60:39:47:58:60 chr2 206218963 . G A 78.25 PASS AO=34;DP=115;FAO=34;FDP=115;FR=.;FRO=81;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=35;FSRR=46;FWDB=0.00936964;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.27;QD=2.72157;RBI=0.0231659;REFB=-0.00909512;REVB=-0.0211865;RO=79;SAF=17;SAR=17;SRF=34;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0829646;STB=0.547798;TYPE=snp;VARB=0.0182412;OID=.;OPOS=206218963;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:115:115:79:81:34:34:17:17:34:45:17:17:35:46 chr2 206219012 . T C 80.81 PASS AO=38;DP=134;FAO=38;FDP=134;FR=.;FRO=96;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=42;FSRR=54;FWDB=-0.0105618;FXX=0.00740686;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.7717;QD=2.41213;RBI=0.0147255;REFB=-0.00383673;REVB=-0.010261;RO=95;SAF=16;SAR=22;SRF=42;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0259848;STB=0.512032;TYPE=snp;VARB=0.00954103;OID=.;OPOS=206219012;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:134:134:95:96:38:38:22:16:42:53:22:16:42:54 chr2 206219013 . A C 82.43 PASS AO=39;DP=133;FAO=39;FDP=134;FR=.;FRO=95;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=41;FSRR=54;FWDB=-0.0129991;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.446;QD=2.46051;RBI=0.0144121;REFB=-0.0105683;REVB=-0.00622356;RO=93;SAF=17;SAR=22;SRF=41;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00604598;STB=0.503114;TYPE=snp;VARB=0.0235104;OID=.;OPOS=206219013;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:133:134:93:95:39:39:22:17:41:52:22:17:41:54 chr2 206305156 . C T 479.86 PASS AO=126;DP=276;FAO=126;FDP=276;FR=.;FRO=150;FSAF=60;FSAR=66;FSRF=61;FSRR=89;FWDB=0.0136134;FXX=0.00360998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.457;QD=6.95443;RBI=0.013813;REFB=-0.0215924;REVB=-0.00233941;RO=144;SAF=61;SAR=65;SRF=58;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0789777;STB=0.538002;TYPE=snp;VARB=0.0214782;OID=.;OPOS=206305156;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:276:276:144:150:126:126:65:61:58:86:66:60:61:89 chr2 206581033 . G A 1145.72 PASS AO=120;DP=120;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0193863;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.5767;QD=38.5116;RBI=0.0284162;REFB=0;REVB=0.0207762;RO=0;SAF=60;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.04433e-06;OID=.;OPOS=206581033;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:120:119:0:0:120:119:60:60:0:0:60:59:0:0 chr2 206592695 . T C 974.55 PASS AO=215;DP=407;FAO=213;FDP=398;FR=.;FRO=185;FSAF=70;FSAR=143;FSRF=73;FSRR=112;FWDB=-0.00323675;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.134;QD=9.79448;RBI=0.0154859;REFB=-0.0234834;REVB=-0.0151439;RO=189;SAF=70;SAR=145;SRF=75;SRR=114;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0677636;STB=0.533927;TYPE=snp;VARB=0.019541;OID=.;OPOS=206592695;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:407:398:189:185:215:213:145:70:75:114:143:70:73:112 chr2 206608039 . T C 479.18 PASS AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0076783;FXX=0.0192271;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.1541;QD=37.5829;RBI=0.00925794;REFB=0;REVB=-0.00517234;RO=0;SAF=16;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.5765e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.06269e-05;OID=.;OPOS=206608039;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:52:51:0:0:51:51:35:16:0:0:35:16:0:0 chr2 206863874 . C T 110.16 PASS AO=23;DP=46;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=2;FSAR=22;FSRF=5;FSRR=19;FWDB=-0.0260237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.516;QD=9.18033;RBI=0.0310716;REFB=-0.00195156;REVB=-0.0169767;RO=19;SAF=2;SAR=21;SRF=1;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0961226;STB=0.652387;TYPE=snp;VARB=0.00180963;OID=.;OPOS=206863874;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:48:19:24:23:24:21:2:1:18:22:2:5:19 chr2 206921451 . G A 184.96 PASS AO=67;DP=192;FAO=67;FDP=192;FR=.;FRO=125;FSAF=32;FSAR=35;FSRF=71;FSRR=54;FWDB=0.0169273;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=302.813;QD=3.85328;RBI=0.0175691;REFB=-0.000128845;REVB=0.00470517;RO=124;SAF=32;SAR=35;SRF=70;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0986192;STB=0.558638;TYPE=snp;VARB=0.00026677;OID=.;OPOS=206921451;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:192:124:125:67:67:35:32:70:54:35:32:71:54 chr2 207006676 . T C 289.33 PASS AO=60;DP=110;FAO=60;FDP=110;FR=.;FRO=50;FSAF=39;FSAR=21;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=-0.0118774;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.202;QD=10.5212;RBI=0.0225649;REFB=0.0103126;REVB=0.019186;RO=50;SAF=39;SAR=21;SRF=25;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130467;STB=0.571677;TYPE=snp;VARB=-0.00816973;OID=.;OPOS=207006676;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:50:50:60:60:21:39:25:25:21:39:25:25 chr2 207008763 . C A 163.51 PASS AO=72;DP=234;FAO=72;FDP=234;FR=.;FRO=162;FSAF=45;FSAR=27;FSRF=77;FSRR=85;FWDB=-0.0050009;FXX=0.00425514;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.396;QD=2.79509;RBI=0.0183283;REFB=0.00175422;REVB=0.0176328;RO=161;SAF=45;SAR=27;SRF=77;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176903;STB=0.604722;TYPE=snp;VARB=-0.00352435;OID=.;OPOS=207008763;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:234:234:161:162:72:72:27:45:77:84:27:45:77:85 chr2 207041053 . T C 433.32 PASS AO=79;DP=130;FAO=82;FDP=136;FR=.;FRO=54;FSAF=42;FSAR=40;FSRF=22;FSRR=32;FWDB=0.0172278;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.4284;QD=12.7448;RBI=0.0558303;REFB=-0.0230224;REVB=-0.0531057;RO=51;SAF=42;SAR=37;SRF=22;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0724408;STB=0.541537;TYPE=snp;VARB=0.0206486;OID=.;OPOS=207041053;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:136:51:54:79:82:37:42:22:29:40:42:22:32 chr2 207041441 . G A 138.75 PASS AO=38;DP=91;FAO=38;FDP=91;FR=.;FRO=53;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=25;FSRR=28;FWDB=-0.0256705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.927;QD=6.09898;RBI=0.0258767;REFB=-0.00914431;REVB=-0.00326046;RO=51;SAF=18;SAR=20;SRF=23;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0231735;STB=0.501159;TYPE=snp;VARB=0.0116474;OID=.;OPOS=207041441;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:51:53:38:38:20:18:23:28:20:18:25:28 chr2 207041454 . AG A 552.27 PASS AO=75;DP=95;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0225761;FXX=0.0329634;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.7679;QD=25.1033;RBI=0.239392;REFB=-0.0293653;REVB=0.238325;RO=11;SAF=37;SAR=38;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0750993;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00949342;OID=.;OPOS=207041455;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:75:91:88:88:0:40:48:0:0:41:11:37:38:2:9 chr2 207041933 . T C 109.16 PASS AO=34;DP=91;FAO=34;FDP=91;FR=.;FRO=57;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=28;FSRR=29;FWDB=0.013356;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=209.585;QD=4.79811;RBI=0.0314439;REFB=-0.0117793;REVB=-0.0284663;RO=57;SAF=19;SAR=15;SRF=28;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0741862;STB=0.54248;TYPE=snp;VARB=0.0257102;OID=.;OPOS=207041933;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:57:57:34:34:15:19:28:29:15:19:28:29 chr2 207086148 . T C 196.9 PASS AO=61;DP=160;FAO=63;FDP=161;FR=.;FRO=98;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=31;FSRR=67;FWDB=-0.0091733;FXX=0.00617246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.274;QD=4.89187;RBI=0.0094694;REFB=0.00400854;REVB=-0.00234949;RO=97;SAF=31;SAR=30;SRF=31;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205198;STB=0.625036;TYPE=snp;VARB=-0.00633231;OID=.;OPOS=207086148;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:161:97:98:61:63:30:31:31:66:30:33:31:67 chr2 207172627 . A G 499.09 PASS AO=111;DP=215;FAO=112;FDP=215;FR=.;FRO=103;FSAF=53;FSAR=59;FSRF=53;FSRR=50;FWDB=-0.000272176;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.3983;QD=9.28544;RBI=0.033596;REFB=-0.0322679;REVB=0.0335949;RO=100;SAF=53;SAR=58;SRF=53;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0455068;STB=0.51982;TYPE=snp;VARB=0.0340321;OID=.;OPOS=207172627;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:215:100:103:111:112:58:53:53:47:59:53:53:50 chr2 207174316 . T C 166.39 PASS AO=51;DP=141;FAO=54;FDP=144;FR=.;FRO=90;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=48;FSRR=42;FWDB=-0.0165983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.317;QD=4.62187;RBI=0.0174926;REFB=-0.00356359;REVB=-0.00552148;RO=89;SAF=27;SAR=24;SRF=47;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00147825;STB=0.514013;TYPE=snp;VARB=0.00399099;OID=.;OPOS=207174316;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:144:89:90:51:54:24:27:47:42:24:30:48:42 chr2 207472683 . C CTA 354.31 PASS AO=126;DP=374;FAO=127;FDP=351;FR=.;FRO=224;FSAF=61;FSAR=66;FSRF=106;FSRR=118;FWDB=0.000196041;FXX=0.0614957;HRUN=1;LEN=2;MLLD=205.022;QD=4.03774;RBI=0.0310018;REFB=-0.0187709;REVB=0.0310012;RO=224;SAF=61;SAR=65;SRF=107;SRR=117;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00729596;STB=0.504539;TYPE=ins;VARB=0.0295438;OID=.;OPOS=207472684;OREF=-;OALT=TA;OMAPALT=CTA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:126:374:127:351:224:61:66:106:118:99:224:61:65:107:117 chr2 207621759 . A G 1315.92 PASS AO=146;DP=151;FAO=146;FDP=151;FR=.;FRO=5;FSAF=61;FSAR=85;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0152668;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.2549;QD=34.8588;RBI=0.0187893;REFB=-0.0531427;REVB=0.0109526;RO=5;SAF=61;SAR=85;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0246039;STB=0.51295;TYPE=snp;VARB=0.00613764;OID=.;OPOS=207621759;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:151:151:5:5:146:146:85:61:4:1:85:61:4:1 chr2 207827220 . G A 413.97 PASS AO=105;DP=227;FAO=106;FDP=229;FR=.;FRO=123;FSAF=71;FSAR=35;FSRF=80;FSRR=43;FWDB=-0.00974859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.823;QD=7.23092;RBI=0.0170575;REFB=-0.00660586;REVB=0.0139973;RO=122;SAF=71;SAR=34;SRF=79;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0313664;STB=0.511686;TYPE=snp;VARB=0.00805978;OID=.;OPOS=207827220;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:227:229:122:123:105:106:34:71:79:43:35:71:80:43 chr2 207945785 . A G 80.57 PASS AO=19;DP=43;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=-0.0471196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.49;QD=7.32493;RBI=0.0680211;REFB=-0.0321334;REVB=-0.0490572;RO=23;SAF=11;SAR=8;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.073141;STB=0.541626;TYPE=snp;VARB=0.0339362;OID=.;OPOS=207945785;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:43:44:23:24:19:20:8:11:15:8:9:11:15:9 chr2 207988613 . C T 1378.58 PASS AO=90;DP=169;FAO=146;FDP=147;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=96;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0429573;FXX=0.0199987;HRUN=5;LEN=1;MLLD=138.571;QD=37.5125;RBI=0.0429573;REFB=-0.0232304;REVB=-3.88026e-05;RO=0;SAF=4;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.79347e-08;STB=0.50495;TYPE=snp;VARB=0.000195408;OID=.;OPOS=207988613;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:94:147:0:1:90:146:86:4:0:0:96:50:1:0 chr2 207998800 . C T 29.51 PASS AO=9;DP=49;FAO=13;FDP=52;FR=.,HEALED;FRO=39;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=27;FWDB=-0.0109605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.9785;QD=2.27012;RBI=0.0274657;REFB=0.00519748;REVB=0.0251839;RO=25;SAF=1;SAR=8;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.51103;STB=0.7994;TYPE=snp;VARB=-0.0240785;OID=.;OPOS=207998800;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:48:52:25:39:9:13:8:1:12:13:12:1:12:27 chr2 208477852 . G A 1903.25 PASS AO=197;DP=197;FAO=198;FDP=198;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=114;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0094386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.508;QD=38.4494;RBI=0.011585;REFB=0;REVB=0.00671749;RO=0;SAF=84;SAR=113;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.04747e-06;OID=.;OPOS=208477852;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:197:198:0:0:197:198:113:84:0:0:114:84:0:0 chr2 208477956 . C T 1726.72 PASS AO=179;DP=179;FAO=182;FDP=182;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=123;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166662;FXX=0.0162153;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.446;QD=37.9499;RBI=0.0251956;REFB=0.0159663;REVB=0.0188959;RO=0;SAF=57;SAR=122;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.07887e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000333843;OID=.;OPOS=208477956;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:179:182:0:0:179:182:122:57:0:0:123:59:0:0 chr2 208489101 . C A 173.56 PASS AO=44;DP=97;FAO=44;FDP=97;FR=.;FRO=53;FSAF=14;FSAR=30;FSRF=15;FSRR=38;FWDB=-0.0188805;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.947;QD=7.15718;RBI=0.0189929;REFB=4.5025e-05;REVB=0.00206264;RO=53;SAF=14;SAR=30;SRF=15;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0403096;STB=0.522493;TYPE=snp;VARB=-0.000125924;OID=.;OPOS=208489101;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:53:53:44:44:30:14:15:38:30:14:15:38 chr2 208633627 . C T 1232.09 PASS AO=119;DP=119;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.726;QD=38.2043;RBI=0.0490513;REFB=0;REVB=0.047213;RO=0;SAF=58;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.93668e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.61339e-05;OID=.;OPOS=208633627;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:119:129:0:0:119:129:61:58:0:0:64:65:0:0 chr2 208717582 . G A 29.83 PASS AO=4;DP=38;FAO=5;FDP=25;FR=.,HEALED;FRO=17;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.00623138;FXX=0.107105;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.743;QD=4.77303;RBI=0.0399139;REFB=-0.00154912;REVB=-0.0394244;RO=2;SAF=3;SAR=1;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210252;STB=0.694787;TYPE=snp;VARB=0.00816044;OID=.;OPOS=208717582;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:18:25:2:17:4:5:1:3:2:0:1:4:10:7 chr2 208811097 . C T 1966.34 PASS AO=202;DP=203;FAO=207;FDP=207;FR=.;FRO=0;FSAF=112;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0198564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.3149;QD=37.9969;RBI=0.0869191;REFB=0;REVB=0.0846207;RO=0;SAF=112;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000186906;OID=.;OPOS=208811097;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:92:203:207:0:0:202:207:90:112:0:0:95:112:0:0 chr2 208841964 . A G 222.92 PASS AO=64;DP=157;FAO=67;FDP=167;FR=.;FRO=100;FSAF=30;FSAR=37;FSRF=51;FSRR=49;FWDB=-0.0127178;FXX=0.00595203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.409;QD=5.33951;RBI=0.0197719;REFB=-0.00608429;REVB=-0.0151389;RO=90;SAF=30;SAR=34;SRF=49;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.078736;STB=0.537374;TYPE=snp;VARB=0.00923733;OID=.;OPOS=208841964;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:167:90:100:64:67:34:30:49:41:37:30:51:49 chr2 208918917 . C T 208.02 PASS AO=69;DP=172;FAO=69;FDP=184;FR=.;FRO=115;FSAF=54;FSAR=15;FSRF=61;FSRR=54;FWDB=-0.0575696;FXX=0.0107521;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8022;QD=4.52215;RBI=0.144786;REFB=-0.00687096;REVB=-0.132848;RO=102;SAF=54;SAR=15;SRF=51;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.340858;STB=0.683486;TYPE=snp;VARB=0.0165555;OID=.;OPOS=208918917;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:184:102:115:69:69:15:54:51:51:15:54:61:54 chr2 208938866 . G T 325.75 PASS AO=78;DP=161;FAO=78;FDP=161;FR=.;FRO=83;FSAF=37;FSAR=41;FSRF=34;FSRR=49;FWDB=-0.00276325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.087;QD=8.09317;RBI=0.0139679;REFB=0.00492754;REVB=0.0136918;RO=78;SAF=37;SAR=41;SRF=31;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0703688;STB=0.53356;TYPE=snp;VARB=-0.00417023;OID=.;OPOS=208938866;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:161:78:83:78:78:41:37:31:47:41:37:34:49 chr2 208986637 . T C 617.25 PASS AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0143041;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167;QD=36.8506;RBI=0.0144099;REFB=-0.0361714;REVB=-0.00174306;RO=1;SAF=21;SAR=45;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0103857;STB=0.505493;TYPE=snp;VARB=0.000772886;OID=.;OPOS=208986637;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:67:67:1:1:66:66:45:21:0:1:45:21:0:1 chr2 209007559 . T G 2194.04 PASS AO=227;DP=228;FAO=230;FDP=230;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=156;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0608019;FXX=0.0170933;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.064;QD=38.1573;RBI=0.069001;REFB=0;REVB=-0.0326232;RO=0;SAF=74;SAR=153;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00014662;OID=.;OPOS=209007559;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:228:230:0:0:227:230:153:74:0:0:156:74:0:0 chr2 209030050 . T A 933.25 PASS AO=100;DP=101;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00218801;FXX=0.0196059;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.2088;QD=37.3299;RBI=0.102923;REFB=-0.0797191;REVB=0.1029;RO=1;SAF=52;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00903581;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000867052;OID=.;OPOS=209030050;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:101:100:1:0:100:100:48:52:1:0:48:52:0:0 chr2 209033138 . C T 1356.78 PASS AO=150;DP=154;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00338778;FXX=0.0324654;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4795;QD=36.4236;RBI=0.0105667;REFB=-0.0579354;REVB=-0.010009;RO=2;SAF=52;SAR=98;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00960771;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.72674e-05;OID=.;OPOS=209033138;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:154:149:2:0:150:149:98:52:0:2:97:52:0:0 chr2 209033173 . A G 673.04 PASS AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.031142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.784;QD=37.9176;RBI=0.0318704;REFB=0;REVB=-0.00677453;RO=0;SAF=19;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.63684e-05;OID=.;OPOS=209033173;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:71:71:0:0:71:71:52:19:0:0:52:19:0:0 chr2 209036712 . T C 2000.45 PASS AO=204;DP=204;FAO=210;FDP=210;FR=.;FRO=0;FSAF=123;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0103924;FXX=0.00473911;HRUN=1;LEN=1;MLLD=300.787;QD=38.1039;RBI=0.0107959;REFB=0;REVB=0.00292372;RO=0;SAF=119;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.18562e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.83007e-05;OID=.;OPOS=209036712;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:204:210:0:0:204:210:85:119:0:0:87:123:0:0 chr2 209036778 . A G 1824.97 PASS AO=192;DP=192;FAO=191;FDP=191;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00253694;FXX=0.00520806;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.537;QD=38.2194;RBI=0.0335168;REFB=0;REVB=0.0334207;RO=0;SAF=102;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.02734e-05;OID=.;OPOS=209036778;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:192:191:0:0:192:191:90:102:0:0:90:101:0:0 chr2 209184980 . G A 1169.1 PASS AO=117;DP=119;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00929562;FXX=0.0159987;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.24;QD=38.0195;RBI=0.0375476;REFB=0;REVB=0.0363787;RO=0;SAF=59;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000134699;OID=.;OPOS=209184980;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:119:123:0:0:117:123:58:59:0:0:61:62:0:0 chr2 209184999 . C T 1038.97 PASS AO=118;DP=125;FAO=118;FDP=124;FR=.;FRO=6;FSAF=56;FSAR=62;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0151165;FXX=0.00799936;HRUN=4;LEN=1;MLLD=136.033;QD=33.5152;RBI=0.0298809;REFB=-0.0208471;REVB=-0.0257751;RO=5;SAF=56;SAR=62;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00576771;STB=0.501233;TYPE=snp;VARB=4.36475e-05;OID=.;OPOS=209184999;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:125:124:5:6:118:118:62:56:2:3:62:56:3:3 chr2 209190330 . T C 1224.87 PASS AO=151;DP=170;FAO=151;FDP=170;FR=.;FRO=19;FSAF=79;FSAR=72;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.0618505;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.5223;QD=28.8205;RBI=0.0625649;REFB=-0.132637;REVB=-0.00942757;RO=12;SAF=79;SAR=72;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0148934;STB=0.511425;TYPE=snp;VARB=0.0164813;OID=.;OPOS=209190330;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:170:170:12:19:151:151:72:79:5:7:72:79:8:11 chr2 209190519 . A T 1169.16 PASS AO=127;DP=130;FAO=130;FDP=132;FR=.;FRO=2;FSAF=71;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00380392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.633;QD=35.4292;RBI=0.0560195;REFB=-0.0571601;REVB=0.0558902;RO=0;SAF=71;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508332;TYPE=snp;VARB=0.000537656;OID=.;OPOS=209190519;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:130:132:0:2:127:130:56:71:0:0:59:71:0:2 chr2 209190528 . C G 1133.12 PASS AO=116;DP=122;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0600054;FXX=0.0775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.0944;QD=38.0882;RBI=0.110229;REFB=0;REVB=0.0924652;RO=0;SAF=58;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0014469;OID=.;OPOS=209190528;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:122:119:0:0:116:119:58:58:0:0:60:59:0:0 chr2 209191082 . C A 368.9 PASS AO=51;DP=53;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.191153;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.7013;QD=37.8362;RBI=0.193438;REFB=0;REVB=-0.0296415;RO=1;SAF=23;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200325;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00322338;OID=.;OPOS=209191082;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:53:39:1:0:51:39:28:23:1:0:28:11:0:0 chr2 209191099 . T C 356.85 PASS AO=43;DP=45;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0378071;FXX=0.0512689;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.414;QD=38.5783;RBI=0.0393581;REFB=0;REVB=0.0109402;RO=0;SAF=15;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02792e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000326566;OID=.;OPOS=209191099;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:45:37:0:0:43:37:28:15:0:0:28:9:0:0 chr2 209209827 . G A 662.5 PASS AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0283246;FXX=0.0277739;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.716;QD=37.8573;RBI=0.0378131;REFB=0;REVB=0.0250509;RO=0;SAF=38;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.68928e-05;OID=.;OPOS=209209827;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:70:70:0:0:70:70:32:38:0:0:32:38:0:0 chr2 209212707 . G A 1564.02 PASS AO=161;DP=164;FAO=173;FDP=173;FR=.;FRO=0;FSAF=107;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00112857;FXX=0.0388867;HRUN=3;LEN=1;MLLD=83.2023;QD=36.1623;RBI=0.0195499;REFB=0.0089663;REVB=0.0195173;RO=1;SAF=103;SAR=58;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00813279;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00134245;OID=.;OPOS=209212707;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:164:173:1:0:161:173:58:103:0:1:66:107:0:0 chr2 209214770 . A G 972.73 PASS AO=110;DP=119;FAO=114;FDP=118;FR=.;FRO=4;FSAF=49;FSAR=65;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0328208;FXX=0.00840265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.1;QD=32.9739;RBI=0.0438834;REFB=-0.207468;REVB=0.0291298;RO=6;SAF=46;SAR=64;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00855938;STB=0.506228;TYPE=snp;VARB=0.00177162;OID=.;OPOS=209214770;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:119:118:6:4:110:114:64:46:2:4:65:49:1:3 chr2 209215586 . A G 1189.5 PASS AO=133;DP=137;FAO=131;FDP=135;FR=.;FRO=4;FSAF=71;FSAR=60;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0134065;FXX=0.0145975;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.7238;QD=35.2444;RBI=0.0223869;REFB=-0.0271045;REVB=0.0179287;RO=4;SAF=72;SAR=61;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0256716;STB=0.513697;TYPE=snp;VARB=0.00103329;OID=.;OPOS=209215586;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:137:135:4:4:133:131:61:72:4:0:60:71:4:0 chr2 209220157 . G T 2344.89 PASS AO=247;DP=250;FAO=247;FDP=247;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=174;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183463;FXX=0.0119995;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.085;QD=37.9739;RBI=0.0189326;REFB=-0.0608639;REVB=-0.0046749;RO=1;SAF=73;SAR=174;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00648438;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000217923;OID=.;OPOS=209220157;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:94:250:247:1:0:247:247:174:73:1:0:174:73:0:0 chr2 209220238 . G C 2879.23 PASS AO=316;DP=327;FAO=318;FDP=329;FR=.;FRO=11;FSAF=91;FSAR=227;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.0391826;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.3443;QD=35.0059;RBI=0.0440241;REFB=-0.0811125;REVB=0.020071;RO=10;SAF=91;SAR=225;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0289707;STB=0.517774;TYPE=snp;VARB=0.00211271;OID=.;OPOS=209220238;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:327:329:10:11:316:318:225:91:7:3:227:91:8:3 chr2 209224874 . CA C 832.82 PASS AO=100;DP=115;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0568382;FXX=0.0090082;HRUN=2;LEN=1;MLLD=22.7418;QD=30.2842;RBI=0.0726907;REFB=0;REVB=-0.045314;RO=1;SAF=44;SAR=56;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106594;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.000691697;OID=.;OPOS=209224875;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:100:104:110:110:0:52:58:0:0:73:1:44:56:1:0 chr2 209358027 . C T 227.03 PASS AO=54;DP=108;FAO=54;FDP=112;FR=.;FRO=58;FSAF=15;FSAR=39;FSRF=26;FSRR=32;FWDB=-0.0410534;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.084;QD=8.10821;RBI=0.0410536;REFB=-0.0155028;REVB=0.000114725;RO=54;SAF=15;SAR=39;SRF=24;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171058;STB=0.600186;TYPE=snp;VARB=0.0120582;OID=.;OPOS=209358027;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:112:54:58:54:54:39:15:24:30:39:15:26:32 chr2 210586685 . T C 1933.86 PASS AO=190;DP=190;FAO=203;FDP=203;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0483628;FXX=0.00490172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.337;QD=38.1056;RBI=0.0484417;REFB=0;REVB=-0.0027626;RO=0;SAF=81;SAR=109;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.79139e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.60477e-05;OID=.;OPOS=210586685;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:92:190:203:0:0:190:203:109:81:0:0:110:93:0:0 chr2 210705348 . C G 1426.8 PASS AO=148;DP=149;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00124368;FXX=0.0133324;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.577;QD=38.5622;RBI=0.00467435;REFB=0;REVB=0.00450586;RO=0;SAF=68;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.87518e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.67936e-05;OID=.;OPOS=210705348;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:149:148:0:0:148:148:80:68:0:0:80:68:0:0 chr2 210843383 . G A 275.47 PASS AO=66;DP=129;FAO=63;FDP=125;FR=.;FRO=62;FSAF=13;FSAR=50;FSRF=15;FSRR=47;FWDB=0.00294149;FXX=0.0310053;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.264;QD=8.81516;RBI=0.00624537;REFB=-0.0183495;REVB=-0.00550929;RO=61;SAF=16;SAR=50;SRF=14;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0155044;STB=0.526109;TYPE=snp;VARB=0.0157204;OID=.;OPOS=210843383;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:125:61:62:66:63:50:16:14:47:50:13:15:47 chr2 211060050 . T G 278.28 PASS AO=60;DP=113;FAO=60;FDP=113;FR=.;FRO=53;FSAF=29;FSAR=31;FSRF=17;FSRR=36;FWDB=-0.00807661;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=80.5238;QD=9.85064;RBI=0.0187691;REFB=-0.0113604;REVB=-0.0169425;RO=52;SAF=29;SAR=31;SRF=16;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149896;STB=0.576704;TYPE=snp;VARB=0.0071761;OID=.;OPOS=211060050;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:52:53:60:60:31:29:16:36:31:29:17:36 chr2 211074909 . T C 189.79 PASS AO=59;DP=152;FAO=59;FDP=152;FR=.;FRO=93;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=50;FSRR=43;FWDB=0.00367824;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=227.77;QD=4.99451;RBI=0.00377935;REFB=0.00910987;REVB=0.000868346;RO=93;SAF=25;SAR=34;SRF=50;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123468;STB=0.569809;TYPE=snp;VARB=-0.0129182;OID=.;OPOS=211074909;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:152:93:93:59:59:34:25:50:43:34:25:50:43 chr2 211098113 . C T 2074.41 PASS AO=201;DP=201;FAO=219;FDP=219;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=122;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.041;QD=37.8888;RBI=0.0143682;REFB=0;REVB=0.00769525;RO=0;SAF=84;SAR=117;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.0243e-05;OID=.;OPOS=211098113;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:201:219:0:0:201:219:117:84:0:0:122:97:0:0 chr2 211296239 . G A 175.43 PASS AO=44;DP=96;FAO=44;FDP=96;FR=.;FRO=52;FSAF=30;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=31;FWDB=-0.0313845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.674;QD=7.30951;RBI=0.0380574;REFB=-0.00661657;REVB=-0.0215262;RO=51;SAF=30;SAR=14;SRF=21;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.26622;STB=0.653998;TYPE=snp;VARB=0.00748117;OID=.;OPOS=211296239;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:51:52:44:44:14:30:21:30:14:30:21:31 chr2 211342502 . G A 183.02 PASS AO=47;DP=108;FAO=48;FDP=109;FR=.;FRO=61;FSAF=33;FSAR=15;FSRF=30;FSRR=31;FWDB=-0.0300326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.64;QD=6.71636;RBI=0.0300326;REFB=0.000539849;REVB=5.22008e-05;RO=61;SAF=33;SAR=14;SRF=30;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226063;STB=0.616271;TYPE=snp;VARB=-0.000896108;OID=.;OPOS=211342502;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:109:61:61:47:48:14:33:30:31:15:33:30:31 chr2 211421452 . A ATCT 270.68 PASS AO=74;DP=200;FAO=77;FDP=182;FR=.;FRO=105;FSAF=42;FSAR=35;FSRF=52;FSRR=53;FWDB=-0.00501734;FXX=0.0854228;HRUN=1;LEN=3;MLLD=247.213;QD=5.94905;RBI=0.0127045;REFB=-0.0172829;REVB=-0.0116718;RO=106;SAF=40;SAR=34;SRF=53;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0426783;STB=0.529051;TYPE=ins;VARB=0.022753;OID=.;OPOS=211421453;OREF=-;OALT=TCT;OMAPALT=ATCT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:74:200:77:182:105:42:35:52:53:99:106:40:34:53:53 chr2 211456637 . A G 603.43 PASS AO=168;DP=384;FAO=168;FDP=384;FR=.;FRO=216;FSAF=87;FSAR=81;FSRF=88;FSRR=128;FWDB=-0.0348935;FXX=0.00259734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.298;QD=6.2857;RBI=0.0397321;REFB=0.00070511;REVB=0.0190023;RO=207;SAF=87;SAR=81;SRF=85;SRR=122;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106786;STB=0.561925;TYPE=snp;VARB=-0.00210201;OID=.;OPOS=211456637;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:384:384:207:216:168:168:81:87:85:122:81:87:88:128 chr2 211456639 . C T 624.09 PASS AO=171;DP=386;FAO=171;FDP=386;FR=.;FRO=215;FSAF=89;FSAR=82;FSRF=88;FSRR=127;FWDB=-0.00297964;FXX=0.00258391;HRUN=3;LEN=1;MLLD=229.888;QD=6.46725;RBI=0.0155758;REFB=-0.00126323;REVB=0.0152882;RO=214;SAF=89;SAR=82;SRF=88;SRR=126;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109444;STB=0.561702;TYPE=snp;VARB=0.00150427;OID=.;OPOS=211456639;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:386:386:214:215:171:171:82:89:88:126:82:89:88:127 chr2 212642775 . T C 346.52 PASS AO=69;DP=124;FAO=70;FDP=124;FR=.;FRO=54;FSAF=46;FSAR=24;FSRF=33;FSRR=21;FWDB=0.0102415;FXX=0.0158718;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.747;QD=11.1781;RBI=0.0116916;REFB=-0.0168494;REVB=0.00563948;RO=53;SAF=46;SAR=23;SRF=32;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0550791;STB=0.52193;TYPE=snp;VARB=0.0113044;OID=.;OPOS=212642775;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:53:54:69:70:23:46:32:21:24:46:33:21 chr2 213291044 . TA T 21.84 PASS AO=27;DP=94;FAO=29;FDP=89;FR=.;FRO=60;FSAF=24;FSAR=5;FSRF=32;FSRR=28;FWDB=-0.0378628;FXX=0.0111099;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.2238;QD=0.981718;RBI=0.113194;REFB=-0.070478;REVB=0.106674;RO=55;SAF=21;SAR=6;SRF=32;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.26526;STB=0.738621;TYPE=del;VARB=0.100152;OID=.;OPOS=213291045;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:27:90:29:89:60:24:5:32:28:21:55:21:6:32:23 chr2 213790998 . G A 285.87 PASS AO=71;DP=132;FAO=63;FDP=123;FR=.;FRO=60;FSAF=27;FSAR=36;FSRF=33;FSRR=27;FWDB=0.00459699;FXX=0.0681767;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.1487;QD=9.29672;RBI=0.00459808;REFB=0.0128917;REVB=0.000100204;RO=61;SAF=35;SAR=36;SRF=34;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0543026;STB=0.559422;TYPE=snp;VARB=-0.00316321;OID=.;OPOS=213790998;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:123:61:60:71:63:36:35:34:27:36:27:33:27 chr2 213866714 . G A 1891.18 PASS AO=188;DP=190;FAO=200;FDP=200;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019322;FXX=0.00497488;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.786;QD=37.8237;RBI=0.0225548;REFB=0;REVB=0.0116352;RO=1;SAF=104;SAR=84;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00563496;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000133006;OID=.;OPOS=213866714;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:190:200:1:0:188:200:84:104:0:1:95:105:0:0 chr2 213886454 . A T 293 PASS AO=71;DP=148;FAO=71;FDP=148;FR=.;FRO=77;FSAF=33;FSAR=38;FSRF=35;FSRR=42;FWDB=-0.00218997;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=192.105;QD=7.91899;RBI=0.00659309;REFB=-0.008769;REVB=-0.00621875;RO=74;SAF=33;SAR=38;SRF=34;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0049523;STB=0.505358;TYPE=snp;VARB=0.0114505;OID=.;OPOS=213886454;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:74:77:71:71:38:33:34:40:38:33:35:42 chr2 214012405 . A C 299.36 PASS AO=39;DP=167;FAO=60;FDP=134;FR=.,HEALED;FRO=59;FSAF=20;FSAR=40;FSRF=35;FSRR=24;FWDB=0.0313271;FXX=0.118413;HRUN=9;LEN=1;MLLD=156.66;QD=8.93618;RBI=0.0679758;REFB=-0.00790643;REVB=-0.0603268;RO=37;SAF=8;SAR=31;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.386848;STB=0.632139;TYPE=snp;VARB=0.00733617;OID=.;OPOS=214012405;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:134:37:59:39:60:31:8:22:15:40:20:35:24 chr2 214012508 . C T 352.13 PASS AO=87;DP=176;FAO=87;FDP=183;FR=.;FRO=96;FSAF=24;FSAR=63;FSRF=59;FSRR=37;FWDB=0.00918179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.158;QD=7.69691;RBI=0.0110959;REFB=-0.0100965;REVB=-0.00623;RO=89;SAF=24;SAR=63;SRF=54;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.318976;STB=0.685367;TYPE=snp;VARB=0.0117563;OID=.;OPOS=214012508;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:183:89:96:87:87:63:24:54:35:63:24:59:37 chr2 214161773 . C T 84.37 PASS AO=36;DP=120;FAO=36;FDP=120;FR=.;FRO=84;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=31;FSRR=53;FWDB=0.0525975;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0883;QD=2.81235;RBI=0.0529973;REFB=0.0146999;REVB=0.00649803;RO=84;SAF=17;SAR=19;SRF=31;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124946;STB=0.572994;TYPE=snp;VARB=-0.0348663;OID=.;OPOS=214161773;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:120:120:84:84:36:36:19:17:31:53:19:17:31:53 chr2 214161849 . C T 168.37 PASS AO=50;DP=138;FAO=54;FDP=142;FR=.;FRO=88;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=25;FSRR=63;FWDB=0.0326209;FXX=0.00699252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.876;QD=4.74288;RBI=0.0330214;REFB=-0.0206531;REVB=0.00512761;RO=83;SAF=24;SAR=26;SRF=25;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19975;STB=0.613294;TYPE=snp;VARB=0.0262399;OID=.;OPOS=214161849;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:142:83:88:50:54:26:24:25:58:29:25:25:63 chr2 214637087 . A AT 23.68 PASS AO=8;DP=28;FAO=8;FDP=27;FR=.;FRO=19;FSAF=0;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=19;FWDB=0;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=32.3784;QD=3.50811;RBI=0.0273199;REFB=-0.0227423;REVB=-0.0273199;RO=20;SAF=0;SAR=8;SRF=0;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.0936872;OID=.;OPOS=214637088;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:8:28:8:27:19:0:8:0:19:23:20:0:8:0:20 chr2 214727221 . A C 252.76 PASS AO=75;DP=184;FAO=75;FDP=184;FR=.;FRO=109;FSAF=43;FSAR=32;FSRF=52;FSRR=57;FWDB=-0.0258469;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.0783;QD=5.49477;RBI=0.093707;REFB=0.00671888;REVB=-0.0900718;RO=104;SAF=43;SAR=32;SRF=49;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106468;STB=0.557288;TYPE=snp;VARB=-0.0147601;OID=.;OPOS=214727221;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:184:104:109:75:75:32:43:49:55:32:43:52:57 chr2 215102929 . T A 786.4 PASS AO=81;DP=81;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0493259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=304.659;QD=37.8987;RBI=0.0529314;REFB=0;REVB=0.0192012;RO=0;SAF=20;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.26704e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.59799e-05;OID=.;OPOS=215102929;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:81:83:0:0:81:83:61:20:0:0:62:21:0:0 chr2 215632256 . A G 413.38 PASS AO=109;DP=242;FAO=109;FDP=241;FR=.;FRO=132;FSAF=51;FSAR=58;FSRF=67;FSRR=65;FWDB=-0.0147166;FXX=0.00823011;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9914;QD=6.86105;RBI=0.0147612;REFB=-0.00698643;REVB=0.00114672;RO=130;SAF=51;SAR=58;SRF=67;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0467004;STB=0.521762;TYPE=snp;VARB=0.00955469;OID=.;OPOS=215632256;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:242:241:130:132:109:109:58:51:67:63:58:51:67:65 chr2 215645464 . C G 1741.48 PASS AO=194;DP=202;FAO=194;FDP=201;FR=.;FRO=7;FSAF=72;FSAR=122;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=-0.00857567;FXX=0.00495025;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.658;QD=34.6564;RBI=0.01041;REFB=0.017362;REVB=-0.00590132;RO=3;SAF=72;SAR=122;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00915521;STB=0.51796;TYPE=snp;VARB=-0.00038126;OID=.;OPOS=215645464;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:202:201:3:7:194:194:122:72:2:1:122:72:6:1 chr2 215674224 . G A 94.81 PASS AO=20;DP=40;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.00545122;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=123.065;QD=9.48084;RBI=0.00557782;REFB=-0.0155492;REVB=0.00118165;RO=20;SAF=9;SAR=11;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132146;STB=0.574553;TYPE=snp;VARB=0.0125461;OID=.;OPOS=215674224;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:40:40:20:20:20:20:11:9:12:8:11:9:12:8 chr2 215796568 . T C 252.21 PASS AO=72;DP=172;FAO=72;FDP=172;FR=.;FRO=100;FSAF=36;FSAR=36;FSRF=79;FSRR=21;FWDB=-0.0429729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.941;QD=5.86529;RBI=0.0474252;REFB=-0.0236893;REVB=0.0200619;RO=100;SAF=36;SAR=36;SRF=79;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.304807;STB=0.668563;TYPE=snp;VARB=0.0227046;OID=.;OPOS=215796568;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:172:100:100:72:72:36:36:79:21:36:36:79:21 chr2 215820013 . G A 243.41 PASS AO=62;DP=135;FAO=62;FDP=135;FR=.;FRO=73;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=34;FSRR=39;FWDB=0.00196514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.559;QD=7.21213;RBI=0.00645299;REFB=-0.00816133;REVB=-0.00614649;RO=73;SAF=30;SAR=32;SRF=34;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0176497;STB=0.50981;TYPE=snp;VARB=0.0102981;OID=.;OPOS=215820013;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:73:73:62:62:32:30:34:39:32:30:34:39 chr2 215851303 . A G 287.89 PASS AO=70;DP=148;FAO=70;FDP=147;FR=.;FRO=77;FSAF=27;FSAR=43;FSRF=28;FSRR=49;FWDB=-0.00925041;FXX=0.0134219;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.5569;QD=7.83363;RBI=0.0257747;REFB=-0.0306271;REVB=0.0240575;RO=73;SAF=27;SAR=43;SRF=26;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0290548;STB=0.512267;TYPE=snp;VARB=0.0313943;OID=.;OPOS=215851303;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:147:73:77:70:70:43:27:26:47:43:27:28:49 chr2 215854156 . C T 319.94 PASS AO=81;DP=182;FAO=81;FDP=176;FR=.;FRO=95;FSAF=52;FSAR=29;FSRF=53;FSRR=42;FWDB=0.0111902;FXX=0.0329652;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.736;QD=7.27139;RBI=0.0213897;REFB=-0.0203159;REVB=-0.018229;RO=84;SAF=52;SAR=29;SRF=50;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0462085;STB=0.548006;TYPE=snp;VARB=0.0157452;OID=.;OPOS=215854156;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:176:84:95:81:81:29:52:50:34:29:52:53:42 chr2 215865575 . T C 354.99 PASS AO=87;DP=182;FAO=87;FDP=182;FR=.;FRO=95;FSAF=47;FSAR=40;FSRF=49;FSRR=46;FWDB=0.00429629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.4563;QD=7.80186;RBI=0.00534165;REFB=-0.0208269;REVB=0.00317412;RO=95;SAF=47;SAR=40;SRF=49;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0232003;STB=0.512811;TYPE=snp;VARB=0.028641;OID=.;OPOS=215865575;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:182:95:95:87:87:40:47:49:46:40:47:49:46 chr2 215876166 . A T 1237.24 PASS AO=142;DP=153;FAO=145;FDP=155;FR=.;FRO=10;FSAF=106;FSAR=39;FSRF=9;FSRR=1;FWDB=-0.00902967;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.0577;QD=31.9289;RBI=0.0246388;REFB=0.00789518;REVB=-0.0229246;RO=9;SAF=103;SAR=39;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0234814;STB=0.514038;TYPE=snp;VARB=-0.00297918;OID=.;OPOS=215876166;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:153:155:9:10:142:145:39:103:8:1:39:106:9:1 chr2 215876371 . T C 535.08 PASS AO=127;DP=257;FAO=127;FDP=256;FR=.;FRO=129;FSAF=41;FSAR=86;FSRF=54;FSRR=75;FWDB=0.037547;FXX=0.0038909;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.265;QD=8.36061;RBI=0.042635;REFB=-0.00810207;REVB=0.020198;RO=125;SAF=41;SAR=86;SRF=52;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0926833;STB=0.553102;TYPE=snp;VARB=0.00937538;OID=.;OPOS=215876371;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:257:256:125:129:127:127:86:41:52:73:86:41:54:75 chr2 215884092 . A G 189.19 PASS AO=43;DP=86;FAO=43;FDP=86;FR=.;FRO=43;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=0.0264909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.724;QD=8.79936;RBI=0.0730035;REFB=-0.019577;REVB=-0.0680275;RO=43;SAF=17;SAR=26;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0858219;STB=0.547649;TYPE=snp;VARB=0.0192535;OID=.;OPOS=215884092;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:43:43:43:43:26:17:21:22:26:17:21:22 chr2 215940242 . T C 856.1 PASS AO=91;DP=91;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186552;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.009;QD=38.0488;RBI=0.0218476;REFB=0;REVB=-0.0113711;RO=0;SAF=33;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.45581e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.63699e-05;OID=.;OPOS=215940242;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:91:90:0:0:91:90:58:33:0:0:58:32:0:0 chr2 216190020 . C G 294.81 PASS AO=74;DP=159;FAO=74;FDP=159;FR=.;FRO=85;FSAF=31;FSAR=43;FSRF=40;FSRR=45;FWDB=-0.00740797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.54;QD=7.41654;RBI=0.0172268;REFB=-0.0174681;REVB=-0.0155526;RO=84;SAF=31;SAR=43;SRF=39;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0443277;STB=0.528102;TYPE=snp;VARB=0.0220623;OID=.;OPOS=216190020;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:159:84:85:74:74:43:31:39:45:43:31:40:45 chr2 216212339 . T C 445.67 PASS AO=65;DP=217;FAO=98;FDP=188;FR=.,HEALED;FRO=89;FSAF=38;FSAR=60;FSRF=27;FSRR=62;FWDB=-0.00715958;FXX=0.015706;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.0153;QD=9.48225;RBI=0.013985;REFB=-0.0131925;REVB=0.0120134;RO=52;SAF=20;SAR=45;SRF=9;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136534;STB=0.543103;TYPE=snp;VARB=0.00913329;OID=.;OPOS=216212339;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:188:52:89:65:98:45:20:9:43:60:38:27:62 chr2 216229692 . A G 153.04 PASS AO=48;DP=124;FAO=48;FDP=125;FR=.;FRO=77;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=23;FSRR=54;FWDB=0.053567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.222;QD=4.89729;RBI=0.0583485;REFB=-0.0245923;REVB=-0.0231328;RO=76;SAF=18;SAR=30;SRF=22;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101908;STB=0.551402;TYPE=snp;VARB=0.0601992;OID=.;OPOS=216229692;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:125:76:77:48:48:30:18:22:54:30:18:23:54 chr2 216235089 . C T 2285.76 PASS AO=237;DP=240;FAO=237;FDP=237;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=150;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0283332;FXX=0.0124995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.88;QD=38.5782;RBI=0.0289473;REFB=0;REVB=-0.00593096;RO=0;SAF=87;SAR=150;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.20574e-05;OID=.;OPOS=216235089;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:240:237:0:0:237:237:150:87:0:0:150:87:0:0 chr2 216249587 . C T 1868.31 PASS AO=190;DP=190;FAO=195;FDP=195;FR=.;FRO=0;FSAF=99;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0248788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.938;QD=38.3243;RBI=0.0551259;REFB=0;REVB=0.0491926;RO=0;SAF=98;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.69201e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.63069e-05;OID=.;OPOS=216249587;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:190:195:0:0:190:195:92:98:0:0:96:99:0:0 chr2 216269209 . T G 1678.43 PASS AO=167;DP=167;FAO=177;FDP=177;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00706588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.615;QD=37.9305;RBI=0.0129084;REFB=0;REVB=0.0108028;RO=0;SAF=80;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.03409e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.02511e-05;OID=.;OPOS=216269209;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:167:177:0:0:167:177:87:80:0:0:89:88:0:0 chr2 216269254 . T G 2167.54 PASS AO=221;DP=222;FAO=226;FDP=226;FR=.;FRO=0;FSAF=110;FSAR=116;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0102628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.159;QD=38.3636;RBI=0.0104791;REFB=0;REVB=0.00211788;RO=0;SAF=107;SAR=114;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.47381e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.11542e-06;OID=.;OPOS=216269254;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:222:226:0:0:221:226:114:107:0:0:116:110:0:0 chr2 216272900 . T G 961.24 PASS AO=81;DP=103;FAO=101;FDP=101;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=62;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0265356;FXX=0.0194156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.52;QD=38.0689;RBI=0.1148;REFB=0;REVB=0.111691;RO=0;SAF=59;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000280574;OID=.;OPOS=216272900;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:101:101:0:0:81:101:22:59:0:0:39:62:0:0 chr2 216300482 . T A 116.19 PASS AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000825844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.3689;QD=35.75;RBI=0.0205631;REFB=0;REVB=0.0205466;RO=0;SAF=7;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000733141;OID=.;OPOS=216300482;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:13:0:0:13:13:6:7:0:0:6:7:0:0 chr2 216908679 . C T 128.22 PASS AO=30;DP=63;FAO=30;FDP=63;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=0.0375369;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.917;QD=8.1408;RBI=0.0378065;REFB=-0.0209031;REVB=-0.00450731;RO=33;SAF=15;SAR=15;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0707694;STB=0.539656;TYPE=snp;VARB=0.015544;OID=.;OPOS=216908679;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:33:33:30:30:15:15:14:19:15:15:14:19 chr2 217012901 . A G 826.14 PASS AO=100;DP=117;FAO=104;FDP=117;FR=.;FRO=13;FSAF=43;FSAR=61;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.011127;FXX=0.0639949;HRUN=5;LEN=1;MLLD=64.3228;QD=28.2442;RBI=0.0143703;REFB=-0.177164;REVB=0.00909366;RO=14;SAF=43;SAR=57;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.017267;STB=0.503307;TYPE=snp;VARB=0.0135106;OID=.;OPOS=217012901;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:117:117:14:13:100:104:57:43:5:9:61:43:5:8 chr2 217364013 . C T 264.22 PASS AO=63;DP=140;FAO=66;FDP=140;FR=.;FRO=74;FSAF=29;FSAR=37;FSRF=44;FSRR=30;FWDB=-0.00449912;FXX=0.0070917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.252;QD=7.54913;RBI=0.0254013;REFB=-0.0232827;REVB=0.0249997;RO=71;SAF=28;SAR=35;SRF=42;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139887;STB=0.581586;TYPE=snp;VARB=0.023687;OID=.;OPOS=217364013;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:71:74:63:66:35:28:42:29:37:29:44:30 chr2 217364539 . C T 496.56 PASS AO=164;DP=419;FAO=158;FDP=400;FR=.;FRO=242;FSAF=77;FSAR=81;FSRF=90;FSRR=152;FWDB=0.0659365;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.8887;QD=4.96555;RBI=0.0820068;REFB=0.0190463;REVB=0.0487596;RO=250;SAF=81;SAR=83;SRF=93;SRR=157;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132067;STB=0.570126;TYPE=snp;VARB=-0.034748;OID=.;OPOS=217364539;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:419:400:250:242:164:158:83:81:93:157:81:77:90:152 chr2 217541582 . T C 423.69 PASS AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0129903;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=193.953;QD=37.6611;RBI=0.0255327;REFB=0;REVB=-0.0219812;RO=0;SAF=28;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.02719e-05;OID=.;OPOS=217541582;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:44:45:0:0:44:45:16:28:0:0:16:29:0:0 chr2 218604247 . A C 614.78 PASS AO=62;DP=69;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0874042;FXX=0.085702;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.195;QD=38.4234;RBI=0.0878011;REFB=0;REVB=0.00833837;RO=1;SAF=28;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165629;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000244516;OID=.;OPOS=218604247;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:69:64:1:0:62:64:34:28:1:0:34:30:0:0 chr2 218664633 . T G 503.92 PASS AO=115;DP=230;FAO=117;FDP=232;FR=.;FRO=115;FSAF=69;FSAR=48;FSRF=66;FSRR=49;FWDB=-0.0110868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.029;QD=8.68833;RBI=0.022699;REFB=0.00395955;REVB=-0.0198073;RO=113;SAF=69;SAR=46;SRF=66;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149365;STB=0.508083;TYPE=snp;VARB=-0.00468045;OID=.;OPOS=218664633;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:230:232:113:115:115:117:46:69:66:47:48:69:66:49 chr2 218674697 . C T 919 PASS AO=96;DP=97;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0289488;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.14;QD=38.2918;RBI=0.051339;REFB=0;REVB=0.0423989;RO=0;SAF=12;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.18626e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.9476e-05;OID=.;OPOS=218674697;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:97:96:0:0:96:96:84:12:0:0:84:12:0:0 chr2 218682474 . A G 136.09 PASS AO=35;DP=77;FAO=34;FDP=75;FR=.;FRO=41;FSAF=29;FSAR=5;FSRF=32;FSRR=9;FWDB=-0.00938071;FXX=0.0259707;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.665;QD=7.25816;RBI=0.0177104;REFB=-0.027731;REVB=0.015022;RO=40;SAF=30;SAR=5;SRF=31;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140071;STB=0.570981;TYPE=snp;VARB=0.0293596;OID=.;OPOS=218682474;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:75:40:41:35:34:5:30:31:9:5:29:32:9 chr2 218682771 . A G 63.88 PASS AO=13;DP=28;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=12;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.000785149;FXX=0.0714031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.003;QD=9.82831;RBI=0.0314259;REFB=-0.0109748;REVB=-0.0314161;RO=13;SAF=12;SAR=1;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.472555;STB=0.782041;TYPE=snp;VARB=0.00700615;OID=.;OPOS=218682771;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:28:26:13:13:13:13:1:12:8:5:1:12:8:5 chr2 218683154 . A G 101.96 PASS AO=10;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0754693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.542;QD=37.0753;RBI=0.0994337;REFB=0;REVB=0.0647414;RO=0;SAF=7;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00434983;OID=.;OPOS=218683154;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:10:11:3:7:0:0:4:7:0:0 chr2 218683257 . A G 82.58 PASS AO=10;DP=14;FAO=12;FDP=16;FR=.;FRO=4;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.00728973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.084;QD=20.6438;RBI=0.00888264;REFB=-0.0427059;REVB=0.00507553;RO=4;SAF=6;SAR=4;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0802204;STB=0.52377;TYPE=snp;VARB=0.0223263;OID=.;OPOS=218683257;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:14:16:4:4:10:12:4:6:3:1:4:8:3:1 chr2 218683368 . CG C,AC,TG 94.92 PASS AO=6,3,6;DP=20;FAO=7,3,8;FDP=22;FR=.;FRO=4;FSAF=0,0,6;FSAR=7,3,2;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.125348,-0.04937,0.069359;FXX=0;HRUN=3,1,1;LEN=1,2,1;MLLD=15.9703,51.4397,65.2234;QD=17.2582;RBI=0.143817,0.052078,0.0965999;REFB=-0.012601,-0.0638331,0.00439809;REVB=-0.0705067,-0.0165749,-0.0672374;RO=5;SAF=0,0,4;SAR=6,3,2;SRF=3;SRR=2;SSEN=0.384615,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.773282,-0.698233,0.0553146;STB=0.997915,0.996186,0.5;TYPE=del,mnp,snp;VARB=0.0799922,0.0644582,0.0285306;OID=.,.,.;OPOS=218683369,218683368,218683368;OREF=G,CG,C;OALT=-,AC,T;OMAPALT=C,AC,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/3:25:20:22:5:4:6,3,6:7,3,8:6,3,2:0,0,4:3:2:7,3,2:0,0,6:3:1 chr2 218694551 . A G 629.84 PASS AO=156;DP=320;FAO=154;FDP=318;FR=.;FRO=164;FSAF=55;FSAR=99;FSRF=28;FSRR=136;FWDB=0.0229072;FXX=0.0062498;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.766;QD=7.92255;RBI=0.0331327;REFB=-0.00504868;REVB=-0.0239382;RO=163;SAF=57;SAR=99;SRF=28;SRR=135;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208041;STB=0.611329;TYPE=snp;VARB=0.00428683;OID=.;OPOS=218694551;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:320:318:163:164:156:154:99:57:28:135:99:55:28:136 chr2 218706857 . T C 308.22 PASS AO=89;DP=221;FAO=93;FDP=226;FR=.;FRO=133;FSAF=52;FSAR=41;FSRF=43;FSRR=90;FWDB=-0.0180662;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.767;QD=5.45518;RBI=0.0227283;REFB=-0.0244596;REVB=-0.0137908;RO=130;SAF=52;SAR=37;SRF=41;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.279114;STB=0.636191;TYPE=snp;VARB=0.0378472;OID=.;OPOS=218706857;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:226:130:133:89:93:37:52:41:89:41:52:43:90 chr2 218712306 . C T 454.32 PASS AO=78;DP=119;FAO=78;FDP=119;FR=.;FRO=41;FSAF=78;FSAR=0;FSRF=41;FSRR=0;FWDB=0.0154597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.8939;QD=15.2712;RBI=0.0154597;REFB=0.0148937;REVB=0;RO=41;SAF=78;SAR=0;SRF=41;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00782168;OID=.;OPOS=218712306;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:41:41:78:78:0:78:41:0:0:78:41:0 chr2 218712606 . G A 100.42 PASS AO=32;DP=87;FAO=32;FDP=87;FR=.;FRO=55;FSAF=24;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=35;FWDB=0.0187059;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=204.16;QD=4.61702;RBI=0.0253743;REFB=-0.0112926;REVB=-0.0171448;RO=55;SAF=24;SAR=8;SRF=20;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.427348;STB=0.74551;TYPE=snp;VARB=0.0165587;OID=.;OPOS=218712606;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:55:55:32:32:8:24:20:35:8:24:20:35 chr2 218712726 . A G 218.56 PASS AO=34;DP=48;FAO=34;FDP=48;FR=.;FRO=14;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.0994788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.6662;QD=18.2132;RBI=0.106409;REFB=-0.036571;REVB=-0.0377735;RO=14;SAF=23;SAR=11;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0627042;STB=0.534133;TYPE=snp;VARB=0.0093037;OID=.;OPOS=218712726;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:48:48:14:14:34:34:11:23:8:6:11:23:8:6 chr2 218712918 . C T 34.5 PASS AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.106507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.1906;QD=22.9972;RBI=0.11944;REFB=-0.00775998;REVB=-0.054057;RO=1;SAF=4;SAR=1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0951258;STB=0.555346;TYPE=snp;VARB=0.00716081;OID=.;OPOS=218712918;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:6:6:1:1:5:5:1:4:1:0:1:4:1:0 chr2 218713282 . G A 47.9 PASS AO=15;DP=44;FAO=15;FDP=44;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.106106;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.8189;QD=4.35491;RBI=0.106752;REFB=0.00372854;REVB=0.0117325;RO=29;SAF=12;SAR=3;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.324432;STB=0.695363;TYPE=snp;VARB=-0.00843558;OID=.;OPOS=218713282;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:44:44:29:29:15:15:3:12:16:13:3:12:16:13 chr2 218750817 . T C 125.63 PASS AO=22;DP=35;FAO=22;FDP=35;FR=.;FRO=13;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.0147292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.271;QD=14.3579;RBI=0.031213;REFB=-0.0388812;REVB=-0.0275191;RO=13;SAF=12;SAR=10;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100496;STB=0.555506;TYPE=snp;VARB=0.0151168;OID=.;OPOS=218750817;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:35:35:13:13:22:22:10:12:9:4:10:12:9:4 chr2 218940259 . C T 19.84 PASS AO=5;DP=16;FAO=5;FDP=16;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.00243412;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.599;QD=4.95933;RBI=0.0315213;REFB=-0.00938023;REVB=-0.0314272;RO=11;SAF=2;SAR=3;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.059321;STB=0.538306;TYPE=snp;VARB=0.0311621;OID=.;OPOS=218940259;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:16:16:11:11:5:5:3:2:5:6:3:2:5:6 chr2 219000292 . C T 237.63 PASS AO=59;DP=125;FAO=59;FDP=126;FR=.;FRO=67;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=31;FSRR=36;FWDB=0.0206655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.4277;QD=7.5439;RBI=0.0315654;REFB=0.01461;REVB=0.0238602;RO=64;SAF=27;SAR=32;SRF=31;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.025227;STB=0.502708;TYPE=snp;VARB=-0.00938355;OID=.;OPOS=219000292;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:126:64:67:59:59:32:27:31:33:32:27:31:36 chr2 219000310 . C T 311.23 PASS AO=64;DP=121;FAO=66;FDP=122;FR=.;FRO=56;FSAF=29;FSAR=37;FSRF=28;FSRR=28;FWDB=0.00622929;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.029;QD=10.2041;RBI=0.032371;REFB=-0.0270244;REVB=0.031766;RO=57;SAF=27;SAR=37;SRF=28;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0602976;STB=0.528034;TYPE=snp;VARB=0.0240956;OID=.;OPOS=219000310;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:122:57:56:64:66:37:27:28:29:37:29:28:28 chr2 219000734 . T C 760.82 PASS AO=80;DP=81;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00546814;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.5351;QD=38.0407;RBI=0.0381492;REFB=0;REVB=0.0377553;RO=0;SAF=16;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000189618;OID=.;OPOS=219000734;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:81:80:0:0:80:80:64:16:0:0:64:16:0:0 chr2 219000962 . C T 37.49 PASS AO=7;DP=18;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.00320604;FXX=0.166574;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.104;QD=9.99846;RBI=0.00390512;REFB=-0.00237314;REVB=-0.00222964;RO=8;SAF=3;SAR=4;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.296554;STB=0.673053;TYPE=snp;VARB=0.0173812;OID=.;OPOS=219000962;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:18:15:8:8:7:7:4:3:1:7:4:3:1:7 chr2 219000966 . G A 39.29 PASS AO=8;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.118291;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=99.9219;QD=9.24474;RBI=0.118412;REFB=-0.0261233;REVB=-0.00534893;RO=9;SAF=1;SAR=7;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.298237;STB=0.682379;TYPE=snp;VARB=0.0128778;OID=.;OPOS=219000966;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:17:17:9:9:8:8:7:1:3:6:7:1:3:6 chr2 219029108 . C G 256.93 PASS AO=50;DP=108;FAO=59;FDP=117;FR=.;FRO=58;FSAF=20;FSAR=39;FSRF=29;FSRR=29;FWDB=-0.0274806;FXX=0.0168053;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.072;QD=8.78404;RBI=0.0371304;REFB=-0.0275172;REVB=0.0249696;RO=58;SAF=19;SAR=31;SRF=29;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118643;STB=0.584196;TYPE=snp;VARB=0.0314857;OID=.;OPOS=219029108;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:117:58:58:50:59:31:19:29:29:39:20:29:29 chr2 219029792 . AG A 409.66 PASS AO=51;DP=83;FAO=78;FDP=80;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.226043;FXX=0.0123442;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.7766;QD=20.4829;RBI=0.288428;REFB=0.000624862;REVB=-0.179151;RO=13;SAF=20;SAR=31;SRF=10;SRR=3;SSEN=0.469521;SSEP=0;SSSB=-0.144647;STB=0.510867;TYPE=del;VARB=0.00473771;OID=.;OPOS=219029793;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:51:81:78:80:2:33:45:0:2:23:13:20:31:10:3 chr2 219110555 . A G 863.24 PASS AO=91;DP=92;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.042348;FXX=0.0108684;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.403;QD=37.9448;RBI=0.042658;REFB=0;REVB=-0.00513392;RO=0;SAF=79;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.5076e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000177809;OID=.;OPOS=219110555;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:92:91:0:0:91:91:12:79:0:0:12:79:0:0 chr2 219128321 . AG A 427.13 PASS AO=60;DP=87;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.277364;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=10.4974;QD=19.415;RBI=0.331379;REFB=0.12044;REVB=0.181333;RO=20;SAF=23;SAR=37;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0.38206;SSSB=0.0164835;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0230594;OID=.;OPOS=219128322;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:60:88:88:88:0:32:56:0:0:31:20:23:37:7:13 chr2 219128506 . C T 3635.33 PASS AO=456;DP=466;FAO=392;FDP=392;FR=.;FRO=0;FSAF=158;FSAR=234;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00186003;FXX=0.0199995;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.822;QD=37.0952;RBI=0.0109943;REFB=0.00640609;REVB=-0.0108358;RO=10;SAF=190;SAR=266;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011906;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.5501e-06;OID=.;OPOS=219128506;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:466:392:10:0:456:392:266:190:7:3:234:158:0:0 chr2 219144815 . T C 1127.12 PASS AO=121;DP=121;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00849855;FXX=0.00826378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.046;QD=37.5705;RBI=0.00850161;REFB=-0.0118141;REVB=0.000227906;RO=0;SAF=65;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.55642e-05;OID=.;OPOS=219144815;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:121:120:0:0:121:120:56:65:0:0:56:64:0:0 chr2 219146803 . G A 61.3 PASS AO=6;DP=6;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.155623;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.2138;QD=35.0312;RBI=0.155623;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0152208;OID=.;OPOS=219146803;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:7:0:0:6:7:0:6:0:0:0:7:0:0 chr2 219231807 . C T 514.47 PASS AO=54;DP=59;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.049384;FXX=0.0677851;HRUN=3;LEN=1;MLLD=195.454;QD=37.4162;RBI=0.0512862;REFB=0;REVB=0.0138385;RO=1;SAF=15;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0303766;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00043697;OID=.;OPOS=219231807;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:59:55:1:0:54:55:39:15:1:0:39:16:0:0 chr2 219254622 . A G 1251.05 PASS AO=131;DP=132;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0205941;FXX=0.00746213;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.729;QD=37.6255;RBI=0.0249786;REFB=-0.0241721;REVB=0.0141356;RO=1;SAF=79;SAR=52;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00905196;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.95201e-05;OID=.;OPOS=219254622;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:132:133:1:0:131:133:52:79:0:1:54:79:0:0 chr2 219265094 . T C 97.76 PASS AO=13;DP=13;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0227153;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.1417;QD=30.0806;RBI=0.0455375;REFB=0.0291383;REVB=-0.0394674;RO=0;SAF=2;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.666322;TYPE=snp;VARB=-0.00701721;OID=.;OPOS=219265094;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:13:13:0:1:13:12:11:2:0:0:11:1:1:0 chr2 219267781 . C T 116.14 PASS AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0880631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9916;QD=35.7354;RBI=0.0889547;REFB=0;REVB=0.0125633;RO=0;SAF=7;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0055573;OID=.;OPOS=219267781;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:13:0:0:13:13:6:7:0:0:6:7:0:0 chr2 219319657 . A G 1481.74 PASS AO=155;DP=155;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170346;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.562;QD=38.2384;RBI=0.0180525;REFB=0;REVB=0.00597627;RO=0;SAF=97;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.70171e-05;OID=.;OPOS=219319657;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:155:155:0:0:155:155:58:97:0:0:58:97:0:0 chr2 219339593 . G A 319.61 PASS AO=52;DP=117;FAO=54;FDP=113;FR=.,HEALED;FRO=40;FSAF=21;FSAR=33;FSRF=4;FSRR=36;FWDB=0.00917468;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=218.396;QD=11.3137;RBI=0.0500342;REFB=-0.0296027;REVB=-0.0491858;RO=24;SAF=20;SAR=32;SRF=4;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139633;STB=0.637159;TYPE=snp;VARB=0.0149084;OID=.;OPOS=219339593;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:113:24:40:52:54:32:20:4:20:33:21:4:36 chr2 219492924 . T C 1576.53 PASS AO=166;DP=168;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0415845;FXX=0.0175428;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.9487;QD=37.5363;RBI=0.0423586;REFB=0.0278187;REVB=0.00806146;RO=1;SAF=59;SAR=107;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00442719;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000499821;OID=.;OPOS=219492924;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:168:168:1:0:166:168:107:59:0:1:107:61:0:0 chr2 219508988 . T C 2008.66 PASS AO=195;DP=195;FAO=211;FDP=211;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=165;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0657651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.188;QD=38.0788;RBI=0.066435;REFB=0;REVB=0.00941038;RO=0;SAF=38;SAR=157;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.78983e-05;OID=.;OPOS=219508988;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:195:211:0:0:195:211:157:38:0:0:165:46:0:0 chr2 219509618 . C A 499.28 PASS AO=48;DP=48;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0128901;FXX=0.0185151;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.3337;QD=37.6814;RBI=0.0579765;REFB=0;REVB=0.0565254;RO=0;SAF=32;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000222579;OID=.;OPOS=219509618;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:48:53:0:0:48:53:16:32:0:0:21:32:0:0 chr2 219528830 . TGGGGGC TGGGGC,TGGGG,TGGGGG 43.88 PASS AO=12,11,8;DP=66;FAO=25,0,0;FDP=55;FR=.;FRO=30;FSAF=15,0,0;FSAR=10,0,0;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=0.0182572,-0.221458,-0.446714;FXX=0.0833194;HRUN=5,5,4;LEN=1,2,1;MLLD=10.7595,14.163,11.7871;QD=3.1913;RBI=0.285436,0.287806,0.45214;REFB=-0.0665198,-0.0349575,-0.00222783;REVB=-0.284852,-0.183816,-0.0698378;RO=16;SAF=6,10,8;SAR=6,1,0;SRF=6;SRR=10;SSEN=0.349206,0.349206,0;SSEP=0,0,0.625;SSSB=0.122388,0.618033,0.786697;STB=0.518782,0.5,0.5;TYPE=del,del,del;VARB=0.0281033,0,0.0249588;OID=.,.,.;OPOS=219528831,219528835,219528836;OREF=G,GC,C;OALT=-,-,-;OMAPALT=TGGGGC,TGGGG,TGGGGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:12,11,8:53:25,0,0:55:30:15,0,0:10,0,0:17:13:44:16:6,10,8:6,1,0:6:10 chr2 219738150 . G A 10.47 PASS AO=2;DP=6;FAO=2;FDP=6;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.258;QD=6.97934;RBI=0.00742093;REFB=-0.0251936;REVB=-0.00742093;RO=4;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0361234;OID=.;OPOS=219738150;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:4:4:2:2:2:0:0:4:2:0:0:4 chr2 219826336 . G T 14.36 PASS AO=3;DP=10;FAO=3;FDP=10;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.6721;QD=5.74595;RBI=0.0188989;REFB=0.00492658;REVB=-0.0188989;RO=7;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0117776;OID=.;OPOS=219826336;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:10:10:7:7:3:3:3:0:0:7:3:0:0:7 chr2 219903258 . T G 43.75 PASS AO=14;DP=53;FAO=17;FDP=56;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=25;FSRR=14;FWDB=0.0163819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.834;QD=3.12474;RBI=0.0436056;REFB=-0.0181908;REVB=-0.0404114;RO=38;SAF=11;SAR=3;SRF=24;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225049;STB=0.551995;TYPE=snp;VARB=0.0388742;OID=.;OPOS=219903258;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:53:56:38:39:14:17:3:11:24:14:5:12:25:14 chr2 219903723 . C T 489.21 PASS AO=101;DP=182;FAO=101;FDP=181;FR=.;FRO=80;FSAF=42;FSAR=59;FSRF=39;FSRR=41;FWDB=0.0681019;FXX=0.0054942;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.653;QD=10.8113;RBI=0.0685429;REFB=-0.000631359;REVB=0.00776236;RO=80;SAF=42;SAR=59;SRF=39;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0591504;STB=0.532236;TYPE=snp;VARB=0.000557739;OID=.;OPOS=219903723;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:181:80:80:101:101:59:42:39:41:59:42:39:41 chr2 219920037 . A G 159.76 PASS AO=30;DP=63;FAO=39;FDP=72;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=28;FSRF=10;FSRR=23;FWDB=0.0393401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.777;QD=8.87528;RBI=0.0494294;REFB=-0.0417111;REVB=0.029927;RO=33;SAF=9;SAR=21;SRF=10;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00336204;STB=0.511743;TYPE=snp;VARB=0.0353957;OID=.;OPOS=219920037;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:72:33:33:30:39:21:9:10:23:28:11:10:23 chr2 219920412 . A G 61.44 PASS AO=11;DP=20;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=-0.017921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.247;QD=12.2875;RBI=0.0291749;REFB=-0.0381956;REVB=-0.0230221;RO=7;SAF=4;SAR=7;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.327739;STB=0.723766;TYPE=snp;VARB=0.028747;OID=.;OPOS=219920412;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:20:20:7:9:11:11:7:4:6:1:7:4:8:1 chr2 219923410 . G GAGA 181.69 PASS AO=30;DP=69;FAO=34;FDP=58;FR=.;FRO=24;FSAF=30;FSAR=4;FSRF=19;FSRR=5;FWDB=0.0321984;FXX=0.0333278;HRUN=1;LEN=3;MLLD=143.66;QD=12.5303;RBI=0.0408791;REFB=-0.0317139;REVB=-0.0251867;RO=36;SAF=26;SAR=4;SRF=29;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114634;STB=0.579347;TYPE=ins;VARB=0.0195989;OID=.;OPOS=219923411;OREF=-;OALT=AGA;OMAPALT=GAGA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:30:69:34:58:24:30:4:19:5:89:36:26:4:29:7 chr2 219940484 . C T 1074.64 PASS AO=113;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0126534;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.275;QD=38.0404;RBI=0.0212498;REFB=0;REVB=-0.0170717;RO=0;SAF=48;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.19666e-05;OID=.;OPOS=219940484;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:113:113:0:0:113:113:65:48:0:0:65:48:0:0 chr2 219941063 . G A 476.24 PASS AO=120;DP=256;FAO=120;FDP=255;FR=.;FRO=135;FSAF=56;FSAR=64;FSRF=57;FSRR=78;FWDB=-0.049133;FXX=0.0039061;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.303;QD=7.47044;RBI=0.0491494;REFB=-0.00505626;REVB=0.00127091;RO=131;SAF=56;SAR=64;SRF=55;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.044719;STB=0.523705;TYPE=snp;VARB=0.00570411;OID=.;OPOS=219941063;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:256:255:131:135:120:120:64:56:55:76:64:56:57:78 chr2 219967380 . T C 785.97 PASS AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00892631;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.0939;QD=37.8783;RBI=0.0106212;REFB=0;REVB=-0.00575598;RO=0;SAF=42;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.4138e-05;OID=.;OPOS=219967380;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:83:83:0:0:83:83:41:42:0:0:41:42:0:0 chr2 220033476 . TGGGGG TGGGG,TGGGGGG,TGGGGA 38.82 PASS AO=4,3,3;DP=18;FAO=6,0,3;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=1,0,1;FSAR=5,0,2;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=0.349397,-0.350539,0.143796;FXX=0;HRUN=5,5,5;LEN=1,1,1;MLLD=13.5755,12.7483,23.5265;QD=8.62588;RBI=0.353876,0.356801,0.152853;REFB=0.000114843,0.0019166,-0.014534;REVB=-0.0561283,0.0665541,0.0518323;RO=7;SAF=0,3,1;SAR=4,0,2;SRF=6;SRR=1;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.784402,0.590815,-0.503502;STB=0.881272,0.5,0.855607;TYPE=del,ins,snp;VARB=0.0940515,0,0.0223384;OID=.,.,.;OPOS=220033477,220033477,220033481;OREF=G,-,G;OALT=-,G,A;OMAPALT=TGGGG,TGGGGGG,TGGGGA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:4,3,3:18:6,0,3:18:9:1,0,1:5,0,2:8:1:24:7:0,3,1:4,0,2:6:1 chr2 220033830 . A G 196.01 PASS AO=31;DP=56;FAO=36;FDP=60;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=26;FSRF=5;FSRR=19;FWDB=-0.095203;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=37.2703;QD=13.0674;RBI=0.0999612;REFB=-0.100943;REVB=0.0304733;RO=25;SAF=8;SAR=23;SRF=6;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192237;STB=0.535695;TYPE=snp;VARB=0.0695267;OID=.;OPOS=220033830;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:56:60:25:24:31:36:23:8:6:19:26:10:5:19 chr2 220037393 . A G 173.12 PASS AO=18;DP=19;FAO=19;FDP=20;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0061569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.097;QD=34.6237;RBI=0.0275854;REFB=0.0197451;REVB=0.0268896;RO=1;SAF=7;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0611153;STB=0.533298;TYPE=snp;VARB=-0.000256562;OID=.;OPOS=220037393;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:20:1:1:18:19:11:7:1:0:12:7:1:0 chr2 220037666 . A G 91.34 PASS AO=16;DP=26;FAO=16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=-0.0107855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.302;QD=14.0518;RBI=0.080781;REFB=-0.0293433;REVB=-0.0800578;RO=9;SAF=8;SAR=8;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179467;STB=0.615248;TYPE=snp;VARB=0.0138448;OID=.;OPOS=220037666;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:26:26:9:10:16:16:8:8:2:7:8:8:2:8 chr2 220037756 . A G 56.15 PASS AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.00971709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.263;QD=7.48723;RBI=0.0132861;REFB=-0.00913276;REVB=-0.00906082;RO=17;SAF=6;SAR=7;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167528;STB=0.596717;TYPE=snp;VARB=0.0155514;OID=.;OPOS=220037756;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:30:30:17:17:13:13:7:6:5:12:7:6:5:12 chr2 220040330 . A G 142.74 PASS AO=44;DP=114;FAO=44;FDP=114;FR=.;FRO=70;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=29;FSRR=41;FWDB=0.000891561;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.284;QD=5.00851;RBI=0.0144335;REFB=0.00241795;REVB=0.014406;RO=70;SAF=15;SAR=29;SRF=29;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0852844;STB=0.548559;TYPE=snp;VARB=-0.0043326;OID=.;OPOS=220040330;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:70:70:44:44:29:15:29:41:29:15:29:41 chr2 220046975 . C A 137.96 PASS AO=42;DP=94;FAO=39;FDP=93;FR=.;FRO=54;FSAF=11;FSAR=28;FSRF=7;FSRR=47;FWDB=-0.0108723;FXX=0.0106372;HRUN=7;LEN=1;MLLD=32.5879;QD=5.93358;RBI=0.0384162;REFB=0.00309949;REVB=0.0368456;RO=44;SAF=13;SAR=29;SRF=1;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.364861;STB=0.620715;TYPE=snp;VARB=-0.00295089;OID=.;OPOS=220046975;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:93:44:54:42:39:29:13:1:43:28:11:7:47 chr2 220072766 . G T 733.89 PASS AO=80;DP=81;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00957641;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.4729;QD=35.7996;RBI=0.0612169;REFB=0.00674323;REVB=-0.0604632;RO=1;SAF=28;SAR=52;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00901911;STB=0.504761;TYPE=snp;VARB=-0.000470759;OID=.;OPOS=220072766;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:81:82:1:1:80:81:52:28:0:1:52:29:0:1 chr2 220083279 . C T 57.53 PASS AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.00322841;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=126.422;QD=7.93545;RBI=0.0340345;REFB=-0.0137848;REVB=-0.0338811;RO=15;SAF=9;SAR=4;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219892;STB=0.646177;TYPE=snp;VARB=0.0171478;OID=.;OPOS=220083279;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:29:29:15:16:13:13:4:9:7:8:4:9:7:9 chr2 220084902 . G A 442.55 PASS AO=50;DP=54;FAO=52;FDP=56;FR=.;FRO=4;FSAF=31;FSAR=21;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0650649;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=104.206;QD=31.6109;RBI=0.075157;REFB=-0.116722;REVB=0.0376182;RO=2;SAF=31;SAR=19;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00918946;STB=0.50711;TYPE=snp;VARB=0.00100524;OID=.;OPOS=220084902;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:54:56:2:4:50:52:19:31:1:1:21:31:2:2 chr2 220084938 . C T 86.46 PASS AO=24;DP=54;FAO=23;FDP=55;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=0.00247197;FXX=0.017854;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.5231;QD=6.28767;RBI=0.0509531;REFB=-0.0362116;REVB=-0.0508931;RO=30;SAF=11;SAR=13;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0913055;STB=0.578881;TYPE=snp;VARB=0.00683839;OID=.;OPOS=220084938;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:54:55:30:32:24:23:13:11:11:19:12:11:11:21 chr2 220085845 . A G 195.68 PASS AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0618523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.2168;QD=39.1355;RBI=0.067084;REFB=0;REVB=-0.0259721;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00107562;OID=.;OPOS=220085845;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:20:20:0:0:20:20:10:10:0:0:10:10:0:0 chr2 220087441 . T C 71.75 PASS AO=28;DP=88;FAO=28;FDP=90;FR=.;FRO=62;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=41;FWDB=-0.060443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.57;QD=3.18875;RBI=0.0662229;REFB=-0.0172275;REVB=0.0270577;RO=60;SAF=10;SAR=18;SRF=21;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00908294;STB=0.513927;TYPE=snp;VARB=0.0373361;OID=.;OPOS=220087441;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:88:90:60:62:28:28:18:10:21:39:18:10:21:41 chr2 220107997 . G A 56.81 PASS AO=20;DP=57;FAO=20;FDP=62;FR=.;FRO=42;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=41;FWDB=0.100747;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.954;QD=3.66515;RBI=0.102798;REFB=-0.00786875;REVB=-0.020433;RO=37;SAF=5;SAR=15;SRF=1;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.432596;STB=0.756606;TYPE=snp;VARB=0.0222919;OID=.;OPOS=220107997;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:57:62:37:42:20:20:15:5:1:36:15:5:1:41 chr2 220108300 . T C 53.45 PASS AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0251609;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=194.924;QD=11.2518;RBI=0.0484215;REFB=-0.0153686;REVB=-0.0413712;RO=9;SAF=9;SAR=1;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.510683;STB=0.805219;TYPE=snp;VARB=0.00968092;OID=.;OPOS=220108300;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:19:19:9:9:10:10:1:9:4:5:1:9:4:5 chr2 220113242 . T G 3758.84 PASS AO=492;DP=500;FAO=394;FDP=394;FR=.;FRO=0;FSAF=158;FSAR=236;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00733981;FXX=0.0149996;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.408;QD=38.1608;RBI=0.0361781;REFB=-0.0228099;REVB=0.0354258;RO=1;SAF=192;SAR=300;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00158882;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.10741e-05;OID=.;OPOS=220113242;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:500:394:1:0:492:394:300:192:0:1:236:158:0:0 chr2 220117458 . G A 174.98 PASS AO=35;DP=64;FAO=35;FDP=63;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=6;FSRR=22;FWDB=0.0344225;FXX=0.0156226;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.315;QD=11.1097;RBI=0.0418548;REFB=-0.00713589;REVB=0.0238099;RO=28;SAF=11;SAR=24;SRF=6;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0975093;STB=0.553581;TYPE=snp;VARB=0.00641514;OID=.;OPOS=220117458;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:63:28:28:35:35:24:11:6:22:24:11:6:22 chr2 220118531 . G C 22.3 PASS AO=4;DP=9;FAO=4;FDP=9;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0881501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.831;QD=9.91247;RBI=0.0897228;REFB=-0.000393904;REVB=-0.0167255;RO=5;SAF=3;SAR=1;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.590845;STB=0.855777;TYPE=snp;VARB=0.0214947;OID=.;OPOS=220118531;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:9:9:5:5:4:4:1:3:0:5:1:3:0:5 chr2 220136155 . T C 2144.34 PASS AO=223;DP=223;FAO=224;FDP=224;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=126;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0565198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.841;QD=38.2917;RBI=0.0603607;REFB=0;REVB=0.0211877;RO=0;SAF=98;SAR=125;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.45938e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000106957;OID=.;OPOS=220136155;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:223:224:0:0:223:224:125:98:0:0:126:98:0:0 chr2 220136351 . G A 564.78 PASS AO=119;DP=259;FAO=142;FDP=283;FR=.;FRO=141;FSAF=71;FSAR=71;FSRF=61;FSRR=80;FWDB=0.10429;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=36.1818;QD=7.98276;RBI=0.114374;REFB=-0.00575233;REVB=0.0469591;RO=140;SAF=49;SAR=70;SRF=60;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.016898;STB=0.533564;TYPE=snp;VARB=0.0219439;OID=.;OPOS=220136351;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:259:283:140:141:119:142:70:49:60:80:71:71:61:80 chr2 220136371 . T C 518.19 PASS AO=123;DP=248;FAO=123;FDP=248;FR=.;FRO=125;FSAF=68;FSAR=55;FSRF=62;FSRR=63;FWDB=-0.0973839;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.582;QD=8.35794;RBI=0.0997725;REFB=-0.0105392;REVB=-0.0217009;RO=124;SAF=68;SAR=55;SRF=61;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0559506;STB=0.528795;TYPE=snp;VARB=0.0104505;OID=.;OPOS=220136371;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:248:248:124:125:123:123:55:68:61:63:55:68:62:63 chr2 220197321 . C T 272.33 PASS AO=52;DP=86;FAO=50;FDP=82;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=38;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=0.0187749;FXX=0.0465062;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.817;QD=13.2843;RBI=0.0255851;REFB=-0.0251302;REVB=0.017381;RO=30;SAF=14;SAR=38;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130593;STB=0.608494;TYPE=snp;VARB=0.018346;OID=.;OPOS=220197321;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:82:30:32:52:50:38:14:13:17:38:12:15:17 chr2 220197388 . C A 229.88 PASS AO=36;DP=51;FAO=36;FDP=51;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=33;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=-0.0261357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.613;QD=18.0295;RBI=0.0294411;REFB=-0.0122931;REVB=-0.0135538;RO=14;SAF=3;SAR=33;SRF=2;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.091566;STB=0.594534;TYPE=snp;VARB=0.00855035;OID=.;OPOS=220197388;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:51:51:14:15:36:36:33:3:2:12:33:3:3:12 chr2 220197849 . T A 112.09 PASS AO=43;DP=135;FAO=56;FDP=193;FR=.;FRO=137;FSAF=5;FSAR=51;FSRF=107;FSRR=30;FWDB=-0.0231059;FXX=0.138387;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.1057;QD=2.3232;RBI=0.211418;REFB=-0.0322099;REVB=0.210152;RO=92;SAF=39;SAR=4;SRF=65;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.405204;STB=0.933658;TYPE=snp;VARB=0.179833;OID=.;OPOS=220197849;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:193:92:137:43:56:4:39:65:27:51:5:107:30 chr2 220250147 . A G 584.93 PASS AO=63;DP=64;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00931314;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.775;QD=37.7375;RBI=0.0194268;REFB=0;REVB=-0.0170489;RO=0;SAF=20;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.00371e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000100741;OID=.;OPOS=220250147;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:64:62:0:0:63:62:43:20:0:0:43:19:0:0 chr2 220315970 . G A 773.39 PASS AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0898785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.787;QD=38.6697;RBI=0.0908344;REFB=0;REVB=0.0131431;RO=0;SAF=15;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000196605;OID=.;OPOS=220315970;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:80:80:0:0:80:80:65:15:0:0:65:15:0:0 chr2 220330804 . T C 101.95 PASS AO=10;DP=10;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.6033;QD=37.0728;RBI=0.0530428;REFB=0;REVB=0.051674;RO=0;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00153143;OID=.;OPOS=220330804;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:10:11:0:0:10:11:6:4:0:0:7:4:0:0 chr2 220333950 . T C 366.88 PASS AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00762102;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.64;QD=38.6191;RBI=0.00901266;REFB=0;REVB=0.00481125;RO=0;SAF=22;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.82408e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.7278e-06;OID=.;OPOS=220333950;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:37:38:0:0:37:38:15:22:0:0:17:21:0:0 chr2 220342004 . G A 163.48 PASS AO=27;DP=45;FAO=29;FDP=46;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.0220903;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.5965;QD=14.2158;RBI=0.0725012;REFB=-0.00869062;REVB=0.069054;RO=18;SAF=10;SAR=17;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0976214;STB=0.572057;TYPE=snp;VARB=0.0089958;OID=.;OPOS=220342004;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:45:46:18:17:27:29:17:10:9:9:19:10:9:8 chr2 220354108 . A G 40.64 PASS AO=11;DP=32;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=-0.00652362;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.4208;QD=5.0803;RBI=0.0443873;REFB=-0.0236758;REVB=-0.0439053;RO=18;SAF=5;SAR=6;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219335;STB=0.671449;TYPE=snp;VARB=0.0623711;OID=.;OPOS=220354108;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:32:32:18:20:11:12:6:5:12:6:7:5:14:6 chr2 220354542 . G A 40.84 PASS AO=8;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.0454028;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.2299;QD=6.53483;RBI=0.058529;REFB=-0.00968872;REVB=0.0369355;RO=9;SAF=3;SAR=5;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153362;STB=0.599808;TYPE=snp;VARB=0.023214;OID=.;OPOS=220354542;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:23:25:9:15:8:10:5:3:2:7:5:5:5:10 chr2 220355529 . A G 107.56 PASS AO=26;DP=58;FAO=26;FDP=57;FR=.;FRO=31;FSAF=24;FSAR=2;FSRF=21;FSRR=10;FWDB=-0.00616257;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.573;QD=7.54799;RBI=0.0228997;REFB=-0.0208062;REVB=0.0220549;RO=30;SAF=24;SAR=2;SRF=20;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.455482;STB=0.761642;TYPE=snp;VARB=0.0484371;OID=.;OPOS=220355529;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:57:30:31:26:26:2:24:20:10:2:24:21:10 chr2 220357594 . C A 16.42 PASS AO=7;DP=32;FAO=7;FDP=32;FR=.;FRO=25;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=0.0053369;FXX=0.135099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.036;QD=2.05246;RBI=0.0199011;REFB=-0.0128933;REVB=-0.0191722;RO=22;SAF=2;SAR=5;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0188175;STB=0.566811;TYPE=snp;VARB=0.0463167;OID=.;OPOS=220357594;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:32:32:22:25:7:7:5:2:6:16:5:2:9:16 chr2 220361590 . T TA 215.21 PASS AO=34;DP=57;FAO=37;FDP=55;FR=.;FRO=18;FSAF=26;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.0197219;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=55.5654;QD=15.6515;RBI=0.028448;REFB=0.00998615;REVB=0.020502;RO=20;SAF=24;SAR=10;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0827492;STB=0.555025;TYPE=ins;VARB=-0.00377337;OID=.;OPOS=220361591;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:34:57:37:55:18:26:11:10:8:51:20:24:10:12:8 chr2 220362557 . C T 136.36 PASS AO=25;DP=45;FAO=26;FDP=45;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.0737468;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.785;QD=12.1211;RBI=0.0788401;REFB=-0.0295911;REVB=0.0278778;RO=14;SAF=11;SAR=14;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00755934;STB=0.523791;TYPE=snp;VARB=0.0175909;OID=.;OPOS=220362557;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:45:45:14:19:25:26:14:11:6:8:15:11:7:12 chr2 220362899 . C G 99.21 PASS AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0366549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=45.5826;QD=39.6824;RBI=0.036655;REFB=0;REVB=9.16727e-05;RO=0;SAF=3;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00244402;OID=.;OPOS=220362899;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:7:3:0:0:7:3:0:0 chr2 220371035 . C G 21.72 PASS AO=8;DP=31;FAO=8;FDP=31;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.0239234;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.085;QD=2.80202;RBI=0.0243243;REFB=-0.0177769;REVB=0.00439819;RO=23;SAF=4;SAR=4;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127341;STB=0.580449;TYPE=snp;VARB=0.0613707;OID=.;OPOS=220371035;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:31:31:23:23:8:8:4:4:14:9:4:4:14:9 chr2 220379560 . C G 55.65 PASS AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=18;FWDB=0.0186704;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=164.927;QD=6.54752;RBI=0.0295015;REFB=-0.0166701;REVB=-0.022842;RO=20;SAF=3;SAR=11;SRF=2;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197685;STB=0.61254;TYPE=snp;VARB=0.0186745;OID=.;OPOS=220379560;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:34:34:20:20:14:14:11:3:2:18:11:3:2:18 chr2 220402671 . G T 292.03 PASS AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00189363;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=218.509;QD=38.9373;RBI=0.0170886;REFB=0;REVB=-0.0169834;RO=0;SAF=23;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.68531e-05;OID=.;OPOS=220402671;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:30:30:0:0:30:30:7:23:0:0:7:23:0:0 chr2 220402680 . T C 262.25 PASS AO=27;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00524301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.424;QD=37.4641;RBI=0.0629224;REFB=0;REVB=0.0627036;RO=0;SAF=22;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000778066;OID=.;OPOS=220402680;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:28:28:0:0:27:28:5:22:0:0:5:23:0:0 chr2 220404369 . A G 13.43 PASS AO=3;DP=11;FAO=3;FDP=11;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0.137731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=44.9081;QD=4.8832;RBI=0.160699;REFB=-0.010769;REVB=-0.082791;RO=7;SAF=1;SAR=2;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.535261;STB=0.832302;TYPE=snp;VARB=0.0368981;OID=.;OPOS=220404369;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:11:11:7:8:3:3:2:1:0:7:2:1:0:8 chr2 220404381 . A G 109.57 PASS AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.104097;FXX=0.076864;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.289;QD=36.5247;RBI=0.104104;REFB=0;REVB=-0.00121518;RO=0;SAF=2;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0024601;OID=.;OPOS=220404381;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:13:12:0:0:12:12:10:2:0:0:10:2:0:0 chr2 220405321 . T C 847.47 PASS AO=85;DP=85;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.585;QD=38.0885;RBI=0.0200013;REFB=0;REVB=-0.00425014;RO=0;SAF=47;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.83693e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.19359e-05;OID=.;OPOS=220405321;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:85:89:0:0:85:89:38:47:0:0:38:51:0:0 chr2 220406722 . T C 99.26 PASS AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0796617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.765;QD=39.7025;RBI=0.0817936;REFB=0;REVB=0.0185528;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00123065;OID=.;OPOS=220406722;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:4:6:0:0:4:6:0:0 chr2 220412256 . T C 174.45 PASS AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0937741;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.6644;QD=33.229;RBI=0.094699;REFB=-0.00824126;REVB=0.0132032;RO=0;SAF=7;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.533299;TYPE=snp;VARB=-0.00221902;OID=.;OPOS=220412256;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:21:0:1:20:20:13:7:0:0:13:7:1:0 chr2 220414016 . C T 181.08 PASS AO=20;DP=21;FAO=22;FDP=24;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00766096;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=161.033;QD=30.1799;RBI=0.057474;REFB=-0.149623;REVB=0.0569612;RO=0;SAF=5;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.531221;TYPE=snp;VARB=0.00383165;OID=.;OPOS=220414016;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:21:24:0:2:20:22:15:5:0:0:17:5:1:1 chr2 220419236 . T C 808.31 PASS AO=83;DP=84;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.032;QD=38.0381;RBI=0.113072;REFB=0;REVB=0.111681;RO=0;SAF=50;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.15707e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000643381;OID=.;OPOS=220419236;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:84:85:0:0:83:85:33:50:0:0:34:51:0:0 chr2 220419339 . T C 1000.76 PASS AO=100;DP=100;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00369397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.158;QD=38.1241;RBI=0.01877;REFB=0;REVB=-0.0184029;RO=0;SAF=30;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.68799e-05;OID=.;OPOS=220419339;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:100:105:0:0:100:105:70:30:0:0:75:30:0:0 chr2 220420956 . A G 195.7 PASS AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0481487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.651;QD=39.1402;RBI=0.080009;REFB=0;REVB=0.0638995;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0002128;OID=.;OPOS=220420956;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:20:20:0:0:20:20:10:10:0:0:10:10:0:0 chr2 220421417 . C G 580.95 PASS AO=58;DP=58;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00424984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.298;QD=38.7298;RBI=0.0574045;REFB=0;REVB=0.0572469;RO=0;SAF=25;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000229773;OID=.;OPOS=220421417;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:58:60:0:0:58:60:33:25:0:0:34:26:0:0 chr2 220430203 . C T 331.87 PASS AO=76;DP=148;FAO=75;FDP=147;FR=.;FRO=72;FSAF=35;FSAR=40;FSRF=28;FSRR=44;FWDB=-0.0619769;FXX=0.0067563;HRUN=3;LEN=1;MLLD=40.6245;QD=9.03039;RBI=0.122218;REFB=-0.0171305;REVB=0.105338;RO=64;SAF=35;SAR=41;SRF=27;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0325936;STB=0.538451;TYPE=snp;VARB=0.0173363;OID=.;OPOS=220430203;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:147:64:72:76:75:41:35:27:37:40:35:28:44 chr2 220431631 . G T 799.51 PASS AO=141;DP=216;FAO=141;FDP=219;FR=.;FRO=78;FSAF=62;FSAR=79;FSRF=41;FSRR=37;FWDB=0.00215376;FXX=0.00454525;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.108;QD=14.603;RBI=0.0244494;REFB=-0.0286964;REVB=0.0243544;RO=74;SAF=62;SAR=79;SRF=40;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0649395;STB=0.53082;TYPE=snp;VARB=0.0124657;OID=.;OPOS=220431631;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:216:219:74:78:141:141:79:62:40:34:79:62:41:37 chr2 220432014 . G A 176.5 PASS AO=49;DP=118;FAO=49;FDP=116;FR=.;FRO=67;FSAF=18;FSAR=31;FSRF=21;FSRR=46;FWDB=0.0763692;FXX=0.0169477;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.8903;QD=6.08603;RBI=0.116975;REFB=-0.0330267;REVB=0.0886051;RO=67;SAF=18;SAR=31;SRF=21;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.060822;STB=0.53409;TYPE=snp;VARB=0.055097;OID=.;OPOS=220432014;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:116:67:67:49:49:31:18:21:46:31:18:21:46 chr2 220435034 . A G 78.87 PASS AO=15;DP=27;FAO=15;FDP=27;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0113346;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=140.541;QD=11.6846;RBI=0.0402446;REFB=-0.0255165;REVB=-0.0386154;RO=12;SAF=8;SAR=7;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0395277;STB=0.522358;TYPE=snp;VARB=0.01107;OID=.;OPOS=220435034;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:27:27:12:12:15:15:7:8:7:5:7:8:7:5 chr2 220439474 . C T 270.07 PASS AO=54;DP=95;FAO=54;FDP=95;FR=.;FRO=41;FSAF=23;FSAR=31;FSRF=15;FSRR=26;FWDB=0.0673197;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.7155;QD=11.3715;RBI=0.0727549;REFB=-0.0201301;REVB=0.0275924;RO=41;SAF=23;SAR=31;SRF=15;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0488452;STB=0.526708;TYPE=snp;VARB=0.00925389;OID=.;OPOS=220439474;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:41:41:54:54:31:23:15:26:31:23:15:26 chr2 220462640 . G T 1617.3 PASS AO=173;DP=176;FAO=176;FDP=176;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0322891;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=277.928;QD=36.7568;RBI=0.0324861;REFB=-0.0726582;REVB=0.00357255;RO=0;SAF=82;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.9992e-05;OID=.;OPOS=220462640;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:176:176:0:0:173:176:91:82:0:0:94:82:0:0 chr2 220466199 . G T 790.13 PASS AO=83;DP=84;FAO=85;FDP=86;FR=.;FRO=1;FSAF=77;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00600396;FXX=0.0227247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.982;QD=36.7501;RBI=0.0441851;REFB=0.00353663;REVB=0.0437753;RO=0;SAF=77;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.63762e-08;STB=0.503225;TYPE=snp;VARB=0.00102425;OID=.;OPOS=220466199;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:84:86:0:1:83:85:6:77:0:0:8:77:1:0 chr2 220471116 . C G 602.79 PASS AO=66;DP=68;FAO=66;FDP=68;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=49;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0120413;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=240.752;QD=35.4583;RBI=0.0148251;REFB=-0.0332976;REVB=0.00864821;RO=2;SAF=17;SAR=49;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0523874;STB=0.527769;TYPE=snp;VARB=0.000163916;OID=.;OPOS=220471116;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:68:68:2:2:66:66:49:17:2:0:49:17:2:0 chr2 220476443 . C T 689.71 PASS AO=72;DP=72;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0436894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.339;QD=37.7923;RBI=0.0443805;REFB=0;REVB=-0.00780148;RO=0;SAF=14;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.82223e-05;OID=.;OPOS=220476443;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:72:73:0:0:72:73:58:14:0:0:58:15:0:0 chr2 220479312 . T C 768.53 PASS AO=66;DP=80;FAO=79;FDP=79;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=26;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.059421;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.945;QD=38.913;RBI=0.0611041;REFB=0;REVB=0.0142426;RO=0;SAF=13;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00016352;OID=.;OPOS=220479312;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:79:79:0:0:66:79:53:13:0:0:53:26:0:0 chr2 220494117 . CA C,CC 248.13 PASS AO=13,11;DP=25;FAO=15,13;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=11,10;FSAR=4,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00496879,0.00854299;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=143.607,143.55;QD=35.4469;RBI=0.014432,0.0155438;REFB=0,0;REVB=0.0135497,0.0129856;RO=0;SAF=10,9;SAR=3,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.0124257,0.0163453;OID=.,.;OPOS=220494118,220494118;OREF=A,A;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:13,11:24:15,13:28:0:11,10:4,3:0:0:26:0:10,9:3,2:0:0 chr2 220494887 . CCG C,CC 21.17 PASS AO=18,12;DP=91;FAO=20,0;FDP=79;FR=.;FRO=59;FSAF=5,0;FSAR=15,0;FSRF=31;FSRR=28;FWDB=-0.108496,-0.163396;FXX=0.048187;HRUN=5,3;LEN=2,1;MLLD=17.031,10.046;QD=1.07207;RBI=0.131386,0.196506;REFB=-0.0968576,-0.108007;REVB=-0.0741015,-0.109163;RO=36;SAF=3,7;SAR=15,5;SRF=20;SRR=16;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.480978,0.0340562;STB=0.715008,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.122388,0.0118131;OID=.,.;OPOS=220494888,220494889;OREF=CG,G;OALT=-,-;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:18,12:77:20,0:79:59:5,0:15,0:31:28:19:36:3,7:15,5:20:16 chr2 220494970 . GC G 588.21 PASS AO=71;DP=104;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.144772;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.1341;QD=24.0088;RBI=0.367474;REFB=0;REVB=0.337755;RO=19;SAF=44;SAR=27;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.081429;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00941691;OID=.;OPOS=220494971;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:71:97:98:98:0:57:41:0:0:55:19:44:27:8:11 chr2 220496739 . GC G 76.21 PASS AO=20;DP=55;FAO=27;FDP=48;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=23;FSRF=5;FSRR=16;FWDB=-0.0173712;FXX=0.020404;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.3049;QD=6.35091;RBI=0.0560551;REFB=-0.0483656;REVB=-0.0532955;RO=18;SAF=4;SAR=16;SRF=5;SRR=13;SSEN=0.397173;SSEP=0;SSSB=-0.0950562;STB=0.570191;TYPE=del;VARB=0.0490627;OID=.;OPOS=220496740;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:20:43:27:48:21:4:23:5:16:38:18:4:16:5:13 chr2 220500423 . A G 871.65 PASS AO=95;DP=95;FAO=94;FDP=95;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0136403;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6293;QD=36.701;RBI=0.0233135;REFB=-0.0849991;REVB=0.0189067;RO=0;SAF=40;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504586;TYPE=snp;VARB=0.00213165;OID=.;OPOS=220500423;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:95:95:0:1:95:94:55:40:0:0:54:40:0:1 chr2 220500426 . A G 865.41 PASS AO=91;DP=93;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0258814;FXX=0.0319115;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.5684;QD=38.0401;RBI=0.0346892;REFB=0;REVB=-0.0230974;RO=0;SAF=39;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.09644e-05;OID=.;OPOS=220500426;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:93:91:0:0:91:91:52:39:0:0:52:39:0:0 chr2 220502367 . A C 73.53 PASS AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.0233848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.104;QD=7.94919;RBI=0.030754;REFB=0.0033431;REVB=-0.019974;RO=20;SAF=12;SAR=5;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.339264;STB=0.694302;TYPE=snp;VARB=-0.00403446;OID=.;OPOS=220502367;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:37:37:20:20:17:17:5:12:7:13:5:12:7:13 chr2 220505265 . T C 543.52 PASS AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00483924;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=240.031;QD=38.1421;RBI=0.0122024;REFB=0;REVB=0.0112018;RO=0;SAF=18;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.29861e-05;OID=.;OPOS=220505265;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:57:57:0:0:57:57:39:18:0:0:39:18:0:0 chr2 220771223 . C T 2291.15 PASS AO=265;DP=282;FAO=265;FDP=282;FR=.;FRO=17;FSAF=122;FSAR=143;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=0.0309707;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=208.296;QD=32.4986;RBI=0.0357332;REFB=-0.0539025;REVB=0.0178234;RO=6;SAF=122;SAR=143;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0158123;STB=0.518407;TYPE=snp;VARB=0.00100732;OID=.;OPOS=220771223;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:282:282:6:17:265:265:143:122:5:1:143:122:13:4 chr2 220771290 . G A 2623.73 PASS AO=276;DP=280;FAO=277;FDP=277;FR=.;FRO=0;FSAF=102;FSAR=175;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142323;FXX=0.0177299;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.755;QD=37.8879;RBI=0.0304649;REFB=-0.041932;REVB=0.0269361;RO=1;SAF=101;SAR=175;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00469751;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.3321e-05;OID=.;OPOS=220771290;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:280:277:1:0:276:277:175:101:1:0:175:102:0:0 chr2 222282765 . C T 612.2 PASS AO=270;DP=603;FAO=172;FDP=397;FR=.;FRO=225;FSAF=72;FSAR=100;FSRF=101;FSRR=124;FWDB=0.0163388;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.421;QD=6.16822;RBI=0.0168883;REFB=-0.00796178;REVB=0.00427291;RO=317;SAF=113;SAR=157;SRF=151;SRR=166;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0575878;STB=0.517528;TYPE=snp;VARB=0.00942985;OID=.;OPOS=222282765;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:603:397:317:225:270:172:157:113:151:166:100:72:101:124 chr2 222283000 . A T 269.12 PASS AO=83;DP=231;FAO=92;FDP=239;FR=.;FRO=147;FSAF=37;FSAR=55;FSRF=74;FSRR=73;FWDB=-0.00668203;FXX=0.0123962;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.642;QD=4.50414;RBI=0.0121732;REFB=-0.0210764;REVB=0.0101754;RO=142;SAF=32;SAR=51;SRF=71;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129825;STB=0.563126;TYPE=snp;VARB=0.0345776;OID=.;OPOS=222283000;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:231:239:142:147:83:92:51:32:71:71:55:37:74:73 chr2 222290829 . C T 471.48 PASS AO=106;DP=205;FAO=106;FDP=204;FR=.;FRO=98;FSAF=49;FSAR=57;FSRF=45;FSRR=53;FWDB=0.07174;FXX=0.00487781;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.8639;QD=9.24474;RBI=0.0729125;REFB=-0.0269715;REVB=-0.0130232;RO=96;SAF=48;SAR=58;SRF=44;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00482007;STB=0.501488;TYPE=snp;VARB=0.0308089;OID=.;OPOS=222290829;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:204:96:98:106:106:58:48:44:52:57:49:45:53 chr2 222301323 . AT A 37.23 PASS AO=29;DP=131;FAO=41;FDP=117;FR=.;FRO=76;FSAF=31;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=52;FWDB=-0.257365;FXX=0.0330551;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.5739;QD=1.27284;RBI=0.258085;REFB=-0.0785893;REVB=0.0192718;RO=66;SAF=19;SAR=10;SRF=16;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.460169;STB=0.777377;TYPE=del;VARB=0.0337645;OID=.;OPOS=222301324;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:29:116:41:117:76:31:10:24:52:37:66:19:10:16:50 chr2 222367238 . C T 194.55 PASS AO=46;DP=95;FAO=46;FDP=95;FR=.;FRO=49;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=0.022472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.562;QD=8.19163;RBI=0.0241291;REFB=-0.0109201;REVB=-0.00878757;RO=49;SAF=19;SAR=27;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0912762;STB=0.550743;TYPE=snp;VARB=0.0135842;OID=.;OPOS=222367238;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:49:49:46:46:27:19:25:24:27:19:25:24 chr2 223161882 . TA T 24.38 PASS AO=8;DP=25;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=-0.169111;FXX=0.130378;HRUN=5;LEN=1;MLLD=17.6394;QD=4.87684;RBI=0.175331;REFB=-0.0331505;REVB=0.0462864;RO=11;SAF=7;SAR=1;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.690085;STB=0.894438;TYPE=del;VARB=0.014177;OID=.;OPOS=223161883;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:8:23:8:20:12:7:1:2:10:24:11:7:1:1:10 chr2 223161889 . A G 207.83 PASS AO=22;DP=24;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00478547;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.8311;QD=36.1451;RBI=0.0516013;REFB=0;REVB=-0.0513789;RO=0;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00085263;OID=.;OPOS=223161889;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:24:23:0:0:22:23:12:10:0:0:12:11:0:0 chr2 223423362 . A G 522.35 PASS AO=109;DP=198;FAO=109;FDP=198;FR=.;FRO=89;FSAF=52;FSAR=57;FSRF=49;FSRR=40;FWDB=0.0462789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.71;QD=10.5525;RBI=0.0496158;REFB=-0.0110624;REVB=-0.0178881;RO=88;SAF=52;SAR=57;SRF=49;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0653229;STB=0.533;TYPE=snp;VARB=0.00938211;OID=.;OPOS=223423362;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:198:88:89:109:109:57:52:49:39:57:52:49:40 chr2 223436607 . C T 368.25 PASS AO=81;DP=154;FAO=82;FDP=158;FR=.;FRO=76;FSAF=41;FSAR=41;FSRF=56;FSRR=20;FWDB=0.00315808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.3493;QD=9.32273;RBI=0.033041;REFB=-0.0114928;REVB=-0.0328897;RO=73;SAF=41;SAR=40;SRF=56;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227639;STB=0.613898;TYPE=snp;VARB=0.0181162;OID=.;OPOS=223436607;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:158:73:76:81:82:40:41:56:17:41:41:56:20 chr2 223785740 . A G 317.61 PASS AO=59;DP=97;FAO=59;FDP=97;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=48;FSRF=4;FSRR=34;FWDB=-0.00957328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.364;QD=13.0973;RBI=0.012086;REFB=-0.00304473;REVB=-0.00737725;RO=37;SAF=11;SAR=48;SRF=3;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135472;STB=0.556086;TYPE=snp;VARB=0.00251269;OID=.;OPOS=223785740;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:37:38:59:59:48:11:3:34:48:11:4:34 chr2 223807380 . C A 2452.99 PASS AO=266;DP=272;FAO=265;FDP=265;FR=.;FRO=0;FSAF=118;FSAR=147;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00140579;FXX=0.0221394;HRUN=2;LEN=1;MLLD=247.575;QD=37.0263;RBI=0.0110666;REFB=-0.0744628;REVB=0.0109769;RO=1;SAF=118;SAR=148;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00402335;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.06706e-05;OID=.;OPOS=223807380;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:272:265:1:0:266:265:148:118:1:0:147:118:0:0 chr2 223917629 . C T 43.48 PASS AO=11;DP=28;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=0.00334791;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.8384;QD=6.21142;RBI=0.0283479;REFB=-0.0109437;REVB=-0.0281495;RO=17;SAF=6;SAR=5;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170124;STB=0.599828;TYPE=snp;VARB=0.00387703;OID=.;OPOS=223917629;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:28:28:17:17:11:11:5:6:12:5:5:6:12:5 chr2 223917812 . T C 1037.74 PASS AO=102;DP=102;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0138106;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.184;QD=37.7361;RBI=0.0301901;REFB=0;REVB=0.026846;RO=0;SAF=46;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00037503;OID=.;OPOS=223917812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:102:110:0:0:102:110:56:46:0:0:58:52:0:0 chr2 223917983 . T G 120.19 PASS AO=24;DP=49;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=19;FWDB=-0.0552021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.89;QD=9.42653;RBI=0.0552064;REFB=0.000517766;REVB=0.000689224;RO=25;SAF=11;SAR=13;SRF=6;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20464;STB=0.594526;TYPE=snp;VARB=-0.000430825;OID=.;OPOS=223917983;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:51:25:25:24:26:13:11:6:19:15:11:6:19 chr2 223918080 . C G 287.19 PASS AO=34;DP=37;FAO=34;FDP=37;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0348707;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.1116;QD=31.0472;RBI=0.0375578;REFB=-0.0354435;REVB=-0.0139507;RO=2;SAF=4;SAR=30;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0881756;STB=0.539544;TYPE=snp;VARB=0.0257735;OID=.;OPOS=223918080;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:37:37:2:3:34:34:30:4:1:1:30:4:1:2 chr2 223918363 . T C 811.61 PASS AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018082;FXX=0.0229859;HRUN=3;LEN=1;MLLD=108.479;QD=38.1933;RBI=0.0381171;REFB=0;REVB=0.0335553;RO=0;SAF=47;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.83693e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000360339;OID=.;OPOS=223918363;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:85:85:0:0:85:85:38:47:0:0:38:47:0:0 chr2 223919545 . T TA 25.22 PASS AO=27;DP=117;FAO=34;FDP=90;FR=.;FRO=56;FSAF=6;FSAR=28;FSRF=8;FSRR=48;FWDB=0.0177192;FXX=0.0322546;HRUN=7;LEN=1;MLLD=5.35136;QD=1.12067;RBI=0.0191974;REFB=-0.0807955;REVB=0.00738694;RO=72;SAF=8;SAR=19;SRF=12;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.213281;STB=0.537715;TYPE=ins;VARB=0.0451913;OID=.;OPOS=223919546;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:27:117:34:90:56:6:28:8:48:25:72:8:19:12:60 chr2 223919674 . T C 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.015823;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.3369;QD=33.0207;RBI=0.0298664;REFB=0;REVB=-0.0253305;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000941644;OID=.;OPOS=223919674;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:2:4:0:0:2:4:0:0 chr2 224743373 . C T 205.95 PASS AO=34;DP=51;FAO=34;FDP=51;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.0124477;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.057;QD=16.1531;RBI=0.0141222;REFB=-0.0324453;REVB=0.00667017;RO=17;SAF=12;SAR=22;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00943979;OID=.;OPOS=224743373;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:51:51:17:17:34:34:22:12:6:11:22:12:6:11 chr2 225434445 . A G 166.42 PASS AO=47;DP=119;FAO=48;FDP=118;FR=.;FRO=70;FSAF=33;FSAR=15;FSRF=47;FSRR=23;FWDB=-0.0133824;FXX=0.0166653;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.003;QD=5.64135;RBI=0.108378;REFB=0.00837344;REVB=0.107549;RO=70;SAF=32;SAR=15;SRF=47;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114152;STB=0.510998;TYPE=snp;VARB=-0.0105225;OID=.;OPOS=225434445;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:118:70:70:47:48:15:32:47:23:15:33:47:23 chr2 225449644 . GC G 58.88 PASS AO=10;DP=19;FAO=14;FDP=19;FR=.;FRO=5;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0983755;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=13.0303;QD=12.3957;RBI=0.362081;REFB=-0.06383;REVB=0.348461;RO=8;SAF=9;SAR=1;SRF=4;SRR=4;SSEN=0.300752;SSEP=0;SSSB=0.461553;STB=0.535662;TYPE=del;VARB=0.0693394;OID=.;OPOS=225449645;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:10:19:14:19:5:10:4:3:2:7:8:9:1:4:4 chr2 225719693 . G A 152.94 PASS AO=29;DP=52;FAO=30;FDP=53;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.0718055;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.8084;QD=11.5426;RBI=0.0723183;REFB=0.00448096;REVB=0.00859687;RO=23;SAF=13;SAR=16;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108943;STB=0.513915;TYPE=snp;VARB=-0.00147402;OID=.;OPOS=225719693;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:52:53:23:23:29:30:16:13:10:13:16:14:10:13 chr2 225798838 . T C 534.8 PASS AO=136;DP=290;FAO=136;FDP=290;FR=.;FRO=154;FSAF=59;FSAR=77;FSRF=79;FSRR=75;FWDB=0.0478323;FXX=0.0102386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.0408;QD=7.37657;RBI=0.0491145;REFB=-0.0204526;REVB=-0.0111494;RO=138;SAF=59;SAR=77;SRF=79;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127121;STB=0.542303;TYPE=snp;VARB=0.0276974;OID=.;OPOS=225798838;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:290:290:138:154:136:136:77:59:79:59:77:59:79:75 chr2 225811581 . T A 473.12 PASS AO=116;DP=246;FAO=118;FDP=249;FR=.;FRO=131;FSAF=67;FSAR=51;FSRF=67;FSRR=64;FWDB=-0.0256226;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.3274;QD=7.60039;RBI=0.0256283;REFB=-0.00860866;REVB=0.000538026;RO=130;SAF=66;SAR=50;SRF=66;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0592597;STB=0.529949;TYPE=snp;VARB=0.0106221;OID=.;OPOS=225811581;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:246:249:130:131:116:118:50:66:66:64:51:67:67:64 chr2 226273689 . T C 2745.09 PASS AO=286;DP=286;FAO=286;FDP=286;FR=.;FRO=0;FSAF=107;FSAR=179;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.248;QD=38.3929;RBI=0.0318659;REFB=0;REVB=0.0221501;RO=0;SAF=107;SAR=179;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.69901e-05;OID=.;OPOS=226273689;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:286:286:0:0:286:286:179:107:0:0:179:107:0:0 chr2 226447735 . C T 438 PASS AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029498;FXX=0.0212721;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.3843;QD=38.0868;RBI=0.0502894;REFB=0;REVB=0.0407295;RO=0;SAF=20;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000498763;OID=.;OPOS=226447735;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:47:46:0:0:46:46:26:20:0:0:26:20:0:0 chr2 226491770 . A C 1249.1 PASS AO=93;DP=131;FAO=130;FDP=130;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=48;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.351386;FXX=0.00763301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.7614;QD=38.4338;RBI=0.352309;REFB=0;REVB=-0.0254844;RO=0;SAF=12;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0013552;OID=.;OPOS=226491770;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:129:130:0:0:93:130:81:12:0:0:82:48:0:0 chr2 227661663 . GCC GC,G 42.76 PASS AO=4,9;DP=26;FAO=0,12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=0,11;FSAR=0,1;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.345903,-0.185328;FXX=0;HRUN=8,8;LEN=1,2;MLLD=6.21808,11.061;QD=7.12656;RBI=0.645298,0.354232;REFB=-0.20865,-0.117982;REVB=0.544757,0.301884;RO=7;SAF=4,9;SAR=0,0;SRF=1;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.784402,0.830498;STB=0.5,0.845443;TYPE=del,del;VARB=0.0901242,0.188049;OID=.,.;OPOS=227661664,227661664;OREF=C,CC;OALT=-,-;OMAPALT=GC,G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:4,9:24:0,12:24:12:0,11:0,1:5:7:18:7:4,9:0,0:1:6 chr2 227663855 . AGC A 71.83 PASS AO=5;DP=11;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0652688;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=122.816;QD=35.9163;RBI=0.0842932;REFB=0;REVB=0.0533417;RO=0;SAF=1;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00262515;OID=.;OPOS=227663856;OREF=GC;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:5:8:8:8:0:2:6:0:0:4:0:1:4:0:0 chr2 227807202 . G T 64.72 PASS AO=14;DP=31;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=0.0156086;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.6763;QD=8.08945;RBI=0.0183485;REFB=-0.0173069;REVB=0.00964561;RO=17;SAF=3;SAR=11;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0289461;STB=0.521711;TYPE=snp;VARB=0.0406881;OID=.;OPOS=227807202;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:31:32:17:17:14:15:11:3:4:13:11:4:4:13 chr2 227871266 . A AT 39.93 PASS AO=42;DP=133;FAO=50;FDP=118;FR=.;FRO=68;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=25;FSRR=43;FWDB=-0.0941793;FXX=0.0406471;HRUN=8;LEN=1;MLLD=5.85619;QD=1.35363;RBI=0.0951681;REFB=-0.0777767;REVB=0.0136827;RO=64;SAF=18;SAR=24;SRF=23;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0763193;STB=0.53126;TYPE=ins;VARB=0.0287512;OID=.;OPOS=227871267;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:42:133:50:118:68:21:29:25:43:39:64:18:24:23:41 chr2 227872182 . G A 115.94 PASS AO=42;DP=140;FAO=48;FDP=146;FR=.;FRO=98;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=34;FSRR=64;FWDB=0.0394005;FXX=0.00680226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.7435;QD=3.17643;RBI=0.062944;REFB=-0.0311983;REVB=0.0490872;RO=91;SAF=17;SAR=25;SRF=32;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0659595;STB=0.534792;TYPE=snp;VARB=0.068856;OID=.;OPOS=227872182;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:146:91:98:42:48:25:17:32:59:29:19:34:64 chr2 227872995 . T C 655.8 PASS AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204654;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.8224;QD=38.5764;RBI=0.0455491;REFB=0;REVB=-0.0406926;RO=0;SAF=53;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000190847;OID=.;OPOS=227872995;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:69:68:0:0:68:68:15:53:0:0:15:53:0:0 chr2 227886773 . A G 238.02 PASS AO=48;DP=111;FAO=59;FDP=121;FR=.;FRO=62;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=44;FSRR=18;FWDB=0.00739672;FXX=0.0162588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.89;QD=7.86845;RBI=0.0312264;REFB=-0.0164047;REVB=0.0303377;RO=43;SAF=15;SAR=33;SRF=28;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.295761;STB=0.643398;TYPE=snp;VARB=0.0197021;OID=.;OPOS=227886773;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:121:43:62:48:59:33:15:28:15:34:25:44:18 chr2 227892619 . C T 141.67 PASS AO=43;DP=110;FAO=43;FDP=111;FR=.;FRO=68;FSAF=30;FSAR=13;FSRF=39;FSRR=29;FWDB=0.0040301;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=193.047;QD=5.10531;RBI=0.0278487;REFB=0.00147867;REVB=-0.0275555;RO=67;SAF=30;SAR=13;SRF=39;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137263;STB=0.584104;TYPE=snp;VARB=-0.00309959;OID=.;OPOS=227892619;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:111:67:68:43:43:13:30:39:28:13:30:39:29 chr2 227892720 . C T 106.77 PASS AO=30;DP=74;FAO=30;FDP=74;FR=.;FRO=44;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=0.00727397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.538;QD=5.77106;RBI=0.00756996;REFB=0.0129316;REVB=0.00209611;RO=44;SAF=21;SAR=9;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.288441;STB=0.664692;TYPE=snp;VARB=-0.0145065;OID=.;OPOS=227892720;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:44:44:30:30:9:21:19:25:9:21:19:25 chr2 227896886 . C T 580.7 PASS AO=194;DP=462;FAO=169;FDP=396;FR=.;FRO=227;FSAF=83;FSAR=86;FSRF=136;FSRR=91;FWDB=-0.00900339;FXX=0.00999975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.02;QD=5.86562;RBI=0.0237466;REFB=0.0038813;REVB=0.0219736;RO=261;SAF=96;SAR=98;SRF=155;SRR=106;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10228;STB=0.561782;TYPE=snp;VARB=-0.00410368;OID=.;OPOS=227896886;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:462:396:261:227:194:169:98:96:155:106:86:83:136:91 chr2 227896976 . C T 821.15 PASS AO=248;DP=484;FAO=195;FDP=393;FR=.;FRO=198;FSAF=64;FSAR=131;FSRF=92;FSRR=106;FWDB=-0.00461127;FXX=0.0174996;HRUN=4;LEN=1;MLLD=74.9636;QD=8.35775;RBI=0.00466382;REFB=-0.0115318;REVB=-0.000698166;RO=236;SAF=83;SAR=165;SRF=117;SRR=119;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152239;STB=0.573973;TYPE=snp;VARB=0.0100866;OID=.;OPOS=227896976;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:484:393:236:198:248:195:165:83:117:119:131:64:92:106 chr2 227907794 . TG T 1392.37 PASS AO=196;DP=237;FAO=222;FDP=222;FR=.;FRO=0;FSAF=169;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0872745;FXX=0.0044841;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.855;QD=25.0877;RBI=0.18396;REFB=0;REVB=0.16194;RO=14;SAF=154;SAR=42;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0.401631;SSSB=0.0264146;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00326468;OID=.;OPOS=227907795;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:196:221:222:222:0:169:53:0:0:99:14:154:42:9:5 chr2 227915832 . G A 1348.66 PASS AO=108;DP=171;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.049973;FXX=0.0264883;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.955;QD=36.6983;RBI=0.0527104;REFB=-0.110238;REVB=0.0167656;RO=0;SAF=11;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.91197e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000342359;OID=.;OPOS=227915832;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:110:147:0:0:108:147:97:11:0:0:101:46:0:0 chr2 227924272 . TG T 27.97 PASS AO=25;DP=108;FAO=33;FDP=103;FR=.;FRO=70;FSAF=7;FSAR=26;FSRF=22;FSRR=48;FWDB=-0.0985475;FXX=0.00961446;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.5235;QD=1.08606;RBI=0.124184;REFB=-0.0994004;REVB=0.0755645;RO=47;SAF=1;SAR=24;SRF=3;SRR=44;SSEN=0.375;SSEP=0;SSSB=-0.143723;STB=0.592707;TYPE=del;VARB=0.152299;OID=.;OPOS=227924273;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:25:97:33:103:70:7:26:22:48:27:47:1:24:3:44 chr2 227946893 . C G 521.75 PASS AO=112;DP=209;FAO=112;FDP=208;FR=.;FRO=96;FSAF=50;FSAR=62;FSRF=33;FSRR=63;FWDB=0.00792841;FXX=0.00952336;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.912;QD=10.0337;RBI=0.00795027;REFB=-0.0145383;REVB=0.000589165;RO=96;SAF=50;SAR=62;SRF=33;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0888823;STB=0.54843;TYPE=snp;VARB=0.013049;OID=.;OPOS=227946893;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:208:96:96:112:112:62:50:33:63:62:50:33:63 chr2 227954599 . G A 1617.97 PASS AO=174;DP=190;FAO=177;FDP=177;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=122;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0211062;FXX=0.0684175;HRUN=3;LEN=1;MLLD=248.384;QD=36.5643;RBI=0.0219149;REFB=0.0048762;REVB=0.00589847;RO=3;SAF=55;SAR=119;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000642934;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.70847e-05;OID=.;OPOS=227954599;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:190:177:3:0:174:177:119:55:1:2:122:55:0:0 chr2 228111435 . T C 478.8 PASS AO=100;DP=209;FAO=111;FDP=219;FR=.;FRO=108;FSAF=45;FSAR=66;FSRF=40;FSRR=68;FWDB=-0.00392529;FXX=0.00454525;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.786;QD=8.74525;RBI=0.0179613;REFB=0.0168665;REVB=-0.0175271;RO=84;SAF=44;SAR=56;SRF=38;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104894;STB=0.518038;TYPE=snp;VARB=-0.0143208;OID=.;OPOS=228111435;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:219:84:108:100:111:56:44:38:46:66:45:40:68 chr2 228111600 . G T 226.92 PASS AO=68;DP=162;FAO=66;FDP=161;FR=.;FRO=95;FSAF=13;FSAR=53;FSRF=34;FSRR=61;FWDB=-0.0458161;FXX=0.00617246;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.641;QD=5.63782;RBI=0.0496986;REFB=-0.0073544;REVB=-0.0192572;RO=94;SAF=13;SAR=55;SRF=34;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23563;STB=0.62694;TYPE=snp;VARB=0.0092702;OID=.;OPOS=228111600;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:161:94:95:68:66:55:13:34:60:53:13:34:61 chr2 228113175 . A G 211.11 PASS AO=56;DP=135;FAO=58;FDP=135;FR=.;FRO=77;FSAF=22;FSAR=36;FSRF=30;FSRR=47;FWDB=-0.0219574;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9498;QD=6.2551;RBI=0.0268827;REFB=0.0120501;REVB=0.0155098;RO=79;SAF=20;SAR=36;SRF=32;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0533131;STB=0.506217;TYPE=snp;VARB=-0.0161546;OID=.;OPOS=228113175;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:79:77:56:58:36:20:32:47:36:22:30:47 chr2 228128540 . C T 562.65 PASS AO=178;DP=397;FAO=162;FDP=384;FR=.;FRO=222;FSAF=69;FSAR=93;FSRF=92;FSRR=130;FWDB=0.0146219;FXX=0.0327448;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.4238;QD=5.86089;RBI=0.0459737;REFB=0.0188255;REVB=-0.0435865;RO=208;SAF=72;SAR=106;SRF=79;SRR=129;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0251769;STB=0.506817;TYPE=snp;VARB=-0.0235596;OID=.;OPOS=228128540;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:397:384:208:222:178:162:106:72:79:129:93:69:92:130 chr2 228135631 . C T 357.06 PASS AO=77;DP=145;FAO=77;FDP=144;FR=.;FRO=67;FSAF=22;FSAR=55;FSRF=22;FSRR=45;FWDB=0.0086384;FXX=0.00689608;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.694;QD=9.91823;RBI=0.00936096;REFB=-0.00786541;REVB=0.00360631;RO=65;SAF=22;SAR=55;SRF=22;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0526153;STB=0.523803;TYPE=snp;VARB=0.00615311;OID=.;OPOS=228135631;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:144:65:67:77:77:55:22:22:43:55:22:22:45 chr2 228177479 . C T 2019.7 PASS AO=208;DP=208;FAO=211;FDP=211;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=130;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0683867;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.058;QD=38.2881;RBI=0.0684205;REFB=0;REVB=-0.00214968;RO=0;SAF=80;SAR=128;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.13541e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.91436e-05;OID=.;OPOS=228177479;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:208:211:0:0:208:211:128:80:0:0:130:81:0:0 chr2 228177825 . C G 1194.82 PASS AO=126;DP=127;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127326;FXX=0.023254;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.642;QD=37.9308;RBI=0.0146393;REFB=-0.0234732;REVB=0.00722424;RO=0;SAF=62;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.29882e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.98321e-05;OID=.;OPOS=228177825;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:127:126:0:0:126:126:64:62:0:0:64:62:0:0 chr2 228179238 . G A 3574.27 PASS AO=370;DP=370;FAO=375;FDP=375;FR=.;FRO=0;FSAF=112;FSAR=263;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0387181;FXX=0.0026595;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.0008;QD=38.1256;RBI=0.0400868;REFB=0;REVB=0.0103857;RO=0;SAF=109;SAR=261;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.99124e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000583181;OID=.;OPOS=228179238;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:370:375:0:0:370:375:261:109:0:0:263:112:0:0 chr2 228416712 . A G 382.14 PASS AO=39;DP=39;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.110645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.5383;QD=37.282;RBI=0.110752;REFB=0;REVB=-0.00487928;RO=0;SAF=27;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00146959;OID=.;OPOS=228416712;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:39:41:0:0:39:41:12:27:0:0:12:29:0:0 chr2 228420193 . A T 85.61 PASS AO=24;DP=83;FAO=41;FDP=96;FR=.;FRO=55;FSAF=27;FSAR=14;FSRF=50;FSRR=5;FWDB=-0.00733468;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=27.2089;QD=3.56722;RBI=0.0449533;REFB=-0.152708;REVB=-0.0443509;RO=19;SAF=16;SAR=8;SRF=17;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223094;STB=0.677493;TYPE=snp;VARB=0.0243605;OID=.;OPOS=228420193;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:70:96:19:55:24:41:8:16:17:2:14:27:50:5 chr2 228476140 . C T 1819.12 PASS AO=190;DP=194;FAO=193;FDP=193;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=108;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00518348;FXX=0.0203035;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4398;QD=37.7019;RBI=0.0179427;REFB=0.0481096;REVB=0.0171777;RO=3;SAF=84;SAR=106;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0032641;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00103969;OID=.;OPOS=228476140;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:194:193:3:0:190:193:106:84:1:2:108:85:0:0 chr2 228476253 . C G 1454.8 PASS AO=153;DP=154;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0276752;FXX=0.0064512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9825;QD=37.787;RBI=0.036768;REFB=-0.0379185;REVB=-0.0242069;RO=1;SAF=62;SAR=91;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00519913;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.37472e-06;OID=.;OPOS=228476253;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:154:154:1:0:153:154:91:62:0:1:91:63:0:0 chr2 228493211 . G A 205.84 PASS AO=61;DP=155;FAO=62;FDP=155;FR=.;FRO=93;FSAF=43;FSAR=19;FSRF=47;FSRR=46;FWDB=-0.0194987;FXX=0.00640985;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.254;QD=5.31199;RBI=0.0428034;REFB=0.00374194;REVB=-0.0381042;RO=94;SAF=43;SAR=18;SRF=47;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234602;STB=0.620381;TYPE=snp;VARB=-0.00413327;OID=.;OPOS=228493211;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:94:93:61:62:18:43:47:47:19:43:47:46 chr2 228565656 . G A 245.75 PASS AO=61;DP=131;FAO=61;FDP=131;FR=.;FRO=70;FSAF=45;FSAR=16;FSRF=49;FSRR=21;FWDB=0.0137207;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.906;QD=7.50385;RBI=0.0153016;REFB=-0.022339;REVB=-0.00677358;RO=70;SAF=45;SAR=16;SRF=49;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0456289;STB=0.525394;TYPE=snp;VARB=0.0246947;OID=.;OPOS=228565656;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:70:70:61:61:16:45:49:21:16:45:49:21 chr2 228758580 . G C 201.27 PASS AO=63;DP=174;FAO=67;FDP=178;FR=.;FRO=111;FSAF=28;FSAR=39;FSRF=65;FSRR=46;FWDB=0.0044356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.517;QD=4.52302;RBI=0.0293507;REFB=-0.0111939;REVB=0.0290136;RO=108;SAF=25;SAR=38;SRF=63;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206246;STB=0.603765;TYPE=snp;VARB=0.0164996;OID=.;OPOS=228758580;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:178:108:111:63:67:38:25:63:45:39:28:65:46 chr2 228776996 . T C 97.13 PASS AO=18;DP=30;FAO=17;FDP=29;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.0144435;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.557;QD=13.3979;RBI=0.0152265;REFB=-0.0473835;REVB=-0.00481975;RO=12;SAF=9;SAR=9;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512181;TYPE=snp;VARB=0.0154037;OID=.;OPOS=228776996;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:30:29:12:12:18:17:9:9:6:6:9:8:6:6 chr2 228881588 . C T 202.81 PASS AO=50;DP=107;FAO=50;FDP=107;FR=.;FRO=57;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=26;FSRR=31;FWDB=0.0391338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.163;QD=7.58148;RBI=0.0394105;REFB=-0.0206786;REVB=-0.00466202;RO=57;SAF=21;SAR=29;SRF=26;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0352475;STB=0.519626;TYPE=snp;VARB=0.0207785;OID=.;OPOS=228881588;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:57:57:50:50:29:21:26:31:29:21:26:31 chr2 228882970 . T C 284.38 PASS AO=60;DP=112;FAO=61;FDP=114;FR=.;FRO=53;FSAF=25;FSAR=36;FSRF=24;FSRR=29;FWDB=-0.00285661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.853;QD=9.97817;RBI=0.0215989;REFB=-0.0123196;REVB=0.0214092;RO=52;SAF=24;SAR=36;SRF=23;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0369325;STB=0.520501;TYPE=snp;VARB=0.0106269;OID=.;OPOS=228882970;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:114:52:53:60:61:36:24:23:29:36:25:24:29 chr2 228883721 . T C 1076.06 PASS AO=113;DP=117;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0464049;FXX=0.0341851;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.478;QD=38.0905;RBI=0.0464742;REFB=0;REVB=-0.00253786;RO=0;SAF=79;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.90604e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000123406;OID=.;OPOS=228883721;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:117:113:0:0:113:113:34:79:0:0:34:79:0:0 chr2 230045542 . C G 317.7 PASS AO=76;DP=156;FAO=76;FDP=156;FR=.;FRO=80;FSAF=51;FSAR=25;FSRF=43;FSRR=37;FWDB=0.0346184;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.5972;QD=8.14603;RBI=0.0491581;REFB=-0.0306723;REVB=0.0349012;RO=80;SAF=51;SAR=25;SRF=43;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133052;STB=0.573637;TYPE=snp;VARB=0.0226822;OID=.;OPOS=230045542;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:156:80:80:76:76:25:51:43:37:25:51:43:37 chr2 230045545 . T C 342.43 PASS AO=78;DP=154;FAO=79;FDP=155;FR=.;FRO=76;FSAF=54;FSAR=25;FSRF=39;FSRR=37;FWDB=-0.0157635;FXX=0.00640985;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.825;QD=8.83704;RBI=0.0199293;REFB=-0.0194701;REVB=0.0121938;RO=75;SAF=53;SAR=25;SRF=38;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164815;STB=0.59014;TYPE=snp;VARB=0.00545459;OID=.;OPOS=230045545;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:155:75:76:78:79:25:53:38:37:25:54:39:37 chr2 230045554 . G C 404.48 PASS AO=87;DP=162;FAO=87;FDP=162;FR=.;FRO=75;FSAF=62;FSAR=25;FSRF=36;FSRR=39;FWDB=0.00263233;FXX=0.00613459;HRUN=3;LEN=1;MLLD=188.592;QD=9.98708;RBI=0.0106292;REFB=0.00336295;REVB=0.0102981;RO=74;SAF=62;SAR=25;SRF=35;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219788;STB=0.618233;TYPE=snp;VARB=-0.00213471;OID=.;OPOS=230045554;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:162:74:75:87:87:25:62:35:39:25:62:36:39 chr2 230045564 . T C 434.21 PASS AO=86;DP=152;FAO=88;FDP=154;FR=.;FRO=66;FSAF=67;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=42;FWDB=0.00914127;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.118;QD=11.278;RBI=0.0134136;REFB=-0.00548456;REVB=0.00981644;RO=66;SAF=65;SAR=21;SRF=24;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.340681;STB=0.68831;TYPE=snp;VARB=0.0112961;OID=.;OPOS=230045564;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:154:66:66:86:88:21:65:24:42:21:67:24:42 chr2 230045568 . T C 432.7 PASS AO=83;DP=148;FAO=86;FDP=150;FR=.;FRO=64;FSAF=68;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=42;FWDB=-0.00609349;FXX=0.00662208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.137;QD=11.5386;RBI=0.0329544;REFB=0.00161925;REVB=-0.0323861;RO=64;SAF=65;SAR=18;SRF=22;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.389096;STB=0.715735;TYPE=snp;VARB=-0.000595281;OID=.;OPOS=230045568;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:150:64:64:83:86:18:65:22:42:18:68:22:42 chr2 230045615 . G A 383.55 PASS AO=72;DP=125;FAO=74;FDP=126;FR=.;FRO=52;FSAF=62;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=39;FWDB=-0.00126047;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.255;QD=12.1763;RBI=0.00673397;REFB=-0.0254672;REVB=-0.00661495;RO=52;SAF=60;SAR=12;SRF=13;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.505162;STB=0.778351;TYPE=snp;VARB=0.00925528;OID=.;OPOS=230045615;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:126:52:52:72:74:12:60:13:39:12:62:13:39 chr2 230668858 . T C 2755.6 PASS AO=287;DP=288;FAO=288;FDP=288;FR=.;FRO=0;FSAF=193;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122749;FXX=0.0136982;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.254;QD=38.2723;RBI=0.0230387;REFB=0;REVB=0.0194963;RO=0;SAF=192;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.26778e-06;OID=.;OPOS=230668858;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:288:288:0:0:287:288:95:192:0:0:95:193:0:0 chr2 230861519 . G T 1250.41 PASS AO=122;DP=122;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0294899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.324;QD=37.6062;RBI=0.0409736;REFB=0;REVB=0.0284461;RO=0;SAF=55;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000612994;OID=.;OPOS=230861519;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:122:133:0:0:122:133:67:55:0:0:73:60:0:0 chr2 230901647 . A G 1308.65 PASS AO=132;DP=133;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.101592;FXX=0.00719373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.617;QD=37.932;RBI=0.101596;REFB=-0.0722324;REVB=0.000977691;RO=1;SAF=64;SAR=68;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00736893;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000466964;OID=.;OPOS=230901647;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:133:138:1:0:132:138:68:64:1:0:70:68:0:0 chr2 231042276 . A G 740.46 PASS AO=162;DP=306;FAO=163;FDP=305;FR=.;FRO=142;FSAF=82;FSAR=81;FSRF=89;FSRR=53;FWDB=0.0143163;FXX=0.00326787;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.267;QD=9.71091;RBI=0.0221905;REFB=0.00636389;REVB=-0.0169548;RO=140;SAF=82;SAR=80;SRF=87;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0983015;STB=0.557624;TYPE=snp;VARB=-0.00404631;OID=.;OPOS=231042276;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:306:305:140:142:162:163:80:82:87:53:81:82:89:53 chr2 231050715 . A G 2605.61 PASS AO=269;DP=272;FAO=273;FDP=273;FR=.;FRO=0;FSAF=172;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288086;FXX=0.0036495;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.9799;QD=38.1775;RBI=0.0288095;REFB=0;REVB=0.000236194;RO=0;SAF=172;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000183909;OID=.;OPOS=231050715;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:272:273:0:0:269:273:97:172:0:0:101:172:0:0 chr2 231072709 . C T 80.66 PASS AO=38;DP=133;FAO=38;FDP=132;FR=.;FRO=94;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=35;FSRR=59;FWDB=-0.013768;FXX=0.00751823;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.6414;QD=2.44423;RBI=0.0302532;REFB=0.0050801;REVB=0.0269388;RO=94;SAF=14;SAR=24;SRF=34;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00874525;STB=0.523548;TYPE=snp;VARB=-0.0132207;OID=.;OPOS=231072709;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:133:132:94:94:38:38:24:14:34:60:25:13:35:59 chr2 231077112 . G A 85.91 PASS AO=41;DP=146;FAO=41;FDP=145;FR=.;FRO=104;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=46;FSRR=58;FWDB=0.0240178;FXX=0.00684885;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.32;QD=2.37007;RBI=0.0242399;REFB=-0.00310347;REVB=0.00327373;RO=101;SAF=20;SAR=21;SRF=45;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0512067;STB=0.532688;TYPE=snp;VARB=0.00890312;OID=.;OPOS=231077112;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:146:145:101:104:41:41:21:20:45:56:21:20:46:58 chr2 231077725 . A G 297.4 PASS AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0340363;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7057;QD=37.1756;RBI=0.0755091;REFB=0;REVB=0.0674029;RO=0;SAF=1;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000537245;OID=.;OPOS=231077725;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:33:32:0:0:32:32:31:1:0:0:31:1:0:0 chr2 231113612 . TA T 36.96 PASS AO=86;DP=356;FAO=84;FDP=332;FR=.;FRO=248;FSAF=72;FSAR=12;FSRF=128;FSRR=120;FWDB=-0.0931737;FXX=0.0404613;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.7645;QD=0.445314;RBI=0.138957;REFB=-0.0737255;REVB=0.10309;RO=209;SAF=77;SAR=9;SRF=116;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.532364;STB=0.798307;TYPE=del;VARB=0.104161;OID=.;OPOS=231113613;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:86:345:84:332:248:72:12:128:120:36:209:77:9:116:93 chr2 231149108 . G A 1217.28 PASS AO=164;DP=195;FAO=162;FDP=192;FR=.;FRO=30;FSAF=79;FSAR=83;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.0285209;FXX=0.0153838;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.9405;QD=25.36;RBI=0.0295296;REFB=-0.0108523;REVB=-0.00765196;RO=30;SAF=81;SAR=83;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177002;STB=0.50193;TYPE=snp;VARB=0.0217582;OID=.;OPOS=231149108;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:195:192:30:30:164:162:83:81:13:17:83:79:15:15 chr2 231222655 . G T 157.38 PASS AO=41;DP=93;FAO=41;FDP=93;FR=.;FRO=52;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=35;FWDB=-0.0126575;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=250.814;QD=6.76921;RBI=0.0127757;REFB=-0.00501103;REVB=0.00173401;RO=52;SAF=17;SAR=24;SRF=17;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0918317;STB=0.551377;TYPE=snp;VARB=0.00680088;OID=.;OPOS=231222655;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:52:52:41:41:24:17:17:35:24:17:17:35 chr2 231222675 . T C 131.87 PASS AO=36;DP=88;FAO=36;FDP=86;FR=.;FRO=50;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=32;FWDB=-0.0500711;FXX=0.0227247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.371;QD=6.13332;RBI=0.0501065;REFB=-0.00526915;REVB=-0.00188277;RO=49;SAF=16;SAR=20;SRF=17;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10234;STB=0.550237;TYPE=snp;VARB=0.00724083;OID=.;OPOS=231222675;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:86:49:50:36:36:20:16:17:32:20:16:18:32 chr2 231331896 . G A 96.55 PASS AO=30;DP=77;FAO=30;FDP=81;FR=.;FRO=51;FSAF=26;FSAR=4;FSRF=23;FSRR=28;FWDB=-0.0226882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.425;QD=4.76769;RBI=0.0424432;REFB=0.0109743;REVB=-0.0358702;RO=47;SAF=26;SAR=4;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.493735;STB=0.809106;TYPE=snp;VARB=-0.00801945;OID=.;OPOS=231331896;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:77:81:47:51:30:30:4:26:23:24:4:26:23:28 chr2 231334532 . G A 80.03 PASS AO=20;DP=51;FAO=21;FDP=51;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.0177499;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.99;QD=6.27655;RBI=0.0206568;REFB=-0.00546271;REVB=-0.010566;RO=26;SAF=12;SAR=8;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10041;STB=0.609651;TYPE=snp;VARB=0.00664284;OID=.;OPOS=231334532;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:51:51:26:30:20:21:8:12:13:13:8:13:13:17 chr2 231406680 . T C 367.29 PASS AO=95;DP=213;FAO=97;FDP=213;FR=.;FRO=116;FSAF=40;FSAR=57;FSRF=45;FSRR=71;FWDB=0.00501662;FXX=0.00467268;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.075;QD=6.89747;RBI=0.00503246;REFB=-0.0230245;REVB=0.000398977;RO=115;SAF=40;SAR=55;SRF=45;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0303063;STB=0.513795;TYPE=snp;VARB=0.0260188;OID=.;OPOS=231406680;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:213:213:115:116:95:97:55:40:45:70:57:40:45:71 chr2 231407663 . C T 81.56 PASS AO=28;DP=68;FAO=24;FDP=63;FR=.;FRO=39;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=0.0464287;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.373;QD=5.1783;RBI=0.0490393;REFB=-0.01972;REVB=-0.0157871;RO=40;SAF=15;SAR=13;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0409445;STB=0.522993;TYPE=snp;VARB=0.0397156;OID=.;OPOS=231407663;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:68:63:40:39:28:24:13:15:23:17:9:15:23:16 chr2 231451851 . A G 160.19 PASS AO=35;DP=69;FAO=35;FDP=69;FR=.;FRO=34;FSAF=27;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.0269617;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.627;QD=9.28636;RBI=0.0299231;REFB=-0.0147873;REVB=-0.0129791;RO=34;SAF=27;SAR=8;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.328992;STB=0.684393;TYPE=snp;VARB=0.0248982;OID=.;OPOS=231451851;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:34:34:35:35:8:27:15:19:8:27:15:19 chr2 231738168 . G A 94.88 PASS AO=22;DP=46;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.0159255;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=206.58;QD=8.07449;RBI=0.0167734;REFB=-0.016627;REVB=-0.0052654;RO=23;SAF=10;SAR=12;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0180797;STB=0.507805;TYPE=snp;VARB=0.0169404;OID=.;OPOS=231738168;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:46:47:23:25:22:22:12:10:10:13:12:10:11:14 chr2 231738263 . C T 66.37 PASS AO=24;DP=73;FAO=24;FDP=74;FR=.;FRO=50;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=29;FWDB=0.0309348;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.9188;QD=3.58762;RBI=0.0436695;REFB=0.017069;REVB=0.0308231;RO=49;SAF=10;SAR=14;SRF=21;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0139842;STB=0.502313;TYPE=snp;VARB=-0.0311771;OID=.;OPOS=231738263;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:73:74:49:50:24:24:14:10:21:28:14:10:21:29 chr2 231738269 . G A 64.37 PASS AO=23;DP=70;FAO=23;FDP=71;FR=.;FRO=48;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=-0.0177867;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.769;QD=3.62637;RBI=0.0179636;REFB=-0.0298096;REVB=0.00251425;RO=47;SAF=10;SAR=13;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0107909;STB=0.512489;TYPE=snp;VARB=0.0279942;OID=.;OPOS=231738269;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:70:71:47:48:23:23:13:10:20:27:13:10:20:28 chr2 231775297 . T G 188.97 PASS AO=36;DP=70;FAO=40;FDP=74;FR=.;FRO=34;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.00113388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.944;QD=10.2147;RBI=0.0206342;REFB=-0.0185384;REVB=0.020603;RO=34;SAF=15;SAR=21;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.099488;STB=0.548341;TYPE=snp;VARB=0.0223005;OID=.;OPOS=231775297;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:74:34:34:36:40:21:15:18:16:23:17:18:16 chr2 231861044 . C T 48.6 PASS AO=10;DP=18;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0188546;FXX=0.0454339;HRUN=3;LEN=1;MLLD=165.725;QD=9.25795;RBI=0.0523279;REFB=-0.0614093;REVB=-0.0488131;RO=8;SAF=4;SAR=6;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.264286;STB=0.576768;TYPE=snp;VARB=0.0508536;OID=.;OPOS=231861044;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:18:21:8:11:10:10:6:4:6:2:6:4:6:5 chr2 231861071 . T C 29.46 PASS AO=9;DP=33;FAO=10;FDP=34;FR=.;FRO=24;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=19;FWDB=-0.00445403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.307;QD=3.46618;RBI=0.00629784;REFB=-0.0216265;REVB=-0.00445245;RO=24;SAF=3;SAR=6;SRF=5;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179191;STB=0.581939;TYPE=snp;VARB=0.051699;OID=.;OPOS=231861071;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:33:34:24:24:9:10:6:3:5:19:7:3:5:19 chr2 231865090 . T C 209.84 PASS AO=53;DP=116;FAO=53;FDP=116;FR=.;FRO=63;FSAF=13;FSAR=40;FSRF=18;FSRR=45;FWDB=-0.0503494;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.7551;QD=7.23573;RBI=0.0544322;REFB=-0.0207993;REVB=-0.0206832;RO=63;SAF=13;SAR=40;SRF=18;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.051497;STB=0.528773;TYPE=snp;VARB=0.0278679;OID=.;OPOS=231865090;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:63:63:53:53:40:13:18:45:40:13:18:45 chr2 232070970 . C T 547.93 PASS AO=86;DP=122;FAO=88;FDP=125;FR=.;FRO=37;FSAF=40;FSAR=48;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=-0.0242224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.4195;QD=17.5338;RBI=0.0533149;REFB=-0.0104667;REVB=-0.0474948;RO=33;SAF=39;SAR=47;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0320631;STB=0.51754;TYPE=snp;VARB=0.00437636;OID=.;OPOS=232070970;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:122:125:33:37:86:88:47:39:17:16:48:40:19:18 chr2 232079592 . G A 443.16 PASS AO=124;DP=281;FAO=122;FDP=279;FR=.;FRO=157;FSAF=63;FSAR=59;FSRF=89;FSRR=68;FWDB=0.00879407;FXX=0.00711718;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.5472;QD=6.35357;RBI=0.0377993;REFB=-0.00370712;REVB=0.0367621;RO=156;SAF=64;SAR=60;SRF=88;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0483463;STB=0.528488;TYPE=snp;VARB=0.0053944;OID=.;OPOS=232079592;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:281:279:156:157:124:122:60:64:88:68:59:63:89:68 chr2 232087475 . T A 1346.79 PASS AO=114;DP=146;FAO=149;FDP=149;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=72;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.123503;FXX=0.0132442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.088;QD=36.1554;RBI=0.197825;REFB=0;REVB=0.154538;RO=0;SAF=35;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0340199;OID=.;OPOS=232087475;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:146:149:0:0:114:149:79:35:0:0:77:72:0:0 chr2 232091473 . C G 275.1 PASS AO=65;DP=137;FAO=65;FDP=134;FR=.;FRO=69;FSAF=45;FSAR=20;FSRF=29;FSRR=40;FWDB=0.000121664;FXX=0.0563341;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.858;QD=8.21199;RBI=0.0379626;REFB=-0.000587126;REVB=-0.0379624;RO=61;SAF=45;SAR=20;SRF=27;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.231648;STB=0.645887;TYPE=snp;VARB=0.00030036;OID=.;OPOS=232091473;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:134:61:69:65:65:20:45:27:34:20:45:29:40 chr2 232196564 . C T 190.83 PASS AO=33;DP=58;FAO=36;FDP=61;FR=.;FRO=25;FSAF=25;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.0121626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.413;QD=12.5131;RBI=0.0260377;REFB=-0.0114149;REVB=0.0230224;RO=25;SAF=25;SAR=8;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219217;STB=0.579008;TYPE=snp;VARB=0.00862757;OID=.;OPOS=232196564;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:58:61:25:25:33:36:8:25:13:12:11:25:13:12 chr2 232196597 . G A 138.81 PASS AO=27;DP=48;FAO=27;FDP=48;FR=.;FRO=21;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.040436;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.937;QD=11.5676;RBI=0.0404877;REFB=-0.0108216;REVB=-0.00204439;RO=21;SAF=20;SAR=7;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158016;STB=0.588166;TYPE=snp;VARB=0.00988423;OID=.;OPOS=232196597;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:48:48:21:21:27:27:7:20:12:9:7:20:12:9 chr2 232225535 . C CG 720.87 PASS AO=70;DP=155;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.18492;FXX=0.0583899;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.0927;QD=22.3525;RBI=0.240563;REFB=0;REVB=-0.153867;RO=71;SAF=1;SAR=69;SRF=38;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.808891;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00248825;OID=.;OPOS=232225536;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:70:155:129:129:0:27:102:0:0:68:71:1:69:38:33 chr2 232325414 . TTCA T 125.23 PASS AO=49;DP=117;FAO=50;FDP=113;FR=.;FRO=63;FSAF=32;FSAR=18;FSRF=43;FSRR=20;FWDB=-0.00891653;FXX=0.0504159;HRUN=2;LEN=3;MLLD=174.758;QD=4.43281;RBI=0.0116545;REFB=-0.0308968;REVB=-0.00750486;RO=46;SAF=31;SAR=18;SRF=26;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0623491;STB=0.5261;TYPE=del;VARB=0.0317683;OID=.;OPOS=232325415;OREF=TCA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:49:111:50:113:63:32:18:43:20:99:46:31:18:26:20 chr2 232326417 . C T 306.16 PASS AO=89;DP=210;FAO=88;FDP=209;FR=.;FRO=121;FSAF=64;FSAR=24;FSRF=65;FSRR=56;FWDB=-0.0286445;FXX=0.00476168;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.4406;QD=5.85948;RBI=0.032617;REFB=-0.0241592;REVB=0.0156002;RO=120;SAF=64;SAR=25;SRF=65;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202369;STB=0.623145;TYPE=snp;VARB=0.0391797;OID=.;OPOS=232326417;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:210:209:120:121:89:88:25:64:65:55:24:64:65:56 chr2 232326801 . A T 147.39 PASS AO=15;DP=15;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0878824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.157;QD=36.8485;RBI=0.0888929;REFB=0;REVB=0.0133653;RO=0;SAF=2;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000635454;OID=.;OPOS=232326801;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:16:0:0:15:16:13:2:0:0:13:3:0:0 chr2 232378231 . T C 485.06 PASS AO=114;DP=232;FAO=114;FDP=229;FR=.;FRO=115;FSAF=48;FSAR=66;FSRF=55;FSRR=60;FWDB=-0.0262969;FXX=0.0129305;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.6103;QD=8.47274;RBI=0.0268382;REFB=-0.0388307;REVB=-0.00536293;RO=114;SAF=48;SAR=66;SRF=54;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0487152;STB=0.529187;TYPE=snp;VARB=0.0359577;OID=.;OPOS=232378231;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:229:114:115:114:114:66:48:54:60:66:48:55:60 chr2 232458443 . T C 477.33 PASS AO=44;DP=44;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0512484;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.985;QD=37.4373;RBI=0.0513558;REFB=0;REVB=-0.00331994;RO=0;SAF=21;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2717e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000573459;OID=.;OPOS=232458443;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:44:51:0:0:44:51:23:21:0:0:28:23:0:0 chr2 232790338 . C G 10.31 PASS AO=2;DP=8;FAO=2;FDP=8;FR=.;FRO=6;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=129.879;QD=5.15388;RBI=0.0293375;REFB=0.0117888;REVB=-0.0293375;RO=6;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00203937;OID=.;OPOS=232790338;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:8:6:6:2:2:2:0:0:6:2:0:0:6 chr2 233201034 . AGG AG,A 151.17 PASS AO=9,8;DP=48;FAO=39,2;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=11,0;FSAR=28,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.01106,-0.00624845;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,2;MLLD=6.77056,8.44009;QD=14.7483;RBI=0.312961,0.163377;REFB=0.0726618,0.0744864;REVB=-0.312766,-0.163257;RO=1;SAF=0,0;SAR=9,8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=-0.0103966,-0.0436933;OID=.,.;OPOS=233201035,233201035;OREF=G,GG;OALT=-,-;OMAPALT=AG,A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:9,8:41:39,2:41:0:11,0:28,2:0:0:5:1:0,0:9,8:0:1 chr2 233243981 . A T 251.34 PASS AO=61;DP=128;FAO=61;FDP=128;FR=.;FRO=67;FSAF=37;FSAR=24;FSRF=47;FSRR=20;FWDB=0.00143525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.372;QD=7.85435;RBI=0.0228289;REFB=-0.0243545;REVB=-0.0227837;RO=67;SAF=37;SAR=24;SRF=47;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0963482;STB=0.553221;TYPE=snp;VARB=0.0194919;OID=.;OPOS=233243981;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:67:67:61:61:24:37:47:20:24:37:47:20 chr2 233244575 . G A 89.69 PASS AO=14;DP=21;FAO=14;FDP=21;FR=.;FRO=7;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.00688683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.779;QD=17.0835;RBI=0.00920145;REFB=-0.0421142;REVB=0.00610232;RO=6;SAF=10;SAR=4;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0307691;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0431197;OID=.;OPOS=233244575;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:21:21:6:7:14:14:4:10:4:2:4:10:5:2 chr2 233244584 . TC T 116.29 PASS AO=4;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0652181;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=9.55633;QD=22.1501;RBI=0.0809037;REFB=0;REVB=0.0478749;RO=16;SAF=4;SAR=0;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.615368;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00203004;OID=.;OPOS=233244585;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:4:21:21:21:0:15:6:0:0:12:16:4:0:11:5 chr2 233244586 . C G 141.09 PASS AO=17;DP=21;FAO=18;FDP=21;FR=.;FRO=3;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0243769;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.8173;QD=26.8742;RBI=0.0290728;REFB=-0.0474211;REVB=0.0158428;RO=4;SAF=11;SAR=6;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140596;STB=0.555497;TYPE=snp;VARB=0.0408629;OID=.;OPOS=233244586;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:21:21:4:3:17:18:6:11:4:0:6:12:3:0 chr2 233244930 . G C 48.7 PASS AO=13;DP=46;FAO=16;FDP=49;FR=.;FRO=33;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=0.0122835;FXX=0.039208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.572;QD=3.9754;RBI=0.0248266;REFB=-0.0124965;REVB=0.0215749;RO=33;SAF=2;SAR=11;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.587839;STB=0.729456;TYPE=snp;VARB=0.0230217;OID=.;OPOS=233244930;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:46:49:33:33:13:16:11:2:22:11:11:5:22:11 chr2 233349588 . G A 614.1 PASS AO=65;DP=66;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0528909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.177;QD=36.6629;RBI=0.0644193;REFB=-0.0970761;REVB=0.036775;RO=1;SAF=22;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0209857;STB=0.511108;TYPE=snp;VARB=0.00122461;OID=.;OPOS=233349588;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:66:67:1:1:65:66:43:22:1:0:44:22:1:0 chr2 233385396 . G A 460.05 PASS AO=81;DP=127;FAO=81;FDP=126;FR=.;FRO=45;FSAF=33;FSAR=48;FSRF=18;FSRR=27;FWDB=0.0185658;FXX=0.023254;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.062;QD=14.6049;RBI=0.0443339;REFB=-0.0434495;REVB=0.0402592;RO=43;SAF=33;SAR=48;SRF=16;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0236113;STB=0.502742;TYPE=snp;VARB=0.0568257;OID=.;OPOS=233385396;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:126:43:45:81:81:48:33:16:27:48:33:18:27 chr2 233390937 . A G 37.59 PASS AO=10;DP=27;FAO=10;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=17;FSRR=0;FWDB=-0.0533657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.3521;QD=5.56854;RBI=0.056207;REFB=-0.00921859;REVB=0.0176445;RO=17;SAF=7;SAR=3;SRF=17;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.491917;STB=0.773877;TYPE=snp;VARB=0.00387572;OID=.;OPOS=233390937;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:27:27:17:17:10:10:3:7:17:0:3:7:17:0 chr2 233408397 . AG A 73.6 PASS AO=23;DP=52;FAO=26;FDP=43;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=0.0239959;FXX=0.0227221;HRUN=4;LEN=1;MLLD=11.5663;QD=6.84627;RBI=0.158788;REFB=-0.0880338;REVB=0.156965;RO=18;SAF=7;SAR=16;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.024996;STB=0.534457;TYPE=del;VARB=0.145365;OID=.;OPOS=233408398;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:23:43:26:43:17:8:18:4:13:25:18:7:16:5:13 chr2 233413771 . C T 205.6 PASS AO=37;DP=62;FAO=39;FDP=66;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.0152754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2639;QD=12.4606;RBI=0.0385489;REFB=-0.0103312;REVB=-0.0353932;RO=25;SAF=15;SAR=22;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0856771;STB=0.541041;TYPE=snp;VARB=0.0050844;OID=.;OPOS=233413771;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:62:66:25:27:37:39:22:15:13:12:24:15:13:14 chr2 233414341 . C T 108.92 PASS AO=32;DP=77;FAO=31;FDP=77;FR=.;FRO=46;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=34;FSRR=12;FWDB=0.00934172;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.6134;QD=5.65822;RBI=0.0227433;REFB=-0.0017546;REVB=-0.0207362;RO=45;SAF=23;SAR=9;SRF=33;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0187739;STB=0.521725;TYPE=snp;VARB=0.00329866;OID=.;OPOS=233414341;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:45:46:32:31:9:23:33:12:9:22:34:12 chr2 233470843 . G A 129.2 PASS AO=28;DP=57;FAO=29;FDP=56;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=19;FWDB=0.00146807;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.698;QD=9.22845;RBI=0.0274271;REFB=-0.038152;REVB=0.0273877;RO=26;SAF=15;SAR=13;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228008;STB=0.605805;TYPE=snp;VARB=0.0315863;OID=.;OPOS=233470843;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:56:26:27:28:29:13:15:7:19:14:15:8:19 chr2 233470900 . TC T 110.75 PASS AO=27;DP=59;FAO=35;FDP=58;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=5;FSRR=18;FWDB=-0.0207748;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=17.581;QD=7.63814;RBI=0.0348602;REFB=-0.0777113;REVB=0.0279936;RO=24;SAF=9;SAR=18;SRF=6;SRR=18;SSEN=0.303571;SSEP=0;SSSB=0.0818194;STB=0.587581;TYPE=del;VARB=0.0522969;OID=.;OPOS=233470901;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:27:56:35:58:23:15:20:5:18:42:24:9:18:6:18 chr2 233514636 . G T 218.94 PASS AO=47;DP=90;FAO=47;FDP=90;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=31;FSRF=15;FSRR=28;FWDB=0.00962643;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=240.236;QD=9.73071;RBI=0.0151491;REFB=-0.0180655;REVB=-0.0116973;RO=42;SAF=16;SAR=31;SRF=14;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00677267;STB=0.50446;TYPE=snp;VARB=0.0175396;OID=.;OPOS=233514636;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:42:43:47:47:31:16:14:28:31:16:15:28 chr2 233514638 . G C 214.97 PASS AO=46;DP=87;FAO=46;FDP=87;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=29;FSRF=13;FSRR=28;FWDB=-0.00999735;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=175.582;QD=9.88384;RBI=0.0123271;REFB=-0.00873545;REVB=-0.00721175;RO=41;SAF=17;SAR=29;SRF=13;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0488581;STB=0.526905;TYPE=snp;VARB=0.0168298;OID=.;OPOS=233514638;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:41:41:46:46:29:17:13:28:29:17:13:28 chr2 233599904 . A C 367.94 PASS AO=42;DP=44;FAO=42;FDP=44;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00747646;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=214.48;QD=33.4489;RBI=0.00826724;REFB=-0.166284;REVB=-0.00352842;RO=0;SAF=29;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.36943e-08;STB=0.516659;TYPE=snp;VARB=0.000888448;OID=.;OPOS=233599904;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:44:44:0:2:42:42:13:29:0:0:13:29:2:0 chr2 233633460 . G A 808.08 PASS AO=84;DP=84;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00690458;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.3258;QD=38.0273;RBI=0.0252784;REFB=0;REVB=0.0243172;RO=0;SAF=58;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.45543e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.29874e-05;OID=.;OPOS=233633460;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:84:85:0:0:84:85:26:58:0:0:26:59:0:0 chr2 233671277 . G T 631.94 PASS AO=152;DP=307;FAO=152;FDP=309;FR=.;FRO=157;FSAF=70;FSAR=82;FSRF=79;FSRR=78;FWDB=-0.00708333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.506;QD=8.18044;RBI=0.0223655;REFB=-0.0245112;REVB=-0.0212142;RO=155;SAF=70;SAR=82;SRF=77;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0334665;STB=0.521733;TYPE=snp;VARB=0.0236787;OID=.;OPOS=233671277;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:307:309:155:157:152:152:82:70:77:78:82:70:79:78 chr2 233712208 . G A 79.38 PASS AO=24;DP=67;FAO=24;FDP=64;FR=.;FRO=40;FSAF=5;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=-0.0245609;FXX=0.0588149;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.511;QD=4.96104;RBI=0.0373872;REFB=-0.0413508;REVB=0.028188;RO=39;SAF=5;SAR=19;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265571;STB=0.649699;TYPE=snp;VARB=0.0307225;OID=.;OPOS=233712208;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:67:64:39:40:24:24:19:5:16:23:19:5:16:24 chr2 233712239 . GCAGCAGCCGCCA G 77.21 PASS AO=14;DP=37;FAO=14;FDP=25;FR=.;FRO=11;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=-0.0026509;FXX=0.137883;HRUN=1;LEN=12;MLLD=218.114;QD=12.354;RBI=0.0415986;REFB=-0.0460275;REVB=-0.0415141;RO=7;SAF=10;SAR=4;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.345745;STB=0.697387;TYPE=del;VARB=0.0391006;OID=.;OPOS=233712240;OREF=CAGCAGCCGCCA;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:14:22:14:25:11:10:4:3:8:49:7:10:4:1:6 chr2 233757697 . A G 782.46 PASS AO=84;DP=85;FAO=84;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0131601;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.623;QD=36.8216;RBI=0.0268964;REFB=-0.0827537;REVB=-0.0234569;RO=1;SAF=46;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0123019;STB=0.506492;TYPE=snp;VARB=-5.6351e-05;OID=.;OPOS=233757697;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:85:85:1:1:84:84:38:46:0:1:38:46:0:1 chr2 233834975 . A G 2826.03 PASS AO=291;DP=291;FAO=295;FDP=295;FR=.;FRO=0;FSAF=143;FSAR=152;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0347912;FXX=0.00337826;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.607;QD=38.319;RBI=0.0353302;REFB=0;REVB=0.00614757;RO=0;SAF=141;SAR=150;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000148872;OID=.;OPOS=233834975;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:291:295:0:0:291:295:150:141:0:0:152:143:0:0 chr2 233899126 . C A 188.71 PASS AO=38;DP=69;FAO=38;FDP=69;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=30;FSRF=6;FSRR=25;FWDB=0.00834387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.107;QD=10.9397;RBI=0.0175924;REFB=0.00300658;REVB=0.0154879;RO=31;SAF=8;SAR=30;SRF=6;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0210976;STB=0.511622;TYPE=snp;VARB=-0.00206769;OID=.;OPOS=233899126;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:31:31:38:38:30:8:6:25:30:8:6:25 chr2 233990483 . GC G 37.09 PASS AO=17;DP=81;FAO=27;FDP=62;FR=.;FRO=35;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.0204265;FXX=0.0312451;HRUN=5;LEN=1;MLLD=9.85664;QD=2.39307;RBI=0.0204265;REFB=-0.0746794;REVB=-3.12581e-05;RO=34;SAF=14;SAR=3;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.442527;STB=0.646797;TYPE=del;VARB=0.10609;OID=.;OPOS=233990484;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:17:62:27:62:35:19:8:16:19:37:34:14:3:16:18 chr2 234054873 . G A 317.44 PASS AO=67;DP=125;FAO=68;FDP=126;FR=.;FRO=58;FSAF=21;FSAR=47;FSRF=23;FSRR=35;FWDB=-0.0337228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.822;QD=10.0773;RBI=0.043361;REFB=-0.0472382;REVB=-0.0272572;RO=56;SAF=20;SAR=47;SRF=22;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0896583;STB=0.545633;TYPE=snp;VARB=0.0311526;OID=.;OPOS=234054873;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:126:56:58:67:68:47:20:22:34:47:21:23:35 chr2 234055004 . T C 85.24 PASS AO=23;DP=61;FAO=25;FDP=63;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=-0.00693106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.5106;QD=5.41231;RBI=0.00718921;REFB=-0.0221902;REVB=0.00190922;RO=37;SAF=15;SAR=8;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.263858;STB=0.622545;TYPE=snp;VARB=0.063584;OID=.;OPOS=234055004;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:61:63:37:38:23:25:8:15:15:22:10:15:15:23 chr2 234066969 . C G 313.2 PASS AO=75;DP=155;FAO=75;FDP=154;FR=.;FRO=79;FSAF=51;FSAR=24;FSRF=50;FSRR=29;FWDB=0.00777205;FXX=0.0064512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.7606;QD=8.13508;RBI=0.0474078;REFB=-0.0160181;REVB=-0.0467664;RO=79;SAF=51;SAR=24;SRF=50;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0492027;STB=0.527202;TYPE=snp;VARB=0.0155496;OID=.;OPOS=234066969;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:154:79:79:75:75:24:51:50:29:24:51:50:29 chr2 234115337 . G A 137.84 PASS AO=25;DP=45;FAO=27;FDP=47;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=21;FSRF=4;FSRR=16;FWDB=-0.0375468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.789;QD=11.7311;RBI=0.037731;REFB=0.0195051;REVB=-0.00372388;RO=18;SAF=4;SAR=21;SRF=3;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00928206;STB=0.513879;TYPE=snp;VARB=-0.0213017;OID=.;OPOS=234115337;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:45:47:18:20:25:27:21:4:3:15:21:6:4:16 chr2 234183368 . A G 364.54 PASS AO=110;DP=270;FAO=110;FDP=271;FR=.;FRO=161;FSAF=53;FSAR=57;FSRF=70;FSRR=91;FWDB=-0.0143882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.6182;QD=5.38068;RBI=0.0151472;REFB=-0.00247679;REVB=-0.00473462;RO=159;SAF=53;SAR=57;SRF=70;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0440843;STB=0.528033;TYPE=snp;VARB=0.0030203;OID=.;OPOS=234183368;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:270:271:159:161:110:110:57:53:70:89:57:53:70:91 chr2 234184417 . G A 379.22 PASS AO=92;DP=191;FAO=92;FDP=191;FR=.;FRO=99;FSAF=71;FSAR=21;FSRF=80;FSRR=19;FWDB=0.0391769;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.251;QD=7.94173;RBI=0.0400996;REFB=-0.0180903;REVB=0.00855249;RO=99;SAF=71;SAR=21;SRF=80;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0500615;STB=0.527527;TYPE=snp;VARB=0.0189352;OID=.;OPOS=234184417;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:191:191:99:99:92:92:21:71:80:19:21:71:80:19 chr2 234227523 . A G 1759.03 PASS AO=183;DP=183;FAO=184;FDP=184;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=132;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0349267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.798;QD=38.2398;RBI=0.0363387;REFB=0;REVB=-0.0100312;RO=0;SAF=52;SAR=131;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.88538e-05;OID=.;OPOS=234227523;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:183:184:0:0:183:184:131:52:0:0:132:52:0:0 chr2 234235820 . C T 76.24 PASS AO=19;DP=44;FAO=19;FDP=44;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=-0.000395592;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.832;QD=6.93074;RBI=0.00487564;REFB=-0.0126649;REVB=0.00485957;RO=24;SAF=14;SAR=5;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0350841;STB=0.512182;TYPE=snp;VARB=0.0102511;OID=.;OPOS=234235820;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:44:44:24:25:19:19:5:14:17:7:5:14:18:7 chr2 234247508 . C G 519.12 PASS AO=130;DP=284;FAO=133;FDP=286;FR=.;FRO=153;FSAF=60;FSAR=73;FSRF=66;FSRR=87;FWDB=0.00445522;FXX=0.0034842;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.133;QD=7.26035;RBI=0.00689415;REFB=-0.0042176;REVB=-0.0052612;RO=152;SAF=59;SAR=71;SRF=66;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0193648;STB=0.510691;TYPE=snp;VARB=0.0051996;OID=.;OPOS=234247508;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:284:286:152:153:130:133:71:59:66:86:73:60:66:87 chr2 234255547 . G A 372.43 PASS AO=95;DP=216;FAO=100;FDP=222;FR=.;FRO=122;FSAF=43;FSAR=57;FSRF=47;FSRR=75;FWDB=-0.0246354;FXX=0.0133327;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.0103;QD=6.71043;RBI=0.0316998;REFB=-0.0202775;REVB=-0.0199494;RO=116;SAF=41;SAR=54;SRF=44;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0532701;STB=0.525259;TYPE=snp;VARB=0.0195214;OID=.;OPOS=234255547;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:216:222:116:122:95:100:54:41:44:72:57:43:47:75 chr2 234449316 . G A 872.48 PASS AO=91;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00554861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.451;QD=37.934;RBI=0.013531;REFB=0;REVB=0.012341;RO=0;SAF=49;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.99978e-05;OID=.;OPOS=234449316;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:92:92:0:0:91:92:42:49:0:0:42:50:0:0 chr2 234469664 . T C 3255.19 PASS AO=339;DP=340;FAO=340;FDP=340;FR=.;FRO=0;FSAF=219;FSAR=121;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000682763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.975;QD=38.2964;RBI=0.0540542;REFB=0;REVB=0.0540499;RO=0;SAF=219;SAR=120;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.2363e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000472688;OID=.;OPOS=234469664;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:340:340:0:0:339:340:120:219:0:0:121:219:0:0 chr2 234526871 . C G 470.12 PASS AO=101;DP=208;FAO=109;FDP=213;FR=.;FRO=104;FSAF=49;FSAR=60;FSRF=21;FSRR=83;FWDB=0.00774279;FXX=0.00930189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6511;QD=8.82863;RBI=0.0386639;REFB=-0.0336113;REVB=0.0378806;RO=103;SAF=49;SAR=52;SRF=21;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.262797;STB=0.625213;TYPE=snp;VARB=0.0353442;OID=.;OPOS=234526871;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:213:103:104:101:109:52:49:21:82:60:49:21:83 chr2 234580678 . T C 314.14 PASS AO=66;DP=122;FAO=66;FDP=121;FR=.;FRO=55;FSAF=23;FSAR=43;FSRF=21;FSRR=34;FWDB=0.0160525;FXX=0.0162588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.646;QD=10.3848;RBI=0.0204625;REFB=-0.0150257;REVB=-0.0126898;RO=55;SAF=23;SAR=43;SRF=21;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0301251;STB=0.516511;TYPE=snp;VARB=0.0175661;OID=.;OPOS=234580678;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:121:55:55:66:66:43:23:21:34:43:23:21:34 chr2 234590616 . C A 268.31 PASS AO=60;DP=117;FAO=60;FDP=117;FR=.;FRO=57;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=38;FSRR=19;FWDB=-0.0258524;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=170.639;QD=9.173;RBI=0.0259917;REFB=0.00246186;REVB=-0.00268784;RO=57;SAF=26;SAR=34;SRF=38;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204116;STB=0.612231;TYPE=snp;VARB=-0.00176378;OID=.;OPOS=234590616;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:57:57:60:60:34:26:38:19:34:26:38:19 chr2 234590970 . T G 1370.89 PASS AO=142;DP=142;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0107199;FXX=0.00689608;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.633;QD=38.0803;RBI=0.0214286;REFB=0;REVB=0.0185545;RO=0;SAF=74;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.9735e-05;OID=.;OPOS=234590970;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:142:144:0:0:142:144:68:74:0:0:71:73:0:0 chr2 234590974 . C A 1077.89 PASS AO=129;DP=141;FAO=130;FDP=142;FR=.;FRO=12;FSAF=66;FSAR=64;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0143286;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.0381;QD=30.363;RBI=0.0149166;REFB=-0.000401465;REVB=-0.00414683;RO=12;SAF=66;SAR=63;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0153088;STB=0.507691;TYPE=snp;VARB=0.000316904;OID=.;OPOS=234590974;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:141:142:12:12:129:130:63:66:5:7:64:66:5:7 chr2 234590975 . G A 1318.68 PASS AO=141;DP=141;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0035746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.043;QD=37.1459;RBI=0.0319583;REFB=0;REVB=0.0317577;RO=0;SAF=71;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.23847e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.67127e-05;OID=.;OPOS=234590975;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:141:142:0:0:141:142:70:71:0:0:71:71:0:0 chr2 234591205 . T C 292.27 PASS AO=85;DP=207;FAO=85;FDP=206;FR=.;FRO=121;FSAF=17;FSAR=68;FSRF=30;FSRR=91;FWDB=-0.00291466;FXX=0.00483068;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.8277;QD=5.67512;RBI=0.0332296;REFB=-0.0100395;REVB=0.0331015;RO=119;SAF=17;SAR=68;SRF=30;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0799081;STB=0.541776;TYPE=snp;VARB=0.0168681;OID=.;OPOS=234591205;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:206:119:121:85:85:68:17:30:89:68:17:30:91 chr2 234591339 . G A 287.32 PASS AO=71;DP=150;FAO=71;FDP=151;FR=.;FRO=80;FSAF=27;FSAR=44;FSRF=24;FSRR=56;FWDB=-0.0239156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.467;QD=7.61114;RBI=0.0239274;REFB=-0.00611233;REVB=0.00074925;RO=78;SAF=27;SAR=44;SRF=22;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101584;STB=0.546104;TYPE=snp;VARB=0.00537211;OID=.;OPOS=234591339;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:151:78:80:71:71:44:27:22:56:44:27:24:56 chr2 234601669 . T G 560.31 PASS AO=133;DP=268;FAO=133;FDP=268;FR=.;FRO=135;FSAF=86;FSAR=47;FSRF=68;FSRR=67;FWDB=-0.0138605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.8507;QD=8.36281;RBI=0.0412416;REFB=-0.0175817;REVB=-0.0388428;RO=134;SAF=86;SAR=47;SRF=68;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133012;STB=0.575273;TYPE=snp;VARB=0.0186881;OID=.;OPOS=234601669;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:268:268:134:135:133:133:47:86:68:66:47:86:68:67 chr2 234601965 . A G 298.87 PASS AO=70;DP=140;FAO=70;FDP=142;FR=.;FRO=72;FSAF=33;FSAR=37;FSRF=42;FSRR=30;FWDB=-0.0542816;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.7228;QD=8.41882;RBI=0.0551191;REFB=-0.00297483;REVB=0.00957221;RO=70;SAF=33;SAR=37;SRF=42;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116236;STB=0.556542;TYPE=snp;VARB=0.00242734;OID=.;OPOS=234601965;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:142:70:72:70:70:37:33:42:28:37:33:42:30 chr2 234602191 . A G 326.02 PASS AO=74;DP=145;FAO=74;FDP=145;FR=.;FRO=71;FSAF=2;FSAR=72;FSRF=7;FSRR=64;FWDB=-0.0351123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.572;QD=8.99353;RBI=0.0367466;REFB=0.00612619;REVB=-0.0108367;RO=70;SAF=2;SAR=72;SRF=7;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.362685;STB=0.704273;TYPE=snp;VARB=-0.00547383;OID=.;OPOS=234602191;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:70:71:74:74:72:2:7:63:72:2:7:64 chr2 234602202 . A C 300.82 PASS AO=69;DP=137;FAO=69;FDP=137;FR=.;FRO=68;FSAF=2;FSAR=67;FSRF=5;FSRR=63;FWDB=0.0064692;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.302;QD=8.78294;RBI=0.0121097;REFB=-0.000317442;REVB=-0.010237;RO=68;SAF=2;SAR=67;SRF=5;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254084;STB=0.643295;TYPE=snp;VARB=0.000298438;OID=.;OPOS=234602202;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:68:68:69:69:67:2:5:63:67:2:5:63 chr2 234621780 . T C 28.58 PASS AO=13;DP=52;FAO=13;FDP=52;FR=.;FRO=39;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=0.00641616;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.937;QD=2.19822;RBI=0.0181713;REFB=0.00339441;REVB=-0.0170009;RO=39;SAF=4;SAR=9;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134771;STB=0.584281;TYPE=snp;VARB=-0.0366372;OID=.;OPOS=234621780;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:52:52:39:39:13:13:9:4:16:23:9:4:16:23 chr2 234621787 . C G 65.82 PASS AO=21;DP=58;FAO=21;FDP=60;FR=.;FRO=39;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=-0.0413724;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.708;QD=4.38829;RBI=0.0423901;REFB=-0.0018115;REVB=-0.00923271;RO=37;SAF=6;SAR=15;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147829;STB=0.591307;TYPE=snp;VARB=0.00740794;OID=.;OPOS=234621787;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:58:60:37:39:21:21:15:6:15:22:15:6:16:23 chr2 234621825 . T C 209.23 PASS AO=49;DP=102;FAO=49;FDP=101;FR=.;FRO=52;FSAF=7;FSAR=42;FSRF=24;FSRR=28;FWDB=-0.0339451;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.795;QD=8.28619;RBI=0.0339593;REFB=-0.0143346;REVB=-0.000980539;RO=51;SAF=7;SAR=42;SRF=23;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.389873;STB=0.726454;TYPE=snp;VARB=0.0118042;OID=.;OPOS=234621825;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:101:51:52:49:49:42:7:23:28:42:7:24:28 chr2 234622061 . C A 644.26 PASS AO=173;DP=385;FAO=173;FDP=384;FR=.;FRO=211;FSAF=80;FSAR=93;FSRF=89;FSRR=122;FWDB=0.00503344;FXX=0.00259734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.3;QD=6.71106;RBI=0.00543319;REFB=-0.00564247;REVB=0.00204551;RO=209;SAF=80;SAR=93;SRF=89;SRR=120;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0365627;STB=0.522524;TYPE=snp;VARB=0.00686129;OID=.;OPOS=234622061;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:385:384:209:211:173:173:93:80:89:120:93:80:89:122 chr2 234622110 . C G 736.81 PASS AO=180;DP=399;FAO=188;FDP=400;FR=.;FRO=212;FSAF=73;FSAR=115;FSRF=100;FSRR=112;FWDB=0.0183719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.475;QD=7.36807;RBI=0.025241;REFB=-0.00643973;REVB=-0.0173085;RO=217;SAF=65;SAR=115;SRF=102;SRR=115;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112548;STB=0.545572;TYPE=snp;VARB=0.00755619;OID=.;OPOS=234622110;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:399:400:217:212:180:188:115:65:102:115:115:73:100:112 chr2 234622282 . C T 212.74 PASS AO=86;DP=261;FAO=85;FDP=258;FR=.;FRO=173;FSAF=38;FSAR=47;FSRF=72;FSRR=101;FWDB=-0.00291635;FXX=0.0114938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.049;QD=3.29833;RBI=0.0180222;REFB=-0.0114877;REVB=-0.0177847;RO=174;SAF=38;SAR=48;SRF=73;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0265123;STB=0.521025;TYPE=snp;VARB=0.0279039;OID=.;OPOS=234622282;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:261:258:174:173:86:85:48:38:73:101:47:38:72:101 chr2 234622294 . C T 183.13 PASS AO=83;DP=272;FAO=83;FDP=273;FR=.;FRO=190;FSAF=36;FSAR=47;FSRF=79;FSRR=111;FWDB=0.0110449;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=252.815;QD=2.68319;RBI=0.0137568;REFB=0.00130835;REVB=0.00820113;RO=188;SAF=36;SAR=47;SRF=78;SRR=110;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.023067;STB=0.512753;TYPE=snp;VARB=-0.00288995;OID=.;OPOS=234622294;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:272:273:188:190:83:83:47:36:78:110:47:36:79:111 chr2 234622310 . C T 130.98 PASS AO=74;DP=276;FAO=74;FDP=277;FR=.;FRO=203;FSAF=31;FSAR=43;FSRF=87;FSRR=116;FWDB=-0.015393;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=250.776;QD=1.89135;RBI=0.020389;REFB=-0.0167171;REVB=-0.0133704;RO=202;SAF=31;SAR=43;SRF=86;SRR=116;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00867208;STB=0.507246;TYPE=snp;VARB=0.0440024;OID=.;OPOS=234622310;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:276:277:202:203:74:74:43:31:86:116:43:31:87:116 chr2 234622429 . T C 1978.29 PASS AO=209;DP=212;FAO=211;FDP=211;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=121;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00504236;FXX=0.00938923;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.062;QD=37.5031;RBI=0.017289;REFB=-0.0444991;REVB=0.0165374;RO=2;SAF=88;SAR=121;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.010702;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.24894e-05;OID=.;OPOS=234622429;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:212:211:2:0:209:211:121:88:2:0:121:90:0:0 chr2 234627487 . TC T,TT 306.33 PASS AO=17,8;DP=54;FAO=42,8;FDP=53;FR=.;FRO=3;FSAF=42,8;FSAR=0,0;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.514451,0.245391;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=12.4083,14.2329;QD=23.1194;RBI=0.514451,0.245391;REFB=-0.0268694,-0.0669232;REVB=0,0;RO=27;SAF=17,8;SAR=0,0;SRF=27;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0544601,-0.0522507;OID=.,.;OPOS=234627488,234627488;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:17,8:52:42,8:53:3:42,8:0,0:3:0:9:27:17,8:0,0:27:0 chr2 234627535 . GC G 157.9 PASS AO=15;DP=43;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.204032;FXX=0.0322477;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.9556;QD=21.0532;RBI=0.315694;REFB=-0.102797;REVB=0.240902;RO=3;SAF=14;SAR=1;SRF=3;SRR=0;SSEN=0.346804;SSEP=0;SSSB=-0.0883284;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0601676;OID=.;OPOS=234627536;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:15:19:30:30:0:25:5:0:0:12:3:14:1:3:0 chr2 234627608 . T G 121.89 PASS AO=27;DP=54;FAO=27;FDP=54;FR=.;FRO=27;FSAF=4;FSAR=23;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.0174502;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.784;QD=9.02898;RBI=0.0181563;REFB=-0.0185353;REVB=-0.00501416;RO=27;SAF=4;SAR=23;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.395245;STB=0.725222;TYPE=snp;VARB=0.0130795;OID=.;OPOS=234627608;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:27:27:27:27:23:4:13:14:23:4:13:14 chr2 234627937 . T C 3598.87 PASS AO=374;DP=381;FAO=376;FDP=376;FR=.;FRO=0;FSAF=279;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0391479;FXX=0.0599985;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3296;QD=38.2858;RBI=0.0757469;REFB=-0.0150013;REVB=0.0648462;RO=0;SAF=278;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18882e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0014925;OID=.;OPOS=234627937;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:381:376:0:0:374:376:96:278:0:0:97:279:0:0 chr2 234637803 . T C 125.58 PASS AO=26;DP=50;FAO=26;FDP=50;FR=.;FRO=24;FSAF=24;FSAR=2;FSRF=22;FSRR=2;FWDB=0.033149;FXX=0.0565931;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7921;QD=10.0464;RBI=0.0535598;REFB=-0.035032;REVB=0.042069;RO=23;SAF=24;SAR=2;SRF=22;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110476;STB=0.51063;TYPE=snp;VARB=0.03648;OID=.;OPOS=234637803;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:23:24:26:26:2:24:22:1:2:24:22:2 chr2 234637853 . G A 178.91 PASS AO=31;DP=55;FAO=34;FDP=57;FR=.;FRO=23;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=-0.00500914;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.024;QD=12.5553;RBI=0.00734046;REFB=-0.0190234;REVB=0.00536571;RO=24;SAF=21;SAR=10;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.245901;STB=0.636765;TYPE=snp;VARB=0.00755312;OID=.;OPOS=234637853;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:55:57:24:23:31:34:10:21:9:15:11:23:8:15 chr2 234637912 . T C 188.98 PASS AO=39;DP=62;FAO=35;FDP=58;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=0.0162032;FXX=0.121194;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.442;QD=13.033;RBI=0.0208325;REFB=-0.0148281;REVB=0.0130938;RO=23;SAF=21;SAR=18;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157989;STB=0.550992;TYPE=snp;VARB=0.0172476;OID=.;OPOS=234637912;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:62:58:23:23:39:35:18:21:7:16:20:15:7:16 chr2 234638249 . A G 1113.39 PASS AO=299;DP=526;FAO=228;FDP=400;FR=.;FRO=172;FSAF=98;FSAR=130;FSRF=96;FSRR=76;FWDB=0.0135817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.132;QD=11.1339;RBI=0.0135824;REFB=-0.0117236;REVB=0.000141411;RO=227;SAF=135;SAR=164;SRF=123;SRR=104;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.072146;STB=0.555404;TYPE=snp;VARB=0.00704882;OID=.;OPOS=234638249;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:526:400:227:172:299:228:164:135:123:104:130:98:96:76 chr2 234652347 . C G 145.18 PASS AO=38;DP=85;FAO=38;FDP=85;FR=.;FRO=47;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=-0.0124751;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=185.585;QD=6.83209;RBI=0.0124752;REFB=-0.0170569;REVB=-5.30333e-05;RO=47;SAF=18;SAR=20;SRF=27;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.099015;STB=0.555526;TYPE=snp;VARB=0.0193242;OID=.;OPOS=234652347;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:47:47:38:38:20:18:27:20:20:18:27:20 chr2 234688036 . C A 1230.02 PASS AO=131;DP=132;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00199887;FXX=0.00757518;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.3287;QD=37.5579;RBI=0.0352684;REFB=-0.0967018;REVB=-0.0352117;RO=1;SAF=87;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00543221;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000521224;OID=.;OPOS=234688036;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:132:131:1:0:131:131:44:87:1:0:44:87:0:0 chr2 234702459 . T C 290.52 PASS AO=79;DP=183;FAO=80;FDP=183;FR=.;FRO=103;FSAF=25;FSAR=55;FSRF=32;FSRR=71;FWDB=-0.00474103;FXX=0.00543449;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.98;QD=6.35017;RBI=0.00489376;REFB=-0.01186;REVB=-0.00121307;RO=103;SAF=24;SAR=55;SRF=32;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00822453;STB=0.501193;TYPE=snp;VARB=0.0125333;OID=.;OPOS=234702459;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:183:103:103:79:80:55:24:32:71:55:25:32:71 chr2 234703136 . T C 33.7 PASS AO=9;DP=29;FAO=10;FDP=30;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=0.0335122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.3303;QD=4.49372;RBI=0.0482869;REFB=-0.0102158;REVB=0.0347643;RO=20;SAF=8;SAR=1;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.644946;STB=0.8992;TYPE=snp;VARB=0.0659255;OID=.;OPOS=234703136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:29:30:20:20:9:10:1:8:6:14:1:9:6:14 chr2 234704318 . A G 38.41 PASS AO=20;DP=81;FAO=20;FDP=81;FR=.;FRO=61;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=30;FSRR=31;FWDB=-0.0259572;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.113;QD=1.89694;RBI=0.079038;REFB=0.0109082;REVB=-0.0746541;RO=61;SAF=10;SAR=10;SRF=30;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0100824;STB=0.506167;TYPE=snp;VARB=-0.0373989;OID=.;OPOS=234704318;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:81:81:61:61:20:20:10:10:30:31:10:10:30:31 chr2 234704690 . T C 86.76 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000926282;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=258.799;QD=38.5593;RBI=0.040482;REFB=0;REVB=0.0404714;RO=0;SAF=3;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000455865;OID=.;OPOS=234704690;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:6:3:0:0:6:3:0:0 chr2 234708428 . G A 121.96 PASS AO=39;DP=116;FAO=42;FDP=119;FR=.;FRO=77;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=35;FSRR=42;FWDB=0.0421949;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.8203;QD=4.09954;RBI=0.0735286;REFB=-0.0107326;REVB=0.0602166;RO=77;SAF=22;SAR=17;SRF=35;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125577;STB=0.560051;TYPE=snp;VARB=0.0170234;OID=.;OPOS=234708428;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:119:77:77:39:42:17:22:35:42:19:23:35:42 chr2 234710831 . G C 172.29 PASS AO=33;DP=61;FAO=34;FDP=61;FR=.;FRO=27;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=22;FWDB=0.0114008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.626;QD=11.2978;RBI=0.019095;REFB=-0.012855;REVB=-0.015318;RO=28;SAF=19;SAR=14;SRF=6;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.293111;STB=0.672802;TYPE=snp;VARB=0.00635254;OID=.;OPOS=234710831;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:28:27:33:34:14:19:6:22:14:20:5:22 chr2 234713706 . T C 417.37 PASS AO=101;DP=214;FAO=103;FDP=216;FR=.;FRO=113;FSAF=46;FSAR=57;FSRF=57;FSRR=56;FWDB=-0.0181343;FXX=0.0270258;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.449;QD=7.72904;RBI=0.0188097;REFB=-0.0122743;REVB=0.00499509;RO=109;SAF=45;SAR=56;SRF=57;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.073074;STB=0.530394;TYPE=snp;VARB=0.0106329;OID=.;OPOS=234713706;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:216:109:113:101:103:56:45:57:52:57:46:57:56 chr2 234716426 . G A 281.43 PASS AO=64;DP=128;FAO=64;FDP=127;FR=.;FRO=63;FSAF=38;FSAR=26;FSRF=12;FSRR=51;FWDB=0.0166891;FXX=0.0155027;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.169;QD=8.86392;RBI=0.0171391;REFB=-0.00211364;REVB=-0.00390147;RO=62;SAF=38;SAR=26;SRF=12;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.346528;STB=0.692325;TYPE=snp;VARB=0.0028388;OID=.;OPOS=234716426;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:127:62:63:64:64:26:38:12:50:26:38:12:51 chr2 234720572 . G A 249.03 PASS AO=40;DP=58;FAO=40;FDP=58;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=31;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.00803916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.337;QD=17.1745;RBI=0.0123777;REFB=-0.0184353;REVB=-0.00941169;RO=18;SAF=9;SAR=31;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197339;STB=0.607785;TYPE=snp;VARB=0.0156638;OID=.;OPOS=234720572;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:58:58:18:18:40:40:31:9:9:9:31:9:9:9 chr2 234725502 . T C 192.84 PASS AO=50;DP=115;FAO=51;FDP=116;FR=.;FRO=65;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=35;FSRR=30;FWDB=-0.0549508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.8;QD=6.64959;RBI=0.0784537;REFB=-0.0459603;REVB=-0.0559946;RO=64;SAF=26;SAR=24;SRF=35;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0270266;STB=0.50509;TYPE=snp;VARB=0.0472997;OID=.;OPOS=234725502;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:116:64:65:50:51:24:26:35:29:24:27:35:30 chr2 234727986 . C T 146.94 PASS AO=29;DP=52;FAO=29;FDP=52;FR=.;FRO=23;FSAF=23;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.0643145;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.3862;QD=11.3031;RBI=0.0703377;REFB=-0.0260942;REVB=0.0284789;RO=23;SAF=23;SAR=6;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152919;STB=0.585391;TYPE=snp;VARB=0.0207077;OID=.;OPOS=234727986;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:52:52:23:23:29:29:6:23:15:8:6:23:15:8 chr2 234728078 . T C 199.58 PASS AO=35;DP=55;FAO=36;FDP=59;FR=.;FRO=23;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.056439;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.5892;QD=13.531;RBI=0.0637686;REFB=0.048767;REVB=-0.0296828;RO=20;SAF=21;SAR=14;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0681411;STB=0.530286;TYPE=snp;VARB=-0.0475513;OID=.;OPOS=234728078;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:55:59:20:23:35:36:14:21:10:10:16:20:11:12 chr2 234732311 . G A 52.67 PASS AO=12;DP=24;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=-0.00175583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.257;QD=9.16073;RBI=0.0576209;REFB=-0.039606;REVB=0.0575942;RO=12;SAF=5;SAR=7;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0755114;STB=0.51721;TYPE=snp;VARB=0.0640025;OID=.;OPOS=234732311;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:24:23:12:12:12:11:7:5:4:8:7:4:4:8 chr2 234732317 . A G 52.68 PASS AO=12;DP=24;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.0122136;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=168.816;QD=9.16252;RBI=0.0655404;REFB=-0.00863604;REVB=-0.0643924;RO=12;SAF=5;SAR=7;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0755114;STB=0.51721;TYPE=snp;VARB=0.0202956;OID=.;OPOS=234732317;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:24:23:12:12:12:11:7:5:4:8:7:4:4:8 chr2 234737372 . C A 148.97 PASS AO=32;DP=62;FAO=32;FDP=62;FR=.;FRO=30;FSAF=30;FSAR=2;FSRF=24;FSRR=6;FWDB=-0.00599204;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.474;QD=9.61106;RBI=0.0213481;REFB=-0.0008595;REVB=0.0204899;RO=30;SAF=30;SAR=2;SRF=24;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.331273;STB=0.689503;TYPE=snp;VARB=0.000952969;OID=.;OPOS=234737372;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:30:30:32:32:2:30:24:6:2:30:24:6 chr2 234737539 . A G 13.35 PASS AO=4;DP=17;FAO=4;FDP=17;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=0;FSRF=13;FSRR=0;FWDB=-0.0864031;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.0976;QD=3.14144;RBI=0.0864031;REFB=-0.0501661;REVB=0;RO=13;SAF=4;SAR=0;SRF=13;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.12772;OID=.;OPOS=234737539;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:17:17:13:13:4:4:0:4:13:0:0:4:13:0 chr2 234740136 . G A 366.73 PASS AO=63;DP=99;FAO=64;FDP=100;FR=.;FRO=36;FSAF=44;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.0505972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.461;QD=14.6693;RBI=0.0593563;REFB=-0.028086;REVB=0.0310338;RO=36;SAF=44;SAR=19;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185382;STB=0.594564;TYPE=snp;VARB=0.0113047;OID=.;OPOS=234740136;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:100:36:36:63:64:19:44:16:20:20:44:16:20 chr2 234741805 . ACCC ACC,ACCT 552.2 PASS AO=33,44;DP=92;FAO=37,45;FDP=91;FR=.;FRO=9;FSAF=36,36;FSAR=1,9;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.0339576,-0.0101463;FXX=0.0108684;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=17.598,100.7;QD=24.2727;RBI=0.228438,0.0560284;REFB=-0.11813,-0.0432558;REVB=0.2259,0.0551021;RO=11;SAF=33,36;SAR=0,8;SRF=3;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0.40678,0;SSSB=0.878324,0.274177;STB=0.883124,0.627388;TYPE=del,snp;VARB=0.114292,0.00369821;OID=.,.;OPOS=234741806,234741808;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=ACC,ACCT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:33,44:90:37,45:91:9:36,36:1,9:2:7:99:11:33,36:0,8:3:8 chr2 234750542 . G C 178.97 PASS AO=63;DP=177;FAO=63;FDP=177;FR=.;FRO=114;FSAF=10;FSAR=53;FSRF=53;FSRR=61;FWDB=-0.0218618;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.931;QD=4.04441;RBI=0.0301399;REFB=-0.00865806;REVB=0.0207479;RO=114;SAF=10;SAR=53;SRF=53;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.423023;STB=0.74539;TYPE=snp;VARB=0.0224512;OID=.;OPOS=234750542;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:177:114:114:63:63:53:10:53:61:53:10:53:61 chr2 234750831 . T C 933.54 PASS AO=98;DP=100;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0521013;FXX=0.0297;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.732;QD=38.1036;RBI=0.0549829;REFB=0;REVB=0.0175664;RO=0;SAF=34;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.80716e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000240437;OID=.;OPOS=234750831;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:100:98:0:0:98:98:64:34:0:0:65:33:0:0 chr2 234758500 . G A 129.8 PASS AO=31;DP=64;FAO=31;FDP=66;FR=.;FRO=35;FSAF=4;FSAR=27;FSRF=6;FSRR=29;FWDB=-0.0194398;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9649;QD=7.86674;RBI=0.0200925;REFB=0.0255137;REVB=0.0050797;RO=33;SAF=4;SAR=27;SRF=5;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0441941;STB=0.546527;TYPE=snp;VARB=-0.0300523;OID=.;OPOS=234758500;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:66:33:35:31:31:27:4:5:28:27:4:6:29 chr2 234761225 . C T 139.36 PASS AO=59;DP=215;FAO=65;FDP=221;FR=.;FRO=156;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=66;FSRR=90;FWDB=0.0204982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.166;QD=2.52228;RBI=0.0240918;REFB=-0.00654298;REVB=-0.0126584;RO=154;SAF=28;SAR=31;SRF=64;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0730478;STB=0.559615;TYPE=snp;VARB=0.0181183;OID=.;OPOS=234761225;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:221:154:156:59:65:31:28:64:90:32:33:66:90 chr2 234762480 . A T 1206.56 PASS AO=131;DP=134;FAO=132;FDP=134;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=89;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0157972;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.126;QD=36.0168;RBI=0.0169771;REFB=-0.0612292;REVB=0.00621856;RO=3;SAF=42;SAR=89;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0327374;STB=0.511362;TYPE=snp;VARB=8.07592e-05;OID=.;OPOS=234762480;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:134:134:3:2:131:132:89:42:3:0:89:43:2:0 chr2 234775346 . G A 170.47 PASS AO=47;DP=114;FAO=48;FDP=115;FR=.;FRO=67;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=45;FSRR=22;FWDB=-0.00191259;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.45;QD=5.92952;RBI=0.052528;REFB=-0.0187021;REVB=0.0524931;RO=65;SAF=28;SAR=19;SRF=43;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0716856;STB=0.553848;TYPE=snp;VARB=0.0214627;OID=.;OPOS=234775346;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:115:65:67:47:48:19:28:43:22:20:28:45:22 chr2 234905078 . C T 347.46 PASS AO=103;DP=252;FAO=104;FDP=254;FR=.;FRO=150;FSAF=32;FSAR=72;FSRF=68;FSRR=82;FWDB=-0.0185612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.9165;QD=5.47184;RBI=0.0206105;REFB=-0.0106217;REVB=-0.00895963;RO=149;SAF=32;SAR=71;SRF=67;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159172;STB=0.593649;TYPE=snp;VARB=0.0126986;OID=.;OPOS=234905078;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:252:254:149:150:103:104:71:32:67:82:72:32:68:82 chr2 234967539 . T A 1694.44 PASS AO=175;DP=175;FAO=177;FDP=177;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.947;QD=38.2925;RBI=0.0226097;REFB=0;REVB=0.0198043;RO=0;SAF=83;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000136465;OID=.;OPOS=234967539;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:175:177:0:0:175:177:92:83:0:0:94:83:0:0 chr2 235950187 . T C 638.13 PASS AO=127;DP=221;FAO=128;FDP=222;FR=.;FRO=94;FSAF=65;FSAR=63;FSRF=50;FSRR=44;FWDB=-0.0203908;FXX=0.0044841;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.572;QD=11.4979;RBI=0.0204005;REFB=-0.0244389;REVB=-0.000630561;RO=93;SAF=65;SAR=62;SRF=49;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0117517;STB=0.51021;TYPE=snp;VARB=0.0181897;OID=.;OPOS=235950187;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:222:93:94:127:128:62:65:49:44:63:65:50:44 chr2 235951818 . TA T,TG 736.56 PASS AO=15,55;DP=75;FAO=23,57;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=9,30;FSAR=14,27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00053632,-0.0373933;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=76.8417,89.756;QD=36.8279;RBI=0.0209154,0.0401374;REFB=0,0;REVB=0.0209085,0.0145861;RO=0;SAF=6,30;SAR=9,25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.0156734,-0.00299685;OID=.,.;OPOS=235951819,235951819;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=T,TG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:15,55:74:23,57:80:0:9,30:14,27:0:0:47:0:6,30:9,25:0:0 chr2 236433161 . G A 26.39 PASS AO=10;DP=36;FAO=10;FDP=37;FR=.;FRO=27;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=9;FWDB=-0.00897349;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=115.417;QD=2.85267;RBI=0.0322474;REFB=-0.00464489;REVB=0.0309738;RO=26;SAF=5;SAR=5;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180618;STB=0.621393;TYPE=snp;VARB=0.0196948;OID=.;OPOS=236433161;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:36:37:26:27:10:10:5:5:17:9:5:5:18:9 chr2 236649675 . GGCC G 347.47 PASS AO=24;DP=93;FAO=84;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.120368;FXX=0.16665;HRUN=5;LEN=3;MLLD=15.145;QD=16.3515;RBI=0.242084;REFB=-0.0584247;REVB=0.210039;RO=33;SAF=24;SAR=0;SRF=6;SRR=27;SSEN=0.416667;SSEP=0;SSSB=0.8705;STB=0.506328;TYPE=del;VARB=0.0563367;OID=.;OPOS=236649676;OREF=GCC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:24:77:84:85:1:39:45:1:0:26:33:24:0:6:27 chr2 236683030 . AG A,AA 669.87 PASS AO=25,20;DP=84;FAO=86,14;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=39,7;FSAR=47,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.579353,0.23209;FXX=0.0291234;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=12.4218,9.28503;QD=26.7947;RBI=0.582048,0.27591;REFB=0,0;REVB=-0.0559401,0.149199;RO=32;SAF=0,12;SAR=25,8;SRF=29;SRR=3;SSEN=0.483906,0;SSEP=0.227976,0;SSSB=-0.882384,-0.380692;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.029997,-0.0680453;OID=.,.;OPOS=236683031,236683031;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:25,20:83:86,14:100:0:39,7:47,7:0:0:6:32:0,12:25,8:29:3 chr2 236691982 . A G 1839.27 PASS AO=199;DP=204;FAO=200;FDP=204;FR=.;FRO=4;FSAF=85;FSAR=115;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0467354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.7894;QD=36.0641;RBI=0.0745585;REFB=-0.183213;REVB=0.0580928;RO=2;SAF=84;SAR=115;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0112033;STB=0.503514;TYPE=snp;VARB=0.00245021;OID=.;OPOS=236691982;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:204:204:2:4:199:200:115:84:2:0:115:85:1:3 chr2 236708166 . C T 928.04 PASS AO=99;DP=101;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288257;FXX=0.00990001;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.664;QD=37.1214;RBI=0.0390743;REFB=-0.12738;REVB=0.0263795;RO=2;SAF=11;SAR=88;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106594;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000686484;OID=.;OPOS=236708166;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:101:100:2:0:99:100:88:11:0:2:89:11:0:0 chr2 236761396 . C T 392.41 PASS AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0371567;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=107.236;QD=37.3719;RBI=0.0423842;REFB=0;REVB=-0.0203912;RO=0;SAF=15;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.13648e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000103264;OID=.;OPOS=236761396;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:42:42:0:0:42:42:27:15:0:0:27:15:0:0 chr2 237149941 . C T 1482.12 PASS AO=154;DP=155;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0302975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.178;QD=38.2484;RBI=0.0311679;REFB=0;REVB=0.00731429;RO=0;SAF=79;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.23797e-05;OID=.;OPOS=237149941;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:155:155:0:0:154:155:75:79:0:0:74:81:0:0 chr2 237150166 . A C 1313.37 PASS AO=137;DP=138;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0042942;FXX=0.00714235;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.477;QD=37.7948;RBI=0.00733509;REFB=-0.0783629;REVB=0.00594671;RO=1;SAF=52;SAR=85;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00556068;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000249962;OID=.;OPOS=237150166;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:138:139:1:0:137:139:85:52:0:1:85:54:0:0 chr2 237489904 . C T 212.13 PASS AO=46;DP=93;FAO=48;FDP=95;FR=.;FRO=47;FSAF=14;FSAR=34;FSRF=17;FSRR=30;FWDB=-0.0241948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.255;QD=8.93177;RBI=0.029448;REFB=0.00329467;REVB=0.0167868;RO=47;SAF=13;SAR=33;SRF=17;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0849155;STB=0.540495;TYPE=snp;VARB=-0.00236025;OID=.;OPOS=237489904;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:95:47:47:46:48:33:13:17:30:34:14:17:30 chr2 237923852 . G A 187.96 PASS AO=35;DP=95;FAO=50;FDP=107;FR=.;FRO=57;FSAF=19;FSAR=31;FSRF=29;FSRR=28;FWDB=0.0133898;FXX=0.0360328;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.105;QD=7.0264;RBI=0.020377;REFB=-0.009352;REVB=0.0153602;RO=60;SAF=13;SAR=22;SRF=28;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108515;STB=0.570305;TYPE=snp;VARB=0.0123178;OID=.;OPOS=237923852;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:107:60:57:35:50:22:13:28:32:31:19:29:28 chr2 238166147 . G A 45.29 PASS AO=11;DP=28;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=-0.0133915;FXX=0.0357015;HRUN=2;LEN=1;MLLD=248.851;QD=6.70931;RBI=0.0253602;REFB=-0.000474061;REVB=0.0215362;RO=16;SAF=4;SAR=7;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207001;STB=0.619962;TYPE=snp;VARB=0.00076068;OID=.;OPOS=238166147;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:28:27:16:16:11:11:7:4:3:13:7:4:3:13 chr2 238233483 . G A 309.92 PASS AO=55;DP=88;FAO=56;FDP=88;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=37;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=0.000443563;FXX=0.0537577;HRUN=4;LEN=1;MLLD=147.952;QD=14.0873;RBI=0.00842278;REFB=-0.0314321;REVB=-0.00841109;RO=29;SAF=19;SAR=36;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0705885;STB=0.538821;TYPE=snp;VARB=0.0178718;OID=.;OPOS=238233483;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:29:32:55:56:36:19:13:16:37:19:14:18 chr2 238243285 . G A 208.72 PASS AO=49;DP=102;FAO=49;FDP=101;FR=.;FRO=52;FSAF=33;FSAR=16;FSRF=33;FSRR=19;FWDB=-0.0268025;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.1253;QD=8.26624;RBI=0.0585879;REFB=-0.0276276;REVB=0.0520976;RO=52;SAF=33;SAR=16;SRF=33;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0402744;STB=0.522379;TYPE=snp;VARB=0.0214082;OID=.;OPOS=238243285;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:101:52:52:49:49:16:33:33:19:16:33:33:19 chr2 238243292 . G A 253.38 PASS AO=56;DP=109;FAO=56;FDP=109;FR=.;FRO=53;FSAF=35;FSAR=21;FSRF=35;FSRR=18;FWDB=-0.00186658;FXX=0.00909008;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.941;QD=9.29845;RBI=0.0237921;REFB=-0.020227;REVB=-0.0237188;RO=52;SAF=35;SAR=21;SRF=34;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0271043;STB=0.518512;TYPE=snp;VARB=0.0229876;OID=.;OPOS=238243292;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:52:53:56:56:21:35:34:18:21:35:35:18 chr2 238243464 . C G 658.59 PASS AO=58;DP=59;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0744965;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=39.3203;QD=37.1035;RBI=0.115464;REFB=0;REVB=-0.0882166;RO=1;SAF=22;SAR=36;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0209573;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000107467;OID=.;OPOS=238243464;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:59:71:1:0:58:71:36:22:1:0:36:35:0:0 chr2 238244963 . A G 1316.45 PASS AO=137;DP=138;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=114;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00445535;FXX=0.00724585;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.376;QD=38.4364;RBI=0.0123818;REFB=0;REVB=0.0115525;RO=0;SAF=114;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.37938e-05;OID=.;OPOS=238244963;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:138:137:0:0:137:137:23:114:0:0:23:114:0:0 chr2 238249630 . C T 272.87 PASS AO=48;DP=78;FAO=49;FDP=79;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=35;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=0.0412795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.017;QD=13.816;RBI=0.0420083;REFB=-0.0497316;REVB=-0.00779143;RO=30;SAF=14;SAR=34;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114241;STB=0.564826;TYPE=snp;VARB=0.0291096;OID=.;OPOS=238249630;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:79:30:30:48:49:34:14:13:17:35:14:13:17 chr2 238253149 . G A 257.28 PASS AO=57;DP=113;FAO=58;FDP=114;FR=.;FRO=56;FSAF=15;FSAR=43;FSRF=23;FSRR=33;FWDB=-0.0326589;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.733;QD=9.02737;RBI=0.0362368;REFB=-0.00752313;REVB=-0.0157004;RO=56;SAF=15;SAR=42;SRF=23;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155902;STB=0.589009;TYPE=snp;VARB=0.0109357;OID=.;OPOS=238253149;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:114:56:56:57:58:42:15:23:33:43:15:23:33 chr2 238257013 . G A 197.32 PASS AO=48;DP=102;FAO=48;FDP=102;FR=.;FRO=54;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=27;FSRR=27;FWDB=0.0648793;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.2473;QD=7.73794;RBI=0.101753;REFB=-0.0190268;REVB=0.0783863;RO=52;SAF=23;SAR=25;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00150183;STB=0.511034;TYPE=snp;VARB=0.0272941;OID=.;OPOS=238257013;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:52:54:48:48:25:23:25:27:25:23:27:27 chr2 238258814 . C G 181.55 PASS AO=50;DP=118;FAO=50;FDP=118;FR=.;FRO=68;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=20;FSRR=48;FWDB=-0.0127564;FXX=0.00840265;HRUN=3;LEN=1;MLLD=237.693;QD=6.15435;RBI=0.0138757;REFB=-0.00480298;REVB=0.00545984;RO=67;SAF=21;SAR=29;SRF=20;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1308;STB=0.576236;TYPE=snp;VARB=0.0063654;OID=.;OPOS=238258814;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:67:68:50:50:29:21:20:47:29:21:20:48 chr2 238267717 . C T 1822.98 PASS AO=195;DP=201;FAO=196;FDP=199;FR=.;FRO=3;FSAF=107;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0344055;FXX=0.0148508;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.058;QD=36.6428;RBI=0.0350152;REFB=-0.0317468;REVB=-0.00650608;RO=3;SAF=107;SAR=88;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0159553;STB=0.508286;TYPE=snp;VARB=7.42381e-05;OID=.;OPOS=238267717;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:201:199:3:3:195:196:88:107:0:3:89:107:0:3 chr2 238277795 . A G 1062.12 PASS AO=110;DP=110;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170518;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.1231;QD=38.6224;RBI=0.0170783;REFB=0;REVB=-0.000950445;RO=0;SAF=33;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.12674e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000109541;OID=.;OPOS=238277795;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:110:110:0:0:110:110:77:33:0:0:77:33:0:0 chr2 238287746 . C T 393.47 PASS AO=94;DP=192;FAO=94;FDP=192;FR=.;FRO=98;FSAF=44;FSAR=50;FSRF=56;FSRR=42;FWDB=-0.0111911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.3855;QD=8.1972;RBI=0.0126451;REFB=-0.010122;REVB=-0.00588704;RO=94;SAF=44;SAR=50;SRF=52;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0773041;STB=0.552597;TYPE=snp;VARB=0.00665571;OID=.;OPOS=238287746;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:192:94:98:94:94:50:44:52:42:50:44:56:42 chr2 238434249 . C T 65.32 PASS AO=16;DP=41;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.0279309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.0222;QD=6.22114;RBI=0.0628576;REFB=0.0251488;REVB=0.0563111;RO=24;SAF=4;SAR=12;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.359901;STB=0.70883;TYPE=snp;VARB=-0.0272286;OID=.;OPOS=238434249;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:41:42:24:25:16:17:12:4:14:10:13:4:14:11 chr2 238443226 . A G 156.64 PASS AO=40;DP=89;FAO=40;FDP=90;FR=.;FRO=50;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=32;FSRR=18;FWDB=0.0101655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.339;QD=6.96188;RBI=0.047823;REFB=-0.0105446;REVB=-0.0467301;RO=49;SAF=17;SAR=23;SRF=31;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201912;STB=0.617815;TYPE=snp;VARB=0.016297;OID=.;OPOS=238443226;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:90:49:50:40:40:23:17:31:18:23:17:32:18 chr2 238449007 . T C 149.2 PASS AO=28;DP=48;FAO=28;FDP=48;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=4;FWDB=0.0177243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.393;QD=12.4329;RBI=0.0562978;REFB=-0.0195769;REVB=0.053435;RO=20;SAF=9;SAR=19;SRF=16;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.355744;STB=0.696343;TYPE=snp;VARB=0.015629;OID=.;OPOS=238449007;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:48:48:20:20:28:28:19:9:16:4:19:9:16:4 chr2 238449023 . T C 97.31 PASS AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=4;FWDB=0.0124059;FXX=0.0454442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.394;QD=9.26783;RBI=0.029159;REFB=-0.0168219;REVB=0.0263883;RO=21;SAF=6;SAR=15;SRF=17;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.448359;STB=0.751406;TYPE=snp;VARB=0.00994035;OID=.;OPOS=238449023;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:43:42:21:21:21:21:15:6:17:4:15:6:17:4 chr2 238449107 . A G 113.49 PASS AO=22;DP=39;FAO=22;FDP=40;FR=.;FRO=18;FSAF=2;FSAR=20;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.0207885;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.8135;QD=11.3485;RBI=0.0516996;REFB=-0.00576875;REVB=-0.0473358;RO=16;SAF=2;SAR=20;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.564029;STB=0.827659;TYPE=snp;VARB=0.00225795;OID=.;OPOS=238449107;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:39:40:16:18:22:22:20:2:10:6:20:2:11:7 chr2 238461773 . G A 289.76 PASS AO=72;DP=153;FAO=72;FDP=153;FR=.;FRO=81;FSAF=35;FSAR=37;FSRF=32;FSRR=49;FWDB=-0.0126851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.6297;QD=7.57542;RBI=0.0141294;REFB=-0.0375987;REVB=-0.00622335;RO=81;SAF=35;SAR=37;SRF=32;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.087417;STB=0.548356;TYPE=snp;VARB=0.0432742;OID=.;OPOS=238461773;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:153:81:81:72:72:37:35:32:49:37:35:32:49 chr2 238462324 . A G 206.82 PASS AO=60;DP=146;FAO=60;FDP=146;FR=.;FRO=86;FSAF=14;FSAR=46;FSRF=32;FSRR=54;FWDB=0.0187565;FXX=0.00680226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.929;QD=5.66624;RBI=0.0193797;REFB=-0.0176239;REVB=0.00487497;RO=86;SAF=14;SAR=46;SRF=32;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179646;STB=0.601784;TYPE=snp;VARB=0.0184434;OID=.;OPOS=238462324;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:86:86:60:60:46:14:32:54:46:14:32:54 chr2 238483164 . T C 54.24 PASS AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=-0.0431461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9271;QD=8.34513;RBI=0.0546394;REFB=-0.0318926;REVB=-0.0335243;RO=14;SAF=8;SAR=4;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.402532;STB=0.731348;TYPE=snp;VARB=0.026189;OID=.;OPOS=238483164;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:26:26:14:14:12:12:4:8:3:11:4:8:3:11 chr2 238483671 . G A 12.57 PASS AO=4;DP=18;FAO=4;FDP=18;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.0268594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.105;QD=2.79323;RBI=0.0596807;REFB=0.0141134;REVB=0.053295;RO=13;SAF=2;SAR=2;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0426709;STB=0.555282;TYPE=snp;VARB=-0.0375207;OID=.;OPOS=238483671;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:18:18:13:14:4:4:2:2:7:6:2:2:8:6 chr2 238483729 . A G 13.38 PASS AO=4;DP=17;FAO=4;FDP=17;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.0522089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.735;QD=3.14789;RBI=0.0711716;REFB=-0.0283042;REVB=-0.0483696;RO=12;SAF=2;SAR=2;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0918015;STB=0.529265;TYPE=snp;VARB=0.0712719;OID=.;OPOS=238483729;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:17:17:12:13:4:4:2:2:7:5:2:2:7:6 chr2 238485251 . G A 259.17 PASS AO=52;DP=91;FAO=53;FDP=93;FR=.;FRO=40;FSAF=17;FSAR=36;FSRF=13;FSRR=27;FWDB=0.0123214;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=133.182;QD=11.147;RBI=0.019183;REFB=-0.0134287;REVB=0.0147027;RO=39;SAF=17;SAR=35;SRF=13;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00568691;STB=0.502091;TYPE=snp;VARB=0.00775001;OID=.;OPOS=238485251;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:93:39:40:52:53:35:17:13:26:36:17:13:27 chr2 238494742 . A G 81.68 PASS AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=-0.0314637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.8188;QD=8.82977;RBI=0.110575;REFB=0.00423936;REVB=-0.106004;RO=18;SAF=4;SAR=14;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129032;STB=0.56444;TYPE=snp;VARB=-0.00913999;OID=.;OPOS=238494742;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:37:37:18:19:18:18:14:4:6:12:14:4:6:13 chr2 238499866 . C T 82.06 PASS AO=31;DP=96;FAO=31;FDP=96;FR=.;FRO=65;FSAF=30;FSAR=1;FSRF=57;FSRR=8;FWDB=0.0317535;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.822;QD=3.41915;RBI=0.0636646;REFB=0.00661808;REVB=-0.0551806;RO=65;SAF=30;SAR=1;SRF=57;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.414577;STB=0.756068;TYPE=snp;VARB=-0.00360446;OID=.;OPOS=238499866;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:96:96:65:65:31:31:1:30:57:8:1:30:57:8 chr2 238500642 . A G 185.13 PASS AO=37;DP=66;FAO=37;FDP=66;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=25;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=0.015128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.043;QD=11.2199;RBI=0.0153639;REFB=-0.00637101;REVB=-0.00268204;RO=29;SAF=12;SAR=25;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0489621;STB=0.527025;TYPE=snp;VARB=0.0100925;OID=.;OPOS=238500642;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:29:29:37:37:25:12:11:18:25:12:11:18 chr2 238503559 . C G 330.95 PASS AO=79;DP=162;FAO=79;FDP=162;FR=.;FRO=83;FSAF=51;FSAR=28;FSRF=51;FSRR=32;FWDB=-0.0102168;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.75;QD=8.17167;RBI=0.0565733;REFB=-0.0201649;REVB=-0.0556431;RO=83;SAF=51;SAR=28;SRF=51;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0312208;STB=0.517237;TYPE=snp;VARB=0.0232727;OID=.;OPOS=238503559;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:162:83:83:79:79:28:51:51:32:28:51:51:32 chr2 238668783 . A G 283 PASS AO=77;DP=176;FAO=77;FDP=176;FR=.;FRO=99;FSAF=35;FSAR=42;FSRF=40;FSRR=59;FWDB=0.0355725;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.2123;QD=6.4317;RBI=0.0501009;REFB=0.0251443;REVB=0.0352802;RO=99;SAF=35;SAR=42;SRF=40;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0517192;STB=0.528788;TYPE=snp;VARB=-0.0362639;OID=.;OPOS=238668783;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:176:99:99:77:77:42:35:40:59:42:35:40:59 chr2 238668802 . A G 270.37 PASS AO=74;DP=170;FAO=74;FDP=171;FR=.;FRO=97;FSAF=31;FSAR=43;FSRF=42;FSRR=55;FWDB=-0.0142532;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=142.27;QD=6.32446;RBI=0.0274021;REFB=-0.00498743;REVB=-0.0234034;RO=95;SAF=31;SAR=43;SRF=40;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00220885;STB=0.508173;TYPE=snp;VARB=0.00615861;OID=.;OPOS=238668802;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:171:95:97:74:74:43:31:40:55:43:31:42:55 chr2 238672425 . G C 452.45 PASS AO=63;DP=123;FAO=70;FDP=109;FR=.,HEALED;FRO=30;FSAF=26;FSAR=44;FSRF=30;FSRR=0;FWDB=-0.034495;FXX=0.106549;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.1687;QD=16.6035;RBI=0.06833;REFB=-0.0902453;REVB=0.0589837;RO=12;SAF=21;SAR=42;SRF=12;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207936;STB=0.682877;TYPE=snp;VARB=0.00966459;OID=.;OPOS=238672425;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:114:109:12:30:63:70:42:21:12:0:44:26:30:0 chr2 238672703 . C G 52.22 PASS AO=14;DP=35;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=18;FWDB=0.00104082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.029;QD=5.80178;RBI=0.00628637;REFB=-0.00361595;REVB=-0.00619961;RO=21;SAF=3;SAR=11;SRF=4;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0373098;STB=0.530446;TYPE=snp;VARB=0.00468793;OID=.;OPOS=238672703;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:35:36:21:22:14:14:11:3:4:17:11:3:4:18 chr2 238672938 . T C 190.56 PASS AO=60;DP=159;FAO=61;FDP=159;FR=.;FRO=98;FSAF=14;FSAR=47;FSRF=40;FSRR=58;FWDB=-0.00061826;FXX=0.00624961;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.8444;QD=4.79401;RBI=0.00248518;REFB=0.0123546;REVB=0.00240704;RO=98;SAF=14;SAR=46;SRF=40;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228007;STB=0.633186;TYPE=snp;VARB=-0.017935;OID=.;OPOS=238672938;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:159:98:98:60:61:46:14:40:58:47:14:40:58 chr2 238673302 . T A 134.87 PASS AO=34;DP=86;FAO=37;FDP=88;FR=.;FRO=51;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=30;FWDB=0.0169474;FXX=0.0222198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.178;QD=6.13052;RBI=0.023269;REFB=-0.00964396;REVB=0.0159447;RO=52;SAF=17;SAR=17;SRF=21;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102277;STB=0.543415;TYPE=snp;VARB=0.014262;OID=.;OPOS=238673302;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:88:52:51:34:37:17:17:21:31:19:18:21:30 chr2 238678616 . G A 453.16 PASS AO=117;DP=253;FAO=117;FDP=253;FR=.;FRO=136;FSAF=50;FSAR=67;FSRF=55;FSRR=81;FWDB=0.00817735;FXX=0.00784283;HRUN=3;LEN=1;MLLD=173.445;QD=7.16459;RBI=0.0231581;REFB=-0.00117788;REVB=0.0216663;RO=136;SAF=50;SAR=67;SRF=55;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0228861;STB=0.512641;TYPE=snp;VARB=0.00124426;OID=.;OPOS=238678616;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:253:253:136:136:117:117:67:50:55:81:67:50:55:81 chr2 238820380 . G A 71.28 PASS AO=17;DP=39;FAO=18;FDP=43;FR=.;FRO=25;FSAF=3;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.0634942;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.339;QD=6.63095;RBI=0.069101;REFB=-0.0315756;REVB=0.0272659;RO=22;SAF=3;SAR=14;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.419063;STB=0.727867;TYPE=snp;VARB=0.036152;OID=.;OPOS=238820380;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:39:43:22:25:17:18:14:3:12:10:15:3:12:13 chr2 238903399 . G A 240.31 PASS AO=52;DP=101;FAO=52;FDP=100;FR=.;FRO=48;FSAF=20;FSAR=32;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=-0.00758658;FXX=0.0196059;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.43;QD=9.61248;RBI=0.00814228;REFB=-0.0106556;REVB=0.00295645;RO=48;SAF=20;SAR=32;SRF=21;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0479794;STB=0.526474;TYPE=snp;VARB=0.0101166;OID=.;OPOS=238903399;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:100:48:48:52:52:32:20:21:27:32:20:21:27 chr2 238991733 . C A 266.05 PASS AO=62;DP=125;FAO=62;FDP=125;FR=.;FRO=63;FSAF=36;FSAR=26;FSRF=36;FSRR=27;FWDB=-0.0299793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.798;QD=8.51354;RBI=0.0343897;REFB=-0.0252878;REVB=0.0168491;RO=63;SAF=36;SAR=26;SRF=36;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00861936;STB=0.50476;TYPE=snp;VARB=0.0185685;OID=.;OPOS=238991733;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:63:63:62:62:26:36:36:27:26:36:36:27 chr2 238991796 . C T 561.12 PASS AO=127;DP=250;FAO=128;FDP=250;FR=.;FRO=122;FSAF=67;FSAR=61;FSRF=61;FSRR=61;FWDB=-0.00363669;FXX=0.00398391;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.572;QD=8.97799;RBI=0.0239795;REFB=0.00344477;REVB=0.0237022;RO=118;SAF=67;SAR=60;SRF=57;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0392088;STB=0.511449;TYPE=snp;VARB=-0.00503896;OID=.;OPOS=238991796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:250:250:118:122:127:128:60:67:57:61:61:67:61:61 chr2 238999883 . T C 439.07 PASS AO=108;DP=229;FAO=109;FDP=229;FR=.;FRO=120;FSAF=55;FSAR=54;FSRF=65;FSRR=55;FWDB=-0.00238883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.789;QD=7.6694;RBI=0.0452154;REFB=-0.00966886;REVB=0.0451523;RO=120;SAF=55;SAR=53;SRF=65;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0309475;STB=0.519435;TYPE=snp;VARB=0.00991323;OID=.;OPOS=238999883;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:229:229:120:120:108:109:53:55:65:55:54:55:65:55 chr2 239007997 . A G 251.02 PASS AO=73;DP=191;FAO=81;FDP=208;FR=.;FRO=127;FSAF=24;FSAR=57;FSRF=50;FSRR=77;FWDB=-0.0272079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.951;QD=4.82735;RBI=0.0272095;REFB=-0.00863261;REVB=0.000289803;RO=116;SAF=22;SAR=51;SRF=45;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106003;STB=0.567376;TYPE=snp;VARB=0.0146636;OID=.;OPOS=239007997;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:191:208:116:127:73:81:51:22:45:71:57:24:50:77 chr2 239009136 . GC G 82.53 PASS AO=9;DP=20;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.100434;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=10.9154;QD=18.3393;RBI=0.391061;REFB=0.0259631;REVB=0.377944;RO=6;SAF=2;SAR=7;SRF=1;SRR=5;SSEN=0.226804;SSEP=0;SSSB=0.057902;STB=0.545399;TYPE=del;VARB=0.0605715;OID=.;OPOS=239009137;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:9:16:17:18:1:5:12:1:0:5:6:2:7:1:5 chr2 239016539 . C G 263.82 PASS AO=62;DP=126;FAO=62;FDP=126;FR=.;FRO=64;FSAF=29;FSAR=33;FSRF=41;FSRR=23;FWDB=-0.016007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.7386;QD=8.37534;RBI=0.0634124;REFB=-0.0175355;REVB=0.0613589;RO=63;SAF=29;SAR=33;SRF=41;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166079;STB=0.587161;TYPE=snp;VARB=0.02251;OID=.;OPOS=239016539;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:63:64:62:62:33:29:41:22:33:29:41:23 chr2 239039841 . A G 15.48 PASS AO=3;DP=8;FAO=3;FDP=8;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.00319413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.997;QD=7.73807;RBI=0.0708554;REFB=-0.00818003;REVB=0.0707834;RO=5;SAF=2;SAR=1;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.462295;STB=0.776677;TYPE=snp;VARB=0.055808;OID=.;OPOS=239039841;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:8:8:5:5:3:3:1:2:5:0:1:2:5:0 chr2 239039896 . G C 71.24 PASS AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=4;FWDB=-0.00743404;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.0937;QD=8.38065;RBI=0.163429;REFB=0.00840873;REVB=-0.16326;RO=18;SAF=5;SAR=11;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.414781;STB=0.735637;TYPE=snp;VARB=-0.021342;OID=.;OPOS=239039896;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:34:34:18:18:16:16:11:5:14:4:11:5:14:4 chr2 239040187 . T C 132.44 PASS AO=20;DP=26;FAO=20;FDP=26;FR=.;FRO=6;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.00916795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.624;QD=20.3759;RBI=0.0123846;REFB=-0.054112;REVB=0.00832623;RO=6;SAF=15;SAR=5;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129507;STB=0.571353;TYPE=snp;VARB=0.0330127;OID=.;OPOS=239040187;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:26:26:6:6:20:20:5:15:3:3:5:15:3:3 chr2 239050033 . C T 10.47 PASS AO=2;DP=6;FAO=2;FDP=6;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0667286;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.1166;QD=6.9808;RBI=0.0667286;REFB=-0.018381;REVB=0;RO=4;SAF=2;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0478591;OID=.;OPOS=239050033;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:4:4:2:2:0:2:4:0:0:2:4:0 chr2 239051550 . T C 97.87 PASS AO=26;DP=64;FAO=27;FDP=64;FR=.;FRO=37;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=14;FSRR=23;FWDB=0.0285612;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=98.516;QD=6.11692;RBI=0.0306595;REFB=-0.0123863;REVB=-0.0111475;RO=38;SAF=7;SAR=19;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151366;STB=0.554335;TYPE=snp;VARB=0.0267434;OID=.;OPOS=239051550;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:64:64:38:37:26:27:19:7:15:23:19:8:14:23 chr2 239051575 . G A 158.28 PASS AO=34;DP=69;FAO=35;FDP=70;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=8;FSRR=27;FWDB=-0.00949581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.009;QD=9.04479;RBI=0.0121046;REFB=-0.00528125;REVB=0.00750667;RO=35;SAF=11;SAR=23;SRF=8;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103146;STB=0.551594;TYPE=snp;VARB=0.00525649;OID=.;OPOS=239051575;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:70:35:35:34:35:23:11:8:27:24:11:8:27 chr2 239059484 . T C 28.46 PASS AO=9;DP=30;FAO=9;FDP=30;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.0250215;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.5883;QD=3.79493;RBI=0.0419208;REFB=-0.0562753;REVB=0.0336344;RO=21;SAF=6;SAR=3;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.365064;STB=0.722937;TYPE=snp;VARB=0.0821674;OID=.;OPOS=239059484;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:30:30:21:21:9:9:3:6:7:14:3:6:7:14 chr2 239079542 . A G 44.15 PASS AO=23;DP=89;FAO=23;FDP=91;FR=.;FRO=68;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=51;FWDB=0.0124289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.334;QD=1.94075;RBI=0.0124711;REFB=0.00353216;REVB=0.00102554;RO=65;SAF=10;SAR=13;SRF=17;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226986;STB=0.645701;TYPE=snp;VARB=-0.0128418;OID=.;OPOS=239079542;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:89:91:65:68:23:23:13:10:17:48:13:10:17:51 chr2 239133980 . C T 194.43 PASS AO=33;DP=51;FAO=33;FDP=51;FR=.;FRO=18;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=-0.00329403;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=112.077;QD=15.2493;RBI=0.0237302;REFB=-0.0150227;REVB=0.0235005;RO=18;SAF=18;SAR=15;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116567;STB=0.563599;TYPE=snp;VARB=0.00329503;OID=.;OPOS=239133980;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:51:51:18:18:33:33:15:18:13:5:15:18:13:5 chr2 239134056 . A G 183.49 PASS AO=39;DP=92;FAO=46;FDP=99;FR=.;FRO=53;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=27;FSRR=26;FWDB=0.00578417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.741;QD=7.41368;RBI=0.019394;REFB=-0.0201049;REVB=0.0185113;RO=53;SAF=22;SAR=17;SRF=27;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0562842;STB=0.516689;TYPE=snp;VARB=0.0269007;OID=.;OPOS=239134056;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:99:53:53:39:46:17:22:27:26:24:22:27:26 chr2 239134063 . G T 172.61 PASS AO=22;DP=98;FAO=44;FDP=93;FR=.,HEALED;FRO=48;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=-0.0354058;FXX=0.0106372;HRUN=3;LEN=1;MLLD=96.9566;QD=7.42388;RBI=0.0766333;REFB=-0.061838;REVB=-0.0679639;RO=27;SAF=20;SAR=2;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.645779;STB=0.533548;TYPE=snp;VARB=0.0078076;OID=.;OPOS=239134063;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:93:27:48:22:44:2:20:9:18:21:23:22:26 chr2 239134138 . A C 190.61 PASS AO=43;DP=78;FAO=40;FDP=76;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=-0.00577842;FXX=0.0256377;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.003;QD=10.032;RBI=0.0102675;REFB=-0.00940549;REVB=-0.00848716;RO=34;SAF=18;SAR=25;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0425158;STB=0.547921;TYPE=snp;VARB=0.00921889;OID=.;OPOS=239134138;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:76:34:36:43:40:25:18:16:18:25:15:17:19 chr2 239139883 . G C 215.67 PASS AO=47;DP=91;FAO=47;FDP=91;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=31;FSRF=7;FSRR=37;FWDB=-0.0159308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.4507;QD=9.48014;RBI=0.0538685;REFB=0.0144013;REVB=0.051459;RO=44;SAF=16;SAR=31;SRF=7;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190255;STB=0.604069;TYPE=snp;VARB=-0.00661672;OID=.;OPOS=239139883;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:44:44:47:47:31:16:7:37:31:16:7:37 chr2 239140728 . A G 931.53 PASS AO=228;DP=432;FAO=210;FDP=400;FR=.;FRO=190;FSAF=105;FSAR=105;FSRF=92;FSRR=98;FWDB=-0.0339465;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.5654;QD=9.31529;RBI=0.0794046;REFB=-0.0133469;REVB=-0.0717825;RO=204;SAF=114;SAR=114;SRF=97;SRR=107;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.021243;STB=0.507499;TYPE=snp;VARB=0.0103203;OID=.;OPOS=239140728;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:432:400:204:190:228:210:114:114:97:107:105:105:92:98 chr2 239155053 . C T 346.67 PASS AO=90;DP=199;FAO=91;FDP=199;FR=.;FRO=108;FSAF=37;FSAR=54;FSRF=53;FSRR=55;FWDB=-0.00323199;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3845;QD=6.96829;RBI=0.0638704;REFB=-0.0125057;REVB=0.0637885;RO=109;SAF=37;SAR=53;SRF=53;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0753921;STB=0.546487;TYPE=snp;VARB=0.0166245;OID=.;OPOS=239155053;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:199:199:109:108:90:91:53:37:53:56:54:37:53:55 chr2 239237953 . G T 351.1 PASS AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0511274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.5491;QD=37.9562;RBI=0.157684;REFB=0;REVB=0.149165;RO=0;SAF=27;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.67388e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00436603;OID=.;OPOS=239237953;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:37:37:0:0:37:37:10:27:0:0:10:27:0:0 chr2 239321367 . A T 1816.75 PASS AO=182;DP=183;FAO=196;FDP=196;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00618106;FXX=0.0101005;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.778;QD=37.0766;RBI=0.0163846;REFB=0;REVB=0.015174;RO=1;SAF=82;SAR=100;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00577075;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000142286;OID=.;OPOS=239321367;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:183:196:1:0:182:196:100:82:1:0:110:86:0:0 chr2 239990554 . G A 12.85 PASS AO=5;DP=24;FAO=5;FDP=24;FR=.;FRO=19;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=-0.00213072;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.836;QD=2.14132;RBI=0.0089827;REFB=-0.00259309;REVB=-0.00872633;RO=19;SAF=1;SAR=4;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173399;STB=0.621684;TYPE=snp;VARB=0.0139596;OID=.;OPOS=239990554;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:24:24:19:19:5:5:4:1:6:13:4:1:6:13 chr2 240003870 . G A 940.18 PASS AO=108;DP=115;FAO=108;FDP=115;FR=.;FRO=7;FSAF=69;FSAR=39;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.0117771;FXX=0.0170926;HRUN=4;LEN=1;MLLD=193.615;QD=32.7019;RBI=0.0739536;REFB=-0.140484;REVB=0.0730098;RO=7;SAF=69;SAR=39;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00944682;STB=0.504986;TYPE=snp;VARB=0.000902023;OID=.;OPOS=240003870;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:115:115:7:7:108:108:39:69:5:2:39:69:5:2 chr2 240083528 . G A 10.41 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=32.9983;QD=5.94665;RBI=0.0604906;REFB=-0.038357;REVB=-0.0604906;RO=5;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0604136;OID=.;OPOS=240083528;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:5:5:2:2:2:0:0:5:2:0:0:5 chr2 240923077 . GC G 770.01 PASS AO=101;DP=155;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.151462;FXX=0.00689608;HRUN=4;LEN=1;MLLD=11.9289;QD=21.3893;RBI=0.262149;REFB=0.0079324;REVB=0.213966;RO=26;SAF=44;SAR=57;SRF=8;SRR=18;SSEN=0.665025;SSEP=0;SSSB=0.0503855;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00518096;OID=.;OPOS=240923078;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:101:144:144:144:0:64:80:0:0:62:26:44:57:8:18 chr2 240961728 . T C 354.81 PASS AO=84;DP=173;FAO=85;FDP=176;FR=.;FRO=91;FSAF=40;FSAR=45;FSRF=39;FSRR=52;FWDB=0.0229602;FXX=0.048646;HRUN=3;LEN=1;MLLD=134.223;QD=8.06394;RBI=0.0748802;REFB=-0.0129359;REVB=-0.0712733;RO=89;SAF=40;SAR=44;SRF=38;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0461401;STB=0.521851;TYPE=snp;VARB=0.0122477;OID=.;OPOS=240961728;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:176:89:91:84:85:44:40:38:51:45:40:39:52 chr2 241390002 . A G 252.01 PASS AO=52;DP=258;FAO=93;FDP=246;FR=.,HEALED;FRO=153;FSAF=29;FSAR=64;FSRF=54;FSRR=99;FWDB=0.0087977;FXX=0.039061;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.1147;QD=4.0977;RBI=0.0418093;REFB=-0.0123977;REVB=-0.0408732;RO=147;SAF=28;SAR=24;SRF=49;SRR=98;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253094;STB=0.52913;TYPE=snp;VARB=0.025689;OID=.;OPOS=241390002;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:257:246:147:153:52:93:24:28:49:98:64:29:54:99 chr2 241390516 . C T 70.49 PASS AO=20;DP=52;FAO=20;FDP=52;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=0.00544352;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.889;QD=5.42264;RBI=0.0554642;REFB=-0.0261403;REVB=-0.0551964;RO=30;SAF=10;SAR=10;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209668;STB=0.596061;TYPE=snp;VARB=0.0250198;OID=.;OPOS=241390516;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:52:52:30:32:20:20:10:10:9:21:10:10:11:21 chr2 241404310 . AGGGC AGGC,AGG 119.78 PASS AO=9,5;DP=24;FAO=0,18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=0,11;FSAR=0,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.152726,-0.188013;FXX=0.142789;HRUN=3,3;LEN=1,2;MLLD=12.4081,27.3042;QD=26.6186;RBI=0.564522,0.277574;REFB=0,0;REVB=0.543471,0.204202;RO=9;SAF=8,4;SAR=1,1;SRF=3;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.559542,0.47111;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=-0.0109806,0.00686163;OID=.,.;OPOS=241404311,241404313;OREF=G,GC;OALT=-,-;OMAPALT=AGGC,AGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:9,5:23:0,18:18:0:0,11:0,7:0:0:11:9:8,4:1,1:3:6 chr2 241404317 . C T 163.11 PASS AO=20;DP=22;FAO=20;FDP=22;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0115246;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=91.6686;QD=29.6572;RBI=0.0184743;REFB=-0.108402;REVB=0.0144389;RO=2;SAF=13;SAR=7;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0272783;STB=0.514836;TYPE=snp;VARB=0.00152114;OID=.;OPOS=241404317;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:22:22:2:2:20:20:7:13:1:1:7:13:1:1 chr2 241404499 . C T 99.03 PASS AO=24;DP=53;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=25;FSRR=4;FWDB=0.0231167;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.908;QD=7.47421;RBI=0.024064;REFB=-0.028327;REVB=-0.00668554;RO=29;SAF=17;SAR=7;SRF=25;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199281;STB=0.611146;TYPE=snp;VARB=0.0383812;OID=.;OPOS=241404499;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:29:29:24:24:7:17:25:4:7:17:25:4 chr2 241405485 . C T 136.64 PASS AO=23;DP=35;FAO=23;FDP=35;FR=.;FRO=12;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0331815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.162;QD=15.6164;RBI=0.0365022;REFB=-0.011772;REVB=-0.0152118;RO=12;SAF=11;SAR=12;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0652335;STB=0.535949;TYPE=snp;VARB=0.00516912;OID=.;OPOS=241405485;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:35:35:12:12:23:23:12:11:7:5:12:11:7:5 chr2 241405528 . A G 673.03 PASS AO=61;DP=62;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1825;QD=37.9172;RBI=0.0341677;REFB=0;REVB=0.017716;RO=0;SAF=23;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000241655;OID=.;OPOS=241405528;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:62:71:0:0:61:71:38:23:0:0:48:23:0:0 chr2 241419090 . G A 138.2 PASS AO=21;DP=30;FAO=21;FDP=30;FR=.;FRO=9;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0203535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.758;QD=18.4262;RBI=0.0307231;REFB=-0.0711433;REVB=0.023014;RO=9;SAF=11;SAR=10;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0432098;STB=0.523787;TYPE=snp;VARB=0.0195106;OID=.;OPOS=241419090;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:30:30:9:9:21:21:10:11:4:5:10:11:4:5 chr2 241451351 . G A 152.09 PASS AO=34;DP=70;FAO=35;FDP=72;FR=.;FRO=37;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=0.00795807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.2832;QD=8.44968;RBI=0.0162027;REFB=-0.0120212;REVB=0.0141136;RO=36;SAF=19;SAR=15;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229584;STB=0.512813;TYPE=snp;VARB=0.0142478;OID=.;OPOS=241451351;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:72:36:37:34:35:15:19:21:15:16:19:21:16 chr2 241465261 . G A 130.35 PASS AO=38;DP=101;FAO=40;FDP=103;FR=.;FRO=63;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=33;FSRR=30;FWDB=0.0362325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.1951;QD=5.06198;RBI=0.0527597;REFB=-0.0201305;REVB=0.0383509;RO=63;SAF=21;SAR=17;SRF=33;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0317019;STB=0.50073;TYPE=snp;VARB=0.0271586;OID=.;OPOS=241465261;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:103:63:63:38:40:17:21:33:30:19:21:33:30 chr2 241492255 . G T 239.47 PASS AO=61;DP=135;FAO=61;FDP=133;FR=.;FRO=72;FSAF=45;FSAR=16;FSRF=59;FSRR=13;FWDB=-0.0167468;FXX=0.0148137;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.3122;QD=7.20206;RBI=0.0450641;REFB=0.00981182;REVB=-0.0418368;RO=71;SAF=45;SAR=16;SRF=58;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105168;STB=0.56044;TYPE=snp;VARB=-0.00439878;OID=.;OPOS=241492255;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:133:71:72:61:61:16:45:58:13:16:45:59:13 chr2 241537421 . G A 70.76 PASS AO=9;DP=11;FAO=9;FDP=11;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.025842;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=142.74;QD=25.7295;RBI=0.0323863;REFB=0.0653535;REVB=0.0195208;RO=2;SAF=4;SAR=5;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176689;STB=0.599781;TYPE=snp;VARB=-0.00412745;OID=.;OPOS=241537421;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:11:11:2:2:9:9:5:4:2:0:5:4:2:0 chr2 241538074 . A G 210.67 PASS AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.636;QD=36.6384;RBI=0.0313903;REFB=0;REVB=-0.0226171;RO=0;SAF=14;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84921e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.26876e-06;OID=.;OPOS=241538074;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:0:0:23:23:9:14:0:0:9:14:0:0 chr2 241558397 . G A 1171.07 PASS AO=122;DP=122;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147226;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.379;QD=38.0836;RBI=0.0219836;REFB=0;REVB=0.0163255;RO=0;SAF=34;SAR=88;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.51163e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.23453e-05;OID=.;OPOS=241558397;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:122:123:0:0:122:123:88:34:0:0:88:35:0:0 chr2 241569692 . C T 375.71 PASS AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0508975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.3781;QD=38.5341;RBI=0.0546091;REFB=0;REVB=-0.0197887;RO=0;SAF=3;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000336531;OID=.;OPOS=241569692;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:39:39:0:0:39:39:36:3:0:0:36:3:0:0 chr2 241570391 . A G 369.35 PASS AO=38;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00535594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.087;QD=37.8825;RBI=0.0564748;REFB=0;REVB=0.0562203;RO=0;SAF=24;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76123e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000276633;OID=.;OPOS=241570391;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:38:39:0:0:38:39:14:24:0:0:15:24:0:0 chr2 241622187 . C T 182.19 PASS AO=28;DP=40;FAO=28;FDP=40;FR=.;FRO=12;FSAF=22;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=0;FWDB=0.0314055;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.404;QD=18.2189;RBI=0.0316207;REFB=-0.00888575;REVB=0.00368256;RO=11;SAF=22;SAR=6;SRF=11;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185384;STB=0.607078;TYPE=snp;VARB=0.00458412;OID=.;OPOS=241622187;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:40:40:11:12:28:28:6:22:11:0:6:22:12:0 chr2 241622209 . T C 363.15 PASS AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0417375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.0073;QD=38.2262;RBI=0.0841531;REFB=0;REVB=0.0730734;RO=0;SAF=30;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.26572e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000709196;OID=.;OPOS=241622209;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:38:38:0:0:38:38:8:30:0:0:8:30:0:0 chr2 241627836 . G C 137.9 PASS AO=23;DP=41;FAO=26;FDP=44;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.0417165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.434;QD=12.5361;RBI=0.043978;REFB=-0.0236464;REVB=-0.0139209;RO=17;SAF=11;SAR=12;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128491;STB=0.530012;TYPE=snp;VARB=0.0170406;OID=.;OPOS=241627836;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:41:44:17:18:23:26:12:11:11:6:12:14:11:7 chr2 241627928 . A G 572.67 PASS AO=42;DP=62;FAO=60;FDP=61;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=41;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00118919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.715;QD=37.5524;RBI=0.127499;REFB=0;REVB=0.127494;RO=0;SAF=40;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.96959e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00035667;OID=.;OPOS=241627928;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:61:61:0:0:42:60:2:40:0:0:19:41:0:0 chr2 241631476 . C G 73.78 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0455104;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.502;QD=36.8907;RBI=0.0550808;REFB=0;REVB=-0.0310273;RO=0;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46938e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00720172;OID=.;OPOS=241631476;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:3:5:0:0:3:5:0:0 chr2 241634830 . T C 29.49 PASS AO=3;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0121075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.2314;QD=11.7975;RBI=0.0196155;REFB=-0.0217727;REVB=-0.0154329;RO=5;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.691764;TYPE=snp;VARB=0.0237831;OID=.;OPOS=241634830;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:8:10:5:5:3:5:3:0:0:5:4:1:0:5 chr2 241696843 . C A 14.89 PASS AO=9;DP=46;FAO=9;FDP=48;FR=.;FRO=39;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=35;FWDB=-0.0478169;FXX=0.0769083;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.9262;QD=1.24107;RBI=0.0482755;REFB=-0.0202236;REVB=0.00663799;RO=37;SAF=1;SAR=8;SRF=4;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00937;STB=0.518033;TYPE=snp;VARB=0.111431;OID=.;OPOS=241696843;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:46:48:37:39:9:9:8:1:4:33:8:1:4:35 chr2 241808307 . ACCCCCCC ACCCCCC,ACCCCCCT 149.91 PASS AO=4,11;DP=37;FAO=12,17;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=7,3;FSAR=5,14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.276317,-0.0853353;FXX=0.0937207;HRUN=8,8;LEN=1,1;MLLD=5.67035,227.503;QD=20.6768;RBI=0.369591,0.0892621;REFB=-0.11416,-0.0142115;REVB=0.245451,0.0261842;RO=3;SAF=4,2;SAR=0,9;SRF=0;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.782218,0.128506;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.187643,-0.00455035;OID=.,.;OPOS=241808308,241808314;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=ACCCCCC,ACCCCCCT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:4,11:24:12,17:29:0:7,3:5,14:0:0:31:3:4,2:0,9:0:3 chr2 241808685 . C T 100.72 PASS AO=26;DP=61;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=-0.0272138;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.9886;QD=6.60469;RBI=0.0657173;REFB=-0.0349561;REVB=-0.0598178;RO=35;SAF=13;SAR=13;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101043;STB=0.557334;TYPE=snp;VARB=0.046218;OID=.;OPOS=241808685;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:35:35:26:26:13:13:14:21:13:13:14:21 chr2 241817516 . A G 260.32 PASS AO=65;DP=140;FAO=65;FDP=140;FR=.;FRO=75;FSAF=24;FSAR=41;FSRF=40;FSRR=35;FWDB=-0.0125843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.894;QD=7.43776;RBI=0.052924;REFB=-0.0058263;REVB=-0.051406;RO=75;SAF=24;SAR=41;SRF=40;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161718;STB=0.5899;TYPE=snp;VARB=0.0102078;OID=.;OPOS=241817516;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:75:75:65:65:41:24:40:35:41:24:40:35 chr2 241865156 . T C 69.91 PASS AO=39;DP=152;FAO=39;FDP=152;FR=.;FRO=113;FSAF=11;FSAR=28;FSRF=37;FSRR=76;FWDB=-0.0212029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.294;QD=1.83966;RBI=0.0272926;REFB=-0.00802123;REVB=-0.0171851;RO=113;SAF=11;SAR=28;SRF=37;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0667677;STB=0.540172;TYPE=snp;VARB=0.0331408;OID=.;OPOS=241865156;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:152:152:113:113:39:39:28:11:37:76:28:11:37:76 chr2 241872597 . A G 196.12 PASS AO=37;DP=63;FAO=38;FDP=64;FR=.;FRO=26;FSAF=27;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.0181124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.818;QD=12.2576;RBI=0.0193187;REFB=-0.0272377;REVB=-0.00671941;RO=26;SAF=26;SAR=11;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16782;STB=0.595536;TYPE=snp;VARB=0.0147741;OID=.;OPOS=241872597;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:63:64:26:26:37:38:11:26:13:13:11:27:13:13 chr2 241874835 . C G 11.21 PASS AO=2;DP=9;FAO=2;FDP=9;FR=.,HEALED;FRO=6;FSAF=1;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.0947923;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=29.7594;QD=4.98243;RBI=0.0960748;REFB=-0.0547797;REVB=0.0156457;RO=4;SAF=1;SAR=1;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.532453;STB=0.623829;TYPE=snp;VARB=0.148348;OID=.;OPOS=241874835;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:9:9:4:6:2:2:1:1:0:4:1:1:2:4 chr2 241898824 . A G 78.32 PASS AO=18;DP=42;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.0258032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.948;QD=7.286;RBI=0.0276291;REFB=-0.0104643;REVB=-0.0098774;RO=24;SAF=10;SAR=8;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218396;STB=0.606688;TYPE=snp;VARB=0.00843406;OID=.;OPOS=241898824;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:42:43:24:24:18:19:8:10:8:16:9:10:8:16 chr2 241904000 . AG A,AC 239.47 PASS AO=8,15;DP=50;FAO=26,22;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=7,16;FSAR=19,6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.344989,0.174085;FXX=0.020404;HRUN=7,7;LEN=1,1;MLLD=7.74297,32.4826;QD=19.9562;RBI=0.535423,0.258731;REFB=-0.0314743,-0.0445677;REVB=0.409464,0.191406;RO=15;SAF=2,13;SAR=6,2;SRF=5;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.10912,0.538459;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0864772,-0.0117193;OID=.,.;OPOS=241904001,241904001;OREF=G,G;OALT=-,C;OMAPALT=A,AC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:8,15:46:26,22:48:0:7,16:19,6:0:0:95:15:2,13:6,2:5:10 chr2 241925343 . T C 172.13 PASS AO=33;DP=57;FAO=33;FDP=57;FR=.;FRO=24;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.00213203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.639;QD=12.0794;RBI=0.0102206;REFB=-0.0115581;REVB=0.00999572;RO=24;SAF=20;SAR=13;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0180892;STB=0.509972;TYPE=snp;VARB=0.00658157;OID=.;OPOS=241925343;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:57:57:24:24:33:33:13:20:14:10:13:20:14:10 chr2 241929228 . A G 69.08 PASS AO=25;DP=82;FAO=26;FDP=82;FR=.;FRO=56;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=32;FWDB=-0.015308;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.348;QD=3.36965;RBI=0.0188087;REFB=-0.014262;REVB=-0.0109285;RO=56;SAF=13;SAR=12;SRF=24;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106979;STB=0.57457;TYPE=snp;VARB=0.024004;OID=.;OPOS=241929228;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:82:82:56:56:25:26:12:13:24:32:12:14:24:32 chr2 241979550 . T C 152.76 PASS AO=32;DP=61;FAO=32;FDP=61;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=6;FSRR=23;FWDB=0.00257424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.6041;QD=10.0169;RBI=0.0257279;REFB=-0.0107264;REVB=0.0255988;RO=29;SAF=11;SAR=21;SRF=6;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136753;STB=0.575461;TYPE=snp;VARB=0.00964354;OID=.;OPOS=241979550;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:29:29:32:32:21:11:6:23:21:11:6:23 chr2 242011330 . C A 296.78 PASS AO=30;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.104569;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.7285;QD=37.097;RBI=0.116748;REFB=0;REVB=0.0519183;RO=2;SAF=1;SAR=29;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.452552;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00121735;OID=.;OPOS=242011330;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:32:32:2:0:30:32:29:1:2:0:29:3:0:0 chr2 242028741 . A G 115.29 PASS AO=36;DP=97;FAO=37;FDP=98;FR=.;FRO=61;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=37;FWDB=-0.0192598;FXX=0.0101;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.971;QD=4.70574;RBI=0.0210646;REFB=0.0148615;REVB=0.00853102;RO=61;SAF=16;SAR=20;SRF=24;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0572185;STB=0.524874;TYPE=snp;VARB=-0.0246379;OID=.;OPOS=242028741;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:98:61:61:36:37:20:16:24:37:21:16:24:37 chr2 242029737 . G A 118.21 PASS AO=32;DP=76;FAO=32;FDP=76;FR=.;FRO=44;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=27;FSRR=17;FWDB=-0.0540248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2145;QD=6.22166;RBI=0.0810082;REFB=-0.0103246;REVB=-0.0603626;RO=44;SAF=19;SAR=13;SRF=27;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0211678;STB=0.511979;TYPE=snp;VARB=0.0112091;OID=.;OPOS=242029737;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:44:44:32:32:13:19:27:17:13:19:27:17 chr2 242033770 . T A 273.08 PASS AO=42;DP=134;FAO=65;FDP=131;FR=.,HEALED;FRO=66;FSAF=36;FSAR=29;FSRF=30;FSRR=36;FWDB=0.0337563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.5489;QD=8.33822;RBI=0.041278;REFB=-0.0658205;REVB=0.0237568;RO=67;SAF=13;SAR=29;SRF=31;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17783;STB=0.550055;TYPE=snp;VARB=0.06597;OID=.;OPOS=242033770;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:131:67:66:42:65:29:13:31:36:29:36:30:36 chr2 242054718 . G A 525.66 PASS AO=154;DP=367;FAO=154;FDP=367;FR=.;FRO=213;FSAF=71;FSAR=83;FSRF=116;FSRR=97;FWDB=-0.0208181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.6831;QD=5.72931;RBI=0.032601;REFB=-0.0176547;REVB=-0.0250885;RO=213;SAF=71;SAR=83;SRF=116;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0869832;STB=0.54842;TYPE=snp;VARB=0.0238357;OID=.;OPOS=242054718;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:367:367:213:213:154:154:83:71:116:97:83:71:116:97 chr2 242066314 . T C 237.91 PASS AO=38;DP=53;FAO=38;FDP=54;FR=.;FRO=16;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.0550859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.725;QD=17.6231;RBI=0.0553119;REFB=-0.0250438;REVB=0.0049954;RO=15;SAF=13;SAR=25;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00509542;STB=0.510747;TYPE=snp;VARB=0.00879253;OID=.;OPOS=242066314;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:53:54:15:16:38:38:25:13:5:10:25:13:6:10 chr2 242089074 . GC G 20.85 PASS AO=7;DP=38;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.156764;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.9131;QD=2.31678;RBI=0.176279;REFB=-0.0402981;REVB=-0.0806184;RO=21;SAF=5;SAR=2;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180464;STB=0.562409;TYPE=del;VARB=0.0984138;OID=.;OPOS=242089075;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:7:36:14:36:22:9:5:12:10:20:21:5:2:12:9 chr2 242122391 . T C 1447.2 PASS AO=150;DP=150;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=117;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00871897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.762;QD=38.592;RBI=0.0157505;REFB=0;REVB=-0.0131171;RO=0;SAF=33;SAR=117;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.46108e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.24967e-06;OID=.;OPOS=242122391;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:150:150:0:0:150:150:117:33:0:0:117:33:0:0 chr2 242129487 . G T 851.68 PASS AO=93;DP=98;FAO=94;FDP=97;FR=.;FRO=3;FSAF=47;FSAR=47;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0774151;FXX=0.010203;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7231;QD=35.1208;RBI=0.0822538;REFB=-0.100997;REVB=0.0277955;RO=3;SAF=46;SAR=47;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101859;STB=0.505154;TYPE=snp;VARB=0.00487741;OID=.;OPOS=242129487;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:98:97:3:3:93:94:47:46:2:1:47:47:2:1 chr2 242140785 . C G 411.11 PASS AO=33;DP=48;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0405226;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=240.827;QD=35.7486;RBI=0.0405275;REFB=0.00630323;REVB=-0.000633707;RO=0;SAF=9;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5102;TYPE=snp;VARB=-2.14467e-05;OID=.;OPOS=242140785;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:33:46:0:1:33:45:24:9:0:0:24:21:0:1 chr2 242141719 . C T 532.1 PASS AO=54;DP=54;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.114291;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.541;QD=38.0073;RBI=0.120022;REFB=0;REVB=0.0366461;RO=0;SAF=28;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.52846e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00067442;OID=.;OPOS=242141719;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:54:56:0:0:54:56:26:28:0:0:26:30:0:0 chr2 242149010 . C T 262.58 PASS AO=31;DP=34;FAO=32;FDP=34;FR=.;FRO=2;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0893965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.0199;QD=30.8922;RBI=0.0923077;REFB=-0.0783637;REVB=0.0229997;RO=3;SAF=19;SAR=12;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103249;STB=0.535692;TYPE=snp;VARB=0.00379782;OID=.;OPOS=242149010;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:34:34:3:2:31:32:12:19:0:3:13:19:0:2 chr2 242151585 . C T 593.65 PASS AO=61;DP=62;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0205226;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.415;QD=36.5323;RBI=0.02116;REFB=-0.0138199;REVB=-0.00515434;RO=1;SAF=31;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.014984;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000234927;OID=.;OPOS=242151585;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:62:65:1:0:61:65:30:31:1:0:31:34:0:0 chr2 242157228 . G T 97.85 PASS AO=6;DP=14;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0570156;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.89;QD=30.1074;RBI=0.0933213;REFB=-0.0770092;REVB=0.0738789;RO=0;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.529364;TYPE=snp;VARB=0.00421196;OID=.;OPOS=242157228;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:7:13:0:1:6:12:6:0:0:0:8:4:0:1 chr2 242163357 . CCG C,CCA 218.1 PASS AO=3,12;DP=24;FAO=3,22;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=1,4;FSAR=2,18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0539614,0.0402473;FXX=0;HRUN=3,1;LEN=2,1;MLLD=144.802,171.983;QD=34.8963;RBI=0.0608398,0.0670076;REFB=0,0;REVB=0.0281007,0.053574;RO=0;SAF=1,4;SAR=2,8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.237113,0;SSEP=0.252469,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.0276254,0.0153081;OID=.,.;OPOS=242163358,242163359;OREF=CG,G;OALT=-,A;OMAPALT=C,CCA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:3,12:16:3,22:25:0:1,4:2,18:0:0:4:0:1,4:2,8:0:0 chr2 242179134 . G A 1139.37 PASS AO=80;DP=125;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0360391;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.918;QD=38.2982;RBI=0.0448514;REFB=0;REVB=0.026699;RO=0;SAF=12;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.11622e-05;OID=.;OPOS=242179134;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:81:119:0:0:80:119:68:12:0:0:76:43:0:0 chr2 242192848 . T C 952.21 PASS AO=102;DP=103;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0546162;FXX=0.0097078;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.005;QD=37.3415;RBI=0.0554776;REFB=0.0369127;REVB=-0.00973862;RO=1;SAF=34;SAR=68;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0137487;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000467766;OID=.;OPOS=242192848;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:103:102:1:0:102:102:68:34:1:0:68:34:0:0 chr2 242203916 . A C 1693.79 PASS AO=168;DP=175;FAO=185;FDP=185;FR=.;FRO=0;FSAF=144;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00700757;FXX=0.0886656;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.439;QD=36.6224;RBI=0.0236142;REFB=-0.0258902;REVB=0.0225505;RO=1;SAF=144;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.019412;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00153447;OID=.;OPOS=242203916;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:175:185:1:0:168:185:24:144:0:1:41:144:0:0 chr2 242407746 . A G 471.97 PASS AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0536144;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.289;QD=38.5285;RBI=0.0536695;REFB=0;REVB=-0.00243162;RO=0;SAF=21;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000433928;OID=.;OPOS=242407746;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:49:49:0:0:49:49:28:21:0:0:28:21:0:0 chr2 242440221 . G A 478.07 PASS AO=59;DP=66;FAO=59;FDP=66;FR=.;FRO=7;FSAF=36;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=-0.0157761;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.4226;QD=28.974;RBI=0.021392;REFB=-0.0198311;REVB=0.0144476;RO=7;SAF=36;SAR=23;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123985;STB=0.566015;TYPE=snp;VARB=0.0342718;OID=.;OPOS=242440221;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:66:66:7:7:59:59:23:36:0:7:23:36:0:7 chr2 242572846 . A G 1146.01 PASS AO=118;DP=118;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.12;QD=38.5215;RBI=0.0136333;REFB=0;REVB=-0.00244193;RO=0;SAF=61;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.03988e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.19384e-05;OID=.;OPOS=242572846;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:118:119:0:0:118:119:57:61:0:0:57:62:0:0 chr2 242573211 . T C 125.84 PASS AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0340123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.174;QD=35.9534;RBI=0.0392119;REFB=0;REVB=0.0195125;RO=0;SAF=10;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.63386e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000566575;OID=.;OPOS=242573211;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:14:14:0:0:14:14:4:10:0:0:4:10:0:0 chr2 242606036 . G C 1181.45 PASS AO=124;DP=124;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.8603;QD=38.1113;RBI=0.0527134;REFB=0;REVB=-0.0458157;RO=0;SAF=51;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.64592e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.02249e-05;OID=.;OPOS=242606036;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:124:124:0:0:124:124:73:51:0:0:73:51:0:0 chr2 242610773 . T A 1085.48 PASS AO=113;DP=113;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.102709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.014;QD=38.0869;RBI=0.150573;REFB=0;REVB=0.110105;RO=0;SAF=49;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.34554e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000587268;OID=.;OPOS=242610773;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:113:114:0:0:113:114:64:49:0:0:64:50:0:0 chr2 242611934 . T C 282.57 PASS AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.051542;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.819;QD=38.9747;RBI=0.0524971;REFB=0;REVB=0.00996844;RO=0;SAF=3;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000206036;OID=.;OPOS=242611934;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:30:29:0:0:29:29:26:3:0:0:26:3:0:0 chr2 242613089 . A G 1257.17 PASS AO=129;DP=129;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00596341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.107;QD=38.0962;RBI=0.00688544;REFB=0;REVB=0.00344194;RO=0;SAF=65;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.05633e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.29398e-06;OID=.;OPOS=242613089;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:129:132:0:0:129:132:64:65:0:0:67:65:0:0 chr2 242613133 . T G 1313.76 PASS AO=130;DP=130;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00326748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.66;QD=38.3578;RBI=0.0420386;REFB=0;REVB=0.0419114;RO=0;SAF=62;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.98983e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.25281e-05;OID=.;OPOS=242613133;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:130:137:0:0:130:137:68:62:0:0:75:62:0:0 chr2 242618050 . A G 1214.31 PASS AO=131;DP=133;FAO=131;FDP=133;FR=.;FRO=2;FSAF=53;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0152815;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.041;QD=36.5205;RBI=0.0222995;REFB=-0.0419626;REVB=-0.0162402;RO=1;SAF=53;SAR=78;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00605486;STB=0.506328;TYPE=snp;VARB=0.000190489;OID=.;OPOS=242618050;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:133:133:1:2:131:131:78:53:0:1:78:53:0:2 chr2 242680430 . A G 464.31 PASS AO=46;DP=46;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0335857;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.856;QD=38.6925;RBI=0.0365194;REFB=0;REVB=-0.0143409;RO=0;SAF=22;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000128276;OID=.;OPOS=242680430;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:46:48:0:0:46:48:24:22:0:0:26:22:0:0 chr2 242688292 . C T 316.54 PASS AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0651057;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.7097;QD=37.2402;RBI=0.0656991;REFB=0;REVB=0.00881042;RO=0;SAF=8;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000843072;OID=.;OPOS=242688292;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:34:0:0:34:34:26:8:0:0:26:8:0:0 chr2 242688366 . C T 116.19 PASS AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.8418;QD=35.7495;RBI=0.003756;REFB=0;REVB=0.003756;RO=0;SAF=0;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000207962;OID=.;OPOS=242688366;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:13:0:0:13:13:13:0:0:0:13:0:0:0 chr2 242690745 . C T 519.18 PASS AO=57;DP=58;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.108407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.5334;QD=36.4336;RBI=0.121313;REFB=-0.144787;REVB=0.0544487;RO=1;SAF=39;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119415;STB=0.506491;TYPE=snp;VARB=0.00279801;OID=.;OPOS=242690745;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:58:57:1:1:57:56:18:39:1:0:18:38:1:0 chr2 242716380 . A T 41.77 PASS AO=12;DP=34;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=16;FSRR=6;FWDB=0.0439287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.5826;QD=4.91458;RBI=0.0821193;REFB=-0.00915041;REVB=0.0693818;RO=21;SAF=11;SAR=1;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.397859;STB=0.73987;TYPE=snp;VARB=0.0158664;OID=.;OPOS=242716380;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:34:34:21:22:12:12:1:11:15:6:1:11:16:6 chr2 242756255 . G A 75.09 PASS AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.0527826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.57;QD=10.3572;RBI=0.0528134;REFB=-0.0181113;REVB=-0.00180264;RO=14;SAF=4;SAR=11;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0203786;STB=0.511612;TYPE=snp;VARB=0.0640433;OID=.;OPOS=242756255;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:29:29:14:14:15:15:11:4:4:10:11:4:4:10 chr2 242757729 . C T 73.81 PASS AO=2;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=8;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.272411;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.5003;QD=36.9046;RBI=0.272411;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=2;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0202166;OID=.;OPOS=242757729;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:8:0:0:2:8:0:2:0:0:0:8:0:0 chr2 242793273 . A G 582.93 PASS AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00840105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.78;QD=37.6083;RBI=0.0132915;REFB=0;REVB=-0.0102998;RO=0;SAF=23;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75648e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.87788e-05;OID=.;OPOS=242793273;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:62:62:0:0:62:62:39:23:0:0:39:23:0:0 chr2 242813124 . T C 559.94 PASS AO=64;DP=68;FAO=64;FDP=68;FR=.;FRO=4;FSAF=36;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0353738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.3044;QD=32.9374;RBI=0.0455776;REFB=-0.124868;REVB=0.0287405;RO=0;SAF=36;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.518582;TYPE=snp;VARB=0.00388966;OID=.;OPOS=242813124;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:68:68:0:4:64:64:28:36:0:0:28:36:1:3 chr3 239347 . C G 15.99 PASS AO=2;DP=12;FAO=4;FDP=14;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0327874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.051;QD=4.56871;RBI=0.0344694;REFB=-0.017994;REVB=0.010636;RO=10;SAF=1;SAR=1;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103256;STB=0.748751;TYPE=snp;VARB=0.0225506;OID=.;OPOS=239347;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:12:14:10:10:2:4:1:1:4:6:1:3:4:6 chr3 391100 . A G 2033.15 PASS AO=193;DP=194;FAO=214;FDP=214;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020155;FXX=0.00465095;HRUN=3;LEN=1;MLLD=144.886;QD=38.0028;RBI=0.0203154;REFB=-0.0251997;REVB=-0.0025474;RO=1;SAF=105;SAR=88;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00451406;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.31224e-05;OID=.;OPOS=391100;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:89:194:214:1:0:193:214:88:105:1:0:109:105:0:0 chr3 404929 . AG A 1043.82 PASS AO=121;DP=158;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.289024;FXX=0.013157;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.1896;QD=27.8353;RBI=0.315346;REFB=0;REVB=-0.126126;RO=13;SAF=58;SAR=63;SRF=13;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0.38206;SSSB=-0.0953648;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00176129;OID=.;OPOS=404930;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:121:150:150:150:0:73:77:0:0:94:13:58:63:13:0 chr3 439963 . A G 1780.29 PASS AO=190;DP=192;FAO=190;FDP=190;FR=.;FRO=0;FSAF=106;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0382523;FXX=0.0104161;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.2601;QD=37.4797;RBI=0.0419979;REFB=-0.0410863;REVB=-0.0173375;RO=2;SAF=106;SAR=84;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00116387;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000904211;OID=.;OPOS=439963;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:192:190:2:0:190:190:84:106:1:1:84:106:0:0 chr3 440028 . T C 1507.45 PASS AO=156;DP=157;FAO=158;FDP=158;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00659372;FXX=0.0124992;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.141;QD=38.1634;RBI=0.00883532;REFB=-0.0550371;REVB=0.00588095;RO=0;SAF=81;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.47281e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.40109e-05;OID=.;OPOS=440028;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:157:158:0:0:156:158:75:81:0:0:76:82:0:0 chr3 450391 . T C 882.17 PASS AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00340168;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=130.293;QD=37.9427;RBI=0.0215149;REFB=0;REVB=0.0212443;RO=0;SAF=61;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.35236e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.36164e-05;OID=.;OPOS=450391;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:93:93:0:0:93:93:32:61:0:0:32:61:0:0 chr3 450534 . T C 2753.84 PASS AO=288;DP=289;FAO=288;FDP=288;FR=.;FRO=0;FSAF=134;FSAR=154;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113501;FXX=0.00346009;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1758;QD=38.2478;RBI=0.0286165;REFB=-0.0150136;REVB=0.0262694;RO=0;SAF=134;SAR=154;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11655e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.14692e-05;OID=.;OPOS=450534;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:289:288:0:0:288:288:154:134:0:0:154:134:0:0 chr3 1107455 . T C 1123.97 PASS AO=116;DP=119;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023874;FXX=0.0249979;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.005;QD=38.4262;RBI=0.0268418;REFB=0;REVB=-0.0122683;RO=0;SAF=68;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.21597e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00128518;OID=.;OPOS=1107455;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:119:117:0:0:116:117:48:68:0:0:48:69:0:0 chr3 1134445 . C A 170.58 PASS AO=38;DP=80;FAO=40;FDP=82;FR=.;FRO=42;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=0.00428147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.445;QD=8.32114;RBI=0.0132882;REFB=-0.031937;REVB=-0.0125796;RO=42;SAF=17;SAR=21;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.072033;STB=0.524988;TYPE=snp;VARB=0.0353403;OID=.;OPOS=1134445;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:82:42:42:38:40:21:17:22:20:21:19:22:20 chr3 1134714 . C G 100.54 PASS AO=17;DP=42;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=5;FSRR=19;FWDB=0.00401301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.888;QD=8.55656;RBI=0.0147551;REFB=-0.00599877;REVB=0.0141989;RO=23;SAF=7;SAR=10;SRF=5;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211213;STB=0.582375;TYPE=snp;VARB=0.00787308;OID=.;OPOS=1134714;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:42:47:23:24:17:23:10:7:5:18:15:8:5:19 chr3 1418753 . G A 418.36 PASS AO=119;DP=281;FAO=120;FDP=281;FR=.;FRO=161;FSAF=63;FSAR=57;FSRF=67;FSRR=94;FWDB=0.0112823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.6381;QD=5.95529;RBI=0.0152839;REFB=-0.00960658;REVB=-0.0103106;RO=162;SAF=63;SAR=56;SRF=67;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119461;STB=0.562124;TYPE=snp;VARB=0.0126828;OID=.;OPOS=1418753;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:281:281:162:161:119:120:56:63:67:95:57:63:67:94 chr3 1424850 . T G 548.94 PASS AO=119;DP=249;FAO=133;FDP=263;FR=.;FRO=130;FSAF=56;FSAR=77;FSRF=48;FSRR=82;FWDB=0.00310458;FXX=0.0149807;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.943;QD=8.34885;RBI=0.00544364;REFB=-0.0178206;REVB=0.00447156;RO=104;SAF=49;SAR=70;SRF=46;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0267765;STB=0.526486;TYPE=snp;VARB=0.017823;OID=.;OPOS=1424850;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:249:263:104:130:119:133:70:49:46:58:77:56:48:82 chr3 3076401 . C T 192.03 PASS AO=48;DP=104;FAO=48;FDP=104;FR=.;FRO=56;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=23;FSRR=33;FWDB=0.00149483;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.921;QD=7.38586;RBI=0.0494315;REFB=-0.0028904;REVB=0.0494089;RO=54;SAF=18;SAR=30;SRF=23;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0508635;STB=0.520296;TYPE=snp;VARB=0.00430312;OID=.;OPOS=3076401;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:54:56:48:48:30:18:23:31:30:18:23:33 chr3 3076443 . A G 196.29 PASS AO=44;DP=87;FAO=44;FDP=87;FR=.;FRO=43;FSAF=11;FSAR=33;FSRF=15;FSRR=28;FWDB=0.0215063;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.499;QD=9.02496;RBI=0.0457378;REFB=-0.00409369;REVB=0.0403662;RO=43;SAF=11;SAR=33;SRF=15;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109826;STB=0.561122;TYPE=snp;VARB=0.00604686;OID=.;OPOS=3076443;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:43:43:44:44:33:11:15:28:33:11:15:28 chr3 3081750 . A T 513.44 PASS AO=197;DP=491;FAO=160;FDP=400;FR=.;FRO=240;FSAF=104;FSAR=56;FSRF=132;FSRR=108;FWDB=0.00794938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.1579;QD=5.13438;RBI=0.0541698;REFB=-0.00818364;REVB=0.0535834;RO=290;SAF=129;SAR=68;SRF=153;SRR=137;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142329;STB=0.563417;TYPE=snp;VARB=0.0114967;OID=.;OPOS=3081750;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:491:400:290:240:197:160:68:129:153:137:56:104:132:108 chr3 3081825 . T C 3828.37 PASS AO=491;DP=492;FAO=399;FDP=399;FR=.;FRO=0;FSAF=227;FSAR=172;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115233;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.745;QD=38.3796;RBI=0.0424636;REFB=0;REVB=0.0408701;RO=0;SAF=288;SAR=203;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.83108e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.35055e-05;OID=.;OPOS=3081825;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:492:399:0:0:491:399:203:288:0:0:172:227:0:0 chr3 3098041 . G C 428.57 PASS AO=118;DP=267;FAO=118;FDP=270;FR=.;FRO=152;FSAF=55;FSAR=63;FSRF=77;FSRR=75;FWDB=-0.00536553;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.969;QD=6.34921;RBI=0.0238183;REFB=-0.0112707;REVB=-0.0232061;RO=147;SAF=55;SAR=63;SRF=77;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0577419;STB=0.522818;TYPE=snp;VARB=0.0212692;OID=.;OPOS=3098041;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:267:270:147:152:118:118:63:55:77:70:63:55:77:75 chr3 3115478 . T C 162.52 PASS AO=50;DP=132;FAO=51;FDP=133;FR=.;FRO=82;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=27;FSRR=55;FWDB=-0.00661845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.521;QD=4.8878;RBI=0.00665492;REFB=-0.0245744;REVB=-0.000695785;RO=82;SAF=18;SAR=32;SRF=27;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0369473;STB=0.516123;TYPE=snp;VARB=0.0306267;OID=.;OPOS=3115478;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:133:82:82:50:51:32:18:27:55:33:18:27:55 chr3 3139957 . T C 283.87 PASS AO=65;DP=130;FAO=65;FDP=130;FR=.;FRO=65;FSAF=34;FSAR=31;FSRF=37;FSRR=28;FWDB=0.0129451;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.17;QD=8.73454;RBI=0.0212101;REFB=-0.00517441;REVB=0.0168015;RO=65;SAF=34;SAR=31;SRF=37;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0420227;STB=0.523169;TYPE=snp;VARB=0.00386927;OID=.;OPOS=3139957;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:65:65:65:65:31:34:37:28:31:34:37:28 chr3 3170792 . C T 1547.2 PASS AO=168;DP=172;FAO=169;FDP=173;FR=.;FRO=4;FSAF=88;FSAR=81;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.00268706;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.887;QD=35.7734;RBI=0.00871449;REFB=-0.0510702;REVB=0.00828987;RO=4;SAF=88;SAR=80;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0211374;STB=0.51111;TYPE=snp;VARB=0.000708788;OID=.;OPOS=3170792;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:172:173:4:4:168:169:80:88:4:0:81:88:4:0 chr3 3189279 . A G 1219.31 PASS AO=134;DP=140;FAO=137;FDP=140;FR=.;FRO=3;FSAF=44;FSAR=93;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0135373;FXX=0.0410931;HRUN=4;LEN=1;MLLD=132.749;QD=34.8375;RBI=0.017275;REFB=-0.147232;REVB=-0.0107315;RO=4;SAF=41;SAR=93;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0441389;STB=0.516481;TYPE=snp;VARB=0.000111302;OID=.;OPOS=3189279;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:140:140:4:3:134:137:93:41:4:0:93:44:3:0 chr3 3886580 . A G 1658.8 PASS AO=174;DP=174;FAO=174;FDP=174;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0455303;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=223.146;QD=38.1333;RBI=0.0552947;REFB=0;REVB=0.0313767;RO=0;SAF=65;SAR=109;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.98216e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.36732e-05;OID=.;OPOS=3886580;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:174:174:0:0:174:174:109:65:0:0:109:65:0:0 chr3 3887093 . A G 571.6 PASS AO=122;DP=224;FAO=122;FDP=224;FR=.;FRO=102;FSAF=38;FSAR=84;FSRF=46;FSRR=56;FWDB=0.0150503;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.985;QD=10.207;RBI=0.0213522;REFB=-0.00214736;REVB=0.0151461;RO=102;SAF=38;SAR=84;SRF=46;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128296;STB=0.570124;TYPE=snp;VARB=0.00177923;OID=.;OPOS=3887093;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:224:224:102:102:122:122:84:38:46:56:84:38:46:56 chr3 3887876 . T C 663.93 PASS AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0321471;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.773;QD=37.9386;RBI=0.0369468;REFB=0;REVB=-0.0182107;RO=0;SAF=38;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.17031e-05;OID=.;OPOS=3887876;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:71:70:0:0:70:70:32:38:0:0:32:38:0:0 chr3 3889222 . G T 439.14 PASS AO=47;DP=47;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104564;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.586;QD=38.1859;RBI=0.0300686;REFB=0;REVB=-0.0281919;RO=0;SAF=37;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00192463;OID=.;OPOS=3889222;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:47:46:0:0:47:46:10:37:0:0:10:36:0:0 chr3 4358210 . A G 478.86 PASS AO=132;DP=301;FAO=132;FDP=301;FR=.;FRO=169;FSAF=91;FSAR=41;FSRF=99;FSRR=70;FWDB=0.00210444;FXX=0.00331115;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.539;QD=6.36363;RBI=0.0438949;REFB=0.00861369;REVB=-0.0438444;RO=168;SAF=91;SAR=41;SRF=99;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112039;STB=0.564575;TYPE=snp;VARB=-0.00771929;OID=.;OPOS=4358210;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:301:301:168:169:132:132:41:91:99:69:41:91:99:70 chr3 4508742 . C T 87.07 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.121802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.493;QD=38.6968;RBI=0.129206;REFB=0;REVB=0.0431089;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00393591;OID=.;OPOS=4508742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:5:4:0:0:5:4:0:0 chr3 4508888 . AG A 285.16 PASS AO=39;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.155793;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.3277;QD=22.3655;RBI=0.393006;REFB=0;REVB=0.360807;RO=9;SAF=24;SAR=15;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0.300885;SSSB=0.101087;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0202911;OID=.;OPOS=4508889;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:39:51:51:51:0:27:24:0:0:25:9:24:15:3:6 chr3 4699936 . G C 522.4 PASS AO=134;DP=285;FAO=133;FDP=284;FR=.;FRO=151;FSAF=62;FSAR=71;FSRF=76;FSRR=75;FWDB=-0.0437765;FXX=0.00350865;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.873;QD=7.3578;RBI=0.0437776;REFB=-0.00657775;REVB=0.000305449;RO=151;SAF=62;SAR=72;SRF=76;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0391222;STB=0.519785;TYPE=snp;VARB=0.00711942;OID=.;OPOS=4699936;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:285:284:151:151:134:133:72:62:76:75:71:62:76:75 chr3 4712413 . G A 1255.86 PASS AO=135;DP=141;FAO=135;FDP=137;FR=.;FRO=2;FSAF=73;FSAR=62;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0061622;FXX=0.0283668;HRUN=2;LEN=1;MLLD=221.461;QD=36.6675;RBI=0.032087;REFB=-0.0363509;REVB=0.0314897;RO=2;SAF=73;SAR=62;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0128443;STB=0.506756;TYPE=snp;VARB=6.93035e-05;OID=.;OPOS=4712413;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:141:137:2:2:135:135:62:73:2:0:62:73:2:0 chr3 4716811 . A C 471.41 PASS AO=95;DP=170;FAO=96;FDP=170;FR=.;FRO=74;FSAF=41;FSAR=55;FSRF=46;FSRR=28;FWDB=0.00254843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.093;QD=11.092;RBI=0.00506339;REFB=0.0194693;REVB=0.00437532;RO=74;SAF=40;SAR=55;SRF=46;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160812;STB=0.584374;TYPE=snp;VARB=-0.0109185;OID=.;OPOS=4716811;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:170:74:74:95:96:55:40:46:28:55:41:46:28 chr3 4767262 . T C 143.31 PASS AO=37;DP=88;FAO=38;FDP=88;FR=.;FRO=50;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=35;FSRR=15;FWDB=0.0586121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.966;QD=6.51388;RBI=0.0607394;REFB=0.00107984;REVB=-0.015934;RO=50;SAF=12;SAR=25;SRF=35;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.373476;STB=0.697574;TYPE=snp;VARB=-0.000681114;OID=.;OPOS=4767262;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:50:50:37:38:25:12:35:15:25:13:35:15 chr3 4817057 . T C 1644.12 PASS AO=176;DP=184;FAO=178;FDP=178;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0418458;FXX=0.0326069;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.399;QD=36.9466;RBI=0.045079;REFB=-0.0417353;REVB=0.0167645;RO=3;SAF=67;SAR=109;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00964832;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000745301;OID=.;OPOS=4817057;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:184:178:3:0:176:178:109:67:2:1:111:67:0:0 chr3 4842231 . C T 633.49 PASS AO=141;DP=269;FAO=141;FDP=269;FR=.;FRO=128;FSAF=59;FSAR=82;FSRF=67;FSRR=61;FWDB=-0.00691645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.879;QD=9.41993;RBI=0.030824;REFB=-0.0133072;REVB=0.030038;RO=128;SAF=59;SAR=82;SRF=67;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0923626;STB=0.550475;TYPE=snp;VARB=0.0140111;OID=.;OPOS=4842231;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:269:269:128:128:141:141:82:59:67:61:82:59:67:61 chr3 4856180 . T C 427.41 PASS AO=89;DP=161;FAO=89;FDP=161;FR=.;FRO=72;FSAF=21;FSAR=68;FSRF=35;FSRR=37;FWDB=0.0758264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.0881;QD=10.6189;RBI=0.0758761;REFB=-0.0206498;REVB=-0.00274528;RO=70;SAF=21;SAR=68;SRF=34;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.239282;STB=0.633262;TYPE=snp;VARB=0.0150599;OID=.;OPOS=4856180;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:161:70:72:89:89:68:21:34:36:68:21:35:37 chr3 4856234 . G A 113.29 PASS AO=31;DP=81;FAO=33;FDP=83;FR=.;FRO=50;FSAF=5;FSAR=28;FSRF=20;FSRR=30;FWDB=0.0399478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.248;QD=5.4597;RBI=0.0416787;REFB=0.00110498;REVB=0.0118867;RO=50;SAF=3;SAR=28;SRF=20;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.486594;STB=0.706924;TYPE=snp;VARB=-0.00115976;OID=.;OPOS=4856234;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:83:50:50:31:33:28:3:20:30:28:5:20:30 chr3 5021403 . C T 79.66 PASS AO=12;DP=17;FAO=12;FDP=17;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0312041;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.3297;QD=18.7443;RBI=0.0765179;REFB=-0.073445;REVB=0.0698662;RO=5;SAF=4;SAR=8;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0385364;STB=0.521702;TYPE=snp;VARB=0.0295208;OID=.;OPOS=5021403;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:17:17:5:5:12:12:8:4:2:3:8:4:2:3 chr3 5024771 . T C 71.27 PASS AO=22;DP=61;FAO=22;FDP=61;FR=.;FRO=39;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=25;FWDB=-0.023682;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.2997;QD=4.67336;RBI=0.0239122;REFB=-0.00385264;REVB=-0.0033101;RO=39;SAF=6;SAR=16;SRF=14;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111762;STB=0.565309;TYPE=snp;VARB=0.00914484;OID=.;OPOS=5024771;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:61:61:39:39:22:22:16:6:14:25:16:6:14:25 chr3 5025645 . G C 287.31 PASS AO=77;DP=168;FAO=77;FDP=174;FR=.;FRO=97;FSAF=57;FSAR=20;FSRF=57;FSRR=40;FWDB=0.00860446;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=209.583;QD=6.60487;RBI=0.00943623;REFB=0.000873317;REVB=-0.00387372;RO=91;SAF=57;SAR=20;SRF=57;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133499;STB=0.599972;TYPE=snp;VARB=-0.00113136;OID=.;OPOS=5025645;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:174:91:97:77:77:20:57:57:34:20:57:57:40 chr3 5025650 . G T 326.95 PASS AO=86;DP=190;FAO=86;FDP=191;FR=.;FRO=105;FSAF=61;FSAR=25;FSRF=63;FSRR=42;FWDB=-0.0203574;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=148.27;QD=6.84707;RBI=0.0210215;REFB=0.00206101;REVB=-0.00524202;RO=103;SAF=61;SAR=25;SRF=62;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120238;STB=0.568649;TYPE=snp;VARB=-0.00489416;OID=.;OPOS=5025650;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:191:103:105:86:86:25:61:62:41:25:61:63:42 chr3 5025654 . G A 334.84 PASS AO=89;DP=198;FAO=89;FDP=198;FR=.;FRO=109;FSAF=62;FSAR=27;FSRF=64;FSRR=45;FWDB=-0.0275526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.4287;QD=6.76435;RBI=0.0275766;REFB=-0.0128479;REVB=0.00115044;RO=108;SAF=62;SAR=27;SRF=63;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124714;STB=0.56749;TYPE=snp;VARB=0.0306428;OID=.;OPOS=5025654;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:198:108:109:89:89:27:62:63:45:27:62:64:45 chr3 5241309 . C A 1024.72 PASS AO=107;DP=107;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0261206;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.192;QD=38.3071;RBI=0.0332824;REFB=0;REVB=0.0206261;RO=0;SAF=37;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.02499e-05;OID=.;OPOS=5241309;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:107:107:0:0:107:107:70:37:0:0:70:37:0:0 chr3 5258280 . A G 483.2 PASS AO=117;DP=241;FAO=117;FDP=241;FR=.;FRO=124;FSAF=65;FSAR=52;FSRF=74;FSRR=50;FWDB=0.00774032;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=220.37;QD=8.01992;RBI=0.0201629;REFB=-0.000644462;REVB=0.018618;RO=124;SAF=65;SAR=52;SRF=74;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0392301;STB=0.521572;TYPE=snp;VARB=0.000714974;OID=.;OPOS=5258280;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:241:241:124:124:117:117:52:65:74:50:52:65:74:50 chr3 6828364 . A G 98.14 PASS AO=30;DP=70;FAO=27;FDP=68;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=0.034429;FXX=0.0422476;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.257;QD=5.77267;RBI=0.0345827;REFB=0.00153903;REVB=0.00325643;RO=40;SAF=20;SAR=10;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200395;STB=0.587448;TYPE=snp;VARB=-0.00385378;OID=.;OPOS=6828364;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:70:68:40:41:30:27:10:20:19:21:10:17:20:21 chr3 6903297 . C T 290.65 PASS AO=52;DP=84;FAO=53;FDP=86;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=39;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.0032976;FXX=0.0227247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.511;QD=13.5187;RBI=0.00904311;REFB=-0.0056727;REVB=0.00842043;RO=30;SAF=13;SAR=39;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198851;STB=0.598732;TYPE=snp;VARB=0.00667765;OID=.;OPOS=6903297;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:86:30:33:52:53:39:13:15:15:39:14:16:17 chr3 8406253 . G A 480.6 PASS AO=115;DP=227;FAO=115;FDP=233;FR=.;FRO=118;FSAF=63;FSAR=52;FSRF=55;FSRR=63;FWDB=-0.00720857;FXX=0.0127113;HRUN=4;LEN=1;MLLD=103.706;QD=8.25057;RBI=0.0133946;REFB=-0.0133037;REVB=0.0112895;RO=112;SAF=63;SAR=52;SRF=50;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0911874;STB=0.541432;TYPE=snp;VARB=0.0134462;OID=.;OPOS=8406253;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:227:233:112:118:115:115:52:63:50:62:52:63:55:63 chr3 8556671 . T G 418.96 PASS AO=98;DP=196;FAO=98;FDP=196;FR=.;FRO=98;FSAF=41;FSAR=57;FSRF=50;FSRR=48;FWDB=0.00745129;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=204.234;QD=8.55021;RBI=0.00781379;REFB=-0.00630978;REVB=0.00235237;RO=98;SAF=41;SAR=57;SRF=50;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0844789;STB=0.546451;TYPE=snp;VARB=0.00707271;OID=.;OPOS=8556671;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:196:98:98:98:98:57:41:50:48:57:41:50:48 chr3 8590313 . T C 72.9 PASS AO=9;DP=56;FAO=21;FDP=55;FR=.;FRO=34;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=-0.015523;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.642;QD=5.30163;RBI=0.0163114;REFB=-0.0249724;REVB=-0.00500984;RO=28;SAF=6;SAR=3;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.318873;STB=0.533301;TYPE=snp;VARB=0.0557301;OID=.;OPOS=8590313;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:43:55:28:34:9:21:3:6:11:17:14:7:13:21 chr3 8675539 . G A 276.2 PASS AO=52;DP=83;FAO=53;FDP=91;FR=.;FRO=38;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=-0.0183094;FXX=0.0421008;HRUN=3;LEN=1;MLLD=87.3861;QD=12.1405;RBI=0.0207074;REFB=-0.0415844;REVB=-0.00967289;RO=31;SAF=32;SAR=20;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.047959;STB=0.519223;TYPE=snp;VARB=0.0400857;OID=.;OPOS=8675539;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:91:31:38:52:53:20:32:17:14:20:33:22:16 chr3 8676204 . A G 937.21 PASS AO=94;DP=95;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00601673;FXX=0.029997;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.3;QD=38.6479;RBI=0.0691834;REFB=0;REVB=0.0689213;RO=0;SAF=35;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.06074e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000305214;OID=.;OPOS=8676204;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:95:97:0:0:94:97:59:35:0:0:62:35:0:0 chr3 8676306 . A G 35.47 PASS AO=13;DP=49;FAO=14;FDP=50;FR=.;FRO=36;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=-0.10406;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.714;QD=2.83784;RBI=0.106136;REFB=-0.0107655;REVB=-0.0208869;RO=36;SAF=2;SAR=11;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.386611;STB=0.755131;TYPE=snp;VARB=0.00737529;OID=.;OPOS=8676306;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:49:50:36:36:13:14:11:2:15:21:12:2:15:21 chr3 8809184 . G A 539.89 PASS AO=55;DP=55;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00335601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.777;QD=37.8869;RBI=0.0160849;REFB=0;REVB=0.0157309;RO=0;SAF=44;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000136274;OID=.;OPOS=8809184;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:55:57:0:0:55:57:11:44:0:0:12:45:0:0 chr3 8809703 . G A 498.37 PASS AO=52;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00274988;FXX=0.036357;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.075;QD=37.6128;RBI=0.0897815;REFB=0;REVB=0.0897394;RO=0;SAF=21;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.93989e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00036199;OID=.;OPOS=8809703;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:53:53:0:0:52:53:31:21:0:0:31:22:0:0 chr3 8973283 . C G 193.94 PASS AO=37;DP=63;FAO=37;FDP=63;FR=.;FRO=26;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.0182674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.5542;QD=12.3139;RBI=0.018771;REFB=0.00751525;REVB=0.00431871;RO=25;SAF=23;SAR=14;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165218;STB=0.583506;TYPE=snp;VARB=-0.003653;OID=.;OPOS=8973283;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:63:63:25:26:37:37:14:23:10:15:14:23:11:15 chr3 9005078 . C T 427.11 PASS AO=65;DP=89;FAO=65;FDP=89;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=56;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0193638;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=231.005;QD=19.1958;RBI=0.0206647;REFB=-0.0500856;REVB=0.00721613;RO=23;SAF=9;SAR=56;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.2423;STB=0.628054;TYPE=snp;VARB=0.0145208;OID=.;OPOS=9005078;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:89:89:23:24:65:65:56:9:10:13:56:9:10:14 chr3 9026818 . G A 1654.39 PASS AO=174;DP=176;FAO=175;FDP=175;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0121888;FXX=0.0056815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.769;QD=37.8146;RBI=0.024669;REFB=0;REVB=0.0214475;RO=0;SAF=63;SAR=111;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0214e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.432e-05;OID=.;OPOS=9026818;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:176:175:0:0:174:175:111:63:0:0:111:64:0:0 chr3 9079713 . CA C,CG 266.03 PASS AO=10,19;DP=30;FAO=10,19;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=0,17;FSAR=10,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189089,0.0308207;FXX=0.0644953;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=59.0679,65.7268;QD=36.6944;RBI=0.0296579,0.0449814;REFB=0,0;REVB=-0.0228482,-0.032763;RO=0;SAF=0,17;SAR=10,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.41729e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.0126013,0.0148403;OID=.,.;OPOS=9079714,9079714;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:10,19:30:10,19:29:0:0,17:10,2:0:0:33:0:0,17:10,2:0:0 chr3 9091151 . C G 875.66 PASS AO=100;DP=108;FAO=103;FDP=108;FR=.;FRO=5;FSAF=51;FSAR=52;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0272466;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=180.19;QD=32.432;RBI=0.0279331;REFB=-0.0646108;REVB=0.00615482;RO=6;SAF=49;SAR=51;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0546233;STB=0.52336;TYPE=snp;VARB=0.000549158;OID=.;OPOS=9091151;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:108:108:6:5:100:103:51:49:6:0:52:51:5:0 chr3 9122948 . A G 1741.67 PASS AO=179;DP=181;FAO=182;FDP=182;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0594688;FXX=0.010869;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.317;QD=38.2785;RBI=0.060346;REFB=0;REVB=0.0102515;RO=1;SAF=73;SAR=106;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00647672;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.69834e-05;OID=.;OPOS=9122948;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:82:181:182:1:0:179:182:106:73:1:0:104:78:0:0 chr3 9166510 . GA G 31.63 PASS AO=13;DP=33;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=1;FSAR=15;FSRF=4;FSRR=14;FWDB=-0.0689392;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.8855;QD=3.72163;RBI=0.115034;REFB=-0.110814;REVB=-0.0920877;RO=18;SAF=1;SAR=12;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.325775;STB=0.72079;TYPE=del;VARB=0.08341;OID=.;OPOS=9166511;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:13:32:16:34:18:1:15:4:14:31:18:1:12:4:14 chr3 9425944 . G C 227.43 PASS AO=58;DP=127;FAO=58;FDP=127;FR=.;FRO=69;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=25;FSRR=44;FWDB=0.000664117;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.686;QD=7.16306;RBI=0.00995495;REFB=-0.0191917;REVB=-0.00993277;RO=69;SAF=25;SAR=33;SRF=25;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0691928;STB=0.538448;TYPE=snp;VARB=0.0198037;OID=.;OPOS=9425944;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:69:69:58:58:33:25:25:44:33:25:25:44 chr3 9426224 . G A 501.79 PASS AO=124;DP=281;FAO=132;FDP=289;FR=.;FRO=157;FSAF=63;FSAR=69;FSRF=79;FSRR=78;FWDB=0.00407277;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.447;QD=6.94517;RBI=0.124906;REFB=-0.00388679;REVB=0.12484;RO=152;SAF=61;SAR=63;SRF=78;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0210987;STB=0.514086;TYPE=snp;VARB=0.00505437;OID=.;OPOS=9426224;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:281:289:152:157:124:132:63:61:78:74:69:63:79:78 chr3 9540366 . C G 1222.91 PASS AO=127;DP=129;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218359;FXX=0.0155027;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.849;QD=38.5168;RBI=0.059142;REFB=0;REVB=0.0549634;RO=0;SAF=64;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.21543e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000163154;OID=.;OPOS=9540366;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:129:127:0:0:127:127:63:64:0:0:63:64:0:0 chr3 9768336 . C G 444.03 PASS AO=112;DP=241;FAO=112;FDP=239;FR=.;FRO=127;FSAF=68;FSAR=44;FSRF=63;FSRR=64;FWDB=-0.0106561;FXX=0.0164602;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.789;QD=7.43145;RBI=0.0210056;REFB=-0.00733537;REVB=-0.018102;RO=120;SAF=68;SAR=44;SRF=59;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110584;STB=0.560258;TYPE=snp;VARB=0.00650109;OID=.;OPOS=9768336;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:241:239:120:127:112:112:44:68:59:61:44:68:63:64 chr3 9769008 . A T 189.88 PASS AO=40;DP=69;FAO=40;FDP=75;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=31;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=-0.026946;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.264;QD=10.1271;RBI=0.0576411;REFB=-0.0110781;REVB=-0.0509549;RO=29;SAF=9;SAR=31;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18278;STB=0.572521;TYPE=snp;VARB=0.0229089;OID=.;OPOS=9769008;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:75:29:35:40:40:31:9:12:17:31:9:12:23 chr3 9798773 . C G 316.53 PASS AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207006;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=266.615;QD=37.2382;RBI=0.0208491;REFB=0;REVB=0.00248375;RO=0;SAF=17;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.69146e-05;OID=.;OPOS=9798773;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:34:0:0:34:34:17:17:0:0:17:17:0:0 chr3 9920138 . G C 1311.94 PASS AO=149;DP=160;FAO=152;FDP=160;FR=.;FRO=8;FSAF=97;FSAR=55;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=-9.50801e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.721;QD=32.7986;RBI=0.0315254;REFB=-0.163725;REVB=-0.0315253;RO=4;SAF=94;SAR=55;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00696811;STB=0.506074;TYPE=snp;VARB=0.00318634;OID=.;OPOS=9920138;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:160:160:4:8:149:152:55:94:2:2:55:97:6:2 chr3 9934605 . T C 185.52 PASS AO=42;DP=87;FAO=43;FDP=88;FR=.;FRO=45;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=27;FSRR=18;FWDB=-0.0265341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.323;QD=8.43272;RBI=0.0276764;REFB=-0.00235759;REVB=0.00786927;RO=45;SAF=20;SAR=22;SRF=27;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114712;STB=0.568616;TYPE=snp;VARB=0.00278212;OID=.;OPOS=9934605;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:88:45:45:42:43:22:20:27:18:23:20:27:18 chr3 9970031 . A G 45.01 PASS AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0694801;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.4122;QD=25.7177;RBI=0.169942;REFB=0.0973411;REVB=0.155089;RO=1;SAF=3;SAR=3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123249;STB=0.571194;TYPE=snp;VARB=-0.00284054;OID=.;OPOS=9970031;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:7:7:1:1:6:6:3:3:1:0:3:3:1:0 chr3 9976159 . A G 207.63 PASS AO=20;DP=22;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00802799;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.269;QD=36.1103;RBI=0.00805246;REFB=0;REVB=0.000627276;RO=0;SAF=6;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5931e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000822732;OID=.;OPOS=9976159;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:22:23:0:0:20:23:14:6:0:0:17:6:0:0 chr3 9976236 . TC T 99.85 PASS AO=33;DP=75;FAO=36;FDP=67;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=30;FWDB=0.115339;FXX=0.0289813;HRUN=5;LEN=1;MLLD=13.545;QD=5.96107;RBI=0.138597;REFB=-0.117309;REVB=0.0768511;RO=31;SAF=6;SAR=27;SRF=1;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0.386935;SSSB=0.26503;STB=0.631521;TYPE=del;VARB=0.0959947;OID=.;OPOS=9976237;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:33:68:36:67:31:6:30:1:30:56:31:6:27:1:30 chr3 9982616 . T A 914.48 PASS AO=92;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.236469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.8105;QD=37.7105;RBI=0.236469;REFB=0;REVB=0;RO=3;SAF=92;SAR=0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00179938;OID=.;OPOS=9982616;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:97:97:3:0:92:97:0:92:3:0:0:97:0:0 chr3 9986249 . A G 67.68 PASS AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.00524116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.705;QD=9.66786;RBI=0.070867;REFB=-0.034777;REVB=-0.070673;RO=14;SAF=4;SAR=10;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.320311;STB=0.68394;TYPE=snp;VARB=0.0361086;OID=.;OPOS=9986249;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:28:28:14:14:14:14:10:4:9:5:10:4:9:5 chr3 9991388 . G C 1933.62 PASS AO=203;DP=204;FAO=204;FDP=204;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0100256;FXX=0.00487781;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.549;QD=37.9142;RBI=0.0166609;REFB=0;REVB=0.0133069;RO=0;SAF=96;SAR=107;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.10553e-05;OID=.;OPOS=9991388;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:89:204:204:0:0:203:204:107:96:0:0:107:97:0:0 chr3 10088266 . G T 23.13 PASS AO=48;DP=305;FAO=47;FDP=303;FR=.;FRO=256;FSAF=29;FSAR=18;FSRF=119;FSRR=137;FWDB=-0.003674;FXX=0.00328937;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.719;QD=0.305321;RBI=0.00433654;REFB=0.00280219;REVB=0.00230376;RO=250;SAF=29;SAR=19;SRF=117;SRR=133;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175288;STB=0.627827;TYPE=snp;VARB=-0.0119772;OID=.;OPOS=10088266;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:305:303:250:256:48:47:19:29:117:133:18:29:119:137 chr3 10088299 . C T 47.78 PASS AO=55;DP=284;FAO=54;FDP=284;FR=.;FRO=230;FSAF=31;FSAR=23;FSRF=102;FSRR=128;FWDB=0.000293175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.614;QD=0.673;RBI=0.0182799;REFB=-0.000280023;REVB=-0.0182775;RO=228;SAF=31;SAR=24;SRF=102;SRR=126;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149211;STB=0.604742;TYPE=snp;VARB=0.000539374;OID=.;OPOS=10088299;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:284:284:228:230:55:54:24:31:102:126:23:31:102:128 chr3 10088308 . T C 65.44 PASS AO=57;DP=267;FAO=57;FDP=268;FR=.;FRO=211;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=94;FSRR=117;FWDB=0.0171993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.676;QD=0.976732;RBI=0.0212834;REFB=0.00348742;REVB=0.0125366;RO=209;SAF=29;SAR=28;SRF=93;SRR=116;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0817422;STB=0.563358;TYPE=snp;VARB=-0.00851973;OID=.;OPOS=10088308;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:267:268:209:211:57:57:28:29:93:116:27:30:94:117 chr3 10088343 . A G 76.45 PASS AO=54;DP=227;FAO=53;FDP=226;FR=.;FRO=173;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=76;FSRR=97;FWDB=-0.0149173;FXX=0.00440509;HRUN=3;LEN=1;MLLD=108.175;QD=1.35316;RBI=0.020364;REFB=-0.00516177;REVB=-0.0138624;RO=172;SAF=29;SAR=25;SRF=76;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119764;STB=0.58199;TYPE=snp;VARB=0.0169785;OID=.;OPOS=10088343;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:227:226:172:173:54:53:25:29:76:96:24:29:76:97 chr3 10088404 . C T 18.4 PASS AO=33;DP=151;FAO=25;FDP=143;FR=.;FRO=118;FSAF=23;FSAR=2;FSRF=61;FSRR=57;FWDB=0.00194024;FXX=0.0529766;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.822;QD=0.514578;RBI=0.00767295;REFB=-0.024776;REVB=0.00742359;RO=116;SAF=24;SAR=9;SRF=59;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.289716;STB=0.889482;TYPE=snp;VARB=0.1023;OID=.;OPOS=10088404;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:151:143:116:118:33:25:9:24:59:57:2:23:61:57 chr3 10089723 . G A 123.43 PASS AO=53;DP=168;FAO=52;FDP=167;FR=.;FRO=115;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=50;FSRR=65;FWDB=-0.0314288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.505;QD=2.95644;RBI=0.0317767;REFB=-0.00670049;REVB=0.00468911;RO=115;SAF=25;SAR=28;SRF=50;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0438855;STB=0.53178;TYPE=snp;VARB=0.0165123;OID=.;OPOS=10089723;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:167:115:115:53:52:28:25:50:65:27:25:50:65 chr3 10089738 . A G 74.16 PASS AO=38;DP=138;FAO=37;FDP=136;FR=.;FRO=99;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=41;FSRR=58;FWDB=0.0508569;FXX=0.00729874;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3681;QD=2.18117;RBI=0.0525266;REFB=-0.00967924;REVB=0.0131384;RO=99;SAF=14;SAR=24;SRF=41;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.058669;STB=0.527288;TYPE=snp;VARB=0.0275001;OID=.;OPOS=10089738;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:138:136:99:99:38:37:24:14:41:58:23:14:41:58 chr3 10142949 . C T 253.58 PASS AO=76;DP=188;FAO=76;FDP=188;FR=.;FRO=112;FSAF=39;FSAR=37;FSRF=60;FSRR=52;FWDB=-0.00644703;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=188.245;QD=5.39533;RBI=0.0114885;REFB=-0.0110454;REVB=0.00950897;RO=112;SAF=39;SAR=37;SRF=60;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0239649;STB=0.513453;TYPE=snp;VARB=0.0144861;OID=.;OPOS=10142949;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:188:112:112:76:76:37:39:60:52:37:39:60:52 chr3 10183274 . C T 109.93 PASS AO=12;DP=14;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=2.03393e-05;FXX=0.142755;HRUN=1;LEN=1;MLLD=41.4194;QD=36.6427;RBI=0.0599652;REFB=0;REVB=-0.0599652;RO=0;SAF=0;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00267984;OID=.;OPOS=10183274;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:14:12:0:0:12:12:12:0:0:0:12:0:0:0 chr3 10188340 . TA T 78.38 PASS AO=34;DP=141;FAO=78;FDP=151;FR=.;FRO=73;FSAF=24;FSAR=54;FSRF=31;FSRR=42;FWDB=0.0877948;FXX=0.0382141;HRUN=5;LEN=1;MLLD=6.64555;QD=2.07639;RBI=0.249758;REFB=-0.122754;REVB=-0.233819;RO=62;SAF=1;SAR=33;SRF=30;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.73397;STB=0.563123;TYPE=del;VARB=0.116582;OID=.;OPOS=10188341;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:34:127:78:151:73:24:54:31:42:77:62:1:33:30:32 chr3 10264480 . C G 389.14 PASS AO=83;DP=165;FAO=87;FDP=168;FR=.;FRO=81;FSAF=21;FSAR=66;FSRF=23;FSRR=58;FWDB=0.0702205;FXX=0.00591681;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.459;QD=9.26534;RBI=0.07341;REFB=-0.0158281;REVB=-0.0214035;RO=80;SAF=19;SAR=64;SRF=22;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0561788;STB=0.527227;TYPE=snp;VARB=0.0155584;OID=.;OPOS=10264480;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:168:80:81:83:87:64:19:22:58:66:21:23:58 chr3 10276163 . T A 341.16 PASS AO=73;DP=141;FAO=75;FDP=143;FR=.;FRO=68;FSAF=34;FSAR=41;FSRF=23;FSRR=45;FWDB=-0.00333456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.815;QD=9.54293;RBI=0.0152414;REFB=-0.0149141;REVB=0.0148722;RO=68;SAF=34;SAR=39;SRF=23;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113651;STB=0.555773;TYPE=snp;VARB=0.0141877;OID=.;OPOS=10276163;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:143:68:68:73:75:39:34:23:45:41:34:23:45 chr3 10280465 . C A 373.25 PASS AO=84;DP=163;FAO=84;FDP=163;FR=.;FRO=79;FSAF=55;FSAR=29;FSRF=56;FSRR=23;FWDB=0.0105596;FXX=0.00609719;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.492;QD=9.15959;RBI=0.0113802;REFB=-0.0174703;REVB=-0.00424317;RO=77;SAF=55;SAR=29;SRF=54;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0456489;STB=0.529521;TYPE=snp;VARB=0.020123;OID=.;OPOS=10280465;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:163:77:79:84:84:29:55:54:23:29:55:56:23 chr3 10302045 . C T 83.56 PASS AO=19;DP=41;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.0852322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.826;QD=8.1523;RBI=0.0863079;REFB=-0.0134127;REVB=-0.0135842;RO=21;SAF=9;SAR=10;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0418943;STB=0.534847;TYPE=snp;VARB=0.0130776;OID=.;OPOS=10302045;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:41:41:21:22:19:19:10:9:9:12:10:9:9:13 chr3 10302056 . A G 61.36 PASS AO=19;DP=51;FAO=18;FDP=49;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.0279846;FXX=0.039208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.6484;QD=5.00913;RBI=0.03623;REFB=-0.044014;REVB=0.0230103;RO=31;SAF=9;SAR=10;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.023668;STB=0.530578;TYPE=snp;VARB=0.0709894;OID=.;OPOS=10302056;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:51:49:31:31:19:18:10:9:14:17:9:9:14:17 chr3 10302172 . G A 98.16 PASS AO=28;DP=71;FAO=28;FDP=71;FR=.;FRO=43;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=27;FWDB=-0.0293193;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.347;QD=5.52989;RBI=0.0332067;REFB=-0.00140795;REVB=0.0155905;RO=40;SAF=14;SAR=14;SRF=14;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155507;STB=0.577411;TYPE=snp;VARB=0.00255205;OID=.;OPOS=10302172;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:71:71:40:43:28:28:14:14:14:26:14:14:16:27 chr3 10353550 . T C 107.71 PASS AO=18;DP=31;FAO=19;FDP=31;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.0277711;FXX=0.0605877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=42.9781;QD=13.8985;RBI=0.0720745;REFB=-0.0676855;REVB=0.0665094;RO=8;SAF=10;SAR=8;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0392457;STB=0.542328;TYPE=snp;VARB=0.0463545;OID=.;OPOS=10353550;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:31:31:8:12:18:19:8:10:5:3:9:10:5:7 chr3 10353626 . C T 285.7 PASS AO=54;DP=91;FAO=54;FDP=91;FR=.;FRO=37;FSAF=18;FSAR=36;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=0.00443319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.567;QD=12.5581;RBI=0.0240261;REFB=-0.0103705;REVB=0.0236135;RO=37;SAF=18;SAR=36;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0590144;STB=0.532246;TYPE=snp;VARB=0.00676918;OID=.;OPOS=10353626;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:37:37:54:54:36:18:15:22:36:18:15:22 chr3 10368577 . C A 346.8 PASS AO=89;DP=193;FAO=89;FDP=193;FR=.;FRO=104;FSAF=37;FSAR=52;FSRF=63;FSRR=41;FWDB=0.00813175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.75;QD=7.18745;RBI=0.0495666;REFB=-0.0128464;REVB=0.048895;RO=103;SAF=37;SAR=52;SRF=63;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188679;STB=0.601759;TYPE=snp;VARB=0.0213175;OID=.;OPOS=10368577;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:193:103:104:89:89:52:37:63:40:52:37:63:41 chr3 10368948 . G A 387.05 PASS AO=112;DP=263;FAO=112;FDP=266;FR=.;FRO=154;FSAF=46;FSAR=66;FSRF=98;FSRR=56;FWDB=-0.00211784;FXX=0.00374518;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.348;QD=5.82024;RBI=0.0208168;REFB=-0.0150169;REVB=0.0207088;RO=145;SAF=46;SAR=66;SRF=92;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224601;STB=0.628715;TYPE=snp;VARB=0.0185696;OID=.;OPOS=10368948;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:263:266:145:154:112:112:66:46:92:53:66:46:98:56 chr3 10379923 . C T 336.56 PASS AO=76;DP=149;FAO=76;FDP=149;FR=.;FRO=73;FSAF=46;FSAR=30;FSRF=35;FSRR=38;FWDB=0.0300087;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.38;QD=9.03507;RBI=0.0505633;REFB=-0.0539783;REVB=0.0406956;RO=73;SAF=46;SAR=30;SRF=35;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114069;STB=0.562776;TYPE=snp;VARB=0.054816;OID=.;OPOS=10379923;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:73:73:76:76:30:46:35:38:30:46:35:38 chr3 10413715 . G A 152.1 PASS AO=35;DP=72;FAO=35;FDP=72;FR=.;FRO=37;FSAF=9;FSAR=26;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=-0.00115144;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=248.573;QD=8.44971;RBI=0.0209014;REFB=0.000369384;REVB=0.0208696;RO=36;SAF=9;SAR=26;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171042;STB=0.590854;TYPE=snp;VARB=-0.00023977;OID=.;OPOS=10413715;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:36:37:35:35:26:9:15:21:26:9:15:22 chr3 10443827 . G C 306.62 PASS AO=62;DP=116;FAO=64;FDP=117;FR=.;FRO=53;FSAF=46;FSAR=18;FSRF=35;FSRR=18;FWDB=0.0129005;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.737;QD=10.4827;RBI=0.0237089;REFB=-0.0386267;REVB=0.019892;RO=52;SAF=45;SAR=17;SRF=34;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0723006;STB=0.531782;TYPE=snp;VARB=0.027338;OID=.;OPOS=10443827;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:117:52:53:62:64:17:45:34:18:18:46:35:18 chr3 10967739 . T C 234.36 PASS AO=22;DP=28;FAO=25;FDP=25;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.160498;FXX=0.0740466;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.323;QD=37.4983;RBI=0.164956;REFB=0;REVB=0.0380882;RO=0;SAF=6;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17051e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000810292;OID=.;OPOS=10967739;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:27:25:0:0:22:25:16:6:0:0:15:10:0:0 chr3 10976876 . A G 45.9 PASS AO=14;DP=41;FAO=14;FDP=41;FR=.;FRO=27;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=22;FWDB=-0.0121989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.6801;QD=4.47846;RBI=0.0181982;REFB=-0.00686503;REVB=-0.0135042;RO=27;SAF=4;SAR=10;SRF=5;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148844;STB=0.587044;TYPE=snp;VARB=0.0111156;OID=.;OPOS=10976876;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:41:41:27:27:14:14:10:4:5:22:10:4:5:22 chr3 11302933 . A G 768.96 PASS AO=82;DP=83;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00479461;FXX=0.0240935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.122;QD=37.9732;RBI=0.0354213;REFB=0;REVB=0.0350953;RO=0;SAF=33;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.22047e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000387881;OID=.;OPOS=11302933;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:83:81:0:0:82:81:49:33:0:0:49:32:0:0 chr3 11303437 . T C 73.84 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0546129;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.783;QD=36.9198;RBI=0.0687367;REFB=0;REVB=0.0417391;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000363471;OID=.;OPOS=11303437;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:5:3:0:0:5:3:0:0 chr3 11303874 . T C 2225.41 PASS AO=238;DP=242;FAO=239;FDP=239;FR=.;FRO=0;FSAF=121;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00792021;FXX=0.0123962;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.104;QD=37.2454;RBI=0.0343781;REFB=-0.100375;REVB=0.0334533;RO=0;SAF=121;SAR=117;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000582696;OID=.;OPOS=11303874;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:87:242:239:0:0:238:239:117:121:0:0:118:121:0:0 chr3 11643465 . T C 450.27 PASS AO=48;DP=50;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.018845;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.813;QD=36.757;RBI=0.0496754;REFB=0.0617919;REVB=-0.0459621;RO=1;SAF=12;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012892;STB=0.506846;TYPE=snp;VARB=-0.00165408;OID=.;OPOS=11643465;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:50:49:1:1:48:48:36:12:0:1:36:12:0:1 chr3 11886451 . G A 981.41 PASS AO=102;DP=104;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=100;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166521;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.612;QD=37.0342;RBI=0.148336;REFB=0;REVB=0.147398;RO=2;SAF=98;SAR=4;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187984;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000494355;OID=.;OPOS=11886451;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:104:106:2:0:102:106:4:98:0:2:6:100:0:0 chr3 11887991 . C G 627.14 PASS AO=62;DP=62;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0234607;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.6;QD=38.0082;RBI=0.0363589;REFB=0;REVB=0.027777;RO=0;SAF=32;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000779864;OID=.;OPOS=11887991;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:62:66:0:0:62:66:30:32:0:0:33:33:0:0 chr3 11994493 . C T 450.88 PASS AO=56;DP=64;FAO=57;FDP=65;FR=.;FRO=8;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.0242853;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=271.318;QD=27.7466;RBI=0.0492141;REFB=-0.0801148;REVB=0.0428048;RO=7;SAF=32;SAR=24;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119436;STB=0.553794;TYPE=snp;VARB=0.00208734;OID=.;OPOS=11994493;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:64:65:7:8:56:57:24:32:0:7:25:32:1:7 chr3 12229015 . A G 517.38 PASS AO=52;DP=55;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249852;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.6498;QD=36.3076;RBI=0.0622175;REFB=0;REVB=-0.0569803;RO=0;SAF=2;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.20608e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00412479;OID=.;OPOS=12229015;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:55:57:0:0:52:57:50:2:0:0:52:5:0:0 chr3 12232074 . A G 1242.06 PASS AO=129;DP=129;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.268;QD=38.5135;RBI=0.0148234;REFB=0;REVB=-0.0102317;RO=0;SAF=63;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.8038e-07;OID=.;OPOS=12232074;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:129:129:0:0:129:129:66:63:0:0:66:63:0:0 chr3 12552628 . A C 208.98 PASS AO=42;DP=96;FAO=50;FDP=103;FR=.;FRO=53;FSAF=38;FSAR=12;FSRF=50;FSRR=3;FWDB=0.0132998;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.415;QD=8.11555;RBI=0.0135202;REFB=-0.0321416;REVB=0.00243091;RO=54;SAF=30;SAR=12;SRF=51;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.336127;STB=0.649399;TYPE=snp;VARB=0.0318886;OID=.;OPOS=12552628;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:103:54:53:42:50:12:30:51:3:12:38:50:3 chr3 12586765 . T C 299.37 PASS AO=75;DP=163;FAO=75;FDP=162;FR=.;FRO=87;FSAF=41;FSAR=34;FSRF=41;FSRR=46;FWDB=-0.00737672;FXX=0.00613459;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.882;QD=7.39189;RBI=0.0108643;REFB=-0.0177348;REVB=-0.00797605;RO=83;SAF=41;SAR=34;SRF=41;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0501913;STB=0.54053;TYPE=snp;VARB=0.0178995;OID=.;OPOS=12586765;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:162:83:87:75:75:34:41:41:42:34:41:41:46 chr3 12613866 . T C 327.64 PASS AO=60;DP=97;FAO=60;FDP=97;FR=.;FRO=37;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=0.0450063;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.3099;QD=13.5109;RBI=0.0459763;REFB=-0.0408607;REVB=-0.00939423;RO=37;SAF=28;SAR=32;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0433407;STB=0.523538;TYPE=snp;VARB=0.0259877;OID=.;OPOS=12613866;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:37:37:60:60:32:28:15:22:32:28:15:22 chr3 12645007 . C T 163.06 PASS AO=33;DP=63;FAO=34;FDP=63;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.000437426;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.723;QD=10.3532;RBI=0.00125684;REFB=-0.0139131;REVB=0.00117827;RO=29;SAF=16;SAR=17;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.060113;STB=0.5263;TYPE=snp;VARB=0.0138189;OID=.;OPOS=12645007;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:29:29:33:34:17:16:12:17:18:16:12:17 chr3 12810755 . G C 59.48 PASS AO=16;DP=36;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=1;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=0.0185603;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.1476;QD=6.60838;RBI=0.0377688;REFB=-0.0411084;REVB=0.0328937;RO=20;SAF=1;SAR=15;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.471091;STB=0.77117;TYPE=snp;VARB=0.0164581;OID=.;OPOS=12810755;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:36:36:20:21:16:15:15:1:6:14:14:1:6:15 chr3 12838293 . G C 54.85 PASS AO=13;DP=42;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=23;FWDB=0.0530475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.213;QD=4.76919;RBI=0.0611321;REFB=-0.027664;REVB=0.0303824;RO=27;SAF=3;SAR=10;SRF=6;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136741;STB=0.60703;TYPE=snp;VARB=0.0566331;OID=.;OPOS=12838293;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:42:46:27:29:13:17:10:3:6:21:11:6:6:23 chr3 12848822 . T C 626.29 PASS AO=57;DP=57;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00997058;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.764;QD=37.957;RBI=0.0178276;REFB=0;REVB=-0.0147787;RO=0;SAF=27;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.32681e-05;OID=.;OPOS=12848822;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:57:66:0:0:57:66:30:27:0:0:38:28:0:0 chr3 12856856 . A G 39.78 PASS AO=6;DP=12;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.0326398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.483;QD=12.2402;RBI=0.0392451;REFB=-0.00610958;REVB=0.0217905;RO=6;SAF=3;SAR=3;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280783;STB=0.680376;TYPE=snp;VARB=0.00702063;OID=.;OPOS=12856856;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:12:13:6:6:6:7:3:3:5:1:4:3:5:1 chr3 12857493 . C T 206.11 PASS AO=49;DP=97;FAO=48;FDP=98;FR=.;FRO=50;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=21;FSRR=29;FWDB=-0.017967;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7791;QD=8.41264;RBI=0.0201618;REFB=0.000810693;REVB=0.00914793;RO=47;SAF=24;SAR=25;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0570402;STB=0.530303;TYPE=snp;VARB=-0.00098506;OID=.;OPOS=12857493;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:98:47:50:49:48:25:24:20:27:25:23:21:29 chr3 12858028 . T C 253.44 PASS AO=53;DP=104;FAO=56;FDP=107;FR=.;FRO=51;FSAF=13;FSAR=43;FSRF=16;FSRR=35;FWDB=-0.00920626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.448;QD=9.47447;RBI=0.0138624;REFB=-0.00676866;REVB=-0.0103639;RO=50;SAF=12;SAR=41;SRF=16;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109154;STB=0.551507;TYPE=snp;VARB=0.00614461;OID=.;OPOS=12858028;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:107:50:51:53:56:41:12:16:34:43:13:16:35 chr3 12858463 . GC G 40.16 PASS AO=12;DP=27;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=-0.0523688;FXX=0.0370233;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.867;QD=6.17819;RBI=0.217734;REFB=-0.00920297;REVB=0.211342;RO=11;SAF=11;SAR=1;SRF=2;SRR=9;SSEN=0.220994;SSEP=0;SSSB=0.676066;STB=0.824475;TYPE=del;VARB=0.0561259;OID=.;OPOS=12858464;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:12:26:13:26:13:11:2:3:10:31:11:11:1:2:9 chr3 12859004 . A C 146.3 PASS AO=20;DP=35;FAO=25;FDP=40;FR=.;FRO=15;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0074874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.424;QD=14.6304;RBI=0.055307;REFB=-0.0233745;REVB=0.0547979;RO=15;SAF=12;SAR=8;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103819;STB=0.505006;TYPE=snp;VARB=0.015305;OID=.;OPOS=12859004;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:35:40:15:15:20:25:8:12:7:8:13:12:7:8 chr3 12861586 . T C 105.27 PASS AO=30;DP=67;FAO=28;FDP=66;FR=.;FRO=38;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=0.00651565;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.2259;QD=6.3797;RBI=0.0255358;REFB=-0.0151068;REVB=0.0246905;RO=36;SAF=9;SAR=21;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126227;STB=0.572085;TYPE=snp;VARB=0.044742;OID=.;OPOS=12861586;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:66:36:38:30:28:21:9:15:21:20:8:15:23 chr3 12861608 . G A 135.92 PASS AO=34;DP=75;FAO=34;FDP=75;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=15;FSRR=26;FWDB=0.0109697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.324;QD=7.2491;RBI=0.0137718;REFB=0.00561797;REVB=-0.00832629;RO=41;SAF=10;SAR=24;SRF=15;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0806105;STB=0.545427;TYPE=snp;VARB=-0.00674572;OID=.;OPOS=12861608;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:41:41:34:34:24:10:15:26:24:10:15:26 chr3 12875443 . G A 269.5 PASS AO=55;DP=100;FAO=55;FDP=100;FR=.;FRO=45;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=15;FSRR=30;FWDB=-0.00575492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.553;QD=10.7798;RBI=0.00729828;REFB=0.00551405;REVB=0.0044884;RO=45;SAF=27;SAR=28;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12987;STB=0.571091;TYPE=snp;VARB=-0.00515909;OID=.;OPOS=12875443;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:45:45:55:55:28:27:15:30:28:27:15:30 chr3 13361287 . C T 200.15 PASS AO=50;DP=109;FAO=50;FDP=109;FR=.;FRO=59;FSAF=41;FSAR=9;FSRF=35;FSRR=24;FWDB=-0.00438861;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.469;QD=7.34489;RBI=0.00485167;REFB=-0.00856441;REVB=0.00206852;RO=58;SAF=41;SAR=9;SRF=35;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.278653;STB=0.664138;TYPE=snp;VARB=0.00743346;OID=.;OPOS=13361287;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:58:59:50:50:9:41:35:23:9:41:35:24 chr3 13361391 . A G 801.23 PASS AO=85;DP=88;FAO=85;FDP=86;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0206569;FXX=0.0337041;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.774;QD=37.2666;RBI=0.0206996;REFB=-0.041164;REVB=0.00132984;RO=1;SAF=46;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101877;STB=0.505375;TYPE=snp;VARB=0.000191019;OID=.;OPOS=13361391;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:88:86:1:1:85:85:39:46:1:0:39:46:1:0 chr3 13364876 . G T 363.92 PASS AO=75;DP=138;FAO=76;FDP=139;FR=.;FRO=63;FSAF=41;FSAR=35;FSRF=32;FSRR=31;FWDB=-0.0065974;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0123;QD=10.4726;RBI=0.151557;REFB=0.00556389;REVB=0.151414;RO=63;SAF=40;SAR=35;SRF=32;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0212458;STB=0.514347;TYPE=snp;VARB=-0.00349043;OID=.;OPOS=13364876;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:139:63:63:75:76:35:40:32:31:35:41:32:31 chr3 13368892 . G A 262.22 PASS AO=51;DP=88;FAO=51;FDP=88;FR=.;FRO=37;FSAF=31;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.0136514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.141;QD=11.9189;RBI=0.0922189;REFB=-0.0275596;REVB=0.0912029;RO=37;SAF=31;SAR=20;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0535126;STB=0.529292;TYPE=snp;VARB=0.0223112;OID=.;OPOS=13368892;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:37:37:51:51:20:31:20:17:20:31:20:17 chr3 13379400 . C T 437.02 PASS AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=50;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.023006;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.5947;QD=34.9618;RBI=0.0286199;REFB=-0.00802855;REVB=-0.0170241;RO=1;SAF=17;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.026866;STB=0.527766;TYPE=snp;VARB=0.00102011;OID=.;OPOS=13379400;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:49:50:1:2:48:48:31:17:1:0:31:17:2:0 chr3 13383540 . A G 827.3 PASS AO=98;DP=108;FAO=99;FDP=109;FR=.;FRO=10;FSAF=78;FSAR=21;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0117549;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=144.751;QD=30.3597;RBI=0.0235375;REFB=-0.0604626;REVB=0.020392;RO=10;SAF=77;SAR=21;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0708877;STB=0.53778;TYPE=snp;VARB=0.000937574;OID=.;OPOS=13383540;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:108:109:10:10:98:99:21:77:5:5:21:78:5:5 chr3 13395579 . C A 641.59 PASS AO=68;DP=78;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0664242;FXX=0.11537;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.2663;QD=37.1938;RBI=0.0692842;REFB=-0.128285;REVB=0.019701;RO=1;SAF=38;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122766;STB=0.506492;TYPE=snp;VARB=0.0012775;OID=.;OPOS=13395579;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:78:69:1:1:68:68:30:38:1:0:30:38:1:0 chr3 13407556 . T C 626.1 PASS AO=70;DP=73;FAO=71;FDP=74;FR=.;FRO=3;FSAF=9;FSAR=62;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.025513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.172;QD=33.8435;RBI=0.0558098;REFB=-0.0886734;REVB=0.0496369;RO=1;SAF=9;SAR=61;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0496621;STB=0.518389;TYPE=snp;VARB=0.000683629;OID=.;OPOS=13407556;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:73:74:1:3:70:71:61:9:1:0:62:9:1:2 chr3 13421150 . C T 572.29 PASS AO=62;DP=62;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00622057;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.087;QD=37.5274;RBI=0.0527284;REFB=0;REVB=0.0523602;RO=0;SAF=32;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.60882e-05;OID=.;OPOS=13421150;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:62:61:0:0:62:61:30:32:0:0:30:31:0:0 chr3 13670481 . A G 210.68 PASS AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0270764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2794;QD=36.6391;RBI=0.0295427;REFB=0;REVB=0.0118169;RO=0;SAF=9;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84921e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000882365;OID=.;OPOS=13670481;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:0:0:23:23:14:9:0:0:14:9:0:0 chr3 13670536 . A G 125 PASS AO=12;DP=12;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.160242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.0934;QD=35.7143;RBI=0.160376;REFB=0;REVB=-0.00655191;RO=0;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00432997;OID=.;OPOS=13670536;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:12:14:0:0:12:14:6:6:0:0:6:8:0:0 chr3 13670776 . T C 162.62 PASS AO=15;DP=16;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.1021;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=91.2774;QD=36.1367;RBI=0.116629;REFB=0;REVB=0.0563717;RO=0;SAF=2;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000207508;OID=.;OPOS=13670776;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:16:18:0:0:15:18:13:2:0:0:16:2:0:0 chr3 13679203 . G A 119.4 PASS AO=35;DP=88;FAO=35;FDP=89;FR=.;FRO=54;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=0.00722577;FXX=0.0326052;HRUN=5;LEN=1;MLLD=171.87;QD=5.36633;RBI=0.0225979;REFB=-0.0121124;REVB=0.0214115;RO=52;SAF=17;SAR=18;SRF=24;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0254843;STB=0.513818;TYPE=snp;VARB=0.0134891;OID=.;OPOS=13679203;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:89:52:54:35:35:18:17:24:28:18:17:25:29 chr3 13679335 . C T 112.23 PASS AO=29;DP=69;FAO=29;FDP=68;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=0.0588535;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.901;QD=6.60156;RBI=0.0588812;REFB=-0.0219638;REVB=-0.00180539;RO=38;SAF=12;SAR=17;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00748008;STB=0.512998;TYPE=snp;VARB=0.0233475;OID=.;OPOS=13679335;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:68:38:39:29:29:17:12:16:22:17:12:17:22 chr3 14106499 . G A 163.69 PASS AO=38;DP=80;FAO=38;FDP=79;FR=.;FRO=41;FSAF=11;FSAR=27;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=-0.0152351;FXX=0.0246883;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.842;QD=8.28811;RBI=0.015413;REFB=-0.0044248;REVB=-0.00233523;RO=41;SAF=11;SAR=27;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22409;STB=0.625564;TYPE=snp;VARB=0.00362804;OID=.;OPOS=14106499;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:79:41:41:38:38:27:11:21:20:27:11:21:20 chr3 14107387 . C T 222.47 PASS AO=61;DP=142;FAO=61;FDP=142;FR=.;FRO=81;FSAF=26;FSAR=35;FSRF=26;FSRR=55;FWDB=0.0309273;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1571;QD=6.26675;RBI=0.0467363;REFB=0.00511273;REVB=-0.0350398;RO=81;SAF=26;SAR=35;SRF=26;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112087;STB=0.56248;TYPE=snp;VARB=-0.00705814;OID=.;OPOS=14107387;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:81:81:61:61:35:26:26:55:35:26:26:55 chr3 14123156 . T C 128.89 PASS AO=39;DP=101;FAO=39;FDP=101;FR=.;FRO=62;FSAF=26;FSAR=13;FSRF=48;FSRR=14;FWDB=-0.0125651;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=221.843;QD=5.10444;RBI=0.0257621;REFB=-0.00963143;REVB=-0.0224901;RO=62;SAF=26;SAR=13;SRF=48;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138463;STB=0.578088;TYPE=snp;VARB=0.0149673;OID=.;OPOS=14123156;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:62:62:39:39:13:26:48:14:13:26:48:14 chr3 14175262 . T C 48.38 PASS AO=16;DP=49;FAO=16;FDP=49;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.0373561;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.819;QD=3.94948;RBI=0.0391424;REFB=-0.0158467;REVB=0.0116898;RO=28;SAF=10;SAR=6;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212837;STB=0.57582;TYPE=snp;VARB=0.0250666;OID=.;OPOS=14175262;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:49:49:28:33:16:16:6:10:12:16:6:10:17:16 chr3 14184074 . A C 150.54 PASS AO=50;DP=106;FAO=43;FDP=102;FR=.;FRO=59;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=40;FSRR=19;FWDB=0.0312484;FXX=0.0377323;HRUN=8;LEN=1;MLLD=45.5644;QD=5.90334;RBI=0.051762;REFB=-0.0242093;REVB=-0.0412655;RO=44;SAF=30;SAR=20;SRF=34;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159151;STB=0.558446;TYPE=snp;VARB=0.0467506;OID=.;OPOS=14184074;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:102:44:59:50:43:20:30:34:10:18:25:40:19 chr3 14187449 . G T 1035.91 PASS AO=107;DP=107;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0331956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.983;QD=38.3671;RBI=0.0461929;REFB=0;REVB=0.0321222;RO=0;SAF=62;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.75633e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000109779;OID=.;OPOS=14187449;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:107:108:0:0:107:108:45:62:0:0:45:63:0:0 chr3 14197987 . A T 412.74 PASS AO=42;DP=42;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.030777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.537;QD=37.5215;RBI=0.0537265;REFB=0;REVB=0.0440376;RO=0;SAF=32;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.96961e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000141291;OID=.;OPOS=14197987;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:42:44:0:0:42:44:10:32:0:0:11:33:0:0 chr3 14199887 . G A 77.2 PASS AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=17;FSAR=1;FSRF=17;FSRR=5;FWDB=0.0131787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.9772;QD=7.71988;RBI=0.0584696;REFB=-0.0184872;REVB=0.0569651;RO=21;SAF=17;SAR=1;SRF=16;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.428522;STB=0.749624;TYPE=snp;VARB=0.0228631;OID=.;OPOS=14199887;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:40:40:21:22:18:18:1:17:16:5:1:17:17:5 chr3 14220023 . G C 26.14 PASS AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=1;FWDB=-0.0566202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.3415;QD=6.53465;RBI=0.0838667;REFB=-0.00868741;REVB=0.0618691;RO=10;SAF=1;SAR=5;SRF=9;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.656508;STB=0.891803;TYPE=snp;VARB=0.00939477;OID=.;OPOS=14220023;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:16:16:10:10:6:6:5:1:9:1:5:1:9:1 chr3 14436184 . GT G 1313.3 PASS AO=132;DP=136;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107702;FXX=0.021427;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.567;QD=38.3445;RBI=0.0444907;REFB=0;REVB=0.0431674;RO=0;SAF=62;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84852e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.000123095;OID=.;OPOS=14436185;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:132:134:137:137:0:65:72:0:0:62:0:62:70:0:0 chr3 14485484 . C A 55.25 PASS AO=10;DP=18;FAO=10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=0;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0;FXX=0;HRUN=9;LEN=1;MLLD=343.343;QD=12.2782;RBI=0.00557766;REFB=-0.00960946;REVB=-0.00557766;RO=8;SAF=0;SAR=10;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0105993;OID=.;OPOS=14485484;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:18:18:8:8:10:10:10:0:0:8:10:0:0:8 chr3 14526538 . G A 827.58 PASS AO=174;DP=319;FAO=176;FDP=321;FR=.;FRO=145;FSAF=65;FSAR=111;FSRF=69;FSRR=76;FWDB=-0.0139435;FXX=0.00619176;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.98;QD=10.3125;RBI=0.014651;REFB=0.00345427;REVB=0.00449774;RO=145;SAF=64;SAR=110;SRF=69;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0942914;STB=0.550292;TYPE=snp;VARB=-0.00226995;OID=.;OPOS=14526538;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:319:321:145:145:174:176:110:64:69:76:111:65:69:76 chr3 14526656 . A G 278.27 PASS AO=58;DP=101;FAO=57;FDP=101;FR=.;FRO=44;FSAF=15;FSAR=42;FSRF=9;FSRR=35;FWDB=0.0224844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.2778;QD=11.0205;RBI=0.0266112;REFB=-0.0420476;REVB=0.0142341;RO=43;SAF=15;SAR=43;SRF=9;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0515786;STB=0.533969;TYPE=snp;VARB=0.0137873;OID=.;OPOS=14526656;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:43:44:58:57:43:15:9:34:42:15:9:35 chr3 14551444 . A G 627.68 PASS AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0221624;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.8503;QD=38.0412;RBI=0.0221754;REFB=0;REVB=0.000760005;RO=0;SAF=14;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000101794;OID=.;OPOS=14551444;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:66:66:0:0:66:66:52:14:0:0:52:14:0:0 chr3 14552994 . A G 132.56 PASS AO=19;DP=22;FAO=18;FDP=22;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.106153;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=47.6825;QD=24.1022;RBI=0.138725;REFB=-0.0554766;REVB=-0.0893098;RO=3;SAF=5;SAR=14;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121159;STB=0.620108;TYPE=snp;VARB=0.00273163;OID=.;OPOS=14552994;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:22:22:3:4:19:18:14:5:2:1:14:4:3:1 chr3 14555216 . T C 385.46 PASS AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0514232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7419;QD=37.6055;RBI=0.0624355;REFB=0;REVB=0.0354097;RO=0;SAF=19;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000284259;OID=.;OPOS=14555216;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:41:41:0:0:41:41:22:19:0:0:22:19:0:0 chr3 14555811 . A G 146.58 PASS AO=15;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.81;QD=36.6445;RBI=0.0298411;REFB=0;REVB=0.0276512;RO=0;SAF=6;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000367325;OID=.;OPOS=14555811;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:16:0:0:15:16:9:6:0:0:9:7:0:0 chr3 14563258 . A G 125.78 PASS AO=13;DP=13;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0504292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.8549;QD=35.9356;RBI=0.0791206;REFB=0;REVB=0.0609669;RO=0;SAF=6;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000539885;OID=.;OPOS=14563258;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:14:0:0:13:14:7:6:0:0:8:6:0:0 chr3 14768534 . A G 422.92 PASS AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00295131;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.236;QD=35.9935;RBI=0.0173526;REFB=0.0539229;REVB=-0.0170998;RO=1;SAF=31;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0303064;STB=0.516122;TYPE=snp;VARB=-9.9511e-05;OID=.;OPOS=14768534;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:47:47:1:1:46:46:15:31:0:1:15:31:0:1 chr3 14939479 . G T 952.35 PASS AO=101;DP=103;FAO=104;FDP=105;FR=.;FRO=1;FSAF=62;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0884953;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.1997;QD=36.2798;RBI=0.0908352;REFB=-0.0779524;REVB=0.0204848;RO=0;SAF=60;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.25502e-08;STB=0.503999;TYPE=snp;VARB=0.00647715;OID=.;OPOS=14939479;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:103:105:0:1:101:104:41:60:0:0:42:62:1:0 chr3 15080696 . G A 250.43 PASS AO=50;DP=89;FAO=50;FDP=89;FR=.;FRO=39;FSAF=15;FSAR=35;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=-0.0429874;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.1613;QD=11.2555;RBI=0.0469503;REFB=0.000357521;REVB=0.0188789;RO=39;SAF=15;SAR=35;SRF=15;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.077533;STB=0.542618;TYPE=snp;VARB=-0.000600484;OID=.;OPOS=15080696;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:39:39:50:50:35:15:15:24:35:15:15:24 chr3 15084880 . T A 430.61 PASS AO=71;DP=197;FAO=106;FDP=222;FR=.,HEALED;FRO=114;FSAF=52;FSAR=54;FSRF=37;FSRR=77;FWDB=-0.00834643;FXX=0.0133327;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.15;QD=7.75871;RBI=0.0901887;REFB=-0.0239289;REVB=0.0898016;RO=77;SAF=41;SAR=30;SRF=22;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.269385;STB=0.586316;TYPE=snp;VARB=0.0181424;OID=.;OPOS=15084880;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:222:77:114:71:106:30:41:22:55:54:52:37:77 chr3 15113519 . C T 1683.13 PASS AO=178;DP=180;FAO=178;FDP=178;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109221;FXX=0.0165737;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.248;QD=37.8232;RBI=0.0192655;REFB=-0.0208086;REVB=0.0158703;RO=1;SAF=93;SAR=85;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0055678;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000238699;OID=.;OPOS=15113519;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:180:178:1:0:178:178:85:93:0:1:85:93:0:0 chr3 15131938 . AC A 1399.18 PASS AO=194;DP=269;FAO=264;FDP=265;FR=.;FRO=1;FSAF=114;FSAR=150;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.230048;FXX=0.0111936;HRUN=4;LEN=1;MLLD=13.2179;QD=21.1196;RBI=0.230082;REFB=0.0510543;REVB=0.00392694;RO=38;SAF=85;SAR=109;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0.574939;SSSB=-0.0193875;STB=0.502183;TYPE=del;VARB=0.00264842;OID=.;OPOS=15131939;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:194:261:264:265:1:114:150:1:0:85:38:85:109:19:19 chr3 15216429 . C T 560.64 PASS AO=119;DP=218;FAO=119;FDP=218;FR=.;FRO=99;FSAF=78;FSAR=41;FSRF=49;FSRR=50;FWDB=-0.0166053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.3629;QD=10.287;RBI=0.0192437;REFB=0.00582146;REVB=-0.00972546;RO=99;SAF=78;SAR=41;SRF=49;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140673;STB=0.576825;TYPE=snp;VARB=-0.00287602;OID=.;OPOS=15216429;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:218:218:99:99:119:119:41:78:49:50:41:78:49:50 chr3 15216703 . A T 351.72 PASS AO=94;DP=217;FAO=96;FDP=219;FR=.;FRO=123;FSAF=52;FSAR=44;FSRF=51;FSRR=72;FWDB=0.0367191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.05;QD=6.42406;RBI=0.0386152;REFB=-0.00367863;REVB=-0.0119514;RO=122;SAF=51;SAR=43;SRF=50;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134073;STB=0.570981;TYPE=snp;VARB=0.00436137;OID=.;OPOS=15216703;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:217:219:122:123:94:96:43:51:50:72:44:52:51:72 chr3 15311325 . A G 388.27 PASS AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0138426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.8015;QD=38.8271;RBI=0.0197596;REFB=0;REVB=0.0141005;RO=0;SAF=25;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000324773;OID=.;OPOS=15311325;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:39:40:0:0:39:40:14:25:0:0:15:25:0:0 chr3 15492150 . C T 111.79 PASS AO=34;DP=89;FAO=34;FDP=89;FR=.;FRO=55;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=30;FSRR=25;FWDB=0.0165861;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.856;QD=5.02411;RBI=0.0442745;REFB=-0.0023288;REVB=-0.0410504;RO=55;SAF=20;SAR=14;SRF=30;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.04726;STB=0.527011;TYPE=snp;VARB=0.00321399;OID=.;OPOS=15492150;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:55:55:34:34:14:20:30:25:14:20:30:25 chr3 15492786 . T A 137.1 PASS AO=37;DP=87;FAO=37;FDP=87;FR=.;FRO=50;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=0.00111399;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.7361;QD=6.30328;RBI=0.0180897;REFB=-0.00271892;REVB=-0.0180554;RO=48;SAF=14;SAR=23;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104175;STB=0.560223;TYPE=snp;VARB=0.0084061;OID=.;OPOS=15492786;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:48:50:37:37:23:14:23:25:23:14:24:26 chr3 15492807 . G A 179.88 PASS AO=49;DP=114;FAO=49;FDP=114;FR=.;FRO=65;FSAF=15;FSAR=34;FSRF=22;FSRR=43;FWDB=0.018284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.7203;QD=6.31139;RBI=0.0403669;REFB=-0.027769;REVB=-0.0359886;RO=65;SAF=15;SAR=34;SRF=22;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0379701;STB=0.521334;TYPE=snp;VARB=0.0436074;OID=.;OPOS=15492807;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:65:65:49:49:34:15:22:43:34:15:22:43 chr3 15509327 . C G 1448.85 PASS AO=151;DP=156;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0140112;FXX=0.00640985;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.487;QD=37.3898;RBI=0.0492981;REFB=-0.0425339;REVB=0.047265;RO=1;SAF=82;SAR=69;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00576581;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000156909;OID=.;OPOS=15509327;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:156:155:1:0:151:155:69:82:1:0:73:82:0:0 chr3 15515695 . C T 165.44 PASS AO=43;DP=97;FAO=43;FDP=97;FR=.;FRO=54;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=37;FSRR=17;FWDB=-0.0275786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.332;QD=6.82229;RBI=0.0286511;REFB=0.00380429;REVB=-0.00776562;RO=54;SAF=24;SAR=19;SRF=37;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130567;STB=0.572879;TYPE=snp;VARB=-0.00423972;OID=.;OPOS=15515695;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:54:54:43:43:19:24:37:17:19:24:37:17 chr3 15516481 . T C 388.12 PASS AO=93;DP=191;FAO=93;FDP=191;FR=.;FRO=98;FSAF=27;FSAR=66;FSRF=42;FSRR=56;FWDB=-0.0110564;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=87.6931;QD=8.12825;RBI=0.0114245;REFB=-0.0167165;REVB=-0.00287683;RO=98;SAF=27;SAR=66;SRF=42;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14507;STB=0.580257;TYPE=snp;VARB=0.0169902;OID=.;OPOS=15516481;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:191:191:98:98:93:93:66:27:42:56:66:27:42:56 chr3 15548131 . A G 165.49 PASS AO=42;DP=93;FAO=42;FDP=93;FR=.;FRO=51;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=27;FSRR=24;FWDB=-0.00330672;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=156.999;QD=7.11771;RBI=0.00619318;REFB=-0.011852;REVB=-0.00523651;RO=50;SAF=21;SAR=21;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0194307;STB=0.516121;TYPE=snp;VARB=0.0141403;OID=.;OPOS=15548131;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:50:51:42:42:21:21:26:24:21:21:27:24 chr3 15643043 . A G 927.37 PASS AO=101;DP=103;FAO=101;FDP=103;FR=.;FRO=2;FSAF=50;FSAR=51;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0251195;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=153.878;QD=36.0143;RBI=0.0257494;REFB=-0.0724399;REVB=0.00566048;RO=1;SAF=50;SAR=51;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00939421;STB=0.509802;TYPE=snp;VARB=0.000307411;OID=.;OPOS=15643043;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:103:103:1:2:101:101:51:50:1:0:51:50:2:0 chr3 15643158 . A C 129.07 PASS AO=35;DP=83;FAO=35;FDP=83;FR=.;FRO=48;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=35;FSRR=13;FWDB=-0.0164727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.173;QD=6.22024;RBI=0.0261163;REFB=-0.0149856;REVB=0.020266;RO=47;SAF=22;SAR=13;SRF=34;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106771;STB=0.564321;TYPE=snp;VARB=0.0273247;OID=.;OPOS=15643158;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:47:48:35:35:13:22:34:13:13:22:35:13 chr3 15686693 . G C 673.73 PASS AO=149;DP=283;FAO=150;FDP=285;FR=.;FRO=135;FSAF=65;FSAR=85;FSRF=85;FSRR=50;FWDB=-0.0755745;FXX=0.0069684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.9213;QD=9.45579;RBI=0.0779123;REFB=-0.00388922;REVB=-0.0189424;RO=133;SAF=65;SAR=84;SRF=83;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161402;STB=0.592322;TYPE=snp;VARB=0.0033962;OID=.;OPOS=15686693;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:283:285:133:135:149:150:84:65:83:50:85:65:85:50 chr3 15719049 . T C 389.23 PASS AO=91;DP=192;FAO=94;FDP=193;FR=.;FRO=99;FSAF=43;FSAR=51;FSRF=45;FSRR=54;FWDB=0.0261404;FXX=0.00515437;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.099;QD=8.06695;RBI=0.0261529;REFB=-0.0204238;REVB=0.000808459;RO=100;SAF=40;SAR=51;SRF=46;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0196113;STB=0.501499;TYPE=snp;VARB=0.0219418;OID=.;OPOS=15719049;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:193:100:99:91:94:51:40:46:54:51:43:45:54 chr3 15737689 . G A 989.31 PASS AO=104;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2738;QD=38.0502;RBI=0.042144;REFB=0;REVB=-0.03412;RO=0;SAF=40;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.52643e-05;OID=.;OPOS=15737689;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:104:104:0:0:104:104:64:40:0:0:64:40:0:0 chr3 15737698 . T C 894.61 PASS AO=94;DP=94;FAO=97;FDP=99;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0777472;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.1177;QD=36.1458;RBI=0.0938295;REFB=0.0820401;REVB=-0.0525295;RO=0;SAF=33;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.19147e-08;STB=0.507935;TYPE=snp;VARB=-0.00618914;OID=.;OPOS=15737698;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:94:99:0:2:94:97:61:33:0:0:62:35:0:2 chr3 15753641 . A G 1022.68 PASS AO=106;DP=108;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0413429;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.2805;QD=38.2312;RBI=0.0859361;REFB=0;REVB=-0.0753378;RO=1;SAF=59;SAR=47;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00797668;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000224636;OID=.;OPOS=15753641;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:108:107:1:0:106:107:47:59:1:0:47:60:0:0 chr3 16217110 . C T 57.07 PASS AO=18;DP=52;FAO=18;FDP=52;FR=.;FRO=34;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=0.0207318;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=197.399;QD=4.39027;RBI=0.0247473;REFB=0.00453044;REVB=0.0135138;RO=34;SAF=4;SAR=14;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.312861;STB=0.68605;TYPE=snp;VARB=-0.00717845;OID=.;OPOS=16217110;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:52:52:34:34:18:18:14:4:16:18:14:4:16:18 chr3 16268974 . T A 535.82 PASS AO=143;DP=324;FAO=144;FDP=321;FR=.;FRO=177;FSAF=62;FSAR=82;FSRF=58;FSRR=119;FWDB=-0.0108368;FXX=0.0243154;HRUN=4;LEN=1;MLLD=87.329;QD=6.67688;RBI=0.0644094;REFB=0.000576992;REVB=-0.0634913;RO=176;SAF=62;SAR=81;SRF=58;SRR=118;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107507;STB=0.558776;TYPE=snp;VARB=-0.00107297;OID=.;OPOS=16268974;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:324:321:176:177:143:144:81:62:58:118:82:62:58:119 chr3 16268986 . C A 603.07 PASS AO=152;DP=328;FAO=153;FDP=327;FR=.;FRO=174;FSAF=62;FSAR=91;FSRF=55;FSRR=119;FWDB=0.0264578;FXX=0.00909063;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.663;QD=7.37703;RBI=0.0281276;REFB=-0.0255545;REVB=0.00954699;RO=168;SAF=61;SAR=91;SRF=51;SRR=117;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0993731;STB=0.550127;TYPE=snp;VARB=0.0232365;OID=.;OPOS=16268986;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:328:327:168:174:152:153:91:61:51:117:91:62:55:119 chr3 16327909 . C T 3618.61 PASS AO=379;DP=383;FAO=380;FDP=380;FR=.;FRO=0;FSAF=138;FSAR=242;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0392516;FXX=0.00783269;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.626;QD=38.0907;RBI=0.0399553;REFB=-0.00953811;REVB=0.00746593;RO=1;SAF=137;SAR=242;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00347054;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.05773e-05;OID=.;OPOS=16327909;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:383:380:1:0:379:380:242:137:1:0:242:138:0:0 chr3 16357348 . A C 2216.35 PASS AO=241;DP=248;FAO=243;FDP=248;FR=.;FRO=5;FSAF=121;FSAR=122;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.00830211;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.224;QD=35.7475;RBI=0.0253527;REFB=-0.129457;REVB=0.0239549;RO=5;SAF=121;SAR=120;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0194403;STB=0.506007;TYPE=snp;VARB=0.00151387;OID=.;OPOS=16357348;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:248:248:5:5:241:243:120:121:0:5:122:121:1:4 chr3 16358584 . T C 1034.72 PASS AO=108;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0282621;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.702;QD=37.9714;RBI=0.0358686;REFB=0.0222157;REVB=0.0220865;RO=1;SAF=66;SAR=42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111669;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.53264e-05;OID=.;OPOS=16358584;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:109:109:1:0:108:109:42:66:0:1:43:66:0:0 chr3 16364919 . A C 1283.81 PASS AO=138;DP=141;FAO=138;FDP=140;FR=.;FRO=2;FSAF=87;FSAR=51;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0146634;FXX=0.0070917;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.539;QD=36.6802;RBI=0.0519729;REFB=-0.0731325;REVB=0.0498615;RO=2;SAF=87;SAR=51;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108033;STB=0.505681;TYPE=snp;VARB=0.00111343;OID=.;OPOS=16364919;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:141:140:2:2:138:138:51:87:2:0:51:87:2:0 chr3 16364954 . C T 1183.81 PASS AO=124;DP=125;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0259244;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.42;QD=38.1873;RBI=0.0582781;REFB=0;REVB=-0.0521944;RO=0;SAF=83;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.08841e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00015389;OID=.;OPOS=16364954;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:125:124:0:0:124:124:41:83:0:0:41:83:0:0 chr3 16535229 . C T 89.13 PASS AO=20;DP=42;FAO=20;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=-0.0070204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.955;QD=8.48826;RBI=0.00702273;REFB=-0.0241764;REVB=-0.000180991;RO=22;SAF=9;SAR=11;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0814281;STB=0.546071;TYPE=snp;VARB=0.0299513;OID=.;OPOS=16535229;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:42:42:22:22:20:20:11:9:8:14:11:9:8:14 chr3 16646745 . C G 210.67 PASS AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0619669;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.5418;QD=36.6389;RBI=0.0661098;REFB=0;REVB=0.0230349;RO=0;SAF=7;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00131357;OID=.;OPOS=16646745;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:0:0:23:23:16:7:0:0:16:7:0:0 chr3 17051328 . T C 73.53 PASS AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.00414395;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=230.689;QD=7.94927;RBI=0.01644;REFB=-0.00634982;REVB=-0.0159092;RO=20;SAF=13;SAR=4;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136756;STB=0.578848;TYPE=snp;VARB=0.00696848;OID=.;OPOS=17051328;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:37:37:20:20:17:17:4:13:13:7:4:13:13:7 chr3 17053499 . A G 1106.2 PASS AO=110;DP=113;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233963;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.1593;QD=37.8187;RBI=0.0772142;REFB=0;REVB=-0.0735843;RO=2;SAF=52;SAR=58;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0179062;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000292397;OID=.;OPOS=17053499;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:113:117:2:0:110:117:58:52:2:0:62:55:0:0 chr3 17131501 . C T 528.31 PASS AO=122;DP=249;FAO=125;FDP=252;FR=.;FRO=127;FSAF=67;FSAR=58;FSRF=59;FSRR=68;FWDB=-0.011393;FXX=0.00787371;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.393;QD=8.38581;RBI=0.0543597;REFB=-0.00670719;REVB=0.0531523;RO=122;SAF=64;SAR=58;SRF=57;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0522546;STB=0.535994;TYPE=snp;VARB=0.00710765;OID=.;OPOS=17131501;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:249:252:122:127:122:125:58:64:57:65:58:67:59:68 chr3 17208267 . T C 571.44 PASS AO=128;DP=244;FAO=127;FDP=244;FR=.;FRO=117;FSAF=81;FSAR=46;FSRF=45;FSRR=72;FWDB=0.00270558;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.757;QD=9.36784;RBI=0.00434823;REFB=-0.00702585;REVB=-0.00340396;RO=115;SAF=81;SAR=47;SRF=45;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211121;STB=0.622489;TYPE=snp;VARB=0.0045217;OID=.;OPOS=17208267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:244:115:117:128:127:47:81:45:70:46:81:45:72 chr3 17741409 . C G 1181.98 PASS AO=124;DP=129;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204203;FXX=0.030532;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.763;QD=37.2277;RBI=0.0641347;REFB=-0.0150406;REVB=0.060797;RO=1;SAF=75;SAR=49;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00629329;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00188811;OID=.;OPOS=17741409;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:129:127:1:0:124:127:49:75:1:0:52:75:0:0 chr3 18055231 . A C 354.24 PASS AO=43;DP=71;FAO=77;FDP=145;FR=.;FRO=68;FSAF=25;FSAR=52;FSRF=13;FSRR=55;FWDB=0.0077078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.117;QD=9.77223;RBI=0.0149605;REFB=-0.0154794;REVB=-0.0128221;RO=28;SAF=14;SAR=29;SRF=5;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127224;STB=0.575127;TYPE=snp;VARB=0.0157083;OID=.;OPOS=18055231;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:145:28:68:43:77:29:14:5:23:52:25:13:55 chr3 18390240 . A T 34.47 PASS AO=17;DP=49;FAO=16;FDP=54;FR=.;FRO=38;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=-0.105099;FXX=0.0181785;HRUN=3;LEN=1;MLLD=22.3123;QD=2.55321;RBI=0.105099;REFB=-0.0852945;REVB=0.000354268;RO=32;SAF=6;SAR=11;SRF=9;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0902876;STB=0.504944;TYPE=snp;VARB=0.00764856;OID=.;OPOS=18390240;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:49:54:32:38:17:16:11:6:9:23:10:6:14:24 chr3 19479731 . G A 633.26 PASS AO=155;DP=330;FAO=159;FDP=334;FR=.;FRO=175;FSAF=107;FSAR=52;FSRF=117;FSRR=58;FWDB=0.00790482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.5458;QD=7.58397;RBI=0.00835153;REFB=-0.0252236;REVB=0.0026948;RO=174;SAF=104;SAR=51;SRF=116;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00466692;STB=0.502604;TYPE=snp;VARB=0.026575;OID=.;OPOS=19479731;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:330:334:174:175:155:159:51:104:116:58:52:107:117:58 chr3 19930003 . G A 170.78 PASS AO=60;DP=189;FAO=66;FDP=193;FR=.;FRO=127;FSAF=31;FSAR=35;FSRF=78;FSRR=49;FWDB=-0.0171592;FXX=0.0153053;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.822;QD=3.53938;RBI=0.0234032;REFB=-0.0233258;REVB=-0.0159144;RO=127;SAF=30;SAR=30;SRF=78;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134668;STB=0.594301;TYPE=snp;VARB=0.0526203;OID=.;OPOS=19930003;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:193:127:127:60:66:30:30:78:49:35:31:78:49 chr3 19930130 . A T 565.54 PASS AO=96;DP=189;FAO=117;FDP=210;FR=.;FRO=93;FSAF=39;FSAR=78;FSRF=25;FSRR=68;FWDB=0.0193948;FXX=0.00473911;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.904;QD=10.7723;RBI=0.0195681;REFB=-0.0119688;REVB=0.00259862;RO=92;SAF=17;SAR=79;SRF=25;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130404;STB=0.532841;TYPE=snp;VARB=0.00673958;OID=.;OPOS=19930130;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:210:92:93:96:117:79:17:25:67:78:39:25:68 chr3 19959756 . G A 2332.74 PASS AO=251;DP=255;FAO=251;FDP=251;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=154;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00964591;FXX=0.0156857;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.165;QD=37.1751;RBI=0.0229583;REFB=-0.00158054;REVB=0.0208336;RO=4;SAF=97;SAR=154;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122182;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.59826e-05;OID=.;OPOS=19959756;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:255:251:4:0:251:251:154:97:0:4:154:97:0:0 chr3 19961330 . C T 1330.99 PASS AO=166;DP=168;FAO=169;FDP=169;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0372296;FXX=0.0174408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.423;QD=31.5028;RBI=0.12856;REFB=0;REVB=0.123051;RO=2;SAF=91;SAR=75;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00110199;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00960995;OID=.;OPOS=19961330;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:168:169:2:0:166:169:75:91:1:1:78:91:0:0 chr3 19975215 . C A 152.28 PASS AO=36;DP=80;FAO=37;FDP=80;FR=.;FRO=43;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=-0.0179511;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=155.89;QD=7.61373;RBI=0.0263247;REFB=-0.0172539;REVB=0.0192548;RO=43;SAF=21;SAR=15;SRF=19;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1375;STB=0.567531;TYPE=snp;VARB=0.0223896;OID=.;OPOS=19975215;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:43:43:36:37:15:21:19:24:16:21:19:24 chr3 19992432 . G T 2159.28 PASS AO=235;DP=242;FAO=237;FDP=241;FR=.;FRO=4;FSAF=122;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.00817287;FXX=0.00413206;HRUN=3;LEN=1;MLLD=258.288;QD=35.8387;RBI=0.0130554;REFB=-0.148209;REVB=0.0101808;RO=5;SAF=120;SAR=115;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.01233;STB=0.508546;TYPE=snp;VARB=0.000197764;OID=.;OPOS=19992432;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:242:241:5:4:235:237:115:120:1:4:115:122:0:4 chr3 20042834 . C T 446.64 PASS AO=95;DP=178;FAO=96;FDP=179;FR=.;FRO=83;FSAF=34;FSAR=62;FSRF=42;FSRR=41;FWDB=0.0162233;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.3521;QD=9.98069;RBI=0.0245424;REFB=-0.0073934;REVB=-0.0184156;RO=83;SAF=33;SAR=62;SRF=42;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1418;STB=0.573639;TYPE=snp;VARB=0.00633331;OID=.;OPOS=20042834;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:179:83:83:95:96:62:33:42:41:62:34:42:41 chr3 20053581 . C T 1333.84 PASS AO=143;DP=147;FAO=145;FDP=147;FR=.;FRO=2;FSAF=61;FSAR=84;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0441935;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2361;QD=36.2949;RBI=0.0630671;REFB=-0.137449;REVB=0.0449932;RO=3;SAF=60;SAR=83;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0098902;STB=0.501106;TYPE=snp;VARB=0.00250058;OID=.;OPOS=20053581;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:147:147:3:2:143:145:83:60:2:1:84:61:1:1 chr3 20141356 . C T 183.94 PASS AO=51;DP=122;FAO=51;FDP=121;FR=.;FRO=70;FSAF=15;FSAR=36;FSRF=28;FSRR=42;FWDB=0.000135668;FXX=0.0241916;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.916;QD=6.08059;RBI=0.0282299;REFB=-0.00573879;REVB=0.0282295;RO=70;SAF=15;SAR=36;SRF=27;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107449;STB=0.569508;TYPE=snp;VARB=0.00805086;OID=.;OPOS=20141356;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:121:70:70:51:51:36:15:27:43:36:15:28:42 chr3 20234299 . G A 202.32 PASS AO=63;DP=162;FAO=63;FDP=162;FR=.;FRO=99;FSAF=28;FSAR=35;FSRF=45;FSRR=54;FWDB=0.0108004;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=212.115;QD=4.99564;RBI=0.0187333;REFB=0.00603314;REVB=0.0153065;RO=95;SAF=28;SAR=35;SRF=45;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0314563;STB=0.506239;TYPE=snp;VARB=-0.00810472;OID=.;OPOS=20234299;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:162:95:99:63:63:35:28:45:50:35:28:45:54 chr3 20234346 . C T 251.78 PASS AO=72;DP=159;FAO=72;FDP=173;FR=.;FRO=101;FSAF=35;FSAR=37;FSRF=40;FSRR=61;FWDB=-0.040716;FXX=0.0170445;HRUN=3;LEN=1;MLLD=109.069;QD=5.82158;RBI=0.0418812;REFB=-0.0123887;REVB=-0.00981021;RO=87;SAF=35;SAR=37;SRF=32;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117196;STB=0.552766;TYPE=snp;VARB=0.0246463;OID=.;OPOS=20234346;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:173:87:101:72:72:37:35:32:55:37:35:40:61 chr3 21462754 . A G 75.64 PASS AO=31;DP=102;FAO=31;FDP=102;FR=.;FRO=71;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=37;FSRR=34;FWDB=-0.0175684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.211;QD=2.96641;RBI=0.0261946;REFB=0.0056355;REVB=-0.0194296;RO=69;SAF=16;SAR=15;SRF=37;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0237059;STB=0.503481;TYPE=snp;VARB=-0.0361833;OID=.;OPOS=21462754;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:102:102:69:71:31:31:15:16:37:32:15:16:37:34 chr3 21462787 . G A 155.05 PASS AO=45;DP=114;FAO=46;FDP=115;FR=.;FRO=69;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=36;FSRR=33;FWDB=-0.00104072;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.891;QD=5.39289;RBI=0.00714435;REFB=-0.0149725;REVB=0.00706814;RO=69;SAF=20;SAR=25;SRF=36;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0827121;STB=0.539143;TYPE=snp;VARB=0.0284882;OID=.;OPOS=21462787;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:115:69:69:45:46:25:20:36:33:25:21:36:33 chr3 24006477 . T A 1363.07 PASS AO=141;DP=141;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0322241;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3536;QD=38.1279;RBI=0.0322917;REFB=0;REVB=0.00208854;RO=0;SAF=62;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000195953;OID=.;OPOS=24006477;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:141:143:0:0:141:143:79:62:0:0:81:62:0:0 chr3 24184995 . G A 114.99 PASS AO=37;DP=100;FAO=37;FDP=101;FR=.;FRO=64;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=46;FSRR=18;FWDB=0.0156303;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5826;QD=4.55397;RBI=0.097423;REFB=-0.0124599;REVB=0.096161;RO=62;SAF=18;SAR=19;SRF=45;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.262885;STB=0.646048;TYPE=snp;VARB=0.0453531;OID=.;OPOS=24184995;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:101:62:64:37:37:19:18:45:17:19:18:46:18 chr3 24562877 . G T 189.12 PASS AO=43;DP=95;FAO=47;FDP=98;FR=.;FRO=51;FSAF=4;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=51;FWDB=0.130797;FXX=0.0297;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.537;QD=7.71933;RBI=0.135641;REFB=-0.00988336;REVB=0.0359251;RO=49;SAF=0;SAR=43;SRF=0;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.686079;TYPE=snp;VARB=0.0151082;OID=.;OPOS=24562877;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:98:49:51:43:47:43:0:0:49:43:4:0:51 chr3 26751493 . A T 131.84 PASS AO=30;DP=64;FAO=31;FDP=65;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=-0.0829008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2709;QD=8.11318;RBI=0.0842315;REFB=-0.0316784;REVB=0.0149131;RO=34;SAF=16;SAR=14;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109163;STB=0.568819;TYPE=snp;VARB=0.031592;OID=.;OPOS=26751493;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:65:34:34:30:31:14:16:22:12:15:16:22:12 chr3 26752237 . A G 577.87 PASS AO=155;DP=343;FAO=156;FDP=345;FR=.;FRO=189;FSAF=83;FSAR=73;FSRF=66;FSRR=123;FWDB=0.000329163;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=61.2231;QD=6.69992;RBI=0.0144891;REFB=-0.0252085;REVB=0.0144853;RO=188;SAF=82;SAR=73;SRF=67;SRR=121;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170246;STB=0.599288;TYPE=snp;VARB=0.0328547;OID=.;OPOS=26752237;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:343:345:188:189:155:156:73:82:67:121:73:83:66:123 chr3 27204052 . G A 227.64 PASS AO=67;DP=165;FAO=67;FDP=164;FR=.;FRO=97;FSAF=28;FSAR=39;FSRF=38;FSRR=59;FWDB=0.00632964;FXX=0.00606024;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.9394;QD=5.55226;RBI=0.0323013;REFB=-0.0109853;REVB=-0.031675;RO=96;SAF=28;SAR=39;SRF=37;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0352923;STB=0.515979;TYPE=snp;VARB=0.0113659;OID=.;OPOS=27204052;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:164:96:97:67:67:39:28:37:59:39:28:38:59 chr3 27243045 . G C 699.06 PASS AO=143;DP=251;FAO=143;FDP=252;FR=.;FRO=109;FSAF=61;FSAR=82;FSRF=50;FSRR=59;FWDB=0.017569;FXX=0.00395241;HRUN=3;LEN=1;MLLD=233.748;QD=11.0962;RBI=0.0222615;REFB=-0.000554696;REVB=0.0136713;RO=105;SAF=61;SAR=82;SRF=49;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0318208;STB=0.514148;TYPE=snp;VARB=0.000311919;OID=.;OPOS=27243045;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:251:252:105:109:143:143:82:61:49:56:82:61:50:59 chr3 27296796 . C G 129.98 PASS AO=33;DP=74;FAO=33;FDP=74;FR=.;FRO=41;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=10;FSRR=31;FWDB=0.0220535;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.7881;QD=7.02574;RBI=0.0226526;REFB=-0.0102612;REVB=-0.00517512;RO=40;SAF=12;SAR=21;SRF=9;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153989;STB=0.574543;TYPE=snp;VARB=0.012433;OID=.;OPOS=27296796;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:40:41:33:33:21:12:9:31:21:12:10:31 chr3 27296822 . A T 145.26 PASS AO=27;DP=58;FAO=32;FDP=63;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=9;FSRR=22;FWDB=-0.0114819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.285;QD=9.22258;RBI=0.0165372;REFB=-0.0137851;REVB=0.0119015;RO=31;SAF=13;SAR=14;SRF=9;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183932;STB=0.560426;TYPE=snp;VARB=0.0162106;OID=.;OPOS=27296822;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:63:31:31:27:32:14:13:9:22:19:13:9:22 chr3 27297816 . G C 475.03 PASS AO=97;DP=174;FAO=98;FDP=175;FR=.;FRO=77;FSAF=52;FSAR=46;FSRF=38;FSRR=39;FWDB=-0.000240936;FXX=0.0056815;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.826;QD=10.8579;RBI=0.0255929;REFB=-0.0165336;REVB=-0.0255918;RO=76;SAF=52;SAR=45;SRF=38;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0291804;STB=0.516352;TYPE=snp;VARB=0.0173684;OID=.;OPOS=27297816;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:175:76:77:97:98:45:52:38:38:46:52:38:39 chr3 27307155 . C T 292.96 PASS AO=63;DP=119;FAO=63;FDP=119;FR=.;FRO=56;FSAF=22;FSAR=41;FSRF=31;FSRR=25;FWDB=0.00478725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.135;QD=9.84743;RBI=0.0209641;REFB=0.0161412;REVB=0.0204102;RO=55;SAF=22;SAR=41;SRF=31;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187451;STB=0.599416;TYPE=snp;VARB=-0.0132333;OID=.;OPOS=27307155;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:55:56:63:63:41:22:31:24:41:22:31:25 chr3 27326097 . G T 288.87 PASS AO=75;DP=163;FAO=75;FDP=165;FR=.;FRO=90;FSAF=39;FSAR=36;FSRF=50;FSRR=40;FWDB=-0.0267631;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.982;QD=7.00287;RBI=0.0349007;REFB=0.00306078;REVB=0.0224009;RO=88;SAF=39;SAR=36;SRF=48;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0248396;STB=0.51945;TYPE=snp;VARB=-0.00383399;OID=.;OPOS=27326097;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:165:88:90:75:75:36:39:48:40:36:39:50:40 chr3 27326451 . A G 114.68 PASS AO=35;DP=95;FAO=36;FDP=96;FR=.;FRO=60;FSAF=9;FSAR=27;FSRF=11;FSRR=49;FWDB=-0.00789486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.512;QD=4.77819;RBI=0.00902085;REFB=-0.0136824;REVB=-0.00436428;RO=60;SAF=9;SAR=26;SRF=11;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114225;STB=0.558793;TYPE=snp;VARB=0.020804;OID=.;OPOS=27326451;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:96:60:60:35:36:26:9:11:49:27:9:11:49 chr3 27332820 . A G 210.03 PASS AO=49;DP=105;FAO=50;FDP=104;FR=.;FRO=54;FSAF=18;FSAR=32;FSRF=24;FSRR=30;FWDB=0.0134776;FXX=0.0280348;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.689;QD=8.07804;RBI=0.0166612;REFB=-0.00734896;REVB=0.0097953;RO=54;SAF=18;SAR=31;SRF=24;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0763099;STB=0.546323;TYPE=snp;VARB=0.00969756;OID=.;OPOS=27332820;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:104:54:54:49:50:31:18:24:30:32:18:24:30 chr3 27424718 . A G 411.23 PASS AO=114;DP=261;FAO=114;FDP=261;FR=.;FRO=147;FSAF=46;FSAR=68;FSRF=73;FSRR=74;FWDB=0.00382891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.8049;QD=6.30234;RBI=0.00701668;REFB=-0.0176332;REVB=-0.0058799;RO=144;SAF=46;SAR=68;SRF=73;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105499;STB=0.553328;TYPE=snp;VARB=0.0216544;OID=.;OPOS=27424718;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:261:261:144:147:114:114:68:46:73:71:68:46:73:74 chr3 27478899 . A G 174.23 PASS AO=37;DP=71;FAO=37;FDP=71;FR=.;FRO=34;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=0.0439604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.092;QD=9.81555;RBI=0.0440151;REFB=-0.029453;REVB=-0.00219378;RO=33;SAF=21;SAR=16;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0335605;STB=0.510103;TYPE=snp;VARB=0.0243774;OID=.;OPOS=27478899;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:33:34:37:37:16:21:20:13:16:21:20:14 chr3 28520417 . T A 809.24 PASS AO=186;DP=363;FAO=186;FDP=362;FR=.;FRO=176;FSAF=75;FSAR=111;FSRF=79;FSRR=97;FWDB=-0.00681361;FXX=0.00821895;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.439;QD=8.94183;RBI=0.023731;REFB=-0.010512;REVB=0.0227318;RO=176;SAF=75;SAR=111;SRF=79;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0417885;STB=0.522846;TYPE=snp;VARB=0.00743035;OID=.;OPOS=28520417;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:363:362:176:176:186:186:111:75:79:97:111:75:79:97 chr3 29804487 . A T 579.67 PASS AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00906896;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=242.455;QD=36.2291;RBI=0.0226534;REFB=-0.0802653;REVB=0.0207589;RO=1;SAF=26;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012593;STB=0.506665;TYPE=snp;VARB=3.39106e-05;OID=.;OPOS=29804487;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:64:64:1:1:63:63:37:26:0:1:37:26:0:1 chr3 31270258 . T C 215.91 PASS AO=54;DP=117;FAO=54;FDP=117;FR=.;FRO=63;FSAF=13;FSAR=41;FSRF=22;FSRR=41;FWDB=0.0301287;FXX=0.0168053;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.585;QD=7.38162;RBI=0.0303439;REFB=-0.0161994;REVB=0.003607;RO=62;SAF=13;SAR=41;SRF=22;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137139;STB=0.573741;TYPE=snp;VARB=0.0216758;OID=.;OPOS=31270258;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:62:63:54:54:41:13:22:40:41:13:22:41 chr3 31712393 . C T 439.78 PASS AO=44;DP=211;FAO=71;FDP=180;FR=.,HEALED;FRO=58;FSAF=41;FSAR=30;FSRF=53;FSRR=5;FWDB=-0.00443736;FXX=0.166659;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.74;QD=9.77286;RBI=0.0217009;REFB=-0.00634662;REVB=-0.0212423;RO=55;SAF=41;SAR=3;SRF=53;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143273;STB=0.662711;TYPE=snp;VARB=0.0151523;OID=.;OPOS=31712393;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:180:55:58:44:71:3:41:53:2:30:41:53:5 chr3 31839242 . T C 154.87 PASS AO=44;DP=108;FAO=44;FDP=107;FR=.;FRO=63;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=29;FSRR=34;FWDB=0.021946;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.303;QD=5.78953;RBI=0.0302704;REFB=-0.0115041;REVB=0.0208488;RO=63;SAF=25;SAR=19;SRF=29;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112632;STB=0.563561;TYPE=snp;VARB=0.0144761;OID=.;OPOS=31839242;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:107:63:63:44:44:19:25:29:34:19:25:29:34 chr3 31839284 . A G 161.58 PASS AO=46;DP=112;FAO=46;FDP=112;FR=.;FRO=66;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=32;FSRR=34;FWDB=0.00338201;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.675;QD=5.77076;RBI=0.0370244;REFB=-0.00614242;REVB=0.0368696;RO=65;SAF=22;SAR=24;SRF=32;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0146091;STB=0.503886;TYPE=snp;VARB=0.0136443;OID=.;OPOS=31839284;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:65:66:46:46:24:22:32:33:24:22:32:34 chr3 31839325 . A T 119.44 PASS AO=36;DP=93;FAO=36;FDP=93;FR=.;FRO=57;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=26;FSRR=31;FWDB=-0.0248378;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.748;QD=5.13722;RBI=0.0259185;REFB=-0.0155988;REVB=-0.0074062;RO=57;SAF=17;SAR=19;SRF=26;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.017369;STB=0.509893;TYPE=snp;VARB=0.0341265;OID=.;OPOS=31839325;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:57:57:36:36:19:17:26:31:19:17:26:31 chr3 32181761 . C T 290.36 PASS AO=76;DP=183;FAO=82;FDP=193;FR=.;FRO=111;FSAF=33;FSAR=49;FSRF=49;FSRR=62;FWDB=0.0100153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.338;QD=6.01776;RBI=0.0159521;REFB=-0.0052117;REVB=-0.0124162;RO=107;SAF=33;SAR=43;SRF=49;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0251107;STB=0.523103;TYPE=snp;VARB=0.0064675;OID=.;OPOS=32181761;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:193:107:111:76:82:43:33:49:58:49:33:49:62 chr3 32578505 . T C 523.62 PASS AO=126;DP=257;FAO=126;FDP=257;FR=.;FRO=131;FSAF=49;FSAR=77;FSRF=58;FSRR=73;FWDB=-0.00784495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.414;QD=8.14979;RBI=0.00920198;REFB=-0.010116;REVB=0.00480969;RO=131;SAF=49;SAR=77;SRF=58;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0518349;STB=0.528509;TYPE=snp;VARB=0.00736422;OID=.;OPOS=32578505;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:257:257:131:131:126:126:77:49:58:73:77:49:58:73 chr3 32815231 . A T 586.93 PASS AO=54;DP=55;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226477;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.615;QD=37.2653;RBI=0.0384808;REFB=0;REVB=0.0311103;RO=0;SAF=16;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.22487e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000322636;OID=.;OPOS=32815231;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:55:63:0:0:54:63:38:16:0:0:43:20:0:0 chr3 32927509 . G T 609.49 PASS AO=68;DP=71;FAO=69;FDP=72;FR=.;FRO=3;FSAF=37;FSAR=32;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0622354;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.702;QD=33.8606;RBI=0.0778454;REFB=-0.0738082;REVB=0.0467616;RO=3;SAF=36;SAR=32;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0377688;STB=0.519475;TYPE=snp;VARB=0.00131864;OID=.;OPOS=32927509;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:71:72:3:3:68:69:32:36:3:0:32:37:3:0 chr3 32933036 . G A 218.66 PASS AO=42;DP=72;FAO=42;FDP=72;FR=.;FRO=30;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=-0.000480832;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.377;QD=12.148;RBI=0.0325722;REFB=-0.0267637;REVB=0.0325686;RO=30;SAF=18;SAR=24;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154981;STB=0.58494;TYPE=snp;VARB=0.0205671;OID=.;OPOS=32933036;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:30:30:42:42:24:18:19:11:24:18:19:11 chr3 32996509 . C T 270.69 PASS AO=68;DP=146;FAO=68;FDP=146;FR=.;FRO=78;FSAF=30;FSAR=38;FSRF=40;FSRR=38;FWDB=-0.000147414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.124;QD=7.41604;RBI=0.00357399;REFB=-0.0120103;REVB=-0.00357095;RO=77;SAF=30;SAR=38;SRF=39;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0628935;STB=0.53845;TYPE=snp;VARB=0.0251698;OID=.;OPOS=32996509;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:77:78:68:68:38:30:39:38:38:30:40:38 chr3 33055688 . T C 219.76 PASS AO=60;DP=155;FAO=65;FDP=158;FR=.;FRO=93;FSAF=25;FSAR=40;FSRF=31;FSRR=62;FWDB=0.0304;FXX=0.0186324;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5775;QD=5.56363;RBI=0.0530072;REFB=-0.0149456;REVB=0.0434236;RO=93;SAF=25;SAR=35;SRF=31;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0941903;STB=0.532349;TYPE=snp;VARB=0.0213027;OID=.;OPOS=33055688;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:158:93:93:60:65:35:25:31:62:40:25:31:62 chr3 33055721 . A G 1125.11 PASS AO=117;DP=118;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00833302;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.675;QD=38.4654;RBI=0.0394588;REFB=0;REVB=0.0385689;RO=0;SAF=36;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000126376;OID=.;OPOS=33055721;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:118:117:0:0:117:117:81:36:0:0:81:36:0:0 chr3 33114052 . GC G 490.63 PASS AO=55;DP=67;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.254702;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=18.7349;QD=28.8606;RBI=0.2768;REFB=0;REVB=-0.108375;RO=6;SAF=28;SAR=27;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0.448246;SSSB=-0.090929;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0037574;OID=.;OPOS=33114053;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:55:65:68:68:0:37:31:0:0:44:6:28:27:6:0 chr3 33138544 . A G 269.39 PASS AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0572257;FXX=0.0344709;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.805;QD=38.4843;RBI=0.0632195;REFB=0;REVB=0.0268687;RO=0;SAF=5;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.39272e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000228507;OID=.;OPOS=33138544;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:29:28:0:0:28:28:23:5:0:0:23:5:0:0 chr3 33138549 . G A 277.63 PASS AO=22;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.027417;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=39.8926;QD=38.2943;RBI=0.0388685;REFB=0;REVB=-0.0275512;RO=0;SAF=4;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.58178e-05;OID=.;OPOS=33138549;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:22:29:0:0:22:29:18:4:0:0:24:5:0:0 chr3 33174156 . T G 1219.63 PASS AO=140;DP=149;FAO=140;FDP=149;FR=.;FRO=9;FSAF=39;FSAR=101;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.000164829;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.097;QD=32.7417;RBI=0.00964728;REFB=0.0173572;REVB=0.00964587;RO=9;SAF=39;SAR=101;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.053868;STB=0.528423;TYPE=snp;VARB=-0.00165886;OID=.;OPOS=33174156;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:149:149:9:9:140:140:101:39:6:3:101:39:6:3 chr3 33174168 . G A 1292.19 PASS AO=139;DP=143;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0188465;FXX=0.0279701;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.584;QD=37.1853;RBI=0.0214475;REFB=-0.072832;REVB=0.0102375;RO=1;SAF=43;SAR=96;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0109275;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.84746e-05;OID=.;OPOS=33174168;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:143:139:1:0:139:139:96:43:1:0:96:43:0:0 chr3 33431877 . GAC G 55.21 PASS AO=15;DP=40;FAO=15;FDP=39;FR=.;FRO=24;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=18;FWDB=-0.00582208;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=189.039;QD=5.66294;RBI=0.010163;REFB=0.00270293;REVB=0.00833011;RO=24;SAF=3;SAR=12;SRF=6;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0770945;STB=0.545391;TYPE=del;VARB=-0.00579669;OID=.;OPOS=33431878;OREF=AC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:15:39:15:39:24:3:12:6:18:55:24:3:12:6:18 chr3 33434831 . G A 347.12 PASS AO=97;DP=223;FAO=97;FDP=225;FR=.;FRO=128;FSAF=59;FSAR=38;FSRF=77;FSRR=51;FWDB=0.00955784;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=221.176;QD=6.17106;RBI=0.0307569;REFB=0.00412996;REVB=-0.0292341;RO=126;SAF=59;SAR=38;SRF=77;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00305312;STB=0.503982;TYPE=snp;VARB=-0.00471181;OID=.;OPOS=33434831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:225:126:128:97:97:38:59:77:49:38:59:77:51 chr3 33458266 . T C 309.18 PASS AO=73;DP=150;FAO=73;FDP=149;FR=.;FRO=76;FSAF=36;FSAR=37;FSRF=26;FSRR=50;FWDB=0.0140738;FXX=0.00666622;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.513;QD=8.29999;RBI=0.0140937;REFB=-0.00900366;REVB=-0.000748576;RO=76;SAF=36;SAR=37;SRF=26;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14024;STB=0.5772;TYPE=snp;VARB=0.0121317;OID=.;OPOS=33458266;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:149:76:76:73:73:37:36:26:50:37:36:26:50 chr3 33533554 . C T 105.05 PASS AO=23;DP=46;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=20;FSAR=3;FSRF=19;FSRR=4;FWDB=-0.00591647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.691;QD=9.13463;RBI=0.0130332;REFB=-0.0124419;REVB=0.0116129;RO=23;SAF=20;SAR=3;SRF=19;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0789684;STB=0.544706;TYPE=snp;VARB=0.0062998;OID=.;OPOS=33533554;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:23:23:23:23:3:20:19:4:3:20:19:4 chr3 33539893 . A G 224.38 PASS AO=52;DP=108;FAO=53;FDP=109;FR=.;FRO=56;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=14;FSRR=42;FWDB=0.00309999;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.905;QD=8.23406;RBI=0.00872986;REFB=-0.0139677;REVB=-0.00816091;RO=55;SAF=25;SAR=27;SRF=13;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230755;STB=0.624173;TYPE=snp;VARB=0.0155962;OID=.;OPOS=33539893;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:109:55:56:52:53:27:25:13:42:27:26:14:42 chr3 33552155 . G A 835.71 PASS AO=187;DP=359;FAO=188;FDP=359;FR=.;FRO=171;FSAF=104;FSAR=84;FSRF=68;FSRR=103;FWDB=-0.0185877;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=159.881;QD=9.31152;RBI=0.0258548;REFB=-0.0152372;REVB=0.0179714;RO=167;SAF=103;SAR=84;SRF=65;SRR=102;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139177;STB=0.573747;TYPE=snp;VARB=0.0156055;OID=.;OPOS=33552155;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:359:359:167:171:187:188:84:103:65:102:84:104:68:103 chr3 33638174 . TTAG T 377.41 PASS AO=259;DP=664;FAO=169;FDP=390;FR=.;FRO=221;FSAF=71;FSAR=98;FSRF=96;FSRR=125;FWDB=0.000576851;FXX=0.0249994;HRUN=3;LEN=3;MLLD=214.959;QD=3.87086;RBI=0.0058702;REFB=0.00514919;REVB=0.00584179;RO=328;SAF=110;SAR=149;SRF=141;SRR=187;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0053366;STB=0.508276;TYPE=del;VARB=-0.00637222;OID=.;OPOS=33638175;OREF=TAG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:259:624:169:390:221:71:98:96:125:99:328:110:149:141:187 chr3 33877626 . G A 612.61 PASS AO=123;DP=219;FAO=124;FDP=218;FR=.;FRO=94;FSAF=41;FSAR=83;FSRF=39;FSRR=55;FWDB=-0.0772369;FXX=0.0090905;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.444;QD=11.2405;RBI=0.0775925;REFB=-0.0263053;REVB=-0.00742005;RO=93;SAF=41;SAR=82;SRF=38;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0654204;STB=0.539919;TYPE=snp;VARB=0.0145508;OID=.;OPOS=33877626;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:219:218:93:94:123:124:82:41:38:55:83:41:39:55 chr3 33879770 . G A 447.42 PASS AO=89;DP=154;FAO=89;FDP=154;FR=.;FRO=65;FSAF=50;FSAR=39;FSRF=40;FSRR=25;FWDB=-0.00024493;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.416;QD=11.6213;RBI=0.0130038;REFB=-0.00702352;REVB=0.0130015;RO=64;SAF=50;SAR=39;SRF=39;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0373812;STB=0.523095;TYPE=snp;VARB=0.00490418;OID=.;OPOS=33879770;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:154:64:65:89:89:39:50:39:25:39:50:40:25 chr3 33893987 . A G 114.14 PASS AO=24;DP=46;FAO=24;FDP=46;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=3;FWDB=-0.00865967;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=82.9929;QD=9.92501;RBI=0.021634;REFB=-0.019502;REVB=-0.0198253;RO=21;SAF=10;SAR=14;SRF=19;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.393875;STB=0.704709;TYPE=snp;VARB=0.017468;OID=.;OPOS=33893987;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:46:46:21:22:24:24:14:10:19:2:14:10:19:3 chr3 33895391 . A G 525.06 PASS AO=175;DP=426;FAO=158;FDP=386;FR=.;FRO=228;FSAF=79;FSAR=79;FSRF=111;FSRR=117;FWDB=-0.0105592;FXX=0.0349991;HRUN=5;LEN=1;MLLD=91.0796;QD=5.44105;RBI=0.0111842;REFB=-0.0151293;REVB=0.00368631;RO=242;SAF=87;SAR=88;SRF=117;SRR=125;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0142595;STB=0.507771;TYPE=snp;VARB=0.0179059;OID=.;OPOS=33895391;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:426:386:242:228:175:158:88:87:117:125:79:79:111:117 chr3 33907945 . A G 111.8 PASS AO=35;DP=98;FAO=36;FDP=99;FR=.;FRO=63;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=29;FSRR=34;FWDB=0.00794292;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.853;QD=4.51714;RBI=0.0145268;REFB=-0.0136301;REVB=0.012163;RO=62;SAF=14;SAR=21;SRF=29;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0770065;STB=0.546794;TYPE=snp;VARB=0.0259382;OID=.;OPOS=33907945;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:99:62:63:35:36:21:14:29:33:22:14:29:34 chr3 35725250 . C T 2799.04 PASS AO=299;DP=305;FAO=302;FDP=302;FR=.;FRO=0;FSAF=188;FSAR=114;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0219495;FXX=0.0194799;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.6655;QD=37.0734;RBI=0.0399356;REFB=-0.0299086;REVB=-0.0333627;RO=6;SAF=185;SAR=114;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00471287;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.35405e-05;OID=.;OPOS=35725250;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:87:305:302:6:0:299:302:114:185:3:3:114:188:0:0 chr3 35778773 . A G 29.13 PASS AO=9;DP=29;FAO=9;FDP=29;FR=.;FRO=20;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.0105234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.857;QD=4.0175;RBI=0.0150643;REFB=-0.0258335;REVB=0.0107793;RO=17;SAF=2;SAR=7;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175982;STB=0.647789;TYPE=snp;VARB=0.0594499;OID=.;OPOS=35778773;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:29:29:17:20:9:9:7:2:6:11:7:2:8:12 chr3 35779750 . A G 413.82 PASS AO=91;DP=175;FAO=92;FDP=176;FR=.;FRO=84;FSAF=65;FSAR=27;FSRF=49;FSRR=35;FWDB=0.0291514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.596;QD=9.40508;RBI=0.0301267;REFB=-0.0249122;REVB=0.00760348;RO=83;SAF=64;SAR=27;SRF=48;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12278;STB=0.566952;TYPE=snp;VARB=0.0191173;OID=.;OPOS=35779750;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:176:83:84:91:92:27:64:48:35:27:65:49:35 chr3 36422135 . G A 101.89 PASS AO=17;DP=26;FAO=17;FDP=26;FR=.;FRO=9;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=0.00446946;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.913;QD=15.6749;RBI=0.0960249;REFB=-0.0389699;REVB=0.0959208;RO=9;SAF=12;SAR=5;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147337;STB=0.581308;TYPE=snp;VARB=0.0407703;OID=.;OPOS=36422135;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:26:26:9:9:17:17:5:12:8:1:5:12:8:1 chr3 36422216 . T C 61.74 PASS AO=8;DP=25;FAO=8;FDP=22;FR=.,HEALED;FRO=10;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.0669086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.085;QD=11.2258;RBI=0.0727824;REFB=-0.0180367;REVB=0.0286445;RO=10;SAF=1;SAR=7;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.45078;STB=0.776954;TYPE=snp;VARB=0.0249988;OID=.;OPOS=36422216;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:22:22:10:10:8:8:7:1:5:5:7:1:5:5 chr3 36779707 . G A 240.7 PASS AO=67;DP=148;FAO=65;FDP=149;FR=.;FRO=84;FSAF=36;FSAR=29;FSRF=34;FSRR=50;FWDB=-0.0465067;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.3431;QD=6.46184;RBI=0.0481233;REFB=-0.0100136;REVB=0.0123685;RO=81;SAF=37;SAR=30;SRF=32;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15373;STB=0.583479;TYPE=snp;VARB=0.0122655;OID=.;OPOS=36779707;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:149:81:84:67:65:30:37:32:49:29:36:34:50 chr3 36898381 . G A 202.11 PASS AO=63;DP=162;FAO=63;FDP=162;FR=.;FRO=99;FSAF=22;FSAR=41;FSRF=49;FSRR=50;FWDB=0.0268249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5172;QD=4.99026;RBI=0.0307419;REFB=0.0126268;REVB=0.0150162;RO=99;SAF=22;SAR=41;SRF=49;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163326;STB=0.59248;TYPE=snp;VARB=-0.0197232;OID=.;OPOS=36898381;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:162:99:99:63:63:41:22:49:50:41:22:49:50 chr3 37083740 . A G 302.04 PASS AO=61;DP=110;FAO=61;FDP=110;FR=.;FRO=49;FSAF=24;FSAR=37;FSRF=23;FSRR=26;FWDB=0.0464233;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.3624;QD=10.9833;RBI=0.0496381;REFB=-0.0200934;REVB=0.0175732;RO=49;SAF=24;SAR=37;SRF=23;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0636934;STB=0.534901;TYPE=snp;VARB=0.0304081;OID=.;OPOS=37083740;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:49:49:61:61:37:24:23:26:37:24:23:26 chr3 37163039 . G A 1542.78 PASS AO=156;DP=161;FAO=163;FDP=163;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0492697;FXX=0.0121205;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.174;QD=37.8596;RBI=0.0766307;REFB=0;REVB=0.058692;RO=0;SAF=51;SAR=105;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000112502;OID=.;OPOS=37163039;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:161:163:0:0:156:163:105:51:0:0:110:53:0:0 chr3 37366459 . C A 293.65 PASS AO=64;DP=130;FAO=70;FDP=138;FR=.;FRO=68;FSAF=30;FSAR=40;FSRF=38;FSRR=30;FWDB=0.0135087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.83;QD=8.51164;RBI=0.0156381;REFB=-0.0194609;REVB=0.0078781;RO=62;SAF=27;SAR=37;SRF=34;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113479;STB=0.564297;TYPE=snp;VARB=0.0181671;OID=.;OPOS=37366459;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:138:62:68:64:70:37:27:34:28:40:30:38:30 chr3 37368755 . T A 322.72 PASS AO=86;DP=190;FAO=85;FDP=189;FR=.;FRO=104;FSAF=38;FSAR=47;FSRF=51;FSRR=53;FWDB=-0.0157143;FXX=0.00526288;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.023;QD=6.83011;RBI=0.0167632;REFB=-0.0228953;REVB=0.00583642;RO=103;SAF=38;SAR=48;SRF=50;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.043143;STB=0.523983;TYPE=snp;VARB=0.0273189;OID=.;OPOS=37368755;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:189:103:104:86:85:48:38:50:53:47:38:51:53 chr3 37368886 . G A 199.5 PASS AO=50;DP=109;FAO=50;FDP=109;FR=.;FRO=59;FSAF=6;FSAR=44;FSRF=14;FSRR=45;FWDB=-0.0310976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2335;QD=7.3211;RBI=0.0384349;REFB=-0.00132794;REVB=-0.0225873;RO=59;SAF=6;SAR=44;SRF=14;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21593;STB=0.622291;TYPE=snp;VARB=0.00148564;OID=.;OPOS=37368886;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:59:59:50:50:44:6:14:45:44:6:14:45 chr3 37378684 . C T 23.14 PASS AO=5;DP=10;FAO=4;FDP=9;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.00552353;FXX=0.0999001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.796;QD=10.2835;RBI=0.0107344;REFB=-0.00697596;REVB=0.00920421;RO=5;SAF=1;SAR=4;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.363118;STB=0.704804;TYPE=snp;VARB=0.00411616;OID=.;OPOS=37378684;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:10:9:5:5:5:4:4:1:3:2:3:1:3:2 chr3 37407664 . G T 352.48 PASS AO=81;DP=168;FAO=84;FDP=171;FR=.;FRO=87;FSAF=31;FSAR=53;FSRF=34;FSRR=53;FWDB=-0.00363643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.058;QD=8.24503;RBI=0.0134425;REFB=-0.0107906;REVB=0.0129413;RO=86;SAF=30;SAR=51;SRF=34;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.024794;STB=0.511808;TYPE=snp;VARB=0.011176;OID=.;OPOS=37407664;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:171:86:87:81:84:51:30:34:52:53:31:34:53 chr3 37535984 . C G 117.32 PASS AO=32;DP=73;FAO=32;FDP=77;FR=.;FRO=45;FSAF=30;FSAR=2;FSRF=42;FSRR=3;FWDB=-0.00642449;FXX=0.0128189;HRUN=5;LEN=1;MLLD=227.985;QD=6.09476;RBI=0.101829;REFB=-0.0118683;REVB=-0.101626;RO=41;SAF=30;SAR=2;SRF=40;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197059;STB=0.510198;TYPE=snp;VARB=0.017273;OID=.;OPOS=37535984;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:77:41:45:32:32:2:30:40:1:2:30:42:3 chr3 37567589 . A C 238.81 PASS AO=56;DP=113;FAO=56;FDP=114;FR=.;FRO=58;FSAF=16;FSAR=40;FSRF=18;FSRR=40;FWDB=0.00271425;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=242.498;QD=8.37934;RBI=0.0123897;REFB=0.0019056;REVB=-0.0120887;RO=57;SAF=16;SAR=40;SRF=18;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0330254;STB=0.515146;TYPE=snp;VARB=-0.00163018;OID=.;OPOS=37567589;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:114:57:58:56:56:40:16:18:39:40:16:18:40 chr3 37574951 . G A 170.14 PASS AO=45;DP=103;FAO=45;FDP=103;FR=.;FRO=58;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=32;FSRR=26;FWDB=-0.0419623;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.0188;QD=6.60744;RBI=0.135298;REFB=0.0216114;REVB=0.128626;RO=58;SAF=16;SAR=29;SRF=32;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200499;STB=0.612625;TYPE=snp;VARB=-0.025378;OID=.;OPOS=37574951;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:58:58:45:45:29:16:32:26:29:16:32:26 chr3 38061692 . C T 115.32 PASS AO=44;DP=137;FAO=45;FDP=136;FR=.;FRO=91;FSAF=37;FSAR=8;FSRF=59;FSRR=32;FWDB=0.0141423;FXX=0.00729874;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.7;QD=3.39176;RBI=0.0271129;REFB=-0.0026692;REVB=0.0231323;RO=74;SAF=37;SAR=7;SRF=51;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246702;STB=0.658283;TYPE=snp;VARB=0.00790412;OID=.;OPOS=38061692;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:136:74:91:44:45:7:37:51:23:8:37:59:32 chr3 38061748 . A G 291.05 PASS AO=89;DP=223;FAO=89;FDP=222;FR=.;FRO=133;FSAF=37;FSAR=52;FSRF=62;FSRR=71;FWDB=-0.017731;FXX=0.00892817;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.6071;QD=5.24406;RBI=0.0235384;REFB=-0.0177144;REVB=0.0154813;RO=133;SAF=37;SAR=52;SRF=62;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0547911;STB=0.530769;TYPE=snp;VARB=0.0212672;OID=.;OPOS=38061748;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:222:133:133:89:89:52:37:62:71:52:37:62:71 chr3 38080952 . T G 20.88 PASS AO=8;DP=33;FAO=8;FDP=32;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0353448;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2479;QD=2.61026;RBI=0.0472242;REFB=0.00114904;REVB=-0.0313189;RO=25;SAF=5;SAR=3;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.261076;STB=0.653469;TYPE=snp;VARB=-0.00347606;OID=.;OPOS=38080952;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:33:32:25:24:8:8:3:5:10:15:3:5:10:14 chr3 38087123 . T C 451.95 PASS AO=93;DP=169;FAO=93;FDP=167;FR=.;FRO=74;FSAF=39;FSAR=54;FSRF=30;FSRR=44;FWDB=0.00734751;FXX=0.0118336;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.627;QD=10.8252;RBI=0.00952007;REFB=0.00129532;REVB=0.00605358;RO=74;SAF=39;SAR=54;SRF=30;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116661;STB=0.506358;TYPE=snp;VARB=-0.000791101;OID=.;OPOS=38087123;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:167:74:74:93:93:54:39:30:44:54:39:30:44 chr3 38151731 . T C 244.93 PASS AO=51;DP=95;FAO=52;FDP=97;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=34;FSRF=13;FSRR=32;FWDB=-0.0260003;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.7162;QD=10.1001;RBI=0.0639149;REFB=-0.0488759;REVB=-0.0583875;RO=44;SAF=18;SAR=33;SRF=13;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0539922;STB=0.529873;TYPE=snp;VARB=0.0467264;OID=.;OPOS=38151731;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:97:44:45:51:52:33:18:13:31:34:18:13:32 chr3 38151755 . G A 123.14 PASS AO=32;DP=82;FAO=35;FDP=85;FR=.;FRO=50;FSAF=5;FSAR=30;FSRF=16;FSRR=34;FWDB=0.123614;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.839;QD=5.79497;RBI=0.123614;REFB=-0.0137765;REVB=-0.000445705;RO=49;SAF=2;SAR=30;SRF=16;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.522909;STB=0.663049;TYPE=snp;VARB=0.015141;OID=.;OPOS=38151755;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:85:49:50:32:35:30:2:16:33:30:5:16:34 chr3 38158982 . G A 53.07 PASS AO=8;DP=13;FAO=8;FDP=12;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.00930235;FXX=0.076864;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.832;QD=17.6911;RBI=0.137138;REFB=-0.0218771;REVB=0.136823;RO=4;SAF=3;SAR=5;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.348619;STB=0.699532;TYPE=snp;VARB=0.0426386;OID=.;OPOS=38158982;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:13:12:4:4:8:8:5:3:4:0:5:3:4:0 chr3 38164070 . CATG C 285.07 PASS AO=30;DP=33;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.038461;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=3;MLLD=291.147;QD=36.7831;RBI=0.043663;REFB=0;REVB=0.020669;RO=0;SAF=3;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.84607e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=5.95912e-05;OID=.;OPOS=38164071;OREF=ATG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:30:32:31:31:0:3:28:0:0:14:0:3:27:0:0 chr3 38168125 . A C 280.05 PASS AO=55;DP=106;FAO=59;FDP=110;FR=.;FRO=51;FSAF=2;FSAR=57;FSRF=1;FSRR=50;FWDB=0.0900069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.294;QD=10.1836;RBI=0.0906488;REFB=-0.0140028;REVB=-0.0107689;RO=50;SAF=1;SAR=54;SRF=1;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.021467;STB=0.555827;TYPE=snp;VARB=0.00979625;OID=.;OPOS=38168125;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:110:50:51:55:59:54:1:1:49:57:2:1:50 chr3 38180306 . G A 136.49 PASS AO=32;DP=67;FAO=32;FDP=67;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.00100611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.586;QD=8.14858;RBI=0.0079439;REFB=-0.0344533;REVB=0.00787993;RO=35;SAF=13;SAR=19;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0486493;STB=0.527256;TYPE=snp;VARB=0.0477635;OID=.;OPOS=38180306;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:35:35:32:32:19:13:16:19:19:13:16:19 chr3 38271881 . C T 2268.54 PASS AO=236;DP=238;FAO=236;FDP=236;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=144;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0187486;FXX=0.00840301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.387;QD=38.4498;RBI=0.023046;REFB=0;REVB=0.0134018;RO=0;SAF=92;SAR=144;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.20056e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.60154e-05;OID=.;OPOS=38271881;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:238:236:0:0:236:236:144:92:0:0:144:92:0:0 chr3 38294817 . T C 215.17 PASS AO=75;DP=210;FAO=75;FDP=209;FR=.;FRO=134;FSAF=37;FSAR=38;FSRF=84;FSRR=50;FWDB=0.02319;FXX=0.00476168;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.293;QD=4.11802;RBI=0.0238463;REFB=-0.00283185;REVB=-0.00555613;RO=133;SAF=37;SAR=38;SRF=83;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147192;STB=0.585412;TYPE=snp;VARB=0.00591721;OID=.;OPOS=38294817;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:210:209:133:134:75:75:38:37:83:50:38:37:84:50 chr3 38307510 . T C 245.88 PASS AO=50;DP=89;FAO=50;FDP=88;FR=.;FRO=38;FSAF=18;FSAR=32;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=-0.0319306;FXX=0.0112347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.0298;QD=11.1762;RBI=0.0381319;REFB=-0.0422528;REVB=0.0208442;RO=39;SAF=18;SAR=32;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0429441;STB=0.516123;TYPE=snp;VARB=0.0413971;OID=.;OPOS=38307510;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:88:39:38:50:50:32:18:16:23:32:18:15:23 chr3 38347633 . G A 262.53 PASS AO=62;DP=128;FAO=62;FDP=127;FR=.;FRO=65;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=31;FSRR=34;FWDB=0.000679865;FXX=0.00781189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.908;QD=8.26852;RBI=0.00942628;REFB=-0.00617894;REVB=0.00940173;RO=65;SAF=26;SAR=36;SRF=31;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0541307;STB=0.529949;TYPE=snp;VARB=0.00842053;OID=.;OPOS=38347633;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:127:65:65:62:62:36:26:31:34:36:26:31:34 chr3 38347680 . C T 226.13 PASS AO=56;DP=121;FAO=56;FDP=120;FR=.;FRO=64;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=28;FSRR=36;FWDB=-0.0174701;FXX=0.00826378;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.9897;QD=7.53776;RBI=0.0414733;REFB=-0.0264211;REVB=-0.0376143;RO=64;SAF=22;SAR=34;SRF=28;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0443746;STB=0.524682;TYPE=snp;VARB=0.0288344;OID=.;OPOS=38347680;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:120:64:64:56:56:34:22:28:36:34:22:28:36 chr3 38347851 . A G 280.9 PASS AO=59;DP=116;FAO=63;FDP=124;FR=.;FRO=61;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=24;FSRR=37;FWDB=-0.0614861;FXX=0.0236202;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.2619;QD=9.0613;RBI=0.0625097;REFB=0.0023468;REVB=-0.0112663;RO=54;SAF=30;SAR=29;SRF=21;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103759;STB=0.548587;TYPE=snp;VARB=0.000495272;OID=.;OPOS=38347851;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:124:54:61:59:63:29:30:21:33:32:31:24:37 chr3 38350479 . T C 515.25 PASS AO=111;DP=206;FAO=111;FDP=206;FR=.;FRO=95;FSAF=61;FSAR=50;FSRF=39;FSRR=56;FWDB=0.0179796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.794;QD=10.0049;RBI=0.0462693;REFB=0.00919559;REVB=0.0426331;RO=95;SAF=61;SAR=50;SRF=39;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117149;STB=0.563917;TYPE=snp;VARB=-0.00673977;OID=.;OPOS=38350479;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:206:206:95:95:111:111:50:61:39:56:50:61:39:56 chr3 38350519 . G A 527.35 PASS AO=125;DP=251;FAO=125;FDP=252;FR=.;FRO=127;FSAF=61;FSAR=64;FSRF=55;FSRR=72;FWDB=0.0181385;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.2;QD=8.37058;RBI=0.0186167;REFB=-0.00229272;REVB=0.00419255;RO=124;SAF=61;SAR=64;SRF=54;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0477799;STB=0.527731;TYPE=snp;VARB=0.0019288;OID=.;OPOS=38350519;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:251:252:124:127:125:125:64:61:54:70:64:61:55:72 chr3 38350543 . A G 574.77 PASS AO=128;DP=247;FAO=129;FDP=248;FR=.;FRO=119;FSAF=72;FSAR=57;FSRF=58;FSRR=61;FWDB=0.0110774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.189;QD=9.27054;RBI=0.0623266;REFB=-0.0154265;REVB=-0.0613343;RO=119;SAF=72;SAR=56;SRF=58;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.066559;STB=0.534133;TYPE=snp;VARB=0.0179482;OID=.;OPOS=38350543;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:247:248:119:119:128:129:56:72:58:61:57:72:58:61 chr3 38355225 . G A 56.37 PASS AO=19;DP=57;FAO=19;FDP=57;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=-0.00635657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.039;QD=3.9559;RBI=0.0078817;REFB=-0.00541817;REVB=-0.00465996;RO=38;SAF=11;SAR=8;SRF=24;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0619257;STB=0.536361;TYPE=snp;VARB=0.0389494;OID=.;OPOS=38355225;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:57:57:38:38:19:19:8:11:24:14:8:11:24:14 chr3 38401839 . T C 1077.96 PASS AO=112;DP=113;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159514;FXX=0.0409802;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.384;QD=36.8533;RBI=0.0220551;REFB=0;REVB=0.015231;RO=0;SAF=31;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00182312;OID=.;OPOS=38401839;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:113:117:0:0:112:117:81:31:0:0:81:36:0:0 chr3 38406773 . G T 648.74 PASS AO=66;DP=66;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.05807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.692;QD=38.1612;RBI=0.0722133;REFB=0;REVB=0.0429259;RO=0;SAF=20;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000237907;OID=.;OPOS=38406773;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:66:68:0:0:66:68:46:20:0:0:46:22:0:0 chr3 38408361 . G A 2044.49 PASS AO=216;DP=219;FAO=216;FDP=216;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=154;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0114255;FXX=0.013698;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.089;QD=37.8609;RBI=0.032712;REFB=-0.0273123;REVB=0.0306518;RO=2;SAF=62;SAR=154;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00453808;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.67172e-06;OID=.;OPOS=38408361;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:219:216:2:0:216:216:154:62:1:1:154:62:0:0 chr3 38442490 . G A 280.05 PASS AO=59;DP=110;FAO=59;FDP=110;FR=.;FRO=51;FSAF=18;FSAR=41;FSRF=20;FSRR=31;FWDB=-0.0140176;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.855;QD=10.1836;RBI=0.0172114;REFB=-0.00150657;REVB=0.00998695;RO=51;SAF=18;SAR=41;SRF=20;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0833553;STB=0.545884;TYPE=snp;VARB=0.00149218;OID=.;OPOS=38442490;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:51:51:59:59:41:18:20:31:41:18:20:31 chr3 38519424 . A G 126.05 PASS AO=34;DP=81;FAO=34;FDP=81;FR=.;FRO=47;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=-0.00392007;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.281;QD=6.22459;RBI=0.00515804;REFB=-0.0126522;REVB=-0.00335238;RO=47;SAF=19;SAR=15;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0714929;STB=0.540457;TYPE=snp;VARB=0.0146556;OID=.;OPOS=38519424;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:47:47:34:34:15:19:23:24:15:19:23:24 chr3 38524742 . C T 370.88 PASS AO=95;DP=206;FAO=95;FDP=206;FR=.;FRO=111;FSAF=63;FSAR=32;FSRF=72;FSRR=39;FWDB=-0.00982027;FXX=0.00483068;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.785;QD=7.20155;RBI=0.0136679;REFB=-0.0100596;REVB=-0.00950645;RO=110;SAF=63;SAR=32;SRF=71;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0190684;STB=0.508698;TYPE=snp;VARB=0.0133941;OID=.;OPOS=38524742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:206:206:110:111:95:95:32:63:71:39:32:63:72:39 chr3 38525567 . T C 299.45 PASS AO=72;DP=150;FAO=72;FDP=150;FR=.;FRO=78;FSAF=45;FSAR=27;FSRF=52;FSRR=26;FWDB=0.00415663;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.9477;QD=7.98533;RBI=0.0164526;REFB=-0.0154483;REVB=-0.0159189;RO=78;SAF=45;SAR=27;SRF=52;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0423351;STB=0.523375;TYPE=snp;VARB=0.0264803;OID=.;OPOS=38525567;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:150:78:78:72:72:27:45:52:26:27:45:52:26 chr3 38529818 . C T 180.16 PASS AO=52;DP=129;FAO=52;FDP=127;FR=.;FRO=75;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=37;FSRR=38;FWDB=-0.00397224;FXX=0.0155027;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.072;QD=5.67418;RBI=0.0250111;REFB=-0.010582;REVB=-0.0246937;RO=72;SAF=29;SAR=23;SRF=35;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0742066;STB=0.538166;TYPE=snp;VARB=0.0177873;OID=.;OPOS=38529818;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:127:72:75:52:52:23:29:35:37:23:29:37:38 chr3 38529825 . C T 222.83 PASS AO=58;DP=130;FAO=58;FDP=130;FR=.;FRO=72;FSAF=34;FSAR=24;FSRF=36;FSRR=36;FWDB=0.00170918;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.2389;QD=6.8562;RBI=0.0130052;REFB=-0.0254292;REVB=-0.0128924;RO=70;SAF=34;SAR=24;SRF=34;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0996372;STB=0.54837;TYPE=snp;VARB=0.0213461;OID=.;OPOS=38529825;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:70:72:58:58:24:34:34:36:24:34:36:36 chr3 38532511 . G A 356.4 PASS AO=104;DP=251;FAO=104;FDP=250;FR=.;FRO=146;FSAF=36;FSAR=68;FSRF=53;FSRR=93;FWDB=-0.0253962;FXX=0.00793619;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.276;QD=5.70234;RBI=0.0256488;REFB=-0.0139671;REVB=-0.00359114;RO=146;SAF=36;SAR=68;SRF=53;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0193285;STB=0.510801;TYPE=snp;VARB=0.0198798;OID=.;OPOS=38532511;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:251:250:146:146:104:104:68:36:53:93:68:36:53:93 chr3 38532964 . C A 362.51 PASS AO=106;DP=258;FAO=106;FDP=257;FR=.;FRO=151;FSAF=46;FSAR=60;FSRF=73;FSRR=78;FWDB=-0.00487959;FXX=0.044608;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.203;QD=5.64214;RBI=0.0317579;REFB=-0.014197;REVB=0.0313808;RO=146;SAF=46;SAR=60;SRF=73;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0690546;STB=0.529354;TYPE=snp;VARB=0.0178925;OID=.;OPOS=38532964;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:258:257:146:151:106:106:60:46:73:73:60:46:73:78 chr3 38534142 . T A 416.96 PASS AO=73;DP=155;FAO=93;FDP=175;FR=.;FRO=82;FSAF=23;FSAR=70;FSRF=32;FSRR=50;FWDB=0.00159586;FXX=0.0056815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.272;QD=9.53046;RBI=0.00937578;REFB=0.00241498;REVB=0.00923896;RO=82;SAF=20;SAR=53;SRF=32;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129866;STB=0.582432;TYPE=snp;VARB=-0.00159346;OID=.;OPOS=38534142;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:175:82:82:73:93:53:20:32:50:70:23:32:50 chr3 38589666 . T TCCCTCCTTTTTCCTACTCTCTTCTC 42.91 PASS AO=18;DP=87;FAO=21;FDP=78;FR=.;FRO=57;FSAF=2;FSAR=19;FSRF=41;FSRR=16;FWDB=-0.00248766;FXX=0.0487745;HRUN=3;LEN=25;MLLD=424.695;QD=2.20048;RBI=0.00805703;REFB=-0.00412958;REVB=0.00766338;RO=63;SAF=1;SAR=17;SRF=42;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.729353;STB=0.920716;TYPE=ins;VARB=0.0080277;OID=.;OPOS=38589667;OREF=-;OALT=CCCTCCTTTTTCCTACTCTCTTCTC;OMAPALT=TCCCTCCTTTTTCCTACTCTCTTCTC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:18:87:21:78:57:2:19:41:16:42:63:1:17:42:21 chr3 38622467 . T C 379.65 PASS AO=40;DP=40;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00161789;FXX=0.0249938;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5405;QD=38.9384;RBI=0.0331437;REFB=0;REVB=-0.0331042;RO=0;SAF=35;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000196957;OID=.;OPOS=38622467;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:40:39:0:0:40:39:5:35:0:0:5:34:0:0 chr3 38645420 . T C 53.56 PASS AO=21;DP=70;FAO=21;FDP=70;FR=.;FRO=49;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=27;FSRR=22;FWDB=-0.0418671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.9137;QD=3.06062;RBI=0.0666538;REFB=-0.0289411;REVB=-0.0518641;RO=47;SAF=13;SAR=8;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0794044;STB=0.549248;TYPE=snp;VARB=0.0393965;OID=.;OPOS=38645420;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:70:70:47:49:21:21:8:13:26:21:8:13:27:22 chr3 38647642 . G T 55.91 PASS AO=21;DP=67;FAO=21;FDP=67;FR=.;FRO=46;FSAF=2;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=34;FWDB=0.0941514;FXX=0.0147037;HRUN=5;LEN=1;MLLD=40.1073;QD=3.3377;RBI=0.0980552;REFB=-0.013196;REVB=0.027392;RO=46;SAF=2;SAR=19;SRF=12;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.349897;STB=0.714797;TYPE=snp;VARB=0.030493;OID=.;OPOS=38647642;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:67:67:46:46:21:21:19:2:12:34:19:2:12:34 chr3 38674712 . T C 345.88 PASS AO=87;DP=187;FAO=87;FDP=186;FR=.;FRO=99;FSAF=49;FSAR=38;FSRF=42;FSRR=57;FWDB=-0.0292165;FXX=0.00534731;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.926;QD=7.43829;RBI=0.0346274;REFB=-0.0105579;REVB=-0.0185865;RO=98;SAF=49;SAR=38;SRF=41;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13833;STB=0.573754;TYPE=snp;VARB=0.015313;OID=.;OPOS=38674712;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:186:98:99:87:87:38:49:41:57:38:49:42:57 chr3 38739574 . T C 2198.63 PASS AO=227;DP=230;FAO=232;FDP=232;FR=.;FRO=0;FSAF=129;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0512326;FXX=0.00854664;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.5976;QD=37.9074;RBI=0.055831;REFB=-0.0133738;REVB=0.0221884;RO=2;SAF=128;SAR=99;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00952817;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000222478;OID=.;OPOS=38739574;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:96:230:232:2:0:227:232:99:128:0:2:103:129:0:0 chr3 38739845 . A G 711.83 PASS AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.3039;QD=37.9642;RBI=0.0180121;REFB=0;REVB=-0.00324533;RO=0;SAF=34;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.84595e-05;OID=.;OPOS=38739845;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:75:75:0:0:75:75:41:34:0:0:41:34:0:0 chr3 38763863 . G C 225.65 PASS AO=61;DP=137;FAO=60;FDP=136;FR=.;FRO=76;FSAF=35;FSAR=25;FSRF=35;FSRR=41;FWDB=0.0272582;FXX=0.00729874;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.77;QD=6.63685;RBI=0.0281611;REFB=-0.00450346;REVB=-0.0070738;RO=75;SAF=35;SAR=26;SRF=35;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106397;STB=0.568942;TYPE=snp;VARB=0.00622493;OID=.;OPOS=38763863;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:136:75:76:61:60:26:35:35:40:25:35:35:41 chr3 38764998 . A G 370.17 PASS AO=40;DP=102;FAO=41;FDP=95;FR=.,HEALED;FRO=30;FSAF=4;FSAR=37;FSRF=5;FSRR=25;FWDB=-0.00410743;FXX=0.0686207;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.219;QD=15.5859;RBI=0.00779869;REFB=-0.0263508;REVB=-0.00662938;RO=37;SAF=3;SAR=37;SRF=12;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.436661;STB=0.57311;TYPE=snp;VARB=0.0206395;OID=.;OPOS=38764998;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:95:37:30:40:41:37:3:12:25:37:4:5:25 chr3 38766675 . A G 62.98 PASS AO=15;DP=48;FAO=19;FDP=52;FR=.;FRO=33;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=28;FWDB=-0.0328383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.915;QD=4.84447;RBI=0.0344668;REFB=-0.0106425;REVB=0.0104694;RO=33;SAF=4;SAR=11;SRF=5;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190919;STB=0.599908;TYPE=snp;VARB=0.0192446;OID=.;OPOS=38766675;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:48:52:33:33:15:19:11:4:5:28:14:5:5:28 chr3 38768247 . G A 205.23 PASS AO=37;DP=78;FAO=42;FDP=77;FR=.,HEALED;FRO=35;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.0228138;FXX=0.0253133;HRUN=4;LEN=1;MLLD=185.11;QD=10.6613;RBI=0.0229613;REFB=-0.0117148;REVB=-0.00259834;RO=18;SAF=13;SAR=24;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.087798;STB=0.536065;TYPE=snp;VARB=0.00757677;OID=.;OPOS=38768247;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:77:18:35:37:42:24:13:4:14:26:16:16:19 chr3 38768300 . T C 244.25 PASS AO=53;DP=102;FAO=53;FDP=101;FR=.;FRO=48;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=-0.00727132;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.318;QD=9.6731;RBI=0.0326656;REFB=-0.000811725;REVB=-0.031846;RO=48;SAF=27;SAR=26;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0440588;STB=0.524263;TYPE=snp;VARB=0.000101092;OID=.;OPOS=38768300;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:101:48:48:53:53:26:27:22:26:26:27:22:26 chr3 38793989 . G A 32.04 PASS AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.0107471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.55;QD=5.82602;RBI=0.025312;REFB=0.00264911;REVB=0.0229171;RO=14;SAF=3;SAR=5;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103271;STB=0.562351;TYPE=snp;VARB=-0.00662402;OID=.;OPOS=38793989;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:22:22:14:14:8:8:5:3:4:10:5:3:4:10 chr3 38798171 . C T 341.95 PASS AO=83;DP=173;FAO=83;FDP=172;FR=.;FRO=89;FSAF=39;FSAR=44;FSRF=45;FSRR=44;FWDB=0.0281253;FXX=0.00578001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.57;QD=7.95223;RBI=0.0400001;REFB=-0.0143384;REVB=0.0284425;RO=89;SAF=39;SAR=44;SRF=45;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0335439;STB=0.518514;TYPE=snp;VARB=0.0146874;OID=.;OPOS=38798171;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:172:89:89:83:83:44:39:45:44:44:39:45:44 chr3 38802251 . A G 213.09 PASS AO=54;DP=134;FAO=58;FDP=134;FR=.;FRO=76;FSAF=24;FSAR=34;FSRF=39;FSRR=37;FWDB=0.0260424;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2484;QD=6.3609;RBI=0.0385519;REFB=0.00939994;REVB=-0.0284262;RO=80;SAF=20;SAR=34;SRF=43;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179465;STB=0.556922;TYPE=snp;VARB=-0.012032;OID=.;OPOS=38802251;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:80:76:54:58:34:20:43:37:34:24:39:37 chr3 38802850 . AG A 780.54 PASS AO=107;DP=205;FAO=193;FDP=193;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=108;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.176499;FXX=0.00515437;HRUN=3;LEN=1;MLLD=9.0865;QD=16.1771;RBI=0.315784;REFB=-0.00204112;REVB=0.261854;RO=34;SAF=40;SAR=67;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0.435071;SSSB=-0.00410649;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0220697;OID=.;OPOS=38802851;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:107:191:193:193:0:85:108:0:0:48:34:40:67:13:21 chr3 38945560 . A G 1944.22 PASS AO=203;DP=205;FAO=204;FDP=204;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00651435;FXX=0.0192298;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.484;QD=38.122;RBI=0.00723808;REFB=-0.0344412;REVB=-0.00315485;RO=1;SAF=90;SAR=113;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00526312;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.32673e-07;OID=.;OPOS=38945560;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:205:204:1:0:203:204:113:90:1:0:113:91:0:0 chr3 39142562 . G A 193.92 PASS AO=45;DP=90;FAO=45;FDP=92;FR=.;FRO=47;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=18;FSRR=29;FWDB=-0.00740567;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.962;QD=8.43145;RBI=0.00909241;REFB=-0.00637076;REVB=-0.00527521;RO=45;SAF=19;SAR=26;SRF=17;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0414036;STB=0.520669;TYPE=snp;VARB=0.006384;OID=.;OPOS=39142562;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:92:45:47:45:45:26:19:17:28:26:19:18:29 chr3 39180099 . T C 1489.39 PASS AO=157;DP=159;FAO=158;FDP=158;FR=.;FRO=0;FSAF=109;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0273833;FXX=0.0124992;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.5964;QD=37.706;RBI=0.0359593;REFB=-0.0218938;REVB=-0.0233073;RO=2;SAF=108;SAR=49;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00522469;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00112675;OID=.;OPOS=39180099;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:159:158:2:0:157:158:49:108:1:1:49:109:0:0 chr3 39180263 . G A 1086.3 PASS AO=112;DP=116;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0381461;FXX=0.0169477;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.8843;QD=37.4587;RBI=0.039304;REFB=-0.0405177;REVB=0.00947016;RO=1;SAF=39;SAR=73;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0120174;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000182659;OID=.;OPOS=39180263;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:116:116:1:0:112:116:73:39:1:0:76:40:0:0 chr3 39184959 . C T 488.27 PASS AO=53;DP=53;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.017;QD=37.559;RBI=0.0359608;REFB=0;REVB=0.024742;RO=0;SAF=28;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000222352;OID=.;OPOS=39184959;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:53:52:0:0:53:52:25:28:0:0:24:28:0:0 chr3 39185077 . G A 86.76 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0492619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.178;QD=38.559;RBI=0.0852218;REFB=0;REVB=0.0695416;RO=0;SAF=2;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00231413;OID=.;OPOS=39185077;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:7:2:0:0:7:2:0:0 chr3 39185248 . A G 266.64 PASS AO=23;DP=23;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0312609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.8587;QD=38.0918;RBI=0.0531828;REFB=0;REVB=0.0430252;RO=0;SAF=21;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.63689e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00118593;OID=.;OPOS=39185248;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:23:28:0:0:23:28:2:21:0:0:5:23:0:0 chr3 39186728 . C T 1225.27 PASS AO=132;DP=134;FAO=132;FDP=134;FR=.;FRO=2;FSAF=62;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0257944;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=215.21;QD=36.5753;RBI=0.0438876;REFB=-0.0589825;REVB=0.0355073;RO=2;SAF=62;SAR=70;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0133849;STB=0.507041;TYPE=snp;VARB=0.00018537;OID=.;OPOS=39186728;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:134:134:2:2:132:132:70:62:0:2:70:62:0:2 chr3 39229900 . T C 1328.76 PASS AO=137;DP=137;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00627265;FXX=0.00719373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.003;QD=38.5149;RBI=0.0106021;REFB=0;REVB=0.00854747;RO=0;SAF=60;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000286083;OID=.;OPOS=39229900;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:137:138:0:0:137:138:77:60:0:0:77:61:0:0 chr3 39323163 . A C 924.3 PASS AO=103;DP=107;FAO=102;FDP=106;FR=.;FRO=4;FSAF=23;FSAR=79;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0283406;FXX=0.0275204;HRUN=3;LEN=1;MLLD=144.342;QD=34.8793;RBI=0.0294712;REFB=-0.175495;REVB=0.00808468;RO=4;SAF=23;SAR=80;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00272257;STB=0.501322;TYPE=snp;VARB=0.000180627;OID=.;OPOS=39323163;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:107:106:4:4:103:102:80:23:1:3:79:23:1:3 chr3 39373902 . C G 394.5 PASS AO=100;DP=231;FAO=106;FDP=237;FR=.;FRO=131;FSAF=55;FSAR=51;FSRF=50;FSRR=81;FWDB=-0.00292602;FXX=0.0124995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.804;QD=6.65822;RBI=0.00886202;REFB=-0.00610757;REVB=0.00836504;RO=129;SAF=50;SAR=50;SRF=48;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129829;STB=0.575491;TYPE=snp;VARB=0.00676104;OID=.;OPOS=39373902;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:231:237:129:131:100:106:50:50:48:81:51:55:50:81 chr3 39431081 . G A 245.49 PASS AO=55;DP=108;FAO=55;FDP=108;FR=.;FRO=53;FSAF=9;FSAR=46;FSRF=15;FSRR=38;FWDB=-0.00500941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.113;QD=9.09213;RBI=0.00745868;REFB=-0.0194534;REVB=-0.00552609;RO=53;SAF=9;SAR=46;SRF=15;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167823;STB=0.593511;TYPE=snp;VARB=0.0134923;OID=.;OPOS=39431081;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:53:53:55:55:46:9:15:38:46:9:15:38 chr3 39449137 . T C 289.76 PASS AO=64;DP=122;FAO=64;FDP=123;FR=.;FRO=59;FSAF=27;FSAR=37;FSRF=27;FSRR=32;FWDB=-0.0125692;FXX=0.0159987;HRUN=4;LEN=1;MLLD=149.614;QD=9.42322;RBI=0.0125729;REFB=-0.00169739;REVB=-0.000302279;RO=58;SAF=27;SAR=37;SRF=26;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0233041;STB=0.517477;TYPE=snp;VARB=0.001103;OID=.;OPOS=39449137;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:123:58:59:64:64:37:27:26:32:37:27:27:32 chr3 39541550 . A G 139.57 PASS AO=39;DP=94;FAO=39;FDP=94;FR=.;FRO=55;FSAF=10;FSAR=29;FSRF=18;FSRR=37;FWDB=-0.00119648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.346;QD=5.93923;RBI=0.0343999;REFB=-0.0191071;REVB=-0.0343791;RO=54;SAF=10;SAR=29;SRF=18;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0976385;STB=0.551603;TYPE=snp;VARB=0.0261991;OID=.;OPOS=39541550;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:54:55:39:39:29:10:18:36:29:10:18:37 chr3 39544175 . C T 10.22 PASS AO=2;DP=9;FAO=2;FDP=9;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=52.8359;QD=4.54311;RBI=0.0212955;REFB=-0.027497;REVB=-0.0212955;RO=7;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0663263;OID=.;OPOS=39544175;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:7:7:2:2:2:0:0:7:2:0:0:7 chr3 40231882 . AC A,AT 942.52 PASS AO=32,71;DP=103;FAO=95,7;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=63,0;FSAR=32,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195882,-0.441603;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=34.9781,20.6028;QD=36.9616;RBI=0.0227259,0.443907;REFB=0,0;REVB=0.0115226,0.0451647;RO=0;SAF=1,62;SAR=31,9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=9.09509e-06,-0.0403246;OID=.,.;OPOS=40231883,40231883;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=A,AT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:32,71:103:95,7:102:0:63,0:32,7:0:0:7:0:1,62:31,9:0:0 chr3 40286017 . T C 1415.68 PASS AO=116;DP=154;FAO=149;FDP=149;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=79;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.196194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9449;QD=38.0049;RBI=0.19659;REFB=0;REVB=0.012477;RO=0;SAF=60;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000712546;OID=.;OPOS=40286017;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:144:149:0:0:116:149:56:60:0:0:70:79:0:0 chr3 40286018 . G C 29.5 PASS AO=32;DP=149;FAO=28;FDP=149;FR=.;FRO=121;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=67;FSRR=54;FWDB=-0.110953;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.6789;QD=0.79191;RBI=0.111076;REFB=-0.112698;REVB=0.00523593;RO=117;SAF=16;SAR=16;SRF=63;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0488577;STB=0.600689;TYPE=snp;VARB=0.114333;OID=.;OPOS=40286018;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:149:149:117:121:32:28:16:16:63:54:16:12:67:54 chr3 40435890 . A G 24.7 PASS AO=10;DP=39;FAO=10;FDP=39;FR=.;FRO=29;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.0478766;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0829;QD=2.53378;RBI=0.0577247;REFB=0.00396456;REVB=-0.0322486;RO=29;SAF=1;SAR=9;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.512711;STB=0.833642;TYPE=snp;VARB=-0.0122463;OID=.;OPOS=40435890;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:39:39:29:29:10:10:9:1:13:16:9:1:13:16 chr3 40468896 . C T 295.64 PASS AO=76;DP=177;FAO=81;FDP=186;FR=.;FRO=105;FSAF=28;FSAR=53;FSRF=45;FSRR=60;FWDB=-0.0332636;FXX=0.00534731;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.36;QD=6.35788;RBI=0.0334649;REFB=-0.0212643;REVB=0.00366506;RO=100;SAF=23;SAR=53;SRF=40;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111256;STB=0.550108;TYPE=snp;VARB=0.0235894;OID=.;OPOS=40468896;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:186:100:105:76:81:53:23:40:60:53:28:45:60 chr3 40498845 . C T 126.22 PASS AO=21;DP=32;FAO=21;FDP=32;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.0262159;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.1557;QD=15.7776;RBI=0.0263599;REFB=-0.0475534;REVB=0.00275172;RO=11;SAF=5;SAR=16;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.282599;STB=0.657372;TYPE=snp;VARB=0.0278781;OID=.;OPOS=40498845;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:32:32:11:11:21:21:16:5:7:4:16:5:7:4 chr3 40499182 . C T 158.34 PASS AO=33;DP=62;FAO=33;FDP=62;FR=.;FRO=29;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=7;FWDB=0.0222647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.5375;QD=10.2157;RBI=0.136084;REFB=-0.017169;REVB=0.13425;RO=29;SAF=18;SAR=15;SRF=22;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185658;STB=0.602351;TYPE=snp;VARB=0.0182227;OID=.;OPOS=40499182;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:29:29:33:33:15:18:22:7:15:18:22:7 chr3 40519429 . T C 1167.09 PASS AO=129;DP=132;FAO=128;FDP=131;FR=.;FRO=3;FSAF=53;FSAR=75;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.106936;FXX=0.00757518;HRUN=5;LEN=1;MLLD=44.7515;QD=35.6365;RBI=0.143036;REFB=-0.063732;REVB=-0.094995;RO=1;SAF=54;SAR=75;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0087192;STB=0.505948;TYPE=snp;VARB=7.21994e-06;OID=.;OPOS=40519429;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:132:131:1:3:129:128:75:54:1:0:75:53:2:1 chr3 40559078 . G C 214.14 PASS AO=60;DP=143;FAO=60;FDP=142;FR=.;FRO=82;FSAF=36;FSAR=24;FSRF=50;FSRR=32;FWDB=0.00652709;FXX=0.00699252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.9026;QD=6.03205;RBI=0.0219942;REFB=-0.0105684;REVB=0.0210034;RO=82;SAF=36;SAR=24;SRF=50;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.010496;STB=0.50588;TYPE=snp;VARB=0.0104127;OID=.;OPOS=40559078;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:142:82:82:60:60:24:36:50:32:24:36:50:32 chr3 41756965 . C T 243.56 PASS AO=83;DP=227;FAO=84;FDP=227;FR=.;FRO=143;FSAF=30;FSAR=54;FSRF=39;FSRR=104;FWDB=0.0238098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.809;QD=4.29175;RBI=0.0246851;REFB=-0.0104811;REVB=-0.00651489;RO=142;SAF=29;SAR=54;SRF=38;SRR=104;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104335;STB=0.559873;TYPE=snp;VARB=0.0172997;OID=.;OPOS=41756965;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:227:227:142:143:83:84:54:29:38:104:54:30:39:104 chr3 41756986 . A T 261.51 PASS AO=85;DP=223;FAO=85;FDP=223;FR=.;FRO=138;FSAF=26;FSAR=59;FSRF=37;FSRR=101;FWDB=0.0245536;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.147;QD=4.69077;RBI=0.0247651;REFB=-0.00428373;REVB=0.00322965;RO=137;SAF=26;SAR=59;SRF=37;SRR=100;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0471954;STB=0.528113;TYPE=snp;VARB=0.00420715;OID=.;OPOS=41756986;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:223:137:138:85:85:59:26:37:100:59:26:37:101 chr3 41831203 . C T 387.51 PASS AO=94;DP=194;FAO=94;FDP=194;FR=.;FRO=100;FSAF=52;FSAR=42;FSRF=42;FSRR=58;FWDB=0.0159088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.9365;QD=7.98992;RBI=0.0424682;REFB=-0.0180912;REVB=-0.0393759;RO=100;SAF=52;SAR=42;SRF=42;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124183;STB=0.568416;TYPE=snp;VARB=0.0233134;OID=.;OPOS=41831203;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:194:100:100:94:94:42:52:42:58:42:52:42:58 chr3 41841716 . A C 2205.81 PASS AO=185;DP=219;FAO=228;FDP=228;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=98;FSAR=130;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00193101;FXX=0.00436662;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.998;QD=38.6985;RBI=0.234195;REFB=0;REVB=0.234187;RO=0;SAF=94;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000848505;OID=.;OPOS=41841716;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:225:228:0:0:185:228:91:94:0:0:130:98:0:0 chr3 41877414 . T C 273.93 PASS AO=62;DP=121;FAO=66;FDP=137;FR=.;FRO=71;FSAF=22;FSAR=44;FSRF=11;FSRR=60;FWDB=0.00652489;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=255.846;QD=7.99809;RBI=0.00729608;REFB=-0.00634737;REVB=-0.00326475;RO=59;SAF=22;SAR=40;SRF=11;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173078;STB=0.611735;TYPE=snp;VARB=0.00801581;OID=.;OPOS=41877414;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:137:59:71:62:66:40:22:11:48:44:22:11:60 chr3 41910571 . T C 1182.01 PASS AO=81;DP=151;FAO=141;FDP=141;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=66;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0861501;FXX=0.0208319;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.6433;QD=33.5323;RBI=0.0926714;REFB=0;REVB=0.0341489;RO=0;SAF=7;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0123043;OID=.;OPOS=41910571;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:143:141:0:0:81:141:74:7:0:0:75:66:0:0 chr3 41925398 . C T 372.2 PASS AO=109;DP=255;FAO=107;FDP=253;FR=.;FRO=146;FSAF=34;FSAR=73;FSRF=79;FSRR=67;FWDB=0.014119;FXX=0.00784283;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.593;QD=5.88456;RBI=0.040488;REFB=-0.0139426;REVB=0.0379465;RO=146;SAF=36;SAR=73;SRF=79;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223633;STB=0.634074;TYPE=snp;VARB=0.027405;OID=.;OPOS=41925398;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:255:253:146:146:109:107:73:36:79:67:73:34:79:67 chr3 41925423 . T C 2041.99 PASS AO=219;DP=224;FAO=219;FDP=219;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=137;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180657;FXX=0.0223204;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.9826;QD=37.2965;RBI=0.026217;REFB=-0.122747;REVB=0.018999;RO=3;SAF=82;SAR=137;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00112958;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000446716;OID=.;OPOS=41925423;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:224:219:3:0:219:219:137:82:1:2:137:82:0:0 chr3 41937000 . C T 561.46 PASS AO=118;DP=219;FAO=118;FDP=215;FR=.;FRO=97;FSAF=53;FSAR=65;FSRF=38;FSRR=59;FWDB=-0.000349714;FXX=0.018264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.015;QD=10.4457;RBI=0.00190758;REFB=0.00391213;REVB=0.00187525;RO=97;SAF=53;SAR=65;SRF=38;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0483129;STB=0.526303;TYPE=snp;VARB=-0.00402677;OID=.;OPOS=41937000;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:219:215:97:97:118:118:65:53:38:59:65:53:38:59 chr3 41939993 . T A 950.84 PASS AO=44;DP=119;FAO=116;FDP=116;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=62;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0356689;FXX=0.00854628;HRUN=3;LEN=1;MLLD=18.7521;QD=32.7876;RBI=0.105261;REFB=0;REVB=-0.0990338;RO=0;SAF=25;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00353048;OID=.;OPOS=41939993;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:73:116:0:0:44:116:19:25:0:0:54:62:0:0 chr3 41940667 . CA C 227.57 PASS AO=87;DP=196;FAO=89;FDP=192;FR=.;FRO=103;FSAF=46;FSAR=43;FSRF=54;FSRR=49;FWDB=-0.00772145;FXX=0.0153838;HRUN=2;LEN=1;MLLD=27.2427;QD=4.7411;RBI=0.0158047;REFB=0.024575;REVB=0.0137902;RO=101;SAF=46;SAR=41;SRF=53;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00387563;STB=0.503984;TYPE=del;VARB=-0.0300612;OID=.;OPOS=41940668;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:87:195:89:192:103:46:43:54:49:99:101:46:41:53:48 chr3 41952852 . T C 133.86 PASS AO=39;DP=113;FAO=44;FDP=118;FR=.;FRO=74;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=33;FSRR=41;FWDB=0.0160084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.605;QD=4.53773;RBI=0.0181397;REFB=-0.00173343;REVB=0.00853113;RO=73;SAF=15;SAR=24;SRF=33;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0788214;STB=0.505441;TYPE=snp;VARB=0.0037733;OID=.;OPOS=41952852;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:118:73:74:39:44:24:15:33:40:24:20:33:41 chr3 41957466 . T G 200.85 PASS AO=55;DP=128;FAO=55;FDP=126;FR=.;FRO=71;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=38;FSRR=33;FWDB=-0.0105913;FXX=0.023254;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.644;QD=6.37623;RBI=0.0501227;REFB=-0.0115947;REVB=-0.0489909;RO=70;SAF=26;SAR=29;SRF=36;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.041645;STB=0.545438;TYPE=snp;VARB=0.0097884;OID=.;OPOS=41957466;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:126:70:71:55:55:29:26:36:34:30:25:38:33 chr3 41960006 . T C 83.25 PASS AO=30;DP=95;FAO=31;FDP=95;FR=.;FRO=64;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=30;FSRR=34;FWDB=0.00271925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.152;QD=3.50515;RBI=0.04579;REFB=0.00664446;REVB=0.0457092;RO=65;SAF=15;SAR=15;SRF=30;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0449651;STB=0.510198;TYPE=snp;VARB=-0.0160247;OID=.;OPOS=41960006;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:95:95:65:64:30:31:15:15:30:35:16:15:30:34 chr3 41996136 . T C 333.93 PASS AO=89;DP=201;FAO=89;FDP=200;FR=.;FRO=111;FSAF=58;FSAR=31;FSRF=74;FSRR=37;FWDB=-0.00553373;FXX=0.00497488;HRUN=4;LEN=1;MLLD=248.891;QD=6.67855;RBI=0.0175373;REFB=-0.0236479;REVB=-0.0166413;RO=110;SAF=58;SAR=31;SRF=73;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0131636;STB=0.509206;TYPE=snp;VARB=0.0280729;OID=.;OPOS=41996136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:200:110:111:89:89:31:58:73:37:31:58:74:37 chr3 42236415 . A G 426.4 PASS AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0186446;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.9508;QD=37.9025;RBI=0.0186671;REFB=0;REVB=0.000916175;RO=0;SAF=25;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.09779e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00053222;OID=.;OPOS=42236415;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:46:45:0:0:45:45:20:25:0:0:20:25:0:0 chr3 42244321 . G A 232.96 PASS AO=53;DP=104;FAO=53;FDP=106;FR=.;FRO=53;FSAF=23;FSAR=30;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=-0.00450082;FXX=0.0275204;HRUN=4;LEN=1;MLLD=153.114;QD=8.79097;RBI=0.00457845;REFB=-0.045371;REVB=0.000839567;RO=50;SAF=23;SAR=30;SRF=25;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0585944;STB=0.528576;TYPE=snp;VARB=0.03921;OID=.;OPOS=42244321;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:106:50:53:53:53:30:23:25:25:30:23:26:27 chr3 42251263 . C T 623.56 PASS AO=67;DP=69;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0224716;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.282;QD=36.1485;RBI=0.0320518;REFB=-0.0483947;REVB=0.0228549;RO=1;SAF=25;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0185257;STB=0.509431;TYPE=snp;VARB=0.00082065;OID=.;OPOS=42251263;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:69:69:1:1:67:68:42:25:1:0:42:26:1:0 chr3 42251329 . C T 129.08 PASS AO=35;DP=83;FAO=35;FDP=83;FR=.;FRO=48;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=34;FWDB=-0.00567431;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.822;QD=6.22068;RBI=0.0161268;REFB=0.00607426;REVB=0.0150956;RO=47;SAF=14;SAR=21;SRF=14;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111165;STB=0.566974;TYPE=snp;VARB=-0.0105;OID=.;OPOS=42251329;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:47:48:35:35:21:14:14:33:21:14:14:34 chr3 42251868 . CT C 358.09 PASS AO=44;DP=49;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-4.1495e-05;FXX=0.020829;HRUN=3;LEN=1;MLLD=23.6744;QD=30.4754;RBI=0.00633011;REFB=0;REVB=0.00632997;RO=0;SAF=21;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2717e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.000218533;OID=.;OPOS=42251869;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:44:47:47:47:0:23:24:0:0:32:0:21:23:0:0 chr3 42265166 . T C 160.43 PASS AO=54;DP=150;FAO=55;FDP=152;FR=.;FRO=97;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=51;FSRR=46;FWDB=-0.00641384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.2913;QD=4.22191;RBI=0.0376416;REFB=-0.00262657;REVB=-0.0370912;RO=96;SAF=26;SAR=28;SRF=51;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0557693;STB=0.533815;TYPE=snp;VARB=0.0040716;OID=.;OPOS=42265166;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:152:96:97:54:55:28:26:51:45:29:26:51:46 chr3 42304784 . A G 1116.62 PASS AO=113;DP=116;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.102973;FXX=0.0243883;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.1585;QD=37.2207;RBI=0.126318;REFB=-0.0245438;REVB=-0.0731619;RO=1;SAF=59;SAR=54;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00871196;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00073016;OID=.;OPOS=42304784;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:116:120:1:0:113:120:54:59:0:1:58:62:0:0 chr3 42599091 . G A 70.07 PASS AO=27;DP=87;FAO=27;FDP=86;FR=.;FRO=59;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=46;FSRR=13;FWDB=-0.000282043;FXX=0.0114929;HRUN=2;LEN=1;MLLD=267.519;QD=3.25898;RBI=0.00509734;REFB=0.00114151;REVB=-0.00508954;RO=58;SAF=16;SAR=11;SRF=45;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236027;STB=0.639684;TYPE=snp;VARB=-0.00254982;OID=.;OPOS=42599091;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:87:86:58:59:27:27:11:16:45:13:11:16:46:13 chr3 42610374 . A G 173.26 PASS AO=50;DP=119;FAO=49;FDP=118;FR=.;FRO=69;FSAF=35;FSAR=14;FSRF=52;FSRR=17;FWDB=-0.0181667;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.485;QD=5.87316;RBI=0.0197865;REFB=-0.0192687;REVB=0.00784064;RO=63;SAF=36;SAR=14;SRF=46;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126398;STB=0.528864;TYPE=snp;VARB=0.0267738;OID=.;OPOS=42610374;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:118:63:69:50:49:14:36:46:17:14:35:52:17 chr3 42610515 . G A 119.13 PASS AO=29;DP=61;FAO=28;FDP=60;FR=.;FRO=32;FSAF=2;FSAR=26;FSRF=3;FSRR=29;FWDB=-0.0060522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.1781;QD=7.94164;RBI=0.0069097;REFB=-0.0482443;REVB=0.00333388;RO=30;SAF=3;SAR=26;SRF=2;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0988007;STB=0.541635;TYPE=snp;VARB=0.0538036;OID=.;OPOS=42610515;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:60:30:32:29:28:26:3:2:28:26:2:3:29 chr3 42636141 . G A 84.6 PASS AO=23;DP=56;FAO=23;FDP=56;FR=.;FRO=33;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=7;FSRR=26;FWDB=0.159661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8222;QD=6.04283;RBI=0.159662;REFB=-0.0206721;REVB=-0.000333644;RO=31;SAF=6;SAR=17;SRF=6;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0928894;STB=0.53859;TYPE=snp;VARB=0.0385635;OID=.;OPOS=42636141;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:56:56:31:33:23:23:17:6:6:25:17:6:7:26 chr3 42700456 . C T 189.21 PASS AO=43;DP=86;FAO=43;FDP=86;FR=.;FRO=43;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=0.00651472;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=208.064;QD=8.80043;RBI=0.0107236;REFB=-0.0116829;REVB=0.0085179;RO=43;SAF=21;SAR=22;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0209812;STB=0.511635;TYPE=snp;VARB=0.0103331;OID=.;OPOS=42700456;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:43:43:43:43:22:21:20:23:22:21:20:23 chr3 42700630 . A G 129.01 PASS AO=29;DP=68;FAO=33;FDP=74;FR=.;FRO=41;FSAF=6;FSAR=27;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=-0.013677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.908;QD=6.97349;RBI=0.0318254;REFB=-0.00332256;REVB=-0.0287367;RO=39;SAF=8;SAR=21;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155578;STB=0.683419;TYPE=snp;VARB=0.00318882;OID=.;OPOS=42700630;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:74:39:41:29:33:21:8:16:23:27:6:18:23 chr3 42728144 . A G 298.54 PASS AO=57;DP=96;FAO=57;FDP=96;FR=.;FRO=39;FSAF=24;FSAR=33;FSRF=13;FSRR=26;FWDB=0.011827;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.007;QD=12.439;RBI=0.0130279;REFB=0.0170813;REVB=-0.00546339;RO=39;SAF=24;SAR=33;SRF=13;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0678888;STB=0.536961;TYPE=snp;VARB=-0.0108678;OID=.;OPOS=42728144;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:39:39:57:57:33:24:13:26:33:24:13:26 chr3 42733468 . T C 857.02 PASS AO=81;DP=81;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0870998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.271;QD=38.5177;RBI=0.0890542;REFB=0;REVB=0.0185548;RO=0;SAF=43;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18592e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000247001;OID=.;OPOS=42733468;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:81:89:0:0:81:89:38:43:0:0:46:43:0:0 chr3 42735150 . T C 402.24 PASS AO=40;DP=41;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.243;QD=37.4177;RBI=0.0221029;REFB=0;REVB=0.0151034;RO=0;SAF=19;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17587e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000137535;OID=.;OPOS=42735150;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:41:43:0:0:40:43:21:19:0:0:21:22:0:0 chr3 42735274 . A G 296.85 PASS AO=29;DP=29;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.102912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.024;QD=37.106;RBI=0.104185;REFB=0;REVB=-0.0162406;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000571416;OID=.;OPOS=42735274;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:29:32:0:0:29:32:14:15:0:0:14:18:0:0 chr3 42750587 . AG A 300.96 PASS AO=33;DP=41;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.246591;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.039;QD=25.0801;RBI=0.315685;REFB=-0.017618;REVB=0.197105;RO=5;SAF=2;SAR=31;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0.221264;SSSB=-0.130013;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0193023;OID=.;OPOS=42750588;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:33:43:48:48:0:6:42:0:0:26:5:2:31:1:4 chr3 42781276 . G T 190.6 PASS AO=46;DP=96;FAO=46;FDP=97;FR=.;FRO=51;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=0.00181029;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.655;QD=7.85961;RBI=0.00557581;REFB=-0.0184051;REVB=0.00527376;RO=49;SAF=23;SAR=23;SRF=23;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0284139;STB=0.515457;TYPE=snp;VARB=0.0196422;OID=.;OPOS=42781276;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:97:49:51:46:46:23:23:23:26:23:23:24:27 chr3 42787469 . A G 126.89 PASS AO=40;DP=106;FAO=40;FDP=106;FR=.;FRO=66;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=39;FSRR=27;FWDB=-0.0229223;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5229;QD=4.78831;RBI=0.0397043;REFB=0.00432436;REVB=-0.0324191;RO=65;SAF=22;SAR=18;SRF=39;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0552832;STB=0.525849;TYPE=snp;VARB=-0.0083765;OID=.;OPOS=42787469;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:65:66:40:40:18:22:39:26:18:22:39:27 chr3 42799765 . G A 149.11 PASS AO=48;DP=135;FAO=48;FDP=129;FR=.;FRO=81;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=25;FSRR=56;FWDB=-0.0376345;FXX=0.0514668;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.193;QD=4.62357;RBI=0.0419483;REFB=-0.0108385;REVB=0.0185285;RO=77;SAF=22;SAR=26;SRF=21;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208606;STB=0.596129;TYPE=snp;VARB=0.0196546;OID=.;OPOS=42799765;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:129:77:81:48:48:26:22:21:56:26:22:25:56 chr3 42826168 . A G 435.05 PASS AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0321519;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=65.6287;QD=36.2542;RBI=0.0338516;REFB=-0.0586112;REVB=-0.010592;RO=0;SAF=21;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50943;TYPE=snp;VARB=0.00128498;OID=.;OPOS=42826168;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:48:48:0:1:47:47:26:21:0:0:26:21:0:1 chr3 42907112 . A C 66.87 PASS AO=21;DP=68;FAO=24;FDP=71;FR=.;FRO=47;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=0.0196515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.578;QD=3.76716;RBI=0.0255302;REFB=-0.010064;REVB=-0.0162975;RO=46;SAF=9;SAR=12;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0833616;STB=0.534636;TYPE=snp;VARB=0.0181552;OID=.;OPOS=42907112;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:68:71:46:47:21:24:12:9:23:23:13:11:24:23 chr3 42908775 . A C 92.27 PASS AO=25;DP=63;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=27;FWDB=0.0196132;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.667;QD=5.67836;RBI=0.0205806;REFB=-0.00810152;REVB=0.00623582;RO=38;SAF=6;SAR=19;SRF=12;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101941;STB=0.528528;TYPE=snp;VARB=0.0121574;OID=.;OPOS=42908775;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:63:65:38:39:25:26:19:6:12:26:19:7:12:27 chr3 42917047 . A G 2382.58 PASS AO=232;DP=233;FAO=249;FDP=249;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=158;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0225324;FXX=0.00399984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.891;QD=38.2744;RBI=0.0248794;REFB=0;REVB=0.0105489;RO=0;SAF=83;SAR=149;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.428e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000213827;OID=.;OPOS=42917047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:233:249:0:0:232:249:149:83:0:0:158:91:0:0 chr3 42956273 . T C 724.61 PASS AO=81;DP=84;FAO=81;FDP=84;FR=.;FRO=3;FSAF=51;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0403424;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.879;QD=34.505;RBI=0.0762687;REFB=-0.180669;REVB=0.0647256;RO=2;SAF=51;SAR=30;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0305191;STB=0.523804;TYPE=snp;VARB=0.00230573;OID=.;OPOS=42956273;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:84:84:2:3:81:81:30:51:0:2:30:51:0:3 chr3 43073761 . G A 574.26 PASS AO=61;DP=63;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0270083;FXX=0.031741;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.225;QD=37.6562;RBI=0.106453;REFB=0;REVB=0.10297;RO=0;SAF=41;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.14674e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00134713;OID=.;OPOS=43073761;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:63:61:0:0:61:61:20:41:0:0:20:41:0:0 chr3 43074430 . A G 675.32 PASS AO=44;DP=74;FAO=69;FDP=69;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=44;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233313;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.668;QD=39.1492;RBI=0.109354;REFB=0;REVB=0.106836;RO=0;SAF=40;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97848e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000374676;OID=.;OPOS=43074430;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:68:69:0:0:44:69:4:40:0:0:25:44:0:0 chr3 43074434 . C T 687.28 PASS AO=70;DP=76;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0129391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.5711;QD=36.1729;RBI=0.0444098;REFB=-0.0687141;REVB=0.042483;RO=2;SAF=40;SAR=30;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00382552;STB=0.508195;TYPE=snp;VARB=0.0133864;OID=.;OPOS=43074434;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:76:76:2:1:70:75:30:40:1:1:30:45:0:1 chr3 43074871 . A G 1042.25 PASS AO=98;DP=99;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0591858;FXX=0.00854628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.6926;QD=35.9398;RBI=0.062538;REFB=0;REVB=-0.0202001;RO=0;SAF=25;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.73172e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00827133;OID=.;OPOS=43074871;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:99:116:0:0:98:116:73:25:0:0:73:43:0:0 chr3 43095101 . A G 662.82 PASS AO=71;DP=71;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00449589;FXX=0.0277739;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.181;QD=37.8755;RBI=0.0306306;REFB=0;REVB=-0.0302989;RO=0;SAF=28;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30751e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000214408;OID=.;OPOS=43095101;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:71:70:0:0:71:70:43:28:0:0:44:26:0:0 chr3 43097710 . A G 664.37 PASS AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0502927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.62;QD=38.5144;RBI=0.0544161;REFB=0;REVB=-0.0207788;RO=0;SAF=58;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.25168e-05;OID=.;OPOS=43097710;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:69:69:0:0:69:69:11:58:0:0:11:58:0:0 chr3 43121559 . C T 405.85 PASS AO=44;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0119567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.948;QD=35.2914;RBI=0.0156504;REFB=-0.115881;REVB=-0.0100981;RO=1;SAF=20;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229092;STB=0.511623;TYPE=snp;VARB=0.00059159;OID=.;OPOS=43121559;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:46:46:1:1:44:45:24:20:1:0:24:21:1:0 chr3 43122811 . AG A 53.61 PASS AO=13;DP=26;FAO=18;FDP=25;FR=.;FRO=7;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.100122;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.5677;QD=8.57682;RBI=0.214043;REFB=-0.129605;REVB=0.189183;RO=9;SAF=8;SAR=5;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0.303743;SSSB=0.203205;STB=0.504499;TYPE=del;VARB=0.132199;OID=.;OPOS=43122812;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:13:25:18:25:7:8:10:3:4:14:9:8:5:3:6 chr3 43122894 . G A 134 PASS AO=35;DP=76;FAO=34;FDP=76;FR=.;FRO=42;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=-0.00421028;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4467;QD=7.05251;RBI=0.0234657;REFB=0.0088265;REVB=0.0230849;RO=41;SAF=18;SAR=17;SRF=26;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116067;STB=0.520493;TYPE=snp;VARB=-0.0101289;OID=.;OPOS=43122894;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:41:42:35:34:17:18:26:15:15:19:25:17 chr3 43122966 . G A 683.12 PASS AO=74;DP=77;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.130578;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.1534;QD=35.4869;RBI=0.131401;REFB=-0.0469623;REVB=-0.0146875;RO=3;SAF=40;SAR=34;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00935685;STB=0.506023;TYPE=snp;VARB=0.00372277;OID=.;OPOS=43122966;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:77:77:3:1:74:76:34:40:2:1:35:41:1:0 chr3 43390387 . C CT,CTT 456.14 PASS AO=56,22;DP=101;FAO=93,0;FDP=96;FR=.;FRO=3;FSAF=65,0;FSAR=28,0;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.222692,-0.113578;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,2;MLLD=11.8651,10.5476;QD=19.0059;RBI=0.332473,0.168054;REFB=0.179751,0.120026;REVB=-0.246874,-0.123863;RO=18;SAF=39,18;SAR=17,4;SRF=12;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.015821,0.176923;STB=0.511276,0.5;TYPE=ins,ins;VARB=-0.000723157,0.0351185;OID=.,.;OPOS=43390388,43390388;OREF=-,-;OALT=T,TT;OMAPALT=CT,CTT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:56,22:101:93,0:96:3:65,0:28,0:3:0:25:18:39,18:17,4:12:6 chr3 43392356 . G GTA 95.11 PASS AO=49;DP=267;FAO=55;FDP=213;FR=.;FRO=158;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=72;FSRR=86;FWDB=-0.0075849;FXX=0.0575196;HRUN=1;LEN=2;MLLD=158.975;QD=1.78608;RBI=0.0174228;REFB=-0.014552;REVB=-0.0156852;RO=203;SAF=24;SAR=25;SRF=99;SRR=104;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00272135;STB=0.512684;TYPE=ins;VARB=0.0425451;OID=.;OPOS=43392357;OREF=-;OALT=TA;OMAPALT=GTA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:49:267:55:213:158:26:29:72:86:95:203:24:25:99:104 chr3 43414318 . A G 1936.28 PASS AO=196;DP=196;FAO=203;FDP=203;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=126;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0269525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.973;QD=38.1532;RBI=0.0278245;REFB=0;REVB=-0.00691119;RO=0;SAF=72;SAR=124;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.73998e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000167634;OID=.;OPOS=43414318;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:92:196:203:0:0:196:203:124:72:0:0:126:77:0:0 chr3 43602803 . C T 1215.03 PASS AO=128;DP=129;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0113725;FXX=0.00775134;HRUN=3;LEN=1;MLLD=96.3268;QD=37.9697;RBI=0.0114248;REFB=-0.0313468;REVB=0.00109267;RO=0;SAF=35;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000125337;OID=.;OPOS=43602803;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:129:128:0:0:128:128:93:35:0:0:93:35:0:0 chr3 43607136 . T C 627.46 PASS AO=68;DP=70;FAO=68;FDP=70;FR=.;FRO=2;FSAF=41;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0112479;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=214.721;QD=35.855;RBI=0.0138841;REFB=0.0424115;REVB=-0.00813963;RO=2;SAF=41;SAR=27;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00579477;STB=0.503067;TYPE=snp;VARB=-0.000128848;OID=.;OPOS=43607136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:70:70:2:2:68:68:27:41:1:1:27:41:1:1 chr3 43743914 . G T 634.81 PASS AO=183;DP=419;FAO=176;FDP=399;FR=.;FRO=223;FSAF=65;FSAR=111;FSRF=62;FSRR=161;FWDB=0.00384793;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.9894;QD=6.36399;RBI=0.0167205;REFB=-0.0126383;REVB=0.0162717;RO=234;SAF=66;SAR=117;SRF=65;SRR=169;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0939962;STB=0.556371;TYPE=snp;VARB=0.0339602;OID=.;OPOS=43743914;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:419:399:234:223:183:176:117:66:65:169:111:65:62:161 chr3 44283808 . C A 150.69 PASS AO=10;DP=19;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0235901;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=166.273;QD=33.4858;RBI=0.0376751;REFB=-0.0916834;REVB=0.0293755;RO=0;SAF=8;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.526285;TYPE=snp;VARB=0.00113064;OID=.;OPOS=44283808;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:18:0:1:10:17:2:8:0:0:9:8:0:1 chr3 44284584 . G A 334 PASS AO=80;DP=164;FAO=80;FDP=164;FR=.;FRO=84;FSAF=32;FSAR=48;FSRF=22;FSRR=62;FWDB=0.0110061;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.998;QD=8.14622;RBI=0.0198349;REFB=0.00115369;REVB=-0.0165012;RO=81;SAF=32;SAR=48;SRF=22;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126062;STB=0.575898;TYPE=snp;VARB=-0.000832309;OID=.;OPOS=44284584;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:164:81:84:80:80:48:32:22:59:48:32:22:62 chr3 44284610 . G A 276.41 PASS AO=65;DP=142;FAO=69;FDP=145;FR=.;FRO=76;FSAF=21;FSAR=48;FSRF=32;FSRR=44;FWDB=0.0188634;FXX=0.0136045;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.905;QD=7.62503;RBI=0.0334725;REFB=-0.0120121;REVB=0.0276511;RO=77;SAF=20;SAR=45;SRF=33;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130163;STB=0.568344;TYPE=snp;VARB=0.0119822;OID=.;OPOS=44284610;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:145:77:76:65:69:45:20:33:44:48:21:32:44 chr3 44540791 . TTC T 1097.9 PASS AO=136;DP=171;FAO=156;FDP=165;FR=.;FRO=9;FSAF=85;FSAR=71;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0113494;FXX=0;HRUN=5;LEN=2;MLLD=255.332;QD=26.6157;RBI=0.0465161;REFB=0.0241302;REVB=-0.0451103;RO=0;SAF=74;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58871e-08;STB=0.505516;TYPE=del;VARB=-0.00127304;OID=.;OPOS=44540792;OREF=TC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:136:161:156:165:9:85:71:4:5:43:0:74:62:0:0 chr3 44612050 . C T 240.22 PASS AO=45;DP=78;FAO=46;FDP=79;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=31;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=0.0152443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.263;QD=12.1631;RBI=0.0158695;REFB=-0.0308118;REVB=-0.0044106;RO=32;SAF=14;SAR=31;SRF=21;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.270481;STB=0.633671;TYPE=snp;VARB=0.0150151;OID=.;OPOS=44612050;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:79:32:33:45:46:31:14:21:11:31:15:21:12 chr3 44762830 . A G 132.08 PASS AO=38;DP=94;FAO=38;FDP=94;FR=.;FRO=56;FSAF=6;FSAR=32;FSRF=13;FSRR=43;FWDB=-0.017529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.957;QD=5.62038;RBI=0.0254526;REFB=-0.0156163;REVB=-0.0184544;RO=55;SAF=6;SAR=32;SRF=13;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136175;STB=0.574626;TYPE=snp;VARB=0.0242379;OID=.;OPOS=44762830;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:55:56:38:38:32:6:13:42:32:6:13:43 chr3 44763037 . A C 706.63 PASS AO=85;DP=95;FAO=86;FDP=94;FR=.;FRO=8;FSAF=33;FSAR=53;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=0.0265527;FXX=0.0105252;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.069;QD=30.0694;RBI=0.0282088;REFB=-0.157696;REVB=0.00952313;RO=4;SAF=32;SAR=53;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0556112;STB=0.554041;TYPE=snp;VARB=0.00225031;OID=.;OPOS=44763037;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:95:94:4:8:85:86:53:32:4:0:53:33:8:0 chr3 44775962 . A G 1027.49 PASS AO=107;DP=108;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188403;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.79;QD=38.4108;RBI=0.0200244;REFB=0;REVB=0.00678361;RO=0;SAF=60;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71637e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.67941e-05;OID=.;OPOS=44775962;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:108:107:0:0:107:107:47:60:0:0:47:60:0:0 chr3 44869026 . A T 3260.82 PASS AO=400;DP=428;FAO=389;FDP=398;FR=.;FRO=9;FSAF=152;FSAR=237;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=0.00299231;FXX=0.00499988;HRUN=4;LEN=1;MLLD=40.2666;QD=32.772;RBI=0.134973;REFB=-0.221343;REVB=0.13494;RO=19;SAF=163;SAR=237;SRF=2;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0271894;STB=0.509316;TYPE=snp;VARB=0.0104687;OID=.;OPOS=44869026;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:428:398:19:9:400:389:237:163:2:17:237:152:0:9 chr3 44884647 . C A 1346.34 PASS AO=139;DP=140;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119852;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=259.361;QD=38.467;RBI=0.0131899;REFB=0;REVB=0.00550723;RO=0;SAF=47;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.3502e-05;OID=.;OPOS=44884647;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:140:140:0:0:139:140:92:47:0:0:92:48:0:0 chr3 45077110 . CG C 24.87 PASS AO=13;DP=44;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0344508;FXX=0.0555401;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.917;QD=2.92581;RBI=0.0434832;REFB=-0.0884551;REVB=0.0265317;RO=19;SAF=6;SAR=7;SRF=10;SRR=9;SSEN=0.37037;SSEP=0;SSSB=-0.0656314;STB=0.58702;TYPE=del;VARB=0.155711;OID=.;OPOS=45077111;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:13:36:13:34:21:5:8:11:10:24:19:6:7:10:9 chr3 45127515 . T C 1616.91 PASS AO=168;DP=169;FAO=169;FDP=169;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=129;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165626;FXX=0.00588201;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.1348;QD=38.2701;RBI=0.0871328;REFB=0;REVB=0.0855441;RO=0;SAF=41;SAR=127;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.05587e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000478195;OID=.;OPOS=45127515;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:169:169:0:0:168:169:127:41:0:0:129:40:0:0 chr3 45134822 . T C 1120.96 PASS AO=117;DP=117;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000335111;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.83;QD=38.3235;RBI=0.0433494;REFB=0;REVB=-0.0433481;RO=0;SAF=71;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.21453e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.31064e-05;OID=.;OPOS=45134822;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:117:117:0:0:117:117:46:71:0:0:46:71:0:0 chr3 45527218 . T C 1222.94 PASS AO=130;DP=131;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00276526;FXX=0.00763301;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.153;QD=37.6289;RBI=0.0203776;REFB=-0.0503966;REVB=0.0201891;RO=0;SAF=42;SAR=88;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000192704;OID=.;OPOS=45527218;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:131:130:0:0:130:130:88:42:0:0:88:42:0:0 chr3 45533224 . G A 882.28 PASS AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00473614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.718;QD=37.9474;RBI=0.0154234;REFB=0;REVB=0.0146782;RO=0;SAF=45;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.33166e-05;OID=.;OPOS=45533224;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:93:93:0:0:93:93:48:45:0:0:48:45:0:0 chr3 45557707 . G A 494.54 PASS AO=119;DP=241;FAO=118;FDP=240;FR=.;FRO=122;FSAF=52;FSAR=66;FSRF=64;FSRR=58;FWDB=0.00693163;FXX=0.00414921;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.158;QD=8.24231;RBI=0.0201833;REFB=-0.00581899;REVB=0.0189557;RO=121;SAF=53;SAR=66;SRF=63;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0693363;STB=0.542817;TYPE=snp;VARB=0.00650256;OID=.;OPOS=45557707;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:241:240:121:122:119:118:66:53:63:58:66:52:64:58 chr3 45559519 . T C 1092.58 PASS AO=112;DP=113;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.035609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.514;QD=37.6751;RBI=0.0573734;REFB=0;REVB=0.0449856;RO=0;SAF=48;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41465e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.87894e-05;OID=.;OPOS=45559519;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:113:116:0:0:112:116:64:48:0:0:67:49:0:0 chr3 45565554 . A G 2863 PASS AO=299;DP=300;FAO=299;FDP=299;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=202;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0175452;FXX=0.00333322;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.233;QD=38.301;RBI=0.0324814;REFB=-0.0158747;REVB=-0.0273351;RO=1;SAF=97;SAR=202;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00235531;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.26791e-05;OID=.;OPOS=45565554;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:300:299:1:0:299:299:202:97:0:1:202:97:0:0 chr3 45637253 . C T 139.54 PASS AO=23;DP=81;FAO=27;FDP=76;FR=.,HEALED;FRO=37;FSAF=22;FSAR=5;FSRF=25;FSRR=12;FWDB=-0.0583282;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=212.365;QD=7.344;RBI=0.0588478;REFB=-0.0438142;REVB=0.00780355;RO=20;SAF=18;SAR=5;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.28037;STB=0.614028;TYPE=snp;VARB=0.0341948;OID=.;OPOS=45637253;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:76:20:37:23:27:5:18:10:10:5:22:25:12 chr3 45637439 . T C 290.96 PASS AO=67;DP=177;FAO=83;FDP=193;FR=.;FRO=110;FSAF=45;FSAR=38;FSRF=31;FSRR=79;FWDB=-0.0618093;FXX=0.0102559;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.756;QD=6.03027;RBI=0.0628464;REFB=-0.0342374;REVB=-0.0113707;RO=109;SAF=45;SAR=22;SRF=31;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.407872;STB=0.645742;TYPE=snp;VARB=0.0696936;OID=.;OPOS=45637439;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:193:109:110:67:83:22:45:31:78:38:45:31:79 chr3 45779136 . A T 273.93 PASS AO=72;DP=186;FAO=82;FDP=194;FR=.;FRO=112;FSAF=35;FSAR=47;FSRF=49;FSRR=63;FWDB=0.000166078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.337;QD=5.64812;RBI=0.0256805;REFB=-0.0126524;REVB=0.02568;RO=112;SAF=32;SAR=40;SRF=51;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119101;STB=0.506282;TYPE=snp;VARB=0.0186256;OID=.;OPOS=45779136;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:194:112:112:72:82:40:32:51:61:47:35:49:63 chr3 45817418 . A G 916.35 PASS AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0403782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.058;QD=38.1812;RBI=0.0546447;REFB=0;REVB=-0.0368192;RO=0;SAF=53;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.58476e-05;OID=.;OPOS=45817418;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:96:96:0:0:96:96:43:53:0:0:43:53:0:0 chr3 45959515 . A T 356.78 PASS AO=68;DP=116;FAO=68;FDP=114;FR=.;FRO=46;FSAF=43;FSAR=25;FSRF=31;FSRR=15;FWDB=-0.0458951;FXX=0.0172399;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.1465;QD=12.5184;RBI=0.0534194;REFB=-0.0122116;REVB=-0.0273363;RO=41;SAF=43;SAR=25;SRF=31;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0950652;STB=0.518202;TYPE=snp;VARB=0.0232495;OID=.;OPOS=45959515;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:114:41:46:68:68:25:43:31:10:25:43:31:15 chr3 45959759 . T C 98.95 PASS AO=43;DP=159;FAO=47;FDP=163;FR=.;FRO=116;FSAF=9;FSAR=38;FSRF=67;FSRR=49;FWDB=0.00807094;FXX=0.00609719;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.404;QD=2.42815;RBI=0.013212;REFB=-0.00881176;REVB=-0.0104603;RO=109;SAF=6;SAR=37;SRF=62;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.558788;STB=0.78658;TYPE=snp;VARB=0.0246966;OID=.;OPOS=45959759;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:159:163:109:116:43:47:37:6:62:47:38:9:67:49 chr3 45989044 . T G 137.35 PASS AO=35;DP=77;FAO=35;FDP=79;FR=.;FRO=44;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=-0.0110572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.272;QD=6.95448;RBI=0.0250843;REFB=-0.0253002;REVB=0.0225158;RO=42;SAF=21;SAR=14;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.028706;STB=0.531232;TYPE=snp;VARB=0.0259394;OID=.;OPOS=45989044;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:79:42:44:35:35:14:21:24:18:14:21:24:20 chr3 45996761 . G A 541.24 PASS AO=142;DP=313;FAO=144;FDP=318;FR=.;FRO=174;FSAF=62;FSAR=82;FSRF=88;FSRR=86;FWDB=-0.0264045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.134;QD=6.80807;RBI=0.026434;REFB=-0.0108482;REVB=-0.00124789;RO=171;SAF=62;SAR=80;SRF=85;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0601677;STB=0.541463;TYPE=snp;VARB=0.00800204;OID=.;OPOS=45996761;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:313:318:171:174:142:144:80:62:85:86:82:62:88:86 chr3 46008790 . G A 229.78 PASS AO=47;DP=86;FAO=47;FDP=85;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=33;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=0.0758487;FXX=0.034087;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.6201;QD=10.8133;RBI=0.0917865;REFB=0.00715312;REVB=0.051689;RO=38;SAF=14;SAR=33;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113319;STB=0.562472;TYPE=snp;VARB=-0.00618188;OID=.;OPOS=46008790;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:85:38:38:47:47:33:14:16:22:33:14:16:22 chr3 46009864 . C G 250.24 PASS AO=51;DP=104;FAO=57;FDP=110;FR=.;FRO=53;FSAF=24;FSAR=33;FSRF=32;FSRR=21;FWDB=0.161661;FXX=0.0178555;HRUN=3;LEN=1;MLLD=40.1574;QD=9.0998;RBI=0.161987;REFB=0.00394231;REVB=-0.0102798;RO=53;SAF=22;SAR=29;SRF=32;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157772;STB=0.587756;TYPE=snp;VARB=-0.00133094;OID=.;OPOS=46009864;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:110:53:53:51:57:29:22:32:21:33:24:32:21 chr3 46010077 . C T 113.67 PASS AO=42;DP=125;FAO=42;FDP=125;FR=.;FRO=83;FSAF=12;FSAR=30;FSRF=39;FSRR=44;FWDB=-0.0147185;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.872;QD=3.63743;RBI=0.0201656;REFB=-0.00992425;REVB=0.0137847;RO=83;SAF=12;SAR=30;SRF=39;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228447;STB=0.632688;TYPE=snp;VARB=0.0306551;OID=.;OPOS=46010077;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:83:83:42:42:30:12:39:44:30:12:39:44 chr3 46021218 . G T 195.24 PASS AO=38;DP=66;FAO=38;FDP=66;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=32;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=-0.0197355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.304;QD=11.8328;RBI=0.0237094;REFB=-0.00628843;REVB=0.0131394;RO=28;SAF=6;SAR=32;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267657;STB=0.649075;TYPE=snp;VARB=0.00479922;OID=.;OPOS=46021218;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:28:28:38:38:32:6:11:17:32:6:11:17 chr3 46399798 . T C 303.64 PASS AO=72;DP=147;FAO=72;FDP=147;FR=.;FRO=75;FSAF=32;FSAR=40;FSRF=50;FSRR=25;FWDB=-0.0306934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.588;QD=8.2623;RBI=0.0323571;REFB=0.00789114;REVB=-0.010242;RO=75;SAF=32;SAR=40;SRF=50;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203261;STB=0.61191;TYPE=snp;VARB=-0.00568244;OID=.;OPOS=46399798;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:147:75:75:72:72:40:32:50:25:40:32:50:25 chr3 46416470 . G T 1058.53 PASS AO=116;DP=131;FAO=132;FDP=135;FR=.;FRO=3;FSAF=70;FSAR=62;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.119789;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=36.2126;QD=31.3637;RBI=0.217779;REFB=-0.199014;REVB=0.181874;RO=15;SAF=66;SAR=50;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0370602;STB=0.503042;TYPE=snp;VARB=0.0200055;OID=.;OPOS=46416470;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:131:135:15:3:116:132:50:66:6:9:62:70:2:1 chr3 46417312 . G T 630.61 PASS AO=65;DP=65;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.884;QD=37.6485;RBI=0.0195693;REFB=0;REVB=-0.0116951;RO=0;SAF=42;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.35381e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000339194;OID=.;OPOS=46417312;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:65:67:0:0:65:67:23:42:0:0:23:44:0:0 chr3 46449863 . G A 106.86 PASS AO=52;DP=184;FAO=52;FDP=183;FR=.;FRO=131;FSAF=4;FSAR=48;FSRF=52;FSRR=79;FWDB=0.00536332;FXX=0.00543449;HRUN=5;LEN=1;MLLD=238.463;QD=2.33579;RBI=0.0064973;REFB=-0.00561769;REVB=0.00366737;RO=131;SAF=4;SAR=48;SRF=52;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.558094;STB=0.840886;TYPE=snp;VARB=0.0219547;OID=.;OPOS=46449863;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:183:131:131:52:52:48:4:52:79:48:4:52:79 chr3 46449978 . A C 1094.65 PASS AO=127;DP=144;FAO=130;FDP=137;FR=.;FRO=7;FSAF=47;FSAR=83;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.01597;FXX=0.0486077;HRUN=3;LEN=1;MLLD=167.028;QD=31.9606;RBI=0.0361437;REFB=-0.0881369;REVB=0.0324242;RO=6;SAF=44;SAR=83;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0170918;STB=0.504205;TYPE=snp;VARB=0.000990277;OID=.;OPOS=46449978;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:144:137:6:7:127:130:83:44:1:5:83:47:2:5 chr3 46450070 . T A 1215.28 PASS AO=109;DP=147;FAO=135;FDP=139;FR=.;FRO=4;FSAF=46;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0239578;FXX=0.0141834;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.963;QD=34.9722;RBI=0.0681027;REFB=-0.17472;REVB=0.0637495;RO=0;SAF=34;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11142e-08;STB=0.510987;TYPE=snp;VARB=0.00683626;OID=.;OPOS=46450070;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:115:139:0:4:109:135:75:34:0:0:89:46:0:4 chr3 46480958 . C G 66.5 PASS AO=23;DP=69;FAO=23;FDP=69;FR=.;FRO=46;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=0.0065267;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.859;QD=3.85533;RBI=0.0535048;REFB=-0.0342317;REVB=-0.0531052;RO=46;SAF=18;SAR=5;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.355885;STB=0.710662;TYPE=snp;VARB=0.0328264;OID=.;OPOS=46480958;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:69:69:46:46:23:23:5:18:23:23:5:18:23:23 chr3 46491985 . C T 289.65 PASS AO=85;DP=200;FAO=83;FDP=198;FR=.;FRO=115;FSAF=41;FSAR=42;FSRF=50;FSRR=65;FWDB=0.0165305;FXX=0.0099995;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.1224;QD=5.85159;RBI=0.0422334;REFB=-0.00312892;REVB=0.0388639;RO=113;SAF=43;SAR=42;SRF=49;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0739146;STB=0.534405;TYPE=snp;VARB=0.00523364;OID=.;OPOS=46491985;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:200:198:113:115:85:83:42:43:49:64:42:41:50:65 chr3 46501284 . C CCTT 1383.54 PASS AO=141;DP=181;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00734276;FXX=0.0394711;HRUN=2;LEN=3;MLLD=241.128;QD=37.9051;RBI=0.0156525;REFB=0;REVB=0.0138233;RO=34;SAF=80;SAR=61;SRF=30;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119587;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=8.96453e-05;OID=.;OPOS=46501285;OREF=-;OALT=CTT;OMAPALT=CCTT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:141:181:146:146:0:83:63:0:0:66:34:80:61:30:4 chr3 46620614 . T C 695.07 PASS AO=189;DP=412;FAO=183;FDP=400;FR=.;FRO=217;FSAF=78;FSAR=105;FSRF=67;FSRR=150;FWDB=-0.0386051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.784;QD=6.95069;RBI=0.039995;REFB=-0.00175329;REVB=0.0104519;RO=222;SAF=80;SAR=109;SRF=69;SRR=153;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115361;STB=0.566418;TYPE=snp;VARB=0.00172666;OID=.;OPOS=46620614;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:412:400:222:217:189:183:109:80:69:153:105:78:67:150 chr3 46654132 . G A 2251.12 PASS AO=233;DP=233;FAO=235;FDP=235;FR=.;FRO=0;FSAF=139;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00126417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.981;QD=38.317;RBI=0.0161675;REFB=0;REVB=0.016118;RO=0;SAF=139;SAR=94;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.24475e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.63071e-05;OID=.;OPOS=46654132;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:233:235:0:0:233:235:94:139:0:0:96:139:0:0 chr3 46658737 . A G 1626.72 PASS AO=175;DP=183;FAO=177;FDP=177;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.036725;FXX=0.0380414;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.3823;QD=36.7621;RBI=0.0699839;REFB=-0.0983363;REVB=0.0595737;RO=1;SAF=66;SAR=109;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00715753;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00204518;OID=.;OPOS=46658737;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:183:177:1:0:175:177:109:66:1:0:111:66:0:0 chr3 46713457 . C G 158.82 PASS AO=38;DP=81;FAO=38;FDP=81;FR=.;FRO=43;FSAF=12;FSAR=26;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=0.085415;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6283;QD=7.84294;RBI=0.094729;REFB=0.0428953;REVB=0.0409616;RO=43;SAF=12;SAR=26;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153089;STB=0.585869;TYPE=snp;VARB=-0.0434152;OID=.;OPOS=46713457;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:43:43:38:38:26:12:20:23:26:12:20:23 chr3 46720780 . TG T 23.59 PASS AO=5;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=0.0472294;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=18.462;QD=6.29011;RBI=0.191771;REFB=-0.0642171;REVB=-0.185864;RO=8;SAF=2;SAR=3;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.449288;STB=0.72672;TYPE=del;VARB=0.0571767;OID=.;OPOS=46720781;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:5:15:7:15:8:3:4:7:1:22:8:2:3:7:1 chr3 46722692 . G T 447.3 PASS AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0213384;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.8447;QD=38.068;RBI=0.0540383;REFB=0;REVB=0.0496468;RO=0;SAF=19;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00107207;OID=.;OPOS=46722692;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:47:47:0:0:47:47:28:19:0:0:28:19:0:0 chr3 46723551 . G A 75.97 PASS AO=10;DP=12;FAO=10;FDP=12;FR=.;FRO=2;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00360903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.0524;QD=25.3245;RBI=0.041229;REFB=0.00763054;REVB=0.0410707;RO=2;SAF=1;SAR=9;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0896193;STB=0.549906;TYPE=snp;VARB=0.000608089;OID=.;OPOS=46723551;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:12:12:2:2:10:10:9:1:0:2:9:1:0:2 chr3 46729757 . C G 162.38 PASS AO=36;DP=71;FAO=36;FDP=72;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=26;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=-0.0649428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.4444;QD=9.02123;RBI=0.0658753;REFB=-0.00204638;REVB=-0.0110453;RO=35;SAF=10;SAR=26;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0980536;STB=0.56518;TYPE=snp;VARB=4.46161e-06;OID=.;OPOS=46729757;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:72:35:36:36:36:26:10:13:22:26:10:14:22 chr3 46755937 . C T 147.86 PASS AO=32;DP=64;FAO=32;FDP=62;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=0.075559;FXX=0.0312451;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.546;QD=9.53937;RBI=0.0761704;REFB=-0.0352454;REVB=0.00963206;RO=30;SAF=17;SAR=15;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171112;STB=0.594942;TYPE=snp;VARB=0.0251969;OID=.;OPOS=46755937;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:62:30:30:32:32:15:17:10:20:15:17:10:20 chr3 46783959 . T C 110.47 PASS AO=36;DP=99;FAO=36;FDP=99;FR=.;FRO=63;FSAF=31;FSAR=5;FSRF=45;FSRR=18;FWDB=0.0193031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.5802;QD=4.46322;RBI=0.0240406;REFB=-0.0216173;REVB=-0.0143297;RO=63;SAF=31;SAR=5;SRF=45;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260041;STB=0.652235;TYPE=snp;VARB=0.0393155;OID=.;OPOS=46783959;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:63:63:36:36:5:31:45:18:5:31:45:18 chr3 46784467 . G A 153.95 PASS AO=37;DP=71;FAO=37;FDP=79;FR=.;FRO=42;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=27;FSRR=15;FWDB=-0.0124396;FXX=0.0919435;HRUN=6;LEN=1;MLLD=157.042;QD=7.79483;RBI=0.0354912;REFB=0.00956676;REVB=-0.0332398;RO=32;SAF=19;SAR=18;SRF=26;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254788;STB=0.569036;TYPE=snp;VARB=-0.016549;OID=.;OPOS=46784467;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:79:32:42:37:37:18:19:26:6:18:19:27:15 chr3 46785355 . T C 61.31 PASS AO=17;DP=44;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.00503422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.423;QD=5.57322;RBI=0.0267414;REFB=-0.011983;REVB=-0.0262633;RO=27;SAF=9;SAR=8;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107119;STB=0.562091;TYPE=snp;VARB=0.0279477;OID=.;OPOS=46785355;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:44:44:27:27:17:17:8:9:17:10:8:9:17:10 chr3 46933960 . C G 55.54 PASS AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.0262423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.1447;QD=8.88658;RBI=0.0536335;REFB=-0.0438965;REVB=-0.0467749;RO=13;SAF=9;SAR=3;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.066069;STB=0.538395;TYPE=snp;VARB=0.0397717;OID=.;OPOS=46933960;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:25:25:13:13:12:12:3:9:9:4:3:9:9:4 chr3 46940241 . T C 10.38 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.026;QD=5.93135;RBI=0.0133066;REFB=-0.0278616;REVB=-0.0133066;RO=5;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0451409;OID=.;OPOS=46940241;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:5:5:2:2:2:0:0:5:2:0:0:5 chr3 46944274 . T C 151.94 PASS AO=43;DP=105;FAO=43;FDP=104;FR=.;FRO=61;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=42;FSRR=19;FWDB=0.0243801;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.5956;QD=5.8438;RBI=0.028644;REFB=-0.0210149;REVB=0.0150363;RO=61;SAF=23;SAR=20;SRF=42;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163353;STB=0.591675;TYPE=snp;VARB=0.0307121;OID=.;OPOS=46944274;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:104:61:61:43:43:20:23:42:19:20:23:42:19 chr3 47018214 . T C 543.48 PASS AO=56;DP=56;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0340244;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.345;QD=38.1391;RBI=0.034937;REFB=0;REVB=0.00793287;RO=0;SAF=16;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.01924e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.13418e-05;OID=.;OPOS=47018214;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:56:57:0:0:56:57:40:16:0:0:41:16:0:0 chr3 47036565 . G A 43.02 PASS AO=6;DP=8;FAO=6;FDP=8;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0209981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.84;QD=21.5082;RBI=0.0277385;REFB=0.0609735;REVB=-0.0181247;RO=2;SAF=5;SAR=1;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209294;STB=0.624528;TYPE=snp;VARB=-0.00784433;OID=.;OPOS=47036565;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:8:2:2:6:6:1:5:1:1:1:5:1:1 chr3 47036578 . G A 68.22 PASS AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.038336;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.3276;QD=30.3219;RBI=0.0383677;REFB=-0.0656128;REVB=-0.0015586;RO=1;SAF=7;SAR=1;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.286738;STB=0.666169;TYPE=snp;VARB=0.0101912;OID=.;OPOS=47036578;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:9:9:1:1:8:8:1:7:0:1:1:7:0:1 chr3 47040312 . C T 22.51 PASS AO=5;DP=14;FAO=5;FDP=14;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=-0.0510019;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.07;QD=6.43163;RBI=0.0630174;REFB=-0.0141981;REVB=-0.0370135;RO=9;SAF=1;SAR=4;SRF=1;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162006;STB=0.599654;TYPE=snp;VARB=0.0479363;OID=.;OPOS=47040312;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:14:14:9:9:5:5:4:1:1:8:4:1:1:8 chr3 47043238 . C T 37.09 PASS AO=10;DP=29;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=14;FWDB=-0.0646488;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.5715;QD=5.29831;RBI=0.0646667;REFB=-0.0200129;REVB=0.00152051;RO=18;SAF=6;SAR=4;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.390037;STB=0.72933;TYPE=snp;VARB=0.0168772;OID=.;OPOS=47043238;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:29:28:18:18:10:10:4:6:4:14:4:6:4:14 chr3 47043538 . C T 96.68 PASS AO=24;DP=54;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=0.00797697;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.3335;QD=7.16112;RBI=0.0618861;REFB=-0.00453314;REVB=0.0613699;RO=29;SAF=13;SAR=11;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0775123;STB=0.551682;TYPE=snp;VARB=0.00812163;OID=.;OPOS=47043538;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:54:54:29:30:24:24:11:13:18:11:11:13:19:11 chr3 47049147 . AC A 26.11 PASS AO=14;DP=29;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=12;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=-0.0392644;FXX=0.0344709;HRUN=4;LEN=1;MLLD=10.2186;QD=3.73021;RBI=0.107177;REFB=-0.141156;REVB=0.0997253;RO=13;SAF=13;SAR=1;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.416223;STB=0.722449;TYPE=del;VARB=0.17817;OID=.;OPOS=47049148;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:14:28:13:28:15:12:1:11:4:25:13:13:1:9:4 chr3 47051026 . A G 101.11 PASS AO=19;DP=33;FAO=19;FDP=33;FR=.;FRO=14;FSAF=16;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=-0.0188406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2277;QD=12.2557;RBI=0.0365405;REFB=-0.0151131;REVB=-0.0313088;RO=13;SAF=16;SAR=3;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0919271;STB=0.58937;TYPE=snp;VARB=0.00819647;OID=.;OPOS=47051026;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:33:33:13:14:19:19:3:16:10:3:3:16:10:4 chr3 47125385 . G A 360.52 PASS AO=103;DP=243;FAO=103;FDP=243;FR=.;FRO=140;FSAF=78;FSAR=25;FSRF=118;FSRR=22;FWDB=-0.0157854;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=140.808;QD=5.93448;RBI=0.018061;REFB=-0.00843873;REVB=-0.00877609;RO=140;SAF=78;SAR=25;SRF=118;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130366;STB=0.572016;TYPE=snp;VARB=0.00951806;OID=.;OPOS=47125385;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:243:243:140:140:103:103:25:78:118:22:25:78:118:22 chr3 47161214 . T C 452.43 PASS AO=51;DP=54;FAO=51;FDP=53;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00762816;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.342;QD=34.146;RBI=0.0115654;REFB=-0.038995;REVB=0.00869302;RO=2;SAF=26;SAR=25;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0348494;STB=0.518511;TYPE=snp;VARB=0.00026912;OID=.;OPOS=47161214;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:54:53:2:2:51:51:25:26:2:0:25:26:2:0 chr3 47162661 . A G 752.57 PASS AO=79;DP=82;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00227146;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.6;QD=36.7107;RBI=0.0150515;REFB=-0.0154416;REVB=0.0148791;RO=1;SAF=38;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114068;STB=0.505881;TYPE=snp;VARB=0.000191873;OID=.;OPOS=47162661;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:82:82:1:1:79:81:41:38:0:1:42:39:0:1 chr3 47162886 . C T 251.34 PASS AO=61;DP=128;FAO=61;FDP=128;FR=.;FRO=67;FSAF=43;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=44;FWDB=-0.00115278;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.353;QD=7.85427;RBI=0.029379;REFB=-0.00720585;REVB=-0.0293563;RO=67;SAF=43;SAR=18;SRF=23;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.34548;STB=0.691685;TYPE=snp;VARB=0.00696666;OID=.;OPOS=47162886;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:67:67:61:61:18:43:23:44:18:43:23:44 chr3 47282303 . G A 226.63 PASS AO=56;DP=122;FAO=56;FDP=120;FR=.;FRO=64;FSAF=51;FSAR=5;FSRF=44;FSRR=20;FWDB=-0.0061298;FXX=0.0163921;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.578;QD=7.55438;RBI=0.0247206;REFB=-0.00737577;REVB=0.0239486;RO=64;SAF=51;SAR=5;SRF=44;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.400373;STB=0.728468;TYPE=snp;VARB=0.0117999;OID=.;OPOS=47282303;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:120:64:64:56:56:5:51:44:20:5:51:44:20 chr3 47288905 . G A 150.29 PASS AO=43;DP=105;FAO=43;FDP=105;FR=.;FRO=62;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=31;FSRR=31;FWDB=0.0182486;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=230.199;QD=5.72528;RBI=0.0325301;REFB=-0.0100894;REVB=0.0269294;RO=62;SAF=24;SAR=19;SRF=31;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0610824;STB=0.534505;TYPE=snp;VARB=0.0146449;OID=.;OPOS=47288905;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:62:62:43:43:19:24:31:31:19:24:31:31 chr3 47322496 . C T 143.19 PASS AO=51;DP=145;FAO=51;FDP=146;FR=.;FRO=95;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=27;FSRR=68;FWDB=0.0143685;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.7659;QD=3.92299;RBI=0.138514;REFB=0.00228214;REVB=0.137767;RO=94;SAF=19;SAR=32;SRF=26;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12106;STB=0.55039;TYPE=snp;VARB=-0.00186515;OID=.;OPOS=47322496;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:146:94:95:51:51:32:19:26:68:33:18:27:68 chr3 47385585 . C A 117.73 PASS AO=35;DP=76;FAO=32;FDP=75;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=32;FWDB=0.0510959;FXX=0.0131562;HRUN=5;LEN=1;MLLD=41.2009;QD=6.27915;RBI=0.0586271;REFB=-0.0100643;REVB=0.0287463;RO=36;SAF=14;SAR=21;SRF=11;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0915631;STB=0.592439;TYPE=snp;VARB=0.0231842;OID=.;OPOS=47385585;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:75:36:43:35:32:21:14:11:25:19:13:11:32 chr3 47386060 . G C 782.43 PASS AO=84;DP=85;FAO=84;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0493447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.8232;QD=36.8204;RBI=0.0493839;REFB=-0.118978;REVB=0.00196812;RO=1;SAF=38;SAR=46;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101866;STB=0.505375;TYPE=snp;VARB=0.00154766;OID=.;OPOS=47386060;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:85:85:1:1:84:84:46:38:0:1:46:38:0:1 chr3 47449058 . T C 289.58 PASS AO=28;DP=28;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0323032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.566;QD=37.3648;RBI=0.0334666;REFB=0;REVB=-0.00874744;RO=0;SAF=3;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.13441e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000114385;OID=.;OPOS=47449058;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:28:31:0:0:28:31:25:3:0:0:28:3:0:0 chr3 47452087 . G A 86.76 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.832;QD=38.5586;RBI=0.024407;REFB=0;REVB=0.024407;RO=0;SAF=0;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000292262;OID=.;OPOS=47452087;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:9:0:0:0:9:0:0:0 chr3 47452786 . G A 64.47 PASS AO=15;DP=39;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=2;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=0.062379;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.852;QD=6.61208;RBI=0.0656982;REFB=-0.00418585;REVB=-0.0206184;RO=23;SAF=14;SAR=1;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.471856;STB=0.677155;TYPE=snp;VARB=0.00736119;OID=.;OPOS=47452786;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:39:39:23:23:15:16:1:14:16:7:2:14:16:7 chr3 47454332 . C T 22.75 PASS AO=4;DP=8;FAO=4;FDP=8;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=226.302;QD=11.3735;RBI=0.0107081;REFB=-0.0262728;REVB=0.0107081;RO=4;SAF=0;SAR=4;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00182067;OID=.;OPOS=47454332;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:8:8:4:4:4:4:4:0:0:4:4:0:0:4 chr3 47454399 . G A 57.42 PASS AO=6;DP=6;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0213563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.769;QD=32.8092;RBI=0.108371;REFB=0;REVB=0.106246;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000949394;OID=.;OPOS=47454399;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:7:0:0:6:7:3:3:0:0:4:3:0:0 chr3 47459679 . C T 62.07 PASS AO=11;DP=20;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.0444134;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.332;QD=12.4131;RBI=0.103572;REFB=-0.0511468;REVB=-0.0935658;RO=9;SAF=8;SAR=3;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0512816;STB=0.52936;TYPE=snp;VARB=0.053603;OID=.;OPOS=47459679;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:20:20:9:9:11:11:3:8:7:2:3:8:7:2 chr3 47462199 . GT G,GC 127.14 PASS AO=5,9;DP=14;FAO=14,0;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=11,0;FSAR=3,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.114217,-0.12045;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=181.877,173.882;QD=36.3264;RBI=0.117212,0.159386;REFB=0,0;REVB=0.0263273,-0.104383;RO=0;SAF=5,6;SAR=0,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.000740812,0;OID=.,.;OPOS=47462200,47462200;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=G,GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:5,9:14:14,0:14:0:11,0:3,0:0:0:6:0:5,6:0,3:0:0 chr3 47539751 . T C 1133.22 PASS AO=117;DP=117;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0311368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.683;QD=38.4143;RBI=0.0311383;REFB=0;REVB=0.000306503;RO=0;SAF=59;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.78465e-05;OID=.;OPOS=47539751;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:117:118:0:0:117:118:58:59:0:0:58:60:0:0 chr3 47618953 . C A 570.32 PASS AO=63;DP=66;FAO=63;FDP=65;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=42;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0200105;FXX=0.0151492;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.217;QD=35.0966;RBI=0.0205305;REFB=-0.0527834;REVB=0.00459143;RO=1;SAF=21;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0219527;STB=0.52272;TYPE=snp;VARB=0.000138577;OID=.;OPOS=47618953;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:66:65:1:2:63:63:42:21:1:0:42:21:2:0 chr3 47645933 . A T 524.62 PASS AO=115;DP=219;FAO=116;FDP=221;FR=.;FRO=105;FSAF=33;FSAR=83;FSRF=28;FSRR=77;FWDB=0.00538408;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3639;QD=9.49532;RBI=0.0830542;REFB=-0.00588297;REVB=-0.0828795;RO=104;SAF=32;SAR=83;SRF=28;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00981225;STB=0.510488;TYPE=snp;VARB=0.00436338;OID=.;OPOS=47645933;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:219:221:104:105:115:116:83:32:28:76:83:33:28:77 chr3 47651695 . T C 486.98 PASS AO=99;DP=174;FAO=99;FDP=174;FR=.;FRO=75;FSAF=28;FSAR=71;FSRF=32;FSRR=43;FWDB=0.0025838;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.5352;QD=11.195;RBI=0.00483071;REFB=-0.0165585;REVB=0.00408164;RO=74;SAF=28;SAR=71;SRF=32;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135234;STB=0.571643;TYPE=snp;VARB=0.0147001;OID=.;OPOS=47651695;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:174:74:75:99:99:71:28:32:42:71:28:32:43 chr3 47712202 . T C 179.29 PASS AO=52;DP=131;FAO=53;FDP=132;FR=.;FRO=79;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=29;FSRR=50;FWDB=0.0635282;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.3057;QD=5.43306;RBI=0.104521;REFB=-0.0252902;REVB=-0.0829992;RO=79;SAF=21;SAR=31;SRF=29;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0411491;STB=0.529873;TYPE=snp;VARB=0.0272214;OID=.;OPOS=47712202;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:132:79:79:52:53:31:21:29:50:31:22:29:50 chr3 48299439 . T C 362.95 PASS AO=100;DP=230;FAO=100;FDP=230;FR=.;FRO=130;FSAF=67;FSAR=33;FSRF=53;FSRR=77;FWDB=-0.00376366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.507;QD=6.31224;RBI=0.0185549;REFB=-0.010594;REVB=0.0181692;RO=128;SAF=67;SAR=33;SRF=53;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.262765;STB=0.650455;TYPE=snp;VARB=0.0105823;OID=.;OPOS=48299439;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:230:230:128:130:100:100:33:67:53:75:33:67:53:77 chr3 48309828 . C G 197.64 PASS AO=47;DP=115;FAO=53;FDP=122;FR=.;FRO=69;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=27;FSRR=42;FWDB=0.0214388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.364;QD=6.4801;RBI=0.0223806;REFB=0.00315141;REVB=-0.00642408;RO=67;SAF=18;SAR=29;SRF=26;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00559448;STB=0.513915;TYPE=snp;VARB=-0.00315779;OID=.;OPOS=48309828;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:122:67:69:47:53:29:18:26:41:31:22:27:42 chr3 48327729 . T C 238.5 PASS AO=58;DP=120;FAO=57;FDP=119;FR=.;FRO=62;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=16;FSRR=46;FWDB=-0.00612116;FXX=0.00833264;HRUN=6;LEN=1;MLLD=258.597;QD=8.01674;RBI=0.00661139;REFB=-0.0101952;REVB=-0.00249835;RO=62;SAF=31;SAR=27;SRF=16;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.255497;STB=0.646159;TYPE=snp;VARB=0.01382;OID=.;OPOS=48327729;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:119:62:62:58:57:27:31:16:46:26:31:16:46 chr3 48327751 . G A 328.82 PASS AO=67;DP=137;FAO=74;FDP=144;FR=.;FRO=70;FSAF=36;FSAR=38;FSRF=19;FSRR=51;FWDB=0.0157129;FXX=0.00689608;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.603;QD=9.134;RBI=0.0163332;REFB=-0.0172005;REVB=0.00445856;RO=70;SAF=35;SAR=32;SRF=19;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.231064;STB=0.605186;TYPE=snp;VARB=0.0143893;OID=.;OPOS=48327751;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:144:70:70:67:74:32:35:19:51:38:36:19:51 chr3 48360992 . T G 136.54 PASS AO=56;DP=177;FAO=56;FDP=176;FR=.;FRO=120;FSAF=31;FSAR=25;FSRF=54;FSRR=66;FWDB=-0.00475774;FXX=0.0056494;HRUN=4;LEN=1;MLLD=201.419;QD=3.1032;RBI=0.0218743;REFB=-0.000415542;REVB=-0.0213506;RO=120;SAF=31;SAR=25;SRF=54;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121655;STB=0.570335;TYPE=snp;VARB=0.000813946;OID=.;OPOS=48360992;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:176:120:120:56:56:25:31:54:66:25:31:54:66 chr3 48421387 . G T 507.75 PASS AO=54;DP=56;FAO=56;FDP=58;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0243702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.1478;QD=35.0173;RBI=0.0368197;REFB=-0.0909516;REVB=0.0276005;RO=0;SAF=18;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512816;TYPE=snp;VARB=0.00320188;OID=.;OPOS=48421387;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:56:58:0:2:54:56:36:18:0:0:38:18:0:2 chr3 48422235 . T A 756.28 PASS AO=80;DP=82;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00396329;FXX=0.0240935;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.422;QD=37.3471;RBI=0.0124209;REFB=0;REVB=0.0117717;RO=0;SAF=50;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000344471;OID=.;OPOS=48422235;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:82:81:0:0:80:81:30:50:0:0:30:51:0:0 chr3 48461313 . C G 55.22 PASS AO=8;DP=13;FAO=9;FDP=14;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.0226102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.816;QD=15.7758;RBI=0.0637326;REFB=-0.0249212;REVB=0.0595871;RO=5;SAF=1;SAR=7;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.608654;STB=0.856266;TYPE=snp;VARB=0.0261555;OID=.;OPOS=48461313;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:13:14:5:5:8:9:7:1:5:0:8:1:5:0 chr3 48474249 . A G 45.85 PASS AO=15;DP=50;FAO=16;FDP=51;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.0419422;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.1412;QD=3.59639;RBI=0.0447745;REFB=-0.00352078;REVB=-0.015672;RO=35;SAF=11;SAR=4;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.359848;STB=0.726981;TYPE=snp;VARB=0.007172;OID=.;OPOS=48474249;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:50:51:35:35:15:16:4:11:15:20:4:12:15:20 chr3 48476431 . C G 870.45 PASS AO=95;DP=101;FAO=101;FDP=102;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0472487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3163;QD=34.1354;RBI=0.0474882;REFB=-0.183083;REVB=0.00476323;RO=4;SAF=29;SAR=66;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0278724;STB=0.503496;TYPE=snp;VARB=0.00625967;OID=.;OPOS=48476431;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:101:102:4:1:95:101:66:29:0:4:71:30:0:1 chr3 48597018 . G A 154.85 PASS AO=33;DP=63;FAO=33;FDP=63;FR=.;FRO=30;FSAF=1;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=30;FWDB=2.54317e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=288.06;QD=9.83141;RBI=0.00150085;REFB=-0.0179098;REVB=-0.00150063;RO=30;SAF=1;SAR=32;SRF=0;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.296389;STB=0.659506;TYPE=snp;VARB=0.0140543;OID=.;OPOS=48597018;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:30:30:33:33:32:1:0:30:32:1:0:30 chr3 48625371 . A G 19.9 PASS AO=3;DP=10;FAO=4;FDP=11;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.8847;QD=7.23526;RBI=0.100469;REFB=-0.0220903;REVB=-0.100469;RO=6;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0234282;OID=.;OPOS=48625371;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:10:11:6:7:3:4:3:0:0:6:4:0:0:7 chr3 48628014 . G A 103.6 PASS AO=16;DP=41;FAO=22;FDP=43;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.004937;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.356;QD=9.63727;RBI=0.00956549;REFB=-0.0198607;REVB=0.00819296;RO=14;SAF=9;SAR=7;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110236;STB=0.602013;TYPE=snp;VARB=0.019304;OID=.;OPOS=48628014;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:34:43:14:21:16:22:7:9:6:8:9:13:8:13 chr3 48694471 . C T 55.46 PASS AO=10;DP=20;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0358426;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.1982;QD=10.0843;RBI=0.0470823;REFB=0.0245813;REVB=0.0305295;RO=10;SAF=7;SAR=3;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0969297;STB=0.547738;TYPE=snp;VARB=-0.0212243;OID=.;OPOS=48694471;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:20:22:10:11:10:11:3:7:6:4:4:7:6:5 chr3 48727112 . G A 1000.68 PASS AO=105;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0128032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.359;QD=38.1212;RBI=0.060078;REFB=0;REVB=0.0586978;RO=0;SAF=55;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.80947e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000202005;OID=.;OPOS=48727112;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:105:105:0:0:105:105:50:55:0:0:50:55:0:0 chr3 48956665 . G T 11.57 PASS AO=3;DP=16;FAO=4;FDP=18;FR=.;FRO=14;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=12;FWDB=0.00244044;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.278;QD=2.57197;RBI=0.0136177;REFB=-0.018982;REVB=0.0133973;RO=12;SAF=0;SAR=3;SRF=1;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.531021;STB=0.624477;TYPE=snp;VARB=0.0406232;OID=.;OPOS=48956665;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:16:18:12:14:3:4:3:0:1:11:3:1:2:12 chr3 48986546 . CATTTATTT C 111.89 PASS AO=18;DP=47;FAO=21;FDP=35;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.0304856;FXX=0.102538;HRUN=1;LEN=8;MLLD=201.607;QD=12.7876;RBI=0.0324185;REFB=-0.00534493;REVB=-0.0110267;RO=0;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.538007;TYPE=del;VARB=0.00838448;OID=.;OPOS=48986547;OREF=ATTTATTT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:18:24:21:35:14:10:11:8:6:53:0:9:9:0:0 chr3 48995487 . C T 316.55 PASS AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0429244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.194;QD=37.2408;RBI=0.0455524;REFB=0;REVB=-0.0152484;RO=0;SAF=16;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000157319;OID=.;OPOS=48995487;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:34:0:0:34:34:18:16:0:0:18:16:0:0 chr3 49053219 . A G 1214.59 PASS AO=119;DP=133;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0379352;FXX=0.102034;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.8842;QD=36.8058;RBI=0.0604949;REFB=0;REVB=0.0471227;RO=0;SAF=40;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0026918;OID=.;OPOS=49053219;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:133:132:0:0:119:132:79:40:0:0:85:47:0:0 chr3 49054692 . T C 680.9 PASS AO=73;DP=73;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0220643;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.743;QD=37.8276;RBI=0.0225143;REFB=0;REVB=0.00447892;RO=0;SAF=34;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000123496;OID=.;OPOS=49054692;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:73:72:0:0:73:72:39:34:0:0:38:34:0:0 chr3 49163236 . C T 140.61 PASS AO=34;DP=72;FAO=34;FDP=73;FR=.;FRO=39;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=-0.0232249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2566;QD=7.70484;RBI=0.0864063;REFB=-0.0231935;REVB=-0.0832265;RO=38;SAF=21;SAR=13;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21009;STB=0.624024;TYPE=snp;VARB=0.0265523;OID=.;OPOS=49163236;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:73:38:39:34:34:13:21:15:23:13:21:15:24 chr3 49200482 . C T 29.5 PASS AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=72.1457;QD=11.7994;RBI=0.0378184;REFB=-0.00948337;REVB=0.0378184;RO=5;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0127431;OID=.;OPOS=49200482;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:10:10:5:5:5:5:5:0:0:5:5:0:0:5 chr3 49200484 . A G 31.86 PASS AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0.0999001;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.4891;QD=14.1586;RBI=0.0555185;REFB=-0.0102754;REVB=-0.0555185;RO=4;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00211448;OID=.;OPOS=49200484;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:10:9:4:4:5:5:5:0:0:4:5:0:0:4 chr3 49200627 . A G 157.95 PASS AO=16;DP=16;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.212619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.779;QD=37.1638;RBI=0.212653;REFB=0;REVB=-0.00381594;RO=0;SAF=2;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0014555;OID=.;OPOS=49200627;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:16:17:0:0:16:17:14:2:0:0:14:3:0:0 chr3 49200692 . T A 107.65 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0857984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.314;QD=35.8824;RBI=0.11742;REFB=0;REVB=0.0801625;RO=0;SAF=10;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00385781;OID=.;OPOS=49200692;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:2:10:0:0:2:10:0:0 chr3 49227550 . GC G 854.74 PASS AO=105;DP=146;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.083867;FXX=0.00746213;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.4375;QD=25.7064;RBI=0.280889;REFB=-0.0178883;REVB=0.268076;RO=14;SAF=32;SAR=73;SRF=3;SRR=11;SSEN=0.444157;SSEP=0;SSSB=0.0239618;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00549728;OID=.;OPOS=49227551;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:105:134:133:133:0:42:91:0:0:68:14:32:73:3:11 chr3 49273996 . C T 472.2 PASS AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0321577;FXX=0.019604;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.562;QD=37.7763;RBI=0.0328258;REFB=0;REVB=0.00658892;RO=0;SAF=25;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.27047e-05;OID=.;OPOS=49273996;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:51:50:0:0:50:50:25:25:0:0:25:25:0:0 chr3 49298139 . G A 945.53 PASS AO=101;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0316567;FXX=0.0192289;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.2608;QD=37.0794;RBI=0.0586684;REFB=-0.0650136;REVB=-0.0493947;RO=0;SAF=69;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00104715;OID=.;OPOS=49298139;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:102:102:0:0:101:102:32:69:0:0:32:70:0:0 chr3 49298205 . T C 835.01 PASS AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00923723;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.3753;QD=38.3913;RBI=0.0469713;REFB=0;REVB=0.046054;RO=0;SAF=63;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.26413e-05;OID=.;OPOS=49298205;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:87:87:0:0:87:87:24:63:0:0:24:63:0:0 chr3 49343175 . G A 487.58 PASS AO=107;DP=203;FAO=107;FDP=202;FR=.;FRO=95;FSAF=48;FSAR=59;FSRF=36;FSRR=59;FWDB=-0.0358387;FXX=0.00492587;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.828;QD=9.65513;RBI=0.0441611;REFB=-0.00769791;REVB=-0.0258028;RO=93;SAF=48;SAR=59;SRF=35;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0626561;STB=0.533327;TYPE=snp;VARB=0.0069016;OID=.;OPOS=49343175;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:202:93:95:107:107:59:48:35:58:59:48:36:59 chr3 49362369 . C T 554.2 PASS AO=127;DP=251;FAO=128;FDP=252;FR=.;FRO=124;FSAF=66;FSAR=62;FSRF=69;FSRR=55;FWDB=0.00222844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.7034;QD=8.79685;RBI=0.0215787;REFB=-0.00193755;REVB=0.0214633;RO=124;SAF=66;SAR=61;SRF=69;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0332433;STB=0.520131;TYPE=snp;VARB=0.00252924;OID=.;OPOS=49362369;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:251:252:124:124:127:128:61:66:69:55:62:66:69:55 chr3 49395643 . CG C 22.53 PASS AO=9;DP=22;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=-0.0333126;FXX=0.0908678;HRUN=3;LEN=1;MLLD=10.6039;QD=4.50662;RBI=0.0463815;REFB=-0.106212;REVB=-0.0322724;RO=10;SAF=3;SAR=6;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0.321839;SSSB=0.142989;STB=0.562382;TYPE=del;VARB=0.0956311;OID=.;OPOS=49395644;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:9:22:10:20:10:3:7:2:8:21:10:3:6:2:8 chr3 49548008 . C G 980.53 PASS AO=103;DP=103;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000305415;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=41.9273;QD=35.9827;RBI=0.0312784;REFB=-0.0294463;REVB=0.0312769;RO=0;SAF=58;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000391007;OID=.;OPOS=49548008;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:103:109:0:0:103:109:45:58:0:0:49:60:0:0 chr3 49570200 . C T 326.76 PASS AO=67;DP=121;FAO=67;FDP=121;FR=.;FRO=54;FSAF=22;FSAR=45;FSRF=18;FSRR=36;FWDB=0.010128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.738;QD=10.802;RBI=0.0179661;REFB=-0.0156588;REVB=0.0148393;RO=54;SAF=22;SAR=45;SRF=18;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00459167;STB=0.502512;TYPE=snp;VARB=0.013308;OID=.;OPOS=49570200;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:54:54:67:67:45:22:18:36:45:22:18:36 chr3 49570882 . T C 238.29 PASS AO=76;DP=197;FAO=76;FDP=197;FR=.;FRO=121;FSAF=53;FSAR=23;FSRF=70;FSRR=51;FWDB=-0.00501186;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.238;QD=4.83833;RBI=0.0166399;REFB=-0.00694754;REVB=0.0158672;RO=121;SAF=53;SAR=23;SRF=70;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142799;STB=0.580929;TYPE=snp;VARB=0.00796559;OID=.;OPOS=49570882;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:197:121:121:76:76:23:53:70:51:23:53:70:51 chr3 49689210 . G A 65.77 PASS AO=14;DP=34;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=3;FWDB=0.0406335;FXX=0.0571265;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.979;QD=7.97245;RBI=0.119479;REFB=-0.00479161;REVB=0.112357;RO=16;SAF=10;SAR=4;SRF=13;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118918;STB=0.609626;TYPE=snp;VARB=0.033796;OID=.;OPOS=49689210;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:34:33:16:18:14:15:4:10:13:3:5:10:15:3 chr3 49689211 . C A 13.44 PASS AO=6;DP=32;FAO=7;FDP=35;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=19;FSRR=9;FWDB=-0.00838723;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=53.2856;QD=1.53619;RBI=0.0302834;REFB=-0.0551076;REVB=0.0290988;RO=26;SAF=6;SAR=0;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.651101;STB=0.705191;TYPE=snp;VARB=0.0913443;OID=.;OPOS=49689211;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:32:35:26:28:6:7:0:6:17:9:1:6:19:9 chr3 49690199 . G A 555.09 PASS AO=58;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021474;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.607;QD=37.6331;RBI=0.0473999;REFB=0;REVB=0.0422565;RO=0;SAF=24;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.31293e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000192066;OID=.;OPOS=49690199;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:59:59:0:0:58:59:34:24:0:0:34:25:0:0 chr3 49690496 . C T 191.03 PASS AO=45;DP=93;FAO=45;FDP=93;FR=.;FRO=48;FSAF=9;FSAR=36;FSRF=15;FSRR=33;FWDB=0.00606485;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.097;QD=8.21643;RBI=0.0155433;REFB=-0.0250068;REVB=0.0143112;RO=46;SAF=9;SAR=36;SRF=15;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15897;STB=0.581779;TYPE=snp;VARB=0.020694;OID=.;OPOS=49690496;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:46:48:45:45:36:9:15:31:36:9:15:33 chr3 49701298 . G A 255.7 PASS AO=51;DP=97;FAO=54;FDP=101;FR=.;FRO=47;FSAF=15;FSAR=39;FSRF=17;FSRR=30;FWDB=0.0294436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.746;QD=10.1265;RBI=0.0335426;REFB=-0.00670897;REVB=-0.016068;RO=44;SAF=15;SAR=36;SRF=15;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0463461;STB=0.546631;TYPE=snp;VARB=0.0059207;OID=.;OPOS=49701298;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:101:44:47:51:54:36:15:15:29:39:15:17:30 chr3 49701983 . G A 131.06 PASS AO=25;DP=46;FAO=26;FDP=47;FR=.;FRO=21;FSAF=22;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.000244139;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=272.654;QD=11.154;RBI=0.0197897;REFB=-0.00883046;REVB=-0.0197882;RO=21;SAF=21;SAR=4;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.450585;STB=0.756859;TYPE=snp;VARB=0.00531748;OID=.;OPOS=49701983;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:46:47:21:21:25:26:4:21:8:13:4:22:8:13 chr3 49705512 . T A 114.13 PASS AO=24;DP=46;FAO=24;FDP=46;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.0265591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.4578;QD=9.92456;RBI=0.0557837;REFB=0.00195544;REVB=-0.0490554;RO=22;SAF=12;SAR=12;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116647;STB=0.565164;TYPE=snp;VARB=-0.0024848;OID=.;OPOS=49705512;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:46:46:22:22:24:24:12:12:14:8:12:12:14:8 chr3 49714225 . T C 282.49 PASS AO=61;DP=116;FAO=61;FDP=115;FR=.;FRO=54;FSAF=11;FSAR=50;FSRF=18;FSRR=36;FWDB=-0.0291489;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.503;QD=9.82589;RBI=0.0310639;REFB=-0.00702887;REVB=-0.0107382;RO=54;SAF=11;SAR=50;SRF=18;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189615;STB=0.605137;TYPE=snp;VARB=0.00706444;OID=.;OPOS=49714225;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:115:54:54:61:61:50:11:18:36:50:11:18:36 chr3 49721532 . G A 394.92 PASS AO=95;DP=182;FAO=95;FDP=196;FR=.;FRO=101;FSAF=46;FSAR=49;FSRF=42;FSRR=59;FWDB=-0.0058016;FXX=0.0101005;HRUN=3;LEN=1;MLLD=127.783;QD=8.05964;RBI=0.00852845;REFB=-0.0410912;REVB=-0.00625107;RO=87;SAF=46;SAR=49;SRF=42;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00126817;STB=0.535337;TYPE=snp;VARB=0.0491214;OID=.;OPOS=49721532;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:196:87:101:95:95:49:46:42:45:49:46:42:59 chr3 49721798 . C A 72.6 PASS AO=26;DP=79;FAO=26;FDP=79;FR=.;FRO=53;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=35;FWDB=-0.000837195;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=241.034;QD=3.67583;RBI=0.0329499;REFB=-0.0087008;REVB=-0.0329393;RO=52;SAF=16;SAR=10;SRF=18;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.300583;STB=0.679114;TYPE=snp;VARB=0.0172168;OID=.;OPOS=49721798;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:79:79:52:53:26:26:10:16:18:34:10:16:18:35 chr3 49722060 . AG A 57.93 PASS AO=25;DP=54;FAO=25;FDP=47;FR=.;FRO=22;FSAF=24;FSAR=1;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.160316;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=10.1164;QD=4.93;RBI=0.296473;REFB=-0.0832418;REVB=0.249389;RO=16;SAF=24;SAR=1;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0.435071;SSSB=0.644935;STB=0.866009;TYPE=del;VARB=0.0825579;OID=.;OPOS=49722061;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:25:47:25:47:22:24:1:13:9:37:16:24:1:8:8 chr3 49724808 . T C 930.1 PASS AO=100;DP=106;FAO=101;FDP=103;FR=.;FRO=2;FSAF=42;FSAR=59;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0177341;FXX=0.0282992;HRUN=3;LEN=1;MLLD=75.153;QD=36.1204;RBI=0.0207432;REFB=-0.00463813;REVB=-0.0107602;RO=3;SAF=41;SAR=59;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0334472;STB=0.511626;TYPE=snp;VARB=-9.82016e-05;OID=.;OPOS=49724808;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:106:103:3:2:100:101:59:41:3:0:59:42:2:0 chr3 49736172 . C A 200.98 PASS AO=47;DP=103;FAO=49;FDP=104;FR=.;FRO=55;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=30;FSRR=25;FWDB=0.0238165;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.755;QD=7.73007;RBI=0.0283276;REFB=-0.0167949;REVB=-0.0153372;RO=55;SAF=28;SAR=19;SRF=30;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0498728;STB=0.525141;TYPE=snp;VARB=0.018957;OID=.;OPOS=49736172;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:104:55:55:47:49:19:28:30:25:20:29:30:25 chr3 49737954 . G A 270.35 PASS AO=70;DP=154;FAO=70;FDP=154;FR=.;FRO=84;FSAF=35;FSAR=35;FSRF=39;FSRR=45;FWDB=-0.0127569;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.656;QD=7.02209;RBI=0.0194259;REFB=-0.0270693;REVB=0.0146502;RO=84;SAF=35;SAR=35;SRF=39;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0350527;STB=0.519475;TYPE=snp;VARB=0.0382713;OID=.;OPOS=49737954;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:154:84:84:70:70:35:35:39:45:35:35:39:45 chr3 49738945 . C T 124.65 PASS AO=31;DP=69;FAO=31;FDP=69;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=-0.0171619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.5771;QD=7.22589;RBI=0.04713;REFB=0.00376767;REVB=0.0438942;RO=38;SAF=19;SAR=12;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00784954;STB=0.504422;TYPE=snp;VARB=-0.00429809;OID=.;OPOS=49738945;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:38:38:31:31:12:19:23:15:12:19:23:15 chr3 49739507 . G C 254.96 PASS AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0837385;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.7598;QD=37.7719;RBI=0.0969754;REFB=0;REVB=0.048909;RO=0;SAF=18;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00307306;OID=.;OPOS=49739507;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:27:27:0:0:27:27:9:18:0:0:9:18:0:0 chr3 49751585 . C T 132.06 PASS AO=25;DP=43;FAO=25;FDP=43;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.000358179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.522;QD=12.2842;RBI=0.039833;REFB=-0.0552665;REVB=0.0398314;RO=18;SAF=9;SAR=16;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0675575;STB=0.537519;TYPE=snp;VARB=0.00909774;OID=.;OPOS=49751585;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:43:43:18:18:25:25:16:9:8:10:16:9:8:10 chr3 49757197 . CG C 78.51 PASS AO=23;DP=47;FAO=27;FDP=46;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=25;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.0875709;FXX=0.0212721;HRUN=4;LEN=1;MLLD=14.0824;QD=6.82687;RBI=0.108913;REFB=-0.0957543;REVB=0.0647561;RO=19;SAF=2;SAR=21;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.419503;STB=0.752263;TYPE=del;VARB=0.0784614;OID=.;OPOS=49757198;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:23:47:27:46:19:2:25:7:12:39:19:2:21:7:12 chr3 49757592 . T TACA 30.3 PASS AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=1.84427e-06;FXX=0.0908265;HRUN=1;LEN=3;MLLD=214.017;QD=12.1206;RBI=0.00358841;REFB=0.0041054;REVB=0.00358841;RO=5;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-0.00997766;OID=.;OPOS=49757593;OREF=-;OALT=ACA;OMAPALT=TACA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:5:11:5:10:5:0:5:0:5:27:5:0:5:0:5 chr3 49758764 . A G 78.69 PASS AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=-0.0123613;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.035;QD=8.07032;RBI=0.0249316;REFB=-0.000713135;REVB=0.0216514;RO=21;SAF=5;SAR=13;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00927431;STB=0.505294;TYPE=snp;VARB=0.00167069;OID=.;OPOS=49758764;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:39:39:21:21:18:18:13:5:6:15:13:5:6:15 chr3 49760039 . T C 393.18 PASS AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0302525;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.243;QD=37.4454;RBI=0.0457931;REFB=0;REVB=0.0343773;RO=0;SAF=11;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.72514e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.14122e-05;OID=.;OPOS=49760039;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:43:42:0:0:42:42:31:11:0:0:31:11:0:0 chr3 49829326 . G A 253.62 PASS AO=47;DP=96;FAO=54;FDP=101;FR=.;FRO=47;FSAF=22;FSAR=32;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=0.141615;FXX=0.0288434;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.7187;QD=10.0441;RBI=0.173506;REFB=-0.0182486;REVB=0.100246;RO=48;SAF=18;SAR=29;SRF=28;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183785;STB=0.578142;TYPE=snp;VARB=0.0196403;OID=.;OPOS=49829326;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:101:48:47:47:54:29:18:28:20:32:22:27:20 chr3 49830032 . C T 82.47 PASS AO=19;DP=43;FAO=20;FDP=43;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=3;FSRR=20;FWDB=-0.06928;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.8366;QD=7.6718;RBI=0.0718575;REFB=-0.0171463;REVB=0.0190731;RO=23;SAF=5;SAR=14;SRF=3;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182972;STB=0.593138;TYPE=snp;VARB=0.0230974;OID=.;OPOS=49830032;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:43:43:23:23:19:20:14:5:3:20:15:5:3:20 chr3 49836707 . G A 185.6 PASS AO=41;DP=81;FAO=43;FDP=88;FR=.;FRO=45;FSAF=28;FSAR=15;FSRF=36;FSRR=9;FWDB=-0.00416177;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.749;QD=8.43616;RBI=0.0208305;REFB=-0.0135445;REVB=0.0204106;RO=40;SAF=26;SAR=15;SRF=31;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14166;STB=0.588198;TYPE=snp;VARB=0.016774;OID=.;OPOS=49836707;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:88:40:45:41:43:15:26:31:9:15:28:36:9 chr3 49850913 . TG T 120.91 PASS AO=16;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.195457;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.9742;QD=24.1828;RBI=0.262043;REFB=0;REVB=0.174537;RO=3;SAF=6;SAR=10;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0.473118;SSSB=0.0127953;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0329369;OID=.;OPOS=49850914;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:16:20:20:20:0:8:12:0:0:11:3:6:10:1:2 chr3 49898273 . A G 54.02 PASS AO=22;DP=77;FAO=23;FDP=78;FR=.;FRO=55;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=-0.00503772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.995;QD=2.77014;RBI=0.00629203;REFB=-0.00166968;REVB=-0.00376974;RO=55;SAF=11;SAR=11;SRF=29;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0325899;STB=0.534491;TYPE=snp;VARB=0.00520584;OID=.;OPOS=49898273;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:77:78:55:55:22:23:11:11:29:26:12:11:29:26 chr3 49899795 . G A 278.63 PASS AO=58;DP=107;FAO=58;FDP=106;FR=.;FRO=48;FSAF=28;FSAR=30;FSRF=15;FSRR=33;FWDB=0.0040832;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.457;QD=10.5142;RBI=0.0167479;REFB=-0.0416273;REVB=0.0162425;RO=43;SAF=28;SAR=30;SRF=14;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123383;STB=0.577577;TYPE=snp;VARB=0.0209762;OID=.;OPOS=49899795;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:106:43:48:58:58:30:28:14:29:30:28:15:33 chr3 49901060 . A T 83.43 PASS AO=22;DP=53;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=3;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=0.0206881;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.217;QD=6.29681;RBI=0.0253904;REFB=-0.0435093;REVB=0.0147198;RO=31;SAF=3;SAR=19;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.36538;STB=0.714055;TYPE=snp;VARB=0.0360868;OID=.;OPOS=49901060;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:53:53:31:31:22:22:19:3:12:19:19:3:12:19 chr3 49924940 . T C 99.59 PASS AO=30;DP=80;FAO=30;FDP=79;FR=.;FRO=49;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=27;FSRR=22;FWDB=-0.019924;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.598;QD=5.04243;RBI=0.0284943;REFB=0.00523259;REVB=-0.0203705;RO=49;SAF=20;SAR=10;SRF=27;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133074;STB=0.576524;TYPE=snp;VARB=-0.0100051;OID=.;OPOS=49924940;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:79:49:49:30:30:10:20:27:22:10:20:27:22 chr3 49928691 . T C 86.76 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00889894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.175;QD=38.5593;RBI=0.0219614;REFB=0;REVB=-0.0200777;RO=0;SAF=7;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000860055;OID=.;OPOS=49928691;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:2:7:0:0:2:7:0:0 chr3 49936102 . T C 86.7 PASS AO=15;DP=24;FAO=15;FDP=24;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0171198;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.4766;QD=14.4506;RBI=0.0210782;REFB=0.00131707;REVB=-0.0122964;RO=9;SAF=8;SAR=7;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132903;STB=0.574487;TYPE=snp;VARB=-0.00113362;OID=.;OPOS=49936102;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:24:24:9:9:15:15:7:8:3:6:7:8:3:6 chr3 49949070 . CAG CG,CA,CGG 455.37 PASS AO=11,11,12;DP=67;FAO=23,39,0;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=11,13,0;FSAR=12,26,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0690679,0.0667707,-0.0588622;FXX=0.0158705;HRUN=1,2,1;LEN=1,1,1;MLLD=108.902,18.2643,114.921;QD=29.3787;RBI=0.0713337,0.79339,0.110087;REFB=-0.0485248,-0.13584,0.017903;REVB=-0.017836,0.790575,-0.0930294;RO=24;SAF=10,8,1;SAR=1,3,11;SRF=1;SRR=23;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0.319277,0;SSSB=0.798319,0.678465,0.184177;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=del,del,snp;VARB=0.039347,-0.0427327,0.0235935;OID=.,.,.;OPOS=49949071,49949072,49949071;OREF=A,G,A;OALT=-,-,G;OMAPALT=CG,CA,CGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:11,11,12:61:23,39,0:62:0:11,13,0:12,26,0:0:0:77:24:10,8,1:1,3,11:1:23 chr3 50114515 . C T 141.63 PASS AO=43;DP=109;FAO=43;FDP=111;FR=.;FRO=68;FSAF=12;FSAR=31;FSRF=27;FSRR=41;FWDB=0.00623579;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.256;QD=5.10372;RBI=0.0329679;REFB=-0.0212624;REVB=-0.0323728;RO=66;SAF=12;SAR=31;SRF=26;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140789;STB=0.583172;TYPE=snp;VARB=0.0273768;OID=.;OPOS=50114515;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:111:66:68:43:43:31:12:26:40:31:12:27:41 chr3 50129399 . C T 141.02 PASS AO=47;DP=126;FAO=47;FDP=126;FR=.;FRO=79;FSAF=29;FSAR=18;FSRF=30;FSRR=49;FWDB=0.0264292;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.951;QD=4.47694;RBI=0.0480448;REFB=0.0168613;REVB=-0.0401223;RO=78;SAF=29;SAR=18;SRF=30;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252015;STB=0.646528;TYPE=snp;VARB=-0.0207171;OID=.;OPOS=50129399;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:78:79:47:47:18:29:30:48:18:29:30:49 chr3 50144951 . T C 96.63 PASS AO=27;DP=68;FAO=28;FDP=69;FR=.;FRO=41;FSAF=4;FSAR=24;FSRF=2;FSRR=39;FWDB=-0.00651635;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.3233;QD=5.60151;RBI=0.0322405;REFB=0.0107778;REVB=-0.0315751;RO=41;SAF=4;SAR=23;SRF=2;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.256634;STB=0.636288;TYPE=snp;VARB=-0.0208784;OID=.;OPOS=50144951;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:68:69:41:41:27:28:23:4:2:39:24:4:2:39 chr3 50153356 . T C 228.85 PASS AO=60;DP=139;FAO=61;FDP=139;FR=.;FRO=78;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=43;FSRR=35;FWDB=-0.0191856;FXX=0.00714235;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.7634;QD=6.58555;RBI=0.0540653;REFB=-0.0275998;REVB=0.0505467;RO=78;SAF=28;SAR=32;SRF=42;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0725232;STB=0.542487;TYPE=snp;VARB=0.0271565;OID=.;OPOS=50153356;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:78:78:60:61:32:28:42:36:32:29:43:35 chr3 50197097 . C T 245.25 PASS AO=47;DP=83;FAO=47;FDP=80;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=37;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=0.0100956;FXX=0.0361402;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.943;QD=12.2626;RBI=0.0220099;REFB=-0.0229715;REVB=0.019558;RO=29;SAF=10;SAR=37;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126262;STB=0.583893;TYPE=snp;VARB=0.0116848;OID=.;OPOS=50197097;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:80:29:33:47:47:37:10:10:19:37:10:12:21 chr3 50222926 . T A 370.58 PASS AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0193013;FXX=0.0232504;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.422;QD=35.2936;RBI=0.0571413;REFB=-0.0982093;REVB=0.0537828;RO=1;SAF=33;SAR=8;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140107;STB=0.507459;TYPE=snp;VARB=0.00344001;OID=.;OPOS=50222926;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:42:42:1:1:41:41:8:33:1:0:8:33:1:0 chr3 50229160 . TG T 418.53 PASS AO=57;DP=77;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0599775;FXX=0.0129853;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.4675;QD=22.0277;RBI=0.322582;REFB=0.0230069;REVB=0.316957;RO=14;SAF=43;SAR=14;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0.516484;SSSB=0.148193;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00995381;OID=.;OPOS=50229161;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:57:77:76:76:0:50:26:0:0:31:14:43:14:6:8 chr3 50326907 . AG A 179.93 PASS AO=25;DP=33;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.178953;FXX=0.0312402;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.8711;QD=23.2171;RBI=0.382046;REFB=-0.0480652;REVB=-0.337543;RO=2;SAF=19;SAR=6;SRF=2;SRR=0;SSEN=0.610084;SSEP=0;SSSB=-0.0463889;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.00992848;OID=.;OPOS=50326908;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:25:32:31:31:0:21:10:0:0:14:2:19:6:2:0 chr3 50329826 . A G 107.82 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0544787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.45;QD=35.9383;RBI=0.0758955;REFB=0;REVB=0.0528412;RO=0;SAF=10;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00244527;OID=.;OPOS=50329826;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:2:10:0:0:2:10:0:0 chr3 50332697 . G A 195.83 PASS AO=56;DP=135;FAO=56;FDP=135;FR=.;FRO=79;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=38;FSRR=41;FWDB=0.0199315;FXX=0.0073524;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.405;QD=5.80247;RBI=0.0292745;REFB=-0.0374515;REVB=-0.0214414;RO=77;SAF=27;SAR=29;SRF=36;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0151008;STB=0.500662;TYPE=snp;VARB=0.0528578;OID=.;OPOS=50332697;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:77:79:56:56:29:27:36:41:29:27:38:41 chr3 50357869 . A C 210.66 PASS AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0121016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.969;QD=36.6369;RBI=0.0276053;REFB=0;REVB=-0.0248113;RO=0;SAF=21;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.63689e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0011699;OID=.;OPOS=50357869;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:0:0:23:23:2:21:0:0:2:21:0:0 chr3 50369546 . C A 177.97 PASS AO=34;DP=63;FAO=36;FDP=65;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=8;FWDB=0.019322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.63;QD=10.9517;RBI=0.0201429;REFB=-0.0242361;REVB=0.00569167;RO=28;SAF=16;SAR=18;SRF=21;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226566;STB=0.611287;TYPE=snp;VARB=0.0170224;OID=.;OPOS=50369546;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:65:28:29:34:36:18:16:21:7:19:17:21:8 chr3 50457227 . G A 231.94 PASS AO=56;DP=117;FAO=56;FDP=117;FR=.;FRO=61;FSAF=43;FSAR=13;FSRF=37;FSRR=24;FWDB=-0.00667543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.068;QD=7.92943;RBI=0.019566;REFB=-0.0122069;REVB=0.018392;RO=61;SAF=43;SAR=13;SRF=37;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187334;STB=0.604673;TYPE=snp;VARB=0.0114427;OID=.;OPOS=50457227;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:61:61:56:56:13:43:37:24:13:43:37:24 chr3 50597092 . G A 137.32 PASS AO=28;DP=52;FAO=28;FDP=52;FR=.;FRO=24;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.0238829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.061;QD=10.5631;RBI=0.0367714;REFB=-0.0117603;REVB=0.0279597;RO=24;SAF=16;SAR=12;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0942816;STB=0.552449;TYPE=snp;VARB=0.0165404;OID=.;OPOS=50597092;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:24:24:28:28:12:16:11:13:12:16:11:13 chr3 50609624 . T G 173.43 PASS AO=39;DP=78;FAO=39;FDP=78;FR=.;FRO=39;FSAF=8;FSAR=31;FSRF=12;FSRR=27;FWDB=0.00205584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6621;QD=8.89374;RBI=0.0198616;REFB=-0.0221088;REVB=-0.0197549;RO=38;SAF=8;SAR=31;SRF=12;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136264;STB=0.571916;TYPE=snp;VARB=0.0124659;OID=.;OPOS=50609624;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:38:39:39:39:31:8:12:26:31:8:12:27 chr3 51273773 . T C 1801.22 PASS AO=193;DP=197;FAO=193;FDP=193;FR=.;FRO=0;FSAF=113;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0251774;FXX=0.0203035;HRUN=4;LEN=1;MLLD=114.858;QD=37.331;RBI=0.0269757;REFB=-0.0461072;REVB=-0.00968456;RO=1;SAF=113;SAR=80;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0059155;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.58326e-05;OID=.;OPOS=51273773;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:197:193:1:0:193:193:80:113:0:1:80:113:0:0 chr3 51432895 . T C 227.63 PASS AO=56;DP=120;FAO=56;FDP=120;FR=.;FRO=64;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=34;FSRR=30;FWDB=0.00729385;FXX=0.00826378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.4185;QD=7.58759;RBI=0.0288425;REFB=-0.0250093;REVB=0.027905;RO=60;SAF=23;SAR=33;SRF=34;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145924;STB=0.564842;TYPE=snp;VARB=0.024164;OID=.;OPOS=51432895;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:60:64:56:56:33:23:34:26:33:23:34:30 chr3 51728573 . G A 154.84 PASS AO=33;DP=63;FAO=33;FDP=63;FR=.;FRO=30;FSAF=28;FSAR=5;FSRF=24;FSRR=6;FWDB=-0.043286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.462;QD=9.83128;RBI=0.0547087;REFB=-0.0137662;REVB=-0.0334568;RO=30;SAF=28;SAR=5;SRF=24;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0756398;STB=0.542226;TYPE=snp;VARB=0.0142546;OID=.;OPOS=51728573;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:30:30:33:33:5:28:24:6:5:28:24:6 chr3 51747063 . AC A 30.86 PASS AO=9;DP=35;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0919762;FXX=0.0344709;HRUN=4;LEN=1;MLLD=10.0723;QD=4.40912;RBI=0.315811;REFB=-0.0593595;REVB=0.302121;RO=14;SAF=7;SAR=2;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0.336735;SSSB=0.377757;STB=0.56513;TYPE=del;VARB=0.137556;OID=.;OPOS=51747064;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:9:28:15:28:13:9:6:6:7:27:14:7:2:6:8 chr3 51895693 . G A 225.5 PASS AO=82;DP=237;FAO=83;FDP=238;FR=.;FRO=155;FSAF=57;FSAR=26;FSRF=100;FSRR=55;FWDB=-0.00181729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.9406;QD=3.78988;RBI=0.0261607;REFB=-0.00806533;REVB=-0.0260975;RO=155;SAF=56;SAR=26;SRF=100;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0488392;STB=0.530743;TYPE=snp;VARB=0.0180611;OID=.;OPOS=51895693;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:237:238:155:155:82:83:26:56:100:55:26:57:100:55 chr3 51911083 . A AT 23.05 PASS AO=8;DP=30;FAO=12;FDP=21;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.213973;FXX=0.0454339;HRUN=6;LEN=1;MLLD=7.18399;QD=4.39016;RBI=0.231556;REFB=-0.163474;REVB=0.0885076;RO=21;SAF=4;SAR=4;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0273308;STB=0.559899;TYPE=ins;VARB=0.189261;OID=.;OPOS=51911084;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:8:30:12:21:9:7:5:4:5:17:21:4:4:10:11 chr3 51978220 . A G 267.05 PASS AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.601;QD=38.1502;RBI=0.0226722;REFB=0;REVB=-0.0150493;RO=0;SAF=15;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.96852e-06;OID=.;OPOS=51978220;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:28:28:0:0:28:28:13:15:0:0:13:15:0:0 chr3 52237970 . C T 1505.22 PASS AO=155;DP=155;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0386423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.41;QD=38.3496;RBI=0.0682012;REFB=0;REVB=0.0561976;RO=0;SAF=60;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000134416;OID=.;OPOS=52237970;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:155:157:0:0:155:157:95:60:0:0:97:60:0:0 chr3 52256697 . C T 539.47 PASS AO=57;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00974249;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.171;QD=36.5742;RBI=0.0602513;REFB=-0.115418;REVB=0.0594584;RO=1;SAF=35;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0132859;STB=0.50704;TYPE=snp;VARB=0.00175959;OID=.;OPOS=52256697;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:59:59:1:1:57:58:22:35:1:0:23:35:1:0 chr3 52263967 . G A 101.39 PASS AO=21;DP=41;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=0.00760038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.143;QD=9.89176;RBI=0.00983088;REFB=-0.0101002;REVB=0.00623542;RO=20;SAF=12;SAR=9;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0703917;STB=0.539531;TYPE=snp;VARB=0.00875575;OID=.;OPOS=52263967;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:41:41:20:20:21:21:9:12:13:7:9:12:13:7 chr3 52264907 . T C 236.32 PASS AO=58;DP=124;FAO=58;FDP=123;FR=.;FRO=65;FSAF=35;FSAR=23;FSRF=40;FSRR=25;FWDB=-0.00539356;FXX=0.00806387;HRUN=4;LEN=1;MLLD=229.012;QD=7.68535;RBI=0.0103883;REFB=-0.0140052;REVB=-0.00887838;RO=65;SAF=35;SAR=23;SRF=40;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119049;STB=0.506606;TYPE=snp;VARB=0.015415;OID=.;OPOS=52264907;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:123:65:65:58:58:23:35:40:25:23:35:40:25 chr3 52290474 . C G 159.17 PASS AO=60;DP=157;FAO=56;FDP=154;FR=.;FRO=98;FSAF=33;FSAR=23;FSRF=78;FSRR=20;FWDB=0.00652081;FXX=0.0253149;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.07;QD=4.13424;RBI=0.0428827;REFB=-0.0170132;REVB=-0.042384;RO=97;SAF=37;SAR=23;SRF=78;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232704;STB=0.642705;TYPE=snp;VARB=0.020987;OID=.;OPOS=52290474;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:154:97:98:60:56:23:37:78:19:23:33:78:20 chr3 52290550 . A G 294.82 PASS AO=76;DP=168;FAO=77;FDP=168;FR=.;FRO=91;FSAF=55;FSAR=22;FSRF=60;FSRR=31;FWDB=-0.0122844;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.5737;QD=7.01959;RBI=0.0124206;REFB=-0.00337622;REVB=-0.00183445;RO=92;SAF=55;SAR=21;SRF=60;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0841267;STB=0.535344;TYPE=snp;VARB=0.00244807;OID=.;OPOS=52290550;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:92:91:76:77:21:55:60:32:22:55:60:31 chr3 52293859 . A G 145.07 PASS AO=45;DP=121;FAO=46;FDP=122;FR=.;FRO=76;FSAF=16;FSAR=30;FSRF=35;FSRR=41;FWDB=0.000285224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.274;QD=4.75634;RBI=0.0106991;REFB=-0.0272223;REVB=0.0106953;RO=76;SAF=16;SAR=29;SRF=35;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120811;STB=0.573861;TYPE=snp;VARB=0.0379089;OID=.;OPOS=52293859;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:122:76:76:45:46:29:16:35:41:30:16:35:41 chr3 52325039 . G A 178.37 PASS AO=42;DP=87;FAO=42;FDP=87;FR=.;FRO=45;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=0.0164474;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.08;QD=8.20069;RBI=0.0362943;REFB=-0.00645016;REVB=0.0323537;RO=44;SAF=16;SAR=26;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112466;STB=0.56899;TYPE=snp;VARB=0.00510525;OID=.;OPOS=52325039;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:44:45:42:42:26:16:22:22:26:16:23:22 chr3 52325759 . A G 1444.01 PASS AO=149;DP=149;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00421126;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.367;QD=38.5069;RBI=0.0227744;REFB=0;REVB=-0.0223817;RO=0;SAF=76;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.00769e-05;OID=.;OPOS=52325759;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:149:150:0:0:149:150:73:76:0:0:74:76:0:0 chr3 52391735 . A C 31.6 PASS AO=7;DP=17;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0105691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.409;QD=7.43475;RBI=0.0455911;REFB=-0.0122898;REVB=-0.044349;RO=9;SAF=2;SAR=5;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163877;STB=0.635955;TYPE=snp;VARB=0.0350689;OID=.;OPOS=52391735;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:17:17:9:10:7:7:5:2:4:5:5:2:5:5 chr3 52392021 . TG T 23.2 PASS AO=5;DP=24;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.0565983;FXX=0.0384468;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.1746;QD=3.71201;RBI=0.279486;REFB=-0.0568582;REVB=0.273695;RO=17;SAF=0;SAR=5;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0.234848;SSSB=-0.69019;STB=0.678877;TYPE=del;VARB=0.126418;OID=.;OPOS=52392022;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:5:24:11:25:14:2:9:6:8:23:17:0:5:8:9 chr3 52407041 . C T 150.68 PASS AO=36;DP=76;FAO=36;FDP=76;FR=.;FRO=40;FSAF=10;FSAR=26;FSRF=8;FSRR=32;FWDB=0.018249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.747;QD=7.93046;RBI=0.0266416;REFB=-0.0274173;REVB=-0.01941;RO=40;SAF=10;SAR=26;SRF=8;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0961303;STB=0.553407;TYPE=snp;VARB=0.0418638;OID=.;OPOS=52407041;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:40:40:36:36:26:10:8:32:26:10:8:32 chr3 52409421 . A G 225.91 PASS AO=55;DP=117;FAO=55;FDP=116;FR=.;FRO=61;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=32;FSRR=29;FWDB=0.0026326;FXX=0.00854628;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.396;QD=7.79007;RBI=0.00271185;REFB=0.00791266;REVB=0.0006508;RO=60;SAF=29;SAR=26;SRF=32;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00571746;STB=0.501414;TYPE=snp;VARB=-0.00789519;OID=.;OPOS=52409421;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:116:60:61:55:55:26:29:32:28:26:29:32:29 chr3 52428988 . C A 99.52 PASS AO=27;DP=66;FAO=27;FDP=66;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=0.00743785;FXX=0.0149231;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.173;QD=6.03159;RBI=0.0355348;REFB=-0.00349266;REVB=0.0347476;RO=39;SAF=14;SAR=13;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111929;STB=0.563712;TYPE=snp;VARB=0.00724954;OID=.;OPOS=52428988;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:39:39:27:27:13:14:16:23:13:14:16:23 chr3 52430698 . A G 231.77 PASS AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0297717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.793;QD=37.0833;RBI=0.029773;REFB=0;REVB=-0.000278661;RO=0;SAF=5;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000142816;OID=.;OPOS=52430698;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:25:25:0:0:25:25:20:5:0:0:20:5:0:0 chr3 52453893 . C T 1866.34 PASS AO=158;DP=194;FAO=194;FDP=194;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=93;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.029;QD=38.4812;RBI=0.0601754;REFB=0;REVB=0.0589078;RO=0;SAF=91;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.9218e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000128762;OID=.;OPOS=52453893;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:192:194:0:0:158:194:67:91:0:0:101:93:0:0 chr3 52454262 . T G 420.35 PASS AO=103;DP=214;FAO=103;FDP=214;FR=.;FRO=111;FSAF=44;FSAR=59;FSRF=58;FSRR=53;FWDB=0.0184861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.173;QD=7.85701;RBI=0.0232159;REFB=-0.00379107;REVB=-0.0140444;RO=111;SAF=44;SAR=59;SRF=58;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0902913;STB=0.54978;TYPE=snp;VARB=0.00464001;OID=.;OPOS=52454262;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:214:111:111:103:103:59:44:58:53:59:44:58:53 chr3 52477080 . T C 56.5 PASS AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=4;FWDB=0.00875655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.886;QD=5.94758;RBI=0.0228289;REFB=-0.0291401;REVB=0.0210827;RO=23;SAF=8;SAR=7;SRF=19;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.319287;STB=0.682104;TYPE=snp;VARB=0.0246935;OID=.;OPOS=52477080;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:38:38:23:23:15:15:7:8:19:4:7:8:19:4 chr3 52492707 . T C 1035.12 PASS AO=113;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0238658;FXX=0.0173898;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.147;QD=36.6413;RBI=0.0285724;REFB=0;REVB=0.0157101;RO=0;SAF=50;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33068e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00829157;OID=.;OPOS=52492707;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:113:113:0:0:113:113:63:50:0:0:62:51:0:0 chr3 52510592 . G A 522.19 PASS AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0422583;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.503;QD=37.9777;RBI=0.0478275;REFB=0;REVB=0.0223988;RO=0;SAF=1;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.9503e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000430687;OID=.;OPOS=52510592;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:56:55:0:0:55:55:54:1:0:0:54:1:0:0 chr3 52519854 . G C 211.07 PASS AO=59;DP=140;FAO=59;FDP=140;FR=.;FRO=81;FSAF=24;FSAR=35;FSRF=45;FSRR=36;FWDB=0.00915935;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.799;QD=6.03043;RBI=0.0125796;REFB=-0.0133123;REVB=-0.00862276;RO=81;SAF=24;SAR=35;SRF=45;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153847;STB=0.586278;TYPE=snp;VARB=0.0199458;OID=.;OPOS=52519854;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:81:81:59:59:35:24:45:36:35:24:45:36 chr3 52523405 . C T 74 PASS AO=13;DP=22;FAO=13;FDP=22;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=0.0855303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.8309;QD=13.4554;RBI=0.0871603;REFB=0.00883676;REVB=0.0167778;RO=9;SAF=2;SAR=11;SRF=1;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0623922;STB=0.53516;TYPE=snp;VARB=-0.00530297;OID=.;OPOS=52523405;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:22:22:9:9:13:13:11:2:1:8:11:2:1:8 chr3 52538480 . AG A 486.93 PASS AO=53;DP=86;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.298972;FXX=0.0119033;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.2717;QD=23.4663;RBI=0.376812;REFB=0;REVB=0.229353;RO=15;SAF=34;SAR=19;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0.551402;SSSB=0.0184339;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0127998;OID=.;OPOS=52538481;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:53:81:83:83:0:52:31:0:0:44:15:34:19:9:6 chr3 52544470 . A G 480.46 PASS AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0259616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.116;QD=37.6833;RBI=0.0344841;REFB=0;REVB=-0.0226968;RO=0;SAF=16;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.5765e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.5537e-05;OID=.;OPOS=52544470;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:51:51:0:0:51:51:35:16:0:0:35:16:0:0 chr3 52551010 . C T 199.43 PASS AO=27;DP=62;FAO=30;FDP=59;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=18;FWDB=-0.0615585;FXX=0.0327815;HRUN=4;LEN=1;MLLD=41.9361;QD=13.5209;RBI=0.0643761;REFB=-0.0400168;REVB=0.0188369;RO=19;SAF=13;SAR=14;SRF=2;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.287482;STB=0.670054;TYPE=snp;VARB=-0.00986815;OID=.;OPOS=52551010;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:58:59:19:20:27:30:14:13:2:17:14:16:2:18 chr3 52554304 . G C 391.37 PASS AO=45;DP=48;FAO=45;FDP=48;FR=.;FRO=3;FSAF=10;FSAR=35;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.00541791;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.5626;QD=32.6145;RBI=0.061002;REFB=0.00406945;REVB=-0.060761;RO=3;SAF=10;SAR=35;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0719764;STB=0.538444;TYPE=snp;VARB=-0.00262673;OID=.;OPOS=52554304;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:48:48:3:3:45:45:35:10:2:1:35:10:2:1 chr3 52555957 . T C 269.74 PASS AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00241034;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.1613;QD=38.5346;RBI=0.0994385;REFB=0;REVB=-0.0994093;RO=0;SAF=19;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.62669e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00269664;OID=.;OPOS=52555957;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:29:28:0:0:28:28:9:19:0:0:9:19:0:0 chr3 52556369 . C T 55.22 PASS AO=9;DP=14;FAO=9;FDP=14;FR=.;FRO=5;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0861206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.214;QD=15.7759;RBI=0.0862824;REFB=-0.0305073;REVB=-0.0052816;RO=5;SAF=7;SAR=2;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275108;STB=0.659987;TYPE=snp;VARB=0.015413;OID=.;OPOS=52556369;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:14:14:5:5:9:9:2:7:2:3:2:7:2:3 chr3 52556890 . A G 21.03 PASS AO=9;DP=33;FAO=8;FDP=33;FR=.;FRO=25;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=25;FWDB=0.119959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.1605;QD=2.54951;RBI=0.163094;REFB=-0.0452685;REVB=-0.110496;RO=24;SAF=2;SAR=7;SRF=0;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.567507;STB=0.837491;TYPE=snp;VARB=0.133179;OID=.;OPOS=52556890;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:33:33:24:25:9:8:7:2:0:24:6:2:0:25 chr3 52557038 . C T 188.99 PASS AO=40;DP=75;FAO=40;FDP=75;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=11;FSRR=24;FWDB=0.0431803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.1264;QD=10.0794;RBI=0.0497969;REFB=-0.0201224;REVB=0.0248032;RO=33;SAF=16;SAR=24;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0577296;STB=0.542352;TYPE=snp;VARB=0.0127835;OID=.;OPOS=52557038;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:33:35:40:40:24:16:11:22:24:16:11:24 chr3 52558008 . T C 434.09 PASS AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00864933;FXX=0.062487;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.723;QD=38.5854;RBI=0.0130891;REFB=0;REVB=-0.00982411;RO=0;SAF=42;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00144417;OID=.;OPOS=52558008;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:45:45:0:0:45:45:3:42:0:0:3:42:0:0 chr3 52558133 . T C 438.92 PASS AO=80;DP=129;FAO=80;FDP=129;FR=.;FRO=49;FSAF=51;FSAR=29;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=-0.0103904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.412;QD=13.6098;RBI=0.0161093;REFB=-0.0213423;REVB=0.0123106;RO=49;SAF=51;SAR=29;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108258;STB=0.558719;TYPE=snp;VARB=0.0150082;OID=.;OPOS=52558133;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:49:49:80:80:29:51:24:25:29:51:24:25 chr3 52558904 . A T 91.25 PASS AO=13;DP=19;FAO=13;FDP=18;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.0233279;FXX=0.0526039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.602;QD=20.2783;RBI=0.0343894;REFB=-0.0193033;REVB=-0.0252674;RO=5;SAF=2;SAR=11;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.409551;STB=0.732918;TYPE=snp;VARB=0.00101955;OID=.;OPOS=52558904;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:19:18:5:5:13:13:11:2:4:1:11:2:4:1 chr3 52582152 . AG A 2008.93 PASS AO=263;DP=320;FAO=299;FDP=299;FR=.;FRO=0;FSAF=179;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0148956;FXX=0.0354827;HRUN=3;LEN=1;MLLD=17.3138;QD=26.8753;RBI=0.249254;REFB=0;REVB=0.248809;RO=26;SAF=172;SAR=91;SRF=0;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0.290445;SSSB=0.118558;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00234354;OID=.;OPOS=52582153;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:263:307:299:299:0:179:120:0:0:99:26:172:91:0:26 chr3 52582161 . GC G 2115.82 PASS AO=243;DP=345;FAO=327;FDP=327;FR=.;FRO=0;FSAF=178;FSAR=149;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.295843;FXX=0.0238799;HRUN=2;LEN=1;MLLD=16.1178;QD=25.8816;RBI=0.397168;REFB=-0.0116612;REVB=0.26499;RO=67;SAF=128;SAR=115;SRF=40;SRR=27;SSEN=0.6;SSEP=0;SSSB=-0.0287501;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00660424;OID=.;OPOS=52582162;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:243:334:327:327:0:178:149:0:0:99:67:128:115:40:27 chr3 52610651 . T A 217.67 PASS AO=61;DP=143;FAO=61;FDP=144;FR=.;FRO=83;FSAF=32;FSAR=29;FSRF=40;FSRR=43;FWDB=-0.0128063;FXX=0.0136977;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.3716;QD=6.04651;RBI=0.0166609;REFB=-0.0216249;REVB=0.0106576;RO=82;SAF=32;SAR=29;SRF=39;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0501425;STB=0.524582;TYPE=snp;VARB=0.0252616;OID=.;OPOS=52610651;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:144:82:83:61:61:29:32:39:43:29:32:40:43 chr3 52643307 . A G 265.83 PASS AO=73;DP=172;FAO=74;FDP=171;FR=.;FRO=97;FSAF=39;FSAR=35;FSRF=55;FSRR=42;FWDB=0.0055833;FXX=0.0338964;HRUN=5;LEN=1;MLLD=190.857;QD=6.21832;RBI=0.0169397;REFB=-0.000857315;REVB=-0.0159931;RO=96;SAF=38;SAR=35;SRF=55;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0535459;STB=0.522797;TYPE=snp;VARB=0.00111114;OID=.;OPOS=52643307;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:171:96:97:73:74:35:38:55:41:35:39:55:42 chr3 52643685 . T C 163.21 PASS AO=59;DP=169;FAO=59;FDP=170;FR=.;FRO=111;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=41;FSRR=70;FWDB=-0.0124261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.926;QD=3.84029;RBI=0.0155081;REFB=-0.0147396;REVB=-0.00927871;RO=110;SAF=30;SAR=29;SRF=41;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154592;STB=0.590545;TYPE=snp;VARB=0.0211846;OID=.;OPOS=52643685;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:170:110:111:59:59:29:30:41:69:29:30:41:70 chr3 52676065 . C T 49.68 PASS AO=23;DP=71;FAO=24;FDP=95;FR=.;FRO=71;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=27;FSRR=44;FWDB=0.0037013;FXX=0.144131;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.5098;QD=2.09186;RBI=0.0219816;REFB=0.00163545;REVB=-0.0216677;RO=41;SAF=16;SAR=7;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161552;STB=0.707317;TYPE=snp;VARB=-0.00788352;OID=.;OPOS=52676065;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:71:95:41:71:23:24:7:16:23:18:8:16:27:44 chr3 52720080 . A C 210.67 PASS AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00553144;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.598;QD=36.6388;RBI=0.0501304;REFB=0;REVB=0.0498243;RO=0;SAF=17;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.9951e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000337948;OID=.;OPOS=52720080;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:0:0:23:23:6:17:0:0:6:17:0:0 chr3 52721305 . G A 247.29 PASS AO=77;DP=195;FAO=77;FDP=197;FR=.;FRO=120;FSAF=44;FSAR=33;FSRF=50;FSRR=70;FWDB=0.00434791;FXX=0.034312;HRUN=4;LEN=1;MLLD=102.684;QD=5.02102;RBI=0.0246047;REFB=-0.00169131;REVB=-0.0242175;RO=116;SAF=44;SAR=33;SRF=49;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158578;STB=0.593636;TYPE=snp;VARB=0.0042364;OID=.;OPOS=52721305;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:197:116:120:77:77:33:44:49:67:33:44:50:70 chr3 52727257 . G A 688.04 PASS AO=153;DP=293;FAO=153;FDP=291;FR=.;FRO=138;FSAF=92;FSAR=61;FSRF=71;FSRR=67;FWDB=0.00528515;FXX=0.00682571;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.583;QD=9.45764;RBI=0.00988244;REFB=-0.0197241;REVB=0.00835044;RO=135;SAF=92;SAR=61;SRF=71;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0665059;STB=0.542192;TYPE=snp;VARB=0.0166136;OID=.;OPOS=52727257;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:293:291:135:138:153:153:61:92:71:64:61:92:71:67 chr3 52728804 . C T 437.95 PASS AO=105;DP=214;FAO=105;FDP=214;FR=.;FRO=109;FSAF=50;FSAR=55;FSRF=51;FSRR=58;FWDB=0.00806963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.062;QD=8.18606;RBI=0.0087848;REFB=-0.00279712;REVB=0.00347187;RO=107;SAF=50;SAR=55;SRF=50;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00819355;STB=0.504238;TYPE=snp;VARB=0.00289202;OID=.;OPOS=52728804;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:214:107:109:105:105:55:50:50:57:55:50:51:58 chr3 52740182 . C G 28.2 PASS AO=5;DP=13;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.00784133;FXX=0.0666222;HRUN=4;LEN=1;MLLD=69.5716;QD=8.05841;RBI=0.0300858;REFB=-0.0375484;REVB=0.029046;RO=8;SAF=4;SAR=1;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216791;STB=0.526227;TYPE=snp;VARB=0.0623243;OID=.;OPOS=52740182;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:13:14:8:8:5:6:1:4:5:3:2:4:5:3 chr3 52797634 . G C 126.31 PASS AO=31;DP=68;FAO=31;FDP=68;FR=.;FRO=37;FSAF=3;FSAR=28;FSRF=3;FSRR=34;FWDB=-0.0174806;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.275;QD=7.43004;RBI=0.0393424;REFB=-0.00247689;REVB=0.0352456;RO=37;SAF=3;SAR=28;SRF=3;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0453828;STB=0.525408;TYPE=snp;VARB=0.00283472;OID=.;OPOS=52797634;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:37:37:31:31:28:3:3:34:28:3:3:34 chr3 52800284 . T C 627.65 PASS AO=255;DP=547;FAO=174;FDP=397;FR=.;FRO=223;FSAF=72;FSAR=102;FSRF=92;FSRR=131;FWDB=-0.0319467;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.0445;QD=6.32392;RBI=0.0320656;REFB=-0.0080881;REVB=0.00275845;RO=283;SAF=119;SAR=136;SRF=121;SRR=162;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0377158;STB=0.500716;TYPE=snp;VARB=0.0105143;OID=.;OPOS=52800284;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:547:397:283:223:255:174:136:119:121:162:102:72:92:131 chr3 52802402 . A C 224.08 PASS AO=55;DP=116;FAO=55;FDP=117;FR=.;FRO=62;FSAF=16;FSAR=39;FSRF=31;FSRR=31;FWDB=-0.0396947;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.09;QD=7.66093;RBI=0.0420823;REFB=-0.025357;REVB=-0.013973;RO=59;SAF=16;SAR=39;SRF=28;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18861;STB=0.620679;TYPE=snp;VARB=0.0330647;OID=.;OPOS=52802402;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:117:59:62:55:55:39:16:28:31:39:16:31:31 chr3 52820981 . A T 110.94 PASS AO=24;DP=53;FAO=26;FDP=55;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.012586;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.0117;QD=8.06821;RBI=0.0561004;REFB=-0.0507197;REVB=-0.0546704;RO=29;SAF=12;SAR=12;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0499484;STB=0.507037;TYPE=snp;VARB=0.0515383;OID=.;OPOS=52820981;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:55:29:29:24:26:12:12:13:16:14:12:13:16 chr3 52821011 . A G 127.29 PASS AO=34;DP=79;FAO=34;FDP=79;FR=.;FRO=45;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=-0.0117364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.985;QD=6.4452;RBI=0.0281988;REFB=-0.0213182;REVB=-0.0256404;RO=43;SAF=17;SAR=17;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.034586;STB=0.506325;TYPE=snp;VARB=0.0277893;OID=.;OPOS=52821011;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:43:45:34:34:17:17:23:20:17:17:23:22 chr3 52821177 . A C 89.47 PASS AO=32;DP=95;FAO=32;FDP=95;FR=.;FRO=63;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=29;FSRR=34;FWDB=0.00169145;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.055;QD=3.76706;RBI=0.0020173;REFB=-0.000825471;REVB=0.00109932;RO=62;SAF=16;SAR=16;SRF=29;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.036729;STB=0.526299;TYPE=snp;VARB=0.00140356;OID=.;OPOS=52821177;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:95:95:62:63:32:32:16:16:29:33:16:16:29:34 chr3 52821992 . CT C 43.96 PASS AO=5;DP=33;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=0.0509039;FXX=0.0571265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.909;QD=5.32836;RBI=0.0574701;REFB=-0.00381291;REVB=-0.0266759;RO=18;SAF=0;SAR=5;SRF=3;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.613462;STB=0.599854;TYPE=del;VARB=0.00691481;OID=.;OPOS=52821993;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:5:30:13:33:20:6:7:6:14:43:18:0:5:3:15 chr3 52825585 . T C 69.66 PASS AO=23;DP=62;FAO=22;FDP=62;FR=.;FRO=40;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=33;FWDB=0.00490273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.807;QD=4.49391;RBI=0.00502359;REFB=-0.00303125;REVB=0.0010953;RO=39;SAF=15;SAR=8;SRF=6;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.5059;STB=0.77338;TYPE=snp;VARB=0.00351506;OID=.;OPOS=52825585;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:62:62:39:40:23:22:8:15:6:33:8:14:7:33 chr3 52833805 . C A 1239.08 PASS AO=129;DP=131;FAO=133;FDP=135;FR=.;FRO=2;FSAF=45;FSAR=88;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00675022;FXX=0.0145975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.394;QD=36.7136;RBI=0.0122533;REFB=-0.0977763;REVB=0.0102263;RO=1;SAF=45;SAR=84;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.010443;STB=0.510868;TYPE=snp;VARB=0.000582913;OID=.;OPOS=52833805;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:131:135:1:2:129:133:84:45:1:0:88:45:2:0 chr3 52848227 . AG A 134.7 PASS AO=33;DP=81;FAO=48;FDP=81;FR=.;FRO=33;FSAF=31;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=9;FWDB=-0.0177502;FXX=0.0121936;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.8893;QD=6.65161;RBI=0.190648;REFB=0.0401394;REVB=-0.18982;RO=31;SAF=24;SAR=9;SRF=24;SRR=7;SSEN=0.403698;SSEP=0;SSSB=-0.0530325;STB=0.537033;TYPE=del;VARB=-0.0439073;OID=.;OPOS=52848228;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:33:67:48:81:33:31:17:24:9:71:31:24:9:24:7 chr3 52852538 . G T 671.08 PASS AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.111221;FXX=0.013887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0397;QD=37.8073;RBI=0.124502;REFB=0;REVB=0.0559516;RO=0;SAF=37;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.12261e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00180372;OID=.;OPOS=52852538;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:72:71:0:0:71:71:34:37:0:0:34:37:0:0 chr3 52853747 . C G 433.87 PASS AO=50;DP=53;FAO=51;FDP=53;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0314062;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=223.866;QD=32.7449;RBI=0.0372386;REFB=-0.141854;REVB=0.0200092;RO=1;SAF=21;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218873;STB=0.521731;TYPE=snp;VARB=0.000829059;OID=.;OPOS=52853747;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:53:53:1:2:50:51:29:21:1:0:29:22:2:0 chr3 52857940 . C T 221.47 PASS AO=43;DP=74;FAO=43;FDP=74;FR=.;FRO=31;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=0.0167988;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.723;QD=11.9713;RBI=0.0314257;REFB=-0.0113314;REVB=-0.0265589;RO=31;SAF=26;SAR=17;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0444512;STB=0.524387;TYPE=snp;VARB=0.00526742;OID=.;OPOS=52857940;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:31:31:43:43:17:26:17:14:17:26:17:14 chr3 52860816 . C T 22.37 PASS AO=10;DP=42;FAO=10;FDP=42;FR=.;FRO=32;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=-0.00428221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.152;QD=2.13081;RBI=0.0124265;REFB=-0.0164778;REVB=0.0116654;RO=32;SAF=6;SAR=4;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00779214;STB=0.504941;TYPE=snp;VARB=0.058255;OID=.;OPOS=52860816;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:42:42:32:32:10:10:4:6:19:13:4:6:19:13 chr3 52860936 . C T 65.52 PASS AO=16;DP=37;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=19;FWDB=0.0313292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.226;QD=7.08347;RBI=0.0360328;REFB=-0.000361619;REVB=-0.0178;RO=21;SAF=10;SAR=6;SRF=2;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.491648;STB=0.776119;TYPE=snp;VARB=0.00123123;OID=.;OPOS=52860936;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:37:37:21:21:16:16:6:10:2:19:6:10:2:19 chr3 52860971 . TG T 20.68 PASS AO=6;DP=37;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=0.212506;FXX=0.13885;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.975;QD=2.66872;RBI=0.257406;REFB=-0.0742147;REVB=-0.145256;RO=13;SAF=1;SAR=5;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.602659;STB=0.780064;TYPE=del;VARB=0.0688872;OID=.;OPOS=52860972;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:6:27:13:31:18:3:10:13:5:20:13:1:5:10:3 chr3 52861160 . TG T 152.01 PASS AO=17;DP=21;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.208256;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.1212;QD=26.4361;RBI=0.363291;REFB=0;REVB=0.297674;RO=3;SAF=6;SAR=11;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0.336364;SSSB=0.109755;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0442751;OID=.;OPOS=52861161;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:17:21:23:23:0:8:15:0:0:14:3:6:11:0:3 chr3 52861211 . A T 113.41 PASS AO=16;DP=22;FAO=17;FDP=23;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=-0.00634844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.4808;QD=19.7235;RBI=0.0167282;REFB=0.0195016;REVB=-0.0154767;RO=6;SAF=2;SAR=14;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0448741;STB=0.50442;TYPE=snp;VARB=-0.00833865;OID=.;OPOS=52861211;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:22:23:6:6:16:17:14:2:1:5:14:3:1:5 chr3 52864584 . A G 481.19 PASS AO=48;DP=48;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00764333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.299;QD=37.7405;RBI=0.0184492;REFB=0;REVB=0.0167914;RO=0;SAF=13;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.61818e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.1531e-05;OID=.;OPOS=52864584;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:48:51:0:0:48:51:35:13:0:0:38:13:0:0 chr3 52864635 . A G 63.25 PASS AO=15;DP=35;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=16;FWDB=-0.0338536;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.1243;QD=7.44115;RBI=0.0340645;REFB=-0.0190671;REVB=-0.00378533;RO=19;SAF=3;SAR=12;SRF=3;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0670293;STB=0.538413;TYPE=snp;VARB=0.0188878;OID=.;OPOS=52864635;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:35:34:19:19:15:15:12:3:3:16:12:3:3:16 chr3 52867715 . G C 1000.76 PASS AO=104;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00392572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.383;QD=38.1241;RBI=0.0371101;REFB=0;REVB=0.0369019;RO=0;SAF=49;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.90438e-05;OID=.;OPOS=52867715;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:105:105:0:0:104:105:55:49:0:0:55:50:0:0 chr3 52870618 . T A 261.1 PASS AO=76;DP=182;FAO=75;FDP=180;FR=.;FRO=105;FSAF=40;FSAR=35;FSRF=62;FSRR=43;FWDB=-0.007476;FXX=0.0109884;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.045;QD=5.80232;RBI=0.010394;REFB=-0.0142333;REVB=0.00722113;RO=106;SAF=41;SAR=35;SRF=63;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0577899;STB=0.533623;TYPE=snp;VARB=0.0195068;OID=.;OPOS=52870618;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:180:106:105:76:75:35:41:63:43:35:40:62:43 chr3 52873984 . C T 684.96 PASS AO=143;DP=256;FAO=142;FDP=254;FR=.;FRO=112;FSAF=43;FSAR=99;FSRF=34;FSRR=78;FWDB=-0.00114452;FXX=0.0116727;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.011;QD=10.7869;RBI=0.00741711;REFB=-0.0422464;REVB=-0.00732828;RO=111;SAF=44;SAR=99;SRF=34;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00130928;STB=0.500394;TYPE=snp;VARB=0.0395348;OID=.;OPOS=52873984;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:256:254:111:112:143:142:99:44:34:77:99:43:34:78 chr3 52874288 . T C 119.02 PASS AO=17;DP=22;FAO=17;FDP=22;FR=.;FRO=5;FSAF=15;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.0358667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.804;QD=21.639;RBI=0.0457427;REFB=0.0217688;REVB=-0.0283897;RO=5;SAF=15;SAR=2;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0759728;STB=0.542116;TYPE=snp;VARB=-0.00561141;OID=.;OPOS=52874288;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:22:22:5:5:17:17:2:15:4:1:2:15:4:1 chr3 52874296 . G A 94.88 PASS AO=15;DP=22;FAO=15;FDP=22;FR=.;FRO=7;FSAF=13;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.0645915;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=38.7606;QD=17.2518;RBI=0.148131;REFB=-0.0751603;REVB=0.133307;RO=6;SAF=13;SAR=2;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18536;STB=0.590773;TYPE=snp;VARB=0.0437852;OID=.;OPOS=52874296;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:22:22:6:7:15:15:2:13:4:2:2:13:5:2 chr3 53125922 . T C 820.13 PASS AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3249;QD=38.1458;RBI=0.0490264;REFB=0;REVB=-0.0454136;RO=0;SAF=56;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.10353e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000217884;OID=.;OPOS=53125922;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:86:86:0:0:86:86:30:56:0:0:30:56:0:0 chr3 53215799 . G A 1028.65 PASS AO=104;DP=105;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0590316;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2536;QD=38.4541;RBI=0.0638627;REFB=0;REVB=0.0243662;RO=0;SAF=42;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000369706;OID=.;OPOS=53215799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:105:107:0:0:104:107:62:42:0:0:63:44:0:0 chr3 53220215 . G A 78.13 PASS AO=23;DP=64;FAO=24;FDP=65;FR=.;FRO=41;FSAF=21;FSAR=3;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=0.00662443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.956;QD=4.80822;RBI=0.0183539;REFB=-0.015959;REVB=-0.0171168;RO=41;SAF=21;SAR=2;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.594594;STB=0.803534;TYPE=snp;VARB=0.0219398;OID=.;OPOS=53220215;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:64:65:41:41:23:24:2:21:20:21:3:21:20:21 chr3 53222761 . C T 208.16 PASS AO=48;DP=97;FAO=48;FDP=97;FR=.;FRO=49;FSAF=14;FSAR=34;FSRF=27;FSRR=22;FWDB=-0.0212393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.809;QD=8.58411;RBI=0.0227631;REFB=-0.0142898;REVB=0.00818844;RO=46;SAF=14;SAR=34;SRF=24;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220279;STB=0.639976;TYPE=snp;VARB=0.0237057;OID=.;OPOS=53222761;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:46:49:48:48:34:14:24:22:34:14:27:22 chr3 53223927 . C G 879.08 PASS AO=101;DP=105;FAO=102;FDP=106;FR=.;FRO=4;FSAF=22;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0115427;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.1396;QD=33.1726;RBI=0.0380786;REFB=-0.05416;REVB=-0.036287;RO=4;SAF=22;SAR=79;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0234151;STB=0.512193;TYPE=snp;VARB=0.00348136;OID=.;OPOS=53223927;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:105:106:4:4:101:102:79:22:0:4:80:22:0:4 chr3 53224002 . T C 965.8 PASS AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0226126;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.1016;QD=38.6318;RBI=0.0320664;REFB=0;REVB=0.022736;RO=0;SAF=13;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.46445e-08;OID=.;OPOS=53224002;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:100:100:0:0:100:100:87:13:0:0:87:13:0:0 chr3 53226554 . CAT C 85.2 PASS AO=15;DP=60;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.0477781;FXX=0.0930016;HRUN=1;LEN=2;MLLD=166.936;QD=8.73884;RBI=0.0489708;REFB=-0.0433456;REVB=-0.0107422;RO=16;SAF=1;SAR=14;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.507771;STB=0.651997;TYPE=del;VARB=0.03609;OID=.;OPOS=53226555;OREF=AT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:15:40:19:39:20:4:15:9:11:84:16:1:14:6:10 chr3 53259850 . C T 500.95 PASS AO=55;DP=59;FAO=55;FDP=57;FR=.;FRO=2;FSAF=9;FSAR=46;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0321123;FXX=0.0338926;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9918;QD=35.1543;RBI=0.0382054;REFB=-0.0161767;REVB=-0.0206989;RO=2;SAF=9;SAR=46;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0938565;STB=0.549981;TYPE=snp;VARB=0.000770375;OID=.;OPOS=53259850;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:59:57:2:2:55:55:46:9:2:0:46:9:2:0 chr3 53264485 . A G 663.6 PASS AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00402065;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.596;QD=37.9201;RBI=0.0710189;REFB=0;REVB=-0.070905;RO=0;SAF=33;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00036134;OID=.;OPOS=53264485;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:70:70:0:0:70:70:37:33:0:0:36:34:0:0 chr3 53269046 . T C 973.42 PASS AO=94;DP=97;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0234958;FXX=0.0185168;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.353;QD=36.7328;RBI=0.033198;REFB=0;REVB=0.0234532;RO=0;SAF=53;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000516956;OID=.;OPOS=53269046;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:97:106:0:0:94:106:41:53:0:0:47:59:0:0 chr3 53269163 . G A 447.31 PASS AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.024531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.576;QD=38.0688;RBI=0.0248118;REFB=0;REVB=-0.00372216;RO=0;SAF=5;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.66972e-05;OID=.;OPOS=53269163;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:47:47:0:0:47:47:42:5:0:0:42:5:0:0 chr3 53277653 . G T 1044.21 PASS AO=114;DP=117;FAO=114;FDP=117;FR=.;FRO=3;FSAF=42;FSAR=72;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.00873367;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=188.624;QD=35.6995;RBI=0.00936823;REFB=0.0276864;REVB=0.00338921;RO=2;SAF=42;SAR=72;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0220708;STB=0.517238;TYPE=snp;VARB=-7.84467e-05;OID=.;OPOS=53277653;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:117:117:2:3:114:114:72:42:2:0:72:42:3:0 chr3 53321631 . A C 1633.53 PASS AO=178;DP=183;FAO=178;FDP=182;FR=.;FRO=4;FSAF=81;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.000486085;FXX=0.00546418;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.169;QD=35.9017;RBI=0.0257259;REFB=0.00889389;REVB=0.0257213;RO=4;SAF=81;SAR=97;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192225;STB=0.5101;TYPE=snp;VARB=-3.37933e-05;OID=.;OPOS=53321631;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:183:182:4:4:178:178:97:81:0:4:97:81:0:4 chr3 53324819 . ATGGCAC A 390.34 PASS AO=48;DP=64;FAO=51;FDP=60;FR=.;FRO=9;FSAF=13;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=0.0250635;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=6;MLLD=303.582;QD=26.0224;RBI=0.0279456;REFB=0.0219303;REVB=-0.0123605;RO=0;SAF=11;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.14038e-08;STB=0.552922;TYPE=del;VARB=-0.00526715;OID=.;OPOS=53324820;OREF=TGGCAC;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:48:53:51:60:9:13:38:0:9:8:0:11:37:0:0 chr3 53700550 . T C 2498.46 PASS AO=259;DP=263;FAO=265;FDP=265;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=160;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0250386;FXX=0.00749036;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.145;QD=37.7126;RBI=0.0437972;REFB=-0.0381202;REVB=0.0359341;RO=2;SAF=102;SAR=157;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00162386;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000184903;OID=.;OPOS=53700550;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:263:265:2:0:259:265:157:102:1:1:160:105:0:0 chr3 53766026 . T C 527.28 PASS AO=54;DP=54;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0463749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.2825;QD=37.0023;RBI=0.0541037;REFB=0;REVB=0.0278671;RO=0;SAF=29;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00177793;OID=.;OPOS=53766026;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:54:57:0:0:54:57:25:29:0:0:25:32:0:0 chr3 53769479 . C T 49.67 PASS AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.0602531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.0048;QD=9.46006;RBI=0.0718259;REFB=-0.0593071;REVB=-0.0390964;RO=11;SAF=7;SAR=3;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0654152;STB=0.538383;TYPE=snp;VARB=0.0778184;OID=.;OPOS=53769479;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:21:21:11:11:10:10:3:7:7:4:3:7:7:4 chr3 53856653 . C T 88.59 PASS AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=15;FWDB=0.0125608;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.658;QD=10.4225;RBI=0.0186238;REFB=-0.0144586;REVB=0.0137504;RO=16;SAF=7;SAR=11;SRF=1;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.314899;STB=0.673916;TYPE=snp;VARB=0.0109125;OID=.;OPOS=53856653;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:34:34:16:16:18:18:11:7:1:15:11:7:1:15 chr3 53857676 . C T 186.5 PASS AO=27;DP=35;FAO=27;FDP=35;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0368889;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.0299;QD=21.3138;RBI=0.0606174;REFB=0.00424482;REVB=0.0481006;RO=8;SAF=8;SAR=19;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153733;STB=0.583859;TYPE=snp;VARB=0.000404246;OID=.;OPOS=53857676;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:35:35:8:8:27:27:19:8:5:3:19:8:5:3 chr3 53857803 . A C 20.91 PASS AO=7;DP=26;FAO=7;FDP=26;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.0107932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.32;QD=3.21658;RBI=0.0168079;REFB=-0.00855257;REVB=0.0128845;RO=16;SAF=3;SAR=4;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21358;STB=0.545327;TYPE=snp;VARB=0.0293436;OID=.;OPOS=53857803;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:26:26:16:19:7:7:4:3:4:12:4:3:7:12 chr3 53882663 . G A 885.64 PASS AO=93;DP=95;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0356369;FXX=0.0210504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.252;QD=38.092;RBI=0.0357513;REFB=0;REVB=-0.00285727;RO=0;SAF=70;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.24466e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000102898;OID=.;OPOS=53882663;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:95:93:0:0:93:93:23:70:0:0:23:70:0:0 chr3 53882673 . G GT 369.45 PASS AO=58;DP=100;FAO=94;FDP=96;FR=.;FRO=2;FSAF=72;FSAR=22;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.218805;FXX=0.0103082;HRUN=6;LEN=1;MLLD=9.41799;QD=15.3937;RBI=0.221251;REFB=-0.0631238;REVB=0.0328079;RO=36;SAF=43;SAR=15;SRF=28;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0340712;STB=0.506848;TYPE=ins;VARB=0.0276513;OID=.;OPOS=53882674;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:58:100:94:96:2:72:22:2:0:19:36:43:15:28:8 chr3 53883722 . C G 2412.22 PASS AO=271;DP=284;FAO=278;FDP=285;FR=.;FRO=7;FSAF=130;FSAR=148;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=0.0266211;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=35.9963;QD=33.8558;RBI=0.0842314;REFB=0.0270576;REVB=-0.0799139;RO=4;SAF=124;SAR=147;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00816128;STB=0.509595;TYPE=snp;VARB=0.000266286;OID=.;OPOS=53883722;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:284:285:4:7:271:278:147:124:3:1:148:130:6:1 chr3 53886912 . C T 220.31 PASS AO=71;DP=187;FAO=71;FDP=186;FR=.;FRO=115;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=70;FSRR=45;FWDB=0.00828899;FXX=0.00534731;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.68;QD=4.73785;RBI=0.00952084;REFB=-0.018233;REVB=-0.0046839;RO=112;SAF=36;SAR=35;SRF=68;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108976;STB=0.562957;TYPE=snp;VARB=0.0143575;OID=.;OPOS=53886912;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:186:112:115:71:71:35:36:68:44:35:36:70:45 chr3 53905308 . T C 487.17 PASS AO=116;DP=222;FAO=112;FDP=220;FR=.;FRO=108;FSAF=36;FSAR=76;FSRF=40;FSRR=68;FWDB=-0.0904614;FXX=0.0090086;HRUN=4;LEN=1;MLLD=39.5641;QD=8.85763;RBI=0.0972346;REFB=-0.0232954;REVB=-0.0356553;RO=103;SAF=39;SAR=77;SRF=36;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0127673;STB=0.527002;TYPE=snp;VARB=0.0194313;OID=.;OPOS=53905308;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:220:103:108:116:112:77:39:36:67:76:36:40:68 chr3 53906513 . G A 362.71 PASS AO=93;DP=208;FAO=95;FDP=210;FR=.;FRO=115;FSAF=35;FSAR=60;FSRF=48;FSRR=67;FWDB=-0.0113297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.242;QD=6.9088;RBI=0.0150705;REFB=-0.013244;REVB=0.00993761;RO=115;SAF=34;SAR=59;SRF=48;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0546207;STB=0.528376;TYPE=snp;VARB=0.0236739;OID=.;OPOS=53906513;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:210:115:115:93:95:59:34:48:67:60:35:48:67 chr3 54354510 . T C 512.47 PASS AO=104;DP=183;FAO=104;FDP=183;FR=.;FRO=79;FSAF=49;FSAR=55;FSRF=48;FSRR=31;FWDB=0.00818785;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.764;QD=11.2015;RBI=0.00869358;REFB=0.000175063;REVB=0.0029219;RO=76;SAF=49;SAR=55;SRF=45;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0937954;STB=0.558686;TYPE=snp;VARB=-5.71687e-05;OID=.;OPOS=54354510;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:183:76:79:104:104:55:49:45:31:55:49:48:31 chr3 54798258 . G A 1938.6 PASS AO=152;DP=198;FAO=201;FDP=201;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=96;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.135029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.425;QD=38.5792;RBI=0.135215;REFB=0;REVB=-0.00708589;RO=0;SAF=48;SAR=104;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.43421e-05;OID=.;OPOS=54798258;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:91:197:201:0:0:152:201:104:48:0:0:105:96:0:0 chr3 54961949 . C T 839.32 PASS AO=90;DP=91;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0950316;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.439;QD=36.8934;RBI=0.096135;REFB=-0.0445331;REVB=-0.0145233;RO=1;SAF=44;SAR=46;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106505;STB=0.505617;TYPE=snp;VARB=0.00350463;OID=.;OPOS=54961949;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:91:91:1:1:90:90:46:44:1:0:46:44:1:0 chr3 55501002 . G C 1419.99 PASS AO=150;DP=151;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0414287;FXX=0.00666622;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.638;QD=38.1205;RBI=0.0479559;REFB=0.0208219;REVB=0.0241543;RO=1;SAF=64;SAR=86;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00737395;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.90553e-05;OID=.;OPOS=55501002;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:151:149:1:0:150:149:86:64:1:0:85:64:0:0 chr3 56106226 . C T 1148.08 PASS AO=121;DP=122;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0788794;FXX=0.00799936;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.3154;QD=37.0347;RBI=0.0913645;REFB=0.0374356;REVB=-0.0461033;RO=1;SAF=66;SAR=55;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0085588;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000141265;OID=.;OPOS=56106226;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:122:124:1:0:121:124:55:66:0:1:55:69:0:0 chr3 56219210 . T C 1112.84 PASS AO=132;DP=149;FAO=132;FDP=144;FR=.;FRO=12;FSAF=58;FSAR=74;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.0379044;FXX=0.0335548;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.7647;QD=30.9122;RBI=0.037913;REFB=-0.0440927;REVB=-0.00080612;RO=12;SAF=58;SAR=74;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.017032;STB=0.508988;TYPE=snp;VARB=0.00263572;OID=.;OPOS=56219210;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:149:144:12:12:132:132:74:58:4:8:74:58:4:8 chr3 56591278 . T TGGGGTAAGCA 77.24 PASS AO=16;DP=54;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=18;FSAR=2;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.0031784;FXX=0.0925755;HRUN=4;LEN=10;MLLD=206.789;QD=6.30493;RBI=0.0459112;REFB=-0.0360369;REVB=-0.0458011;RO=26;SAF=14;SAR=2;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.462926;STB=0.813177;TYPE=ins;VARB=0.0378747;OID=.;OPOS=56591279;OREF=-;OALT=GGGGTAAGCA;OMAPALT=TGGGGTAAGCA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:16:54:20:49:29:18:2:15:14:77:26:14:2:14:12 chr3 56591298 . T A 20.46 PASS AO=13;DP=69;FAO=13;FDP=64;FR=.;FRO=51;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=35;FSRR=16;FWDB=-0.00663366;FXX=0.085702;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.521;QD=1.27894;RBI=0.0399537;REFB=-0.0153115;REVB=-0.0393991;RO=43;SAF=6;SAR=7;SRF=32;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.346691;STB=0.675051;TYPE=snp;VARB=0.0629076;OID=.;OPOS=56591298;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:69:64:43:51:13:13:7:6:32:11:7:6:35:16 chr3 56597954 . C T 708.52 PASS AO=74;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127804;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=286.596;QD=37.7878;RBI=0.0135346;REFB=0;REVB=0.00445496;RO=0;SAF=31;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.19951e-05;OID=.;OPOS=56597954;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:75:75:0:0:74:75:43:31:0:0:43:32:0:0 chr3 56599159 . T C 1325.79 PASS AO=137;DP=137;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00248894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.184;QD=38.4286;RBI=0.019824;REFB=0;REVB=0.0196671;RO=0;SAF=62;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.52807e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.4224e-05;OID=.;OPOS=56599159;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:137:138:0:0:137:138:75:62:0:0:76:62:0:0 chr3 56599208 . G C 1176.57 PASS AO=128;DP=128;FAO=126;FDP=128;FR=.;FRO=2;FSAF=41;FSAR=85;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0209715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.651;QD=36.7679;RBI=0.0433666;REFB=-0.0588353;REVB=0.0379586;RO=0;SAF=43;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75417e-08;STB=0.511903;TYPE=snp;VARB=0.000747975;OID=.;OPOS=56599208;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:128:128:0:2:128:126:85:43:0:0:85:41:2:0 chr3 56627048 . A G 3691.43 PASS AO=448;DP=456;FAO=395;FDP=395;FR=.;FRO=0;FSAF=182;FSAR=213;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101883;FXX=0.0124997;HRUN=3;LEN=1;MLLD=262.312;QD=37.3816;RBI=0.0191661;REFB=0.0181846;REVB=0.0162339;RO=6;SAF=205;SAR=243;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00739636;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.75028e-05;OID=.;OPOS=56627048;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:456:395:6:0:448:395:243:205:1:5:213:182:0:0 chr3 56627598 . A G 2171.88 PASS AO=220;DP=220;FAO=226;FDP=226;FR=.;FRO=0;FSAF=114;FSAR=112;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0907356;FXX=0.00877155;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.765;QD=38.4403;RBI=0.0907361;REFB=0;REVB=0.000284539;RO=0;SAF=109;SAR=111;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000147016;OID=.;OPOS=56627598;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:220:226:0:0:220:226:111:109:0:0:112:114:0:0 chr3 56628031 . G A 1532.92 PASS AO=159;DP=159;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=123;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00467642;FXX=0.00624961;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.035;QD=38.5639;RBI=0.0487733;REFB=0;REVB=-0.0485486;RO=0;SAF=37;SAR=122;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=9.35002e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000191809;OID=.;OPOS=56628031;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:159:159:0:0:159:159:122:37:0:0:123:36:0:0 chr3 56835761 . G A 177.72 PASS AO=36;DP=65;FAO=36;FDP=65;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=7;FWDB=0.0138126;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=208.715;QD=10.9368;RBI=0.0340919;REFB=-0.00869945;REVB=0.0311684;RO=29;SAF=15;SAR=21;SRF=22;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.27111;STB=0.649043;TYPE=snp;VARB=0.00803616;OID=.;OPOS=56835761;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:29:29:36:36:21:15:22:7:21:15:22:7 chr3 57131529 . A C 1721.17 PASS AO=197;DP=209;FAO=197;FDP=209;FR=.;FRO=12;FSAF=89;FSAR=108;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=-0.0021475;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.679;QD=32.9411;RBI=0.0129953;REFB=-0.0293987;REVB=0.0128166;RO=12;SAF=89;SAR=108;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0222773;STB=0.511719;TYPE=snp;VARB=0.000534109;OID=.;OPOS=57131529;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:209:209:12:12:197:197:108:89:3:9:108:89:3:9 chr3 57132200 . A G 936.7 PASS AO=104;DP=106;FAO=103;FDP=106;FR=.;FRO=3;FSAF=55;FSAR=48;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0317322;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.4093;QD=35.3471;RBI=0.0319312;REFB=0.0407871;REVB=-0.00355953;RO=1;SAF=56;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00839887;STB=0.503774;TYPE=snp;VARB=-0.00349649;OID=.;OPOS=57132200;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:106:106:1:3:104:103:48:56:1:0:48:55:2:1 chr3 57138419 . G A 1697.95 PASS AO=181;DP=184;FAO=181;FDP=181;FR=.;FRO=0;FSAF=99;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0351863;FXX=0.0163035;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.319;QD=37.5237;RBI=0.0443309;REFB=0.041839;REVB=0.0269658;RO=0;SAF=99;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.29747e-05;OID=.;OPOS=57138419;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:184:181:0:0:181:181:82:99:0:0:82:99:0:0 chr3 57139972 . A G 1600.53 PASS AO=166;DP=166;FAO=167;FDP=167;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.556;QD=38.3361;RBI=0.0303308;REFB=0;REVB=0.0256308;RO=0;SAF=91;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.03931e-05;OID=.;OPOS=57139972;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:166:167:0:0:166:167:75:91:0:0:76:91:0:0 chr3 57323170 . A G 382.51 PASS AO=42;DP=50;FAO=50;FDP=53;FR=.;FRO=3;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.120974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.878;QD=28.869;RBI=0.12253;REFB=-0.0110908;REVB=0.0194644;RO=8;SAF=23;SAR=19;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0996661;STB=0.506132;TYPE=snp;VARB=0.00280111;OID=.;OPOS=57323170;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:50:53:8:3:42:50:19:23:7:1:22:28:2:1 chr3 57335876 . C T 3636.26 PASS AO=410;DP=422;FAO=389;FDP=389;FR=.;FRO=0;FSAF=157;FSAR=232;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0252582;FXX=0.0274993;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.921;QD=37.3908;RBI=0.0291051;REFB=-0.0233314;REVB=0.0144614;RO=7;SAF=167;SAR=243;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101605;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000170852;OID=.;OPOS=57335876;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:422:389:7:0:410:389:243:167:5:2:232:157:0:0 chr3 57386148 . C G 1230.42 PASS AO=131;DP=132;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00763853;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.3255;QD=37.57;RBI=0.019594;REFB=-0.0365694;REVB=0.0180437;RO=0;SAF=68;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000397366;OID=.;OPOS=57386148;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:132:131:0:0:131:131:63:68:0:0:63:68:0:0 chr3 57388114 . C T 1104.24 PASS AO=120;DP=126;FAO=121;FDP=124;FR=.;FRO=3;FSAF=42;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0457028;FXX=0.0158718;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.172;QD=35.6206;RBI=0.0492122;REFB=-0.134523;REVB=-0.0182508;RO=3;SAF=41;SAR=79;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0176949;STB=0.509315;TYPE=snp;VARB=5.88803e-05;OID=.;OPOS=57388114;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:126:124:3:3:120:121:79:41:0:3:79:42:0:3 chr3 57414071 . G A 3805.38 PASS AO=508;DP=511;FAO=397;FDP=397;FR=.;FRO=0;FSAF=258;FSAR=139;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0249638;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1379;QD=38.3414;RBI=0.0596578;REFB=-0.00896469;REVB=0.0541836;RO=1;SAF=332;SAR=176;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00143606;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.11456e-05;OID=.;OPOS=57414071;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:511:397:1:0:508:397:176:332:1:0:139:258:0:0 chr3 57414434 . A G 1618.56 PASS AO=174;DP=183;FAO=175;FDP=178;FR=.;FRO=3;FSAF=71;FSAR=104;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.114577;FXX=0.0273209;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.839;QD=36.3722;RBI=0.114578;REFB=-0.0486172;REVB=0.000528775;RO=3;SAF=70;SAR=104;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00231402;STB=0.501265;TYPE=snp;VARB=0.000543762;OID=.;OPOS=57414434;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:183:178:3:3:174:175:104:70:1:2:104:71:1:2 chr3 57419497 . C T 1375.68 PASS AO=144;DP=145;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0509181;FXX=0.00680226;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0675;QD=37.6897;RBI=0.0546153;REFB=-0.0667899;REVB=-0.0197529;RO=1;SAF=52;SAR=92;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0090568;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000260062;OID=.;OPOS=57419497;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:145:146:1:0:144:146:92:52:1:0:92:54:0:0 chr3 57430988 . G A 2288.36 PASS AO=238;DP=238;FAO=238;FDP=238;FR=.;FRO=0;FSAF=108;FSAR=130;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.06;QD=38.4598;RBI=0.0329461;REFB=0;REVB=0.0270536;RO=0;SAF=108;SAR=130;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02026e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.76558e-05;OID=.;OPOS=57430988;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:238:238:0:0:238:238:130:108:0:0:130:108:0:0 chr3 57431985 . G A 1217.16 PASS AO=127;DP=127;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00565612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.122;QD=38.3357;RBI=0.0072681;REFB=0;REVB=-0.00456439;RO=0;SAF=56;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.67315e-06;OID=.;OPOS=57431985;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:127:127:0:0:127:127:71:56:0:0:71:56:0:0 chr3 57475351 . T G 1310.51 PASS AO=131;DP=131;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0181533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.271;QD=38.2631;RBI=0.0439162;REFB=0;REVB=0.0399886;RO=0;SAF=81;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.19503e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.95308e-05;OID=.;OPOS=57475351;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:131:137:0:0:131:137:50:81:0:0:56:81:0:0 chr3 57479493 . C T 794.52 PASS AO=78;DP=79;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0952928;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.9413;QD=37.834;RBI=0.0953294;REFB=0;REVB=-0.00264202;RO=0;SAF=34;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.47622e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000432086;OID=.;OPOS=57479493;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:79:84:0:0:78:84:44:34:0:0:48:36:0:0 chr3 57542173 . C T 217.99 PASS AO=29;DP=44;FAO=32;FDP=42;FR=.;FRO=10;FSAF=31;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=9;FWDB=0.0381747;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.833;QD=20.7606;RBI=0.045247;REFB=-0.00225818;REVB=-0.0242897;RO=0;SAF=28;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.55046e-08;STB=0.90607;TYPE=snp;VARB=0.000726343;OID=.;OPOS=57542173;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:29:42:0:10:29:32:1:28:0:0:1:31:1:9 chr3 57611237 . A G 849.44 PASS AO=91;DP=94;FAO=91;FDP=92;FR=.;FRO=1;FSAF=62;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0163829;FXX=0.0212743;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.206;QD=36.9323;RBI=0.0609552;REFB=-0.0698814;REVB=-0.0587123;RO=0;SAF=62;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508473;TYPE=snp;VARB=4.52523e-05;OID=.;OPOS=57611237;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:94:92:0:1:91:91:29:62:0:0:29:62:0:1 chr3 58112440 . A G 1042.23 PASS AO=108;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0548399;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.0236;QD=37.5577;RBI=0.104994;REFB=0;REVB=0.0895336;RO=2;SAF=58;SAR=50;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0160847;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00130914;OID=.;OPOS=58112440;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:111:111:2:0:108:111:50:58:2:0:50:61:0:0 chr3 58186727 . C T 454.6 PASS AO=98;DP=185;FAO=99;FDP=186;FR=.;FRO=87;FSAF=46;FSAR=53;FSRF=46;FSRR=41;FWDB=0.0232376;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.722;QD=9.7764;RBI=0.0839562;REFB=-0.0186476;REVB=0.0806763;RO=86;SAF=46;SAR=52;SRF=45;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0460697;STB=0.529994;TYPE=snp;VARB=0.0199442;OID=.;OPOS=58186727;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:186:86:87:98:99:52:46:45:41:53:46:46:41 chr3 58196583 . G A 883.22 PASS AO=96;DP=99;FAO=96;FDP=98;FR=.;FRO=2;FSAF=58;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00678801;FXX=0.0297;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6074;QD=36.0499;RBI=0.109428;REFB=-0.130184;REVB=0.109217;RO=0;SAF=58;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512818;TYPE=snp;VARB=0.00222575;OID=.;OPOS=58196583;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:99:98:0:2:96:96:38:58:0:0:38:58:0:2 chr3 58305033 . A C 1794.73 PASS AO=187;DP=187;FAO=187;FDP=187;FR=.;FRO=0;FSAF=109;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00999986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.448;QD=38.3899;RBI=0.0101343;REFB=0;REVB=-0.00164545;RO=0;SAF=109;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.97473e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.95929e-06;OID=.;OPOS=58305033;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:187:187:0:0:187:187:78:109:0:0:78:109:0:0 chr3 58305079 . T C 1819.77 PASS AO=192;DP=193;FAO=193;FDP=193;FR=.;FRO=0;FSAF=107;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00924153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.713;QD=37.7154;RBI=0.0624191;REFB=-0.0286418;REVB=0.0617312;RO=1;SAF=107;SAR=85;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00556958;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000141296;OID=.;OPOS=58305079;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:193:193:1:0:192:193:85:107:0:1:86:107:0:0 chr3 58305199 . G A 1529.16 PASS AO=161;DP=162;FAO=161;FDP=161;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115078;FXX=0.00617246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.991;QD=37.9916;RBI=0.0163385;REFB=0;REVB=0.0115982;RO=0;SAF=57;SAR=104;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000307444;OID=.;OPOS=58305199;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:162:161:0:0:161:161:104:57:0:0:104:57:0:0 chr3 58416538 . T C 884.73 PASS AO=82;DP=82;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.397;QD=37.6482;RBI=0.0214585;REFB=0;REVB=-0.0156198;RO=0;SAF=63;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.35046e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00021699;OID=.;OPOS=58416538;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:82:94:0:0:82:94:19:63:0:0:19:75:0:0 chr3 58512237 . A G 57.66 PASS AO=19;DP=54;FAO=19;FDP=54;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=0.0108521;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.478;QD=4.27081;RBI=0.050632;REFB=0.00168527;REVB=-0.0494553;RO=34;SAF=10;SAR=9;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0685479;STB=0.529381;TYPE=snp;VARB=-0.00356952;OID=.;OPOS=58512237;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:54:54:34:35:19:19:9:10:20:14:9:10:20:15 chr3 58512285 . T C 55.05 PASS AO=9;DP=38;FAO=14;FDP=34;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.0635257;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=116.567;QD=6.47685;RBI=0.0876692;REFB=-0.00570905;REVB=-0.0604183;RO=15;SAF=4;SAR=5;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119127;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00435291;OID=.;OPOS=58512285;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:30:34:15:20:9:14:5:4:5:10:7:7:10:10 chr3 58520306 . G C 235.88 PASS AO=76;DP=204;FAO=77;FDP=205;FR=.;FRO=128;FSAF=42;FSAR=35;FSRF=74;FSRR=54;FWDB=0.0200977;FXX=0.0284347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.7476;QD=4.60244;RBI=0.026243;REFB=-0.00332204;REVB=0.0168753;RO=125;SAF=42;SAR=34;SRF=71;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171301;STB=0.520641;TYPE=snp;VARB=0.00469712;OID=.;OPOS=58520306;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:205:125:128:76:77:34:42:71:54:35:42:74:54 chr3 59997112 . G A 412.38 PASS AO=92;DP=173;FAO=92;FDP=177;FR=.;FRO=85;FSAF=40;FSAR=52;FSRF=37;FSRR=48;FWDB=-0.0508002;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.887;QD=9.31939;RBI=0.0509173;REFB=-0.0132797;REVB=0.00345063;RO=81;SAF=40;SAR=52;SRF=33;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239193;STB=0.50025;TYPE=snp;VARB=0.0138328;OID=.;OPOS=59997112;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:177:81:85:92:92:52:40:33:48:52:40:37:48 chr3 60519224 . G A 193.58 PASS AO=49;DP=104;FAO=48;FDP=104;FR=.;FRO=56;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=30;FSRR=26;FWDB=-0.129071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.0824;QD=7.44528;RBI=0.129449;REFB=-0.0183816;REVB=-0.00988534;RO=54;SAF=22;SAR=27;SRF=30;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100395;STB=0.541649;TYPE=snp;VARB=0.0168526;OID=.;OPOS=60519224;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:54:56:49:48:27:22:30:24:26:22:30:26 chr3 62189189 . G A 135.26 PASS AO=29;DP=56;FAO=29;FDP=56;FR=.;FRO=27;FSAF=25;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=9;FWDB=-0.0125018;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.034;QD=9.66129;RBI=0.0183464;REFB=0.0048576;REVB=-0.0134275;RO=26;SAF=25;SAR=4;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.239736;STB=0.6538;TYPE=snp;VARB=-0.00557793;OID=.;OPOS=62189189;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:26:27:29:29:4:25:18:8:4:25:18:9 chr3 62189437 . G C 327.56 PASS AO=85;DP=187;FAO=86;FDP=191;FR=.;FRO=105;FSAF=38;FSAR=48;FSRF=59;FSRR=46;FWDB=-0.0747431;FXX=0.0205118;HRUN=3;LEN=1;MLLD=40.3018;QD=6.85996;RBI=0.0749659;REFB=-0.0166448;REVB=-0.00577459;RO=98;SAF=38;SAR=47;SRF=59;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149077;STB=0.565857;TYPE=snp;VARB=0.0290591;OID=.;OPOS=62189437;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:191:98:105:85:86:47:38:59:39:48:38:59:46 chr3 62229553 . C T 878.06 PASS AO=92;DP=93;FAO=94;FDP=95;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0612527;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.9989;QD=36.971;RBI=0.0784419;REFB=-0.0482087;REVB=0.0490025;RO=1;SAF=39;SAR=53;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00886129;STB=0.504586;TYPE=snp;VARB=0.00175783;OID=.;OPOS=62229553;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:93:95:1:1:92:94:53:39:0:1:54:40:0:1 chr3 62317005 . A G 178.75 PASS AO=41;DP=83;FAO=41;FDP=83;FR=.;FRO=42;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=-0.0109632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.55;QD=8.61458;RBI=0.0230591;REFB=0.0127851;REVB=0.0202862;RO=42;SAF=22;SAR=19;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101076;STB=0.505615;TYPE=snp;VARB=-0.0134384;OID=.;OPOS=62317005;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:42:42:41:41:19:22:23:19:19:22:23:19 chr3 62384314 . A G 783.38 PASS AO=60;DP=89;FAO=83;FDP=83;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=45;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0179269;FXX=0.0348797;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.985;QD=37.7533;RBI=0.0185054;REFB=0;REVB=0.00459067;RO=0;SAF=38;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.46126e-05;OID=.;OPOS=62384314;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:79:83:0:0:60:83:22:38:0:0:38:45:0:0 chr3 62384315 . T G 21.94 PASS AO=16;DP=86;FAO=17;FDP=87;FR=.;FRO=70;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=44;FSRR=26;FWDB=0.00297022;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=56.0362;QD=1.00863;RBI=0.0363906;REFB=-0.00668244;REVB=0.0362692;RO=70;SAF=3;SAR=13;SRF=44;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.531676;STB=0.845374;TYPE=snp;VARB=0.0549366;OID=.;OPOS=62384315;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:86:87:70:70:16:17:13:3:44:26:14:3:44:26 chr3 62431415 . T C 388.31 PASS AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0432338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.108;QD=38.8311;RBI=0.085248;REFB=0;REVB=-0.0734715;RO=0;SAF=19;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17587e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.72515e-05;OID=.;OPOS=62431415;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:40:40:0:0:40:40:21:19:0:0:21:19:0:0 chr3 62556622 . A G 891.64 PASS AO=100;DP=104;FAO=100;FDP=104;FR=.;FRO=4;FSAF=52;FSAR=48;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0193653;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=240.528;QD=34.2938;RBI=0.0197881;REFB=-0.0653202;REVB=-0.00406879;RO=4;SAF=52;SAR=48;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0350983;STB=0.518515;TYPE=snp;VARB=0.000224643;OID=.;OPOS=62556622;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:104:104:4:4:100:100:48:52:4:0:48:52:4:0 chr3 62578336 . C T 227.71 PASS AO=57;DP=129;FAO=59;FDP=130;FR=.;FRO=71;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=30;FSRR=41;FWDB=-0.0159777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.669;QD=7.0065;RBI=0.0200355;REFB=-0.0075743;REVB=-0.0120886;RO=71;SAF=29;SAR=28;SRF=30;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0856457;STB=0.546859;TYPE=snp;VARB=0.0113834;OID=.;OPOS=62578336;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:130:71:71:57:59:28:29:30:41:29:30:30:41 chr3 63645410 . A G 386.37 PASS AO=79;DP=142;FAO=79;FDP=141;FR=.;FRO=62;FSAF=31;FSAR=48;FSRF=28;FSRR=34;FWDB=0.0394852;FXX=0.00704176;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0829;QD=10.9609;RBI=0.0827201;REFB=-8.80194e-05;REVB=0.0726879;RO=63;SAF=31;SAR=48;SRF=28;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0438503;STB=0.526975;TYPE=snp;VARB=0.000966764;OID=.;OPOS=63645410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:141:63:62:79:79:48:31:28:35:48:31:28:34 chr3 63816862 . G A 124.1 PASS AO=34;DP=93;FAO=39;FDP=99;FR=.;FRO=60;FSAF=6;FSAR=33;FSRF=25;FSRR=35;FWDB=0.0352232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.7837;QD=5.0143;RBI=0.0497145;REFB=-0.0108392;REVB=0.0350836;RO=54;SAF=6;SAR=28;SRF=22;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.319363;STB=0.714757;TYPE=snp;VARB=0.015371;OID=.;OPOS=63816862;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:99:54:60:34:39:28:6:22:32:33:6:25:35 chr3 63975971 . AG A 523.37 PASS AO=88;DP=119;FAO=105;FDP=117;FR=.;FRO=12;FSAF=30;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=12;FWDB=0.190351;FXX=0.00847386;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.06;QD=17.8931;RBI=0.211136;REFB=-0.0332176;REVB=0.0913503;RO=23;SAF=29;SAR=59;SRF=0;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0.243808;SSSB=0.153686;STB=0.53703;TYPE=del;VARB=0.0460839;OID=.;OPOS=63975972;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:88:116:105:117:12:30:75:0:12:13:23:29:59:0:23 chr3 64133350 . A G 306.08 PASS AO=25;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0349248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.211;QD=37.1;RBI=0.0493057;REFB=0;REVB=0.0348039;RO=0;SAF=8;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000381339;OID=.;OPOS=64133350;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:25:33:0:0:25:33:17:8:0:0:25:8:0:0 chr3 64627542 . C T 456.61 PASS AO=119;DP=262;FAO=120;FDP=263;FR=.;FRO=143;FSAF=54;FSAR=66;FSRF=65;FSRR=78;FWDB=0.0220044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.7811;QD=6.94468;RBI=0.0276322;REFB=-0.00443739;REVB=-0.0167136;RO=143;SAF=53;SAR=66;SRF=65;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0091382;STB=0.502495;TYPE=snp;VARB=0.00579582;OID=.;OPOS=64627542;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:262:263:143:143:119:120:66:53:65:78:66:54:65:78 chr3 65342272 . GC G 61.71 PASS AO=18;DP=34;FAO=21;FDP=33;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.0668917;FXX=0.0294031;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.3198;QD=7.48027;RBI=0.145116;REFB=-0.121648;REVB=-0.128779;RO=13;SAF=5;SAR=13;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215387;STB=0.588147;TYPE=del;VARB=0.10762;OID=.;OPOS=65342273;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:18:33:21:33:12:6:15:6:6:20:13:5:13:7:6 chr3 66293688 . A G 383.41 PASS AO=95;DP=202;FAO=96;FDP=203;FR=.;FRO=107;FSAF=47;FSAR=49;FSRF=48;FSRR=59;FWDB=-0.0011008;FXX=0.00490172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.825;QD=7.55494;RBI=0.00513788;REFB=-0.0152132;REVB=-0.00501857;RO=106;SAF=46;SAR=49;SRF=48;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0300257;STB=0.521627;TYPE=snp;VARB=0.0216195;OID=.;OPOS=66293688;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:203:106:107:95:96:49:46:48:58:49:47:48:59 chr3 66354911 . G C 1920.49 PASS AO=205;DP=209;FAO=205;FDP=205;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=136;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0413983;FXX=0.0191378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.3684;QD=37.473;RBI=0.0496265;REFB=-0.0887429;REVB=0.0273673;RO=2;SAF=69;SAR=136;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00336341;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00113121;OID=.;OPOS=66354911;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:209:205:2:0:205:205:136:69:1:1:136:69:0:0 chr3 66374361 . G C 1004 PASS AO=109;DP=111;FAO=109;FDP=111;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.057783;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.7539;QD=36.18;RBI=0.134712;REFB=-0.110321;REVB=0.12169;RO=0;SAF=24;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.13927e-08;STB=0.505813;TYPE=snp;VARB=0.00211035;OID=.;OPOS=66374361;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:111:111:0:2:109:109:85:24:0:0:85:24:0:2 chr3 66396845 . G A 427.81 PASS AO=46;DP=46;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00746783;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.425;QD=38.0278;RBI=0.0265756;REFB=0;REVB=-0.0255048;RO=0;SAF=7;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.91639e-05;OID=.;OPOS=66396845;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:46:45:0:0:46:45:39:7:0:0:38:7:0:0 chr3 66419956 . C T 279.02 PASS AO=60;DP=113;FAO=60;FDP=113;FR=.;FRO=53;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=32;FSRR=21;FWDB=-0.0125777;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.218;QD=9.87687;RBI=0.0143245;REFB=-0.00782828;REVB=0.00685512;RO=52;SAF=31;SAR=29;SRF=32;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0838902;STB=0.540999;TYPE=snp;VARB=0.00702866;OID=.;OPOS=66419956;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:52:53:60:60:29:31:32:20:29:31:32:21 chr3 66433676 . A G 555.07 PASS AO=62;DP=64;FAO=62;FDP=64;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0402021;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.072;QD=34.6916;RBI=0.0405466;REFB=-0.0667903;REVB=-0.00527438;RO=2;SAF=26;SAR=36;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0349353;STB=0.518513;TYPE=snp;VARB=0.00173706;OID=.;OPOS=66433676;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:64:64:2:2:62:62:36:26:2:0:36:26:2:0 chr3 66434643 . T C 829.75 PASS AO=87;DP=91;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0223208;FXX=0.0219756;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.912;QD=37.2919;RBI=0.0370641;REFB=0.100582;REVB=0.0295894;RO=1;SAF=17;SAR=70;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00672213;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.38943e-05;OID=.;OPOS=66434643;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:91:89:1:0:87:89:70:17:0:1:72:17:0:0 chr3 67048762 . T C 192.21 PASS AO=16;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0577072;FXX=0.0454339;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9886;QD=36.612;RBI=0.13965;REFB=0;REVB=0.127169;RO=1;SAF=5;SAR=11;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0397692;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00187677;OID=.;OPOS=67048762;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:21:21:1:0:16:21:11:5:0:1:16:5:0:0 chr3 67411103 . C T 320.17 PASS AO=72;DP=140;FAO=72;FDP=141;FR=.;FRO=69;FSAF=25;FSAR=47;FSRF=28;FSRR=41;FWDB=-0.0166131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.959;QD=9.08296;RBI=0.0233379;REFB=-0.013038;REVB=-0.0163909;RO=68;SAF=25;SAR=47;SRF=28;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0614915;STB=0.531008;TYPE=snp;VARB=0.0154593;OID=.;OPOS=67411103;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:141:68:69:72:72:47:25:28:40:47:25:28:41 chr3 67411166 . A G 224.31 PASS AO=54;DP=112;FAO=55;FDP=115;FR=.;FRO=60;FSAF=13;FSAR=42;FSRF=20;FSRR=40;FWDB=0.030423;FXX=0.00861995;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.878;QD=7.80199;RBI=0.0366649;REFB=0.0130708;REVB=0.0204634;RO=56;SAF=12;SAR=42;SRF=17;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100891;STB=0.565228;TYPE=snp;VARB=-0.0333783;OID=.;OPOS=67411166;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:115:56:60:54:55:42:12:17:39:42:13:20:40 chr3 68594319 . G A 191.75 PASS AO=49;DP=111;FAO=50;FDP=112;FR=.;FRO=62;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=27;FSRR=35;FWDB=-0.0250563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.405;QD=6.84834;RBI=0.0288181;REFB=-0.00800017;REVB=-0.0142361;RO=62;SAF=28;SAR=21;SRF=27;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135493;STB=0.568754;TYPE=snp;VARB=0.00859066;OID=.;OPOS=68594319;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:112:62:62:49:50:21:28:27:35:22:28:27:35 chr3 69070563 . A C 924.77 PASS AO=123;DP=147;FAO=123;FDP=147;FR=.;FRO=24;FSAF=48;FSAR=75;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=0.00659953;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=193.393;QD=25.1639;RBI=0.00992883;REFB=-0.0212666;REVB=0.00741808;RO=21;SAF=48;SAR=75;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0784114;STB=0.553277;TYPE=snp;VARB=0.00129553;OID=.;OPOS=69070563;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:147:147:21:24:123:123:75:48:14:7:75:48:17:7 chr3 69096614 . G A 1274.31 PASS AO=134;DP=135;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00296398;FXX=0.0073524;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.855;QD=37.7572;RBI=0.00597324;REFB=-0.0189462;REVB=-0.00518599;RO=1;SAF=52;SAR=82;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00905324;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000517324;OID=.;OPOS=69096614;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:135:135:1:0:134:135:82:52:1:0:83:52:0:0 chr3 69167861 . A G 184.84 PASS AO=52;DP=124;FAO=52;FDP=124;FR=.;FRO=72;FSAF=43;FSAR=9;FSRF=59;FSRR=13;FWDB=-0.0131079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.553;QD=5.96249;RBI=0.0317166;REFB=-0.00189429;REVB=-0.0288813;RO=63;SAF=43;SAR=9;SRF=57;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149772;STB=0.507508;TYPE=snp;VARB=0.00233446;OID=.;OPOS=69167861;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:63:72:52:52:9:43:57:6:9:43:59:13 chr3 69230061 . G A 604.61 PASS AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000233937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.75;QD=37.788;RBI=0.00680964;REFB=0;REVB=-0.00680562;RO=0;SAF=48;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.36531e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.60094e-05;OID=.;OPOS=69230061;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:64:64:0:0:64:64:16:48:0:0:16:48:0:0 chr3 69230801 . G A 524.32 PASS AO=57;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0162639;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.714;QD=35.5473;RBI=0.0840468;REFB=-0.151429;REVB=0.0824582;RO=0;SAF=44;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.518512;TYPE=snp;VARB=0.00137321;OID=.;OPOS=69230801;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:59:59:0:1:57:58:13:44:0:0:13:45:0:1 chr3 69245453 . GT G,GC 1495.98 PASS AO=52,105;DP=161;FAO=145,13;FDP=158;FR=.;FRO=0;FSAF=71,6;FSAR=74,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0532227,-0.103445;FXX=0.00628891;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=179.434,164.232;QD=37.8728;RBI=0.0532645,0.109107;REFB=-0.00269685,0.0728475;REVB=-0.00211019,-0.0346891;RO=1;SAF=7,69;SAR=45,36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0103553,0.0129986;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-8.81407e-05,0.0826521;OID=.,.;OPOS=69245454,69245454;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=G,GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:52,105:158:145,13:158:0:71,6:74,7:0:0:5:1:7,69:45,36:0:1 chr3 69246152 . A G 975 PASS AO=115;DP=121;FAO=113;FDP=120;FR=.;FRO=7;FSAF=67;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.00602604;FXX=0.00826378;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0126;QD=32.5;RBI=0.00670375;REFB=-0.0331343;REVB=0.00293719;RO=6;SAF=67;SAR=48;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0399103;STB=0.526916;TYPE=snp;VARB=0.0185089;OID=.;OPOS=69246152;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:121:120:6:7:115:113:48:67:1:5:46:67:1:6 chr3 69271032 . G A 264.8 PASS AO=52;DP=89;FAO=52;FDP=91;FR=.;FRO=39;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=27;FSRR=12;FWDB=-0.0165013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.129;QD=11.6395;RBI=0.023714;REFB=-0.0137432;REVB=-0.0170311;RO=37;SAF=26;SAR=26;SRF=25;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133837;STB=0.582387;TYPE=snp;VARB=0.00634603;OID=.;OPOS=69271032;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:91:37:39:52:52:26:26:25:12:26:26:27:12 chr3 72426901 . A G 3767.84 PASS AO=707;DP=713;FAO=395;FDP=395;FR=.;FRO=0;FSAF=192;FSAR=203;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00278496;FXX=0.0124997;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.2222;QD=38.1554;RBI=0.0499912;REFB=-0.0365742;REVB=0.0499135;RO=4;SAF=347;SAR=360;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00547404;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.27473e-05;OID=.;OPOS=72426901;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:713:395:4:0:707:395:360:347:4:0:203:192:0:0 chr3 72495777 . C G 751.59 PASS AO=86;DP=89;FAO=84;FDP=88;FR=.;FRO=4;FSAF=51;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0420015;FXX=0.0112347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.3058;QD=34.1631;RBI=0.0472313;REFB=-0.0337427;REVB=-0.0216027;RO=3;SAF=53;SAR=33;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0411364;STB=0.516888;TYPE=snp;VARB=0.00602364;OID=.;OPOS=72495777;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:89:88:3:4:86:84:33:53:0:3:33:51:1:3 chr3 72495945 . A G 136.31 PASS AO=14;DP=14;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.063;QD=36.3484;RBI=0.00995606;REFB=0;REVB=0.00995606;RO=0;SAF=0;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.07601e-05;OID=.;OPOS=72495945;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:14:15:0:0:14:15:14:0:0:0:15:0:0:0 chr3 72496001 . G C 10.26 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=8;FR=.;FRO=6;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=35.0614;QD=5.13173;RBI=0.0730651;REFB=0.00425822;REVB=0.0730651;RO=5;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00843092;OID=.;OPOS=72496001;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:8:5:6:2:2:2:0:0:5:2:0:0:6 chr3 73024350 . C A 880.94 PASS AO=234;DP=463;FAO=204;FDP=400;FR=.;FRO=196;FSAF=129;FSAR=75;FSRF=127;FSRR=69;FWDB=0.0179751;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6746;QD=8.80943;RBI=0.0234147;REFB=0.00361096;REVB=-0.0150048;RO=229;SAF=150;SAR=84;SRF=146;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00340761;STB=0.508258;TYPE=snp;VARB=-0.00336165;OID=.;OPOS=73024350;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:463:400:229:196:234:204:84:150:146:83:75:129:127:69 chr3 73111368 . T C 1406.13 PASS AO=170;DP=180;FAO=168;FDP=179;FR=.;FRO=11;FSAF=68;FSAR=100;FSRF=10;FSRR=1;FWDB=0.00651562;FXX=0.00555525;HRUN=4;LEN=1;MLLD=40.2308;QD=31.4219;RBI=0.159686;REFB=-0.0965423;REVB=-0.159553;RO=8;SAF=70;SAR=100;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0405184;STB=0.531766;TYPE=snp;VARB=0.00924481;OID=.;OPOS=73111368;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:180:179:8:11:170:168:100:70:7:1:100:68:10:1 chr3 73111481 . C CA,A 1241.09 PASS AO=107,24;DP=141;FAO=136,0;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=38,0;FSAR=98,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0489337,0.00442904;FXX=0.0144917;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=26.9875,237.625;QD=36.5026;RBI=0.0726644,0.00973749;REFB=0,0;REVB=0.0537179,0.00867193;RO=10;SAF=25,13;SAR=82,11;SRF=3;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0148467,0.12904;STB=0.5,0.5;TYPE=ins,snp;VARB=0.0013895,0;OID=.,.;OPOS=73111482,73111481;OREF=-,C;OALT=A,A;OMAPALT=CA,A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:141:136:10:0:107,24:136,0:82,11:25,13:3:7:98,0:38,0:0:0 chr3 73111809 . A G 351.11 PASS AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00520634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.424;QD=37.9582;RBI=0.0119025;REFB=0;REVB=-0.0107034;RO=0;SAF=20;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71161e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.54448e-05;OID=.;OPOS=73111809;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:37:37:0:0:37:37:17:20:0:0:17:20:0:0 chr3 73111973 . A G 838.62 PASS AO=88;DP=89;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000117867;FXX=0.0329634;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.774;QD=38.1191;RBI=0.0137749;REFB=0;REVB=0.0137744;RO=0;SAF=50;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.49151e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000144435;OID=.;OPOS=73111973;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:89:88:0:0:88:88:38:50:0:0:38:50:0:0 chr3 73111998 . C T 835.91 PASS AO=85;DP=87;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0207313;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.148;QD=37.1516;RBI=0.0215827;REFB=0.0570985;REVB=0.00600222;RO=0;SAF=45;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.79153e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.61608e-05;OID=.;OPOS=73111998;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:87:90:0:0:85:90:40:45:0:0:43:47:0:0 chr3 73112378 . A G 1314.55 PASS AO=140;DP=142;FAO=141;FDP=143;FR=.;FRO=2;FSAF=78;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0291559;FXX=0.00694396;HRUN=3;LEN=1;MLLD=194.778;QD=36.7707;RBI=0.0319177;REFB=0.0678947;REVB=0.0129875;RO=2;SAF=78;SAR=62;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0150883;STB=0.507811;TYPE=snp;VARB=-7.33736e-05;OID=.;OPOS=73112378;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:142:143:2:2:140:141:62:78:0:2:63:78:0:2 chr3 73112489 . A G 17.5 PASS AO=4;DP=8;FAO=3;FDP=7;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0.124844;HRUN=22;LEN=1;MLLD=173.483;QD=10.0013;RBI=0.00871681;REFB=-0.00329605;REVB=-0.00871681;RO=3;SAF=0;SAR=4;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00294769;OID=.;OPOS=73112489;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:8:7:3:4:4:3:4:0:0:3:3:0:0:4 chr3 73114003 . T C 1591.88 PASS AO=171;DP=175;FAO=171;FDP=171;FR=.;FRO=0;FSAF=100;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0200639;FXX=0.0228558;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.2542;QD=37.237;RBI=0.0905842;REFB=-0.0618121;REVB=0.0883342;RO=2;SAF=100;SAR=71;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00192046;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00223072;OID=.;OPOS=73114003;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:175:171:2:0:171:171:71:100:1:1:71:100:0:0 chr3 73433369 . G A 41.09 PASS AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=-0.0172068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.1773;QD=10.2735;RBI=0.0172134;REFB=-0.0248848;REVB=0.000476959;RO=8;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.392387;STB=0.721819;TYPE=snp;VARB=0.0247062;OID=.;OPOS=73433369;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:16:16:8:8:8:8:5:3:0:8:5:3:0:8 chr3 73433494 . T C 19.84 PASS AO=5;DP=16;FAO=5;FDP=16;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.0318017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.117;QD=4.95946;RBI=0.0523184;REFB=-0.00848166;REVB=-0.0415435;RO=11;SAF=2;SAR=3;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0407987;STB=0.526212;TYPE=snp;VARB=0.0180111;OID=.;OPOS=73433494;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:16:16:11:11:5:5:3:2:4:7:3:2:4:7 chr3 73453325 . C T 220.87 PASS AO=65;DP=160;FAO=65;FDP=160;FR=.;FRO=95;FSAF=54;FSAR=11;FSRF=92;FSRR=3;FWDB=0.00801513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.836;QD=5.52168;RBI=0.0189457;REFB=0.00431556;REVB=0.0171667;RO=95;SAF=54;SAR=11;SRF=92;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.330907;STB=0.679893;TYPE=snp;VARB=-0.00654016;OID=.;OPOS=73453325;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:160:95:95:65:65:11:54:92:3:11:54:92:3 chr3 74413676 . T C 681 PASS AO=79;DP=84;FAO=79;FDP=84;FR=.;FRO=5;FSAF=32;FSAR=47;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0356388;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.479;QD=32.4284;RBI=0.0670922;REFB=-0.0442687;REVB=0.056844;RO=5;SAF=32;SAR=47;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000590758;STB=0.500313;TYPE=snp;VARB=0.0017717;OID=.;OPOS=74413676;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:84:84:5:5:79:79:47:32:2:3:47:32:2:3 chr3 75232044 . C T 115.44 PASS AO=36;DP=85;FAO=36;FDP=96;FR=.;FRO=60;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=26;FSRR=34;FWDB=0.0578558;FXX=0.0303;HRUN=5;LEN=1;MLLD=116.427;QD=4.81011;RBI=0.0729014;REFB=-0.0139498;REVB=-0.0443545;RO=49;SAF=22;SAR=14;SRF=26;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0844601;STB=0.611049;TYPE=snp;VARB=0.0448865;OID=.;OPOS=75232044;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:96:49:60:36:36:14:22:26:23:14:22:26:34 chr3 75472209 . C T 236.79 PASS AO=69;DP=164;FAO=69;FDP=168;FR=.;FRO=99;FSAF=39;FSAR=30;FSRF=48;FSRR=51;FWDB=-0.030553;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=64.332;QD=5.63781;RBI=0.0339306;REFB=-0.00323551;REVB=0.014758;RO=93;SAF=39;SAR=30;SRF=43;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105726;STB=0.547568;TYPE=snp;VARB=0.00475312;OID=.;OPOS=75472209;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:168:93:99:69:69:30:39:43:50:30:39:48:51 chr3 75475670 . A C 22.44 PASS AO=5;DP=18;FAO=6;FDP=19;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.0210602;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.065;QD=4.7233;RBI=0.0224816;REFB=-0.0137993;REVB=0.00786703;RO=13;SAF=4;SAR=1;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.516581;STB=0.846342;TYPE=snp;VARB=0.0825186;OID=.;OPOS=75475670;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:18:19:13:13:5:6:1:4:4:9:1:5:4:9 chr3 75679930 . A C 16.58 PASS AO=13;DP=71;FAO=13;FDP=71;FR=.;FRO=58;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=34;FSRR=24;FWDB=-0.0316389;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.598;QD=0.934033;RBI=0.0320479;REFB=-0.0015041;REVB=-0.00510356;RO=58;SAF=3;SAR=10;SRF=34;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.435829;STB=0.783472;TYPE=snp;VARB=0.0206236;OID=.;OPOS=75679930;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:71:71:58:58:13:13:10:3:34:24:10:3:34:24 chr3 75679938 . T C 21.83 PASS AO=16;DP=81;FAO=16;FDP=81;FR=.;FRO=65;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=40;FSRR=25;FWDB=-0.00438843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.794;QD=1.07792;RBI=0.0112803;REFB=0.0001075;REVB=-0.0103917;RO=62;SAF=5;SAR=11;SRF=40;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.399635;STB=0.733057;TYPE=snp;VARB=-0.00076;OID=.;OPOS=75679938;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:81:81:62:65:16:16:11:5:40:22:11:5:40:25 chr3 75679965 . C A 20.49 PASS AO=18;DP=111;FAO=18;FDP=106;FR=.,HEALED;FRO=88;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=44;FSRR=44;FWDB=-0.0612665;FXX=0.0535666;HRUN=3;LEN=1;MLLD=103.867;QD=0.773336;RBI=0.0617428;REFB=-0.0245303;REVB=-0.00765376;RO=60;SAF=5;SAR=13;SRF=17;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00852863;STB=0.690671;TYPE=snp;VARB=0.0337444;OID=.;OPOS=75679965;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:111:106:60:88:18:18:13:5:17:43:13:5:44:44 chr3 75679975 . C T 19.13 PASS AO=22;DP=135;FAO=23;FDP=136;FR=.;FRO=113;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=46;FSRR=67;FWDB=-0.0293027;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.882;QD=0.56253;RBI=0.0298975;REFB=-0.000596536;REVB=0.0059341;RO=113;SAF=6;SAR=16;SRF=46;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188221;STB=0.636761;TYPE=snp;VARB=0.00331051;OID=.;OPOS=75679975;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:135:136:113:113:22:23:16:6:46:67:17:6:46:67 chr3 75713564 . T C 1700.6 PASS AO=205;DP=228;FAO=207;FDP=230;FR=.;FRO=23;FSAF=114;FSAR=93;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.0128998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.735;QD=29.5757;RBI=0.0144613;REFB=-0.0103025;REVB=-0.00653646;RO=23;SAF=112;SAR=93;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0120478;STB=0.505864;TYPE=snp;VARB=0.000811254;OID=.;OPOS=75713564;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:228:230:23:23:205:207:93:112:14:9:93:114:14:9 chr3 75714298 . A G 373.96 PASS AO=110;DP=278;FAO=114;FDP=282;FR=.;FRO=168;FSAF=79;FSAR=35;FSRF=106;FSRR=62;FWDB=-0.00439868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.428;QD=5.3044;RBI=0.00442298;REFB=-0.0118874;REVB=-0.000462998;RO=166;SAF=77;SAR=33;SRF=105;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0826787;STB=0.542007;TYPE=snp;VARB=0.0157145;OID=.;OPOS=75714298;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:278:282:166:168:110:114:33:77:105:61:35:79:106:62 chr3 75714311 . G A 33.29 PASS AO=50;DP=293;FAO=50;FDP=291;FR=.;FRO=241;FSAF=35;FSAR=15;FSRF=153;FSRR=88;FWDB=0.0529747;FXX=0.00342454;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.646;QD=0.457635;RBI=0.087292;REFB=0.00660332;REVB=0.0693799;RO=228;SAF=35;SAR=15;SRF=145;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0931379;STB=0.561064;TYPE=snp;VARB=-0.0381325;OID=.;OPOS=75714311;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:293:291:228:241:50:50:15:35:145:83:15:35:153:88 chr3 75714337 . T G 593.19 PASS AO=144;DP=300;FAO=146;FDP=302;FR=.;FRO=156;FSAF=87;FSAR=59;FSRF=105;FSRR=51;FWDB=-0.01618;FXX=0.00330022;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.563;QD=7.85684;RBI=0.0193989;REFB=-0.00756469;REVB=0.0107016;RO=156;SAF=87;SAR=57;SRF=105;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0692969;STB=0.542056;TYPE=snp;VARB=0.00683827;OID=.;OPOS=75714337;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:300:302:156:156:144:146:57:87:105:51:59:87:105:51 chr3 75714345 . G T 61.27 PASS AO=63;DP=318;FAO=63;FDP=316;FR=.;FRO=253;FSAF=41;FSAR=22;FSRF=149;FSRR=104;FWDB=-0.00158699;FXX=0.00315447;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.8814;QD=0.775602;RBI=0.0171485;REFB=-0.00852604;REVB=0.0170749;RO=250;SAF=41;SAR=22;SRF=146;SRR=104;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0911161;STB=0.552733;TYPE=snp;VARB=0.0180283;OID=.;OPOS=75714345;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:318:316:250:253:63:63:22:41:146:104:22:41:149:104 chr3 75714702 . A G 289.77 PASS AO=77;DP=179;FAO=78;FDP=177;FR=.;FRO=99;FSAF=58;FSAR=20;FSRF=72;FSRR=27;FWDB=-0.000584864;FXX=0.00561766;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.989;QD=6.54841;RBI=0.00107444;REFB=-0.00495559;REVB=-0.000901302;RO=101;SAF=58;SAR=19;SRF=72;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0534138;STB=0.511826;TYPE=snp;VARB=0.00473449;OID=.;OPOS=75714702;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:177:101:99:77:78:19:58:72:29:20:58:72:27 chr3 75714825 . G A 488.48 PASS AO=85;DP=252;FAO=85;FDP=241;FR=.,HEALED;FRO=112;FSAF=51;FSAR=34;FSRF=68;FSRR=44;FWDB=-0.00270106;FXX=0.00413206;HRUN=2;LEN=1;MLLD=37.2821;QD=8.10761;RBI=0.0191933;REFB=-0.0547087;REVB=-0.0190023;RO=100;SAF=49;SAR=36;SRF=67;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0951474;STB=0.504236;TYPE=snp;VARB=0.0354063;OID=.;OPOS=75714825;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:241:241:100:112:85:85:36:49:67:33:34:51:68:44 chr3 75714831 . G A 162.97 PASS AO=86;DP=307;FAO=86;FDP=309;FR=.;FRO=223;FSAF=15;FSAR=71;FSRF=111;FSRR=112;FWDB=-0.024931;FXX=0.00961508;HRUN=3;LEN=1;MLLD=116.502;QD=2.1097;RBI=0.0255935;REFB=-0.00703164;REVB=0.00578551;RO=219;SAF=15;SAR=71;SRF=106;SRR=113;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.432088;STB=0.765136;TYPE=snp;VARB=0.0255858;OID=.;OPOS=75714831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:307:309:219:223:86:86:71:15:106:113:71:15:111:112 chr3 75714835 . C T 131.36 PASS AO=84;DP=338;FAO=84;FDP=335;FR=.;FRO=251;FSAF=17;FSAR=67;FSRF=112;FSRR=139;FWDB=0.0086339;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=203.283;QD=1.56852;RBI=0.00863581;REFB=-0.00197751;REVB=-0.000181593;RO=254;SAF=17;SAR=67;SRF=113;SRR=141;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.348753;STB=0.711596;TYPE=snp;VARB=0.00647806;OID=.;OPOS=75714835;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:338:335:254:251:84:84:67:17:113:141:67:17:112:139 chr3 75714840 . A G 760.9 PASS AO=178;DP=337;FAO=174;FDP=339;FR=.;FRO=165;FSAF=66;FSAR=108;FSRF=69;FSRR=96;FWDB=-0.00380346;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3805;QD=8.97814;RBI=0.115378;REFB=0.0108702;REVB=-0.115316;RO=159;SAF=67;SAR=111;SRF=67;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.040958;STB=0.519895;TYPE=snp;VARB=-0.012062;OID=.;OPOS=75714840;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:337:339:159:165:178:174:111:67:67:92:108:66:69:96 chr3 75714843 . T A 158.05 PASS AO=94;DP=349;FAO=92;FDP=348;FR=.;FRO=256;FSAF=51;FSAR=41;FSRF=88;FSRR=168;FWDB=0.0114262;FXX=0.00571412;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.8963;QD=1.81663;RBI=0.0240073;REFB=-0.00448237;REVB=0.0211138;RO=252;SAF=51;SAR=43;SRF=84;SRR=168;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.256908;STB=0.651577;TYPE=snp;VARB=0.0118427;OID=.;OPOS=75714843;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:349:348:252:256:94:92:43:51:84:168:41:51:88:168 chr3 75714853 . G A 171.46 PASS AO=107;DP=406;FAO=104;FDP=400;FR=.;FRO=296;FSAF=47;FSAR=57;FSRF=111;FSRR=185;FWDB=-0.00492138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.2115;QD=1.7146;RBI=0.0126533;REFB=-0.00963775;REVB=0.0116571;RO=291;SAF=48;SAR=59;SRF=107;SRR=184;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103285;STB=0.558085;TYPE=snp;VARB=0.0304934;OID=.;OPOS=75714853;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:406:400:291:296:107:104:59:48:107:184:57:47:111:185 chr3 75714898 . G A 288.27 PASS AO=127;DP=404;FAO=126;FDP=399;FR=.;FRO=273;FSAF=48;FSAR=78;FSRF=122;FSRR=151;FWDB=-0.0334599;FXX=0.00249994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0425;QD=2.88987;RBI=0.0602465;REFB=-0.0214159;REVB=0.0501006;RO=277;SAF=49;SAR=78;SRF=122;SRR=155;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0673105;STB=0.546751;TYPE=snp;VARB=0.0446066;OID=.;OPOS=75714898;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:404:399:277:273:127:126:78:49:122:155:78:48:122:151 chr3 75714917 . GC G,AC 1746.61 PASS AO=189,50;DP=313;FAO=236,74;FDP=317;FR=.;FRO=7;FSAF=100,25;FSAR=136,49;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=-0.149233,0.00337207;FXX=0.0508967;HRUN=3,1;LEN=1,1;MLLD=13.8891,179.047;QD=22.0393;RBI=0.184102,0.00712829;REFB=-0.17889,-0.00062226;REVB=0.107811,0.00628025;RO=31;SAF=80,1;SAR=109,49;SRF=5;SRR=26;SSEN=0.513158,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0724272,-0.522809;STB=0.508304,0.519059;TYPE=del,snp;VARB=0.0363551,0.0377621;OID=.,.;OPOS=75714918,75714917;OREF=C,G;OALT=-,A;OMAPALT=G,AC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:97:299:317:31:7:189,50:236,74:109,49:80,1:5:26:136,49:100,25:1:6 chr3 75714929 . G A 133.68 PASS AO=54;DP=300;FAO=84;FDP=332;FR=.;FRO=248;FSAF=35;FSAR=49;FSRF=100;FSRR=148;FWDB=-0.0157549;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=81.1018;QD=1.61061;RBI=0.0259969;REFB=-0.0215149;REVB=0.020679;RO=244;SAF=4;SAR=50;SRF=97;SRR=147;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.549474;STB=0.51036;TYPE=snp;VARB=0.0383531;OID=.;OPOS=75714929;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:300:332:244:248:54:84:50:4:97:147:49:35:100:148 chr3 75714950 . C A 76.34 PASS AO=63;DP=283;FAO=62;FDP=282;FR=.;FRO=220;FSAF=25;FSAR=37;FSRF=90;FSRR=130;FWDB=0.00733196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.899;QD=1.08283;RBI=0.00808472;REFB=-0.00802417;REVB=0.00340661;RO=219;SAF=26;SAR=37;SRF=89;SRR=130;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00832155;STB=0.504743;TYPE=snp;VARB=0.026286;OID=.;OPOS=75714950;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:283:282:219:220:63:62:37:26:89:130:37:25:90:130 chr3 75714971 . C A 205.24 PASS AO=80;DP=235;FAO=79;FDP=234;FR=.;FRO=155;FSAF=28;FSAR=51;FSRF=68;FSRR=87;FWDB=0.0435193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.0816;QD=3.50832;RBI=0.044999;REFB=-0.00419088;REVB=-0.0114448;RO=154;SAF=29;SAR=51;SRF=67;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0876881;STB=0.558889;TYPE=snp;VARB=0.00481019;OID=.;OPOS=75714971;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:235:234:154:155:80:79:51:29:67:87:51:28:68:87 chr3 75714976 . C T 357.65 PASS AO=91;DP=212;FAO=95;FDP=212;FR=.;FRO=117;FSAF=40;FSAR=55;FSRF=44;FSRR=73;FWDB=0.0465134;FXX=0.00469462;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.053;QD=6.7482;RBI=0.0583493;REFB=-0.000315172;REVB=0.0352299;RO=118;SAF=36;SAR=55;SRF=45;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0151683;STB=0.525662;TYPE=snp;VARB=0.000694044;OID=.;OPOS=75714976;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:212:118:117:91:95:55:36:45:73:55:40:44:73 chr3 75714980 . C A 36.92 PASS AO=39;DP=200;FAO=38;FDP=199;FR=.;FRO=161;FSAF=12;FSAR=26;FSRF=65;FSRR=96;FWDB=0.01153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.4013;QD=0.742192;RBI=0.0227625;REFB=-0.00564563;REVB=0.0196263;RO=160;SAF=13;SAR=26;SRF=64;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0920492;STB=0.577569;TYPE=snp;VARB=0.0111003;OID=.;OPOS=75714980;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:200:199:160:161:39:38:26:13:64:96:26:12:65:96 chr3 75779719 . T C 37.78 PASS AO=37;DP=199;FAO=39;FDP=201;FR=.;FRO=162;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=72;FSRR=90;FWDB=-0.0249582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.795;QD=0.751914;RBI=0.0349125;REFB=0.00051757;REVB=0.0244126;RO=147;SAF=23;SAR=14;SRF=58;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.284847;STB=0.656818;TYPE=snp;VARB=-0.00564782;OID=.;OPOS=75779719;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:199:201:147:162:37:39:14:23:58:89:14:25:72:90 chr3 75779724 . T C 361.39 PASS AO=94;DP=205;FAO=94;FDP=206;FR=.;FRO=112;FSAF=45;FSAR=49;FSRF=52;FSRR=60;FWDB=-0.0345313;FXX=0.00483068;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.262;QD=7.01736;RBI=0.0345525;REFB=-0.0251244;REVB=0.00120917;RO=110;SAF=45;SAR=49;SRF=51;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0147311;STB=0.507867;TYPE=snp;VARB=0.0329205;OID=.;OPOS=75779724;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:206:110:112:94:94:49:45:51:59:49:45:52:60 chr3 75779727 . A G 397.49 PASS AO=99;DP=208;FAO=99;FDP=208;FR=.;FRO=109;FSAF=50;FSAR=49;FSRF=49;FSRR=60;FWDB=0.0485443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1119;QD=7.644;RBI=0.0490574;REFB=0.00245095;REVB=-0.00707617;RO=105;SAF=50;SAR=49;SRF=45;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0714316;STB=0.529069;TYPE=snp;VARB=-0.00127736;OID=.;OPOS=75779727;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:208:105:109:99:99:49:50:45:60:49:50:49:60 chr3 75779742 . G A 77.88 PASS AO=51;DP=222;FAO=53;FDP=223;FR=.;FRO=170;FSAF=19;FSAR=34;FSRF=82;FSRR=88;FWDB=-0.0180575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.557;QD=1.39699;RBI=0.0231669;REFB=-0.00676498;REVB=-0.0145132;RO=165;SAF=17;SAR=34;SRF=80;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197431;STB=0.596972;TYPE=snp;VARB=0.0268897;OID=.;OPOS=75779742;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:222:223:165:170:51:53:34:17:80:85:34:19:82:88 chr3 75779762 . G T 96.82 PASS AO=58;DP=229;FAO=58;FDP=228;FR=.;FRO=170;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=76;FSRR=94;FWDB=-0.0227382;FXX=0.00436662;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.2403;QD=1.69866;RBI=0.0405561;REFB=-0.0167366;REVB=0.0335823;RO=166;SAF=25;SAR=33;SRF=73;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0110571;STB=0.512135;TYPE=snp;VARB=0.0358046;OID=.;OPOS=75779762;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:229:228:166:170:58:58:33:25:73:93:33:25:76:94 chr3 75779769 . C G 568.62 PASS AO=122;DP=227;FAO=122;FDP=225;FR=.;FRO=103;FSAF=57;FSAR=65;FSRF=37;FSRR=66;FWDB=0.0225444;FXX=0.0131573;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.974;QD=10.1088;RBI=0.0227951;REFB=-0.0176712;REVB=0.00337094;RO=101;SAF=56;SAR=66;SRF=36;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0866214;STB=0.549966;TYPE=snp;VARB=0.0131158;OID=.;OPOS=75779769;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:227:225:101:103:122:122:66:56:36:65:65:57:37:66 chr3 75779777 . TA T 302.56 PASS AO=108;DP=225;FAO=113;FDP=208;FR=.;FRO=95;FSAF=55;FSAR=58;FSRF=31;FSRR=64;FWDB=-0.0291712;FXX=0.054543;HRUN=4;LEN=1;MLLD=15.8126;QD=5.81838;RBI=0.0600335;REFB=-0.0749938;REVB=-0.0524696;RO=92;SAF=48;SAR=60;SRF=30;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0.338931;SSSB=0.102448;STB=0.57359;TYPE=del;VARB=0.0655115;OID=.;OPOS=75779778;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:108:219:113:208:95:55:58:31:64:99:92:48:60:30:62 chr3 75781222 . C T 234.65 PASS AO=69;DP=169;FAO=69;FDP=169;FR=.;FRO=100;FSAF=35;FSAR=34;FSRF=45;FSRR=55;FWDB=-0.0132474;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9336;QD=5.55376;RBI=0.0443366;REFB=0.000618482;REVB=0.0423112;RO=100;SAF=35;SAR=34;SRF=45;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0602946;STB=0.533838;TYPE=snp;VARB=-0.000640647;OID=.;OPOS=75781222;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:169:100:100:69:69:34:35:45:55:34:35:45:55 chr3 75781243 . T C 53.89 PASS AO=39;DP=176;FAO=39;FDP=175;FR=.;FRO=136;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=70;FSRR=66;FWDB=0.0134936;FXX=0.0056815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.2613;QD=1.23167;RBI=0.0192737;REFB=-0.00530802;REVB=0.0137623;RO=136;SAF=13;SAR=26;SRF=70;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23352;STB=0.643336;TYPE=snp;VARB=0.0275175;OID=.;OPOS=75781243;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:176:175:136:136:39:39:26:13:70:66:26:13:70:66 chr3 75781257 . T C 87.07 PASS AO=41;DP=166;FAO=41;FDP=144;FR=.;FRO=103;FSAF=14;FSAR=27;FSRF=49;FSRR=54;FWDB=-0.0177319;FXX=0.132522;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.3289;QD=2.4187;RBI=0.0247793;REFB=-0.000947146;REVB=0.0173088;RO=103;SAF=14;SAR=27;SRF=49;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168913;STB=0.59995;TYPE=snp;VARB=0.00118559;OID=.;OPOS=75781257;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:166:144:103:103:41:41:27:14:49:54:27:14:49:54 chr3 75781263 . T C 195.15 PASS AO=63;DP=166;FAO=63;FDP=166;FR=.;FRO=103;FSAF=29;FSAR=34;FSRF=49;FSRR=54;FWDB=-0.0164138;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4797;QD=4.70239;RBI=0.0170702;REFB=0.020565;REVB=-0.00468806;RO=103;SAF=29;SAR=34;SRF=49;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0169618;STB=0.509605;TYPE=snp;VARB=-0.0357484;OID=.;OPOS=75781263;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:166:103:103:63:63:34:29:49:54:34:29:49:54 chr3 75786042 . G A 506.59 PASS AO=146;DP=365;FAO=162;FDP=377;FR=.;FRO=215;FSAF=102;FSAR=60;FSRF=152;FSRR=63;FWDB=0.00135708;FXX=0.0182287;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.134;QD=5.37499;RBI=0.0044416;REFB=-0.00778667;REVB=0.0042292;RO=217;SAF=89;SAR=57;SRF=155;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121635;STB=0.548472;TYPE=snp;VARB=0.00844216;OID=.;OPOS=75786042;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:365:377:217:215:146:162:57:89:155:62:60:102:152:63 chr3 75786059 . C T 704.76 PASS AO=199;DP=431;FAO=183;FDP=396;FR=.;FRO=213;FSAF=115;FSAR=68;FSRF=147;FSRR=66;FWDB=-0.00717972;FXX=0.00999975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.626;QD=7.1188;RBI=0.00729237;REFB=0.000557691;REVB=0.00127682;RO=222;SAF=124;SAR=75;SRF=157;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0881059;STB=0.536203;TYPE=snp;VARB=-0.00123644;OID=.;OPOS=75786059;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:431:396:222:213:199:183:75:124:157:65:68:115:147:66 chr3 75786060 . A G 274.02 PASS AO=132;DP=433;FAO=123;FDP=397;FR=.;FRO=274;FSAF=74;FSAR=49;FSRF=186;FSRR=88;FWDB=0.00440919;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.8;QD=2.76087;RBI=0.0129926;REFB=0.000927008;REVB=-0.0122216;RO=297;SAF=81;SAR=51;SRF=201;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0819087;STB=0.556858;TYPE=snp;VARB=-0.00437061;OID=.;OPOS=75786060;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:433:397:297:274:132:123:51:81:201:96:49:74:186:88 chr3 75786071 . C A 24.45 PASS AO=75;DP=477;FAO=60;FDP=398;FR=.;FRO=338;FSAF=43;FSAR=17;FSRF=215;FSRR=123;FWDB=-0.0108347;FXX=0.00499988;HRUN=2;LEN=1;MLLD=255.554;QD=0.245742;RBI=0.0135286;REFB=-0.00495023;REVB=-0.00810141;RO=398;SAF=47;SAR=28;SRF=254;SRR=144;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0160757;STB=0.578485;TYPE=snp;VARB=0.0322016;OID=.;OPOS=75786071;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:477:398:398:338:75:60:28:47:254:144:17:43:215:123 chr3 75786079 . C T 20.33 PASS AO=77;DP=487;FAO=58;FDP=400;FR=.;FRO=342;FSAF=38;FSAR=20;FSRF=220;FSRR=122;FWDB=-0.00568689;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.619;QD=0.203279;RBI=0.0520962;REFB=-0.000846703;REVB=-0.0517849;RO=403;SAF=49;SAR=28;SRF=255;SRR=148;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0050488;STB=0.511175;TYPE=snp;VARB=0.0176896;OID=.;OPOS=75786079;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:487:400:403:342:77:58:28:49:255:148:20:38:220:122 chr3 75786080 . G A,T 2552.43 PASS AO=233,192;DP=486;FAO=188,156;FDP=400;FR=.;FRO=56;FSAF=118,105;FSAR=70,51;FSRF=35;FSRR=21;FWDB=0.00342563,0.00507502;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=87.0779,70.6391;QD=25.5243;RBI=0.0319306,0.0291267;REFB=0.010386,-0.0128766;REVB=0.0317463,0.0286812;RO=60;SAF=144,129;SAR=89,63;SRF=37;SRR=23;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.000555665,0.0277211;STB=0.500653,0.514284;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00294896,0.0135768;OID=.,.;OPOS=75786080,75786080;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:486:400:60:56:233,192:188,156:89,63:144,129:37:23:70,51:118,105:35:21 chr3 75786132 . T C 128.25 PASS AO=110;DP=462;FAO=94;FDP=399;FR=.;FRO=305;FSAF=42;FSAR=52;FSRF=162;FSRR=143;FWDB=-0.0176387;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.432;QD=1.28571;RBI=0.0179458;REFB=-0.00252234;REVB=-0.00330608;RO=334;SAF=47;SAR=63;SRF=176;SRR=158;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125846;STB=0.564302;TYPE=snp;VARB=0.00914192;OID=.;OPOS=75786132;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:462:399:334:305:110:94:63:47:176:158:52:42:162:143 chr3 75786163 . C T 159.26 PASS AO=94;DP=344;FAO=91;FDP=341;FR=.;FRO=250;FSAF=44;FSAR=47;FSRF=121;FSRR=129;FWDB=0.00954739;FXX=0.00292389;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3441;QD=1.86816;RBI=0.0292455;REFB=-0.00510821;REVB=-0.0276432;RO=248;SAF=45;SAR=49;SRF=118;SRR=130;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00361036;STB=0.500355;TYPE=snp;VARB=0.0137708;OID=.;OPOS=75786163;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:344:341:248:250:94:91:49:45:118:130:47:44:121:129 chr3 75786211 . A G 278.19 PASS AO=100;DP=273;FAO=98;FDP=270;FR=.;FRO=172;FSAF=44;FSAR=54;FSRF=94;FSRR=78;FWDB=0.0229183;FXX=0.0036899;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.6784;QD=4.12135;RBI=0.0345813;REFB=-0.00463907;REVB=-0.0258963;RO=170;SAF=45;SAR=55;SRF=95;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120795;STB=0.561978;TYPE=snp;VARB=0.0187621;OID=.;OPOS=75786211;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:273:270:170:172:100:98:55:45:95:75:54:44:94:78 chr3 75786224 . AG A 189.43 PASS AO=53;DP=250;FAO=81;FDP=245;FR=.;FRO=164;FSAF=43;FSAR=38;FSRF=82;FSRR=82;FWDB=-0.0564495;FXX=0.00406488;HRUN=1;LEN=1;MLLD=44.0728;QD=3.0928;RBI=0.0564629;REFB=0.00354794;REVB=0.00123248;RO=148;SAF=35;SAR=18;SRF=74;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203713;STB=0.520681;TYPE=del;VARB=-0.00881293;OID=.;OPOS=75786225;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:53:245:81:245:164:43:38:82:82:99:148:35:18:74:74 chr3 75786230 . C T 73.4 PASS AO=54;DP=241;FAO=55;FDP=242;FR=.;FRO=187;FSAF=23;FSAR=32;FSRF=98;FSRR=89;FWDB=0.0292534;FXX=0.00411506;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.3552;QD=1.21319;RBI=0.0311664;REFB=0.00649136;REVB=-0.0107508;RO=187;SAF=22;SAR=32;SRF=99;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155343;STB=0.581788;TYPE=snp;VARB=-0.0193457;OID=.;OPOS=75786230;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:241:242:187:187:54:55:32:22:99:88:32:23:98:89 chr3 75786243 . C T 230.3 PASS AO=83;DP=225;FAO=81;FDP=225;FR=.;FRO=144;FSAF=33;FSAR=48;FSRF=78;FSRR=66;FWDB=-0.00281877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.309;QD=4.09424;RBI=0.0198226;REFB=-0.00575367;REVB=-0.0196212;RO=142;SAF=34;SAR=49;SRF=77;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148045;STB=0.586117;TYPE=snp;VARB=0.0106858;OID=.;OPOS=75786243;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:225:225:142:144:83:81:49:34:77:65:48:33:78:66 chr3 75786245 . T A 241.54 PASS AO=84;DP=219;FAO=81;FDP=218;FR=.;FRO=137;FSAF=33;FSAR=48;FSRF=77;FSRR=60;FWDB=0.0146733;FXX=0.004566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.694;QD=4.43194;RBI=0.0225544;REFB=0.00159775;REVB=0.0171288;RO=135;SAF=35;SAR=49;SRF=76;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159541;STB=0.596991;TYPE=snp;VARB=-0.006483;OID=.;OPOS=75786245;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:219:218:135:137:84:81:49:35:76:59:48:33:77:60 chr3 75786252 . G T 318.57 PASS AO=92;DP=209;FAO=89;FDP=207;FR=.;FRO=118;FSAF=41;FSAR=48;FSRF=67;FSRR=51;FWDB=-0.00506078;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=232.699;QD=6.15598;RBI=0.00797126;REFB=-0.0014022;REVB=-0.0061587;RO=116;SAF=43;SAR=49;SRF=66;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10165;STB=0.560843;TYPE=snp;VARB=0.00263355;OID=.;OPOS=75786252;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:207:116:118:92:89:49:43:66:50:48:41:67:51 chr3 75786256 . T A 224.3 PASS AO=78;DP=204;FAO=75;FDP=202;FR=.;FRO=127;FSAF=30;FSAR=45;FSRF=78;FSRR=49;FWDB=-0.0100446;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=227.815;QD=4.44157;RBI=0.0100902;REFB=-0.00407797;REVB=-0.000958054;RO=126;SAF=32;SAR=46;SRF=78;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225717;STB=0.632778;TYPE=snp;VARB=0.00678687;OID=.;OPOS=75786256;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:202:126:127:78:75:46:32:78:48:45:30:78:49 chr3 75786261 . C T 125.58 PASS AO=54;DP=183;FAO=55;FDP=181;FR=.;FRO=126;FSAF=36;FSAR=19;FSRF=63;FSRR=63;FWDB=-0.00539829;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=231.627;QD=2.77515;RBI=0.00989076;REFB=-0.00688231;REVB=-0.00828768;RO=128;SAF=36;SAR=18;SRF=64;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206778;STB=0.61076;TYPE=snp;VARB=0.0135878;OID=.;OPOS=75786261;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:181:128:126:54:55:18:36:64:64:19:36:63:63 chr3 75786278 . A C 423 PASS AO=91;DP=161;FAO=87;FDP=156;FR=.;FRO=69;FSAF=55;FSAR=32;FSRF=39;FSRR=30;FWDB=9.55848e-05;FXX=0.00636902;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.696;QD=10.8461;RBI=0.00151315;REFB=-0.0397139;REVB=-0.00151013;RO=69;SAF=59;SAR=32;SRF=39;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0704603;STB=0.531311;TYPE=snp;VARB=0.0309081;OID=.;OPOS=75786278;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:156:69:69:91:87:32:59:39:30:32:55:39:30 chr3 75786288 . A G 37.41 PASS AO=30;DP=144;FAO=29;FDP=138;FR=.;FRO=109;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=63;FSRR=46;FWDB=-0.00662201;FXX=0.0142847;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.677;QD=1.08432;RBI=0.0186728;REFB=-0.00394746;REVB=-0.0174591;RO=113;SAF=21;SAR=9;SRF=66;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159917;STB=0.56471;TYPE=snp;VARB=0.0134489;OID=.;OPOS=75786288;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:144:138:113:109:30:29:9:21:66:47:10:19:63:46 chr3 75786298 . T C 35.09 PASS AO=27;DP=133;FAO=27;FDP=129;FR=.;FRO=102;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=61;FSRR=41;FWDB=0.036711;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2034;QD=1.08803;RBI=0.0578033;REFB=-0.00476567;REVB=0.0446489;RO=105;SAF=19;SAR=8;SRF=63;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144873;STB=0.558615;TYPE=snp;VARB=0.0218432;OID=.;OPOS=75786298;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:133:129:105:102:27:27:8:19:63:42:9:18:61:41 chr3 75786302 . G A 58.02 PASS AO=36;DP=131;FAO=32;FDP=126;FR=.;FRO=94;FSAF=23;FSAR=9;FSRF=57;FSRR=37;FWDB=0.00797872;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=260.329;QD=1.84183;RBI=0.0239047;REFB=-0.00194219;REVB=0.0225338;RO=95;SAF=26;SAR=10;SRF=58;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154653;STB=0.594988;TYPE=snp;VARB=0.00674301;OID=.;OPOS=75786302;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:131:126:95:94:36:32:10:26:58:37:9:23:57:37 chr3 75786314 . CCTACATTCT C 62.88 PASS AO=40;DP=141;FAO=40;FDP=118;FR=.;FRO=78;FSAF=32;FSAR=8;FSRF=52;FSRR=26;FWDB=-0.000892538;FXX=0.0247913;HRUN=2;LEN=9;MLLD=272.593;QD=2.13153;RBI=0.0129108;REFB=-0.00233042;REVB=-0.0128799;RO=76;SAF=32;SAR=8;SRF=51;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195275;STB=0.618117;TYPE=del;VARB=0.00691314;OID=.;OPOS=75786315;OREF=CTACATTCT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:40:120:40:118:78:32:8:52:26:62:76:32:8:51:25 chr3 75786379 . T C 106.16 PASS AO=53;DP=178;FAO=50;FDP=173;FR=.;FRO=123;FSAF=33;FSAR=17;FSRF=79;FSRR=44;FWDB=0.0160494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.559;QD=2.45453;RBI=0.0183501;REFB=-0.00309764;REVB=0.00889621;RO=125;SAF=34;SAR=19;SRF=79;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0123717;STB=0.513908;TYPE=snp;VARB=0.0120789;OID=.;OPOS=75786379;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:173:125:123:53:50:19:34:79:46:17:33:79:44 chr3 75786385 . C G 143.46 PASS AO=63;DP=175;FAO=55;FDP=165;FR=.;FRO=110;FSAF=35;FSAR=20;FSRF=72;FSRR=38;FWDB=-0.00695706;FXX=0.00602373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.09;QD=3.47773;RBI=0.0224076;REFB=0.000605426;REVB=0.0213003;RO=109;SAF=37;SAR=26;SRF=71;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0749562;STB=0.513185;TYPE=snp;VARB=-0.00436807;OID=.;OPOS=75786385;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:165:109:110:63:55:26:37:71:38:20:35:72:38 chr3 75786417 . T C 51.84 PASS AO=48;DP=199;FAO=41;FDP=190;FR=.;FRO=149;FSAF=29;FSAR=12;FSRF=86;FSRR=63;FWDB=-0.00548005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4521;QD=1.09133;RBI=0.00791303;REFB=4.00167e-05;REVB=-0.00570834;RO=150;SAF=32;SAR=16;SRF=85;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133236;STB=0.611757;TYPE=snp;VARB=-0.000512856;OID=.;OPOS=75786417;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:199:190:150:149:48:41:16:32:85:65:12:29:86:63 chr3 75786438 . G A 16.7 PASS AO=37;DP=207;FAO=30;FDP=196;FR=.;FRO=166;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=90;FSRR=76;FWDB=-0.0207959;FXX=0.0101005;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.077;QD=0.340742;RBI=0.0256645;REFB=-0.00455225;REVB=0.0150398;RO=161;SAF=18;SAR=19;SRF=85;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0532616;STB=0.535691;TYPE=snp;VARB=0.0236774;OID=.;OPOS=75786438;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:207:196:161:166:37:30:19:18:85:76:15:15:90:76 chr3 75786440 . C T 1702.62 PASS AO=174;DP=179;FAO=189;FDP=193;FR=.;FRO=4;FSAF=105;FSAR=84;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0196794;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.2003;QD=35.2875;RBI=0.0366935;REFB=-0.10691;REVB=-0.0309699;RO=5;SAF=97;SAR=77;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192008;STB=0.506402;TYPE=snp;VARB=0.00189402;OID=.;OPOS=75786440;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:179:193:5:4:174:189:77:97:1:4:84:105:1:3 chr3 75786450 . G A 12.02 PASS AO=33;DP=201;FAO=27;FDP=191;FR=.;FRO=164;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=91;FSRR=73;FWDB=-0.0236829;FXX=0.00520806;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.095;QD=0.251705;RBI=0.0325562;REFB=-0.0128491;REVB=-0.0223389;RO=165;SAF=15;SAR=18;SRF=91;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124083;STB=0.593934;TYPE=snp;VARB=0.0661184;OID=.;OPOS=75786450;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:201:191:165:164:33:27:18:15:91:74:15:12:91:73 chr3 75786453 . C T 51.2 PASS AO=50;DP=204;FAO=42;FDP=197;FR=.;FRO=155;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=86;FSRR=69;FWDB=-0.0279426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.893;QD=1.03968;RBI=0.0349453;REFB=-0.0161246;REVB=-0.0209853;RO=154;SAF=26;SAR=24;SRF=85;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0403057;STB=0.505736;TYPE=snp;VARB=0.0469293;OID=.;OPOS=75786453;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:204:197:154:155:50:42:24:26:85:69:19:23:86:69 chr3 75786500 . A G 161.83 PASS AO=82;DP=251;FAO=73;FDP=241;FR=.;FRO=168;FSAF=36;FSAR=37;FSRF=76;FSRR=92;FWDB=0.0152556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.748;QD=2.68601;RBI=0.0191459;REFB=-0.00172934;REVB=-0.0115686;RO=166;SAF=40;SAR=42;SRF=76;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0350355;STB=0.52844;TYPE=snp;VARB=0.00563721;OID=.;OPOS=75786500;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:251:241:166:168:82:73:42:40:76:90:37:36:76:92 chr3 75786506 . T C 20.18 PASS AO=43;DP=257;FAO=39;FDP=252;FR=.;FRO=213;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=95;FSRR=118;FWDB=0.00500912;FXX=0.00787371;HRUN=5;LEN=1;MLLD=171.461;QD=0.320325;RBI=0.0178434;REFB=-0.00177484;REVB=0.0171259;RO=214;SAF=21;SAR=22;SRF=98;SRR=116;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0393602;STB=0.556317;TYPE=snp;VARB=0.00719466;OID=.;OPOS=75786506;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:257:252:214:213:43:39:22:21:98:116:19:20:95:118 chr3 75786515 . G A 228.37 PASS AO=96;DP=277;FAO=90;FDP=270;FR=.;FRO=180;FSAF=45;FSAR=45;FSRF=80;FSRR=100;FWDB=-0.000984387;FXX=0.0036899;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.054;QD=3.38327;RBI=0.00673933;REFB=-0.00164886;REVB=0.00666705;RO=179;SAF=49;SAR=47;SRF=80;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.072532;STB=0.537029;TYPE=snp;VARB=0.00502635;OID=.;OPOS=75786515;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:277:270:179:180:96:90:47:49:80:99:45:45:80:100 chr3 75786518 . A C 28.92 PASS AO=49;DP=283;FAO=46;FDP=276;FR=.;FRO=230;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=105;FSRR=125;FWDB=-0.0196136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.3722;QD=0.419137;RBI=0.0213176;REFB=-0.0004233;REVB=-0.00835148;RO=232;SAF=30;SAR=19;SRF=105;SRR=127;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205038;STB=0.607833;TYPE=snp;VARB=0.00271728;OID=.;OPOS=75786518;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:283:276:232:230:49:46:19:30:105:127:19:27:105:125 chr3 75786521 . G A 27.5 PASS AO=48;DP=280;FAO=45;FDP=273;FR=.;FRO=228;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=106;FSRR=122;FWDB=0.00284735;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=194.747;QD=0.402933;RBI=0.0161429;REFB=-0.000776043;REVB=-0.0158898;RO=231;SAF=30;SAR=18;SRF=107;SRR=124;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208385;STB=0.612195;TYPE=snp;VARB=0.00412458;OID=.;OPOS=75786521;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:280:273:231:228:48:45:18:30:107:124:18:27:106:122 chr3 75786533 . T G 33.61 PASS AO=52;DP=285;FAO=48;FDP=277;FR=.;FRO=229;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=116;FSRR=113;FWDB=0.0151813;FXX=0.00359699;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.681;QD=0.485283;RBI=0.0160373;REFB=-0.00923546;REVB=-0.00516934;RO=231;SAF=25;SAR=27;SRF=118;SRR=113;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.038829;STB=0.505413;TYPE=snp;VARB=0.025716;OID=.;OPOS=75786533;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:285:277:231:229:52:48:27:25:118:113:24:24:116:113 chr3 75786555 . C CTG 358.11 PASS AO=112;DP=290;FAO=111;FDP=278;FR=.;FRO=167;FSAF=63;FSAR=48;FSRF=82;FSRR=85;FWDB=-0.00357303;FXX=0.0071426;HRUN=0;LEN=2;MLLD=240.455;QD=5.15266;RBI=0.00904714;REFB=-0.0109915;REVB=0.00831169;RO=169;SAF=66;SAR=46;SRF=86;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0874554;STB=0.546246;TYPE=ins;VARB=0.00832841;OID=.;OPOS=75786556;OREF=-;OALT=TG;OMAPALT=CTG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:112:290:111:278:167:63:48:82:85:99:169:66:46:86:83 chr3 75786572 . T C 80.64 PASS AO=67;DP=304;FAO=66;FDP=300;FR=.;FRO=234;FSAF=26;FSAR=40;FSRF=123;FSRR=111;FWDB=0.0117458;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.958;QD=1.07518;RBI=0.0118046;REFB=-0.00910803;REVB=0.001177;RO=231;SAF=26;SAR=41;SRF=121;SRR=110;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173733;STB=0.602841;TYPE=snp;VARB=0.0380349;OID=.;OPOS=75786572;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:304:300:231:234:67:66:41:26:121:110:40:26:123:111 chr3 75786597 . C T 49.48 PASS AO=59;DP=319;FAO=59;FDP=315;FR=.;FRO=256;FSAF=18;FSAR=41;FSRF=137;FSRR=119;FWDB=0.0020803;FXX=0.00316446;HRUN=5;LEN=1;MLLD=164.426;QD=0.628371;RBI=0.0187741;REFB=-0.00169037;REVB=0.0186585;RO=253;SAF=18;SAR=41;SRF=139;SRR=114;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.315281;STB=0.688079;TYPE=snp;VARB=0.0115569;OID=.;OPOS=75786597;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:319:315:253:256:59:59:41:18:139:114:41:18:137:119 chr3 75786607 . C T 49.07 PASS AO=61;DP=327;FAO=61;FDP=331;FR=.;FRO=270;FSAF=19;FSAR=42;FSRF=145;FSRR=125;FWDB=-0.00576349;FXX=0.00301196;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.3473;QD=0.592932;RBI=0.0180965;REFB=-0.0126499;REVB=-0.0171542;RO=265;SAF=19;SAR=42;SRF=147;SRR=118;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.313046;STB=0.684563;TYPE=snp;VARB=0.0232944;OID=.;OPOS=75786607;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:327:331:265:270:61:61:42:19:147:118:42:19:145:125 chr3 75786623 . G T 123.4 PASS AO=85;DP=339;FAO=82;FDP=334;FR=.;FRO=252;FSAF=51;FSAR=31;FSRF=120;FSRR=132;FWDB=0.0181229;FXX=0.0059522;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.95;QD=1.47788;RBI=0.0187988;REFB=-0.00153604;REVB=0.00499578;RO=252;SAF=54;SAR=31;SRF=120;SRR=132;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201505;STB=0.610594;TYPE=snp;VARB=0.00388414;OID=.;OPOS=75786623;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:339:334:252:252:85:82:31:54:120:132:31:51:120:132 chr3 75786670 . G A 256.3 PASS AO=105;DP=308;FAO=102;FDP=306;FR=.;FRO=204;FSAF=54;FSAR=48;FSRF=83;FSRR=121;FWDB=-0.0045502;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=193.056;QD=3.35029;RBI=0.0204214;REFB=-0.00371692;REVB=0.019908;RO=203;SAF=57;SAR=48;SRF=82;SRR=121;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159486;STB=0.581184;TYPE=snp;VARB=0.00416997;OID=.;OPOS=75786670;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:308:306:203:204:105:102:48:57:82:121:48:54:83:121 chr3 75786681 . G A 774.1 PASS AO=160;DP=282;FAO=159;FDP=280;FR=.;FRO=121;FSAF=67;FSAR=92;FSRF=46;FSRR=75;FWDB=-0.0114932;FXX=0.00709195;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.181;QD=11.0585;RBI=0.0115388;REFB=-0.0137323;REVB=0.00102408;RO=118;SAF=69;SAR=91;SRF=43;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0538258;STB=0.518367;TYPE=snp;VARB=0.0137141;OID=.;OPOS=75786681;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:282:280:118:121:160:159:91:69:43:75:92:67:46:75 chr3 75786737 . A T 261.21 PASS AO=73;DP=194;FAO=77;FDP=186;FR=.;FRO=109;FSAF=40;FSAR=37;FSRF=31;FSRR=78;FWDB=0.0083423;FXX=0.0558347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.273;QD=5.61741;RBI=0.00914835;REFB=-0.000698718;REVB=0.00375477;RO=105;SAF=37;SAR=36;SRF=28;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253713;STB=0.636469;TYPE=snp;VARB=0.00197973;OID=.;OPOS=75786737;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:186:105:109:73:77:36:37:28:77:37:40:31:78 chr3 75786740 . C G 31.59 PASS AO=36;DP=197;FAO=36;FDP=197;FR=.;FRO=161;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=68;FSRR=93;FWDB=0.0161471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.536;QD=0.641448;RBI=0.016148;REFB=-0.000119284;REVB=-0.000167679;RO=159;SAF=16;SAR=20;SRF=67;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0301703;STB=0.518339;TYPE=snp;VARB=0.000839335;OID=.;OPOS=75786740;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:197:197:159:161:36:36:20:16:67:92:20:16:68:93 chr3 75786741 . A G 435.95 PASS AO=99;DP=193;FAO=99;FDP=193;FR=.;FRO=94;FSAF=48;FSAR=51;FSRF=34;FSRR=60;FWDB=0.0143011;FXX=0.0102559;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.692;QD=9.0353;RBI=0.0150206;REFB=-0.000715174;REVB=0.00459334;RO=92;SAF=48;SAR=51;SRF=33;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111582;STB=0.56024;TYPE=snp;VARB=0.000372373;OID=.;OPOS=75786741;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:193:92:94:99:99:51:48:33:59:51:48:34:60 chr3 75786753 . C T 173.85 PASS AO=63;DP=182;FAO=63;FDP=182;FR=.;FRO=119;FSAF=11;FSAR=52;FSRF=67;FSRR=52;FWDB=-0.0066784;FXX=0.0162153;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.134;QD=3.82088;RBI=0.0170835;REFB=-0.000706755;REVB=0.015724;RO=117;SAF=11;SAR=52;SRF=66;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.48414;STB=0.779904;TYPE=snp;VARB=0.00218881;OID=.;OPOS=75786753;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:182:117:119:63:63:52:11:66:51:52:11:67:52 chr3 75786754 . G T 27.18 PASS AO=33;DP=188;FAO=33;FDP=187;FR=.;FRO=154;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=67;FSRR=87;FWDB=0.00500455;FXX=0.0105815;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.244;QD=0.581435;RBI=0.0122028;REFB=-0.00112279;REVB=-0.0111293;RO=154;SAF=15;SAR=18;SRF=67;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0253255;STB=0.516214;TYPE=snp;VARB=0.0076391;OID=.;OPOS=75786754;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:188:187:154:154:33:33:18:15:67:87:18:15:67:87 chr3 75786759 . T C 394.32 PASS AO=93;DP=188;FAO=93;FDP=188;FR=.;FRO=95;FSAF=53;FSAR=40;FSRF=34;FSRR=61;FWDB=-0.00974527;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=249.147;QD=8.38968;RBI=0.0216002;REFB=-0.00464507;REVB=-0.0192769;RO=93;SAF=53;SAR=40;SRF=33;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1938;STB=0.606;TYPE=snp;VARB=0.00554372;OID=.;OPOS=75786759;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:188:93:95:93:93:40:53:33:60:40:53:34:61 chr3 75786773 . T A 186.46 PASS AO=68;DP=195;FAO=68;FDP=195;FR=.;FRO=127;FSAF=39;FSAR=29;FSRF=52;FSRR=75;FWDB=-0.0100785;FXX=0.00510178;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.2486;QD=3.82484;RBI=0.0166304;REFB=-0.00891556;REVB=0.0132286;RO=126;SAF=39;SAR=29;SRF=52;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181621;STB=0.605795;TYPE=snp;VARB=0.0222606;OID=.;OPOS=75786773;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:195:126:127:68:68:29:39:52:74:29:39:52:75 chr3 75786784 . T C 24.06 PASS AO=31;DP=186;FAO=32;FDP=186;FR=.;FRO=154;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=75;FSRR=79;FWDB=-0.0120216;FXX=0.0106377;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.537;QD=0.517524;RBI=0.0171454;REFB=-0.00412011;REVB=-0.0122247;RO=153;SAF=14;SAR=17;SRF=74;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0412691;STB=0.515142;TYPE=snp;VARB=0.0190825;OID=.;OPOS=75786784;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:186:186:153:154:31:32:17:14:74:79:17:15:75:79 chr3 75786802 . G A 179.32 PASS AO=61;DP=179;FAO=62;FDP=172;FR=.;FRO=110;FSAF=38;FSAR=24;FSRF=51;FSRR=59;FWDB=-0.00727101;FXX=0.033706;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.903;QD=4.17011;RBI=0.0126648;REFB=-0.0072366;REVB=0.0103697;RO=111;SAF=37;SAR=24;SRF=51;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16705;STB=0.596188;TYPE=snp;VARB=0.0192071;OID=.;OPOS=75786802;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:172:111:110:61:62:24:37:51:60:24:38:51:59 chr3 75786827 . A T 559.2 PASS AO=100;DP=165;FAO=104;FDP=168;FR=.;FRO=64;FSAF=70;FSAR=34;FSRF=45;FSRR=19;FWDB=0.00646791;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.53;QD=13.3143;RBI=0.0107535;REFB=-0.0243237;REVB=0.00859089;RO=65;SAF=70;SAR=30;SRF=45;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00664039;STB=0.513121;TYPE=snp;VARB=0.0140581;OID=.;OPOS=75786827;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:168:65:64:100:104:30:70:45:20:34:70:45:19 chr3 75786832 . C T 787.53 PASS AO=130;DP=191;FAO=129;FDP=187;FR=.;FRO=58;FSAF=86;FSAR=43;FSRF=36;FSRR=22;FWDB=-0.00187978;FXX=0.0105815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.726;QD=16.8456;RBI=0.00736133;REFB=-0.00921605;REVB=-0.00711727;RO=58;SAF=87;SAR=43;SRF=35;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0420692;STB=0.515871;TYPE=snp;VARB=0.00294216;OID=.;OPOS=75786832;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:191:187:58:58:130:129:43:87:35:23:43:86:36:22 chr3 75786845 . T C 766.25 PASS AO=85;DP=183;FAO=94;FDP=165;FR=.,HEALED;FRO=44;FSAF=62;FSAR=32;FSRF=25;FSRR=19;FWDB=-0.0100135;FXX=0.0236672;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.991;QD=18.5758;RBI=0.0117857;REFB=-0.0355785;REVB=0.00621557;RO=52;SAF=52;SAR=33;SRF=31;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.011485;STB=0.531779;TYPE=snp;VARB=0.0397593;OID=.;OPOS=75786845;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:165:52:44:85:94:33:52:31:21:32:62:25:19 chr3 75786854 . A T 49.93 PASS AO=42;DP=206;FAO=43;FDP=205;FR=.;FRO=162;FSAF=34;FSAR=9;FSRF=98;FSRR=64;FWDB=-0.0228256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.2323;QD=0.974297;RBI=0.0236776;REFB=-0.0105121;REVB=-0.00629442;RO=162;SAF=33;SAR=9;SRF=97;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.278715;STB=0.676204;TYPE=snp;VARB=0.0634592;OID=.;OPOS=75786854;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:206:205:162:162:42:43:9:33:97:65:9:34:98:64 chr3 75786866 . G T 185.57 PASS AO=77;DP=235;FAO=76;FDP=235;FR=.;FRO=159;FSAF=45;FSAR=31;FSRF=95;FSRR=64;FWDB=-0.0231733;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=166.5;QD=3.15857;RBI=0.0257226;REFB=-0.0149646;REVB=-0.0111647;RO=158;SAF=46;SAR=31;SRF=94;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00299642;STB=0.503771;TYPE=snp;VARB=0.0311191;OID=.;OPOS=75786866;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:235:235:158:159:77:76:31:46:94:64:31:45:95:64 chr3 75786892 . A C 238.68 PASS AO=93;DP=286;FAO=95;FDP=284;FR=.;FRO=189;FSAF=51;FSAR=44;FSRF=87;FSRR=102;FWDB=0.00711887;FXX=0.00699276;HRUN=3;LEN=1;MLLD=228.695;QD=3.36162;RBI=0.00993957;REFB=-0.0109155;REVB=-0.00693663;RO=182;SAF=49;SAR=44;SRF=86;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0628801;STB=0.55081;TYPE=snp;VARB=0.0191641;OID=.;OPOS=75786892;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:286:284:182:189:93:95:44:49:86:96:44:51:87:102 chr3 75786899 . T C 195.81 PASS AO=92;DP=289;FAO=89;FDP=287;FR=.;FRO=198;FSAF=44;FSAR=45;FSRF=86;FSRR=112;FWDB=-0.0244775;FXX=0.00692018;HRUN=5;LEN=1;MLLD=40.3349;QD=2.72901;RBI=0.0615498;REFB=-0.00390708;REVB=-0.0564733;RO=155;SAF=47;SAR=45;SRF=45;SRR=110;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.245395;STB=0.541455;TYPE=snp;VARB=0.0111843;OID=.;OPOS=75786899;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:289:287:155:198:92:89:45:47:45:110:45:44:86:112 chr3 75786916 . C A 249.25 PASS AO=104;DP=311;FAO=101;FDP=307;FR=.;FRO=206;FSAF=50;FSAR=51;FSRF=86;FSRR=120;FWDB=0.00194744;FXX=0.0128613;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.285;QD=3.24755;RBI=0.00530432;REFB=-0.00235688;REVB=-0.00493389;RO=203;SAF=53;SAR=51;SRF=84;SRR=119;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110917;STB=0.552101;TYPE=snp;VARB=0.00779166;OID=.;OPOS=75786916;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:311:307:203:206:104:101:51:53:84:119:51:50:86:120 chr3 75786919 . A T 243.71 PASS AO=101;DP=305;FAO=100;FDP=306;FR=.;FRO=206;FSAF=50;FSAR=50;FSRF=82;FSRR=124;FWDB=-0.012041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.146;QD=3.18571;RBI=0.0220417;REFB=-0.000481254;REVB=-0.0184621;RO=193;SAF=52;SAR=49;SRF=77;SRR=116;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133236;STB=0.568614;TYPE=snp;VARB=0.00175078;OID=.;OPOS=75786919;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:305:306:193:206:101:100:49:52:77:116:50:50:82:124 chr3 75786965 . C T 89.05 PASS AO=74;DP=342;FAO=75;FDP=342;FR=.;FRO=267;FSAF=31;FSAR=44;FSRF=107;FSRR=160;FWDB=0.00641387;FXX=0.00291537;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.359;QD=1.04151;RBI=0.0175019;REFB=-0.00408091;REVB=-0.0162843;RO=265;SAF=31;SAR=43;SRF=106;SRR=159;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0250625;STB=0.510162;TYPE=snp;VARB=0.0239376;OID=.;OPOS=75786965;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:342:342:265:267:74:75:43:31:106:159:44:31:107:160 chr3 75786991 . C T 74.59 PASS AO=72;DP=359;FAO=74;FDP=360;FR=.;FRO=286;FSAF=31;FSAR=43;FSRF=140;FSRR=146;FWDB=-0.0372432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.2709;QD=0.828731;RBI=0.0381947;REFB=-0.00944511;REVB=0.00847208;RO=282;SAF=31;SAR=41;SRF=139;SRR=143;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0808277;STB=0.556524;TYPE=snp;VARB=0.0445562;OID=.;OPOS=75786991;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:359:360:282:286:72:74:41:31:139:143:43:31:140:146 chr3 75787015 . C T 259.9 PASS AO=113;DP=354;FAO=112;FDP=353;FR=.;FRO=241;FSAF=41;FSAR=71;FSRF=132;FSRR=109;FWDB=0.0100617;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.722;QD=2.945;RBI=0.0111471;REFB=-0.00241773;REVB=0.0047978;RO=240;SAF=41;SAR=72;SRF=131;SRR=109;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217865;STB=0.624653;TYPE=snp;VARB=0.00365098;OID=.;OPOS=75787015;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:354:353:240:241:113:112:72:41:131:109:71:41:132:109 chr3 75787032 . T C 65.26 PASS AO=71;DP=359;FAO=71;FDP=359;FR=.;FRO=288;FSAF=31;FSAR=40;FSRF=132;FSRR=156;FWDB=-0.00516411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.263;QD=0.72711;RBI=0.00745831;REFB=-0.00685149;REVB=0.0053813;RO=286;SAF=31;SAR=40;SRF=130;SRR=156;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0234384;STB=0.51762;TYPE=snp;VARB=0.0394094;OID=.;OPOS=75787032;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:359:359:286:288:71:71:40:31:130:156:40:31:132:156 chr3 75787043 . G A 444.94 PASS AO=175;DP=328;FAO=134;FDP=327;FR=.;FRO=193;FSAF=50;FSAR=84;FSRF=101;FSRR=92;FWDB=0.0261682;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.9882;QD=5.44266;RBI=0.0262761;REFB=-0.00549243;REVB=-0.00237893;RO=152;SAF=63;SAR=112;SRF=88;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190641;STB=0.590379;TYPE=snp;VARB=0.0133655;OID=.;OPOS=75787043;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:328:327:152:193:175:134:112:63:88:64:84:50:101:92 chr3 75787047 . G GACTTATA 97.94 PASS AO=63;DP=325;FAO=68;FDP=283;FR=.;FRO=215;FSAF=12;FSAR=56;FSRF=129;FSRR=86;FWDB=-0.0174721;FXX=0.110059;HRUN=1;LEN=7;MLLD=244.184;QD=1.38426;RBI=0.0206755;REFB=-0.00418667;REVB=-0.0110546;RO=252;SAF=9;SAR=54;SRF=141;SRR=111;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.552903;STB=0.822405;TYPE=ins;VARB=0.0105931;OID=.;OPOS=75787048;OREF=-;OALT=ACTTATA;OMAPALT=GACTTATA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:63:325:68:283:215:12:56:129:86:97:252:9:54:141:111 chr3 75787057 . G A 785.92 PASS AO=110;DP=276;FAO=151;FDP=255;FR=.,HEALED;FRO=101;FSAF=41;FSAR=110;FSRF=63;FSRR=38;FWDB=-0.00289397;FXX=0.0377344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.482;QD=12.3282;RBI=0.0711367;REFB=-0.00854694;REVB=0.0710778;RO=98;SAF=39;SAR=71;SRF=59;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216683;STB=0.653394;TYPE=snp;VARB=0.0218336;OID=.;OPOS=75787057;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:268:255:98:101:110:151:71:39:59:39:110:41:63:38 chr3 75787081 . A T 127.3 PASS AO=71;DP=255;FAO=69;FDP=254;FR=.;FRO=185;FSAF=17;FSAR=52;FSRF=82;FSRR=103;FWDB=0.0117055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.515;QD=2.00477;RBI=0.0117547;REFB=-0.0117993;REVB=-0.00107432;RO=178;SAF=19;SAR=52;SRF=78;SRR=100;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230108;STB=0.661391;TYPE=snp;VARB=0.0246908;OID=.;OPOS=75787081;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:255:254:178:185:71:69:52:19:78:100:52:17:82:103 chr3 75787116 . T G 178.34 PASS AO=89;DP=305;FAO=88;FDP=303;FR=.;FRO=215;FSAF=30;FSAR=58;FSRF=78;FSRR=137;FWDB=-0.0129017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.236;QD=2.35438;RBI=0.0129845;REFB=-0.00755669;REVB=0.00146425;RO=216;SAF=30;SAR=59;SRF=78;SRR=138;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0322382;STB=0.517084;TYPE=snp;VARB=0.018705;OID=.;OPOS=75787116;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:305:303:216:215:89:88:59:30:78:138:58:30:78:137 chr3 75787127 . G T 154.8 PASS AO=84;DP=298;FAO=82;FDP=295;FR=.;FRO=213;FSAF=30;FSAR=52;FSRF=86;FSRR=127;FWDB=-0.00173489;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.668;QD=2.09893;RBI=0.00836285;REFB=-0.0067915;REVB=-0.00818091;RO=214;SAF=31;SAR=53;SRF=86;SRR=128;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0425872;STB=0.529023;TYPE=snp;VARB=0.014627;OID=.;OPOS=75787127;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:298:295:214:213:84:82:53:31:86:128:52:30:86:127 chr3 75787145 . T C 54.28 PASS AO=61;DP=300;FAO=58;FDP=297;FR=.;FRO=239;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=106;FSRR=133;FWDB=0.00276282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.829;QD=0.730978;RBI=0.00515397;REFB=-0.000866826;REVB=-0.00435089;RO=239;SAF=28;SAR=33;SRF=106;SRR=133;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0201534;STB=0.517828;TYPE=snp;VARB=0.00377919;OID=.;OPOS=75787145;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:300:297:239:239:61:58:33:28:106:133:31:27:106:133 chr3 75787159 . C T 217.17 PASS AO=93;DP=288;FAO=91;FDP=285;FR=.;FRO=194;FSAF=55;FSAR=36;FSRF=89;FSRR=105;FWDB=-0.0157801;FXX=0.0104163;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.294;QD=3.04806;RBI=0.0207905;REFB=-0.00625526;REVB=-0.0135365;RO=193;SAF=55;SAR=38;SRF=89;SRR=104;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153228;STB=0.599329;TYPE=snp;VARB=0.0256305;OID=.;OPOS=75787159;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:288:285:193:194:93:91:38:55:89:104:36:55:89:105 chr3 75787169 . G A 426.38 PASS AO=122;DP=280;FAO=119;FDP=275;FR=.;FRO=156;FSAF=89;FSAR=30;FSRF=61;FSRR=95;FWDB=-0.00528076;FXX=0.00721996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.899;QD=6.20186;RBI=0.0191204;REFB=-0.00398309;REVB=-0.0183767;RO=154;SAF=90;SAR=32;SRF=61;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.358343;STB=0.711963;TYPE=snp;VARB=0.00209632;OID=.;OPOS=75787169;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:280:275:154:156:122:119:32:90:61:93:30:89:61:95 chr3 75787186 . C T 367.08 PASS AO=119;DP=295;FAO=115;FDP=291;FR=.;FRO=176;FSAF=92;FSAR=23;FSRF=65;FSRR=111;FWDB=-0.00121599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.601;QD=5.04573;RBI=0.0120281;REFB=-0.0127824;REVB=-0.0119665;RO=176;SAF=93;SAR=26;SRF=65;SRR=111;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.455871;STB=0.773399;TYPE=snp;VARB=0.0111666;OID=.;OPOS=75787186;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:295:291:176:176:119:115:26:93:65:111:23:92:65:111 chr3 75787221 . C T 26.28 PASS AO=45;DP=267;FAO=43;FDP=263;FR=.;FRO=220;FSAF=36;FSAR=7;FSRF=110;FSRR=110;FWDB=-0.0264563;FXX=0.00378774;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.617;QD=0.399717;RBI=0.0531766;REFB=-0.00625631;REVB=-0.0461282;RO=217;SAF=36;SAR=9;SRF=107;SRR=110;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.414832;STB=0.804587;TYPE=snp;VARB=0.0288672;OID=.;OPOS=75787221;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:267:263:217:220:45:43:9:36:107:110:7:36:110:110 chr3 75787224 . C T 42.04 PASS AO=49;DP=265;FAO=44;FDP=228;FR=.;FRO=184;FSAF=33;FSAR=11;FSRF=81;FSRR=103;FWDB=-0.0210465;FXX=0.126432;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.1237;QD=0.73748;RBI=0.0955356;REFB=-0.00884566;REVB=-0.0931885;RO=180;SAF=34;SAR=15;SRF=79;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.324789;STB=0.749886;TYPE=snp;VARB=0.00996831;OID=.;OPOS=75787224;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:265:228:180:184:49:44:15:34:79:101:11:33:81:103 chr3 75787353 . G A 10.26 PASS AO=19;DP=121;FAO=17;FDP=119;FR=.;FRO=102;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=79;FWDB=0.00826788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.9968;QD=0.344741;RBI=0.00948396;REFB=0.00289652;REVB=-0.00464625;RO=101;SAF=7;SAR=12;SRF=23;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212249;STB=0.674803;TYPE=snp;VARB=-0.00255159;OID=.;OPOS=75787353;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:121:119:101:102:19:17:12:7:23:78:10:7:23:79 chr3 75787372 . A T 104.2 PASS AO=44;DP=131;FAO=41;FDP=128;FR=.;FRO=87;FSAF=10;FSAR=31;FSRF=15;FSRR=72;FWDB=-0.00337726;FXX=0.00775134;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.476;QD=3.2563;RBI=0.00422729;REFB=-0.0125129;REVB=0.00254246;RO=85;SAF=10;SAR=34;SRF=14;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110018;STB=0.570606;TYPE=snp;VARB=0.0119842;OID=.;OPOS=75787372;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:128:85:87:44:41:34:10:14:71:31:10:15:72 chr3 75787382 . T C 505.68 PASS AO=91;DP=148;FAO=91;FDP=144;FR=.;FRO=53;FSAF=20;FSAR=71;FSRF=17;FSRR=36;FWDB=0.0151479;FXX=0.00689608;HRUN=3;LEN=1;MLLD=171.938;QD=14.0467;RBI=0.0157752;REFB=-0.00769854;REVB=0.00440432;RO=53;SAF=20;SAR=71;SRF=15;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0603356;STB=0.551069;TYPE=snp;VARB=0.00512293;OID=.;OPOS=75787382;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:144:53:53:91:91:71:20:15:38:71:20:17:36 chr3 75787405 . C T 248.34 PASS AO=70;DP=160;FAO=67;FDP=153;FR=.;FRO=86;FSAF=22;FSAR=45;FSRF=34;FSRR=52;FWDB=0.0239084;FXX=0.0254761;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.44;QD=6.49241;RBI=0.0243213;REFB=-0.0043089;REVB=-0.0044626;RO=85;SAF=22;SAR=48;SRF=34;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0939497;STB=0.541457;TYPE=snp;VARB=0.0084043;OID=.;OPOS=75787405;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:153:85:86:70:67:48:22:34:51:45:22:34:52 chr3 75787416 . C T 117.86 PASS AO=57;DP=191;FAO=55;FDP=188;FR=.;FRO=133;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=54;FSRR=79;FWDB=0.0033337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.421;QD=2.5076;RBI=0.0177659;REFB=0.000188781;REVB=-0.0174503;RO=131;SAF=25;SAR=32;SRF=52;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0510638;STB=0.534826;TYPE=snp;VARB=-0.000425344;OID=.;OPOS=75787416;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:191:188:131:133:57:55:32:25:52:79:30:25:54:79 chr3 75787424 . C G 354.67 PASS AO=92;DP=207;FAO=94;FDP=207;FR=.;FRO=113;FSAF=42;FSAR=52;FSRF=53;FSRR=60;FWDB=-0.000924066;FXX=0.00480746;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.518;QD=6.85353;RBI=0.0356296;REFB=-0.00130682;REVB=-0.0356177;RO=111;SAF=40;SAR=52;SRF=53;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0425426;STB=0.512233;TYPE=snp;VARB=0.00450054;OID=.;OPOS=75787424;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:207:111:113:92:94:52:40:53:58:52:42:53:60 chr3 75787427 . T C 212.58 PASS AO=77;DP=209;FAO=74;FDP=205;FR=.;FRO=131;FSAF=32;FSAR=42;FSRF=63;FSRR=68;FWDB=-0.00341224;FXX=0.00966137;HRUN=5;LEN=1;MLLD=175.967;QD=4.14799;RBI=0.0189446;REFB=0.000345055;REVB=-0.0186347;RO=130;SAF=32;SAR=45;SRF=62;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.069022;STB=0.531283;TYPE=snp;VARB=-0.000537618;OID=.;OPOS=75787427;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:205:130:131:77:74:45:32:62:68:42:32:63:68 chr3 75787464 . C T 353.46 PASS AO=109;DP=259;FAO=105;FDP=254;FR=.;FRO=149;FSAF=45;FSAR=60;FSRF=81;FSRR=68;FWDB=-0.0162931;FXX=0.00781219;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.0075;QD=5.56634;RBI=0.0295982;REFB=0.000699017;REVB=-0.0247101;RO=148;SAF=46;SAR=63;SRF=80;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122801;STB=0.567555;TYPE=snp;VARB=-0.00210391;OID=.;OPOS=75787464;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:259:254:148:149:109:105:63:46:80:68:60:45:81:68 chr3 75787486 . C T 560.17 PASS AO=134;DP=285;FAO=142;FDP=292;FR=.;FRO=150;FSAF=70;FSAR=72;FSRF=86;FSRR=64;FWDB=0.00257778;FXX=0.00680249;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.587;QD=7.67358;RBI=0.00497408;REFB=-0.0129935;REVB=0.004254;RO=148;SAF=63;SAR=71;SRF=87;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111775;STB=0.541243;TYPE=snp;VARB=0.0146432;OID=.;OPOS=75787486;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:285:292:148:150:134:142:71:63:87:61:72:70:86:64 chr3 75787516 . C G 385.38 PASS AO=130;DP=339;FAO=130;FDP=348;FR=.;FRO=218;FSAF=66;FSAR=64;FSRF=119;FSRR=99;FWDB=-0.00693224;FXX=0.00854676;HRUN=4;LEN=1;MLLD=276.457;QD=4.42964;RBI=0.0104137;REFB=-0.0081567;REVB=-0.0077711;RO=206;SAF=66;SAR=64;SRF=112;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0393239;STB=0.523937;TYPE=snp;VARB=0.0165101;OID=.;OPOS=75787516;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:339:348:206:218:130:130:64:66:112:94:64:66:119:99 chr3 75787519 . C A 438.14 PASS AO=142;DP=364;FAO=141;FDP=362;FR=.;FRO=221;FSAF=73;FSAR=68;FSRF=123;FSRR=98;FWDB=0.00644724;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=199.891;QD=4.84129;RBI=0.00711672;REFB=-0.010388;REVB=-0.00301346;RO=220;SAF=73;SAR=69;SRF=121;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0390112;STB=0.523772;TYPE=snp;VARB=0.00959259;OID=.;OPOS=75787519;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:364:362:220:221:142:141:69:73:121:99:68:73:123:98 chr3 75787520 . T G 659.89 PASS AO=172;DP=364;FAO=169;FDP=361;FR=.;FRO=192;FSAF=87;FSAR=82;FSRF=109;FSRR=83;FWDB=-0.000120466;FXX=0.00550949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.92;QD=7.31184;RBI=0.0108584;REFB=-0.00788352;REVB=0.0108577;RO=190;SAF=87;SAR=85;SRF=108;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0598029;STB=0.528212;TYPE=snp;VARB=0.0162345;OID=.;OPOS=75787520;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:364:361:190:192:172:169:85:87:108:82:82:87:109:83 chr3 75787637 . C T 363.69 PASS AO=112;DP=294;FAO=116;FDP=297;FR=.;FRO=181;FSAF=54;FSAR=62;FSRF=67;FSRR=114;FWDB=0.013134;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.714;QD=4.8982;RBI=0.0140592;REFB=-0.0197346;REVB=-0.0050158;RO=172;SAF=50;SAR=62;SRF=62;SRR=110;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0951359;STB=0.558852;TYPE=snp;VARB=0.0263995;OID=.;OPOS=75787637;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:294:297:172:181:112:116:62:50:62:110:62:54:67:114 chr3 75787645 . GAA G 213.33 PASS AO=77;DP=277;FAO=102;FDP=246;FR=.;FRO=144;FSAF=50;FSAR=52;FSRF=46;FSRR=98;FWDB=-0.0510283;FXX=0.0681792;HRUN=4;LEN=2;MLLD=34.7645;QD=3.46879;RBI=0.0530479;REFB=-0.0103807;REVB=-0.0144979;RO=116;SAF=30;SAR=47;SRF=32;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132788;STB=0.600365;TYPE=del;VARB=0.0150283;OID=.;OPOS=75787646;OREF=AA;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:77:236:102:246:144:50:52:46:98:99:116:30:47:32:84 chr3 75787679 . T C 343.51 PASS AO=119;DP=331;FAO=122;FDP=336;FR=.;FRO=214;FSAF=61;FSAR=61;FSRF=75;FSRR=139;FWDB=-1.7386e-05;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=171.316;QD=4.08939;RBI=0.00767093;REFB=-0.010023;REVB=-0.00767091;RO=212;SAF=60;SAR=59;SRF=73;SRR=139;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181244;STB=0.595223;TYPE=snp;VARB=0.0166569;OID=.;OPOS=75787679;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:331:336:212:214:119:122:59:60:73:139:61:61:75:139 chr3 75787688 . T A 415.07 PASS AO=89;DP=356;FAO=138;FDP=363;FR=.;FRO=225;FSAF=71;FSAR=67;FSRF=77;FSRR=148;FWDB=-0.00532941;FXX=0.0081965;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9851;QD=4.57377;RBI=0.0118543;REFB=-0.0208105;REVB=0.0105887;RO=154;SAF=28;SAR=61;SRF=29;SRR=125;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178079;STB=0.606196;TYPE=snp;VARB=0.0439512;OID=.;OPOS=75787688;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:303:363:154:225:89:138:61:28:29:125:67:71:77:148 chr3 75787702 . C G 1037.61 PASS AO=224;DP=400;FAO=220;FDP=400;FR=.;FRO=180;FSAF=96;FSAR=124;FSRF=70;FSRR=110;FWDB=-0.0265851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.4747;QD=10.3761;RBI=0.0510576;REFB=-0.036022;REVB=-0.0435903;RO=172;SAF=100;SAR=124;SRF=64;SRR=108;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0607384;STB=0.521834;TYPE=snp;VARB=0.0317035;OID=.;OPOS=75787702;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:400:400:172:180:224:220:124:100:64:108:124:96:70:110 chr3 75787726 . G A 2436.07 PASS AO=352;DP=431;FAO=330;FDP=400;FR=.;FRO=70;FSAF=161;FSAR=169;FSRF=27;FSRR=43;FWDB=-0.0128556;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.582;QD=24.3607;RBI=0.0231115;REFB=-0.00647246;REVB=0.0192061;RO=79;SAF=171;SAR=181;SRF=32;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.028022;STB=0.517904;TYPE=snp;VARB=0.00444504;OID=.;OPOS=75787726;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:431:400:79:70:352:330:181:171:32:47:169:161:27:43 chr3 75787732 . A C 174.15 PASS AO=120;DP=448;FAO=104;FDP=397;FR=.;FRO=293;FSAF=60;FSAR=44;FSRF=132;FSRR=161;FWDB=-0.00157681;FXX=0.00749981;HRUN=3;LEN=1;MLLD=126.063;QD=1.75467;RBI=0.0152207;REFB=-0.00591816;REVB=-0.0151388;RO=322;SAF=69;SAR=51;SRF=143;SRR=179;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161616;STB=0.59281;TYPE=snp;VARB=0.0127602;OID=.;OPOS=75787732;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:448:397:322:293:120:104:51:69:143:179:44:60:132:161 chr3 75787739 . A T 3718.22 PASS AO=404;DP=420;FAO=397;FDP=397;FR=.;FRO=0;FSAF=186;FSAR=211;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00286031;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.974;QD=37.4632;RBI=0.0239287;REFB=0;REVB=0.0237571;RO=0;SAF=210;SAR=194;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0019723;OID=.;OPOS=75787739;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:420:397:0:0:404:397:194:210:0:0:211:186:0:0 chr3 75787794 . A G 1232.46 PASS AO=351;DP=580;FAO=238;FDP=398;FR=.;FRO=160;FSAF=111;FSAR=127;FSRF=76;FSRR=84;FWDB=0.0104336;FXX=0.00499988;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.14;QD=12.3865;RBI=0.0214919;REFB=-0.0172711;REVB=0.0187894;RO=226;SAF=172;SAR=179;SRF=110;SRR=116;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00240327;STB=0.503477;TYPE=snp;VARB=0.0114351;OID=.;OPOS=75787794;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:580:398:226:160:351:238:179:172:110:116:127:111:76:84 chr3 75787809 . T C 756.19 PASS AO=279;DP=597;FAO=190;FDP=400;FR=.;FRO=210;FSAF=91;FSAR=99;FSRF=99;FSRR=111;FWDB=0.00975086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.717;QD=7.56191;RBI=0.0103456;REFB=-0.0388587;REVB=-0.00345714;RO=318;SAF=136;SAR=143;SRF=158;SRR=160;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00910534;STB=0.503955;TYPE=snp;VARB=0.0258036;OID=.;OPOS=75787809;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:597:400:318:210:279:190:143:136:158:160:99:91:99:111 chr3 75787869 . C T 1172.71 PASS AO=313;DP=543;FAO=233;FDP=400;FR=.;FRO=167;FSAF=108;FSAR=125;FSRF=67;FSRR=100;FWDB=-0.0116595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.2992;QD=11.7271;RBI=0.0265573;REFB=-0.0607512;REVB=-0.023861;RO=228;SAF=141;SAR=172;SRF=98;SRR=130;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0162924;STB=0.526257;TYPE=snp;VARB=0.0188983;OID=.;OPOS=75787869;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:543:400:228:167:313:233:172:141:98:130:125:108:67:100 chr3 75787870 . A G 1109.41 PASS AO=313;DP=542;FAO=227;FDP=400;FR=.;FRO=173;FSAF=105;FSAR=122;FSRF=71;FSRR=102;FWDB=-0.0053721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.8099;QD=11.0941;RBI=0.0128876;REFB=-0.00383853;REVB=-0.0117146;RO=226;SAF=141;SAR=172;SRF=95;SRR=131;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0236688;STB=0.522758;TYPE=snp;VARB=0.00174483;OID=.;OPOS=75787870;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:542:400:226:173:313:227:172:141:95:131:122:105:71:102 chr3 75787876 . G T 1231.51 PASS AO=321;DP=543;FAO=239;FDP=399;FR=.;FRO=160;FSAF=111;FSAR=128;FSRF=74;FSRR=86;FWDB=0.0159854;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.496;QD=12.346;RBI=0.016064;REFB=-0.0432566;REVB=-0.00158794;RO=219;SAF=145;SAR=176;SRF=95;SRR=124;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136209;STB=0.50078;TYPE=snp;VARB=0.025306;OID=.;OPOS=75787876;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:543:399:219:160:321:239:176:145:95:124:128:111:74:86 chr3 75787880 . A G 308.97 PASS AO=168;DP=538;FAO=130;FDP=400;FR=.;FRO=270;FSAF=63;FSAR=67;FSRF=124;FSRR=146;FWDB=-0.00573902;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.341;QD=3.08974;RBI=0.0139632;REFB=-0.000843554;REVB=-0.0127293;RO=369;SAF=81;SAR=87;SRF=161;SRR=208;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0549963;STB=0.517147;TYPE=snp;VARB=0.00248797;OID=.;OPOS=75787880;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:538:400:369:270:168:130:87:81:161:208:67:63:124:146 chr3 75787897 . T C 54.09 PASS AO=98;DP=515;FAO=73;FDP=399;FR=.;FRO=326;FSAF=32;FSAR=41;FSRF=143;FSRR=183;FWDB=-0.00508022;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.875;QD=0.542283;RBI=0.0113816;REFB=-0.00279646;REVB=-0.0101849;RO=408;SAF=41;SAR=57;SRF=185;SRR=223;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.046239;STB=0.500244;TYPE=snp;VARB=0.0156231;OID=.;OPOS=75787897;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:515:399:408:326:98:73:57:41:185:223:41:32:143:183 chr3 75787927 . A G 886.53 PASS AO=241;DP=466;FAO=204;FDP=399;FR=.;FRO=195;FSAF=86;FSAR=118;FSRF=79;FSRR=116;FWDB=0.00732448;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.354;QD=8.88748;RBI=0.018099;REFB=-0.00579916;REVB=-0.0165507;RO=218;SAF=96;SAR=145;SRF=90;SRR=128;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0131433;STB=0.508258;TYPE=snp;VARB=0.00509899;OID=.;OPOS=75787927;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:466:399:218:195:241:204:145:96:90:128:118:86:79:116 chr3 75787949 . C T 1198.58 PASS AO=248;DP=423;FAO=235;FDP=398;FR=.;FRO=163;FSAF=103;FSAR=132;FSRF=59;FSRR=104;FWDB=0.0165126;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.855;QD=12.0461;RBI=0.0167998;REFB=-0.011696;REVB=-0.00309311;RO=171;SAF=104;SAR=144;SRF=60;SRR=111;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0536763;STB=0.531994;TYPE=snp;VARB=0.00816595;OID=.;OPOS=75787949;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:423:398:171:163:248:235:144:104:60:111:132:103:59:104 chr3 75787961 . A G 140.14 PASS AO=106;DP=422;FAO=97;FDP=400;FR=.;FRO=303;FSAF=34;FSAR=63;FSRF=127;FSRR=176;FWDB=-0.0065168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.727;QD=1.40139;RBI=0.0131106;REFB=-0.0111424;REVB=-0.0113763;RO=311;SAF=38;SAR=68;SRF=124;SRR=187;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0538489;STB=0.555191;TYPE=snp;VARB=0.0289314;OID=.;OPOS=75787961;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:422:400:311:303:106:97:68:38:124:187:63:34:127:176 chr3 75787962 . G C 171.53 PASS AO=107;DP=418;FAO=104;FDP=400;FR=.;FRO=296;FSAF=46;FSAR=58;FSRF=107;FSRR=189;FWDB=-0.0270964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.989;QD=1.71533;RBI=0.0279196;REFB=-0.00559271;REVB=0.00672973;RO=311;SAF=47;SAR=60;SRF=113;SRR=198;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0985131;STB=0.561463;TYPE=snp;VARB=0.0382931;OID=.;OPOS=75787962;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:418:400:311:296:107:104:60:47:113:198:58:46:107:189 chr3 75787996 . C T 80.97 PASS AO=69;DP=306;FAO=66;FDP=300;FR=.;FRO=234;FSAF=29;FSAR=37;FSRF=78;FSRR=156;FWDB=-0.00994508;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.0746;QD=1.07958;RBI=0.0117816;REFB=0.000832753;REVB=0.00631685;RO=235;SAF=29;SAR=40;SRF=79;SRR=156;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113263;STB=0.585681;TYPE=snp;VARB=-0.00456503;OID=.;OPOS=75787996;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:306:300:235:234:69:66:40:29:79:156:37:29:78:156 chr3 75788010 . A C 2649 PASS AO=277;DP=277;FAO=276;FDP=276;FR=.;FRO=0;FSAF=109;FSAR=167;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.055;QD=38.3912;RBI=0.0137915;REFB=0;REVB=0.00826576;RO=0;SAF=106;SAR=171;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.55061e-06;OID=.;OPOS=75788010;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:277:276:0:0:277:276:171:106:0:0:167:109:0:0 chr3 75788023 . C T 785.88 PASS AO=161;DP=278;FAO=158;FDP=274;FR=.;FRO=116;FSAF=69;FSAR=89;FSRF=43;FSRR=73;FWDB=-0.00757002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.7633;QD=11.4728;RBI=0.0319005;REFB=-0.0317945;REVB=-0.0309893;RO=116;SAF=69;SAR=92;SRF=43;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.046042;STB=0.528607;TYPE=snp;VARB=0.0215943;OID=.;OPOS=75788023;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:278:274:116:116:161:158:92:69:43:73:89:69:43:73 chr3 75788028 . G C 183.58 PASS AO=78;DP=273;FAO=76;FDP=238;FR=.;FRO=162;FSAF=31;FSAR=45;FSRF=65;FSRR=97;FWDB=0.00656196;FXX=0.124995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.376;QD=3.08539;RBI=0.0187606;REFB=-0.00406463;REVB=-0.0175756;RO=161;SAF=31;SAR=47;SRF=63;SRR=98;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00751537;STB=0.5047;TYPE=snp;VARB=0.0151644;OID=.;OPOS=75788028;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:273:238:161:162:78:76:47:31:63:98:45:31:65:97 chr3 75788068 . A C 109.19 PASS AO=72;DP=295;FAO=72;FDP=294;FR=.;FRO=222;FSAF=35;FSAR=37;FSRF=83;FSRR=139;FWDB=-0.00334977;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=123.133;QD=1.48562;RBI=0.00903154;REFB=-0.0212282;REVB=-0.00838736;RO=221;SAF=35;SAR=37;SRF=83;SRR=138;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1409;STB=0.585195;TYPE=snp;VARB=0.0578934;OID=.;OPOS=75788068;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:295:294:221:222:72:72:37:35:83:138:37:35:83:139 chr3 75788076 . A C 1087.1 PASS AO=194;DP=308;FAO=195;FDP=304;FR=.;FRO=109;FSAF=92;FSAR=103;FSRF=41;FSRR=68;FWDB=0.00115826;FXX=0.0129866;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.2664;QD=14.3039;RBI=0.0260762;REFB=-0.00490433;REVB=0.0260505;RO=111;SAF=90;SAR=104;SRF=40;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.070882;STB=0.534535;TYPE=snp;VARB=0.00306167;OID=.;OPOS=75788076;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:308:304:111:109:194:195:104:90:40:71:103:92:41:68 chr3 75788088 . C T 135.55 PASS AO=81;DP=303;FAO=79;FDP=301;FR=.;FRO=222;FSAF=32;FSAR=47;FSRF=103;FSRR=119;FWDB=-0.0150861;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.2302;QD=1.80127;RBI=0.0253198;REFB=0.00895256;REVB=-0.0203348;RO=221;SAF=32;SAR=49;SRF=103;SRR=118;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0899428;STB=0.544297;TYPE=snp;VARB=-0.0247091;OID=.;OPOS=75788088;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:303:301:221:222:81:79:49:32:103:118:47:32:103:119 chr3 75788115 . G A 914.01 PASS AO=181;DP=305;FAO=178;FDP=300;FR=.;FRO=122;FSAF=87;FSAR=91;FSRF=51;FSRR=71;FWDB=-0.0289266;FXX=0.0066223;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.1632;QD=12.1868;RBI=0.0313174;REFB=-0.00815982;REVB=-0.0120011;RO=122;SAF=87;SAR=94;SRF=51;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0468489;STB=0.528813;TYPE=snp;VARB=0.00606873;OID=.;OPOS=75788115;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:305:300:122:122:181:178:94:87:51:71:91:87:51:71 chr3 75788130 . C A 104.93 PASS AO=81;DP=344;FAO=78;FDP=336;FR=.;FRO=258;FSAF=35;FSAR=43;FSRF=129;FSRR=129;FWDB=0.0179829;FXX=0.0088493;HRUN=3;LEN=1;MLLD=236.933;QD=1.24912;RBI=0.0249692;REFB=-0.00274455;REVB=-0.0173227;RO=260;SAF=35;SAR=46;SRF=129;SRR=131;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0816691;STB=0.539464;TYPE=snp;VARB=0.00963648;OID=.;OPOS=75788130;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:344:336:260:258:81:78:46:35:129:131:43:35:129:129 chr3 75788152 . T G 625.74 PASS AO=120;DP=346;FAO=146;FDP=289;FR=.;FRO=143;FSAF=87;FSAR=59;FSRF=70;FSRR=73;FWDB=0.0166975;FXX=0.159879;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.797;QD=8.66079;RBI=0.0348516;REFB=-0.00511144;REVB=0.0305913;RO=142;SAF=61;SAR=59;SRF=70;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0150682;STB=0.553518;TYPE=snp;VARB=0.00385696;OID=.;OPOS=75788152;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:346:289:142:143:120:146:59:61:70:72:59:87:70:73 chr3 75788199 . T C 141.54 PASS AO=99;DP=393;FAO=95;FDP=387;FR=.;FRO=292;FSAF=36;FSAR=59;FSRF=155;FSRR=137;FWDB=0.00289883;FXX=0.00257725;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.713;QD=1.4629;RBI=0.0421123;REFB=-0.00428525;REVB=0.0420124;RO=293;SAF=37;SAR=62;SRF=155;SRR=138;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196201;STB=0.614928;TYPE=snp;VARB=0.0157439;OID=.;OPOS=75788199;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:393:387:293:292:99:95:62:37:155:138:59:36:155:137 chr3 75788226 . C G 448.51 PASS AO=120;DP=353;FAO=119;FDP=264;FR=.;FRO=145;FSAF=65;FSAR=54;FSRF=73;FSRR=72;FWDB=0.00645057;FXX=0.247856;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.894;QD=6.79555;RBI=0.0200032;REFB=-0.00335487;REVB=-0.0189346;RO=144;SAF=65;SAR=55;SRF=72;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0411901;STB=0.523586;TYPE=snp;VARB=0.00128811;OID=.;OPOS=75788226;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:353:264:144:145:120:119:55:65:72:72:54:65:73:72 chr3 75788227 . A G 257.13 PASS AO=206;DP=353;FAO=110;FDP=346;FR=.;FRO=236;FSAF=65;FSAR=45;FSRF=104;FSRR=132;FWDB=0.00187477;FXX=0.00288176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.536;QD=2.97255;RBI=0.024861;REFB=-0.0150596;REVB=-0.0247902;RO=146;SAF=98;SAR=108;SRF=72;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133833;STB=0.602022;TYPE=snp;VARB=0.0111359;OID=.;OPOS=75788227;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:353:346:146:236:206:110:108:98:72:74:45:65:104:132 chr3 75788245 . C T 201.84 PASS AO=97;DP=330;FAO=96;FDP=323;FR=.;FRO=227;FSAF=54;FSAR=42;FSRF=106;FSRR=121;FWDB=0.0144086;FXX=0.00308632;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.435;QD=2.4996;RBI=0.0164997;REFB=-0.00741306;REVB=-0.0080395;RO=227;SAF=53;SAR=44;SRF=103;SRR=124;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111576;STB=0.567052;TYPE=snp;VARB=0.0255976;OID=.;OPOS=75788245;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:330:323:227:227:97:96:44:53:103:124:42:54:106:121 chr3 75788258 . C A 806.44 PASS AO=170;DP=294;FAO=164;FDP=288;FR=.;FRO=124;FSAF=79;FSAR=85;FSRF=59;FSRR=65;FWDB=-0.00919911;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=211.736;QD=11.2005;RBI=0.025409;REFB=-0.00152847;REVB=0.0236853;RO=123;SAF=80;SAR=90;SRF=59;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00706424;STB=0.502544;TYPE=snp;VARB=0.00114517;OID=.;OPOS=75788258;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:294:288:123:124:170:164:90:80:59:64:85:79:59:65 chr3 75788281 . T C 732.07 PASS AO=150;DP=252;FAO=144;FDP=246;FR=.;FRO=102;FSAF=66;FSAR=78;FSRF=46;FSRR=56;FWDB=-0.0256774;FXX=0.00404842;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.184;QD=11.9036;RBI=0.029123;REFB=-0.000816626;REVB=0.0137412;RO=101;SAF=67;SAR=83;SRF=46;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00660225;STB=0.503071;TYPE=snp;VARB=0.00111027;OID=.;OPOS=75788281;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:252:246:101:102:150:144:83:67:46:55:78:66:46:56 chr3 75788291 . A G 142.73 PASS AO=72;DP=244;FAO=69;FDP=238;FR=.;FRO=169;FSAF=27;FSAR=42;FSRF=77;FSRR=92;FWDB=0.00175777;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.153;QD=2.39879;RBI=0.0250469;REFB=-0.00259661;REVB=-0.0249852;RO=170;SAF=28;SAR=44;SRF=76;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0723429;STB=0.546943;TYPE=snp;VARB=0.00520192;OID=.;OPOS=75788291;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:238:170:169:72:69:44:28:76:94:42:27:77:92 chr3 75788292 . T A 194.86 PASS AO=131;DP=235;FAO=63;FDP=169;FR=.;FRO=106;FSAF=29;FSAR=34;FSRF=45;FSRR=61;FWDB=0.0543565;FXX=0.268387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.911;QD=4.61216;RBI=0.0549374;REFB=-0.0199301;REVB=0.00796801;RO=101;SAF=53;SAR=78;SRF=44;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0256811;STB=0.522664;TYPE=snp;VARB=0.0220311;OID=.;OPOS=75788292;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:235:169:101:106:131:63:78:53:44:57:34:29:45:61 chr3 75788314 . T C 85.01 PASS AO=51;DP=205;FAO=51;FDP=203;FR=.;FRO=152;FSAF=15;FSAR=36;FSRF=60;FSRR=92;FWDB=-0.00383771;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.139;QD=1.67515;RBI=0.00384595;REFB=-0.00295873;REVB=-0.000251601;RO=153;SAF=15;SAR=36;SRF=61;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145235;STB=0.584381;TYPE=snp;VARB=0.018585;OID=.;OPOS=75788314;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:205:203:153:152:51:51:36:15:61:92:36:15:60:92 chr3 75788316 . C T 120.88 PASS AO=58;DP=195;FAO=57;FDP=195;FR=.;FRO=138;FSAF=18;FSAR=39;FSRF=51;FSRR=87;FWDB=0.0334696;FXX=0.0101518;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.1881;QD=2.47965;RBI=0.0334883;REFB=-0.0177828;REVB=0.00111981;RO=137;SAF=16;SAR=42;SRF=52;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143414;STB=0.542634;TYPE=snp;VARB=0.046312;OID=.;OPOS=75788316;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:195:137:138:58:57:42:16:52:85:39:18:51:87 chr3 75788366 . C A 45.18 PASS AO=27;DP=113;FAO=27;FDP=112;FR=.;FRO=85;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=39;FSRR=46;FWDB=-0.00171041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.573;QD=1.61354;RBI=0.00941155;REFB=-0.00255134;REVB=-0.00925483;RO=84;SAF=8;SAR=19;SRF=40;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23513;STB=0.631887;TYPE=snp;VARB=0.0118657;OID=.;OPOS=75788366;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:113:112:84:85:27:27:19:8:40:44:19:8:39:46 chr3 75788434 . G T 52.75 PASS AO=8;DP=23;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=-0.0145519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.268;QD=8.1148;RBI=0.036296;REFB=-0.0646269;REVB=0.0332512;RO=14;SAF=4;SAR=4;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226511;STB=0.699677;TYPE=snp;VARB=0.0447965;OID=.;OPOS=75788434;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:23:26:14:14:8:12:4:4:10:4:8:4:10:4 chr3 75790444 . G A 335.61 PASS AO=111;DP=287;FAO=112;FDP=297;FR=.;FRO=185;FSAF=39;FSAR=73;FSRF=69;FSRR=116;FWDB=-0.0177351;FXX=0.0388337;HRUN=4;LEN=1;MLLD=131.552;QD=4.51996;RBI=0.0324162;REFB=-0.00613831;REVB=-0.0271344;RO=175;SAF=39;SAR=72;SRF=65;SRR=110;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0237581;STB=0.516811;TYPE=snp;VARB=0.00743843;OID=.;OPOS=75790444;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:287:297:175:185:111:112:72:39:65:110:73:39:69:116 chr3 75790446 . G T 22.56 PASS AO=48;DP=307;FAO=47;FDP=305;FR=.;FRO=258;FSAF=14;FSAR=33;FSRF=89;FSRR=169;FWDB=-0.0152969;FXX=0.00326787;HRUN=4;LEN=1;MLLD=228.344;QD=0.295838;RBI=0.0157912;REFB=-0.00547139;REVB=-0.00392003;RO=252;SAF=15;SAR=33;SRF=85;SRR=167;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0364622;STB=0.545829;TYPE=snp;VARB=0.0308768;OID=.;OPOS=75790446;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:307:305:252:258:48:47:33:15:85:167:33:14:89:169 chr3 75790447 . G A 25.03 PASS AO=49;DP=305;FAO=48;FDP=304;FR=.;FRO=256;FSAF=14;FSAR=34;FSRF=86;FSRR=170;FWDB=-0.00938918;FXX=0.0161807;HRUN=4;LEN=1;MLLD=105.186;QD=0.329401;RBI=0.00940276;REFB=-0.000204553;REVB=0.000505089;RO=245;SAF=15;SAR=34;SRF=77;SRR=168;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.012325;STB=0.54346;TYPE=snp;VARB=0.0029375;OID=.;OPOS=75790447;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:305:304:245:256:49:48:34:15:77:168:34:14:86:170 chr3 75790466 . G T 37.45 PASS AO=57;DP=333;FAO=57;FDP=331;FR=.;FRO=274;FSAF=15;FSAR=42;FSRF=89;FSRR=185;FWDB=-0.0774593;FXX=0.00301196;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.015;QD=0.452561;RBI=0.0775639;REFB=0.000908827;REVB=0.00402598;RO=275;SAF=15;SAR=42;SRF=90;SRR=185;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0995066;STB=0.561922;TYPE=snp;VARB=-0.00511345;OID=.;OPOS=75790466;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:333:331:275:274:57:57:42:15:90:185:42:15:89:185 chr3 75790479 . C T 328.2 PASS AO=123;DP=343;FAO=120;FDP=339;FR=.;FRO=219;FSAF=39;FSAR=81;FSRF=69;FSRR=150;FWDB=0.00431227;FXX=0.00877167;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.319;QD=3.87259;RBI=0.0121172;REFB=-0.000107159;REVB=-0.0113239;RO=219;SAF=39;SAR=84;SRF=69;SRR=150;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00261917;STB=0.507348;TYPE=snp;VARB=5.06404e-05;OID=.;OPOS=75790479;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:343:339:219:219:123:120:84:39:69:150:81:39:69:150 chr3 75790513 . T C 2920.09 PASS AO=305;DP=308;FAO=305;FDP=305;FR=.;FRO=0;FSAF=99;FSAR=206;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014331;FXX=0.0129446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.139;QD=38.2962;RBI=0.0204427;REFB=-0.0145658;REVB=0.0145784;RO=1;SAF=100;SAR=205;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00232102;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.33005e-05;OID=.;OPOS=75790513;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:308:305:1:0:305:305:205:100:0:1:206:99:0:0 chr3 75790797 . C T 18.81 PASS AO=19;DP=109;FAO=19;FDP=108;FR=.;FRO=89;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=61;FSRR=28;FWDB=0.026656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.767;QD=0.696684;RBI=0.0448879;REFB=-0.00580921;REVB=0.0361162;RO=89;SAF=8;SAR=11;SRF=61;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.329612;STB=0.708489;TYPE=snp;VARB=0.0196069;OID=.;OPOS=75790797;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:109:108:89:89:19:19:11:8:61:28:11:8:61:28 chr3 75790811 . G T 16.13 PASS AO=16;DP=101;FAO=17;FDP=100;FR=.;FRO=83;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=55;FSRR=28;FWDB=-0.0127894;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.9147;QD=0.645202;RBI=0.0129586;REFB=-0.0131345;REVB=0.00208733;RO=84;SAF=5;SAR=11;SRF=57;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.437555;STB=0.741183;TYPE=snp;VARB=0.0906488;OID=.;OPOS=75790811;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:101:100:84:83:16:17:11:5:57:27:11:6:55:28 chr3 75790822 . A G 139.16 PASS AO=35;DP=79;FAO=35;FDP=78;FR=.;FRO=43;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=-0.0231214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.327;QD=7.13632;RBI=0.0293249;REFB=-0.00683052;REVB=-0.0180375;RO=42;SAF=21;SAR=14;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144418;STB=0.587579;TYPE=snp;VARB=0.0100431;OID=.;OPOS=75790822;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:78:42:43:35:35:14:21:19:23:14:21:19:24 chr3 75790864 . T A 23.53 PASS AO=11;DP=45;FAO=11;FDP=47;FR=.;FRO=36;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.173097;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.4229;QD=2.0022;RBI=0.174154;REFB=-0.0399835;REVB=0.0191631;RO=27;SAF=3;SAR=8;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175059;STB=0.718349;TYPE=snp;VARB=0.106591;OID=.;OPOS=75790864;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:45:47:27:36:11:11:8:3:11:16:8:3:20:16 chr3 75790867 . C A 20.12 PASS AO=10;DP=46;FAO=10;FDP=46;FR=.;FRO=36;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.0885555;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.993;QD=1.74966;RBI=0.0886424;REFB=-0.00767921;REVB=-0.00392422;RO=35;SAF=4;SAR=6;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172494;STB=0.620451;TYPE=snp;VARB=0.0149231;OID=.;OPOS=75790867;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:46:46:35:36:10:10:6:4:19:16:6:4:20:16 chr3 75986663 . C A 611.63 PASS AO=312;DP=704;FAO=172;FDP=396;FR=.;FRO=224;FSAF=92;FSAR=80;FSRF=118;FSRR=106;FWDB=-0.00996735;FXX=0.00999975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.598;QD=6.17803;RBI=0.0110117;REFB=-0.0290109;REVB=-0.00468072;RO=379;SAF=176;SAR=136;SRF=195;SRR=184;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0497573;STB=0.5046;TYPE=snp;VARB=0.0285121;OID=.;OPOS=75986663;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:704:396:379:224:312:172:136:176:195:184:80:92:118:106 chr3 75986686 . A G 634.82 PASS AO=365;DP=801;FAO=175;FDP=398;FR=.;FRO=223;FSAF=85;FSAR=90;FSRF=120;FSRR=103;FWDB=-0.0117306;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.57;QD=6.38011;RBI=0.0722014;REFB=-0.018898;REVB=0.071242;RO=429;SAF=190;SAR=175;SRF=222;SRR=207;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0030129;STB=0.529332;TYPE=snp;VARB=0.0331209;OID=.;OPOS=75986686;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:801:398:429:223:365:175:175:190:222:207:90:85:120:103 chr3 75986719 . G C 691.71 PASS AO=373;DP=824;FAO=178;FDP=384;FR=.;FRO=206;FSAF=79;FSAR=99;FSRF=109;FSRR=97;FWDB=-0.00117011;FXX=0.039999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.6941;QD=7.20526;RBI=0.0301281;REFB=-0.0131229;REVB=-0.0301054;RO=417;SAF=162;SAR=211;SRF=210;SRR=207;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0670697;STB=0.545865;TYPE=snp;VARB=0.0150763;OID=.;OPOS=75986719;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:824:384:417:206:373:178:211:162:210:207:99:79:109:97 chr3 77588065 . A AT 23.96 PASS AO=12;DP=72;FAO=21;FDP=56;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=0.0870374;FXX=0.151492;HRUN=8;LEN=1;MLLD=7.3975;QD=1.7115;RBI=0.0911287;REFB=-0.0825294;REVB=0.0269985;RO=44;SAF=1;SAR=11;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.553937;STB=0.576916;TYPE=ins;VARB=0.0885648;OID=.;OPOS=77588066;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:12:72:21:56:35:11:10:14:21:23:44:1:11:20:24 chr3 77588074 . C T 11.2 PASS AO=10;DP=64;FAO=10;FDP=64;FR=.;FRO=54;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=34;FWDB=-0.0033784;FXX=0.0447694;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.636;QD=0.700247;RBI=0.00347037;REFB=-0.00416922;REVB=0.000793652;RO=53;SAF=5;SAR=5;SRF=20;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152729;STB=0.566763;TYPE=snp;VARB=0.0202527;OID=.;OPOS=77588074;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:64:64:53:54:10:10:5:5:20:33:7:3:20:34 chr3 77860987 . A G 127.12 PASS AO=23;DP=37;FAO=23;FDP=37;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.081788;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.4664;QD=13.7424;RBI=0.082015;REFB=-0.00687662;REVB=-0.00609772;RO=12;SAF=5;SAR=18;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220431;STB=0.660863;TYPE=snp;VARB=0.0125806;OID=.;OPOS=77860987;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:37:37:12:14:23:23:18:5:6:6:18:5:8:6 chr3 78685024 . C T 270.31 PASS AO=77;DP=182;FAO=77;FDP=181;FR=.;FRO=104;FSAF=21;FSAR=56;FSRF=44;FSRR=60;FWDB=-0.00761437;FXX=0.0109284;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.6041;QD=5.97361;RBI=0.0584358;REFB=-0.0220087;REVB=-0.0579376;RO=101;SAF=20;SAR=57;SRF=42;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184669;STB=0.599051;TYPE=snp;VARB=0.033744;OID=.;OPOS=78685024;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:181:101:104:77:77:57:20:42:59:56:21:44:60 chr3 78700901 . G T 314.75 PASS AO=92;DP=222;FAO=92;FDP=222;FR=.;FRO=130;FSAF=71;FSAR=21;FSRF=69;FSRR=61;FWDB=-0.00895757;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.263;QD=5.67113;RBI=0.0371745;REFB=-0.0106172;REVB=-0.0360791;RO=130;SAF=71;SAR=21;SRF=69;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.291393;STB=0.664421;TYPE=snp;VARB=0.0131937;OID=.;OPOS=78700901;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:222:130:130:92:92:21:71:69:61:21:71:69:61 chr3 78717343 . C T 441 PASS AO=95;DP=177;FAO=95;FDP=177;FR=.;FRO=82;FSAF=44;FSAR=51;FSRF=53;FSRR=29;FWDB=-0.0226827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.464;QD=9.96607;RBI=0.022918;REFB=-0.0140912;REVB=-0.00327576;RO=82;SAF=44;SAR=51;SRF=53;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154367;STB=0.584251;TYPE=snp;VARB=0.0103055;OID=.;OPOS=78717343;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:177:82:82:95:95:51:44:53:29:51:44:53:29 chr3 80677187 . T C 845.32 PASS AO=91;DP=94;FAO=93;FDP=94;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=57;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00758209;FXX=0.0105252;HRUN=4;LEN=1;MLLD=137.55;QD=35.9711;RBI=0.007687;REFB=-0.142962;REVB=0.00126562;RO=2;SAF=34;SAR=57;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0270634;STB=0.506848;TYPE=snp;VARB=0.00024275;OID=.;OPOS=80677187;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:94:94:2:1:91:93:57:34:2:0:57:36:1:0 chr3 80677225 . G A 126.28 PASS AO=33;DP=73;FAO=32;FDP=72;FR=.;FRO=40;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=10;FSRR=30;FWDB=-0.0359908;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.511;QD=7.01542;RBI=0.0359935;REFB=-0.00988208;REVB=-0.000439494;RO=40;SAF=12;SAR=21;SRF=10;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124918;STB=0.559845;TYPE=snp;VARB=0.0103815;OID=.;OPOS=80677225;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:72:40:40:33:32:21:12:10:30:21:11:10:30 chr3 81643167 . T C 1235.39 PASS AO=135;DP=140;FAO=136;FDP=140;FR=.;FRO=4;FSAF=44;FSAR=92;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.00656224;FXX=0.0209776;HRUN=3;LEN=1;MLLD=97.6127;QD=35.2969;RBI=0.0124365;REFB=-0.00598013;REVB=0.0105642;RO=4;SAF=44;SAR=91;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00473162;STB=0.502403;TYPE=snp;VARB=0.000240946;OID=.;OPOS=81643167;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:140:140:4:4:135:136:91:44:1:3:92:44:1:3 chr3 86411485 . A G 162.12 PASS AO=34;DP=78;FAO=42;FDP=90;FR=.;FRO=48;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=0.0192811;FXX=0.052626;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.759;QD=7.2053;RBI=0.0199032;REFB=-0.0356996;REVB=0.00493747;RO=39;SAF=20;SAR=14;SRF=25;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0525375;STB=0.523798;TYPE=snp;VARB=0.0253402;OID=.;OPOS=86411485;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:90:39:48:34:42:14:20:25:14:22:20:25:23 chr3 86411527 . G A 223.35 PASS AO=38;DP=62;FAO=40;FDP=63;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=27;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.0290055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.5024;QD=14.1812;RBI=0.032075;REFB=-0.0155903;REVB=-0.0136927;RO=23;SAF=13;SAR=25;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130997;STB=0.577377;TYPE=snp;VARB=0.00650134;OID=.;OPOS=86411527;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:62:63:23:23:38:40:25:13:12:11:27:13:12:11 chr3 86995839 . T TC 407.11 PASS AO=47;DP=59;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0440739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=21.5364;QD=30.1565;RBI=0.0879326;REFB=0;REVB=0.0760897;RO=10;SAF=13;SAR=34;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159319;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00431543;OID=.;OPOS=86995840;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:47:59:54:54:0:15:39:0:0:37:10:13:34:7:3 chr3 87295049 . T C 326.23 PASS AO=83;DP=180;FAO=83;FDP=180;FR=.;FRO=97;FSAF=26;FSAR=57;FSRF=41;FSRR=56;FWDB=0.00468673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.327;QD=7.24946;RBI=0.006953;REFB=-0.0149261;REVB=-0.00513603;RO=96;SAF=26;SAR=57;SRF=40;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110661;STB=0.565175;TYPE=snp;VARB=0.0191243;OID=.;OPOS=87295049;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:180:96:97:83:83:57:26:40:56:57:26:41:56 chr3 87304561 . G A 338.2 PASS AO=78;DP=157;FAO=78;FDP=156;FR=.;FRO=78;FSAF=38;FSAR=40;FSRF=26;FSRR=52;FWDB=-0.00754671;FXX=0.0126574;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.937;QD=8.67179;RBI=0.00771777;REFB=-0.00935355;REVB=-0.00161591;RO=76;SAF=38;SAR=40;SRF=25;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142988;STB=0.577259;TYPE=snp;VARB=0.0101818;OID=.;OPOS=87304561;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:156:76:78:78:78:40:38:25:51:40:38:26:52 chr3 87791778 . C T 1422.01 PASS AO=148;DP=148;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0420596;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2417;QD=38.4328;RBI=0.0425351;REFB=0;REVB=-0.00634213;RO=0;SAF=72;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.85252e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000159739;OID=.;OPOS=87791778;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:148:148:0:0:148:148:76:72:0:0:76:72:0:0 chr3 88041650 . G A 551.01 PASS AO=175;DP=429;FAO=165;FDP=400;FR=.;FRO=235;FSAF=69;FSAR=96;FSRF=122;FSRR=113;FWDB=0.0101888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.022;QD=5.51005;RBI=0.0230147;REFB=-0.00380589;REVB=0.0206365;RO=252;SAF=76;SAR=99;SRF=132;SRR=120;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0950119;STB=0.559751;TYPE=snp;VARB=0.00573019;OID=.;OPOS=88041650;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:429:400:252:235:175:165:99:76:132:120:96:69:122:113 chr3 88101694 . G T 3675.89 PASS AO=419;DP=428;FAO=391;FDP=391;FR=.;FRO=0;FSAF=143;FSAR=248;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00320613;FXX=0.0224994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.393;QD=37.6051;RBI=0.00346401;REFB=-0.0322581;REVB=-0.00131152;RO=5;SAF=153;SAR=266;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0105213;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.16108e-05;OID=.;OPOS=88101694;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:428:391:5:0:419:391:266:153:4:1:248:143:0:0 chr3 88105264 . A C 1797.02 PASS AO=199;DP=207;FAO=200;FDP=208;FR=.;FRO=8;FSAF=99;FSAR=101;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.00957773;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=214.37;QD=34.558;RBI=0.0156331;REFB=-0.177475;REVB=-0.0123556;RO=3;SAF=99;SAR=100;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0142113;STB=0.505;TYPE=snp;VARB=0.000361854;OID=.;OPOS=88105264;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:207:208:3:8:199:200:100:99:3:0:101:99:5:3 chr3 88105818 . T C 977.43 PASS AO=102;DP=102;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00619655;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7444;QD=37.9585;RBI=0.0489629;REFB=0;REVB=0.0485692;RO=0;SAF=38;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30493e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000302178;OID=.;OPOS=88105818;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:102:103:0:0:102:103:64:38:0:0:65:38:0:0 chr3 88105879 . TACTTC T 852.71 PASS AO=87;DP=106;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183697;FXX=0.126201;HRUN=1;LEN=5;MLLD=267.153;QD=37.8983;RBI=0.0450217;REFB=0;REVB=0.0411036;RO=0;SAF=35;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=2.1992e-06;OID=.;OPOS=88105880;OREF=ACTTC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:87:103:90:90:0:37:53:0:0:40:0:35:52:0:0 chr3 88189341 . T C 1772.83 PASS AO=192;DP=196;FAO=192;FDP=196;FR=.;FRO=4;FSAF=97;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.0569215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0764;QD=36.1803;RBI=0.0623244;REFB=-0.163129;REVB=0.0253826;RO=1;SAF=97;SAR=95;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00498656;STB=0.510308;TYPE=snp;VARB=0.00189255;OID=.;OPOS=88189341;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:196:196:1:4:192:192:95:97:0:1:95:97:0:4 chr3 88190768 . C A 1292.76 PASS AO=134;DP=134;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176517;FXX=0.0145975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.438;QD=38.3041;RBI=0.0182377;REFB=0;REVB=0.00458614;RO=0;SAF=89;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00010749;OID=.;OPOS=88190768;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:134:135:0:0:134:135:45:89:0:0:45:90:0:0 chr3 88190809 . C T 1592.99 PASS AO=166;DP=167;FAO=166;FDP=166;FR=.;FRO=0;FSAF=112;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0120645;FXX=0.0177504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.465;QD=38.3854;RBI=0.0126346;REFB=0;REVB=0.0037526;RO=0;SAF=112;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.72478e-05;OID=.;OPOS=88190809;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:167:166:0:0:166:166:54:112:0:0:54:112:0:0 chr3 88191170 . TGGGGA TGGGA,TGGG 839.31 PASS AO=64,42;DP=144;FAO=128,0;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=73,0;FSAR=55,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0562956,-0.0192932;FXX=0.0857082;HRUN=4,4;LEN=1,2;MLLD=18.3577,168.583;QD=26.2285;RBI=0.095596,0.037721;REFB=0,0;REVB=-0.0772619,0.0324137;RO=4;SAF=46,17;SAR=18,25;SRF=4;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.03932,-0.0984373;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=-0.0285206,0;OID=.,.;OPOS=88191171,88191174;OREF=G,GA;OALT=-,-;OMAPALT=TGGGA,TGGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:64,42:134:128,0:128:0:73,0:55,0:0:0:74:4:46,17:18,25:4:0 chr3 88191446 . C CAA,CAAA,A 472.64 PASS AO=17,19,14;DP=65;FAO=33,25,8;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=21,22,7;FSAR=12,3,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0585628,-0.0386272,0.0265454;FXX=0.0149231;HRUN=8,8,1;LEN=2,3,1;MLLD=13.2334,14.0928,252.102;QD=28.6446;RBI=0.0966446,0.0637162,0.032871;REFB=0,0,0;REVB=0.0768803,0.0506725,0.0193867;RO=2;SAF=13,16,12;SAR=4,3,2;SRF=2;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.0654562,-0.0541411,-0.069999;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=ins,ins,snp;VARB=-0.0819601,0.000224649,0.0104197;OID=.,.,.;OPOS=88191447,88191447,88191446;OREF=-,-,C;OALT=AA,AAA,A;OMAPALT=CAA,CAAA,A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:25:65:66:2:0:17,19,14:33,25,8:4,3,2:13,16,12:2:0:12,3,1:21,22,7:0:0 chr3 88192423 . A G 1257.54 PASS AO=132;DP=133;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0342153;FXX=0.00751823;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.759;QD=38.1073;RBI=0.0411569;REFB=0;REVB=0.0228737;RO=0;SAF=65;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.83182e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.83884e-05;OID=.;OPOS=88192423;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:133:132:0:0:132:132:67:65:0:0:67:65:0:0 chr3 88192484 . T C 1299.01 PASS AO=140;DP=144;FAO=143;FDP=146;FR=.;FRO=3;FSAF=52;FSAR=91;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0502147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0064;QD=35.5894;RBI=0.0526525;REFB=-0.100165;REVB=0.0158357;RO=4;SAF=50;SAR=90;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00818907;STB=0.506701;TYPE=snp;VARB=0.00171406;OID=.;OPOS=88192484;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:144:146:4:3:140:143:90:50:2:2:91:52:2:1 chr3 88199298 . T C 195.16 PASS AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.627;QD=37.1733;RBI=0.0281339;REFB=0;REVB=-0.0105262;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000159781;OID=.;OPOS=88199298;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:21:21:0:0:21:21:9:12:0:0:9:12:0:0 chr3 89498428 . G A 479.71 PASS AO=117;DP=267;FAO=127;FDP=277;FR=.;FRO=150;FSAF=78;FSAR=49;FSRF=70;FSRR=80;FWDB=0.00231543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.443;QD=6.92726;RBI=0.00705086;REFB=-0.0256131;REVB=-0.00665984;RO=150;SAF=78;SAR=39;SRF=70;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209385;STB=0.581135;TYPE=snp;VARB=0.0354785;OID=.;OPOS=89498428;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:267:277:150:150:117:127:39:78:70:80:49:78:70:80 chr3 89521693 . T C 403.36 PASS AO=107;DP=238;FAO=107;FDP=237;FR=.;FRO=130;FSAF=36;FSAR=71;FSRF=65;FSRR=65;FWDB=-0.00550373;FXX=0.0042015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.035;QD=6.80776;RBI=0.00987273;REFB=-0.00749138;REVB=-0.00819632;RO=130;SAF=36;SAR=71;SRF=65;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169639;STB=0.594247;TYPE=snp;VARB=0.00793894;OID=.;OPOS=89521693;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:238:237:130:130:107:107:71:36:65:65:71:36:65:65 chr3 93780109 . G C 1924.9 PASS AO=211;DP=219;FAO=212;FDP=218;FR=.;FRO=6;FSAF=142;FSAR=70;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.00102424;FXX=0.004566;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.36;QD=35.3192;RBI=0.00222006;REFB=0.0561997;REVB=-0.00196967;RO=5;SAF=141;SAR=70;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00338772;STB=0.505264;TYPE=snp;VARB=-0.00152586;OID=.;OPOS=93780109;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:219:218:5:6:211:212:70:141:3:2:70:142:3:3 chr3 96327750 . C T 45.9 PASS AO=14;DP=41;FAO=14;FDP=41;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=0.062855;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.726;QD=4.47848;RBI=0.063048;REFB=0.000675721;REVB=-0.00492967;RO=27;SAF=6;SAR=8;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110257;STB=0.565127;TYPE=snp;VARB=0.000110599;OID=.;OPOS=96327750;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:41:41:27:27:14:14:8:6:9:18:8:6:9:18 chr3 97365038 . G A 672.62 PASS AO=145;DP=268;FAO=145;FDP=269;FR=.;FRO=124;FSAF=77;FSAR=68;FSRF=56;FSRR=68;FWDB=-0.0154916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.344;QD=10.0018;RBI=0.0158589;REFB=-0.00103988;REVB=0.00339331;RO=122;SAF=77;SAR=68;SRF=56;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0604027;STB=0.53658;TYPE=snp;VARB=0.000622694;OID=.;OPOS=97365038;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:268:269:122:124:145:145:68:77:56:66:68:77:56:68 chr3 97365074 . A G 642.7 PASS AO=142;DP=268;FAO=142;FDP=270;FR=.;FRO=128;FSAF=70;FSAR=72;FSRF=56;FSRR=72;FWDB=-0.0124705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.9752;QD=9.52152;RBI=0.0126809;REFB=-0.0206527;REVB=0.00230011;RO=124;SAF=70;SAR=72;SRF=55;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0422719;STB=0.526312;TYPE=snp;VARB=0.0204375;OID=.;OPOS=97365074;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:268:270:124:128:142:142:72:70:55:69:72:70:56:72 chr3 97591153 . C T 358.95 PASS AO=66;DP=117;FAO=72;FDP=123;FR=.;FRO=51;FSAF=39;FSAR=33;FSRF=15;FSRR=36;FWDB=0.0187404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.162;QD=11.6733;RBI=0.0190099;REFB=-0.0223164;REVB=0.00318978;RO=50;SAF=35;SAR=31;SRF=15;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180681;STB=0.601582;TYPE=snp;VARB=0.0199593;OID=.;OPOS=97591153;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:123:50:51:66:72:31:35:15:35:33:39:15:36 chr3 97593485 . C T 361.46 PASS AO=76;DP=140;FAO=77;FDP=141;FR=.;FRO=64;FSAF=24;FSAR=53;FSRF=26;FSRR=38;FWDB=0.0173972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1605;QD=10.2543;RBI=0.021947;REFB=-0.0177164;REVB=-0.0133793;RO=63;SAF=24;SAR=52;SRF=24;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0608381;STB=0.548187;TYPE=snp;VARB=0.012662;OID=.;OPOS=97593485;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:141:63:64:76:77:52:24:24:39:53:24:26:38 chr3 97607290 . G A 368.69 PASS AO=86;DP=172;FAO=86;FDP=172;FR=.;FRO=86;FSAF=37;FSAR=49;FSRF=39;FSRR=47;FWDB=-0.0397614;FXX=0.0114936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.869;QD=8.57421;RBI=0.0401601;REFB=-0.0165438;REVB=0.00564505;RO=85;SAF=37;SAR=49;SRF=38;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154709;STB=0.511817;TYPE=snp;VARB=0.0148292;OID=.;OPOS=97607290;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:172:85:86:86:86:49:37:38:47:49:37:39:47 chr3 97660084 . C T 379.72 PASS AO=79;DP=143;FAO=79;FDP=143;FR=.;FRO=64;FSAF=44;FSAR=35;FSRF=25;FSRR=39;FWDB=0.00816838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.554;QD=10.6216;RBI=0.00831865;REFB=-0.00113077;REVB=-0.00157402;RO=63;SAF=44;SAR=35;SRF=25;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129745;STB=0.57413;TYPE=snp;VARB=0.00136026;OID=.;OPOS=97660084;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:63:64:79:79:35:44:25:38:35:44:25:39 chr3 97660106 . A C 154.56 PASS AO=47;DP=126;FAO=48;FDP=126;FR=.;FRO=78;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=42;FSRR=36;FWDB=0.0357034;FXX=0.0307669;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.312;QD=4.90664;RBI=0.0369628;REFB=-0.0114479;REVB=-0.00956652;RO=77;SAF=16;SAR=31;SRF=42;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228147;STB=0.616191;TYPE=snp;VARB=0.012424;OID=.;OPOS=97660106;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:77:78:47:48:31:16:42:35:31:17:42:36 chr3 97664725 . C T 147.14 PASS AO=38;DP=96;FAO=41;FDP=100;FR=.;FRO=59;FSAF=14;FSAR=27;FSRF=23;FSRR=36;FWDB=0.0530907;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.19;QD=5.88546;RBI=0.0534403;REFB=-0.024993;REVB=-0.00610224;RO=58;SAF=15;SAR=23;SRF=23;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00201859;STB=0.531085;TYPE=snp;VARB=0.0320641;OID=.;OPOS=97664725;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:100:58:59:38:41:23:15:23:35:27:14:23:36 chr3 97673268 . A C 1723.32 PASS AO=179;DP=179;FAO=179;FDP=179;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00123413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.356;QD=38.5099;RBI=0.00539598;REFB=0;REVB=-0.00525295;RO=0;SAF=76;SAR=103;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.40016e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.67266e-06;OID=.;OPOS=97673268;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:179:179:0:0:179:179:103:76:0:0:103:76:0:0 chr3 97726747 . T A 611.54 PASS AO=141;DP=279;FAO=142;FDP=281;FR=.;FRO=139;FSAF=47;FSAR=95;FSRF=39;FSRR=100;FWDB=-0.00834289;FXX=0.00354597;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.103;QD=8.70518;RBI=0.0171089;REFB=-0.0138783;REVB=0.0149368;RO=137;SAF=47;SAR=94;SRF=39;SRR=98;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0502496;STB=0.528695;TYPE=snp;VARB=0.0178574;OID=.;OPOS=97726747;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:279:281:137:139:141:142:94:47:39:98:95:47:39:100 chr3 97806167 . A G 654.39 PASS AO=183;DP=411;FAO=177;FDP=397;FR=.;FRO=220;FSAF=83;FSAR=94;FSRF=88;FSRR=132;FWDB=-0.0139141;FXX=0.00749981;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.8223;QD=6.59334;RBI=0.0139155;REFB=-0.0130624;REVB=0.000194693;RO=220;SAF=85;SAR=98;SRF=91;SRR=129;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.050746;STB=0.538523;TYPE=snp;VARB=0.0176396;OID=.;OPOS=97806167;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:411:397:220:220:183:177:98:85:91:129:94:83:88:132 chr3 97806944 . T C 594.93 PASS AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000584542;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.098;QD=37.773;RBI=0.030813;REFB=0;REVB=0.0308074;RO=0;SAF=15;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.58777e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000130466;OID=.;OPOS=97806944;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:63:63:0:0:63:63:48:15:0:0:48:15:0:0 chr3 97851998 . A C 239.96 PASS AO=77;DP=201;FAO=77;FDP=201;FR=.;FRO=124;FSAF=35;FSAR=42;FSRF=48;FSRR=76;FWDB=0.0279207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.203;QD=4.77536;RBI=0.0387845;REFB=-0.0109218;REVB=-0.0269198;RO=122;SAF=35;SAR=42;SRF=46;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0858533;STB=0.542269;TYPE=snp;VARB=0.0213586;OID=.;OPOS=97851998;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:201:122:124:77:77:42:35:46:76:42:35:48:76 chr3 97852083 . C T 228.44 PASS AO=58;DP=130;FAO=59;FDP=131;FR=.;FRO=72;FSAF=26;FSAR=33;FSRF=35;FSRR=37;FWDB=-0.0371318;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.501;QD=6.97519;RBI=0.038417;REFB=-0.0111628;REVB=-0.0098536;RO=72;SAF=25;SAR=33;SRF=35;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0552289;STB=0.525168;TYPE=snp;VARB=0.015257;OID=.;OPOS=97852083;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:131:72:72:58:59:33:25:35:37:33:26:35:37 chr3 97868419 . G A 606.6 PASS AO=164;DP=360;FAO=165;FDP=371;FR=.;FRO=206;FSAF=74;FSAR=91;FSRF=118;FSRR=88;FWDB=-0.00233925;FXX=0.0026881;HRUN=3;LEN=1;MLLD=111.95;QD=6.54016;RBI=0.0147115;REFB=-0.00559079;REVB=-0.0145244;RO=196;SAF=74;SAR=90;SRF=115;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133009;STB=0.568779;TYPE=snp;VARB=0.00797018;OID=.;OPOS=97868419;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:360:371:196:206:164:165:90:74:115:81:91:74:118:88 chr3 97868524 . A T 757.2 PASS AO=187;DP=388;FAO=187;FDP=388;FR=.;FRO=201;FSAF=102;FSAR=85;FSRF=106;FSRR=95;FWDB=0.000629981;FXX=0.00257063;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.888;QD=7.80613;RBI=0.0276901;REFB=-0.00630021;REVB=-0.0276829;RO=199;SAF=102;SAR=85;SRF=104;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0215742;STB=0.509433;TYPE=snp;VARB=0.00642947;OID=.;OPOS=97868524;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:388:388:199:201:187:187:85:102:104:95:85:102:106:95 chr3 97868616 . C T 336.83 PASS AO=97;DP=232;FAO=98;FDP=232;FR=.;FRO=134;FSAF=57;FSAR=41;FSRF=60;FSRR=74;FWDB=-0.00802737;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.7247;QD=5.8075;RBI=0.0715458;REFB=-0.00589166;REVB=0.071094;RO=131;SAF=57;SAR=40;SRF=59;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141806;STB=0.577415;TYPE=snp;VARB=0.00945656;OID=.;OPOS=97868616;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:232:131:134:97:98:40:57:59:72:41:57:60:74 chr3 97868795 . A G 338.3 PASS AO=81;DP=166;FAO=81;FDP=166;FR=.;FRO=85;FSAF=45;FSAR=36;FSRF=51;FSRR=34;FWDB=0.0384967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.793;QD=8.15181;RBI=0.0385299;REFB=-0.0151567;REVB=-0.00159979;RO=85;SAF=45;SAR=36;SRF=51;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0420151;STB=0.523155;TYPE=snp;VARB=0.0136969;OID=.;OPOS=97868795;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:166:85:85:81:81:36:45:51:34:36:45:51:34 chr3 97868970 . T A 575.31 PASS AO=132;DP=259;FAO=132;FDP=259;FR=.;FRO=127;FSAF=50;FSAR=82;FSRF=71;FSRR=56;FWDB=-0.00827947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.6243;QD=8.8851;RBI=0.0263202;REFB=-0.030865;REVB=-0.024984;RO=126;SAF=50;SAR=82;SRF=70;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160211;STB=0.589809;TYPE=snp;VARB=0.030404;OID=.;OPOS=97868970;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:259:259:126:127:132:132:82:50:70:56:82:50:71:56 chr3 97887865 . G A 330.55 PASS AO=90;DP=208;FAO=91;FDP=210;FR=.;FRO=119;FSAF=29;FSAR=62;FSRF=54;FSRR=65;FWDB=-0.0317132;FXX=0.00473911;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.785;QD=6.29613;RBI=0.0321749;REFB=-0.0198427;REVB=0.00543112;RO=117;SAF=29;SAR=61;SRF=52;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134012;STB=0.582833;TYPE=snp;VARB=0.0165997;OID=.;OPOS=97887865;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:210:117:119:90:91:61:29:52:65:62:29:54:65 chr3 97887985 . T A 104.07 PASS AO=41;DP=135;FAO=43;FDP=137;FR=.;FRO=94;FSAF=30;FSAR=13;FSRF=41;FSRR=53;FWDB=0.0122634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.601;QD=3.03856;RBI=0.0134324;REFB=-0.0147548;REVB=0.00548066;RO=94;SAF=28;SAR=13;SRF=41;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.295891;STB=0.681967;TYPE=snp;VARB=0.0277169;OID=.;OPOS=97887985;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:137:94:94:41:43:13:28:41:53:13:30:41:53 chr3 97888042 . A T 105.11 PASS AO=35;DP=98;FAO=35;FDP=98;FR=.;FRO=63;FSAF=26;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=42;FWDB=-0.00212543;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.55;QD=4.29033;RBI=0.00360474;REFB=0.00237145;REVB=0.00291147;RO=61;SAF=26;SAR=9;SRF=21;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.437469;STB=0.758003;TYPE=snp;VARB=-0.00580924;OID=.;OPOS=97888042;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:61:63:35:35:9:26:21:40:9:26:21:42 chr3 97888197 . C T 215.63 PASS AO=47;DP=91;FAO=47;FDP=91;FR=.;FRO=44;FSAF=17;FSAR=30;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=-0.0132184;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.263;QD=9.47836;RBI=0.0272097;REFB=-0.0186825;REVB=-0.0237833;RO=44;SAF=17;SAR=30;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125743;STB=0.56959;TYPE=snp;VARB=0.0288607;OID=.;OPOS=97888197;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:44:44:47:47:30:17:22:22:30:17:22:22 chr3 97957349 . G A 294.66 PASS AO=80;DP=194;FAO=84;FDP=195;FR=.;FRO=111;FSAF=42;FSAR=42;FSRF=71;FSRR=40;FWDB=0.0217142;FXX=0.0249988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.482;QD=6.04431;RBI=0.0218822;REFB=-0.000294456;REVB=0.00270612;RO=114;SAF=40;SAR=40;SRF=71;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129102;STB=0.579469;TYPE=snp;VARB=0.000810748;OID=.;OPOS=97957349;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:195:114:111:80:84:40:40:71:43:42:42:71:40 chr3 97983257 . C G 3145.76 PASS AO=327;DP=327;FAO=327;FDP=327;FR=.;FRO=0;FSAF=156;FSAR=171;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00614735;FXX=0.00304869;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.7058;QD=38.4802;RBI=0.00625034;REFB=0;REVB=0.00113002;RO=0;SAF=156;SAR=171;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18747e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.90508e-05;OID=.;OPOS=97983257;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:327:327:0:0:327:327:171:156:0:0:171:156:0:0 chr3 97983391 . C T 3378.51 PASS AO=348;DP=348;FAO=353;FDP=353;FR=.;FRO=0;FSAF=188;FSAR=165;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.442;QD=38.2834;RBI=0.0251819;REFB=0;REVB=0.0188628;RO=0;SAF=186;SAR=162;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.64613e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.65307e-05;OID=.;OPOS=97983391;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:348:353:0:0:348:353:162:186:0:0:165:188:0:0 chr3 97983487 . TTGTAACCACTGTAACCAC TTGTAACCACT,TTGTAACCAC 1282.89 PASS AO=19,103;DP=199;FAO=0,139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=0,58;FSAR=0,81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00409326,0.0138748;FXX=0.108967;HRUN=1,1;LEN=8,9;MLLD=166.629,292.065;QD=36.9177;RBI=0.00448714,0.0139593;REFB=0,0;REVB=0.0018384,-0.00153369;RO=0;SAF=0,44;SAR=19,59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.03381e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=-0.0379131,0.000401041;OID=.,.;OPOS=97983498,97983488;OREF=GTAACCAC,TGTAACCAC;OALT=-,-;OMAPALT=TTGTAACCACT,TTGTAACCAC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:19,103:125:0,139:139:0:0,58:0,81:0:0:63:0:0,44:19,59:0:0 chr3 97983561 . G C 1806.4 PASS AO=185;DP=185;FAO=189;FDP=189;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=116;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00178439;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.996;QD=38.2307;RBI=0.00600374;REFB=0;REVB=0.00573244;RO=0;SAF=72;SAR=113;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000142224;OID=.;OPOS=97983561;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:185:189:0:0:185:189:113:72:0:0:116:73:0:0 chr3 97983711 . T C 1431.12 PASS AO=147;DP=148;FAO=151;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0141772;FXX=0.00657851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.313;QD=37.9104;RBI=0.0172633;REFB=0;REVB=-0.0098503;RO=0;SAF=65;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.35939e-05;OID=.;OPOS=97983711;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:148:151:0:0:147:151:82:65:0:0:82:69:0:0 chr3 97983942 . A G 2033.68 PASS AO=211;DP=214;FAO=212;FDP=212;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=128;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0364907;FXX=0.036362;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.586;QD=38.3712;RBI=0.0369559;REFB=0;REVB=0.00584543;RO=0;SAF=83;SAR=128;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.98655e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000230756;OID=.;OPOS=97983942;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:94:214:212:0:0:211:212:128:83:0:0:128:84:0:0 chr3 97983981 . G A 1856.7 PASS AO=192;DP=193;FAO=194;FDP=194;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=117;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000871637;FXX=0.00512794;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4232;QD=38.2825;RBI=0.00560523;REFB=0;REVB=-0.00553704;RO=0;SAF=76;SAR=116;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.79905e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.69202e-05;OID=.;OPOS=97983981;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:193:194:0:0:192:194:116:76:0:0:117:77:0:0 chr3 98001858 . A G 460.1 PASS AO=124;DP=278;FAO=124;FDP=278;FR=.;FRO=154;FSAF=52;FSAR=72;FSRF=65;FSRR=89;FWDB=0.0342619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.401;QD=6.62011;RBI=0.0344949;REFB=-0.0187606;REVB=-0.00400219;RO=153;SAF=52;SAR=72;SRF=65;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00560443;STB=0.501548;TYPE=snp;VARB=0.0268269;OID=.;OPOS=98001858;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:278:278:153:154:124:124:72:52:65:88:72:52:65:89 chr3 98110406 . G GA,GAA 432.56 PASS AO=81,36;DP=162;FAO=150,0;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=56,0;FSAR=94,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0418043,0.0186355;FXX=0.0196066;HRUN=7,7;LEN=1,2;MLLD=6.77402,8.76691;QD=11.5349;RBI=0.0838836,0.042727;REFB=0.0494166,0.0483793;REVB=-0.0727245,-0.0384489;RO=37;SAF=28,11;SAR=53,25;SRF=18;SRR=19;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0879024,-0.178098;STB=0.5,0.5;TYPE=ins,ins;VARB=-0.0287409,-0.0802793;OID=.,.;OPOS=98110407,98110407;OREF=-,-;OALT=A,AA;OMAPALT=GA,GAA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:81,36:162:150,0:150:0:56,0:94,0:0:0:23:37:28,11:53,25:18:19 chr3 98304467 . T C 1085.47 PASS AO=114;DP=114;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00980855;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.914;QD=38.0868;RBI=0.00980856;REFB=0;REVB=-1.85862e-05;RO=0;SAF=44;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40696e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.40655e-06;OID=.;OPOS=98304467;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:114:114:0:0:114:114:70:44:0:0:70:44:0:0 chr3 98501080 . C T 118.37 PASS AO=33;DP=81;FAO=33;FDP=81;FR=.;FRO=48;FSAF=5;FSAR=28;FSRF=11;FSRR=37;FWDB=0.0248552;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.443;QD=5.84546;RBI=0.0279354;REFB=-0.0142185;REVB=-0.0127517;RO=47;SAF=5;SAR=28;SRF=10;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111328;STB=0.579507;TYPE=snp;VARB=0.0220267;OID=.;OPOS=98501080;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:47:48:33:33:28:5:10:37:28:5:11:37 chr3 98519481 . G A 205.64 PASS AO=62;DP=155;FAO=62;FDP=155;FR=.;FRO=93;FSAF=31;FSAR=31;FSRF=56;FSRR=37;FWDB=-0.0119639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.018;QD=5.30673;RBI=0.0232596;REFB=-0.0106418;REVB=0.0199468;RO=93;SAF=31;SAR=31;SRF=56;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10897;STB=0.561271;TYPE=snp;VARB=0.0174386;OID=.;OPOS=98519481;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:93:93:62:62:31:31:56:37:31:31:56:37 chr3 98540982 . A G 187.25 PASS AO=49;DP=111;FAO=49;FDP=111;FR=.;FRO=62;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=39;FWDB=0.0153136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.8601;QD=6.74782;RBI=0.0159971;REFB=-0.030812;REVB=0.00462623;RO=60;SAF=26;SAR=23;SRF=23;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144424;STB=0.588501;TYPE=snp;VARB=0.0406822;OID=.;OPOS=98540982;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:60:62:49:49:23:26:23:37:23:26:23:39 chr3 98541012 . G A 1060.05 PASS AO=113;DP=113;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0128774;FXX=0.0176975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.128;QD=38.2001;RBI=0.0227314;REFB=0;REVB=-0.018732;RO=0;SAF=47;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.38221e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.56413e-06;OID=.;OPOS=98541012;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:113:111:0:0:113:111:66:47:0:0:66:45:0:0 chr3 98541116 . G A 175.45 PASS AO=50;DP=122;FAO=50;FDP=122;FR=.;FRO=72;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=27;FSRR=45;FWDB=0.0749196;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=39.8549;QD=5.75258;RBI=0.102081;REFB=-0.0325449;REVB=0.0693372;RO=69;SAF=26;SAR=24;SRF=26;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14727;STB=0.585094;TYPE=snp;VARB=0.0463627;OID=.;OPOS=98541116;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:69:72:50:50:24:26:26:43:24:26:27:45 chr3 98619997 . G C 29.49 PASS AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.185;QD=11.7975;RBI=0.0107605;REFB=-0.0269859;REVB=-0.0107605;RO=5;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0279527;OID=.;OPOS=98619997;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:10:10:5:5:5:5:5:0:0:5:5:0:0:5 chr3 99536882 . GC G 50.57 PASS AO=12;DP=20;FAO=12;FDP=18;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.125301;FXX=0.0526039;HRUN=3;LEN=1;MLLD=22.3241;QD=11.2385;RBI=0.144445;REFB=-0.0499879;REVB=-0.0718624;RO=6;SAF=2;SAR=10;SRF=6;SRR=0;SSEN=0.434251;SSEP=0;SSSB=-0.526566;STB=0.799466;TYPE=del;VARB=0.00389659;OID=.;OPOS=99536883;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:12:19:12:18:6:2:10:6:0:17:6:2:10:6:0 chr3 99567822 . GC G 1950.82 PASS AO=259;DP=331;FAO=322;FDP=322;FR=.;FRO=0;FSAF=145;FSAR=177;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0718551;FXX=0.0122696;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.3922;QD=24.2338;RBI=0.266533;REFB=0.0280141;REVB=0.256664;RO=49;SAF=119;SAR=140;SRF=13;SRR=36;SSEN=0.406863;SSEP=0;SSSB=0.0591455;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00290117;OID=.;OPOS=99567823;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:259:323:322:322:0:145:177:0:0:99:49:119:140:13:36 chr3 99568272 . G T 71.67 PASS AO=44;DP=148;FAO=49;FDP=156;FR=.;FRO=107;FSAF=15;FSAR=34;FSRF=72;FSRR=35;FWDB=0.00202359;FXX=0.0126574;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.5996;QD=1.83777;RBI=0.0572424;REFB=-0.00667883;REVB=0.0572066;RO=69;SAF=15;SAR=29;SRF=51;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.410435;STB=0.740704;TYPE=snp;VARB=0.0505587;OID=.;OPOS=99568272;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:148:156:69:107:44:49:29:15:51:18:34:15:72:35 chr3 99569321 . T C 97.38 PASS AO=38;DP=118;FAO=38;FDP=118;FR=.;FRO=80;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=42;FSRR=38;FWDB=-0.0169927;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.847;QD=3.30106;RBI=0.030718;REFB=-0.00472662;REVB=-0.0255899;RO=79;SAF=14;SAR=24;SRF=42;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191701;STB=0.607538;TYPE=snp;VARB=0.00916961;OID=.;OPOS=99569321;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:118:118:79:80:38:38:24:14:42:37:24:14:42:38 chr3 100170596 . T C 10.32 PASS AO=13;DP=81;FAO=12;FDP=80;FR=.;FRO=68;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=30;FSRR=38;FWDB=-0.0316785;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.6972;QD=0.515851;RBI=0.0359555;REFB=-0.00470038;REVB=0.017008;RO=68;SAF=11;SAR=2;SRF=30;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.508651;STB=0.832778;TYPE=snp;VARB=0.0235051;OID=.;OPOS=100170596;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:81:80:68:68:13:12:2:11:30:38:2:10:30:38 chr3 100170628 . A G 111.25 PASS AO=48;DP=159;FAO=48;FDP=157;FR=.;FRO=109;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=14;FSRR=95;FWDB=0.0857937;FXX=0.00632871;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.2435;QD=2.83426;RBI=0.0859903;REFB=-0.00947972;REVB=-0.00581241;RO=110;SAF=20;SAR=28;SRF=14;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.39597;STB=0.720916;TYPE=snp;VARB=0.0195937;OID=.;OPOS=100170628;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:157:110:109:48:48:28:20:14:96:28:20:14:95 chr3 100170634 . T C 92.8 PASS AO=44;DP=155;FAO=44;FDP=154;FR=.;FRO=110;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=13;FSRR=97;FWDB=0.0311071;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.0994;QD=2.41032;RBI=0.0599907;REFB=-0.0167227;REVB=-0.0512955;RO=111;SAF=17;SAR=27;SRF=14;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.381113;STB=0.722339;TYPE=snp;VARB=0.0349433;OID=.;OPOS=100170634;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:155:154:111:110:44:44:27:17:14:97:27:17:13:97 chr3 100174722 . G A 961.34 PASS AO=97;DP=97;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00949373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.737;QD=38.4535;RBI=0.0295157;REFB=0;REVB=0.0279472;RO=0;SAF=35;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.81934e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000408784;OID=.;OPOS=100174722;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:97:100:0:0:97:100:62:35:0:0:65:35:0:0 chr3 100374740 . T C 1205.15 PASS AO=126;DP=126;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.086545;FXX=0.0307669;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.7871;QD=38.2588;RBI=0.12322;REFB=0;REVB=0.0877103;RO=0;SAF=45;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.76837e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000515336;OID=.;OPOS=100374740;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:126:126:0:0:126:126:81:45:0:0:81:45:0:0 chr3 100467018 . T C 185.53 PASS AO=10;DP=19;FAO=18;FDP=19;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0898654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.859;QD=39.0592;RBI=0.0907894;REFB=0;REVB=-0.0129205;RO=0;SAF=2;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000767759;OID=.;OPOS=100467018;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:18:19:0:0:10:18:8:2:0:0:8:10:0:0 chr3 100468407 . C CAGTT 1041.29 PASS AO=138;DP=189;FAO=144;FDP=177;FR=.;FRO=33;FSAF=65;FSAR=79;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=-0.0258884;FXX=0.0634887;HRUN=1;LEN=4;MLLD=254.738;QD=23.5319;RBI=0.0267172;REFB=-0.0228192;REVB=-0.0066031;RO=34;SAF=64;SAR=74;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0463849;STB=0.523299;TYPE=ins;VARB=0.00389928;OID=.;OPOS=100468408;OREF=-;OALT=AGTT;OMAPALT=CAGTT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:138:189:144:177:33:65:79:19:14:31:34:64:74:20:14 chr3 100558416 . T C 2817.15 PASS AO=295;DP=298;FAO=297;FDP=297;FR=.;FRO=0;FSAF=140;FSAR=157;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243382;FXX=0.00999967;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.456;QD=37.9414;RBI=0.0246306;REFB=-0.0103692;REVB=0.00378427;RO=2;SAF=139;SAR=156;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00681204;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.20716e-05;OID=.;OPOS=100558416;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:298:297:2:0:295:297:156:139:2:0:157:140:0:0 chr3 100617629 . C T 195.18 PASS AO=65;DP=181;FAO=65;FDP=177;FR=.;FRO=112;FSAF=34;FSAR=31;FSRF=53;FSRR=59;FWDB=0.000267807;FXX=0.0220982;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.706;QD=4.41082;RBI=0.00364014;REFB=-0.00811922;REVB=0.00363028;RO=111;SAF=34;SAR=31;SRF=52;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0606006;STB=0.531517;TYPE=snp;VARB=0.0101292;OID=.;OPOS=100617629;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:177:111:112:65:65:31:34:52:59:31:34:53:59 chr3 100617680 . C T 252.41 PASS AO=71;DP=181;FAO=76;FDP=189;FR=.;FRO=113;FSAF=31;FSAR=45;FSRF=43;FSRR=70;FWDB=-0.0321141;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.836;QD=5.34191;RBI=0.0324046;REFB=-0.0104905;REVB=0.00432918;RO=110;SAF=31;SAR=40;SRF=42;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0606575;STB=0.517037;TYPE=snp;VARB=0.0138194;OID=.;OPOS=100617680;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:189:110:113:71:76:40:31:42:68:45:31:43:70 chr3 100712249 . T C 595.3 PASS AO=119;DP=223;FAO=119;FDP=208;FR=.;FRO=89;FSAF=43;FSAR=76;FSRF=37;FSRR=52;FWDB=0.00675838;FXX=0.0755522;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.6737;QD=11.4481;RBI=0.0197878;REFB=5.30704e-05;REVB=0.0185979;RO=78;SAF=43;SAR=76;SRF=35;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0677755;STB=0.524858;TYPE=snp;VARB=0.0016068;OID=.;OPOS=100712249;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:208:78:89:119:119:76:43:35:43:76:43:37:52 chr3 100949842 . G A 235.16 PASS AO=69;DP=164;FAO=68;FDP=164;FR=.;FRO=96;FSAF=22;FSAR=46;FSRF=52;FSRR=44;FWDB=0.0431636;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5269;QD=5.73571;RBI=0.0532609;REFB=0.00891983;REVB=-0.031203;RO=94;SAF=23;SAR=46;SRF=50;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211454;STB=0.632204;TYPE=snp;VARB=-0.0121449;OID=.;OPOS=100949842;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:164:94:96:69:68:46:23:50:44:46:22:52:44 chr3 100963154 . G A 389.41 PASS AO=119;DP=294;FAO=119;FDP=294;FR=.;FRO=175;FSAF=59;FSAR=60;FSRF=94;FSRR=81;FWDB=-0.0300904;FXX=0.0101007;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.591;QD=5.29813;RBI=0.0305098;REFB=-0.00641832;REVB=-0.0050412;RO=174;SAF=59;SAR=60;SRF=94;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0471617;STB=0.524597;TYPE=snp;VARB=0.00704027;OID=.;OPOS=100963154;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:294:294:174:175:119:119:60:59:94:80:60:59:94:81 chr3 101043906 . G A 289.19 PASS AO=95;DP=248;FAO=95;FDP=250;FR=.;FRO=155;FSAF=49;FSAR=46;FSRF=98;FSRR=57;FWDB=-0.103432;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.8378;QD=4.62709;RBI=0.10611;REFB=-0.00486591;REVB=-0.0236885;RO=153;SAF=49;SAR=46;SRF=97;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130484;STB=0.572599;TYPE=snp;VARB=0.00712572;OID=.;OPOS=101043906;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:248:250:153:155:95:95:46:49:97:56:46:49:98:57 chr3 101066717 . T A 396.96 PASS AO=94;DP=191;FAO=94;FDP=191;FR=.;FRO=97;FSAF=68;FSAR=26;FSRF=54;FSRR=43;FWDB=0.0129039;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.6886;QD=8.31327;RBI=0.025362;REFB=-0.0190835;REVB=-0.0218339;RO=97;SAF=68;SAR=26;SRF=54;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174684;STB=0.596621;TYPE=snp;VARB=0.0242361;OID=.;OPOS=101066717;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:191:191:97:97:94:94:26:68:54:43:26:68:54:43 chr3 101080694 . T C 301.79 PASS AO=77;DP=166;FAO=77;FDP=167;FR=.;FRO=90;FSAF=31;FSAR=46;FSRF=38;FSRR=52;FWDB=0.00986049;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.097;QD=7.22859;RBI=0.0115705;REFB=-0.0210843;REVB=0.0060537;RO=89;SAF=31;SAR=46;SRF=38;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0243604;STB=0.510944;TYPE=snp;VARB=0.0256156;OID=.;OPOS=101080694;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:167:89:90:77:77:46:31:38:51:46:31:38:52 chr3 101085413 . G A 357.7 PASS AO=98;DP=225;FAO=98;FDP=224;FR=.;FRO=126;FSAF=30;FSAR=68;FSRF=67;FSRR=59;FWDB=-0.00506447;FXX=0.00444425;HRUN=2;LEN=1;MLLD=264.725;QD=6.38742;RBI=0.0118194;REFB=-0.00264135;REVB=-0.0106794;RO=125;SAF=30;SAR=68;SRF=66;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23561;STB=0.633837;TYPE=snp;VARB=0.00384006;OID=.;OPOS=101085413;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:225:224:125:126:98:98:68:30:66:59:68:30:67:59 chr3 101219889 . G C 405.46 PASS AO=88;DP=165;FAO=88;FDP=165;FR=.;FRO=77;FSAF=44;FSAR=44;FSRF=42;FSRR=35;FWDB=0.000205206;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.594;QD=9.82936;RBI=0.00915014;REFB=-0.00957559;REVB=0.00914784;RO=77;SAF=44;SAR=44;SRF=42;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0387667;STB=0.521207;TYPE=snp;VARB=0.00933779;OID=.;OPOS=101219889;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:165:77:77:88:88:44:44:42:35:44:44:42:35 chr3 101221069 . T C 343.52 PASS AO=77;DP=176;FAO=90;FDP=189;FR=.;FRO=99;FSAF=36;FSAR=54;FSRF=37;FSRR=62;FWDB=0.0691639;FXX=0.00526288;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.6076;QD=7.27021;RBI=0.0802644;REFB=-0.00192674;REVB=-0.0407275;RO=99;SAF=23;SAR=54;SRF=37;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0865955;STB=0.514409;TYPE=snp;VARB=0.00421282;OID=.;OPOS=101221069;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:189:99:99:77:90:54:23:37:62:54:36:37:62 chr3 101231921 . T C 59.81 PASS AO=15;DP=40;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=2;FSRF=23;FSRR=2;FWDB=0.00024857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.17;QD=5.83503;RBI=0.0166436;REFB=-0.0404906;REVB=-0.0166417;RO=25;SAF=13;SAR=2;SRF=23;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140072;STB=0.569154;TYPE=snp;VARB=0.0753352;OID=.;OPOS=101231921;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:40:41:25:25:15:16:2:13:23:2:2:14:23:2 chr3 101334753 . C A 1087.11 PASS AO=115;DP=116;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00168496;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.95;QD=37.4864;RBI=0.00566868;REFB=-0.0413894;REVB=0.00541247;RO=0;SAF=73;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.42309e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000163856;OID=.;OPOS=101334753;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:116:116:0:0:115:116:42:73:0:0:43:73:0:0 chr3 101484335 . G A 3051.76 PASS AO=323;DP=335;FAO=340;FDP=350;FR=.;FRO=10;FSAF=143;FSAR=197;FSRF=1;FSRR=9;FWDB=-0.0475711;FXX=0.00568166;HRUN=4;LEN=1;MLLD=49.5638;QD=34.8772;RBI=0.0493641;REFB=-0.00585766;REVB=-0.0131834;RO=11;SAF=139;SAR=184;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0159447;STB=0.509424;TYPE=snp;VARB=0.000190243;OID=.;OPOS=101484335;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:335:350:11:10:323:340:184:139:2:9:197:143:1:9 chr3 101571550 . A G 1123.89 PASS AO=118;DP=123;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124843;FXX=0.0406471;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.55;QD=38.0979;RBI=0.0411291;REFB=0;REVB=0.0391886;RO=0;SAF=60;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.50748e-05;OID=.;OPOS=101571550;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:123:118:0:0:118:118:58:60:0:0:58:60:0:0 chr3 101572544 . T G 125.59 PASS AO=30;DP=64;FAO=30;FDP=64;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=-0.010681;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.906;QD=7.84929;RBI=0.0145691;REFB=-0.0118617;REVB=0.00990836;RO=34;SAF=13;SAR=17;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145933;STB=0.581896;TYPE=snp;VARB=0.0145801;OID=.;OPOS=101572544;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:34:34:30:30:17:13:20:14:17:13:20:14 chr3 101576029 . T TACTTTTAGAAAGCTTTAATAACC 96.62 PASS AO=24;DP=79;FAO=27;FDP=67;FR=.;FRO=40;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=38;FSRR=2;FWDB=-0.0136694;FXX=0.118405;HRUN=1;LEN=23;MLLD=424.231;QD=5.76839;RBI=0.0163886;REFB=-0.0137404;REVB=0.00904063;RO=42;SAF=9;SAR=15;SRF=40;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.591445;STB=0.810965;TYPE=ins;VARB=0.0103404;OID=.;OPOS=101576030;OREF=-;OALT=ACTTTTAGAAAGCTTTAATAACC;OMAPALT=TACTTTTAGAAAGCTTTAATAACC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:24:79:27:67:40:10:17:38:2:96:42:9:15:40:2 chr3 101576175 . T C 2776.66 PASS AO=290;DP=290;FAO=290;FDP=290;FR=.;FRO=0;FSAF=134;FSAR=156;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0440477;FXX=0.00343631;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.6857;QD=38.2987;RBI=0.0551843;REFB=0;REVB=0.0332432;RO=0;SAF=133;SAR=157;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.06847e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00021105;OID=.;OPOS=101576175;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:290:290:0:0:290:290:157:133:0:0:156:134:0:0 chr3 101673934 . G A 212.76 PASS AO=52;DP=111;FAO=52;FDP=111;FR=.;FRO=59;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=32;FSRR=27;FWDB=0.0190573;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=256.645;QD=7.66707;RBI=0.0283022;REFB=0.0173167;REVB=0.0209244;RO=59;SAF=28;SAR=24;SRF=32;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00376056;STB=0.502091;TYPE=snp;VARB=-0.0200416;OID=.;OPOS=101673934;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:59:59:52:52:24:28:32:27:24:28:32:27 chr3 103879569 . G A 3793.8 PASS AO=417;DP=420;FAO=395;FDP=395;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=294;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0754741;FXX=0.0124997;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.202;QD=38.4182;RBI=0.0757302;REFB=0;REVB=-0.00622346;RO=1;SAF=91;SAR=326;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00146193;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.15641e-05;OID=.;OPOS=103879569;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:420:395:1:0:417:395:326:91:0:1:294:101:0:0 chr3 103879599 . T A 1853.89 PASS AO=169;DP=234;FAO=213;FDP=213;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=34;FSAR=179;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0260426;FXX=0.044841;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.064;QD=34.8148;RBI=0.0268115;REFB=0;REVB=0.00637523;RO=4;SAF=28;SAR=141;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0133088;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000466722;OID=.;OPOS=103879599;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:224:213:4:0:169:213:141:28:0:4:179:34:0:0 chr3 105260596 . T C 968.9 PASS AO=99;DP=99;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.709;QD=37.9962;RBI=0.0488435;REFB=0;REVB=0.044759;RO=0;SAF=25;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.65554e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.68552e-05;OID=.;OPOS=105260596;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:99:102:0:0:99:102:74:25:0:0:77:25:0:0 chr3 105422844 . C T 1049.48 PASS AO=109;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0336518;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=85.8924;QD=38.5132;RBI=0.0398339;REFB=0;REVB=-0.0213143;RO=0;SAF=87;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000162498;OID=.;OPOS=105422844;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:109:109:0:0:109:109:22:87:0:0:22:87:0:0 chr3 106617500 . C T 1060.44 PASS AO=111;DP=112;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0400547;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.769;QD=37.8727;RBI=0.0419831;REFB=0;REVB=0.0125778;RO=0;SAF=39;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.73502e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000115334;OID=.;OPOS=106617500;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:112:112:0:0:111:112:72:39:0:0:72:40:0:0 chr3 107096547 . G A 172.13 PASS AO=49;DP=118;FAO=49;FDP=119;FR=.;FRO=70;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=27;FSRR=43;FWDB=0.00118175;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.674;QD=5.78587;RBI=0.00621562;REFB=-0.0156191;REVB=0.00610225;RO=69;SAF=29;SAR=20;SRF=26;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220986;STB=0.619904;TYPE=snp;VARB=0.0222813;OID=.;OPOS=107096547;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:119:69:70:49:49:20:29:26:43:20:29:27:43 chr3 107765392 . G A 208.64 PASS AO=44;DP=84;FAO=45;FDP=85;FR=.;FRO=40;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=0.00774736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.6748;QD=9.81856;RBI=0.01473;REFB=-0.022834;REVB=0.012528;RO=40;SAF=20;SAR=24;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0608371;STB=0.538041;TYPE=snp;VARB=0.0259221;OID=.;OPOS=107765392;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:85:40:40:44:45:24:20:21:19:25:20:21:19 chr3 108072298 . T C 1725.77 PASS AO=185;DP=190;FAO=185;FDP=185;FR=.;FRO=0;FSAF=127;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00113027;FXX=0.0263144;HRUN=3;LEN=1;MLLD=184.366;QD=37.314;RBI=0.0016619;REFB=-0.00513368;REVB=0.00121836;RO=3;SAF=127;SAR=58;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000699098;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.83271e-05;OID=.;OPOS=108072298;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:190:185:3:0:185:185:58:127:2:1:58:127:0:0 chr3 108081247 . G A 156.33 PASS AO=47;DP=126;FAO=49;FDP=128;FR=.;FRO=79;FSAF=17;FSAR=32;FSRF=26;FSRR=53;FWDB=0.011264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4246;QD=4.88516;RBI=0.0135036;REFB=-0.0032627;REVB=-0.00744787;RO=77;SAF=17;SAR=30;SRF=24;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0604327;STB=0.512225;TYPE=snp;VARB=0.0043191;OID=.;OPOS=108081247;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:128:77:79:47:49:30:17:24:53:32:17:26:53 chr3 108096098 . C G 2148.2 PASS AO=225;DP=230;FAO=225;FDP=225;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=137;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181968;FXX=0.0259729;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.846;QD=38.1903;RBI=0.0259328;REFB=0;REVB=-0.0184767;RO=0;SAF=89;SAR=136;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.50143e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.15529e-06;OID=.;OPOS=108096098;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:230:225:0:0:225:225:136:89:0:0:137:88:0:0 chr3 108147728 . T C 67.46 PASS AO=16;DP=40;FAO=17;FDP=41;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=18;FWDB=0.0449653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.959;QD=6.58114;RBI=0.0453053;REFB=-0.017386;REVB=0.00554054;RO=23;SAF=6;SAR=10;SRF=5;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182119;STB=0.601117;TYPE=snp;VARB=0.0303031;OID=.;OPOS=108147728;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:40:41:23:24:16:17:10:6:5:18:10:7:6:18 chr3 108188993 . G A 137.85 PASS AO=52;DP=156;FAO=52;FDP=155;FR=.;FRO=103;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=56;FSRR=47;FWDB=-0.0052691;FXX=0.00640985;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.59;QD=3.5574;RBI=0.00568195;REFB=-0.00416176;REVB=0.00212628;RO=101;SAF=26;SAR=26;SRF=56;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0625898;STB=0.529021;TYPE=snp;VARB=0.00820048;OID=.;OPOS=108188993;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:155:101:103:52:52:26:26:56:45:26:26:56:47 chr3 108403086 . T C 1768.4 PASS AO=172;DP=173;FAO=188;FDP=188;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0642513;FXX=0.00529073;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.876;QD=37.6255;RBI=0.0649921;REFB=0.0417411;REVB=-0.00978448;RO=1;SAF=61;SAR=111;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00773857;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.12291e-05;OID=.;OPOS=108403086;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:173:188:1:0:172:188:111:61:1:0:113:75:0:0 chr3 108557820 . T C 1101.05 PASS AO=117;DP=118;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00607438;FXX=0.0409802;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.52;QD=37.6428;RBI=0.013013;REFB=0;REVB=-0.0115083;RO=0;SAF=47;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19108e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000219938;OID=.;OPOS=108557820;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:118:117:0:0:117:117:70:47:0:0:70:47:0:0 chr3 108634973 . C A 1648 PASS AO=173;DP=173;FAO=174;FDP=174;FR=.;FRO=0;FSAF=113;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00656669;FXX=0.00571396;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4622;QD=37.8851;RBI=0.0453231;REFB=0;REVB=-0.0448448;RO=0;SAF=113;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.11609e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000393791;OID=.;OPOS=108634973;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:173:174:0:0:173:174:60:113:0:0:61:113:0:0 chr3 108639423 . C T 1129.16 PASS AO=118;DP=123;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00704137;FXX=0.063487;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0574;QD=38.2767;RBI=0.00895271;REFB=0;REVB=0.00552903;RO=0;SAF=41;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.32605e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000493222;OID=.;OPOS=108639423;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:123:118:0:0:118:118:77:41:0:0:77:41:0:0 chr3 108677821 . C A 1909.24 PASS AO=203;DP=205;FAO=203;FDP=203;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=116;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00478557;FXX=0.00975562;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.717;QD=37.6205;RBI=0.00917369;REFB=-0.0920793;REVB=0.00782655;RO=1;SAF=87;SAR=116;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00408874;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.36812e-05;OID=.;OPOS=108677821;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:205:203:1:0:203:203:116:87:0:1:116:87:0:0 chr3 108690221 . G A 476.2 PASS AO=48;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0849193;FXX=0.0377287;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.4974;QD=37.3493;RBI=0.0854138;REFB=0;REVB=0.00917782;RO=0;SAF=27;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00162447;OID=.;OPOS=108690221;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:52:51:0:0:48:51:21:27:0:0:24:27:0:0 chr3 108703548 . C T 113.08 PASS AO=41;DP=117;FAO=40;FDP=116;FR=.;FRO=76;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=40;FSRR=36;FWDB=-0.0162686;FXX=0.00854628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.0354;QD=3.89925;RBI=0.0178068;REFB=-0.0066235;REVB=0.00723973;RO=76;SAF=18;SAR=23;SRF=40;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0987405;STB=0.566518;TYPE=snp;VARB=0.0136668;OID=.;OPOS=108703548;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:116:76:76:41:40:23:18:40:36:23:17:40:36 chr3 108719470 . C G 387.96 PASS AO=91;DP=191;FAO=95;FDP=198;FR=.;FRO=103;FSAF=34;FSAR=61;FSRF=50;FSRR=53;FWDB=0.0104868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.078;QD=7.83766;RBI=0.0120619;REFB=0.00355984;REVB=0.00595974;RO=99;SAF=34;SAR=57;SRF=49;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118125;STB=0.569318;TYPE=snp;VARB=-0.00278576;OID=.;OPOS=108719470;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:191:198:99:103:91:95:57:34:49:50:61:34:50:53 chr3 108725862 . T C 326.61 PASS AO=93;DP=220;FAO=93;FDP=220;FR=.;FRO=127;FSAF=38;FSAR=55;FSRF=75;FSRR=52;FWDB=-0.0229924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.628;QD=5.93835;RBI=0.0354415;REFB=-0.0359075;REVB=0.0269713;RO=126;SAF=38;SAR=55;SRF=74;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183601;STB=0.604491;TYPE=snp;VARB=0.0282533;OID=.;OPOS=108725862;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:220:220:126:127:93:93:55:38:74:52:55:38:75:52 chr3 108754238 . A T 1785.26 PASS AO=193;DP=197;FAO=193;FDP=197;FR=.;FRO=4;FSAF=98;FSAR=95;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.00149455;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=263.38;QD=36.249;RBI=0.00544252;REFB=-0.0797276;REVB=0.00523329;RO=3;SAF=98;SAR=95;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00463223;STB=0.50492;TYPE=snp;VARB=0.000356648;OID=.;OPOS=108754238;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:197:197:3:4:193:193:95:98:2:1:95:98:3:1 chr3 108754260 . A G 470.43 PASS AO=101;DP=192;FAO=103;FDP=194;FR=.;FRO=91;FSAF=61;FSAR=42;FSRF=42;FSRR=49;FWDB=0.00955789;FXX=0.00512794;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.157;QD=9.69964;RBI=0.00957267;REFB=-0.0119293;REVB=0.000531722;RO=91;SAF=60;SAR=41;SRF=42;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116057;STB=0.562001;TYPE=snp;VARB=0.0101224;OID=.;OPOS=108754260;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:194:91:91:101:103:41:60:42:49:42:61:42:49 chr3 108780831 . G A 219.14 PASS AO=65;DP=161;FAO=65;FDP=161;FR=.;FRO=96;FSAF=39;FSAR=26;FSRF=61;FSRR=35;FWDB=-0.0252757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.835;QD=5.44447;RBI=0.0259302;REFB=-0.012719;REVB=-0.00578922;RO=96;SAF=39;SAR=26;SRF=61;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0394962;STB=0.522186;TYPE=snp;VARB=0.0215952;OID=.;OPOS=108780831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:161:96:96:65:65:26:39:61:35:26:39:61:35 chr3 108867128 . A G 366.62 PASS AO=91;DP=192;FAO=92;FDP=192;FR=.;FRO=100;FSAF=42;FSAR=50;FSRF=55;FSRR=45;FWDB=0.0179833;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.0379;QD=7.63787;RBI=0.0185606;REFB=0.0171012;REVB=-0.00459318;RO=100;SAF=42;SAR=49;SRF=55;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0837837;STB=0.548632;TYPE=snp;VARB=-0.0175268;OID=.;OPOS=108867128;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:192:100:100:91:92:49:42:55:45:50:42:55:45 chr3 109049384 . T C 299.89 PASS AO=78;DP=170;FAO=77;FDP=169;FR=.;FRO=92;FSAF=41;FSAR=36;FSRF=33;FSRR=59;FWDB=0.0169648;FXX=0.050559;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.52;QD=7.09802;RBI=0.020264;REFB=-0.00317401;REVB=0.0110827;RO=91;SAF=41;SAR=37;SRF=33;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157627;STB=0.593817;TYPE=snp;VARB=0.00317503;OID=.;OPOS=109049384;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:169:91:92:78:77:37:41:33:58:36:41:33:59 chr3 109052732 . T C 168.11 PASS AO=70;DP=220;FAO=70;FDP=220;FR=.;FRO=150;FSAF=34;FSAR=36;FSRF=68;FSRR=82;FWDB=0.00900622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.366;QD=3.05652;RBI=0.0252381;REFB=-0.00435211;REVB=-0.0235765;RO=149;SAF=34;SAR=36;SRF=67;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0426272;STB=0.522118;TYPE=snp;VARB=0.0087591;OID=.;OPOS=109052732;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:220:220:149:150:70:70:36:34:67:82:36:34:68:82 chr3 109178707 . C G 160.6 PASS AO=41;DP=91;FAO=41;FDP=92;FR=.;FRO=51;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=18;FSRR=33;FWDB=0.00668189;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.322;QD=6.98282;RBI=0.00668468;REFB=-0.0140715;REVB=-0.0001931;RO=49;SAF=15;SAR=26;SRF=17;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199565;STB=0.507742;TYPE=snp;VARB=0.0224233;OID=.;OPOS=109178707;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:92:49:51:41:41:26:15:17:32:26:15:18:33 chr3 109178758 . C T 811.37 PASS AO=85;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0521529;FXX=0.0227247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.4604;QD=37.738;RBI=0.0595816;REFB=0;REVB=0.0288105;RO=0;SAF=22;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76073e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000263723;OID=.;OPOS=109178758;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:86:86:0:0:85:86:63:22:0:0:63:23:0:0 chr3 110611137 . G A 651.79 PASS AO=65;DP=66;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0167827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.9001;QD=36.2107;RBI=0.0307045;REFB=-0.128006;REVB=-0.0257121;RO=1;SAF=28;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165719;STB=0.50769;TYPE=snp;VARB=0.001468;OID=.;OPOS=110611137;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:66:72:1:1:65:71:37:28:1:0:39:32:1:0 chr3 110793050 . G A 367.8 PASS AO=96;DP=213;FAO=96;FDP=211;FR=.;FRO=115;FSAF=59;FSAR=37;FSRF=58;FSRR=57;FWDB=-0.00187665;FXX=0.00938923;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.532;QD=6.97246;RBI=0.039882;REFB=0.0010605;REVB=0.0398379;RO=115;SAF=59;SAR=37;SRF=58;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111038;STB=0.561607;TYPE=snp;VARB=-0.000938342;OID=.;OPOS=110793050;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:213:211:115:115:96:96:37:59:58:57:37:59:58:57 chr3 110912226 . AT A 91.7 PASS AO=68;DP=185;FAO=70;FDP=172;FR=.;FRO=102;FSAF=13;FSAR=57;FSRF=55;FSRR=47;FWDB=0.0477296;FXX=0.028247;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.9655;QD=2.13253;RBI=0.153317;REFB=-0.0999053;REVB=-0.145699;RO=96;SAF=12;SAR=56;SRF=52;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.439074;STB=0.741317;TYPE=del;VARB=0.122701;OID=.;OPOS=110912227;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:68:176:70:172:102:13:57:55:47:91:96:12:56:52:44 chr3 111313457 . T C 1314.82 PASS AO=141;DP=150;FAO=145;FDP=149;FR=.;FRO=4;FSAF=78;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.00101051;FXX=0.0132442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.1485;QD=35.2971;RBI=0.0613454;REFB=-0.029786;REVB=-0.0613371;RO=8;SAF=78;SAR=63;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0439077;STB=0.514491;TYPE=snp;VARB=0.000345747;OID=.;OPOS=111313457;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:150:149:8:4:141:145:63:78:1:7:67:78:0:4 chr3 111313854 . C T 246.12 PASS AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.135473;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.653;QD=37.8642;RBI=0.136913;REFB=0;REVB=0.0197999;RO=0;SAF=4;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.50493e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00138261;OID=.;OPOS=111313854;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:27:26:0:0:26:26:22:4:0:0:22:4:0:0 chr3 111356082 . CG C,CC 2297.19 PASS AO=103,142;DP=263;FAO=91,161;FDP=252;FR=.;FRO=0;FSAF=58,11;FSAR=33,150;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0560904,0.0704497;FXX=0.030768;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=70.297,72.7933;QD=36.4633;RBI=0.0574631,0.070989;REFB=0,0;REVB=-0.0124847,-0.0087341;RO=2;SAF=60,4;SAR=43,138;SRF=2;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0155526,-0.18844;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0231218,0.0086042;OID=.,.;OPOS=111356083,111356083;OREF=G,G;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:103,142:255:91,161:252:0:58,11:33,150:0:0:99:2:60,4:43,138:2:0 chr3 111369088 . C T 324.45 PASS AO=74;DP=147;FAO=74;FDP=146;FR=.;FRO=72;FSAF=28;FSAR=46;FSRF=26;FSRR=46;FWDB=0.0258754;FXX=0.00680226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.3323;QD=8.88907;RBI=0.0299545;REFB=-0.0138579;REVB=0.015091;RO=71;SAF=28;SAR=46;SRF=26;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0115647;STB=0.509088;TYPE=snp;VARB=0.0194213;OID=.;OPOS=111369088;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:146:71:72:74:74:46:28:26:45:46:28:26:46 chr3 111432805 . G A 156.46 PASS AO=36;DP=74;FAO=36;FDP=74;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=-0.00461503;FXX=0.0263123;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.3266;QD=8.45705;RBI=0.0147624;REFB=-0.0283254;REVB=0.0140225;RO=37;SAF=15;SAR=21;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0147046;STB=0.502313;TYPE=snp;VARB=0.0238506;OID=.;OPOS=111432805;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:37:38:36:36:21:15:16:21:21:15:16:22 chr3 111604541 . G C 340.87 PASS AO=73;DP=139;FAO=75;FDP=143;FR=.;FRO=68;FSAF=26;FSAR=49;FSRF=16;FSRR=52;FWDB=0.044036;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.259;QD=9.53488;RBI=0.0442624;REFB=0.0115863;REVB=0.0044707;RO=66;SAF=26;SAR=47;SRF=16;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111514;STB=0.560617;TYPE=snp;VARB=-0.0117629;OID=.;OPOS=111604541;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:143:66:68:73:75:47:26:16:50:49:26:16:52 chr3 111677526 . G A 139.62 PASS AO=42;DP=111;FAO=43;FDP=112;FR=.;FRO=69;FSAF=11;FSAR=32;FSRF=24;FSRR=45;FWDB=0.0133346;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.61;QD=4.98652;RBI=0.0236365;REFB=-0.00278665;REVB=-0.019516;RO=69;SAF=10;SAR=32;SRF=24;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148991;STB=0.569361;TYPE=snp;VARB=0.00203604;OID=.;OPOS=111677526;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:112:69:69:42:43:32:10:24:45:32:11:24:45 chr3 111688578 . C T 147.42 PASS AO=58;DP=183;FAO=60;FDP=184;FR=.;FRO=124;FSAF=37;FSAR=23;FSRF=73;FSRR=51;FWDB=0.0154547;FXX=0.00540511;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.8148;QD=3.20484;RBI=0.028601;REFB=-0.00557321;REVB=0.0240659;RO=122;SAF=34;SAR=24;SRF=72;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00479092;STB=0.519735;TYPE=snp;VARB=0.016488;OID=.;OPOS=111688578;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:184:122:124:58:60:24:34:72:50:23:37:73:51 chr3 111694355 . A G 274.27 PASS AO=84;DP=211;FAO=84;FDP=211;FR=.;FRO=127;FSAF=41;FSAR=43;FSRF=74;FSRR=53;FWDB=-0.0140896;FXX=0.00471676;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3673;QD=5.19946;RBI=0.014223;REFB=-0.00249641;REVB=0.00194357;RO=125;SAF=41;SAR=43;SRF=73;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102063;STB=0.556793;TYPE=snp;VARB=0.00253713;OID=.;OPOS=111694355;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:211:125:127:84:84:43:41:73:52:43:41:74:53 chr3 111694438 . T C 1675.23 PASS AO=179;DP=196;FAO=184;FDP=184;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0571229;FXX=0.0980344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.65;QD=36.418;RBI=0.0748521;REFB=-0.0932045;REVB=0.0483716;RO=3;SAF=88;SAR=91;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159498;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00169794;OID=.;OPOS=111694438;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:196:184:3:0:179:184:91:88:3:0:94:90:0:0 chr3 111710398 . A G 539.98 PASS AO=128;DP=258;FAO=128;FDP=258;FR=.;FRO=130;FSAF=60;FSAR=68;FSRF=41;FSRR=89;FWDB=0.0468355;FXX=0.00386085;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.506;QD=8.37184;RBI=0.0479647;REFB=-0.0224372;REVB=-0.0103465;RO=126;SAF=60;SAR=68;SRF=38;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153946;STB=0.578328;TYPE=snp;VARB=0.0255167;OID=.;OPOS=111710398;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:258:258:126:130:128:128:68:60:38:88:68:60:41:89 chr3 111760771 . A G 1555.27 PASS AO=168;DP=171;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00155507;FXX=0.0175428;HRUN=4;LEN=1;MLLD=177.564;QD=37.0302;RBI=0.00184095;REFB=0.0529087;REVB=-0.000985319;RO=3;SAF=91;SAR=77;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00699849;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.27491e-06;OID=.;OPOS=111760771;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:171:168:3:0:168:168:77:91:1:2:77:91:0:0 chr3 111765834 . G A 712.34 PASS AO=77;DP=79;FAO=77;FDP=79;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=51;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0237434;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.322;QD=36.0678;RBI=0.0247918;REFB=-0.0652227;REVB=0.00713331;RO=0;SAF=26;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504579;TYPE=snp;VARB=0.000627278;OID=.;OPOS=111765834;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:79:79:0:2:77:77:51:26:0:0:51:26:1:1 chr3 111799845 . A T 3801.1 PASS AO=435;DP=439;FAO=397;FDP=397;FR=.;FRO=0;FSAF=201;FSAR=196;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0488266;FXX=0.00749981;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.0376;QD=38.2983;RBI=0.0489503;REFB=0.0108989;REVB=-0.00347878;RO=1;SAF=218;SAR=217;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0021947;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000214786;OID=.;OPOS=111799845;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:439:397:1:0:435:397:217:218:0:1:196:201:0:0 chr3 111828423 . G A 2518.11 PASS AO=263;DP=263;FAO=263;FDP=263;FR=.;FRO=0;FSAF=106;FSAR=157;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0266891;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=234.449;QD=38.2983;RBI=0.026749;REFB=0;REVB=-0.00178948;RO=0;SAF=106;SAR=157;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.29469e-05;OID=.;OPOS=111828423;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:263:263:0:0:263:263:157:106:0:0:157:106:0:0 chr3 111918215 . C T 1653.13 PASS AO=182;DP=198;FAO=182;FDP=188;FR=.;FRO=6;FSAF=81;FSAR=101;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.031715;FXX=0.0505025;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.374;QD=35.173;RBI=0.0340041;REFB=-0.046973;REVB=0.0122653;RO=5;SAF=81;SAR=101;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00797089;STB=0.507147;TYPE=snp;VARB=0.00159263;OID=.;OPOS=111918215;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:198:188:5:6:182:182:101:81:3:2:101:81:4:2 chr3 111918216 . A G 1584.77 PASS AO=181;DP=198;FAO=182;FDP=193;FR=.;FRO=11;FSAF=80;FSAR=102;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=0.0153572;FXX=0.0252513;HRUN=4;LEN=1;MLLD=138.999;QD=32.8449;RBI=0.0274923;REFB=-0.117317;REVB=0.0228031;RO=7;SAF=80;SAR=101;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000963103;STB=0.509671;TYPE=snp;VARB=0.00326255;OID=.;OPOS=111918216;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:198:193:7:11:181:182:101:80:3:4:102:80:3:8 chr3 111921116 . C A 2443 PASS AO=225;DP=225;FAO=257;FDP=257;FR=.;FRO=0;FSAF=130;FSAR=127;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0542406;FXX=0.00387582;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3239;QD=38.0233;RBI=0.08331;REFB=0;REVB=0.0632339;RO=0;SAF=127;SAR=98;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00411947;OID=.;OPOS=111921116;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:225:257:0:0:225:257:98:127:0:0:127:130:0:0 chr3 111921225 . G T 1327.38 PASS AO=126;DP=126;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.024;QD=38.198;RBI=0.0418167;REFB=0;REVB=0.0403661;RO=0;SAF=53;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.43441e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000440284;OID=.;OPOS=111921225;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:126:139:0:0:126:139:73:53:0:0:77:62:0:0 chr3 111923123 . G A 1673.86 PASS AO=173;DP=173;FAO=175;FDP=175;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.402;QD=38.2596;RBI=0.0177521;REFB=0;REVB=0.0129271;RO=0;SAF=87;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.64744e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.00937e-05;OID=.;OPOS=111923123;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:173:175:0:0:173:175:86:87:0:0:88:87:0:0 chr3 111962851 . T C 1553.26 PASS AO=162;DP=165;FAO=163;FDP=163;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0277358;FXX=0.0411741;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.37;QD=38.1169;RBI=0.0653898;REFB=-0.0790232;REVB=0.0592162;RO=1;SAF=85;SAR=77;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00613977;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000312573;OID=.;OPOS=111962851;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:165:163:1:0:162:163:77:85:0:1:78:85:0:0 chr3 111981849 . C T 1118.44 PASS AO=123;DP=128;FAO=124;FDP=127;FR=.;FRO=3;FSAF=59;FSAR=65;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.108456;FXX=0.00781189;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.4363;QD=35.2264;RBI=0.145828;REFB=-0.136529;REVB=0.0974841;RO=0;SAF=58;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504516;TYPE=snp;VARB=0.0105014;OID=.;OPOS=111981849;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:128:127:0:3:123:124:65:58:0:0:65:59:2:1 chr3 111981878 . T C 1059.14 PASS AO=84;DP=117;FAO=113;FDP=114;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=54;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.111745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.101;QD=37.1629;RBI=0.113498;REFB=0;REVB=0.0198729;RO=0;SAF=24;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6186e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00160901;OID=.;OPOS=111981878;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:114:114:0:0:84:113:60:24:0:0:59:54:0:0 chr3 111981924 . T C 726.69 PASS AO=75;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00723777;FXX=0.0129853;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.7678;QD=38.2466;RBI=0.0679588;REFB=0;REVB=-0.0675722;RO=0;SAF=28;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94731e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00178035;OID=.;OPOS=111981924;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:76:76:0:0:75:76:47:28:0:0:47:29:0:0 chr3 111985107 . T C 3648.85 PASS AO=417;DP=426;FAO=392;FDP=392;FR=.;FRO=0;FSAF=191;FSAR=201;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190592;FXX=0.0199995;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.885;QD=37.2331;RBI=0.0221041;REFB=-0.0450149;REVB=0.0111954;RO=8;SAF=203;SAR=214;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00945583;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.43098e-05;OID=.;OPOS=111985107;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:426:392:8:0:417:392:214:203:6:2:201:191:0:0 chr3 111996554 . T C 961.17 PASS AO=101;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.040195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.536;QD=38.066;RBI=0.0644921;REFB=0;REVB=0.0504341;RO=0;SAF=63;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.37233e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000243872;OID=.;OPOS=111996554;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:101:101:0:0:101:101:38:63:0:0:38:63:0:0 chr3 112059768 . C G 776.37 PASS AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0150358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.952;QD=37.8715;RBI=0.0171924;REFB=0;REVB=-0.00833687;RO=0;SAF=28;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.44411e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.52518e-05;OID=.;OPOS=112059768;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:82:82:0:0:82:82:54:28:0:0:54:28:0:0 chr3 112081560 . T TTA 1308.16 PASS AO=161;DP=294;FAO=180;FDP=217;FR=.;FRO=37;FSAF=107;FSAR=73;FSRF=30;FSRR=7;FWDB=0.0259471;FXX=0.035554;HRUN=3;LEN=2;MLLD=156.749;QD=24.1135;RBI=0.0799718;REFB=-0.106842;REVB=0.0756454;RO=118;SAF=97;SAR=64;SRF=69;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0144013;STB=0.538814;TYPE=ins;VARB=0.017547;OID=.;OPOS=112081561;OREF=-;OALT=TA;OMAPALT=TTA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:161:294:180:217:37:107:73:30:7:26:118:97:64:69:49 chr3 112185025 . G A 2335.98 PASS AO=251;DP=255;FAO=251;FDP=251;FR=.;FRO=0;FSAF=120;FSAR=131;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260519;FXX=0.0156857;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.423;QD=37.2267;RBI=0.0269399;REFB=-0.0288729;REVB=0.00685973;RO=3;SAF=120;SAR=131;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00425275;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000108177;OID=.;OPOS=112185025;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:255:251:3:0:251:251:131:120:2:1:131:120:0:0 chr3 112190137 . G T 942.32 PASS AO=101;DP=102;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0361418;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.721;QD=37.3197;RBI=0.0490987;REFB=-0.0758803;REVB=0.0332334;RO=1;SAF=45;SAR=56;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0083971;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000176311;OID=.;OPOS=112190137;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:102:101:1:0:101:101:56:45:0:1:56:45:0:0 chr3 112545939 . C T 223.45 PASS AO=60;DP=137;FAO=60;FDP=137;FR=.;FRO=77;FSAF=24;FSAR=36;FSRF=38;FSRR=39;FWDB=-0.00235365;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=259.221;QD=6.52401;RBI=0.0028273;REFB=-0.0101251;REVB=-0.00156651;RO=77;SAF=24;SAR=36;SRF=38;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0957851;STB=0.553553;TYPE=snp;VARB=0.0131074;OID=.;OPOS=112545939;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:77:77:60:60:36:24:38:39:36:24:38:39 chr3 112546473 . G A 1594.5 PASS AO=164;DP=164;FAO=167;FDP=167;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.7159;QD=38.1916;RBI=0.0536435;REFB=0;REVB=0.0525292;RO=0;SAF=48;SAR=116;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000208633;OID=.;OPOS=112546473;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:164:167:0:0:164:167:116:48:0:0:118:49:0:0 chr3 112642568 . C G 431.11 PASS AO=123;DP=291;FAO=124;FDP=291;FR=.;FRO=167;FSAF=103;FSAR=21;FSRF=72;FSRR=95;FWDB=-0.00774619;FXX=0.00342454;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2311;QD=5.92584;RBI=0.00988888;REFB=-0.00238684;REVB=0.00614707;RO=166;SAF=103;SAR=20;SRF=72;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.480051;STB=0.764723;TYPE=snp;VARB=0.00363598;OID=.;OPOS=112642568;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:291:291:166:167:123:124:20:103:72:94:21:103:72:95 chr3 112642572 . T C 15.81 PASS AO=30;DP=199;FAO=30;FDP=199;FR=.;FRO=169;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=76;FSRR=93;FWDB=0.0327058;FXX=0.00499975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.747;QD=0.317863;RBI=0.0391267;REFB=-0.0183007;REVB=0.0214763;RO=167;SAF=12;SAR=18;SRF=75;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0641366;STB=0.543181;TYPE=snp;VARB=0.0585489;OID=.;OPOS=112642572;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:199:199:167:169:30:30:18:12:75:92:18:12:76:93 chr3 112643403 . G T 284.37 PASS AO=53;DP=83;FAO=52;FDP=84;FR=.;FRO=32;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.0416305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.993;QD=13.5415;RBI=0.0428726;REFB=0.00187868;REVB=0.010245;RO=29;SAF=27;SAR=26;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0173805;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000768921;OID=.;OPOS=112643403;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:84:29:32:53:52:26:27:14:15:26:26:16:16 chr3 112643952 . C T 88.81 PASS AO=38;DP=126;FAO=38;FDP=126;FR=.;FRO=88;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=52;FSRR=36;FWDB=-0.00186038;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.589;QD=2.81944;RBI=0.00200788;REFB=-0.00653107;REVB=-0.000755365;RO=87;SAF=20;SAR=18;SRF=51;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0718298;STB=0.545431;TYPE=snp;VARB=0.0166475;OID=.;OPOS=112643952;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:126:126:87:88:38:38:18:20:51:36:18:20:52:36 chr3 112647832 . A C 122.41 PASS AO=53;DP=173;FAO=53;FDP=172;FR=.;FRO=119;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=56;FSRR=63;FWDB=-0.0403923;FXX=0.00578001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.1179;QD=2.8467;RBI=0.0451104;REFB=-0.00150028;REVB=-0.0200852;RO=116;SAF=27;SAR=26;SRF=54;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0519333;STB=0.526848;TYPE=snp;VARB=0.00531961;OID=.;OPOS=112647832;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:172:116:119:53:53:26:27:54:62:26:27:56:63 chr3 112647988 . C T 227.83 PASS AO=74;DP=198;FAO=75;FDP=198;FR=.;FRO=123;FSAF=25;FSAR=50;FSRF=56;FSRR=67;FWDB=0.00831465;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.285;QD=4.60271;RBI=0.0171969;REFB=0.0019454;REVB=-0.0150532;RO=122;SAF=24;SAR=50;SRF=55;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148785;STB=0.580623;TYPE=snp;VARB=-0.00261741;OID=.;OPOS=112647988;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:198:122:123:74:75:50:24:55:67:50:25:56:67 chr3 112648125 . G T 467.59 PASS AO=131;DP=302;FAO=131;FDP=303;FR=.;FRO=172;FSAF=68;FSAR=63;FSRF=88;FSRR=84;FWDB=-0.0361925;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.735;QD=6.17286;RBI=0.0370208;REFB=-0.0126178;REVB=0.00778772;RO=171;SAF=68;SAR=63;SRF=88;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00455571;STB=0.504237;TYPE=snp;VARB=0.00655306;OID=.;OPOS=112648125;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:302:303:171:172:131:131:63:68:88:83:63:68:88:84 chr3 112648127 . T G 11.8 PASS AO=130;DP=299;FAO=7;FDP=171;FR=.;FRO=164;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=83;FSRR=81;FWDB=-0.0023685;FXX=0.429986;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.052;QD=0.276122;RBI=0.0046016;REFB=-0.000175299;REVB=-0.00394524;RO=160;SAF=67;SAR=63;SRF=80;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0153315;STB=0.711288;TYPE=snp;VARB=0.0634169;OID=.;OPOS=112648127;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:299:171:160:164:130:7:63:67:80:80:5:2:83:81 chr3 112648222 . T C 573.68 PASS AO=133;DP=260;FAO=132;FDP=257;FR=.;FRO=125;FSAF=69;FSAR=63;FSRF=66;FSRR=59;FWDB=0.00296619;FXX=0.011538;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8853;QD=8.9289;RBI=0.0174422;REFB=0.0110417;REVB=0.0171881;RO=127;SAF=67;SAR=66;SRF=68;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0282685;STB=0.50257;TYPE=snp;VARB=-0.00979737;OID=.;OPOS=112648222;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:260:257:127:125:133:132:66:67:68:59:63:69:66:59 chr3 112727184 . A T 2349.28 PASS AO=248;DP=250;FAO=249;FDP=249;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=152;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0112;FXX=0.00796781;HRUN=4;LEN=1;MLLD=253.886;QD=37.7394;RBI=0.0155828;REFB=0.0254525;REVB=-0.0108344;RO=1;SAF=97;SAR=151;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00314643;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.10167e-05;OID=.;OPOS=112727184;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:250:249:1:0:248:249:151:97:0:1:152:97:0:0 chr3 112935052 . G A 399.67 PASS AO=79;DP=138;FAO=79;FDP=137;FR=.;FRO=58;FSAF=41;FSAR=38;FSRF=24;FSRR=34;FWDB=0.0292247;FXX=0.00724585;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.952;QD=11.6693;RBI=0.0318559;REFB=0.00244682;REVB=0.0126773;RO=58;SAF=41;SAR=38;SRF=24;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0816509;STB=0.544437;TYPE=snp;VARB=-0.0017823;OID=.;OPOS=112935052;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:137:58:58:79:79:38:41:24:34:38:41:24:34 chr3 112935114 . TAGA T 167.27 PASS AO=48;DP=148;FAO=55;FDP=143;FR=.;FRO=88;FSAF=18;FSAR=37;FSRF=34;FSRR=54;FWDB=0.00580163;FXX=0.0466636;HRUN=1;LEN=3;MLLD=204.741;QD=4.67873;RBI=0.0253453;REFB=-0.00673102;REVB=-0.0246723;RO=75;SAF=15;SAR=33;SRF=34;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163303;STB=0.540131;TYPE=del;VARB=0.00845786;OID=.;OPOS=112935115;OREF=AGA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:48:144:55:143:88:18:37:34:54:99:75:15:33:34:41 chr3 112935138 . C G 1338.14 PASS AO=139;DP=141;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109317;FXX=0.00704176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.6218;QD=37.9613;RBI=0.0311053;REFB=0;REVB=-0.0291211;RO=0;SAF=45;SAR=94;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.35468e-05;OID=.;OPOS=112935138;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:141:141:0:0:139:141:94:45:0:0:93:48:0:0 chr3 112993367 . G A 155.56 PASS AO=36;DP=75;FAO=36;FDP=74;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=-0.00011901;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.775;QD=8.40874;RBI=0.0041819;REFB=-0.00199518;REVB=0.00418021;RO=37;SAF=19;SAR=17;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.086554;STB=0.554611;TYPE=snp;VARB=0.00144842;OID=.;OPOS=112993367;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:74:37:38:36:36:17:19:16:21:17:19:16:22 chr3 112997554 . A G 29.77 PASS AO=12;DP=43;FAO=12;FDP=43;FR=.;FRO=31;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=23;FWDB=-0.161022;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.7444;QD=2.76906;RBI=0.168547;REFB=-0.016806;REVB=-0.0498002;RO=31;SAF=1;SAR=11;SRF=8;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.377678;STB=0.743838;TYPE=snp;VARB=0.0255119;OID=.;OPOS=112997554;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:43:43:31:31:12:12:11:1:8:23:11:1:8:23 chr3 112998268 . G A 178.4 PASS AO=42;DP=88;FAO=42;FDP=87;FR=.;FRO=45;FSAF=11;FSAR=31;FSRF=5;FSRR=40;FWDB=-0.00113805;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.398;QD=8.20251;RBI=0.00613803;REFB=0.00239931;REVB=-0.0060316;RO=45;SAF=11;SAR=31;SRF=5;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203366;STB=0.611544;TYPE=snp;VARB=-0.0033951;OID=.;OPOS=112998268;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:87:45:45:42:42:31:11:5:40:31:11:5:40 chr3 113010466 . T C 3758.12 PASS AO=362;DP=366;FAO=395;FDP=395;FR=.;FRO=0;FSAF=160;FSAR=235;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0290548;FXX=0.0124997;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.497;QD=38.0569;RBI=0.0293302;REFB=-0.0647439;REVB=-0.00400954;RO=0;SAF=169;SAR=193;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.40144e-05;OID=.;OPOS=113010466;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:366:395:0:0:362:395:193:169:0:0:235:160:0:0 chr3 113022870 . T C 1920.96 PASS AO=204;DP=206;FAO=204;FDP=204;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00722859;FXX=0.00970827;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.176;QD=37.6658;RBI=0.00735759;REFB=-0.0818083;REVB=-0.00137174;RO=2;SAF=89;SAR=115;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0082113;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.88203e-05;OID=.;OPOS=113022870;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:206:204:2:0:204:204:115:89:0:2:115:89:0:0 chr3 113082077 . T G 272.88 PASS AO=82;DP=203;FAO=82;FDP=203;FR=.;FRO=121;FSAF=24;FSAR=58;FSRF=47;FSRR=74;FWDB=0.00581288;FXX=0.00490172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.8297;QD=5.37693;RBI=0.00657076;REFB=-0.0201427;REVB=0.00306353;RO=116;SAF=24;SAR=58;SRF=47;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132749;STB=0.565177;TYPE=snp;VARB=0.0311617;OID=.;OPOS=113082077;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:203:116:121:82:82:58:24:47:69:58:24:47:74 chr3 113082082 . C T 339.41 PASS AO=85;DP=197;FAO=90;FDP=200;FR=.;FRO=110;FSAF=29;FSAR=61;FSRF=43;FSRR=67;FWDB=0.00754548;FXX=0.0099005;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.332;QD=6.78825;RBI=0.0202509;REFB=-0.0251517;REVB=0.0187927;RO=111;SAF=26;SAR=59;SRF=43;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0932929;STB=0.541945;TYPE=snp;VARB=0.0231258;OID=.;OPOS=113082082;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:200:111:110:85:90:59:26:43:68:61:29:43:67 chr3 113128051 . G T 223.23 PASS AO=71;DP=186;FAO=72;FDP=190;FR=.;FRO=118;FSAF=24;FSAR=48;FSRF=41;FSRR=77;FWDB=0.0329221;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.168;QD=4.69957;RBI=0.0621862;REFB=-0.00395229;REVB=0.0527566;RO=115;SAF=23;SAR=48;SRF=39;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0188034;STB=0.509801;TYPE=snp;VARB=0.00567689;OID=.;OPOS=113128051;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:190:115:118:71:72:48:23:39:76:48:24:41:77 chr3 113320477 . C T 1617.61 PASS AO=170;DP=171;FAO=170;FDP=170;FR=.;FRO=0;FSAF=119;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0131681;FXX=0.00584761;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.5284;QD=38.0615;RBI=0.0156948;REFB=0;REVB=0.00853979;RO=0;SAF=119;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.48035e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.12604e-05;OID=.;OPOS=113320477;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:171:170:0:0:170:170:51:119:0:0:51:119:0:0 chr3 113323787 . G A 766.69 PASS AO=82;DP=85;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00713405;FXX=0.0235266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.304;QD=36.9488;RBI=0.0381873;REFB=-0.0750761;REVB=0.037515;RO=1;SAF=47;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00997022;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.47774e-05;OID=.;OPOS=113323787;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:85:83:1:0:82:83:35:47:1:0:35:48:0:0 chr3 113351719 . T C 636.49 PASS AO=65;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0313075;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.859;QD=37.9996;RBI=0.0313171;REFB=0;REVB=-0.000776472;RO=0;SAF=25;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00013371;OID=.;OPOS=113351719;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:66:67:0:0:65:67:40:25:0:0:41:26:0:0 chr3 113367734 . T C 469.86 PASS AO=83;DP=129;FAO=83;FDP=129;FR=.;FRO=46;FSAF=27;FSAR=56;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=-0.0121185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.7899;QD=14.5693;RBI=0.0239947;REFB=-0.0141241;REVB=0.0207096;RO=46;SAF=27;SAR=56;SRF=18;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0486543;STB=0.526309;TYPE=snp;VARB=0.00533375;OID=.;OPOS=113367734;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:46:46:83:83:56:27:18:28:56:27:18:28 chr3 113373930 . A G 1394.86 PASS AO=147;DP=148;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0485106;FXX=0.0067563;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.4777;QD=37.9552;RBI=0.0538635;REFB=-0.0445317;REVB=-0.0234094;RO=0;SAF=71;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.2464e-05;OID=.;OPOS=113373930;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:148:147:0:0:147:147:76:71:0:0:76:71:0:0 chr3 113376110 . TTGCTGCTGC T 28.6 PASS AO=22;DP=64;FAO=13;FDP=36;FR=.;FRO=23;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.0253111;FXX=0.428503;HRUN=2;LEN=9;MLLD=141.527;QD=3.17742;RBI=0.0255779;REFB=-0.0459873;REVB=-0.00368463;RO=0;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.894834;TYPE=del;VARB=0.109213;OID=.;OPOS=113376111;OREF=TGCTGCTGC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:22:25:13:36:23:1:12:14:9:28:0:10:12:0:0 chr3 113377361 . A G 1232.49 PASS AO=128;DP=129;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181888;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.41;QD=38.5154;RBI=0.0189283;REFB=0;REVB=0.00523922;RO=0;SAF=74;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.83748e-05;OID=.;OPOS=113377361;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:129:128:0:0:128:128:54:74:0:0:54:74:0:0 chr3 113379865 . G C 934.27 PASS AO=103;DP=104;FAO=102;FDP=103;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=57;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0231618;FXX=0.00961446;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.6311;QD=36.2822;RBI=0.0659739;REFB=-0.0579265;REVB=0.0617745;RO=1;SAF=45;SAR=58;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104275;STB=0.505493;TYPE=snp;VARB=0.00149022;OID=.;OPOS=113379865;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:104:103:1:1:103:102:58:45:1:0:57:45:1:0 chr3 113858350 . C T 2945.52 PASS AO=298;DP=300;FAO=308;FDP=308;FR=.;FRO=0;FSAF=153;FSAR=155;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00408182;FXX=0.00323614;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.9656;QD=38.2534;RBI=0.0311957;REFB=-0.0134788;REVB=-0.0309275;RO=1;SAF=146;SAR=152;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00312743;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.13553e-05;OID=.;OPOS=113858350;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:300:308:1:0:298:308:152:146:0:1:155:153:0:0 chr3 113890815 . C T 1075.55 PASS AO=113;DP=115;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000442153;FXX=0.0173898;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.444;QD=38.0726;RBI=0.0185013;REFB=0;REVB=-0.018496;RO=0;SAF=53;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.19802e-05;OID=.;OPOS=113890815;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:115:113:0:0:113:113:60:53:0:0:60:53:0:0 chr3 113955164 . T G 907.68 PASS AO=91;DP=93;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0141587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.602;QD=37.82;RBI=0.0220305;REFB=0;REVB=0.0168783;RO=0;SAF=57;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000225653;OID=.;OPOS=113955164;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:93:96:0:0:91:96:34:57:0:0:38:58:0:0 chr3 113955187 . A C 1223.13 PASS AO=129;DP=130;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00168749;FXX=0.00763301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.515;QD=37.6346;RBI=0.0527532;REFB=0.00866692;REVB=-0.0527262;RO=0;SAF=78;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.28766e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.99225e-05;OID=.;OPOS=113955187;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:130:130:0:0:129:130:51:78:0:0:52:78:0:0 chr3 113955265 . G A 2074.51 PASS AO=212;DP=213;FAO=216;FDP=216;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=112;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0422856;FXX=0.00460808;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.932;QD=38.4168;RBI=0.0463636;REFB=0;REVB=0.0190136;RO=0;SAF=104;SAR=108;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.77094e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.43496e-05;OID=.;OPOS=113955265;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:213:216:0:0:212:216:108:104:0:0:112:104:0:0 chr3 113955320 . C T 1569.47 PASS AO=137;DP=182;FAO=169;FDP=169;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=78;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0326719;FXX=0.0231201;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1811;QD=37.1472;RBI=0.0594905;REFB=0;REVB=0.0497158;RO=0;SAF=78;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.5753e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000755495;OID=.;OPOS=113955320;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:173:169:0:0:137:169:59:78:0:0:91:78:0:0 chr3 115440007 . T G 1547.89 PASS AO=181;DP=196;FAO=185;FDP=196;FR=.;FRO=11;FSAF=71;FSAR=114;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=-0.0315168;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=38.229;QD=31.5895;RBI=0.0713179;REFB=-0.026658;REVB=-0.0639761;RO=10;SAF=70;SAR=111;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00911737;STB=0.512048;TYPE=snp;VARB=0.00237624;OID=.;OPOS=115440007;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:196:196:10:11:181:185:111:70:3:7:114:71:2:9 chr3 116301660 . C T 321.4 PASS AO=34;DP=34;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0893018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.811;QD=36.7309;RBI=0.0942877;REFB=0;REVB=0.0302551;RO=0;SAF=6;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.73777e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00173465;OID=.;OPOS=116301660;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:35:0:0:34:35:28:6:0:0:28:7:0:0 chr3 116683964 . G C 3790.52 PASS AO=575;DP=581;FAO=398;FDP=398;FR=.;FRO=0;FSAF=220;FSAR=178;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00103082;FXX=0.00499988;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.094;QD=38.0957;RBI=0.0270951;REFB=-0.0201852;REVB=0.0270755;RO=3;SAF=309;SAR=266;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00461363;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.73509e-05;OID=.;OPOS=116683964;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:581:398:3:0:575:398:266:309:3:0:178:220:0:0 chr3 118269774 . A G 503.18 PASS AO=109;DP=203;FAO=109;FDP=203;FR=.;FRO=94;FSAF=53;FSAR=56;FSRF=50;FSRR=44;FWDB=0.0904407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.294;QD=9.91486;RBI=0.0905372;REFB=-0.0359479;REVB=-0.00417825;RO=94;SAF=53;SAR=56;SRF=50;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0387177;STB=0.521138;TYPE=snp;VARB=0.03019;OID=.;OPOS=118269774;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:203:94:94:109:109:56:53:50:44:56:53:50:44 chr3 118381320 . C A 289.72 PASS AO=26;DP=26;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0113053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.757;QD=38.6287;RBI=0.0689937;REFB=0;REVB=0.0680612;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000165778;OID=.;OPOS=118381320;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:26:30:0:0:26:30:15:11:0:0:19:11:0:0 chr3 118621664 . C A 1838.59 PASS AO=194;DP=195;FAO=194;FDP=194;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=170;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0281757;FXX=0.00512794;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.7361;QD=37.9091;RBI=0.0284344;REFB=-0.0519944;REVB=0.00382658;RO=1;SAF=24;SAR=170;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00279343;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000205217;OID=.;OPOS=118621664;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:195:194:1:0:194:194:170:24:0:1:170:24:0:0 chr3 118649060 . G T 1472.36 PASS AO=153;DP=154;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0308919;FXX=0.0064512;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.738;QD=38.243;RBI=0.0405254;REFB=0;REVB=0.0262297;RO=0;SAF=72;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.61649e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.95371e-05;OID=.;OPOS=118649060;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:154:154:0:0:153:154:81:72:0:0:81:73:0:0 chr3 118865801 . C T 188.52 PASS AO=41;DP=80;FAO=41;FDP=80;FR=.;FRO=39;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=0.0274417;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.057;QD=9.42575;RBI=0.0303004;REFB=-0.0336226;REVB=0.0128478;RO=39;SAF=15;SAR=26;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177713;STB=0.598582;TYPE=snp;VARB=0.0235496;OID=.;OPOS=118865801;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:39:39:41:41:26:15:22:17:26:15:22:17 chr3 118865970 . G A 187.67 PASS AO=42;DP=83;FAO=42;FDP=83;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=-0.00770371;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.384;QD=9.04425;RBI=0.0652111;REFB=-0.0161423;REVB=-0.0647545;RO=41;SAF=16;SAR=26;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0762021;STB=0.542292;TYPE=snp;VARB=0.0162313;OID=.;OPOS=118865970;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:41:41:42:42:26:16:19:22:26:16:19:22 chr3 118867047 . C G 172.48 PASS AO=45;DP=102;FAO=45;FDP=102;FR=.;FRO=57;FSAF=33;FSAR=12;FSRF=44;FSRR=13;FWDB=0.00954219;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.402;QD=6.76394;RBI=0.0176713;REFB=-0.0109;REVB=0.0148735;RO=57;SAF=33;SAR=12;SRF=44;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0506485;STB=0.52829;TYPE=snp;VARB=0.0137679;OID=.;OPOS=118867047;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:57:57:45:45:12:33:44:13:12:33:44:13 chr3 118878789 . C T 313.98 PASS AO=77;DP=162;FAO=77;FDP=162;FR=.;FRO=85;FSAF=27;FSAR=50;FSRF=37;FSRR=48;FWDB=-0.0172044;FXX=0.00613459;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.587;QD=7.7526;RBI=0.0196752;REFB=0.0108628;REVB=0.00954584;RO=85;SAF=27;SAR=50;SRF=37;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0855009;STB=0.54737;TYPE=snp;VARB=-0.0101349;OID=.;OPOS=118878789;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:162:85:85:77:77:50:27:37:48:50:27:37:48 chr3 118909159 . A G 679.41 PASS AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0621438;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.4538;QD=37.745;RBI=0.0626571;REFB=0;REVB=-0.00800432;RO=0;SAF=32;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.05346e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000403518;OID=.;OPOS=118909159;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:72:72:0:0:72:72:40:32:0:0:40:32:0:0 chr3 118931113 . C T 282 PASS AO=64;DP=126;FAO=64;FDP=126;FR=.;FRO=62;FSAF=15;FSAR=49;FSRF=27;FSRR=35;FWDB=0.0127975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.592;QD=8.95239;RBI=0.0173081;REFB=-0.0113091;REVB=0.0116532;RO=62;SAF=15;SAR=49;SRF=27;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216592;STB=0.620213;TYPE=snp;VARB=0.00767915;OID=.;OPOS=118931113;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:62:62:64:64:49:15:27:35:49:15:27:35 chr3 118945796 . G C 2014.68 PASS AO=209;DP=209;FAO=209;FDP=209;FR=.;FRO=0;FSAF=119;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00940863;FXX=0.00476168;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.89;QD=38.5585;RBI=0.0272507;REFB=0;REVB=-0.0255749;RO=0;SAF=119;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.7656e-05;OID=.;OPOS=118945796;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:209:209:0:0:209:209:90:119:0:0:90:119:0:0 chr3 119118104 . A G 898.06 PASS AO=93;DP=93;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.534;QD=37.8128;RBI=0.095407;REFB=0;REVB=0.0943273;RO=0;SAF=38;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.99896e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000361277;OID=.;OPOS=119118104;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:93:95:0:0:93:95:55:38:0:0:57:38:0:0 chr3 119128397 . CG C,CA 209.16 PASS AO=13,19;DP=51;FAO=13,25;FDP=50;FR=.;FRO=12;FSAF=1,4;FSAR=12,21;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=0.0800296,-0.001963;FXX=0.019604;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=14.5084,187.734;QD=16.7329;RBI=0.23962,0.0269703;REFB=-0.00625142,-0.0240826;REVB=-0.225861,-0.0268988;RO=8;SAF=1,4;SAR=12,15;SRF=8;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0.505495,0;SSSB=-0.69746,-0.449963;STB=0.888197,0.739618;TYPE=del,snp;VARB=0.135987,0.0332884;OID=.,.;OPOS=119128398,119128398;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=C,CA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:13,19:46:13,25:50:12:1,4:12,21:9:3:38:8:1,4:12,15:8:0 chr3 119133183 . G A 317.79 PASS AO=64;DP=112;FAO=64;FDP=113;FR=.;FRO=49;FSAF=28;FSAR=36;FSRF=18;FSRR=31;FWDB=-0.040893;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.54;QD=11.2492;RBI=0.0427003;REFB=-0.00843741;REVB=0.0122915;RO=46;SAF=28;SAR=36;SRF=18;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0361783;STB=0.531134;TYPE=snp;VARB=0.00657676;OID=.;OPOS=119133183;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:113:46:49:64:64:36:28:18:28:36:28:18:31 chr3 119150836 . C T 709.2 PASS AO=176;DP=367;FAO=177;FDP=371;FR=.;FRO=194;FSAF=105;FSAR=72;FSRF=82;FSRR=112;FWDB=0.0139024;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.884;QD=7.64633;RBI=0.0155379;REFB=-0.00209437;REVB=-0.00693902;RO=189;SAF=104;SAR=72;SRF=80;SRR=109;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158186;STB=0.589302;TYPE=snp;VARB=0.00353879;OID=.;OPOS=119150836;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:367:371:189:194:176:177:72:104:80:109:72:105:82:112 chr3 119197285 . A G 423.38 PASS AO=109;DP=237;FAO=109;FDP=236;FR=.;FRO=127;FSAF=59;FSAR=50;FSRF=39;FSRR=88;FWDB=-0.0302883;FXX=0.00421923;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.536;QD=7.17588;RBI=0.0374795;REFB=-0.00569863;REVB=0.0220756;RO=127;SAF=59;SAR=50;SRF=39;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22568;STB=0.624269;TYPE=snp;VARB=0.00715878;OID=.;OPOS=119197285;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:237:236:127:127:109:109:50:59:39:88:50:59:39:88 chr3 119222456 . G C 381.3 PASS AO=111;DP=265;FAO=111;FDP=265;FR=.;FRO=154;FSAF=53;FSAR=58;FSRF=90;FSRR=64;FWDB=0.00740218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.075;QD=5.75547;RBI=0.0174901;REFB=-0.0150561;REVB=0.0158465;RO=152;SAF=53;SAR=58;SRF=89;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111715;STB=0.561913;TYPE=snp;VARB=0.0202004;OID=.;OPOS=119222456;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:265:265:152:154:111:111:58:53:89:63:58:53:90:64 chr3 119248301 . G A 931.1 PASS AO=294;DP=565;FAO=208;FDP=393;FR=.;FRO=185;FSAF=86;FSAR=122;FSRF=106;FSRR=79;FWDB=-0.0412365;FXX=0.0174996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.0027;QD=9.47684;RBI=0.0441224;REFB=-0.0086828;REVB=-0.0156952;RO=255;SAF=120;SAR=174;SRF=138;SRR=117;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114802;STB=0.57538;TYPE=snp;VARB=0.00756097;OID=.;OPOS=119248301;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:565:393:255:185:294:208:174:120:138:117:122:86:106:79 chr3 119248321 . A G 497.6 PASS AO=216;DP=531;FAO=157;FDP=396;FR=.;FRO=239;FSAF=64;FSAR=93;FSRF=118;FSRR=121;FWDB=0.00127099;FXX=0.00999975;HRUN=9;LEN=1;MLLD=253.505;QD=5.02624;RBI=0.0034146;REFB=-0.00128121;REVB=-0.00316924;RO=315;SAF=95;SAR=121;SRF=159;SRR=156;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0694119;STB=0.552733;TYPE=snp;VARB=0.001912;OID=.;OPOS=119248321;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:531:396:315:239:216:157:121:95:159:156:93:64:118:121 chr3 119305379 . T A 356.5 PASS AO=73;DP=128;FAO=73;FDP=131;FR=.;FRO=58;FSAF=21;FSAR=52;FSRF=19;FSRR=39;FWDB=-0.0175963;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.001;QD=10.8854;RBI=0.0479906;REFB=-0.0282408;REVB=-0.0446483;RO=54;SAF=21;SAR=52;SRF=16;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00817413;STB=0.521167;TYPE=snp;VARB=0.0227793;OID=.;OPOS=119305379;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:131:54:58:73:73:52:21:16:38:52:21:19:39 chr3 119338956 . A G 2540.66 PASS AO=265;DP=265;FAO=265;FDP=265;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=183;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=316.192;QD=38.3495;RBI=0.0171916;REFB=0;REVB=-0.00305555;RO=0;SAF=82;SAR=183;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.10901e-06;OID=.;OPOS=119338956;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:265:265:0:0:265:265:183:82:0:0:183:82:0:0 chr3 119367390 . T C 1012.6 PASS AO=106;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0435733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.763;QD=38.2113;RBI=0.0517793;REFB=0;REVB=0.0279725;RO=0;SAF=52;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.49916e-05;OID=.;OPOS=119367390;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:106:106:0:0:106:106:54:52:0:0:54:52:0:0 chr3 119395662 . C G 3132.76 PASS AO=325;DP=329;FAO=326;FDP=326;FR=.;FRO=0;FSAF=192;FSAR=134;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00485804;FXX=0.00911826;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2296;QD=38.4388;RBI=0.0788324;REFB=0;REVB=0.0786826;RO=0;SAF=192;SAR=133;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000125254;OID=.;OPOS=119395662;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:329:326:0:0:325:326:133:192:0:0:134:192:0:0 chr3 119426307 . T C 864.43 PASS AO=90;DP=90;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00169651;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.217;QD=37.9969;RBI=0.0130197;REFB=0;REVB=0.0129087;RO=0;SAF=42;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.92377e-05;OID=.;OPOS=119426307;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:90:91:0:0:90:91:48:42:0:0:49:42:0:0 chr3 119434527 . G C 2455.36 PASS AO=253;DP=253;FAO=256;FDP=256;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=163;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.027362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.097;QD=38.365;RBI=0.0307784;REFB=0;REVB=0.0140937;RO=0;SAF=93;SAR=160;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.81068e-05;OID=.;OPOS=119434527;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:253:256:0:0:253:256:160:93:0:0:163:93:0:0 chr3 119533910 . T C 741.59 PASS AO=80;DP=82;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=54;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0595104;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.8957;QD=36.6218;RBI=0.0960187;REFB=-0.00142875;REVB=0.0753532;RO=0;SAF=54;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509432;TYPE=snp;VARB=0.000766614;OID=.;OPOS=119533910;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:82:81:0:1:80:80:26:54:0:0:26:54:0:1 chr3 119886548 . G C 485.34 PASS AO=40;DP=50;FAO=51;FDP=52;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0538184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.574;QD=37.334;RBI=0.0662473;REFB=0;REVB=0.03863;RO=0;SAF=12;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00321284;OID=.;OPOS=119886548;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:51:52:0:0:40:51:28:12:0:0:30:21:0:0 chr3 119886776 . T A 1825.84 PASS AO=193;DP=198;FAO=194;FDP=194;FR=.;FRO=0;FSAF=148;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00546668;FXX=0.020201;HRUN=3;LEN=1;MLLD=180.582;QD=37.6462;RBI=0.00685662;REFB=-0.0135138;REVB=0.00413868;RO=2;SAF=148;SAR=45;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00725679;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.71165e-05;OID=.;OPOS=119886776;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:198:194:2:0:193:194:45:148:1:1:46:148:0:0 chr3 120389316 . T A 426.09 PASS AO=100;DP=204;FAO=101;FDP=204;FR=.;FRO=103;FSAF=52;FSAR=49;FSRF=50;FSRR=53;FWDB=-0.0221054;FXX=0.00487781;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.126;QD=8.35463;RBI=0.0221372;REFB=-0.0273713;REVB=-0.00118641;RO=101;SAF=52;SAR=48;SRF=48;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0408957;STB=0.514849;TYPE=snp;VARB=0.0257188;OID=.;OPOS=120389316;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:204:101:103:100:101:48:52:48:53:49:52:50:53 chr3 121137976 . C T 1476.85 PASS AO=156;DP=158;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00845662;FXX=0.0125778;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.642;QD=37.6268;RBI=0.00908372;REFB=0.028813;REVB=0.00331654;RO=2;SAF=85;SAR=71;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0132108;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.54572e-05;OID=.;OPOS=121137976;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:158:157:2:0:156:157:71:85:0:2:71:86:0:0 chr3 121138015 . C T 1691.98 PASS AO=180;DP=181;FAO=179;FDP=179;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.041736;FXX=0.0164826;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.581;QD=37.8095;RBI=0.0441901;REFB=0.00226362;REVB=0.0145215;RO=0;SAF=77;SAR=103;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.3304e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.43169e-05;OID=.;OPOS=121138015;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:181:179:0:0:180:179:103:77:0:0:104:75:0:0 chr3 121154974 . T C 2037.81 PASS AO=220;DP=229;FAO=221;FDP=221;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=157;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0053473;FXX=0.034933;HRUN=3;LEN=1;MLLD=138.865;QD=36.8834;RBI=0.00878601;REFB=-0.0785931;REVB=0.00697139;RO=4;SAF=63;SAR=157;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119827;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000223075;OID=.;OPOS=121154974;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:229:221:4:0:220:221:157:63:0:4:157:64:0:0 chr3 121238749 . G A 1692.32 PASS AO=179;DP=182;FAO=179;FDP=179;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00716379;FXX=0.0164826;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.984;QD=37.8173;RBI=0.0248055;REFB=-0.0719343;REVB=0.0237486;RO=1;SAF=78;SAR=101;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00606421;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000476593;OID=.;OPOS=121238749;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:182:179:1:0:179:179:101:78:1:0:101:78:0:0 chr3 121238863 . C T 1147.88 PASS AO=125;DP=130;FAO=126;FDP=130;FR=.;FRO=4;FSAF=47;FSAR=79;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0281025;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.7057;QD=35.3193;RBI=0.0413039;REFB=-0.112144;REVB=0.0302698;RO=1;SAF=46;SAR=79;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0102166;STB=0.520405;TYPE=snp;VARB=0.00431551;OID=.;OPOS=121238863;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:130:130:1:4:125:126:79:46:1:0:79:47:4:0 chr3 121258368 . G A 2593.86 PASS AO=260;DP=260;FAO=273;FDP=273;FR=.;FRO=0;FSAF=137;FSAR=136;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00471998;FXX=0.0108692;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.339;QD=38.0053;RBI=0.0318028;REFB=0;REVB=0.0314506;RO=0;SAF=131;SAR=129;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.02262e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000166047;OID=.;OPOS=121258368;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:260:273:0:0:260:273:129:131:0:0:136:137:0:0 chr3 121263720 . C A 2482.37 PASS AO=259;DP=262;FAO=259;FDP=259;FR=.;FRO=0;FSAF=136;FSAR=123;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217594;FXX=0.0189387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.7759;QD=38.3377;RBI=0.0303071;REFB=0;REVB=0.0210962;RO=0;SAF=136;SAR=123;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.07379e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.68245e-05;OID=.;OPOS=121263720;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:262:259:0:0:259:259:123:136:0:0:123:136:0:0 chr3 121340536 . T C 358.52 PASS AO=83;DP=165;FAO=83;FDP=165;FR=.;FRO=82;FSAF=31;FSAR=52;FSRF=26;FSRR=56;FWDB=-0.0413444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6587;QD=8.69139;RBI=0.0443271;REFB=-0.0304551;REVB=-0.0159856;RO=82;SAF=31;SAR=52;SRF=26;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0553903;STB=0.530411;TYPE=snp;VARB=0.0278059;OID=.;OPOS=121340536;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:165:82:82:83:83:52:31:26:56:52:31:26:56 chr3 121345694 . G A 520.67 PASS AO=116;DP=225;FAO=117;FDP=225;FR=.;FRO=108;FSAF=56;FSAR=61;FSRF=58;FSRR=50;FWDB=-0.0050232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.254;QD=9.25627;RBI=0.0086424;REFB=-0.00195731;REVB=-0.00703267;RO=106;SAF=55;SAR=61;SRF=58;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0636938;STB=0.528013;TYPE=snp;VARB=0.00144146;OID=.;OPOS=121345694;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:225:225:106:108:116:117:61:55:58:48:61:56:58:50 chr3 121350966 . C G 281.47 PASS AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0485582;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.59;QD=37.529;RBI=0.0553011;REFB=0;REVB=0.0264635;RO=0;SAF=14;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.56309e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000568117;OID=.;OPOS=121350966;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:31:30:0:0:30:30:16:14:0:0:16:14:0:0 chr3 121353254 . T C 109.55 PASS AO=18;DP=29;FAO=18;FDP=28;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=10;FWDB=-0.0198913;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.958;QD=15.6497;RBI=0.0215998;REFB=0.0109695;REVB=0.0084196;RO=10;SAF=1;SAR=17;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208541;STB=0.613534;TYPE=snp;VARB=-0.00647269;OID=.;OPOS=121353254;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:29:28:10:10:18:18:17:1:0:10:17:1:0:10 chr3 121354583 . G A 231.57 PASS AO=60;DP=134;FAO=60;FDP=133;FR=.;FRO=73;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=32;FSRR=41;FWDB=-0.000812228;FXX=0.0148137;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.054;QD=6.96443;RBI=0.00701687;REFB=-0.0225365;REVB=0.0069697;RO=72;SAF=28;SAR=32;SRF=32;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0219073;STB=0.506462;TYPE=snp;VARB=0.0283064;OID=.;OPOS=121354583;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:133:72:73:60:60:32:28:32:40:33:27:32:41 chr3 121372875 . A G 59.57 PASS AO=22;DP=70;FAO=22;FDP=70;FR=.;FRO=48;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=-0.0171651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.5792;QD=3.40401;RBI=0.0214151;REFB=-0.00109614;REVB=-0.012805;RO=48;SAF=8;SAR=14;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18504;STB=0.609398;TYPE=snp;VARB=0.00064704;OID=.;OPOS=121372875;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:70:70:48:48:22:22:14:8:25:23:14:8:25:23 chr3 121373058 . T C 108.71 PASS AO=29;DP=69;FAO=29;FDP=69;FR=.;FRO=40;FSAF=25;FSAR=4;FSRF=26;FSRR=14;FWDB=-0.0660691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.0599;QD=6.30224;RBI=0.0763326;REFB=-0.0224606;REVB=-0.03823;RO=38;SAF=25;SAR=4;SRF=24;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.33986;STB=0.68792;TYPE=snp;VARB=0.0401974;OID=.;OPOS=121373058;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:38:40:29:29:4:25:24:14:4:25:26:14 chr3 121373111 . T C 198.5 PASS AO=44;DP=85;FAO=44;FDP=86;FR=.;FRO=42;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=14;FSRR=28;FWDB=-0.0228925;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.199;QD=9.2327;RBI=0.0245476;REFB=-0.0430518;REVB=-0.00886122;RO=37;SAF=16;SAR=28;SRF=13;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0110425;STB=0.516122;TYPE=snp;VARB=0.0346838;OID=.;OPOS=121373111;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:86:37:42:44:44:28:16:13:24:28:16:14:28 chr3 121374361 . G A 154.15 PASS AO=37;DP=78;FAO=37;FDP=79;FR=.;FRO=42;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=34;FWDB=0.00962564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.8989;QD=7.80529;RBI=0.0097735;REFB=-0.0335626;REVB=-0.00169365;RO=41;SAF=22;SAR=15;SRF=7;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.384659;STB=0.705397;TYPE=snp;VARB=0.0292091;OID=.;OPOS=121374361;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:79:41:42:37:37:15:22:7:34:15:22:8:34 chr3 121413637 . G A 218.22 PASS AO=50;DP=101;FAO=50;FDP=101;FR=.;FRO=51;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=26;FSRR=25;FWDB=0.0183451;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.777;QD=8.64224;RBI=0.0196133;REFB=0.00745121;REVB=0.00693819;RO=51;SAF=25;SAR=25;SRF=26;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00893553;STB=0.504948;TYPE=snp;VARB=-0.0072828;OID=.;OPOS=121413637;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:51:51:50:50:25:25:26:25:25:25:26:25 chr3 121414061 . C T 198.47 PASS AO=61;DP=155;FAO=61;FDP=155;FR=.;FRO=94;FSAF=25;FSAR=36;FSRF=32;FSRR=62;FWDB=0.0149567;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.335;QD=5.12171;RBI=0.0235191;REFB=-0.00193276;REVB=-0.0181507;RO=94;SAF=25;SAR=36;SRF=32;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0785212;STB=0.544188;TYPE=snp;VARB=0.00357753;OID=.;OPOS=121414061;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:94:94:61:61:36:25:32:62:36:25:32:62 chr3 121415720 . T C 421.76 PASS AO=116;DP=263;FAO=116;FDP=263;FR=.;FRO=147;FSAF=70;FSAR=46;FSRF=64;FSRR=83;FWDB=-0.0121034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.827;QD=6.41456;RBI=0.0125992;REFB=-0.0116884;REVB=0.00349954;RO=146;SAF=70;SAR=46;SRF=64;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16652;STB=0.594297;TYPE=snp;VARB=0.0158272;OID=.;OPOS=121415720;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:263:263:146:147:116:116:46:70:64:82:46:70:64:83 chr3 121416623 . G C 294.49 PASS AO=62;DP=114;FAO=62;FDP=114;FR=.;FRO=52;FSAF=19;FSAR=43;FSRF=20;FSRR=32;FWDB=-0.020695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.279;QD=10.333;RBI=0.0308446;REFB=-0.014226;REVB=-0.0228715;RO=51;SAF=19;SAR=43;SRF=19;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0622187;STB=0.540605;TYPE=snp;VARB=0.0136629;OID=.;OPOS=121416623;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:51:52:62:62:43:19:19:32:43:19:20:32 chr3 121435621 . T C 35.95 PASS AO=11;DP=34;FAO=11;FDP=35;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=4;FWDB=-0.00445476;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.5508;QD=4.10845;RBI=0.0763853;REFB=-0.0153237;REVB=0.0762552;RO=23;SAF=3;SAR=8;SRF=20;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.599978;STB=0.792036;TYPE=snp;VARB=0.036412;OID=.;OPOS=121435621;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:34:35:23:24:11:11:8:3:20:3:7:4:20:4 chr3 121435624 . C T 44.87 PASS AO=12;DP=39;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=3;FWDB=-0.00399984;FXX=0.0749813;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.621;QD=4.85112;RBI=0.00861387;REFB=-0.00370797;REVB=0.00762889;RO=27;SAF=5;SAR=7;SRF=21;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.401489;STB=0.790532;TYPE=snp;VARB=0.00877782;OID=.;OPOS=121435624;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:39:37:27:24:12:13:7:5:21:6:8:5:21:3 chr3 121488995 . C G 124.91 PASS AO=35;DP=89;FAO=36;FDP=90;FR=.;FRO=54;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=32;FWDB=-0.00154477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.6384;QD=5.55162;RBI=0.0187238;REFB=-0.0220904;REVB=-0.01866;RO=53;SAF=19;SAR=16;SRF=22;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134686;STB=0.588187;TYPE=snp;VARB=0.0422858;OID=.;OPOS=121488995;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:90:53:54:35:36:16:19:22:31:16:20:22:32 chr3 121500699 . C T 336.63 PASS AO=82;DP=174;FAO=84;FDP=176;FR=.;FRO=92;FSAF=47;FSAR=37;FSRF=58;FSRR=34;FWDB=-0.0111137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.0221;QD=7.65066;RBI=0.0204935;REFB=-0.0107348;REVB=0.0172183;RO=92;SAF=46;SAR=36;SRF=58;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0681027;STB=0.537931;TYPE=snp;VARB=0.0271802;OID=.;OPOS=121500699;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:176:92:92:82:84:36:46:58:34:37:47:58:34 chr3 121526204 . G A 70.34 PASS AO=23;DP=68;FAO=24;FDP=69;FR=.;FRO=45;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=27;FWDB=-0.0346077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.3906;QD=4.07753;RBI=0.0433722;REFB=-0.0291052;REVB=-0.0261429;RO=45;SAF=11;SAR=12;SRF=18;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0893453;STB=0.538524;TYPE=snp;VARB=0.0868857;OID=.;OPOS=121526204;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:68:69:45:45:23:24:12:11:18:27:13:11:18:27 chr3 121712051 . A C 30.47 PASS AO=8;DP=23;FAO=8;FDP=23;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=13;FSRR=2;FWDB=-0.0696062;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.9051;QD=5.29915;RBI=0.0697133;REFB=0.025677;REVB=0.00386245;RO=15;SAF=7;SAR=1;SRF=13;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.019821;STB=0.512164;TYPE=snp;VARB=-0.049591;OID=.;OPOS=121712051;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:23:23:15:15:8:8:1:7:13:2:1:7:13:2 chr3 121825197 . G A 2865.9 PASS AO=298;DP=298;FAO=298;FDP=298;FR=.;FRO=0;FSAF=128;FSAR=170;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00604521;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.083;QD=38.4684;RBI=0.0135905;REFB=0;REVB=0.012172;RO=0;SAF=128;SAR=170;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.62354e-06;OID=.;OPOS=121825197;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:298:298:0:0:298:298:170:128:0:0:170:128:0:0 chr3 121836966 . TGA T 811.73 PASS AO=75;DP=102;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00153798;FXX=0.0439512;HRUN=1;LEN=2;MLLD=97.428;QD=37.3207;RBI=0.00166994;REFB=0;REVB=0.000650636;RO=1;SAF=26;SAR=49;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0178482;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-5.25997e-05;OID=.;OPOS=121836967;OREF=GA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:75:86:87:87:0:29:58:0:0:39:1:26:49:1:0 chr3 121838792 . TTG T 2146.07 PASS AO=193;DP=227;FAO=229;FDP=229;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=142;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0310733;FXX=0.0255308;HRUN=1;LEN=2;MLLD=190.713;QD=37.4859;RBI=0.0321487;REFB=0;REVB=-0.00824544;RO=0;SAF=69;SAR=124;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-3.28097e-06;OID=.;OPOS=121838793;OREF=TG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:193:216:229:229:0:87:142:0:0:99:0:69:124:0:0 chr3 121980536 . TG T 25.2 PASS AO=19;DP=58;FAO=21;FDP=54;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=25;FSRR=8;FWDB=-0.0568407;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=10.5568;QD=1.86641;RBI=0.287032;REFB=-0.057191;REVB=0.281348;RO=27;SAF=15;SAR=4;SRF=22;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0400266;STB=0.503628;TYPE=del;VARB=0.103056;OID=.;OPOS=121980537;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:19:53:21:54:33:16:5:25:8:25:27:15:4:22:5 chr3 122003045 . G C 1784.17 PASS AO=153;DP=196;FAO=187;FDP=187;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=71;FSAR=116;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301086;FXX=0.0105815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.296;QD=38.164;RBI=0.052504;REFB=0;REVB=0.0430133;RO=0;SAF=66;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.67317e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00251477;OID=.;OPOS=122003045;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:187:187:0:0:153:187:87:66:0:0:116:71:0:0 chr3 122003757 . G T 75.01 PASS AO=22;DP=58;FAO=22;FDP=58;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=25;FWDB=-0.00422573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.346;QD=5.17324;RBI=0.0513671;REFB=-0.0277675;REVB=0.051193;RO=36;SAF=9;SAR=13;SRF=11;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118481;STB=0.568047;TYPE=snp;VARB=0.0450614;OID=.;OPOS=122003757;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:58:58:36:36:22:22:13:9:11:25:13:9:11:25 chr3 122003832 . G C 948.58 PASS AO=98;DP=99;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00757126;FXX=0.0196059;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.661;QD=37.9432;RBI=0.022419;REFB=0;REVB=0.0211018;RO=0;SAF=41;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.49318e-05;OID=.;OPOS=122003832;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:99:100:0:0:98:100:57:41:0:0:59:41:0:0 chr3 122056432 . C T 486.25 PASS AO=87;DP=137;FAO=87;FDP=137;FR=.;FRO=50;FSAF=43;FSAR=44;FSRF=28;FSRR=22;FWDB=-0.00299391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.945;QD=14.1969;RBI=0.0367445;REFB=-0.0223182;REVB=-0.0366223;RO=50;SAF=43;SAR=44;SRF=28;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0443838;STB=0.52398;TYPE=snp;VARB=0.0140766;OID=.;OPOS=122056432;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:50:50:87:87:44:43:28:22:44:43:28:22 chr3 122060404 . C T 34.44 PASS AO=9;DP=29;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.00392681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.497;QD=4.44332;RBI=0.0334109;REFB=-0.00550731;REVB=-0.0331793;RO=19;SAF=5;SAR=4;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0864553;STB=0.53565;TYPE=snp;VARB=0.0131937;OID=.;OPOS=122060404;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:29:31:19:20:9:11:4:5:12:7:5:6:12:8 chr3 122133830 . T G 365.63 PASS AO=73;DP=128;FAO=73;FDP=128;FR=.;FRO=55;FSAF=30;FSAR=43;FSRF=32;FSRR=23;FWDB=-0.0300795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.24;QD=11.4258;RBI=0.0444228;REFB=-0.019392;REVB=-0.0326895;RO=55;SAF=30;SAR=43;SRF=32;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135303;STB=0.573807;TYPE=snp;VARB=0.0206916;OID=.;OPOS=122133830;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:55:55:73:73:43:30:32:23:43:30:32:23 chr3 122140919 . T C 245.02 PASS AO=54;DP=104;FAO=54;FDP=104;FR=.;FRO=50;FSAF=23;FSAR=31;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=0.0215814;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=228.96;QD=9.42384;RBI=0.0259177;REFB=-0.0206748;REVB=-0.0143516;RO=50;SAF=23;SAR=31;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0827066;STB=0.545601;TYPE=snp;VARB=0.0199789;OID=.;OPOS=122140919;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:50:50:54:54:31:23:26:24:31:23:26:24 chr3 122145470 . C A 340.29 PASS AO=90;DP=201;FAO=90;FDP=201;FR=.;FRO=111;FSAF=48;FSAR=42;FSRF=74;FSRR=37;FWDB=-0.00255047;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=252.628;QD=6.77184;RBI=0.0053422;REFB=0.00351551;REVB=0.00469406;RO=111;SAF=48;SAR=42;SRF=74;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134944;STB=0.574681;TYPE=snp;VARB=-0.00316203;OID=.;OPOS=122145470;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:201:111:111:90:90:42:48:74:37:42:48:74:37 chr3 122186188 . C T 872.46 PASS AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0319005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.861;QD=37.933;RBI=0.0449226;REFB=0;REVB=0.0316291;RO=0;SAF=53;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000176495;OID=.;OPOS=122186188;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:92:92:0:0:92:92:39:53:0:0:39:53:0:0 chr3 122259606 . T C 1794.52 PASS AO=197;DP=203;FAO=198;FDP=201;FR=.;FRO=3;FSAF=122;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0407816;FXX=0.00985173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.22;QD=35.7118;RBI=0.0728283;REFB=-0.16563;REVB=0.0603393;RO=0;SAF=123;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.64964e-08;STB=0.509676;TYPE=snp;VARB=0.000958416;OID=.;OPOS=122259606;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:203:201:0:3:197:198:74:123:0:0:76:122:0:3 chr3 122259640 . T C 355.77 PASS AO=85;DP=177;FAO=86;FDP=178;FR=.;FRO=92;FSAF=47;FSAR=39;FSRF=51;FSRR=41;FWDB=-0.00959138;FXX=0.00558628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.944;QD=7.99481;RBI=0.0163466;REFB=-0.0406187;REVB=0.013237;RO=83;SAF=46;SAR=39;SRF=43;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0208637;STB=0.504088;TYPE=snp;VARB=0.0375989;OID=.;OPOS=122259640;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:178:83:92:85:86:39:46:43:40:39:47:51:41 chr3 122274757 . G C 232.86 PASS AO=53;DP=109;FAO=54;FDP=110;FR=.;FRO=56;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=27;FSRR=29;FWDB=0.00666998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.509;QD=8.46762;RBI=0.00954651;REFB=-0.0225867;REVB=0.00682987;RO=56;SAF=27;SAR=26;SRF=27;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0252864;STB=0.509088;TYPE=snp;VARB=0.0196779;OID=.;OPOS=122274757;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:110:56:56:53:54:26:27:27:29:27:27:27:29 chr3 122277268 . G A 299.55 PASS AO=70;DP=142;FAO=70;FDP=142;FR=.;FRO=72;FSAF=28;FSAR=42;FSRF=33;FSRR=39;FWDB=-0.023278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.193;QD=8.43794;RBI=0.0236956;REFB=0.00732096;REVB=-0.00442892;RO=70;SAF=28;SAR=42;SRF=32;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0533099;STB=0.530426;TYPE=snp;VARB=-0.00864163;OID=.;OPOS=122277268;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:70:72:70:70:42:28:32:38:42:28:33:39 chr3 122288210 . G A 1623.44 PASS AO=171;DP=173;FAO=177;FDP=180;FR=.;FRO=3;FSAF=96;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0373047;FXX=0.00552456;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.467;QD=36.0764;RBI=0.119638;REFB=0.105244;REVB=-0.113673;RO=2;SAF=96;SAR=75;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125213;STB=0.50909;TYPE=snp;VARB=-0.00117833;OID=.;OPOS=122288210;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:173:180:2:3:171:177:75:96:0:2:81:96:0:3 chr3 122290579 . C T 2245.51 PASS AO=235;DP=246;FAO=236;FDP=236;FR=.;FRO=0;FSAF=116;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0176212;FXX=0.0406488;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.637;QD=38.0594;RBI=0.0230715;REFB=-0.0153129;REVB=0.0148925;RO=0;SAF=115;SAR=120;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.27611e-06;OID=.;OPOS=122290579;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:246:236:0:0:235:236:120:115:0:0:120:116:0:0 chr3 122418750 . G A 151.19 PASS AO=42;DP=101;FAO=42;FDP=101;FR=.;FRO=59;FSAF=35;FSAR=7;FSRF=40;FSRR=19;FWDB=0.047593;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.4689;QD=5.98755;RBI=0.0476013;REFB=0.0133528;REVB=0.000891847;RO=59;SAF=35;SAR=7;SRF=40;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234239;STB=0.634074;TYPE=snp;VARB=-0.0139126;OID=.;OPOS=122418750;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:59:59:42:42:7:35:40:19:7:35:40:19 chr3 122437321 . T C 1511.84 PASS AO=157;DP=159;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0437136;FXX=0.00624961;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.5118;QD=38.0336;RBI=0.0627199;REFB=0;REVB=0.0449767;RO=1;SAF=89;SAR=68;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00694506;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000443355;OID=.;OPOS=122437321;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:159:159:1:0:157:159:68:89:0:1:70:89:0:0 chr3 122474121 . G C 295.64 PASS AO=63;DP=119;FAO=64;FDP=121;FR=.;FRO=57;FSAF=44;FSAR=20;FSRF=27;FSRR=30;FWDB=-0.0305099;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.1785;QD=9.77309;RBI=0.0313287;REFB=-0.0126703;REVB=-0.00711566;RO=54;SAF=44;SAR=19;SRF=27;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181679;STB=0.6077;TYPE=snp;VARB=0.0103509;OID=.;OPOS=122474121;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:121:54:57:63:64:19:44:27:27:20:44:27:30 chr3 122630323 . T G 641.93 PASS AO=68;DP=68;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00584429;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.79;QD=38.3239;RBI=0.00594424;REFB=0;REVB=-0.00108547;RO=0;SAF=32;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.49594e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.22863e-05;OID=.;OPOS=122630323;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:68:67:0:0:68:67:36:32:0:0:35:32:0:0 chr3 122630346 . T C 577.91 PASS AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0537771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.821;QD=38.5272;RBI=0.0727986;REFB=0;REVB=-0.049068;RO=0;SAF=25;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.89445e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.45427e-05;OID=.;OPOS=122630346;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:60:60:0:0:60:60:35:25:0:0:35:25:0:0 chr3 122642590 . G A 59.82 PASS AO=16;DP=41;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=19;FSRR=6;FWDB=-0.0108446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.125;QD=5.8357;RBI=0.031788;REFB=-0.0164793;REVB=-0.0298809;RO=25;SAF=10;SAR=6;SRF=19;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159259;STB=0.591731;TYPE=snp;VARB=0.0176312;OID=.;OPOS=122642590;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:41:41:25:25:16:16:6:10:19:6:6:10:19:6 chr3 122646734 . C T 319.98 PASS AO=123;DP=362;FAO=123;FDP=359;FR=.;FRO=236;FSAF=47;FSAR=76;FSRF=120;FSRR=116;FWDB=0.0372909;FXX=0.00828706;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.289;QD=3.56528;RBI=0.0402648;REFB=-0.0250013;REVB=0.0151868;RO=235;SAF=47;SAR=76;SRF=119;SRR=116;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14552;STB=0.58444;TYPE=snp;VARB=0.0537478;OID=.;OPOS=122646734;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:362:359:235:236:123:123:76:47:119:116:76:47:120:116 chr3 122646828 . A G 187.64 PASS AO=70;DP=204;FAO=70;FDP=204;FR=.;FRO=134;FSAF=29;FSAR=41;FSRF=88;FSRR=46;FWDB=-0.020027;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.6131;QD=3.67913;RBI=0.038787;REFB=0.00659675;REVB=-0.0332167;RO=130;SAF=29;SAR=41;SRF=84;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.259525;STB=0.655285;TYPE=snp;VARB=-0.00972798;OID=.;OPOS=122646828;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:204:130:134:70:70:41:29:84:46:41:29:88:46 chr3 122843110 . G T 2895.29 PASS AO=286;DP=294;FAO=310;FDP=310;FR=.;FRO=0;FSAF=128;FSAR=182;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0844941;FXX=0.00641005;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.074;QD=37.3585;RBI=0.0962307;REFB=-0.0659429;REVB=0.0460553;RO=1;SAF=112;SAR=174;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00423875;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000396982;OID=.;OPOS=122843110;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:294:310:1:0:286:310:174:112:1:0:182:128:0:0 chr3 122864436 . G A 178.77 PASS AO=45;DP=99;FAO=45;FDP=99;FR=.;FRO=54;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=16;FSRR=38;FWDB=-0.0200423;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.44;QD=7.22316;RBI=0.0202279;REFB=-0.00443734;REVB=0.00273378;RO=54;SAF=20;SAR=25;SRF=16;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14979;STB=0.583298;TYPE=snp;VARB=0.00956625;OID=.;OPOS=122864436;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:54:54:45:45:25:20:16:38:25:20:16:38 chr3 122880191 . T C 310.21 PASS AO=74;DP=152;FAO=74;FDP=152;FR=.;FRO=78;FSAF=53;FSAR=21;FSRF=27;FSRR=51;FWDB=-0.087881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.509;QD=8.16337;RBI=0.0932477;REFB=-0.00575956;REVB=-0.0311779;RO=78;SAF=53;SAR=21;SRF=27;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.351227;STB=0.69427;TYPE=snp;VARB=0.00963767;OID=.;OPOS=122880191;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:152:78:78:74:74:21:53:27:51:21:53:27:51 chr3 122991021 . A T 2263.54 PASS AO=228;DP=228;FAO=236;FDP=236;FR=.;FRO=0;FSAF=116;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0234583;FXX=0.00421923;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.32;QD=38.3652;RBI=0.0234715;REFB=0;REVB=0.000786787;RO=0;SAF=109;SAR=119;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.83885e-06;OID=.;OPOS=122991021;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:228:236:0:0:228:236:119:109:0:0:120:116:0:0 chr3 122991038 . C T 2362.02 PASS AO=244;DP=245;FAO=246;FDP=246;FR=.;FRO=0;FSAF=114;FSAR=132;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.01539;FXX=0.00404842;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.449;QD=38.4069;RBI=0.0415994;REFB=0;REVB=0.0386479;RO=0;SAF=113;SAR=131;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.73051e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.65861e-05;OID=.;OPOS=122991038;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:245:246:0:0:244:246:131:113:0:0:132:114:0:0 chr3 123411589 . G A 693.41 PASS AO=79;DP=86;FAO=81;FDP=85;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=79;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.1172;FXX=0.0229859;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.509;QD=32.6312;RBI=0.119824;REFB=-0.122167;REVB=0.024938;RO=5;SAF=1;SAR=78;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.606808;STB=0.71164;TYPE=snp;VARB=0.00375136;OID=.;OPOS=123411589;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:86:85:5:4:79:81:78:1:4:1:79:2:3:1 chr3 123418913 . G A 856.63 PASS AO=92;DP=93;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00496513;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.42;QD=37.2448;RBI=0.0184827;REFB=-0.0702631;REVB=0.0178033;RO=1;SAF=53;SAR=39;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119999;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.91295e-05;OID=.;OPOS=123418913;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:93:92:1:0:92:92:39:53:0:1:39:53:0:0 chr3 123419198 . GC G,TG 384.64 PASS AO=25,19;DP=61;FAO=37,19;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=7,0;FSAR=30,19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.702128,0.387422;FXX=0;HRUN=3,1;LEN=1,2;MLLD=16.8472,21.7394;QD=27.4741;RBI=0.719133,0.39253;REFB=-0.0721059,-0.0866139;REVB=0.155465,0.0631191;RO=11;SAF=0,0;SAR=25,19;SRF=7;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.864933,-0.852559;STB=0.5,0.5;TYPE=del,mnp;VARB=0.0999148,-0.0456369;OID=.,.;OPOS=123419199,123419198;OREF=C,GC;OALT=-,TG;OMAPALT=G,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:60:56:56:11:0:25,19:37,19:25,19:0,0:7:4:30,19:7,0:0:0 chr3 123451773 . G C 1120.96 PASS AO=116;DP=116;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.576;QD=38.3235;RBI=0.0392295;REFB=0;REVB=0.0325963;RO=0;SAF=57;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.17365e-05;OID=.;OPOS=123451773;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:116:117:0:0:116:117:59:57:0:0:60:57:0:0 chr3 123452838 . G A 689.42 PASS AO=77;DP=82;FAO=79;FDP=83;FR=.;FRO=4;FSAF=49;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0236902;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=246.4;QD=33.2249;RBI=0.0256872;REFB=-0.150399;REVB=0.00992993;RO=0;SAF=48;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.531242;TYPE=snp;VARB=0.00075613;OID=.;OPOS=123452838;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:82:83:0:4:77:79:29:48:0:0:30:49:0:4 chr3 123457893 . G A 461.41 PASS AO=52;DP=54;FAO=52;FDP=54;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0936418;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.7789;QD=34.1782;RBI=0.093993;REFB=-0.0681617;REVB=0.00811711;RO=2;SAF=5;SAR=47;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.019626;STB=0.510413;TYPE=snp;VARB=0.00810097;OID=.;OPOS=123457893;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:54:54:2:2:52:52:47:5:0:2:47:5:0:2 chr3 123634046 . G A 1892.6 PASS AO=199;DP=203;FAO=200;FDP=200;FR=.;FRO=0;FSAF=107;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00152868;FXX=0.0147776;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.7121;QD=37.8521;RBI=0.0408421;REFB=0;REVB=0.0408135;RO=1;SAF=106;SAR=93;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00447223;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000753744;OID=.;OPOS=123634046;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:203:200:1:0:199:200:93:106:1:0:93:107:0:0 chr3 123665902 . T G 706.32 PASS AO=173;DP=367;FAO=176;FDP=368;FR=.;FRO=192;FSAF=111;FSAR=65;FSRF=118;FSRR=74;FWDB=0.00788991;FXX=0.00270995;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.4624;QD=7.6774;RBI=0.0345982;REFB=-0.00337282;REVB=0.0336865;RO=194;SAF=109;SAR=64;SRF=120;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0117997;STB=0.508972;TYPE=snp;VARB=0.00477252;OID=.;OPOS=123665902;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:367:368:194:192:173:176:64:109:120:74:65:111:118:74 chr3 123988039 . T C 221.81 PASS AO=63;DP=150;FAO=63;FDP=151;FR=.;FRO=88;FSAF=37;FSAR=26;FSRF=49;FSRR=39;FWDB=-0.0117535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.008;QD=5.87567;RBI=0.0189451;REFB=-0.0251429;REVB=0.0148584;RO=87;SAF=37;SAR=26;SRF=48;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0376636;STB=0.518201;TYPE=snp;VARB=0.0338158;OID=.;OPOS=123988039;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:151:87:88:63:63:26:37:48:39:26:37:49:39 chr3 124044949 . C T 1793.61 PASS AO=174;DP=177;FAO=188;FDP=188;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0389711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.755;QD=38.162;RBI=0.0505385;REFB=0;REVB=0.0321775;RO=0;SAF=67;SAR=107;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.89444e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000134136;OID=.;OPOS=124044949;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:177:188:0:0:174:188:107:67:0:0:110:78:0:0 chr3 124181454 . C T 188.84 PASS AO=41;DP=80;FAO=41;FDP=80;FR=.;FRO=39;FSAF=3;FSAR=38;FSRF=8;FSRR=31;FWDB=0.0262479;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1304;QD=9.44216;RBI=0.0369613;REFB=-0.0197206;REVB=-0.0260228;RO=39;SAF=3;SAR=38;SRF=8;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.297462;STB=0.668697;TYPE=snp;VARB=0.0169378;OID=.;OPOS=124181454;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:39:39:41:41:38:3:8:31:38:3:8:31 chr3 124351316 . G A 177.92 PASS AO=42;DP=86;FAO=42;FDP=88;FR=.;FRO=46;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=28;FSRR=18;FWDB=-0.000932393;FXX=0.0112347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.14;QD=8.08728;RBI=0.0240484;REFB=-0.00858023;REVB=0.0240303;RO=43;SAF=24;SAR=18;SRF=26;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0310493;STB=0.519991;TYPE=snp;VARB=0.0116551;OID=.;OPOS=124351316;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:88:43:46:42:42:18:24:26:17:18:24:28:18 chr3 124351424 . T C 314.4 PASS AO=70;DP=135;FAO=70;FDP=135;FR=.;FRO=65;FSAF=26;FSAR=44;FSRF=28;FSRR=37;FWDB=-0.0132874;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.238;QD=9.31546;RBI=0.0348135;REFB=-0.0253374;REVB=-0.032178;RO=64;SAF=26;SAR=44;SRF=28;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0603921;STB=0.530112;TYPE=snp;VARB=0.0240407;OID=.;OPOS=124351424;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:64:65:70:70:44:26:28:36:44:26:28:37 chr3 124376653 . G A 336.52 PASS AO=74;DP=147;FAO=76;FDP=149;FR=.;FRO=73;FSAF=36;FSAR=40;FSRF=35;FSRR=38;FWDB=0.013321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.36;QD=9.03416;RBI=0.0196003;REFB=0.00156045;REVB=-0.0143778;RO=73;SAF=36;SAR=38;SRF=35;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00634974;STB=0.502832;TYPE=snp;VARB=-0.0021655;OID=.;OPOS=124376653;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:149:73:73:74:76:38:36:35:38:40:36:35:38 chr3 124379748 . G C 537.77 PASS AO=124;DP=260;FAO=129;FDP=264;FR=.;FRO=135;FSAF=73;FSAR=56;FSRF=77;FSRR=58;FWDB=0.00802244;FXX=0.00751851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.579;QD=8.14798;RBI=0.0163966;REFB=-0.010108;REVB=-0.0143;RO=132;SAF=69;SAR=55;SRF=76;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0183717;STB=0.502332;TYPE=snp;VARB=0.0118236;OID=.;OPOS=124379748;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:260:264:132:135:124:129:55:69:76:56:56:73:77:58 chr3 124379817 . T C 735.2 PASS AO=177;DP=362;FAO=177;FDP=360;FR=.;FRO=183;FSAF=84;FSAR=93;FSRF=78;FSRR=105;FWDB=-0.0214861;FXX=0.00552471;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.5977;QD=8.16891;RBI=0.0247478;REFB=-0.00674066;REVB=0.0122802;RO=182;SAF=84;SAR=93;SRF=77;SRR=105;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0478801;STB=0.524699;TYPE=snp;VARB=0.00726823;OID=.;OPOS=124379817;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:362:360:182:183:177:177:93:84:77:105:93:84:78:105 chr3 124390639 . AG A,AA 145.79 PASS AO=15,4;DP=25;FAO=18,4;FDP=24;FR=.;FRO=2;FSAF=4,0;FSAR=14,4;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.131981,0.118535;FXX=0.039984;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=16.5359,11.5452;QD=24.2981;RBI=0.133518,0.121791;REFB=-0.0611539,-0.0336434;REVB=0.0202045,0.0279765;RO=4;SAF=2,0;SAR=13,4;SRF=2;SRR=2;SSEN=0.503311,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.238562,-0.719948;STB=0.538417,0.995773;TYPE=del,snp;VARB=0.00590199,0.0347959;OID=.,.;OPOS=124390640,124390640;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:15,4:25:18,4:24:2:4,0:14,4:1:1:6:4:2,0:13,4:2:2 chr3 124412634 . G T 201.81 PASS AO=49;DP=108;FAO=50;FDP=108;FR=.;FRO=58;FSAF=31;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=33;FWDB=-0.00258401;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.409;QD=7.47427;RBI=0.0114207;REFB=-0.00221661;REVB=-0.0111245;RO=59;SAF=30;SAR=19;SRF=26;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169136;STB=0.60235;TYPE=snp;VARB=0.00451631;OID=.;OPOS=124412634;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:59:58:49:50:19:30:26:33:19:31:25:33 chr3 124451284 . T C 161.83 PASS AO=42;DP=97;FAO=43;FDP=98;FR=.;FRO=55;FSAF=40;FSAR=3;FSRF=42;FSRR=13;FWDB=0.00222824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.704;QD=6.60512;RBI=0.0101282;REFB=0.000199322;REVB=0.00988008;RO=55;SAF=39;SAR=3;SRF=42;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.378541;STB=0.722213;TYPE=snp;VARB=-0.000142336;OID=.;OPOS=124451284;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:98:55:55:42:43:3:39:42:13:3:40:42:13 chr3 124482494 . TTTGTTGAAC T 27.45 PASS AO=29;DP=116;FAO=29;FDP=111;FR=.;FRO=82;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=28;FSRR=54;FWDB=-0.00455858;FXX=0.0430997;HRUN=3;LEN=9;MLLD=257.171;QD=0.989307;RBI=0.00766683;REFB=-0.00779957;REVB=0.00616438;RO=77;SAF=9;SAR=20;SRF=29;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0898864;STB=0.526297;TYPE=del;VARB=0.0231313;OID=.;OPOS=124482495;OREF=TTGTTGAAC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:29:113:29:111:82:9:20:28:54:27:77:9:20:29:48 chr3 124627024 . T G 461.24 PASS AO=105;DP=231;FAO=116;FDP=242;FR=.;FRO=126;FSAF=63;FSAR=53;FSRF=76;FSRR=50;FWDB=-0.0130294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.689;QD=7.62375;RBI=0.0137863;REFB=-0.00816445;REVB=0.00450511;RO=126;SAF=63;SAR=42;SRF=76;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.003259;STB=0.531678;TYPE=snp;VARB=0.0106314;OID=.;OPOS=124627024;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:231:242:126:126:105:116:42:63:76:50:53:63:76:50 chr3 124646515 . T A 480.74 PASS AO=140;DP=341;FAO=144;FDP=350;FR=.;FRO=206;FSAF=64;FSAR=80;FSRF=109;FSRR=97;FWDB=-0.00406478;FXX=0.00284892;HRUN=3;LEN=1;MLLD=204.494;QD=5.49417;RBI=0.00738818;REFB=-0.00463881;REVB=-0.0061695;RO=198;SAF=64;SAR=76;SRF=108;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0926202;STB=0.549898;TYPE=snp;VARB=0.00624007;OID=.;OPOS=124646515;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:341:350:198:206:140:144:76:64:108:90:80:64:109:97 chr3 124646705 . A AG,AAAG,G 526.64 PASS AO=11,13,17;DP=66;FAO=0,56,0;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=0,14,0;FSAR=0,42,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0177234,-0.0133857,-0.0265796;FXX=0.0508388;HRUN=2,3,3;LEN=1,3,1;MLLD=140.066,175.879,15.6728;QD=37.6169;RBI=0.11476,0.142147,0.0308506;REFB=-0.144244,-0.137043,-0.0972906;REVB=0.113383,0.141515,0.0156615;RO=17;SAF=0,10,2;SAR=11,3,15;SRF=7;SRR=10;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.781622,0.371638,-0.393813;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=ins,ins,snp;VARB=0,0.00183699,0;OID=.,.,.;OPOS=124646706,124646706,124646705;OREF=-,-,A;OALT=G,AAG,G;OMAPALT=AG,AAAG,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 2/2:21:66:56:17:0:11,13,17:0,56,0:11,3,15:0,10,2:7:10:0,42,0:0,14,0:0:0 chr3 124688787 . A AT 151.12 PASS AO=6;DP=30;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0646591;FXX=0.0999667;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.312;QD=22.3887;RBI=0.065099;REFB=0;REVB=-0.0075558;RO=24;SAF=5;SAR=1;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.346627;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.0126376;OID=.;OPOS=124688788;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:6:30:27:27:0:18:9:0:0:14:24:5:1:14:10 chr3 124688791 . A T 86.77 PASS AO=16;DP=27;FAO=17;FDP=30;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=-0.0392803;FXX=0;HRUN=10;LEN=1;MLLD=21.2862;QD=11.5695;RBI=0.0940132;REFB=-0.0527917;REVB=0.0854139;RO=11;SAF=10;SAR=6;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0810739;STB=0.60546;TYPE=snp;VARB=0.0440582;OID=.;OPOS=124688791;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:27:30:11:13:16:17:6:10:8:3:8:9:10:3 chr3 124692689 . C T 2623.97 PASS AO=251;DP=258;FAO=287;FDP=287;FR=.;FRO=0;FSAF=138;FSAR=149;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0366499;FXX=0.0590145;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.0497;QD=36.571;RBI=0.0366783;REFB=0;REVB=0.00144298;RO=0;SAF=113;SAR=138;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00359861;OID=.;OPOS=124692689;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:258:287:0:0:251:287:138:113:0:0:149:138:0:0 chr3 124728626 . A G 488.72 PASS AO=116;DP=234;FAO=116;FDP=234;FR=.;FRO=118;FSAF=67;FSAR=49;FSRF=59;FSRR=59;FWDB=-0.00533022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.6853;QD=8.35417;RBI=0.0382024;REFB=-0.00478498;REVB=0.0378287;RO=116;SAF=67;SAR=49;SRF=58;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.071485;STB=0.53959;TYPE=snp;VARB=0.00388203;OID=.;OPOS=124728626;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:234:234:116:118:116:116:49:67:58:58:49:67:59:59 chr3 124731485 . C G 315.1 PASS AO=73;DP=146;FAO=73;FDP=144;FR=.;FRO=71;FSAF=34;FSAR=39;FSRF=35;FSRR=36;FWDB=-0.00478961;FXX=0.0136977;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.873;QD=8.75278;RBI=0.00515455;REFB=-0.019818;REVB=0.00190502;RO=71;SAF=34;SAR=39;SRF=35;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0244362;STB=0.513448;TYPE=snp;VARB=0.020176;OID=.;OPOS=124731485;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:144:71:71:73:73:39:34:35:36:39:34:35:36 chr3 124732618 . A G 95.98 PASS AO=33;DP=95;FAO=33;FDP=95;FR=.;FRO=62;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=37;FWDB=-0.00465631;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=161.959;QD=4.04135;RBI=0.00962061;REFB=-0.00242443;REVB=0.00841872;RO=62;SAF=20;SAR=13;SRF=25;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.227029;STB=0.630837;TYPE=snp;VARB=0.00262979;OID=.;OPOS=124732618;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:95:95:62:62:33:33:13:20:25:37:13:20:25:37 chr3 124733649 . T G 507.34 PASS AO=92;DP=169;FAO=102;FDP=178;FR=.;FRO=76;FSAF=56;FSAR=46;FSRF=39;FSRR=37;FWDB=0.0144749;FXX=0.00558628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.998;QD=11.4009;RBI=0.0160887;REFB=-0.0221497;REVB=0.00702305;RO=77;SAF=46;SAR=46;SRF=40;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0162506;STB=0.515411;TYPE=snp;VARB=0.0145873;OID=.;OPOS=124733649;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:178:77:76:92:102:46:46:40:37:46:56:39:37 chr3 124738107 . C T 210.23 PASS AO=65;DP=165;FAO=65;FDP=165;FR=.;FRO=100;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=70;FSRR=30;FWDB=0.0257412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8881;QD=5.09651;RBI=0.0371441;REFB=0.0189418;REVB=0.0267783;RO=100;SAF=33;SAR=32;SRF=70;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208827;STB=0.616964;TYPE=snp;VARB=-0.0241555;OID=.;OPOS=124738107;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:165:100:100:65:65:32:33:70:30:32:33:70:30 chr3 124739892 . G A 688.78 PASS AO=152;DP=294;FAO=155;FDP=298;FR=.;FRO=143;FSAF=62;FSAR=93;FSRF=83;FSRR=60;FWDB=-0.016609;FXX=0.00666644;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.5089;QD=9.24532;RBI=0.017696;REFB=-0.028048;REVB=0.00610649;RO=142;SAF=59;SAR=93;SRF=83;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174714;STB=0.587033;TYPE=snp;VARB=0.0247836;OID=.;OPOS=124739892;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:294:298:142:143:152:155:93:59:83:59:93:62:83:60 chr3 124746049 . A G 415.66 PASS AO=94;DP=185;FAO=95;FDP=185;FR=.;FRO=90;FSAF=57;FSAR=38;FSRF=53;FSRR=37;FWDB=0.00775109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.514;QD=8.98734;RBI=0.030897;REFB=-0.0161419;REVB=0.029909;RO=90;SAF=56;SAR=38;SRF=53;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00633332;STB=0.505617;TYPE=snp;VARB=0.0125134;OID=.;OPOS=124746049;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:185:90:90:94:95:38:56:53:37:38:57:53:37 chr3 124746182 . C A 925.97 PASS AO=121;DP=207;FAO=161;FDP=245;FR=.;FRO=84;FSAF=81;FSAR=80;FSRF=42;FSRR=42;FWDB=0.0084564;FXX=0.00809684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.148;QD=15.1178;RBI=0.0208723;REFB=-0.014873;REVB=0.0190825;RO=83;SAF=47;SAR=74;SRF=44;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108939;STB=0.501065;TYPE=snp;VARB=0.00843227;OID=.;OPOS=124746182;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:245:83:84:121:161:74:47:44:39:80:81:42:42 chr3 124746183 . G A 14.33 PASS AO=36;DP=237;FAO=36;FDP=244;FR=.;FRO=208;FSAF=34;FSAR=2;FSRF=89;FSRR=119;FWDB=-0.0221742;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.9401;QD=0.234939;RBI=0.0397642;REFB=-0.0218213;REVB=-0.0330075;RO=200;SAF=34;SAR=2;SRF=89;SRR=111;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.660041;STB=0.94333;TYPE=snp;VARB=0.198311;OID=.;OPOS=124746183;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:237:244:200:208:36:36:2:34:89:111:2:34:89:119 chr3 124746347 . T C 322.17 PASS AO=56;DP=81;FAO=54;FDP=79;FR=.;FRO=25;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.00651757;FXX=0.0246883;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.736;QD=16.3122;RBI=0.0106135;REFB=-0.0101044;REVB=-0.00837658;RO=25;SAF=26;SAR=30;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100179;STB=0.561775;TYPE=snp;VARB=0.00360855;OID=.;OPOS=124746347;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:81:79:25:25:56:54:30:26:16:9:30:24:16:9 chr3 124748226 . G A 720.37 PASS AO=136;DP=227;FAO=136;FDP=225;FR=.;FRO=89;FSAF=45;FSAR=91;FSRF=46;FSRR=43;FWDB=-0.00144486;FXX=0.0217382;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.441;QD=12.8066;RBI=0.00334258;REFB=-0.00661513;REVB=-0.00301417;RO=80;SAF=45;SAR=91;SRF=41;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133719;STB=0.578634;TYPE=snp;VARB=0.00688001;OID=.;OPOS=124748226;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:227:225:80:89:136:136:91:45:41:39:91:45:46:43 chr3 124802881 . A G 214.97 PASS AO=44;DP=95;FAO=50;FDP=101;FR=.;FRO=51;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=35;FSRR=16;FWDB=-0.0123277;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.327;QD=8.51349;RBI=0.0213579;REFB=-0.016469;REVB=0.017441;RO=47;SAF=20;SAR=24;SRF=34;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246758;STB=0.641968;TYPE=snp;VARB=0.021653;OID=.;OPOS=124802881;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:101:47:51:44:50:24:20:34:13:30:20:35:16 chr3 124802888 . C T 239.85 PASS AO=52;DP=100;FAO=52;FDP=100;FR=.;FRO=48;FSAF=20;FSAR=32;FSRF=34;FSRR=14;FWDB=-0.000135207;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.083;QD=9.59384;RBI=0.00321678;REFB=0.00723571;REVB=-0.00321394;RO=48;SAF=20;SAR=32;SRF=34;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.277268;STB=0.652511;TYPE=snp;VARB=-0.00269076;OID=.;OPOS=124802888;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:48:48:52:52:32:20:34:14:32:20:34:14 chr3 124826622 . T C 366.61 PASS AO=94;DP=210;FAO=97;FDP=214;FR=.;FRO=117;FSAF=52;FSAR=45;FSRF=54;FSRR=63;FWDB=-0.00448082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.912;QD=6.85257;RBI=0.0118906;REFB=-0.00647849;REVB=-0.011014;RO=115;SAF=50;SAR=44;SRF=52;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0789685;STB=0.54072;TYPE=snp;VARB=0.00862958;OID=.;OPOS=124826622;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:210:214:115:117:94:97:44:50:52:63:45:52:54:63 chr3 124837684 . T C 1602.2 PASS AO=166;DP=166;FAO=167;FDP=167;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0380696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.2339;QD=38.3759;RBI=0.0508262;REFB=0;REVB=0.033675;RO=0;SAF=82;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.06555e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.33895e-05;OID=.;OPOS=124837684;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:166:167:0:0:166:167:84:82:0:0:85:82:0:0 chr3 124839470 . G A 826.11 PASS AO=100;DP=110;FAO=102;FDP=111;FR=.;FRO=9;FSAF=56;FSAR=46;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.00871914;FXX=0.0512777;HRUN=5;LEN=1;MLLD=209.841;QD=29.7696;RBI=0.0111265;REFB=-0.175034;REVB=0.00691197;RO=8;SAF=56;SAR=44;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0271128;STB=0.509648;TYPE=snp;VARB=0.00106733;OID=.;OPOS=124839470;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:110:111:8:9:100:102:44:56:6:2:46:56:6:3 chr3 124896668 . G A 170.47 PASS AO=48;DP=115;FAO=48;FDP=115;FR=.;FRO=67;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=33;FSRR=34;FWDB=-0.0416622;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.437;QD=5.92923;RBI=0.0430639;REFB=-0.0260323;REVB=0.0108977;RO=66;SAF=23;SAR=25;SRF=33;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.021459;STB=0.507795;TYPE=snp;VARB=0.0332079;OID=.;OPOS=124896668;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:66:67:48:48:25:23:33:33:25:23:33:34 chr3 124906162 . G A 86.46 PASS AO=28;DP=78;FAO=28;FDP=78;FR=.;FRO=50;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=34;FSRR=16;FWDB=0.000475643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.348;QD=4.43387;RBI=0.0185212;REFB=-0.00982923;REVB=0.0185151;RO=50;SAF=13;SAR=15;SRF=34;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237678;STB=0.63619;TYPE=snp;VARB=0.0242694;OID=.;OPOS=124906162;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:78:78:50:50:28:28:15:13:34:16:15:13:34:16 chr3 124951596 . G A 218.08 PASS AO=42;DP=114;FAO=59;FDP=130;FR=.;FRO=71;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=31;FSRR=40;FWDB=0.0201399;FXX=0.0151504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.294;QD=6.71005;RBI=0.0292652;REFB=-0.0249353;REVB=0.0212329;RO=70;SAF=22;SAR=20;SRF=31;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0885521;STB=0.511575;TYPE=snp;VARB=0.0319478;OID=.;OPOS=124951596;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:130:70:71:42:59:20:22:31:39:32:27:31:40 chr3 125235852 . A ATTTAT 203.04 PASS AO=63;DP=187;FAO=68;FDP=179;FR=.;FRO=111;FSAF=33;FSAR=35;FSRF=69;FSRR=42;FWDB=0.0114659;FXX=0.0271724;HRUN=3;LEN=5;MLLD=230.333;QD=4.53726;RBI=0.0370008;REFB=-0.00906374;REVB=0.0351794;RO=111;SAF=28;SAR=35;SRF=66;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167082;STB=0.584168;TYPE=ins;VARB=0.0154806;OID=.;OPOS=125235853;OREF=-;OALT=TTTAT;OMAPALT=ATTTAT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:63:187:68:179:111:33:35:69:42:99:111:28:35:66:45 chr3 125266387 . G A 317.32 PASS AO=86;DP=174;FAO=86;FDP=197;FR=.;FRO=111;FSAF=35;FSAR=51;FSRF=55;FSRR=56;FWDB=-0.00430714;FXX=0.00505025;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.1545;QD=6.44304;RBI=0.124726;REFB=-0.0341888;REVB=-0.124651;RO=88;SAF=35;SAR=51;SRF=55;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199075;STB=0.550678;TYPE=snp;VARB=0.0432811;OID=.;OPOS=125266387;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:197:88:111:86:86:51:35:55:33:51:35:55:56 chr3 125413244 . AG A 149.82 PASS AO=74;DP=182;FAO=88;FDP=179;FR=.;FRO=91;FSAF=43;FSAR=45;FSRF=59;FSRR=32;FWDB=-0.134295;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=12.3658;QD=3.34801;RBI=0.13466;REFB=-0.0318607;REVB=-0.00991348;RO=85;SAF=34;SAR=40;SRF=58;SRR=27;SSEN=0.280702;SSEP=0;SSSB=-0.213014;STB=0.580921;TYPE=del;VARB=0.0199962;OID=.;OPOS=125413245;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:74:175:88:179:91:43:45:59:32:99:85:34:40:58:27 chr3 125651476 . AG A 116.06 PASS AO=11;DP=16;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.360263;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.0611;QD=25.7907;RBI=0.360946;REFB=0;REVB=-0.0222005;RO=2;SAF=1;SAR=10;SRF=2;SRR=0;SSEN=0.471125;SSEP=0;SSSB=-0.43408;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0325076;OID=.;OPOS=125651477;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:11:15:18:18:0:5:13:0:0:11:2:1:10:2:0 chr3 125653291 . A G 229.8 PASS AO=24;DP=24;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.017241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.346;QD=36.7671;RBI=0.0435433;REFB=0;REVB=0.0399846;RO=0;SAF=11;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000172311;OID=.;OPOS=125653291;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:24:25:0:0:24:25:13:11:0:0:14:11:0:0 chr3 125692141 . G A 2234.16 PASS AO=240;DP=244;FAO=242;FDP=242;FR=.;FRO=0;FSAF=138;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.035394;FXX=0.00819639;HRUN=3;LEN=1;MLLD=199.193;QD=36.9283;RBI=0.0531266;REFB=-0.126913;REVB=0.0396194;RO=1;SAF=136;SAR=104;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00456075;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000276406;OID=.;OPOS=125692141;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:244:242:1:0:240:242:104:136:0:1:104:138:0:0 chr3 125692148 . G A 2471.05 PASS AO=260;DP=262;FAO=260;FDP=260;FR=.;FRO=0;FSAF=144;FSAR=116;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00706736;FXX=0.0114064;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.16;QD=38.0161;RBI=0.0160366;REFB=-0.0384992;REVB=0.0143953;RO=0;SAF=144;SAR=116;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.08125e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000119992;OID=.;OPOS=125692148;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:262:260:0:0:260:260:116:144:0:0:116:144:0:0 chr3 125726048 . G C 583.99 PASS AO=60;DP=60;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0568801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.592;QD=37.0787;RBI=0.0637563;REFB=0;REVB=0.0288014;RO=0;SAF=30;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000287972;OID=.;OPOS=125726048;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:60:63:0:0:60:63:30:30:0:0:30:33:0:0 chr3 125775228 . T C 390.73 PASS AO=36;DP=37;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00772436;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.195;QD=36.3472;RBI=0.0887233;REFB=0;REVB=0.0883864;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0011056;OID=.;OPOS=125775228;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:37:43:0:0:36:43:17:19:0:0:23:20:0:0 chr3 125786879 . T C 394.58 PASS AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.118985;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.8503;QD=37.5792;RBI=0.122955;REFB=0;REVB=0.0309921;RO=0;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000143562;OID=.;OPOS=125786879;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:42:42:0:0:42:42:21:21:0:0:21:21:0:0 chr3 125854311 . TC T 228.25 PASS AO=36;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.336689;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=8.64556;QD=17.2265;RBI=0.337982;REFB=0.0572985;REVB=0.0295321;RO=13;SAF=19;SAR=17;SRF=11;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158282;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0283811;OID=.;OPOS=125854312;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:36:52:53:53:0:34:19:0:0:18:13:19:17:11:2 chr3 125872384 . A G 175.42 PASS AO=43;DP=95;FAO=44;FDP=96;FR=.;FRO=52;FSAF=13;FSAR=31;FSRF=17;FSRR=35;FWDB=0.052102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.826;QD=7.30931;RBI=0.0564836;REFB=0.00647589;REVB=-0.0218125;RO=50;SAF=13;SAR=30;SRF=16;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0199676;STB=0.520125;TYPE=snp;VARB=-0.0159521;OID=.;OPOS=125872384;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:96:50:52:43:44:30:13:16:34:31:13:17:35 chr3 126126084 . GA G 45.98 PASS AO=12;DP=40;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.115096;FXX=0.0810592;HRUN=6;LEN=1;MLLD=12.3468;QD=5.40912;RBI=0.346969;REFB=-0.0807181;REVB=0.327323;RO=17;SAF=11;SAR=1;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0.315789;SSSB=0.644302;STB=0.694412;TYPE=del;VARB=0.177551;OID=.;OPOS=126126085;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:12:34:17:34:17:13:4:7:10:33:17:11:1:6:11 chr3 126152474 . C T 133.81 PASS AO=28;DP=53;FAO=28;FDP=53;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=0.101025;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=95.2541;QD=10.0988;RBI=0.101067;REFB=0.00886908;REVB=0.00290594;RO=25;SAF=16;SAR=12;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0598986;STB=0.53331;TYPE=snp;VARB=-0.00750355;OID=.;OPOS=126152474;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:25:25:28:28:12:16:16:9:12:16:16:9 chr3 126169230 . C T 1248.24 PASS AO=134;DP=136;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0320591;FXX=0.0147048;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.437;QD=37.2609;RBI=0.0320848;REFB=-0.0538885;REVB=0.00128377;RO=0;SAF=75;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.77535e-05;OID=.;OPOS=126169230;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:136:134:0:0:134:134:59:75:0:0:59:75:0:0 chr3 126169472 . T C 332.81 PASS AO=34;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0293692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.015;QD=36.9793;RBI=0.0297485;REFB=0;REVB=-0.00473544;RO=0;SAF=9;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000253581;OID=.;OPOS=126169472;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:35:36:0:0:34:36:25:9:0:0:26:10:0:0 chr3 126194076 . T C 62.51 PASS AO=14;DP=31;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=-0.0478645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.464;QD=8.06529;RBI=0.047873;REFB=-0.00970157;REVB=0.000905337;RO=16;SAF=10;SAR=4;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.419353;STB=0.751869;TYPE=snp;VARB=0.0183646;OID=.;OPOS=126194076;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:31:31:16:17:14:14:4:10:4:12:4:10:4:13 chr3 126202257 . G A 1002.92 PASS AO=210;DP=375;FAO=211;FDP=380;FR=.;FRO=169;FSAF=88;FSAR=123;FSRF=85;FSRR=84;FWDB=-0.0169287;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.331;QD=10.5571;RBI=0.0247743;REFB=-0.035089;REVB=0.0180882;RO=154;SAF=88;SAR=122;SRF=71;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0334908;STB=0.538773;TYPE=snp;VARB=0.0244872;OID=.;OPOS=126202257;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:375:380:154:169:210:211:122:88:71:83:123:88:85:84 chr3 126218167 . G A 395.48 PASS AO=74;DP=126;FAO=74;FDP=122;FR=.;FRO=48;FSAF=35;FSAR=39;FSRF=30;FSRR=18;FWDB=-0.0119937;FXX=0.039367;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.436;QD=12.9665;RBI=0.0433503;REFB=-0.0151234;REVB=0.0416581;RO=43;SAF=35;SAR=39;SRF=28;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120546;STB=0.559587;TYPE=snp;VARB=0.0118125;OID=.;OPOS=126218167;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:122:43:48:74:74:39:35:28:15:39:35:30:18 chr3 126219627 . G A 212.05 PASS AO=44;DP=84;FAO=45;FDP=83;FR=.;FRO=38;FSAF=13;FSAR=32;FSRF=25;FSRR=13;FWDB=-0.00957786;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.5914;QD=10.2191;RBI=0.0837708;REFB=-0.0193563;REVB=0.0832215;RO=32;SAF=13;SAR=31;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.266492;STB=0.6751;TYPE=snp;VARB=0.0283882;OID=.;OPOS=126219627;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:83:32:38:44:45:31:13:20:12:32:13:25:13 chr3 126329910 . A G 687.14 PASS AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0379545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.689;QD=37.6516;RBI=0.0450603;REFB=0;REVB=-0.0242875;RO=0;SAF=44;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.00394e-05;OID=.;OPOS=126329910;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:73:73:0:0:73:73:29:44:0:0:29:44:0:0 chr3 126737268 . C A 568.58 PASS AO=58;DP=58;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.104356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.488;QD=38.5475;RBI=0.110691;REFB=0;REVB=0.0369092;RO=0;SAF=22;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000619003;OID=.;OPOS=126737268;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:58:59:0:0:58:59:36:22:0:0:36:23:0:0 chr3 126916371 . T C 568.14 PASS AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00147975;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0261;QD=38.5178;RBI=0.0145691;REFB=0;REVB=-0.0144937;RO=0;SAF=8;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.15842e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000180541;OID=.;OPOS=126916371;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:59:59:0:0:59:59:51:8:0:0:51:8:0:0 chr3 126916433 . T TTTC 370.81 PASS AO=32;DP=54;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190005;FXX=0.215644;HRUN=3;LEN=3;MLLD=236.327;QD=37.0809;RBI=0.0216805;REFB=0;REVB=-0.0104416;RO=14;SAF=8;SAR=24;SRF=1;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144461;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-3.09673e-05;OID=.;OPOS=126916434;OREF=-;OALT=TTC;OMAPALT=TTTC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:32:54:40:40:0:10:30:0:0:18:14:8:24:1:13 chr3 127323830 . C T 332.41 PASS AO=35;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0587797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.9579;QD=36.9347;RBI=0.0597174;REFB=0;REVB=0.0105408;RO=0;SAF=22;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.39865e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00377269;OID=.;OPOS=127323830;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:36:36:0:0:35:36:13:22:0:0:14:22:0:0 chr3 127379270 . C T 346.16 PASS AO=65;DP=108;FAO=65;FDP=108;FR=.;FRO=43;FSAF=26;FSAR=39;FSRF=17;FSRR=26;FWDB=-0.000278069;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.266;QD=12.8207;RBI=0.0327604;REFB=-0.0209998;REVB=0.0327592;RO=43;SAF=26;SAR=39;SRF=17;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00354884;STB=0.50193;TYPE=snp;VARB=0.0141829;OID=.;OPOS=127379270;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:43:43:65:65:39:26:17:26:39:26:17:26 chr3 127394820 . C T 203.24 PASS AO=47;DP=103;FAO=49;FDP=102;FR=.;FRO=53;FSAF=18;FSAR=31;FSRF=23;FSRR=30;FWDB=0.00178413;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.218;QD=7.97004;RBI=0.0154039;REFB=-0.0132491;REVB=0.0153002;RO=54;SAF=18;SAR=29;SRF=23;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0430459;STB=0.536498;TYPE=snp;VARB=0.027276;OID=.;OPOS=127394820;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:102:54:53:47:49:29:18:23:31:31:18:23:30 chr3 127395817 . G A 358.71 PASS AO=83;DP=166;FAO=83;FDP=165;FR=.;FRO=82;FSAF=61;FSAR=22;FSRF=52;FSRR=30;FWDB=0.0222982;FXX=0.00602373;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.195;QD=8.69606;RBI=0.0223076;REFB=-0.00619903;REVB=-0.00064632;RO=82;SAF=61;SAR=22;SRF=52;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109753;STB=0.560607;TYPE=snp;VARB=0.00858868;OID=.;OPOS=127395817;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:165:82:82:83:83:22:61:52:30:22:61:52:30 chr3 127409941 . T C 92.14 PASS AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.00350617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.965;QD=8.37611;RBI=0.00883156;REFB=-0.0152849;REVB=-0.00810575;RO=23;SAF=14;SAR=7;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181521;STB=0.603074;TYPE=snp;VARB=0.0145659;OID=.;OPOS=127409941;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:44:44:23:23:21:21:7:14:11:12:7:14:11:12 chr3 127410915 . C T 153.23 PASS AO=37;DP=85;FAO=39;FDP=87;FR=.;FRO=48;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=-0.00325433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.205;QD=7.04497;RBI=0.010013;REFB=-0.00861226;REVB=-0.00946943;RO=48;SAF=21;SAR=16;SRF=20;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150702;STB=0.580945;TYPE=snp;VARB=0.00933591;OID=.;OPOS=127410915;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:87:48:48:37:39:16:21:20:28:17:22:20:28 chr3 127434580 . G A 133.61 PASS AO=23;DP=36;FAO=23;FDP=36;FR=.;FRO=13;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0442628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.4147;QD=14.8456;RBI=0.0795141;REFB=0.016002;REVB=0.0660553;RO=13;SAF=12;SAR=11;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0615279;STB=0.533951;TYPE=snp;VARB=-0.0188983;OID=.;OPOS=127434580;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:36:36:13:13:23:23:11:12:8:5:11:12:8:5 chr3 127983495 . T C 664.94 PASS AO=61;DP=61;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0690927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.107;QD=37.9967;RBI=0.0868922;REFB=0;REVB=0.0526921;RO=0;SAF=8;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.04283e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000999493;OID=.;OPOS=127983495;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:61:70:0:0:61:70:53:8:0:0:54:16:0:0 chr3 128181777 . A G 428.06 PASS AO=43;DP=45;FAO=50;FDP=52;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00198139;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=78.6757;QD=32.928;RBI=0.0172366;REFB=-0.131256;REVB=-0.0171224;RO=2;SAF=13;SAR=30;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0193671;STB=0.505821;TYPE=snp;VARB=0.00489293;OID=.;OPOS=128181777;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:45:52:2:2:43:50:30:13:1:1:32:18:1:1 chr3 128182378 . G A 35.06 PASS AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.00460406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.712;QD=7.01145;RBI=0.0285591;REFB=-0.0313351;REVB=0.0281856;RO=11;SAF=2;SAR=6;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132829;STB=0.617332;TYPE=snp;VARB=0.062135;OID=.;OPOS=128182378;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:20:20:11:12:8:8:6:2:4:7:6:2:5:7 chr3 128182626 . T G 10.29 PASS AO=2;DP=8;FAO=2;FDP=8;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.00394478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.058;QD=5.1474;RBI=0.00394478;REFB=-0.0117956;REVB=0;RO=6;SAF=2;SAR=0;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.115359;OID=.;OPOS=128182626;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:8:6:6:2:2:0:2:6:0:0:2:6:0 chr3 128182816 . G A 91.08 PASS AO=23;DP=53;FAO=23;FDP=53;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=24;FSRR=6;FWDB=-0.0231466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.638;QD=6.8736;RBI=0.0231467;REFB=-0.00599488;REVB=6.61826e-05;RO=30;SAF=16;SAR=7;SRF=24;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130683;STB=0.573711;TYPE=snp;VARB=0.00741821;OID=.;OPOS=128182816;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:53:53:30:30:23:23:7:16:24:6:7:16:24:6 chr3 128199662 . G A 167.86 PASS AO=34;DP=62;FAO=34;FDP=62;FR=.;FRO=28;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=0.00184862;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.9853;QD=10.8297;RBI=0.00991569;REFB=-0.0236435;REVB=0.00974184;RO=28;SAF=18;SAR=16;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240521;STB=0.5133;TYPE=snp;VARB=0.0277756;OID=.;OPOS=128199662;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:28:28:34:34:16:18:14:14:16:18:14:14 chr3 128205860 . G C 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=64.4768;QD=35.087;RBI=0.0106155;REFB=0;REVB=-0.0106155;RO=0;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00068928;OID=.;OPOS=128205860;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:7:0:0:0:7:0:0:0 chr3 128292213 . A G 2598.72 PASS AO=272;DP=272;FAO=271;FDP=271;FR=.;FRO=0;FSAF=179;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00460016;FXX=0.0109485;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.286;QD=38.3574;RBI=0.018619;REFB=0;REVB=0.0180418;RO=0;SAF=179;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.99584e-05;OID=.;OPOS=128292213;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:272:271:0:0:272:271:93:179:0:0:92:179:0:0 chr3 128292858 . T C 47.12 PASS AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.0250391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.882;QD=8.56652;RBI=0.0251194;REFB=0.00446764;REVB=-0.00200763;RO=12;SAF=9;SAR=1;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.445016;STB=0.770751;TYPE=snp;VARB=-0.00508216;OID=.;OPOS=128292858;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:22:22:12:12:10:10:1:9:7:5:1:9:7:5 chr3 128344786 . G A 330.41 PASS AO=88;DP=197;FAO=88;FDP=197;FR=.;FRO=109;FSAF=54;FSAR=34;FSRF=49;FSRR=60;FWDB=-0.0358418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.204;QD=6.70893;RBI=0.0368847;REFB=-0.00600117;REVB=0.00870867;RO=109;SAF=54;SAR=34;SRF=49;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165012;STB=0.591725;TYPE=snp;VARB=0.00972402;OID=.;OPOS=128344786;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:197:109:109:88:88:34:54:49:60:34:54:49:60 chr3 128356852 . C T 2328.13 PASS AO=167;DP=286;FAO=271;FDP=271;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=130;FSAR=141;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023047;FXX=0.0216599;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.0953;QD=34.3635;RBI=0.0320506;REFB=0;REVB=0.0222728;RO=0;SAF=128;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000582608;OID=.;OPOS=128356852;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:278:271:0:0:167:271:39:128:0:0:141:130:0:0 chr3 128392630 . G C 710.24 PASS AO=74;DP=77;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0238665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.648;QD=36.8954;RBI=0.0307691;REFB=0.011776;REVB=-0.0194199;RO=0;SAF=18;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504424;TYPE=snp;VARB=-2.82714e-05;OID=.;OPOS=128392630;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:77:77:0:1:74:76:56:18:0:0:56:20:0:1 chr3 128533128 . C G 745.65 PASS AO=173;DP=345;FAO=175;FDP=347;FR=.;FRO=172;FSAF=58;FSAR=117;FSRF=60;FSRR=112;FWDB=0.0148381;FXX=0.00287348;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.61;QD=8.59544;RBI=0.022695;REFB=-0.0249266;REVB=0.0171724;RO=172;SAF=58;SAR=115;SRF=60;SRR=112;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.013789;STB=0.509671;TYPE=snp;VARB=0.0191143;OID=.;OPOS=128533128;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:345:347:172:172:173:175:115:58:60:112:117:58:60:112 chr3 128580574 . T C 249.93 PASS AO=51;DP=91;FAO=51;FDP=92;FR=.;FRO=41;FSAF=42;FSAR=9;FSRF=26;FSRR=15;FWDB=-0.0258242;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.3651;QD=10.8663;RBI=0.0261066;REFB=-0.0462365;REVB=-0.00382953;RO=40;SAF=42;SAR=9;SRF=25;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226787;STB=0.622169;TYPE=snp;VARB=0.050445;OID=.;OPOS=128580574;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:92:40:41:51:51:9:42:25:15:9:42:26:15 chr3 128580585 . C A 275.85 PASS AO=49;DP=95;FAO=57;FDP=104;FR=.;FRO=47;FSAF=45;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=0.0113819;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.44;QD=10.6096;RBI=0.028596;REFB=-0.0164123;REVB=0.0262333;RO=46;SAF=45;SAR=4;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.530124;STB=0.635378;TYPE=snp;VARB=0.0073028;OID=.;OPOS=128580585;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:104:46:47:49:57:4:45:25:21:12:45:26:21 chr3 128614185 . A C 28.58 PASS AO=13;DP=49;FAO=13;FDP=52;FR=.;FRO=39;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=-0.0317809;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.7453;QD=2.19871;RBI=0.0541031;REFB=-0.0017445;REVB=-0.0437849;RO=36;SAF=4;SAR=9;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206113;STB=0.622446;TYPE=snp;VARB=0.00324484;OID=.;OPOS=128614185;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:49:52:36:39:13:13:9:4:17:19:9:4:18:21 chr3 128627021 . A G 62.47 PASS AO=10;DP=15;FAO=10;FDP=15;FR=.;FRO=5;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.00144534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.038;QD=16.6587;RBI=0.0289814;REFB=-0.0178149;REVB=-0.0289454;RO=5;SAF=9;SAR=1;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.451874;STB=0.765291;TYPE=snp;VARB=0.00893616;OID=.;OPOS=128627021;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:15:15:5:5:10:10:1:9:2:3:1:9:2:3 chr3 128627933 . C T 77.1 PASS AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.00915038;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=175.814;QD=7.71018;RBI=0.0179645;REFB=-0.00855792;REVB=-0.0154594;RO=21;SAF=8;SAR=10;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0750124;STB=0.555494;TYPE=snp;VARB=0.0125718;OID=.;OPOS=128627933;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:39:40:21:22:18:18:10:8:11:10:10:8:12:10 chr3 128663955 . G A 33.43 PASS AO=11;DP=34;FAO=11;FDP=36;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.0332679;FXX=0.0270197;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.01;QD=3.71482;RBI=0.0620975;REFB=-0.0165884;REVB=0.0524342;RO=22;SAF=4;SAR=7;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153944;STB=0.636116;TYPE=snp;VARB=0.0743714;OID=.;OPOS=128663955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:34:36:22:25:11:11:7:4:11:11:7:4:14:11 chr3 128664654 . G T 549.67 PASS AO=83;DP=222;FAO=100;FDP=188;FR=.,HEALED;FRO=65;FSAF=63;FSAR=37;FSRF=49;FSRR=16;FWDB=-0.113792;FXX=0.0309262;HRUN=7;LEN=1;MLLD=25.7366;QD=11.6951;RBI=0.114138;REFB=-0.101844;REVB=-0.00888155;RO=38;SAF=53;SAR=30;SRF=25;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.012276;STB=0.553778;TYPE=snp;VARB=0.0466012;OID=.;OPOS=128664654;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:188:38:65:83:100:30:53:25:13:37:63:49:16 chr3 128755953 . G A 255.38 PASS AO=40;DP=56;FAO=40;FDP=56;FR=.;FRO=16;FSAF=13;FSAR=27;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.00622662;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=140.977;QD=18.2415;RBI=0.0229537;REFB=-0.0141451;REVB=0.0220931;RO=16;SAF=13;SAR=27;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00753484;STB=0.50408;TYPE=snp;VARB=0.0154799;OID=.;OPOS=128755953;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:56:56:16:16:40:40:27:13:5:11:27:13:5:11 chr3 128890350 . G A 946.81 PASS AO=99;DP=101;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147014;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.5317;QD=37.8725;RBI=0.0268401;REFB=0;REVB=0.0224557;RO=0;SAF=45;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000210538;OID=.;OPOS=128890350;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:101:100:0:0:99:100:54:45:0:0:55:45:0:0 chr3 129140489 . T C 202.94 PASS AO=48;DP=100;FAO=48;FDP=100;FR=.;FRO=52;FSAF=37;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=29;FWDB=-0.0372274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.6373;QD=8.11757;RBI=0.0471168;REFB=0.00065261;REVB=-0.028881;RO=51;SAF=37;SAR=11;SRF=22;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.348832;STB=0.691503;TYPE=snp;VARB=-0.002111;OID=.;OPOS=129140489;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:51:52:48:48:11:37:22:29:11:37:23:29 chr3 129152089 . G A 494.06 PASS AO=122;DP=254;FAO=122;FDP=254;FR=.;FRO=132;FSAF=76;FSAR=46;FSRF=66;FSRR=66;FWDB=-0.0320329;FXX=0.00392141;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.081;QD=7.78054;RBI=0.0320352;REFB=-0.0119273;REVB=-0.000383666;RO=130;SAF=76;SAR=46;SRF=64;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125731;STB=0.565796;TYPE=snp;VARB=0.0159869;OID=.;OPOS=129152089;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:254:254:130:132:122:122:46:76:64:66:46:76:66:66 chr3 129155670 . C T 152.07 PASS AO=35;DP=72;FAO=35;FDP=72;FR=.;FRO=37;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=13;FWDB=0.000875648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.327;QD=8.44847;RBI=0.0042143;REFB=-0.016043;REVB=-0.00412232;RO=37;SAF=21;SAR=14;SRF=24;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.047203;STB=0.526301;TYPE=snp;VARB=0.0216986;OID=.;OPOS=129155670;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:37:37:35:35:14:21:24:13:14:21:24:13 chr3 129210977 . G C 133.56 PASS AO=30;DP=59;FAO=29;FDP=58;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.00102455;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.051;QD=9.21122;RBI=0.00959235;REFB=-0.000576169;REVB=0.00953748;RO=28;SAF=9;SAR=21;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156839;STB=0.593481;TYPE=snp;VARB=0.00105339;OID=.;OPOS=129210977;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:58:28:29:30:29:21:9:13:15:20:9:14:15 chr3 129214302 . G A 357.37 PASS AO=92;DP=197;FAO=93;FDP=203;FR=.;FRO=110;FSAF=52;FSAR=41;FSRF=63;FSRR=47;FWDB=0.0141725;FXX=0.00490172;HRUN=4;LEN=1;MLLD=150.446;QD=7.04176;RBI=0.0172618;REFB=-0.0197333;REVB=0.00985438;RO=104;SAF=52;SAR=40;SRF=63;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0398494;STB=0.507479;TYPE=snp;VARB=0.0190419;OID=.;OPOS=129214302;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:203:104:110:92:93:40:52:63:41:41:52:63:47 chr3 129274363 . G A 87.88 PASS AO=37;DP=123;FAO=37;FDP=123;FR=.;FRO=86;FSAF=10;FSAR=27;FSRF=27;FSRR=59;FWDB=0.00260585;FXX=0.0159987;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.7;QD=2.85787;RBI=0.010222;REFB=-0.000874473;REVB=-0.00988424;RO=86;SAF=11;SAR=26;SRF=27;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0234574;STB=0.537365;TYPE=snp;VARB=0.00243102;OID=.;OPOS=129274363;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:123:123:86:86:37:37:26:11:27:59:27:10:27:59 chr3 129275206 . C T 219.29 PASS AO=49;DP=96;FAO=49;FDP=96;FR=.;FRO=47;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=0.0622742;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7817;QD=9.13731;RBI=0.0668662;REFB=-0.00571336;REVB=0.0243519;RO=46;SAF=21;SAR=28;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0249074;STB=0.509087;TYPE=snp;VARB=0.00666894;OID=.;OPOS=129275206;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:46:47:49:49:28:21:21:25:28:21:21:26 chr3 129279570 . T C 88.96 PASS AO=16;DP=29;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.0527593;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3985;QD=12.7089;RBI=0.0530197;REFB=-0.061353;REVB=0.00524899;RO=12;SAF=6;SAR=10;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0341381;STB=0.519207;TYPE=snp;VARB=0.0194975;OID=.;OPOS=129279570;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:29:28:12:12:16:16:10:6:4:8:10:6:4:8 chr3 129279597 . C T 269.22 PASS AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013458;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.91;QD=38.4604;RBI=0.0212547;REFB=0;REVB=0.0164513;RO=0;SAF=10;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000215557;OID=.;OPOS=129279597;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:29:28:0:0:28:28:18:10:0:0:18:10:0:0 chr3 129281980 . C T 363.26 PASS AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0679742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9475;QD=38.2376;RBI=0.0747338;REFB=0;REVB=0.0310587;RO=0;SAF=15;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00143785;OID=.;OPOS=129281980;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:38:38:0:0:38:38:23:15:0:0:23:15:0:0 chr3 129282021 . GC G 254.82 PASS AO=30;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.100913;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=17.6709;QD=28.3137;RBI=0.284691;REFB=0;REVB=0.266206;RO=4;SAF=9;SAR=21;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0.34965;SSSB=-0.0507748;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.016905;OID=.;OPOS=129282022;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:30:35:36:36:0:12:24:0:0:23:4:9:21:2:2 chr3 129284818 . A C 73 PASS AO=23;DP=64;FAO=23;FDP=64;FR=.;FRO=41;FSAF=4;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=28;FWDB=0.0028719;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.8216;QD=4.5624;RBI=0.0479368;REFB=-0.00517105;REVB=0.0478507;RO=40;SAF=4;SAR=19;SRF=12;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200158;STB=0.631965;TYPE=snp;VARB=0.0118561;OID=.;OPOS=129284818;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:64:64:40:41:23:23:19:4:12:28:19:4:13:28 chr3 129286413 . G C 116.27 PASS AO=23;DP=42;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.00135174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.1328;QD=11.0732;RBI=0.0178911;REFB=-0.0177751;REVB=-0.01784;RO=19;SAF=11;SAR=12;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0389085;STB=0.52172;TYPE=snp;VARB=0.0195189;OID=.;OPOS=129286413;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:42:42:19:19:23:23:12:11:10:9:12:11:10:9 chr3 129286635 . G A 41.47 PASS AO=6;DP=9;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0466544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.09;QD=18.4312;RBI=0.0466836;REFB=-0.0412253;REVB=-0.00164922;RO=3;SAF=4;SAR=2;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0187283;OID=.;OPOS=129286635;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:9:9:3:3:6:6:2:4:2:1:2:4:2:1 chr3 129289978 . G A 236.03 PASS AO=46;DP=104;FAO=57;FDP=120;FR=.;FRO=63;FSAF=20;FSAR=37;FSRF=31;FSRR=32;FWDB=0.0258722;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.996;QD=7.86781;RBI=0.0425112;REFB=-0.0110614;REVB=0.0337317;RO=57;SAF=20;SAR=26;SRF=30;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0908163;STB=0.577566;TYPE=snp;VARB=0.0126078;OID=.;OPOS=129289978;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:120:57:63:46:57:26:20:30:27:37:20:31:32 chr3 129291751 . T C 94.81 PASS AO=20;DP=40;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=-0.0346314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.0105;QD=9.48071;RBI=0.0420297;REFB=-0.0216637;REVB=-0.0238152;RO=19;SAF=5;SAR=15;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0150102;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0180834;OID=.;OPOS=129291751;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:40:40:19:20:20:20:15:5:5:14:15:5:5:15 chr3 129293183 . T C 263.71 PASS AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104536;FXX=0.0644953;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.0271;QD=36.3744;RBI=0.0542753;REFB=-0.0623068;REVB=0.0532591;RO=0;SAF=12;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.0947e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0022381;OID=.;OPOS=129293183;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:29:29:0:0:29:29:17:12:0:0:17:12:0:0 chr3 129293256 . T C 81.89 PASS AO=21;DP=50;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=23;FSRR=6;FWDB=-0.0189528;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.591;QD=6.5512;RBI=0.0785795;REFB=-0.0315463;REVB=0.0762597;RO=29;SAF=16;SAR=5;SRF=23;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0448446;STB=0.525583;TYPE=snp;VARB=0.0666994;OID=.;OPOS=129293256;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:50:50:29:29:21:21:5:16:23:6:5:16:23:6 chr3 129297223 . C G 90.03 PASS AO=11;DP=12;FAO=11;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0601546;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.6281;QD=30.0097;RBI=0.0601546;REFB=-0.0885288;REVB=0;RO=1;SAF=11;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0093273;OID=.;OPOS=129297223;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:12:12:1:1:11:11:0:11:1:0:0:11:1:0 chr3 129367024 . T A 1701.85 PASS AO=188;DP=197;FAO=192;FDP=199;FR=.;FRO=7;FSAF=47;FSAR=145;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=0.0446269;FXX=0.00499975;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.491;QD=34.2081;RBI=0.0446968;REFB=-0.192798;REVB=-0.00249838;RO=3;SAF=44;SAR=144;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0313559;STB=0.53465;TYPE=snp;VARB=0.00160827;OID=.;OPOS=129367024;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:197:199:3:7:188:192:144:44:3:0:145:47:7:0 chr3 129538635 . A G 222.32 PASS AO=37;DP=69;FAO=40;FDP=66;FR=.;FRO=26;FSAF=30;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=25;FWDB=-0.000467146;FXX=0.0571347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.32;QD=13.4736;RBI=0.00424562;REFB=-0.008392;REVB=-0.00421984;RO=0;SAF=28;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.771927;TYPE=snp;VARB=0.0023407;OID=.;OPOS=129538635;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:38:66:0:26:37:40:9:28:0:0:10:30:1:25 chr3 129546729 . T C 980.97 PASS AO=96;DP=97;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00986387;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.18;QD=37.7294;RBI=0.0128745;REFB=0;REVB=0.00827387;RO=0;SAF=35;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.72536e-06;OID=.;OPOS=129546729;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:97:104:0:0:96:104:61:35:0:0:67:37:0:0 chr3 129694681 . C G 141.64 PASS AO=23;DP=33;FAO=23;FDP=34;FR=.;FRO=11;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=-0.0128724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.8536;QD=16.6633;RBI=0.0746789;REFB=1.32644e-05;REVB=-0.0735611;RO=10;SAF=9;SAR=14;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114141;STB=0.573347;TYPE=snp;VARB=-0.00214686;OID=.;OPOS=129694681;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:33:34:10:11:23:23:14:9:2:8:14:9:2:9 chr3 129695954 . T C 392.3 PASS AO=43;DP=43;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00910999;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7001;QD=37.3619;RBI=0.0513976;REFB=0;REVB=-0.0505838;RO=0;SAF=31;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41862e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00109058;OID=.;OPOS=129695954;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:43:42:0:0:43:42:12:31:0:0:12:30:0:0 chr3 129696041 . A G 306.11 PASS AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.021012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.994;QD=37.1047;RBI=0.0258239;REFB=0;REVB=-0.0150124;RO=0;SAF=9;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000120487;OID=.;OPOS=129696041;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:33:33:0:0:33:33:24:9:0:0:24:9:0:0 chr3 129800895 . G A 182.09 PASS AO=55;DP=139;FAO=55;FDP=139;FR=.;FRO=84;FSAF=17;FSAR=38;FSRF=39;FSRR=45;FWDB=-0.0170036;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.088;QD=5.24;RBI=0.0177417;REFB=-0.00856193;REVB=-0.0050641;RO=82;SAF=17;SAR=38;SRF=39;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189103;STB=0.601262;TYPE=snp;VARB=0.0366143;OID=.;OPOS=129800895;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:82:84:55:55:38:17:39:43:38:17:39:45 chr3 129810128 . G A 154.35 PASS AO=34;DP=66;FAO=34;FDP=67;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=-0.0178745;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.354;QD=9.21481;RBI=0.0303712;REFB=-0.053278;REVB=0.0245542;RO=32;SAF=12;SAR=22;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187422;STB=0.612141;TYPE=snp;VARB=0.0383274;OID=.;OPOS=129810128;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:67:32:33:34:34:22:12:18:14:22:12:19:14 chr3 129810158 . C T 93.08 PASS AO=25;DP=59;FAO=25;FDP=61;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.0175222;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.7995;QD=6.10336;RBI=0.0433725;REFB=-0.0235138;REVB=-0.0396755;RO=34;SAF=8;SAR=17;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220483;STB=0.643126;TYPE=snp;VARB=0.0385834;OID=.;OPOS=129810158;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:59:61:34:36:25:25:17:8:18:16:17:8:20:16 chr3 129814934 . GC G 72.88 PASS AO=14;DP=22;FAO=15;FDP=22;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=0.108244;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=27.4664;QD=13.2508;RBI=0.150307;REFB=0.0291417;REVB=-0.104285;RO=7;SAF=5;SAR=9;SRF=6;SRR=1;SSEN=0.251645;SSEP=0;SSSB=-0.293468;STB=0.666444;TYPE=del;VARB=-0.0124642;OID=.;OPOS=129814935;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:14:22:15:22:7:5:10:6:1:16:7:5:9:6:1 chr3 130098349 . G A 2876.36 PASS AO=304;DP=308;FAO=304;FDP=304;FR=.;FRO=0;FSAF=125;FSAR=179;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00533347;FXX=0.0129866;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.2042;QD=37.8469;RBI=0.0388229;REFB=-0.0652957;REVB=0.0384548;RO=2;SAF=125;SAR=179;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00114312;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.62297e-05;OID=.;OPOS=130098349;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:308:304:2:0:304:304:179:125:1:1:179:125:0:0 chr3 130103709 . G A 1249.79 PASS AO=131;DP=131;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00461951;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3377;QD=38.1615;RBI=0.0395998;REFB=0;REVB=-0.0393294;RO=0;SAF=62;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=9.83631e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000253259;OID=.;OPOS=130103709;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:131:131:0:0:131:131:69:62:0:0:69:62:0:0 chr3 130104062 . T C 1714.74 PASS AO=171;DP=171;FAO=180;FDP=180;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.023574;FXX=0.00552456;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.441;QD=38.1054;RBI=0.0263035;REFB=0;REVB=0.0116681;RO=0;SAF=91;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000163887;OID=.;OPOS=130104062;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:171:180:0:0:171:180:80:91:0:0:88:92:0:0 chr3 130104206 . A G 1269.12 PASS AO=158;DP=174;FAO=157;FDP=171;FR=.;FRO=14;FSAF=78;FSAR=79;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=-0.0673528;FXX=0.0172404;HRUN=5;LEN=1;MLLD=36.7915;QD=29.6871;RBI=0.0784766;REFB=-0.074788;REVB=-0.0402762;RO=10;SAF=81;SAR=77;SRF=1;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0466057;STB=0.517285;TYPE=snp;VARB=0.00386877;OID=.;OPOS=130104206;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:174:171:10:14:158:157:77:81:1:9:79:78:4:10 chr3 130107720 . A T 317.31 PASS AO=78;DP=167;FAO=78;FDP=164;FR=.;FRO=86;FSAF=44;FSAR=34;FSRF=32;FSRR=54;FWDB=0.0655273;FXX=0.017963;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.15;QD=7.73938;RBI=0.0683318;REFB=-0.00474218;REVB=0.0193753;RO=83;SAF=44;SAR=34;SRF=29;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19848;STB=0.599727;TYPE=snp;VARB=0.00606507;OID=.;OPOS=130107720;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:164:83:86:78:78:34:44:29:54:34:44:32:54 chr3 130110550 . A G 507.61 PASS AO=54;DP=55;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00271279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.799;QD=36.258;RBI=0.00726043;REFB=-0.0987257;REVB=-0.00673459;RO=1;SAF=22;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.020938;STB=0.511107;TYPE=snp;VARB=0.000279226;OID=.;OPOS=130110550;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:55:56:1:1:54:55:32:22:1:0:33:22:1:0 chr3 130116684 . G A 228.52 PASS AO=66;DP=161;FAO=66;FDP=160;FR=.;FRO=94;FSAF=22;FSAR=44;FSRF=39;FSRR=55;FWDB=-0.0125715;FXX=0.00621079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.773;QD=5.71288;RBI=0.0144544;REFB=-0.0119151;REVB=0.00713346;RO=94;SAF=22;SAR=44;SRF=39;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0924592;STB=0.55202;TYPE=snp;VARB=0.0146581;OID=.;OPOS=130116684;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:160:94:94:66:66:44:22:39:55:44:22:39:55 chr3 130129322 . G C 203.08 PASS AO=49;DP=106;FAO=49;FDP=103;FR=.;FRO=54;FSAF=34;FSAR=15;FSRF=30;FSRR=24;FWDB=0.00323419;FXX=0.0373797;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.334;QD=7.88661;RBI=0.0124199;REFB=0.00615524;REVB=0.0119914;RO=54;SAF=34;SAR=15;SRF=30;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143402;STB=0.580019;TYPE=snp;VARB=-0.00877981;OID=.;OPOS=130129322;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:103:54:54:49:49:15:34:30:24:15:34:30:24 chr3 130134563 . G A 99.15 PASS AO=30;DP=79;FAO=30;FDP=79;FR=.;FRO=49;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=0.0132571;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.272;QD=5.02029;RBI=0.0357717;REFB=-0.000953062;REVB=0.0332244;RO=49;SAF=21;SAR=9;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280526;STB=0.661307;TYPE=snp;VARB=0.0016947;OID=.;OPOS=130134563;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:49:49:30:30:9:21:22:27:9:21:22:27 chr3 130162395 . A G 304.05 PASS AO=58;DP=101;FAO=63;FDP=111;FR=.;FRO=48;FSAF=18;FSAR=45;FSRF=31;FSRR=17;FWDB=-0.0785186;FXX=0.0512777;HRUN=4;LEN=1;MLLD=62.1005;QD=10.9567;RBI=0.0977232;REFB=-0.0653744;REVB=-0.0581778;RO=43;SAF=18;SAR=40;SRF=30;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.30704;STB=0.663903;TYPE=snp;VARB=0.0349973;OID=.;OPOS=130162395;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:111:43:48:58:63:40:18:30:13:45:18:31:17 chr3 130174334 . G A 176.58 PASS AO=63;DP=179;FAO=63;FDP=179;FR=.;FRO=116;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=71;FSRR=45;FWDB=-0.0153088;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.567;QD=3.94599;RBI=0.0159165;REFB=-0.000552839;REVB=-0.00435614;RO=114;SAF=36;SAR=27;SRF=70;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0495808;STB=0.527085;TYPE=snp;VARB=0.000814549;OID=.;OPOS=130174334;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:179:114:116:63:63:27:36:70:44:27:36:71:45 chr3 130187817 . T C 319.4 PASS AO=94;DP=228;FAO=94;FDP=228;FR=.;FRO=134;FSAF=49;FSAR=45;FSRF=76;FSRR=58;FWDB=0.0329092;FXX=0.00436662;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.901;QD=5.60344;RBI=0.0417638;REFB=-0.0100662;REVB=0.0257137;RO=133;SAF=49;SAR=45;SRF=75;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.044864;STB=0.527074;TYPE=snp;VARB=0.0120018;OID=.;OPOS=130187817;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:228:228:133:134:94:94:45:49:75:58:45:49:76:58 chr3 130190716 . G A 97.27 PASS AO=25;DP=62;FAO=26;FDP=62;FR=.;FRO=36;FSAF=20;FSAR=6;FSRF=26;FSRR=10;FWDB=0.0262747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.427;QD=6.27573;RBI=0.0263715;REFB=-0.00906219;REVB=0.00225723;RO=36;SAF=19;SAR=6;SRF=26;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0516403;STB=0.536883;TYPE=snp;VARB=0.0114465;OID=.;OPOS=130190716;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:62:62:36:36:25:26:6:19:26:10:6:20:26:10 chr3 130282383 . C A 48.14 PASS AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.00309313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.145;QD=6.87698;RBI=0.0358782;REFB=-0.0303825;REVB=-0.0357446;RO=16;SAF=2;SAR=10;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.488622;STB=0.788951;TYPE=snp;VARB=0.0388065;OID=.;OPOS=130282383;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:28:28:16:16:12:12:10:2:10:6:10:2:10:6 chr3 130284284 . G A 327.96 PASS AO=59;DP=97;FAO=60;FDP=96;FR=.;FRO=36;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=-0.0379773;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.459;QD=13.6649;RBI=0.0493963;REFB=-0.0313583;REVB=0.0315868;RO=35;SAF=30;SAR=29;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113462;STB=0.552066;TYPE=snp;VARB=0.0157167;OID=.;OPOS=130284284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:96:35:36:59:60:29:30:12:23:30:30:13:23 chr3 130287194 . AGG AG,A 518.75 PASS AO=13,44;DP=72;FAO=9,69;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=1,5;FSAR=8,64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0438728,-0.0257957;FXX=0.0487745;HRUN=3,3;LEN=1,2;MLLD=11.9845,22.5175;QD=26.6027;RBI=0.0660621,0.0374979;REFB=0,0;REVB=-0.0493901,-0.0272153;RO=1;SAF=2,4;SAR=11,40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0.221239,0.221239;SSSB=0.0394551,0.0116043;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.0235169,0.0177568;OID=.,.;OPOS=130287195,130287195;OREF=G,GG;OALT=-,-;OMAPALT=AG,A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:13,44:61:9,69:78:0:1,5:8,64:0:0:5:1:2,4:11,40:0:1 chr3 130300650 . T C 397.13 PASS AO=78;DP=133;FAO=78;FDP=134;FR=.;FRO=56;FSAF=28;FSAR=50;FSRF=24;FSRR=32;FWDB=-0.015506;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8386;QD=11.8546;RBI=0.0272591;REFB=0.0145371;REVB=0.0224192;RO=55;SAF=28;SAR=50;SRF=24;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0626114;STB=0.531038;TYPE=snp;VARB=-0.00964143;OID=.;OPOS=130300650;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:134:55:56:78:78:50:28:24:31:50:28:24:32 chr3 130317283 . G A 218.21 PASS AO=53;DP=112;FAO=53;FDP=112;FR=.;FRO=59;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=29;FSRR=30;FWDB=-0.00780938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.703;QD=7.79306;RBI=0.0228335;REFB=-0.000385658;REVB=-0.0214565;RO=59;SAF=24;SAR=29;SRF=29;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0368601;STB=0.52048;TYPE=snp;VARB=0.00035144;OID=.;OPOS=130317283;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:59:59:53:53:29:24:29:30:29:24:29:30 chr3 130368069 . A G 726.67 PASS AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.025109;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.431;QD=38.2455;RBI=0.0301319;REFB=0;REVB=0.0166574;RO=0;SAF=22;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.87937e-05;OID=.;OPOS=130368069;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:77:76:0:0:76:76:54:22:0:0:54:22:0:0 chr3 130368337 . C T 68.34 PASS AO=12;DP=21;FAO=12;FDP=21;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.00492702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.7085;QD=13.0175;RBI=0.0242623;REFB=-0.00961631;REVB=-0.0237567;RO=9;SAF=3;SAR=9;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0791542;STB=0.545376;TYPE=snp;VARB=0.0215701;OID=.;OPOS=130368337;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:21:21:9:9:12:12:9:3:3:6:9:3:3:6 chr3 130395749 . A G 1347.54 PASS AO=142;DP=143;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0089493;FXX=0.00694396;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.545;QD=37.6934;RBI=0.0187332;REFB=-0.0556929;REVB=-0.0164573;RO=1;SAF=45;SAR=97;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00487734;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000109085;OID=.;OPOS=130395749;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:143:143:1:0:142:143:97:45:0:1:98:45:0:0 chr3 130449222 . A G 882.27 PASS AO=94;DP=94;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00442083;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.815;QD=37.9469;RBI=0.0127795;REFB=0;REVB=0.0119905;RO=0;SAF=15;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.41402e-05;OID=.;OPOS=130449222;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:94:93:0:0:94:93:79:15:0:0:78:15:0:0 chr3 130613634 . C G 401.83 PASS AO=93;DP=194;FAO=99;FDP=202;FR=.;FRO=103;FSAF=50;FSAR=49;FSRF=58;FSRR=45;FWDB=0.044868;FXX=0.00980344;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.0922;QD=7.95704;RBI=0.0793367;REFB=-0.00470538;REVB=-0.0654307;RO=101;SAF=48;SAR=45;SRF=58;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0550362;STB=0.529618;TYPE=snp;VARB=0.00579145;OID=.;OPOS=130613634;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:202:101:103:93:99:45:48:58:43:49:50:58:45 chr3 130734061 . C T 69.33 PASS AO=29;DP=98;FAO=29;FDP=98;FR=.;FRO=69;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=36;FSRR=33;FWDB=0.00212009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.163;QD=2.82981;RBI=0.0237837;REFB=-0.00565943;REVB=-0.023689;RO=67;SAF=13;SAR=16;SRF=36;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105277;STB=0.551688;TYPE=snp;VARB=0.0156962;OID=.;OPOS=130734061;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:98:98:67:69:29:29:16:13:36:31:16:13:36:33 chr3 130743812 . G A 256.34 PASS AO=76;DP=186;FAO=76;FDP=186;FR=.;FRO=110;FSAF=45;FSAR=31;FSRF=73;FSRR=37;FWDB=-6.43485e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.05;QD=5.51271;RBI=0.0249976;REFB=-0.00682031;REVB=-0.0249975;RO=108;SAF=45;SAR=31;SRF=73;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0929067;STB=0.544496;TYPE=snp;VARB=0.00804588;OID=.;OPOS=130743812;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:186:108:110:76:76:31:45:73:35:31:45:73:37 chr3 130852185 . T C 42.8 PASS AO=19;DP=71;FAO=19;FDP=70;FR=.;FRO=51;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=29;FWDB=0.0260528;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.94;QD=2.44597;RBI=0.0260648;REFB=-0.00572197;REVB=-0.000789846;RO=51;SAF=9;SAR=10;SRF=22;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0513311;STB=0.530981;TYPE=snp;VARB=0.0179105;OID=.;OPOS=130852185;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:71:70:51:51:19:19:10:9:22:29:10:9:22:29 chr3 130947435 . A T 303.58 PASS AO=85;DP=200;FAO=85;FDP=199;FR=.;FRO=114;FSAF=32;FSAR=53;FSRF=40;FSRR=74;FWDB=0.0282906;FXX=0.00994975;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.514;QD=6.10202;RBI=0.0335862;REFB=-0.0160606;REVB=-0.0181018;RO=113;SAF=32;SAR=53;SRF=40;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.024692;STB=0.515732;TYPE=snp;VARB=0.0208634;OID=.;OPOS=130947435;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:200:199:113:114:85:85:53:32:40:73:53:32:40:74 chr3 131136797 . T C 1888.26 PASS AO=196;DP=196;FAO=197;FDP=197;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0459751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.202;QD=38.3403;RBI=0.0496775;REFB=0;REVB=0.0188186;RO=0;SAF=87;SAR=109;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46257e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.38794e-05;OID=.;OPOS=131136797;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:89:196:197:0:0:196:197:109:87:0:0:110:87:0:0 chr3 131947937 . A G 389.91 PASS AO=98;DP=209;FAO=98;FDP=209;FR=.;FRO=111;FSAF=46;FSAR=52;FSRF=62;FSRR=49;FWDB=-0.0208059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5329;QD=7.46247;RBI=0.0210382;REFB=-0.0100646;REVB=-0.00311788;RO=108;SAF=46;SAR=52;SRF=61;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0904592;STB=0.547252;TYPE=snp;VARB=0.01323;OID=.;OPOS=131947937;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:209:108:111:98:98:52:46:61:47:52:46:62:49 chr3 132068831 . C T 229.98 PASS AO=69;DP=176;FAO=70;FDP=175;FR=.;FRO=105;FSAF=31;FSAR=39;FSRF=56;FSRR=49;FWDB=-0.0152432;FXX=0.0056815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.385;QD=5.25676;RBI=0.0165769;REFB=-0.00228654;REVB=0.00651454;RO=103;SAF=31;SAR=38;SRF=56;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100395;STB=0.554306;TYPE=snp;VARB=0.00454401;OID=.;OPOS=132068831;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:175:103:105:69:70:38:31:56:47:39:31:56:49 chr3 132075554 . T C 338.49 PASS AO=73;DP=137;FAO=73;FDP=137;FR=.;FRO=64;FSAF=25;FSAR=48;FSRF=35;FSRR=29;FWDB=0.000381193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.209;QD=9.88305;RBI=0.0170621;REFB=-0.00252563;REVB=-0.0170579;RO=64;SAF=25;SAR=48;SRF=35;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180871;STB=0.599348;TYPE=snp;VARB=0.00251245;OID=.;OPOS=132075554;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:64:64:73:73:48:25:35:29:48:25:35:29 chr3 132075707 . A G 52.82 PASS AO=16;DP=45;FAO=16;FDP=45;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=23;FWDB=0.00679801;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9393;QD=4.69517;RBI=0.0606359;REFB=-0.0110883;REVB=-0.0602536;RO=29;SAF=5;SAR=11;SRF=6;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144883;STB=0.584096;TYPE=snp;VARB=0.0224565;OID=.;OPOS=132075707;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:45:45:29:29:16:16:11:5:6:23:11:5:6:23 chr3 132166266 . T G 48.33 PASS AO=24;DP=94;FAO=24;FDP=94;FR=.;FRO=70;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=60;FWDB=-0.0450639;FXX=0.0408122;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.0413;QD=2.0565;RBI=0.0500739;REFB=-0.0146872;REVB=-0.0218323;RO=69;SAF=7;SAR=17;SRF=9;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.282696;STB=0.650864;TYPE=snp;VARB=0.0472721;OID=.;OPOS=132166266;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:94:94:69:70:24:24:17:7:9:60:17:7:10:60 chr3 132186187 . G A 182.18 PASS AO=43;DP=90;FAO=43;FDP=90;FR=.;FRO=47;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=20;FSRR=27;FWDB=-0.00137146;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.65;QD=8.09708;RBI=0.0186565;REFB=0.00858122;REVB=0.018606;RO=47;SAF=19;SAR=24;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0155541;STB=0.508657;TYPE=snp;VARB=-0.00578105;OID=.;OPOS=132186187;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:47:47:43:43:24:19:20:27:24:19:20:27 chr3 132218623 . G T 549.35 PASS AO=121;DP=225;FAO=120;FDP=225;FR=.;FRO=105;FSAF=67;FSAR=53;FSRF=63;FSRR=42;FWDB=-0.00356754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.298;QD=9.76625;RBI=0.00403121;REFB=-0.0192253;REVB=-0.00187704;RO=103;SAF=68;SAR=53;SRF=61;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0259986;STB=0.519801;TYPE=snp;VARB=0.0177667;OID=.;OPOS=132218623;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:225:225:103:105:121:120:53:68:61:42:53:67:63:42 chr3 132226100 . A G 484.96 PASS AO=128;DP=282;FAO=128;FDP=282;FR=.;FRO=154;FSAF=50;FSAR=78;FSRF=69;FSRR=85;FWDB=0.0053361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.5285;QD=6.87889;RBI=0.0414791;REFB=0.000290296;REVB=0.0411345;RO=154;SAF=50;SAR=78;SRF=69;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0586276;STB=0.532464;TYPE=snp;VARB=-4.204e-05;OID=.;OPOS=132226100;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:282:282:154:154:128:128:78:50:69:85:78:50:69:85 chr3 132257419 . A G 189.63 PASS AO=59;DP=153;FAO=59;FDP=152;FR=.;FRO=93;FSAF=22;FSAR=37;FSRF=26;FSRR=67;FWDB=0.00725363;FXX=0.00653552;HRUN=4;LEN=1;MLLD=263.862;QD=4.99028;RBI=0.00725406;REFB=-0.00054394;REVB=7.91773e-05;RO=92;SAF=22;SAR=37;SRF=26;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107812;STB=0.562972;TYPE=snp;VARB=0.00102395;OID=.;OPOS=132257419;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:152:92:93:59:59:37:22:26:66:37:22:26:67 chr3 132277866 . G A 326.36 PASS AO=81;DP=178;FAO=83;FDP=180;FR=.;FRO=97;FSAF=42;FSAR=41;FSRF=42;FSRR=55;FWDB=-0.0101126;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.7167;QD=7.25251;RBI=0.0181233;REFB=-0.00913405;REVB=-0.0150395;RO=97;SAF=40;SAR=41;SRF=42;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0598248;STB=0.539316;TYPE=snp;VARB=0.0119862;OID=.;OPOS=132277866;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:180:97:97:81:83:41:40:42:55:41:42:42:55 chr3 132338346 . T G 142.84 PASS AO=42;DP=104;FAO=42;FDP=105;FR=.;FRO=63;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=25;FSRR=38;FWDB=0.0322471;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.01;QD=5.44161;RBI=0.0332825;REFB=-0.0104491;REVB=-0.00823718;RO=61;SAF=16;SAR=26;SRF=24;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0138119;STB=0.510043;TYPE=snp;VARB=0.0127165;OID=.;OPOS=132338346;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:105:61:63:42:42:26:16:24:37:26:16:25:38 chr3 132360883 . C T 2372.23 PASS AO=248;DP=250;FAO=248;FDP=248;FR=.;FRO=0;FSAF=110;FSAR=138;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0109838;FXX=0.00799968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.315;QD=38.2618;RBI=0.0110796;REFB=-0.0328117;REVB=-0.00145447;RO=0;SAF=110;SAR=138;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.58903e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.03191e-05;OID=.;OPOS=132360883;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:250:248:0:0:248:248:138:110:0:0:138:110:0:0 chr3 132436901 . ATT AT,A 200.66 PASS AO=30,9;DP=52;FAO=45,2;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=26,2;FSAR=19,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0418667,-0.0213797;FXX=0.040808;HRUN=8,8;LEN=1,2;MLLD=7.76307,9.09097;QD=17.0778;RBI=0.214039,0.111298;REFB=0,0;REVB=-0.209904,-0.109226;RO=4;SAF=19,4;SAR=11,5;SRF=3;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0276579,-0.162954;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=-0.0117043,-0.0457899;OID=.,.;OPOS=132436902,132436902;OREF=T,TT;OALT=-,-;OMAPALT=AT,A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:30,9:48:45,2:47:0:26,2:19,0:0:0:12:4:19,4:11,5:3:1 chr3 132436967 . A G 176.2 PASS AO=34;DP=60;FAO=34;FDP=60;FR=.;FRO=26;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.0894293;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.0662;QD=11.7469;RBI=0.089503;REFB=-0.000565714;REVB=-0.00363286;RO=23;SAF=22;SAR=12;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129633;STB=0.59994;TYPE=snp;VARB=-0.000939406;OID=.;OPOS=132436967;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:23:26:34:34:12:22:11:12:12:22:11:15 chr3 133114893 . C T 769.08 PASS AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0017534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.208;QD=37.9794;RBI=0.00732437;REFB=0;REVB=0.0071114;RO=0;SAF=65;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.00557e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.95971e-05;OID=.;OPOS=133114893;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:81:81:0:0:81:81:16:65:0:0:16:65:0:0 chr3 133167363 . G A 146.1 PASS AO=39;DP=91;FAO=39;FDP=91;FR=.;FRO=52;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=37;FSRR=15;FWDB=-0.0385045;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.7258;QD=6.42202;RBI=0.0423074;REFB=-0.0130945;REVB=-0.0175304;RO=52;SAF=21;SAR=18;SRF=37;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180455;STB=0.600987;TYPE=snp;VARB=0.0292394;OID=.;OPOS=133167363;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:52:52:39:39:18:21:37:15:18:21:37:15 chr3 133191385 . C A 59.3 PASS AO=12;DP=23;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=10;FWDB=0.0508421;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=75.9942;QD=10.3127;RBI=0.0591387;REFB=-0.028521;REVB=-0.0302072;RO=11;SAF=2;SAR=10;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125863;STB=0.571321;TYPE=snp;VARB=0.0389082;OID=.;OPOS=133191385;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:23:23:11:11:12:12:10:2:1:10:10:2:1:10 chr3 133308436 . T C 129.3 PASS AO=36;DP=85;FAO=36;FDP=87;FR=.;FRO=51;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=28;FWDB=0.00709398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.887;QD=5.94467;RBI=0.01224;REFB=-0.00427507;REVB=0.00997468;RO=48;SAF=14;SAR=22;SRF=20;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0293526;STB=0.537627;TYPE=snp;VARB=0.00662394;OID=.;OPOS=133308436;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:87:48:51:36:36:22:14:20:28:22:14:23:28 chr3 133485133 . A G 1746.22 PASS AO=184;DP=186;FAO=184;FDP=184;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00888515;FXX=0.0107521;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.6128;QD=37.9612;RBI=0.0239828;REFB=-0.0752696;REVB=0.0222762;RO=0;SAF=95;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000215317;OID=.;OPOS=133485133;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:186:184:0:0:184:184:89:95:0:0:89:95:0:0 chr3 133494354 . C T 949.64 PASS AO=102;DP=104;FAO=103;FDP=105;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=66;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0363391;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.4692;QD=36.1768;RBI=0.0366032;REFB=-0.0941736;REVB=-0.00438921;RO=2;SAF=37;SAR=65;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0249518;STB=0.513155;TYPE=snp;VARB=0.00275775;OID=.;OPOS=133494354;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:104:105:2:2:102:103:65:37:2:0:66:37:2:0 chr3 133524717 . G C 901.73 PASS AO=97;DP=99;FAO=97;FDP=99;FR=.;FRO=2;FSAF=64;FSAR=33;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0174374;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=75.0593;QD=36.4336;RBI=0.0475862;REFB=-0.00313718;REVB=-0.0442762;RO=1;SAF=64;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00735372;STB=0.507691;TYPE=snp;VARB=-0.000246846;OID=.;OPOS=133524717;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:99:99:1:2:97:97:33:64:1:0:33:64:2:0 chr3 134075065 . T C 234.55 PASS AO=78;DP=207;FAO=78;FDP=209;FR=.;FRO=131;FSAF=36;FSAR=42;FSRF=92;FSRR=39;FWDB=-0.0453253;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.8172;QD=4.48891;RBI=0.045329;REFB=-0.0066368;REVB=-0.000578283;RO=123;SAF=36;SAR=42;SRF=86;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.255527;STB=0.6483;TYPE=snp;VARB=0.00691301;OID=.;OPOS=134075065;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:209:123:131:78:78:42:36:86:37:42:36:92:39 chr3 134075522 . A G 524.04 PASS AO=125;DP=253;FAO=125;FDP=253;FR=.;FRO=128;FSAF=43;FSAR=82;FSRF=66;FSRR=62;FWDB=0.00622528;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=134.615;QD=8.2852;RBI=0.0275908;REFB=0.00352573;REVB=-0.0268793;RO=128;SAF=43;SAR=82;SRF=66;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164839;STB=0.590732;TYPE=snp;VARB=-0.00332956;OID=.;OPOS=134075522;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:253:253:128:128:125:125:82:43:66:62:82:43:66:62 chr3 134077470 . C G 125.81 PASS AO=39;DP=99;FAO=39;FDP=100;FR=.;FRO=61;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=24;FSRR=37;FWDB=-0.0511523;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=182.896;QD=5.03243;RBI=0.051224;REFB=-0.00414496;REVB=0.0027088;RO=60;SAF=16;SAR=23;SRF=24;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0113355;STB=0.510633;TYPE=snp;VARB=0.00522268;OID=.;OPOS=134077470;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:100:60:61:39:39:23:16:24:36:23:16:24:37 chr3 134278270 . C T 543.18 PASS AO=56;DP=56;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00384403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.99;QD=38.1176;RBI=0.0119591;REFB=0;REVB=0.0113245;RO=0;SAF=17;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.87981e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.63027e-05;OID=.;OPOS=134278270;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:56:57:0:0:56:57:39:17:0:0:39:18:0:0 chr3 134280395 . T A 2110.02 PASS AO=216;DP=216;FAO=219;FDP=219;FR=.;FRO=0;FSAF=120;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00559389;FXX=0.00454525;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.546;QD=38.5391;RBI=0.00566212;REFB=0;REVB=0.000876343;RO=0;SAF=120;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.21715e-05;OID=.;OPOS=134280395;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:216:219:0:0:216:219:96:120:0:0:99:120:0:0 chr3 134322163 . C A 826.66 PASS AO=81;DP=81;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0284431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.563;QD=38.0075;RBI=0.031098;REFB=0;REVB=0.0125729;RO=0;SAF=34;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.25769e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000314008;OID=.;OPOS=134322163;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:81:87:0:0:81:87:47:34:0:0:53:34:0:0 chr3 134322742 . A G 447.29 PASS AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0170892;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.6918;QD=38.0673;RBI=0.0417932;REFB=0;REVB=-0.0381396;RO=0;SAF=12;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.04037e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000512183;OID=.;OPOS=134322742;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:47:47:0:0:47:47:35:12:0:0:35:12:0:0 chr3 134323156 . A G 776.36 PASS AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135782;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=85.7083;QD=37.8714;RBI=0.078828;REFB=0;REVB=-0.0776498;RO=0;SAF=37;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000333985;OID=.;OPOS=134323156;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:82:82:0:0:82:82:45:37:0:0:45:37:0:0 chr3 134670524 . C T 1702.04 PASS AO=177;DP=178;FAO=178;FDP=178;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017642;FXX=0.00558628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.548;QD=38.2481;RBI=0.0552644;REFB=0;REVB=0.0523728;RO=0;SAF=103;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.1985e-05;OID=.;OPOS=134670524;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:178:178:0:0:177:178:74:103:0:0:74:104:0:0 chr3 134885770 . CT C 21.46 PASS AO=12;DP=55;FAO=15;FDP=45;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=23;FSRR=7;FWDB=-0.0151509;FXX=0.09998;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.017;QD=1.90716;RBI=0.0721255;REFB=-0.142154;REVB=-0.0705163;RO=28;SAF=4;SAR=8;SRF=22;SRR=6;SSEN=0.444444;SSEP=0;SSSB=-0.487994;STB=0.659387;TYPE=del;VARB=0.14969;OID=.;OPOS=134885771;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:12:48:15:45:30:8:7:23:7:21:28:4:8:22:6 chr3 134898742 . C T 603.98 PASS AO=147;DP=306;FAO=149;FDP=310;FR=.;FRO=161;FSAF=77;FSAR=72;FSRF=74;FSRR=87;FWDB=-0.00207066;FXX=0.00641005;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.646;QD=7.79333;RBI=0.00510584;REFB=-0.0175799;REVB=-0.00466711;RO=157;SAF=76;SAR=71;SRF=71;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0607926;STB=0.529652;TYPE=snp;VARB=0.0178065;OID=.;OPOS=134898742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:306:310:157:161:147:149:71:76:71:86:72:77:74:87 chr3 135720851 . G T 344.69 PASS AO=90;DP=211;FAO=91;FDP=204;FR=.;FRO=113;FSAF=43;FSAR=48;FSRF=65;FSRR=48;FWDB=-0.019728;FXX=0.0422515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.667;QD=6.75869;RBI=0.0211974;REFB=-0.00160524;REVB=0.00775466;RO=92;SAF=42;SAR=48;SRF=52;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0903216;STB=0.556689;TYPE=snp;VARB=0.00205983;OID=.;OPOS=135720851;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:204:92:113:90:91:48:42:52:40:48:43:65:48 chr3 136573440 . A G 438.56 PASS AO=104;DP=210;FAO=104;FDP=211;FR=.;FRO=107;FSAF=49;FSAR=55;FSRF=58;FSRR=49;FWDB=-0.111456;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.87;QD=8.31395;RBI=0.111745;REFB=-0.0309939;REVB=-0.0080348;RO=106;SAF=48;SAR=56;SRF=58;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0785606;STB=0.535919;TYPE=snp;VARB=0.0318237;OID=.;OPOS=136573440;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:210:211:106:107:104:104:56:48:58:48:55:49:58:49 chr3 136574501 . A G 495.77 PASS AO=143;DP=325;FAO=140;FDP=323;FR=.;FRO=183;FSAF=78;FSAR=62;FSRF=100;FSRR=83;FWDB=0.0506295;FXX=0.00615366;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.5391;QD=6.13952;RBI=0.0522526;REFB=-0.0352559;REVB=-0.0129224;RO=181;SAF=79;SAR=64;SRF=99;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00558605;STB=0.50613;TYPE=snp;VARB=0.0506077;OID=.;OPOS=136574501;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:325:323:181:183:143:140:64:79:99:82:62:78:100:83 chr3 136574578 . T TTAA 244.01 PASS AO=77;DP=238;FAO=81;FDP=214;FR=.;FRO=133;FSAF=39;FSAR=42;FSRF=69;FSRR=64;FWDB=0.000745786;FXX=0.0403569;HRUN=2;LEN=3;MLLD=234.528;QD=4.56085;RBI=0.000808084;REFB=-0.00800984;REVB=-0.000311132;RO=153;SAF=38;SAR=39;SRF=82;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0492411;STB=0.523178;TYPE=ins;VARB=0.0137107;OID=.;OPOS=136574579;OREF=-;OALT=TAA;OMAPALT=TTAA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:77:238:81:214:133:39:42:69:64:99:153:38:39:82:71 chr3 136649463 . C T 380.51 PASS AO=77;DP=139;FAO=78;FDP=140;FR=.;FRO=62;FSAF=39;FSAR=39;FSRF=32;FSRR=30;FWDB=-0.0107824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.555;QD=10.8717;RBI=0.0126735;REFB=-0.00218276;REVB=-0.00666017;RO=61;SAF=39;SAR=38;SRF=32;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.014656;STB=0.507141;TYPE=snp;VARB=0.00310261;OID=.;OPOS=136649463;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:140:61:62:77:78:38:39:32:29:39:39:32:30 chr3 137787047 . C T 70.44 PASS AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=4;FWDB=0.0107734;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.625;QD=7.2245;RBI=0.0107735;REFB=-0.0208646;REVB=5.54995e-05;RO=22;SAF=5;SAR=12;SRF=18;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.48472;STB=0.774989;TYPE=snp;VARB=0.019477;OID=.;OPOS=137787047;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:39:39:22:22:17:17:12:5:18:4:12:5:18:4 chr3 137787192 . T C 92.9 PASS AO=25;DP=61;FAO=25;FDP=61;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=0.00516706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.4282;QD=6.0916;RBI=0.00971964;REFB=-0.0309038;REVB=0.00823243;RO=36;SAF=8;SAR=17;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.249908;STB=0.643126;TYPE=snp;VARB=0.0669197;OID=.;OPOS=137787192;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:61:61:36:36:25:25:17:8:20:16:17:8:20:16 chr3 137787963 . T G 208.98 PASS AO=65;DP=179;FAO=68;FDP=180;FR=.;FRO=112;FSAF=23;FSAR=45;FSRF=51;FSRR=61;FWDB=0.00170788;FXX=0.0163925;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.23;QD=4.64409;RBI=0.0020191;REFB=-0.00433628;REVB=0.00107698;RO=113;SAF=23;SAR=42;SRF=52;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12412;STB=0.5773;TYPE=snp;VARB=0.00648277;OID=.;OPOS=137787963;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:180:113:112:65:68:42:23:52:61:45:23:51:61 chr3 137880295 . T C 51.4 PASS AO=19;DP=65;FAO=19;FDP=63;FR=.;FRO=44;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=34;FWDB=-0.0128578;FXX=0.0307645;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.266;QD=3.26372;RBI=0.0155209;REFB=-0.0114705;REVB=0.00869347;RO=43;SAF=7;SAR=12;SRF=10;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182458;STB=0.612061;TYPE=snp;VARB=0.0160929;OID=.;OPOS=137880295;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:65:63:43:44:19:19:12:7:10:33:12:7:10:34 chr3 138033181 . C T 73.09 PASS AO=23;DP=57;FAO=21;FDP=55;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=27;FSRR=7;FWDB=0.0284351;FXX=0.0350816;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.145;QD=5.31556;RBI=0.113019;REFB=-0.0130515;REVB=-0.109383;RO=33;SAF=15;SAR=8;SRF=26;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164408;STB=0.594121;TYPE=snp;VARB=0.0177342;OID=.;OPOS=138033181;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:57:55:33:34:23:21:8:15:26:7:7:14:27:7 chr3 138187568 . C T 775.78 PASS AO=202;DP=434;FAO=192;FDP=400;FR=.;FRO=208;FSAF=95;FSAR=97;FSRF=99;FSRR=109;FWDB=0.0468772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.613;QD=7.75782;RBI=0.0473309;REFB=-0.0248585;REVB=-0.00653803;RO=231;SAF=102;SAR=100;SRF=113;SRR=118;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0152776;STB=0.509794;TYPE=snp;VARB=0.0286356;OID=.;OPOS=138187568;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:434:400:231:208:202:192:100:102:113:118:97:95:99:109 chr3 138191232 . G A 96.37 PASS AO=27;DP=67;FAO=27;FDP=67;FR=.;FRO=40;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=27;FSRR=13;FWDB=0.00767814;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=251.06;QD=5.75349;RBI=0.00769;REFB=-0.0139486;REVB=0.000426796;RO=40;SAF=20;SAR=7;SRF=27;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0848235;STB=0.548659;TYPE=snp;VARB=0.0176739;OID=.;OPOS=138191232;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:67:67:40:40:27:27:7:20:27:13:7:20:27:13 chr3 138213849 . ATTTGT A 68.05 PASS AO=45;DP=160;FAO=47;FDP=143;FR=.;FRO=96;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=52;FSRR=44;FWDB=-0.00217408;FXX=0.111794;HRUN=3;LEN=5;MLLD=174.857;QD=1.90343;RBI=0.0180265;REFB=-0.00206053;REVB=-0.017895;RO=85;SAF=26;SAR=19;SRF=44;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0691836;STB=0.507809;TYPE=del;VARB=0.00401388;OID=.;OPOS=138213850;OREF=TTTGT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:45:158:47:143:96:26:21:52:44:68:85:26:19:44:41 chr3 138244400 . C T 637.78 PASS AO=278;DP=606;FAO=176;FDP=400;FR=.;FRO=224;FSAF=74;FSAR=102;FSRF=99;FSRR=125;FWDB=-0.0336598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.7136;QD=6.37782;RBI=0.0352187;REFB=-0.0305784;REVB=-0.0103621;RO=324;SAF=122;SAR=156;SRF=150;SRR=174;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0238425;STB=0.512308;TYPE=snp;VARB=0.0387619;OID=.;OPOS=138244400;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:606:400:324:224:278:176:156:122:150:174:102:74:99:125 chr3 138289163 . T C 291.91 PASS AO=83;DP=203;FAO=84;FDP=201;FR=.;FRO=117;FSAF=66;FSAR=18;FSRF=74;FSRR=43;FWDB=-0.0122405;FXX=0.0147052;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.382;QD=5.80924;RBI=0.0646703;REFB=-0.0160813;REVB=0.0635013;RO=108;SAF=66;SAR=17;SRF=71;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186304;STB=0.615002;TYPE=snp;VARB=0.0161031;OID=.;OPOS=138289163;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:201:108:117:83:84:17:66:71:37:18:66:74:43 chr3 138289221 . C T 406.05 PASS AO=111;DP=254;FAO=114;FDP=262;FR=.;FRO=148;FSAF=64;FSAR=50;FSRF=85;FSRR=63;FWDB=0.0231165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.3939;QD=6.19921;RBI=0.0231666;REFB=-0.0385289;REVB=0.00152293;RO=141;SAF=60;SAR=51;SRF=80;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0272948;STB=0.507423;TYPE=snp;VARB=0.0628942;OID=.;OPOS=138289221;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:254:262:141:148:111:114:51:60:80:61:50:64:85:63 chr3 138329862 . G A 414.4 PASS AO=92;DP=176;FAO=92;FDP=176;FR=.;FRO=84;FSAF=43;FSAR=49;FSRF=33;FSRR=51;FWDB=0.00177067;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.518;QD=9.41812;RBI=0.0147301;REFB=-0.0188241;REVB=0.0146233;RO=84;SAF=43;SAR=49;SRF=33;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0655622;STB=0.535885;TYPE=snp;VARB=0.0191693;OID=.;OPOS=138329862;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:176:84:84:92:92:49:43:33:51:49:43:33:51 chr3 138663138 . C CA 31.02 PASS AO=12;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0792288;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=11.1992;QD=6.89388;RBI=0.119529;REFB=-0.159038;REVB=0.089498;RO=5;SAF=3;SAR=9;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212555;STB=0.571292;TYPE=ins;VARB=0.162105;OID=.;OPOS=138663139;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:12:18:11:18:7:3:8:3:4:17:5:3:9:3:2 chr3 138665796 . C T 73.8 PASS AO=11;DP=15;FAO=11;FDP=15;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.1952;QD=19.6797;RBI=0.0111974;REFB=-0.00945611;REVB=0.0111974;RO=4;SAF=0;SAR=11;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00358245;OID=.;OPOS=138665796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:15:15:4:4:11:11:11:0:0:4:11:0:0:4 chr3 138724757 . C G 54.1 PASS AO=12;DP=29;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=-0.0644719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.13;QD=7.21325;RBI=0.0722733;REFB=-0.0291726;REVB=0.0326619;RO=17;SAF=5;SAR=7;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129894;STB=0.555473;TYPE=snp;VARB=0.0338667;OID=.;OPOS=138724757;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:29:30:17:17:12:13:7:5:5:12:8:5:5:12 chr3 138762707 . C G 72.51 PASS AO=26;DP=88;FAO=28;FDP=89;FR=.;FRO=61;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=35;FSRR=26;FWDB=-0.0301821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.4648;QD=3.25872;RBI=0.0425641;REFB=0.0013063;REVB=-0.0300124;RO=57;SAF=15;SAR=11;SRF=33;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00242238;STB=0.526297;TYPE=snp;VARB=-0.00688802;OID=.;OPOS=138762707;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:88:89:57:61:26:28:11:15:33:24:13:15:35:26 chr3 138763634 . TGCT T,TG 326.72 PASS AO=24,9;DP=38;FAO=31,4;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=25,2;FSAR=6,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0159259,-0.0159066;FXX=0.0789266;HRUN=1,1;LEN=3,2;MLLD=236.959,231.28;QD=37.3392;RBI=0.0761333,0.0846278;REFB=0,0;REVB=0.0744489,0.0831194;RO=0;SAF=18,7;SAR=6,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.00448242,-0.082854;OID=.,.;OPOS=138763634,138763636;OREF=TGC,CT;OALT=-,-;OMAPALT=T,TG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:24,9:33:31,4:35:0:25,2:6,2:0:0:7:0:18,7:6,2:0:0 chr3 139080073 . TG T 926.28 PASS AO=128;DP=161;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.122869;FXX=0.00653552;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.3797;QD=24.3759;RBI=0.133231;REFB=0.0902084;REVB=-0.0515157;RO=6;SAF=60;SAR=68;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0.283563;SSSB=0.025815;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00682602;OID=.;OPOS=139080074;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:128:152:152:152:0:69:83:0:0:76:6:60:68:1:5 chr3 139102120 . C A 1544.43 PASS AO=156;DP=156;FAO=160;FDP=160;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.528;QD=38.6107;RBI=0.0316874;REFB=0;REVB=0.0217095;RO=0;SAF=58;SAR=98;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.7117e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.78346e-05;OID=.;OPOS=139102120;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:156:160:0:0:156:160:98:58:0:0:102:58:0:0 chr3 139107130 . G A 200.62 PASS AO=54;DP=124;FAO=54;FDP=124;FR=.;FRO=70;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=42;FSRR=28;FWDB=-0.00645944;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.619;QD=6.47146;RBI=0.0519861;REFB=-0.0139841;REVB=0.0515832;RO=70;SAF=28;SAR=26;SRF=42;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.082678;STB=0.546202;TYPE=snp;VARB=0.0179483;OID=.;OPOS=139107130;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:70:70:54:54:26:28:42:28:26:28:42:28 chr3 139107139 . T C 195.06 PASS AO=54;DP=127;FAO=54;FDP=127;FR=.;FRO=73;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=45;FSRR=28;FWDB=-0.022582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.6423;QD=6.14355;RBI=0.0263916;REFB=0.00731265;REVB=-0.013659;RO=72;SAF=28;SAR=26;SRF=44;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0950437;STB=0.556578;TYPE=snp;VARB=-0.0113954;OID=.;OPOS=139107139;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:72:73:54:54:26:28:44:28:26:28:45:28 chr3 139257603 . A G 263.29 PASS AO=53;DP=89;FAO=52;FDP=91;FR=.;FRO=39;FSAF=34;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=29;FWDB=0.0127616;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.8375;QD=11.5729;RBI=0.0178235;REFB=-0.0163484;REVB=-0.0124426;RO=35;SAF=35;SAR=18;SRF=10;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275082;STB=0.668555;TYPE=snp;VARB=0.00423248;OID=.;OPOS=139257603;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:91:35:39:53:52:18:35:10:25:18:34:10:29 chr3 139258411 . G A 47.9 PASS AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.0597615;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.4965;QD=11.2713;RBI=0.0723871;REFB=0.000584437;REVB=0.0408468;RO=8;SAF=4;SAR=5;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243059;STB=0.640727;TYPE=snp;VARB=0.00417218;OID=.;OPOS=139258411;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:17:17:8:8:9:9:5:4:6:2:5:4:6:2 chr3 139303248 . G A 306.08 PASS AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00153746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.593;QD=37.1002;RBI=0.0470738;REFB=0;REVB=0.0470487;RO=0;SAF=10;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000160318;OID=.;OPOS=139303248;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:33:33:0:0:33:33:23:10:0:0:23:10:0:0 chr3 139318241 . A T 297.29 PASS AO=67;DP=139;FAO=72;FDP=143;FR=.;FRO=71;FSAF=23;FSAR=49;FSRF=27;FSRR=44;FWDB=0.0189597;FXX=0.00694396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.786;QD=8.31571;RBI=0.0192268;REFB=-0.0054636;REVB=0.00319384;RO=66;SAF=20;SAR=47;SRF=26;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.097801;STB=0.533876;TYPE=snp;VARB=0.00744371;OID=.;OPOS=139318241;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:143:66:71:67:72:47:20:26:40:49:23:27:44 chr3 139328739 . C T 691.08 PASS AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00648122;FXX=0.0649266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.0931;QD=38.3936;RBI=0.0558353;REFB=0;REVB=0.0554579;RO=0;SAF=24;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00050835;OID=.;OPOS=139328739;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:73:72:0:0:72:72:48:24:0:0:48:24:0:0 chr3 140167536 . A G 1500.57 PASS AO=166;DP=173;FAO=169;FDP=177;FR=.;FRO=8;FSAF=79;FSAR=90;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=-0.00679361;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=269.871;QD=33.9111;RBI=0.0203462;REFB=-0.0481737;REVB=-0.0191785;RO=7;SAF=79;SAR=87;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0257079;STB=0.515574;TYPE=snp;VARB=0.000419654;OID=.;OPOS=140167536;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:173:177:7:8:166:169:87:79:1:6:90:79:1:7 chr3 140281723 . C T 292.95 PASS AO=63;DP=119;FAO=63;FDP=119;FR=.;FRO=56;FSAF=40;FSAR=23;FSRF=29;FSRR=27;FWDB=0.015539;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=217.505;QD=9.84696;RBI=0.0248364;REFB=0.0114211;REVB=0.0193749;RO=55;SAF=40;SAR=23;SRF=28;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111225;STB=0.55755;TYPE=snp;VARB=-0.00909412;OID=.;OPOS=140281723;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:55:56:63:63:23:40:28:27:23:40:29:27 chr3 140282861 . C T 441.25 PASS AO=150;DP=403;FAO=150;FDP=400;FR=.;FRO=250;FSAF=121;FSAR=29;FSRF=235;FSRR=15;FWDB=-0.0064014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.895;QD=4.41254;RBI=0.0276352;REFB=-0.00581057;REVB=0.0268836;RO=253;SAF=121;SAR=29;SRF=237;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.284433;STB=0.659749;TYPE=snp;VARB=0.00591005;OID=.;OPOS=140282861;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:403:400:253:250:150:150:29:121:237:16:29:121:235:15 chr3 140285504 . T C 271.21 PASS AO=51;DP=88;FAO=52;FDP=89;FR=.;FRO=37;FSAF=19;FSAR=33;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=0.0404727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.939;QD=12.1891;RBI=0.0406566;REFB=0.00932074;REVB=0.0038624;RO=37;SAF=19;SAR=32;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0267854;STB=0.51776;TYPE=snp;VARB=-0.00675844;OID=.;OPOS=140285504;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:89:37:37:51:52:32:19:15:22:33:19:15:22 chr3 140401693 . A G 291.61 PASS AO=35;DP=39;FAO=35;FDP=39;FR=.;FRO=4;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.0442379;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.1518;QD=29.9089;RBI=0.0506426;REFB=-0.0595489;REVB=-0.0246513;RO=4;SAF=16;SAR=19;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0888448;STB=0.547592;TYPE=snp;VARB=0.0156309;OID=.;OPOS=140401693;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:39:39:4:4:35:35:19:16:0:4:19:16:0:4 chr3 140406947 . G A 96.22 PASS AO=26;DP=63;FAO=26;FDP=63;FR=.;FRO=37;FSAF=5;FSAR=21;FSRF=11;FSRR=26;FWDB=-0.044166;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.203;QD=6.10951;RBI=0.0450094;REFB=0.000728786;REVB=0.0086723;RO=37;SAF=5;SAR=21;SRF=11;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153369;STB=0.588367;TYPE=snp;VARB=-0.00156372;OID=.;OPOS=140406947;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:63:63:37:37:26:26:21:5:11:26:21:5:11:26 chr3 140407260 . C A 101.3 PASS AO=21;DP=41;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=4;FSRR=16;FWDB=0.121047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.306;QD=9.88334;RBI=0.121055;REFB=-0.00548145;REVB=0.00139822;RO=20;SAF=5;SAR=16;SRF=4;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0468796;STB=0.526291;TYPE=snp;VARB=0.00864107;OID=.;OPOS=140407260;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:41:41:20:20:21:21:16:5:4:16:16:5:4:16 chr3 140697301 . T C 302.52 PASS AO=80;DP=178;FAO=80;FDP=179;FR=.;FRO=99;FSAF=21;FSAR=59;FSRF=18;FSRR=81;FWDB=0.0251865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.1308;QD=6.76023;RBI=0.0252453;REFB=-0.0180598;REVB=0.0017214;RO=98;SAF=21;SAR=59;SRF=18;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107242;STB=0.560947;TYPE=snp;VARB=0.0271246;OID=.;OPOS=140697301;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:179:98:99:80:80:59:21:18:80:59:21:18:81 chr3 141327474 . G A 292.72 PASS AO=57;DP=111;FAO=66;FDP=119;FR=.;FRO=53;FSAF=20;FSAR=46;FSRF=25;FSRR=28;FWDB=0.0494541;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.5042;QD=9.83925;RBI=0.0574568;REFB=-0.063277;REVB=0.0292502;RO=48;SAF=11;SAR=46;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.283288;STB=0.583072;TYPE=snp;VARB=0.0426653;OID=.;OPOS=141327474;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:119:48:53:57:66:46:11:22:26:46:20:25:28 chr3 141331222 . G A 738.8 PASS AO=233;DP=495;FAO=188;FDP=400;FR=.;FRO=212;FSAF=56;FSAR=132;FSRF=93;FSRR=119;FWDB=-0.029057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.481;QD=7.38796;RBI=0.0330026;REFB=-0.0212916;REVB=0.0156481;RO=262;SAF=74;SAR=159;SRF=114;SRR=148;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123585;STB=0.583196;TYPE=snp;VARB=0.0257508;OID=.;OPOS=141331222;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:495:400:262:212:233:188:159:74:114:148:132:56:93:119 chr3 141876569 . CAACA C 219.62 PASS AO=124;DP=379;FAO=129;FDP=348;FR=.;FRO=219;FSAF=66;FSAR=63;FSRF=104;FSRR=115;FWDB=0.00671431;FXX=0.049179;HRUN=2;LEN=4;MLLD=241.449;QD=2.52431;RBI=0.0180148;REFB=-0.00398861;REVB=-0.0167168;RO=211;SAF=64;SAR=60;SRF=104;SRR=107;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0259206;STB=0.523106;TYPE=del;VARB=0.00625232;OID=.;OPOS=141876570;OREF=AACA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:124:363:129:348:219:66:63:104:115:99:211:64:60:104:107 chr3 141923506 . C T 352.19 PASS AO=25;DP=163;FAO=68;FDP=123;FR=.,HEALED;FRO=49;FSAF=28;FSAR=40;FSRF=27;FSRR=22;FWDB=-0.0753729;FXX=0.0314936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.092;QD=11.4533;RBI=0.0753856;REFB=0.0104101;REVB=-0.00138182;RO=18;SAF=10;SAR=15;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159922;STB=0.558926;TYPE=snp;VARB=-0.00381899;OID=.;OPOS=141923506;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:81:123:18:49:25:68:15:10:11:7:40:28:27:22 chr3 141932356 . G A 289.85 PASS AO=77;DP=179;FAO=79;FDP=181;FR=.;FRO=102;FSAF=34;FSAR=45;FSRF=60;FSRR=42;FWDB=0.00991285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.954;QD=6.40548;RBI=0.0482155;REFB=-0.0151547;REVB=-0.0471855;RO=97;SAF=33;SAR=44;SRF=56;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148532;STB=0.588459;TYPE=snp;VARB=0.020518;OID=.;OPOS=141932356;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:181:97:102:77:79:44:33:56:41:45:34:60:42 chr3 142030227 . GAA G 36.36 PASS AO=14;DP=58;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=22;FWDB=-0.159367;FXX=0.061212;HRUN=7;LEN=2;MLLD=25.7069;QD=3.16174;RBI=0.166104;REFB=0.0127581;REVB=-0.046825;RO=20;SAF=4;SAR=10;SRF=3;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186362;STB=0.580557;TYPE=del;VARB=-0.0232522;OID=.;OPOS=142030228;OREF=AA;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:14:48:17:46:29:6:11:7:22:36:20:4:10:3:17 chr3 142078759 . C T 357.52 PASS AO=82;DP=162;FAO=82;FDP=162;FR=.;FRO=80;FSAF=42;FSAR=40;FSRF=32;FSRR=48;FWDB=-0.0138789;FXX=0.00613459;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.053;QD=8.82772;RBI=0.0143467;REFB=-0.00552317;REVB=-0.00363388;RO=78;SAF=42;SAR=40;SRF=31;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101715;STB=0.555275;TYPE=snp;VARB=0.00435758;OID=.;OPOS=142078759;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:162:78:80:82:82:40:42:31:47:40:42:32:48 chr3 142123841 . C T 536.32 PASS AO=133;DP=272;FAO=131;FDP=272;FR=.;FRO=141;FSAF=70;FSAR=61;FSRF=62;FSRR=79;FWDB=-0.0287356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6938;QD=7.88701;RBI=0.0291667;REFB=-0.0183138;REVB=0.00499616;RO=138;SAF=70;SAR=63;SRF=62;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0713235;STB=0.548951;TYPE=snp;VARB=0.016988;OID=.;OPOS=142123841;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:272:272:138:141:133:131:63:70:62:76:61:70:62:79 chr3 142139172 . T C 111.47 PASS AO=30;DP=69;FAO=29;FDP=68;FR=.;FRO=39;FSAF=5;FSAR=24;FSRF=11;FSRR=28;FWDB=0.00682432;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.993;QD=6.55685;RBI=0.012739;REFB=0.00441751;REVB=0.0107569;RO=39;SAF=6;SAR=24;SRF=11;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116931;STB=0.5962;TYPE=snp;VARB=-0.00514222;OID=.;OPOS=142139172;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:68:39:39:30:29:24:6:11:28:24:5:11:28 chr3 142168331 . C T 1684.09 PASS AO=177;DP=177;FAO=180;FDP=180;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0107884;FXX=0.0109884;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.9336;QD=37.4242;RBI=0.0784798;REFB=0.0460536;REVB=0.0777347;RO=0;SAF=98;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00172721;OID=.;OPOS=142168331;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:177:180:0:0:177:180:79:98:0:0:82:98:0:0 chr3 142178144 . C T 98.84 PASS AO=45;DP=158;FAO=46;FDP=159;FR=.;FRO=113;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=59;FSRR=54;FWDB=-0.00882506;FXX=0.00624961;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.4631;QD=2.48661;RBI=0.0146417;REFB=0.00104521;REVB=0.0116833;RO=113;SAF=19;SAR=26;SRF=60;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132078;STB=0.577744;TYPE=snp;VARB=-0.00213794;OID=.;OPOS=142178144;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:158:159:113:113:45:46:26:19:60:53:27:19:59:54 chr3 142217537 . A G 167.21 PASS AO=40;DP=83;FAO=40;FDP=84;FR=.;FRO=44;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=29;FSRR=15;FWDB=0.0349305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.0239;QD=7.96215;RBI=0.0356953;REFB=-0.0236025;REVB=-0.00734928;RO=43;SAF=23;SAR=17;SRF=28;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0734648;STB=0.545657;TYPE=snp;VARB=0.0223611;OID=.;OPOS=142217537;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:84:43:44:40:40:17:23:28:15:17:23:29:15 chr3 142277575 . A T 504.65 PASS AO=126;DP=274;FAO=129;FDP=276;FR=.;FRO=147;FSAF=38;FSAR=91;FSRF=56;FSRR=91;FWDB=0.00355329;FXX=0.00360998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.918;QD=7.31376;RBI=0.0291244;REFB=-0.0203011;REVB=-0.0289069;RO=144;SAF=38;SAR=88;SRF=55;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0883285;STB=0.552933;TYPE=snp;VARB=0.0254048;OID=.;OPOS=142277575;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:274:276:144:147:126:129:88:38:55:89:91:38:56:91 chr3 142281612 . A G 214.34 PASS AO=50;DP=103;FAO=50;FDP=102;FR=.;FRO=52;FSAF=34;FSAR=16;FSRF=32;FSRR=20;FWDB=0.00505781;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.143;QD=8.40532;RBI=0.00803887;REFB=-0.00352883;REVB=-0.00624836;RO=51;SAF=34;SAR=16;SRF=31;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0731801;STB=0.536827;TYPE=snp;VARB=0.00428245;OID=.;OPOS=142281612;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:102:51:52:50:50:16:34:31:20:16:34:32:20 chr3 142392596 . T TC 168.84 PASS AO=58;DP=120;FAO=60;FDP=118;FR=.;FRO=58;FSAF=15;FSAR=45;FSRF=30;FSRR=28;FWDB=0.0824506;FXX=0.00840265;HRUN=3;LEN=1;MLLD=18.1002;QD=5.72341;RBI=0.162008;REFB=-0.00552779;REVB=-0.139458;RO=57;SAF=14;SAR=44;SRF=30;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.289116;STB=0.648985;TYPE=ins;VARB=0.000124682;OID=.;OPOS=142392597;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:58:120:60:118:58:15:45:30:28:99:57:14:44:30:27 chr3 142405191 . C T 481.99 PASS AO=109;DP=212;FAO=109;FDP=211;FR=.;FRO=102;FSAF=34;FSAR=75;FSRF=53;FSRR=49;FWDB=0.0150424;FXX=0.00471676;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.262;QD=9.13715;RBI=0.0154575;REFB=-0.00907709;REVB=-0.00355845;RO=101;SAF=34;SAR=75;SRF=52;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190636;STB=0.607465;TYPE=snp;VARB=0.00956872;OID=.;OPOS=142405191;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:211:101:102:109:109:75:34:52:49:75:34:53:49 chr3 142408606 . G A 436.64 PASS AO=115;DP=252;FAO=115;FDP=253;FR=.;FRO=138;FSAF=44;FSAR=71;FSRF=57;FSRR=81;FWDB=-0.0280288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.88;QD=6.90339;RBI=0.028223;REFB=0.00650104;REVB=-0.00330516;RO=137;SAF=44;SAR=71;SRF=56;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0269831;STB=0.517422;TYPE=snp;VARB=-0.00865896;OID=.;OPOS=142408606;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:252:253:137:138:115:115:71:44:56:81:71:44:57:81 chr3 142503605 . G A 807.62 PASS AO=201;DP=404;FAO=195;FDP=398;FR=.;FRO=203;FSAF=80;FSAR=115;FSRF=69;FSRR=134;FWDB=0.00741985;FXX=0.00499988;HRUN=3;LEN=1;MLLD=161.825;QD=8.11678;RBI=0.00741996;REFB=-0.0120164;REVB=4.08935e-05;RO=203;SAF=84;SAR=117;SRF=70;SRR=133;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0698773;STB=0.537575;TYPE=snp;VARB=0.01032;OID=.;OPOS=142503605;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:404:398:203:203:201:195:117:84:70:133:115:80:69:134 chr3 142523349 . G A 393 PASS AO=95;DP=196;FAO=95;FDP=197;FR=.;FRO=102;FSAF=19;FSAR=76;FSRF=31;FSRR=71;FWDB=-0.0158601;FXX=0.00505025;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.258;QD=7.9797;RBI=0.0262101;REFB=-0.00324275;REVB=-0.0208669;RO=97;SAF=19;SAR=76;SRF=29;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128972;STB=0.576352;TYPE=snp;VARB=0.0042775;OID=.;OPOS=142523349;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:197:97:102:95:95:76:19:29:68:76:19:31:71 chr3 142524858 . G A 488.52 PASS AO=127;DP=271;FAO=125;FDP=269;FR=.;FRO=144;FSAF=74;FSAR=51;FSRF=86;FSRR=58;FWDB=-0.0442475;FXX=0.0073798;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3926;QD=7.26419;RBI=0.0553512;REFB=-0.0176255;REVB=0.0332553;RO=142;SAF=74;SAR=53;SRF=86;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0227;STB=0.502896;TYPE=snp;VARB=0.0223664;OID=.;OPOS=142524858;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:271:269:142:144:127:125:53:74:86:56:51:74:86:58 chr3 142681249 . G A 110.64 PASS AO=31;DP=76;FAO=31;FDP=76;FR=.;FRO=45;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=0.0199662;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.775;QD=5.82288;RBI=0.0230024;REFB=-0.000781973;REVB=-0.0114219;RO=44;SAF=21;SAR=10;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192568;STB=0.617019;TYPE=snp;VARB=0.00106671;OID=.;OPOS=142681249;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:44:45:31:31:10:21:22:22:10:21:22:23 chr3 142730774 . T G 253.29 PASS AO=64;DP=139;FAO=64;FDP=139;FR=.;FRO=75;FSAF=28;FSAR=36;FSRF=35;FSRR=40;FWDB=0.00663687;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.5253;QD=7.28886;RBI=0.00770046;REFB=-0.00106841;REVB=-0.003905;RO=75;SAF=28;SAR=36;SRF=35;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0286447;STB=0.515919;TYPE=snp;VARB=0.00110091;OID=.;OPOS=142730774;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:75:75:64:64:36:28:35:40:36:28:35:40 chr3 142775361 . TA T 23.65 PASS AO=9;DP=62;FAO=26;FDP=54;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.287302;FXX=0.0847314;HRUN=7;LEN=1;MLLD=6.16586;QD=1.75171;RBI=0.32532;REFB=-0.0701917;REVB=-0.152614;RO=19;SAF=1;SAR=8;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.536389;STB=0.54274;TYPE=del;VARB=0.0991826;OID=.;OPOS=142775362;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:9:41:26:54:28:10:16:13:15:23:19:1:8:10:9 chr3 142779294 . C T 202.43 PASS AO=53;DP=120;FAO=53;FDP=120;FR=.;FRO=67;FSAF=20;FSAR=33;FSRF=34;FSRR=33;FWDB=-0.0232988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.557;QD=6.74763;RBI=0.0238081;REFB=-0.00667281;REVB=0.00489774;RO=66;SAF=20;SAR=33;SRF=34;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139746;STB=0.57444;TYPE=snp;VARB=0.00757783;OID=.;OPOS=142779294;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:66:67:53:53:33:20:34:32:33:20:34:33 chr3 143692018 . C G 53.46 PASS AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.0130076;FXX=0.0357015;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.9034;QD=7.92002;RBI=0.140858;REFB=0.0260542;REVB=0.140256;RO=15;SAF=6;SAR=6;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0317486;STB=0.555464;TYPE=snp;VARB=-0.0315477;OID=.;OPOS=143692018;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:28:27:15:15:12:12:6:6:8:7:6:6:9:6 chr3 145782812 . T C 115.65 PASS AO=31;DP=74;FAO=31;FDP=73;FR=.;FRO=42;FSAF=26;FSAR=5;FSRF=30;FSRR=12;FWDB=0.00979659;FXX=0.0266631;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.9062;QD=6.33717;RBI=0.0102269;REFB=-0.0213161;REVB=-0.00293522;RO=36;SAF=26;SAR=5;SRF=27;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138602;STB=0.612107;TYPE=snp;VARB=0.0144261;OID=.;OPOS=145782812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:73:36:42:31:31:5:26:27:9:5:26:30:12 chr3 145803138 . T C 101.8 PASS AO=33;DP=86;FAO=32;FDP=86;FR=.;FRO=54;FSAF=8;FSAR=24;FSRF=16;FSRR=38;FWDB=-0.0347239;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.5088;QD=4.73463;RBI=0.0349576;REFB=0.0173247;REVB=0.00403541;RO=53;SAF=9;SAR=24;SRF=15;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0138752;STB=0.537289;TYPE=snp;VARB=-0.0272896;OID=.;OPOS=145803138;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:53:54:33:32:24:9:15:38:24:8:16:38 chr3 145803142 . T A 119.41 PASS AO=34;DP=84;FAO=34;FDP=84;FR=.;FRO=50;FSAF=9;FSAR=25;FSRF=15;FSRR=35;FWDB=-0.0357039;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=222.697;QD=5.68605;RBI=0.0433148;REFB=-0.0162853;REVB=-0.0245236;RO=50;SAF=9;SAR=25;SRF=15;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.046202;STB=0.5263;TYPE=snp;VARB=0.0170158;OID=.;OPOS=145803142;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:50:50:34:34:25:9:15:35:25:9:15:35 chr3 145911164 . C T 214.7 PASS AO=40;DP=75;FAO=44;FDP=79;FR=.;FRO=35;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=0.079504;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.56;QD=10.8706;RBI=0.155916;REFB=-0.0243807;REVB=0.134123;RO=35;SAF=18;SAR=22;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0924912;STB=0.530672;TYPE=snp;VARB=0.0212012;OID=.;OPOS=145911164;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:79:35:35:40:44:22:18:12:23:26:18:12:23 chr3 145917761 . T C 1013.76 PASS AO=199;DP=349;FAO=205;FDP=358;FR=.;FRO=153;FSAF=73;FSAR=132;FSRF=58;FSRR=95;FWDB=0.0246605;FXX=0.0055554;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.273;QD=11.3269;RBI=0.0314406;REFB=-0.00793207;REVB=0.019503;RO=149;SAF=73;SAR=126;SRF=58;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0189645;STB=0.510645;TYPE=snp;VARB=0.0050956;OID=.;OPOS=145917761;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:349:358:149:153:199:205:126:73:58:91:132:73:58:95 chr3 145938619 . T C 314.15 PASS AO=85;DP=193;FAO=85;FDP=193;FR=.;FRO=108;FSAF=77;FSAR=8;FSRF=86;FSRR=22;FWDB=-0.00677957;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.319;QD=6.51087;RBI=0.00866821;REFB=0.00666623;REVB=0.00540141;RO=108;SAF=77;SAR=8;SRF=86;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.245364;STB=0.639142;TYPE=snp;VARB=-0.00838583;OID=.;OPOS=145938619;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:193:108:108:85:85:8:77:86:22:8:77:86:22 chr3 146177815 . C T 260.21 PASS AO=77;DP=184;FAO=76;FDP=184;FR=.;FRO=108;FSAF=24;FSAR=52;FSRF=48;FSRR=60;FWDB=-0.000326594;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2868;QD=5.65676;RBI=0.0743841;REFB=-0.00938571;REVB=-0.0743834;RO=106;SAF=25;SAR=52;SRF=46;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122426;STB=0.582067;TYPE=snp;VARB=0.013034;OID=.;OPOS=146177815;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:184:106:108:77:76:52:25:46:60:52:24:48:60 chr3 146289323 . T C 551.71 PASS AO=54;DP=54;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0224123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.6834;QD=37.4041;RBI=0.0415833;REFB=0;REVB=0.0350265;RO=0;SAF=25;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000366421;OID=.;OPOS=146289323;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:54:59:0:0:54:59:29:25:0:0:34:25:0:0 chr3 147121751 . C T 153.79 PASS AO=37;DP=79;FAO=37;FDP=79;FR=.;FRO=42;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=8;FSRR=34;FWDB=-0.0228688;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.4636;QD=7.78662;RBI=0.0242223;REFB=0.0393713;REVB=0.00798362;RO=41;SAF=15;SAR=22;SRF=8;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216683;STB=0.624011;TYPE=snp;VARB=-0.0466574;OID=.;OPOS=147121751;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:41:42:37:37:22:15:8:33:22:15:8:34 chr3 147128414 . AC A 137.46 PASS AO=21;DP=39;FAO=26;FDP=28;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.239561;FXX=0.0344709;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.9359;QD=19.6373;RBI=0.345803;REFB=-0.00125059;REVB=0.24938;RO=14;SAF=14;SAR=7;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0.42446;SSSB=0.0191005;STB=0.555511;TYPE=del;VARB=0.0296009;OID=.;OPOS=147128415;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:21:37:26:28:2:18:8:0:2:6:14:14:7:9:5 chr3 148459988 . A C 199.54 PASS AO=52;DP=124;FAO=55;FDP=127;FR=.;FRO=72;FSAF=33;FSAR=22;FSRF=27;FSRR=45;FWDB=-0.00643372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.353;QD=6.28484;RBI=0.0128973;REFB=-0.0130807;REVB=-0.011178;RO=72;SAF=30;SAR=22;SRF=27;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206481;STB=0.626123;TYPE=snp;VARB=0.0209725;OID=.;OPOS=148459988;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:127:72:72:52:55:22:30:27:45:22:33:27:45 chr3 148460467 . C A 3179.87 PASS AO=340;DP=349;FAO=343;FDP=343;FR=.;FRO=0;FSAF=150;FSAR=193;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0255498;FXX=0.0171915;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.632;QD=37.0831;RBI=0.0356291;REFB=0.0574481;REVB=0.0248322;RO=5;SAF=150;SAR=190;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00444953;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000233048;OID=.;OPOS=148460467;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:349:343:5:0:340:343:190:150:3:2:193:150:0:0 chr3 148460700 . G A 155.28 PASS AO=22;DP=29;FAO=22;FDP=29;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.057659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.3242;QD=21.4182;RBI=0.0718201;REFB=0.0157321;REVB=0.0428202;RO=7;SAF=3;SAR=19;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00604391;STB=0.503308;TYPE=snp;VARB=-0.00242593;OID=.;OPOS=148460700;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:29:29:7:7:22:22:19:3:1:6:19:3:1:6 chr3 148597612 . C T 1055.87 PASS AO=111;DP=113;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00651913;FXX=0.0176975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.922;QD=38.0492;RBI=0.016592;REFB=0;REVB=-0.0152577;RO=0;SAF=69;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.61903e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.89982e-05;OID=.;OPOS=148597612;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:113:111:0:0:111:111:42:69:0:0:42:69:0:0 chr3 148766666 . T C 223.15 PASS AO=63;DP=145;FAO=62;FDP=145;FR=.;FRO=83;FSAF=31;FSAR=31;FSRF=52;FSRR=31;FWDB=0.0466982;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0935;QD=6.15594;RBI=0.049769;REFB=0.0025865;REVB=0.0172111;RO=82;SAF=32;SAR=31;SRF=51;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115882;STB=0.572391;TYPE=snp;VARB=-0.00319305;OID=.;OPOS=148766666;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:82:83:63:62:31:32:51:31:31:31:52:31 chr3 148786108 . C T 437.79 PASS AO=108;DP=231;FAO=109;FDP=230;FR=.;FRO=121;FSAF=40;FSAR=69;FSRF=55;FSRR=66;FWDB=0.0146812;FXX=0.00432882;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.281;QD=7.6138;RBI=0.0308432;REFB=-0.000101303;REVB=-0.027125;RO=120;SAF=39;SAR=69;SRF=54;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0892078;STB=0.548297;TYPE=snp;VARB=0.000105116;OID=.;OPOS=148786108;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:231:230:120:121:108:109:69:39:54:66:69:40:55:66 chr3 148872987 . G A 146.98 PASS AO=36;DP=78;FAO=36;FDP=78;FR=.;FRO=42;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=34;FSRR=8;FWDB=0.00514526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1446;QD=7.53731;RBI=0.0126032;REFB=-0.0279392;REVB=0.0115051;RO=42;SAF=23;SAR=13;SRF=34;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19004;STB=0.605339;TYPE=snp;VARB=0.0424306;OID=.;OPOS=148872987;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:42:42:36:36:13:23:34:8:13:23:34:8 chr3 148881673 . C T 134.41 PASS AO=34;DP=77;FAO=34;FDP=76;FR=.;FRO=42;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=-0.0253402;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.206;QD=7.07421;RBI=0.0253963;REFB=-0.00528463;REVB=-0.0016871;RO=41;SAF=16;SAR=18;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.016785;STB=0.51627;TYPE=snp;VARB=0.00644443;OID=.;OPOS=148881673;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:76:41:42:34:34:18:16:20:21:18:16:21:21 chr3 148916235 . T A 1901.69 PASS AO=197;DP=199;FAO=202;FDP=202;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00203832;FXX=0.0146334;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.7763;QD=37.6572;RBI=0.0158081;REFB=-0.0243813;REVB=0.0156761;RO=2;SAF=104;SAR=93;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000536088;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000251481;OID=.;OPOS=148916235;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:199:202:2:0:197:202:93:104:1:1:97:105:0:0 chr3 149093238 . A G 1096.41 PASS AO=115;DP=116;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0491519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.473;QD=37.8073;RBI=0.0491751;REFB=0;REVB=0.00151045;RO=1;SAF=49;SAR=66;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00959259;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000107066;OID=.;OPOS=149093238;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:116:116:1:0:115:116:66:49:1:0:66:50:0:0 chr3 149192676 . G A 483.03 PASS AO=80;DP=127;FAO=83;FDP=126;FR=.;FRO=43;FSAF=44;FSAR=39;FSRF=33;FSRR=10;FWDB=0.0598188;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=170.381;QD=15.3342;RBI=0.062832;REFB=-0.024904;REVB=0.0192245;RO=0;SAF=42;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.26068e-08;STB=0.58207;TYPE=snp;VARB=0.00152631;OID=.;OPOS=149192676;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:126:0:43:80:83:38:42:0:0:39:44:33:10 chr3 149238595 . C CTTAA 183.46 PASS AO=60;DP=219;FAO=69;FDP=202;FR=.;FRO=133;FSAF=52;FSAR=17;FSRF=76;FSRR=57;FWDB=0.0128669;FXX=0.0560721;HRUN=0;LEN=4;MLLD=216.563;QD=3.63283;RBI=0.0242773;REFB=-0.012677;REVB=0.0205872;RO=137;SAF=43;SAR=17;SRF=80;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176648;STB=0.638735;TYPE=ins;VARB=0.0249669;OID=.;OPOS=149238596;OREF=-;OALT=TTAA;OMAPALT=CTTAA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:60:219:69:202:133:52:17:76:57:99:137:43:17:80:57 chr3 149258066 . T C 1809.55 PASS AO=189;DP=191;FAO=189;FDP=189;FR=.;FRO=0;FSAF=107;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00486233;FXX=0.0104707;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.9911;QD=38.2973;RBI=0.015239;REFB=0;REVB=-0.0144424;RO=0;SAF=107;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000237524;OID=.;OPOS=149258066;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:191:189:0:0:189:189:82:107:0:0:82:107:0:0 chr3 149459341 . A G 300.2 PASS AO=85;DP=264;FAO=100;FDP=264;FR=.;FRO=164;FSAF=74;FSAR=26;FSRF=90;FSRR=74;FWDB=-0.00143226;FXX=0.00377344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.391;QD=4.54851;RBI=0.0492003;REFB=-0.00886117;REVB=0.0491794;RO=163;SAF=61;SAR=24;SRF=90;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209035;STB=0.634402;TYPE=snp;VARB=0.00996428;OID=.;OPOS=149459341;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:264:264:163:164:85:100:24:61:90:73:26:74:90:74 chr3 149488442 . A G 397.03 PASS AO=94;DP=191;FAO=94;FDP=191;FR=.;FRO=97;FSAF=38;FSAR=56;FSRF=60;FSRR=37;FWDB=-0.00494178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.7714;QD=8.31466;RBI=0.0380469;REFB=-0.00587324;REVB=-0.0377246;RO=97;SAF=38;SAR=56;SRF=60;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196804;STB=0.608268;TYPE=snp;VARB=0.00909947;OID=.;OPOS=149488442;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:191:191:97:97:94:94:56:38:60:37:56:38:60:37 chr3 149678534 . C T 281.95 PASS AO=60;DP=114;FAO=61;FDP=115;FR=.;FRO=54;FSAF=49;FSAR=12;FSRF=33;FSRR=21;FWDB=0.0349671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.917;QD=9.80678;RBI=0.0360692;REFB=-0.000789758;REVB=-0.00884824;RO=53;SAF=48;SAR=12;SRF=32;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221119;STB=0.62164;TYPE=snp;VARB=0.000998714;OID=.;OPOS=149678534;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:115:53:54:60:61:12:48:32:21:12:49:33:21 chr3 150280445 . C G 206.64 PASS AO=53;DP=117;FAO=53;FDP=117;FR=.;FRO=64;FSAF=18;FSAR=35;FSRF=27;FSRR=37;FWDB=-0.0666763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.1193;QD=7.06448;RBI=0.0677151;REFB=-0.000744982;REVB=-0.0118155;RO=63;SAF=18;SAR=35;SRF=27;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0931537;STB=0.548571;TYPE=snp;VARB=-0.000124835;OID=.;OPOS=150280445;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:63:64:53:53:35:18:27:36:35:18:27:37 chr3 150391810 . A C 279.31 PASS AO=67;DP=139;FAO=67;FDP=139;FR=.;FRO=72;FSAF=28;FSAR=39;FSRF=25;FSRR=47;FWDB=0.0385231;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.1088;QD=8.03762;RBI=0.0424055;REFB=-0.0139549;REVB=-0.0177257;RO=72;SAF=28;SAR=39;SRF=25;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0689884;STB=0.538089;TYPE=snp;VARB=0.0176273;OID=.;OPOS=150391810;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:72:72:67:67:39:28:25:47:39:28:25:47 chr3 150690439 . T A 200.69 PASS AO=47;DP=102;FAO=49;FDP=104;FR=.;FRO=55;FSAF=19;FSAR=30;FSRF=24;FSRR=31;FWDB=0.103496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.013;QD=7.71882;RBI=0.103585;REFB=-0.00310573;REVB=0.00431096;RO=55;SAF=18;SAR=29;SRF=24;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0537548;STB=0.526735;TYPE=snp;VARB=0.00324651;OID=.;OPOS=150690439;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:104:55:55:47:49:29:18:24:31:30:19:24:31 chr3 150877794 . GC G,GG 417.62 PASS AO=27,11;DP=62;FAO=50,11;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0;FSAR=50,11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000399443,0.00113595;FXX=0.0161264;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=14.9481,11.4643;QD=27.3847;RBI=0.395436,0.217994;REFB=-0.060789,-0.0327601;REVB=0.395436,0.217991;RO=23;SAF=0,0;SAR=27,11;SRF=0;SRR=23;SSEN=0,0;SSEP=0.409557,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0679209,-0.122321;OID=.,.;OPOS=150877795,150877795;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:27,11:62:50,11:61:0:0,0:50,11:0:0:13:23:0,0:27,11:0:23 chr3 150881774 . A C 156.24 PASS AO=44;DP=110;FAO=45;FDP=111;FR=.;FRO=66;FSAF=6;FSAR=39;FSRF=8;FSRR=58;FWDB=-0.0051759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2383;QD=5.63013;RBI=0.0238824;REFB=-0.00968876;REVB=0.0233148;RO=66;SAF=6;SAR=38;SRF=8;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0351986;STB=0.515951;TYPE=snp;VARB=0.0158365;OID=.;OPOS=150881774;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:111:66:66:44:45:38:6:8:58:39:6:8:58 chr3 150932075 . T G 318.4 PASS AO=57;DP=90;FAO=57;FDP=91;FR=.;FRO=34;FSAF=35;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=-0.018503;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.98;QD=13.9957;RBI=0.0404775;REFB=-0.0261534;REVB=-0.036001;RO=33;SAF=35;SAR=22;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0270705;STB=0.510118;TYPE=snp;VARB=0.0117803;OID=.;OPOS=150932075;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:91:33:34:57:57:22:35:19:14:22:35:20:14 chr3 151011969 . G A 165.43 PASS AO=35;DP=66;FAO=35;FDP=66;FR=.;FRO=31;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.00476811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.586;QD=10.0258;RBI=0.0126705;REFB=-0.0192479;REVB=-0.0117391;RO=31;SAF=18;SAR=17;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0289497;STB=0.516036;TYPE=snp;VARB=0.0211333;OID=.;OPOS=151011969;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:31:31:35:35:17:18:17:14:17:18:17:14 chr3 151012497 . T C 1799.53 PASS AO=193;DP=196;FAO=193;FDP=193;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0642902;FXX=0.0153053;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.8474;QD=37.2961;RBI=0.0663437;REFB=-0.166394;REVB=0.0163787;RO=3;SAF=90;SAR=103;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136661;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000833397;OID=.;OPOS=151012497;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:196:193:3:0:193:193:103:90:0:3:103:90:0:0 chr3 151012896 . C T 937.94 PASS AO=200;DP=368;FAO=200;FDP=366;FR=.;FRO=166;FSAF=112;FSAR=88;FSRF=96;FSRR=70;FWDB=-0.023502;FXX=0.00543463;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.2958;QD=10.2507;RBI=0.0281341;REFB=-0.0156811;REVB=-0.0154656;RO=165;SAF=112;SAR=88;SRF=96;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184597;STB=0.508444;TYPE=snp;VARB=0.0105371;OID=.;OPOS=151012896;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:368:366:165:166:200:200:88:112:96:69:88:112:96:70 chr3 151046308 . G A 722.46 PASS AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.011841;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.01;QD=37.0491;RBI=0.0153064;REFB=-0.0859942;REVB=0.00969936;RO=0;SAF=3;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503355;TYPE=snp;VARB=0.00038604;OID=.;OPOS=151046308;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:78:78:0:1:77:77:74:3:0:0:74:3:0:1 chr3 151056598 . A C 285.08 PASS AO=27;DP=27;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00566571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.643;QD=38.01;RBI=0.0277331;REFB=0;REVB=0.0271482;RO=0;SAF=9;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00128209;OID=.;OPOS=151056598;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:27:30:0:0:27:30:18:9:0:0:21:9:0:0 chr3 151056616 . G A 32.04 PASS AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=12;FWDB=0.0298558;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.929;QD=5.82604;RBI=0.0314991;REFB=-0.0135157;REVB=-0.0100412;RO=14;SAF=6;SAR=2;SRF=2;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.576491;STB=0.839307;TYPE=snp;VARB=0.0291979;OID=.;OPOS=151056616;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:22:22:14:14:8:8:2:6:2:12:2:6:2:12 chr3 151134104 . AGCAGCCCCAGCAGCCCCAGCCCCAGCAGCCTCCCCAGCCCCAGCAGTCCTCGCAGTCCCAGAGTCAGACCCTTGGTCTCCAAGCAAT A 50 PASS AO=97;DP=254;LEN=87;RO=157;SAF=7;SAR=127;SRF=10;SRR=110;TYPE=del;FR=.;OID=.;OPOS=151134105;OREF=GCAGCCCCAGCAGCCCCAGCCCCAGCAGCCTCCCCAGCCCCAGCAGTCCTCGCAGTCCCAGAGTCAGACCCTTGGTCTCCAAGCAAT;OALT=-;OMAPALT=A GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR 0/1:99:254:157:97:127:7:10:110 chr3 151143447 . G T 676.9 PASS AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0178445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.864;QD=38.6802;RBI=0.0188856;REFB=0;REVB=-0.0061838;RO=0;SAF=32;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.18408e-05;OID=.;OPOS=151143447;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:70:70:0:0:70:70:38:32:0:0:38:32:0:0 chr3 151150967 . T TG 998.43 PASS AO=42;DP=180;FAO=137;FDP=156;FR=.;FRO=19;FSAF=79;FSAR=58;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.0264236;FXX=0.0429422;HRUN=0;LEN=1;MLLD=186.979;QD=25.6006;RBI=0.0903745;REFB=-0.0160722;REVB=-0.0864254;RO=132;SAF=14;SAR=28;SRF=82;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.35223;STB=0.525762;TYPE=ins;VARB=0.00429878;OID=.;OPOS=151150968;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:42:180:137:156:19:79:58:7:12:6:132:14:28:82:50 chr3 151150968 . T G 338.9 PASS AO=91;DP=185;FAO=84;FDP=177;FR=.;FRO=93;FSAF=52;FSAR=32;FSRF=45;FSRR=48;FWDB=-0.00586399;FXX=0.0432409;HRUN=13;LEN=1;MLLD=147.835;QD=7.65885;RBI=0.0186873;REFB=0.00213175;REVB=0.0177434;RO=93;SAF=59;SAR=32;SRF=45;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156785;STB=0.57267;TYPE=snp;VARB=-0.000374883;OID=.;OPOS=151150968;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:177:93:93:91:84:32:59:45:48:32:52:45:48 chr3 151154666 . T C 2339.99 PASS AO=246;DP=249;FAO=247;FDP=247;FR=.;FRO=0;FSAF=189;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0244872;FXX=0.00803181;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.751;QD=37.8946;RBI=0.0306916;REFB=-0.0643766;REVB=0.0185027;RO=1;SAF=188;SAR=58;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00814627;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000239614;OID=.;OPOS=151154666;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:249:247:1:0:246:247:58:188:0:1:58:189:0:0 chr3 151155620 . G A 1660.87 PASS AO=170;DP=177;FAO=174;FDP=174;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0164528;FXX=0.0842061;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.6049;QD=38.1809;RBI=0.0267567;REFB=0;REVB=0.0211004;RO=0;SAF=81;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.85996e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00352579;OID=.;OPOS=151155620;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:177:174:0:0:170:174:89:81:0:0:90:84:0:0 chr3 151165678 . T C 1082.23 PASS AO=115;DP=116;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00169695;FXX=0.00861995;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.492;QD=37.6426;RBI=0.00721902;REFB=-0.00635943;REVB=-0.00701674;RO=1;SAF=60;SAR=55;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0078492;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.94051e-06;OID=.;OPOS=151165678;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:116:115:1:0:115:115:55:60:1:0:55:60:0:0 chr3 151166422 . C T 1179.95 PASS AO=123;DP=123;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0363784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.616;QD=38.0631;RBI=0.0369101;REFB=0;REVB=0.00624258;RO=0;SAF=76;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.88373e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.82444e-05;OID=.;OPOS=151166422;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:123:124:0:0:123:124:47:76:0:0:47:77:0:0 chr3 151171439 . A C 1416.49 PASS AO=166;DP=180;FAO=171;FDP=185;FR=.;FRO=14;FSAF=106;FSAR=65;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.00647053;FXX=0.0512794;HRUN=6;LEN=1;MLLD=170.75;QD=30.6267;RBI=0.0184276;REFB=-0.184118;REVB=0.0172542;RO=13;SAF=105;SAR=61;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.036359;STB=0.515247;TYPE=snp;VARB=0.000889143;OID=.;OPOS=151171439;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:180:185:13:14:166:171:61:105:5:8:65:106:6:8 chr3 151171542 . A G 1481.93 PASS AO=155;DP=155;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00939853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.018;QD=38.2433;RBI=0.00990625;REFB=0;REVB=0.00313075;RO=0;SAF=69;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.555e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.12765e-06;OID=.;OPOS=151171542;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:155:155:0:0:155:155:86:69:0:0:86:69:0:0 chr3 151283691 . C A 172.31 PASS AO=42;DP=94;FAO=43;FDP=94;FR=.;FRO=51;FSAF=8;FSAR=35;FSRF=18;FSRR=33;FWDB=0.00109522;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.519;QD=7.33229;RBI=0.0151156;REFB=-0.00933996;REVB=-0.0150758;RO=51;SAF=7;SAR=35;SRF=18;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.259904;STB=0.625795;TYPE=snp;VARB=0.0168703;OID=.;OPOS=151283691;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:51:51:42:43:35:7:18:33:35:8:18:33 chr3 151463421 . G T 293.38 PASS AO=79;DP=177;FAO=80;FDP=183;FR=.;FRO=103;FSAF=40;FSAR=40;FSRF=33;FSRR=70;FWDB=0.00321627;FXX=0.00543449;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.294;QD=6.41264;RBI=0.00399854;REFB=-0.0117984;REVB=0.00237569;RO=96;SAF=40;SAR=39;SRF=34;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150352;STB=0.601069;TYPE=snp;VARB=0.0161416;OID=.;OPOS=151463421;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:183:96:103:79:80:39:40:34:62:40:40:33:70 chr3 151545601 . G A 1467.95 PASS AO=152;DP=153;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0268179;FXX=0.0254761;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.253;QD=38.3778;RBI=0.0306389;REFB=0;REVB=0.014817;RO=0;SAF=69;SAR=83;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.68244e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000145341;OID=.;OPOS=151545601;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:153:153:0:0:152:153:83:69:0:0:84:69:0:0 chr3 152180329 . C T 382.16 PASS AO=96;DP=206;FAO=96;FDP=204;FR=.;FRO=108;FSAF=38;FSAR=58;FSRF=53;FSRR=55;FWDB=0.0168868;FXX=0.00970827;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.484;QD=7.49341;RBI=0.0177583;REFB=-0.0195531;REVB=0.00549476;RO=108;SAF=38;SAR=58;SRF=53;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0929231;STB=0.551389;TYPE=snp;VARB=0.02085;OID=.;OPOS=152180329;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:206:204:108:108:96:96:58:38:53:55:58:38:53:55 chr3 152182300 . T C 965.23 PASS AO=211;DP=399;FAO=212;FDP=397;FR=.;FRO=185;FSAF=86;FSAR=126;FSRF=72;FSRR=113;FWDB=0.000656799;FXX=0.00749981;HRUN=3;LEN=1;MLLD=216.007;QD=9.72525;RBI=0.0208651;REFB=-0.0276851;REVB=0.0208548;RO=183;SAF=85;SAR=126;SRF=71;SRR=112;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0132208;STB=0.507982;TYPE=snp;VARB=0.0220379;OID=.;OPOS=152182300;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:399:397:183:185:211:212:126:85:71:112:126:86:72:113 chr3 152555710 . A G 223.67 PASS AO=62;DP=145;FAO=62;FDP=145;FR=.;FRO=83;FSAF=25;FSAR=37;FSRF=36;FSRR=47;FWDB=0.0455153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.541;QD=6.17024;RBI=0.0456721;REFB=0.00475057;REVB=-0.00378087;RO=83;SAF=25;SAR=37;SRF=36;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0321688;STB=0.518011;TYPE=snp;VARB=-0.00627978;OID=.;OPOS=152555710;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:83:83:62:62:37:25:36:47:37:25:36:47 chr3 152637565 . C T 1675.47 PASS AO=182;DP=186;FAO=185;FDP=189;FR=.;FRO=4;FSAF=48;FSAR=137;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0122571;FXX=0.00526288;HRUN=4;LEN=1;MLLD=93.9836;QD=35.4598;RBI=0.0192235;REFB=-0.117748;REVB=0.014809;RO=3;SAF=47;SAR=135;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0104616;STB=0.513333;TYPE=snp;VARB=0.00115646;OID=.;OPOS=152637565;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:186:189:3:4:182:185:135:47:0:3:137:48:3:1 chr3 152881874 . GA G 44.7 PASS AO=12;DP=32;FAO=23;FDP=31;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=-0.193226;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=5.89793;QD=5.76779;RBI=0.293536;REFB=-0.0180829;REVB=0.220969;RO=12;SAF=4;SAR=8;SRF=1;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.2754;STB=0.557046;TYPE=del;VARB=0.111809;OID=.;OPOS=152881875;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:12:30:23:31:8:7:16:1:7:7:12:4:8:1:11 chr3 153325222 . T C 509.14 PASS AO=132;DP=288;FAO=133;FDP=289;FR=.;FRO=156;FSAF=28;FSAR=105;FSRF=65;FSRR=91;FWDB=-0.0106226;FXX=0.00344816;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.358;QD=7.04691;RBI=0.0363644;REFB=0.00653674;REVB=-0.0347783;RO=156;SAF=27;SAR=105;SRF=64;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.255089;STB=0.640179;TYPE=snp;VARB=-0.00799561;OID=.;OPOS=153325222;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:288:289:156:156:132:133:105:27:64:92:105:28:65:91 chr3 153725166 . G A 380.66 PASS AO=125;DP=326;FAO=125;FDP=326;FR=.;FRO=201;FSAF=53;FSAR=72;FSRF=91;FSRR=110;FWDB=-0.0189995;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=214.574;QD=4.67069;RBI=0.019415;REFB=0.00312625;REVB=-0.00399558;RO=201;SAF=53;SAR=72;SRF=91;SRR=110;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.032048;STB=0.518034;TYPE=snp;VARB=-0.00425739;OID=.;OPOS=153725166;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:326:326:201:201:125:125:72:53:91:110:72:53:91:110 chr3 153725172 . C T 432.92 PASS AO=134;DP=339;FAO=135;FDP=339;FR=.;FRO=204;FSAF=57;FSAR=78;FSRF=93;FSRR=111;FWDB=-0.0418484;FXX=0.00294109;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.4241;QD=5.10817;RBI=0.0572428;REFB=0.00443528;REVB=0.0390569;RO=198;SAF=57;SAR=77;SRF=88;SRR=110;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0207179;STB=0.520622;TYPE=snp;VARB=-0.004568;OID=.;OPOS=153725172;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:339:339:198:204:134:135:77:57:88:110:78:57:93:111 chr3 153725251 . T C 621.89 PASS AO=148;DP=373;FAO=178;FDP=398;FR=.;FRO=220;FSAF=88;FSAR=90;FSRF=106;FSRR=114;FWDB=0.0692047;FXX=0.00499988;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.1775;QD=6.25017;RBI=0.0692925;REFB=-0.0154917;REVB=-0.00348578;RO=225;SAF=59;SAR=89;SRF=108;SRR=117;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0894172;STB=0.506946;TYPE=snp;VARB=0.025217;OID=.;OPOS=153725251;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:373:398:225:220:148:178:89:59:108:117:90:88:106:114 chr3 153839866 . G C 605.11 PASS AO=67;DP=70;FAO=67;FDP=70;FR=.;FRO=3;FSAF=17;FSAR=50;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.00146196;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.154;QD=34.5777;RBI=0.0132603;REFB=0.0031188;REVB=0.0131794;RO=2;SAF=17;SAR=50;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0523961;STB=0.540528;TYPE=snp;VARB=0.000153181;OID=.;OPOS=153839866;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:70:70:2:3:67:67:50:17:2:0:50:17:3:0 chr3 153839960 . T C 106.9 PASS AO=42;DP=42;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=19;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.00616203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.393;QD=10.1811;RBI=0.00843101;REFB=-0.0125562;REVB=-0.00575425;RO=0;SAF=11;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.72514e-08;STB=0.691846;TYPE=snp;VARB=0.00909466;OID=.;OPOS=153839960;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:42:42:0:20:42:22:31:11:0:0:19:3:8:12 chr3 153840389 . T C 468.6 PASS AO=85;DP=137;FAO=85;FDP=136;FR=.;FRO=51;FSAF=54;FSAR=31;FSRF=34;FSRR=17;FWDB=0.0151547;FXX=0.00729874;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.924;QD=13.7824;RBI=0.0159739;REFB=-0.00400695;REVB=0.00505007;RO=51;SAF=54;SAR=31;SRF=34;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.023633;STB=0.512779;TYPE=snp;VARB=0.00126538;OID=.;OPOS=153840389;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:136:51:51:85:85:31:54:34:17:31:54:34:17 chr3 153935677 . AG A 388.48 PASS AO=61;DP=91;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.222261;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=10.6921;QD=17.4598;RBI=0.243864;REFB=0.142059;REVB=-0.100347;RO=15;SAF=40;SAR=21;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0.41519;SSSB=0.0225926;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00443892;OID=.;OPOS=153935678;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:61:88:89:89:0:50:39:0:0:22:15:40:21:9:6 chr3 153958173 . A G 388.69 PASS AO=109;DP=253;FAO=109;FDP=253;FR=.;FRO=144;FSAF=52;FSAR=57;FSRF=64;FSRR=80;FWDB=0.0112453;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.501;QD=6.14534;RBI=0.028392;REFB=-0.00857306;REVB=0.02607;RO=143;SAF=52;SAR=57;SRF=64;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0302216;STB=0.518634;TYPE=snp;VARB=0.0136048;OID=.;OPOS=153958173;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:253:253:143:144:109:109:57:52:64:79:57:52:64:80 chr3 154018887 . G C 141.16 PASS AO=42;DP=106;FAO=42;FDP=106;FR=.;FRO=64;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=37;FSRR=27;FWDB=-0.0174188;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=157.739;QD=5.32694;RBI=0.0198449;REFB=-0.00931717;REVB=-0.00950825;RO=64;SAF=17;SAR=25;SRF=37;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184021;STB=0.604248;TYPE=snp;VARB=0.012529;OID=.;OPOS=154018887;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:64:64:42:42:25:17:37:27:25:17:37:27 chr3 154886278 . T C 236.93 PASS AO=78;DP=211;FAO=79;FDP=210;FR=.;FRO=131;FSAF=22;FSAR=57;FSRF=36;FSRR=95;FWDB=0.00449475;FXX=0.00473911;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.812;QD=4.51298;RBI=0.0571061;REFB=-0.016591;REVB=0.056929;RO=123;SAF=22;SAR=56;SRF=35;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00334582;STB=0.502856;TYPE=snp;VARB=0.0219589;OID=.;OPOS=154886278;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:210:123:131:78:79:56:22:35:88:57:22:36:95 chr3 155241740 . A G 1485.51 PASS AO=155;DP=155;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00862955;FXX=0.00640985;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.636;QD=38.3357;RBI=0.0160416;REFB=0;REVB=-0.0135227;RO=0;SAF=88;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.82346e-05;OID=.;OPOS=155241740;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:155:155:0:0:155:155:67:88:0:0:67:88:0:0 chr3 155314034 . A G 144 PASS AO=47;DP=138;FAO=49;FDP=136;FR=.;FRO=87;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=49;FSRR=38;FWDB=-0.019896;FXX=0.0144917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.27;QD=4.23536;RBI=0.0204118;REFB=-0.0195282;REVB=0.00455956;RO=83;SAF=20;SAR=27;SRF=48;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169697;STB=0.598882;TYPE=snp;VARB=0.0393989;OID=.;OPOS=155314034;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:136:83:87:47:49:27:20:48:35:29:20:49:38 chr3 155481609 . G A 1385.33 PASS AO=145;DP=151;FAO=145;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0284716;FXX=0.0460496;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.7853;QD=38.216;RBI=0.0299284;REFB=0;REVB=0.00922359;RO=0;SAF=75;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.01417e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.19931e-05;OID=.;OPOS=155481609;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:151:145:0:0:145:145:70:75:0:0:70:75:0:0 chr3 155485302 . C T 978.31 PASS AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.227;QD=37.9925;RBI=0.0211215;REFB=0;REVB=0.000975261;RO=0;SAF=80;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.69118e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.94198e-05;OID=.;OPOS=155485302;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:103:103:0:0:103:103:23:80:0:0:23:80:0:0 chr3 156544584 . C T 2326.31 PASS AO=238;DP=242;FAO=246;FDP=246;FR=.;FRO=0;FSAF=120;FSAR=126;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0011298;FXX=0.00806419;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.1538;QD=37.8261;RBI=0.00631949;REFB=0.0222552;REVB=-0.00621768;RO=4;SAF=118;SAR=120;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000132332;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000175223;OID=.;OPOS=156544584;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:242:246:4:0:238:246:120:118:2:2:126:120:0:0 chr3 156877276 . CAA C 23.23 PASS AO=16;DP=56;FAO=16;FDP=55;FR=.;FRO=39;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=-0.0131325;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=199.679;QD=1.68947;RBI=0.0148772;REFB=0.00204501;REVB=-0.00699066;RO=39;SAF=10;SAR=6;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134615;STB=0.581292;TYPE=del;VARB=-0.00448847;OID=.;OPOS=156877277;OREF=AA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:16:55:16:55:39:10:6:20:19:23:39:10:6:20:19 chr3 156983414 . T C 667.2 PASS AO=145;DP=270;FAO=146;FDP=273;FR=.;FRO=127;FSAF=75;FSAR=71;FSRF=49;FSRR=78;FWDB=-0.00489582;FXX=0.0353344;HRUN=4;LEN=1;MLLD=159.479;QD=9.77587;RBI=0.0164403;REFB=-0.0131041;REVB=-0.0156944;RO=123;SAF=74;SAR=71;SRF=48;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101064;STB=0.559329;TYPE=snp;VARB=0.00816137;OID=.;OPOS=156983414;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:270:273:123:127:145:146:71:74:48:75:71:75:49:78 chr3 157081324 . A G 2549.97 PASS AO=269;DP=271;FAO=271;FDP=271;FR=.;FRO=0;FSAF=127;FSAR=144;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127439;FXX=0.00732574;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.2586;QD=37.638;RBI=0.0914672;REFB=-0.0659712;REVB=-0.0905751;RO=2;SAF=126;SAR=143;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000446448;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.47942e-05;OID=.;OPOS=157081324;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:271:271:2:0:269:271:143:126:1:1:144:127:0:0 chr3 157155314 . C A 640.9 PASS AO=71;DP=73;FAO=71;FDP=73;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0385277;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.717;QD=35.118;RBI=0.0790933;REFB=-0.0869283;REVB=0.0690751;RO=2;SAF=36;SAR=35;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000364693;STB=0.500193;TYPE=snp;VARB=0.00106067;OID=.;OPOS=157155314;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:73:73:2:2:71:71:35:36:1:1:35:36:1:1 chr3 157161198 . A AT,T 992.22 PASS AO=58,42;DP=111;FAO=63,42;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=24,13;FSAR=39,29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-3.10002e-05,0.00468367;FXX=0.0277752;HRUN=0,8;LEN=1,1;MLLD=95.3911,98.297;QD=37.7986;RBI=0.00135114,0.00577202;REFB=0,0;REVB=-0.00135079,-0.00337334;RO=6;SAF=19,14;SAR=39,28;SRF=5;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0973784,-0.125202;STB=0.5,0.5;TYPE=ins,snp;VARB=-4.12024e-05,0.0164194;OID=.,.;OPOS=157161199,157161198;OREF=-,A;OALT=T,T;OMAPALT=AT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:67:111:105:6:0:58,42:63,42:39,28:19,14:5:1:39,29:24,13:0:0 chr3 157815088 . G A 1440.29 PASS AO=151;DP=154;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0058343;FXX=0.0129862;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.638;QD=37.9023;RBI=0.0197515;REFB=0;REVB=0.0188701;RO=0;SAF=72;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.70733e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.7414e-05;OID=.;OPOS=157815088;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:154:152:0:0:151:152:79:72:0:0:79:73:0:0 chr3 157815938 . C T 10.37 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0531029;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.8343;QD=5.92779;RBI=0.114238;REFB=-0.0105813;REVB=0.101145;RO=5;SAF=1;SAR=1;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0967026;STB=0.57073;TYPE=snp;VARB=0.0586719;OID=.;OPOS=157815938;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:5:5:2:2:1:1:2:3:1:1:2:3 chr3 158187189 . G A 2186.93 PASS AO=225;DP=225;FAO=229;FDP=229;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=148;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0555028;FXX=0.00865763;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.357;QD=38.1997;RBI=0.0557232;REFB=0;REVB=-0.00495178;RO=0;SAF=80;SAR=145;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000175366;OID=.;OPOS=158187189;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:225:229:0:0:225:229:145:80:0:0:148:81:0:0 chr3 158306630 . T G 875.55 PASS AO=97;DP=100;FAO=97;FDP=100;FR=.;FRO=3;FSAF=54;FSAR=43;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0131339;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.8197;QD=35.0221;RBI=0.0466743;REFB=-0.0251586;REVB=-0.0447883;RO=0;SAF=54;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.50386e-08;STB=0.503344;TYPE=snp;VARB=0.00665895;OID=.;OPOS=158306630;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:100:100:0:3:97:97:43:54:0:0:43:54:2:1 chr3 158320597 . T C 1258.66 PASS AO=138;DP=143;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166048;FXX=0.0279701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.413;QD=36.2204;RBI=0.0230607;REFB=-0.0907031;REVB=0.0160024;RO=4;SAF=85;SAR=53;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00759705;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000228445;OID=.;OPOS=158320597;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:143:139:4:0:138:139:53:85:3:1:54:85:0:0 chr3 158362441 . T C 827.61 PASS AO=86;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0835932;FXX=0.0326052;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.9485;QD=37.1961;RBI=0.087934;REFB=0;REVB=0.0272865;RO=0;SAF=54;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00126185;OID=.;OPOS=158362441;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:89:89:0:0:86:89:32:54:0:0:33:56:0:0 chr3 158366900 . G A 1866.84 PASS AO=196;DP=196;FAO=195;FDP=195;FR=.;FRO=0;FSAF=100;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00557855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.017;QD=38.2941;RBI=0.0132942;REFB=0;REVB=-0.0120672;RO=0;SAF=100;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.21702e-05;OID=.;OPOS=158366900;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:196:195:0:0:196:195:96:100:0:0:95:100:0:0 chr3 158388780 . T C 1054.41 PASS AO=109;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=5.36085e-05;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.865;QD=38.694;RBI=0.0365593;REFB=0;REVB=0.0365593;RO=0;SAF=42;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.7257e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000514082;OID=.;OPOS=158388780;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:109:109:0:0:109:109:67:42:0:0:67:42:0:0 chr3 158537443 . A G 1123.66 PASS AO=117;DP=118;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000419339;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.067;QD=38.4157;RBI=0.0362286;REFB=0;REVB=0.0362261;RO=0;SAF=64;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.09512e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000124331;OID=.;OPOS=158537443;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:118:117:0:0:117:117:53:64:0:0:53:64:0:0 chr3 158952315 . C A 1309.99 PASS AO=139;DP=141;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0141848;FXX=0.0141834;HRUN=3;LEN=1;MLLD=186.081;QD=37.6976;RBI=0.0233494;REFB=-0.020383;REVB=0.0185469;RO=1;SAF=86;SAR=53;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00549684;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.17662e-06;OID=.;OPOS=158952315;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:141:139:1:0:139:139:53:86:1:0:53:86:0:0 chr3 159557953 . T C 12.21 PASS AO=4;DP=22;FAO=5;FDP=23;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0213325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.745;QD=2.12288;RBI=0.021684;REFB=-0.0177409;REVB=0.00388853;RO=16;SAF=3;SAR=1;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.293573;STB=0.620213;TYPE=snp;VARB=0.0431862;OID=.;OPOS=159557953;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:22:23:16:18:4:5:1:3:8:8:2:3:8:10 chr3 159744438 . C T 784.63 PASS AO=79;DP=80;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0387626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.5261;QD=37.8136;RBI=0.0482485;REFB=0;REVB=0.0287294;RO=0;SAF=45;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40017e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000213566;OID=.;OPOS=159744438;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:80:83:0:0:79:83:34:45:0:0:34:49:0:0 chr3 159744440 . C T 733.99 PASS AO=76;DP=78;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.120236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.4495;QD=37.1643;RBI=0.124302;REFB=-0.0680686;REVB=0.0315314;RO=1;SAF=46;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101772;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00212151;OID=.;OPOS=159744440;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:78:79:1:0:76:79:30:46:1:0:30:49:0:0 chr3 159997061 . T A 540.73 PASS AO=117;DP=219;FAO=118;FDP=222;FR=.;FRO=104;FSAF=55;FSAR=63;FSRF=72;FSRR=32;FWDB=0.00232063;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.351;QD=9.74296;RBI=0.00278759;REFB=-0.0057753;REVB=-0.00154444;RO=101;SAF=54;SAR=63;SRF=71;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203187;STB=0.604928;TYPE=snp;VARB=0.00530594;OID=.;OPOS=159997061;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:219:222:101:104:117:118:63:54:71:30:63:55:72:32 chr3 160151452 . C CA 36.28 PASS AO=27;DP=94;FAO=32;FDP=92;FR=.;FRO=60;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=30;FSRR=30;FWDB=0.0211417;FXX=0.0212743;HRUN=6;LEN=1;MLLD=12.3828;QD=1.57742;RBI=0.100221;REFB=-0.0731051;REVB=0.0979661;RO=60;SAF=10;SAR=17;SRF=28;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116424;STB=0.628488;TYPE=ins;VARB=0.113714;OID=.;OPOS=160151453;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:27:94:32:92:60:10:22:30:30:36:60:10:17:28:32 chr3 160396176 . G A 318.69 PASS AO=75;DP=158;FAO=77;FDP=160;FR=.;FRO=83;FSAF=18;FSAR=59;FSRF=31;FSRR=52;FWDB=0.0151683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.992;QD=7.96726;RBI=0.0177046;REFB=-0.00541907;REVB=0.00913097;RO=82;SAF=18;SAR=57;SRF=30;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148046;STB=0.591302;TYPE=snp;VARB=0.00529312;OID=.;OPOS=160396176;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:160:82:83:75:77:57:18:30:52:59:18:31:52 chr3 160967354 . G A 243.25 PASS AO=76;DP=193;FAO=76;FDP=191;FR=.;FRO=115;FSAF=35;FSAR=41;FSRF=53;FSRR=62;FWDB=-0.0231095;FXX=0.0103622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.9539;QD=5.09425;RBI=0.0297399;REFB=-0.00307222;REVB=-0.0187193;RO=109;SAF=35;SAR=41;SRF=48;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0213622;STB=0.500208;TYPE=snp;VARB=0.00318452;OID=.;OPOS=160967354;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:191:109:115:76:76:41:35:48:61:41:35:53:62 chr3 161221705 . A C 189.61 PASS AO=38;DP=69;FAO=38;FDP=69;FR=.;FRO=31;FSAF=33;FSAR=5;FSRF=27;FSRR=4;FWDB=0.0530149;FXX=0.028165;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.8111;QD=10.9917;RBI=0.0611056;REFB=0.0208628;REVB=-0.0303861;RO=29;SAF=33;SAR=5;SRF=25;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108193;STB=0.502511;TYPE=snp;VARB=-0.010537;OID=.;OPOS=161221705;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:29:31:38:38:5:33:25:4:5:33:27:4 chr3 164714532 . C T 662.49 PASS AO=190;DP=422;FAO=179;FDP=400;FR=.;FRO=221;FSAF=78;FSAR=101;FSRF=114;FSRR=107;FWDB=-0.0284782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.8955;QD=6.62492;RBI=0.0373611;REFB=-0.0134478;REVB=-0.0241835;RO=232;SAF=84;SAR=106;SRF=117;SRR=115;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0622029;STB=0.544469;TYPE=snp;VARB=0.0162377;OID=.;OPOS=164714532;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:422:400:232:221:190:179:106:84:117:115:101:78:114:107 chr3 164793758 . C A 569.51 PASS AO=234;DP=574;FAO=167;FDP=397;FR=.;FRO=230;FSAF=70;FSAR=97;FSRF=118;FSRR=112;FWDB=0.0208016;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.081;QD=5.73815;RBI=0.0210401;REFB=-0.011742;REVB=0.00315901;RO=337;SAF=88;SAR=146;SRF=173;SRR=164;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148352;STB=0.554852;TYPE=snp;VARB=0.014972;OID=.;OPOS=164793758;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:574:397:337:230:234:167:146:88:173:164:97:70:118:112 chr3 164905688 . G A 338.67 PASS AO=69;DP=172;FAO=89;FDP=192;FR=.;FRO=103;FSAF=48;FSAR=41;FSRF=57;FSRR=46;FWDB=0.00800021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.115;QD=7.05569;RBI=0.0346463;REFB=-0.0175911;REVB=0.03371;RO=99;SAF=41;SAR=28;SRF=57;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.019986;STB=0.507604;TYPE=snp;VARB=0.0221451;OID=.;OPOS=164905688;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:192:99:103:69:89:28:41:57:42:41:48:57:46 chr3 165951073 . C A 346.52 PASS AO=85;DP=178;FAO=85;FDP=178;FR=.;FRO=93;FSAF=34;FSAR=51;FSRF=44;FSRR=49;FWDB=0.0777171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.158;QD=7.78701;RBI=0.0777261;REFB=-0.0157616;REVB=0.00117767;RO=92;SAF=34;SAR=51;SRF=43;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0650764;STB=0.539161;TYPE=snp;VARB=0.0234487;OID=.;OPOS=165951073;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:178:92:93:85:85:51:34:43:49:51:34:44:49 chr3 167023738 . G C 435.33 PASS AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00490741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.08;QD=37.8551;RBI=0.0141787;REFB=0;REVB=-0.0133024;RO=0;SAF=12;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.12678e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.5331e-05;OID=.;OPOS=167023738;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:46:46:0:0:46:46:34:12:0:0:34:12:0:0 chr3 167034814 . T C 1288.77 PASS AO=185;DP=188;FAO=137;FDP=139;FR=.;FRO=2;FSAF=85;FSAR=52;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0181695;FXX=0.00714235;HRUN=3;LEN=1;MLLD=181.631;QD=37.087;RBI=0.0349832;REFB=-0.117851;REVB=0.0298946;RO=0;SAF=114;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505813;TYPE=snp;VARB=0.000224981;OID=.;OPOS=167034814;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:188:139:0:2:185:137:71:114:0:0:52:85:2:0 chr3 167051769 . T C 893.01 PASS AO=119;DP=143;FAO=120;FDP=144;FR=.;FRO=24;FSAF=32;FSAR=88;FSRF=23;FSRR=1;FWDB=-0.00756455;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=132.092;QD=24.8058;RBI=0.0076712;REFB=-0.0329416;REVB=-0.00127471;RO=23;SAF=32;SAR=87;SRF=22;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235232;STB=0.62953;TYPE=snp;VARB=0.00133537;OID=.;OPOS=167051769;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:143:144:23:24:119:120:87:32:22:1:88:32:23:1 chr3 167068256 . T A 3447.67 PASS AO=379;DP=391;FAO=380;FDP=392;FR=.;FRO=12;FSAF=218;FSAR=162;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=0.070846;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=107.763;QD=35.1803;RBI=0.0709761;REFB=-0.154118;REVB=-0.00429563;RO=12;SAF=217;SAR=162;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106234;STB=0.505526;TYPE=snp;VARB=0.00137109;OID=.;OPOS=167068256;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:391:392:12:12:379:380:162:217:9:3:162:218:9:3 chr3 167077691 . T A 1313.46 PASS AO=137;DP=137;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00854957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.321;QD=38.3492;RBI=0.0103902;REFB=0;REVB=-0.00590432;RO=0;SAF=76;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.89364e-06;OID=.;OPOS=167077691;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:137:137:0:0:137:137:61:76:0:0:61:76:0:0 chr3 167159980 . A G 27.75 PASS AO=5;DP=18;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.00920253;FXX=0;HRUN=9;LEN=1;MLLD=19.2104;QD=5.28503;RBI=0.0361788;REFB=-0.0584074;REVB=-0.0349888;RO=13;SAF=2;SAR=3;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233544;STB=0.506313;TYPE=snp;VARB=0.0658883;OID=.;OPOS=167159980;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:18:21:13:13:5:8:3:2:8:5:3:5:8:5 chr3 167164187 . A G 387.84 PASS AO=103;DP=240;FAO=107;FDP=243;FR=.;FRO=136;FSAF=44;FSAR=63;FSRF=43;FSRR=93;FWDB=-0.00396465;FXX=0.00409819;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.124;QD=6.38425;RBI=0.0286487;REFB=-0.00195005;REVB=0.0283731;RO=134;SAF=44;SAR=59;SRF=42;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120877;STB=0.556004;TYPE=snp;VARB=0.00251776;OID=.;OPOS=167164187;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:240:243:134:136:103:107:59:44:42:92:63:44:43:93 chr3 167167100 . C T 359.94 PASS AO=89;DP=185;FAO=88;FDP=184;FR=.;FRO=96;FSAF=41;FSAR=47;FSRF=50;FSRR=46;FWDB=-0.0397135;FXX=0.00540511;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.4316;QD=7.82471;RBI=0.0452603;REFB=0.00371917;REVB=0.0217102;RO=96;SAF=42;SAR=47;SRF=50;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0460174;STB=0.528671;TYPE=snp;VARB=-0.00371738;OID=.;OPOS=167167100;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:184:96:96:89:88:47:42:50:46:47:41:50:46 chr3 167167186 . T A 1419.19 PASS AO=147;DP=148;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00592375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.53;QD=38.3564;RBI=0.00947533;REFB=0;REVB=0.00739534;RO=0;SAF=63;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.98315e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.97661e-05;OID=.;OPOS=167167186;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:148:148:0:0:147:148:84:63:0:0:85:63:0:0 chr3 167184875 . ATCT AT,ATCC 1049.05 PASS AO=62,45;DP=129;FAO=71,45;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=71,0;FSAR=0,45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.167476,0.126596;FXX=0.0169477;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=137.071,137.277;QD=36.1742;RBI=0.167644,0.12778;REFB=-0.132206,-0.0791229;REVB=-0.00749682,-0.0173528;RO=2;SAF=62,0;SAR=0,45;SRF=2;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-0.889065;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.00454706,-1.94183e-05;OID=.,.;OPOS=167184876,167184878;OREF=TC,T;OALT=-,C;OMAPALT=AT,ATCC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:62,45:116:71,45:116:0:71,0:0,45:0:0:99:2:62,0:0,45:2:0 chr3 167189607 . A C 187.35 PASS AO=53;DP=127;FAO=53;FDP=127;FR=.;FRO=74;FSAF=23;FSAR=30;FSRF=36;FSRR=38;FWDB=0.0111084;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.988;QD=5.90067;RBI=0.0367906;REFB=-0.00216242;REVB=0.0350735;RO=73;SAF=23;SAR=30;SRF=35;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.047394;STB=0.530882;TYPE=snp;VARB=0.00465998;OID=.;OPOS=167189607;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:73:74:53:53:30:23:35:38:30:23:36:38 chr3 167217960 . C T 272.86 PASS AO=41;DP=156;FAO=72;FDP=161;FR=.;FRO=89;FSAF=39;FSAR=33;FSRF=47;FSRR=42;FWDB=-0.000485611;FXX=0.0182916;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.7214;QD=6.77914;RBI=0.0233058;REFB=0.00245574;REVB=-0.0233008;RO=48;SAF=32;SAR=9;SRF=29;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212706;STB=0.507546;TYPE=snp;VARB=-0.00799799;OID=.;OPOS=167217960;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:161:48:89:41:72:9:32:29:19:33:39:47:42 chr3 167217964 . A G 1594.56 PASS AO=158;DP=162;FAO=167;FDP=167;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.6;QD=38.1931;RBI=0.0223176;REFB=0;REVB=0.0148164;RO=0;SAF=83;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.38974e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.75244e-05;OID=.;OPOS=167217964;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:162:167:0:0:158:167:75:83:0:0:78:89:0:0 chr3 168538993 . A G 2509.91 PASS AO=251;DP=251;FAO=264;FDP=264;FR=.;FRO=0;FSAF=125;FSAR=139;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288799;FXX=0.00377344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.243;QD=38.0289;RBI=0.0303964;REFB=0;REVB=0.00948129;RO=0;SAF=120;SAR=131;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000771212;OID=.;OPOS=168538993;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:251:264:0:0:251:264:131:120:0:0:139:125:0:0 chr3 168546914 . C T 211.62 PASS AO=74;DP=205;FAO=74;FDP=205;FR=.;FRO=131;FSAF=13;FSAR=61;FSRF=16;FSRR=115;FWDB=0.059943;FXX=0.00485413;HRUN=3;LEN=1;MLLD=154.409;QD=4.12907;RBI=0.0602623;REFB=-0.0179058;REVB=-0.00619585;RO=130;SAF=13;SAR=61;SRF=15;SRR=115;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129361;STB=0.563948;TYPE=snp;VARB=0.0388829;OID=.;OPOS=168546914;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:205:130:131:74:74:61:13:15:115:61:13:16:115 chr3 168810874 . C T 386.49 PASS AO=80;DP=145;FAO=80;FDP=144;FR=.;FRO=64;FSAF=29;FSAR=51;FSRF=25;FSRR=39;FWDB=-0.00697958;FXX=0.00689608;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.374;QD=10.7358;RBI=0.015261;REFB=-0.0187885;REVB=-0.0135714;RO=63;SAF=29;SAR=51;SRF=25;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0296905;STB=0.513419;TYPE=snp;VARB=0.0162499;OID=.;OPOS=168810874;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:144:63:64:80:80:51:29:25:38:51:29:25:39 chr3 169802788 . T TAA 92.87 PASS AO=35;DP=138;FAO=46;FDP=121;FR=.;FRO=75;FSAF=15;FSAR=31;FSRF=45;FSRR=30;FWDB=0.0631975;FXX=0.0546832;HRUN=4;LEN=2;MLLD=29.9615;QD=3.07016;RBI=0.0636841;REFB=-0.00729894;REVB=0.0078575;RO=88;SAF=8;SAR=27;SRF=54;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.464024;STB=0.670196;TYPE=ins;VARB=0.0100644;OID=.;OPOS=169802789;OREF=-;OALT=AA;OMAPALT=TAA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:35:138:46:121:75:15:31:45:30:92:88:8:27:54:34 chr3 169802930 . G T 204.73 PASS AO=57;DP=138;FAO=58;FDP=139;FR=.;FRO=81;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=42;FSRR=39;FWDB=-0.0532862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.166;QD=5.89151;RBI=0.0553907;REFB=-0.0208389;REVB=-0.0151233;RO=78;SAF=28;SAR=29;SRF=40;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0222365;STB=0.510788;TYPE=snp;VARB=0.033672;OID=.;OPOS=169802930;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:139:78:81:57:58:29:28:40:38:29:29:42:39 chr3 169806170 . G A 147.04 PASS AO=43;DP=107;FAO=43;FDP=107;FR=.;FRO=64;FSAF=14;FSAR=29;FSRF=30;FSRR=34;FWDB=-0.0595347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.2334;QD=5.49685;RBI=0.0612288;REFB=-0.0113811;REVB=0.0143032;RO=63;SAF=14;SAR=29;SRF=30;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167638;STB=0.591244;TYPE=snp;VARB=0.0150507;OID=.;OPOS=169806170;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:63:64:43:43:29:14:30:33:29:14:30:34 chr3 169894680 . G A 1217.66 PASS AO=132;DP=136;FAO=133;FDP=136;FR=.;FRO=3;FSAF=85;FSAR=48;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0116687;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=218.985;QD=35.8134;RBI=0.028334;REFB=0.00899551;REVB=-0.0258197;RO=3;SAF=84;SAR=48;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00138275;STB=0.500659;TYPE=snp;VARB=-0.000164575;OID=.;OPOS=169894680;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:136:136:3:3:132:133:48:84:2:1:48:85:2:1 chr3 169988286 . C T 243.49 PASS AO=53;DP=99;FAO=52;FDP=98;FR=.;FRO=46;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=-0.00142744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.582;QD=9.93843;RBI=0.00701792;REFB=0.00239463;REVB=0.00687122;RO=45;SAF=30;SAR=23;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0463665;STB=0.536552;TYPE=snp;VARB=-0.00177721;OID=.;OPOS=169988286;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:98:45:46:53:52:23:30:23:22:22:30:23:23 chr3 170078232 . C T 235.46 PASS AO=54;DP=110;FAO=54;FDP=109;FR=.;FRO=55;FSAF=23;FSAR=31;FSRF=19;FSRR=36;FWDB=-0.00992773;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.455;QD=8.64073;RBI=0.0149299;REFB=-0.016592;REVB=-0.0111509;RO=55;SAF=23;SAR=31;SRF=19;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0760955;STB=0.542018;TYPE=snp;VARB=0.0146011;OID=.;OPOS=170078232;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:109:55:55:54:54:31:23:19:36:31:23:19:36 chr3 170140971 . GCC GC,G 319.06 PASS AO=40,8;DP=52;FAO=53,0;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=30,0;FSAR=23,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0704883,-0.0386428;FXX=0.0185151;HRUN=3,3;LEN=1,2;MLLD=14.0426,8.33054;QD=24.0799;RBI=0.340394,0.17636;REFB=-0.0267804,-0.0326187;REVB=-0.333015,-0.172074;RO=2;SAF=22,3;SAR=18,5;SRF=2;SRR=0;SSEN=0.588235,0.588235;SSEP=0,0;SSSB=-0.0407438,-0.218484;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=-0.00325184,0;OID=.,.;OPOS=170140972,170140972;OREF=C,CC;OALT=-,-;OMAPALT=GC,G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:40,8:53:53,0:53:0:30,0:23,0:0:0:25:2:22,3:18,5:2:0 chr3 170198898 . C T 93.52 PASS AO=16;DP=28;FAO=16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=9;FWDB=-0.00788728;FXX=0.0714031;HRUN=4;LEN=1;MLLD=247.532;QD=14.3876;RBI=0.0134088;REFB=-0.0110754;REVB=0.0108437;RO=10;SAF=5;SAR=11;SRF=1;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184742;STB=0.602295;TYPE=snp;VARB=0.0124482;OID=.;OPOS=170198898;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:28:26:10:10:16:16:11:5:1:9:11:5:1:9 chr3 170587834 . A G 151.24 PASS AO=56;DP=163;FAO=56;FDP=164;FR=.;FRO=108;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=52;FSRR=56;FWDB=0.0143618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.681;QD=3.68888;RBI=0.0335686;REFB=-0.0105808;REVB=-0.0303412;RO=106;SAF=26;SAR=30;SRF=51;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0193011;STB=0.51136;TYPE=snp;VARB=0.0166413;OID=.;OPOS=170587834;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:164:106:108:56:56:30:26:51:55:30:26:52:56 chr3 170802910 . C T 355.44 PASS AO=115;DP=304;FAO=117;FDP=306;FR=.;FRO=189;FSAF=75;FSAR=42;FSRF=83;FSRR=106;FWDB=0.0500962;FXX=0.0755264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.0329;QD=4.64626;RBI=0.0501231;REFB=-0.0317695;REVB=-0.00164298;RO=156;SAF=76;SAR=39;SRF=76;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186297;STB=0.625824;TYPE=snp;VARB=0.0418932;OID=.;OPOS=170802910;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:304:306:156:189:115:117:39:76:76:80:42:75:83:106 chr3 170811667 . G A 235.85 PASS AO=58;DP=123;FAO=58;FDP=123;FR=.;FRO=65;FSAF=40;FSAR=18;FSRF=44;FSRR=21;FWDB=-0.0372421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.526;QD=7.66983;RBI=0.037249;REFB=-0.0178526;REVB=0.000716379;RO=64;SAF=40;SAR=18;SRF=44;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00237757;STB=0.50781;TYPE=snp;VARB=0.0189962;OID=.;OPOS=170811667;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:64:65:58:58:18:40:44:20:18:40:44:21 chr3 170825905 . C G 1273.12 PASS AO=134;DP=134;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0187037;FXX=0.0220572;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.499;QD=38.2892;RBI=0.0220109;REFB=0;REVB=-0.0116038;RO=0;SAF=54;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.87219e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.10726e-05;OID=.;OPOS=170825905;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:134:133:0:0:134:133:80:54:0:0:80:53:0:0 chr3 170843782 . C A 469 PASS AO=83;DP=132;FAO=84;FDP=132;FR=.;FRO=48;FSAF=44;FSAR=40;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=0.0109778;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.213;QD=14.2121;RBI=0.018633;REFB=-0.0314976;REVB=0.0150558;RO=47;SAF=43;SAR=40;SRF=22;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0334358;STB=0.516242;TYPE=snp;VARB=0.0131908;OID=.;OPOS=170843782;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:47:48:83:84:40:43:22:25:40:44:23:25 chr3 171065031 . G C 262.94 PASS AO=25;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153339;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.009;QD=37.5625;RBI=0.0250949;REFB=0;REVB=-0.0198652;RO=0;SAF=7;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.65984e-08;OID=.;OPOS=171065031;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:28:28:0:0:25:28:18:7:0:0:21:7:0:0 chr3 171338237 . T G 279.27 PASS AO=67;DP=139;FAO=67;FDP=139;FR=.;FRO=72;FSAF=39;FSAR=28;FSRF=38;FSRR=34;FWDB=-0.00789702;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.7025;QD=8.03654;RBI=0.0137624;REFB=-0.00634929;REVB=-0.0112712;RO=72;SAF=39;SAR=28;SRF=38;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0517373;STB=0.528632;TYPE=snp;VARB=0.00710717;OID=.;OPOS=171338237;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:72:72:67:67:28:39:38:34:28:39:38:34 chr3 171844787 . A T 560.73 PASS AO=128;DP=246;FAO=127;FDP=246;FR=.;FRO=119;FSAF=67;FSAR=60;FSRF=66;FSRR=53;FWDB=0.0183963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.259;QD=9.11762;RBI=0.0273539;REFB=-0.0315259;REVB=0.0202438;RO=118;SAF=68;SAR=60;SRF=65;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0172791;STB=0.513148;TYPE=snp;VARB=0.0288707;OID=.;OPOS=171844787;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:246:246:118:119:128:127:60:68:65:53:60:67:66:53 chr3 172034271 . T C 410.16 PASS AO=110;DP=250;FAO=111;FDP=251;FR=.;FRO=140;FSAF=29;FSAR=82;FSRF=59;FSRR=81;FWDB=0.00106191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.05;QD=6.53645;RBI=0.00346695;REFB=0.00398375;REVB=0.00330032;RO=140;SAF=28;SAR=82;SRF=59;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196479;STB=0.604183;TYPE=snp;VARB=-0.00517406;OID=.;OPOS=172034271;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:250:251:140:140:110:111:82:28:59:81:82:29:59:81 chr3 172046861 . T C 380.44 PASS AO=100;DP=221;FAO=100;FDP=221;FR=.;FRO=121;FSAF=37;FSAR=63;FSRF=56;FSRR=65;FWDB=-0.0338727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.982;QD=6.88579;RBI=0.0543052;REFB=-0.00916484;REVB=0.0424465;RO=121;SAF=37;SAR=63;SRF=56;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0954486;STB=0.552986;TYPE=snp;VARB=0.0105382;OID=.;OPOS=172046861;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:221:121:121:100:100:63:37:56:65:63:37:56:65 chr3 172165727 . C T 56.21 PASS AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.000996027;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=242.05;QD=8.99305;RBI=0.00109764;REFB=-0.00597946;REVB=-0.000461232;RO=13;SAF=5;SAR=7;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177348;STB=0.602479;TYPE=snp;VARB=0.00598717;OID=.;OPOS=172165727;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:25:25:13:13:12:12:7:5:8:5:7:5:8:5 chr3 172166033 . G A 144.99 PASS AO=16;DP=18;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0436458;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.0306;QD=32.2198;RBI=0.060309;REFB=-0.102203;REVB=0.0416198;RO=1;SAF=9;SAR=7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0481057;STB=0.523782;TYPE=snp;VARB=0.0182462;OID=.;OPOS=172166033;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:18:18:1:1:16:17:7:9:1:0:7:10:1:0 chr3 172348906 . A ACCTC 45.08 PASS AO=23;DP=93;FAO=23;FDP=90;FR=.;FRO=67;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=57;FSRR=10;FWDB=-0.00550414;FXX=0.0322546;HRUN=2;LEN=4;MLLD=285.501;QD=2.00366;RBI=0.00834475;REFB=0.00259018;REVB=0.0062721;RO=69;SAF=17;SAR=6;SRF=58;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183502;STB=0.620023;TYPE=ins;VARB=-0.00841684;OID=.;OPOS=172348907;OREF=-;OALT=CCTC;OMAPALT=ACCTC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:23:93:23:90:67:17:6:57:10:45:69:17:6:58:11 chr3 172428782 . T C 626.94 PASS AO=65;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.040548;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.63;QD=37.9963;RBI=0.0449135;REFB=0;REVB=-0.0193153;RO=0;SAF=14;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000326236;OID=.;OPOS=172428782;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:66:66:0:0:65:66:51:14:0:0:52:14:0:0 chr3 172489076 . C T 985.94 PASS AO=105;DP=106;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00132547;FXX=0.00943307;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.612;QD=37.5596;RBI=0.0202079;REFB=-0.0863513;REVB=-0.0201644;RO=1;SAF=88;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0270912;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000189137;OID=.;OPOS=172489076;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:106:105:1:0:105:105:17:88:0:1:17:88:0:0 chr3 172514294 . G A 1270.86 PASS AO=120;DP=128;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.034652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.8501;QD=37.936;RBI=0.087624;REFB=0;REVB=0.0804811;RO=0;SAF=65;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000536562;OID=.;OPOS=172514294;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:128:134:0:0:120:134:55:65:0:0:61:73:0:0 chr3 172835082 . C T 288.43 PASS AO=79;DP=188;FAO=79;FDP=182;FR=.;FRO=103;FSAF=34;FSAR=45;FSRF=47;FSRR=56;FWDB=0.0132762;FXX=0.0319132;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.236;QD=6.33915;RBI=0.0140462;REFB=-0.0193686;REVB=0.00458663;RO=103;SAF=34;SAR=45;SRF=47;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0267214;STB=0.514899;TYPE=snp;VARB=0.0246609;OID=.;OPOS=172835082;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:182:103:103:79:79:45:34:47:56:45:34:47:56 chr3 172835125 . T C 425.78 PASS AO=95;DP=194;FAO=104;FDP=207;FR=.;FRO=103;FSAF=52;FSAR=52;FSRF=59;FSRR=44;FWDB=0.00818421;FXX=0.00480746;HRUN=3;LEN=1;MLLD=128.84;QD=8.22758;RBI=0.0129127;REFB=-0.0205682;REVB=0.0099878;RO=97;SAF=44;SAR=51;SRF=55;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0951621;STB=0.536225;TYPE=snp;VARB=0.0198906;OID=.;OPOS=172835125;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:207:97:103:95:104:51:44:55:42:52:52:59:44 chr3 172835290 . C T 396.1 PASS AO=92;DP=196;FAO=97;FDP=202;FR=.;FRO=105;FSAF=35;FSAR=62;FSRF=43;FSRR=62;FWDB=-0.00247107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.664;QD=7.84362;RBI=0.00507942;REFB=-0.00271277;REVB=-0.00443783;RO=104;SAF=33;SAR=59;SRF=43;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.056047;STB=0.527021;TYPE=snp;VARB=0.00264103;OID=.;OPOS=172835290;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:202:104:105:92:97:59:33:43:61:62:35:43:62 chr3 173997153 . G A 275.14 PASS AO=83;DP=229;FAO=90;FDP=234;FR=.;FRO=144;FSAF=39;FSAR=51;FSRF=78;FSRR=66;FWDB=0.0126932;FXX=0.016806;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.329;QD=4.7032;RBI=0.013125;REFB=0.00206064;REVB=0.00333896;RO=145;SAF=37;SAR=46;SRF=77;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0955581;STB=0.566652;TYPE=snp;VARB=-0.00282225;OID=.;OPOS=173997153;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:229:234:145:144:83:90:46:37:77:68:51:39:78:66 chr3 174581888 . T C 86.07 PASS AO=22;DP=54;FAO=23;FDP=55;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=23;FWDB=0.0230778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.737;QD=6.25931;RBI=0.0318848;REFB=-0.0269699;REVB=-0.0220013;RO=32;SAF=13;SAR=9;SRF=9;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.311942;STB=0.660886;TYPE=snp;VARB=0.040236;OID=.;OPOS=174581888;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:54:55:32:32:22:23:9:13:9:23:10:13:9:23 chr3 174814920 . A G 433.26 PASS AO=100;DP=198;FAO=100;FDP=198;FR=.;FRO=98;FSAF=59;FSAR=41;FSRF=34;FSRR=64;FWDB=0.0291977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.716;QD=8.75277;RBI=0.0292065;REFB=-0.00865543;REVB=-0.000716103;RO=97;SAF=59;SAR=41;SRF=34;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21295;STB=0.618981;TYPE=snp;VARB=0.00369016;OID=.;OPOS=174814920;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:198:97:98:100:100:41:59:34:63:41:59:34:64 chr3 175165079 . C T 669.25 PASS AO=73;DP=75;FAO=73;FDP=75;FR=.;FRO=2;FSAF=41;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0164548;FXX=0.0259707;HRUN=4;LEN=1;MLLD=147.55;QD=35.6933;RBI=0.0249601;REFB=-0.115924;REVB=-0.0187682;RO=2;SAF=41;SAR=32;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00315477;STB=0.501668;TYPE=snp;VARB=0.00119781;OID=.;OPOS=175165079;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:75:75:2:2:73:73:32:41:1:1:32:41:1:1 chr3 175189447 . G A 108.47 PASS AO=34;DP=117;FAO=41;FDP=122;FR=.;FRO=81;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=36;FSRR=45;FWDB=0.0161733;FXX=0.0161277;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.997;QD=3.55649;RBI=0.0194538;REFB=-0.00625297;REVB=-0.0108109;RO=73;SAF=15;SAR=19;SRF=31;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0196481;STB=0.528832;TYPE=snp;VARB=0.0120474;OID=.;OPOS=175189447;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:122:73:81:34:41:19:15:31:42:21:20:36:45 chr3 175327309 . G A 3835.12 PASS AO=410;DP=410;FAO=400;FDP=400;FR=.;FRO=0;FSAF=194;FSAR=206;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.121642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.1991;QD=38.3512;RBI=0.126548;REFB=0;REVB=-0.0348958;RO=0;SAF=189;SAR=221;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.07713e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000199562;OID=.;OPOS=175327309;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:410:400:0:0:410:400:221:189:0:0:206:194:0:0 chr3 175345143 . C G 1505.54 PASS AO=158;DP=161;FAO=161;FDP=161;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00555498;FXX=0.00617246;HRUN=3;LEN=1;MLLD=256.246;QD=37.4048;RBI=0.00574207;REFB=-0.00699725;REVB=0.00145385;RO=1;SAF=70;SAR=88;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00674841;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.52222e-05;OID=.;OPOS=175345143;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:161:161:1:0:158:161:88:70:1:0:90:71:0:0 chr3 175473047 . T C 418.15 PASS AO=121;DP=287;FAO=121;FDP=287;FR=.;FRO=166;FSAF=55;FSAR=66;FSRF=94;FSRR=72;FWDB=0.0142357;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.4855;QD=5.82788;RBI=0.0509381;REFB=0.00981259;REVB=-0.0489085;RO=164;SAF=55;SAR=66;SRF=93;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115921;STB=0.564383;TYPE=snp;VARB=-0.0116201;OID=.;OPOS=175473047;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:287:287:164:166:121:121:66:55:93:71:66:55:94:72 chr3 176838514 . C G 648.7 PASS AO=54;DP=72;FAO=67;FDP=71;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=34;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.432;QD=36.5464;RBI=0.0193539;REFB=0;REVB=0.0124835;RO=0;SAF=30;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00522184;OID=.;OPOS=176838514;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:71:71:0:0:54:67:24:30:0:0:33:34:0:0 chr3 178546026 . T C 639.71 PASS AO=145;DP=281;FAO=145;FDP=281;FR=.;FRO=136;FSAF=85;FSAR=60;FSRF=58;FSRR=78;FWDB=-0.00890486;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.54;QD=9.10616;RBI=0.0192075;REFB=-0.0106968;REVB=0.0170186;RO=133;SAF=85;SAR=60;SRF=58;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132047;STB=0.577537;TYPE=snp;VARB=0.0107969;OID=.;OPOS=178546026;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:281:281:133:136:145:145:60:85:58:75:60:85:58:78 chr3 178560581 . A C 327.97 PASS AO=79;DP=166;FAO=80;FDP=167;FR=.;FRO=87;FSAF=42;FSAR=38;FSRF=49;FSRR=38;FWDB=-0.0621522;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=49.2401;QD=7.85567;RBI=0.0646955;REFB=-0.0133995;REVB=-0.0179613;RO=87;SAF=42;SAR=37;SRF=49;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0301193;STB=0.519995;TYPE=snp;VARB=0.0146719;OID=.;OPOS=178560581;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:167:87:87:79:80:37:42:49:38:38:42:49:38 chr3 178742690 . T C 263.55 PASS AO=65;DP=138;FAO=65;FDP=138;FR=.;FRO=73;FSAF=34;FSAR=31;FSRF=38;FSRR=35;FWDB=0.00742682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.39;QD=7.63908;RBI=0.00918654;REFB=-0.0127963;REVB=-0.00540692;RO=72;SAF=34;SAR=31;SRF=38;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00446866;STB=0.50134;TYPE=snp;VARB=0.0110758;OID=.;OPOS=178742690;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:72:73:65:65:31:34:38:34:31:34:38:35 chr3 178815528 . G A 888.32 PASS AO=184;DP=345;FAO=193;FDP=353;FR=.;FRO=160;FSAF=97;FSAR=96;FSRF=82;FSRR=78;FWDB=0.00202418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.7282;QD=10.0659;RBI=0.0146931;REFB=-0.045532;REVB=0.014553;RO=150;SAF=92;SAR=92;SRF=81;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0330567;STB=0.504491;TYPE=snp;VARB=0.0391549;OID=.;OPOS=178815528;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:345:353:150:160:184:193:92:92:81:69:96:97:82:78 chr3 178968634 . C T 172.11 PASS AO=54;DP=140;FAO=54;FDP=141;FR=.;FRO=87;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=30;FSRR=57;FWDB=0.000625563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.4355;QD=4.88246;RBI=0.0138078;REFB=-0.0327185;REVB=0.0137936;RO=86;SAF=24;SAR=30;SRF=30;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106723;STB=0.563084;TYPE=snp;VARB=0.0421275;OID=.;OPOS=178968634;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:141:86:87:54:54:30:24:30:56:30:24:30:57 chr3 178976777 . C T 872.98 PASS AO=96;DP=98;FAO=96;FDP=98;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=81;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0457266;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3421;QD=35.6318;RBI=0.0488848;REFB=-0.0542698;REVB=0.017286;RO=2;SAF=15;SAR=81;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0591244;STB=0.531243;TYPE=snp;VARB=0.00323043;OID=.;OPOS=178976777;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:98:98:2:2:96:96:81:15:2:0:81:15:2:0 chr3 179096508 . C G 1215.25 PASS AO=141;DP=157;FAO=141;FDP=151;FR=.;FRO=10;FSAF=60;FSAR=81;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.00250302;FXX=0.0382141;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.1556;QD=32.192;RBI=0.0298316;REFB=0.0054801;REVB=0.0297264;RO=6;SAF=60;SAR=81;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00589731;STB=0.50173;TYPE=snp;VARB=-0.00123544;OID=.;OPOS=179096508;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:157:151:6:10:141:141:81:60:3:3:81:60:4:6 chr3 179114529 . GATTA G 188.36 PASS AO=42;DP=86;FAO=42;FDP=83;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=0.00412963;FXX=0.0348797;HRUN=1;LEN=4;MLLD=250.404;QD=9.07776;RBI=0.00874755;REFB=0.0110308;REVB=0.0077114;RO=35;SAF=14;SAR=28;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0603634;STB=0.543838;TYPE=del;VARB=-0.00890343;OID=.;OPOS=179114530;OREF=ATTA;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:42:81:42:83:41:14:28:17:24:99:35:14:28:14:21 chr3 179137273 . A G 289.75 PASS AO=90;DP=224;FAO=89;FDP=223;FR=.;FRO=134;FSAF=37;FSAR=52;FSRF=51;FSRR=83;FWDB=-0.0131142;FXX=0.00446409;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.05;QD=5.1973;RBI=0.0134769;REFB=-0.00668241;REVB=-0.00310532;RO=133;SAF=37;SAR=53;SRF=51;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0305736;STB=0.521884;TYPE=snp;VARB=0.0103402;OID=.;OPOS=179137273;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:224:223:133:134:90:89:53:37:51:82:52:37:51:83 chr3 179298999 . C T 3550.07 PASS AO=370;DP=371;FAO=370;FDP=370;FR=.;FRO=0;FSAF=128;FSAR=242;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00283323;FXX=0.00269535;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.557;QD=38.3791;RBI=0.00876718;REFB=0;REVB=-0.00829677;RO=0;SAF=128;SAR=242;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.77444e-05;OID=.;OPOS=179298999;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:371:370:0:0:370:370:242:128:0:0:242:128:0:0 chr3 179879730 . G A 87.65 PASS AO=23;DP=53;FAO=23;FDP=53;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=-0.0153074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.096;QD=6.61492;RBI=0.0153284;REFB=0.00637242;REVB=0.00080133;RO=30;SAF=12;SAR=11;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120645;STB=0.568569;TYPE=snp;VARB=-0.00662749;OID=.;OPOS=179879730;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:53:53:30:30:23:23:11:12:12:18:11:12:12:18 chr3 180320047 . G T 181.62 PASS AO=35;DP=61;FAO=35;FDP=61;FR=.;FRO=26;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.0221091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.249;QD=11.9093;RBI=0.0253617;REFB=-0.02262;REVB=0.012426;RO=26;SAF=19;SAR=16;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0332827;STB=0.518334;TYPE=snp;VARB=0.0523166;OID=.;OPOS=180320047;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:26:26:35:35:16:19:13:13:16:19:13:13 chr3 180320048 . C T 182.21 PASS AO=35;DP=61;FAO=35;FDP=61;FR=.;FRO=26;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.00110301;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.6732;QD=11.9481;RBI=0.0830581;REFB=-0.0175489;REVB=0.0830508;RO=26;SAF=19;SAR=16;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0332827;STB=0.518334;TYPE=snp;VARB=0.0446787;OID=.;OPOS=180320048;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:26:26:35:35:16:19:13:13:16:19:13:13 chr3 180325487 . T C 255.17 PASS AO=52;DP=108;FAO=58;FDP=114;FR=.;FRO=56;FSAF=22;FSAR=36;FSRF=22;FSRR=34;FWDB=0.116046;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.3461;QD=8.95329;RBI=0.137873;REFB=-0.067337;REVB=0.0744463;RO=56;SAF=17;SAR=35;SRF=22;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0680094;STB=0.50704;TYPE=snp;VARB=0.0832448;OID=.;OPOS=180325487;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:114:56:56:52:58:35:17:22:34:36:22:22:34 chr3 180334623 . C T 299.16 PASS AO=96;DP=251;FAO=97;FDP=252;FR=.;FRO=155;FSAF=55;FSAR=42;FSRF=65;FSRR=90;FWDB=-0.00909817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.058;QD=4.74853;RBI=0.0120515;REFB=-0.00360536;REVB=-0.00790321;RO=150;SAF=55;SAR=41;SRF=64;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157886;STB=0.590225;TYPE=snp;VARB=0.00546344;OID=.;OPOS=180334623;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:251:252:150:155:96:97:41:55:64:86:42:55:65:90 chr3 180365956 . G A 326.5 PASS AO=85;DP=188;FAO=85;FDP=187;FR=.;FRO=102;FSAF=37;FSAR=48;FSRF=44;FSRR=58;FWDB=-0.0374971;FXX=0.00531887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.313;QD=6.98401;RBI=0.0375043;REFB=-0.0137818;REVB=0.00073007;RO=101;SAF=37;SAR=48;SRF=43;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00952649;STB=0.502176;TYPE=snp;VARB=0.0165083;OID=.;OPOS=180365956;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:187:101:102:85:85:48:37:43:58:48:37:44:58 chr3 180377529 . G C 304.43 PASS AO=72;DP=149;FAO=72;FDP=148;FR=.;FRO=76;FSAF=20;FSAR=52;FSRF=17;FSRR=59;FWDB=0.0198418;FXX=0.0133324;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.6412;QD=8.22774;RBI=0.0199721;REFB=0.000482478;REVB=-0.00227717;RO=70;SAF=20;SAR=52;SRF=15;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0736734;STB=0.535705;TYPE=snp;VARB=-0.000573324;OID=.;OPOS=180377529;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:148:70:76:72:72:52:20:15:55:52:20:17:59 chr3 182631792 . C A 425.61 PASS AO=104;DP=218;FAO=104;FDP=216;FR=.;FRO=112;FSAF=33;FSAR=71;FSRF=46;FSRR=66;FWDB=-0.0203643;FXX=0.00917389;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.7132;QD=7.88159;RBI=0.0371176;REFB=-0.00301226;REVB=0.0310325;RO=112;SAF=33;SAR=71;SRF=46;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0971772;STB=0.553691;TYPE=snp;VARB=0.0058151;OID=.;OPOS=182631792;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:218:216:112:112:104:104:71:33:46:66:71:33:46:66 chr3 182639272 . T C 211.16 PASS AO=59;DP=140;FAO=59;FDP=140;FR=.;FRO=81;FSAF=26;FSAR=33;FSRF=35;FSRR=46;FWDB=-0.0124651;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=182.109;QD=6.0331;RBI=0.0185841;REFB=-0.01392;REVB=-0.0137837;RO=81;SAF=26;SAR=33;SRF=35;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00898874;STB=0.505039;TYPE=snp;VARB=0.0174964;OID=.;OPOS=182639272;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:81:81:59:59:33:26:35:46:33:26:35:46 chr3 182681740 . C T 1753.59 PASS AO=183;DP=186;FAO=183;FDP=183;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=123;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0246766;FXX=0.0161282;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.174;QD=38.3298;RBI=0.0283717;REFB=0;REVB=0.0140005;RO=0;SAF=60;SAR=123;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.0666e-05;OID=.;OPOS=182681740;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:186:183:0:0:183:183:123:60:0:0:123:60:0:0 chr3 182755209 . T G 385.23 PASS AO=88;DP=215;FAO=106;FDP=236;FR=.;FRO=130;FSAF=41;FSAR=65;FSRF=56;FSRR=74;FWDB=-0.00434382;FXX=0.00421923;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.698;QD=6.52939;RBI=0.0199704;REFB=-0.01012;REVB=0.0194922;RO=126;SAF=27;SAR=61;SRF=55;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14928;STB=0.525237;TYPE=snp;VARB=0.0111968;OID=.;OPOS=182755209;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:236:126:130:88:106:61:27:55:71:65:41:56:74 chr3 182790249 . G A 250.91 PASS AO=66;DP=156;FAO=69;FDP=159;FR=.;FRO=90;FSAF=25;FSAR=44;FSRF=29;FSRR=61;FWDB=-0.00289264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.044;QD=6.3123;RBI=0.00584192;REFB=-0.0173716;REVB=0.0050755;RO=88;SAF=24;SAR=42;SRF=28;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0510594;STB=0.524888;TYPE=snp;VARB=0.0188782;OID=.;OPOS=182790249;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:159:88:90:66:69:42:24:28:60:44:25:29:61 chr3 182853554 . G A 447.96 PASS AO=115;DP=252;FAO=116;FDP=252;FR=.;FRO=136;FSAF=60;FSAR=56;FSRF=50;FSRR=86;FWDB=0.0156455;FXX=0.00787371;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.363;QD=7.11056;RBI=0.01577;REFB=-0.0024167;REVB=0.00197746;RO=136;SAF=59;SAR=56;SRF=50;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142211;STB=0.580368;TYPE=snp;VARB=0.0036807;OID=.;OPOS=182853554;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:252:252:136:136:115:116:56:59:50:86:56:60:50:86 chr3 182853670 . T C 437.68 PASS AO=91;DP=164;FAO=91;FDP=164;FR=.;FRO=73;FSAF=37;FSAR=54;FSRF=30;FSRR=43;FWDB=-0.00498615;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.158;QD=10.6751;RBI=0.00500841;REFB=-0.0140584;REVB=0.000471755;RO=73;SAF=37;SAR=54;SRF=30;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00368833;STB=0.502011;TYPE=snp;VARB=0.00663416;OID=.;OPOS=182853670;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:164:73:73:91:91:54:37:30:43:54:37:30:43 chr3 182871962 . C T 2089.06 PASS AO=219;DP=220;FAO=222;FDP=222;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=163;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0611086;FXX=0.00892817;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.836;QD=37.6406;RBI=0.0618494;REFB=-0.115509;REVB=0.00954413;RO=0;SAF=60;SAR=159;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.44126e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000317524;OID=.;OPOS=182871962;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:220:222:0:0:219:222:159:60:0:0:163:59:0:0 chr3 182925404 . T C 1900.54 PASS AO=191;DP=191;FAO=197;FDP=197;FR=.;FRO=0;FSAF=146;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.039834;FXX=0.0149993;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.8162;QD=38.5895;RBI=0.0409306;REFB=0;REVB=-0.0094106;RO=0;SAF=140;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92518e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000124634;OID=.;OPOS=182925404;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:89:191:197:0:0:191:197:51:140:0:0:51:146:0:0 chr3 183368216 . A T 384.42 PASS AO=93;DP=192;FAO=93;FDP=192;FR=.;FRO=99;FSAF=26;FSAR=67;FSRF=32;FSRR=67;FWDB=0.0129661;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=191.71;QD=8.00879;RBI=0.0141629;REFB=-0.00844956;REVB=-0.00569811;RO=98;SAF=26;SAR=67;SRF=32;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0527653;STB=0.527267;TYPE=snp;VARB=0.0126104;OID=.;OPOS=183368216;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:192:98:99:93:93:67:26:32:66:67:26:32:67 chr3 183368891 . C T 266.94 PASS AO=79;DP=193;FAO=79;FDP=193;FR=.;FRO=114;FSAF=39;FSAR=40;FSRF=35;FSRR=79;FWDB=0.0246533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.4537;QD=5.53248;RBI=0.110337;REFB=-0.0140913;REVB=-0.107547;RO=112;SAF=39;SAR=40;SRF=35;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19119;STB=0.610551;TYPE=snp;VARB=0.0202902;OID=.;OPOS=183368891;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:193:112:114:79:79:40:39:35:77:40:39:35:79 chr3 183432983 . C T 503.21 PASS AO=118;DP=236;FAO=118;FDP=236;FR=.;FRO=118;FSAF=45;FSAR=73;FSRF=52;FSRR=66;FWDB=0.00330397;FXX=0.00421923;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.24;QD=8.52897;RBI=0.0299939;REFB=-0.0166646;REVB=-0.0298114;RO=116;SAF=45;SAR=73;SRF=52;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0629673;STB=0.530964;TYPE=snp;VARB=0.0155915;OID=.;OPOS=183432983;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:236:236:116:118:118:118:73:45:52:64:73:45:52:66 chr3 183558402 . C G 413.42 PASS AO=129;DP=324;FAO=129;FDP=324;FR=.;FRO=195;FSAF=73;FSAR=56;FSRF=96;FSRR=99;FWDB=0.0163518;FXX=0.00613478;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9991;QD=5.10393;RBI=0.0253845;REFB=-0.00614992;REVB=-0.0194163;RO=192;SAF=73;SAR=56;SRF=93;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0874713;STB=0.544533;TYPE=snp;VARB=0.00841466;OID=.;OPOS=183558402;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:324:324:192:195:129:129:56:73:93:99:56:73:96:99 chr3 183560195 . A G 405.06 PASS AO=87;DP=162;FAO=87;FDP=162;FR=.;FRO=75;FSAF=45;FSAR=42;FSRF=40;FSRR=35;FWDB=-0.00801575;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=79.0551;QD=10.0014;RBI=0.0114044;REFB=-0.0206189;REVB=0.00811215;RO=75;SAF=45;SAR=42;SRF=40;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136434;STB=0.507461;TYPE=snp;VARB=0.0203327;OID=.;OPOS=183560195;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:162:75:75:87:87:42:45:40:35:42:45:40:35 chr3 183685534 . A G 125.51 PASS AO=32;DP=80;FAO=34;FDP=79;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=0.00501215;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.1449;QD=6.35501;RBI=0.0657742;REFB=-0.0263011;REVB=0.065583;RO=46;SAF=17;SAR=15;SRF=20;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0999068;STB=0.560795;TYPE=snp;VARB=0.0635427;OID=.;OPOS=183685534;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:79:46:45:32:34:15:17:20:26:16:18:19:26 chr3 183696402 . A G 497.77 PASS AO=93;DP=171;FAO=101;FDP=178;FR=.;FRO=77;FSAF=46;FSAR=55;FSRF=35;FSRR=42;FWDB=0.0395119;FXX=0.00558628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.532;QD=11.1859;RBI=0.0396462;REFB=-0.0251033;REVB=-0.00326034;RO=56;SAF=38;SAR=55;SRF=14;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117;STB=0.500392;TYPE=snp;VARB=0.0108505;OID=.;OPOS=183696402;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:178:56:77:93:101:55:38:14:42:55:46:35:42 chr3 183699516 . T C 161.96 PASS AO=32;DP=57;FAO=32;FDP=57;FR=.;FRO=25;FSAF=28;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.00558726;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=222.12;QD=11.3655;RBI=0.0131405;REFB=-0.00435289;REVB=-0.0118935;RO=25;SAF=28;SAR=4;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.380103;STB=0.714125;TYPE=snp;VARB=0.00295672;OID=.;OPOS=183699516;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:57:57:25:25:32:32:4:28:14:11:4:28:14:11 chr3 183754294 . G C 478.77 PASS AO=106;DP=201;FAO=106;FDP=202;FR=.;FRO=96;FSAF=49;FSAR=57;FSRF=50;FSRR=46;FWDB=-0.0553592;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.6069;QD=9.48061;RBI=0.0614085;REFB=0.0156357;REVB=-0.0265776;RO=95;SAF=49;SAR=57;SRF=50;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0554062;STB=0.527871;TYPE=snp;VARB=-0.0176917;OID=.;OPOS=183754294;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:202:95:96:106:106:57:49:50:45:57:49:50:46 chr3 183755822 . G A 241.07 PASS AO=59;DP=127;FAO=60;FDP=129;FR=.;FRO=69;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=21;FSRR=48;FWDB=0.0110984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.034;QD=7.47513;RBI=0.0370194;REFB=-0.0403029;REVB=0.0353166;RO=67;SAF=30;SAR=29;SRF=20;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201232;STB=0.604618;TYPE=snp;VARB=0.0351044;OID=.;OPOS=183755822;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:129:67:69:59:60:29:30:20:47:30:30:21:48 chr3 183756702 . G A 198.35 PASS AO=44;DP=87;FAO=44;FDP=87;FR=.;FRO=43;FSAF=14;FSAR=30;FSRF=6;FSRR=37;FWDB=0.0144864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.9537;QD=9.11949;RBI=0.0665206;REFB=-0.0545223;REVB=0.0649241;RO=39;SAF=14;SAR=30;SRF=6;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173956;STB=0.609839;TYPE=snp;VARB=0.0301545;OID=.;OPOS=183756702;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:39:43:44:44:30:14:6:33:30:14:6:37 chr3 183756742 . C T 217.13 PASS AO=47;DP=86;FAO=46;FDP=86;FR=.;FRO=40;FSAF=12;FSAR=34;FSRF=6;FSRR=34;FWDB=0.0430609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.159;QD=10.0991;RBI=0.0430849;REFB=-0.0173609;REVB=-0.00144051;RO=39;SAF=13;SAR=34;SRF=5;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166839;STB=0.5714;TYPE=snp;VARB=0.0206033;OID=.;OPOS=183756742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:39:40:47:46:34:13:5:34:34:12:6:34 chr3 183774762 . C A 725.71 PASS AO=167;DP=339;FAO=172;FDP=342;FR=.;FRO=170;FSAF=103;FSAR=69;FSRF=82;FSRR=88;FWDB=0.0500812;FXX=0.00581378;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3657;QD=8.4878;RBI=0.0617895;REFB=-0.00464274;REVB=0.0361913;RO=171;SAF=103;SAR=64;SRF=82;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129298;STB=0.558847;TYPE=snp;VARB=0.00479935;OID=.;OPOS=183774762;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:339:342:171:170:167:172:64:103:82:89:69:103:82:88 chr3 183778010 . G C 340.03 PASS AO=64;DP=106;FAO=64;FDP=106;FR=.;FRO=42;FSAF=37;FSAR=27;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=-0.0132506;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.683;QD=12.8314;RBI=0.0133237;REFB=-0.013799;REVB=-0.00139385;RO=42;SAF=37;SAR=27;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0402581;STB=0.521902;TYPE=snp;VARB=0.00755551;OID=.;OPOS=183778010;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:42:42:64:64:27:37:22:20:27:37:22:20 chr3 183823575 . GT G,GC 937.53 PASS AO=31,66;DP=112;FAO=36,74;FDP=113;FR=.;FRO=3;FSAF=0,63;FSAR=36,11;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0215074,0.00832233;FXX=0.0258598;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=136.193,147.442;QD=33.1868;RBI=0.244573,0.370908;REFB=0.00122415,0.00766525;REVB=0.243625,0.370815;RO=5;SAF=0,62;SAR=31,4;SRF=3;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.874654,0.165605;STB=0.999484,0.511625;TYPE=del,snp;VARB=-0.015446,0.00363546;OID=.,.;OPOS=183823576,183823576;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=G,GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:31,66:108:36,74:113:3:0,63:36,11:3:0:50:5:0,62:31,4:3:2 chr3 183898501 . TG T,TT 275.09 PASS AO=13,11;DP=42;FAO=36,8;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=18,6;FSAR=18,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.631238,0.301484;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=11.6372,10.0534;QD=25.0081;RBI=0.648345,0.304881;REFB=0,0;REVB=-0.147952,0.0453881;RO=13;SAF=0,9;SAR=13,2;SRF=13;SRR=0;SSEN=0.471264,0;SSEP=0.357576,0;SSSB=-0.869314,-0.377809;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0725916,-0.163066;OID=.,.;OPOS=183898502,183898502;OREF=G,G;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:13,11:41:36,8:44:0:18,6:18,2:0:0:7:13:0,9:13,2:13:0 chr3 183900729 . T C 334.16 PASS AO=56;DP=83;FAO=56;FDP=83;FR=.;FRO=27;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=8;FSRR=19;FWDB=-0.0172404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.991;QD=16.1042;RBI=0.0178336;REFB=-0.0192737;REVB=-0.00456129;RO=27;SAF=22;SAR=34;SRF=8;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0618243;STB=0.533383;TYPE=snp;VARB=0.00982667;OID=.;OPOS=183900729;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:83:83:27:27:56:56:34:22:8:19:34:22:8:19 chr3 183907032 . G C 553.11 PASS AO=157;DP=374;FAO=157;FDP=367;FR=.;FRO=210;FSAF=84;FSAR=73;FSRF=121;FSRR=89;FWDB=0.00327375;FXX=0.0442697;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.016;QD=6.02841;RBI=0.0402213;REFB=-0.00612019;REVB=0.0400878;RO=186;SAF=84;SAR=73;SRF=110;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.055902;STB=0.523743;TYPE=snp;VARB=0.00612435;OID=.;OPOS=183907032;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:374:367:186:210:157:157:73:84:110:76:73:84:121:89 chr3 183975365 . C T 356.79 PASS AO=42;DP=46;FAO=43;FDP=46;FR=.;FRO=3;FSAF=33;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.00265768;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.501;QD=31.0248;RBI=0.0871743;REFB=-0.145204;REVB=0.0871338;RO=4;SAF=33;SAR=9;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169268;STB=0.565185;TYPE=snp;VARB=0.00501243;OID=.;OPOS=183975365;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:46:46:4:3:42:43:9:33:0:4:10:33:0:3 chr3 183996068 . C T 454.41 PASS AO=103;DP=201;FAO=103;FDP=201;FR=.;FRO=98;FSAF=44;FSAR=59;FSRF=39;FSRR=59;FWDB=0.0318066;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.666;QD=9.04291;RBI=0.0318541;REFB=-0.0331011;REVB=-0.00173854;RO=98;SAF=44;SAR=59;SRF=39;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0266747;STB=0.514617;TYPE=snp;VARB=0.0305815;OID=.;OPOS=183996068;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:201:98:98:103:103:59:44:39:59:59:44:39:59 chr3 184037533 . A G 712.96 PASS AO=72;DP=74;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144239;FXX=0.0256377;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.378;QD=37.5244;RBI=0.059547;REFB=0;REVB=-0.0577737;RO=0;SAF=42;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1178e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.10979e-05;OID=.;OPOS=184037533;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:74:76:0:0:72:76:30:42:0:0:31:45:0:0 chr3 184039666 . A G 31.46 PASS AO=15;DP=61;FAO=15;FDP=60;FR=.;FRO=45;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=28;FWDB=0.00367483;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.7772;QD=2.09741;RBI=0.0320389;REFB=-0.00755551;REVB=0.0318275;RO=44;SAF=5;SAR=10;SRF=17;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0698431;STB=0.536536;TYPE=snp;VARB=0.0202112;OID=.;OPOS=184039666;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:61:60:44:45:15:15:10:5:17:27:10:5:17:28 chr3 184044376 . A G 168.98 PASS AO=50;DP=116;FAO=48;FDP=116;FR=.;FRO=68;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=36;FSRR=32;FWDB=-0.015086;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.0847;QD=5.82703;RBI=0.0429533;REFB=-0.00598897;REVB=-0.0402169;RO=64;SAF=21;SAR=29;SRF=33;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0966279;STB=0.579124;TYPE=snp;VARB=0.01176;OID=.;OPOS=184044376;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:64:68:50:48:29:21:33:31:29:19:36:32 chr3 184064457 . GGGCC GC,GGC,GGG 272.7 PASS AO=8,11,8;DP=52;FAO=0,42,0;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=0,12,0;FSAR=0,30,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.2718,0.142969,-0.395045;FXX=0;HRUN=4,4,5;LEN=3,2,2;MLLD=10.5255,14.8278,8.0235;QD=25.9711;RBI=0.327655,0.28931,0.399156;REFB=0,0,0;REVB=-0.182984,-0.251516,-0.0571401;RO=3;SAF=0,0,8;SAR=8,11,0;SRF=0;SRR=3;SSEN=0.509542,0.509542,0.344828;SSEP=0,0,0.305556;SSSB=0,0,0.819744;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=del,del,del;VARB=0,-0.00101401,0;OID=.,.,.;OPOS=184064458,184064459,184064460;OREF=GGC,GC,CC;OALT=-,-,-;OMAPALT=GC,GGC,GGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:8,11,8:41:0,42,0:42:0:0,12,0:0,30,0:0:0:25:3:0,0,8:8,11,0:0:3 chr3 184075047 . A G 106.16 PASS AO=27;DP=61;FAO=27;FDP=62;FR=.;FRO=35;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=-0.00967097;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.754;QD=6.84911;RBI=0.0347628;REFB=-0.015987;REVB=-0.0333905;RO=34;SAF=19;SAR=8;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127622;STB=0.566345;TYPE=snp;VARB=0.0246019;OID=.;OPOS=184075047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:62:34:35:27:27:8:19:20:14:8:19:21:14 chr3 184290348 . G A 234.16 PASS AO=45;DP=77;FAO=45;FDP=77;FR=.;FRO=32;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=-0.0271859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.412;QD=12.1641;RBI=0.0272926;REFB=-0.00300623;REVB=0.00241172;RO=32;SAF=26;SAR=19;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0369657;STB=0.520229;TYPE=snp;VARB=0.00216697;OID=.;OPOS=184290348;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:32:32:45:45:19:26:20:12:19:26:20:12 chr3 184293769 . T C 111.4 PASS AO=28;DP=64;FAO=28;FDP=63;FR=.;FRO=35;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.0220709;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.472;QD=7.07314;RBI=0.0242049;REFB=-0.016725;REVB=-0.00993754;RO=35;SAF=18;SAR=10;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103159;STB=0.55843;TYPE=snp;VARB=0.0158997;OID=.;OPOS=184293769;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:63:35:35:28:28:10:18:19:16:10:18:19:16 chr3 184298663 . G A 67.34 PASS AO=17;DP=41;FAO=17;FDP=41;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.00192897;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5622;QD=6.5699;RBI=0.053845;REFB=0.0311546;REVB=0.0538104;RO=24;SAF=12;SAR=5;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138692;STB=0.580546;TYPE=snp;VARB=-0.0457727;OID=.;OPOS=184298663;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:41:41:24:24:17:17:5:12:14:10:5:12:14:10 chr3 184299167 . T C 275.16 PASS AO=63;DP=128;FAO=65;FDP=133;FR=.;FRO=68;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=40;FSRR=28;FWDB=-0.0184406;FXX=0.00746213;HRUN=4;LEN=1;MLLD=40.9617;QD=8.27546;RBI=0.0585005;REFB=-0.0144797;REVB=-0.055518;RO=63;SAF=29;SAR=34;SRF=37;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11467;STB=0.541229;TYPE=snp;VARB=0.0142766;OID=.;OPOS=184299167;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:133:63:68:63:65:34:29:37:26:32:33:40:28 chr3 184300061 . T C 21.83 PASS AO=6;DP=24;FAO=7;FDP=25;FR=.;FRO=18;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.00605446;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.6776;QD=3.49276;RBI=0.00656731;REFB=-0.0342056;REVB=-0.00254422;RO=18;SAF=1;SAR=5;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.31649;STB=0.737664;TYPE=snp;VARB=0.0909969;OID=.;OPOS=184300061;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:24:25:18:18:6:7:5:1:7:11:6:1:7:11 chr3 184300063 . T C 17.43 PASS AO=5;DP=23;FAO=6;FDP=24;FR=.;FRO=18;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.0385758;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.3489;QD=2.90514;RBI=0.0435358;REFB=-0.0114389;REVB=-0.0201809;RO=18;SAF=1;SAR=4;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.257959;STB=0.71347;TYPE=snp;VARB=0.0354639;OID=.;OPOS=184300063;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:23:24:18:18:5:6:4:1:7:11:5:1:7:11 chr3 184300067 . C T 55.64 PASS AO=11;DP=21;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.0265625;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.549;QD=10.1165;RBI=0.0400574;REFB=-0.118797;REVB=0.0299838;RO=10;SAF=5;SAR=6;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0455781;STB=0.546136;TYPE=snp;VARB=0.086786;OID=.;OPOS=184300067;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:21:22:10:11:11:11:6:5:4:6:6:5:4:7 chr3 184300069 . C T 52.71 PASS AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0220122;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.0209;QD=10.5417;RBI=0.029755;REFB=-0.115148;REVB=-0.0200206;RO=10;SAF=5;SAR=5;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0858363;STB=0.549901;TYPE=snp;VARB=0.101653;OID=.;OPOS=184300069;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:20:20:10:10:10:10:5:5:4:6:5:5:4:6 chr3 184428903 . T G 675.42 PASS AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=59;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0225263;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.373;QD=36.5089;RBI=0.0263727;REFB=-0.0825515;REVB=-0.0137145;RO=0;SAF=59;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.14199e-08;STB=0.517237;TYPE=snp;VARB=0.000186089;OID=.;OPOS=184428903;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:74:74:0:1:73:73:14:59:0:0:14:59:0:1 chr3 184429133 . A ATCC 276.84 PASS AO=20;DP=85;FAO=34;FDP=36;FR=.;FRO=2;FSAF=8;FSAR=26;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0354678;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=3;MLLD=206.334;QD=30.7605;RBI=0.0461614;REFB=-0.0698064;REVB=0.029545;RO=63;SAF=1;SAR=19;SRF=58;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.842989;STB=0.555521;TYPE=ins;VARB=0.00280433;OID=.;OPOS=184429134;OREF=-;OALT=TCC;OMAPALT=ATCC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:20:85:34:36:2:8:26:2:0:5:63:1:19:58:5 chr3 184429414 . C A 143.92 PASS AO=15;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.363;QD=33.8644;RBI=0.0290083;REFB=0;REVB=0.00991709;RO=2;SAF=2;SAR=13;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147635;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000198597;OID=.;OPOS=184429414;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:17:17:2:0:15:17:13:2:1:1:14:3:0:0 chr3 184429718 . A G 136.23 PASS AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.5663;QD=36.3287;RBI=0.0649069;REFB=0;REVB=-0.0649069;RO=0;SAF=0;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00239529;OID=.;OPOS=184429718;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:15:0:0:15:15:15:0:0:0:15:0:0:0 chr3 184633247 . A C 942.48 PASS AO=99;DP=100;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0183924;FXX=0.0198;HRUN=3;LEN=1;MLLD=122.262;QD=38.0802;RBI=0.0523764;REFB=0;REVB=0.0490408;RO=0;SAF=40;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.43337e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.15475e-05;OID=.;OPOS=184633247;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:100:99:0:0:99:99:59:40:0:0:59:40:0:0 chr3 184647413 . T C 1524.44 PASS AO=156;DP=168;FAO=160;FDP=160;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153081;FXX=0.0751402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.738;QD=38.111;RBI=0.0175741;REFB=0;REVB=-0.00863191;RO=0;SAF=63;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000417493;OID=.;OPOS=184647413;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:168:160:0:0:156:160:93:63:0:0:95:65:0:0 chr3 184700356 . A C 231.75 PASS AO=23;DP=23;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00878891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.835;QD=37.0804;RBI=0.00949251;REFB=0;REVB=-0.00358648;RO=0;SAF=1;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.47154e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.0902e-05;OID=.;OPOS=184700356;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:23:25:0:0:23:25:22:1:0:0:24:1:0:0 chr3 184742111 . CT C,CTT 41.08 PASS AO=78,51;DP=344;FAO=88,0;FDP=320;FR=.;FRO=232;FSAF=36,0;FSAR=52,0;FSRF=110;FSRR=122;FWDB=0.394149,-0.404618;FXX=0.0123453;HRUN=8,8;LEN=1,1;MLLD=6.04575,7.814;QD=0.51354;RBI=0.394357,0.405012;REFB=-0.0712868,0.0663862;REVB=-0.0128159,0.0178733;RO=172;SAF=18,34;SAR=60,17;SRF=89;SRR=83;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.366795,0.195384;STB=0.547911,0.5;TYPE=del,ins;VARB=0.151958,0;OID=.,.;OPOS=184742112,184742112;OREF=T,-;OALT=-,T;OMAPALT=C,CTT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:78,51:324:88,0:320:232:36,0:52,0:110:122:43:172:18,34:60,17:89:83 chr3 184798067 . T C 254.83 PASS AO=70;DP=163;FAO=70;FDP=162;FR=.;FRO=92;FSAF=50;FSAR=20;FSRF=58;FSRR=34;FWDB=-0.0316373;FXX=0.00613459;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.584;QD=6.29205;RBI=0.0361729;REFB=-0.0106036;REVB=-0.0175374;RO=92;SAF=50;SAR=20;SRF=58;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0991003;STB=0.555539;TYPE=snp;VARB=0.0151643;OID=.;OPOS=184798067;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:162:92:92:70:70:20:50:58:34:20:50:58:34 chr3 185046975 . T C 2687.91 PASS AO=287;DP=297;FAO=290;FDP=290;FR=.;FRO=0;FSAF=122;FSAR=168;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00570948;FXX=0.0235682;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.764;QD=37.0746;RBI=0.00736483;REFB=-0.0416466;REVB=0.00465216;RO=0;SAF=121;SAR=166;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.22915e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000130231;OID=.;OPOS=185046975;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:97:297:290:0:0:287:290:166:121:0:0:168:122:0:0 chr3 185226396 . A G 127.81 PASS AO=43;DP=114;FAO=42;FDP=113;FR=.;FRO=71;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=46;FWDB=-6.77867e-06;FXX=0.0173898;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.359;QD=4.52413;RBI=0.00298773;REFB=-0.00279472;REVB=-0.00298772;RO=69;SAF=21;SAR=22;SRF=23;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169651;STB=0.564327;TYPE=snp;VARB=0.00451666;OID=.;OPOS=185226396;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:113:69:71:43:42:22:21:23:46:23:19:25:46 chr3 185229464 . T C 474.35 PASS AO=103;DP=194;FAO=104;FDP=197;FR=.;FRO=93;FSAF=43;FSAR=61;FSRF=42;FSRR=51;FWDB=-0.00455598;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.896;QD=9.63154;RBI=0.00855627;REFB=-0.01043;REVB=0.00724243;RO=88;SAF=42;SAR=61;SRF=39;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0307254;STB=0.518445;TYPE=snp;VARB=0.0090182;OID=.;OPOS=185229464;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:197:88:93:103:104:61:42:39:49:61:43:42:51 chr3 185236964 . G A 464.28 PASS AO=119;DP=256;FAO=119;FDP=256;FR=.;FRO=137;FSAF=65;FSAR=54;FSRF=75;FSRR=62;FWDB=0.0211225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.9999;QD=7.25445;RBI=0.0474679;REFB=-0.0321796;REVB=0.0425093;RO=136;SAF=65;SAR=54;SRF=75;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00511979;STB=0.500662;TYPE=snp;VARB=0.0396595;OID=.;OPOS=185236964;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:256:256:136:137:119:119:54:65:75:61:54:65:75:62 chr3 185300589 . T C 315.75 PASS AO=69;DP=134;FAO=70;FDP=134;FR=.;FRO=64;FSAF=20;FSAR=50;FSRF=16;FSRR=48;FWDB=0.0343822;FXX=0.0147048;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.425;QD=9.4253;RBI=0.0345829;REFB=-0.0324742;REVB=0.0037198;RO=64;SAF=20;SAR=49;SRF=16;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0433043;STB=0.521271;TYPE=snp;VARB=0.0288504;OID=.;OPOS=185300589;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:64:64:69:70:49:20:16:48:50:20:16:48 chr3 185331165 . C A 116.41 PASS AO=49;DP=167;FAO=51;FDP=167;FR=.;FRO=116;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=40;FSRR=76;FWDB=-0.0319871;FXX=0.00595203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.039;QD=2.78823;RBI=0.0324224;REFB=-0.0171852;REVB=-0.00529496;RO=116;SAF=26;SAR=23;SRF=40;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222281;STB=0.626694;TYPE=snp;VARB=0.0467126;OID=.;OPOS=185331165;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:167:116:116:49:51:23:26:40:76:24:27:40:76 chr3 185348402 . C T 455.8 PASS AO=120;DP=260;FAO=119;FDP=260;FR=.;FRO=141;FSAF=73;FSAR=46;FSRF=80;FSRR=61;FWDB=0.0426331;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=40.8076;QD=7.01237;RBI=0.0476065;REFB=-0.0389563;REVB=-0.021185;RO=133;SAF=74;SAR=46;SRF=73;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0671065;STB=0.526024;TYPE=snp;VARB=0.0552539;OID=.;OPOS=185348402;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:260:260:133:141:120:119:46:74:73:60:46:73:80:61 chr3 185867550 . G C 73.78 PASS AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=0;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=17;FWDB=0;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=185.042;QD=8.9427;RBI=0.00356267;REFB=-0.0230829;REVB=-0.00356267;RO=17;SAF=0;SAR=16;SRF=0;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0217341;OID=.;OPOS=185867550;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:33:33:17:17:16:16:16:0:0:17:16:0:0:17 chr3 186006566 . T C 1024.69 PASS AO=107;DP=107;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0128139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.421;QD=38.3062;RBI=0.0163802;REFB=0;REVB=0.0102037;RO=0;SAF=67;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.9105e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.75335e-06;OID=.;OPOS=186006566;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:107:107:0:0:107:107:40:67:0:0:40:67:0:0 chr3 186006618 . G C 191.39 PASS AO=18;DP=82;FAO=45;FDP=91;FR=.;FRO=46;FSAF=30;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=-0.00129242;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=134.32;QD=8.4128;RBI=0.0021334;REFB=-0.0339494;REVB=-0.00169737;RO=23;SAF=10;SAR=8;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141979;STB=0.599954;TYPE=snp;VARB=0.0346938;OID=.;OPOS=186006618;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:91:23:46:18:45:8:10:16:7:15:30:22:24 chr3 186015283 . A G 1003.02 PASS AO=118;DP=129;FAO=118;FDP=128;FR=.;FRO=10;FSAF=62;FSAR=56;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.0259424;FXX=0.00775134;HRUN=8;LEN=1;MLLD=203.013;QD=31.3445;RBI=0.0277499;REFB=-0.0533433;REVB=-0.00985154;RO=7;SAF=62;SAR=56;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00489774;STB=0.509813;TYPE=snp;VARB=0.000227677;OID=.;OPOS=186015283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:129:128:7:10:118:118:56:62:4:3:56:62:4:6 chr3 186274566 . T TA 31.48 PASS AO=12;DP=41;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=-0.0801268;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=6.15065;QD=3.70348;RBI=0.112168;REFB=-0.0344374;REVB=0.0784948;RO=26;SAF=10;SAR=2;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.551115;STB=0.673269;TYPE=ins;VARB=0.0696386;OID=.;OPOS=186274567;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:12:41:17:34:17:11:6:5:12:17:26:10:2:9:17 chr3 186358366 . A C 100.71 PASS AO=25;DP=56;FAO=25;FDP=56;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=0.0199845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.028;QD=7.1937;RBI=0.0290195;REFB=-0.0098741;REVB=-0.0210417;RO=31;SAF=12;SAR=13;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0913967;STB=0.551683;TYPE=snp;VARB=0.015567;OID=.;OPOS=186358366;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:31:31:25:25:13:12:12:19:13:12:12:19 chr3 186370333 . G T 206.08 PASS AO=47;DP=94;FAO=47;FDP=94;FR=.;FRO=47;FSAF=29;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=31;FWDB=-0.0164126;FXX=0.0105252;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.5229;QD=8.76947;RBI=0.0164248;REFB=0.00128112;REVB=-0.000632756;RO=47;SAF=29;SAR=18;SRF=16;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.247419;STB=0.636876;TYPE=snp;VARB=-0.00213279;OID=.;OPOS=186370333;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:47:47:47:47:18:29:16:31:18:29:16:31 chr3 186390627 . C T 231.21 PASS AO=66;DP=158;FAO=66;FDP=158;FR=.;FRO=92;FSAF=33;FSAR=33;FSRF=28;FSRR=64;FWDB=-0.000595051;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=171.728;QD=5.8534;RBI=0.0267238;REFB=-0.000959647;REVB=0.0267172;RO=91;SAF=33;SAR=33;SRF=27;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211587;STB=0.613891;TYPE=snp;VARB=0.00111926;OID=.;OPOS=186390627;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:158:91:92:66:66:33:33:27:64:33:33:28:64 chr3 186395113 . A G 232.21 PASS AO=55;DP=113;FAO=55;FDP=113;FR=.;FRO=58;FSAF=24;FSAR=31;FSRF=24;FSRR=34;FWDB=0.00965358;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.381;QD=8.21966;RBI=0.00971143;REFB=0.0118043;REVB=-0.00105848;RO=55;SAF=24;SAR=31;SRF=22;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0336067;STB=0.511807;TYPE=snp;VARB=-0.0131481;OID=.;OPOS=186395113;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:55:58:55:55:31:24:22:33:31:24:24:34 chr3 186395180 . T C 742.16 PASS AO=71;DP=74;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.24988;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.282;QD=36.2031;RBI=0.250631;REFB=0;REVB=0.0193894;RO=2;SAF=36;SAR=35;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0255447;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00390371;OID=.;OPOS=186395180;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:74:82:2:0:71:82:35:36:2:0:35:47:0:0 chr3 186395572 . A T 113.37 PASS AO=29;DP=66;FAO=29;FDP=66;FR=.;FRO=37;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=7;FSRR=30;FWDB=-0.0117845;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.54;QD=6.87101;RBI=0.013548;REFB=-0.0233349;REVB=-0.00668384;RO=36;SAF=8;SAR=21;SRF=7;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10602;STB=0.564274;TYPE=snp;VARB=0.0415395;OID=.;OPOS=186395572;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:36:37:29:29:21:8:7:29:21:8:7:30 chr3 186504148 . T C 2978.37 PASS AO=306;DP=322;FAO=335;FDP=335;FR=.;FRO=0;FSAF=175;FSAR=160;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00320412;FXX=0.0482941;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.124;QD=35.5626;RBI=0.0404515;REFB=-0.0201546;REVB=0.0403244;RO=8;SAF=175;SAR=131;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0150655;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000184381;OID=.;OPOS=186504148;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:322:335:8:0:306:335:131:175:7:1:160:175:0:0 chr3 186509517 . G A 1150.91 PASS AO=140;DP=157;FAO=141;FDP=157;FR=.;FRO=16;FSAF=75;FSAR=66;FSRF=1;FSRR=15;FWDB=0.0229365;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.306;QD=29.3225;RBI=0.0230826;REFB=-0.0151828;REVB=0.00259258;RO=15;SAF=74;SAR=66;SRF=0;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0966387;STB=0.547735;TYPE=snp;VARB=0.000517858;OID=.;OPOS=186509517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:157:157:15:16:140:141:66:74:0:15:66:75:1:15 chr3 186917751 . C G 584.19 PASS AO=61;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.048684;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.6607;QD=37.6898;RBI=0.0552518;REFB=0;REVB=0.0261273;RO=0;SAF=34;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000227973;OID=.;OPOS=186917751;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:61:62:0:0:61:62:27:34:0:0:28:34:0:0 chr3 186937568 . A G 1581.15 PASS AO=167;DP=171;FAO=171;FDP=171;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00671396;FXX=0.113984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.106;QD=36.9859;RBI=0.01244;REFB=-0.071035;REVB=0.0104726;RO=0;SAF=72;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.17463e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00145927;OID=.;OPOS=186937568;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:171:171:0:0:167:171:95:72:0:0:99:72:0:0 chr3 186953808 . C T 123.79 PASS AO=29;DP=65;FAO=30;FDP=66;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=25;FWDB=0.0356216;FXX=0.0294074;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.998;QD=7.50245;RBI=0.0386825;REFB=0.00632714;REVB=-0.0150811;RO=36;SAF=13;SAR=16;SRF=11;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144548;STB=0.589265;TYPE=snp;VARB=-0.00358537;OID=.;OPOS=186953808;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:66:36:36:29:30:16:13:11:25:16:14:11:25 chr3 186954285 . A G 450.8 PASS AO=27;DP=50;FAO=47;FDP=47;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0598703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.9166;QD=38.3662;RBI=0.33432;REFB=0;REVB=0.328916;RO=0;SAF=18;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00295025;OID=.;OPOS=186954285;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:49:47:0:0:27:47:9:18:0:0:27:20:0:0 chr3 186954324 . G A 110.92 PASS AO=26;DP=55;FAO=26;FDP=55;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=21;FWDB=0.0239327;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.293;QD=8.0671;RBI=0.0389325;REFB=-0.00316063;REVB=0.0307077;RO=29;SAF=16;SAR=10;SRF=8;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.310197;STB=0.673785;TYPE=snp;VARB=0.00421139;OID=.;OPOS=186954324;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:29:29:26:26:10:16:8:21:10:16:8:21 chr3 187009176 . G A 259.47 PASS AO=58;DP=114;FAO=58;FDP=113;FR=.;FRO=55;FSAF=21;FSAR=37;FSRF=26;FSRR=29;FWDB=-0.00812196;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.568;QD=9.18459;RBI=0.0190622;REFB=-0.0344366;REVB=0.0172453;RO=54;SAF=21;SAR=37;SRF=26;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109162;STB=0.55646;TYPE=snp;VARB=0.0313016;OID=.;OPOS=187009176;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:113:54:55:58:58:37:21:26:28:37:21:26:29 chr3 187088812 . C T 1547.35 PASS AO=162;DP=163;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.020133;FXX=0.00613459;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.601;QD=38.2062;RBI=0.0222263;REFB=0;REVB=0.00941665;RO=0;SAF=68;SAR=94;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.30233e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.43955e-05;OID=.;OPOS=187088812;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:163:162:0:0:162:162:94:68:0:0:94:68:0:0 chr3 187088903 . C A 1202.65 PASS AO=124;DP=125;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0459757;FXX=0.00781189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.0482;QD=37.8786;RBI=0.0503084;REFB=-0.0438277;REVB=0.0204248;RO=0;SAF=72;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.61425e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000507162;OID=.;OPOS=187088903;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:125:127:0:0:124:127:52:72:0:0:55:72:0:0 chr3 187088926 . G A 1074.51 PASS AO=113;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000724545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.902;QD=38.0356;RBI=0.00281015;REFB=0;REVB=0.00271513;RO=0;SAF=71;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.03664e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.58495e-06;OID=.;OPOS=187088926;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:113:113:0:0:113:113:42:71:0:0:42:71:0:0 chr3 187089031 . C A 986.2 PASS AO=133;DP=133;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0259754;FXX=0.0282992;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.401;QD=38.2992;RBI=0.0279817;REFB=0;REVB=-0.0104044;RO=0;SAF=58;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.26522e-05;OID=.;OPOS=187089031;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:133:103:0:0:133:103:75:58:0:0:64:39:0:0 chr3 187416634 . C A 28.57 PASS AO=12;DP=46;FAO=12;FDP=46;FR=.;FRO=34;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=11;FWDB=-0.0495084;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0447;QD=2.4843;RBI=0.0729812;REFB=-0.010379;REVB=0.0536206;RO=34;SAF=2;SAR=10;SRF=23;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.581208;STB=0.855608;TYPE=snp;VARB=0.0231397;OID=.;OPOS=187416634;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:46:46:34:34:12:12:10:2:23:11:10:2:23:11 chr3 187416666 . C T 187.73 PASS AO=31;DP=46;FAO=31;FDP=46;FR=.;FRO=15;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0598202;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.7831;QD=16.3245;RBI=0.0630191;REFB=-0.0110661;REVB=0.0198232;RO=14;SAF=21;SAR=10;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192694;STB=0.596348;TYPE=snp;VARB=0.00659795;OID=.;OPOS=187416666;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:46:46:14:15:31:31:10:21:5:9:10:21:6:9 chr3 187416719 . T C 79.7 PASS AO=18;DP=45;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.0216832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.096;QD=9.37629;RBI=0.0218165;REFB=-0.00508579;REVB=-0.0024074;RO=25;SAF=10;SAR=8;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155977;STB=0.55937;TYPE=snp;VARB=0.004522;OID=.;OPOS=187416719;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:45:34:25:17:18:17:8:10:10:15:7:10:8:9 chr3 187419816 . T C 173.34 PASS AO=30;DP=47;FAO=30;FDP=47;FR=.;FRO=17;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=3;FSRR=14;FWDB=0.0022456;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.678;QD=14.7526;RBI=0.00458375;REFB=-0.0130485;REVB=-0.003996;RO=17;SAF=14;SAR=16;SRF=3;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195862;STB=0.606869;TYPE=snp;VARB=0.00380365;OID=.;OPOS=187419816;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:47:47:17:17:30:30:16:14:3:14:16:14:3:14 chr3 187447032 . G A 113.83 PASS AO=27;DP=58;FAO=27;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.00133234;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.927;QD=7.84997;RBI=0.0210842;REFB=-0.0123741;REVB=0.0210421;RO=31;SAF=12;SAR=15;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12873;STB=0.572466;TYPE=snp;VARB=0.0134275;OID=.;OPOS=187447032;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:31:31:27:27:15:12:18:13:15:12:18:13 chr3 187450128 . C T 188.78 PASS AO=40;DP=75;FAO=40;FDP=75;FR=.;FRO=35;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=11;FSRR=24;FWDB=0.0129463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.957;QD=10.0684;RBI=0.0182488;REFB=-0.00350846;REVB=0.0128613;RO=32;SAF=20;SAR=20;SRF=10;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151634;STB=0.586625;TYPE=snp;VARB=0.00297051;OID=.;OPOS=187450128;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:32:35:40:40:20:20:10:22:20:20:11:24 chr3 187897059 . G A 241.42 PASS AO=49;DP=90;FAO=49;FDP=89;FR=.;FRO=40;FSAF=7;FSAR=42;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=0.0105779;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5355;QD=10.8504;RBI=0.0494074;REFB=-0.0087127;REVB=0.0482618;RO=38;SAF=7;SAR=42;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.328844;STB=0.700838;TYPE=snp;VARB=0.00802783;OID=.;OPOS=187897059;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:89:38:40:49:49:42:7:16:22:42:7:18:22 chr3 187897283 . G A 146.94 PASS AO=29;DP=52;FAO=29;FDP=52;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=2;FSRR=21;FWDB=0.0338719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.036;QD=11.3034;RBI=0.0575542;REFB=-0.0158096;REVB=0.0465315;RO=23;SAF=11;SAR=18;SRF=2;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.269091;STB=0.646972;TYPE=snp;VARB=0.00575611;OID=.;OPOS=187897283;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:52:52:23:23:29:29:18:11:2:21:18:11:2:21 chr3 187897614 . C G 269.63 PASS AO=46;DP=76;FAO=46;FDP=70;FR=.;FRO=24;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=0.0241302;FXX=0.078937;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.503;QD=15.4074;RBI=0.0247804;REFB=0.00653782;REVB=-0.00563936;RO=23;SAF=23;SAR=23;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0935184;STB=0.557118;TYPE=snp;VARB=-0.0024785;OID=.;OPOS=187897614;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:76:70:23:24:46:46:23:23:15:8:23:23:16:8 chr3 187897954 . T A 378.23 PASS AO=103;DP=203;FAO=96;FDP=202;FR=.;FRO=106;FSAF=38;FSAR=58;FSRF=43;FSRR=63;FWDB=0.0446207;FXX=0.00980344;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.74;QD=7.48973;RBI=0.0636657;REFB=-0.0302106;REVB=-0.0454128;RO=100;SAF=40;SAR=63;SRF=41;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0203447;STB=0.505378;TYPE=snp;VARB=0.0350103;OID=.;OPOS=187897954;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:202:100:106:103:96:63:40:41:59:58:38:43:63 chr3 187898523 . T C 125.99 PASS AO=33;DP=76;FAO=33;FDP=76;FR=.;FRO=43;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=-0.0126866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.978;QD=6.63114;RBI=0.0129696;REFB=-0.0122474;REVB=-0.00269432;RO=40;SAF=19;SAR=14;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146591;STB=0.562812;TYPE=snp;VARB=0.0111413;OID=.;OPOS=187898523;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:40:43:33:33:14:19:17:23:14:19:20:23 chr3 188327461 . C T 1492.58 PASS AO=160;DP=162;FAO=160;FDP=160;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0294168;FXX=0.0123449;HRUN=3;LEN=1;MLLD=219.303;QD=37.3146;RBI=0.03227;REFB=-0.126386;REVB=0.0132667;RO=1;SAF=62;SAR=98;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00483082;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000253787;OID=.;OPOS=188327461;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:162:160:1:0:160:160:98:62:0:1:98:62:0:0 chr3 188590446 . A G 2517.67 PASS AO=261;DP=262;FAO=263;FDP=263;FR=.;FRO=0;FSAF=150;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0350727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.874;QD=38.2915;RBI=0.0352888;REFB=0;REVB=-0.00389975;RO=0;SAF=149;SAR=112;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.08629e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.21998e-05;OID=.;OPOS=188590446;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:262:263:0:0:261:263:112:149:0:0:113:150:0:0 chr3 189033292 . C G 1969.26 PASS AO=205;DP=209;FAO=209;FDP=209;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=131;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0647882;FXX=0.00947822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.323;QD=37.6893;RBI=0.0757905;REFB=-0.053013;REVB=0.0393279;RO=0;SAF=77;SAR=128;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.29585e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000649868;OID=.;OPOS=189033292;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:87:209:209:0:0:205:209:128:77:0:0:131:78:0:0 chr3 189033298 . C T 398.6 PASS AO=97;DP=207;FAO=99;FDP=209;FR=.;FRO=110;FSAF=46;FSAR=53;FSRF=35;FSRR=75;FWDB=-0.0149052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.157;QD=7.62866;RBI=0.0338998;REFB=0.0182362;REVB=-0.0304472;RO=110;SAF=45;SAR=52;SRF=35;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142935;STB=0.578317;TYPE=snp;VARB=-0.0145714;OID=.;OPOS=189033298;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:209:110:110:97:99:52:45:35:75:53:46:35:75 chr3 189614239 . A T 16.08 PASS AO=5;DP=26;FAO=6;FDP=26;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.014722;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.014;QD=2.47396;RBI=0.0532409;REFB=-0.00491445;REVB=0.051165;RO=18;SAF=5;SAR=0;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.693941;STB=0.784679;TYPE=snp;VARB=0.0121121;OID=.;OPOS=189614239;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:26:26:18:20:5:6:0:5:9:9:1:5:10:10 chr3 189615080 . A G 46.33 PASS AO=18;DP=61;FAO=18;FDP=61;FR=.;FRO=43;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=0.0580215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.3453;QD=3.0378;RBI=0.0583604;REFB=0.000939271;REVB=0.00628031;RO=43;SAF=6;SAR=12;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162247;STB=0.597589;TYPE=snp;VARB=0.000106007;OID=.;OPOS=189615080;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:61:61:43:43:18:18:12:6:20:23:12:6:20:23 chr3 189692382 . C T 377.53 PASS AO=69;DP=112;FAO=70;FDP=114;FR=.;FRO=44;FSAF=18;FSAR=52;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=0.0688513;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.3365;QD=13.2468;RBI=0.0698712;REFB=-0.00975893;REVB=0.0118944;RO=43;SAF=17;SAR=52;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185876;STB=0.590882;TYPE=snp;VARB=0.00610985;OID=.;OPOS=189692382;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:114:43:44:69:70:52:17:20:23:52:18:20:24 chr3 190023552 . T C 160.05 PASS AO=27;DP=44;FAO=28;FDP=44;FR=.;FRO=16;FSAF=22;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.0165325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.631;QD=14.5497;RBI=0.025202;REFB=-0.0167159;REVB=-0.0190214;RO=16;SAF=21;SAR=6;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135932;STB=0.578887;TYPE=snp;VARB=0.0063196;OID=.;OPOS=190023552;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:44:44:16:16:27:28:6:21:10:6:6:22:10:6 chr3 190024457 . A G 305.75 PASS AO=82;DP=192;FAO=84;FDP=193;FR=.;FRO=109;FSAF=36;FSAR=48;FSRF=56;FSRR=53;FWDB=-0.00357384;FXX=0.00515437;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.261;QD=6.33678;RBI=0.00959871;REFB=-0.00250374;REVB=0.00890858;RO=109;SAF=36;SAR=46;SRF=56;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0767633;STB=0.548424;TYPE=snp;VARB=0.0022039;OID=.;OPOS=190024457;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:193:109:109:82:84:46:36:56:53:48:36:56:53 chr3 190030680 . A G 1233.57 PASS AO=129;DP=143;FAO=135;FDP=137;FR=.;FRO=2;FSAF=47;FSAR=88;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0285957;FXX=0.159499;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.762;QD=36.0167;RBI=0.0433925;REFB=-0.138417;REVB=0.0326373;RO=2;SAF=44;SAR=85;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0211072;STB=0.510415;TYPE=snp;VARB=0.000935394;OID=.;OPOS=190030680;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:143:137:2:2:129:135:85:44:2:0:88:47:2:0 chr3 190158168 . G C 664.36 PASS AO=66;DP=66;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00830878;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.183;QD=38.5134;RBI=0.0295728;REFB=0;REVB=0.0283816;RO=0;SAF=31;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.769e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000120592;OID=.;OPOS=190158168;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:66:69:0:0:66:69:35:31:0:0:36:33:0:0 chr3 190167533 . C T 977.7 PASS AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0305478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.592;QD=37.9691;RBI=0.0307368;REFB=0;REVB=0.00340302;RO=0;SAF=45;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.43231e-05;OID=.;OPOS=190167533;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:103:103:0:0:103:103:58:45:0:0:58:45:0:0 chr3 190333162 . TG T,TT 2100.65 PASS AO=173,50;DP=227;FAO=224,0;FDP=224;FR=.;FRO=0;FSAF=104,0;FSAR=120,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0325818,-0.0265879;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=279.65,264.058;QD=37.5115;RBI=0.0326499,0.0266525;REFB=0,0;REVB=-0.00210861,-0.001854;RO=0;SAF=83,20;SAR=90,30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.00068595,0.0778723;OID=.,.;OPOS=190333163,190333163;OREF=G,G;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:173,50:223:224,0:224:0:104,0:120,0:0:0:99:0:83,20:90,30:0:0 chr3 190573340 . G C 200.42 PASS AO=64;DP=170;FAO=64;FDP=168;FR=.;FRO=104;FSAF=31;FSAR=33;FSRF=73;FSRR=31;FWDB=-0.0402838;FXX=0.011764;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.8919;QD=4.77179;RBI=0.0403657;REFB=-0.00962017;REVB=0.00256954;RO=101;SAF=31;SAR=33;SRF=72;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247618;STB=0.633639;TYPE=snp;VARB=0.020778;OID=.;OPOS=190573340;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:168:101:104:64:64:33:31:72:29:33:31:73:31 chr3 190573374 . C G 386.08 PASS AO=108;DP=251;FAO=108;FDP=251;FR=.;FRO=143;FSAF=64;FSAR=44;FSRF=89;FSRR=54;FWDB=0.00537764;FXX=0.00790483;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.825;QD=6.15265;RBI=0.0065188;REFB=0.00522791;REVB=-0.00368453;RO=141;SAF=64;SAR=44;SRF=88;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0334879;STB=0.517684;TYPE=snp;VARB=-0.00568473;OID=.;OPOS=190573374;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:251:251:141:143:108:108:44:64:88:53:44:64:89:54 chr3 190999917 . C A 211.3 PASS AO=60;DP=151;FAO=64;FDP=156;FR=.;FRO=92;FSAF=25;FSAR=39;FSRF=36;FSRR=56;FWDB=0.0320792;FXX=0.00636902;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.2251;QD=5.41803;RBI=0.0361542;REFB=-0.0329239;REVB=0.0166749;RO=90;SAF=25;SAR=35;SRF=36;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.01832;STB=0.500421;TYPE=snp;VARB=0.0203617;OID=.;OPOS=190999917;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:156:90:92:60:64:35:25:36:54:39:25:36:56 chr3 191047532 . A G 42.51 PASS AO=16;DP=52;FAO=16;FDP=55;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=0.0230923;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.047;QD=3.09142;RBI=0.0289339;REFB=-0.0152604;REVB=0.0174331;RO=36;SAF=13;SAR=3;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.429569;STB=0.78276;TYPE=snp;VARB=0.0387182;OID=.;OPOS=191047532;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:52:55:36:39:16:16:3:13:17:19:3:13:17:22 chr3 191074873 . C G 314.69 PASS AO=61;DP=105;FAO=61;FDP=104;FR=.;FRO=43;FSAF=34;FSAR=27;FSRF=17;FSRR=26;FWDB=0.00793772;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.54;QD=12.1035;RBI=0.0220974;REFB=-0.0327363;REVB=0.0206225;RO=42;SAF=34;SAR=27;SRF=16;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131598;STB=0.566823;TYPE=snp;VARB=0.0291677;OID=.;OPOS=191074873;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:104:42:43:61:61:27:34:16:26:27:34:17:26 chr3 191075902 . C T 361.05 PASS AO=83;DP=164;FAO=83;FDP=164;FR=.;FRO=81;FSAF=56;FSAR=27;FSRF=40;FSRR=41;FWDB=-0.0206824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.969;QD=8.80598;RBI=0.02444;REFB=-0.00699413;REVB=-0.0130212;RO=81;SAF=56;SAR=27;SRF=40;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172274;STB=0.594976;TYPE=snp;VARB=0.00855918;OID=.;OPOS=191075902;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:164:81:81:83:83:27:56:40:41:27:56:40:41 chr3 191093053 . T C 245.39 PASS AO=55;DP=108;FAO=55;FDP=108;FR=.;FRO=53;FSAF=16;FSAR=39;FSRF=24;FSRR=29;FWDB=0.00285515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.9666;QD=9.0884;RBI=0.00506099;REFB=-0.0126142;REVB=-0.00417872;RO=53;SAF=16;SAR=39;SRF=24;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160751;STB=0.58909;TYPE=snp;VARB=0.0114414;OID=.;OPOS=191093053;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:53:53:55:55:39:16:24:29:39:16:24:29 chr3 191093175 . T A 97.96 PASS AO=29;DP=79;FAO=30;FDP=80;FR=.;FRO=50;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=0.00848725;FXX=0.0123442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1824;QD=4.89822;RBI=0.0497785;REFB=-0.0194007;REVB=-0.0490496;RO=49;SAF=9;SAR=20;SRF=21;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140853;STB=0.57138;TYPE=snp;VARB=0.0292579;OID=.;OPOS=191093175;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:79:80:49:50:29:30:20:9:21:28:20:10:22:28 chr3 191093310 . A G 80.15 PASS AO=32;DP=103;FAO=32;FDP=103;FR=.;FRO=71;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=47;FWDB=0.00419111;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=205.372;QD=3.11255;RBI=0.0256694;REFB=-0.0149852;REVB=-0.025325;RO=71;SAF=10;SAR=22;SRF=24;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0343547;STB=0.520154;TYPE=snp;VARB=0.0361381;OID=.;OPOS=191093310;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:103:103:71:71:32:32:22:10:24:47:22:10:24:47 chr3 191097966 . T C 268.18 PASS AO=55;DP=105;FAO=56;FDP=102;FR=.;FRO=46;FSAF=43;FSAR=13;FSRF=37;FSRR=9;FWDB=-0.0138088;FXX=0.0285687;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.882;QD=10.517;RBI=0.0452225;REFB=-0.00768807;REVB=0.0430627;RO=44;SAF=42;SAR=13;SRF=36;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0637138;STB=0.523657;TYPE=snp;VARB=0.00445989;OID=.;OPOS=191097966;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:102:44:46:55:56:13:42:36:8:13:43:37:9 chr3 191100561 . C A 323.15 PASS AO=68;DP=124;FAO=68;FDP=124;FR=.;FRO=56;FSAF=42;FSAR=26;FSRF=22;FSRR=34;FWDB=-0.0218336;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.5146;QD=10.4241;RBI=0.100596;REFB=0.0340948;REVB=-0.0981981;RO=55;SAF=42;SAR=26;SRF=22;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179482;STB=0.602264;TYPE=snp;VARB=-0.0296819;OID=.;OPOS=191100561;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:55:56:68:68:26:42:22:33:26:42:22:34 chr3 191179193 . A G 783.99 PASS AO=91;DP=98;FAO=91;FDP=98;FR=.;FRO=7;FSAF=52;FSAR=39;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.045543;FXX=0.0101;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.0826;QD=31.9997;RBI=0.0472155;REFB=-0.170992;REVB=0.0124554;RO=7;SAF=52;SAR=39;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0391453;STB=0.520706;TYPE=snp;VARB=0.0089659;OID=.;OPOS=191179193;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:98:98:7:7:91:91:39:52:2:5:39:52:2:5 chr3 191810914 . T C 285.36 PASS AO=66;DP=134;FAO=66;FDP=132;FR=.;FRO=66;FSAF=46;FSAR=20;FSRF=29;FSRR=37;FWDB=-0.0187206;FXX=0.0149243;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.727;QD=8.64734;RBI=0.0190521;REFB=-0.00205111;REVB=-0.00353825;RO=66;SAF=46;SAR=20;SRF=29;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.245867;STB=0.636056;TYPE=snp;VARB=0.00133104;OID=.;OPOS=191810914;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:132:66:66:66:66:20:46:29:37:20:46:29:37 chr3 191810915 . A G 280.44 PASS AO=66;DP=135;FAO=66;FDP=134;FR=.;FRO=68;FSAF=46;FSAR=20;FSRF=30;FSRR=38;FWDB=-0.00144169;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.1;QD=8.37132;RBI=0.0424552;REFB=-0.0224923;REVB=0.0424307;RO=68;SAF=46;SAR=20;SRF=30;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.247287;STB=0.637015;TYPE=snp;VARB=0.0162446;OID=.;OPOS=191810915;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:134:68:68:66:66:20:46:30:38:20:46:30:38 chr3 192447403 . G A 224.37 PASS AO=64;DP=153;FAO=64;FDP=153;FR=.;FRO=89;FSAF=28;FSAR=36;FSRF=39;FSRR=50;FWDB=-0.0175448;FXX=0.00649309;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.275;QD=5.86594;RBI=0.0227338;REFB=-0.00347168;REVB=0.014457;RO=88;SAF=28;SAR=36;SRF=39;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.005958;STB=0.500415;TYPE=snp;VARB=0.00506133;OID=.;OPOS=192447403;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:153:88:89:64:64:36:28:39:49:36:28:39:50 chr3 192447418 . A G 197.1 PASS AO=57;DP=142;FAO=58;FDP=144;FR=.;FRO=86;FSAF=24;FSAR=34;FSRF=37;FSRR=49;FWDB=-0.00940731;FXX=0.0136977;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.397;QD=5.47511;RBI=0.0144782;REFB=-0.00647796;REVB=-0.0110055;RO=80;SAF=23;SAR=34;SRF=34;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.023076;STB=0.51008;TYPE=snp;VARB=0.0161303;OID=.;OPOS=192447418;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:144:80:86:57:58:34:23:34:46:34:24:37:49 chr3 192515557 . G A 370.84 PASS AO=91;DP=198;FAO=94;FDP=202;FR=.;FRO=108;FSAF=44;FSAR=50;FSRF=50;FSRR=58;FWDB=-0.00671213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.865;QD=7.34342;RBI=0.0428035;REFB=-0.0208019;REVB=-0.042274;RO=107;SAF=41;SAR=50;SRF=50;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0164601;STB=0.50275;TYPE=snp;VARB=0.0220555;OID=.;OPOS=192515557;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:202:107:108:91:94:50:41:50:57:50:44:50:58 chr3 192516931 . A C 172.87 PASS AO=40;DP=82;FAO=40;FDP=82;FR=.;FRO=42;FSAF=6;FSAR=34;FSRF=5;FSRR=37;FWDB=-0.0026207;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=75.1254;QD=8.43255;RBI=0.0159845;REFB=-0.0339374;REVB=-0.0157682;RO=41;SAF=6;SAR=34;SRF=5;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0523102;STB=0.532484;TYPE=snp;VARB=0.0357171;OID=.;OPOS=192516931;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:41:42:40:40:34:6:5:36:34:6:5:37 chr3 192994543 . A G 398.79 PASS AO=98;DP=205;FAO=99;FDP=205;FR=.;FRO=106;FSAF=44;FSAR=55;FSRF=72;FSRR=34;FWDB=0.0128874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.6088;QD=7.78124;RBI=0.0140819;REFB=-0.02744;REVB=0.00567567;RO=105;SAF=43;SAR=55;SRF=73;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237322;STB=0.619635;TYPE=snp;VARB=0.0497935;OID=.;OPOS=192994543;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:205:105:106:98:99:55:43:73:32:55:44:72:34 chr3 193031926 . C T 693.92 PASS AO=76;DP=79;FAO=77;FDP=80;FR=.;FRO=3;FSAF=27;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0475331;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.0633;QD=34.696;RBI=0.0514112;REFB=-0.0110457;REVB=0.0195886;RO=3;SAF=27;SAR=49;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0280923;STB=0.514559;TYPE=snp;VARB=0.000399089;OID=.;OPOS=193031926;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:79:80:3:3:76:77:49:27:0:3:50:27:0:3 chr3 193036794 . G C 677.13 PASS AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.989;QD=38.6933;RBI=0.0144972;REFB=0;REVB=0.00320985;RO=0;SAF=39;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.73885e-05;OID=.;OPOS=193036794;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:70:70:0:0:70:70:31:39:0:0:31:39:0:0 chr3 193042776 . T C 594.61 PASS AO=61;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204872;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.826;QD=37.753;RBI=0.0204901;REFB=0;REVB=-0.00034562;RO=0;SAF=17;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.89926e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.40871e-05;OID=.;OPOS=193042776;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:62:63:0:0:61:63:44:17:0:0:46:17:0:0 chr3 193080344 . C T 408.23 PASS AO=107;DP=235;FAO=107;FDP=235;FR=.;FRO=128;FSAF=39;FSAR=68;FSRF=63;FSRR=65;FWDB=0.00127365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.336;QD=6.94857;RBI=0.0167994;REFB=0.001407;REVB=-0.0167511;RO=126;SAF=39;SAR=68;SRF=63;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136815;STB=0.572122;TYPE=snp;VARB=-0.00230809;OID=.;OPOS=193080344;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:235:235:126:128:107:107:68:39:63:63:68:39:63:65 chr3 193080414 . C G 578.44 PASS AO=114;DP=195;FAO=114;FDP=195;FR=.;FRO=81;FSAF=53;FSAR=61;FSRF=32;FSRR=49;FWDB=0.00525763;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=272.881;QD=11.8655;RBI=0.00731947;REFB=-0.0165595;REVB=0.00509234;RO=80;SAF=53;SAR=61;SRF=32;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0498212;STB=0.529273;TYPE=snp;VARB=0.012742;OID=.;OPOS=193080414;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:195:80:81:114:114:61:53:32:48:61:53:32:49 chr3 193081122 . G T 458.8 PASS AO=131;DP=310;FAO=131;FDP=309;FR=.;FRO=178;FSAF=39;FSAR=92;FSRF=58;FSRR=120;FWDB=0.00102443;FXX=0.0032257;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.615;QD=5.93923;RBI=0.00108858;REFB=-0.0106485;REVB=0.000368158;RO=177;SAF=39;SAR=92;SRF=57;SRR=120;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0295927;STB=0.519076;TYPE=snp;VARB=0.0140161;OID=.;OPOS=193081122;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:310:309:177:178:131:131:92:39:57:120:92:39:58:120 chr3 193096529 . C T 1355.35 PASS AO=146;DP=149;FAO=146;FDP=149;FR=.;FRO=3;FSAF=65;FSAR=81;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0107985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.9006;QD=36.3851;RBI=0.0131084;REFB=-0.0432131;REVB=0.00743126;RO=2;SAF=65;SAR=81;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0144061;STB=0.504508;TYPE=snp;VARB=0.00147929;OID=.;OPOS=193096529;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:149:149:2:3:146:146:81:65:2:0:81:65:2:1 chr3 193120359 . GA G 196.69 PASS AO=67;DP=190;FAO=67;FDP=185;FR=.;FRO=118;FSAF=37;FSAR=30;FSRF=69;FSRR=49;FWDB=-0.00666433;FXX=0.0159566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.399;QD=4.25271;RBI=0.00672921;REFB=-0.0142732;REVB=-0.000932212;RO=117;SAF=37;SAR=30;SRF=68;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0328944;STB=0.521049;TYPE=del;VARB=0.0267894;OID=.;OPOS=193120360;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:67:188:67:185:118:37:30:69:49:99:117:37:30:68:49 chr3 193183817 . A G 1224.21 PASS AO=128;DP=131;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0519466;FXX=0.015266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.582;QD=37.9601;RBI=0.0550826;REFB=0;REVB=0.0183207;RO=0;SAF=85;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.75417e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.19062e-05;OID=.;OPOS=193183817;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:131:129:0:0:128:129:43:85:0:0:44:85:0:0 chr3 193209178 . T C 712.11 PASS AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00301713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9403;QD=37.979;RBI=0.03263;REFB=0;REVB=-0.0324902;RO=0;SAF=41;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00025755;OID=.;OPOS=193209178;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:75:75:0:0:75:75:34:41:0:0:34:41:0:0 chr3 193210768 . A G 1792.55 PASS AO=189;DP=190;FAO=190;FDP=190;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=125;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.025469;FXX=0.00523533;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.857;QD=37.7379;RBI=0.032585;REFB=0.0126857;REVB=0.0203252;RO=1;SAF=64;SAR=125;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00379446;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.89912e-05;OID=.;OPOS=193210768;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:190:190:1:0:189:190:125:64:0:1:125:65:0:0 chr3 193334991 . G A 305.77 PASS AO=77;DP=166;FAO=77;FDP=165;FR=.;FRO=88;FSAF=40;FSAR=37;FSRF=37;FSRR=51;FWDB=-0.00896445;FXX=0.00602373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.7555;QD=7.41266;RBI=0.0388067;REFB=-0.0164856;REVB=0.0377571;RO=87;SAF=40;SAR=37;SRF=36;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101047;STB=0.552663;TYPE=snp;VARB=0.0190876;OID=.;OPOS=193334991;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:165:87:88:77:77:37:40:36:51:37:40:37:51 chr3 193336676 . C T 178.35 PASS AO=47;DP=107;FAO=47;FDP=107;FR=.;FRO=60;FSAF=38;FSAR=9;FSRF=45;FSRR=15;FWDB=-0.0211739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.5378;QD=6.66735;RBI=0.0232761;REFB=-0.00401252;REVB=-0.00966656;RO=60;SAF=38;SAR=9;SRF=45;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0882188;STB=0.549706;TYPE=snp;VARB=0.00814012;OID=.;OPOS=193336676;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:60:60:47:47:9:38:45:15:9:38:45:15 chr3 193355074 . T C 590.93 PASS AO=154;DP=337;FAO=155;FDP=339;FR=.;FRO=184;FSAF=63;FSAR=92;FSRF=80;FSRR=104;FWDB=0.00965496;FXX=0.00294109;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.88;QD=6.97258;RBI=0.0114671;REFB=-0.00500022;REVB=0.00618679;RO=181;SAF=62;SAR=92;SRF=80;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0397021;STB=0.515839;TYPE=snp;VARB=0.00584695;OID=.;OPOS=193355074;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:337:339:181:184:154:155:92:62:80:101:92:63:80:104 chr3 193364872 . A C 55.21 PASS AO=15;DP=39;FAO=15;FDP=39;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=21;FWDB=-0.0267064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.906;QD=5.66294;RBI=0.0274013;REFB=0.0123604;REVB=-0.0061318;RO=24;SAF=4;SAR=11;SRF=3;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217544;STB=0.624251;TYPE=snp;VARB=-0.0252676;OID=.;OPOS=193364872;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:39:39:24:24:15:15:11:4:3:21:11:4:3:21 chr3 193374964 . T C 355.48 PASS AO=88;DP=189;FAO=89;FDP=190;FR=.;FRO=101;FSAF=35;FSAR=54;FSRF=45;FSRR=56;FWDB=-0.00621498;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.051;QD=7.48374;RBI=0.0211888;REFB=-0.0117976;REVB=0.0202568;RO=101;SAF=34;SAR=54;SRF=45;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0592924;STB=0.528757;TYPE=snp;VARB=0.0137993;OID=.;OPOS=193374964;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:190:101:101:88:89:54:34:45:56:54:35:45:56 chr3 193385188 . G A 178.69 PASS AO=41;DP=82;FAO=41;FDP=83;FR=.;FRO=42;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=-0.0212253;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.825;QD=8.61144;RBI=0.0458023;REFB=-0.0193502;REVB=-0.0405874;RO=41;SAF=18;SAR=23;SRF=16;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0448934;STB=0.517667;TYPE=snp;VARB=0.0199473;OID=.;OPOS=193385188;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:83:41:42:41:41:23:18:16:25:23:18:17:25 chr3 193385233 . G A 46.83 PASS AO=13;DP=35;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=-0.00681802;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=132.58;QD=5.35186;RBI=0.0124796;REFB=-0.0309733;REVB=-0.0104525;RO=22;SAF=3;SAR=10;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119645;STB=0.571312;TYPE=snp;VARB=0.0242963;OID=.;OPOS=193385233;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:35:35:22:22:13:13:10:3:7:15:10:3:7:15 chr3 193386239 . C T 178.13 PASS AO=53;DP=138;FAO=56;FDP=138;FR=.;FRO=82;FSAF=33;FSAR=23;FSRF=48;FSRR=34;FWDB=0.0441925;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=36.1151;QD=5.16329;RBI=0.0478385;REFB=0.0144211;REVB=0.018318;RO=74;SAF=30;SAR=23;SRF=41;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126159;STB=0.502403;TYPE=snp;VARB=-0.00802074;OID=.;OPOS=193386239;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:74:82:53:56:23:30:41:33:23:33:48:34 chr3 193863706 . A G 88.39 PASS AO=20;DP=43;FAO=20;FDP=43;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=0.0506902;FXX=0.0444346;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.9666;QD=8.22204;RBI=0.0669944;REFB=-0.0305219;REVB=-0.0438035;RO=23;SAF=6;SAR=14;SRF=17;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.403368;STB=0.728285;TYPE=snp;VARB=0.0342961;OID=.;OPOS=193863706;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:43:43:23:23:20:20:14:6:17:6:14:6:17:6 chr3 194118874 . T C 305.92 PASS AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0196154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.989;QD=37.0811;RBI=0.0201314;REFB=0;REVB=0.00452888;RO=0;SAF=12;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.55838e-05;OID=.;OPOS=194118874;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:33:33:0:0:33:33:21:12:0:0:21:12:0:0 chr3 194219566 . G A 74.24 PASS AO=20;DP=50;FAO=20;FDP=50;FR=.;FRO=30;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=22;FWDB=0.00476272;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=211.465;QD=5.93944;RBI=0.00559163;REFB=-0.00978051;REVB=-0.00292965;RO=29;SAF=4;SAR=16;SRF=7;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.063225;STB=0.558078;TYPE=snp;VARB=0.0150777;OID=.;OPOS=194219566;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:50:50:29:30:20:20:16:4:7:22:16:4:8:22 chr3 194313832 . T C 187.49 PASS AO=38;DP=72;FAO=39;FDP=72;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=30;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=-0.0183439;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.491;QD=10.4162;RBI=0.0184671;REFB=-0.00734768;REVB=-0.00212904;RO=33;SAF=8;SAR=30;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170837;STB=0.578469;TYPE=snp;VARB=0.00760544;OID=.;OPOS=194313832;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:33:33:38:39:30:8:12:21:30:9:12:21 chr3 194337901 . T C 39.29 PASS AO=8;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=-0.0792334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.032;QD=9.24563;RBI=0.0792384;REFB=-0.0192202;REVB=-0.000889801;RO=8;SAF=1;SAR=7;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.574942;STB=0.860595;TYPE=snp;VARB=0.0148107;OID=.;OPOS=194337901;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:17:17:8:9:8:8:7:1:6:2:7:1:7:2 chr3 194338423 . C T 216.4 PASS AO=46;DP=88;FAO=46;FDP=87;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=0.00460465;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.25;QD=9.9494;RBI=0.00923465;REFB=-0.00738695;REVB=-0.00800475;RO=40;SAF=19;SAR=27;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0533171;STB=0.524261;TYPE=snp;VARB=0.00840097;OID=.;OPOS=194338423;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:87:40:41:46:46:27:19:19:21:27:19:19:22 chr3 194349178 . C T 1001.51 PASS AO=104;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0334045;FXX=0.0185168;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.494;QD=37.7927;RBI=0.0519611;REFB=-0.0180485;REVB=0.0398007;RO=1;SAF=33;SAR=71;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00663745;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000232655;OID=.;OPOS=194349178;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:106:106:1:0:104:106:71:33:0:1:73:33:0:0 chr3 194373832 . T C 642.68 PASS AO=219;DP=494;FAO=176;FDP=396;FR=.;FRO=220;FSAF=61;FSAR=115;FSRF=100;FSRR=120;FWDB=0.038927;FXX=0.00999975;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.076;QD=6.49168;RBI=0.0457256;REFB=0.00106297;REVB=0.02399;RO=269;SAF=80;SAR=139;SRF=121;SRR=148;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0883774;STB=0.563615;TYPE=snp;VARB=-0.00155367;OID=.;OPOS=194373832;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:494:396:269:220:219:176:139:80:121:148:115:61:100:120 chr3 194373833 . G A 692.66 PASS AO=218;DP=493;FAO=182;FDP=398;FR=.;FRO=216;FSAF=64;FSAR=118;FSRF=98;FSRR=118;FWDB=0.035107;FXX=0.00499988;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.828;QD=6.96142;RBI=0.0416371;REFB=0.000939764;REVB=0.0223863;RO=270;SAF=79;SAR=139;SRF=122;SRR=148;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0939503;STB=0.558614;TYPE=snp;VARB=-0.00117564;OID=.;OPOS=194373833;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:493:398:270:216:218:182:139:79:122:148:118:64:98:118 chr3 195076877 . C G 99.76 PASS AO=33;DP=92;FAO=34;FDP=94;FR=.;FRO=60;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=38;FWDB=-0.0127339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.697;QD=4.24527;RBI=0.0437001;REFB=-0.00241617;REVB=0.0418036;RO=59;SAF=13;SAR=20;SRF=22;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0247358;STB=0.530009;TYPE=snp;VARB=0.00435336;OID=.;OPOS=195076877;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:94:59:60:33:34:20:13:22:37:20:14:22:38 chr3 195345953 . C T 309.9 PASS AO=41;DP=50;FAO=41;FDP=50;FR=.;FRO=9;FSAF=14;FSAR=27;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0602229;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.4533;QD=24.7918;RBI=0.0694699;REFB=-0.0357208;REVB=0.0346304;RO=9;SAF=14;SAR=27;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0775016;STB=0.54169;TYPE=snp;VARB=0.0125305;OID=.;OPOS=195345953;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:50:50:9:9:41:41:27:14:5:4:27:14:5:4 chr3 195346352 . C T 40.43 PASS AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.219;QD=16.1714;RBI=0.0407497;REFB=-0.0283136;REVB=0.0407497;RO=4;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0260303;OID=.;OPOS=195346352;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:10:10:4:4:6:6:6:0:0:4:6:0:0:4 chr3 195346477 . C T 125.97 PASS AO=28;DP=56;FAO=28;FDP=56;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=23;FSRF=6;FSRR=22;FWDB=0.0391479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.5385;QD=8.99768;RBI=0.0741398;REFB=0.0153577;REVB=-0.0629615;RO=28;SAF=5;SAR=23;SRF=6;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0521268;STB=0.529267;TYPE=snp;VARB=-0.0194105;OID=.;OPOS=195346477;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:28:28:28:28:23:5:6:22:23:5:6:22 chr3 195346623 . A G 154.8 PASS AO=32;DP=62;FAO=33;FDP=63;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.00187217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.575;QD=9.82872;RBI=0.0339383;REFB=-0.00771714;REVB=0.0338866;RO=29;SAF=17;SAR=15;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0120172;STB=0.508665;TYPE=snp;VARB=0.00824913;OID=.;OPOS=195346623;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:63:29:30:32:33:15:17:15:14:16:17:16:14 chr3 195346665 . G A 93.16 PASS AO=23;DP=50;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=9;FWDB=0.017171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.648;QD=7.16631;RBI=0.0252178;REFB=-0.018022;REVB=-0.0184688;RO=27;SAF=14;SAR=9;SRF=18;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0589451;STB=0.553648;TYPE=snp;VARB=0.0249399;OID=.;OPOS=195346665;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:50:52:27:28:23:24:9:14:18:9:10:14:19:9 chr3 195346677 . G A 57.08 PASS AO=5;DP=51;FAO=18;FDP=46;FR=.,HEALED;FRO=28;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=8;FWDB=-0.00984221;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=113.151;QD=4.96366;RBI=0.0194402;REFB=0.0136334;REVB=-0.0167646;RO=15;SAF=1;SAR=4;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.393696;STB=0.567991;TYPE=snp;VARB=-0.0486263;OID=.;OPOS=195346677;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:33:46:15:28:5:18:4:1:8:7:7:11:20:8 chr3 195346861 . T C 180.34 PASS AO=45;DP=98;FAO=45;FDP=98;FR=.;FRO=53;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=16;FSRR=37;FWDB=-0.00984037;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.9053;QD=7.36067;RBI=0.034249;REFB=-0.0265633;REVB=-0.0328049;RO=52;SAF=16;SAR=29;SRF=16;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0510976;STB=0.532244;TYPE=snp;VARB=0.0184546;OID=.;OPOS=195346861;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:52:53:45:45:29:16:16:36:29:16:16:37 chr3 195391049 . CA C,CG 52.09 PASS AO=2,3;DP=7;FAO=6,0;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=1,0;FSAR=5,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0337461,-0.0934131;FXX=0.142653;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=216.949,206.339;QD=34.7252;RBI=0.0594584,0.097193;REFB=0,0;REVB=0.048954,0.0268416;RO=1;SAF=0,0;SAR=2,3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.000748982,0;OID=.,.;OPOS=195391050,195391050;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:2,3:6:6,0:6:0:1,0:5,0:0:0:3:1:0,0:2,3:0:1 chr3 195399487 . G A 61.4 PASS AO=6;DP=6;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.478;QD=35.0872;RBI=0.0295953;REFB=0;REVB=0.0247538;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000797161;OID=.;OPOS=195399487;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:7:0:0:6:7:3:3:0:0:4:3:0:0 chr3 195399505 . C T 73.84 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0120567;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.417;QD=36.9198;RBI=0.0783941;REFB=0;REVB=-0.0774614;RO=0;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00397545;OID=.;OPOS=195399505;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:4:4:0:0:4:4:0:0 chr3 195400822 . G A 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00226592;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.056;QD=35.0856;RBI=0.0144261;REFB=0;REVB=0.0142471;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00024299;OID=.;OPOS=195400822;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:3:4:0:0:3:4:0:0 chr3 195400841 . C A 99.27 PASS AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00206712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.955;QD=39.7067;RBI=0.0891965;REFB=0;REVB=0.0891726;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00148446;OID=.;OPOS=195400841;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:5:5:0:0:5:5:0:0 chr3 195400848 . G A 99.27 PASS AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0121165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2237;QD=39.7067;RBI=0.0684274;REFB=0;REVB=0.0673461;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00365438;OID=.;OPOS=195400848;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:5:5:0:0:5:5:0:0 chr3 195404649 . A G 84.58 PASS AO=10;DP=11;FAO=10;FDP=11;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.074556;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.4919;QD=30.7569;RBI=0.0807714;REFB=-0.00515087;REVB=-0.0310714;RO=1;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0687795;STB=0.538386;TYPE=snp;VARB=0.00325467;OID=.;OPOS=195404649;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:11:11:1:1:10:10:6:4:0:1:6:4:0:1 chr3 195447886 . G C 269.57 PASS AO=61;DP=118;FAO=61;FDP=118;FR=.;FRO=57;FSAF=37;FSAR=24;FSRF=39;FSRR=18;FWDB=0.0181737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.3816;QD=9.13785;RBI=0.0233694;REFB=-0.0113206;REVB=-0.0146917;RO=57;SAF=37;SAR=24;SRF=39;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0727328;STB=0.539952;TYPE=snp;VARB=0.0155493;OID=.;OPOS=195447886;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:57:57:61:61:24:37:39:18:24:37:39:18 chr3 195451880 . A G 99.11 PASS AO=14;DP=15;FAO=16;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0272475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.489;QD=23.3193;RBI=0.0766002;REFB=-0.0293674;REVB=0.0715903;RO=0;SAF=1;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.666403;TYPE=snp;VARB=0.00583853;OID=.;OPOS=195451880;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:15:17:0:1:14:16:13:1:0:0:15:1:1:0 chr3 195452668 . C G 34.5 PASS AO=3;DP=8;FAO=4;FDP=8;FR=.,HEALED;FRO=2;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.035971;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=34.516;QD=17.2507;RBI=0.0429265;REFB=-0.064705;REVB=0.0234259;RO=3;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.624469;TYPE=snp;VARB=0.0578972;OID=.;OPOS=195452668;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:8:8:3:2:3:4:3:0:0:3:3:1:0:2 chr3 195452770 . G A 30.16 PASS AO=9;DP=27;FAO=9;FDP=28;FR=.;FRO=19;FSAF=0;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=19;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.3804;QD=4.30904;RBI=0.0071751;REFB=-0.0313154;REVB=-0.0071751;RO=18;SAF=0;SAR=9;SRF=0;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0755732;OID=.;OPOS=195452770;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:27:28:18:19:9:9:9:0:0:18:9:0:0:19 chr3 195452951 . G C 315.79 PASS AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00490206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3058;QD=35.0878;RBI=0.0415013;REFB=0.0239359;REVB=-0.0412108;RO=1;SAF=16;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239852;STB=0.512813;TYPE=snp;VARB=-0.00178509;OID=.;OPOS=195452951;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:36:36:1:1:35:35:19:16:0:1:19:16:0:1 chr3 195453064 . T G 401.68 PASS AO=48;DP=52;FAO=48;FDP=52;FR=.;FRO=4;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.00423538;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7867;QD=30.8988;RBI=0.0302686;REFB=-0.0665395;REVB=-0.0299708;RO=4;SAF=26;SAR=22;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0422292;STB=0.522499;TYPE=snp;VARB=0.00933668;OID=.;OPOS=195453064;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:52:52:4:4:48:48:22:26:1:3:22:26:1:3 chr3 195453243 . C T 126.77 PASS AO=37;DP=93;FAO=37;FDP=93;FR=.;FRO=56;FSAF=10;FSAR=27;FSRF=17;FSRR=39;FWDB=-0.0254803;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.848;QD=5.45238;RBI=0.0272085;REFB=-0.0195134;REVB=0.0095425;RO=54;SAF=10;SAR=27;SRF=15;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00990505;STB=0.524824;TYPE=snp;VARB=0.0344575;OID=.;OPOS=195453243;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:54:56:37:37:27:10:15:39:27:10:17:39 chr3 195453257 . G A 149.84 PASS AO=39;DP=89;FAO=39;FDP=89;FR=.;FRO=50;FSAF=11;FSAR=28;FSRF=13;FSRR=37;FWDB=0.00597975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0018;QD=6.73434;RBI=0.00612516;REFB=-0.0113829;REVB=0.00132672;RO=50;SAF=11;SAR=28;SRF=13;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0276135;STB=0.515493;TYPE=snp;VARB=0.0118372;OID=.;OPOS=195453257;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:50:50:39:39:28:11:13:37:28:11:13:37 chr3 195474159 . G A 31.21 PASS AO=7;DP=36;FAO=10;FDP=34;FR=.,HEALED;FRO=24;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=0.00689953;FXX=0.0555401;HRUN=3;LEN=1;MLLD=125.763;QD=3.6723;RBI=0.0760928;REFB=-0.0121246;REVB=-0.0757793;RO=12;SAF=6;SAR=1;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182856;STB=0.888076;TYPE=snp;VARB=0.0405049;OID=.;OPOS=195474159;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:26:34:12:24:7:10:1:6:9:3:1:9:9:15 chr3 195477791 . G A 412.79 PASS AO=76;DP=146;FAO=87;FDP=156;FR=.;FRO=69;FSAF=54;FSAR=33;FSRF=37;FSRR=32;FWDB=0.0261429;FXX=0.00636902;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.291;QD=10.5844;RBI=0.026254;REFB=-0.015924;REVB=0.00241257;RO=69;SAF=49;SAR=27;SRF=37;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0992777;STB=0.538913;TYPE=snp;VARB=0.0138907;OID=.;OPOS=195477791;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:156:69:69:76:87:27:49:37:32:33:54:37:32 chr3 195479256 . T C 766.66 PASS AO=56;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=27;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0348273;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.6333;QD=38.818;RBI=0.213482;REFB=0;REVB=0.210622;RO=0;SAF=26;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.29784e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00179893;OID=.;OPOS=195479256;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:78:79:0:0:56:79:30:26:0:0:52:27:0:0 chr3 195480010 . GC G 433.67 PASS AO=56;DP=79;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.333717;FXX=0.0249969;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.037;QD=22.2396;RBI=0.397899;REFB=0;REVB=0.216694;RO=18;SAF=50;SAR=6;SRF=18;SRR=0;SSEN=0.432526;SSEP=0;SSSB=-0.143239;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0138883;OID=.;OPOS=195480011;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:56:79:78:78:0:69:9:0:0:35:18:50:6:18:0 chr3 195489009 . C A 879.35 PASS AO=94;DP=98;FAO=95;FDP=97;FR=.;FRO=2;FSAF=55;FSAR=40;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0564108;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.801;QD=36.2618;RBI=0.0780291;REFB=-0.145102;REVB=0.0539107;RO=1;SAF=55;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00854356;STB=0.508927;TYPE=snp;VARB=0.00116993;OID=.;OPOS=195489009;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:98:97:1:2:94:95:39:55:1:0:40:55:2:0 chr3 195489067 . C G 84.69 PASS AO=34;DP=110;FAO=34;FDP=109;FR=.;FRO=75;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=37;FSRR=38;FWDB=-0.0210544;FXX=0.00909008;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0677;QD=3.10793;RBI=0.0515512;REFB=0.00653243;REVB=-0.0470558;RO=75;SAF=15;SAR=19;SRF=36;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0460031;STB=0.536061;TYPE=snp;VARB=-0.0162907;OID=.;OPOS=195489067;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:110:109:75:75:34:34:19:15:36:39:19:15:37:38 chr3 195495916 . G C 265.45 PASS AO=49;DP=81;FAO=49;FDP=81;FR=.;FRO=32;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=9;FWDB=0.00171992;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.405;QD=13.1086;RBI=0.0103762;REFB=-0.0179623;REVB=-0.0102327;RO=28;SAF=31;SAR=18;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0598177;STB=0.537299;TYPE=snp;VARB=0.010432;OID=.;OPOS=195495916;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:28:32:49:49:18:31:20:8:18:31:23:9 chr3 195497174 . C G 1406.87 PASS AO=150;DP=153;FAO=151;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0611307;FXX=0.013071;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.8796;QD=37.2682;RBI=0.0612162;REFB=-0.0639145;REVB=0.00323375;RO=0;SAF=31;SAR=119;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.7157e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000566673;OID=.;OPOS=195497174;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:153:151:0:0:150:151:119:31:0:0:120:31:0:0 chr3 195497743 . T C 135.95 PASS AO=39;DP=96;FAO=39;FDP=96;FR=.;FRO=57;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=28;FSRR=29;FWDB=0.0078569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.521;QD=5.66455;RBI=0.017892;REFB=-0.00645789;REVB=-0.0160746;RO=57;SAF=15;SAR=24;SRF=28;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114344;STB=0.564827;TYPE=snp;VARB=0.00707886;OID=.;OPOS=195497743;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:57:57:39:39:24:15:28:29:24:15:28:29 chr3 195501149 . C T 110.07 PASS AO=26;DP=72;FAO=32;FDP=80;FR=.;FRO=48;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=31;FWDB=0.0235492;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.5348;QD=5.50364;RBI=0.0489388;REFB=-0.0666181;REVB=0.0429004;RO=45;SAF=11;SAR=15;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103151;STB=0.605199;TYPE=snp;VARB=0.0978427;OID=.;OPOS=195501149;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:80:45:48:26:32:15:11:15:30:15:17:17:31 chr3 195505664 . G A 612.14 PASS AO=66;DP=68;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0288035;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.527;QD=36.0082;RBI=0.0884527;REFB=-0.152132;REVB=0.0836315;RO=1;SAF=45;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0103857;STB=0.505493;TYPE=snp;VARB=0.000978116;OID=.;OPOS=195505664;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:68:68:1:1:66:67:21:45:1:0:22:45:1:0 chr3 195505788 . G C 61.44 PASS AO=11;DP=20;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.000600639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.935;QD=12.2875;RBI=0.0132025;REFB=-0.0449818;REVB=0.0131888;RO=9;SAF=8;SAR=3;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0576918;STB=0.533271;TYPE=snp;VARB=0.0286401;OID=.;OPOS=195505788;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:20:20:9:9:11:11:3:8:6:3:3:8:6:3 chr3 195510827 . C T 15.36 PASS AO=3;DP=9;FAO=3;FDP=9;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=-0.0802265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.969;QD=6.82575;RBI=0.0872641;REFB=-0.0633455;REVB=-0.0343327;RO=6;SAF=1;SAR=2;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208152;STB=0.635588;TYPE=snp;VARB=0.0860804;OID=.;OPOS=195510827;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:9:9:6:6:3:3:2:1:1:5:2:1:1:5 chr3 195512107 . T A 107.82 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0961235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.275;QD=35.9383;RBI=0.104257;REFB=0;REVB=0.0403716;RO=0;SAF=2;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00132345;OID=.;OPOS=195512107;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:10:2:0:0:10:2:0:0 chr3 195513126 . G A 50.97 PASS AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0134701;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=182.087;QD=7.28192;RBI=0.0229882;REFB=-0.0517951;REVB=-0.0186282;RO=15;SAF=2;SAR=10;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.414557;STB=0.763399;TYPE=snp;VARB=0.0442739;OID=.;OPOS=195513126;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:28:28:15:16:12:12:10:2:8:7:10:2:9:7 chr3 195515568 . C T 405.09 PASS AO=78;DP=131;FAO=78;FDP=132;FR=.;FRO=54;FSAF=69;FSAR=9;FSRF=48;FSRR=6;FWDB=0.0141346;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=233.221;QD=12.2754;RBI=0.0145956;REFB=-0.0216452;REVB=0.0036396;RO=53;SAF=69;SAR=9;SRF=47;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00398435;STB=0.504309;TYPE=snp;VARB=0.0120396;OID=.;OPOS=195515568;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:132:53:54:78:78:9:69:47:6:9:69:48:6 chr3 195515594 . C G 1397.84 PASS AO=146;DP=146;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=128;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00495589;FXX=0.0201329;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.85;QD=38.2971;RBI=0.0102647;REFB=0;REVB=0.00898905;RO=0;SAF=128;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.37419e-05;OID=.;OPOS=195515594;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:146:146:0:0:146:146:18:128:0:0:18:128:0:0 chr3 195515617 . G C 1455.42 PASS AO=140;DP=146;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=130;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0908543;FXX=0.0379723;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.292;QD=38.3005;RBI=0.204199;REFB=0;REVB=0.182873;RO=0;SAF=118;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00130911;OID=.;OPOS=195515617;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:146:152:0:0:140:152:22:118:0:0:22:130:0:0 chr3 195516305 . C T 411.27 PASS AO=83;DP=146;FAO=83;FDP=146;FR=.;FRO=63;FSAF=51;FSAR=32;FSRF=24;FSRR=39;FWDB=-0.000217752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.073;QD=11.2677;RBI=0.00463794;REFB=-0.0286478;REVB=0.00463282;RO=63;SAF=51;SAR=32;SRF=24;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185997;STB=0.601371;TYPE=snp;VARB=0.0258421;OID=.;OPOS=195516305;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:63:63:83:83:32:51:24:39:32:51:24:39 chr3 195516630 . G T 1155.8 PASS AO=123;DP=126;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301168;FXX=0.00793588;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.469;QD=36.9857;RBI=0.0329765;REFB=-0.101068;REVB=0.0134324;RO=1;SAF=43;SAR=80;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0109197;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000395868;OID=.;OPOS=195516630;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:126:125:1:0:123:125:80:43:1:0:80:45:0:0 chr3 195516877 . GT G,GC 842.28 PASS AO=42,50;DP=96;FAO=30,62;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=24,44;FSAR=6,18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0267245,0.0474717;FXX=0.0107515;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=79.4392,81.0539;QD=36.6208;RBI=0.0695091,0.0765147;REFB=0,0;REVB=0.0641663,0.0600078;RO=0;SAF=34,33;SAR=8,17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.67012e-08,4.56458e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0251333,0.0303672;OID=.,.;OPOS=195516878,195516878;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=G,GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:42,50:92:30,62:92:0:24,44:6,18:0:0:49:0:34,33:8,17:0:0 chr3 195517124 . G A 872.44 PASS AO=188;DP=367;FAO=197;FDP=376;FR=.;FRO=179;FSAF=104;FSAR=93;FSRF=76;FSRR=103;FWDB=-0.0198062;FXX=0.00265245;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.81;QD=9.28129;RBI=0.0249338;REFB=0.00446733;REVB=0.0151463;RO=179;SAF=105;SAR=83;SRF=76;SRR=103;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119345;STB=0.549074;TYPE=snp;VARB=-0.00292629;OID=.;OPOS=195517124;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:367:376:179:179:188:197:83:105:76:103:93:104:76:103 chr3 195517258 . G A 2072.53 PASS AO=219;DP=237;FAO=219;FDP=219;FR=.;FRO=0;FSAF=151;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00732689;FXX=0.0759462;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.065;QD=37.8545;RBI=0.0181728;REFB=-0.0466669;REVB=0.0166304;RO=1;SAF=151;SAR=68;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00314518;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000193014;OID=.;OPOS=195517258;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:82:237:219:1:0:219:219:68:151:1:0:68:151:0:0 chr3 195517321 . G A 1665.92 PASS AO=177;DP=183;FAO=178;FDP=178;FR=.;FRO=0;FSAF=141;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0203644;FXX=0.0273209;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.4174;QD=37.4365;RBI=0.0212264;REFB=-0.111242;REVB=0.00598784;RO=1;SAF=141;SAR=36;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00336452;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000147895;OID=.;OPOS=195517321;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:183:178:1:0:177:178:36:141:1:0:37:141:0:0 chr3 195517553 . A C 1443.34 PASS AO=153;DP=154;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0225271;FXX=0.00649309;HRUN=3;LEN=1;MLLD=197.419;QD=37.7344;RBI=0.0296186;REFB=-0.0750579;REVB=0.01923;RO=0;SAF=101;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.9845e-05;OID=.;OPOS=195517553;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:154:153:0:0:153:153:52:101:0:0:52:101:0:0 chr3 195518112 . T TGTCTCCTGCGTAACA 1073.38 PASS AO=172;DP=312;FAO=189;FDP=289;FR=.;FRO=100;FSAF=74;FSAR=115;FSRF=74;FSRR=26;FWDB=0.0100209;FXX=0.0677397;HRUN=1;LEN=15;MLLD=380.042;QD=14.8564;RBI=0.010527;REFB=-0.0429509;REVB=0.00322494;RO=101;SAF=64;SAR=108;SRF=76;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.259782;STB=0.619933;TYPE=ins;VARB=0.0126309;OID=.;OPOS=195518113;OREF=-;OALT=GTCTCCTGCGTAACA;OMAPALT=TGTCTCCTGCGTAACA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:172:312:189:289:100:74:115:74:26:99:101:64:108:76:25 chr3 195518330 . C G 66.48 PASS AO=22;DP=64;FAO=22;FDP=64;FR=.;FRO=42;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=-0.00307325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.184;QD=4.15508;RBI=0.00333799;REFB=-0.0127355;REVB=0.00130279;RO=40;SAF=10;SAR=12;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105509;STB=0.576203;TYPE=snp;VARB=0.0159686;OID=.;OPOS=195518330;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:64:64:40:42:22:22:12:10:22:18:12:10:24:18 chr3 195667034 . C T 34.05 PASS AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.0938054;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.823;QD=5.44767;RBI=0.116505;REFB=-0.00157192;REVB=0.0690943;RO=16;SAF=4;SAR=5;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189101;STB=0.613789;TYPE=snp;VARB=0.0101016;OID=.;OPOS=195667034;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:25:25:16:16:9:9:5:4:10:6:5:4:10:6 chr3 195667106 . C G 14.79 PASS AO=2;DP=9;FAO=3;FDP=10;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0.088447;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=90.9465;QD=5.91658;RBI=0.0886092;REFB=-0.00343218;REVB=-0.00535947;RO=7;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.817119;TYPE=snp;VARB=0.113983;OID=.;OPOS=195667106;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:9:10:7:7:2:3:2:0:0:7:2:1:0:7 chr3 195701278 . C T 37.85 PASS AO=29;DP=143;FAO=30;FDP=144;FR=.;FRO=114;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=80;FSRR=34;FWDB=0.000629333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.728;QD=1.05127;RBI=0.00658993;REFB=-0.00935852;REVB=0.00655982;RO=112;SAF=17;SAR=12;SRF=79;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164002;STB=0.612067;TYPE=snp;VARB=0.0801981;OID=.;OPOS=195701278;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:143:144:112:114:29:30:12:17:79:33:13:17:80:34 chr3 195701285 . G T 28.41 PASS AO=29;DP=162;FAO=30;FDP=163;FR=.;FRO=133;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=95;FSRR=38;FWDB=0.00955701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.951;QD=0.697228;RBI=0.00996231;REFB=-0.0028291;REVB=0.00281268;RO=133;SAF=17;SAR=12;SRF=95;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179012;STB=0.626699;TYPE=snp;VARB=0.0118103;OID=.;OPOS=195701285;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:162:163:133:133:29:30:12:17:95:38:13:17:95:38 chr3 195701304 . C T 37.48 PASS AO=36;DP=184;FAO=36;FDP=184;FR=.;FRO=148;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=105;FSRR=43;FWDB=0.0301393;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.723;QD=0.814815;RBI=0.0343069;REFB=-0.00220505;REVB=0.0163887;RO=148;SAF=20;SAR=16;SRF=105;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.209394;STB=0.628866;TYPE=snp;VARB=0.0194039;OID=.;OPOS=195701304;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:184:184:148:148:36:36:16:20:105:43:16:20:105:43 chr3 195701331 . G A 50.42 PASS AO=40;DP=186;FAO=40;FDP=186;FR=.;FRO=146;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=99;FSRR=47;FWDB=-0.0206413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.557;QD=1.08421;RBI=0.0382273;REFB=0.00124701;REVB=0.0321755;RO=146;SAF=20;SAR=20;SRF=99;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230344;STB=0.63972;TYPE=snp;VARB=-0.0105072;OID=.;OPOS=195701331;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:186:186:146:146:40:40:20:20:99:47:20:20:99:47 chr3 195701388 . G A 55.63 PASS AO=36;DP=153;FAO=36;FDP=153;FR=.;FRO=117;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=67;FSRR=50;FWDB=-0.022477;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.0975;QD=1.45445;RBI=0.0256366;REFB=0.000197925;REVB=0.0123297;RO=115;SAF=21;SAR=15;SRF=65;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0232656;STB=0.508375;TYPE=snp;VARB=-0.00269621;OID=.;OPOS=195701388;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:153:153:115:117:36:36:15:21:65:50:15:21:67:50 chr3 195701389 . C A 56.45 PASS AO=37;DP=152;FAO=36;FDP=152;FR=.;FRO=116;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=66;FSRR=50;FWDB=0.00350828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.816;QD=1.48557;RBI=0.00861331;REFB=-0.00227685;REVB=0.00786646;RO=113;SAF=22;SAR=15;SRF=63;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.047438;STB=0.51123;TYPE=snp;VARB=0.019835;OID=.;OPOS=195701389;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:152:152:113:116:37:36:15:22:63:50:15:21:66:50 chr3 195709088 . T C 130.71 PASS AO=38;DP=128;FAO=49;FDP=139;FR=.;FRO=90;FSAF=41;FSAR=8;FSRF=59;FSRR=31;FWDB=-0.0236403;FXX=0.00714235;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.762;QD=3.76143;RBI=0.0243377;REFB=-0.0609854;REVB=-0.00578441;RO=90;SAF=30;SAR=8;SRF=59;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204306;STB=0.66645;TYPE=snp;VARB=0.0893307;OID=.;OPOS=195709088;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:139:90:90:38:49:8:30:59:31:8:41:59:31 chr3 195710989 . G A 24.47 PASS AO=29;DP=166;FAO=29;FDP=165;FR=.;FRO=136;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=64;FSRR=72;FWDB=-0.0331373;FXX=0.0119753;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.844;QD=0.593139;RBI=0.0363725;REFB=-0.00416584;REVB=0.0149958;RO=135;SAF=17;SAR=12;SRF=63;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152647;STB=0.594935;TYPE=snp;VARB=0.0453659;OID=.;OPOS=195710989;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:166:165:135:136:29:29:12:17:63:72:12:17:64:72 chr3 195710993 . A G 38.64 PASS AO=35;DP=173;FAO=35;FDP=175;FR=.;FRO=140;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=71;FSRR=69;FWDB=-0.0238021;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.007;QD=0.883118;RBI=0.0356727;REFB=-0.00168148;REVB=-0.0265707;RO=137;SAF=19;SAR=16;SRF=69;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.050183;STB=0.528625;TYPE=snp;VARB=0.00704416;OID=.;OPOS=195710993;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:173:175:137:140:35:35:16:19:69:68:16:19:71:69 chr3 195800811 . C T 500.65 PASS AO=136;DP=306;FAO=136;FDP=306;FR=.;FRO=170;FSAF=52;FSAR=84;FSRF=107;FSRR=63;FWDB=-0.00622549;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.691;QD=6.5445;RBI=0.0164812;REFB=-0.0113804;REVB=-0.0152601;RO=167;SAF=52;SAR=84;SRF=105;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24343;STB=0.63598;TYPE=snp;VARB=0.0167664;OID=.;OPOS=195800811;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:306:306:167:170:136:136:84:52:105:62:84:52:107:63 chr3 195929252 . G T 76.4 PASS AO=21;DP=56;FAO=22;FDP=57;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=0.0255347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.196;QD=5.36142;RBI=0.0287081;REFB=-0.034751;REVB=0.01312;RO=35;SAF=8;SAR=13;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0109233;STB=0.524105;TYPE=snp;VARB=0.0539143;OID=.;OPOS=195929252;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:56:57:35:35:21:22:13:8:13:22:13:9:13:22 chr3 195938177 . A G 71.46 PASS AO=24;DP=65;FAO=23;FDP=65;FR=.;FRO=42;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=-0.0656614;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.531;QD=4.39763;RBI=0.0656684;REFB=-0.00489336;REVB=-0.000958411;RO=41;SAF=8;SAR=16;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226904;STB=0.616335;TYPE=snp;VARB=0.007041;OID=.;OPOS=195938177;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:65:65:41:42:24:23:16:8:22:19:15:8:22:20 chr3 195941118 . C G 87.88 PASS AO=24;DP=60;FAO=24;FDP=60;FR=.;FRO=36;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=25;FSRR=11;FWDB=0.0135254;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=124.448;QD=5.85899;RBI=0.0647882;REFB=-0.000536712;REVB=0.0633606;RO=35;SAF=18;SAR=6;SRF=25;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0478282;STB=0.542516;TYPE=snp;VARB=0.0014142;OID=.;OPOS=195941118;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:60:60:35:36:24:24:6:18:25:10:6:18:25:11 chr3 195941216 . C G 1817.54 PASS AO=190;DP=191;FAO=190;FDP=190;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00502574;FXX=0.00523533;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.829;QD=38.2639;RBI=0.022055;REFB=0;REVB=0.0214747;RO=0;SAF=103;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.66245e-05;OID=.;OPOS=195941216;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:191:190:0:0:190:190:87:103:0:0:87:103:0:0 chr3 195955762 . G A 327.72 PASS AO=98;DP=241;FAO=99;FDP=244;FR=.;FRO=145;FSAF=51;FSAR=48;FSRF=68;FSRR=77;FWDB=0.0203108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.628;QD=5.37252;RBI=0.0270079;REFB=0.000269411;REVB=0.0178017;RO=142;SAF=51;SAR=47;SRF=68;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0438829;STB=0.527421;TYPE=snp;VARB=-0.000386864;OID=.;OPOS=195955762;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:241:244:142:145:98:99:47:51:68:74:48:51:68:77 chr3 195956827 . T C 318.09 PASS AO=74;DP=149;FAO=74;FDP=149;FR=.;FRO=75;FSAF=34;FSAR=40;FSRF=41;FSRR=34;FWDB=-0.00539016;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.0457;QD=8.53943;RBI=0.0109378;REFB=0.0160481;REVB=-0.00951744;RO=75;SAF=34;SAR=40;SRF=41;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0795873;STB=0.543861;TYPE=snp;VARB=-0.0180337;OID=.;OPOS=195956827;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:75:75:74:74:40:34:41:34:40:34:41:34 chr3 196054439 . T G 479.47 PASS AO=52;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0394821;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.734;QD=37.6057;RBI=0.0453776;REFB=0;REVB=0.0223672;RO=0;SAF=20;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.00761e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000324997;OID=.;OPOS=196054439;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:52:51:0:0:52:51:32:20:0:0:32:19:0:0 chr3 196118702 . A G 364.59 PASS AO=98;DP=222;FAO=98;FDP=221;FR=.;FRO=123;FSAF=56;FSAR=42;FSRF=85;FSRR=38;FWDB=-0.00128825;FXX=0.0045043;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.944;QD=6.59898;RBI=0.0135962;REFB=-0.0115188;REVB=0.013535;RO=122;SAF=56;SAR=42;SRF=85;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130925;STB=0.5693;TYPE=snp;VARB=0.0189084;OID=.;OPOS=196118702;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:221:122:123:98:98:42:56:85:37:42:56:85:38 chr3 196158773 . G A 26.07 PASS AO=4;DP=11;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0279463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.054;QD=8.68834;RBI=0.0289434;REFB=-0.00228231;REVB=0.00753178;RO=6;SAF=2;SAR=2;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517172;TYPE=snp;VARB=0.00256133;OID=.;OPOS=196158773;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:11:12:6:7:4:5:2:2:3:3:3:2:3:4 chr3 196199204 . G T 599.35 PASS AO=150;DP=304;FAO=146;FDP=300;FR=.;FRO=154;FSAF=54;FSAR=92;FSRF=71;FSRR=83;FWDB=-0.0102438;FXX=0.0131575;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.374;QD=7.9913;RBI=0.0395858;REFB=0.000778565;REVB=-0.0382374;RO=154;SAF=57;SAR=93;SRF=71;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0776578;STB=0.548919;TYPE=snp;VARB=-0.000860679;OID=.;OPOS=196199204;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:304:300:154:154:150:146:93:57:71:83:92:54:71:83 chr3 196281208 . T C 2844.7 PASS AO=301;DP=305;FAO=303;FDP=303;FR=.;FRO=0;FSAF=171;FSAR=132;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00726888;FXX=0.0098036;HRUN=3;LEN=1;MLLD=125.097;QD=37.5538;RBI=0.0160933;REFB=0.00497113;REVB=-0.0143582;RO=3;SAF=170;SAR=131;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0083412;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.6824e-05;OID=.;OPOS=196281208;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:305:303:3:0:301:303:131:170:3:0:132:171:0:0 chr3 196294104 . C G 2055.38 PASS AO=203;DP=205;FAO=214;FDP=214;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00734604;FXX=0.00925883;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.055;QD=38.4183;RBI=0.0116114;REFB=0;REVB=0.00899217;RO=0;SAF=97;SAR=106;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000109956;OID=.;OPOS=196294104;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:97:205:214:0:0:203:214:106:97:0:0:109:105:0:0 chr3 196386964 . C G 785.92 PASS AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222986;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.138;QD=37.8758;RBI=0.0286892;REFB=0;REVB=0.0180511;RO=0;SAF=42;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.43125e-05;OID=.;OPOS=196386964;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:83:83:0:0:83:83:41:42:0:0:41:42:0:0 chr3 196544948 . T C 217.13 PASS AO=46;DP=86;FAO=46;FDP=86;FR=.;FRO=40;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=13;FSRR=27;FWDB=-0.000141681;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=201.391;QD=10.0992;RBI=0.0115195;REFB=-0.00222497;REVB=-0.0115186;RO=40;SAF=19;SAR=27;SRF=13;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0778991;STB=0.542839;TYPE=snp;VARB=0.00198903;OID=.;OPOS=196544948;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:40:40:46:46:27:19:13:27:27:19:13:27 chr3 196613075 . C T 211.81 PASS AO=62;DP=150;FAO=62;FDP=151;FR=.;FRO=89;FSAF=37;FSAR=25;FSRF=38;FSRR=51;FWDB=0.0681994;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.157;QD=5.61097;RBI=0.0692641;REFB=-0.0121699;REVB=-0.0120978;RO=88;SAF=37;SAR=25;SRF=38;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172328;STB=0.599925;TYPE=snp;VARB=0.0332087;OID=.;OPOS=196613075;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:151:88:89:62:62:25:37:38:50:25:37:38:51 chr3 196660820 . C T 264.74 PASS AO=76;DP=182;FAO=76;FDP=182;FR=.;FRO=106;FSAF=29;FSAR=47;FSRF=58;FSRR=48;FWDB=-0.0635568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.831;QD=5.81848;RBI=0.0656658;REFB=-0.00894369;REVB=-0.0165086;RO=105;SAF=29;SAR=47;SRF=57;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16904;STB=0.597432;TYPE=snp;VARB=0.0120813;OID=.;OPOS=196660820;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:182:105:106:76:76:47:29:57:48:47:29:58:48 chr3 196673831 . A G 331.46 PASS AO=62;DP=103;FAO=62;FDP=102;FR=.;FRO=40;FSAF=21;FSAR=41;FSRF=13;FSRR=27;FWDB=0.0392363;FXX=0.0097078;HRUN=3;LEN=1;MLLD=158.009;QD=12.9983;RBI=0.0433781;REFB=-0.0301163;REVB=0.0184978;RO=40;SAF=21;SAR=41;SRF=13;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0110785;STB=0.506022;TYPE=snp;VARB=0.0179731;OID=.;OPOS=196673831;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:102:40:40:62:62:41:21:13:27:41:21:13:27 chr3 196674366 . GC G,GG 121.92 PASS AO=8,7;DP=24;FAO=20,0;FDP=29;FR=.;FRO=9;FSAF=6,0;FSAR=14,0;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.00174875,-0.0752373;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=194.122,191.979;QD=16.8158;RBI=0.0225312,0.0782622;REFB=-0.0325194,-0.0241739;REVB=0.0224632,0.0215482;RO=9;SAF=1,5;SAR=7,2;SRF=4;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.398438,0.263271;STB=0.551128,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.00816508,-0.0109255;OID=.,.;OPOS=196674367,196674367;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:8,7:24:20,0:29:9:6,0:14,0:4:5:31:9:1,5:7,2:4:5 chr3 196674398 . T G 21.34 PASS AO=3;DP=18;FAO=3;FDP=13;FR=.,HEALED;FRO=7;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=-0.0181861;FXX=0.133244;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.86;QD=6.56572;RBI=0.0599381;REFB=0.00165222;REVB=-0.0571125;RO=6;SAF=3;SAR=0;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.101891;OID=.;OPOS=196674398;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:15:13:6:7:3:3:0:3:6:0:0:3:7:0 chr3 196674879 . A G 98.19 PASS AO=27;DP=70;FAO=28;FDP=71;FR=.;FRO=43;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=27;FWDB=-0.0386566;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.5029;QD=5.53164;RBI=0.0780448;REFB=-0.00349068;REVB=-0.0677986;RO=43;SAF=17;SAR=10;SRF=16;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.272288;STB=0.64014;TYPE=snp;VARB=0.00458315;OID=.;OPOS=196674879;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:70:71:43:43:27:28:10:17:16:27:11:17:16:27 chr3 196674916 . A C 78.32 PASS AO=23;DP=65;FAO=24;FDP=65;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=27;FWDB=-0.0132538;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.386;QD=4.81972;RBI=0.0213664;REFB=-0.017235;REVB=0.0167589;RO=41;SAF=10;SAR=13;SRF=14;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106876;STB=0.549558;TYPE=snp;VARB=0.0207393;OID=.;OPOS=196674916;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:65:65:41:41:23:24:13:10:14:27:14:10:14:27 chr3 197237588 . G A 18.88 PASS AO=4;DP=12;FAO=4;FDP=12;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.0596469;FXX=0.076864;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.0289;QD=6.29482;RBI=0.0939035;REFB=0.000772181;REVB=0.0725266;RO=8;SAF=2;SAR=2;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127513;STB=0.582928;TYPE=snp;VARB=0.000676796;OID=.;OPOS=197237588;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:12:12:8:8:4:4:2:2:3:5:2:2:3:5 chr3 197237589 . T C 17.78 PASS AO=4;DP=12;FAO=4;FDP=13;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.00472972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.2939;QD=5.46949;RBI=0.0525731;REFB=-0.0137987;REVB=-0.0523599;RO=8;SAF=2;SAR=2;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127513;STB=0.53827;TYPE=snp;VARB=0.0473556;OID=.;OPOS=197237589;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:12:13:8:9:4:4:2:2:3:5:2:2:4:5 chr3 197241286 . G C 272.45 PASS AO=66;DP=137;FAO=66;FDP=137;FR=.;FRO=71;FSAF=16;FSAR=50;FSRF=21;FSRR=50;FWDB=0.0132882;FXX=0.00724585;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.398;QD=7.95461;RBI=0.0145041;REFB=-0.0111;REVB=0.00581313;RO=70;SAF=17;SAR=49;SRF=20;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0335663;STB=0.536221;TYPE=snp;VARB=0.0126262;OID=.;OPOS=197241286;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:70:71:66:66:49:17:20:50:50:16:21:50 chr3 197495334 . G A 1738.18 PASS AO=180;DP=180;FAO=182;FDP=182;FR=.;FRO=0;FSAF=108;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0444591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7775;QD=38.2017;RBI=0.0525424;REFB=0;REVB=0.0280017;RO=0;SAF=106;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000265109;OID=.;OPOS=197495334;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:82:180:182:0:0:180:182:74:106:0:0:74:108:0:0 chr3 197566254 . T C 426.49 PASS AO=111;DP=243;FAO=112;FDP=247;FR=.;FRO=135;FSAF=54;FSAR=58;FSRF=65;FSRR=70;FWDB=-0.00562829;FXX=0.00803181;HRUN=3;LEN=1;MLLD=75.342;QD=6.90676;RBI=0.033071;REFB=-0.0325369;REVB=-0.0325886;RO=130;SAF=52;SAR=59;SRF=64;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0233048;STB=0.500362;TYPE=snp;VARB=0.0459809;OID=.;OPOS=197566254;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:243:247:130:135:111:112:59:52:64:66:58:54:65:70 chr3 197579466 . C T 495.99 PASS AO=136;DP=309;FAO=136;FDP=309;FR=.;FRO=173;FSAF=48;FSAR=88;FSRF=58;FSRR=115;FWDB=0.016848;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.642;QD=6.42063;RBI=0.0168884;REFB=-0.00983508;REVB=-0.00116708;RO=171;SAF=48;SAR=88;SRF=56;SRR=115;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0282871;STB=0.510904;TYPE=snp;VARB=0.0123999;OID=.;OPOS=197579466;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:309:309:171:173:136:136:88:48:56:115:88:48:58:115 chr3 197659160 . C G 275.73 PASS AO=61;DP=118;FAO=61;FDP=118;FR=.;FRO=57;FSAF=32;FSAR=29;FSRF=14;FSRR=43;FWDB=-0.00838803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.006;QD=9.34691;RBI=0.00963534;REFB=-0.0122305;REVB=-0.00474139;RO=56;SAF=32;SAR=29;SRF=14;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237568;STB=0.633274;TYPE=snp;VARB=0.0102986;OID=.;OPOS=197659160;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:56:57:61:61:29:32:14:42:29:32:14:43 chr3 197665599 . G T 450.17 PASS AO=111;DP=235;FAO=113;FDP=240;FR=.;FRO=127;FSAF=66;FSAR=47;FSRF=59;FSRR=68;FWDB=-0.0150949;FXX=0.00414921;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.629;QD=7.50277;RBI=0.0160825;REFB=-0.000543704;REVB=-0.00554882;RO=122;SAF=66;SAR=45;SRF=56;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129822;STB=0.563672;TYPE=snp;VARB=1.10614e-05;OID=.;OPOS=197665599;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:235:240:122:127:111:113:45:66:56:66:47:66:59:68 chr3 197762896 . AC A 108.68 PASS AO=117;DP=329;FAO=97;FDP=305;FR=.;FRO=208;FSAF=13;FSAR=84;FSRF=89;FSRR=119;FWDB=-0.0771698;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.2726;QD=1.42537;RBI=0.0819867;REFB=-0.0296232;REVB=-0.0276882;RO=180;SAF=29;SAR=88;SRF=70;SRR=110;SSEN=0;SSEP=0.494118;SSSB=-0.181713;STB=0.764458;TYPE=del;VARB=0.0222869;OID=.;OPOS=197762897;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:117:303:97:305:208:13:84:89:119:99:180:29:88:70:110 chr4 53428 . G A 231.77 PASS AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0305278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.928;QD=37.0831;RBI=0.0347337;REFB=0;REVB=0.0165675;RO=0;SAF=5;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000364582;OID=.;OPOS=53428;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:25:25:0:0:25:25:20:5:0:0:20:5:0:0 chr4 60303 . G A 446.23 PASS AO=173;DP=449;FAO=150;FDP=397;FR=.;FRO=247;FSAF=59;FSAR=91;FSRF=115;FSRR=132;FWDB=-0.00856899;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.433;QD=4.49601;RBI=0.00882742;REFB=-0.0196061;REVB=0.00212033;RO=273;SAF=66;SAR=107;SRF=130;SRR=143;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106205;STB=0.546163;TYPE=snp;VARB=0.0357107;OID=.;OPOS=60303;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:449:397:273:247:173:150:107:66:130:143:91:59:115:132 chr4 85995 . C CA 213.92 PASS AO=31;DP=57;FAO=44;FDP=49;FR=.;FRO=5;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.205383;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=11.824;QD=17.4626;RBI=0.210058;REFB=-0.0838414;REVB=-0.0440693;RO=23;SAF=15;SAR=16;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0291936;STB=0.526304;TYPE=ins;VARB=0.0439451;OID=.;OPOS=85996;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:31:57:44:49:5:20:24:1:4:9:23:15:16:12:11 chr4 86023 . A T 137.17 PASS AO=20;DP=28;FAO=20;FDP=27;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=-0.0104907;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.741;QD=20.3214;RBI=0.0152945;REFB=0.0163299;REVB=0.0111295;RO=6;SAF=4;SAR=16;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145252;STB=0.589665;TYPE=snp;VARB=-0.00162991;OID=.;OPOS=86023;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:28:27:6:7:20:20:16:4:0:6:16:4:0:7 chr4 86040 . G T 147.38 PASS AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.131311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.566;QD=36.8441;RBI=0.131377;REFB=0;REVB=-0.00414967;RO=0;SAF=4;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07465e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00207372;OID=.;OPOS=86040;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:16:0:0:16:16:12:4:0:0:12:4:0:0 chr4 86042 . A G 147.38 PASS AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0179944;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.92;QD=36.8441;RBI=0.0190471;REFB=0;REVB=0.00624442;RO=0;SAF=4;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07465e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000149556;OID=.;OPOS=86042;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:16:0:0:16:16:12:4:0:0:12:4:0:0 chr4 86044 . G A 147.63 PASS AO=15;DP=15;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00982746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.425;QD=36.9069;RBI=0.0808548;REFB=0;REVB=0.0802554;RO=0;SAF=4;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33019e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0016242;OID=.;OPOS=86044;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:16:0:0:15:16:11:4:0:0:12:4:0:0 chr4 86738 . A G 412.47 PASS AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.326;QD=37.4973;RBI=0.0300804;REFB=0;REVB=-0.0275736;RO=0;SAF=20;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30465e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.70617e-05;OID=.;OPOS=86738;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:44:44:0:0:44:44:24:20:0:0:24:20:0:0 chr4 86798 . C T 46.5 PASS AO=14;DP=43;FAO=15;FDP=45;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=21;FSRR=9;FWDB=-0.0217315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.645;QD=4.13374;RBI=0.0250972;REFB=-0.0133278;REVB=0.0125544;RO=28;SAF=11;SAR=3;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108584;STB=0.527637;TYPE=snp;VARB=0.029344;OID=.;OPOS=86798;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:43:45:28:30:14:15:3:11:20:8:4:11:21:9 chr4 87113 . T C 91.41 PASS AO=22;DP=52;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.0610988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.88;QD=7.0313;RBI=0.0738135;REFB=-0.0336882;REVB=0.0414169;RO=29;SAF=8;SAR=14;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122984;STB=0.578877;TYPE=snp;VARB=0.0269544;OID=.;OPOS=87113;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:52:52:29:29:22:23:14:8:14:15:15:8:14:15 chr4 87277 . G C 346.69 PASS AO=53;DP=85;FAO=57;FDP=83;FR=.;FRO=26;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=2;FSRR=24;FWDB=0.0179838;FXX=0.0235266;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.741;QD=16.7078;RBI=0.0181792;REFB=-0.00082391;REVB=0.00265796;RO=0;SAF=27;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.64364;TYPE=snp;VARB=0.00203321;OID=.;OPOS=87277;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:54:83:0:26:53:57:26:27:0:0:26:31:2:24 chr4 87313 . G GA 791.63 PASS AO=98;DP=103;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0561939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=25.8365;QD=31.0444;RBI=0.0844156;REFB=0;REVB=-0.0629939;RO=2;SAF=35;SAR=63;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0263282;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-0.00201376;OID=.;OPOS=87314;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:98:103:102:102:0:37:65:0:0:70:2:35:63:2:0 chr4 155713 . A G 362.84 PASS AO=74;DP=133;FAO=75;FDP=135;FR=.;FRO=60;FSAF=30;FSAR=45;FSRF=12;FSRR=48;FWDB=0.0178118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.3;QD=10.7509;RBI=0.0178409;REFB=-0.0124609;REVB=-0.0010189;RO=59;SAF=30;SAR=44;SRF=12;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177382;STB=0.59613;TYPE=snp;VARB=0.0115005;OID=.;OPOS=155713;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:135:59:60:74:75:44:30:12:47:45:30:12:48 chr4 264941 . A G 181.55 PASS AO=47;DP=106;FAO=47;FDP=106;FR=.;FRO=59;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=33;FSRR=26;FWDB=-0.00962443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.466;QD=6.85093;RBI=0.0182896;REFB=-0.0107426;REVB=-0.0155525;RO=56;SAF=25;SAR=22;SRF=31;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0212071;STB=0.515341;TYPE=snp;VARB=0.0163038;OID=.;OPOS=264941;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:56:59:47:47:22:25:31:25:22:25:33:26 chr4 265310 . A G 25.52 PASS AO=7;DP=24;FAO=8;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.0260482;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.1438;QD=4.08337;RBI=0.0847803;REFB=-0.00513033;REVB=0.0806795;RO=17;SAF=7;SAR=0;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.763434;STB=0.845217;TYPE=snp;VARB=0.0362312;OID=.;OPOS=265310;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:24:25:17:17:7:8:0:7:7:10:1:7:7:10 chr4 331740 . G T 79.88 PASS AO=21;DP=52;FAO=21;FDP=51;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=21;FWDB=-0.0168056;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.285;QD=6.2653;RBI=0.0273438;REFB=-0.0133343;REVB=0.0215698;RO=29;SAF=7;SAR=14;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0264746;STB=0.522367;TYPE=snp;VARB=0.0254342;OID=.;OPOS=331740;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:52:51:29:30:21:21:14:7:9:20:14:7:9:21 chr4 376888 . C A 223.57 PASS AO=53;DP=110;FAO=53;FDP=110;FR=.;FRO=57;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=37;FSRR=20;FWDB=-0.080688;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.324;QD=8.12976;RBI=0.081552;REFB=0.0101319;REVB=0.0118392;RO=56;SAF=26;SAR=27;SRF=37;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157631;STB=0.581906;TYPE=snp;VARB=-0.00570052;OID=.;OPOS=376888;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:56:57:53:53:27:26:37:19:27:26:37:20 chr4 420389 . C G 712.77 PASS AO=180;DP=380;FAO=180;FDP=381;FR=.;FRO=201;FSAF=96;FSAR=84;FSRF=105;FSRR=96;FWDB=-0.012968;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.955;QD=7.48318;RBI=0.0129891;REFB=-0.0130389;REVB=-0.000739319;RO=200;SAF=96;SAR=84;SRF=104;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0127971;STB=0.505795;TYPE=snp;VARB=0.017018;OID=.;OPOS=420389;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:380:381:200:201:180:180:84:96:104:96:84:96:105:96 chr4 420688 . C T 531.08 PASS AO=204;DP=474;FAO=162;FDP=399;FR=.;FRO=237;FSAF=73;FSAR=89;FSRF=98;FSRR=139;FWDB=0.0329759;FXX=0.00249994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.5256;QD=5.32411;RBI=0.0485972;REFB=-0.0194145;REVB=-0.0356971;RO=270;SAF=89;SAR=115;SRF=116;SRR=154;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00694225;STB=0.522359;TYPE=snp;VARB=0.0277335;OID=.;OPOS=420688;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:474:399:270:237:204:162:115:89:116:154:89:73:98:139 chr4 437221 . G A 67.36 PASS AO=17;DP=41;FAO=17;FDP=41;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.0358855;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.235;QD=6.57134;RBI=0.0400087;REFB=-0.0246058;REVB=0.0176898;RO=24;SAF=6;SAR=11;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234768;STB=0.635677;TYPE=snp;VARB=0.0310245;OID=.;OPOS=437221;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:41:41:24:24:17:17:11:6:14:10:11:6:14:10 chr4 438067 . C T 278.06 PASS AO=61;DP=116;FAO=61;FDP=116;FR=.;FRO=55;FSAF=34;FSAR=27;FSRF=38;FSRR=17;FWDB=0.00617401;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=39.9894;QD=9.58827;RBI=0.00625545;REFB=0.000303586;REVB=-0.00100607;RO=54;SAF=34;SAR=27;SRF=37;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112531;STB=0.565096;TYPE=snp;VARB=6.48024e-05;OID=.;OPOS=438067;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:54:55:61:61:27:34:37:17:27:34:38:17 chr4 515489 . G A 433.63 PASS AO=78;DP=125;FAO=79;FDP=125;FR=.;FRO=46;FSAF=52;FSAR=27;FSRF=30;FSRR=16;FWDB=0.0183354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.136;QD=13.8761;RBI=0.0969128;REFB=-0.00683528;REVB=0.0951626;RO=46;SAF=52;SAR=26;SRF=30;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111246;STB=0.502471;TYPE=snp;VARB=0.00548456;OID=.;OPOS=515489;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:46:46:78:79:26:52:30:16:27:52:30:16 chr4 517376 . T C 99.55 PASS AO=27;DP=65;FAO=27;FDP=65;FR=.;FRO=38;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=-0.046235;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.265;QD=6.12605;RBI=0.0469467;REFB=-0.0118703;REVB=0.0081439;RO=37;SAF=10;SAR=17;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227918;STB=0.636675;TYPE=snp;VARB=0.0158655;OID=.;OPOS=517376;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:37:38:27:27:17:10:22:15:17:10:23:15 chr4 517461 . T C 141.03 PASS AO=32;DP=68;FAO=33;FDP=68;FR=.;FRO=35;FSAF=6;FSAR=27;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.00644136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.841;QD=8.29614;RBI=0.0175412;REFB=-0.0196357;REVB=-0.0163157;RO=34;SAF=6;SAR=26;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.298397;STB=0.682633;TYPE=snp;VARB=0.0263395;OID=.;OPOS=517461;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:34:35:32:33:26:6:15:19:27:6:16:19 chr4 517622 . C T 129.69 PASS AO=29;DP=59;FAO=29;FDP=59;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=0.0366649;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7738;QD=8.79282;RBI=0.0371921;REFB=-0.0378904;REVB=0.00624018;RO=29;SAF=7;SAR=22;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218568;STB=0.617024;TYPE=snp;VARB=0.0271963;OID=.;OPOS=517622;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:29:30:29:29:22:7:13:16:22:7:13:17 chr4 520853 . G A 166.4 PASS AO=39;DP=83;FAO=40;FDP=83;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=0.0439226;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.3706;QD=8.01948;RBI=0.0479711;REFB=-0.00182867;REVB=-0.0192881;RO=43;SAF=15;SAR=24;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0334137;STB=0.523797;TYPE=snp;VARB=0.00505283;OID=.;OPOS=520853;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:43:43:39:40:24:15:18:25:25:15:18:25 chr4 527677 . T C 107.59 PASS AO=22;DP=70;FAO=32;FDP=80;FR=.;FRO=48;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=0.015907;FXX=0.0243873;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.93;QD=5.37969;RBI=0.0201518;REFB=-0.0284197;REVB=-0.0123719;RO=48;SAF=12;SAR=10;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.004432;STB=0.594533;TYPE=snp;VARB=0.0491885;OID=.;OPOS=527677;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:80:48:48:22:32:10:12:26:22:10:22:26:22 chr4 533001 . T C 310 PASS AO=71;DP=138;FAO=70;FDP=137;FR=.;FRO=67;FSAF=26;FSAR=44;FSRF=30;FSRR=37;FWDB=-0.0182036;FXX=0.00724585;HRUN=4;LEN=1;MLLD=42.421;QD=9.05118;RBI=0.0812004;REFB=-0.0337039;REVB=-0.0791337;RO=64;SAF=26;SAR=45;SRF=29;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0788713;STB=0.539157;TYPE=snp;VARB=0.029221;OID=.;OPOS=533001;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:137:64:67:71:70:45:26:29:35:44:26:30:37 chr4 648643 . G A 267.77 PASS AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0193805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.81;QD=34.5507;RBI=0.0433688;REFB=-0.0781119;REVB=0.0387976;RO=1;SAF=1;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.304639;STB=0.666522;TYPE=snp;VARB=0.00130334;OID=.;OPOS=648643;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:31:31:1:1:30:30:29:1:1:0:29:1:1:0 chr4 663908 . A G 1207.39 PASS AO=127;DP=130;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000875784;FXX=0.0227256;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.545;QD=37.4384;RBI=0.0589982;REFB=-0.00522558;REVB=0.0589917;RO=0;SAF=43;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.82188e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.32621e-05;OID=.;OPOS=663908;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:130:129:0:0:127:129:84:43:0:0:84:45:0:0 chr4 755129 . C T 518.55 PASS AO=121;DP=243;FAO=122;FDP=244;FR=.;FRO=122;FSAF=48;FSAR=74;FSRF=63;FSRR=59;FWDB=-0.0115278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.243;QD=8.5008;RBI=0.0574188;REFB=-0.00100649;REVB=0.0562497;RO=120;SAF=48;SAR=73;SRF=61;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103255;STB=0.562669;TYPE=snp;VARB=0.00140092;OID=.;OPOS=755129;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:243:244:120:122:121:122:73:48:61:59:74:48:63:59 chr4 759872 . T C 134.46 PASS AO=30;DP=61;FAO=30;FDP=61;FR=.;FRO=31;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.0244799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.099;QD=8.81722;RBI=0.0424311;REFB=-0.0309681;REVB=-0.0346574;RO=31;SAF=18;SAR=12;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13599;STB=0.576108;TYPE=snp;VARB=0.0242357;OID=.;OPOS=759872;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:31:31:30:30:12:18:14:17:12:18:14:17 chr4 761661 . C T 406.07 PASS AO=97;DP=199;FAO=97;FDP=198;FR=.;FRO=101;FSAF=37;FSAR=60;FSRF=39;FSRR=62;FWDB=-0.009846;FXX=0.00502487;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4148;QD=8.20346;RBI=0.0102662;REFB=-0.013841;REVB=0.00290721;RO=97;SAF=37;SAR=60;SRF=35;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199862;STB=0.502534;TYPE=snp;VARB=0.012549;OID=.;OPOS=761661;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:199:198:97:101:97:97:60:37:35:62:60:37:39:62 chr4 762285 . A G 438.95 PASS AO=109;DP=248;FAO=116;FDP=256;FR=.;FRO=140;FSAF=60;FSAR=56;FSRF=67;FSRR=73;FWDB=-0.0144078;FXX=0.0038909;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.746;QD=6.85853;RBI=0.0147998;REFB=-0.00362049;REVB=0.00338358;RO=137;SAF=55;SAR=54;SRF=65;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.030231;STB=0.521138;TYPE=snp;VARB=0.00373578;OID=.;OPOS=762285;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:248:256:137:140:109:116:54:55:65:72:56:60:67:73 chr4 780286 . C G 11.18 PASS AO=4;DP=21;FAO=4;FDP=20;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.0151486;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.134;QD=2.23576;RBI=0.0178843;REFB=-0.0116617;REVB=-0.00950626;RO=17;SAF=3;SAR=1;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203746;STB=0.617018;TYPE=snp;VARB=0.0586844;OID=.;OPOS=780286;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:21:20:17:16:4:4:1:3:10:7:1:3:10:6 chr4 858941 . T C 101.96 PASS AO=10;DP=10;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0635515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.239;QD=37.0753;RBI=0.105222;REFB=0;REVB=0.083862;RO=0;SAF=7;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00403318;OID=.;OPOS=858941;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:10:11:0:0:10:11:3:7:0:0:3:8:0:0 chr4 860192 . A G 105.57 PASS AO=18;DP=29;FAO=18;FDP=29;FR=.;FRO=11;FSAF=17;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.00454619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.462;QD=14.561;RBI=0.0344166;REFB=-0.0194712;REVB=-0.0341151;RO=10;SAF=17;SAR=1;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.496675;STB=0.77939;TYPE=snp;VARB=0.0125805;OID=.;OPOS=860192;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:29:29:10:11:18:18:1:17:6:4:1:17:7:4 chr4 946226 . T C 65.47 PASS AO=9;DP=14;FAO=10;FDP=14;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0916509;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.2603;QD=18.705;RBI=0.113206;REFB=-0.0655549;REVB=0.0664508;RO=4;SAF=4;SAR=5;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107529;STB=0.545366;TYPE=snp;VARB=0.0292311;OID=.;OPOS=946226;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:14:14:4:4:9:10:5:4:1:3:6:4:1:3 chr4 956364 . G C 42.63 PASS AO=10;DP=30;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=-0.0317946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.679;QD=5.50057;RBI=0.0383911;REFB=-0.0283064;REVB=0.021517;RO=19;SAF=0;SAR=10;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.742435;STB=0.593049;TYPE=snp;VARB=0.0403345;OID=.;OPOS=956364;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:30:31:19:19:10:12:10:0:5:14:10:2:5:14 chr4 960930 . G A 33.21 PASS AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=165.776;QD=8.3028;RBI=0.0305882;REFB=-0.0634375;REVB=0.0305882;RO=9;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.040575;OID=.;OPOS=960930;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:16:16:9:9:7:7:7:0:0:9:7:0:0:9 chr4 961373 . G A 1262.25 PASS AO=134;DP=134;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=115;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196961;FXX=0.00746213;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.172;QD=37.9625;RBI=0.0284174;REFB=0;REVB=0.0204845;RO=0;SAF=116;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.04019e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.14316e-05;OID=.;OPOS=961373;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:134:133:0:0:134:133:18:116:0:0:18:115:0:0 chr4 962669 . CCG C 90.94 PASS AO=7;DP=26;FAO=19;FDP=23;FR=.;FRO=4;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.338101;FXX=0;HRUN=5;LEN=2;MLLD=16.5546;QD=15.8161;RBI=0.347724;REFB=-0.0289462;REVB=-0.0812367;RO=10;SAF=5;SAR=2;SRF=10;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.440886;STB=0.571357;TYPE=del;VARB=0.0570614;OID=.;OPOS=962670;OREF=CG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:7:23:19:23:4:12:7:4:0:3:10:5:2:10:0 chr4 982852 . G A 853.56 PASS AO=78;DP=80;FAO=93;FDP=95;FR=.;FRO=2;FSAF=19;FSAR=74;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0514028;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.19;QD=35.9392;RBI=0.0676054;REFB=-0.0272031;REVB=0.0439117;RO=2;SAF=17;SAR=61;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0193321;STB=0.509464;TYPE=snp;VARB=0.000833864;OID=.;OPOS=982852;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:80:95:2:2:78:93:61:17:1:1:74:19:1:1 chr4 983060 . T C 362.63 PASS AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000701154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.997;QD=38.172;RBI=0.10952;REFB=0;REVB=0.109518;RO=0;SAF=14;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.91909e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00085235;OID=.;OPOS=983060;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:37:38:0:0:37:38:23:14:0:0:24:14:0:0 chr4 983809 . C T 199.11 PASS AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0735603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.8825;QD=33.1849;RBI=0.0736922;REFB=-0.197263;REVB=-0.0044078;RO=1;SAF=12;SAR=11;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0402265;STB=0.52172;TYPE=snp;VARB=0.00708913;OID=.;OPOS=983809;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:24:24:1:1:23:23:11:12:0:1:11:12:0:1 chr4 985727 . A G 339.21 PASS AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0278382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.469;QD=37.69;RBI=0.0431744;REFB=0;REVB=0.033001;RO=0;SAF=17;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00014396;OID=.;OPOS=985727;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:36:36:0:0:36:36:19:17:0:0:19:17:0:0 chr4 994452 . C T 186.03 PASS AO=46;DP=100;FAO=46;FDP=100;FR=.;FRO=54;FSAF=3;FSAR=43;FSRF=17;FSRR=37;FWDB=0.0351903;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.9179;QD=7.4411;RBI=0.0608602;REFB=0.00661254;REVB=0.0496549;RO=54;SAF=3;SAR=43;SRF=17;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.48764;STB=0.781654;TYPE=snp;VARB=-0.00622952;OID=.;OPOS=994452;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:54:54:46:46:43:3:17:37:43:3:17:37 chr4 1050636 . C T 57.31 PASS AO=10;DP=17;FAO=10;FDP=17;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.000589708;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.8504;QD=13.4858;RBI=0.00536345;REFB=-0.0431521;REVB=0.00533094;RO=7;SAF=7;SAR=3;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122361;STB=0.507028;TYPE=snp;VARB=0.0117852;OID=.;OPOS=1050636;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:17:17:7:7:10:10:3:7:5:2:3:7:5:2 chr4 1050653 . G A 149.76 PASS AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0106396;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=205.948;QD=33.2795;RBI=0.0290505;REFB=-0.116064;REVB=0.027032;RO=0;SAF=12;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.519977;TYPE=snp;VARB=0.00210355;OID=.;OPOS=1050653;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:18:18:0:1:17:17:5:12:0:0:5:12:1:0 chr4 1052125 . T C 195.71 PASS AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0684764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.0166;QD=39.1417;RBI=0.115755;REFB=0;REVB=0.093329;RO=0;SAF=14;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5931e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000961011;OID=.;OPOS=1052125;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:20:20:0:0:20:20:6:14:0:0:6:14:0:0 chr4 1052164 . CCA C,CCC 170.8 PASS AO=7,10;DP=19;FAO=18,0;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=8,0;FSAR=10,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0178623,0.0242107;FXX=0.0526039;HRUN=3,1;LEN=2,1;MLLD=139.59,117.64;QD=37.955;RBI=0.106014,0.193075;REFB=0,0;REVB=-0.104498,-0.191551;RO=0;SAF=7,0;SAR=0,10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0.314879,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.000460661,0.127111;OID=.,.;OPOS=1052165,1052166;OREF=CA,A;OALT=-,C;OMAPALT=C,CCC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:7,10:18:18,0:18:0:8,0:10,0:0:0:8:0:7,0:0,10:0:0 chr4 1066916 . C T 251.96 PASS AO=102;DP=309;FAO=102;FDP=310;FR=.;FRO=208;FSAF=51;FSAR=51;FSRF=95;FSRR=113;FWDB=0.0144383;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.666;QD=3.25104;RBI=0.0149895;REFB=-0.00427961;REVB=-0.00402761;RO=188;SAF=51;SAR=51;SRF=92;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0121284;STB=0.529027;TYPE=snp;VARB=0.00743448;OID=.;OPOS=1066916;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:309:310:188:208:102:102:51:51:92:96:51:51:95:113 chr4 1087265 . T C 86.75 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.3291;QD=38.5554;RBI=0.0432277;REFB=0;REVB=-0.040005;RO=0;SAF=6;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00155786;OID=.;OPOS=1087265;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:3:6:0:0:3:6:0:0 chr4 1087327 . G GCTGCCCAGGCTGGAGCCAGCC 239.72 PASS AO=24;DP=34;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137525;FXX=0.107105;HRUN=0;LEN=21;MLLD=697.171;QD=38.3549;RBI=0.0371063;REFB=0;REVB=0.0344637;RO=6;SAF=21;SAR=3;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115702;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=7.25938e-05;OID=.;OPOS=1087328;OREF=-;OALT=CTGCCCAGGCTGGAGCCAGCC;OMAPALT=GCTGCCCAGGCTGGAGCCAGCC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:24:34:25:25:0:22:3:0:0:11:6:21:3:6:0 chr4 1087329 . C T 267.06 PASS AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243711;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.165;QD=38.152;RBI=0.0257913;REFB=0;REVB=0.00844055;RO=0;SAF=25;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.13441e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000178269;OID=.;OPOS=1087329;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:28:28:0:0:28:28:3:25:0:0:3:25:0:0 chr4 1087338 . C T 412.47 PASS AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108464;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=178.057;QD=37.4968;RBI=0.0946009;REFB=0;REVB=0.093977;RO=0;SAF=33;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000314332;OID=.;OPOS=1087338;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:44:44:0:0:44:44:11:33:0:0:11:33:0:0 chr4 1087362 . C T 201 PASS AO=32;DP=50;FAO=34;FDP=51;FR=.;FRO=17;FSAF=28;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.00143455;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.865;QD=15.7643;RBI=0.00292073;REFB=-0.0242956;REVB=-0.00254416;RO=17;SAF=28;SAR=4;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.304928;STB=0.61479;TYPE=snp;VARB=0.0310717;OID=.;OPOS=1087362;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:50:51:17:17:32:34:4:28:10:7:6:28:10:7 chr4 1087393 . G T 227.12 PASS AO=40;DP=61;FAO=40;FDP=62;FR=.;FRO=22;FSAF=32;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.00323562;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=126.672;QD=14.6526;RBI=0.0120861;REFB=-0.012717;REVB=0.011645;RO=20;SAF=32;SAR=8;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.272467;STB=0.671904;TYPE=snp;VARB=0.0145006;OID=.;OPOS=1087393;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:61:62:20:22:40:40:8:32:9:11:8:32:9:13 chr4 1087531 . T C 103.85 PASS AO=28;DP=67;FAO=28;FDP=67;FR=.;FRO=39;FSAF=23;FSAR=5;FSRF=31;FSRR=8;FWDB=-0.0019016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.368;QD=6.19976;RBI=0.0223542;REFB=0.00389328;REVB=-0.0222732;RO=38;SAF=23;SAR=5;SRF=30;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0528418;STB=0.525465;TYPE=snp;VARB=-0.00680873;OID=.;OPOS=1087531;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:38:39:28:28:5:23:30:8:5:23:31:8 chr4 1087617 . C A 167.06 PASS AO=38;DP=78;FAO=38;FDP=77;FR=.;FRO=39;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=31;FSRR=8;FWDB=0.031197;FXX=0.0128189;HRUN=3;LEN=1;MLLD=115.528;QD=8.67822;RBI=0.0311977;REFB=-0.00775711;REVB=-0.000220237;RO=38;SAF=23;SAR=15;SRF=30;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182103;STB=0.604878;TYPE=snp;VARB=0.00580622;OID=.;OPOS=1087617;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:77:38:39:38:38:15:23:30:8:15:23:31:8 chr4 1090625 . G A 188.1 PASS AO=48;DP=110;FAO=50;FDP=114;FR=.;FRO=64;FSAF=14;FSAR=36;FSRF=20;FSRR=44;FWDB=0.00286897;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.773;QD=6.59999;RBI=0.0292582;REFB=-0.0128394;REVB=-0.0291172;RO=62;SAF=14;SAR=34;SRF=19;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0178241;STB=0.522175;TYPE=snp;VARB=0.0159532;OID=.;OPOS=1090625;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:114:62:64:48:50:34:14:19:43:36:14:20:44 chr4 1164277 . C G 48.24 PASS AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=-0.0219109;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.957;QD=7.71909;RBI=0.0240213;REFB=-0.0419236;REVB=-0.00984574;RO=14;SAF=10;SAR=1;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.257402;STB=0.655393;TYPE=snp;VARB=0.0254717;OID=.;OPOS=1164277;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:25:25:14:14:11:11:1:10:11:3:1:10:11:3 chr4 1164378 . AGAG A 33.61 PASS AO=12;DP=55;FAO=13;FDP=47;FR=.;FRO=34;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=23;FSRR=11;FWDB=0.00808912;FXX=0.078416;HRUN=1;LEN=3;MLLD=192.404;QD=2.86067;RBI=0.0166533;REFB=0.000752194;REVB=0.0145567;RO=30;SAF=8;SAR=4;SRF=22;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0914955;STB=0.547632;TYPE=del;VARB=-0.00274014;OID=.;OPOS=1164379;OREF=GAG;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:12:48:13:47:34:8:5:23:11:33:30:8:4:22:8 chr4 1164461 . G A 33.75 PASS AO=13;DP=51;FAO=13;FDP=48;FR=.,HEALED;FRO=35;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.0180179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.285;QD=2.81244;RBI=0.0239371;REFB=-0.0141641;REVB=0.0157589;RO=14;SAF=6;SAR=7;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.288924;STB=0.517658;TYPE=snp;VARB=0.0407182;OID=.;OPOS=1164461;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:48:48:14:35:13:13:7:6:11:3:7:6:17:18 chr4 1164552 . A G 447.19 PASS AO=33;DP=57;FAO=47;FDP=47;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.107051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.241;QD=38.0583;RBI=0.107662;REFB=0;REVB=0.0114559;RO=0;SAF=13;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.82173e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000982776;OID=.;OPOS=1164552;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:46:47:0:0:33:47:20:13:0:0:21:26:0:0 chr4 1165130 . G T 33.98 PASS AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=-0.00548813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.134;QD=5.43616;RBI=0.00548947;REFB=-0.0120504;REVB=-0.00012129;RO=15;SAF=7;SAR=2;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0633357;STB=0.524943;TYPE=snp;VARB=0.0217399;OID=.;OPOS=1165130;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:25:25:15:16:9:9:2:7:11:4:2:7:12:4 chr4 1165741 . A G 273.33 PASS AO=27;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145082;FXX=0.0644953;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.7666;QD=37.7;RBI=0.0716873;REFB=0;REVB=0.0702038;RO=0;SAF=21;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00213882;OID=.;OPOS=1165741;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:28:29:0:0:27:29:6:21:0:0:8:21:0:0 chr4 1165748 . T C 53.99 PASS AO=12;DP=30;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.0171313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.71;QD=6.96651;RBI=0.0362829;REFB=-0.018819;REVB=0.0319839;RO=15;SAF=9;SAR=3;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16979;STB=0.613308;TYPE=snp;VARB=0.0119915;OID=.;OPOS=1165748;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:30:31:15:18:12:13:3:9:9:6:3:10:11:7 chr4 1194586 . T A 84 PASS AO=19;DP=43;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=2;FSAR=18;FSRF=4;FSRR=20;FWDB=-0.00959687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.4449;QD=7.63598;RBI=0.0302463;REFB=-0.0397714;REVB=-0.0286834;RO=24;SAF=1;SAR=18;SRF=4;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.341474;STB=0.586858;TYPE=snp;VARB=0.0348396;OID=.;OPOS=1194586;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:43:44:24:24:19:20:18:1:4:20:18:2:4:20 chr4 1194594 . A T 112.48 PASS AO=22;DP=43;FAO=23;FDP=43;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=19;FSRF=2;FSRR=18;FWDB=0.0164566;FXX=0.0227221;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.286;QD=10.4628;RBI=0.0186185;REFB=-0.0136197;REVB=-0.00870802;RO=19;SAF=3;SAR=19;SRF=1;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169764;STB=0.564834;TYPE=snp;VARB=0.0146677;OID=.;OPOS=1194594;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:43:43:19:20:22:23:19:3:1:18:19:4:2:18 chr4 1194630 . T C 151.82 PASS AO=22;DP=33;FAO=25;FDP=37;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=21;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=-0.0749335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.711;QD=16.4127;RBI=0.0763561;REFB=-0.0311512;REVB=0.0146707;RO=11;SAF=4;SAR=18;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0993793;STB=0.503997;TYPE=snp;VARB=0.0149368;OID=.;OPOS=1194630;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:33:37:11:12:22:25:18:4:1:10:21:4:2:10 chr4 1244416 . A G 760.76 PASS AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00295387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.736;QD=38.5196;RBI=0.0141861;REFB=0;REVB=-0.0138752;RO=0;SAF=48;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.95433e-05;OID=.;OPOS=1244416;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:79:79:0:0:79:79:31:48:0:0:31:48:0:0 chr4 1244879 . A G 165.26 PASS AO=40;DP=84;FAO=40;FDP=85;FR=.;FRO=45;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=30;FWDB=0.0236284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.762;QD=7.77699;RBI=0.0351672;REFB=-0.0229694;REVB=-0.0260466;RO=43;SAF=19;SAR=21;SRF=15;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118649;STB=0.575721;TYPE=snp;VARB=0.033512;OID=.;OPOS=1244879;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:85:43:45:40:40:21:19:15:28:21:19:15:30 chr4 1369885 . GC G,AC 391.33 PASS AO=27,27;DP=74;FAO=28,40;FDP=82;FR=.;FRO=14;FSAF=28,26;FSAR=0,14;FSRF=1;FSRR=13;FWDB=-0.211892,0.0203427;FXX=0.0238067;HRUN=2,1;LEN=1,1;MLLD=17.28,101.292;QD=19.0891;RBI=0.212795,0.0507678;REFB=-0.0781461,-0.0644546;REVB=-0.0195885,0.0465139;RO=11;SAF=27,14;SAR=0,13;SRF=1;SRR=10;SSEN=0.324786,0;SSEP=0.269231,0;SSSB=0.879254,0.225703;STB=0.999506,0.649925;TYPE=del,snp;VARB=0.0697908,0.0523921;OID=.,.;OPOS=1369886,1369885;OREF=C,G;OALT=-,A;OMAPALT=G,AC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:86:71:82:11:14:27,27:28,40:0,13:27,14:1:10:0,14:28,26:1:13 chr4 1374695 . C A 330.47 PASS AO=34;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0343601;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.863;QD=37.768;RBI=0.0365309;REFB=0;REVB=0.0124052;RO=0;SAF=6;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.73777e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000324124;OID=.;OPOS=1374695;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:35:35:0:0:34:35:28:6:0:0:29:6:0:0 chr4 1374774 . C T 65.87 PASS AO=5;DP=16;FAO=10;FDP=14;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0218874;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=87.3605;QD=18.8195;RBI=0.0357915;REFB=0.0241632;REVB=0.0283191;RO=0;SAF=3;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.610916;TYPE=snp;VARB=-0.0217723;OID=.;OPOS=1374774;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:5:14:0:4:5:10:2:3:0:0:7:3:0:4 chr4 1377615 . A G 407.71 PASS AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0311068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.336;QD=37.0641;RBI=0.0348716;REFB=0;REVB=-0.0157604;RO=0;SAF=22;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00245621;OID=.;OPOS=1377615;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:43:44:0:0:43:44:21:22:0:0:21:23:0:0 chr4 1619865 . T C 869.66 PASS AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0186112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.385;QD=38.6515;RBI=0.029261;REFB=0;REVB=0.0225794;RO=0;SAF=38;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.28321e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.21208e-05;OID=.;OPOS=1619865;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:90:90:0:0:90:90:52:38:0:0:52:38:0:0 chr4 1646017 . C G 159.72 PASS AO=37;DP=77;FAO=37;FDP=76;FR=.;FRO=39;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=-0.00218706;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.5906;QD=8.4063;RBI=0.039449;REFB=-0.0218819;REVB=-0.0393883;RO=40;SAF=19;SAR=18;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0340235;STB=0.512814;TYPE=snp;VARB=0.0275844;OID=.;OPOS=1646017;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:76:40:39:37:37:18:19:22:18:18:19:21:18 chr4 1656801 . A C 30.62 PASS AO=8;DP=24;FAO=8;FDP=23;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=-0.0433225;FXX=0.0416493;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.013;QD=5.32584;RBI=0.0731466;REFB=-0.0464195;REVB=-0.0589372;RO=14;SAF=6;SAR=2;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.522846;STB=0.822834;TYPE=snp;VARB=0.0863852;OID=.;OPOS=1656801;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:24:23:14:15:8:8:2:6:3:11:2:6:3:12 chr4 1657281 . G A 39.77 PASS AO=11;DP=31;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=16;FSRR=4;FWDB=-0.000331022;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.673;QD=5.13109;RBI=0.00433821;REFB=-0.0243278;REVB=-0.00432556;RO=20;SAF=8;SAR=3;SRF=16;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105447;STB=0.562394;TYPE=snp;VARB=0.0336198;OID=.;OPOS=1657281;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:31:31:20:20:11:11:3:8:16:4:3:8:16:4 chr4 1670472 . CGG CG,C 164.28 PASS AO=9,7;DP=35;FAO=20,8;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=9,0;FSAR=11,8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0493424,-0.0289218;FXX=0.0344709;HRUN=4,4;LEN=1,2;MLLD=11.6725,16.5578;QD=23.4683;RBI=0.108772,0.0603355;REFB=0,0;REVB=-0.096936,-0.0529519;RO=0;SAF=0,0;SAR=9,7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.445946,0.445946;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=-0.0230752,0.0197214;OID=.,.;OPOS=1670473,1670473;OREF=G,GG;OALT=-,-;OMAPALT=CG,C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:9,7:27:20,8:28:0:9,0:11,8:0:0:15:0:0,0:9,7:0:0 chr4 1685211 . T C 1184.68 PASS AO=124;DP=125;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0144214;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.697;QD=38.2156;RBI=0.0356448;REFB=0;REVB=0.0325972;RO=0;SAF=47;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.05768e-05;OID=.;OPOS=1685211;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:125:124:0:0:124:124:77:47:0:0:77:47:0:0 chr4 1701317 . G A 451.74 PASS AO=106;DP=211;FAO=107;FDP=215;FR=.;FRO=108;FSAF=44;FSAR=63;FSRF=61;FSRR=47;FWDB=-0.0215342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.372;QD=8.40445;RBI=0.0337998;REFB=-0.030249;REVB=-0.026052;RO=103;SAF=43;SAR=63;SRF=59;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150767;STB=0.577463;TYPE=snp;VARB=0.0321512;OID=.;OPOS=1701317;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:215:103:108:106:107:63:43:59:44:63:44:61:47 chr4 1729556 . G A 325.45 PASS AO=55;DP=88;FAO=58;FDP=91;FR=.;FRO=33;FSAF=34;FSAR=24;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=0.00572524;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.437;QD=14.3054;RBI=0.00825079;REFB=-0.0358966;REVB=0.00594114;RO=33;SAF=31;SAR=24;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0298765;STB=0.507437;TYPE=snp;VARB=0.0297593;OID=.;OPOS=1729556;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:91:33:33:55:58:24:31:20:13:24:34:20:13 chr4 1730299 . A G 151.63 PASS AO=46;DP=114;FAO=45;FDP=113;FR=.;FRO=68;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=27;FSRR=41;FWDB=0.00430033;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.349;QD=5.36729;RBI=0.0187795;REFB=-0.0220986;REVB=-0.0182805;RO=67;SAF=23;SAR=23;SRF=27;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102023;STB=0.5554;TYPE=snp;VARB=0.0316829;OID=.;OPOS=1730299;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:113:67:68:46:45:23:23:27:40:23:22:27:41 chr4 1732695 . G C 69.5 PASS AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=-0.00474753;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=237.967;QD=10.297;RBI=0.0208083;REFB=-0.0143695;REVB=-0.0202595;RO=13;SAF=4;SAR=10;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0585624;STB=0.533287;TYPE=snp;VARB=0.0135814;OID=.;OPOS=1732695;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:27:27:13:13:14:14:10:4:3:10:10:4:3:10 chr4 1737071 . C A 221.85 PASS AO=34;DP=47;FAO=34;FDP=47;FR=.;FRO=13;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0497294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.432;QD=18.881;RBI=0.0581145;REFB=-0.0588057;REVB=0.0300714;RO=13;SAF=13;SAR=21;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0422003;STB=0.522922;TYPE=snp;VARB=0.00684963;OID=.;OPOS=1737071;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:47:47:13:13:34:34:21:13:6:7:21:13:6:7 chr4 1737502 . C T 111.31 PASS AO=33;DP=86;FAO=34;FDP=87;FR=.;FRO=53;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=28;FWDB=-0.0148717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.48;QD=5.11761;RBI=0.0246415;REFB=-0.00589761;REVB=-0.0196478;RO=53;SAF=18;SAR=15;SRF=25;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0795367;STB=0.535114;TYPE=snp;VARB=0.00622728;OID=.;OPOS=1737502;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:87:53:53:33:34:15:18:25:28:16:18:25:28 chr4 1739518 . CGCCATCCCTGCCATC CGCCATC,CGCCAT 35.58 PASS AO=8,4;DP=45;FAO=12,0;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=4,0;FSAR=8,0;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.122153,-0.140009;FXX=0.096743;HRUN=3,3;LEN=9,10;MLLD=265.088,267.53;QD=5.08343;RBI=0.122241,0.140018;REFB=-0.0543874,-0.0535349;REVB=-0.00464577,-0.00157854;RO=7;SAF=0,4;SAR=8,0;SRF=0;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0.446729,0.446729;SSSB=0,0.819748;STB=0.633918,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.0583377,0;OID=.,.;OPOS=1739519,1739524;OREF=GCCATCCCT,CCCTGCCATC;OALT=-,-;OMAPALT=CGCCATC,CGCCAT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:8,4:25:12,0:28:16:4,0:8,0:9:7:34:7:0,4:8,0:0:7 chr4 1739592 . A G 243.17 PASS AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.614;QD=37.4113;RBI=0.0695329;REFB=0;REVB=-0.0680205;RO=0;SAF=18;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.28381e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00056585;OID=.;OPOS=1739592;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:26:26:0:0:26:26:8:18:0:0:8:18:0:0 chr4 1741663 . G A 68.22 PASS AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0256451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.345;QD=30.3218;RBI=0.0307663;REFB=-0.0938774;REVB=0.0169969;RO=1;SAF=7;SAR=1;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.286738;STB=0.666169;TYPE=snp;VARB=0.00991882;OID=.;OPOS=1741663;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:9:9:1:1:8:8:1:7:0:1:1:7:0:1 chr4 1741740 . G A 80.82 PASS AO=7;DP=12;FAO=9;FDP=10;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.111911;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=92.2812;QD=32.3278;RBI=0.112456;REFB=-0.0400225;REVB=0.0110592;RO=1;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.533262;TYPE=snp;VARB=0.0203935;OID=.;OPOS=1741740;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:10:10:1:1:7:9:7:0:0:1:7:2:0:1 chr4 1806131 . T C 110.93 PASS AO=18;DP=26;FAO=18;FDP=26;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.0608781;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5414;QD=17.0654;RBI=0.0609296;REFB=0.0202761;REVB=0.00250491;RO=8;SAF=6;SAR=12;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0531802;STB=0.52938;TYPE=snp;VARB=-0.0119182;OID=.;OPOS=1806131;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:26:26:8:8:18:18:12:6:2:6:12:6:2:6 chr4 1806690 . G A 14.97 PASS AO=4;DP=14;FAO=4;FDP=15;FR=.;FRO=11;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=-0.0291057;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=80.2308;QD=3.99206;RBI=0.168258;REFB=-0.0211041;REVB=0.165721;RO=10;SAF=1;SAR=3;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.457083;STB=0.816794;TYPE=snp;VARB=0.113272;OID=.;OPOS=1806690;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:14:15:10:11:4:4:3:1:7:3:3:1:8:3 chr4 1807894 . G A 253.71 PASS AO=24;DP=25;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.179379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.4579;QD=37.587;RBI=0.184872;REFB=0;REVB=-0.0447308;RO=0;SAF=6;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00366937;OID=.;OPOS=1807894;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:25:27:0:0:24:27:18:6:0:0:19:8:0:0 chr4 1809127 . CGT C 937.3 PASS AO=68;DP=164;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0334156;FXX=0.174589;HRUN=1;LEN=2;MLLD=66.242;QD=36.05;RBI=0.0365692;REFB=-0.0645563;REVB=-0.0148562;RO=1;SAF=9;SAR=59;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0496463;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.000830283;OID=.;OPOS=1809128;OREF=GT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:68:87:104:104:0:18:86:0:0:37:1:9:59:1:0 chr4 1815990 . G A 306.1 PASS AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.031752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.985;QD=37.1035;RBI=0.0402684;REFB=0;REVB=0.0247661;RO=0;SAF=29;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000142358;OID=.;OPOS=1815990;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:33:33:0:0:33:33:4:29:0:0:4:29:0:0 chr4 1818594 . C T 1662.98 PASS AO=160;DP=161;FAO=181;FDP=181;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0636767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.0428;QD=36.751;RBI=0.0637464;REFB=0;REVB=-0.00297885;RO=0;SAF=76;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3059e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00353544;OID=.;OPOS=1818594;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:161:181:0:0:160:181:84:76:0:0:86:95:0:0 chr4 1902762 . A G 250.03 PASS AO=69;DP=161;FAO=69;FDP=161;FR=.;FRO=92;FSAF=19;FSAR=50;FSRF=33;FSRR=59;FWDB=-0.01632;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=260.059;QD=6.21185;RBI=0.0208679;REFB=-0.00685671;REVB=-0.0130049;RO=92;SAF=19;SAR=50;SRF=33;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100881;STB=0.556609;TYPE=snp;VARB=0.010283;OID=.;OPOS=1902762;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:161:92:92:69:69:50:19:33:59:50:19:33:59 chr4 1954945 . A G 2263.77 PASS AO=236;DP=236;FAO=236;FDP=236;FR=.;FRO=0;FSAF=133;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0377361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.882;QD=38.369;RBI=0.0383397;REFB=0;REVB=-0.00677602;RO=0;SAF=133;SAR=103;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0952e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.8917e-05;OID=.;OPOS=1954945;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:236:236:0:0:236:236:103:133:0:0:103:133:0:0 chr4 1977088 . A G 550.24 PASS AO=173;DP=429;FAO=165;FDP=400;FR=.;FRO=235;FSAF=76;FSAR=89;FSRF=105;FSRR=130;FWDB=-0.0522909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.256;QD=5.50235;RBI=0.0528388;REFB=-0.00725733;REVB=0.00758928;RO=256;SAF=85;SAR=88;SRF=116;SRR=140;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0408597;STB=0.508166;TYPE=snp;VARB=0.0105563;OID=.;OPOS=1977088;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:429:400:256:235:173:165:88:85:116:140:89:76:105:130 chr4 2275835 . G A 658.42 PASS AO=84;DP=92;FAO=82;FDP=92;FR=.;FRO=10;FSAF=40;FSAR=42;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.115519;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.3216;QD=28.6268;RBI=0.123453;REFB=-0.126374;REVB=0.0435438;RO=7;SAF=41;SAR=43;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0294453;STB=0.509552;TYPE=snp;VARB=0.0293623;OID=.;OPOS=2275835;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:92:92:7:10:84:82:43:41:2:5:42:40:4:6 chr4 2306053 . A G 47.24 PASS AO=9;DP=27;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=0.000229377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.045;QD=6.29903;RBI=0.0701807;REFB=-0.00985709;REVB=0.0701803;RO=17;SAF=7;SAR=2;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.019992;STB=0.538399;TYPE=snp;VARB=0.0132819;OID=.;OPOS=2306053;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:27:30:17:18:9:12:2:7:13:4:4:8:13:5 chr4 2306259 . C T 28.97 PASS AO=8;DP=24;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.0223833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2874;QD=4.82842;RBI=0.0673404;REFB=-0.0122475;REVB=-0.0635115;RO=16;SAF=1;SAR=7;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.485258;STB=0.806805;TYPE=snp;VARB=0.0750416;OID=.;OPOS=2306259;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:24:24:16:16:8:8:7:1:8:8:7:1:8:8 chr4 2341194 . T C 1119.96 PASS AO=115;DP=115;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0064976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.3497;QD=38.2891;RBI=0.0182962;REFB=0;REVB=0.0171035;RO=0;SAF=62;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19391e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.91733e-05;OID=.;OPOS=2341194;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:115:117:0:0:115:117:53:62:0:0:55:62:0:0 chr4 2444931 . A G 1742.81 PASS AO=177;DP=177;FAO=183;FDP=183;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0067565;FXX=0.00543449;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.082;QD=38.0942;RBI=0.0239932;REFB=0;REVB=-0.0230222;RO=0;SAF=87;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000517835;OID=.;OPOS=2444931;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:177:183:0:0:177:183:90:87:0:0:97:86:0:0 chr4 2446973 . GC G,CG 29.77 PASS AO=4,4;DP=27;FAO=11,0;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=2,0;FSAR=9,0;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=-0.116017,-0.0365113;FXX=0.0416493;HRUN=5,1;LEN=1,2;MLLD=12.3046,34.9717;QD=5.17674;RBI=0.135015,0.189354;REFB=-0.119548,-0.00582091;REVB=-0.0690583,-0.1858;RO=11;SAF=0,0;SAR=4,4;SRF=4;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.657755,-0.657755;STB=0.613407,0.5;TYPE=del,mnp;VARB=0.121795,0;OID=.,.;OPOS=2446974,2446973;OREF=C,GC;OALT=-,CG;OMAPALT=G,CG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:22:23:11:12:4,4:11,0:4,4:0,0:4:7:9,0:2,0:4:8 chr4 2451694 . T C 254.96 PASS AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0373096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.469;QD=37.7721;RBI=0.0444643;REFB=0;REVB=0.0241883;RO=0;SAF=14;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39874e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000118454;OID=.;OPOS=2451694;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:27:27:0:0:27:27:13:14:0:0:13:14:0:0 chr4 2461888 . A G 377.42 PASS AO=40;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00720621;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.528;QD=36.8212;RBI=0.0351261;REFB=0;REVB=0.034379;RO=1;SAF=24;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0284076;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00031984;OID=.;OPOS=2461888;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:42:41:1:0:40:41:16:24:0:1:17:24:0:0 chr4 2664913 . GC G 115.02 PASS AO=11;DP=48;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0471242;FXX=0.103413;HRUN=5;LEN=1;MLLD=9.10081;QD=17.6952;RBI=0.0740048;REFB=-0.0364777;REVB=-0.0570615;RO=2;SAF=10;SAR=1;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253844;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00467818;OID=.;OPOS=2664914;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:11:28:26:26:0:14:12:0:0:8:2:10:1:1:1 chr4 2664921 . GGGCC GC,G,AGGCC 251.73 PASS AO=8,4,6;DP=26;FAO=27,0,0;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=16,0,0;FSAR=11,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.074122,0.0142703,-0.0221961;FXX=0;HRUN=4,4,4;LEN=3,4,1;MLLD=43.723,32.9931,126.112;QD=37.2939;RBI=0.245421,0.245396,0.0222064;REFB=0,0,0;REVB=0.23396,0.244981,-0.000678114;RO=1;SAF=6,4,0;SAR=2,0,6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0.534653,0.534653,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.174483,0.749895,0;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=del,del,snp;VARB=0.00400402,-0.00310648,0;OID=.,.,.;OPOS=2664922,2664922,2664921;OREF=GGC,GGCC,G;OALT=-,-,A;OMAPALT=GC,G,AGGCC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:25:27:1:0:8,4,6:27,0,0:2,0,6:6,4,0:0:1:11,0,0:16,0,0:0:0 chr4 2698230 . G A 112.94 PASS AO=45;DP=141;FAO=45;FDP=141;FR=.;FRO=96;FSAF=7;FSAR=38;FSRF=14;FSRR=82;FWDB=-0.0201325;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.728;QD=3.20386;RBI=0.021125;REFB=-0.00918973;REVB=-0.00639902;RO=96;SAF=7;SAR=38;SRF=14;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0221489;STB=0.512815;TYPE=snp;VARB=0.0219563;OID=.;OPOS=2698230;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:96:96:45:45:38:7:14:82:38:7:14:82 chr4 2717840 . G A 283.9 PASS AO=68;DP=140;FAO=68;FDP=141;FR=.;FRO=73;FSAF=17;FSAR=51;FSRF=20;FSRR=53;FWDB=-0.00818087;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.5639;QD=8.05379;RBI=0.00820773;REFB=-0.00879023;REVB=0.000663386;RO=72;SAF=17;SAR=51;SRF=20;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0337563;STB=0.516274;TYPE=snp;VARB=0.0136708;OID=.;OPOS=2717840;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:141:72:73:68:68:51:17:20:52:51:17:20:53 chr4 2734175 . G A 388.26 PASS AO=64;DP=119;FAO=81;FDP=135;FR=.;FRO=54;FSAF=38;FSAR=43;FSRF=8;FSRR=46;FWDB=0.077081;FXX=0.0145975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.553;QD=11.5039;RBI=0.078911;REFB=-0.0192245;REVB=0.016896;RO=52;SAF=23;SAR=41;SRF=7;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21502;STB=0.630941;TYPE=snp;VARB=0.0223677;OID=.;OPOS=2734175;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:135:52:54:64:81:41:23:7:45:43:38:8:46 chr4 2743983 . G A 187.66 PASS AO=37;DP=65;FAO=37;FDP=65;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=6;FSRR=22;FWDB=0.0196246;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.084;QD=11.5482;RBI=0.0388837;REFB=-0.0337842;REVB=0.033568;RO=28;SAF=15;SAR=22;SRF=6;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161125;STB=0.588191;TYPE=snp;VARB=0.0284834;OID=.;OPOS=2743983;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:28:28:37:37:22:15:6:22:22:15:6:22 chr4 2743999 . A G 652.02 PASS AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0319152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.058;QD=38.3541;RBI=0.051134;REFB=0;REVB=-0.0399513;RO=0;SAF=22;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.88752e-05;OID=.;OPOS=2743999;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:68:68:0:0:68:68:46:22:0:0:46:22:0:0 chr4 2826400 . T C 481.19 PASS AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.047964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.346;QD=37.7401;RBI=0.0766302;REFB=0;REVB=-0.0597632;RO=0;SAF=20;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.13361e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00148847;OID=.;OPOS=2826400;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:51:51:0:0:51:51:31:20:0:0:31:20:0:0 chr4 2828771 . T G 107.75 PASS AO=25;DP=55;FAO=26;FDP=56;FR=.;FRO=30;FSAF=5;FSAR=21;FSRF=9;FSRR=21;FWDB=0.0442208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4699;QD=7.69654;RBI=0.0452058;REFB=-0.0496955;REVB=0.00938549;RO=30;SAF=5;SAR=20;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135408;STB=0.583264;TYPE=snp;VARB=0.0397886;OID=.;OPOS=2828771;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:56:30:30:25:26:20:5:9:21:21:5:9:21 chr4 2831383 . T G 34.05 PASS AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.00623727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.07;QD=11.3501;RBI=0.0149927;REFB=-0.00895727;REVB=-0.0136337;RO=6;SAF=2;SAR=4;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.275357;STB=0.66611;TYPE=snp;VARB=0.0180017;OID=.;OPOS=2831383;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:12:12:6:6:6:6:4:2:4:2:4:2:4:2 chr4 2928413 . T C 776.3 PASS AO=81;DP=81;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00860489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.859;QD=37.8683;RBI=0.037509;REFB=0;REVB=0.0365086;RO=0;SAF=23;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.46245e-05;OID=.;OPOS=2928413;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:81:82:0:0:81:82:58:23:0:0:59:23:0:0 chr4 2941073 . A G 423.23 PASS AO=88;DP=158;FAO=88;FDP=160;FR=.;FRO=72;FSAF=45;FSAR=43;FSRF=38;FSRR=34;FWDB=0.00444276;FXX=0.00621079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.3726;QD=10.5808;RBI=0.0342239;REFB=-0.0345865;REVB=0.0339343;RO=69;SAF=45;SAR=43;SRF=37;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200689;STB=0.507391;TYPE=snp;VARB=0.0405477;OID=.;OPOS=2941073;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:160:69:72:88:88:43:45:37:32:43:45:38:34 chr4 3039150 . T C 1096.91 PASS AO=115;DP=115;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.104094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.178;QD=38.1533;RBI=0.10411;REFB=0;REVB=0.00180687;RO=0;SAF=46;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000146254;OID=.;OPOS=3039150;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:115:115:0:0:115:115:69:46:0:0:69:46:0:0 chr4 3148653 . T G 307.82 PASS AO=90;DP=218;FAO=90;FDP=217;FR=.;FRO=127;FSAF=43;FSAR=47;FSRF=68;FSRR=59;FWDB=-0.00644334;FXX=0.00458695;HRUN=4;LEN=1;MLLD=218.224;QD=5.674;RBI=0.0118104;REFB=-0.0213411;REVB=-0.00989796;RO=127;SAF=43;SAR=47;SRF=68;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0602734;STB=0.533701;TYPE=snp;VARB=0.0261849;OID=.;OPOS=3148653;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:218:217:127:127:90:90:47:43:68:59:47:43:68:59 chr4 3219613 . A C 1608.1 PASS AO=176;DP=182;FAO=177;FDP=182;FR=.;FRO=5;FSAF=50;FSAR=127;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.00133731;FXX=0.00546418;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.399;QD=35.3428;RBI=0.0500063;REFB=-0.152405;REVB=0.0499884;RO=5;SAF=50;SAR=126;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0185121;STB=0.509651;TYPE=snp;VARB=0.00336678;OID=.;OPOS=3219613;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:182:182:5:5:176:177:126:50:0:5:127:50:0:5 chr4 3257593 . C T 94.99 PASS AO=15;DP=22;FAO=15;FDP=22;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0176299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.677;QD=17.2705;RBI=0.0181509;REFB=-0.113859;REVB=0.00431752;RO=7;SAF=4;SAR=11;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110509;STB=0.561957;TYPE=snp;VARB=0.038657;OID=.;OPOS=3257593;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:22:22:7:7:15:15:11:4:3:4:11:4:3:4 chr4 3263138 . G A 215.36 PASS AO=52;DP=109;FAO=52;FDP=110;FR=.;FRO=58;FSAF=5;FSAR=47;FSRF=22;FSRR=36;FWDB=-0.00637649;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=126.779;QD=7.83141;RBI=0.0497515;REFB=-0.0115479;REVB=0.0493412;RO=57;SAF=5;SAR=47;SRF=22;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.448963;STB=0.75344;TYPE=snp;VARB=0.0214002;OID=.;OPOS=3263138;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:110:57:58:52:52:47:5:22:35:47:5:22:36 chr4 3318413 . A G 1237.05 PASS AO=129;DP=129;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0465022;FXX=0.0153834;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.164;QD=38.6577;RBI=0.046656;REFB=0;REVB=0.00378568;RO=0;SAF=41;SAR=88;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000180667;OID=.;OPOS=3318413;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:129:128:0:0:129:128:88:41:0:0:86:42:0:0 chr4 3318726 . A T 163.69 PASS AO=37;DP=79;FAO=38;FDP=79;FR=.;FRO=41;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=-0.00132946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.288;QD=8.28798;RBI=0.00723748;REFB=-0.0140882;REVB=-0.00711433;RO=40;SAF=19;SAR=18;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0107014;STB=0.505345;TYPE=snp;VARB=0.0140659;OID=.;OPOS=3318726;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:40:41:37:38:18:19:21:19:18:20:22:19 chr4 3344680 . G A 667.77 PASS AO=174;DP=378;FAO=175;FDP=380;FR=.;FRO=205;FSAF=102;FSAR=73;FSRF=100;FSRR=105;FWDB=0.00559365;FXX=0.00783269;HRUN=4;LEN=1;MLLD=72.3268;QD=7.0291;RBI=0.00715018;REFB=-0.0291552;REVB=-0.00445379;RO=201;SAF=101;SAR=73;SRF=98;SRR=103;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.09116;STB=0.551815;TYPE=snp;VARB=0.039431;OID=.;OPOS=3344680;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:378:380:201:205:174:175:73:101:98:103:73:102:100:105 chr4 3424231 . C T 52.52 PASS AO=12;DP=27;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.00166022;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.695;QD=7.78033;RBI=0.010136;REFB=-0.00206783;REVB=0.00999907;RO=13;SAF=2;SAR=10;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.40287;STB=0.713877;TYPE=snp;VARB=0.00187778;OID=.;OPOS=3424231;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:27:27:13:15:12:12:10:2:7:6:10:2:7:8 chr4 3444503 . G A 68.53 PASS AO=17;DP=44;FAO=18;FDP=44;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=24;FSRR=2;FWDB=0.00430046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.0856;QD=6.22961;RBI=0.0502176;REFB=-0.0317364;REVB=0.0500332;RO=26;SAF=10;SAR=7;SRF=24;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.403155;STB=0.73099;TYPE=snp;VARB=0.0306895;OID=.;OPOS=3444503;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:44:44:26:26:17:18:7:10:24:2:8:10:24:2 chr4 3446132 . C G 42.34 PASS AO=11;DP=36;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.00238144;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.809;QD=4.5773;RBI=0.0163262;REFB=-0.0109247;REVB=-0.0161516;RO=22;SAF=5;SAR=6;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100164;STB=0.524961;TYPE=snp;VARB=0.0269055;OID=.;OPOS=3446132;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:36:37:22:24:11:13:6:5:12:10:7:6:12:12 chr4 3449886 . G A 656.49 PASS AO=76;DP=80;FAO=75;FDP=80;FR=.;FRO=5;FSAF=30;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.048016;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.9142;QD=32.8246;RBI=0.0536795;REFB=-0.0482606;REVB=0.0239992;RO=1;SAF=29;SAR=47;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0160369;STB=0.526309;TYPE=snp;VARB=0.0315727;OID=.;OPOS=3449886;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:80:80:1:5:76:75:47:29:1:0:45:30:0:5 chr4 3475252 . T C 914.44 PASS AO=111;DP=113;FAO=111;FDP=113;FR=.;FRO=2;FSAF=54;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.242032;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=36.0375;QD=32.3696;RBI=0.244877;REFB=-0.132892;REVB=0.0372179;RO=2;SAF=54;SAR=57;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0163649;STB=0.508619;TYPE=snp;VARB=0.0290726;OID=.;OPOS=3475252;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:113:113:2:2:111:111:57:54:0:2:57:54:0:2 chr4 3491504 . G A 135.01 PASS AO=34;DP=72;FAO=36;FDP=84;FR=.;FRO=48;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=-0.0318286;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=140.282;QD=6.42898;RBI=0.0343208;REFB=-0.0314695;REVB=0.0128398;RO=38;SAF=14;SAR=20;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0166252;STB=0.543742;TYPE=snp;VARB=0.0309323;OID=.;OPOS=3491504;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:84:38:48:34:36:20:14:15:23:20:16:25:23 chr4 3494826 . A C 54.73 PASS AO=8;DP=13;FAO=9;FDP=14;FR=.;FRO=5;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0472155;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.284;QD=15.6363;RBI=0.054193;REFB=-0.0588558;REVB=0.0266004;RO=5;SAF=6;SAR=2;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121731;STB=0.526256;TYPE=snp;VARB=0.032702;OID=.;OPOS=3494826;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:13:14:5:5:8:9:2:6:3:2:3:6:3:2 chr4 3494847 . G A 50.18 PASS AO=7;DP=10;FAO=7;FDP=10;FR=.;FRO=3;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.00336967;FXX=0.0908265;HRUN=5;LEN=1;MLLD=125.034;QD=20.073;RBI=0.0287874;REFB=0.0193595;REVB=0.0285895;RO=3;SAF=5;SAR=2;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21311;STB=0.624624;TYPE=snp;VARB=-0.00804791;OID=.;OPOS=3494847;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:10:10:3:3:7:7:2:5:1:2:2:5:1:2 chr4 3494898 . C T 39.46 PASS AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0513454;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.484;QD=15.7826;RBI=0.0650923;REFB=0.00959896;REVB=0.0400082;RO=4;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.28888;STB=0.666218;TYPE=snp;VARB=-0.00577118;OID=.;OPOS=3494898;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:10:10:4:4:6:6:4:2:0:4:4:2:0:4 chr4 3514689 . T C 65.09 PASS AO=26;DP=84;FAO=26;FDP=85;FR=.;FRO=59;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=34;FSRR=25;FWDB=-0.0155689;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.639;QD=3.06312;RBI=0.0331682;REFB=-0.00197062;REVB=-0.0292872;RO=52;SAF=18;SAR=8;SRF=32;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0980887;STB=0.588048;TYPE=snp;VARB=0.0058544;OID=.;OPOS=3514689;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:84:85:52:59:26:26:8:18:32:20:8:18:34:25 chr4 3514695 . A G 52.79 PASS AO=23;DP=85;FAO=23;FDP=82;FR=.;FRO=59;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=34;FSRR=25;FWDB=-0.0401787;FXX=0.03529;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.2637;QD=2.57521;RBI=0.0415236;REFB=-0.00848529;REVB=0.0104822;RO=59;SAF=14;SAR=9;SRF=34;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0404209;STB=0.524208;TYPE=snp;VARB=0.0251097;OID=.;OPOS=3514695;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:85:82:59:59:23:23:9:14:34:25:9:14:34:25 chr4 3526645 . C T 333.37 PASS AO=110;DP=289;FAO=110;FDP=289;FR=.;FRO=179;FSAF=40;FSAR=70;FSRF=83;FSRR=96;FWDB=0.0898286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.7617;QD=4.61407;RBI=0.107624;REFB=0.0008043;REVB=0.0592778;RO=179;SAF=40;SAR=70;SRF=83;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114387;STB=0.564578;TYPE=snp;VARB=-0.000175141;OID=.;OPOS=3526645;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:289:289:179:179:110:110:70:40:83:96:70:40:83:96 chr4 3526786 . C T 116.61 PASS AO=29;DP=64;FAO=29;FDP=65;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=4;FSRR=32;FWDB=0.0364778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.601;QD=7.17596;RBI=0.0575189;REFB=-0.0390191;REVB=-0.0444723;RO=35;SAF=13;SAR=16;SRF=4;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.347442;STB=0.696318;TYPE=snp;VARB=0.0246575;OID=.;OPOS=3526786;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:65:35:36:29:29:16:13:4:31:16:13:4:32 chr4 3589689 . C A 515.59 PASS AO=74;DP=96;FAO=75;FDP=97;FR=.;FRO=22;FSAF=33;FSAR=42;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=0.0867542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.617;QD=21.2615;RBI=0.0950698;REFB=-0.0462398;REVB=0.0388843;RO=22;SAF=33;SAR=41;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0557717;STB=0.528215;TYPE=snp;VARB=0.0225316;OID=.;OPOS=3589689;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:96:97:22:22:74:75:41:33:7:15:42:33:7:15 chr4 3589719 . CA C 636.39 PASS AO=76;DP=82;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0667137;FXX=0.0121936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=28.0612;QD=31.4264;RBI=0.0900561;REFB=0;REVB=-0.0604928;RO=0;SAF=27;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.00223324;OID=.;OPOS=3589720;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:76:80:81:81:0:29:52:0:0:56:0:27:49:0:0 chr4 3589747 . T C 24.19 PASS AO=14;DP=63;FAO=14;FDP=64;FR=.;FRO=50;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=42;FWDB=-0.0481409;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.276;QD=1.51177;RBI=0.0505743;REFB=-0.00316603;REVB=-0.0154987;RO=49;SAF=7;SAR=7;SRF=8;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.440155;STB=0.765352;TYPE=snp;VARB=0.013206;OID=.;OPOS=3589747;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:63:64:49:50:14:14:7:7:8:41:7:7:8:42 chr4 3590683 . T G 188.48 PASS AO=48;DP=103;FAO=47;FDP=102;FR=.;FRO=55;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=19;FSRR=36;FWDB=0.013245;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.855;QD=7.39149;RBI=0.0149168;REFB=-0.00107629;REVB=-0.00686153;RO=55;SAF=21;SAR=27;SRF=19;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0909489;STB=0.544728;TYPE=snp;VARB=0.0013776;OID=.;OPOS=3590683;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:102:55:55:48:47:27:21:19:36:27:20:19:36 chr4 3590711 . G T 182.14 PASS AO=47;DP=101;FAO=46;FDP=101;FR=.;FRO=55;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=23;FSRR=32;FWDB=0.018757;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.0016;QD=7.21346;RBI=0.0188578;REFB=-0.0147062;REVB=0.00194713;RO=54;SAF=21;SAR=26;SRF=23;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0203118;STB=0.521105;TYPE=snp;VARB=0.0231861;OID=.;OPOS=3590711;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:54:55:47:46:26:21:23:31:25:21:23:32 chr4 3590730 . G A 211.86 PASS AO=50;DP=103;FAO=50;FDP=103;FR=.;FRO=53;FSAF=30;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=31;FWDB=0.0183653;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.698;QD=8.22745;RBI=0.0234383;REFB=-0.0166143;REVB=0.0145626;RO=53;SAF=30;SAR=20;SRF=22;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171754;STB=0.595293;TYPE=snp;VARB=0.0192879;OID=.;OPOS=3590730;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:53:53:50:50:20:30:22:31:20:30:22:31 chr4 3590817 . T C 270.34 PASS AO=86;DP=221;FAO=86;FDP=222;FR=.;FRO=136;FSAF=57;FSAR=29;FSRF=102;FSRR=34;FWDB=0.000768917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.072;QD=4.87103;RBI=0.0252005;REFB=-0.0232025;REVB=0.0251887;RO=133;SAF=57;SAR=29;SRF=100;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112662;STB=0.562166;TYPE=snp;VARB=0.0374683;OID=.;OPOS=3590817;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:222:133:136:86:86:29:57:100:33:29:57:102:34 chr4 3590823 . GACAC G 1023.13 PASS AO=84;DP=210;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0736677;FXX=0.299981;HRUN=1;LEN=4;MLLD=148.035;QD=36.5403;RBI=0.111422;REFB=0;REVB=0.0835944;RO=0;SAF=67;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.57488e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-2.95966e-05;OID=.;OPOS=3590824;OREF=ACAC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:84:117:112:112:0:90:22:0:0:49:0:67:17:0:0 chr4 3590878 . C T 562.92 PASS AO=149;DP=337;FAO=151;FDP=336;FR=.;FRO=185;FSAF=87;FSAR=64;FSRF=100;FSRR=85;FWDB=-0.0473938;FXX=0.0088493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.3835;QD=6.70147;RBI=0.0784143;REFB=-0.0420823;REVB=0.062471;RO=175;SAF=87;SAR=62;SRF=98;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239328;STB=0.519952;TYPE=snp;VARB=0.052523;OID=.;OPOS=3590878;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:337:336:175:185:149:151:62:87:98:77:64:87:100:85 chr4 3590911 . A C 679.76 PASS AO=218;DP=469;FAO=181;FDP=400;FR=.;FRO=219;FSAF=102;FSAR=79;FSRF=109;FSRR=110;FWDB=-0.017356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.3653;QD=6.79757;RBI=0.0262811;REFB=-0.0141366;REVB=-0.0197349;RO=249;SAF=119;SAR=99;SRF=120;SRR=129;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0620498;STB=0.536286;TYPE=snp;VARB=0.0169201;OID=.;OPOS=3590911;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:469:400:249:219:218:181:99:119:120:129:79:102:109:110 chr4 3591015 . A C 522.16 PASS AO=302;DP=726;FAO=160;FDP=395;FR=.;FRO=235;FSAF=63;FSAR=97;FSRF=100;FSRR=135;FWDB=-0.0665397;FXX=0.0124997;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.678;QD=5.28773;RBI=0.0671201;REFB=0.000401523;REVB=-0.0088078;RO=386;SAF=120;SAR=182;SRF=169;SRR=217;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0424139;STB=0.519635;TYPE=snp;VARB=-0.000581441;OID=.;OPOS=3591015;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:726:395:386:235:302:160:182:120:169:217:97:63:100:135 chr4 3591049 . C T 471.25 PASS AO=242;DP=623;FAO=155;FDP=400;FR=.;FRO=245;FSAF=58;FSAR=97;FSRF=109;FSRR=136;FWDB=0.028339;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=37.4932;QD=4.71253;RBI=0.120891;REFB=-0.0548381;REVB=0.117522;RO=381;SAF=85;SAR=157;SRF=157;SRR=224;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0709956;STB=0.545176;TYPE=snp;VARB=0.048207;OID=.;OPOS=3591049;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:623:400:381:245:242:155:157:85:157:224:97:58:109:136 chr4 3591069 . C T 626.59 PASS AO=273;DP=615;FAO=174;FDP=396;FR=.;FRO=222;FSAF=62;FSAR=112;FSRF=99;FSRR=123;FWDB=-0.0142429;FXX=0.00999975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.956;QD=6.32919;RBI=0.0154888;REFB=-0.0149816;REVB=0.0060863;RO=321;SAF=102;SAR=171;SRF=134;SRR=187;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0452899;STB=0.553089;TYPE=snp;VARB=0.0207832;OID=.;OPOS=3591069;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:615:396:321:222:273:174:171:102:134:187:112:62:99:123 chr4 3768777 . C T 101.11 PASS AO=19;DP=33;FAO=19;FDP=33;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=-0.0100556;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.358;QD=12.2555;RBI=0.0420968;REFB=-0.0153599;REVB=-0.0408782;RO=14;SAF=9;SAR=10;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181401;STB=0.601162;TYPE=snp;VARB=0.0173955;OID=.;OPOS=3768777;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:33:33:14:14:19:19:10:9:10:4:10:9:10:4 chr4 3770069 . G C 47.14 PASS AO=7;DP=11;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.051;QD=17.1402;RBI=0.00977609;REFB=-0.00624289;REVB=0.00977609;RO=4;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0584302;OID=.;OPOS=3770069;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:11:11:4:4:7:7:7:0:0:4:7:0:0:4 chr4 4239587 . G T 93.34 PASS AO=64;DP=274;FAO=65;FDP=274;FR=.;FRO=209;FSAF=41;FSAR=24;FSRF=121;FSRR=88;FWDB=0.0530854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.4435;QD=1.36257;RBI=0.056813;REFB=-0.00617724;REVB=0.0202401;RO=208;SAF=40;SAR=24;SRF=120;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0636356;STB=0.541496;TYPE=snp;VARB=0.0233034;OID=.;OPOS=4239587;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:274:274:208:209:64:65:24:40:120:88:24:41:121:88 chr4 4276132 . T C 508.4 PASS AO=56;DP=59;FAO=57;FDP=59;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.13954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.316;QD=34.468;RBI=0.141554;REFB=-0.107862;REVB=0.0237939;RO=3;SAF=14;SAR=42;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0516512;STB=0.510247;TYPE=snp;VARB=0.00249035;OID=.;OPOS=4276132;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:59:59:3:2:56:57:42:14:2:1:42:15:1:1 chr4 4304337 . C T 153.15 PASS AO=21;DP=26;FAO=21;FDP=26;FR=.;FRO=5;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.00476822;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=221.038;QD=23.5609;RBI=0.0254424;REFB=-0.000525579;REVB=0.0249916;RO=5;SAF=9;SAR=12;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0609641;STB=0.533301;TYPE=snp;VARB=0.000386673;OID=.;OPOS=4304337;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:26:26:5:5:21:21:12:9:3:2:12:9:3:2 chr4 4864301 . C A 248.33 PASS AO=56;DP=111;FAO=56;FDP=111;FR=.;FRO=55;FSAF=21;FSAR=35;FSRF=9;FSRR=46;FWDB=-0.00275823;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.558;QD=8.94871;RBI=0.012511;REFB=-0.0112372;REVB=0.0122032;RO=55;SAF=21;SAR=35;SRF=9;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216458;STB=0.618283;TYPE=snp;VARB=0.00748843;OID=.;OPOS=4864301;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:55:55:56:56:35:21:9:46:35:21:9:46 chr4 4865685 . CTTTTAT C 480.64 PASS AO=323;DP=913;FAO=175;FDP=356;FR=.;FRO=181;FSAF=75;FSAR=100;FSRF=70;FSRR=111;FWDB=0.00480512;FXX=0.109997;HRUN=4;LEN=6;MLLD=221.184;QD=5.40041;RBI=0.0128477;REFB=-0.0117949;REVB=0.0119152;RO=334;SAF=136;SAR=187;SRF=115;SRR=219;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0741362;STB=0.521844;TYPE=del;VARB=0.0135552;OID=.;OPOS=4865686;OREF=TTTTAT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:323:858:175:356:181:75:100:70:111:99:334:136:187:115:219 chr4 5642274 . T C 232.57 PASS AO=80;DP=225;FAO=83;FDP=230;FR=.;FRO=147;FSAF=37;FSAR=46;FSRF=54;FSRR=93;FWDB=0.0204173;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.9136;QD=4.04466;RBI=0.0205625;REFB=-0.0549228;REVB=-0.00243905;RO=145;SAF=35;SAR=45;SRF=53;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0840137;STB=0.55128;TYPE=snp;VARB=0.0704282;OID=.;OPOS=5642274;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:225:230:145:147:80:83:45:35:53:92:46:37:54:93 chr4 5690902 . T C 272.29 PASS AO=76;DP=194;FAO=81;FDP=199;FR=.;FRO=118;FSAF=41;FSAR=40;FSRF=71;FSRR=47;FWDB=-0.0152506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.145;QD=5.47323;RBI=0.0153135;REFB=-0.0126388;REVB=0.00138703;RO=111;SAF=39;SAR=37;SRF=68;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105773;STB=0.556715;TYPE=snp;VARB=0.0137425;OID=.;OPOS=5690902;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:199:111:118:76:81:37:39:68:43:40:41:71:47 chr4 5731074 . C T 199.29 PASS AO=57;DP=124;FAO=57;FDP=139;FR=.;FRO=82;FSAF=13;FSAR=44;FSRF=50;FSRR=32;FWDB=-0.0147897;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.611;QD=5.73512;RBI=0.0431711;REFB=-0.0311271;REVB=-0.0405588;RO=67;SAF=13;SAR=44;SRF=49;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.488567;STB=0.737147;TYPE=snp;VARB=0.0426571;OID=.;OPOS=5731074;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:139:67:82:57:57:44:13:49:18:44:13:50:32 chr4 5743509 . C T 2457.16 PASS AO=252;DP=252;FAO=256;FDP=256;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=177;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0547732;FXX=0.00775164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.877;QD=38.3932;RBI=0.0547803;REFB=0;REVB=0.000882276;RO=0;SAF=76;SAR=176;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17186e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.6368e-05;OID=.;OPOS=5743509;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:252:256:0:0:252:256:176:76:0:0:177:79:0:0 chr4 5743512 . T C 458.27 PASS AO=119;DP=259;FAO=119;FDP=259;FR=.;FRO=140;FSAF=33;FSAR=86;FSRF=47;FSRR=93;FWDB=0.0302058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.783;QD=7.07757;RBI=0.0557268;REFB=-0.0369937;REVB=0.0468304;RO=137;SAF=33;SAR=86;SRF=47;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0762541;STB=0.53804;TYPE=snp;VARB=0.0518892;OID=.;OPOS=5743512;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:259:259:137:140:119:119:86:33:47:90:86:33:47:93 chr4 5749904 . T C 145.26 PASS AO=32;DP=66;FAO=33;FDP=67;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=0.00215158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.0311;QD=8.6721;RBI=0.0441224;REFB=0.00549448;REVB=0.0440699;RO=34;SAF=17;SAR=15;SRF=12;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163341;STB=0.596717;TYPE=snp;VARB=-0.00438657;OID=.;OPOS=5749904;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:67:34:34:32:33:15:17:12:22:15:18:12:22 chr4 5749961 . G C 115.26 PASS AO=30;DP=70;FAO=30;FDP=70;FR=.;FRO=40;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=26;FWDB=0.0541513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.3477;QD=6.58648;RBI=0.0542079;REFB=-0.00776942;REVB=0.00247798;RO=40;SAF=13;SAR=17;SRF=14;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0869363;STB=0.549084;TYPE=snp;VARB=0.0106704;OID=.;OPOS=5749961;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:40:40:30:30:17:13:14:26:17:13:14:26 chr4 5750003 . A G 119.15 PASS AO=25;DP=50;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.0560977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.7548;QD=9.34535;RBI=0.0634257;REFB=-0.0141318;REVB=-0.0295949;RO=25;SAF=12;SAR=13;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0357519;STB=0.51063;TYPE=snp;VARB=0.028792;OID=.;OPOS=5750003;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:51:25:25:25:26:13:12:11:14:14:12:11:14 chr4 5754579 . C T 34.32 PASS AO=10;DP=30;FAO=10;FDP=30;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=0.0177062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.0086;QD=4.57605;RBI=0.021997;REFB=-0.0371014;REVB=0.0130521;RO=20;SAF=7;SAR=3;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0630627;STB=0.538383;TYPE=snp;VARB=0.0733954;OID=.;OPOS=5754579;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:30:30:20:20:10:10:3:7:13:7:3:7:13:7 chr4 5755542 . C A 1346.73 PASS AO=125;DP=125;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0359836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.308;QD=38.2052;RBI=0.0415415;REFB=0;REVB=0.0207576;RO=0;SAF=64;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.3614e-05;OID=.;OPOS=5755542;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:125:141:0:0:125:141:61:64:0:0:77:64:0:0 chr4 5785442 . G A 159.04 PASS AO=42;DP=96;FAO=42;FDP=96;FR=.;FRO=54;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=0.0240235;FXX=0.0103082;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.849;QD=6.62668;RBI=0.0255715;REFB=-0.0148507;REVB=-0.00876192;RO=52;SAF=18;SAR=24;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0521216;STB=0.519628;TYPE=snp;VARB=0.0133225;OID=.;OPOS=5785442;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:52:54:42:42:24:18:25:27:24:18:25:29 chr4 5795412 . C T 137.1 PASS AO=30;DP=60;FAO=30;FDP=60;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.0021942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.4429;QD=9.13972;RBI=0.0201442;REFB=-0.0265673;REVB=0.0200244;RO=30;SAF=16;SAR=14;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0596491;STB=0.533311;TYPE=snp;VARB=0.0405187;OID=.;OPOS=5795412;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:30:30:30:30:14:16:14:16:14:16:14:16 chr4 5838513 . C G 270.84 PASS AO=63;DP=132;FAO=64;FDP=131;FR=.;FRO=67;FSAF=31;FSAR=33;FSRF=33;FSRR=34;FWDB=-0.0156056;FXX=0.00757518;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2208;QD=8.26989;RBI=0.0158576;REFB=0.00945462;REVB=0.00281584;RO=68;SAF=30;SAR=33;SRF=34;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.022343;STB=0.504176;TYPE=snp;VARB=-0.010008;OID=.;OPOS=5838513;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:131:68:67:63:64:33:30:34:34:33:31:33:34 chr4 5975538 . G A 171.19 PASS AO=27;DP=42;FAO=29;FDP=44;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.00829349;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.556;QD=15.563;RBI=0.0178296;REFB=0.0180062;REVB=0.0157833;RO=15;SAF=7;SAR=20;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159567;STB=0.575814;TYPE=snp;VARB=-0.0125458;OID=.;OPOS=5975538;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:42:44:15:15:27:29:20:7:7:8:21:8:7:8 chr4 5990110 . C A 2254.94 PASS AO=241;DP=245;FAO=242;FDP=242;FR=.;FRO=0;FSAF=130;FSAR=112;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218576;FXX=0.0122444;HRUN=4;LEN=1;MLLD=210.588;QD=37.2717;RBI=0.0221332;REFB=-0.106514;REVB=-0.00348221;RO=1;SAF=130;SAR=111;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00365229;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000158455;OID=.;OPOS=5990110;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:245:242:1:0:241:242:111:130:1:0:112:130:0:0 chr4 5990339 . G A 753 PASS AO=77;DP=77;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0345687;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.737;QD=37.1851;RBI=0.0607382;REFB=0;REVB=0.0499414;RO=0;SAF=34;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.11157e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00379299;OID=.;OPOS=5990339;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:77:81:0:0:77:81:43:34:0:0:43:38:0:0 chr4 5990599 . T C 437.86 PASS AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0287183;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.958;QD=36.4885;RBI=0.0380645;REFB=-0.0245167;REVB=0.0249833;RO=0;SAF=12;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.04037e-08;STB=0.507039;TYPE=snp;VARB=0.000335203;OID=.;OPOS=5990599;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:48:48:0:1:47:47:35:12:0:0:35:12:0:1 chr4 5990791 . A G 1442.01 PASS AO=150;DP=150;FAO=151;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=102;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0182143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.98;QD=38.199;RBI=0.0182298;REFB=0;REVB=-0.000751117;RO=0;SAF=102;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.14848e-05;OID=.;OPOS=5990791;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:150:151:0:0:150:151:48:102:0:0:49:102:0:0 chr4 5991084 . T G 306.11 PASS AO=32;DP=32;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00961175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.987;QD=37.1047;RBI=0.0247404;REFB=0;REVB=0.022797;RO=0;SAF=14;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.79453e-05;OID=.;OPOS=5991084;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:32:33:0:0:32:33:18:14:0:0:19:14:0:0 chr4 5991384 . T C 382.73 PASS AO=41;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.134014;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.127;QD=36.4501;RBI=0.137743;REFB=0;REVB=-0.0318352;RO=1;SAF=8;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.055073;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000894673;OID=.;OPOS=5991384;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:42:42:1:0:41:42:33:8:1:0:33:9:0:0 chr4 5991476 . G A 136.31 PASS AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0859865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.9364;QD=36.3484;RBI=0.116299;REFB=0;REVB=0.0783052;RO=0;SAF=4;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33019e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000176563;OID=.;OPOS=5991476;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:15:0:0:15:15:11:4:0:0:11:4:0:0 chr4 6293696 . C G 1144.4 PASS AO=117;DP=118;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0558898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.772;QD=38.4671;RBI=0.057487;REFB=0;REVB=0.0134569;RO=0;SAF=42;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.25933e-05;OID=.;OPOS=6293696;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:118:119:0:0:117:119:75:42:0:0:76:43:0:0 chr4 6302519 . G A 575.2 PASS AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00714689;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.359;QD=37.718;RBI=0.0527583;REFB=0;REVB=0.052272;RO=0;SAF=10;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000328082;OID=.;OPOS=6302519;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:62:61:0:0:61:61:51:10:0:0:51:10:0:0 chr4 6302707 . C T 497.84 PASS AO=52;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00992365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.825;QD=37.5732;RBI=0.0414427;REFB=0;REVB=0.040237;RO=0;SAF=15;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.84047e-05;OID=.;OPOS=6302707;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:53:53:0:0:52:53:37:15:0:0:37:16:0:0 chr4 6303022 . C T 652 PASS AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00321615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.208;QD=38.3527;RBI=0.00988122;REFB=0;REVB=-0.00934317;RO=0;SAF=28;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.36469e-05;OID=.;OPOS=6303022;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:68:68:0:0:68:68:40:28:0:0:40:28:0:0 chr4 6303955 . G A 363.29 PASS AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0556305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.761;QD=38.241;RBI=0.0697587;REFB=0;REVB=0.0420895;RO=0;SAF=20;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71161e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000269001;OID=.;OPOS=6303955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:37:38:0:0:37:38:17:20:0:0:18:20:0:0 chr4 6304087 . A G 298.84 PASS AO=32;DP=34;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00102821;FXX=0.0588062;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.254;QD=37.3548;RBI=0.0459725;REFB=0;REVB=-0.045961;RO=0;SAF=16;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000228473;OID=.;OPOS=6304087;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:34:32:0:0:32:32:16:16:0:0:16:16:0:0 chr4 6304242 . T C 295.44 PASS AO=43;DP=53;FAO=43;FDP=53;FR=.;FRO=10;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0238169;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=37.8026;QD=22.2974;RBI=0.0502642;REFB=-0.0606743;REVB=-0.0442633;RO=10;SAF=26;SAR=17;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109052;STB=0.558612;TYPE=snp;VARB=0.0169342;OID=.;OPOS=6304242;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:53:53:10:10:43:43:17:26:3:7:17:26:3:7 chr4 6304286 . C T 624.34 PASS AO=67;DP=69;FAO=69;FDP=71;FR=.;FRO=2;FSAF=41;FSAR=28;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00348651;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.6993;QD=35.1739;RBI=0.0107387;REFB=-0.0593204;REVB=0.010157;RO=2;SAF=39;SAR=28;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0236171;STB=0.511901;TYPE=snp;VARB=0.0013356;OID=.;OPOS=6304286;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:69:71:2:2:67:69:28:39:2:0:28:41:2:0 chr4 6304344 . G A 953.89 PASS AO=101;DP=101;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00204684;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.196;QD=38.1556;RBI=0.00304818;REFB=0;REVB=0.00225873;RO=0;SAF=64;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.79816e-05;OID=.;OPOS=6304344;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:101:100:0:0:101:100:37:64:0:0:36:64:0:0 chr4 6325086 . G A 283.7 PASS AO=67;DP=140;FAO=68;FDP=141;FR=.;FRO=73;FSAF=36;FSAR=32;FSRF=40;FSRR=33;FWDB=-0.00925069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.037;QD=8.0483;RBI=0.0139762;REFB=-0.0269897;REVB=0.0104766;RO=72;SAF=36;SAR=31;SRF=40;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0172027;STB=0.509637;TYPE=snp;VARB=0.0263025;OID=.;OPOS=6325086;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:141:72:73:67:68:31:36:40:32:32:36:40:33 chr4 6594939 . GCCTCCCCA GCTCCCCA,GCCTCCCCC 594.34 PASS AO=25,50;DP=111;FAO=24,68;FDP=101;FR=.;FRO=9;FSAF=0,20;FSAR=24,48;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.0709674,-0.0459346;FXX=0.0380916;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=14.5048,34.7619;QD=23.5381;RBI=0.245712,0.049012;REFB=-0.0952193,0.00935126;REVB=-0.235241,-0.0170936;RO=7;SAF=0,14;SAR=25,36;SRF=6;SRR=1;SSEN=0.405083,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.873071,-0.15233;STB=0.999316,0.550249;TYPE=del,snp;VARB=0.256849,-0.000198738;OID=.,.;OPOS=6594940,6594947;OREF=C,A;OALT=-,C;OMAPALT=GCTCCCCA,GCCTCCCCC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:25,50:85:24,68:101:9:0,20:24,48:6:3:41:7:0,14:25,36:6:1 chr4 6596360 . G A 251.13 PASS AO=56;DP=109;FAO=56;FDP=110;FR=.;FRO=54;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=23;FSRR=31;FWDB=0.00238665;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.097;QD=9.13188;RBI=0.0106978;REFB=-0.0189984;REVB=0.0104282;RO=52;SAF=27;SAR=29;SRF=23;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0349052;STB=0.527677;TYPE=snp;VARB=0.0232168;OID=.;OPOS=6596360;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:110:52:54:56:56:29:27:23:29:29:27:23:31 chr4 6600012 . A G 243.97 PASS AO=67;DP=155;FAO=67;FDP=155;FR=.;FRO=88;FSAF=19;FSAR=48;FSRF=11;FSRR=77;FWDB=0.0327076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.671;QD=6.29596;RBI=0.0329202;REFB=-0.0245552;REVB=-0.00373496;RO=85;SAF=19;SAR=48;SRF=10;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230961;STB=0.622512;TYPE=snp;VARB=0.042814;OID=.;OPOS=6600012;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:85:88:67:67:48:19:10:75:48:19:11:77 chr4 6606864 . A G 457.16 PASS AO=47;DP=50;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018082;FXX=0.059988;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.2933;QD=38.9075;RBI=0.0469282;REFB=0;REVB=0.0433048;RO=0;SAF=18;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000740844;OID=.;OPOS=6606864;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:50:47:0:0:47:47:29:18:0:0:29:18:0:0 chr4 6619165 . A G 306.1 PASS AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0627541;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.9423;QD=37.1035;RBI=0.0682903;REFB=0;REVB=0.0269347;RO=0;SAF=21;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000986516;OID=.;OPOS=6619165;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:33:33:0:0:33:33:12:21:0:0:12:21:0:0 chr4 6619204 . G A 531.5 PASS AO=64;DP=64;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00303929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.4687;QD=37.9646;RBI=0.0426089;REFB=0;REVB=0.0425004;RO=0;SAF=24;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.3845e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000293097;OID=.;OPOS=6619204;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:64:56:0:0:64:56:40:24:0:0:35:21:0:0 chr4 6698667 . T C 796.11 PASS AO=87;DP=91;FAO=89;FDP=90;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0313161;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.464;QD=35.3827;RBI=0.0363143;REFB=0.0291819;REVB=0.0183856;RO=2;SAF=46;SAR=41;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0012271;STB=0.505881;TYPE=snp;VARB=-1.62268e-05;OID=.;OPOS=6698667;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:91:90:2:1:87:89:41:46:1:1:42:47:0:1 chr4 6698706 . A C 1256.98 PASS AO=132;DP=132;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0148213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.0149;QD=38.0903;RBI=0.0150099;REFB=0;REVB=-0.00237238;RO=0;SAF=62;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84852e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.97327e-05;OID=.;OPOS=6698706;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:132:132:0:0:132:132:70:62:0:0:70:62:0:0 chr4 6718775 . G T 181.58 PASS AO=28;DP=66;FAO=40;FDP=78;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=-0.000326273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.492;QD=9.31187;RBI=0.0452518;REFB=-0.00104582;REVB=0.0452507;RO=38;SAF=12;SAR=16;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.035246;STB=0.515144;TYPE=snp;VARB=0.000388787;OID=.;OPOS=6718775;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:78:38:38:28:40:16:12:15:23:23:17:15:23 chr4 6719092 . TAGTC T 99.73 PASS AO=39;DP=136;FAO=39;FDP=123;FR=.;FRO=84;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=38;FSRR=46;FWDB=-0.000900845;FXX=0.061064;HRUN=1;LEN=4;MLLD=233.33;QD=3.2431;RBI=0.00838414;REFB=-0.00420979;REVB=-0.0083356;RO=85;SAF=16;SAR=23;SRF=38;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0442784;STB=0.529397;TYPE=del;VARB=0.010041;OID=.;OPOS=6719093;OREF=AGTC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:39:133:39:123:84:16:23:38:46:99:85:16:23:38:47 chr4 6884329 . T C 1066.69 PASS AO=127;DP=138;FAO=127;FDP=139;FR=.;FRO=12;FSAF=83;FSAR=44;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.00719723;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=149.751;QD=30.6961;RBI=0.02258;REFB=0.0309007;REVB=-0.0214022;RO=10;SAF=83;SAR=44;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00711191;STB=0.501252;TYPE=snp;VARB=-0.000882148;OID=.;OPOS=6884329;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:138:139:10:12:127:127:44:83:7:3:44:83:8:4 chr4 6884352 . GGT G 112.53 PASS AO=43;DP=144;FAO=56;FDP=116;FR=.;FRO=60;FSAF=19;FSAR=37;FSRF=42;FSRR=18;FWDB=-0.0794668;FXX=0.205465;HRUN=3;LEN=2;MLLD=93.8827;QD=3.88048;RBI=0.0795025;REFB=-0.0423339;REVB=-0.0023825;RO=0;SAF=32;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.61286e-08;STB=0.683461;TYPE=del;VARB=0.0369279;OID=.;OPOS=6884353;OREF=GT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:43:69:56:116:60:19:37:42:18:99:0:32:11:0:0 chr4 7044600 . G A 129.16 PASS AO=20;DP=29;FAO=20;FDP=29;FR=.;FRO=9;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.0172269;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.873;QD=17.8149;RBI=0.0175041;REFB=-0.121743;REVB=0.003103;RO=9;SAF=12;SAR=8;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150775;STB=0.583249;TYPE=snp;VARB=0.0421258;OID=.;OPOS=7044600;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:29:29:9:9:20:20:8:12:3:6:8:12:3:6 chr4 7057106 . G C 593.08 PASS AO=65;DP=66;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0422597;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.788;QD=36.497;RBI=0.0487904;REFB=-0.0813896;REVB=0.024385;RO=0;SAF=10;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.526307;TYPE=snp;VARB=0.000263104;OID=.;OPOS=7057106;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:66:65:0:1:65:64:55:10:0:0:55:9:1:0 chr4 7058305 . A G 223.62 PASS AO=51;DP=105;FAO=52;FDP=105;FR=.;FRO=53;FSAF=16;FSAR=36;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=0.0531941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.221;QD=8.51871;RBI=0.0533147;REFB=-0.013439;REVB=-0.00358406;RO=53;SAF=16;SAR=35;SRF=26;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174491;STB=0.59996;TYPE=snp;VARB=0.0104521;OID=.;OPOS=7058305;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:53:53:51:52:35:16:26:27:36:16:26:27 chr4 7325840 . G T 104.59 PASS AO=34;DP=96;FAO=35;FDP=97;FR=.;FRO=62;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=36;FSRR=26;FWDB=-0.0183532;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.854;QD=4.31288;RBI=0.0376565;REFB=-0.0169506;REVB=-0.0328812;RO=61;SAF=15;SAR=19;SRF=35;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14722;STB=0.57841;TYPE=snp;VARB=0.0349181;OID=.;OPOS=7325840;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:97:61:62:34:35:19:15:35:26:19:16:36:26 chr4 7435058 . C T 137.37 PASS AO=28;DP=52;FAO=28;FDP=52;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=22;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.0232922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.704;QD=10.5668;RBI=0.0293447;REFB=-0.00258182;REVB=-0.017849;RO=24;SAF=6;SAR=22;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174334;STB=0.59775;TYPE=snp;VARB=0.00104743;OID=.;OPOS=7435058;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:24:24:28:28:22:6:9:15:22:6:9:15 chr4 7435379 . A G 892.19 PASS AO=96;DP=97;FAO=95;FDP=96;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=52;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00202465;FXX=0.0103082;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.4285;QD=37.1747;RBI=0.0408441;REFB=-0.0248133;REVB=-0.0407939;RO=1;SAF=43;SAR=53;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0109008;STB=0.505746;TYPE=snp;VARB=0.000821712;OID=.;OPOS=7435379;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:97:96:1:1:96:95:53:43:1:0:52:43:1:0 chr4 7435443 . G A 215.68 PASS AO=48;DP=96;FAO=49;FDP=98;FR=.;FRO=49;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=29;FSRR=20;FWDB=-0.00168179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.167;QD=8.80341;RBI=0.00906486;REFB=-0.00213056;REVB=0.00890749;RO=48;SAF=21;SAR=27;SRF=29;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149769;STB=0.581362;TYPE=snp;VARB=0.00222114;OID=.;OPOS=7435443;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:98:48:49:48:49:27:21:29:19:28:21:29:20 chr4 7435486 . G T 250.75 PASS AO=43;DP=71;FAO=45;FDP=72;FR=.;FRO=27;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.0357641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.249;QD=13.9306;RBI=0.0363381;REFB=-0.0279943;REVB=0.00643293;RO=27;SAF=27;SAR=16;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0806627;STB=0.540522;TYPE=snp;VARB=0.0148232;OID=.;OPOS=7435486;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:71:72:27:27:43:45:16:27:14:13:17:28:14:13 chr4 7435721 . C T 101.07 PASS AO=28;DP=69;FAO=28;FDP=69;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=-0.0145411;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.208;QD=5.85907;RBI=0.0148811;REFB=-0.0260138;REVB=-0.00316282;RO=40;SAF=16;SAR=12;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0743494;STB=0.535539;TYPE=snp;VARB=0.048567;OID=.;OPOS=7435721;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:40:41:28:28:12:16:20:20:12:16:21:20 chr4 7436073 . C T 71.87 PASS AO=12;DP=20;FAO=12;FDP=20;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0507245;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.2415;QD=14.3738;RBI=0.0592342;REFB=-0.0348823;REVB=0.0305894;RO=8;SAF=6;SAR=6;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0879115;STB=0.549917;TYPE=snp;VARB=0.0129231;OID=.;OPOS=7436073;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:20:20:8:8:12:12:6:6:5:3:6:6:5:3 chr4 7436239 . C T 171.69 PASS AO=47;DP=109;FAO=47;FDP=111;FR=.;FRO=64;FSAF=15;FSAR=32;FSRF=38;FSRR=26;FWDB=-0.0288643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.6074;QD=6.18705;RBI=0.0326523;REFB=-0.0292577;REVB=-0.0152653;RO=60;SAF=15;SAR=32;SRF=35;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.270184;STB=0.660881;TYPE=snp;VARB=0.0660024;OID=.;OPOS=7436239;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:111:60:64:47:47:32:15:35:25:32:15:38:26 chr4 7436701 . C T 42.7 PASS AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.00530636;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.112;QD=7.116;RBI=0.00995958;REFB=-0.0326127;REVB=-0.00842827;RO=14;SAF=3;SAR=7;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.275052;STB=0.663456;TYPE=snp;VARB=0.0137714;OID=.;OPOS=7436701;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:25:24:14:14:10:10:7:3:8:6:7:3:8:6 chr4 7461769 . A G 27.19 PASS AO=9;DP=31;FAO=9;FDP=31;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.0711523;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.2252;QD=3.50869;RBI=0.072317;REFB=-0.020626;REVB=0.0129264;RO=22;SAF=7;SAR=2;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.298292;STB=0.68807;TYPE=snp;VARB=0.0333961;OID=.;OPOS=7461769;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:31:31:22:22:9:9:2:7:12:10:2:7:12:10 chr4 7461826 . C CCCA 253.95 PASS AO=26;DP=41;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0110936;FXX=0.263089;HRUN=3;LEN=3;MLLD=214.448;QD=36.2781;RBI=0.0111971;REFB=0.0744193;REVB=-0.00151876;RO=15;SAF=18;SAR=8;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117311;STB=0.513504;TYPE=ins;VARB=0.000222738;OID=.;OPOS=7461827;OREF=-;OALT=CCA;OMAPALT=CCCA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:26:41:27:28:1:18:9:1:0:7:15:18:8:8:7 chr4 7655855 . C T 664.02 PASS AO=131;DP=272;FAO=135;FDP=267;FR=.,HEALED;FRO=118;FSAF=37;FSAR=98;FSRF=50;FSRR=68;FWDB=-0.00455515;FXX=0.0183817;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.3542;QD=9.94786;RBI=0.00930703;REFB=-0.0195259;REVB=0.00811612;RO=88;SAF=33;SAR=98;SRF=21;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0131741;STB=0.581253;TYPE=snp;VARB=-0.0129791;OID=.;OPOS=7655855;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:267:267:88:118:131:135:98:33:21:67:98:37:50:68 chr4 7714490 . T C 195.74 PASS AO=57;DP=139;FAO=57;FDP=140;FR=.;FRO=83;FSAF=12;FSAR=45;FSRF=23;FSRR=60;FWDB=-0.0316278;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.7301;QD=5.59242;RBI=0.0320398;REFB=-0.00730218;REVB=-0.0051215;RO=82;SAF=12;SAR=45;SRF=22;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0855391;STB=0.555535;TYPE=snp;VARB=0.0115944;OID=.;OPOS=7714490;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:140:82:83:57:57:45:12:22:60:45:12:23:60 chr4 7716932 . T C 54.4 PASS AO=18;DP=68;FAO=21;FDP=70;FR=.;FRO=49;FSAF=4;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=28;FWDB=-0.0301884;FXX=0.0277739;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.765;QD=3.10838;RBI=0.0304519;REFB=-0.0080042;REVB=0.00399785;RO=49;SAF=3;SAR=15;SRF=21;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.380181;STB=0.702264;TYPE=snp;VARB=0.0186752;OID=.;OPOS=7716932;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:68:70:49:49:18:21:15:3:21:28:17:4:21:28 chr4 7761211 . C T 318.14 PASS AO=83;DP=183;FAO=83;FDP=183;FR=.;FRO=100;FSAF=35;FSAR=48;FSRF=31;FSRR=69;FWDB=-0.00814964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.766;QD=6.95383;RBI=0.0277603;REFB=-0.0126861;REVB=-0.0265371;RO=100;SAF=35;SAR=48;SRF=31;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115384;STB=0.563802;TYPE=snp;VARB=0.016916;OID=.;OPOS=7761211;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:183:100:100:83:83:48:35:31:69:48:35:31:69 chr4 7761286 . T C 262.04 PASS AO=63;DP=130;FAO=63;FDP=131;FR=.;FRO=68;FSAF=32;FSAR=31;FSRF=29;FSRR=39;FWDB=-0.0121126;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.3359;QD=8.00117;RBI=0.0220373;REFB=0.00546775;REVB=0.01841;RO=67;SAF=32;SAR=31;SRF=29;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0699098;STB=0.542228;TYPE=snp;VARB=-0.00730398;OID=.;OPOS=7761286;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:131:67:68:63:63:31:32:29:38:31:32:29:39 chr4 7765495 . G T 229.63 PASS AO=63;DP=146;FAO=63;FDP=146;FR=.;FRO=83;FSAF=32;FSAR=31;FSRF=44;FSRR=39;FWDB=-0.0171827;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.539;QD=6.2913;RBI=0.0226451;REFB=0.000606415;REVB=0.0147497;RO=83;SAF=32;SAR=31;SRF=44;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.022572;STB=0.512616;TYPE=snp;VARB=-0.000657687;OID=.;OPOS=7765495;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:83:83:63:63:31:32:44:39:31:32:44:39 chr4 7770723 . G T 229.8 PASS AO=56;DP=118;FAO=56;FDP=119;FR=.;FRO=63;FSAF=18;FSAR=38;FSRF=36;FSRR=27;FWDB=0.064655;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.856;QD=7.72425;RBI=0.069923;REFB=-0.0183153;REVB=0.0266262;RO=61;SAF=18;SAR=38;SRF=36;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.259132;STB=0.636821;TYPE=snp;VARB=0.0158173;OID=.;OPOS=7770723;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:119:61:63:56:56:38:18:36:25:38:18:36:27 chr4 7774610 . C T 112.08 PASS AO=40;DP=111;FAO=39;FDP=112;FR=.;FRO=73;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=36;FSRR=37;FWDB=0.0404267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.9707;QD=4.00284;RBI=0.0426182;REFB=-0.00129633;REVB=-0.0134907;RO=70;SAF=21;SAR=19;SRF=36;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.011927;STB=0.529558;TYPE=snp;VARB=0.00184169;OID=.;OPOS=7774610;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:112:70:73:40:39:19:21:36:34:18:21:36:37 chr4 7780582 . C T 156.34 PASS AO=35;DP=78;FAO=37;FDP=77;FR=.;FRO=40;FSAF=9;FSAR=28;FSRF=10;FSRR=30;FWDB=-0.0306116;FXX=0.0722804;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.137;QD=8.12138;RBI=0.0318246;REFB=-0.0325316;REVB=0.00870262;RO=34;SAF=7;SAR=28;SRF=8;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0471623;STB=0.504741;TYPE=snp;VARB=0.0567209;OID=.;OPOS=7780582;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:77:34:40:35:37:28:7:8:26:28:9:10:30 chr4 7783163 . G A 1476.87 PASS AO=159;DP=165;FAO=163;FDP=169;FR=.;FRO=6;FSAF=83;FSAR=80;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0400003;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.097;QD=34.9554;RBI=0.100878;REFB=-0.128147;REVB=0.0926085;RO=2;SAF=83;SAR=76;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0113257;STB=0.506244;TYPE=snp;VARB=0.00249176;OID=.;OPOS=7783163;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:165:169:2:6:159:163:76:83:2:0:80:83:2:4 chr4 7783286 . G A 300.7 PASS AO=72;DP=155;FAO=75;FDP=161;FR=.;FRO=86;FSAF=23;FSAR=52;FSRF=39;FSRR=47;FWDB=-0.0106061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.9926;QD=7.47068;RBI=0.0367331;REFB=-0.0223317;REVB=0.0351687;RO=83;SAF=23;SAR=49;SRF=37;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13238;STB=0.586051;TYPE=snp;VARB=0.0282484;OID=.;OPOS=7783286;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:161:83:86:72:75:49:23:37:46:52:23:39:47 chr4 7802292 . G A 158.56 PASS AO=44;DP=107;FAO=44;FDP=105;FR=.;FRO=61;FSAF=11;FSAR=33;FSRF=27;FSRR=34;FWDB=-0.00945491;FXX=0.0277752;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.831;QD=6.04018;RBI=0.0152996;REFB=0.00640225;REVB=-0.0120284;RO=60;SAF=11;SAR=33;SRF=26;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217813;STB=0.629771;TYPE=snp;VARB=-0.00891764;OID=.;OPOS=7802292;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:105:60:61:44:44:33:11:26:34:33:11:27:34 chr4 7845067 . G A 350.33 PASS AO=59;DP=89;FAO=59;FDP=89;FR=.;FRO=30;FSAF=19;FSAR=40;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=0.0211097;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.213;QD=15.745;RBI=0.0211185;REFB=-0.013036;REVB=0.000608006;RO=30;SAF=19;SAR=40;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0768926;STB=0.54167;TYPE=snp;VARB=0.00622177;OID=.;OPOS=7845067;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:89:89:30:30:59:59:40:19:13:17:40:19:13:17 chr4 7857230 . C T 150.8 PASS AO=43;DP=106;FAO=44;FDP=107;FR=.;FRO=63;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=36;FSRR=27;FWDB=-0.0585013;FXX=0.0183469;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.8595;QD=5.63724;RBI=0.0691794;REFB=-0.0122815;REVB=-0.0369241;RO=60;SAF=26;SAR=17;SRF=33;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0581699;STB=0.525885;TYPE=snp;VARB=0.0187098;OID=.;OPOS=7857230;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:107:60:63:43:44:17:26:33:27:17:27:36:27 chr4 7941901 . A C 748.28 PASS AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0323421;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=237.28;QD=38.3735;RBI=0.0338077;REFB=0;REVB=0.00984633;RO=0;SAF=66;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.2831e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.49503e-05;OID=.;OPOS=7941901;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:78:78:0:0:78:78:12:66:0:0:12:66:0:0 chr4 8021417 . A G 238.55 PASS AO=56;DP=143;FAO=63;FDP=142;FR=.;FRO=79;FSAF=19;FSAR=44;FSRF=27;FSRR=52;FWDB=0.00778178;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=194.737;QD=6.71984;RBI=0.024232;REFB=0.00545496;REVB=-0.0229485;RO=33;SAF=17;SAR=39;SRF=9;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0251797;STB=0.525979;TYPE=snp;VARB=-0.00633049;OID=.;OPOS=8021417;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:142:33:79:56:63:39:17:9:24:44:19:27:52 chr4 8062689 . T C 1145.63 PASS AO=119;DP=119;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.010292;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=77.943;QD=38.5084;RBI=0.0491985;REFB=0;REVB=-0.0481099;RO=0;SAF=61;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.93668e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00025901;OID=.;OPOS=8062689;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:119:119:0:0:119:119:58:61:0:0:58:61:0:0 chr4 8062690 . G A 1145.74 PASS AO=119;DP=119;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0169662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.0823;QD=38.5124;RBI=0.0388442;REFB=0;REVB=0.0349431;RO=0;SAF=61;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.93668e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.7411e-05;OID=.;OPOS=8062690;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:119:119:0:0:119:119:58:61:0:0:58:61:0:0 chr4 8089995 . CGG CG,C 107.45 PASS AO=7,4;DP=39;FAO=23,2;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=5,1;FSAR=18,1;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0344336,0.0230749;FXX=0.0714031;HRUN=7,7;LEN=1,2;MLLD=8.37075,11.0472;QD=16.5309;RBI=0.230919,0.137594;REFB=0.10735,0.115047;REVB=0.228337,0.135645;RO=6;SAF=2,2;SAR=5,2;SRF=0;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.329175,0.506476;STB=0.513502,0.665164;TYPE=del,del;VARB=-0.0376115,0.0295453;OID=.,.;OPOS=8089996,8089996;OREF=G,GG;OALT=-,-;OMAPALT=CG,C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:7,4:20:23,2:26:1:5,1:18,1:0:1:3:6:2,2:5,2:0:6 chr4 8207083 . A G 116.19 PASS AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.028028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.913;QD=35.7501;RBI=0.034298;REFB=0;REVB=-0.0197683;RO=0;SAF=1;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.00075e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000114935;OID=.;OPOS=8207083;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:13:0:0:13:13:12:1:0:0:12:1:0:0 chr4 8228731 . T C 1612.91 PASS AO=128;DP=179;FAO=173;FDP=173;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=72;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.264236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.031;QD=37.2926;RBI=0.26432;REFB=0;REVB=0.00667059;RO=2;SAF=29;SAR=99;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0113262;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000763895;OID=.;OPOS=8228731;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:173:173:2:0:128:173:99:29:1:1:101:72:0:0 chr4 8228894 . T C 670.92 PASS AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018545;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.5482;QD=37.7981;RBI=0.0614124;REFB=0;REVB=-0.0585454;RO=0;SAF=33;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000247416;OID=.;OPOS=8228894;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:72:71:0:0:71:71:38:33:0:0:38:33:0:0 chr4 8228948 . T C 104.05 PASS AO=16;DP=39;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=0.0241089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.8994;QD=8.67056;RBI=0.0316631;REFB=-0.0245455;REVB=0.0205259;RO=17;SAF=10;SAR=6;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142198;STB=0.623187;TYPE=snp;VARB=0.0819461;OID=.;OPOS=8228948;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:48:17:24:16:24:6:10:8:9:10:14:8:16 chr4 8229218 . A G 703.1 PASS AO=75;DP=75;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0410588;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.329;QD=38.0053;RBI=0.0411203;REFB=0;REVB=-0.00224732;RO=0;SAF=35;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71047e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000155359;OID=.;OPOS=8229218;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:75:74:0:0:75:74:40:35:0:0:40:34:0:0 chr4 8229326 . T C 325.64 PASS AO=34;DP=34;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0195825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.616;QD=37.2155;RBI=0.0243722;REFB=0;REVB=0.0145097;RO=0;SAF=2;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000133754;OID=.;OPOS=8229326;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:34:35:0:0:34:35:32:2:0:0:32:3:0:0 chr4 8229684 . G GGC 10.08 PASS AO=2;DP=9;FAO=2;FDP=6;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=19.1373;QD=6.72187;RBI=0.144824;REFB=-0.0400693;REVB=0.144824;RO=6;SAF=0;SAR=2;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.606693;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.13502;OID=.;OPOS=8229685;OREF=-;OALT=GC;OMAPALT=GGC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:2:9:2:6:4:0:2:0:4:9:6:0:2:3:3 chr4 8229713 . A G 15.55 PASS AO=3;DP=8;FAO=3;FDP=8;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=195.714;QD=7.77492;RBI=0.00349384;REFB=0.00256902;REVB=0.00349384;RO=5;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00664061;OID=.;OPOS=8229713;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:8:8:5:5:3:3:3:0:0:5:3:0:0:5 chr4 8230070 . T C 25.98 PASS AO=5;DP=17;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=-0.0251557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.817;QD=5.47001;RBI=0.0537579;REFB=-0.0480163;REVB=0.047509;RO=11;SAF=3;SAR=2;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.433121;STB=0.676997;TYPE=snp;VARB=0.0769877;OID=.;OPOS=8230070;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:17:19:11:12:5:7:2:3:2:9:4:3:2:10 chr4 8242466 . A G 1248.82 PASS AO=109;DP=114;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0525555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.517;QD=38.4253;RBI=0.0530342;REFB=0;REVB=0.00710975;RO=0;SAF=69;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.79859e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.80121e-05;OID=.;OPOS=8242466;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:114:130:0:0:109:130:40:69:0:0:54:76:0:0 chr4 8358361 . G A 111.55 PASS AO=29;DP=67;FAO=29;FDP=67;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=0.0333153;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.6174;QD=6.65948;RBI=0.0398625;REFB=-0.0195391;REVB=0.0218886;RO=38;SAF=11;SAR=18;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0708549;STB=0.540165;TYPE=snp;VARB=0.0238697;OID=.;OPOS=8358361;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:38:38:29:29:18:11:17:21:18:11:17:21 chr4 8418190 . GGC G 983.33 PASS AO=93;DP=162;FAO=153;FDP=154;FR=.;FRO=1;FSAF=62;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.226961;FXX=0.0191071;HRUN=4;LEN=2;MLLD=21.38;QD=25.541;RBI=0.346853;REFB=0.0560972;REVB=0.262289;RO=49;SAF=45;SAR=48;SRF=14;SRR=35;SSEN=0.509542;SSEP=0;SSSB=0.127751;STB=0.502732;TYPE=del;VARB=0.00942625;OID=.;OPOS=8418191;OREF=GC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:93:160:153:154:1:62:91:0:1:73:49:45:48:14:35 chr4 8454639 . A G 1125.03 PASS AO=112;DP=112;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00838771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.167;QD=38.1366;RBI=0.00880738;REFB=0;REVB=-0.00268629;RO=0;SAF=72;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.64229e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.1486e-05;OID=.;OPOS=8454639;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:112:118:0:0:112:118:40:72:0:0:42:76:0:0 chr4 8582742 . C T 161.52 PASS AO=35;DP=73;FAO=37;FDP=75;FR=.;FRO=38;FSAF=29;FSAR=8;FSRF=26;FSRR=12;FWDB=0.0740651;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.3466;QD=8.6143;RBI=0.0769182;REFB=0.00750174;REVB=0.020755;RO=38;SAF=27;SAR=8;SRF=27;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0763474;STB=0.568588;TYPE=snp;VARB=-0.00580317;OID=.;OPOS=8582742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:75:38:38:35:37:8:27:27:11:8:29:26:12 chr4 8582856 . T G 134.8 PASS AO=27;DP=51;FAO=27;FDP=50;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=-0.0106291;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.2493;QD=10.7838;RBI=0.0258279;REFB=0.00322972;REVB=-0.0235394;RO=23;SAF=11;SAR=16;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0900473;STB=0.549964;TYPE=snp;VARB=-0.0048449;OID=.;OPOS=8582856;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:51:50:23:23:27:27:16:11:7:16:16:11:7:16 chr4 8602884 . T C 136.31 PASS AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.138265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.2281;QD=36.3483;RBI=0.145856;REFB=0;REVB=0.0464396;RO=0;SAF=4;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33019e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00356852;OID=.;OPOS=8602884;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:15:0:0:15:15:11:4:0:0:11:4:0:0 chr4 8602935 . A G 170.86 PASS AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00361018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.006;QD=37.9686;RBI=0.0179751;REFB=0;REVB=-0.0176088;RO=0;SAF=6;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000389698;OID=.;OPOS=8602935;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:18:0:0:18:18:12:6:0:0:12:6:0:0 chr4 8609065 . TG T 32.67 PASS AO=12;DP=33;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=14;FWDB=-0.00926007;FXX=0.0333222;HRUN=5;LEN=1;MLLD=13.1819;QD=4.50628;RBI=0.0658507;REFB=-0.0159755;REVB=0.0651964;RO=15;SAF=5;SAR=7;SRF=2;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0.334694;SSSB=0.300428;STB=0.692062;TYPE=del;VARB=0.052166;OID=.;OPOS=8609066;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:12:29:13:29:16:6:7:2:14:32:15:5:7:2:13 chr4 8613762 . G T 353.31 PASS AO=77;DP=148;FAO=77;FDP=146;FR=.;FRO=69;FSAF=32;FSAR=45;FSRF=37;FSRR=32;FWDB=0.0122346;FXX=0.0135126;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.135;QD=9.67977;RBI=0.0165601;REFB=-0.0194481;REVB=0.0111602;RO=68;SAF=32;SAR=45;SRF=36;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0983669;STB=0.557536;TYPE=snp;VARB=0.0145514;OID=.;OPOS=8613762;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:146:68:69:77:77:45:32:36:32:45:32:37:32 chr4 8616096 . T C 120.81 PASS AO=28;DP=61;FAO=29;FDP=62;FR=.;FRO=33;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=0.00139868;FXX=0.0312451;HRUN=3;LEN=1;MLLD=115.154;QD=7.79447;RBI=0.0723482;REFB=-0.0146302;REVB=-0.0723346;RO=33;SAF=20;SAR=8;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237269;STB=0.616031;TYPE=snp;VARB=0.00618704;OID=.;OPOS=8616096;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:62:33:33:28:29:8:20:16:17:9:20:16:17 chr4 8616179 . T C 519.75 PASS AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8017;QD=37.8;RBI=0.0341677;REFB=0;REVB=-0.0185168;RO=0;SAF=21;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.25626e-05;OID=.;OPOS=8616179;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:55:55:0:0:55:55:34:21:0:0:34:21:0:0 chr4 8621194 . A G 245.88 PASS AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0283167;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.763;QD=37.828;RBI=0.0298916;REFB=0;REVB=0.00957474;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.74597e-05;OID=.;OPOS=8621194;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:27:26:0:0:26:26:15:11:0:0:15:11:0:0 chr4 8951816 . A G 236.11 PASS AO=24;DP=24;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196257;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.216;QD=37.7778;RBI=0.0203438;REFB=0;REVB=0.00535741;RO=0;SAF=5;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000630057;OID=.;OPOS=8951816;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:24:25:0:0:24:25:19:5:0:0:19:6:0:0 chr4 9218609 . C A 16.95 PASS AO=2;DP=8;FAO=3;FDP=8;FR=.,HEALED;FRO=5;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.0245356;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=184.029;QD=8.47579;RBI=0.114933;REFB=-0.024995;REVB=-0.112283;RO=1;SAF=1;SAR=1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.25849;STB=0.599397;TYPE=snp;VARB=0.0387408;OID=.;OPOS=9218609;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:7:8:1:5:2:3:1:1:1:0:1:2:4:1 chr4 9388888 . A G 736.43 PASS AO=75;DP=75;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0560636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.914;QD=38.256;RBI=0.0628344;REFB=0;REVB=0.0283733;RO=0;SAF=52;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.34336e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000163066;OID=.;OPOS=9388888;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:75:77:0:0:75:77:23:52:0:0:23:54:0:0 chr4 9390659 . TA T,TG 290.35 PASS AO=21,10;DP=32;FAO=31,0;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=10,0;FSAR=21,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0575464,-0.382038;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=209.257,188.067;QD=37.4644;RBI=0.0934248,0.389561;REFB=0,0;REVB=0.0735976,0.0761878;RO=0;SAF=0,10;SAR=21,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0005858,0;OID=.,.;OPOS=9390660,9390660;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=T,TG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:21,10:31:31,0:31:0:10,0:21,0:0:0:14:0:0,10:21,0:0:0 chr4 9446325 . AG A,AA 1511.6 PASS AO=110,36;DP=155;FAO=139,29;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=45,5;FSAR=94,24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00420518,0.00728627;FXX=0.0289001;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=250.385,242.393;QD=35.9905;RBI=0.0080693,0.0150875;REFB=0,0;REVB=0.00688695,0.0132114;RO=0;SAF=39,5;SAR=71,31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.00115408,-0.00340745;OID=.,.;OPOS=9446326,9446326;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:110,36:150:139,29:168:0:45,5:94,24:0:0:16:0:39,5:71,31:0:0 chr4 9784631 . C T 76.37 PASS AO=22;DP=57;FAO=22;FDP=57;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=-0.0210321;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=200.358;QD=5.35933;RBI=0.0241735;REFB=-0.0242077;REVB=-0.0119167;RO=34;SAF=10;SAR=12;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109617;STB=0.571364;TYPE=snp;VARB=0.035868;OID=.;OPOS=9784631;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:57:57:34:35:22:22:12:10:19:15:12:10:20:15 chr4 9785134 . T C 187.84 PASS AO=51;DP=121;FAO=52;FDP=122;FR=.;FRO=70;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=32;FSRR=38;FWDB=-0.0162524;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.061;QD=6.15863;RBI=0.016752;REFB=-0.0297853;REVB=-0.00406033;RO=69;SAF=22;SAR=29;SRF=32;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0336248;STB=0.51989;TYPE=snp;VARB=0.0400532;OID=.;OPOS=9785134;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:122:69:70:51:52:29:22:32:37:30:22:32:38 chr4 9785265 . G T 153.13 PASS AO=47;DP=123;FAO=47;FDP=122;FR=.;FRO=75;FSAF=7;FSAR=40;FSRF=38;FSRR=37;FWDB=-0.0147761;FXX=0.0161277;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.786;QD=5.02057;RBI=0.0166777;REFB=-0.0017627;REVB=-0.0077339;RO=74;SAF=7;SAR=40;SRF=37;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.460304;STB=0.769429;TYPE=snp;VARB=0.00270156;OID=.;OPOS=9785265;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:122:74:75:47:47:40:7:37:37:40:7:38:37 chr4 9922130 . C T 233.4 PASS AO=42;DP=69;FAO=42;FDP=68;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.0574239;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.4447;QD=13.7291;RBI=0.0639425;REFB=-0.0297473;REVB=0.0281273;RO=26;SAF=14;SAR=28;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178812;STB=0.59789;TYPE=snp;VARB=0.0198771;OID=.;OPOS=9922130;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:69:68:26:26:42:42:28:14:15:11:28:14:15:11 chr4 9982330 . A G 343.58 PASS AO=37;DP=38;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0483564;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.5294;QD=35.2386;RBI=0.0803688;REFB=0.00782602;REVB=-0.0641935;RO=0;SAF=16;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.7558e-08;STB=0.511622;TYPE=snp;VARB=-0.000417197;OID=.;OPOS=9982330;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:38:39:0:1:37:38:21:16:0:0:21:17:0:1 chr4 9987324 . G A 143.49 PASS AO=40;DP=96;FAO=40;FDP=96;FR=.;FRO=56;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=39;FSRR=17;FWDB=0.0148007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.4454;QD=5.97877;RBI=0.014986;REFB=0.00566981;REVB=0.00234913;RO=56;SAF=14;SAR=26;SRF=39;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.348656;STB=0.695866;TYPE=snp;VARB=-0.0078475;OID=.;OPOS=9987324;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:56:56:40:40:26:14:39:17:26:14:39:17 chr4 9998440 . C T 329.66 PASS AO=84;DP=183;FAO=84;FDP=182;FR=.;FRO=98;FSAF=55;FSAR=29;FSRF=63;FSRR=35;FWDB=0.00401005;FXX=0.00546418;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.171;QD=7.24532;RBI=0.0113262;REFB=-0.000689616;REVB=-0.0105926;RO=98;SAF=55;SAR=29;SRF=63;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0127331;STB=0.507057;TYPE=snp;VARB=0.000549367;OID=.;OPOS=9998440;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:182:98:98:84:84:29:55:63:35:29:55:63:35 chr4 9998493 . A G 2302.33 PASS AO=245;DP=248;FAO=245;FDP=245;FR=.;FRO=0;FSAF=138;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00512553;FXX=0.0120963;HRUN=3;LEN=1;MLLD=182.596;QD=37.589;RBI=0.0209478;REFB=-0.0539852;REVB=0.0203111;RO=3;SAF=138;SAR=107;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00242358;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000288209;OID=.;OPOS=9998493;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:248:245:3:0:245:245:107:138:2:1:107:138:0:0 chr4 10022981 . C T 72.88 PASS AO=18;DP=42;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=-0.0234281;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=121.096;QD=6.94141;RBI=0.0267481;REFB=-0.0199293;REVB=0.0129068;RO=22;SAF=6;SAR=12;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.330109;STB=0.707471;TYPE=snp;VARB=0.0122622;OID=.;OPOS=10022981;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:42:42:22:24:18:18:12:6:15:7:12:6:17:7 chr4 10090178 . T C 1570.88 PASS AO=167;DP=170;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0117263;FXX=0.0232545;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.813;QD=37.4018;RBI=0.0125574;REFB=0.0298792;REVB=0.00449239;RO=2;SAF=64;SAR=103;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00915078;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.26973e-05;OID=.;OPOS=10090178;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:170:168:2:0:167:168:103:64:0:2:104:64:0:0 chr4 10099340 . T C 1485.22 PASS AO=161;DP=166;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00799097;FXX=0.0240949;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.796;QD=36.6722;RBI=0.00799118;REFB=0.0537042;REVB=-5.78727e-05;RO=3;SAF=82;SAR=79;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170868;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.39439e-05;OID=.;OPOS=10099340;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:166:162:3:0:161:162:79:82:3:0:80:82:0:0 chr4 10442602 . C CTACTT 366.08 PASS AO=76;DP=161;FAO=81;FDP=156;FR=.;FRO=75;FSAF=44;FSAR=37;FSRF=55;FSRR=20;FWDB=-0.00611313;FXX=0.0188667;HRUN=1;LEN=5;MLLD=248.477;QD=9.38661;RBI=0.0471173;REFB=-0.0263653;REVB=0.0467191;RO=76;SAF=43;SAR=33;SRF=54;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136862;STB=0.593561;TYPE=ins;VARB=0.0244133;OID=.;OPOS=10442603;OREF=-;OALT=TACTT;OMAPALT=CTACTT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:76:161:81:156:75:44:37:55:20:99:76:43:33:54:22 chr4 10442700 . C T 351.77 PASS AO=103;DP=248;FAO=103;FDP=248;FR=.;FRO=145;FSAF=52;FSAR=51;FSRF=67;FSRR=78;FWDB=-0.025328;FXX=0.0040159;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1879;QD=5.67376;RBI=0.0295214;REFB=0.000570231;REVB=0.0151658;RO=143;SAF=52;SAR=51;SRF=66;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0450952;STB=0.525001;TYPE=snp;VARB=-0.000939094;OID=.;OPOS=10442700;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:248:248:143:145:103:103:51:52:66:77:51:52:67:78 chr4 10446385 . C T 1605.24 PASS AO=167;DP=167;FAO=167;FDP=167;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0312578;FXX=0.00595203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.542;QD=38.4488;RBI=0.033424;REFB=0;REVB=0.0118371;RO=0;SAF=78;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.04195e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.85918e-05;OID=.;OPOS=10446385;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:167:167:0:0:167:167:89:78:0:0:89:78:0:0 chr4 10446906 . A G 895.19 PASS AO=93;DP=93;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0874458;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.389;QD=38.0933;RBI=0.0896339;REFB=0;REVB=0.019684;RO=0;SAF=30;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.52795e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000246335;OID=.;OPOS=10446906;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:93:94:0:0:93:94:63:30:0:0:63:31:0:0 chr4 10447640 . A G 127.84 PASS AO=36;DP=100;FAO=43;FDP=107;FR=.;FRO=64;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=31;FSRR=33;FWDB=-0.00558622;FXX=0.0092584;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.3756;QD=4.77892;RBI=0.0208827;REFB=-0.041982;REVB=0.0201216;RO=64;SAF=19;SAR=17;SRF=32;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0309815;STB=0.525612;TYPE=snp;VARB=0.0680675;OID=.;OPOS=10447640;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:107:64:64:36:43:17:19:32:32:24:19:31:33 chr4 10447985 . AT A 209.16 PASS AO=58;DP=112;FAO=64;FDP=117;FR=.;FRO=53;FSAF=18;FSAR=46;FSRF=19;FSRR=34;FWDB=-0.106068;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=25.3231;QD=7.1509;RBI=0.10835;REFB=0.011547;REVB=0.022119;RO=52;SAF=14;SAR=44;SRF=18;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114335;STB=0.54168;TYPE=del;VARB=-0.012516;OID=.;OPOS=10447986;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:58:112:64:117:53:18:46:19:34:99:52:14:44:18:34 chr4 10502937 . T G 832.15 PASS AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.010378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.7252;QD=38.2595;RBI=0.0436642;REFB=0;REVB=-0.0424129;RO=0;SAF=64;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000158725;OID=.;OPOS=10502937;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:87:87:0:0:87:87:23:64:0:0:23:64:0:0 chr4 10599670 . G T 98.32 PASS AO=42;DP=159;FAO=47;FDP=163;FR=.;FRO=116;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=77;FSRR=39;FWDB=-0.00777304;FXX=0.0121205;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.629;QD=2.41285;RBI=0.019779;REFB=-0.00162135;REVB=0.0181876;RO=107;SAF=26;SAR=16;SRF=70;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0460331;STB=0.551236;TYPE=snp;VARB=0.00378707;OID=.;OPOS=10599670;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:159:163:107:116:42:47:16:26:70:37:19:28:77:39 chr4 10669522 . A C 1926.17 PASS AO=121;DP=212;FAO=203;FDP=203;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=122;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00841988;FXX=0.00975562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.349;QD=37.954;RBI=0.021567;REFB=-0.0409108;REVB=0.0198555;RO=0;SAF=34;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.55146e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.21073e-05;OID=.;OPOS=10669522;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:123:203:0:0:121:203:87:34:0:0:122:81:0:0 chr4 13545743 . TC T 72.99 PASS AO=6;DP=9;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.294529;FXX=0.110988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=20.0109;QD=36.4952;RBI=0.294529;REFB=0;REVB=0;RO=2;SAF=6;SAR=0;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0458362;OID=.;OPOS=13545744;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:6:9:8:8:0:8:0:0:0:3:2:6:0:2:0 chr4 13548796 . T G 254.96 PASS AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0793759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.751;QD=37.7713;RBI=0.0956057;REFB=0;REVB=0.0532907;RO=0;SAF=17;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000377925;OID=.;OPOS=13548796;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:27:27:0:0:27:27:10:17:0:0:10:17:0:0 chr4 13606576 . A T 1859.03 PASS AO=223;DP=240;FAO=221;FDP=240;FR=.;FRO=19;FSAF=115;FSAR=106;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=0.0421513;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.1996;QD=30.9839;RBI=0.0429728;REFB=-0.0441853;REVB=0.00836228;RO=15;SAF=117;SAR=106;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0250943;STB=0.517189;TYPE=snp;VARB=0.0329275;OID=.;OPOS=13606576;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:240:240:15:19:223:221:106:117:11:4:106:115:14:5 chr4 15482360 . C T 311.59 PASS AO=83;DP=186;FAO=83;FDP=186;FR=.;FRO=103;FSAF=27;FSAR=56;FSRF=29;FSRR=74;FWDB=-0.0069132;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.464;QD=6.70095;RBI=0.0134112;REFB=-0.00625218;REVB=-0.0114921;RO=102;SAF=27;SAR=56;SRF=28;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0588778;STB=0.528131;TYPE=snp;VARB=0.0085927;OID=.;OPOS=15482360;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:186:102:103:83:83:56:27:28:74:56:27:29:74 chr4 15518357 . A C 269.4 PASS AO=63;DP=129;FAO=63;FDP=128;FR=.;FRO=65;FSAF=26;FSAR=37;FSRF=19;FSRR=46;FWDB=0.0454141;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.937;QD=8.41876;RBI=0.0467523;REFB=-0.0156716;REVB=-0.0111059;RO=64;SAF=26;SAR=37;SRF=19;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111728;STB=0.564458;TYPE=snp;VARB=0.0235041;OID=.;OPOS=15518357;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:128:64:65:63:63:37:26:19:45:37:26:19:46 chr4 15539730 . G A 51.27 PASS AO=20;DP=71;FAO=21;FDP=71;FR=.;FRO=50;FSAF=1;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=40;FWDB=0.0755713;FXX=0.0273935;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.7263;QD=2.88853;RBI=0.0802888;REFB=-0.0142052;REVB=0.027116;RO=50;SAF=1;SAR=19;SRF=10;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.438676;STB=0.785334;TYPE=snp;VARB=0.0510086;OID=.;OPOS=15539730;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:71:71:50:50:20:21:19:1:10:40:20:1:10:40 chr4 15689632 . G A 293.87 PASS AO=73;DP=153;FAO=73;FDP=155;FR=.;FRO=82;FSAF=33;FSAR=40;FSRF=38;FSRR=44;FWDB=-0.0473177;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.4081;QD=7.58374;RBI=0.048624;REFB=-0.0189174;REVB=0.0111949;RO=80;SAF=33;SAR=40;SRF=36;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00196053;STB=0.506057;TYPE=snp;VARB=0.0201634;OID=.;OPOS=15689632;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:155:80:82:73:73:40:33:36:44:40:33:38:44 chr4 15690233 . C A 811.06 PASS AO=75;DP=75;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00992281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.425;QD=37.7235;RBI=0.0269845;REFB=0;REVB=0.0250939;RO=0;SAF=36;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6999e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.23677e-05;OID=.;OPOS=15690233;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:75:86:0:0:75:86:39:36:0:0:47:39:0:0 chr4 15733454 . A C 362.44 PASS AO=108;DP=263;FAO=108;FDP=263;FR=.;FRO=155;FSAF=54;FSAR=54;FSRF=88;FSRR=67;FWDB=-0.0180662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.683;QD=5.51241;RBI=0.040453;REFB=0.00444425;REVB=-0.0361947;RO=155;SAF=54;SAR=54;SRF=88;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.07145;STB=0.539917;TYPE=snp;VARB=-0.00658457;OID=.;OPOS=15733454;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:263:263:155:155:108:108:54:54:88:67:54:54:88:67 chr4 15739390 . T G 168.71 PASS AO=48;DP=116;FAO=48;FDP=116;FR=.;FRO=68;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=41;FSRR=27;FWDB=-0.008587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.088;QD=5.81758;RBI=0.0106151;REFB=0.00323759;REVB=0.00624044;RO=68;SAF=25;SAR=23;SRF=41;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0860547;STB=0.548391;TYPE=snp;VARB=-0.0046098;OID=.;OPOS=15739390;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:68:68:48:48:23:25:41:27:23:25:41:27 chr4 15739428 . A T 92.12 PASS AO=34;DP=111;FAO=36;FDP=113;FR=.;FRO=77;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=42;FSRR=35;FWDB=-0.0198855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.435;QD=3.26095;RBI=0.0334008;REFB=0.00390873;REVB=-0.0268363;RO=77;SAF=18;SAR=16;SRF=42;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0190821;STB=0.506954;TYPE=snp;VARB=-0.00380613;OID=.;OPOS=15739428;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:111:113:77:77:34:36:16:18:42:35:16:20:42:35 chr4 15937731 . T C 2059.53 PASS AO=138;DP=226;FAO=222;FDP=224;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=139;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.177888;FXX=0.0175431;HRUN=3;LEN=1;MLLD=33.1832;QD=36.7773;RBI=0.181283;REFB=0;REVB=0.0349223;RO=2;SAF=59;SAR=79;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00200958;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00444529;OID=.;OPOS=15937731;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:223:224:2:0:138:222:79:59:1:1:83:139:0:0 chr4 15964485 . G A 52.85 PASS AO=8;DP=12;FAO=8;FDP=12;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.00616107;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.039;QD=17.6151;RBI=0.0354007;REFB=0.010003;REVB=0.0348604;RO=4;SAF=3;SAR=5;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215906;STB=0.624687;TYPE=snp;VARB=-0.00319116;OID=.;OPOS=15964485;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:12:12:4:4:8:8:5:3:3:1:5:3:3:1 chr4 15964501 . G A 14.03 PASS AO=3;DP=15;FAO=4;FDP=16;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.0219567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.9009;QD=3.50798;RBI=0.0553105;REFB=0.00653101;REVB=0.0507657;RO=12;SAF=2;SAR=1;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.267894;STB=0.562193;TYPE=snp;VARB=-0.00818534;OID=.;OPOS=15964501;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:15:16:12:12:3:4:1:2:5:7:2:2:5:7 chr4 15964573 . A G 584.23 PASS AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00422554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.499;QD=37.6924;RBI=0.0720102;REFB=0;REVB=-0.0718862;RO=0;SAF=47;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000299837;OID=.;OPOS=15964573;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:62:62:0:0:62:62:15:47:0:0:15:47:0:0 chr4 15964763 . C T 101.58 PASS AO=27;DP=64;FAO=27;FDP=64;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=0.00789135;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.618;QD=6.349;RBI=0.0101616;REFB=-0.0100915;REVB=0.00640187;RO=37;SAF=17;SAR=10;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201908;STB=0.61485;TYPE=snp;VARB=0.0112124;OID=.;OPOS=15964763;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:37:37:27:27:10:17:16:21:10:17:16:21 chr4 15977823 . A C 178.26 PASS AO=52;DP=128;FAO=52;FDP=128;FR=.;FRO=76;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=30;FSRR=46;FWDB=-0.0205124;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=268.969;QD=5.57054;RBI=0.0222021;REFB=-0.0118778;REVB=-0.00849573;RO=72;SAF=27;SAR=25;SRF=30;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105746;STB=0.573581;TYPE=snp;VARB=0.0188348;OID=.;OPOS=15977823;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:72:76:52:52:25:27:30:42:25:27:30:46 chr4 15977828 . C G 213.27 PASS AO=56;DP=128;FAO=56;FDP=126;FR=.;FRO=70;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=30;FSRR=40;FWDB=0.00366271;FXX=0.0156238;HRUN=3;LEN=1;MLLD=106.175;QD=6.77047;RBI=0.0125007;REFB=-0.00207274;REVB=0.0119521;RO=70;SAF=25;SAR=31;SRF=30;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0180157;STB=0.510054;TYPE=snp;VARB=0.00275597;OID=.;OPOS=15977828;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:126:70:70:56:56:31:25:30:40:31:25:30:40 chr4 16037352 . C T 421.07 PASS AO=92;DP=182;FAO=94;FDP=181;FR=.;FRO=87;FSAF=47;FSAR=47;FSRF=42;FSRR=45;FWDB=0.0250181;FXX=0.0054942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.891;QD=9.30544;RBI=0.0275863;REFB=-0.019492;REVB=0.0116232;RO=87;SAF=47;SAR=45;SRF=41;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0350733;STB=0.508286;TYPE=snp;VARB=0.0175463;OID=.;OPOS=16037352;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:181:87:87:92:94:45:47:41:46:47:47:42:45 chr4 16675898 . C A 404.42 PASS AO=46;DP=49;FAO=46;FDP=49;FR=.;FRO=3;FSAF=39;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0128444;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=195.217;QD=33.0135;RBI=0.0311665;REFB=-0.0875364;REVB=0.0283967;RO=2;SAF=39;SAR=7;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116844;STB=0.556234;TYPE=snp;VARB=0.00099452;OID=.;OPOS=16675898;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:49:49:2:3:46:46:7:39:0:2:7:39:1:2 chr4 17488286 . T G 736.15 PASS AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.01163;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.493;QD=38.2415;RBI=0.0226312;REFB=0;REVB=0.0194143;RO=0;SAF=36;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.52206e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000302684;OID=.;OPOS=17488286;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:77:77:0:0:77:77:41:36:0:0:41:36:0:0 chr4 17503382 . C T 81.53 PASS AO=20;DP=50;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=0.03407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.257;QD=6.15323;RBI=0.0350659;REFB=-0.0436282;REVB=-0.00829774;RO=28;SAF=14;SAR=6;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.348157;STB=0.678773;TYPE=snp;VARB=0.0635263;OID=.;OPOS=17503382;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:50:53:28:31:20:22:6:14:10:18:8:14:10:21 chr4 17513582 . G A 22.3 PASS AO=4;DP=9;FAO=4;FDP=9;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=239.977;QD=9.91247;RBI=0.0181139;REFB=-0.0125881;REVB=0.0181139;RO=5;SAF=0;SAR=4;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0243271;OID=.;OPOS=17513582;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:9:9:5:5:4:4:4:0:0:5:4:0:0:5 chr4 17517099 . A G 347.44 PASS AO=49;DP=55;FAO=47;FDP=55;FR=.;FRO=8;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=-0.0421728;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.2173;QD=25.2687;RBI=0.066693;REFB=-0.0234674;REVB=0.0516663;RO=6;SAF=24;SAR=25;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0701641;STB=0.579966;TYPE=snp;VARB=0.00328898;OID=.;OPOS=17517099;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:55:55:6:8:49:47:25:24:5:1:26:21:8:0 chr4 17528463 . G A 250.03 PASS AO=49;DP=86;FAO=49;FDP=85;FR=.;FRO=36;FSAF=39;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=13;FWDB=0.0254458;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.113;QD=11.7659;RBI=0.0498658;REFB=-0.0197017;REVB=0.0428848;RO=35;SAF=39;SAR=10;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172728;STB=0.591258;TYPE=snp;VARB=0.0147441;OID=.;OPOS=17528463;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:85:35:36:49:49:10:39:22:13:10:39:23:13 chr4 17528570 . G C 553.12 PASS AO=116;DP=247;FAO=128;FDP=252;FR=.;FRO=124;FSAF=66;FSAR=62;FSRF=55;FSRR=69;FWDB=-0.0375658;FXX=0.0117642;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.1985;QD=8.77968;RBI=0.0380913;REFB=0.00216609;REVB=0.00630506;RO=102;SAF=62;SAR=54;SRF=48;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0547614;STB=0.535417;TYPE=snp;VARB=-0.00290713;OID=.;OPOS=17528570;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:247:252:102:124:116:128:54:62:48:54:62:66:55:69 chr4 17530585 . C T 382.89 PASS AO=98;DP=212;FAO=98;FDP=212;FR=.;FRO=114;FSAF=55;FSAR=43;FSRF=49;FSRR=65;FWDB=0.000555513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.853;QD=7.22435;RBI=0.0395463;REFB=-0.0148637;REVB=-0.0395424;RO=114;SAF=55;SAR=43;SRF=49;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127431;STB=0.570481;TYPE=snp;VARB=0.0115923;OID=.;OPOS=17530585;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:212:114:114:98:98:43:55:49:65:43:55:49:65 chr4 17586703 . T C 261.71 PASS AO=65;DP=138;FAO=65;FDP=138;FR=.;FRO=73;FSAF=24;FSAR=41;FSRF=24;FSRR=49;FWDB=-0.0202813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.161;QD=7.58567;RBI=0.0211392;REFB=-0.0213626;REVB=-0.00596116;RO=72;SAF=24;SAR=41;SRF=24;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0369781;STB=0.523249;TYPE=snp;VARB=0.0200875;OID=.;OPOS=17586703;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:72:73:65:65:41:24:24:48:41:24:24:49 chr4 17627294 . A G 220.25 PASS AO=58;DP=131;FAO=58;FDP=131;FR=.;FRO=73;FSAF=36;FSAR=22;FSRF=49;FSRR=24;FWDB=-0.0154847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.815;QD=6.72525;RBI=0.0155191;REFB=-0.00256617;REVB=-0.0010336;RO=72;SAF=36;SAR=22;SRF=49;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0643387;STB=0.530336;TYPE=snp;VARB=0.00299821;OID=.;OPOS=17627294;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:72:73:58:58:22:36:49:23:22:36:49:24 chr4 17627332 . T C 97.3 PASS AO=33;DP=94;FAO=33;FDP=94;FR=.;FRO=61;FSAF=27;FSAR=6;FSRF=44;FSRR=17;FWDB=-0.00947862;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=250.81;QD=4.14023;RBI=0.0257305;REFB=-0.0115717;REVB=-0.023921;RO=61;SAF=27;SAR=6;SRF=44;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159363;STB=0.593061;TYPE=snp;VARB=0.0177565;OID=.;OPOS=17627332;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:94:94:61:61:33:33:6:27:44:17:6:27:44:17 chr4 17634213 . A G 1874.23 PASS AO=189;DP=190;FAO=196;FDP=196;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.1211;QD=38.2496;RBI=0.0452634;REFB=0;REVB=-0.0422682;RO=0;SAF=89;SAR=100;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000120101;OID=.;OPOS=17634213;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:89:190:196:0:0:189:196:100:89:0:0:103:93:0:0 chr4 17660082 . C T 165.11 PASS AO=42;DP=93;FAO=42;FDP=93;FR=.;FRO=51;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=22;FSRR=29;FWDB=0.00132266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.9883;QD=7.10146;RBI=0.00677817;REFB=-0.0241157;REVB=-0.00664787;RO=51;SAF=16;SAR=26;SRF=22;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0515652;STB=0.528894;TYPE=snp;VARB=0.0188702;OID=.;OPOS=17660082;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:51:51:42:42:26:16:22:29:26:16:22:29 chr4 17694943 . A G 381.96 PASS AO=77;DP=136;FAO=78;FDP=138;FR=.;FRO=60;FSAF=35;FSAR=43;FSRF=23;FSRR=37;FWDB=-0.0372388;FXX=0.00719373;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.7123;QD=11.0714;RBI=0.05723;REFB=0.00870416;REVB=-0.0434574;RO=59;SAF=34;SAR=43;SRF=22;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0558239;STB=0.528893;TYPE=snp;VARB=-0.00732503;OID=.;OPOS=17694943;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:138:59:60:77:78:43:34:22:37:43:35:23:37 chr4 17711076 . T C 366.48 PASS AO=71;DP=72;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0164158;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=204.799;QD=35.7546;RBI=0.0199114;REFB=-0.08869;REVB=0.0112689;RO=1;SAF=12;SAR=59;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00794925;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000309511;OID=.;OPOS=17711076;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:72:41:1:0:71:41:59:12:0:1:31:10:0:0 chr4 17818885 . T C 1675.49 PASS AO=174;DP=176;FAO=176;FDP=176;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0341852;FXX=0.0112353;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.778;QD=38.0793;RBI=0.0581047;REFB=-0.0723843;REVB=0.0469844;RO=0;SAF=88;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000171506;OID=.;OPOS=17818885;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:176:176:0:0:174:176:86:88:0:0:88:88:0:0 chr4 17847181 . TAA TA,T 200.71 PASS AO=22,9;DP=45;FAO=33,5;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=13,1;FSAR=20,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.266187,0.144425;FXX=0.136333;HRUN=8,8;LEN=1,2;MLLD=10.8117,10.4513;QD=21.1273;RBI=0.347867,0.184333;REFB=0,0;REVB=-0.223955,-0.114542;RO=3;SAF=7,3;SAR=15,6;SRF=3;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.161939,-0.292304;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=-0.0747665,0.100142;OID=.,.;OPOS=17847182,17847182;OREF=A,AA;OALT=-,-;OMAPALT=TA,T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:22,9:40:33,5:38:0:13,1:20,4:0:0:3:3:7,3:15,6:3:0 chr4 20520993 . T C 843.38 PASS AO=100;DP=118;FAO=100;FDP=109;FR=.;FRO=9;FSAF=54;FSAR=46;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=-0.0136344;FXX=0.0762647;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.7362;QD=30.9498;RBI=0.0136402;REFB=0.0143149;REVB=-0.000398846;RO=8;SAF=54;SAR=46;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0296969;STB=0.519818;TYPE=snp;VARB=-0.0151777;OID=.;OPOS=20520993;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:118:109:8:9:100:100:46:54:6:2:46:54:7:2 chr4 20544184 . C T 982.4 PASS AO=281;DP=514;FAO=214;FDP=399;FR=.;FRO=185;FSAF=104;FSAR=110;FSRF=115;FSRR=70;FWDB=0.0785725;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.4046;QD=9.84859;RBI=0.0796952;REFB=-0.0026399;REVB=-0.0133296;RO=233;SAF=136;SAR=145;SRF=141;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10096;STB=0.562713;TYPE=snp;VARB=0.00192413;OID=.;OPOS=20544184;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:514:399:233:185:281:214:145:136:141:92:110:104:115:70 chr4 20618776 . GGCC GC,G 160.04 PASS AO=9,5;DP=26;FAO=26,0;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=14,0;FSAR=12,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000479335,-0.0999041;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=2,3;MLLD=20.7069,14.0468;QD=24.621;RBI=0.222732,0.21;REFB=-0.11304,-0.113787;REVB=0.222731,0.184714;RO=3;SAF=0,5;SAR=9,0;SRF=0;SRR=3;SSEN=0.445161,0.445161;SSEP=0,0;SSSB=0,0.794084;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.0466681,0;OID=.,.;OPOS=20618777,20618777;OREF=GC,GCC;OALT=-,-;OMAPALT=GC,G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:9,5:25:26,0:26:0:14,0:12,0:0:0:12:3:0,5:9,0:0:3 chr4 20733708 . C CA 117.78 PASS AO=43;DP=114;FAO=61;FDP=107;FR=.;FRO=46;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=0.128742;FXX=0.0272702;HRUN=5;LEN=1;MLLD=9.1449;QD=4.40287;RBI=0.346813;REFB=-0.0660766;REVB=-0.322032;RO=50;SAF=19;SAR=24;SRF=29;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132529;STB=0.522465;TYPE=ins;VARB=0.0333523;OID=.;OPOS=20733709;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:43:114:61:107:46:27:34:18:28:61:50:19:24:29:21 chr4 20751278 . A G 176.99 PASS AO=51;DP=128;FAO=52;FDP=129;FR=.;FRO=77;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=40;FSRR=37;FWDB=0.00798095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.573;QD=5.4879;RBI=0.0209782;REFB=-0.00658507;REVB=0.0194008;RO=76;SAF=26;SAR=25;SRF=40;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0175166;STB=0.500149;TYPE=snp;VARB=0.00940443;OID=.;OPOS=20751278;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:129:76:77:51:52:25:26:40:36:25:27:40:37 chr4 20852166 . A G 1103.8 PASS AO=115;DP=117;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00490892;FXX=0.0168053;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.537;QD=37.7369;RBI=0.0275592;REFB=-0.0273435;REVB=0.0271185;RO=1;SAF=60;SAR=55;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00855602;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000214641;OID=.;OPOS=20852166;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:117:117:1:0:115:117:55:60:0:1:57:60:0:0 chr4 20852244 . A G 1364.81 PASS AO=129;DP=129;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0378386;FXX=0.00689608;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.905;QD=37.9114;RBI=0.0380547;REFB=0;REVB=-0.00405046;RO=0;SAF=65;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.05633e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000427974;OID=.;OPOS=20852244;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:129:144:0:0:129:144:64:65:0:0:74:70:0:0 chr4 21950259 . A G 1015.98 PASS AO=78;DP=111;FAO=110;FDP=110;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=20;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0946714;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.607;QD=36.9447;RBI=0.114261;REFB=0;REVB=0.0639755;RO=0;SAF=16;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00628462;OID=.;OPOS=21950259;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:106:110:0:0:78:110:62:16:0:0:90:20:0:0 chr4 22416195 . C G 262.26 PASS AO=67;DP=146;FAO=67;FDP=146;FR=.;FRO=79;FSAF=39;FSAR=28;FSRF=28;FSRR=51;FWDB=-0.00198815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.5962;QD=7.18511;RBI=0.00603904;REFB=-0.0166618;REVB=0.0057024;RO=79;SAF=39;SAR=28;SRF=28;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219196;STB=0.62151;TYPE=snp;VARB=0.0134729;OID=.;OPOS=22416195;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:79:79:67:67:28:39:28:51:28:39:28:51 chr4 22439914 . A C 2881.57 PASS AO=306;DP=310;FAO=306;FDP=306;FR=.;FRO=0;FSAF=150;FSAR=156;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176442;FXX=0.0160767;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.691;QD=37.6676;RBI=0.037197;REFB=-0.163824;REVB=0.032746;RO=1;SAF=150;SAR=156;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00316923;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000299474;OID=.;OPOS=22439914;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:310:306:1:0:306:306:156:150:1:0:156:150:0:0 chr4 22444692 . C T 435.34 PASS AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106387;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.56;QD=37.8552;RBI=0.0301879;REFB=0;REVB=0.0282511;RO=0;SAF=22;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000142147;OID=.;OPOS=22444692;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:46:46:0:0:46:46:24:22:0:0:24:22:0:0 chr4 22457478 . C T 2532.44 PASS AO=270;DP=272;FAO=269;FDP=269;FR=.;FRO=0;FSAF=127;FSAR=142;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0178804;FXX=0.011029;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.9493;QD=37.657;RBI=0.0604288;REFB=0.0418406;REVB=-0.0577229;RO=2;SAF=127;SAR=143;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00662124;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000928309;OID=.;OPOS=22457478;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:272:269:2:0:270:269:143:127:0:2:142:127:0:0 chr4 22820504 . A T 1626.08 PASS AO=177;DP=181;FAO=177;FDP=177;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00969436;FXX=0.0220982;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.579;QD=36.7475;RBI=0.0126539;REFB=0.0512032;REVB=-0.00813269;RO=3;SAF=90;SAR=87;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00501986;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.03853e-05;OID=.;OPOS=22820504;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:181:177:3:0:177:177:87:90:2:1:87:90:0:0 chr4 23815522 . C T 408.99 PASS AO=114;DP=263;FAO=114;FDP=263;FR=.;FRO=149;FSAF=37;FSAR=77;FSRF=45;FSRR=104;FWDB=0.0105083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.207;QD=6.22039;RBI=0.010606;REFB=-0.0167655;REVB=-0.00143594;RO=147;SAF=37;SAR=77;SRF=45;SRR=102;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0215126;STB=0.514716;TYPE=snp;VARB=0.0197669;OID=.;OPOS=23815522;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:263:263:147:149:114:114:77:37:45:102:77:37:45:104 chr4 23815662 . C T 423.5 PASS AO=98;DP=194;FAO=98;FDP=194;FR=.;FRO=96;FSAF=43;FSAR=55;FSRF=51;FSRR=45;FWDB=0.0112985;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.278;QD=8.73188;RBI=0.0546722;REFB=-0.00346163;REVB=0.053492;RO=96;SAF=43;SAR=55;SRF=51;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0836226;STB=0.545925;TYPE=snp;VARB=0.00321759;OID=.;OPOS=23815662;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:194:96:96:98:98:55:43:51:45:55:43:51:45 chr4 23815681 . G A 367.79 PASS AO=94;DP=203;FAO=94;FDP=203;FR=.;FRO=109;FSAF=44;FSAR=50;FSRF=54;FSRR=55;FWDB=0.00167146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.758;QD=7.24707;RBI=0.0629197;REFB=0.0028522;REVB=0.0628975;RO=109;SAF=44;SAR=50;SRF=54;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0265693;STB=0.514703;TYPE=snp;VARB=-0.00161291;OID=.;OPOS=23815681;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:203:109:109:94:94:50:44:54:55:50:44:54:55 chr4 23815924 . T C 322.81 PASS AO=92;DP=222;FAO=93;FDP=221;FR=.;FRO=128;FSAF=44;FSAR=49;FSRF=60;FSRR=68;FWDB=0.00346224;FXX=0.0045043;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.408;QD=5.84265;RBI=0.00519099;REFB=-0.0074601;REVB=0.00386772;RO=127;SAF=44;SAR=48;SRF=59;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0142557;STB=0.502538;TYPE=snp;VARB=0.00908746;OID=.;OPOS=23815924;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:221:127:128:92:93:48:44:59:68:49:44:60:68 chr4 23886323 . G T 117.44 PASS AO=43;DP=125;FAO=43;FDP=127;FR=.;FRO=84;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=47;FSRR=37;FWDB=0.00778361;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=219.901;QD=3.69876;RBI=0.0201802;REFB=-0.000174971;REVB=0.0186187;RO=82;SAF=23;SAR=20;SRF=46;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.029971;STB=0.516407;TYPE=snp;VARB=0.000391472;OID=.;OPOS=23886323;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:127:82:84:43:43:20:23:46:36:20:23:47:37 chr4 24801976 . T C 83.5 PASS AO=24;DP=62;FAO=24;FDP=62;FR=.;FRO=38;FSAF=23;FSAR=1;FSRF=25;FSRR=13;FWDB=-0.00834188;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=156.765;QD=5.38716;RBI=0.00836208;REFB=-0.000276264;REVB=-0.000580969;RO=38;SAF=23;SAR=1;SRF=25;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.61093;STB=0.869836;TYPE=snp;VARB=0.000399984;OID=.;OPOS=24801976;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:62:62:38:38:24:24:1:23:25:13:1:23:25:13 chr4 24802323 . G C 195.58 PASS AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0265297;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=190.329;QD=39.1165;RBI=0.028872;REFB=0;REVB=0.0113915;RO=0;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0487e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.11747e-05;OID=.;OPOS=24802323;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:20:20:0:0:20:20:9:11:0:0:9:11:0:0 chr4 25253995 . C T 1803.65 PASS AO=190;DP=194;FAO=191;FDP=191;FR=.;FRO=0;FSAF=124;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0414643;FXX=0.0154631;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.158;QD=37.7728;RBI=0.0493694;REFB=-0.0793504;REVB=0.0267964;RO=1;SAF=123;SAR=67;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00705395;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000263216;OID=.;OPOS=25253995;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:194:191:1:0:190:191:67:123:0:1:67:124:0:0 chr4 25278988 . T C 547.15 PASS AO=112;DP=200;FAO=114;FDP=205;FR=.;FRO=91;FSAF=48;FSAR=66;FSRF=31;FSRR=60;FWDB=0.00316977;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.8732;QD=10.6761;RBI=0.00323679;REFB=-0.0350385;REVB=0.000655284;RO=88;SAF=48;SAR=64;SRF=29;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0829187;STB=0.537021;TYPE=snp;VARB=0.0298754;OID=.;OPOS=25278988;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:200:205:88:91:112:114:64:48:29:59:66:48:31:60 chr4 25363901 . T A 520.64 PASS AO=124;DP=251;FAO=124;FDP=251;FR=.;FRO=127;FSAF=51;FSAR=73;FSRF=42;FSRR=85;FWDB=0.0324229;FXX=0.0039681;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9761;QD=8.29707;RBI=0.0439019;REFB=-0.0349359;REVB=0.0295995;RO=126;SAF=51;SAR=73;SRF=41;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0828862;STB=0.542729;TYPE=snp;VARB=0.0362689;OID=.;OPOS=25363901;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:251:251:126:127:124:124:73:51:41:85:73:51:42:85 chr4 25396001 . TAAACTC T 69.92 PASS AO=39;DP=143;FAO=41;FDP=115;FR=.;FRO=74;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=33;FSRR=41;FWDB=-0.0186296;FXX=0.172649;HRUN=3;LEN=6;MLLD=209.567;QD=2.43186;RBI=0.0187679;REFB=-0.0036828;REVB=-0.00227412;RO=66;SAF=25;SAR=14;SRF=33;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15942;STB=0.605558;TYPE=del;VARB=0.00660407;OID=.;OPOS=25396002;OREF=AAACTC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:39:113:41:115:74:25:16:33:41:69:66:25:14:33:33 chr4 25419283 . T C 474.39 PASS AO=122;DP=283;FAO=122;FDP=262;FR=.;FRO=140;FSAF=80;FSAR=42;FSRF=78;FSRR=62;FWDB=-0.0462094;FXX=0.0742023;HRUN=4;LEN=1;MLLD=94.7697;QD=7.24253;RBI=0.0501894;REFB=-0.019985;REVB=-0.0195875;RO=138;SAF=80;SAR=42;SRF=76;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107482;STB=0.556289;TYPE=snp;VARB=0.0322234;OID=.;OPOS=25419283;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:283:262:138:140:122:122:42:80:76:62:42:80:78:62 chr4 25678199 . A G 423.67 PASS AO=44;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00652329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.6241;QD=37.6595;RBI=0.0254441;REFB=0;REVB=0.0245936;RO=0;SAF=31;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000239147;OID=.;OPOS=25678199;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:45:45:0:0:44:45:13:31:0:0:13:32:0:0 chr4 25760693 . A G 1369.65 PASS AO=153;DP=163;FAO=163;FDP=172;FR=.;FRO=9;FSAF=80;FSAR=83;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.0179557;FXX=0.00578001;HRUN=5;LEN=1;MLLD=99.3176;QD=31.8522;RBI=0.0181377;REFB=-0.201184;REVB=0.0025624;RO=10;SAF=71;SAR=82;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00750144;STB=0.508244;TYPE=snp;VARB=0.00222812;OID=.;OPOS=25760693;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:163:172:10:9:153:163:82:71:4:6:83:80:3:6 chr4 25915648 . G A 57.52 PASS AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=0.0286372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.031;QD=7.9342;RBI=0.0316076;REFB=0.00409053;REVB=0.0133772;RO=16;SAF=4;SAR=9;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144291;STB=0.582665;TYPE=snp;VARB=-0.00540953;OID=.;OPOS=25915648;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:29:29:16:16:13:13:9:4:3:13:9:4:3:13 chr4 25915858 . C A 54.42 PASS AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.000374845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.6664;QD=7.02197;RBI=0.0472539;REFB=-0.0017798;REVB=0.0472524;RO=18;SAF=11;SAR=2;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.321688;STB=0.691964;TYPE=snp;VARB=0.00762472;OID=.;OPOS=25915858;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:31:31:18:18:13:13:2:11:11:7:2:11:11:7 chr4 26274274 . T A 2045.2 PASS AO=211;DP=213;FAO=215;FDP=215;FR=.;FRO=0;FSAF=114;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00414401;FXX=0.00462942;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.8039;QD=38.0503;RBI=0.06672;REFB=-0.041004;REVB=0.0665911;RO=1;SAF=114;SAR=97;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.004886;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.10315e-05;OID=.;OPOS=26274274;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:89:213:215:1:0:211:215:97:114:0:1:101:114:0:0 chr4 26417136 . T C 1151.5 PASS AO=117;DP=118;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0207879;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.2905;QD=38.0661;RBI=0.0580395;REFB=0;REVB=0.054189;RO=0;SAF=37;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000205696;OID=.;OPOS=26417136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:118:121:0:0:117:121:80:37:0:0:80:41:0:0 chr4 26432993 . GT G 24.97 PASS AO=21;DP=60;FAO=18;FDP=60;FR=.;FRO=42;FSAF=3;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=0.0744927;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.9498;QD=1.66478;RBI=0.139604;REFB=-0.0675188;REVB=-0.118068;RO=37;SAF=3;SAR=18;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.523203;STB=0.792332;TYPE=del;VARB=0.102794;OID=.;OPOS=26432994;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:21:60:18:60:42:3:15:23:19:24:37:3:18:21:16 chr4 26585881 . C T 69.22 PASS AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.00909782;FXX=0.0344709;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.1713;QD=9.88835;RBI=0.052673;REFB=-0.000974652;REVB=0.0518814;RO=14;SAF=6;SAR=8;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12462;STB=0.571326;TYPE=snp;VARB=0.00324805;OID=.;OPOS=26585881;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:28:28:14:14:14:14:8:6:8:6:8:6:8:6 chr4 26673761 . T A 1713.81 PASS AO=290;DP=405;FAO=290;FDP=400;FR=.;FRO=110;FSAF=89;FSAR=201;FSRF=50;FSRR=60;FWDB=-0.00903893;FXX=0;HRUN=9;LEN=1;MLLD=32.7355;QD=17.1381;RBI=0.010052;REFB=-0.026251;REVB=0.00439786;RO=75;SAF=81;SAR=209;SRF=38;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103908;STB=0.546022;TYPE=snp;VARB=0.0155304;OID=.;OPOS=26673761;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:405:400:75:110:290:290:209:81:38:37:201:89:50:60 chr4 26673787 . A G 3281.43 PASS AO=441;DP=495;FAO=376;FDP=389;FR=.;FRO=13;FSAF=81;FSAR=295;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=0.0930766;FXX=0.0274993;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.22;QD=33.7423;RBI=0.0931003;REFB=-0.112076;REVB=0.00210064;RO=11;SAF=96;SAR=345;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0399139;STB=0.526547;TYPE=snp;VARB=0.000485056;OID=.;OPOS=26673787;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:495:389:11:13:441:376:345:96:9:2:295:81:10:3 chr4 27004011 . G A 1029.47 PASS AO=110;DP=112;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0122572;FXX=0.0178555;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6468;QD=37.4353;RBI=0.0284884;REFB=-0.119723;REVB=0.0257167;RO=1;SAF=46;SAR=64;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0102081;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000976657;OID=.;OPOS=27004011;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:112:110:1:0:110:110:64:46:1:0:64:46:0:0 chr4 27024535 . A G 327.32 PASS AO=75;DP=149;FAO=75;FDP=149;FR=.;FRO=74;FSAF=33;FSAR=42;FSRF=39;FSRR=35;FWDB=0.0275049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.036;QD=8.787;RBI=0.0321182;REFB=-0.018857;REVB=0.0165848;RO=74;SAF=33;SAR=42;SRF=39;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0787959;STB=0.543385;TYPE=snp;VARB=0.0170999;OID=.;OPOS=27024535;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:74:74:75:75:42:33:39:35:42:33:39:35 chr4 28372419 . T C 235.04 PASS AO=82;DP=230;FAO=83;FDP=230;FR=.;FRO=147;FSAF=34;FSAR=49;FSRF=44;FSRR=103;FWDB=0.00275527;FXX=0.012875;HRUN=3;LEN=1;MLLD=150.003;QD=4.08758;RBI=0.00277689;REFB=0.00221596;REVB=-0.000345851;RO=143;SAF=34;SAR=48;SRF=42;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144311;STB=0.574844;TYPE=snp;VARB=-0.00412416;OID=.;OPOS=28372419;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:230:230:143:147:82:83:48:34:42:101:49:34:44:103 chr4 28712968 . A G 170.24 PASS AO=44;DP=101;FAO=45;FDP=102;FR=.;FRO=57;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=29;FSRR=28;FWDB=-0.000386895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.4221;QD=6.67608;RBI=0.00725747;REFB=0.00775465;REVB=0.00724715;RO=57;SAF=25;SAR=19;SRF=29;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0602622;STB=0.526304;TYPE=snp;VARB=-0.00954952;OID=.;OPOS=28712968;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:102:57:57:44:45:19:25:29:28:20:25:29:28 chr4 30725272 . C T 340.73 PASS AO=68;DP=122;FAO=69;FDP=122;FR=.;FRO=53;FSAF=45;FSAR=24;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=-0.0141453;FXX=0.00812942;HRUN=3;LEN=1;MLLD=143.373;QD=11.1716;RBI=0.0163971;REFB=-0.00934462;REVB=0.00829295;RO=51;SAF=44;SAR=24;SRF=26;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113475;STB=0.573872;TYPE=snp;VARB=0.00578141;OID=.;OPOS=30725272;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:51:53:68:69:24:44:26:25:24:45:26:27 chr4 30921827 . AG A 31.42 PASS AO=24;DP=75;FAO=25;FDP=72;FR=.;FRO=47;FSAF=2;FSAR=23;FSRF=14;FSRR=33;FWDB=-0.058665;FXX=0.0649266;HRUN=4;LEN=1;MLLD=16.391;QD=1.74557;RBI=0.0607277;REFB=-0.0702296;REVB=-0.0156932;RO=46;SAF=3;SAR=21;SRF=13;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0.703704;SSSB=-0.291735;STB=0.76639;TYPE=del;VARB=0.165601;OID=.;OPOS=30921828;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:24:73:25:72:47:2:23:14:33:31:46:3:21:13:33 chr4 31144138 . T C 335.48 PASS AO=85;DP=182;FAO=85;FDP=181;FR=.;FRO=96;FSAF=36;FSAR=49;FSRF=44;FSRR=52;FWDB=-0.0185831;FXX=0.0109284;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.034;QD=7.41395;RBI=0.0192803;REFB=-0.0226565;REVB=-0.00513786;RO=97;SAF=36;SAR=49;SRF=44;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0294986;STB=0.518789;TYPE=snp;VARB=0.0260499;OID=.;OPOS=31144138;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:181:97:96:85:85:49:36:44:53:49:36:44:52 chr4 31146018 . A G 221.12 PASS AO=50;DP=100;FAO=50;FDP=100;FR=.;FRO=50;FSAF=30;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=27;FWDB=-0.0187046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.2855;QD=8.84465;RBI=0.0195161;REFB=-0.00270803;REVB=0.0055695;RO=47;SAF=30;SAR=20;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153965;STB=0.570822;TYPE=snp;VARB=0.00231059;OID=.;OPOS=31146018;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:47:50:50:50:20:30:20:27:20:30:23:27 chr4 31147272 . A C 669.97 PASS AO=149;DP=283;FAO=149;FDP=283;FR=.;FRO=134;FSAF=55;FSAR=94;FSRF=67;FSRR=67;FWDB=-0.00232624;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=171.636;QD=9.46957;RBI=0.0102591;REFB=0.000731573;REVB=-0.00999192;RO=133;SAF=55;SAR=94;SRF=66;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113913;STB=0.564278;TYPE=snp;VARB=-0.000701428;OID=.;OPOS=31147272;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:283:283:133:134:149:149:94:55:66:67:94:55:67:67 chr4 34967868 . G T 250.71 PASS AO=60;DP=124;FAO=60;FDP=124;FR=.;FRO=64;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=33;FSRR=31;FWDB=0.00726654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.6706;QD=8.08736;RBI=0.0324961;REFB=-0.00935367;REVB=-0.0316732;RO=62;SAF=30;SAR=30;SRF=31;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508062;TYPE=snp;VARB=0.0100382;OID=.;OPOS=34967868;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:62:64:60:60:30:30:31:31:30:30:33:31 chr4 36081878 . C T 1136.04 PASS AO=119;DP=119;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0205311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.014;QD=37.555;RBI=0.0208292;REFB=0;REVB=0.00351093;RO=0;SAF=62;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.9434e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000357823;OID=.;OPOS=36081878;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:119:121:0:0:119:121:57:62:0:0:59:62:0:0 chr4 36152584 . G T 585.95 PASS AO=141;DP=291;FAO=142;FDP=292;FR=.;FRO=150;FSAF=86;FSAR=56;FSRF=93;FSRR=57;FWDB=-0.0158923;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0111;QD=8.02677;RBI=0.0171856;REFB=0.0129066;REVB=0.00654076;RO=149;SAF=85;SAR=56;SRF=93;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0209216;STB=0.507749;TYPE=snp;VARB=-0.0125768;OID=.;OPOS=36152584;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:291:292:149:150:141:142:56:85:93:56:56:86:93:57 chr4 36212290 . GT G 26.86 PASS AO=34;DP=263;FAO=65;FDP=246;FR=.;FRO=181;FSAF=53;FSAR=12;FSRF=84;FSRR=97;FWDB=-0.0760881;FXX=0.0159994;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.5326;QD=0.43681;RBI=0.211141;REFB=-0.0703625;REVB=0.196955;RO=129;SAF=27;SAR=7;SRF=58;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.448339;STB=0.778375;TYPE=del;VARB=0.0846175;OID=.;OPOS=36212291;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:34:209:65:246:181:53:12:84:97:26:129:27:7:58:71 chr4 36258197 . T C 3502.79 PASS AO=418;DP=434;FAO=389;FDP=400;FR=.;FRO=11;FSAF=249;FSAR=140;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=0.0163536;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.0689;QD=35.0279;RBI=0.0277924;REFB=-0.092203;REVB=0.0224716;RO=12;SAF=270;SAR=148;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0276362;STB=0.513572;TYPE=snp;VARB=0.00230412;OID=.;OPOS=36258197;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:434:400:12:11:418:389:148:270:2:10:140:249:2:9 chr4 36292018 . T A 1098.68 PASS AO=116;DP=118;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0486183;FXX=0.0165276;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1053;QD=36.9305;RBI=0.0936396;REFB=0.0342234;REVB=0.080029;RO=2;SAF=43;SAR=73;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0128327;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000844128;OID=.;OPOS=36292018;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:118:119:2:0:116:119:73:43:0:2:76:43:0:0 chr4 36340753 . G A 632.41 PASS AO=157;DP=328;FAO=157;FDP=328;FR=.;FRO=171;FSAF=70;FSAR=87;FSRF=60;FSRR=111;FWDB=-0.0124621;FXX=0.00303942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.132;QD=7.7123;RBI=0.0127608;REFB=-0.0240162;REVB=0.0027449;RO=170;SAF=70;SAR=87;SRF=59;SRR=111;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0957746;STB=0.550649;TYPE=snp;VARB=0.0218885;OID=.;OPOS=36340753;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:328:328:170:171:157:157:87:70:59:111:87:70:60:111 chr4 36340812 . C G 478.28 PASS AO=137;DP=319;FAO=137;FDP=322;FR=.;FRO=185;FSAF=54;FSAR=83;FSRF=54;FSRR=131;FWDB=-0.0183039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.4591;QD=5.94132;RBI=0.0223312;REFB=-0.000571443;REVB=-0.0127927;RO=181;SAF=54;SAR=83;SRF=53;SRR=128;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111967;STB=0.563149;TYPE=snp;VARB=0.00014155;OID=.;OPOS=36340812;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:319:322:181:185:137:137:83:54:53:128:83:54:54:131 chr4 36428048 . G A 185.89 PASS AO=44;DP=94;FAO=45;FDP=95;FR=.;FRO=50;FSAF=15;FSAR=30;FSRF=20;FSRR=30;FWDB=0.0294367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.603;QD=7.82698;RBI=0.0344442;REFB=-0.0360015;REVB=-0.0178851;RO=49;SAF=15;SAR=29;SRF=20;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0688858;STB=0.538444;TYPE=snp;VARB=0.0438814;OID=.;OPOS=36428048;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:95:49:50:44:45:29:15:20:29:30:15:20:30 chr4 37445315 . C A 103.1 PASS AO=29;DP=72;FAO=29;FDP=72;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=-0.00158812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.202;QD=5.72768;RBI=0.0111153;REFB=-0.00577555;REVB=0.0110012;RO=43;SAF=13;SAR=16;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177843;STB=0.510138;TYPE=snp;VARB=0.0104427;OID=.;OPOS=37445315;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:43:43:29:29:16:13:20:23:16:13:20:23 chr4 37592128 . G A 293.96 PASS AO=38;DP=44;FAO=38;FDP=44;FR=.;FRO=6;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.00774532;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.015;QD=26.7235;RBI=0.016004;REFB=-0.0678056;REVB=0.0140049;RO=6;SAF=21;SAR=17;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.013499;STB=0.507243;TYPE=snp;VARB=0.00920841;OID=.;OPOS=37592128;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:44:44:6:6:38:38:17:21:3:3:17:21:3:3 chr4 37593173 . G A 1426.66 PASS AO=155;DP=159;FAO=155;FDP=159;FR=.;FRO=4;FSAF=56;FSAR=99;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0185104;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=141.583;QD=35.8909;RBI=0.0264991;REFB=-0.020872;REVB=0.0189622;RO=4;SAF=56;SAR=99;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200199;STB=0.510531;TYPE=snp;VARB=0.000251954;OID=.;OPOS=37593173;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:159:159:4:4:155:155:99:56:3:1:99:56:3:1 chr4 37612486 . T A 1000.76 PASS AO=105;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00083201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.404;QD=38.1241;RBI=0.00451591;REFB=0;REVB=-0.00443861;RO=0;SAF=51;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.42725e-06;OID=.;OPOS=37612486;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:105:105:0:0:105:105:54:51:0:0:54:51:0:0 chr4 37836302 . T C 593.24 PASS AO=193;DP=460;FAO=171;FDP=399;FR=.;FRO=228;FSAF=77;FSAR=94;FSRF=120;FSRR=108;FWDB=0.0263908;FXX=0.00249994;HRUN=4;LEN=1;MLLD=47.5735;QD=5.9473;RBI=0.0275771;REFB=-0.04018;REVB=-0.00800159;RO=267;SAF=86;SAR=107;SRF=138;SRR=129;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0745447;STB=0.543491;TYPE=snp;VARB=0.0584072;OID=.;OPOS=37836302;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:460:399:267:228:193:171:107:86:138:129:94:77:120:108 chr4 37857342 . G C 157.88 PASS AO=50;DP=130;FAO=50;FDP=131;FR=.;FRO=81;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=44;FSRR=37;FWDB=0.0136405;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.682;QD=4.82079;RBI=0.0182293;REFB=-0.00637629;REVB=0.0120931;RO=77;SAF=22;SAR=28;SRF=41;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0991566;STB=0.563733;TYPE=snp;VARB=0.0173577;OID=.;OPOS=37857342;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:131:77:81:50:50:28:22:41:36:28:22:44:37 chr4 37903756 . T C 86.37 PASS AO=32;DP=95;FAO=32;FDP=95;FR=.;FRO=63;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=32;FWDB=-0.0332408;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.6004;QD=3.63679;RBI=0.058813;REFB=0.0095684;REVB=-0.0485182;RO=63;SAF=16;SAR=16;SRF=31;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00907233;STB=0.50526;TYPE=snp;VARB=-0.0186141;OID=.;OPOS=37903756;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:95:95:63:63:32:32:16:16:31:32:16:16:31:32 chr4 38051499 . A G 832.23 PASS AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.436;QD=38.2633;RBI=0.0128912;REFB=0;REVB=-0.00640511;RO=0;SAF=31;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.00429e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.13603e-05;OID=.;OPOS=38051499;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:87:87:0:0:87:87:56:31:0:0:56:31:0:0 chr4 38139024 . C T 238.17 PASS AO=46;DP=80;FAO=46;FDP=80;FR=.;FRO=34;FSAF=35;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=8;FWDB=0.0165633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.658;QD=11.9085;RBI=0.0560904;REFB=0.0186013;REVB=0.0535891;RO=34;SAF=35;SAR=11;SRF=26;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00409616;STB=0.502245;TYPE=snp;VARB=-0.0138775;OID=.;OPOS=38139024;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:34:34:46:46:11:35:26:8:11:35:26:8 chr4 38258908 . G T 104.63 PASS AO=31;DP=77;FAO=31;FDP=80;FR=.;FRO=49;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=36;FSRR=13;FWDB=-0.0618285;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.2057;QD=5.23126;RBI=0.0618397;REFB=-0.0404107;REVB=-0.001175;RO=46;SAF=17;SAR=14;SRF=33;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183964;STB=0.617748;TYPE=snp;VARB=0.067735;OID=.;OPOS=38258908;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:80:46:49:31:31:14:17:33:13:14:17:36:13 chr4 38259005 . T G 25.77 PASS AO=10;DP=36;FAO=10;FDP=37;FR=.;FRO=27;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.0249347;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=137.803;QD=2.78648;RBI=0.0254578;REFB=0.00529286;REVB=-0.0051344;RO=26;SAF=5;SAR=5;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0896548;STB=0.54046;TYPE=snp;VARB=-0.0252174;OID=.;OPOS=38259005;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:36:37:26:27:10:10:5:5:11:15:5:5:12:15 chr4 38702437 . A G 158.74 PASS AO=55;DP=161;FAO=56;FDP=159;FR=.;FRO=103;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=55;FSRR=48;FWDB=-0.0140154;FXX=0.0185174;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.329;QD=3.99347;RBI=0.0174546;REFB=-0.0121548;REVB=-0.0104034;RO=103;SAF=27;SAR=28;SRF=55;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0490058;STB=0.533531;TYPE=snp;VARB=0.0225669;OID=.;OPOS=38702437;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:159:103:103:55:56:28:27:55:48:29:27:55:48 chr4 38776107 . T G 1142.27 PASS AO=120;DP=125;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.126795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.923;QD=36.5527;RBI=0.127348;REFB=-0.0179972;REVB=-0.0118568;RO=4;SAF=18;SAR=102;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0945872;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00025634;OID=.;OPOS=38776107;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:125:125:4:0:120:125:102:18:4:0:102:23:0:0 chr4 38776303 . T C 965.03 PASS AO=100;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000520881;FXX=0.0373797;HRUN=4;LEN=1;MLLD=124.421;QD=37.477;RBI=0.00801691;REFB=-0.061741;REVB=0.00799997;RO=2;SAF=34;SAR=66;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141578;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00263336;OID=.;OPOS=38776303;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:103:103:2:0:100:103:66:34:0:2:67:36:0:0 chr4 38776491 . T G 1363.83 PASS AO=148;DP=151;FAO=148;FDP=151;FR=.;FRO=3;FSAF=70;FSAR=78;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.023987;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=255.581;QD=36.128;RBI=0.035582;REFB=0.00136637;REVB=0.0262812;RO=3;SAF=70;SAR=78;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00529201;STB=0.502783;TYPE=snp;VARB=2.59275e-05;OID=.;OPOS=38776491;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:151:151:3:3:148:148:78:70:1:2:78:70:1:2 chr4 38777173 . A T 1949.99 PASS AO=205;DP=207;FAO=205;FDP=205;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=125;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0330377;FXX=0.00966137;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.177;QD=38.0487;RBI=0.0335983;REFB=-0.0531147;REVB=-0.00611183;RO=1;SAF=80;SAR=125;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00591687;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000148849;OID=.;OPOS=38777173;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:207:205:1:0:205:205:125:80:1:0:125:80:0:0 chr4 38777236 . T G 1187.64 PASS AO=128;DP=134;FAO=128;FDP=130;FR=.;FRO=2;FSAF=53;FSAR=75;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0323602;FXX=0.0298485;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.453;QD=36.5427;RBI=0.0427676;REFB=0.00339364;REVB=-0.0279622;RO=2;SAF=53;SAR=75;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0175918;STB=0.509258;TYPE=snp;VARB=-2.18163e-05;OID=.;OPOS=38777236;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:134:130:2:2:128:128:75:53:2:0:75:53:2:0 chr4 38798648 . C A 94.69 PASS AO=25;DP=60;FAO=25;FDP=60;FR=.;FRO=35;FSAF=21;FSAR=4;FSRF=27;FSRR=8;FWDB=-0.00944321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.901;QD=6.31257;RBI=0.0114241;REFB=-0.00765922;REVB=-0.00642936;RO=35;SAF=21;SAR=4;SRF=27;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117241;STB=0.567509;TYPE=snp;VARB=0.0102964;OID=.;OPOS=38798648;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:60:60:35:35:25:25:4:21:27:8:4:21:27:8 chr4 38830350 . A G 204.21 PASS AO=59;DP=143;FAO=59;FDP=143;FR=.;FRO=84;FSAF=39;FSAR=20;FSRF=49;FSRR=35;FWDB=0.0369528;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6832;QD=5.71211;RBI=0.0498742;REFB=0.0146581;REVB=0.0334953;RO=83;SAF=39;SAR=20;SRF=49;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0794924;STB=0.549279;TYPE=snp;VARB=-0.020145;OID=.;OPOS=38830350;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:83:84:59:59:20:39:49:34:20:39:49:35 chr4 38933859 . G A 99.11 PASS AO=35;DP=106;FAO=36;FDP=107;FR=.;FRO=71;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=30;FSRR=41;FWDB=0.0127571;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.403;QD=3.70501;RBI=0.014253;REFB=-0.0172872;REVB=0.00635644;RO=64;SAF=20;SAR=15;SRF=25;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200918;STB=0.605815;TYPE=snp;VARB=0.0393305;OID=.;OPOS=38933859;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:107:64:71:35:36:15:20:25:39:15:21:30:41 chr4 38937372 . T C 157.58 PASS AO=29;DP=49;FAO=29;FDP=49;FR=.;FRO=20;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.00948075;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.3327;QD=12.8634;RBI=0.0343478;REFB=-0.00549809;REVB=0.0330134;RO=20;SAF=20;SAR=9;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260471;STB=0.644114;TYPE=snp;VARB=0.0041857;OID=.;OPOS=38937372;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:49:49:20:20:29:29:9:20:7:13:9:20:7:13 chr4 38945169 . A G 481.62 PASS AO=93;DP=157;FAO=93;FDP=157;FR=.;FRO=64;FSAF=43;FSAR=50;FSRF=37;FSRR=27;FWDB=0.00504295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.076;QD=12.2705;RBI=0.0191173;REFB=-0.0213066;REVB=-0.0184402;RO=63;SAF=43;SAR=50;SRF=37;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0928415;STB=0.547111;TYPE=snp;VARB=0.0161583;OID=.;OPOS=38945169;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:157:63:64:93:93:50:43:37:26:50:43:37:27 chr4 38995374 . T C 2794.3 PASS AO=291;DP=291;FAO=292;FDP=292;FR=.;FRO=0;FSAF=164;FSAR=128;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.861;QD=38.2781;RBI=0.0281741;REFB=0;REVB=0.0185094;RO=0;SAF=164;SAR=127;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.07893e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.43135e-05;OID=.;OPOS=38995374;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:291:292:0:0:291:292:127:164:0:0:128:164:0:0 chr4 39000305 . A G 378.88 PASS AO=83;DP=162;FAO=85;FDP=164;FR=.;FRO=79;FSAF=38;FSAR=47;FSRF=49;FSRR=30;FWDB=0.032498;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.427;QD=9.24098;RBI=0.0328084;REFB=-0.0221076;REVB=-0.00450266;RO=77;SAF=36;SAR=47;SRF=48;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165358;STB=0.582875;TYPE=snp;VARB=0.0263678;OID=.;OPOS=39000305;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:164:77:79:83:85:47:36:48:29:47:38:49:30 chr4 39064162 . A C 1428.21 PASS AO=146;DP=158;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=124;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156385;FXX=0.128647;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.1372;QD=38.3413;RBI=0.0633943;REFB=0;REVB=0.0614351;RO=0;SAF=122;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.59915e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00278736;OID=.;OPOS=39064162;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:158:149:0:0:146:149:24:122:0:0:25:124:0:0 chr4 39094738 . G A 865.21 PASS AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0252921;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.898;QD=38.031;RBI=0.0473767;REFB=0;REVB=0.0400608;RO=0;SAF=45;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000117091;OID=.;OPOS=39094738;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:91:91:0:0:91:91:46:45:0:0:46:45:0:0 chr4 39116911 . T C 2070.39 PASS AO=210;DP=211;FAO=216;FDP=216;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0152659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.274;QD=38.3405;RBI=0.0171245;REFB=0;REVB=0.00775898;RO=0;SAF=93;SAR=117;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.80696e-06;OID=.;OPOS=39116911;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:211:216:0:0:210:216:117:93:0:0:120:96:0:0 chr4 39122697 . C T 2006.94 PASS AO=218;DP=226;FAO=218;FDP=223;FR=.;FRO=5;FSAF=91;FSAR=127;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0088392;FXX=0.0132737;HRUN=4;LEN=1;MLLD=113.59;QD=35.9989;RBI=0.0108305;REFB=-0.0349681;REVB=0.00625852;RO=2;SAF=91;SAR=127;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00744352;STB=0.509652;TYPE=snp;VARB=0.00095661;OID=.;OPOS=39122697;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:226:223:2:5:218:218:127:91:0:2:127:91:0:5 chr4 39226582 . AT A 250.99 PASS AO=78;DP=183;FAO=101;FDP=176;FR=.;FRO=75;FSAF=25;FSAR=76;FSRF=52;FSRR=23;FWDB=0.0605067;FXX=0.0167588;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.9907;QD=5.70441;RBI=0.171603;REFB=-0.00564374;REVB=-0.160582;RO=71;SAF=17;SAR=61;SRF=51;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.4553;STB=0.702732;TYPE=del;VARB=0.0206896;OID=.;OPOS=39226583;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:78:178:101:176:75:25:76:52:23:99:71:17:61:51:20 chr4 39302029 . T C 1120.61 PASS AO=101;DP=123;FAO=119;FDP=119;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=56;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0495442;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2008;QD=37.6676;RBI=0.0509511;REFB=0;REVB=0.0118904;RO=0;SAF=56;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.15371e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000397957;OID=.;OPOS=39302029;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:123:119:0:0:101:119:45:56:0:0:63:56:0:0 chr4 39310575 . CT C 22.43 PASS AO=36;DP=159;FAO=39;FDP=144;FR=.;FRO=105;FSAF=3;FSAR=36;FSRF=42;FSRR=63;FWDB=0.0285431;FXX=0.0335548;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.007;QD=0.623115;RBI=0.0437583;REFB=-0.0403386;REVB=0.0331675;RO=93;SAF=2;SAR=34;SRF=42;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.645804;STB=0.844848;TYPE=del;VARB=0.0221441;OID=.;OPOS=39310576;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:36:149:39:144:105:3:36:42:63:22:93:2:34:42:51 chr4 39448542 . C G 101.96 PASS AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0455993;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.057;QD=37.0748;RBI=0.0609093;REFB=0;REVB=0.0403813;RO=0;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00070107;OID=.;OPOS=39448542;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:11:11:7:4:0:0:7:4:0:0 chr4 39458051 . A G 131.67 PASS AO=47;DP=138;FAO=47;FDP=136;FR=.;FRO=89;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=27;FSRR=62;FWDB=0.0241938;FXX=0.0215812;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.6547;QD=3.87249;RBI=0.0253484;REFB=0.00253987;REVB=-0.00756297;RO=89;SAF=19;SAR=28;SRF=27;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123247;STB=0.570352;TYPE=snp;VARB=-0.00255835;OID=.;OPOS=39458051;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:136:89:89:47:47:28:19:27:62:28:19:27:62 chr4 39459724 . T C 463.87 PASS AO=121;DP=265;FAO=121;FDP=264;FR=.;FRO=143;FSAF=63;FSAR=58;FSRF=69;FSRR=74;FWDB=0.00618031;FXX=0.00377344;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.946;QD=7.02835;RBI=0.00644234;REFB=0.00468026;REVB=0.00181865;RO=142;SAF=63;SAR=58;SRF=68;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0408095;STB=0.520658;TYPE=snp;VARB=-0.00563432;OID=.;OPOS=39459724;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:265:264:142:143:121:121:58:63:68:74:58:63:69:74 chr4 39460797 . G A 98.65 PASS AO=14;DP=25;FAO=19;FDP=34;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0151813;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=45.0377;QD=11.6064;RBI=0.0348318;REFB=-0.0471542;REVB=0.0313494;RO=11;SAF=7;SAR=7;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105797;STB=0.526288;TYPE=snp;VARB=0.0390109;OID=.;OPOS=39460797;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:25:34:11:15:14:19:7:7:4:7:9:10:7:8 chr4 39463903 . C A 387.94 PASS AO=106;DP=247;FAO=108;FDP=248;FR=.;FRO=140;FSAF=44;FSAR=64;FSRF=53;FSRR=87;FWDB=-0.077096;FXX=0.0040159;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.6094;QD=6.25704;RBI=0.0777049;REFB=-0.0123323;REVB=-0.00970864;RO=139;SAF=44;SAR=62;SRF=53;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0357573;STB=0.516959;TYPE=snp;VARB=0.0189054;OID=.;OPOS=39463903;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:247:248:139:140:106:108:62:44:53:86:64:44:53:87 chr4 39899979 . G C 179.58 PASS AO=50;DP=119;FAO=50;FDP=119;FR=.;FRO=69;FSAF=42;FSAR=8;FSRF=57;FSRR=12;FWDB=0.0111333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.8033;QD=6.03636;RBI=0.0111333;REFB=-0.00118559;REVB=8.96425e-06;RO=69;SAF=42;SAR=8;SRF=57;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0260999;STB=0.5147;TYPE=snp;VARB=0.00195118;OID=.;OPOS=39899979;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:69:69:50:50:8:42:57:12:8:42:57:12 chr4 40045340 . G C 641.76 PASS AO=153;DP=314;FAO=155;FDP=316;FR=.;FRO=161;FSAF=60;FSAR=95;FSRF=82;FSRR=79;FWDB=-0.0151352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.319;QD=8.12357;RBI=0.0152821;REFB=-0.000439491;REVB=-0.00211443;RO=157;SAF=58;SAR=95;SRF=80;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123533;STB=0.563719;TYPE=snp;VARB=0.000386103;OID=.;OPOS=40045340;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:314:316:157:161:153:155:95:58:80:77:95:60:82:79 chr4 40245990 . A C 997.42 PASS AO=110;DP=113;FAO=110;FDP=113;FR=.;FRO=3;FSAF=59;FSAR=51;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0274258;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.8032;QD=35.3071;RBI=0.0826433;REFB=-0.0802758;REVB=-0.0779599;RO=2;SAF=58;SAR=52;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000927147;STB=0.505414;TYPE=snp;VARB=0.00125032;OID=.;OPOS=40245990;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:113:113:2:3:110:110:52:58:1:1:51:59:1:2 chr4 40337523 . C T 551.56 PASS AO=89;DP=89;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0451952;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.284;QD=36.1676;RBI=0.0502729;REFB=0.0451302;REVB=0.0220171;RO=0;SAF=58;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517236;TYPE=snp;VARB=-0.00125892;OID=.;OPOS=40337523;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:89:61:0:1:89:60:31:58:0:0:14:46:0:1 chr4 40337908 . T C 1615.5 PASS AO=183;DP=184;FAO=185;FDP=185;FR=.;FRO=0;FSAF=100;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0679772;FXX=0.00537606;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.029;QD=34.9297;RBI=0.0686786;REFB=0;REVB=-0.00978962;RO=0;SAF=98;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.07612e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00217615;OID=.;OPOS=40337908;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:184:185:0:0:183:185:85:98:0:0:85:100:0:0 chr4 40337944 . C T 2096.55 PASS AO=219;DP=219;FAO=218;FDP=218;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=114;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.019191;FXX=0.004566;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.8663;QD=38.4688;RBI=0.0447203;REFB=0;REVB=-0.0403932;RO=0;SAF=104;SAR=115;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.54261e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000308485;OID=.;OPOS=40337944;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:219:218:0:0:219:218:115:104:0:0:114:104:0:0 chr4 40356422 . A G 973.15 PASS AO=105;DP=108;FAO=106;FDP=109;FR=.;FRO=3;FSAF=56;FSAR=50;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0229275;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.245;QD=35.7119;RBI=0.0260344;REFB=0.0122411;REVB=0.0123337;RO=3;SAF=56;SAR=49;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00705969;STB=0.503821;TYPE=snp;VARB=-0.000130861;OID=.;OPOS=40356422;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:108:109:3:3:105:106:49:56:2:1:50:56:2:1 chr4 40428010 . T C 1048.63 PASS AO=110;DP=111;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0538443;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.798;QD=38.132;RBI=0.054559;REFB=0;REVB=0.00880202;RO=0;SAF=26;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.8013e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000217669;OID=.;OPOS=40428010;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:111:110:0:0:110:110:84:26:0:0:84:26:0:0 chr4 40438576 . A G 1691.68 PASS AO=165;DP=168;FAO=176;FDP=176;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0371414;FXX=0.0167588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.177;QD=38.4473;RBI=0.039002;REFB=0;REVB=-0.0119025;RO=0;SAF=62;SAR=103;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.30626e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000851105;OID=.;OPOS=40438576;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:168:176:0:0:165:176:103:62:0:0:106:70:0:0 chr4 40440215 . T C 642.56 PASS AO=67;DP=68;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.031762;FXX=0.0147037;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.733;QD=38.362;RBI=0.0403565;REFB=0;REVB=0.0248963;RO=0;SAF=30;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000110004;OID=.;OPOS=40440215;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:68:67:0:0:67:67:37:30:0:0:37:30:0:0 chr4 40778146 . C T 315.64 PASS AO=96;DP=242;FAO=97;FDP=243;FR=.;FRO=146;FSAF=37;FSAR=60;FSRF=61;FSRR=85;FWDB=-0.00413298;FXX=0.00409819;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.495;QD=5.19572;RBI=0.00427197;REFB=-0.0203356;REVB=-0.00108081;RO=146;SAF=38;SAR=58;SRF=61;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0245243;STB=0.522894;TYPE=snp;VARB=0.0302783;OID=.;OPOS=40778146;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:242:243:146:146:96:97:58:38:61:85:60:37:61:85 chr4 40778162 . T G 224.88 PASS AO=78;DP=227;FAO=81;FDP=228;FR=.;FRO=147;FSAF=28;FSAR=53;FSRF=54;FSRR=93;FWDB=0.0363884;FXX=0.00436662;HRUN=3;LEN=1;MLLD=130.648;QD=3.94523;RBI=0.0378629;REFB=-0.0158629;REVB=-0.0104637;RO=140;SAF=27;SAR=51;SRF=48;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00411827;STB=0.515291;TYPE=snp;VARB=0.0295375;OID=.;OPOS=40778162;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:227:228:140:147:78:81:51:27:48:92:53:28:54:93 chr4 40810747 . A G 998.22 PASS AO=106;DP=107;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00322851;FXX=0.00934492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.218;QD=37.6688;RBI=0.00637308;REFB=0.00880184;REVB=-0.0054948;RO=1;SAF=50;SAR=56;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00839996;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000104413;OID=.;OPOS=40810747;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:107:106:1:0:106:106:56:50:0:1:56:50:0:0 chr4 40870972 . C T 146.56 PASS AO=38;DP=86;FAO=38;FDP=86;FR=.;FRO=48;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=-0.00619807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.303;QD=6.81693;RBI=0.00664481;REFB=-0.0174101;REVB=-0.00239527;RO=47;SAF=17;SAR=21;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0833533;STB=0.552604;TYPE=snp;VARB=0.0252665;OID=.;OPOS=40870972;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:47:48:38:38:21:17:25:22:21:17:26:22 chr4 41015823 . G A,T 1158.69 PASS AO=60,62;DP=122;FAO=61,64;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=11,5;FSAR=50,59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0859272,0.0190238;FXX=0.0310053;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=45.6531,175.49;QD=37.078;RBI=0.117805,0.0219862;REFB=0,0;REVB=0.0805882,0.0110222;RO=0;SAF=11,5;SAR=49,57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.78446e-08,0;STB=0.5,0.5;TYPE=snp,snp;VARB=0.0205039,-0.000769089;OID=.,.;OPOS=41015823,41015823;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:122:125:0:0:60,62:61,64:49,57:11,5:0:0:50,59:11,5:0:0 chr4 41015899 . C T 1602.09 PASS AO=165;DP=165;FAO=167;FDP=167;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=127;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0114633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.819;QD=38.3734;RBI=0.0231984;REFB=0;REVB=0.0201683;RO=0;SAF=40;SAR=125;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.22276e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.13739e-05;OID=.;OPOS=41015899;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:165:167:0:0:165:167:125:40:0:0:127:40:0:0 chr4 41016484 . T C 181.3 PASS AO=46;DP=97;FAO=46;FDP=103;FR=.;FRO=57;FSAF=12;FSAR=34;FSRF=25;FSRR=32;FWDB=-0.0108358;FXX=0.0550408;HRUN=5;LEN=1;MLLD=168.456;QD=7.04059;RBI=0.0298735;REFB=-0.00310341;REVB=-0.0278391;RO=50;SAF=12;SAR=34;SRF=23;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212809;STB=0.613606;TYPE=snp;VARB=0.00216164;OID=.;OPOS=41016484;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:103:50:57:46:46:34:12:23:27:34:12:25:32 chr4 41259149 . T C 45.07 PASS AO=12;DP=32;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=-0.170534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.8834;QD=5.63404;RBI=0.170998;REFB=-0.0338637;REVB=0.0125953;RO=19;SAF=4;SAR=8;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0851185;STB=0.560879;TYPE=snp;VARB=0.0572715;OID=.;OPOS=41259149;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:32:32:19:20:12:12:8:4:5:14:8:4:5:15 chr4 41259633 . C A 30.9 PASS AO=4;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0860692;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.4347;QD=13.7354;RBI=0.138494;REFB=0.0735466;REVB=0.108502;RO=4;SAF=4;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.666163;TYPE=snp;VARB=-0.0298227;OID=.;OPOS=41259633;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:9:9:4:4:4:5:0:4:4:0:1:4:4:0 chr4 41526503 . C T 267.23 PASS AO=79;DP=193;FAO=79;FDP=193;FR=.;FRO=114;FSAF=33;FSAR=46;FSRF=52;FSRR=62;FWDB=-0.0172754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.8933;QD=5.53835;RBI=0.0201624;REFB=-0.0115791;REVB=-0.0103962;RO=114;SAF=33;SAR=46;SRF=52;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0412571;STB=0.523141;TYPE=snp;VARB=0.0185182;OID=.;OPOS=41526503;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:193:114:114:79:79:46:33:52:62:46:33:52:62 chr4 41672759 . C T 48.25 PASS AO=24;DP=92;FAO=24;FDP=92;FR=.;FRO=68;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=47;FWDB=0.00555132;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.965;QD=2.09801;RBI=0.0183138;REFB=-0.00172793;REVB=-0.0174521;RO=68;SAF=13;SAR=11;SRF=21;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.283156;STB=0.668312;TYPE=snp;VARB=0.00478458;OID=.;OPOS=41672759;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:92:92:68:68:24:24:11:13:21:47:11:13:21:47 chr4 41673604 . T C 2144.1 PASS AO=225;DP=225;FAO=224;FDP=224;FR=.;FRO=0;FSAF=115;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0037894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.312;QD=38.2875;RBI=0.00383226;REFB=0;REVB=0.000571522;RO=0;SAF=116;SAR=109;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.35189e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.71667e-06;OID=.;OPOS=41673604;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:225:224:0:0:225:224:109:116:0:0:109:115:0:0 chr4 41691601 . T C 395.61 PASS AO=98;DP=207;FAO=98;FDP=206;FR=.;FRO=108;FSAF=37;FSAR=61;FSRF=67;FSRR=41;FWDB=-0.00609499;FXX=0.00483068;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.756;QD=7.68168;RBI=0.022358;REFB=-0.017465;REVB=0.0215112;RO=109;SAF=37;SAR=61;SRF=68;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234129;STB=0.626976;TYPE=snp;VARB=0.0163828;OID=.;OPOS=41691601;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:206:109:108:98:98:61:37:68:41:61:37:67:41 chr4 41701167 . CAT C 258.62 PASS AO=56;DP=116;FAO=59;FDP=114;FR=.;FRO=55;FSAF=19;FSAR=40;FSRF=23;FSRR=32;FWDB=-0.00644194;FXX=0.0172399;HRUN=1;LEN=2;MLLD=200.221;QD=9.07424;RBI=0.0166689;REFB=-0.00917812;REVB=-0.0153738;RO=54;SAF=18;SAR=38;SRF=22;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0845271;STB=0.551163;TYPE=del;VARB=0.00761114;OID=.;OPOS=41701168;OREF=AT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:56:112:59:114:55:19:40:23:32:99:54:18:38:22:32 chr4 41701248 . A G 329.68 PASS AO=69;DP=126;FAO=69;FDP=126;FR=.;FRO=57;FSAF=40;FSAR=29;FSRF=23;FSRR=34;FWDB=0.00963002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.819;QD=10.466;RBI=0.0122516;REFB=-0.00305861;REVB=-0.00757389;RO=56;SAF=40;SAR=29;SRF=23;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138553;STB=0.579687;TYPE=snp;VARB=0.00341081;OID=.;OPOS=41701248;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:56:57:69:69:29:40:23:33:29:40:23:34 chr4 41701833 . A G 178.23 PASS AO=58;DP=154;FAO=58;FDP=154;FR=.;FRO=96;FSAF=24;FSAR=34;FSRF=39;FSRR=57;FWDB=0.0207152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.39;QD=4.62929;RBI=0.0218784;REFB=-0.010499;REVB=0.00703877;RO=96;SAF=24;SAR=34;SRF=39;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00855746;STB=0.504853;TYPE=snp;VARB=0.0190049;OID=.;OPOS=41701833;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:154:96:96:58:58:34:24:39:57:34:24:39:57 chr4 41985478 . A G 1153.63 PASS AO=121;DP=121;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.328;QD=38.1365;RBI=0.0196154;REFB=0;REVB=-0.0144245;RO=0;SAF=61;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.74056e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.62382e-06;OID=.;OPOS=41985478;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:121:121:0:0:121:121:60:61:0:0:60:61:0:0 chr4 42020142 . A G 2477.03 PASS AO=262;DP=265;FAO=263;FDP=263;FR=.;FRO=0;FSAF=143;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0273412;FXX=0.00754688;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.654;QD=37.6734;RBI=0.0273447;REFB=-0.0119244;REVB=0.000436741;RO=2;SAF=142;SAR=120;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00666702;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.26988e-05;OID=.;OPOS=42020142;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:265:263:2:0:262:263:120:142:2:0:120:143:0:0 chr4 42113241 . C T 566.56 PASS AO=56;DP=56;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0536392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.884;QD=38.4111;RBI=0.0941317;REFB=0;REVB=0.0773538;RO=0;SAF=25;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00196608;OID=.;OPOS=42113241;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:56:59:0:0:56:59:31:25:0:0:32:27:0:0 chr4 42127678 . G A 697.09 PASS AO=147;DP=268;FAO=147;FDP=267;FR=.;FRO=120;FSAF=71;FSAR=76;FSRF=53;FSRR=67;FWDB=-0.0335727;FXX=0.0037312;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.616;QD=10.4433;RBI=0.0365732;REFB=-0.0117507;REVB=0.0145077;RO=120;SAF=71;SAR=76;SRF=53;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0342285;STB=0.518616;TYPE=snp;VARB=0.0100186;OID=.;OPOS=42127678;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:268:267:120:120:147:147:76:71:53:67:76:71:53:67 chr4 42414945 . G A 289.2 PASS AO=64;DP=125;FAO=64;FDP=124;FR=.;FRO=60;FSAF=25;FSAR=39;FSRF=18;FSRR=42;FWDB=0.00836643;FXX=0.00799936;HRUN=3;LEN=1;MLLD=145.678;QD=9.32907;RBI=0.0110786;REFB=-0.0100349;REVB=0.00726212;RO=60;SAF=25;SAR=39;SRF=18;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0856217;STB=0.546987;TYPE=snp;VARB=0.00951438;OID=.;OPOS=42414945;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:124:60:60:64:64:39:25:18:42:39:25:18:42 chr4 44626641 . A G 44.72 PASS AO=27;DP=114;FAO=27;FDP=114;FR=.;FRO=87;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=34;FSRR=53;FWDB=0.0188952;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.682;QD=1.56923;RBI=0.0188985;REFB=-0.011739;REVB=-0.000352194;RO=86;SAF=17;SAR=10;SRF=34;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.286772;STB=0.677293;TYPE=snp;VARB=0.0380962;OID=.;OPOS=44626641;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:114:114:86:87:27:27:10:17:34:52:10:17:34:53 chr4 44682465 . T C 225.64 PASS AO=42;DP=205;FAO=71;FDP=178;FR=.,HEALED;FRO=107;FSAF=53;FSAR=18;FSRF=64;FSRR=43;FWDB=0.0524623;FXX=0.0165737;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.8476;QD=5.07064;RBI=0.0524669;REFB=-0.0113107;REVB=-0.000698625;RO=62;SAF=35;SAR=7;SRF=30;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.435396;STB=0.605512;TYPE=snp;VARB=0.0198016;OID=.;OPOS=44682465;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:178:62:107:42:71:7:35:30:32:18:53:64:43 chr4 44699484 . T G 183.56 PASS AO=51;DP=123;FAO=52;FDP=123;FR=.;FRO=71;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=49;FWDB=-0.00509174;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.432;QD=5.96953;RBI=0.0153708;REFB=-0.00310967;REVB=-0.014503;RO=71;SAF=28;SAR=23;SRF=22;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.244541;STB=0.640243;TYPE=snp;VARB=0.00766107;OID=.;OPOS=44699484;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:71:71:51:52:23:28:22:49:23:29:22:49 chr4 44704757 . C T 872.5 PASS AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00430034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.453;QD=37.9348;RBI=0.00719997;REFB=0;REVB=0.00577465;RO=0;SAF=41;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.99529e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.96925e-05;OID=.;OPOS=44704757;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:92:92:0:0:92:92:51:41:0:0:51:41:0:0 chr4 46086060 . T C 1264.22 PASS AO=133;DP=133;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0240706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.341;QD=38.0217;RBI=0.0244092;REFB=0;REVB=0.00405204;RO=0;SAF=42;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.50634e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.17404e-05;OID=.;OPOS=46086060;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:133:133:0:0:133:133:91:42:0:0:91:42:0:0 chr4 46314593 . T C 2023.98 PASS AO=226;DP=235;FAO=227;FDP=227;FR=.;FRO=0;FSAF=110;FSAR=117;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00176083;FXX=0.0340411;HRUN=6;LEN=1;MLLD=201.488;QD=35.6649;RBI=0.00387933;REFB=0.00165271;REVB=-0.00345669;RO=8;SAF=110;SAR=116;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00727748;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.71797e-05;OID=.;OPOS=46314593;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:235:227:8:0:226:227:116:110:3:5:117:110:0:0 chr4 46334702 . A G 666 PASS AO=75;DP=79;FAO=75;FDP=79;FR=.;FRO=4;FSAF=54;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0494459;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.0956;QD=33.7215;RBI=0.0719894;REFB=-0.105459;REVB=0.0523219;RO=4;SAF=54;SAR=21;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0542726;STB=0.528756;TYPE=snp;VARB=0.00619935;OID=.;OPOS=46334702;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:79:79:4:4:75:75:21:54:1:3:21:54:1:3 chr4 46928746 . A T 214.11 PASS AO=53;DP=117;FAO=54;FDP=118;FR=.;FRO=64;FSAF=36;FSAR=18;FSRF=28;FSRR=36;FWDB=-0.000612629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.8058;QD=7.25791;RBI=0.0115917;REFB=-0.00429445;REVB=-0.0115755;RO=63;SAF=36;SAR=17;SRF=28;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.236913;STB=0.627859;TYPE=snp;VARB=0.00483991;OID=.;OPOS=46928746;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:118:63:64:53:54:17:36:28:35:18:36:28:36 chr4 46928834 . C T 230.76 PASS AO=63;DP=144;FAO=64;FDP=149;FR=.;FRO=85;FSAF=37;FSAR=27;FSRF=44;FSRR=41;FWDB=-0.00316722;FXX=0.0324654;HRUN=3;LEN=1;MLLD=229.746;QD=6.19486;RBI=0.0144287;REFB=-0.00727006;REVB=-0.0140768;RO=81;SAF=37;SAR=26;SRF=40;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0952385;STB=0.534967;TYPE=snp;VARB=0.00850577;OID=.;OPOS=46928834;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:149:81:85:63:64:26:37:40:41:27:37:44:41 chr4 46995366 . G T 79.81 PASS AO=23;DP=58;FAO=23;FDP=60;FR=.;FRO=37;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.00759382;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.557;QD=5.32098;RBI=0.0125702;REFB=-0.0236371;REVB=0.0100171;RO=34;SAF=16;SAR=7;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.30065;STB=0.651448;TYPE=snp;VARB=0.0322331;OID=.;OPOS=46995366;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:58:60:34:37:23:23:7:16:14:20:7:16:17:20 chr4 47034626 . C G 103.79 PASS AO=27;DP=63;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=0.0052886;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=205.089;QD=6.58955;RBI=0.0147192;REFB=-0.00901883;REVB=0.0137362;RO=36;SAF=12;SAR=15;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0118704;OID=.;OPOS=47034626;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:36:36:27:27:15:12:16:20:15:12:16:20 chr4 47322190 . T C 723.74 PASS AO=75;DP=75;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159809;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.2375;QD=38.0914;RBI=0.0207193;REFB=0;REVB=0.0131872;RO=0;SAF=33;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000199368;OID=.;OPOS=47322190;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:75:76:0:0:75:76:42:33:0:0:43:33:0:0 chr4 47408709 . A G 236.86 PASS AO=59;DP=125;FAO=58;FDP=123;FR=.;FRO=65;FSAF=31;FSAR=27;FSRF=28;FSRR=37;FWDB=0.0366669;FXX=0.0314936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.9407;QD=7.70287;RBI=0.0378361;REFB=-0.0309805;REVB=0.0093332;RO=64;SAF=32;SAR=27;SRF=28;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0982705;STB=0.554636;TYPE=snp;VARB=0.0340419;OID=.;OPOS=47408709;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:123:64:65:59:58:27:32:28:36:27:31:28:37 chr4 47408838 . C T 262.59 PASS AO=73;DP=170;FAO=72;FDP=167;FR=.;FRO=95;FSAF=38;FSAR=34;FSRF=41;FSRR=54;FWDB=0.0177519;FXX=0.017646;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.606;QD=6.28954;RBI=0.021188;REFB=-0.0204077;REVB=-0.0115673;RO=95;SAF=38;SAR=35;SRF=41;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0900123;STB=0.554545;TYPE=snp;VARB=0.0334752;OID=.;OPOS=47408838;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:167:95:95:73:72:35:38:41:54:34:38:41:54 chr4 47428305 . G A 291.31 PASS AO=95;DP=244;FAO=94;FDP=244;FR=.;FRO=150;FSAF=47;FSAR=47;FSRF=72;FSRR=78;FWDB=0.00329948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.537;QD=4.77563;RBI=0.00500302;REFB=0.00664245;REVB=0.00376081;RO=149;SAF=48;SAR=47;SRF=71;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.031199;STB=0.512293;TYPE=snp;VARB=-0.0101457;OID=.;OPOS=47428305;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:244:149:150:95:94:47:48:71:78:47:47:72:78 chr4 47514685 . C T 153.76 PASS AO=46;DP=180;FAO=51;FDP=162;FR=.,HEALED;FRO=106;FSAF=12;FSAR=39;FSRF=49;FSRR=57;FWDB=-0.0145713;FXX=0.0581362;HRUN=4;LEN=1;MLLD=108.983;QD=3.79648;RBI=0.0219425;REFB=-0.0162037;REVB=0.0164059;RO=80;SAF=7;SAR=39;SRF=33;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.380277;STB=0.673673;TYPE=snp;VARB=0.0210939;OID=.;OPOS=47514685;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:162:80:106:46:51:39:7:33:47:39:12:49:57 chr4 47525054 . T C 438.15 PASS AO=107;DP=222;FAO=107;FDP=222;FR=.;FRO=115;FSAF=35;FSAR=72;FSRF=40;FSRR=75;FWDB=-0.0201968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.045;QD=7.8946;RBI=0.0202284;REFB=-0.0189172;REVB=0.0011296;RO=114;SAF=35;SAR=72;SRF=40;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0250287;STB=0.512089;TYPE=snp;VARB=0.0234325;OID=.;OPOS=47525054;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:222:114:115:107:107:72:35:40:74:72:35:40:75 chr4 47560002 . C A 103.09 PASS AO=30;DP=76;FAO=30;FDP=76;FR=.;FRO=46;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=29;FWDB=0.0160358;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.4566;QD=5.42559;RBI=0.0253368;REFB=-0.0032542;REVB=0.0196165;RO=46;SAF=13;SAR=17;SRF=17;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0696883;STB=0.539685;TYPE=snp;VARB=0.00600291;OID=.;OPOS=47560002;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:46:46:30:30:17:13:17:29:17:13:17:29 chr4 47560163 . C A 253.87 PASS AO=82;DP=214;FAO=82;FDP=214;FR=.;FRO=132;FSAF=39;FSAR=43;FSRF=59;FSRR=73;FWDB=-0.0183439;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.1;QD=4.7453;RBI=0.0398466;REFB=0.0102166;REVB=-0.0353731;RO=132;SAF=39;SAR=43;SRF=59;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0314449;STB=0.517734;TYPE=snp;VARB=-0.0147341;OID=.;OPOS=47560163;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:214:132:132:82:82:43:39:59:73:43:39:59:73 chr4 47593283 . G C 370.75 PASS AO=85;DP=168;FAO=85;FDP=168;FR=.;FRO=83;FSAF=34;FSAR=51;FSRF=51;FSRR=32;FWDB=0.0456589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.9845;QD=8.82728;RBI=0.0643681;REFB=-0.011028;REVB=0.0453709;RO=83;SAF=34;SAR=51;SRF=51;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192322;STB=0.605676;TYPE=snp;VARB=0.00941074;OID=.;OPOS=47593283;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:83:83:85:85:51:34:51:32:51:34:51:32 chr4 47594220 . G A 192.63 PASS AO=56;DP=141;FAO=57;FDP=141;FR=.;FRO=84;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=39;FSRR=45;FWDB=-0.0253034;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.8221;QD=5.46466;RBI=0.0315622;REFB=-0.00082671;REVB=0.0188656;RO=81;SAF=25;SAR=31;SRF=37;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0109938;STB=0.504884;TYPE=snp;VARB=0.00186171;OID=.;OPOS=47594220;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:81:84:56:57:31:25:37:44:31:26:39:45 chr4 47667064 . T C 218.69 PASS AO=51;DP=107;FAO=52;FDP=106;FR=.;FRO=54;FSAF=43;FSAR=9;FSRF=41;FSRR=13;FWDB=0.00798872;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.928;QD=8.25248;RBI=0.0716716;REFB=0.000541014;REVB=0.071225;RO=55;SAF=43;SAR=8;SRF=41;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15102;STB=0.555794;TYPE=snp;VARB=-0.00046524;OID=.;OPOS=47667064;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:106:55:54:51:52:8:43:41:14:9:43:41:13 chr4 47682174 . A G 179.83 PASS AO=40;DP=79;FAO=40;FDP=79;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=14;FSRR=25;FWDB=-0.0162966;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.448;QD=9.10534;RBI=0.0318503;REFB=-0.0341345;REVB=-0.0273654;RO=38;SAF=16;SAR=24;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0291133;STB=0.521266;TYPE=snp;VARB=0.0344367;OID=.;OPOS=47682174;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:38:39:40:40:24:16:14:24:24:16:14:25 chr4 47839929 . C T 807.22 PASS AO=86;DP=87;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00663642;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0646;QD=37.5452;RBI=0.0371706;REFB=-0.0109628;REVB=0.0365733;RO=1;SAF=40;SAR=46;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101887;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000280502;OID=.;OPOS=47839929;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:87:86:1:0:86:86:46:40:0:1:46:40:0:0 chr4 47887536 . T C 1819.4 PASS AO=189;DP=189;FAO=189;FDP=189;FR=.;FRO=0;FSAF=108;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.295;QD=38.5058;RBI=0.0201619;REFB=0;REVB=0.0155807;RO=0;SAF=108;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.03262e-05;OID=.;OPOS=47887536;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:189:189:0:0:189:189:81:108:0:0:81:108:0:0 chr4 47887991 . G A 2538.76 PASS AO=272;DP=279;FAO=273;FDP=273;FR=.;FRO=0;FSAF=111;FSAR=162;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0235795;FXX=0.0249991;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.315;QD=37.198;RBI=0.0237257;REFB=-0.0504217;REVB=-0.00262947;RO=5;SAF=111;SAR=161;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0209878;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.68052e-06;OID=.;OPOS=47887991;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:279:273:5:0:272:273:161:111:5:0:162:111:0:0 chr4 47901476 . G A 195.14 PASS AO=63;DP=166;FAO=63;FDP=166;FR=.;FRO=103;FSAF=24;FSAR=39;FSRF=45;FSRR=58;FWDB=-0.0217121;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.451;QD=4.7021;RBI=0.0219363;REFB=0.00074275;REVB=0.00312834;RO=103;SAF=24;SAR=39;SRF=45;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0637583;STB=0.536151;TYPE=snp;VARB=-0.00133462;OID=.;OPOS=47901476;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:166:103:103:63:63:39:24:45:58:39:24:45:58 chr4 47945295 . C T 55.21 PASS AO=15;DP=39;FAO=15;FDP=39;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.02;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.4287;QD=5.66293;RBI=0.0312721;REFB=-0.0382814;REVB=0.0240404;RO=24;SAF=12;SAR=3;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235448;STB=0.639793;TYPE=snp;VARB=0.0365702;OID=.;OPOS=47945295;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:39:39:24:24:15:15:3:12:15:9:3:12:15:9 chr4 47945455 . C G 242.79 PASS AO=25;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0595402;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.179;QD=37.3526;RBI=0.0626737;REFB=0;REVB=0.0195691;RO=0;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99383e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00076432;OID=.;OPOS=47945455;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:26:26:0:0:25:26:11:14:0:0:12:14:0:0 chr4 48069696 . G C 1400.86 PASS AO=150;DP=154;FAO=152;FDP=155;FR=.;FRO=3;FSAF=82;FSAR=70;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0326228;FXX=0.00640985;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9664;QD=36.1513;RBI=0.0445433;REFB=-0.0275876;REVB=0.0303291;RO=4;SAF=81;SAR=69;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229057;STB=0.508981;TYPE=snp;VARB=0.00176119;OID=.;OPOS=48069696;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:154:155:4:3:150:152:69:81:4:0:70:82:3:0 chr4 48069725 . G A 1074.06 PASS AO=116;DP=121;FAO=116;FDP=118;FR=.;FRO=2;FSAF=54;FSAR=62;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00923241;FXX=0.0247913;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.003;QD=36.4088;RBI=0.0491958;REFB=0.0164812;REVB=0.0483218;RO=2;SAF=54;SAR=62;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00111502;STB=0.500587;TYPE=snp;VARB=-0.000296917;OID=.;OPOS=48069725;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:121:118:2:2:116:116:62:54:1:1:62:54:1:1 chr4 48111418 . C T 171.49 PASS AO=44;DP=98;FAO=44;FDP=98;FR=.;FRO=54;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=30;FSRR=24;FWDB=-0.00631493;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.8;QD=6.99977;RBI=0.0342216;REFB=-0.0133008;REVB=-0.0336339;RO=54;SAF=19;SAR=25;SRF=30;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121788;STB=0.568151;TYPE=snp;VARB=0.0260341;OID=.;OPOS=48111418;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:54:54:44:44:25:19:30:24:25:19:30:24 chr4 48115264 . C T 427.26 PASS AO=88;DP=157;FAO=88;FDP=158;FR=.;FRO=70;FSAF=60;FSAR=28;FSRF=43;FSRR=27;FWDB=0.0207486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.267;QD=10.8168;RBI=0.0357165;REFB=-0.0120078;REVB=-0.0290717;RO=69;SAF=60;SAR=28;SRF=42;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0660283;STB=0.533627;TYPE=snp;VARB=0.0102632;OID=.;OPOS=48115264;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:158:69:70:88:88:28:60:42:27:28:60:43:27 chr4 48147309 . T C 193.86 PASS AO=57;DP=140;FAO=57;FDP=141;FR=.;FRO=84;FSAF=25;FSAR=32;FSRF=17;FSRR=67;FWDB=-0.0065172;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=181.798;QD=5.49951;RBI=0.013425;REFB=-0.00843292;REVB=-0.011737;RO=83;SAF=25;SAR=32;SRF=16;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.276687;STB=0.64803;TYPE=snp;VARB=0.0138141;OID=.;OPOS=48147309;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:141:83:84:57:57:32:25:16:67:32:25:17:67 chr4 48170669 . A G 679.15 PASS AO=70;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00589791;FXX=0.0270234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.397;QD=37.7305;RBI=0.0261373;REFB=0;REVB=0.0254632;RO=0;SAF=48;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000305726;OID=.;OPOS=48170669;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:72:72:0:0:70:72:22:48:0:0:24:48:0:0 chr4 48172266 . G A 134.01 PASS AO=40;DP=102;FAO=40;FDP=102;FR=.;FRO=62;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=29;FSRR=33;FWDB=-0.00582261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.4013;QD=5.2553;RBI=0.0506013;REFB=-0.00208517;REVB=0.0502652;RO=62;SAF=17;SAR=23;SRF=29;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0463855;STB=0.526355;TYPE=snp;VARB=0.00367727;OID=.;OPOS=48172266;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:62:62:40:40:23:17:29:33:23:17:29:33 chr4 48426066 . A T 315.95 PASS AO=73;DP=148;FAO=74;FDP=150;FR=.;FRO=76;FSAF=28;FSAR=46;FSRF=21;FSRR=55;FWDB=0.0220766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.5687;QD=8.42533;RBI=0.0268645;REFB=-0.00458364;REVB=0.0153076;RO=75;SAF=27;SAR=46;SRF=21;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0911563;STB=0.556459;TYPE=snp;VARB=0.0018512;OID=.;OPOS=48426066;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:150:75:76:73:74:46:27:21:54:46:28:21:55 chr4 48500800 . T C 118.37 PASS AO=31;DP=73;FAO=31;FDP=72;FR=.;FRO=41;FSAF=30;FSAR=1;FSRF=34;FSRR=7;FWDB=0.012356;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.351;QD=6.57582;RBI=0.0465203;REFB=-0.00811015;REVB=0.0448494;RO=40;SAF=30;SAR=1;SRF=33;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.491313;STB=0.789202;TYPE=snp;VARB=0.0101434;OID=.;OPOS=48500800;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:72:40:41:31:31:1:30:33:7:1:30:34:7 chr4 48582909 . G A 181.52 PASS AO=45;DP=117;FAO=50;FDP=116;FR=.,HEALED;FRO=66;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=33;FSRR=33;FWDB=0.0329448;FXX=0.00854628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.363;QD=6.25935;RBI=0.0358394;REFB=-0.0108798;REVB=-0.0141104;RO=35;SAF=23;SAR=22;SRF=3;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.340101;STB=0.534337;TYPE=snp;VARB=0.0161827;OID=.;OPOS=48582909;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:35:66:45:50:22:23:3:32:22:28:33:33 chr4 48588742 . C T 168.06 PASS AO=50;DP=125;FAO=50;FDP=125;FR=.;FRO=75;FSAF=7;FSAR=43;FSRF=7;FSRR=68;FWDB=0.00235544;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=212.07;QD=5.37804;RBI=0.0127781;REFB=0.00250392;REVB=-0.0125591;RO=75;SAF=7;SAR=43;SRF=7;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113597;STB=0.563429;TYPE=snp;VARB=-0.00390117;OID=.;OPOS=48588742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:75:75:50:50:43:7:7:68:43:7:7:68 chr4 48625213 . C A 1304.35 PASS AO=117;DP=117;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.977;QD=37.8072;RBI=0.0219875;REFB=0;REVB=0.00341728;RO=0;SAF=51;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.11903e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.67606e-06;OID=.;OPOS=48625213;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:117:138:0:0:117:138:66:51:0:0:83:55:0:0 chr4 48988450 . C A 131.23 PASS AO=24;DP=48;FAO=28;FDP=54;FR=.;FRO=26;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=-0.0173421;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=37.1499;QD=9.72095;RBI=0.0547189;REFB=-0.0282088;REVB=0.0518981;RO=24;SAF=16;SAR=8;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.540955;TYPE=snp;VARB=0.0247182;OID=.;OPOS=48988450;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:54:24:26:24:28:8:16:16:8:12:16:17:9 chr4 49063871 . TC T,TA 1794.02 PASS AO=33,159;DP=194;FAO=32,162;FDP=194;FR=.;FRO=0;FSAF=9,95;FSAR=23,67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00833363,-0.0114238;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=149.613,166.466;QD=36.9901;RBI=0.0303058,0.027224;REFB=0,0;REVB=0.0291374,0.0247112;RO=0;SAF=9,93;SAR=24,66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.43809e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0159435,-0.00181861;OID=.,.;OPOS=49063872,49063872;OREF=C,C;OALT=-,A;OMAPALT=T,TA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:33,159:192:32,162:194:0:9,95:23,67:0:0:20:0:9,93:24,66:0:0 chr4 49550892 . T C 29.27 PASS AO=18;DP=93;FAO=20;FDP=94;FR=.;FRO=74;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=45;FSRR=29;FWDB=-0.00741702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.617;QD=1.24535;RBI=0.00897501;REFB=-0.00508802;REVB=0.00505358;RO=74;SAF=13;SAR=5;SRF=45;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160674;STB=0.629491;TYPE=snp;VARB=0.0205549;OID=.;OPOS=49550892;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:93:94:74:74:18:20:5:13:45:29:5:15:45:29 chr4 52889602 . T A 148.9 PASS AO=21;DP=27;FAO=21;FDP=27;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=-0.0145728;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=202.271;QD=22.0585;RBI=0.0176339;REFB=-0.0556592;REVB=0.00992923;RO=5;SAF=6;SAR=15;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0376578;STB=0.533303;TYPE=snp;VARB=0.00758386;OID=.;OPOS=52889602;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:27:27:5:6:21:21:15:6:1:4:15:6:1:5 chr4 52938243 . T C 85.98 PASS AO=29;DP=84;FAO=30;FDP=87;FR=.;FRO=57;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=33;FSRR=24;FWDB=-0.122647;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=44.9424;QD=3.95293;RBI=0.131238;REFB=-0.0221673;REVB=-0.0467028;RO=52;SAF=21;SAR=8;SRF=30;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183832;STB=0.587725;TYPE=snp;VARB=0.0491967;OID=.;OPOS=52938243;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:84:87:52:57:29:30:8:21:30:22:9:21:33:24 chr4 53729429 . G A 259.68 PASS AO=63;DP=134;FAO=63;FDP=132;FR=.;FRO=69;FSAF=38;FSAR=25;FSRF=27;FSRR=42;FWDB=-0.0178676;FXX=0.0294096;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.451;QD=7.86919;RBI=0.0178841;REFB=-0.0204121;REVB=0.000768551;RO=69;SAF=38;SAR=25;SRF=27;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19932;STB=0.61037;TYPE=snp;VARB=0.0190183;OID=.;OPOS=53729429;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:132:69:69:63:63:25:38:27:42:25:38:27:42 chr4 53732943 . T A 126.97 PASS AO=32;DP=74;FAO=33;FDP=74;FR=.;FRO=41;FSAF=7;FSAR=26;FSRF=12;FSRR=29;FWDB=-0.00990366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.233;QD=6.86338;RBI=0.0123354;REFB=-0.00491147;REVB=0.00735386;RO=41;SAF=7;SAR=25;SRF=12;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100109;STB=0.561962;TYPE=snp;VARB=0.01167;OID=.;OPOS=53732943;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:41:41:32:33:25:7:12:29:26:7:12:29 chr4 54011603 . C T 3725.01 PASS AO=397;DP=403;FAO=394;FDP=394;FR=.;FRO=0;FSAF=172;FSAR=222;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107591;FXX=0.0149996;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.516;QD=37.8174;RBI=0.0118747;REFB=0.00730792;REVB=-0.00502494;RO=1;SAF=173;SAR=224;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00212595;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.09631e-05;OID=.;OPOS=54011603;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:403:394:1:0:397:394:224:173:0:1:222:172:0:0 chr4 54232110 . G A 441.76 PASS AO=50;DP=52;FAO=50;FDP=52;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.025215;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.844;QD=33.9815;RBI=0.0417479;REFB=0.035976;REVB=0.033273;RO=1;SAF=27;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.017117;STB=0.501547;TYPE=snp;VARB=-0.000241302;OID=.;OPOS=54232110;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:52:52:1:2:50:50:23:27:1:0:23:27:1:1 chr4 54352468 . GC G 477.58 PASS AO=58;DP=72;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.258014;FXX=0.0149231;HRUN=4;LEN=1;MLLD=19.0818;QD=28.9441;RBI=0.295336;REFB=0;REVB=-0.143708;RO=3;SAF=25;SAR=33;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0533028;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00228939;OID=.;OPOS=54352469;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:58:65:66:66:0:31:35:0:0:44:3:25:33:3:0 chr4 54966667 . C T 108.1 PASS AO=18;DP=28;FAO=18;FDP=28;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=10;FWDB=0.024566;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=161.129;QD=15.4433;RBI=0.0258011;REFB=0.0198656;REVB=-0.007887;RO=10;SAF=1;SAR=17;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208541;STB=0.613534;TYPE=snp;VARB=-0.00590545;OID=.;OPOS=54966667;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:28:28:10:10:18:18:17:1:0:10:17:1:0:10 chr4 54966830 . G A 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0306341;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=180.141;QD=33.022;RBI=0.0479808;REFB=0;REVB=-0.0369284;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000143592;OID=.;OPOS=54966830;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:4:2:0:0:4:2:0:0 chr4 55129831 . C T 199.63 PASS AO=58;DP=133;FAO=56;FDP=133;FR=.;FRO=77;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=41;FSRR=36;FWDB=0.00495022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.1399;QD=6.00404;RBI=0.0984807;REFB=0.00482807;REVB=-0.0983562;RO=75;SAF=32;SAR=26;SRF=41;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00515243;STB=0.522868;TYPE=snp;VARB=-0.00949632;OID=.;OPOS=55129831;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:75:77:58:56:26:32:41:34:24:32:41:36 chr4 55141055 . A G 3074.22 PASS AO=244;DP=358;FAO=344;FDP=344;FR=.;FRO=0;FSAF=186;FSAR=158;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0699375;FXX=0.0227266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.749;QD=35.7468;RBI=0.0711807;REFB=-0.00630719;REVB=0.0132451;RO=0;SAF=122;SAR=122;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0124328;OID=.;OPOS=55141055;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:248:344:0:0:244:344:122:122:0:0:158:186:0:0 chr4 55161391 . T C 3264.94 PASS AO=350;DP=356;FAO=351;FDP=351;FR=.;FRO=0;FSAF=212;FSAR=139;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216443;FXX=0.0140445;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.128;QD=37.2073;RBI=0.0550759;REFB=-0.088523;REVB=0.0506446;RO=0;SAF=212;SAR=138;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000452614;OID=.;OPOS=55161391;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:356:351:0:0:350:351:138:212:0:0:139:212:0:0 chr4 55161517 . A G 2949.79 PASS AO=307;DP=307;FAO=307;FDP=307;FR=.;FRO=0;FSAF=134;FSAR=173;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0138252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.179;QD=38.4337;RBI=0.0138913;REFB=0;REVB=0.00135407;RO=0;SAF=134;SAR=173;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.61592e-06;OID=.;OPOS=55161517;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:307:307:0:0:307:307:173:134:0:0:173:134:0:0 chr4 55599436 . T C 1039.77 PASS AO=109;DP=110;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0263179;FXX=0.0353951;HRUN=4;LEN=1;MLLD=73.7818;QD=38.1567;RBI=0.0388754;REFB=0;REVB=-0.0286123;RO=0;SAF=24;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.13927e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00143851;OID=.;OPOS=55599436;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:110:109:0:0:109:109:85:24:0:0:85:24:0:0 chr4 55946081 . A G 2944.84 PASS AO=307;DP=307;FAO=307;FDP=307;FR=.;FRO=0;FSAF=156;FSAR=151;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00458037;FXX=0.0160251;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.748;QD=38.3693;RBI=0.00500438;REFB=0;REVB=-0.00201594;RO=0;SAF=158;SAR=149;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.22033e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000216409;OID=.;OPOS=55946081;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:307:307:0:0:307:307:149:158:0:0:151:156:0:0 chr4 55972974 . T A 100.23 PASS AO=25;DP=59;FAO=26;FDP=59;FR=.;FRO=33;FSAF=23;FSAR=3;FSRF=33;FSRR=0;FWDB=0.00790536;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.689;QD=6.79495;RBI=0.145419;REFB=-0.0168287;REVB=0.145204;RO=33;SAF=22;SAR=3;SRF=33;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.395115;STB=0.70876;TYPE=snp;VARB=0.0340261;OID=.;OPOS=55972974;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:33:33:25:26:3:22:33:0:3:23:33:0 chr4 56291620 . CAA C 309.4 PASS AO=106;DP=241;FAO=114;FDP=238;FR=.;FRO=124;FSAF=69;FSAR=45;FSRF=56;FSRR=68;FWDB=0.00495298;FXX=0.0364358;HRUN=2;LEN=2;MLLD=99.065;QD=5.19991;RBI=0.00615761;REFB=0.0014349;REVB=-0.00365844;RO=122;SAF=68;SAR=38;SRF=55;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188518;STB=0.580898;TYPE=del;VARB=-0.00117005;OID=.;OPOS=56291621;OREF=AA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:106:234:114:238:124:69:45:56:68:99:122:68:38:55:67 chr4 56300685 . C T 337.42 PASS AO=76;DP=150;FAO=76;FDP=149;FR=.;FRO=73;FSAF=17;FSAR=59;FSRF=21;FSRR=52;FWDB=-0.0155058;FXX=0.00666622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.03;QD=9.05814;RBI=0.0155079;REFB=0.00206608;REVB=0.000257563;RO=73;SAF=17;SAR=59;SRF=21;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0778734;STB=0.542977;TYPE=snp;VARB=-0.00297307;OID=.;OPOS=56300685;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:149:73:73:76:76:59:17:21:52:59:17:21:52 chr4 56301049 . G GA 170.72 PASS AO=62;DP=156;FAO=72;FDP=151;FR=.;FRO=79;FSAF=33;FSAR=39;FSRF=44;FSRR=35;FWDB=0.0634848;FXX=0.00657851;HRUN=2;LEN=1;MLLD=17.9831;QD=4.5224;RBI=0.0902599;REFB=-0.031182;REVB=-0.0641602;RO=89;SAF=26;SAR=36;SRF=52;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172178;STB=0.551501;TYPE=ins;VARB=0.032777;OID=.;OPOS=56301050;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:62:156:72:151:79:33:39:44:35:99:89:26:36:52:37 chr4 56301369 . A G 215.56 PASS AO=52;DP=108;FAO=52;FDP=109;FR=.;FRO=57;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=25;FSRR=32;FWDB=0.056994;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.0337;QD=7.91046;RBI=0.0602099;REFB=-0.0141506;REVB=0.0194144;RO=56;SAF=28;SAR=24;SRF=24;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102414;STB=0.552093;TYPE=snp;VARB=0.0150416;OID=.;OPOS=56301369;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:109:56:57:52:52:24:28:24:32:24:28:25:32 chr4 56306111 . G A 1385.61 PASS AO=144;DP=144;FAO=145;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00453018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.0457;QD=38.2236;RBI=0.00653063;REFB=0;REVB=0.0047039;RO=0;SAF=90;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.33583e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.64982e-05;OID=.;OPOS=56306111;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:144:145:0:0:144:145:54:90:0:0:55:90:0:0 chr4 56309992 . A G 917.35 PASS AO=95;DP=95;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0880877;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.663;QD=38.223;RBI=0.0882328;REFB=0;REVB=-0.00505807;RO=0;SAF=33;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.10899e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000640875;OID=.;OPOS=56309992;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:95:96:0:0:95:96:62:33:0:0:62:34:0:0 chr4 56318462 . G A 150.72 PASS AO=36;DP=78;FAO=37;FDP=80;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=-0.00683089;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.6239;QD=7.53584;RBI=0.0141346;REFB=-0.0226436;REVB=0.0123744;RO=39;SAF=15;SAR=21;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0183461;STB=0.507582;TYPE=snp;VARB=0.0934177;OID=.;OPOS=56318462;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:80:39:43:36:37:21:15:17:22:21:16:18:25 chr4 56367796 . T G 138.14 PASS AO=17;DP=67;FAO=21;FDP=70;FR=.,HEALED;FRO=36;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=-0.000964946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.989;QD=7.89368;RBI=0.00781145;REFB=-0.0187953;REVB=0.00775162;RO=36;SAF=7;SAR=10;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194537;STB=0.627167;TYPE=snp;VARB=0.0443278;OID=.;OPOS=56367796;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:65:70:36:36:17:21:10:7:21:15:13:8:21:15 chr4 56471433 . A G 71.27 PASS AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=16;FSRR=2;FWDB=0.00602349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.7534;QD=8.38444;RBI=0.00611406;REFB=-0.00684212;REVB=0.00104845;RO=16;SAF=13;SAR=3;SRF=15;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211003;STB=0.572287;TYPE=snp;VARB=0.00330832;OID=.;OPOS=56471433;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:34:34:16:18:16:16:3:13:15:1:3:13:16:2 chr4 56475338 . G A 209.43 PASS AO=73;DP=198;FAO=72;FDP=199;FR=.;FRO=127;FSAF=34;FSAR=38;FSRF=48;FSRR=79;FWDB=-0.0844525;FXX=0.00499975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2158;QD=4.20955;RBI=0.0864901;REFB=0.00209405;REVB=-0.018663;RO=121;SAF=35;SAR=38;SRF=45;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119707;STB=0.560739;TYPE=snp;VARB=-0.00590088;OID=.;OPOS=56475338;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:199:121:127:73:72:38:35:45:76:38:34:48:79 chr4 56874517 . A C 209.37 PASS AO=49;DP=101;FAO=49;FDP=101;FR=.;FRO=52;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=27;FSRR=25;FWDB=-0.00472661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.2617;QD=8.29175;RBI=0.0243644;REFB=-0.033614;REVB=-0.0239015;RO=51;SAF=21;SAR=28;SRF=27;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0932149;STB=0.546989;TYPE=snp;VARB=0.0239804;OID=.;OPOS=56874517;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:51:52:49:49:28:21:27:24:28:21:27:25 chr4 57154755 . A ACTCTTC 72.45 PASS AO=30;DP=142;FAO=37;FDP=136;FR=.;FRO=99;FSAF=7;FSAR=30;FSRF=74;FSRR=25;FWDB=-0.053948;FXX=0.0422505;HRUN=1;LEN=6;MLLD=114.922;QD=2.13093;RBI=0.0550157;REFB=-0.0112176;REVB=-0.010786;RO=104;SAF=3;SAR=27;SRF=78;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.727268;STB=0.863064;TYPE=ins;VARB=0.016865;OID=.;OPOS=57154756;OREF=-;OALT=CTCTTC;OMAPALT=ACTCTTC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:30:142:37:136:99:7:30:74:25:72:104:3:27:78:26 chr4 57180473 . C A 108.76 PASS AO=24;DP=58;FAO=28;FDP=58;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.0611861;FXX=0.0491723;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.918;QD=7.50085;RBI=0.066283;REFB=-0.056235;REVB=-0.0254891;RO=25;SAF=5;SAR=19;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181461;STB=0.563296;TYPE=snp;VARB=0.0479903;OID=.;OPOS=57180473;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:25:30:24:28:19:5:9:16:19:9:13:17 chr4 57181632 . G C 544.17 PASS AO=41;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0729203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.879;QD=38.187;RBI=0.0769732;REFB=0;REVB=0.0246477;RO=0;SAF=17;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.2194e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00083499;OID=.;OPOS=57181632;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:57:57:0:0:41:57:24:17:0:0:31:26:0:0 chr4 57190356 . G A 126.32 PASS AO=37;DP=93;FAO=37;FDP=93;FR=.;FRO=56;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=33;FWDB=0.0107654;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.3;QD=5.4332;RBI=0.0115795;REFB=-0.0186202;REVB=0.00426518;RO=53;SAF=16;SAR=21;SRF=22;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184261;STB=0.513362;TYPE=snp;VARB=0.0219663;OID=.;OPOS=57190356;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:53:56:37:37:21:16:22:31:21:16:23:33 chr4 57194329 . G T 1982.87 PASS AO=192;DP=194;FAO=213;FDP=213;FR=.;FRO=0;FSAF=114;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0507086;FXX=0.00930189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.1183;QD=37.237;RBI=0.0532713;REFB=-0.140633;REVB=0.0163238;RO=1;SAF=95;SAR=97;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00498656;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00209374;OID=.;OPOS=57194329;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:194:213:1:0:192:213:97:95:1:0:99:114:0:0 chr4 57196155 . C T 1245.13 PASS AO=132;DP=133;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204887;FXX=0.0222206;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.26;QD=37.7312;RBI=0.0210803;REFB=-0.0379459;REVB=0.00495887;RO=1;SAF=94;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0123421;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000178327;OID=.;OPOS=57196155;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:133:132:1:0:132:132:38:94:0:1:38:94:0:0 chr4 57197401 . T TC 2912.88 PASS AO=148;DP=506;FAO=363;FDP=382;FR=.;FRO=19;FSAF=123;FSAR=240;FSRF=3;FSRR=16;FWDB=0.0216524;FXX=0.0449989;HRUN=0;LEN=1;MLLD=161.823;QD=30.5013;RBI=0.04111;REFB=-0.00374537;REVB=-0.0349457;RO=343;SAF=55;SAR=93;SRF=105;SRR=238;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0873227;STB=0.510108;TYPE=ins;VARB=0.00124386;OID=.;OPOS=57197402;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:148:506:363:382:19:123:240:3:16:36:343:55:93:105:238 chr4 57197402 . T C 634.78 PASS AO=245;DP=533;FAO=175;FDP=393;FR=.;FRO=218;FSAF=60;FSAR=115;FSRF=64;FSRR=154;FWDB=-0.000756796;FXX=0.0174996;HRUN=13;LEN=1;MLLD=135.113;QD=6.46085;RBI=0.00382988;REFB=0.00473651;REVB=-0.00375436;RO=279;SAF=89;SAR=156;SRF=76;SRR=203;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0981787;STB=0.530918;TYPE=snp;VARB=-0.00137063;OID=.;OPOS=57197402;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:533:393:279:218:245:175:156:89:76:203:115:60:64:154 chr4 57204777 . A C 290.75 PASS AO=56;DP=95;FAO=56;FDP=95;FR=.;FRO=39;FSAF=53;FSAR=3;FSRF=37;FSRR=2;FWDB=-0.0143206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.4137;QD=12.2421;RBI=0.0423236;REFB=-0.0125536;REVB=-0.0398272;RO=39;SAF=53;SAR=3;SRF=37;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00856764;STB=0.504671;TYPE=snp;VARB=0.00703435;OID=.;OPOS=57204777;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:39:39:56:56:3:53:37:2:3:53:37:2 chr4 57204882 . CA C 67.88 PASS AO=22;DP=66;FAO=34;FDP=62;FR=.;FRO=28;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=2;FWDB=0.259596;FXX=0.0605969;HRUN=6;LEN=1;MLLD=9.51705;QD=4.37934;RBI=0.286245;REFB=-0.0180572;REVB=-0.120606;RO=25;SAF=14;SAR=8;SRF=23;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.323541;STB=0.651509;TYPE=del;VARB=0.0816567;OID=.;OPOS=57204883;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:22:56:34:62:28:22:12:26:2:50:25:14:8:23:2 chr4 57211352 . T C 133.36 PASS AO=48;DP=133;FAO=48;FDP=139;FR=.;FRO=91;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=42;FSRR=49;FWDB=0.036351;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.3456;QD=3.83769;RBI=0.0974911;REFB=-0.00269472;REVB=-0.0904605;RO=84;SAF=18;SAR=30;SRF=42;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142289;STB=0.558634;TYPE=snp;VARB=0.00586653;OID=.;OPOS=57211352;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:139:84:91:48:48:30:18:42:42:30:18:42:49 chr4 57215677 . G A 218.35 PASS AO=67;DP=174;FAO=68;FDP=174;FR=.;FRO=106;FSAF=38;FSAR=30;FSRF=51;FSRR=55;FWDB=-0.0323021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.6414;QD=5.01962;RBI=0.0340581;REFB=-0.00426913;REVB=-0.0107948;RO=105;SAF=38;SAR=29;SRF=51;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0884698;STB=0.547444;TYPE=snp;VARB=0.00525274;OID=.;OPOS=57215677;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:174:105:106:67:68:29:38:51:54:30:38:51:55 chr4 57219592 . G A 1371.96 PASS AO=141;DP=142;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.035;QD=38.11;RBI=0.0244927;REFB=0;REVB=0.00974532;RO=0;SAF=85;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.14291e-05;OID=.;OPOS=57219592;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:142:144:0:0:141:144:56:85:0:0:56:88:0:0 chr4 57219613 . C T 174.48 PASS AO=60;DP=166;FAO=60;FDP=166;FR=.;FRO=106;FSAF=49;FSAR=11;FSRF=48;FSRR=58;FWDB=0.0139225;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.909;QD=4.20434;RBI=0.0226059;REFB=-0.00895758;REVB=-0.0178099;RO=103;SAF=49;SAR=11;SRF=48;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.438025;STB=0.760023;TYPE=snp;VARB=0.0259634;OID=.;OPOS=57219613;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:166:103:106:60:60:11:49:48:55:11:49:48:58 chr4 57220347 . T C 158.91 PASS AO=43;DP=101;FAO=43;FDP=101;FR=.;FRO=58;FSAF=8;FSAR=35;FSRF=20;FSRR=38;FWDB=-0.0200244;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.338;QD=6.29362;RBI=0.0265287;REFB=-0.0112459;REVB=-0.017401;RO=57;SAF=8;SAR=35;SRF=19;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20745;STB=0.626533;TYPE=snp;VARB=0.0130783;OID=.;OPOS=57220347;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:57:58:43:43:35:8:19:38:35:8:20:38 chr4 57237683 . G A 174.75 PASS AO=49;DP=117;FAO=49;FDP=117;FR=.;FRO=68;FSAF=17;FSAR=32;FSRF=36;FSRR=32;FWDB=0.00657505;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.829;QD=5.97448;RBI=0.0280033;REFB=-0.00426279;REVB=0.0272205;RO=68;SAF=17;SAR=32;SRF=36;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193658;STB=0.60915;TYPE=snp;VARB=0.00762205;OID=.;OPOS=57237683;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:68:68:49:49:32:17:36:32:32:17:36:32 chr4 57244580 . C T 101.12 PASS AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.00598173;FXX=0.0263089;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.738;QD=10.932;RBI=0.0122858;REFB=-0.0213798;REVB=-0.0107312;RO=17;SAF=7;SAR=13;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0544063;STB=0.530581;TYPE=snp;VARB=0.0138896;OID=.;OPOS=57244580;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:38:37:17:17:20:20:13:7:7:10:13:7:7:10 chr4 57259856 . C T 130.2 PASS AO=31;DP=67;FAO=31;FDP=66;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.00665471;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.17;QD=7.89117;RBI=0.0296261;REFB=-0.0114707;REVB=-0.0288691;RO=35;SAF=15;SAR=16;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0253037;STB=0.514193;TYPE=snp;VARB=0.0108605;OID=.;OPOS=57259856;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:66:35:35:31:31:16:15:16:19:16:15:16:19 chr4 57270197 . T C 1555.48 PASS AO=160;DP=161;FAO=165;FDP=165;FR=.;FRO=0;FSAF=100;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00544853;FXX=0.00602373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.454;QD=37.7086;RBI=0.0687876;REFB=-0.0164803;REVB=0.0685715;RO=1;SAF=99;SAR=61;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00773599;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.48851e-05;OID=.;OPOS=57270197;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:161:165:1:0:160:165:61:99:0:1:65:100:0:0 chr4 57273840 . C G 354.87 PASS AO=74;DP=138;FAO=74;FDP=135;FR=.;FRO=61;FSAF=26;FSAR=48;FSRF=15;FSRR=46;FWDB=-0.057974;FXX=0.0217376;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5058;QD=10.5146;RBI=0.0588286;REFB=0.0136904;REVB=-0.0099909;RO=64;SAF=26;SAR=48;SRF=15;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113094;STB=0.55393;TYPE=snp;VARB=-0.0108389;OID=.;OPOS=57273840;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:135:64:61:74:74:48:26:15:49:48:26:15:46 chr4 57516849 . C T 263.32 PASS AO=60;DP=119;FAO=60;FDP=119;FR=.;FRO=59;FSAF=34;FSAR=26;FSRF=28;FSRR=31;FWDB=0.00547928;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.6242;QD=8.85104;RBI=0.019046;REFB=-0.0315521;REVB=-0.0182408;RO=57;SAF=34;SAR=26;SRF=28;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0671973;STB=0.5459;TYPE=snp;VARB=0.0505827;OID=.;OPOS=57516849;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:57:59:60:60:26:34:28:29:26:34:28:31 chr4 57516896 . G A 1630.53 PASS AO=175;DP=179;FAO=176;FDP=180;FR=.;FRO=4;FSAF=75;FSAR=101;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.00174189;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.008;QD=36.2339;RBI=0.0272028;REFB=-0.0667261;REVB=0.027147;RO=4;SAF=74;SAR=101;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00753825;STB=0.504006;TYPE=snp;VARB=0.000381614;OID=.;OPOS=57516896;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:179:180:4:4:175:176:101:74:1:3:101:75:1:3 chr4 57660802 . T G 267.06 PASS AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0628345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.3;QD=38.1508;RBI=0.0658904;REFB=0;REVB=-0.0198338;RO=0;SAF=7;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000419879;OID=.;OPOS=57660802;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:28:28:0:0:28:28:21:7:0:0:21:7:0:0 chr4 57876955 . G A 745.28 PASS AO=161;DP=299;FAO=161;FDP=299;FR=.;FRO=138;FSAF=68;FSAR=93;FSRF=55;FSRR=83;FWDB=-0.00462913;FXX=0.00333322;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.806;QD=9.97032;RBI=0.026832;REFB=-0.0215735;REVB=0.0264296;RO=135;SAF=68;SAR=93;SRF=54;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192661;STB=0.511299;TYPE=snp;VARB=0.0198231;OID=.;OPOS=57876955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:299:299:135:138:161:161:93:68:54:81:93:68:55:83 chr4 57881715 . G A 562.64 PASS AO=117;DP=211;FAO=117;FDP=211;FR=.;FRO=94;FSAF=51;FSAR=66;FSRF=50;FSRR=44;FWDB=-0.0141901;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.891;QD=10.6661;RBI=0.0149941;REFB=-0.00954194;REVB=-0.00484376;RO=94;SAF=51;SAR=66;SRF=50;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0789693;STB=0.543003;TYPE=snp;VARB=0.00811234;OID=.;OPOS=57881715;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:211:94:94:117:117:66:51:50:44:66:51:50:44 chr4 57889677 . C T 530.04 PASS AO=124;DP=246;FAO=124;FDP=246;FR=.;FRO=122;FSAF=55;FSAR=69;FSRF=54;FSRR=68;FWDB=0.00395801;FXX=0.00404842;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.819;QD=8.61856;RBI=0.0055056;REFB=-0.0171537;REVB=-0.00382697;RO=121;SAF=55;SAR=69;SRF=54;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00249272;STB=0.500465;TYPE=snp;VARB=0.0228575;OID=.;OPOS=57889677;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:246:246:121:122:124:124:69:55:54:67:69:55:54:68 chr4 62598689 . C T 2453.64 PASS AO=262;DP=269;FAO=263;FDP=263;FR=.;FRO=0;FSAF=120;FSAR=143;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185449;FXX=0.022304;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.756;QD=37.3178;RBI=0.0371214;REFB=-0.0928574;REVB=0.0321572;RO=3;SAF=119;SAR=143;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0098952;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000372081;OID=.;OPOS=62598689;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:269:263:3:0:262:263:143:119:0:3:143:120:0:0 chr4 62758491 . G A 401.77 PASS AO=85;DP=156;FAO=85;FDP=156;FR=.;FRO=71;FSAF=33;FSAR=52;FSRF=25;FSRR=46;FWDB=0.0050505;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.843;QD=10.3018;RBI=0.0305755;REFB=0.00387302;REVB=0.0301555;RO=71;SAF=33;SAR=52;SRF=25;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0319355;STB=0.517436;TYPE=snp;VARB=-0.00240685;OID=.;OPOS=62758491;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:156:71:71:85:85:52:33:25:46:52:33:25:46 chr4 62800728 . T C 1814.92 PASS AO=190;DP=192;FAO=190;FDP=190;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0330461;FXX=0.0104161;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.0677;QD=38.2088;RBI=0.0330671;REFB=0;REVB=0.00117725;RO=0;SAF=90;SAR=100;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.06642e-05;OID=.;OPOS=62800728;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:192:190:0:0:190:190:100:90:0:0:100:90:0:0 chr4 62845388 . G C 2951.67 PASS AO=334;DP=352;FAO=334;FDP=350;FR=.;FRO=16;FSAF=145;FSAR=189;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.0018604;FXX=0.00568166;HRUN=5;LEN=1;MLLD=264.324;QD=33.7334;RBI=0.00189668;REFB=-0.00976262;REVB=-0.000369167;RO=16;SAF=145;SAR=189;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000298398;STB=0.500157;TYPE=snp;VARB=0.00017876;OID=.;OPOS=62845388;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:352:350:16:16:334:334:189:145:7:9:189:145:7:9 chr4 62845490 . A G 2155.65 PASS AO=223;DP=224;FAO=225;FDP=225;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=133;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00547502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.779;QD=38.3226;RBI=0.0150488;REFB=0;REVB=-0.0140175;RO=0;SAF=91;SAR=132;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.7165e-06;OID=.;OPOS=62845490;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:224:225:0:0:223:225:132:91:0:0:133:92:0:0 chr4 65473384 . C G 940.57 PASS AO=206;DP=387;FAO=206;FDP=386;FR=.;FRO=180;FSAF=70;FSAR=136;FSRF=53;FSRR=127;FWDB=-0.0126562;FXX=0.00771188;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.956;QD=9.74688;RBI=0.0135301;REFB=-0.0251727;REVB=0.00478357;RO=178;SAF=70;SAR=136;SRF=51;SRR=127;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0515631;STB=0.523932;TYPE=snp;VARB=0.0214491;OID=.;OPOS=65473384;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:387:386:178:180:206:206:136:70:51:127:136:70:53:127 chr4 66189755 . T C 186.72 PASS AO=50;DP=114;FAO=50;FDP=115;FR=.;FRO=65;FSAF=14;FSAR=36;FSRF=7;FSRR=58;FWDB=-0.0216535;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=272.957;QD=6.49474;RBI=0.0308436;REFB=-0.00727961;REVB=-0.0219648;RO=64;SAF=14;SAR=36;SRF=6;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.266817;STB=0.63509;TYPE=snp;VARB=0.00710288;OID=.;OPOS=66189755;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:115:64:65:50:50:36:14:6:58:36:14:7:58 chr4 66535284 . G A 66.43 PASS AO=10;DP=14;FAO=10;FDP=14;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0226116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.015;QD=18.98;RBI=0.0451357;REFB=-0.0959858;REVB=0.0390634;RO=4;SAF=2;SAR=8;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.329371;STB=0.689234;TYPE=snp;VARB=0.0225437;OID=.;OPOS=66535284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:14:14:4:4:10:10:8:2:3:1:8:2:3:1 chr4 66931170 . G A 198.36 PASS AO=61;DP=154;FAO=61;FDP=155;FR=.;FRO=94;FSAF=21;FSAR=40;FSRF=24;FSRR=70;FWDB=0.0637595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.331;QD=5.11884;RBI=0.0705138;REFB=0.00209827;REVB=0.0301152;RO=93;SAF=21;SAR=40;SRF=24;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106607;STB=0.562025;TYPE=snp;VARB=-0.00243188;OID=.;OPOS=66931170;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:155:93:94:61:61:40:21:24:69:40:21:24:70 chr4 68374597 . C T 2180.58 PASS AO=227;DP=227;FAO=227;FDP=227;FR=.;FRO=0;FSAF=108;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0218797;FXX=0.00438577;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.0956;QD=38.4244;RBI=0.032087;REFB=0;REVB=-0.0234702;RO=0;SAF=108;SAR=119;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.29793e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000147434;OID=.;OPOS=68374597;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:227:227:0:0:227:227:119:108:0:0:119:108:0:0 chr4 68376708 . T C 741.95 PASS AO=75;DP=77;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.015404;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.432;QD=37.0973;RBI=0.0166767;REFB=-0.0617457;REVB=0.00638988;RO=1;SAF=21;SAR=54;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0219938;STB=0.510201;TYPE=snp;VARB=0.00163553;OID=.;OPOS=68376708;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:77:80:1:1:75:79:54:21:1:0:55:24:1:0 chr4 68380215 . G A 2108.13 PASS AO=202;DP=210;FAO=228;FDP=228;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=137;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0402898;FXX=0.00869527;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.3616;QD=36.9847;RBI=0.110063;REFB=-0.171865;REVB=0.102423;RO=6;SAF=87;SAR=115;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00387719;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00638135;OID=.;OPOS=68380215;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:210:228:6:0:202:228:115:87:3:3:137:91:0:0 chr4 68384008 . C T 904.72 PASS AO=99;DP=102;FAO=100;FDP=102;FR=.;FRO=2;FSAF=64;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0113874;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.543;QD=35.4794;RBI=0.0227491;REFB=-0.0352696;REVB=0.0196939;RO=0;SAF=64;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.513511;TYPE=snp;VARB=0.000722335;OID=.;OPOS=68384008;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:102:102:0:2:99:100:35:64:0:0:36:64:0:2 chr4 68436883 . T C 2094.61 PASS AO=224;DP=229;FAO=226;FDP=226;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=151;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247129;FXX=0.0130999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.8132;QD=37.0727;RBI=0.0358883;REFB=-0.147956;REVB=0.026024;RO=1;SAF=74;SAR=150;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0063953;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00124922;OID=.;OPOS=68436883;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:229:226:1:0:224:226:150:74:1:0:151:75:0:0 chr4 68442968 . A G 478.77 PASS AO=106;DP=202;FAO=106;FDP=202;FR=.;FRO=96;FSAF=45;FSAR=61;FSRF=37;FSRR=59;FWDB=-0.0025137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.193;QD=9.48064;RBI=0.0039456;REFB=-0.0144028;REVB=0.00304122;RO=96;SAF=45;SAR=61;SRF=37;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0349849;STB=0.519127;TYPE=snp;VARB=0.01479;OID=.;OPOS=68442968;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:202:96:96:106:106:61:45:37:59:61:45:37:59 chr4 68484094 . G A 332.02 PASS AO=81;DP=167;FAO=80;FDP=165;FR=.;FRO=85;FSAF=29;FSAR=51;FSRF=39;FSRR=46;FWDB=-0.0122307;FXX=0.0119753;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.853;QD=8.04902;RBI=0.0128139;REFB=-0.00164902;REVB=-0.00382164;RO=83;SAF=29;SAR=52;SRF=38;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0965106;STB=0.552128;TYPE=snp;VARB=0.00132924;OID=.;OPOS=68484094;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:165:83:85:81:80:52:29:38:45:51:29:39:46 chr4 68497597 . C A 206.81 PASS AO=45;DP=87;FAO=45;FDP=87;FR=.;FRO=42;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=0.0144666;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.443;QD=9.50833;RBI=0.0196045;REFB=-0.0267449;REVB=-0.0132308;RO=41;SAF=18;SAR=27;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0347907;STB=0.514279;TYPE=snp;VARB=0.0197065;OID=.;OPOS=68497597;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:41:42:45:45:27:18:18:23:27:18:18:24 chr4 68500171 . A G 407.67 PASS AO=110;DP=247;FAO=110;FDP=247;FR=.;FRO=137;FSAF=46;FSAR=64;FSRF=64;FSRR=73;FWDB=-0.02168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.496;QD=6.60192;RBI=0.02174;REFB=-0.0014446;REVB=-0.00161415;RO=137;SAF=46;SAR=64;SRF=64;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0498241;STB=0.527652;TYPE=snp;VARB=0.00145623;OID=.;OPOS=68500171;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:247:247:137:137:110:110:64:46:64:73:64:46:64:73 chr4 68534392 . C T 293.95 PASS AO=80;DP=189;FAO=82;FDP=191;FR=.;FRO=109;FSAF=32;FSAR=50;FSRF=54;FSRR=55;FWDB=0.0550855;FXX=0.0103622;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.471;QD=6.15609;RBI=0.055712;REFB=-0.0116441;REVB=-0.00833112;RO=107;SAF=31;SAR=49;SRF=54;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12245;STB=0.561343;TYPE=snp;VARB=0.0124788;OID=.;OPOS=68534392;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:191:107:109:80:82:49:31:54:53:50:32:54:55 chr4 68562365 . A G 208.45 PASS AO=49;DP=102;FAO=49;FDP=101;FR=.;FRO=52;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=28;FSRR=24;FWDB=-0.027048;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.755;QD=8.25555;RBI=0.0301774;REFB=-0.0119094;REVB=0.0133821;RO=52;SAF=31;SAR=18;SRF=28;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0912856;STB=0.55074;TYPE=snp;VARB=0.0152534;OID=.;OPOS=68562365;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:101:52:52:49:49:18:31:28:24:18:31:28:24 chr4 68567025 . T G 81.02 PASS AO=19;DP=49;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=19;FSAR=3;FSRF=20;FSRR=10;FWDB=-0.00477477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.896;QD=6.23213;RBI=0.0244667;REFB=-0.00141456;REVB=-0.0239963;RO=28;SAF=18;SAR=1;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.510979;STB=0.67838;TYPE=snp;VARB=0.00174453;OID=.;OPOS=68567025;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:49:52:28:30:19:22:1:18:20:8:3:19:20:10 chr4 68749618 . G A 352.72 PASS AO=78;DP=153;FAO=79;FDP=154;FR=.;FRO=75;FSAF=44;FSAR=35;FSRF=41;FSRR=34;FWDB=-0.00532462;FXX=0.0128197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.666;QD=9.16164;RBI=0.00926278;REFB=-0.0104777;REVB=-0.00757941;RO=73;SAF=43;SAR=35;SRF=41;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0092281;STB=0.505073;TYPE=snp;VARB=0.010838;OID=.;OPOS=68749618;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:154:73:75:78:79:35:43:41:32:35:44:41:34 chr4 68780399 . A G 919.78 PASS AO=274;DP=567;FAO=207;FDP=397;FR=.;FRO=190;FSAF=107;FSAR=100;FSRF=81;FSRR=109;FWDB=-0.000780808;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.78;QD=9.26733;RBI=0.00118892;REFB=-0.0180861;REVB=0.000896587;RO=291;SAF=140;SAR=134;SRF=127;SRR=164;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0699361;STB=0.543275;TYPE=snp;VARB=0.0163843;OID=.;OPOS=68780399;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:567:397:291:190:274:207:134:140:127:164:100:107:81:109 chr4 68784774 . T C 395.77 PASS AO=111;DP=268;FAO=113;FDP=266;FR=.;FRO=153;FSAF=57;FSAR=56;FSRF=64;FSRR=89;FWDB=-0.000611176;FXX=0.00746241;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.847;QD=5.95144;RBI=0.0275378;REFB=-0.00368485;REVB=0.027531;RO=147;SAF=55;SAR=56;SRF=64;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0616285;STB=0.549489;TYPE=snp;VARB=0.00435148;OID=.;OPOS=68784774;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:268:266:147:153:111:113:56:55:64:83:56:57:64:89 chr4 68810246 . G A 372 PASS AO=106;DP=251;FAO=106;FDP=250;FR=.;FRO=144;FSAF=62;FSAR=44;FSRF=93;FSRR=51;FWDB=0.00911578;FXX=0.00398391;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.969;QD=5.95193;RBI=0.0104656;REFB=-0.0106011;REVB=0.00514119;RO=144;SAF=62;SAR=44;SRF=93;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0657462;STB=0.536579;TYPE=snp;VARB=0.013636;OID=.;OPOS=68810246;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:251:250:144:144:106:106:44:62:93:51:44:62:93:51 chr4 68812283 . C T 318.6 PASS AO=61;DP=106;FAO=61;FDP=103;FR=.;FRO=42;FSAF=7;FSAR=54;FSRF=6;FSRR=36;FWDB=-0.0358477;FXX=0.0282992;HRUN=3;LEN=1;MLLD=117.751;QD=12.3727;RBI=0.0383624;REFB=-0.0127663;REVB=0.0136609;RO=42;SAF=7;SAR=54;SRF=6;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0494229;STB=0.527018;TYPE=snp;VARB=0.0128363;OID=.;OPOS=68812283;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:103:42:42:61:61:54:7:6:36:54:7:6:36 chr4 68829109 . C T 173.75 PASS AO=43;DP=93;FAO=43;FDP=93;FR=.;FRO=50;FSAF=27;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=-0.0019316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.52;QD=7.4733;RBI=0.0588958;REFB=-0.00767027;REVB=0.0588641;RO=50;SAF=27;SAR=16;SRF=22;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183171;STB=0.602386;TYPE=snp;VARB=0.00785891;OID=.;OPOS=68829109;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:50:50:43:43:16:27:22:28:16:27:22:28 chr4 68928537 . G A 815.42 PASS AO=231;DP=474;FAO=196;FDP=398;FR=.;FRO=202;FSAF=115;FSAR=81;FSRF=119;FSRR=83;FWDB=0.0326037;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.4138;QD=8.19519;RBI=0.0334736;REFB=-0.026206;REVB=-0.00758197;RO=237;SAF=136;SAR=95;SRF=141;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0059176;STB=0.501243;TYPE=snp;VARB=0.0222044;OID=.;OPOS=68928537;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:474:398:237:202:231:196:95:136:141:96:81:115:119:83 chr4 68935672 . G T 484.71 PASS AO=128;DP=283;FAO=128;FDP=282;FR=.;FRO=154;FSAF=66;FSAR=62;FSRF=62;FSRR=92;FWDB=0.00215879;FXX=0.00353344;HRUN=3;LEN=1;MLLD=271.266;QD=6.87529;RBI=0.00728066;REFB=0.00914102;REVB=0.00695324;RO=154;SAF=66;SAR=62;SRF=62;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111362;STB=0.561537;TYPE=snp;VARB=-0.00913483;OID=.;OPOS=68935672;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:283:282:154:154:128:128:62:66:62:92:62:66:62:92 chr4 68995529 . C T 418.93 PASS AO=102;DP=211;FAO=102;FDP=211;FR=.;FRO=109;FSAF=39;FSAR=63;FSRF=49;FSRR=60;FWDB=0.011097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.5388;QD=7.94172;RBI=0.0225364;REFB=-0.00793318;REVB=0.0196149;RO=108;SAF=39;SAR=63;SRF=49;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0691793;STB=0.536111;TYPE=snp;VARB=0.00879027;OID=.;OPOS=68995529;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:211:108:109:102:102:63:39:49:59:63:39:49:60 chr4 69078113 . T C 288.97 PASS AO=63;DP=122;FAO=64;FDP=122;FR=.;FRO=58;FSAF=35;FSAR=29;FSRF=28;FSRR=30;FWDB=-0.0144444;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.127;QD=9.47432;RBI=0.0149022;REFB=-0.0142697;REVB=0.00366569;RO=58;SAF=35;SAR=28;SRF=28;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0637071;STB=0.530566;TYPE=snp;VARB=0.011784;OID=.;OPOS=69078113;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:58:58:63:64:28:35:28:30:29:35:28:30 chr4 69094507 . T A 324.05 PASS AO=65;DP=117;FAO=66;FDP=118;FR=.;FRO=52;FSAF=34;FSAR=32;FSRF=22;FSRR=30;FWDB=0.00541605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.804;QD=10.9847;RBI=0.0311734;REFB=-0.0198008;REVB=-0.0306993;RO=51;SAF=33;SAR=32;SRF=22;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0613323;STB=0.540501;TYPE=snp;VARB=0.01454;OID=.;OPOS=69094507;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:118:51:52:65:66:32:33:22:29:32:34:22:30 chr4 69094575 . T G 964.56 PASS AO=103;DP=104;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00986381;FXX=0.0192289;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.426;QD=37.8257;RBI=0.0263868;REFB=0;REVB=-0.0244738;RO=0;SAF=49;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.95759e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000158582;OID=.;OPOS=69094575;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:104:102:0:0:103:102:54:49:0:0:54:48:0:0 chr4 69095146 . GA G 46.04 PASS AO=50;DP=166;FAO=56;FDP=154;FR=.;FRO=98;FSAF=16;FSAR=40;FSRF=48;FSRR=50;FWDB=-0.0178358;FXX=0.0374977;HRUN=5;LEN=1;MLLD=8.91974;QD=1.19576;RBI=0.0667366;REFB=-0.0665572;REVB=0.0643091;RO=86;SAF=15;SAR=35;SRF=44;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246781;STB=0.639948;TYPE=del;VARB=0.0823693;OID=.;OPOS=69095147;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:50:153:56:154:98:16:40:48:50:46:86:15:35:44:42 chr4 69095197 . T C 252.43 PASS AO=53;DP=104;FAO=55;FDP=105;FR=.;FRO=50;FSAF=20;FSAR=35;FSRF=16;FSRR=34;FWDB=-0.0173152;FXX=0.00943307;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.284;QD=9.61646;RBI=0.0220083;REFB=-0.022656;REVB=0.013585;RO=49;SAF=20;SAR=33;SRF=16;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0477944;STB=0.522719;TYPE=snp;VARB=0.019285;OID=.;OPOS=69095197;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:105:49:50:53:55:33:20:16:33:35:20:16:34 chr4 69203551 . A T 893.21 PASS AO=92;DP=92;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000181921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.16;QD=38.009;RBI=0.0451263;REFB=0;REVB=0.0451259;RO=0;SAF=51;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.99529e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.41073e-05;OID=.;OPOS=69203551;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:92:94:0:0:92:94:41:51:0:0:43:51:0:0 chr4 69417570 . A G 2655.25 PASS AO=279;DP=281;FAO=279;FDP=279;FR=.;FRO=0;FSAF=146;FSAR=133;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0069783;FXX=0.00711718;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.683;QD=38.0681;RBI=0.00697968;REFB=-0.0491565;REVB=0.000139104;RO=0;SAF=146;SAR=133;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.37365e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.44418e-05;OID=.;OPOS=69417570;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:281:279:0:0:279:279:133:146:0:0:133:146:0:0 chr4 69512847 . T G 1379.29 PASS AO=193;DP=243;FAO=193;FDP=240;FR=.;FRO=47;FSAF=108;FSAR=85;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=0.0155365;FXX=0.0123452;HRUN=6;LEN=1;MLLD=204.867;QD=22.9881;RBI=0.017101;REFB=0.0112274;REVB=-0.00714569;RO=46;SAF=108;SAR=85;SRF=18;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0614661;STB=0.530629;TYPE=snp;VARB=-0.000959836;OID=.;OPOS=69512847;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:243:240:46:47:193:193:85:108:18:28:85:108:19:28 chr4 69519916 . C T 293.98 PASS AO=114;DP=342;FAO=117;FDP=350;FR=.;FRO=233;FSAF=57;FSAR=60;FSRF=85;FSRR=148;FWDB=-0.0101889;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.148;QD=3.35977;RBI=0.0296979;REFB=-0.00921817;REVB=-0.0278954;RO=228;SAF=57;SAR=57;SRF=85;SRR=143;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148836;STB=0.581847;TYPE=snp;VARB=0.0230022;OID=.;OPOS=69519916;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:342:350:228:233:114:117:57:57:85:143:60:57:85:148 chr4 69536084 . A C 337.66 PASS AO=78;DP=155;FAO=78;FDP=155;FR=.;FRO=77;FSAF=48;FSAR=30;FSRF=40;FSRR=37;FWDB=-0.0167107;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.046;QD=8.71383;RBI=0.0323966;REFB=-0.0255861;REVB=-0.0277541;RO=74;SAF=48;SAR=30;SRF=38;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0929645;STB=0.549168;TYPE=snp;VARB=0.0201572;OID=.;OPOS=69536084;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:74:77:78:78:30:48:38:36:30:48:40:37 chr4 69687987 . C A 1926.66 PASS AO=203;DP=205;FAO=203;FDP=203;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=129;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00224864;FXX=0.00975562;HRUN=2;LEN=1;MLLD=250.07;QD=37.9637;RBI=0.00309688;REFB=-0.0625373;REVB=-0.00212938;RO=1;SAF=74;SAR=129;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00367837;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.77769e-05;OID=.;OPOS=69687987;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:205:203:1:0:203:203:129:74:0:1:129:74:0:0 chr4 69795626 . C T 260.52 PASS AO=43;DP=112;FAO=59;FDP=115;FR=.;FRO=56;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=26;FSRR=30;FWDB=0.01902;FXX=0.00861995;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.6999;QD=9.0617;RBI=0.107132;REFB=-0.0304509;REVB=-0.105431;RO=36;SAF=32;SAR=11;SRF=26;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.023519;STB=0.53804;TYPE=snp;VARB=0.0182605;OID=.;OPOS=69795626;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:115:36:56:43:59:11:32:26:10:27:32:26:30 chr4 69964271 . A G 140.82 PASS AO=32;DP=66;FAO=32;FDP=65;FR=.;FRO=33;FSAF=28;FSAR=4;FSRF=32;FSRR=1;FWDB=0.00451775;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.505;QD=8.66587;RBI=0.0139565;REFB=0.0193395;REVB=0.0132051;RO=30;SAF=28;SAR=4;SRF=29;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219292;STB=0.631515;TYPE=snp;VARB=-0.0159395;OID=.;OPOS=69964271;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:65:30:33:32:32:4:28:29:1:4:28:32:1 chr4 69964338 . T C 197.85 PASS AO=43;DP=87;FAO=44;FDP=86;FR=.;FRO=42;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=39;FSRR=3;FWDB=-0.003303;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.144;QD=9.20216;RBI=0.0320841;REFB=-0.0522733;REVB=0.0319136;RO=43;SAF=28;SAR=15;SRF=39;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.282104;STB=0.668267;TYPE=snp;VARB=0.0121255;OID=.;OPOS=69964338;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:86:43:42:43:44:15:28:39:4:16:28:39:3 chr4 69972949 . C G 972.01 PASS AO=246;DP=450;FAO=213;FDP=397;FR=.;FRO=184;FSAF=100;FSAR=113;FSRF=81;FSRR=103;FWDB=0.00170707;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.557;QD=9.79359;RBI=0.0019419;REFB=-0.0182573;REVB=-0.000925675;RO=194;SAF=117;SAR=129;SRF=84;SRR=110;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0348056;STB=0.513636;TYPE=snp;VARB=0.0179242;OID=.;OPOS=69972949;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:450:397:194:184:246:213:129:117:84:110:113:100:81:103 chr4 69972952 . C T 963.41 PASS AO=246;DP=449;FAO=213;FDP=398;FR=.;FRO=185;FSAF=100;FSAR=113;FSRF=80;FSRR=105;FWDB=0.0136237;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.123;QD=9.68247;RBI=0.0414824;REFB=-0.00115056;REVB=-0.0391814;RO=201;SAF=117;SAR=129;SRF=90;SRR=111;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0231497;STB=0.517322;TYPE=snp;VARB=0.0029747;OID=.;OPOS=69972952;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:449:398:201:185:246:213:129:117:90:111:113:100:80:105 chr4 70296603 . A G 147.38 PASS AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.104779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.6184;QD=36.8438;RBI=0.159098;REFB=0;REVB=-0.119723;RO=0;SAF=7;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000593663;OID=.;OPOS=70296603;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:16:0:0:16:16:9:7:0:0:9:7:0:0 chr4 70296662 . C T 100.21 PASS AO=20;DP=37;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=1;FWDB=-0.0157076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.27;QD=10.834;RBI=0.0194424;REFB=-0.0112069;REVB=-0.0114575;RO=17;SAF=6;SAR=14;SRF=16;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.493154;STB=0.773624;TYPE=snp;VARB=0.00664182;OID=.;OPOS=70296662;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:37:37:17:17:20:20:14:6:16:1:14:6:16:1 chr4 70355211 . T C 1550.77 PASS AO=163;DP=164;FAO=164;FDP=164;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00766667;FXX=0.00606024;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.779;QD=37.8236;RBI=0.0107468;REFB=-0.0317473;REVB=-0.00753106;RO=1;SAF=86;SAR=77;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00613985;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.45962e-06;OID=.;OPOS=70355211;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:164:164:1:0:163:164:77:86:0:1:78:86:0:0 chr4 70513139 . C T 1160.48 PASS AO=127;DP=129;FAO=126;FDP=129;FR=.;FRO=3;FSAF=82;FSAR=44;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.012808;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.4081;QD=35.984;RBI=0.0450769;REFB=-0.0964996;REVB=0.043219;RO=1;SAF=83;SAR=44;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106765;STB=0.500406;TYPE=snp;VARB=0.00262377;OID=.;OPOS=70513139;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:129:129:1:3:127:126:44:83:0:1:44:82:2:1 chr4 70802218 . T C 211.7 PASS AO=50;DP=103;FAO=50;FDP=103;FR=.;FRO=53;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=28;FSRR=25;FWDB=-0.00788277;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=236.943;QD=8.22134;RBI=0.0185538;REFB=-0.0110617;REVB=-0.016796;RO=53;SAF=26;SAR=24;SRF=28;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00771315;STB=0.504278;TYPE=snp;VARB=0.0119161;OID=.;OPOS=70802218;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:53:53:50:50:24:26:28:25:24:26:28:25 chr4 70807747 . T C 221.38 PASS AO=56;DP=123;FAO=56;FDP=122;FR=.;FRO=66;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=39;FSRR=27;FWDB=0.00247039;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.798;QD=7.2582;RBI=0.00896381;REFB=0.00210072;REVB=-0.00861667;RO=66;SAF=30;SAR=26;SRF=39;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0541793;STB=0.530131;TYPE=snp;VARB=-0.00274086;OID=.;OPOS=70807747;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:122:66:66:56:56:26:30:39:27:26:30:39:27 chr4 70807771 . C T 229.05 PASS AO=59;DP=128;FAO=59;FDP=131;FR=.;FRO=72;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=36;FSRR=36;FWDB=0.0190087;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.3106;QD=6.99393;RBI=0.0199362;REFB=-0.0162692;REVB=0.00600982;RO=69;SAF=30;SAR=29;SRF=33;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0292758;STB=0.504657;TYPE=snp;VARB=0.0249418;OID=.;OPOS=70807771;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:131:69:72:59:59:29:30:33:36:29:30:36:36 chr4 70898953 . C T 375.37 PASS AO=102;DP=246;FAO=104;FDP=239;FR=.;FRO=135;FSAF=43;FSAR=61;FSRF=72;FSRR=63;FWDB=-0.0412715;FXX=0.0439982;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.7523;QD=6.28234;RBI=0.049451;REFB=-0.0266892;REVB=-0.0272408;RO=122;SAF=41;SAR=61;SRF=68;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153549;STB=0.568141;TYPE=snp;VARB=0.0338806;OID=.;OPOS=70898953;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:246:239:122:135:102:104:61:41:68:54:61:43:72:63 chr4 70944452 . G A 3796.69 PASS AO=423;DP=430;FAO=394;FDP=394;FR=.;FRO=0;FSAF=172;FSAR=222;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0233427;FXX=0.0149996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.804;QD=38.5451;RBI=0.025224;REFB=0;REVB=0.00955848;RO=0;SAF=184;SAR=239;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.9935e-05;OID=.;OPOS=70944452;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:430:394:0:0:423:394:239:184:0:0:222:172:0:0 chr4 71062256 . C T 435.55 PASS AO=105;DP=211;FAO=105;FDP=215;FR=.;FRO=110;FSAF=24;FSAR=81;FSRF=28;FSRR=82;FWDB=-0.0111985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.0064;QD=8.10325;RBI=0.0870241;REFB=-0.0409872;REVB=-0.0863005;RO=105;SAF=24;SAR=81;SRF=27;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0360104;STB=0.51846;TYPE=snp;VARB=0.0543486;OID=.;OPOS=71062256;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:215:105:110:105:105:81:24:27:78:81:24:28:82 chr4 71062426 . C T 262.24 PASS AO=67;DP=146;FAO=67;FDP=146;FR=.;FRO=79;FSAF=12;FSAR=55;FSRF=16;FSRR=63;FWDB=0.00954896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.4141;QD=7.18475;RBI=0.0292027;REFB=0.00307842;REVB=0.0275974;RO=79;SAF=12;SAR=55;SRF=16;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0376521;STB=0.520968;TYPE=snp;VARB=-0.00405294;OID=.;OPOS=71062426;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:79:79:67:67:55:12:16:63:55:12:16:63 chr4 71068058 . T C 157.44 PASS AO=37;DP=77;FAO=37;FDP=77;FR=.;FRO=40;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=0.0152079;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.239;QD=8.17864;RBI=0.0276308;REFB=-0.00741533;REVB=-0.023069;RO=40;SAF=17;SAR=20;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145373;STB=0.508111;TYPE=snp;VARB=0.0073725;OID=.;OPOS=71068058;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:40:40:37:37:20:17:19:21:20:17:19:21 chr4 71068489 . T C 240.2 PASS AO=54;DP=106;FAO=54;FDP=106;FR=.;FRO=52;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=26;FSRR=26;FWDB=0.00326161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.506;QD=9.06399;RBI=0.0294232;REFB=-0.00894486;REVB=0.0292418;RO=52;SAF=25;SAR=29;SRF=26;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0329949;STB=0.518213;TYPE=snp;VARB=0.00613964;OID=.;OPOS=71068489;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:52:52:54:54:29:25:26:26:29:25:26:26 chr4 71115060 . G A 122.19 PASS AO=24;DP=42;FAO=24;FDP=43;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0459248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.019;QD=11.3664;RBI=0.0465965;REFB=-0.0244621;REVB=-0.00788304;RO=18;SAF=9;SAR=15;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0561095;STB=0.521454;TYPE=snp;VARB=0.0203178;OID=.;OPOS=71115060;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:42:43:18:19:24:24:15:9:8:10:15:9:8:11 chr4 71115152 . T C 231.76 PASS AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00217975;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.523;QD=37.0816;RBI=0.00491268;REFB=0;REVB=-0.00440262;RO=0;SAF=9;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.72289e-05;OID=.;OPOS=71115152;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:25:25:0:0:25:25:16:9:0:0:16:9:0:0 chr4 71201388 . C T 529.54 PASS AO=55;DP=56;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0255322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.6824;QD=36.5203;RBI=0.0279538;REFB=-0.104541;REVB=0.0113806;RO=1;SAF=49;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0722727;STB=0.533321;TYPE=snp;VARB=0.0133627;OID=.;OPOS=71201388;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:56:58:1:1:55:57:6:49:0:1:7:50:0:1 chr4 71201648 . T G 127.94 PASS AO=38;DP=95;FAO=38;FDP=96;FR=.;FRO=58;FSAF=26;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=43;FWDB=-0.115201;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.4724;QD=5.33095;RBI=0.132572;REFB=-0.0221772;REVB=-0.065606;RO=56;SAF=26;SAR=12;SRF=14;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.436338;STB=0.743897;TYPE=snp;VARB=0.0386408;OID=.;OPOS=71201648;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:96:56:58:38:38:12:26:14:42:12:26:15:43 chr4 71232430 . T C 526.99 PASS AO=54;DP=54;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.1811;QD=37.6425;RBI=0.0228516;REFB=0;REVB=-0.006952;RO=0;SAF=2;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0874e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.16739e-05;OID=.;OPOS=71232430;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:54:56:0:0:54:56:52:2:0:0:54:2:0:0 chr4 71232701 . C T 198.93 PASS AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0173571;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0932;QD=33.1542;RBI=0.0186153;REFB=-0.0926961;REVB=0.00672755;RO=1;SAF=6;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0264628;STB=0.514273;TYPE=snp;VARB=0.0375721;OID=.;OPOS=71232701;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:24:24:1:1:23:23:17:6:0:1:17:6:0:1 chr4 71255767 . A G 1158.24 PASS AO=119;DP=119;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0228059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.011;QD=38.6079;RBI=0.0253838;REFB=0;REVB=0.0111458;RO=0;SAF=53;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.00457e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.12575e-05;OID=.;OPOS=71255767;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:119:120:0:0:119:120:66:53:0:0:66:54:0:0 chr4 71384488 . C T 1000.76 PASS AO=105;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00377417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.438;QD=38.1243;RBI=0.00671325;REFB=0;REVB=0.00555187;RO=0;SAF=50;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.80947e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.0401e-06;OID=.;OPOS=71384488;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:105:105:0:0:105:105:55:50:0:0:55:50:0:0 chr4 71384537 . C T 225.62 PASS AO=59;DP=138;FAO=61;FDP=139;FR=.;FRO=78;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=38;FSRR=40;FWDB=-0.00697727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.761;QD=6.49259;RBI=0.0125324;REFB=0.000138897;REVB=-0.0104105;RO=76;SAF=26;SAR=33;SRF=38;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0600996;STB=0.515864;TYPE=snp;VARB=-0.00020072;OID=.;OPOS=71384537;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:139:76:78:59:61:33:26:38:38:33:28:38:40 chr4 71396989 . C T 264.15 PASS AO=68;DP=150;FAO=68;FDP=150;FR=.;FRO=82;FSAF=10;FSAR=58;FSRF=33;FSRR=49;FWDB=-0.0374804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.8653;QD=7.04407;RBI=0.0378205;REFB=-0.00916108;REVB=0.0050605;RO=82;SAF=10;SAR=58;SRF=33;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.353143;STB=0.699707;TYPE=snp;VARB=0.00813377;OID=.;OPOS=71396989;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:150:82:82:68:68:58:10:33:49:58:10:33:49 chr4 71472164 . T C 11.82 PASS AO=4;DP=18;FAO=4;FDP=19;FR=.;FRO=15;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=-0.0992034;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5333;QD=2.48849;RBI=0.103397;REFB=0.0101851;REVB=0.0291472;RO=14;SAF=1;SAR=3;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0508503;STB=0.517154;TYPE=snp;VARB=-0.0544694;OID=.;OPOS=71472164;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:18:19:14:15:4:4:3:1:4:10:3:1:4:11 chr4 71657772 . G A 1768.88 PASS AO=182;DP=183;FAO=185;FDP=185;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0197609;FXX=0.0463894;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.562;QD=38.2461;RBI=0.019761;REFB=0;REVB=-5.70823e-05;RO=0;SAF=72;SAR=110;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.33854e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000372792;OID=.;OPOS=71657772;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:183:185:0:0:182:185:110:72:0:0:111:74:0:0 chr4 71704965 . C T 126.06 PASS AO=13;DP=13;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.131507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3605;QD=36.017;RBI=0.19749;REFB=0;REVB=0.147336;RO=0;SAF=8;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60098e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0108325;OID=.;OPOS=71704965;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:14:0:0:13:14:5:8:0:0:5:9:0:0 chr4 71849697 . C T 1313.46 PASS AO=137;DP=137;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148805;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.898;QD=38.3493;RBI=0.047899;REFB=0;REVB=0.045529;RO=0;SAF=49;SAR=88;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.883e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.28039e-05;OID=.;OPOS=71849697;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:137:137:0:0:137:137:88:49:0:0:88:49:0:0 chr4 71849888 . G T 1690.06 PASS AO=105;DP=181;FAO=175;FDP=175;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=75;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0345751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.874;QD=38.6299;RBI=0.135121;REFB=0;REVB=0.130623;RO=0;SAF=71;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000926559;OID=.;OPOS=71849888;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:174:175:0:0:105:175:34:71:0:0:100:75:0:0 chr4 72425863 . C T 904.13 PASS AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100269;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.84;QD=38.0687;RBI=0.045431;REFB=0;REVB=-0.0443107;RO=0;SAF=34;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.04002e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000114864;OID=.;OPOS=72425863;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:95:95:0:0:95:95:61:34:0:0:61:34:0:0 chr4 72433668 . CTGTT C 108.61 PASS AO=35;DP=132;FAO=39;FDP=111;FR=.;FRO=72;FSAF=7;FSAR=32;FSRF=9;FSRR=63;FWDB=-0.0175512;FXX=0.059317;HRUN=1;LEN=4;MLLD=261.917;QD=3.91373;RBI=0.0196772;REFB=0.000988555;REVB=0.00889655;RO=60;SAF=6;SAR=29;SRF=6;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157307;STB=0.564965;TYPE=del;VARB=-0.00239508;OID=.;OPOS=72433669;OREF=TGTT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:35:104:39:111:72:7:32:9:63:99:60:6:29:6:54 chr4 72436804 . G A 2287.71 PASS AO=242;DP=246;FAO=242;FDP=242;FR=.;FRO=0;FSAF=115;FSAR=127;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00179089;FXX=0.0162595;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.559;QD=37.8134;RBI=0.00572828;REFB=-0.0462526;REVB=-0.00544114;RO=2;SAF=115;SAR=127;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00744621;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.71482e-05;OID=.;OPOS=72436804;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:92:246:242:2:0:242:242:127:115:0:2:127:115:0:0 chr4 72618296 . T C 2721.9 PASS AO=295;DP=307;FAO=301;FDP=306;FR=.;FRO=5;FSAF=120;FSAR=181;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0614065;FXX=0.00325722;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.187;QD=35.5804;RBI=0.0760896;REFB=-0.182603;REVB=0.0449317;RO=5;SAF=117;SAR=178;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133502;STB=0.500023;TYPE=snp;VARB=0.00300695;OID=.;OPOS=72618296;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:307:306:5:5:295:301:178:117:4:1:181:120:2:3 chr4 72618323 . G T 540.02 PASS AO=146;DP=339;FAO=149;FDP=339;FR=.;FRO=190;FSAF=51;FSAR=98;FSRF=66;FSRR=124;FWDB=0.010201;FXX=0.00877167;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.6891;QD=6.37187;RBI=0.0426706;REFB=-0.0112892;REVB=0.0414333;RO=190;SAF=51;SAR=95;SRF=66;SRR=124;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00218279;STB=0.503159;TYPE=snp;VARB=0.0186099;OID=.;OPOS=72618323;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:339:339:190:190:146:149:95:51:66:124:98:51:66:124 chr4 72649774 . G A 287.99 PASS AO=62;DP=119;FAO=63;FDP=121;FR=.;FRO=58;FSAF=21;FSAR=42;FSRF=16;FSRR=42;FWDB=-0.0102993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.8611;QD=9.52031;RBI=0.0104045;REFB=-0.0161148;REVB=0.00147519;RO=57;SAF=20;SAR=42;SRF=15;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0607376;STB=0.531636;TYPE=snp;VARB=0.0175458;OID=.;OPOS=72649774;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:121:57:58:62:63:42:20:15:42:42:21:16:42 chr4 73414286 . C T 491.63 PASS AO=106;DP=205;FAO=109;FDP=208;FR=.;FRO=99;FSAF=55;FSAR=54;FSRF=42;FSRR=57;FWDB=0.0125862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.98;QD=9.45434;RBI=0.0262109;REFB=-0.0172551;REVB=0.0229913;RO=99;SAF=55;SAR=51;SRF=42;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0832838;STB=0.53821;TYPE=snp;VARB=0.0157658;OID=.;OPOS=73414286;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:208:99:99:106:109:51:55:42:57:54:55:42:57 chr4 73433122 . GA G 93.03 PASS AO=39;DP=90;FAO=40;FDP=83;FR=.;FRO=43;FSAF=32;FSAR=8;FSRF=38;FSRR=5;FWDB=-0.115152;FXX=0.0235266;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.7162;QD=4.48327;RBI=0.173609;REFB=-0.0562666;REVB=-0.129923;RO=37;SAF=31;SAR=8;SRF=32;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101116;STB=0.573737;TYPE=del;VARB=0.0487421;OID=.;OPOS=73433123;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:39:84:40:83:43:32:8:38:5:93:37:31:8:32:5 chr4 73930552 . G A 439.83 PASS AO=93;DP=171;FAO=93;FDP=170;FR=.;FRO=77;FSAF=52;FSAR=41;FSRF=42;FSRR=35;FWDB=-0.0210755;FXX=0.0116272;HRUN=3;LEN=1;MLLD=173.842;QD=10.3488;RBI=0.0249141;REFB=0.00388896;REVB=-0.0132867;RO=77;SAF=52;SAR=41;SRF=42;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114967;STB=0.506276;TYPE=snp;VARB=-0.00348624;OID=.;OPOS=73930552;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:170:77:77:93:93:41:52:42:35:41:52:42:35 chr4 73956736 . G A 224.51 PASS AO=41;DP=67;FAO=41;FDP=67;FR=.;FRO=26;FSAF=30;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=4;FWDB=0.0274033;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.577;QD=13.4033;RBI=0.0274058;REFB=-0.0192526;REVB=0.000372388;RO=26;SAF=30;SAR=11;SRF=22;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109747;STB=0.55966;TYPE=snp;VARB=0.0213757;OID=.;OPOS=73956736;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:67:67:26:26:41:41:11:30:22:4:11:30:22:4 chr4 73991006 . T C 1195.56 PASS AO=125;DP=126;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0456979;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.05;QD=38.2578;RBI=0.0476836;REFB=0;REVB=0.0136174;RO=0;SAF=7;SAR=118;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000117553;OID=.;OPOS=73991006;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:126:125:0:0:125:125:118:7:0:0:118:7:0:0 chr4 74124071 . TCCGCCTCCACCG T 45.81 PASS AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.01047;FXX=0;HRUN=2;LEN=12;MLLD=239.29;QD=7.96667;RBI=0.0112008;REFB=-0.0186033;REVB=0.00397949;RO=1;SAF=4;SAR=8;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0998765;STB=0.605879;TYPE=del;VARB=0.0246199;OID=.;OPOS=74124072;OREF=CCGCCTCCACCG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:12:14:12:23:11:4:8:6:5:35:1:4:8:1:0 chr4 74285239 . C T 65.24 PASS AO=17;DP=42;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.0960255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.559;QD=6.21373;RBI=0.0961748;REFB=-0.012044;REVB=0.00535635;RO=24;SAF=6;SAR=11;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153997;STB=0.578852;TYPE=snp;VARB=0.0147128;OID=.;OPOS=74285239;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:42:42:24:25:17:17:11:6:12:12:11:6:12:13 chr4 74302071 . T A 287.59 PASS AO=68;DP=152;FAO=73;FDP=157;FR=.;FRO=84;FSAF=45;FSAR=28;FSRF=36;FSRR=48;FWDB=-0.000353662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.548;QD=7.32717;RBI=0.00289632;REFB=-0.0130231;REVB=0.00287465;RO=84;SAF=43;SAR=25;SRF=36;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204202;STB=0.601238;TYPE=snp;VARB=0.0120548;OID=.;OPOS=74302071;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:157:84:84:68:73:25:43:36:48:28:45:36:48 chr4 74302870 . T C 176.69 PASS AO=69;DP=184;FAO=67;FDP=198;FR=.;FRO=131;FSAF=44;FSAR=23;FSRF=90;FSRR=41;FWDB=-0.0638426;FXX=0.00502487;HRUN=3;LEN=1;MLLD=39.2868;QD=3.56941;RBI=0.0660885;REFB=-0.0348047;REVB=0.0170826;RO=115;SAF=46;SAR=23;SRF=74;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0284368;STB=0.522543;TYPE=snp;VARB=0.0612543;OID=.;OPOS=74302870;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:198:115:131:69:67:23:46:74:41:23:44:90:41 chr4 74318330 . A G 799.47 PASS AO=86;DP=88;FAO=87;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0625615;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.535;QD=36.3394;RBI=0.0706237;REFB=-0.0894867;REVB=-0.0327683;RO=1;SAF=46;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101887;STB=0.505262;TYPE=snp;VARB=0.000591858;OID=.;OPOS=74318330;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:88:88:1:1:86:87:40:46:1:0:40:47:1:0 chr4 74442349 . G C 265.56 PASS AO=70;DP=154;FAO=69;FDP=153;FR=.;FRO=84;FSAF=52;FSAR=17;FSRF=43;FSRR=41;FWDB=0.00808225;FXX=0.00649309;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.701;QD=6.94262;RBI=0.00819519;REFB=-0.00759916;REVB=-0.00135583;RO=82;SAF=53;SAR=17;SRF=42;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.27109;STB=0.651216;TYPE=snp;VARB=0.0103215;OID=.;OPOS=74442349;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:153:82:84:70:69:17:53:42:40:17:52:43:41 chr4 74447510 . A C 487.41 PASS AO=111;DP=218;FAO=111;FDP=217;FR=.;FRO=106;FSAF=42;FSAR=69;FSRF=44;FSRR=62;FWDB=-0.00446261;FXX=0.00458695;HRUN=5;LEN=1;MLLD=178.371;QD=8.98454;RBI=0.0105826;REFB=-0.00623192;REVB=0.00959561;RO=105;SAF=42;SAR=69;SRF=44;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0379345;STB=0.518884;TYPE=snp;VARB=0.0050597;OID=.;OPOS=74447510;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:218:217:105:106:111:111:69:42:44:61:69:42:44:62 chr4 74451073 . A G 434.14 PASS AO=113;DP=248;FAO=113;FDP=247;FR=.;FRO=134;FSAF=65;FSAR=48;FSRF=69;FSRR=65;FWDB=0.00387311;FXX=0.0040321;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.769;QD=7.03058;RBI=0.00474878;REFB=-0.0143071;REVB=-0.00274771;RO=133;SAF=65;SAR=48;SRF=69;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.055876;STB=0.533129;TYPE=snp;VARB=0.0185718;OID=.;OPOS=74451073;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:248:247:133:134:113:113:48:65:69:64:48:65:69:65 chr4 74714084 . T C 2700.64 PASS AO=280;DP=280;FAO=282;FDP=282;FR=.;FRO=0;FSAF=146;FSAR=136;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.679;QD=38.3069;RBI=0.0353941;REFB=0;REVB=0.031211;RO=0;SAF=146;SAR=134;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.34114e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.98903e-05;OID=.;OPOS=74714084;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:280:282:0:0:280:282:134:146:0:0:136:146:0:0 chr4 74863997 . T C 919.9 PASS AO=108;DP=117;FAO=109;FDP=117;FR=.;FRO=8;FSAF=58;FSAR=51;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.114572;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.6162;QD=31.4495;RBI=0.118942;REFB=-0.057331;REVB=0.0319474;RO=9;SAF=58;SAR=50;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.045915;STB=0.519318;TYPE=snp;VARB=0.00545299;OID=.;OPOS=74863997;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:117:117:9:8:108:109:50:58:2:7:51:58:2:6 chr4 74964625 . T C 107.27 PASS AO=23;DP=45;FAO=23;FDP=45;FR=.;FRO=22;FSAF=1;FSAR=22;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.0021891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.86;QD=9.53528;RBI=0.00254508;REFB=-0.00405026;REVB=-0.00129817;RO=21;SAF=1;SAR=22;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.625893;STB=0.876357;TYPE=snp;VARB=0.00615787;OID=.;OPOS=74964625;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:45:45:21:22:23:23:22:1:9:12:22:1:10:12 chr4 75023609 . T C 399.68 PASS AO=42;DP=44;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.15677;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.7539;QD=35.5271;RBI=0.157024;REFB=0.0117853;REVB=0.00893037;RO=2;SAF=22;SAR=20;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00203384;STB=0.511623;TYPE=snp;VARB=-0.00402145;OID=.;OPOS=75023609;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:44:45:2:1:42:44:20:22:1:1:21:23:0:1 chr4 75023709 . C T 255.57 PASS AO=25;DP=34;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0516015;FXX=0.117612;HRUN=4;LEN=1;MLLD=92.484;QD=34.0761;RBI=0.0632298;REFB=0;REVB=0.0365416;RO=0;SAF=13;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94263e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00799886;OID=.;OPOS=75023709;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:26:30:0:0:25:30:12:13:0:0:12:18:0:0 chr4 75046465 . C G 870.42 PASS AO=90;DP=92;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109379;FXX=0.0520779;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.2699;QD=38.2602;RBI=0.0331122;REFB=0;REVB=0.0312535;RO=0;SAF=36;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00237072;OID=.;OPOS=75046465;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:92:91:0:0:90:91:54:36:0:0:55:36:0:0 chr4 75248434 . A G 1752.48 PASS AO=183;DP=190;FAO=184;FDP=184;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00895793;FXX=0.0315773;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.939;QD=38.0973;RBI=0.0247819;REFB=-0.0387271;REVB=-0.0231062;RO=0;SAF=81;SAR=102;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.22096e-05;OID=.;OPOS=75248434;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:190:184:0:0:183:184:102:81:0:0:103:81:0:0 chr4 75254282 . G A 3265.96 PASS AO=341;DP=341;FAO=341;FDP=341;FR=.;FRO=0;FSAF=145;FSAR=196;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0144309;FXX=0.00872068;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.283;QD=38.3104;RBI=0.0563095;REFB=0;REVB=0.0544289;RO=0;SAF=145;SAR=196;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000121236;OID=.;OPOS=75254282;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:341:341:0:0:341:341:196:145:0:0:196:145:0:0 chr4 75675841 . A T 127.28 PASS AO=42;DP=115;FAO=42;FDP=115;FR=.;FRO=73;FSAF=13;FSAR=29;FSRF=19;FSRR=54;FWDB=-0.00757406;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=246.224;QD=4.42699;RBI=0.00769851;REFB=-0.00823269;REVB=0.00137865;RO=73;SAF=13;SAR=29;SRF=19;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0660532;STB=0.537601;TYPE=snp;VARB=0.0137783;OID=.;OPOS=75675841;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:73:73:42:42:29:13:19:54:29:13:19:54 chr4 75719517 . A C 59.22 PASS AO=9;DP=19;FAO=11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=0.0766017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.248;QD=11.2794;RBI=0.0769036;REFB=-0.0320843;REVB=-0.006807;RO=10;SAF=1;SAR=8;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166059;STB=0.545376;TYPE=snp;VARB=0.0219945;OID=.;OPOS=75719517;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:19:21:10:10:9:11:8:1:2:8:8:3:2:8 chr4 75858604 . AG A 135.19 PASS AO=15;DP=22;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.398812;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.0443;QD=23.5107;RBI=0.399175;REFB=0;REVB=-0.0170195;RO=6;SAF=2;SAR=13;SRF=5;SRR=1;SSEN=0.5;SSEP=0;SSSB=-0.466636;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0279492;OID=.;OPOS=75858605;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:15:22:23:23:0:7:16:0:0:12:6:2:13:5:1 chr4 76407217 . A ACT,T 2470 PASS AO=217,44;DP=281;FAO=221,44;FDP=265;FR=.;FRO=0;FSAF=105,36;FSAR=116,8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0274927,0.0532763;FXX=0.0148693;HRUN=0,1;LEN=2,1;MLLD=190.043,94.4751;QD=37.2829;RBI=0.0388899,0.0536799;REFB=0,0;REVB=0.027506,0.00657012;RO=17;SAF=103,36;SAR=114,8;SRF=13;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0400474,0.0447965;STB=0.5,0.5;TYPE=ins,snp;VARB=0.00597465,-0.00437097;OID=.,.;OPOS=76407218,76407217;OREF=-,A;OALT=CT,T;OMAPALT=ACT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:27:281:265:17:0:217,44:221,44:114,8:103,36:13:4:116,8:105,36:0:0 chr4 76407219 . T C 2465.68 PASS AO=269;DP=277;FAO=269;FDP=269;FR=.;FRO=0;FSAF=145;FSAR=124;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000140481;FXX=0.0288798;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.304;QD=36.6644;RBI=0.0193544;REFB=-0.0239598;REVB=0.0193539;RO=4;SAF=145;SAR=124;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0151282;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.29785e-06;OID=.;OPOS=76407219;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:277:269:4:0:269:269:124:145:0:4:124:145:0:0 chr4 76720885 . T C 1727.3 PASS AO=189;DP=194;FAO=189;FDP=194;FR=.;FRO=5;FSAF=83;FSAR=106;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.00210922;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.411;QD=35.6144;RBI=0.00702142;REFB=-0.122995;REVB=0.00669713;RO=3;SAF=83;SAR=106;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00686342;STB=0.501024;TYPE=snp;VARB=0.000510288;OID=.;OPOS=76720885;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:194:194:3:5:189:189:106:83:2:1:106:83:2:3 chr4 76722353 . G A 644.49 PASS AO=71;DP=72;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.05748;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.4636;QD=35.3146;RBI=0.0603058;REFB=-0.185301;REVB=-0.0182438;RO=0;SAF=27;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508769;TYPE=snp;VARB=0.00675681;OID=.;OPOS=76722353;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:72:73:0:1:71:72:44:27:0:0:44:28:1:0 chr4 76787673 . T C 2245.3 PASS AO=221;DP=225;FAO=235;FDP=235;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=142;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0219485;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.781;QD=38.2179;RBI=0.109054;REFB=0;REVB=0.106823;RO=0;SAF=92;SAR=129;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.57041e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000255024;OID=.;OPOS=76787673;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:225:235:0:0:221:235:129:92:0:0:142:93:0:0 chr4 76793228 . A G 1920.99 PASS AO=203;DP=205;FAO=205;FDP=205;FR=.;FRO=0;FSAF=134;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174184;FXX=0.00485413;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.72;QD=37.4828;RBI=0.198416;REFB=-0.0179242;REVB=-0.19765;RO=2;SAF=133;SAR=70;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00710852;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.14351e-05;OID=.;OPOS=76793228;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:205:205:2:0:203:205:70:133:2:0:71:134:0:0 chr4 76794345 . T G 3095.05 PASS AO=317;DP=319;FAO=326;FDP=326;FR=.;FRO=0;FSAF=162;FSAR=164;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0119869;FXX=0.00609737;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.63;QD=37.976;RBI=0.0131358;REFB=-0.0125451;REVB=0.0053724;RO=0;SAF=160;SAR=157;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.05476e-05;OID=.;OPOS=76794345;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:319:326:0:0:317:326:157:160:0:0:164:162:0:0 chr4 76805902 . C T 1936.97 PASS AO=202;DP=206;FAO=202;FDP=202;FR=.;FRO=0;FSAF=118;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0178763;FXX=0.0194165;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.186;QD=38.3559;RBI=0.0203592;REFB=0;REVB=-0.00974331;RO=0;SAF=118;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.57156e-06;OID=.;OPOS=76805902;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:91:206:202:0:0:202:202:84:118:0:0:84:118:0:0 chr4 76807180 . G A 17.57 PASS AO=4;DP=18;FAO=5;FDP=17;FR=.,HEALED;FRO=12;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.0233254;FXX=0.0555247;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.777;QD=4.13471;RBI=0.278789;REFB=0.0111798;REVB=0.277812;RO=8;SAF=3;SAR=1;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.37999;STB=0.732528;TYPE=snp;VARB=-0.0078886;OID=.;OPOS=76807180;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:18:17:8:12:4:5:1:3:3:5:2:3:3:9 chr4 76807218 . C G 496.83 PASS AO=84;DP=125;FAO=84;FDP=125;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=70;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=-0.0152608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.4619;QD=15.8985;RBI=0.0160504;REFB=-0.0231531;REVB=0.00497228;RO=40;SAF=14;SAR=70;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.282944;STB=0.6513;TYPE=snp;VARB=0.027732;OID=.;OPOS=76807218;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:40:41:84:84:70:14:20:20:70:14:20:21 chr4 76807249 . C G 272.37 PASS AO=59;DP=111;FAO=59;FDP=112;FR=.;FRO=53;FSAF=6;FSAR=53;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=-0.0202679;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.892;QD=9.72738;RBI=0.020296;REFB=-0.00891965;REVB=-0.00106767;RO=50;SAF=6;SAR=53;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.51018;STB=0.779294;TYPE=snp;VARB=0.0143665;OID=.;OPOS=76807249;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:112:50:53:59:59:53:6:26:24:53:6:26:27 chr4 76807252 . C A 225.82 PASS AO=55;DP=101;FAO=52;FDP=106;FR=.;FRO=54;FSAF=5;FSAR=47;FSRF=26;FSRR=28;FWDB=-0.116911;FXX=0.0275204;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.3441;QD=8.5215;RBI=0.116911;REFB=-0.0310078;REVB=-0.000193077;RO=46;SAF=6;SAR=49;SRF=18;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.388951;STB=0.795164;TYPE=snp;VARB=0.0295823;OID=.;OPOS=76807252;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:106:46:54:55:52:49:6:18:28:47:5:26:28 chr4 76807270 . C T 270.62 PASS AO=56;DP=107;FAO=58;FDP=110;FR=.;FRO=52;FSAF=9;FSAR=49;FSRF=22;FSRR=30;FWDB=0.0142079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.846;QD=9.84066;RBI=0.0157044;REFB=-0.0130383;REVB=0.00669049;RO=51;SAF=8;SAR=48;SRF=22;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.358091;STB=0.681094;TYPE=snp;VARB=0.0127027;OID=.;OPOS=76807270;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:110:51:52:56:58:48:8:22:29:49:9:22:30 chr4 76807288 . A G 227.26 PASS AO=53;DP=107;FAO=53;FDP=108;FR=.;FRO=55;FSAF=8;FSAR=45;FSRF=24;FSRR=31;FWDB=0.0255234;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.78;QD=8.41714;RBI=0.0270742;REFB=-0.00681181;REVB=0.00903147;RO=54;SAF=8;SAR=45;SRF=24;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.366071;STB=0.703036;TYPE=snp;VARB=0.00521535;OID=.;OPOS=76807288;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:108:54:55:53:53:45:8:24:30:45:8:24:31 chr4 76807302 . A G 188.91 PASS AO=45;DP=94;FAO=46;FDP=97;FR=.;FRO=51;FSAF=7;FSAR=39;FSRF=22;FSRR=29;FWDB=-0.0327149;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.7782;QD=7.79007;RBI=0.0467113;REFB=-0.0224621;REVB=-0.0333419;RO=49;SAF=7;SAR=38;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.36743;STB=0.703693;TYPE=snp;VARB=0.0227271;OID=.;OPOS=76807302;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:97:49:51:45:46:38:7:22:27:39:7:22:29 chr4 76807304 . A G 194.4 PASS AO=46;DP=95;FAO=46;FDP=96;FR=.;FRO=50;FSAF=7;FSAR=39;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=-0.00274039;FXX=0.0103082;HRUN=3;LEN=1;MLLD=111.957;QD=8.10009;RBI=0.0063982;REFB=-0.00968585;REVB=-0.00578163;RO=49;SAF=7;SAR=39;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.371733;STB=0.70677;TYPE=snp;VARB=0.00811602;OID=.;OPOS=76807304;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:96:49:50:46:46:39:7:22:27:39:7:22:28 chr4 76807313 . C A 178.92 PASS AO=43;DP=91;FAO=43;FDP=92;FR=.;FRO=49;FSAF=7;FSAR=36;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=-0.0255402;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=129.724;QD=7.77908;RBI=0.0259023;REFB=-0.0313139;REVB=0.00431588;RO=47;SAF=7;SAR=36;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.351916;STB=0.702922;TYPE=snp;VARB=0.00793536;OID=.;OPOS=76807313;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:92:47:49:43:43:36:7:21:26:36:7:22:27 chr4 76809386 . A G 3008.72 PASS AO=315;DP=317;FAO=315;FDP=315;FR=.;FRO=0;FSAF=123;FSAR=192;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314996;FXX=0.00630895;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.1102;QD=38.206;RBI=0.0665187;REFB=-0.0238934;REVB=-0.0585877;RO=1;SAF=123;SAR=192;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00247799;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.16592e-06;OID=.;OPOS=76809386;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:317:315:1:0:315:315:192:123:0:1:192:123:0:0 chr4 76811175 . G T 935.2 PASS AO=186;DP=324;FAO=189;FDP=329;FR=.;FRO=140;FSAF=95;FSAR=94;FSRF=69;FSRR=71;FWDB=-0.00136895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.992;QD=11.3702;RBI=0.016028;REFB=0.00432239;REVB=-0.0159694;RO=136;SAF=93;SAR=93;SRF=67;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00573463;STB=0.504165;TYPE=snp;VARB=-0.00327222;OID=.;OPOS=76811175;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:324:329:136:140:186:189:93:93:67:69:94:95:69:71 chr4 76836137 . A G 1279.88 PASS AO=152;DP=164;FAO=151;FDP=163;FR=.;FRO=12;FSAF=73;FSAR=78;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.0290541;FXX=0.00609719;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2243;QD=31.408;RBI=0.0359177;REFB=-0.0158616;REVB=-0.0211174;RO=8;SAF=74;SAR=78;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106298;STB=0.507357;TYPE=snp;VARB=0.00754346;OID=.;OPOS=76836137;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:164:163:8:12:152:151:78:74:3:5:78:73:7:5 chr4 76878716 . G C 393.52 PASS AO=54;DP=209;FAO=96;FDP=200;FR=.;FRO=104;FSAF=47;FSAR=49;FSRF=51;FSRR=53;FWDB=0.0265047;FXX=0.00497488;HRUN=3;LEN=1;MLLD=144.561;QD=7.87031;RBI=0.0273796;REFB=-0.0165513;REVB=-0.00686632;RO=94;SAF=6;SAR=48;SRF=46;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.536179;STB=0.500417;TYPE=snp;VARB=0.0155521;OID=.;OPOS=76878716;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:200:94:104:54:96:48:6:46:48:49:47:51:53 chr4 76942943 . C G 650.3 PASS AO=141;DP=269;FAO=143;FDP=270;FR=.;FRO=127;FSAF=64;FSAR=79;FSRF=67;FSRR=60;FWDB=-0.040051;FXX=0.0036899;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.3165;QD=9.6341;RBI=0.0400517;REFB=-0.0104452;REVB=-0.00024255;RO=127;SAF=62;SAR=79;SRF=67;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.076549;STB=0.537745;TYPE=snp;VARB=0.00832129;OID=.;OPOS=76942943;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:269:270:127:127:141:143:79:62:67:60:79:64:67:60 chr4 76943137 . G C 340.74 PASS AO=81;DP=176;FAO=84;FDP=177;FR=.;FRO=93;FSAF=42;FSAR=42;FSRF=31;FSRR=62;FWDB=0.0454091;FXX=0.00561766;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.1769;QD=7.70031;RBI=0.0583591;REFB=-0.0208562;REVB=0.0366579;RO=92;SAF=41;SAR=40;SRF=30;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173187;STB=0.58755;TYPE=snp;VARB=0.0246442;OID=.;OPOS=76943137;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:177:92:93:81:84:40:41:30:62:42:42:31:62 chr4 76955914 . T C 201.56 PASS AO=48;DP=108;FAO=50;FDP=109;FR=.;FRO=59;FSAF=15;FSAR=35;FSRF=28;FSRR=31;FWDB=0.00447526;FXX=0.0180164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.882;QD=7.39658;RBI=0.00497277;REFB=-0.00746998;REVB=0.00216805;RO=60;SAF=15;SAR=33;SRF=28;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165046;STB=0.603163;TYPE=snp;VARB=0.013777;OID=.;OPOS=76955914;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:109:60:59:48:50:33:15:28:32:35:15:28:31 chr4 76956188 . T C 336.29 PASS AO=88;DP=194;FAO=88;FDP=194;FR=.;FRO=106;FSAF=53;FSAR=35;FSRF=74;FSRR=32;FWDB=0.0142777;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=231.679;QD=6.93385;RBI=0.0199401;REFB=-0.00334765;REVB=-0.0139196;RO=106;SAF=53;SAR=35;SRF=74;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101116;STB=0.555891;TYPE=snp;VARB=0.00405403;OID=.;OPOS=76956188;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:194:106:106:88:88:35:53:74:32:35:53:74:32 chr4 77025810 . G A 212.99 PASS AO=46;DP=88;FAO=46;FDP=88;FR=.;FRO=42;FSAF=28;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=0.00121402;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=245.03;QD=9.68134;RBI=0.00352348;REFB=-0.00624512;REVB=0.00330773;RO=42;SAF=28;SAR=18;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157097;STB=0.586788;TYPE=snp;VARB=0.006906;OID=.;OPOS=77025810;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:42:42:46:46:18:28:18:24:18:28:18:24 chr4 77055474 . A G 422.54 PASS AO=92;DP=271;FAO=114;FDP=261;FR=.,HEALED;FRO=146;FSAF=28;FSAR=86;FSRF=47;FSRR=99;FWDB=0.0334571;FXX=0.0113632;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.258;QD=6.47574;RBI=0.0336013;REFB=-0.0182181;REVB=-0.00310929;RO=82;SAF=8;SAR=84;SRF=17;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247705;STB=0.55459;TYPE=snp;VARB=0.0228075;OID=.;OPOS=77055474;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:240:261:82:146:92:114:84:8:17:65:86:28:47:99 chr4 77057501 . A G 628.09 PASS AO=143;DP=284;FAO=144;FDP=281;FR=.;FRO=137;FSAF=60;FSAR=84;FSRF=59;FSRR=78;FWDB=-0.0238531;FXX=0.0140346;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.347;QD=8.94081;RBI=0.0368822;REFB=-0.0115518;REVB=0.0281306;RO=139;SAF=60;SAR=83;SRF=59;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00450463;STB=0.506998;TYPE=snp;VARB=0.0109098;OID=.;OPOS=77057501;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:284:281:139:137:143:144:83:60:59:80:84:60:59:78 chr4 77065318 . C CTGT 326.69 PASS AO=104;DP=337;FAO=111;FDP=296;FR=.;FRO=185;FSAF=66;FSAR=45;FSRF=107;FSRR=78;FWDB=0.0180079;FXX=0.0778792;HRUN=1;LEN=3;MLLD=184.29;QD=4.41477;RBI=0.0255739;REFB=-0.00625461;REVB=-0.0181587;RO=205;SAF=63;SAR=41;SRF=122;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0128945;STB=0.510468;TYPE=ins;VARB=0.0108923;OID=.;OPOS=77065319;OREF=-;OALT=TGT;OMAPALT=CTGT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:104:337:111:296:185:66:45:107:78:99:205:63:41:122:83 chr4 77065580 . T C 281.27 PASS AO=69;DP=145;FAO=69;FDP=145;FR=.;FRO=76;FSAF=36;FSAR=33;FSRF=35;FSRR=41;FWDB=-0.00515134;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.016;QD=7.75923;RBI=0.0064176;REFB=-0.0346295;REVB=-0.00382745;RO=75;SAF=36;SAR=33;SRF=35;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0518094;STB=0.532046;TYPE=snp;VARB=0.0295154;OID=.;OPOS=77065580;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:75:76:69:69:33:36:35:40:33:36:35:41 chr4 77081814 . G C 225.18 PASS AO=54;DP=113;FAO=54;FDP=113;FR=.;FRO=59;FSAF=22;FSAR=32;FSRF=12;FSRR=47;FWDB=0.00866351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.83;QD=7.97088;RBI=0.012474;REFB=-0.00270918;REVB=0.00897459;RO=56;SAF=22;SAR=32;SRF=11;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211359;STB=0.614965;TYPE=snp;VARB=0.00218968;OID=.;OPOS=77081814;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:56:59:54:54:32:22:11:45:32:22:12:47 chr4 77192868 . G A 288.06 PASS AO=75;DP=162;FAO=74;FDP=162;FR=.;FRO=88;FSAF=17;FSAR=57;FSRF=35;FSRR=53;FWDB=0.0237703;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2594;QD=7.11262;RBI=0.0499058;REFB=-0.00289683;REVB=0.0438812;RO=86;SAF=17;SAR=58;SRF=35;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213715;STB=0.613124;TYPE=snp;VARB=0.00412675;OID=.;OPOS=77192868;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:162:86:88:75:74:58:17:35:51:57:17:35:53 chr4 77201487 . C T 843.21 PASS AO=92;DP=94;FAO=92;FDP=94;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=70;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0164038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.7383;QD=35.8811;RBI=0.0217775;REFB=-0.126464;REVB=-0.0143239;RO=1;SAF=22;SAR=70;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0210563;STB=0.521734;TYPE=snp;VARB=0.0012034;OID=.;OPOS=77201487;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:94:94:1:2:92:92:70:22:1:0:70:22:2:0 chr4 77278678 . C T 274.29 PASS AO=71;DP=156;FAO=71;FDP=156;FR=.;FRO=85;FSAF=32;FSAR=39;FSRF=30;FSRR=55;FWDB=-0.0199986;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2711;QD=7.03308;RBI=0.0437534;REFB=-0.00203902;REVB=-0.0389155;RO=85;SAF=32;SAR=39;SRF=30;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0980578;STB=0.554353;TYPE=snp;VARB=0.00189531;OID=.;OPOS=77278678;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:156:85:85:71:71:39:32:30:55:39:32:30:55 chr4 77305346 . A G 315.47 PASS AO=76;DP=157;FAO=76;FDP=157;FR=.;FRO=81;FSAF=36;FSAR=40;FSRF=27;FSRR=54;FWDB=8.08193e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.818;QD=8.03746;RBI=0.027681;REFB=-0.0132437;REVB=0.0276808;RO=79;SAF=36;SAR=40;SRF=27;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123364;STB=0.573152;TYPE=snp;VARB=0.0119614;OID=.;OPOS=77305346;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:157:79:81:76:76:40:36:27:52:40:36:27:54 chr4 77637502 . A C 1167.57 PASS AO=118;DP=120;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208276;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.198;QD=37.3622;RBI=0.0539263;REFB=-0.0688954;REVB=0.0497419;RO=0;SAF=58;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000394731;OID=.;OPOS=77637502;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:120:125:0:0:118:125:60:58:0:0:65:60:0:0 chr4 77660162 . G C 623.85 PASS AO=76;DP=87;FAO=78;FDP=87;FR=.;FRO=9;FSAF=44;FSAR=34;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0178579;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.0147;QD=28.6827;RBI=0.0458303;REFB=-0.170186;REVB=0.042208;RO=10;SAF=42;SAR=34;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0336631;STB=0.524115;TYPE=snp;VARB=0.0311897;OID=.;OPOS=77660162;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:87:87:10:9:76:78:34:42:4:6:34:44:3:6 chr4 77660299 . T G 323.09 PASS AO=85;DP=189;FAO=85;FDP=189;FR=.;FRO=104;FSAF=8;FSAR=77;FSRF=12;FSRR=92;FWDB=-0.0215598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.9734;QD=6.8379;RBI=0.0356055;REFB=-0.0112302;REVB=-0.028336;RO=104;SAF=8;SAR=77;SRF=12;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0582304;STB=0.532495;TYPE=snp;VARB=0.0168126;OID=.;OPOS=77660299;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:189:104:104:85:85:77:8:12:92:77:8:12:92 chr4 77660731 . C G 1345.12 PASS AO=140;DP=140;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00759322;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=285.985;QD=38.4319;RBI=0.0165147;REFB=0;REVB=0.0146655;RO=0;SAF=56;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.64837e-05;OID=.;OPOS=77660731;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:140:140:0:0:140:140:84:56:0:0:84:56:0:0 chr4 77662309 . C T 73.83 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00905322;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.806;QD=36.9156;RBI=0.0840734;REFB=0;REVB=0.0835845;RO=0;SAF=7;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.78849e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.007532;OID=.;OPOS=77662309;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:7:0:0:1:7:0:0 chr4 77675505 . C T 119.62 PASS AO=33;DP=79;FAO=33;FDP=79;FR=.;FRO=46;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=12;FSRR=34;FWDB=0.0181105;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.229;QD=6.05657;RBI=0.0206091;REFB=-0.0162862;REVB=0.00983591;RO=46;SAF=10;SAR=23;SRF=12;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0526468;STB=0.529722;TYPE=snp;VARB=0.0281124;OID=.;OPOS=77675505;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:46:46:33:33:23:10:12:34:23:10:12:34 chr4 77959751 . AT A 119.5 PASS AO=65;DP=179;FAO=79;FDP=164;FR=.;FRO=85;FSAF=18;FSAR=61;FSRF=32;FSRR=53;FWDB=0.00350438;FXX=0.029584;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.1053;QD=2.91472;RBI=0.0913963;REFB=-0.101632;REVB=-0.0913291;RO=75;SAF=8;SAR=57;SRF=29;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.386597;STB=0.597778;TYPE=del;VARB=0.106059;OID=.;OPOS=77959752;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:65:164:79:164:85:18:61:32:53:99:75:8:57:29:46 chr4 78635780 . GC G 112.62 PASS AO=80;DP=216;FAO=86;FDP=213;FR=.;FRO=127;FSAF=19;FSAR=67;FSRF=13;FSRR=114;FWDB=0.0544229;FXX=0.00467268;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.2996;QD=2.11487;RBI=0.117164;REFB=0.000732361;REVB=-0.103757;RO=112;SAF=17;SAR=63;SRF=10;SRR=102;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223076;STB=0.615955;TYPE=del;VARB=-0.0458068;OID=.;OPOS=78635781;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:80:210:86:213:127:19:67:13:114:99:112:17:63:10:102 chr4 78638730 . T C 2268.69 PASS AO=248;DP=263;FAO=251;FDP=257;FR=.;FRO=6;FSAF=155;FSAR=96;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0185371;FXX=0.0228128;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.392;QD=35.3103;RBI=0.0697621;REFB=-0.0760077;REVB=0.0672542;RO=5;SAF=154;SAR=94;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.024674;STB=0.5029;TYPE=snp;VARB=0.00442617;OID=.;OPOS=78638730;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:263:257:5:6:248:251:94:154:0:5:96:155:3:3 chr4 78650181 . TG T 491.58 PASS AO=64;DP=80;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0721104;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=18.8679;QD=26.5719;RBI=0.176227;REFB=-0.0408469;REVB=0.160798;RO=7;SAF=53;SAR=11;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0.465116;SSSB=0.0361021;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0134742;OID=.;OPOS=78650182;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:64:72:74:74:0:61:13:0:0:36:7:53:11:5:2 chr4 78669454 . A G 1012.46 PASS AO=106;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122459;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.557;QD=38.2062;RBI=0.0206977;REFB=0;REVB=0.0166863;RO=0;SAF=60;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.51764e-05;OID=.;OPOS=78669454;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:106:106:0:0:106:106:46:60:0:0:46:60:0:0 chr4 78987157 . A G 307.63 PASS AO=75;DP=203;FAO=92;FDP=218;FR=.;FRO=126;FSAF=31;FSAR=61;FSRF=43;FSRR=83;FWDB=-0.000820373;FXX=0.0180172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.575;QD=5.64466;RBI=0.00609792;REFB=-0.0249742;REVB=-0.00604249;RO=124;SAF=20;SAR=55;SRF=43;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105908;STB=0.502784;TYPE=snp;VARB=0.039593;OID=.;OPOS=78987157;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:218:124:126:75:92:55:20:43:81:61:31:43:83 chr4 78989672 . G C 256.8 PASS AO=77;DP=191;FAO=77;FDP=191;FR=.;FRO=114;FSAF=26;FSAR=51;FSRF=40;FSRR=74;FWDB=0.0448116;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.277;QD=5.37799;RBI=0.0617786;REFB=-0.0252369;REVB=0.0425266;RO=113;SAF=26;SAR=51;SRF=39;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00881521;STB=0.508764;TYPE=snp;VARB=0.0318033;OID=.;OPOS=78989672;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:191:191:113:114:77:77:51:26:39:74:51:26:40:74 chr4 78989716 . T C 331.06 PASS AO=83;DP=177;FAO=83;FDP=177;FR=.;FRO=94;FSAF=23;FSAR=60;FSRF=21;FSRR=73;FWDB=-0.0136595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.466;QD=7.48159;RBI=0.025033;REFB=-0.023445;REVB=-0.0209778;RO=93;SAF=23;SAR=60;SRF=21;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0632791;STB=0.536752;TYPE=snp;VARB=0.0202319;OID=.;OPOS=78989716;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:177:93:94:83:83:60:23:21:72:60:23:21:73 chr4 79186047 . G A 283.88 PASS AO=74;DP=166;FAO=74;FDP=165;FR=.;FRO=91;FSAF=40;FSAR=34;FSRF=48;FSRR=43;FWDB=0.0315403;FXX=0.0119753;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.5074;QD=6.88193;RBI=0.0876741;REFB=-0.0148288;REVB=0.0818044;RO=90;SAF=40;SAR=34;SRF=47;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0181716;STB=0.507244;TYPE=snp;VARB=0.0133674;OID=.;OPOS=79186047;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:165:90:91:74:74:34:40:47:43:34:40:48:43 chr4 79186171 . G A 1739.87 PASS AO=182;DP=187;FAO=184;FDP=184;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00364764;FXX=0.0212755;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.787;QD=37.8232;RBI=0.060797;REFB=0;REVB=0.0606875;RO=1;SAF=87;SAR=95;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0054411;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000154783;OID=.;OPOS=79186171;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:187:184:1:0:182:184:95:87:1:0:96:88:0:0 chr4 79205699 . T A 443.51 PASS AO=112;DP=239;FAO=112;FDP=239;FR=.;FRO=127;FSAF=40;FSAR=72;FSRF=46;FSRR=81;FWDB=0.00289254;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=194.342;QD=7.42282;RBI=0.0288911;REFB=-0.0314577;REVB=-0.0287459;RO=127;SAF=40;SAR=72;SRF=46;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0052947;STB=0.502923;TYPE=snp;VARB=0.035682;OID=.;OPOS=79205699;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:239:239:127:127:112:112:72:40:46:81:72:40:46:81 chr4 79238649 . T C 414.43 PASS AO=97;DP=194;FAO=97;FDP=194;FR=.;FRO=97;FSAF=33;FSAR=64;FSRF=41;FSRR=56;FWDB=0.00748475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.528;QD=8.54484;RBI=0.00825042;REFB=-0.00507506;REVB=0.00347101;RO=97;SAF=33;SAR=64;SRF=41;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0810171;STB=0.544609;TYPE=snp;VARB=0.00471541;OID=.;OPOS=79238649;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:194:97:97:97:97:64:33:41:56:64:33:41:56 chr4 79240063 . A G 171.39 PASS AO=48;DP=118;FAO=49;FDP=120;FR=.;FRO=71;FSAF=32;FSAR=17;FSRF=38;FSRR=33;FWDB=0.0365789;FXX=0.00826378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.7485;QD=5.71282;RBI=0.0660151;REFB=-0.0222342;REVB=-0.0549543;RO=69;SAF=31;SAR=17;SRF=38;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104715;STB=0.573446;TYPE=snp;VARB=0.0226347;OID=.;OPOS=79240063;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:120:69:71:48:49:17:31:38:31:17:32:38:33 chr4 79372930 . C T 491.32 PASS AO=95;DP=161;FAO=95;FDP=161;FR=.;FRO=66;FSAF=57;FSAR=38;FSRF=31;FSRR=35;FWDB=0.00887636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.7;QD=12.2066;RBI=0.0298437;REFB=-0.00993231;REVB=-0.0284931;RO=65;SAF=57;SAR=38;SRF=30;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105435;STB=0.554419;TYPE=snp;VARB=0.00804041;OID=.;OPOS=79372930;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:161:65:66:95:95:38:57:30:35:38:57:31:35 chr4 79385632 . C T 299.35 PASS AO=82;DP=189;FAO=82;FDP=189;FR=.;FRO=107;FSAF=66;FSAR=16;FSRF=61;FSRR=46;FWDB=0.0158544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.9796;QD=6.33553;RBI=0.0185815;REFB=-0.0165101;REVB=-0.00969063;RO=105;SAF=66;SAR=16;SRF=61;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.285569;STB=0.668145;TYPE=snp;VARB=0.0237954;OID=.;OPOS=79385632;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:189:105:107:82:82:16:66:61:44:16:66:61:46 chr4 79385719 . G A 581.75 PASS AO=148;DP=315;FAO=148;FDP=316;FR=.;FRO=168;FSAF=61;FSAR=87;FSRF=71;FSRR=97;FWDB=-0.0172347;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=261.444;QD=7.36396;RBI=0.0172803;REFB=-0.0148835;REVB=-0.00125471;RO=166;SAF=61;SAR=87;SRF=71;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.015344;STB=0.505724;TYPE=snp;VARB=0.0164922;OID=.;OPOS=79385719;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:315:316:166:168:148:148:87:61:71:95:87:61:71:97 chr4 79387464 . A G 1985.15 PASS AO=206;DP=207;FAO=211;FDP=211;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0252608;FXX=0.00471676;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.7165;QD=37.6331;RBI=0.0685037;REFB=0.0121294;REVB=-0.0636761;RO=1;SAF=102;SAR=104;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00455837;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000348291;OID=.;OPOS=79387464;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:207:211:1:0:206:211:104:102:0:1:106:105:0:0 chr4 79387586 . A G 303.95 PASS AO=76;DP=157;FAO=75;FDP=158;FR=.;FRO=83;FSAF=28;FSAR=47;FSRF=51;FSRR=32;FWDB=0.0124396;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=39.6996;QD=7.69496;RBI=0.0283657;REFB=-0.00835136;REVB=-0.0254925;RO=81;SAF=31;SAR=45;SRF=48;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172343;STB=0.626633;TYPE=snp;VARB=0.00871391;OID=.;OPOS=79387586;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:158:81:83:76:75:45:31:48:33:47:28:51:32 chr4 79400868 . C T 182.66 PASS AO=39;DP=75;FAO=39;FDP=74;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=0.016916;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.321;QD=9.87356;RBI=0.0360484;REFB=-0.0156108;REVB=-0.0318329;RO=35;SAF=17;SAR=22;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0313451;STB=0.51733;TYPE=snp;VARB=0.0141966;OID=.;OPOS=79400868;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:74:35:35:39:39:22:17:14:21:22:17:14:21 chr4 79432455 . A C 385.9 PASS AO=99;DP=219;FAO=100;FDP=219;FR=.;FRO=119;FSAF=53;FSAR=47;FSRF=67;FSRR=52;FWDB=-0.00726768;FXX=0.00454525;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.56;QD=7.04831;RBI=0.0498199;REFB=-0.0264851;REVB=-0.0492869;RO=119;SAF=52;SAR=47;SRF=68;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0457392;STB=0.518045;TYPE=snp;VARB=0.0241353;OID=.;OPOS=79432455;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:219:219:119:119:99:100:47:52:68:51:47:53:67:52 chr4 79443850 . G A 260.45 PASS AO=67;DP=147;FAO=67;FDP=147;FR=.;FRO=80;FSAF=32;FSAR=35;FSRF=44;FSRR=36;FWDB=-0.0216561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.828;QD=7.08693;RBI=0.0216729;REFB=-0.0051272;REVB=0.000852966;RO=79;SAF=32;SAR=35;SRF=43;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0648821;STB=0.539323;TYPE=snp;VARB=0.00613199;OID=.;OPOS=79443850;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:147:79:80:67:67:35:32:43:36:35:32:44:36 chr4 79455714 . C G 260.91 PASS AO=72;DP=167;FAO=72;FDP=167;FR=.;FRO=95;FSAF=26;FSAR=46;FSRF=39;FSRR=56;FWDB=-0.036817;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=156.352;QD=6.24924;RBI=0.0375028;REFB=-0.00242738;REVB=0.00713955;RO=94;SAF=26;SAR=46;SRF=39;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0579851;STB=0.529945;TYPE=snp;VARB=0.00251318;OID=.;OPOS=79455714;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:167:94:95:72:72:46:26:39:55:46:26:39:56 chr4 79455733 . C T 305.96 PASS AO=79;DP=165;FAO=77;FDP=165;FR=.;FRO=88;FSAF=27;FSAR=50;FSRF=41;FSRR=47;FWDB=-0.0463726;FXX=0.00602373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.0042;QD=7.4173;RBI=0.0515544;REFB=-0.0321495;REVB=0.0225263;RO=84;SAF=27;SAR=52;SRF=40;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132635;STB=0.564861;TYPE=snp;VARB=0.0350358;OID=.;OPOS=79455733;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:165:84:88:79:77:52:27:40:44:50:27:41:47 chr4 79507411 . T C 275.21 PASS AO=60;DP=114;FAO=60;FDP=114;FR=.;FRO=54;FSAF=41;FSAR=19;FSRF=31;FSRR=23;FWDB=-0.0119255;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=215.044;QD=9.65658;RBI=0.0125883;REFB=-0.00221129;REVB=0.00403089;RO=51;SAF=41;SAR=19;SRF=30;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0884824;STB=0.557262;TYPE=snp;VARB=0.00159509;OID=.;OPOS=79507411;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:51:54:60:60:19:41:30:21:19:41:31:23 chr4 79832706 . C G 189.21 PASS AO=43;DP=86;FAO=43;FDP=86;FR=.;FRO=43;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=0.0146759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.891;QD=8.80041;RBI=0.0166954;REFB=-0.0171652;REVB=0.00795962;RO=43;SAF=17;SAR=26;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127476;STB=0.570768;TYPE=snp;VARB=0.0147416;OID=.;OPOS=79832706;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:43:43:43:43:26:17:23:20:26:17:23:20 chr4 79845007 . C A 671.12 PASS AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0109614;FXX=0.013887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=266.08;QD=37.8096;RBI=0.0159463;REFB=0;REVB=-0.0115816;RO=0;SAF=31;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.18246e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.82586e-05;OID=.;OPOS=79845007;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:72:71:0:0:71:71:40:31:0:0:40:31:0:0 chr4 80827062 . T C 2823.22 PASS AO=308;DP=316;FAO=309;FDP=316;FR=.;FRO=7;FSAF=131;FSAR=178;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=2.25013e-05;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=281.994;QD=35.737;RBI=0.0229557;REFB=0.0031968;REVB=-0.0229557;RO=8;SAF=131;SAR=177;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00368334;STB=0.503341;TYPE=snp;VARB=-2.73258e-05;OID=.;OPOS=80827062;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:316:316:8:7:308:309:177:131:4:4:178:131:4:3 chr4 80905990 . C G 547.33 PASS AO=41;DP=61;FAO=54;FDP=58;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=53;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0240723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.122;QD=37.747;RBI=0.0664972;REFB=0;REVB=0.0619872;RO=0;SAF=41;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00858552;OID=.;OPOS=80905990;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:58:58:0:0:41:54:0:41:0:0:1:53:0:0 chr4 80977078 . T G 1536.82 PASS AO=161;DP=161;FAO=161;FDP=161;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.038119;FXX=0.00617246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0129;QD=38.182;RBI=0.0546556;REFB=0;REVB=0.0391686;RO=0;SAF=79;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.25821e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00022719;OID=.;OPOS=80977078;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:161:161:0:0:161:161:82:79:0:0:82:79:0:0 chr4 81124596 . G C 497.43 PASS AO=114;DP=224;FAO=114;FDP=223;FR=.;FRO=109;FSAF=35;FSAR=79;FSRF=46;FSRR=63;FWDB=0.00137491;FXX=0.00446409;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.4076;QD=8.9225;RBI=0.0324496;REFB=-0.0273963;REVB=0.0324205;RO=109;SAF=35;SAR=79;SRF=46;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114327;STB=0.562835;TYPE=snp;VARB=0.0272791;OID=.;OPOS=81124596;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:224:223:109:109:114:114:79:35:46:63:79:35:46:63 chr4 81188065 . AG A,AA 464.15 PASS AO=17,12;DP=76;FAO=66,10;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=28,4;FSAR=38,6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.634805,0.318948;FXX=0.0499937;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=13.2736,9.97398;QD=24.4289;RBI=0.652276,0.319219;REFB=-0.0846474,-0.070066;REVB=-0.149952,-0.0131467;RO=30;SAF=1,4;SAR=16,8;SRF=25;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.781987,-0.541362;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.000390901,-0.0392807;OID=.,.;OPOS=81188066,81188066;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:17,12:71:66,10:76:0:28,4:38,6:0:0:5:30:1,4:16,8:25:5 chr4 81529518 . T C 267.35 PASS AO=63;DP=129;FAO=63;FDP=129;FR=.;FRO=66;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=45;FSRR=21;FWDB=-0.00329722;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.663;QD=8.28997;RBI=0.00934688;REFB=-0.00470484;REVB=0.00874599;RO=66;SAF=33;SAR=30;SRF=45;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148143;STB=0.58163;TYPE=snp;VARB=0.00690627;OID=.;OPOS=81529518;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:66:66:63:63:30:33:45:21:30:33:45:21 chr4 81884722 . G A 1545.82 PASS AO=162;DP=162;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0016628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.367;QD=38.1685;RBI=0.0120587;REFB=0;REVB=0.0119435;RO=0;SAF=76;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.22958e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.1169e-05;OID=.;OPOS=81884722;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:162:162:0:0:162:162:86:76:0:0:86:76:0:0 chr4 81967188 . C T 1113.05 PASS AO=96;DP=137;FAO=122;FDP=128;FR=.,HEALED;FRO=4;FSAF=44;FSAR=78;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0917067;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.294;QD=34.7829;RBI=0.0934876;REFB=-0.200477;REVB=-0.0181611;RO=4;SAF=20;SAR=76;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0858895;STB=0.521735;TYPE=snp;VARB=0.00805625;OID=.;OPOS=81967188;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:128:128:4:4:96:122:76:20:4:0:78:44:4:0 chr4 81974809 . T C 788.8 PASS AO=88;DP=93;FAO=89;FDP=92;FR=.;FRO=3;FSAF=36;FSAR=53;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0201018;FXX=0.0107515;HRUN=3;LEN=1;MLLD=162.272;QD=34.2955;RBI=0.0471797;REFB=-0.0991901;REVB=0.0426831;RO=2;SAF=36;SAR=52;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00395496;STB=0.50241;TYPE=snp;VARB=0.000731205;OID=.;OPOS=81974809;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:93:92:2:3:88:89:52:36:1:1:53:36:1:2 chr4 81975088 . G A 492.99 PASS AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0238291;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.855;QD=35.8536;RBI=0.0333662;REFB=0.00540083;REVB=0.0233554;RO=0;SAF=30;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508194;TYPE=snp;VARB=9.89729e-05;OID=.;OPOS=81975088;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:55:55:0:1:54:54:24:30:0:0:24:30:1:0 chr4 81977690 . C T 1425.9 PASS AO=152;DP=156;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148001;FXX=0.0129024;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.234;QD=37.2784;RBI=0.039243;REFB=-0.00826351;REVB=0.0363452;RO=1;SAF=75;SAR=77;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00630036;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.52772e-05;OID=.;OPOS=81977690;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:156:153:1:0:152:153:77:75:1:0:78:75:0:0 chr4 81977730 . A T 1738.63 PASS AO=201;DP=213;FAO=200;FDP=212;FR=.;FRO=12;FSAF=95;FSAR=105;FSRF=1;FSRR=11;FWDB=-0.00631213;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.191;QD=32.8043;RBI=0.00642813;REFB=-0.159702;REVB=0.00121567;RO=0;SAF=96;SAR=105;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.522273;TYPE=snp;VARB=0.00130063;OID=.;OPOS=81977730;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:213:212:0:12:201:200:105:96:0:0:105:95:1:11 chr4 82092870 . A G 255.5 PASS AO=61;DP=126;FAO=61;FDP=126;FR=.;FRO=65;FSAF=39;FSAR=22;FSRF=38;FSRR=27;FWDB=0.0188371;FXX=0.0078734;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.587;QD=8.11095;RBI=0.0471568;REFB=-0.000236661;REVB=0.0432311;RO=64;SAF=39;SAR=22;SRF=38;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0450613;STB=0.530087;TYPE=snp;VARB=0.000266356;OID=.;OPOS=82092870;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:64:65:61:61:22:39:38:26:22:39:38:27 chr4 83345740 . AT A 446.7 PASS AO=66;DP=95;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0406117;FXX=0.0215031;HRUN=6;LEN=1;MLLD=10.5281;QD=19.6351;RBI=0.0487534;REFB=-0.0118978;REVB=-0.0269739;RO=9;SAF=40;SAR=26;SRF=4;SRR=5;SSEN=0.480916;SSEP=0;SSSB=0.0378347;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00797039;OID=.;OPOS=83345741;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:66:91:91:91:0:47:44:0:0:34:9:40:26:4:5 chr4 83582211 . C G 358.64 PASS AO=63;DP=100;FAO=63;FDP=98;FR=.;FRO=35;FSAF=44;FSAR=19;FSRF=26;FSRR=9;FWDB=-0.0182889;FXX=0.0392118;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.616;QD=14.6382;RBI=0.0372337;REFB=0.00572421;REVB=-0.0324325;RO=28;SAF=44;SAR=19;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108031;STB=0.51912;TYPE=snp;VARB=-0.00231798;OID=.;OPOS=83582211;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:98:28:35:63:63:19:44:20:8:19:44:26:9 chr4 83763533 . T C 104.86 PASS AO=25;DP=55;FAO=25;FDP=54;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.0132039;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.5283;QD=7.76731;RBI=0.0201068;REFB=-0.0539777;REVB=0.0151638;RO=29;SAF=12;SAR=13;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0302481;STB=0.517074;TYPE=snp;VARB=0.0459971;OID=.;OPOS=83763533;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:54:29:29:25:25:13:12:13:16:13:12:13:16 chr4 83778839 . T C 162.8 PASS AO=38;DP=79;FAO=38;FDP=79;FR=.;FRO=41;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=-0.00629244;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.387;QD=8.24288;RBI=0.00784562;REFB=0.00253183;REVB=-0.00468604;RO=41;SAF=21;SAR=17;SRF=16;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150232;STB=0.583676;TYPE=snp;VARB=-0.00172129;OID=.;OPOS=83778839;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:41:41:38:38:17:21:16:25:17:21:16:25 chr4 83788344 . A T 1951.54 PASS AO=201;DP=202;FAO=204;FDP=204;FR=.;FRO=0;FSAF=106;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00893777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.355;QD=38.2654;RBI=0.0295143;REFB=0;REVB=0.0281285;RO=0;SAF=105;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.83338e-05;OID=.;OPOS=83788344;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:92:202:204:0:0:201:204:96:105:0:0:98:106:0:0 chr4 83792555 . C A 526.2 PASS AO=54;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0395324;FXX=0.0344768;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5673;QD=37.5857;RBI=0.0825632;REFB=0;REVB=-0.0724837;RO=0;SAF=32;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.64875e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000548555;OID=.;OPOS=83792555;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:56:56:0:0:54:56:22:32:0:0:22:34:0:0 chr4 83795806 . T C 211.81 PASS AO=61;DP=146;FAO=61;FDP=145;FR=.;FRO=84;FSAF=34;FSAR=27;FSRF=38;FSRR=46;FWDB=0.0012096;FXX=0.00684885;HRUN=6;LEN=1;MLLD=39.5598;QD=5.84298;RBI=0.0529338;REFB=-0.0099074;REVB=-0.05292;RO=82;SAF=34;SAR=27;SRF=36;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120943;STB=0.560757;TYPE=snp;VARB=0.014554;OID=.;OPOS=83795806;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:145:82:84:61:61:27:34:36:46:27:34:38:46 chr4 83838217 . G A 2621.04 PASS AO=276;DP=283;FAO=277;FDP=277;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=185;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000764487;FXX=0.0280692;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.1614;QD=37.8489;RBI=0.0262102;REFB=-0.0677042;REVB=0.0261991;RO=1;SAF=92;SAR=184;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00515454;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000495262;OID=.;OPOS=83838217;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:283:277:1:0:276:277:184:92:1:0:185:92:0:0 chr4 83838262 . G T 518.37 PASS AO=134;DP=311;FAO=141;FDP=318;FR=.;FRO=177;FSAF=69;FSAR=72;FSRF=28;FSRR=149;FWDB=-0.00378181;FXX=0.012422;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.225;QD=6.52032;RBI=0.00378679;REFB=-0.0152832;REVB=0.000194126;RO=176;SAF=69;SAR=65;SRF=28;SRR=148;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.365032;STB=0.68585;TYPE=snp;VARB=0.0217501;OID=.;OPOS=83838262;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:311:318:176:177:134:141:65:69:28:148:72:69:28:149 chr4 83839799 . A G 1326.97 PASS AO=139;DP=141;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00506899;FXX=0.013985;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.933;QD=37.6444;RBI=0.00702183;REFB=-0.020318;REVB=-0.00485916;RO=1;SAF=63;SAR=76;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00748709;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.49228e-07;OID=.;OPOS=83839799;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:141:141:1:0:139:141:76:63:1:0:77:64:0:0 chr4 83848965 . G A 513.64 PASS AO=157;DP=388;FAO=157;FDP=387;FR=.;FRO=230;FSAF=82;FSAR=75;FSRF=125;FSRR=105;FWDB=-0.028203;FXX=0.00769211;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.86;QD=5.3089;RBI=0.0282911;REFB=-0.00661132;REVB=0.00223143;RO=228;SAF=82;SAR=75;SRF=124;SRR=104;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229504;STB=0.512628;TYPE=snp;VARB=0.00842834;OID=.;OPOS=83848965;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:388:387:228:230:157:157:75:82:124:104:75:82:125:105 chr4 83848976 . CAGAA C 415.24 PASS AO=132;DP=365;FAO=132;FDP=336;FR=.;FRO=204;FSAF=69;FSAR=63;FSRF=109;FSRR=95;FWDB=-0.00158709;FXX=0.0175433;HRUN=1;LEN=4;MLLD=204.312;QD=4.94328;RBI=0.0298863;REFB=-0.00754023;REVB=-0.0298441;RO=204;SAF=69;SAR=63;SRF=112;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0285648;STB=0.507053;TYPE=del;VARB=0.0131666;OID=.;OPOS=83848977;OREF=AGAA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:132:342:132:336:204:69:63:109:95:99:204:69:63:112:92 chr4 83900043 . A G 1956.81 PASS AO=207;DP=209;FAO=207;FDP=207;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=127;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0116797;FXX=0.00956892;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.866;QD=37.8127;RBI=0.0460045;REFB=-0.0607164;REVB=-0.0444972;RO=1;SAF=80;SAR=127;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00373635;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.16216e-05;OID=.;OPOS=83900043;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:209:207:1:0:207:207:127:80:0:1:127:80:0:0 chr4 84188850 . G A 1325.71 PASS AO=138;DP=138;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00684541;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.08;QD=38.4265;RBI=0.0175176;REFB=0;REVB=0.0161247;RO=0;SAF=46;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.97458e-05;OID=.;OPOS=84188850;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:138:138:0:0:138:138:92:46:0:0:92:46:0:0 chr4 84230619 . T C 914.06 PASS AO=69;DP=97;FAO=96;FDP=96;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=38;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.249433;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.0876;QD=38.0857;RBI=0.249606;REFB=0;REVB=0.00927248;RO=0;SAF=12;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00258243;OID=.;OPOS=84230619;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:96:96:0:0:69:96:57:12:0:0:58:38:0:0 chr4 84376743 . A T 344.16 PASS AO=19;DP=49;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0801633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7201;QD=37.2065;RBI=0.0802019;REFB=0;REVB=-0.00249027;RO=0;SAF=6;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.851e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00181378;OID=.;OPOS=84376743;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:21:37:0:0:19:37:13:6:0:0:22:15:0:0 chr4 85612894 . T C 224.08 PASS AO=68;DP=171;FAO=68;FDP=171;FR=.;FRO=103;FSAF=37;FSAR=31;FSRF=54;FSRR=49;FWDB=0.00437749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.204;QD=5.24171;RBI=0.032963;REFB=-0.0196789;REVB=0.0326711;RO=103;SAF=37;SAR=31;SRF=54;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0213437;STB=0.512019;TYPE=snp;VARB=0.0339627;OID=.;OPOS=85612894;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:171:103:103:68:68:31:37:54:49:31:37:54:49 chr4 85762385 . T C 593.51 PASS AO=161;DP=365;FAO=162;FDP=365;FR=.;FRO=203;FSAF=98;FSAR=64;FSRF=120;FSRR=83;FWDB=-0.00197304;FXX=0.00273217;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.574;QD=6.5042;RBI=0.0019731;REFB=-0.0195168;REVB=-1.47302e-05;RO=202;SAF=98;SAR=63;SRF=120;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0153743;STB=0.508004;TYPE=snp;VARB=0.0202476;OID=.;OPOS=85762385;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:365:365:202:203:161:162:63:98:120:82:64:98:120:83 chr4 86021741 . C T 1391.97 PASS AO=139;DP=139;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.087936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.802;QD=37.3683;RBI=0.088525;REFB=0;REVB=0.0101952;RO=0;SAF=77;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000488691;OID=.;OPOS=86021741;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:139:149:0:0:139:149:62:77:0:0:69:80:0:0 chr4 86021765 . C T 1649.49 PASS AO=174;DP=175;FAO=174;FDP=174;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0418618;FXX=0.0169482;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.6229;QD=37.9194;RBI=0.0794501;REFB=-0.0593313;REVB=0.0675271;RO=1;SAF=84;SAR=90;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00563313;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000769423;OID=.;OPOS=86021765;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:175:174:1:0:174:174:90:84:1:0:90:84:0:0 chr4 86021967 . C T 935.83 PASS AO=102;DP=105;FAO=103;FDP=106;FR=.;FRO=3;FSAF=66;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00623609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.795;QD=35.3144;RBI=0.00891316;REFB=-0.104916;REVB=0.00636832;RO=2;SAF=65;SAR=37;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00540624;STB=0.509399;TYPE=snp;VARB=0.000405018;OID=.;OPOS=86021967;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:105:106:2:3:102:103:37:65:1:1:37:66:1:2 chr4 86021976 . T A 111.59 PASS AO=42;DP=62;FAO=39;FDP=102;FR=.;FRO=63;FSAF=26;FSAR=13;FSRF=38;FSRR=25;FWDB=0.000486119;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=87.0258;QD=4.37604;RBI=0.00604559;REFB=0.000527927;REVB=-0.00602601;RO=20;SAF=28;SAR=14;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0437913;STB=0.542835;TYPE=snp;VARB=-0.00919554;OID=.;OPOS=86021976;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:102:20:63:42:39:14:28:12:8:13:26:38:25 chr4 86916056 . C G 201.21 PASS AO=36;DP=98;FAO=47;FDP=96;FR=.;FRO=49;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=15;FSRR=34;FWDB=-0.011196;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=220.647;QD=8.38378;RBI=0.0151095;REFB=0.00886138;REVB=0.0101462;RO=30;SAF=9;SAR=27;SRF=8;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0180717;STB=0.55303;TYPE=snp;VARB=-0.0092622;OID=.;OPOS=86916056;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:96:30:49:36:47:27:9:8:22:28:19:15:34 chr4 87684031 . A G 1127.3 PASS AO=117;DP=118;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=100;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0318039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.647;QD=38.2134;RBI=0.0426777;REFB=0;REVB=-0.0284587;RO=0;SAF=99;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.14474e-05;OID=.;OPOS=87684031;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:118:118:0:0:117:118:18:99:0:0:18:100:0:0 chr4 87690998 . A G 2303 PASS AO=239;DP=240;FAO=239;FDP=239;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=155;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0128931;FXX=0.00416649;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.5;QD=38.5439;RBI=0.0317747;REFB=0;REVB=0.0290413;RO=0;SAF=84;SAR=155;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.24786e-06;OID=.;OPOS=87690998;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:240:239:0:0:239:239:155:84:0:0:155:84:0:0 chr4 87706506 . T G 1662.47 PASS AO=171;DP=173;FAO=176;FDP=176;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=121;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0588657;FXX=0.022221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.8551;QD=37.7833;RBI=0.0636712;REFB=-0.1006;REVB=-0.0242664;RO=2;SAF=55;SAR=116;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00813527;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00177279;OID=.;OPOS=87706506;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:173:176:2:0:171:176:116:55:0:2:121:55:0:0 chr4 87769929 . T C 566.14 PASS AO=107;DP=176;FAO=107;FDP=177;FR=.;FRO=70;FSAF=56;FSAR=51;FSRF=27;FSRR=43;FWDB=-0.0416501;FXX=0.00561766;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.038;QD=12.7942;RBI=0.0423513;REFB=-0.0151189;REVB=0.0076746;RO=67;SAF=56;SAR=51;SRF=27;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0855587;STB=0.55427;TYPE=snp;VARB=0.0112704;OID=.;OPOS=87769929;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:177:67:70:107:107:51:56:27:40:51:56:27:43 chr4 87809387 . G T 1243.96 PASS AO=132;DP=134;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.030161;FXX=0.0149243;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.886;QD=37.6958;RBI=0.0305332;REFB=-0.0921006;REVB=-0.00475331;RO=1;SAF=72;SAR=60;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00785583;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000492933;OID=.;OPOS=87809387;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:134:132:1:0:132:132:60:72:0:1:60:72:0:0 chr4 87968798 . A T 84.58 PASS AO=10;DP=11;FAO=10;FDP=11;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00471818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.503;QD=30.7577;RBI=0.0166971;REFB=0.0243215;REVB=0.0160166;RO=1;SAF=1;SAR=9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0471711;STB=0.526264;TYPE=snp;VARB=-0.000643808;OID=.;OPOS=87968798;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:11:11:1:1:10:10:9:1:0:1:9:1:0:1 chr4 88035755 . G A 54.39 PASS AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0995604;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.253;QD=7.0187;RBI=0.105544;REFB=-0.00607781;REVB=0.0350325;RO=18;SAF=4;SAR=9;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148003;STB=0.586817;TYPE=snp;VARB=0.0151924;OID=.;OPOS=88035755;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:31:31:18:18:13:13:9:4:8:10:9:4:8:10 chr4 88048863 . T C 337.36 PASS AO=101;DP=251;FAO=102;FDP=252;FR=.;FRO=150;FSAF=42;FSAR=60;FSRF=56;FSRR=94;FWDB=0.00808943;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.329;QD=5.3549;RBI=0.0213286;REFB=0.00101629;REVB=0.019735;RO=150;SAF=42;SAR=59;SRF=56;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0471135;STB=0.523805;TYPE=snp;VARB=-0.00149852;OID=.;OPOS=88048863;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:251:252:150:150:101:102:59:42:56:94:60:42:56:94 chr4 88056925 . A G 998.17 PASS AO=102;DP=116;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0150752;FXX=0.119648;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.558;QD=38.764;RBI=0.0257123;REFB=0;REVB=0.0208293;RO=0;SAF=54;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.03919e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.90421e-05;OID=.;OPOS=88056925;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:116:103:0:0:102:103:48:54:0:0:49:54:0:0 chr4 88057353 . G A 892.83 PASS AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00608413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3963;QD=37.9925;RBI=0.0117221;REFB=0;REVB=-0.0100195;RO=0;SAF=20;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.09908e-05;OID=.;OPOS=88057353;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:94:94:0:0:94:94:74:20:0:0:74:20:0:0 chr4 88058337 . A T 213.91 PASS AO=56;DP=126;FAO=56;FDP=125;FR=.;FRO=69;FSAF=21;FSAR=35;FSRF=17;FSRR=52;FWDB=-0.0233318;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.7711;QD=6.84516;RBI=0.0252221;REFB=-0.0294544;REVB=0.00958049;RO=69;SAF=21;SAR=35;SRF=17;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141974;STB=0.578688;TYPE=snp;VARB=0.0316162;OID=.;OPOS=88058337;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:125:69:69:56:56:35:21:17:52:35:21:17:52 chr4 88059415 . G A 216.45 PASS AO=83;DP=249;FAO=85;FDP=253;FR=.;FRO=168;FSAF=53;FSAR=32;FSRF=88;FSRR=80;FWDB=-0.027094;FXX=0.00393685;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.3381;QD=3.42206;RBI=0.0415226;REFB=-0.00648471;REVB=0.0314648;RO=166;SAF=51;SAR=32;SRF=86;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114562;STB=0.568131;TYPE=snp;VARB=0.013329;OID=.;OPOS=88059415;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:249:253:166:168:83:85:32:51:86:80:32:53:88:80 chr4 88059617 . G C 199.23 PASS AO=56;DP=134;FAO=56;FDP=133;FR=.;FRO=77;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=37;FSRR=40;FWDB=-0.00922433;FXX=0.00746213;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.2066;QD=5.99196;RBI=0.0189368;REFB=-0.0121531;REVB=0.0165382;RO=77;SAF=28;SAR=28;SRF=37;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200956;STB=0.511274;TYPE=snp;VARB=0.0142084;OID=.;OPOS=88059617;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:133:77:77:56:56:28:28:37:40:28:28:37:40 chr4 88059642 . GGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG GGTGTGTGTGTGTGTGTG,GGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 422.22 PASS AO=21,19;DP=94;FAO=24,22;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=5,5;FSAR=19,17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.02211,0.0218687;FXX=0.245861;HRUN=1,1;LEN=8,5;MLLD=201.655,146.374;QD=36.7145;RBI=0.0374398,0.0640467;REFB=0,0;REVB=0.0302141,0.0601975;RO=0;SAF=3,4;SAR=18,15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,5.00629e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.0192849,-0.0224356;OID=.,.;OPOS=88059643,88059663;OREF=GTGTGTGT,GTGTG;OALT=-,-;OMAPALT=GGTGTGTGTGTGTGTGTG,GGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:21,19:45:24,22:46:0:5,5:19,17:0:0:98:0:3,4:18,15:0:0 chr4 88061624 . ATATAT A 223.05 PASS AO=35;DP=53;FAO=36;FDP=52;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=29;FSRF=14;FSRR=2;FWDB=0.00843833;FXX=0.0370302;HRUN=1;LEN=5;MLLD=194.5;QD=17.158;RBI=0.0348384;REFB=0.007735;REVB=-0.033801;RO=0;SAF=7;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.737144;TYPE=del;VARB=-0.00318964;OID=.;OPOS=88061625;OREF=TATAT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:35:36:36:52:16:7:29:14:2:43:0:7:28:0:0 chr4 88231392 . T TA 176.38 PASS AO=55;DP=162;FAO=74;FDP=160;FR=.;FRO=86;FSAF=30;FSAR=44;FSRF=12;FSRR=74;FWDB=-0.121972;FXX=0.0184038;HRUN=1;LEN=1;MLLD=18.6208;QD=4.40955;RBI=0.134893;REFB=0.0277905;REVB=-0.0576092;RO=91;SAF=27;SAR=28;SRF=14;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.381458;STB=0.65698;TYPE=ins;VARB=-0.0421074;OID=.;OPOS=88231393;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:55:162:74:160:86:30:44:12:74:99:91:27:28:14:77 chr4 88258483 . T C 891.21 PASS AO=112;DP=129;FAO=112;FDP=127;FR=.;FRO=15;FSAF=62;FSAR=50;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=0.00750393;FXX=0.00781189;HRUN=6;LEN=1;MLLD=100.206;QD=28.0694;RBI=0.0157646;REFB=-0.00876701;REVB=0.0138641;RO=2;SAF=62;SAR=50;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0018045;STB=0.534024;TYPE=snp;VARB=0.000723212;OID=.;OPOS=88258483;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:129:127:2:15:112:112:50:62:1:1:50:62:4:11 chr4 88333389 . G A 786.02 PASS AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0316493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.847;QD=37.8806;RBI=0.0341175;REFB=0;REVB=0.0127409;RO=0;SAF=33;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.15707e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000406642;OID=.;OPOS=88333389;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:83:83:0:0:83:83:50:33:0:0:51:32:0:0 chr4 88333400 . A T 788.2 PASS AO=85;DP=86;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131694;FXX=0.0235266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.143;QD=37.9853;RBI=0.0199016;REFB=0;REVB=0.0149211;RO=0;SAF=32;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07334e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000759688;OID=.;OPOS=88333400;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:86:83:0:0:85:83:53:32:0:0:54:29:0:0 chr4 88394758 . TGTTAAATACCTG T 138.67 PASS AO=46;DP=144;FAO=47;FDP=130;FR=.;FRO=83;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=60;FSRR=23;FWDB=-0.00726507;FXX=0.0225547;HRUN=1;LEN=12;MLLD=280.527;QD=4.26678;RBI=0.0156669;REFB=-0.00432212;REVB=-0.0138806;RO=76;SAF=20;SAR=26;SRF=55;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.310053;STB=0.671703;TYPE=del;VARB=0.00696837;OID=.;OPOS=88394759;OREF=GTTAAATACCTG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:46:130:47:130:83:21:26:60:23:99:76:20:26:55:21 chr4 88401616 . A G 2506.71 PASS AO=254;DP=259;FAO=264;FDP=264;FR=.;FRO=0;FSAF=125;FSAR=139;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0359621;FXX=0.00377344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.608;QD=37.9805;RBI=0.0364105;REFB=0.0114329;REVB=0.0056968;RO=1;SAF=117;SAR=137;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00346704;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000189404;OID=.;OPOS=88401616;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:259:264:1:0:254:264:137:117:0:1:139:125:0:0 chr4 88412806 . T C 227.13 PASS AO=53;DP=108;FAO=53;FDP=108;FR=.;FRO=55;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=37;FSRR=18;FWDB=0.00612397;FXX=0.00917347;HRUN=3;LEN=1;MLLD=213.604;QD=8.41213;RBI=0.0127928;REFB=-0.0110038;REVB=-0.0112317;RO=53;SAF=33;SAR=20;SRF=35;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0366969;STB=0.527495;TYPE=snp;VARB=0.0101736;OID=.;OPOS=88412806;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:53:55:53:53:20:33:35:18:20:33:37:18 chr4 88415636 . G C 243.82 PASS AO=62;DP=133;FAO=62;FDP=135;FR=.;FRO=73;FSAF=20;FSAR=42;FSRF=23;FSRR=50;FWDB=-0.0036067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.778;QD=7.22435;RBI=0.0238343;REFB=-0.0106626;REVB=-0.0235598;RO=70;SAF=20;SAR=42;SRF=23;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00653074;STB=0.504661;TYPE=snp;VARB=0.0124655;OID=.;OPOS=88415636;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:135:70:73:62:62:42:20:23:47:42:20:23:50 chr4 88416188 . G T 301.74 PASS AO=108;DP=296;FAO=107;FDP=297;FR=.;FRO=190;FSAF=47;FSAR=60;FSRF=101;FSRR=89;FWDB=-0.0209113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.288;QD=4.06383;RBI=0.0217103;REFB=-0.0142532;REVB=0.00583547;RO=181;SAF=47;SAR=61;SRF=100;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129861;STB=0.559077;TYPE=snp;VARB=0.0200864;OID=.;OPOS=88416188;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:296:297:181:190:108:107:61:47:100:81:60:47:101:89 chr4 88416223 . A G 2179.61 PASS AO=221;DP=222;FAO=229;FDP=229;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=202;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00581853;FXX=0.00434764;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.1552;QD=38.0717;RBI=0.0474783;REFB=-0.1054;REVB=0.0471204;RO=1;SAF=26;SAR=195;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00243745;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00057961;OID=.;OPOS=88416223;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:94:222:229:1:0:221:229:195:26:0:1:202:27:0:0 chr4 88534398 . C T 174.98 PASS AO=42;DP=89;FAO=42;FDP=89;FR=.;FRO=47;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=29;FSRR=18;FWDB=-0.00986751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.666;QD=7.86442;RBI=0.0100254;REFB=-0.0191081;REVB=-0.00177251;RO=46;SAF=24;SAR=18;SRF=28;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0359168;STB=0.524741;TYPE=snp;VARB=0.023882;OID=.;OPOS=88534398;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:46:47:42:42:18:24:28:18:18:24:29:18 chr4 88536520 . T C 201.64 PASS AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.2572;QD=36.6624;RBI=0.107386;REFB=0;REVB=0.106821;RO=0;SAF=15;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.79751e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00230005;OID=.;OPOS=88536520;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:22:22:0:0:22:22:7:15:0:0:7:15:0:0 chr4 88727266 . ATTTTTA ATTTTA,ATTTT 50.56 PASS AO=10,8;DP=44;FAO=22,0;FDP=40;FR=.;FRO=18;FSAF=18,0;FSAR=4,0;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=-0.0861404,-0.0481649;FXX=0.0476077;HRUN=5,5;LEN=1,2;MLLD=10.5992,88.8164;QD=5.05595;RBI=0.142435,0.0511182;REFB=-0.112296,-0.0162269;REVB=0.113436,0.0171234;RO=21;SAF=10,8;SAR=0,0;SRF=5;SRR=16;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.825139,0.809789;STB=0.76858,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.18274,0;OID=.,.;OPOS=88727267,88727271;OREF=T,TA;OALT=-,-;OMAPALT=ATTTTA,ATTTT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:10,8:42:22,0:40:18:18,0:4,0:5:13:30:21:10,8:0,0:5:16 chr4 88732531 . T C 393.16 PASS AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0363911;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.266;QD=37.4438;RBI=0.055836;REFB=0;REVB=0.0423479;RO=0;SAF=27;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.13648e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.16653e-05;OID=.;OPOS=88732531;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:43:42:0:0:42:42:15:27:0:0:15:27:0:0 chr4 88732692 . G A 559.32 PASS AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0353759;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2728;QD=36.0854;RBI=0.0936134;REFB=-0.000628668;REVB=0.0866719;RO=0;SAF=34;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507244;TYPE=snp;VARB=0.000419661;OID=.;OPOS=88732692;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:62:62:0:1:61:61:27:34:0:0:27:34:1:0 chr4 88732746 . A G 826.63 PASS AO=88;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00373398;FXX=0.0219756;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.008;QD=37.1519;RBI=0.0117235;REFB=-0.0234413;REVB=0.011113;RO=1;SAF=48;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116996;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000418974;OID=.;OPOS=88732746;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:89:89:1:0:88:89:40:48:0:1:41:48:0:0 chr4 88732918 . A T 1769.62 PASS AO=194;DP=199;FAO=193;FDP=197;FR=.;FRO=4;FSAF=84;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.016447;FXX=0.0100497;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.863;QD=35.9315;RBI=0.0585623;REFB=-0.0844696;REVB=0.0562053;RO=5;SAF=84;SAR=110;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0211505;STB=0.509008;TYPE=snp;VARB=0.0041333;OID=.;OPOS=88732918;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:199:197:5:4:194:193:110:84:0:5:109:84:0:4 chr4 88766969 . A G 345.16 PASS AO=65;DP=110;FAO=65;FDP=109;FR=.;FRO=44;FSAF=24;FSAR=41;FSRF=33;FSRR=11;FWDB=0.00584778;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.83;QD=12.6665;RBI=0.00714836;REFB=-0.000811997;REVB=-0.00411127;RO=44;SAF=24;SAR=41;SRF=33;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.279326;STB=0.651837;TYPE=snp;VARB=0.000241425;OID=.;OPOS=88766969;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:109:44:44:65:65:41:24:33:11:41:24:33:11 chr4 88767942 . T A 107.87 PASS AO=36;DP=116;FAO=40;FDP=119;FR=.;FRO=79;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=26;FSRR=53;FWDB=0.0104111;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.045;QD=3.62589;RBI=0.0105279;REFB=-0.0248979;REVB=0.00156374;RO=79;SAF=14;SAR=22;SRF=27;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0593775;STB=0.566386;TYPE=snp;VARB=0.0464596;OID=.;OPOS=88767942;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:119:79:79:36:40:22:14:27:52:23:17:26:53 chr4 88813503 . T C 3826.41 PASS AO=485;DP=485;FAO=398;FDP=398;FR=.;FRO=0;FSAF=140;FSAR=258;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153027;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.818;QD=38.4564;RBI=0.0190473;REFB=0;REVB=0.0113413;RO=0;SAF=166;SAR=319;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000200277;OID=.;OPOS=88813503;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:485:398:0:0:485:398:319:166:0:0:258:140:0:0 chr4 88815163 . A ATTAGG 275.44 PASS AO=94;DP=267;FAO=95;FDP=259;FR=.;FRO=164;FSAF=12;FSAR=83;FSRF=71;FSRR=93;FWDB=-0.00323337;FXX=0.0152085;HRUN=2;LEN=5;MLLD=263.636;QD=4.25391;RBI=0.0132368;REFB=-0.00501767;REVB=-0.0128359;RO=168;SAF=11;SAR=83;SRF=75;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.493322;STB=0.765293;TYPE=ins;VARB=0.00747265;OID=.;OPOS=88815164;OREF=-;OALT=TTAGG;OMAPALT=ATTAGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:94:267:95:259:164:12:83:71:93:99:168:11:83:75:93 chr4 88898941 . C T 1370.22 PASS AO=150;DP=157;FAO=152;FDP=158;FR=.;FRO=6;FSAF=93;FSAR=59;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.0102669;FXX=0.00628891;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.0652;QD=34.6891;RBI=0.0108586;REFB=-0.00367596;REVB=-0.00353533;RO=5;SAF=92;SAR=58;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0137389;STB=0.511077;TYPE=snp;VARB=-3.84597e-05;OID=.;OPOS=88898941;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:157:158:5:6:150:152:58:92:2:3:59:93:2:4 chr4 88902692 . T C 69.01 PASS AO=29;DP=103;FAO=30;FDP=103;FR=.;FRO=73;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=34;FSRR=39;FWDB=0.00230716;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.664;QD=2.68011;RBI=0.0165465;REFB=-0.00760698;REVB=0.0163848;RO=73;SAF=11;SAR=18;SRF=34;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106954;STB=0.572623;TYPE=snp;VARB=0.0241278;OID=.;OPOS=88902692;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:103:103:73:73:29:30:18:11:34:39:19:11:34:39 chr4 88903853 . C T 537.78 PASS AO=140;DP=317;FAO=143;FDP=317;FR=.;FRO=174;FSAF=31;FSAR=112;FSRF=76;FSRR=98;FWDB=0.00740226;FXX=0.00937471;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.222;QD=6.78582;RBI=0.00878568;REFB=-0.0205239;REVB=0.0047323;RO=171;SAF=29;SAR=111;SRF=75;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.282447;STB=0.647971;TYPE=snp;VARB=0.0237212;OID=.;OPOS=88903853;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:317:317:171:174:140:143:111:29:75:96:112:31:76:98 chr4 88921446 . G C 737.8 PASS AO=145;DP=246;FAO=145;FDP=247;FR=.;FRO=102;FSAF=73;FSAR=72;FSRF=44;FSRR=58;FWDB=-0.0343405;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9867;QD=11.9482;RBI=0.059238;REFB=0.0191268;REVB=0.0482687;RO=100;SAF=73;SAR=72;SRF=43;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0553834;STB=0.529749;TYPE=snp;VARB=-0.0147876;OID=.;OPOS=88921446;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:246:247:100:102:145:145:72:73:43:57:72:73:44:58 chr4 88921512 . G A 659.92 PASS AO=133;DP=231;FAO=133;FDP=232;FR=.;FRO=99;FSAF=58;FSAR=75;FSRF=36;FSRR=63;FWDB=-0.0187403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.105;QD=11.3778;RBI=0.0200676;REFB=-0.0068409;REVB=0.00717714;RO=97;SAF=58;SAR=75;SRF=35;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.060049;STB=0.531681;TYPE=snp;VARB=0.00582572;OID=.;OPOS=88921512;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:231:232:97:99:133:133:75:58:35:62:75:58:36:63 chr4 89053718 . T C 491.5 PASS AO=94;DP=160;FAO=95;FDP=161;FR=.;FRO=66;FSAF=44;FSAR=51;FSRF=31;FSRR=35;FWDB=-0.00292202;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.095;QD=12.2113;RBI=0.0320263;REFB=-0.00260499;REVB=-0.0318927;RO=65;SAF=43;SAR=51;SRF=30;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00310319;STB=0.502694;TYPE=snp;VARB=0.00132536;OID=.;OPOS=89053718;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:161:65:66:94:95:51:43:30:35:51:44:31:35 chr4 89061114 . C T 496.73 PASS AO=100;DP=175;FAO=100;FDP=175;FR=.;FRO=75;FSAF=45;FSAR=55;FSRF=43;FSRR=32;FWDB=-0.023399;FXX=0.0056815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.273;QD=11.3538;RBI=0.0259152;REFB=-0.00209643;REVB=0.0111393;RO=74;SAF=45;SAR=55;SRF=42;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0919734;STB=0.552816;TYPE=snp;VARB=0.00170281;OID=.;OPOS=89061114;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:175:74:75:100:100:55:45:42:32:55:45:43:32 chr4 89182518 . T C 84.32 PASS AO=18;DP=75;FAO=25;FDP=66;FR=.;FRO=41;FSAF=2;FSAR=23;FSRF=9;FSRR=32;FWDB=-0.0221178;FXX=0.0149231;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.0988;QD=5.11015;RBI=0.0318389;REFB=-0.0184722;REVB=-0.0229025;RO=30;SAF=1;SAR=17;SRF=5;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.342327;STB=0.69677;TYPE=snp;VARB=0.0403884;OID=.;OPOS=89182518;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:60:66:30:41:18:25:17:1:5:25:23:2:9:32 chr4 89311962 . T C 289.3 PASS AO=77;DP=173;FAO=77;FDP=173;FR=.;FRO=96;FSAF=23;FSAR=54;FSRF=31;FSRR=65;FWDB=-0.00707717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.516;QD=6.68908;RBI=0.0074523;REFB=-0.0115058;REVB=-0.00233461;RO=96;SAF=23;SAR=54;SRF=31;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.028422;STB=0.515828;TYPE=snp;VARB=0.0190754;OID=.;OPOS=89311962;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:173:96:96:77:77:54:23:31:65:54:23:31:65 chr4 89415396 . T C 2205.65 PASS AO=219;DP=253;FAO=245;FDP=253;FR=.;FRO=8;FSAF=105;FSAR=140;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=-0.009499;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2182;QD=34.8719;RBI=0.0250061;REFB=-0.0235179;REVB=-0.0231316;RO=34;SAF=79;SAR=140;SRF=27;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115371;STB=0.509826;TYPE=snp;VARB=0.00587278;OID=.;OPOS=89415396;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:253:253:34:8:219:245:140:79:27:7:140:105:1:7 chr4 90034686 . A G 305.65 PASS AO=66;DP=124;FAO=66;FDP=124;FR=.;FRO=58;FSAF=43;FSAR=23;FSRF=30;FSRR=28;FWDB=-0.0108162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.012;QD=9.85956;RBI=0.0114559;REFB=-0.0140886;REVB=0.00377442;RO=58;SAF=43;SAR=23;SRF=30;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120675;STB=0.566353;TYPE=snp;VARB=0.011571;OID=.;OPOS=90034686;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:58:58:66:66:23:43:30:28:23:43:30:28 chr4 90874879 . T C 140.91 PASS AO=35;DP=79;FAO=35;FDP=78;FR=.;FRO=43;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=28;FWDB=0.029764;FXX=0.0249969;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.238;QD=7.22591;RBI=0.0302147;REFB=0.00639266;REVB=-0.00519938;RO=42;SAF=14;SAR=21;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0438493;STB=0.529713;TYPE=snp;VARB=-0.00578452;OID=.;OPOS=90874879;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:78:42:43:35:35:21:14:15:27:21:14:15:28 chr4 91234223 . C G 156.07 PASS AO=38;DP=84;FAO=39;FDP=84;FR=.;FRO=45;FSAF=6;FSAR=33;FSRF=13;FSRR=32;FWDB=-0.00152242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.381;QD=7.43195;RBI=0.0322462;REFB=-0.0192355;REVB=-0.0322102;RO=45;SAF=6;SAR=32;SRF=13;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198891;STB=0.616452;TYPE=snp;VARB=0.0167699;OID=.;OPOS=91234223;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:45:45:38:39:32:6:13:32:33:6:13:32 chr4 91584992 . A G 505.28 PASS AO=139;DP=317;FAO=139;FDP=316;FR=.;FRO=177;FSAF=86;FSAR=53;FSRF=103;FSRR=74;FWDB=0.0356787;FXX=0.00315447;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.0602;QD=6.39596;RBI=0.036993;REFB=-0.0135451;REVB=-0.00977321;RO=177;SAF=86;SAR=53;SRF=103;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0389315;STB=0.521607;TYPE=snp;VARB=0.0167287;OID=.;OPOS=91584992;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:317:316:177:177:139:139:53:86:103:74:53:86:103:74 chr4 91585060 . A T 390.33 PASS AO=97;DP=210;FAO=99;FDP=212;FR=.;FRO=113;FSAF=47;FSAR=52;FSRF=57;FSRR=56;FWDB=0.000242653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.834;QD=7.3647;RBI=0.00881513;REFB=-0.00811148;REVB=0.00881179;RO=113;SAF=46;SAR=51;SRF=57;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0293885;STB=0.51583;TYPE=snp;VARB=0.00948482;OID=.;OPOS=91585060;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:210:212:113:113:97:99:51:46:57:56:52:47:57:56 chr4 92240278 . A T 208.66 PASS AO=101;DP=357;FAO=108;FDP=366;FR=.;FRO=258;FSAF=31;FSAR=77;FSRF=91;FSRR=167;FWDB=0.00242677;FXX=0.00543463;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.7282;QD=2.28048;RBI=0.00599588;REFB=-0.00230902;REVB=0.00548283;RO=211;SAF=25;SAR=76;SRF=76;SRR=135;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16006;STB=0.553946;TYPE=snp;VARB=0.0166034;OID=.;OPOS=92240278;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:357:366:211:258:101:108:76:25:76:135:77:31:91:167 chr4 92240802 . C T 438.59 PASS AO=95;DP=176;FAO=94;FDP=175;FR=.;FRO=81;FSAF=38;FSAR=56;FSRF=51;FSRR=30;FWDB=-0.0122192;FXX=0.0223451;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2253;QD=10.0248;RBI=0.0737526;REFB=-0.00967645;REVB=-0.0727333;RO=72;SAF=38;SAR=57;SRF=43;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157108;STB=0.603953;TYPE=snp;VARB=0.0265026;OID=.;OPOS=92240802;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:175:72:81:95:94:57:38:43:29:56:38:51:30 chr4 92246344 . G A 409.16 PASS AO=113;DP=259;FAO=113;FDP=259;FR=.;FRO=146;FSAF=49;FSAR=64;FSRF=59;FSRR=87;FWDB=-0.0144184;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.765;QD=6.31906;RBI=0.015014;REFB=-0.0138994;REVB=0.00418714;RO=144;SAF=49;SAR=64;SRF=59;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0246536;STB=0.517012;TYPE=snp;VARB=0.0192946;OID=.;OPOS=92246344;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:259:259:144:146:113:113:64:49:59:85:64:49:59:87 chr4 94316763 . T G 438.59 PASS AO=107;DP=227;FAO=109;FDP=228;FR=.;FRO=119;FSAF=68;FSAR=41;FSRF=76;FSRR=43;FWDB=-0.0193559;FXX=0.00436662;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.4044;QD=7.69461;RBI=0.0702025;REFB=0.0156641;REVB=-0.0674814;RO=120;SAF=67;SAR=40;SRF=77;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159278;STB=0.508263;TYPE=snp;VARB=-0.0178611;OID=.;OPOS=94316763;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:227:228:120:119:107:109:40:67:77:43:41:68:76:43 chr4 95169682 . G T 551.34 PASS AO=107;DP=181;FAO=107;FDP=180;FR=.;FRO=73;FSAF=37;FSAR=70;FSRF=21;FSRR=52;FWDB=0.0707565;FXX=0.00552456;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.1937;QD=12.2521;RBI=0.0882257;REFB=-0.0444168;REVB=0.0527001;RO=73;SAF=37;SAR=70;SRF=20;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0607005;STB=0.52647;TYPE=snp;VARB=0.0532593;OID=.;OPOS=95169682;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:180:73:73:107:107:70:37:20:53:70:37:21:52 chr4 95170839 . G A 279.85 PASS AO=74;DP=176;FAO=78;FDP=181;FR=.;FRO=103;FSAF=31;FSAR=47;FSRF=50;FSRR=53;FWDB=-0.00922341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.879;QD=6.18462;RBI=0.0251;REFB=-0.0182539;REVB=0.0233439;RO=101;SAF=30;SAR=44;SRF=48;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0735155;STB=0.551167;TYPE=snp;VARB=0.0214817;OID=.;OPOS=95170839;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:181:101:103:74:78:44:30:48:53:47:31:50:53 chr4 95173779 . T C 400.89 PASS AO=82;DP=146;FAO=82;FDP=146;FR=.;FRO=64;FSAF=40;FSAR=42;FSRF=42;FSRR=22;FWDB=-0.00643029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.6119;QD=10.9834;RBI=0.0355704;REFB=-0.0145062;REVB=0.0349843;RO=64;SAF=40;SAR=42;SRF=42;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135173;STB=0.5736;TYPE=snp;VARB=0.0141453;OID=.;OPOS=95173779;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:64:64:82:82:42:40:42:22:42:40:42:22 chr4 95186055 . A G 484.73 PASS AO=105;DP=196;FAO=105;FDP=196;FR=.;FRO=91;FSAF=35;FSAR=70;FSRF=27;FSRR=64;FWDB=-0.00372765;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=226.177;QD=9.89241;RBI=0.0192103;REFB=0.00275391;REVB=-0.0188452;RO=91;SAF=35;SAR=70;SRF=27;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0355161;STB=0.519376;TYPE=snp;VARB=-0.00239807;OID=.;OPOS=95186055;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:196:91:91:105:105:70:35:27:64:70:35:27:64 chr4 95197520 . C T 592.79 PASS AO=118;DP=209;FAO=121;FDP=214;FR=.;FRO=93;FSAF=66;FSAR=55;FSRF=43;FSRR=50;FWDB=-0.00292337;FXX=0.00465095;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.687;QD=11.0802;RBI=0.00302271;REFB=-0.0256097;REVB=-0.000768557;RO=91;SAF=66;SAR=52;SRF=41;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0873353;STB=0.536164;TYPE=snp;VARB=0.0202088;OID=.;OPOS=95197520;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:214:91:93:118:121:52:66:41:50:55:66:43:50 chr4 95211610 . T C 331.07 PASS AO=77;DP=153;FAO=77;FDP=154;FR=.;FRO=77;FSAF=34;FSAR=43;FSRF=44;FSRR=33;FWDB=-0.0147065;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=147.971;QD=8.59926;RBI=0.0371066;REFB=-0.00905425;REVB=0.0340679;RO=76;SAF=34;SAR=43;SRF=43;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112028;STB=0.56482;TYPE=snp;VARB=0.0133205;OID=.;OPOS=95211610;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:154:76:77:77:77:43:34:43:33:43:34:44:33 chr4 95503902 . T C 875.9 PASS AO=94;DP=97;FAO=96;FDP=99;FR=.;FRO=3;FSAF=37;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0695015;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.4487;QD=35.3898;RBI=0.0782291;REFB=-0.0773373;REVB=0.0359073;RO=3;SAF=37;SAR=57;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0242998;STB=0.512394;TYPE=snp;VARB=0.00489073;OID=.;OPOS=95503902;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:97:99:3:3:94:96:57:37:0:3:59:37:0:3 chr4 95531417 . A G 1639.92 PASS AO=168;DP=168;FAO=170;FDP=170;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=108;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.07062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.928;QD=38.5865;RBI=0.0720637;REFB=0;REVB=-0.0143522;RO=0;SAF=61;SAR=107;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.75234e-05;OID=.;OPOS=95531417;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:168:170:0:0:168:170:107:61:0:0:108:62:0:0 chr4 95539267 . G A 1012.86 PASS AO=105;DP=105;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0106739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.697;QD=38.2211;RBI=0.0254745;REFB=0;REVB=0.0231305;RO=0;SAF=23;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.06566e-05;OID=.;OPOS=95539267;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:105:106:0:0:105:106:82:23:0:0:82:24:0:0 chr4 95561459 . A G 935.6 PASS AO=104;DP=111;FAO=105;FDP=109;FR=.;FRO=4;FSAF=64;FSAR=41;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0584143;FXX=0.0180164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.117;QD=34.3339;RBI=0.0693107;REFB=-0.139763;REVB=0.0373061;RO=4;SAF=64;SAR=40;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0287346;STB=0.515149;TYPE=snp;VARB=0.00163505;OID=.;OPOS=95561459;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:111:109:4:4:104:105:40:64:4:0:41:64:4:0 chr4 95578588 . G A 2228.91 PASS AO=231;DP=231;FAO=233;FDP=233;FR=.;FRO=0;FSAF=120;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148498;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.1104;QD=38.2646;RBI=0.0151227;REFB=0;REVB=0.00285986;RO=0;SAF=120;SAR=111;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18261e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.20515e-05;OID=.;OPOS=95578588;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:231:233:0:0:231:233:111:120:0:0:113:120:0:0 chr4 95587587 . T C 2910.62 PASS AO=304;DP=305;FAO=305;FDP=305;FR=.;FRO=0;FSAF=154;FSAR=151;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288496;FXX=0.00973994;HRUN=3;LEN=1;MLLD=90.8706;QD=38.1721;RBI=0.0332269;REFB=0.0416265;REVB=-0.0164841;RO=1;SAF=154;SAR=150;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00316913;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000282151;OID=.;OPOS=95587587;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:305:305:1:0:304:305:150:154:0:1:151:154:0:0 chr4 96075965 . C T 287.34 PASS AO=88;DP=231;FAO=92;FDP=235;FR=.;FRO=143;FSAF=48;FSAR=44;FSRF=70;FSRR=73;FWDB=0.00466955;FXX=0.00423711;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.401;QD=4.89093;RBI=0.0226567;REFB=-0.00428446;REVB=0.0221702;RO=143;SAF=45;SAR=43;SRF=70;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239705;STB=0.519611;TYPE=snp;VARB=0.00689552;OID=.;OPOS=96075965;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:231:235:143:143:88:92:43:45:70:73:44:48:70:73 chr4 96079442 . G A 392.12 PASS AO=93;DP=190;FAO=93;FDP=189;FR=.;FRO=96;FSAF=39;FSAR=54;FSRF=51;FSRR=45;FWDB=-0.0196394;FXX=0.0104707;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.3337;QD=8.29874;RBI=0.026806;REFB=-0.0137912;REVB=-0.0182443;RO=95;SAF=39;SAR=54;SRF=50;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0990076;STB=0.557263;TYPE=snp;VARB=0.00991012;OID=.;OPOS=96079442;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:189:95:96:93:93:54:39:50:45:54:39:51:45 chr4 96089978 . C T 325.75 PASS AO=82;DP=171;FAO=82;FDP=177;FR=.;FRO=95;FSAF=35;FSAR=47;FSRF=41;FSRR=54;FWDB=-0.0151431;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.1978;QD=7.36149;RBI=0.0487027;REFB=-0.0236203;REVB=-0.0462887;RO=89;SAF=35;SAR=47;SRF=40;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0216865;STB=0.502602;TYPE=snp;VARB=0.0299901;OID=.;OPOS=96089978;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:177:89:95:82:82:47:35:40:49:47:35:41:54 chr4 96106322 . A G 755.87 PASS AO=166;DP=315;FAO=167;FDP=315;FR=.;FRO=148;FSAF=67;FSAR=100;FSRF=39;FSRR=109;FWDB=-0.00464068;FXX=0.00316446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.849;QD=9.59834;RBI=0.00913575;REFB=0.00203797;REVB=0.00786931;RO=145;SAF=66;SAR=100;SRF=39;SRR=106;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118273;STB=0.56915;TYPE=snp;VARB=-0.00196718;OID=.;OPOS=96106322;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:315:315:145:148:166:167:100:66:39:106:100:67:39:109 chr4 96123981 . C T 961.46 PASS AO=101;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0308643;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.13;QD=38.0776;RBI=0.031224;REFB=0;REVB=0.00472633;RO=0;SAF=53;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11453e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000780272;OID=.;OPOS=96123981;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:101:101:0:0:101:101:48:53:0:0:48:53:0:0 chr4 96127869 . T G 117.16 PASS AO=28;DP=68;FAO=31;FDP=71;FR=.;FRO=40;FSAF=27;FSAR=4;FSRF=28;FSRR=12;FWDB=0.00744374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.652;QD=6.60043;RBI=0.0288868;REFB=-0.0100451;REVB=-0.0279112;RO=39;SAF=24;SAR=4;SRF=27;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.264014;STB=0.662453;TYPE=snp;VARB=0.0100934;OID=.;OPOS=96127869;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:71:39:40:28:31:4:24:27:12:4:27:28:12 chr4 96169733 . G T 144.09 PASS AO=43;DP=108;FAO=43;FDP=108;FR=.;FRO=65;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=30;FSRR=35;FWDB=0.00792428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.6509;QD=5.3367;RBI=0.0148311;REFB=-0.0116556;REVB=-0.0125367;RO=65;SAF=21;SAR=22;SRF=30;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0285494;STB=0.516163;TYPE=snp;VARB=0.0289886;OID=.;OPOS=96169733;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:65:65:43:43:22:21:30:35:22:21:30:35 chr4 96256673 . G A 702.18 PASS AO=89;DP=208;FAO=101;FDP=202;FR=.,HEALED;FRO=64;FSAF=56;FSAR=45;FSRF=56;FSRR=8;FWDB=0.0177701;FXX=0.0146334;HRUN=3;LEN=1;MLLD=94.9274;QD=13.9046;RBI=0.0818353;REFB=0.00513234;REVB=-0.0798827;RO=56;SAF=51;SAR=38;SRF=54;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.301899;STB=0.629347;TYPE=snp;VARB=0.00186744;OID=.;OPOS=96256673;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:202:56:64:89:101:38:51:54:2:45:56:56:8 chr4 97270063 . C A 177.9 PASS AO=46;DP=102;FAO=46;FDP=103;FR=.;FRO=57;FSAF=30;FSAR=16;FSRF=34;FSRR=23;FWDB=0.0138059;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.921;QD=6.90868;RBI=0.0223682;REFB=-0.00866351;REVB=-0.0175992;RO=45;SAF=30;SAR=16;SRF=34;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105843;STB=0.533258;TYPE=snp;VARB=0.0087718;OID=.;OPOS=97270063;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:103:45:57:46:46:16:30:34:11:16:30:34:23 chr4 98893437 . A G 143.47 PASS AO=33;DP=68;FAO=33;FDP=68;FR=.;FRO=35;FSAF=25;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=0.0166575;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.027;QD=8.43953;RBI=0.0168804;REFB=-0.0410336;REVB=-0.00273472;RO=35;SAF=25;SAR=8;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176022;STB=0.599064;TYPE=snp;VARB=0.0346919;OID=.;OPOS=98893437;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:35:35:33:33:8:25:21:14:8:25:21:14 chr4 98893476 . C T 139.24 PASS AO=37;DP=91;FAO=38;FDP=91;FR=.;FRO=53;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=30;FSRR=23;FWDB=-0.00234591;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.3001;QD=6.12033;RBI=0.0102791;REFB=-0.00507421;REVB=-0.0100078;RO=53;SAF=21;SAR=16;SRF=30;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00162016;STB=0.507688;TYPE=snp;VARB=0.00709585;OID=.;OPOS=98893476;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:53:53:37:38:16:21:30:23:16:22:30:23 chr4 99027137 . T C 85.86 PASS AO=30;DP=87;FAO=30;FDP=87;FR=.;FRO=57;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=29;FSRR=28;FWDB=0.011107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.783;QD=3.94771;RBI=0.0203523;REFB=-0.0243183;REVB=0.0170544;RO=57;SAF=11;SAR=19;SRF=29;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163869;STB=0.59508;TYPE=snp;VARB=0.03979;OID=.;OPOS=99027137;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:87:87:57:57:30:30:19:11:29:28:19:11:29:28 chr4 99027184 . T C 67.44 PASS AO=29;DP=99;FAO=29;FDP=99;FR=.;FRO=70;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=28;FSRR=42;FWDB=-0.0168506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.032;QD=2.72502;RBI=0.0176535;REFB=-0.0107179;REVB=0.00526345;RO=70;SAF=12;SAR=17;SRF=28;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0170603;STB=0.51008;TYPE=snp;VARB=0.0164682;OID=.;OPOS=99027184;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:99:99:70:70:29:29:17:12:28:42:17:12:28:42 chr4 99027185 . G A 67.45 PASS AO=29;DP=99;FAO=29;FDP=99;FR=.;FRO=70;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=28;FSRR=42;FWDB=-0.0101202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.023;QD=2.72544;RBI=0.0269116;REFB=-0.0252678;REVB=-0.0249362;RO=69;SAF=12;SAR=17;SRF=28;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00984424;STB=0.51008;TYPE=snp;VARB=0.0155612;OID=.;OPOS=99027185;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:99:99:69:70:29:29:17:12:28:41:17:12:28:42 chr4 99027218 . T C 55.43 PASS AO=23;DP=78;FAO=23;FDP=79;FR=.;FRO=56;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=34;FWDB=0.0219392;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.4688;QD=2.80652;RBI=0.0573771;REFB=-0.00236714;REVB=-0.053017;RO=55;SAF=11;SAR=12;SRF=21;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115716;STB=0.560924;TYPE=snp;VARB=0.00593216;OID=.;OPOS=99027218;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:78:79:55:56:23:23:12:11:21:34:12:11:22:34 chr4 99049593 . A G 144.49 PASS AO=38;DP=87;FAO=38;FDP=87;FR=.;FRO=49;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=0.00170731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.8698;QD=6.64298;RBI=0.0141275;REFB=-0.0125149;REVB=0.0140239;RO=48;SAF=17;SAR=21;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0936364;STB=0.546916;TYPE=snp;VARB=0.0172852;OID=.;OPOS=99049593;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:48:49:38:38:21:17:26:22:21:17:26:23 chr4 99218108 . G GA 711.04 PASS AO=86;DP=97;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130861;FXX=0.0531858;HRUN=0;LEN=1;MLLD=139.181;QD=31.9567;RBI=0.0144908;REFB=0;REVB=0.00622384;RO=4;SAF=38;SAR=48;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0261806;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.000268504;OID=.;OPOS=99218109;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:86:97:89:89:0:41:48:0:0:63:4:38:48:3:1 chr4 99808254 . G A 567.73 PASS AO=115;DP=202;FAO=115;FDP=202;FR=.;FRO=87;FSAF=49;FSAR=66;FSRF=30;FSRR=57;FWDB=-0.0140717;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.006;QD=11.2421;RBI=0.0302528;REFB=-0.0149426;REVB=0.0267809;RO=86;SAF=49;SAR=66;SRF=29;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0724926;STB=0.536156;TYPE=snp;VARB=0.0120724;OID=.;OPOS=99808254;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:202:86:87:115:115:66:49:29:57:66:49:30:57 chr4 99850126 . A G 61.98 PASS AO=16;DP=41;FAO=17;FDP=43;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.0492183;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.6834;QD=5.76535;RBI=0.0498093;REFB=-0.00356638;REVB=0.00764996;RO=21;SAF=7;SAR=9;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0570481;STB=0.507034;TYPE=snp;VARB=0.0168205;OID=.;OPOS=99850126;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:41:43:21:26:16:17:9:7:8:13:10:7:11:15 chr4 99926965 . T C 39.46 PASS AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0112577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.334;QD=15.7836;RBI=0.0148428;REFB=-0.0313623;REVB=0.00967331;RO=4;SAF=4;SAR=2;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0648362;STB=0.538337;TYPE=snp;VARB=0.019487;OID=.;OPOS=99926965;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:10:10:4:4:6:6:2:4:3:1:2:4:3:1 chr4 99952710 . A G 397.62 PASS AO=114;DP=270;FAO=114;FDP=270;FR=.;FRO=156;FSAF=47;FSAR=67;FSRF=72;FSRR=84;FWDB=0.00683015;FXX=0.0036899;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.042;QD=5.89068;RBI=0.0101424;REFB=0.000553534;REVB=0.00749786;RO=155;SAF=47;SAR=67;SRF=72;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0550891;STB=0.529059;TYPE=snp;VARB=-0.000803179;OID=.;OPOS=99952710;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:270:270:155:156:114:114:67:47:72:83:67:47:72:84 chr4 100045574 . T C 141.21 PASS AO=42;DP=106;FAO=42;FDP=106;FR=.;FRO=64;FSAF=13;FSAR=29;FSRF=34;FSRR=30;FWDB=-0.00936458;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.882;QD=5.32855;RBI=0.0204004;REFB=0.000871979;REVB=-0.018124;RO=64;SAF=13;SAR=29;SRF=34;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.245814;STB=0.639837;TYPE=snp;VARB=-0.00157695;OID=.;OPOS=100045574;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:64:64:42:42:29:13:34:30:29:13:34:30 chr4 100045616 . C T 114.09 PASS AO=40;DP=115;FAO=40;FDP=115;FR=.;FRO=75;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=37;FSRR=38;FWDB=-0.049776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.6984;QD=3.96825;RBI=0.053186;REFB=-0.025124;REVB=-0.0187375;RO=75;SAF=15;SAR=25;SRF=37;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137109;STB=0.579024;TYPE=snp;VARB=0.0474174;OID=.;OPOS=100045616;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:75:75:40:40:25:15:37:38:25:15:37:38 chr4 100045647 . A G 87.15 PASS AO=32;DP=98;FAO=32;FDP=97;FR=.;FRO=65;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=30;FSRR=35;FWDB=-0.0262765;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.995;QD=3.59373;RBI=0.029388;REFB=0.00125666;REVB=-0.0131605;RO=65;SAF=14;SAR=18;SRF=30;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0280111;STB=0.516287;TYPE=snp;VARB=-0.00222575;OID=.;OPOS=100045647;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:98:97:65:65:32:32:18:14:30:35:18:14:30:35 chr4 100047812 . G A 488.72 PASS AO=120;DP=253;FAO=121;FDP=253;FR=.;FRO=132;FSAF=55;FSAR=66;FSRF=60;FSRR=72;FWDB=-0.00991281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.616;QD=7.72677;RBI=0.0135694;REFB=-0.0255157;REVB=-0.00926635;RO=132;SAF=55;SAR=65;SRF=60;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00362647;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0271591;OID=.;OPOS=100047812;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:253:253:132:132:120:121:65:55:60:72:66:55:60:72 chr4 100048414 . T C 425.62 PASS AO=103;DP=215;FAO=103;FDP=212;FR=.;FRO=109;FSAF=53;FSAR=50;FSRF=36;FSRR=73;FWDB=0.0187276;FXX=0.0139528;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.83;QD=8.03058;RBI=0.0197483;REFB=-0.0160261;REVB=0.00626678;RO=108;SAF=53;SAR=50;SRF=36;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168176;STB=0.594293;TYPE=snp;VARB=0.014387;OID=.;OPOS=100048414;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:212:108:109:103:103:50:53:36:72:50:53:36:73 chr4 100052733 . C A 179.26 PASS AO=50;DP=123;FAO=51;FDP=124;FR=.;FRO=73;FSAF=36;FSAR=15;FSRF=31;FSRR=42;FWDB=-0.0105777;FXX=0.0461503;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.957;QD=5.78261;RBI=0.0129043;REFB=-0.00213793;REVB=-0.00739129;RO=73;SAF=35;SAR=15;SRF=31;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.297617;STB=0.671177;TYPE=snp;VARB=0.00277219;OID=.;OPOS=100052733;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:124:73:73:50:51:15:35:31:42:15:36:31:42 chr4 100062819 . A G 1213.93 PASS AO=113;DP=113;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191701;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.804;QD=37.9352;RBI=0.0747021;REFB=-0.121127;REVB=0.0722005;RO=0;SAF=56;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.28685e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000741407;OID=.;OPOS=100062819;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:113:128:0:0:113:128:57:56:0:0:70:58:0:0 chr4 100064233 . G A 240.74 PASS AO=83;DP=241;FAO=87;FDP=245;FR=.;FRO=158;FSAF=36;FSAR=51;FSRF=89;FSRR=69;FWDB=-0.0074216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.987;QD=3.93041;RBI=0.0254;REFB=-0.0110294;REVB=0.0242915;RO=157;SAF=36;SAR=47;SRF=88;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144786;STB=0.596051;TYPE=snp;VARB=0.0159116;OID=.;OPOS=100064233;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:241:245:157:158:83:87:47:36:88:69:51:36:89:69 chr4 100064305 . C G 1977.55 PASS AO=175;DP=233;FAO=229;FDP=229;FR=.;FRO=0;FSAF=116;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0687991;FXX=0.0129305;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.891;QD=34.5424;RBI=0.0688218;REFB=-0.0326533;REVB=-0.00176865;RO=0;SAF=65;SAR=110;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00844601;OID=.;OPOS=100064305;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:89:179:229:0:0:175:229:110:65:0:0:113:116:0:0 chr4 100064326 . A T 318.89 PASS AO=95;DP=233;FAO=95;FDP=232;FR=.;FRO=137;FSAF=40;FSAR=55;FSRF=73;FSRR=64;FWDB=-0.0269268;FXX=0.00854664;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.047;QD=5.49809;RBI=0.0283484;REFB=-0.00851742;REVB=0.00886448;RO=137;SAF=41;SAR=54;SRF=73;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10705;STB=0.566273;TYPE=snp;VARB=0.0102411;OID=.;OPOS=100064326;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:233:232:137:137:95:95:54:41:73:64:55:40:73:64 chr4 100140306 . A T 1467.16 PASS AO=155;DP=156;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00269717;FXX=0.00640985;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.807;QD=37.8623;RBI=0.0550872;REFB=-0.0614454;REVB=0.0550212;RO=1;SAF=48;SAR=107;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0044258;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000453191;OID=.;OPOS=100140306;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:156:155:1:0:155:155:107:48:0:1:107:48:0:0 chr4 100235053 . A G 3442.72 PASS AO=364;DP=368;FAO=368;FDP=368;FR=.;FRO=0;FSAF=184;FSAR=184;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00362528;FXX=0.0107524;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.7544;QD=37.4208;RBI=0.0525637;REFB=0.0145069;REVB=-0.0524386;RO=4;SAF=182;SAR=182;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00518483;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000418809;OID=.;OPOS=100235053;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:368:368:4:0:364:368:182:182:1:3:184:184:0:0 chr4 100239319 . T C 414.31 PASS AO=115;DP=262;FAO=115;FDP=265;FR=.;FRO=150;FSAF=39;FSAR=76;FSRF=39;FSRR=111;FWDB=-0.0205387;FXX=0.00749036;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.0139;QD=6.25372;RBI=0.020737;REFB=-0.0254178;REVB=0.00286083;RO=142;SAF=39;SAR=76;SRF=37;SRR=105;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0905217;STB=0.551614;TYPE=snp;VARB=0.0354529;OID=.;OPOS=100239319;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:262:265:142:150:115:115:76:39:37:105:76:39:39:111 chr4 100260789 . T C 389.89 PASS AO=79;DP=144;FAO=81;FDP=145;FR=.;FRO=64;FSAF=41;FSAR=40;FSRF=32;FSRR=32;FWDB=-0.00924193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.975;QD=10.7556;RBI=0.00957308;REFB=-0.00430322;REVB=0.00249613;RO=63;SAF=40;SAR=39;SRF=32;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00130629;STB=0.502724;TYPE=snp;VARB=0.00272961;OID=.;OPOS=100260789;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:145:63:64:79:81:39:40:32:31:40:41:32:32 chr4 100263965 . C T 703.38 PASS AO=205;DP=452;FAO=183;FDP=396;FR=.;FRO=213;FSAF=83;FSAR=100;FSRF=120;FSRR=93;FWDB=0.00987124;FXX=0.00999975;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.406;QD=7.10489;RBI=0.0179149;REFB=0.000770214;REVB=-0.01495;RO=241;SAF=95;SAR=110;SRF=135;SRR=106;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0946165;STB=0.55893;TYPE=snp;VARB=-0.00106198;OID=.;OPOS=100263965;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:452:396:241:213:205:183:110:95:135:106:100:83:120:93 chr4 100266112 . C T 529.66 PASS AO=130;DP=271;FAO=130;FDP=270;FR=.;FRO=140;FSAF=63;FSAR=67;FSRF=64;FSRR=76;FWDB=0.0290358;FXX=0.0036899;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.768;QD=7.84675;RBI=0.0398696;REFB=-0.0075404;REVB=-0.0273224;RO=140;SAF=63;SAR=67;SRF=64;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0259344;STB=0.514269;TYPE=snp;VARB=0.00836876;OID=.;OPOS=100266112;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:271:270:140:140:130:130:67:63:64:76:67:63:64:76 chr4 100266330 . A G 625.82 PASS AO=143;DP=279;FAO=143;FDP=279;FR=.;FRO=136;FSAF=94;FSAR=49;FSRF=80;FSRR=56;FWDB=-0.0106932;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=210.348;QD=8.97239;RBI=0.0179287;REFB=0.00159253;REVB=0.0143908;RO=133;SAF=94;SAR=49;SRF=79;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0605987;STB=0.536524;TYPE=snp;VARB=-0.00124585;OID=.;OPOS=100266330;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:279:279:133:136:143:143:49:94:79:54:49:94:80:56 chr4 100266371 . A G 601.88 PASS AO=139;DP=282;FAO=141;FDP=278;FR=.;FRO=137;FSAF=87;FSAR=54;FSRF=84;FSRR=53;FWDB=0.0852304;FXX=0.0176672;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.6782;QD=8.66016;RBI=0.0856935;REFB=-0.0141554;REVB=-0.00889696;RO=133;SAF=87;SAR=52;SRF=82;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00890076;STB=0.502022;TYPE=snp;VARB=0.012199;OID=.;OPOS=100266371;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:282:278:133:137:139:141:52:87:82:51:54:87:84:53 chr4 100268190 . A C 2959.75 PASS AO=299;DP=311;FAO=316;FDP=316;FR=.;FRO=0;FSAF=182;FSAR=134;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.004441;FXX=0.00628911;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.2677;QD=37.4652;RBI=0.0264275;REFB=-0.0302605;REVB=0.0260517;RO=4;SAF=167;SAR=132;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0078668;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000546003;OID=.;OPOS=100268190;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:311:316:4:0:299:316:132:167:1:3:134:182:0:0 chr4 100341861 . C T 853.55 PASS AO=128;DP=295;FAO=129;FDP=288;FR=.,HEALED;FRO=105;FSAF=49;FSAR=80;FSRF=83;FSRR=22;FWDB=0.0021164;FXX=0.0136982;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.0497;QD=11.8548;RBI=0.00324111;REFB=-0.0662464;REVB=-0.00245472;RO=99;SAF=49;SAR=79;SRF=82;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.346593;STB=0.678724;TYPE=snp;VARB=-0.0120035;OID=.;OPOS=100341861;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:292:288:99:105:128:129:79:49:82:17:80:49:83:22 chr4 100349669 . C G 424.5 PASS AO=107;DP=227;FAO=107;FDP=228;FR=.;FRO=121;FSAF=39;FSAR=68;FSRF=64;FSRR=57;FWDB=-0.00195847;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.787;QD=7.44731;RBI=0.00732448;REFB=-0.00407179;REVB=-0.00705779;RO=120;SAF=39;SAR=68;SRF=63;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157784;STB=0.589595;TYPE=snp;VARB=0.00612635;OID=.;OPOS=100349669;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:227:228:120:121:107:107:68:39:63:57:68:39:64:57 chr4 100443720 . G A 219.41 PASS AO=34;DP=165;FAO=66;FDP=164;FR=.;FRO=98;FSAF=30;FSAR=36;FSRF=34;FSRR=64;FWDB=0.00944897;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.2613;QD=5.35157;RBI=0.016383;REFB=-0.0159391;REVB=-0.0133835;RO=89;SAF=29;SAR=5;SRF=33;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.589995;STB=0.565592;TYPE=snp;VARB=0.0236952;OID=.;OPOS=100443720;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:164:89:98:34:66:5:29:33:56:36:30:34:64 chr4 100443782 . T C 1189.3 PASS AO=99;DP=137;FAO=126;FDP=129;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=38;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0861015;FXX=0.015266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.32;QD=36.8776;RBI=0.0879002;REFB=-0.130074;REVB=0.0176914;RO=1;SAF=19;SAR=80;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0243055;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00256465;OID=.;OPOS=100443782;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:130:129:1:0:99:126:80:19:1:0:88:38:0:0 chr4 100443784 . C G 179.25 PASS AO=53;DP=131;FAO=53;FDP=132;FR=.;FRO=79;FSAF=21;FSAR=32;FSRF=20;FSRR=59;FWDB=-0.0322774;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.09;QD=5.43183;RBI=0.0329569;REFB=-0.00904411;REVB=-0.00665794;RO=74;SAF=21;SAR=32;SRF=19;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157727;STB=0.592893;TYPE=snp;VARB=0.0223268;OID=.;OPOS=100443784;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:132:74:79:53:53:32:21:19:55:32:21:20:59 chr4 100443800 . G A 181.77 PASS AO=51;DP=121;FAO=51;FDP=122;FR=.;FRO=71;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=18;FSRR=53;FWDB=0.00261014;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2081;QD=5.95976;RBI=0.0420546;REFB=0.0112622;REVB=0.0419735;RO=70;SAF=18;SAR=33;SRF=17;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130256;STB=0.565765;TYPE=snp;VARB=-0.0144885;OID=.;OPOS=100443800;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:122:70:71:51:51:33:18:17:53:33:18:18:53 chr4 100457117 . A ACAGT 93.53 PASS AO=34;DP=103;FAO=34;FDP=102;FR=.;FRO=68;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=39;FSRR=29;FWDB=0.00152217;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=4;MLLD=180.119;QD=3.66776;RBI=0.00857479;REFB=-9.7408e-06;REVB=-0.0084386;RO=68;SAF=19;SAR=15;SRF=39;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171836;STB=0.509959;TYPE=ins;VARB=0.0100668;OID=.;OPOS=100457118;OREF=-;OALT=CAGT;OMAPALT=ACAGT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:34:103:34:102:68:19:15:39:29:93:68:19:15:39:29 chr4 100485255 . G A 109.78 PASS AO=23;DP=44;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=20;FSAR=3;FSRF=17;FSRR=4;FWDB=0.00531775;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.796;QD=9.97974;RBI=0.0285605;REFB=-0.0126754;REVB=-0.028061;RO=21;SAF=20;SAR=3;SRF=17;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102152;STB=0.557715;TYPE=snp;VARB=0.013905;OID=.;OPOS=100485255;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:44:44:21:21:23:23:3:20:17:4:3:20:17:4 chr4 100504664 . T C 557.87 PASS AO=129;DP=252;FAO=131;FDP=254;FR=.;FRO=123;FSAF=50;FSAR=81;FSRF=60;FSRR=63;FWDB=0.0405955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.0873;QD=8.78537;RBI=0.0434571;REFB=-0.02557;REVB=-0.0155088;RO=121;SAF=49;SAR=80;SRF=60;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105739;STB=0.553064;TYPE=snp;VARB=0.0214592;OID=.;OPOS=100504664;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:252:254:121:123:129:131:80:49:60:61:81:50:60:63 chr4 100510859 . T C 1332.92 PASS AO=142;DP=145;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0659518;FXX=0.0536877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.62;QD=37.8134;RBI=0.0692436;REFB=0;REVB=0.0210958;RO=0;SAF=68;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00440181;OID=.;OPOS=100510859;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:145:141:0:0:142:141:74:68:0:0:76:65:0:0 chr4 100512849 . T C 333.04 PASS AO=77;DP=162;FAO=79;FDP=161;FR=.;FRO=82;FSAF=45;FSAR=34;FSRF=36;FSRR=46;FWDB=0.0102282;FXX=0.0122692;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.4211;QD=8.27437;RBI=0.177227;REFB=-0.0411855;REVB=0.176931;RO=82;SAF=45;SAR=32;SRF=35;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147309;STB=0.566555;TYPE=snp;VARB=0.0474797;OID=.;OPOS=100512849;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:161:82:82:77:79:32:45:35:47:34:45:36:46 chr4 100516022 . C G 1602.2 PASS AO=167;DP=167;FAO=167;FDP=167;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0102369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.041;QD=38.3761;RBI=0.0265261;REFB=0;REVB=0.0244712;RO=0;SAF=79;SAR=88;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.12523e-05;OID=.;OPOS=100516022;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:167:167:0:0:167:167:88:79:0:0:88:79:0:0 chr4 100518283 . T C 336.87 PASS AO=81;DP=175;FAO=83;FDP=174;FR=.;FRO=91;FSAF=29;FSAR=54;FSRF=54;FSRR=37;FWDB=-0.00746061;FXX=0.011363;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.34;QD=7.74418;RBI=0.0143008;REFB=-0.017193;REVB=-0.0122005;RO=93;SAF=29;SAR=52;SRF=57;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246687;STB=0.629374;TYPE=snp;VARB=0.019362;OID=.;OPOS=100518283;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:174:93:91:81:83:52:29:57:36:54:29:54:37 chr4 100532602 . G A 329.93 PASS AO=85;DP=186;FAO=86;FDP=190;FR=.;FRO=104;FSAF=30;FSAR=56;FSRF=47;FSRR=57;FWDB=-0.024497;FXX=0.00523533;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.388;QD=6.94587;RBI=0.0363264;REFB=-0.00027793;REVB=0.0268236;RO=101;SAF=29;SAR=56;SRF=47;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128751;STB=0.55984;TYPE=snp;VARB=-0.000324848;OID=.;OPOS=100532602;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:190:101:104:85:86:56:29:47:54:56:30:47:57 chr4 100544118 . G C 372.02 PASS AO=93;DP=201;FAO=93;FDP=198;FR=.;FRO=105;FSAF=22;FSAR=71;FSRF=29;FSRR=76;FWDB=-0.00740321;FXX=0.0149246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.514;QD=7.51555;RBI=0.00875133;REFB=0.00664938;REVB=0.00466672;RO=105;SAF=22;SAR=71;SRF=29;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0509307;STB=0.528221;TYPE=snp;VARB=-0.00676573;OID=.;OPOS=100544118;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:198:105:105:93:93:71:22:29:76:71:22:29:76 chr4 100570681 . T A 81.74 PASS AO=19;DP=62;FAO=24;FDP=63;FR=.;FRO=39;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=31;FSRR=8;FWDB=0.0247897;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.5044;QD=5.18997;RBI=0.0692796;REFB=0.00620327;REVB=0.0646926;RO=43;SAF=11;SAR=8;SRF=35;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.304775;STB=0.618746;TYPE=snp;VARB=-0.00548652;OID=.;OPOS=100570681;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:62:63:43:39:19:24:8:11:35:8:9:15:31:8 chr4 100571001 . T C 116.7 PASS AO=29;DP=70;FAO=31;FDP=73;FR=.;FRO=42;FSAF=24;FSAR=7;FSRF=30;FSRR=12;FWDB=0.0187635;FXX=0.0266631;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.6003;QD=6.39434;RBI=0.0432007;REFB=-0.0316163;REVB=0.0389131;RO=41;SAF=22;SAR=7;SRF=29;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0688959;STB=0.546731;TYPE=snp;VARB=0.0562686;OID=.;OPOS=100571001;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:73:41:42:29:31:7:22:29:12:7:24:30:12 chr4 100574195 . A G 167.49 PASS AO=36;DP=70;FAO=36;FDP=70;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.00302311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7432;QD=9.57058;RBI=0.0198405;REFB=-0.00723008;REVB=-0.0196089;RO=34;SAF=14;SAR=22;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0474969;STB=0.526388;TYPE=snp;VARB=0.00548188;OID=.;OPOS=100574195;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:34:34:36:36:22:14:15:19:22:14:15:19 chr4 100574816 . T C 21.29 PASS AO=7;DP=36;FAO=10;FDP=39;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.034636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.324;QD=2.18346;RBI=0.0411368;REFB=-0.0120702;REVB=-0.0221942;RO=28;SAF=3;SAR=4;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.043134;STB=0.512795;TYPE=snp;VARB=0.0524427;OID=.;OPOS=100574816;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:36:39:28:29:7:10:4:3:13:15:5:5:14:15 chr4 100574821 . C G 152.43 PASS AO=27;DP=46;FAO=27;FDP=43;FR=.;FRO=16;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.0455559;FXX=0.0652032;HRUN=5;LEN=1;MLLD=98.4232;QD=14.1796;RBI=0.0517018;REFB=-0.0279755;REVB=0.0244486;RO=13;SAF=11;SAR=16;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168869;STB=0.603697;TYPE=snp;VARB=0.0218121;OID=.;OPOS=100574821;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:46:43:13:16:27:27:16:11:9:4:16:11:11:5 chr4 100575711 . C T 213.62 PASS AO=44;DP=85;FAO=45;FDP=84;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=32;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=0.00261435;FXX=0.0232531;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.828;QD=10.1725;RBI=0.0610317;REFB=-0.016313;REVB=-0.0609757;RO=36;SAF=12;SAR=32;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.295516;STB=0.637386;TYPE=snp;VARB=0.0202179;OID=.;OPOS=100575711;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:84:36:39:44:45:32:12:22:14:32:13:22:17 chr4 100784980 . C T 231.38 PASS AO=46;DP=83;FAO=47;FDP=84;FR=.;FRO=37;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.0109421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.469;QD=11.0182;RBI=0.0111321;REFB=-0.0322577;REVB=0.00204815;RO=37;SAF=24;SAR=22;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0285972;STB=0.510634;TYPE=snp;VARB=0.027616;OID=.;OPOS=100784980;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:84:37:37:46:47:22:24:18:19:23:24:18:19 chr4 100805207 . C A 379 PASS AO=100;DP=223;FAO=101;FDP=225;FR=.;FRO=124;FSAF=56;FSAR=45;FSRF=63;FSRR=61;FWDB=0.00430189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.438;QD=6.7377;RBI=0.00870395;REFB=0.00288914;REVB=0.00756653;RO=116;SAF=55;SAR=45;SRF=63;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00675728;STB=0.525723;TYPE=snp;VARB=-0.00342724;OID=.;OPOS=100805207;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:225:116:124:100:101:45:55:63:53:45:56:63:61 chr4 101109161 . G T 632.71 PASS AO=134;DP=244;FAO=134;FDP=244;FR=.;FRO=110;FSAF=37;FSAR=97;FSRF=76;FSRR=34;FWDB=0.00702464;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=259.26;QD=10.3723;RBI=0.0131002;REFB=-0.000196282;REVB=0.0110576;RO=110;SAF=37;SAR=97;SRF=76;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.354368;STB=0.693353;TYPE=snp;VARB=0.000216913;OID=.;OPOS=101109161;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:244:110:110:134:134:97:37:76:34:97:37:76:34 chr4 101368661 . A G 160.19 PASS AO=39;DP=81;FAO=39;FDP=84;FR=.;FRO=45;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=0.0308968;FXX=0.0117633;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.354;QD=7.62804;RBI=0.0382477;REFB=-0.0111162;REVB=0.022545;RO=41;SAF=20;SAR=19;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000575833;STB=0.524698;TYPE=snp;VARB=0.0102059;OID=.;OPOS=101368661;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:84:41:45:39:39:19:20:21:20:19:20:21:24 chr4 101946948 . T C 48.47 PASS AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.0110824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.932;QD=5.7019;RBI=0.0143443;REFB=-0.00594362;REVB=-0.00910716;RO=18;SAF=8;SAR=5;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00448006;STB=0.502389;TYPE=snp;VARB=0.00870214;OID=.;OPOS=101946948;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:32:34:18:21:13:13:5:8:11:7:5:8:13:8 chr4 102751076 . G A 257.51 PASS AO=76;DP=187;FAO=76;FDP=186;FR=.;FRO=110;FSAF=23;FSAR=53;FSRF=55;FSRR=55;FWDB=-0.0243592;FXX=0.00534731;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.8052;QD=5.53778;RBI=0.0328944;REFB=-0.0147118;REVB=0.022106;RO=110;SAF=23;SAR=53;SRF=55;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22124;STB=0.624626;TYPE=snp;VARB=0.0322407;OID=.;OPOS=102751076;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:186:110:110:76:76:53:23:55:55:53:23:55:55 chr4 102751276 . C T 316.56 PASS AO=98;DP=246;FAO=99;FDP=251;FR=.;FRO=152;FSAF=59;FSAR=40;FSRF=84;FSRR=68;FWDB=-0.00841984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.461;QD=5.0448;RBI=0.0116774;REFB=-0.0058539;REVB=-0.00809126;RO=147;SAF=59;SAR=39;SRF=83;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0413262;STB=0.526954;TYPE=snp;VARB=0.00778749;OID=.;OPOS=102751276;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:246:251:147:152:98:99:39:59:83:64:40:59:84:68 chr4 102839287 . G A 393.67 PASS AO=102;DP=219;FAO=101;FDP=219;FR=.;FRO=118;FSAF=54;FSAR=47;FSRF=48;FSRR=70;FWDB=-0.0268518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.8992;QD=7.19039;RBI=0.0376437;REFB=-0.00674647;REVB=0.0263824;RO=116;SAF=55;SAR=47;SRF=46;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136734;STB=0.568561;TYPE=snp;VARB=0.00972741;OID=.;OPOS=102839287;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:219:219:116:118:102:101:47:55:46:70:47:54:48:70 chr4 102965043 . T C 1770.63 PASS AO=185;DP=185;FAO=185;FDP=185;FR=.;FRO=0;FSAF=115;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0134;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.267;QD=38.2838;RBI=0.0134;REFB=0;REVB=3.2777e-05;RO=0;SAF=115;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.25338e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.76343e-05;OID=.;OPOS=102965043;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:185:185:0:0:185:185:70:115:0:0:70:115:0:0 chr4 103188709 . C T 544.67 PASS AO=163;DP=400;FAO=164;FDP=399;FR=.;FRO=235;FSAF=89;FSAR=75;FSRF=107;FSRR=128;FWDB=0.00571782;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.453;QD=5.4603;RBI=0.016158;REFB=-0.00234083;REVB=0.0151125;RO=235;SAF=88;SAR=75;SRF=106;SRR=129;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0938135;STB=0.551372;TYPE=snp;VARB=0.00322005;OID=.;OPOS=103188709;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:400:399:235:235:163:164:75:88:106:129:75:89:107:128 chr4 103514658 . T C 1036.85 PASS AO=106;DP=107;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0256195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.975;QD=38.4018;RBI=0.0273192;REFB=0;REVB=-0.00948555;RO=0;SAF=91;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.74656e-05;OID=.;OPOS=103514658;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:107:108:0:0:106:108:15:91:0:0:15:93:0:0 chr4 103555992 . A G 167.06 PASS AO=49;DP=125;FAO=50;FDP=125;FR=.;FRO=75;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=38;FSRR=37;FWDB=0.0140037;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9432;QD=5.34591;RBI=0.0615805;REFB=0.00913417;REVB=-0.0599671;RO=75;SAF=19;SAR=30;SRF=38;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129276;STB=0.564909;TYPE=snp;VARB=-0.0124974;OID=.;OPOS=103555992;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:75:75:49:50:30:19:38:37:30:20:38:37 chr4 103557077 . G A 358.74 PASS AO=80;DP=154;FAO=80;FDP=154;FR=.;FRO=74;FSAF=44;FSAR=36;FSRF=45;FSRR=29;FWDB=-0.00817133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.055;QD=9.31796;RBI=0.0191915;REFB=-0.0165582;REVB=0.017365;RO=74;SAF=44;SAR=36;SRF=45;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0517194;STB=0.528357;TYPE=snp;VARB=0.015111;OID=.;OPOS=103557077;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:154:74:74:80:80:36:44:45:29:36:44:45:29 chr4 103611845 . C T 223.52 PASS AO=65;DP=158;FAO=65;FDP=158;FR=.;FRO=93;FSAF=28;FSAR=37;FSRF=46;FSRR=47;FWDB=-0.00258231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5934;QD=5.65884;RBI=0.0213304;REFB=-0.0120474;REVB=-0.0211735;RO=93;SAF=28;SAR=37;SRF=46;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0674898;STB=0.537906;TYPE=snp;VARB=0.0207064;OID=.;OPOS=103611845;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:158:93:93:65:65:37:28:46:47:37:28:46:47 chr4 103808862 . T C 114.12 PASS AO=46;DP=143;FAO=46;FDP=145;FR=.;FRO=99;FSAF=13;FSAR=33;FSRF=57;FSRR=42;FWDB=0.0119044;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=168.033;QD=3.14801;RBI=0.0138817;REFB=0.000485144;REVB=0.00714058;RO=97;SAF=13;SAR=33;SRF=56;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.349598;STB=0.703107;TYPE=snp;VARB=-0.00253348;OID=.;OPOS=103808862;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:145:97:99:46:46:33:13:56:41:33:13:57:42 chr4 103866480 . G A 171.54 PASS AO=41;DP=86;FAO=41;FDP=86;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=9;FSRR=36;FWDB=0.0122131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.375;QD=7.97877;RBI=0.0123568;REFB=-0.0245523;REVB=0.00187882;RO=44;SAF=18;SAR=23;SRF=9;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230244;STB=0.630958;TYPE=snp;VARB=0.0299096;OID=.;OPOS=103866480;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:44:45:41:41:23:18:9:35:23:18:9:36 chr4 103911069 . C A 744.75 PASS AO=80;DP=82;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0208925;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.671;QD=36.3293;RBI=0.0222456;REFB=-0.0861438;REVB=-0.00763989;RO=0;SAF=26;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504503;TYPE=snp;VARB=0.000353339;OID=.;OPOS=103911069;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:82:82:0:1:80:81:54:26:0:0:55:26:0:1 chr4 104059542 . G A 441.11 PASS AO=116;DP=259;FAO=117;FDP=259;FR=.;FRO=142;FSAF=61;FSAR=56;FSRF=78;FSRR=64;FWDB=-0.0163774;FXX=0.00384601;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.828;QD=6.81247;RBI=0.0164197;REFB=-0.0178464;REVB=0.00117796;RO=141;SAF=60;SAR=56;SRF=77;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0286555;STB=0.515358;TYPE=snp;VARB=0.021038;OID=.;OPOS=104059542;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:259:259:141:142:116:117:56:60:77:64:56:61:78:64 chr4 104066461 . A G 184.09 PASS AO=54;DP=134;FAO=54;FDP=133;FR=.;FRO=79;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=40;FSRR=39;FWDB=-0.00669498;FXX=0.00746213;HRUN=3;LEN=1;MLLD=150.72;QD=5.53647;RBI=0.00682713;REFB=-0.00468754;REVB=-0.00133678;RO=74;SAF=24;SAR=30;SRF=39;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0851741;STB=0.536899;TYPE=snp;VARB=0.0071096;OID=.;OPOS=104066461;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:133:74:79:54:54:30:24:39:35:30:24:40:39 chr4 104082349 . C T 439.37 PASS AO=89;DP=157;FAO=89;FDP=157;FR=.;FRO=68;FSAF=39;FSAR=50;FSRF=30;FSRR=38;FWDB=-0.0208012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.752;QD=11.1942;RBI=0.028524;REFB=-0.00118449;REVB=-0.0195173;RO=68;SAF=39;SAR=50;SRF=30;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0024009;STB=0.501307;TYPE=snp;VARB=0.000999615;OID=.;OPOS=104082349;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:157:68:68:89:89:50:39:30:38:50:39:30:38 chr4 104102563 . T C 415.57 PASS AO=93;DP=181;FAO=93;FDP=180;FR=.;FRO=87;FSAF=38;FSAR=55;FSRF=43;FSRR=44;FWDB=-0.00980067;FXX=0.00552456;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.6175;QD=9.23496;RBI=0.0194489;REFB=-0.0125071;REVB=0.0167991;RO=85;SAF=38;SAR=55;SRF=43;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0861384;STB=0.54216;TYPE=snp;VARB=0.0093802;OID=.;OPOS=104102563;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:180:85:87:93:93:55:38:43:42:55:38:43:44 chr4 104117191 . A G 148.26 PASS AO=30;DP=78;FAO=40;FDP=87;FR=.;FRO=47;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=0.00265428;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.26;QD=6.81658;RBI=0.035908;REFB=-0.0108176;REVB=0.0358098;RO=46;SAF=20;SAR=10;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184126;STB=0.505744;TYPE=snp;VARB=0.0150632;OID=.;OPOS=104117191;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:87:46:47:30:40:10:20:23:23:20:20:23:24 chr4 105895837 . G A 274.21 PASS AO=65;DP=133;FAO=65;FDP=133;FR=.;FRO=68;FSAF=49;FSAR=16;FSRF=43;FSRR=25;FWDB=0.0122805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.5305;QD=8.24678;RBI=0.0134915;REFB=-0.00517454;REVB=0.00558656;RO=67;SAF=49;SAR=16;SRF=42;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143626;STB=0.577108;TYPE=snp;VARB=0.0066042;OID=.;OPOS=105895837;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:67:68:65:65:16:49:42:25:16:49:43:25 chr4 106159644 . T A 580.87 PASS AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0327786;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=254.964;QD=38.7245;RBI=0.0329727;REFB=0;REVB=-0.0035728;RO=0;SAF=23;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03034e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.95777e-05;OID=.;OPOS=106159644;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:60:60:0:0:60:60:37:23:0:0:37:23:0:0 chr4 106160133 . G A 1021.5 PASS AO=219;DP=401;FAO=218;FDP=397;FR=.;FRO=179;FSAF=104;FSAR=114;FSRF=77;FSRR=102;FWDB=-0.01645;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.011;QD=10.2922;RBI=0.0399986;REFB=-0.00549305;REVB=0.0364594;RO=168;SAF=106;SAR=113;SRF=70;SRR=98;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0541191;STB=0.521229;TYPE=snp;VARB=0.00403504;OID=.;OPOS=106160133;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:401:397:168:179:219:218:113:106:70:98:114:104:77:102 chr4 106160365 . A C 234.11 PASS AO=54;DP=118;FAO=57;FDP=120;FR=.;FRO=63;FSAF=5;FSAR=52;FSRF=13;FSRR=50;FWDB=0.00466482;FXX=0.00826378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.033;QD=7.80354;RBI=0.00944215;REFB=-0.0108916;REVB=-0.00820936;RO=62;SAF=5;SAR=49;SRF=13;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251748;STB=0.647241;TYPE=snp;VARB=0.0116168;OID=.;OPOS=106160365;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:120:62:63:54:57:49:5:13:49:52:5:13:50 chr4 106161358 . GA G 24.97 PASS AO=11;DP=28;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.292017;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=9.27249;QD=3.6997;RBI=0.373483;REFB=0.00761829;REVB=0.232842;RO=12;SAF=5;SAR=6;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0408741;STB=0.601059;TYPE=del;VARB=0.0447875;OID=.;OPOS=106161359;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:11:27:12:27:15:5:7:9:6:24:12:5:6:6:6 chr4 106163110 . TC T,TT 136.58 PASS AO=10,9;DP=48;FAO=31,0;FDP=60;FR=.;FRO=29;FSAF=2,0;FSAR=29,0;FSRF=4;FSRR=25;FWDB=0.00963372,0.00321687;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=197.19,195.24;QD=9.10556;RBI=0.0103253,0.00480552;REFB=-0.00166418,-0.00179522;REVB=0.00371539,0.00356998;RO=28;SAF=0,1;SAR=10,8;SRF=4;SRR=24;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.689536,-0.0856905;STB=0.616931,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.00157419,-0.0165907;OID=.,.;OPOS=106163111,106163111;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:10,9:48:31,0:60:29:2,0:29,0:4:25:99:28:0,1:10,8:4:24 chr4 106196829 . T G 227.91 PASS AO=61;DP=145;FAO=63;FDP=147;FR=.;FRO=84;FSAF=19;FSAR=44;FSRF=29;FSRR=55;FWDB=0.00691511;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8051;QD=6.20159;RBI=0.0168508;REFB=0.00567285;REVB=0.0153665;RO=81;SAF=19;SAR=42;SRF=29;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0539395;STB=0.528916;TYPE=snp;VARB=-0.00820726;OID=.;OPOS=106196829;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:147:81:84:61:63:42:19:29:52:44:19:29:55 chr4 106474078 . G A 262.67 PASS AO=59;DP=112;FAO=58;FDP=112;FR=.;FRO=54;FSAF=16;FSAR=42;FSRF=15;FSRR=39;FWDB=-0.0321386;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2749;QD=9.38093;RBI=0.0479764;REFB=0.00767757;REVB=0.0356208;RO=52;SAF=16;SAR=43;SRF=14;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00211083;STB=0.501154;TYPE=snp;VARB=-0.00913568;OID=.;OPOS=106474078;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:52:54:59:58:43:16:14:38:42:16:15:39 chr4 106474096 . T C 978.26 PASS AO=101;DP=101;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0416755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.281;QD=37.9908;RBI=0.0426471;REFB=0;REVB=-0.00905163;RO=0;SAF=24;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.66415e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.15123e-05;OID=.;OPOS=106474096;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:101:103:0:0:101:103:77:24:0:0:77:26:0:0 chr4 106859549 . G C 92.26 PASS AO=21;DP=41;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0537674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.846;QD=9.00088;RBI=0.0717395;REFB=-0.0076049;REVB=0.0474933;RO=19;SAF=4;SAR=17;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.301507;STB=0.649833;TYPE=snp;VARB=0.00554198;OID=.;OPOS=106859549;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:41:41:19:21:21:20:17:4:9:10:16:4:9:12 chr4 106861730 . A G 1327.97 PASS AO=137;DP=138;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0324613;FXX=0.00719373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.717;QD=38.4918;RBI=0.032661;REFB=0;REVB=-0.00360654;RO=0;SAF=45;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.70626e-05;OID=.;OPOS=106861730;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:138:138:0:0:137:138:92:45:0:0:92:46:0:0 chr4 106924931 . G A 507.11 PASS AO=100;DP=170;FAO=100;FDP=172;FR=.;FRO=72;FSAF=68;FSAR=32;FSRF=36;FSRR=36;FWDB=0.0378367;FXX=0.00578001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.412;QD=11.7932;RBI=0.0388224;REFB=-0.0124541;REVB=-0.00869258;RO=70;SAF=68;SAR=32;SRF=34;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158411;STB=0.581472;TYPE=snp;VARB=0.0139105;OID=.;OPOS=106924931;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:172:70:72:100:100:32:68:34:36:32:68:36:36 chr4 107133919 . A G 294.6 PASS AO=65;DP=124;FAO=65;FDP=123;FR=.;FRO=58;FSAF=34;FSAR=31;FSRF=36;FSRR=22;FWDB=0.0120538;FXX=0.00806387;HRUN=3;LEN=1;MLLD=237.279;QD=9.58036;RBI=0.0210734;REFB=-0.0329005;REVB=0.0172856;RO=57;SAF=34;SAR=31;SRF=36;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0931094;STB=0.54631;TYPE=snp;VARB=0.0263461;OID=.;OPOS=107133919;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:123:57:58:65:65:31:34:36:21:31:34:36:22 chr4 107156462 . C T 647 PASS AO=214;DP=468;FAO=177;FDP=399;FR=.;FRO=222;FSAF=67;FSAR=110;FSRF=113;FSRR=109;FWDB=0.0144406;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.02;QD=6.48621;RBI=0.0182693;REFB=-0.00956771;REVB=-0.0111908;RO=254;SAF=84;SAR=130;SRF=130;SRR=124;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119436;STB=0.574354;TYPE=snp;VARB=0.00995063;OID=.;OPOS=107156462;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:468:399:254:222:214:177:130:84:130:124:110:67:113:109 chr4 107168431 . G C 1142.56 PASS AO=119;DP=120;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029714;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.3108;QD=37.4608;RBI=0.0597978;REFB=-0.0705539;REVB=0.0518927;RO=1;SAF=19;SAR=100;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00472703;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00127218;OID=.;OPOS=107168431;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:120:122:1:0:119:122:100:19:0:1:103:19:0:0 chr4 107171637 . TAAATA T 214.97 PASS AO=114;DP=377;FAO=120;FDP=312;FR=.;FRO=192;FSAF=73;FSAR=47;FSRF=100;FSRR=92;FWDB=-0.0345779;FXX=0.0458702;HRUN=3;LEN=5;MLLD=200.681;QD=2.75604;RBI=0.0346344;REFB=-0.00832825;REVB=-0.00197753;RO=163;SAF=68;SAR=46;SRF=82;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0998806;STB=0.555139;TYPE=del;VARB=0.0141067;OID=.;OPOS=107171638;OREF=AAATA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:114:327:120:312:192:73:47:100:92:99:163:68:46:82:81 chr4 107279450 . C T 438.03 PASS AO=113;DP=245;FAO=113;FDP=245;FR=.;FRO=132;FSAF=52;FSAR=61;FSRF=50;FSRR=82;FWDB=0.00626601;FXX=0.00406488;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.215;QD=7.15153;RBI=0.0118863;REFB=-0.000863968;REVB=-0.0101005;RO=131;SAF=52;SAR=61;SRF=50;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0773629;STB=0.544435;TYPE=snp;VARB=0.000646973;OID=.;OPOS=107279450;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:245:245:131:132:113:113:61:52:50:81:61:52:50:82 chr4 107279482 . T A 508.99 PASS AO=137;DP=308;FAO=137;FDP=306;FR=.;FRO=169;FSAF=59;FSAR=78;FSRF=65;FSRR=104;FWDB=-0.00271953;FXX=0.0064933;HRUN=4;LEN=1;MLLD=195.694;QD=6.65346;RBI=0.0193353;REFB=-0.0178924;REVB=-0.0191431;RO=168;SAF=59;SAR=78;SRF=65;SRR=103;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0447312;STB=0.526111;TYPE=snp;VARB=0.0230171;OID=.;OPOS=107279482;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:308:306:168:169:137:137:78:59:65:103:78:59:65:104 chr4 108641300 . T C 214.12 PASS AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00590326;FXX=0.0416493;HRUN=3;LEN=1;MLLD=93.4452;QD=37.2388;RBI=0.0246158;REFB=0;REVB=0.0238974;RO=0;SAF=9;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84921e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000660488;OID=.;OPOS=108641300;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:0:0:23:23:14:9:0:0:14:9:0:0 chr4 108641317 . G A 199.07 PASS AO=22;DP=23;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0669638;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.3723;QD=31.8508;RBI=0.0814725;REFB=-0.0765305;REVB=-0.0464071;RO=1;SAF=9;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0342405;STB=0.517227;TYPE=snp;VARB=0.0244834;OID=.;OPOS=108641317;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:23:25:1:1:22:24:13:9:0:1:14:10:0:1 chr4 108788981 . G A 205.47 PASS AO=68;DP=183;FAO=68;FDP=183;FR=.;FRO=115;FSAF=30;FSAR=38;FSRF=64;FSRR=51;FWDB=-0.0334618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.411;QD=4.49112;RBI=0.0364191;REFB=0.00220113;REVB=0.0143755;RO=113;SAF=30;SAR=38;SRF=63;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127861;STB=0.572231;TYPE=snp;VARB=-0.00413085;OID=.;OPOS=108788981;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:183:113:115:68:68:38:30:63:50:38:30:64:51 chr4 108931039 . T C 1915.87 PASS AO=203;DP=206;FAO=204;FDP=204;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=124;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00517887;FXX=0.0144921;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.3246;QD=37.5661;RBI=0.0304367;REFB=-0.0159767;REVB=-0.0299929;RO=2;SAF=79;SAR=124;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011904;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000345888;OID=.;OPOS=108931039;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:206:204:2:0:203:204:124:79:2:0:124:80:0:0 chr4 109087412 . C CAA 41.63 PASS AO=22;DP=80;FAO=26;FDP=77;FR=.;FRO=51;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=29;FSRR=22;FWDB=0.136935;FXX=0.0253133;HRUN=4;LEN=2;MLLD=32.3489;QD=2.16246;RBI=0.16378;REFB=0.0161579;REVB=0.0898485;RO=50;SAF=15;SAR=7;SRF=29;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129094;STB=0.5322;TYPE=ins;VARB=-0.0230633;OID=.;OPOS=109087413;OREF=-;OALT=AA;OMAPALT=CAA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:22:80:26:77:51:16:10:29:22:41:50:15:7:29:21 chr4 109735133 . T C 233.44 PASS AO=49;DP=92;FAO=51;FDP=99;FR=.;FRO=48;FSAF=13;FSAR=38;FSRF=7;FSRR=41;FWDB=-0.0297619;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.1851;QD=9.43173;RBI=0.0308452;REFB=-0.0249807;REVB=0.00810278;RO=43;SAF=13;SAR=36;SRF=7;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119187;STB=0.574679;TYPE=snp;VARB=0.0293849;OID=.;OPOS=109735133;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:99:43:48:49:51:36:13:7:36:38:13:7:41 chr4 109745336 . T G 52.1 PASS AO=19;DP=62;FAO=19;FDP=61;FR=.;FRO=42;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=30;FSRR=12;FWDB=-0.0286754;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.998;QD=3.41618;RBI=0.030734;REFB=0.00905858;REVB=-0.011059;RO=38;SAF=10;SAR=9;SRF=26;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1827;STB=0.631452;TYPE=snp;VARB=-0.0120184;OID=.;OPOS=109745336;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:62:61:38:42:19:19:9:10:26:12:9:10:30:12 chr4 109769899 . C T 1959.47 PASS AO=206;DP=207;FAO=206;FDP=206;FR=.;FRO=0;FSAF=113;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0245644;FXX=0.00483068;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.4692;QD=38.048;RBI=0.0491367;REFB=-0.0149728;REVB=0.042556;RO=1;SAF=113;SAR=93;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00509455;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000195384;OID=.;OPOS=109769899;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:207:206:1:0:206:206:93:113:0:1:93:113:0:0 chr4 109790319 . G A 469.35 PASS AO=110;DP=266;FAO=119;FDP=257;FR=.,HEALED;FRO=136;FSAF=44;FSAR=75;FSRF=17;FSRR=119;FWDB=-0.000251741;FXX=0.00772171;HRUN=3;LEN=1;MLLD=187.715;QD=7.30508;RBI=0.030761;REFB=-0.0154238;REVB=-0.03076;RO=85;SAF=41;SAR=69;SRF=15;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177535;STB=0.651035;TYPE=snp;VARB=0.0115287;OID=.;OPOS=109790319;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:251:257:85:136:110:119:69:41:15:70:75:44:17:119 chr4 109841743 . C T 290.75 PASS AO=59;DP=105;FAO=59;FDP=105;FR=.;FRO=46;FSAF=35;FSAR=24;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=0.0093659;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=296.997;QD=11.0763;RBI=0.0131618;REFB=0.011146;REVB=0.00924737;RO=46;SAF=35;SAR=24;SRF=24;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0585267;STB=0.532045;TYPE=snp;VARB=-0.00914151;OID=.;OPOS=109841743;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:46:46:59:59:24:35:24:22:24:35:24:22 chr4 109863370 . C T 154.75 PASS AO=42;DP=102;FAO=42;FDP=99;FR=.;FRO=57;FSAF=27;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=28;FWDB=0.0312277;FXX=0.0294089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.444;QD=6.25251;RBI=0.047812;REFB=-0.00875562;REVB=-0.0362052;RO=55;SAF=27;SAR=15;SRF=28;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139969;STB=0.580171;TYPE=snp;VARB=0.0123509;OID=.;OPOS=109863370;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:99:55:57:42:42:15:27:28:27:15:27:29:28 chr4 109969337 . G T 187.63 PASS AO=51;DP=119;FAO=51;FDP=119;FR=.;FRO=68;FSAF=37;FSAR=14;FSRF=49;FSRR=19;FWDB=0.0225093;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=149.148;QD=6.30677;RBI=0.0254462;REFB=-0.00201567;REVB=0.0118674;RO=67;SAF=37;SAR=14;SRF=48;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114616;STB=0.503504;TYPE=snp;VARB=0.00229333;OID=.;OPOS=109969337;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:67:68:51:51:14:37:48:19:14:37:49:19 chr4 110581363 . T A 191.96 PASS AO=49;DP=108;FAO=49;FDP=109;FR=.;FRO=60;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=26;FSRR=34;FWDB=0.0136416;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.8073;QD=7.04452;RBI=0.025668;REFB=-0.0234565;REVB=0.0217429;RO=59;SAF=21;SAR=28;SRF=26;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0120657;STB=0.502673;TYPE=snp;VARB=0.0294058;OID=.;OPOS=110581363;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:109:59:60:49:49:28:21:26:33:28:21:26:34 chr4 110603784 . T C 56.12 PASS AO=16;DP=43;FAO=16;FDP=43;FR=.;FRO=27;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=24;FWDB=-0.0509441;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.5606;QD=5.22017;RBI=0.057143;REFB=-0.0288188;REVB=-0.0258848;RO=27;SAF=5;SAR=11;SRF=3;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.291182;STB=0.665235;TYPE=snp;VARB=0.0257934;OID=.;OPOS=110603784;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:43:43:27:27:16:16:11:5:3:24:11:5:3:24 chr4 110605744 . A T 736.93 PASS AO=152;DP=271;FAO=153;FDP=273;FR=.;FRO=120;FSAF=58;FSAR=95;FSRF=63;FSRR=57;FWDB=0.0257247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.564;QD=10.7975;RBI=0.0304879;REFB=-0.0138259;REVB=-0.0163632;RO=118;SAF=57;SAR=95;SRF=63;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131362;STB=0.565941;TYPE=snp;VARB=0.0102938;OID=.;OPOS=110605744;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:271:273:118:120:152:153:95:57:63:55:95:58:63:57 chr4 110638810 . C T 482.36 PASS AO=129;DP=296;FAO=132;FDP=300;FR=.;FRO=168;FSAF=67;FSAR=65;FSRF=77;FSRR=91;FWDB=0.00188584;FXX=0.00332215;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.716;QD=6.43146;RBI=0.016837;REFB=-0.024498;REVB=0.0167311;RO=167;SAF=69;SAR=60;SRF=76;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0809666;STB=0.527555;TYPE=snp;VARB=0.0341941;OID=.;OPOS=110638810;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:296:300:167:168:129:132:60:69:76:91:65:67:77:91 chr4 110661937 . G A 935.82 PASS AO=96;DP=96;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.705;QD=38.1967;RBI=0.0381166;REFB=0;REVB=0.024982;RO=0;SAF=63;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.19306e-05;OID=.;OPOS=110661937;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:96:98:0:0:96:98:33:63:0:0:33:65:0:0 chr4 110678925 . T C 657.85 PASS AO=68;DP=68;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0541598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.6365;QD=38.1361;RBI=0.0549378;REFB=0;REVB=-0.00921338;RO=0;SAF=4;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00188578;OID=.;OPOS=110678925;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:68:69:0:0:68:69:64:4:0:0:64:5:0:0 chr4 110737389 . T C 267.05 PASS AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0683158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.117;QD=38.1502;RBI=0.0683333;REFB=0;REVB=0.00154665;RO=0;SAF=13;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000456549;OID=.;OPOS=110737389;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:28:28:0:0:28:28:15:13:0:0:15:13:0:0 chr4 110773067 . G A 362.06 PASS AO=41;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0134611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.834;QD=35.3226;RBI=0.0486805;REFB=-0.010315;REVB=0.0467824;RO=0;SAF=19;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511622;TYPE=snp;VARB=0.000742381;OID=.;OPOS=110773067;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:41:41:0:1:41:40:22:19:0:0:21:19:0:1 chr4 110790911 . A T 2050.6 PASS AO=222;DP=225;FAO=219;FDP=219;FR=.;FRO=0;FSAF=127;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00361555;FXX=0.0352407;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.809;QD=37.4539;RBI=0.00890011;REFB=-0.0914805;REVB=-0.00813263;RO=1;SAF=131;SAR=91;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00362356;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000457371;OID=.;OPOS=110790911;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:225:219:1:0:222:219:91:131:1:0:92:127:0:0 chr4 110914427 . A T 442.05 PASS AO=109;DP=233;FAO=110;FDP=231;FR=.;FRO=121;FSAF=73;FSAR=37;FSRF=88;FSRR=33;FWDB=-0.00551018;FXX=0.01282;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8853;QD=7.65462;RBI=0.0269627;REFB=-0.0146896;REVB=-0.0263936;RO=120;SAF=72;SAR=37;SRF=87;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0701651;STB=0.53826;TYPE=snp;VARB=0.0179335;OID=.;OPOS=110914427;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:233:231:120:121:109:110:37:72:87:33:37:73:88:33 chr4 111398208 . A G 942.46 PASS AO=98;DP=99;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112385;FXX=0.00980296;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.518;QD=37.3253;RBI=0.0178916;REFB=0.0405402;REVB=0.0139214;RO=1;SAF=35;SAR=63;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00747007;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.10278e-05;OID=.;OPOS=111398208;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:99:101:1:0:98:101:63:35:0:1:65:36:0:0 chr4 111409705 . T C 385.95 PASS AO=96;DP=206;FAO=97;FDP=206;FR=.;FRO=109;FSAF=59;FSAR=38;FSRF=63;FSRR=46;FWDB=0.0229257;FXX=0.00961492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.242;QD=7.49413;RBI=0.0411938;REFB=-0.0264357;REVB=0.0342249;RO=105;SAF=59;SAR=37;SRF=61;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0332945;STB=0.516677;TYPE=snp;VARB=0.0330292;OID=.;OPOS=111409705;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:206:206:105:109:96:97:37:59:61:44:38:59:63:46 chr4 111483133 . C A 265.75 PASS AO=80;DP=185;FAO=77;FDP=185;FR=.;FRO=108;FSAF=23;FSAR=54;FSRF=33;FSRR=75;FWDB=-0.0231511;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.8562;QD=5.74603;RBI=0.0275454;REFB=0.00132281;REVB=0.0149256;RO=102;SAF=26;SAR=54;SRF=30;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0359748;STB=0.504756;TYPE=snp;VARB=-0.00205686;OID=.;OPOS=111483133;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:185:102:108:80:77:54:26:30:72:54:23:33:75 chr4 112252643 . G T 426.19 PASS AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.067489;FXX=0.0217344;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5898;QD=37.8832;RBI=0.0690787;REFB=0;REVB=0.0147342;RO=0;SAF=26;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.15971e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000805645;OID=.;OPOS=112252643;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:46:45:0:0:45:45:19:26:0:0:19:26:0:0 chr4 113178894 . ATTTGT A 60.63 PASS AO=45;DP=168;FAO=50;FDP=164;FR=.;FRO=114;FSAF=31;FSAR=19;FSRF=62;FSRR=52;FWDB=-0.0151801;FXX=0.017963;HRUN=3;LEN=5;MLLD=247.076;QD=1.47881;RBI=0.0330087;REFB=-0.00684303;REVB=0.0293111;RO=101;SAF=28;SAR=17;SRF=57;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0714219;STB=0.554665;TYPE=del;VARB=0.0167997;OID=.;OPOS=113178895;OREF=TTTGT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:45:163:50:164:114:31:19:62:52:60:101:28:17:57:44 chr4 113198805 . G C 187.11 PASS AO=62;DP=168;FAO=62;FDP=167;FR=.;FRO=105;FSAF=22;FSAR=40;FSRF=52;FSRR=53;FWDB=0.000628796;FXX=0.00595203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.3786;QD=4.48166;RBI=0.0149943;REFB=-0.0231924;REVB=-0.0149811;RO=103;SAF=22;SAR=40;SRF=52;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169831;STB=0.59126;TYPE=snp;VARB=0.0227014;OID=.;OPOS=113198805;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:167:103:105:62:62:40:22:52:51:40:22:52:53 chr4 113199075 . A G 205.12 PASS AO=71;DP=197;FAO=71;FDP=196;FR=.;FRO=125;FSAF=33;FSAR=38;FSRF=64;FSRR=61;FWDB=-0.0231636;FXX=0.00507588;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.6256;QD=4.18607;RBI=0.0241836;REFB=-0.00676324;REVB=-0.00694952;RO=121;SAF=33;SAR=38;SRF=62;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0529291;STB=0.530122;TYPE=snp;VARB=0.0134448;OID=.;OPOS=113199075;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:196:121:125:71:71:38:33:62:59:38:33:64:61 chr4 113344925 . C T 340.16 PASS AO=74;DP=147;FAO=78;FDP=151;FR=.;FRO=73;FSAF=36;FSAR=42;FSRF=29;FSRR=44;FWDB=0.0109388;FXX=0.00657851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.485;QD=9.01081;RBI=0.0110219;REFB=-0.00740718;REVB=0.00135124;RO=64;SAF=33;SAR=41;SRF=25;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0476826;STB=0.531403;TYPE=snp;VARB=0.00656617;OID=.;OPOS=113344925;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:151:64:73:74:78:41:33:25:39:42:36:29:44 chr4 113351822 . G A 256.4 PASS AO=63;DP=134;FAO=63;FDP=133;FR=.;FRO=70;FSAF=43;FSAR=20;FSRF=30;FSRR=40;FWDB=0.0151322;FXX=0.00746213;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.7867;QD=7.71115;RBI=0.0203478;REFB=0.00343458;REVB=-0.0136033;RO=70;SAF=43;SAR=20;SRF=30;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249339;STB=0.638569;TYPE=snp;VARB=-0.00430291;OID=.;OPOS=113351822;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:133:70:70:63:63:20:43:30:40:20:43:30:40 chr4 113352397 . G A 855.99 PASS AO=93;DP=95;FAO=93;FDP=95;FR=.;FRO=2;FSAF=41;FSAR=52;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0275611;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.65;QD=36.0419;RBI=0.0297352;REFB=-0.102451;REVB=0.0111609;RO=1;SAF=41;SAR=52;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011423;STB=0.511902;TYPE=snp;VARB=0.000418562;OID=.;OPOS=113352397;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:95:95:1:2:93:93:52:41:1:0:52:41:2:0 chr4 113352628 . A G 575.17 PASS AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0411066;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.166;QD=37.7161;RBI=0.0419343;REFB=0;REVB=0.00829086;RO=0;SAF=35;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00019594;OID=.;OPOS=113352628;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:62:61:0:0:61:61:26:35:0:0:26:35:0:0 chr4 113352899 . G A 1351.16 PASS AO=131;DP=179;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0286709;FXX=0.109189;HRUN=3;LEN=1;MLLD=130.331;QD=34.8686;RBI=0.0288057;REFB=0;REVB=0.00278346;RO=0;SAF=49;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2364e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00557515;OID=.;OPOS=113352899;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:131:155:0:0:131:155:82:49:0:0:92:63:0:0 chr4 113353285 . T C 353.99 PASS AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189891;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.299;QD=38.2689;RBI=0.051348;REFB=0;REVB=-0.0477078;RO=0;SAF=16;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.7558e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000315274;OID=.;OPOS=113353285;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:38:37:0:0:37:37:21:16:0:0:21:16:0:0 chr4 113359703 . A G 1816.53 PASS AO=182;DP=184;FAO=190;FDP=190;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0289271;FXX=0.00523533;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.28;QD=38.2426;RBI=0.0707242;REFB=0;REVB=0.0645378;RO=0;SAF=86;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000114227;OID=.;OPOS=113359703;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:184:190:0:0:182:190:96:86:0:0:103:87:0:0 chr4 113362316 . A G 322.68 PASS AO=77;DP=158;FAO=77;FDP=158;FR=.;FRO=81;FSAF=34;FSAR=43;FSRF=45;FSRR=36;FWDB=-0.0228973;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=173.065;QD=8.16901;RBI=0.0234299;REFB=-0.0155782;REVB=-0.00496722;RO=81;SAF=34;SAR=43;SRF=45;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105884;STB=0.558426;TYPE=snp;VARB=0.0152751;OID=.;OPOS=113362316;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:158:81:81:77:77:43:34:45:36:43:34:45:36 chr4 113362622 . C G 1071.55 PASS AO=116;DP=120;FAO=116;FDP=119;FR=.;FRO=3;FSAF=63;FSAR=53;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0258828;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.1506;QD=36.0185;RBI=0.028293;REFB=-0.0626673;REVB=-0.011427;RO=0;SAF=63;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.14374e-08;STB=0.50314;TYPE=snp;VARB=-0.00060379;OID=.;OPOS=113362622;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:120:119:0:3:116:116:53:63:0:0:53:63:2:1 chr4 113539969 . T C 255.87 PASS AO=66;DP=145;FAO=66;FDP=145;FR=.;FRO=79;FSAF=30;FSAR=36;FSRF=44;FSRR=35;FWDB=0.01244;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.089;QD=7.05859;RBI=0.0194967;REFB=-0.0160326;REVB=0.0150122;RO=79;SAF=30;SAR=36;SRF=44;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100173;STB=0.555678;TYPE=snp;VARB=0.0206449;OID=.;OPOS=113539969;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:79:79:66:66:36:30:44:35:36:30:44:35 chr4 113549989 . G A 153.49 PASS AO=31;DP=68;FAO=35;FDP=70;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.00499045;FXX=0.0277739;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.407;QD=8.77097;RBI=0.0177668;REFB=-0.0222976;REVB=0.0170515;RO=37;SAF=14;SAR=17;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0599994;STB=0.572213;TYPE=snp;VARB=0.0248542;OID=.;OPOS=113549989;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:70:37:35:31:35:17:14:19:18:21:14:19:16 chr4 114081490 . A G 235.38 PASS AO=44;DP=73;FAO=44;FDP=73;FR=.;FRO=29;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.0207264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.07;QD=12.8975;RBI=0.0242922;REFB=-0.0230724;REVB=0.0126701;RO=29;SAF=22;SAR=22;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0375792;STB=0.520539;TYPE=snp;VARB=0.015485;OID=.;OPOS=114081490;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:29:29:44:44:22:22:13:16:22:22:13:16 chr4 114275356 . CA C 34.67 PASS AO=6;DP=39;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=-0.214794;FXX=0.0731529;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.3643;QD=3.64934;RBI=0.219322;REFB=-0.0416306;REVB=0.0443338;RO=19;SAF=4;SAR=2;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0.301587;SSSB=0.442448;STB=0.715677;TYPE=del;VARB=0.0220238;OID=.;OPOS=114275357;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:6:37:19:38:19:14:5:6:13:34:19:4:2:5:14 chr4 114309839 . C T 2446.21 PASS AO=255;DP=261;FAO=255;FDP=255;FR=.;FRO=0;FSAF=165;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00220301;FXX=0.0229876;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.406;QD=38.372;RBI=0.0116684;REFB=0;REVB=0.0114585;RO=0;SAF=165;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.61649e-05;OID=.;OPOS=114309839;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:261:255:0:0:255:255:90:165:0:0:90:165:0:0 chr4 114822485 . G A 1172.42 PASS AO=123;DP=124;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00793535;FXX=0.00806387;HRUN=2;LEN=1;MLLD=268.543;QD=38.1275;RBI=0.00893203;REFB=0;REVB=0.00410016;RO=0;SAF=69;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.94221e-06;OID=.;OPOS=114822485;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:124:123:0:0:123:123:54:69:0:0:54:69:0:0 chr4 115544714 . A G 1800.12 PASS AO=190;DP=193;FAO=190;FDP=190;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0109728;FXX=0.0206175;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.924;QD=37.8972;RBI=0.0124235;REFB=-0.0413179;REVB=0.00582587;RO=1;SAF=106;SAR=84;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00563524;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000243107;OID=.;OPOS=115544714;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:193:190:1:0:190:190:84:106:0:1:87:103:0:0 chr4 115577997 . C G 486.94 PASS AO=132;DP=306;FAO=132;FDP=297;FR=.;FRO=165;FSAF=87;FSAR=45;FSRF=111;FSRR=54;FWDB=0.0169662;FXX=0.0294108;HRUN=4;LEN=1;MLLD=200.297;QD=6.55814;RBI=0.0197519;REFB=-0.0142401;REVB=-0.0101137;RO=164;SAF=87;SAR=45;SRF=111;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0198884;STB=0.508473;TYPE=snp;VARB=0.016281;OID=.;OPOS=115577997;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:306:297:164:165:132:132:45:87:111:53:45:87:111:54 chr4 115589302 . A G 1933.06 PASS AO=200;DP=201;FAO=202;FDP=202;FR=.;FRO=0;FSAF=107;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0423196;FXX=0.00492587;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.6552;QD=38.2785;RBI=0.0436682;REFB=0;REVB=-0.0107684;RO=0;SAF=107;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.25367e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.05339e-05;OID=.;OPOS=115589302;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:91:201:202:0:0:200:202:93:107:0:0:95:107:0:0 chr4 119161795 . G A 295.4 PASS AO=71;DP=135;FAO=71;FDP=148;FR=.;FRO=77;FSAF=16;FSAR=55;FSRF=8;FSRR=69;FWDB=-0.00835781;FXX=0.0263141;HRUN=4;LEN=1;MLLD=255.086;QD=7.98365;RBI=0.0371208;REFB=-0.0143942;REVB=-0.0361677;RO=64;SAF=16;SAR=55;SRF=8;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135297;STB=0.60046;TYPE=snp;VARB=0.0208221;OID=.;OPOS=119161795;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:148:64:77:71:71:55:16:8:56:55:16:8:69 chr4 119237348 . T C 301.85 PASS AO=86;DP=205;FAO=86;FDP=204;FR=.;FRO=118;FSAF=41;FSAR=45;FSRF=55;FSRR=63;FWDB=-0.0166054;FXX=0.00487781;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.739;QD=5.9186;RBI=0.0172254;REFB=0.00235554;REVB=-0.00457995;RO=117;SAF=41;SAR=45;SRF=55;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00689039;STB=0.506171;TYPE=snp;VARB=-0.00381956;OID=.;OPOS=119237348;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:204:117:118:86:86:45:41:55:62:45:41:55:63 chr4 119273712 . C G 86.75 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0414157;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.481;QD=38.5536;RBI=0.0414157;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=9;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0011852;OID=.;OPOS=119273712;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:0:9:0:0:0:9:0:0 chr4 119273847 . AG A 224.81 PASS AO=29;DP=43;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.063186;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.5796;QD=22.4809;RBI=0.368108;REFB=0.014803;REVB=0.362645;RO=7;SAF=20;SAR=9;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0.631579;SSSB=0.157856;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0271855;OID=.;OPOS=119273848;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:29:40:40:40:0:24:16:0:0:18:7:20:9:2:5 chr4 119736796 . A C 1658.55 PASS AO=177;DP=187;FAO=179;FDP=179;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0121495;FXX=0.0427785;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.2255;QD=37.0626;RBI=0.0226194;REFB=-0.118834;REVB=0.0190795;RO=4;SAF=91;SAR=86;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111115;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00291007;OID=.;OPOS=119736796;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:187:179:4:0:177:179:86:91:1:3:88:91:0:0 chr4 119944611 . G T 226.93 PASS AO=63;DP=144;FAO=62;FDP=143;FR=.;FRO=81;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=26;FSRR=55;FWDB=0.0297289;FXX=0.00694396;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.2871;QD=6.34774;RBI=0.0807773;REFB=0.0187157;REVB=-0.0751077;RO=81;SAF=26;SAR=37;SRF=26;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0973957;STB=0.558264;TYPE=snp;VARB=-0.0250114;OID=.;OPOS=119944611;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:143:81:81:63:62:37:26:26:55:36:26:26:55 chr4 119947961 . AAAG A 84.69 PASS AO=26;DP=89;FAO=35;FDP=80;FR=.;FRO=45;FSAF=26;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=-0.0027984;FXX=0.0697593;HRUN=3;LEN=3;MLLD=149.024;QD=4.23435;RBI=0.0565569;REFB=-0.0102973;REVB=-0.0564877;RO=27;SAF=19;SAR=7;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181629;STB=0.6919;TYPE=del;VARB=0.0136973;OID=.;OPOS=119947962;OREF=AAG;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:26:67:35:80:45:26:9:19:26:84:27:19:7:15:12 chr4 119951647 . A G 747.23 PASS AO=72;DP=73;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0555774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.188;QD=38.3196;RBI=0.167476;REFB=0;REVB=0.157985;RO=0;SAF=67;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.74392e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00189785;OID=.;OPOS=119951647;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:73:78:0:0:72:78:5:67:0:0:7:71:0:0 chr4 119952955 . C T 345.56 PASS AO=48;DP=116;FAO=67;FDP=114;FR=.;FRO=47;FSAF=22;FSAR=45;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=0.0404826;FXX=0.0086949;HRUN=4;LEN=1;MLLD=111.337;QD=12.125;RBI=0.0405324;REFB=-0.00490233;REVB=0.00200777;RO=34;SAF=5;SAR=43;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.397019;STB=0.580458;TYPE=snp;VARB=0.002608;OID=.;OPOS=119952955;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:114:34:47:48:67:43:5:14:20:45:22:24:23 chr4 120158685 . T G 133.43 PASS AO=29;DP=59;FAO=30;FDP=60;FR=.;FRO=30;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.0153755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.073;QD=8.89526;RBI=0.0178218;REFB=-0.0186031;REVB=0.00901165;RO=29;SAF=15;SAR=14;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0619243;STB=0.533311;TYPE=snp;VARB=0.0152942;OID=.;OPOS=120158685;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:60:29:30:29:30:14:15:17:12:15:15:17:13 chr4 120214030 . T G 437.73 PASS AO=101;DP=204;FAO=103;FDP=207;FR=.;FRO=104;FSAF=30;FSAR=73;FSRF=26;FSRR=78;FWDB=0.0248514;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.3831;QD=8.45853;RBI=0.0476497;REFB=-0.0206092;REVB=-0.0406559;RO=103;SAF=29;SAR=72;SRF=25;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0511095;STB=0.525639;TYPE=snp;VARB=0.0198225;OID=.;OPOS=120214030;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:207:103:104:101:103:72:29:25:78:73:30:26:78 chr4 120215314 . A G 347.55 PASS AO=99;DP=236;FAO=101;FDP=240;FR=.;FRO=139;FSAF=49;FSAR=52;FSRF=46;FSRR=93;FWDB=-0.00551943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.014;QD=5.79242;RBI=0.00552099;REFB=-0.00220409;REVB=0.000130907;RO=132;SAF=49;SAR=50;SRF=45;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158815;STB=0.589854;TYPE=snp;VARB=0.00203072;OID=.;OPOS=120215314;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:236:240:132:139:99:101:50:49:45:87:52:49:46:93 chr4 120216418 . T TTA 119.19 PASS AO=30;DP=140;FAO=42;FDP=112;FR=.;FRO=70;FSAF=6;FSAR=36;FSRF=19;FSRR=51;FWDB=-0.0293986;FXX=0.111102;HRUN=5;LEN=2;MLLD=247.104;QD=4.25688;RBI=0.0294044;REFB=-0.00111081;REVB=-0.00058072;RO=93;SAF=1;SAR=29;SRF=31;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.632993;STB=0.632839;TYPE=ins;VARB=0.00225856;OID=.;OPOS=120216419;OREF=-;OALT=TA;OMAPALT=TTA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:30:140:42:112:70:6:36:19:51:99:93:1:29:31:62 chr4 120239831 . A G 210.23 PASS AO=49;DP=100;FAO=49;FDP=100;FR=.;FRO=51;FSAF=15;FSAR=34;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=0.0370138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.177;QD=8.409;RBI=0.0380847;REFB=-0.0128257;REVB=0.00896796;RO=51;SAF=15;SAR=34;SRF=24;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16467;STB=0.591661;TYPE=snp;VARB=0.0165043;OID=.;OPOS=120239831;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:51:51:49:49:34:15:24:27:34:15:24:27 chr4 120239878 . G A 278.75 PASS AO=63;DP=127;FAO=64;FDP=128;FR=.;FRO=64;FSAF=22;FSAR=42;FSRF=30;FSRR=34;FWDB=0.00252684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.6621;QD=8.71107;RBI=0.0128654;REFB=-0.00556165;REVB=-0.0126148;RO=62;SAF=21;SAR=42;SRF=29;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129158;STB=0.566369;TYPE=snp;VARB=0.00651352;OID=.;OPOS=120239878;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:128:62:64:63:64:42:21:29:33:42:22:30:34 chr4 120240238 . T C 132.59 PASS AO=36;DP=85;FAO=36;FDP=85;FR=.;FRO=49;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=16;FSRR=33;FWDB=0.00926567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.4495;QD=6.23947;RBI=0.0213234;REFB=-0.00978965;REVB=-0.019205;RO=49;SAF=14;SAR=22;SRF=16;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.068263;STB=0.538441;TYPE=snp;VARB=0.0160246;OID=.;OPOS=120240238;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:49:49:36:36:22:14:16:33:22:14:16:33 chr4 120241849 . A G 129.01 PASS AO=41;DP=124;FAO=45;FDP=128;FR=.;FRO=83;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=35;FSRR=48;FWDB=0.00187865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.49;QD=4.03165;RBI=0.00259209;REFB=-0.0109975;REVB=-0.00178594;RO=81;SAF=18;SAR=23;SRF=35;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00809208;STB=0.500356;TYPE=snp;VARB=0.0136661;OID=.;OPOS=120241849;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:128:81:83:41:45:23:18:35:46:26:19:35:48 chr4 120241902 . T C 183.43 PASS AO=61;DP=166;FAO=61;FDP=164;FR=.;FRO=103;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=30;FSRR=73;FWDB=-0.00175361;FXX=0.0120475;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.716;QD=4.47381;RBI=0.00514555;REFB=-0.00693397;REVB=0.00483752;RO=100;SAF=31;SAR=30;SRF=30;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228974;STB=0.635635;TYPE=snp;VARB=0.0148153;OID=.;OPOS=120241902;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:164:100:103:61:61:30:31:30:70:30:31:30:73 chr4 120325529 . G A 41.47 PASS AO=6;DP=9;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0169136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.048;QD=18.4312;RBI=0.0169136;REFB=-0.0220043;REVB=0;RO=3;SAF=6;SAR=0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0185896;OID=.;OPOS=120325529;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:9:9:3:3:6:6:0:6:3:0:0:6:3:0 chr4 120325630 . G A 41.19 PASS AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.0279374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.686;QD=10.2979;RBI=0.0279747;REFB=-0.00430879;REVB=0.0014442;RO=7;SAF=4;SAR=4;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.287934;STB=0.624707;TYPE=snp;VARB=0.0044886;OID=.;OPOS=120325630;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:16:16:7:8:8:8:4:4:1:6:4:4:2:6 chr4 120325732 . C A 110.25 PASS AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.0244676;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=259.761;QD=9.18711;RBI=0.0244729;REFB=-0.0248659;REVB=-0.000510904;RO=24;SAF=15;SAR=9;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0390642;STB=0.52196;TYPE=snp;VARB=0.0240284;OID=.;OPOS=120325732;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:24:24:24:24:9:15:14:10:9:15:14:10 chr4 120330155 . C T 36.61 PASS AO=12;DP=38;FAO=12;FDP=38;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=-0.0118905;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6133;QD=3.85335;RBI=0.12126;REFB=-0.000536102;REVB=-0.120676;RO=26;SAF=8;SAR=4;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0161919;STB=0.509787;TYPE=snp;VARB=-0.00635162;OID=.;OPOS=120330155;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:38:38:26:26:12:12:4:8:17:9:4:8:17:9 chr4 120330272 . C G 24.13 PASS AO=8;DP=34;FAO=10;FDP=37;FR=.;FRO=27;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.0582629;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=33.6743;QD=2.60835;RBI=0.104985;REFB=-0.0403616;REVB=-0.0873348;RO=26;SAF=1;SAR=7;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.468487;STB=0.828999;TYPE=snp;VARB=0.079128;OID=.;OPOS=120330272;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:34:37:26:27:8:10:7:1:12:14:9:1:12:15 chr4 120330379 . T C 16.26 PASS AO=4;DP=14;FAO=4;FDP=14;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=1;FWDB=-0.0545497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.711;QD=4.64556;RBI=0.0596135;REFB=-0.00384606;REVB=0.0240436;RO=10;SAF=1;SAR=3;SRF=9;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.621758;STB=0.881065;TYPE=snp;VARB=0.0242443;OID=.;OPOS=120330379;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:14:14:10:10:4:4:3:1:9:1:3:1:9:1 chr4 120330448 . G A 32.04 PASS AO=7;DP=21;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.00300727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.392;QD=5.82599;RBI=0.0772967;REFB=-0.025651;REVB=0.0772382;RO=13;SAF=5;SAR=2;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275446;STB=0.581189;TYPE=snp;VARB=0.028168;OID=.;OPOS=120330448;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:21:22:13:14:7:8:2:5:6:7:3:5:7:7 chr4 120330449 . C A 31.54 PASS AO=8;DP=21;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.0281791;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.912;QD=5.73464;RBI=0.0285957;REFB=-0.0178348;REVB=0.00486381;RO=13;SAF=5;SAR=3;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168369;STB=0.581189;TYPE=snp;VARB=0.114823;OID=.;OPOS=120330449;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:21:22:13:14:8:8:3:5:6:7:3:5:7:7 chr4 120330539 . G A 44.38 PASS AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0255478;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.4451;QD=9.34417;RBI=0.0834747;REFB=-0.0592898;REVB=-0.0794691;RO=9;SAF=6;SAR=3;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101784;STB=0.592381;TYPE=snp;VARB=0.0711465;OID=.;OPOS=120330539;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:18:19:9:10:9:9:3:6:5:4:3:6:5:5 chr4 120423729 . T C 118.25 PASS AO=63;DP=229;FAO=63;FDP=228;FR=.;FRO=165;FSAF=43;FSAR=20;FSRF=91;FSRR=74;FWDB=0.00370363;FXX=0.00436662;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.333;QD=2.0745;RBI=0.0632112;REFB=-0.0216018;REVB=0.0631026;RO=163;SAF=43;SAR=20;SRF=88;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184819;STB=0.601276;TYPE=snp;VARB=0.0355863;OID=.;OPOS=120423729;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:229:228:163:165:63:63:20:43:88:75:20:43:91:74 chr4 120474859 . A G 277.99 PASS AO=79;DP=187;FAO=79;FDP=187;FR=.;FRO=108;FSAF=27;FSAR=52;FSRF=43;FSRR=65;FWDB=0.0199175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.123;QD=5.94627;RBI=0.0223055;REFB=-0.0160187;REVB=-0.0100412;RO=108;SAF=27;SAR=52;SRF=43;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0631628;STB=0.535364;TYPE=snp;VARB=0.02126;OID=.;OPOS=120474859;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:187:108:108:79:79:52:27:43:65:52:27:43:65 chr4 120528327 . G A 958.78 PASS AO=113;DP=124;FAO=113;FDP=122;FR=.;FRO=9;FSAF=65;FSAR=48;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.0184155;FXX=0.0161277;HRUN=4;LEN=1;MLLD=144.926;QD=31.4354;RBI=0.0233864;REFB=-0.0950507;REVB=-0.014415;RO=1;SAF=65;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00724945;STB=0.526427;TYPE=snp;VARB=0.00114348;OID=.;OPOS=120528327;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:124:122:1:9:113:113:48:65:1:0:48:65:2:7 chr4 121719544 . A T 728.41 PASS AO=378;DP=832;FAO=187;FDP=400;FR=.;FRO=213;FSAF=87;FSAR=100;FSRF=98;FSRR=115;FWDB=0.0266076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.834;QD=7.28413;RBI=0.0271622;REFB=0.00244603;REVB=-0.00546091;RO=446;SAF=176;SAR=202;SRF=192;SRR=254;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0347861;STB=0.502755;TYPE=snp;VARB=-0.00341513;OID=.;OPOS=121719544;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:832:400:446:213:378:187:202:176:192:254:100:87:98:115 chr4 121957051 . C T 3815.35 PASS AO=553;DP=555;FAO=396;FDP=396;FR=.;FRO=0;FSAF=153;FSAR=243;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0231117;FXX=0.00999975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.25;QD=38.5388;RBI=0.0354393;REFB=0;REVB=-0.0268662;RO=0;SAF=213;SAR=340;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.70983e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000133675;OID=.;OPOS=121957051;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:555:396:0:0:553:396:340:213:0:0:243:153:0:0 chr4 121957734 . T C 1580.74 PASS AO=165;DP=165;FAO=165;FDP=165;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00214329;FXX=0.00602373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.075;QD=38.3209;RBI=0.0496836;REFB=0;REVB=0.0496374;RO=0;SAF=83;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.09123e-05;OID=.;OPOS=121957734;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:165:165:0:0:165:165:82:83:0:0:83:82:0:0 chr4 121958091 . T G 866.74 PASS AO=110;DP=127;FAO=110;FDP=127;FR=.;FRO=17;FSAF=49;FSAR=61;FSRF=3;FSRR=14;FWDB=0.0323047;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=148.344;QD=27.2991;RBI=0.0349525;REFB=-0.180853;REVB=0.0133448;RO=13;SAF=49;SAR=61;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0436357;STB=0.536725;TYPE=snp;VARB=0.00285772;OID=.;OPOS=121958091;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:127:127:13:17:110:110:61:49:3:10:61:49:3:14 chr4 121958187 . A G 1566.51 PASS AO=162;DP=162;FAO=164;FDP=164;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-5.71934e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.166;QD=38.2075;RBI=0.00323846;REFB=0;REVB=-0.00323796;RO=0;SAF=71;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.55804e-06;OID=.;OPOS=121958187;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:162:164:0:0:162:164:91:71:0:0:92:72:0:0 chr4 121958697 . G A 1166.27 PASS AO=128;DP=133;FAO=129;FDP=133;FR=.;FRO=4;FSAF=47;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.016029;FXX=0.00746213;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.249;QD=35.0759;RBI=0.0235767;REFB=-0.0356706;REVB=0.0172897;RO=4;SAF=47;SAR=81;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0228863;STB=0.511903;TYPE=snp;VARB=0.000777029;OID=.;OPOS=121958697;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:133:133:4:4:128:129:81:47:0:4:82:47:0:4 chr4 121966807 . C T 1192.89 PASS AO=123;DP=123;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=300.136;QD=38.1725;RBI=0.0240359;REFB=0;REVB=0.0217194;RO=0;SAF=63;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.68469e-05;OID=.;OPOS=121966807;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:123:125:0:0:123:125:60:63:0:0:61:64:0:0 chr4 122137662 . T G 762.95 PASS AO=63;DP=76;FAO=80;FDP=82;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=26;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0440115;FXX=0.0238067;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.7237;QD=37.2169;RBI=0.0460682;REFB=0;REVB=0.0136112;RO=0;SAF=20;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.00371e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000950971;OID=.;OPOS=122137662;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:76:82:0:0:63:80:43:20:0:0:54:26:0:0 chr4 122250272 . C G 137.14 PASS AO=24;DP=39;FAO=24;FDP=39;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=-0.00541774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.457;QD=14.066;RBI=0.0306675;REFB=0.00232507;REVB=-0.0301851;RO=15;SAF=6;SAR=18;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0476847;STB=0.526294;TYPE=snp;VARB=-0.00190845;OID=.;OPOS=122250272;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:39:39:15:15:24:24:18:6:3:12:18:6:3:12 chr4 122250514 . A G 413.94 PASS AO=105;DP=232;FAO=108;FDP=237;FR=.;FRO=129;FSAF=49;FSAR=59;FSRF=73;FSRR=56;FWDB=-0.00307822;FXX=0.00836785;HRUN=3;LEN=1;MLLD=91.0371;QD=6.98639;RBI=0.0298202;REFB=-0.00754066;REVB=0.0296609;RO=126;SAF=49;SAR=56;SRF=71;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0951392;STB=0.560887;TYPE=snp;VARB=0.00958404;OID=.;OPOS=122250514;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:237:126:129:105:108:56:49:71:55:59:49:73:56 chr4 122257950 . A G 256.1 PASS AO=52;DP=93;FAO=52;FDP=93;FR=.;FRO=41;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=0.00553512;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.4609;QD=11.0149;RBI=0.00952257;REFB=-0.000457611;REVB=0.00774866;RO=41;SAF=28;SAR=24;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.040816;STB=0.522379;TYPE=snp;VARB=0.000593986;OID=.;OPOS=122257950;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:41:41:52:52:24:28:20:21:24:28:20:21 chr4 122617718 . G C 98.66 PASS AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=0.0122884;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=146.492;QD=8.77009;RBI=0.0123494;REFB=-0.0388708;REVB=-0.00122559;RO=20;SAF=8;SAR=14;SRF=4;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158483;STB=0.533304;TYPE=snp;VARB=0.0229076;OID=.;OPOS=122617718;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:45:45:20:23:22:22:14:8:4:16:14:8:7:16 chr4 122617745 . G A 102.4 PASS AO=20;DP=36;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=14;FWDB=0.015892;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.21;QD=11.3776;RBI=0.0239205;REFB=-0.0461973;REVB=-0.0178783;RO=16;SAF=6;SAR=14;SRF=2;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180555;STB=0.599911;TYPE=snp;VARB=0.0209247;OID=.;OPOS=122617745;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:36:36:16:16:20:20:14:6:2:14:14:6:2:14 chr4 122683007 . G A 2412.43 PASS AO=248;DP=249;FAO=252;FDP=252;FR=.;FRO=0;FSAF=122;FSAR=130;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0288848;FXX=0.00787371;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.481;QD=38.2925;RBI=0.0307072;REFB=0;REVB=-0.0104211;RO=0;SAF=121;SAR=127;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.3457e-05;OID=.;OPOS=122683007;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:249:252:0:0:248:252:127:121:0:0:130:122:0:0 chr4 122687238 . A G 347.32 PASS AO=97;DP=232;FAO=99;FDP=231;FR=.;FRO=132;FSAF=67;FSAR=32;FSRF=82;FSRR=50;FWDB=-0.024468;FXX=0.00431016;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.803;QD=6.01425;RBI=0.0291134;REFB=-0.0156318;REVB=-0.0157768;RO=125;SAF=67;SAR=30;SRF=78;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0762743;STB=0.535366;TYPE=snp;VARB=0.0244592;OID=.;OPOS=122687238;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:231:125:132:97:99:30:67:78:47:32:67:82:50 chr4 122687491 . G C 402.91 PASS AO=108;DP=242;FAO=108;FDP=242;FR=.;FRO=134;FSAF=62;FSAR=46;FSRF=81;FSRR=53;FWDB=-0.0192248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.0871;QD=6.65971;RBI=0.0400202;REFB=-0.0147199;REVB=-0.0351002;RO=131;SAF=62;SAR=46;SRF=81;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0451261;STB=0.517298;TYPE=snp;VARB=0.0178711;OID=.;OPOS=122687491;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:242:242:131:134:108:108:46:62:81:50:46:62:81:53 chr4 122742217 . T C 1987.05 PASS AO=212;DP=219;FAO=215;FDP=215;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=117;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156709;FXX=0.0227262;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.367;QD=36.9684;RBI=0.0339409;REFB=-0.131286;REVB=0.0301066;RO=1;SAF=97;SAR=115;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00488606;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000927599;OID=.;OPOS=122742217;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:219:215:1:0:212:215:115:97:1:0:117:98:0:0 chr4 122824052 . C T 557.46 PASS AO=136;DP=279;FAO=136;FDP=281;FR=.;FRO=145;FSAF=67;FSAR=69;FSRF=70;FSRR=75;FWDB=-0.00261532;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.487;QD=7.93542;RBI=0.0038205;REFB=0.00649354;REVB=0.00278502;RO=143;SAF=67;SAR=69;SRF=69;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00944958;STB=0.505104;TYPE=snp;VARB=-0.00711493;OID=.;OPOS=122824052;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:279:281:143:145:136:136:69:67:69:74:69:67:70:75 chr4 122854116 . G C 70.76 PASS AO=9;DP=11;FAO=9;FDP=11;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0347024;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.759;QD=25.7324;RBI=0.0837047;REFB=-0.0872079;REVB=0.0761724;RO=2;SAF=4;SAR=5;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0179867;STB=0.510181;TYPE=snp;VARB=0.00886814;OID=.;OPOS=122854116;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:11:11:2:2:9:9:5:4:1:1:5:4:1:1 chr4 123008808 . C T 176.24 PASS AO=41;DP=83;FAO=41;FDP=84;FR=.;FRO=43;FSAF=29;FSAR=12;FSRF=32;FSRR=11;FWDB=-0.016736;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.094;QD=8.39252;RBI=0.0462771;REFB=-0.0215523;REVB=-0.0431449;RO=41;SAF=29;SAR=12;SRF=32;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0829559;STB=0.52322;TYPE=snp;VARB=0.0235917;OID=.;OPOS=123008808;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:84:41:43:41:41:12:29:32:9:12:29:32:11 chr4 123145751 . T A 272.2 PASS AO=71;DP=156;FAO=71;FDP=157;FR=.;FRO=86;FSAF=31;FSAR=40;FSRF=29;FSRR=57;FWDB=-0.00518288;FXX=0.00632871;HRUN=3;LEN=1;MLLD=235.548;QD=6.93503;RBI=0.0183113;REFB=-0.0101906;REVB=-0.0175625;RO=83;SAF=31;SAR=40;SRF=26;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12431;STB=0.556116;TYPE=snp;VARB=0.0132061;OID=.;OPOS=123145751;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:157:83:86:71:71:40:31:26:57:40:31:29:57 chr4 123150286 . T C 656.39 PASS AO=165;DP=350;FAO=165;FDP=349;FR=.;FRO=184;FSAF=75;FSAR=90;FSRF=67;FSRR=117;FWDB=0.0127218;FXX=0.00285706;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.052;QD=7.52311;RBI=0.0208074;REFB=-0.0234111;REVB=0.0164652;RO=179;SAF=75;SAR=90;SRF=62;SRR=117;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104519;STB=0.548484;TYPE=snp;VARB=0.0228438;OID=.;OPOS=123150286;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:350:349:179:184:165:165:90:75:62:117:90:75:67:117 chr4 123192383 . T C 220.31 PASS AO=70;DP=183;FAO=70;FDP=182;FR=.;FRO=112;FSAF=21;FSAR=49;FSRF=35;FSRR=77;FWDB=-0.00910432;FXX=0.010869;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.968;QD=4.84187;RBI=0.0164038;REFB=-0.00216887;REVB=-0.0136454;RO=111;SAF=21;SAR=49;SRF=35;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.019609;STB=0.509088;TYPE=snp;VARB=0.0035621;OID=.;OPOS=123192383;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:182:111:112:70:70:49:21:35:76:49:21:35:77 chr4 123229132 . C T 587.35 PASS AO=152;DP=328;FAO=152;FDP=329;FR=.;FRO=177;FSAF=73;FSAR=79;FSRF=81;FSRR=96;FWDB=0.000261915;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.119;QD=7.14106;RBI=0.000368403;REFB=-0.00739009;REVB=-0.000259078;RO=174;SAF=73;SAR=79;SRF=80;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0198857;STB=0.512207;TYPE=snp;VARB=0.00788135;OID=.;OPOS=123229132;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:328:329:174:177:152:152:79:73:80:94:79:73:81:96 chr4 123536963 . G A 2014.75 PASS AO=196;DP=196;FAO=214;FDP=214;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0513053;FXX=0.00465095;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.928;QD=37.6589;RBI=0.0552969;REFB=-0.0304766;REVB=0.0206279;RO=0;SAF=91;SAR=105;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.42894e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000260005;OID=.;OPOS=123536963;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:87:196:214:0:0:196:214:105:91:0:0:118:96:0:0 chr4 123664204 . G A 137.29 PASS AO=35;DP=79;FAO=35;FDP=79;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=28;FWDB=-0.00743519;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.278;QD=6.95155;RBI=0.00776733;REFB=-0.0143082;REVB=0.00224709;RO=44;SAF=16;SAR=19;SRF=16;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0942724;STB=0.552912;TYPE=snp;VARB=0.0130034;OID=.;OPOS=123664204;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:44:44:35:35:19:16:16:28:19:16:16:28 chr4 123664445 . C T 119.77 PASS AO=30;DP=67;FAO=30;FDP=67;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=25;FWDB=0.0575163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.5517;QD=7.1504;RBI=0.0575253;REFB=-0.00441096;REVB=-0.00101743;RO=37;SAF=17;SAR=13;SRF=12;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233984;STB=0.631391;TYPE=snp;VARB=0.0105398;OID=.;OPOS=123664445;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:37:37:30:30:13:17:12:25:13:17:12:25 chr4 123665428 . G A 40.03 PASS AO=15;DP=51;FAO=15;FDP=51;FR=.;FRO=36;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=-0.0240373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.0847;QD=3.13933;RBI=0.0244959;REFB=-0.00507561;REVB=0.00471748;RO=36;SAF=4;SAR=11;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.37301;STB=0.72529;TYPE=snp;VARB=0.00735512;OID=.;OPOS=123665428;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:51:51:36:36:15:15:11:4:21:15:11:4:21:15 chr4 123665991 . C G 443.03 PASS AO=99;DP=191;FAO=99;FDP=191;FR=.;FRO=92;FSAF=40;FSAR=59;FSRF=18;FSRR=74;FWDB=0.0236986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.115;QD=9.27804;RBI=0.0274646;REFB=-0.00456591;REVB=-0.0138809;RO=91;SAF=40;SAR=59;SRF=18;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196323;STB=0.608536;TYPE=snp;VARB=0.0030968;OID=.;OPOS=123665991;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:191:191:91:92:99:99:59:40:18:73:59:40:18:74 chr4 123814308 . C T 397.92 PASS AO=102;DP=221;FAO=102;FDP=221;FR=.;FRO=119;FSAF=70;FSAR=32;FSRF=70;FSRR=49;FWDB=-0.00134502;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.4861;QD=7.20225;RBI=0.00809603;REFB=-0.00883354;REVB=0.00798352;RO=119;SAF=70;SAR=32;SRF=70;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105637;STB=0.558609;TYPE=snp;VARB=0.009975;OID=.;OPOS=123814308;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:221:119:119:102:102:32:70:70:49:32:70:70:49 chr4 123838758 . A G 337.62 PASS AO=91;DP=215;FAO=94;FDP=218;FR=.;FRO=124;FSAF=41;FSAR=53;FSRF=58;FSRR=66;FWDB=-0.0395211;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.608;QD=6.1949;RBI=0.0395964;REFB=-0.0167487;REVB=-0.00244145;RO=124;SAF=41;SAR=50;SRF=58;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0179007;STB=0.518167;TYPE=snp;VARB=0.0178697;OID=.;OPOS=123838758;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:218:124:124:91:94:50:41:58:66:53:41:58:66 chr4 123949556 . G A 1352.6 PASS AO=139;DP=141;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.011003;FXX=0.0205465;HRUN=3;LEN=1;MLLD=131.694;QD=37.835;RBI=0.0120566;REFB=0.000757849;REVB=-0.00492918;RO=0;SAF=42;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.07854e-05;OID=.;OPOS=123949556;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:141:143:0:0:139:143:97:42:0:0:97:46:0:0 chr4 125631269 . TG T 832.42 PASS AO=111;DP=160;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.221176;FXX=0.00671096;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.1166;QD=22.4979;RBI=0.396856;REFB=0;REVB=0.329508;RO=18;SAF=63;SAR=48;SRF=2;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0.612613;SSSB=0.120273;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00358703;OID=.;OPOS=125631270;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:111:147:148:148:0:84:64:0:0:68:18:63:48:2:16 chr4 126238305 . C A 121.4 PASS AO=25;DP=47;FAO=25;FDP=47;FR=.;FRO=22;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.0230522;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=170.17;QD=10.3321;RBI=0.0236079;REFB=0.00136513;REVB=-0.00509196;RO=22;SAF=15;SAR=10;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0319934;STB=0.517843;TYPE=snp;VARB=-0.00135332;OID=.;OPOS=126238305;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:47:47:22:22:25:25:10:15:14:8:10:15:14:8 chr4 126329789 . T C 2719.5 PASS AO=288;DP=293;FAO=289;FDP=290;FR=.;FRO=1;FSAF=108;FSAR=181;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0170329;FXX=0.0169486;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.646;QD=37.5103;RBI=0.0312241;REFB=-0.193774;REVB=0.0261692;RO=0;SAF=107;SAR=181;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.502304;TYPE=snp;VARB=0.000137646;OID=.;OPOS=126329789;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:293:290:0:1:288:289:181:107:0:0:181:108:1:0 chr4 126369872 . G C 1798.69 PASS AO=185;DP=186;FAO=187;FDP=187;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0263276;FXX=0.00531887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.719;QD=38.4746;RBI=0.0268528;REFB=0;REVB=-0.00528495;RO=0;SAF=79;SAR=106;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000121915;OID=.;OPOS=126369872;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:186:187:0:0:185:187:106:79:0:0:107:80:0:0 chr4 126373789 . G A 1738.53 PASS AO=181;DP=181;FAO=182;FDP=182;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193269;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.134;QD=38.2094;RBI=0.0196362;REFB=0;REVB=0.00347152;RO=0;SAF=68;SAR=113;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.81243e-05;OID=.;OPOS=126373789;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:82:181:182:0:0:181:182:113:68:0:0:113:69:0:0 chr4 126397321 . C T 166.29 PASS AO=39;DP=88;FAO=42;FDP=91;FR=.;FRO=49;FSAF=30;FSAR=12;FSRF=40;FSRR=9;FWDB=-0.0248632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.766;QD=7.30962;RBI=0.0278791;REFB=-0.0204363;REVB=-0.0126121;RO=49;SAF=29;SAR=10;SRF=40;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100411;STB=0.571397;TYPE=snp;VARB=0.0206992;OID=.;OPOS=126397321;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:91:49:49:39:42:10:29:40:9:12:30:40:9 chr4 126402890 . G A 505.02 PASS AO=103;DP=189;FAO=105;FDP=190;FR=.;FRO=85;FSAF=43;FSAR=62;FSRF=49;FSRR=36;FWDB=-0.0130959;FXX=0.00523533;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.414;QD=10.632;RBI=0.0143774;REFB=-0.0253726;REVB=0.00593335;RO=83;SAF=43;SAR=60;SRF=48;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132123;STB=0.575102;TYPE=snp;VARB=0.0221235;OID=.;OPOS=126402890;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:190:83:85:103:105:60:43:48:35:62:43:49:36 chr4 126408635 . T C 431.97 PASS AO=109;DP=234;FAO=110;FDP=236;FR=.;FRO=126;FSAF=49;FSAR=61;FSRF=58;FSRR=68;FWDB=0.014526;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.9544;QD=7.32151;RBI=0.0269309;REFB=-0.022218;REVB=0.0226775;RO=125;SAF=48;SAR=61;SRF=58;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0231014;STB=0.508015;TYPE=snp;VARB=0.0232278;OID=.;OPOS=126408635;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:234:236:125:126:109:110:61:48:58:67:61:49:58:68 chr4 126411594 . G A 156.51 PASS AO=31;DP=62;FAO=34;FDP=65;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=0.0284891;FXX=0.0441112;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.7261;QD=9.63166;RBI=0.0806927;REFB=-0.00886553;REVB=0.0754962;RO=31;SAF=10;SAR=21;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211216;STB=0.63027;TYPE=snp;VARB=0.0108415;OID=.;OPOS=126411594;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:65:31:31:31:34:21:10:17:14:24:10:17:14 chr4 126412575 . A G 255.55 PASS AO=65;DP=138;FAO=64;FDP=138;FR=.;FRO=74;FSAF=31;FSAR=33;FSRF=22;FSRR=52;FWDB=0.0358307;FXX=0.00719373;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.1717;QD=7.40712;RBI=0.0358782;REFB=0.0121079;REVB=0.00184712;RO=73;SAF=31;SAR=34;SRF=23;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156543;STB=0.601019;TYPE=snp;VARB=-0.0155373;OID=.;OPOS=126412575;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:73:74:65:64:34:31:23:50:33:31:22:52 chr4 128565000 . A G 1248.95 PASS AO=129;DP=130;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.412;QD=37.847;RBI=0.0251761;REFB=0;REVB=0.0135659;RO=1;SAF=75;SAR=54;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0087192;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.80531e-05;OID=.;OPOS=128565000;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:130:132:1:0:129:132:54:75:0:1:57:75:0:0 chr4 128584580 . G A 689.98 PASS AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0146636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.102;QD=37.8071;RBI=0.0522767;REFB=0;REVB=0.050178;RO=0;SAF=42;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.98661e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.86729e-05;OID=.;OPOS=128584580;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:73:73:0:0:73:73:31:42:0:0:31:42:0:0 chr4 128689936 . A G 1463.2 PASS AO=153;DP=155;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0158431;FXX=0.0129024;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.262;QD=38.2536;RBI=0.0159102;REFB=0;REVB=-0.00145938;RO=0;SAF=66;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.67317e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.31199e-05;OID=.;OPOS=128689936;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:155:153:0:0:153:153:87:66:0:0:87:66:0:0 chr4 128723042 . T C 1859.71 PASS AO=200;DP=203;FAO=200;FDP=200;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0539581;FXX=0.0147776;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4746;QD=37.1942;RBI=0.0584682;REFB=-0.0566475;REVB=0.022518;RO=1;SAF=87;SAR=113;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00419652;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00154975;OID=.;OPOS=128723042;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:203:200:1:0:200:200:113:87:0:1:113:87:0:0 chr4 128807219 . T A 733.95 PASS AO=72;DP=72;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0215458;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.26;QD=38.1274;RBI=0.0258823;REFB=0;REVB=0.0143411;RO=0;SAF=47;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.7512e-06;OID=.;OPOS=128807219;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:72:77:0:0:72:77:25:47:0:0:27:50:0:0 chr4 128814964 . G T 1544.8 PASS AO=161;DP=162;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0134514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.108;QD=38.1432;RBI=0.0419568;REFB=0;REVB=-0.0397421;RO=0;SAF=71;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000333244;OID=.;OPOS=128814964;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:162:162:0:0:161:162:90:71:0:0:91:71:0:0 chr4 128815030 . T C 242.71 PASS AO=58;DP=128;FAO=61;FDP=131;FR=.;FRO=70;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=21;FSRR=49;FWDB=-0.0165606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.606;QD=7.41098;RBI=0.0190178;REFB=-0.00529692;REVB=0.00935002;RO=67;SAF=28;SAR=30;SRF=18;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209586;STB=0.602831;TYPE=snp;VARB=0.00409089;OID=.;OPOS=128815030;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:131:67:70:58:61:30:28:18:49:31:30:21:49 chr4 129012181 . G A 2196.52 PASS AO=233;DP=235;FAO=233;FDP=233;FR=.;FRO=0;FSAF=121;FSAR=112;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00284588;FXX=0.00851028;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.879;QD=37.7085;RBI=0.00932529;REFB=0.0120733;REVB=-0.00888043;RO=2;SAF=121;SAR=112;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00781129;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.227e-06;OID=.;OPOS=129012181;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:87:235:233:2:0:233:233:112:121:2:0:112:121:0:0 chr4 129012638 . A G 1927.32 PASS AO=200;DP=202;FAO=202;FDP=202;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0400958;FXX=0.00980344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.9582;QD=38.1647;RBI=0.0478712;REFB=0;REVB=0.0261529;RO=0;SAF=90;SAR=110;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.27558e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000259062;OID=.;OPOS=129012638;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:91:202:202:0:0:200:202:110:90:0:0:110:92:0:0 chr4 129029009 . G GA 277.94 PASS AO=46;DP=93;FAO=86;FDP=90;FR=.;FRO=4;FSAF=47;FSAR=39;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.13576;FXX=0.0109878;HRUN=6;LEN=1;MLLD=8.46555;QD=12.3527;RBI=0.232664;REFB=0.0211676;REVB=-0.188948;RO=26;SAF=32;SAR=14;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116661;STB=0.509136;TYPE=ins;VARB=0.02283;OID=.;OPOS=129029010;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:46:93:86:90:4:47:39:3:1:9:26:32:14:14:12 chr4 129043204 . C G 1779.53 PASS AO=187;DP=188;FAO=187;FDP=187;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0409288;FXX=0.00531887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.975;QD=38.0649;RBI=0.0448462;REFB=0.0500586;REVB=0.0183305;RO=1;SAF=97;SAR=90;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00526137;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.81749e-05;OID=.;OPOS=129043204;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:188:187:1:0:187:187:90:97:0:1:90:97:0:0 chr4 129043286 . C T 2269.18 PASS AO=238;DP=239;FAO=238;FDP=238;FR=.;FRO=0;FSAF=116;FSAR=122;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.022542;FXX=0.00833299;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.624;QD=38.1375;RBI=0.0369118;REFB=-0.00456966;REVB=0.029229;RO=1;SAF=117;SAR=121;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00392264;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000291039;OID=.;OPOS=129043286;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:239:238:1:0:238:238:121:117:0:1:122:116:0:0 chr4 129043614 . G T 182.54 PASS AO=22;DP=24;FAO=23;FDP=25;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0993263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.52;QD=29.207;RBI=0.153217;REFB=-0.0772596;REVB=0.116661;RO=2;SAF=19;SAR=3;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0462387;STB=0.523789;TYPE=snp;VARB=0.0163048;OID=.;OPOS=129043614;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:24:25:2:2:22:23:3:19:2:0:3:20:2:0 chr4 129043617 . T G 104.77 PASS AO=17;DP=28;FAO=18;FDP=28;FR=.;FRO=10;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=1;FWDB=-0.0159198;FXX=0;HRUN=9;LEN=1;MLLD=169.759;QD=14.967;RBI=0.0257595;REFB=-0.0213103;REVB=0.0202512;RO=6;SAF=14;SAR=3;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00800182;STB=0.545407;TYPE=snp;VARB=0.00242202;OID=.;OPOS=129043617;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:28:28:6:10:17:18:3:14:5:1:3:15:9:1 chr4 129100643 . G A 2022.99 PASS AO=212;DP=215;FAO=214;FDP=214;FR=.;FRO=0;FSAF=109;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0112652;FXX=0.0138242;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.7602;QD=37.8128;RBI=0.0216293;REFB=-0.0105542;REVB=-0.0184641;RO=0;SAF=108;SAR=104;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.77094e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.96506e-05;OID=.;OPOS=129100643;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:215:214:0:0:212:214:104:108:0:0:105:109:0:0 chr4 129677184 . C A 261.11 PASS AO=80;DP=203;FAO=80;FDP=201;FR=.;FRO=121;FSAF=37;FSAR=43;FSRF=75;FSRR=46;FWDB=-0.00328606;FXX=0.0195112;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.738;QD=5.19613;RBI=0.0193312;REFB=-0.0195506;REVB=0.0190498;RO=116;SAF=37;SAR=43;SRF=72;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165926;STB=0.593885;TYPE=snp;VARB=0.0181171;OID=.;OPOS=129677184;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:201:116:121:80:80:43:37:72:44:43:37:75:46 chr4 129677239 . T C 1691.34 PASS AO=114;DP=188;FAO=177;FDP=177;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=69;FSAR=108;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.233537;FXX=0.0220982;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.03;QD=38.2225;RBI=0.233949;REFB=-0.0294646;REVB=0.0138794;RO=2;SAF=6;SAR=108;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0684532;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000983033;OID=.;OPOS=129677239;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:180:177:2:0:114:177:108:6:1:1:108:69:0:0 chr4 129867280 . T A 352.43 PASS AO=83;DP=168;FAO=83;FDP=168;FR=.;FRO=85;FSAF=30;FSAR=53;FSRF=35;FSRR=50;FWDB=-0.011005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.693;QD=8.39117;RBI=0.014501;REFB=-0.0028651;REVB=-0.00944283;RO=85;SAF=30;SAR=53;SRF=35;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0492454;STB=0.527155;TYPE=snp;VARB=0.00347737;OID=.;OPOS=129867280;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:85:85:83:83:53:30:35:50:53:30:35:50 chr4 129913345 . G A 216.57 PASS AO=55;DP=121;FAO=55;FDP=121;FR=.;FRO=66;FSAF=16;FSAR=39;FSRF=33;FSRR=33;FWDB=-0.0371793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1923;QD=7.15935;RBI=0.0373784;REFB=0.00490656;REVB=-0.00385219;RO=66;SAF=16;SAR=39;SRF=33;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.221205;STB=0.623851;TYPE=snp;VARB=-0.00992246;OID=.;OPOS=129913345;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:66:66:55:55:39:16:33:33:39:16:33:33 chr4 129924977 . C A 276.31 PASS AO=61;DP=128;FAO=64;FDP=129;FR=.;FRO=65;FSAF=40;FSAR=24;FSRF=34;FSRR=31;FWDB=0.023388;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.2016;QD=8.56762;RBI=0.036899;REFB=0.00419821;REVB=-0.0285401;RO=65;SAF=37;SAR=24;SRF=35;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0653795;STB=0.553303;TYPE=snp;VARB=-0.00526654;OID=.;OPOS=129924977;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:129:65:65:61:64:24:37:35:30:24:40:34:31 chr4 130030644 . C T 355.53 PASS AO=83;DP=170;FAO=84;FDP=171;FR=.;FRO=87;FSAF=34;FSAR=50;FSRF=42;FSRR=45;FWDB=0.0249056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.294;QD=8.31659;RBI=0.0249057;REFB=-0.0154004;REVB=6.30119e-05;RO=86;SAF=34;SAR=49;SRF=41;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0631916;STB=0.540531;TYPE=snp;VARB=0.0148405;OID=.;OPOS=130030644;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:171:86:87:83:84:49:34:41:45:50:34:42:45 chr4 130030652 . A G 1522.16 PASS AO=164;DP=167;FAO=164;FDP=167;FR=.;FRO=3;FSAF=74;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0128109;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.143;QD=36.4589;RBI=0.0276432;REFB=-0.127042;REVB=0.0244954;RO=3;SAF=74;SAR=90;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0155954;STB=0.508196;TYPE=snp;VARB=0.00271065;OID=.;OPOS=130030652;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:167:167:3:3:164:164:90:74:0:3:90:74:0:3 chr4 130032843 . A G 172.98 PASS AO=52;DP=129;FAO=51;FDP=127;FR=.;FRO=76;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=36;FSRR=40;FWDB=0.00470853;FXX=0.0155027;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.601;QD=5.44813;RBI=0.0424905;REFB=-0.000381705;REVB=0.0422288;RO=75;SAF=28;SAR=24;SRF=36;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0613187;STB=0.5451;TYPE=snp;VARB=0.000573538;OID=.;OPOS=130032843;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:127:75:76:52:51:24:28:36:39:23:28:36:40 chr4 132641498 . T A 362.41 PASS AO=104;DP=236;FAO=107;FDP=261;FR=.;FRO=154;FSAF=64;FSAR=43;FSRF=83;FSRR=71;FWDB=0.00120845;FXX=0.0404397;HRUN=7;LEN=1;MLLD=167.547;QD=5.55416;RBI=0.0162511;REFB=-0.00034274;REVB=0.0162061;RO=131;SAF=63;SAR=41;SRF=79;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0028519;STB=0.535794;TYPE=snp;VARB=0.000529021;OID=.;OPOS=132641498;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:236:261:131:154:104:107:41:63:79:52:43:64:83:71 chr4 133367588 . T C 996.03 PASS AO=107;DP=109;FAO=107;FDP=109;FR=.;FRO=2;FSAF=56;FSAR=51;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0136529;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.6654;QD=36.5514;RBI=0.0206417;REFB=-0.0792101;REVB=0.0154814;RO=1;SAF=56;SAR=51;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00921579;STB=0.50043;TYPE=snp;VARB=-1.12874e-05;OID=.;OPOS=133367588;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:109:109:1:2:107:107:51:56:0:1:51:56:1:1 chr4 134072293 . TG T 108.05 PASS AO=14;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.308078;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=9.28877;QD=16.6235;RBI=0.374464;REFB=-0.114054;REVB=0.212865;RO=7;SAF=3;SAR=11;SRF=2;SRR=5;SSEN=0.395349;SSEP=0;SSSB=-0.0603092;STB=0.512185;TYPE=del;VARB=0.0836082;OID=.;OPOS=134072294;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:14:24:25:26:1:5:20:0:1:7:7:3:11:2:5 chr4 134072821 . G A 351.23 PASS AO=74;DP=138;FAO=74;FDP=136;FR=.;FRO=62;FSAF=44;FSAR=30;FSRF=38;FSRR=24;FWDB=-0.000599577;FXX=0.0144917;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.742;QD=10.3302;RBI=0.000958044;REFB=-0.0222195;REVB=0.000747231;RO=60;SAF=44;SAR=30;SRF=38;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0331564;STB=0.508683;TYPE=snp;VARB=0.012444;OID=.;OPOS=134072821;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:136:60:62:74:74:30:44:38:22:30:44:38:24 chr4 134082967 . T C 749.82 PASS AO=366;DP=784;FAO=188;FDP=396;FR=.;FRO=208;FSAF=98;FSAR=90;FSRF=101;FSRR=107;FWDB=-0.014076;FXX=0.00999975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.031;QD=7.57392;RBI=0.0620057;REFB=0.0113302;REVB=0.0603869;RO=339;SAF=191;SAR=175;SRF=170;SRR=169;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0180053;STB=0.518753;TYPE=snp;VARB=-0.00985954;OID=.;OPOS=134082967;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:784:396:339:208:366:188:175:191:170:169:90:98:101:107 chr4 134710417 . T C 447.31 PASS AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0065029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.635;QD=38.0686;RBI=0.0288387;REFB=0;REVB=0.0280959;RO=0;SAF=25;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000190795;OID=.;OPOS=134710417;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:47:47:0:0:47:47:22:25:0:0:22:25:0:0 chr4 135121066 . T G 1417.92 PASS AO=148;DP=148;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135615;FXX=0.0134219;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.202;QD=38.5827;RBI=0.0140327;REFB=0;REVB=0.00360572;RO=0;SAF=69;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.86736e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.49301e-05;OID=.;OPOS=135121066;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:148:147:0:0:148:147:79:69:0:0:80:67:0:0 chr4 135121368 . G T 892.6 PASS AO=93;DP=93;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0743393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.41;QD=37.9829;RBI=0.0748471;REFB=0;REVB=0.0087033;RO=0;SAF=27;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000179023;OID=.;OPOS=135121368;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:93:94:0:0:93:94:66:27:0:0:67:27:0:0 chr4 135121601 . C T 510.57 PASS AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226334;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.292;QD=37.8199;RBI=0.0229652;REFB=0;REVB=0.00389007;RO=0;SAF=25;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.08126e-05;OID=.;OPOS=135121601;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:55:54:0:0:54:54:29:25:0:0:29:25:0:0 chr4 138449683 . A G 1039.17 PASS AO=111;DP=113;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0593187;FXX=0.0176975;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.413;QD=37.4477;RBI=0.0646701;REFB=-0.065481;REVB=0.0257588;RO=1;SAF=56;SAR=55;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00840273;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000913516;OID=.;OPOS=138449683;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:113:111:1:0:111:111:55:56:1:0:55:56:0:0 chr4 138453453 . G A 331.88 PASS AO=99;DP=247;FAO=100;FDP=246;FR=.;FRO=146;FSAF=53;FSAR=47;FSRF=84;FSRR=62;FWDB=-0.0108991;FXX=0.00806419;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.119;QD=5.39638;RBI=0.0254898;REFB=9.86415e-05;REVB=0.0230421;RO=145;SAF=52;SAR=47;SRF=83;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0503358;STB=0.52709;TYPE=snp;VARB=-0.000176008;OID=.;OPOS=138453453;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:247:246:145:146:99:100:47:52:83:62:47:53:84:62 chr4 139092719 . A G 154.8 PASS AO=37;DP=80;FAO=37;FDP=79;FR=.;FRO=42;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=8;FSRR=34;FWDB=0.0396355;FXX=0.0246883;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.9853;QD=7.83781;RBI=0.040586;REFB=0.00978552;REVB=-0.0087323;RO=38;SAF=19;SAR=18;SRF=6;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.324563;STB=0.670203;TYPE=snp;VARB=-0.0159678;OID=.;OPOS=139092719;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:79:38:42:37:37:18:19:6:32:18:19:8:34 chr4 139100372 . C T 751.29 PASS AO=81;DP=83;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0375831;FXX=0.0120467;HRUN=3;LEN=1;MLLD=193.694;QD=36.6483;RBI=0.0376196;REFB=-0.0618312;REVB=-0.00165539;RO=0;SAF=49;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.32002e-08;STB=0.505049;TYPE=snp;VARB=2.52324e-05;OID=.;OPOS=139100372;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:83:82:0:1:81:81:32:49:0:0:32:49:1:0 chr4 139140494 . G C 274.47 PASS AO=78;DP=183;FAO=78;FDP=185;FR=.;FRO=107;FSAF=30;FSAR=48;FSRF=41;FSRR=66;FWDB=-0.0068971;FXX=0.0159566;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.827;QD=5.93447;RBI=0.0147522;REFB=-0.016534;REVB=0.0130406;RO=103;SAF=30;SAR=48;SRF=37;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0275697;STB=0.500879;TYPE=snp;VARB=0.0221473;OID=.;OPOS=139140494;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:185:103:107:78:78:48:30:37:66:48:30:41:66 chr4 140005294 . A G 538.5 PASS AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0940803;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.9573;QD=36.5088;RBI=0.0982537;REFB=0;REVB=-0.0283317;RO=0;SAF=18;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.49224e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0059255;OID=.;OPOS=140005294;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:59:59:0:0:59:59:41:18:0:0:41:18:0:0 chr4 140396931 . C A 34.32 PASS AO=10;DP=30;FAO=10;FDP=30;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=-0.0308297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.6136;QD=4.57661;RBI=0.0548019;REFB=-0.000638578;REVB=-0.0453075;RO=20;SAF=9;SAR=1;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.366969;STB=0.731977;TYPE=snp;VARB=-0.00414017;OID=.;OPOS=140396931;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:30:30:20:20:10:10:1:9:14:6:1:9:14:6 chr4 140417671 . G C 1204.97 PASS AO=126;DP=126;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0245485;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.946;QD=38.2532;RBI=0.027667;REFB=0;REVB=0.0127607;RO=0;SAF=41;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.78436e-05;OID=.;OPOS=140417671;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:126:126:0:0:126:126:85:41:0:0:85:41:0:0 chr4 140606425 . G A 331.93 PASS AO=63;DP=105;FAO=63;FDP=105;FR=.;FRO=42;FSAF=28;FSAR=35;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=-0.0172783;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.7639;QD=12.645;RBI=0.0372686;REFB=-0.0216043;REVB=-0.0330213;RO=42;SAF=28;SAR=35;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00590055;STB=0.503211;TYPE=snp;VARB=0.0158863;OID=.;OPOS=140606425;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:42:42:63:63:35:28:19:23:35:28:19:23 chr4 140606447 . G T 297.34 PASS AO=56;DP=93;FAO=56;FDP=93;FR=.;FRO=37;FSAF=35;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=-0.0102077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.929;QD=12.7887;RBI=0.0467367;REFB=-0.0189139;REVB=0.0456083;RO=37;SAF=35;SAR=21;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0847033;STB=0.546202;TYPE=snp;VARB=0.0103881;OID=.;OPOS=140606447;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:37:37:56:56:21:35:19:18:21:35:19:18 chr4 140640703 . G T 102.75 PASS AO=10;DP=44;FAO=14;FDP=44;FR=.,HEALED;FRO=19;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=0.0199627;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=209.108;QD=9.34105;RBI=0.0203398;REFB=-0.0469427;REVB=0.00389882;RO=20;SAF=4;SAR=6;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.269437;STB=0.683291;TYPE=snp;VARB=0.0344306;OID=.;OPOS=140640703;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:41:44:20:19:10:14:6:4:13:7:9:5:13:6 chr4 140640909 . CG C,CA 781.68 PASS AO=17,54;DP=95;FAO=22,68;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=18,0;FSAR=4,68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.382056,0.105354;FXX=0.0109878;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=25.1614,116.336;QD=34.7413;RBI=0.531353,0.229724;REFB=0,0;REVB=0.369282,0.204141;RO=10;SAF=14,0;SAR=3,54;SRF=4;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0.419847,0;SSSB=0.352907,-0.885804;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.059559,0.0101771;OID=.,.;OPOS=140640910,140640910;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=C,CA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:17,54:91:22,68:90:0:18,0:4,68:0:0:40:10:14,0:3,54:4:6 chr4 140651584 . TCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGC TCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTG,TCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGC 85.72 PASS AO=5,2;DP=15;FAO=0,10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=0,7;FSAR=0,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0465663,0.0525497;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=4,3;MLLD=168.464,186.852;QD=34.2884;RBI=0.0466958,0.0541387;REFB=0,0;REVB=0.00347575,0.0130203;RO=0;SAF=5,2;SAR=0,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=0,0.00186297;OID=.,.;OPOS=140651609,140651585;OREF=CTGC,CTG;OALT=-,-;OMAPALT=TCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTG,TCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:5,2:7:0,10:10:0:0,7:0,3:0:0:4:0:5,2:0,0:0:0 chr4 140810334 . T C 242.49 PASS AO=45;DP=74;FAO=45;FDP=74;FR=.;FRO=29;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=6;FSRR=23;FWDB=-0.0365051;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=222.945;QD=13.1075;RBI=0.0369882;REFB=-0.00134989;REVB=-0.00595863;RO=29;SAF=24;SAR=21;SRF=6;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232181;STB=0.626281;TYPE=snp;VARB=0.000860427;OID=.;OPOS=140810334;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:29:29:45:45:21:24:6:23:21:24:6:23 chr4 140810637 . C T 104.86 PASS AO=20;DP=35;FAO=20;FDP=35;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.00614474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.5104;QD=11.984;RBI=0.0137224;REFB=-0.0037496;REVB=-0.0122698;RO=15;SAF=5;SAR=15;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195499;STB=0.610052;TYPE=snp;VARB=0.0033978;OID=.;OPOS=140810637;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:35:35:15:15:20:20:15:5:7:8:15:5:7:8 chr4 140811084 . C T 59.31 PASS AO=9;DP=15;FAO=10;FDP=16;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0567027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.33;QD=14.8279;RBI=0.0622367;REFB=-0.0689126;REVB=0.0256557;RO=6;SAF=3;SAR=6;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.526264;TYPE=snp;VARB=0.0466537;OID=.;OPOS=140811084;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:15:16:6:6:9:10:6:3:2:4:6:4:2:4 chr4 140811135 . T C 39.29 PASS AO=8;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.00447788;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=168.062;QD=9.24579;RBI=0.0181391;REFB=-0.0353842;REVB=-0.0175777;RO=9;SAF=3;SAR=5;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162764;STB=0.596769;TYPE=snp;VARB=0.0200701;OID=.;OPOS=140811135;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:17:17:9:9:8:8:5:3:5:4:5:3:5:4 chr4 141543471 . CCAG CCA,CTCAG,CTCA,TCAG 98.97 PASS AO=3,2,2,2;DP=15;FAO=2,3,0,8;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=1,0,0,0;FSAR=1,3,0,8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159209,-0.0179785,0.00257588,-0.0214022;FXX=0;HRUN=3,0,2,2;LEN=1,1,3,1;MLLD=13.1036,39.2652,33.2195,35.8229;QD=30.4521;RBI=0.449297,0.0778734,0.0327121,0.235137;REFB=0,0,0,0;REVB=-0.449015,0.0757697,-0.0326105,0.234161;RO=0;SAF=1,0,0,0;SAR=2,2,2,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0.408163,0,0,0;SSSB=0,0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;TYPE=del,ins,mnp,snp;VARB=0.106684,-0.00256928,0,0.0882963;OID=.,.,.,.;OPOS=141543474,141543472,141543472,141543471;OREF=G,-,CAG,C;OALT=-,T,TCA,T;OMAPALT=CCA,CTCAG,CTCA,TCAG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 2/4:7:10:13:0:0:3,2,2,2:2,3,0,8:2,2,2,2:1,0,0,0:0:0:1,3,0,8:1,0,0,0:0:0 chr4 141543997 . G A 986.03 PASS AO=101;DP=102;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00712702;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.268;QD=37.5631;RBI=0.0437393;REFB=-0.038507;REVB=0.0431547;RO=1;SAF=36;SAR=65;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.012995;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000445757;OID=.;OPOS=141543997;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:102:105:1:0:101:105:65:36:1:0:69:36:0:0 chr4 141583176 . C T 470.16 PASS AO=131;DP=295;FAO=129;FDP=293;FR=.;FRO=164;FSAF=61;FSAR=68;FSRF=101;FSRR=63;FWDB=-0.0129383;FXX=0.00677943;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3527;QD=6.41858;RBI=0.026148;REFB=-0.00198494;REVB=-0.0227227;RO=162;SAF=62;SAR=69;SRF=99;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13704;STB=0.579564;TYPE=snp;VARB=0.00205182;OID=.;OPOS=141583176;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:295:293:162:164:131:129:69:62:99:63:68:61:101:63 chr4 141600320 . A G 1093.41 PASS AO=114;DP=117;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171589;FXX=0.0338954;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.706;QD=38.3652;RBI=0.0177285;REFB=0;REVB=0.00445793;RO=0;SAF=22;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000130045;OID=.;OPOS=141600320;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:117:114:0:0:114:114:92:22:0:0:92:22:0:0 chr4 142654084 . C A 297.12 PASS AO=81;DP=193;FAO=84;FDP=196;FR=.;FRO=112;FSAF=31;FSAR=53;FSRF=34;FSRR=78;FWDB=0.0160385;FXX=0.00507588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.183;QD=6.06362;RBI=0.0160647;REFB=-0.016554;REVB=0.000916991;RO=108;SAF=31;SAR=50;SRF=33;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0857516;STB=0.541024;TYPE=snp;VARB=0.0159159;OID=.;OPOS=142654084;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:196:108:112:81:84:50:31:33:75:53:31:34:78 chr4 142949864 . A C 479.98 PASS AO=134;DP=312;FAO=138;FDP=324;FR=.;FRO=186;FSAF=78;FSAR=60;FSRF=74;FSRR=112;FWDB=0.0144181;FXX=0.00613478;HRUN=6;LEN=1;MLLD=41.1497;QD=5.92571;RBI=0.0215992;REFB=-0.0280128;REVB=0.0160824;RO=178;SAF=76;SAR=58;SRF=71;SRR=107;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171548;STB=0.5953;TYPE=snp;VARB=0.049004;OID=.;OPOS=142949864;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:312:324:178:186:134:138:58:76:71:107:60:78:74:112 chr4 143324094 . G A 197.17 PASS AO=52;DP=118;FAO=52;FDP=118;FR=.;FRO=66;FSAF=19;FSAR=33;FSRF=37;FSRR=29;FWDB=-0.0759603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.4231;QD=6.68368;RBI=0.0759608;REFB=-0.025254;REVB=0.000279511;RO=65;SAF=19;SAR=33;SRF=36;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190124;STB=0.610664;TYPE=snp;VARB=0.0314572;OID=.;OPOS=143324094;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:65:66:52:52:33:19:36:29:33:19:37:29 chr4 144135718 . G A 301.17 PASS AO=72;DP=146;FAO=72;FDP=146;FR=.;FRO=74;FSAF=41;FSAR=31;FSRF=47;FSRR=27;FWDB=0.0491898;FXX=0.00680226;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.1368;QD=8.25118;RBI=0.0493754;REFB=-0.0225932;REVB=-0.00427758;RO=73;SAF=40;SAR=32;SRF=47;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.082569;STB=0.534264;TYPE=snp;VARB=0.0330712;OID=.;OPOS=144135718;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:73:74:72:72:32:40:47:26:31:41:47:27 chr4 144442735 . C T 62.26 PASS AO=18;DP=48;FAO=18;FDP=48;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=0.0224626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.5671;QD=5.18794;RBI=0.0233188;REFB=-0.00211298;REVB=0.00626085;RO=30;SAF=10;SAR=8;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130602;STB=0.575953;TYPE=snp;VARB=0.00593025;OID=.;OPOS=144442735;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:48:48:30:30:18:18:8:10:13:17:8:10:13:17 chr4 144467104 . T C 646.86 PASS AO=67;DP=71;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148338;FXX=0.042851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.174;QD=38.6188;RBI=0.0194438;REFB=0;REVB=0.0125706;RO=0;SAF=41;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.55435e-05;OID=.;OPOS=144467104;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:71:67:0:0:67:67:26:41:0:0:25:42:0:0 chr4 144617842 . G T 269.26 PASS AO=61;DP=120;FAO=61;FDP=121;FR=.;FRO=60;FSAF=4;FSAR=57;FSRF=4;FSRR=56;FWDB=0.0193333;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=304.821;QD=8.90106;RBI=0.01954;REFB=-0.00765011;REVB=-0.00283454;RO=59;SAF=4;SAR=57;SRF=4;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00801914;STB=0.502202;TYPE=snp;VARB=0.00888194;OID=.;OPOS=144617842;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:121:59:60:61:61:57:4:4:55:57:4:4:56 chr4 144618610 . G C 1564.87 PASS AO=165;DP=171;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166275;FXX=0.0399977;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.021;QD=37.2587;RBI=0.0173717;REFB=0.0251017;REVB=-0.00502997;RO=1;SAF=91;SAR=74;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00520105;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000289724;OID=.;OPOS=144618610;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:171:168:1:0:165:168:74:91:1:0:75:93:0:0 chr4 144620758 . C T 50.18 PASS AO=13;DP=34;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.017185;FXX=0.0294031;HRUN=4;LEN=1;MLLD=64.1656;QD=6.08226;RBI=0.0177242;REFB=-0.0117817;REVB=0.00433817;RO=19;SAF=5;SAR=8;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0174255;STB=0.522354;TYPE=snp;VARB=0.0113868;OID=.;OPOS=144620758;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:34:33:19:20:13:13:8:5:7:12:8:5:7:13 chr4 144621199 . A G 11.68 PASS AO=2;DP=12;FAO=3;FDP=13;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.0800823;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.258;QD=3.5944;RBI=0.0803035;REFB=-0.0247708;REVB=0.0059571;RO=10;SAF=1;SAR=1;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.630686;TYPE=snp;VARB=0.0238021;OID=.;OPOS=144621199;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:12:13:10:10:2:3:1:1:5:5:2:1:5:5 chr4 144794616 . C T 97.98 PASS AO=30;DP=80;FAO=30;FDP=80;FR=.;FRO=50;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=0.00540168;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.45;QD=4.89908;RBI=0.0183586;REFB=-0.0117303;REVB=-0.017546;RO=50;SAF=16;SAR=14;SRF=22;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101351;STB=0.558101;TYPE=snp;VARB=0.0180271;OID=.;OPOS=144794616;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:80:80:50:50:30:30:14:16:22:28:14:16:22:28 chr4 144799840 . G A 216.28 PASS AO=43;DP=103;FAO=56;FDP=124;FR=.;FRO=68;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=21;FSRR=47;FWDB=-0.0027651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.96;QD=6.97677;RBI=0.00736692;REFB=-0.0129994;REVB=0.00682831;RO=56;SAF=26;SAR=17;SRF=20;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246117;STB=0.595786;TYPE=snp;VARB=0.00933866;OID=.;OPOS=144799840;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:124:56:68:43:56:17:26:20:36:29:27:21:47 chr4 144801662 . C G 286.57 PASS AO=74;DP=218;FAO=74;FDP=162;FR=.;FRO=88;FSAF=42;FSAR=32;FSRF=43;FSRR=45;FWDB=-0.0169741;FXX=0.27353;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.222;QD=7.07576;RBI=0.0943106;REFB=-0.000596822;REVB=-0.0927705;RO=85;SAF=42;SAR=32;SRF=43;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0600204;STB=0.543153;TYPE=snp;VARB=0.00182725;OID=.;OPOS=144801662;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:218:162:85:88:74:74:32:42:43:42:32:42:43:45 chr4 144918712 . C G 174.74 PASS AO=36;DP=66;FAO=36;FDP=66;FR=.;FRO=30;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.0371185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.2218;QD=10.5902;RBI=0.0391763;REFB=-0.0397085;REVB=0.0125299;RO=30;SAF=21;SAR=15;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0419353;STB=0.523183;TYPE=snp;VARB=0.0368658;OID=.;OPOS=144918712;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:30:30:36:36:15:21:16:14:15:21:16:14 chr4 144920596 . G A 195.43 PASS AO=48;DP=107;FAO=50;FDP=110;FR=.;FRO=60;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=28;FSRR=32;FWDB=-0.0136356;FXX=0.0677909;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.754;QD=7.10638;RBI=0.0183873;REFB=0.00275141;REVB=-0.0123355;RO=55;SAF=26;SAR=22;SRF=25;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0834267;STB=0.539984;TYPE=snp;VARB=-0.00430778;OID=.;OPOS=144920596;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:110:55:60:48:50:22:26:25:30:23:27:28:32 chr4 145041686 . A G 136.29 PASS AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0138091;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.5691;QD=36.3437;RBI=0.0153142;REFB=0;REVB=0.00662085;RO=0;SAF=2;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00030755;OID=.;OPOS=145041686;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:15:0:0:15:15:13:2:0:0:13:2:0:0 chr4 145041720 . A G 236.23 PASS AO=27;DP=29;FAO=27;FDP=29;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0176504;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.625;QD=32.5827;RBI=0.0676684;REFB=-0.0915998;REVB=0.0653259;RO=1;SAF=2;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0182464;STB=0.519217;TYPE=snp;VARB=0.00310707;OID=.;OPOS=145041720;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:1:2:27:27:25:2:0:1:25:2:0:2 chr4 145041741 . T G 270.04 PASS AO=35;DP=44;FAO=36;FDP=43;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0.0571226;FXX=0.0227221;HRUN=3;LEN=1;MLLD=71.7546;QD=25.1203;RBI=0.063654;REFB=-0.0222809;REVB=0.0280864;RO=0;SAF=2;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.546643;TYPE=snp;VARB=0.00522351;OID=.;OPOS=145041741;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:36:43:0:7:35:36:33:2:0:0:34:2:0:7 chr4 146479247 . C A 211.9 PASS AO=61;DP=153;FAO=61;FDP=149;FR=.;FRO=88;FSAF=23;FSAR=38;FSRF=48;FSRR=40;FWDB=0.0109753;FXX=0.0509522;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.756;QD=5.68845;RBI=0.0109783;REFB=0.00313254;REVB=0.000256086;RO=91;SAF=22;SAR=39;SRF=45;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146782;STB=0.60059;TYPE=snp;VARB=-0.00248952;OID=.;OPOS=146479247;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:149:91:88:61:61:39:22:45:46:38:23:48:40 chr4 147177468 . T G 254.2 PASS AO=58;DP=115;FAO=58;FDP=115;FR=.;FRO=57;FSAF=37;FSAR=21;FSRF=31;FSRR=26;FWDB=-0.00823584;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=256.461;QD=8.84158;RBI=0.0204211;REFB=-0.0130946;REVB=-0.0186867;RO=57;SAF=37;SAR=21;SRF=31;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0887869;STB=0.549083;TYPE=snp;VARB=0.0125878;OID=.;OPOS=147177468;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:57:57:58:58:21:37:31:26:21:37:31:26 chr4 147501225 . A G 497.72 PASS AO=106;DP=194;FAO=106;FDP=195;FR=.;FRO=89;FSAF=66;FSAR=40;FSRF=59;FSRR=30;FWDB=0.00981418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.1626;QD=10.2097;RBI=0.0227419;REFB=-0.00816367;REVB=0.0205153;RO=88;SAF=66;SAR=40;SRF=58;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0325597;STB=0.519747;TYPE=snp;VARB=0.00527543;OID=.;OPOS=147501225;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:195:88:89:106:106:40:66:58:30:40:66:59:30 chr4 147501301 . A G 648.93 PASS AO=133;DP=244;FAO=137;FDP=250;FR=.;FRO=113;FSAF=78;FSAR=59;FSRF=63;FSRR=50;FWDB=0.0142327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.689;QD=10.3829;RBI=0.019681;REFB=-0.0182815;REVB=0.0135932;RO=111;SAF=78;SAR=55;SRF=63;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0162144;STB=0.505439;TYPE=snp;VARB=0.0272765;OID=.;OPOS=147501301;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:250:111:113:133:137:55:78:63:48:59:78:63:50 chr4 147561654 . C G 146.91 PASS AO=50;DP=139;FAO=50;FDP=139;FR=.;FRO=89;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=35;FSRR=54;FWDB=0.0108592;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.383;QD=4.22763;RBI=0.0168625;REFB=0.000372847;REVB=0.0129005;RO=88;SAF=28;SAR=22;SRF=35;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179785;STB=0.605536;TYPE=snp;VARB=-0.000612215;OID=.;OPOS=147561654;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:88:89:50:50:22:28:35:53:22:28:35:54 chr4 147788709 . C T 829.95 PASS AO=237;DP=476;FAO=198;FDP=399;FR=.;FRO=201;FSAF=105;FSAR=93;FSRF=83;FSRR=118;FWDB=0.00758896;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.769;QD=8.32032;RBI=0.0130511;REFB=-0.0035809;REVB=-0.0106179;RO=234;SAF=116;SAR=121;SRF=103;SRR=131;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0448467;STB=0.558913;TYPE=snp;VARB=0.00335125;OID=.;OPOS=147788709;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:476:399:234:201:237:198:121:116:103:131:93:105:83:118 chr4 147824864 . G A 268.34 PASS AO=71;DP=159;FAO=71;FDP=160;FR=.;FRO=89;FSAF=32;FSAR=39;FSRF=37;FSRR=52;FWDB=0.0309164;FXX=0.00621079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.0266;QD=6.70851;RBI=0.0311624;REFB=-0.0112893;REVB=0.00390811;RO=87;SAF=32;SAR=39;SRF=36;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0370631;STB=0.519716;TYPE=snp;VARB=0.0154135;OID=.;OPOS=147824864;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:160:87:89:71:71:39:32:36:51:39:32:37:52 chr4 148461037 . T C 455.62 PASS AO=113;DP=237;FAO=113;FDP=237;FR=.;FRO=124;FSAF=17;FSAR=96;FSRF=23;FSRR=101;FWDB=0.031005;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=61.9789;QD=7.68984;RBI=0.0338057;REFB=-0.001944;REVB=0.0134729;RO=124;SAF=17;SAR=96;SRF=23;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0616842;STB=0.534143;TYPE=snp;VARB=0.0023336;OID=.;OPOS=148461037;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:237:237:124:124:113:113:96:17:23:101:96:17:23:101 chr4 148461073 . G A 457.24 PASS AO=101;DP=201;FAO=104;FDP=204;FR=.;FRO=100;FSAF=15;FSAR=89;FSRF=15;FSRR=85;FWDB=0.00101141;FXX=0.0144921;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.128;QD=8.96542;RBI=0.0128967;REFB=-0.00636214;REVB=0.012857;RO=98;SAF=15;SAR=86;SRF=15;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00801046;STB=0.505681;TYPE=snp;VARB=0.00656774;OID=.;OPOS=148461073;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:204:98:100:101:104:86:15:15:83:89:15:15:85 chr4 148560193 . C T 189.18 PASS AO=56;DP=139;FAO=56;FDP=139;FR=.;FRO=83;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=47;FSRR=36;FWDB=-0.0132247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.47;QD=5.44393;RBI=0.0162341;REFB=-0.00703801;REVB=-0.00941553;RO=82;SAF=30;SAR=26;SRF=46;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0268514;STB=0.518378;TYPE=snp;VARB=0.00935903;OID=.;OPOS=148560193;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:82:83:56:56:26:30:46:36:26:30:47:36 chr4 149000024 . C T 1050.47 PASS AO=103;DP=103;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.278;QD=37.5167;RBI=0.0163925;REFB=0;REVB=0.00242206;RO=0;SAF=59;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.03381e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.63874e-06;OID=.;OPOS=149000024;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:103:112:0:0:103:112:44:59:0:0:49:63:0:0 chr4 149356516 . A G 2615.81 PASS AO=273;DP=274;FAO=273;FDP=273;FR=.;FRO=0;FSAF=124;FSAR=149;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287467;FXX=0.0036495;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.666;QD=38.3269;RBI=0.0380234;REFB=0;REVB=-0.0248878;RO=0;SAF=124;SAR=149;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.28854e-06;OID=.;OPOS=149356516;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:274:273:0:0:273:273:149:124:0:0:149:124:0:0 chr4 149357475 . C T 415.17 PASS AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193428;FXX=0.0434688;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.4;QD=37.7423;RBI=0.0499544;REFB=0;REVB=0.0460576;RO=0;SAF=17;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.54734e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000518468;OID=.;OPOS=149357475;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:45:44:0:0:44:44:27:17:0:0:27:17:0:0 chr4 151177340 . C T 73.84 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.835;QD=36.9198;RBI=0.00104909;REFB=0;REVB=-0.00104909;RO=0;SAF=0;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.97382e-06;OID=.;OPOS=151177340;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:8:0:0:0:8:0:0:0 chr4 151177341 . C G 73.91 PASS AO=7;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.5056;QD=36.9544;RBI=0.115346;REFB=0;REVB=0.115346;RO=1;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00810436;OID=.;OPOS=151177341;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:1:0:7:8:7:0:0:1:8:0:0:0 chr4 151505322 . T A 471.97 PASS AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00491223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.32;QD=38.5285;RBI=0.0447877;REFB=0;REVB=-0.0445175;RO=0;SAF=28;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000343222;OID=.;OPOS=151505322;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:49:49:0:0:49:49:21:28:0:0:21:28:0:0 chr4 152041502 . C G 723.9 PASS AO=75;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.083;QD=38.1;RBI=0.0159844;REFB=0;REVB=-0.00897593;RO=0;SAF=38;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.68084e-05;OID=.;OPOS=152041502;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:76:76:0:0:75:76:37:38:0:0:37:39:0:0 chr4 152065447 . C T 85.45 PASS AO=22;DP=56;FAO=24;FDP=61;FR=.;FRO=37;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=25;FWDB=-0.0130217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.304;QD=5.60344;RBI=0.0174108;REFB=-0.00370537;REVB=-0.0115573;RO=34;SAF=7;SAR=15;SRF=11;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00647526;STB=0.523481;TYPE=snp;VARB=0.00603051;OID=.;OPOS=152065447;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:56:61:34:37:22:24:15:7:11:23:17:7:12:25 chr4 152070633 . T A 2113.66 PASS AO=229;DP=236;FAO=230;FDP=230;FR=.;FRO=0;FSAF=164;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00554102;FXX=0.0416649;HRUN=4;LEN=1;MLLD=191.606;QD=36.7594;RBI=0.00707638;REFB=-0.153449;REVB=-0.0044014;RO=5;SAF=164;SAR=65;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0143042;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000140452;OID=.;OPOS=152070633;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:236:230:5:0:229:230:65:164:5:0:66:164:0:0 chr4 152201018 . G GCAGGT 568.17 PASS AO=73;DP=97;FAO=74;FDP=87;FR=.;FRO=13;FSAF=51;FSAR=23;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.028921;FXX=0.103082;HRUN=1;LEN=5;MLLD=177.639;QD=26.1228;RBI=0.0299506;REFB=-0.080866;REVB=-0.00778542;RO=14;SAF=50;SAR=23;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0103184;STB=0.500544;TYPE=ins;VARB=0.0173008;OID=.;OPOS=152201019;OREF=-;OALT=CAGGT;OMAPALT=GCAGGT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:73:97:74:87:13:51:23:9:4:10:14:50:23:10:4 chr4 152212603 . T G 1125.85 PASS AO=111;DP=113;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0211441;FXX=0.0247913;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.8583;QD=38.1644;RBI=0.0909604;REFB=0;REVB=0.0884688;RO=0;SAF=59;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41849e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000475238;OID=.;OPOS=152212603;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:113:118:0:0:111:118:52:59:0:0:58:60:0:0 chr4 152498625 . C T 334.46 PASS AO=99;DP=241;FAO=99;FDP=241;FR=.;FRO=142;FSAF=44;FSAR=55;FSRF=36;FSRR=106;FWDB=-0.00242333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.526;QD=5.55116;RBI=0.0172684;REFB=-0.00853412;REVB=-0.0170975;RO=142;SAF=44;SAR=55;SRF=36;SRR=106;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210632;STB=0.616836;TYPE=snp;VARB=0.0105771;OID=.;OPOS=152498625;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:241:241:142:142:99:99:55:44:36:106:55:44:36:106 chr4 153601063 . A G 40.45 PASS AO=9;DP=29;FAO=11;FDP=31;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.0734789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.518;QD=5.21975;RBI=0.0734813;REFB=-0.0223512;REVB=0.000598271;RO=13;SAF=5;SAR=4;SRF=1;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.46905;STB=0.624061;TYPE=snp;VARB=0.0631719;OID=.;OPOS=153601063;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:29:31:13:20:9:11:4:5:1:12:5:6:7:13 chr4 153690842 . T C 1678.41 PASS AO=179;DP=181;FAO=179;FDP=179;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233879;FXX=0.0110491;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9188;QD=37.5063;RBI=0.0353789;REFB=-0.118702;REVB=0.0265457;RO=1;SAF=68;SAR=111;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00426984;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000867458;OID=.;OPOS=153690842;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:181:179:1:0:179:179:111:68:0:1:111:68:0:0 chr4 153896358 . C T 213.25 PASS AO=55;DP=124;FAO=56;FDP=124;FR=.;FRO=68;FSAF=18;FSAR=38;FSRF=16;FSRR=52;FWDB=0.00792055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.608;QD=6.87912;RBI=0.0103782;REFB=-0.0147058;REVB=-0.00670606;RO=67;SAF=18;SAR=37;SRF=16;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103363;STB=0.5563;TYPE=snp;VARB=0.0159908;OID=.;OPOS=153896358;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:67:68:55:56:37:18:16:51:38:18:16:52 chr4 153897770 . G A 105.04 PASS AO=19;DP=32;FAO=19;FDP=32;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.046218;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.851;QD=13.1301;RBI=0.0478607;REFB=-0.00157354;REVB=0.0124316;RO=13;SAF=6;SAR=13;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00683169;STB=0.503813;TYPE=snp;VARB=0.00157748;OID=.;OPOS=153897770;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:32:32:13:13:19:19:13:6:4:9:13:6:4:9 chr4 153898178 . A G 230.93 PASS AO=25;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0491357;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.6533;QD=35.5275;RBI=0.0527172;REFB=0;REVB=0.0190993;RO=0;SAF=16;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.004505;OID=.;OPOS=153898178;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:26:26:0:0:25:26:9:16:0:0:9:17:0:0 chr4 154256423 . T TA 219.48 PASS AO=87;DP=195;FAO=116;FDP=191;FR=.;FRO=75;FSAF=63;FSAR=53;FSRF=33;FSRR=42;FWDB=-0.135432;FXX=0.00520806;HRUN=6;LEN=1;MLLD=8.66061;QD=4.59644;RBI=0.135997;REFB=-0.00349953;REVB=-0.012383;RO=79;SAF=45;SAR=42;SRF=37;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0424348;STB=0.540497;TYPE=ins;VARB=0.0191045;OID=.;OPOS=154256424;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:87:195:116:191:75:63:53:33:42:76:79:45:42:37:42 chr4 154479430 . T C 146.52 PASS AO=39;DP=91;FAO=39;FDP=91;FR=.;FRO=52;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=33;FSRR=19;FWDB=-0.00979779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.6179;QD=6.44028;RBI=0.00982041;REFB=0.00663408;REVB=-0.000666231;RO=52;SAF=14;SAR=25;SRF=33;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.277305;STB=0.655979;TYPE=snp;VARB=-0.0178227;OID=.;OPOS=154479430;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:52:52:39:39:25:14:33:19:25:14:33:19 chr4 154631543 . A T 1115.88 PASS AO=112;DP=115;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0485911;FXX=0.0168053;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.5598;QD=38.1498;RBI=0.0492098;REFB=0;REVB=0.00777874;RO=0;SAF=25;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.58083e-05;OID=.;OPOS=154631543;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:115:117:0:0:112:117:87:25:0:0:91:26:0:0 chr4 154631587 . C G 179.51 PASS AO=48;DP=111;FAO=48;FDP=111;FR=.;FRO=63;FSAF=10;FSAR=38;FSRF=5;FSRR=58;FWDB=-0.0408987;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.0546;QD=6.46896;RBI=0.0564918;REFB=-0.000312528;REVB=-0.0389694;RO=63;SAF=10;SAR=38;SRF=5;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.231866;STB=0.627408;TYPE=snp;VARB=-0.000657367;OID=.;OPOS=154631587;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:63:63:48:48:38:10:5:58:38:10:5:58 chr4 154644537 . T C 265.91 PASS AO=59;DP=114;FAO=59;FDP=114;FR=.;FRO=55;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=26;FSRR=29;FWDB=-0.00449622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2715;QD=9.33019;RBI=0.00453826;REFB=-0.0102156;REVB=-0.000616288;RO=55;SAF=28;SAR=31;SRF=26;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00162389;STB=0.500894;TYPE=snp;VARB=0.00825013;OID=.;OPOS=154644537;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:55:55:59:59:31:28:26:29:31:28:26:29 chr4 154709856 . A C 388.07 PASS AO=34;DP=34;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00101611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.084;QD=38.8067;RBI=0.040075;REFB=0;REVB=0.0400621;RO=0;SAF=8;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.81837e-05;OID=.;OPOS=154709856;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:34:40:0:0:34:40:26:8:0:0:32:8:0:0 chr4 155156207 . G A 1228.95 PASS AO=128;DP=129;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0036694;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.019;QD=38.4048;RBI=0.013987;REFB=0;REVB=0.0134971;RO=0;SAF=76;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.32173e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.53728e-05;OID=.;OPOS=155156207;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:129:128:0:0:128:128:52:76:0:0:52:76:0:0 chr4 155241572 . G A 2949.06 PASS AO=306;DP=306;FAO=307;FDP=307;FR=.;FRO=0;FSAF=160;FSAR=147;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.335;QD=38.4242;RBI=0.0271905;REFB=0;REVB=0.0244564;RO=0;SAF=160;SAR=146;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6382e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.17792e-05;OID=.;OPOS=155241572;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:306:307:0:0:306:307:146:160:0:0:147:160:0:0 chr4 155243573 . C T 2015.27 PASS AO=208;DP=208;FAO=209;FDP=209;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0680871;FXX=0.00476168;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.4808;QD=38.5698;RBI=0.0685473;REFB=0;REVB=-0.00793036;RO=0;SAF=95;SAR=113;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.84408e-05;OID=.;OPOS=155243573;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:208:209:0:0:208:209:113:95:0:0:113:96:0:0 chr4 155243604 . T C 1598.71 PASS AO=169;DP=171;FAO=171;FDP=171;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147042;FXX=0.01156;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.381;QD=37.3967;RBI=0.0147047;REFB=0.0219151;REVB=0.000127529;RO=2;SAF=62;SAR=107;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00318681;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000231347;OID=.;OPOS=155243604;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:171:171:2:0:169:171:107:62:1:1:107:64:0:0 chr4 155244401 . TTTTG T 127.4 PASS AO=29;DP=81;FAO=39;FDP=73;FR=.;FRO=34;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.0207633;FXX=0.0987532;HRUN=4;LEN=4;MLLD=212.475;QD=6.98103;RBI=0.0226652;REFB=0.016987;REVB=-0.00908818;RO=0;SAF=16;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0.318807;SSSB=0;STB=0.517961;TYPE=del;VARB=-0.0135746;OID=.;OPOS=155244402;OREF=TTTG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:29:55:39:73:34:21:18:17:17:91:0:16:13:0:0 chr4 155244475 . G T 615.95 PASS AO=64;DP=64;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00830758;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.36;QD=37.9049;RBI=0.0122218;REFB=0;REVB=-0.00896421;RO=0;SAF=30;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.2183e-05;OID=.;OPOS=155244475;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:64:65:0:0:64:65:34:30:0:0:34:31:0:0 chr4 155254540 . G C 111.42 PASS AO=27;DP=59;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.0336024;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.8486;QD=7.42775;RBI=0.0338481;REFB=-0.0198992;REVB=-0.00407111;RO=32;SAF=8;SAR=19;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.239563;STB=0.629039;TYPE=snp;VARB=0.0354974;OID=.;OPOS=155254540;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:60:32:33:27:27:19:8:17:15:19:8:17:16 chr4 155256177 . A G 1018.82 PASS AO=105;DP=106;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0383507;FXX=0.0272702;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.5;QD=38.0868;RBI=0.0430922;REFB=-0.113339;REVB=0.0196509;RO=1;SAF=30;SAR=75;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00628634;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0003281;OID=.;OPOS=155256177;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:106:107:1:0:105:107:75:30:0:1:77:30:0:0 chr4 155256205 . G A 783.12 PASS AO=72;DP=76;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0678718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.8999;QD=36.4241;RBI=0.116381;REFB=0;REVB=0.0945413;RO=0;SAF=27;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.27032e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00138546;OID=.;OPOS=155256205;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:76:86:0:0:72:86:45:27:0:0:58:28:0:0 chr4 155407680 . A G 615.61 PASS AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.100131;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=52.2568;QD=37.8834;RBI=0.100956;REFB=0;REVB=0.0128803;RO=0;SAF=17;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.33797e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000564517;OID=.;OPOS=155407680;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:65:65:0:0:65:65:48:17:0:0:48:17:0:0 chr4 155410822 . G A 949.55 PASS AO=103;DP=105;FAO=103;FDP=105;FR=.;FRO=2;FSAF=68;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0370412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.1373;QD=36.1732;RBI=0.0562833;REFB=-0.0923815;REVB=0.0423764;RO=0;SAF=68;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.39991e-08;STB=0.513886;TYPE=snp;VARB=0.00107679;OID=.;OPOS=155410822;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:105:105:0:2:103:103:35:68:0:0:35:68:0:2 chr4 155411065 . T C 757.55 PASS AO=80;DP=82;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0116907;FXX=0.0243873;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.3596;QD=37.8775;RBI=0.0127983;REFB=0;REVB=-0.00520802;RO=0;SAF=20;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.16687e-05;OID=.;OPOS=155411065;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:82:80:0:0:80:80:60:20:0:0:60:20:0:0 chr4 155411104 . A C 1074.46 PASS AO=113;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0196857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.6522;QD=38.0339;RBI=0.0204984;REFB=0;REVB=-0.00571469;RO=0;SAF=41;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.55408e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000105726;OID=.;OPOS=155411104;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:113:113:0:0:113:113:72:41:0:0:72:41:0:0 chr4 155411883 . G A 216.98 PASS AO=46;DP=86;FAO=46;FDP=86;FR=.;FRO=40;FSAF=30;FSAR=16;FSRF=28;FSRR=12;FWDB=0.0330643;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.3272;QD=10.0923;RBI=0.055769;REFB=-0.0396566;REVB=0.0449102;RO=40;SAF=30;SAR=16;SRF=28;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0452163;STB=0.524876;TYPE=snp;VARB=0.0573694;OID=.;OPOS=155411883;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:40:40:46:46:16:30:28:12:16:30:28:12 chr4 155507590 . T C 63.79 PASS AO=19;DP=53;FAO=20;FDP=56;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=29;FWDB=0.0043477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.5344;QD=4.55654;RBI=0.0720906;REFB=-0.0234228;REVB=-0.0719594;RO=33;SAF=11;SAR=8;SRF=6;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.41964;STB=0.74476;TYPE=snp;VARB=0.0444053;OID=.;OPOS=155507590;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:53:56:33:36:19:20:8:11:6:27:8:12:7:29 chr4 156135676 . C T 377.25 PASS AO=83;DP=153;FAO=85;FDP=165;FR=.;FRO=80;FSAF=49;FSAR=36;FSRF=41;FSRR=39;FWDB=0.00933919;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.765;QD=9.14549;RBI=0.0659674;REFB=-0.0565058;REVB=0.065303;RO=69;SAF=48;SAR=35;SRF=30;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119672;STB=0.531446;TYPE=snp;VARB=0.0645299;OID=.;OPOS=156135676;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:165:69:80:83:85:35:48:30:39:36:49:41:39 chr4 156136027 . C T 238.67 PASS AO=65;DP=156;FAO=67;FDP=158;FR=.;FRO=91;FSAF=16;FSAR=51;FSRF=39;FSRR=52;FWDB=0.00839978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.922;QD=6.04235;RBI=0.0502749;REFB=-0.00898669;REVB=0.0495683;RO=91;SAF=15;SAR=50;SRF=39;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24434;STB=0.629871;TYPE=snp;VARB=0.0176246;OID=.;OPOS=156136027;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:158:91:91:65:67:50:15:39:52:51:16:39:52 chr4 156632391 . A G 1301.35 PASS AO=146;DP=152;FAO=146;FDP=152;FR=.;FRO=6;FSAF=57;FSAR=89;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.00339981;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=270.551;QD=34.2462;RBI=0.00357562;REFB=-0.16335;REVB=0.00110742;RO=4;SAF=57;SAR=89;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0190568;STB=0.518217;TYPE=snp;VARB=0.000305738;OID=.;OPOS=156632391;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:152:152:4:6:146:146:89:57:3:1:89:57:5:1 chr4 156706412 . C T 205.28 PASS AO=47;DP=94;FAO=47;FDP=94;FR=.;FRO=47;FSAF=13;FSAR=34;FSRF=12;FSRR=35;FWDB=-0.06555;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.8608;QD=8.73536;RBI=0.0684616;REFB=-0.0216383;REVB=-0.0197532;RO=44;SAF=13;SAR=34;SRF=9;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.082319;STB=0.513446;TYPE=snp;VARB=0.0350698;OID=.;OPOS=156706412;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:44:47:47:47:34:13:9:35:34:13:12:35 chr4 156706482 . G A 1081.44 PASS AO=113;DP=116;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0290615;FXX=0.0258598;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.186;QD=38.2812;RBI=0.0290618;REFB=0;REVB=-0.000145183;RO=0;SAF=26;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000394792;OID=.;OPOS=156706482;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:116:113:0:0:113:113:87:26:0:0:87:26:0:0 chr4 156787340 . G A 1092.88 PASS AO=114;DP=121;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0259333;FXX=0.0495827;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.93;QD=38.0133;RBI=0.0260591;REFB=0;REVB=0.0025574;RO=0;SAF=20;SAR=94;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000229262;OID=.;OPOS=156787340;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:121:115:0:0:114:115:94:20:0:0:94:21:0:0 chr4 156832715 . A C 194.51 PASS AO=48;DP=103;FAO=48;FDP=103;FR=.;FRO=55;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=21;FSRR=34;FWDB=-0.0374003;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=233.924;QD=7.55394;RBI=0.0381724;REFB=0.012071;REVB=0.00763894;RO=55;SAF=19;SAR=29;SRF=21;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140908;STB=0.507846;TYPE=snp;VARB=-0.0152805;OID=.;OPOS=156832715;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:55:55:48:48:29:19:21:34:29:19:21:34 chr4 156847230 . A G 791.64 PASS AO=93;DP=100;FAO=94;FDP=100;FR=.;FRO=6;FSAF=48;FSAR=46;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.0232923;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=41.1439;QD=31.6655;RBI=0.0547676;REFB=-0.00715101;REVB=-0.0495677;RO=7;SAF=47;SAR=46;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.010167;STB=0.510636;TYPE=snp;VARB=-0.000527037;OID=.;OPOS=156847230;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:100:100:7:6:93:94:46:47:3:4:46:48:2:4 chr4 156847237 . AG A,AA 817.4 PASS AO=63,18;DP=87;FAO=83,10;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=42,4;FSAR=41,6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.102121,0.0501254;FXX=0.0210504;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=20.7094,15.9814;QD=35.1571;RBI=0.184294,0.0552315;REFB=0,0;REVB=-0.153413,-0.023194;RO=0;SAF=32,7;SAR=31,11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.00916825,0.00455825;OID=.,.;OPOS=156847238,156847238;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:63,18:85:83,10:93:0:42,4:41,6:0:0:6:0:32,7:31,11:0:0 chr4 157563398 . C A 105.58 PASS AO=27;DP=64;FAO=27;FDP=62;FR=.;FRO=35;FSAF=24;FSAR=3;FSRF=28;FSRR=7;FWDB=-0.014846;FXX=0.0461467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.4624;QD=6.81154;RBI=0.0224054;REFB=-0.0283058;REVB=0.0167808;RO=34;SAF=24;SAR=3;SRF=27;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192145;STB=0.605971;TYPE=snp;VARB=0.0164582;OID=.;OPOS=157563398;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:62:34:35:27:27:3:24:27:7:3:24:28:7 chr4 158043559 . C T 452.86 PASS AO=114;DP=243;FAO=114;FDP=242;FR=.;FRO=128;FSAF=40;FSAR=74;FSRF=56;FSRR=72;FWDB=0.0238575;FXX=0.00411506;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.6978;QD=7.48524;RBI=0.0274698;REFB=-0.00673623;REVB=-0.0136167;RO=126;SAF=40;SAR=74;SRF=55;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0867638;STB=0.548817;TYPE=snp;VARB=0.011119;OID=.;OPOS=158043559;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:243:242:126:128:114:114:74:40:55:71:74:40:56:72 chr4 158065038 . T C 1285.32 PASS AO=76;DP=134;FAO=131;FDP=134;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=69;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.171776;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.943;QD=38.3677;RBI=0.171984;REFB=0;REVB=-0.00844783;RO=0;SAF=14;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.99345e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00113591;OID=.;OPOS=158065038;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:129:134:0:0:76:131:62:14:0:0:62:69:0:0 chr4 158238830 . T C 607.77 PASS AO=305;DP=678;FAO=172;FDP=398;FR=.;FRO=226;FSAF=87;FSAR=85;FSRF=89;FSRR=137;FWDB=0.0369559;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.739;QD=6.10825;RBI=0.0369589;REFB=-0.0120751;REVB=-0.00047127;RO=370;SAF=149;SAR=156;SRF=135;SRR=235;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123573;STB=0.56351;TYPE=snp;VARB=0.0173336;OID=.;OPOS=158238830;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:678:398:370:226:305:172:156:149:135:235:85:87:89:137 chr4 159076826 . C T 2329.06 PASS AO=246;DP=248;FAO=246;FDP=246;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=150;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000569882;FXX=0.00806419;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.743;QD=37.8708;RBI=0.0175589;REFB=-0.0131256;REVB=0.0175497;RO=2;SAF=96;SAR=150;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00631265;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.21212e-06;OID=.;OPOS=159076826;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:248:246:2:0:246:246:150:96:0:2:150:96:0:0 chr4 159092633 . A G 2085.13 PASS AO=216;DP=218;FAO=218;FDP=218;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130506;FXX=0.0090905;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.6152;QD=38.2592;RBI=0.0369867;REFB=0;REVB=-0.0346078;RO=1;SAF=104;SAR=112;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00455914;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.56677e-05;OID=.;OPOS=159092633;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:97:218:218:1:0:216:218:112:104:1:0:113:105:0:0 chr4 159601676 . C T 1242.06 PASS AO=128;DP=128;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.447;QD=38.5134;RBI=0.0112861;REFB=0;REVB=0.00336013;RO=0;SAF=87;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.89613e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.50951e-05;OID=.;OPOS=159601676;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:128:129:0:0:128:129:41:87:0:0:41:88:0:0 chr4 159789441 . C A 405.65 PASS AO=97;DP=234;FAO=114;FDP=255;FR=.;FRO=141;FSAF=59;FSAR=55;FSRF=69;FSRR=72;FWDB=-0.0199944;FXX=0.0154434;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.9339;QD=6.3631;RBI=0.0202227;REFB=-0.0351096;REVB=0.00302995;RO=133;SAF=59;SAR=38;SRF=68;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102663;STB=0.515583;TYPE=snp;VARB=0.029923;OID=.;OPOS=159789441;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:234:255:133:141:97:114:38:59:68:65:55:59:69:72 chr4 159826773 . T G 675.42 PASS AO=77;DP=81;FAO=77;FDP=81;FR=.;FRO=4;FSAF=43;FSAR=34;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0303159;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=300.454;QD=33.3538;RBI=0.0361854;REFB=-0.146738;REVB=0.0197568;RO=4;SAF=43;SAR=34;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00552546;STB=0.502923;TYPE=snp;VARB=0.000482012;OID=.;OPOS=159826773;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:81:81:4:4:77:77:34:43:2:2:34:43:2:2 chr4 159881479 . T C 86.44 PASS AO=29;DP=83;FAO=29;FDP=83;FR=.;FRO=54;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=39;FWDB=-0.027925;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.0263;QD=4.16598;RBI=0.0324916;REFB=0.00324069;REVB=-0.0166102;RO=54;SAF=10;SAR=19;SRF=15;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0864144;STB=0.54973;TYPE=snp;VARB=-0.00925074;OID=.;OPOS=159881479;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:83:83:54:54:29:29:19:10:15:39:19:10:15:39 chr4 159894250 . C T 1630.51 PASS AO=178;DP=183;FAO=179;FDP=183;FR=.;FRO=4;FSAF=113;FSAR=66;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.00108373;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=249.715;QD=35.6395;RBI=0.0189301;REFB=-0.0436804;REVB=0.0188991;RO=4;SAF=112;SAR=66;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.016912;STB=0.508908;TYPE=snp;VARB=0.000124522;OID=.;OPOS=159894250;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:183:183:4:4:178:179:66:112:1:3:66:113:1:3 chr4 159894305 . T C 1998.81 PASS AO=207;DP=208;FAO=213;FDP=213;FR=.;FRO=0;FSAF=132;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00151858;FXX=0.00467268;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.763;QD=37.5363;RBI=0.0247726;REFB=-0.0215419;REVB=0.024726;RO=1;SAF=132;SAR=75;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00630884;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0002919;OID=.;OPOS=159894305;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:87:208:213:1:0:207:213:75:132:0:1:81:132:0:0 chr4 160164899 . TG T 1207.84 PASS AO=152;DP=185;FAO=175;FDP=175;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.331908;FXX=0.0112988;HRUN=2;LEN=1;MLLD=18.6779;QD=27.6078;RBI=0.338694;REFB=0;REVB=0.0674597;RO=19;SAF=65;SAR=87;SRF=15;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0768018;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0046759;OID=.;OPOS=160164900;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:152:177:175:175:0:83:92:0:0:99:19:65:87:15:4 chr4 160277276 . C T 89.57 PASS AO=21;DP=45;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=17;FSRF=5;FSRR=19;FWDB=0.103873;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=43.1801;QD=7.96214;RBI=0.110387;REFB=-0.0224162;REVB=0.0373595;RO=23;SAF=4;SAR=17;SRF=5;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0390389;STB=0.515137;TYPE=snp;VARB=0.0329592;OID=.;OPOS=160277276;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:45:45:23:24:21:21:17:4:5:18:17:4:5:19 chr4 164272418 . AG A 596.8 PASS AO=72;DP=116;FAO=111;FDP=112;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=65;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.122721;FXX=0.00884877;HRUN=4;LEN=1;MLLD=10.8463;QD=21.3142;RBI=0.236088;REFB=0.0686802;REVB=0.201686;RO=15;SAF=31;SAR=41;SRF=1;SRR=14;SSEN=0.464286;SSEP=0;SSSB=0.122439;STB=0.505375;TYPE=del;VARB=0.0012263;OID=.;OPOS=164272419;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:72:112:111:112:1:46:65:1:0:49:15:31:41:1:14 chr4 164393117 . T A 130.83 PASS AO=38;DP=100;FAO=39;FDP=100;FR=.;FRO=61;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=22;FSRR=39;FWDB=-0.0251313;FXX=0.00990001;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.4279;QD=5.23304;RBI=0.0337381;REFB=-0.00948927;REVB=0.0225096;RO=61;SAF=13;SAR=25;SRF=22;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0220812;STB=0.518509;TYPE=snp;VARB=0.0147271;OID=.;OPOS=164393117;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:61:61:38:39:25:13:22:39:26:13:22:39 chr4 165118652 . C T 188.41 PASS AO=50;DP=134;FAO=57;FDP=137;FR=.;FRO=80;FSAF=50;FSAR=7;FSRF=69;FSRR=11;FWDB=-0.00758661;FXX=0.021427;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.169;QD=5.501;RBI=0.0155735;REFB=-0.0274984;REVB=-0.0136006;RO=80;SAF=43;SAR=7;SRF=69;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00566078;STB=0.519324;TYPE=snp;VARB=0.0381258;OID=.;OPOS=165118652;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:137:80:80:50:57:7:43:69:11:7:50:69:11 chr4 165118796 . G A 269.23 PASS AO=62;DP=121;FAO=62;FDP=124;FR=.;FRO=62;FSAF=37;FSAR=25;FSRF=39;FSRR=23;FWDB=0.0132959;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=135.958;QD=8.68477;RBI=0.0756173;REFB=-0.0173474;REVB=0.0744392;RO=58;SAF=37;SAR=25;SRF=38;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0539483;STB=0.516861;TYPE=snp;VARB=0.0163944;OID=.;OPOS=165118796;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:124:58:62:62:62:25:37:38:20:25:37:39:23 chr4 165878609 . T A 159.83 PASS AO=44;DP=104;FAO=44;FDP=104;FR=.;FRO=60;FSAF=33;FSAR=11;FSRF=42;FSRR=18;FWDB=-0.0691077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.453;QD=6.14736;RBI=0.0694093;REFB=-0.00413083;REVB=-0.00646341;RO=59;SAF=33;SAR=11;SRF=42;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0501768;STB=0.53702;TYPE=snp;VARB=0.00599553;OID=.;OPOS=165878609;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:59:60:44:44:11:33:42:17:11:33:42:18 chr4 165879007 . G A 119.08 PASS AO=24;DP=44;FAO=24;FDP=44;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=5;FWDB=-0.000164866;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=160.727;QD=10.8258;RBI=0.00613267;REFB=-0.0132795;REVB=-0.00613045;RO=20;SAF=12;SAR=12;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204678;STB=0.613546;TYPE=snp;VARB=0.011552;OID=.;OPOS=165879007;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:44:44:20:20:24:24:12:12:15:5:12:12:15:5 chr4 165879381 . T C 178.62 PASS AO=44;DP=96;FAO=45;FDP=99;FR=.;FRO=54;FSAF=30;FSAR=15;FSRF=31;FSRR=23;FWDB=0.00445664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.4739;QD=7.21684;RBI=0.00734436;REFB=6.0913e-05;REVB=0.00583764;RO=52;SAF=30;SAR=14;SRF=31;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0918391;STB=0.55472;TYPE=snp;VARB=1.51255e-05;OID=.;OPOS=165879381;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:99:52:54:44:45:14:30:31:21:15:30:31:23 chr4 165961240 . GC G 62.64 PASS AO=47;DP=129;FAO=47;FDP=123;FR=.;FRO=76;FSAF=8;FSAR=39;FSRF=29;FSRR=47;FWDB=-0.0344736;FXX=0.00806387;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.5706;QD=2.03696;RBI=0.263278;REFB=-0.0595918;REVB=-0.261011;RO=65;SAF=6;SAR=41;SRF=27;SRR=38;SSEN=0.570681;SSEP=0;SSSB=-0.418201;STB=0.677061;TYPE=del;VARB=0.0803158;OID=.;OPOS=165961241;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:47:124:47:123:76:8:39:29:47:62:65:6:41:27:38 chr4 166000195 . A G 831.07 PASS AO=75;DP=76;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0488507;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.641;QD=38.21;RBI=0.0517468;REFB=0;REVB=-0.0170687;RO=0;SAF=38;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000389701;OID=.;OPOS=166000195;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:76:87:0:0:75:87:37:38:0:0:47:40:0:0 chr4 166000263 . C T 359.89 PASS AO=80;DP=150;FAO=80;FDP=153;FR=.;FRO=73;FSAF=27;FSAR=53;FSRF=30;FSRR=43;FWDB=-0.000106951;FXX=0.00649309;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.6131;QD=9.40897;RBI=0.0920001;REFB=-0.0304211;REVB=-0.0920001;RO=70;SAF=27;SAR=53;SRF=30;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0839973;STB=0.538205;TYPE=snp;VARB=0.0274004;OID=.;OPOS=166000263;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:153:70:73:80:80:53:27:30:40:53:27:30:43 chr4 166021811 . G C 249.23 PASS AO=84;DP=226;FAO=84;FDP=226;FR=.;FRO=142;FSAF=49;FSAR=35;FSRF=75;FSRR=67;FWDB=-0.0102882;FXX=0.00440509;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.0181;QD=4.41112;RBI=0.0387019;REFB=-0.0186871;REVB=-0.0373094;RO=142;SAF=49;SAR=35;SRF=75;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0621953;STB=0.535224;TYPE=snp;VARB=0.0255231;OID=.;OPOS=166021811;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:226:226:142:142:84:84:35:49:75:67:35:49:75:67 chr4 166173788 . G A 469.13 PASS AO=100;DP=184;FAO=100;FDP=184;FR=.;FRO=84;FSAF=48;FSAR=52;FSRF=50;FSRR=34;FWDB=0.0345439;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.572;QD=10.1984;RBI=0.0385917;REFB=-0.0240911;REVB=0.0172059;RO=83;SAF=48;SAR=52;SRF=49;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0915545;STB=0.552461;TYPE=snp;VARB=0.0177228;OID=.;OPOS=166173788;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:184:83:84:100:100:52:48:49:34:52:48:50:34 chr4 166199345 . C T 490.37 PASS AO=138;DP=315;FAO=135;FDP=307;FR=.;FRO=172;FSAF=57;FSAR=78;FSRF=102;FSRR=70;FWDB=0.00593195;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5307;QD=6.38918;RBI=0.0400303;REFB=0.00278946;REVB=0.0395883;RO=177;SAF=62;SAR=76;SRF=107;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156256;STB=0.595149;TYPE=snp;VARB=-0.00330234;OID=.;OPOS=166199345;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:315:307:177:172:138:135:76:62:107:70:78:57:102:70 chr4 166231868 . A G 485.29 PASS AO=145;DP=356;FAO=147;FDP=358;FR=.;FRO=211;FSAF=72;FSAR=75;FSRF=77;FSRR=134;FWDB=0.0019915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.41;QD=5.42224;RBI=0.0159757;REFB=-0.0173376;REVB=-0.0158511;RO=208;SAF=71;SAR=74;SRF=76;SRR=132;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131981;STB=0.573838;TYPE=snp;VARB=0.0256247;OID=.;OPOS=166231868;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:356:358:208:211:145:147:74:71:76:132:75:72:77:134 chr4 166264119 . A G 575.14 PASS AO=139;DP=287;FAO=140;FDP=288;FR=.;FRO=148;FSAF=89;FSAR=51;FSRF=105;FSRR=43;FWDB=0.0119443;FXX=0.00346009;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.002;QD=7.9881;RBI=0.0119707;REFB=-0.00998092;REVB=0.00079408;RO=146;SAF=88;SAR=51;SRF=104;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0816153;STB=0.541834;TYPE=snp;VARB=0.00894257;OID=.;OPOS=166264119;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:287:288:146:148:139:140:51:88:104:42:51:89:105:43 chr4 167012381 . G A 3229.02 PASS AO=336;DP=337;FAO=336;FDP=336;FR=.;FRO=0;FSAF=144;FSAR=192;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0324839;FXX=0.00296727;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.4805;QD=38.4407;RBI=0.0379459;REFB=0;REVB=0.0196136;RO=0;SAF=144;SAR=192;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.10697e-05;OID=.;OPOS=167012381;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:337:336:0:0:336:336:192:144:0:0:192:144:0:0 chr4 167012480 . T C 2086.58 PASS AO=226;DP=232;FAO=228;FDP=228;FR=.;FRO=0;FSAF=112;FSAR=116;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0949944;FXX=0.029786;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.671;QD=36.6067;RBI=0.100321;REFB=-0.0526811;REVB=0.0322541;RO=4;SAF=111;SAR=115;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00857691;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000373485;OID=.;OPOS=167012480;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:232:228:4:0:226:228:115:111:3:1:116:112:0:0 chr4 167020644 . A G 418.83 PASS AO=108;DP=234;FAO=108;FDP=234;FR=.;FRO=126;FSAF=36;FSAR=72;FSRF=34;FSRR=92;FWDB=0.00263785;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.179;QD=7.15944;RBI=0.00651345;REFB=-0.0142218;REVB=-0.00595539;RO=126;SAF=36;SAR=72;SRF=34;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0715937;STB=0.539467;TYPE=snp;VARB=0.0174732;OID=.;OPOS=167020644;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:234:234:126:126:108:108:72:36:34:92:72:36:34:92 chr4 167023255 . A G 264.68 PASS AO=83;DP=210;FAO=82;FDP=209;FR=.;FRO=127;FSAF=38;FSAR=44;FSRF=53;FSRR=74;FWDB=0.0116695;FXX=0.00947822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3285;QD=5.06571;RBI=0.0211798;REFB=-0.00716131;REVB=-0.017675;RO=122;SAF=39;SAR=44;SRF=50;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0642634;STB=0.528268;TYPE=snp;VARB=0.00788861;OID=.;OPOS=167023255;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:210:209:122:127:83:82:44:39:50:72:44:38:53:74 chr4 167654960 . C G 302.37 PASS AO=62;DP=115;FAO=63;FDP=114;FR=.;FRO=51;FSAF=51;FSAR=12;FSRF=43;FSRR=8;FWDB=-0.0043013;FXX=0.0172399;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.306;QD=10.6096;RBI=0.0290666;REFB=-0.019746;REVB=0.0287466;RO=51;SAF=51;SAR=11;SRF=43;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0296658;STB=0.525132;TYPE=snp;VARB=0.0189996;OID=.;OPOS=167654960;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:114:51:51:62:63:11:51:43:8:12:51:43:8 chr4 168584259 . T A 70.5 PASS AO=11;DP=16;FAO=11;FDP=16;FR=.;FRO=5;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0248134;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.7784;QD=17.6255;RBI=0.0317963;REFB=-0.0474395;REVB=0.0198822;RO=5;SAF=6;SAR=5;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0801957;STB=0.545372;TYPE=snp;VARB=0.0211619;OID=.;OPOS=168584259;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:16:16:5:5:11:11:5:6:2:3:5:6:2:3 chr4 169048942 . A G 205.3 PASS AO=58;DP=141;FAO=58;FDP=139;FR=.;FRO=81;FSAF=36;FSAR=22;FSRF=50;FSRR=31;FWDB=0.0515033;FXX=0.0141834;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.6049;QD=5.908;RBI=0.051725;REFB=-0.0180922;REVB=0.00478315;RO=80;SAF=36;SAR=22;SRF=50;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00473552;STB=0.502105;TYPE=snp;VARB=0.0246987;OID=.;OPOS=169048942;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:139:80:81:58:58:22:36:50:30:22:36:50:31 chr4 169083694 . A C 213.39 PASS AO=60;DP=149;FAO=61;FDP=146;FR=.;FRO=85;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=48;FSRR=37;FWDB=-0.00200741;FXX=0.0201329;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.299;QD=5.84637;RBI=0.00520459;REFB=-0.00529533;REVB=0.00480188;RO=84;SAF=33;SAR=27;SRF=47;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0100094;STB=0.513932;TYPE=snp;VARB=0.00975999;OID=.;OPOS=169083694;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:146:84:85:60:61:27:33:47:37:28:33:48:37 chr4 169086441 . A G 127.97 PASS AO=31;DP=67;FAO=31;FDP=67;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.0309758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.122;QD=7.64022;RBI=0.0386246;REFB=-0.0222941;REVB=-0.0230729;RO=32;SAF=17;SAR=14;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100596;STB=0.526095;TYPE=snp;VARB=0.0300536;OID=.;OPOS=169086441;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:32:36:31:31:14:17:14:18:14:17:18:18 chr4 169282355 . T C 346.64 PASS AO=85;DP=178;FAO=85;FDP=178;FR=.;FRO=93;FSAF=37;FSAR=48;FSRF=33;FSRR=60;FWDB=0.00364892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.202;QD=7.78956;RBI=0.00432406;REFB=-0.00165065;REVB=0.00232011;RO=91;SAF=37;SAR=48;SRF=33;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0700266;STB=0.54322;TYPE=snp;VARB=0.00222853;OID=.;OPOS=169282355;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:178:91:93:85:85:48:37:33:58:48:37:33:60 chr4 169315760 . C A 1313.46 PASS AO=137;DP=137;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=112;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0208382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.0142;QD=38.3491;RBI=0.021625;REFB=0;REVB=0.00578019;RO=0;SAF=25;SAR=112;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.2007e-05;OID=.;OPOS=169315760;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:137:137:0:0:137:137:112:25:0:0:112:25:0:0 chr4 169336662 . T C 711.42 PASS AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287835;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.995;QD=37.9426;RBI=0.0349988;REFB=0;REVB=-0.0199104;RO=0;SAF=29;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.89405e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.36294e-05;OID=.;OPOS=169336662;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:75:75:0:0:75:75:46:29:0:0:46:29:0:0 chr4 169341435 . A G 3193.83 PASS AO=338;DP=342;FAO=339;FDP=339;FR=.;FRO=0;FSAF=173;FSAR=166;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0310624;FXX=0.0145345;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.934;QD=37.6853;RBI=0.0528828;REFB=-0.0498819;REVB=-0.0427986;RO=3;SAF=173;SAR=165;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00260048;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00015836;OID=.;OPOS=169341435;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:342:339:3:0:338:339:165:173:2:1:166:173:0:0 chr4 169362557 . C G 1154.42 PASS AO=120;DP=121;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=112;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0408616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.7881;QD=37.2394;RBI=0.0418281;REFB=-0.0512864;REVB=0.00893945;RO=0;SAF=10;SAR=110;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00101436;OID=.;OPOS=169362557;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:121:124:0:0:120:124:110:10:0:0:112:12:0:0 chr4 169369820 . T A 1012.6 PASS AO=106;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00200215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.887;QD=38.2113;RBI=0.0697798;REFB=0;REVB=0.0697511;RO=0;SAF=54;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000170496;OID=.;OPOS=169369820;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:106:106:0:0:106:106:52:54:0:0:52:54:0:0 chr4 169369853 . A T 1037.04 PASS AO=108;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0502297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.867;QD=38.4089;RBI=0.0565828;REFB=0;REVB=0.0260498;RO=0;SAF=57;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60583e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000171948;OID=.;OPOS=169369853;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:108:108:0:0:108:108:51:57:0:0:51:57:0:0 chr4 169369920 . C T 664.49 PASS AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0186696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.048;QD=38.5214;RBI=0.018827;REFB=0;REVB=0.00242876;RO=0;SAF=35;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.95086e-05;OID=.;OPOS=169369920;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:69:69:0:0:69:69:34:35:0:0:34:35:0:0 chr4 169393595 . A G 1191.73 PASS AO=126;DP=127;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0472244;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.7606;QD=37.8326;RBI=0.0505609;REFB=-0.088391;REVB=0.0180628;RO=1;SAF=44;SAR=82;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.010676;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00182254;OID=.;OPOS=169393595;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:127:126:1:0:126:126:82:44:1:0:82:44:0:0 chr4 169835134 . A G 429.71 PASS AO=123;DP=291;FAO=124;FDP=292;FR=.;FRO=168;FSAF=50;FSAR=74;FSRF=95;FSRR=73;FWDB=0.0430898;FXX=0.00341285;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.1601;QD=5.88643;RBI=0.0473133;REFB=0.0209853;REVB=-0.0195403;RO=168;SAF=49;SAR=74;SRF=95;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173493;STB=0.593458;TYPE=snp;VARB=-0.0278069;OID=.;OPOS=169835134;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:291:292:168:168:123:124:74:49:95:73:74:50:95:73 chr4 170077789 . A G 515.52 PASS AO=110;DP=205;FAO=111;FDP=206;FR=.;FRO=95;FSAF=48;FSAR=63;FSRF=48;FSRR=47;FWDB=-0.0423287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.518;QD=10.01;RBI=0.0455458;REFB=-0.0154178;REVB=-0.0168137;RO=95;SAF=48;SAR=62;SRF=48;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0589251;STB=0.533892;TYPE=snp;VARB=0.0135934;OID=.;OPOS=170077789;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:206:95:95:110:111:62:48:48:47:63:48:48:47 chr4 170428901 . C T 182.2 PASS AO=43;DP=90;FAO=43;FDP=90;FR=.;FRO=47;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=0.00376131;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.253;QD=8.09753;RBI=0.0121065;REFB=-0.000971728;REVB=-0.0115074;RO=47;SAF=21;SAR=22;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000928348;STB=0.500517;TYPE=snp;VARB=0.00101996;OID=.;OPOS=170428901;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:47:47:43:43:22:21:23:24:22:21:23:24 chr4 170581570 . G A 1801 PASS AO=183;DP=186;FAO=187;FDP=187;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00746443;FXX=0.0105815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.145;QD=38.524;RBI=0.0151415;REFB=0;REVB=-0.0131737;RO=0;SAF=73;SAR=110;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.26576e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000249578;OID=.;OPOS=170581570;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:186:187:0:0:183:187:110:73:0:0:110:77:0:0 chr4 170663235 . C T 856.06 PASS AO=91;DP=91;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153017;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.438;QD=37.2198;RBI=0.0188208;REFB=0.0625391;REVB=0.0109582;RO=0;SAF=19;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.97497e-05;OID=.;OPOS=170663235;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:91:92:0:0:91:92:72:19:0:0:72:20:0:0 chr4 170678993 . T C 12.63 PASS AO=4;DP=19;FAO=4;FDP=18;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=13;FSRR=1;FWDB=-0.0125835;FXX=0.0526039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=313.398;QD=2.8067;RBI=0.0164792;REFB=0.00100984;REVB=0.0106405;RO=15;SAF=3;SAR=1;SRF=14;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.382061;STB=0.726532;TYPE=snp;VARB=-0.00519823;OID=.;OPOS=170678993;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:19:18:15:14:4:4:1:3:14:1:1:3:13:1 chr4 170982112 . C T 72.35 PASS AO=21;DP=55;FAO=21;FDP=55;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=-0.0218975;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.2668;QD=5.2621;RBI=0.0549967;REFB=-0.00473898;REVB=-0.0504494;RO=33;SAF=10;SAR=11;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120585;STB=0.576852;TYPE=snp;VARB=0.00563521;OID=.;OPOS=170982112;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:55:55:33:34:21:21:11:10:12:21:11:10:12:22 chr4 172735897 . C G 1635.23 PASS AO=164;DP=169;FAO=172;FDP=172;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00435558;FXX=0.033706;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1312;QD=38.0287;RBI=0.0345016;REFB=0;REVB=-0.0342256;RO=0;SAF=86;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.29459e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000842861;OID=.;OPOS=172735897;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:169:172:0:0:164:172:78:86:0:0:86:86:0:0 chr4 173232805 . G A 151.66 PASS AO=44;DP=109;FAO=44;FDP=109;FR=.;FRO=65;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=35;FSRR=30;FWDB=-0.0283207;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.4013;QD=5.5655;RBI=0.02898;REFB=0.00185753;REVB=0.00614639;RO=65;SAF=22;SAR=22;SRF=35;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0405655;STB=0.522925;TYPE=snp;VARB=-0.00391328;OID=.;OPOS=173232805;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:65:65:44:44:22:22:35:30:22:22:35:30 chr4 173961786 . G GT 26.02 PASS AO=37;DP=182;FAO=43;FDP=146;FR=.;FRO=103;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=38;FSRR=65;FWDB=0.201783;FXX=0.0580608;HRUN=8;LEN=1;MLLD=5.93615;QD=0.712852;RBI=0.212445;REFB=-0.0956813;REVB=-0.0664554;RO=127;SAF=16;SAR=21;SRF=50;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0504648;STB=0.519642;TYPE=ins;VARB=0.0860095;OID=.;OPOS=173961787;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:37:182:43:146:103:17:26:38:65:26:127:16:21:50:77 chr4 174062875 . A G 292.03 PASS AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0924332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.0322;QD=38.9373;RBI=0.101121;REFB=0;REVB=-0.0410058;RO=0;SAF=2;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.56306e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00101915;OID=.;OPOS=174062875;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:30:30:0:0:30:30:28:2:0:0:28:2:0:0 chr4 174090004 . G A 33.2 PASS AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.0381036;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=113.464;QD=8.29942;RBI=0.0715354;REFB=0.00227183;REVB=0.0605428;RO=9;SAF=4;SAR=3;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206013;STB=0.622323;TYPE=snp;VARB=0.00106395;OID=.;OPOS=174090004;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:16:16:9:9:7:7:3:4:7:2:3:4:7:2 chr4 174189370 . C CT 20.44 PASS AO=8;DP=21;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.0261049;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=14.5481;QD=4.5414;RBI=0.0492437;REFB=-0.104764;REVB=0.0417549;RO=13;SAF=2;SAR=6;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.44244;STB=0.705344;TYPE=ins;VARB=0.109775;OID=.;OPOS=174189371;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:8:21:8:18:10:2:6:6:4:20:13:2:6:9:4 chr4 175225452 . G A 489.77 PASS AO=109;DP=209;FAO=109;FDP=209;FR=.;FRO=100;FSAF=52;FSAR=57;FSRF=47;FSRR=53;FWDB=-0.000604926;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=178.369;QD=9.37352;RBI=0.00413688;REFB=-0.00946359;REVB=-0.00409241;RO=100;SAF=52;SAR=57;SRF=47;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0061905;STB=0.503388;TYPE=snp;VARB=0.00710801;OID=.;OPOS=175225452;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:209:100:100:109:109:57:52:47:53:57:52:47:53 chr4 175237408 . T C 1779.36 PASS AO=185;DP=185;FAO=187;FDP=187;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=133;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188914;FXX=0.00531887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.984;QD=38.0612;RBI=0.0233819;REFB=-0.0257454;REVB=0.0137777;RO=0;SAF=52;SAR=133;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.58637e-05;OID=.;OPOS=175237408;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:185:187:0:0:185:187:133:52:0:0:133:54:0:0 chr4 175241128 . A T 166.65 PASS AO=51;DP=139;FAO=53;FDP=140;FR=.;FRO=87;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=55;FSRR=32;FWDB=0.00590817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.611;QD=4.76132;RBI=0.0114707;REFB=-0.0011943;REVB=-0.00983207;RO=86;SAF=26;SAR=25;SRF=54;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131111;STB=0.587713;TYPE=snp;VARB=0.0020403;OID=.;OPOS=175241128;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:140:86:87:51:53:25:26:54:32:27:26:55:32 chr4 175443156 . C T 304.29 PASS AO=63;DP=114;FAO=63;FDP=114;FR=.;FRO=51;FSAF=25;FSAR=38;FSRF=18;FSRR=33;FWDB=0.0167858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.0274;QD=10.6767;RBI=0.0174109;REFB=-0.0100456;REVB=0.00462345;RO=51;SAF=25;SAR=38;SRF=18;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0378004;STB=0.520674;TYPE=snp;VARB=0.00805544;OID=.;OPOS=175443156;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:51:51:63:63:38:25:18:33:38:25:18:33 chr4 175598334 . T C 3198.04 PASS AO=334;DP=335;FAO=335;FDP=335;FR=.;FRO=0;FSAF=133;FSAR=202;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0036494;FXX=0.0029761;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.019;QD=38.1856;RBI=0.0141447;REFB=0;REVB=0.0136658;RO=1;SAF=133;SAR=201;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00357352;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.39781e-05;OID=.;OPOS=175598334;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:335:335:1:0:334:335:201:133:1:0:202:133:0:0 chr4 175688138 . A G 204.35 PASS AO=61;DP=152;FAO=61;FDP=152;FR=.;FRO=91;FSAF=37;FSAR=24;FSRF=47;FSRR=44;FWDB=0.00404454;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=160.486;QD=5.3776;RBI=0.00683047;REFB=-0.0126939;REVB=0.00550428;RO=91;SAF=37;SAR=24;SRF=47;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0977965;STB=0.555145;TYPE=snp;VARB=0.0119312;OID=.;OPOS=175688138;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:152:91:91:61:61:24:37:47:44:24:37:47:44 chr4 175688141 . G A 69.36 PASS AO=63;DP=151;FAO=33;FDP=121;FR=.;FRO=88;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=46;FSRR=42;FWDB=0.0119636;FXX=0.203934;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.057;QD=2.29299;RBI=0.0128821;REFB=-0.0204948;REVB=0.00477716;RO=86;SAF=38;SAR=25;SRF=44;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0962048;STB=0.640363;TYPE=snp;VARB=0.0828195;OID=.;OPOS=175688141;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:151:121:86:88:63:33:25:38:44:42:22:11:46:42 chr4 176555585 . A C 2381.69 PASS AO=252;DP=254;FAO=254;FDP=254;FR=.;FRO=0;FSAF=113;FSAR=141;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201198;FXX=0.00392141;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.549;QD=37.5069;RBI=0.0203432;REFB=-0.060856;REVB=-0.00300659;RO=2;SAF=112;SAR=140;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00843531;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000443232;OID=.;OPOS=176555585;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:254:254:2:0:252:254:140:112:2:0:141:113:0:0 chr4 177058751 . C T 330.96 PASS AO=104;DP=281;FAO=111;FDP=296;FR=.;FRO=185;FSAF=22;FSAR=89;FSRF=40;FSRR=145;FWDB=-0.0755337;FXX=0.00336689;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5398;QD=4.47247;RBI=0.105622;REFB=-0.00108506;REVB=-0.0738291;RO=173;SAF=21;SAR=83;SRF=35;SRR=138;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000667453;STB=0.517342;TYPE=snp;VARB=0.0013844;OID=.;OPOS=177058751;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:281:296:173:185:104:111:83:21:35:138:89:22:40:145 chr4 177073026 . G A 1666.3 PASS AO=172;DP=173;FAO=176;FDP=176;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0372511;FXX=0.0382493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.008;QD=37.8705;RBI=0.0480275;REFB=0;REVB=0.030315;RO=0;SAF=71;SAR=101;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00183503;OID=.;OPOS=177073026;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:173:176:0:0:172:176:101:71:0:0:101:75:0:0 chr4 177087322 . C T 1217.58 PASS AO=128;DP=130;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.01679;FXX=0.0153834;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.7137;QD=38.0492;RBI=0.0193543;REFB=0.0104781;REVB=-0.00962729;RO=1;SAF=47;SAR=81;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00583124;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.23427e-05;OID=.;OPOS=177087322;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:130:128:1:0:128:128:81:47:0:1:81:47:0:0 chr4 177095773 . G A 229.86 PASS AO=52;DP=121;FAO=59;FDP=127;FR=.;FRO=68;FSAF=12;FSAR=47;FSRF=31;FSRR=37;FWDB=-0.000633555;FXX=0.00781189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.2435;QD=7.23976;RBI=0.0402624;REFB=-0.0355701;REVB=0.0402574;RO=67;SAF=7;SAR=45;SRF=31;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.439797;STB=0.667154;TYPE=snp;VARB=0.0621938;OID=.;OPOS=177095773;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:127:67:68:52:59:45:7:31:36:47:12:31:37 chr4 177113779 . T C 372.78 PASS AO=87;DP=174;FAO=87;FDP=174;FR=.;FRO=87;FSAF=42;FSAR=45;FSRF=50;FSRR=37;FWDB=0.00325477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.482;QD=8.56957;RBI=0.00386293;REFB=-0.00359583;REVB=-0.00208055;RO=87;SAF=42;SAR=45;SRF=50;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0834458;STB=0.545876;TYPE=snp;VARB=0.00366129;OID=.;OPOS=177113779;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:174:87:87:87:87:45:42:50:37:45:42:50:37 chr4 177113836 . C T 752.36 PASS AO=183;DP=381;FAO=185;FDP=382;FR=.;FRO=197;FSAF=87;FSAR=98;FSRF=79;FSRR=118;FWDB=0.00260317;FXX=0.0026109;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.06;QD=7.87806;RBI=0.0447899;REFB=-0.00955804;REVB=-0.0447142;RO=195;SAF=85;SAR=98;SRF=79;SRR=116;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0563219;STB=0.535992;TYPE=snp;VARB=0.00906909;OID=.;OPOS=177113836;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:381:382:195:197:183:185:98:85:79:116:98:87:79:118 chr4 177113956 . A G 535.22 PASS AO=143;DP=326;FAO=145;FDP=325;FR=.;FRO=180;FSAF=60;FSAR=85;FSRF=81;FSRR=99;FWDB=0.0275705;FXX=0.00914606;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.468;QD=6.58727;RBI=0.0275778;REFB=-0.0077548;REVB=-0.000635786;RO=181;SAF=59;SAR=84;SRF=81;SRR=100;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0360325;STB=0.520518;TYPE=snp;VARB=0.00887537;OID=.;OPOS=177113956;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:326:325:181:180:143:145:84:59:81:100:85:60:81:99 chr4 177137988 . C T 1588.09 PASS AO=170;DP=172;FAO=170;FDP=170;FR=.;FRO=0;FSAF=102;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190516;FXX=0.0116272;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8301;QD=37.3668;RBI=0.0528297;REFB=0.108365;REVB=-0.0492749;RO=2;SAF=102;SAR=68;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0137903;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00360552;OID=.;OPOS=177137988;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:172:170:2:0:170:170:68:102:0:2:68:102:0:0 chr4 177243366 . G T 211.73 PASS AO=71;DP=185;FAO=70;FDP=187;FR=.;FRO=117;FSAF=32;FSAR=38;FSRF=52;FSRR=65;FWDB=-0.0519982;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.7402;QD=4.52889;RBI=0.052873;REFB=0.0105629;REVB=0.00957829;RO=114;SAF=32;SAR=39;SRF=50;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0133578;STB=0.508013;TYPE=snp;VARB=-0.0189845;OID=.;OPOS=177243366;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:187:114:117:71:70:39:32:50:64:38:32:52:65 chr4 177605081 . CTCA C 1546.21 PASS AO=165;DP=172;FAO=167;FDP=167;FR=.;FRO=0;FSAF=111;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00543265;FXX=0.0402276;HRUN=1;LEN=3;MLLD=276.755;QD=37.0351;RBI=0.00737792;REFB=-0.0364751;REVB=0.004992;RO=0;SAF=109;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=2.88195e-05;OID=.;OPOS=177605082;OREF=TCA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:165:170:167:167:0:111:56:0:0:51:0:109:56:0:0 chr4 178102691 . C G 448.66 PASS AO=91;DP=182;FAO=103;FDP=202;FR=.;FRO=99;FSAF=55;FSAR=48;FSRF=41;FSRR=58;FWDB=0.031635;FXX=0.00492587;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.6596;QD=8.88434;RBI=0.0488373;REFB=-0.0187478;REVB=-0.0372063;RO=90;SAF=54;SAR=37;SRF=41;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125786;STB=0.558525;TYPE=snp;VARB=0.0176378;OID=.;OPOS=178102691;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:202:90:99:91:103:37:54:41:49:48:55:41:58 chr4 178231152 . C A 71.25 PASS AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=14;FWDB=-0.0190267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.5515;QD=8.38223;RBI=0.0549733;REFB=-0.0287831;REVB=0.0515757;RO=18;SAF=7;SAR=9;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210401;STB=0.619094;TYPE=snp;VARB=0.0233153;OID=.;OPOS=178231152;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:34:34:18:18:16:16:9:7:4:14:9:7:4:14 chr4 178256913 . C G 256.71 PASS AO=71;DP=172;FAO=71;FDP=166;FR=.;FRO=95;FSAF=11;FSAR=60;FSRF=30;FSRR=65;FWDB=-0.0159616;FXX=0.0348817;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.539;QD=6.18571;RBI=0.0194665;REFB=-0.00880158;REVB=0.0111433;RO=92;SAF=11;SAR=60;SRF=27;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218892;STB=0.641415;TYPE=snp;VARB=0.0105452;OID=.;OPOS=178256913;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:166:92:95:71:71:60:11:27:65:60:11:30:65 chr4 178262683 . T C 62.98 PASS AO=30;DP=109;FAO=30;FDP=109;FR=.;FRO=79;FSAF=22;FSAR=8;FSRF=44;FSRR=35;FWDB=-0.00135273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.654;QD=2.31113;RBI=0.0172726;REFB=0.00557244;REVB=-0.0172196;RO=78;SAF=22;SAR=8;SRF=43;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.241749;STB=0.641691;TYPE=snp;VARB=-0.00841037;OID=.;OPOS=178262683;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:109:109:78:79:30:30:8:22:43:35:8:22:44:35 chr4 178274565 . A G 2405.33 PASS AO=239;DP=242;FAO=259;FDP=259;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=164;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0996524;FXX=0.0152085;HRUN=5;LEN=1;MLLD=45.7342;QD=37.1479;RBI=0.124278;REFB=-0.0225432;REVB=-0.0742593;RO=3;SAF=84;SAR=155;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00913419;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000558454;OID=.;OPOS=178274565;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:242:259:3:0:239:259:155:84:0:3:164:95:0:0 chr4 178274694 . T G 2225.46 PASS AO=238;DP=243;FAO=238;FDP=238;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=140;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000327394;FXX=0.0205753;HRUN=3;LEN=1;MLLD=235.79;QD=37.4026;RBI=0.000377242;REFB=-0.0743355;REVB=0.000187415;RO=3;SAF=98;SAR=140;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0062338;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.53241e-05;OID=.;OPOS=178274694;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:82:243:238:3:0:238:238:140:98:2:1:140:98:0:0 chr4 178274750 . C T 1557.69 PASS AO=167;DP=170;FAO=167;FDP=167;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0101872;FXX=0.017646;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.492;QD=37.3101;RBI=0.0109977;REFB=-0.05301;REVB=0.00414358;RO=1;SAF=73;SAR=94;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00503622;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.14978e-06;OID=.;OPOS=178274750;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:170:167:1:0:167:167:94:73:0:1:94:73:0:0 chr4 178274835 . A C 434.96 PASS AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0608799;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.2144;QD=36.2463;RBI=0.0625247;REFB=-0.051826;REVB=-0.0142472;RO=0;SAF=10;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.523799;TYPE=snp;VARB=0.00128832;OID=.;OPOS=178274835;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:48:48:0:1:47:47:37:10:0:0:37:10:1:0 chr4 178281754 . G A 1425.8 PASS AO=162;DP=171;FAO=163;FDP=171;FR=.;FRO=8;FSAF=102;FSAR=61;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0343211;FXX=0.00581362;HRUN=4;LEN=1;MLLD=157.547;QD=33.3522;RBI=0.0590064;REFB=-0.0180571;REVB=0.0479981;RO=9;SAF=102;SAR=60;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0431244;STB=0.518589;TYPE=snp;VARB=0.000385772;OID=.;OPOS=178281754;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:171:171:9:8:162:163:60:102:2:7:61:102:2:6 chr4 178359960 . G C 1207.64 PASS AO=126;DP=127;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0303767;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.0808;QD=38.3378;RBI=0.0331239;REFB=0;REVB=-0.0132077;RO=0;SAF=79;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.79956e-05;OID=.;OPOS=178359960;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:127:126:0:0:126:126:47:79:0:0:47:79:0:0 chr4 178363496 . C A 127.49 PASS AO=29;DP=62;FAO=30;FDP=63;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.0128881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.781;QD=8.09442;RBI=0.0824502;REFB=-0.0382006;REVB=0.0814366;RO=33;SAF=12;SAR=17;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0683278;STB=0.527254;TYPE=snp;VARB=0.0447646;OID=.;OPOS=178363496;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:63:33:33:29:30:17:12:16:17:17:13:16:17 chr4 178378317 . C A 550.56 PASS AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00297212;FXX=0.0161264;HRUN=3;LEN=1;MLLD=117.852;QD=36.102;RBI=0.0150236;REFB=-0.0295676;REVB=-0.0147267;RO=0;SAF=33;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.7886e-08;STB=0.50746;TYPE=snp;VARB=-0.00019787;OID=.;OPOS=178378317;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:61:61:0:1:60:60:27:33:0:0:27:33:1:0 chr4 179037926 . C G 142.61 PASS AO=31;DP=63;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=8;FWDB=0.0136465;FXX=0.031741;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.521;QD=9.35117;RBI=0.0207476;REFB=-0.00422706;REVB=0.015628;RO=30;SAF=21;SAR=10;SRF=22;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0578594;STB=0.532158;TYPE=snp;VARB=0.00255434;OID=.;OPOS=179037926;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:61:30:30:31:31:10:21:22:8:10:21:22:8 chr4 179037990 . C A 117.8 PASS AO=35;DP=90;FAO=35;FDP=90;FR=.;FRO=55;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=36;FSRR=19;FWDB=0.0394411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.5279;QD=5.23549;RBI=0.0508848;REFB=0.0119322;REVB=-0.0321505;RO=55;SAF=17;SAR=18;SRF=36;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1809;STB=0.602597;TYPE=snp;VARB=-0.0246276;OID=.;OPOS=179037990;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:55:55:35:35:18:17:36:19:18:17:36:19 chr4 179038006 . A G 127.48 PASS AO=35;DP=87;FAO=36;FDP=88;FR=.;FRO=52;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=36;FSRR=16;FWDB=-0.0226654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.2219;QD=5.79465;RBI=0.0254262;REFB=-1.54551e-05;REVB=0.0115227;RO=52;SAF=14;SAR=21;SRF=36;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.300461;STB=0.658588;TYPE=snp;VARB=-0.000141364;OID=.;OPOS=179038006;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:88:52:52:35:36:21:14:36:16:21:15:36:16 chr4 179327856 . G A 2773.12 PASS AO=287;DP=288;FAO=288;FDP=288;FR=.;FRO=0;FSAF=154;FSAR=134;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00240889;FXX=0.00346009;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.875;QD=38.5155;RBI=0.0305225;REFB=0;REVB=0.0304272;RO=0;SAF=154;SAR=133;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.14739e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000121472;OID=.;OPOS=179327856;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:288:288:0:0:287:288:133:154:0:0:134:154:0:0 chr4 183601847 . T C 296.09 PASS AO=85;DP=219;FAO=90;FDP=223;FR=.;FRO=133;FSAF=34;FSAR=56;FSRF=43;FSRR=90;FWDB=0.0246897;FXX=0.00446409;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.1805;QD=5.31098;RBI=0.0597812;REFB=0.00520753;REVB=0.0544446;RO=133;SAF=30;SAR=55;SRF=43;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0356122;STB=0.535137;TYPE=snp;VARB=-0.00683192;OID=.;OPOS=183601847;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:219:223:133:133:85:90:55:30:43:90:56:34:43:90 chr4 183652175 . T C 2986.31 PASS AO=315;DP=320;FAO=318;FDP=318;FR=.;FRO=0;FSAF=160;FSAR=158;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0157567;FXX=0.0062498;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.851;QD=37.5637;RBI=0.0733232;REFB=-0.055713;REVB=0.0716102;RO=2;SAF=160;SAR=155;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00611459;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000154911;OID=.;OPOS=183652175;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:320:318:2:0:315:318:155:160:0:2:158:160:0:0 chr4 183710332 . G A 430.32 PASS AO=99;DP=196;FAO=99;FDP=196;FR=.;FRO=97;FSAF=64;FSAR=35;FSRF=63;FSRR=34;FWDB=-0.011264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.748;QD=8.78198;RBI=0.0167271;REFB=-0.0134942;REVB=0.012366;RO=92;SAF=64;SAR=35;SRF=62;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.026639;STB=0.501636;TYPE=snp;VARB=0.011402;OID=.;OPOS=183710332;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:196:92:97:99:99:35:64:62:30:35:64:63:34 chr4 183713630 . A G 134.33 PASS AO=42;DP=111;FAO=42;FDP=111;FR=.;FRO=69;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=34;FSRR=35;FWDB=-0.00392163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.027;QD=4.84054;RBI=0.0132983;REFB=-0.00726216;REVB=-0.0127069;RO=69;SAF=18;SAR=24;SRF=34;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0706188;STB=0.54024;TYPE=snp;VARB=0.0141245;OID=.;OPOS=183713630;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:69:69:42:42:24:18:34:35:24:18:34:35 chr4 183721398 . AGGGC AGGC,AGGCG 100.7 PASS AO=7,3;DP=15;FAO=15,0;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=9,0;FSAR=6,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0516491,-0.0554559;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,2;MLLD=14.1077,37.823;QD=26.8535;RBI=0.26992,0.0935085;REFB=0,0;REVB=0.264932,0.0752893;RO=4;SAF=5,3;SAR=2,0;SRF=0;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0.243056,0;SSSB=0.429216,0.782218;STB=0.5,0.5;TYPE=del,mnp;VARB=0.0327726,0;OID=.,.;OPOS=183721399,183721401;OREF=G,GC;OALT=-,CG;OMAPALT=AGGC,AGGCG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:7,3:15:15,0:15:0:9,0:6,0:0:0:5:4:5,3:2,0:0:4 chr4 183721852 . G A 356.35 PASS AO=87;DP=182;FAO=87;FDP=181;FR=.;FRO=94;FSAF=36;FSAR=51;FSRF=37;FSRR=57;FWDB=0.00974747;FXX=0.0054942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.506;QD=7.8752;RBI=0.00995131;REFB=0.00696892;REVB=0.00200382;RO=91;SAF=36;SAR=51;SRF=37;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00689218;STB=0.510837;TYPE=snp;VARB=-0.00832462;OID=.;OPOS=183721852;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:181:91:94:87:87:51:36:37:54:51:36:37:57 chr4 183721872 . C A 414.04 PASS AO=103;DP=217;FAO=103;FDP=217;FR=.;FRO=114;FSAF=37;FSAR=66;FSRF=45;FSRR=69;FWDB=0.0129871;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=173.652;QD=7.63203;RBI=0.0179323;REFB=-0.00352128;REVB=-0.0123654;RO=114;SAF=37;SAR=66;SRF=45;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0362704;STB=0.520031;TYPE=snp;VARB=0.00448142;OID=.;OPOS=183721872;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:217:217:114:114:103:103:66:37:45:69:66:37:45:69 chr4 183815688 . A G 1880 PASS AO=197;DP=199;FAO=197;FDP=197;FR=.;FRO=0;FSAF=119;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0350181;FXX=0.0149993;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.0509;QD=38.1726;RBI=0.0485442;REFB=-0.00155056;REVB=-0.0336195;RO=1;SAF=119;SAR=78;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00606662;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.23482e-06;OID=.;OPOS=183815688;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:199:197:1:0:197:197:78:119:0:1:78:119:0:0 chr4 184192278 . G T 49.53 PASS AO=22;DP=79;FAO=22;FDP=79;FR=.;FRO=57;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=27;FSRR=30;FWDB=0.000810057;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.9155;QD=2.50807;RBI=0.0473479;REFB=-0.0127105;REVB=0.0473409;RO=55;SAF=13;SAR=9;SRF=26;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141471;STB=0.584698;TYPE=snp;VARB=0.0342996;OID=.;OPOS=184192278;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:79:79:55:57:22:22:9:13:26:29:9:13:27:30 chr4 184203886 . G C 412.1 PASS AO=87;DP=166;FAO=89;FDP=165;FR=.;FRO=76;FSAF=40;FSAR=49;FSRF=49;FSRR=27;FWDB=0.0698858;FXX=0.0178561;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.6436;QD=9.99031;RBI=0.101136;REFB=-0.0229739;REVB=0.0731055;RO=75;SAF=39;SAR=48;SRF=48;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161211;STB=0.589225;TYPE=snp;VARB=0.0194946;OID=.;OPOS=184203886;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:165:75:76:87:89:48:39:48:27:49:40:49:27 chr4 184237193 . A AC 189.13 PASS AO=76;DP=192;FAO=81;FDP=183;FR=.;FRO=102;FSAF=29;FSAR=52;FSRF=43;FSRR=59;FWDB=0.158568;FXX=0.0468726;HRUN=1;LEN=1;MLLD=23.2852;QD=4.13389;RBI=0.160132;REFB=-0.0105802;REVB=0.0223244;RO=106;SAF=27;SAR=49;SRF=45;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0765514;STB=0.53769;TYPE=ins;VARB=0.0182699;OID=.;OPOS=184237194;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:76:192:81:183:102:29:52:43:59:99:106:27:49:45:61 chr4 184238670 . C G 260.97 PASS AO=68;DP=156;FAO=68;FDP=151;FR=.;FRO=83;FSAF=34;FSAR=34;FSRF=34;FSRR=49;FWDB=0.00879352;FXX=0.0320492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.918;QD=6.91301;RBI=0.0154393;REFB=-0.00956506;REVB=0.0126904;RO=82;SAF=34;SAR=34;SRF=34;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0839859;STB=0.549654;TYPE=snp;VARB=0.0113409;OID=.;OPOS=184238670;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:151:82:83:68:68:34:34:34:48:34:34:34:49 chr4 184239649 . A T 17.94 PASS AO=21;DP=76;FAO=15;FDP=91;FR=.;FRO=76;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=57;FWDB=-0.0647213;FXX=0;HRUN=10;LEN=1;MLLD=31.5372;QD=0.788768;RBI=0.0660906;REFB=-0.0122173;REVB=-0.0133836;RO=55;SAF=3;SAR=18;SRF=16;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.269521;STB=0.660765;TYPE=snp;VARB=0.0162034;OID=.;OPOS=184239649;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:76:91:55:76:21:15:18:3:16:39:13:2:19:57 chr4 184243528 . G A 1030.68 PASS AO=86;DP=109;FAO=107;FDP=107;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=51;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0109968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.645;QD=38.5301;RBI=0.0401473;REFB=0;REVB=0.0386118;RO=0;SAF=47;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000271623;OID=.;OPOS=184243528;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:106:107:0:0:86:107:39:47:0:0:56:51:0:0 chr4 184250472 . A G 188.33 PASS AO=55;DP=136;FAO=55;FDP=135;FR=.;FRO=80;FSAF=21;FSAR=34;FSRF=33;FSRR=47;FWDB=0.0165422;FXX=0.0073524;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.521;QD=5.58;RBI=0.0229778;REFB=-0.024659;REVB=0.0159479;RO=80;SAF=21;SAR=34;SRF=33;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.033856;STB=0.519077;TYPE=snp;VARB=0.0326828;OID=.;OPOS=184250472;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:135:80:80:55:55:34:21:33:47:34:21:33:47 chr4 184367558 . TCTG T 739.78 PASS AO=77;DP=93;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0266942;FXX=0.0365809;HRUN=1;LEN=3;MLLD=247.985;QD=37.4573;RBI=0.0289974;REFB=0;REVB=0.0113256;RO=0;SAF=42;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.00072526;OID=.;OPOS=184367559;OREF=CTG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:77:84:79:79:0:42:37:0:0:35:0:42:35:0:0 chr4 184426387 . C T 569.71 PASS AO=64;DP=67;FAO=64;FDP=67;FR=.;FRO=3;FSAF=33;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0244669;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.172;QD=34.0127;RBI=0.0496304;REFB=-0.0615615;REVB=0.0431804;RO=2;SAF=33;SAR=31;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000894695;STB=0.508164;TYPE=snp;VARB=0.00321136;OID=.;OPOS=184426387;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:67:67:2:3:64:64:31:33:1:1:31:33:1:2 chr4 184560790 . G A 214.69 PASS AO=70;DP=185;FAO=70;FDP=185;FR=.;FRO=115;FSAF=25;FSAR=45;FSRF=45;FSRR=70;FWDB=-0.0243558;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.4336;QD=4.64193;RBI=0.0243924;REFB=0.00386221;REVB=0.00133586;RO=114;SAF=25;SAR=45;SRF=45;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0441408;STB=0.522815;TYPE=snp;VARB=-0.00748316;OID=.;OPOS=184560790;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:185:114:115:70:70:45:25:45:69:45:25:45:70 chr4 184572218 . G A 551.87 PASS AO=105;DP=174;FAO=105;FDP=174;FR=.;FRO=69;FSAF=61;FSAR=44;FSRF=47;FSRR=22;FWDB=0.00323675;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.517;QD=12.6866;RBI=0.0123501;REFB=-0.0149589;REVB=-0.0119184;RO=69;SAF=61;SAR=44;SRF=47;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0764773;STB=0.541346;TYPE=snp;VARB=0.00559681;OID=.;OPOS=184572218;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:174:69:69:105:105:44:61:47:22:44:61:47:22 chr4 184618936 . G C 288.24 PASS AO=77;DP=180;FAO=79;FDP=182;FR=.;FRO=103;FSAF=28;FSAR=51;FSRF=45;FSRR=58;FWDB=-0.0102729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.567;QD=6.33504;RBI=0.0201742;REFB=-0.00407229;REVB=-0.0173627;RO=103;SAF=27;SAR=50;SRF=45;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0937809;STB=0.549507;TYPE=snp;VARB=0.00538978;OID=.;OPOS=184618936;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:182:103:103:77:79:50:27:45:58:51:28:45:58 chr4 184931818 . G A 712.14 PASS AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00237273;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.332;QD=37.9805;RBI=0.0147984;REFB=0;REVB=0.0146069;RO=0;SAF=37;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.45182e-05;OID=.;OPOS=184931818;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:75:75:0:0:75:75:38:37:0:0:38:37:0:0 chr4 185310218 . C T 166.98 PASS AO=46;DP=107;FAO=46;FDP=109;FR=.;FRO=63;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=30;FSRR=33;FWDB=0.0031423;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=118.022;QD=6.12763;RBI=0.0162249;REFB=-0.020488;REVB=-0.0159177;RO=61;SAF=20;SAR=26;SRF=29;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0416738;STB=0.524183;TYPE=snp;VARB=0.0311473;OID=.;OPOS=185310218;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:109:61:63:46:46:26:20:29:32:26:20:30:33 chr4 185587165 . A G 1967.78 PASS AO=206;DP=206;FAO=209;FDP=209;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=123;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0488727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.081;QD=37.6608;RBI=0.0496697;REFB=0;REVB=-0.00886209;RO=0;SAF=83;SAR=123;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.14753e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000693241;OID=.;OPOS=185587165;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:206:209:0:0:206:209:123:83:0:0:123:86:0:0 chr4 185599489 . G A 392.38 PASS AO=88;DP=211;FAO=107;FDP=231;FR=.;FRO=124;FSAF=52;FSAR=55;FSRF=60;FSRR=64;FWDB=0.00237558;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.187;QD=6.7945;RBI=0.0415692;REFB=-0.0289599;REVB=0.0415013;RO=123;SAF=33;SAR=55;SRF=59;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112543;STB=0.501134;TYPE=snp;VARB=0.0419813;OID=.;OPOS=185599489;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:231:123:124:88:107:55:33:59:64:55:52:60:64 chr4 185615764 . C A 220.74 PASS AO=56;DP=120;FAO=55;FDP=120;FR=.;FRO=65;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=30;FSRR=35;FWDB=-0.000860474;FXX=0.00826378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.708;QD=7.35805;RBI=0.0146859;REFB=-0.00763853;REVB=-0.0146606;RO=63;SAF=25;SAR=31;SRF=29;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133656;STB=0.503815;TYPE=snp;VARB=0.00609115;OID=.;OPOS=185615764;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:63:65:56:55:31:25:29:34:30:25:30:35 chr4 185615768 . T G 210.28 PASS AO=53;DP=118;FAO=54;FDP=119;FR=.;FRO=65;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=30;FSRR=35;FWDB=-0.0257659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.17;QD=7.06823;RBI=0.0280045;REFB=-0.0012951;REVB=0.0109715;RO=65;SAF=24;SAR=29;SRF=30;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00866086;STB=0.50943;TYPE=snp;VARB=0.00112754;OID=.;OPOS=185615768;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:119:65:65:53:54:29:24:30:35:30:24:30:35 chr4 185620751 . C G 272.19 PASS AO=82;DP=203;FAO=82;FDP=203;FR=.;FRO=121;FSAF=39;FSAR=43;FSRF=52;FSRR=69;FWDB=0.051816;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.766;QD=5.36332;RBI=0.0520071;REFB=-0.00130095;REVB=-0.00445377;RO=120;SAF=39;SAR=43;SRF=52;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.045011;STB=0.527466;TYPE=snp;VARB=0.00258302;OID=.;OPOS=185620751;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:203:120:121:82:82:43:39:52:68:43:39:52:69 chr4 185622046 . C T 239.86 PASS AO=69;DP=167;FAO=69;FDP=166;FR=.;FRO=97;FSAF=25;FSAR=44;FSRF=46;FSRR=51;FWDB=-0.036114;FXX=0.0119041;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.7535;QD=5.77973;RBI=0.0454931;REFB=-0.0281346;REVB=-0.027666;RO=93;SAF=25;SAR=44;SRF=43;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107222;STB=0.568083;TYPE=snp;VARB=0.033801;OID=.;OPOS=185622046;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:166:93:97:69:69:44:25:43:50:44:25:46:51 chr4 185623312 . C T 252.07 PASS AO=55;DP=105;FAO=55;FDP=105;FR=.;FRO=50;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=-0.00624531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.9643;QD=9.60262;RBI=0.0214271;REFB=-0.0261946;REVB=-0.0204967;RO=50;SAF=30;SAR=25;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0221384;STB=0.512191;TYPE=snp;VARB=0.0202135;OID=.;OPOS=185623312;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:50:50:55:55:25:30:26:24:25:30:26:24 chr4 185634144 . T C 167.71 PASS AO=43;DP=96;FAO=43;FDP=96;FR=.;FRO=53;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=35;FSRR=18;FWDB=-0.0128573;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.31;QD=6.98799;RBI=0.0314188;REFB=-0.00102261;REVB=0.0286676;RO=53;SAF=24;SAR=19;SRF=35;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103817;STB=0.557963;TYPE=snp;VARB=0.00161568;OID=.;OPOS=185634144;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:53:53:43:43:19:24:35:18:19:24:35:18 chr4 185637699 . A G 432.5 PASS AO=85;DP=149;FAO=85;FDP=148;FR=.;FRO=63;FSAF=25;FSAR=60;FSRF=22;FSRR=41;FWDB=0.0155962;FXX=0.0807403;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3896;QD=11.6892;RBI=0.0230601;REFB=-0.0235695;REVB=-0.0169861;RO=51;SAF=25;SAR=60;SRF=15;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.527589;TYPE=snp;VARB=0.0154291;OID=.;OPOS=185637699;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:148:51:63:85:85:60:25:15:36:60:25:22:41 chr4 185650154 . G A 281.85 PASS AO=55;DP=99;FAO=56;FDP=99;FR=.;FRO=43;FSAF=20;FSAR=36;FSRF=11;FSRR=32;FWDB=-0.0753377;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.926;QD=11.388;RBI=0.0760192;REFB=-0.0109742;REVB=-0.0101566;RO=42;SAF=20;SAR=35;SRF=11;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0895162;STB=0.549256;TYPE=snp;VARB=0.0122307;OID=.;OPOS=185650154;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:42:43:55:56:35:20:11:31:36:20:11:32 chr4 185652147 . G A 261.29 PASS AO=77;DP=191;FAO=77;FDP=189;FR=.;FRO=112;FSAF=29;FSAR=48;FSRF=46;FSRR=66;FWDB=0.0204463;FXX=0.0156242;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.801;QD=5.52992;RBI=0.021414;REFB=0.00302923;REVB=-0.00636468;RO=113;SAF=29;SAR=48;SRF=47;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0437548;STB=0.52128;TYPE=snp;VARB=-0.0048202;OID=.;OPOS=185652147;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:191:189:113:112:77:77:48:29:47:66:48:29:46:66 chr4 185655171 . C T 43.04 PASS AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.0334468;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=133.376;QD=8.6085;RBI=0.0427707;REFB=0.00245634;REVB=-0.026658;RO=11;SAF=6;SAR=3;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0311955;STB=0.518477;TYPE=snp;VARB=-0.00338714;OID=.;OPOS=185655171;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:20:20:11:11:9:9:3:6:7:4:3:6:7:4 chr4 185676746 . C CA 157.01 PASS AO=49;DP=96;FAO=49;FDP=92;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=33;FSRF=26;FSRR=17;FWDB=0.0599201;FXX=0.0315756;HRUN=1;LEN=1;MLLD=26.8479;QD=6.82671;RBI=0.0956284;REFB=0.00719338;REVB=-0.0745276;RO=44;SAF=16;SAR=33;SRF=27;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252454;STB=0.633979;TYPE=ins;VARB=-0.00751144;OID=.;OPOS=185676747;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:49:96:49:92:43:16:33:26:17:99:44:16:33:27:17 chr4 185678118 . C G 2833.43 PASS AO=295;DP=300;FAO=297;FDP=297;FR=.;FRO=0;FSAF=126;FSAR=171;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00127549;FXX=0.0357131;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.8164;QD=38.1607;RBI=0.0213367;REFB=-0.0268307;REVB=0.0212986;RO=1;SAF=124;SAR=171;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00383053;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000416465;OID=.;OPOS=185678118;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:300:297:1:0:295:297:171:124:1:0:171:126:0:0 chr4 185686032 . C T 987.1 PASS AO=100;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0158836;FXX=0.0185168;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.0203;QD=37.249;RBI=0.171239;REFB=0;REVB=0.170501;RO=2;SAF=55;SAR=45;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0206141;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0019121;OID=.;OPOS=185686032;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:106:106:2:0:100:106:45:55:0:2:49:57:0:0 chr4 185687863 . A G 133.68 PASS AO=40;DP=103;FAO=40;FDP=102;FR=.;FRO=62;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=38;FSRR=24;FWDB=0.0105175;FXX=0.0097078;HRUN=3;LEN=1;MLLD=198.44;QD=5.24215;RBI=0.0277246;REFB=-0.0048754;REVB=-0.0256522;RO=62;SAF=19;SAR=21;SRF=38;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147032;STB=0.583292;TYPE=snp;VARB=0.0093626;OID=.;OPOS=185687863;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:102:62:62:40:40:21:19:38:24:21:19:38:24 chr4 185735054 . G A 243.83 PASS AO=59;DP=123;FAO=59;FDP=123;FR=.;FRO=64;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=39;FSRR=25;FWDB=-0.00583768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.419;QD=7.92939;RBI=0.0087069;REFB=-0.0267866;REVB=0.00646;RO=63;SAF=34;SAR=25;SRF=38;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0258042;STB=0.517725;TYPE=snp;VARB=0.0317913;OID=.;OPOS=185735054;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:63:64:59:59:25:34:38:25:25:34:39:25 chr4 186091487 . G A 1651.5 PASS AO=176;DP=176;FAO=176;FDP=176;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235337;FXX=0.0167588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.109;QD=37.5341;RBI=0.0310376;REFB=-0.127219;REVB=0.020236;RO=0;SAF=83;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00177108;OID=.;OPOS=186091487;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:176:176:0:0:176:176:93:83:0:0:93:83:0:0 chr4 186097045 . C T 995.63 PASS AO=193;DP=333;FAO=195;FDP=330;FR=.;FRO=135;FSAF=53;FSAR=142;FSRF=130;FSRR=5;FWDB=0.0167535;FXX=0.00602391;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.303;QD=12.0683;RBI=0.0294353;REFB=0.00849541;REVB=-0.0242024;RO=2;SAF=51;SAR=142;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00665998;STB=0.769314;TYPE=snp;VARB=-0.000960604;OID=.;OPOS=186097045;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:330:2:135:193:195:142:51:0:2:142:53:130:5 chr4 186294198 . C T 533.37 PASS AO=122;DP=250;FAO=128;FDP=256;FR=.;FRO=128;FSAF=42;FSAR=86;FSRF=43;FSRR=85;FWDB=0.0642387;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.6649;QD=8.33396;RBI=0.179496;REFB=-0.00470506;REVB=0.167607;RO=128;SAF=39;SAR=83;SRF=43;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.017278;STB=0.504416;TYPE=snp;VARB=0.00585184;OID=.;OPOS=186294198;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:250:256:128:128:122:128:83:39:43:85:86:42:43:85 chr4 186299260 . A G 253.28 PASS AO=38;DP=103;FAO=44;FDP=95;FR=.,HEALED;FRO=36;FSAF=42;FSAR=2;FSRF=35;FSRR=1;FWDB=-0.0149867;FXX=0.049995;HRUN=5;LEN=1;MLLD=244.949;QD=10.6644;RBI=0.0210295;REFB=-0.00282699;REVB=-0.0147525;RO=32;SAF=36;SAR=2;SRF=31;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0981504;STB=0.549979;TYPE=snp;VARB=0.0111173;OID=.;OPOS=186299260;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:32:36:38:44:2:36:31:1:2:42:35:1 chr4 186339584 . A G 965.92 PASS AO=99;DP=99;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.197;QD=38.6368;RBI=0.0342152;REFB=0;REVB=0.0263227;RO=0;SAF=62;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.19642e-05;OID=.;OPOS=186339584;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:99:100:0:0:99:100:37:62:0:0:37:63:0:0 chr4 186347055 . G A 14.37 PASS AO=3;DP=10;FAO=3;FDP=10;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.00968414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.696;QD=5.74619;RBI=0.0769123;REFB=-0.0101002;REVB=0.0763002;RO=7;SAF=1;SAR=2;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.254889;STB=0.665772;TYPE=snp;VARB=0.0196507;OID=.;OPOS=186347055;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:10:10:7:7:3:3:2:1:1:6:2:1:1:6 chr4 186357523 . C G 218.1 PASS AO=67;DP=171;FAO=67;FDP=170;FR=.;FRO=103;FSAF=15;FSAR=52;FSRF=35;FSRR=68;FWDB=0.00560725;FXX=0.00584761;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.02;QD=5.13168;RBI=0.00625271;REFB=-0.00522336;REVB=0.00276679;RO=102;SAF=15;SAR=52;SRF=35;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16354;STB=0.59088;TYPE=snp;VARB=0.0103528;OID=.;OPOS=186357523;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:170:102:103:67:67:52:15:35:67:52:15:35:68 chr4 186361876 . A G 358.65 PASS AO=76;DP=143;FAO=77;FDP=143;FR=.;FRO=66;FSAF=16;FSAR=61;FSRF=19;FSRR=47;FWDB=0.0119803;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.65;QD=10.0323;RBI=0.0120325;REFB=0.00449318;REVB=0.00111969;RO=66;SAF=15;SAR=61;SRF=19;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111547;STB=0.552665;TYPE=snp;VARB=-0.00258555;OID=.;OPOS=186361876;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:66:66:76:77:61:15:19:47:61:16:19:47 chr4 186379371 . G A 2143.97 PASS AO=223;DP=223;FAO=224;FDP=224;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=133;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.015092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.5263;QD=38.2852;RBI=0.0547695;REFB=0;REVB=0.0526492;RO=0;SAF=90;SAR=133;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.08061e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.61248e-05;OID=.;OPOS=186379371;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:223:224:0:0:223:224:133:90:0:0:133:91:0:0 chr4 186379735 . T C 212.86 PASS AO=59;DP=139;FAO=59;FDP=138;FR=.;FRO=79;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=34;FSRR=45;FWDB=0.00605908;FXX=0.00719373;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.747;QD=6.16976;RBI=0.013145;REFB=-0.0158847;REVB=0.0116653;RO=77;SAF=34;SAR=25;SRF=34;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136369;STB=0.583305;TYPE=snp;VARB=0.0353985;OID=.;OPOS=186379735;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:138:77:79:59:59:25:34:34:43:25:34:34:45 chr4 186379899 . G C 194.04 PASS AO=41;DP=77;FAO=41;FDP=77;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=29;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=-0.0225577;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.198;QD=10.0797;RBI=0.0254202;REFB=-0.0195937;REVB=0.0117192;RO=35;SAF=12;SAR=29;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0763518;STB=0.55195;TYPE=snp;VARB=0.0196408;OID=.;OPOS=186379899;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:35:36:41:41:29:12:13:22:29:12:14:22 chr4 186380243 . A C 209 PASS AO=53;DP=117;FAO=53;FDP=117;FR=.;FRO=64;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=45;FSRR=19;FWDB=-0.0165516;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.6869;QD=7.1454;RBI=0.0585434;REFB=-0.0070682;REVB=0.056155;RO=64;SAF=25;SAR=28;SRF=45;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225584;STB=0.625154;TYPE=snp;VARB=0.00583961;OID=.;OPOS=186380243;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:64:64:53:53:28:25:45:19:28:25:45:19 chr4 186380295 . A G 237.74 PASS AO=69;DP=173;FAO=70;FDP=172;FR=.;FRO=102;FSAF=35;FSAR=35;FSRF=64;FSRR=38;FWDB=0.018727;FXX=0.0114936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.5237;QD=5.52894;RBI=0.018884;REFB=-0.0186549;REVB=-0.00242977;RO=101;SAF=34;SAR=35;SRF=64;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149074;STB=0.57556;TYPE=snp;VARB=0.0424379;OID=.;OPOS=186380295;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:172:101:102:69:70:35:34:64:37:35:35:64:38 chr4 186380515 . G A 411.09 PASS AO=77;DP=131;FAO=79;FDP=132;FR=.;FRO=53;FSAF=20;FSAR=59;FSRF=21;FSRR=32;FWDB=0.0242385;FXX=0.00751823;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.166;QD=12.4574;RBI=0.028235;REFB=-0.0117657;REVB=0.0144815;RO=51;SAF=20;SAR=57;SRF=20;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118052;STB=0.570635;TYPE=snp;VARB=0.00733824;OID=.;OPOS=186380515;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:132:51:53:77:79:57:20:20:31:59:20:21:32 chr4 186380846 . A T 237.43 PASS AO=54;DP=109;FAO=54;FDP=108;FR=.;FRO=54;FSAF=23;FSAR=31;FSRF=29;FSRR=25;FWDB=-0.0059816;FXX=0.00917347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.842;QD=8.79361;RBI=0.0170435;REFB=-0.00294047;REVB=0.0159594;RO=50;SAF=23;SAR=31;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0827066;STB=0.555841;TYPE=snp;VARB=0.00255705;OID=.;OPOS=186380846;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:108:50:54:54:54:31:23:26:24:31:23:29:25 chr4 186381115 . G T 214.76 PASS AO=63;DP=156;FAO=64;FDP=160;FR=.;FRO=96;FSAF=17;FSAR=47;FSRF=33;FSRR=63;FWDB=-0.00545757;FXX=0.00621079;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.3721;QD=5.36906;RBI=0.0281108;REFB=-0.0244471;REVB=0.0275759;RO=92;SAF=17;SAR=46;SRF=31;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0855313;STB=0.556854;TYPE=snp;VARB=0.0410403;OID=.;OPOS=186381115;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:160:92:96:63:64:46:17:31:61:47:17:33:63 chr4 186381165 . G A 215.97 PASS AO=66;DP=169;FAO=66;FDP=167;FR=.;FRO=101;FSAF=24;FSAR=42;FSRF=32;FSRR=69;FWDB=-0.0107859;FXX=0.0118336;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.763;QD=5.17287;RBI=0.0155126;REFB=-0.00523888;REVB=0.0111493;RO=98;SAF=24;SAR=42;SRF=32;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0432113;STB=0.531091;TYPE=snp;VARB=0.0074722;OID=.;OPOS=186381165;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:167:98:101:66:66:42:24:32:66:42:24:32:69 chr4 186382206 . A G 54.17 PASS AO=35;DP=144;FAO=34;FDP=143;FR=.;FRO=109;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=57;FSRR=52;FWDB=-0.0299591;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=168.531;QD=1.51532;RBI=0.0329461;REFB=-0.00242641;REVB=-0.0137074;RO=107;SAF=14;SAR=21;SRF=57;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1656;STB=0.607626;TYPE=snp;VARB=0.00742981;OID=.;OPOS=186382206;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:144:143:107:109:35:34:21:14:57:50:21:13:57:52 chr4 186391868 . T C 216.42 PASS AO=55;DP=121;FAO=55;FDP=121;FR=.;FRO=66;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=21;FSRR=45;FWDB=-0.0287533;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.316;QD=7.15447;RBI=0.0287626;REFB=-0.0113057;REVB=-0.000733095;RO=65;SAF=27;SAR=28;SRF=20;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179675;STB=0.594537;TYPE=snp;VARB=0.0120809;OID=.;OPOS=186391868;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:65:66:55:55:28:27:20:45:28:27:21:45 chr4 186391898 . C T 121.17 PASS AO=37;DP=97;FAO=37;FDP=96;FR=.;FRO=59;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=47;FWDB=0.0143909;FXX=0.0103082;HRUN=3;LEN=1;MLLD=124.765;QD=5.0489;RBI=0.0219162;REFB=0.00277757;REVB=0.0165295;RO=59;SAF=22;SAR=15;SRF=12;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.406423;STB=0.727748;TYPE=snp;VARB=-0.00622266;OID=.;OPOS=186391898;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:96:59:59:37:37:15:22:12:47:15:22:12:47 chr4 186392830 . G C 12.25 PASS AO=2;DP=9;FAO=3;FDP=10;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0227363;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.9821;QD=4.89851;RBI=0.0350665;REFB=-0.172371;REVB=-0.0266968;RO=7;SAF=0;SAR=2;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.50628;STB=0.665772;TYPE=snp;VARB=0.0644949;OID=.;OPOS=186392830;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:9:10:7:7:2:3:2:0:1:6:2:1:1:6 chr4 186507298 . AAT A 38.7 PASS AO=20;DP=64;FAO=21;FDP=62;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=-0.0106743;FXX=0.0158705;HRUN=2;LEN=2;MLLD=164.968;QD=2.4966;RBI=0.0112607;REFB=-0.00530138;REVB=-0.00358645;RO=36;SAF=13;SAR=7;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0782544;STB=0.572257;TYPE=del;VARB=0.0123592;OID=.;OPOS=186507299;OREF=AT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:20:61:21:62:41:13:8:21:20:38:36:13:7:21:15 chr4 186528433 . T C 236.28 PASS AO=56;DP=115;FAO=56;FDP=115;FR=.;FRO=59;FSAF=50;FSAR=6;FSRF=46;FSRR=13;FWDB=-0.0158478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.133;QD=8.21857;RBI=0.0191504;REFB=0.00249362;REVB=-0.010751;RO=56;SAF=50;SAR=6;SRF=44;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20458;STB=0.622492;TYPE=snp;VARB=-0.00218071;OID=.;OPOS=186528433;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:56:59:56:56:6:50:44:12:6:50:46:13 chr4 187074833 . A G 1572.23 PASS AO=166;DP=168;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00152812;FXX=0.0289001;HRUN=3;LEN=1;MLLD=153.749;QD=37.434;RBI=0.0060205;REFB=-0.0882467;REVB=0.00582333;RO=2;SAF=74;SAR=92;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126865;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000150947;OID=.;OPOS=187074833;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:168:168:2:0:166:168:92:74:2:0:94:74:0:0 chr4 187077206 . A G 2352.2 PASS AO=247;DP=250;FAO=248;FDP=248;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=160;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124781;FXX=0.00799968;HRUN=3;LEN=1;MLLD=125.75;QD=37.9387;RBI=0.0309739;REFB=-0.00890945;REVB=-0.0283492;RO=1;SAF=88;SAR=159;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00298863;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.76809e-05;OID=.;OPOS=187077206;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:250:248:1:0:247:248:159:88:0:1:160:88:0:0 chr4 187078785 . A G 1801.79 PASS AO=187;DP=190;FAO=189;FDP=189;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=122;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0298256;FXX=0.0104707;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.7209;QD=38.1331;RBI=0.0444644;REFB=0;REVB=0.0329776;RO=0;SAF=66;SAR=121;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.29617e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000314437;OID=.;OPOS=187078785;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:190:189:0:0:187:189:121:66:0:0:122:67:0:0 chr4 187078866 . C T 92.37 PASS AO=27;DP=70;FAO=27;FDP=70;FR=.;FRO=43;FSAF=5;FSAR=22;FSRF=6;FSRR=37;FWDB=-0.0288612;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=75.2428;QD=5.27825;RBI=0.053126;REFB=-0.00590277;REVB=0.0446028;RO=43;SAF=5;SAR=22;SRF=6;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0867519;STB=0.549314;TYPE=snp;VARB=0.021441;OID=.;OPOS=187078866;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:70:70:43:43:27:27:22:5:6:37:22:5:6:37 chr4 187079047 . A G 1205.1 PASS AO=125;DP=127;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0136189;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.3811;QD=38.257;RBI=0.0604206;REFB=0;REVB=-0.0588657;RO=0;SAF=62;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000403961;OID=.;OPOS=187079047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:127:126:0:0:125:126:63:62:0:0:64:62:0:0 chr4 187120211 . C A 769.12 PASS AO=80;DP=80;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0238391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.565;QD=37.9811;RBI=0.0350493;REFB=0;REVB=-0.0256933;RO=0;SAF=26;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000126192;OID=.;OPOS=187120211;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:80:81:0:0:80:81:54:26:0:0:55:26:0:0 chr4 187122319 . T G 1770.72 PASS AO=184;DP=184;FAO=185;FDP=185;FR=.;FRO=0;FSAF=112;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.29;QD=38.2859;RBI=0.0532678;REFB=0;REVB=0.0515199;RO=0;SAF=112;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.24391e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.0362e-05;OID=.;OPOS=187122319;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:184:185:0:0:184:185:72:112:0:0:73:112:0:0 chr4 187133576 . A C 1542.36 PASS AO=159;DP=159;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0286715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.468;QD=38.083;RBI=0.0292063;REFB=0;REVB=0.00556354;RO=0;SAF=78;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.03936e-05;OID=.;OPOS=187133576;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:159:162:0:0:159:162:81:78:0:0:84:78:0:0 chr4 187158034 . G A 405.69 PASS AO=89;DP=170;FAO=89;FDP=169;FR=.;FRO=80;FSAF=35;FSAR=54;FSRF=48;FSRR=32;FWDB=0.0189464;FXX=0.00588201;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.6631;QD=9.60205;RBI=0.0203868;REFB=-0.00590463;REVB=-0.00752692;RO=81;SAF=35;SAR=54;SRF=49;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184473;STB=0.598216;TYPE=snp;VARB=0.00311486;OID=.;OPOS=187158034;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:169:81:80:89:89:54:35:49:32:54:35:48:32 chr4 187173012 . T G 401.59 PASS AO=89;DP=171;FAO=89;FDP=171;FR=.;FRO=82;FSAF=40;FSAR=49;FSRF=41;FSRR=41;FWDB=0.031135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.235;QD=9.39382;RBI=0.0353057;REFB=-0.01685;REVB=0.0166464;RO=80;SAF=40;SAR=49;SRF=40;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.043923;STB=0.52437;TYPE=snp;VARB=0.0190253;OID=.;OPOS=187173012;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:171:80:82:89:89:49:40:40:40:49:40:41:41 chr4 187179210 . T C 172.23 PASS AO=48;DP=116;FAO=48;FDP=114;FR=.;FRO=66;FSAF=36;FSAR=12;FSRF=39;FSRR=27;FWDB=0.00595939;FXX=0.0172399;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.299;QD=6.04305;RBI=0.0311555;REFB=-0.00172808;REVB=0.0305802;RO=64;SAF=36;SAR=12;SRF=37;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204638;STB=0.609326;TYPE=snp;VARB=0.00302389;OID=.;OPOS=187179210;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:114:64:66:48:48:12:36:37:27:12:36:39:27 chr4 187422331 . C A 176.72 PASS AO=51;DP=104;FAO=44;FDP=97;FR=.;FRO=53;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=19;FSRR=34;FWDB=-0.0216704;FXX=0.0673012;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.7874;QD=7.28756;RBI=0.0590701;REFB=-0.0186384;REVB=0.0549515;RO=50;SAF=22;SAR=29;SRF=19;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0472552;STB=0.510611;TYPE=snp;VARB=0.0318381;OID=.;OPOS=187422331;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:97:50:53:51:44:29:22:19:31:29:15:19:34 chr4 187519205 . GC G,GG 2465.6 PASS AO=120,127;DP=251;FAO=257,0;FDP=257;FR=.;FRO=0;FSAF=118,0;FSAR=139,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00311737,-0.0621996;FXX=0.011538;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=125.691,111.292;QD=38.3751;RBI=0.0260945,0.0638646;REFB=0,0;REVB=0.0259076,0.0144875;RO=0;SAF=2,115;SAR=118,12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.80953e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.000246881,0.0145164;OID=.,.;OPOS=187519206,187519206;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:120,127:248:257,0:257:0:118,0:139,0:0:0:99:0:2,115:118,12:0:0 chr4 187534363 . G A 382.18 PASS AO=111;DP=268;FAO=112;FDP=266;FR=.;FRO=154;FSAF=37;FSAR=75;FSRF=77;FSRR=77;FWDB=-0.0366789;FXX=0.029196;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.68;QD=5.7471;RBI=0.0381048;REFB=0.00518249;REVB=0.0103266;RO=150;SAF=37;SAR=74;SRF=74;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173185;STB=0.603198;TYPE=snp;VARB=-0.00740761;OID=.;OPOS=187534363;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:268:266:150:154:111:112:74:37:74:76:75:37:77:77 chr4 187534375 . A G 438.28 PASS AO=125;DP=293;FAO=125;FDP=293;FR=.;FRO=168;FSAF=45;FSAR=80;FSRF=84;FSRR=84;FWDB=-0.0159842;FXX=0.00340124;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.741;QD=5.98332;RBI=0.0380668;REFB=-0.0114649;REVB=-0.0345483;RO=167;SAF=45;SAR=80;SRF=83;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145573;STB=0.583037;TYPE=snp;VARB=0.0132257;OID=.;OPOS=187534375;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:293:293:167:168:125:125:80:45:83:84:80:45:84:84 chr4 187538330 . G A 218.67 PASS AO=73;DP=196;FAO=73;FDP=196;FR=.;FRO=123;FSAF=36;FSAR=37;FSRF=57;FSRR=66;FWDB=-0.0250375;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.24;QD=4.4627;RBI=0.0310337;REFB=-0.00768077;REVB=0.0183361;RO=123;SAF=36;SAR=37;SRF=57;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0329636;STB=0.518669;TYPE=snp;VARB=0.012923;OID=.;OPOS=187538330;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:196:123:123:73:73:37:36:57:66:37:36:57:66 chr4 187538942 . T G 428.95 PASS AO=131;DP=318;FAO=130;FDP=318;FR=.;FRO=188;FSAF=68;FSAR=62;FSRF=82;FSRR=106;FWDB=0.00953458;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.003;QD=5.39556;RBI=0.023762;REFB=0.00265575;REVB=0.0217652;RO=144;SAF=70;SAR=61;SRF=73;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.026122;STB=0.551237;TYPE=snp;VARB=-0.00828598;OID=.;OPOS=187538942;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:318:318:144:188:131:130:61:70:73:71:62:68:82:106 chr4 187557893 . T C 777.4 PASS AO=204;DP=425;FAO=193;FDP=399;FR=.;FRO=206;FSAF=112;FSAR=81;FSRF=98;FSRR=108;FWDB=-0.00398229;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.0077;QD=7.79349;RBI=0.0849864;REFB=-0.0255491;REVB=0.0848931;RO=218;SAF=119;SAR=85;SRF=103;SRR=115;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105163;STB=0.55445;TYPE=snp;VARB=0.0265306;OID=.;OPOS=187557893;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:425:399:218:206:204:193:85:119:103:115:81:112:98:108 chr4 187627792 . T C 1514.3 PASS AO=158;DP=158;FAO=158;FDP=158;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0211626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.734;QD=38.3367;RBI=0.0266291;REFB=0;REVB=-0.0161634;RO=0;SAF=58;SAR=100;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.63812e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.09094e-05;OID=.;OPOS=187627792;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:158:158:0:0:158:158:100:58:0:0:100:58:0:0 chr4 187628398 . C G 1680.35 PASS AO=176;DP=178;FAO=179;FDP=179;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=117;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0416122;FXX=0.0324307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.9674;QD=37.5497;RBI=0.0663218;REFB=-0.0244077;REVB=0.051643;RO=1;SAF=59;SAR=117;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00799941;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000246532;OID=.;OPOS=187628398;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:178:179:1:0:176:179:117:59:1:0:117:62:0:0 chr4 187629140 . G C 850.07 PASS AO=89;DP=91;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301083;FXX=0.0219756;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.4382;QD=38.2052;RBI=0.0457784;REFB=0;REVB=0.0344841;RO=0;SAF=48;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30324e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000334307;OID=.;OPOS=187629140;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:91:89:0:0:89:89:41:48:0:0:41:48:0:0 chr4 187629497 . G A 1340.57 PASS AO=70;DP=138;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145265;FXX=0.0344804;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.942;QD=38.3019;RBI=0.0145332;REFB=0;REVB=-0.000441599;RO=0;SAF=3;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.22387e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00017044;OID=.;OPOS=187629497;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:75:140:0:0:70:140:67:3:0:0:74:66:0:0 chr4 187629538 . C T 1812.02 PASS AO=193;DP=195;FAO=193;FDP=193;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0248077;FXX=0.0102559;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.047;QD=37.5547;RBI=0.072059;REFB=-0.0902046;REVB=0.0676541;RO=2;SAF=103;SAR=90;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0104638;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000456863;OID=.;OPOS=187629538;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:195:193:2:0:193:193:90:103:0:2:90:103:0:0 chr4 187629770 . A C 1859.68 PASS AO=210;DP=214;FAO=201;FDP=201;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=108;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144578;FXX=0.00495025;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.727;QD=37.0086;RBI=0.0409558;REFB=0;REVB=-0.0383191;RO=3;SAF=93;SAR=117;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0151159;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.90238e-05;OID=.;OPOS=187629770;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:214:201:3:0:210:201:117:93:3:0:108:93:0:0 chr4 188924979 . C T 214.28 PASS AO=37;DP=71;FAO=43;FDP=76;FR=.;FRO=33;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=0.0150899;FXX=0.0379699;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.324;QD=11.2781;RBI=0.01596;REFB=-0.012147;REVB=0.00519787;RO=34;SAF=19;SAR=18;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0370587;STB=0.534867;TYPE=snp;VARB=0.0112395;OID=.;OPOS=188924979;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:76:34:33:37:43:18:19:16:18:20:23:15:18 chr4 188925080 . C CT,T 30.29 PASS AO=11,12;DP=57;FAO=18,0;FDP=55;FR=.;FRO=37;FSAF=2,0;FSAR=16,0;FSRF=9;FSRR=28;FWDB=0.191918,-0.00055992;FXX=0.017854;HRUN=4,1;LEN=1,1;MLLD=10.0357,155.427;QD=2.2028;RBI=0.206604,0.00580658;REFB=-0.0852823,-0.00627638;REVB=0.0765024,0.00577952;RO=34;SAF=0,3;SAR=11,9;SRF=9;SRR=25;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.707678,-0.0229713;STB=0.666444,0.5;TYPE=ins,snp;VARB=0.196241,0;OID=.,.;OPOS=188925081,188925080;OREF=-,C;OALT=T,T;OMAPALT=CT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:57:55:34:37:11,12:18,0:11,9:0,3:9:25:16,0:2,0:9:28 chr4 188925176 . T TGAC 316.04 PASS AO=78;DP=170;FAO=78;FDP=162;FR=.;FRO=84;FSAF=33;FSAR=45;FSRF=39;FSRR=45;FWDB=-0.0262735;FXX=0.0470561;HRUN=0;LEN=3;MLLD=258.362;QD=7.80334;RBI=0.0263019;REFB=-0.0123682;REVB=-0.00122176;RO=86;SAF=33;SAR=45;SRF=38;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0181816;STB=0.521734;TYPE=ins;VARB=0.0135468;OID=.;OPOS=188925177;OREF=-;OALT=GAC;OMAPALT=TGAC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:78:170:78:162:84:33:45:39:45:99:86:33:45:38:48 chr4 188925449 . T A 560.58 PASS AO=46;DP=64;FAO=71;FDP=73;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.236288;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=37.7944;QD=30.7167;RBI=0.236396;REFB=-0.000469707;REVB=0.00712485;RO=17;SAF=8;SAR=38;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139462;STB=0.510414;TYPE=snp;VARB=0.0115221;OID=.;OPOS=188925449;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:64:73:17:2:46:71:38:8:6:11:47:24:0:2 chr4 189012728 . G C 959.77 PASS AO=103;DP=103;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=6.55598e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.007;QD=36.9144;RBI=0.00774627;REFB=0;REVB=0.00774599;RO=0;SAF=44;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.03381e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00217036;OID=.;OPOS=189012728;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:103:104:0:0:103:104:59:44:0:0:60:44:0:0 chr4 189018486 . A G 994.78 PASS AO=109;DP=112;FAO=110;FDP=112;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=67;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00190614;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.9866;QD=35.5277;RBI=0.0026251;REFB=-0.176572;REVB=-0.00180493;RO=1;SAF=43;SAR=66;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0109111;STB=0.502043;TYPE=snp;VARB=0.00407296;OID=.;OPOS=189018486;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:112:112:1:2:109:110:66:43:1:0:67:43:1:1 chr4 189026524 . C G 1302.6 PASS AO=142;DP=146;FAO=143;FDP=146;FR=.;FRO=3;FSAF=66;FSAR=77;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0110346;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.7093;QD=35.6878;RBI=0.0115072;REFB=-0.0627762;REVB=-0.00326392;RO=3;SAF=66;SAR=76;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00519776;STB=0.504237;TYPE=snp;VARB=0.000361697;OID=.;OPOS=189026524;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:146:146:3:3:142:143:76:66:1:2:77:66:2:1 chr4 190630778 . GC AT 1703.64 PASS AO=280;DP=466;FAO=246;FDP=392;FR=.,HEALED;FRO=95;FSAF=120;FSAR=126;FSRF=60;FSRR=35;FWDB=0.0504896;FXX=0.0199995;HRUN=1;LEN=2;MLLD=155.701;QD=17.3841;RBI=0.0517357;REFB=-0.0436852;REVB=0.0112861;RO=87;SAF=135;SAR=145;SRF=59;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0873159;STB=0.539997;TYPE=mnp;VARB=0.0136702;OID=.;OPOS=190630778;OREF=GC;OALT=AT;OMAPALT=AT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:455:392:87:95:280:246:145:135:59:28:126:120:60:35 chr4 190630786 . A G 1463.66 PASS AO=309;DP=487;FAO=259;FDP=400;FR=.;FRO=141;FSAF=123;FSAR=136;FSRF=57;FSRR=84;FWDB=0.0137855;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.447;QD=14.6366;RBI=0.0235382;REFB=-0.0154147;REVB=-0.019079;RO=178;SAF=144;SAR=165;SRF=76;SRR=102;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0267542;STB=0.525027;TYPE=snp;VARB=0.00897785;OID=.;OPOS=190630786;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:487:400:178:141:309:259:165:144:76:102:136:123:57:84 chr4 190814952 . T C 10.84 PASS AO=12;DP=80;FAO=12;FDP=78;FR=.;FRO=66;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=44;FSRR=22;FWDB=-0.00769063;FXX=0.0249969;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.4839;QD=0.555928;RBI=0.0625102;REFB=-0.0143012;REVB=0.0620353;RO=66;SAF=6;SAR=6;SRF=44;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211449;STB=0.640809;TYPE=snp;VARB=0.0704398;OID=.;OPOS=190814952;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:80:78:66:66:12:12:6:6:44:22:6:6:44:22 chr4 190814990 . T C 26.31 PASS AO=18;DP=85;FAO=18;FDP=86;FR=.;FRO=68;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=42;FSRR=26;FWDB=0.0226929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.0044;QD=1.22381;RBI=0.0285079;REFB=0.00373653;REVB=0.017255;RO=67;SAF=9;SAR=9;SRF=42;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1601;STB=0.592923;TYPE=snp;VARB=-0.00657619;OID=.;OPOS=190814990;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:85:86:67:68:18:18:9:9:42:25:9:9:42:26 chr4 190815066 . CA C,CG 148.57 PASS AO=9,5;DP=22;FAO=15,2;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=4,1;FSAR=11,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.109788,-0.127098;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=154.217,149.391;QD=34.9565;RBI=0.110537,0.130651;REFB=0,0;REVB=-0.0128431,-0.0302628;RO=0;SAF=1,1;SAR=8,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.00457293,-0.0426517;OID=.,.;OPOS=190815067,190815067;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:9,5:16:15,2:17:0:4,1:11,1:0:0:5:0:1,1:8,4:0:0 chr4 190874206 . T A 110.55 PASS AO=72;DP=299;FAO=73;FDP=299;FR=.;FRO=226;FSAF=34;FSAR=39;FSRF=141;FSRR=85;FWDB=-0.00471285;FXX=0.0066443;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.066;QD=1.47898;RBI=0.0408896;REFB=-0.000759468;REVB=-0.0406171;RO=222;SAF=32;SAR=40;SRF=139;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226776;STB=0.618119;TYPE=snp;VARB=0.000678377;OID=.;OPOS=190874206;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:299:299:222:226:72:73:40:32:139:83:39:34:141:85 chr4 190874234 . C T 152.91 PASS AO=89;DP=338;FAO=89;FDP=337;FR=.;FRO=248;FSAF=38;FSAR=51;FSRF=155;FSRR=93;FWDB=-0.0153222;FXX=0.00295849;HRUN=3;LEN=1;MLLD=217.626;QD=1.81498;RBI=0.0294991;REFB=0.00103571;REVB=0.0252077;RO=248;SAF=38;SAR=51;SRF=155;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243142;STB=0.642672;TYPE=snp;VARB=-0.00265182;OID=.;OPOS=190874234;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:338:337:248:248:89:89:51:38:155:93:51:38:155:93 chr4 190876195 . C T 163.17 PASS AO=70;DP=225;FAO=70;FDP=224;FR=.;FRO=154;FSAF=41;FSAR=29;FSRF=74;FSRR=80;FWDB=-0.033369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.607;QD=2.91369;RBI=0.0430096;REFB=-0.0010628;REVB=-0.0271354;RO=154;SAF=41;SAR=29;SRF=74;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125508;STB=0.572634;TYPE=snp;VARB=0.00240083;OID=.;OPOS=190876195;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:225:224:154:154:70:70:29:41:74:80:29:41:74:80 chr4 190876204 . G A 342.65 PASS AO=95;DP=240;FAO=96;FDP=225;FR=.;FRO=129;FSAF=53;FSAR=43;FSRF=69;FSRR=60;FWDB=0.0331839;FXX=0.0624974;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.72;QD=6.09149;RBI=0.0379798;REFB=-0.0300797;REVB=0.0184741;RO=129;SAF=54;SAR=41;SRF=69;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0350764;STB=0.509947;TYPE=snp;VARB=0.0261561;OID=.;OPOS=190876204;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:240:225:129:129:95:96:41:54:69:60:43:53:69:60 chr4 190876242 . G A 982.69 PASS AO=194;DP=329;FAO=193;FDP=328;FR=.;FRO=135;FSAF=97;FSAR=96;FSRF=65;FSRR=70;FWDB=0.0255217;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.8924;QD=11.9841;RBI=0.0278567;REFB=-0.0027528;REVB=-0.0111641;RO=131;SAF=97;SAR=97;SRF=63;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0142402;STB=0.508687;TYPE=snp;VARB=0.00214493;OID=.;OPOS=190876242;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:329:328:131:135:194:193:97:97:63:68:96:97:65:70 chr4 190878597 . C T 269.68 PASS AO=98;DP=277;FAO=97;FDP=272;FR=.;FRO=175;FSAF=20;FSAR=77;FSRF=72;FSRR=103;FWDB=-0.00492123;FXX=0.0180499;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.3815;QD=3.96584;RBI=0.0263281;REFB=-0.0117437;REVB=-0.0258641;RO=174;SAF=21;SAR=77;SRF=72;SRR=102;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.271425;STB=0.66301;TYPE=snp;VARB=0.0281182;OID=.;OPOS=190878597;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:277:272:174:175:98:97:77:21:72:102:77:20:72:103 chr4 190906025 . G A 63.59 PASS AO=18;DP=47;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=1;FSRF=24;FSRR=5;FWDB=-0.0267034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.993;QD=5.41226;RBI=0.0271934;REFB=-0.0101414;REVB=0.00513922;RO=29;SAF=17;SAR=1;SRF=24;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.351193;STB=0.712974;TYPE=snp;VARB=0.0151399;OID=.;OPOS=190906025;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:47:47:29:29:18:18:1:17:24:5:1:17:24:5 chr5 163260 . A C 66.79 PASS AO=7;DP=7;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.136623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.6683;QD=33.3959;RBI=0.148087;REFB=0;REVB=0.0571288;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0259801;OID=.;OPOS=163260;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:8:0:0:7:8:3:4:0:0:3:5:0:0 chr5 163265 . GC G,GG 74.81 PASS AO=3,4;DP=7;FAO=2,6;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=1,4;FSAR=1,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0788868,0.100074;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=170.137,179.228;QD=37.4066;RBI=0.0923144,0.102486;REFB=0,0;REVB=0.0479459,0.0221027;RO=0;SAF=3,1;SAR=0,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.86674e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0500602,-0.0246177;OID=.,.;OPOS=163266,163266;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:3,4:7:2,6:8:0:1,4:1,2:0:0:10:0:3,1:0,3:0:0 chr5 174106 . G A 293.36 PASS AO=75;DP=162;FAO=75;FDP=163;FR=.;FRO=88;FSAF=45;FSAR=30;FSRF=47;FSRR=41;FWDB=0.000829759;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.844;QD=7.19904;RBI=0.0360352;REFB=-0.00816695;REVB=0.0360257;RO=86;SAF=45;SAR=30;SRF=47;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0530236;STB=0.536514;TYPE=snp;VARB=0.00993388;OID=.;OPOS=174106;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:163:86:88:75:75:30:45:47:39:30:45:47:41 chr5 181659 . GT G,GG 146.27 PASS AO=3,10;DP=16;FAO=2,14;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=0,12;FSAR=2,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.043767,0.0577744;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=120.901,136.59;QD=36.5673;RBI=0.160194,0.17024;REFB=0,0;REVB=0.154099,0.160137;RO=0;SAF=1,10;SAR=2,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0875658,-0.00178531;OID=.,.;OPOS=181660,181660;OREF=T,T;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:3,10:14:2,14:16:0:0,12:2,2:0:0:5:0:1,10:2,0:0:0 chr5 181730 . C G 46.48 PASS AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.0153724;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.376;QD=5.99694;RBI=0.0369686;REFB=-0.0274916;REVB=-0.0336209;RO=17;SAF=5;SAR=7;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226981;STB=0.598767;TYPE=snp;VARB=0.0540848;OID=.;OPOS=181730;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:31:31:17:19:12:12:7:5:11:6:7:5:11:8 chr5 181762 . A G 297.43 PASS AO=27;DP=27;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000449323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.273;QD=37.1791;RBI=0.105659;REFB=0;REVB=0.105658;RO=0;SAF=12;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000536653;OID=.;OPOS=181762;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:27:32:0:0:27:32:15:12:0:0:19:13:0:0 chr5 182291 . A G 48.85 PASS AO=14;DP=41;FAO=14;FDP=39;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0112972;FXX=0.0487686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.193;QD=5.01032;RBI=0.0124897;REFB=-0.00696862;REVB=-0.00532608;RO=24;SAF=7;SAR=7;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512802;TYPE=snp;VARB=0.0165324;OID=.;OPOS=182291;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:41:39:24:25:14:14:7:7:12:12:7:7:13:12 chr5 195318 . T C 98.49 PASS AO=26;DP=62;FAO=26;FDP=62;FR=.;FRO=36;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=0.00151782;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.471;QD=6.35429;RBI=0.0111529;REFB=-0.0257365;REVB=-0.0110491;RO=35;SAF=16;SAR=10;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216571;STB=0.615296;TYPE=snp;VARB=0.0445065;OID=.;OPOS=195318;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:62:62:35:36:26:26:10:16:14:21:10:16:15:21 chr5 205574 . G A 271.83 PASS AO=64;DP=131;FAO=64;FDP=131;FR=.;FRO=67;FSAF=31;FSAR=33;FSRF=25;FSRR=42;FWDB=0.0331928;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.4018;QD=8.30017;RBI=0.0340006;REFB=-0.0217774;REVB=0.00736759;RO=67;SAF=31;SAR=33;SRF=25;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103536;STB=0.557136;TYPE=snp;VARB=0.0248568;OID=.;OPOS=205574;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:67:67:64:64:33:31:25:42:33:31:25:42 chr5 220433 . T TG 155 PASS AO=54;DP=117;FAO=55;FDP=109;FR=.;FRO=54;FSAF=22;FSAR=33;FSRF=23;FSRR=31;FWDB=-0.0287799;FXX=0.0180164;HRUN=2;LEN=1;MLLD=19.7378;QD=5.68817;RBI=0.0988576;REFB=0.0506824;REVB=-0.0945756;RO=61;SAF=22;SAR=32;SRF=28;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0504236;STB=0.513303;TYPE=ins;VARB=-0.0578023;OID=.;OPOS=220434;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:54:117:55:109:54:22:33:23:31:99:61:22:32:28:33 chr5 224633 . A G 40.35 PASS AO=11;DP=30;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.00390908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.7515;QD=5.37934;RBI=0.0988446;REFB=-0.0515681;REVB=-0.0987672;RO=19;SAF=3;SAR=8;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232226;STB=0.639731;TYPE=snp;VARB=0.0834852;OID=.;OPOS=224633;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:30:30:19:19:11:11:8:3:9:10:8:3:9:10 chr5 226160 . A C 127.81 PASS AO=53;DP=167;FAO=53;FDP=167;FR=.;FRO=114;FSAF=37;FSAR=16;FSRF=62;FSRR=52;FWDB=-0.00565274;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=264.028;QD=3.06123;RBI=0.0338993;REFB=-0.00768011;REVB=-0.0334247;RO=110;SAF=37;SAR=16;SRF=60;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191802;STB=0.613614;TYPE=snp;VARB=0.0126353;OID=.;OPOS=226160;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:167:110:114:53:53:16:37:60:50:16:37:62:52 chr5 228362 . T C 385.99 PASS AO=100;DP=226;FAO=101;FDP=221;FR=.;FRO=120;FSAF=52;FSAR=49;FSRF=56;FSRR=64;FWDB=0.0019625;FXX=0.0221229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.728;QD=6.98631;RBI=0.00435811;REFB=0.017131;REVB=0.00389124;RO=115;SAF=51;SAR=49;SRF=56;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0222883;STB=0.526141;TYPE=snp;VARB=-0.0181856;OID=.;OPOS=228362;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:226:221:115:120:100:101:49:51:56:59:49:52:56:64 chr5 231111 . T C 1121.88 PASS AO=113;DP=114;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00537356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.472;QD=38.3549;RBI=0.0128172;REFB=0;REVB=0.0116363;RO=0;SAF=45;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.42864e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.87249e-05;OID=.;OPOS=231111;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:114:117:0:0:113:117:68:45:0:0:70:47:0:0 chr5 233734 . C G 705.48 PASS AO=234;DP=508;FAO=183;FDP=398;FR=.;FRO=215;FSAF=91;FSAR=92;FSRF=108;FSRR=107;FWDB=0.0695103;FXX=0.00499988;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.9687;QD=7.0902;RBI=0.0703182;REFB=-0.0174544;REVB=-0.0106283;RO=265;SAF=115;SAR=119;SRF=133;SRR=132;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0100714;STB=0.502732;TYPE=snp;VARB=0.0212319;OID=.;OPOS=233734;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:508:398:265:215:234:183:119:115:133:132:92:91:108:107 chr5 235364 . C T 309.61 PASS AO=75;DP=176;FAO=84;FDP=185;FR=.;FRO=101;FSAF=27;FSAR=57;FSRF=34;FSRR=67;FWDB=0.0729585;FXX=0.00537606;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.32;QD=6.69431;RBI=0.0729719;REFB=-0.0200163;REVB=-0.00139525;RO=100;SAF=18;SAR=57;SRF=33;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116923;STB=0.509448;TYPE=snp;VARB=0.0205107;OID=.;OPOS=235364;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:185:100:101:75:84:57:18:33:67:57:27:34:67 chr5 235548 . T C 1481.92 PASS AO=155;DP=155;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0178284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.906;QD=38.243;RBI=0.0217624;REFB=0;REVB=-0.0124801;RO=0;SAF=48;SAR=107;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.10735e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.39082e-06;OID=.;OPOS=235548;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:155:155:0:0:155:155:107:48:0:0:107:48:0:0 chr5 251469 . G A 33.19 PASS AO=10;DP=31;FAO=10;FDP=31;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.0468435;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.978;QD=4.28315;RBI=0.0691946;REFB=-0.00162087;REVB=0.0509271;RO=21;SAF=2;SAR=8;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194481;STB=0.620424;TYPE=snp;VARB=0.00413882;OID=.;OPOS=251469;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:31:31:21:21:10:10:8:2:7:14:8:2:7:14 chr5 251541 . A G 35.28 PASS AO=17;DP=68;FAO=17;FDP=67;FR=.;FRO=50;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=29;FWDB=0.00494704;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.134;QD=2.10633;RBI=0.0129572;REFB=-0.0160639;REVB=-0.0119756;RO=50;SAF=6;SAR=11;SRF=21;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.086217;STB=0.553009;TYPE=snp;VARB=0.0265882;OID=.;OPOS=251541;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:68:67:50:50:17:17:11:6:21:29:11:6:21:29 chr5 251784 . C T 69.38 PASS AO=21;DP=56;FAO=21;FDP=57;FR=.;FRO=36;FSAF=2;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=26;FWDB=-0.0335695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.4652;QD=4.86894;RBI=0.0348379;REFB=-0.0165343;REVB=-0.00931483;RO=27;SAF=2;SAR=19;SRF=2;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0645716;STB=0.716722;TYPE=snp;VARB=0.0266147;OID=.;OPOS=251784;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:56:57:27:36:21:21:19:2:2:25:19:2:10:26 chr5 251792 . A G 197.95 PASS AO=33;DP=52;FAO=34;FDP=52;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=25;FSRF=2;FSRR=16;FWDB=-0.00722324;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.053;QD=15.2271;RBI=0.0151043;REFB=-0.0296633;REVB=0.0132652;RO=18;SAF=9;SAR=24;SRF=2;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141641;STB=0.572942;TYPE=snp;VARB=0.0191996;OID=.;OPOS=251792;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:52:52:18:18:33:34:24:9:2:16:25:9:2:16 chr5 256472 . G A 446.81 PASS AO=104;DP=206;FAO=103;FDP=204;FR=.;FRO=101;FSAF=49;FSAR=54;FSRF=55;FSRR=46;FWDB=-0.0090902;FXX=0.0192298;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.123;QD=8.76101;RBI=0.00928767;REFB=-0.0115898;REVB=0.00190504;RO=101;SAF=49;SAR=55;SRF=55;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0658532;STB=0.534037;TYPE=snp;VARB=0.0112378;OID=.;OPOS=256472;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:206:204:101:101:104:103:55:49:55:46:54:49:55:46 chr5 311478 . T C 542.53 PASS AO=62;DP=65;FAO=62;FDP=65;FR=.;FRO=3;FSAF=36;FSAR=26;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0558986;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.684;QD=33.3866;RBI=0.0564987;REFB=-0.17232;REVB=0.00821284;RO=1;SAF=36;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129354;STB=0.519994;TYPE=snp;VARB=0.000554634;OID=.;OPOS=311478;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:65:65:1:3:62:62:26:36:1:0:26:36:3:0 chr5 315073 . G A 324.92 PASS AO=80;DP=168;FAO=81;FDP=171;FR=.;FRO=90;FSAF=40;FSAR=41;FSRF=44;FSRR=46;FWDB=0.0324687;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.5589;QD=7.6004;RBI=0.0812151;REFB=-0.00381411;REVB=0.0744424;RO=88;SAF=39;SAR=41;SRF=44;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011847;STB=0.502599;TYPE=snp;VARB=0.00381022;OID=.;OPOS=315073;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:171:88:90:80:81:41:39:44:44:41:40:44:46 chr5 376809 . T C 147.46 PASS AO=33;DP=70;FAO=34;FDP=71;FR=.;FRO=37;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=-0.0467821;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.631;QD=8.30736;RBI=0.0470285;REFB=-0.0182464;REVB=-0.00480765;RO=37;SAF=20;SAR=13;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114732;STB=0.553659;TYPE=snp;VARB=0.0188609;OID=.;OPOS=376809;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:71:37:37:33:34:13:20:18:19:14:20:18:19 chr5 422955 . C G 65.98 PASS AO=12;DP=32;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.0247959;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=39.1564;QD=7.3313;RBI=0.0933892;REFB=-0.00644282;REVB=-0.0900373;RO=20;SAF=3;SAR=9;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.238155;STB=0.554194;TYPE=snp;VARB=0.00262239;OID=.;OPOS=422955;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:32:36:20:20:12:16:9:3:9:11:11:5:8:12 chr5 453567 . G A 170.86 PASS AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.028129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.819;QD=37.9685;RBI=0.0701366;REFB=0;REVB=0.0642488;RO=0;SAF=17;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.001871;OID=.;OPOS=453567;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:18:0:0:18:18:1:17:0:0:1:17:0:0 chr5 462465 . C A 1331.07 PASS AO=144;DP=147;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145251;FXX=0.0204068;HRUN=3;LEN=1;MLLD=252.217;QD=36.9741;RBI=0.0261841;REFB=0.0132576;REVB=0.0217859;RO=1;SAF=56;SAR=88;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0053736;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.38453e-05;OID=.;OPOS=462465;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:147:144:1:0:144:144:88:56:0:1:88:56:0:0 chr5 475104 . A G 125.84 PASS AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0472986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.6484;QD=35.9533;RBI=0.0914548;REFB=0;REVB=0.0782741;RO=0;SAF=12;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000833583;OID=.;OPOS=475104;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:14:14:0:0:14:14:2:12:0:0:2:12:0:0 chr5 482186 . C G 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.209844;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.0613;QD=33.0193;RBI=0.244282;REFB=0;REVB=0.125057;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0390659;OID=.;OPOS=482186;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:2:4:0:0:2:4:0:0 chr5 601966 . T A 293.06 PASS AO=70;DP=143;FAO=70;FDP=144;FR=.;FRO=74;FSAF=35;FSAR=35;FSRF=36;FSRR=38;FWDB=-0.0326492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5256;QD=8.1405;RBI=0.0422443;REFB=-0.0187832;REVB=0.0268069;RO=71;SAF=35;SAR=35;SRF=34;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192868;STB=0.506942;TYPE=snp;VARB=0.0156052;OID=.;OPOS=601966;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:144:71:74:70:70:35:35:34:37:35:35:36:38 chr5 640705 . A G 131.2 PASS AO=29;DP=59;FAO=29;FDP=58;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.0586159;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.4453;QD=9.0481;RBI=0.0600026;REFB=-0.0465395;REVB=-0.0128255;RO=29;SAF=9;SAR=20;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135216;STB=0.575862;TYPE=snp;VARB=0.0479936;OID=.;OPOS=640705;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:58:29:29:29:29:20:9:13:16:20:9:13:16 chr5 665280 . T C 117.19 PASS AO=24;DP=47;FAO=25;FDP=48;FR=.;FRO=23;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=0.00633156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.895;QD=9.76598;RBI=0.00633358;REFB=-0.00994005;REVB=-0.000159809;RO=23;SAF=16;SAR=8;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0287827;STB=0.508664;TYPE=snp;VARB=0.00821835;OID=.;OPOS=665280;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:48:23:23:24:25:8:16:16:7:8:17:16:7 chr5 678062 . A G 87.25 PASS AO=27;DP=72;FAO=27;FDP=73;FR=.;FRO=46;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=-0.0817702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.01;QD=4.7807;RBI=0.081946;REFB=-0.00594906;REVB=0.00536494;RO=45;SAF=7;SAR=20;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.29515;STB=0.678198;TYPE=snp;VARB=0.00494278;OID=.;OPOS=678062;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:72:73:45:46:27:27:20:7:23:22:20:7:24:22 chr5 741736 . G T 447.29 PASS AO=41;DP=41;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0326553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.444;QD=38.0668;RBI=0.0436687;REFB=0;REVB=0.0289928;RO=0;SAF=10;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.09277e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000343406;OID=.;OPOS=741736;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:41:47:0:0:41:47:31:10:0:0:34:13:0:0 chr5 745306 . A C 97.78 PASS AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0421355;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=239.286;QD=30.0852;RBI=0.065104;REFB=-0.0434822;REVB=0.04963;RO=0;SAF=1;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.23983e-08;STB=0.521703;TYPE=snp;VARB=0.000668938;OID=.;OPOS=745306;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:13:13:0:1:12:12:11:1:0:0:11:1:0:1 chr5 766910 . C T 868.91 PASS AO=159;DP=266;FAO=160;FDP=257;FR=.;FRO=97;FSAF=57;FSAR=103;FSRF=45;FSRR=52;FWDB=0.00714897;FXX=0.0374518;HRUN=3;LEN=1;MLLD=188.287;QD=13.5238;RBI=0.00904978;REFB=-0.00811453;REVB=0.00554894;RO=91;SAF=57;SAR=102;SRF=41;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0662293;STB=0.543193;TYPE=snp;VARB=0.00438325;OID=.;OPOS=766910;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:266:257:91:97:159:160:102:57:41:50:103:57:45:52 chr5 766939 . G A 250.91 PASS AO=92;DP=268;FAO=94;FDP=271;FR=.;FRO=177;FSAF=43;FSAR=51;FSRF=63;FSRR=114;FWDB=0.00907854;FXX=0.0109485;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.977;QD=3.70343;RBI=0.00922506;REFB=-0.0104502;REVB=0.00163767;RO=171;SAF=42;SAR=50;SRF=62;SRR=109;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109607;STB=0.567541;TYPE=snp;VARB=0.0239062;OID=.;OPOS=766939;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:268:271:171:177:92:94:50:42:62:109:51:43:63:114 chr5 767033 . A C 513.75 PASS AO=81;DP=120;FAO=85;FDP=123;FR=.;FRO=38;FSAF=27;FSAR=58;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=-0.00223491;FXX=0.0159987;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.094;QD=16.7073;RBI=0.00641809;REFB=-0.0124812;REVB=-0.00601639;RO=38;SAF=25;SAR=56;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0755379;STB=0.535874;TYPE=snp;VARB=0.00501941;OID=.;OPOS=767033;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:120:123:38:38:81:85:56:25:16:22:58:27:16:22 chr5 796251 . T C 43.17 PASS AO=10;DP=30;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.00488626;FXX=0.0644953;HRUN=3;LEN=1;MLLD=108.877;QD=5.95406;RBI=0.0442887;REFB=-0.00446641;REVB=0.0440184;RO=18;SAF=6;SAR=4;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.27891;STB=0.629404;TYPE=snp;VARB=0.00454976;OID=.;OPOS=796251;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:30:29:18:18:10:11:4:6:6:12:5:6:6:12 chr5 840342 . A G 196.4 PASS AO=90;DP=297;FAO=90;FDP=297;FR=.;FRO=207;FSAF=57;FSAR=33;FSRF=128;FSRR=79;FWDB=-0.0403808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.825;QD=2.64507;RBI=0.0710606;REFB=-0.0222578;REVB=-0.0584722;RO=206;SAF=57;SAR=33;SRF=127;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0216009;STB=0.511167;TYPE=snp;VARB=0.0603424;OID=.;OPOS=840342;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:297:297:206:207:90:90:33:57:127:79:33:57:128:79 chr5 843723 . C A 40.23 PASS AO=23;DP=97;FAO=23;FDP=96;FR=.;FRO=73;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=38;FSRR=35;FWDB=0.0176221;FXX=0.0103082;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.021;QD=1.67605;RBI=0.0278844;REFB=-0.00666393;REVB=-0.0216103;RO=72;SAF=17;SAR=6;SRF=38;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280548;STB=0.678512;TYPE=snp;VARB=0.0464333;OID=.;OPOS=843723;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:97:96:72:73:23:23:6:17:38:34:6:17:38:35 chr5 878525 . T A 187.42 PASS AO=74;DP=235;FAO=77;FDP=237;FR=.;FRO=160;FSAF=38;FSAR=39;FSRF=64;FSRR=96;FWDB=-0.0376329;FXX=0.0042015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.403;QD=3.16326;RBI=0.0382113;REFB=-0.0115763;REVB=-0.00662364;RO=160;SAF=37;SAR=37;SRF=64;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118717;STB=0.563225;TYPE=snp;VARB=0.0276698;OID=.;OPOS=878525;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:235:237:160:160:74:77:37:37:64:96:39:38:64:96 chr5 989660 . C T 24.08 PASS AO=4;DP=6;FAO=4;FDP=6;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=0;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0468294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.6962;QD=16.0538;RBI=0.0468294;REFB=-0.0577312;REVB=0;RO=2;SAF=4;SAR=0;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0228323;OID=.;OPOS=989660;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:2:2:4:4:0:4:2:0:0:4:2:0 chr5 1009145 . C G 73.84 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.961;QD=36.9199;RBI=0.0377462;REFB=0;REVB=0.0377462;RO=0;SAF=0;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00081809;OID=.;OPOS=1009145;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:8:0:0:0:8:0:0:0 chr5 1036900 . C T 456.55 PASS AO=49;DP=50;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.098691;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.091;QD=35.8076;RBI=0.0987565;REFB=-0.0211756;REVB=0.00359519;RO=1;SAF=19;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0241219;STB=0.51219;TYPE=snp;VARB=0.000474816;OID=.;OPOS=1036900;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:50:51:1:1:49:50:30:19:1:0:30:20:1:0 chr5 1036962 . C A 205.88 PASS AO=23;DP=27;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.104624;FXX=0.11107;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.243;QD=34.3141;RBI=0.108583;REFB=-0.0358702;REVB=0.0290546;RO=0;SAF=5;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.513502;TYPE=snp;VARB=0.00352782;OID=.;OPOS=1036962;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:27:24:0:1:23:23:18:5:0:0:18:5:0:1 chr5 1038526 . A G 106.8 PASS AO=14;DP=14;FAO=13;FDP=14;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0643982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.636;QD=30.5148;RBI=0.093982;REFB=-0.0241807;REVB=0.0684507;RO=0;SAF=9;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.555467;TYPE=snp;VARB=0.00335708;OID=.;OPOS=1038526;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:14:14:0:1:14:13:5:9:0:0:4:9:0:1 chr5 1052360 . C T 104.43 PASS AO=24;DP=50;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.0946395;FXX=0.0377287;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.2301;QD=8.19056;RBI=0.0982348;REFB=-0.0156373;REVB=-0.0263333;RO=22;SAF=18;SAR=6;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.316695;STB=0.694566;TYPE=snp;VARB=0.051208;OID=.;OPOS=1052360;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:51:22:27:24:24:6:18:9:13:6:18:11:16 chr5 1057615 . A G 46.76 PASS AO=17;DP=55;FAO=17;FDP=55;FR=.;FRO=38;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=-0.0887098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.083;QD=3.40109;RBI=0.089689;REFB=-0.00977611;REVB=-0.0132172;RO=38;SAF=5;SAR=12;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.249868;STB=0.64993;TYPE=snp;VARB=0.0182657;OID=.;OPOS=1057615;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:55:55:38:38:17:17:12:5:19:19:12:5:19:19 chr5 1063998 . G A 286.6 PASS AO=58;DP=105;FAO=59;FDP=105;FR=.;FRO=46;FSAF=46;FSAR=13;FSRF=30;FSRR=16;FWDB=0.0310523;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.233;QD=10.9182;RBI=0.0442685;REFB=-0.0176631;REVB=0.0315509;RO=46;SAF=46;SAR=12;SRF=29;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176015;STB=0.574478;TYPE=snp;VARB=0.0110206;OID=.;OPOS=1063998;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:46:46:58:59:12:46:29:17:13:46:30:16 chr5 1065399 . C T 102.4 PASS AO=20;DP=36;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.0158676;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=276.385;QD=11.3778;RBI=0.0241502;REFB=-0.0092514;REVB=0.0182059;RO=16;SAF=9;SAR=11;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138107;STB=0.577271;TYPE=snp;VARB=0.0081866;OID=.;OPOS=1065399;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:36:36:16:16:20:20:11:9:10:6:11:9:10:6 chr5 1081702 . A G 84.29 PASS AO=24;DP=64;FAO=25;FDP=64;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=-0.0488737;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5459;QD=5.26823;RBI=0.0791361;REFB=-0.0278407;REVB=-0.0622406;RO=37;SAF=14;SAR=10;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103021;STB=0.559952;TYPE=snp;VARB=0.0756336;OID=.;OPOS=1081702;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:64:64:37:39:24:25:10:14:18:19:11:14:18:21 chr5 1081767 . C T 102.36 PASS AO=26;DP=60;FAO=26;FDP=60;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=0.0498337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.436;QD=6.82427;RBI=0.0519053;REFB=-0.0205698;REVB=-0.0145177;RO=34;SAF=14;SAR=12;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154913;STB=0.58772;TYPE=snp;VARB=0.0341581;OID=.;OPOS=1081767;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:34:34:26:26:12:14:13:21:12:14:13:21 chr5 1208964 . T C 85.63 PASS AO=13;DP=19;FAO=13;FDP=19;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.110104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.9057;QD=18.0278;RBI=0.110158;REFB=-0.0367672;REVB=0.00342048;RO=6;SAF=6;SAR=7;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0216875;STB=0.512176;TYPE=snp;VARB=0.0438095;OID=.;OPOS=1208964;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:19:19:6:6:13:13:7:6:3:3:7:6:3:3 chr5 1213668 . G A 260.72 PASS AO=51;DP=89;FAO=51;FDP=89;FR=.;FRO=38;FSAF=44;FSAR=7;FSRF=35;FSRR=3;FWDB=-0.00562652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.4608;QD=11.7176;RBI=0.0404154;REFB=-0.0501286;REVB=-0.0400218;RO=37;SAF=44;SAR=7;SRF=34;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0989485;STB=0.556878;TYPE=snp;VARB=0.0347127;OID=.;OPOS=1213668;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:37:38:51:51:7:44:34:3:7:44:35:3 chr5 1216775 . A G 90.59 PASS AO=26;DP=66;FAO=26;FDP=66;FR=.;FRO=40;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=28;FWDB=-0.0550067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.4685;QD=5.49036;RBI=0.0597379;REFB=-0.0271419;REVB=-0.0232997;RO=40;SAF=8;SAR=18;SRF=12;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00959163;STB=0.50549;TYPE=snp;VARB=0.0387976;OID=.;OPOS=1216775;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:66:66:40:40:26:26:18:8:12:28:18:8:12:28 chr5 1225613 . G A 65.95 PASS AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=4;FWDB=-0.00373745;FXX=0.0263089;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.881;QD=7.12986;RBI=0.0133458;REFB=-0.010819;REVB=-0.0128118;RO=21;SAF=9;SAR=7;SRF=17;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260042;STB=0.647524;TYPE=snp;VARB=0.00801721;OID=.;OPOS=1225613;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:38:37:21:21:16:16:7:9:17:4:7:9:17:4 chr5 1225626 . T A 59.81 PASS AO=16;DP=41;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=5;FWDB=-0.0364323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.502;QD=5.83504;RBI=0.0434389;REFB=-0.0255493;REVB=0.0236564;RO=25;SAF=9;SAR=7;SRF=20;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.266801;STB=0.652566;TYPE=snp;VARB=0.0233835;OID=.;OPOS=1225626;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:41:41:25:25:16:16:7:9:20:5:7:9:20:5 chr5 1225703 . A G 86.38 PASS AO=19;DP=42;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=0.0560427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.201;QD=7.67802;RBI=0.0560632;REFB=-0.0243015;REVB=-0.00151376;RO=22;SAF=4;SAR=15;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0827631;STB=0.537778;TYPE=snp;VARB=0.0213225;OID=.;OPOS=1225703;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:42:45:22:24:19:21:15:4:6:16:16:5:7:17 chr5 1240757 . C G 85.99 PASS AO=27;DP=71;FAO=26;FDP=70;FR=.;FRO=44;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=31;FWDB=-0.0178158;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.041;QD=4.91344;RBI=0.0223539;REFB=-0.00197817;REVB=-0.0135016;RO=44;SAF=10;SAR=17;SRF=13;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0893194;STB=0.560814;TYPE=snp;VARB=0.00350848;OID=.;OPOS=1240757;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:71:70:44:44:27:26:17:10:13:31:16:10:13:31 chr5 1243708 . G A 131.06 PASS AO=26;DP=47;FAO=26;FDP=47;FR=.;FRO=21;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.00443102;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.044;QD=11.1541;RBI=0.0644356;REFB=-0.0259887;REVB=0.0642831;RO=21;SAF=16;SAR=10;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152097;STB=0.584652;TYPE=snp;VARB=0.0205955;OID=.;OPOS=1243708;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:47:47:21:21:26:26:10:16:9:12:10:16:9:12 chr5 1244425 . C T 1213.95 PASS AO=129;DP=131;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=102;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018346;FXX=0.015266;HRUN=4;LEN=1;MLLD=263.399;QD=37.6418;RBI=0.0184249;REFB=-0.110443;REVB=-0.00170351;RO=1;SAF=102;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00463709;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.54276e-05;OID=.;OPOS=1244425;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:131:129:1:0:129:129:27:102:1:0:27:102:0:0 chr5 1363825 . T C 50.28 PASS AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0161169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.77;QD=8.38066;RBI=0.022294;REFB=-0.019619;REVB=0.0154036;RO=13;SAF=6;SAR=5;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0777652;STB=0.545372;TYPE=snp;VARB=0.0249528;OID=.;OPOS=1363825;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:24:24:13:13:11:11:5:6:6:7:5:6:6:7 chr5 1364617 . G C 601.69 PASS AO=96;DP=221;FAO=101;FDP=210;FR=.,HEALED;FRO=80;FSAF=29;FSAR=72;FSRF=27;FSRR=53;FWDB=-0.0284788;FXX=0.00943352;HRUN=3;LEN=1;MLLD=82.8757;QD=11.4608;RBI=0.0286434;REFB=-0.0817911;REVB=0.00306584;RO=68;SAF=27;SAR=69;SRF=22;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0391243;STB=0.526572;TYPE=snp;VARB=0.0133228;OID=.;OPOS=1364617;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:210:68:80:96:101:69:27:22:46:72:29:27:53 chr5 1394815 . A G 302.18 PASS AO=76;DP=163;FAO=76;FDP=163;FR=.;FRO=87;FSAF=33;FSAR=43;FSRF=34;FSRR=53;FWDB=-0.0196977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.388;QD=7.41538;RBI=0.0310567;REFB=-0.00626232;REVB=-0.0240108;RO=85;SAF=33;SAR=43;SRF=34;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0333863;STB=0.523717;TYPE=snp;VARB=0.00655611;OID=.;OPOS=1394815;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:163:85:87:76:76:43:33:34:51:43:33:34:53 chr5 1411412 . T C 80.26 PASS AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.0024684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.4471;QD=8.44808;RBI=0.00247272;REFB=-0.0462547;REVB=-0.000146123;RO=20;SAF=7;SAR=11;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0584155;STB=0.533296;TYPE=snp;VARB=0.0439747;OID=.;OPOS=1411412;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:38:38:20:20:18:18:11:7:9:11:11:7:9:11 chr5 1501695 . G A 17.63 PASS AO=4;DP=15;FAO=4;FDP=13;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0100748;FXX=0.133244;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.569;QD=5.42547;RBI=0.0136999;REFB=-0.0157983;REVB=0.00928361;RO=11;SAF=1;SAR=3;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.408699;STB=0.718863;TYPE=snp;VARB=0.0276203;OID=.;OPOS=1501695;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:15:13:11:9:4:4:3:1:7:4:3:1:5:4 chr5 1574319 . T A 17.16 PASS AO=18;DP=106;FAO=18;FDP=105;FR=.;FRO=87;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=53;FSRR=34;FWDB=0.00853788;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.903;QD=0.653653;RBI=0.0211918;REFB=-0.00359198;REVB=-0.0193958;RO=86;SAF=12;SAR=6;SRF=54;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0536109;STB=0.551665;TYPE=snp;VARB=0.0183331;OID=.;OPOS=1574319;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:106:105:86:87:18:18:6:12:54:32:6:12:53:34 chr5 1814783 . T C 292.02 PASS AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00213345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.164;QD=38.9362;RBI=0.0265471;REFB=0;REVB=0.0264613;RO=0;SAF=3;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.84607e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000185826;OID=.;OPOS=1814783;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:30:30:0:0:30:30:27:3:0:0:27:3:0:0 chr5 1877638 . CAA C 154.12 PASS AO=68;DP=169;FAO=68;FDP=161;FR=.;FRO=93;FSAF=37;FSAR=31;FSRF=42;FSRR=51;FWDB=0.028816;FXX=0.035926;HRUN=2;LEN=2;MLLD=141.431;QD=3.82913;RBI=0.0297082;REFB=-0.00807565;REVB=0.007226;RO=88;SAF=37;SAR=31;SRF=41;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0790432;STB=0.553331;TYPE=del;VARB=0.0122109;OID=.;OPOS=1877639;OREF=AA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:68:166:68:161:93:37:31:42:51:99:88:37:31:41:47 chr5 1878212 . G A 48.81 PASS AO=8;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=8;FSAR=0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0103326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.6088;QD=15.017;RBI=0.0103326;REFB=-0.0672667;REVB=0;RO=5;SAF=8;SAR=0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0155562;OID=.;OPOS=1878212;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:13:13:5:5:8:8:0:8:5:0:0:8:5:0 chr5 2184901 . C T 319.87 PASS AO=62;DP=109;FAO=63;FDP=109;FR=.;FRO=46;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=0.0100807;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=166.589;QD=11.7385;RBI=0.0189375;REFB=-0.00349033;REVB=-0.0160315;RO=45;SAF=35;SAR=27;SRF=17;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14343;STB=0.575892;TYPE=snp;VARB=0.00312989;OID=.;OPOS=2184901;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:45:46:62:63:27:35:17:28:27:36:18:28 chr5 3600334 . T C 543.4 PASS AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.000342438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.316;QD=36.8404;RBI=0.0282194;REFB=-0.102134;REVB=0.0282173;RO=0;SAF=32;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.09576e-08;STB=0.509431;TYPE=snp;VARB=0.00118294;OID=.;OPOS=3600334;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:59:59:0:1:58:58:26:32:0:0:26:32:0:1 chr5 3610658 . T C 2443.69 PASS AO=255;DP=256;FAO=256;FDP=256;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=178;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0543263;FXX=0.00775164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.903;QD=38.1827;RBI=0.0576175;REFB=-0.0275225;REVB=0.0191946;RO=1;SAF=78;SAR=177;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00607213;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000180571;OID=.;OPOS=3610658;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:256:256:1:0:255:256:177:78:1:0:178:78:0:0 chr5 5126260 . C CATCT 206.14 PASS AO=77;DP=229;FAO=77;FDP=225;FR=.;FRO=148;FSAF=34;FSAR=43;FSRF=96;FSRR=52;FWDB=-0.0220013;FXX=0.0174665;HRUN=1;LEN=4;MLLD=227.804;QD=3.66462;RBI=0.0220415;REFB=-0.0114791;REVB=0.00133099;RO=147;SAF=34;SAR=43;SRF=95;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232146;STB=0.633754;TYPE=ins;VARB=0.02378;OID=.;OPOS=5126261;OREF=-;OALT=ATCT;OMAPALT=CATCT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:77:229:77:225:148:34:43:96:52:99:147:34:43:95:52 chr5 5146335 . C G 1351.03 PASS AO=136;DP=136;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0627896;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.1324;QD=38.6008;RBI=0.0713183;REFB=0;REVB=-0.0338197;RO=0;SAF=74;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58871e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00018398;OID=.;OPOS=5146335;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:136:140:0:0:136:140:62:74:0:0:62:78:0:0 chr5 5146377 . T C 203.53 PASS AO=52;DP=130;FAO=57;FDP=132;FR=.;FRO=75;FSAF=41;FSAR=16;FSRF=56;FSRR=19;FWDB=0.00268453;FXX=0.0222206;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.481;QD=6.16765;RBI=0.00880826;REFB=-0.00590294;REVB=-0.00838921;RO=76;SAF=37;SAR=15;SRF=58;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0686656;STB=0.519578;TYPE=snp;VARB=0.00664118;OID=.;OPOS=5146377;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:132:76:75:52:57:15:37:58:18:16:41:56:19 chr5 5146395 . A G 370.35 PASS AO=76;DP=136;FAO=76;FDP=136;FR=.;FRO=60;FSAF=58;FSAR=18;FSRF=43;FSRR=17;FWDB=0.00390254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.613;QD=10.8927;RBI=0.00633765;REFB=-0.0161033;REVB=-0.00499359;RO=59;SAF=58;SAR=18;SRF=42;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0548865;STB=0.527539;TYPE=snp;VARB=0.0105783;OID=.;OPOS=5146395;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:59:60:76:76:18:58:42:17:18:58:43:17 chr5 5146562 . AGGC AGC,AG 633.97 PASS AO=52,17;DP=98;FAO=94,0;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=68,0;FSAR=26,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.304903,0.0821373;FXX=0.0105252;HRUN=2,2;LEN=1,2;MLLD=19.5965,39.7652;QD=26.9773;RBI=0.311102,0.121062;REFB=0,0;REVB=0.0617931,-0.0889347;RO=17;SAF=46,3;SAR=6,14;SRF=15;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0.308901,0.308901;SSSB=0.00253245,-0.600931;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.015093,0.0179659;OID=.,.;OPOS=5146563,5146564;OREF=G,GC;OALT=-,-;OMAPALT=AGC,AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:52,17:90:94,0:94:0:68,0:26,0:0:0:53:17:46,3:6,14:15:2 chr5 5200281 . C T 136.53 PASS AO=33;DP=91;FAO=38;FDP=92;FR=.;FRO=54;FSAF=27;FSAR=11;FSRF=30;FSRR=24;FWDB=0.00623047;FXX=0.0515411;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.386;QD=5.93595;RBI=0.0174008;REFB=-0.000573331;REVB=-0.0162471;RO=50;SAF=22;SAR=11;SRF=29;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0989504;STB=0.601089;TYPE=snp;VARB=0.000662986;OID=.;OPOS=5200281;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:92:50:54:33:38:11:22:29:21:11:27:30:24 chr5 5460569 . C T 1029.5 PASS AO=110;DP=113;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019783;FXX=0.0265463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.4953;QD=37.4365;RBI=0.0198439;REFB=-0.0502047;REVB=-0.00155403;RO=1;SAF=50;SAR=60;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00784689;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000125921;OID=.;OPOS=5460569;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:113:110:1:0:110:110:60:50:0:1:60:50:0:0 chr5 5460619 . G C 1186.24 PASS AO=124;DP=126;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0023037;FXX=0.0158718;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.213;QD=38.2658;RBI=0.028289;REFB=0;REVB=0.0281951;RO=0;SAF=52;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.61425e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.80203e-05;OID=.;OPOS=5460619;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:126:124:0:0:124:124:72:52:0:0:72:52:0:0 chr5 5462148 . G A 760.7 PASS AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00762683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.536;QD=38.5164;RBI=0.0280515;REFB=0;REVB=0.0269948;RO=0;SAF=43;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.71707e-05;OID=.;OPOS=5462148;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:79:79:0:0:79:79:36:43:0:0:36:43:0:0 chr5 6337241 . T A 221.19 PASS AO=59;DP=146;FAO=63;FDP=150;FR=.;FRO=87;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=29;FSRR=58;FWDB=0.0423446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.63;QD=5.89843;RBI=0.0424862;REFB=-0.0278721;REVB=-0.00346597;RO=86;SAF=32;SAR=27;SRF=29;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214263;STB=0.635473;TYPE=snp;VARB=0.0357563;OID=.;OPOS=6337241;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:150:86:87:59:63:27:32:29:57:27:36:29:58 chr5 6600150 . G A 314.07 PASS AO=80;DP=175;FAO=80;FDP=173;FR=.;FRO=93;FSAF=52;FSAR=28;FSRF=56;FSRR=37;FWDB=0.0028781;FXX=0.0114279;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.807;QD=7.26181;RBI=0.02693;REFB=-0.0173323;REVB=0.0267758;RO=93;SAF=52;SAR=28;SRF=56;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0500805;STB=0.527788;TYPE=snp;VARB=0.0143228;OID=.;OPOS=6600150;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:173:93:93:80:80:28:52:56:37:28:52:56:37 chr5 6602544 . T C 449.36 PASS AO=110;DP=228;FAO=110;FDP=228;FR=.;FRO=118;FSAF=58;FSAR=52;FSRF=47;FSRR=71;FWDB=-0.00354931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.1556;QD=7.88344;RBI=0.00358795;REFB=-0.0196299;REVB=-0.000525129;RO=117;SAF=58;SAR=52;SRF=47;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11716;STB=0.566448;TYPE=snp;VARB=0.0195762;OID=.;OPOS=6602544;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:228:228:117:118:110:110:52:58:47:70:52:58:47:71 chr5 6645016 . A G 194.72 PASS AO=50;DP=111;FAO=50;FDP=111;FR=.;FRO=61;FSAF=35;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=36;FWDB=0.0301773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.4014;QD=7.01689;RBI=0.0307467;REFB=-0.0171815;REVB=-0.00588995;RO=61;SAF=35;SAR=15;SRF=25;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.294214;STB=0.664737;TYPE=snp;VARB=0.0291232;OID=.;OPOS=6645016;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:61:61:50:50:15:35:25:36:15:35:25:36 chr5 6645163 . G A 208.95 PASS AO=45;DP=91;FAO=47;FDP=92;FR=.;FRO=45;FSAF=17;FSAR=30;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=0.0631815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.352;QD=9.08455;RBI=0.0645675;REFB=-0.0169196;REVB=0.0133064;RO=45;SAF=16;SAR=29;SRF=19;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0641435;STB=0.531482;TYPE=snp;VARB=0.014801;OID=.;OPOS=6645163;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:92:45:45:45:47:29:16:19:26:30:17:19:26 chr5 6748659 . T C 105.02 PASS AO=32;DP=84;FAO=32;FDP=84;FR=.;FRO=52;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=-0.0174118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.857;QD=5.00115;RBI=0.0177764;REFB=-0.0152308;REVB=0.00358151;RO=52;SAF=19;SAR=13;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123206;STB=0.570526;TYPE=snp;VARB=0.0153556;OID=.;OPOS=6748659;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:52:52:32:32:13:19:25:27:13:19:25:27 chr5 6753013 . C T 793.09 PASS AO=162;DP=282;FAO=162;FDP=280;FR=.;FRO=118;FSAF=71;FSAR=91;FSRF=50;FSRR=68;FWDB=-0.00020298;FXX=0.00709195;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.6601;QD=11.3298;RBI=0.0135807;REFB=0.00582025;REVB=0.0135792;RO=119;SAF=71;SAR=91;SRF=51;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00770567;STB=0.506232;TYPE=snp;VARB=-0.00941859;OID=.;OPOS=6753013;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:282:280:119:118:162:162:91:71:51:68:91:71:50:68 chr5 7802363 . C T 211.01 PASS AO=55;DP=123;FAO=55;FDP=123;FR=.;FRO=68;FSAF=33;FSAR=22;FSRF=48;FSRR=20;FWDB=0.0428683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.6223;QD=6.86194;RBI=0.0586815;REFB=-0.0156844;REVB=-0.0400728;RO=68;SAF=33;SAR=22;SRF=48;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112426;STB=0.562478;TYPE=snp;VARB=0.019537;OID=.;OPOS=7802363;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:68:68:55:55:22:33:48:20:22:33:48:20 chr5 7826680 . T C 194.24 PASS AO=66;DP=182;FAO=66;FDP=181;FR=.;FRO=115;FSAF=33;FSAR=33;FSRF=49;FSRR=66;FWDB=-0.0174238;FXX=0.0054942;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.397;QD=4.29258;RBI=0.0203876;REFB=0.00138741;REVB=0.0105861;RO=108;SAF=33;SAR=33;SRF=49;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0507791;STB=0.546947;TYPE=snp;VARB=-0.00203185;OID=.;OPOS=7826680;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:181:108:115:66:66:33:33:49:59:33:33:49:66 chr5 7866967 . G C 1749.42 PASS AO=188;DP=192;FAO=190;FDP=194;FR=.;FRO=4;FSAF=94;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0324284;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.506;QD=36.0705;RBI=0.0348763;REFB=-0.0514111;REVB=0.0128358;RO=4;SAF=94;SAR=94;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.019827;STB=0.510203;TYPE=snp;VARB=0.00231176;OID=.;OPOS=7866967;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:192:194:4:4:188:190:94:94:0:4:96:94:0:4 chr5 7868030 . T C 2366.86 PASS AO=251;DP=253;FAO=251;FDP=251;FR=.;FRO=0;FSAF=109;FSAR=142;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00930922;FXX=0.00790483;HRUN=3;LEN=1;MLLD=229.9;QD=37.7189;RBI=0.0129776;REFB=0.0110583;REVB=-0.00904191;RO=1;SAF=109;SAR=142;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00334526;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.14276e-06;OID=.;OPOS=7868030;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:96:253:251:1:0:251:251:142:109:0:1:142:109:0:0 chr5 7870973 . A G 3051.59 PASS AO=321;DP=329;FAO=325;FDP=325;FR=.;FRO=0;FSAF=166;FSAR=159;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0259757;FXX=0.0121577;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.1565;QD=37.5581;RBI=0.0260548;REFB=-0.0855082;REVB=-0.00202873;RO=4;SAF=166;SAR=155;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00627688;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000481422;OID=.;OPOS=7870973;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:329:325:4:0:321:325:155:166:1:3:159:166:0:0 chr5 7878179 . C T 270.52 PASS AO=74;DP=171;FAO=74;FDP=171;FR=.;FRO=97;FSAF=36;FSAR=38;FSRF=45;FSRR=52;FWDB=0.0191805;FXX=0.00581362;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.9206;QD=6.32791;RBI=0.0462879;REFB=0.00872512;REVB=-0.0421269;RO=93;SAF=35;SAR=39;SRF=45;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0109236;STB=0.512817;TYPE=snp;VARB=-0.0136509;OID=.;OPOS=7878179;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:171:93:97:74:74:39:35:45:48:38:36:45:52 chr5 7897319 . G A 193.26 PASS AO=45;DP=93;FAO=45;FDP=92;FR=.;FRO=47;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=18;FSRR=29;FWDB=0.0140814;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.73;QD=8.40249;RBI=0.0140823;REFB=-0.0126441;REVB=-0.0001591;RO=48;SAF=18;SAR=27;SRF=18;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0243209;STB=0.509087;TYPE=snp;VARB=0.00979991;OID=.;OPOS=7897319;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:92:48:47:45:45:27:18:18:30:27:18:18:29 chr5 8619227 . C T 160.99 PASS AO=42;DP=95;FAO=42;FDP=95;FR=.;FRO=53;FSAF=11;FSAR=31;FSRF=33;FSRR=20;FWDB=-0.0421163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.167;QD=6.77869;RBI=0.0463782;REFB=-0.0190654;REVB=-0.0194205;RO=53;SAF=11;SAR=31;SRF=33;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.370505;STB=0.708469;TYPE=snp;VARB=0.00457775;OID=.;OPOS=8619227;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:53:53:42:42:31:11:33:20:31:11:33:20 chr5 8619258 . G A 158.47 PASS AO=40;DP=100;FAO=45;FDP=105;FR=.;FRO=60;FSAF=12;FSAR=33;FSRF=37;FSRR=23;FWDB=0.0180904;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.559;QD=6.03699;RBI=0.023623;REFB=-0.0102905;REVB=0.0151914;RO=60;SAF=9;SAR=31;SRF=37;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.43156;STB=0.706328;TYPE=snp;VARB=0.00910148;OID=.;OPOS=8619258;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:105:60:60:40:45:31:9:37:23:33:12:37:23 chr5 9041924 . T C 342.44 PASS AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00157338;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.0249;QD=38.049;RBI=0.0477963;REFB=0;REVB=0.0477704;RO=0;SAF=10;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000830756;OID=.;OPOS=9041924;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:36:36:0:0:36:36:26:10:0:0:26:10:0:0 chr5 9041935 . G A 339.21 PASS AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00043151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.243;QD=37.69;RBI=0.0245094;REFB=0;REVB=0.0245056;RO=0;SAF=10;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000140716;OID=.;OPOS=9041935;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:36:36:0:0:36:36:26:10:0:0:26:10:0:0 chr5 9053945 . C T 386.94 PASS AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.004;QD=36.8512;RBI=0.0179773;REFB=0;REVB=0.014912;RO=0;SAF=17;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.98888e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000194233;OID=.;OPOS=9053945;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:42:42:0:0:42:42:25:17:0:0:25:17:0:0 chr5 9154659 . G C 901.82 PASS AO=102;DP=105;FAO=101;FDP=105;FR=.;FRO=4;FSAF=52;FSAR=49;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0475093;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.0384;QD=34.3549;RBI=0.0483656;REFB=-0.176108;REVB=-0.00906083;RO=3;SAF=53;SAR=49;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00798213;STB=0.508969;TYPE=snp;VARB=0.00646491;OID=.;OPOS=9154659;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:105:105:3:4:102:101:49:53:2:1:49:52:3:1 chr5 9265602 . C T 312.82 PASS AO=88;DP=207;FAO=88;FDP=206;FR=.;FRO=118;FSAF=41;FSAR=47;FSRF=64;FSRR=54;FWDB=-0.0212893;FXX=0.00483068;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.9;QD=6.07425;RBI=0.0396441;REFB=-0.0290348;REVB=-0.0334428;RO=118;SAF=41;SAR=47;SRF=64;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0784241;STB=0.543732;TYPE=snp;VARB=0.0373147;OID=.;OPOS=9265602;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:206:118:118:88:88:47:41:64:54:47:41:64:54 chr5 9280957 . C A 1096.67 PASS AO=110;DP=110;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.060716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.677;QD=38.1449;RBI=0.0654045;REFB=0;REVB=0.0243169;RO=0;SAF=32;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.35771e-05;OID=.;OPOS=9280957;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:110:115:0:0:110:115:78:32:0:0:82:33:0:0 chr5 10250430 . G A 199 PASS AO=62;DP=154;FAO=61;FDP=153;FR=.;FRO=92;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=45;FSRR=47;FWDB=0.0976784;FXX=0.00649309;HRUN=6;LEN=1;MLLD=39.8295;QD=5.20268;RBI=0.109994;REFB=-0.0262578;REVB=0.0505729;RO=85;SAF=27;SAR=35;SRF=41;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0488043;STB=0.528146;TYPE=snp;VARB=0.0468006;OID=.;OPOS=10250430;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:153:85:92:62:61:35:27:41:44:34:27:45:47 chr5 10250443 . T C 294.77 PASS AO=71;DP=147;FAO=71;FDP=147;FR=.;FRO=76;FSAF=33;FSAR=38;FSRF=39;FSRR=37;FWDB=-0.0297152;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=307.167;QD=8.02083;RBI=0.0315859;REFB=-0.00187664;REVB=-0.0107087;RO=76;SAF=33;SAR=38;SRF=39;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0452976;STB=0.525036;TYPE=snp;VARB=0.001673;OID=.;OPOS=10250443;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:147:76:76:71:71:38:33:39:37:38:33:39:37 chr5 10254817 . A G 159.23 PASS AO=47;DP=122;FAO=48;FDP=122;FR=.;FRO=74;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=24;FSRR=50;FWDB=0.0167174;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.156;QD=5.22069;RBI=0.0192617;REFB=-0.0156018;REVB=-0.00956779;RO=74;SAF=17;SAR=30;SRF=24;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0443334;STB=0.53332;TYPE=snp;VARB=0.0192264;OID=.;OPOS=10254817;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:74:74:47:48:30:17:24:50:30:18:24:50 chr5 10256161 . T C 392.25 PASS AO=102;DP=224;FAO=102;FDP=223;FR=.;FRO=121;FSAF=40;FSAR=62;FSRF=39;FSRR=82;FWDB=0.0128238;FXX=0.00446409;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.393;QD=7.03579;RBI=0.0129322;REFB=-0.0127056;REVB=0.0016712;RO=121;SAF=40;SAR=62;SRF=39;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0732008;STB=0.540431;TYPE=snp;VARB=0.0156941;OID=.;OPOS=10256161;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:224:223:121:121:102:102:62:40:39:82:62:40:39:82 chr5 10261966 . G A 228.93 PASS AO=68;DP=177;FAO=72;FDP=185;FR=.;FRO=113;FSAF=22;FSAR=50;FSRF=32;FSRR=81;FWDB=0.00849522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.8518;QD=4.94993;RBI=0.0231294;REFB=0.0146867;REVB=0.0215128;RO=106;SAF=22;SAR=46;SRF=32;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0270177;STB=0.516298;TYPE=snp;VARB=-0.0231558;OID=.;OPOS=10261966;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:185:106:113:68:72:46:22:32:74:50:22:32:81 chr5 10282396 . A G 210.37 PASS AO=55;DP=123;FAO=55;FDP=124;FR=.;FRO=69;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=42;FSRR=27;FWDB=0.00265404;FXX=0.0236202;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.92;QD=6.78599;RBI=0.0113271;REFB=-0.00825529;REVB=-0.0110118;RO=68;SAF=27;SAR=28;SRF=41;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11089;STB=0.565385;TYPE=snp;VARB=0.00996993;OID=.;OPOS=10282396;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:124:68:69:55:55:28:27:41:27:28:27:42:27 chr5 10415701 . AG A 1732.76 PASS AO=223;DP=305;FAO=289;FDP=289;FR=.;FRO=0;FSAF=99;FSAR=190;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0747064;FXX=0.0136514;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.0454;QD=23.9829;RBI=0.347657;REFB=0.00255893;REVB=0.339535;RO=50;SAF=81;SAR=142;SRF=5;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0.524887;SSSB=0.101495;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00789785;OID=.;OPOS=10415702;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:223:287:289:289:0:99:190:0:0:99:50:81:142:5:45 chr5 10505585 . A G 298.64 PASS AO=81;DP=185;FAO=81;FDP=185;FR=.;FRO=104;FSAF=51;FSAR=30;FSRF=66;FSRR=38;FWDB=0.00925517;FXX=0.00537606;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.162;QD=6.45697;RBI=0.0284592;REFB=-0.0224679;REVB=0.0269122;RO=104;SAF=52;SAR=29;SRF=66;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00805754;STB=0.503009;TYPE=snp;VARB=0.0234927;OID=.;OPOS=10505585;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:185:104:104:81:81:29:52:66:38:30:51:66:38 chr5 10564846 . C T 116.19 PASS AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0331543;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.952;QD=35.7495;RBI=0.0371098;REFB=0;REVB=-0.0166713;RO=0;SAF=1;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.00075e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00249786;OID=.;OPOS=10564846;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:13:0:0:13:13:12:1:0:0:12:1:0:0 chr5 10624866 . T G 665.63 PASS AO=76;DP=80;FAO=75;FDP=79;FR=.;FRO=4;FSAF=33;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.043021;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=139.713;QD=33.7027;RBI=0.0431408;REFB=0.000577253;REVB=0.00321208;RO=4;SAF=34;SAR=42;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0188977;STB=0.509781;TYPE=snp;VARB=8.64171e-05;OID=.;OPOS=10624866;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:80:79:4:4:76:75:42:34:1:3:42:33:1:3 chr5 10624887 . T C 844.15 PASS AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.813;QD=38.3706;RBI=0.0190555;REFB=0;REVB=-0.00177902;RO=0;SAF=33;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.74869e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.69402e-05;OID=.;OPOS=10624887;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:88:88:0:0:88:88:55:33:0:0:55:33:0:0 chr5 10638180 . T C 1316.21 PASS AO=137;DP=138;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0192067;FXX=0.00719373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.654;QD=38.1509;RBI=0.0242035;REFB=0;REVB=-0.014728;RO=0;SAF=62;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.52807e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.92716e-05;OID=.;OPOS=10638180;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:138:138:0:0:137:138:75:62:0:0:77:61:0:0 chr5 10973727 . G A 597.81 PASS AO=148;DP=310;FAO=149;FDP=311;FR=.;FRO=162;FSAF=101;FSAR=48;FSRF=104;FSRR=58;FWDB=0.00145218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.693;QD=7.68885;RBI=0.0244255;REFB=-0.0151431;REVB=0.0243823;RO=161;SAF=101;SAR=47;SRF=103;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0456993;STB=0.521072;TYPE=snp;VARB=0.0226697;OID=.;OPOS=10973727;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:310:311:161:162:148:149:47:101:103:58:48:101:104:58 chr5 13701525 . T C 1144.83 PASS AO=120;DP=124;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0895596;FXX=0.0322555;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.566;QD=38.161;RBI=0.0896185;REFB=0;REVB=-0.00324903;RO=0;SAF=21;SAR=99;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.05224e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000129937;OID=.;OPOS=13701525;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:124:120:0:0:120:120:99:21:0:0:99:21:0:0 chr5 13701536 . T C 1034.61 PASS AO=103;DP=103;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0999466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.086;QD=38.3189;RBI=0.105185;REFB=0;REVB=0.0327808;RO=0;SAF=11;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000136629;OID=.;OPOS=13701536;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:103:108:0:0:103:108:92:11:0:0:92:16:0:0 chr5 13719022 . T G 1528.14 PASS AO=125;DP=181;FAO=167;FDP=175;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=74;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206172;FXX=0.016853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.9141;QD=34.929;RBI=0.0219228;REFB=0;REVB=-0.00745238;RO=3;SAF=66;SAR=59;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0235431;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0127789;OID=.;OPOS=13719022;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:181:175:3:0:125:167:59:66:0:3:93:74:0:0 chr5 13719023 . C G 23.41 PASS AO=36;DP=179;FAO=37;FDP=181;FR=.;FRO=144;FSAF=2;FSAR=35;FSRF=83;FSRR=61;FWDB=0.079306;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=31.9907;QD=0.51736;RBI=0.120625;REFB=-0.0466751;REVB=-0.0908902;RO=142;SAF=0;SAR=36;SRF=83;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.791041;STB=0.939125;TYPE=snp;VARB=0.243212;OID=.;OPOS=13719023;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:179:181:142:144:36:37:36:0:83:59:35:2:83:61 chr5 13719089 . G A 2170.75 PASS AO=207;DP=209;FAO=227;FDP=227;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=161;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0363753;FXX=0.0130429;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.128;QD=38.2511;RBI=0.0373226;REFB=-0.0252639;REVB=-0.00835565;RO=1;SAF=52;SAR=155;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00306367;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.79643e-05;OID=.;OPOS=13719089;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:94:209:227:1:0:207:227:155:52:0:1:161:66:0:0 chr5 13754394 . C T 386.5 PASS AO=89;DP=176;FAO=89;FDP=176;FR=.;FRO=87;FSAF=39;FSAR=50;FSRF=44;FSRR=43;FWDB=-0.00645853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.083;QD=8.78417;RBI=0.0276549;REFB=0.00471142;REVB=-0.0268902;RO=86;SAF=39;SAR=50;SRF=43;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0557023;STB=0.533617;TYPE=snp;VARB=-0.00540216;OID=.;OPOS=13754394;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:176:86:87:89:89:50:39:43:43:50:39:44:43 chr5 13788886 . C A 1491.74 PASS AO=159;DP=160;FAO=158;FDP=158;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000762741;FXX=0.0124992;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.7503;QD=37.7657;RBI=0.0347136;REFB=-0.0281923;REVB=0.0347052;RO=1;SAF=75;SAR=84;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00563079;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000352818;OID=.;OPOS=13788886;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:160:158:1:0:159:158:84:75:0:1:83:75:0:0 chr5 13864728 . C A 134.4 PASS AO=50;DP=148;FAO=50;FDP=148;FR=.;FRO=98;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=45;FSRR=53;FWDB=-0.0117348;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=277.508;QD=3.63248;RBI=0.0154696;REFB=-0.00309837;REVB=0.0100799;RO=98;SAF=26;SAR=24;SRF=45;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0698986;STB=0.540189;TYPE=snp;VARB=0.005678;OID=.;OPOS=13864728;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:98:98:50:50:24:26:45:53:24:26:45:53 chr5 13865980 . T C 200.57 PASS AO=57;DP=138;FAO=57;FDP=137;FR=.;FRO=80;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=31;FSRR=49;FWDB=-0.0108793;FXX=0.00724585;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.911;QD=5.85616;RBI=0.0211094;REFB=-0.0166901;REVB=0.01809;RO=80;SAF=31;SAR=26;SRF=31;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161491;STB=0.59052;TYPE=snp;VARB=0.0187595;OID=.;OPOS=13865980;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:137:80:80:57:57:26:31:31:49:26:31:31:49 chr5 13867949 . T C 534.87 PASS AO=105;DP=186;FAO=108;FDP=189;FR=.;FRO=81;FSAF=29;FSAR=79;FSRF=45;FSRR=36;FWDB=0.00220175;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.5536;QD=11.32;RBI=0.0196933;REFB=0.024308;REVB=0.0195699;RO=81;SAF=28;SAR=77;SRF=45;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.255738;STB=0.636723;TYPE=snp;VARB=-0.0139281;OID=.;OPOS=13867949;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:189:81:81:105:108:77:28:45:36:79:29:45:36 chr5 13882841 . A G 85.31 PASS AO=32;DP=102;FAO=33;FDP=103;FR=.;FRO=70;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=35;FSRR=35;FWDB=0.00264025;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.0606;QD=3.31297;RBI=0.0585265;REFB=-8.39638e-05;REVB=0.058467;RO=70;SAF=19;SAR=13;SRF=35;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111058;STB=0.551836;TYPE=snp;VARB=0.0018921;OID=.;OPOS=13882841;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:102:103:70:70:32:33:13:19:35:35:14:19:35:35 chr5 13894894 . T A 1322.07 PASS AO=166;DP=192;FAO=172;FDP=196;FR=.;FRO=24;FSAF=82;FSAR=90;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.0752022;FXX=0.0101005;HRUN=5;LEN=1;MLLD=34.9954;QD=26.981;RBI=0.106524;REFB=-0.167252;REVB=-0.0754453;RO=26;SAF=79;SAR=87;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0258969;STB=0.50796;TYPE=snp;VARB=0.0263774;OID=.;OPOS=13894894;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:192:196:26:24:166:172:87:79:15:11:90:82:13:11 chr5 13944512 . A C 1257.19 PASS AO=132;DP=132;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.010402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4751;QD=38.0967;RBI=0.0221823;REFB=0;REVB=0.0195922;RO=0;SAF=91;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.63993e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.7538e-05;OID=.;OPOS=13944512;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:132:132:0:0:132:132:41:91:0:0:41:91:0:0 chr5 14184022 . G A 242.7 PASS AO=65;DP=157;FAO=67;FDP=154;FR=.;FRO=87;FSAF=26;FSAR=41;FSRF=49;FSRR=38;FWDB=-0.00817715;FXX=0.0552113;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.935;QD=6.30379;RBI=0.0144251;REFB=-0.00244804;REVB=-0.0118835;RO=67;SAF=25;SAR=40;SRF=35;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129141;STB=0.599502;TYPE=snp;VARB=0.00388734;OID=.;OPOS=14184022;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:154:67:87:65:67:40:25:35:32:41:26:49:38 chr5 14184079 . G A 341.31 PASS AO=85;DP=185;FAO=85;FDP=181;FR=.;FRO=96;FSAF=33;FSAR=52;FSRF=49;FSRR=47;FWDB=0.0172692;FXX=0.0216205;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.311;QD=7.54282;RBI=0.0176627;REFB=-0.00673844;REVB=-0.00370792;RO=96;SAF=33;SAR=52;SRF=49;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11951;STB=0.566177;TYPE=snp;VARB=0.00640915;OID=.;OPOS=14184079;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:181:96:96:85:85:52:33:49:47:52:33:49:47 chr5 14420027 . A C 539.5 PASS AO=56;DP=57;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0164796;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.0562;QD=36.5763;RBI=0.0622825;REFB=-0.122523;REVB=0.0600628;RO=1;SAF=25;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184862;STB=0.509801;TYPE=snp;VARB=0.00621591;OID=.;OPOS=14420027;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:57:59:1:1:56:58:31:25:1:0:33:25:1:0 chr5 14498270 . G A 514.84 PASS AO=119;DP=238;FAO=120;FDP=239;FR=.;FRO=119;FSAF=45;FSAR=75;FSRF=43;FSRR=76;FWDB=0.0124812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.952;QD=8.61648;RBI=0.0186645;REFB=-0.0168457;REVB=0.0138775;RO=118;SAF=45;SAR=74;SRF=42;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0215698;STB=0.507278;TYPE=snp;VARB=0.013279;OID=.;OPOS=14498270;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:238:239:118:119:119:120:74:45:42:76:75:45:43:76 chr5 14498727 . G A 85.46 PASS AO=26;DP=71;FAO=26;FDP=70;FR=.;FRO=44;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=28;FWDB=-0.0393317;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.6128;QD=4.8834;RBI=0.0399622;REFB=-0.00142644;REVB=0.00707028;RO=43;SAF=12;SAR=14;SRF=15;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12456;STB=0.562453;TYPE=snp;VARB=0.00168782;OID=.;OPOS=14498727;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:71:70:43:44:26:26:14:12:15:28:14:12:16:28 chr5 14709412 . A AT 68.48 PASS AO=25;DP=66;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=23;FWDB=-0.112164;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=18.2415;QD=4.6427;RBI=0.113773;REFB=-0.0362352;REVB=-0.0190683;RO=38;SAF=11;SAR=14;SRF=11;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165509;STB=0.591376;TYPE=ins;VARB=0.02218;OID=.;OPOS=14709413;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:25:66:27:59:32:12:15:9:23:68:38:11:14:11:27 chr5 15939558 . A G 430.16 PASS AO=101;DP=205;FAO=101;FDP=203;FR=.;FRO=102;FSAF=66;FSAR=35;FSRF=71;FSRR=31;FWDB=-0.0301861;FXX=0.00975562;HRUN=3;LEN=1;MLLD=140.674;QD=8.47599;RBI=0.030188;REFB=-0.0095497;REVB=0.000341646;RO=102;SAF=66;SAR=35;SRF=71;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0436991;STB=0.523982;TYPE=snp;VARB=0.00886165;OID=.;OPOS=15939558;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:203:102:102:101:101:35:66:71:31:35:66:71:31 chr5 15939696 . C G 825.44 PASS AO=191;DP=375;FAO=191;FDP=374;FR=.;FRO=183;FSAF=90;FSAR=101;FSRF=103;FSRR=80;FWDB=0.0146821;FXX=0.0026666;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.6091;QD=8.82822;RBI=0.0267854;REFB=-0.010953;REVB=-0.0224029;RO=181;SAF=90;SAR=101;SRF=102;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0820848;STB=0.544751;TYPE=snp;VARB=0.0189074;OID=.;OPOS=15939696;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:375:374:181:183:191:191:101:90:102:79:101:90:103:80 chr5 15939874 . T TACC 582.29 PASS AO=139;DP=293;FAO=139;FDP=282;FR=.;FRO=143;FSAF=26;FSAR=113;FSRF=22;FSRR=121;FWDB=-0.00944532;FXX=0.0309268;HRUN=1;LEN=3;MLLD=120.728;QD=8.25942;RBI=0.00944679;REFB=-0.012608;REVB=-0.000166647;RO=142;SAF=26;SAR=113;SRF=19;SRR=123;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0858063;STB=0.528672;TYPE=ins;VARB=0.0145042;OID=.;OPOS=15939875;OREF=-;OALT=ACC;OMAPALT=TACC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:139:293:139:282:143:26:113:22:121:99:142:26:113:19:123 chr5 16478200 . G A 150.19 PASS AO=45;DP=115;FAO=45;FDP=114;FR=.;FRO=69;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=31;FSRR=38;FWDB=-0.0514311;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1957;QD=5.26985;RBI=0.0515347;REFB=-0.00391487;REVB=0.00326618;RO=68;SAF=25;SAR=20;SRF=30;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121278;STB=0.564174;TYPE=snp;VARB=0.0115044;OID=.;OPOS=16478200;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:114:68:69:45:45:20:25:30:38:20:25:31:38 chr5 16508674 . A G 313.32 PASS AO=76;DP=158;FAO=76;FDP=158;FR=.;FRO=82;FSAF=40;FSAR=36;FSRF=30;FSRR=52;FWDB=0.0349842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.9377;QD=7.93215;RBI=0.0402078;REFB=-0.0248298;REVB=-0.0198186;RO=82;SAF=40;SAR=36;SRF=30;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150067;STB=0.58276;TYPE=snp;VARB=0.0234461;OID=.;OPOS=16508674;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:158:82:82:76:76:36:40:30:52:36:40:30:52 chr5 16623160 . C A 243.46 PASS AO=63;DP=139;FAO=63;FDP=140;FR=.;FRO=77;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=40;FSRR=37;FWDB=-0.0181085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.956;QD=6.95614;RBI=0.0192241;REFB=-0.00108035;REVB=-0.00645339;RO=76;SAF=30;SAR=33;SRF=40;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0492228;STB=0.523802;TYPE=snp;VARB=0.00085651;OID=.;OPOS=16623160;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:140:76:77:63:63:33:30:40:36:33:30:40:37 chr5 16666180 . A G 914.29 PASS AO=98;DP=100;FAO=98;FDP=100;FR=.;FRO=2;FSAF=50;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.026126;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.0059;QD=36.5715;RBI=0.0285577;REFB=-0.0776736;REVB=0.0115314;RO=1;SAF=50;SAR=48;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0097792;STB=0.500204;TYPE=snp;VARB=0.00126991;OID=.;OPOS=16666180;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:100:100:1:2:98:98:48:50:0:1:48:50:1:1 chr5 16673975 . C G 863.87 PASS AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00170362;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.791;QD=37.9723;RBI=0.008869;REFB=0;REVB=0.00870384;RO=0;SAF=28;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.91974e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000208153;OID=.;OPOS=16673975;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:91:91:0:0:91:91:63:28:0:0:62:29:0:0 chr5 16701480 . G T 19.85 PASS AO=12;DP=61;FAO=12;FDP=60;FR=.,HEALED;FRO=48;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=0.081158;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=29.4945;QD=1.32345;RBI=0.122305;REFB=-0.0523703;REVB=-0.0914987;RO=33;SAF=2;SAR=10;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.572896;STB=0.823313;TYPE=snp;VARB=0.189078;OID=.;OPOS=16701480;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:57:60:33:48:12:12:10:2:22:11:10:2:27:21 chr5 16769273 . G A 1422.66 PASS AO=150;DP=151;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0622874;FXX=0.0129862;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.9212;QD=37.4384;RBI=0.0669918;REFB=0;REVB=-0.0246615;RO=0;SAF=62;SAR=88;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000717865;OID=.;OPOS=16769273;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:151:152:0:0:150:152:88:62:0:0:89:63:0:0 chr5 17345804 . C A 289.46 PASS AO=72;DP=155;FAO=72;FDP=153;FR=.;FRO=81;FSAF=17;FSAR=55;FSRF=24;FSRR=57;FWDB=-0.027316;FXX=0.0129024;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.6085;QD=7.56765;RBI=0.0434605;REFB=-0.0126018;REVB=0.0338031;RO=76;SAF=17;SAR=55;SRF=23;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0813155;STB=0.542185;TYPE=snp;VARB=0.0144524;OID=.;OPOS=17345804;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:153:76:81:72:72:55:17:23:53:55:17:24:57 chr5 19591174 . A G 359.23 PASS AO=95;DP=213;FAO=96;FDP=214;FR=.;FRO=118;FSAF=55;FSAR=41;FSRF=68;FSRR=50;FWDB=-0.00964336;FXX=0.00925883;HRUN=3;LEN=1;MLLD=252.577;QD=6.71459;RBI=0.0291459;REFB=-0.00951687;REVB=-0.0275044;RO=116;SAF=55;SAR=40;SRF=68;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0073882;STB=0.501891;TYPE=snp;VARB=0.0116611;OID=.;OPOS=19591174;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:213:214:116:118:95:96:40:55:68:48:41:55:68:50 chr5 19721490 . T C 3455.89 PASS AO=374;DP=388;FAO=379;FDP=389;FR=.;FRO=10;FSAF=147;FSAR=232;FSRF=1;FSRR=9;FWDB=-0.0554656;FXX=0.00256404;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.068;QD=35.5362;RBI=0.0555286;REFB=0.014255;REVB=0.00264434;RO=10;SAF=142;SAR=232;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00949453;STB=0.507819;TYPE=snp;VARB=-0.00315959;OID=.;OPOS=19721490;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:89:388:389:10:10:374:379:232:142:2:8:232:147:1:9 chr5 21751367 . CTT C 781.1 PASS AO=92;DP=103;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0157293;FXX=0.0198;HRUN=3;LEN=2;MLLD=39.2237;QD=31.5598;RBI=0.022279;REFB=0;REVB=-0.015778;RO=0;SAF=45;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.9386e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.000157088;OID=.;OPOS=21751368;OREF=TT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:92:92:99:99:0:47:52:0:0:69:0:45:47:0:0 chr5 21752050 . A G 2971.61 PASS AO=301;DP=303;FAO=312;FDP=312;FR=.;FRO=0;FSAF=144;FSAR=168;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00948847;FXX=0.00636922;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.251;QD=38.0976;RBI=0.0098399;REFB=0;REVB=0.00260624;RO=0;SAF=142;SAR=159;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000940642;OID=.;OPOS=21752050;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:303:312:0:0:301:312:159:142:0:0:168:144:0:0 chr5 21752056 . A G 2900 PASS AO=304;DP=306;FAO=304;FDP=304;FR=.;FRO=0;FSAF=141;FSAR=163;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0284087;FXX=0.00653573;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.677;QD=38.1579;RBI=0.0366698;REFB=-0.0209601;REVB=-0.0231866;RO=1;SAF=141;SAR=163;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00337068;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.23299e-05;OID=.;OPOS=21752056;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:306:304:1:0:304:304:163:141:1:0:163:141:0:0 chr5 23526987 . C G 20.91 PASS AO=8;DP=31;FAO=8;FDP=32;FR=.;FRO=24;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.046268;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.1536;QD=2.61331;RBI=0.0532564;REFB=-0.0262431;REVB=-0.0263727;RO=23;SAF=2;SAR=6;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.329763;STB=0.699475;TYPE=snp;VARB=0.137086;OID=.;OPOS=23526987;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:31:32:23:24:8:8:6:2:12:11:6:2:12:12 chr5 23527388 . A G 10.26 PASS AO=5;DP=25;FAO=5;FDP=25;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.0560897;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.8748;QD=1.64081;RBI=0.093866;REFB=-0.0427213;REVB=-0.0752646;RO=19;SAF=3;SAR=2;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.262872;STB=0.655649;TYPE=snp;VARB=0.142206;OID=.;OPOS=23527388;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:25:25:19:20:5:5:2:3:7:12:2:3:8:12 chr5 23976115 . G A 2471.7 PASS AO=257;DP=258;FAO=257;FDP=257;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=164;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193426;FXX=0.00387582;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1056;QD=38.4701;RBI=0.0381536;REFB=0;REVB=0.0328871;RO=0;SAF=93;SAR=164;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000235752;OID=.;OPOS=23976115;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:258:257:0:0:257:257:164:93:0:0:164:93:0:0 chr5 24910721 . C G 688.52 PASS AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0869933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.5271;QD=37.2175;RBI=0.0870662;REFB=0;REVB=-0.00356231;RO=0;SAF=30;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.93382e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000750425;OID=.;OPOS=24910721;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:74:74:0:0:74:74:44:30:0:0:44:30:0:0 chr5 26198575 . G T 2082.29 PASS AO=211;DP=213;FAO=217;FDP=217;FR=.;FRO=0;FSAF=100;FSAR=117;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.9782;QD=38.3833;RBI=0.0249204;REFB=0;REVB=-0.0187988;RO=0;SAF=98;SAR=113;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.82455e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.02968e-06;OID=.;OPOS=26198575;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:213:217:0:0:211:217:113:98:0:0:117:100:0:0 chr5 26198591 . C T 2204.03 PASS AO=233;DP=239;FAO=235;FDP=235;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=140;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0274754;FXX=0.0208325;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.19;QD=37.5154;RBI=0.0398576;REFB=-0.098027;REVB=0.0288744;RO=4;SAF=95;SAR=138;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00525614;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.94464e-05;OID=.;OPOS=26198591;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:239:235:4:0:233:235:138:95:1:3:140:95:0:0 chr5 31302288 . C T 603.75 PASS AO=122;DP=212;FAO=123;FDP=214;FR=.;FRO=91;FSAF=58;FSAR=65;FSRF=49;FSRR=42;FWDB=0.0278471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.737;QD=11.285;RBI=0.0439523;REFB=-0.027286;REVB=-0.0340051;RO=90;SAF=58;SAR=64;SRF=48;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0452981;STB=0.528451;TYPE=snp;VARB=0.028479;OID=.;OPOS=31302288;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:214:90:91:122:123:64:58:48:42:65:58:49:42 chr5 31317494 . C T 306.45 PASS AO=91;DP=220;FAO=90;FDP=219;FR=.;FRO=129;FSAF=35;FSAR=55;FSRF=58;FSRR=71;FWDB=-0.0385054;FXX=0.00454525;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.8235;QD=5.59731;RBI=0.0481343;REFB=0.0122561;REVB=0.0288832;RO=129;SAF=36;SAR=55;SRF=58;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0583204;STB=0.537;TYPE=snp;VARB=-0.015818;OID=.;OPOS=31317494;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:220:219:129:129:91:90:55:36:58:71:55:35:58:71 chr5 31317529 . A G 290.88 PASS AO=84;DP=207;FAO=86;FDP=210;FR=.;FRO=124;FSAF=33;FSAR=53;FSRF=55;FSRR=69;FWDB=0.0304387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.174;QD=5.54051;RBI=0.0327197;REFB=-0.00755632;REVB=-0.0120027;RO=123;SAF=32;SAR=52;SRF=54;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0640179;STB=0.5367;TYPE=snp;VARB=0.0107465;OID=.;OPOS=31317529;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:210:123:124:84:86:52:32:54:69:53:33:55:69 chr5 31317952 . T C 307.25 PASS AO=70;DP=141;FAO=71;FDP=142;FR=.;FRO=71;FSAF=24;FSAR=47;FSRF=26;FSRR=45;FWDB=-0.0104467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.424;QD=8.65503;RBI=0.0271347;REFB=-0.00824885;REVB=0.0250432;RO=71;SAF=24;SAR=46;SRF=26;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0234329;STB=0.515573;TYPE=snp;VARB=0.00831349;OID=.;OPOS=31317952;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:142:71:71:70:71:46:24:26:45:47:24:26:45 chr5 31401447 . A G 1450.04 PASS AO=152;DP=153;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00618945;FXX=0.00653552;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.187;QD=38.1589;RBI=0.0106327;REFB=0;REVB=-0.00864548;RO=0;SAF=59;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.84351e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.26047e-06;OID=.;OPOS=31401447;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:153:152:0:0:152:152:93:59:0:0:93:59:0:0 chr5 31515657 . G A 186.93 PASS AO=34;DP=59;FAO=35;FDP=60;FR=.;FRO=25;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.0385557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.7493;QD=12.4618;RBI=0.0443567;REFB=-0.0231965;REVB=0.0219313;RO=25;SAF=17;SAR=17;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0769211;STB=0.535796;TYPE=snp;VARB=0.0159082;OID=.;OPOS=31515657;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:59:60:25:25:34:35:17:17:10:15:18:17:10:15 chr5 31526371 . T C 378.13 PASS AO=99;DP=220;FAO=99;FDP=219;FR=.;FRO=120;FSAF=42;FSAR=57;FSRF=52;FSRR=68;FWDB=0.00314767;FXX=0.00454525;HRUN=3;LEN=1;MLLD=236.094;QD=6.90645;RBI=0.0203911;REFB=-0.00376018;REVB=-0.0201467;RO=120;SAF=42;SAR=57;SRF=52;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00918044;STB=0.505089;TYPE=snp;VARB=0.00437102;OID=.;OPOS=31526371;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:220:219:120:120:99:99:57:42:52:68:57:42:52:68 chr5 31538692 . A C 505.8 PASS AO=116;DP=277;FAO=135;FDP=295;FR=.;FRO=160;FSAF=85;FSAR=50;FSRF=87;FSRR=73;FWDB=-0.00234086;FXX=0.0166661;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.406;QD=6.8583;RBI=0.0177585;REFB=-0.0113507;REVB=0.0176035;RO=159;SAF=76;SAR=40;SRF=86;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125167;STB=0.548668;TYPE=snp;VARB=0.01193;OID=.;OPOS=31538692;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:277:295:159:160:116:135:40:76:86:73:50:85:87:73 chr5 31541007 . T A 426.44 PASS AO=109;DP=247;FAO=135;FDP=269;FR=.;FRO=134;FSAF=57;FSAR=78;FSRF=66;FSRR=68;FWDB=-0.0072281;FXX=0.00370357;HRUN=4;LEN=1;MLLD=27.4916;QD=6.34106;RBI=0.0115528;REFB=-0.0698112;REVB=0.00901234;RO=138;SAF=40;SAR=69;SRF=72;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159419;STB=0.535494;TYPE=snp;VARB=0.0379601;OID=.;OPOS=31541007;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:247:269:138:134:109:135:69:40:72:66:78:57:66:68 chr5 31832619 . T C 295.34 PASS AO=38;DP=45;FAO=40;FDP=46;FR=.;FRO=6;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0123838;FXX=0.041658;HRUN=5;LEN=1;MLLD=72.4763;QD=25.6816;RBI=0.0153445;REFB=-0.00842784;REVB=-0.00906058;RO=6;SAF=12;SAR=26;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0529475;STB=0.521216;TYPE=snp;VARB=0.00195582;OID=.;OPOS=31832619;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:45:46:6:6:38:40:26:12:3:3:26:14:3:3 chr5 31832628 . A G 190.68 PASS AO=26;DP=33;FAO=26;FDP=32;FR=.;FRO=6;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.0115044;FXX=0.0302939;HRUN=5;LEN=1;MLLD=194.459;QD=23.8348;RBI=0.0215515;REFB=-0.206904;REVB=0.018224;RO=3;SAF=7;SAR=19;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0679039;STB=0.568133;TYPE=snp;VARB=0.00275751;OID=.;OPOS=31832628;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:33:32:3:6:26:26:19:7:0:3:19:7:0:6 chr5 32058115 . A G 233.44 PASS AO=50;DP=94;FAO=50;FDP=94;FR=.;FRO=44;FSAF=9;FSAR=41;FSRF=14;FSRR=30;FWDB=0.00597457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.392;QD=9.9335;RBI=0.0216193;REFB=-0.0155957;REVB=-0.0207774;RO=44;SAF=9;SAR=41;SRF=14;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172862;STB=0.596039;TYPE=snp;VARB=0.0155928;OID=.;OPOS=32058115;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:44:44:50:50:41:9:14:30:41:9:14:30 chr5 32074173 . G A 206.56 PASS AO=51;DP=110;FAO=51;FDP=110;FR=.;FRO=59;FSAF=32;FSAR=19;FSRF=41;FSRR=18;FWDB=-0.00437145;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=267.827;QD=7.51136;RBI=0.0051603;REFB=0.00117146;REVB=-0.00274211;RO=51;SAF=32;SAR=19;SRF=33;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0190588;STB=0.539464;TYPE=snp;VARB=-0.00155578;OID=.;OPOS=32074173;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:51:59:51:51:19:32:33:18:19:32:41:18 chr5 32074392 . G A 188.78 PASS AO=50;DP=112;FAO=50;FDP=114;FR=.;FRO=64;FSAF=18;FSAR=32;FSRF=22;FSRR=42;FWDB=-0.0264148;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.725;QD=6.62376;RBI=0.0295901;REFB=-0.0161481;REVB=0.0133353;RO=62;SAF=18;SAR=32;SRF=22;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00555624;STB=0.50995;TYPE=snp;VARB=0.0175459;OID=.;OPOS=32074392;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:114:62:64:50:50:32:18:22:40:32:18:22:42 chr5 32087253 . A G 352.76 PASS AO=105;DP=250;FAO=103;FDP=248;FR=.;FRO=145;FSAF=36;FSAR=67;FSRF=65;FSRR=80;FWDB=0.00633486;FXX=0.00799968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.56;QD=5.68968;RBI=0.0201745;REFB=-0.011327;REVB=-0.0191541;RO=144;SAF=37;SAR=68;SRF=64;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100859;STB=0.561145;TYPE=snp;VARB=0.0163398;OID=.;OPOS=32087253;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:250:248:144:145:105:103:68:37:64:80:67:36:65:80 chr5 32087326 . C A 365.45 PASS AO=98;DP=223;FAO=100;FDP=227;FR=.;FRO=127;FSAF=24;FSAR=76;FSRF=38;FSRR=89;FWDB=0.0227766;FXX=0.00438577;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.83;QD=6.43965;RBI=0.0229036;REFB=-0.00769102;REVB=0.00240928;RO=125;SAF=22;SAR=76;SRF=37;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0968729;STB=0.543349;TYPE=snp;VARB=0.00870107;OID=.;OPOS=32087326;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:227:125:127:98:100:76:22:37:88:76:24:38:89 chr5 32087374 . A G 326.74 PASS AO=75;DP=151;FAO=75;FDP=149;FR=.;FRO=74;FSAF=29;FSAR=46;FSRF=37;FSRR=37;FWDB=0.00883073;FXX=0.0197355;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.03;QD=8.77153;RBI=0.00979783;REFB=-0.0164682;REVB=0.00424448;RO=74;SAF=29;SAR=46;SRF=37;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104815;STB=0.557765;TYPE=snp;VARB=0.0193257;OID=.;OPOS=32087374;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:149:74:74:75:75:46:29:37:37:46:29:37:37 chr5 32087430 . G A 153.31 PASS AO=30;DP=133;FAO=43;FDP=112;FR=.;FRO=69;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=27;FSRR=42;FWDB=0.00661519;FXX=0.205659;HRUN=5;LEN=1;MLLD=181.496;QD=5.47533;RBI=0.012599;REFB=-0.0121906;REVB=-0.0107226;RO=38;SAF=18;SAR=12;SRF=11;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.300103;STB=0.60168;TYPE=snp;VARB=0.0226135;OID=.;OPOS=32087430;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:112:38:69:30:43:12:18:11:27:19:24:27:42 chr5 32087802 . A G 51.3 PASS AO=8;DP=23;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.00446961;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.208;QD=7.60059;RBI=0.00784495;REFB=-0.0351512;REVB=0.00644716;RO=10;SAF=7;SAR=1;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.45078;STB=0.578812;TYPE=snp;VARB=0.025098;OID=.;OPOS=32087802;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:23:27:10:15:8:12:1:7:5:5:4:8:8:7 chr5 32088500 . C T 185.47 PASS AO=56;DP=144;FAO=57;FDP=145;FR=.;FRO=88;FSAF=17;FSAR=40;FSRF=23;FSRR=65;FWDB=-0.0155867;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.6468;QD=5.11634;RBI=0.0244645;REFB=-0.0151511;REVB=-0.0188566;RO=86;SAF=17;SAR=39;SRF=23;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0468775;STB=0.527317;TYPE=snp;VARB=0.0136347;OID=.;OPOS=32088500;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:145:86:88:56:57:39:17:23:63:40:17:23:65 chr5 32229677 . G A 220.67 PASS AO=58;DP=131;FAO=58;FDP=131;FR=.;FRO=73;FSAF=34;FSAR=24;FSRF=44;FSRR=29;FWDB=-0.00576707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.275;QD=6.73804;RBI=0.0070114;REFB=-0.0103685;REVB=-0.00398756;RO=72;SAF=34;SAR=24;SRF=43;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0112962;STB=0.509523;TYPE=snp;VARB=0.0133636;OID=.;OPOS=32229677;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:72:73:58:58:24:34:43:29:24:34:44:29 chr5 32403346 . C T 3795.07 PASS AO=448;DP=449;FAO=397;FDP=397;FR=.;FRO=0;FSAF=234;FSAR=163;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0182999;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.0516;QD=38.2375;RBI=0.0296233;REFB=-0.0454132;REVB=0.0232949;RO=0;SAF=270;SAR=178;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.09022e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000291008;OID=.;OPOS=32403346;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:449:397:0:0:448:397:178:270:0:0:163:234:0:0 chr5 32716534 . TC T,TT 62.09 PASS AO=6,7;DP=25;FAO=8,5;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=4,0;FSAR=4,5;FSRF=1;FSRR=11;FWDB=-0.00885968,-0.0251914;FXX=0.0384468;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=231.399,231.567;QD=9.93441;RBI=0.00916917,0.0252575;REFB=-0.0114739,-0.0106729;REVB=0.00236213,0.0018255;RO=11;SAF=2,2;SAR=4,5;SRF=0;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.507343,0.462391;STB=0.74953,0.996174;TYPE=del,snp;VARB=0.0189453,0.0136269;OID=.,.;OPOS=32716535,32716535;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:6,7:26:8,5:25:12:4,0:4,5:1:11:30:11:2,2:4,5:0:11 chr5 33278049 . T C 311.71 PASS AO=75;DP=167;FAO=80;FDP=174;FR=.;FRO=94;FSAF=48;FSAR=32;FSRF=56;FSRR=38;FWDB=-0.00825633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.85;QD=7.16574;RBI=0.00985598;REFB=-0.0185912;REVB=-0.00538269;RO=91;SAF=48;SAR=27;SRF=55;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0376229;STB=0.502392;TYPE=snp;VARB=0.0265559;OID=.;OPOS=33278049;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:174:91:94:75:80:27:48:55:36:32:48:56:38 chr5 33461355 . G A 171.88 PASS AO=49;DP=119;FAO=49;FDP=119;FR=.;FRO=70;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=46;FSRR=24;FWDB=-0.00245061;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=250.686;QD=5.77736;RBI=0.0116172;REFB=-0.00135711;REVB=0.0113558;RO=70;SAF=31;SAR=18;SRF=46;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0277572;STB=0.515619;TYPE=snp;VARB=0.00182586;OID=.;OPOS=33461355;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:70:70:49:49:18:31:46:24:18:31:46:24 chr5 33624430 . A G 1396.35 PASS AO=150;DP=152;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0392625;FXX=0.013157;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.553;QD=37.2361;RBI=0.0396689;REFB=-0.123063;REVB=0.00566378;RO=2;SAF=44;SAR=106;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00622025;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00121965;OID=.;OPOS=33624430;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:152:150:2:0:150:150:106:44:1:1:106:44:0:0 chr5 33751454 . A T 726.75 PASS AO=80;DP=82;FAO=82;FDP=84;FR=.;FRO=2;FSAF=47;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0053631;FXX=0.0117633;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.147;QD=34.6072;RBI=0.00878658;REFB=-0.110147;REVB=-0.00695997;RO=2;SAF=47;SAR=33;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00416352;STB=0.501779;TYPE=snp;VARB=0.000928443;OID=.;OPOS=33751454;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:82:84:2:2:80:82:33:47:1:1:35:47:1:1 chr5 33951693 . C G 1928.8 PASS AO=201;DP=206;FAO=201;FDP=201;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0332501;FXX=0.0289841;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1313;QD=38.3841;RBI=0.0332543;REFB=0;REVB=0.000531929;RO=0;SAF=82;SAR=119;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000246362;OID=.;OPOS=33951693;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:91:206:201:0:0:201:201:119:82:0:0:119:82:0:0 chr5 33954511 . T C 1656.36 PASS AO=173;DP=173;FAO=174;FDP=174;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0312522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.236;QD=38.0772;RBI=0.0447654;REFB=0;REVB=0.0320506;RO=0;SAF=64;SAR=109;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02853e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.14664e-07;OID=.;OPOS=33954511;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:173:174:0:0:173:174:109:64:0:0:110:64:0:0 chr5 33989518 . C T 312.44 PASS AO=70;DP=143;FAO=73;FDP=146;FR=.;FRO=73;FSAF=24;FSAR=49;FSRF=41;FSRR=32;FWDB=0.0144622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.337;QD=8.55988;RBI=0.0144764;REFB=-0.00738929;REVB=-0.000639933;RO=73;SAF=21;SAR=49;SRF=41;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254528;STB=0.620945;TYPE=snp;VARB=0.00775072;OID=.;OPOS=33989518;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:146:73:73:70:73:49:21:41:32:49:24:41:32 chr5 33994116 . A T 377.31 PASS AO=77;DP=184;FAO=99;FDP=206;FR=.;FRO=107;FSAF=53;FSAR=46;FSRF=41;FSRR=66;FWDB=0.00803323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.052;QD=7.3265;RBI=0.00804687;REFB=-0.0108284;REVB=0.000468368;RO=93;SAF=41;SAR=36;SRF=31;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194826;STB=0.578542;TYPE=snp;VARB=0.00994189;OID=.;OPOS=33994116;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:206:93:107:77:99:36:41:31:62:46:53:41:66 chr5 33998883 . A G 579.58 PASS AO=144;DP=314;FAO=149;FDP=318;FR=.;FRO=169;FSAF=57;FSAR=92;FSRF=71;FSRR=98;FWDB=0.0710963;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.0988;QD=7.2903;RBI=0.0724899;REFB=0.0079301;REVB=0.0141456;RO=169;SAF=52;SAR=92;SRF=71;SRR=98;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0612544;STB=0.520921;TYPE=snp;VARB=-0.0104434;OID=.;OPOS=33998883;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:314:318:169:169:144:149:92:52:71:98:92:57:71:98 chr5 34004707 . C T 214.75 PASS AO=51;DP=109;FAO=52;FDP=110;FR=.;FRO=58;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=33;FSRR=25;FWDB=0.0553715;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.9024;QD=7.80897;RBI=0.0899434;REFB=0.00218397;REVB=0.0708789;RO=58;SAF=26;SAR=25;SRF=33;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.056686;STB=0.53635;TYPE=snp;VARB=-0.000582346;OID=.;OPOS=34004707;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:110:58:58:51:52:25:26:33:25:26:26:33:25 chr5 34008077 . CG C,CC 83.8 PASS AO=4,5;DP=18;FAO=11,5;FDP=18;FR=.;FRO=2;FSAF=3,0;FSAR=8,5;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.433423,0.208905;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=11.4598,15.4175;QD=18.6214;RBI=0.609882,0.267803;REFB=-0.0876892,-0.09234;REVB=0.42907,0.167563;RO=8;SAF=0,0;SAR=4,5;SRF=3;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.67854,-0.711762;STB=0.55546,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.158733,-0.0409078;OID=.,.;OPOS=34008078,34008078;OREF=G,G;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:4,5:18:11,5:18:2:3,0:8,5:0:2:14:8:0,0:4,5:3:5 chr5 34008100 . C T 91.8 PASS AO=13;DP=17;FAO=13;FDP=17;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.7503;QD=21.6004;RBI=0.0393112;REFB=0.0105338;REVB=0.0393112;RO=4;SAF=0;SAR=13;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00813961;OID=.;OPOS=34008100;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:17:17:4:4:13:13:13:0:0:4:13:0:0:4 chr5 34020277 . C T 254.25 PASS AO=62;DP=131;FAO=62;FDP=131;FR=.;FRO=69;FSAF=27;FSAR=35;FSRF=22;FSRR=47;FWDB=0.00486189;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.898;QD=7.76323;RBI=0.0110935;REFB=-0.0100263;REVB=-0.00997132;RO=69;SAF=27;SAR=35;SRF=22;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114864;STB=0.563482;TYPE=snp;VARB=0.0139451;OID=.;OPOS=34020277;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:69:69:62:62:35:27:22:47:35:27:22:47 chr5 34038537 . A G 330.67 PASS AO=80;DP=172;FAO=82;FDP=173;FR=.;FRO=91;FSAF=39;FSAR=43;FSRF=57;FSRR=34;FWDB=-0.00127379;FXX=0.0114279;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.812;QD=7.64554;RBI=0.00474127;REFB=0.00114521;REVB=-0.00456696;RO=89;SAF=37;SAR=43;SRF=57;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168347;STB=0.578862;TYPE=snp;VARB=-0.00111693;OID=.;OPOS=34038537;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:173:89:91:80:82:43:37:57:32:43:39:57:34 chr5 34124590 . C A 79.35 PASS AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0289467;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.1155;QD=10.2385;RBI=0.054292;REFB=-0.0128558;REVB=-0.0459316;RO=16;SAF=13;SAR=3;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.335724;STB=0.704147;TYPE=snp;VARB=0.0103638;OID=.;OPOS=34124590;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:32:31:16:15:16:16:3:13:8:8:3:13:7:8 chr5 34716124 . A G 300.43 PASS AO=68;DP=133;FAO=68;FDP=133;FR=.;FRO=65;FSAF=29;FSAR=39;FSRF=25;FSRR=40;FWDB=-0.00117274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5053;QD=9.03556;RBI=0.0589428;REFB=-0.000330313;REVB=0.0589311;RO=63;SAF=29;SAR=39;SRF=23;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0554434;STB=0.521031;TYPE=snp;VARB=0.000849268;OID=.;OPOS=34716124;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:63:65:68:68:39:29:23:40:39:29:25:40 chr5 34802384 . A G 2018.29 PASS AO=211;DP=211;FAO=211;FDP=211;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=129;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0463132;FXX=0.00938923;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.941;QD=38.2614;RBI=0.0463132;REFB=0;REVB=-3.51123e-05;RO=0;SAF=82;SAR=129;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.00388e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.47144e-05;OID=.;OPOS=34802384;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:211:211:0:0:211:211:129:82:0:0:129:82:0:0 chr5 34807928 . C T 476.68 PASS AO=110;DP=222;FAO=112;FDP=224;FR=.;FRO=112;FSAF=38;FSAR=74;FSRF=58;FSRR=54;FWDB=0.0521345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.079;QD=8.51208;RBI=0.0521357;REFB=-0.000800851;REVB=-0.000352876;RO=112;SAF=38;SAR=72;SRF=58;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164792;STB=0.593566;TYPE=snp;VARB=0.000804443;OID=.;OPOS=34807928;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:224:112:112:110:112:72:38:58:54:74:38:58:54 chr5 34811131 . G A 235.9 PASS AO=54;DP=110;FAO=54;FDP=109;FR=.;FRO=55;FSAF=34;FSAR=20;FSRF=31;FSRR=24;FWDB=-0.0333494;FXX=0.0180164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.1506;QD=8.65669;RBI=0.0714343;REFB=0.00566424;REVB=-0.0631718;RO=54;SAF=34;SAR=20;SRF=30;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.070258;STB=0.535037;TYPE=snp;VARB=-0.00760262;OID=.;OPOS=34811131;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:109:54:55:54:54:20:34:30:24:20:34:31:24 chr5 34823336 . G A 193.67 PASS AO=40;DP=76;FAO=40;FDP=76;FR=.;FRO=36;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=30;FSRR=6;FWDB=-0.0112214;FXX=0.0256377;HRUN=3;LEN=1;MLLD=205.645;QD=10.1933;RBI=0.0164046;REFB=-0.00530206;REVB=-0.0119663;RO=33;SAF=20;SAR=20;SRF=30;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.339633;STB=0.657824;TYPE=snp;VARB=0.00240451;OID=.;OPOS=34823336;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:33:36:40:40:20:20:30:3:20:20:30:6 chr5 34824555 . G T 199.96 PASS AO=32;DP=46;FAO=32;FDP=46;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=24;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=0.0120192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.395;QD=17.3879;RBI=0.0239773;REFB=-0.0256667;REVB=0.0207472;RO=14;SAF=8;SAR=24;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0270129;STB=0.514697;TYPE=snp;VARB=0.0203133;OID=.;OPOS=34824555;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:46:46:14:14:32:32:24:8:3:11:24:8:3:11 chr5 34840841 . A G 245.87 PASS AO=46;DP=78;FAO=46;FDP=77;FR=.;FRO=31;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=8;FSRR=23;FWDB=0.0255273;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.707;QD=12.7727;RBI=0.0255926;REFB=-0.0284893;REVB=-0.00182783;RO=30;SAF=25;SAR=21;SRF=8;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198221;STB=0.613449;TYPE=snp;VARB=0.0164828;OID=.;OPOS=34840841;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:77:30:31:46:46:21:25:8:22:21:25:8:23 chr5 34862125 . C T 889.65 PASS AO=161;DP=254;FAO=161;FDP=254;FR=.;FRO=93;FSAF=69;FSAR=92;FSRF=27;FSRR=66;FWDB=-0.0115261;FXX=0.00392141;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.183;QD=14.0103;RBI=0.0142417;REFB=-0.000604199;REVB=0.00836508;RO=92;SAF=69;SAR=92;SRF=27;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0946862;STB=0.552441;TYPE=snp;VARB=0.000434954;OID=.;OPOS=34862125;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:254:254:92:93:161:161:92:69:27:65:92:69:27:66 chr5 35010138 . A G 2764.24 PASS AO=222;DP=303;FAO=299;FDP=299;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=122;FSAR=177;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0751085;FXX=0.00333322;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.799;QD=36.9798;RBI=0.0807388;REFB=0;REVB=-0.0296221;RO=0;SAF=61;SAR=161;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00501472;OID=.;OPOS=35010138;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:300:299:0:0:222:299:161:61:0:0:177:122:0:0 chr5 35033605 . G A 1156.84 PASS AO=121;DP=125;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000627836;FXX=0.0238076;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.596;QD=37.6208;RBI=0.0239679;REFB=-0.0716297;REVB=0.0239597;RO=1;SAF=49;SAR=72;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00959571;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.94281e-05;OID=.;OPOS=35033605;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:125:123:1:0:121:123:72:49:1:0:74:49:0:0 chr5 35039486 . C T 1967.74 PASS AO=192;DP=193;FAO=206;FDP=206;FR=.;FRO=0;FSAF=128;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0095846;FXX=0.00483068;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.836;QD=38.2086;RBI=0.0838161;REFB=0;REVB=0.0832663;RO=0;SAF=125;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.05175e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000964275;OID=.;OPOS=35039486;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:193:206:0:0:192:206:67:125:0:0:78:128:0:0 chr5 35641582 . A C 349.45 PASS AO=108;DP=271;FAO=108;FDP=271;FR=.;FRO=163;FSAF=38;FSAR=70;FSRF=40;FSRR=123;FWDB=0.0182275;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.812;QD=5.15787;RBI=0.0193708;REFB=0.000591085;REVB=-0.00655612;RO=163;SAF=38;SAR=70;SRF=40;SRR=123;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131474;STB=0.573225;TYPE=snp;VARB=-0.000873824;OID=.;OPOS=35641582;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:271:271:163:163:108:108:70:38:40:123:70:38:40:123 chr5 35643585 . A T 38.66 PASS AO=18;DP=69;FAO=18;FDP=69;FR=.;FRO=51;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=26;FSRR=25;FWDB=-0.0118442;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.922;QD=2.24093;RBI=0.0170507;REFB=-0.000241005;REVB=-0.0122655;RO=50;SAF=9;SAR=9;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0241824;STB=0.507238;TYPE=snp;VARB=0.000343207;OID=.;OPOS=35643585;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:69:69:50:51:18:18:9:9:26:24:9:9:26:25 chr5 35643615 . G A 49.09 PASS AO=23;DP=85;FAO=23;FDP=85;FR=.;FRO=62;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=32;FSRR=30;FWDB=0.0104006;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=126.854;QD=2.31023;RBI=0.0250696;REFB=-0.0107759;REVB=-0.0228104;RO=59;SAF=11;SAR=12;SRF=31;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0566443;STB=0.527583;TYPE=snp;VARB=0.030145;OID=.;OPOS=35643615;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:85:85:59:62:23:23:12:11:31:28:12:11:32:30 chr5 35644621 . T C 289.36 PASS AO=77;DP=173;FAO=77;FDP=173;FR=.;FRO=96;FSAF=46;FSAR=31;FSRF=46;FSRR=50;FWDB=0.0121005;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0205;QD=6.6904;RBI=0.0161869;REFB=0.016564;REVB=-0.0107514;RO=96;SAF=46;SAR=31;SRF=46;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119303;STB=0.566416;TYPE=snp;VARB=-0.0143743;OID=.;OPOS=35644621;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:173:96:96:77:77:31:46:46:50:31:46:46:50 chr5 35654711 . C T 679.16 PASS AO=210;DP=473;FAO=181;FDP=400;FR=.;FRO=219;FSAF=80;FSAR=101;FSRF=117;FSRR=102;FWDB=0.00263141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.907;QD=6.79157;RBI=0.00316001;REFB=-0.0133508;REVB=0.00174967;RO=262;SAF=92;SAR=118;SRF=140;SRR=122;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0967977;STB=0.550593;TYPE=snp;VARB=0.0144971;OID=.;OPOS=35654711;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:473:400:262:219:210:181:118:92:140:122:101:80:117:102 chr5 35670303 . G A 132.75 PASS AO=36;DP=86;FAO=37;FDP=90;FR=.;FRO=53;FSAF=12;FSAR=25;FSRF=17;FSRR=36;FWDB=0.0122815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.518;QD=5.8998;RBI=0.0222573;REFB=-0.0192945;REVB=0.0185622;RO=50;SAF=12;SAR=24;SRF=17;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00768548;STB=0.502401;TYPE=snp;VARB=0.0258524;OID=.;OPOS=35670303;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:90:50:53:36:37:24:12:17:33:25:12:17:36 chr5 35692775 . T A 565.32 PASS AO=119;DP=257;FAO=137;FDP=275;FR=.;FRO=138;FSAF=44;FSAR=93;FSRF=54;FSRR=84;FWDB=0.0675042;FXX=0.010791;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.153;QD=8.22283;RBI=0.0677398;REFB=-0.00678596;REVB=0.00564488;RO=133;SAF=39;SAR=80;SRF=53;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0744976;STB=0.53922;TYPE=snp;VARB=0.0060047;OID=.;OPOS=35692775;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:257:275:133:138:119:137:80:39:53:80:93:44:54:84 chr5 35695915 . A C 275.7 PASS AO=92;DP=238;FAO=92;FDP=245;FR=.;FRO=153;FSAF=31;FSAR=61;FSRF=54;FSRR=99;FWDB=-0.0210028;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.828;QD=4.50125;RBI=0.0220455;REFB=-0.0261787;REVB=0.00669971;RO=144;SAF=31;SAR=61;SRF=45;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.030039;STB=0.511087;TYPE=snp;VARB=0.0413413;OID=.;OPOS=35695915;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:238:245:144:153:92:92:61:31:45:99:61:31:54:99 chr5 35700598 . T C 55.21 PASS AO=15;DP=39;FAO=15;FDP=39;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=5;FWDB=0.0110561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.978;QD=5.66298;RBI=0.0327145;REFB=-0.0148434;REVB=-0.0307896;RO=24;SAF=7;SAR=8;SRF=19;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.340696;STB=0.695425;TYPE=snp;VARB=0.0109988;OID=.;OPOS=35700598;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:39:39:24:24:15:15:8:7:19:5:8:7:19:5 chr5 35702306 . A G 224.61 PASS AO=47;DP=86;FAO=47;FDP=87;FR=.;FRO=40;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=0.00410367;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.88;QD=10.327;RBI=0.00895707;REFB=-0.00828232;REVB=-0.00796172;RO=39;SAF=28;SAR=19;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132852;STB=0.578991;TYPE=snp;VARB=0.00631102;OID=.;OPOS=35702306;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:87:39:40:47:47:19:28:17:22:19:28:17:23 chr5 35709095 . C T 1780.82 PASS AO=184;DP=185;FAO=187;FDP=187;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00101557;FXX=0.0105815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.987;QD=38.0924;RBI=0.019499;REFB=0.00733553;REVB=0.0194726;RO=1;SAF=92;SAR=92;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00514729;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.7802e-05;OID=.;OPOS=35709095;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:185:187:1:0:184:187:92:92:0:1:95:92:0:0 chr5 35709184 . G C 1584.5 PASS AO=183;DP=188;FAO=179;FDP=188;FR=.;FRO=9;FSAF=63;FSAR=116;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=-0.00520169;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.3737;QD=33.7128;RBI=0.0681182;REFB=-0.016603;REVB=0.0679193;RO=5;SAF=67;SAR=116;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0234876;STB=0.527709;TYPE=snp;VARB=0.0167637;OID=.;OPOS=35709184;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:188:188:5:9:183:179:116:67:4:1:116:63:8:1 chr5 35764696 . C T 193.07 PASS AO=49;DP=111;FAO=50;FDP=112;FR=.;FRO=62;FSAF=34;FSAR=16;FSRF=35;FSRR=27;FWDB=0.0118655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.055;QD=6.89539;RBI=0.0121423;REFB=-0.0146452;REVB=-0.00257768;RO=62;SAF=33;SAR=16;SRF=35;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117557;STB=0.56973;TYPE=snp;VARB=0.0234295;OID=.;OPOS=35764696;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:112:62:62:49:50:16:33:35:27:16:34:35:27 chr5 35861068 . T C 555.17 PASS AO=128;DP=256;FAO=130;FDP=259;FR=.;FRO=129;FSAF=54;FSAR=76;FSRF=62;FSRR=67;FWDB=-0.015037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.837;QD=8.57411;RBI=0.0386443;REFB=-0.003476;REVB=0.0355987;RO=127;SAF=53;SAR=75;SRF=61;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0612358;STB=0.53307;TYPE=snp;VARB=0.00400044;OID=.;OPOS=35861068;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:256:259:127:129:128:130:75:53:61:66:76:54:62:67 chr5 35871190 . G A 217.34 PASS AO=74;DP=202;FAO=74;FDP=202;FR=.;FRO=128;FSAF=39;FSAR=35;FSRF=64;FSRR=64;FWDB=-0.0191755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.45;QD=4.30368;RBI=0.0221734;REFB=-0.00382388;REVB=-0.0111337;RO=128;SAF=39;SAR=35;SRF=64;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0302041;STB=0.51714;TYPE=snp;VARB=0.00636168;OID=.;OPOS=35871190;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:202:128:128:74:74:35:39:64:64:35:39:64:64 chr5 35871273 . C T 274.51 PASS AO=92;DP=243;FAO=91;FDP=242;FR=.;FRO=151;FSAF=36;FSAR=55;FSRF=68;FSRR=83;FWDB=0.00222474;FXX=0.00411506;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.9784;QD=4.53727;RBI=0.00323027;REFB=-0.0195553;REVB=0.00234204;RO=147;SAF=37;SAR=55;SRF=65;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0449139;STB=0.535172;TYPE=snp;VARB=0.0301337;OID=.;OPOS=35871273;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:243:242:147:151:92:91:55:37:65:82:55:36:68:83 chr5 35910529 . C T 152.07 PASS AO=30;DP=56;FAO=31;FDP=57;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=4;FSRR=22;FWDB=-0.0077708;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.277;QD=10.6715;RBI=0.00981749;REFB=0.00641305;REVB=0.00599981;RO=26;SAF=12;SAR=18;SRF=4;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.227359;STB=0.629465;TYPE=snp;VARB=-0.0063173;OID=.;OPOS=35910529;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:57:26:26:30:31:18:12:4:22:18:13:4:22 chr5 35962984 . A G 116.19 PASS AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0235679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.646;QD=35.7501;RBI=0.0588281;REFB=0;REVB=0.0539009;RO=0;SAF=1;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.00075e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00029889;OID=.;OPOS=35962984;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:13:0:0:13:13:12:1:0:0:12:1:0:0 chr5 35965970 . A C 111.8 PASS AO=33;DP=89;FAO=34;FDP=89;FR=.;FRO=55;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=45;FWDB=0.0148984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.258;QD=5.02463;RBI=0.014946;REFB=0.00195918;REVB=0.00119188;RO=55;SAF=13;SAR=20;SRF=10;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.262186;STB=0.654598;TYPE=snp;VARB=-0.00382644;OID=.;OPOS=35965970;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:55:55:33:34:20:13:10:45:20:14:10:45 chr5 36142648 . A G 123.68 PASS AO=34;DP=82;FAO=34;FDP=82;FR=.;FRO=48;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=37;FWDB=0.0283074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5875;QD=6.03318;RBI=0.0482816;REFB=-0.0214558;REVB=0.0391127;RO=47;SAF=16;SAR=18;SRF=11;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.250059;STB=0.64414;TYPE=snp;VARB=0.0268577;OID=.;OPOS=36142648;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:47:48:34:34:18:16:11:36:18:16:11:37 chr5 36143392 . C T 176.46 PASS AO=50;DP=121;FAO=50;FDP=121;FR=.;FRO=71;FSAF=34;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=48;FWDB=0.00434091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.6842;QD=5.83336;RBI=0.0193492;REFB=0.00857202;REVB=0.018856;RO=71;SAF=34;SAR=16;SRF=23;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.364398;STB=0.704583;TYPE=snp;VARB=-0.00861412;OID=.;OPOS=36143392;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:71:71:50:50:16:34:23:48:16:34:23:48 chr5 36155318 . C CTT 373.81 PASS AO=36;DP=60;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0904795;FXX=0.111091;HRUN=4;LEN=2;MLLD=26.8778;QD=31.151;RBI=0.140559;REFB=0;REVB=-0.107566;RO=9;SAF=7;SAR=29;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0776967;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-0.00128;OID=.;OPOS=36155319;OREF=-;OALT=TT;OMAPALT=CTT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:36:60:48:48:0:12:36:0:0:33:9:7:29:3:6 chr5 36269551 . G C 1337.94 PASS AO=139;DP=144;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177282;FXX=0.0275843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.78;QD=37.9558;RBI=0.0219032;REFB=0;REVB=0.0128631;RO=0;SAF=67;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.36576e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000256956;OID=.;OPOS=36269551;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:144:141:0:0:139:141:72:67:0:0:74:67:0:0 chr5 37244488 . TA T 83.53 PASS AO=30;DP=87;FAO=41;FDP=84;FR=.;FRO=43;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=38;FSRR=5;FWDB=-0.00436474;FXX=0.0344788;HRUN=5;LEN=1;MLLD=13.1616;QD=3.97751;RBI=0.142035;REFB=-0.060535;REVB=-0.141967;RO=41;SAF=12;SAR=18;SRF=36;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.464666;STB=0.70959;TYPE=del;VARB=0.0625934;OID=.;OPOS=37244489;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:30:86:41:84:43:19:22:38:5:83:41:12:18:36:5 chr5 37364443 . C T 591.68 PASS AO=60;DP=63;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00185178;FXX=0.115925;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.933;QD=38.799;RBI=0.0353659;REFB=0;REVB=0.0353174;RO=0;SAF=44;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6631e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000313809;OID=.;OPOS=37364443;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:63:61:0:0:60:61:16:44:0:0:16:45:0:0 chr5 37688010 . A G 348.61 PASS AO=96;DP=221;FAO=96;FDP=221;FR=.;FRO=125;FSAF=43;FSAR=53;FSRF=68;FSRR=57;FWDB=0.00618497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.552;QD=6.30974;RBI=0.00626295;REFB=-0.0039385;REVB=0.000985247;RO=123;SAF=43;SAR=53;SRF=68;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105838;STB=0.554309;TYPE=snp;VARB=0.00447232;OID=.;OPOS=37688010;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:221:123:125:96:96:53:43:68:55:53:43:68:57 chr5 37688094 . C T 305.99 PASS AO=84;DP=197;FAO=85;FDP=199;FR=.;FRO=114;FSAF=39;FSAR=46;FSRF=53;FSRR=61;FWDB=0.00879153;FXX=0.00499975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.463;QD=6.15064;RBI=0.0139678;REFB=-0.0256515;REVB=0.010854;RO=110;SAF=39;SAR=45;SRF=52;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00862528;STB=0.503509;TYPE=snp;VARB=0.0351317;OID=.;OPOS=37688094;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:199:110:114:84:85:45:39:52:58:46:39:53:61 chr5 37700516 . C T 1998.79 PASS AO=204;DP=219;FAO=211;FDP=211;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=131;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0638728;FXX=0.0452468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.7842;QD=37.8917;RBI=0.0656982;REFB=0;REVB=0.0153793;RO=0;SAF=73;SAR=131;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000636559;OID=.;OPOS=37700516;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:219:211:0:0:204:211:131:73:0:0:131:80:0:0 chr5 38370537 . T C 111.27 PASS AO=26;DP=56;FAO=26;FDP=56;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.0127468;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.317;QD=7.94789;RBI=0.0139896;REFB=-0.0114422;REVB=-0.00576448;RO=28;SAF=7;SAR=19;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20287;STB=0.601183;TYPE=snp;VARB=0.0111947;OID=.;OPOS=38370537;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:28:30:26:26:19:7:13:15:19:7:13:17 chr5 38486065 . C T 202.23 PASS AO=51;DP=114;FAO=53;FDP=115;FR=.;FRO=62;FSAF=10;FSAR=43;FSRF=9;FSRR=53;FWDB=0.0059601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.152;QD=7.03412;RBI=0.0143633;REFB=0.00964845;REVB=0.0130683;RO=55;SAF=8;SAR=43;SRF=9;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0118473;STB=0.540222;TYPE=snp;VARB=-0.0101719;OID=.;OPOS=38486065;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:115:55:62:51:53:43:8:9:46:43:10:9:53 chr5 38820807 . T C 29.49 PASS AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.00128474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.1345;QD=11.796;RBI=0.0161303;REFB=-0.0107859;REVB=-0.0160791;RO=5;SAF=1;SAR=4;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0102707;OID=.;OPOS=38820807;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:10:10:5:5:5:5:4:1:1:4:4:1:1:4 chr5 38822029 . G A 23.97 PASS AO=4;DP=6;FAO=4;FDP=6;FR=.;FRO=2;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0478358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9598;QD=15.9803;RBI=0.0686102;REFB=0.0184955;REVB=0.0491843;RO=2;SAF=1;SAR=3;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210252;STB=0.624469;TYPE=snp;VARB=0.00270284;OID=.;OPOS=38822029;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:2:2:4:4:3:1:0:2:3:1:0:2 chr5 38823254 . C T 210.01 PASS AO=60;DP=145;FAO=60;FDP=144;FR=.;FRO=84;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=49;FSRR=35;FWDB=0.0205167;FXX=0.00689608;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.7613;QD=5.83369;RBI=0.0218653;REFB=-0.0159435;REVB=-0.0075603;RO=82;SAF=32;SAR=28;SRF=48;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0541007;STB=0.529402;TYPE=snp;VARB=0.0310541;OID=.;OPOS=38823254;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:144:82:84:60:60:28:32:48:34:28:32:49:35 chr5 38823306 . A G 186.74 PASS AO=52;DP=124;FAO=52;FDP=123;FR=.;FRO=71;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=41;FSRR=30;FWDB=-0.0289504;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.6477;QD=6.07285;RBI=0.0293249;REFB=-0.0425549;REVB=-0.00467129;RO=71;SAF=25;SAR=27;SRF=41;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0991992;STB=0.555638;TYPE=snp;VARB=0.040294;OID=.;OPOS=38823306;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:123:71:71:52:52:27:25:41:30:27:25:41:30 chr5 38884071 . T G 639.54 PASS AO=155;DP=321;FAO=156;FDP=321;FR=.;FRO=165;FSAF=70;FSAR=86;FSRF=66;FSRR=99;FWDB=0.000851057;FXX=0.00310549;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.583;QD=7.9693;RBI=0.0116821;REFB=-0.000332436;REVB=0.0116511;RO=165;SAF=70;SAR=85;SRF=66;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.049174;STB=0.525437;TYPE=snp;VARB=0.00032146;OID=.;OPOS=38884071;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:321:321:165:165:155:156:85:70:66:99:86:70:66:99 chr5 38940858 . T G 362.44 PASS AO=63;DP=109;FAO=68;FDP=109;FR=.;FRO=41;FSAF=24;FSAR=44;FSRF=15;FSRR=26;FWDB=0.0302879;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=246.699;QD=13.3004;RBI=0.0305389;REFB=-0.0036639;REVB=-0.00390684;RO=41;SAF=19;SAR=44;SRF=15;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0539041;STB=0.505299;TYPE=snp;VARB=0.00343084;OID=.;OPOS=38940858;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:41:41:63:68:44:19:15:26:44:24:15:26 chr5 38942090 . T C 456.54 PASS AO=100;DP=192;FAO=100;FDP=188;FR=.;FRO=88;FSAF=52;FSAR=48;FSRF=46;FSRR=42;FWDB=0.0186002;FXX=0.0259054;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.848;QD=9.71358;RBI=0.0320085;REFB=-0.00536144;REVB=0.0260494;RO=80;SAF=52;SAR=48;SRF=40;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0163239;STB=0.501279;TYPE=snp;VARB=0.00428335;OID=.;OPOS=38942090;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:188:80:88:100:100:48:52:40:40:48:52:46:42 chr5 38942449 . G A 399.74 PASS AO=91;DP=179;FAO=91;FDP=179;FR=.;FRO=88;FSAF=21;FSAR=70;FSRF=34;FSRR=54;FWDB=-0.0678625;FXX=0.00555525;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.104;QD=8.93273;RBI=0.0689547;REFB=-0.0130658;REVB=-0.0122241;RO=88;SAF=21;SAR=70;SRF=34;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174599;STB=0.596506;TYPE=snp;VARB=0.0148158;OID=.;OPOS=38942449;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:179:88:88:91:91:70:21:34:54:70:21:34:54 chr5 38950776 . G A 272.98 PASS AO=75;DP=173;FAO=75;FDP=173;FR=.;FRO=98;FSAF=37;FSAR=38;FSRF=41;FSRR=57;FWDB=-0.0151148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.978;QD=6.3116;RBI=0.0155447;REFB=-0.00557979;REVB=0.00363054;RO=94;SAF=37;SAR=38;SRF=38;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0892409;STB=0.542511;TYPE=snp;VARB=0.00720774;OID=.;OPOS=38950776;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:173:94:98:75:75:38:37:38:56:38:37:41:57 chr5 39107100 . A G 1170.72 PASS AO=123;DP=123;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00235068;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4388;QD=38.0721;RBI=0.0257589;REFB=0;REVB=0.0256515;RO=0;SAF=51;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.7235e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000150399;OID=.;OPOS=39107100;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:123:123:0:0:123:123:72:51:0:0:72:51:0:0 chr5 39108309 . A G 1348.14 PASS AO=102;DP=142;FAO=142;FDP=142;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=73;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0631376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.845;QD=37.9759;RBI=0.0809023;REFB=0;REVB=0.0505849;RO=0;SAF=48;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.03919e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000311921;OID=.;OPOS=39108309;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:138:142:0:0:102:142:54:48:0:0:69:73:0:0 chr5 39108322 . A G 1341.92 PASS AO=135;DP=136;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0076218;FXX=0.00714235;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.479;QD=38.6163;RBI=0.00929324;REFB=0;REVB=0.00531718;RO=0;SAF=67;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.62038e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.97727e-06;OID=.;OPOS=39108322;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:136:139:0:0:135:139:68:67:0:0:68:71:0:0 chr5 39119723 . C A 890.83 PASS AO=89;DP=90;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0409015;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.281;QD=37.5088;RBI=0.050811;REFB=-3.67804e-05;REVB=0.0301468;RO=1;SAF=28;SAR=61;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0166228;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.1386e-05;OID=.;OPOS=39119723;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:90:95:1:0:89:95:61:28:1:0:66:29:0:0 chr5 40681254 . C T 59.2 PASS AO=26;DP=76;FAO=23;FDP=76;FR=.;FRO=53;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=33;FSRR=20;FWDB=0.00785748;FXX=0.0129853;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.2497;QD=3.11588;RBI=0.0522509;REFB=-0.0296769;REVB=-0.0516567;RO=48;SAF=15;SAR=11;SRF=31;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0802859;STB=0.522368;TYPE=snp;VARB=0.0577162;OID=.;OPOS=40681254;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:76:76:48:53:26:23:11:15:31:17:8:15:33:20 chr5 40852451 . C G 2576.28 PASS AO=303;DP=318;FAO=298;FDP=317;FR=.;FRO=19;FSAF=142;FSAR=156;FSRF=1;FSRR=18;FWDB=-0.0305818;FXX=0.00314456;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.3652;QD=32.5083;RBI=0.036541;REFB=-0.0725864;REVB=-0.0199999;RO=14;SAF=142;SAR=161;SRF=1;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0336179;STB=0.525522;TYPE=snp;VARB=0.0138338;OID=.;OPOS=40852451;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:318:317:14:19:303:298:161:142:1:13:156:142:1:18 chr5 40853048 . C T 399.6 PASS AO=94;DP=213;FAO=89;FDP=202;FR=.,HEALED;FRO=94;FSAF=28;FSAR=61;FSRF=36;FSRR=58;FWDB=-0.0277257;FXX=0.00492587;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.7972;QD=7.91296;RBI=0.0626143;REFB=-0.0540632;REVB=-0.0561413;RO=74;SAF=29;SAR=65;SRF=34;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134516;STB=0.539515;TYPE=snp;VARB=-0.0368778;OID=.;OPOS=40853048;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:213:202:74:94:94:89:65:29:34:40:61:28:36:58 chr5 40955561 . G C 2657.82 PASS AO=271;DP=271;FAO=276;FDP=276;FR=.;FRO=0;FSAF=125;FSAR=151;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0366356;FXX=0.0107523;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.0489;QD=38.5192;RBI=0.0752307;REFB=0;REVB=0.0657077;RO=0;SAF=122;SAR=149;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000309018;OID=.;OPOS=40955561;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:271:276:0:0:271:276:149:122:0:0:151:125:0:0 chr5 40964852 . A C 525.11 PASS AO=158;DP=383;FAO=158;FDP=382;FR=.;FRO=224;FSAF=71;FSAR=87;FSRF=94;FSRR=130;FWDB=0.0177066;FXX=0.0052082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.8465;QD=5.49857;RBI=0.0219179;REFB=0.00477109;REVB=0.012918;RO=224;SAF=71;SAR=87;SRF=93;SRR=131;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0365006;STB=0.517671;TYPE=snp;VARB=-0.00658775;OID=.;OPOS=40964852;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:383:382:224:224:158:158:87:71:93:131:87:71:94:130 chr5 40972111 . C T 3832.14 PASS AO=426;DP=429;FAO=398;FDP=398;FR=.;FRO=0;FSAF=218;FSAR=180;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0019913;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.254;QD=38.514;RBI=0.00788101;REFB=0;REVB=0.00762529;RO=0;SAF=234;SAR=192;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.79125e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.23522e-06;OID=.;OPOS=40972111;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:429:398:0:0:426:398:192:234:0:0:180:218:0:0 chr5 40998196 . T C 130.06 PASS AO=36;DP=89;FAO=36;FDP=87;FR=.;FRO=51;FSAF=27;FSAR=9;FSRF=38;FSRR=13;FWDB=-0.0167762;FXX=0.0224694;HRUN=3;LEN=1;MLLD=192.016;QD=5.97975;RBI=0.0195296;REFB=-0.00725679;REVB=-0.00999826;RO=51;SAF=27;SAR=9;SRF=38;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00673847;STB=0.503815;TYPE=snp;VARB=0.0124409;OID=.;OPOS=40998196;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:87:51:51:36:36:9:27:38:13:9:27:38:13 chr5 41000343 . G A 410.74 PASS AO=109;DP=243;FAO=109;FDP=242;FR=.;FRO=133;FSAF=66;FSAR=43;FSRF=61;FSRR=72;FWDB=-0.0214292;FXX=0.00411506;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.262;QD=6.78905;RBI=0.0225552;REFB=8.25491e-05;REVB=0.00703771;RO=132;SAF=66;SAR=43;SRF=60;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150583;STB=0.58155;TYPE=snp;VARB=-0.000139387;OID=.;OPOS=41000343;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:243:242:132:133:109:109:43:66:60:72:43:66:61:72 chr5 41007422 . A C 336.82 PASS AO=69;DP=132;FAO=72;FDP=133;FR=.;FRO=61;FSAF=46;FSAR=26;FSRF=37;FSRR=24;FWDB=0.00312461;FXX=0.0148137;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.733;QD=10.1298;RBI=0.0200117;REFB=-0.0270247;REVB=0.0197663;RO=61;SAF=46;SAR=23;SRF=37;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.056542;STB=0.515922;TYPE=snp;VARB=0.0220413;OID=.;OPOS=41007422;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:133:61:61:69:72:23:46:37:24:26:46:37:24 chr5 41008780 . A G 262.71 PASS AO=71;DP=173;FAO=75;FDP=176;FR=.;FRO=101;FSAF=48;FSAR=27;FSRF=40;FSRR=61;FWDB=0.0023143;FXX=0.0056494;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.708;QD=5.97064;RBI=0.0102662;REFB=-0.00694669;REVB=-0.010002;RO=102;SAF=48;SAR=23;SRF=40;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.299939;STB=0.639963;TYPE=snp;VARB=0.0108578;OID=.;OPOS=41008780;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:176:102:101:71:75:23:48:40:62:27:48:40:61 chr5 41018452 . A T 278.75 PASS AO=66;DP=135;FAO=66;FDP=135;FR=.;FRO=69;FSAF=23;FSAR=43;FSRF=36;FSRR=33;FWDB=0.023408;FXX=0.0073524;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.774;QD=8.25921;RBI=0.0268203;REFB=-0.0124457;REVB=0.0130917;RO=66;SAF=23;SAR=43;SRF=33;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143619;STB=0.592037;TYPE=snp;VARB=0.0107563;OID=.;OPOS=41018452;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:66:69:66:66:43:23:33:33:43:23:36:33 chr5 41033909 . ATCTATCTATCTATC A 31.05 PASS AO=5;DP=20;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0382043;FXX=0.411523;HRUN=1;LEN=14;MLLD=206.745;QD=12.4196;RBI=0.0385178;REFB=-0.0408063;REVB=-0.00490498;RO=4;SAF=1;SAR=4;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.268008;STB=0.726279;TYPE=del;VARB=0.0329121;OID=.;OPOS=41033910;OREF=TCTATCTATCTATC;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:5:15:5:10:5:1:4:3:2:27:4:1:4:2:2 chr5 41033931 . C T 23.13 PASS AO=5;DP=21;FAO=6;FDP=19;FR=.;FRO=13;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.0235706;FXX=0.136302;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.095;QD=4.86895;RBI=0.0323268;REFB=-0.0341461;REVB=-0.0221234;RO=16;SAF=0;SAR=5;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.656709;STB=0.640492;TYPE=snp;VARB=0.0777235;OID=.;OPOS=41033931;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:21:19:16:13:5:6:5:0:5:11:5:1:4:9 chr5 41033992 . G T 47.1 PASS AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=0.0317424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.7406;QD=8.56402;RBI=0.0494752;REFB=-0.02763;REVB=0.0379501;RO=12;SAF=1;SAR=9;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14509;STB=0.58676;TYPE=snp;VARB=0.0395146;OID=.;OPOS=41033992;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:22:22:12:12:10:10:9:1:2:10:9:1:2:10 chr5 41042284 . G T 1855.28 PASS AO=192;DP=194;FAO=194;FDP=194;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0821019;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2106;QD=38.2531;RBI=0.0822421;REFB=0;REVB=0.00480005;RO=1;SAF=93;SAR=99;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00509308;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000268568;OID=.;OPOS=41042284;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:194:194:1:0:192:194:99:93:1:0:99:95:0:0 chr5 41048533 . C T 111.44 PASS AO=40;DP=117;FAO=40;FDP=117;FR=.;FRO=77;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=28;FSRR=49;FWDB=-0.00749021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.338;QD=3.80995;RBI=0.0228375;REFB=-0.00876306;REVB=-0.0215743;RO=77;SAF=15;SAR=25;SRF=28;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0138969;STB=0.508005;TYPE=snp;VARB=0.0164781;OID=.;OPOS=41048533;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:77:77:40:40:25:15:28:49:25:15:28:49 chr5 41049389 . T C 1364.59 PASS AO=146;DP=149;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00193956;FXX=0.0199987;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.976;QD=37.1317;RBI=0.0023164;REFB=-0.0828107;REVB=-0.00126642;RO=3;SAF=85;SAR=61;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0164867;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.16722e-05;OID=.;OPOS=41049389;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:149:147:3:0:146:147:61:85:3:0:61:86:0:0 chr5 41049397 . C T 1221.53 PASS AO=134;DP=141;FAO=136;FDP=140;FR=.;FRO=4;FSAF=85;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0362149;FXX=0.0070917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.169;QD=34.9008;RBI=0.040944;REFB=-0.154835;REVB=0.0191022;RO=6;SAF=85;SAR=49;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.054724;STB=0.518865;TYPE=snp;VARB=0.00151428;OID=.;OPOS=41049397;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:141:140:6:4:134:136:49:85:0:6:51:85:0:4 chr5 41055888 . C T 370.68 PASS AO=85;DP=167;FAO=85;FDP=168;FR=.;FRO=83;FSAF=36;FSAR=49;FSRF=43;FSRR=40;FWDB=-0.00189781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.495;QD=8.82582;RBI=0.0167963;REFB=-0.0133473;REVB=-0.0166888;RO=81;SAF=36;SAR=49;SRF=42;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0851385;STB=0.547127;TYPE=snp;VARB=0.0262475;OID=.;OPOS=41055888;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:168:81:83:85:85:49:36:42:39:49:36:43:40 chr5 41061715 . C T 337.7 PASS AO=81;DP=168;FAO=81;FDP=167;FR=.;FRO=86;FSAF=64;FSAR=17;FSRF=41;FSRR=45;FWDB=-0.000788893;FXX=0.00595203;HRUN=2;LEN=1;MLLD=271.341;QD=8.0886;RBI=0.0282158;REFB=0.0028296;REVB=0.0282047;RO=85;SAF=64;SAR=17;SRF=40;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.34452;STB=0.689676;TYPE=snp;VARB=-0.00259348;OID=.;OPOS=41061715;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:167:85:86:81:81:17:64:40:45:17:64:41:45 chr5 41061716 . A G 1581.51 PASS AO=169;DP=172;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=109;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0175589;FXX=0.0232545;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.299;QD=37.6551;RBI=0.0250217;REFB=0.0853589;REVB=-0.017826;RO=0;SAF=109;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000833842;OID=.;OPOS=41061716;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:172:168:0:0:169:168:60:109:0:0:59:109:0:0 chr5 41069852 . T C 136.88 PASS AO=46;DP=127;FAO=46;FDP=127;FR=.;FRO=81;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=43;FSRR=38;FWDB=-0.00501315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.803;QD=4.31119;RBI=0.00518046;REFB=-0.00396301;REVB=0.00130594;RO=80;SAF=27;SAR=19;SRF=43;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0560162;STB=0.536408;TYPE=snp;VARB=0.0153775;OID=.;OPOS=41069852;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:80:81:46:46:19:27:43:37:19:27:43:38 chr5 41158863 . G A 2406.23 PASS AO=251;DP=254;FAO=251;FDP=251;FR=.;FRO=0;FSAF=111;FSAR=140;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00262244;FXX=0.0195305;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.187;QD=38.3463;RBI=0.0165668;REFB=0;REVB=0.0163579;RO=0;SAF=111;SAR=140;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.90265e-05;OID=.;OPOS=41158863;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:254:251:0:0:251:251:140:111:0:0:140:111:0:0 chr5 41199959 . G T 942.68 PASS AO=99;DP=100;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115231;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.152;QD=37.3339;RBI=0.0273139;REFB=-0.0829786;REVB=0.0247643;RO=0;SAF=48;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000338388;OID=.;OPOS=41199959;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:100:101:0:0:99:101:51:48:0:0:52:49:0:0 chr5 42700043 . GA G,GG 1009 PASS AO=17,87;DP=105;FAO=13,96;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=0,64;FSAR=13,32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0135458,-0.00657576;FXX=0.0180164;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=44.6557,60.3762;QD=37.0276;RBI=0.0154287,0.0300518;REFB=0,0;REVB=0.0073863,0.0293235;RO=0;SAF=0,64;SAR=17,23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.182984,0.0165637;OID=.,.;OPOS=42700044,42700044;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:17,87:104:13,96:109:0:0,64:13,32:0:0:4:0:0,64:17,23:0:0 chr5 42719239 . A C 179.15 PASS AO=54;DP=134;FAO=54;FDP=136;FR=.;FRO=82;FSAF=22;FSAR=32;FSRF=43;FSRR=39;FWDB=-0.00625779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.19;QD=5.26901;RBI=0.0156817;REFB=0.00355907;REVB=-0.014379;RO=80;SAF=22;SAR=32;SRF=43;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138413;STB=0.571088;TYPE=snp;VARB=-0.00865987;OID=.;OPOS=42719239;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:136:80:82:54:54:32:22:43:37:32:22:43:39 chr5 42720068 . T TA 329.99 PASS AO=55;DP=80;FAO=58;FDP=72;FR=.;FRO=14;FSAF=38;FSAR=20;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.0149286;FXX=0.0769132;HRUN=2;LEN=1;MLLD=273.094;QD=18.3325;RBI=0.0157692;REFB=0.0026284;REVB=-0.00507989;RO=20;SAF=35;SAR=20;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00731451;STB=0.502645;TYPE=ins;VARB=-0.000527298;OID=.;OPOS=42720069;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:55:80:58:72:14:38:20:9:5:7:20:35:20:13:7 chr5 43039793 . T C 119.83 PASS AO=28;DP=56;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=27;FWDB=-0.0245421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.712;QD=8.71453;RBI=0.0280528;REFB=-0.020295;REVB=0.0135884;RO=28;SAF=8;SAR=20;SRF=1;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.32314;STB=0.672705;TYPE=snp;VARB=0.0163953;OID=.;OPOS=43039793;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:55:28:28:28:27:20:8:1:27:20:7:1:27 chr5 43040521 . AG A 146.34 PASS AO=20;DP=28;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.308369;FXX=0.0370233;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.9237;QD=22.5135;RBI=0.378109;REFB=-0.0487413;REVB=0.218804;RO=4;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=4;SSEN=0.456522;SSEP=0;SSSB=0.141223;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0162801;OID=.;OPOS=43040522;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:20:27:26:26:0:11:15:0:0:9:4:9:11:0:4 chr5 43245922 . C T 105.09 PASS AO=33;DP=82;FAO=33;FDP=85;FR=.;FRO=52;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=26;FWDB=0.00446789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.028;QD=4.94516;RBI=0.0597901;REFB=-0.0159068;REVB=0.0596229;RO=47;SAF=17;SAR=16;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0173874;STB=0.509267;TYPE=snp;VARB=0.039688;OID=.;OPOS=43245922;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:85:47:52:33:33:16:17:25:22:16:17:26:26 chr5 43297144 . A G 386.53 PASS AO=95;DP=199;FAO=95;FDP=199;FR=.;FRO=104;FSAF=60;FSAR=35;FSRF=62;FSRR=42;FWDB=-0.0026659;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.515;QD=7.76943;RBI=0.010204;REFB=-0.0106509;REVB=-0.00984962;RO=104;SAF=60;SAR=35;SRF=62;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0356367;STB=0.519681;TYPE=snp;VARB=0.0131593;OID=.;OPOS=43297144;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:199:199:104:104:95:95:35:60:62:42:35:60:62:42 chr5 43492978 . G A 560.91 PASS AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0109712;FXX=0.0605969;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.261;QD=36.1874;RBI=0.025768;REFB=-0.0787124;REVB=0.0233157;RO=1;SAF=24;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192603;STB=0.510201;TYPE=snp;VARB=2.42999e-05;OID=.;OPOS=43492978;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:62:62:1:1:61:61:37:24:1:0:37:24:1:0 chr5 43505993 . A G 352.53 PASS AO=75;DP=143;FAO=77;FDP=145;FR=.;FRO=68;FSAF=47;FSAR=30;FSRF=27;FSRR=41;FWDB=0.022327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.304;QD=9.72494;RBI=0.0244822;REFB=-0.021757;REVB=-0.010044;RO=67;SAF=47;SAR=28;SRF=27;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194353;STB=0.600478;TYPE=snp;VARB=0.0256862;OID=.;OPOS=43505993;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:145:67:68:75:77:28:47:27:40:30:47:27:41 chr5 43509348 . T A 2060.96 PASS AO=218;DP=220;FAO=219;FDP=219;FR=.;FRO=0;FSAF=110;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000321679;FXX=0.00454525;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.3714;QD=37.643;RBI=0.0720631;REFB=-0.110381;REVB=0.0720624;RO=1;SAF=110;SAR=108;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00439126;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000696632;OID=.;OPOS=43509348;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:220:219:1:0:218:219:108:110:0:1:109:110:0:0 chr5 43527135 . A C 1918.48 PASS AO=205;DP=208;FAO=205;FDP=205;FR=.;FRO=0;FSAF=129;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171592;FXX=0.0144224;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.821;QD=37.4337;RBI=0.0220598;REFB=0.000842113;REVB=0.0138636;RO=2;SAF=129;SAR=76;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00254787;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.06349e-05;OID=.;OPOS=43527135;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:208:205:2:0:205:205:76:129:1:1:76:129:0:0 chr5 43609343 . C T 739.38 PASS AO=255;DP=574;FAO=188;FDP=399;FR=.;FRO=211;FSAF=83;FSAR=105;FSRF=104;FSRR=107;FWDB=0.00611724;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.068;QD=7.41233;RBI=0.00616149;REFB=-0.0181568;REVB=-0.000737102;RO=317;SAF=116;SAR=139;SRF=158;SRR=159;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0438041;STB=0.52738;TYPE=snp;VARB=0.0206131;OID=.;OPOS=43609343;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:574:399:317:211:255:188:139:116:158:159:105:83:104:107 chr5 44066732 . A G 1405.81 PASS AO=151;DP=153;FAO=151;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00492719;FXX=0.013071;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.925;QD=37.24;RBI=0.0593261;REFB=-0.0262754;REVB=0.0591211;RO=2;SAF=71;SAR=80;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0132087;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00108861;OID=.;OPOS=44066732;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:153:151:2:0:151:151:80:71:2:0:80:71:0:0 chr5 50045967 . G T 1702.25 PASS AO=147;DP=188;FAO=178;FDP=183;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=77;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00444479;FXX=0.0213892;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.147;QD=37.2077;RBI=0.0146075;REFB=0;REVB=-0.0139149;RO=0;SAF=65;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.002793;OID=.;OPOS=50045967;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:182:183:0:0:147:178:82:65:0:0:101:77:0:0 chr5 50053015 . G A 666.71 PASS AO=71;DP=76;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00769457;FXX=0.0874891;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.676;QD=36.5318;RBI=0.0124948;REFB=-0.0563513;REVB=-0.00984443;RO=0;SAF=37;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.12261e-08;STB=0.50704;TYPE=snp;VARB=0.000126962;OID=.;OPOS=50053015;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:76:73:0:1:71:72:34:37:0:0:35:37:0:1 chr5 50057729 . G A 501.36 PASS AO=43;DP=59;FAO=53;FDP=54;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0448285;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=142.343;QD=37.1376;RBI=0.0758393;REFB=0;REVB=0.0611719;RO=0;SAF=28;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02792e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000795251;OID=.;OPOS=50057729;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:52:54:0:0:43:53:15:28:0:0:23:30:0:0 chr5 50685505 . A G 20.55 PASS AO=5;DP=14;FAO=5;FDP=14;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.0386634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.4;QD=5.8718;RBI=0.0623913;REFB=-0.00548864;REVB=-0.0489676;RO=9;SAF=3;SAR=2;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.046104;STB=0.529293;TYPE=snp;VARB=0.00824542;OID=.;OPOS=50685505;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:14:14:9:9:5:5:2:3:5:4:2:3:5:4 chr5 52087584 . T TCA 426.04 PASS AO=44;DP=47;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0755311;FXX=0.0217344;HRUN=0;LEN=2;MLLD=232.019;QD=37.87;RBI=0.0755313;REFB=0;REVB=0.000198546;RO=1;SAF=2;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18592;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.000125499;OID=.;OPOS=52087585;OREF=-;OALT=CA;OMAPALT=TCA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:44:47:45:45:0:2:43:0:0:20:1:2:42:1:0 chr5 52096889 . C A 1839.35 PASS AO=194;DP=195;FAO=194;FDP=194;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0180922;FXX=0.00512794;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.964;QD=37.9248;RBI=0.0181917;REFB=0.04464;REVB=0.00189995;RO=0;SAF=97;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.11917e-05;OID=.;OPOS=52096889;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:195:194:0:0:194:194:97:97:0:0:97:97:0:0 chr5 52157374 . T C 2683.77 PASS AO=278;DP=278;FAO=280;FDP=280;FR=.;FRO=0;FSAF=112;FSAR=168;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0128633;FXX=0.00355859;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.5541;QD=38.3396;RBI=0.0210018;REFB=0;REVB=0.0166015;RO=0;SAF=112;SAR=166;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.56783e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.30997e-05;OID=.;OPOS=52157374;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:278:280:0:0:278:280:166:112:0:0:168:112:0:0 chr5 52193287 . C T 24.65 PASS AO=13;DP=57;FAO=13;FDP=57;FR=.;FRO=44;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=-0.0306424;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.0695;QD=1.72955;RBI=0.0309615;REFB=0.00722203;REVB=0.00443366;RO=44;SAF=6;SAR=7;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0471458;STB=0.529684;TYPE=snp;VARB=-0.0217033;OID=.;OPOS=52193287;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:57:57:44:44:13:13:7:6:22:22:7:6:22:22 chr5 52248291 . T C 1038.7 PASS AO=108;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00243489;FXX=0.0267833;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.497;QD=38.1174;RBI=0.0267182;REFB=0;REVB=0.026607;RO=0;SAF=35;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1026e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000172167;OID=.;OPOS=52248291;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:109:109:0:0:108:109:73:35:0:0:73:36:0:0 chr5 52351377 . T C 498.53 PASS AO=118;DP=247;FAO=122;FDP=252;FR=.;FRO=130;FSAF=83;FSAR=39;FSRF=95;FSRR=35;FWDB=0.0385122;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.1114;QD=7.91316;RBI=0.0401765;REFB=-0.00772639;REVB=0.0114436;RO=129;SAF=81;SAR=37;SRF=95;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0564456;STB=0.530567;TYPE=snp;VARB=0.00829506;OID=.;OPOS=52351377;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:247:252:129:130:118:122:37:81:95:34:39:83:95:35 chr5 52351876 . A G 265.33 PASS AO=80;DP=196;FAO=80;FDP=199;FR=.;FRO=119;FSAF=36;FSAR=44;FSRF=54;FSRR=65;FWDB=0.0182428;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.5023;QD=5.33331;RBI=0.0197262;REFB=-0.00795078;REVB=0.00750489;RO=113;SAF=36;SAR=44;SRF=51;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00140179;STB=0.502283;TYPE=snp;VARB=0.00826599;OID=.;OPOS=52351876;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:199:113:119:80:80:44:36:51:62:44:36:54:65 chr5 52358757 . G A 225.18 PASS AO=54;DP=124;FAO=58;FDP=126;FR=.;FRO=68;FSAF=22;FSAR=36;FSRF=24;FSRR=44;FWDB=-0.00555879;FXX=0.0156238;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.573;QD=7.14859;RBI=0.00950315;REFB=0.0204468;REVB=0.00770776;RO=67;SAF=20;SAR=34;SRF=25;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00293516;STB=0.515217;TYPE=snp;VARB=-0.0143879;OID=.;OPOS=52358757;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:126:67:68:54:58:34:20:25:42:36:22:24:44 chr5 52368472 . C T 352.19 PASS AO=101;DP=238;FAO=100;FDP=235;FR=.;FRO=135;FSAF=40;FSAR=60;FSRF=54;FSRR=81;FWDB=0.00219027;FXX=0.00843846;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.496;QD=5.99474;RBI=0.00820592;REFB=0.00901276;REVB=-0.00790822;RO=134;SAF=41;SAR=60;SRF=54;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00313924;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0201046;OID=.;OPOS=52368472;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:238:235:134:135:101:100:60:41:54:80:60:40:54:81 chr5 52369002 . G A 202.45 PASS AO=67;DP=180;FAO=67;FDP=180;FR=.;FRO=113;FSAF=23;FSAR=44;FSRF=49;FSRR=64;FWDB=0.00581684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.7214;QD=4.49888;RBI=0.00763075;REFB=-0.00652198;REVB=0.00493889;RO=106;SAF=23;SAR=44;SRF=43;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0729365;STB=0.560491;TYPE=snp;VARB=0.0247778;OID=.;OPOS=52369002;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:180:106:113:67:67:44:23:43:63:44:23:49:64 chr5 52369086 . G A 213.79 PASS AO=62;DP=154;FAO=63;FDP=154;FR=.;FRO=91;FSAF=27;FSAR=36;FSRF=49;FSRR=42;FWDB=-0.0178636;FXX=0.0064512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.3656;QD=5.55293;RBI=0.0198884;REFB=-0.0153925;REVB=-0.00874287;RO=88;SAF=26;SAR=36;SRF=49;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143606;STB=0.565035;TYPE=snp;VARB=0.0215904;OID=.;OPOS=52369086;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:154:88:91:62:63:36:26:49:39:36:27:49:42 chr5 52389455 . A G 581.1 PASS AO=58;DP=58;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0380193;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.904;QD=38.7398;RBI=0.0403796;REFB=0;REVB=0.0136031;RO=0;SAF=24;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.31293e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000101631;OID=.;OPOS=52389455;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:58:60:0:0:58:60:34:24:0:0:34:26:0:0 chr5 52389593 . G A 294.16 PASS AO=58;DP=104;FAO=58;FDP=102;FR=.;FRO=44;FSAF=22;FSAR=36;FSRF=14;FSRR=30;FWDB=0.00369851;FXX=0.0192289;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.497;QD=11.5358;RBI=0.0254867;REFB=-0.0265139;REVB=-0.0252169;RO=44;SAF=22;SAR=36;SRF=14;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0519683;STB=0.528375;TYPE=snp;VARB=0.0204371;OID=.;OPOS=52389593;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:102:44:44:58:58:36:22:14:30:36:22:14:30 chr5 52389811 . T TAAAG 413.44 PASS AO=49;DP=61;FAO=52;FDP=59;FR=.;FRO=7;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0133284;FXX=0.0483793;HRUN=4;LEN=4;MLLD=224.303;QD=28.0296;RBI=0.0182873;REFB=-0.0185402;REVB=-0.0125212;RO=7;SAF=24;SAR=25;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0191037;STB=0.513084;TYPE=ins;VARB=0.00134971;OID=.;OPOS=52389812;OREF=-;OALT=AAAG;OMAPALT=TAAAG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:49:61:52:59:7:24:28:4:3:4:7:24:25:4:3 chr5 52394018 . GC G 23.57 PASS AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.0145371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.833;QD=5.23782;RBI=0.0146891;REFB=-0.0137485;REVB=-0.00210811;RO=12;SAF=3;SAR=3;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.270468;STB=0.666172;TYPE=del;VARB=0.0202582;OID=.;OPOS=52394019;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:6:18:6:18:12:3:3:3:9:23:12:3:3:3:9 chr5 52402939 . TGG TG,T 457.66 PASS AO=21,70;DP=129;FAO=0,98;FDP=110;FR=.;FRO=12;FSAF=0,12;FSAR=0,86;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.455769,0.251456;FXX=0.0434745;HRUN=7,7;LEN=1,2;MLLD=8.42766,13.1647;QD=16.6423;RBI=0.477414,0.263825;REFB=-0.0661172,-0.0350554;REVB=-0.142122,-0.079832;RO=29;SAF=5,1;SAR=16,69;SRF=22;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.508613,-0.816506;STB=0.5,0.54951;TYPE=del,del;VARB=0.125304,0.0640443;OID=.,.;OPOS=52402940,52402940;OREF=G,GG;OALT=-,-;OMAPALT=TG,T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:21,70:127:0,98:110:12:0,12:0,86:4:8:9:29:5,1:16,69:22:7 chr5 52856504 . G C 1013.09 PASS AO=111;DP=114;FAO=112;FDP=114;FR=.;FRO=2;FSAF=66;FSAR=46;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00270321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.745;QD=35.5471;RBI=0.0960092;REFB=-0.156275;REVB=0.0959711;RO=3;SAF=66;SAR=45;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00373538;STB=0.507461;TYPE=snp;VARB=0.00230054;OID=.;OPOS=52856504;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:114:114:3:2:111:112:45:66:2:1:46:66:2:0 chr5 52942083 . A C 714 PASS AO=76;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.836;QD=37.0907;RBI=0.0287718;REFB=-0.0323228;REVB=0.02432;RO=1;SAF=48;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00975781;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000153848;OID=.;OPOS=52942083;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:77:77:1:0:76:77:28:48:1:0:28:49:0:0 chr5 52942197 . A G 1313.47 PASS AO=135;DP=136;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00590879;FXX=0.0070917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.559;QD=37.5278;RBI=0.0376144;REFB=-0.0452246;REVB=0.0371474;RO=1;SAF=60;SAR=75;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00629643;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000436927;OID=.;OPOS=52942197;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:136:140:1:0:135:140:75:60:0:1:80:60:0:0 chr5 52979097 . G A 1415.63 PASS AO=147;DP=149;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00473328;FXX=0.0134219;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.79;QD=38.5204;RBI=0.00856283;REFB=0;REVB=0.00713569;RO=0;SAF=47;SAR=100;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.48485e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.04307e-05;OID=.;OPOS=52979097;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:149:147:0:0:147:147:100:47:0:0:100:47:0:0 chr5 53606295 . T C 1422.12 PASS AO=154;DP=156;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189482;FXX=0.0128197;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.543;QD=36.9381;RBI=0.0897612;REFB=-0.115663;REVB=-0.0877385;RO=1;SAF=53;SAR=101;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00468719;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00402654;OID=.;OPOS=53606295;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:156:154:1:0:154:154:101:53:0:1:101:53:0:0 chr5 53751901 . G A 1448.58 PASS AO=145;DP=147;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129324;FXX=0.0129862;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.8467;QD=38.1204;RBI=0.0699319;REFB=0;REVB=0.0687257;RO=0;SAF=86;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000719285;OID=.;OPOS=53751901;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:147:152:0:0:145:152:59:86:0:0:61:91:0:0 chr5 53751988 . T C 2543.37 PASS AO=263;DP=266;FAO=264;FDP=264;FR=.;FRO=0;FSAF=136;FSAR=128;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00891328;FXX=0.0185867;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.156;QD=38.5359;RBI=0.0249651;REFB=0;REVB=0.0233197;RO=0;SAF=135;SAR=128;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000168512;OID=.;OPOS=53751988;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:266:264:0:0:263:264:128:135:0:0:128:136:0:0 chr5 53815066 . C A 126.2 PASS AO=28;DP=56;FAO=28;FDP=56;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=23;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=-0.00501219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.6579;QD=9.01396;RBI=0.031178;REFB=-0.0220689;REVB=0.0307725;RO=28;SAF=5;SAR=23;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224542;STB=0.627171;TYPE=snp;VARB=0.0309953;OID=.;OPOS=53815066;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:28:28:28:28:23:5:10:18:23:5:10:18 chr5 53815495 . A C 1136 PASS AO=117;DP=122;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000259888;FXX=0.039367;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.0439;QD=37.2458;RBI=0.00758224;REFB=-0.123111;REVB=-0.00757779;RO=1;SAF=55;SAR=62;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.008557;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000259382;OID=.;OPOS=53815495;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:122:122:1:0:117:122:62:55:1:0:63:59:0:0 chr5 53815722 . G A 311.73 PASS AO=77;DP=163;FAO=77;FDP=162;FR=.;FRO=85;FSAF=35;FSAR=42;FSRF=41;FSRR=44;FWDB=0.0372163;FXX=0.0121944;HRUN=3;LEN=1;MLLD=135.007;QD=7.69691;RBI=0.0391209;REFB=-0.0282686;REVB=-0.0120578;RO=83;SAF=35;SAR=42;SRF=41;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0371814;STB=0.514669;TYPE=snp;VARB=0.0166089;OID=.;OPOS=53815722;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:162:83:85:77:77:42:35:41:42:42:35:41:44 chr5 53815918 . A C 1109.36 PASS AO=120;DP=123;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00384066;FXX=0.0243883;HRUN=3;LEN=1;MLLD=211.866;QD=36.9786;RBI=0.00411843;REFB=-0.00577459;REVB=0.00148687;RO=1;SAF=46;SAR=74;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.010214;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.36495e-06;OID=.;OPOS=53815918;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:123:120:1:0:120:120:74:46:1:0:74:46:0:0 chr5 53816267 . TG T 123.66 PASS AO=31;DP=78;FAO=33;FDP=78;FR=.;FRO=45;FSAF=29;FSAR=4;FSRF=40;FSRR=5;FWDB=-0.0157953;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.942;QD=6.34127;RBI=0.0557111;REFB=-0.0141748;REVB=0.053425;RO=45;SAF=27;SAR=4;SRF=40;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0432057;STB=0.513958;TYPE=del;VARB=0.0156734;OID=.;OPOS=53816268;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:31:79:33:78:45:29:4:40:5:99:45:27:4:40:5 chr5 53816341 . G A 139.01 PASS AO=37;DP=90;FAO=38;FDP=91;FR=.;FRO=53;FSAF=6;FSAR=32;FSRF=47;FSRR=6;FWDB=0.0162365;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=204.932;QD=6.11039;RBI=0.0224998;REFB=-0.00204948;REVB=-0.0155761;RO=48;SAF=6;SAR=31;SRF=44;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.686332;STB=0.881321;TYPE=snp;VARB=0.00358998;OID=.;OPOS=53816341;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:91:48:53:37:38:31:6:44:4:32:6:47:6 chr5 53816782 . T C 1221.7 PASS AO=160;DP=190;FAO=161;FDP=189;FR=.;FRO=28;FSAF=48;FSAR=113;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=-0.00154384;FXX=0.0156242;HRUN=6;LEN=1;MLLD=135.303;QD=25.856;RBI=0.00911838;REFB=-0.121302;REVB=-0.00898674;RO=28;SAF=48;SAR=112;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109323;STB=0.558142;TYPE=snp;VARB=0.00424676;OID=.;OPOS=53816782;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:190:189:28:28:160:161:112:48:18:10:113:48:18:10 chr5 54252345 . T C 954.84 PASS AO=78;DP=100;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0917483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.931;QD=37.8154;RBI=0.0947277;REFB=0;REVB=0.0235709;RO=0;SAF=13;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000413206;OID=.;OPOS=54252345;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:79:101:0:0:78:101:65:13:0:0:69:32:0:0 chr5 54253555 . A G 828.27 PASS AO=99;DP=103;FAO=96;FDP=102;FR=.;FRO=6;FSAF=56;FSAR=40;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.0313469;FXX=0.0097078;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.4621;QD=32.4812;RBI=0.0327341;REFB=-0.0877889;REVB=-0.00942849;RO=4;SAF=56;SAR=43;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00491264;STB=0.515047;TYPE=snp;VARB=0.00917656;OID=.;OPOS=54253555;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:103:102:4:6:99:96:43:56:2:2:40:56:2:4 chr5 54253581 . A G 1052.74 PASS AO=109;DP=109;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0113452;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.4509;QD=37.9367;RBI=0.0163683;REFB=0;REVB=-0.0117987;RO=0;SAF=57;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.53715e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000119245;OID=.;OPOS=54253581;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:109:111:0:0:109:111:52:57:0:0:54:57:0:0 chr5 54403957 . T C 978.54 PASS AO=105;DP=109;FAO=105;FDP=107;FR=.;FRO=2;FSAF=67;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00553919;FXX=0.0183469;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.375;QD=36.5811;RBI=0.0112203;REFB=-0.140122;REVB=-0.00975764;RO=2;SAF=67;SAR=38;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0243179;STB=0.512818;TYPE=snp;VARB=0.00105407;OID=.;OPOS=54403957;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:109:107:2:2:105:105:38:67:0:2:38:67:0:2 chr5 54404015 . C T 1586.37 PASS AO=166;DP=171;FAO=166;FDP=166;FR=.;FRO=0;FSAF=109;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0496728;FXX=0.0348817;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.292;QD=38.2258;RBI=0.0499223;REFB=0;REVB=-0.00498512;RO=0;SAF=109;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.36497e-06;OID=.;OPOS=54404015;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:171:166:0:0:166:166:57:109:0:0:57:109:0:0 chr5 54410120 . A C 927.49 PASS AO=99;DP=100;FAO=98;FDP=99;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0086755;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.0206;QD=37.4742;RBI=0.034792;REFB=-0.0627435;REVB=0.033693;RO=0;SAF=43;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504504;TYPE=snp;VARB=0.000449864;OID=.;OPOS=54410120;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:100:99:0:1:99:98:56:43:0:0:55:43:0:1 chr5 54433393 . G A 931.26 PASS AO=97;DP=98;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0240874;FXX=0.010203;HRUN=3;LEN=1;MLLD=240.798;QD=38.4025;RBI=0.0246651;REFB=0;REVB=-0.00530686;RO=0;SAF=53;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.4253e-05;OID=.;OPOS=54433393;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:98:97:0:0:97:97:44:53:0:0:44:53:0:0 chr5 54439466 . G A 1513.24 PASS AO=157;DP=158;FAO=158;FDP=158;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00388518;FXX=0.00628891;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.138;QD=38.3098;RBI=0.0151256;REFB=0;REVB=0.0146181;RO=0;SAF=39;SAR=118;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.78227e-05;OID=.;OPOS=54439466;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:158:158:0:0:157:158:118:39:0:0:119:39:0:0 chr5 54459961 . A G 809.19 PASS AO=107;DP=126;FAO=106;FDP=125;FR=.;FRO=19;FSAF=32;FSAR=74;FSRF=2;FSRR=17;FWDB=0.0997493;FXX=0.00793588;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.5273;QD=25.8941;RBI=0.100991;REFB=0.00324524;REVB=-0.0157884;RO=19;SAF=32;SAR=75;SRF=2;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0677114;STB=0.536471;TYPE=snp;VARB=-0.00498603;OID=.;OPOS=54459961;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:126:125:19:19:107:106:75:32:2:17:74:32:2:17 chr5 54516521 . G A 961.15 PASS AO=99;DP=99;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0164517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.231;QD=38.0653;RBI=0.084024;REFB=0;REVB=0.0823976;RO=0;SAF=45;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000156318;OID=.;OPOS=54516521;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:99:101:0:0:99:101:54:45:0:0:55:46:0:0 chr5 54960609 . A G 566.24 PASS AO=143;DP=303;FAO=143;FDP=303;FR=.;FRO=160;FSAF=60;FSAR=83;FSRF=69;FSRR=91;FWDB=0.0128402;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=199.084;QD=7.47511;RBI=0.0300561;REFB=-0.00697098;REVB=-0.0271753;RO=152;SAF=60;SAR=83;SRF=67;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0203268;STB=0.506312;TYPE=snp;VARB=0.00657953;OID=.;OPOS=54960609;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:303:303:152:160:143:143:83:60:67:85:83:60:69:91 chr5 54960673 . C G 243.23 PASS AO=78;DP=203;FAO=78;FDP=203;FR=.;FRO=125;FSAF=12;FSAR=66;FSRF=31;FSRR=94;FWDB=-0.0202274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.201;QD=4.79267;RBI=0.0206356;REFB=0.0112651;REVB=-0.00408404;RO=125;SAF=12;SAR=66;SRF=31;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168782;STB=0.596442;TYPE=snp;VARB=-0.0157413;OID=.;OPOS=54960673;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:203:125:125:78:78:66:12:31:94:66:12:31:94 chr5 54960687 . C T 237.03 PASS AO=71;DP=176;FAO=71;FDP=176;FR=.;FRO=105;FSAF=10;FSAR=61;FSRF=27;FSRR=78;FWDB=-0.0231128;FXX=0.0056494;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.684;QD=5.38702;RBI=0.025082;REFB=0.000714721;REVB=-0.00974174;RO=104;SAF=10;SAR=61;SRF=27;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211381;STB=0.618827;TYPE=snp;VARB=-0.00101381;OID=.;OPOS=54960687;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:176:104:105:71:71:61:10:27:77:61:10:27:78 chr5 54990005 . C T 135.44 PASS AO=37;DP=88;FAO=37;FDP=88;FR=.;FRO=51;FSAF=28;FSAR=9;FSRF=28;FSRR=23;FWDB=-0.0131219;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.784;QD=6.15612;RBI=0.0165713;REFB=-0.00387774;REVB=-0.0101205;RO=50;SAF=28;SAR=9;SRF=28;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233016;STB=0.639919;TYPE=snp;VARB=0.00522584;OID=.;OPOS=54990005;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:50:51:37:37:9:28:28:22:9:28:28:23 chr5 55149407 . T C 2323.78 PASS AO=248;DP=253;FAO=250;FDP=250;FR=.;FRO=0;FSAF=116;FSAR=134;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0264406;FXX=0.0157474;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.924;QD=37.1804;RBI=0.0268482;REFB=-0.0834125;REVB=-0.0046603;RO=5;SAF=114;SAR=134;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0128841;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000375566;OID=.;OPOS=55149407;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:253:250:5:0:248:250:134:114:4:1:134:116:0:0 chr5 55155402 . C T 1511.92 PASS AO=133;DP=171;FAO=167;FDP=167;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.221384;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.0048;QD=36.2136;RBI=0.221699;REFB=0;REVB=0.0118094;RO=0;SAF=40;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0334088;OID=.;OPOS=55155402;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:136:167:0:0:133:167:93:40:0:0:94:73:0:0 chr5 55204187 . T G 356.06 PASS AO=82;DP=174;FAO=86;FDP=178;FR=.;FRO=92;FSAF=39;FSAR=47;FSRF=55;FSRR=37;FWDB=-0.0130006;FXX=0.00558628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.517;QD=8.00123;RBI=0.0130007;REFB=-0.0178843;REVB=-2.41522e-05;RO=92;SAF=39;SAR=43;SRF=55;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116468;STB=0.574197;TYPE=snp;VARB=0.0137246;OID=.;OPOS=55204187;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:178:92:92:82:86:43:39:55:37:47:39:55:37 chr5 55246001 . A G 492.45 PASS AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00826464;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=41.1633;QD=37.1662;RBI=0.0160783;REFB=0;REVB=0.0137916;RO=0;SAF=25;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000120595;OID=.;OPOS=55246001;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:52:53:0:0:52:53:27:25:0:0:27:26:0:0 chr5 56161787 . G A 1061.22 PASS AO=113;DP=115;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0064683;FXX=0.0173898;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.008;QD=37.5652;RBI=0.0110361;REFB=-0.0282116;REVB=0.00894181;RO=1;SAF=23;SAR=90;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0201921;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.32008e-06;OID=.;OPOS=56161787;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:115:113:1:0:113:113:90:23:1:0:90:23:0:0 chr5 56177443 . G A 1039.08 PASS AO=110;DP=112;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0533284;FXX=0.0178555;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7603;QD=37.7848;RBI=0.054592;REFB=0;REVB=0.0116777;RO=0;SAF=55;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00130305;OID=.;OPOS=56177443;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:112:110:0:0:110:110:55:55:0:0:56:54:0:0 chr5 56177743 . G A 1794.46 PASS AO=186;DP=186;FAO=187;FDP=187;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=117;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0234396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.789;QD=38.3841;RBI=0.0238454;REFB=0;REVB=-0.0043803;RO=0;SAF=69;SAR=117;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.23875e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.5413e-05;OID=.;OPOS=56177743;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:186:187:0:0:186:187:117:69:0:0:117:70:0:0 chr5 56177848 . TCAA T 445.92 PASS AO=41;DP=64;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0118503;FXX=0.039208;HRUN=1;LEN=3;MLLD=180.678;QD=36.4014;RBI=0.0123596;REFB=0;REVB=-0.00351147;RO=0;SAF=33;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.8059e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.000848507;OID=.;OPOS=56177849;OREF=CAA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:41:44:49:49:0:38:11:0:0:22:0:33:8:0:0 chr5 56178217 . A C 782.07 PASS AO=82;DP=83;FAO=84;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0172835;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.8607;QD=36.8035;RBI=0.0441384;REFB=0.0135193;REVB=0.0406138;RO=1;SAF=39;SAR=43;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108864;STB=0.505746;TYPE=snp;VARB=0.00132296;OID=.;OPOS=56178217;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:83:85:1:1:82:84:43:39:0:1:43:41:0:1 chr5 56190986 . A G 473.08 PASS AO=110;DP=220;FAO=110;FDP=219;FR=.;FRO=109;FSAF=75;FSAR=35;FSRF=64;FSRR=45;FWDB=-0.0172284;FXX=0.00454525;HRUN=3;LEN=1;MLLD=78.1874;QD=8.64065;RBI=0.0174497;REFB=-0.0218657;REVB=-0.00277057;RO=108;SAF=75;SAR=35;SRF=64;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0892944;STB=0.552222;TYPE=snp;VARB=0.0197254;OID=.;OPOS=56190986;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:220:219:108:109:110:110:35:75:64:44:35:75:64:45 chr5 56207123 . T A 426.23 PASS AO=93;DP=174;FAO=93;FDP=175;FR=.;FRO=82;FSAF=38;FSAR=55;FSRF=23;FSRR=59;FWDB=-0.00456176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.2437;QD=9.74239;RBI=0.00472328;REFB=-0.00717343;REVB=0.00122463;RO=80;SAF=38;SAR=55;SRF=23;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108598;STB=0.563536;TYPE=snp;VARB=0.00610872;OID=.;OPOS=56207123;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:175:80:82:93:93:55:38:23:57:55:38:23:59 chr5 56526565 . G T 1857.44 PASS AO=176;DP=179;FAO=197;FDP=197;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0434581;FXX=0.0149993;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.073;QD=37.7145;RBI=0.0558468;REFB=0;REVB=0.0350751;RO=0;SAF=90;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00221836;OID=.;OPOS=56526565;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:179:197:0:0:176:197:86:90:0:0:93:104:0:0 chr5 56526783 . G A 2024.34 PASS AO=214;DP=216;FAO=215;FDP=215;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=132;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0265111;FXX=0.0137608;HRUN=3;LEN=1;MLLD=122.516;QD=37.6622;RBI=0.0276667;REFB=-0.0530864;REVB=0.00791266;RO=2;SAF=83;SAR=131;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00721764;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000166866;OID=.;OPOS=56526783;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:216:215:2:0:214:215:131:83:0:2:132:83:0:0 chr5 56778103 . A G 264.65 PASS AO=73;DP=171;FAO=74;FDP=171;FR=.;FRO=97;FSAF=31;FSAR=43;FSRF=56;FSRR=41;FWDB=0.0120916;FXX=0.00581362;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.413;QD=6.19072;RBI=0.0158369;REFB=-0.0212029;REVB=0.0102274;RO=80;SAF=30;SAR=43;SRF=57;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.279333;STB=0.589574;TYPE=snp;VARB=0.0255956;OID=.;OPOS=56778103;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:171:80:97:73:74:43:30:57:23:43:31:56:41 chr5 57750267 . A C 1250.05 PASS AO=83;DP=137;FAO=130;FDP=130;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=76;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.230087;FXX=0.00763301;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.895;QD=38.4632;RBI=0.231842;REFB=0;REVB=0.0284713;RO=0;SAF=32;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00177244;OID=.;OPOS=57750267;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:130:130:0:0:83:130:51:32:0:0:54:76:0:0 chr5 57751443 . A G 1852.41 PASS AO=194;DP=195;FAO=194;FDP=194;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00737685;FXX=0.0251244;HRUN=3;LEN=1;MLLD=243.02;QD=38.1941;RBI=0.0137907;REFB=-0.0330981;REVB=-0.0116518;RO=1;SAF=94;SAR=100;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00473862;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.02934e-05;OID=.;OPOS=57751443;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:195:194:1:0:194:194:100:94:0:1:100:94:0:0 chr5 57753116 . C T 2219.39 PASS AO=232;DP=232;FAO=232;FDP=232;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=159;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0147779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.976;QD=38.2654;RBI=0.0201707;REFB=0;REVB=-0.0137284;RO=0;SAF=73;SAR=159;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.65246e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.83332e-05;OID=.;OPOS=57753116;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:232:232:0:0:232:232:159:73:0:0:159:73:0:0 chr5 57753149 . A G 2374.91 PASS AO=247;DP=248;FAO=247;FDP=247;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=164;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00967129;FXX=0.0040321;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.014;QD=38.4601;RBI=0.0409395;REFB=0;REVB=-0.0397808;RO=0;SAF=83;SAR=164;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.24079e-05;OID=.;OPOS=57753149;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:248:247:0:0:247:247:164:83:0:0:164:83:0:0 chr5 57754004 . C T 1022.02 PASS AO=109;DP=110;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0539911;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.71;QD=36.8297;RBI=0.0561522;REFB=-0.120989;REVB=-0.0154283;RO=1;SAF=84;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0056185;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000476492;OID=.;OPOS=57754004;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:110:111:1:0:109:111:25:84:1:0:26:85:0:0 chr5 57754132 . G C 670.61 PASS AO=70;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00963646;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.4733;QD=37.7808;RBI=0.0198747;REFB=0;REVB=0.0173823;RO=0;SAF=37;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000158103;OID=.;OPOS=57754132;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:71:71:0:0:70:71:33:37:0:0:34:37:0:0 chr5 57754808 . G A 1659.94 PASS AO=176;DP=179;FAO=176;FDP=176;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0014835;FXX=0.0167588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.3425;QD=37.726;RBI=0.0182921;REFB=-0.076986;REVB=-0.0182319;RO=2;SAF=92;SAR=84;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000487111;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000657176;OID=.;OPOS=57754808;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:179:176:2:0:176:176:84:92:1:1:84:92:0:0 chr5 57791311 . T G 3213.67 PASS AO=354;DP=361;FAO=352;FDP=360;FR=.;FRO=8;FSAF=197;FSAR=155;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=0.0792168;FXX=0.00277001;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.8296;QD=35.7075;RBI=0.0793133;REFB=-0.162634;REVB=-0.00391223;RO=5;SAF=200;SAR=154;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000946734;STB=0.50712;TYPE=snp;VARB=0.00606602;OID=.;OPOS=57791311;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:361:360:5:8:354:352:154:200:3:2:155:197:7:1 chr5 57792549 . G T 219.83 PASS AO=49;DP=94;FAO=49;FDP=96;FR=.;FRO=47;FSAF=32;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=0.00295472;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.965;QD=9.15943;RBI=0.0133119;REFB=-0.0284054;REVB=-0.0129799;RO=44;SAF=32;SAR=17;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17635;STB=0.60426;TYPE=snp;VARB=0.0289024;OID=.;OPOS=57792549;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:96:44:47:49:49:17:32:20:24:17:32:21:26 chr5 57792770 . AG A,GG 720.72 PASS AO=55,57;DP=142;FAO=61,61;FDP=141;FR=.;FRO=19;FSAF=4,20;FSAR=57,41;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=-0.0205923,0.00773;FXX=0.0275843;HRUN=3,1;LEN=1,1;MLLD=14.4716,229.1;QD=20.4458;RBI=0.035273,0.0174322;REFB=-0.123473,-0.0114716;REVB=0.0286381,0.0156246;RO=18;SAF=2,19;SAR=53,38;SRF=11;SRR=7;SSEN=0.342294,0;SSEP=0.213152,0;SSSB=-0.634236,-0.132757;STB=0.805204,0.602385;TYPE=del,snp;VARB=0.144731,0.0236623;OID=.,.;OPOS=57792771,57792770;OREF=G,A;OALT=-,G;OMAPALT=A,GG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:139:141:18:19:55,57:61,61:53,38:2,19:11:7:57,41:4,20:14:5 chr5 57841921 . C A 647.98 PASS AO=147;DP=285;FAO=147;FDP=284;FR=.;FRO=137;FSAF=78;FSAR=69;FSRF=63;FSRR=74;FWDB=-0.00645719;FXX=0.00350865;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.292;QD=9.12651;RBI=0.00925695;REFB=-0.00261259;REVB=0.00663294;RO=136;SAF=78;SAR=69;SRF=63;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0592312;STB=0.534114;TYPE=snp;VARB=0.00238822;OID=.;OPOS=57841921;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:285:284:136:137:147:147:69:78:63:73:69:78:63:74 chr5 58267277 . A T 145.22 PASS AO=31;DP=65;FAO=33;FDP=67;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=24;FSRF=11;FSRR=23;FWDB=0.0217501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3657;QD=8.66961;RBI=0.0308428;REFB=-0.0424029;REVB=-0.0218681;RO=33;SAF=9;SAR=22;SRF=10;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140967;STB=0.531542;TYPE=snp;VARB=0.0265824;OID=.;OPOS=58267277;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:67:33:34:31:33:22:9:10:23:24:9:11:23 chr5 58267557 . C T 380.74 PASS AO=109;DP=257;FAO=109;FDP=257;FR=.;FRO=148;FSAF=47;FSAR=62;FSRF=71;FSRR=77;FWDB=0.0106912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.8628;QD=5.92594;RBI=0.0165796;REFB=-0.00421717;REVB=0.0126721;RO=148;SAF=47;SAR=62;SRF=71;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0506966;STB=0.528264;TYPE=snp;VARB=0.00815413;OID=.;OPOS=58267557;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:257:257:148:148:109:109:62:47:71:77:62:47:71:77 chr5 58267723 . A C 226.36 PASS AO=47;DP=89;FAO=47;FDP=87;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=-0.00496207;FXX=0.0224694;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.239;QD=10.4073;RBI=0.0143936;REFB=5.13973e-06;REVB=-0.0135112;RO=42;SAF=18;SAR=29;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102952;STB=0.543823;TYPE=snp;VARB=-5.24369e-05;OID=.;OPOS=58267723;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:87:42:40:47:47:29:18:21:21:29:18:19:21 chr5 58295380 . G GTA 73.07 PASS AO=25;DP=155;FAO=28;FDP=89;FR=.;FRO=61;FSAF=4;FSAR=24;FSRF=21;FSRR=40;FWDB=-0.0666976;FXX=0.0430061;HRUN=1;LEN=2;MLLD=123.852;QD=3.2841;RBI=0.0717253;REFB=-0.0614057;REVB=-0.026381;RO=125;SAF=4;SAR=21;SRF=30;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158279;STB=0.700766;TYPE=ins;VARB=0.118131;OID=.;OPOS=58295381;OREF=-;OALT=TA;OMAPALT=GTA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:25:155:28:89:61:4:24:21:40:73:125:4:21:30:95 chr5 58489384 . G A 1469.99 PASS AO=155;DP=156;FAO=156;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0129423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5115;QD=37.6919;RBI=0.0325227;REFB=-0.0479722;REVB=0.0298365;RO=0;SAF=59;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00150668;OID=.;OPOS=58489384;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:156:156:0:0:155:156:96:59:0:0:97:59:0:0 chr5 59189402 . C T 16.08 PASS AO=3;DP=6;FAO=3;FDP=6;FR=.;FRO=3;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=178.405;QD=10.7188;RBI=0.0023681;REFB=0.0504057;REVB=-0.0023681;RO=3;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00628995;OID=.;OPOS=59189402;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:6:6:3:3:3:3:3:0:0:3:3:0:0:3 chr5 60241142 . G A 202.86 PASS AO=51;DP=127;FAO=56;FDP=132;FR=.;FRO=76;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=42;FSRR=34;FWDB=0.0137926;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.1122;QD=6.14733;RBI=0.0977709;REFB=-0.0242231;REVB=0.0967931;RO=76;SAF=27;SAR=24;SRF=42;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0247446;STB=0.540504;TYPE=snp;VARB=0.0342523;OID=.;OPOS=60241142;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:132:76:76:51:56:24:27:42:34:29:27:42:34 chr5 60999768 . C T 604.21 PASS AO=139;DP=274;FAO=140;FDP=276;FR=.;FRO=136;FSAF=67;FSAR=73;FSRF=63;FSRR=73;FWDB=-0.00474156;FXX=0.00360998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.018;QD=8.75664;RBI=0.0063615;REFB=0.00835357;REVB=-0.00424103;RO=128;SAF=67;SAR=72;SRF=56;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0391632;STB=0.507575;TYPE=snp;VARB=-0.00794498;OID=.;OPOS=60999768;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:274:276:128:136:139:140:72:67:56:72:73:67:63:73 chr5 61694379 . T C 351.28 PASS AO=84;DP=175;FAO=85;FDP=174;FR=.;FRO=89;FSAF=41;FSAR=44;FSRF=52;FSRR=37;FWDB=-0.0026155;FXX=0.00571396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.559;QD=8.07547;RBI=0.02432;REFB=-0.0139874;REVB=0.024179;RO=88;SAF=41;SAR=43;SRF=52;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0952885;STB=0.551991;TYPE=snp;VARB=0.0163103;OID=.;OPOS=61694379;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:174:88:89:84:85:43:41:52:36:44:41:52:37 chr5 61697859 . C T 167.25 PASS AO=45;DP=114;FAO=49;FDP=117;FR=.;FRO=68;FSAF=38;FSAR=11;FSRF=46;FSRR=22;FWDB=0.0432556;FXX=0.0168053;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.277;QD=5.71784;RBI=0.0437707;REFB=0.00464697;REVB=-0.00669525;RO=69;SAF=34;SAR=11;SRF=47;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100691;STB=0.575725;TYPE=snp;VARB=-0.00522369;OID=.;OPOS=61697859;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:117:69:68:45:49:11:34:47:22:11:38:46:22 chr5 61772535 . G T 303.5 PASS AO=84;DP=199;FAO=85;FDP=199;FR=.;FRO=114;FSAF=27;FSAR=58;FSRF=58;FSRR=56;FWDB=0.0059722;FXX=0.00499975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.699;QD=6.1005;RBI=0.00763381;REFB=-0.0090106;REVB=0.00475477;RO=115;SAF=26;SAR=58;SRF=59;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22203;STB=0.615606;TYPE=snp;VARB=0.0106089;OID=.;OPOS=61772535;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:199:199:115:114:84:85:58:26:59:56:58:27:58:56 chr5 61833068 . TG T 13.84 PASS AO=20;DP=71;FAO=14;FDP=69;FR=.;FRO=55;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=27;FSRR=28;FWDB=-0.00612638;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.549;QD=0.802266;RBI=0.0160765;REFB=-0.0111658;REVB=0.0148635;RO=46;SAF=0;SAR=20;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.808847;STB=0.898111;TYPE=del;VARB=0.0980395;OID=.;OPOS=61833069;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:20:70:14:69:55:1:13:27:28:13:46:0:20:25:21 chr5 61876773 . C T 115.93 PASS AO=22;DP=39;FAO=22;FDP=39;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=18;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.0359175;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.416;QD=11.8904;RBI=0.038734;REFB=-0.0233711;REVB=0.0145001;RO=17;SAF=4;SAR=18;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.245383;STB=0.638568;TYPE=snp;VARB=0.0134737;OID=.;OPOS=61876773;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:39:39:17:17:22:22:18:4:7:10:18:4:7:10 chr5 63905068 . A G 2157.9 PASS AO=226;DP=229;FAO=226;FDP=226;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=151;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0106193;FXX=0.0130999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.1649;QD=38.1928;RBI=0.0113727;REFB=-0.0649342;REVB=0.00407033;RO=1;SAF=75;SAR=151;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00314542;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000196266;OID=.;OPOS=63905068;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:229:226:1:0:226:226:151:75:0:1:151:75:0:0 chr5 63907999 . TC T 59.64 PASS AO=26;DP=73;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=30;FWDB=-0.046696;FXX=0.0298463;HRUN=2;LEN=1;MLLD=29.1656;QD=3.67016;RBI=0.0599626;REFB=0.00270683;REVB=0.0376165;RO=36;SAF=14;SAR=12;SRF=7;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.347517;STB=0.680431;TYPE=del;VARB=0.000187294;OID=.;OPOS=63908000;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:26:66:26:65:39:14:12:9:30:59:36:14:12:7:29 chr5 63991473 . G C 337.54 PASS AO=80;DP=171;FAO=82;FDP=171;FR=.;FRO=89;FSAF=31;FSAR=51;FSRF=12;FSRR=77;FWDB=-0.0147126;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.1177;QD=7.89567;RBI=0.0599283;REFB=0.0352021;REVB=0.0580942;RO=89;SAF=29;SAR=51;SRF=14;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228568;STB=0.644021;TYPE=snp;VARB=-0.0533532;OID=.;OPOS=63991473;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:171:89:89:80:82:51:29:14:75:51:31:12:77 chr5 64015361 . G C 512.62 PASS AO=112;DP=212;FAO=113;FDP=214;FR=.;FRO=101;FSAF=54;FSAR=59;FSRF=41;FSRR=60;FWDB=0.0106732;FXX=0.00465095;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.6955;QD=9.58171;RBI=0.0107574;REFB=-0.0360188;REVB=-0.00134347;RO=99;SAF=54;SAR=58;SRF=40;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0673655;STB=0.534114;TYPE=snp;VARB=0.0309358;OID=.;OPOS=64015361;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:214:99:101:112:113:58:54:40:59:59:54:41:60 chr5 64020313 . CTTT CTT,CTTG 120.7 PASS AO=4,11;DP=23;FAO=4,15;FDP=23;FR=.;FRO=4;FSAF=0,6;FSAR=4,9;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.0056822,0.0181134;FXX=0;HRUN=7,7;LEN=1,1;MLLD=6.54468,223.551;QD=20.9916;RBI=0.133444,0.0195283;REFB=0.174107,0.0440427;REVB=0.133323,0.00729795;RO=2;SAF=0,4;SAR=4,7;SRF=0;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0.112219;STB=0.5,0.590796;TYPE=del,snp;VARB=0.0128319,-0.00269517;OID=.,.;OPOS=64020314,64020316;OREF=T,T;OALT=-,G;OMAPALT=CTT,CTTG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:4,11:20:4,15:23:4:0,6:4,9:0:4:11:2:0,4:4,7:0:2 chr5 64023924 . C A 331.99 PASS AO=98;DP=242;FAO=102;FDP=247;FR=.;FRO=145;FSAF=71;FSAR=31;FSRF=94;FSRR=51;FWDB=0.000801624;FXX=0.0119995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.106;QD=5.37635;RBI=0.00328467;REFB=-0.00698557;REVB=0.00318535;RO=113;SAF=64;SAR=34;SRF=79;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0501301;STB=0.532315;TYPE=snp;VARB=0.00756915;OID=.;OPOS=64023924;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:242:247:113:145:98:102:34:64:79:34:31:71:94:51 chr5 64023981 . C T 305.99 PASS AO=103;DP=278;FAO=104;FDP=279;FR=.;FRO=175;FSAF=70;FSAR=34;FSRF=97;FSRR=78;FWDB=-0.00561948;FXX=0.0106379;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.279;QD=4.38693;RBI=0.0113987;REFB=-0.0113137;REVB=0.00991728;RO=164;SAF=69;SAR=34;SRF=92;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127385;STB=0.579952;TYPE=snp;VARB=0.0146504;OID=.;OPOS=64023981;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:278:279:164:175:103:104:34:69:92:72:34:70:97:78 chr5 64070617 . A AAATTATGAC 50 PASS AO=71;DP=325;LEN=9;RO=254;SAF=54;SAR=82;SRF=92;SRR=97;TYPE=ins;FR=.;OID=.;OPOS=64070618;OREF=-;OALT=AATTATGAC;OMAPALT=AAATTATGAC GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR 0/1:99:325:254:71:82:54:92:97 chr5 64267595 . T C 444.38 PASS AO=83;DP=138;FAO=84;FDP=139;FR=.;FRO=55;FSAF=31;FSAR=53;FSRF=22;FSRR=33;FWDB=0.0267652;FXX=0.00714235;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.68;QD=12.788;RBI=0.0288351;REFB=-0.0385825;REVB=0.0107278;RO=55;SAF=31;SAR=52;SRF=22;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0206703;STB=0.513056;TYPE=snp;VARB=0.0211073;OID=.;OPOS=64267595;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:139:55:55:83:84:52:31:22:33:53:31:22:33 chr5 64273018 . G A 90.63 PASS AO=26;DP=66;FAO=26;FDP=66;FR=.;FRO=40;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=25;FWDB=-0.0230597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.228;QD=5.49249;RBI=0.0231173;REFB=-0.0117235;REVB=0.00163092;RO=40;SAF=8;SAR=18;SRF=15;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.080274;STB=0.546138;TYPE=snp;VARB=0.0167466;OID=.;OPOS=64273018;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:66:66:40:40:26:26:18:8:15:25:18:8:15:25 chr5 64552788 . T C 35.54 PASS AO=9;DP=24;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.00679711;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=120.14;QD=5.92364;RBI=0.0297242;REFB=-0.0268747;REVB=0.0289366;RO=15;SAF=4;SAR=5;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0920876;STB=0.555432;TYPE=snp;VARB=0.0369315;OID=.;OPOS=64552788;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:24:24:15:15:9:9:5:4:8:7:5:4:8:7 chr5 64584120 . C T 24.14 PASS AO=8;DP=19;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0299353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.692;QD=4.59785;RBI=0.0388884;REFB=-0.013995;REVB=0.0248231;RO=10;SAF=1;SAR=7;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.45078;STB=0.785954;TYPE=snp;VARB=0.0245041;OID=.;OPOS=64584120;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:19:21:10:14:8:7:7:1:5:5:6:1:7:7 chr5 64584135 . C T 11.87 PASS AO=3;DP=11;FAO=3;FDP=11;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0200581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.616;QD=4.31678;RBI=0.0272444;REFB=-0.00795301;REVB=0.0184372;RO=8;SAF=1;SAR=2;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177018;STB=0.624149;TYPE=snp;VARB=0.0205112;OID=.;OPOS=64584135;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:11:11:8:8:3:3:2:1:4:4:2:1:4:4 chr5 64584140 . C T 12.22 PASS AO=4;DP=7;FAO=2;FDP=6;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0264081;FXX=0.142653;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.137;QD=8.14338;RBI=0.0266763;REFB=-0.00147459;REVB=0.00377304;RO=3;SAF=2;SAR=2;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115334;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00500595;OID=.;OPOS=64584140;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:7:6:3:4:4:2:2:2:2:1:1:1:2:2 chr5 64748681 . T C 819.1 PASS AO=180;DP=338;FAO=180;FDP=338;FR=.;FRO=158;FSAF=77;FSAR=103;FSRF=50;FSRR=108;FWDB=0.0161602;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.707;QD=9.6935;RBI=0.0162967;REFB=-0.0236107;REVB=-0.00210472;RO=158;SAF=77;SAR=103;SRF=50;SRR=108;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.099265;STB=0.55397;TYPE=snp;VARB=0.0198083;OID=.;OPOS=64748681;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:338:338:158:158:180:180:103:77:50:108:103:77:50:108 chr5 64881936 . A G 293.93 PASS AO=71;DP=149;FAO=71;FDP=148;FR=.;FRO=77;FSAF=33;FSAR=38;FSRF=32;FSRR=45;FWDB=0.0536044;FXX=0.00671096;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.786;QD=7.94398;RBI=0.0551621;REFB=-0.0145828;REVB=-0.0130166;RO=77;SAF=33;SAR=38;SRF=32;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0467097;STB=0.525813;TYPE=snp;VARB=0.0162397;OID=.;OPOS=64881936;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:148:77:77:71:71:38:33:32:45:38:33:32:45 chr5 64926315 . G A 331.48 PASS AO=74;DP=143;FAO=74;FDP=143;FR=.;FRO=69;FSAF=40;FSAR=34;FSRF=39;FSRR=30;FWDB=-0.0264124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.776;QD=9.27226;RBI=0.0308163;REFB=-0.0117026;REVB=0.0158755;RO=67;SAF=40;SAR=34;SRF=39;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0363446;STB=0.512006;TYPE=snp;VARB=0.0106794;OID=.;OPOS=64926315;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:67:69:74:74:34:40:39:28:34:40:39:30 chr5 64926553 . G C 348.48 PASS AO=86;DP=190;FAO=90;FDP=196;FR=.;FRO=106;FSAF=47;FSAR=43;FSRF=42;FSRR=64;FWDB=0.0479214;FXX=0.00507588;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.4821;QD=7.11185;RBI=0.0531137;REFB=-0.00450807;REVB=0.0229041;RO=100;SAF=47;SAR=39;SRF=41;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131941;STB=0.567849;TYPE=snp;VARB=0.00764021;OID=.;OPOS=64926553;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:196:100:106:86:90:39:47:41:59:43:47:42:64 chr5 65108215 . A G 631.08 PASS AO=135;DP=249;FAO=135;FDP=249;FR=.;FRO=114;FSAF=54;FSAR=81;FSRF=31;FSRR=83;FWDB=0.0360223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.906;QD=10.1378;RBI=0.0370983;REFB=-0.0124511;REVB=-0.00886988;RO=114;SAF=54;SAR=81;SRF=31;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115262;STB=0.562598;TYPE=snp;VARB=0.0126874;OID=.;OPOS=65108215;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:249:249:114:114:135:135:81:54:31:83:81:54:31:83 chr5 65317181 . C T 854.48 PASS AO=89;DP=89;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165393;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.677;QD=37.977;RBI=0.0420922;REFB=0;REVB=0.0387067;RO=0;SAF=46;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000261063;OID=.;OPOS=65317181;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:89:90:0:0:89:90:43:46:0:0:44:46:0:0 chr5 66283374 . C T 116.08 PASS AO=38;DP=104;FAO=38;FDP=104;FR=.;FRO=66;FSAF=10;FSAR=28;FSRF=19;FSRR=47;FWDB=-0.0824943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.3046;QD=4.46457;RBI=0.0845942;REFB=-0.0276885;REVB=0.0187317;RO=65;SAF=10;SAR=28;SRF=18;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0193399;STB=0.519836;TYPE=snp;VARB=0.0526548;OID=.;OPOS=66283374;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:65:66:38:38:28:10:18:47:28:10:19:47 chr5 66459878 . G C 41.48 PASS AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=0;FWDB=-0.0516486;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.3159;QD=7.90091;RBI=0.0661237;REFB=-0.00111017;REVB=0.0412888;RO=11;SAF=7;SAR=2;SRF=11;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.392851;STB=0.730445;TYPE=snp;VARB=-0.0029825;OID=.;OPOS=66459878;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:20:21:11:12:9:9:2:7:11:0:2:7:12:0 chr5 66480004 . T C 1628.51 PASS AO=173;DP=173;FAO=172;FDP=172;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0158523;FXX=0.00578001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.274;QD=37.8724;RBI=0.0183455;REFB=0;REVB=-0.0092338;RO=0;SAF=73;SAR=100;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.45818e-05;OID=.;OPOS=66480004;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:173:172:0:0:173:172:100:73:0:0:100:72:0:0 chr5 67589197 . A G 243.48 PASS AO=63;DP=138;FAO=63;FDP=140;FR=.;FRO=77;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=37;FSRR=40;FWDB=0.000813693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.512;QD=6.95652;RBI=0.0122528;REFB=-0.00539581;REVB=0.0122257;RO=74;SAF=31;SAR=32;SRF=37;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00771249;STB=0.50635;TYPE=snp;VARB=0.00635172;OID=.;OPOS=67589197;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:140:74:77:63:63:32:31:37:37:32:31:37:40 chr5 67594324 . A G 420.52 PASS AO=95;DP=187;FAO=97;FDP=192;FR=.;FRO=95;FSAF=43;FSAR=54;FSRF=30;FSRR=65;FWDB=-0.0118294;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=210.23;QD=8.76072;RBI=0.0118294;REFB=0.000404992;REVB=-1.17234e-05;RO=91;SAF=41;SAR=54;SRF=27;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125241;STB=0.56484;TYPE=snp;VARB=-0.000435205;OID=.;OPOS=67594324;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:192:91:95:95:97:54:41:27:64:54:43:30:65 chr5 68266553 . A T 259.81 PASS AO=50;DP=84;FAO=50;FDP=85;FR=.;FRO=35;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=0.0187533;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.4575;QD=12.2264;RBI=0.0269651;REFB=-0.0188162;REVB=0.0193761;RO=32;SAF=23;SAR=27;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0955418;STB=0.569059;TYPE=snp;VARB=0.0162198;OID=.;OPOS=68266553;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:85:32:35:50:50:27:23:19:13:27:23:22:13 chr5 68417643 . C T 503.48 PASS AO=110;DP=211;FAO=112;FDP=213;FR=.;FRO=101;FSAF=14;FSAR=98;FSRF=6;FSRR=95;FWDB=0.00281262;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=244.924;QD=9.45504;RBI=0.0213734;REFB=-0.0016651;REVB=0.0211876;RO=101;SAF=14;SAR=96;SRF=6;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151681;STB=0.579567;TYPE=snp;VARB=0.00178939;OID=.;OPOS=68417643;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:213:101:101:110:112:96:14:6:95:98:14:6:95 chr5 68419054 . A T 211.81 PASS AO=48;DP=100;FAO=49;FDP=100;FR=.;FRO=51;FSAF=35;FSAR=14;FSRF=29;FSRR=22;FWDB=0.00787702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.835;QD=8.47243;RBI=0.0249662;REFB=0.00119432;REVB=-0.023691;RO=50;SAF=34;SAR=14;SRF=29;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133393;STB=0.584379;TYPE=snp;VARB=-0.00113187;OID=.;OPOS=68419054;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:50:51:48:49:14:34:29:21:14:35:29:22 chr5 68616331 . C T 287.95 PASS AO=74;DP=162;FAO=74;FDP=162;FR=.;FRO=88;FSAF=15;FSAR=59;FSRF=30;FSRR=58;FWDB=-0.0802178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.775;QD=7.10994;RBI=0.0807641;REFB=-0.0137271;REVB=-0.00937836;RO=88;SAF=15;SAR=59;SRF=30;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182121;STB=0.602011;TYPE=snp;VARB=0.0128523;OID=.;OPOS=68616331;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:162:88:88:74:74:59:15:30:58:59:15:30:58 chr5 68720419 . T G 281.9 PASS AO=59;DP=109;FAO=59;FDP=109;FR=.;FRO=50;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=28;FSRR=22;FWDB=0.00717927;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=233.409;QD=10.3449;RBI=0.0131454;REFB=0.00116891;REVB=0.0110118;RO=49;SAF=25;SAR=34;SRF=28;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122494;STB=0.562752;TYPE=snp;VARB=-0.000724419;OID=.;OPOS=68720419;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:49:50:59:59:34:25:28:21:34:25:28:22 chr5 68775065 . C T 532.12 PASS AO=60;DP=63;FAO=61;FDP=63;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=40;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.022232;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.232;QD=33.7857;RBI=0.022237;REFB=-0.1734;REVB=0.000473534;RO=0;SAF=20;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.52272;TYPE=snp;VARB=0.000877604;OID=.;OPOS=68775065;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:63:63:0:2:60:61:40:20:0:0:40:21:2:0 chr5 68929183 . C G 86.68 PASS AO=15;DP=24;FAO=15;FDP=24;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.0912128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.547;QD=14.447;RBI=0.0921668;REFB=-0.0275151;REVB=0.0132265;RO=9;SAF=5;SAR=10;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156502;STB=0.588114;TYPE=snp;VARB=0.0180133;OID=.;OPOS=68929183;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:24:24:9:9:15:15:10:5:5:4:10:5:5:4 chr5 69804970 . CA C,CG 404.94 PASS AO=8,35;DP=46;FAO=7,38;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=4,19;FSAR=3,19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0496493,0.0103887;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=89.0959,100.325;QD=35.9944;RBI=0.0601225,0.0414579;REFB=0,0;REVB=0.0339066,0.0401352;RO=0;SAF=2,19;SAR=6,16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-5.58669e-08,-4.1382e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0318552,0.00590797;OID=.,.;OPOS=69804971,69804971;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:8,35:45:7,38:45:0:4,19:3,19:0:0:6:0:2,19:6,16:0:0 chr5 70308251 . C T 673.07 PASS AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00834452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.674;QD=37.9194;RBI=0.00849902;REFB=0;REVB=0.00161315;RO=0;SAF=59;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.28835e-05;OID=.;OPOS=70308251;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:71:71:0:0:71:71:12:59:0:0:12:59:0:0 chr5 70751818 . T G 615.93 PASS AO=61;DP=61;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00730581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.449;QD=37.9035;RBI=0.0249817;REFB=0;REVB=-0.0238895;RO=0;SAF=24;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.64048e-05;OID=.;OPOS=70751818;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:61:65:0:0:61:65:37:24:0:0:37:28:0:0 chr5 70800475 . C T 1670.87 PASS AO=176;DP=177;FAO=176;FDP=176;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00632733;FXX=0.0056494;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.281;QD=37.9744;RBI=0.0190907;REFB=-0.0140649;REVB=-0.0180116;RO=1;SAF=77;SAR=99;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.006142;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.16721e-05;OID=.;OPOS=70800475;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:177:176:1:0:176:176:99:77:1:0:99:77:0:0 chr5 70806711 . C G 351.07 PASS AO=36;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0127346;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.3469;QD=37.9532;RBI=0.0217554;REFB=0;REVB=-0.0176389;RO=0;SAF=16;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.9376e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000524505;OID=.;OPOS=70806711;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:36:37:0:0:36:37:20:16:0:0:21:16:0:0 chr5 70806958 . G A 1242.04 PASS AO=128;DP=129;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0442819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.999;QD=38.5129;RBI=0.0460574;REFB=0;REVB=0.0126651;RO=0;SAF=60;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.19567e-05;OID=.;OPOS=70806958;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:129:129:0:0:128:129:68:60:0:0:69:60:0:0 chr5 70807016 . CT C 418.96 PASS AO=61;DP=88;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0693648;FXX=0.0249969;HRUN=6;LEN=1;MLLD=13.2042;QD=21.4853;RBI=0.106402;REFB=-0.0747501;REVB=-0.0806836;RO=9;SAF=25;SAR=36;SRF=2;SRR=7;SSEN=0.471698;SSEP=0;SSSB=0.0472636;STB=0.505746;TYPE=del;VARB=0.0170704;OID=.;OPOS=70807017;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:61:78:77:78:1:34:43:0:1:27:9:25:36:2:7 chr5 70834926 . T C 830.75 PASS AO=82;DP=83;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00811842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6314;QD=38.1954;RBI=0.0809076;REFB=0;REVB=0.0804992;RO=1;SAF=28;SAR=54;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0166109;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00032201;OID=.;OPOS=70834926;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:83:87:1:0:82:87:54:28:1:0:58:29:0:0 chr5 70837295 . A C 782.52 PASS AO=86;DP=89;FAO=86;FDP=89;FR=.;FRO=3;FSAF=56;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00389648;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.009;QD=35.1694;RBI=0.0585796;REFB=-0.0870029;REVB=0.0584499;RO=2;SAF=56;SAR=30;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0305353;STB=0.511705;TYPE=snp;VARB=0.00127653;OID=.;OPOS=70837295;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:89:89:2:3:86:86:30:56:0:2:30:56:1:2 chr5 70858194 . C T 1630.81 PASS AO=177;DP=184;FAO=178;FDP=182;FR=.;FRO=4;FSAF=113;FSAR=65;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.00901209;FXX=0.010869;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.6368;QD=35.8419;RBI=0.0363317;REFB=-0.0167221;REVB=-0.0351962;RO=4;SAF=112;SAR=65;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00531179;STB=0.502733;TYPE=snp;VARB=0.00284041;OID=.;OPOS=70858194;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:184:182:4:4:177:178:65:112:3:1:65:113:3:1 chr5 70858342 . A G 133.28 PASS AO=46;DP=130;FAO=46;FDP=130;FR=.;FRO=84;FSAF=8;FSAR=38;FSRF=48;FSRR=36;FWDB=-0.00191221;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.5669;QD=4.10102;RBI=0.0524472;REFB=-0.00656143;REVB=0.0524123;RO=78;SAF=8;SAR=38;SRF=42;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.454645;STB=0.782221;TYPE=snp;VARB=0.010984;OID=.;OPOS=70858342;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:78:84:46:46:38:8:42:36:38:8:48:36 chr5 70932002 . G A 806.92 PASS AO=83;DP=83;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.405;QD=37.9728;RBI=0.0232853;REFB=0;REVB=-0.0198398;RO=0;SAF=40;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.43144e-05;OID=.;OPOS=70932002;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:83:85:0:0:83:85:43:40:0:0:43:42:0:0 chr5 70945075 . A G 698.18 PASS AO=75;DP=76;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0370635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.045;QD=36.7464;RBI=0.0552682;REFB=-0.118358;REVB=0.0409984;RO=0;SAF=26;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505049;TYPE=snp;VARB=0.000990446;OID=.;OPOS=70945075;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:76:76:0:1:75:75:49:26:0:0:49:26:0:1 chr5 71146757 . T C 283.86 PASS AO=33;DP=35;FAO=33;FDP=35;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0113361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2129;QD=32.4411;RBI=0.0182319;REFB=0.0632742;REVB=-0.0142792;RO=2;SAF=27;SAR=6;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0547419;STB=0.529393;TYPE=snp;VARB=-0.00268439;OID=.;OPOS=71146757;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:35:35:2:2:33:33:6:27:1:1:6:27:1:1 chr5 71146882 . T C 1271.13 PASS AO=140;DP=146;FAO=141;FDP=146;FR=.;FRO=5;FSAF=87;FSAR=54;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.00365559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.862;QD=34.8255;RBI=0.0242432;REFB=-0.0324036;REVB=0.023966;RO=5;SAF=86;SAR=54;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0284271;STB=0.515001;TYPE=snp;VARB=0.000847444;OID=.;OPOS=71146882;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:146:146:5:5:140:141:54:86:1:4:54:87:1:4 chr5 71146889 . A G 1219.04 PASS AO=136;DP=141;FAO=136;FDP=141;FR=.;FRO=5;FSAF=85;FSAR=51;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0122375;FXX=0.00704176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.515;QD=34.5828;RBI=0.0123735;REFB=-0.0345056;REVB=-0.00182921;RO=5;SAF=85;SAR=51;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0160909;STB=0.508473;TYPE=snp;VARB=0.000785742;OID=.;OPOS=71146889;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:141:141:5:5:136:136:51:85:2:3:51:85:2:3 chr5 71490962 . A G 506.67 PASS AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0281893;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.0331;QD=36.1908;RBI=0.0282263;REFB=-0.0908849;REVB=0.00144536;RO=0;SAF=21;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507244;TYPE=snp;VARB=-0.000249043;OID=.;OPOS=71490962;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:56:56:0:1:55:55:34:21:0:0:34:21:0:1 chr5 71492734 . C T 227.39 PASS AO=53;DP=108;FAO=53;FDP=108;FR=.;FRO=55;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=21;FSRR=34;FWDB=0.00824726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.149;QD=8.42181;RBI=0.019062;REFB=0.0100736;REVB=0.0171855;RO=55;SAF=29;SAR=24;SRF=21;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151131;STB=0.583591;TYPE=snp;VARB=-0.0137819;OID=.;OPOS=71492734;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:55:55:53:53:24:29:21:34:24:29:21:34 chr5 71494906 . G A 445.13 PASS AO=116;DP=268;FAO=121;FDP=272;FR=.;FRO=151;FSAF=51;FSAR=70;FSRF=67;FSRR=84;FWDB=0.0114103;FXX=0.007299;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.925;QD=6.54607;RBI=0.0195886;REFB=-0.018563;REVB=0.0159223;RO=151;SAF=50;SAR=66;SRF=67;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0131164;STB=0.512596;TYPE=snp;VARB=0.0228272;OID=.;OPOS=71494906;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:268:272:151:151:116:121:66:50:67:84:70:51:67:84 chr5 71519664 . C T 275.42 PASS AO=79;DP=188;FAO=79;FDP=189;FR=.;FRO=110;FSAF=21;FSAR=58;FSRF=44;FSRR=66;FWDB=0.00410665;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=205.679;QD=5.82908;RBI=0.00703012;REFB=-0.0121147;REVB=-0.00570596;RO=109;SAF=21;SAR=58;SRF=44;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166027;STB=0.591441;TYPE=snp;VARB=0.0133068;OID=.;OPOS=71519664;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:189:109:110:79:79:58:21:44:65:58:21:44:66 chr5 71524163 . A T 245.54 PASS AO=70;DP=168;FAO=70;FDP=167;FR=.;FRO=97;FSAF=35;FSAR=35;FSRF=48;FSRR=49;FWDB=-0.00293466;FXX=0.00595203;HRUN=4;LEN=1;MLLD=227.649;QD=5.88112;RBI=0.00299551;REFB=0.000766528;REVB=-0.000600721;RO=95;SAF=35;SAR=35;SRF=46;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0162515;STB=0.502993;TYPE=snp;VARB=-0.00100208;OID=.;OPOS=71524163;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:167:95:97:70:70:35:35:46:49:35:35:48:49 chr5 72174432 . C G 1505.26 PASS AO=158;DP=158;FAO=158;FDP=158;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235543;FXX=0.00628891;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.4406;QD=38.1079;RBI=0.0242405;REFB=0;REVB=-0.0057267;RO=0;SAF=51;SAR=107;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.9294e-05;OID=.;OPOS=72174432;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:158:158:0:0:158:158:107:51:0:0:106:52:0:0 chr5 72184098 . C T 1355.58 PASS AO=143;DP=148;FAO=145;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0735842;FXX=0.0202689;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.1098;QD=37.3952;RBI=0.0738122;REFB=-0.173207;REVB=0.00579649;RO=2;SAF=64;SAR=79;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0146259;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00335573;OID=.;OPOS=72184098;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:148:145:2:0:143:145:79:64:2:0:79:66:0:0 chr5 72395915 . G A 1049.54 PASS AO=109;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0083568;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.609;QD=38.5152;RBI=0.0140195;REFB=0;REVB=0.0112566;RO=0;SAF=42;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.7257e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.69036e-05;OID=.;OPOS=72395915;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:109:109:0:0:109:109:67:42:0:0:67:42:0:0 chr5 72419267 . T C 221.31 PASS AO=43;DP=78;FAO=44;FDP=78;FR=.;FRO=34;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=5;FSRR=29;FWDB=-0.0159632;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.2528;QD=11.349;RBI=0.0172577;REFB=0.00825783;REVB=0.00655785;RO=35;SAF=25;SAR=18;SRF=6;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.325486;STB=0.686439;TYPE=snp;VARB=-0.0075343;OID=.;OPOS=72419267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:35:34:43:44:18:25:6:29:18:26:5:29 chr5 72419287 . C T 111.91 PASS AO=31;DP=76;FAO=31;FDP=75;FR=.;FRO=44;FSAF=8;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=-0.0300075;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.586;QD=5.96829;RBI=0.0300104;REFB=-0.017475;REVB=-0.000414513;RO=44;SAF=8;SAR=23;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252326;STB=0.644345;TYPE=snp;VARB=0.0207816;OID=.;OPOS=72419287;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:75:44:44:31:31:23:8:21:23:23:8:21:23 chr5 72419410 . A G 575.86 PASS AO=58;DP=60;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0807887;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.534;QD=37.1521;RBI=0.0831348;REFB=0;REVB=0.0196104;RO=0;SAF=17;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00179308;OID=.;OPOS=72419410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:60:62:0:0:58:62:41:17:0:0:43:19:0:0 chr5 72427404 . C G 245.16 PASS AO=57;DP=115;FAO=57;FDP=115;FR=.;FRO=58;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=24;FSRR=34;FWDB=0.0511162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.238;QD=8.5274;RBI=0.0597289;REFB=-0.0109349;REVB=0.0308979;RO=57;SAF=32;SAR=25;SRF=23;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14233;STB=0.574183;TYPE=snp;VARB=0.0180284;OID=.;OPOS=72427404;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:57:58:57:57:25:32:23:34:25:32:24:34 chr5 72742882 . T C 86.69 PASS AO=16;DP=28;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.0375659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.168;QD=12.3837;RBI=0.0426899;REFB=-0.00904306;REVB=-0.020279;RO=12;SAF=5;SAR=11;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0883617;STB=0.549936;TYPE=snp;VARB=0.00527693;OID=.;OPOS=72742882;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:28:28:12:12:16:16:11:5:5:7:11:5:5:7 chr5 72742916 . GA G 10.41 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.327;QD=5.94654;RBI=0.0685913;REFB=-0.0626763;REVB=0.0685913;RO=5;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0298854;OID=.;OPOS=72742917;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:2:7:2:7:5:0:2:0:5:10:5:0:2:0:5 chr5 73142296 . C T 412.23 PASS AO=109;DP=242;FAO=110;FDP=245;FR=.;FRO=135;FSAF=21;FSAR=89;FSRF=33;FSRR=102;FWDB=-0.0355862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.8079;QD=6.73032;RBI=0.0479782;REFB=-0.0155085;REVB=-0.0321796;RO=131;SAF=21;SAR=88;SRF=32;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0770941;STB=0.545075;TYPE=snp;VARB=0.0189296;OID=.;OPOS=73142296;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:242:245:131:135:109:110:88:21:32:99:89:21:33:102 chr5 73144845 . A G 733.91 PASS AO=145;DP=251;FAO=147;FDP=255;FR=.;FRO=108;FSAF=85;FSAR=62;FSRF=58;FSRR=50;FWDB=-0.007276;FXX=0.0116275;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.222;QD=11.5123;RBI=0.0293771;REFB=-0.0128184;REVB=-0.0284618;RO=101;SAF=83;SAR=62;SRF=58;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00142841;STB=0.517783;TYPE=snp;VARB=0.0104249;OID=.;OPOS=73144845;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:251:255:101:108:145:147:62:83:58:43:62:85:58:50 chr5 73148481 . G A 321.96 PASS AO=82;DP=193;FAO=87;FDP=192;FR=.;FRO=105;FSAF=27;FSAR=60;FSRF=44;FSRR=61;FWDB=-0.00032306;FXX=0.0351741;HRUN=1;LEN=1;MLLD=294.889;QD=6.70753;RBI=0.00482229;REFB=-0.00136584;REVB=0.00481145;RO=110;SAF=24;SAR=58;SRF=43;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114785;STB=0.565947;TYPE=snp;VARB=0.00164022;OID=.;OPOS=73148481;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:192:110:105:82:87:58:24:43:67:60:27:44:61 chr5 73163831 . C T 262.92 PASS AO=64;DP=134;FAO=64;FDP=134;FR=.;FRO=70;FSAF=26;FSAR=38;FSRF=28;FSRR=42;FWDB=-0.0292964;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.117;QD=7.84828;RBI=0.0293307;REFB=-0.00837157;REVB=-0.0014187;RO=70;SAF=26;SAR=38;SRF=28;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00611714;STB=0.503387;TYPE=snp;VARB=0.0101404;OID=.;OPOS=73163831;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:70:70:64:64:38:26:28:42:38:26:28:42 chr5 73163965 . C A 63.81 PASS AO=24;DP=77;FAO=24;FDP=76;FR=.;FRO=52;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=48;FSRR=4;FWDB=-0.0905477;FXX=0.0129853;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.4099;QD=3.35828;RBI=0.104314;REFB=-0.0424343;REVB=-0.051794;RO=53;SAF=18;SAR=6;SRF=49;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.33792;STB=0.687387;TYPE=snp;VARB=0.0939972;OID=.;OPOS=73163965;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:77:76:53:52:24:24:6:18:49:4:6:18:48:4 chr5 73207372 . T A 1832.4 PASS AO=189;DP=189;FAO=190;FDP=190;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=117;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0075767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.977;QD=38.5769;RBI=0.0107695;REFB=0;REVB=-0.00765344;RO=0;SAF=72;SAR=117;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.46616e-07;OID=.;OPOS=73207372;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:189:190:0:0:189:190:117:72:0:0:117:73:0:0 chr5 73471334 . G C 385.94 PASS AO=107;DP=246;FAO=107;FDP=246;FR=.;FRO=139;FSAF=40;FSAR=67;FSRF=69;FSRR=70;FWDB=-0.0248348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.7011;QD=6.27541;RBI=0.0273956;REFB=-0.0088392;REVB=0.0115653;RO=138;SAF=40;SAR=67;SRF=68;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12401;STB=0.571292;TYPE=snp;VARB=0.0124921;OID=.;OPOS=73471334;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:246:246:138:139:107:107:67:40:68:70:67:40:69:70 chr5 73930751 . C T 1125.59 PASS AO=123;DP=128;FAO=124;FDP=128;FR=.;FRO=4;FSAF=36;FSAR=88;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0275575;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.431;QD=35.1747;RBI=0.0590729;REFB=-0.0761506;REVB=0.0522512;RO=4;SAF=36;SAR=87;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0499066;STB=0.526311;TYPE=snp;VARB=0.0163469;OID=.;OPOS=73930751;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:128:128:4:4:123:124:87:36:4:0:88:36:4:0 chr5 73931246 . T C 327.58 PASS AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0296282;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=181.382;QD=35.4135;RBI=0.0321039;REFB=-0.068298;REVB=0.0123624;RO=1;SAF=14;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0208029;STB=0.511105;TYPE=snp;VARB=0.000163587;OID=.;OPOS=73931246;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:37:37:1:1:36:36:22:14:0:1:22:14:0:1 chr5 73932315 . T C 584.31 PASS AO=64;DP=68;FAO=64;FDP=66;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00762933;FXX=0.0294074;HRUN=3;LEN=1;MLLD=171.593;QD=35.4126;RBI=0.020661;REFB=-0.0451458;REVB=0.0192008;RO=2;SAF=33;SAR=31;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000894695;STB=0.500474;TYPE=snp;VARB=0.000133221;OID=.;OPOS=73932315;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:68:66:2:2:64:64:31:33:1:1:31:33:1:1 chr5 73981270 . T C 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0307705;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2953;QD=35.0867;RBI=0.0307705;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=7;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00284787;OID=.;OPOS=73981270;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:0:7:0:0:0:7:0:0 chr5 74178511 . C T 167.24 PASS AO=36;DP=71;FAO=36;FDP=70;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.00175172;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.729;QD=9.55682;RBI=0.0026699;REFB=-0.0103169;REVB=0.0020149;RO=34;SAF=14;SAR=22;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0474969;STB=0.526388;TYPE=snp;VARB=0.0109933;OID=.;OPOS=74178511;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:70:34:34:36:36:22:14:15:19:22:14:15:19 chr5 74323529 . G C 273.22 PASS AO=73;DP=168;FAO=74;FDP=169;FR=.;FRO=95;FSAF=26;FSAR=48;FSRF=29;FSRR=66;FWDB=-0.0352269;FXX=0.00588201;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.2486;QD=6.46665;RBI=0.0436513;REFB=-0.0311404;REVB=0.025778;RO=93;SAF=26;SAR=47;SRF=28;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0617224;STB=0.5289;TYPE=snp;VARB=0.0429024;OID=.;OPOS=74323529;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:169:93:95:73:74:47:26:28:65:48:26:29:66 chr5 74324548 . G A 353.19 PASS AO=76;DP=141;FAO=76;FDP=141;FR=.;FRO=65;FSAF=43;FSAR=33;FSRF=35;FSRR=30;FWDB=-0.00934092;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=186.142;QD=10.0196;RBI=0.00951513;REFB=-0.000382049;REVB=-0.00181242;RO=64;SAF=43;SAR=33;SRF=35;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.016039;STB=0.512773;TYPE=snp;VARB=0.000315358;OID=.;OPOS=74324548;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:64:65:76:76:33:43:35:29:33:43:35:30 chr5 74324902 . C T 247.02 PASS AO=62;DP=135;FAO=63;FDP=136;FR=.;FRO=73;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=43;FSRR=30;FWDB=-0.00412224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.7645;QD=7.26543;RBI=0.0045309;REFB=-0.0335508;REVB=-0.00188049;RO=72;SAF=31;SAR=31;SRF=42;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0806414;STB=0.551965;TYPE=snp;VARB=0.0230383;OID=.;OPOS=74324902;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:136:72:73:62:63:31:31:42:30:32:31:43:30 chr5 74376380 . C T 78.91 PASS AO=18;DP=66;FAO=19;FDP=65;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=38;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=0.0129256;FXX=0.0579626;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.295;QD=4.85601;RBI=0.0361883;REFB=0.00109841;REVB=-0.0338012;RO=18;SAF=7;SAR=11;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0522875;STB=0.518644;TYPE=snp;VARB=-0.0106767;OID=.;OPOS=74376380;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:61:65:18:38:18:19:11:7:6:12:12:7:15:23 chr5 74400386 . G C 288.79 PASS AO=93;DP=247;FAO=95;FDP=251;FR=.;FRO=156;FSAF=41;FSAR=54;FSRF=89;FSRR=67;FWDB=-0.0301284;FXX=0.0039681;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.44;QD=4.6022;RBI=0.0325592;REFB=-0.0016219;REVB=-0.0123442;RO=151;SAF=41;SAR=52;SRF=88;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15484;STB=0.58591;TYPE=snp;VARB=0.00200405;OID=.;OPOS=74400386;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:247:251:151:156:93:95:52:41:88:63:54:41:89:67 chr5 74442410 . G A 221.46 PASS AO=73;DP=171;FAO=68;FDP=170;FR=.;FRO=102;FSAF=25;FSAR=43;FSRF=48;FSRR=54;FWDB=0.0271042;FXX=0.0116272;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.0532;QD=5.21085;RBI=0.0309749;REFB=-0.0215305;REVB=0.0149935;RO=98;SAF=29;SAR=44;SRF=44;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0546304;STB=0.564143;TYPE=snp;VARB=0.0319377;OID=.;OPOS=74442410;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:170:98:102:73:68:44:29:44:54:43:25:48:54 chr5 74442920 . A G 372.14 PASS AO=81;DP=159;FAO=84;FDP=161;FR=.;FRO=77;FSAF=55;FSAR=29;FSRF=45;FSRR=32;FWDB=-0.0164215;FXX=0.0122692;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.494;QD=9.24575;RBI=0.016499;REFB=-0.0123967;REVB=0.00159708;RO=74;SAF=55;SAR=26;SRF=44;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0813971;STB=0.536362;TYPE=snp;VARB=0.0104538;OID=.;OPOS=74442920;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:161:74:77:81:84:26:55:44:30:29:55:45:32 chr5 74443132 . C T 834.41 PASS AO=179;DP=342;FAO=184;FDP=346;FR=.;FRO=162;FSAF=89;FSAR=95;FSRF=82;FSRR=80;FWDB=-0.0250379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.789;QD=9.64633;RBI=0.0287907;REFB=-0.0100428;REVB=-0.014213;RO=161;SAF=87;SAR=92;SRF=82;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0202158;STB=0.510527;TYPE=snp;VARB=0.0076459;OID=.;OPOS=74443132;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:342:346:161:162:179:184:92:87:82:79:95:89:82:80 chr5 74491492 . C T 146.56 PASS AO=38;DP=86;FAO=38;FDP=86;FR=.;FRO=48;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=34;FSRR=14;FWDB=-0.00122919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.326;QD=6.81683;RBI=0.0481875;REFB=-0.0221087;REVB=-0.0481718;RO=48;SAF=16;SAR=22;SRF=34;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.279688;STB=0.656246;TYPE=snp;VARB=0.0357912;OID=.;OPOS=74491492;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:48:48:38:38:22:16:34:14:22:16:34:14 chr5 74491715 . TTCA T 211.8 PASS AO=61;DP=165;FAO=85;FDP=179;FR=.;FRO=94;FSAF=37;FSAR=48;FSRF=61;FSRR=33;FWDB=0.00304338;FXX=0.0427785;HRUN=2;LEN=3;MLLD=236.721;QD=4.73287;RBI=0.0199141;REFB=-0.0146459;REVB=0.0196802;RO=75;SAF=35;SAR=26;SRF=45;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0266607;STB=0.610804;TYPE=del;VARB=0.0191873;OID=.;OPOS=74491716;OREF=TCA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:61:153:85:179:94:37:48:61:33:99:75:35:26:45:30 chr5 74506658 . C T 142.04 PASS AO=36;DP=81;FAO=36;FDP=81;FR=.;FRO=45;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=31;FSRR=14;FWDB=0.000463581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.421;QD=7.0143;RBI=0.0191039;REFB=0.0101499;REVB=-0.0190983;RO=42;SAF=22;SAR=14;SRF=29;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0820963;STB=0.546367;TYPE=snp;VARB=-0.0212623;OID=.;OPOS=74506658;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:42:45:36:36:14:22:29:13:14:22:31:14 chr5 75003678 . T C 855.5 PASS AO=201;DP=405;FAO=200;FDP=393;FR=.;FRO=193;FSAF=69;FSAR=131;FSRF=77;FSRR=116;FWDB=-0.0114649;FXX=0.0174996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.267;QD=8.70738;RBI=0.0451487;REFB=-0.0071563;REVB=0.0436688;RO=186;SAF=70;SAR=131;SRF=75;SRR=111;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0523245;STB=0.528792;TYPE=snp;VARB=0.00645828;OID=.;OPOS=75003678;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:405:393:186:193:201:200:131:70:75:111:131:69:77:116 chr5 75008193 . T C 151.13 PASS AO=46;DP=119;FAO=46;FDP=118;FR=.;FRO=72;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=36;FSRR=36;FWDB=-0.00505048;FXX=0.00840265;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.422;QD=5.12291;RBI=0.0102014;REFB=-0.0130632;REVB=-0.00886352;RO=71;SAF=19;SAR=27;SRF=36;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101641;STB=0.553668;TYPE=snp;VARB=0.0225265;OID=.;OPOS=75008193;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:118:71:72:46:46:27:19:36:35:27:19:36:36 chr5 75427935 . G A 387.64 PASS AO=85;DP=168;FAO=88;FDP=172;FR=.;FRO=84;FSAF=44;FSAR=44;FSRF=38;FSRR=46;FWDB=0.0332138;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.4277;QD=9.01497;RBI=0.0798375;REFB=-0.0143846;REVB=0.0726008;RO=82;SAF=41;SAR=44;SRF=36;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0388382;STB=0.523251;TYPE=snp;VARB=0.0134925;OID=.;OPOS=75427935;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:172:82:84:85:88:44:41:36:46:44:44:38:46 chr5 75912401 . A G 1031.03 PASS AO=103;DP=105;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.127231;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.7481;QD=37.8359;RBI=0.131397;REFB=-0.0185332;REVB=0.0328226;RO=1;SAF=78;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00604539;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000543717;OID=.;OPOS=75912401;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:105:109:1:0:103:109:25:78:1:0:27:82:0:0 chr5 75923285 . C T 255.39 PASS AO=76;DP=188;FAO=76;FDP=187;FR=.;FRO=111;FSAF=72;FSAR=4;FSRF=94;FSRR=17;FWDB=-0.0351184;FXX=0.00531887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.6017;QD=5.46285;RBI=0.0355179;REFB=-0.00583365;REVB=-0.00531218;RO=109;SAF=72;SAR=4;SRF=92;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.340824;STB=0.694786;TYPE=snp;VARB=0.00896251;OID=.;OPOS=75923285;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:187:109:111:76:76:4:72:92:17:4:72:94:17 chr5 75923294 . T G 1707.45 PASS AO=94;DP=187;FAO=178;FDP=181;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=158;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0790168;FXX=0.0109284;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.223;QD=37.7337;RBI=0.0792061;REFB=0;REVB=0.00547286;RO=0;SAF=75;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00409049;OID=.;OPOS=75923294;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:178:181:0:0:94:178:19:75:0:0:20:158:0:0 chr5 75923307 . A G 1838.12 PASS AO=192;DP=195;FAO=192;FDP=192;FR=.;FRO=0;FSAF=169;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00448994;FXX=0.0153838;HRUN=2;LEN=1;MLLD=277.732;QD=38.2941;RBI=0.0226618;REFB=0;REVB=-0.0222126;RO=0;SAF=169;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.48613e-06;OID=.;OPOS=75923307;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:87:195:192:0:0:192:192:23:169:0:0:23:169:0:0 chr5 75932869 . C T 279.66 PASS AO=83;DP=202;FAO=83;FDP=204;FR=.;FRO=121;FSAF=49;FSAR=34;FSRF=55;FSRR=66;FWDB=0.00721976;FXX=0.0239223;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.207;QD=5.48344;RBI=0.026179;REFB=-0.013847;REVB=-0.0251638;RO=118;SAF=49;SAR=34;SRF=55;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131025;STB=0.580824;TYPE=snp;VARB=0.0184198;OID=.;OPOS=75932869;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:204:118:121:83:83:34:49:55:63:34:49:55:66 chr5 75932965 . G C 268.17 PASS AO=84;DP=214;FAO=84;FDP=214;FR=.;FRO=130;FSAF=39;FSAR=45;FSRF=58;FSRR=72;FWDB=-0.002167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.4538;QD=5.01257;RBI=0.0196802;REFB=-0.0256948;REVB=-0.0195605;RO=128;SAF=39;SAR=45;SRF=57;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0205181;STB=0.511086;TYPE=snp;VARB=0.0288767;OID=.;OPOS=75932965;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:214:128:130:84:84:45:39:57:71:45:39:58:72 chr5 75948650 . A G 297.18 PASS AO=116;DP=344;FAO=117;FDP=345;FR=.;FRO=228;FSAF=48;FSAR=69;FSRF=102;FSRR=126;FWDB=0.0499896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.2001;QD=3.44558;RBI=0.0502848;REFB=0.0024735;REVB=0.00544007;RO=225;SAF=47;SAR=69;SRF=102;SRR=123;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0570232;STB=0.52511;TYPE=snp;VARB=-0.00604748;OID=.;OPOS=75948650;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:344:345:225:228:116:117:69:47:102:123:69:48:102:126 chr5 75960865 . T C 951.9 PASS AO=102;DP=103;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.001006;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.0035;QD=37.3296;RBI=0.0156782;REFB=-0.0783697;REVB=0.0156459;RO=1;SAF=74;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0063694;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.58829e-05;OID=.;OPOS=75960865;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:103:102:1:0:102:102:28:74:1:0:28:74:0:0 chr5 76003258 . C T 1573.37 PASS AO=4;DP=175;FAO=165;FDP=165;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=117;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0503934;FXX=0.00602373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.123;QD=38.1424;RBI=0.0503967;REFB=0;REVB=0.000575323;RO=0;SAF=0;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.52167e-06;OID=.;OPOS=76003258;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:6:165:0:0:4:165:4:0:0:0:117:48:0:0 chr5 76128521 . G A 1987.3 PASS AO=205;DP=208;FAO=210;FDP=210;FR=.;FRO=0;FSAF=108;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00689758;FXX=0.00473911;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.41;QD=37.8533;RBI=0.041388;REFB=0;REVB=0.0408092;RO=1;SAF=105;SAR=100;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00473972;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0001057;OID=.;OPOS=76128521;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:92:208:210:1:0:205:210:100:105:0:1:102:108:0:0 chr5 76131080 . TA T 23.19 PASS AO=19;DP=122;FAO=34;FDP=101;FR=.;FRO=67;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=30;FSRR=37;FWDB=-0.152815;FXX=0.0194156;HRUN=5;LEN=1;MLLD=9.73376;QD=0.918231;RBI=0.155215;REFB=-0.128849;REVB=0.0271897;RO=64;SAF=10;SAR=9;SRF=29;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0907754;STB=0.504422;TYPE=del;VARB=0.197562;OID=.;OPOS=76131081;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:19:96:34:101:67:15:19:30:37:23:64:10:9:29:35 chr5 76171252 . A C 412.47 PASS AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0254359;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=184.418;QD=37.4974;RBI=0.0472029;REFB=0;REVB=0.0397634;RO=0;SAF=23;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2717e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.86408e-05;OID=.;OPOS=76171252;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:44:44:0:0:44:44:21:23:0:0:21:23:0:0 chr5 76249503 . G A 21.92 PASS AO=7;DP=25;FAO=7;FDP=25;FR=.;FRO=18;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=18;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.418;QD=3.50777;RBI=0.00864381;REFB=0.016791;REVB=-0.00864381;RO=18;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0208749;OID=.;OPOS=76249503;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:25:25:18:18:7:7:7:0:0:18:7:0:0:18 chr5 76343999 . T C 155.51 PASS AO=46;DP=116;FAO=46;FDP=116;FR=.;FRO=70;FSAF=31;FSAR=15;FSRF=43;FSRR=27;FWDB=0.00146961;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=277.656;QD=5.36238;RBI=0.00647119;REFB=-0.000173893;REVB=-0.0063021;RO=68;SAF=31;SAR=15;SRF=43;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0488476;STB=0.539783;TYPE=snp;VARB=0.000105672;OID=.;OPOS=76343999;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:68:70:46:46:15:31:43:25:15:31:43:27 chr5 76359024 . C A 129.25 PASS AO=34;DP=79;FAO=34;FDP=79;FR=.;FRO=45;FSAF=26;FSAR=8;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=-0.0172765;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.44;QD=6.54417;RBI=0.0189559;REFB=-0.00186572;REVB=0.00780042;RO=45;SAF=26;SAR=8;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.2471;STB=0.640755;TYPE=snp;VARB=0.00233202;OID=.;OPOS=76359024;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:45:45:34:34:8:26:25:20:8:26:25:20 chr5 76360816 . C T 247.45 PASS AO=44;DP=84;FAO=51;FDP=91;FR=.;FRO=40;FSAF=10;FSAR=41;FSRF=11;FSRR=29;FWDB=-0.00737877;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.672;QD=10.877;RBI=0.034573;REFB=-0.0364576;REVB=0.0337764;RO=40;SAF=10;SAR=34;SRF=11;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0563851;STB=0.551548;TYPE=snp;VARB=0.0266623;OID=.;OPOS=76360816;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:91:40:40:44:51:34:10:11:29:41:10:11:29 chr5 76607841 . G A 343.44 PASS AO=86;DP=183;FAO=86;FDP=183;FR=.;FRO=97;FSAF=39;FSAR=47;FSRF=51;FSRR=46;FWDB=0.0339754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.6653;QD=7.50678;RBI=0.0341209;REFB=-0.0320577;REVB=-0.00314728;RO=97;SAF=39;SAR=47;SRF=51;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.069368;STB=0.538365;TYPE=snp;VARB=0.0322453;OID=.;OPOS=76607841;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:183:97:97:86:86:47:39:51:46:47:39:51:46 chr5 76704849 . T C 1131.21 PASS AO=106;DP=106;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0521153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.509;QD=38.024;RBI=0.0522453;REFB=0;REVB=0.0036836;RO=0;SAF=22;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00106961;OID=.;OPOS=76704849;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:106:119:0:0:106:119:84:22:0:0:93:26:0:0 chr5 76708987 . A G 545.57 PASS AO=136;DP=308;FAO=137;FDP=292;FR=.;FRO=155;FSAF=71;FSAR=66;FSRF=56;FSRR=99;FWDB=0.00974812;FXX=0.0519464;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.2379;QD=7.47354;RBI=0.012168;REFB=-0.00332387;REVB=-0.00728246;RO=145;SAF=70;SAR=66;SRF=51;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152618;STB=0.582911;TYPE=snp;VARB=0.00454618;OID=.;OPOS=76708987;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:308:292:145:155:136:137:66:70:51:94:66:71:56:99 chr5 76722442 . C T 261.67 PASS AO=67;DP=148;FAO=67;FDP=147;FR=.;FRO=80;FSAF=34;FSAR=33;FSRF=34;FSRR=46;FWDB=0.0643532;FXX=0.0134219;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.911;QD=7.12014;RBI=0.0643979;REFB=-0.00574298;REVB=-0.0023994;RO=80;SAF=34;SAR=33;SRF=34;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.080686;STB=0.544814;TYPE=snp;VARB=0.00773503;OID=.;OPOS=76722442;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:147:80:80:67:67:33:34:34:46:33:34:34:46 chr5 76916335 . G GC 286.28 PASS AO=90;DP=200;FAO=96;FDP=189;FR=.;FRO=93;FSAF=60;FSAR=36;FSRF=34;FSRR=59;FWDB=0.0106323;FXX=0.00526288;HRUN=1;LEN=1;MLLD=24.6288;QD=6.05891;RBI=0.12564;REFB=-0.0355186;REVB=0.125189;RO=109;SAF=57;SAR=33;SRF=41;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253001;STB=0.62745;TYPE=ins;VARB=0.0392001;OID=.;OPOS=76916336;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:90:200:96:189:93:60:36:34:59:99:109:57:33:41:68 chr5 76926578 . T C 13.38 PASS AO=4;DP=17;FAO=4;FDP=17;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=2;FWDB=-0.014515;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=249.853;QD=3.14789;RBI=0.0152806;REFB=0.00595183;REVB=0.00477624;RO=13;SAF=3;SAR=1;SRF=11;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163891;STB=0.608227;TYPE=snp;VARB=-0.0179856;OID=.;OPOS=76926578;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:17:17:13:13:4:4:1:3:11:2:1:3:11:2 chr5 77298619 . A T 1107.45 PASS AO=105;DP=111;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207063;FXX=0.0247913;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.5317;QD=37.5408;RBI=0.0523775;REFB=-0.0205177;REVB=0.0481108;RO=1;SAF=66;SAR=39;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0120121;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.14276e-05;OID=.;OPOS=77298619;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:111:118:1:0:105:118:39:66:0:1:41:77:0:0 chr5 77412011 . A G 1100.41 PASS AO=114;DP=115;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.117965;FXX=0.0487765;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.352;QD=37.6208;RBI=0.118097;REFB=-0.103881;REVB=0.00557847;RO=0;SAF=65;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.29464e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000153687;OID=.;OPOS=77412011;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:115:117:0:0:114:117:49:65:0:0:49:68:0:0 chr5 77425028 . A T 3579.94 PASS AO=355;DP=355;FAO=376;FDP=376;FR=.;FRO=0;FSAF=183;FSAR=193;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0407372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.369;QD=38.0844;RBI=0.0518791;REFB=0;REVB=0.0321235;RO=0;SAF=176;SAR=179;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000326559;OID=.;OPOS=77425028;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:355:376:0:0:355:376:179:176:0:0:193:183:0:0 chr5 77437072 . AG A 1358.83 PASS AO=176;DP=280;FAO=275;FDP=275;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=178;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.148101;FXX=0.0143364;HRUN=4;LEN=1;MLLD=10.3069;QD=19.7649;RBI=0.346354;REFB=0;REVB=0.313093;RO=69;SAF=71;SAR=105;SRF=17;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0.665025;SSSB=0.0877365;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00610537;OID=.;OPOS=77437073;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:176:275:275:275:0:97:178:0:0:99:69:71:105:17:52 chr5 77473165 . A G 816.34 PASS AO=89;DP=91;FAO=91;FDP=92;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0509469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.044;QD=35.4929;RBI=0.0584722;REFB=-0.0934937;REVB=0.0286951;RO=0;SAF=28;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504064;TYPE=snp;VARB=0.000982149;OID=.;OPOS=77473165;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:91:92:0:1:89:91:61:28:0:0:61:30:0:1 chr5 77745853 . C CA 543.62 PASS AO=59;DP=95;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.100628;FXX=0.0344788;HRUN=1;LEN=1;MLLD=17.5448;QD=25.8864;RBI=0.285473;REFB=0;REVB=0.267149;RO=28;SAF=32;SAR=27;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131033;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00692376;OID=.;OPOS=77745854;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:59:95:84:84:0:34:50:0:0:50:28:32:27:9:19 chr5 77781785 . C CT 1249.43 PASS AO=165;DP=182;FAO=177;FDP=177;FR=.;FRO=0;FSAF=121;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0261904;FXX=0.0166657;HRUN=2;LEN=1;MLLD=17.999;QD=28.2356;RBI=0.100671;REFB=0.00784888;REVB=0.0972049;RO=12;SAF=113;SAR=52;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0272458;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.002021;OID=.;OPOS=77781786;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:165:182:177:177:0:121:56:0:0:99:12:113:52:6:6 chr5 77782447 . C G 3611.97 PASS AO=410;DP=417;FAO=377;FDP=377;FR=.;FRO=0;FSAF=151;FSAR=226;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0680155;FXX=0.0574986;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.6573;QD=38.3233;RBI=0.0701437;REFB=0.00654503;REVB=-0.0171473;RO=1;SAF=168;SAR=242;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00196826;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.00533e-05;OID=.;OPOS=77782447;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:417:377:1:0:410:377:242:168:0:1:226:151:0:0 chr5 77784738 . A G 1714.09 PASS AO=166;DP=170;FAO=178;FDP=178;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.056911;FXX=0.0111105;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.1445;QD=38.5188;RBI=0.0569129;REFB=0;REVB=0.000464617;RO=0;SAF=97;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.15487e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.03706e-05;OID=.;OPOS=77784738;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:170:178:0:0:166:178:69:97:0:0:77:101:0:0 chr5 78135201 . C T 279.89 PASS AO=55;DP=103;FAO=57;FDP=102;FR=.;FRO=45;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=15;FSRR=30;FWDB=-0.00703941;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.167;QD=10.976;RBI=0.00745009;REFB=-0.00310566;REVB=0.00243938;RO=42;SAF=26;SAR=29;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0923195;STB=0.569828;TYPE=snp;VARB=0.00261432;OID=.;OPOS=78135201;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:102:42:45:55:57:29:26:15:27:29:28:15:30 chr5 78181477 . C T 498.89 PASS AO=100;DP=174;FAO=100;FDP=174;FR=.;FRO=74;FSAF=44;FSAR=56;FSRF=34;FSRR=40;FWDB=0.036494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.493;QD=11.4687;RBI=0.0366515;REFB=-0.0234017;REVB=0.00339472;RO=73;SAF=44;SAR=56;SRF=33;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00948496;STB=0.508378;TYPE=snp;VARB=0.0165751;OID=.;OPOS=78181477;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:174:73:74:100:100:56:44:33:40:56:44:34:40 chr5 78324352 . A G 825.85 PASS AO=193;DP=400;FAO=198;FDP=396;FR=.;FRO=198;FSAF=100;FSAR=98;FSRF=90;FSRR=108;FWDB=0.0206393;FXX=0.00999975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.811;QD=8.34188;RBI=0.0212809;REFB=-0.0190004;REVB=-0.00518589;RO=198;SAF=100;SAR=93;SRF=90;SRR=108;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0586921;STB=0.52524;TYPE=snp;VARB=0.017574;OID=.;OPOS=78324352;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:400:396:198:198:193:198:93:100:90:108:98:100:90:108 chr5 78326750 . G C 748.7 PASS AO=188;DP=405;FAO=188;FDP=396;FR=.;FRO=208;FSAF=98;FSAR=90;FSRF=128;FSRR=80;FWDB=0.0220086;FXX=0.00999975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.163;QD=7.56257;RBI=0.0266972;REFB=-0.0122225;REVB=0.0151116;RO=217;SAF=98;SAR=90;SRF=133;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0897278;STB=0.549725;TYPE=snp;VARB=0.0137187;OID=.;OPOS=78326750;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:405:396:217:208:188:188:90:98:133:84:90:98:128:80 chr5 78328560 . G A 719.99 PASS AO=173;DP=349;FAO=171;FDP=345;FR=.;FRO=174;FSAF=95;FSAR=76;FSRF=59;FSRR=115;FWDB=-0.0233699;FXX=0.0142853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6063;QD=8.34767;RBI=0.024449;REFB=-0.00554034;REVB=-0.00718327;RO=168;SAF=98;SAR=75;SRF=60;SRR=108;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186901;STB=0.607881;TYPE=snp;VARB=0.00475286;OID=.;OPOS=78328560;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:349:345:168:174:173:171:75:98:60:108:76:95:59:115 chr5 78340257 . C G 509.33 PASS AO=120;DP=239;FAO=120;FDP=241;FR=.;FRO=121;FSAF=74;FSAR=46;FSRF=48;FSRR=73;FWDB=0.00124681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.871;QD=8.45361;RBI=0.00129987;REFB=-0.00564091;REVB=-0.000367569;RO=116;SAF=75;SAR=45;SRF=45;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.213424;STB=0.610746;TYPE=snp;VARB=0.00657053;OID=.;OPOS=78340257;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:239:241:116:121:120:120:45:75:45:71:46:74:48:73 chr5 78340286 . A G 565.88 PASS AO=120;DP=229;FAO=122;FDP=227;FR=.;FRO=105;FSAF=72;FSAR=50;FSRF=44;FSRR=61;FWDB=0.0336327;FXX=0.0173153;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.5224;QD=9.97139;RBI=0.0454488;REFB=-0.0406616;REVB=-0.0305686;RO=104;SAF=69;SAR=51;SRF=45;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121346;STB=0.579453;TYPE=snp;VARB=0.0276917;OID=.;OPOS=78340286;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:229:227:104:105:120:122:51:69:45:59:50:72:44:61 chr5 78373431 . C T 315.6 PASS AO=73;DP=153;FAO=76;FDP=157;FR=.;FRO=81;FSAF=26;FSAR=50;FSRF=21;FSRR=60;FWDB=-0.0108499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.3;QD=8.04065;RBI=0.0269321;REFB=-0.00804129;REVB=-0.0246499;RO=79;SAF=26;SAR=47;SRF=21;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0957603;STB=0.548932;TYPE=snp;VARB=0.00785696;OID=.;OPOS=78373431;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:157:79:81:73:76:47:26:21:58:50:26:21:60 chr5 78421959 . G A 333.14 PASS AO=88;DP=190;FAO=86;FDP=188;FR=.;FRO=102;FSAF=47;FSAR=39;FSRF=44;FSRR=58;FWDB=-0.00602965;FXX=0.015706;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.038;QD=7.08812;RBI=0.0226353;REFB=-0.00669658;REVB=-0.0218174;RO=100;SAF=47;SAR=41;SRF=44;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0903011;STB=0.56227;TYPE=snp;VARB=0.00726536;OID=.;OPOS=78421959;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:188:100:102:88:86:41:47:44:56:39:47:44:58 chr5 78573790 . A T 544.04 PASS AO=122;DP=240;FAO=124;FDP=242;FR=.;FRO=118;FSAF=56;FSAR=68;FSRF=55;FSRR=63;FWDB=-0.0120022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.2848;QD=8.99239;RBI=0.0201687;REFB=-0.0180466;REVB=0.0162088;RO=118;SAF=54;SAR=68;SRF=55;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0212823;STB=0.507121;TYPE=snp;VARB=0.0169232;OID=.;OPOS=78573790;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:240:242:118:118:122:124:68:54:55:63:68:56:55:63 chr5 78596044 . T C 471.94 PASS AO=141;DP=325;FAO=135;FDP=318;FR=.;FRO=183;FSAF=52;FSAR=83;FSRF=86;FSRR=97;FWDB=-0.0152996;FXX=0.0215378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.251;QD=5.9364;RBI=0.0176665;REFB=0.00192193;REVB=0.00883342;RO=183;SAF=53;SAR=88;SRF=86;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0990403;STB=0.550295;TYPE=snp;VARB=-0.00277405;OID=.;OPOS=78596044;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:325:318:183:183:141:135:88:53:86:97:83:52:86:97 chr5 78617534 . T G 421.06 PASS AO=89;DP=163;FAO=89;FDP=163;FR=.;FRO=74;FSAF=31;FSAR=58;FSRF=31;FSRR=43;FWDB=-0.0154773;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=282.87;QD=10.3328;RBI=0.0313529;REFB=-0.0309425;REVB=-0.0272664;RO=72;SAF=31;SAR=58;SRF=29;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.048315;STB=0.534554;TYPE=snp;VARB=0.0213701;OID=.;OPOS=78617534;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:163:72:74:89:89:58:31:29:43:58:31:31:43 chr5 78981550 . G T 366.46 PASS AO=90;DP=198;FAO=94;FDP=203;FR=.;FRO=109;FSAF=33;FSAR=61;FSRF=59;FSRR=50;FWDB=-0.0151683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.0434;QD=7.22089;RBI=0.0349646;REFB=-0.0201398;REVB=0.0315031;RO=99;SAF=32;SAR=58;SRF=54;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184595;STB=0.605045;TYPE=snp;VARB=0.0189906;OID=.;OPOS=78981550;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:203:99:109:90:94:58:32:54:45:61:33:59:50 chr5 79277817 . A C 89.69 PASS AO=24;DP=58;FAO=24;FDP=58;FR=.;FRO=34;FSAF=4;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.0282985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.921;QD=6.18551;RBI=0.0299321;REFB=-0.0169633;REVB=0.00975306;RO=33;SAF=4;SAR=20;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.396184;STB=0.739211;TYPE=snp;VARB=0.0167155;OID=.;OPOS=79277817;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:58:58:33:34:24:24:20:4:16:17:20:4:17:17 chr5 79286831 . C G 187.5 PASS AO=41;DP=80;FAO=42;FDP=82;FR=.;FRO=40;FSAF=10;FSAR=32;FSRF=11;FSRR=29;FWDB=0.01871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.499;QD=9.14608;RBI=0.0188137;REFB=-0.0200892;REVB=-0.00197285;RO=39;SAF=9;SAR=32;SRF=11;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0761421;STB=0.524169;TYPE=snp;VARB=0.0249047;OID=.;OPOS=79286831;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:82:39:40:41:42:32:9:11:28:32:10:11:29 chr5 79351852 . A T 87.85 PASS AO=17;DP=33;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.0235991;FXX=0.0605877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.993;QD=11.3354;RBI=0.0262541;REFB=-0.0248154;REVB=-0.0115047;RO=11;SAF=5;SAR=12;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192334;STB=0.568881;TYPE=snp;VARB=0.0297941;OID=.;OPOS=79351852;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:33:31:11:14:17:17:12:5:6:5:12:5:6:8 chr5 79439630 . G A 121.37 PASS AO=30;DP=68;FAO=31;FDP=71;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=28;FSRR=12;FWDB=-0.0146453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.282;QD=6.83748;RBI=0.0180727;REFB=-0.0103971;REVB=0.0105895;RO=37;SAF=14;SAR=16;SRF=26;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229397;STB=0.620865;TYPE=snp;VARB=0.00846867;OID=.;OPOS=79439630;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:71:37:40:30:31:16:14:26:11:16:15:28:12 chr5 79595942 . G A 254.75 PASS AO=72;DP=172;FAO=73;FDP=172;FR=.;FRO=99;FSAF=33;FSAR=40;FSRF=41;FSRR=58;FWDB=-0.00535705;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.135;QD=5.92446;RBI=0.0345302;REFB=-0.00518266;REVB=0.0341121;RO=97;SAF=32;SAR=40;SRF=40;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0335004;STB=0.522112;TYPE=snp;VARB=0.00484969;OID=.;OPOS=79595942;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:172:97:99:72:73:40:32:40:57:40:33:41:58 chr5 79596021 . T C 252.09 PASS AO=68;DP=157;FAO=69;FDP=159;FR=.;FRO=90;FSAF=27;FSAR=42;FSRF=33;FSRR=57;FWDB=-0.0156479;FXX=0.00624961;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.099;QD=6.34199;RBI=0.0157684;REFB=-0.0168373;REVB=-0.00194509;RO=89;SAF=27;SAR=41;SRF=33;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.028049;STB=0.514727;TYPE=snp;VARB=0.0169934;OID=.;OPOS=79596021;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:159:89:90:68:69:41:27:33:56:42:27:33:57 chr5 79616083 . G C 881.66 PASS AO=93;DP=93;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0363897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.37;QD=37.5174;RBI=0.0434063;REFB=0;REVB=-0.0236622;RO=0;SAF=29;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.09547e-05;OID=.;OPOS=79616083;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:93:94:0:0:93:94:64:29:0:0:64:30:0:0 chr5 79616936 . A C 334.17 PASS AO=81;DP=171;FAO=82;FDP=172;FR=.;FRO=90;FSAF=42;FSAR=40;FSRF=47;FSRR=43;FWDB=0.00803898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.225;QD=7.77146;RBI=0.0218406;REFB=-0.0316477;REVB=0.0203073;RO=89;SAF=42;SAR=39;SRF=47;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00908168;STB=0.50525;TYPE=snp;VARB=0.0305156;OID=.;OPOS=79616936;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:172:89:90:81:82:39:42:47:42:40:42:47:43 chr5 79617357 . T C 211.28 PASS AO=55;DP=126;FAO=56;FDP=127;FR=.;FRO=71;FSAF=17;FSAR=39;FSRF=28;FSRR=43;FWDB=-0.00792537;FXX=0.0155027;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.69;QD=6.65449;RBI=0.0107449;REFB=-0.00280026;REVB=-0.00725542;RO=70;SAF=18;SAR=37;SRF=28;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0799605;STB=0.557299;TYPE=snp;VARB=0.0030862;OID=.;OPOS=79617357;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:127:70:71:55:56:37:18:28:42:39:17:28:43 chr5 79733079 . T C 365.97 PASS AO=39;DP=39;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0460181;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.642;QD=38.5233;RBI=0.046229;REFB=0;REVB=0.00441081;RO=0;SAF=15;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00030173;OID=.;OPOS=79733079;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:39:38:0:0:39:38:24:15:0:0:24:14:0:0 chr5 79734297 . T C 447.3 PASS AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00450038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.845;QD=38.0681;RBI=0.0168707;REFB=0;REVB=-0.0162594;RO=0;SAF=35;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.04037e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.93351e-05;OID=.;OPOS=79734297;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:47:47:0:0:47:47:12:35:0:0:12:35:0:0 chr5 79734409 . G A 481.19 PASS AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00486598;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.893;QD=37.7405;RBI=0.00628045;REFB=0;REVB=-0.00397067;RO=0;SAF=43;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.72506e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.43469e-06;OID=.;OPOS=79734409;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:51:51:0:0:51:51:8:43:0:0:8:43:0:0 chr5 79735858 . A G 2333.16 PASS AO=241;DP=243;FAO=242;FDP=242;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=148;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0506965;FXX=0.0281113;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.609;QD=38.5646;RBI=0.0522739;REFB=0;REVB=0.0127449;RO=1;SAF=93;SAR=148;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00509729;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000382278;OID=.;OPOS=79735858;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:243:242:1:0:241:242:148:93:1:0:148:94:0:0 chr5 79745469 . A G 1892.94 PASS AO=201;DP=205;FAO=202;FDP=202;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0418369;FXX=0.0146334;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.1725;QD=37.484;RBI=0.0447703;REFB=-0.0963176;REVB=-0.015939;RO=1;SAF=102;SAR=99;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0046469;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000305797;OID=.;OPOS=79745469;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:205:202:1:0:201:202:99:102:1:0:99:103:0:0 chr5 79815658 . T C 2240.92 PASS AO=235;DP=239;FAO=236;FDP=236;FR=.;FRO=0;FSAF=116;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00177788;FXX=0.020746;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.188;QD=37.9816;RBI=0.049707;REFB=-0.0333379;REVB=0.0496752;RO=0;SAF=116;SAR=119;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00043674;OID=.;OPOS=79815658;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:239:236:0:0:235:236:119:116:0:0:120:116:0:0 chr5 79855372 . A G 965.01 PASS AO=103;DP=105;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00547753;FXX=0.0190458;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.478;QD=37.4763;RBI=0.0072364;REFB=0.0161279;REVB=0.00472886;RO=1;SAF=72;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0150582;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.13784e-05;OID=.;OPOS=79855372;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:105:103:1:0:103:103:31:72:0:1:31:72:0:0 chr5 80149981 . A G 1031.51 PASS AO=106;DP=107;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0116383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.211;QD=38.2041;RBI=0.0126752;REFB=0;REVB=-0.00502094;RO=0;SAF=57;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.80814e-05;OID=.;OPOS=80149981;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:107:108:0:0:106:108:49:57:0:0:51:57:0:0 chr5 80168937 . G A 1538.16 PASS AO=161;DP=161;FAO=161;FDP=161;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2808;QD=38.2151;RBI=0.0183811;REFB=0;REVB=0.0116137;RO=0;SAF=80;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.2572e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000110576;OID=.;OPOS=80168937;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:161:161:0:0:161:161:81:80:0:0:81:80:0:0 chr5 80604430 . C T 511.24 PASS AO=125;DP=259;FAO=125;FDP=259;FR=.;FRO=134;FSAF=73;FSAR=52;FSRF=88;FSRR=46;FWDB=-0.00354829;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.601;QD=7.8956;RBI=0.0255091;REFB=-0.0136467;REVB=-0.0252611;RO=134;SAF=73;SAR=52;SRF=88;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0713936;STB=0.539218;TYPE=snp;VARB=0.0142216;OID=.;OPOS=80604430;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:259:259:134:134:125:125:52:73:88:46:52:73:88:46 chr5 80631642 . C T 266.44 PASS AO=66;DP=141;FAO=66;FDP=141;FR=.;FRO=75;FSAF=40;FSAR=26;FSRF=40;FSRR=35;FWDB=-0.0198422;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.557;QD=7.5587;RBI=0.0347894;REFB=-0.0265985;REVB=-0.028576;RO=75;SAF=40;SAR=26;SRF=40;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0717115;STB=0.539811;TYPE=snp;VARB=0.0279654;OID=.;OPOS=80631642;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:75:75:66:66:26:40:40:35:26:40:40:35 chr5 80736444 . A G 228.4 PASS AO=29;DP=111;FAO=48;FDP=106;FR=.,HEALED;FRO=52;FSAF=40;FSAR=8;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=0.00333163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.585;QD=8.61906;RBI=0.00695818;REFB=-0.0453617;REVB=0.00610872;RO=51;SAF=24;SAR=5;SRF=24;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.447963;STB=0.729058;TYPE=snp;VARB=0.027346;OID=.;OPOS=80736444;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:51:52:29:48:5:24:24:27:8:40:25:27 chr5 80756855 . A T 525.86 PASS AO=194;DP=690;FAO=160;FDP=392;FR=.;FRO=232;FSAF=90;FSAR=70;FSRF=125;FSRR=107;FWDB=-0.0331186;FXX=0.0199995;HRUN=8;LEN=1;MLLD=141.212;QD=5.36595;RBI=0.0344585;REFB=-0.00129819;REVB=-0.00951578;RO=216;SAF=134;SAR=60;SRF=100;SRR=116;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229792;STB=0.514201;TYPE=snp;VARB=0.00190335;OID=.;OPOS=80756855;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:574:392:216:232:194:160:60:134:100:116:70:90:125:107 chr5 81354389 . T C 299.88 PASS AO=75;DP=168;FAO=78;FDP=171;FR=.;FRO=93;FSAF=26;FSAR=52;FSRF=47;FSRR=46;FWDB=-0.00802488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.214;QD=7.01481;RBI=0.0238215;REFB=-0.0227465;REVB=0.0224292;RO=93;SAF=25;SAR=50;SRF=47;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179221;STB=0.598335;TYPE=snp;VARB=0.0272473;OID=.;OPOS=81354389;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:171:93:93:75:78:50:25:47:46:52:26:47:46 chr5 81549216 . C T 114.2 PASS AO=27;DP=57;FAO=27;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=7;FSRR=24;FWDB=0.00757332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.514;QD=7.87604;RBI=0.0436378;REFB=-0.0113937;REVB=-0.0429756;RO=29;SAF=7;SAR=20;SRF=7;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0217302;STB=0.523792;TYPE=snp;VARB=0.0145013;OID=.;OPOS=81549216;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:58:29:31:27:27:20:7:7:22:20:7:7:24 chr5 81549240 . C A 106.24 PASS AO=24;DP=50;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=4;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=25;FWDB=-0.0322983;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=95.7985;QD=8.4993;RBI=0.0325833;REFB=-0.00807315;REVB=-0.00429996;RO=26;SAF=4;SAR=20;SRF=1;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260051;STB=0.642765;TYPE=snp;VARB=0.0100862;OID=.;OPOS=81549240;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:26:26:24:24:20:4:1:25:20:4:1:25 chr5 81572184 . G C 370.55 PASS AO=89;DP=185;FAO=89;FDP=183;FR=.;FRO=94;FSAF=42;FSAR=47;FSRF=37;FSRR=57;FWDB=0.0177673;FXX=0.0108102;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.3425;QD=8.09954;RBI=0.0234295;REFB=-0.0187737;REVB=-0.015273;RO=91;SAF=42;SAR=47;SRF=37;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0604371;STB=0.540518;TYPE=snp;VARB=0.0209101;OID=.;OPOS=81572184;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:183:91:94:89:89:47:42:37:54:47:42:37:57 chr5 82786194 . T C 228.05 PASS AO=59;DP=142;FAO=62;FDP=143;FR=.;FRO=81;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=32;FSRR=49;FWDB=-0.0101479;FXX=0.00694396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.686;QD=6.37897;RBI=0.0272229;REFB=-0.0097747;REVB=-0.0252608;RO=81;SAF=31;SAR=28;SRF=32;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134021;STB=0.586179;TYPE=snp;VARB=0.0111702;OID=.;OPOS=82786194;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:143:81:81:59:62:28:31:32:49:28:34:32:49 chr5 82789647 . A G 545.14 PASS AO=152;DP=375;FAO=164;FDP=388;FR=.;FRO=224;FSAF=95;FSAR=69;FSRF=140;FSRR=84;FWDB=0.000287583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.073;QD=5.62004;RBI=0.0139545;REFB=0.00566581;REVB=0.0139516;RO=211;SAF=93;SAR=59;SRF=138;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0469545;STB=0.527314;TYPE=snp;VARB=-0.00675671;OID=.;OPOS=82789647;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:375:388:211:224:152:164:59:93:138:73:69:95:140:84 chr5 82875800 . C T 1853.89 PASS AO=192;DP=192;FAO=194;FDP=194;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=116;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0297238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.061;QD=38.2245;RBI=0.0331407;REFB=0;REVB=-0.0146561;RO=0;SAF=78;SAR=114;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.27691e-05;OID=.;OPOS=82875800;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:192:194:0:0:192:194:114:78:0:0:116:78:0:0 chr5 82876284 . A G 775.3 PASS AO=165;DP=302;FAO=165;FDP=301;FR=.;FRO=136;FSAF=49;FSAR=116;FSRF=38;FSRR=98;FWDB=-0.00646126;FXX=0.00660044;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.811;QD=10.3031;RBI=0.0282604;REFB=-0.0147606;REVB=-0.0275119;RO=129;SAF=49;SAR=116;SRF=32;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0484234;STB=0.509572;TYPE=snp;VARB=0.0107551;OID=.;OPOS=82876284;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:302:301:129:136:165:165:116:49:32:97:116:49:38:98 chr5 82940273 . C G 1626.12 PASS AO=187;DP=214;FAO=207;FDP=229;FR=.;FRO=22;FSAF=103;FSAR=104;FSRF=19;FSRR=3;FWDB=0.111463;FXX=0.00865763;HRUN=6;LEN=1;MLLD=35.5239;QD=28.4038;RBI=0.111546;REFB=-0.210039;REVB=0.00430044;RO=27;SAF=100;SAR=87;SRF=21;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0586067;STB=0.535152;TYPE=snp;VARB=0.020199;OID=.;OPOS=82940273;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:214:229:27:22:187:207:87:100:21:6:104:103:19:3 chr5 85582712 . T C 17.67 PASS AO=16;DP=92;FAO=16;FDP=92;FR=.;FRO=76;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=62;FWDB=-0.0216378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.7992;QD=0.768269;RBI=0.0243559;REFB=6.8475e-05;REVB=0.0111809;RO=72;SAF=4;SAR=12;SRF=14;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100989;STB=0.578037;TYPE=snp;VARB=-0.000893358;OID=.;OPOS=85582712;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:92:92:72:76:16:16:12:4:14:58:12:4:14:62 chr5 85583507 . T G 73.98 PASS AO=12;DP=19;FAO=12;FDP=19;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0100554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.204;QD=15.5754;RBI=0.0369452;REFB=-0.0168112;REVB=-0.0355505;RO=7;SAF=7;SAR=5;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00793731;STB=0.504497;TYPE=snp;VARB=0.0214276;OID=.;OPOS=85583507;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:19:19:7:7:12:12:5:7:4:3:5:7:4:3 chr5 85583651 . C T 75.09 PASS AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0116148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.498;QD=10.3572;RBI=0.0151232;REFB=-0.00660052;REVB=-0.0096854;RO=14;SAF=7;SAR=8;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0940743;STB=0.553418;TYPE=snp;VARB=0.00537134;OID=.;OPOS=85583651;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:29:29:14:14:15:15:8:7:5:9:8:7:5:9 chr5 85586831 . C T 309.36 PASS AO=72;DP=147;FAO=73;FDP=149;FR=.;FRO=76;FSAF=43;FSAR=30;FSRF=41;FSRR=35;FWDB=0.0491573;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.3353;QD=8.30501;RBI=0.0495132;REFB=-0.0314402;REVB=0.0059258;RO=75;SAF=42;SAR=30;SRF=40;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0470896;STB=0.525863;TYPE=snp;VARB=0.0260169;OID=.;OPOS=85586831;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:149:75:76:72:73:30:42:40:35:30:43:41:35 chr5 86513974 . A G 1312.31 PASS AO=141;DP=145;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153249;FXX=0.0457486;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.7394;QD=35.9537;RBI=0.0237841;REFB=0.0399328;REVB=-0.0181887;RO=4;SAF=38;SAR=103;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0474546;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000791133;OID=.;OPOS=86513974;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:145:146:4:0:141:146:103:38:4:0:106:40:0:0 chr5 86687176 . T G 282.88 PASS AO=68;DP=162;FAO=75;FDP=169;FR=.;FRO=94;FSAF=33;FSAR=42;FSRF=42;FSRR=52;FWDB=-0.017136;FXX=0.0116952;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.615;QD=6.69529;RBI=0.0179195;REFB=-0.00930072;REVB=0.00524062;RO=94;SAF=34;SAR=34;SRF=42;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0551221;STB=0.503838;TYPE=snp;VARB=0.010588;OID=.;OPOS=86687176;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:169:94:94:68:75:34:34:42:52:42:33:42:52 chr5 86695274 . A G 262.49 PASS AO=72;DP=166;FAO=72;FDP=166;FR=.;FRO=94;FSAF=30;FSAR=42;FSRF=21;FSRR=73;FWDB=0.0270339;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.237;QD=6.32516;RBI=0.0324659;REFB=-0.000573269;REVB=0.0179777;RO=93;SAF=30;SAR=42;SRF=21;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207867;STB=0.616923;TYPE=snp;VARB=0.00109879;OID=.;OPOS=86695274;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:166:93:94:72:72:42:30:21:72:42:30:21:73 chr5 87497977 . C T 844.71 PASS AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.100404;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.203;QD=38.396;RBI=0.10412;REFB=0;REVB=-0.027567;RO=0;SAF=33;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.74869e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000237906;OID=.;OPOS=87497977;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:88:88:0:0:88:88:55:33:0:0:54:34:0:0 chr5 87498849 . G A 596.17 PASS AO=120;DP=217;FAO=125;FDP=225;FR=.;FRO=100;FSAF=47;FSAR=78;FSRF=41;FSRR=59;FWDB=0.0471509;FXX=0.00442458;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.651;QD=10.5986;RBI=0.0472308;REFB=-0.0219694;REVB=-0.00274626;RO=95;SAF=43;SAR=77;SRF=41;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0633283;STB=0.515971;TYPE=snp;VARB=0.0193288;OID=.;OPOS=87498849;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:217:225:95:100:120:125:77:43:41:54:78:47:41:59 chr5 87502325 . G A 309.66 PASS AO=44;DP=67;FAO=55;FDP=74;FR=.;FRO=19;FSAF=49;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=2;FWDB=0.0112845;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=22.682;QD=16.7386;RBI=0.0374567;REFB=-0.0142169;REVB=-0.0357164;RO=21;SAF=39;SAR=5;SRF=18;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0415554;STB=0.502537;TYPE=snp;VARB=0.00376761;OID=.;OPOS=87502325;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:67:74:21:19:44:55:5:39:18:3:6:49:17:2 chr5 87678632 . T C 389.53 PASS AO=108;DP=251;FAO=110;FDP=253;FR=.;FRO=143;FSAF=17;FSAR=93;FSRF=57;FSRR=86;FWDB=0.0609328;FXX=0.00784283;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.4682;QD=6.15851;RBI=0.0646651;REFB=-0.00151934;REVB=0.021651;RO=143;SAF=17;SAR=91;SRF=59;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.352282;STB=0.69336;TYPE=snp;VARB=0.00341357;OID=.;OPOS=87678632;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:251:253:143:143:108:110:91:17:59:84:93:17:57:86 chr5 87968864 . A G 1134.43 PASS AO=121;DP=122;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00755157;FXX=0.00819605;HRUN=3;LEN=1;MLLD=251.57;QD=37.5018;RBI=0.0117296;REFB=-0.0279914;REVB=0.00897538;RO=1;SAF=85;SAR=36;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00555658;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.79003e-05;OID=.;OPOS=87968864;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:122:121:1:0:121:121:36:85:1:0:36:85:0:0 chr5 89703641 . C G 216.93 PASS AO=57;DP=129;FAO=57;FDP=129;FR=.;FRO=72;FSAF=18;FSAR=39;FSRF=28;FSRR=44;FWDB=0.0197874;FXX=0.00769172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.0509;QD=6.72653;RBI=0.0350813;REFB=-0.0397552;REVB=0.0289681;RO=72;SAF=18;SAR=39;SRF=28;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.081448;STB=0.545604;TYPE=snp;VARB=0.0306822;OID=.;OPOS=89703641;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:72:72:57:57:39:18:28:44:39:18:28:44 chr5 89769728 . T C 289.84 PASS AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0747186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.9957;QD=37.3987;RBI=0.074754;REFB=0;REVB=-0.00229998;RO=0;SAF=3;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.7166e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00113624;OID=.;OPOS=89769728;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:31:31:0:0:31:31:28:3:0:0:28:3:0:0 chr5 89810077 . G A 118.2 PASS AO=32;DP=76;FAO=32;FDP=76;FR=.;FRO=44;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=36;FSRR=8;FWDB=-0.0167101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5664;QD=6.2212;RBI=0.0477182;REFB=-0.00413505;REVB=-0.0446967;RO=44;SAF=18;SAR=14;SRF=36;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280105;STB=0.656165;TYPE=snp;VARB=0.00939559;OID=.;OPOS=89810077;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:44:44:32:32:14:18:36:8:14:18:36:8 chr5 89816299 . C A 380.81 PASS AO=84;DP=162;FAO=85;FDP=163;FR=.;FRO=78;FSAF=13;FSAR=72;FSRF=32;FSRR=46;FWDB=-0.0314113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.556;QD=9.34506;RBI=0.0351238;REFB=0.00988951;REVB=-0.0157167;RO=78;SAF=13;SAR=71;SRF=32;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.318993;STB=0.678627;TYPE=snp;VARB=-0.00598093;OID=.;OPOS=89816299;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:163:78:78:84:85:71:13:32:46:72:13:32:46 chr5 89816309 . A AT 144.45 PASS AO=68;DP=165;FAO=75;FDP=163;FR=.;FRO=88;FSAF=14;FSAR=61;FSRF=30;FSRR=58;FWDB=0.16291;FXX=0.0180712;HRUN=4;LEN=1;MLLD=13.9375;QD=3.54474;RBI=0.24265;REFB=0.0684536;REVB=0.179831;RO=81;SAF=13;SAR=55;SRF=27;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192803;STB=0.616977;TYPE=ins;VARB=-0.0655234;OID=.;OPOS=89816310;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:68:165:75:163:88:14:61:30:58:99:81:13:55:27:54 chr5 89820984 . T C 269.36 PASS AO=77;DP=183;FAO=77;FDP=183;FR=.;FRO=106;FSAF=31;FSAR=46;FSRF=52;FSRR=54;FWDB=-0.000461383;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.797;QD=5.88765;RBI=0.000504083;REFB=-0.015057;REVB=0.000203041;RO=106;SAF=31;SAR=46;SRF=52;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0926837;STB=0.55188;TYPE=snp;VARB=0.0217304;OID=.;OPOS=89820984;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:183:106:106:77:77:46:31:52:54:46:31:52:54 chr5 89943571 . G T 183.44 PASS AO=39;DP=78;FAO=40;FDP=78;FR=.;FRO=38;FSAF=8;FSAR=32;FSRF=7;FSRR=31;FWDB=0.0586413;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.7902;QD=9.40716;RBI=0.0586825;REFB=-0.0159048;REVB=0.00219713;RO=38;SAF=7;SAR=32;SRF=7;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00708731;STB=0.512189;TYPE=snp;VARB=0.0101067;OID=.;OPOS=89943571;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:38:38:39:40:32:7:7:31:32:8:7:31 chr5 89979460 . G A 343.54 PASS AO=83;DP=186;FAO=88;FDP=189;FR=.;FRO=101;FSAF=32;FSAR=56;FSRF=57;FSRR=44;FWDB=0.0186147;FXX=0.0104707;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.9598;QD=7.27075;RBI=0.0383141;REFB=-0.029762;REVB=0.0334882;RO=102;SAF=28;SAR=55;SRF=56;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216051;STB=0.608968;TYPE=snp;VARB=0.0288399;OID=.;OPOS=89979460;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:189:102:101:83:88:55:28:56:46:56:32:57:44 chr5 89979589 . G A 751.93 PASS AO=171;DP=331;FAO=171;FDP=331;FR=.;FRO=160;FSAF=79;FSAR=92;FSRF=45;FSRR=115;FWDB=-0.011587;FXX=0.00301196;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.522;QD=9.08674;RBI=0.0173901;REFB=-0.0141829;REVB=0.0129676;RO=160;SAF=78;SAR=93;SRF=45;SRR=115;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158886;STB=0.589054;TYPE=snp;VARB=0.0207426;OID=.;OPOS=89979589;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:331:331:160:160:171:171:93:78:45:115:92:79:45:115 chr5 89979698 . C T 430.44 PASS AO=112;DP=238;FAO=111;FDP=238;FR=.;FRO=127;FSAF=44;FSAR=67;FSRF=52;FSRR=75;FWDB=-0.00798053;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6953;QD=7.23436;RBI=0.0549825;REFB=0.0023811;REVB=-0.0544003;RO=123;SAF=45;SAR=67;SRF=49;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00337148;STB=0.507254;TYPE=snp;VARB=-0.00359321;OID=.;OPOS=89979698;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:238:238:123:127:112:111:67:45:49:74:67:44:52:75 chr5 89985882 . A G 218.28 PASS AO=69;DP=179;FAO=69;FDP=179;FR=.;FRO=110;FSAF=19;FSAR=50;FSRF=34;FSRR=76;FWDB=0.0185961;FXX=0.0110491;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.528;QD=4.87778;RBI=0.0322577;REFB=-0.013905;REVB=-0.026358;RO=109;SAF=19;SAR=50;SRF=33;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.036461;STB=0.525369;TYPE=snp;VARB=0.034748;OID=.;OPOS=89985882;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:179:109:110:69:69:50:19:33:76:50:19:34:76 chr5 89988504 . A G 445.51 PASS AO=123;DP=284;FAO=123;FDP=281;FR=.;FRO=158;FSAF=106;FSAR=17;FSRF=118;FSRR=40;FWDB=0.0188671;FXX=0.010563;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.2989;QD=6.3418;RBI=0.0199779;REFB=-0.00815896;REVB=-0.00656874;RO=158;SAF=106;SAR=17;SRF=118;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201527;STB=0.61338;TYPE=snp;VARB=0.00668733;OID=.;OPOS=89988504;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:284:281:158:158:123:123:17:106:118:40:17:106:118:40 chr5 89989779 . G A 1134.56 PASS AO=230;DP=385;FAO=229;FDP=399;FR=.;FRO=170;FSAF=77;FSAR=152;FSRF=70;FSRR=100;FWDB=0.0501217;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.552;QD=11.374;RBI=0.0642025;REFB=-0.0351827;REVB=-0.0401221;RO=154;SAF=76;SAR=154;SRF=71;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105217;STB=0.535208;TYPE=snp;VARB=0.0257398;OID=.;OPOS=89989779;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:385:399:154:170:230:229:154:76:71:83:152:77:70:100 chr5 89990324 . A G 278.5 PASS AO=74;DP=167;FAO=74;FDP=166;FR=.;FRO=92;FSAF=26;FSAR=48;FSRF=50;FSRR=42;FWDB=0.00252644;FXX=0.00598767;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.9171;QD=6.71093;RBI=0.0146465;REFB=-0.00448938;REVB=-0.014427;RO=92;SAF=26;SAR=48;SRF=50;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195891;STB=0.609188;TYPE=snp;VARB=0.0065189;OID=.;OPOS=89990324;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:166:92:92:74:74:48:26:50:42:48:26:50:42 chr5 90020923 . T G 378.9 PASS AO=108;DP=261;FAO=110;FDP=258;FR=.;FRO=148;FSAF=65;FSAR=45;FSRF=71;FSRR=77;FWDB=0.0050847;FXX=0.0190107;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.137;QD=5.87443;RBI=0.0150735;REFB=-0.0077356;REVB=0.01419;RO=137;SAF=65;SAR=43;SRF=66;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122546;STB=0.564401;TYPE=snp;VARB=0.0110463;OID=.;OPOS=90020923;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:261:258:137:148:108:110:43:65:66:71:45:65:71:77 chr5 90107108 . A G 1742.26 PASS AO=162;DP=162;FAO=183;FDP=183;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162337;FXX=0.00543449;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.532;QD=38.0821;RBI=0.042699;REFB=0;REVB=0.0394926;RO=0;SAF=70;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.57291e-05;OID=.;OPOS=90107108;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:162:183:0:0:162:183:92:70:0:0:109:74:0:0 chr5 90119324 . G A 2141.94 PASS AO=226;DP=228;FAO=227;FDP=227;FR=.;FRO=0;FSAF=99;FSAR=128;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0338729;FXX=0.00438577;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.012;QD=37.7435;RBI=0.0452617;REFB=-0.0183924;REVB=0.0300207;RO=2;SAF=99;SAR=127;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00105154;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000104399;OID=.;OPOS=90119324;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:228:227:2:0:226:227:127:99:1:1:128:99:0:0 chr5 90151589 . G A 347.46 PASS AO=95;DP=218;FAO=95;FDP=217;FR=.;FRO=122;FSAF=58;FSAR=37;FSRF=62;FSRR=60;FWDB=0.0116827;FXX=0.00458695;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.577;QD=6.40484;RBI=0.0191287;REFB=-0.00884002;REVB=-0.0151466;RO=116;SAF=58;SAR=37;SRF=59;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103348;STB=0.558899;TYPE=snp;VARB=0.01058;OID=.;OPOS=90151589;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:218:217:116:122:95:95:37:58:59:57:37:58:62:60 chr5 93111875 . CCG C,CC 74.9 PASS AO=7,14;DP=80;FAO=0,30;FDP=54;FR=.;FRO=24;FSAF=0,21;FSAR=0,9;FSRF=21;FSRR=3;FWDB=-0.144729,-0.073185;FXX=0.0689536;HRUN=3,5;LEN=2,1;MLLD=16.084,11.2885;QD=5.54794;RBI=0.195595,0.0743775;REFB=0.0129429,-0.0991834;REVB=-0.131571,0.0132655;RO=23;SAF=5,10;SAR=2,4;SRF=20;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0.602941,0;SSSB=-0.269228,-0.229322;STB=0.5,0.599941;TYPE=del,del;VARB=-0.0706346,0.0877048;OID=.,.;OPOS=93111876,93111877;OREF=CG,G;OALT=-,-;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:7,14:45:0,30:54:24:0,21:0,9:21:3:40:23:5,10:2,4:20:3 chr5 93731985 . A G 2123 PASS AO=221;DP=221;FAO=222;FDP=222;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=139;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0125958;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.738;QD=38.2523;RBI=0.0125962;REFB=0;REVB=-9.93072e-05;RO=0;SAF=82;SAR=139;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71763e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.15279e-05;OID=.;OPOS=93731985;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:221:222:0:0:221:222:139:82:0:0:139:83:0:0 chr5 93800660 . T C 340.48 PASS AO=89;DP=196;FAO=89;FDP=196;FR=.;FRO=107;FSAF=24;FSAR=65;FSRF=39;FSRR=68;FWDB=0.00956268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.9029;QD=6.94852;RBI=0.0372014;REFB=0.0139672;REVB=0.0359514;RO=107;SAF=24;SAR=65;SRF=39;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111224;STB=0.561945;TYPE=snp;VARB=-0.0167761;OID=.;OPOS=93800660;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:196:107:107:89:89:65:24:39:68:65:24:39:68 chr5 94259682 . C T 164.16 PASS AO=36;DP=70;FAO=36;FDP=70;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.00623747;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.8222;QD=9.38031;RBI=0.0279185;REFB=-0.0104111;REVB=0.0272128;RO=34;SAF=14;SAR=22;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0474969;STB=0.526388;TYPE=snp;VARB=0.00732715;OID=.;OPOS=94259682;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:34:34:36:36:22:14:15:19:22:14:15:19 chr5 94278129 . T C 24.36 PASS AO=8;DP=28;FAO=8;FDP=28;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=17;FSRR=3;FWDB=0.030276;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.2136;QD=3.47965;RBI=0.0304033;REFB=-0.0255778;REVB=0.0027801;RO=19;SAF=6;SAR=2;SRF=17;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263028;STB=0.605035;TYPE=snp;VARB=0.0187421;OID=.;OPOS=94278129;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:28:28:19:20:8:8:2:6:17:2:2:6:17:3 chr5 94749723 . G A 396.6 PASS AO=103;DP=227;FAO=103;FDP=225;FR=.;FRO=122;FSAF=55;FSAR=48;FSRF=57;FSRR=65;FWDB=0.0232297;FXX=0.00881018;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.236;QD=7.0506;RBI=0.0375236;REFB=-0.00408674;REVB=0.0294686;RO=120;SAF=55;SAR=48;SRF=56;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0654624;STB=0.536185;TYPE=snp;VARB=0.00480415;OID=.;OPOS=94749723;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:227:225:120:122:103:103:48:55:56:64:48:55:57:65 chr5 94759802 . G A 369.5 PASS AO=78;DP=149;FAO=81;FDP=153;FR=.;FRO=72;FSAF=26;FSAR=55;FSRF=27;FSRR=45;FWDB=-0.00544938;FXX=0.00649309;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.672;QD=9.66024;RBI=0.0397281;REFB=-0.0078925;REVB=0.0393526;RO=71;SAF=26;SAR=52;SRF=27;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0450583;STB=0.528551;TYPE=snp;VARB=0.00824321;OID=.;OPOS=94759802;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:153:71:72:78:81:52:26:27:44:55:26:27:45 chr5 94772540 . C T 1155.09 PASS AO=123;DP=126;FAO=129;FDP=133;FR=.;FRO=4;FSAF=72;FSAR=57;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0424382;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.5903;QD=34.7396;RBI=0.0568671;REFB=-0.129947;REVB=-0.0378532;RO=3;SAF=66;SAR=57;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0211022;STB=0.513511;TYPE=snp;VARB=0.00982694;OID=.;OPOS=94772540;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:126:133:3:4:123:129:57:66:3:0:57:72:4:0 chr5 94826655 . C A 382.91 PASS AO=85;DP=167;FAO=86;FDP=167;FR=.;FRO=81;FSAF=33;FSAR=53;FSRF=39;FSRR=42;FWDB=-0.0261194;FXX=0.00595203;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.062;QD=9.17143;RBI=0.0284298;REFB=-0.00871768;REVB=0.0112265;RO=82;SAF=33;SAR=52;SRF=39;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0804726;STB=0.548974;TYPE=snp;VARB=0.00895684;OID=.;OPOS=94826655;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:167:82:81:85:86:52:33:39:43:53:33:39:42 chr5 94833109 . C T 239.1 PASS AO=66;DP=155;FAO=67;FDP=155;FR=.;FRO=88;FSAF=37;FSAR=30;FSRF=41;FSRR=47;FWDB=0.00279444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.321;QD=6.17033;RBI=0.00483726;REFB=-0.00456302;REVB=0.00394845;RO=88;SAF=36;SAR=30;SRF=42;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0697454;STB=0.549031;TYPE=snp;VARB=0.00538373;OID=.;OPOS=94833109;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:88:88:66:67:30:36:42:46:30:37:41:47 chr5 94861118 . G C 262.28 PASS AO=80;DP=201;FAO=80;FDP=201;FR=.;FRO=121;FSAF=53;FSAR=27;FSRF=66;FSRR=55;FWDB=-0.00782826;FXX=0.00495025;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.3716;QD=5.21944;RBI=0.0115947;REFB=-0.021742;REVB=-0.00855307;RO=120;SAF=53;SAR=27;SRF=66;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127641;STB=0.574925;TYPE=snp;VARB=0.0298446;OID=.;OPOS=94861118;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:201:120:121:80:80:27:53:66:54:27:53:66:55 chr5 94939193 . A G 289.72 PASS AO=81;DP=186;FAO=80;FDP=185;FR=.;FRO=105;FSAF=37;FSAR=43;FSRF=49;FSRR=56;FWDB=0.0134956;FXX=0.00537606;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.316;QD=6.26414;RBI=0.017647;REFB=-0.00762679;REVB=-0.0113704;RO=105;SAF=38;SAR=43;SRF=49;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0025114;STB=0.502377;TYPE=snp;VARB=0.0103243;OID=.;OPOS=94939193;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:185:105:105:81:80:43:38:49:56:43:37:49:56 chr5 95084131 . G A 348.63 PASS AO=96;DP=221;FAO=96;FDP=221;FR=.;FRO=125;FSAF=19;FSAR=77;FSRF=35;FSRR=90;FWDB=-0.015763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.591;QD=6.30997;RBI=0.0233539;REFB=-0.00989532;REVB=-0.0172317;RO=124;SAF=19;SAR=77;SRF=35;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122533;STB=0.567165;TYPE=snp;VARB=0.0151946;OID=.;OPOS=95084131;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:221:124:125:96:96:77:19:35:89:77:19:35:90 chr5 95091194 . C T 536.62 PASS AO=125;DP=249;FAO=125;FDP=248;FR=.;FRO=123;FSAF=58;FSAR=67;FSRF=53;FSRR=70;FWDB=-0.00571312;FXX=0.0040159;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.307;QD=8.65518;RBI=0.0085405;REFB=0.0166291;REVB=0.00634826;RO=122;SAF=58;SAR=67;SRF=53;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.026849;STB=0.516542;TYPE=snp;VARB=-0.0156499;OID=.;OPOS=95091194;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:249:248:122:123:125:125:67:58:53:69:67:58:53:70 chr5 95091201 . A G 557.91 PASS AO=130;DP=259;FAO=130;FDP=259;FR=.;FRO=129;FSAF=60;FSAR=70;FSRF=57;FSRR=72;FWDB=-0.0051199;FXX=0.00384601;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.076;QD=8.61642;RBI=0.0117224;REFB=-0.00514805;REVB=-0.0105452;RO=128;SAF=60;SAR=70;SRF=57;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0147907;STB=0.509873;TYPE=snp;VARB=0.00600883;OID=.;OPOS=95091201;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:259:259:128:129:130:130:70:60:57:71:70:60:57:72 chr5 95152313 . A G 846.32 PASS AO=91;DP=92;FAO=91;FDP=92;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0348921;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.856;QD=36.7964;RBI=0.0372652;REFB=-0.00642728;REVB=-0.0130857;RO=1;SAF=34;SAR=57;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0082444;STB=0.504347;TYPE=snp;VARB=0.000323369;OID=.;OPOS=95152313;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:92:92:1:1:91:91:57:34:0:1:57:34:0:1 chr5 95194571 . T C 233.13 PASS AO=63;DP=135;FAO=61;FDP=135;FR=.;FRO=74;FSAF=26;FSAR=35;FSRF=45;FSRR=29;FWDB=-0.000905244;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8811;QD=6.90762;RBI=0.0554521;REFB=0.00155118;REVB=-0.0554447;RO=72;SAF=28;SAR=35;SRF=43;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146049;STB=0.598907;TYPE=snp;VARB=-0.00201375;OID=.;OPOS=95194571;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:72:74:63:61:35:28:43:29:35:26:45:29 chr5 95194686 . C T 142.9 PASS AO=32;DP=63;FAO=32;FDP=64;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.0225998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.463;QD=8.93152;RBI=0.0227543;REFB=-0.0180422;REVB=-0.0026466;RO=30;SAF=17;SAR=15;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0018185;STB=0.515707;TYPE=snp;VARB=0.0180951;OID=.;OPOS=95194686;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:64:30:32:32:32:15:17:16:14:15:17:18:14 chr5 95223698 . C CA,A 37.12 PASS AO=27,20;DP=98;FAO=31,0;FDP=89;FR=.;FRO=58;FSAF=11,0;FSAR=20,0;FSRF=16;FSRR=42;FWDB=0.0427432,0.0102755;FXX=0;HRUN=7,1;LEN=1,1;MLLD=8.77176,202.345;QD=1.66813;RBI=0.087825,0.0159522;REFB=-0.0924977,-0.00708502;REVB=-0.0767219,-0.012202;RO=49;SAF=7,8;SAR=20,12;SRF=19;SRR=30;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.167357,0.0151984;STB=0.558066,0.5;TYPE=ins,snp;VARB=0.0774161,0;OID=.,.;OPOS=95223699,95223698;OREF=-,C;OALT=A,A;OMAPALT=CA,A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:98:89:49:58:27,20:31,0:20,12:7,8:19:30:20,0:11,0:16:42 chr5 95728898 . C G 1633.4 PASS AO=171;DP=173;FAO=171;FDP=171;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0458733;FXX=0.01156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.7895;QD=38.2083;RBI=0.0459114;REFB=0;REVB=0.0018695;RO=0;SAF=67;SAR=104;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03155e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.70554e-05;OID=.;OPOS=95728898;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:173:171:0:0:171:171:104:67:0:0:104:67:0:0 chr5 95728974 . G C 582.89 PASS AO=63;DP=65;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00159082;FXX=0.0153822;HRUN=3;LEN=1;MLLD=247.303;QD=36.4309;RBI=0.0213499;REFB=-0.0672368;REVB=0.0212905;RO=1;SAF=19;SAR=44;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106134;STB=0.505616;TYPE=snp;VARB=0.000190212;OID=.;OPOS=95728974;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:65:64:1:1:63:63:44:19:0:1:44:19:0:1 chr5 95751785 . T C 358.71 PASS AO=89;DP=188;FAO=89;FDP=188;FR=.;FRO=99;FSAF=35;FSAR=54;FSRF=44;FSRR=55;FWDB=0.00169529;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=239.932;QD=7.63213;RBI=0.00241987;REFB=-0.00832367;REVB=-0.00172678;RO=99;SAF=35;SAR=54;SRF=44;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0504542;STB=0.527899;TYPE=snp;VARB=0.00853152;OID=.;OPOS=95751785;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:188:99:99:89:89:54:35:44:55:54:35:44:55 chr5 95865526 . G A 718.04 PASS AO=83;DP=89;FAO=83;FDP=89;FR=.;FRO=6;FSAF=19;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.0916365;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0924;QD=32.2716;RBI=0.0950845;REFB=-0.118959;REVB=0.0253736;RO=6;SAF=19;SAR=64;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0423616;STB=0.522383;TYPE=snp;VARB=0.0155193;OID=.;OPOS=95865526;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:89:89:6:6:83:83:64:19:0:6:64:19:0:6 chr5 96031569 . A G 185.75 PASS AO=36;DP=63;FAO=36;FDP=62;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=0.000610611;FXX=0.0158705;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.356;QD=11.984;RBI=0.0191981;REFB=-0.00434565;REVB=0.0191884;RO=26;SAF=11;SAR=25;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.035845;STB=0.519739;TYPE=snp;VARB=0.0026582;OID=.;OPOS=96031569;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:63:62:26:26:36:36:25:11:9:17:25:11:9:17 chr5 96079387 . C T 156.14 PASS AO=38;DP=81;FAO=38;FDP=82;FR=.;FRO=44;FSAF=12;FSAR=26;FSRF=8;FSRR=36;FWDB=-0.0330671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.1248;QD=7.61668;RBI=0.0343025;REFB=-0.0228229;REVB=-0.00912288;RO=42;SAF=12;SAR=26;SRF=8;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145631;STB=0.588565;TYPE=snp;VARB=0.0166639;OID=.;OPOS=96079387;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:82:42:44:38:38:26:12:8:34:26:12:8:36 chr5 96079402 . C T 211.94 PASS AO=46;DP=90;FAO=46;FDP=89;FR=.;FRO=43;FSAF=12;FSAR=34;FSRF=7;FSRR=36;FWDB=0.01089;FXX=0.0219756;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.078;QD=9.52536;RBI=0.019209;REFB=-0.0189503;REVB=0.0158238;RO=41;SAF=12;SAR=34;SRF=7;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106018;STB=0.56525;TYPE=snp;VARB=0.0116249;OID=.;OPOS=96079402;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:89:41:43:46:46:34:12:7:34:34:12:7:36 chr5 96093222 . G A 3148.59 PASS AO=329;DP=339;FAO=335;FDP=335;FR=.;FRO=0;FSAF=146;FSAR=189;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0608449;FXX=0.0117991;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.8702;QD=37.5951;RBI=0.0742375;REFB=-0.0304649;REVB=0.0425336;RO=7;SAF=144;SAR=185;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00613733;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.1043e-05;OID=.;OPOS=96093222;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:339:335:7:0:329:335:185:144:2:5:189:146:0:0 chr5 96109244 . G A 403.31 PASS AO=120;DP=291;FAO=120;FDP=291;FR=.;FRO=171;FSAF=48;FSAR=72;FSRF=62;FSRR=109;FWDB=-0.00592703;FXX=0.00682571;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.947;QD=5.54381;RBI=0.00798498;REFB=-0.0147152;REVB=0.00535072;RO=166;SAF=48;SAR=72;SRF=59;SRR=107;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0489332;STB=0.523118;TYPE=snp;VARB=0.017716;OID=.;OPOS=96109244;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:291:291:166:171:120:120:72:48:59:107:72:48:62:109 chr5 96118852 . G C 969.1 PASS AO=102;DP=103;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0221012;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.7098;QD=38.0041;RBI=0.0525329;REFB=0;REVB=0.0476575;RO=0;SAF=92;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000124479;OID=.;OPOS=96118852;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:103:102:0:0:102:102:10:92:0:0:10:92:0:0 chr5 96121524 . C T 1938.1 PASS AO=208;DP=212;FAO=209;FDP=209;FR=.;FRO=0;FSAF=111;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188928;FXX=0.0141503;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.553;QD=37.0929;RBI=0.0224108;REFB=-0.0223811;REVB=-0.0120543;RO=2;SAF=110;SAR=98;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0085816;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.95342e-05;OID=.;OPOS=96121524;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:212:209:2:0:208:209:98:110:2:0:98:111:0:0 chr5 96122260 . T G 1268.83 PASS AO=131;DP=133;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208261;FXX=0.0633758;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.568;QD=38.1604;RBI=0.03467;REFB=0;REVB=0.0277179;RO=0;SAF=73;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000387703;OID=.;OPOS=96122260;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:133:133:0:0:131:133:58:73:0:0:60:73:0:0 chr5 96124330 . T C 3176.27 PASS AO=318;DP=334;FAO=357;FDP=367;FR=.;FRO=10;FSAF=149;FSAR=208;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.105658;FXX=0.00271732;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.9869;QD=34.6187;RBI=0.113695;REFB=-0.0580612;REVB=0.0419877;RO=8;SAF=130;SAR=188;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0164558;STB=0.503291;TYPE=snp;VARB=0.0163591;OID=.;OPOS=96124330;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:334:367:8:10:318:357:188:130:6:2:208:149:3:7 chr5 96126308 . A G 1286.36 PASS AO=135;DP=138;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0644252;FXX=0.0283668;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.5951;QD=37.558;RBI=0.133184;REFB=0;REVB=0.116564;RO=1;SAF=51;SAR=84;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00922929;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00191167;OID=.;OPOS=96126308;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:138:137:1:0:135:137:84:51:1:0:85:52:0:0 chr5 96129512 . A G 1633.98 PASS AO=168;DP=168;FAO=172;FDP=172;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00755115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=299.403;QD=37.9995;RBI=0.0133439;REFB=0;REVB=0.0110018;RO=0;SAF=94;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000136657;OID=.;OPOS=96129512;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:168:172:0:0:168:172:74:94:0:0:76:96:0:0 chr5 96130836 . T C 1148.25 PASS AO=120;DP=124;FAO=126;FDP=128;FR=.;FRO=2;FSAF=49;FSAR=77;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0351524;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=116.003;QD=35.8829;RBI=0.0359605;REFB=-0.215448;REVB=0.00758078;RO=3;SAF=47;SAR=73;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.029352;STB=0.501825;TYPE=snp;VARB=0.00221486;OID=.;OPOS=96130836;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:124:128:3:2:120:126:73:47:3:0:77:49:1:1 chr5 96139250 . C G 1878.79 PASS AO=136;DP=209;FAO=193;FDP=202;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=125;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.035556;FXX=0.0146334;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.255;QD=37.2038;RBI=0.0466257;REFB=0;REVB=0.0301618;RO=0;SAF=96;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00493678;OID=.;OPOS=96139250;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:182:202:0:0:136:193:40:96:0:0:68:125:0:0 chr5 96231017 . A G 692.9 PASS AO=186;DP=412;FAO=182;FDP=398;FR=.;FRO=216;FSAF=79;FSAR=103;FSRF=93;FSRR=123;FWDB=-0.0148486;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.738;QD=6.96384;RBI=0.0170818;REFB=-0.010822;REVB=-0.00844432;RO=224;SAF=80;SAR=106;SRF=95;SRR=129;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00606006;STB=0.50194;TYPE=snp;VARB=0.0152475;OID=.;OPOS=96231017;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:412:398:224:216:186:182:106:80:95:129:103:79:93:123 chr5 96498783 . G A 1462.71 PASS AO=160;DP=164;FAO=160;FDP=164;FR=.;FRO=4;FSAF=99;FSAR=61;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0271585;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.782;QD=35.6759;RBI=0.0366629;REFB=-0.0842558;REVB=0.0246289;RO=4;SAF=99;SAR=61;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0188333;STB=0.5099;TYPE=snp;VARB=0.000578713;OID=.;OPOS=96498783;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:164:164:4:4:160:160:61:99:4:0:61:99:4:0 chr5 96503523 . C T 1006.03 PASS AO=109;DP=111;FAO=109;FDP=111;FR=.;FRO=2;FSAF=72;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0233291;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=121.8;QD=36.2534;RBI=0.0287253;REFB=-0.0828091;REVB=-0.0167599;RO=1;SAF=72;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126556;STB=0.503218;TYPE=snp;VARB=-1.93106e-05;OID=.;OPOS=96503523;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:111:111:1:2:109:109:37:72:0:1:37:72:1:1 chr5 96512865 . T A 1776.39 PASS AO=180;DP=180;FAO=188;FDP=188;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0265292;FXX=0.0105258;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.421;QD=37.7956;RBI=0.0451134;REFB=0.046602;REVB=0.0364887;RO=0;SAF=90;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000407288;OID=.;OPOS=96512865;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:180:188:0:0:180:188:90:90:0:0:99:89:0:0 chr5 96512871 . T A 1893.88 PASS AO=192;DP=194;FAO=199;FDP=199;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00555891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.657;QD=38.068;RBI=0.0368703;REFB=0;REVB=-0.0364488;RO=1;SAF=93;SAR=99;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0047861;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000237772;OID=.;OPOS=96512871;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:194:199:1:0:192:199:99:93:0:1:105:94:0:0 chr5 96513471 . G C 1160.96 PASS AO=122;DP=122;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.014236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.3177;QD=38.0642;RBI=0.0238418;REFB=0;REVB=-0.0191252;RO=0;SAF=65;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000169128;OID=.;OPOS=96513471;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:122:122:0:0:122:122:57:65:0:0:57:65:0:0 chr5 96518791 . GT G 377.36 PASS AO=44;DP=63;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00431874;FXX=0.0701631;HRUN=2;LEN=1;MLLD=23.5515;QD=28.4798;RBI=0.010424;REFB=0;REVB=-0.00948726;RO=1;SAF=0;SAR=44;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.00314449;OID=.;OPOS=96518792;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:44:57:53:53:0:6:47:0:0:34:1:0:44:0:1 chr5 98131505 . A G 95.5 PASS AO=32;DP=91;FAO=32;FDP=91;FR=.;FRO=59;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=33;FSRR=26;FWDB=-0.0133462;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.284;QD=4.19775;RBI=0.0168594;REFB=-0.0139563;REVB=-0.0103013;RO=56;SAF=13;SAR=19;SRF=33;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20108;STB=0.598979;TYPE=snp;VARB=0.0203025;OID=.;OPOS=98131505;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:91:91:56:59:32:32:19:13:33:23:19:13:33:26 chr5 98192164 . AAGG A 238.8 PASS AO=93;DP=218;FAO=98;FDP=219;FR=.;FRO=121;FSAF=49;FSAR=49;FSRF=49;FSRR=72;FWDB=0.0108094;FXX=0.0179364;HRUN=2;LEN=3;MLLD=227.131;QD=4.36168;RBI=0.0130146;REFB=-0.00889476;REVB=-0.00724822;RO=115;SAF=48;SAR=45;SRF=47;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10679;STB=0.552501;TYPE=del;VARB=0.0113482;OID=.;OPOS=98192165;OREF=AGG;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:93:217:98:219:121:49:49:49:72:99:115:48:45:47:68 chr5 98195818 . A G 257.21 PASS AO=80;DP=200;FAO=79;FDP=199;FR=.;FRO=120;FSAF=48;FSAR=31;FSRF=76;FSRR=44;FWDB=0.000907376;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=171.366;QD=5.17;RBI=0.0239002;REFB=-0.00749974;REVB=-0.023883;RO=113;SAF=49;SAR=31;SRF=71;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.017508;STB=0.516385;TYPE=snp;VARB=0.0111967;OID=.;OPOS=98195818;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:200:199:113:120:80:79:31:49:71:42:31:48:76:44 chr5 98199204 . C T 2627.7 PASS AO=275;DP=275;FAO=274;FDP=274;FR=.;FRO=0;FSAF=106;FSAR=168;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0241818;FXX=0.00363623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.006;QD=38.3606;RBI=0.0264892;REFB=0;REVB=0.0108129;RO=0;SAF=106;SAR=169;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.65475e-05;OID=.;OPOS=98199204;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:275:274:0:0:275:274:169:106:0:0:168:106:0:0 chr5 100068875 . C T 2080.24 PASS AO=218;DP=219;FAO=218;FDP=218;FR=.;FRO=0;FSAF=99;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0274816;FXX=0.004566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.7645;QD=38.1695;RBI=0.0584976;REFB=-0.0437248;REVB=0.0516404;RO=1;SAF=99;SAR=119;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00398713;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00035243;OID=.;OPOS=100068875;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:219:218:1:0:218:218:119:99:0:1:119:99:0:0 chr5 100145388 . A C 1318.64 PASS AO=132;DP=133;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0282595;FXX=0.00724585;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.5788;QD=38.5005;RBI=0.0455295;REFB=0;REVB=0.0356979;RO=0;SAF=80;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.72886e-05;OID=.;OPOS=100145388;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:133:137:0:0:132:137:52:80:0:0:57:80:0:0 chr5 100145662 . A AACAC 111.69 PASS AO=14;DP=77;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=2;FSAR=24;FSRF=22;FSRR=3;FWDB=-0.0723726;FXX=0.177391;HRUN=2;LEN=4;MLLD=130.585;QD=8.76013;RBI=0.118499;REFB=-0.0321186;REVB=0.0938311;RO=41;SAF=2;SAR=12;SRF=31;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.667779;STB=0.913951;TYPE=ins;VARB=0.0266684;OID=.;OPOS=100145663;OREF=-;OALT=ACAC;OMAPALT=AACAC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:14:77:26:51:25:2:24:22:3:99:41:2:12:31:10 chr5 100146447 . G T 2146.77 PASS AO=233;DP=241;FAO=235;FDP=240;FR=.;FRO=5;FSAF=101;FSAR=134;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0281857;FXX=0.0123452;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.039;QD=35.7795;RBI=0.0317469;REFB=-0.0484945;REVB=0.0146093;RO=1;SAF=100;SAR=133;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00474182;STB=0.512076;TYPE=snp;VARB=0.000617717;OID=.;OPOS=100146447;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:241:240:1:5:233:235:133:100:1:0:134:101:5:0 chr5 101466768 . C G 1151.36 PASS AO=121;DP=122;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=108;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0815225;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.073;QD=38.0614;RBI=0.133984;REFB=0;REVB=0.106328;RO=0;SAF=108;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000380956;OID=.;OPOS=101466768;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:122:121:0:0:121:121:13:108:0:0:13:108:0:0 chr5 101575091 . C T 1254.4 PASS AO=130;DP=130;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.065084;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.7462;QD=38.597;RBI=0.0753196;REFB=0;REVB=0.0379093;RO=0;SAF=50;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000645807;OID=.;OPOS=101575091;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:130:130:0:0:130:130:80:50:0:0:80:50:0:0 chr5 101631761 . T C 167.89 PASS AO=50;DP=133;FAO=52;FDP=133;FR=.;FRO=81;FSAF=35;FSAR=17;FSRF=47;FSRR=34;FWDB=0.0289749;FXX=0.00746213;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.312;QD=5.04923;RBI=0.0296934;REFB=0.00813413;REVB=-0.00649223;RO=80;SAF=35;SAR=15;SRF=47;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135658;STB=0.561473;TYPE=snp;VARB=-0.0103138;OID=.;OPOS=101631761;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:80:81:50:52:15:35:47:33:17:35:47:34 chr5 101631790 . T G 440.8 PASS AO=91;DP=162;FAO=91;FDP=163;FR=.;FRO=72;FSAF=52;FSAR=39;FSRF=47;FSRR=25;FWDB=-0.0127864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.744;QD=10.8172;RBI=0.0664972;REFB=-0.017092;REVB=-0.0652563;RO=67;SAF=52;SAR=39;SRF=46;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0931361;STB=0.537063;TYPE=snp;VARB=0.0159593;OID=.;OPOS=101631790;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:163:67:72:91:91:39:52:46:21:39:52:47:25 chr5 101638266 . T C 208.3 PASS AO=48;DP=97;FAO=48;FDP=97;FR=.;FRO=49;FSAF=35;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=0.0018993;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=97.5516;QD=8.58976;RBI=0.02711;REFB=-0.0232521;REVB=-0.0270434;RO=42;SAF=35;SAR=13;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197062;STB=0.63418;TYPE=snp;VARB=0.0355535;OID=.;OPOS=101638266;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:42:49:48:48:13:35:22:20:13:35:24:25 chr5 101638381 . G A 139.54 PASS AO=44;DP=114;FAO=44;FDP=116;FR=.;FRO=72;FSAF=10;FSAR=34;FSRF=35;FSRR=37;FWDB=0.00893145;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=132.66;QD=4.81155;RBI=0.00920362;REFB=0.00402773;REVB=-0.0022217;RO=70;SAF=10;SAR=34;SRF=35;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.329853;STB=0.682946;TYPE=snp;VARB=-0.00792538;OID=.;OPOS=101638381;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:116:70:72:44:44:34:10:35:35:34:10:35:37 chr5 101638440 . C A 222.58 PASS AO=47;DP=88;FAO=47;FDP=88;FR=.;FRO=41;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=7;FSRR=34;FWDB=0.0298035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.261;QD=10.1172;RBI=0.0356115;REFB=0.000676984;REVB=-0.0194918;RO=41;SAF=26;SAR=21;SRF=7;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.317481;STB=0.673508;TYPE=snp;VARB=-0.000832431;OID=.;OPOS=101638440;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:41:41:47:47:21:26:7:34:21:26:7:34 chr5 101724448 . G C 274.44 PASS AO=74;DP=170;FAO=74;FDP=169;FR=.;FRO=95;FSAF=35;FSAR=39;FSRF=44;FSRR=51;FWDB=0.0152701;FXX=0.00588201;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.619;QD=6.49564;RBI=0.0252862;REFB=-0.00466957;REVB=-0.0201548;RO=95;SAF=35;SAR=39;SRF=44;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00993352;STB=0.505535;TYPE=snp;VARB=0.00608728;OID=.;OPOS=101724448;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:169:95:95:74:74:39:35:44:51:39:35:44:51 chr5 101794112 . T C 258.64 PASS AO=69;DP=155;FAO=69;FDP=155;FR=.;FRO=86;FSAF=27;FSAR=42;FSRF=22;FSRR=64;FWDB=-0.0124483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.462;QD=6.67469;RBI=0.0212471;REFB=-0.00119411;REVB=-0.0172185;RO=86;SAF=27;SAR=42;SRF=22;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147606;STB=0.581685;TYPE=snp;VARB=0.00150245;OID=.;OPOS=101794112;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:86:86:69:69:42:27:22:64:42:27:22:64 chr5 101816104 . G A 182.47 PASS AO=45;DP=103;FAO=46;FDP=102;FR=.;FRO=56;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=33;FWDB=-0.0356717;FXX=0.0192289;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.2745;QD=7.15574;RBI=0.0412544;REFB=-0.0163942;REVB=0.0207234;RO=55;SAF=25;SAR=20;SRF=22;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15206;STB=0.572488;TYPE=snp;VARB=0.0209507;OID=.;OPOS=101816104;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:102:55:56:45:46:20:25:22:33:21:25:23:33 chr5 102365186 . G A 1005.41 PASS AO=105;DP=107;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124316;FXX=0.0275204;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.0292;QD=37.9401;RBI=0.0541955;REFB=-0.0972273;REVB=0.0527504;RO=0;SAF=52;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00124708;OID=.;OPOS=102365186;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:107:106:0:0:105:106:53:52:0:0:55:51:0:0 chr5 102365426 . C CAG 1020.46 PASS AO=157;DP=224;FAO=159;FDP=219;FR=.;FRO=60;FSAF=58;FSAR=101;FSRF=42;FSRR=18;FWDB=0.0244837;FXX=0.0309721;HRUN=1;LEN=2;MLLD=197.714;QD=18.6385;RBI=0.0345704;REFB=-0.0221701;REVB=0.0244061;RO=64;SAF=58;SAR=99;SRF=47;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200157;STB=0.594036;TYPE=ins;VARB=0.00541095;OID=.;OPOS=102365427;OREF=-;OALT=AG;OMAPALT=CAG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:157:224:159:219:60:58:101:42:18:99:64:58:99:47:17 chr5 102512570 . C CA 1038.84 PASS AO=127;DP=138;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0266296;FXX=0.0218962;HRUN=1;LEN=1;MLLD=24.7772;QD=31.0101;RBI=0.0274651;REFB=0;REVB=-0.00672279;RO=7;SAF=45;SAR=82;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0384942;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.000351788;OID=.;OPOS=102512571;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:127:138:134:134:0:49:85:0:0:92:7:45:82:5:2 chr5 102891695 . A G 1602.1 PASS AO=175;DP=181;FAO=176;FDP=180;FR=.;FRO=4;FSAF=64;FSAR=112;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0285598;FXX=0.00552456;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.5;QD=35.6023;RBI=0.0289582;REFB=-0.139468;REVB=0.00478683;RO=3;SAF=64;SAR=111;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0103716;STB=0.503268;TYPE=snp;VARB=0.000372437;OID=.;OPOS=102891695;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:181:180:3:4:175:176:111:64:2:1:112:64:2:2 chr5 107197420 . G A 415.4 PASS AO=105;DP=225;FAO=105;FDP=224;FR=.;FRO=119;FSAF=58;FSAR=47;FSRF=60;FSRR=59;FWDB=0.0219296;FXX=0.00444425;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.3005;QD=7.41781;RBI=0.0247605;REFB=-0.0649265;REVB=0.0114968;RO=118;SAF=58;SAR=47;SRF=59;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0504444;STB=0.525735;TYPE=snp;VARB=0.0616263;OID=.;OPOS=107197420;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:225:224:118:119:105:105:47:58:59:59:47:58:60:59 chr5 107197502 . G A 388.52 PASS AO=91;DP=183;FAO=92;FDP=186;FR=.;FRO=94;FSAF=46;FSAR=46;FSRF=50;FSRR=44;FWDB=0.0138569;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.441;QD=8.35523;RBI=0.015488;REFB=-0.0260634;REVB=-0.00691848;RO=92;SAF=46;SAR=45;SRF=49;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0247877;STB=0.516126;TYPE=snp;VARB=0.0227701;OID=.;OPOS=107197502;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:186:92:94:91:92:45:46:49:43:46:46:50:44 chr5 108133967 . A G 1881.17 PASS AO=202;DP=208;FAO=204;FDP=204;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=126;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00202239;FXX=0.0239223;HRUN=3;LEN=1;MLLD=77.931;QD=36.8856;RBI=0.0164575;REFB=-0.0750445;REVB=0.0163328;RO=6;SAF=77;SAR=125;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00278644;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.09133e-06;OID=.;OPOS=108133967;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:208:204:6:0:202:204:125:77:2:4:126:78:0:0 chr5 108350576 . G A 117.72 PASS AO=28;DP=62;FAO=29;FDP=62;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=0.0341314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.6509;QD=7.59477;RBI=0.0344898;REFB=-0.0655346;REVB=-0.00495934;RO=33;SAF=12;SAR=16;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0253269;STB=0.503368;TYPE=snp;VARB=0.0382283;OID=.;OPOS=108350576;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:33:33:28:29:16:12:15:18:16:13:15:18 chr5 108373106 . C A 301.1 PASS AO=78;DP=171;FAO=78;FDP=172;FR=.;FRO=94;FSAF=29;FSAR=49;FSRF=32;FSRR=62;FWDB=-0.0243669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.3136;QD=7.00237;RBI=0.0282882;REFB=-0.0215031;REVB=-0.0143693;RO=91;SAF=29;SAR=49;SRF=31;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.032698;STB=0.51852;TYPE=snp;VARB=0.0376612;OID=.;OPOS=108373106;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:172:91:94:78:78:49:29:31:60:49:29:32:62 chr5 108380419 . T C 698.06 PASS AO=293;DP=656;FAO=178;FDP=382;FR=.;FRO=204;FSAF=99;FSAR=79;FSRF=107;FSRR=97;FWDB=-0.00228165;FXX=0.0449989;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.535;QD=7.30952;RBI=0.0344613;REFB=-0.0177751;REVB=0.0343857;RO=300;SAF=166;SAR=127;SRF=157;SRR=143;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0404099;STB=0.517061;TYPE=snp;VARB=0.018155;OID=.;OPOS=108380419;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:656:382:300:204:293:178:127:166:157:143:79:99:107:97 chr5 108672755 . T A 593.76 PASS AO=154;DP=333;FAO=154;FDP=333;FR=.;FRO=179;FSAF=71;FSAR=83;FSRF=88;FSRR=91;FWDB=-0.00492409;FXX=0.00299392;HRUN=3;LEN=1;MLLD=214.413;QD=7.13223;RBI=0.00504423;REFB=-0.00244325;REVB=0.00109436;RO=178;SAF=71;SAR=83;SRF=87;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.027043;STB=0.516494;TYPE=snp;VARB=0.00304114;OID=.;OPOS=108672755;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:333:333:178:179:154:154:83:71:87:91:83:71:88:91 chr5 108672946 . C T 176.07 PASS AO=53;DP=138;FAO=53;FDP=135;FR=.;FRO=82;FSAF=37;FSAR=16;FSRF=45;FSRR=37;FWDB=0.0119342;FXX=0.0357117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.799;QD=5.21685;RBI=0.0375185;REFB=-0.010337;REVB=-0.0355699;RO=79;SAF=37;SAR=16;SRF=44;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163731;STB=0.599106;TYPE=snp;VARB=0.0212015;OID=.;OPOS=108672946;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:135:79:82:53:53:16:37:44:35:16:37:45:37 chr5 108713970 . C T 337.91 PASS AO=87;DP=190;FAO=87;FDP=190;FR=.;FRO=103;FSAF=53;FSAR=34;FSRF=56;FSRR=47;FWDB=-0.0561599;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.0053;QD=7.11393;RBI=0.0614651;REFB=-0.0122373;REVB=-0.0249804;RO=102;SAF=53;SAR=34;SRF=56;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0605836;STB=0.536684;TYPE=snp;VARB=0.0143745;OID=.;OPOS=108713970;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:190:102:103:87:87:34:53:56:46:34:53:56:47 chr5 108713982 . T C 268.47 PASS AO=60;DP=164;FAO=79;FDP=184;FR=.;FRO=105;FSAF=43;FSAR=36;FSRF=54;FSRR=51;FWDB=0.021544;FXX=0.00540511;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.98;QD=5.83625;RBI=0.0218851;REFB=-0.0147771;REVB=0.00384863;RO=103;SAF=24;SAR=36;SRF=53;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128624;STB=0.517208;TYPE=snp;VARB=0.0152594;OID=.;OPOS=108713982;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:184:103:105:60:79:36:24:53:50:36:43:54:51 chr5 108714298 . T C 157.94 PASS AO=35;DP=70;FAO=35;FDP=70;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=10;FSRR=25;FWDB=-0.0395669;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=110.313;QD=9.025;RBI=0.0427231;REFB=-0.00787298;REVB=-0.016116;RO=34;SAF=14;SAR=21;SRF=10;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100208;STB=0.560942;TYPE=snp;VARB=0.010588;OID=.;OPOS=108714298;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:34:35:35:35:21:14:10:24:21:14:10:25 chr5 108719151 . G A 208.16 PASS AO=64;DP=163;FAO=64;FDP=163;FR=.;FRO=99;FSAF=33;FSAR=31;FSRF=44;FSRR=55;FWDB=-0.0527403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.985;QD=5.10811;RBI=0.0529137;REFB=-0.00483149;REVB=0.00428122;RO=98;SAF=33;SAR=31;SRF=43;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0823351;STB=0.543144;TYPE=snp;VARB=0.00702251;OID=.;OPOS=108719151;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:163:98:99:64:64:31:33:43:55:31:33:44:55 chr5 110439509 . A G 1735.94 PASS AO=180;DP=180;FAO=180;FDP=180;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00548545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9374;QD=38.5764;RBI=0.0477397;REFB=0;REVB=0.0474235;RO=0;SAF=96;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.24249e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00017485;OID=.;OPOS=110439509;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:180:180:0:0:180:180:84:96:0:0:84:96:0:0 chr5 110456704 . A T 1028.45 PASS AO=105;DP=105;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0161777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.497;QD=38.0907;RBI=0.0568787;REFB=0;REVB=0.0545295;RO=0;SAF=51;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.03623e-05;OID=.;OPOS=110456704;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:105:108:0:0:105:108:54:51:0:0:55:53:0:0 chr5 110784822 . A G 2247.65 PASS AO=235;DP=242;FAO=235;FDP=235;FR=.;FRO=0;FSAF=111;FSAR=124;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185735;FXX=0.0289244;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.5279;QD=38.2579;RBI=0.0465182;REFB=0;REVB=0.0426494;RO=0;SAF=111;SAR=124;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.08045e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000114142;OID=.;OPOS=110784822;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:242:235:0:0:235:235:124:111:0:0:124:111:0:0 chr5 110819753 . G C 568.55 PASS AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00532483;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.591;QD=37.9033;RBI=0.0157808;REFB=0;REVB=0.0148553;RO=0;SAF=34;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.91422e-05;OID=.;OPOS=110819753;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:60:60:0:0:60:60:26:34:0:0:27:33:0:0 chr5 111013695 . G T 295.6 PASS AO=85;DP=201;FAO=85;FDP=203;FR=.;FRO=118;FSAF=36;FSAR=49;FSRF=77;FSRR=41;FWDB=-0.0144734;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=161.233;QD=5.82456;RBI=0.0148513;REFB=-0.00686503;REVB=0.00332885;RO=116;SAF=36;SAR=49;SRF=77;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.244478;STB=0.630823;TYPE=snp;VARB=0.0141598;OID=.;OPOS=111013695;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:203:116:118:85:85:49:36:77:39:49:36:77:41 chr5 111500816 . C CTAAAA 956.68 PASS AO=161;DP=329;FAO=187;FDP=314;FR=.;FRO=127;FSAF=48;FSAR=139;FSRF=60;FSRR=67;FWDB=-0.0129573;FXX=0.0187494;HRUN=1;LEN=5;MLLD=214.613;QD=12.1871;RBI=0.0131361;REFB=-0.0166457;REVB=0.0021604;RO=138;SAF=32;SAR=129;SRF=69;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.31433;STB=0.60288;TYPE=ins;VARB=0.0115602;OID=.;OPOS=111500817;OREF=-;OALT=TAAAA;OMAPALT=CTAAAA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:161:329:187:314:127:48:139:60:67:99:138:32:129:69:69 chr5 111504479 . C T 441.23 PASS AO=121;DP=275;FAO=121;FDP=276;FR=.;FRO=155;FSAF=38;FSAR=83;FSRF=60;FSRR=95;FWDB=-0.0233654;FXX=0.0349638;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.15;QD=6.39457;RBI=0.0247671;REFB=-0.0054888;REVB=-0.00821378;RO=139;SAF=38;SAR=83;SRF=54;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0806563;STB=0.545972;TYPE=snp;VARB=0.00579698;OID=.;OPOS=111504479;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:275:276:139:155:121:121:83:38:54:85:83:38:60:95 chr5 111519740 . T C 550.24 PASS AO=147;DP=325;FAO=147;FDP=326;FR=.;FRO=179;FSAF=85;FSAR=62;FSRF=118;FSRR=61;FWDB=0.0222715;FXX=0.00609737;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.707;QD=6.75141;RBI=0.0222755;REFB=-0.00488057;REVB=-0.00042433;RO=177;SAF=85;SAR=62;SRF=118;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.091206;STB=0.546237;TYPE=snp;VARB=0.00728026;OID=.;OPOS=111519740;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:325:326:177:179:147:147:62:85:118:59:62:85:118:61 chr5 111530284 . A G 222.93 PASS AO=49;DP=99;FAO=50;FDP=99;FR=.;FRO=49;FSAF=30;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=32;FWDB=0.0279478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.8965;QD=9.00725;RBI=0.0282282;REFB=-0.00101586;REVB=0.00396847;RO=50;SAF=30;SAR=19;SRF=17;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.245649;STB=0.623951;TYPE=snp;VARB=0.000995843;OID=.;OPOS=111530284;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:50:49:49:50:19:30:17:33:20:30:17:32 chr5 111545670 . C G 644.59 PASS AO=121;DP=203;FAO=123;FDP=204;FR=.;FRO=81;FSAF=60;FSAR=63;FSRF=31;FSRR=50;FWDB=0.0117222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.186;QD=12.639;RBI=0.0137836;REFB=-0.0147619;REVB=-0.00725101;RO=80;SAF=58;SAR=63;SRF=30;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0771992;STB=0.54183;TYPE=snp;VARB=0.00885379;OID=.;OPOS=111545670;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:204:80:81:121:123:63:58:30:50:63:60:31:50 chr5 111611076 . A G 358.55 PASS AO=81;DP=154;FAO=81;FDP=159;FR=.;FRO=78;FSAF=33;FSAR=48;FSRF=22;FSRR=56;FWDB=-0.0146317;FXX=0.0245384;HRUN=4;LEN=1;MLLD=110.4;QD=9.02;RBI=0.0709254;REFB=-0.0402346;REVB=-0.0693997;RO=71;SAF=33;SAR=48;SRF=17;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153713;STB=0.565202;TYPE=snp;VARB=0.0211643;OID=.;OPOS=111611076;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:159:71:78:81:81:48:33:17:54:48:33:22:56 chr5 111755619 . G A 61.44 PASS AO=11;DP=20;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.00377978;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=226.709;QD=12.2875;RBI=0.00447389;REFB=-0.00149305;REVB=-0.00239353;RO=9;SAF=2;SAR=9;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.270831;STB=0.658211;TYPE=snp;VARB=0.00145747;OID=.;OPOS=111755619;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:20:20:9:9:11:11:9:2:4:5:9:2:4:5 chr5 112162854 . T C 849.94 PASS AO=194;DP=387;FAO=194;FDP=378;FR=.;FRO=184;FSAF=90;FSAR=104;FSRF=87;FSRR=97;FWDB=0.0154455;FXX=0.0307684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.698;QD=8.99407;RBI=0.0204158;REFB=-0.0258947;REVB=-0.0133507;RO=175;SAF=90;SAR=104;SRF=83;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00905682;STB=0.504356;TYPE=snp;VARB=0.0236996;OID=.;OPOS=112162854;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:387:378:175:184:194:194:104:90:83:92:104:90:87:97 chr5 112164561 . G A 365.78 PASS AO=101;DP=232;FAO=101;FDP=232;FR=.;FRO=131;FSAF=44;FSAR=57;FSRF=45;FSRR=86;FWDB=-0.019263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.702;QD=6.30663;RBI=0.0218884;REFB=-0.0122256;REVB=0.0103942;RO=131;SAF=44;SAR=57;SRF=45;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0966542;STB=0.553619;TYPE=snp;VARB=0.0119978;OID=.;OPOS=112164561;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:232:131:131:101:101:57:44:45:86:57:44:45:86 chr5 112175770 . G A 118.34 PASS AO=41;DP=121;FAO=42;FDP=122;FR=.;FRO=80;FSAF=29;FSAR=13;FSRF=34;FSRR=46;FWDB=0.00847387;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.545;QD=3.8801;RBI=0.021977;REFB=-0.00267906;REVB=0.0202777;RO=79;SAF=29;SAR=12;SRF=33;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.334796;STB=0.6762;TYPE=snp;VARB=0.00726904;OID=.;OPOS=112175770;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:122:79:80:41:42:12:29:33:46:13:29:34:46 chr5 112176325 . G A 224.88 PASS AO=46;DP=112;FAO=48;FDP=105;FR=.,HEALED;FRO=52;FSAF=32;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=26;FWDB=0.00651541;FXX=0.0277752;HRUN=4;LEN=1;MLLD=173.337;QD=8.56703;RBI=0.0537458;REFB=-0.0365458;REVB=-0.0533494;RO=37;SAF=31;SAR=15;SRF=24;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0230809;STB=0.59151;TYPE=snp;VARB=0.0248928;OID=.;OPOS=112176325;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:105:37:52:46:48:15:31:24:13:16:32:26:26 chr5 112176559 . T G 280.4 PASS AO=62;DP=125;FAO=64;FDP=127;FR=.;FRO=63;FSAF=40;FSAR=24;FSRF=30;FSRR=33;FWDB=0.0492929;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.14;QD=8.83162;RBI=0.049835;REFB=-0.00412552;REVB=-0.00733068;RO=63;SAF=38;SAR=24;SRF=30;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127116;STB=0.575734;TYPE=snp;VARB=0.00413106;OID=.;OPOS=112176559;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:127:63:63:62:64:24:38:30:33:24:40:30:33 chr5 112176756 . T A 1542.89 PASS AO=160;DP=160;FAO=160;FDP=160;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0110609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9695;QD=38.5723;RBI=0.0213012;REFB=0;REVB=0.0182044;RO=0;SAF=82;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.2997e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.39717e-05;OID=.;OPOS=112176756;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:160:160:0:0:160:160:78:82:0:0:78:82:0:0 chr5 112177171 . G A 31.85 PASS AO=11;DP=37;FAO=11;FDP=37;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.0202541;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=264.716;QD=3.4435;RBI=0.020645;REFB=-0.00283736;REVB=-0.00399832;RO=26;SAF=6;SAR=5;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0080845;STB=0.504942;TYPE=snp;VARB=0.00804215;OID=.;OPOS=112177171;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:37:37:26:26:11:11:5:6:14:12:5:6:14:12 chr5 112200098 . A G 466.49 PASS AO=112;DP=229;FAO=112;FDP=229;FR=.;FRO=117;FSAF=53;FSAR=59;FSRF=45;FSRR=72;FWDB=0.0365895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.1439;QD=8.14835;RBI=0.0588959;REFB=-0.00826971;REVB=0.0461513;RO=117;SAF=53;SAR=59;SRF=45;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0830233;STB=0.545611;TYPE=snp;VARB=0.00829199;OID=.;OPOS=112200098;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:229:229:117:117:112:112:59:53:45:72:59:53:45:72 chr5 112203564 . T A 207.21 PASS AO=64;DP=160;FAO=63;FDP=159;FR=.;FRO=96;FSAF=17;FSAR=46;FSRF=35;FSRR=61;FWDB=-0.00971645;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=260.815;QD=5.21286;RBI=0.0156964;REFB=-0.00848545;REVB=-0.0123275;RO=96;SAF=17;SAR=47;SRF=35;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125415;STB=0.568013;TYPE=snp;VARB=0.0119015;OID=.;OPOS=112203564;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:159:96:96:64:63:47:17:35:61:46:17:35:61 chr5 112227799 . A G 174.37 PASS AO=46;DP=111;FAO=48;FDP=113;FR=.;FRO=65;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=27;FSRR=38;FWDB=-0.012248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.799;QD=6.17247;RBI=0.0127158;REFB=-0.0187991;REVB=0.00341738;RO=63;SAF=21;SAR=25;SRF=25;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0622373;STB=0.524971;TYPE=snp;VARB=0.0218066;OID=.;OPOS=112227799;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:113:63:65:46:48:25:21:25:38:26:22:27:38 chr5 112227939 . T C 573.26 PASS AO=156;DP=357;FAO=158;FDP=357;FR=.;FRO=199;FSAF=78;FSAR=80;FSRF=102;FSRR=97;FWDB=0.00196688;FXX=0.00557088;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.781;QD=6.42308;RBI=0.0054989;REFB=-0.0182611;REVB=0.00513511;RO=199;SAF=77;SAR=79;SRF=102;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0191839;STB=0.510528;TYPE=snp;VARB=0.0205253;OID=.;OPOS=112227939;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:357:357:199:199:156:158:79:77:102:97:80:78:102:97 chr5 112228765 . C A 95.2 PASS AO=31;DP=82;FAO=31;FDP=82;FR=.;FRO=51;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=29;FSRR=22;FWDB=-0.0186823;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=43.1658;QD=4.64368;RBI=0.019116;REFB=-0.0255267;REVB=0.00404916;RO=45;SAF=14;SAR=17;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0850781;STB=0.572389;TYPE=snp;VARB=0.0458369;OID=.;OPOS=112228765;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:82:82:45:51:31:31:17:14:24:21:17:14:29:22 chr5 112257908 . T C 52.16 PASS AO=18;DP=67;FAO=21;FDP=70;FR=.;FRO=49;FSAF=4;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=33;FWDB=0.0179204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.432;QD=2.98043;RBI=0.022608;REFB=-0.0101202;REVB=-0.0137833;RO=48;SAF=3;SAR=15;SRF=15;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.245325;STB=0.629492;TYPE=snp;VARB=0.0299917;OID=.;OPOS=112257908;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:67:70:48:49:18:21:15:3:15:33:17:4:16:33 chr5 112312528 . T C 45 PASS AO=13;DP=32;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.00747828;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.608;QD=5.62523;RBI=0.110555;REFB=-0.00795272;REVB=-0.110302;RO=19;SAF=12;SAR=1;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.490331;STB=0.785102;TYPE=snp;VARB=0.0191028;OID=.;OPOS=112312528;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:32:32:19:20:13:12:1:12:12:7:1:11:13:7 chr5 112312676 . T C 368.64 PASS AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0139058;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=213.289;QD=35.1086;RBI=0.0144364;REFB=-0.118924;REVB=0.00387797;RO=1;SAF=21;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218198;STB=0.511622;TYPE=snp;VARB=0.00466078;OID=.;OPOS=112312676;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:42:42:1:1:41:41:20:21:1:0:20:21:1:0 chr5 112328377 . A G 318.75 PASS AO=76;DP=159;FAO=77;FDP=160;FR=.;FRO=83;FSAF=32;FSAR=45;FSRF=45;FSRR=38;FWDB=-0.00921767;FXX=0.0123449;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.483;QD=7.96875;RBI=0.0417516;REFB=-0.020089;REVB=0.0407214;RO=80;SAF=33;SAR=43;SRF=43;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.096254;STB=0.566067;TYPE=snp;VARB=0.0214999;OID=.;OPOS=112328377;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:160:80:83:76:77:43:33:43:37:45:32:45:38 chr5 112346432 . G T 29.53 PASS AO=7;DP=26;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=0.00239093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.7797;QD=3.80988;RBI=0.0148534;REFB=-0.00527746;REVB=0.0146597;RO=13;SAF=2;SAR=5;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.34615;STB=0.679684;TYPE=snp;VARB=0.0952104;OID=.;OPOS=112346432;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:26:31:13:20:7:11:5:2:8:5:7:4:13:7 chr5 112349070 . T C 251.99 PASS AO=56;DP=114;FAO=58;FDP=116;FR=.;FRO=58;FSAF=21;FSAR=37;FSRF=29;FSRR=29;FWDB=-0.0182094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.909;QD=8.68932;RBI=0.023395;REFB=-0.0169124;REVB=-0.0146881;RO=58;SAF=21;SAR=35;SRF=29;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118347;STB=0.571668;TYPE=snp;VARB=0.0203672;OID=.;OPOS=112349070;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:116:58:58:56:58:35:21:29:29:37:21:29:29 chr5 112349379 . T C 254.2 PASS AO=72;DP=173;FAO=73;FDP=175;FR=.;FRO=102;FSAF=10;FSAR=63;FSRF=33;FSRR=69;FWDB=0.00895562;FXX=0.016853;HRUN=3;LEN=1;MLLD=82.1193;QD=5.8103;RBI=0.0288211;REFB=-0.00987042;REVB=-0.0273944;RO=98;SAF=10;SAR=62;SRF=31;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.286913;STB=0.67232;TYPE=snp;VARB=0.0212787;OID=.;OPOS=112349379;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:175:98:102:72:73:62:10:31:67:63:10:33:69 chr5 112350707 . G A 267.12 PASS AO=81;DP=202;FAO=81;FDP=202;FR=.;FRO=121;FSAF=60;FSAR=21;FSRF=75;FSRR=46;FWDB=-0.0376662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.351;QD=5.28942;RBI=0.0403907;REFB=-0.00752321;REVB=-0.014583;RO=119;SAF=60;SAR=21;SRF=73;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159432;STB=0.586411;TYPE=snp;VARB=0.0120046;OID=.;OPOS=112350707;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:202:119:121:81:81:21:60:73:46:21:60:75:46 chr5 112358045 . CAGT C 252.14 PASS AO=65;DP=149;FAO=65;FDP=143;FR=.;FRO=78;FSAF=24;FSAR=41;FSRF=28;FSRR=50;FWDB=-0.0179874;FXX=0.0205465;HRUN=1;LEN=3;MLLD=243.801;QD=7.0529;RBI=0.0201916;REFB=-0.00991194;REVB=-0.00917367;RO=78;SAF=24;SAR=41;SRF=28;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108329;STB=0.506022;TYPE=del;VARB=0.0127519;OID=.;OPOS=112358046;OREF=AGT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:65:147:65:143:78:24:41:28:50:99:78:24:41:28:50 chr5 112358131 . T C 144.89 PASS AO=42;DP=108;FAO=43;FDP=109;FR=.;FRO=66;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=24;FSRR=42;FWDB=-0.00388462;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.835;QD=5.31712;RBI=0.0110073;REFB=-0.00198965;REVB=-0.0102991;RO=66;SAF=15;SAR=27;SRF=24;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00758487;STB=0.505492;TYPE=snp;VARB=0.0030641;OID=.;OPOS=112358131;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:109:66:66:42:43:27:15:24:42:27:16:24:42 chr5 112379289 . G A 205.19 PASS AO=53;DP=118;FAO=53;FDP=118;FR=.;FRO=65;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=23;FSRR=42;FWDB=-0.0212801;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.188;QD=6.95563;RBI=0.045429;REFB=-0.0143003;REVB=0.0401367;RO=65;SAF=25;SAR=28;SRF=23;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117824;STB=0.565587;TYPE=snp;VARB=0.0222002;OID=.;OPOS=112379289;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:65:65:53:53:28:25:23:42:28:25:23:42 chr5 112384802 . G A 735.83 PASS AO=75;DP=75;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0600671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.1691;QD=38.2251;RBI=0.0600764;REFB=0;REVB=0.00105831;RO=0;SAF=39;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6999e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000338593;OID=.;OPOS=112384802;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:75:77:0:0:75:77:36:39:0:0:38:39:0:0 chr5 112399791 . G A 114.29 PASS AO=29;DP=71;FAO=32;FDP=76;FR=.;FRO=44;FSAF=26;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=0.0146682;FXX=0.0499937;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.246;QD=6.01507;RBI=0.0300777;REFB=-0.0496052;REVB=-0.0262585;RO=41;SAF=26;SAR=3;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.547437;STB=0.738472;TYPE=snp;VARB=0.0381508;OID=.;OPOS=112399791;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:76:41:44:29:32:3:26:20:21:6:26:20:24 chr5 112406862 . G A 254.63 PASS AO=72;DP=171;FAO=72;FDP=171;FR=.;FRO=99;FSAF=19;FSAR=53;FSRF=20;FSRR=79;FWDB=-0.0169705;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.105;QD=5.95628;RBI=0.0239346;REFB=-0.00989829;REVB=0.016878;RO=99;SAF=19;SAR=53;SRF=20;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0866024;STB=0.548184;TYPE=snp;VARB=0.0140493;OID=.;OPOS=112406862;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:171:99:99:72:72:53:19:20:79:53:19:20:79 chr5 112439941 . T C 948.62 PASS AO=91;DP=92;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0801606;FXX=0.00980296;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.5673;QD=37.569;RBI=0.141401;REFB=0;REVB=0.116484;RO=1;SAF=48;SAR=43;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108962;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00186347;OID=.;OPOS=112439941;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:92:101:1:0:91:101:43:48:0:1:51:50:0:0 chr5 112479004 . T C 1174.74 PASS AO=126;DP=128;FAO=126;FDP=128;FR=.;FRO=2;FSAF=75;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0106745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.646;QD=36.7105;RBI=0.0106745;REFB=-0.148474;REVB=-3.56278e-05;RO=2;SAF=75;SAR=51;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.018266;STB=0.509614;TYPE=snp;VARB=0.000793741;OID=.;OPOS=112479004;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:128:128:2:2:126:126:51:75:0:2:51:75:0:2 chr5 112770568 . GC G 224 PASS AO=31;DP=52;FAO=34;FDP=36;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.200331;FXX=0.0270197;HRUN=3;LEN=1;MLLD=20.5453;QD=24.889;RBI=0.254938;REFB=-0.0221493;REVB=0.157672;RO=4;SAF=4;SAR=27;SRF=0;SRR=4;SSEN=0.301518;SSEP=0;SSSB=0.0642983;STB=0.516657;TYPE=del;VARB=0.0195725;OID=.;OPOS=112770569;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:31:36:34:36:2:5:29:0:2:11:4:4:27:0:4 chr5 112823998 . C T 82.59 PASS AO=16;DP=43;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=25;FWDB=0.0949218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.098;QD=6.8828;RBI=0.0996303;REFB=-0.0145544;REVB=0.0302662;RO=27;SAF=4;SAR=12;SRF=2;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.305995;STB=0.684075;TYPE=snp;VARB=0.0227167;OID=.;OPOS=112823998;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:43:48:27:27:16:21:12:4:2:25:14:7:2:25 chr5 112824039 . T C 102.06 PASS AO=10;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0377313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.0878;QD=37.1133;RBI=0.0718887;REFB=0;REVB=0.061191;RO=0;SAF=2;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00386151;OID=.;OPOS=112824039;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:10:11:8:2:0:0:9:2:0:0 chr5 112824045 . C T 35.91 PASS AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0;FXX=0.1998;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.781;QD=17.9531;RBI=0.00318807;REFB=-0.0750534;REVB=0.00318807;RO=5;SAF=0;SAR=5;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.730294;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0375778;OID=.;OPOS=112824045;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:10:8:5:3:5:5:5:0:2:3:5:0:0:3 chr5 112824054 . C T 16.08 PASS AO=3;DP=6;FAO=3;FDP=6;FR=.;FRO=3;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.672;QD=10.7182;RBI=0.0529492;REFB=-0.0181527;REVB=-0.0529492;RO=3;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0436675;OID=.;OPOS=112824054;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:6:6:3:3:3:3:3:0:0:3:3:0:0:3 chr5 112889370 . G C 1120.83 PASS AO=208;DP=337;FAO=208;FDP=335;FR=.;FRO=127;FSAF=112;FSAR=96;FSRF=77;FSRR=50;FWDB=0.0287789;FXX=0.00887548;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.3072;QD=13.383;RBI=0.033549;REFB=-0.0420719;REVB=-0.0172428;RO=126;SAF=112;SAR=96;SRF=77;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0514452;STB=0.525972;TYPE=snp;VARB=0.0265619;OID=.;OPOS=112889370;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:337:335:126:127:208:208:96:112:77:49:96:112:77:50 chr5 113589389 . T A 850.55 PASS AO=106;DP=148;FAO=119;FDP=149;FR=.;FRO=30;FSAF=46;FSAR=73;FSRF=27;FSRR=3;FWDB=0.0032586;FXX=0.00666622;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.388;QD=22.8337;RBI=0.00932436;REFB=-0.0434907;REVB=0.00873643;RO=0;SAF=35;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21654e-08;STB=0.603835;TYPE=snp;VARB=0.00320686;OID=.;OPOS=113589389;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:108:149:0:30:106:119:71:35:0:0:73:46:27:3 chr5 113829121 . A G 1056.36 PASS AO=115;DP=118;FAO=115;FDP=118;FR=.;FRO=3;FSAF=44;FSAR=71;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0204427;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.391;QD=35.8087;RBI=0.0241715;REFB=-0.0298477;REVB=0.0128981;RO=3;SAF=44;SAR=71;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00251817;STB=0.501326;TYPE=snp;VARB=0.00840458;OID=.;OPOS=113829121;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:118:118:3:3:115:115:71:44:1:2:71:44:1:2 chr5 114460580 . C G 2649.47 PASS AO=274;DP=276;FAO=278;FDP=278;FR=.;FRO=0;FSAF=134;FSAR=144;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0240674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.8958;QD=38.1218;RBI=0.0252207;REFB=0;REVB=-0.00753947;RO=1;SAF=132;SAR=142;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00334614;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.83683e-05;OID=.;OPOS=114460580;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:276:278:1:0:274:278:142:132:0:1:144:134:0:0 chr5 114462355 . C T 1727.22 PASS AO=172;DP=172;FAO=181;FDP=181;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0275623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.005;QD=38.1706;RBI=0.0291562;REFB=0;REVB=0.00950806;RO=0;SAF=82;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000137425;OID=.;OPOS=114462355;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:82:172:181:0:0:172:181:90:82:0:0:94:87:0:0 chr5 114860161 . G A 412.22 PASS AO=107;DP=232;FAO=108;FDP=234;FR=.;FRO=126;FSAF=37;FSAR=71;FSRF=60;FSRR=66;FWDB=-0.000662637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.6303;QD=7.04649;RBI=0.0146001;REFB=-0.0211083;REVB=0.0145851;RO=125;SAF=37;SAR=70;SRF=60;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137358;STB=0.576014;TYPE=snp;VARB=0.0224326;OID=.;OPOS=114860161;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:234:125:126:107:108:70:37:60:65:71:37:60:66 chr5 115110090 . A C 178.25 PASS AO=62;DP=173;FAO=62;FDP=173;FR=.;FRO=111;FSAF=32;FSAR=30;FSRF=45;FSRR=66;FWDB=0.0209988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.583;QD=4.12138;RBI=0.0244568;REFB=-0.0122928;REVB=-0.0125374;RO=110;SAF=32;SAR=30;SRF=44;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130164;STB=0.570769;TYPE=snp;VARB=0.0268857;OID=.;OPOS=115110090;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:173:110:111:62:62:30:32:44:66:30:32:45:66 chr5 115110172 . C G 121.7 PASS AO=42;DP=123;FAO=43;FDP=124;FR=.;FRO=81;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=27;FSRR=54;FWDB=-0.0329984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4054;QD=3.92565;RBI=0.0331397;REFB=-0.0236311;REVB=-0.00305698;RO=80;SAF=20;SAR=22;SRF=27;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160606;STB=0.587523;TYPE=snp;VARB=0.0453326;OID=.;OPOS=115110172;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:124:80:81:42:43:22:20:27:53:23:20:27:54 chr5 115176589 . A G 457.56 PASS AO=107;DP=214;FAO=107;FDP=213;FR=.;FRO=106;FSAF=51;FSAR=56;FSRF=67;FSRR=39;FWDB=-0.00887259;FXX=0.00467268;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.908;QD=8.59275;RBI=0.0173637;REFB=-0.0172066;REVB=0.0149256;RO=106;SAF=51;SAR=56;SRF=67;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140385;STB=0.576953;TYPE=snp;VARB=0.0216699;OID=.;OPOS=115176589;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:213:106:106:107:107:56:51:67:39:56:51:67:39 chr5 115249078 . C T 23.21 PASS AO=26;DP=147;FAO=26;FDP=147;FR=.;FRO=121;FSAF=5;FSAR=21;FSRF=77;FSRR=44;FWDB=-0.00468564;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.452;QD=0.631557;RBI=0.0186665;REFB=-0.00794868;REVB=-0.0180688;RO=121;SAF=5;SAR=21;SRF=77;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.539227;STB=0.840989;TYPE=snp;VARB=0.0336668;OID=.;OPOS=115249078;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:147:147:121:121:26:26:21:5:77:44:21:5:77:44 chr5 115249271 . G A 558.18 PASS AO=196;DP=468;FAO=166;FDP=400;FR=.;FRO=234;FSAF=83;FSAR=83;FSRF=116;FSRR=118;FWDB=-0.0170594;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.719;QD=5.58175;RBI=0.0172263;REFB=0.0147301;REVB=0.00239245;RO=272;SAF=98;SAR=98;SRF=135;SRR=137;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00384055;STB=0.5025;TYPE=snp;VARB=-0.0223824;OID=.;OPOS=115249271;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:468:400:272:234:196:166:98:98:135:137:83:83:116:118 chr5 115297984 . C T 207.68 PASS AO=42;DP=64;FAO=42;FDP=75;FR=.;FRO=33;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=-0.0661649;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=33.2605;QD=11.0762;RBI=0.0728736;REFB=-0.109174;REVB=0.0305412;RO=22;SAF=26;SAR=16;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163623;STB=0.533759;TYPE=snp;VARB=0.0682167;OID=.;OPOS=115297984;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:75:22:33:42:42:16:26:8:14:16:26:18:15 chr5 115298232 . G C 23.95 PASS AO=10;DP=41;FAO=10;FDP=39;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.00287859;FXX=0.0487686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.686;QD=2.45624;RBI=0.0253258;REFB=-0.0152373;REVB=-0.0251617;RO=31;SAF=8;SAR=2;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.487813;STB=0.807475;TYPE=snp;VARB=0.0523695;OID=.;OPOS=115298232;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:41:39:31:29:10:10:2:8:12:19:2:8:11:18 chr5 115298475 . T C 22.51 PASS AO=5;DP=14;FAO=5;FDP=14;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0321103;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.169;QD=6.4317;RBI=0.0328964;REFB=-0.00737286;REVB=-0.00714861;RO=9;SAF=2;SAR=3;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.046104;STB=0.529293;TYPE=snp;VARB=0.0147968;OID=.;OPOS=115298475;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:14:14:9:9:5:5:3:2:4:5:3:2:4:5 chr5 115298518 . A G 21.46 PASS AO=5;DP=15;FAO=5;FDP=15;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.0301577;FXX=0.062461;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.9819;QD=5.72269;RBI=0.0550094;REFB=0.00544491;REVB=-0.046006;RO=10;SAF=1;SAR=4;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253419;STB=0.665926;TYPE=snp;VARB=-0.0494699;OID=.;OPOS=115298518;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:15:15:10:10:5:5:4:1:4:6:4:1:4:6 chr5 115335543 . G A 127.85 PASS AO=29;DP=60;FAO=29;FDP=60;FR=.;FRO=31;FSAF=5;FSAR=24;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.122687;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.5719;QD=8.52309;RBI=0.123754;REFB=-0.00674439;REVB=0.0162139;RO=30;SAF=5;SAR=24;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.371525;STB=0.720857;TYPE=snp;VARB=0.0110274;OID=.;OPOS=115335543;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:30:31:29:29:24:5:15:15:24:5:16:15 chr5 115336862 . T C 251.67 PASS AO=73;DP=176;FAO=73;FDP=176;FR=.;FRO=103;FSAF=38;FSAR=35;FSRF=51;FSRR=52;FWDB=-0.0242082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.078;QD=5.71986;RBI=0.0259754;REFB=0.00247302;REVB=0.00941709;RO=101;SAF=38;SAR=35;SRF=49;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0367076;STB=0.514869;TYPE=snp;VARB=-0.0021409;OID=.;OPOS=115336862;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:176:101:103:73:73:35:38:49:52:35:38:51:52 chr5 115341611 . G T 723.88 PASS AO=189;DP=418;FAO=186;FDP=399;FR=.;FRO=213;FSAF=61;FSAR=125;FSRF=97;FSRR=116;FWDB=-0.0112512;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.056;QD=7.25698;RBI=0.0122029;REFB=-0.00905452;REVB=0.00472451;RO=227;SAF=61;SAR=128;SRF=100;SRR=127;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126143;STB=0.57327;TYPE=snp;VARB=0.0107877;OID=.;OPOS=115341611;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:418:399:227:213:189:186:128:61:100:127:125:61:97:116 chr5 115341638 . G C 680.17 PASS AO=180;DP=398;FAO=181;FDP=398;FR=.;FRO=217;FSAF=63;FSAR=118;FSRF=96;FSRR=121;FWDB=-0.0172646;FXX=0.0025062;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.9341;QD=6.83591;RBI=0.0192653;REFB=0.00422938;REVB=-0.00854907;RO=216;SAF=63;SAR=117;SRF=95;SRR=121;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0942388;STB=0.554771;TYPE=snp;VARB=-0.00382694;OID=.;OPOS=115341638;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:398:398:216:217:180:181:117:63:95:121:118:63:96:121 chr5 115346245 . T G 364.8 PASS AO=86;DP=177;FAO=87;FDP=178;FR=.;FRO=91;FSAF=41;FSAR=46;FSRF=49;FSRR=42;FWDB=0.0278631;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.249;QD=8.1977;RBI=0.0279494;REFB=-0.0112472;REVB=-0.00219466;RO=90;SAF=41;SAR=45;SRF=48;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0524683;STB=0.534324;TYPE=snp;VARB=0.0157892;OID=.;OPOS=115346245;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:178:90:91:86:87:45:41:48:42:46:41:49:42 chr5 115362148 . A G 359.67 PASS AO=99;DP=229;FAO=99;FDP=227;FR=.;FRO=128;FSAF=50;FSAR=49;FSRF=70;FSRR=58;FWDB=-0.0284595;FXX=0.00873324;HRUN=5;LEN=1;MLLD=68.2873;QD=6.33771;RBI=0.0304379;REFB=-0.0119459;REVB=-0.0107947;RO=126;SAF=50;SAR=49;SRF=69;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0429276;STB=0.523593;TYPE=snp;VARB=0.0153307;OID=.;OPOS=115362148;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:229:227:126:128:99:99:49:50:69:57:49:50:70:58 chr5 115394626 . G A 2039.1 PASS AO=210;DP=218;FAO=213;FDP=213;FR=.;FRO=0;FSAF=114;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149517;FXX=0.044841;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.868;QD=38.293;RBI=0.0267806;REFB=0;REVB=0.0222182;RO=0;SAF=111;SAR=99;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.85394e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000294542;OID=.;OPOS=115394626;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:97:218:213:0:0:210:213:99:111:0:0:99:114:0:0 chr5 115428334 . G T 481.8 PASS AO=135;DP=312;FAO=136;FDP=313;FR=.;FRO=177;FSAF=68;FSAR=68;FSRF=67;FSRR=110;FWDB=-0.0237026;FXX=0.006349;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.896;QD=6.15712;RBI=0.024066;REFB=0.00534698;REVB=0.00416613;RO=177;SAF=69;SAR=66;SRF=67;SRR=110;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135257;STB=0.56868;TYPE=snp;VARB=-0.00797016;OID=.;OPOS=115428334;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:312:313:177:177:135:136:66:69:67:110:68:68:67:110 chr5 115469773 . C T 447.09 PASS AO=115;DP=249;FAO=115;FDP=249;FR=.;FRO=134;FSAF=44;FSAR=71;FSRF=60;FSRR=74;FWDB=-0.0131864;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.212;QD=7.18214;RBI=0.0218974;REFB=-0.0130185;REVB=-0.0174819;RO=133;SAF=44;SAR=71;SRF=59;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.061586;STB=0.536466;TYPE=snp;VARB=0.0184569;OID=.;OPOS=115469773;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:249:249:133:134:115:115:71:44:59:74:71:44:60:74 chr5 115781974 . GTGTGT G 44.25 PASS AO=6;DP=26;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.00741603;FXX=0.437227;HRUN=1;LEN=5;MLLD=184.109;QD=19.6685;RBI=0.00741603;REFB=-0.0147197;REVB=0;RO=3;SAF=6;SAR=0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0159848;OID=.;OPOS=115781975;OREF=TGTGT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:6:11:6:9:3:6:0:3:0:16:3:6:0:3:0 chr5 115813726 . A G 2235.07 PASS AO=235;DP=236;FAO=235;FDP=235;FR=.;FRO=0;FSAF=119;FSAR=116;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.108303;FXX=0.00423711;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.6006;QD=38.0438;RBI=0.110036;REFB=-0.0315575;REVB=-0.0194561;RO=1;SAF=119;SAR=116;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00398817;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000262795;OID=.;OPOS=115813726;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:236:235:1:0:235:235:116:119:1:0:116:119:0:0 chr5 118484804 . G A 247.62 PASS AO=66;DP=150;FAO=66;FDP=150;FR=.;FRO=84;FSAF=36;FSAR=30;FSRF=44;FSRR=40;FWDB=0.00605062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.656;QD=6.60306;RBI=0.00619589;REFB=-0.0118817;REVB=0.00133381;RO=82;SAF=36;SAR=30;SRF=42;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0332311;STB=0.512191;TYPE=snp;VARB=0.0113943;OID=.;OPOS=118484804;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:150:82:84:66:66:30:36:42:40:30:36:44:40 chr5 118669304 . C T 151.75 PASS AO=127;DP=278;FAO=37;FDP=72;FR=.;FRO=35;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=-0.0227138;FXX=0.0399947;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.6706;QD=8.43045;RBI=0.107404;REFB=-0.0281118;REVB=-0.104975;RO=101;SAF=69;SAR=58;SRF=54;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00709444;STB=0.570099;TYPE=snp;VARB=0.0128856;OID=.;OPOS=118669304;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:278:72:101:35:127:37:58:69:54:47:19:18:12:23 chr5 118691784 . T C 225.98 PASS AO=58;DP=129;FAO=58;FDP=129;FR=.;FRO=71;FSAF=32;FSAR=26;FSRF=40;FSRR=31;FWDB=0.0180983;FXX=0.00769172;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.344;QD=7.0071;RBI=0.0321343;REFB=-0.00216051;REVB=-0.026553;RO=71;SAF=32;SAR=26;SRF=40;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116478;STB=0.506491;TYPE=snp;VARB=0.00312678;OID=.;OPOS=118691784;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:71:71:58:58:26:32:40:31:26:32:40:31 chr5 118691832 . C T 177.25 PASS AO=50;DP=129;FAO=52;FDP=128;FR=.;FRO=76;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=40;FSRR=36;FWDB=0.00664596;FXX=0.0303007;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.847;QD=5.5391;RBI=0.0348898;REFB=0.00260474;REVB=0.034251;RO=79;SAF=27;SAR=23;SRF=41;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0227991;STB=0.515619;TYPE=snp;VARB=-0.00345197;OID=.;OPOS=118691832;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:128:79:76:50:52:23:27:41:38:26:26:40:36 chr5 118728953 . G C 135.37 PASS AO=37;DP=92;FAO=38;FDP=93;FR=.;FRO=55;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=32;FWDB=0.00618962;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.961;QD=5.82236;RBI=0.0219489;REFB=-0.0173981;REVB=0.0210581;RO=53;SAF=20;SAR=17;SRF=23;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110517;STB=0.563665;TYPE=snp;VARB=0.0122635;OID=.;OPOS=118728953;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:93:53:55:37:38:17:20:23:30:18:20:23:32 chr5 118729286 . C T 217.77 PASS AO=62;DP=149;FAO=62;FDP=149;FR=.;FRO=87;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=56;FSRR=31;FWDB=0.00590322;FXX=0.00666622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.678;QD=5.84625;RBI=0.00923016;REFB=-0.0107145;REVB=-0.00709562;RO=84;SAF=26;SAR=36;SRF=55;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.238359;STB=0.628847;TYPE=snp;VARB=0.017267;OID=.;OPOS=118729286;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:84:87:62:62:36:26:55:29:36:26:56:31 chr5 118811533 . G A 1378.33 PASS AO=142;DP=146;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100465;FXX=0.101259;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.527;QD=38.8263;RBI=0.0117898;REFB=0;REVB=0.00616989;RO=0;SAF=73;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00327497;OID=.;OPOS=118811533;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:146:142:0:0:142:142:69:73:0:0:69:73:0:0 chr5 118845139 . G A 27.79 PASS AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=11;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.00536111;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.99;QD=10.106;RBI=0.0858303;REFB=-0.0235282;REVB=-0.0856627;RO=6;SAF=4;SAR=1;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.308675;STB=0.694785;TYPE=snp;VARB=0.00429563;OID=.;OPOS=118845139;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:11:11:6:6:5:5:1:4:3:3:1:4:3:3 chr5 118861713 . A G 302.62 PASS AO=67;DP=130;FAO=67;FDP=130;FR=.;FRO=63;FSAF=40;FSAR=27;FSRF=19;FSRR=44;FWDB=0.0117222;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.416;QD=9.31143;RBI=0.0127101;REFB=-0.014936;REVB=0.00491285;RO=62;SAF=40;SAR=27;SRF=19;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.250382;STB=0.640609;TYPE=snp;VARB=0.00829867;OID=.;OPOS=118861713;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:62:63:67:67:27:40:19:43:27:40:19:44 chr5 118945923 . A G 297.88 PASS AO=61;DP=112;FAO=62;FDP=113;FR=.;FRO=51;FSAF=24;FSAR=38;FSRF=21;FSRR=30;FWDB=-0.00704965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.939;QD=10.5443;RBI=0.0318941;REFB=-0.0199596;REVB=-0.0311053;RO=51;SAF=24;SAR=37;SRF=21;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0158736;STB=0.511666;TYPE=snp;VARB=0.0311161;OID=.;OPOS=118945923;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:113:51:51:61:62:37:24:21:30:38:24:21:30 chr5 118969956 . TCCCC TCCC,TCCCT 406.89 PASS AO=18,49;DP=118;FAO=32,58;FDP=113;FR=.;FRO=23;FSAF=24,28;FSAR=8,30;FSRF=4;FSRR=19;FWDB=0.10057,0.0200109;FXX=0.00877116;HRUN=6,6;LEN=1,1;MLLD=5.48419,147.016;QD=14.4032;RBI=0.197616,0.0445859;REFB=-0.078183,-0.012629;REVB=0.17011,0.0398431;RO=24;SAF=15,20;SAR=3,29;SRF=6;SRR=18;SSEN=0.588235,0;SSEP=0.8,0;SSSB=0.579674,0.101523;STB=0.742966,0.588307;TYPE=del,snp;VARB=0.167917,0.00909163;OID=.,.;OPOS=118969957,118969960;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=TCCC,TCCCT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:18,49:108:32,58:113:23:24,28:8,30:4:19:63:24:15,20:3,29:6:18 chr5 118970770 . C T 169.81 PASS AO=40;DP=86;FAO=41;FDP=87;FR=.;FRO=46;FSAF=27;FSAR=14;FSRF=35;FSRR=11;FWDB=0.00162638;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.657;QD=7.80745;RBI=0.029807;REFB=-0.0130768;REVB=0.0297626;RO=46;SAF=26;SAR=14;SRF=35;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122058;STB=0.562512;TYPE=snp;VARB=0.0143227;OID=.;OPOS=118970770;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:87:46:46:40:41:14:26:35:11:14:27:35:11 chr5 120021817 . C A 391.01 PASS AO=69;DP=108;FAO=69;FDP=108;FR=.;FRO=39;FSAF=46;FSAR=23;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=-0.0309342;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=192.579;QD=14.4819;RBI=0.0341774;REFB=-0.00262621;REVB=0.0145316;RO=38;SAF=46;SAR=23;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0445589;STB=0.520542;TYPE=snp;VARB=0.000976305;OID=.;OPOS=120021817;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:38:39:69:69:23:46:23:15:23:46:24:15 chr5 120021819 . G A 943.89 PASS AO=98;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0149612;FXX=0.0196059;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.817;QD=37.7554;RBI=0.0150088;REFB=0;REVB=0.0011937;RO=0;SAF=66;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.98291e-05;OID=.;OPOS=120021819;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:100:100:0:0:98:100:32:66:0:0:33:67:0:0 chr5 121489077 . A G 281.35 PASS AO=70;DP=149;FAO=70;FDP=150;FR=.;FRO=80;FSAF=15;FSAR=55;FSRF=23;FSRR=57;FWDB=0.00231208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.059;QD=7.50257;RBI=0.014934;REFB=-0.0376398;REVB=0.0147539;RO=79;SAF=15;SAR=55;SRF=23;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101561;STB=0.55436;TYPE=snp;VARB=0.0372171;OID=.;OPOS=121489077;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:150:79:80:70:70:55:15:23:56:55:15:23:57 chr5 121518309 . G A 523.18 PASS AO=142;DP=323;FAO=144;FDP=327;FR=.;FRO=183;FSAF=67;FSAR=77;FSRF=73;FSRR=110;FWDB=-0.00207433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.975;QD=6.39971;RBI=0.0161339;REFB=0.000355676;REVB=0.016;RO=181;SAF=66;SAR=76;SRF=73;SRR=108;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.06279;STB=0.537513;TYPE=snp;VARB=-0.000393126;OID=.;OPOS=121518309;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:323:327:181:183:142:144:76:66:73:108:77:67:73:110 chr5 122681834 . C T 2001.54 PASS AO=209;DP=210;FAO=209;FDP=209;FR=.;FRO=0;FSAF=119;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0146083;FXX=0.00947822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.5237;QD=38.3071;RBI=0.0247409;REFB=0;REVB=0.0199677;RO=0;SAF=119;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000407805;OID=.;OPOS=122681834;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:210:209:0:0:209:209:90:119:0:0:90:119:0:0 chr5 122682348 . A G 1337.42 PASS AO=139;DP=140;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0366218;FXX=0.0206882;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.929;QD=37.6738;RBI=0.0402467;REFB=0.170095;REVB=0.0166927;RO=1;SAF=68;SAR=71;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00664964;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000183661;OID=.;OPOS=122682348;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:140:142:1:0:139:142:71:68:0:1:72:70:0:0 chr5 122685727 . C G 670.26 PASS AO=166;DP=345;FAO=166;FDP=345;FR=.;FRO=179;FSAF=84;FSAR=82;FSRF=73;FSRR=106;FWDB=0.00229224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.802;QD=7.77112;RBI=0.0254118;REFB=-0.0154242;REVB=0.0253082;RO=176;SAF=84;SAR=82;SRF=71;SRR=105;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0961133;STB=0.55089;TYPE=snp;VARB=0.0162031;OID=.;OPOS=122685727;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:345:345:176:179:166:166:82:84:71:105:82:84:73:106 chr5 122718736 . G C 3586.96 PASS AO=374;DP=379;FAO=376;FDP=376;FR=.;FRO=0;FSAF=162;FSAR=214;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0309911;FXX=0.00791536;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.6592;QD=38.1591;RBI=0.0363903;REFB=0;REVB=0.0190736;RO=1;SAF=162;SAR=212;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00224568;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000477231;OID=.;OPOS=122718736;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:379:376:1:0:374:376:212:162:0:1:214:162:0:0 chr5 122727026 . G A 1679.54 PASS AO=176;DP=178;FAO=177;FDP=177;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029931;FXX=0.00561766;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.156;QD=37.9556;RBI=0.0299564;REFB=-0.119569;REVB=0.00123285;RO=1;SAF=76;SAR=100;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00473673;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000341323;OID=.;OPOS=122727026;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:178:177:1:0:176:177:100:76:0:1:101:76:0:0 chr5 122739421 . G C 909.04 PASS AO=96;DP=97;FAO=96;FDP=97;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0635055;FXX=0.0202;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.2952;QD=37.4863;RBI=0.064598;REFB=-0.0697563;REVB=0.0118302;RO=1;SAF=34;SAR=62;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0075884;STB=0.503999;TYPE=snp;VARB=0.000548972;OID=.;OPOS=122739421;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:97:97:1:1:96:96:62:34:0:1:62:34:0:1 chr5 122758268 . G C 1848.41 PASS AO=123;DP=200;FAO=192;FDP=192;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=69;FSAR=123;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.212347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.019;QD=38.5086;RBI=0.212357;REFB=0;REVB=-0.0021263;RO=0;SAF=4;SAR=119;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00034495;OID=.;OPOS=122758268;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:187:192:0:0:123:192:119:4:0:0:123:69:0:0 chr5 122950911 . G A 1421.9 PASS AO=148;DP=148;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0221328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.132;QD=38.4296;RBI=0.0275454;REFB=0;REVB=-0.0163979;RO=0;SAF=78;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.10121e-05;OID=.;OPOS=122950911;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:148:148:0:0:148:148:70:78:0:0:70:78:0:0 chr5 123984763 . C T 195.16 PASS AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0619279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.533;QD=37.1732;RBI=0.0623555;REFB=0;REVB=0.0072895;RO=0;SAF=8;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000478978;OID=.;OPOS=123984763;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:21:21:0:0:21:21:13:8:0:0:13:8:0:0 chr5 124044428 . C T 154.33 PASS AO=32;DP=70;FAO=32;FDP=70;FR=.,HEALED;FRO=34;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=-0.0884003;FXX=0.0140825;HRUN=3;LEN=1;MLLD=33.9687;QD=8.81875;RBI=0.0967563;REFB=-0.0713634;REVB=-0.039334;RO=25;SAF=20;SAR=12;SRF=6;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.299633;STB=0.624922;TYPE=snp;VARB=0.0398217;OID=.;OPOS=124044428;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:70:25:34:32:32:12:20:6:19:12:20:13:21 chr5 125696140 . G A 1505.97 PASS AO=156;DP=156;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=114;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0343638;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=283.461;QD=38.3686;RBI=0.0353396;REFB=0;REVB=0.00824707;RO=0;SAF=43;SAR=113;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.88959e-05;OID=.;OPOS=125696140;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:156:157:0:0:156:157:113:43:0:0:114:43:0:0 chr5 125802027 . G A 284.44 PASS AO=63;DP=134;FAO=68;FDP=139;FR=.;FRO=71;FSAF=12;FSAR=56;FSRF=31;FSRR=40;FWDB=0.00066902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.894;QD=8.18531;RBI=0.00277354;REFB=-0.00536329;REVB=0.00269164;RO=70;SAF=8;SAR=55;SRF=30;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.41273;STB=0.676346;TYPE=snp;VARB=0.00551658;OID=.;OPOS=125802027;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:139:70:71:63:68:55:8:30:40:56:12:31:40 chr5 125813450 . GC G 560.18 PASS AO=72;DP=118;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.313409;FXX=0.0341851;HRUN=3;LEN=1;MLLD=10.884;QD=19.8292;RBI=0.369225;REFB=-0.0170414;REVB=0.195197;RO=31;SAF=27;SAR=45;SRF=17;SRR=14;SSEN=0.46988;SSEP=0;SSSB=-0.100521;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0207071;OID=.;OPOS=125813451;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:72:116:113:113:0:50:63:0:0:43:31:27:45:17:14 chr5 125828803 . A G 1816.98 PASS AO=186;DP=187;FAO=194;FDP=194;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=137;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00141263;FXX=0.020201;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.183;QD=37.4635;RBI=0.00790932;REFB=0.00778912;REVB=0.00778214;RO=0;SAF=55;SAR=131;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.86987e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000627288;OID=.;OPOS=125828803;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:187:194:0:0:186:194:131:55:0:0:137:57:0:0 chr5 125939409 . C T 557.97 PASS AO=129;DP=255;FAO=129;FDP=254;FR=.;FRO=125;FSAF=59;FSAR=70;FSRF=46;FSRR=79;FWDB=-0.0128512;FXX=0.00392141;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.005;QD=8.78686;RBI=0.0128763;REFB=-0.019578;REVB=-0.00080314;RO=124;SAF=59;SAR=70;SRF=45;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0859488;STB=0.544631;TYPE=snp;VARB=0.0118574;OID=.;OPOS=125939409;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:255:254:124:125:129:129:70:59:45:79:70:59:46:79 chr5 126171999 . T C 280.31 PASS AO=67;DP=137;FAO=67;FDP=138;FR=.;FRO=71;FSAF=15;FSAR=52;FSRF=16;FSRR=55;FWDB=0.0374301;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.6342;QD=8.12502;RBI=0.0427211;REFB=-0.0235073;REVB=-0.0205933;RO=70;SAF=15;SAR=52;SRF=16;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00621495;STB=0.501088;TYPE=snp;VARB=0.0246604;OID=.;OPOS=126171999;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:138:70:71:67:67:52:15:16:54:52:15:16:55 chr5 126250812 . C T 145.8 PASS AO=35;DP=76;FAO=35;FDP=75;FR=.;FRO=40;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=-0.00284586;FXX=0.0131562;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.621;QD=7.77613;RBI=0.00695393;REFB=-0.010729;REVB=-0.00634494;RO=39;SAF=11;SAR=24;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.221501;STB=0.631501;TYPE=snp;VARB=0.00765897;OID=.;OPOS=126250812;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:75:39:40:35:35:24:11:21:18:24:11:22:18 chr5 126746277 . C T 787.85 PASS AO=86;DP=88;FAO=86;FDP=88;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=64;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0593561;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2312;QD=35.8114;RBI=0.0725648;REFB=0.00764769;REVB=-0.0417433;RO=2;SAF=22;SAR=64;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0137012;STB=0.507235;TYPE=snp;VARB=-0.00171937;OID=.;OPOS=126746277;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:88:88:2:2:86:86:64:22:1:1:64:22:1:1 chr5 126792974 . T A 1682.28 PASS AO=172;DP=172;FAO=175;FDP=175;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.013603;FXX=0.0112988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.221;QD=38.4521;RBI=0.0147915;REFB=0;REVB=0.00580918;RO=0;SAF=88;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.54076e-05;OID=.;OPOS=126792974;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:172:175:0:0:172:175:84:88:0:0:86:89:0:0 chr5 126887569 . G A 172.73 PASS AO=38;DP=76;FAO=39;FDP=77;FR=.;FRO=38;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=-0.0495997;FXX=0.0609682;HRUN=3;LEN=1;MLLD=89.9545;QD=8.97277;RBI=0.0500991;REFB=-0.0421193;REVB=-0.00705607;RO=34;SAF=24;SAR=14;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0653102;STB=0.518819;TYPE=snp;VARB=0.0456185;OID=.;OPOS=126887569;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:77:34:38:38:39:14:24:19:15:15:24:22:16 chr5 126890472 . C T 185.7 PASS AO=45;DP=96;FAO=45;FDP=95;FR=.;FRO=50;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=-0.0129851;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2064;QD=7.81895;RBI=0.0465477;REFB=-0.00231715;REVB=-0.0446998;RO=50;SAF=16;SAR=29;SRF=22;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0845237;STB=0.547148;TYPE=snp;VARB=0.00470412;OID=.;OPOS=126890472;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:95:50:50:45:45:29:16:22:28:29:16:22:28 chr5 126890541 . T C 195.29 PASS AO=32;DP=101;FAO=41;FDP=100;FR=.,HEALED;FRO=52;FSAF=13;FSAR=28;FSRF=21;FSRR=31;FWDB=0.0260042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.084;QD=7.81166;RBI=0.0262057;REFB=-0.00884411;REVB=0.00324345;RO=50;SAF=5;SAR=27;SRF=21;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.369179;STB=0.553783;TYPE=snp;VARB=0.0285198;OID=.;OPOS=126890541;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:50:52:32:41:27:5:21:29:28:13:21:31 chr5 126993249 . G C 939.76 PASS AO=101;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00884879;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2763;QD=37.2181;RBI=0.013317;REFB=0.00355083;REVB=-0.00995198;RO=0;SAF=6;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.41717e-05;OID=.;OPOS=126993249;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:101:101:0:0:101:101:95:6:0:0:95:6:0:0 chr5 126993263 . A T 1262.58 PASS AO=134;DP=135;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0087123;FXX=0.00740686;HRUN=2;LEN=1;MLLD=295.513;QD=37.689;RBI=0.0125822;REFB=0.0159078;REVB=0.00907791;RO=1;SAF=29;SAR=105;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00450617;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.20784e-05;OID=.;OPOS=126993263;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:135:134:1:0:134:134:105:29:0:1:105:29:0:0 chr5 126993838 . A G 220.46 PASS AO=68;DP=170;FAO=67;FDP=169;FR=.;FRO=102;FSAF=31;FSAR=36;FSRF=51;FSRR=51;FWDB=-0.00220533;FXX=0.00588201;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.003;QD=5.21796;RBI=0.00506325;REFB=0.00147851;REVB=-0.00455774;RO=102;SAF=32;SAR=36;SRF=51;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0313946;STB=0.522564;TYPE=snp;VARB=-0.00173095;OID=.;OPOS=126993838;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:169:102:102:68:67:36:32:51:51:36:31:51:51 chr5 126993922 . T C 203.76 PASS AO=64;DP=165;FAO=64;FDP=165;FR=.;FRO=101;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=47;FSRR=54;FWDB=-0.00295755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.8323;QD=4.93973;RBI=0.0170842;REFB=-0.0195661;REVB=0.0168262;RO=101;SAF=32;SAR=32;SRF=47;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0375527;STB=0.521205;TYPE=snp;VARB=0.030985;OID=.;OPOS=126993922;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:165:101:101:64:64:32:32:47:54:32:32:47:54 chr5 126993958 . C T 1154.95 PASS AO=130;DP=136;FAO=130;FDP=136;FR=.;FRO=6;FSAF=59;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.0219691;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=207.806;QD=33.9691;RBI=0.022147;REFB=-0.108595;REVB=0.00280164;RO=6;SAF=59;SAR=71;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0384804;STB=0.520267;TYPE=snp;VARB=0.000469531;OID=.;OPOS=126993958;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:136:136:6:6:130:130:71:59:0:6:71:59:0:6 chr5 127469859 . A G 568.23 PASS AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0252722;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.039;QD=38.5243;RBI=0.0274205;REFB=0;REVB=-0.0106395;RO=0;SAF=21;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.22967e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.79384e-05;OID=.;OPOS=127469859;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:59:59:0:0:59:59:38:21:0:0:38:21:0:0 chr5 127522543 . C T 3695.22 PASS AO=388;DP=391;FAO=391;FDP=391;FR=.;FRO=0;FSAF=186;FSAR=205;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00163744;FXX=0.0101263;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.727;QD=37.8028;RBI=0.0110018;REFB=-0.0356869;REVB=0.0108793;RO=3;SAF=183;SAR=205;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00775811;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.29991e-06;OID=.;OPOS=127522543;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:391:391:3:0:388:391:205:183:3:0:205:186:0:0 chr5 127594328 . T C 1008.56 PASS AO=234;DP=437;FAO=217;FDP=400;FR=.;FRO=183;FSAF=114;FSAR=103;FSRF=103;FSRR=80;FWDB=-0.00895945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.894;QD=10.0856;RBI=0.0112083;REFB=-0.0156618;REVB=0.0067346;RO=203;SAF=125;SAR=109;SRF=113;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192944;STB=0.517227;TYPE=snp;VARB=0.012132;OID=.;OPOS=127594328;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:437:400:203:183:234:217:109:125:113:90:103:114:103:80 chr5 127614472 . A G 1800.99 PASS AO=190;DP=192;FAO=191;FDP=191;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00629558;FXX=0.00520806;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.1189;QD=37.7171;RBI=0.018079;REFB=-0.0415219;REVB=-0.0169474;RO=1;SAF=85;SAR=105;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00556935;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000530716;OID=.;OPOS=127614472;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:192:191:1:0:190:191:105:85:1:0:105:86:0:0 chr5 127625559 . T C 306.18 PASS AO=97;DP=248;FAO=97;FDP=247;FR=.;FRO=150;FSAF=44;FSAR=53;FSRF=83;FSRR=67;FWDB=-0.0176435;FXX=0.0040321;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.6231;QD=4.95843;RBI=0.0217186;REFB=-0.0143121;REVB=0.012665;RO=149;SAF=44;SAR=53;SRF=82;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104069;STB=0.560391;TYPE=snp;VARB=0.0266779;OID=.;OPOS=127625559;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:248:247:149:150:97:97:53:44:82:67:53:44:83:67 chr5 127685135 . C T 1248.4 PASS AO=132;DP=132;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.022986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.62;QD=37.8303;RBI=0.0230096;REFB=0;REVB=-0.00104099;RO=0;SAF=46;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.31915e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.67285e-05;OID=.;OPOS=127685135;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:132:132:0:0:132:132:86:46:0:0:86:46:0:0 chr5 127685624 . C A 378.69 PASS AO=113;DP=275;FAO=113;FDP=275;FR=.;FRO=162;FSAF=55;FSAR=58;FSRF=73;FSRR=89;FWDB=0.000622485;FXX=0.00362306;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.934;QD=5.50824;RBI=0.000750162;REFB=-0.00633881;REVB=0.000418636;RO=161;SAF=55;SAR=58;SRF=73;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0351001;STB=0.521306;TYPE=snp;VARB=0.00782322;OID=.;OPOS=127685624;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:275:275:161:162:113:113:58:55:73:88:58:55:73:89 chr5 128301885 . T G 382.88 PASS AO=98;DP=212;FAO=98;FDP=212;FR=.;FRO=114;FSAF=52;FSAR=46;FSRF=61;FSRR=53;FWDB=0.0170877;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.832;QD=7.22414;RBI=0.0176738;REFB=-0.00798011;REVB=0.00451379;RO=114;SAF=52;SAR=46;SRF=61;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00436698;STB=0.502416;TYPE=snp;VARB=0.0141484;OID=.;OPOS=128301885;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:212:114:114:98:98:46:52:61:53:46:52:61:53 chr5 128301971 . T C 325.91 PASS AO=79;DP=166;FAO=80;FDP=165;FR=.;FRO=85;FSAF=42;FSAR=38;FSRF=44;FSRR=41;FWDB=-0.0360089;FXX=0.00602373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.4895;QD=7.90085;RBI=0.0398841;REFB=-0.0404131;REVB=0.0171493;RO=81;SAF=42;SAR=37;SRF=39;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0461068;STB=0.503795;TYPE=snp;VARB=0.0657869;OID=.;OPOS=128301971;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:165:81:85:79:80:37:42:39:42:38:42:44:41 chr5 128430757 . T C 73.53 PASS AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.00221639;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.638;QD=7.94915;RBI=0.0234476;REFB=-0.000494368;REVB=-0.0233426;RO=20;SAF=4;SAR=13;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136756;STB=0.578848;TYPE=snp;VARB=0.000322142;OID=.;OPOS=128430757;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:37:37:20:20:17:17:13:4:7:13:13:4:7:13 chr5 128863471 . A G 1466.33 PASS AO=152;DP=152;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00259188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.709;QD=38.0864;RBI=0.0358634;REFB=0;REVB=-0.0357697;RO=0;SAF=51;SAR=101;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.64646e-05;OID=.;OPOS=128863471;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:152:154:0:0:152:154:101:51:0:0:103:51:0:0 chr5 129072943 . G T 1153.65 PASS AO=119;DP=120;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103169;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0287;QD=38.1373;RBI=0.0368705;REFB=0;REVB=0.0353977;RO=1;SAF=29;SAR=90;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0160942;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000296673;OID=.;OPOS=129072943;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:120:121:1:0:119:121:90:29:1:0:90:31:0:0 chr5 129521126 . A G 189.65 PASS AO=57;DP=143;FAO=57;FDP=143;FR=.;FRO=86;FSAF=19;FSAR=38;FSRF=25;FSRR=61;FWDB=0.00247224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.555;QD=5.30489;RBI=0.00587863;REFB=0.0033038;REVB=-0.00533351;RO=83;SAF=19;SAR=38;SRF=24;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0535239;STB=0.529402;TYPE=snp;VARB=-0.00568845;OID=.;OPOS=129521126;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:83:86:57:57:38:19:24:59:38:19:25:61 chr5 130766662 . T C 1530.7 PASS AO=158;DP=158;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00601108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.872;QD=38.5082;RBI=0.0179759;REFB=0;REVB=0.0169411;RO=0;SAF=72;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.4078e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.33702e-05;OID=.;OPOS=130766662;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:158:159:0:0:158:159:86:72:0:0:86:73:0:0 chr5 130808198 . T C 1477.8 PASS AO=153;DP=153;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0248474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.986;QD=38.1369;RBI=0.0263772;REFB=0;REVB=-0.0088524;RO=0;SAF=82;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6227e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.64347e-05;OID=.;OPOS=130808198;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:153:155:0:0:153:155:71:82:0:0:72:83:0:0 chr5 130979332 . A G 907.38 PASS AO=68;DP=103;FAO=97;FDP=98;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=61;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00459755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.534;QD=37.0357;RBI=0.104963;REFB=-0.0273512;REVB=0.104863;RO=1;SAF=56;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0377568;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00154812;OID=.;OPOS=130979332;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:96:98:1:0:68:97:12:56:0:1:36:61:0:0 chr5 131008194 . T C 808.33 PASS AO=84;DP=84;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00634635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.712;QD=38.0391;RBI=0.00824541;REFB=0;REVB=0.00526409;RO=0;SAF=33;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.09613e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.01625e-06;OID=.;OPOS=131008194;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:84:85:0:0:84:85:51:33:0:0:51:34:0:0 chr5 131013476 . AT A 44.7 PASS AO=19;DP=73;FAO=25;FDP=62;FR=.;FRO=37;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=24;FSRR=13;FWDB=0.08872;FXX=0.0461467;HRUN=5;LEN=1;MLLD=13.2879;QD=2.88403;RBI=0.142921;REFB=-0.0409929;REVB=-0.11205;RO=33;SAF=4;SAR=15;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.447871;STB=0.719824;TYPE=del;VARB=0.0794815;OID=.;OPOS=131013477;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:19:63:25:62:37:7:18:24:13:44:33:4:15:20:13 chr5 131066725 . C A 1577.71 PASS AO=166;DP=168;FAO=166;FDP=166;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0286032;FXX=0.0119041;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.914;QD=38.0171;RBI=0.0294349;REFB=-0.052645;REVB=0.0069478;RO=0;SAF=67;SAR=99;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.1834e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000149579;OID=.;OPOS=131066725;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:168:166:0:0:166:166:99:67:0:0:99:67:0:0 chr5 131322494 . C T 1381.08 PASS AO=147;DP=149;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0341568;FXX=0.0134219;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.572;QD=37.5803;RBI=0.0346483;REFB=0.0405978;REVB=0.00581478;RO=2;SAF=84;SAR=63;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111881;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.29921e-05;OID=.;OPOS=131322494;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:149:147:2:0:147:147:63:84:2:0:63:84:0:0 chr5 131324250 . C CTG,G 762.41 PASS AO=51,37;DP=102;FAO=54,37;FDP=96;FR=.;FRO=5;FSAF=11,37;FSAR=43,0;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.00641155,0.00257984;FXX=0.0303;HRUN=1,3;LEN=2,1;MLLD=177.426,69.8941;QD=31.7669;RBI=0.0183055,0.00266718;REFB=0.020962,-0.00598762;REVB=-0.0171459,0.000676984;RO=11;SAF=9,37;SAR=42,0;SRF=10;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.320985,0.86382;STB=0.571274,0.99946;TYPE=ins,snp;VARB=0.00638107,0.0166721;OID=.,.;OPOS=131324251,131324250;OREF=-,C;OALT=TG,G;OMAPALT=CTG,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:102:96:11:5:51,37:54,37:42,0:9,37:10:1:43,0:11,37:4:1 chr5 131602182 . GCCCCT GCCCT,GCCCTG 66.41 PASS AO=8,3;DP=17;FAO=11,1;FDP=18;FR=.;FRO=6;FSAF=4,0;FSAR=7,1;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0717005,-0.0361512;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,2;MLLD=16.8781,15.8375;QD=14.7569;RBI=0.134426,0.0532277;REFB=-0.0899211,-0.052498;REVB=0.113707,0.0390677;RO=7;SAF=2,1;SAR=6,2;SRF=5;SRR=2;SSEN=0.665025,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.379034,-0.371415;STB=0.608495,0.9915;TYPE=del,mnp;VARB=0.086918,0.0235646;OID=.,.;OPOS=131602183,131602186;OREF=C,CT;OALT=-,TG;OMAPALT=GCCCT,GCCCTG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:8,3:18:11,1:18:6:4,0:7,1:4:2:17:7:2,1:6,2:5:2 chr5 131663062 . T C 300.15 PASS AO=82;DP=188;FAO=82;FDP=188;FR=.;FRO=106;FSAF=36;FSAR=46;FSRF=47;FSRR=59;FWDB=-0.00140425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.0416;QD=6.38613;RBI=0.00249669;REFB=-0.0114;REVB=0.00206435;RO=106;SAF=36;SAR=46;SRF=47;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00448848;STB=0.5025;TYPE=snp;VARB=0.0154845;OID=.;OPOS=131663062;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:188:106:106:82:82:46:36:47:59:46:36:47:59 chr5 131670546 . C G 402.72 PASS AO=104;DP=227;FAO=104;FDP=226;FR=.;FRO=122;FSAF=58;FSAR=46;FSRF=64;FSRR=58;FWDB=-0.00871199;FXX=0.00440509;HRUN=3;LEN=1;MLLD=193.002;QD=7.12781;RBI=0.00872687;REFB=-0.00770939;REVB=-0.00050929;RO=120;SAF=58;SAR=46;SRF=63;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0319644;STB=0.518032;TYPE=snp;VARB=0.00744444;OID=.;OPOS=131670546;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:227:226:120:122:104:104:46:58:63:57:46:58:64:58 chr5 131701279 . T C 245.18 PASS AO=54;DP=105;FAO=54;FDP=104;FR=.;FRO=50;FSAF=22;FSAR=32;FSRF=21;FSRR=29;FWDB=-0.016347;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.501;QD=9.42998;RBI=0.0171723;REFB=0.00257675;REVB=0.0052597;RO=50;SAF=22;SAR=32;SRF=21;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0113431;STB=0.506252;TYPE=snp;VARB=-0.00320551;OID=.;OPOS=131701279;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:104:50:50:54:54:32:22:21:29:32:22:21:29 chr5 131721174 . A G 48.47 PASS AO=19;DP=64;FAO=19;FDP=64;FR=.;FRO=45;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=28;FWDB=0.0568277;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.999;QD=3.02951;RBI=0.0695962;REFB=-0.0245747;REVB=-0.0401776;RO=42;SAF=6;SAR=13;SRF=16;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0837931;STB=0.548571;TYPE=snp;VARB=0.0507693;OID=.;OPOS=131721174;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:64:64:42:45:19:19:13:6:16:26:13:6:17:28 chr5 131731304 . A T 281.56 PASS AO=51;DP=82;FAO=51;FDP=82;FR=.;FRO=31;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=0.0702044;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.37;QD=13.7347;RBI=0.0702597;REFB=-0.00504904;REVB=0.00278598;RO=31;SAF=18;SAR=33;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0257317;STB=0.514013;TYPE=snp;VARB=0.00287707;OID=.;OPOS=131731304;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:31:31:51:51:33:18:12:19:33:18:12:19 chr5 131755651 . C T 158.61 PASS AO=34;DP=65;FAO=34;FDP=65;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.011849;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.069;QD=9.76053;RBI=0.011901;REFB=-0.00237889;REVB=0.0011116;RO=30;SAF=14;SAR=20;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159097;STB=0.580715;TYPE=snp;VARB=0.00217499;OID=.;OPOS=131755651;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:30:31:34:34:20:14:18:12:20:14:18:13 chr5 131796498 . T C 593.89 PASS AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.061141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.081;QD=37.7072;RBI=0.0611461;REFB=0;REVB=-0.000789856;RO=0;SAF=15;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.88845e-05;OID=.;OPOS=131796498;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:62:63:0:0:62:63:47:15:0:0:48:15:0:0 chr5 131803868 . A G 33.19 PASS AO=10;DP=31;FAO=10;FDP=31;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.0132197;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.6703;QD=4.28318;RBI=0.0943436;REFB=0.00279205;REVB=0.0934128;RO=20;SAF=2;SAR=8;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.368419;STB=0.742333;TYPE=snp;VARB=-0.00669746;OID=.;OPOS=131803868;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:31:31:20:21:10:10:8:2:10:10:8:2:11:10 chr5 131805735 . C T 542.88 PASS AO=99;DP=158;FAO=99;FDP=159;FR=.;FRO=60;FSAF=55;FSAR=44;FSRF=33;FSRR=27;FWDB=0.0243404;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=164.406;QD=13.6574;RBI=0.0243409;REFB=-0.00223442;REVB=-0.000147003;RO=59;SAF=55;SAR=44;SRF=33;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00263609;STB=0.502121;TYPE=snp;VARB=0.00126164;OID=.;OPOS=131805735;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:159:59:60:99:99:44:55:33:26:44:55:33:27 chr5 131819126 . C T 211.19 PASS AO=46;DP=90;FAO=46;FDP=90;FR=.;FRO=44;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=-0.0329994;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.2779;QD=9.38608;RBI=0.0335229;REFB=0.00614519;REVB=-0.00590132;RO=43;SAF=21;SAR=25;SRF=19;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.01293;STB=0.51219;TYPE=snp;VARB=-0.00539309;OID=.;OPOS=131819126;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:43:44:46:46:25:21:19:24:25:21:19:25 chr5 131822055 . T C 230.14 PASS AO=35;DP=50;FAO=35;FDP=49;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=26;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0441693;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.3353;QD=18.7871;RBI=0.084723;REFB=-0.0569957;REVB=0.0722983;RO=13;SAF=9;SAR=26;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0795538;STB=0.536061;TYPE=snp;VARB=0.0155507;OID=.;OPOS=131822055;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:50:49:13:14:35:35:26:9:5:8:26:9:5:9 chr5 131822072 . A G 128.96 PASS AO=18;DP=28;FAO=21;FDP=31;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=0.04805;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.1444;QD=16.6397;RBI=0.0498653;REFB=0.00999059;REVB=0.0133321;RO=10;SAF=4;SAR=14;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0209076;STB=0.549954;TYPE=snp;VARB=-0.0137222;OID=.;OPOS=131822072;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:28:31:10:10:18:21:14:4:2:8:14:7:2:8 chr5 131822133 . T C 64.84 PASS AO=11;DP=20;FAO=13;FDP=23;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0195501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.871;QD=11.2764;RBI=0.0196009;REFB=-0.0420626;REVB=-0.00141078;RO=9;SAF=5;SAR=6;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.249998;STB=0.602495;TYPE=snp;VARB=0.0409171;OID=.;OPOS=131822133;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:20:23:9:10:11:13:6:5:7:2:7:6:7:3 chr5 131822224 . T C 32.58 PASS AO=9;DP=26;FAO=9;FDP=26;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=0.00278666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.325;QD=5.01286;RBI=0.0140554;REFB=-0.00222156;REVB=0.0137764;RO=16;SAF=2;SAR=7;SRF=13;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.574782;STB=0.826118;TYPE=snp;VARB=0.00217052;OID=.;OPOS=131822224;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:26:26:16:17:9:9:7:2:13:3:7:2:13:4 chr5 131892357 . C T 584.23 PASS AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0334407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7863;QD=37.6921;RBI=0.0760054;REFB=0;REVB=0.0682535;RO=0;SAF=26;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51662e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00121606;OID=.;OPOS=131892357;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:62:62:0:0:62:62:36:26:0:0:36:26:0:0 chr5 131995964 . A G 158.29 PASS AO=39;DP=89;FAO=40;FDP=89;FR=.;FRO=49;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=28;FSRR=21;FWDB=0.027773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.509;QD=7.11396;RBI=0.031684;REFB=-0.00477562;REVB=0.0152491;RO=49;SAF=16;SAR=23;SRF=28;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159782;STB=0.594547;TYPE=snp;VARB=0.00524455;OID=.;OPOS=131995964;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:49:49:39:40:23:16:28:21:24:16:28:21 chr5 131996500 . A C 65.17 PASS AO=15;DP=44;FAO=19;FDP=48;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=0.00480926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.893;QD=5.43052;RBI=0.00494536;REFB=-0.0191408;REVB=0.0011522;RO=26;SAF=13;SAR=2;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.449192;STB=0.651997;TYPE=snp;VARB=0.0279236;OID=.;OPOS=131996500;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:44:48:26:29:15:19:2:13:14:12:4:15:17:12 chr5 132030414 . T A 133.99 PASS AO=34;DP=75;FAO=34;FDP=76;FR=.;FRO=42;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=28;FWDB=0.050313;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6642;QD=7.05219;RBI=0.0511272;REFB=0.00186712;REVB=-0.00908817;RO=41;SAF=20;SAR=14;SRF=14;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.236797;STB=0.638219;TYPE=snp;VARB=-0.00230642;OID=.;OPOS=132030414;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:76:41:42:34:34:14:20:14:27:14:20:14:28 chr5 132031972 . T C 107.27 PASS AO=32;DP=83;FAO=32;FDP=84;FR=.;FRO=52;FSAF=9;FSAR=23;FSRF=12;FSRR=40;FWDB=-0.0252932;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=42.3969;QD=5.10792;RBI=0.0329211;REFB=-0.0110706;REVB=-0.0210726;RO=51;SAF=9;SAR=23;SRF=12;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0633052;STB=0.539976;TYPE=snp;VARB=0.0290682;OID=.;OPOS=132031972;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:84:51:52:32:32:23:9:12:39:23:9:12:40 chr5 132042146 . C T 625.62 PASS AO=144;DP=305;FAO=153;FDP=313;FR=.;FRO=160;FSAF=61;FSAR=92;FSRF=52;FSRR=108;FWDB=-0.00173096;FXX=0.00318461;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.985;QD=7.99518;RBI=0.0334247;REFB=-0.0188868;REVB=0.0333799;RO=157;SAF=61;SAR=83;SRF=49;SRR=108;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110543;STB=0.539913;TYPE=snp;VARB=0.0180747;OID=.;OPOS=132042146;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:305:313:157:160:144:153:83:61:49:108:92:61:52:108 chr5 132098242 . A G 1557.5 PASS AO=163;DP=164;FAO=163;FDP=163;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020994;FXX=0.00609719;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.9133;QD=38.221;RBI=0.0213396;REFB=0;REVB=0.0038246;RO=0;SAF=92;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000111065;OID=.;OPOS=132098242;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:164:163:0:0:163:163:71:92:0:0:71:92:0:0 chr5 132099999 . A G 408.84 PASS AO=75;DP=121;FAO=75;FDP=121;FR=.;FRO=46;FSAF=31;FSAR=44;FSRF=30;FSRR=16;FWDB=-0.0388198;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.202;QD=13.5152;RBI=0.0389226;REFB=-0.0380174;REVB=-0.00282665;RO=45;SAF=31;SAR=44;SRF=29;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159963;STB=0.590645;TYPE=snp;VARB=0.0137141;OID=.;OPOS=132099999;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:45:46:75:75:44:31:29:16:44:31:30:16 chr5 132150948 . T G 1220.12 PASS AO=136;DP=141;FAO=136;FDP=141;FR=.;FRO=5;FSAF=34;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0276669;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=146.657;QD=34.6133;RBI=0.0276678;REFB=-0.0301816;REVB=0.000229128;RO=5;SAF=34;SAR=102;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0227308;STB=0.51196;TYPE=snp;VARB=0.000154087;OID=.;OPOS=132150948;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:141:141:5:5:136:136:102:34:0:5:102:34:0:5 chr5 132198199 . G A 234.98 PASS AO=53;DP=105;FAO=53;FDP=105;FR=.;FRO=52;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=28;FSRR=24;FWDB=-0.0046054;FXX=0.00943307;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.13;QD=8.95165;RBI=0.0194825;REFB=-0.026208;REVB=0.0189304;RO=52;SAF=24;SAR=29;SRF=28;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0767931;STB=0.54243;TYPE=snp;VARB=0.022302;OID=.;OPOS=132198199;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:52:52:53:53:29:24:28:24:29:24:28:24 chr5 132220748 . C T 290.29 PASS AO=83;DP=199;FAO=83;FDP=197;FR=.;FRO=114;FSAF=35;FSAR=48;FSRF=49;FSRR=65;FWDB=-0.00733126;FXX=0.0100497;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.479;QD=5.89423;RBI=0.0549812;REFB=-0.0040498;REVB=0.0544903;RO=114;SAF=35;SAR=48;SRF=49;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00862376;STB=0.504819;TYPE=snp;VARB=0.00614808;OID=.;OPOS=132220748;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:199:197:114:114:83:83:48:35:49:65:48:35:49:65 chr5 132408967 . G A 185.24 PASS AO=53;DP=130;FAO=53;FDP=129;FR=.;FRO=76;FSAF=15;FSAR=38;FSRF=31;FSRR=45;FWDB=-0.0379907;FXX=0.00769172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.883;QD=5.74391;RBI=0.0525645;REFB=0.00276335;REVB=0.0363281;RO=76;SAF=15;SAR=38;SRF=31;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148451;STB=0.583996;TYPE=snp;VARB=-0.00399092;OID=.;OPOS=132408967;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:129:76:76:53:53:38:15:31:45:38:15:31:45 chr5 133186592 . G A 273.3 PASS AO=32;DP=34;FAO=32;FDP=34;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0352718;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8012;QD=32.1525;RBI=0.0567555;REFB=-0.120938;REVB=0.0444644;RO=2;SAF=20;SAR=12;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145609;STB=0.507808;TYPE=snp;VARB=0.00825122;OID=.;OPOS=133186592;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:34:34:2:2:32:32:12:20:1:1:12:20:1:1 chr5 133186603 . A C 327.65 PASS AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00956833;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.865;QD=37.4458;RBI=0.078694;REFB=0;REVB=-0.0781102;RO=0;SAF=21;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.27896e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000357523;OID=.;OPOS=133186603;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:35:35:0:0:35:35:14:21:0:0:14:21:0:0 chr5 133459424 . C T 138.39 PASS AO=32;DP=66;FAO=32;FDP=66;FR=.;FRO=34;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=-0.00305887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.3066;QD=8.38725;RBI=0.0221493;REFB=-0.013267;REVB=0.021937;RO=34;SAF=20;SAR=12;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218141;STB=0.512188;TYPE=snp;VARB=0.0141361;OID=.;OPOS=133459424;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:34:34:32:32:12:20:22:12:12:20:22:12 chr5 133477802 . C T 320.3 PASS AO=97;DP=243;FAO=98;FDP=243;FR=.;FRO=145;FSAF=44;FSAR=54;FSRF=68;FSRR=77;FWDB=0.00128696;FXX=0.00409819;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.528;QD=5.27249;RBI=0.0563646;REFB=-0.0180656;REVB=-0.0563499;RO=144;SAF=44;SAR=53;SRF=67;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125259;STB=0.512019;TYPE=snp;VARB=0.0255307;OID=.;OPOS=133477802;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:243:243:144:145:97:98:53:44:67:77:54:44:68:77 chr5 133481467 . G A 374.75 PASS AO=80;DP=148;FAO=80;FDP=149;FR=.;FRO=69;FSAF=36;FSAR=44;FSRF=26;FSRR=43;FWDB=0.0251485;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.292;QD=10.0604;RBI=0.0268161;REFB=-0.0135335;REVB=-0.00930896;RO=68;SAF=36;SAR=44;SRF=26;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.057793;STB=0.534463;TYPE=snp;VARB=0.0134835;OID=.;OPOS=133481467;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:149:68:69:80:80:44:36:26:42:44:36:26:43 chr5 133747354 . C G 94.19 PASS AO=16;DP=25;FAO=16;FDP=25;FR=.;FRO=9;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.0461142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.171;QD=15.0701;RBI=0.0468107;REFB=-0.00759881;REVB=0.00804485;RO=9;SAF=10;SAR=6;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10851;STB=0.560367;TYPE=snp;VARB=0.00150904;OID=.;OPOS=133747354;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:25:25:9:9:16:16:6:10:7:2:6:10:7:2 chr5 133861426 . G T 78.55 PASS AO=31;DP=72;FAO=35;FDP=85;FR=.;FRO=50;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=35;FWDB=0.0426221;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=17.0055;QD=3.69631;RBI=0.122798;REFB=-0.11103;REVB=-0.115164;RO=15;SAF=15;SAR=16;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108852;STB=0.578904;TYPE=snp;VARB=0.149007;OID=.;OPOS=133861426;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:66:85:15:50:31:35:16:15:10:5:20:15:15:35 chr5 133898000 . GC G 271.7 PASS AO=34;DP=50;FAO=46;FDP=48;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.262488;FXX=0.039992;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.0812;QD=22.6412;RBI=0.39431;REFB=-0.0260629;REVB=0.294245;RO=12;SAF=19;SAR=15;SRF=6;SRR=6;SSEN=0.375;SSEP=0;SSSB=0.0285757;STB=0.519222;TYPE=del;VARB=0.0311719;OID=.;OPOS=133898001;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:34:49:46:48:2:25:21:2:0:17:12:19:15:6:6 chr5 133909475 . G A 128.44 PASS AO=40;DP=106;FAO=40;FDP=105;FR=.;FRO=65;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=30;FSRR=35;FWDB=0.0193973;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.3965;QD=4.89285;RBI=0.023247;REFB=-0.0219818;REVB=-0.0128128;RO=65;SAF=22;SAR=18;SRF=30;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0960257;STB=0.554682;TYPE=snp;VARB=0.0367782;OID=.;OPOS=133909475;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:105:65:65:40:40:18:22:30:35:18:22:30:35 chr5 133956668 . G A 456.03 PASS AO=115;DP=231;FAO=112;FDP=228;FR=.;FRO=116;FSAF=49;FSAR=63;FSRF=48;FSRR=68;FWDB=0.0115736;FXX=0.0172406;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.012;QD=8.00048;RBI=0.0122575;REFB=-0.00785785;REVB=0.00403723;RO=116;SAF=52;SAR=63;SRF=48;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0355656;STB=0.512288;TYPE=snp;VARB=0.0124033;OID=.;OPOS=133956668;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:231:228:116:116:115:112:63:52:48:68:63:49:48:68 chr5 134235613 . A C 367.33 PASS AO=105;DP=248;FAO=105;FDP=248;FR=.;FRO=143;FSAF=42;FSAR=63;FSRF=75;FSRR=68;FWDB=-0.00233419;FXX=0.0040159;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.951;QD=5.92461;RBI=0.00749977;REFB=-0.0138304;REVB=0.00712727;RO=139;SAF=42;SAR=63;SRF=74;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136695;STB=0.57258;TYPE=snp;VARB=0.0256218;OID=.;OPOS=134235613;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:248:248:139:143:105:105:63:42:74:65:63:42:75:68 chr5 134262271 . C A 345.79 PASS AO=89;DP=193;FAO=89;FDP=193;FR=.;FRO=104;FSAF=43;FSAR=46;FSRF=46;FSRR=58;FWDB=-0.00576777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.6418;QD=7.16661;RBI=0.0322251;REFB=-0.0350126;REVB=-0.0317047;RO=103;SAF=43;SAR=46;SRF=45;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0449626;STB=0.522059;TYPE=snp;VARB=0.0403767;OID=.;OPOS=134262271;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:193:103:104:89:89:46:43:45:58:46:43:46:58 chr5 134343661 . C T 330.95 PASS AO=61;DP=101;FAO=61;FDP=100;FR=.;FRO=39;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=0.0142235;FXX=0.00990001;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.213;QD=13.2381;RBI=0.0142402;REFB=-0.00787222;REVB=-0.000690477;RO=38;SAF=28;SAR=33;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.027063;STB=0.509088;TYPE=snp;VARB=0.00567161;OID=.;OPOS=134343661;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:100:38:39:61:61:33:28:16:22:33:28:17:22 chr5 134573448 . G A 226.46 PASS AO=52;DP=102;FAO=52;FDP=104;FR=.;FRO=52;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=27;FSRR=25;FWDB=-0.00872735;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.7888;QD=8.70985;RBI=0.0348406;REFB=-0.00737603;REVB=-0.0337298;RO=50;SAF=29;SAR=23;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0337447;STB=0.519395;TYPE=snp;VARB=0.0067495;OID=.;OPOS=134573448;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:104:50:52:52:52:23:29:26:24:23:29:27:25 chr5 134678863 . G A 243.32 PASS AO=53;DP=108;FAO=55;FDP=108;FR=.;FRO=53;FSAF=22;FSAR=33;FSRF=31;FSRR=22;FWDB=-0.00150328;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.161;QD=9.012;RBI=0.0303912;REFB=-0.0124205;REVB=0.030354;RO=52;SAF=22;SAR=31;SRF=30;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14522;STB=0.591045;TYPE=snp;VARB=0.0102373;OID=.;OPOS=134678863;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:52:53:53:55:31:22:30:22:33:22:31:22 chr5 134986196 . C T 73 PASS AO=23;DP=63;FAO=23;FDP=64;FR=.;FRO=41;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=28;FWDB=-0.0106926;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.242;QD=4.56229;RBI=0.012957;REFB=-0.00867439;REVB=0.00731798;RO=39;SAF=8;SAR=15;SRF=13;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0174831;STB=0.521984;TYPE=snp;VARB=0.0137702;OID=.;OPOS=134986196;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:63:64:39:41:23:23:15:8:13:26:15:8:13:28 chr5 135178124 . T C 624.31 PASS AO=69;DP=71;FAO=69;FDP=71;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0255475;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.8268;QD=35.1726;RBI=0.101057;REFB=-0.019273;REVB=0.0977749;RO=1;SAF=27;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171851;STB=0.503208;TYPE=snp;VARB=0.00225701;OID=.;OPOS=135178124;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:71:71:1:2:69:69:42:27:1:0:42:27:1:1 chr5 135207382 . C T 107.8 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126758;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.7279;QD=35.9326;RBI=0.0423388;REFB=0;REVB=0.0403968;RO=0;SAF=8;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000970601;OID=.;OPOS=135207382;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:4:8:0:0:4:8:0:0 chr5 135223713 . G T 120.48 PASS AO=31;DP=75;FAO=32;FDP=76;FR=.;FRO=44;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=34;FSRR=10;FWDB=-0.00477717;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=337.476;QD=6.34089;RBI=0.0160948;REFB=-0.000394397;REVB=0.0153695;RO=43;SAF=17;SAR=14;SRF=33;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234868;STB=0.627514;TYPE=snp;VARB=0.000984715;OID=.;OPOS=135223713;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:76:43:44:31:32:14:17:33:10:14:18:34:10 chr5 135258105 . G A 380.87 PASS AO=85;DP=162;FAO=85;FDP=164;FR=.;FRO=79;FSAF=27;FSAR=58;FSRF=37;FSRR=42;FWDB=0.0189576;FXX=0.0409333;HRUN=4;LEN=1;MLLD=154.803;QD=9.28953;RBI=0.0235381;REFB=-0.00687972;REVB=0.0139517;RO=77;SAF=27;SAR=58;SRF=35;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129439;STB=0.578895;TYPE=snp;VARB=0.00781435;OID=.;OPOS=135258105;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:164:77:79:85:85:58:27:35:42:58:27:37:42 chr5 135272373 . C CA 300.72 PASS AO=127;DP=271;FAO=130;FDP=265;FR=.;FRO=135;FSAF=65;FSAR=65;FSRF=76;FSRR=59;FWDB=0.112593;FXX=0.0257343;HRUN=2;LEN=1;MLLD=18.9603;QD=4.53923;RBI=0.113236;REFB=-0.0778111;REVB=-0.0120507;RO=143;SAF=64;SAR=63;SRF=84;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0802828;STB=0.532071;TYPE=ins;VARB=0.09476;OID=.;OPOS=135272374;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:127:271:130:265:135:65:65:76:59:99:143:64:63:84:59 chr5 135276201 . AGTT A 247.48 PASS AO=49;DP=119;FAO=58;FDP=118;FR=.;FRO=60;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=34;FSRR=26;FWDB=-0.0131601;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=239.856;QD=8.3893;RBI=0.0132351;REFB=-0.00838841;REVB=-0.0014065;RO=45;SAF=26;SAR=23;SRF=27;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0607135;STB=0.525196;TYPE=del;VARB=0.00905313;OID=.;OPOS=135276202;OREF=GTT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:49:115:58:118:60:30:28:34:26:99:45:26:23:27:18 chr5 135276314 . C T 212.49 PASS AO=57;DP=132;FAO=57;FDP=130;FR=.;FRO=73;FSAF=13;FSAR=44;FSRF=30;FSRR=43;FWDB=0.000146596;FXX=0.0151504;HRUN=3;LEN=1;MLLD=207.683;QD=6.53816;RBI=0.0115216;REFB=-0.000720629;REVB=0.0115207;RO=72;SAF=13;SAR=44;SRF=30;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228123;STB=0.62582;TYPE=snp;VARB=0.000838112;OID=.;OPOS=135276314;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:130:72:73:57:57:44:13:30:42:44:13:30:43 chr5 135276847 . T C 857.43 PASS AO=198;DP=391;FAO=200;FDP=393;FR=.;FRO=193;FSAF=78;FSAR=122;FSRF=80;FSRR=113;FWDB=-0.031202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.68;QD=8.72702;RBI=0.0320824;REFB=-0.00976531;REVB=-0.00746427;RO=190;SAF=78;SAR=120;SRF=77;SRR=113;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0105943;STB=0.512577;TYPE=snp;VARB=0.0119525;OID=.;OPOS=135276847;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:391:393:190:193:198:200:120:78:77:113:122:78:80:113 chr5 135282630 . C T 265.65 PASS AO=80;DP=193;FAO=79;FDP=194;FR=.;FRO=115;FSAF=43;FSAR=36;FSRF=51;FSRR=64;FWDB=-0.00173291;FXX=0.0102036;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.674;QD=5.47739;RBI=0.00521577;REFB=-0.0016297;REVB=0.00491948;RO=110;SAF=43;SAR=37;SRF=47;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113773;STB=0.559589;TYPE=snp;VARB=0.00192563;OID=.;OPOS=135282630;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:194:110:115:80:79:37:43:47:63:36:43:51:64 chr5 135287029 . T C 283.57 PASS AO=70;DP=155;FAO=72;FDP=156;FR=.;FRO=84;FSAF=45;FSAR=27;FSRF=54;FSRR=30;FWDB=-0.0279376;FXX=0.00636902;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.86;QD=7.27101;RBI=0.0334553;REFB=0.0084341;REVB=0.018405;RO=82;SAF=45;SAR=25;SRF=52;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00918725;STB=0.510306;TYPE=snp;VARB=-0.0102389;OID=.;OPOS=135287029;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:156:82:84:70:72:25:45:52:30:27:45:54:30 chr5 135508381 . A G 469.31 PASS AO=121;DP=262;FAO=121;FDP=262;FR=.;FRO=141;FSAF=44;FSAR=77;FSRF=79;FSRR=62;FWDB=-0.024952;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.366;QD=7.16502;RBI=0.0261835;REFB=-0.012576;REVB=0.00793563;RO=141;SAF=44;SAR=77;SRF=79;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194511;STB=0.607604;TYPE=snp;VARB=0.0135101;OID=.;OPOS=135508381;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:262:262:141:141:121:121:77:44:79:62:77:44:79:62 chr5 135513085 . T TC 2393.35 PASS AO=250;DP=255;FAO=251;FDP=251;FR=.;FRO=0;FSAF=145;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.039032;FXX=0.0118106;HRUN=0;LEN=1;MLLD=85.1931;QD=38.1411;RBI=0.0563894;REFB=0;REVB=-0.0406973;RO=2;SAF=145;SAR=105;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00652906;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=8.13477e-05;OID=.;OPOS=135513086;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:250:255:251:251:0:145:106:0:0:99:2:145:105:2:0 chr5 135514055 . A G 339.59 PASS AO=84;DP=173;FAO=84;FDP=178;FR=.;FRO=94;FSAF=36;FSAR=48;FSRF=53;FSRR=41;FWDB=-0.0194451;FXX=0.0165737;HRUN=4;LEN=1;MLLD=138.811;QD=7.63125;RBI=0.0516055;REFB=-0.0327329;REVB=-0.0478018;RO=89;SAF=36;SAR=48;SRF=49;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114018;STB=0.571412;TYPE=snp;VARB=0.0301799;OID=.;OPOS=135514055;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:178:89:94:84:84:48:36:49:40:48:36:53:41 chr5 135514216 . A G 338 PASS AO=84;DP=178;FAO=84;FDP=178;FR=.;FRO=94;FSAF=27;FSAR=57;FSRF=29;FSRR=65;FWDB=0.0417221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.5006;QD=7.59541;RBI=0.0455077;REFB=-0.0105147;REVB=-0.0181718;RO=94;SAF=27;SAR=57;SRF=29;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0142262;STB=0.507861;TYPE=snp;VARB=0.0112179;OID=.;OPOS=135514216;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:178:94:94:84:84:57:27:29:65:57:27:29:65 chr5 135522879 . T A 270.13 PASS AO=71;DP=158;FAO=71;FDP=158;FR=.;FRO=87;FSAF=30;FSAR=41;FSRF=52;FSRR=35;FWDB=-0.0246231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.176;QD=6.8388;RBI=0.0246288;REFB=0.00287214;REVB=-0.000529076;RO=84;SAF=30;SAR=41;SRF=49;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156492;STB=0.595861;TYPE=snp;VARB=-0.00199582;OID=.;OPOS=135522879;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:158:84:87:71:71:41:30:49:35:41:30:52:35 chr5 135692575 . G A 180.86 PASS AO=31;DP=49;FAO=33;FDP=54;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=27;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0221744;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=84.1995;QD=13.397;RBI=0.0510608;REFB=-0.0174526;REVB=0.0459946;RO=16;SAF=6;SAR=25;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207139;STB=0.633712;TYPE=snp;VARB=0.0137634;OID=.;OPOS=135692575;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:49:54:16:21:31:33:25:6:7:9:27:6:9:12 chr5 136313330 . A AG 923.66 PASS AO=127;DP=185;FAO=184;FDP=184;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.156699;FXX=0.00540511;HRUN=4;LEN=1;MLLD=10.4243;QD=20.0795;RBI=0.280292;REFB=0;REVB=0.232399;RO=36;SAF=68;SAR=59;SRF=9;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117999;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00443899;OID=.;OPOS=136313331;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:127:185:184:184:0:79:105:0:0:83:36:68:59:9:27 chr5 137028029 . T C 1135.11 PASS AO=119;DP=121;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0445397;FXX=0.0165276;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.6374;QD=38.155;RBI=0.0578406;REFB=0;REVB=0.0369019;RO=0;SAF=70;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0618e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000265773;OID=.;OPOS=137028029;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:121:119:0:0:119:119:49:70:0:0:49:70:0:0 chr5 137144441 . G A 342.94 PASS AO=83;DP=172;FAO=83;FDP=172;FR=.;FRO=89;FSAF=48;FSAR=35;FSRF=35;FSRR=54;FWDB=0.0118102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.048;QD=7.97527;RBI=0.104435;REFB=-0.0235356;REVB=0.103765;RO=89;SAF=48;SAR=35;SRF=35;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172627;STB=0.595212;TYPE=snp;VARB=0.0278285;OID=.;OPOS=137144441;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:172:89:89:83:83:35:48:35:54:35:48:35:54 chr5 137206560 . A C 963.12 PASS AO=95;DP=102;FAO=111;FDP=115;FR=.;FRO=4;FSAF=40;FSAR=71;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.129286;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=35.377;QD=33.4999;RBI=0.129687;REFB=-0.243726;REVB=-0.0101892;RO=6;SAF=27;SAR=68;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0732125;STB=0.514577;TYPE=snp;VARB=0.0204529;OID=.;OPOS=137206560;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:102:115:6:4:95:111:68:27:5:1:71:40:3:1 chr5 137244517 . G A 431.86 PASS AO=106;DP=222;FAO=106;FDP=221;FR=.;FRO=115;FSAF=42;FSAR=64;FSRF=48;FSRR=67;FWDB=-0.0213801;FXX=0.00896821;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.292;QD=7.8164;RBI=0.0251044;REFB=0.00820505;REVB=0.0131576;RO=112;SAF=42;SAR=64;SRF=48;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0312961;STB=0.511452;TYPE=snp;VARB=-0.00974911;OID=.;OPOS=137244517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:221:112:115:106:106:64:42:48:64:64:42:48:67 chr5 137259179 . T C 3626.37 PASS AO=380;DP=385;FAO=395;FDP=395;FR=.;FRO=0;FSAF=148;FSAR=247;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0489198;FXX=0.00503766;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.2928;QD=36.7227;RBI=0.0610389;REFB=0;REVB=0.0365048;RO=1;SAF=144;SAR=236;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00201791;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00303966;OID=.;OPOS=137259179;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:385:395:1:0:380:395:236:144:0:1:247:148:0:0 chr5 137347498 . G A 1738.25 PASS AO=182;DP=182;FAO=182;FDP=182;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0162331;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.498;QD=38.2033;RBI=0.0372859;REFB=0;REVB=0.0335667;RO=0;SAF=87;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.35428e-05;OID=.;OPOS=137347498;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:82:182:182:0:0:182:182:95:87:0:0:95:87:0:0 chr5 137372207 . A T 1249.77 PASS AO=130;DP=130;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0218507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.878;QD=38.1608;RBI=0.0434586;REFB=0;REVB=0.0375659;RO=0;SAF=85;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.75105e-05;OID=.;OPOS=137372207;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:130:131:0:0:130:131:45:85:0:0:46:85:0:0 chr5 137426447 . G A 65.51 PASS AO=16;DP=37;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=5;FWDB=-0.0184791;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.722;QD=7.08195;RBI=0.0224278;REFB=-0.0190927;REVB=0.0127093;RO=21;SAF=12;SAR=4;SRF=16;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0157703;STB=0.50908;TYPE=snp;VARB=0.0173943;OID=.;OPOS=137426447;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:37:37:21:21:16:16:4:12:16:5:4:12:16:5 chr5 137476416 . T C 1712.34 PASS AO=184;DP=188;FAO=184;FDP=187;FR=.;FRO=3;FSAF=106;FSAR=78;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0877791;FXX=0.00531887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.4276;QD=36.6277;RBI=0.090597;REFB=-0.00998666;REVB=0.0224198;RO=3;SAF=106;SAR=78;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0132824;STB=0.506976;TYPE=snp;VARB=0.000446508;OID=.;OPOS=137476416;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:188:187:3:3:184:184:78:106:3:0:78:106:3:0 chr5 137523318 . A G 115.26 PASS AO=30;DP=70;FAO=30;FDP=70;FR=.;FRO=40;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=14;FSRR=26;FWDB=0.00567154;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=208.883;QD=6.58654;RBI=0.0103817;REFB=-0.0145278;REVB=-0.00869555;RO=40;SAF=11;SAR=19;SRF=14;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0182122;STB=0.510302;TYPE=snp;VARB=0.0209131;OID=.;OPOS=137523318;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:40:40:30:30:19:11:14:26:19:11:14:26 chr5 137665323 . G A 94.04 PASS AO=29;DP=85;FAO=31;FDP=84;FR=.;FRO=53;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=30;FWDB=-0.0434764;FXX=0.0232531;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.3085;QD=4.47814;RBI=0.0435283;REFB=-0.00836453;REVB=0.00212501;RO=46;SAF=13;SAR=16;SRF=18;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0622262;STB=0.531567;TYPE=snp;VARB=0.00394445;OID=.;OPOS=137665323;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:85:84:46:53:29:31:16:13:18:28:16:15:23:30 chr5 137708434 . C T 484.55 PASS AO=125;DP=271;FAO=125;FDP=271;FR=.;FRO=146;FSAF=58;FSAR=67;FSRF=80;FSRR=66;FWDB=0.00410872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.803;QD=7.15205;RBI=0.00681685;REFB=-0.0219232;REVB=0.00543948;RO=145;SAF=58;SAR=67;SRF=79;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0785091;STB=0.545158;TYPE=snp;VARB=0.020967;OID=.;OPOS=137708434;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:271:271:145:146:125:125:67:58:79:66:67:58:80:66 chr5 137717265 . G A 1502.88 PASS AO=154;DP=158;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0442119;FXX=0.00624961;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.271;QD=37.8083;RBI=0.0491727;REFB=0;REVB=-0.0215234;RO=2;SAF=71;SAR=83;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.01321;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00018696;OID=.;OPOS=137717265;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:158:159:2:0:154:159:83:71:2:0:84:75:0:0 chr5 137754695 . T C 596.93 PASS AO=119;DP=206;FAO=119;FDP=206;FR=.;FRO=87;FSAF=25;FSAR=94;FSRF=18;FSRR=69;FWDB=-0.00272436;FXX=0.00483068;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.3238;QD=11.5908;RBI=0.0121655;REFB=-0.0141062;REVB=-0.0118566;RO=87;SAF=25;SAR=94;SRF=18;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0037458;STB=0.502032;TYPE=snp;VARB=0.00815542;OID=.;OPOS=137754695;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:206:206:87:87:119:119:94:25:18:69:94:25:18:69 chr5 137782335 . G A 169.22 PASS AO=36;DP=69;FAO=36;FDP=69;FR=.;FRO=33;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.0124396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.6556;QD=9.80975;RBI=0.0144912;REFB=-0.0213285;REVB=0.00743313;RO=33;SAF=20;SAR=16;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0351064;STB=0.51947;TYPE=snp;VARB=0.0169968;OID=.;OPOS=137782335;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:33:33:36:36:16:20:17:16:16:20:17:16 chr5 137892170 . G A 386.81 PASS AO=81;DP=152;FAO=83;FDP=154;FR=.;FRO=71;FSAF=45;FSAR=38;FSRF=28;FSRR=43;FWDB=-0.0420985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.376;QD=10.0469;RBI=0.042645;REFB=-0.0272514;REVB=-0.00680496;RO=71;SAF=43;SAR=38;SRF=28;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116028;STB=0.567829;TYPE=snp;VARB=0.0192457;OID=.;OPOS=137892170;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:154:71:71:81:83:38:43:28:43:38:45:28:43 chr5 137902339 . T C 531.52 PASS AO=124;DP=246;FAO=125;FDP=250;FR=.;FRO=125;FSAF=59;FSAR=66;FSRF=57;FSRR=68;FWDB=0.00473879;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=166.302;QD=8.50435;RBI=0.00566758;REFB=-0.00713126;REVB=0.00310892;RO=121;SAF=59;SAR=65;SRF=56;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.011744;STB=0.508031;TYPE=snp;VARB=0.00596548;OID=.;OPOS=137902339;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:246:250:121:125:124:125:65:59:56:65:66:59:57:68 chr5 138208441 . A G 274.65 PASS AO=75;DP=175;FAO=76;FDP=176;FR=.;FRO=100;FSAF=35;FSAR=41;FSRF=35;FSRR=65;FWDB=0.00581177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.792;QD=6.24198;RBI=0.00605043;REFB=-0.00184073;REVB=0.00168256;RO=100;SAF=35;SAR=40;SRF=35;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121327;STB=0.563813;TYPE=snp;VARB=0.00278074;OID=.;OPOS=138208441;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:176:100:100:75:76:40:35:35:65:41:35:35:65 chr5 138221989 . G C 349.04 PASS AO=85;DP=178;FAO=85;FDP=177;FR=.;FRO=92;FSAF=30;FSAR=55;FSRF=35;FSRR=57;FWDB=0.0199768;FXX=0.00561766;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.5015;QD=7.88796;RBI=0.039181;REFB=-0.021539;REVB=0.0337058;RO=92;SAF=30;SAR=55;SRF=35;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0280528;STB=0.515497;TYPE=snp;VARB=0.0194981;OID=.;OPOS=138221989;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:177:92:92:85:85:55:30:35:57:55:30:35:57 chr5 138266546 . G A 243.46 PASS AO=40;DP=60;FAO=40;FDP=60;FR=.;FRO=20;FSAF=32;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=3;FWDB=0.012112;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.299;QD=16.2307;RBI=0.0214959;REFB=-0.02233;REVB=0.0177588;RO=20;SAF=32;SAR=8;SRF=17;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0495409;STB=0.526869;TYPE=snp;VARB=0.0118815;OID=.;OPOS=138266546;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:60:60:20:20:40:40:8:32:17:3:8:32:17:3 chr5 138270291 . T TATC 235.64 PASS AO=69;DP=170;FAO=69;FDP=169;FR=.;FRO=100;FSAF=37;FSAR=32;FSRF=53;FSRR=47;FWDB=-0.0196959;FXX=0.00588201;HRUN=1;LEN=3;MLLD=232.526;QD=5.57737;RBI=0.0216715;REFB=-0.0172836;REVB=-0.00904028;RO=100;SAF=37;SAR=32;SRF=53;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00659695;STB=0.503704;TYPE=ins;VARB=0.0209272;OID=.;OPOS=138270292;OREF=-;OALT=ATC;OMAPALT=TATC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:69:170:69:169:100:37:32:53:47:99:100:37:32:53:47 chr5 138270542 . T A 339.05 PASS AO=95;DP=222;FAO=95;FDP=221;FR=.;FRO=126;FSAF=34;FSAR=61;FSRF=47;FSRR=79;FWDB=-0.00460603;FXX=0.0045043;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.3945;QD=6.13666;RBI=0.00850514;REFB=0.00639538;REVB=0.00714995;RO=126;SAF=34;SAR=61;SRF=47;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0167344;STB=0.509327;TYPE=snp;VARB=-0.00863715;OID=.;OPOS=138270542;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:221:126:126:95:95:61:34:47:79:61:34:47:79 chr5 138456815 . T C 1584.1 PASS AO=166;DP=169;FAO=166;FDP=166;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157277;FXX=0.0177504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.236;QD=38.1711;RBI=0.0354947;REFB=-0.00203749;REVB=0.0318201;RO=1;SAF=88;SAR=78;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00537746;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000142841;OID=.;OPOS=138456815;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:169:166:1:0:166:166:78:88:1:0:78:88:0:0 chr5 138632030 . G T 266.38 PASS AO=64;DP=135;FAO=64;FDP=132;FR=.;FRO=68;FSAF=17;FSAR=47;FSRF=31;FSRR=37;FWDB=-0.0308949;FXX=0.0222206;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.494;QD=8.07226;RBI=0.0328669;REFB=-0.00495421;REVB=-0.0112134;RO=63;SAF=17;SAR=47;SRF=27;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170302;STB=0.612341;TYPE=snp;VARB=0.00608089;OID=.;OPOS=138632030;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:132:63:68:64:64:47:17:27:36:47:17:31:37 chr5 138665756 . G A 366.28 PASS AO=88;DP=187;FAO=90;FDP=189;FR=.;FRO=99;FSAF=39;FSAR=51;FSRF=50;FSRR=49;FWDB=-0.0145375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.445;QD=7.75194;RBI=0.0413076;REFB=-0.00854328;REVB=0.038665;RO=99;SAF=38;SAR=50;SRF=50;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0706513;STB=0.537852;TYPE=snp;VARB=0.0155553;OID=.;OPOS=138665756;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:189:99:99:88:90:50:38:50:49:51:39:50:49 chr5 138705188 . C CATT 2289.16 PASS AO=272;DP=322;FAO=282;FDP=312;FR=.;FRO=30;FSAF=150;FSAR=132;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.00162503;FXX=0.0280365;HRUN=1;LEN=3;MLLD=267.058;QD=29.3482;RBI=0.00543197;REFB=0.00390424;REVB=-0.0051832;RO=32;SAF=149;SAR=123;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00927463;STB=0.503356;TYPE=ins;VARB=-0.000129668;OID=.;OPOS=138705189;OREF=-;OALT=ATT;OMAPALT=CATT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:272:322:282:312:30:150:132:17:13:4:32:149:123:19:13 chr5 138713959 . A C 201.65 PASS AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0164874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.701;QD=36.6631;RBI=0.0670472;REFB=0;REVB=0.0649884;RO=0;SAF=6;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000765617;OID=.;OPOS=138713959;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:21:22:0:0:21:22:15:6:0:0:16:6:0:0 chr5 138720108 . C T 100.83 PASS AO=22;DP=44;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=0.0662633;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6893;QD=9.16612;RBI=0.163163;REFB=0.0511751;REVB=0.149102;RO=22;SAF=10;SAR=12;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199884;STB=0.612146;TYPE=snp;VARB=-0.0429032;OID=.;OPOS=138720108;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:44:44:22:22:22:22:12:10:15:7:12:10:15:7 chr5 138720156 . C T 102.69 PASS AO=35;DP=100;FAO=35;FDP=100;FR=.;FRO=65;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=30;FSRR=35;FWDB=-0.00171936;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.332;QD=4.10754;RBI=0.0296804;REFB=-0.0224808;REVB=0.0296305;RO=63;SAF=19;SAR=16;SRF=30;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0745046;STB=0.552737;TYPE=snp;VARB=0.0448018;OID=.;OPOS=138720156;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:63:65:35:35:16:19:30:33:16:19:30:35 chr5 138728483 . A G 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00912242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.8862;QD=33.022;RBI=0.0743185;REFB=0;REVB=-0.0737565;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00762476;OID=.;OPOS=138728483;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:5:0:0:1:5:0:0 chr5 138728533 . C T 39.46 PASS AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.105285;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7776;QD=15.7833;RBI=0.106063;REFB=-0.0256848;REVB=-0.0128233;RO=4;SAF=5;SAR=1;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0921951;STB=0.555356;TYPE=snp;VARB=0.0265088;OID=.;OPOS=138728533;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:10:10:4:4:6:6:1:5:3:1:1:5:3:1 chr5 138732579 . C T 164.19 PASS AO=42;DP=96;FAO=42;FDP=94;FR=.;FRO=52;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=36;FSRR=16;FWDB=0.004274;FXX=0.0309246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.665;QD=6.98658;RBI=0.0232488;REFB=-0.0114921;REVB=0.0228525;RO=54;SAF=21;SAR=21;SRF=37;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186368;STB=0.606335;TYPE=snp;VARB=0.0157714;OID=.;OPOS=138732579;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:94:54:52:42:42:21:21:37:17:21:21:36:16 chr5 138773090 . A G 184.18 PASS AO=51;DP=121;FAO=51;FDP=121;FR=.;FRO=70;FSAF=10;FSAR=41;FSRF=9;FSRR=61;FWDB=-0.0620216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.468;QD=6.08857;RBI=0.062073;REFB=-0.0257415;REVB=0.00252536;RO=69;SAF=10;SAR=41;SRF=9;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11611;STB=0.566958;TYPE=snp;VARB=0.0328384;OID=.;OPOS=138773090;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:69:70:51:51:41:10:9:60:41:10:9:61 chr5 138856982 . C T 196.9 PASS AO=39;DP=70;FAO=39;FDP=70;FR=.;FRO=31;FSAF=33;FSAR=6;FSRF=25;FSRR=6;FWDB=0.046019;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.596;QD=11.2514;RBI=0.049702;REFB=-0.0137443;REVB=0.018776;RO=31;SAF=33;SAR=6;SRF=25;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0583025;STB=0.532241;TYPE=snp;VARB=0.0103166;OID=.;OPOS=138856982;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:31:31:39:39:6:33:25:6:6:33:25:6 chr5 138857919 . T C 2413.9 PASS AO=257;DP=263;FAO=259;FDP=259;FR=.;FRO=0;FSAF=115;FSAR=144;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00203493;FXX=0.0152085;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.645;QD=37.2803;RBI=0.0342876;REFB=-0.118931;REVB=0.0342272;RO=1;SAF=114;SAR=143;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00332216;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000104104;OID=.;OPOS=138857919;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:92:263:259:1:0:257:259:143:114:0:1:144:115:0:0 chr5 138857925 . C G 534.3 PASS AO=131;DP=270;FAO=131;FDP=272;FR=.;FRO=141;FSAF=65;FSAR=66;FSRF=55;FSRR=86;FWDB=0.027491;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.207;QD=7.85738;RBI=0.0277337;REFB=-0.0148755;REVB=0.00366101;RO=139;SAF=65;SAR=66;SRF=54;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101021;STB=0.555048;TYPE=snp;VARB=0.0133535;OID=.;OPOS=138857925;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:270:272:139:141:131:131:66:65:54:85:66:65:55:86 chr5 138861078 . C T 81.97 PASS AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.0134651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.194;QD=8.86201;RBI=0.0338627;REFB=-0.024137;REVB=-0.0310704;RO=19;SAF=11;SAR=7;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0788358;STB=0.544841;TYPE=snp;VARB=0.019763;OID=.;OPOS=138861078;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:37:37:19:19:18:18:7:11:10:9:7:11:10:9 chr5 138861146 . C G 112.27 PASS AO=26;DP=58;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=22;FWDB=-0.0073076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.115;QD=7.61143;RBI=0.0235617;REFB=0.0192649;REVB=-0.0223998;RO=31;SAF=7;SAR=19;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0628721;STB=0.53625;TYPE=snp;VARB=-0.0208436;OID=.;OPOS=138861146;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:59:31:32:26:27:19:7:10:21:20:7:10:22 chr5 139060569 . T C 15.55 PASS AO=3;DP=8;FAO=3;FDP=8;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.00102418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.051;QD=7.77512;RBI=0.00102418;REFB=-0.0107901;REVB=0;RO=5;SAF=3;SAR=0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0135688;OID=.;OPOS=139060569;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:8:8:5:5:3:3:0:3:5:0:0:3:5:0 chr5 139097627 . A C 115.41 PASS AO=37;DP=104;FAO=38;FDP=104;FR=.;FRO=66;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=34;FSRR=32;FWDB=0.0282942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.3543;QD=4.43873;RBI=0.0316192;REFB=0.0013258;REVB=-0.0141144;RO=65;SAF=21;SAR=16;SRF=33;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0670109;STB=0.523918;TYPE=snp;VARB=-0.00237725;OID=.;OPOS=139097627;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:65:66:37:38:16:21:33:32:17:21:34:32 chr5 139216744 . C T 79.37 PASS AO=18;DP=35;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=0.106059;FXX=0.0285633;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.4196;QD=9.33818;RBI=0.129504;REFB=-0.0134505;REVB=-0.0743141;RO=17;SAF=10;SAR=8;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187418;STB=0.619587;TYPE=snp;VARB=0.0146691;OID=.;OPOS=139216744;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:35:34:17:17:18:17:8:10:13:4:8:9:13:4 chr5 139217320 . G C 272.7 PASS AO=71;DP=148;FAO=68;FDP=146;FR=.;FRO=78;FSAF=27;FSAR=41;FSRF=51;FSRR=27;FWDB=-0.00646418;FXX=0.0135126;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.97;QD=7.4712;RBI=0.016573;REFB=-0.0146173;REVB=-0.0152603;RO=76;SAF=30;SAR=41;SRF=50;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217585;STB=0.635241;TYPE=snp;VARB=0.0308065;OID=.;OPOS=139217320;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:146:76:78:71:68:41:30:50:26:41:27:51:27 chr5 139422232 . G A 104.78 PASS AO=23;DP=46;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.0694033;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.442;QD=9.1113;RBI=0.0707772;REFB=-0.0428945;REVB=0.0138779;RO=23;SAF=9;SAR=14;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117974;STB=0.566415;TYPE=snp;VARB=0.0236775;OID=.;OPOS=139422232;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:23:23:23:23:14:9:12:11:14:9:12:11 chr5 139496174 . TC T 318.51 PASS AO=122;DP=272;FAO=124;FDP=266;FR=.;FRO=142;FSAF=58;FSAR=66;FSRF=80;FSRR=62;FWDB=-0.00621071;FXX=0.0184495;HRUN=2;LEN=1;MLLD=27.1917;QD=4.78961;RBI=0.110508;REFB=0.0167019;REVB=-0.110333;RO=132;SAF=56;SAR=66;SRF=73;SRR=59;SSEN=0.227205;SSEP=0;SSSB=-0.0886205;STB=0.550923;TYPE=del;VARB=-0.0216061;OID=.;OPOS=139496175;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:122:268:124:266:142:58:66:80:62:99:132:56:66:73:59 chr5 139713761 . G A 376.95 PASS AO=86;DP=171;FAO=87;FDP=171;FR=.;FRO=84;FSAF=19;FSAR=68;FSRF=29;FSRR=55;FWDB=-0.0510739;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.7122;QD=8.81764;RBI=0.051442;REFB=-0.0102504;REVB=0.00614303;RO=84;SAF=19;SAR=67;SRF=29;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146667;STB=0.582733;TYPE=snp;VARB=0.0121105;OID=.;OPOS=139713761;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:171:84:84:86:87:67:19:29:55:68:19:29:55 chr5 139745154 . T C 245.71 PASS AO=62;DP=135;FAO=62;FDP=134;FR=.;FRO=72;FSAF=37;FSAR=25;FSRF=60;FSRR=12;FWDB=-0.0155578;FXX=0.00740686;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.346;QD=7.33468;RBI=0.0192228;REFB=0.0068982;REVB=0.0112903;RO=70;SAF=37;SAR=25;SRF=58;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24495;STB=0.639128;TYPE=snp;VARB=-0.00445935;OID=.;OPOS=139745154;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:134:70:72:62:62:25:37:58:12:25:37:60:12 chr5 139936760 . G T 74 PASS AO=12;DP=19;FAO=12;FDP=19;FR=.;FRO=7;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.0244631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.61;QD=15.5779;RBI=0.0596658;REFB=-0.0104552;REVB=-0.0544203;RO=6;SAF=8;SAR=4;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116132;STB=0.519967;TYPE=snp;VARB=0.00361418;OID=.;OPOS=139936760;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:19:19:6:7:12:12:4:8:5:1:4:8:5:2 chr5 139936980 . A G 56.39 PASS AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.00951705;FXX=0.0384468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.784;QD=9.02198;RBI=0.0465757;REFB=-0.0247036;REVB=-0.045593;RO=13;SAF=9;SAR=3;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.403987;STB=0.734295;TYPE=snp;VARB=0.0181106;OID=.;OPOS=139936980;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:25:25:13:13:12:12:3:9:4:9:3:9:4:9 chr5 139940233 . G A 249.67 PASS AO=43;DP=142;FAO=65;FDP=144;FR=.;FRO=79;FSAF=44;FSAR=21;FSRF=58;FSRR=21;FWDB=0.00159331;FXX=0.00689608;HRUN=4;LEN=1;MLLD=131.079;QD=6.93519;RBI=0.0051852;REFB=-0.00610628;REVB=0.00493434;RO=60;SAF=43;SAR=0;SRF=54;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.806029;STB=0.536831;TYPE=snp;VARB=0.00558479;OID=.;OPOS=139940233;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:144:60:79:43:65:0:43:54:6:21:44:58:21 chr5 139941228 . A G 612.49 PASS AO=67;DP=71;FAO=72;FDP=75;FR=.;FRO=3;FSAF=37;FSAR=35;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.00416492;FXX=0.0131562;HRUN=4;LEN=1;MLLD=97.4979;QD=32.666;RBI=0.0173328;REFB=-0.0659354;REVB=0.0168249;RO=4;SAF=37;SAR=30;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0213034;STB=0.519475;TYPE=snp;VARB=0.000911947;OID=.;OPOS=139941228;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:71:75:4:3:67:72:30:37:3:1:35:37:3:0 chr5 140048209 . T C 408.34 PASS AO=99;DP=204;FAO=99;FDP=204;FR=.;FRO=105;FSAF=45;FSAR=54;FSRF=65;FSRR=40;FWDB=0.0143928;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.5211;QD=8.00659;RBI=0.0184974;REFB=-0.0172948;REVB=0.011619;RO=102;SAF=45;SAR=54;SRF=63;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149565;STB=0.584054;TYPE=snp;VARB=0.0198477;OID=.;OPOS=140048209;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:204:102:105:99:99:54:45:63:39:54:45:65:40 chr5 140048267 . T C 1343.4 PASS AO=139;DP=140;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0123634;FXX=0.00704176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.229;QD=38.1106;RBI=0.0482612;REFB=0;REVB=0.0466508;RO=0;SAF=89;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.60883e-05;OID=.;OPOS=140048267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:140:141:0:0:139:141:50:89:0:0:52:89:0:0 chr5 140048707 . A G 333.72 PASS AO=80;DP=161;FAO=80;FDP=161;FR=.;FRO=81;FSAF=45;FSAR=35;FSRF=35;FSRR=46;FWDB=-0.00741576;FXX=0.00617246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.4726;QD=8.29125;RBI=0.0224341;REFB=-0.0118298;REVB=-0.021173;RO=81;SAF=45;SAR=35;SRF=35;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119016;STB=0.565538;TYPE=snp;VARB=0.00857415;OID=.;OPOS=140048707;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:161:81:81:80:80:35:45:35:46:35:45:35:46 chr5 140075474 . C T 335.84 PASS AO=76;DP=149;FAO=76;FDP=149;FR=.;FRO=73;FSAF=29;FSAR=47;FSRF=27;FSRR=46;FWDB=-0.0181458;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.1625;QD=9.01586;RBI=0.0366654;REFB=-0.0109556;REVB=-0.0318604;RO=72;SAF=29;SAR=47;SRF=26;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192989;STB=0.506097;TYPE=snp;VARB=0.0126765;OID=.;OPOS=140075474;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:72:73:76:76:47:29:26:46:47:29:27:46 chr5 140167463 . C T 52.68 PASS AO=11;DP=23;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0218014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.8254;QD=9.16258;RBI=0.0393299;REFB=-0.0812577;REVB=0.0327345;RO=12;SAF=5;SAR=6;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0343697;STB=0.519964;TYPE=snp;VARB=0.0432432;OID=.;OPOS=140167463;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:23:23:12:12:11:11:6:5:5:7:6:5:5:7 chr5 140168070 . A G 68.41 PASS AO=12;DP=21;FAO=12;FDP=21;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.045893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.4303;QD=13.0305;RBI=0.0774366;REFB=0.0210252;REVB=-0.062372;RO=9;SAF=4;SAR=8;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253577;STB=0.644916;TYPE=snp;VARB=-0.0384141;OID=.;OPOS=140168070;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:21:21:9:9:12:12:8:4:6:3:8:4:6:3 chr5 140168151 . G T 119.32 PASS AO=28;DP=60;FAO=28;FDP=60;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=0.0292041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.167;QD=7.9544;RBI=0.0320127;REFB=0.000183279;REVB=-0.0131124;RO=32;SAF=19;SAR=9;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.263666;STB=0.648672;TYPE=snp;VARB=-0.00011597;OID=.;OPOS=140168151;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:32:32:28:28:9:19:13:19:9:19:13:19 chr5 140174622 . G A 112.13 PASS AO=21;DP=36;FAO=21;FDP=36;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0759654;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.5532;QD=12.4591;RBI=0.0763495;REFB=0.0362713;REVB=-0.00764896;RO=15;SAF=6;SAR=15;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152712;STB=0.5855;TYPE=snp;VARB=-0.0216051;OID=.;OPOS=140174622;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:36:36:15:15:21:21:15:6:7:8:15:6:7:8 chr5 140174865 . G C 153.07 PASS AO=44;DP=108;FAO=44;FDP=108;FR=.;FRO=64;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=43;FSRR=21;FWDB=-0.0013709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.9839;QD=5.66922;RBI=0.0151079;REFB=-0.0196676;REVB=0.0150455;RO=64;SAF=24;SAR=20;SRF=43;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136134;STB=0.576559;TYPE=snp;VARB=0.0411073;OID=.;OPOS=140174865;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:64:64:44:44:20:24:43:21:20:24:43:21 chr5 140181734 . A G 275.88 PASS AO=60;DP=114;FAO=60;FDP=114;FR=.;FRO=54;FSAF=44;FSAR=16;FSRF=28;FSRR=26;FWDB=-0.00638661;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=88.7262;QD=9.68012;RBI=0.015257;REFB=-0.0419122;REVB=-0.0138559;RO=54;SAF=44;SAR=16;SRF=28;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209761;STB=0.615959;TYPE=snp;VARB=0.0290604;OID=.;OPOS=140181734;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:54:54:60:60:16:44:28:26:16:44:28:26 chr5 140181892 . T C 276.41 PASS AO=54;DP=108;FAO=62;FDP=118;FR=.;FRO=56;FSAF=37;FSAR=25;FSRF=24;FSRR=32;FWDB=-0.0083749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.639;QD=9.36981;RBI=0.0109788;REFB=-0.035509;REVB=0.00709903;RO=53;SAF=37;SAR=17;SRF=24;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218987;STB=0.580326;TYPE=snp;VARB=0.0295191;OID=.;OPOS=140181892;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:118:53:56:54:62:17:37:24:29:25:37:24:32 chr5 140182101 . G T 65.44 PASS AO=15;DP=35;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0492844;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.8018;QD=7.69843;RBI=0.0493681;REFB=-0.0292801;REVB=-0.00287234;RO=18;SAF=9;SAR=6;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148075;STB=0.571332;TYPE=snp;VARB=0.039862;OID=.;OPOS=140182101;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:35:34:18:19:15:15:6:9:8:10:6:9:9:10 chr5 140183058 . G A 98.25 PASS AO=23;DP=50;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=-0.0518281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.6379;QD=7.86032;RBI=0.0560489;REFB=-0.0143979;REVB=-0.0213385;RO=27;SAF=8;SAR=15;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0611233;STB=0.534678;TYPE=snp;VARB=0.0176441;OID=.;OPOS=140183058;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:50:50:27:27:23:23:15:8:11:16:15:8:11:16 chr5 140187048 . G C 35.59 PASS AO=12;DP=39;FAO=12;FDP=39;FR=.;FRO=27;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=9;FWDB=0.0200993;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=178.988;QD=3.65036;RBI=0.026181;REFB=0.000391342;REVB=0.0167769;RO=27;SAF=5;SAR=7;SRF=18;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.279931;STB=0.667787;TYPE=snp;VARB=-0.000239892;OID=.;OPOS=140187048;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:39:39:27:27:12:12:7:5:18:9:7:5:18:9 chr5 140187102 . A G 93.91 PASS AO=27;DP=69;FAO=27;FDP=69;FR=.;FRO=42;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=27;FSRR=15;FWDB=-0.0132197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.859;QD=5.44403;RBI=0.0209312;REFB=-0.00685888;REVB=-0.0162282;RO=40;SAF=9;SAR=18;SRF=25;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.303483;STB=0.685579;TYPE=snp;VARB=0.0151433;OID=.;OPOS=140187102;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:69:69:40:42:27:27:18:9:25:15:18:9:27:15 chr5 140187322 . C T 206.67 PASS AO=60;DP=146;FAO=61;FDP=151;FR=.;FRO=90;FSAF=44;FSAR=17;FSRF=45;FSRR=45;FWDB=-0.011811;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.151;QD=5.47476;RBI=0.0119275;REFB=-0.00101652;REVB=-0.00166365;RO=85;SAF=44;SAR=16;SRF=45;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.236514;STB=0.643195;TYPE=snp;VARB=0.00228614;OID=.;OPOS=140187322;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:151:85:90:60:61:16:44:45:40:17:44:45:45 chr5 140188383 . T G 52.66 PASS AO=11;DP=23;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.000537271;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.063;QD=9.15837;RBI=0.01327;REFB=-0.00529241;REVB=0.0132591;RO=12;SAF=7;SAR=4;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126336;STB=0.573634;TYPE=snp;VARB=0.00882279;OID=.;OPOS=140188383;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:23:23:12:12:11:11:4:7:6:6:4:7:6:6 chr5 140188401 . A G 78.32 PASS AO=12;DP=18;FAO=12;FDP=18;FR=.;FRO=6;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.00391376;FXX=0.0526039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.857;QD=17.4052;RBI=0.0555823;REFB=-0.0449836;REVB=0.0554443;RO=5;SAF=8;SAR=4;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0385364;STB=0.559897;TYPE=snp;VARB=0.0485283;OID=.;OPOS=140188401;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:18:18:5:6:12:12:4:8:3:2:4:8:3:3 chr5 140188575 . G C 27.67 PASS AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0375185;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=61.1314;QD=7.37739;RBI=0.130352;REFB=-0.0260186;REVB=-0.124836;RO=8;SAF=5;SAR=1;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.373885;STB=0.768236;TYPE=snp;VARB=0.0327262;OID=.;OPOS=140188575;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:14:15:8:9:6:6:1:5:4:4:1:5:4:5 chr5 140201420 . T C 151.32 PASS AO=39;DP=87;FAO=39;FDP=88;FR=.;FRO=49;FSAF=7;FSAR=32;FSRF=5;FSRR=44;FWDB=-0.024514;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=255.883;QD=6.87797;RBI=0.0245142;REFB=-0.00716156;REVB=-0.000102289;RO=48;SAF=7;SAR=32;SRF=5;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139941;STB=0.580749;TYPE=snp;VARB=0.00968754;OID=.;OPOS=140201420;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:88:48:49:39:39:32:7:5:43:32:7:5:44 chr5 140203431 . GC G,GT 186.95 PASS AO=3,17;DP=20;FAO=3,17;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=0,1;FSAR=3,16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0196184,-0.014291;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=23.3701,60.6237;QD=37.3897;RBI=0.111957,0.0175345;REFB=0,0;REVB=-0.110225,-0.0101601;RO=0;SAF=0,1;SAR=3,16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.408163,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.00409112,-0.00109202;OID=.,.;OPOS=140203432,140203432;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=G,GT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:3,17:20:3,17:20:0:0,1:3,16:0:0:7:0:0,1:3,16:0:0 chr5 140209467 . T G 12.56 PASS AO=4;DP=18;FAO=4;FDP=18;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=2;FWDB=-0.073733;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.4714;QD=2.79;RBI=0.13575;REFB=-0.00351728;REVB=-0.11398;RO=14;SAF=3;SAR=1;SRF=12;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188413;STB=0.624477;TYPE=snp;VARB=-0.0207286;OID=.;OPOS=140209467;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:18:18:14:14:4:4:1:3:12:2:1:3:12:2 chr5 140214231 . C G 200.91 PASS AO=39;DP=68;FAO=39;FDP=68;FR=.;FRO=29;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.00764518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.6645;QD=11.8184;RBI=0.0539573;REFB=-0.0340668;REVB=-0.053413;RO=29;SAF=22;SAR=17;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142824;STB=0.578472;TYPE=snp;VARB=0.0192892;OID=.;OPOS=140214231;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:29:29:39:39:17:22:11:18:17:22:11:18 chr5 140214381 . G A 48.21 PASS AO=28;DP=121;FAO=30;FDP=124;FR=.;FRO=94;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=53;FSRR=41;FWDB=0.00635858;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.3312;QD=1.55523;RBI=0.0528267;REFB=-0.0182133;REVB=0.0524426;RO=93;SAF=12;SAR=16;SRF=52;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162778;STB=0.622922;TYPE=snp;VARB=0.0748937;OID=.;OPOS=140214381;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:121:124:93:94:28:30:16:12:52:41:18:12:53:41 chr5 140221098 . C G 39.28 PASS AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.00871227;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=244.293;QD=7.14219;RBI=0.0247202;REFB=0.00322456;REVB=0.0231341;RO=13;SAF=1;SAR=8;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.466795;STB=0.787955;TYPE=snp;VARB=-0.00374979;OID=.;OPOS=140221098;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:22:22:13:13:9:9:8:1:6:7:8:1:6:7 chr5 140221139 . G A 112.72 PASS AO=23;DP=43;FAO=23;FDP=43;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.0358632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.731;QD=10.4857;RBI=0.0403043;REFB=0.00234887;REVB=0.0183921;RO=20;SAF=8;SAR=15;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1327;STB=0.574402;TYPE=snp;VARB=-0.00244466;OID=.;OPOS=140221139;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:43:43:20:20:23:23:15:8:10:10:15:8:10:10 chr5 140222757 . C T 267.78 PASS AO=29;DP=30;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00103326;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=83.5246;QD=34.552;RBI=0.0263796;REFB=-0.0655695;REVB=0.0263594;RO=1;SAF=15;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0300429;STB=0.516118;TYPE=snp;VARB=0.00269309;OID=.;OPOS=140222757;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:30:31:1:1:29:30:14:15:1:0:15:15:1:0 chr5 140228164 . C A 102.44 PASS AO=11;DP=11;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00633347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.777;QD=34.1452;RBI=0.0714664;REFB=0;REVB=0.0711852;RO=0;SAF=5;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00453711;OID=.;OPOS=140228164;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:12:0:0:11:12:6:5:0:0:7:5:0:0 chr5 140228410 . A G 116.19 PASS AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0243398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.684;QD=35.7497;RBI=0.0348243;REFB=0;REVB=-0.0249059;RO=0;SAF=6;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000662748;OID=.;OPOS=140228410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:13:0:0:13:13:7:6:0:0:7:6:0:0 chr5 140228413 . C A 116.42 PASS AO=9;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00723515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.902;QD=35.821;RBI=0.0356402;REFB=0;REVB=0.0348981;RO=0;SAF=6;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00197107;OID=.;OPOS=140228413;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:13:0:0:9:13:3:6:0:0:7:6:0:0 chr5 140229086 . C G 639.74 PASS AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0213957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.0138;QD=38.1933;RBI=0.0680138;REFB=0;REVB=-0.0645608;RO=0;SAF=29;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00046875;OID=.;OPOS=140229086;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:67:67:0:0:67:67:38:29:0:0:38:29:0:0 chr5 140229368 . G C 207.96 PASS AO=24;DP=27;FAO=25;FDP=28;FR=.;FRO=3;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.00447059;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=42.5286;QD=29.7081;RBI=0.00841404;REFB=-0.00976454;REVB=0.0071281;RO=3;SAF=7;SAR=17;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0750649;STB=0.540509;TYPE=snp;VARB=0.00314912;OID=.;OPOS=140229368;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:27:28:3:3:24:25:17:7:0:3:17:8:0:3 chr5 140229526 . T G 215.25 PASS AO=23;DP=23;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0406922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.056;QD=35.8749;RBI=0.0414218;REFB=0;REVB=0.00774003;RO=0;SAF=9;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84921e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.43449e-05;OID=.;OPOS=140229526;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:24:0:0:23:24:14:9:0:0:15:9:0:0 chr5 140230370 . A C 292 PASS AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00901156;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.06;QD=38.9335;RBI=0.0232286;REFB=0;REVB=0.0214093;RO=0;SAF=20;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000133378;OID=.;OPOS=140230370;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:30:30:0:0:30:30:10:20:0:0:10:20:0:0 chr5 140230371 . A C 292.03 PASS AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0016492;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.47;QD=38.9371;RBI=0.0237393;REFB=0;REVB=-0.0236819;RO=0;SAF=20;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000162376;OID=.;OPOS=140230371;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:30:30:0:0:30:30:10:20:0:0:10:20:0:0 chr5 140231237 . T C 735.84 PASS AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0125571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.2666;QD=38.2254;RBI=0.0179625;REFB=0;REVB=-0.0128441;RO=0;SAF=30;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.62523e-06;OID=.;OPOS=140231237;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:77:77:0:0:77:77:47:30:0:0:47:30:0:0 chr5 140231252 . T C 724.83 PASS AO=77;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0259091;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.9368;QD=37.1705;RBI=0.0371517;REFB=-0.0898501;REVB=0.0266265;RO=1;SAF=29;SAR=48;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00975903;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00102062;OID=.;OPOS=140231252;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:78:78:1:0:77:78:48:29:0:1:49:29:0:0 chr5 140231415 . T TTA,A 19.19 PASS AO=6,9;DP=40;FAO=8,0;FDP=29;FR=.;FRO=21;FSAF=4,0;FSAR=4,0;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.24292,0.0318196;FXX=0.0937207;HRUN=7,7;LEN=2,1;MLLD=20.3962,14.6559;QD=2.64694;RBI=0.244588,0.0958951;REFB=0.0303086,-0.0109561;REVB=0.0285147,0.0904621;RO=22;SAF=4,6;SAR=2,3;SRF=11;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.199028,0.195702;STB=0.551596,0.5;TYPE=ins,snp;VARB=-0.0460797,0;OID=.,.;OPOS=140231416,140231415;OREF=-,T;OALT=TA,A;OMAPALT=TTA,A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:40:29:22:21:6,9:8,0:2,3:4,6:11:11:4,0:4,0:9:12 chr5 140232950 . G C 339.91 PASS AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0140722;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.339;QD=35.7805;RBI=0.0153254;REFB=-0.111665;REVB=0.00606974;RO=1;SAF=17;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0228411;STB=0.512189;TYPE=snp;VARB=-0.000257773;OID=.;OPOS=140232950;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:38:38:1:1:37:37:20:17:0:1:20:17:0:1 chr5 140236950 . C G 201.65 PASS AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.81;QD=36.6635;RBI=0.0302003;REFB=0;REVB=-0.0281075;RO=0;SAF=11;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000106168;OID=.;OPOS=140236950;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:22:22:0:0:22:22:11:11:0:0:11:11:0:0 chr5 140237109 . T G 183.13 PASS AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0775208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.2479;QD=38.5546;RBI=0.100419;REFB=0;REVB=-0.0638319;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00586575;OID=.;OPOS=140237109;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:19:19:0:0:19:19:9:10:0:0:9:10:0:0 chr5 140237548 . A G 56.53 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.065049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.094;QD=28.267;RBI=0.0653066;REFB=-0.0298442;REVB=0.0057954;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.599698;TYPE=snp;VARB=0.0103374;OID=.;OPOS=140237548;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:7:8:0:1:7:7:3:4:0:0:2:5:0:1 chr5 140238124 . T A 392.35 PASS AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0296879;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.4753;QD=37.3668;RBI=0.0297053;REFB=0;REVB=0.00101484;RO=0;SAF=13;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.36943e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000504127;OID=.;OPOS=140238124;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:42:42:0:0:42:42:29:13:0:0:29:13:0:0 chr5 140242451 . GC G 232.67 PASS AO=29;DP=31;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0254654;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=30.6792;QD=31.022;RBI=0.0304022;REFB=0;REVB=-0.0166074;RO=0;SAF=19;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.000451986;OID=.;OPOS=140242452;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:29:30:30:30:0:19:11:0:0:21:0:19:10:0:0 chr5 140242479 . T A 290.01 PASS AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00821357;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=187.926;QD=37.4205;RBI=0.0408857;REFB=0;REVB=0.0400522;RO=0;SAF=17;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000274772;OID=.;OPOS=140242479;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:31:31:0:0:31:31:14:17:0:0:14:17:0:0 chr5 140255792 . C A 260.59 PASS AO=44;DP=90;FAO=50;FDP=86;FR=.,HEALED;FRO=36;FSAF=35;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.0260675;FXX=0.0114929;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.8434;QD=12.1203;RBI=0.318268;REFB=-0.00898468;REVB=-0.317199;RO=20;SAF=34;SAR=10;SRF=19;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160553;STB=0.568035;TYPE=snp;VARB=-0.00246351;OID=.;OPOS=140255792;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:86:20:36:44:50:10:34:19:1:15:35:20:16 chr5 140262492 . A T 349.68 PASS AO=71;DP=126;FAO=71;FDP=126;FR=.;FRO=55;FSAF=28;FSAR=43;FSRF=36;FSRR=19;FWDB=0.00625671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.421;QD=11.101;RBI=0.0325636;REFB=-0.0297595;REVB=0.0319568;RO=54;SAF=28;SAR=43;SRF=35;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200577;STB=0.613159;TYPE=snp;VARB=0.0149431;OID=.;OPOS=140262492;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:54:55:71:71:43:28:35:19:43:28:36:19 chr5 140263290 . T G 292.03 PASS AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0495072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.111;QD=38.9374;RBI=0.062205;REFB=0;REVB=0.0376629;RO=0;SAF=24;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0003907;OID=.;OPOS=140263290;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:30:30:0:0:30:30:6:24:0:0:6:24:0:0 chr5 140307284 . G A 404.48 PASS AO=83;DP=147;FAO=83;FDP=149;FR=.;FRO=66;FSAF=34;FSAR=49;FSRF=36;FSRR=30;FWDB=0.00275954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.509;QD=10.8586;RBI=0.00901191;REFB=-0.00359253;REVB=-0.00857902;RO=64;SAF=34;SAR=49;SRF=36;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12307;STB=0.560809;TYPE=snp;VARB=0.00299258;OID=.;OPOS=140307284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:149:64:66:83:83:49:34:36:28:49:34:36:30 chr5 140307969 . C G 268.02 PASS AO=61;DP=120;FAO=60;FDP=118;FR=.;FRO=58;FSAF=24;FSAR=36;FSRF=26;FSRR=32;FWDB=0.0159471;FXX=0.0166653;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.8499;QD=9.08542;RBI=0.0168332;REFB=-0.0016627;REVB=-0.00538941;RO=56;SAF=25;SAR=36;SRF=25;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0326699;STB=0.524467;TYPE=snp;VARB=0.00201848;OID=.;OPOS=140307969;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:118:56:58:61:60:36:25:25:31:36:24:26:32 chr5 140309016 . C T 349.5 PASS AO=79;DP=165;FAO=83;FDP=168;FR=.;FRO=85;FSAF=40;FSAR=43;FSRF=42;FSRR=43;FWDB=0.0165678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.959;QD=8.32141;RBI=0.0177439;REFB=-0.000417473;REVB=-0.00635245;RO=84;SAF=38;SAR=41;SRF=42;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177359;STB=0.506171;TYPE=snp;VARB=0.00030755;OID=.;OPOS=140309016;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:168:84:85:79:83:41:38:42:42:43:40:42:43 chr5 140346468 . T A 46.33 PASS AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0287218;FXX=0.153728;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.931;QD=16.848;RBI=0.0362314;REFB=-0.0383399;REVB=0.0220856;RO=4;SAF=7;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0164284;OID=.;OPOS=140346468;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:13:11:4:4:7:7:0:7:4:0:0:7:4:0 chr5 140347044 . TG T 216.7 PASS AO=22;DP=46;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.34179;FXX=0.0697512;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.4254;QD=21.6704;RBI=0.395866;REFB=-0.0127565;REVB=0.199724;RO=14;SAF=11;SAR=11;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0.388489;SSSB=-0.10021;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0251462;OID=.;OPOS=140347045;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:22:42:40:40:0:21:19:0:0:20:14:11:11:9:5 chr5 140347398 . C T 321.58 PASS AO=56;DP=88;FAO=56;FDP=87;FR=.;FRO=31;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.0150294;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.333;QD=14.7854;RBI=0.0288388;REFB=-0.0267174;REVB=0.0246128;RO=31;SAF=25;SAR=31;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0248006;STB=0.513453;TYPE=snp;VARB=0.0141282;OID=.;OPOS=140347398;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:88:87:31:31:56:56:31:25:15:16:31:25:15:16 chr5 140432663 . TG T 24.27 PASS AO=18;DP=51;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.127223;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=9.42083;QD=2.15735;RBI=0.179695;REFB=-0.0913922;REVB=0.126904;RO=22;SAF=17;SAR=1;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0.5625;SSSB=0.613331;STB=0.618917;TYPE=del;VARB=0.134405;OID=.;OPOS=140432664;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:18:45:20:45:25:16:4:16:9:24:22:17:1:12:10 chr5 140474756 . G A 178.95 PASS AO=46;DP=103;FAO=47;FDP=105;FR=.;FRO=58;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=25;FSRR=33;FWDB=-0.00635725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.074;QD=6.81725;RBI=0.012908;REFB=0.00100583;REVB=0.011234;RO=57;SAF=26;SAR=20;SRF=24;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142068;STB=0.579084;TYPE=snp;VARB=-0.000953243;OID=.;OPOS=140474756;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:105:57:58:46:47:20:26:24:33:20:27:25:33 chr5 140476894 . A G 459.84 PASS AO=121;DP=265;FAO=121;FDP=266;FR=.;FRO=145;FSAF=29;FSAR=92;FSRF=38;FSRR=107;FWDB=0.0188632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.368;QD=6.91483;RBI=0.0195001;REFB=-0.0149067;REVB=0.00494314;RO=144;SAF=29;SAR=92;SRF=38;SRR=106;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0319838;STB=0.516461;TYPE=snp;VARB=0.019285;OID=.;OPOS=140476894;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:265:266:144:145:121:121:92:29:38:106:92:29:38:107 chr5 140476905 . A G 481.19 PASS AO=113;DP=226;FAO=113;FDP=226;FR=.;FRO=113;FSAF=28;FSAR=85;FSRF=37;FSRR=76;FWDB=0.00401819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.576;QD=8.51668;RBI=0.011339;REFB=-0.00569737;REVB=-0.0106032;RO=107;SAF=28;SAR=85;SRF=34;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0793803;STB=0.550673;TYPE=snp;VARB=0.00548427;OID=.;OPOS=140476905;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:226:226:107:113:113:113:85:28:34:73:85:28:37:76 chr5 140476939 . A G 281.46 PASS AO=69;DP=149;FAO=71;FDP=152;FR=.;FRO=81;FSAF=21;FSAR=50;FSRF=29;FSRR=52;FWDB=-0.0126145;FXX=0.0129862;HRUN=3;LEN=1;MLLD=113.311;QD=7.40679;RBI=0.0134872;REFB=-0.0181903;REVB=0.00477278;RO=79;SAF=20;SAR=49;SRF=28;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0727074;STB=0.53855;TYPE=snp;VARB=0.0206482;OID=.;OPOS=140476939;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:152:79:81:69:71:49:20:28:51:50:21:29:52 chr5 140480355 . A G 299.34 PASS AO=38;DP=132;FAO=52;FDP=116;FR=.,HEALED;FRO=44;FSAF=40;FSAR=12;FSRF=31;FSRR=13;FWDB=0.0304074;FXX=0.100767;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4491;QD=10.322;RBI=0.0305566;REFB=0.00732611;REVB=-0.00301549;RO=30;SAF=31;SAR=7;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23684;STB=0.539941;TYPE=snp;VARB=0.0328638;OID=.;OPOS=140480355;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:116:30:44:38:52:7:31:18:12:12:40:31:13 chr5 140480578 . A G 540.82 PASS AO=113;DP=206;FAO=113;FDP=204;FR=.;FRO=91;FSAF=43;FSAR=70;FSRF=32;FSRR=59;FWDB=0.0160705;FXX=0.00970827;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.108;QD=10.6044;RBI=0.0168993;REFB=-0.0252239;REVB=-0.00522738;RO=89;SAF=43;SAR=70;SRF=32;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0181051;STB=0.513751;TYPE=snp;VARB=0.025781;OID=.;OPOS=140480578;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:206:204:89:91:113:113:70:43:32:57:70:43:32:59 chr5 140481594 . T C 26.7 PASS AO=7;DP=21;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=14;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.767;QD=5.0866;RBI=0.00788584;REFB=-0.0100297;REVB=-0.00788584;RO=14;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0121271;OID=.;OPOS=140481594;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:21:21:14:14:7:7:7:0:0:14:7:0:0:14 chr5 140481650 . G C 10.27 PASS AO=2;DP=8;FAO=2;FDP=8;FR=.;FRO=6;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.3688;QD=5.1336;RBI=0.0197126;REFB=-0.0373308;REVB=-0.0197126;RO=5;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.146212;OID=.;OPOS=140481650;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:8:5:6:2:2:2:0:0:5:2:0:0:6 chr5 140482483 . G A 193.58 PASS AO=50;DP=109;FAO=49;FDP=108;FR=.;FRO=59;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=31;FSRR=28;FWDB=0.0110155;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.157;QD=7.16944;RBI=0.0241171;REFB=-0.00283621;REVB=0.0214544;RO=58;SAF=29;SAR=21;SRF=31;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0446373;STB=0.537022;TYPE=snp;VARB=0.00246858;OID=.;OPOS=140482483;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:108:58:59:50:49:21:29:31:27:20:29:31:28 chr5 140502841 . G A 277.27 PASS AO=64;DP=129;FAO=64;FDP=129;FR=.;FRO=65;FSAF=36;FSAR=28;FSRF=27;FSRR=38;FWDB=-0.0360918;FXX=0.00769172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.0412;QD=8.59743;RBI=0.0818004;REFB=-0.0281133;REVB=-0.0734077;RO=64;SAF=36;SAR=28;SRF=27;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127197;STB=0.57389;TYPE=snp;VARB=0.0377569;OID=.;OPOS=140502841;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:64:65:64:64:28:36:27:37:28:36:27:38 chr5 140503237 . A G 21.11 PASS AO=4;DP=10;FAO=4;FDP=10;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0219823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.487;QD=8.44499;RBI=0.0270271;REFB=-0.0278001;REVB=0.0157238;RO=6;SAF=2;SAR=2;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156622;STB=0.599519;TYPE=snp;VARB=0.0723882;OID=.;OPOS=140503237;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:10:10:6:6:4:4:2:2:4:2:2:2:4:2 chr5 140517174 . T C 106.46 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0955168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.1;QD=35.4869;RBI=0.104464;REFB=0;REVB=0.0423003;RO=0;SAF=3;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000957119;OID=.;OPOS=140517174;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:9:3:0:0:9:3:0:0 chr5 140517431 . T C 740.93 PASS AO=185;DP=390;FAO=187;FDP=395;FR=.;FRO=208;FSAF=79;FSAR=108;FSRF=121;FSRR=87;FWDB=-0.0444401;FXX=0.00503766;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.678;QD=7.50305;RBI=0.0579228;REFB=-0.00454832;REVB=0.0371501;RO=203;SAF=80;SAR=105;SRF=118;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14127;STB=0.583696;TYPE=snp;VARB=0.00569559;OID=.;OPOS=140517431;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:390:395:203:208:185:187:105:80:118:85:108:79:121:87 chr5 140517690 . C A 128.85 PASS AO=37;DP=92;FAO=37;FDP=92;FR=.;FRO=55;FSAF=11;FSAR=26;FSRF=16;FSRR=39;FWDB=0.00703206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.718;QD=5.60233;RBI=0.0154408;REFB=-0.0180136;REVB=-0.0137466;RO=55;SAF=11;SAR=26;SRF=16;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00808725;STB=0.504585;TYPE=snp;VARB=0.0172221;OID=.;OPOS=140517690;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:55:55:37:37:26:11:16:39:26:11:16:39 chr5 140530718 . G T 350.45 PASS AO=91;DP=202;FAO=92;FDP=204;FR=.;FRO=112;FSAF=48;FSAR=44;FSRF=48;FSRR=64;FWDB=-0.00116013;FXX=0.00970827;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.934;QD=6.8716;RBI=0.0127885;REFB=-0.0184948;REVB=0.0127357;RO=111;SAF=47;SAR=44;SRF=47;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0920014;STB=0.551009;TYPE=snp;VARB=0.0235804;OID=.;OPOS=140530718;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:204:111:112:91:92:44:47:47:64:44:48:48:64 chr5 140531175 . T C 561.59 PASS AO=51;DP=51;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0580949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.4823;QD=37.439;RBI=0.0588758;REFB=0;REVB=0.00955753;RO=0;SAF=10;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.12541e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000870237;OID=.;OPOS=140531175;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:51:60:0:0:51:60:41:10:0:0:42:18:0:0 chr5 140531746 . C G 16.08 PASS AO=3;DP=6;FAO=3;FDP=6;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0613423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.0994;QD=10.7184;RBI=0.0644808;REFB=-0.00404704;REVB=-0.0198718;RO=3;SAF=1;SAR=2;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.352427;STB=0.713247;TYPE=snp;VARB=-0.013333;OID=.;OPOS=140531746;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:6:6:3:3:3:3:2:1:0:3:2:1:0:3 chr5 140553581 . G C 206.12 PASS AO=68;DP=182;FAO=68;FDP=182;FR=.;FRO=114;FSAF=34;FSAR=34;FSRF=67;FSRR=47;FWDB=-0.0136098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.278;QD=4.53017;RBI=0.031209;REFB=-0.00209117;REVB=0.0280851;RO=110;SAF=34;SAR=34;SRF=64;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0895157;STB=0.554929;TYPE=snp;VARB=0.00340615;OID=.;OPOS=140553581;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:182:110:114:68:68:34:34:64:46:34:34:67:47 chr5 140553856 . G A 29.19 PASS AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.2564;QD=8.33866;RBI=0.0305662;REFB=-0.0557891;REVB=-0.0305662;RO=8;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.050725;OID=.;OPOS=140553856;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:14:14:8:8:6:6:6:0:0:8:6:0:0:8 chr5 140554006 . C G 10.3 PASS AO=2;DP=8;FAO=2;FDP=8;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=-0.0216075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.997;QD=5.14794;RBI=0.0226464;REFB=-0.010618;REVB=0.00678052;RO=6;SAF=1;SAR=1;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.611271;STB=0.873328;TYPE=snp;VARB=0.0588033;OID=.;OPOS=140554006;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:8:6:6:2:2:1:1:0:6:1:1:0:6 chr5 140554562 . A T 22.5 PASS AO=12;DP=54;FAO=12;FDP=54;FR=.;FRO=42;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=-0.00202384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.63;QD=1.66672;RBI=0.0159606;REFB=0.0030585;REVB=-0.0158318;RO=42;SAF=7;SAR=5;SRF=25;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0150433;STB=0.509538;TYPE=snp;VARB=-0.00920529;OID=.;OPOS=140554562;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:54:54:42:42:12:12:5:7:25:17:5:7:25:17 chr5 140558345 . G C 55.02 PASS AO=84;DP=443;FAO=73;FDP=400;FR=.;FRO=327;FSAF=45;FSAR=28;FSRF=184;FSRR=143;FWDB=-0.00548708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.7479;QD=0.550205;RBI=0.0117716;REFB=-0.00516421;REVB=-0.0104145;RO=356;SAF=51;SAR=33;SRF=201;SRR=155;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0568158;STB=0.545461;TYPE=snp;VARB=0.0281921;OID=.;OPOS=140558345;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:443:400:356:327:84:73:33:51:201:155:28:45:184:143 chr5 140559596 . T G 19.9 PASS AO=4;DP=11;FAO=4;FDP=11;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.00549982;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=272.836;QD=7.23539;RBI=0.0293795;REFB=-0.0123549;REVB=-0.0288601;RO=7;SAF=1;SAR=3;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198753;STB=0.630873;TYPE=snp;VARB=0.0285572;OID=.;OPOS=140559596;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:11:11:7:7:4:4:3:1:3:4:3:1:3:4 chr5 140559914 . T C 308.6 PASS AO=79;DP=171;FAO=79;FDP=172;FR=.;FRO=93;FSAF=25;FSAR=54;FSRF=28;FSRR=65;FWDB=-0.000625207;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.977;QD=7.17668;RBI=0.0194284;REFB=0.00203828;REVB=0.0194183;RO=92;SAF=25;SAR=54;SRF=28;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136638;STB=0.509677;TYPE=snp;VARB=-0.00251412;OID=.;OPOS=140559914;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:172:92:93:79:79:54:25:28:64:54:25:28:65 chr5 140568034 . C CA 710.07 PASS AO=89;DP=108;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0321014;FXX=0.029997;HRUN=1;LEN=1;MLLD=18.6772;QD=29.2813;RBI=0.0833926;REFB=0;REVB=-0.0769664;RO=14;SAF=31;SAR=58;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0616098;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-0.000468592;OID=.;OPOS=140568035;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:89:108:97:97:0:34:63:0:0:65:14:31:58:8:6 chr5 140572763 . C G 134.13 PASS AO=40;DP=102;FAO=40;FDP=102;FR=.;FRO=62;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=50;FWDB=-0.0246009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.402;QD=5.26003;RBI=0.0254022;REFB=-0.00291425;REVB=-0.00632966;RO=61;SAF=21;SAR=19;SRF=12;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.349008;STB=0.697892;TYPE=snp;VARB=0.00858832;OID=.;OPOS=140572763;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:61:62:40:40:19:21:12:49:19:21:12:50 chr5 140575211 . G T 220.83 PASS AO=46;DP=87;FAO=47;FDP=89;FR=.;FRO=42;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=-0.0100434;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.879;QD=9.92474;RBI=0.0131624;REFB=-0.0207301;REVB=0.00850747;RO=40;SAF=17;SAR=29;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0927557;STB=0.534082;TYPE=snp;VARB=0.0196823;OID=.;OPOS=140575211;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:89:40:42:46:47:29:17:19:21:29:18:19:23 chr5 140589738 . C T 235.39 PASS AO=49;DP=91;FAO=49;FDP=91;FR=.;FRO=42;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=0.0363909;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.8044;QD=10.3467;RBI=0.0368953;REFB=-0.0303156;REVB=0.00607981;RO=42;SAF=30;SAR=19;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155787;STB=0.585796;TYPE=snp;VARB=0.0187617;OID=.;OPOS=140589738;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:42:42:49:49:19:30:18:24:19:30:18:24 chr5 140590766 . A G 189.57 PASS AO=52;DP=122;FAO=52;FDP=122;FR=.;FRO=70;FSAF=33;FSAR=19;FSRF=37;FSRR=33;FWDB=-0.0224502;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.2227;QD=6.21544;RBI=0.0264372;REFB=-0.00640406;REVB=0.0139612;RO=70;SAF=33;SAR=19;SRF=37;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112684;STB=0.563337;TYPE=snp;VARB=0.00734691;OID=.;OPOS=140590766;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:70:70:52:52:19:33:37:33:19:33:37:33 chr5 140595106 . C G 30.49 PASS AO=8;DP=23;FAO=8;FDP=23;FR=.;FRO=15;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=0.0735868;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.0438;QD=5.30239;RBI=0.0739238;REFB=-0.00212056;REVB=0.00705137;RO=15;SAF=1;SAR=7;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152616;STB=0.595475;TYPE=snp;VARB=0.00905364;OID=.;OPOS=140595106;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:23:23:15:15:8:8:7:1:3:12:7:1:3:12 chr5 140596162 . C T 392.68 PASS AO=87;DP=171;FAO=88;FDP=170;FR=.;FRO=82;FSAF=37;FSAR=51;FSRF=45;FSRR=37;FWDB=0.00360578;FXX=0.0116272;HRUN=5;LEN=1;MLLD=176.199;QD=9.23957;RBI=0.00388459;REFB=0.00350549;REVB=-0.00144515;RO=80;SAF=37;SAR=50;SRF=45;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120173;STB=0.562234;TYPE=snp;VARB=-0.00287008;OID=.;OPOS=140596162;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:170:80:82:87:88:50:37:45:35:51:37:45:37 chr5 140596704 . A G 340.5 PASS AO=91;DP=213;FAO=94;FDP=216;FR=.;FRO=122;FSAF=48;FSAR=46;FSRF=70;FSRR=52;FWDB=-0.00314832;FXX=0.00460808;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.641;QD=6.30554;RBI=0.072978;REFB=-0.0227052;REVB=0.0729101;RO=119;SAF=47;SAR=44;SRF=70;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0733497;STB=0.535721;TYPE=snp;VARB=0.0340176;OID=.;OPOS=140596704;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:213:216:119:122:91:94:44:47:70:49:46:48:70:52 chr5 140614830 . G A 201.6 PASS AO=71;DP=205;FAO=73;FDP=206;FR=.;FRO=133;FSAF=42;FSAR=31;FSRF=65;FSRR=68;FWDB=0.00172116;FXX=0.00483068;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.159;QD=3.9145;RBI=0.0266815;REFB=-0.0116799;REVB=-0.0266259;RO=133;SAF=40;SAR=31;SRF=66;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0769998;STB=0.556239;TYPE=snp;VARB=0.0185948;OID=.;OPOS=140614830;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:206:133:133:71:73:31:40:66:67:31:42:65:68 chr5 140615221 . C T 414.48 PASS AO=104;DP=223;FAO=105;FDP=224;FR=.;FRO=119;FSAF=54;FSAR=51;FSRF=47;FSRR=72;FWDB=0.000149479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.465;QD=7.40134;RBI=0.0143574;REFB=-0.00711754;REVB=-0.0143566;RO=119;SAF=54;SAR=50;SRF=47;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1197;STB=0.563204;TYPE=snp;VARB=0.0101695;OID=.;OPOS=140615221;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:224:119:119:104:105:50:54:47:72:51:54:47:72 chr5 140615269 . A G 187.06 PASS AO=65;DP=177;FAO=64;FDP=176;FR=.;FRO=112;FSAF=40;FSAR=24;FSRF=50;FSRR=62;FWDB=0.0261666;FXX=0.0056494;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.204;QD=4.25139;RBI=0.0268029;REFB=-0.000796945;REVB=-0.00580555;RO=112;SAF=41;SAR=24;SRF=50;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206659;STB=0.61425;TYPE=snp;VARB=0.00248651;OID=.;OPOS=140615269;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:176:112:112:65:64:24:41:50:62:24:40:50:62 chr5 140615609 . G A 11.46 PASS AO=2;DP=8;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0.124844;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.3392;QD=6.54927;RBI=0.0710644;REFB=0.0109462;REVB=-0.0710644;RO=6;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0466089;OID=.;OPOS=140615609;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:8:7:6:5:2:2:2:0:0:6:2:0:0:5 chr5 140625207 . C T 223.43 PASS AO=59;DP=133;FAO=59;FDP=133;FR=.;FRO=74;FSAF=33;FSAR=26;FSRF=52;FSRR=22;FWDB=0.0228286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.746;QD=6.71957;RBI=0.0667286;REFB=-0.000519458;REVB=0.0627022;RO=74;SAF=33;SAR=26;SRF=52;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14852;STB=0.582472;TYPE=snp;VARB=0.00153104;OID=.;OPOS=140625207;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:74:74:59:59:26:33:52:22:26:33:52:22 chr5 140626627 . G A 52.63 PASS AO=11;DP=23;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.016681;FXX=0.0416493;HRUN=3;LEN=1;MLLD=152.57;QD=9.15317;RBI=0.0189359;REFB=0.00171796;REVB=0.00896176;RO=11;SAF=8;SAR=3;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.325354;STB=0.709289;TYPE=snp;VARB=-0.00255853;OID=.;OPOS=140626627;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:23:23:11:12:11:11:3:8:4:7:3:8:4:8 chr5 140626767 . C T 37.23 PASS AO=5;DP=10;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.112324;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.427;QD=13.5388;RBI=0.112405;REFB=-0.0309059;REVB=0.00425972;RO=5;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.666254;TYPE=snp;VARB=0.0296555;OID=.;OPOS=140626767;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:10:11:5:5:5:6:5:0:0:5:5:1:0:5 chr5 140626790 . A C 31.79 PASS AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.107306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.861;QD=15.895;RBI=0.107327;REFB=-0.0312433;REVB=0.00212872;RO=3;SAF=1;SAR=4;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23409;STB=0.635921;TYPE=snp;VARB=0.0289864;OID=.;OPOS=140626790;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:8:8:3:3:5:5:4:1:0:3:4:1:0:3 chr5 140683265 . G A 688.27 PASS AO=79;DP=86;FAO=79;FDP=83;FR=.;FRO=4;FSAF=42;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.02147;FXX=0.0348797;HRUN=3;LEN=1;MLLD=222.384;QD=33.1696;RBI=0.0237989;REFB=-0.0557355;REVB=0.0102678;RO=2;SAF=42;SAR=37;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0248992;STB=0.525635;TYPE=snp;VARB=-0.000886634;OID=.;OPOS=140683265;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:86:83:2:4:79:79:37:42:0:2:37:42:0:4 chr5 140710705 . G A 604.61 PASS AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0127332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.302;QD=37.7878;RBI=0.0294115;REFB=0;REVB=0.0265123;RO=0;SAF=31;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.6171e-05;OID=.;OPOS=140710705;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:64:64:0:0:64:64:33:31:0:0:33:31:0:0 chr5 140720516 . C G 107.81 PASS AO=11;DP=11;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00790546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.897;QD=35.9382;RBI=0.0477971;REFB=0;REVB=-0.0471388;RO=0;SAF=6;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000629151;OID=.;OPOS=140720516;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:12:0:0:11:12:5:6:0:0:6:6:0:0 chr5 140720954 . T C 174.15 PASS AO=52;DP=129;FAO=52;FDP=131;FR=.;FRO=79;FSAF=20;FSAR=32;FSRF=17;FSRR=62;FWDB=0.0241822;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=161.755;QD=5.31746;RBI=0.027199;REFB=-0.00729952;REVB=-0.0124502;RO=77;SAF=20;SAR=32;SRF=17;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194286;STB=0.613538;TYPE=snp;VARB=0.0102077;OID=.;OPOS=140720954;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:131:77:79:52:52:32:20:17:60:32:20:17:62 chr5 140723835 . C T 123.57 PASS AO=31;DP=75;FAO=34;FDP=79;FR=.;FRO=45;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=-0.00659238;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.4232;QD=6.25649;RBI=0.0550246;REFB=0.023758;REVB=0.0546283;RO=44;SAF=20;SAR=11;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0842172;STB=0.561395;TYPE=snp;VARB=-0.0305703;OID=.;OPOS=140723835;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:79:44:45:31:34:11:20:25:19:11:23:26:19 chr5 140739874 . G A 312.28 PASS AO=68;DP=130;FAO=68;FDP=130;FR=.;FRO=62;FSAF=30;FSAR=38;FSRF=23;FSRR=39;FWDB=-0.0070108;FXX=0.00763301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.047;QD=9.60847;RBI=0.0247582;REFB=-0.0284946;REVB=-0.0237448;RO=61;SAF=30;SAR=38;SRF=23;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0564627;STB=0.534218;TYPE=snp;VARB=0.0319288;OID=.;OPOS=140739874;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:61:62:68:68:38:30:23:38:38:30:23:39 chr5 140750044 . T C 3075.23 PASS AO=334;DP=342;FAO=335;FDP=343;FR=.;FRO=8;FSAF=153;FSAR=182;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0180364;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=258.864;QD=35.8628;RBI=0.0219238;REFB=-0.121;REVB=0.0124637;RO=5;SAF=152;SAR=182;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00410806;STB=0.503952;TYPE=snp;VARB=0.000656179;OID=.;OPOS=140750044;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:87:342:343:5:8:334:335:182:152:3:2:182:153:5:3 chr5 140774288 . T C 136.31 PASS AO=14;DP=14;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0342638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.089;QD=36.3484;RBI=0.0625617;REFB=0;REVB=0.0523446;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00157266;OID=.;OPOS=140774288;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:14:15:0:0:14:15:8:6:0:0:9:6:0:0 chr5 140788581 . AG A 27.02 PASS AO=18;DP=55;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=-0.163853;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=9.63882;QD=2.07847;RBI=0.190848;REFB=-0.0736276;REVB=0.0978536;RO=23;SAF=12;SAR=6;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.309572;STB=0.671081;TYPE=del;VARB=0.0664863;OID=.;OPOS=140788582;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:18:52:22:52:30:14:8:10:20:27:23:12:6:8:15 chr5 140802493 . GC G 70.98 PASS AO=8;DP=19;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.37983;FXX=0.0526039;HRUN=3;LEN=1;MLLD=10.5569;QD=15.7741;RBI=0.394488;REFB=-0.0915746;REVB=0.106536;RO=6;SAF=4;SAR=4;SRF=3;SRR=3;SSEN=0.325771;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.529377;TYPE=del;VARB=0.0771292;OID=.;OPOS=140802494;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:8:18:17:18:1:9:8:0:1:4:6:4:4:3:3 chr5 141021068 . G C 99.54 PASS AO=37;DP=112;FAO=37;FDP=112;FR=.;FRO=75;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=55;FSRR=20;FWDB=-0.0186786;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.6172;QD=3.55502;RBI=0.0240361;REFB=-0.010955;REVB=0.0151277;RO=75;SAF=21;SAR=16;SRF=55;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203498;STB=0.616575;TYPE=snp;VARB=0.0445268;OID=.;OPOS=141021068;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:75:75:37:37:16:21:55:20:16:21:55:20 chr5 141036337 . A G 213.91 PASS AO=28;DP=58;FAO=35;FDP=54;FR=.,HEALED;FRO=17;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.0624801;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.3416;QD=15.8455;RBI=0.0631731;REFB=-0.0371197;REVB=-0.00933201;RO=15;SAF=9;SAR=19;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187348;STB=0.542833;TYPE=snp;VARB=0.0177395;OID=.;OPOS=141036337;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:52:54:15:17:28:35:19:9:9:6:19:16:10:7 chr5 141045991 . T TC 12.57 PASS AO=10;DP=39;FAO=8;FDP=39;FR=.;FRO=31;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=23;FWDB=-0.0614159;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=51.5437;QD=1.28929;RBI=0.0630476;REFB=-0.0084312;REVB=0.0142508;RO=29;SAF=1;SAR=9;SRF=8;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.348171;STB=0.676891;TYPE=ins;VARB=0.131651;OID=.;OPOS=141045992;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:10:39:8:39:31:1:7:8:23:12:29:1:9:8:21 chr5 141051236 . C T 104.76 PASS AO=33;DP=89;FAO=33;FDP=89;FR=.;FRO=56;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=28;FSRR=28;FWDB=-0.0288974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.1945;QD=4.70812;RBI=0.0953723;REFB=-0.0175322;REVB=-0.090889;RO=56;SAF=20;SAR=13;SRF=28;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118163;STB=0.567825;TYPE=snp;VARB=0.0323418;OID=.;OPOS=141051236;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:56:56:33:33:13:20:28:28:13:20:28:28 chr5 141059868 . T C 20.07 PASS AO=7;DP=26;FAO=7;FDP=27;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.0560677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.504;QD=2.9729;RBI=0.0626671;REFB=-0.0192929;REVB=0.0279924;RO=18;SAF=6;SAR=1;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.36153;STB=0.715691;TYPE=snp;VARB=0.0374505;OID=.;OPOS=141059868;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:26:27:18:20:7:7:1:6:11:7:1:6:13:7 chr5 141243646 . A G 2805.37 PASS AO=296;DP=296;FAO=294;FDP=294;FR=.;FRO=0;FSAF=138;FSAR=156;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0120065;FXX=0.00675653;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.92;QD=38.1683;RBI=0.0210221;REFB=-0.0588988;REVB=-0.0172561;RO=0;SAF=140;SAR=156;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.78088e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.94265e-05;OID=.;OPOS=141243646;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:296:294:0:0:296:294:156:140:0:0:156:138:0:0 chr5 141249100 . G GC 20.97 PASS AO=5;DP=14;FAO=5;FDP=14;FR=.;FRO=9;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=0;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=143.149;QD=5.99226;RBI=0.0181537;REFB=0.00234338;REVB=0.0181537;RO=9;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-0.0390544;OID=.;OPOS=141249101;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:5:14:5:14:9:0:5:0:9:20:9:0:5:0:9 chr5 141307833 . T C 178.49 PASS AO=46;DP=102;FAO=46;FDP=103;FR=.;FRO=57;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=35;FWDB=-0.0848559;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.4317;QD=6.93147;RBI=0.0895851;REFB=-0.0237504;REVB=-0.0287223;RO=56;SAF=23;SAR=23;SRF=22;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105343;STB=0.56308;TYPE=snp;VARB=0.0300303;OID=.;OPOS=141307833;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:103:56:57:46:46:23:23:22:34:23:23:22:35 chr5 141309265 . C T 167.05 PASS AO=44;DP=101;FAO=44;FDP=101;FR=.;FRO=57;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=42;FWDB=0.00458428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.832;QD=6.61571;RBI=0.0320089;REFB=2.73906e-06;REVB=-0.0316789;RO=57;SAF=22;SAR=22;SRF=15;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.239967;STB=0.633607;TYPE=snp;VARB=-6.30013e-05;OID=.;OPOS=141309265;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:57:57:44:44:22:22:15:42:22:22:15:42 chr5 141309824 . G A 103.49 PASS AO=29;DP=72;FAO=29;FDP=72;FR=.;FRO=43;FSAF=3;FSAR=26;FSRF=12;FSRR=31;FWDB=-0.0154146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.9376;QD=5.74929;RBI=0.0160164;REFB=-0.0180184;REVB=0.00434942;RO=42;SAF=3;SAR=26;SRF=12;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.339745;STB=0.695022;TYPE=snp;VARB=0.0291087;OID=.;OPOS=141309824;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:42:43:29:29:26:3:12:30:26:3:12:31 chr5 141325249 . T C 671.54 PASS AO=71;DP=77;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0204065;FXX=0.0519413;HRUN=2;LEN=1;MLLD=294.585;QD=36.7968;RBI=0.0289759;REFB=-0.0620028;REVB=0.0205713;RO=1;SAF=12;SAR=59;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00794925;STB=0.504201;TYPE=snp;VARB=0.000760802;OID=.;OPOS=141325249;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:77:73:1:1:71:72:59:12:0:1:59:13:0:1 chr5 141334635 . GC G 154.11 PASS AO=19;DP=31;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.311751;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.251;QD=25.6849;RBI=0.324515;REFB=0;REVB=0.0901189;RO=2;SAF=3;SAR=16;SRF=2;SRR=0;SSEN=0.435071;SSEP=0;SSSB=-0.22684;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0290623;OID=.;OPOS=141334636;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:19:24:24:24:0:6:18:0:0:14:2:3:16:2:0 chr5 141335241 . A G 144.64 PASS AO=30;DP=56;FAO=30;FDP=56;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.0648481;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.349;QD=10.3316;RBI=0.0648494;REFB=-0.0164108;REVB=0.000400234;RO=25;SAF=12;SAR=18;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0999999;STB=0.547413;TYPE=snp;VARB=0.0126743;OID=.;OPOS=141335241;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:25:26:30:30:18:12:13:12:18:12:13:13 chr5 141335284 . G A 180.19 PASS AO=38;DP=69;FAO=38;FDP=71;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=-0.0146725;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.5902;QD=10.1516;RBI=0.0466832;REFB=-0.0411974;REVB=0.0443175;RO=29;SAF=18;SAR=20;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115199;STB=0.561268;TYPE=snp;VARB=0.0535208;OID=.;OPOS=141335284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:71:29:33:38:38:20:18:18:11:20:18:20:13 chr5 141335498 . C T 484.48 PASS AO=102;DP=186;FAO=102;FDP=186;FR=.;FRO=84;FSAF=34;FSAR=68;FSRF=43;FSRR=41;FWDB=0.034608;FXX=0.00534731;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.637;QD=10.4189;RBI=0.0347805;REFB=-0.0219695;REVB=0.00346004;RO=84;SAF=34;SAR=68;SRF=43;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15646;STB=0.585534;TYPE=snp;VARB=0.0129922;OID=.;OPOS=141335498;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:186:84:84:102:102:68:34:43:41:68:34:43:41 chr5 141336264 . G T 259.86 PASS AO=61;DP=163;FAO=76;FDP=177;FR=.;FRO=101;FSAF=35;FSAR=41;FSRF=55;FSRR=46;FWDB=0.0283847;FXX=0.0327851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.848;QD=5.87262;RBI=0.0331191;REFB=-0.00450121;REVB=0.0170641;RO=102;SAF=33;SAR=28;SRF=56;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00893052;STB=0.547872;TYPE=snp;VARB=0.0086225;OID=.;OPOS=141336264;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:177:102:101:61:76:28:33:56:46:41:35:55:46 chr5 141337126 . C T 81.91 PASS AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=0.0597598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.6566;QD=8.85554;RBI=0.0680022;REFB=5.93421e-05;REVB=0.032451;RO=18;SAF=9;SAR=9;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.247082;STB=0.621494;TYPE=snp;VARB=0.00185991;OID=.;OPOS=141337126;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:37:37:18:19:18:18:9:9:4:14:9:9:5:14 chr5 141337225 . A G 126.07 PASS AO=18;DP=25;FAO=19;FDP=26;FR=.;FRO=7;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=-0.0294979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.4917;QD=19.3947;RBI=0.0315156;REFB=-0.0558574;REVB=0.0110951;RO=7;SAF=8;SAR=10;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23654;STB=0.620574;TYPE=snp;VARB=0.0323746;OID=.;OPOS=141337225;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:25:26:7:7:18:19:10:8:0:7:11:8:0:7 chr5 141391532 . G A 501.64 PASS AO=113;DP=221;FAO=114;FDP=222;FR=.;FRO=108;FSAF=36;FSAR=78;FSRF=50;FSRR=58;FWDB=0.0116007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.4739;QD=9.0385;RBI=0.0117284;REFB=-0.0094406;REVB=0.00172634;RO=108;SAF=36;SAR=77;SRF=50;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13958;STB=0.578062;TYPE=snp;VARB=0.0100184;OID=.;OPOS=141391532;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:222:108:108:113:114:77:36:50:58:78:36:50:58 chr5 141531735 . C T 1497.28 PASS AO=160;DP=162;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0160428;FXX=0.0308623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.072;QD=38.1473;RBI=0.0321416;REFB=0;REVB=0.0278516;RO=0;SAF=46;SAR=114;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.02457e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.6404e-05;OID=.;OPOS=141531735;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:162:157:0:0:160:157:114:46:0:0:115:42:0:0 chr5 141774022 . G A 2245.16 PASS AO=240;DP=249;FAO=242;FDP=242;FR=.;FRO=0;FSAF=165;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131445;FXX=0.0358551;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.015;QD=37.1101;RBI=0.0253466;REFB=-0.14112;REVB=0.021672;RO=0;SAF=165;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.4269e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000632322;OID=.;OPOS=141774022;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:249:242:0:0:240:242:75:165:0:0:77:165:0:0 chr5 141774052 . G A 3145 PASS AO=328;DP=329;FAO=329;FDP=329;FR=.;FRO=0;FSAF=226;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154525;FXX=0.00303021;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.321;QD=38.237;RBI=0.0528754;REFB=-0.0267271;REVB=0.0505671;RO=0;SAF=225;SAR=103;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0011411;OID=.;OPOS=141774052;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:329:329:0:0:328:329:103:225:0:0:103:226:0:0 chr5 141973349 . C G 664.67 PASS AO=135;DP=250;FAO=137;FDP=243;FR=.;FRO=106;FSAF=40;FSAR=97;FSRF=37;FSRR=69;FWDB=0.00861618;FXX=0.0279989;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.922;QD=10.941;RBI=0.0100617;REFB=-0.0196416;REVB=0.00519617;RO=95;SAF=40;SAR=95;SRF=37;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0819054;STB=0.529374;TYPE=snp;VARB=0.0149513;OID=.;OPOS=141973349;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:250:243:95:106:135:137:95:40:37:58:97:40:37:69 chr5 141973501 . T C 449.11 PASS AO=107;DP=225;FAO=111;FDP=229;FR=.;FRO=118;FSAF=42;FSAR=69;FSRF=50;FSRR=68;FWDB=0.00338864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.36;QD=7.84464;RBI=0.00438899;REFB=-0.00651914;REVB=0.00278934;RO=117;SAF=42;SAR=65;SRF=49;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0259262;STB=0.524537;TYPE=snp;VARB=0.00667075;OID=.;OPOS=141973501;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:225:229:117:118:107:111:65:42:49:68:69:42:50:68 chr5 142421415 . T G 789.28 PASS AO=76;DP=76;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00532592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.013;QD=37.5847;RBI=0.0226428;REFB=0;REVB=0.0220075;RO=0;SAF=37;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.95667e-05;OID=.;OPOS=142421415;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:76:84:0:0:76:84:39:37:0:0:45:39:0:0 chr5 142593652 . C T 892.66 PASS AO=93;DP=93;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151843;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.413;QD=37.9856;RBI=0.0237312;REFB=0;REVB=0.0182375;RO=0;SAF=74;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71544e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.64786e-05;OID=.;OPOS=142593652;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:93:94:0:0:93:94:19:74:0:0:19:75:0:0 chr5 142660213 . G C 165.4 PASS AO=59;DP=170;FAO=60;FDP=173;FR=.;FRO=113;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=56;FSRR=57;FWDB=-0.00549083;FXX=0.0114279;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.096;QD=3.82416;RBI=0.00794081;REFB=-0.0102087;REVB=0.00573648;RO=110;SAF=26;SAR=33;SRF=56;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0780924;STB=0.540925;TYPE=snp;VARB=0.016113;OID=.;OPOS=142660213;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:173:110:113:59:60:33:26:56:54:34:26:56:57 chr5 143059433 . T C 74.6 PASS AO=32;DP=108;FAO=32;FDP=108;FR=.;FRO=76;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=40;FSRR=36;FWDB=-0.0232977;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.7024;QD=2.76296;RBI=0.0298954;REFB=-0.00688097;REVB=-0.0187337;RO=74;SAF=20;SAR=12;SRF=38;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135262;STB=0.571383;TYPE=snp;VARB=0.0224427;OID=.;OPOS=143059433;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:108:108:74:76:32:32:12:20:38:36:12:20:40:36 chr5 143853335 . C T 185.37 PASS AO=60;DP=158;FAO=60;FDP=159;FR=.;FRO=99;FSAF=36;FSAR=24;FSRF=57;FSRR=42;FWDB=0.0804429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.6728;QD=4.6633;RBI=0.0824763;REFB=-0.0209757;REVB=0.0182014;RO=97;SAF=36;SAR=24;SRF=57;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140104;STB=0.51562;TYPE=snp;VARB=0.0343635;OID=.;OPOS=143853335;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:159:97:99:60:60:24:36:57:40:24:36:57:42 chr5 145197565 . T C 250.02 PASS AO=78;DP=199;FAO=78;FDP=199;FR=.;FRO=121;FSAF=40;FSAR=38;FSRF=51;FSRR=70;FWDB=0.00925603;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.555;QD=5.02558;RBI=0.0369818;REFB=-0.00380084;REVB=-0.0358048;RO=120;SAF=40;SAR=38;SRF=50;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1034;STB=0.555399;TYPE=snp;VARB=0.00562967;OID=.;OPOS=145197565;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:199:199:120:121:78:78:38:40:50:70:38:40:51:70 chr5 145246085 . T G 3787.46 PASS AO=470;DP=478;FAO=397;FDP=397;FR=.;FRO=0;FSAF=251;FSAR=146;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0337292;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.554;QD=38.1608;RBI=0.0354686;REFB=-0.0345358;REVB=-0.0109711;RO=3;SAF=310;SAR=160;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00886558;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.73252e-05;OID=.;OPOS=145246085;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:478:397:3:0:470:397:160:310:0:3:146:251:0:0 chr5 145393364 . C T 149 PASS AO=42;DP=107;FAO=43;FDP=106;FR=.;FRO=63;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=33;FSRR=30;FWDB=-0.00231767;FXX=0.00934492;HRUN=3;LEN=1;MLLD=118.869;QD=5.62245;RBI=0.026712;REFB=-0.0014674;REVB=0.0266112;RO=62;SAF=19;SAR=23;SRF=32;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0672623;STB=0.534867;TYPE=snp;VARB=0.00355538;OID=.;OPOS=145393364;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:106:62:63:42:43:23:19:32:30:23:20:33:30 chr5 145439647 . T C 466.33 PASS AO=48;DP=51;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00342598;FXX=0.0384541;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.941;QD=37.3064;RBI=0.00414794;REFB=0;REVB=-0.00233839;RO=0;SAF=13;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.61818e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00146248;OID=.;OPOS=145439647;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:51:50:0:0:48:50:35:13:0:0:36:14:0:0 chr5 145442203 . G C 24.55 PASS AO=16;DP=79;FAO=16;FDP=76;FR=.;FRO=60;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=42;FWDB=-0.107346;FXX=0.0379699;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.7792;QD=1.29207;RBI=0.108168;REFB=3.77034e-05;REVB=0.0133135;RO=60;SAF=7;SAR=9;SRF=18;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182071;STB=0.613271;TYPE=snp;VARB=-0.00418082;OID=.;OPOS=145442203;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:79:76:60:60:16:16:9:7:18:42:9:7:18:42 chr5 145477855 . T C 1344.04 PASS AO=108;DP=144;FAO=141;FDP=141;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=53;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0047048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.953;QD=38.1288;RBI=0.0513619;REFB=0;REVB=0.0511459;RO=1;SAF=42;SAR=66;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111669;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000389176;OID=.;OPOS=145477855;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:141:141:1:0:108:141:66:42:1:0:88:53:0:0 chr5 145483844 . A T 1361.99 PASS AO=143;DP=145;FAO=145;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00985754;FXX=0.00684885;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.0111;QD=37.572;RBI=0.0491208;REFB=0;REVB=0.0481215;RO=2;SAF=43;SAR=100;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0215988;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.76885e-05;OID=.;OPOS=145483844;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:145:145:2:0:143:145:100:43:2:0:100:45:0:0 chr5 145499996 . C T 1975.69 PASS AO=254;DP=258;FAO=235;FDP=256;FR=.;FRO=21;FSAF=127;FSAR=108;FSRF=3;FSRR=18;FWDB=-0.0350368;FXX=0.00775164;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.6927;QD=30.8701;RBI=0.0584333;REFB=0.0465829;REVB=-0.046764;RO=4;SAF=129;SAR=125;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000232645;STB=0.532651;TYPE=snp;VARB=-0.0268043;OID=.;OPOS=145499996;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:258:256:4:21:254:235:125:129:2:2:108:127:3:18 chr5 145508340 . A G 1598.88 PASS AO=163;DP=164;FAO=170;FDP=170;FR=.;FRO=0;FSAF=106;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0779883;FXX=0.00584761;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.242;QD=37.6206;RBI=0.0780481;REFB=-0.0111049;REVB=0.00305359;RO=1;SAF=99;SAR=64;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00478268;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000191474;OID=.;OPOS=145508340;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:164:170:1:0:163:170:64:99:1:0:64:106:0:0 chr5 145508636 . T C 1248.59 PASS AO=140;DP=146;FAO=140;FDP=146;FR=.;FRO=6;FSAF=62;FSAR=78;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0627667;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.237;QD=34.2078;RBI=0.0655041;REFB=-0.0693669;REVB=0.0187386;RO=6;SAF=62;SAR=78;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0307567;STB=0.516197;TYPE=snp;VARB=0.0071637;OID=.;OPOS=145508636;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:146:146:6:6:140:140:78:62:5:1:78:62:5:1 chr5 145508637 . A C 1344.74 PASS AO=144;DP=146;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.106827;FXX=0.0136977;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.4338;QD=37.3539;RBI=0.109762;REFB=-0.142765;REVB=0.0252118;RO=2;SAF=65;SAR=79;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0144051;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00239709;OID=.;OPOS=145508637;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:146:144:2:0:144:144:79:65:2:0:79:65:0:0 chr5 145519821 . G A 631.36 PASS AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0709953;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.59;QD=38.2639;RBI=0.0754239;REFB=0;REVB=0.0254643;RO=0;SAF=3;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.42219e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000141288;OID=.;OPOS=145519821;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:67:66:0:0:66:66:63:3:0:0:63:3:0:0 chr5 145523105 . G A 1104.25 PASS AO=116;DP=116;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0423907;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.6913;QD=38.0775;RBI=0.065854;REFB=0;REVB=-0.0503962;RO=0;SAF=27;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000544806;OID=.;OPOS=145523105;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:116:116:0:0:116:116:89:27:0:0:89:27:0:0 chr5 145539996 . T G 850.66 PASS AO=85;DP=86;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0375949;FXX=0.0222198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.2081;QD=38.6664;RBI=0.0635878;REFB=0;REVB=0.0512838;RO=0;SAF=41;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.35764e-05;OID=.;OPOS=145539996;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:86:88:0:0:85:88:44:41:0:0:48:40:0:0 chr5 145543972 . G A 1291.83 PASS AO=137;DP=140;FAO=138;FDP=140;FR=.;FRO=2;FSAF=56;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00382922;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.956;QD=36.9094;RBI=0.0290562;REFB=-0.0290372;REVB=0.0288028;RO=2;SAF=56;SAR=81;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0115929;STB=0.506023;TYPE=snp;VARB=0.00050115;OID=.;OPOS=145543972;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:140:140:2:2:137:138:81:56:0:2:82:56:0:2 chr5 145887453 . G A 222.71 PASS AO=64;DP=155;FAO=64;FDP=154;FR=.;FRO=90;FSAF=43;FSAR=21;FSRF=45;FSRR=45;FWDB=0.00303799;FXX=0.0064512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.876;QD=5.78457;RBI=0.0205278;REFB=-0.00893801;REVB=-0.0203017;RO=90;SAF=43;SAR=21;SRF=45;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187656;STB=0.6056;TYPE=snp;VARB=0.00963965;OID=.;OPOS=145887453;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:154:90:90:64:64:21:43:45:45:21:43:45:45 chr5 145890028 . A G 1466.05 PASS AO=149;DP=149;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0148573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.581;QD=38.0793;RBI=0.0239028;REFB=0;REVB=0.0187244;RO=0;SAF=75;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.04822e-06;OID=.;OPOS=145890028;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:149:154:0:0:149:154:74:75:0:0:74:80:0:0 chr5 145890228 . G A 239.19 PASS AO=48;DP=89;FAO=50;FDP=89;FR=.;FRO=39;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=-0.0199361;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=40.5876;QD=10.75;RBI=0.100691;REFB=-0.060753;REVB=0.098698;RO=36;SAF=19;SAR=29;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105138;STB=0.539155;TYPE=snp;VARB=0.0591899;OID=.;OPOS=145890228;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:36:39:48:50:29:19:19:17:30:20:19:20 chr5 145894896 . G C 419.35 PASS AO=75;DP=119;FAO=75;FDP=119;FR=.;FRO=44;FSAF=21;FSAR=54;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=-0.0749852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.385;QD=14.0959;RBI=0.0751687;REFB=-0.0932839;REVB=0.00524928;RO=44;SAF=21;SAR=54;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170431;STB=0.592623;TYPE=snp;VARB=0.0404291;OID=.;OPOS=145894896;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:44:44:75:75:54:21:22:22:54:21:22:22 chr5 145895558 . G A 347.43 PASS AO=65;DP=110;FAO=77;FDP=132;FR=.;FRO=55;FSAF=45;FSAR=32;FSRF=44;FSRR=11;FWDB=-0.020791;FXX=0.0222206;HRUN=3;LEN=1;MLLD=104.027;QD=10.5281;RBI=0.0290685;REFB=-0.0449345;REVB=-0.0203153;RO=45;SAF=45;SAR=20;SRF=42;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236063;STB=0.595419;TYPE=snp;VARB=0.02867;OID=.;OPOS=145895558;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:132:45:55:65:77:20:45:42:3:32:45:44:11 chr5 145935658 . G A 523.49 PASS AO=120;DP=261;FAO=131;FDP=274;FR=.;FRO=143;FSAF=42;FSAR=89;FSRF=50;FSRR=93;FWDB=0.00373211;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.614;QD=7.64221;RBI=0.0376197;REFB=-0.0102496;REVB=-0.0374341;RO=137;SAF=41;SAR=79;SRF=50;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.024766;STB=0.517178;TYPE=snp;VARB=0.0146389;OID=.;OPOS=145935658;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:261:274:137:143:120:131:79:41:50:87:89:42:50:93 chr5 146460691 . T A 213.78 PASS AO=58;DP=138;FAO=59;FDP=138;FR=.;FRO=79;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=41;FSRR=38;FWDB=0.0101573;FXX=0.0416638;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.8136;QD=6.19652;RBI=0.0224;REFB=-0.00706841;REVB=-0.0199647;RO=75;SAF=29;SAR=29;SRF=39;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0201715;STB=0.515712;TYPE=snp;VARB=0.01151;OID=.;OPOS=146460691;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:75:79:58:59:29:29:39:36:30:29:41:38 chr5 146619206 . G C 210.54 PASS AO=52;DP=113;FAO=53;FDP=115;FR=.;FRO=62;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=21;FSRR=41;FWDB=-0.0102143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.185;QD=7.32304;RBI=0.0122121;REFB=-0.0150859;REVB=0.00669343;RO=59;SAF=26;SAR=26;SRF=20;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154297;STB=0.591723;TYPE=snp;VARB=0.0140802;OID=.;OPOS=146619206;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:115:59:62:52:53:26:26:20:39:26:27:21:41 chr5 146773638 . GC G 137.78 PASS AO=49;DP=110;FAO=49;FDP=97;FR=.;FRO=48;FSAF=7;FSAR=42;FSRF=37;FSRR=11;FWDB=0.0199086;FXX=0.0934492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=19.452;QD=5.68146;RBI=0.0851455;REFB=-0.118336;REVB=-0.0827853;RO=47;SAF=7;SAR=42;SRF=37;SRR=10;SSEN=0.380082;SSEP=0;SSSB=-0.60358;STB=0.832663;TYPE=del;VARB=0.07674;OID=.;OPOS=146773639;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:49:106:49:97:48:7:42:37:11:99:47:7:42:37:10 chr5 146971253 . C T 267.5 PASS AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00972686;FXX=0.121175;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.459;QD=36.8958;RBI=0.0260157;REFB=0;REVB=0.0241289;RO=0;SAF=6;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.41311e-05;OID=.;OPOS=146971253;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:30:29:0:0:29:29:23:6:0:0:23:6:0:0 chr5 146971279 . A G 63.3 PASS AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.0242953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.023;QD=13.3257;RBI=0.0298118;REFB=-0.0476992;REVB=-0.0172766;RO=8;SAF=3;SAR=8;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14905;STB=0.584277;TYPE=snp;VARB=0.00368693;OID=.;OPOS=146971279;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:19:19:8:8:11:11:8:3:1:7:8:3:1:7 chr5 147012291 . G A 341.87 PASS AO=102;DP=251;FAO=103;FDP=252;FR=.;FRO=149;FSAF=45;FSAR=58;FSRF=81;FSRR=68;FWDB=-0.0149033;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.0533;QD=5.42655;RBI=0.0238577;REFB=-0.0111464;REVB=-0.0186301;RO=146;SAF=45;SAR=57;SRF=78;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0980513;STB=0.563095;TYPE=snp;VARB=0.0146547;OID=.;OPOS=147012291;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:251:252:146:149:102:103:57:45:78:68:58:45:81:68 chr5 147024476 . C A 687.32 PASS AO=152;DP=291;FAO=154;FDP=293;FR=.;FRO=139;FSAF=63;FSAR=91;FSRF=37;FSRR=102;FWDB=-0.0029334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.374;QD=9.38313;RBI=0.00674952;REFB=-0.00208689;REVB=-0.00607875;RO=139;SAF=62;SAR=90;SRF=37;SRR=102;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132189;STB=0.571937;TYPE=snp;VARB=0.00209299;OID=.;OPOS=147024476;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:291:293:139:139:152:154:90:62:37:102:91:63:37:102 chr5 147024509 . C T 589.01 PASS AO=129;DP=245;FAO=130;FDP=245;FR=.;FRO=115;FSAF=50;FSAR=80;FSRF=29;FSRR=86;FWDB=0.0114285;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.3049;QD=9.61644;RBI=0.0362364;REFB=0.0180373;REVB=-0.034387;RO=116;SAF=49;SAR=80;SRF=30;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115292;STB=0.567706;TYPE=snp;VARB=-0.0172157;OID=.;OPOS=147024509;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:245:245:116:115:129:130:80:49:30:86:80:50:29:86 chr5 147286054 . G A 1205.7 PASS AO=126;DP=129;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195821;FXX=0.0155027;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.161;QD=37.9748;RBI=0.0357234;REFB=-0.011765;REVB=0.0298782;RO=1;SAF=40;SAR=86;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0117297;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000119714;OID=.;OPOS=147286054;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:129:127:1:0:126:127:86:40:1:0:86:41:0:0 chr5 147468614 . A G 247.05 PASS AO=76;DP=188;FAO=75;FDP=188;FR=.;FRO=113;FSAF=44;FSAR=31;FSRF=71;FSRR=42;FWDB=-0.00995129;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.6041;QD=5.25638;RBI=0.0185828;REFB=-0.000324072;REVB=-0.0156937;RO=112;SAF=45;SAR=31;SRF=70;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0364285;STB=0.526037;TYPE=snp;VARB=0.000928789;OID=.;OPOS=147468614;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:188:112:113:76:75:31:45:70:42:31:44:71:42 chr5 147475386 . A G 395.02 PASS AO=106;DP=240;FAO=107;FDP=242;FR=.;FRO=135;FSAF=85;FSAR=22;FSRF=104;FSRR=31;FWDB=0.00777045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.22;QD=6.52932;RBI=0.00800308;REFB=-0.00269318;REVB=-0.00191559;RO=133;SAF=84;SAR=22;SRF=103;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0269275;STB=0.520024;TYPE=snp;VARB=0.00450278;OID=.;OPOS=147475386;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:240:242:133:135:106:107:22:84:103:30:22:85:104:31 chr5 147477551 . C T 406.88 PASS AO=99;DP=200;FAO=99;FDP=205;FR=.;FRO=106;FSAF=46;FSAR=53;FSRF=48;FSRR=58;FWDB=-0.00390672;FXX=0.00485413;HRUN=2;LEN=1;MLLD=244.585;QD=7.93915;RBI=0.0198304;REFB=0.00399174;REVB=-0.0194418;RO=100;SAF=46;SAR=53;SRF=48;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140864;STB=0.506145;TYPE=snp;VARB=-0.00435791;OID=.;OPOS=147477551;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:200:205:100:106:99:99:53:46:48:52:53:46:48:58 chr5 147480027 . G A 282.31 PASS AO=59;DP=113;FAO=61;FDP=114;FR=.;FRO=53;FSAF=38;FSAR=23;FSRF=35;FSRR=18;FWDB=-0.0104916;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.338;QD=9.90573;RBI=0.0629612;REFB=-0.0242588;REVB=0.0620809;RO=54;SAF=37;SAR=22;SRF=36;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0371299;STB=0.518684;TYPE=snp;VARB=0.0160897;OID=.;OPOS=147480027;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:114:54:53:59:61:22:37:36:18:23:38:35:18 chr5 147480112 . T C 318.64 PASS AO=78;DP=164;FAO=78;FDP=163;FR=.;FRO=85;FSAF=41;FSAR=37;FSRF=37;FSRR=48;FWDB=-0.00523961;FXX=0.00609719;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.747;QD=7.81939;RBI=0.00552286;REFB=0.00361299;REVB=-0.00174599;RO=84;SAF=41;SAR=37;SRF=37;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0798084;STB=0.546998;TYPE=snp;VARB=-0.00323316;OID=.;OPOS=147480112;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:163:84:85:78:78:37:41:37:47:37:41:37:48 chr5 147480955 . A G 61.66 PASS AO=21;DP=63;FAO=21;FDP=63;FR=.;FRO=42;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=0.00664667;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=84.8651;QD=3.91475;RBI=0.00666311;REFB=-0.0016922;REVB=0.000467801;RO=42;SAF=10;SAR=11;SRF=25;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134774;STB=0.578874;TYPE=snp;VARB=0.00637383;OID=.;OPOS=147480955;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:63:63:42:42:21:21:11:10:25:17:11:10:25:17 chr5 147481430 . A G 234.11 PASS AO=72;DP=222;FAO=99;FDP=270;FR=.;FRO=171;FSAF=31;FSAR=68;FSRF=74;FSRR=97;FWDB=-0.0773472;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=27.7502;QD=3.46832;RBI=0.0827415;REFB=-0.0283747;REVB=-0.0293866;RO=150;SAF=28;SAR=44;SRF=67;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0699401;STB=0.582602;TYPE=snp;VARB=0.040709;OID=.;OPOS=147481430;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:270:150:171:72:99:44:28:67:83:68:31:74:97 chr5 147486677 . C A 372.57 PASS AO=71;DP=221;FAO=100;FDP=205;FR=.;FRO=105;FSAF=51;FSAR=49;FSRF=56;FSRR=49;FWDB=0.0113352;FXX=0.100873;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.7634;QD=7.26963;RBI=0.0170736;REFB=-0.105974;REVB=-0.012768;RO=75;SAF=45;SAR=26;SRF=48;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00621915;STB=0.511959;TYPE=snp;VARB=0.0475834;OID=.;OPOS=147486677;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:205:75:105:71:100:26:45:48:27:49:51:56:49 chr5 147488367 . C T 273.16 PASS AO=63;DP=127;FAO=63;FDP=126;FR=.;FRO=63;FSAF=21;FSAR=42;FSRF=23;FSRR=40;FWDB=-0.0171767;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.6513;QD=8.67173;RBI=0.0184335;REFB=-0.0107031;REVB=0.0066899;RO=63;SAF=21;SAR=42;SRF=23;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0319419;STB=0.517641;TYPE=snp;VARB=0.00356032;OID=.;OPOS=147488367;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:126:63:63:63:63:42:21:23:40:42:21:23:40 chr5 147498019 . G A 2294.09 PASS AO=243;DP=248;FAO=246;FDP=246;FR=.;FRO=0;FSAF=114;FSAR=132;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0125489;FXX=0.0120477;HRUN=3;LEN=1;MLLD=253.382;QD=37.3022;RBI=0.015492;REFB=-0.016908;REVB=0.00908444;RO=4;SAF=111;SAR=132;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00910827;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.60886e-05;OID=.;OPOS=147498019;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:248:246:4:0:243:246:132:111:3:1:132:114:0:0 chr5 147498543 . C T 226 PASS AO=59;DP=132;FAO=59;FDP=132;FR=.;FRO=73;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=48;FSRR=25;FWDB=0.0390434;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.6139;QD=6.84839;RBI=0.0419406;REFB=0.00881312;REVB=-0.0153175;RO=73;SAF=31;SAR=28;SRF=48;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132716;STB=0.573776;TYPE=snp;VARB=-0.0214744;OID=.;OPOS=147498543;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:73:73:59:59:28:31:48:25:28:31:48:25 chr5 147499616 . C T 1024.64 PASS AO=110;DP=114;FAO=111;FDP=113;FR=.;FRO=2;FSAF=54;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0279872;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.506;QD=36.2706;RBI=0.0293156;REFB=0.0219628;REVB=-0.00872478;RO=2;SAF=53;SAR=57;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0163638;STB=0.508619;TYPE=snp;VARB=-0.000168898;OID=.;OPOS=147499616;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:114:113:2:2:110:111:57:53:0:2:57:54:0:2 chr5 147499670 . C T 1205.41 PASS AO=129;DP=131;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0299692;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.574;QD=36.8063;RBI=0.031885;REFB=-0.107847;REVB=-0.0108858;RO=2;SAF=69;SAR=60;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0155753;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000530874;OID=.;OPOS=147499670;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:131:131:2:0:129:131:60:69:0:2:61:70:0:0 chr5 147505116 . G A 1057.48 PASS AO=111;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00346257;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.387;QD=38.1072;RBI=0.0240225;REFB=0;REVB=0.0237716;RO=0;SAF=40;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.69294e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.80197e-05;OID=.;OPOS=147505116;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:111:111:0:0:111:111:71:40:0:0:71:40:0:0 chr5 147510866 . T C 1521.19 PASS AO=164;DP=168;FAO=165;FDP=168;FR=.;FRO=3;FSAF=110;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0216057;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.007;QD=36.2187;RBI=0.0855766;REFB=-0.0655608;REVB=0.0828043;RO=2;SAF=110;SAR=54;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0172947;STB=0.513273;TYPE=snp;VARB=0.000318029;OID=.;OPOS=147510866;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:168:168:2:3:164:165:54:110:0:2:55:110:0:3 chr5 147554889 . A C 646.58 PASS AO=223;DP=498;FAO=177;FDP=400;FR=.;FRO=223;FSAF=85;FSAR=92;FSRF=127;FSRR=96;FWDB=-0.0208866;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=157.122;QD=6.4658;RBI=0.0248844;REFB=-0.0318325;REVB=0.0135272;RO=275;SAF=108;SAR=115;SRF=152;SRR=123;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0683008;STB=0.549651;TYPE=snp;VARB=0.0272381;OID=.;OPOS=147554889;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:498:400:275:223:223:177:115:108:152:123:92:85:127:96 chr5 147593497 . C A 681.82 PASS AO=147;DP=270;FAO=147;FDP=272;FR=.;FRO=125;FSAF=72;FSAR=75;FSRF=78;FSRR=47;FWDB=-0.0237987;FXX=0.00366287;HRUN=4;LEN=1;MLLD=176.389;QD=10.0267;RBI=0.0273414;REFB=-0.00377704;REVB=-0.01346;RO=122;SAF=72;SAR=75;SRF=76;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110816;STB=0.561537;TYPE=snp;VARB=0.00201166;OID=.;OPOS=147593497;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:270:272:122:125:147:147:75:72:76:46:75:72:78:47 chr5 147703416 . C T 138.29 PASS AO=39;DP=97;FAO=40;FDP=99;FR=.;FRO=59;FSAF=11;FSAR=29;FSRF=19;FSRR=40;FWDB=0.0130699;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.301;QD=5.58765;RBI=0.0132941;REFB=-0.00311022;REVB=0.00243146;RO=57;SAF=11;SAR=28;SRF=18;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0426507;STB=0.534052;TYPE=snp;VARB=0.00425717;OID=.;OPOS=147703416;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:99:57:59:39:40:28:11:18:39:29:11:19:40 chr5 147805120 . T C 1636.86 PASS AO=165;DP=165;FAO=172;FDP=172;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.857;QD=38.0665;RBI=0.0226766;REFB=0;REVB=0.0041834;RO=0;SAF=75;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.12797e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.36749e-05;OID=.;OPOS=147805120;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:165:172:0:0:165:172:90:75:0:0:90:82:0:0 chr5 147856333 . G A 88.24 PASS AO=32;DP=97;FAO=32;FDP=96;FR=.;FRO=64;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=38;FWDB=0.0133011;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.464;QD=3.67652;RBI=0.0177423;REFB=0.0080162;REVB=0.0117418;RO=63;SAF=19;SAR=13;SRF=26;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205292;STB=0.623476;TYPE=snp;VARB=-0.0166283;OID=.;OPOS=147856333;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:97:96:63:64:32:32:13:19:26:37:13:19:26:38 chr5 148206440 . G A 328.4 PASS AO=37;DP=39;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0459764;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.086;QD=34.5687;RBI=0.0461701;REFB=-0.123359;REVB=0.00422425;RO=2;SAF=25;SAR=12;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0718399;STB=0.518508;TYPE=snp;VARB=0.000776814;OID=.;OPOS=148206440;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:39:38:2:1:37:37:12:25:0:2:13:24:0:1 chr5 148206473 . G C 264.66 PASS AO=32;DP=35;FAO=31;FDP=33;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00448577;FXX=0.0294031;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.052;QD=32.0798;RBI=0.0820864;REFB=0.00344323;REVB=0.0819637;RO=2;SAF=18;SAR=14;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0621254;STB=0.533312;TYPE=snp;VARB=0.00021142;OID=.;OPOS=148206473;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:35:33:2:2:32:31:14:18:0:2:14:17:0:2 chr5 148386525 . T G 865.19 PASS AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0219006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.825;QD=38.0303;RBI=0.0368534;REFB=0;REVB=0.0296401;RO=0;SAF=80;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.38974e-06;OID=.;OPOS=148386525;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:91:91:0:0:91:91:11:80:0:0:11:80:0:0 chr5 148407708 . A C 837.29 PASS AO=88;DP=89;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.1717;QD=37.213;RBI=0.0160277;REFB=-0.0454168;REVB=0.0082107;RO=1;SAF=42;SAR=46;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111493;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00336622;OID=.;OPOS=148407708;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:89:90:1:0:88:90:46:42:1:0:47:43:0:0 chr5 148407893 . C A 690.17 PASS AO=43;DP=76;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0191361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.743;QD=33.667;RBI=0.221451;REFB=-0.102671;REVB=0.220622;RO=0;SAF=38;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506492;TYPE=snp;VARB=0.00274178;OID=.;OPOS=148407893;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:46:82:0:1:43:81:5:38:0:0:38:43:0:1 chr5 148408101 . A G 323.12 PASS AO=37;DP=40;FAO=37;FDP=40;FR=.;FRO=3;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0318292;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=188.737;QD=32.3124;RBI=0.0319951;REFB=-0.15206;REVB=0.00325449;RO=3;SAF=19;SAR=18;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0214906;STB=0.511496;TYPE=snp;VARB=0.00213502;OID=.;OPOS=148408101;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:40:40:3:3:37:37:18:19:2:1:18:19:2:1 chr5 148425517 . TA T,TT 125.08 PASS AO=5,8;DP=13;FAO=11,3;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=4,1;FSAR=7,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00947421,-0.00328358;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=163.578,161.516;QD=35.738;RBI=0.0431026,0.0406421;REFB=0,0;REVB=-0.0420485,-0.0405093;RO=0;SAF=4,0;SAR=1,8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.0194313,0.0177047;OID=.,.;OPOS=148425518,148425518;OREF=A,A;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:5,8:13:11,3:14:0:4,1:7,2:0:0:8:0:4,0:1,8:0:0 chr5 148578636 . T C 1478.6 PASS AO=149;DP=149;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.185;QD=38.1574;RBI=0.023821;REFB=0;REVB=0.011287;RO=0;SAF=72;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.80287e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.80515e-05;OID=.;OPOS=148578636;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:149:155:0:0:149:155:77:72:0:0:79:76:0:0 chr5 148720087 . T G 1791.1 PASS AO=164;DP=170;FAO=190;FDP=190;FR=.;FRO=0;FSAF=102;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0833252;FXX=0.00523533;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.0026;QD=37.7074;RBI=0.0845809;REFB=-0.0347078;REVB=0.0145201;RO=1;SAF=88;SAR=76;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00537716;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000149764;OID=.;OPOS=148720087;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:170:190:1:0:164:190:76:88:1:0:88:102:0:0 chr5 148747902 . G C 15.65 PASS AO=5;DP=19;FAO=5;FDP=19;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.0566604;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.8648;QD=3.29445;RBI=0.0656657;REFB=-0.0384199;REVB=0.0331902;RO=14;SAF=3;SAR=2;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189489;STB=0.624507;TYPE=snp;VARB=0.0643296;OID=.;OPOS=148747902;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:19:19:14:14:5:5:2:3:6:8:2:3:6:8 chr5 148986244 . G C 309.17 PASS AO=81;DP=181;FAO=81;FDP=180;FR=.;FRO=99;FSAF=33;FSAR=48;FSRF=48;FSRR=51;FWDB=-0.0572543;FXX=0.00552456;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.1078;QD=6.87041;RBI=0.0573729;REFB=-0.0177339;REVB=-0.0036864;RO=99;SAF=33;SAR=48;SRF=48;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0780454;STB=0.543385;TYPE=snp;VARB=0.0197322;OID=.;OPOS=148986244;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:180:99:99:81:81:48:33:48:51:48:33:48:51 chr5 148989122 . C T 228.21 PASS AO=53;DP=125;FAO=60;FDP=131;FR=.;FRO=71;FSAF=3;FSAR=57;FSRF=14;FSRR=57;FWDB=-0.00151602;FXX=0.0150365;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.195;QD=6.96831;RBI=0.0132962;REFB=-0.00802918;REVB=0.0132095;RO=70;SAF=3;SAR=50;SRF=14;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.392422;STB=0.739022;TYPE=snp;VARB=0.00994011;OID=.;OPOS=148989122;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:131:70:71:53:60:50:3:14:56:57:3:14:57 chr5 149001551 . A C 179.36 PASS AO=35;DP=61;FAO=35;FDP=62;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.0408918;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.117;QD=11.5718;RBI=0.0414758;REFB=-0.0140083;REVB=-0.00693566;RO=26;SAF=15;SAR=20;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00434152;STB=0.507038;TYPE=snp;VARB=0.00719267;OID=.;OPOS=149001551;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:62:26:27:35:35:20:15:11:15:20:15:12:15 chr5 149006640 . C T 73.91 PASS AO=21;DP=54;FAO=21;FDP=54;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=4;FSRF=28;FSRR=5;FWDB=-0.0259754;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.7192;QD=5.47488;RBI=0.0448777;REFB=-0.0142661;REVB=-0.0365963;RO=33;SAF=17;SAR=4;SRF=28;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0707154;STB=0.540504;TYPE=snp;VARB=0.0301441;OID=.;OPOS=149006640;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:54:54:33:33:21:21:4:17:28:5:4:17:28:5 chr5 149006837 . A G 26.71 PASS AO=7;DP=21;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=-0.0358673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.478;QD=5.08667;RBI=0.0588764;REFB=-0.00756651;REVB=-0.0466901;RO=14;SAF=4;SAR=3;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.301111;STB=0.68373;TYPE=snp;VARB=0.00943477;OID=.;OPOS=149006837;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:21:21:14:14:7:7:3:4:4:10:3:4:4:10 chr5 149008403 . A G 232.17 PASS AO=57;DP=122;FAO=57;FDP=121;FR=.;FRO=64;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=23;FSRR=41;FWDB=-0.067783;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.058;QD=7.67509;RBI=0.0724421;REFB=-0.0139236;REVB=-0.0255602;RO=63;SAF=27;SAR=30;SRF=22;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119185;STB=0.560997;TYPE=snp;VARB=0.013256;OID=.;OPOS=149008403;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:121:63:64:57:57:30:27:22:41:30:27:23:41 chr5 149008521 . A G 157.59 PASS AO=42;DP=99;FAO=42;FDP=97;FR=.;FRO=55;FSAF=5;FSAR=37;FSRF=7;FSRR=48;FWDB=-0.122349;FXX=0.0202;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.214;QD=6.49862;RBI=0.122632;REFB=-0.0033543;REVB=-0.00833087;RO=55;SAF=5;SAR=37;SRF=7;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0194118;STB=0.510927;TYPE=snp;VARB=0.00558387;OID=.;OPOS=149008521;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:97:55:55:42:42:37:5:7:48:37:5:7:48 chr5 149200043 . T C 406.25 PASS AO=107;DP=236;FAO=107;FDP=236;FR=.;FRO=129;FSAF=31;FSAR=76;FSRF=29;FSRR=100;FWDB=-0.083686;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.188;QD=6.88553;RBI=0.0880874;REFB=-0.00962288;REVB=0.0274961;RO=129;SAF=31;SAR=76;SRF=29;SRR=100;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0810904;STB=0.54472;TYPE=snp;VARB=0.0119325;OID=.;OPOS=149200043;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:236:236:129:129:107:107:76:31:29:100:76:31:29:100 chr5 149323772 . G A 462.97 PASS AO=53;DP=56;FAO=53;FDP=56;FR=.;FRO=3;FSAF=38;FSAR=15;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0186534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.208;QD=33.0696;RBI=0.027155;REFB=-0.173162;REVB=-0.0197344;RO=1;SAF=38;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122398;STB=0.51898;TYPE=snp;VARB=-0.00133083;OID=.;OPOS=149323772;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:56:56:1:3:53:53:15:38:1:0:15:38:3:0 chr5 149323906 . T G 1186.55 PASS AO=125;DP=125;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0143278;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.357;QD=37.9696;RBI=0.0192634;REFB=0;REVB=-0.0128761;RO=0;SAF=44;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.89864e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.24519e-05;OID=.;OPOS=149323906;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:125:125:0:0:125:125:81:44:0:0:80:45:0:0 chr5 149324009 . T C 157.79 PASS AO=49;DP=127;FAO=49;FDP=128;FR=.;FRO=79;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=42;FSRR=37;FWDB=-0.031733;FXX=0.00775134;HRUN=3;LEN=1;MLLD=104.822;QD=4.93078;RBI=0.0338787;REFB=-0.0149555;REVB=0.0118651;RO=78;SAF=27;SAR=22;SRF=42;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0137175;STB=0.512049;TYPE=snp;VARB=0.0250384;OID=.;OPOS=149324009;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:128:78:79:49:49:22:27:42:36:22:27:42:37 chr5 149360877 . T C 2133.85 PASS AO=224;DP=227;FAO=227;FDP=227;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=123;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0160817;FXX=0.0130429;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.3886;QD=37.6009;RBI=0.0352809;REFB=-0.0229201;REVB=0.0314025;RO=2;SAF=104;SAR=120;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000605335;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00056742;OID=.;OPOS=149360877;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:227:227:2:0:224:227:120:104:1:1:123:104:0:0 chr5 149433400 . G GC 110.35 PASS AO=17;DP=57;FAO=24;FDP=46;FR=.;FRO=22;FSAF=21;FSAR=3;FSRF=21;FSRR=1;FWDB=0.000248479;FXX=0.148121;HRUN=0;LEN=1;MLLD=244.55;QD=9.59542;RBI=0.172986;REFB=0.0100113;REVB=-0.172986;RO=33;SAF=17;SAR=0;SRF=27;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.758805;STB=0.59993;TYPE=ins;VARB=-0.00839173;OID=.;OPOS=149433401;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:17:57:24:46:22:21:3:21:1:93:33:17:0:27:6 chr5 149449827 . C T 53.3 PASS AO=16;DP=56;FAO=19;FDP=60;FR=.;FRO=41;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=0.0107882;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.622;QD=3.55317;RBI=0.0500046;REFB=0.0109666;REVB=0.048827;RO=38;SAF=8;SAR=8;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0925254;STB=0.5045;TYPE=snp;VARB=-0.0248816;OID=.;OPOS=149449827;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:56:60:38:41:16:19:8:8:16:22:11:8:17:24 chr5 149456771 . C A 373.27 PASS AO=104;DP=241;FAO=104;FDP=241;FR=.;FRO=137;FSAF=53;FSAR=51;FSRF=61;FSRR=76;FWDB=-0.00942227;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.47;QD=6.19527;RBI=0.0103288;REFB=-0.000449364;REVB=0.00423134;RO=137;SAF=53;SAR=51;SRF=61;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0656889;STB=0.536541;TYPE=snp;VARB=0.00646138;OID=.;OPOS=149456771;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:241:241:137:137:104:104:51:53:61:76:51:53:61:76 chr5 149456772 . T A 395.77 PASS AO=106;DP=241;FAO=107;FDP=241;FR=.;FRO=134;FSAF=54;FSAR=53;FSRF=60;FSRR=74;FWDB=0.00556501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.309;QD=6.56881;RBI=0.0110907;REFB=-0.00915026;REVB=0.00959347;RO=132;SAF=54;SAR=52;SRF=59;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0623954;STB=0.531622;TYPE=snp;VARB=0.00996332;OID=.;OPOS=149456772;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:241:241:132:134:106:107:52:54:59:73:53:54:60:74 chr5 149457678 . G A 146.54 PASS AO=32;DP=63;FAO=32;FDP=63;FR=.;FRO=31;FSAF=26;FSAR=6;FSRF=22;FSRR=9;FWDB=0.0302866;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.673;QD=9.30405;RBI=0.0308023;REFB=-0.0102915;REVB=0.00561237;RO=30;SAF=26;SAR=6;SRF=22;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104039;STB=0.575171;TYPE=snp;VARB=0.0103435;OID=.;OPOS=149457678;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:30:31:32:32:6:26:22:8:6:26:22:9 chr5 149460553 . A G 54.45 PASS AO=9;DP=26;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.00550295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.414;QD=7.5097;RBI=0.050834;REFB=-0.00511548;REVB=-0.0505353;RO=14;SAF=3;SAR=6;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.244315;STB=0.670447;TYPE=snp;VARB=0.0107608;OID=.;OPOS=149460553;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:26:29:14:16:9:13:6:3:8:6:10:3:8:8 chr5 149493472 . C T 862.03 PASS AO=89;DP=89;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00391706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.36;QD=37.8913;RBI=0.00451228;REFB=0;REVB=0.00223993;RO=0;SAF=65;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.34512e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.24313e-06;OID=.;OPOS=149493472;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:89:91:0:0:89:91:24:65:0:0:26:65:0:0 chr5 149495050 . T C 3689.5 PASS AO=421;DP=427;FAO=394;FDP=394;FR=.;FRO=0;FSAF=164;FSAR=230;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00103305;FXX=0.0149996;HRUN=4;LEN=1;MLLD=305.011;QD=37.4569;RBI=0.00801214;REFB=-0.00358413;REVB=0.00794526;RO=4;SAF=177;SAR=244;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0014662;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.68639e-05;OID=.;OPOS=149495050;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:427:394:4:0:421:394:244:177:2:2:230:164:0:0 chr5 149495395 . T C 52.69 PASS AO=15;DP=41;FAO=15;FDP=41;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.0104042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.888;QD=5.14008;RBI=0.036764;REFB=-0.00559146;REVB=-0.0352611;RO=23;SAF=9;SAR=6;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0371963;STB=0.56427;TYPE=snp;VARB=0.00870049;OID=.;OPOS=149495395;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:41:41:23:26:15:15:6:9:13:10:6:9:13:13 chr5 149499672 . T C 198.32 PASS AO=44;DP=86;FAO=44;FDP=86;FR=.;FRO=42;FSAF=29;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=16;FWDB=0.00171865;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=165.528;QD=9.22424;RBI=0.00763504;REFB=0.00389389;REVB=-0.00743909;RO=41;SAF=29;SAR=15;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.047014;STB=0.521452;TYPE=snp;VARB=-0.0040284;OID=.;OPOS=149499672;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:41:42:44:44:15:29:25:16:15:29:26:16 chr5 149563715 . T C 782.54 PASS AO=85;DP=89;FAO=86;FDP=89;FR=.;FRO=3;FSAF=43;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0476239;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.5977;QD=35.1701;RBI=0.0547606;REFB=0.029148;REVB=-0.0270312;RO=4;SAF=42;SAR=43;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0207665;STB=0.51685;TYPE=snp;VARB=-0.00178014;OID=.;OPOS=149563715;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:89:89:4:3:85:86:43:42:1:3:43:43:0:3 chr5 149583300 . T C 195.2 PASS AO=29;DP=40;FAO=29;FDP=40;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=24;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.0677148;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=66.1629;QD=19.5195;RBI=0.124662;REFB=0.0127609;REVB=-0.104668;RO=11;SAF=5;SAR=24;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149733;STB=0.582148;TYPE=snp;VARB=-0.0115765;OID=.;OPOS=149583300;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:40:40:11:11:29:29:24:5:4:7:24:5:4:7 chr5 149583336 . T C 150.97 PASS AO=25;DP=38;FAO=25;FDP=38;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=23;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.00991402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.8714;QD=15.8918;RBI=0.0206605;REFB=-0.0382318;REVB=0.0181264;RO=13;SAF=2;SAR=23;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.393269;STB=0.721745;TYPE=snp;VARB=0.0174074;OID=.;OPOS=149583336;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:38:38:13:13:25:25:23:2:5:8:23:2:5:8 chr5 149585025 . A C 584.24 PASS AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0315742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.803;QD=37.6926;RBI=0.0343724;REFB=0;REVB=-0.0135842;RO=0;SAF=37;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.58877e-05;OID=.;OPOS=149585025;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:62:62:0:0:62:62:25:37:0:0:25:37:0:0 chr5 149597160 . A G 159.6 PASS AO=54;DP=149;FAO=54;FDP=149;FR=.;FRO=95;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=67;FSRR=28;FWDB=0.00915151;FXX=0.00666622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.055;QD=4.2846;RBI=0.0467955;REFB=-0.0218396;REVB=-0.045892;RO=94;SAF=30;SAR=24;SRF=67;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182931;STB=0.598731;TYPE=snp;VARB=0.0319988;OID=.;OPOS=149597160;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:94:95:54:54:24:30:67:27:24:30:67:28 chr5 149602222 . GAC G 134.84 PASS AO=37;DP=90;FAO=37;FDP=89;FR=.;FRO=52;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=32;FWDB=0.0145979;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=2;MLLD=220.32;QD=6.06013;RBI=0.0293425;REFB=-0.00459179;REVB=-0.0254535;RO=50;SAF=22;SAR=15;SRF=20;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197045;STB=0.62133;TYPE=del;VARB=0.00651674;OID=.;OPOS=149602223;OREF=AC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:37:90:37:89:52:22:15:20:32:99:50:22:15:20:30 chr5 149602280 . T C 794.85 PASS AO=82;DP=86;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168154;FXX=0.0344788;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.947;QD=37.8501;RBI=0.0179977;REFB=0;REVB=-0.00641549;RO=0;SAF=30;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000323408;OID=.;OPOS=149602280;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:86:84:0:0:82:84:52:30:0:0:53:31:0:0 chr5 149602608 . A G 316.55 PASS AO=20;DP=37;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0244424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.526;QD=37.2411;RBI=0.0392637;REFB=0;REVB=0.0307279;RO=0;SAF=2;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.19193e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000105472;OID=.;OPOS=149602608;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:20:34:0:0:20:34:18:2:0:0:24:10:0:0 chr5 149644597 . T G 1373.26 PASS AO=145;DP=145;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00988542;FXX=0.00689608;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.913;QD=38.1461;RBI=0.0293023;REFB=0;REVB=0.0275844;RO=0;SAF=61;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11288e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.15334e-05;OID=.;OPOS=149644597;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:145:144:0:0:145:144:84:61:0:0:84:60:0:0 chr5 149677851 . A G 767.62 PASS AO=82;DP=83;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00433352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.7387;QD=36.5533;RBI=0.017469;REFB=-0.0981804;REVB=0.0169229;RO=1;SAF=40;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116923;STB=0.506171;TYPE=snp;VARB=0.000755689;OID=.;OPOS=149677851;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:83:84:1:1:82:83:42:40:1:0:43:40:1:0 chr5 149755073 . G A 248.82 PASS AO=44;DP=87;FAO=52;FDP=95;FR=.;FRO=43;FSAF=6;FSAR=46;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=0.00442931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.388;QD=10.4766;RBI=0.0372191;REFB=-0.0419132;REVB=0.0369546;RO=43;SAF=4;SAR=40;SRF=19;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.496555;STB=0.732375;TYPE=snp;VARB=0.0380723;OID=.;OPOS=149755073;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:95:43:43:44:52:40:4:19:24:46:6:19:24 chr5 149776232 . C T 266.48 PASS AO=52;DP=92;FAO=53;FDP=93;FR=.;FRO=40;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=0.0139313;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.256;QD=11.4614;RBI=0.0165116;REFB=-0.019796;REVB=0.00886292;RO=38;SAF=27;SAR=25;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0462599;STB=0.52823;TYPE=snp;VARB=0.0138769;OID=.;OPOS=149776232;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:93:38:40:52:53:25:27:22:16:26:27:23:17 chr5 149824223 . T C 88.86 PASS AO=23;DP=54;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.0035123;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=275.508;QD=6.58209;RBI=0.0068747;REFB=0.00153719;REVB=0.00590976;RO=31;SAF=8;SAR=15;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110308;STB=0.563084;TYPE=snp;VARB=-0.0023369;OID=.;OPOS=149824223;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:54:54:31:31:23:23:15:8:14:17:15:8:14:17 chr5 149825118 . T C 162.38 PASS AO=43;DP=99;FAO=43;FDP=99;FR=.;FRO=56;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=28;FWDB=-0.00505593;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=179.814;QD=6.56092;RBI=0.00703599;REFB=-0.0187269;REVB=0.00489313;RO=43;SAF=22;SAR=21;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506576;TYPE=snp;VARB=0.015268;OID=.;OPOS=149825118;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:43:56:43:43:21:22:22:21:21:22:28:28 chr5 149826526 . C T 480.53 PASS AO=86;DP=135;FAO=86;FDP=135;FR=.;FRO=49;FSAF=46;FSAR=40;FSRF=20;FSRR=29;FWDB=0.00710106;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=194.423;QD=14.2379;RBI=0.0199576;REFB=-0.0176056;REVB=-0.0186516;RO=49;SAF=46;SAR=40;SRF=20;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.084991;STB=0.545913;TYPE=snp;VARB=0.00861746;OID=.;OPOS=149826526;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:49:49:86:86:40:46:20:29:40:46:20:29 chr5 149907533 . T G 249.58 PASS AO=49;DP=83;FAO=48;FDP=82;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=38;FSRF=10;FSRR=24;FWDB=0.00207807;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=203.015;QD=12.1744;RBI=0.0364218;REFB=-0.0189246;REVB=-0.0363624;RO=34;SAF=11;SAR=38;SRF=10;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0714401;STB=0.550702;TYPE=snp;VARB=0.0121613;OID=.;OPOS=149907533;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:82:34:34:49:48:38:11:10:24:38:10:10:24 chr5 149907602 . A G 97.93 PASS AO=19;DP=34;FAO=19;FDP=34;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.0110768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5136;QD=11.5211;RBI=0.0241537;REFB=0.00193459;REVB=-0.0214641;RO=14;SAF=10;SAR=9;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144517;STB=0.562436;TYPE=snp;VARB=-0.00183637;OID=.;OPOS=149907602;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:34:34:14:15:19:19:9:10:10:4:9:10:10:5 chr5 149919739 . G C 712.13 PASS AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0305888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.005;QD=37.9803;RBI=0.0313031;REFB=0;REVB=-0.00664917;RO=0;SAF=30;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.25968e-05;OID=.;OPOS=149919739;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:75:75:0:0:75:75:45:30:0:0:45:30:0:0 chr5 149923209 . C T 302.66 PASS AO=72;DP=148;FAO=72;FDP=148;FR=.;FRO=76;FSAF=60;FSAR=12;FSRF=53;FSRR=23;FWDB=-0.0155776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.3769;QD=8.18006;RBI=0.0157603;REFB=-0.00681988;REVB=0.00239246;RO=74;SAF=60;SAR=12;SRF=51;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200594;STB=0.607606;TYPE=snp;VARB=0.0092179;OID=.;OPOS=149923209;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:74:76:72:72:12:60:51:23:12:60:53:23 chr5 149937495 . TA T 190.13 PASS AO=47;DP=130;FAO=56;FDP=134;FR=.;FRO=78;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=43;FSRR=35;FWDB=-0.00651174;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.398;QD=5.67554;RBI=0.0165489;REFB=-0.0249929;REVB=0.0152139;RO=78;SAF=22;SAR=25;SRF=42;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0770657;STB=0.550514;TYPE=del;VARB=0.0351996;OID=.;OPOS=149937496;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:47:130:56:134:78:26:30:43:35:99:78:22:25:42:36 chr5 150051851 . G A 31.23 PASS AO=7;DP=17;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=0.0117029;FXX=0.117578;HRUN=5;LEN=1;MLLD=143.589;QD=8.32909;RBI=0.0203214;REFB=0.00416502;REVB=0.0166133;RO=8;SAF=3;SAR=4;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.497472;STB=0.785113;TYPE=snp;VARB=-0.00969137;OID=.;OPOS=150051851;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:17:15:8:8:7:7:4:3:8:0:4:3:8:0 chr5 150051958 . T C 577.13 PASS AO=58;DP=58;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0453368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.933;QD=37.2344;RBI=0.0686685;REFB=0;REVB=0.0515747;RO=0;SAF=25;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000205207;OID=.;OPOS=150051958;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:58:62:0:0:58:62:33:25:0:0:33:29:0:0 chr5 150227998 . C T 271.72 PASS AO=55;DP=98;FAO=55;FDP=98;FR=.;FRO=43;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=28;FSRR=15;FWDB=0.0762048;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.6672;QD=11.0906;RBI=0.0762808;REFB=0.0290889;REVB=-0.00340273;RO=43;SAF=30;SAR=25;SRF=28;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0862269;STB=0.547153;TYPE=snp;VARB=-0.0193262;OID=.;OPOS=150227998;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:43:43:55:55:25:30:28:15:25:30:28:15 chr5 150257616 . A G 186.8 PASS AO=53;DP=129;FAO=53;FDP=128;FR=.;FRO=75;FSAF=20;FSAR=33;FSRF=22;FSRR=53;FWDB=-0.0236474;FXX=0.00775134;HRUN=4;LEN=1;MLLD=52.9914;QD=5.83757;RBI=0.0305718;REFB=-0.00224664;REVB=-0.0193762;RO=76;SAF=20;SAR=33;SRF=22;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101017;STB=0.553747;TYPE=snp;VARB=0.00262153;OID=.;OPOS=150257616;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:128:76:75:53:53:33:20:22:54:33:20:22:53 chr5 150311773 . T C 1666.76 PASS AO=179;DP=189;FAO=189;FDP=195;FR=.;FRO=6;FSAF=66;FSAR=123;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.0352909;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=36.1382;QD=34.1899;RBI=0.0359845;REFB=-0.14952;REVB=-0.00703109;RO=6;SAF=59;SAR=120;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0346983;STB=0.521737;TYPE=snp;VARB=0.00726364;OID=.;OPOS=150311773;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:189:195:6:6:179:189:120:59:5:1:123:66:6:0 chr5 150323428 . A G 609.93 PASS AO=141;DP=279;FAO=141;FDP=278;FR=.;FRO=137;FSAF=64;FSAR=77;FSRF=55;FSRR=82;FWDB=0.00923285;FXX=0.0035841;HRUN=2;LEN=1;MLLD=266.473;QD=8.77601;RBI=0.0173362;REFB=-0.0131982;REVB=0.0146731;RO=137;SAF=64;SAR=77;SRF=55;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0478488;STB=0.526187;TYPE=snp;VARB=0.0108408;OID=.;OPOS=150323428;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:279:278:137:137:141:141:77:64:55:82:77:64:55:82 chr5 150407456 . T C 3058.66 PASS AO=319;DP=320;FAO=320;FDP=320;FR=.;FRO=0;FSAF=193;FSAR=127;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0499312;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.299;QD=38.2333;RBI=0.072022;REFB=0;REVB=0.0519042;RO=1;SAF=193;SAR=126;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00377081;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.71938e-05;OID=.;OPOS=150407456;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:320:320:1:0:319:320:126:193:0:1:127:193:0:0 chr5 150409477 . T C 352.58 PASS AO=66;DP=110;FAO=66;FDP=110;FR=.;FRO=44;FSAF=9;FSAR=57;FSRF=17;FSRR=27;FWDB=0.030624;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.166;QD=12.8212;RBI=0.0306596;REFB=0.00260408;REVB=0.00147703;RO=44;SAF=9;SAR=57;SRF=17;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.294066;STB=0.662141;TYPE=snp;VARB=-0.00147083;OID=.;OPOS=150409477;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:44:44:66:66:57:9:17:27:57:9:17:27 chr5 150413226 . A G 21.11 PASS AO=7;DP=9;FAO=4;FDP=10;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.00177398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.62;QD=8.44441;RBI=0.0338776;REFB=-0.00269404;REVB=0.0338311;RO=2;SAF=3;SAR=4;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216951;STB=0.816791;TYPE=snp;VARB=0.0169758;OID=.;OPOS=150413226;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:9:10:2:6:7:4:4:3:2:0:3:1:5:1 chr5 150425467 . G A 117.66 PASS AO=15;DP=19;FAO=16;FDP=20;FR=.;FRO=4;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0288363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.616;QD=23.5323;RBI=0.057344;REFB=-0.0230235;REVB=0.0495661;RO=4;SAF=11;SAR=4;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.299345;STB=0.642673;TYPE=snp;VARB=0.00404673;OID=.;OPOS=150425467;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:19:20:4:4:15:16:4:11:0:4:5:11:0:4 chr5 150480520 . C T 243.24 PASS AO=63;DP=140;FAO=63;FDP=140;FR=.;FRO=77;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=35;FSRR=42;FWDB=0.0150641;FXX=0.0070917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.8125;QD=6.94962;RBI=0.0293203;REFB=-0.0300266;REVB=-0.0251546;RO=76;SAF=30;SAR=33;SRF=35;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154361;STB=0.511942;TYPE=snp;VARB=0.0328964;OID=.;OPOS=150480520;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:76:77:63:63:33:30:35:41:33:30:35:42 chr5 150489390 . A G 173.15 PASS AO=48;DP=125;FAO=51;FDP=128;FR=.;FRO=77;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=42;FSRR=35;FWDB=0.0167443;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.599;QD=5.41088;RBI=0.0203639;REFB=-0.0110577;REVB=0.0115896;RO=77;SAF=23;SAR=25;SRF=42;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0718396;STB=0.521464;TYPE=snp;VARB=0.018832;OID=.;OPOS=150489390;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:128:77:77:48:51:25:23:42:35:25:26:42:35 chr5 150857062 . T G 563.48 PASS AO=134;DP=271;FAO=134;FDP=271;FR=.;FRO=137;FSAF=51;FSAR=83;FSRF=62;FSRR=75;FWDB=0.00847725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.23;QD=8.31697;RBI=0.00885433;REFB=-0.0011164;REVB=-0.00255643;RO=137;SAF=51;SAR=83;SRF=62;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.068916;STB=0.537874;TYPE=snp;VARB=0.000890842;OID=.;OPOS=150857062;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:271:271:137:137:134:134:83:51:62:75:83:51:62:75 chr5 150884057 . C T 184.2 PASS AO=51;DP=121;FAO=51;FDP=121;FR=.;FRO=70;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=38;FSRR=32;FWDB=0.0227012;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.734;QD=6.08932;RBI=0.0244772;REFB=-0.00500481;REVB=0.00915364;RO=69;SAF=28;SAR=23;SRF=37;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0132023;STB=0.503596;TYPE=snp;VARB=0.00765839;OID=.;OPOS=150884057;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:69:70:51:51:23:28:37:32:23:28:38:32 chr5 150884089 . A G 172.18 PASS AO=51;DP=127;FAO=51;FDP=127;FR=.;FRO=76;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=42;FSRR=34;FWDB=-0.0219712;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.9401;QD=5.42312;RBI=0.0281488;REFB=-0.0161272;REVB=-0.017596;RO=76;SAF=29;SAR=22;SRF=42;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0172295;STB=0.509726;TYPE=snp;VARB=0.0226596;OID=.;OPOS=150884089;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:76:76:51:51:22:29:42:34:22:29:42:34 chr5 150886725 . G A 204.24 PASS AO=61;DP=152;FAO=61;FDP=152;FR=.;FRO=91;FSAF=34;FSAR=27;FSRF=38;FSRR=53;FWDB=0.00828323;FXX=0.00653552;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1109;QD=5.37473;RBI=0.038854;REFB=0.00225508;REVB=-0.0379608;RO=90;SAF=34;SAR=27;SRF=37;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153985;STB=0.583163;TYPE=snp;VARB=-0.00592298;OID=.;OPOS=150886725;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:152:90:91:61:61:27:34:37:53:27:34:38:53 chr5 150901111 . A G 210.51 PASS AO=61;DP=148;FAO=61;FDP=149;FR=.;FRO=88;FSAF=20;FSAR=41;FSRF=33;FSRR=55;FWDB=-0.0424922;FXX=0.00666622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.741;QD=5.65117;RBI=0.0494279;REFB=-0.00590008;REVB=-0.0252493;RO=85;SAF=20;SAR=41;SRF=31;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0425804;STB=0.530896;TYPE=snp;VARB=0.00967996;OID=.;OPOS=150901111;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:149:85:88:61:61:41:20:31:54:41:20:33:55 chr5 150901261 . C T 106.87 PASS AO=22;DP=42;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=0.0400428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.0727;QD=10.1778;RBI=0.0413885;REFB=0.00937091;REVB=0.0104682;RO=19;SAF=8;SAR=14;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0926859;STB=0.560334;TYPE=snp;VARB=-0.00476352;OID=.;OPOS=150901261;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:42:42:19:20:22:22:14:8:5:14:14:8:5:15 chr5 150901300 . G A 45.08 PASS AO=12;DP=32;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=16;FWDB=0.0323798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.04;QD=5.63449;RBI=0.0434306;REFB=-0.00588579;REVB=0.0289442;RO=20;SAF=9;SAR=3;SRF=4;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.539816;STB=0.813823;TYPE=snp;VARB=0.0292754;OID=.;OPOS=150901300;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:32:32:20:20:12:12:3:9:4:16:3:9:4:16 chr5 150901382 . TG T 99.18 PASS AO=16;DP=32;FAO=25;FDP=32;FR=.;FRO=7;FSAF=20;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=-0.325514;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.2378;QD=12.3973;RBI=0.372525;REFB=-0.0440038;REVB=0.181151;RO=7;SAF=14;SAR=2;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.563714;STB=0.676766;TYPE=del;VARB=0.0167466;OID=.;OPOS=150901383;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:16:29:25:32:7:20:5:1:6:10:7:14:2:0:7 chr5 150901597 . G C 38.23 PASS AO=14;DP=47;FAO=14;FDP=47;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=0.00532052;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.273;QD=3.25371;RBI=0.0193351;REFB=-0.0167888;REVB=0.0185887;RO=33;SAF=11;SAR=3;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.377333;STB=0.730545;TYPE=snp;VARB=0.056449;OID=.;OPOS=150901597;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:47:47:33:33:14:14:3:11:16:17:3:11:16:17 chr5 150901630 . G T 39.04 PASS AO=14;DP=46;FAO=14;FDP=46;FR=.;FRO=32;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=0.0196432;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=117.41;QD=3.39499;RBI=0.0220189;REFB=0.00283611;REVB=-0.00994863;RO=32;SAF=6;SAR=8;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153747;STB=0.592461;TYPE=snp;VARB=-0.0198514;OID=.;OPOS=150901630;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:46:46:32:32:14:14:8:6:18:14:8:6:18:14 chr5 150905398 . C T 80.71 PASS AO=40;DP=167;FAO=43;FDP=162;FR=.;FRO=119;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=84;FSRR=35;FWDB=0.00860565;FXX=0.0357122;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.516;QD=1.99294;RBI=0.00965263;REFB=-0.00442244;REVB=-0.0043722;RO=59;SAF=18;SAR=22;SRF=32;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0971092;STB=0.658616;TYPE=snp;VARB=0.0125922;OID=.;OPOS=150905398;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:121:162:59:119:40:43:22:18:32:27:22:21:84:35 chr5 150908813 . G A 483.39 PASS AO=104;DP=190;FAO=104;FDP=193;FR=.;FRO=89;FSAF=42;FSAR=62;FSRF=51;FSRR=38;FWDB=0.00143338;FXX=0.00515437;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.861;QD=10.0183;RBI=0.0270805;REFB=-0.0144371;REVB=-0.0270425;RO=84;SAF=42;SAR=62;SRF=49;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14799;STB=0.578552;TYPE=snp;VARB=0.0164612;OID=.;OPOS=150908813;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:193:84:89:104:104:62:42:49:35:62:42:51:38 chr5 150911317 . G A 195 PASS AO=34;DP=53;FAO=34;FDP=53;FR=.;FRO=19;FSAF=28;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0110283;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.851;QD=14.7169;RBI=0.0228958;REFB=-0.0339632;REVB=0.0200648;RO=19;SAF=28;SAR=6;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18592;STB=0.602582;TYPE=snp;VARB=0.0257576;OID=.;OPOS=150911317;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:53:53:19:19:34:34:6:28:12:7:6:28:12:7 chr5 150914184 . A T 90.93 PASS AO=30;DP=85;FAO=30;FDP=84;FR=.;FRO=54;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=30;FWDB=-0.0632469;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.817;QD=4.3299;RBI=0.0661575;REFB=-0.0197539;REVB=-0.0194072;RO=54;SAF=9;SAR=21;SRF=24;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174964;STB=0.601492;TYPE=snp;VARB=0.0202381;OID=.;OPOS=150914184;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:85:84:54:54:30:30:21:9:24:30:21:9:24:30 chr5 150923405 . A G 1442.73 PASS AO=152;DP=154;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0549325;FXX=0.00649309;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.4622;QD=37.7185;RBI=0.0626765;REFB=-0.00953973;REVB=-0.0301788;RO=2;SAF=64;SAR=88;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00199946;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00038569;OID=.;OPOS=150923405;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:154:153:2:0:152:153:88:64:1:1:88:65:0:0 chr5 150924769 . G A 145.04 PASS AO=42;DP=100;FAO=41;FDP=100;FR=.;FRO=59;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=30;FSRR=29;FWDB=-0.0151084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.1586;QD=5.80172;RBI=0.0368602;REFB=-0.00230171;REVB=-0.0336216;RO=57;SAF=23;SAR=19;SRF=29;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0398927;STB=0.516626;TYPE=snp;VARB=0.00358065;OID=.;OPOS=150924769;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:57:59:42:41:19:23:29:28:19:22:30:29 chr5 150925144 . A G 615.04 PASS AO=57;DP=57;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00999526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.256;QD=37.275;RBI=0.0212886;REFB=0;REVB=0.0187962;RO=0;SAF=52;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.95004e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000577807;OID=.;OPOS=150925144;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:57:66:0:0:57:66:5:52:0:0:14:52:0:0 chr5 150942919 . A G 1391.9 PASS AO=140;DP=140;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00551275;FXX=0.0067563;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.6;QD=37.875;RBI=0.00856993;REFB=0;REVB=0.00656149;RO=0;SAF=97;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.8762e-05;OID=.;OPOS=150942919;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:140:147:0:0:140:147:43:97:0:0:50:97:0:0 chr5 150942969 . G A 439.33 PASS AO=94;DP=170;FAO=94;FDP=174;FR=.;FRO=80;FSAF=66;FSAR=28;FSRF=48;FSRR=32;FWDB=0.0161395;FXX=0.00571396;HRUN=3;LEN=1;MLLD=133.582;QD=10.0995;RBI=0.0328005;REFB=-0.0225589;REVB=-0.028555;RO=75;SAF=66;SAR=28;SRF=48;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0587709;STB=0.553679;TYPE=snp;VARB=0.0197715;OID=.;OPOS=150942969;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:174:75:80:94:94:28:66:48:27:28:66:48:32 chr5 150943085 . G A 477.93 PASS AO=125;DP=271;FAO=125;FDP=272;FR=.;FRO=147;FSAF=70;FSAR=55;FSRF=88;FSRR=59;FWDB=0.0167585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.0751;QD=7.02844;RBI=0.0237419;REFB=0.0108217;REVB=0.0168176;RO=146;SAF=70;SAR=55;SRF=88;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0425503;STB=0.521292;TYPE=snp;VARB=-0.0139973;OID=.;OPOS=150943085;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:271:272:146:147:125:125:55:70:88:58:55:70:88:59 chr5 150945483 . C T 230.61 PASS AO=48;DP=91;FAO=49;FDP=92;FR=.;FRO=43;FSAF=14;FSAR=35;FSRF=13;FSRR=30;FWDB=0.0645638;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.456;QD=10.0265;RBI=0.0666986;REFB=0.00198462;REVB=0.0167397;RO=43;SAF=14;SAR=34;SRF=13;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0109897;STB=0.50943;TYPE=snp;VARB=-0.00175767;OID=.;OPOS=150945483;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:92:43:43:48:49:34:14:13:30:35:14:13:30 chr5 150945699 . G A 260.95 PASS AO=63;DP=137;FAO=65;FDP=140;FR=.;FRO=75;FSAF=27;FSAR=38;FSRF=34;FSRR=41;FWDB=0.00701933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.988;QD=7.45567;RBI=0.0172681;REFB=-0.019684;REVB=0.0157771;RO=68;SAF=25;SAR=38;SRF=27;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000228575;STB=0.520775;TYPE=snp;VARB=0.0239769;OID=.;OPOS=150945699;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:140:68:75:63:65:38:25:27:41:38:27:34:41 chr5 150945862 . A G 174.35 PASS AO=54;DP=128;FAO=50;FDP=122;FR=.;FRO=72;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=24;FSRR=48;FWDB=-0.00843267;FXX=0.0161277;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.9695;QD=5.71648;RBI=0.0886646;REFB=-0.0103153;REVB=-0.0882626;RO=74;SAF=21;SAR=33;SRF=23;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0866893;STB=0.54165;TYPE=snp;VARB=0.0109058;OID=.;OPOS=150945862;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:122:74:72:54:50:33:21:23:51:30:20:24:48 chr5 150945931 . C T 265.94 PASS AO=65;DP=133;FAO=59;FDP=114;FR=.;FRO=55;FSAF=22;FSAR=37;FSRF=20;FSRR=35;FWDB=0.0153327;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=250.051;QD=9.33122;RBI=0.0174021;REFB=-0.0236958;REVB=-0.00823059;RO=67;SAF=23;SAR=42;SRF=24;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00437633;STB=0.504779;TYPE=snp;VARB=0.0170908;OID=.;OPOS=150945931;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:114:67:55:65:59:42:23:24:43:37:22:20:35 chr5 150946132 . G A 237.45 PASS AO=68;DP=161;FAO=69;FDP=167;FR=.;FRO=98;FSAF=21;FSAR=48;FSRF=24;FSRR=74;FWDB=-0.0111783;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4879;QD=5.68745;RBI=0.0637829;REFB=0.0234324;REVB=-0.0627958;RO=93;SAF=21;SAR=47;SRF=23;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0771021;STB=0.542555;TYPE=snp;VARB=-0.0444704;OID=.;OPOS=150946132;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:167:93:98:68:69:47:21:23:70:48:21:24:74 chr5 150946436 . A G 203.8 PASS AO=64;DP=165;FAO=64;FDP=165;FR=.;FRO=101;FSAF=43;FSAR=21;FSRF=54;FSRR=47;FWDB=-0.00638478;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=238.454;QD=4.9407;RBI=0.0194873;REFB=0.00240935;REVB=-0.0184116;RO=101;SAF=43;SAR=21;SRF=54;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157661;STB=0.589368;TYPE=snp;VARB=-0.0056903;OID=.;OPOS=150946436;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:165:101:101:64:64:21:43:54:47:21:43:54:47 chr5 150946773 . G A 285.41 PASS AO=57;DP=100;FAO=57;FDP=101;FR=.;FRO=44;FSAF=39;FSAR=18;FSRF=34;FSRR=10;FWDB=0.00581351;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.864;QD=11.3033;RBI=0.0301695;REFB=-0.00773277;REVB=0.0296041;RO=43;SAF=39;SAR=18;SRF=33;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.078341;STB=0.546119;TYPE=snp;VARB=0.00537842;OID=.;OPOS=150946773;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:101:43:44:57:57:18:39:33:10:18:39:34:10 chr5 150946966 . G A 2491.16 PASS AO=127;DP=273;FAO=265;FDP=265;FR=.;FRO=0;FSAF=141;FSAR=124;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00850315;FXX=0.00749036;HRUN=4;LEN=1;MLLD=47.3114;QD=37.6024;RBI=0.0908027;REFB=-0.103285;REVB=0.0904037;RO=1;SAF=124;SAR=3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00381743;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00173722;OID=.;OPOS=150946966;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:139:265:1:0:127:265:3:124:1:0:124:141:0:0 chr5 150947719 . C T 158.84 PASS AO=37;DP=80;FAO=38;FDP=81;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=-0.00138743;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.848;QD=7.84382;RBI=0.00769184;REFB=-0.0213043;REVB=-0.00756568;RO=43;SAF=14;SAR=23;SRF=19;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0635486;STB=0.525877;TYPE=snp;VARB=0.0242979;OID=.;OPOS=150947719;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:81:43:43:37:38:23:14:19:24:23:15:19:24 chr5 150948016 . C T 61.63 PASS AO=30;DP=94;FAO=27;FDP=94;FR=.;FRO=67;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=32;FSRR=35;FWDB=0.0348324;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.893;QD=2.62256;RBI=0.0350159;REFB=-0.012022;REVB=0.00358071;RO=64;SAF=10;SAR=20;SRF=32;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200473;STB=0.578547;TYPE=snp;VARB=0.0293063;OID=.;OPOS=150948016;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:94:94:64:67:30:27:20:10:32:32:17:10:32:35 chr5 151167380 . A T 77.8 PASS AO=29;DP=95;FAO=30;FDP=96;FR=.;FRO=66;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=36;FSRR=30;FWDB=0.0122179;FXX=0.0303;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.293;QD=3.24147;RBI=0.0195423;REFB=-0.0148424;REVB=0.0152521;RO=60;SAF=21;SAR=8;SRF=31;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.257319;STB=0.614785;TYPE=snp;VARB=0.0323262;OID=.;OPOS=151167380;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:95:96:60:66:29:30:8:21:31:29:9:21:36:30 chr5 151175139 . A T 207.08 PASS AO=72;DP=169;FAO=56;FDP=130;FR=.;FRO=74;FSAF=20;FSAR=36;FSRF=43;FSRR=31;FWDB=-0.0646925;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.5059;QD=6.37177;RBI=0.104597;REFB=-0.0117137;REVB=0.0821913;RO=97;SAF=33;SAR=39;SRF=56;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12172;STB=0.628557;TYPE=snp;VARB=0.0185325;OID=.;OPOS=151175139;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:130:97:74:72:56:39:33:56:41:36:20:43:31 chr5 151255217 . C T 343.5 PASS AO=74;DP=141;FAO=75;FDP=142;FR=.;FRO=67;FSAF=28;FSAR=47;FSRF=30;FSRR=37;FWDB=-0.00220496;FXX=0.00699252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.159;QD=9.67609;RBI=0.00536297;REFB=-0.0089439;REVB=-0.00488873;RO=65;SAF=28;SAR=46;SRF=30;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0738248;STB=0.536816;TYPE=snp;VARB=0.00723687;OID=.;OPOS=151255217;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:142:65:67:74:75:46:28:30:35:47:28:30:37 chr5 151771817 . C T 3452.06 PASS AO=342;DP=343;FAO=359;FDP=359;FR=.;FRO=0;FSAF=186;FSAR=173;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0438298;FXX=0.0027777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.887;QD=38.4631;RBI=0.0447101;REFB=0;REVB=0.00882841;RO=0;SAF=186;SAR=156;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.12573e-05;OID=.;OPOS=151771817;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:343:359:0:0:342:359:156:186:0:0:173:186:0:0 chr5 153413390 . C T 1562.79 PASS AO=165;DP=166;FAO=165;FDP=165;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00303055;FXX=0.00602373;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.412;QD=37.8858;RBI=0.0245186;REFB=-0.00336621;REVB=0.0243306;RO=1;SAF=94;SAR=71;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00665539;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.25371e-05;OID=.;OPOS=153413390;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:166:165:1:0:165:165:71:94:0:1:71:94:0:0 chr5 153429459 . T C 2160.88 PASS AO=223;DP=224;FAO=226;FDP=226;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=169;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195493;FXX=0.0300416;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9395;QD=38.2457;RBI=0.0397727;REFB=0;REVB=0.0346367;RO=0;SAF=57;SAR=166;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000777971;OID=.;OPOS=153429459;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:224:226:0:0:223:226:166:57:0:0:169:57:0:0 chr5 153432733 . T C 757.17 PASS AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00729104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.661;QD=36.9351;RBI=0.0387329;REFB=0;REVB=0.0380405;RO=0;SAF=36;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.14462e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000313734;OID=.;OPOS=153432733;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:82:82:0:0:82:82:46:36:0:0:46:36:0:0 chr5 153432970 . C T 1518.02 PASS AO=158;DP=158;FAO=158;FDP=158;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00636567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.6766;QD=38.4308;RBI=0.0063945;REFB=0;REVB=-0.000606502;RO=0;SAF=75;SAR=83;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.38974e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.62313e-05;OID=.;OPOS=153432970;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:158:158:0:0:158:158:83:75:0:0:83:75:0:0 chr5 153729217 . A G 163.9 PASS AO=37;DP=74;FAO=37;FDP=74;FR=.;FRO=37;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=0.0182775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.436;QD=8.85951;RBI=0.0200522;REFB=-0.0171659;REVB=0.00824762;RO=36;SAF=20;SAR=17;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109613;STB=0.553907;TYPE=snp;VARB=0.0169102;OID=.;OPOS=153729217;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:36:37:37:37:17:20:15:21:17:20:16:21 chr5 153788991 . G C 2680.19 PASS AO=287;DP=293;FAO=290;FDP=296;FR=.;FRO=6;FSAF=177;FSAR=113;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.00431032;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.676;QD=36.2188;RBI=0.00473139;REFB=-0.0503671;REVB=0.0019512;RO=6;SAF=177;SAR=110;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00896272;STB=0.504761;TYPE=snp;VARB=0.000440674;OID=.;OPOS=153788991;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:82:293:296:6:6:287:290:110:177:5:1:113:177:5:1 chr5 153789292 . C T 178.56 PASS AO=46;DP=102;FAO=46;FDP=101;FR=.;FRO=55;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=33;FWDB=-0.0393226;FXX=0.00980296;HRUN=3;LEN=1;MLLD=165.793;QD=7.0715;RBI=0.0401336;REFB=0.00672802;REVB=-0.00802748;RO=54;SAF=23;SAR=23;SRF=21;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107644;STB=0.554432;TYPE=snp;VARB=-0.00990153;OID=.;OPOS=153789292;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:101:54:55:46:46:23:23:21:33:23:23:22:33 chr5 154203121 . C T 235.25 PASS AO=59;DP=128;FAO=59;FDP=128;FR=.;FRO=69;FSAF=23;FSAR=36;FSRF=31;FSRR=38;FWDB=0.0600275;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.9729;QD=7.35151;RBI=0.0600402;REFB=-0.00419537;REVB=0.00123832;RO=68;SAF=23;SAR=36;SRF=31;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0657251;STB=0.533176;TYPE=snp;VARB=0.00549181;OID=.;OPOS=154203121;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:68:69:59:59:36:23:31:37:36:23:31:38 chr5 154214232 . C T 210.36 PASS AO=47;DP=93;FAO=47;FDP=93;FR=.;FRO=46;FSAF=30;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=-0.0159747;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.3194;QD=9.04779;RBI=0.0256166;REFB=-0.0252682;REVB=0.0200255;RO=46;SAF=30;SAR=17;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147549;STB=0.5818;TYPE=snp;VARB=0.037552;OID=.;OPOS=154214232;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:46:46:47:47:17:30:22:24:17:30:22:24 chr5 154247297 . TAA T 104.33 PASS AO=49;DP=128;FAO=50;FDP=125;FR=.;FRO=75;FSAF=37;FSAR=13;FSRF=32;FSRR=43;FWDB=-0.0309585;FXX=0.0157468;HRUN=4;LEN=2;MLLD=35.7049;QD=3.33841;RBI=0.0895736;REFB=-0.0126213;REVB=-0.0840535;RO=64;SAF=36;SAR=13;SRF=28;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.318498;STB=0.697796;TYPE=del;VARB=0.0205545;OID=.;OPOS=154247298;OREF=AA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:49:125:50:125:75:37:13:32:43:99:64:36:13:28:36 chr5 154268902 . C T 1584.91 PASS AO=167;DP=168;FAO=170;FDP=170;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.042245;FXX=0.0116272;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.2692;QD=37.292;RBI=0.106289;REFB=0;REVB=0.097533;RO=1;SAF=74;SAR=93;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0050901;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00338851;OID=.;OPOS=154268902;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:168:170:1:0:167:170:93:74:0:1:97:73:0:0 chr5 154271948 . G A 1212.06 PASS AO=129;DP=132;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0342238;FXX=0.0227256;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.1676;QD=37.5833;RBI=0.0453311;REFB=-0.0576188;REVB=0.029726;RO=0;SAF=80;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.3659e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000418969;OID=.;OPOS=154271948;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:132:129:0:0:129:129:49:80:0:0:49:80:0:0 chr5 154291409 . C T 1301.03 PASS AO=141;DP=143;FAO=140;FDP=142;FR=.;FRO=2;FSAF=51;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0354028;FXX=0.00699252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.767;QD=36.6488;RBI=0.0421177;REFB=-0.0274778;REVB=0.0228155;RO=2;SAF=51;SAR=90;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0104485;STB=0.505555;TYPE=snp;VARB=1.38249e-05;OID=.;OPOS=154291409;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:143:142:2:2:141:140:90:51:0:2:89:51:0:2 chr5 154292516 . C T 458.25 PASS AO=96;DP=174;FAO=96;FDP=174;FR=.;FRO=78;FSAF=51;FSAR=45;FSRF=45;FSRR=33;FWDB=0.00974914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.558;QD=10.5346;RBI=0.0269921;REFB=-0.0327538;REVB=0.0251699;RO=77;SAF=51;SAR=45;SRF=45;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0437207;STB=0.520603;TYPE=snp;VARB=0.0281801;OID=.;OPOS=154292516;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:174:77:78:96:96:45:51:45:32:45:51:45:33 chr5 154300940 . A C 1358.63 PASS AO=149;DP=156;FAO=152;FDP=157;FR=.;FRO=5;FSAF=71;FSAR=81;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.0273424;FXX=0.00632871;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.7993;QD=34.6149;RBI=0.0528241;REFB=-0.216611;REVB=0.045197;RO=3;SAF=71;SAR=78;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00538647;STB=0.508552;TYPE=snp;VARB=0.00500341;OID=.;OPOS=154300940;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:156:157:3:5:149:152:78:71:1:2:81:71:1:4 chr5 154306972 . T C 2043.62 PASS AO=224;DP=231;FAO=227;FDP=231;FR=.;FRO=4;FSAF=111;FSAR=116;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.010894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.1205;QD=35.3874;RBI=0.0183902;REFB=-0.173113;REVB=0.0148163;RO=4;SAF=110;SAR=114;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00865452;STB=0.500191;TYPE=snp;VARB=0.0020482;OID=.;OPOS=154306972;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:231:231:4:4:224:227:114:110:3:1:116:111:2:2 chr5 154395158 . G T 190.82 PASS AO=53;DP=129;FAO=54;FDP=130;FR=.;FRO=76;FSAF=34;FSAR=20;FSRF=50;FSRR=26;FWDB=-0.0127829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.019;QD=5.87129;RBI=0.0146766;REFB=0.00422983;REVB=0.00721107;RO=75;SAF=33;SAR=20;SRF=49;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0343765;STB=0.517873;TYPE=snp;VARB=-0.00594235;OID=.;OPOS=154395158;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:130:75:76:53:54:20:33:49:26:20:34:50:26 chr5 154395458 . G A 365.28 PASS AO=80;DP=151;FAO=80;FDP=152;FR=.;FRO=72;FSAF=32;FSAR=48;FSRF=30;FSRR=42;FWDB=0.00620597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.466;QD=9.61258;RBI=0.0105849;REFB=-0.0256881;REVB=0.00857473;RO=71;SAF=32;SAR=48;SRF=29;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0075395;STB=0.508195;TYPE=snp;VARB=0.0287932;OID=.;OPOS=154395458;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:152:71:72:80:80:48:32:29:42:48:32:30:42 chr5 154395682 . G A 454.21 PASS AO=115;DP=245;FAO=115;FDP=245;FR=.;FRO=130;FSAF=65;FSAR=50;FSRF=70;FSRR=60;FWDB=-0.00514842;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.25;QD=7.41569;RBI=0.00757008;REFB=-0.0409462;REVB=-0.00554976;RO=129;SAF=65;SAR=50;SRF=70;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.021936;STB=0.514386;TYPE=snp;VARB=0.0419769;OID=.;OPOS=154395682;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:245:245:129:130:115:115:50:65:70:59:50:65:70:60 chr5 154396505 . G A 289.39 PASS AO=91;DP=233;FAO=91;FDP=232;FR=.;FRO=141;FSAF=51;FSAR=40;FSRF=63;FSRR=78;FWDB=-0.0221205;FXX=0.00429166;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.671;QD=4.98939;RBI=0.0283595;REFB=-0.0241106;REVB=-0.0177466;RO=140;SAF=51;SAR=40;SRF=63;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118892;STB=0.568902;TYPE=snp;VARB=0.0352563;OID=.;OPOS=154396505;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:233:232:140:141:91:91:40:51:63:77:40:51:63:78 chr5 155771579 . T C 466.73 PASS AO=117;DP=256;FAO=121;FDP=260;FR=.;FRO=139;FSAF=52;FSAR=69;FSRF=55;FSRR=84;FWDB=0.00392045;FXX=0.0151509;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.054;QD=7.18045;RBI=0.00422177;REFB=-0.0132233;REVB=-0.00156632;RO=130;SAF=48;SAR=69;SRF=52;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101365;STB=0.518675;TYPE=snp;VARB=0.0177191;OID=.;OPOS=155771579;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:256:260:130:139:117:121:69:48:52:78:69:52:55:84 chr5 156376703 . A G 217.7 PASS AO=23;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.107728;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.55;QD=36.2829;RBI=0.108073;REFB=0;REVB=0.00863166;RO=0;SAF=8;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00136072;OID=.;OPOS=156376703;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:24:24:0:0:23:24:15:8:0:0:15:9:0:0 chr5 156479424 . A C 3818.88 PASS AO=440;DP=443;FAO=399;FDP=399;FR=.;FRO=0;FSAF=225;FSAR=174;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0184245;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.892;QD=38.2845;RBI=0.0440094;REFB=0;REVB=0.039967;RO=1;SAF=247;SAR=193;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00246696;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.7023e-05;OID=.;OPOS=156479424;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:443:399:1:0:440:399:193:247:0:1:174:225:0:0 chr5 156479443 . CTTG C 2477.09 PASS AO=398;DP=463;FAO=363;FDP=391;FR=.;FRO=28;FSAF=188;FSAR=175;FSRF=22;FSRR=6;FWDB=-0.016677;FXX=0.0224994;HRUN=2;LEN=3;MLLD=247.385;QD=25.341;RBI=0.0182588;REFB=-0.00511671;REVB=-0.00743396;RO=0;SAF=202;SAR=196;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.30059e-08;STB=0.519228;TYPE=del;VARB=-3.72575e-05;OID=.;OPOS=156479444;OREF=TTG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:398:419:363:391:28:188:175:22:6:58:0:202:196:0:0 chr5 156479508 . CAGAACAGTCGTTGTCGTTGGAATGCTCATTGTTGTTGGAACAGTTGTCGTTGGAACAGTCGTCATT C 50 PASS AO=161;DP=690;LEN=66;RO=529;SAF=217;SAR=320;SRF=42;SRR=111;TYPE=del;FR=.;OID=.;OPOS=156479509;OREF=AGAACAGTCGTTGTCGTTGGAATGCTCATTGTTGTTGGAACAGTTGTCGTTGGAACAGTCGTCATT;OALT=-;OMAPALT=C GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR 0/1:99:690:529:161:320:217:42:111 chr5 156479509 . A G 3654.96 PASS AO=371;DP=378;FAO=384;FDP=384;FR=.;FRO=0;FSAF=151;FSAR=233;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00744122;FXX=0.0204076;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.831;QD=38.0725;RBI=0.0162689;REFB=0;REVB=0.0144674;RO=0;SAF=144;SAR=227;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00013717;OID=.;OPOS=156479509;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:378:384:0:0:371:384:227:144:0:0:233:151:0:0 chr5 156479568 . C CGTT 2503.32 PASS AO=313;DP=385;FAO=323;FDP=373;FR=.;FRO=50;FSAF=39;FSAR=284;FSRF=15;FSRR=35;FWDB=0.011657;FXX=0.0209968;HRUN=1;LEN=3;MLLD=198.063;QD=26.8453;RBI=0.0391172;REFB=-0.0420536;REVB=0.0373399;RO=57;SAF=36;SAR=277;SRF=17;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118036;STB=0.552108;TYPE=ins;VARB=0.00653474;OID=.;OPOS=156479569;OREF=-;OALT=GTT;OMAPALT=CGTT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:313:385:323:373:50:39:284:15:35:13:57:36:277:17:40 chr5 156479596 . A ATGCTCATTGTTGTTGGAACAGTTGTCGTTGGAACAGTCGTTGTCATTGGAACAGTCGTTGTCGTTGGAA 50 PASS AO=129;DP=690;LEN=69;RO=561;SAF=217;SAR=320;SRF=42;SRR=111;TYPE=ins;FR=.;OID=.;OPOS=156479596;OREF=-;OALT=ATGCTCATTGTTGTTGGAACAGTTGTCGTTGGAACAGTCGTTGTCATTGGAACAGTCGTTGTCGTTGGA;OMAPALT=ATGCTCATTGTTGTTGGAACAGTTGTCGTTGGAACAGTCGTTGTCATTGGAACAGTCGTTGTCGTTGGAA GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR 0/1:99:690:561:129:320:217:42:111 chr5 156482459 . G T 1973.1 PASS AO=212;DP=214;FAO=210;FDP=210;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0268588;FXX=0.0140838;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2236;QD=37.5829;RBI=0.0299375;REFB=-0.0577424;REVB=-0.0132234;RO=2;SAF=105;SAR=107;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00882052;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00177994;OID=.;OPOS=156482459;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:214:210:2:0:212:210:107:105:0:2:106:104:0:0 chr5 156531736 . C A 943.74 PASS AO=100;DP=101;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161534;FXX=0.00990001;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.353;QD=37.7497;RBI=0.02183;REFB=0;REVB=0.0146839;RO=0;SAF=17;SAR=83;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.70839e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.0957e-05;OID=.;OPOS=156531736;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:101:100:0:0:100:100:83:17:0:0:83:17:0:0 chr5 156671437 . G T 301.99 PASS AO=67;DP=131;FAO=67;FDP=130;FR=.;FRO=63;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=32;FSRR=31;FWDB=0.00119891;FXX=0.00763301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.905;QD=9.29207;RBI=0.0173468;REFB=-0.0181014;REVB=0.0173053;RO=64;SAF=33;SAR=34;SRF=32;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00662332;STB=0.50746;TYPE=snp;VARB=0.0157686;OID=.;OPOS=156671437;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:130:64:63:67:67:34:33:32:32:34:33:32:31 chr5 156721863 . T TC 902.91 PASS AO=127;DP=161;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0795434;FXX=0.012738;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.7711;QD=23.3009;RBI=0.0803483;REFB=0;REVB=0.0113446;RO=20;SAF=90;SAR=37;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0482578;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.000439647;OID=.;OPOS=156721864;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:127:161:155:155:0:105:50:0:0:74:20:90:37:11:9 chr5 156747669 . A G 321.19 PASS AO=76;DP=156;FAO=76;FDP=154;FR=.;FRO=78;FSAF=48;FSAR=28;FSRF=39;FSRR=39;FWDB=-0.0397019;FXX=0.0191071;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.264;QD=8.3426;RBI=0.041769;REFB=-0.0334602;REVB=0.0129772;RO=77;SAF=48;SAR=28;SRF=39;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118307;STB=0.568984;TYPE=snp;VARB=0.035964;OID=.;OPOS=156747669;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:154:77:78:76:76:28:48:39:38:28:48:39:39 chr5 156749968 . AG A,GA 324.04 PASS AO=27,6;DP=42;FAO=37,5;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=21,5;FSAR=16,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.175887,0.0379413;FXX=0;HRUN=3,1;LEN=1,2;MLLD=15.668,25.9587;QD=30.8609;RBI=0.197999,0.0517433;REFB=0,0;REVB=0.0909242,0.0351827;RO=2;SAF=16,5;SAR=11,1;SRF=2;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0.397173,0;SSSB=-0.0546421,-0.144764;STB=0.5,0.5;TYPE=del,mnp;VARB=0.0199948,0.000805348;OID=.,.;OPOS=156749969,156749968;OREF=G,AG;OALT=-,GA;OMAPALT=A,GA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:5:39:42:2:0:27,6:37,5:11,1:16,5:2:0:16,0:21,5:0:0 chr5 156770133 . C T 127.35 PASS AO=33;DP=75;FAO=33;FDP=75;FR=.;FRO=42;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=-0.0024967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.1558;QD=6.79178;RBI=0.0220491;REFB=-0.0197912;REVB=0.0219073;RO=42;SAF=19;SAR=14;SRF=25;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.019877;STB=0.511197;TYPE=snp;VARB=0.0217048;OID=.;OPOS=156770133;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:42:42:33:33:14:19:25:17:14:19:25:17 chr5 156887593 . TC GT 59.66 PASS AO=3;DP=11;FAO=7;FDP=10;FR=.,HEALED;FRO=2;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0586491;FXX=0.0908265;HRUN=1;LEN=2;MLLD=27.7769;QD=23.8636;RBI=0.124166;REFB=-0.0766103;REVB=0.109441;RO=2;SAF=1;SAR=2;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.272699;STB=0.666171;TYPE=mnp;VARB=0.0525726;OID=.;OPOS=156887593;OREF=TC;OALT=GT;OMAPALT=GT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:10:2:2:3:7:2:1:0:2:2:5:0:2 chr5 156898689 . GA G,GG 1586.9 PASS AO=33,123;DP=166;FAO=163,0;FDP=163;FR=.;FRO=0;FSAF=108,0;FSAR=55,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.174814,-0.166065;FXX=0.0239507;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=194.241,184.12;QD=38.9423;RBI=0.179278,0.177435;REFB=0,0;REVB=-0.0397587,-0.0624953;RO=0;SAF=4,102;SAR=29,21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.000320379,0;OID=.,.;OPOS=156898690,156898690;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:33,123:162:163,0:163:0:108,0:55,0:0:0:74:0:4,102:29,21:0:0 chr5 156899869 . T C 267.05 PASS AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00646855;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.055;QD=38.1505;RBI=0.0154005;REFB=0;REVB=0.0139762;RO=0;SAF=19;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.62669e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.80157e-05;OID=.;OPOS=156899869;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:28:28:0:0:28:28:9:19:0:0:9:19:0:0 chr5 156904633 . C T 269.67 PASS AO=59;DP=113;FAO=59;FDP=113;FR=.;FRO=54;FSAF=21;FSAR=38;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=0.00874265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.312;QD=9.546;RBI=0.00875046;REFB=0.00403451;REVB=-0.00036966;RO=54;SAF=21;SAR=38;SRF=25;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0980012;STB=0.554022;TYPE=snp;VARB=-0.00334098;OID=.;OPOS=156904633;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:54:54:59:59:38:21:25:29:38:21:25:29 chr5 156907110 . G T 78.06 PASS AO=22;DP=60;FAO=23;FDP=61;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=0.0148132;FXX=0.031741;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.12;QD=5.11883;RBI=0.0685572;REFB=-0.0254011;REVB=0.0669377;RO=38;SAF=15;SAR=7;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151335;STB=0.631542;TYPE=snp;VARB=0.0467551;OID=.;OPOS=156907110;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:60:61:38:38:22:23:7:15:21:17:6:17:21:17 chr5 156917340 . A C 1360.81 PASS AO=155;DP=165;FAO=156;FDP=165;FR=.;FRO=9;FSAF=65;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=0.0119643;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.591;QD=32.9894;RBI=0.0195785;REFB=-0.0217915;REVB=0.0154976;RO=9;SAF=65;SAR=90;SRF=0;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0452291;STB=0.523557;TYPE=snp;VARB=0.00108057;OID=.;OPOS=156917340;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:165:165:9:9:155:156:90:65:0:9:91:65:0:9 chr5 156918627 . AG A 48.73 PASS AO=15;DP=37;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=-0.093359;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.6223;QD=5.26775;RBI=0.230605;REFB=-0.105699;REVB=0.210862;RO=18;SAF=12;SAR=3;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0.368421;SSSB=0.538599;STB=0.695571;TYPE=del;VARB=0.127886;OID=.;OPOS=156918628;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:15:35:19:37:18:13:6:5:13:32:18:12:3:4:14 chr5 156918850 . C T 154.76 PASS AO=39;DP=90;FAO=40;FDP=91;FR=.;FRO=51;FSAF=12;FSAR=28;FSRF=20;FSRR=31;FWDB=-0.0393237;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.8434;QD=6.80249;RBI=0.0608059;REFB=-0.0343516;REVB=0.0463789;RO=51;SAF=12;SAR=27;SRF=20;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0953386;STB=0.558573;TYPE=snp;VARB=0.0549695;OID=.;OPOS=156918850;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:91:51:51:39:40:27:12:20:31:28:12:20:31 chr5 156936364 . T C 169.84 PASS AO=41;DP=83;FAO=40;FDP=83;FR=.;FRO=43;FSAF=31;FSAR=9;FSRF=30;FSRR=13;FWDB=0.0244978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.223;QD=8.18514;RBI=0.0245036;REFB=0.00587099;REVB=-0.000532919;RO=42;SAF=31;SAR=10;SRF=30;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0499947;STB=0.553993;TYPE=snp;VARB=-0.0124418;OID=.;OPOS=156936364;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:42:43:41:40:10:31:30:12:9:31:30:13 chr5 157078475 . C G 123.74 PASS AO=44;DP=125;FAO=44;FDP=127;FR=.;FRO=83;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=38;FSRR=45;FWDB=0.0327795;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.5952;QD=3.89744;RBI=0.0327881;REFB=-0.0081751;REVB=-0.000750534;RO=75;SAF=21;SAR=23;SRF=34;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0265354;STB=0.512741;TYPE=snp;VARB=0.0274284;OID=.;OPOS=157078475;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:127:75:83:44:44:23:21:34:41:23:21:38:45 chr5 157098756 . G T 82.26 PASS AO=25;DP=73;FAO=26;FDP=72;FR=.;FRO=46;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=39;FWDB=-0.0129897;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.462;QD=4.57014;RBI=0.0222021;REFB=-0.0104488;REVB=0.0180056;RO=41;SAF=9;SAR=16;SRF=5;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.314463;STB=0.668993;TYPE=snp;VARB=0.0197283;OID=.;OPOS=157098756;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:73:72:41:46:25:26:16:9:5:36:16:10:7:39 chr5 157102185 . A G 1054.09 PASS AO=110;DP=110;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00668143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.95;QD=38.3306;RBI=0.02508;REFB=0;REVB=0.0241737;RO=0;SAF=52;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.4768e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.86599e-05;OID=.;OPOS=157102185;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:110:110:0:0:110:110:58:52:0:0:58:52:0:0 chr5 157106968 . C T 225.11 PASS AO=56;DP=120;FAO=56;FDP=120;FR=.;FRO=64;FSAF=17;FSAR=39;FSRF=27;FSRR=37;FWDB=-0.00862458;FXX=0.0322555;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.021;QD=7.5038;RBI=0.0261716;REFB=-0.0124266;REVB=0.0247097;RO=63;SAF=17;SAR=39;SRF=26;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116286;STB=0.570453;TYPE=snp;VARB=0.0108502;OID=.;OPOS=157106968;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:63:64:56:56:39:17:26:37:39:17:27:37 chr5 157164962 . T C 1226.37 PASS AO=119;DP=121;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0527021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.1668;QD=38.3242;RBI=0.153606;REFB=0;REVB=0.144282;RO=0;SAF=60;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000638734;OID=.;OPOS=157164962;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:121:128:0:0:119:128:59:60:0:0:64:64:0:0 chr5 157183739 . G A 530.71 PASS AO=58;DP=60;FAO=58;FDP=60;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00327396;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=66.0892;QD=35.3807;RBI=0.0387354;REFB=-0.00692148;REVB=0.0385968;RO=0;SAF=38;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.38905e-08;STB=0.523801;TYPE=snp;VARB=0.000251956;OID=.;OPOS=157183739;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:60:60:0:2:58:58:20:38:0:0:20:38:0:2 chr5 157183770 . C T 447.28 PASS AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0423509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.5744;QD=38.0667;RBI=0.0447797;REFB=0;REVB=0.0145471;RO=0;SAF=18;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000522889;OID=.;OPOS=157183770;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:47:47:0:0:47:47:29:18:0:0:29:18:0:0 chr5 157213497 . A G 693 PASS AO=167;DP=340;FAO=168;FDP=343;FR=.;FRO=175;FSAF=89;FSAR=79;FSRF=76;FSRR=99;FWDB=0.0592057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.162;QD=8.08164;RBI=0.0592148;REFB=-0.0228208;REVB=-0.00104219;RO=173;SAF=89;SAR=78;SRF=76;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.086672;STB=0.548597;TYPE=snp;VARB=0.0250264;OID=.;OPOS=157213497;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:340:343:173:175:167:168:78:89:76:97:79:89:76:99 chr5 157236124 . T C 191.4 PASS AO=43;DP=85;FAO=43;FDP=85;FR=.;FRO=42;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=-0.0179107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.7082;QD=9.00691;RBI=0.0274326;REFB=-0.0120163;REVB=0.0207787;RO=42;SAF=18;SAR=25;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0946259;STB=0.552462;TYPE=snp;VARB=0.0131091;OID=.;OPOS=157236124;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:42:42:43:43:25:18:22:20:25:18:22:20 chr5 157403931 . A G 291.17 PASS AO=63;DP=120;FAO=63;FDP=120;FR=.;FRO=57;FSAF=14;FSAR=49;FSRF=15;FSRR=42;FWDB=0.0100796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.396;QD=9.70566;RBI=0.0405822;REFB=-0.0100072;REVB=-0.0393105;RO=57;SAF=14;SAR=49;SRF=15;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0494829;STB=0.527264;TYPE=snp;VARB=0.0110366;OID=.;OPOS=157403931;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:57:57:63:63:49:14:15:42:49:14:15:42 chr5 159505208 . C A 169.02 PASS AO=55;DP=153;FAO=57;FDP=153;FR=.;FRO=96;FSAF=21;FSAR=36;FSRF=51;FSRR=45;FWDB=0.0101046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.589;QD=4.41872;RBI=0.0441376;REFB=-0.0121609;REVB=0.0429654;RO=94;SAF=20;SAR=35;SRF=51;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200688;STB=0.603737;TYPE=snp;VARB=0.0259142;OID=.;OPOS=159505208;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:153:94:96:55:57:35:20:51:43:36:21:51:45 chr5 159659273 . C T 360.99 PASS AO=83;DP=161;FAO=83;FDP=164;FR=.;FRO=81;FSAF=37;FSAR=46;FSRF=31;FSRR=50;FWDB=0.00540122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.0615;QD=8.80471;RBI=0.00688958;REFB=-0.0237779;REVB=-0.00427704;RO=78;SAF=37;SAR=46;SRF=28;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0783535;STB=0.531729;TYPE=snp;VARB=0.0288758;OID=.;OPOS=159659273;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:164:78:81:83:83:46:37:28:50:46:37:31:50 chr5 159665599 . G A 192.82 PASS AO=36;DP=61;FAO=36;FDP=61;FR=.;FRO=25;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=7;FSRR=18;FWDB=0.00793247;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.507;QD=12.6436;RBI=0.0546747;REFB=-0.00336969;REVB=0.0540962;RO=25;SAF=18;SAR=18;SRF=7;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16452;STB=0.590115;TYPE=snp;VARB=0.00445651;OID=.;OPOS=159665599;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:61:61:25:25:36:36:18:18:7:18:18:18:7:18 chr5 159679199 . A C 449.68 PASS AO=121;DP=274;FAO=121;FDP=271;FR=.;FRO=150;FSAF=53;FSAR=68;FSRF=65;FSRR=85;FWDB=0.00642423;FXX=0.0109485;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.91;QD=6.6374;RBI=0.090972;REFB=0.000617605;REVB=-0.0907449;RO=151;SAF=53;SAR=68;SRF=64;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0144458;STB=0.502634;TYPE=snp;VARB=-0.00165064;OID=.;OPOS=159679199;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:274:271:151:150:121:121:68:53:64:87:68:53:65:85 chr5 159775741 . G A 1913.02 PASS AO=200;DP=202;FAO=201;FDP=201;FR=.;FRO=0;FSAF=114;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.01458;FXX=0.00495025;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.0837;QD=38.07;RBI=0.0757199;REFB=0;REVB=0.0743029;RO=0;SAF=114;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.31745e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.43827e-05;OID=.;OPOS=159775741;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:91:202:201:0:0:200:201:86:114:0:0:87:114:0:0 chr5 159776047 . A G 392.37 PASS AO=42;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0191481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.966;QD=36.4991;RBI=0.0278618;REFB=0;REVB=0.0202393;RO=0;SAF=10;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.96961e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.1364e-06;OID=.;OPOS=159776047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:43:43:0:0:42:43:32:10:0:0:33:10:0:0 chr5 159776637 . C T 665.96 PASS AO=81;DP=89;FAO=84;FDP=89;FR=.;FRO=5;FSAF=29;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.10132;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=35.5601;QD=29.9307;RBI=0.101321;REFB=-0.226746;REVB=0.000367861;RO=1;SAF=27;SAR=54;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0172124;STB=0.509073;TYPE=snp;VARB=0.0313304;OID=.;OPOS=159776637;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:89:89:1:5:81:84:54:27:1:0:55:29:1:4 chr5 159831803 . A G 364.24 PASS AO=88;DP=185;FAO=89;FDP=185;FR=.;FRO=96;FSAF=45;FSAR=44;FSRF=38;FSRR=58;FWDB=0.020961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.058;QD=7.87536;RBI=0.0209637;REFB=-0.00939842;REVB=-0.000337373;RO=92;SAF=44;SAR=44;SRF=38;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0807006;STB=0.556891;TYPE=snp;VARB=0.0124879;OID=.;OPOS=159831803;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:185:92:96:88:89:44:44:38:54:44:45:38:58 chr5 159835658 . A G 1702.85 PASS AO=179;DP=186;FAO=180;FDP=180;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=135;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.036878;FXX=0.0322563;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.848;QD=37.8412;RBI=0.0457257;REFB=-0.065177;REVB=0.0270343;RO=1;SAF=45;SAR=134;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104602;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000575923;OID=.;OPOS=159835658;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:186:180:1:0:179:180:134:45:1:0:135:45:0:0 chr5 159901408 . C A 296.88 PASS AO=72;DP=151;FAO=72;FDP=150;FR=.;FRO=78;FSAF=51;FSAR=21;FSRF=54;FSRR=24;FWDB=0.0488227;FXX=0.013157;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.2264;QD=7.91681;RBI=0.0517733;REFB=-0.0486283;REVB=-0.0172285;RO=75;SAF=51;SAR=21;SRF=51;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.031191;STB=0.509997;TYPE=snp;VARB=0.0514912;OID=.;OPOS=159901408;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:150:75:78:72:72:21:51:51:24:21:51:54:24 chr5 159912418 . C G 1096.91 PASS AO=115;DP=115;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0430926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.8242;QD=38.1536;RBI=0.0613493;REFB=0;REVB=-0.0436665;RO=0;SAF=25;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000546547;OID=.;OPOS=159912418;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:115:115:0:0:115:115:90:25:0:0:90:25:0:0 chr5 159990279 . G A 796.95 PASS AO=178;DP=340;FAO=178;FDP=340;FR=.;FRO=162;FSAF=87;FSAR=91;FSRF=82;FSRR=80;FWDB=0.0102253;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.9021;QD=9.37585;RBI=0.0113037;REFB=-0.00359759;REVB=0.0048184;RO=160;SAF=87;SAR=91;SRF=81;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0151768;STB=0.508295;TYPE=snp;VARB=0.00886459;OID=.;OPOS=159990279;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:340:340:160:162:178:178:91:87:81:79:91:87:82:80 chr5 159992001 . GC G 1553.33 PASS AO=204;DP=275;FAO=270;FDP=270;FR=.;FRO=0;FSAF=131;FSAR=139;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0984039;FXX=0.0109886;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.0703;QD=23.0123;RBI=0.342696;REFB=0.0193016;REVB=0.328264;RO=50;SAF=114;SAR=90;SRF=11;SRR=39;SSEN=0.494792;SSEP=0;SSSB=0.125554;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00528109;OID=.;OPOS=159992002;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:204:271:270:270:0:131:139:0:0:99:50:114:90:11:39 chr5 159992655 . T C 250.71 PASS AO=60;DP=124;FAO=60;FDP=124;FR=.;FRO=64;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=26;FSRR=38;FWDB=0.0045998;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.897;QD=8.08753;RBI=0.0188486;REFB=-0.0170182;REVB=0.0182787;RO=63;SAF=31;SAR=29;SRF=25;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11071;STB=0.556818;TYPE=snp;VARB=0.0158909;OID=.;OPOS=159992655;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:63:64:60:60:29:31:25:38:29:31:26:38 chr5 159992697 . C T 118.07 PASS AO=39;DP=113;FAO=41;FDP=115;FR=.;FRO=74;FSAF=32;FSAR=9;FSRF=42;FSRR=32;FWDB=0.00696138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.306;QD=4.10684;RBI=0.0195391;REFB=-0.00375248;REVB=-0.0182569;RO=74;SAF=31;SAR=8;SRF=42;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.307766;STB=0.663209;TYPE=snp;VARB=0.0050803;OID=.;OPOS=159992697;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:115:74:74:39:41:8:31:42:32:9:32:42:32 chr5 160097496 . A G 1153.61 PASS AO=121;DP=124;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0317864;FXX=0.0241916;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.1835;QD=38.1357;RBI=0.033403;REFB=0;REVB=0.0102657;RO=0;SAF=55;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000191447;OID=.;OPOS=160097496;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:124:121:0:0:121:121:66:55:0:0:66:55:0:0 chr5 160097632 . G A 1026.72 PASS AO=111;DP=114;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127414;FXX=0.0347796;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.64;QD=36.999;RBI=0.0354221;REFB=-0.0191983;REVB=-0.0330512;RO=1;SAF=41;SAR=70;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00673463;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000418606;OID=.;OPOS=160097632;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:114:111:1:0:111:111:70:41:0:1:70:41:0:0 chr5 161117243 . A G 365.28 PASS AO=94;DP=204;FAO=94;FDP=204;FR=.;FRO=110;FSAF=58;FSAR=36;FSRF=63;FSRR=47;FWDB=0.00862032;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=230.135;QD=7.16233;RBI=0.0177228;REFB=-0.01917;REVB=-0.0154851;RO=110;SAF=58;SAR=36;SRF=63;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0450625;STB=0.524967;TYPE=snp;VARB=0.0216146;OID=.;OPOS=161117243;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:204:110:110:94:94:36:58:63:47:36:58:63:47 chr5 161119071 . G T 2040.78 PASS AO=213;DP=215;FAO=213;FDP=213;FR=.;FRO=0;FSAF=118;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0369732;FXX=0.00930189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.1428;QD=38.3245;RBI=0.0429539;REFB=0;REVB=0.0218636;RO=0;SAF=118;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000205799;OID=.;OPOS=161119071;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:96:215:213:0:0:213:213:95:118:0:0:95:118:0:0 chr5 161128761 . C G 1346 PASS AO=141;DP=141;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0127717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.3074;QD=38.1845;RBI=0.023129;REFB=0;REVB=0.019283;RO=0;SAF=38;SAR=103;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.18197e-05;OID=.;OPOS=161128761;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:141:141:0:0:141:141:103:38:0:0:103:38:0:0 chr5 161522556 . C T 181.71 PASS AO=57;DP=148;FAO=57;FDP=148;FR=.;FRO=91;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=52;FSRR=39;FWDB=-0.0161996;FXX=0.00671096;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.597;QD=4.91119;RBI=0.0171388;REFB=-0.0128041;REVB=-0.00559561;RO=86;SAF=26;SAR=31;SRF=51;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145144;STB=0.570528;TYPE=snp;VARB=0.0142645;OID=.;OPOS=161522556;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:86:91:57:57:31:26:51:35:31:26:52:39 chr5 161904930 . A G 297.64 PASS AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020591;FXX=0.0302939;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.992;QD=37.2044;RBI=0.0307651;REFB=0;REVB=-0.0228584;RO=0;SAF=24;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000162994;OID=.;OPOS=161904930;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:32:32:0:0:32:32:8:24:0:0:8:24:0:0 chr5 162210532 . A G 722.01 PASS AO=73;DP=73;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0158585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.11;QD=38.0005;RBI=0.0331224;REFB=0;REVB=0.0290792;RO=0;SAF=39;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00010661;OID=.;OPOS=162210532;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:73:76:0:0:73:76:34:39:0:0:36:40:0:0 chr5 162890953 . G A 1490.85 PASS AO=153;DP=155;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0496175;FXX=0.00624961;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.794;QD=37.5056;RBI=0.0558381;REFB=-0.0957634;REVB=0.0256124;RO=1;SAF=71;SAR=82;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00576617;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000465567;OID=.;OPOS=162890953;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:155:159:1:0:153:159:82:71:0:1:83:76:0:0 chr5 167645888 . T C 266.03 PASS AO=62;DP=124;FAO=62;FDP=125;FR=.;FRO=63;FSAF=20;FSAR=42;FSRF=35;FSRR=28;FWDB=0.00334948;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.7362;QD=8.51303;RBI=0.0260608;REFB=-0.00589642;REVB=-0.0258447;RO=61;SAF=20;SAR=42;SRF=35;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234017;STB=0.622601;TYPE=snp;VARB=0.00863861;OID=.;OPOS=167645888;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:125:61:63:62:62:42:20:35:26:42:20:35:28 chr5 167689296 . C T 293.46 PASS AO=53;DP=92;FAO=55;FDP=91;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=38;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.0169523;FXX=0.0215031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.069;QD=12.8995;RBI=0.0172694;REFB=-0.0315462;REVB=0.0032941;RO=35;SAF=17;SAR=36;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151876;STB=0.582791;TYPE=snp;VARB=0.0191225;OID=.;OPOS=167689296;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:91:35:36:53:55:36:17:18:17:38:17:18:18 chr5 167689782 . GT G 44.41 PASS AO=19;DP=47;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=0.0650137;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=13.7343;QD=3.77938;RBI=0.0730394;REFB=-0.0572754;REVB=-0.0332862;RO=24;SAF=5;SAR=14;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.363609;STB=0.737712;TYPE=del;VARB=0.0513264;OID=.;OPOS=167689783;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:19:46:21:47:26:5:16:17:9:44:24:5:14:15:9 chr5 167835539 . C T 180.19 PASS AO=49;DP=114;FAO=49;FDP=114;FR=.;FRO=65;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=31;FSRR=34;FWDB=0.035246;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.207;QD=6.32235;RBI=0.0355139;REFB=-0.0208022;REVB=0.00435377;RO=64;SAF=24;SAR=25;SRF=31;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00547873;STB=0.507342;TYPE=snp;VARB=0.0332489;OID=.;OPOS=167835539;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:64:65:49:49:25:24:31:33:25:24:31:34 chr5 167891830 . T C 796.92 PASS AO=83;DP=83;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0256087;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.302;QD=37.9488;RBI=0.0374428;REFB=0;REVB=-0.0273159;RO=0;SAF=49;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.04426e-06;OID=.;OPOS=167891830;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:83:84:0:0:83:84:34:49:0:0:34:50:0:0 chr5 168098463 . A G 261.11 PASS AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0141391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.17;QD=37.3018;RBI=0.019397;REFB=0;REVB=0.013279;RO=0;SAF=9;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.62669e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.86096e-05;OID=.;OPOS=168098463;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:28:28:0:0:28:28:19:9:0:0:19:9:0:0 chr5 168176517 . A G 109.33 PASS AO=33;DP=80;FAO=33;FDP=84;FR=.;FRO=51;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=25;FWDB=-0.074993;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.3443;QD=5.20638;RBI=0.0958132;REFB=-0.0534028;REVB=-0.0596341;RO=47;SAF=16;SAR=17;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0267062;STB=0.515142;TYPE=snp;VARB=0.0607215;OID=.;OPOS=168176517;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:84:47:51:33:33:17:16:24:23:17:16:26:25 chr5 168180081 . C T 1119.02 PASS AO=118;DP=119;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00321744;FXX=0.00840265;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.013;QD=37.9329;RBI=0.0485532;REFB=-0.050726;REVB=0.0484464;RO=1;SAF=48;SAR=70;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0097919;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000269231;OID=.;OPOS=168180081;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:119:118:1:0:118:118:70:48:1:0:70:48:0:0 chr5 168244447 . C G 11.54 PASS AO=5;DP=26;FAO=5;FDP=26;FR=.;FRO=21;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=18;FWDB=0.0170583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.0662;QD=1.77502;RBI=0.062117;REFB=-0.00533618;REVB=-0.0597289;RO=21;SAF=1;SAR=4;SRF=3;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11712;STB=0.578665;TYPE=snp;VARB=0.0110542;OID=.;OPOS=168244447;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:26:26:21:21:5:5:4:1:3:18:4:1:3:18 chr5 168250350 . C G 479.25 PASS AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0505414;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.332;QD=37.5882;RBI=0.0626929;REFB=0;REVB=0.037094;RO=0;SAF=30;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.24711e-05;OID=.;OPOS=168250350;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:52:51:0:0:51:51:21:30:0:0:21:30:0:0 chr5 168690612 . A G 646.17 PASS AO=186;DP=418;FAO=176;FDP=397;FR=.;FRO=221;FSAF=76;FSAR=100;FSRF=114;FSRR=107;FWDB=-0.0118952;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.436;QD=6.51052;RBI=0.0237921;REFB=-0.0120936;REVB=-0.020605;RO=231;SAF=78;SAR=108;SRF=119;SRR=112;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.09674;STB=0.547041;TYPE=snp;VARB=0.02017;OID=.;OPOS=168690612;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:418:397:231:221:186:176:108:78:119:112:100:76:114:107 chr5 169021610 . C T 1290.34 PASS AO=125;DP=127;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0198895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.07;QD=37.9512;RBI=0.0559158;REFB=0;REVB=0.0522588;RO=0;SAF=43;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.96221e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000246598;OID=.;OPOS=169021610;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:127:136:0:0:125:136:82:43:0:0:92:44:0:0 chr5 169028481 . T C 1227.37 PASS AO=128;DP=128;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00824529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.233;QD=38.3552;RBI=0.0601959;REFB=0;REVB=0.0596285;RO=0;SAF=50;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000120776;OID=.;OPOS=169028481;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:128:128:0:0:128:128:78:50:0:0:78:50:0:0 chr5 169031150 . T C 2491.51 PASS AO=276;DP=294;FAO=280;FDP=288;FR=.;FRO=8;FSAF=116;FSAR=164;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=-0.0293883;FXX=0.0204075;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.3301;QD=34.6043;RBI=0.0697988;REFB=-0.215263;REVB=0.0633103;RO=10;SAF=116;SAR=160;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0288658;STB=0.508302;TYPE=snp;VARB=0.00273138;OID=.;OPOS=169031150;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:294:288:10:8:276:280:160:116:0:10:164:116:1:7 chr5 169129422 . A G 174.75 PASS AO=49;DP=114;FAO=49;FDP=117;FR=.;FRO=68;FSAF=18;FSAR=31;FSRF=35;FSRR=33;FWDB=-0.0237104;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=147.715;QD=5.9744;RBI=0.0244197;REFB=-0.00917552;REVB=-0.00584276;RO=65;SAF=18;SAR=31;SRF=34;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161716;STB=0.587799;TYPE=snp;VARB=0.0124372;OID=.;OPOS=169129422;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:117:65:68:49:49:31:18:34:31:31:18:35:33 chr5 169310213 . A C 2272.45 PASS AO=222;DP=222;FAO=237;FDP=237;FR=.;FRO=0;FSAF=143;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00794821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.077;QD=38.3536;RBI=0.0113569;REFB=0;REVB=-0.00811209;RO=0;SAF=141;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.28722e-05;OID=.;OPOS=169310213;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:222:237:0:0:222:237:81:141:0:0:94:143:0:0 chr5 169435713 . A C 2812.57 PASS AO=299;DP=303;FAO=299;FDP=299;FR=.;FRO=0;FSAF=163;FSAR=136;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0033401;FXX=0.0164468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.878;QD=37.6263;RBI=0.0114739;REFB=0.00960267;REVB=0.010977;RO=3;SAF=163;SAR=136;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00869576;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.68692e-06;OID=.;OPOS=169435713;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:303:299:3:0:299:299:136:163:3:0:136:163:0:0 chr5 169454941 . C G 350.2 PASS AO=67;DP=123;FAO=70;FDP=124;FR=.;FRO=54;FSAF=29;FSAR=41;FSRF=27;FSRR=27;FWDB=-0.00668668;FXX=0.0746213;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.8922;QD=11.2966;RBI=0.0550512;REFB=-0.0130902;REVB=-0.0546436;RO=54;SAF=29;SAR=38;SRF=27;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0553166;STB=0.537946;TYPE=snp;VARB=0.0129385;OID=.;OPOS=169454941;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:124:54:54:67:70:38:29:27:27:41:29:27:27 chr5 169461547 . C T 237.74 PASS AO=43;DP=73;FAO=45;FDP=74;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=8;FSRR=21;FWDB=-0.0253281;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.3351;QD=12.851;RBI=0.0271768;REFB=-0.0270177;REVB=-0.00985233;RO=30;SAF=17;SAR=26;SRF=8;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103646;STB=0.54336;TYPE=snp;VARB=0.0181597;OID=.;OPOS=169461547;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:74:30:29:43:45:26:17:8:22:28:17:8:21 chr5 169504743 . T C 196.31 PASS AO=63;DP=171;FAO=65;FDP=172;FR=.;FRO=107;FSAF=21;FSAR=44;FSRF=58;FSRR=49;FWDB=-0.00477105;FXX=0.00578001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.554;QD=4.56534;RBI=0.0252112;REFB=-0.0113132;REVB=-0.0247556;RO=101;SAF=19;SAR=44;SRF=54;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.264296;STB=0.640221;TYPE=snp;VARB=0.0276544;OID=.;OPOS=169504743;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:172:101:107:63:65:44:19:54:47:44:21:58:49 chr5 169535492 . G A 289.09 PASS AO=62;DP=133;FAO=68;FDP=135;FR=.;FRO=67;FSAF=20;FSAR=48;FSRF=17;FSRR=50;FWDB=0.0274181;FXX=0.0073524;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.9815;QD=8.56571;RBI=0.0809718;REFB=-0.0170788;REVB=0.0761885;RO=68;SAF=17;SAR=45;SRF=17;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0291457;STB=0.524618;TYPE=snp;VARB=0.012007;OID=.;OPOS=169535492;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:135:68:67:62:68:45:17:17:51:48:20:17:50 chr5 169535522 . T C 198.55 PASS AO=55;DP=130;FAO=55;FDP=130;FR=.;FRO=75;FSAF=10;FSAR=45;FSRF=19;FSRR=56;FWDB=-0.0130727;FXX=0.0151504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.8903;QD=6.10916;RBI=0.0345501;REFB=-0.0179286;REVB=-0.0319814;RO=72;SAF=10;SAR=45;SRF=19;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125977;STB=0.56369;TYPE=snp;VARB=0.0186955;OID=.;OPOS=169535522;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:72:75:55:55:45:10:19:53:45:10:19:56 chr5 169661994 . G C 797.7 PASS AO=80;DP=82;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0197856;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.582;QD=37.9858;RBI=0.0286897;REFB=0;REVB=-0.0207757;RO=0;SAF=45;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.30416e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.43872e-05;OID=.;OPOS=169661994;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:82:84:0:0:80:84:35:45:0:0:37:47:0:0 chr5 169685163 . C T 776.67 PASS AO=80;DP=80;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0259957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.771;QD=37.8863;RBI=0.0896957;REFB=0;REVB=0.085846;RO=0;SAF=63;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000130173;OID=.;OPOS=169685163;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:80:82:0:0:80:82:17:63:0:0:19:63:0:0 chr5 169715038 . A G 287.18 PASS AO=62;DP=117;FAO=62;FDP=117;FR=.;FRO=55;FSAF=21;FSAR=41;FSRF=18;FSRR=37;FWDB=-0.030481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.6032;QD=9.81826;RBI=0.030485;REFB=-0.0300121;REVB=0.000492518;RO=55;SAF=21;SAR=41;SRF=18;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0109678;STB=0.506022;TYPE=snp;VARB=0.0261834;OID=.;OPOS=169715038;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:55:55:62:62:41:21:18:37:41:21:18:37 chr5 169805956 . C G 30.83 PASS AO=10;DP=37;FAO=11;FDP=38;FR=.;FRO=27;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=20;FWDB=0.0214049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.943;QD=3.24556;RBI=0.0287873;REFB=-0.0213829;REVB=-0.0192493;RO=27;SAF=4;SAR=6;SRF=7;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182535;STB=0.643331;TYPE=snp;VARB=0.0436286;OID=.;OPOS=169805956;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:37:38:27:27:10:11:6:4:7:20:6:5:7:20 chr5 169910084 . G T 1132.67 PASS AO=121;DP=123;FAO=124;FDP=126;FR=.;FRO=2;FSAF=46;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0286157;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=50.4945;QD=35.9579;RBI=0.0349651;REFB=0.0386667;REVB=0.0200923;RO=2;SAF=44;SAR=77;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0121782;STB=0.506328;TYPE=snp;VARB=-0.000237181;OID=.;OPOS=169910084;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:123:126:2:2:121:124:77:44:0:2:78:46:0:2 chr5 170239112 . C A 783.57 PASS AO=204;DP=414;FAO=192;FDP=396;FR=.;FRO=204;FSAF=94;FSAR=98;FSRF=90;FSRR=114;FWDB=-0.0231403;FXX=0.00999975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.1157;QD=7.91482;RBI=0.0232805;REFB=-0.00857019;REVB=-0.00255103;RO=203;SAF=101;SAR=103;SRF=89;SRR=114;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0516939;STB=0.524971;TYPE=snp;VARB=0.00804833;OID=.;OPOS=170239112;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:414:396:203:204:204:192:103:101:89:114:98:94:90:114 chr5 170240981 . GT G 201.05 PASS AO=101;DP=349;FAO=143;FDP=323;FR=.;FRO=180;FSAF=102;FSAR=41;FSRF=100;FSRR=80;FWDB=-0.0844928;FXX=0.0415418;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.1858;QD=2.48979;RBI=0.089594;REFB=-0.0947653;REVB=-0.0298003;RO=170;SAF=91;SAR=10;SRF=93;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.537347;STB=0.598415;TYPE=del;VARB=0.120665;OID=.;OPOS=170240982;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:101:323:143:323:180:102:41:100:80:99:170:91:10:93:77 chr5 170294132 . G A 256.61 PASS AO=64;DP=137;FAO=64;FDP=137;FR=.;FRO=73;FSAF=34;FSAR=30;FSRF=26;FSRR=47;FWDB=0.0073098;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.361;QD=7.49228;RBI=0.0181577;REFB=-0.0241445;REVB=-0.0166213;RO=73;SAF=34;SAR=30;SRF=26;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167177;STB=0.592548;TYPE=snp;VARB=0.0290066;OID=.;OPOS=170294132;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:73:73:64:64:30:34:26:47:30:34:26:47 chr5 170343469 . G T 14.62 PASS AO=14;DP=84;FAO=14;FDP=82;FR=.;FRO=68;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=31;FSRR=37;FWDB=0.0212376;FXX=0.03529;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.0496;QD=0.713095;RBI=0.0232103;REFB=-0.00348982;REVB=0.00936377;RO=61;SAF=11;SAR=3;SRF=31;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.367543;STB=0.776984;TYPE=snp;VARB=0.0305363;OID=.;OPOS=170343469;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:84:82:61:68:14:14:3:11:31:30:3:11:31:37 chr5 170395512 . A T 533.56 PASS AO=123;DP=242;FAO=123;FDP=242;FR=.;FRO=119;FSAF=54;FSAR=69;FSRF=67;FSRR=52;FWDB=0.00496582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.044;QD=8.81916;RBI=0.0151228;REFB=-0.0132323;REVB=0.0142842;RO=118;SAF=54;SAR=69;SRF=66;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10756;STB=0.560966;TYPE=snp;VARB=0.0183563;OID=.;OPOS=170395512;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:242:242:118:119:123:123:69:54:66:52:69:54:67:52 chr5 170847242 . GCC GC,GCG 249.89 PASS AO=13,9;DP=38;FAO=26,10;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=17,10;FSAR=9,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.131468,-0.026479;FXX=0.0270197;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=13.3705,139.038;QD=27.7658;RBI=0.785546,0.12048;REFB=0,0;REVB=0.774467,0.117534;RO=9;SAF=13,9;SAR=0,0;SRF=0;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.861836,0.851555;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.0372005,0.0358865;OID=.,.;OPOS=170847243,170847244;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=GC,GCG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:13,9:36:26,10:36:0:17,10:9,0:0:0:23:9:13,9:0,0:0:9 chr5 171201499 . G C 115.61 PASS AO=26;DP=53;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=2;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=26;FWDB=0.0240334;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.6069;QD=8.72531;RBI=0.0576707;REFB=0.0026383;REVB=0.0524243;RO=26;SAF=2;SAR=24;SRF=1;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138387;STB=0.581341;TYPE=snp;VARB=-0.00382362;OID=.;OPOS=171201499;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:26:27:26:26:24:2:1:25:24:2:1:26 chr5 171472417 . A G 759.91 PASS AO=86;DP=91;FAO=86;FDP=90;FR=.;FRO=4;FSAF=43;FSAR=43;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.00306411;FXX=0.0109878;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.3651;QD=33.7737;RBI=0.01378;REFB=-0.0885022;REVB=0.013435;RO=4;SAF=43;SAR=43;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00252237;OID=.;OPOS=171472417;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:91:90:4:4:86:86:43:43:2:2:43:43:2:2 chr5 171481606 . A G 82.48 PASS AO=17;DP=33;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=16;FSAR=1;FSRF=15;FSRR=1;FWDB=-0.0428323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.246;QD=9.99741;RBI=0.186016;REFB=-0.0359746;REVB=-0.181018;RO=16;SAF=16;SAR=1;SRF=15;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0139702;STB=0.507927;TYPE=snp;VARB=0.0245387;OID=.;OPOS=171481606;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:33:33:16:16:17:17:1:16:15:1:1:16:15:1 chr5 171533629 . A G 112.31 PASS AO=30;DP=69;FAO=29;FDP=68;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=0.0304106;FXX=0.0285673;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.128;QD=6.60635;RBI=0.03455;REFB=-0.024636;REVB=-0.016398;RO=39;SAF=13;SAR=17;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0542976;STB=0.54271;TYPE=snp;VARB=0.0280179;OID=.;OPOS=171533629;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:68:39:39:30:29:17:13:19:20:17:12:19:20 chr5 171533656 . C T 259.85 PASS AO=53;DP=95;FAO=53;FDP=95;FR=.;FRO=42;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=0.00556708;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.74;QD=10.9411;RBI=0.0131799;REFB=-0.0211718;REVB=0.0119464;RO=42;SAF=29;SAR=24;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0764879;STB=0.541932;TYPE=snp;VARB=0.0186065;OID=.;OPOS=171533656;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:42:42:53:53:24:29:19:23:24:29:19:23 chr5 171533782 . T C 200.57 PASS AO=47;DP=118;FAO=56;FDP=130;FR=.;FRO=74;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=28;FSRR=46;FWDB=-0.0210466;FXX=0.00763301;HRUN=3;LEN=1;MLLD=39.7348;QD=6.17129;RBI=0.0212572;REFB=-0.0658567;REVB=-0.00298463;RO=69;SAF=24;SAR=23;SRF=26;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140896;STB=0.579021;TYPE=snp;VARB=0.0686387;OID=.;OPOS=171533782;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:130:69:74:47:56:23:24:26:43:27:29:28:46 chr5 171630299 . GA G 22.77 PASS AO=15;DP=89;FAO=25;FDP=90;FR=.;FRO=65;FSAF=3;FSAR=22;FSRF=22;FSRR=43;FWDB=0.262744;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.9416;QD=1.01194;RBI=0.267389;REFB=-0.0374802;REVB=-0.0496242;RO=59;SAF=3;SAR=12;SRF=16;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12334;STB=0.738024;TYPE=del;VARB=0.0952236;OID=.;OPOS=171630300;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:15:83:25:90:65:3:22:22:43:22:59:3:12:16:43 chr5 171636675 . A T 39.07 PASS AO=9;DP=31;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=-0.00339292;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=44.071;QD=4.4649;RBI=0.0208831;REFB=-0.00253196;REVB=0.0206056;RO=22;SAF=5;SAR=4;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0951184;STB=0.631413;TYPE=snp;VARB=0.00268344;OID=.;OPOS=171636675;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:31:35:22:20:9:15:4:5:14:8:8:7:14:6 chr5 171636926 . C T 215.37 PASS AO=49;DP=98;FAO=49;FDP=98;FR=.;FRO=49;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=18;FSRR=31;FWDB=0.0057987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.812;QD=8.79056;RBI=0.00652261;REFB=-0.0136651;REVB=-0.00298655;RO=48;SAF=25;SAR=24;SRF=18;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120824;STB=0.571222;TYPE=snp;VARB=0.00978258;OID=.;OPOS=171636926;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:48:49:49:49:24:25:18:30:24:25:18:31 chr5 171638165 . T C 477.04 PASS AO=122;DP=263;FAO=122;FDP=262;FR=.;FRO=140;FSAF=55;FSAR=67;FSRF=83;FSRR=57;FWDB=-0.00569183;FXX=0.00757547;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.839;QD=7.28298;RBI=0.00821831;REFB=-0.0113308;REVB=0.00592821;RO=137;SAF=55;SAR=67;SRF=80;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127194;STB=0.575489;TYPE=snp;VARB=0.0111223;OID=.;OPOS=171638165;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:263:262:137:140:122:122:67:55:80:57:67:55:83:57 chr5 171712758 . T C 93.26 PASS AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=0.0626939;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6572;QD=7.77153;RBI=0.0643148;REFB=-0.0378813;REVB=-0.0143479;RO=25;SAF=15;SAR=7;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00196504;STB=0.506573;TYPE=snp;VARB=0.0354357;OID=.;OPOS=171712758;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:49:48:25:26:22:22:7:15:17:8:7:15:18:8 chr5 171760569 . A G 1624.01 PASS AO=170;DP=174;FAO=179;FDP=183;FR=.;FRO=4;FSAF=99;FSAR=80;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.00418883;FXX=0.0468726;HRUN=3;LEN=1;MLLD=139.473;QD=35.4975;RBI=0.00532527;REFB=-0.134012;REVB=-0.0032882;RO=2;SAF=98;SAR=72;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00173247;STB=0.50669;TYPE=snp;VARB=0.000834617;OID=.;OPOS=171760569;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:174:183:2:4:170:179:72:98:1:1:80:99:1:3 chr5 171761437 . C T 160 PASS AO=41;DP=92;FAO=41;FDP=92;FR=.;FRO=51;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=31;FSRR=20;FWDB=0.00251724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.571;QD=6.95663;RBI=0.00685736;REFB=-0.0253287;REVB=0.00637863;RO=49;SAF=26;SAR=15;SRF=31;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00156426;STB=0.515573;TYPE=snp;VARB=0.0324879;OID=.;OPOS=171761437;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:49:51:41:41:15:26:31:18:15:26:31:20 chr5 172196711 . G T 904.53 PASS AO=93;DP=93;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.736;QD=38.0854;RBI=0.0383466;REFB=0;REVB=0.0336148;RO=0;SAF=7;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000131361;OID=.;OPOS=172196711;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:93:95:0:0:93:95:86:7:0:0:88:7:0:0 chr5 172294194 . G T 877.16 PASS AO=95;DP=96;FAO=94;FDP=95;FR=.;FRO=1;FSAF=58;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0521376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.829;QD=36.9331;RBI=0.0548447;REFB=-0.0669469;REVB=0.0170182;RO=0;SAF=58;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.87092e-08;STB=0.504273;TYPE=snp;VARB=0.000806466;OID=.;OPOS=172294194;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:96:95:0:1:95:94:37:58:0:0:36:58:1:0 chr5 172341917 . T C 89.92 PASS AO=23;DP=53;FAO=23;FDP=53;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=10;FWDB=-0.00118863;FXX=0.0535619;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.783;QD=6.78609;RBI=0.00573209;REFB=-0.0118343;REVB=-0.0056075;RO=30;SAF=12;SAR=11;SRF=20;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14591;STB=0.582712;TYPE=snp;VARB=0.0269849;OID=.;OPOS=172341917;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:53:53:30:30:23:23:11:12:20:10:11:12:20:10 chr5 172342029 . G GT 26.32 PASS AO=12;DP=63;FAO=24;FDP=60;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=13;FWDB=0.0731264;FXX=0.0163908;HRUN=4;LEN=1;MLLD=11.3749;QD=1.75438;RBI=0.0891287;REFB=0.0185309;REVB=-0.0509554;RO=42;SAF=5;SAR=7;SRF=28;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.300342;STB=0.607056;TYPE=ins;VARB=-0.0819243;OID=.;OPOS=172342030;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:12:63:24:60:36:11:13:23:13:26:42:5:7:28:14 chr5 172562142 . G A 3775.37 PASS AO=950;DP=954;FAO=395;FDP=395;FR=.;FRO=0;FSAF=159;FSAR=236;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00429561;FXX=0.0124997;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.1586;QD=38.2316;RBI=0.00858853;REFB=0;REVB=-0.0074371;RO=0;SAF=356;SAR=594;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000474627;OID=.;OPOS=172562142;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:954:395:0:0:950:395:594:356:0:0:236:159:0:0 chr5 172660523 . T A 14.81 PASS AO=12;DP=59;FAO=13;FDP=68;FR=.;FRO=55;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=44;FWDB=0.0277469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.378;QD=0.871415;RBI=0.0298202;REFB=-0.000583615;REVB=0.010925;RO=45;SAF=4;SAR=8;SRF=10;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168707;STB=0.669888;TYPE=snp;VARB=0.0056854;OID=.;OPOS=172660523;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:59:68:45:55:12:13:8:4:10:35:8:5:11:44 chr5 172660527 . T A 46.99 PASS AO=20;DP=62;FAO=21;FDP=67;FR=.;FRO=46;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=36;FWDB=0.0363171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.762;QD=2.80526;RBI=0.0368472;REFB=-0.00287142;REVB=0.00622799;RO=38;SAF=6;SAR=14;SRF=7;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168793;STB=0.560386;TYPE=snp;VARB=0.00774771;OID=.;OPOS=172660527;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:62:67:38:46:20:21:14:6:7:31:15:6:10:36 chr5 172681229 . G A 1035.83 PASS AO=114;DP=121;FAO=120;FDP=126;FR=.;FRO=6;FSAF=55;FSAR=65;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.00656737;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.43;QD=32.8834;RBI=0.0358425;REFB=-0.0347414;REVB=0.0352357;RO=6;SAF=54;SAR=60;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0133511;STB=0.514016;TYPE=snp;VARB=0.00959829;OID=.;OPOS=172681229;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:121:126:6:6:114:120:60:54:2:4:65:55:1:5 chr5 172744195 . TC T 82.29 PASS AO=24;DP=100;FAO=53;FDP=88;FR=.;FRO=35;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.155451;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.81413;QD=3.74058;RBI=0.209454;REFB=-0.118829;REVB=0.140379;RO=26;SAF=15;SAR=9;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.320046;STB=0.532225;TYPE=del;VARB=0.136252;OID=.;OPOS=172744196;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:24:61:53:88:35:30:23:17:18:46:26:15:9:7:19 chr5 174156168 . T C 1153.59 PASS AO=121;DP=121;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.025124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.004;QD=38.1352;RBI=0.0280588;REFB=0;REVB=0.0124931;RO=0;SAF=58;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.74998e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.76141e-05;OID=.;OPOS=174156168;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:121:121:0:0:121:121:63:58:0:0:63:58:0:0 chr5 174868840 . T C 1422.59 PASS AO=151;DP=151;FAO=151;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00531156;FXX=0.00657851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.419;QD=37.6845;RBI=0.018175;REFB=-0.0515347;REVB=0.0173815;RO=0;SAF=81;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.05665e-05;OID=.;OPOS=174868840;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:151:151:0:0:151:151:70:81:0:0:71:80:0:0 chr5 174870150 . C T 779.02 PASS AO=86;DP=91;FAO=88;FDP=89;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=50;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0107332;FXX=0.0219756;HRUN=3;LEN=1;MLLD=141.737;QD=35.0123;RBI=0.0264166;REFB=-0.0617983;REVB=0.0241379;RO=3;SAF=37;SAR=49;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0153507;STB=0.506492;TYPE=snp;VARB=0.000687599;OID=.;OPOS=174870150;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:91:89:3:1:86:88:49:37:2:1:50:38:1:0 chr5 174870196 . C T 173.5 PASS AO=46;DP=105;FAO=46;FDP=105;FR=.;FRO=59;FSAF=29;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=33;FWDB=-0.00493948;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.53;QD=6.60935;RBI=0.0159919;REFB=-0.0174939;REVB=-0.01521;RO=59;SAF=29;SAR=17;SRF=26;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19234;STB=0.607919;TYPE=snp;VARB=0.014893;OID=.;OPOS=174870196;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:59:59:46:46:17:29:26:33:17:29:26:33 chr5 175307292 . CAGG CGG,CG,C 361.87 PASS AO=10,13,13;DP=48;FAO=0,24,17;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=0,10,3;FSAR=0,14,14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.069884,-0.065374,-0.0571676;FXX=0;HRUN=1,1,1;LEN=1,2,3;MLLD=83.1198,91.3081,91.2761;QD=35.3048;RBI=0.0824858,0.0689124,0.0577143;REFB=0,0,0;REVB=0.0438193,0.0217983,0.0079255;RO=0;SAF=3,5,2;SAR=7,8,11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,-3.60098e-08,0;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=del,del,del;VARB=0.0243946,-0.00454468,-0.012658;OID=.,.,.;OPOS=175307293,175307293,175307293;OREF=A,AG,AGG;OALT=-,-,-;OMAPALT=CGG,CG,C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/3:10,13,13:42:0,24,17:41:0:0,10,3:0,14,14:0:0:29:0:3,5,2:7,8,11:0:0 chr5 175717216 . C T 157.65 PASS AO=14;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0494482;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.427;QD=37.093;RBI=0.0875712;REFB=0;REVB=0.0722744;RO=0;SAF=10;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.63386e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00103034;OID=.;OPOS=175717216;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:17:17:0:0:14:17:4:10:0:0:4:13:0:0 chr5 175721962 . C T 127.22 PASS AO=15;DP=16;FAO=15;FDP=16;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.037558;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.277;QD=31.8059;RBI=0.038683;REFB=-0.00183991;REVB=0.00926132;RO=0;SAF=13;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.518494;TYPE=snp;VARB=-1.06747e-05;OID=.;OPOS=175721962;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:16:16:0:1:15:15:2:13:0:0:2:13:1:0 chr5 175772208 . C T 543.51 PASS AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0065469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.7955;QD=38.141;RBI=0.0908416;REFB=0;REVB=0.0906054;RO=0;SAF=26;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19358e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00122575;OID=.;OPOS=175772208;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:57:57:0:0:57:57:31:26:0:0:31:26:0:0 chr5 175774655 . GC G 1025.94 PASS AO=140;DP=188;FAO=182;FDP=182;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=135;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.175096;FXX=0.010869;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.4295;QD=22.5481;RBI=0.196126;REFB=0.0402656;REVB=0.0883575;RO=16;SAF=32;SAR=108;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0.5875;SSSB=0.0113842;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00372347;OID=.;OPOS=175774656;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:140:175:182:182:0:47:135:0:0:75:16:32:108:3:13 chr5 175793532 . C T 269.6 PASS AO=25;DP=26;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026389;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.164;QD=38.5136;RBI=0.0272994;REFB=0;REVB=0.00699112;RO=0;SAF=10;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000891965;OID=.;OPOS=175793532;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:26:28:0:0:25:28:15:10:0:0:16:12:0:0 chr5 175811094 . C CGT 844.84 PASS AO=97;DP=140;FAO=111;FDP=129;FR=.;FRO=18;FSAF=61;FSAR=50;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=0.0317399;FXX=0.0227256;HRUN=1;LEN=2;MLLD=190.034;QD=26.1966;RBI=0.0354368;REFB=-0.0743724;REVB=-0.0157591;RO=33;SAF=52;SAR=45;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0480578;STB=0.524446;TYPE=ins;VARB=0.00666702;OID=.;OPOS=175811095;OREF=-;OALT=GT;OMAPALT=CGT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:97:140:111:129:18:61:50:13:5:9:33:52:45:21:12 chr5 175843189 . G A 125.84 PASS AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314313;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=215.804;QD=35.9535;RBI=0.0314763;REFB=0;REVB=0.0016816;RO=0;SAF=12;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00016666;OID=.;OPOS=175843189;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:14:14:0:0:14:14:2:12:0:0:2:12:0:0 chr5 175956177 . G A 653.49 PASS AO=72;DP=75;FAO=73;FDP=75;FR=.;FRO=2;FSAF=44;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0237479;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.042;QD=34.8527;RBI=0.0355787;REFB=-0.0567185;REVB=0.0264931;RO=3;SAF=43;SAR=29;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00546099;STB=0.502856;TYPE=snp;VARB=0.001928;OID=.;OPOS=175956177;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:75:75:3:2:72:73:29:43:2:1:29:44:1:1 chr5 175956271 . A C 642.37 PASS AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0122047;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.324;QD=37.239;RBI=0.035134;REFB=-0.0421489;REVB=-0.0329461;RO=1;SAF=22;SAR=46;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0209962;STB=0.511108;TYPE=snp;VARB=0.000290446;OID=.;OPOS=175956271;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:69:69:1:1:68:68:46:22:1:0:46:22:1:0 chr5 175998246 . T C 953.26 PASS AO=100;DP=100;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0114542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.446;QD=38.5155;RBI=0.0172622;REFB=0;REVB=-0.0129145;RO=0;SAF=32;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.80932e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.62365e-05;OID=.;OPOS=175998246;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:100:99:0:0:100:99:68:32:0:0:67:32:0:0 chr5 176002144 . A C 214.5 PASS AO=23;DP=25;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156181;FXX=0.079968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.025;QD=37.304;RBI=0.015653;REFB=0;REVB=0.00104539;RO=0;SAF=20;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000219796;OID=.;OPOS=176002144;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:25:23:0:0:23:23:3:20:0:0:3:20:0:0 chr5 176004476 . T C 249.95 PASS AO=23;DP=24;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0231239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.3781;QD=35.7074;RBI=0.0835564;REFB=0;REVB=0.080293;RO=0;SAF=18;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000704761;OID=.;OPOS=176004476;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:24:28:0:0:23:28:5:18:0:0:9:19:0:0 chr5 176017639 . C A 1447.54 PASS AO=152;DP=155;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0286697;FXX=0.0193536;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.165;QD=38.0933;RBI=0.0305878;REFB=0;REVB=0.0106611;RO=0;SAF=89;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00013506;OID=.;OPOS=176017639;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:155:152:0:0:152:152:63:89:0:0:63:89:0:0 chr5 176024880 . C T 680.1 PASS AO=84;DP=94;FAO=84;FDP=94;FR=.;FRO=10;FSAF=18;FSAR=66;FSRF=9;FSRR=1;FWDB=0.00869038;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=234.533;QD=28.9402;RBI=0.0099238;REFB=-0.0969496;REVB=0.00479156;RO=5;SAF=18;SAR=66;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0872703;STB=0.596361;TYPE=snp;VARB=0.000532387;OID=.;OPOS=176024880;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:94:94:5:10:84:84:66:18:4:1:66:18:9:1 chr5 176025938 . T C 651.41 PASS AO=49;DP=77;FAO=73;FDP=73;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=44;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0149155;FXX=0.0519413;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.428;QD=35.6936;RBI=0.0176261;REFB=0;REVB=-0.00939176;RO=0;SAF=43;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000981087;OID=.;OPOS=176025938;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:76:73:0:0:49:73:6:43:0:0:29:44:0:0 chr5 176053645 . C G 280.24 PASS AO=19;DP=32;FAO=31;FDP=31;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=7;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0733443;FXX=0.0312402;HRUN=5;LEN=1;MLLD=32.6187;QD=36.1599;RBI=0.185248;REFB=0;REVB=0.17011;RO=7;SAF=5;SAR=14;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183452;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0140153;OID=.;OPOS=176053645;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:32:31:7:0:19:31:14:5:0:7:24:7:0:0 chr5 176056487 . C CCG 10.27 PASS AO=2;DP=9;FAO=2;FDP=9;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=31.9793;QD=4.5644;RBI=0.0314201;REFB=-0.040075;REVB=0.0314201;RO=7;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.11516;OID=.;OPOS=176056488;OREF=-;OALT=CG;OMAPALT=CCG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:2:9:2:9:7:0:2:0:7:10:7:0:2:0:7 chr5 176081907 . C T 176.07 PASS AO=41;DP=84;FAO=41;FDP=84;FR=.;FRO=43;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=30;FWDB=0.0626473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.0968;QD=8.38411;RBI=0.0630268;REFB=-0.0220673;REVB=-0.00690608;RO=42;SAF=22;SAR=19;SRF=13;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205091;STB=0.618418;TYPE=snp;VARB=0.020793;OID=.;OPOS=176081907;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:42:43:41:41:19:22:13:29:19:22:13:30 chr5 176307210 . GGCC GC,G,GGC 216.27 PASS AO=11,5,6;DP=34;FAO=32,0,0;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=25,0,0;FSAR=7,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.110189,0.0110202,-0.191229;FXX=0.0302939;HRUN=4,4,4;LEN=2,3,1;MLLD=22.1013,15.1523,11.3906;QD=27.0338;RBI=0.397669,0.33918,0.780836;REFB=-0.0696661,-0.067619,-0.0172571;REVB=0.382098,0.339001,0.757057;RO=7;SAF=11,5,6;SAR=0,0,0;SRF=2;SRR=5;SSEN=0.534653,0.534653,0.329545;SSEP=0,0,0.552632;SSSB=0.829173,0.772338,0.787422;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=del,del,del;VARB=0.0145959,0,0.0605645;OID=.,.,.;OPOS=176307211,176307211,176307212;OREF=GC,GCC,C;OALT=-,-,-;OMAPALT=GC,G,GGC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:11,5,6:31:32,0,0:32:0:25,0,0:7,0,0:0:0:16:7:11,5,6:0,0,0:2:5 chr5 176314459 . G A 39.29 PASS AO=8;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.0147789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.821;QD=9.24565;RBI=0.0180741;REFB=-0.0105835;REVB=-0.0104047;RO=9;SAF=5;SAR=3;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0645053;STB=0.538364;TYPE=snp;VARB=0.00448122;OID=.;OPOS=176314459;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:17:17:9:9:8:8:3:5:5:4:3:5:5:4 chr5 176314638 . C CA 24.73 PASS AO=3;DP=20;FAO=5;FDP=13;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.049142;FXX=0.349825;HRUN=0;LEN=1;MLLD=130.656;QD=7.61054;RBI=0.0643536;REFB=-0.0723644;REVB=-0.0415505;RO=14;SAF=2;SAR=1;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.329006;STB=0.77305;TYPE=ins;VARB=0.105294;OID=.;OPOS=176314639;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:3:20:5:13:8:4:1:3:5:24:14:2:1:5:9 chr5 176314639 . G A 33.83 PASS AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.00935251;FXX=0.190386;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.14;QD=7.95997;RBI=0.0316668;REFB=-0.0588712;REVB=-0.0302542;RO=9;SAF=3;SAR=4;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206013;STB=0.578732;TYPE=snp;VARB=0.0717284;OID=.;OPOS=176314639;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:20:17:9:10:7:7:4:3:2:7:4:3:3:7 chr5 176334195 . C T 225.58 PASS AO=38;DP=116;FAO=53;FDP=109;FR=.;FRO=56;FSAF=36;FSAR=17;FSRF=41;FSRR=15;FWDB=0.0349459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.004;QD=8.27806;RBI=0.0377886;REFB=-0.0114461;REVB=-0.0143793;RO=43;SAF=27;SAR=11;SRF=34;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0973067;STB=0.531886;TYPE=snp;VARB=0.00990146;OID=.;OPOS=176334195;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:109:43:56:38:53:11:27:34:9:17:36:41:15 chr5 176378574 . G T 72.63 PASS AO=20;DP=51;FAO=20;FDP=51;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.00454993;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=182.155;QD=5.6968;RBI=0.0254055;REFB=-0.00630592;REVB=0.0249947;RO=31;SAF=6;SAR=14;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.331379;STB=0.691506;TYPE=snp;VARB=0.00677245;OID=.;OPOS=176378574;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:51:51:31:31:20:20:14:6:19:12:14:6:19:12 chr5 176382995 . G A 163.13 PASS AO=53;DP=142;FAO=53;FDP=142;FR=.;FRO=89;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=44;FSRR=45;FWDB=-0.0328743;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.123;QD=4.59515;RBI=0.0345955;REFB=-0.0080018;REVB=-0.0107763;RO=89;SAF=32;SAR=21;SRF=44;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122227;STB=0.569553;TYPE=snp;VARB=0.0155486;OID=.;OPOS=176382995;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:89:89:53:53:21:32:44:45:21:32:44:45 chr5 176396254 . A G 12.53 PASS AO=3;DP=12;FAO=3;FDP=12;FR=.;FRO=9;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.542;QD=4.17567;RBI=0.0186725;REFB=0.00656051;REVB=0.0186725;RO=9;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0154228;OID=.;OPOS=176396254;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:12:12:9:9:3:3:3:0:0:9:3:0:0:9 chr5 176402401 . G A 434.31 PASS AO=120;DP=272;FAO=119;FDP=271;FR=.;FRO=152;FSAF=71;FSAR=48;FSRF=72;FSRR=80;FWDB=-0.00760048;FXX=0.0145449;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.666;QD=6.41047;RBI=0.042392;REFB=-0.00499415;REVB=-0.0417051;RO=150;SAF=69;SAR=51;SRF=69;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11556;STB=0.569697;TYPE=snp;VARB=0.00401651;OID=.;OPOS=176402401;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:272:271:150:152:120:119:51:69:69:81:48:71:72:80 chr5 176492557 . G A 170.51 PASS AO=38;DP=75;FAO=38;FDP=75;FR=.;FRO=37;FSAF=6;FSAR=32;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=-0.0132269;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=124.927;QD=9.09368;RBI=0.0230609;REFB=-0.0110434;REVB=0.0188906;RO=37;SAF=6;SAR=32;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.309749;STB=0.674593;TYPE=snp;VARB=0.00824605;OID=.;OPOS=176492557;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:37:37:38:38:32:6:15:22:32:6:15:22 chr5 176516631 . G A 69.03 PASS AO=21;DP=68;FAO=23;FDP=67;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=-0.0159999;FXX=0.0147037;HRUN=5;LEN=1;MLLD=194.739;QD=4.12119;RBI=0.0185034;REFB=-0.0289129;REVB=0.00929391;RO=27;SAF=13;SAR=8;SRF=19;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0909894;STB=0.542743;TYPE=snp;VARB=0.0346311;OID=.;OPOS=176516631;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:61:67:27:44:21:23:8:13:19:8:9:14:24:20 chr5 176517170 . G A 34.33 PASS AO=10;DP=31;FAO=10;FDP=30;FR=.;FRO=20;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=17;FWDB=0.0259614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.92;QD=4.57673;RBI=0.0266067;REFB=-0.0189128;REVB=-0.00582421;RO=21;SAF=1;SAR=9;SRF=3;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115003;STB=0.580464;TYPE=snp;VARB=0.028751;OID=.;OPOS=176517170;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:31:30:21:20:10:10:9:1:3:18:9:1:3:17 chr5 176517292 . A G 111.34 PASS AO=24;DP=50;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=3;FSRR=21;FWDB=0.0207532;FXX=0.058812;HRUN=3;LEN=1;MLLD=71.3439;QD=9.27836;RBI=0.0349294;REFB=-0.0301325;REVB=-0.0280958;RO=24;SAF=6;SAR=18;SRF=3;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163802;STB=0.590842;TYPE=snp;VARB=0.0196894;OID=.;OPOS=176517292;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:48:24:24:24:24:18:6:3:21:18:6:3:21 chr5 176517326 . T C 126.31 PASS AO=23;DP=39;FAO=23;FDP=39;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=15;FWDB=-0.0180377;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.224;QD=12.955;RBI=0.0254262;REFB=-0.0259639;REVB=0.0179203;RO=16;SAF=5;SAR=18;SRF=1;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190624;STB=0.604318;TYPE=snp;VARB=0.0147055;OID=.;OPOS=176517326;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:39:39:16:16:23:23:18:5:1:15:18:5:1:15 chr5 176517461 . T G 10.38 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.9229;QD=5.93124;RBI=0.00599178;REFB=-0.0456766;REVB=0.00599178;RO=5;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0978004;OID=.;OPOS=176517461;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:5:5:2:2:2:0:0:5:2:0:0:5 chr5 176517797 . C T 358.95 PASS AO=74;DP=133;FAO=74;FDP=133;FR=.;FRO=59;FSAF=30;FSAR=44;FSRF=30;FSRR=29;FWDB=-0.0206335;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=202.086;QD=10.7954;RBI=0.0208884;REFB=-0.00878975;REVB=-0.00325347;RO=55;SAF=30;SAR=44;SRF=26;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0539658;STB=0.546571;TYPE=snp;VARB=0.00552513;OID=.;OPOS=176517797;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:55:59:74:74:44:30:26:29:44:30:30:29 chr5 176518784 . C T 177.82 PASS AO=33;DP=61;FAO=35;FDP=62;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.00473845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.671;QD=11.4719;RBI=0.0117814;REFB=0.0136057;REVB=0.0107865;RO=27;SAF=12;SAR=21;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00590345;STB=0.513177;TYPE=snp;VARB=-0.0093207;OID=.;OPOS=176518784;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:62:27:27:33:35:21:12:10:17:23:12:10:17 chr5 176721198 . T C 1077.3 PASS AO=115;DP=117;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00695457;FXX=0.00854628;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.009;QD=37.1482;RBI=0.0380177;REFB=-0.0158997;REVB=0.0373762;RO=0;SAF=59;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17651e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000282938;OID=.;OPOS=176721198;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:117:116:0:0:115:116:56:59:0:0:56:60:0:0 chr5 176728400 . G A 174.71 PASS AO=53;DP=136;FAO=53;FDP=134;FR=.;FRO=81;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=57;FWDB=0.00991577;FXX=0.0147048;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.4375;QD=5.21537;RBI=0.0378206;REFB=0.00175094;REVB=0.0364976;RO=82;SAF=31;SAR=22;SRF=24;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.30653;STB=0.679675;TYPE=snp;VARB=-0.00268479;OID=.;OPOS=176728400;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:134:82:81:53:53:22:31:24:58:21:32:24:57 chr5 176728458 . G T 259.23 PASS AO=74;DP=174;FAO=74;FDP=175;FR=.;FRO=101;FSAF=38;FSAR=36;FSRF=26;FSRR=75;FWDB=0.0072559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.374;QD=5.92531;RBI=0.0141708;REFB=-0.00964969;REVB=-0.0121723;RO=99;SAF=37;SAR=37;SRF=26;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.24505;STB=0.646698;TYPE=snp;VARB=0.00920985;OID=.;OPOS=176728458;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:175:99:101:74:74:37:37:26:73:36:38:26:75 chr5 176733116 . A G 760.68 PASS AO=82;DP=82;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0429116;FXX=0.0243873;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.643;QD=38.0338;RBI=0.0431061;REFB=0;REVB=0.00409017;RO=0;SAF=37;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000281058;OID=.;OPOS=176733116;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:82:80:0:0:82:80:45:37:0:0:45:35:0:0 chr5 176733615 . CT C,CC 603.22 PASS AO=19,43;DP=68;FAO=63,0;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=22,0;FSAR=41,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0269821,-0.0828126;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=132.581,122.277;QD=38.2994;RBI=0.166307,0.18922;REFB=0,0;REVB=-0.164104,-0.170136;RO=0;SAF=13,9;SAR=6,34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.851e-08,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.000569371,0;OID=.,.;OPOS=176733616,176733616;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:19,43:62:63,0:63:0:22,0:41,0:0:0:28:0:13,9:6,34:0:0 chr5 176737720 . A G 220.84 PASS AO=23;DP=23;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0793122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.968;QD=36.8065;RBI=0.119363;REFB=0;REVB=0.0892022;RO=0;SAF=16;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000997462;OID=.;OPOS=176737720;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:23:24:0:0:23:24:7:16:0:0:7:17:0:0 chr5 176831826 . C G 517.79 PASS AO=50;DP=51;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0226534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.667;QD=37.6577;RBI=0.0434197;REFB=0;REVB=0.0370418;RO=0;SAF=24;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.10374e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.16706e-05;OID=.;OPOS=176831826;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:51:55:0:0:50:55:26:24:0:0:31:24:0:0 chr5 176836532 . A G 767.16 PASS AO=81;DP=82;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0441326;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.793;QD=37.8844;RBI=0.0452603;REFB=0;REVB=0.0100405;RO=0;SAF=30;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40248e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.87308e-05;OID=.;OPOS=176836532;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:82:81:0:0:81:81:51:30:0:0:51:30:0:0 chr5 176863519 . G C 292.03 PASS AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.786;QD=38.9368;RBI=0.0245398;REFB=0;REVB=-0.0218905;RO=0;SAF=28;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.56306e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.26063e-05;OID=.;OPOS=176863519;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:30:30:0:0:30:30:2:28:0:0:2:28:0:0 chr5 176867943 . A G 340.98 PASS AO=40;DP=41;FAO=39;FDP=41;FR=.;FRO=2;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0260579;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.9487;QD=33.2662;RBI=0.053586;REFB=0.0523816;REVB=-0.0468236;RO=1;SAF=17;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199568;STB=0.504514;TYPE=snp;VARB=-0.0182847;OID=.;OPOS=176867943;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:41:41:1:2:40:39:23:17:0:1:23:16:1:1 chr5 176885178 . A G 106.6 PASS AO=10;DP=11;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.116185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.892;QD=35.5318;RBI=0.117873;REFB=0;REVB=0.0198747;RO=0;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00120473;OID=.;OPOS=176885178;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:12:0:0:10:12:6:4:0:0:8:4:0:0 chr5 176885499 . T C 543.62 PASS AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.945;QD=38.1488;RBI=0.0126186;REFB=0;REVB=0.00430325;RO=0;SAF=8;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.28319e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.55075e-05;OID=.;OPOS=176885499;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:57:57:0:0:57:57:49:8:0:0:49:8:0:0 chr5 176894756 . C T 75.09 PASS AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=12;FWDB=0.0170068;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=256.329;QD=10.3573;RBI=0.0171128;REFB=-0.0253899;REVB=-0.00190152;RO=14;SAF=6;SAR=9;SRF=2;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242932;STB=0.636204;TYPE=snp;VARB=0.0214303;OID=.;OPOS=176894756;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:29:29:14:14:15:15:9:6:2:12:9:6:2:12 chr5 176916516 . C T 40.37 PASS AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.00397756;FXX=0.0908265;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.8146;QD=16.1471;RBI=0.0148698;REFB=-0.0283379;REVB=-0.0143279;RO=3;SAF=1;SAR=5;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.354507;STB=0.681121;TYPE=snp;VARB=0.0151704;OID=.;OPOS=176916516;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:11:10:3:4:6:6:5:1:2:1:5:1:2:2 chr5 176917078 . T C 358.3 PASS AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0343308;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.564;QD=34.9565;RBI=0.0348572;REFB=0.148458;REVB=0.00603488;RO=1;SAF=15;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0183934;STB=0.509799;TYPE=snp;VARB=-0.00290635;OID=.;OPOS=176917078;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:41:41:1:1:40:40:25:15:0:1:25:15:0:1 chr5 176930135 . G A 639.75 PASS AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00803987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.617;QD=38.1939;RBI=0.0404593;REFB=0;REVB=0.0396524;RO=0;SAF=38;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.78396e-05;OID=.;OPOS=176930135;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:67:67:0:0:67:67:29:38:0:0:29:38:0:0 chr5 176936650 . T C 279.62 PASS AO=28;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0201011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.7129;QD=38.5685;RBI=0.0592091;REFB=0;REVB=0.0556926;RO=0;SAF=9;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.62669e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000500546;OID=.;OPOS=176936650;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:28:29:0:0:28:29:19:9:0:0:20:9:0:0 chr5 176940384 . G A 743.66 PASS AO=76;DP=77;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0263936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.3354;QD=36.7241;RBI=0.0433073;REFB=-0.0379919;REVB=-0.0343351;RO=1;SAF=36;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.011684;STB=0.506023;TYPE=snp;VARB=0.000188612;OID=.;OPOS=176940384;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:77:81:1:1:76:80:40:36:0:1:41:39:0:1 chr5 176951276 . A G 201.84 PASS AO=20;DP=20;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0338346;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.436;QD=36.6974;RBI=0.0339767;REFB=0;REVB=0.00310387;RO=0;SAF=7;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000124563;OID=.;OPOS=176951276;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:20:22:0:0:20:22:13:7:0:0:13:9:0:0 chr5 177023096 . A AT,T 798.81 PASS AO=16,17;DP=101;FAO=94,0;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=13,0;FSAR=81,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0604171,-0.120255;FXX=0.0408122;HRUN=1,2;LEN=1,1;MLLD=19.4521,32.8645;QD=33.9917;RBI=0.109085,0.124791;REFB=0,0;REVB=0.0908257,-0.0333417;RO=67;SAF=1,2;SAR=15,15;SRF=11;SRR=56;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.315888,-0.120815;STB=0.5,0.5;TYPE=ins,snp;VARB=0.00401829,0.00854755;OID=.,.;OPOS=177023097,177023096;OREF=-,A;OALT=T,T;OMAPALT=AT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:101:94:67:0:16,17:94,0:15,15:1,2:11:56:81,0:13,0:0:0 chr5 177023098 . A T 291.58 PASS AO=46;DP=81;FAO=59;FDP=99;FR=.;FRO=40;FSAF=8;FSAR=51;FSRF=5;FSRR=35;FWDB=0.0551159;FXX=0;HRUN=11;LEN=1;MLLD=25.4485;QD=11.7811;RBI=0.085132;REFB=-0.0654212;REVB=0.0648821;RO=35;SAF=7;SAR=39;SRF=3;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110799;STB=0.509249;TYPE=snp;VARB=0.0492068;OID=.;OPOS=177023098;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:99:35:40:46:59:39:7:3:32:51:8:5:35 chr5 177161891 . A G 161.89 PASS AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.259563;FXX=0.0555247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.4289;QD=38.0906;RBI=0.259862;REFB=0;REVB=0.0124582;RO=0;SAF=5;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0129865;OID=.;OPOS=177161891;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:17:0:0:17:17:12:5:0:0:12:5:0:0 chr5 177180236 . G A 917.47 PASS AO=97;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136933;FXX=0.0392118;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.261;QD=37.4479;RBI=0.0150201;REFB=-0.0940695;REVB=0.00617234;RO=1;SAF=93;SAR=4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00507351;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00027285;OID=.;OPOS=177180236;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:98:98:1:0:97:98:4:93:1:0:4:94:0:0 chr5 177305797 . G A 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0761152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.677;QD=35.0868;RBI=0.0845298;REFB=0;REVB=0.0367663;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0087127;OID=.;OPOS=177305797;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:3:4:0:0:3:4:0:0 chr5 177309472 . A G 63.28 PASS AO=10;DP=18;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.0159624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.607;QD=13.3225;RBI=0.0160314;REFB=-0.0177235;REVB=0.00148578;RO=8;SAF=3;SAR=7;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260141;STB=0.659488;TYPE=snp;VARB=0.0126808;OID=.;OPOS=177309472;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:18:19:8:8:10:11:7:3:5:3:8:3:5:3 chr5 177310717 . A G 71.98 PASS AO=8;DP=12;FAO=10;FDP=12;FR=.,HEALED;FRO=2;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0146191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=44.0516;QD=23.9919;RBI=0.0525161;REFB=-0.0991064;REVB=-0.0504403;RO=2;SAF=6;SAR=2;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12621;STB=0.555452;TYPE=snp;VARB=0.0334118;OID=.;OPOS=177310717;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:12:12:2:2:8:10:2:6:2:0:2:8:2:0 chr5 177422876 . T C 1012.62 PASS AO=105;DP=105;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0416733;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.677;QD=38.2122;RBI=0.054014;REFB=0;REVB=0.0343635;RO=0;SAF=59;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000226102;OID=.;OPOS=177422876;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:105:106:0:0:105:106:46:59:0:0:47:59:0:0 chr5 177422908 . A G 819.36 PASS AO=78;DP=80;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0640956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.356;QD=38.1097;RBI=0.0753616;REFB=0;REVB=-0.0396375;RO=0;SAF=32;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5329e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.45617e-05;OID=.;OPOS=177422908;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:80:86:0:0:78:86:46:32:0:0:48:38:0:0 chr5 177547247 . T C 580.87 PASS AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.203;QD=38.7245;RBI=0.00635304;REFB=0;REVB=-0.00635304;RO=0;SAF=0;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.20154e-06;OID=.;OPOS=177547247;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:60:60:0:0:60:60:60:0:0:0:60:0:0:0 chr5 177550723 . T C 212.88 PASS AO=33;DP=49;FAO=34;FDP=50;FR=.;FRO=16;FSAF=33;FSAR=1;FSRF=16;FSRR=0;FWDB=-0.0274121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.215;QD=17.03;RBI=0.0740498;REFB=-0.039411;REVB=0.0687892;RO=14;SAF=32;SAR=1;SRF=14;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167184;STB=0.597513;TYPE=snp;VARB=0.00621181;OID=.;OPOS=177550723;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:49:50:14:16:33:34:1:32:14:0:1:33:16:0 chr5 177551154 . C T 83.69 PASS AO=15;DP=25;FAO=15;FDP=25;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0406167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.8984;QD=13.3911;RBI=0.0417218;REFB=0.0385054;REVB=0.00953937;RO=10;SAF=6;SAR=9;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0753894;STB=0.542318;TYPE=snp;VARB=-0.0182687;OID=.;OPOS=177551154;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:25:25:10:10:15:15:9:6:3:7:9:6:3:7 chr5 177551169 . T C 79.37 PASS AO=11;DP=26;FAO=14;FDP=26;FR=.,HEALED;FRO=11;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.0254113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.228;QD=12.2102;RBI=0.0307879;REFB=-0.0557878;REVB=-0.0173827;RO=11;SAF=2;SAR=9;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216984;STB=0.503101;TYPE=snp;VARB=0.0249532;OID=.;OPOS=177551169;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:26:26:11:11:11:14:9:2:4:7:9:5:4:7 chr5 177551176 . T C 86.6 PASS AO=16;DP=28;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=-0.104521;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.511;QD=12.3711;RBI=0.104832;REFB=-0.0244045;REVB=-0.00806617;RO=11;SAF=6;SAR=10;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0810739;STB=0.519207;TYPE=snp;VARB=0.0139198;OID=.;OPOS=177551176;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:28:28:11:12:16:16:10:6:3:8:10:6:4:8 chr5 177612734 . T C 3512.56 PASS AO=428;DP=444;FAO=387;FDP=400;FR=.;FRO=13;FSAF=185;FSAR=202;FSRF=1;FSRR=12;FWDB=-0.0009195;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=188.564;QD=35.1256;RBI=0.00513475;REFB=-0.143243;REVB=0.00505175;RO=14;SAF=204;SAR=224;SRF=2;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0202247;STB=0.513076;TYPE=snp;VARB=0.000359526;OID=.;OPOS=177612734;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:444:400:14:13:428:387:224:204:2:12:202:185:1:12 chr5 177612744 . A G 3779.79 PASS AO=416;DP=419;FAO=400;FDP=400;FR=.;FRO=0;FSAF=177;FSAR=223;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0652924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.609;QD=37.7979;RBI=0.0678079;REFB=0;REVB=-0.0182978;RO=2;SAF=183;SAR=233;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00518741;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000462805;OID=.;OPOS=177612744;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:419:400:2:0:416:400:233:183:2:0:223:177:0:0 chr5 177612983 . G A 1891.31 PASS AO=201;DP=205;FAO=202;FDP=202;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=135;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224511;FXX=0.0194165;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.213;QD=37.4517;RBI=0.0293576;REFB=0.0721501;REVB=-0.018916;RO=2;SAF=66;SAR=135;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00700374;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.55266e-05;OID=.;OPOS=177612983;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:205:202:2:0:201:202:135:66:0:2:135:67:0:0 chr5 177613123 . T C 2004.32 PASS AO=216;DP=222;FAO=219;FDP=224;FR=.;FRO=5;FSAF=114;FSAR=105;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.035316;FXX=0.00444425;HRUN=3;LEN=1;MLLD=85.9637;QD=35.7914;RBI=0.0399589;REFB=0.00569117;REVB=0.0186947;RO=5;SAF=114;SAR=102;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0117727;STB=0.506251;TYPE=snp;VARB=-8.96083e-05;OID=.;OPOS=177613123;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:222:224:5:5:216:219:102:114:4:1:105:114:4:1 chr5 177613168 . C T 2537.85 PASS AO=260;DP=271;FAO=271;FDP=271;FR=.;FRO=0;FSAF=144;FSAR=127;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0225141;FXX=0.00367634;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.7799;QD=37.459;RBI=0.0652335;REFB=0;REVB=0.0612252;RO=0;SAF=144;SAR=116;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.08125e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00120379;OID=.;OPOS=177613168;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:271:271:0:0:260:271:116:144:0:0:127:144:0:0 chr5 177637232 . C T 205.62 PASS AO=51;DP=111;FAO=52;FDP=112;FR=.;FRO=60;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=32;FSRR=28;FWDB=0.0189915;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.821;QD=7.34347;RBI=0.0191045;REFB=-0.0265429;REVB=0.00207505;RO=60;SAF=24;SAR=27;SRF=32;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0608148;STB=0.528129;TYPE=snp;VARB=0.0259649;OID=.;OPOS=177637232;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:112:60:60:51:52:27:24:32:28:27:25:32:28 chr5 177669413 . T G 334.77 PASS AO=60;DP=117;FAO=70;FDP=124;FR=.;FRO=54;FSAF=26;FSAR=44;FSRF=24;FSRR=30;FWDB=0.0368095;FXX=0.0236202;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.2045;QD=10.799;RBI=0.0492148;REFB=-0.0403371;REVB=-0.0326673;RO=54;SAF=16;SAR=44;SRF=24;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17694;STB=0.533453;TYPE=snp;VARB=0.0363766;OID=.;OPOS=177669413;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:124:54:54:60:70:44:16:24:30:44:26:24:30 chr5 177674589 . C T 313.69 PASS AO=73;DP=144;FAO=74;FDP=151;FR=.;FRO=77;FSAF=27;FSAR=47;FSRF=30;FSRR=47;FWDB=-0.00713198;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.087;QD=8.30966;RBI=0.0174147;REFB=0.000817665;REVB=0.0158873;RO=71;SAF=27;SAR=46;SRF=29;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0366578;STB=0.51351;TYPE=snp;VARB=-0.000809787;OID=.;OPOS=177674589;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:151:71:77:73:74:46:27:29:42:47:27:30:47 chr5 177675217 . C T 293.57 PASS AO=65;DP=125;FAO=65;FDP=125;FR=.;FRO=60;FSAF=9;FSAR=56;FSRF=5;FSRR=55;FWDB=0.0100972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.0429;QD=9.39431;RBI=0.0369476;REFB=-0.00920832;REVB=0.0355412;RO=59;SAF=9;SAR=56;SRF=5;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106502;STB=0.560275;TYPE=snp;VARB=0.00519138;OID=.;OPOS=177675217;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:59:60:65:65:56:9:5:54:56:9:5:55 chr5 177683377 . T C 210.67 PASS AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2686;QD=36.6389;RBI=0.0333115;REFB=0;REVB=0.0161189;RO=0;SAF=9;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84921e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000942552;OID=.;OPOS=177683377;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:0:0:23:23:14:9:0:0:14:9:0:0 chr5 177688772 . G A 364.08 PASS AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0050795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.4302;QD=36.4082;RBI=0.00512245;REFB=-0.0571253;REVB=-0.000661908;RO=0;SAF=18;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.34792e-08;STB=0.511622;TYPE=snp;VARB=0.00113405;OID=.;OPOS=177688772;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:40:40:0:1:39:39:21:18:0:0:21:18:0:1 chr5 177715291 . G A 401.9 PASS AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0073595;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=249.207;QD=37.3859;RBI=0.00881496;REFB=0;REVB=-0.00485193;RO=0;SAF=31;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41862e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.99639e-05;OID=.;OPOS=177715291;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:43:43:0:0:43:43:12:31:0:0:12:31:0:0 chr5 177715302 . CAA CA,C 187.76 PASS AO=25,7;DP=43;FAO=40,0;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=28,0;FSAR=12,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184544,0.0110552;FXX=0.0697512;HRUN=7,7;LEN=1,2;MLLD=11.2485,12.0526;QD=18.7764;RBI=0.264983,0.144077;REFB=-0.0292496,-0.0371451;REVB=-0.264339,-0.143653;RO=4;SAF=20,2;SAR=5,5;SRF=4;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0842652,-0.429216;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.0061607,0;OID=.,.;OPOS=177715303,177715303;OREF=A,AA;OALT=-,-;OMAPALT=CA,C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:25,7:39:40,0:40:0:28,0:12,0:0:0:14:4:20,2:5,5:4:0 chr5 177715578 . GGCT G,GGC 200.28 PASS AO=3,7;DP=32;FAO=6,16;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=5,13;FSAR=1,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00144673,0.0187473;FXX=0.185117;HRUN=4,1;LEN=3,1;MLLD=110.546,121.683;QD=36.4141;RBI=0.127077,0.0217922;REFB=0,0;REVB=-0.127069,-0.0111103;RO=0;SAF=3,7;SAR=0,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0.576471,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.0162995,0.0180377;OID=.,.;OPOS=177715579,177715581;OREF=GCT,T;OALT=-,-;OMAPALT=G,GGC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:3,7:14:6,16:22:0:5,13:1,3:0:0:17:0:3,7:0,0:0:0 chr5 177989232 . G A 45.01 PASS AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=343.795;QD=25.7205;RBI=0.00637483;REFB=-0.0708272;REVB=0.00637483;RO=1;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00595366;OID=.;OPOS=177989232;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:7:7:1:1:6:6:6:0:0:1:6:0:0:1 chr5 178049444 . C G 419.17 PASS AO=126;DP=309;FAO=126;FDP=308;FR=.;FRO=182;FSAF=38;FSAR=88;FSRF=59;FSRR=123;FWDB=0.023119;FXX=0.00323614;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.204;QD=5.44377;RBI=0.02315;REFB=-0.00181765;REVB=-0.00119708;RO=180;SAF=38;SAR=88;SRF=57;SRR=123;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0186804;STB=0.515643;TYPE=snp;VARB=0.00301136;OID=.;OPOS=178049444;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:309:308:180:182:126:126:88:38:57:123:88:38:59:123 chr5 178138657 . A ATTCATTTGTAT 123.68 PASS AO=46;DP=192;FAO=53;FDP=172;FR=.;FRO=119;FSAF=17;FSAR=36;FSRF=51;FSRR=68;FWDB=-0.0179072;FXX=0.049721;HRUN=0;LEN=11;MLLD=242.116;QD=2.87616;RBI=0.0227231;REFB=-0.0145227;REVB=-0.0139882;RO=132;SAF=12;SAR=34;SRF=61;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.270997;STB=0.580614;TYPE=ins;VARB=0.033967;OID=.;OPOS=178138658;OREF=-;OALT=TTCATTTGTAT;OMAPALT=ATTCATTTGTAT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:46:192:53:172:119:17:36:51:68:99:132:12:34:61:71 chr5 178139442 . T G 541.83 PASS AO=124;DP=251;FAO=127;FDP=253;FR=.;FRO=126;FSAF=73;FSAR=54;FSRF=71;FSRR=55;FWDB=-0.0123063;FXX=0.00393685;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.335;QD=8.56646;RBI=0.0139699;REFB=-0.0173583;REVB=-0.00661149;RO=126;SAF=71;SAR=53;SRF=71;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00850866;STB=0.505751;TYPE=snp;VARB=0.0165772;OID=.;OPOS=178139442;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:251:253:126:126:124:127:53:71:71:55:54:73:71:55 chr5 178140090 . C T 225.29 PASS AO=56;DP=121;FAO=56;FDP=121;FR=.;FRO=65;FSAF=38;FSAR=18;FSRF=33;FSRR=32;FWDB=0.0139192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.2371;QD=7.44743;RBI=0.0219147;REFB=-0.0250805;REVB=-0.0169266;RO=65;SAF=38;SAR=18;SRF=33;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175285;STB=0.597824;TYPE=snp;VARB=0.0204484;OID=.;OPOS=178140090;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:65:65:56:56:18:38:33:32:18:38:33:32 chr5 178294059 . T C 3534.54 PASS AO=368;DP=375;FAO=368;FDP=368;FR=.;FRO=0;FSAF=183;FSAR=185;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0376179;FXX=0.0186662;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.0004;QD=38.4189;RBI=0.0473191;REFB=0;REVB=0.0287052;RO=0;SAF=183;SAR=185;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.88767e-05;OID=.;OPOS=178294059;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:375:368:0:0:368:368:185:183:0:0:185:183:0:0 chr5 178294060 . G A 686.93 PASS AO=176;DP=376;FAO=176;FDP=376;FR=.;FRO=200;FSAF=104;FSAR=72;FSRF=81;FSRR=119;FWDB=-0.022465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.017;QD=7.30773;RBI=0.0227296;REFB=0.00292249;REVB=0.00345768;RO=199;SAF=104;SAR=72;SRF=81;SRR=118;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176779;STB=0.598591;TYPE=snp;VARB=-0.00365367;OID=.;OPOS=178294060;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:376:376:199:200:176:176:72:104:81:118:72:104:81:119 chr5 178310446 . C T 759 PASS AO=78;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0412869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.459;QD=38.4305;RBI=0.0427923;REFB=0;REVB=0.0112503;RO=0;SAF=20;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000161431;OID=.;OPOS=178310446;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:79:79:0:0:78:79:58:20:0:0:59:20:0:0 chr5 178368465 . C CCAAA 154.22 PASS AO=31;DP=74;FAO=36;FDP=72;FR=.;FRO=36;FSAF=33;FSAR=3;FSRF=32;FSRR=4;FWDB=0.0248466;FXX=0.0136968;HRUN=3;LEN=4;MLLD=262.139;QD=8.56802;RBI=0.0256022;REFB=-0.0171127;REVB=0.00617386;RO=38;SAF=28;SAR=3;SRF=34;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0231704;STB=0.542228;TYPE=ins;VARB=0.0157427;OID=.;OPOS=178368466;OREF=-;OALT=CAAA;OMAPALT=CCAAA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:31:74:36:72:36:33:3:32:4:99:38:28:3:34:4 chr5 178391902 . A C 1283.66 PASS AO=131;DP=133;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161849;FXX=0.0147048;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.987;QD=38.3182;RBI=0.037159;REFB=0;REVB=0.033449;RO=0;SAF=56;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.00949e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.94687e-05;OID=.;OPOS=178391902;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:133:134:0:0:131:134:75:56:0:0:75:59:0:0 chr5 178395850 . G C 2974.62 PASS AO=312;DP=312;FAO=310;FDP=310;FR=.;FRO=0;FSAF=143;FSAR=167;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0268664;FXX=0.00958436;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.884;QD=38.3822;RBI=0.0268869;REFB=0;REVB=0.00105129;RO=0;SAF=146;SAR=166;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.73719e-05;OID=.;OPOS=178395850;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:312:310:0:0:312:310:166:146:0:0:167:143:0:0 chr5 178409928 . C A 235 PASS AO=59;DP=127;FAO=59;FDP=128;FR=.;FRO=69;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=30;FSRR=39;FWDB=0.00535483;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.529;QD=7.3438;RBI=0.00582554;REFB=-0.00682561;REVB=-0.00229406;RO=68;SAF=30;SAR=29;SRF=29;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0789498;STB=0.548729;TYPE=snp;VARB=0.00788451;OID=.;OPOS=178409928;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:128:68:69:59:59:29:30:29:39:28:31:30:39 chr5 178412273 . T C 593.34 PASS AO=64;DP=66;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.000899076;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.162;QD=36.5132;RBI=0.0207775;REFB=-0.118481;REVB=0.0207581;RO=0;SAF=48;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.36531e-08;STB=0.505153;TYPE=snp;VARB=0.000442776;OID=.;OPOS=178412273;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:66:65:0:1:64:64:16:48:0:0:16:48:1:0 chr5 178413816 . T C 209.8 PASS AO=16;DP=25;FAO=23;FDP=23;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=21;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0696303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.798;QD=36.4861;RBI=0.104192;REFB=0;REVB=0.0775086;RO=0;SAF=14;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00592707;OID=.;OPOS=178413816;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:0:0:16:23:2:14:0:0:2:21:0:0 chr5 178413947 . T C 200.69 PASS AO=19;DP=19;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0376607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.397;QD=36.4897;RBI=0.0398731;REFB=0;REVB=-0.0130971;RO=0;SAF=17;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.41729e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000219573;OID=.;OPOS=178413947;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:19:22:0:0:19:22:2:17:0:0:2:20:0:0 chr5 178415937 . A G 250.79 PASS AO=26;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.635;QD=37.1535;RBI=0.0343656;REFB=0;REVB=0.0314743;RO=0;SAF=13;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000611002;OID=.;OPOS=178415937;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:27:27:0:0:26:27:13:13:0:0:14:13:0:0 chr5 178415982 . A G 296.8 PASS AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0488003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.563;QD=37.0999;RBI=0.0493722;REFB=0;REVB=0.00749308;RO=0;SAF=11;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00015239;OID=.;OPOS=178415982;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:32:32:0:0:32:32:21:11:0:0:21:11:0:0 chr5 178416063 . G A 327.65 PASS AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0682075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.098;QD=37.4457;RBI=0.0687816;REFB=0;REVB=0.00886864;RO=0;SAF=8;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000254133;OID=.;OPOS=178416063;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:35:35:0:0:35:35:27:8:0:0:27:8:0:0 chr5 178416288 . G A 834.84 PASS AO=88;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0751888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.816;QD=37.5207;RBI=0.0916014;REFB=-0.0318833;REVB=0.0523207;RO=1;SAF=73;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0305384;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000712138;OID=.;OPOS=178416288;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:89:89:1:0:88:89:15:73:0:1:16:73:0:0 chr5 178419279 . G GGGCAAGGTCT 56.77 PASS AO=5;DP=10;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220283;FXX=0.249688;HRUN=2;LEN=10;MLLD=293.557;QD=37.8474;RBI=0.0268533;REFB=0;REVB=0.0153576;RO=4;SAF=1;SAR=4;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.268008;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.000318289;OID=.;OPOS=178419280;OREF=-;OALT=GGCAAGGTCT;OMAPALT=GGGCAAGGTCT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:5:10:6:6:0:2:4:0:0:3:4:1:4:2:2 chr5 178419288 . C T 70.42 PASS AO=7;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.245884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.2863;QD=35.2097;RBI=0.27178;REFB=0;REVB=0.115782;RO=0;SAF=1;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.032228;OID=.;OPOS=178419288;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:7:8:6:1:0:0:6:2:0:0 chr5 178555045 . G A 567.98 PASS AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0362778;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.73;QD=37.8653;RBI=0.047645;REFB=0;REVB=0.0308863;RO=0;SAF=27;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.7886e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000278939;OID=.;OPOS=178555045;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:61:60:0:0:60:60:33:27:0:0:33:27:0:0 chr5 178562967 . G A 773.69 PASS AO=84;DP=86;FAO=85;FDP=86;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0246662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.4808;QD=35.9857;RBI=0.067587;REFB=-0.1178;REVB=0.0629252;RO=2;SAF=42;SAR=42;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505881;TYPE=snp;VARB=0.00153407;OID=.;OPOS=178562967;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:86:86:2:1:84:85:42:42:1:1:43:42:1:0 chr5 178634547 . G A 65.36 PASS AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=0.00857255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.015;QD=14.5244;RBI=0.0384372;REFB=-0.0523125;REVB=0.0374691;RO=7;SAF=9;SAR=2;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0462643;STB=0.526269;TYPE=snp;VARB=0.00900496;OID=.;OPOS=178634547;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:18:18:7:7:11:11:2:9:6:1:2:9:6:1 chr5 178770981 . A G 72.37 PASS AO=19;DP=46;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.0288543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.26;QD=6.29335;RBI=0.0288879;REFB=-0.00837171;REVB=0.00139289;RO=27;SAF=8;SAR=11;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0535817;STB=0.530774;TYPE=snp;VARB=0.0109929;OID=.;OPOS=178770981;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:46:46:27:27:19:19:11:8:10:17:11:8:10:17 chr5 178949560 . A G 732.59 PASS AO=89;DP=91;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.137521;FXX=0.0315756;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.944;QD=31.8515;RBI=0.170299;REFB=0;REVB=0.100448;RO=1;SAF=25;SAR=64;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00734866;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0375052;OID=.;OPOS=178949560;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:91:92:1:0:89:92:64:25:0:1:67:25:0:0 chr5 178949561 . G T 859.65 PASS AO=92;DP=95;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.015013;FXX=0.0315756;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.47;QD=37.3759;RBI=0.0167545;REFB=-0.0835802;REVB=0.00743796;RO=1;SAF=25;SAR=67;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00702405;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.80516e-05;OID=.;OPOS=178949561;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:95:92:1:0:92:92:67:25:0:1:67:25:0:0 chr5 178949781 . A G 211.31 PASS AO=40;DP=68;FAO=40;FDP=68;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=30;FSRF=21;FSRR=7;FWDB=0.0133574;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.093;QD=12.4297;RBI=0.0147925;REFB=-0.0240533;REVB=-0.00635588;RO=28;SAF=10;SAR=30;SRF=21;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.391218;STB=0.715273;TYPE=snp;VARB=0.0090167;OID=.;OPOS=178949781;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:28:28:40:40:30:10:21:7:30:10:21:7 chr5 178951598 . G A 377.82 PASS AO=43;DP=45;FAO=43;FDP=45;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=30;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0242007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.6961;QD=33.5841;RBI=0.0243649;REFB=0.00419294;REVB=0.00282392;RO=2;SAF=13;SAR=30;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0669048;STB=0.535697;TYPE=snp;VARB=-0.000329873;OID=.;OPOS=178951598;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:45:45:2:2:43:43:30:13:2:0:30:13:2:0 chr5 179036433 . G A 347.16 PASS AO=71;DP=129;FAO=72;FDP=130;FR=.;FRO=58;FSAF=20;FSAR=52;FSRF=21;FSRR=37;FWDB=0.018834;FXX=0.00763301;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.706;QD=10.6817;RBI=0.0363857;REFB=-0.0158826;REVB=0.031132;RO=57;SAF=20;SAR=51;SRF=21;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0835577;STB=0.544977;TYPE=snp;VARB=0.0120946;OID=.;OPOS=179036433;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:130:57:58:71:72:51:20:21:36:52:20:21:37 chr5 179071836 . C T 137.42 PASS AO=53;DP=162;FAO=53;FDP=161;FR=.;FRO=108;FSAF=36;FSAR=17;FSRF=63;FSRR=45;FWDB=0.0204505;FXX=0.0122692;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.848;QD=3.41421;RBI=0.024322;REFB=0.00506846;REVB=-0.0131658;RO=107;SAF=36;SAR=17;SRF=62;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125431;STB=0.570088;TYPE=snp;VARB=-0.0104845;OID=.;OPOS=179071836;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:161:107:108:53:53:17:36:62:45:17:36:63:45 chr5 179071866 . A G 478.39 PASS AO=96;DP=164;FAO=96;FDP=168;FR=.;FRO=72;FSAF=59;FSAR=37;FSRF=42;FSRR=30;FWDB=-0.0176373;FXX=0.00591681;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.589;QD=11.3901;RBI=0.082921;REFB=-0.0165115;REVB=-0.0810235;RO=68;SAF=59;SAR=37;SRF=42;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0024704;STB=0.514041;TYPE=snp;VARB=0.0126116;OID=.;OPOS=179071866;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:168:68:72:96:96:37:59:42:26:37:59:42:30 chr5 179071947 . A G 194.93 PASS AO=59;DP=150;FAO=60;FDP=153;FR=.;FRO=93;FSAF=21;FSAR=39;FSRF=28;FSRR=65;FWDB=0.0147338;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.7412;QD=5.09615;RBI=0.0362817;REFB=0.0102131;REVB=-0.0331554;RO=91;SAF=21;SAR=38;SRF=28;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.057725;STB=0.533323;TYPE=snp;VARB=-0.0168553;OID=.;OPOS=179071947;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:153:91:93:59:60:38:21:28:63:39:21:28:65 chr5 179078940 . T C 712.65 PASS AO=71;DP=71;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0376112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.524;QD=38.0082;RBI=0.0431541;REFB=0;REVB=-0.0211583;RO=0;SAF=30;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21646e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.98e-05;OID=.;OPOS=179078940;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:71:75:0:0:71:75:41:30:0:0:41:34:0:0 chr5 179193598 . C T 146.72 PASS AO=33;DP=64;FAO=32;FDP=63;FR=.;FRO=31;FSAF=25;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.0365455;FXX=0.0156226;HRUN=3;LEN=1;MLLD=61.2054;QD=9.31532;RBI=0.0372567;REFB=-0.0124386;REVB=0.00724468;RO=30;SAF=26;SAR=7;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237756;STB=0.624135;TYPE=snp;VARB=0.00718444;OID=.;OPOS=179193598;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:63:30:31:33:32:7:26:17:13:7:25:18:13 chr5 179201847 . G A 84.67 PASS AO=22;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=2;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=26;FWDB=-0.0515034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.7269;QD=7.05579;RBI=0.0521121;REFB=-0.0351093;REVB=-0.00794175;RO=26;SAF=2;SAR=20;SRF=1;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179907;STB=0.612158;TYPE=snp;VARB=0.0396912;OID=.;OPOS=179201847;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:48:48:26:27:22:21:20:2:1:25:19:2:1:26 chr5 179203933 . A G 1747.1 PASS AO=183;DP=186;FAO=184;FDP=184;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224909;FXX=0.0160419;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.028;QD=37.9805;RBI=0.0389065;REFB=-0.00531724;REVB=-0.031747;RO=1;SAF=90;SAR=93;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0052609;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.66775e-05;OID=.;OPOS=179203933;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:186:184:1:0:183:184:93:90:1:0:94:90:0:0 chr5 179218842 . G A 307.02 PASS AO=68;DP=137;FAO=70;FDP=139;FR=.;FRO=69;FSAF=41;FSAR=29;FSRF=33;FSRR=36;FWDB=0.00549057;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.09;QD=8.83506;RBI=0.0114763;REFB=-0.0233541;REVB=-0.0100777;RO=69;SAF=41;SAR=27;SRF=33;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115605;STB=0.553923;TYPE=snp;VARB=0.0243816;OID=.;OPOS=179218842;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:139:69:69:68:70:27:41:33:36:29:41:33:36 chr5 179267949 . T C 110.79 PASS AO=27;DP=60;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=-0.0405388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.18;QD=7.38632;RBI=0.0697034;REFB=-0.022807;REVB=-0.0567025;RO=32;SAF=8;SAR=19;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0867227;STB=0.561134;TYPE=snp;VARB=0.0243356;OID=.;OPOS=179267949;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:32:33:27:27:19:8:12:20:19:8:13:20 chr5 179294609 . GC G 23.61 PASS AO=13;DP=44;FAO=15;FDP=41;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.0921113;FXX=0.0238039;HRUN=5;LEN=1;MLLD=13.711;QD=2.30301;RBI=0.152157;REFB=-0.0504032;REVB=-0.121109;RO=24;SAF=8;SAR=5;SRF=11;SRR=13;SSEN=0.340909;SSEP=0;SSSB=0.172139;STB=0.633152;TYPE=del;VARB=0.0976226;OID=.;OPOS=179294610;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:13:41:15:41:26:10:5:12:14:23:24:8:5:11:13 chr5 179529124 . G A 810.75 PASS AO=85;DP=86;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0040247;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.881;QD=38.153;RBI=0.0215523;REFB=0;REVB=0.0211731;RO=0;SAF=26;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.71506e-05;OID=.;OPOS=179529124;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:86:85:0:0:85:85:59:26:0:0:59:26:0:0 chr5 179542285 . CT C 1407.39 PASS AO=45;DP=236;FAO=224;FDP=224;FR=.;FRO=0;FSAF=142;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.148896;FXX=0.0132153;HRUN=5;LEN=1;MLLD=13.6349;QD=25.1319;RBI=0.293758;REFB=0.00104626;REVB=-0.253227;RO=187;SAF=20;SAR=25;SRF=129;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.313035;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00251789;OID=.;OPOS=179542286;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:45:236:224:224:0:142:82:0:0:99:187:20:25:129:58 chr5 179542290 . T A 1153.52 PASS AO=136;DP=194;FAO=207;FDP=233;FR=.;FRO=26;FSAF=124;FSAR=83;FSRF=23;FSRR=3;FWDB=0.0189063;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=18.5112;QD=19.8029;RBI=0.0977376;REFB=-0.0717721;REVB=0.0958915;RO=50;SAF=101;SAR=35;SRF=21;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190575;STB=0.533607;TYPE=snp;VARB=0.00553233;OID=.;OPOS=179542290;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:194:233:50:26:136:207:35:101:21:29:83:124:23:3 chr5 179729519 . A G 972.98 PASS AO=106;DP=109;FAO=106;FDP=109;FR=.;FRO=3;FSAF=29;FSAR=77;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0231148;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.7254;QD=35.7058;RBI=0.0468694;REFB=-0.00289659;REVB=0.0407731;RO=3;SAF=29;SAR=77;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00391613;STB=0.502064;TYPE=snp;VARB=0.00068967;OID=.;OPOS=179729519;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:109:109:3:3:106:106:77:29:1:2:77:29:1:2 chr5 179734200 . A G 193.16 PASS AO=39;DP=71;FAO=39;FDP=71;FR=.;FRO=32;FSAF=37;FSAR=2;FSRF=21;FSRR=11;FWDB=-0.0110416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.057;QD=10.8821;RBI=0.0464799;REFB=-0.00416946;REVB=-0.0451494;RO=32;SAF=37;SAR=2;SRF=21;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.534672;STB=0.805477;TYPE=snp;VARB=0.000950348;OID=.;OPOS=179734200;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:32:32:39:39:2:37:21:11:2:37:21:11 chr5 179740827 . T C 43.7 PASS AO=18;DP=64;FAO=19;FDP=66;FR=.;FRO=47;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=32;FWDB=-0.0373006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.6785;QD=2.64849;RBI=0.038853;REFB=-0.0276712;REVB=-0.0108726;RO=45;SAF=7;SAR=11;SRF=14;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100371;STB=0.538422;TYPE=snp;VARB=0.109735;OID=.;OPOS=179740827;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:64:66:45:47:18:19:11:7:14:31:12:7:15:32 chr5 179996111 . C T 362.36 PASS AO=89;DP=186;FAO=89;FDP=186;FR=.;FRO=97;FSAF=50;FSAR=39;FSRF=45;FSRR=52;FWDB=-0.00583057;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.215;QD=7.79268;RBI=0.00592772;REFB=-0.00833156;REVB=-0.00106881;RO=97;SAF=50;SAR=39;SRF=45;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0926841;STB=0.55117;TYPE=snp;VARB=0.0126965;OID=.;OPOS=179996111;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:186:97:97:89:89:39:50:45:52:39:50:45:52 chr5 180030313 . C A 88.72 PASS AO=15;DP=60;FAO=24;FDP=60;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=26;FWDB=0.0355389;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=53.4644;QD=5.915;RBI=0.0387427;REFB=-0.0249038;REVB=-0.0154268;RO=27;SAF=6;SAR=9;SRF=5;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.264547;STB=0.655193;TYPE=snp;VARB=0.0258357;OID=.;OPOS=180030313;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:50:60:27:36:15:24:9:6:5:22:11:13:10:26 chr5 180046344 . G C 292.03 PASS AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0192337;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.8197;QD=38.9372;RBI=0.0192488;REFB=0;REVB=-0.000762083;RO=0;SAF=17;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.63861e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000322307;OID=.;OPOS=180046344;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:30:30:0:0:30:30:13:17:0:0:13:17:0:0 chr5 180046426 . C CTGGCCGCTTAGCTAAGGCACAG 68.49 PASS AO=6;DP=13;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0103183;FXX=0.181653;HRUN=0;LEN=22;MLLD=849.071;QD=30.4403;RBI=0.0156106;REFB=0.00995985;REVB=-0.0117143;RO=4;SAF=2;SAR=4;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119263;STB=0.545344;TYPE=ins;VARB=-0.0010998;OID=.;OPOS=180046427;OREF=-;OALT=TGGCCGCTTAGCTAAGGCACAG;OMAPALT=CTGGCCGCTTAGCTAAGGCACAG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:6:13:8:9:1:3:5:0:1:5:4:2:4:2:2 chr5 180046492 . CAGAG CAG,CA 273.53 PASS AO=20,6;DP=27;FAO=26,3;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=19,2;FSAR=7,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00973825,0.0123138;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,3;MLLD=246.096,234.047;QD=37.728;RBI=0.0594683,0.0172191;REFB=0,0;REVB=0.0586655,0.0120362;RO=0;SAF=15,4;SAR=5,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.00792256,-0.0332776;OID=.,.;OPOS=180046493,180046494;OREF=AG,GAG;OALT=-,-;OMAPALT=CAG,CA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:20,6:26:26,3:29:0:19,2:7,1:0:0:3:0:15,4:5,2:0:0 chr5 180051003 . T C 169.06 PASS AO=29;DP=50;FAO=31;FDP=50;FR=.;FRO=19;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.00906354;FXX=0.0565931;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.148;QD=13.5251;RBI=0.0208787;REFB=-0.0227504;REVB=0.0188088;RO=17;SAF=16;SAR=13;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0151333;STB=0.511742;TYPE=snp;VARB=0.0178532;OID=.;OPOS=180051003;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:50:50:17:19:29:31:13:16:9:8:14:17:11:8 chr5 180052915 . GC G 138.71 PASS AO=16;DP=21;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.208954;FXX=0.049975;HRUN=2;LEN=1;MLLD=18.5192;QD=29.2018;RBI=0.353528;REFB=0;REVB=0.285167;RO=1;SAF=9;SAR=7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0481057;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0388102;OID=.;OPOS=180052916;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:16:19:19:19:0:12:7:0:0:13:1:9:7:1:0 chr5 180120149 . T C 681.14 PASS AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0114062;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.658;QD=37.8411;RBI=0.02422;REFB=0;REVB=-0.021366;RO=0;SAF=35;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000470783;OID=.;OPOS=180120149;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:73:72:0:0:72:72:37:35:0:0:37:35:0:0 chr5 180166461 . C G 462.6 PASS AO=48;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0122714;FXX=0.0576812;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.6716;QD=37.7632;RBI=0.0325579;REFB=0;REVB=-0.0301568;RO=0;SAF=21;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.62374e-06;OID=.;OPOS=180166461;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:50:49:0:0:48:49:27:21:0:0:28:21:0:0 chr5 180218668 . A G 1036.57 PASS AO=102;DP=102;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0558293;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.889;QD=38.0391;RBI=0.0618214;REFB=0;REVB=0.0265514;RO=0;SAF=60;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000308439;OID=.;OPOS=180218668;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:102:109:0:0:102:109:42:60:0:0:42:67:0:0 chr5 180218820 . C A 287.92 PASS AO=61;DP=112;FAO=63;FDP=121;FR=.;FRO=58;FSAF=34;FSAR=29;FSRF=17;FSRR=41;FWDB=0.0114338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.678;QD=9.51807;RBI=0.0145199;REFB=-0.00206083;REVB=0.00894966;RO=51;SAF=34;SAR=27;SRF=17;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18444;STB=0.616704;TYPE=snp;VARB=0.00142279;OID=.;OPOS=180218820;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:121:51:58:61:63:27:34:17:34:29:34:17:41 chr5 180218831 . G A 279.92 PASS AO=66;DP=131;FAO=67;FDP=138;FR=.;FRO=71;FSAF=36;FSAR=31;FSRF=28;FSRR=43;FWDB=0.0247108;FXX=0.0142847;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.828;QD=8.11359;RBI=0.0252333;REFB=-0.000724243;REVB=-0.00510802;RO=64;SAF=36;SAR=30;SRF=28;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0963455;STB=0.573128;TYPE=snp;VARB=0.00105602;OID=.;OPOS=180218831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:138:64:71:66:67:30:36:28:36:31:36:28:43 chr5 180219304 . C T 191.68 PASS AO=40;DP=74;FAO=40;FDP=74;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.00847933;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.426;QD=10.3612;RBI=0.0372929;REFB=-0.0226653;REVB=0.0363162;RO=33;SAF=18;SAR=22;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0536062;STB=0.523086;TYPE=snp;VARB=0.0190029;OID=.;OPOS=180219304;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:33:34:40:40:22:18:17:16:22:18:17:17 chr5 180276402 . C T 327.74 PASS AO=92;DP=215;FAO=92;FDP=215;FR=.;FRO=123;FSAF=62;FSAR=30;FSRF=87;FSRR=36;FWDB=0.038189;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7602;QD=6.09751;RBI=0.0390496;REFB=0.00955011;REVB=-0.00815283;RO=122;SAF=62;SAR=30;SRF=86;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0366516;STB=0.52207;TYPE=snp;VARB=-0.0119477;OID=.;OPOS=180276402;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:215:122:123:92:92:30:62:86:36:30:62:87:36 chr5 180278393 . C G 129.1 PASS AO=35;DP=90;FAO=37;FDP=92;FR=.;FRO=55;FSAF=8;FSAR=29;FSRF=22;FSRR=33;FWDB=0.044481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.782;QD=5.6131;RBI=0.0459705;REFB=0.0030805;REVB=-0.0116073;RO=55;SAF=7;SAR=28;SRF=22;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.268918;STB=0.636815;TYPE=snp;VARB=-0.00282973;OID=.;OPOS=180278393;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:92:55:55:35:37:28:7:22:33:29:8:22:33 chr5 180329359 . T C 149.68 PASS AO=46;DP=119;FAO=46;FDP=119;FR=.;FRO=73;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=21;FSRR=52;FWDB=0.0411344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.7676;QD=5.03132;RBI=0.127016;REFB=-0.000244858;REVB=0.12017;RO=72;SAF=22;SAR=24;SRF=21;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204658;STB=0.618295;TYPE=snp;VARB=0.00257369;OID=.;OPOS=180329359;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:72:73:46:46:24:22:21:51:24:22:21:52 chr5 180336849 . C T 501.26 PASS AO=111;DP=211;FAO=111;FDP=212;FR=.;FRO=101;FSAF=50;FSAR=61;FSRF=51;FSRR=50;FWDB=-0.00813717;FXX=0.00934536;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.959;QD=9.45778;RBI=0.0294828;REFB=-0.00666016;REVB=-0.0283377;RO=97;SAF=50;SAR=61;SRF=51;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0644746;STB=0.526082;TYPE=snp;VARB=0.00613116;OID=.;OPOS=180336849;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:212:97:101:111:111:61:50:51:46:61:50:51:50 chr5 180338368 . A G 427.85 PASS AO=102;DP=209;FAO=102;FDP=209;FR=.;FRO=107;FSAF=53;FSAR=49;FSRF=47;FSRR=60;FWDB=0.0334777;FXX=0.00476168;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.322;QD=8.18849;RBI=0.0364617;REFB=-0.011658;REVB=-0.0144464;RO=105;SAF=53;SAR=49;SRF=47;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0663031;STB=0.541062;TYPE=snp;VARB=0.0139437;OID=.;OPOS=180338368;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:209:105:107:102:102:49:53:47:58:49:53:47:60 chr5 180374534 . G A 540.09 PASS AO=158;DP=376;FAO=158;FDP=376;FR=.;FRO=218;FSAF=68;FSAR=90;FSRF=99;FSRR=119;FWDB=-0.0374269;FXX=0.00265245;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8809;QD=5.74564;RBI=0.0501936;REFB=-0.0231424;REVB=-0.0334459;RO=217;SAF=68;SAR=90;SRF=98;SRR=119;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0224289;STB=0.513985;TYPE=snp;VARB=0.02869;OID=.;OPOS=180374534;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:376:376:217:218:158:158:90:68:98:119:90:68:99:119 chr5 180432416 . C T 119.45 PASS AO=25;DP=47;FAO=25;FDP=48;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=0.0251647;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=214.214;QD=9.95439;RBI=0.0255543;REFB=-0.0274629;REVB=-0.00444528;RO=22;SAF=15;SAR=10;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0727411;STB=0.548635;TYPE=snp;VARB=0.0212219;OID=.;OPOS=180432416;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:48:22:23:25:25:10:15:15:7:10:15:16:7 chr5 180472498 . C T 44.7 PASS AO=16;DP=52;FAO=16;FDP=52;FR=.;FRO=36;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.0116716;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.645;QD=3.4383;RBI=0.0294449;REFB=0.0012554;REVB=0.0270329;RO=35;SAF=2;SAR=14;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.499629;STB=0.800767;TYPE=snp;VARB=-0.0150469;OID=.;OPOS=180472498;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:52:52:35:36:16:16:14:2:17:18:14:2:17:19 chr5 180472513 . A G 63.74 PASS AO=22;DP=66;FAO=22;FDP=66;FR=.;FRO=44;FSAF=4;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=-0.0325328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.45;QD=3.86285;RBI=0.0405999;REFB=0.0129728;REVB=-0.0242894;RO=41;SAF=4;SAR=18;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.418193;STB=0.756754;TYPE=snp;VARB=-0.0237324;OID=.;OPOS=180472513;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:66:66:41:44:22:22:18:4:21:20:18:4:23:21 chr5 180482899 . C T 75.52 PASS AO=19;DP=47;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=3;FSRF=27;FSRR=2;FWDB=-0.0387365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.1941;QD=6.16459;RBI=0.0411705;REFB=-0.0177444;REVB=-0.0139463;RO=27;SAF=17;SAR=2;SRF=25;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0924424;STB=0.608205;TYPE=snp;VARB=0.0533247;OID=.;OPOS=180482899;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:47:49:27:29:19:20:2:17:25:2:3:17:27:2 chr5 180486247 . G T 53.86 PASS AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0265163;FXX=0.142653;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.9102;QD=35.9051;RBI=0.0635995;REFB=0;REVB=0.0578081;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00324846;OID=.;OPOS=180486247;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:7:6:0:0:6:6:3:3:0:0:3:3:0:0 chr5 180486785 . G C 24.11 PASS AO=9;DP=34;FAO=9;FDP=34;FR=.;FRO=25;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=24;FWDB=0.0489547;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=241.963;QD=2.83699;RBI=0.0494804;REFB=-0.00468227;REVB=0.00719338;RO=25;SAF=1;SAR=8;SRF=1;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.281827;STB=0.666402;TYPE=snp;VARB=0.0117176;OID=.;OPOS=180486785;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:34:34:25:25:9:9:8:1:1:24:8:1:1:24 chr5 180551660 . G T 173.66 PASS AO=46;DP=106;FAO=46;FDP=105;FR=.;FRO=59;FSAF=31;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=30;FWDB=0.0330026;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9781;QD=6.61563;RBI=0.0498315;REFB=-0.0112961;REVB=0.0373365;RO=59;SAF=31;SAR=15;SRF=30;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175081;STB=0.607795;TYPE=snp;VARB=0.0138628;OID=.;OPOS=180551660;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:105:59:59:46:46:15:31:30:29:15:31:29:30 chr5 180582256 . TTGTC T 125.75 PASS AO=70;DP=217;FAO=74;FDP=204;FR=.;FRO=130;FSAF=45;FSAR=29;FSRF=72;FSRR=58;FWDB=-1.58132e-06;FXX=0.0285701;HRUN=3;LEN=4;MLLD=250.668;QD=2.4657;RBI=0.00287757;REFB=-0.00753087;REVB=-0.00287757;RO=114;SAF=42;SAR=28;SRF=60;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0824134;STB=0.535705;TYPE=del;VARB=0.0125321;OID=.;OPOS=180582257;OREF=TGTC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:70:196:74:204:130:45:29:72:58:99:114:42:28:60:54 chr5 180582604 . A G 1009.71 PASS AO=109;DP=114;FAO=112;FDP=116;FR=.;FRO=4;FSAF=29;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.000164982;FXX=0.00854628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.9184;QD=34.8177;RBI=0.0121393;REFB=0.00572474;REVB=-0.0121382;RO=4;SAF=28;SAR=81;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0228635;STB=0.511763;TYPE=snp;VARB=-0.00023056;OID=.;OPOS=180582604;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:114:116:4:4:109:112:81:28:0:4:83:29:0:4 chr5 180591147 . C T 94.16 PASS AO=16;DP=25;FAO=16;FDP=25;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=15;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.0035662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.701;QD=15.0651;RBI=0.0182706;REFB=-0.00312205;REVB=-0.0179191;RO=9;SAF=1;SAR=15;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.415714;STB=0.74034;TYPE=snp;VARB=0.00146482;OID=.;OPOS=180591147;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:25:25:9:9:16:16:15:1:3:6:15:1:3:6 chr5 180591153 . A G 79.99 PASS AO=14;DP=23;FAO=14;FDP=23;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0148442;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.7944;QD=13.9115;RBI=0.0502625;REFB=0.0215799;REVB=-0.0480205;RO=9;SAF=1;SAR=13;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.397727;STB=0.73196;TYPE=snp;VARB=-0.0164148;OID=.;OPOS=180591153;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:23:23:9:9:14:14:13:1:3:6:13:1:3:6 chr5 180596597 . A G 1175.33 PASS AO=301;DP=508;FAO=233;FDP=398;FR=.;FRO=165;FSAF=88;FSAR=145;FSRF=85;FSRR=80;FWDB=-0.0446455;FXX=0.00499988;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.7877;QD=11.8124;RBI=0.0451441;REFB=-0.0102185;REVB=-0.00669128;RO=207;SAF=111;SAR=190;SRF=103;SRR=104;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101316;STB=0.558868;TYPE=snp;VARB=0.00635993;OID=.;OPOS=180596597;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:508:398:207:165:301:233:190:111:103:104:145:88:85:80 chr5 180600638 . T C 1144.05 PASS AO=120;DP=121;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0223906;FXX=0.00826378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.335;QD=38.135;RBI=0.0712418;REFB=0;REVB=0.0676317;RO=0;SAF=60;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.97181e-05;OID=.;OPOS=180600638;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:121:120:0:0:120:120:60:60:0:0:60:60:0:0 chr5 180615403 . A C 128.03 PASS AO=34;DP=76;FAO=33;FDP=75;FR=.;FRO=42;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=0.0152926;FXX=0.0131562;HRUN=14;LEN=1;MLLD=209.847;QD=6.82816;RBI=0.0153598;REFB=0.0053455;REVB=-0.00143517;RO=41;SAF=16;SAR=18;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0548591;STB=0.531586;TYPE=snp;VARB=-0.0120712;OID=.;OPOS=180615403;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:75:41:42:34:33:18:16:17:24:17:16:18:24 chr5 180615933 . T C 300.45 PASS AO=84;DP=193;FAO=83;FDP=192;FR=.;FRO=109;FSAF=25;FSAR=58;FSRF=34;FSRR=75;FWDB=-0.0187292;FXX=0.00518108;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.233;QD=6.25932;RBI=0.0243239;REFB=-0.00547735;REVB=-0.01552;RO=108;SAF=25;SAR=59;SRF=34;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0205635;STB=0.507187;TYPE=snp;VARB=0.00662384;OID=.;OPOS=180615933;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:192:108:109:84:83:59:25:34:74:58:25:34:75 chr5 180615938 . G A 318.7 PASS AO=84;DP=190;FAO=84;FDP=188;FR=.;FRO=104;FSAF=25;FSAR=59;FSRF=32;FSRR=72;FWDB=-0.000337037;FXX=0.0105258;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.402;QD=6.7808;RBI=0.000596566;REFB=-0.0147492;REVB=0.000492238;RO=101;SAF=25;SAR=59;SRF=32;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0223569;STB=0.506627;TYPE=snp;VARB=0.016362;OID=.;OPOS=180615938;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:188:101:104:84:84:59:25:32:69:59:25:32:72 chr5 180618713 . A AC 952.33 PASS AO=106;DP=155;FAO=145;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.364437;FXX=0.0202689;HRUN=3;LEN=1;MLLD=17.1324;QD=26.2713;RBI=0.364489;REFB=0;REVB=-0.00615443;RO=46;SAF=23;SAR=83;SRF=44;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.445464;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00423661;OID=.;OPOS=180618714;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:106:155:145:145:0:60:85:0:0:87:46:23:83:44:2 chr5 180621410 . C T 268.99 PASS AO=66;DP=140;FAO=66;FDP=140;FR=.;FRO=74;FSAF=40;FSAR=26;FSRF=39;FSRR=35;FWDB=0.0290996;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.624;QD=7.68554;RBI=0.0308899;REFB=0.0135827;REVB=0.0103634;RO=74;SAF=40;SAR=26;SRF=39;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0773818;STB=0.542933;TYPE=snp;VARB=-0.0110676;OID=.;OPOS=180621410;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:74:74:66:66:26:40:39:35:26:40:39:35 chr5 180621472 . CAG C 282.51 PASS AO=74;DP=189;FAO=78;FDP=179;FR=.;FRO=101;FSAF=34;FSAR=44;FSRF=43;FSRR=58;FWDB=-0.0111413;FXX=0.0218567;HRUN=1;LEN=2;MLLD=128.032;QD=6.31314;RBI=0.0364423;REFB=-0.00549058;REVB=-0.0346974;RO=94;SAF=30;SAR=44;SRF=41;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0318115;STB=0.505833;TYPE=del;VARB=0.00396106;OID=.;OPOS=180621473;OREF=AG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:74:188:78:179:101:34:44:43:58:99:94:30:44:41:53 chr5 180626927 . A G 134.1 PASS AO=48;DP=140;FAO=48;FDP=139;FR=.;FRO=91;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=47;FSRR=44;FWDB=-0.00406258;FXX=0.00714235;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.437;QD=3.85893;RBI=0.00408167;REFB=-0.013587;REVB=-0.000394334;RO=85;SAF=18;SAR=30;SRF=43;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149199;STB=0.59411;TYPE=snp;VARB=0.0298987;OID=.;OPOS=180626927;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:139:85:91:48:48:30:18:43:42:30:18:47:44 chr5 180633854 . T G 247.14 PASS AO=51;DP=95;FAO=52;FDP=96;FR=.;FRO=44;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=32;FSRR=12;FWDB=-0.0073066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.684;QD=10.2973;RBI=0.0123192;REFB=-0.00268066;REVB=0.00991845;RO=44;SAF=27;SAR=24;SRF=32;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169637;STB=0.596165;TYPE=snp;VARB=0.00329583;OID=.;OPOS=180633854;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:96:44:44:51:52:24:27:32:12:25:27:32:12 chr5 180634747 . C T 422.54 PASS AO=109;DP=242;FAO=111;FDP=244;FR=.;FRO=133;FSAF=77;FSAR=34;FSRF=92;FSRR=41;FWDB=-0.00781337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.582;QD=6.92695;RBI=0.0992489;REFB=-0.00276515;REVB=0.0989408;RO=130;SAF=77;SAR=32;SRF=90;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0165788;STB=0.501258;TYPE=snp;VARB=0.00337123;OID=.;OPOS=180634747;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:242:244:130:133:109:111:32:77:90:40:34:77:92:41 chr5 180645350 . G C 397.24 PASS AO=111;DP=256;FAO=111;FDP=256;FR=.;FRO=145;FSAF=50;FSAR=61;FSRF=60;FSRR=85;FWDB=0.0140735;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.138;QD=6.20691;RBI=0.0201122;REFB=-0.00292989;REVB=0.0143679;RO=144;SAF=50;SAR=61;SRF=60;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0348103;STB=0.521053;TYPE=snp;VARB=0.00492593;OID=.;OPOS=180645350;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:256:256:144:145:111:111:61:50:60:84:61:50:60:85 chr5 180649054 . C T 280.83 PASS AO=85;DP=215;FAO=86;FDP=215;FR=.;FRO=129;FSAF=28;FSAR=58;FSRF=60;FSRR=69;FWDB=0.0159787;FXX=0.00462942;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.4946;QD=5.22478;RBI=0.0507236;REFB=-0.00774293;REVB=0.0481411;RO=129;SAF=28;SAR=57;SRF=60;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154406;STB=0.589355;TYPE=snp;VARB=0.0145139;OID=.;OPOS=180649054;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:215:129:129:85:86:57:28:60:69:58:28:60:69 chr5 180649062 . G A 271.51 PASS AO=84;DP=213;FAO=84;FDP=213;FR=.;FRO=129;FSAF=30;FSAR=54;FSRF=58;FSRR=71;FWDB=-0.0297265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.152;QD=5.09886;RBI=0.0305989;REFB=-0.00610366;REVB=0.00725426;RO=125;SAF=30;SAR=54;SRF=56;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101721;STB=0.558913;TYPE=snp;VARB=0.0117882;OID=.;OPOS=180649062;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:213:213:125:129:84:84:54:30:56:69:54:30:58:71 chr5 180649616 . G A 33.04 PASS AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0129875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.649;QD=18.8792;RBI=0.0447907;REFB=0.030798;REVB=0.0428664;RO=2;SAF=2;SAR=3;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212944;STB=0.62455;TYPE=snp;VARB=-0.0014045;OID=.;OPOS=180649616;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:2:2:5:5:3:2:0:2:3:2:0:2 chr5 180660447 . G C 143.54 PASS AO=31;DP=61;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=-0.0568838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.4151;QD=9.41256;RBI=0.0592028;REFB=-0.0174125;REVB=-0.0164075;RO=29;SAF=10;SAR=21;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122134;STB=0.50602;TYPE=snp;VARB=0.0140431;OID=.;OPOS=180660447;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:29:30:31:31:21:10:9:20:21:10:10:20 chr5 180661328 . C G 10.22 PASS AO=2;DP=9;FAO=2;FDP=9;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.889;QD=4.5413;RBI=0.00248793;REFB=-0.0100608;REVB=-0.00248793;RO=7;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0264162;OID=.;OPOS=180661328;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:7:7:2:2:2:0:0:7:2:0:0:7 chr5 180674152 . C T 570.41 PASS AO=123;DP=231;FAO=125;FDP=235;FR=.;FRO=110;FSAF=65;FSAR=60;FSRF=64;FSRR=46;FWDB=0.00389117;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.5548;QD=9.70905;RBI=0.00454499;REFB=-0.0377137;REVB=-0.00234856;RO=106;SAF=63;SAR=60;SRF=62;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.061852;STB=0.529045;TYPE=snp;VARB=0.0427393;OID=.;OPOS=180674152;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:231:235:106:110:123:125:60:63:62:44:60:65:64:46 chr5 180687428 . CTCT C 150.38 PASS AO=38;DP=128;FAO=43;FDP=104;FR=.;FRO=61;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=36;FSRR=25;FWDB=-0.000262498;FXX=0.118634;HRUN=1;LEN=3;MLLD=170.597;QD=5.78379;RBI=0.00681619;REFB=-0.0147465;REVB=-0.00681113;RO=54;SAF=22;SAR=16;SRF=28;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0635276;STB=0.532716;TYPE=del;VARB=0.0182415;OID=.;OPOS=180687429;OREF=TCT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:38:107:43:104:61:23:20:36:25:99:54:22:16:28:26 chr5 180729007 . TAGAG T 47.81 PASS AO=7;DP=11;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0119417;FXX=0;HRUN=1;LEN=4;MLLD=227.582;QD=17.3836;RBI=0.0515294;REFB=-0.0168586;REVB=0.0501266;RO=2;SAF=2;SAR=5;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0955799;STB=0.58797;TYPE=del;VARB=0.00962431;OID=.;OPOS=180729008;OREF=AGAG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:7:11:7:11:4:2:5:2:2:18:2:2:5:1:1 chr6 335175 . A T 401.25 PASS AO=40;DP=40;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0389251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.928;QD=37.3253;RBI=0.0437285;REFB=0;REVB=0.0199254;RO=0;SAF=22;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19993e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.2842e-05;OID=.;OPOS=335175;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:40:43:0:0:40:43:18:22:0:0:18:25:0:0 chr6 348906 . G A 78.93 PASS AO=26;DP=74;FAO=26;FDP=74;FR=.;FRO=48;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=34;FSRR=14;FWDB=0.00272156;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.187;QD=4.26652;RBI=0.0160581;REFB=-0.0176555;REVB=0.0158258;RO=48;SAF=9;SAR=17;SRF=34;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.389573;STB=0.723603;TYPE=snp;VARB=0.017762;OID=.;OPOS=348906;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:74:74:48:48:26:26:17:9:34:14:17:9:34:14 chr6 350940 . T TA 66.04 PASS AO=59;DP=202;FAO=60;FDP=200;FR=.;FRO=140;FSAF=15;FSAR=45;FSRF=41;FSRR=99;FWDB=-0.0821303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=28.5146;QD=1.3208;RBI=0.0984895;REFB=0.00935917;REVB=0.0543581;RO=142;SAF=15;SAR=44;SRF=42;SRR=100;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0634912;STB=0.538448;TYPE=ins;VARB=-0.0198065;OID=.;OPOS=350941;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:59:202:60:200:140:15:45:41:99:66:142:15:44:42:100 chr6 408012 . G A 1200.9 PASS AO=125;DP=127;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00322135;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.927;QD=38.1238;RBI=0.0456401;REFB=0;REVB=0.0455262;RO=0;SAF=53;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000143231;OID=.;OPOS=408012;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:127:126:0:0:125:126:72:53:0:0:73:53:0:0 chr6 656143 . C A 1475.52 PASS AO=155;DP=156;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0256591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2826;QD=37.5929;RBI=0.025682;REFB=-0.0628158;REVB=-0.00108308;RO=1;SAF=77;SAR=78;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00613843;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000643358;OID=.;OPOS=656143;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:156:157:1:0:155:157:78:77:1:0:78:79:0:0 chr6 1395805 . ATT AT,A 513.12 PASS AO=67,17;DP=139;FAO=126,0;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=53,0;FSAR=73,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.261417,0.127749;FXX=0.0078734;HRUN=8,8;LEN=1,2;MLLD=8.51697,8.91725;QD=16.2894;RBI=0.373793,0.186172;REFB=0.143634,0.101294;REVB=-0.267175,-0.135426;RO=23;SAF=29,1;SAR=38,16;SRF=17;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.14548,-0.735512;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.0151743,0;OID=.,.;OPOS=1395806,1395806;OREF=T,TT;OALT=-,-;OMAPALT=AT,A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:67,17:113:126,0:126:0:53,0:73,0:0:0:36:23:29,1:38,16:17:6 chr6 1507626 . G A 309.79 PASS AO=67;DP=137;FAO=71;FDP=141;FR=.;FRO=70;FSAF=33;FSAR=38;FSRF=47;FSRR=23;FWDB=0.000370055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.498;QD=8.78833;RBI=0.0102618;REFB=-0.0229302;REVB=0.0102551;RO=67;SAF=32;SAR=35;SRF=44;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161758;STB=0.601595;TYPE=snp;VARB=0.0193127;OID=.;OPOS=1507626;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:141:67:70:67:71:35:32:44:23:38:33:47:23 chr6 1507808 . G T 673.14 PASS AO=139;DP=252;FAO=140;FDP=250;FR=.;FRO=110;FSAF=52;FSAR=88;FSRF=57;FSRR=53;FWDB=-0.00470284;FXX=0.00793619;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.552;QD=10.7702;RBI=0.0266295;REFB=0.00332139;REVB=0.0262109;RO=105;SAF=51;SAR=88;SRF=54;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121156;STB=0.566759;TYPE=snp;VARB=-0.00330337;OID=.;OPOS=1507808;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:252:250:105:110:139:140:88:51:54:51:88:52:57:53 chr6 1523145 . C G 946.65 PASS AO=114;DP=125;FAO=114;FDP=125;FR=.;FRO=11;FSAF=88;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=11;FWDB=-0.00665658;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.2344;QD=30.2928;RBI=0.0926845;REFB=0.000146965;REVB=-0.0924452;RO=3;SAF=88;SAR=26;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0516886;STB=0.587285;TYPE=snp;VARB=-0.000413898;OID=.;OPOS=1523145;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:125:125:3:11:114:114:26:88:0:3:26:88:0:11 chr6 1742794 . A G 343.46 PASS AO=82;DP=168;FAO=82;FDP=168;FR=.;FRO=86;FSAF=30;FSAR=52;FSRF=22;FSRR=64;FWDB=0.0269396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.5515;QD=8.17759;RBI=0.0432564;REFB=-0.0216667;REVB=-0.0338433;RO=84;SAF=30;SAR=52;SRF=22;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106527;STB=0.562728;TYPE=snp;VARB=0.0241223;OID=.;OPOS=1742794;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:84:86:82:82:52:30:22:62:52:30:22:64 chr6 2623820 . G A 94.54 PASS AO=22;DP=47;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=3;FSAR=19;FSRF=7;FSRR=18;FWDB=0.00113154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.7627;QD=8.04572;RBI=0.0628725;REFB=-0.00232655;REVB=0.0628624;RO=25;SAF=3;SAR=19;SRF=7;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227558;STB=0.631092;TYPE=snp;VARB=0.00479747;OID=.;OPOS=2623820;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:47:47:25:25:22:22:19:3:7:18:19:3:7:18 chr6 2623930 . G A 233.98 PASS AO=46;DP=80;FAO=46;FDP=81;FR=.;FRO=35;FSAF=31;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.00376287;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=77.3617;QD=11.5548;RBI=0.00527268;REFB=-0.00184106;REVB=0.0036935;RO=34;SAF=31;SAR=15;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0974729;STB=0.561632;TYPE=snp;VARB=0.00144179;OID=.;OPOS=2623930;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:81:34:35:46:46:15:31:19:15:15:31:19:16 chr6 2664375 . C A 71 PASS AO=19;DP=47;FAO=19;FDP=47;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=-0.00633846;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.159;QD=6.0422;RBI=0.0890471;REFB=-0.014312;REVB=-0.0888212;RO=28;SAF=8;SAR=11;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190523;STB=0.609642;TYPE=snp;VARB=0.0147184;OID=.;OPOS=2664375;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:47:47:28:28:19:19:11:8:17:11:11:8:17:11 chr6 2667031 . A G 174.61 PASS AO=32;DP=70;FAO=40;FDP=77;FR=.;FRO=37;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=-0.000991075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.408;QD=9.07074;RBI=0.0447068;REFB=-0.00122892;REVB=0.0446958;RO=36;SAF=23;SAR=9;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275359;STB=0.568606;TYPE=snp;VARB=0.0016527;OID=.;OPOS=2667031;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:77:36:37:32:40:9:23:16:20:17:23:16:21 chr6 2667864 . T A 20.27 PASS AO=8;DP=29;FAO=14;FDP=47;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=0.254898;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=15.1385;QD=1.72477;RBI=0.255388;REFB=-0.0591988;REVB=-0.0158038;RO=21;SAF=4;SAR=4;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137469;STB=0.531869;TYPE=snp;VARB=0.274077;OID=.;OPOS=2667864;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:29:47:21:33:8:14:4:4:13:8:7:7:15:18 chr6 2675271 . C T 1225.21 PASS AO=132;DP=134;FAO=132;FDP=134;FR=.;FRO=2;FSAF=70;FSAR=62;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.015884;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.9774;QD=36.5735;RBI=0.0203472;REFB=-0.0117859;REVB=-0.0127163;RO=2;SAF=70;SAR=62;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00086272;STB=0.500454;TYPE=snp;VARB=0.000107866;OID=.;OPOS=2675271;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:134:134:2:2:132:132:62:70:1:1:62:70:1:1 chr6 2955802 . T C 355.63 PASS AO=93;DP=206;FAO=94;FDP=207;FR=.;FRO=113;FSAF=24;FSAR=70;FSRF=65;FSRR=48;FWDB=-0.0113268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.165;QD=6.87201;RBI=0.016897;REFB=-0.0209303;REVB=-0.0125385;RO=111;SAF=24;SAR=69;SRF=63;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.325419;STB=0.687444;TYPE=snp;VARB=0.0217383;OID=.;OPOS=2955802;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:206:207:111:113:93:94:69:24:63:48:70:24:65:48 chr6 3010337 . A G 244 PASS AO=67;DP=170;FAO=73;FDP=177;FR=.;FRO=104;FSAF=52;FSAR=21;FSRF=69;FSRR=35;FWDB=0.00924789;FXX=0.00561766;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.4212;QD=5.5141;RBI=0.0160685;REFB=-0.0569058;REVB=0.0131405;RO=103;SAF=48;SAR=19;SRF=69;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0595505;STB=0.534008;TYPE=snp;VARB=0.0907344;OID=.;OPOS=3010337;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:177:103:104:67:73:19:48:69:34:21:52:69:35 chr6 3010390 . C T 246.79 PASS AO=65;DP=145;FAO=65;FDP=145;FR=.;FRO=80;FSAF=34;FSAR=31;FSRF=48;FSRR=32;FWDB=-0.0665146;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.0799;QD=6.80785;RBI=0.0683997;REFB=-0.0156982;REVB=0.0159477;RO=79;SAF=34;SAR=31;SRF=47;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0713077;STB=0.542686;TYPE=snp;VARB=0.0216137;OID=.;OPOS=3010390;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:79:80:65:65:31:34:47:32:31:34:48:32 chr6 3015790 . A G 147.2 PASS AO=50;DP=157;FAO=55;FDP=163;FR=.;FRO=108;FSAF=21;FSAR=34;FSRF=54;FSRR=54;FWDB=-0.0176395;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.418;QD=3.61221;RBI=0.0227434;REFB=-0.0105224;REVB=-0.0143567;RO=106;SAF=16;SAR=34;SRF=52;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208937;STB=0.57978;TYPE=snp;VARB=0.0174192;OID=.;OPOS=3015790;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:163:106:108:50:55:34:16:52:54:34:21:54:54 chr6 3015865 . C T 122.32 PASS AO=49;DP=151;FAO=49;FDP=153;FR=.;FRO=104;FSAF=17;FSAR=32;FSRF=49;FSRR=55;FWDB=-0.0247216;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.012;QD=3.19785;RBI=0.0249601;REFB=0.00279228;REVB=-0.00344205;RO=100;SAF=17;SAR=32;SRF=49;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17177;STB=0.5881;TYPE=snp;VARB=-0.00567969;OID=.;OPOS=3015865;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:153:100:104:49:49:32:17:49:51:32:17:49:55 chr6 3077141 . T C 2983.69 PASS AO=121;DP=320;FAO=314;FDP=314;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=106;FSAR=208;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0218946;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=85.0345;QD=38.0088;RBI=0.0760009;REFB=0;REVB=-0.0727788;RO=0;SAF=96;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.37717e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.25719e-06;OID=.;OPOS=3077141;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:151:314:0:0:121:314:25:96:0:0:208:106:0:0 chr6 3154871 . A C 392.67 PASS AO=40;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00977571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.0011;QD=37.3973;RBI=0.0158369;REFB=0;REVB=-0.0124597;RO=0;SAF=27;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00026983;OID=.;OPOS=3154871;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:41:42:0:0:40:42:13:27:0:0:13:29:0:0 chr6 3255327 . G A 2091.5 PASS AO=222;DP=225;FAO=222;FDP=222;FR=.;FRO=0;FSAF=119;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0152962;FXX=0.0133327;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.8297;QD=37.6846;RBI=0.0302683;REFB=-0.0573168;REVB=0.0261188;RO=2;SAF=119;SAR=103;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000616241;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000569612;OID=.;OPOS=3255327;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:225:222:2:0:222:222:103:119:1:1:103:119:0:0 chr6 3255340 . A C 2281.59 PASS AO=229;DP=229;FAO=238;FDP=238;FR=.;FRO=0;FSAF=127;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100546;FXX=0.00418393;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.374;QD=38.3461;RBI=0.0453342;REFB=0;REVB=-0.0442051;RO=0;SAF=120;SAR=109;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.18264e-05;OID=.;OPOS=3255340;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:229:238:0:0:229:238:109:120:0:0:111:127:0:0 chr6 3264487 . T C 927.22 PASS AO=77;DP=105;FAO=97;FDP=97;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=33;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0415742;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.243;QD=38.2358;RBI=0.0491386;REFB=0;REVB=0.0261953;RO=0;SAF=28;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000781465;OID=.;OPOS=3264487;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:95:97:0:0:77:97:49:28:0:0:64:33:0:0 chr6 3264488 . G C 16.78 PASS AO=17;DP=99;FAO=17;FDP=99;FR=.;FRO=82;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=32;FSRR=50;FWDB=-0.0063139;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=68.5638;QD=0.678015;RBI=0.02336;REFB=-0.0712446;REVB=0.0224905;RO=82;SAF=2;SAR=15;SRF=32;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.433225;STB=0.796461;TYPE=snp;VARB=0.0488929;OID=.;OPOS=3264488;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:99:99:82:82:17:17:15:2:32:50:15:2:32:50 chr6 3264502 . G C 808.77 PASS AO=89;DP=92;FAO=90;FDP=93;FR=.;FRO=3;FSAF=25;FSAR=65;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0423566;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.169;QD=34.7857;RBI=0.0427987;REFB=-0.0371273;REVB=0.00613635;RO=3;SAF=24;SAR=65;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0306337;STB=0.515415;TYPE=snp;VARB=0.000672553;OID=.;OPOS=3264502;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:92:93:3:3:89:90:65:24:2:1:65:25:2:1 chr6 3285286 . A G 1887.36 PASS AO=216;DP=229;FAO=216;FDP=229;FR=.;FRO=13;FSAF=103;FSAR=113;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.102983;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.4082;QD=32.9671;RBI=0.117688;REFB=-0.054093;REVB=-0.0569648;RO=12;SAF=103;SAR=113;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0190196;STB=0.507875;TYPE=snp;VARB=0.0090727;OID=.;OPOS=3285286;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:229:229:12:13:216:216:113:103:8:4:113:103:8:5 chr6 3287118 . T C 73.83 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0122331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.7944;QD=36.9158;RBI=0.0332205;REFB=0;REVB=-0.0308862;RO=0;SAF=6;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.58669e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00413949;OID=.;OPOS=3287118;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:2:6:0:0:2:6:0:0 chr6 3438738 . G A 131.46 PASS AO=35;DP=82;FAO=35;FDP=82;FR=.;FRO=47;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=0.000843912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.659;QD=6.41244;RBI=0.0676562;REFB=-0.0116383;REVB=0.067651;RO=47;SAF=18;SAR=17;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0684119;STB=0.5386;TYPE=snp;VARB=0.0149651;OID=.;OPOS=3438738;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:47:47:35:35:17:18:21:26:17:18:21:26 chr6 3439595 . G GA 116.52 PASS AO=42;DP=88;FAO=50;FDP=87;FR=.;FRO=37;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.245194;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.1617;QD=5.35717;RBI=0.25798;REFB=-0.0817237;REVB=0.0802072;RO=43;SAF=24;SAR=18;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012325;STB=0.540273;TYPE=ins;VARB=0.0913238;OID=.;OPOS=3439596;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:42:88:50:87:37:29:21:18:19:77:43:24:18:24:19 chr6 3727811 . C G 508.07 PASS AO=135;DP=299;FAO=135;FDP=299;FR=.;FRO=164;FSAF=68;FSAR=67;FSRF=59;FSRR=105;FWDB=0.0214236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.384;QD=6.79693;RBI=0.0223098;REFB=-0.0117794;REVB=-0.00622531;RO=164;SAF=68;SAR=67;SRF=59;SRR=105;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142845;STB=0.578855;TYPE=snp;VARB=0.0140289;OID=.;OPOS=3727811;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:299:299:164:164:135:135:67:68:59:105:67:68:59:105 chr6 3851545 . G C 481.02 PASS AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0699604;FXX=0.0377287;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.38;QD=37.7274;RBI=0.0702488;REFB=0;REVB=0.0063593;RO=0;SAF=9;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00113966;OID=.;OPOS=3851545;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:52:51:0:0:51:51:42:9:0:0:42:9:0:0 chr6 4031998 . A G 125.98 PASS AO=25;DP=45;FAO=25;FDP=45;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.0172246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.982;QD=11.1982;RBI=0.0173069;REFB=-0.00313907;REVB=-0.00168614;RO=19;SAF=12;SAR=13;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0872689;STB=0.558094;TYPE=snp;VARB=0.00448739;OID=.;OPOS=4031998;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:45:45:19:20:25:25:13:12:7:12:13:12:7:13 chr6 4069133 . T C 448.73 PASS AO=112;DP=236;FAO=112;FDP=236;FR=.;FRO=124;FSAF=50;FSAR=62;FSRF=70;FSRR=54;FWDB=-0.0114621;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.685;QD=7.6056;RBI=0.0180999;REFB=-0.00753168;REVB=0.0140082;RO=124;SAF=50;SAR=62;SRF=70;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112312;STB=0.561922;TYPE=snp;VARB=0.00786637;OID=.;OPOS=4069133;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:236:236:124:124:112:112:62:50:70:54:62:50:70:54 chr6 4069166 . C T 459.42 PASS AO=100;DP=188;FAO=100;FDP=189;FR=.;FRO=89;FSAF=54;FSAR=46;FSRF=38;FSRR=51;FWDB=0.0199091;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.162;QD=9.72316;RBI=0.0295377;REFB=-0.00733428;REVB=-0.0218198;RO=88;SAF=54;SAR=46;SRF=38;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0924648;STB=0.553105;TYPE=snp;VARB=0.0093792;OID=.;OPOS=4069166;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:189:88:89:100:100:46:54:38:50:46:54:38:51 chr6 4069685 . C T 262.26 PASS AO=61;DP=122;FAO=61;FDP=123;FR=.;FRO=62;FSAF=21;FSAR=40;FSRF=35;FSRR=27;FWDB=-0.0207948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.242;QD=8.52867;RBI=0.0220525;REFB=-0.0112865;REVB=0.00734078;RO=61;SAF=21;SAR=40;SRF=34;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198687;STB=0.614165;TYPE=snp;VARB=0.0146418;OID=.;OPOS=4069685;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:123:61:62:61:61:40:21:34:27:40:21:35:27 chr6 4074604 . T A 447.14 PASS AO=77;DP=425;FAO=132;FDP=382;FR=.,HEALED;FRO=216;FSAF=67;FSAR=65;FSRF=72;FSRR=144;FWDB=-0.0634143;FXX=0.0449989;HRUN=7;LEN=1;MLLD=19.1304;QD=4.6821;RBI=0.110768;REFB=0.0172192;REVB=-0.09082;RO=153;SAF=34;SAR=43;SRF=55;SRR=98;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0981597;STB=0.607806;TYPE=snp;VARB=0.0137526;OID=.;OPOS=4074604;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:358:382:153:216:77:132:43:34:55:98:65:67:72:144 chr6 4074634 . C A 732.38 PASS AO=211;DP=433;FAO=187;FDP=399;FR=.;FRO=212;FSAF=78;FSAR=109;FSRF=60;FSRR=152;FWDB=-0.00304874;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.131;QD=7.34211;RBI=0.00670916;REFB=-0.0230335;REVB=-0.00597645;RO=218;SAF=89;SAR=122;SRF=67;SRR=151;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11116;STB=0.575077;TYPE=snp;VARB=0.0205803;OID=.;OPOS=4074634;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:433:399:218:212:211:187:122:89:67:151:109:78:60:152 chr6 4079858 . C G 100.11 PASS AO=17;DP=27;FAO=17;FDP=27;FR=.;FRO=10;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=9;FWDB=-0.0122029;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=77.2736;QD=14.8311;RBI=0.0135258;REFB=-0.0512442;REVB=-0.0058341;RO=8;SAF=9;SAR=8;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.231207;STB=0.656483;TYPE=snp;VARB=0.0153099;OID=.;OPOS=4079858;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:27:27:8:10:17:17:8:9:1:7:8:9:1:9 chr6 4079875 . T C 470.72 PASS AO=62;DP=73;FAO=62;FDP=73;FR=.;FRO=11;FSAF=19;FSAR=43;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=0.0063627;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.8731;QD=25.7931;RBI=0.0142581;REFB=0.0190395;REVB=0.0127597;RO=10;SAF=19;SAR=43;SRF=1;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0651124;STB=0.522468;TYPE=snp;VARB=-0.010515;OID=.;OPOS=4079875;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:73:73:10:11:62:62:43:19:1:9:43:19:2:9 chr6 4087934 . G C 277.49 PASS AO=64;DP=128;FAO=64;FDP=127;FR=.;FRO=63;FSAF=28;FSAR=36;FSRF=30;FSRR=33;FWDB=-0.0155858;FXX=0.0155027;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.07;QD=8.73976;RBI=0.0173677;REFB=-0.0125916;REVB=0.00766288;RO=62;SAF=29;SAR=35;SRF=31;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0420319;STB=0.519397;TYPE=snp;VARB=0.0104656;OID=.;OPOS=4087934;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:127:62:63:64:64:35:29:31:31:36:28:30:33 chr6 4115758 . C T 1539.43 PASS AO=163;DP=164;FAO=163;FDP=163;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0248013;FXX=0.00609719;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.887;QD=37.7774;RBI=0.0293697;REFB=-0.0204228;REVB=-0.0157313;RO=1;SAF=93;SAR=70;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00674934;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.0222e-05;OID=.;OPOS=4115758;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:164:163:1:0:163:163:70:93:0:1:70:93:0:0 chr6 4116262 . G A 568.46 PASS AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0440251;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.866;QD=37.8976;RBI=0.0441209;REFB=0;REVB=-0.00290655;RO=0;SAF=20;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000160263;OID=.;OPOS=4116262;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:61:60:0:0:60:60:40:20:0:0:40:20:0:0 chr6 4122249 . C A 451.53 PASS AO=50;DP=53;FAO=52;FDP=55;FR=.;FRO=3;FSAF=47;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0731806;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.3391;QD=32.8385;RBI=0.0798349;REFB=0.00156518;REVB=-0.0319095;RO=3;SAF=45;SAR=5;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145552;STB=0.578174;TYPE=snp;VARB=0.00206226;OID=.;OPOS=4122249;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:53:55:3:3:50:52:5:45:1:2:5:47:1:2 chr6 4133855 . C T 2360.35 PASS AO=249;DP=251;FAO=251;FDP=251;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=171;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220549;FXX=0.00790483;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.7621;QD=37.6151;RBI=0.0252937;REFB=-0.0800053;REVB=0.0123836;RO=1;SAF=78;SAR=171;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00277955;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000727967;OID=.;OPOS=4133855;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:251:251:1:0:249:251:171:78:0:1:171:80:0:0 chr6 4996543 . C T 75.71 PASS AO=21;DP=55;FAO=21;FDP=53;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=0.0185465;FXX=0.036357;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.626;QD=5.71413;RBI=0.0314603;REFB=-0.0129954;REVB=0.0254122;RO=34;SAF=18;SAR=3;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.551865;STB=0.80949;TYPE=snp;VARB=0.021325;OID=.;OPOS=4996543;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:55:53:34:32:21:21:3:18:13:21:3:18:13:19 chr6 4998963 . A G 130.69 PASS AO=33;DP=73;FAO=33;FDP=73;FR=.;FRO=40;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=0.0385898;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.3633;QD=7.16086;RBI=0.064496;REFB=0.00420305;REVB=0.0516774;RO=36;SAF=21;SAR=12;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157057;STB=0.563597;TYPE=snp;VARB=-0.00526433;OID=.;OPOS=4998963;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:36:40:33:33:12:21:17:19:12:21:21:19 chr6 5001341 . C T 469.61 PASS AO=106;DP=207;FAO=106;FDP=206;FR=.;FRO=100;FSAF=50;FSAR=56;FSRF=39;FSRR=61;FWDB=0.0262231;FXX=0.0143534;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.986;QD=9.11858;RBI=0.02779;REFB=-0.00723221;REVB=-0.00919956;RO=96;SAF=50;SAR=56;SRF=38;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0664294;STB=0.539959;TYPE=snp;VARB=0.00884482;OID=.;OPOS=5001341;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:206:96:100:106:106:56:50:38:58:56:50:39:61 chr6 5086558 . C A 31.01 PASS AO=4;DP=8;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.025713;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.9;QD=13.7802;RBI=0.0361238;REFB=-0.0168938;REVB=0.0253726;RO=4;SAF=2;SAR=2;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201109;STB=0.651584;TYPE=snp;VARB=0.00894932;OID=.;OPOS=5086558;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:8:9:4:4:4:5:2:2:3:1:3:2:3:1 chr6 5139012 . C A 220.77 PASS AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0595419;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.755;QD=36.7943;RBI=0.0681068;REFB=0;REVB=0.033065;RO=0;SAF=3;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.86584e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000855633;OID=.;OPOS=5139012;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:24:24:0:0:24:24:21:3:0:0:21:3:0:0 chr6 5260936 . A C 342.63 PASS AO=82;DP=169;FAO=82;FDP=169;FR=.;FRO=87;FSAF=43;FSAR=39;FSRF=51;FSRR=36;FWDB=-0.0160755;FXX=0.00588201;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.642;QD=8.10953;RBI=0.0320879;REFB=-0.0225047;REVB=-0.0277707;RO=85;SAF=43;SAR=39;SRF=50;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0593174;STB=0.531991;TYPE=snp;VARB=0.0195692;OID=.;OPOS=5260936;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:169:85:87:82:82:39:43:50:35:39:43:51:36 chr6 6174866 . G A 551.08 PASS AO=128;DP=254;FAO=128;FDP=253;FR=.;FRO=125;FSAF=89;FSAR=39;FSRF=86;FSRR=39;FWDB=-0.00549614;FXX=0.00393685;HRUN=3;LEN=1;MLLD=258.499;QD=8.71277;RBI=0.0196466;REFB=0.00267973;REVB=0.0188622;RO=125;SAF=89;SAR=39;SRF=86;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00775012;STB=0.504249;TYPE=snp;VARB=-0.00280521;OID=.;OPOS=6174866;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:254:253:125:125:128:128:39:89:86:39:39:89:86:39 chr6 6222382 . T G 376.07 PASS AO=62;DP=93;FAO=64;FDP=95;FR=.;FRO=31;FSAF=27;FSAR=37;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=0.0169235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.2208;QD=15.8347;RBI=0.017099;REFB=-0.0335445;REVB=0.00244375;RO=29;SAF=25;SAR=37;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129668;STB=0.572959;TYPE=snp;VARB=0.02201;OID=.;OPOS=6222382;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:93:95:29:31:62:64:37:25:18:11:37:27:20:11 chr6 6251120 . T A 345.47 PASS AO=78;DP=160;FAO=81;FDP=163;FR=.;FRO=82;FSAF=45;FSAR=36;FSRF=39;FSRR=43;FWDB=0.0200188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.17;QD=8.47786;RBI=0.0273189;REFB=0.010246;REVB=-0.0185894;RO=82;SAF=44;SAR=34;SRF=39;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.082552;STB=0.540346;TYPE=snp;VARB=-0.00854485;OID=.;OPOS=6251120;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:163:82:82:78:81:34:44:39:43:36:45:39:43 chr6 6318795 . C A 180.18 PASS AO=57;DP=153;FAO=58;FDP=154;FR=.;FRO=96;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=36;FSRR=60;FWDB=0.030152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.7;QD=4.67987;RBI=0.0331287;REFB=-0.0232334;REVB=0.0137247;RO=96;SAF=26;SAR=31;SRF=36;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0913365;STB=0.546602;TYPE=snp;VARB=0.032398;OID=.;OPOS=6318795;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:154:96:96:57:58:31:26:36:60:32:26:36:60 chr6 6320808 . T G 519.73 PASS AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0076803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.3641;QD=37.7989;RBI=0.0599341;REFB=0;REVB=-0.05944;RO=0;SAF=28;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.4002e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00080328;OID=.;OPOS=6320808;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:55:55:0:0:55:55:27:28:0:0:27:28:0:0 chr6 6938928 . C T 178.32 PASS AO=50;DP=120;FAO=50;FDP=120;FR=.;FRO=70;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=43;FSRR=27;FWDB=0.00584368;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=86.5305;QD=5.94405;RBI=0.0515021;REFB=-0.0262357;REVB=0.0511695;RO=70;SAF=22;SAR=28;SRF=43;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179227;STB=0.600621;TYPE=snp;VARB=0.0386416;OID=.;OPOS=6938928;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:70:70:50:50:28:22:43:27:28:22:43:27 chr6 7387236 . G A 337.36 PASS AO=83;DP=173;FAO=83;FDP=174;FR=.;FRO=91;FSAF=48;FSAR=35;FSRF=60;FSRR=31;FWDB=0.00790988;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=221.212;QD=7.7555;RBI=0.00796399;REFB=-0.00526772;REVB=-0.000926753;RO=90;SAF=48;SAR=35;SRF=59;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0757042;STB=0.544031;TYPE=snp;VARB=0.00545222;OID=.;OPOS=7387236;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:174:90:91:83:83:35:48:59:31:35:48:60:31 chr6 7393452 . C T 250.99 PASS AO=44;DP=68;FAO=44;FDP=70;FR=.;FRO=26;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=0.0116784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.2528;QD=14.3425;RBI=0.0159823;REFB=-0.0340909;REVB=-0.0109109;RO=24;SAF=28;SAR=16;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0512615;STB=0.507039;TYPE=snp;VARB=0.0189416;OID=.;OPOS=7393452;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:68:70:24:26:44:44:16:28:17:7:16:28:17:9 chr6 7395229 . A G 821.02 PASS AO=173;DP=315;FAO=174;FDP=317;FR=.;FRO=143;FSAF=122;FSAR=52;FSRF=87;FSRR=56;FWDB=0.0114179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.563;QD=10.3598;RBI=0.0116917;REFB=-0.00940266;REVB=0.00251542;RO=142;SAF=123;SAR=50;SRF=86;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101024;STB=0.54799;TYPE=snp;VARB=0.00967316;OID=.;OPOS=7395229;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:315:317:142:143:173:174:50:123:86:56:52:122:87:56 chr6 7563983 . T G 3033.22 PASS AO=321;DP=330;FAO=321;FDP=321;FR=.;FRO=0;FSAF=155;FSAR=166;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134741;FXX=0.0243154;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.398;QD=37.7972;RBI=0.0356349;REFB=-0.0810456;REVB=0.0329893;RO=3;SAF=155;SAR=166;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00264454;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000472935;OID=.;OPOS=7563983;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:330:321:3:0:321:321:166:155:1:2:166:155:0:0 chr6 7572262 . A G 197.02 PASS AO=56;DP=162;FAO=66;FDP=173;FR=.;FRO=107;FSAF=29;FSAR=37;FSRF=45;FSRR=62;FWDB=0.0260549;FXX=0.0170445;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.2275;QD=4.55536;RBI=0.0261951;REFB=-0.0209935;REVB=-0.00270659;RO=104;SAF=26;SAR=30;SRF=44;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0472713;STB=0.511852;TYPE=snp;VARB=0.0538555;OID=.;OPOS=7572262;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:173:104:107:56:66:30:26:44:60:37:29:45:62 chr6 7576527 . G A 1025.49 PASS AO=112;DP=117;FAO=112;FDP=115;FR=.;FRO=3;FSAF=69;FSAR=43;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0452073;FXX=0.0170926;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.1338;QD=35.6691;RBI=0.0453865;REFB=0.0477959;REVB=-0.00402854;RO=1;SAF=69;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00683193;STB=0.510636;TYPE=snp;VARB=-0.00384356;OID=.;OPOS=7576527;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:117:115:1:3:112:112:43:69:1:0:43:69:3:0 chr6 7580958 . A G 75.5 PASS AO=20;DP=49;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.0107145;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.6253;QD=6.16352;RBI=0.0151295;REFB=-0.0422501;REVB=-0.0106818;RO=29;SAF=9;SAR=11;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0692642;STB=0.539837;TYPE=snp;VARB=0.0281945;OID=.;OPOS=7580958;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:49:49:29:29:20:20:11:9:15:14:11:9:15:14 chr6 7584618 . G T 84.2 PASS AO=33;DP=180;FAO=40;FDP=147;FR=.,HEALED;FRO=107;FSAF=3;FSAR=37;FSRF=59;FSRR=48;FWDB=0.0204937;FXX=0.226304;HRUN=6;LEN=1;MLLD=137.764;QD=2.29123;RBI=0.0904937;REFB=0.000717711;REVB=-0.0881426;RO=47;SAF=2;SAR=31;SRF=42;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.801488;STB=0.899736;TYPE=snp;VARB=0.0359369;OID=.;OPOS=7584618;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:174:147:47:107:33:40:31:2:42:5:37:3:59:48 chr6 7585967 . G C 150.15 PASS AO=19;DP=21;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0339602;FXX=0.0587889;HRUN=4;LEN=1;MLLD=211.556;QD=37.5373;RBI=0.0378412;REFB=0;REVB=0.0166929;RO=1;SAF=7;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0612242;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000274788;OID=.;OPOS=7585967;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:21:16:1:0:19:16:12:7:1:0:10:6:0:0 chr6 7590624 . C T 15.16 PASS AO=6;DP=26;FAO=6;FDP=27;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.000388739;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=165.753;QD=2.24536;RBI=0.00572016;REFB=-0.00110039;REVB=0.00570694;RO=20;SAF=3;SAR=3;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116726;STB=0.592295;TYPE=snp;VARB=0.00335653;OID=.;OPOS=7590624;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:26:27:20:21:6:6:3:3:8:12:3:3:8:13 chr6 7601720 . C T 542.97 PASS AO=133;DP=276;FAO=133;FDP=275;FR=.;FRO=142;FSAF=57;FSAR=76;FSRF=63;FSRR=79;FWDB=-0.0313186;FXX=0.00362306;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7138;QD=7.89767;RBI=0.0389052;REFB=-0.00789575;REVB=-0.0230816;RO=142;SAF=57;SAR=76;SRF=63;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0144253;STB=0.507935;TYPE=snp;VARB=0.00952663;OID=.;OPOS=7601720;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:276:275:142:142:133:133:76:57:63:79:76:57:63:79 chr6 7862556 . C T 140.46 PASS AO=37;DP=85;FAO=37;FDP=85;FR=.;FRO=48;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=30;FSRR=18;FWDB=-0.0101887;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.194;QD=6.60976;RBI=0.0107593;REFB=-0.0370939;REVB=-0.00345732;RO=47;SAF=20;SAR=17;SRF=29;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0772384;STB=0.548361;TYPE=snp;VARB=0.0511484;OID=.;OPOS=7862556;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:47:48:37:37:17:20:29:18:17:20:30:18 chr6 7862631 . G C 189.16 PASS AO=37;DP=68;FAO=40;FDP=74;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=31;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=0.0136084;FXX=0.0263123;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.198;QD=10.2246;RBI=0.0220253;REFB=-0.016785;REVB=-0.0173184;RO=31;SAF=7;SAR=30;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.25239;STB=0.592993;TYPE=snp;VARB=0.0207667;OID=.;OPOS=7862631;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:74:31:34:37:40:30:7:13:18:31:9:13:21 chr6 7881864 . A C 232.19 PASS AO=80;DP=232;FAO=84;FDP=237;FR=.;FRO=153;FSAF=43;FSAR=41;FSRF=85;FSRR=68;FWDB=-0.0119296;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.487;QD=3.91885;RBI=0.0119886;REFB=0.00310718;REVB=0.00118821;RO=149;SAF=41;SAR=39;SRF=82;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0432753;STB=0.528227;TYPE=snp;VARB=-0.00377427;OID=.;OPOS=7881864;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:237:149:153:80:84:39:41:82:67:41:43:85:68 chr6 7881865 . G C 235.7 PASS AO=80;DP=230;FAO=84;FDP=235;FR=.;FRO=151;FSAF=43;FSAR=41;FSRF=84;FSRR=67;FWDB=0.0036814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.3641;QD=4.01194;RBI=0.0119219;REFB=-0.00117771;REVB=-0.0113393;RO=148;SAF=41;SAR=39;SRF=82;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0474492;STB=0.528569;TYPE=snp;VARB=0.0022871;OID=.;OPOS=7881865;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:230:235:148:151:80:84:39:41:82:66:41:43:84:67 chr6 7881931 . T C 269.54 PASS AO=77;DP=189;FAO=79;FDP=191;FR=.;FRO=112;FSAF=14;FSAR=65;FSRF=25;FSRR=87;FWDB=0.0211881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.4144;QD=5.64481;RBI=0.111558;REFB=-0.00712736;REVB=0.109527;RO=109;SAF=14;SAR=63;SRF=25;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0784408;STB=0.54363;TYPE=snp;VARB=0.014962;OID=.;OPOS=7881931;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:191:109:112:77:79:63:14:25:84:65:14:25:87 chr6 7883073 . C T 231.3 PASS AO=61;DP=139;FAO=61;FDP=138;FR=.;FRO=77;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=42;FSRR=35;FWDB=-0.000545417;FXX=0.00719373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.761;QD=6.70426;RBI=0.000589128;REFB=-0.0300867;REVB=-0.000222695;RO=75;SAF=28;SAR=33;SRF=41;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.086633;STB=0.548157;TYPE=snp;VARB=0.0256547;OID=.;OPOS=7883073;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:138:75:77:61:61:33:28:41:34:33:28:42:35 chr6 7987883 . G C 1277.9 PASS AO=137;DP=140;FAO=138;FDP=140;FR=.;FRO=2;FSAF=55;FSAR=83;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0167825;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=232.048;QD=36.5115;RBI=0.0214202;REFB=-0.070251;REVB=-0.0133106;RO=2;SAF=54;SAR=83;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00302868;STB=0.50151;TYPE=snp;VARB=0.000372123;OID=.;OPOS=7987883;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:140:140:2:2:137:138:83:54:1:1:83:55:1:1 chr6 8015129 . T C 239.78 PASS AO=62;DP=137;FAO=62;FDP=137;FR=.;FRO=75;FSAF=21;FSAR=41;FSRF=26;FSRR=49;FWDB=0.00168163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.104;QD=7.00096;RBI=0.0229296;REFB=-0.00462161;REVB=-0.0228678;RO=73;SAF=21;SAR=41;SRF=26;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0188052;STB=0.504845;TYPE=snp;VARB=0.00578781;OID=.;OPOS=8015129;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:73:75:62:62:41:21:26:47:41:21:26:49 chr6 8428137 . A AAGT 164.22 PASS AO=34;DP=72;FAO=35;FDP=67;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.0054378;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=3;MLLD=190.467;QD=9.80401;RBI=0.0312315;REFB=-0.00325257;REVB=-0.0307545;RO=36;SAF=18;SAR=16;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00150932;STB=0.506822;TYPE=ins;VARB=0.00295808;OID=.;OPOS=8428138;OREF=-;OALT=AGT;OMAPALT=AAGT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:34:72:35:67:32:18:17:16:16:99:36:18:16:19:17 chr6 8430049 . G A 542.19 PASS AO=144;DP=315;FAO=144;FDP=319;FR=.;FRO=175;FSAF=66;FSAR=78;FSRF=80;FSRR=95;FWDB=-0.0395048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.7929;QD=6.79867;RBI=0.0420276;REFB=-0.00501537;REVB=-0.0143417;RO=171;SAF=66;SAR=78;SRF=76;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0137596;STB=0.500658;TYPE=snp;VARB=0.00781949;OID=.;OPOS=8430049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:315:319:171:175:144:144:78:66:76:95:78:66:80:95 chr6 8435454 . T C 544.47 PASS AO=62;DP=159;FAO=90;FDP=159;FR=.,HEALED;FRO=58;FSAF=33;FSAR=57;FSRF=41;FSRR=17;FWDB=0.0122817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.986;QD=13.6972;RBI=0.0351321;REFB=-0.0334687;REVB=-0.0329154;RO=57;SAF=15;SAR=47;SRF=41;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.427522;STB=0.633304;TYPE=snp;VARB=0.0424344;OID=.;OPOS=8435454;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:159:57:58:62:90:47:15:41:16:57:33:41:17 chr6 9705636 . T C 57.93 PASS AO=15;DP=37;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=-0.028942;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.766;QD=6.2628;RBI=0.029271;REFB=-0.00830255;REVB=0.00437648;RO=21;SAF=3;SAR=12;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233587;STB=0.628382;TYPE=snp;VARB=0.0059153;OID=.;OPOS=9705636;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:37:37:21:22:15:15:12:3:8:13:12:3:8:14 chr6 9900599 . T TGAG 396.7 PASS AO=116;DP=293;FAO=118;FDP=285;FR=.;FRO=167;FSAF=81;FSAR=37;FSRF=103;FSRR=64;FWDB=0.0256403;FXX=0.0239718;HRUN=1;LEN=3;MLLD=208.523;QD=5.56769;RBI=0.0258344;REFB=-0.00816696;REVB=0.00316074;RO=167;SAF=80;SAR=36;SRF=103;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0863195;STB=0.545792;TYPE=ins;VARB=0.0135692;OID=.;OPOS=9900600;OREF=-;OALT=GAG;OMAPALT=TGAG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:116:293:118:285:167:81:37:103:64:99:167:80:36:103:64 chr6 10398707 . G A 21.72 PASS AO=8;DP=31;FAO=8;FDP=31;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=0;FSRF=23;FSRR=0;FWDB=-0.0257334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.1168;QD=2.80263;RBI=0.0257334;REFB=-0.0167656;REVB=0;RO=22;SAF=8;SAR=0;SRF=22;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0402389;OID=.;OPOS=10398707;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:31:31:22:23:8:8:0:8:22:0:0:8:23:0 chr6 10439968 . T C 755.45 PASS AO=74;DP=76;FAO=84;FDP=86;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.102002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.56;QD=35.1374;RBI=0.102058;REFB=-0.029716;REVB=-0.00336761;RO=2;SAF=14;SAR=60;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0155095;STB=0.508195;TYPE=snp;VARB=0.00119681;OID=.;OPOS=10439968;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:76:86:2:2:74:84:60:14:0:2:60:24:0:2 chr6 10556872 . C T 246.57 PASS AO=65;DP=147;FAO=65;FDP=146;FR=.;FRO=81;FSAF=21;FSAR=44;FSRF=28;FSRR=53;FWDB=4.20473e-05;FXX=0.0135126;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.106;QD=6.75523;RBI=0.0165237;REFB=-0.0105128;REVB=0.0165237;RO=78;SAF=21;SAR=44;SRF=28;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.039554;STB=0.514186;TYPE=snp;VARB=0.01194;OID=.;OPOS=10556872;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:146:78:81:65:65:44:21:28:50:44:21:28:53 chr6 10587038 . C G 1757.59 PASS AO=181;DP=188;FAO=182;FDP=182;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0500503;FXX=0.042103;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.1796;QD=38.6283;RBI=0.0518938;REFB=0;REVB=0.0137089;RO=0;SAF=85;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000547925;OID=.;OPOS=10587038;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:82:188:182:0:0:181:182:96:85:0:0:97:85:0:0 chr6 10587056 . A G 357.88 PASS AO=84;DP=173;FAO=85;FDP=173;FR=.;FRO=88;FSAF=39;FSAR=46;FSRF=36;FSRR=52;FWDB=-0.0123294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.69;QD=8.27473;RBI=0.0123385;REFB=-0.0140783;REVB=0.000473653;RO=88;SAF=39;SAR=45;SRF=36;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0517206;STB=0.525572;TYPE=snp;VARB=0.0149782;OID=.;OPOS=10587056;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:173:88:88:84:85:45:39:36:52:46:39:36:52 chr6 10729020 . C T 527.15 PASS AO=136;DP=292;FAO=135;FDP=291;FR=.;FRO=156;FSAF=53;FSAR=82;FSRF=63;FSRR=93;FWDB=-0.0338201;FXX=0.00342454;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2017;QD=7.24609;RBI=0.0376878;REFB=-0.0109616;REVB=0.0166306;RO=153;SAF=54;SAR=82;SRF=61;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00163786;STB=0.506307;TYPE=snp;VARB=0.0114952;OID=.;OPOS=10729020;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:292:291:153:156:136:135:82:54:61:92:82:53:63:93 chr6 10753107 . T A 589.2 PASS AO=63;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00196415;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=106.34;QD=36.2583;RBI=0.0887282;REFB=-0.0707552;REVB=0.0887065;RO=0;SAF=40;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510201;TYPE=snp;VARB=0.00101729;OID=.;OPOS=10753107;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:65:65:0:1:63:64:23:40:0:0:24:40:0:1 chr6 10763312 . G A 1024.92 PASS AO=105;DP=105;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0142539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.643;QD=38.3146;RBI=0.0157215;REFB=0;REVB=0.00663267;RO=0;SAF=29;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.12552e-06;OID=.;OPOS=10763312;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:105:107:0:0:105:107:76:29:0:0:77:30:0:0 chr6 10764727 . A G 2313.53 PASS AO=240;DP=240;FAO=240;FDP=240;FR=.;FRO=0;FSAF=126;FSAR=114;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.654;QD=38.5588;RBI=0.0283392;REFB=0;REVB=-0.0265151;RO=0;SAF=126;SAR=114;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.90474e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.21632e-05;OID=.;OPOS=10764727;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:240:240:0:0:240:240:114:126:0:0:114:126:0:0 chr6 10891781 . C T 808.33 PASS AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00958986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.086;QD=38.0389;RBI=0.00974866;REFB=0;REVB=-0.00175241;RO=0;SAF=42;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.2332e-05;OID=.;OPOS=10891781;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:85:85:0:0:85:85:43:42:0:0:43:42:0:0 chr6 10955408 . C T 1791.11 PASS AO=186;DP=193;FAO=192;FDP=192;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00452424;FXX=0.0103087;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.661;QD=37.3148;RBI=0.0614443;REFB=-0.0344972;REVB=0.0612775;RO=5;SAF=99;SAR=87;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00338928;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000609099;OID=.;OPOS=10955408;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:193:192:5:0:186:192:87:99:3:2:89:103:0:0 chr6 10981053 . G A 90.59 PASS AO=25;DP=67;FAO=27;FDP=67;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=-0.00687396;FXX=0.0289813;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.153;QD=5.40846;RBI=0.0107617;REFB=-0.0190238;REVB=-0.00828023;RO=42;SAF=17;SAR=8;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229228;STB=0.632553;TYPE=snp;VARB=0.0246886;OID=.;OPOS=10981053;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:67:67:42:40:25:27:8:17:20:22:9:18:18:22 chr6 11005686 . G A 422.8 PASS AO=107;DP=229;FAO=107;FDP=229;FR=.;FRO=122;FSAF=50;FSAR=57;FSRF=47;FSRR=75;FWDB=0.00945791;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.699;QD=7.38509;RBI=0.038753;REFB=-0.0040728;REVB=-0.0375811;RO=117;SAF=50;SAR=57;SRF=43;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0957256;STB=0.544142;TYPE=snp;VARB=0.00456788;OID=.;OPOS=11005686;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:229:229:117:122:107:107:57:50:43:74:57:50:47:75 chr6 11185257 . A T 1206.71 PASS AO=129;DP=131;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193054;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.1561;QD=36.8462;RBI=0.0302371;REFB=0.000468313;REVB=0.0232719;RO=0;SAF=19;SAR=110;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000250991;OID=.;OPOS=11185257;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:131:131:0:0:129:131:110:19:0:0:110:21:0:0 chr6 11185533 . G A 1758.61 PASS AO=184;DP=184;FAO=184;FDP=184;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00955927;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.791;QD=38.2307;RBI=0.0325892;REFB=0;REVB=0.0311556;RO=0;SAF=79;SAR=105;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.1834e-05;OID=.;OPOS=11185533;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:184:184:0:0:184:184:105:79:0:0:105:79:0:0 chr6 11190626 . A G 2086.64 PASS AO=220;DP=222;FAO=222;FDP=222;FR=.;FRO=0;FSAF=106;FSAR=116;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00492428;FXX=0.00892817;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.702;QD=37.5972;RBI=0.0119998;REFB=0.0183681;REVB=-0.0109429;RO=1;SAF=105;SAR=115;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00412534;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.75323e-05;OID=.;OPOS=11190626;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:222:222:1:0:220:222:115:105:0:1:116:106:0:0 chr6 11192575 . C T 531.39 PASS AO=55;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00323737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.9751;QD=37.9561;RBI=0.0957597;REFB=0;REVB=0.095705;RO=0;SAF=47;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41828e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000416381;OID=.;OPOS=11192575;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:55:56:0:0:55:56:8:47:0:0:9:47:0:0 chr6 11193860 . G A 2308.64 PASS AO=253;DP=261;FAO=255;FDP=261;FR=.;FRO=6;FSAF=111;FSAR=144;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.00374165;FXX=0.00381665;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.151;QD=35.3814;RBI=0.0219202;REFB=-0.139322;REVB=0.0215985;RO=8;SAF=109;SAR=144;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0263297;STB=0.509283;TYPE=snp;VARB=0.000418108;OID=.;OPOS=11193860;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:261:261:8:6:253:255:144:109:7:1:144:111:5:1 chr6 11213832 . T C 738.8 PASS AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0151126;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.464;QD=38.3794;RBI=0.0413153;REFB=0;REVB=0.0384521;RO=0;SAF=38;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5078e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.92266e-05;OID=.;OPOS=11213832;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:78:77:0:0:77:77:39:38:0:0:39:38:0:0 chr6 11576130 . T C 1975.52 PASS AO=217;DP=223;FAO=217;FDP=223;FR=.;FRO=6;FSAF=108;FSAR=109;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=-0.0153931;FXX=0.00446409;HRUN=4;LEN=1;MLLD=73.5258;QD=35.4354;RBI=0.0478816;REFB=-0.164339;REVB=0.0453398;RO=2;SAF=108;SAR=109;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.01037e-05;STB=0.508907;TYPE=snp;VARB=0.00171339;OID=.;OPOS=11576130;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:223:223:2:6:217:217:109:108:1:1:109:108:1:5 chr6 11644302 . T C 307.89 PASS AO=31;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0584704;FXX=0.0294031;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.3599;QD=37.3197;RBI=0.196885;REFB=0;REVB=0.188002;RO=0;SAF=27;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.004004;OID=.;OPOS=11644302;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:33:33:0:0:31:33:4:27:0:0:6:27:0:0 chr6 11644518 . C T 1036.5 PASS AO=107;DP=107;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0562767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.623;QD=38.3887;RBI=0.0568805;REFB=0;REVB=-0.00826592;RO=0;SAF=49;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000248823;OID=.;OPOS=11644518;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:107:108:0:0:107:108:58:49:0:0:58:50:0:0 chr6 12120445 . A G 198.32 PASS AO=44;DP=86;FAO=44;FDP=86;FR=.;FRO=42;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=13;FSRR=29;FWDB=0.0297526;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.018;QD=9.22404;RBI=0.0299206;REFB=-0.00518323;REVB=-0.00316644;RO=42;SAF=17;SAR=27;SRF=13;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0729571;STB=0.540277;TYPE=snp;VARB=0.00698061;OID=.;OPOS=12120445;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:42:42:44:44:27:17:13:29:27:17:13:29 chr6 12120588 . C T 163.68 PASS AO=39;DP=81;FAO=39;FDP=82;FR=.;FRO=43;FSAF=27;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=0.00942955;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.976;QD=7.98433;RBI=0.102706;REFB=0.00914237;REVB=-0.102272;RO=42;SAF=27;SAR=12;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191767;STB=0.614397;TYPE=snp;VARB=-0.00661443;OID=.;OPOS=12120588;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:82:42:43:39:39:12:27:21:21:12:27:21:22 chr6 12122174 . A G 394.29 PASS AO=80;DP=142;FAO=80;FDP=142;FR=.;FRO=62;FSAF=48;FSAR=32;FSRF=26;FSRR=36;FWDB=0.0343549;FXX=0.00699252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.583;QD=11.1068;RBI=0.0392308;REFB=-0.0443644;REVB=0.0189419;RO=60;SAF=48;SAR=32;SRF=26;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132518;STB=0.579525;TYPE=snp;VARB=0.0267157;OID=.;OPOS=12122174;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:60:62:80:80:32:48:26:34:32:48:26:36 chr6 12122645 . A G 1623.29 PASS AO=170;DP=171;FAO=170;FDP=170;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00497684;FXX=0.00584761;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.681;QD=38.195;RBI=0.0176903;REFB=0;REVB=-0.0169758;RO=0;SAF=79;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.4833e-05;OID=.;OPOS=12122645;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:171:170:0:0:170:170:91:79:0:0:91:79:0:0 chr6 12123249 . A G 319.55 PASS AO=67;DP=131;FAO=71;FDP=137;FR=.;FRO=66;FSAF=14;FSAR=57;FSRF=23;FSRR=43;FWDB=0.0512442;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.156;QD=9.33001;RBI=0.0514302;REFB=0.00135101;REVB=-0.00436968;RO=64;SAF=10;SAR=57;SRF=21;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.248429;STB=0.600995;TYPE=snp;VARB=-0.000681424;OID=.;OPOS=12123249;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:137:64:66:67:71:57:10:21:43:57:14:23:43 chr6 12124855 . G A 315.69 PASS AO=71;DP=139;FAO=71;FDP=139;FR=.;FRO=68;FSAF=34;FSAR=37;FSRF=37;FSRR=31;FWDB=0.0135523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.636;QD=9.08466;RBI=0.0157743;REFB=-0.0156488;REVB=0.00807254;RO=66;SAF=34;SAR=37;SRF=35;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0450685;STB=0.53188;TYPE=snp;VARB=0.0161286;OID=.;OPOS=12124855;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:66:68:71:71:37:34:35:31:37:34:37:31 chr6 12125772 . A G 320.88 PASS AO=76;DP=160;FAO=77;FDP=159;FR=.;FRO=82;FSAF=43;FSAR=34;FSRF=35;FSRR=47;FWDB=-0.0116384;FXX=0.00624961;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.247;QD=8.07251;RBI=0.0292451;REFB=-0.000223221;REVB=-0.0268295;RO=81;SAF=43;SAR=33;SRF=34;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136107;STB=0.567709;TYPE=snp;VARB=9.43524e-05;OID=.;OPOS=12125772;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:159:81:82:76:77:33:43:34:47:34:43:35:47 chr6 12294258 . A G 1090.66 PASS AO=142;DP=169;FAO=142;FDP=167;FR=.;FRO=25;FSAF=82;FSAR=60;FSRF=2;FSRR=23;FWDB=-0.0120562;FXX=0.0118336;HRUN=4;LEN=1;MLLD=224.221;QD=26.1235;RBI=0.0287059;REFB=0.0189711;REVB=-0.0260515;RO=24;SAF=82;SAR=60;SRF=1;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146313;STB=0.574529;TYPE=snp;VARB=-0.00276081;OID=.;OPOS=12294258;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:169:167:24:25:142:142:60:82:1:23:60:82:2:23 chr6 13288648 . A G 566.96 PASS AO=56;DP=57;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0318506;FXX=0.0322529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.731;QD=37.7975;RBI=0.0349726;REFB=0;REVB=0.0144437;RO=0;SAF=21;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00013479;OID=.;OPOS=13288648;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:57:60:0:0:56:60:35:21:0:0:38:22:0:0 chr6 13288669 . C T 92.38 PASS AO=24;DP=55;FAO=25;FDP=60;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=25;FWDB=0.0238614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.7573;QD=6.15864;RBI=0.0254354;REFB=-0.0014294;REVB=0.00880885;RO=31;SAF=9;SAR=15;SRF=9;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0922508;STB=0.548254;TYPE=snp;VARB=0.00600972;OID=.;OPOS=13288669;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:55:60:31:35:24:25:15:9:9:22:16:9:10:25 chr6 13288679 . GCT G 61.68 PASS AO=19;DP=55;FAO=19;FDP=53;FR=.;FRO=34;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=26;FWDB=0.014697;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=2;MLLD=182.586;QD=4.6553;RBI=0.0768318;REFB=-0.0312596;REVB=-0.075413;RO=31;SAF=4;SAR=15;SRF=7;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0240844;STB=0.523231;TYPE=del;VARB=0.0543106;OID=.;OPOS=13288680;OREF=CT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:19:54:19:53:34:4:15:8:26:61:31:4:15:7:24 chr6 13295502 . T C 1623.15 PASS AO=169;DP=169;FAO=170;FDP=170;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0646948;FXX=0.0116272;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.36;QD=38.1918;RBI=0.0687245;REFB=0;REVB=0.0231871;RO=0;SAF=92;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.98145e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000135385;OID=.;OPOS=13295502;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:169:170:0:0:169:170:77:92:0:0:79:91:0:0 chr6 13295515 . A C 1536.18 PASS AO=147;DP=151;FAO=164;FDP=164;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0551783;FXX=0.00606024;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.269;QD=37.4679;RBI=0.0607874;REFB=0;REVB=-0.025504;RO=0;SAF=67;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000104702;OID=.;OPOS=13295515;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:151:164:0:0:147:164:80:67:0:0:81:83:0:0 chr6 13295536 . C T 1410.83 PASS AO=154;DP=156;FAO=153;FDP=155;FR=.;FRO=2;FSAF=76;FSAR=77;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0729963;FXX=0.00640985;HRUN=4;LEN=1;MLLD=49.5714;QD=36.4085;RBI=0.0806343;REFB=-0.106503;REVB=0.0342555;RO=1;SAF=77;SAR=77;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00613824;STB=0.500042;TYPE=snp;VARB=0.00174831;OID=.;OPOS=13295536;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:156:155:1:2:154:153:77:77:0:1:77:76:1:1 chr6 13321097 . G A 1406.53 PASS AO=151;DP=153;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013098;FXX=0.00653552;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.991;QD=37.0138;RBI=0.0141013;REFB=-0.108463;REVB=0.00522399;RO=1;SAF=52;SAR=99;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00478091;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000142783;OID=.;OPOS=13321097;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:153:152:1:0:151:152:99:52:0:1:100:52:0:0 chr6 13361088 . A G 141.38 PASS AO=46;DP=124;FAO=46;FDP=124;FR=.;FRO=78;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=35;FSRR=43;FWDB=0.00342953;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.29;QD=4.56062;RBI=0.03119;REFB=-0.0104208;REVB=-0.0310009;RO=78;SAF=19;SAR=27;SRF=35;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0402352;STB=0.522945;TYPE=snp;VARB=0.0211967;OID=.;OPOS=13361088;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:78:78:46:46:27:19:35:43:27:19:35:43 chr6 13470113 . A T 1323.67 PASS AO=138;DP=138;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00177486;FXX=0.0141834;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.5335;QD=38.0913;RBI=0.00201109;REFB=0;REVB=0.000945691;RO=0;SAF=94;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000286745;OID=.;OPOS=13470113;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:138:139:0:0:138:139:44:94:0:0:45:94:0:0 chr6 13547958 . C T 645.49 PASS AO=67;DP=69;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0559441;FXX=0.0289813;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.4856;QD=38.5364;RBI=0.0616;REFB=0;REVB=-0.0257839;RO=0;SAF=59;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000188565;OID=.;OPOS=13547958;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:69:67:0:0:67:67:8:59:0:0:8:59:0:0 chr6 13548165 . A G 471.97 PASS AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0220984;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.666;QD=38.5285;RBI=0.027342;REFB=0;REVB=-0.016101;RO=0;SAF=19;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.48867e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.51076e-05;OID=.;OPOS=13548165;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:49:49:0:0:49:49:30:19:0:0:30:19:0:0 chr6 13599303 . C T 367.73 PASS AO=82;DP=160;FAO=82;FDP=159;FR=.;FRO=77;FSAF=32;FSAR=50;FSRF=33;FSRR=44;FWDB=0.0305553;FXX=0.00624961;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.715;QD=9.25106;RBI=0.032559;REFB=-0.00707752;REVB=0.0112454;RO=76;SAF=32;SAR=50;SRF=33;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0400698;STB=0.519331;TYPE=snp;VARB=0.00713651;OID=.;OPOS=13599303;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:159:76:77:82:82:50:32:33:43:50:32:33:44 chr6 13659079 . T G 19.99 PASS AO=16;DP=69;FAO=16;FDP=76;FR=.;FRO=60;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=35;FSRR=25;FWDB=-0.0102649;FXX=0.0129853;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.6228;QD=1.0523;RBI=0.0825099;REFB=-0.00840891;REVB=-0.0818689;RO=40;SAF=11;SAR=5;SRF=31;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128953;STB=0.58917;TYPE=snp;VARB=0.103062;OID=.;OPOS=13659079;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:69:76:40:60:16:16:5:11:31:9:5:11:35:25 chr6 13711279 . A G 92.75 PASS AO=21;DP=49;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=0.0185975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.5169;QD=7.13458;RBI=0.0338129;REFB=-0.0205362;REVB=-0.028239;RO=27;SAF=7;SAR=14;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.291933;STB=0.644614;TYPE=snp;VARB=0.0149791;OID=.;OPOS=13711279;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:49:52:27:29:21:23:14:7:17:10:14:9:19:10 chr6 13794110 . C A 207.62 PASS AO=58;DP=137;FAO=58;FDP=137;FR=.;FRO=79;FSAF=23;FSAR=35;FSRF=42;FSRR=37;FWDB=-0.0113423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.658;QD=6.0619;RBI=0.0157312;REFB=-0.00379161;REVB=-0.0109005;RO=78;SAF=23;SAR=35;SRF=42;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146479;STB=0.578706;TYPE=snp;VARB=0.00593777;OID=.;OPOS=13794110;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:78:79:58:58:35:23:42:36:35:23:42:37 chr6 13977698 . C T 388.05 PASS AO=85;DP=174;FAO=90;FDP=180;FR=.;FRO=90;FSAF=38;FSAR=52;FSRF=49;FSRR=41;FWDB=0.0310567;FXX=0.00552456;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.8158;QD=8.62322;RBI=0.0504888;REFB=-0.00599654;REVB=-0.039807;RO=89;SAF=38;SAR=47;SRF=49;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0960235;STB=0.561416;TYPE=snp;VARB=0.00364254;OID=.;OPOS=13977698;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:180:89:90:85:90:47:38:49:40:52:38:49:41 chr6 13978275 . A C 838.12 PASS AO=183;DP=349;FAO=187;FDP=353;FR=.;FRO=166;FSAF=97;FSAR=90;FSRF=69;FSRR=97;FWDB=0.0104946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.1057;QD=9.49713;RBI=0.0186703;REFB=-0.0127749;REVB=0.0154416;RO=162;SAF=95;SAR=88;SRF=66;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0960493;STB=0.548349;TYPE=snp;VARB=0.0194281;OID=.;OPOS=13978275;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:349:353:162:166:183:187:88:95:66:96:90:97:69:97 chr6 13978618 . C G 175.34 PASS AO=48;DP=112;FAO=48;FDP=113;FR=.;FRO=65;FSAF=33;FSAR=15;FSRF=41;FSRR=24;FWDB=0.015496;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=177.481;QD=6.20658;RBI=0.0207714;REFB=-0.0249736;REVB=-0.013832;RO=61;SAF=33;SAR=15;SRF=37;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0902547;STB=0.536905;TYPE=snp;VARB=0.0281716;OID=.;OPOS=13978618;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:113:61:65:48:48:15:33:37:24:15:33:41:24 chr6 13978802 . TCTC T 103.11 PASS AO=39;DP=146;FAO=42;FDP=133;FR=.;FRO=91;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=43;FSRR=48;FWDB=-0.0233724;FXX=0.0220572;HRUN=1;LEN=3;MLLD=225.217;QD=3.10113;RBI=0.0235851;REFB=-0.0166784;REVB=-0.00316039;RO=88;SAF=23;SAR=16;SRF=41;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146994;STB=0.601108;TYPE=del;VARB=0.0416064;OID=.;OPOS=13978803;OREF=CTC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:39:133:42:133:91:26:16:43:48:99:88:23:16:41:47 chr6 13978837 . G T 117.58 PASS AO=43;DP=130;FAO=44;FDP=131;FR=.;FRO=87;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=40;FSRR=47;FWDB=-0.0258074;FXX=0.0150365;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.213;QD=3.59016;RBI=0.026961;REFB=0.00560458;REVB=0.00780224;RO=87;SAF=20;SAR=23;SRF=40;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00622187;STB=0.503495;TYPE=snp;VARB=-0.0159412;OID=.;OPOS=13978837;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:131:87:87:43:44:23:20:40:47:24:20:40:47 chr6 14646772 . A G 117.51 PASS AO=34;DP=85;FAO=34;FDP=85;FR=.;FRO=51;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=22;FWDB=0.039451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8543;QD=5.52997;RBI=0.0406039;REFB=-0.017097;REVB=0.00960686;RO=51;SAF=19;SAR=15;SRF=29;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0105051;STB=0.50597;TYPE=snp;VARB=0.0320852;OID=.;OPOS=14646772;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:51:51:34:34:15:19:29:22:15:19:29:22 chr6 15513482 . G A 283.44 PASS AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0182815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.6308;QD=34.3561;RBI=0.0580181;REFB=-0.140746;REVB=0.0550625;RO=1;SAF=15;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0301077;STB=0.516119;TYPE=snp;VARB=0.0056247;OID=.;OPOS=15513482;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:33:33:1:1:32:32:17:15:1:0:17:15:1:0 chr6 15520967 . C T 271.86 PASS AO=59;DP=119;FAO=63;FDP=124;FR=.;FRO=61;FSAF=53;FSAR=10;FSRF=50;FSRR=11;FWDB=0.00405563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.9835;QD=8.76976;RBI=0.0166124;REFB=-0.0275969;REVB=-0.0161098;RO=57;SAF=49;SAR=10;SRF=46;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0361002;STB=0.519359;TYPE=snp;VARB=0.0297845;OID=.;OPOS=15520967;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:124:57:61:59:63:10:49:46:11:10:53:50:11 chr6 15586009 . G T 1635.58 PASS AO=173;DP=174;FAO=173;FDP=173;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0420231;FXX=0.0057468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.313;QD=37.817;RBI=0.0420249;REFB=-0.0593038;REVB=0.000393094;RO=1;SAF=85;SAR=88;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00556709;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000118875;OID=.;OPOS=15586009;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:174:173:1:0:173:173:88:85:1:0:88:85:0:0 chr6 15663118 . T C 25.99 PASS AO=5;DP=13;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0.076864;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.281;QD=8.664;RBI=0.0201036;REFB=-0.00697769;REVB=-0.0201036;RO=8;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00689164;OID=.;OPOS=15663118;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:13:12:8:7:5:5:5:0:0:8:5:0:0:7 chr6 16145334 . GC G 608.89 PASS AO=74;DP=133;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0433399;FXX=0.0166653;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.7889;QD=20.6405;RBI=0.381669;REFB=-0.0124492;REVB=0.379201;RO=30;SAF=32;SAR=42;SRF=6;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0.365741;SSSB=0.129806;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0193109;OID=.;OPOS=16145335;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:74:120:118:118:0:49:69:0:0:42:30:32:42:6:24 chr6 16306751 . G A 128.95 PASS AO=26;DP=47;FAO=26;FDP=48;FR=.;FRO=22;FSAF=2;FSAR=24;FSRF=4;FSRR=18;FWDB=-0.00781521;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.4564;QD=10.7456;RBI=0.0320069;REFB=-0.0360434;REVB=0.0310381;RO=20;SAF=2;SAR=24;SRF=3;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166869;STB=0.631457;TYPE=snp;VARB=0.0507086;OID=.;OPOS=16306751;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:47:48:20:22:26:26:24:2:3:17:24:2:4:18 chr6 16327031 . GC G 31.91 PASS AO=6;DP=21;FAO=10;FDP=17;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.156863;FXX=0.0555247;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.9268;QD=7.50803;RBI=0.180878;REFB=-0.148379;REVB=-0.0900606;RO=9;SAF=5;SAR=1;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.33738;STB=0.620002;TYPE=del;VARB=0.132447;OID=.;OPOS=16327032;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:6:18:10:17:7:7:3:3:4:17:9:5:1:5:4 chr6 16327615 . A G 107.82 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0411841;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.355;QD=35.9384;RBI=0.0432369;REFB=0;REVB=0.0131642;RO=0;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000689169;OID=.;OPOS=16327615;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:6:6:0:0:6:6:0:0 chr6 17629616 . G A 1369.58 PASS AO=144;DP=146;FAO=145;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139971;FXX=0.00684885;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.925;QD=37.7816;RBI=0.0171112;REFB=0.0348336;REVB=0.00984258;RO=1;SAF=72;SAR=72;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00655917;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.37053e-05;OID=.;OPOS=17629616;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:146:145:1:0:144:145:72:72:0:1:72:73:0:0 chr6 17633033 . G C 815.65 PASS AO=89;DP=91;FAO=89;FDP=91;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.022165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.089;QD=35.8527;RBI=0.0228967;REFB=-0.201785;REVB=-0.00574224;RO=0;SAF=26;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18583e-08;STB=0.507811;TYPE=snp;VARB=0.00100155;OID=.;OPOS=17633033;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:91:91:0:2:89:89:63:26:0:0:63:26:0:2 chr6 17633061 . C T 680.13 PASS AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.101388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.211;QD=37.7848;RBI=0.101909;REFB=0;REVB=0.0102951;RO=0;SAF=20;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000288685;OID=.;OPOS=17633061;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:72:72:0:0:72:72:52:20:0:0:52:20:0:0 chr6 17688798 . G A 1632.74 PASS AO=164;DP=167;FAO=170;FDP=170;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00390845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.485;QD=38.4173;RBI=0.00763421;REFB=0;REVB=-0.00655783;RO=0;SAF=69;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.88292e-06;OID=.;OPOS=17688798;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:167:170:0:0:164:170:95:69:0:0:98:72:0:0 chr6 17794494 . G A 541.04 PASS AO=103;DP=297;FAO=149;FDP=332;FR=.,HEALED;FRO=182;FSAF=73;FSAR=76;FSRF=82;FSRR=100;FWDB=0.00291545;FXX=0.017751;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.297;QD=6.51853;RBI=0.0111072;REFB=-0.0438748;REVB=0.0107177;RO=131;SAF=31;SAR=72;SRF=38;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0131276;STB=0.52168;TYPE=snp;VARB=0.0465111;OID=.;OPOS=17794494;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:290:332:131:182:103:149:72:31:38:93:76:73:82:100 chr6 17799575 . A G 251.67 PASS AO=65;DP=152;FAO=67;FDP=152;FR=.;FRO=85;FSAF=46;FSAR=21;FSRF=46;FSRR=39;FWDB=0.0137475;FXX=0.00653552;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.044;QD=6.62288;RBI=0.01461;REFB=-0.0096212;REVB=-0.00494564;RO=84;SAF=44;SAR=21;SRF=45;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152583;STB=0.588208;TYPE=snp;VARB=0.0138079;OID=.;OPOS=17799575;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:152:84:85:65:67:21:44:45:39:21:46:46:39 chr6 17831419 . G A 433.74 PASS AO=88;DP=159;FAO=89;FDP=160;FR=.;FRO=71;FSAF=25;FSAR=64;FSRF=32;FSRR=39;FWDB=-0.0384551;FXX=0.0123449;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.4956;QD=10.8435;RBI=0.0384636;REFB=-0.00209195;REVB=0.000806385;RO=69;SAF=25;SAR=63;SRF=31;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151372;STB=0.586192;TYPE=snp;VARB=0.0011753;OID=.;OPOS=17831419;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:160:69:71:88:89:63:25:31:38:64:25:32:39 chr6 17834198 . T G 139.24 PASS AO=56;DP=175;FAO=56;FDP=174;FR=.;FRO=118;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=55;FSRR=63;FWDB=0.00483886;FXX=0.00571396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.107;QD=3.20079;RBI=0.0244784;REFB=-0.0202947;REVB=0.0239954;RO=118;SAF=32;SAR=24;SRF=55;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123596;STB=0.571403;TYPE=snp;VARB=0.048025;OID=.;OPOS=17834198;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:174:118:118:56:56:24:32:55:63:24:32:55:63 chr6 17834213 . T C 198.18 PASS AO=69;DP=192;FAO=69;FDP=192;FR=.;FRO=123;FSAF=42;FSAR=27;FSRF=56;FSRR=67;FWDB=-0.0702454;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=49.087;QD=4.12879;RBI=0.0865044;REFB=0.0112917;REVB=-0.0504837;RO=122;SAF=42;SAR=27;SRF=56;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168931;STB=0.598697;TYPE=snp;VARB=-0.0200612;OID=.;OPOS=17834213;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:192:122:123:69:69:27:42:56:66:27:42:56:67 chr6 17837152 . C T 681.52 PASS AO=173;DP=367;FAO=173;FDP=367;FR=.;FRO=194;FSAF=74;FSAR=99;FSRF=95;FSRR=99;FWDB=-0.0282044;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=132.979;QD=7.42801;RBI=0.0387867;REFB=-0.0166987;REVB=0.0266256;RO=192;SAF=74;SAR=99;SRF=93;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0547758;STB=0.533119;TYPE=snp;VARB=0.0173994;OID=.;OPOS=17837152;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:367:367:192:194:173:173:99:74:93:99:99:74:95:99 chr6 18122506 . G A 53.99 PASS AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00395301;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=185.511;QD=23.9971;RBI=0.03237;REFB=-0.178655;REVB=0.0321277;RO=1;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0796435;STB=0.55539;TYPE=snp;VARB=0.00615023;OID=.;OPOS=18122506;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:9:9:1:2:7:7:5:2:0:1:5:2:1:1 chr6 18134021 . C A 214.43 PASS AO=42;DP=43;FAO=37;FDP=48;FR=.;FRO=11;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.0290312;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=71.9265;QD=17.8693;RBI=0.0299939;REFB=-0.0110962;REVB=0.00753809;RO=1;SAF=22;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208598;STB=0.561134;TYPE=snp;VARB=0.00777281;OID=.;OPOS=18134021;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:43:48:1:11:42:37:20:22:1:0:20:17:8:3 chr6 18134022 . C A 27.4 PASS AO=13;DP=48;FAO=12;FDP=48;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.0227559;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=33.834;QD=2.28296;RBI=0.0295717;REFB=-0.0425661;REVB=0.0188853;RO=35;SAF=10;SAR=3;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.411849;STB=0.733645;TYPE=snp;VARB=0.0144861;OID=.;OPOS=18134022;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:48:48:35:36:13:12:3:10:15:20:3:9:16:20 chr6 18139214 . G A 989.29 PASS AO=104;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00590458;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.834;QD=38.0498;RBI=0.0251245;REFB=0;REVB=-0.0244208;RO=0;SAF=46;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.15202e-05;OID=.;OPOS=18139214;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:104:104:0:0:104:104:58:46:0:0:58:46:0:0 chr6 18213988 . C T 679.14 PASS AO=201;DP=453;FAO=181;FDP=400;FR=.;FRO=219;FSAF=72;FSAR=109;FSRF=83;FSRR=136;FWDB=-0.0450364;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.194;QD=6.79143;RBI=0.0451161;REFB=0.00616443;REVB=0.00267986;RO=252;SAF=78;SAR=123;SRF=92;SRR=160;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0244885;STB=0.510785;TYPE=snp;VARB=-0.00776234;OID=.;OPOS=18213988;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:453:400:252:219:201:181:123:78:92:160:109:72:83:136 chr6 18215303 . T C 2367.62 PASS AO=221;DP=224;FAO=249;FDP=249;FR=.;FRO=0;FSAF=102;FSAR=147;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0335579;FXX=0.0119043;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.768;QD=38.0341;RBI=0.0805342;REFB=0;REVB=0.0732095;RO=0;SAF=101;SAR=120;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.49617e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00010497;OID=.;OPOS=18215303;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:224:249:0:0:221:249:120:101:0:0:147:102:0:0 chr6 18237661 . C T 392.89 PASS AO=97;DP=236;FAO=109;FDP=246;FR=.;FRO=137;FSAF=66;FSAR=43;FSRF=69;FSRR=68;FWDB=0.00857694;FXX=0.0159994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.969;QD=6.38847;RBI=0.00909522;REFB=-0.0106337;REVB=0.00302639;RO=139;SAF=58;SAR=39;SRF=69;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108396;STB=0.557906;TYPE=snp;VARB=0.0123864;OID=.;OPOS=18237661;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:236:246:139:137:97:109:39:58:69:70:43:66:69:68 chr6 18466677 . A T 1078.94 PASS AO=147;DP=174;FAO=146;FDP=174;FR=.;FRO=28;FSAF=66;FSAR=80;FSRF=22;FSRR=6;FWDB=0.0418991;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.5682;QD=24.8032;RBI=0.0675295;REFB=-0.0265815;REVB=0.0529594;RO=24;SAF=67;SAR=80;SRF=21;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110912;STB=0.553626;TYPE=snp;VARB=0.0580126;OID=.;OPOS=18466677;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:174:174:24:28:147:146:80:67:21:3:80:66:22:6 chr6 20282269 . T C 283.63 PASS AO=27;DP=28;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00246611;FXX=0.0294031;HRUN=4;LEN=1;MLLD=214.649;QD=34.3797;RBI=0.0232736;REFB=-0.0300009;REVB=0.0231426;RO=1;SAF=19;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0545937;STB=0.521725;TYPE=snp;VARB=7.49434e-05;OID=.;OPOS=20282269;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:28:33:1:1:27:32:8:19:0:1:11:21:0:1 chr6 20492995 . T C 470.39 PASS AO=117;DP=249;FAO=118;FDP=251;FR=.;FRO=133;FSAF=70;FSAR=48;FSRF=62;FSRR=71;FWDB=-0.00817773;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.602;QD=7.49623;RBI=0.0105599;REFB=-0.00948133;REVB=0.00668102;RO=130;SAF=70;SAR=47;SRF=61;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124561;STB=0.567969;TYPE=snp;VARB=0.00910572;OID=.;OPOS=20492995;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:249:251:130:133:117:118:47:70:61:69:48:70:62:71 chr6 20500458 . G A 153.1 PASS AO=40;DP=94;FAO=41;FDP=95;FR=.;FRO=54;FSAF=27;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=31;FWDB=0.0106403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.341;QD=6.44629;RBI=0.0273259;REFB=-0.00900588;REVB=0.0251692;RO=53;SAF=27;SAR=13;SRF=22;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.26766;STB=0.634398;TYPE=snp;VARB=0.00945818;OID=.;OPOS=20500458;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:95:53:54:40:41:13:27:22:31:14:27:23:31 chr6 22136879 . G T 106.25 PASS AO=44;DP=166;FAO=51;FDP=170;FR=.;FRO=119;FSAF=32;FSAR=19;FSRF=63;FSRR=56;FWDB=0.00317536;FXX=0.0116272;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.877;QD=2.50002;RBI=0.0190598;REFB=-0.00907872;REVB=-0.0187934;RO=121;SAF=29;SAR=15;SRF=65;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156693;STB=0.570721;TYPE=snp;VARB=0.0192752;OID=.;OPOS=22136879;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:170:121:119:44:51:15:29:65:56:19:32:63:56 chr6 24147483 . A G 231.95 PASS AO=58;DP=129;FAO=58;FDP=126;FR=.;FRO=68;FSAF=17;FSAR=41;FSRF=38;FSRR=30;FWDB=0.0407785;FXX=0.023254;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.494;QD=7.36341;RBI=0.0411037;REFB=-0.0289064;REVB=-0.00516044;RO=68;SAF=17;SAR=41;SRF=38;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.270976;STB=0.651303;TYPE=snp;VARB=0.0202343;OID=.;OPOS=24147483;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:126:68:68:58:58:41:17:38:30:41:17:38:30 chr6 24174955 . G C 520.48 PASS AO=127;DP=263;FAO=127;FDP=262;FR=.;FRO=135;FSAF=75;FSAR=52;FSRF=89;FSRR=46;FWDB=0.00900199;FXX=0.00380214;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.8775;QD=7.94628;RBI=0.0106879;REFB=-0.0221505;REVB=0.00576151;RO=130;SAF=75;SAR=52;SRF=84;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0535775;STB=0.53709;TYPE=snp;VARB=0.0254504;OID=.;OPOS=24174955;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:263:262:130:135:127:127:52:75:84:46:52:75:89:46 chr6 24291203 . T C 1522.35 PASS AO=161;DP=165;FAO=166;FDP=166;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.04809;FXX=0.00598767;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.9853;QD=36.6831;RBI=0.0664933;REFB=-0.056821;REVB=0.0459208;RO=4;SAF=79;SAR=82;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0234786;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00128453;OID=.;OPOS=24291203;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:165:166:4:0:161:166:82:79:4:0:82:84:0:0 chr6 24418348 . G A 1343.07 PASS AO=141;DP=141;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00525578;FXX=0.00694396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.309;QD=37.5683;RBI=0.0059699;REFB=0.0168252;REVB=0.00283134;RO=0;SAF=103;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.39577e-05;OID=.;OPOS=24418348;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:141:143:0:0:141:143:38:103:0:0:40:103:0:0 chr6 24437445 . G A 726.87 PASS AO=79;DP=82;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0431594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.439;QD=35.4573;RBI=0.060859;REFB=-0.109843;REVB=0.0429079;RO=2;SAF=45;SAR=34;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00331574;STB=0.507041;TYPE=snp;VARB=0.000952226;OID=.;OPOS=24437445;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:82:82:2:1:79:81:34:45:1:1:35:46:0:1 chr6 24437458 . T C 784.43 PASS AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.5192;QD=37.8036;RBI=0.0274759;REFB=0;REVB=0.0155626;RO=0;SAF=46;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.12122e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000280646;OID=.;OPOS=24437458;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:83:83:0:0:83:83:37:46:0:0:37:46:0:0 chr6 24588884 . C T 1575.36 PASS AO=164;DP=170;FAO=165;FDP=165;FR=.;FRO=0;FSAF=125;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226611;FXX=0.0350857;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.0447;QD=38.1906;RBI=0.0256076;REFB=0;REVB=0.0119259;RO=0;SAF=124;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.85931e-05;OID=.;OPOS=24588884;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:170:165:0:0:164:165:40:124:0:0:40:125:0:0 chr6 24596478 . T G 930.06 PASS AO=95;DP=95;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00702655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.0748;QD=37.9614;RBI=0.0185318;REFB=0;REVB=0.0171481;RO=0;SAF=61;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.04002e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000125863;OID=.;OPOS=24596478;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:95:98:0:0:95:98:34:61:0:0:35:63:0:0 chr6 24804808 . G C 3058.17 PASS AO=317;DP=320;FAO=319;FDP=319;FR=.;FRO=0;FSAF=146;FSAR=173;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0422598;FXX=0.0123835;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1673;QD=38.347;RBI=0.0517867;REFB=0;REVB=0.0299329;RO=0;SAF=146;SAR=171;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40504e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000159348;OID=.;OPOS=24804808;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:320:319:0:0:317:319:171:146:0:0:173:146:0:0 chr6 24804860 . G T 3478 PASS AO=363;DP=363;FAO=363;FDP=363;FR=.;FRO=0;FSAF=165;FSAR=198;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00858043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.283;QD=38.3251;RBI=0.0211265;REFB=0;REVB=0.0193055;RO=0;SAF=165;SAR=198;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.20891e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.80466e-05;OID=.;OPOS=24804860;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:363:363:0:0:363:363:198:165:0:0:198:165:0:0 chr6 24818785 . A G 776.55 PASS AO=80;DP=80;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120596;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.467;QD=37.8805;RBI=0.0284757;REFB=0;REVB=-0.025796;RO=0;SAF=24;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.87206e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.58454e-05;OID=.;OPOS=24818785;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:80:82:0:0:80:82:56:24:0:0:57:25:0:0 chr6 24825511 . A G 1956.19 PASS AO=203;DP=205;FAO=204;FDP=204;FR=.;FRO=0;FSAF=114;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0240528;FXX=0.00970827;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.6098;QD=38.3567;RBI=0.0241994;REFB=0;REVB=-0.00265972;RO=0;SAF=113;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.16276e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000282761;OID=.;OPOS=24825511;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:92:205:204:0:0:203:204:90:113:0:0:90:114:0:0 chr6 24869300 . T C 264.2 PASS AO=67;DP=147;FAO=68;FDP=147;FR=.;FRO=79;FSAF=31;FSAR=37;FSRF=40;FSRR=39;FWDB=-0.0125032;FXX=0.0067563;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.914;QD=7.18915;RBI=0.0137682;REFB=-0.0131875;REVB=-0.0057648;RO=77;SAF=31;SAR=36;SRF=38;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0297858;STB=0.527184;TYPE=snp;VARB=0.0124437;OID=.;OPOS=24869300;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:147:77:79:67:68:36:31:38:39:37:31:40:39 chr6 25082105 . T C 217.2 PASS AO=62;DP=149;FAO=62;FDP=149;FR=.;FRO=87;FSAF=25;FSAR=37;FSRF=46;FSRR=41;FWDB=-0.0269902;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.6369;QD=5.83097;RBI=0.0293784;REFB=-0.0117819;REVB=-0.0116025;RO=87;SAF=25;SAR=37;SRF=46;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131683;STB=0.573933;TYPE=snp;VARB=0.0259748;OID=.;OPOS=25082105;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:87:87:62:62:37:25:46:41:37:25:46:41 chr6 25084718 . A G 2193.78 PASS AO=228;DP=229;FAO=228;FDP=228;FR=.;FRO=0;FSAF=115;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0321053;FXX=0.00436662;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.5571;QD=38.4873;RBI=0.0324125;REFB=0;REVB=-0.00445166;RO=0;SAF=115;SAR=113;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.63979e-05;OID=.;OPOS=25084718;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:229:228:0:0:228:228:113:115:0:0:113:115:0:0 chr6 25106745 . A G 283.91 PASS AO=77;DP=177;FAO=77;FDP=176;FR=.;FRO=99;FSAF=50;FSAR=27;FSRF=46;FSRR=53;FWDB=0.0166603;FXX=0.0056494;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.58;QD=6.45247;RBI=0.0174538;REFB=-0.0132316;REVB=0.00520273;RO=97;SAF=50;SAR=27;SRF=44;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200485;STB=0.606768;TYPE=snp;VARB=0.0157394;OID=.;OPOS=25106745;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:176:97:99:77:77:27:50:44:53:27:50:46:53 chr6 25106783 . G A 195.17 PASS AO=49;DP=108;FAO=49;FDP=108;FR=.;FRO=59;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=22;FSRR=37;FWDB=-0.0625444;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.2132;QD=7.22835;RBI=0.0630112;REFB=-0.0237634;REVB=0.00765581;RO=57;SAF=24;SAR=25;SRF=21;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117683;STB=0.564038;TYPE=snp;VARB=0.0176292;OID=.;OPOS=25106783;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:57:59:49:49:25:24:21:36:25:24:22:37 chr6 25383843 . T C 134.95 PASS AO=44;DP=121;FAO=44;FDP=121;FR=.;FRO=77;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=42;FSRR=35;FWDB=0.00584792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.066;QD=4.46129;RBI=0.0100708;REFB=-0.0031917;REVB=-0.00819898;RO=77;SAF=20;SAR=24;SRF=42;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100991;STB=0.557695;TYPE=snp;VARB=0.00656273;OID=.;OPOS=25383843;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:77:77:44:44:24:20:42:35:24:20:42:35 chr6 25383897 . T A 95 PASS AO=34;DP=100;FAO=34;FDP=101;FR=.;FRO=67;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=42;FSRR=25;FWDB=0.0253167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.3784;QD=3.76225;RBI=0.0263655;REFB=-0.00332603;REVB=0.00736245;RO=66;SAF=10;SAR=24;SRF=41;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.37038;STB=0.71794;TYPE=snp;VARB=0.00725013;OID=.;OPOS=25383897;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:100:101:66:67:34:34:24:10:41:25:24:10:42:25 chr6 25420344 . C G 1296.06 PASS AO=141;DP=144;FAO=141;FDP=144;FR=.;FRO=3;FSAF=68;FSAR=73;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00125128;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.408;QD=36.0015;RBI=0.0138131;REFB=-0.0852838;REVB=0.0137564;RO=3;SAF=68;SAR=73;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0073091;STB=0.503845;TYPE=snp;VARB=0.00166248;OID=.;OPOS=25420344;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:144:144:3:3:141:141:73:68:2:1:73:68:2:1 chr6 25420350 . A C 307.55 PASS AO=72;DP=149;FAO=73;FDP=150;FR=.;FRO=77;FSAF=31;FSAR=42;FSRF=43;FSRR=34;FWDB=0.0315203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.869;QD=8.20121;RBI=0.0323812;REFB=-0.0249467;REVB=-0.0074172;RO=75;SAF=31;SAR=41;SRF=41;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107586;STB=0.568795;TYPE=snp;VARB=0.0190214;OID=.;OPOS=25420350;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:150:75:77:72:73:41:31:41:34:42:31:43:34 chr6 25492208 . A G 565.14 PASS AO=128;DP=248;FAO=128;FDP=248;FR=.;FRO=120;FSAF=52;FSAR=76;FSRF=42;FSRR=78;FWDB=-0.011152;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.234;QD=9.11516;RBI=0.0149253;REFB=-0.0201209;REVB=0.00991953;RO=119;SAF=52;SAR=76;SRF=42;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0492032;STB=0.528507;TYPE=snp;VARB=0.0186701;OID=.;OPOS=25492208;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:248:248:119:120:128:128:76:52:42:77:76:52:42:78 chr6 25511008 . C CAT 162.19 PASS AO=34;DP=123;FAO=49;FDP=116;FR=.;FRO=67;FSAF=19;FSAR=30;FSRF=25;FSRR=42;FWDB=8.02909e-05;FXX=0.0169477;HRUN=0;LEN=2;MLLD=189.25;QD=5.59265;RBI=0.0124274;REFB=0.00479858;REVB=0.0124271;RO=66;SAF=12;SAR=22;SRF=26;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0502065;STB=0.508925;TYPE=ins;VARB=-0.00571802;OID=.;OPOS=25511009;OREF=-;OALT=AT;OMAPALT=CAT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:34:123:49:116:67:19:30:25:42:99:66:12:22:26:40 chr6 25600968 . G A 430.6 PASS AO=50;DP=53;FAO=50;FDP=53;FR=.;FRO=3;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00921722;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.75;QD=32.4983;RBI=0.0553679;REFB=-0.122986;REVB=0.0545954;RO=1;SAF=21;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218873;STB=0.505041;TYPE=snp;VARB=0.0031616;OID=.;OPOS=25600968;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:53:53:1:3:50:50:29:21:1:0:29:21:1:2 chr6 25605091 . G A 1145.76 PASS AO=117;DP=117;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186122;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.4635;QD=38.513;RBI=0.0226068;REFB=0;REVB=-0.0128316;RO=0;SAF=30;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.42123e-05;OID=.;OPOS=25605091;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:117:119:0:0:117:119:87:30:0:0:87:32:0:0 chr6 25726675 . G A 346.87 PASS AO=79;DP=153;FAO=79;FDP=155;FR=.;FRO=76;FSAF=41;FSAR=38;FSRF=28;FSRR=48;FWDB=0.010358;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=257.528;QD=8.95145;RBI=0.0154148;REFB=-0.0141688;REVB=0.0114162;RO=74;SAF=41;SAR=38;SRF=27;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135363;STB=0.573502;TYPE=snp;VARB=0.0113205;OID=.;OPOS=25726675;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:155:74:76:79:79:38:41:27:47:38:41:28:48 chr6 25726720 . G A 190.98 PASS AO=42;DP=82;FAO=42;FDP=82;FR=.;FRO=40;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=12;FSRR=28;FWDB=0.00818255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.0673;QD=9.3163;RBI=0.0255843;REFB=-0.0392739;REVB=0.0242405;RO=40;SAF=19;SAR=23;SRF=12;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137864;STB=0.576065;TYPE=snp;VARB=0.0418255;OID=.;OPOS=25726720;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:40:40:42:42:23:19:12:28:23:19:12:28 chr6 25726774 . A C 64.75 PASS AO=12;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=12;FWDB=-0.0496063;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.0007;QD=10.3606;RBI=0.0496472;REFB=-0.00149953;REVB=0.00201535;RO=12;SAF=1;SAR=11;SRF=0;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.319453;STB=0.666485;TYPE=snp;VARB=0.000461055;OID=.;OPOS=25726774;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:25:25:12:12:12:13:11:1:0:12:12:1:0:12 chr6 25727265 . C T 445.63 PASS AO=109;DP=241;FAO=114;FDP=245;FR=.;FRO=131;FSAF=68;FSAR=46;FSRF=52;FSRR=79;FWDB=0.0205945;FXX=0.00406488;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.841;QD=7.27563;RBI=0.0206062;REFB=-0.0175241;REVB=0.000695768;RO=131;SAF=64;SAR=45;SRF=52;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186513;STB=0.606258;TYPE=snp;VARB=0.0209505;OID=.;OPOS=25727265;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:241:245:131:131:109:114:45:64:52:79:46:68:52:79 chr6 25727334 . C T 395.93 PASS AO=116;DP=278;FAO=116;FDP=278;FR=.;FRO=162;FSAF=62;FSAR=54;FSRF=78;FSRR=84;FWDB=0.00348168;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2234;QD=5.6969;RBI=0.0224239;REFB=0.00344902;REVB=-0.022152;RO=161;SAF=62;SAR=54;SRF=78;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0521457;STB=0.530896;TYPE=snp;VARB=-0.00639968;OID=.;OPOS=25727334;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:278:278:161:162:116:116:54:62:78:83:54:62:78:84 chr6 25727517 . G A 62.87 PASS AO=17;DP=44;FAO=17;FDP=43;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=20;FSRR=6;FWDB=0.0095348;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.159;QD=5.84833;RBI=0.0212155;REFB=-0.0169703;REVB=0.0189522;RO=26;SAF=14;SAR=3;SRF=20;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0898525;STB=0.552566;TYPE=snp;VARB=0.0534374;OID=.;OPOS=25727517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:44:43:26:26:17:17:3:14:20:6:3:14:20:6 chr6 25769349 . T C 1021.83 PASS AO=98;DP=98;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.02325;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.5044;QD=37.4982;RBI=0.0885882;REFB=0;REVB=0.0854828;RO=0;SAF=26;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0013834;OID=.;OPOS=25769349;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:98:109:0:0:98:109:72:26:0:0:83:26:0:0 chr6 25776949 . G A 531.61 PASS AO=144;DP=325;FAO=144;FDP=323;FR=.;FRO=179;FSAF=54;FSAR=90;FSRF=79;FSRR=100;FWDB=0.0100449;FXX=0.00920217;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.647;QD=6.58337;RBI=0.0192913;REFB=-0.0178774;REVB=0.0164698;RO=178;SAF=54;SAR=90;SRF=78;SRR=100;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0659931;STB=0.538456;TYPE=snp;VARB=0.0220517;OID=.;OPOS=25776949;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:325:323:178:179:144:144:90:54:78:100:90:54:79:100 chr6 25779392 . A G 861.26 PASS AO=192;DP=359;FAO=191;FDP=359;FR=.;FRO=168;FSAF=90;FSAR=101;FSRF=85;FSRR=83;FWDB=0.0456339;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.8516;QD=9.59618;RBI=0.0493946;REFB=0.00762766;REVB=-0.0189043;RO=167;SAF=91;SAR=101;SRF=84;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0248308;STB=0.516283;TYPE=snp;VARB=-0.010934;OID=.;OPOS=25779392;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:359:359:167:168:192:191:101:91:84:83:101:90:85:83 chr6 25813150 . G A 401.01 PASS AO=82;DP=146;FAO=82;FDP=146;FR=.;FRO=64;FSAF=51;FSAR=31;FSRF=38;FSRR=26;FWDB=-0.00203028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.246;QD=10.9865;RBI=0.00987767;REFB=0.00684465;REVB=0.00966676;RO=64;SAF=51;SAR=31;SRF=38;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239331;STB=0.513057;TYPE=snp;VARB=-0.00455447;OID=.;OPOS=25813150;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:64:64:82:82:31:51:38:26:31:51:38:26 chr6 25849620 . A G 246.44 PASS AO=73;DP=180;FAO=73;FDP=180;FR=.;FRO=107;FSAF=31;FSAR=42;FSRF=60;FSRR=47;FWDB=0.0360723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.0319;QD=5.4764;RBI=0.0580869;REFB=-0.00170444;REVB=0.0455288;RO=104;SAF=31;SAR=42;SRF=60;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15897;STB=0.580741;TYPE=snp;VARB=0.00392487;OID=.;OPOS=25849620;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:180:104:107:73:73:42:31:60:44:42:31:60:47 chr6 25914801 . G A 132.95 PASS AO=55;DP=175;FAO=55;FDP=174;FR=.;FRO=119;FSAF=37;FSAR=18;FSRF=59;FSRR=60;FWDB=-0.00399987;FXX=0.00571396;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.915;QD=3.05638;RBI=0.0413107;REFB=-0.00580469;REVB=-0.0411166;RO=110;SAF=37;SAR=18;SRF=54;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21761;STB=0.625441;TYPE=snp;VARB=0.0134287;OID=.;OPOS=25914801;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:174:110:119:55:55:18:37:54:56:18:37:59:60 chr6 25914901 . G A 216.67 PASS AO=69;DP=180;FAO=69;FDP=180;FR=.;FRO=111;FSAF=33;FSAR=36;FSRF=48;FSRR=63;FWDB=-0.0115563;FXX=0.00552456;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.661;QD=4.81496;RBI=0.0126322;REFB=-0.0136613;REVB=0.00510157;RO=110;SAF=33;SAR=36;SRF=47;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0557685;STB=0.528376;TYPE=snp;VARB=0.0213842;OID=.;OPOS=25914901;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:180:110:111:69:69:36:33:47:63:36:33:48:63 chr6 25916979 . C T 570.18 PASS AO=121;DP=228;FAO=123;FDP=227;FR=.;FRO=104;FSAF=86;FSAR=37;FSRF=60;FSRR=44;FWDB=0.00927305;FXX=0.0130429;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.807;QD=10.0473;RBI=0.00939375;REFB=-0.010423;REVB=-0.001501;RO=99;SAF=84;SAR=37;SRF=58;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100656;STB=0.563217;TYPE=snp;VARB=0.00682154;OID=.;OPOS=25916979;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:228:227:99:104:121:123:37:84:58:41:37:86:60:44 chr6 25967068 . C T 552.51 PASS AO=105;DP=179;FAO=107;FDP=181;FR=.;FRO=74;FSAF=53;FSAR=54;FSRF=40;FSRR=34;FWDB=0.0127659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.855;QD=12.2101;RBI=0.0130779;REFB=-0.0168492;REVB=-0.00283935;RO=73;SAF=51;SAR=54;SRF=40;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0470252;STB=0.518477;TYPE=snp;VARB=0.0179936;OID=.;OPOS=25967068;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:181:73:74:105:107:54:51:40:33:54:53:40:34 chr6 25972179 . A G 319.39 PASS AO=78;DP=163;FAO=78;FDP=163;FR=.;FRO=85;FSAF=54;FSAR=24;FSRF=48;FSRR=37;FWDB=-0.00198413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.0004;QD=7.83788;RBI=0.0284527;REFB=-0.00277133;REVB=0.0283834;RO=85;SAF=54;SAR=24;SRF=48;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132809;STB=0.573648;TYPE=snp;VARB=0.00332964;OID=.;OPOS=25972179;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:163:85:85:78:78:24:54:48:37:24:54:48:37 chr6 26027433 . G A 145.27 PASS AO=38;DP=88;FAO=38;FDP=88;FR=.;FRO=50;FSAF=12;FSAR=26;FSRF=15;FSRR=35;FWDB=0.0112183;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.245;QD=6.60316;RBI=0.0137226;REFB=-0.0162465;REVB=0.00790312;RO=49;SAF=12;SAR=26;SRF=14;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.035405;STB=0.510455;TYPE=snp;VARB=0.0143251;OID=.;OPOS=26027433;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:49:50:38:38:26:12:14:35:26:12:15:35 chr6 26033506 . G A 158.61 PASS AO=33;DP=64;FAO=34;FDP=65;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=25;FSRF=4;FSRR=27;FWDB=0.0191017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.507;QD=9.76029;RBI=0.0303721;REFB=-0.00615306;REVB=0.0236133;RO=31;SAF=8;SAR=25;SRF=4;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147134;STB=0.590117;TYPE=snp;VARB=0.00482232;OID=.;OPOS=26033506;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:65:31:31:33:34:25:8:4:27:25:9:4:27 chr6 26044369 . A G 152.51 PASS AO=50;DP=139;FAO=51;FDP=140;FR=.;FRO=89;FSAF=19;FSAR=32;FSRF=42;FSRR=47;FWDB=-0.0263832;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.973;QD=4.35749;RBI=0.0384208;REFB=-0.0164126;REVB=-0.02793;RO=88;SAF=19;SAR=31;SRF=42;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111559;STB=0.565279;TYPE=snp;VARB=0.0332598;OID=.;OPOS=26044369;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:140:88:89:50:51:31:19:42:46:32:19:42:47 chr6 26045929 . T C 101.37 PASS AO=29;DP=73;FAO=29;FDP=73;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=18;FWDB=-0.00487003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7961;QD=5.55463;RBI=0.00549234;REFB=-0.0242058;REVB=0.0025394;RO=43;SAF=16;SAR=13;SRF=26;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0564701;STB=0.523976;TYPE=snp;VARB=0.0267638;OID=.;OPOS=26045929;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:43:44:29:29:13:16:26:17:13:16:26:18 chr6 26056072 . G C 99.69 PASS AO=15;DP=78;FAO=29;FDP=75;FR=.,HEALED;FRO=44;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=-0.0234458;FXX=0.0963739;HRUN=3;LEN=1;MLLD=178.181;QD=5.31668;RBI=0.0234615;REFB=-0.0208037;REVB=0.000859338;RO=31;SAF=2;SAR=13;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.478202;STB=0.502922;TYPE=snp;VARB=0.0303098;OID=.;OPOS=26056072;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:61:75:31:44:15:29:13:2:15:16:17:12:18:26 chr6 26056549 . A G 174.56 PASS AO=33;DP=56;FAO=33;FDP=56;FR=.;FRO=23;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.00879029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.334;QD=12.4689;RBI=0.0177353;REFB=0.0202742;REVB=-0.0154037;RO=23;SAF=21;SAR=12;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0221325;STB=0.512188;TYPE=snp;VARB=-0.0130052;OID=.;OPOS=26056549;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:56:56:23:23:33:33:12:21:14:9:12:21:14:9 chr6 26104280 . T C 259.58 PASS AO=75;DP=162;FAO=70;FDP=160;FR=.;FRO=90;FSAF=32;FSAR=38;FSRF=46;FSRR=44;FWDB=0.00854436;FXX=0.0123449;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.2198;QD=6.48953;RBI=0.00866666;REFB=0.0120929;REVB=-0.00145084;RO=85;SAF=37;SAR=38;SRF=41;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0105346;STB=0.530414;TYPE=snp;VARB=-0.0203745;OID=.;OPOS=26104280;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:160:85:90:75:70:38:37:41:44:38:32:46:44 chr6 26104448 . A G 311.91 PASS AO=88;DP=206;FAO=88;FDP=207;FR=.;FRO=119;FSAF=37;FSAR=51;FSRF=48;FSRR=71;FWDB=-0.0119431;FXX=0.0189564;HRUN=4;LEN=1;MLLD=106.483;QD=6.02718;RBI=0.0275249;REFB=-0.0235745;REVB=-0.0247988;RO=114;SAF=37;SAR=51;SRF=45;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0268853;STB=0.510112;TYPE=snp;VARB=0.0306451;OID=.;OPOS=26104448;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:206:207:114:119:88:88:51:37:45:69:51:37:48:71 chr6 26107790 . G T 459.61 PASS AO=178;DP=481;FAO=152;FDP=393;FR=.;FRO=241;FSAF=74;FSAR=78;FSRF=133;FSRR=108;FWDB=-0.0160192;FXX=0.0174996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.441;QD=4.67799;RBI=0.0230781;REFB=-0.0161508;REVB=0.0166128;RO=297;SAF=80;SAR=98;SRF=158;SRR=139;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0916666;STB=0.539814;TYPE=snp;VARB=0.0278023;OID=.;OPOS=26107790;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:481:393:297:241:178:152:98:80:158:139:78:74:133:108 chr6 26108282 . C G 968.43 PASS AO=102;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0601939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.8551;QD=37.9776;RBI=0.060352;REFB=0;REVB=-0.00436583;RO=0;SAF=56;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000352954;OID=.;OPOS=26108282;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:102:102:0:0:102:102:46:56:0:0:46:56:0:0 chr6 26124634 . C T 125.71 PASS AO=25;DP=49;FAO=26;FDP=50;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.0320999;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.174;QD=10.0568;RBI=0.0421841;REFB=-0.0230596;REVB=0.0273696;RO=24;SAF=9;SAR=16;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127161;STB=0.556918;TYPE=snp;VARB=0.0161337;OID=.;OPOS=26124634;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:50:24:24:25:26:16:9:12:12:16:10:12:12 chr6 26156950 . C T 60.73 PASS AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0235169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.1288;QD=8.99763;RBI=0.0953854;REFB=-0.0609974;REVB=-0.092441;RO=14;SAF=10;SAR=3;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.39126;STB=0.726905;TYPE=snp;VARB=0.0133011;OID=.;OPOS=26156950;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:27:27:14:14:13:13:3:10:5:9:3:10:5:9 chr6 26184102 . G A 297.29 PASS AO=73;DP=147;FAO=73;FDP=153;FR=.;FRO=80;FSAF=38;FSAR=35;FSRF=41;FSRR=39;FWDB=-0.0147605;FXX=0.00649309;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.635;QD=7.77237;RBI=0.0296473;REFB=-0.0378809;REVB=0.0257117;RO=74;SAF=38;SAR=35;SRF=35;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0434262;STB=0.504213;TYPE=snp;VARB=0.0397815;OID=.;OPOS=26184102;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:153:74:80:73:73:35:38:35:39:35:38:41:39 chr6 26199454 . C T 23.02 PASS AO=7;DP=24;FAO=7;FDP=24;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.00403443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.328;QD=3.83732;RBI=0.00665275;REFB=0.00327156;REVB=-0.00528984;RO=17;SAF=3;SAR=4;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192881;STB=0.51216;TYPE=snp;VARB=-0.0079026;OID=.;OPOS=26199454;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:24:24:17:17:7:7:4:3:7:10:4:3:7:10 chr6 26199822 . A G 329.13 PASS AO=89;DP=202;FAO=89;FDP=202;FR=.;FRO=113;FSAF=63;FSAR=26;FSRF=62;FSRR=51;FWDB=-0.00879593;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=218.663;QD=6.5175;RBI=0.00884824;REFB=-0.00397446;REVB=-0.000960697;RO=111;SAF=63;SAR=26;SRF=60;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183921;STB=0.598792;TYPE=snp;VARB=0.00492547;OID=.;OPOS=26199822;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:202:111:113:89:89:26:63:60:51:26:63:62:51 chr6 26200083 . A G 392.39 PASS AO=41;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020276;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.517;QD=37.3707;RBI=0.0432867;REFB=0;REVB=-0.0382443;RO=0;SAF=22;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000105884;OID=.;OPOS=26200083;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:41:42:0:0:41:42:19:22:0:0:20:22:0:0 chr6 26200256 . C T 687.01 PASS AO=148;DP=271;FAO=147;FDP=271;FR=.;FRO=124;FSAF=91;FSAR=56;FSRF=64;FSRR=60;FWDB=-0.0135767;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.74;QD=10.1404;RBI=0.0549425;REFB=0.00164718;REVB=-0.0532386;RO=122;SAF=91;SAR=57;SRF=64;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0775126;STB=0.548756;TYPE=snp;VARB=-0.00118351;OID=.;OPOS=26200256;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:271:271:122:124:148:147:57:91:64:58:56:91:64:60 chr6 26200518 . G A 477.24 PASS AO=124;DP=272;FAO=125;FDP=274;FR=.;FRO=149;FSAF=71;FSAR=54;FSRF=67;FSRR=82;FWDB=0.00344632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.4377;QD=6.96694;RBI=0.00499491;REFB=-0.0154741;REVB=0.00361553;RO=148;SAF=70;SAR=54;SRF=66;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116631;STB=0.564404;TYPE=snp;VARB=0.0257062;OID=.;OPOS=26200518;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:272:274:148:149:124:125:54:70:66:82:54:71:67:82 chr6 26200677 . A G 271.99 PASS AO=35;DP=92;FAO=52;FDP=89;FR=.;FRO=37;FSAF=20;FSAR=32;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=0.0787264;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.515;QD=12.2245;RBI=0.0787703;REFB=-0.00818263;REVB=-0.00262691;RO=20;SAF=16;SAR=19;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0286129;STB=0.532362;TYPE=snp;VARB=0.0061091;OID=.;OPOS=26200677;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:89:20:37:35:52:19:16:10:10:32:20:17:20 chr6 26200707 . G A 53.9 PASS AO=21;DP=72;FAO=21;FDP=71;FR=.;FRO=50;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=29;FWDB=-0.0234581;FXX=0.013887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.436;QD=3.03648;RBI=0.0236661;REFB=-0.00601412;REVB=-0.00313106;RO=49;SAF=13;SAR=8;SRF=21;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222868;STB=0.638648;TYPE=snp;VARB=0.0100677;OID=.;OPOS=26200707;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:72:71:49:50:21:21:8:13:21:28:8:13:21:29 chr6 26205052 . G A 291.86 PASS AO=69;DP=152;FAO=73;FDP=155;FR=.;FRO=82;FSAF=36;FSAR=37;FSRF=53;FSRR=29;FWDB=-0.00238058;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.9124;QD=7.53196;RBI=0.0593954;REFB=-0.0102677;REVB=0.0593477;RO=82;SAF=36;SAR=33;SRF=53;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12303;STB=0.580857;TYPE=snp;VARB=0.0100427;OID=.;OPOS=26205052;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:155:82:82:69:73:33:36:53:29:37:36:53:29 chr6 26205293 . G A 844.54 PASS AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0129943;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.657;QD=38.388;RBI=0.0133115;REFB=0;REVB=-0.00288849;RO=0;SAF=16;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.13739e-05;OID=.;OPOS=26205293;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:88:88:0:0:88:88:72:16:0:0:72:16:0:0 chr6 26205500 . C T 111.66 PASS AO=37;DP=98;FAO=36;FDP=98;FR=.;FRO=62;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=38;FWDB=0.0420693;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.8218;QD=4.55733;RBI=0.0421812;REFB=0.0224495;REVB=-0.00307067;RO=61;SAF=21;SAR=16;SRF=24;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1881;STB=0.622416;TYPE=snp;VARB=-0.0447816;OID=.;OPOS=26205500;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:61:62:37:36:16:21:24:37:15:21:24:38 chr6 26205604 . C T 280.77 PASS AO=58;DP=105;FAO=58;FDP=105;FR=.;FRO=47;FSAF=44;FSAR=14;FSRF=31;FSRR=16;FWDB=0.00893258;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.026;QD=10.696;RBI=0.0165665;REFB=0.00604112;REVB=0.0139519;RO=47;SAF=44;SAR=14;SRF=31;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103474;STB=0.556941;TYPE=snp;VARB=-0.00455779;OID=.;OPOS=26205604;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:47:47:58:58:14:44:31:16:14:44:31:16 chr6 26205718 . T C 145.09 PASS AO=47;DP=126;FAO=47;FDP=126;FR=.;FRO=79;FSAF=30;FSAR=17;FSRF=33;FSRR=46;FWDB=-0.00463497;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.247;QD=4.60617;RBI=0.0472598;REFB=-0.00464318;REVB=-0.047032;RO=79;SAF=30;SAR=17;SRF=33;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.2428;STB=0.638239;TYPE=snp;VARB=0.0075484;OID=.;OPOS=26205718;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:79:79:47:47:17:30:33:46:17:30:33:46 chr6 26205939 . A AG 195.23 PASS AO=84;DP=191;FAO=88;FDP=188;FR=.;FRO=100;FSAF=45;FSAR=43;FSRF=46;FSRR=54;FWDB=-0.0102108;FXX=0.015706;HRUN=2;LEN=1;MLLD=19.6984;QD=4.15373;RBI=0.0842968;REFB=0.0248492;REVB=-0.0836761;RO=102;SAF=44;SAR=40;SRF=47;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0621977;STB=0.527295;TYPE=ins;VARB=-0.0313871;OID=.;OPOS=26205940;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:84:191:88:188:100:45:43:46:54:99:102:44:40:47:55 chr6 26206074 . C A 157.25 PASS AO=38;DP=91;FAO=38;FDP=82;FR=.;FRO=44;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=13;FSRR=31;FWDB=-0.00290418;FXX=0.127646;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.694;QD=7.67085;RBI=0.00718878;REFB=0.00067194;REVB=0.00657604;RO=36;SAF=15;SAR=23;SRF=12;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0571806;STB=0.557055;TYPE=snp;VARB=0.00023029;OID=.;OPOS=26206074;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:82:36:44:38:38:23:15:12:24:23:15:13:31 chr6 26216584 . C T 297.78 PASS AO=68;DP=151;FAO=73;FDP=152;FR=.;FRO=79;FSAF=45;FSAR=28;FSRF=59;FSRR=20;FWDB=-0.00679076;FXX=0.0379723;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.407;QD=7.83624;RBI=0.0241952;REFB=0.00314439;REVB=0.0232226;RO=83;SAF=45;SAR=23;SRF=59;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0553531;STB=0.574113;TYPE=snp;VARB=-0.00218896;OID=.;OPOS=26216584;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:152:83:79:68:73:23:45:59:24:28:45:59:20 chr6 26234883 . A G 186.49 PASS AO=50;DP=120;FAO=52;FDP=121;FR=.;FRO=69;FSAF=20;FSAR=32;FSRF=25;FSRR=44;FWDB=0.00596254;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.71;QD=6.16502;RBI=0.0105897;REFB=-0.0296233;REVB=0.00875152;RO=70;SAF=18;SAR=32;SRF=25;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00321759;STB=0.513508;TYPE=snp;VARB=0.037507;OID=.;OPOS=26234883;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:121:70:69:50:52:32:18:25:45:32:20:25:44 chr6 26234952 . A G 91.31 PASS AO=30;DP=88;FAO=31;FDP=89;FR=.;FRO=58;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=39;FWDB=0.0162088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.167;QD=4.10398;RBI=0.0225258;REFB=-0.00509553;REVB=-0.0156424;RO=58;SAF=9;SAR=21;SRF=19;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0365953;STB=0.50372;TYPE=snp;VARB=0.00921389;OID=.;OPOS=26234952;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:88:89:58:58:30:31:21:9:19:39:21:10:19:39 chr6 26240752 . C T 90.01 PASS AO=21;DP=45;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=5;FWDB=0.0231433;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=178.55;QD=8.0007;RBI=0.0231547;REFB=-0.00212468;REVB=0.000727212;RO=24;SAF=16;SAR=5;SRF=19;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0395595;STB=0.522367;TYPE=snp;VARB=0.00231661;OID=.;OPOS=26240752;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:45:45:24:24:21:21:5:16:19:5:5:16:19:5 chr6 26285560 . A G 515.88 PASS AO=118;DP=233;FAO=119;FDP=234;FR=.;FRO=115;FSAF=54;FSAR=65;FSRF=55;FSRR=60;FWDB=-0.00977428;FXX=0.00847422;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.974;QD=8.81843;RBI=0.0121156;REFB=-0.00876323;REVB=0.00715899;RO=111;SAF=54;SAR=64;SRF=54;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0256661;STB=0.512105;TYPE=snp;VARB=0.0108012;OID=.;OPOS=26285560;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:233:234:111:115:118:119:64:54:54:57:65:54:55:60 chr6 26285683 . T C 241.95 PASS AO=61;DP=165;FAO=73;FDP=177;FR=.;FRO=104;FSAF=11;FSAR=62;FSRF=42;FSRR=62;FWDB=0.00527685;FXX=0.00561766;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.513;QD=5.46777;RBI=0.0159646;REFB=-0.0109167;REVB=0.0150673;RO=99;SAF=4;SAR=57;SRF=43;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.607132;STB=0.706601;TYPE=snp;VARB=0.0272348;OID=.;OPOS=26285683;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:177:99:104:61:73:57:4:43:56:62:11:42:62 chr6 26286744 . C T 291.15 PASS AO=77;DP=166;FAO=75;FDP=164;FR=.;FRO=89;FSAF=48;FSAR=27;FSRF=48;FSRR=41;FWDB=0.0178469;FXX=0.0120475;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.9623;QD=7.10129;RBI=0.0773633;REFB=0.0175436;REVB=-0.0752766;RO=87;SAF=49;SAR=28;SRF=46;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107576;STB=0.557361;TYPE=snp;VARB=-0.0248804;OID=.;OPOS=26286744;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:164:87:89:77:75:28:49:46:41:27:48:48:41 chr6 26299900 . C T 496.58 PASS AO=143;DP=349;FAO=144;FDP=341;FR=.;FRO=197;FSAF=129;FSAR=15;FSRF=181;FSRR=16;FWDB=-0.0148293;FXX=0.0312491;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.9344;QD=5.82499;RBI=0.132408;REFB=-0.00223847;REVB=-0.131575;RO=169;SAF=129;SAR=14;SRF=155;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0435783;STB=0.537629;TYPE=snp;VARB=0.00223641;OID=.;OPOS=26299900;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:349:341:169:197:143:144:14:129:155:14:15:129:181:16 chr6 26305792 . A ACCTCGTCACAT 110.76 PASS AO=46;DP=173;FAO=47;FDP=153;FR=.;FRO=106;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=49;FSRR=57;FWDB=-0.0304804;FXX=0.0377335;HRUN=0;LEN=11;MLLD=400.21;QD=2.89581;RBI=0.0309608;REFB=-0.00251153;REVB=0.00543255;RO=119;SAF=24;SAR=22;SRF=63;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00939567;STB=0.548134;TYPE=ins;VARB=0.00464423;OID=.;OPOS=26305793;OREF=-;OALT=CCTCGTCACAT;OMAPALT=ACCTCGTCACAT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:46:173:47:153:106:25:22:49:57:99:119:24:22:63:56 chr6 26305796 . C CAGGTT 121.46 PASS AO=47;DP=159;FAO=48;FDP=150;FR=.;FRO=102;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=49;FSRR=53;FWDB=0.00267104;FXX=0.0624961;HRUN=0;LEN=5;MLLD=243.893;QD=3.23898;RBI=0.0033954;REFB=-0.00497106;REVB=0.00209624;RO=102;SAF=25;SAR=22;SRF=49;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0607122;STB=0.527473;TYPE=ins;VARB=0.00917829;OID=.;OPOS=26305797;OREF=-;OALT=AGGTT;OMAPALT=CAGGTT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:47:159:48:150:102:25:23:49:53:99:102:25:22:49:53 chr6 26305801 . C G 193.97 PASS AO=63;DP=168;FAO=63;FDP=167;FR=.;FRO=104;FSAF=25;FSAR=38;FSRF=51;FSRR=53;FWDB=0.000455173;FXX=0.00595203;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.446;QD=4.64608;RBI=0.00187333;REFB=-0.0205884;REVB=0.00181719;RO=102;SAF=25;SAR=38;SRF=49;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0931336;STB=0.559346;TYPE=snp;VARB=0.0153232;OID=.;OPOS=26305801;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:167:102:104:63:63:38:25:49:53:38:25:51:53 chr6 26327814 . T C 414.47 PASS AO=110;DP=245;FAO=110;FDP=244;FR=.;FRO=134;FSAF=72;FSAR=38;FSRF=95;FSRR=39;FWDB=-0.00618133;FXX=0.00408147;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.217;QD=6.7946;RBI=0.00623297;REFB=0.00785803;REVB=0.000800679;RO=132;SAF=72;SAR=38;SRF=93;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0556103;STB=0.53372;TYPE=snp;VARB=-0.00815697;OID=.;OPOS=26327814;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:245:244:132:134:110:110:38:72:93:39:38:72:95:39 chr6 26328365 . A G 325.74 PASS AO=92;DP=215;FAO=92;FDP=216;FR=.;FRO=124;FSAF=69;FSAR=23;FSRF=82;FSRR=42;FWDB=0.00729108;FXX=0.00460808;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.383;QD=6.0323;RBI=0.00867101;REFB=0.00736983;REVB=-0.00469325;RO=123;SAF=68;SAR=24;SRF=82;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.091307;STB=0.563569;TYPE=snp;VARB=-0.00784;OID=.;OPOS=26328365;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:216:123:124:92:92:24:68:82:41:23:69:82:42 chr6 26368938 . C T 60.41 PASS AO=30;DP=112;FAO=30;FDP=112;FR=.;FRO=82;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=62;FWDB=0.0121935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.799;QD=2.15746;RBI=0.0138282;REFB=-0.000475748;REVB=0.00652201;RO=82;SAF=10;SAR=20;SRF=20;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131002;STB=0.577417;TYPE=snp;VARB=0.00185825;OID=.;OPOS=26368938;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:112:112:82:82:30:30:20:10:20:62:20:10:20:62 chr6 26370605 . T C 449.13 PASS AO=110;DP=229;FAO=110;FDP=229;FR=.;FRO=119;FSAF=69;FSAR=41;FSRF=79;FSRR=40;FWDB=-0.00707841;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.951;QD=7.84514;RBI=0.0177626;REFB=-0.00897131;REVB=0.0162912;RO=119;SAF=69;SAR=41;SRF=79;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0373266;STB=0.520542;TYPE=snp;VARB=0.00974564;OID=.;OPOS=26370605;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:229:229:119:119:110:110:41:69:79:40:41:69:79:40 chr6 26370833 . T G 166.26 PASS AO=43;DP=106;FAO=47;FDP=110;FR=.;FRO=63;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=39;FWDB=0.0500324;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.926;QD=6.04595;RBI=0.0701778;REFB=-0.0135155;REVB=0.0492106;RO=62;SAF=26;SAR=17;SRF=24;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225457;STB=0.609598;TYPE=snp;VARB=0.0183654;OID=.;OPOS=26370833;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:110:62:63:43:47:17:26:24:38:20:27:24:39 chr6 26388405 . G A 397.27 PASS AO=77;DP=132;FAO=79;FDP=138;FR=.;FRO=59;FSAF=38;FSAR=41;FSRF=42;FSRR=17;FWDB=-0.0317624;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.871;QD=11.515;RBI=0.0547684;REFB=-0.0501341;REVB=0.0446176;RO=55;SAF=38;SAR=39;SRF=38;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151135;STB=0.59808;TYPE=snp;VARB=0.0327537;OID=.;OPOS=26388405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:138:55:59:77:79:39:38:38:17:41:38:42:17 chr6 26393021 . G A 555.06 PASS AO=115;DP=209;FAO=115;FDP=207;FR=.;FRO=92;FSAF=42;FSAR=73;FSRF=36;FSRR=56;FWDB=0.0280964;FXX=0.00956892;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.137;QD=10.7259;RBI=0.0378125;REFB=-0.00629935;REVB=0.0253056;RO=91;SAF=42;SAR=73;SRF=36;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0263746;STB=0.512417;TYPE=snp;VARB=0.00536253;OID=.;OPOS=26393021;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:207:91:92:115:115:73:42:36:55:73:42:36:56 chr6 26405835 . G A 592.52 PASS AO=122;DP=219;FAO=122;FDP=218;FR=.;FRO=96;FSAF=63;FSAR=59;FSRF=45;FSRR=51;FWDB=-0.0513167;FXX=0.004566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.6111;QD=10.8719;RBI=0.0515391;REFB=-0.0297237;REVB=0.00478253;RO=94;SAF=63;SAR=59;SRF=43;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0471656;STB=0.520971;TYPE=snp;VARB=0.0259492;OID=.;OPOS=26405835;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:219:218:94:96:122:122:59:63:43:51:59:63:45:51 chr6 26410227 . G A 311.75 PASS AO=84;DP=195;FAO=85;FDP=193;FR=.;FRO=108;FSAF=46;FSAR=39;FSRF=54;FSRR=54;FWDB=-0.00404038;FXX=0.0203035;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.9503;QD=6.46118;RBI=0.0288984;REFB=-0.0114933;REVB=-0.0286145;RO=99;SAF=46;SAR=38;SRF=52;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0219708;STB=0.523105;TYPE=snp;VARB=0.0166332;OID=.;OPOS=26410227;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:193:99:108:84:85:38:46:52:47:39:46:54:54 chr6 26422354 . C T 15.21 PASS AO=4;DP=15;FAO=4;FDP=15;FR=.;FRO=11;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=-0.0289863;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.903;QD=4.05712;RBI=0.032502;REFB=-0.0165726;REVB=0.0147027;RO=11;SAF=1;SAR=3;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.485919;STB=0.816794;TYPE=snp;VARB=0.0279129;OID=.;OPOS=26422354;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:15:15:11:11:4:4:3:1:8:3:3:1:8:3 chr6 26423314 . AGGG AGG,AGGA 2206.21 PASS AO=96,134;DP=281;FAO=143,135;FDP=278;FR=.;FRO=0;FSAF=24,13;FSAR=119,122;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.619749,0.0733054;FXX=0.0313578;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=13.9515,135.769;QD=31.744;RBI=0.624199,0.0805534;REFB=0,0;REVB=-0.0744031,-0.033394;RO=21;SAF=0,13;SAR=96,121;SRF=21;SRR=0;SSEN=0.35,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.905124,-0.41626;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.0699661,0.0549882;OID=.,.;OPOS=26423315,26423317;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=AGG,AGGA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:96,134:274:143,135:278:0:24,13:119,122:0:0:99:21:0,13:96,121:21:0 chr6 26426487 . G A 242.4 PASS AO=37;DP=74;FAO=46;FDP=78;FR=.;FRO=32;FSAF=37;FSAR=9;FSRF=29;FSRR=3;FWDB=0.000802794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.984;QD=12.4309;RBI=0.0145118;REFB=-0.00851876;REVB=-0.0144896;RO=21;SAF=30;SAR=7;SRF=19;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109729;STB=0.572226;TYPE=snp;VARB=0.00547579;OID=.;OPOS=26426487;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:78:21:32:37:46:7:30:19:2:9:37:29:3 chr6 26430981 . A G 90.74 PASS AO=28;DP=75;FAO=28;FDP=75;FR=.;FRO=47;FSAF=23;FSAR=5;FSRF=39;FSRR=8;FWDB=0.0101469;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.409;QD=4.83965;RBI=0.0345681;REFB=-0.0147587;REVB=0.0330454;RO=47;SAF=23;SAR=5;SRF=39;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0157229;STB=0.509025;TYPE=snp;VARB=0.0309267;OID=.;OPOS=26430981;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:75:75:47:47:28:28:5:23:39:8:5:23:39:8 chr6 26431340 . A G 251.43 PASS AO=74;DP=188;FAO=76;FDP=190;FR=.;FRO=114;FSAF=24;FSAR=52;FSRF=51;FSRR=63;FWDB=-0.0175382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.211;QD=5.29318;RBI=0.0211042;REFB=-0.00589286;REVB=-0.0117388;RO=110;SAF=24;SAR=50;SRF=50;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148202;STB=0.585562;TYPE=snp;VARB=0.00846158;OID=.;OPOS=26431340;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:190:110:114:74:76:50:24:50:60:52:24:51:63 chr6 26443853 . C A 310.23 PASS AO=72;DP=144;FAO=72;FDP=144;FR=.;FRO=72;FSAF=37;FSAR=35;FSRF=32;FSRR=40;FWDB=0.0118994;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=180.84;QD=8.61756;RBI=0.0146215;REFB=-0.00192493;REVB=0.00849667;RO=72;SAF=37;SAR=35;SRF=32;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0629468;STB=0.534672;TYPE=snp;VARB=0.00185021;OID=.;OPOS=26443853;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:144:72:72:72:72:35:37:32:40:35:37:32:40 chr6 26446209 . C T 181.58 PASS AO=47;DP=105;FAO=47;FDP=105;FR=.;FRO=58;FSAF=7;FSAR=40;FSRF=20;FSRR=38;FWDB=-0.0199416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.815;QD=6.91728;RBI=0.0555479;REFB=-0.0252304;REVB=-0.051845;RO=58;SAF=7;SAR=40;SRF=20;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.288642;STB=0.664126;TYPE=snp;VARB=0.023685;OID=.;OPOS=26446209;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:58:58:47:47:40:7:20:38:40:7:20:38 chr6 26448824 . C A 145.66 PASS AO=32;DP=85;FAO=37;FDP=78;FR=.;FRO=41;FSAF=2;FSAR=35;FSRF=4;FSRR=37;FWDB=-0.0260816;FXX=0.142841;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1229;QD=7.46978;RBI=0.0297795;REFB=-0.0719533;REVB=-0.0143725;RO=35;SAF=2;SAR=30;SRF=2;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218211;STB=0.593162;TYPE=snp;VARB=0.0358072;OID=.;OPOS=26448824;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:78:35:41:32:37:30:2:2:33:35:2:4:37 chr6 26466225 . A C 418.11 PASS AO=90;DP=165;FAO=89;FDP=164;FR=.;FRO=75;FSAF=46;FSAR=43;FSRF=43;FSRR=32;FWDB=0.0013615;FXX=0.00606024;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.729;QD=10.1977;RBI=0.0414395;REFB=0.00408845;REVB=-0.0414171;RO=75;SAF=46;SAR=44;SRF=43;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0518907;STB=0.525898;TYPE=snp;VARB=-0.008418;OID=.;OPOS=26466225;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:164:75:75:90:89:44:46:43:32:43:46:43:32 chr6 26466234 . A G 330.14 PASS AO=85;DP=185;FAO=85;FDP=185;FR=.;FRO=100;FSAF=46;FSAR=39;FSRF=51;FSRR=49;FWDB=0.0171512;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.541;QD=7.13806;RBI=0.0229977;REFB=0.00164649;REVB=0.0153209;RO=95;SAF=46;SAR=39;SRF=50;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0142613;STB=0.516916;TYPE=snp;VARB=-0.0022579;OID=.;OPOS=26466234;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:185:95:100:85:85:39:46:50:45:39:46:51:49 chr6 26468660 . G A 257.66 PASS AO=70;DP=161;FAO=70;FDP=159;FR=.;FRO=89;FSAF=28;FSAR=42;FSRF=34;FSRR=55;FWDB=-0.0383802;FXX=0.0185174;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.3513;QD=6.48189;RBI=0.0404386;REFB=-0.00596824;REVB=-0.0127372;RO=88;SAF=28;SAR=42;SRF=33;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0262034;STB=0.510523;TYPE=snp;VARB=0.0107926;OID=.;OPOS=26468660;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:159:88:89:70:70:42:28:33:55:42:28:34:55 chr6 26501897 . T C 74.71 PASS AO=12;DP=29;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.0181138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.857;QD=8.78949;RBI=0.0216255;REFB=-0.0226416;REVB=-0.0118131;RO=17;SAF=3;SAR=9;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0565028;STB=0.561973;TYPE=snp;VARB=0.0328757;OID=.;OPOS=26501897;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:29:34:17:17:12:17:9:3:5:12:10:7:5:12 chr6 26505362 . G A 249.01 PASS AO=66;DP=149;FAO=66;FDP=149;FR=.;FRO=83;FSAF=41;FSAR=25;FSRF=19;FSRR=64;FWDB=-0.0174137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.0581;QD=6.68475;RBI=0.0371481;REFB=-0.000673995;REVB=0.0328137;RO=82;SAF=41;SAR=25;SRF=18;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.384147;STB=0.708623;TYPE=snp;VARB=0.00155084;OID=.;OPOS=26505362;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:82:83:66:66:25:41:18:64:25:41:19:64 chr6 26505403 . C A 175.18 PASS AO=45;DP=101;FAO=45;FDP=101;FR=.;FRO=56;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=40;FWDB=-0.00509934;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.082;QD=6.93799;RBI=0.00741371;REFB=-0.00215095;REVB=-0.00538142;RO=56;SAF=28;SAR=17;SRF=16;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.324616;STB=0.680811;TYPE=snp;VARB=0.00738319;OID=.;OPOS=26505403;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:56:56:45:45:17:28:16:40:17:28:16:40 chr6 26509330 . C G 200.36 PASS AO=54;DP=127;FAO=53;FDP=121;FR=.;FRO=68;FSAF=5;FSAR=48;FSRF=10;FSRR=58;FWDB=0.00708338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8466;QD=6.62334;RBI=0.00751447;REFB=-0.0239713;REVB=0.00250861;RO=70;SAF=5;SAR=49;SRF=10;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131024;STB=0.575968;TYPE=snp;VARB=0.0332086;OID=.;OPOS=26509330;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:121:70:68:54:53:49:5:10:60:48:5:10:58 chr6 26521435 . C G 235.55 PASS AO=58;DP=126;FAO=59;FDP=127;FR=.;FRO=68;FSAF=36;FSAR=23;FSRF=51;FSRR=17;FWDB=-0.00392157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.26;QD=7.41891;RBI=0.0244862;REFB=-0.0103802;REVB=-0.0241701;RO=68;SAF=35;SAR=23;SRF=51;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154744;STB=0.581491;TYPE=snp;VARB=0.0121922;OID=.;OPOS=26521435;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:127:68:68:58:59:23:35:51:17:23:36:51:17 chr6 26521520 . T C 1535.2 PASS AO=158;DP=161;FAO=165;FDP=168;FR=.;FRO=3;FSAF=42;FSAR=123;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0247663;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.7215;QD=36.5525;RBI=0.0308069;REFB=-0.0391694;REVB=0.018322;RO=3;SAF=40;SAR=118;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.019176;STB=0.509603;TYPE=snp;VARB=0.00123284;OID=.;OPOS=26521520;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:161:168:3:3:158:165:118:40:2:1:123:42:2:1 chr6 26538268 . T C 321.65 PASS AO=62;DP=107;FAO=62;FDP=106;FR=.;FRO=44;FSAF=40;FSAR=22;FSRF=28;FSRR=16;FWDB=0.0103889;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.475;QD=12.1377;RBI=0.012325;REFB=-0.0217524;REVB=0.00663151;RO=41;SAF=40;SAR=22;SRF=28;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0304772;STB=0.503977;TYPE=snp;VARB=0.0154322;OID=.;OPOS=26538268;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:106:41:44:62:62:22:40:28:13:22:40:28:16 chr6 26545632 . G A 263.32 PASS AO=42;DP=83;FAO=45;FDP=83;FR=.,HEALED;FRO=32;FSAF=10;FSAR=35;FSRF=8;FSRR=24;FWDB=0.125036;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=32.1992;QD=12.6901;RBI=0.125151;REFB=-0.0387419;REVB=-0.00535926;RO=27;SAF=9;SAR=33;SRF=8;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0823011;STB=0.516386;TYPE=snp;VARB=0.0375054;OID=.;OPOS=26545632;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:83:27:32:42:45:33:9:8:19:35:10:8:24 chr6 26546048 . C T 1547.7 PASS AO=166;DP=169;FAO=166;FDP=169;FR=.;FRO=3;FSAF=101;FSAR=65;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.00655731;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=245.103;QD=36.6319;RBI=0.00854126;REFB=0.0218831;REVB=-0.0054731;RO=1;SAF=101;SAR=65;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00468886;STB=0.501085;TYPE=snp;VARB=-0.000359562;OID=.;OPOS=26546048;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:169:169:1:3:166:166:65:101:1:0:65:101:2:1 chr6 26546808 . T C 138.82 PASS AO=47;DP=131;FAO=48;FDP=135;FR=.;FRO=87;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=29;FSRR=58;FWDB=-0.0276394;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.877;QD=4.11331;RBI=0.0319038;REFB=-0.0248529;REVB=-0.0159347;RO=84;SAF=17;SAR=30;SRF=26;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0648392;STB=0.514795;TYPE=snp;VARB=0.0438623;OID=.;OPOS=26546808;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:135:84:87:47:48:30:17:26:58:31:17:29:58 chr6 26553815 . C G 368.56 PASS AO=70;DP=117;FAO=70;FDP=117;FR=.;FRO=47;FSAF=10;FSAR=60;FSRF=14;FSRR=33;FWDB=0.0347169;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.2355;QD=12.6002;RBI=0.0457487;REFB=-0.023095;REVB=0.0297939;RO=45;SAF=10;SAR=60;SRF=14;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20547;STB=0.60756;TYPE=snp;VARB=0.0138202;OID=.;OPOS=26553815;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:45:47:70:70:60:10:14:31:60:10:14:33 chr6 26555484 . A G 381.67 PASS AO=110;DP=262;FAO=110;FDP=261;FR=.;FRO=151;FSAF=72;FSAR=38;FSRF=97;FSRR=54;FWDB=0.00808551;FXX=0.00381665;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.032;QD=5.84931;RBI=0.0123142;REFB=-0.0104855;REVB=-0.00928788;RO=151;SAF=72;SAR=38;SRF=97;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0138763;STB=0.50774;TYPE=snp;VARB=0.00958171;OID=.;OPOS=26555484;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:262:261:151:151:110:110:38:72:97:54:38:72:97:54 chr6 26556769 . G T 480.2 PASS AO=131;DP=296;FAO=131;FDP=296;FR=.;FRO=165;FSAF=78;FSAR=53;FSRF=103;FSRR=62;FWDB=0.00479711;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.093;QD=6.48923;RBI=0.00482048;REFB=-0.0160674;REVB=0.000473997;RO=162;SAF=78;SAR=53;SRF=101;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0292405;STB=0.516778;TYPE=snp;VARB=0.0207329;OID=.;OPOS=26556769;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:296:296:162:165:131:131:53:78:101:61:53:78:103:62 chr6 26556843 . G A 480.42 PASS AO=123;DP=264;FAO=123;FDP=264;FR=.;FRO=141;FSAF=60;FSAR=63;FSRF=61;FSRR=80;FWDB=0.00379611;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=166.739;QD=7.27911;RBI=0.0076989;REFB=-0.00675467;REVB=-0.00669796;RO=140;SAF=60;SAR=63;SRF=60;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0572805;STB=0.529527;TYPE=snp;VARB=0.00759036;OID=.;OPOS=26556843;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:264:264:140:141:123:123:63:60:60:80:63:60:61:80 chr6 26572165 . G T 88.44 PASS AO=54;DP=141;FAO=39;FDP=136;FR=.;FRO=97;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=45;FSRR=52;FWDB=0.0367518;FXX=0.0354585;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.456;QD=2.60123;RBI=0.0375992;REFB=0.00429936;REVB=-0.00793741;RO=70;SAF=27;SAR=27;SRF=20;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217476;STB=0.597887;TYPE=snp;VARB=-0.0108635;OID=.;OPOS=26572165;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:141:136:70:97:54:39:27:27:20:50:26:13:45:52 chr6 26575798 . CT C 422.38 PASS AO=212;DP=474;FAO=182;FDP=394;FR=.;FRO=212;FSAF=104;FSAR=78;FSRF=117;FSRR=95;FWDB=0.03855;FXX=0.0149996;HRUN=3;LEN=1;MLLD=22.1775;QD=4.28812;RBI=0.0843603;REFB=0.024721;REVB=-0.075037;RO=233;SAF=122;SAR=90;SRF=130;SRR=103;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.017038;STB=0.5107;TYPE=del;VARB=-0.0245353;OID=.;OPOS=26575799;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:212:472:182:394:212:104:78:117:95:99:233:122:90:130:103 chr6 26577326 . C A 773.88 PASS AO=223;DP=467;FAO=192;FDP=400;FR=.;FRO=208;FSAF=86;FSAR=106;FSRF=107;FSRR=101;FWDB=-0.0235051;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.38;QD=7.73879;RBI=0.0292253;REFB=-0.0161134;REVB=0.0173675;RO=242;SAF=106;SAR=117;SRF=130;SRR=112;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0585712;STB=0.534706;TYPE=snp;VARB=0.0156896;OID=.;OPOS=26577326;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:467:400:242:208:223:192:117:106:130:112:106:86:107:101 chr6 26577370 . C T 740.76 PASS AO=273;DP=547;FAO=188;FDP=399;FR=.;FRO=211;FSAF=85;FSAR=103;FSRF=113;FSRR=98;FWDB=0.00211138;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.282;QD=7.42615;RBI=0.0252148;REFB=-0.0213368;REVB=-0.0251262;RO=274;SAF=130;SAR=143;SRF=148;SRR=126;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0585216;STB=0.54414;TYPE=snp;VARB=0.025164;OID=.;OPOS=26577370;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:547:399:274:211:273:188:143:130:148:126:103:85:113:98 chr6 26595168 . T C 251.34 PASS AO=91;DP=360;FAO=118;FDP=385;FR=.;FRO=267;FSAF=47;FSAR=71;FSRF=127;FSRR=140;FWDB=0.0595665;FXX=0.0350868;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.0675;QD=2.6113;RBI=0.0624492;REFB=-0.0227266;REVB=-0.0187545;RO=259;SAF=21;SAR=70;SRF=123;SRR=136;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.333718;STB=0.554703;TYPE=snp;VARB=0.06222;OID=.;OPOS=26595168;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:360:385:259:267:91:118:70:21:123:136:71:47:127:140 chr6 26597333 . A G 952.21 PASS AO=102;DP=103;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0219916;FXX=0.0097078;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.435;QD=37.3417;RBI=0.0255086;REFB=-0.0232049;REVB=0.0129251;RO=0;SAF=43;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.50103e-05;OID=.;OPOS=26597333;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:103:102:0:0:102:102:59:43:0:0:59:43:0:0 chr6 26598188 . A G 200.02 PASS AO=38;DP=78;FAO=47;FDP=93;FR=.;FRO=46;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=30;FWDB=0.0201564;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=27.4289;QD=8.603;RBI=0.101711;REFB=-0.0750955;REVB=-0.0996941;RO=40;SAF=20;SAR=18;SRF=15;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138723;STB=0.600502;TYPE=snp;VARB=0.0624414;OID=.;OPOS=26598188;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:93:40:46:38:47:18:20:15:25:21:26:16:30 chr6 26638503 . G A 56.72 PASS AO=17;DP=47;FAO=17;FDP=47;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.0105443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.224;QD=4.82746;RBI=0.0188233;REFB=-0.00539316;REVB=0.0155928;RO=30;SAF=12;SAR=5;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.271037;STB=0.659492;TYPE=snp;VARB=0.0123048;OID=.;OPOS=26638503;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:47:47:30:30:17:17:5:12:14:16:5:12:14:16 chr6 26701709 . C T 88.56 PASS AO=76;DP=348;FAO=76;FDP=350;FR=.;FRO=274;FSAF=29;FSAR=47;FSRF=121;FSRR=153;FWDB=0.0405547;FXX=0.00284892;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.8883;QD=1.01207;RBI=0.0422148;REFB=0.000534134;REVB=-0.011722;RO=268;SAF=29;SAR=47;SRF=119;SRR=149;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0825131;STB=0.548625;TYPE=snp;VARB=-0.00208856;OID=.;OPOS=26701709;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:348:350:268:274:76:76:47:29:119:149:47:29:121:153 chr6 26705613 . T G 57.32 PASS AO=71;DP=379;FAO=71;FDP=379;FR=.;FRO=308;FSAF=34;FSAR=37;FSRF=175;FSRR=133;FWDB=-0.0335238;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.075;QD=0.604964;RBI=0.047111;REFB=-0.00715934;REVB=0.0330998;RO=307;SAF=34;SAR=37;SRF=175;SRR=132;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117967;STB=0.572244;TYPE=snp;VARB=0.0365689;OID=.;OPOS=26705613;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:379:379:307:308:71:71:37:34:175:132:37:34:175:133 chr6 26745250 . A G 149.22 PASS AO=51;DP=142;FAO=51;FDP=142;FR=.;FRO=91;FSAF=46;FSAR=5;FSRF=43;FSRR=48;FWDB=0.00594818;FXX=0.00699252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.7148;QD=4.20326;RBI=0.0455099;REFB=-0.0150159;REVB=-0.0451196;RO=90;SAF=46;SAR=5;SRF=43;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.587988;STB=0.845488;TYPE=snp;VARB=0.00594764;OID=.;OPOS=26745250;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:90:91:51:51:5:46:43:47:5:46:43:48 chr6 26745254 . C G 537.48 PASS AO=95;DP=148;FAO=95;FDP=148;FR=.;FRO=53;FSAF=47;FSAR=48;FSRF=48;FSRR=5;FWDB=-0.00222905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.949;QD=14.5264;RBI=0.0374011;REFB=0.000986473;REVB=0.0373346;RO=53;SAF=47;SAR=48;SRF=48;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.273522;STB=0.646688;TYPE=snp;VARB=-0.00102239;OID=.;OPOS=26745254;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:53:53:95:95:48:47:48:5:48:47:48:5 chr6 26745257 . G A 152.86 PASS AO=53;DP=149;FAO=53;FDP=149;FR=.;FRO=96;FSAF=48;FSAR=5;FSRF=49;FSRR=47;FWDB=-0.0278481;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.8556;QD=4.10357;RBI=0.0509649;REFB=-0.0330053;REVB=-0.0426837;RO=95;SAF=48;SAR=5;SRF=48;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.578497;STB=0.83715;TYPE=snp;VARB=0.0197308;OID=.;OPOS=26745257;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:95:96:53:53:5:48:48:47:5:48:49:47 chr6 26745260 . A G 139.9 PASS AO=51;DP=149;FAO=51;FDP=149;FR=.;FRO=98;FSAF=47;FSAR=4;FSRF=49;FSRR=49;FWDB=-0.00474721;FXX=0.00666622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.178;QD=3.75569;RBI=0.00816638;REFB=-0.00238014;REVB=0.00664482;RO=97;SAF=47;SAR=4;SRF=49;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.61734;STB=0.866261;TYPE=snp;VARB=0.0141359;OID=.;OPOS=26745260;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:97:98:51:51:4:47:49:48:4:47:49:49 chr6 26745262 . T C 144.98 PASS AO=52;DP=148;FAO=52;FDP=150;FR=.;FRO=98;FSAF=48;FSAR=4;FSRF=49;FSRR=49;FWDB=-0.00949473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.825;QD=3.86603;RBI=0.0181929;REFB=0.000958318;REVB=0.0155188;RO=96;SAF=48;SAR=4;SRF=48;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.623212;STB=0.867495;TYPE=snp;VARB=-0.00361176;OID=.;OPOS=26745262;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:150:96:98:52:52:4:48:48:48:4:48:49:49 chr6 26745286 . A G 228.32 PASS AO=71;DP=178;FAO=70;FDP=178;FR=.;FRO=108;FSAF=47;FSAR=23;FSRF=53;FSRR=55;FWDB=0.0367786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.807;QD=5.13079;RBI=0.0372559;REFB=0.00351258;REVB=-0.00594424;RO=107;SAF=48;SAR=23;SRF=52;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211582;STB=0.614448;TYPE=snp;VARB=-0.0147847;OID=.;OPOS=26745286;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:178:107:108:71:70:23:48:52:55:23:47:53:55 chr6 26758631 . A G 35.35 PASS AO=17;DP=67;FAO=17;FDP=67;FR=.;FRO=50;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=0.00467022;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.1289;QD=2.11067;RBI=0.0548602;REFB=-0.0152852;REVB=-0.0546611;RO=49;SAF=13;SAR=4;SRF=27;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.288076;STB=0.686653;TYPE=snp;VARB=0.0471252;OID=.;OPOS=26758631;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:67:67:49:50:17:17:4:13:27:22:4:13:27:23 chr6 26758632 . T C 35.28 PASS AO=17;DP=68;FAO=17;FDP=67;FR=.;FRO=50;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=-0.0400224;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.6432;QD=2.10628;RBI=0.094117;REFB=0.00184766;REVB=-0.0851834;RO=49;SAF=13;SAR=4;SRF=26;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.310316;STB=0.686653;TYPE=snp;VARB=-0.0176369;OID=.;OPOS=26758632;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:68:67:49:50:17:17:4:13:26:23:4:13:27:23 chr6 26758635 . T C 34.45 PASS AO=17;DP=66;FAO=17;FDP=68;FR=.;FRO=51;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=28;FSRR=23;FWDB=0.0110646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.517;QD=2.02628;RBI=0.0449218;REFB=0.00256784;REVB=-0.0435378;RO=49;SAF=13;SAR=4;SRF=27;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.288076;STB=0.681324;TYPE=snp;VARB=-0.0107327;OID=.;OPOS=26758635;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:66:68:49:51:17:17:4:13:27:22:4:13:28:23 chr6 26796080 . T C 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0426452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.2848;QD=35.0875;RBI=0.0426452;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=7;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0047144;OID=.;OPOS=26796080;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:0:7:0:0:0:7:0:0 chr6 27181610 . G A 457.49 PASS AO=46;DP=46;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0494623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.832;QD=37.3462;RBI=0.0852199;REFB=0;REVB=0.0693968;RO=0;SAF=29;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00245243;OID=.;OPOS=27181610;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:46:49:0:0:46:49:17:29:0:0:18:31:0:0 chr6 27181701 . T C 1161.39 PASS AO=122;DP=123;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0190931;FXX=0.00812942;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.6791;QD=38.0783;RBI=0.0244035;REFB=0;REVB=0.0151982;RO=0;SAF=57;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.8597e-05;OID=.;OPOS=27181701;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:123:122:0:0:122:122:65:57:0:0:65:57:0:0 chr6 27261661 . A C 399.04 PASS AO=97;DP=206;FAO=98;FDP=205;FR=.;FRO=107;FSAF=64;FSAR=34;FSRF=70;FSRR=37;FWDB=0.00660864;FXX=0.0144224;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.114;QD=7.78604;RBI=0.0627587;REFB=-0.0040553;REVB=-0.0624097;RO=106;SAF=64;SAR=33;SRF=69;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0092947;STB=0.500659;TYPE=snp;VARB=0.00456148;OID=.;OPOS=27261661;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:206:205:106:107:97:98:33:64:69:37:34:64:70:37 chr6 27261700 . C G 498.29 PASS AO=122;DP=252;FAO=122;FDP=251;FR=.;FRO=129;FSAF=66;FSAR=56;FSRF=73;FSRR=56;FWDB=0.0259308;FXX=0.00790483;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.335;QD=7.94087;RBI=0.0331695;REFB=-0.0110885;REVB=-0.0206836;RO=129;SAF=67;SAR=55;SRF=74;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.023142;STB=0.512913;TYPE=snp;VARB=0.010387;OID=.;OPOS=27261700;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:252:251:129:129:122:122:55:67:74:55:56:66:73:56 chr6 27271575 . G C 597.66 PASS AO=145;DP=298;FAO=145;FDP=297;FR=.;FRO=152;FSAF=84;FSAR=61;FSRF=91;FSRR=61;FWDB=0.00465167;FXX=0.00335559;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.155;QD=8.04926;RBI=0.0128668;REFB=-0.000314965;REVB=-0.0119966;RO=152;SAF=84;SAR=61;SRF=91;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0185797;STB=0.510203;TYPE=snp;VARB=0.000303827;OID=.;OPOS=27271575;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:298:297:152:152:145:145:61:84:91:61:61:84:91:61 chr6 27277402 . C T 689.99 PASS AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00264807;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152;QD=37.8075;RBI=0.00324415;REFB=0;REVB=-0.00187409;RO=0;SAF=43;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.25179e-06;OID=.;OPOS=27277402;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:73:73:0:0:73:73:30:43:0:0:30:43:0:0 chr6 27278020 . C A 244.93 PASS AO=82;DP=221;FAO=82;FDP=222;FR=.;FRO=140;FSAF=25;FSAR=57;FSRF=58;FSRR=82;FWDB=0.057391;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.4565;QD=4.41311;RBI=0.0591866;REFB=0.00614645;REVB=-0.0144679;RO=133;SAF=25;SAR=57;SRF=55;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131679;STB=0.57651;TYPE=snp;VARB=-0.0127113;OID=.;OPOS=27278020;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:222:133:140:82:82:57:25:55:78:57:25:58:82 chr6 27279852 . T C 94.5 PASS AO=18;DP=28;FAO=18;FDP=28;FR=.;FRO=10;FSAF=17;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.00687619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.89;QD=13.4998;RBI=0.0157511;REFB=-0.00962439;REVB=-0.0141709;RO=9;SAF=17;SAR=1;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.430041;STB=0.786599;TYPE=snp;VARB=0.0125814;OID=.;OPOS=27279852;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:28:28:9:10:18:18:1:17:6:3:1:17:6:4 chr6 27327349 . C G 430.57 PASS AO=116;DP=260;FAO=116;FDP=261;FR=.;FRO=145;FSAF=66;FSAR=50;FSRF=77;FSRR=68;FWDB=0.00543978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.6278;QD=6.59875;RBI=0.0203131;REFB=-0.015706;REVB=-0.0195712;RO=143;SAF=66;SAR=50;SRF=77;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0308177;STB=0.521351;TYPE=snp;VARB=0.0189305;OID=.;OPOS=27327349;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:260:261:143:145:116:116:50:66:77:66:50:66:77:68 chr6 27356867 . A G 351.11 PASS AO=36;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0190076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.499;QD=37.9583;RBI=0.0191116;REFB=0;REVB=-0.00199093;RO=0;SAF=11;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58193e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.03551e-05;OID=.;OPOS=27356867;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:36:37:0:0:36:37:25:11:0:0:26:11:0:0 chr6 27356902 . A G 37.68 PASS AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=-0.0294826;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2002;QD=5.5827;RBI=0.099881;REFB=-0.00801228;REVB=-0.0954306;RO=16;SAF=2;SAR=8;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230172;STB=0.627169;TYPE=snp;VARB=0.00853123;OID=.;OPOS=27356902;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:26:27:16:17:10:10:8:2:6:10:8:2:6:11 chr6 27356925 . T G 36.55 PASS AO=10;DP=27;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.0226815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.651;QD=5.22097;RBI=0.0270965;REFB=-0.0196859;REVB=0.0148247;RO=17;SAF=2;SAR=8;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.272686;STB=0.654202;TYPE=snp;VARB=0.0224297;OID=.;OPOS=27356925;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:27:28:17:18:10:10:8:2:7:10:8:2:7:11 chr6 27369873 . C T 205.88 PASS AO=65;DP=169;FAO=65;FDP=169;FR=.;FRO=104;FSAF=25;FSAR=40;FSRF=48;FSRR=56;FWDB=0.0141268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.736;QD=4.87289;RBI=0.0162403;REFB=0.00991789;REVB=0.00801125;RO=102;SAF=25;SAR=40;SRF=48;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0956215;STB=0.548857;TYPE=snp;VARB=-0.0146628;OID=.;OPOS=27369873;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:169:102:104:65:65:40:25:48:54:40:25:48:56 chr6 27369892 . C T 171.19 PASS AO=60;DP=170;FAO=60;FDP=169;FR=.;FRO=109;FSAF=22;FSAR=38;FSRF=45;FSRR=64;FWDB=-0.0179535;FXX=0.00588201;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.4676;QD=4.05174;RBI=0.0238068;REFB=-0.020891;REVB=-0.0156345;RO=109;SAF=22;SAR=38;SRF=45;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0551356;STB=0.531513;TYPE=snp;VARB=0.0315307;OID=.;OPOS=27369892;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:169:109:109:60:60:38:22:45:64:38:22:45:64 chr6 27370046 . T G 149.98 PASS AO=45;DP=114;FAO=45;FDP=114;FR=.;FRO=69;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=22;FSRR=47;FWDB=-0.00162152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.496;QD=5.26251;RBI=0.0128795;REFB=0.00545165;REVB=0.012777;RO=69;SAF=17;SAR=28;SRF=22;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0684201;STB=0.53864;TYPE=snp;VARB=-0.00783004;OID=.;OPOS=27370046;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:69:69:45:45:28:17:22:47:28:17:22:47 chr6 27370473 . T C 65.5 PASS AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=16;FWDB=0.00482476;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8415;QD=7.08149;RBI=0.021344;REFB=0.0328057;REVB=0.0207915;RO=20;SAF=7;SAR=9;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190615;STB=0.618239;TYPE=snp;VARB=-0.0565439;OID=.;OPOS=27370473;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:36:37:20:21:16:16:9:7:5:15:9:7:5:16 chr6 27370544 . G GT 20.11 PASS AO=6;DP=21;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.158577;FXX=0.117578;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.43951;QD=5.36201;RBI=0.329119;REFB=-0.0391413;REVB=0.288397;RO=13;SAF=4;SAR=2;SRF=2;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.517567;STB=0.545355;TYPE=ins;VARB=0.104099;OID=.;OPOS=27370545;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:6:21:9:15:6:4:5:2:4:15:13:4:2:2:11 chr6 27371011 . C T 191.85 PASS AO=46;DP=98;FAO=46;FDP=97;FR=.;FRO=51;FSAF=17;FSAR=29;FSRF=27;FSRR=24;FWDB=-0.00587986;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.986;QD=7.91123;RBI=0.0186004;REFB=-0.00292052;REVB=0.0176466;RO=51;SAF=17;SAR=29;SRF=27;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154448;STB=0.58609;TYPE=snp;VARB=0.00431941;OID=.;OPOS=27371011;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:97:51:51:46:46:29:17:27:24:29:17:27:24 chr6 27371193 . G A 376.44 PASS AO=82;DP=159;FAO=83;FDP=157;FR=.;FRO=74;FSAF=26;FSAR=57;FSRF=30;FSRR=44;FWDB=-0.0601131;FXX=0.0125778;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.6116;QD=9.59076;RBI=0.0618014;REFB=-0.0208353;REVB=-0.0143469;RO=75;SAF=26;SAR=56;SRF=30;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0805045;STB=0.54863;TYPE=snp;VARB=0.0170174;OID=.;OPOS=27371193;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:157:75:74:82:83:56:26:30:45:57:26:30:44 chr6 27425185 . C A 445.26 PASS AO=95;DP=183;FAO=98;FDP=188;FR=.;FRO=90;FSAF=48;FSAR=50;FSRF=34;FSRR=56;FWDB=0.0227615;FXX=0.0105258;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.681;QD=9.4737;RBI=0.0295845;REFB=-0.0242173;REVB=0.0188986;RO=86;SAF=47;SAR=48;SRF=34;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0864051;STB=0.553755;TYPE=snp;VARB=0.0175636;OID=.;OPOS=27425185;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:188:86:90:95:98:48:47:34:52:50:48:34:56 chr6 27435707 . G A 298.91 PASS AO=56;DP=123;FAO=58;FDP=120;FR=.,HEALED;FRO=51;FSAF=12;FSAR=46;FSRF=13;FSRR=38;FWDB=-0.0281735;FXX=0.00826378;HRUN=5;LEN=1;MLLD=30.8803;QD=9.96351;RBI=0.0743993;REFB=-0.069187;REVB=-0.0688586;RO=33;SAF=11;SAR=45;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134016;STB=0.532889;TYPE=snp;VARB=0.0248631;OID=.;OPOS=27435707;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:33:51:56:58:45:11:11:22:46:12:13:38 chr6 27447535 . C CT 303.59 PASS AO=51;DP=150;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.15763;FXX=0.00714235;HRUN=8;LEN=1;MLLD=5.17865;QD=8.73644;RBI=0.187692;REFB=0;REVB=0.101887;RO=66;SAF=19;SAR=32;SRF=34;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146899;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00094444;OID=.;OPOS=27447536;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:51:150:139:139:0:58:81:0:0:21:66:19:32:34:32 chr6 27471515 . A G 314.28 PASS AO=64;DP=114;FAO=64;FDP=114;FR=.;FRO=50;FSAF=53;FSAR=11;FSRF=43;FSRR=7;FWDB=-0.0191916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.322;QD=11.0274;RBI=0.0193411;REFB=-0.0022143;REVB=0.00240043;RO=49;SAF=53;SAR=11;SRF=42;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0417609;STB=0.525365;TYPE=snp;VARB=0.00152808;OID=.;OPOS=27471515;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:49:50:64:64:11:53:42:7:11:53:43:7 chr6 27515519 . A C 172.47 PASS AO=45;DP=102;FAO=45;FDP=102;FR=.;FRO=57;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=33;FSRR=24;FWDB=-0.00338273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.208;QD=6.76366;RBI=0.0518498;REFB=0.00718926;REVB=0.0517393;RO=55;SAF=27;SAR=18;SRF=32;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0185324;STB=0.51219;TYPE=snp;VARB=-0.00902784;OID=.;OPOS=27515519;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:55:57:45:45:18:27:32:23:18:27:33:24 chr6 27551316 . C G 653.9 PASS AO=163;DP=345;FAO=163;FDP=342;FR=.;FRO=179;FSAF=15;FSAR=148;FSRF=14;FSRR=165;FWDB=0.00377161;FXX=0.0256403;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.561;QD=7.64789;RBI=0.0149038;REFB=0.00419271;REVB=-0.0144187;RO=128;SAF=15;SAR=148;SRF=11;SRR=117;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149618;STB=0.522419;TYPE=snp;VARB=-0.00348836;OID=.;OPOS=27551316;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:345:342:128:179:163:163:148:15:11:117:148:15:14:165 chr6 27560587 . A G 227.07 PASS AO=61;DP=140;FAO=61;FDP=140;FR=.;FRO=79;FSAF=24;FSAR=37;FSRF=48;FSRR=31;FWDB=0.00922578;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=228.599;QD=6.48763;RBI=0.00942986;REFB=0.00291774;REVB=0.00195123;RO=79;SAF=24;SAR=37;SRF=48;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215083;STB=0.620073;TYPE=snp;VARB=-0.00385184;OID=.;OPOS=27560587;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:79:79:61:61:37:24:48:31:37:24:48:31 chr6 27573456 . A G 115.79 PASS AO=20;DP=107;FAO=40;FDP=106;FR=.,HEALED;FRO=66;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=27;FSRR=39;FWDB=0.0166168;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.864;QD=4.3694;RBI=0.0174909;REFB=-0.0180731;REVB=-0.00546012;RO=62;SAF=14;SAR=6;SRF=24;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.377075;STB=0.510159;TYPE=snp;VARB=0.016893;OID=.;OPOS=27573456;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:106:62:66:20:40:6:14:24:38:23:17:27:39 chr6 27573463 . G A 361.79 PASS AO=61;DP=104;FAO=68;FDP=111;FR=.;FRO=43;FSAF=28;FSAR=40;FSRF=17;FSRR=26;FWDB=0.0256529;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.224;QD=13.0373;RBI=0.0256756;REFB=-0.0155781;REVB=-0.00107863;RO=43;SAF=26;SAR=35;SRF=17;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240326;STB=0.506577;TYPE=snp;VARB=0.008838;OID=.;OPOS=27573463;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:111:43:43:61:68:35:26:17:26:40:28:17:26 chr6 27688927 . G A 429.08 PASS AO=78;DP=126;FAO=78;FDP=125;FR=.;FRO=47;FSAF=47;FSAR=31;FSRF=36;FSRR=11;FWDB=-0.0714895;FXX=0.00793588;HRUN=3;LEN=1;MLLD=68.9244;QD=13.7304;RBI=0.0763781;REFB=-0.00511036;REVB=0.0268862;RO=46;SAF=47;SAR=31;SRF=35;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116529;STB=0.565851;TYPE=snp;VARB=0.00209082;OID=.;OPOS=27688927;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:125:46:47:78:78:31:47:35:11:31:47:36:11 chr6 27688930 . C T 419.75 PASS AO=77;DP=124;FAO=77;FDP=124;FR=.;FRO=47;FSAF=46;FSAR=31;FSRF=36;FSRR=11;FWDB=0.000543004;FXX=0.00799936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.368;QD=13.5402;RBI=0.00276332;REFB=-0.0101295;REVB=0.00270945;RO=46;SAF=46;SAR=31;SRF=36;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137291;STB=0.568155;TYPE=snp;VARB=0.00874702;OID=.;OPOS=27688930;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:46:47:77:77:31:46:36:10:31:46:36:11 chr6 27745719 . T G 98.37 PASS AO=16;DP=26;FAO=17;FDP=25;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.0030115;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.39;QD=15.7396;RBI=0.00311075;REFB=-0.02734;REVB=-0.00077954;RO=7;SAF=7;SAR=9;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168452;STB=0.612316;TYPE=snp;VARB=0.00855875;OID=.;OPOS=27745719;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:26:25:7:8:16:17:9:7:1:6:9:8:1:7 chr6 27745738 . G A 95.36 PASS AO=13;DP=19;FAO=14;FDP=20;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.00101545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.214;QD=19.0719;RBI=0.0281945;REFB=-0.00255089;REVB=0.0281762;RO=5;SAF=5;SAR=8;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0995427;STB=0.564429;TYPE=snp;VARB=0.000948492;OID=.;OPOS=27745738;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:19:20:5:6:13:14:8:5:1:4:9:5:1:5 chr6 27782559 . A G 71.51 PASS AO=25;DP=77;FAO=26;FDP=80;FR=.;FRO=54;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=40;FWDB=-0.0733691;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=68.295;QD=3.57558;RBI=0.0769751;REFB=-0.0100607;REVB=-0.0232838;RO=52;SAF=9;SAR=16;SRF=14;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118837;STB=0.567429;TYPE=snp;VARB=0.0351298;OID=.;OPOS=27782559;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:77:80:52:54:25:26:16:9:14:38:17:9:14:40 chr6 27782564 . A G 63.85 PASS AO=23;DP=74;FAO=24;FDP=76;FR=.;FRO=52;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=39;FWDB=-0.00627075;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=119.044;QD=3.36034;RBI=0.00937177;REFB=-0.00503401;REVB=-0.00696475;RO=50;SAF=9;SAR=14;SRF=13;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168944;STB=0.595515;TYPE=snp;VARB=0.0120898;OID=.;OPOS=27782564;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:74:76:50:52:23:24:14:9:13:37:15:9:13:39 chr6 27792221 . C T 404.17 PASS AO=47;DP=50;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.106949;FXX=0.019996;HRUN=3;LEN=1;MLLD=35.9972;QD=32.9932;RBI=0.215868;REFB=-0.191987;REVB=0.187512;RO=3;SAF=21;SAR=26;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129486;STB=0.509087;TYPE=snp;VARB=0.0319539;OID=.;OPOS=27792221;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:50:49:3:1:47:48:26:21:1:2:27:21:0:1 chr6 27792228 . T C 484.59 PASS AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.528;QD=38.7675;RBI=0.0433997;REFB=0;REVB=-0.0409605;RO=0;SAF=22;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.15703e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.3481e-05;OID=.;OPOS=27792228;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:50:50:0:0:50:50:28:22:0:0:28:22:0:0 chr6 27834702 . C T 135.35 PASS AO=32;DP=95;FAO=38;FDP=90;FR=.,HEALED;FRO=52;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=28;FSRR=24;FWDB=0.033007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.222;QD=6.0157;RBI=0.0462807;REFB=-0.018615;REVB=0.0324413;RO=31;SAF=17;SAR=15;SRF=8;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.239486;STB=0.50826;TYPE=snp;VARB=0.0242214;OID=.;OPOS=27834702;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:90:31:52:32:38:15:17:8:23:17:21:28:24 chr6 27835055 . G A 215.08 PASS AO=39;DP=63;FAO=39;FDP=63;FR=.;FRO=24;FSAF=27;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=-0.00809755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.276;QD=13.6559;RBI=0.00885705;REFB=0.00145226;REVB=-0.00358844;RO=23;SAF=27;SAR=12;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.064679;STB=0.529396;TYPE=snp;VARB=-0.000821736;OID=.;OPOS=27835055;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:63:63:23:24:39:39:12:27:14:9:12:27:15:9 chr6 27839746 . T C 194.33 PASS AO=51;DP=115;FAO=51;FDP=116;FR=.;FRO=65;FSAF=14;FSAR=37;FSRF=25;FSRR=40;FWDB=0.0117691;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=79.0322;QD=6.70102;RBI=0.0410151;REFB=-0.00235421;REVB=0.0392903;RO=63;SAF=14;SAR=37;SRF=23;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105947;STB=0.572362;TYPE=snp;VARB=0.00322504;OID=.;OPOS=27839746;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:116:63:65:51:51:37:14:23:40:37:14:25:40 chr6 27925629 . A T 636.32 PASS AO=150;DP=300;FAO=150;FDP=299;FR=.;FRO=149;FSAF=71;FSAR=79;FSRF=80;FSRR=69;FWDB=0.0261907;FXX=0.00333322;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2001;QD=8.51259;RBI=0.0270554;REFB=-0.0472511;REVB=-0.0067852;RO=148;SAF=71;SAR=79;SRF=80;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0608824;STB=0.531662;TYPE=snp;VARB=0.0409568;OID=.;OPOS=27925629;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:300:299:148:149:150:150:79:71:80:68:79:71:80:69 chr6 28059020 . G A 217.41 PASS AO=55;DP=126;FAO=57;FDP=128;FR=.;FRO=71;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=36;FSRR=35;FWDB=-0.000207726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.2959;QD=6.79409;RBI=0.059521;REFB=0.00262997;REVB=0.0595207;RO=69;SAF=30;SAR=25;SRF=36;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0237574;STB=0.510705;TYPE=snp;VARB=-0.0031704;OID=.;OPOS=28059020;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:128:69:71:55:57:25:30:36:33:27:30:36:35 chr6 28059217 . G C 166.01 PASS AO=50;DP=130;FAO=51;FDP=131;FR=.;FRO=80;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=29;FSRR=51;FWDB=0.0221009;FXX=0.00757518;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.737;QD=5.06912;RBI=0.0292797;REFB=-0.0039754;REVB=0.0192055;RO=80;SAF=19;SAR=31;SRF=29;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0202712;STB=0.519144;TYPE=snp;VARB=0.0077947;OID=.;OPOS=28059217;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:131:80:80:50:51:31:19:29:51:31:20:29:51 chr6 28104634 . G T 308.24 PASS AO=88;DP=209;FAO=92;FDP=225;FR=.;FRO=133;FSAF=53;FSAR=39;FSRF=55;FSRR=78;FWDB=0.00671594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.212;QD=5.47982;RBI=0.0166612;REFB=-0.0182562;REVB=-0.0152477;RO=121;SAF=51;SAR=37;SRF=51;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163259;STB=0.595485;TYPE=snp;VARB=0.0326048;OID=.;OPOS=28104634;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:225:121:133:88:92:37:51:51:70:39:53:55:78 chr6 28120898 . G A 209.73 PASS AO=44;DP=82;FAO=44;FDP=82;FR=.;FRO=38;FSAF=31;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=0.00040227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.227;QD=10.2305;RBI=0.0230651;REFB=-0.0380162;REVB=0.0230616;RO=37;SAF=31;SAR=13;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0793816;STB=0.552841;TYPE=snp;VARB=0.0346519;OID=.;OPOS=28120898;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:37:38:44:44:13:31:23:14:13:31:23:15 chr6 28134582 . C T 286.42 PASS AO=66;DP=132;FAO=66;FDP=132;FR=.;FRO=66;FSAF=23;FSAR=43;FSRF=23;FSRR=43;FWDB=0.028732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.874;QD=8.67937;RBI=0.0296695;REFB=-0.0199443;REVB=-0.00739968;RO=66;SAF=23;SAR=43;SRF=23;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0206601;OID=.;OPOS=28134582;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:66:66:66:66:43:23:23:43:43:23:23:43 chr6 28219270 . G A 581.6 PASS AO=127;DP=239;FAO=127;FDP=239;FR=.;FRO=112;FSAF=49;FSAR=78;FSRF=57;FSRR=55;FWDB=-0.0443669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.5258;QD=9.73392;RBI=0.0497373;REFB=0.00938066;REVB=-0.0224807;RO=111;SAF=49;SAR=78;SRF=57;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11177;STB=0.559206;TYPE=snp;VARB=-0.006041;OID=.;OPOS=28219270;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:239:239:111:112:127:127:78:49:57:54:78:49:57:55 chr6 28219661 . G A 89.99 PASS AO=21;DP=45;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=18;FWDB=-0.0148957;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1315;QD=7.99915;RBI=0.0386923;REFB=0.0121236;REVB=0.0357101;RO=24;SAF=11;SAR=10;SRF=6;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.256468;STB=0.644224;TYPE=snp;VARB=-0.0107871;OID=.;OPOS=28219661;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:45:45:24:24:21:21:10:11:6:18:10:11:6:18 chr6 28227633 . C T 261.85 PASS AO=47;DP=79;FAO=47;FDP=76;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=38;FSRF=8;FSRR=21;FWDB=0.00153887;FXX=0.0379699;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.335;QD=13.7816;RBI=0.00906318;REFB=-0.0233386;REVB=0.00893158;RO=29;SAF=9;SAR=38;SRF=8;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0891828;STB=0.548831;TYPE=snp;VARB=0.0207308;OID=.;OPOS=28227633;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:79:76:29:29:47:47:38:9:8:21:38:9:8:21 chr6 28228342 . A G 239.48 PASS AO=56;DP=119;FAO=57;FDP=119;FR=.;FRO=62;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=27;FSRR=35;FWDB=-0.0148094;FXX=0.0165276;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.146;QD=8.04966;RBI=0.0207875;REFB=-0.0162478;REVB=0.0145876;RO=63;SAF=31;SAR=25;SRF=27;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118835;STB=0.55632;TYPE=snp;VARB=0.0119642;OID=.;OPOS=28228342;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:63:62:56:57:25:31:27:36:26:31:27:35 chr6 28239915 . G A 142.05 PASS AO=43;DP=110;FAO=43;FDP=111;FR=.;FRO=68;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=27;FSRR=41;FWDB=0.00171561;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=113.963;QD=5.11897;RBI=0.0185272;REFB=-0.000421711;REVB=0.0184476;RO=66;SAF=25;SAR=18;SRF=27;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182827;STB=0.611728;TYPE=snp;VARB=0.000221692;OID=.;OPOS=28239915;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:111:66:68:43:43:18:25:27:39:18:25:27:41 chr6 28239932 . T TG 614.35 PASS AO=78;DP=94;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0622552;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=25.6992;QD=29.9682;RBI=0.104869;REFB=0;REVB=0.0843906;RO=15;SAF=34;SAR=44;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0703934;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.0026979;OID=.;OPOS=28239933;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:78:94:82:82:0:35:47:0:0:54:15:34:44:10:5 chr6 28269663 . A G 614.31 PASS AO=130;DP=237;FAO=130;FDP=237;FR=.;FRO=107;FSAF=52;FSAR=78;FSRF=43;FSRR=64;FWDB=0.00366916;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.779;QD=10.3681;RBI=0.0105229;REFB=-0.0241281;REVB=-0.00986246;RO=106;SAF=52;SAR=78;SRF=43;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00485894;STB=0.500879;TYPE=snp;VARB=0.0185863;OID=.;OPOS=28269663;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:237:237:106:107:130:130:78:52:43:63:78:52:43:64 chr6 28270060 . AGGGT AGGT,AGGGA 575.61 PASS AO=33,66;DP=151;FAO=45,71;FDP=158;FR=.;FRO=42;FSAF=1,35;FSAR=44,36;FSRF=29;FSRR=13;FWDB=-0.0629399,0.033836;FXX=0.0186324;HRUN=3,1;LEN=1,1;MLLD=13.7644,157.491;QD=14.5724;RBI=0.064525,0.0338687;REFB=-0.172085,-0.0525257;REVB=0.0142145,-0.00148868;RO=39;SAF=2,34;SAR=31,32;SRF=28;SRR=11;SSEN=0.446729,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.731353,-0.139961;STB=0.958344,0.573257;TYPE=del,snp;VARB=0.0714404,0.0365249;OID=.,.;OPOS=28270061,28270064;OREF=G,T;OALT=-,A;OMAPALT=AGGT,AGGGA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:33,66:138:45,71:158:42:1,35:44,36:29:13:99:39:2,34:31,32:28:11 chr6 28294550 . T C 252.63 PASS AO=86;DP=234;FAO=86;FDP=233;FR=.;FRO=147;FSAF=37;FSAR=49;FSRF=62;FSRR=85;FWDB=-0.00923702;FXX=0.00427332;HRUN=3;LEN=1;MLLD=243.136;QD=4.33697;RBI=0.0122858;REFB=-0.0117547;REVB=-0.00810054;RO=147;SAF=37;SAR=49;SRF=62;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00963237;STB=0.505453;TYPE=snp;VARB=0.0208659;OID=.;OPOS=28294550;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:234:233:147:147:86:86:49:37:62:85:49:37:62:85 chr6 28297313 . T A 613.6 PASS AO=126;DP=226;FAO=127;FDP=227;FR=.;FRO=100;FSAF=72;FSAR=55;FSRF=49;FSRR=51;FWDB=0.0226;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.3054;QD=10.8123;RBI=0.023598;REFB=-0.0172351;REVB=0.00678999;RO=97;SAF=72;SAR=54;SRF=46;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0784187;STB=0.534186;TYPE=snp;VARB=0.0199892;OID=.;OPOS=28297313;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:226:227:97:100:126:127:54:72:46:51:55:72:49:51 chr6 28327473 . GC G 430.1 PASS AO=54;DP=82;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0062999;FXX=0.0243873;HRUN=3;LEN=1;MLLD=10.2249;QD=21.505;RBI=0.243954;REFB=0;REVB=0.243873;RO=21;SAF=5;SAR=49;SRF=2;SRR=19;SSEN=0.612613;SSEP=0;SSSB=-0.00407324;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00612058;OID=.;OPOS=28327474;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:54:82:80:80:0:9:71:0:0:41:21:5:49:2:19 chr6 28328791 . CA C 196.04 PASS AO=65;DP=169;FAO=73;FDP=150;FR=.;FRO=77;FSAF=24;FSAR=49;FSRF=30;FSRR=47;FWDB=0.0553967;FXX=0.0506297;HRUN=2;LEN=1;MLLD=18.35;QD=5.22772;RBI=0.059658;REFB=-0.0108067;REVB=0.0221422;RO=69;SAF=20;SAR=45;SRF=28;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102195;STB=0.534536;TYPE=del;VARB=0.0147208;OID=.;OPOS=28328792;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:65:154:73:150:77:24:49:30:47:99:69:20:45:28:41 chr6 28331094 . G A 185.54 PASS AO=41;DP=81;FAO=41;FDP=81;FR=.;FRO=40;FSAF=9;FSAR=32;FSRF=13;FSRR=27;FWDB=-0.0476725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.06;QD=9.16239;RBI=0.0511751;REFB=-0.0105794;REVB=-0.0186069;RO=39;SAF=9;SAR=32;SRF=13;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133062;STB=0.570004;TYPE=snp;VARB=0.00789788;OID=.;OPOS=28331094;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:39:40:41:41:32:9:13:26:32:9:13:27 chr6 28331127 . A G 165.47 PASS AO=36;DP=70;FAO=36;FDP=71;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=8;FSRR=27;FWDB=-0.0546845;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=82.9538;QD=9.32245;RBI=0.055401;REFB=-0.00975973;REVB=0.00888102;RO=34;SAF=11;SAR=25;SRF=8;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0750179;STB=0.546298;TYPE=snp;VARB=0.00645983;OID=.;OPOS=28331127;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:71:34:35:36:36:25:11:8:26:25:11:8:27 chr6 28331128 . A C 164.56 PASS AO=36;DP=71;FAO=36;FDP=71;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=8;FSRR=27;FWDB=-0.00255862;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=216.879;QD=9.27074;RBI=0.00272548;REFB=0.00301929;REVB=0.000938989;RO=35;SAF=11;SAR=25;SRF=8;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0836751;STB=0.546298;TYPE=snp;VARB=-0.00378443;OID=.;OPOS=28331128;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:35:35:36:36:25:11:8:27:25:11:8:27 chr6 28358320 . A G 515.34 PASS AO=153;DP=369;FAO=153;FDP=369;FR=.;FRO=216;FSAF=75;FSAR=78;FSRF=138;FSRR=78;FWDB=-0.00779861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.822;QD=5.58628;RBI=0.008673;REFB=-0.0226275;REVB=-0.00379508;RO=215;SAF=75;SAR=78;SRF=137;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15406;STB=0.586766;TYPE=snp;VARB=0.0296263;OID=.;OPOS=28358320;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:369:369:215:216:153:153:78:75:137:78:78:75:138:78 chr6 28358335 . G C 468.87 PASS AO=121;DP=327;FAO=143;FDP=348;FR=.;FRO=205;FSAF=69;FSAR=74;FSRF=123;FSRR=82;FWDB=0.044551;FXX=0.00854676;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.561;QD=5.38932;RBI=0.0446702;REFB=-0.0342742;REVB=0.00326016;RO=206;SAF=47;SAR=74;SRF=124;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236059;STB=0.568948;TYPE=snp;VARB=0.0189491;OID=.;OPOS=28358335;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:327:348:206:205:121:143:74:47:124:82:74:69:123:82 chr6 28359170 . A G 448.64 PASS AO=96;DP=178;FAO=96;FDP=178;FR=.;FRO=82;FSAF=52;FSAR=44;FSRF=32;FSRR=50;FWDB=0.0390315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.36;QD=10.0818;RBI=0.0420957;REFB=-0.000807723;REVB=-0.0157665;RO=81;SAF=52;SAR=44;SRF=31;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132598;STB=0.569417;TYPE=snp;VARB=0.000797416;OID=.;OPOS=28359170;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:178:81:82:96:96:44:52:31:50:44:52:32:50 chr6 28483482 . A C 362.35 PASS AO=89;DP=186;FAO=89;FDP=186;FR=.;FRO=97;FSAF=46;FSAR=43;FSRF=54;FSRR=43;FWDB=-0.0171323;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=238.827;QD=7.79244;RBI=0.0210347;REFB=0.00155528;REVB=-0.0122042;RO=97;SAF=46;SAR=43;SRF=54;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0377462;STB=0.520829;TYPE=snp;VARB=-0.00158685;OID=.;OPOS=28483482;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:186:97:97:89:89:43:46:54:43:43:46:54:43 chr6 28542424 . G A 949.73 PASS AO=90;DP=91;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.178047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.9834;QD=38.373;RBI=0.178915;REFB=0;REVB=-0.0175972;RO=0;SAF=36;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000902124;OID=.;OPOS=28542424;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:91:99:0:0:90:99:54:36:0:0:55:44:0:0 chr6 28542520 . C T 1625.41 PASS AO=152;DP=152;FAO=173;FDP=173;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0342184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.526;QD=37.5817;RBI=0.0708869;REFB=0;REVB=0.062081;RO=0;SAF=79;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.3138e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.61434e-05;OID=.;OPOS=28542520;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:152:173:0:0:152:173:73:79:0:0:86:87:0:0 chr6 28543264 . C T 53.81 PASS AO=16;DP=50;FAO=16;FDP=46;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=0.00321803;FXX=0.132051;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.504;QD=4.67924;RBI=0.0117304;REFB=-0.00976428;REVB=0.0112803;RO=26;SAF=11;SAR=5;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.356248;STB=0.723415;TYPE=snp;VARB=0.00866207;OID=.;OPOS=28543264;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:50:46:26:30:16:16:5:11:9:17:5:11:10:20 chr6 28601934 . A T 890.41 PASS AO=100;DP=107;FAO=103;FDP=109;FR=.;FRO=6;FSAF=38;FSAR=65;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0464578;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.723;QD=32.6757;RBI=0.0464578;REFB=-0.0193952;REVB=-3.50951e-05;RO=3;SAF=36;SAR=64;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00159853;STB=0.502106;TYPE=snp;VARB=0.00109445;OID=.;OPOS=28601934;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:107:109:3:6:100:103:64:36:1:2:65:38:2:4 chr6 28616066 . T A 1241.82 PASS AO=129;DP=130;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00327757;FXX=0.00763301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.972;QD=38.2098;RBI=0.0203908;REFB=0;REVB=0.0201256;RO=0;SAF=38;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.3227e-06;OID=.;OPOS=28616066;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:130:130:0:0:129:130:91:38:0:0:92:38:0:0 chr6 28626098 . G A 1118.64 PASS AO=115;DP=120;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013744;FXX=0.0330551;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.384;QD=38.244;RBI=0.0148648;REFB=0;REVB=-0.00566241;RO=0;SAF=43;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.97004e-05;OID=.;OPOS=28626098;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:120:117:0:0:115:117:72:43:0:0:73:44:0:0 chr6 28663716 . A G 1826.02 PASS AO=191;DP=191;FAO=191;FDP=191;FR=.;FRO=0;FSAF=124;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0123622;FXX=0.00520806;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.385;QD=38.2413;RBI=0.015368;REFB=0;REVB=-0.00912973;RO=0;SAF=124;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000118339;OID=.;OPOS=28663716;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:191:191:0:0:191:191:67:124:0:0:67:124:0:0 chr6 28663754 . T C 2036.79 PASS AO=213;DP=213;FAO=213;FDP=213;FR=.;FRO=0;FSAF=122;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0603334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.956;QD=38.2496;RBI=0.062495;REFB=0;REVB=0.0162945;RO=0;SAF=122;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000129546;OID=.;OPOS=28663754;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:96:213:213:0:0:213:213:91:122:0:0:91:122:0:0 chr6 28678357 . T C 942.9 PASS AO=98;DP=100;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00599443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.282;QD=37.3427;RBI=0.0226378;REFB=0;REVB=0.0218297;RO=2;SAF=38;SAR=60;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0243056;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000166976;OID=.;OPOS=28678357;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:100:101:2:0:98:101:60:38:2:0:60:41:0:0 chr6 28687489 . A G 207.68 PASS AO=43;DP=81;FAO=46;FDP=84;FR=.;FRO=38;FSAF=35;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=-0.0253163;FXX=0.0344788;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.562;QD=9.88956;RBI=0.0375397;REFB=-0.0202431;REVB=0.0277185;RO=38;SAF=36;SAR=7;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.305377;STB=0.601098;TYPE=snp;VARB=0.0218868;OID=.;OPOS=28687489;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:84:38:38:43:46:7:36:22:16:11:35:22:16 chr6 28687542 . T C 756.54 PASS AO=76;DP=76;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0160972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.466;QD=38.3058;RBI=0.0267425;REFB=0;REVB=0.0213552;RO=0;SAF=46;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000107278;OID=.;OPOS=28687542;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:76:79:0:0:76:79:30:46:0:0:32:47:0:0 chr6 28697086 . C T 1453.98 PASS AO=152;DP=152;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0334695;FXX=0.0129862;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.24;QD=38.2627;RBI=0.0340979;REFB=0;REVB=0.00651637;RO=0;SAF=51;SAR=101;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000142625;OID=.;OPOS=28697086;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:152:152:0:0:152:152:101:51:0:0:101:51:0:0 chr6 28703244 . T C 1908.61 PASS AO=203;DP=205;FAO=203;FDP=203;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=117;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107912;FXX=0.00975562;HRUN=2;LEN=1;MLLD=270.221;QD=37.6081;RBI=0.0268561;REFB=-0.0291035;REVB=0.0245927;RO=2;SAF=86;SAR=117;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00145249;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.08362e-05;OID=.;OPOS=28703244;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:205:203:2:0:203:203:117:86:1:1:117:86:0:0 chr6 28715516 . C G 155.53 PASS AO=61;DP=186;FAO=61;FDP=185;FR=.;FRO=124;FSAF=48;FSAR=13;FSRF=74;FSRR=50;FWDB=-0.00421574;FXX=0.00537606;HRUN=3;LEN=1;MLLD=217.603;QD=3.36286;RBI=0.0143342;REFB=-0.0120387;REVB=0.0137002;RO=123;SAF=48;SAR=13;SRF=73;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.27082;STB=0.655909;TYPE=snp;VARB=0.024421;OID=.;OPOS=28715516;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:185:123:124:61:61:13:48:73:50:13:48:74:50 chr6 28715537 . T C 146.17 PASS AO=61;DP=193;FAO=61;FDP=193;FR=.;FRO=132;FSAF=47;FSAR=14;FSRF=77;FSRR=55;FWDB=-0.0334643;FXX=0.00515437;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.027;QD=3.02935;RBI=0.0336614;REFB=-0.0127731;REVB=0.00363678;RO=128;SAF=47;SAR=14;SRF=75;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.254104;STB=0.651282;TYPE=snp;VARB=0.0566842;OID=.;OPOS=28715537;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:193:128:132:61:61:14:47:75:53:14:47:77:55 chr6 28715564 . C G 167.95 PASS AO=59;DP=182;FAO=65;FDP=189;FR=.;FRO=124;FSAF=44;FSAR=21;FSRF=68;FSRR=56;FWDB=0.0203706;FXX=0.00526288;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.2333;QD=3.55441;RBI=0.0250222;REFB=-0.0152862;REVB=-0.0145308;RO=123;SAF=38;SAR=21;SRF=68;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111847;STB=0.590215;TYPE=snp;VARB=0.0225092;OID=.;OPOS=28715564;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:189:123:124:59:65:21:38:68:55:21:44:68:56 chr6 28715583 . C T 216.53 PASS AO=69;DP=179;FAO=70;FDP=180;FR=.;FRO=110;FSAF=38;FSAR=32;FSRF=57;FSRR=53;FWDB=0.0199175;FXX=0.0109884;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.9729;QD=4.81176;RBI=0.0413799;REFB=0.0138667;REVB=0.036271;RO=108;SAF=39;SAR=30;SRF=54;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0709656;STB=0.515147;TYPE=snp;VARB=-0.0305947;OID=.;OPOS=28715583;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:180:108:110:69:70:30:39:54:54:32:38:57:53 chr6 28715604 . G C 127.92 PASS AO=55;DP=180;FAO=55;FDP=179;FR=.;FRO=124;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=52;FSRR=72;FWDB=-0.0584216;FXX=0.00555525;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.7526;QD=2.85865;RBI=0.0594928;REFB=-0.00832258;REVB=-0.0112386;RO=123;SAF=26;SAR=29;SRF=52;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0598994;STB=0.537221;TYPE=snp;VARB=0.01558;OID=.;OPOS=28715604;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:179:123:124:55:55:29:26:52:71:29:26:52:72 chr6 28726163 . CG C 70.37 PASS AO=27;DP=77;FAO=34;FDP=76;FR=.;FRO=42;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=-0.0791795;FXX=0.0129853;HRUN=4;LEN=1;MLLD=15.5081;QD=3.70386;RBI=0.0793491;REFB=-0.0198114;REVB=-0.00518582;RO=38;SAF=14;SAR=13;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0459943;STB=0.58449;TYPE=del;VARB=0.0243853;OID=.;OPOS=28726164;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:27:73:34:76:42:22:12:21:21:70:38:14:13:18:20 chr6 28732209 . G A 263.71 PASS AO=50;DP=89;FAO=50;FDP=85;FR=.;FRO=35;FSAF=45;FSAR=5;FSRF=27;FSRR=8;FWDB=-0.0120106;FXX=0.0449388;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.928;QD=12.4101;RBI=0.0128617;REFB=0.0122835;REVB=-0.00460095;RO=34;SAF=45;SAR=5;SRF=26;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220796;STB=0.618992;TYPE=snp;VARB=-0.00619108;OID=.;OPOS=28732209;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:85:34:35:50:50:5:45:26:8:5:45:27:8 chr6 28758580 . TTTG T 587.88 PASS AO=84;DP=109;FAO=93;FDP=105;FR=.;FRO=12;FSAF=16;FSAR=77;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0198693;FXX=0.0540492;HRUN=3;LEN=3;MLLD=282.381;QD=22.3953;RBI=0.0400643;REFB=0.0132742;REVB=-0.0347902;RO=1;SAF=14;SAR=70;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0326272;STB=0.560542;TYPE=del;VARB=-0.00136951;OID=.;OPOS=28758581;OREF=TTG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:84:104:93:105:12:16:77:6:6:7:1:14:70:1:0 chr6 28770596 . A AC 839.75 PASS AO=103;DP=127;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.156883;FXX=0.0317435;HRUN=2;LEN=1;MLLD=19.0829;QD=27.5328;RBI=0.163989;REFB=0.0128521;REVB=0.04775;RO=14;SAF=61;SAR=42;SRF=13;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0799731;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00297949;OID=.;OPOS=28770597;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:103:127:122:122:0:79:43:0:0:69:14:61:42:13:1 chr6 28779887 . C G 1193.22 PASS AO=125;DP=125;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0292404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.147;QD=38.1829;RBI=0.0321308;REFB=0;REVB=0.0133188;RO=0;SAF=67;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.65796e-05;OID=.;OPOS=28779887;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:125:125:0:0:125:125:58:67:0:0:58:67:0:0 chr6 28785085 . C T 875.55 PASS AO=94;DP=96;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0588886;FXX=0.0416623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.266;QD=38.0675;RBI=0.0591668;REFB=0;REVB=0.00573147;RO=0;SAF=52;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00102084;OID=.;OPOS=28785085;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:96:92:0:0:94:92:42:52:0:0:42:50:0:0 chr6 28791134 . G A 1301.32 PASS AO=136;DP=136;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.028295;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.322;QD=38.2742;RBI=0.030874;REFB=0;REVB=0.012353;RO=0;SAF=50;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.2219e-05;OID=.;OPOS=28791134;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:136:136:0:0:136:136:86:50:0:0:86:50:0:0 chr6 28806218 . G A 430.81 PASS AO=64;DP=75;FAO=60;FDP=74;FR=.;FRO=14;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=12;FSRR=2;FWDB=0.01803;FXX=0.0133316;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.7508;QD=23.287;RBI=0.0180533;REFB=0.00903066;REVB=0.000917952;RO=3;SAF=36;SAR=28;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00894996;STB=0.562024;TYPE=snp;VARB=-0.0451309;OID=.;OPOS=28806218;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:75:74:3:14:64:60:28:36:2:1:28:32:12:2 chr6 28831535 . A G 713.52 PASS AO=77;DP=80;FAO=77;FDP=79;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0280456;FXX=0.0124984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.7077;QD=36.1274;RBI=0.0366725;REFB=-0.063109;REVB=0.0236288;RO=2;SAF=36;SAR=41;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0225254;STB=0.511902;TYPE=snp;VARB=0.00198458;OID=.;OPOS=28831535;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:80:79:2:2:77:77:41:36:0:2:41:36:0:2 chr6 28872103 . AG A 939.87 PASS AO=142;DP=209;FAO=182;FDP=186;FR=.;FRO=4;FSAF=81;FSAR=101;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.067234;FXX=0.0461515;HRUN=4;LEN=1;MLLD=12.741;QD=20.2123;RBI=0.0991855;REFB=-0.0257978;REVB=0.0729202;RO=21;SAF=59;SAR=83;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00867428;STB=0.501196;TYPE=del;VARB=0.0257579;OID=.;OPOS=28872104;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:142:195:182:186:4:81:101:2:2:51:21:59:83:8:13 chr6 28911802 . G A 1450.99 PASS AO=161;DP=165;FAO=160;FDP=165;FR=.;FRO=5;FSAF=122;FSAR=38;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0343926;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.7812;QD=35.1754;RBI=0.0785778;REFB=-0.179347;REVB=0.0706514;RO=3;SAF=123;SAR=38;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0046818;STB=0.506749;TYPE=snp;VARB=0.00464066;OID=.;OPOS=28911802;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:165:165:3:5:161:160:38:123:2:1:38:122:3:2 chr6 28912345 . G C 1854.74 PASS AO=195;DP=197;FAO=195;FDP=195;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00795831;FXX=0.0101518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.633;QD=38.046;RBI=0.0653424;REFB=-0.0239207;REVB=0.064856;RO=1;SAF=103;SAR=92;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00514846;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000552416;OID=.;OPOS=28912345;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:197:195:1:0:195:195:92:103:0:1:92:103:0:0 chr6 28912437 . T C 1934.82 PASS AO=212;DP=215;FAO=214;FDP=221;FR=.;FRO=7;FSAF=86;FSAR=128;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.00239766;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=102.37;QD=35.0194;RBI=0.0110531;REFB=-0.172558;REVB=0.0107899;RO=3;SAF=84;SAR=128;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00749879;STB=0.500879;TYPE=snp;VARB=0.000959566;OID=.;OPOS=28912437;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:215:221:3:7:212:214:128:84:2:1:128:86:3:4 chr6 28949460 . G A 404.01 PASS AO=90;DP=172;FAO=91;FDP=175;FR=.;FRO=84;FSAF=1;FSAR=90;FSRF=3;FSRR=81;FWDB=0.0623898;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=227.101;QD=9.23456;RBI=0.0626111;REFB=-0.010978;REVB=0.0052599;RO=82;SAF=0;SAR=90;SRF=2;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.840559;STB=0.677913;TYPE=snp;VARB=0.00963499;OID=.;OPOS=28949460;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:175:82:84:90:91:90:0:2:80:90:1:3:81 chr6 28963248 . T G 3732.18 PASS AO=462;DP=467;FAO=395;FDP=395;FR=.;FRO=0;FSAF=224;FSAR=171;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00656025;FXX=0.0124997;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.448;QD=37.7943;RBI=0.0110267;REFB=-0.0163134;REVB=-0.00886286;RO=4;SAF=263;SAR=199;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00949733;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.15661e-05;OID=.;OPOS=28963248;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:467:395:4:0:462:395:199:263:0:4:171:224:0:0 chr6 28964086 . G A 2367.1 PASS AO=238;DP=243;FAO=246;FDP=246;FR=.;FRO=0;FSAF=124;FSAR=122;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000260994;FXX=0.00806419;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.498;QD=38.4895;RBI=0.0301038;REFB=0;REVB=0.0301027;RO=0;SAF=121;SAR=117;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000172667;OID=.;OPOS=28964086;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:243:246:0:0:238:246:117:121:0:0:122:124:0:0 chr6 29068759 . C A 2024.27 PASS AO=213;DP=223;FAO=216;FDP=216;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=125;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.020696;FXX=0.0357127;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4153;QD=37.4865;RBI=0.029294;REFB=-0.0471347;REVB=0.020732;RO=0;SAF=89;SAR=124;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.83811e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000539285;OID=.;OPOS=29068759;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:223:216:0:0:213:216:124:89:0:0:125:91:0:0 chr6 29069337 . A T 3766.58 PASS AO=499;DP=499;FAO=398;FDP=398;FR=.;FRO=0;FSAF=183;FSAR=215;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155757;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.857;QD=37.8551;RBI=0.0183052;REFB=0;REVB=0.00961647;RO=0;SAF=241;SAR=258;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000530646;OID=.;OPOS=29069337;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:499:398:0:0:499:398:258:241:0:0:215:183:0:0 chr6 29080004 . A G 3823.89 PASS AO=585;DP=589;FAO=398;FDP=398;FR=.;FRO=0;FSAF=106;FSAR=292;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00226242;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.299;QD=38.4311;RBI=0.0171545;REFB=0;REVB=-0.0170047;RO=0;SAF=160;SAR=425;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.79648e-06;OID=.;OPOS=29080004;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:589:398:0:0:585:398:425:160:0:0:292:106:0:0 chr6 29080344 . G A 3787.8 PASS AO=568;DP=571;FAO=397;FDP=397;FR=.;FRO=0;FSAF=180;FSAR=217;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0155916;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.1533;QD=38.1642;RBI=0.0165394;REFB=-0.0674556;REVB=-0.00551861;RO=0;SAF=260;SAR=308;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.13695e-05;OID=.;OPOS=29080344;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:571:397:0:0:568:397:308:260:0:0:217:180:0:0 chr6 29080349 . A G 3815.7 PASS AO=568;DP=571;FAO=398;FDP=398;FR=.;FRO=0;FSAF=176;FSAR=222;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111781;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.232;QD=38.3487;RBI=0.0185291;REFB=-0.0280449;REVB=0.0147776;RO=2;SAF=263;SAR=305;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00361758;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.26839e-05;OID=.;OPOS=29080349;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:571:398:2:0:568:398:305:263:2:0:222:176:0:0 chr6 29080450 . G A 3776.67 PASS AO=431;DP=435;FAO=396;FDP=396;FR=.;FRO=0;FSAF=203;FSAR=193;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0237573;FXX=0.00999975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.2099;QD=38.1482;RBI=0.0663053;REFB=-0.0319908;REVB=0.061903;RO=1;SAF=215;SAR=216;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00221502;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.02252e-05;OID=.;OPOS=29080450;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:435:396:1:0:431:396:216:215:1:0:193:203:0:0 chr6 29141743 . A G 3812.38 PASS AO=611;DP=617;FAO=398;FDP=398;FR=.;FRO=0;FSAF=102;FSAR=296;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0441432;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.849;QD=38.3154;RBI=0.044208;REFB=0;REVB=0.00239157;RO=1;SAF=155;SAR=456;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00307127;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.94696e-05;OID=.;OPOS=29141743;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:617:398:1:0:611:398:456:155:1:0:296:102:0:0 chr6 29141772 . A G 3760.71 PASS AO=610;DP=617;FAO=396;FDP=396;FR=.;FRO=0;FSAF=99;FSAR=297;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0731833;FXX=0.00999975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.392;QD=37.987;RBI=0.0732023;REFB=-0.0642421;REVB=-0.00166881;RO=5;SAF=148;SAR=462;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0158569;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.46431e-05;OID=.;OPOS=29141772;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:617:396:5:0:610:396:462:148:5:0:297:99:0:0 chr6 29274486 . T C 583.58 PASS AO=146;DP=307;FAO=146;FDP=305;FR=.;FRO=159;FSAF=92;FSAR=54;FSRF=87;FSRR=72;FWDB=0.0325512;FXX=0.00651445;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.186;QD=7.65351;RBI=0.0796614;REFB=-0.0117266;REVB=0.0727073;RO=149;SAF=92;SAR=54;SRF=87;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0450288;STB=0.545294;TYPE=snp;VARB=0.0135093;OID=.;OPOS=29274486;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:307:305:149:159:146:146:54:92:87:62:54:92:87:72 chr6 29275507 . T C 254.64 PASS AO=72;DP=171;FAO=72;FDP=171;FR=.;FRO=99;FSAF=30;FSAR=42;FSRF=50;FSRR=49;FWDB=0.0212756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.946;QD=5.95644;RBI=0.025884;REFB=0.00262057;REVB=0.0147421;RO=98;SAF=30;SAR=42;SRF=50;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0972905;STB=0.55171;TYPE=snp;VARB=-0.00280755;OID=.;OPOS=29275507;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:171:98:99:72:72:42:30:50:48:42:30:50:49 chr6 29323259 . G A 783.74 PASS AO=77;DP=77;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.441;QD=37.7706;RBI=0.0654331;REFB=0;REVB=0.0641836;RO=0;SAF=49;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000189378;OID=.;OPOS=29323259;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:77:83:0:0:77:83:28:49:0:0:33:50:0:0 chr6 29342825 . G A 194.49 PASS AO=61;DP=178;FAO=68;FDP=186;FR=.;FRO=118;FSAF=32;FSAR=36;FSRF=34;FSRR=84;FWDB=0.0154261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.835;QD=4.18249;RBI=0.0165549;REFB=-0.0255073;REVB=-0.00600847;RO=115;SAF=25;SAR=36;SRF=32;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16174;STB=0.617728;TYPE=snp;VARB=0.0368355;OID=.;OPOS=29342825;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:186:115:118:61:68:36:25:32:83:36:32:34:84 chr6 29364615 . G T 3817.33 PASS AO=345;DP=345;FAO=398;FDP=398;FR=.;FRO=0;FSAF=160;FSAR=238;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0747839;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.092;QD=38.3652;RBI=0.0918597;REFB=0;REVB=0.0533438;RO=0;SAF=137;SAR=208;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.98497e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.36813e-05;OID=.;OPOS=29364615;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:345:398:0:0:345:398:208:137:0:0:238:160:0:0 chr6 29364643 . T C 3052.65 PASS AO=310;DP=321;FAO=335;FDP=335;FR=.;FRO=0;FSAF=122;FSAR=213;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0120547;FXX=0.0204672;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.8833;QD=36.4495;RBI=0.110528;REFB=-0.0402951;REVB=0.109869;RO=10;SAF=121;SAR=189;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00565813;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00123749;OID=.;OPOS=29364643;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:321:335:10:0:310:335:189:121:3:7:213:122:0:0 chr6 29364787 . C T 2395.78 PASS AO=257;DP=262;FAO=261;FDP=261;FR=.;FRO=0;FSAF=114;FSAR=147;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0536862;FXX=0.00760427;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.3617;QD=36.717;RBI=0.0538765;REFB=-0.102347;REVB=0.00452512;RO=5;SAF=111;SAR=146;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136116;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00216471;OID=.;OPOS=29364787;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:262:261:5:0:257:261:146:111:4:1:147:114:0:0 chr6 29364815 . C G 2658.43 PASS AO=261;DP=261;FAO=277;FDP=277;FR=.;FRO=0;FSAF=136;FSAR=141;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0585042;FXX=0.00359699;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.394;QD=38.3888;RBI=0.0594169;REFB=0;REVB=-0.0103741;RO=0;SAF=124;SAR=137;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.99647e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.50967e-05;OID=.;OPOS=29364815;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:261:277:0:0:261:277:137:124:0:0:141:136:0:0 chr6 29364835 . T G 2587.45 PASS AO=273;DP=276;FAO=273;FDP=273;FR=.;FRO=0;FSAF=138;FSAR=135;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0346357;FXX=0.0144399;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.112;QD=37.9113;RBI=0.036828;REFB=-0.0855266;REVB=0.0125167;RO=2;SAF=138;SAR=135;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00685959;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.35404e-05;OID=.;OPOS=29364835;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:276:273:2:0:273:273:135:138:2:0:135:138:0:0 chr6 29364838 . C G 585.3 PASS AO=138;DP=276;FAO=138;FDP=276;FR=.;FRO=138;FSAF=74;FSAR=64;FSRF=72;FSRR=66;FWDB=-0.0192313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5572;QD=8.48257;RBI=0.0454858;REFB=-0.00366122;REVB=0.0412203;RO=138;SAF=74;SAR=64;SRF=72;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0132677;STB=0.507276;TYPE=snp;VARB=0.00347097;OID=.;OPOS=29364838;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:276:276:138:138:138:138:64:74:72:66:64:74:72:66 chr6 29364951 . G A 2642.05 PASS AO=273;DP=279;FAO=278;FDP=278;FR=.;FRO=0;FSAF=143;FSAR=135;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0269143;FXX=0.021126;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.956;QD=38.0151;RBI=0.0273706;REFB=-0.0330129;REVB=0.00497692;RO=0;SAF=138;SAR=135;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.32849e-05;OID=.;OPOS=29364951;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:279:278:0:0:273:278:135:138:0:0:135:143:0:0 chr6 29365241 . T C 2939.27 PASS AO=324;DP=335;FAO=325;FDP=336;FR=.;FRO=11;FSAF=171;FSAR=154;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.0193822;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=277.302;QD=34.9913;RBI=0.0194298;REFB=-0.0516623;REVB=0.00135982;RO=10;SAF=170;SAR=154;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0100334;STB=0.506606;TYPE=snp;VARB=0.000656535;OID=.;OPOS=29365241;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:335:336:10:11:324:325:154:170:7:3:154:171:8:3 chr6 29365423 . A T 1986.5 PASS AO=207;DP=209;FAO=211;FDP=211;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=123;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0490535;FXX=0.00938923;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.25;QD=37.6587;RBI=0.0501345;REFB=-0.0361986;REVB=0.0103545;RO=1;SAF=86;SAR=121;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00550677;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.60876e-05;OID=.;OPOS=29365423;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:209:211:1:0:207:211:121:86:1:0:123:88:0:0 chr6 29385237 . T C 2931.64 PASS AO=328;DP=346;FAO=331;FDP=346;FR=.;FRO=15;FSAF=114;FSAR=217;FSRF=1;FSRR=14;FWDB=-0.00894499;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0409;QD=33.8917;RBI=0.0117022;REFB=-0.00571016;REVB=0.00754509;RO=18;SAF=111;SAR=217;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.01291;STB=0.513443;TYPE=snp;VARB=0.000990187;OID=.;OPOS=29385237;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:346:346:18:15:328:331:217:111:4:14:217:114:1:14 chr6 29394926 . C T 276.92 PASS AO=59;DP=108;FAO=58;FDP=107;FR=.;FRO=49;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=-0.0200282;FXX=0.0092584;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.031;QD=10.352;RBI=0.0203221;REFB=-0.027683;REVB=0.00344323;RO=49;SAF=28;SAR=31;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0212565;STB=0.507615;TYPE=snp;VARB=0.0202597;OID=.;OPOS=29394926;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:107:49:49:59:58:31:28:22:27:31:27:22:27 chr6 29407970 . T C 358.61 PASS AO=72;DP=156;FAO=84;FDP=167;FR=.;FRO=83;FSAF=45;FSAR=39;FSRF=56;FSRR=27;FWDB=0.0431694;FXX=0.00595203;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.641;QD=8.58943;RBI=0.0575063;REFB=-0.0790192;REVB=-0.0379918;RO=81;SAF=32;SAR=40;SRF=54;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210071;STB=0.57011;TYPE=snp;VARB=0.0612096;OID=.;OPOS=29407970;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:167:81:83:72:84:40:32:54:27:39:45:56:27 chr6 29408313 . C A 194.64 PASS AO=59;DP=149;FAO=59;FDP=149;FR=.;FRO=90;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=51;FSRR=39;FWDB=-0.0128141;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=139.846;QD=5.22521;RBI=0.0476772;REFB=-0.00317353;REVB=0.0459229;RO=89;SAF=32;SAR=27;SRF=51;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0330529;STB=0.514812;TYPE=snp;VARB=0.00552034;OID=.;OPOS=29408313;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:89:90:59:59:27:32:51:38:27:32:51:39 chr6 29408528 . A G 396.87 PASS AO=109;DP=248;FAO=110;FDP=251;FR=.;FRO=141;FSAF=58;FSAR=52;FSRF=54;FSRR=87;FWDB=0.0441511;FXX=0.00790483;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.056;QD=6.32466;RBI=0.0447868;REFB=-0.0154244;REVB=-0.00751875;RO=136;SAF=57;SAR=52;SRF=50;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154795;STB=0.58057;TYPE=snp;VARB=0.0195954;OID=.;OPOS=29408528;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:248:251:136:141:109:110:52:57:50:86:52:58:54:87 chr6 29431698 . A G 1921.23 PASS AO=200;DP=201;FAO=201;FDP=201;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0503961;FXX=0.00495025;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.8232;QD=38.2335;RBI=0.0505641;REFB=0;REVB=0.00411865;RO=0;SAF=94;SAR=106;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.88983e-05;OID=.;OPOS=29431698;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:91:201:201:0:0:200:201:106:94:0:0:107:94:0:0 chr6 29523676 . C G 960.97 PASS AO=104;DP=106;FAO=104;FDP=106;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=68;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0492919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.6899;QD=36.2632;RBI=0.0502865;REFB=-0.0969188;REVB=-0.00995217;RO=1;SAF=36;SAR=68;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129978;STB=0.503199;TYPE=snp;VARB=0.00112718;OID=.;OPOS=29523676;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:106:106:1:2:104:104:68:36:1:0:68:36:1:1 chr6 29523952 . A G 366.14 PASS AO=210;DP=461;FAO=96;FDP=212;FR=.;FRO=116;FSAF=40;FSAR=56;FSRF=50;FSRR=66;FWDB=-0.0138682;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.4321;QD=6.90821;RBI=0.0660843;REFB=-0.0205926;REVB=0.0646127;RO=247;SAF=101;SAR=109;SRF=117;SRR=130;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00713674;STB=0.508063;TYPE=snp;VARB=0.0328649;OID=.;OPOS=29523952;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:461:212:247:116:210:96:109:101:117:130:56:40:50:66 chr6 29555778 . A G 589 PASS AO=165;DP=378;FAO=167;FDP=381;FR=.;FRO=214;FSAF=99;FSAR=68;FSRF=84;FSRR=130;FWDB=0.0063167;FXX=0.0052218;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.4898;QD=6.18377;RBI=0.0136802;REFB=-0.00799142;REVB=-0.0121346;RO=179;SAF=100;SAR=65;SRF=69;SRR=110;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208047;STB=0.61167;TYPE=snp;VARB=0.00794624;OID=.;OPOS=29555778;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:378:381:179:214:165:167:65:100:69:110:68:99:84:130 chr6 29555809 . C T 3690.52 PASS AO=416;DP=420;FAO=394;FDP=394;FR=.;FRO=0;FSAF=186;FSAR=208;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0515845;FXX=0.0149996;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0383;QD=37.4672;RBI=0.0654879;REFB=-0.00563022;REVB=0.0403447;RO=3;SAF=196;SAR=220;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0026806;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000174653;OID=.;OPOS=29555809;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:420:394:3:0:416:394:220:196:2:1:208:186:0:0 chr6 29555864 . C T 968.12 PASS AO=248;DP=452;FAO=213;FDP=400;FR=.;FRO=187;FSAF=98;FSAR=115;FSRF=89;FSRR=98;FWDB=0.00105282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.387;QD=9.68116;RBI=0.0168011;REFB=-0.031785;REVB=0.0167681;RO=204;SAF=112;SAR=136;SRF=99;SRR=105;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0281671;STB=0.507444;TYPE=snp;VARB=0.0237242;OID=.;OPOS=29555864;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:452:400:204:187:248:213:136:112:99:105:115:98:89:98 chr6 29625001 . A G 1204.85 PASS AO=130;DP=132;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104988;FXX=0.0151504;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.5695;QD=37.0723;RBI=0.0126956;REFB=-0.0327094;REVB=-0.0071382;RO=2;SAF=47;SAR=83;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0113137;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000168845;OID=.;OPOS=29625001;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:132:130:2:0:130:130:83:47:0:2:83:47:0:0 chr6 29634003 . G C 436.39 PASS AO=97;DP=186;FAO=97;FDP=186;FR=.;FRO=89;FSAF=48;FSAR=49;FSRF=56;FSRR=33;FWDB=-0.0156712;FXX=0.00534731;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.168;QD=9.38481;RBI=0.0256093;REFB=-0.0122062;REVB=-0.0202546;RO=83;SAF=48;SAR=49;SRF=53;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121293;STB=0.564203;TYPE=snp;VARB=0.0146659;OID=.;OPOS=29634003;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:186:83:89:97:97:49:48:53:30:49:48:56:33 chr6 29634012 . A G 1816.93 PASS AO=193;DP=195;FAO=193;FDP=193;FR=.;FRO=0;FSAF=109;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0109741;FXX=0.0203035;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.191;QD=37.6565;RBI=0.0165097;REFB=-0.0658881;REVB=-0.0123345;RO=1;SAF=109;SAR=84;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00563555;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.62034e-05;OID=.;OPOS=29634012;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:195:193:1:0:193:193:84:109:0:1:84:109:0:0 chr6 29691857 . C G 22.3 PASS AO=4;DP=9;FAO=4;FDP=9;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.0119312;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=211.545;QD=9.91243;RBI=0.0137572;REFB=-0.00249585;REVB=0.00684886;RO=5;SAF=3;SAR=1;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.590845;STB=0.855777;TYPE=snp;VARB=0.00349126;OID=.;OPOS=29691857;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:9:9:5:5:4:4:1:3:0:5:1:3:0:5 chr6 29693011 . C T 289.96 PASS AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226111;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.983;QD=37.4145;RBI=0.0242517;REFB=0;REVB=-0.0087683;RO=0;SAF=18;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.33668e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000248428;OID=.;OPOS=29693011;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:31:31:0:0:31:31:13:18:0:0:13:18:0:0 chr6 29695854 . G A 526.51 PASS AO=116;DP=211;FAO=113;FDP=210;FR=.;FRO=97;FSAF=52;FSAR=61;FSRF=30;FSRR=67;FWDB=0.0212594;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.3294;QD=10.0288;RBI=0.021289;REFB=0.0373715;REVB=-0.00112285;RO=95;SAF=54;SAR=62;SRF=29;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134744;STB=0.570926;TYPE=snp;VARB=-0.0356;OID=.;OPOS=29695854;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:210:95:97:116:113:62:54:29:66:61:52:30:67 chr6 29718220 . G A 202.22 PASS AO=49;DP=105;FAO=49;FDP=102;FR=.;FRO=53;FSAF=17;FSAR=32;FSRF=20;FSRR=33;FWDB=-0.0275516;FXX=0.0285687;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.264;QD=7.93016;RBI=0.032272;REFB=-0.0107514;REVB=-0.0168044;RO=53;SAF=17;SAR=32;SRF=20;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.03103;STB=0.517249;TYPE=snp;VARB=0.00701119;OID=.;OPOS=29718220;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:102:53:53:49:49:32:17:20:33:32:17:20:33 chr6 29794860 . C T 256.18 PASS AO=79;DP=200;FAO=79;FDP=200;FR=.;FRO=121;FSAF=23;FSAR=56;FSRF=48;FSRR=73;FWDB=0.00765317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.33;QD=5.12358;RBI=0.0300282;REFB=-0.00284235;REVB=-0.0290366;RO=121;SAF=23;SAR=56;SRF=48;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128524;STB=0.572644;TYPE=snp;VARB=0.00463097;OID=.;OPOS=29794860;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:200:200:121:121:79:79:56:23:48:73:56:23:48:73 chr6 29795636 . G A 157.16 PASS AO=31;DP=59;FAO=32;FDP=57;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=23;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=0.0114459;FXX=0.0338926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.3153;QD=11.0291;RBI=0.0229843;REFB=-0.0369654;REVB=0.0199316;RO=18;SAF=8;SAR=23;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10736;STB=0.54115;TYPE=snp;VARB=0.0403555;OID=.;OPOS=29795636;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:57:18:25:31:32:23:8:7:11:23:9:9:16 chr6 29795657 . G A 107.63 PASS AO=21;DP=42;FAO=22;FDP=41;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=4;FSRR=15;FWDB=0.0331672;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.648;QD=10.5004;RBI=0.0331687;REFB=-0.0100992;REVB=-0.000316206;RO=19;SAF=5;SAR=16;SRF=4;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0327974;STB=0.537539;TYPE=snp;VARB=0.00776056;OID=.;OPOS=29795657;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:42:41:19:19:21:22:16:5:4:15:16:6:4:15 chr6 29795993 . G A 41.1 PASS AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.00175349;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.309;QD=10.2749;RBI=0.00284149;REFB=0.00487368;REVB=0.00223592;RO=7;SAF=3;SAR=5;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158056;STB=0.564352;TYPE=snp;VARB=-0.00236754;OID=.;OPOS=29795993;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:16:16:7:8:8:8:5:3:4:3:5:3:4:4 chr6 29796376 . C A 78.13 PASS AO=24;DP=65;FAO=24;FDP=65;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=32;FSRR=9;FWDB=-0.0270082;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.298;QD=4.80822;RBI=0.0283387;REFB=-0.00853096;REVB=-0.00858133;RO=39;SAF=15;SAR=9;SRF=31;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.209201;STB=0.610307;TYPE=snp;VARB=0.0201901;OID=.;OPOS=29796376;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:65:65:39:41:24:24:9:15:31:8:9:15:32:9 chr6 29797696 . A G 325.51 PASS AO=80;DP=168;FAO=81;FDP=172;FR=.;FRO=91;FSAF=41;FSAR=40;FSRF=57;FSRR=34;FWDB=-0.0418109;FXX=0.00578001;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.1642;QD=7.57;RBI=0.129257;REFB=-0.0290818;REVB=-0.122308;RO=88;SAF=39;SAR=41;SRF=58;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162385;STB=0.563689;TYPE=snp;VARB=0.0292585;OID=.;OPOS=29797696;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:172:88:91:80:81:41:39:58:30:40:41:57:34 chr6 29798140 . A G 141.85 PASS AO=48;DP=140;FAO=49;FDP=138;FR=.;FRO=89;FSAF=39;FSAR=10;FSRF=42;FSRR=47;FWDB=-0.00289838;FXX=0.0142847;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.737;QD=4.11163;RBI=0.0122435;REFB=-0.00394922;REVB=-0.0118955;RO=81;SAF=39;SAR=9;SRF=37;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.436542;STB=0.732835;TYPE=snp;VARB=0.00424265;OID=.;OPOS=29798140;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:138:81:89:48:49:9:39:37:44:10:39:42:47 chr6 29855580 . GCCCTGACCCT GCCCT,GCCCTGACCCA 105.79 PASS AO=8,2;DP=13;FAO=9,3;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=1,0;FSAR=8,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0346198,0.0558149;FXX=0.249844;HRUN=1,1;LEN=6,1;MLLD=242.472,86.0061;QD=35.2649;RBI=0.0351508,0.055831;REFB=0,0;REVB=0.00608705,0.00134084;RO=0;SAF=1,0;SAR=7,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.78849e-08,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.00995833,0.0151666;OID=.,.;OPOS=29855581,29855590;OREF=CCCTGA,T;OALT=-,A;OMAPALT=GCCCT,GCCCTGACCCA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:8,2:12:9,3:12:0:1,0:8,3:0:0:13:0:1,0:7,2:0:0 chr6 29855849 . A C 125.83 PASS AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00459397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.2785;QD=35.9518;RBI=0.0470245;REFB=0;REVB=-0.0467996;RO=0;SAF=10;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.63386e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00126186;OID=.;OPOS=29855849;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:14:14:0:0:14:14:4:10:0:0:4:10:0:0 chr6 29855856 . T C 98.91 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.186094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.7555;QD=32.9692;RBI=0.323066;REFB=0;REVB=0.264084;RO=0;SAF=8;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.018946;OID=.;OPOS=29855856;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:4:8:0:0:4:8:0:0 chr6 29855858 . C A 107.82 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102492;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.379;QD=35.9384;RBI=0.010771;REFB=0;REVB=0.00331193;RO=0;SAF=8;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000254249;OID=.;OPOS=29855858;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:4:8:0:0:4:8:0:0 chr6 29855864 . A T 75.97 PASS AO=10;DP=12;FAO=10;FDP=12;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0414618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.0212;QD=25.3235;RBI=0.0419324;REFB=0.0438639;REVB=0.00626464;RO=1;SAF=6;SAR=4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0687795;STB=0.571292;TYPE=snp;VARB=-0.00288474;OID=.;OPOS=29855864;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:12:12:1:2:10:10:4:6:1:0:4:6:2:0 chr6 29855901 . A G 174 PASS AO=18;DP=18;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00627538;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.664;QD=36.6314;RBI=0.00810459;REFB=0;REVB=-0.00512874;RO=0;SAF=8;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00073639;OID=.;OPOS=29855901;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:19:0:0:18:19:10:8:0:0:10:9:0:0 chr6 29855999 . G C 11.79 PASS AO=4;DP=19;FAO=4;FDP=19;FR=.;FRO=15;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=-0.0348066;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.7427;QD=2.48293;RBI=0.0571078;REFB=0.00267615;REVB=-0.0452748;RO=15;SAF=1;SAR=3;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0806035;STB=0.555295;TYPE=snp;VARB=-0.0188445;OID=.;OPOS=29855999;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:19:19:15:15:4:4:3:1:3:12:3:1:3:12 chr6 29856330 . G A 45.01 PASS AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0357417;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.581;QD=25.721;RBI=0.0402297;REFB=-0.108383;REVB=0.0184651;RO=1;SAF=5;SAR=1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0789211;STB=0.54531;TYPE=snp;VARB=0.00903312;OID=.;OPOS=29856330;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:7:7:1:1:6:6:1:5:1:0:1:5:1:0 chr6 29856347 . C T 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.027576;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=254.669;QD=35.0875;RBI=0.027576;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=7;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000448672;OID=.;OPOS=29856347;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:0:7:0:0:0:7:0:0 chr6 29856427 . G A 220.84 PASS AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0579899;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=75.8274;QD=36.8073;RBI=0.0583992;REFB=0;REVB=-0.00690176;RO=0;SAF=4;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.83186e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000869064;OID=.;OPOS=29856427;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:24:24:0:0:24:24:20:4:0:0:20:4:0:0 chr6 29856550 . C G 243.12 PASS AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0537291;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.901;QD=37.4035;RBI=0.0537951;REFB=0;REVB=-0.00266374;RO=0;SAF=13;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94263e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000365611;OID=.;OPOS=29856550;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:25:26:0:0:25:26:12:13:0:0:13:13:0:0 chr6 29856633 . T C 567.55 PASS AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0128518;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9665;QD=36.0347;RBI=0.0694063;REFB=-0.0366212;REVB=0.068206;RO=0;SAF=34;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508769;TYPE=snp;VARB=0.00405639;OID=.;OPOS=29856633;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:63:63:0:1:62:62:28:34:0:0:28:34:0:1 chr6 29856686 . C G 846.47 PASS AO=91;DP=92;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0341312;FXX=0.0108684;HRUN=3;LEN=1;MLLD=110.948;QD=37.2076;RBI=0.0342015;REFB=-0.0666352;REVB=0.00219266;RO=1;SAF=52;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00902916;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.98164e-05;OID=.;OPOS=29856686;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:92:91:1:0:91:91:39:52:1:0:39:52:0:0 chr6 29856693 . C T 881.26 PASS AO=91;DP=91;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00118357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.217;QD=37.9037;RBI=0.0379539;REFB=0;REVB=0.0379355;RO=0;SAF=52;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000138;OID=.;OPOS=29856693;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:91:93:0:0:91:93:39:52:0:0:40:53:0:0 chr6 29856718 . G C 881.86 PASS AO=94;DP=98;FAO=96;FDP=98;FR=.;FRO=2;FSAF=50;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0229959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.2514;QD=35.9942;RBI=0.0321833;REFB=-0.133169;REVB=0.0225156;RO=1;SAF=48;SAR=46;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101963;STB=0.500426;TYPE=snp;VARB=0.00158726;OID=.;OPOS=29856718;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:98:98:1:2:94:96:46:48:0:1:46:50:1:1 chr6 29910358 . C G 284.01 PASS AO=33;DP=35;FAO=33;FDP=35;FR=.;FRO=2;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0526029;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.9053;QD=32.4578;RBI=0.067833;REFB=-0.181202;REVB=0.0428281;RO=2;SAF=12;SAR=21;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0156293;STB=0.508375;TYPE=snp;VARB=0.0105697;OID=.;OPOS=29910358;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:35:35:2:2:33:33:21:12:1:1:21:12:1:1 chr6 29910378 . C T 62.82 PASS AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.0179126;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=277.514;QD=9.66488;RBI=0.0188571;REFB=0.00455382;REVB=0.00589334;RO=12;SAF=4;SAR=9;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0583577;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00469224;OID=.;OPOS=29910378;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:25:26:12:13:13:13:9:4:3:9:9:4:4:9 chr6 29910402 . G A 29.48 PASS AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.0412244;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=177.559;QD=8.42264;RBI=0.0493376;REFB=-0.0099443;REVB=-0.0271062;RO=8;SAF=3;SAR=3;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.361323;STB=0.713701;TYPE=snp;VARB=0.00979706;OID=.;OPOS=29910402;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:14:14:8:8:6:6:3:3:1:7:3:3:1:7 chr6 29910538 . C T 254.47 PASS AO=30;DP=32;FAO=30;FDP=32;FR=.;FRO=2;FSAF=1;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0131922;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=256.417;QD=31.8093;RBI=0.0448675;REFB=-0.00268646;REVB=0.0428843;RO=2;SAF=1;SAR=29;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0310876;STB=0.516656;TYPE=snp;VARB=0.000324915;OID=.;OPOS=29910538;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:32:32:2:2:30:30:29:1:0:2:29:1:0:2 chr6 29910604 . C A 256.38 PASS AO=27;DP=28;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0540361;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.312;QD=35.3627;RBI=0.133882;REFB=0.121194;REVB=-0.122493;RO=1;SAF=1;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0175586;STB=0.509427;TYPE=snp;VARB=-0.0155216;OID=.;OPOS=29910604;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:28:29:1:1:27:28:26:1:0:1:26:2:0:1 chr6 29911056 . A C,G 71.11 PASS AO=6,3;DP=9;FAO=6,2;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=4,2;FSAR=2,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0133992,-0.147709;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=69.0748,35.8684;QD=35.5574;RBI=0.0144519,0.153969;REFB=0,0;REVB=0.00541457,-0.0434589;RO=0;SAF=3,3;SAR=3,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=snp,snp;VARB=0.00798704,0.0197787;OID=.,.;OPOS=29911056,29911056;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:10:9:8:0:0:6,3:6,2:3,0:3,3:0:0:2,0:4,2:0:0 chr6 29911064 . A G 86.75 PASS AO=10;DP=10;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0695332;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.3644;QD=38.5574;RBI=0.136543;REFB=0;REVB=-0.117512;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00802822;OID=.;OPOS=29911064;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:9:0:0:10:9:4:6:0:0:3:6:0:0 chr6 29911069 . A T 51.06 PASS AO=8;DP=11;FAO=7;FDP=10;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.00546558;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.096;QD=20.4255;RBI=0.0501609;REFB=0.0040461;REVB=0.0498622;RO=3;SAF=3;SAR=5;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.290717;STB=0.666221;TYPE=snp;VARB=-0.00160173;OID=.;OPOS=29911069;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:11:10:3:3:8:7:5:3:3:0:4:3:3:0 chr6 29911114 . G A 109.44 PASS AO=9;DP=15;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0468745;FXX=0.076864;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.3422;QD=36.4803;RBI=0.181246;REFB=0;REVB=0.17508;RO=0;SAF=0;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0154603;OID=.;OPOS=29911114;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:10:12:0:0:9:12:9:0:0:0:8:4:0:0 chr6 29911115 . G C 98.42 PASS AO=13;DP=13;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.20725;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.046;QD=30.2819;RBI=0.208536;REFB=-0.108864;REVB=0.0231226;RO=0;SAF=4;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.55546;TYPE=snp;VARB=0.00780751;OID=.;OPOS=29911115;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:13:13:0:1:13:12:9:4:0:0:8:4:1:0 chr6 29911119 . G T 83.26 PASS AO=12;DP=13;FAO=11;FDP=13;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0332332;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.168;QD=25.6192;RBI=0.0560769;REFB=-0.101335;REVB=0.0451682;RO=1;SAF=3;SAR=9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128042;STB=0.624759;TYPE=snp;VARB=0.0132889;OID=.;OPOS=29911119;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:13:13:1:2:12:11:9:3:1:0:8:3:2:0 chr6 29911154 . C A 125.83 PASS AO=15;DP=15;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0234737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.606;QD=35.9516;RBI=0.139618;REFB=0;REVB=0.13763;RO=0;SAF=7;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00227654;OID=.;OPOS=29911154;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:15:14:0:0:15:14:8:7:0:0:7:7:0:0 chr6 29911198 . T C 30.47 PASS AO=8;DP=24;FAO=8;FDP=23;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.0184535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.19;QD=5.29959;RBI=0.0485936;REFB=0.000363248;REVB=-0.0449534;RO=14;SAF=4;SAR=4;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149874;STB=0.608437;TYPE=snp;VARB=-0.00127086;OID=.;OPOS=29911198;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:24:23:14:15:8:8:4:4:5:9:4:4:5:10 chr6 29911207 . G A 39.52 PASS AO=11;DP=32;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.0212556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.504;QD=5.09914;RBI=0.0402009;REFB=-0.015884;REVB=-0.034122;RO=21;SAF=6;SAR=5;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126972;STB=0.561292;TYPE=snp;VARB=0.04878;OID=.;OPOS=29911207;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:32:31:21:20:11:11:5:6:9:12:5:6:9:11 chr6 29911228 . A T 186.2 PASS AO=25;DP=30;FAO=24;FDP=29;FR=.;FRO=5;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0538718;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.1218;QD=25.6829;RBI=0.107472;REFB=-0.0298325;REVB=0.0929953;RO=5;SAF=10;SAR=15;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124378;STB=0.566418;TYPE=snp;VARB=0.00879253;OID=.;OPOS=29911228;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:30:29:5:5:25:24:15:10:4:1:14:10:4:1 chr6 29911239 . T C 95.17 PASS AO=19;DP=33;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.0438933;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.165;QD=11.896;RBI=0.0561253;REFB=-0.00236199;REVB=-0.0349775;RO=14;SAF=9;SAR=10;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0343481;STB=0.531215;TYPE=snp;VARB=-0.000293864;OID=.;OPOS=29911239;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:33:32:14:14:19:18:10:9:6:8:9:9:6:8 chr6 29911240 . T A 95.16 PASS AO=19;DP=33;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0313655;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.3817;QD=11.8954;RBI=0.0429616;REFB=-0.0224759;REVB=0.0293582;RO=14;SAF=9;SAR=10;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0343481;STB=0.531215;TYPE=snp;VARB=0.0383987;OID=.;OPOS=29911240;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:33:32:14:14:19:18:10:9:6:8:9:9:6:8 chr6 29911256 . T G 293.2 PASS AO=24;DP=33;FAO=32;FDP=32;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0391826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.136;QD=36.65;RBI=0.115472;REFB=0;REVB=0.108621;RO=0;SAF=19;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000673158;OID=.;OPOS=29911256;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:32:32:0:0:24:32:5:19:0:0:13:19:0:0 chr6 29911271 . G C 15.16 PASS AO=6;DP=27;FAO=6;FDP=27;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.0207001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.2918;QD=2.24558;RBI=0.0713717;REFB=-0.00806852;REVB=-0.0683039;RO=20;SAF=5;SAR=1;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.276216;STB=0.71347;TYPE=snp;VARB=0.0279032;OID=.;OPOS=29911271;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:27:27:20:21:6:6:1:5:13:7:1:5:13:8 chr6 29911296 . G A 30.72 PASS AO=10;DP=33;FAO=10;FDP=33;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.00879175;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=222.29;QD=3.72337;RBI=0.00959285;REFB=-0.00311759;REVB=0.00383769;RO=23;SAF=9;SAR=1;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.462616;STB=0.795729;TYPE=snp;VARB=0.00622741;OID=.;OPOS=29911296;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:33:33:23:23:10:10:1:9:14:9:1:9:14:9 chr6 29911306 . C T 36.61 PASS AO=12;DP=38;FAO=12;FDP=38;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=-0.0296817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.568;QD=3.85357;RBI=0.0326771;REFB=-0.0104932;REVB=-0.0136669;RO=26;SAF=11;SAR=1;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.501789;STB=0.816897;TYPE=snp;VARB=0.0309598;OID=.;OPOS=29911306;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:38:38:26:26:12:12:1:11:16:10:1:11:16:10 chr6 29911319 . G T 55.72 PASS AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=13;FSAR=1;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=0.0190203;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.675;QD=6.55512;RBI=0.0790243;REFB=-0.00184867;REVB=-0.0767012;RO=19;SAF=13;SAR=1;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.400255;STB=0.770675;TYPE=snp;VARB=0.00638516;OID=.;OPOS=29911319;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:33:34:19:20:14:14:1:13:14:5:1:13:14:6 chr6 29911951 . C T 31.59 PASS AO=6;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=0.0587696;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=176.894;QD=9.71867;RBI=0.0587696;REFB=0.0201428;REVB=0;RO=7;SAF=6;SAR=0;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0133643;OID=.;OPOS=29911951;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:13:13:7:7:6:6:0:6:7:0:0:6:7:0 chr6 29911957 . G A 31.59 PASS AO=6;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=-0.067081;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.3144;QD=9.71867;RBI=0.067081;REFB=-0.0197929;REVB=0;RO=7;SAF=6;SAR=0;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0102054;OID=.;OPOS=29911957;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:13:13:7:7:6:6:0:6:7:0:0:6:7:0 chr6 29912041 . C T 15.32 PASS AO=2;DP=6;FAO=3;FDP=7;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0543006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.6627;QD=8.75522;RBI=0.0543006;REFB=0.00940216;REVB=0;RO=4;SAF=2;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00420078;OID=.;OPOS=29912041;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:6:7:4:4:2:3:0:2:4:0:0:3:4:0 chr6 29912098 . G A 21.11 PASS AO=4;DP=10;FAO=4;FDP=10;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.0252597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.239;QD=8.44499;RBI=0.0437699;REFB=0.0194448;REVB=0.0357457;RO=6;SAF=3;SAR=1;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113038;STB=0.5711;TYPE=snp;VARB=-0.0201512;OID=.;OPOS=29912098;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:10:10:6:6:4:4:1:3:5:1:1:3:5:1 chr6 29912108 . G C 29.48 PASS AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0612162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.2259;QD=8.42244;RBI=0.0635506;REFB=-0.0376915;REVB=0.0170662;RO=8;SAF=5;SAR=1;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.46433;STB=0.788428;TYPE=snp;VARB=0.0525707;OID=.;OPOS=29912108;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:14:14:8:8:6:6:1:5:3:5:1:5:3:5 chr6 29912147 . C T 67.99 PASS AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.0244577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.624;QD=7.99939;RBI=0.0275379;REFB=-0.00614106;REVB=-0.0126554;RO=18;SAF=13;SAR=3;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.348589;STB=0.702419;TYPE=snp;VARB=0.00547469;OID=.;OPOS=29912147;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:34:34:18:18:16:16:3:13:9:9:3:13:9:9 chr6 29912280 . T C 606.65 PASS AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000231867;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.796;QD=37.9158;RBI=0.00367506;REFB=0;REVB=-0.00366774;RO=0;SAF=36;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00021724;OID=.;OPOS=29912280;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:65:64:0:0:64:64:28:36:0:0:28:36:0:0 chr6 29912281 . G A 212.57 PASS AO=39;DP=66;FAO=40;FDP=66;FR=.;FRO=26;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=-0.0151635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.075;QD=12.8831;RBI=0.0356129;REFB=-0.024379;REVB=0.0322234;RO=26;SAF=20;SAR=19;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103413;STB=0.560576;TYPE=snp;VARB=0.0259946;OID=.;OPOS=29912281;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:66:66:26:26:39:40:19:20:17:9:20:20:17:9 chr6 29912297 . A G 265.81 PASS AO=49;DP=81;FAO=49;FDP=81;FR=.;FRO=32;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=9;FWDB=-0.00778266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.022;QD=13.1266;RBI=0.0253368;REFB=-0.0349092;REVB=0.0241119;RO=32;SAF=25;SAR=24;SRF=23;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151908;STB=0.582668;TYPE=snp;VARB=0.0160156;OID=.;OPOS=29912297;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:32:32:49:49:24:25:23:9:24:25:23:9 chr6 29912333 . C T 101.82 PASS AO=32;DP=86;FAO=32;FDP=86;FR=.;FRO=54;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=32;FSRR=22;FWDB=0.0395647;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.3365;QD=4.73593;RBI=0.039751;REFB=-0.0151161;REVB=0.00384466;RO=53;SAF=21;SAR=11;SRF=31;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0832376;STB=0.543076;TYPE=snp;VARB=0.0286462;OID=.;OPOS=29912333;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:53:54:32:32:11:21:31:22:11:21:32:22 chr6 29912368 . C T 835.24 PASS AO=86;DP=88;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0500432;FXX=0.0113623;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.111;QD=38.402;RBI=0.0944929;REFB=0;REVB=0.0801535;RO=0;SAF=55;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000359986;OID=.;OPOS=29912368;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:88:87:0:0:86:87:31:55:0:0:32:55:0:0 chr6 29912386 . G C 295.26 PASS AO=54;DP=88;FAO=55;FDP=88;FR=.;FRO=33;FSAF=37;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=0.00549706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.0282;QD=13.4207;RBI=0.0279381;REFB=-0.0195878;REVB=0.027392;RO=34;SAF=36;SAR=18;SRF=23;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00784988;STB=0.502575;TYPE=snp;VARB=0.0117438;OID=.;OPOS=29912386;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:34:33:54:55:18:36:23:11:18:37:22:11 chr6 29912398 . A G 86.59 PASS AO=27;DP=77;FAO=28;FDP=78;FR=.;FRO=50;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=35;FSRR=15;FWDB=-0.0016085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.66;QD=4.4407;RBI=0.00956236;REFB=-0.0109565;REVB=0.00942611;RO=50;SAF=16;SAR=11;SRF=35;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128848;STB=0.564059;TYPE=snp;VARB=0.0205079;OID=.;OPOS=29912398;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:77:78:50:50:27:28:11:16:35:15:11:17:35:15 chr6 29912830 . T C 1336.36 PASS AO=143;DP=143;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020797;FXX=0.00699252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.659;QD=37.6439;RBI=0.023689;REFB=-0.00258653;REVB=-0.0113426;RO=0;SAF=84;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.25139e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.17086e-06;OID=.;OPOS=29912830;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:143:142:0:0:143:142:59:84:0:0:59:83:0:0 chr6 29912852 . T C 1510.38 PASS AO=157;DP=157;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00104774;FXX=0.00632871;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.203;QD=38.481;RBI=0.0605196;REFB=0;REVB=0.0605106;RO=0;SAF=91;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.51302e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.41928e-05;OID=.;OPOS=29912852;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:157:157:0:0:157:157:66:91:0:0:66:91:0:0 chr6 29912856 . A T 1539.4 PASS AO=162;DP=163;FAO=163;FDP=163;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0337256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1574;QD=37.7766;RBI=0.0360226;REFB=0;REVB=0.0126576;RO=1;SAF=94;SAR=68;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00503556;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000245899;OID=.;OPOS=29912856;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:163:163:1:0:162:163:68:94:1:0:68:95:0:0 chr6 29913007 . C T 406 PASS AO=99;DP=205;FAO=99;FDP=205;FR=.;FRO=106;FSAF=48;FSAR=51;FSRF=49;FSRR=57;FWDB=-0.00288981;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=173.891;QD=7.92204;RBI=0.00289618;REFB=-0.00699088;REVB=0.000192024;RO=105;SAF=48;SAR=51;SRF=48;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0259324;STB=0.511694;TYPE=snp;VARB=0.00814287;OID=.;OPOS=29913007;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:205:105:106:99:99:51:48:48:57:51:48:49:57 chr6 29913042 . C T 1632.75 PASS AO=170;DP=171;FAO=173;FDP=173;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0418183;FXX=0.0170445;HRUN=3;LEN=1;MLLD=202.042;QD=37.7516;RBI=0.0445836;REFB=-0.00627569;REVB=0.0154572;RO=1;SAF=74;SAR=96;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00638833;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.47289e-05;OID=.;OPOS=29913042;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:171:173:1:0:170:173:96:74:1:0:97:76:0:0 chr6 29913067 . T C 408.35 PASS AO=89;DP=163;FAO=88;FDP=162;FR=.;FRO=74;FSAF=38;FSAR=50;FSRF=37;FSRR=37;FWDB=0.0419067;FXX=0.0181807;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.8521;QD=10.0827;RBI=0.0466526;REFB=-0.0158941;REVB=0.0205011;RO=74;SAF=40;SAR=49;SRF=37;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0422513;STB=0.531455;TYPE=snp;VARB=0.0183179;OID=.;OPOS=29913067;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:162:74:74:89:88:49:40:37:37:50:38:37:37 chr6 29913074 . A G 1468.72 PASS AO=134;DP=134;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0080455;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.405;QD=38.1487;RBI=0.0105229;REFB=0;REVB=-0.00678241;RO=0;SAF=68;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.60211e-06;OID=.;OPOS=29913074;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:134:154:0:0:134:154:66:68:0:0:80:74:0:0 chr6 29913078 . A G 1457.2 PASS AO=152;DP=153;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0054064;FXX=0.0128197;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.761;QD=37.8493;RBI=0.00767523;REFB=-0.0633206;REVB=-0.00544794;RO=1;SAF=72;SAR=80;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00656101;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000339935;OID=.;OPOS=29913078;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:153:154:1:0:152:154:80:72:1:0:81:73:0:0 chr6 29913213 . TA T 161.36 PASS AO=34;DP=156;FAO=56;FDP=154;FR=.;FRO=98;FSAF=35;FSAR=21;FSRF=52;FSRR=46;FWDB=-0.00536362;FXX=0.0434756;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.898;QD=4.19128;RBI=0.00979981;REFB=0.0192565;REVB=0.0082017;RO=61;SAF=22;SAR=12;SRF=36;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0677488;STB=0.562058;TYPE=del;VARB=-0.0316985;OID=.;OPOS=29913214;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:34:146:56:154:98:35:21:52:46:99:61:22:12:36:25 chr6 29976838 . A G 2240.48 PASS AO=233;DP=233;FAO=234;FDP=234;FR=.;FRO=0;FSAF=116;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180864;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.2972;QD=38.2988;RBI=0.054995;REFB=0;REVB=-0.0519358;RO=0;SAF=115;SAR=118;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.61275e-05;OID=.;OPOS=29976838;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:233:234:0:0:233:234:118:115:0:0:118:116:0:0 chr6 29977145 . G C 496.16 PASS AO=163;DP=411;FAO=158;FDP=400;FR=.;FRO=242;FSAF=108;FSAR=50;FSRF=149;FSRR=93;FWDB=-0.00449368;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.924;QD=4.96159;RBI=0.0200819;REFB=-0.00436176;REVB=0.0195727;RO=247;SAF=109;SAR=54;SRF=153;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0584204;STB=0.545834;TYPE=snp;VARB=0.00904867;OID=.;OPOS=29977145;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:411:400:247:242:163:158:54:109:153:94:50:108:149:93 chr6 30075843 . T C 156.79 PASS AO=59;DP=174;FAO=59;FDP=174;FR=.;FRO=115;FSAF=33;FSAR=26;FSRF=71;FSRR=44;FWDB=0.0344482;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=135.833;QD=3.60429;RBI=0.034496;REFB=0.00197975;REVB=0.00181571;RO=110;SAF=33;SAR=26;SRF=67;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0579784;STB=0.539277;TYPE=snp;VARB=-0.00329616;OID=.;OPOS=30075843;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:174:110:115:59:59:26:33:67:43:26:33:71:44 chr6 30075864 . A G 186.05 PASS AO=66;DP=185;FAO=66;FDP=186;FR=.;FRO=120;FSAF=42;FSAR=24;FSRF=78;FSRR=42;FWDB=-0.000834167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1692;QD=4.00097;RBI=0.0231455;REFB=-0.0110785;REVB=-0.0231304;RO=119;SAF=42;SAR=24;SRF=78;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0234812;STB=0.509551;TYPE=snp;VARB=0.02077;OID=.;OPOS=30075864;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:186:119:120:66:66:24:42:78:41:24:42:78:42 chr6 30075903 . C T 241.06 PASS AO=72;DP=178;FAO=72;FDP=178;FR=.;FRO=106;FSAF=48;FSAR=24;FSRF=75;FSRR=31;FWDB=-0.0107313;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.261;QD=5.41706;RBI=0.0211322;REFB=-0.00325691;REVB=-0.0182046;RO=104;SAF=48;SAR=24;SRF=75;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0663497;STB=0.527889;TYPE=snp;VARB=0.00415435;OID=.;OPOS=30075903;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:178:104:106:72:72:24:48:75:29:24:48:75:31 chr6 30114845 . T C 82.82 PASS AO=22;DP=55;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.00946033;FXX=0.036357;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.128;QD=6.25049;RBI=0.00953539;REFB=-0.00920251;REVB=-0.00119402;RO=33;SAF=15;SAR=7;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.244444;STB=0.639302;TYPE=snp;VARB=0.0182022;OID=.;OPOS=30114845;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:55:53:33:31:22:22:7:15:15:18:7:15:14:17 chr6 30114955 . C T 162.38 PASS AO=43;DP=99;FAO=43;FDP=99;FR=.;FRO=56;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=32;FWDB=-0.00803388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.925;QD=6.56081;RBI=0.0178457;REFB=-0.0102474;REVB=0.0159351;RO=55;SAF=17;SAR=26;SRF=24;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0424293;STB=0.519484;TYPE=snp;VARB=0.00984889;OID=.;OPOS=30114955;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:55:56:43:43:26:17:24:31:26:17:24:32 chr6 30115542 . G A 144.02 PASS AO=44;DP=113;FAO=44;FDP=113;FR=.;FRO=69;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=38;FSRR=31;FWDB=-0.0351575;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.8335;QD=5.09803;RBI=0.0449205;REFB=0.0184072;REVB=0.0279608;RO=69;SAF=24;SAR=20;SRF=38;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00572049;STB=0.503245;TYPE=snp;VARB=-0.0365006;OID=.;OPOS=30115542;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:69:69:44:44:20:24:38:31:20:24:38:31 chr6 30121460 . C T 341.27 PASS AO=79;DP=202;FAO=86;FDP=193;FR=.,HEALED;FRO=104;FSAF=48;FSAR=38;FSRF=60;FSRR=44;FWDB=-0.0538524;FXX=0.0252513;HRUN=3;LEN=1;MLLD=250.742;QD=7.073;RBI=0.0611645;REFB=-0.0127236;REVB=0.0290001;RO=66;SAF=42;SAR=37;SRF=23;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151677;STB=0.510445;TYPE=snp;VARB=0.0137907;OID=.;OPOS=30121460;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:193:66:104:79:86:37:42:23:43:38:48:60:44 chr6 30122154 . T C 748.45 PASS AO=89;DP=97;FAO=89;FDP=97;FR=.;FRO=8;FSAF=71;FSAR=18;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.00456463;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.383;QD=30.864;RBI=0.0154385;REFB=-0.0371848;REVB=0.0147483;RO=8;SAF=71;SAR=18;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114411;STB=0.506057;TYPE=snp;VARB=0.00386647;OID=.;OPOS=30122154;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:97:97:8:8:89:89:18:71:6:2:18:71:6:2 chr6 30131515 . C A 92.17 PASS AO=31;DP=91;FAO=32;FDP=93;FR=.;FRO=61;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=32;FSRR=29;FWDB=0.00844744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.6624;QD=3.96436;RBI=0.0257156;REFB=-0.0341467;REVB=0.0242885;RO=58;SAF=15;SAR=16;SRF=31;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0569883;STB=0.536579;TYPE=snp;VARB=0.0543227;OID=.;OPOS=30131515;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:91:93:58:61:31:32:16:15:31:27:17:15:32:29 chr6 30139699 . G A 94.49 PASS AO=26;DP=70;FAO=28;FDP=72;FR=.;FRO=44;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=8;FSRR=36;FWDB=-0.00605262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.204;QD=5.2494;RBI=0.00675719;REFB=-0.0173544;REVB=-0.00300424;RO=44;SAF=8;SAR=18;SRF=8;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175946;STB=0.624922;TYPE=snp;VARB=0.0221789;OID=.;OPOS=30139699;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:70:72:44:44:26:28:18:8:8:36:18:10:8:36 chr6 30140342 . T C 776.36 PASS AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00224626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.4135;QD=37.8714;RBI=0.0282568;REFB=0;REVB=0.0281674;RO=0;SAF=48;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000120326;OID=.;OPOS=30140342;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:82:82:0:0:82:82:34:48:0:0:34:48:0:0 chr6 30154199 . T C 497.97 PASS AO=47;DP=47;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.004;QD=37.5828;RBI=0.0223842;REFB=0;REVB=0.0112327;RO=0;SAF=22;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.85056e-05;OID=.;OPOS=30154199;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:47:53:0:0:47:53:25:22:0:0:31:22:0:0 chr6 30166266 . C T 306.09 PASS AO=62;DP=109;FAO=62;FDP=111;FR=.;FRO=49;FSAF=31;FSAR=31;FSRF=29;FSRR=20;FWDB=0.00703107;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=229.758;QD=11.0303;RBI=0.00947879;REFB=-0.00489561;REVB=-0.00635701;RO=47;SAF=31;SAR=31;SRF=29;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0924088;STB=0.540528;TYPE=snp;VARB=0.00389255;OID=.;OPOS=30166266;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:111:47:49:62:62:31:31:29:18:31:31:29:20 chr6 30228229 . CA C 72.23 PASS AO=20;DP=70;FAO=23;FDP=65;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=0.0106789;FXX=0.0714184;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.541;QD=4.44467;RBI=0.0106789;REFB=-0.00669859;REVB=3.35345e-06;RO=42;SAF=9;SAR=11;SRF=17;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0528266;STB=0.547738;TYPE=del;VARB=0.0140752;OID=.;OPOS=30228230;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:20:70:23:65:42:11:12:17:25:72:42:9:11:17:25 chr6 30228379 . A G 78.13 PASS AO=20;DP=47;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.0104364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.521;QD=6.64962;RBI=0.0419571;REFB=-0.0316519;REVB=0.0406384;RO=27;SAF=11;SAR=9;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0317387;STB=0.518183;TYPE=snp;VARB=0.0489856;OID=.;OPOS=30228379;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:47:47:27:27:20:20:9:11:14:13:9:11:14:13 chr6 30229013 . A G 198.51 PASS AO=38;DP=66;FAO=38;FDP=65;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=26;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=0.0114425;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.98;QD=12.2162;RBI=0.0125117;REFB=0.00170851;REVB=-0.00506092;RO=27;SAF=12;SAR=26;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0152431;STB=0.508375;TYPE=snp;VARB=-0.00149303;OID=.;OPOS=30229013;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:65:27:27:38:38:26:12:9:18:26:12:9:18 chr6 30229034 . C CT 115.9 PASS AO=33;DP=78;FAO=39;FDP=77;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=-0.00758052;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=25.1409;QD=6.02081;RBI=0.0622223;REFB=0.00888902;REVB=0.0617588;RO=41;SAF=10;SAR=23;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.286081;STB=0.596724;TYPE=ins;VARB=-0.00908527;OID=.;OPOS=30229035;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:33:78:39:77:38:15:24:22:16:99:41:10:23:24:17 chr6 30229457 . C T 449.72 PASS AO=93;DP=167;FAO=93;FDP=167;FR=.;FRO=74;FSAF=56;FSAR=37;FSRF=41;FSRR=33;FWDB=-0.0117488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1686;QD=10.7716;RBI=0.0315456;REFB=-0.052782;REVB=-0.0292761;RO=72;SAF=56;SAR=37;SRF=39;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0499665;STB=0.522035;TYPE=snp;VARB=0.0567906;OID=.;OPOS=30229457;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:167:72:74:93:93:37:56:39:33:37:56:41:33 chr6 30229463 . G A 476.51 PASS AO=95;DP=166;FAO=95;FDP=165;FR=.;FRO=70;FSAF=59;FSAR=36;FSRF=37;FSRR=33;FWDB=0.0209149;FXX=0.0119753;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.265;QD=11.5516;RBI=0.0325007;REFB=-0.0241993;REVB=-0.024877;RO=69;SAF=59;SAR=36;SRF=37;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0684179;STB=0.540844;TYPE=snp;VARB=0.0182196;OID=.;OPOS=30229463;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:165:69:70:95:95:36:59:37:32:36:59:37:33 chr6 30230085 . T C 203.53 PASS AO=24;DP=119;FAO=51;FDP=116;FR=.,HEALED;FRO=64;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=36;FSRR=28;FWDB=0.0526817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.758;QD=7.01837;RBI=0.0526817;REFB=-0.0536134;REVB=-1.97709e-05;RO=61;SAF=2;SAR=22;SRF=33;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.630642;STB=0.518511;TYPE=snp;VARB=0.0799816;OID=.;OPOS=30230085;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:116:61:64:24:51:22:2:33:28:24:27:36:28 chr6 30230128 . T C 52.05 PASS AO=14;DP=43;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.0335006;FXX=0.159055;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8828;QD=5.62712;RBI=0.0342166;REFB=-0.029403;REVB=-0.00696335;RO=20;SAF=5;SAR=9;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.244948;STB=0.654953;TYPE=snp;VARB=0.0839217;OID=.;OPOS=30230128;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:43:37:20:23:14:14:9:5:12:8:9:5:14:9 chr6 30231071 . G A 284.93 PASS AO=79;DP=184;FAO=79;FDP=183;FR=.;FRO=104;FSAF=29;FSAR=50;FSRF=54;FSRR=50;FWDB=-0.00742058;FXX=0.00543449;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.9291;QD=6.2279;RBI=0.0448267;REFB=-0.0110637;REVB=0.0442082;RO=103;SAF=29;SAR=50;SRF=53;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153469;STB=0.58863;TYPE=snp;VARB=0.0158478;OID=.;OPOS=30231071;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:183:103:104:79:79:50:29:53:50:50:29:54:50 chr6 30231108 . G T 328.85 PASS AO=118;DP=246;FAO=99;FDP=243;FR=.;FRO=144;FSAF=56;FSAR=43;FSRF=49;FSRR=95;FWDB=-0.0351288;FXX=0.0121946;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.3166;QD=5.4131;RBI=0.0353047;REFB=0.0219944;REVB=0.0035197;RO=126;SAF=58;SAR=60;SRF=49;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0965994;STB=0.631192;TYPE=snp;VARB=-0.00889173;OID=.;OPOS=30231108;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:246:243:126:144:118:99:60:58:49:77:43:56:49:95 chr6 30297529 . T C 366.54 PASS AO=86;DP=173;FAO=86;FDP=173;FR=.;FRO=87;FSAF=46;FSAR=40;FSRF=41;FSRR=46;FWDB=-0.0318379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.569;QD=8.47493;RBI=0.0327465;REFB=-0.0262293;REVB=0.00766035;RO=87;SAF=46;SAR=40;SRF=41;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0581415;STB=0.531999;TYPE=snp;VARB=0.02344;OID=.;OPOS=30297529;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:173:87:87:86:86:40:46:41:46:40:46:41:46 chr6 30309508 . T C 218.47 PASS AO=56;DP=157;FAO=68;FDP=167;FR=.;FRO=99;FSAF=34;FSAR=34;FSRF=68;FSRR=31;FWDB=0.0560663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.263;QD=5.23284;RBI=0.0637233;REFB=-0.0291287;REVB=0.0302857;RO=98;SAF=29;SAR=27;SRF=67;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188046;STB=0.610747;TYPE=snp;VARB=0.0308378;OID=.;OPOS=30309508;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:167:98:99:56:68:27:29:67:31:34:34:68:31 chr6 30313268 . G A 48.56 PASS AO=7;DP=12;FAO=8;FDP=12;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.051558;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=184.871;QD=16.1871;RBI=0.0537786;REFB=-0.000856375;REVB=0.0152941;RO=4;SAF=3;SAR=4;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0448465;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00177982;OID=.;OPOS=30313268;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:12:12:4:4:7:8:4:3:2:2:4:4:2:2 chr6 30314566 . T G 459.74 PASS AO=118;DP=258;FAO=118;FDP=255;FR=.;FRO=137;FSAF=54;FSAR=64;FSRF=51;FSRR=86;FWDB=-0.00635287;FXX=0.0413518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.487;QD=7.21156;RBI=0.0346266;REFB=-0.012482;REVB=0.0340389;RO=137;SAF=54;SAR=64;SRF=51;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0843872;STB=0.546551;TYPE=snp;VARB=0.0221857;OID=.;OPOS=30314566;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:258:255:137:137:118:118:64:54:51:86:64:54:51:86 chr6 30314567 . C A 452.91 PASS AO=119;DP=264;FAO=117;FDP=255;FR=.;FRO=138;FSAF=54;FSAR=63;FSRF=50;FSRR=88;FWDB=-0.011282;FXX=0.0340896;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.847;QD=7.10445;RBI=0.0114589;REFB=-0.0133375;REVB=0.0020052;RO=136;SAF=55;SAR=64;SRF=49;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100002;STB=0.554458;TYPE=snp;VARB=0.012166;OID=.;OPOS=30314567;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:264:255:136:138:119:117:64:55:49:87:63:54:50:88 chr6 30575603 . A G 1309.46 PASS AO=138;DP=139;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0347704;FXX=0.00719373;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6549;QD=37.9553;RBI=0.0470306;REFB=-0.045591;REVB=0.0316685;RO=1;SAF=63;SAR=75;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00629719;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000281492;OID=.;OPOS=30575603;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:139:138:1:0:138:138:75:63:0:1:75:63:0:0 chr6 30615603 . A G 112.01 PASS AO=20;DP=35;FAO=21;FDP=36;FR=.;FRO=15;FSAF=17;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=13;FWDB=0.0320741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.36;QD=12.4456;RBI=0.0400348;REFB=-0.0181485;REVB=-0.023959;RO=14;SAF=16;SAR=4;SRF=2;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.500717;STB=0.791494;TYPE=snp;VARB=0.00850683;OID=.;OPOS=30615603;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:35:36:14:15:20:21:4:16:2:12:4:17:2:13 chr6 30653141 . C G 107.09 PASS AO=25;DP=54;FAO=26;FDP=57;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=8;FSRR=23;FWDB=-0.0160669;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.4696;QD=7.51533;RBI=0.0201943;REFB=-0.0355935;REVB=-0.0122337;RO=29;SAF=5;SAR=20;SRF=6;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101625;STB=0.52043;TYPE=snp;VARB=0.0409111;OID=.;OPOS=30653141;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:57:29:31:25:26:20:5:6:23:20:6:8:23 chr6 30653418 . AGG AG,A 252.21 PASS AO=35,9;DP=60;FAO=69,0;FDP=75;FR=.;FRO=6;FSAF=16,0;FSAR=53,0;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=-0.197656,-0.104206;FXX=0.0131562;HRUN=3,3;LEN=1,2;MLLD=10.2455,13.3653;QD=13.4513;RBI=0.279399,0.143404;REFB=-0.0237933,-0.0110577;REVB=-0.197474,-0.0985184;RO=7;SAF=2,0;SAR=33,9;SRF=0;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0.346804,0.346804;SSSB=0.0895762,0;STB=0.526778,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.0283299,0.00521844;OID=.,.;OPOS=30653419,30653419;OREF=G,GG;OALT=-,-;OMAPALT=AG,A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:35,9:53:69,0:75:6:16,0:53,0:0:6:5:7:2,0:33,9:0:7 chr6 30658385 . C T 269.2 PASS AO=59;DP=120;FAO=61;FDP=121;FR=.;FRO=60;FSAF=24;FSAR=37;FSRF=31;FSRR=29;FWDB=0.0163761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.941;QD=8.8992;RBI=0.0165067;REFB=-0.0238062;REVB=-0.00207198;RO=59;SAF=23;SAR=36;SRF=30;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109732;STB=0.562289;TYPE=snp;VARB=0.0113584;OID=.;OPOS=30658385;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:121:59:60:59:61:36:23:30:29:37:24:31:29 chr6 30671452 . T C 529.89 PASS AO=128;DP=272;FAO=131;FDP=272;FR=.;FRO=141;FSAF=46;FSAR=85;FSRF=51;FSRR=90;FWDB=-0.00799199;FXX=0.007299;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.936;QD=7.79252;RBI=0.0108148;REFB=-0.0104497;REVB=-0.0072862;RO=138;SAF=46;SAR=82;SRF=50;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00300987;STB=0.505983;TYPE=snp;VARB=0.00904463;OID=.;OPOS=30671452;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:272:272:138:141:128:131:82:46:50:88:85:46:51:90 chr6 30671760 . C T 487.19 PASS AO=147;DP=361;FAO=147;FDP=360;FR=.;FRO=213;FSAF=73;FSAR=74;FSRF=69;FSRR=144;FWDB=0.00987856;FXX=0.00552471;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.0648;QD=5.41325;RBI=0.0113502;REFB=-0.0215574;REVB=0.00558928;RO=210;SAF=73;SAR=74;SRF=68;SRR=142;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18323;STB=0.602288;TYPE=snp;VARB=0.0376711;OID=.;OPOS=30671760;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:361:360:210:213:147:147:74:73:68:142:74:73:69:144 chr6 30671969 . G C 459.5 PASS AO=123;DP=283;FAO=126;FDP=287;FR=.;FRO=161;FSAF=81;FSAR=45;FSRF=83;FSRR=78;FWDB=0.00649936;FXX=0.0137452;HRUN=5;LEN=1;MLLD=267.974;QD=6.40416;RBI=0.0138998;REFB=-0.0119312;REVB=-0.0122867;RO=146;SAF=81;SAR=42;SRF=78;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129131;STB=0.574456;TYPE=snp;VARB=0.0138947;OID=.;OPOS=30671969;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:283:287:146:161:123:126:42:81:78:68:45:81:83:78 chr6 30672718 . G A 69.01 PASS AO=39;DP=143;FAO=38;FDP=143;FR=.;FRO=105;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=28;FSRR=77;FWDB=-9.40222e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.7799;QD=1.93023;RBI=0.0102053;REFB=-0.00593611;REVB=-0.0102049;RO=93;SAF=25;SAR=14;SRF=26;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.414143;STB=0.765446;TYPE=snp;VARB=0.0197652;OID=.;OPOS=30672718;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:143:143:93:105:39:38:14:25:26:67:13:25:28:77 chr6 30673113 . G T 37.65 PASS AO=19;DP=73;FAO=19;FDP=73;FR=.;FRO=54;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=30;FWDB=-0.0103506;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.42;QD=2.06291;RBI=0.0288856;REFB=-0.0137191;REVB=-0.0269674;RO=44;SAF=9;SAR=10;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0493596;STB=0.521716;TYPE=snp;VARB=0.0648753;OID=.;OPOS=30673113;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:73:73:44:54:19:19:10:9:19:25:10:9:24:30 chr6 30673236 . G T 178.87 PASS AO=56;DP=188;FAO=68;FDP=188;FR=.,HEALED;FRO=120;FSAF=23;FSAR=45;FSRF=47;FSRR=73;FWDB=-0.0587605;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=28.0701;QD=3.8058;RBI=0.0640008;REFB=-0.0970773;REVB=0.0253635;RO=91;SAF=18;SAR=38;SRF=30;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.010267;STB=0.537165;TYPE=snp;VARB=0.194328;OID=.;OPOS=30673236;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:188:91:120:56:68:38:18:30:61:45:23:47:73 chr6 30673314 . C T 102.77 PASS AO=46;DP=163;FAO=48;FDP=166;FR=.;FRO=118;FSAF=34;FSAR=14;FSRF=62;FSRR=56;FWDB=-0.0350546;FXX=0.00598767;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.537;QD=2.47632;RBI=0.044747;REFB=-0.0129319;REVB=-0.0278114;RO=101;SAF=32;SAR=14;SRF=57;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168109;STB=0.639037;TYPE=snp;VARB=0.0492539;OID=.;OPOS=30673314;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:166:101:118:46:48:14:32:57:44:14:34:62:56 chr6 30673351 . C G 30.75 PASS AO=46;DP=153;FAO=35;FDP=160;FR=.;FRO=125;FSAF=10;FSAR=25;FSRF=79;FSRR=46;FWDB=-0.082452;FXX=0.0184038;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.4474;QD=0.768799;RBI=0.0828845;REFB=-0.0289448;REVB=0.0084559;RO=103;SAF=15;SAR=31;SRF=72;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.423084;STB=0.757953;TYPE=snp;VARB=0.13501;OID=.;OPOS=30673351;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:153:160:103:125:46:35:31:15:72:31:25:10:79:46 chr6 30673422 . A G 36.28 PASS AO=35;DP=103;FAO=23;FDP=104;FR=.;FRO=81;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=32;FSRR=49;FWDB=-0.00910702;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.815;QD=1.39532;RBI=0.0156949;REFB=-0.0195798;REVB=-0.0127825;RO=64;SAF=20;SAR=15;SRF=20;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.285259;STB=0.503065;TYPE=snp;VARB=0.0832452;OID=.;OPOS=30673422;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:103:104:64:81:35:23:15:20:20:44:14:9:32:49 chr6 30673489 . G C 46.99 PASS AO=26;DP=105;FAO=26;FDP=105;FR=.;FRO=79;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=29;FSRR=50;FWDB=0.00197618;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=228.223;QD=1.79015;RBI=0.0321679;REFB=-0.0128413;REVB=0.0321072;RO=79;SAF=15;SAR=11;SRF=29;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.255857;STB=0.653926;TYPE=snp;VARB=0.0372077;OID=.;OPOS=30673489;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:105:105:79:79:26:26:11:15:29:50:11:15:29:50 chr6 30676046 . C G 354.94 PASS AO=82;DP=162;FAO=82;FDP=163;FR=.;FRO=81;FSAF=10;FSAR=72;FSRF=8;FSRR=73;FWDB=0.00702902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.439;QD=8.71013;RBI=0.0169783;REFB=-0.00561814;REVB=0.015455;RO=80;SAF=10;SAR=72;SRF=8;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0480354;STB=0.528034;TYPE=snp;VARB=0.00489042;OID=.;OPOS=30676046;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:163:80:81:82:82:72:10:8:72:72:10:8:73 chr6 30680562 . G A 285.6 PASS AO=71;DP=148;FAO=70;FDP=149;FR=.;FRO=79;FSAF=34;FSAR=36;FSRF=28;FSRR=51;FWDB=-0.00859007;FXX=0.0569584;HRUN=4;LEN=1;MLLD=120.947;QD=7.66707;RBI=0.0095711;REFB=-0.0220084;REVB=-0.00422096;RO=76;SAF=35;SAR=36;SRF=27;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129338;STB=0.569923;TYPE=snp;VARB=0.023443;OID=.;OPOS=30680562;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:149:76:79:71:70:36:35:27:49:36:34:28:51 chr6 30680608 . C T 434.43 PASS AO=84;DP=143;FAO=85;FDP=145;FR=.;FRO=60;FSAF=41;FSAR=44;FSRF=19;FSRR=41;FWDB=-0.016814;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.749;QD=11.9843;RBI=0.0262167;REFB=0.0209397;REVB=-0.0201148;RO=59;SAF=40;SAR=44;SRF=18;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131341;STB=0.568964;TYPE=snp;VARB=-0.016672;OID=.;OPOS=30680608;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:145:59:60:84:85:44:40:18:41:44:41:19:41 chr6 30691490 . G A 561.15 PASS AO=105;DP=172;FAO=106;FDP=172;FR=.;FRO=66;FSAF=93;FSAR=13;FSRF=50;FSRR=16;FWDB=0.00285656;FXX=0.0114936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.169;QD=13.05;RBI=0.0226958;REFB=0.00487153;REVB=0.0225153;RO=65;SAF=92;SAR=13;SRF=50;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151399;STB=0.591947;TYPE=snp;VARB=-0.00163797;OID=.;OPOS=30691490;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:172:65:66:105:106:13:92:50:15:13:93:50:16 chr6 30692752 . C CTG 120.59 PASS AO=43;DP=134;FAO=45;FDP=134;FR=.;FRO=89;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=26;FSRR=63;FWDB=-0.0184664;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=2;MLLD=212.461;QD=3.59957;RBI=0.0194616;REFB=0.000484903;REVB=0.00614394;RO=88;SAF=16;SAR=27;SRF=26;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0984941;STB=0.562315;TYPE=ins;VARB=-0.000511672;OID=.;OPOS=30692753;OREF=-;OALT=TG;OMAPALT=CTG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:43:134:45:134:89:17:28:26:63:99:88:16:27:26:62 chr6 30692754 . C T 63.66 PASS AO=46;DP=128;FAO=30;FDP=107;FR=.;FRO=77;FSAF=1;FSAR=29;FSRF=19;FSRR=58;FWDB=0.0332933;FXX=0.16405;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.79;QD=2.37967;RBI=0.033341;REFB=-0.00528228;REVB=-0.00178259;RO=77;SAF=18;SAR=28;SRF=19;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175618;STB=0.869205;TYPE=snp;VARB=0.0112381;OID=.;OPOS=30692754;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:128:107:77:77:46:30:28:18:19:58:29:1:19:58 chr6 30693121 . A G 392.17 PASS AO=103;DP=227;FAO=103;FDP=227;FR=.;FRO=124;FSAF=36;FSAR=67;FSRF=60;FSRR=64;FWDB=0.00196783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.891;QD=6.91039;RBI=0.0202349;REFB=-0.0157295;REVB=-0.0201389;RO=123;SAF=36;SAR=67;SRF=59;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134036;STB=0.576949;TYPE=snp;VARB=0.0208283;OID=.;OPOS=30693121;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:227:227:123:124:103:103:67:36:59:64:67:36:60:64 chr6 30697931 . T C 187.71 PASS AO=57;DP=142;FAO=57;FDP=144;FR=.;FRO=87;FSAF=14;FSAR=43;FSRF=51;FSRR=36;FWDB=-0.0302616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.026;QD=5.21408;RBI=0.0302617;REFB=-0.0112917;REVB=-7.63714e-05;RO=83;SAF=14;SAR=43;SRF=47;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.359201;STB=0.716404;TYPE=snp;VARB=0.0148044;OID=.;OPOS=30697931;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:144:83:87:57:57:43:14:47:36:43:14:51:36 chr6 30711805 . C G 527.77 PASS AO=54;DP=54;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0198295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.302;QD=37.6976;RBI=0.0250593;REFB=0;REVB=0.0153219;RO=0;SAF=19;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.86274e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.88302e-05;OID=.;OPOS=30711805;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:54:56:0:0:54:56:35:19:0:0:37:19:0:0 chr6 30712327 . G A 188.4 PASS AO=28;DP=38;FAO=28;FDP=38;FR=.;FRO=10;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=0;FWDB=-0.0211661;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.2804;QD=19.8313;RBI=0.115823;REFB=0.0691201;REVB=0.113873;RO=10;SAF=18;SAR=10;SRF=10;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201175;STB=0.608626;TYPE=snp;VARB=-0.023447;OID=.;OPOS=30712327;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:38:38:10:10:28:28:10:18:10:0:10:18:10:0 chr6 30832063 . C T 647.72 PASS AO=130;DP=226;FAO=130;FDP=226;FR=.;FRO=96;FSAF=63;FSAR=67;FSRF=49;FSRR=47;FWDB=0.0213556;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=226.656;QD=11.4641;RBI=0.0213656;REFB=-0.0179978;REVB=-0.000654368;RO=94;SAF=63;SAR=67;SRF=47;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119109;STB=0.510961;TYPE=snp;VARB=0.0118676;OID=.;OPOS=30832063;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:226:226:94:96:130:130:67:63:47:47:67:63:49:47 chr6 30832119 . T C 463.29 PASS AO=101;DP=207;FAO=107;FDP=211;FR=.;FRO=104;FSAF=39;FSAR=68;FSRF=47;FSRR=57;FWDB=0.0208649;FXX=0.00938923;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.5313;QD=8.78269;RBI=0.0421791;REFB=0.00407859;REVB=0.0366569;RO=101;SAF=39;SAR=62;SRF=44;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0469113;STB=0.545361;TYPE=snp;VARB=-0.004685;OID=.;OPOS=30832119;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:211:101:104:101:107:62:39:44:57:68:39:47:57 chr6 30857072 . G C 49.59 PASS AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.000284857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.272;QD=6.84026;RBI=0.00815368;REFB=-0.00834649;REVB=0.00814871;RO=17;SAF=9;SAR=3;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.353727;STB=0.708727;TYPE=snp;VARB=0.00876735;OID=.;OPOS=30857072;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:29:29:17:17:12:12:3:9:7:10:3:9:7:10 chr6 30858857 . C T 274.53 PASS AO=64;DP=130;FAO=64;FDP=130;FR=.;FRO=66;FSAF=51;FSAR=13;FSRF=48;FSRR=18;FWDB=-0.0501438;FXX=0.00763301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.9441;QD=8.44717;RBI=0.0539938;REFB=-0.0317438;REVB=-0.0200233;RO=64;SAF=51;SAR=13;SRF=47;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0823493;STB=0.551238;TYPE=snp;VARB=0.0482653;OID=.;OPOS=30858857;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:64:66:64:64:13:51:47:17:13:51:48:18 chr6 30864552 . AG A 105.13 PASS AO=4;DP=27;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.24429;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=11.4523;QD=22.1327;RBI=0.361012;REFB=0;REVB=0.265806;RO=6;SAF=2;SAR=2;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0.3;SSSB=-0.156622;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0386876;OID=.;OPOS=30864553;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:4:10:19:19:0:13:6:0:0:9:6:2:2:4:2 chr6 30864829 . T C 363.32 PASS AO=97;DP=217;FAO=97;FDP=217;FR=.;FRO=120;FSAF=52;FSAR=45;FSRF=58;FSRR=62;FWDB=-0.0298274;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.869;QD=6.69706;RBI=0.0310552;REFB=-0.00804918;REVB=0.00864594;RO=116;SAF=52;SAR=45;SRF=58;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0355417;STB=0.529193;TYPE=snp;VARB=0.00683304;OID=.;OPOS=30864829;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:217:217:116:120:97:97:45:52:58:58:45:52:58:62 chr6 30865204 . A C 178.83 PASS AO=29;DP=71;FAO=38;FDP=71;FR=.,HEALED;FRO=32;FSAF=29;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=10;FWDB=0.0698728;FXX=0.013887;HRUN=3;LEN=1;MLLD=38.0736;QD=10.0749;RBI=0.0698969;REFB=0.00114771;REVB=-0.00183688;RO=20;SAF=24;SAR=5;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240101;STB=0.54552;TYPE=snp;VARB=0.00974085;OID=.;OPOS=30865204;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:71:20:32:29:38:5:24:12:8:9:29:22:10 chr6 30876238 . G A 230.69 PASS AO=40;DP=62;FAO=40;FDP=62;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=30;FSRF=2;FSRR=20;FWDB=-0.0145053;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=238.444;QD=14.883;RBI=0.0150046;REFB=-6.45169e-05;REVB=-0.00383873;RO=22;SAF=10;SAR=30;SRF=2;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150524;STB=0.581359;TYPE=snp;VARB=-2.54748e-05;OID=.;OPOS=30876238;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:62:62:22:22:40:40:30:10:2:20:30:10:2:20 chr6 30877760 . A C 107.78 PASS AO=27;DP=66;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=28;FSRR=9;FWDB=-0.0292593;FXX=0.0298463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.204;QD=6.63243;RBI=0.039713;REFB=-0.0143253;REVB=-0.0268518;RO=39;SAF=16;SAR=11;SRF=28;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1393;STB=0.592753;TYPE=snp;VARB=0.0180704;OID=.;OPOS=30877760;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:65:39:37:27:28:11:16:28:11:11:17:28:9 chr6 30882634 . C T 428.94 PASS AO=97;DP=189;FAO=97;FDP=189;FR=.;FRO=92;FSAF=44;FSAR=53;FSRF=27;FSRR=65;FWDB=0.0780025;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.458;QD=9.07815;RBI=0.0780368;REFB=-0.00458482;REVB=-0.00231239;RO=91;SAF=44;SAR=53;SRF=26;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152393;STB=0.579772;TYPE=snp;VARB=0.00585743;OID=.;OPOS=30882634;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:189:91:92:97:97:53:44:26:65:53:44:27:65 chr6 30882781 . G T 198.07 PASS AO=50;DP=110;FAO=50;FDP=110;FR=.;FRO=60;FSAF=31;FSAR=19;FSRF=37;FSRR=23;FWDB=-0.00588196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.787;QD=7.20261;RBI=0.00630856;REFB=-0.0131207;REVB=0.00228046;RO=58;SAF=31;SAR=19;SRF=37;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184383;STB=0.501927;TYPE=snp;VARB=0.0160937;OID=.;OPOS=30882781;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:58:60:50:50:19:31:37:21:19:31:37:23 chr6 30887972 . C T 412.31 PASS AO=90;DP=170;FAO=90;FDP=171;FR=.;FRO=81;FSAF=66;FSAR=24;FSRF=47;FSRR=34;FWDB=0.00851054;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.104;QD=9.64475;RBI=0.0171719;REFB=-0.0294966;REVB=0.0149146;RO=80;SAF=66;SAR=24;SRF=47;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147441;STB=0.585301;TYPE=snp;VARB=0.0225112;OID=.;OPOS=30887972;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:171:80:81:90:90:24:66:47:33:24:66:47:34 chr6 30887988 . C T 327.51 PASS AO=80;DP=169;FAO=81;FDP=171;FR=.;FRO=90;FSAF=48;FSAR=33;FSRF=65;FSRR=25;FWDB=0.0158495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.561;QD=7.66106;RBI=0.0191182;REFB=0.00127198;REVB=-0.0106912;RO=89;SAF=47;SAR=33;SRF=65;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144931;STB=0.57253;TYPE=snp;VARB=-0.00189946;OID=.;OPOS=30887988;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:171:89:90:80:81:33:47:65:24:33:48:65:25 chr6 30888161 . T C 1576.7 PASS AO=164;DP=167;FAO=165;FDP=165;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000299142;FXX=0.0350857;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.576;QD=38.2231;RBI=0.0341977;REFB=0;REVB=0.0341964;RO=0;SAF=72;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.20319e-05;OID=.;OPOS=30888161;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:167:165:0:0:164:165:92:72:0:0:93:72:0:0 chr6 30888169 . G A 363.76 PASS AO=78;DP=145;FAO=78;FDP=145;FR=.;FRO=67;FSAF=36;FSAR=42;FSRF=32;FSRR=35;FWDB=-0.0109973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.794;QD=10.0348;RBI=0.0155777;REFB=-0.00165743;REVB=0.0110328;RO=66;SAF=36;SAR=42;SRF=32;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0196066;STB=0.507461;TYPE=snp;VARB=0.00133898;OID=.;OPOS=30888169;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:66:67:78:78:42:36:32:34:42:36:32:35 chr6 30889389 . T C 269.48 PASS AO=54;DP=98;FAO=54;FDP=97;FR=.;FRO=43;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=-0.0143793;FXX=0.0202;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.976;QD=11.1126;RBI=0.0289156;REFB=0.00111035;REVB=-0.0250868;RO=41;SAF=26;SAR=28;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0242199;STB=0.513364;TYPE=snp;VARB=-0.00312005;OID=.;OPOS=30889389;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:97:41:43:54:54:28:26:21:20:28:26:22:21 chr6 30890206 . T C 121.54 PASS AO=30;DP=70;FAO=31;FDP=71;FR=.;FRO=40;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=-0.0154343;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.1614;QD=6.84741;RBI=0.0416024;REFB=-0.0271466;REVB=-0.0386335;RO=40;SAF=12;SAR=18;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0518713;STB=0.536699;TYPE=snp;VARB=0.0371831;OID=.;OPOS=30890206;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:71:40:40:30:31:18:12:18:22:19:12:18:22 chr6 30890483 . G T 36.5 PASS AO=10;DP=28;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=-0.0311565;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7202;QD=5.21408;RBI=0.0617058;REFB=-0.0176014;REVB=0.0532624;RO=18;SAF=2;SAR=8;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.538566;STB=0.821303;TYPE=snp;VARB=0.0330539;OID=.;OPOS=30890483;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:28:28:18:18:10:10:8:2:13:5:8:2:13:5 chr6 30892322 . C T 16.08 PASS AO=5;DP=20;FAO=5;FDP=20;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.0269935;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=89.0722;QD=3.2169;RBI=0.0664079;REFB=-0.04966;REVB=-0.0606742;RO=13;SAF=3;SAR=2;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.06903;STB=0.550814;TYPE=snp;VARB=0.101824;OID=.;OPOS=30892322;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:20:20:13:15:5:5:2:3:7:6:2:3:8:7 chr6 30893127 . G A 183.99 PASS AO=32;DP=52;FAO=33;FDP=53;FR=.;FRO=20;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.0326591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0555;QD=13.886;RBI=0.0344157;REFB=-0.0269571;REVB=0.0108545;RO=20;SAF=12;SAR=20;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0908811;STB=0.541151;TYPE=snp;VARB=0.0112777;OID=.;OPOS=30893127;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:52:53:20:20:32:33:20:12:10:10:20:13:10:10 chr6 30893428 . G A 63.64 PASS AO=9;DP=12;FAO=9;FDP=12;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0300315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.0937;QD=21.2137;RBI=0.101515;REFB=-0.014269;REVB=0.0969712;RO=3;SAF=3;SAR=6;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0186779;OID=.;OPOS=30893428;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:12:12:3:3:9:9:6:3:1:2:6:3:1:2 chr6 30893728 . C T 487.17 PASS AO=54;DP=57;FAO=54;FDP=56;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.076847;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.271;QD=34.7978;RBI=0.130659;REFB=-0.140522;REVB=0.105671;RO=1;SAF=25;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184775;STB=0.501329;TYPE=snp;VARB=0.0074214;OID=.;OPOS=30893728;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:57:56:1:2:54:54:29:25:1:0:29:25:1:1 chr6 30899571 . C T 123.55 PASS AO=26;DP=50;FAO=27;FDP=54;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=5;FWDB=-0.00483408;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=70.6227;QD=9.15157;RBI=0.00908062;REFB=-0.0172254;REVB=0.00768695;RO=24;SAF=14;SAR=12;SRF=19;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224784;STB=0.635103;TYPE=snp;VARB=0.0135584;OID=.;OPOS=30899571;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:54:24:27:26:27:12:14:19:5:12:15:22:5 chr6 30900399 . C G 65.14 PASS AO=29;DP=101;FAO=29;FDP=101;FR=.;FRO=72;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=34;FSRR=38;FWDB=-0.0717854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.6876;QD=2.57964;RBI=0.0791393;REFB=-0.0292534;REVB=-0.0333149;RO=72;SAF=8;SAR=21;SRF=34;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253226;STB=0.651294;TYPE=snp;VARB=0.0801803;OID=.;OPOS=30900399;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:101:101:72:72:29:29:21:8:34:38:21:8:34:38 chr6 30900427 . T G 1290.34 PASS AO=135;DP=136;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.357;QD=37.6741;RBI=0.0833975;REFB=0;REVB=0.0826312;RO=1;SAF=65;SAR=70;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00674279;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000209655;OID=.;OPOS=30900427;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:136:137:1:0:135:137:70:65:0:1:72:65:0:0 chr6 30900435 . G T 178.44 PASS AO=46;DP=131;FAO=56;FDP=141;FR=.;FRO=85;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=44;FSRR=41;FWDB=-0.0400146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.4282;QD=5.06199;RBI=0.047949;REFB=-0.0238212;REVB=0.0264186;RO=84;SAF=22;SAR=24;SRF=44;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0513274;STB=0.576244;TYPE=snp;VARB=0.0482137;OID=.;OPOS=30900435;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:141:84:85:46:56:24:22:44:40:34:22:44:41 chr6 30920890 . G A 305.09 PASS AO=57;DP=99;FAO=60;FDP=103;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=45;FSRF=16;FSRR=27;FWDB=0.0485341;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.467;QD=11.848;RBI=0.0490529;REFB=0.00355458;REVB=-0.00711529;RO=42;SAF=15;SAR=42;SRF=16;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110666;STB=0.563614;TYPE=snp;VARB=-0.00568806;OID=.;OPOS=30920890;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:103:42:43:57:60:42:15:16:26:45:15:16:27 chr6 30954211 . A AG 24.32 PASS AO=9;DP=35;FAO=11;FDP=32;FR=.;FRO=21;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.0582026;FXX=0.0302939;HRUN=0;LEN=1;MLLD=37.4448;QD=3.03977;RBI=0.0595993;REFB=-0.0302158;REVB=0.0128273;RO=24;SAF=0;SAR=9;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.738743;STB=0.818951;TYPE=ins;VARB=0.132267;OID=.;OPOS=30954212;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:9:35:11:32:21:1:10:9:12:24:24:0:9:10:14 chr6 30954245 . T C 101.95 PASS AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0387286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.211;QD=37.0727;RBI=0.0730875;REFB=0;REVB=0.0619829;RO=0;SAF=2;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000559996;OID=.;OPOS=30954245;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:11:11:9:2:0:0:9:2:0:0 chr6 30993377 . T A 130.71 PASS AO=22;DP=39;FAO=24;FDP=41;FR=.;FRO=17;FSAF=23;FSAR=1;FSRF=15;FSRR=2;FWDB=-0.0609689;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.3129;QD=12.7517;RBI=0.0640676;REFB=-0.0656195;REVB=0.0196837;RO=17;SAF=21;SAR=1;SRF=15;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.238532;STB=0.644708;TYPE=snp;VARB=0.0211649;OID=.;OPOS=30993377;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:39:41:17:17:22:24:1:21:15:2:1:23:15:2 chr6 30993499 . C T 74.03 PASS AO=21;DP=54;FAO=21;FDP=54;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=0.00811118;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.4;QD=5.48402;RBI=0.0102867;REFB=-0.0230412;REVB=-0.00632661;RO=33;SAF=16;SAR=5;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197767;STB=0.615266;TYPE=snp;VARB=0.0783898;OID=.;OPOS=30993499;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:54:54:33:33:21:21:5:16:20:13:5:16:20:13 chr6 30993567 . G T 115.56 PASS AO=27;DP=65;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=24;FSAR=3;FSRF=25;FSRR=8;FWDB=-0.0182091;FXX=0.0769112;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.074;QD=7.70429;RBI=0.0565399;REFB=-0.038263;REVB=-0.0535274;RO=33;SAF=24;SAR=3;SRF=25;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246621;STB=0.642211;TYPE=snp;VARB=0.0376738;OID=.;OPOS=30993567;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:60:33:33:27:27:3:24:25:8:3:24:25:8 chr6 30993776 . A T 51.52 PASS AO=15;DP=51;FAO=17;FDP=51;FR=.;FRO=34;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=-0.0246213;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.901;QD=4.04101;RBI=0.0246224;REFB=-0.0271682;REVB=-0.00023308;RO=32;SAF=4;SAR=11;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143692;STB=0.541822;TYPE=snp;VARB=0.0410942;OID=.;OPOS=30993776;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:51:51:32:34:15:17:11:4:12:20:11:6:14:20 chr6 30993958 . A G 119.31 PASS AO=28;DP=60;FAO=28;FDP=60;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=25;FSRR=7;FWDB=0.00379902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.545;QD=7.9539;RBI=0.00915645;REFB=-0.000230647;REVB=0.00833115;RO=32;SAF=17;SAR=11;SRF=25;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182043;STB=0.601496;TYPE=snp;VARB=0.000349561;OID=.;OPOS=30993958;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:32:32:28:28:11:17:25:7:11:17:25:7 chr6 30995181 . T C 13.9 PASS AO=11;DP=59;FAO=11;FDP=63;FR=.;FRO=52;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=30;FSRR=22;FWDB=-0.0212151;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=112.88;QD=0.882594;RBI=0.109019;REFB=-0.00756086;REVB=-0.106935;RO=48;SAF=3;SAR=8;SRF=29;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.398608;STB=0.745327;TYPE=snp;VARB=0.0984578;OID=.;OPOS=30995181;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:59:63:48:52:11:11:8:3:29:19:8:3:30:22 chr6 30997692 . G C 178.37 PASS AO=42;DP=87;FAO=42;FDP=87;FR=.;FRO=45;FSAF=41;FSAR=1;FSRF=31;FSRR=14;FWDB=0.0192809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.764;QD=8.20067;RBI=0.0208451;REFB=-0.0330259;REVB=-0.00792246;RO=45;SAF=41;SAR=1;SRF=31;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.674299;STB=0.894911;TYPE=snp;VARB=0.0309995;OID=.;OPOS=30997692;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:45:45:42:42:1:41:31:14:1:41:31:14 chr6 31002504 . G A 591.28 PASS AO=118;DP=204;FAO=118;FDP=204;FR=.;FRO=86;FSAF=68;FSAR=50;FSRF=63;FSRR=23;FWDB=-0.00778922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.885;QD=11.5937;RBI=0.0185124;REFB=-0.000590406;REVB=-0.0167939;RO=86;SAF=68;SAR=50;SRF=63;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127286;STB=0.568861;TYPE=snp;VARB=0.000285942;OID=.;OPOS=31002504;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:204:86:86:118:118:50:68:63:23:50:68:63:23 chr6 31079889 . C G 76.89 PASS AO=15;DP=28;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=14;FSAR=1;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=0.0081454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.218;QD=10.9839;RBI=0.0712372;REFB=-0.0279632;REVB=-0.0707699;RO=13;SAF=14;SAR=1;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.340246;STB=0.699656;TYPE=snp;VARB=0.0444846;OID=.;OPOS=31079889;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:28:28:13:13:15:15:1:14:10:3:1:14:10:3 chr6 31084163 . A G 15.55 PASS AO=3;DP=8;FAO=3;FDP=8;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.0132035;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=122.984;QD=7.77526;RBI=0.0132035;REFB=0.000515305;REVB=0;RO=5;SAF=3;SAR=0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00144109;OID=.;OPOS=31084163;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:8:8:5:5:3:3:0:3:5:0:0:3:5:0 chr6 31084170 . A C 22.75 PASS AO=4;DP=8;FAO=4;FDP=8;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.00449815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.3645;QD=11.3734;RBI=0.00449815;REFB=-0.000147038;REVB=0;RO=4;SAF=4;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000909278;OID=.;OPOS=31084170;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:8:8:4:4:4:4:0:4:4:0:0:4:4:0 chr6 31084233 . A C 10.15 PASS AO=2;DP=6;FAO=2;FDP=6;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0315449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.1507;QD=6.76605;RBI=0.0315449;REFB=-0.0399415;REVB=0;RO=4;SAF=2;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0525822;OID=.;OPOS=31084233;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:6:6:4:4:2:2:0:2:4:0:0:2:4:0 chr6 31084639 . C T 58.66 PASS AO=11;DP=22;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=12;FSAR=0;FSRF=11;FSRR=0;FWDB=0.0240434;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.6711;QD=10.2009;RBI=0.0240434;REFB=-0.0142364;REVB=0;RO=11;SAF=11;SAR=0;SRF=11;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0141013;OID=.;OPOS=31084639;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:22:23:11:11:11:12:0:11:11:0:0:12:11:0 chr6 31084684 . G A 92.93 PASS AO=19;DP=36;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=17;FSAR=2;FSRF=16;FSRR=1;FWDB=0.0311212;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.5948;QD=10.3254;RBI=0.0361119;REFB=-0.0167047;REVB=0.0183177;RO=17;SAF=17;SAR=2;SRF=16;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115094;STB=0.564042;TYPE=snp;VARB=0.0127396;OID=.;OPOS=31084684;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:36:36:17:17:19:19:2:17:16:1:2:17:16:1 chr6 31084792 . C T 191.24 PASS AO=27;DP=69;FAO=30;FDP=69;FR=.,HEALED;FRO=30;FSAF=22;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=8;FWDB=0.00288171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.882;QD=11.0866;RBI=0.0227733;REFB=0.0011235;REVB=0.0225902;RO=29;SAF=21;SAR=6;SRF=21;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0681525;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00385155;OID=.;OPOS=31084792;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:29:30:27:30:6:21:21:8:8:22:22:8 chr6 31097453 . T G 351.56 PASS AO=100;DP=236;FAO=100;FDP=235;FR=.;FRO=135;FSAF=58;FSAR=42;FSRF=70;FSRR=65;FWDB=-0.030744;FXX=0.00423711;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.8115;QD=5.98391;RBI=0.0320721;REFB=-0.0292837;REVB=-0.00913395;RO=134;SAF=58;SAR=42;SRF=70;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0600659;STB=0.535824;TYPE=snp;VARB=0.0317538;OID=.;OPOS=31097453;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:236:235:134:135:100:100:42:58:70:64:42:58:70:65 chr6 31105741 . TC T 71.07 PASS AO=13;DP=24;FAO=18;FDP=25;FR=.;FRO=7;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.070128;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.1005;QD=11.3708;RBI=0.173702;REFB=-0.0469835;REVB=-0.158916;RO=7;SAF=8;SAR=5;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0.539062;SSSB=0.0285713;STB=0.535674;TYPE=del;VARB=0.0323314;OID=.;OPOS=31105742;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:13:22:18:25:7:8:10:4:3:11:7:8:5:4:3 chr6 31105891 . A G 125.84 PASS AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0188469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=315.002;QD=35.9535;RBI=0.0204228;REFB=0;REVB=0.00786675;RO=0;SAF=8;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.01608e-05;OID=.;OPOS=31105891;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:14:14:0:0:14:14:6:8:0:0:6:8:0:0 chr6 31106177 . T C 41.73 PASS AO=12;DP=34;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.0185796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.7278;QD=4.90975;RBI=0.030097;REFB=-0.0114011;REVB=0.0236777;RO=21;SAF=7;SAR=5;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.064554;STB=0.524958;TYPE=snp;VARB=0.0148291;OID=.;OPOS=31106177;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:34:34:21:22:12:12:5:7:11:10:5:7:12:10 chr6 31106499 . G A 107.36 PASS AO=45;DP=156;FAO=45;FDP=147;FR=.;FRO=102;FSAF=7;FSAR=38;FSRF=37;FSRR=65;FWDB=-0.0255435;FXX=0.0576886;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.216;QD=2.92124;RBI=0.0294931;REFB=-0.00695287;REVB=0.0147436;RO=101;SAF=7;SAR=38;SRF=37;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.336827;STB=0.698602;TYPE=snp;VARB=0.0181357;OID=.;OPOS=31106499;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:147:101:102:45:45:38:7:37:64:38:7:37:65 chr6 31107648 . C T 582.9 PASS AO=119;DP=211;FAO=119;FDP=211;FR=.;FRO=92;FSAF=9;FSAR=110;FSRF=7;FSRR=85;FWDB=0.0555716;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.319;QD=11.0502;RBI=0.0558223;REFB=-0.00668963;REVB=0.00528463;RO=90;SAF=9;SAR=110;SRF=7;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00604955;STB=0.500711;TYPE=snp;VARB=0.00503073;OID=.;OPOS=31107648;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:211:90:92:119:119:110:9:7:83:110:9:7:85 chr6 31107723 . AC A 391.13 PASS AO=120;DP=234;FAO=125;FDP=223;FR=.;FRO=98;FSAF=11;FSAR=114;FSRF=14;FSRR=84;FWDB=0.150159;FXX=0.00446409;HRUN=4;LEN=1;MLLD=21.2748;QD=7.01586;RBI=0.165386;REFB=-0.00129123;REVB=0.0693157;RO=97;SAF=11;SAR=109;SRF=11;SRR=86;SSEN=0.366197;SSEP=0;SSSB=-0.0509525;STB=0.566814;TYPE=del;VARB=0.00298837;OID=.;OPOS=31107724;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:120:224:125:223:98:11:114:14:84:99:97:11:109:11:86 chr6 31110786 . T A 548.98 PASS AO=137;DP=301;FAO=141;FDP=303;FR=.;FRO=162;FSAF=60;FSAR=81;FSRF=83;FSRR=79;FWDB=0.00301282;FXX=0.0130289;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.667;QD=7.24722;RBI=0.00647323;REFB=-0.0177605;REVB=-0.00572937;RO=161;SAF=57;SAR=80;SRF=82;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0921841;STB=0.5468;TYPE=snp;VARB=0.016744;OID=.;OPOS=31110786;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:301:303:161:162:137:141:80:57:82:79:81:60:83:79 chr6 31111180 . T C 172.3 PASS AO=38;DP=75;FAO=38;FDP=74;FR=.;FRO=36;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=-0.0185881;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.7637;QD=9.31334;RBI=0.0208667;REFB=-0.00456129;REVB=-0.00948162;RO=36;SAF=24;SAR=14;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190928;STB=0.606004;TYPE=snp;VARB=0.00324136;OID=.;OPOS=31111180;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:74:36:36:38:38:14:24:15:21:14:24:15:21 chr6 31113030 . A G 125.02 PASS AO=35;DP=85;FAO=35;FDP=85;FR=.;FRO=50;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=-0.0238821;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.381;QD=5.88322;RBI=0.0261993;REFB=-0.0104663;REVB=-0.0107724;RO=46;SAF=12;SAR=23;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143123;STB=0.56094;TYPE=snp;VARB=0.0175324;OID=.;OPOS=31113030;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:46:50:35:35:23:12:22:24:23:12:22:28 chr6 31113052 . G A 155.94 PASS AO=41;DP=92;FAO=41;FDP=92;FR=.;FRO=51;FSAF=11;FSAR=30;FSRF=22;FSRR=29;FWDB=-0.0380032;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.506;QD=6.77982;RBI=0.0392259;REFB=-0.0209349;REVB=0.00971767;RO=47;SAF=11;SAR=30;SRF=18;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12954;STB=0.603973;TYPE=snp;VARB=0.0294724;OID=.;OPOS=31113052;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:47:51:41:41:30:11:18:29:30:11:22:29 chr6 31116220 . G A 171.65 PASS AO=47;DP=110;FAO=47;FDP=111;FR=.;FRO=64;FSAF=14;FSAR=33;FSRF=20;FSRR=44;FWDB=-0.0354245;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.1521;QD=6.18572;RBI=0.0364871;REFB=-0.0334869;REVB=-0.00874145;RO=62;SAF=14;SAR=33;SRF=18;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00918675;STB=0.509996;TYPE=snp;VARB=0.0333109;OID=.;OPOS=31116220;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:111:62:64:47:47:33:14:18:44:33:14:20:44 chr6 31116246 . G A 250.34 PASS AO=59;DP=125;FAO=61;FDP=128;FR=.;FRO=67;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=23;FSRR=44;FWDB=0.00967604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.4342;QD=7.82312;RBI=0.0793821;REFB=-0.0385583;REVB=0.0787902;RO=63;SAF=27;SAR=32;SRF=23;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0877701;STB=0.55332;TYPE=snp;VARB=0.0342798;OID=.;OPOS=31116246;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:128:63:67:59:61:32:27:23:40:34:27:23:44 chr6 31118565 . C G 196.25 PASS AO=36;DP=74;FAO=43;FDP=81;FR=.;FRO=38;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=0.0510729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.156;QD=9.69118;RBI=0.0512853;REFB=-0.00964115;REVB=-0.00466246;RO=38;SAF=17;SAR=19;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0979965;STB=0.520824;TYPE=snp;VARB=0.00762132;OID=.;OPOS=31118565;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:81:38:38:36:43:19:17:22:16:20:23:22:16 chr6 31129616 . A G 110.57 PASS AO=33;DP=87;FAO=33;FDP=85;FR=.;FRO=52;FSAF=9;FSAR=24;FSRF=13;FSRR=39;FWDB=-0.015631;FXX=0.0229859;HRUN=3;LEN=1;MLLD=111.864;QD=5.20308;RBI=0.0164461;REFB=0.000156138;REVB=-0.0051134;RO=50;SAF=9;SAR=24;SRF=13;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171407;STB=0.517798;TYPE=snp;VARB=-0.000250348;OID=.;OPOS=31129616;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:85:50:52:33:33:24:9:13:37:24:9:13:39 chr6 31129642 . A C 178.42 PASS AO=42;DP=95;FAO=45;FDP=98;FR=.;FRO=53;FSAF=13;FSAR=32;FSRF=16;FSRR=37;FWDB=-0.00922441;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.625;QD=7.28247;RBI=0.0119135;REFB=-0.0155686;REVB=0.00753928;RO=53;SAF=13;SAR=29;SRF=16;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00892072;STB=0.508489;TYPE=snp;VARB=0.0186295;OID=.;OPOS=31129642;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:98:53:53:42:45:29:13:16:37:32:13:16:37 chr6 31133943 . C A 593.68 PASS AO=133;DP=257;FAO=133;FDP=255;FR=.;FRO=122;FSAF=48;FSAR=85;FSRF=45;FSRR=77;FWDB=0.00317066;FXX=0.0077818;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.0819;QD=9.31255;RBI=0.00637836;REFB=-0.00721621;REVB=-0.00553448;RO=122;SAF=48;SAR=85;SRF=45;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00752292;STB=0.504113;TYPE=snp;VARB=0.00738439;OID=.;OPOS=31133943;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:257:255:122:122:133:133:85:48:45:77:85:48:45:77 chr6 31134118 . C CGAG 142.17 PASS AO=44;DP=119;FAO=44;FDP=115;FR=.;FRO=71;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=31;FSRR=40;FWDB=0.000238192;FXX=0.0416632;HRUN=1;LEN=3;MLLD=215.61;QD=4.94488;RBI=0.00612043;REFB=-0.0106591;REVB=0.00611579;RO=70;SAF=16;SAR=28;SRF=28;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0418542;STB=0.547399;TYPE=ins;VARB=0.0165035;OID=.;OPOS=31134119;OREF=-;OALT=GAG;OMAPALT=CGAG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:44:119:44:115:71:16:28:31:40:99:70:16:28:28:42 chr6 31165566 . T C 1116.69 PASS AO=114;DP=114;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00752682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.9542;QD=37.8541;RBI=0.0524067;REFB=0;REVB=0.0518633;RO=0;SAF=44;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40696e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000430148;OID=.;OPOS=31165566;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:114:118:0:0:114:118:70:44:0:0:73:45:0:0 chr6 31165962 . G A 850.41 PASS AO=88;DP=90;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.027857;FXX=0.0222198;HRUN=3;LEN=1;MLLD=239.776;QD=38.6549;RBI=0.0390336;REFB=0;REVB=0.0273425;RO=1;SAF=27;SAR=61;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0172251;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.97312e-05;OID=.;OPOS=31165962;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:90:88:1:0:88:88:61:27:1:0:61:27:0:0 chr6 31170228 . G C 228.93 PASS AO=54;DP=117;FAO=56;FDP=119;FR=.;FRO=63;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=33;FSRR=30;FWDB=0.0316601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.331;QD=7.69519;RBI=0.0393919;REFB=-0.0188951;REVB=0.0234384;RO=62;SAF=23;SAR=31;SRF=32;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0872815;STB=0.550706;TYPE=snp;VARB=0.0196982;OID=.;OPOS=31170228;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:119:62:63:54:56:31:23:32:30:32:24:33:30 chr6 31170528 . A G 240.26 PASS AO=50;DP=93;FAO=51;FDP=94;FR=.;FRO=43;FSAF=6;FSAR=45;FSRF=4;FSRR=39;FWDB=0.0318375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.135;QD=10.2237;RBI=0.0318382;REFB=-0.00497781;REVB=0.000206295;RO=43;SAF=6;SAR=44;SRF=4;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0564244;STB=0.528291;TYPE=snp;VARB=0.00458225;OID=.;OPOS=31170528;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:94:43:43:50:51:44:6:4:39:45:6:4:39 chr6 31236853 . G A 584.2 PASS AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00511917;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.3926;QD=37.6905;RBI=0.00907767;REFB=0;REVB=0.00749655;RO=0;SAF=32;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.38621e-05;OID=.;OPOS=31236853;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:62:62:0:0:62:62:30:32:0:0:30:32:0:0 chr6 31236862 . C T 44.14 PASS AO=18;DP=63;FAO=18;FDP=63;FR=.;FRO=45;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=-0.0114039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.841;QD=2.80253;RBI=0.0228138;REFB=-0.0166579;REVB=-0.0197591;RO=45;SAF=9;SAR=9;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0131872;STB=0.507928;TYPE=snp;VARB=0.0430527;OID=.;OPOS=31236862;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:63:63:45:45:18:18:9:9:22:23:9:9:22:23 chr6 31237100 . TC T 48.19 PASS AO=20;DP=46;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.160134;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=17.2785;QD=4.28317;RBI=0.225159;REFB=-0.000219958;REVB=0.158285;RO=23;SAF=10;SAR=10;SRF=14;SRR=9;SSEN=0.366197;SSEP=0;SSSB=-0.102402;STB=0.5333;TYPE=del;VARB=0.0362348;OID=.;OPOS=31237101;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:20:46:20:45:25:10:10:14:11:48:23:10:10:14:9 chr6 31237124 . T C 385.45 PASS AO=42;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.5482;QD=37.6045;RBI=0.0174401;REFB=0;REVB=0.00958037;RO=0;SAF=23;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000411037;OID=.;OPOS=31237124;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:42:41:0:0:42:41:19:23:0:0:19:22:0:0 chr6 31237162 . C G 274.19 PASS AO=33;DP=33;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0149553;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7047;QD=34.2738;RBI=0.0469058;REFB=0.00687374;REVB=-0.0444578;RO=0;SAF=18;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.64315e-08;STB=0.51723;TYPE=snp;VARB=-0.000994242;OID=.;OPOS=31237162;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:33:32:0:1:33:31:15:18:0:0:14:17:0:1 chr6 31237254 . C T 106.99 PASS AO=24;DP=50;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=0.00933645;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=142.374;QD=8.55923;RBI=0.00942577;REFB=0.0166913;REVB=-0.00129449;RO=26;SAF=9;SAR=15;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107701;STB=0.560391;TYPE=snp;VARB=-0.021213;OID=.;OPOS=31237254;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:26:26:24:24:15:9:7:19:15:9:7:19 chr6 31237255 . G A 117.66 PASS AO=25;DP=49;FAO=25;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.00724475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.4567;QD=9.60505;RBI=0.0227595;REFB=0.0327658;REVB=0.0215756;RO=23;SAF=6;SAR=19;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200167;STB=0.605487;TYPE=snp;VARB=-0.0236469;OID=.;OPOS=31237255;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:23:24:25:25:19:6:10:13:19:6:10:14 chr6 31237323 . A G 435.32 PASS AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00797415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.1834;QD=37.8542;RBI=0.0578375;REFB=0;REVB=0.0572852;RO=0;SAF=24;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000345542;OID=.;OPOS=31237323;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:46:46:0:0:46:46:22:24:0:0:22:24:0:0 chr6 31237333 . T A 402.74 PASS AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00730987;FXX=0.10636;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.576;QD=38.3566;RBI=0.0269694;REFB=0;REVB=0.0259599;RO=0;SAF=23;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000141298;OID=.;OPOS=31237333;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:43:42:0:0:42:42:19:23:0:0:19:23:0:0 chr6 31237723 . G A 125.84 PASS AO=15;DP=15;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0320902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.842;QD=35.9534;RBI=0.0322448;REFB=0;REVB=-0.00315388;RO=0;SAF=7;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000699237;OID=.;OPOS=31237723;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:15:14:0:0:15:14:8:7:0:0:8:6:0:0 chr6 31237727 . T C 116.32 PASS AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135623;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2381;QD=35.7892;RBI=0.0208016;REFB=0;REVB=-0.0157725;RO=0;SAF=6;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000108735;OID=.;OPOS=31237727;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:13:0:0:13:13:7:6:0:0:8:5:0:0 chr6 31237767 . T C 183.14 PASS AO=21;DP=21;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165145;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.374;QD=38.5548;RBI=0.0451285;REFB=0;REVB=0.0419983;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000837895;OID=.;OPOS=31237767;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:21:19:0:0:21:19:9:12:0:0:9:10:0:0 chr6 31237771 . G A 183.14 PASS AO=21;DP=21;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108991;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.851;QD=38.5548;RBI=0.0446947;REFB=0;REVB=0.0433454;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000684586;OID=.;OPOS=31237771;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:21:19:0:0:21:19:9:12:0:0:9:10:0:0 chr6 31237773 . T C 170.86 PASS AO=20;DP=20;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0576063;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.2406;QD=37.9682;RBI=0.0634236;REFB=0;REVB=0.0265343;RO=0;SAF=12;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00335276;OID=.;OPOS=31237773;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:20:18:0:0:20:18:8:12:0:0:8:10:0:0 chr6 31237774 . G C 170.86 PASS AO=20;DP=20;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.687;QD=37.9684;RBI=0.0364913;REFB=0;REVB=0.0224633;RO=0;SAF=12;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000965176;OID=.;OPOS=31237774;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:20:18:0:0:20:18:8:12:0:0:8:10:0:0 chr6 31237786 . A T 170.86 PASS AO=20;DP=20;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0521724;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.715;QD=37.9686;RBI=0.0754297;REFB=0;REVB=0.0544765;RO=0;SAF=12;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0010219;OID=.;OPOS=31237786;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:20:18:0:0:20:18:8:12:0:0:8:10:0:0 chr6 31237802 . A G 158.92 PASS AO=19;DP=19;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0305152;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.452;QD=37.393;RBI=0.0321803;REFB=0;REVB=0.0102172;RO=0;SAF=12;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000258973;OID=.;OPOS=31237802;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:19:17:0:0:19:17:7:12:0:0:7:10:0:0 chr6 31237833 . T C 136.31 PASS AO=17;DP=17;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0328639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.7203;QD=36.3483;RBI=0.0806169;REFB=0;REVB=0.0736142;RO=0;SAF=11;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00164217;OID=.;OPOS=31237833;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:17:15:0:0:17:15:6:11:0:0:6:9:0:0 chr6 31237858 . T C 27.88 PASS AO=7;DP=21;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0117575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.5762;QD=5.57536;RBI=0.0183486;REFB=-0.0327558;REVB=-0.0140866;RO=14;SAF=2;SAR=5;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.37647;STB=0.713673;TYPE=snp;VARB=0.0236717;OID=.;OPOS=31237858;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:21:20:14:13:7:7:5:2:9:5:5:2:8:5 chr6 31238029 . T C 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0778005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.2275;QD=33.0215;RBI=0.0779669;REFB=0;REVB=0.0050919;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00781483;OID=.;OPOS=31238029;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:3:3:0:0:3:3:0:0 chr6 31238053 . G C 73.84 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0031087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.0591;QD=36.9199;RBI=0.011111;REFB=0;REVB=0.0106672;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000658633;OID=.;OPOS=31238053;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:5:3:0:0:5:3:0:0 chr6 31238068 . C T 55.27 PASS AO=8;DP=12;FAO=9;FDP=13;FR=.;FRO=4;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0193526;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.796;QD=17.0055;RBI=0.0616663;REFB=-0.00665389;REVB=-0.0585509;RO=4;SAF=7;SAR=1;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.567155;STB=0.832477;TYPE=snp;VARB=0.00451119;OID=.;OPOS=31238068;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:12:13:4:4:8:9:1:7:0:4:1:8:0:4 chr6 31238135 . G A 108.68 PASS AO=13;DP=15;FAO=13;FDP=14;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0202534;FXX=0.0666222;HRUN=3;LEN=1;MLLD=201.339;QD=31.0501;RBI=0.0347689;REFB=-0.131532;REVB=0.0282608;RO=0;SAF=7;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.533282;TYPE=snp;VARB=0.0016976;OID=.;OPOS=31238135;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:15:14:0:1:13:13:6:7:0:0:6:7:1:0 chr6 31238138 . C T 136.31 PASS AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00483376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.385;QD=36.3484;RBI=0.00858524;REFB=0;REVB=0.00709514;RO=0;SAF=8;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.83035e-05;OID=.;OPOS=31238138;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:15:0:0:15:15:7:8:0:0:7:8:0:0 chr6 31238147 . C G 11.68 PASS AO=3;DP=13;FAO=3;FDP=13;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0408117;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=169.999;QD=3.59408;RBI=0.0546416;REFB=0.000549774;REVB=-0.0363334;RO=10;SAF=1;SAR=2;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.37802;STB=0.760371;TYPE=snp;VARB=-0.00100993;OID=.;OPOS=31238147;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:13:13:10:10:3:3:2:1:7:3:2:1:7:3 chr6 31238155 . G A 63.56 PASS AO=6;DP=12;FAO=9;FDP=12;FR=.;FRO=3;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0862856;FXX=0.076864;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.5151;QD=21.1863;RBI=0.0929892;REFB=-0.054847;REVB=0.0346668;RO=2;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215133;STB=0.588033;TYPE=snp;VARB=0.0494526;OID=.;OPOS=31238155;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:9:12:2:3:6:9:3:3:0:2:3:6:1:2 chr6 31238179 . C T 11.68 PASS AO=3;DP=13;FAO=3;FDP=13;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.0168743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.468;QD=3.59436;RBI=0.0390791;REFB=0.000998811;REVB=-0.0352481;RO=10;SAF=1;SAR=2;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.37802;STB=0.760371;TYPE=snp;VARB=-0.00966181;OID=.;OPOS=31238179;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:13:13:10:10:3:3:2:1:7:3:2:1:7:3 chr6 31238259 . G T 286.18 PASS AO=33;DP=37;FAO=35;FDP=40;FR=.;FRO=5;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.00473262;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=204.648;QD=28.6182;RBI=0.0136256;REFB=-0.131973;REVB=-0.0127773;RO=3;SAF=17;SAR=16;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0755813;STB=0.564066;TYPE=snp;VARB=0.00209196;OID=.;OPOS=31238259;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:37:40:3:5:33:35:16:17:3:0:18:17:5:0 chr6 31238490 . T C 427.96 PASS AO=47;DP=47;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0046054;FXX=0.0425441;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.4198;QD=38.0405;RBI=0.0399006;REFB=0;REVB=0.039634;RO=0;SAF=24;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000237686;OID=.;OPOS=31238490;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:47:45:0:0:47:45:23:24:0:0:22:23:0:0 chr6 31238492 . C A 391.64 PASS AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=46;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00584067;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.779;QD=34.0558;RBI=0.0094663;REFB=-0.0725778;REVB=0.00744965;RO=0;SAF=24;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50099;TYPE=snp;VARB=0.000531241;OID=.;OPOS=31238492;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:43:46:0:2:43:44:19:24:0:0:21:23:1:1 chr6 31238851 . T C 253.58 PASS AO=23;DP=24;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.090933;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.659;QD=37.5668;RBI=0.0913117;REFB=0;REVB=0.00830853;RO=0;SAF=8;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00233592;OID=.;OPOS=31238851;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:24:27:0:0:23:27:15:8:0:0:16:11:0:0 chr6 31238910 . T C 63.28 PASS AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.198507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.9508;QD=13.3218;RBI=0.199069;REFB=0.00769643;REVB=-0.0149455;RO=8;SAF=3;SAR=8;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0897445;STB=0.551626;TYPE=snp;VARB=-0.0208251;OID=.;OPOS=31238910;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:19:19:8:8:11:11:8:3:3:5:8:3:3:5 chr6 31238930 . A C 41.47 PASS AO=8;DP=9;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0225635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.173;QD=18.4312;RBI=0.0285279;REFB=-0.0198514;REVB=-0.0174564;RO=1;SAF=3;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125393;STB=0.79893;TYPE=snp;VARB=0.0240002;OID=.;OPOS=31238930;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:9:9:1:3:8:6:5:3:1:0:5:1:3:0 chr6 31238942 . G T 65.8 PASS AO=7;DP=8;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00236985;FXX=0.124844;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.009;QD=37.5976;RBI=0.00272663;REFB=0;REVB=-0.00134845;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00351057;OID=.;OPOS=31238942;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:7:0:0:7:7:4:3:0:0:4:3:0:0 chr6 31238957 . A C 61.39 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0505758;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.4449;QD=35.0819;RBI=0.149548;REFB=0;REVB=-0.140736;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.021978;OID=.;OPOS=31238957;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:4:3:0:0:4:3:0:0 chr6 31238983 . G T 23.32 PASS AO=4;DP=7;FAO=4;FDP=7;FR=.;FRO=3;FSAF=0;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.878;QD=13.325;RBI=0.0347917;REFB=-0.0181423;REVB=0.0347917;RO=3;SAF=0;SAR=4;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0178834;OID=.;OPOS=31238983;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:7:7:3:3:4:4:4:0:0:3:4:0:0:3 chr6 31239050 . G T 13.43 PASS AO=3;DP=11;FAO=3;FDP=11;FR=.;FRO=8;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.051;QD=4.88255;RBI=0.0168303;REFB=-0.0162971;REVB=-0.0168303;RO=8;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0378607;OID=.;OPOS=31239050;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:11:11:8:8:3:3:3:0:0:8:3:0:0:8 chr6 31239101 . G C,T 71.91 PASS AO=2,6;DP=8;FAO=2,6;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0;FSAR=2,6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0,0;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=136.027,167.949;QD=35.9525;RBI=0.0204494,0.0132726;REFB=0,0;REVB=-0.0204494,-0.0132726;RO=0;SAF=0,0;SAR=2,6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=snp,snp;VARB=-0.0367434,-0.00573502;OID=.,.;OPOS=31239101,31239101;OREF=G,G;OALT=C,T;OMAPALT=C,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:10:8:8:0:0:2,6:2,6:2,6:0,0:0:0:2,6:0,0:0:0 chr6 31239378 . T G 147.36 PASS AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0551347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.2693;QD=36.8397;RBI=0.0693935;REFB=0;REVB=0.0421381;RO=0;SAF=6;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00406444;OID=.;OPOS=31239378;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:16:0:0:16:16:10:6:0:0:10:6:0:0 chr6 31239407 . G T 36.64 PASS AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.048376;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.894;QD=6.66205;RBI=0.0724362;REFB=-0.032263;REVB=-0.0539145;RO=13;SAF=6;SAR=3;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.346427;STB=0.705442;TYPE=snp;VARB=0.0612871;OID=.;OPOS=31239407;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:22:22:13:13:9:9:3:6:4:9:3:6:4:9 chr6 31239417 . C T 47.12 PASS AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.00651295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.572;QD=8.56652;RBI=0.0131305;REFB=-0.0245863;REVB=0.0114013;RO=12;SAF=6;SAR=4;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243833;STB=0.642579;TYPE=snp;VARB=0.0255428;OID=.;OPOS=31239417;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:22:22:12:12:10:10:4:6:4:8:4:6:4:8 chr6 31239430 . C T 201.77 PASS AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.109015;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.0437;QD=36.685;RBI=0.117767;REFB=0;REVB=-0.0445503;RO=0;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51176e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00114339;OID=.;OPOS=31239430;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:21:22:0:0:21:22:11:10:0:0:11:11:0:0 chr6 31239518 . C T 30.6 PASS AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0297032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.3805;QD=13.5995;RBI=0.0364985;REFB=0.0434875;REVB=0.0212099;RO=4;SAF=1;SAR=4;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0543107;STB=0.533194;TYPE=snp;VARB=-0.0185102;OID=.;OPOS=31239518;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:9:9:4:4:5:5:4:1:1:3:4:1:1:3 chr6 31239722 . A C 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0158861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.518;QD=33.022;RBI=0.0158861;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000188927;OID=.;OPOS=31239722;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:0:6:0:0:0:6:0:0 chr6 31239733 . C T 22.75 PASS AO=4;DP=8;FAO=4;FDP=8;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0135316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.948;QD=11.3741;RBI=0.0144222;REFB=0.00082514;REVB=0.00498943;RO=4;SAF=3;SAR=1;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.37692e-05;OID=.;OPOS=31239733;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:8:8:4:4:4:4:1:3:3:1:1:3:3:1 chr6 31239752 . C T 136.3 PASS AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.877;QD=36.3459;RBI=0.0954656;REFB=0;REVB=0.0948641;RO=0;SAF=12;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00102714;OID=.;OPOS=31239752;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:15:0:0:15:15:3:12:0:0:3:12:0:0 chr6 31239821 . G T 140.28 PASS AO=22;DP=32;FAO=23;FDP=34;FR=.;FRO=11;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0147202;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.482;QD=16.5031;RBI=0.0540839;REFB=-0.0317178;REVB=0.0520421;RO=9;SAF=17;SAR=5;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0758135;STB=0.575315;TYPE=snp;VARB=0.010279;OID=.;OPOS=31239821;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:32:34:9:11:22:23:5:17:6:3:6:17:6:5 chr6 31239827 . C T 288.57 PASS AO=28;DP=28;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0237265;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.733;QD=37.2349;RBI=0.098141;REFB=0;REVB=0.0952298;RO=0;SAF=21;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000318652;OID=.;OPOS=31239827;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:28:31:0:0:28:31:7:21:0:0:11:20:0:0 chr6 31322402 . C T 510.3 PASS AO=57;DP=60;FAO=57;FDP=60;FR=.;FRO=3;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00858895;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.894;QD=34.0203;RBI=0.0198928;REFB=-0.031708;REVB=0.0179431;RO=2;SAF=31;SAR=26;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00282326;STB=0.510585;TYPE=snp;VARB=0.000191894;OID=.;OPOS=31322402;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:60:60:2:3:57:57:26:31:1:1:26:31:1:2 chr6 31322459 . T C 574.17 PASS AO=42;DP=62;FAO=60;FDP=60;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=23;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.334027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.213;QD=38.2779;RBI=0.334469;REFB=0;REVB=0.0171894;RO=0;SAF=5;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43317e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00100827;OID=.;OPOS=31322459;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:60:60:0:0:42:60:37:5:0:0:37:23:0:0 chr6 31322470 . C G 567.74 PASS AO=56;DP=57;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00731071;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.43;QD=38.4905;RBI=0.0540209;REFB=0;REVB=0.0535239;RO=0;SAF=23;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000179277;OID=.;OPOS=31322470;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:57:59:0:0:56:59:33:23:0:0:36:23:0:0 chr6 31322474 . G A 80.15 PASS AO=22;DP=50;FAO=22;FDP=55;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=0.0435852;FXX=0.0350816;HRUN=3;LEN=1;MLLD=131.791;QD=5.82928;RBI=0.0487051;REFB=-0.0237517;REVB=-0.0217375;RO=26;SAF=8;SAR=14;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205612;STB=0.557041;TYPE=snp;VARB=0.0371491;OID=.;OPOS=31322474;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:50:55:26:33:22:22:14:8:15:11:14:8:15:18 chr6 31322888 . A G 497.85 PASS AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0400236;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.612;QD=37.5732;RBI=0.0406125;REFB=0;REVB=0.00689109;RO=0;SAF=28;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000243927;OID=.;OPOS=31322888;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:53:53:0:0:53:53:25:28:0:0:25:28:0:0 chr6 31323296 . A G 185.32 PASS AO=27;DP=38;FAO=28;FDP=39;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=25;FSRF=11;FSRR=0;FWDB=-0.032149;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=122.95;QD=19.0072;RBI=0.0329587;REFB=-0.0915147;REVB=-0.00726091;RO=0;SAF=3;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.823256;TYPE=snp;VARB=0.00526258;OID=.;OPOS=31323296;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:28:39:0:11:27:28:24:3:0:0:25:3:11:0 chr6 31323945 . A C 86.76 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.337;QD=38.5591;RBI=0.0198463;REFB=0;REVB=-0.00273684;RO=0;SAF=2;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000189301;OID=.;OPOS=31323945;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:7:2:0:0:7:2:0:0 chr6 31323953 . C G 79.98 PASS AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0572917;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.007;QD=31.9919;RBI=0.0577939;REFB=-0.0725302;REVB=0.00760189;RO=0;SAF=2;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.533262;TYPE=snp;VARB=0.0048503;OID=.;OPOS=31323953;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:10:10:0:1:9:9:7:2:0:0:7:2:0:1 chr6 31323958 . T G 80.92 PASS AO=9;DP=10;FAO=10;FDP=11;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.095314;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.4212;QD=29.4245;RBI=0.0961408;REFB=-0.0256531;REVB=0.0125816;RO=1;SAF=1;SAR=8;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.28888;STB=0.599781;TYPE=snp;VARB=0.0130421;OID=.;OPOS=31323958;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:10:11:1:1:9:10:8:1:1:0:8:2:1:0 chr6 31323960 . G C 101.95 PASS AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0880132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.336;QD=37.0721;RBI=0.0880209;REFB=0;REVB=-0.00116015;RO=0;SAF=3;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00214695;OID=.;OPOS=31323960;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:11:11:8:3:0:0:8:3:0:0 chr6 31324024 . C A 91.56 PASS AO=16;DP=26;FAO=16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.0391096;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.973;QD=14.0867;RBI=0.132608;REFB=-0.0306227;REVB=0.12671;RO=9;SAF=7;SAR=9;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146799;STB=0.562422;TYPE=snp;VARB=0.0113201;OID=.;OPOS=31324024;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:26:26:9:10:16:16:9:7:6:3:9:7:6:4 chr6 31324025 . G A 26.47 PASS AO=8;DP=26;FAO=8;FDP=26;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0304134;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.2203;QD=4.07256;RBI=0.0939657;REFB=0.0219676;REVB=0.0889077;RO=18;SAF=5;SAR=3;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200918;STB=0.624688;TYPE=snp;VARB=-0.0178246;OID=.;OPOS=31324025;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:26:26:18:18:8:8:3:5:8:10:3:5:8:10 chr6 31324036 . T A 111.01 PASS AO=17;DP=28;FAO=18;FDP=27;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.0377533;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.5086;QD=16.4452;RBI=0.107238;REFB=-0.0638642;REVB=0.100372;RO=9;SAF=8;SAR=9;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121332;STB=0.573689;TYPE=snp;VARB=0.0308291;OID=.;OPOS=31324036;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:28:27:9:9:17:18:9:8:6:3:10:8:6:3 chr6 31324077 . C T 13.04 PASS AO=6;DP=30;FAO=6;FDP=30;FR=.;FRO=24;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=0.0313181;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.862;QD=1.73912;RBI=0.0357252;REFB=-0.00709849;REVB=-0.0171892;RO=24;SAF=3;SAR=3;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148935;STB=0.59968;TYPE=snp;VARB=0.0345322;OID=.;OPOS=31324077;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:30:30:24:24:6:6:3:3:9:15:3:3:9:15 chr6 31324100 . G T 173.36 PASS AO=23;DP=28;FAO=23;FDP=28;FR=.;FRO=5;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0462832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.578;QD=24.7659;RBI=0.0512442;REFB=0.017755;REVB=0.0219963;RO=5;SAF=7;SAR=16;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0364208;STB=0.519838;TYPE=snp;VARB=-0.00205177;OID=.;OPOS=31324100;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:28:28:5:5:23:23:16:7:2:3:16:7:2:3 chr6 31324145 . A C 126.89 PASS AO=15;DP=18;FAO=16;FDP=19;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0711197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8535;QD=26.7148;RBI=0.0716374;REFB=-0.0248246;REVB=-0.00859629;RO=3;SAF=3;SAR=12;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.060143;STB=0.536035;TYPE=snp;VARB=0.00714582;OID=.;OPOS=31324145;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:18:19:3:3:15:16:12:3:1:2:13:3:1:2 chr6 31324151 . C G 134.96 PASS AO=15;DP=17;FAO=16;FDP=18;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0371495;FXX=0.0526039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.968;QD=29.9911;RBI=0.0371793;REFB=-0.000361392;REVB=-0.0014885;RO=2;SAF=2;SAR=13;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147635;STB=0.553121;TYPE=snp;VARB=0.00068744;OID=.;OPOS=31324151;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:17:18:2:2:15:16:13:2:1:1:13:3:1:1 chr6 31324152 . A G 143.12 PASS AO=16;DP=18;FAO=17;FDP=19;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0189532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.361;QD=30.1304;RBI=0.0298333;REFB=0.0123276;REVB=0.0230391;RO=2;SAF=2;SAR=14;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150291;STB=0.554387;TYPE=snp;VARB=-0.00123261;OID=.;OPOS=31324152;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:18:19:2:2:16:17:14:2:1:1:14:3:1:1 chr6 31324154 . G A 173.9 PASS AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0266545;FXX=0.0526039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.823;QD=38.6448;RBI=0.026662;REFB=0;REVB=-0.000630132;RO=0;SAF=3;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.32e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000200221;OID=.;OPOS=31324154;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:19:18:0:0:18:18:15:3:0:0:15:3:0:0 chr6 31324194 . G A 84.58 PASS AO=10;DP=11;FAO=10;FDP=11;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.154;QD=30.7578;RBI=0.0273795;REFB=-0.016422;REVB=0.0273795;RO=1;SAF=0;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00267753;OID=.;OPOS=31324194;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:11:11:1:1:10:10:10:0:0:1:10:0:0:1 chr6 31324200 . G A 94.72 PASS AO=10;DP=11;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0.0908265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.244;QD=37.8861;RBI=0.0302945;REFB=0;REVB=-0.0302945;RO=0;SAF=0;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000461458;OID=.;OPOS=31324200;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:10:0:0:10:10:10:0:0:0:10:0:0:0 chr6 31324201 . C T 84.58 PASS AO=10;DP=11;FAO=10;FDP=11;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.9795;QD=30.7566;RBI=0.0557726;REFB=0.123783;REVB=0.0557726;RO=1;SAF=0;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0176417;OID=.;OPOS=31324201;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:11:11:1:1:10:10:10:0:0:1:10:0:0:1 chr6 31324489 . C G 68.21 PASS AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00226684;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.5166;QD=30.3175;RBI=0.0210297;REFB=-0.006946;REVB=0.0209072;RO=1;SAF=6;SAR=2;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174483;STB=0.599732;TYPE=snp;VARB=0.0030733;OID=.;OPOS=31324489;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:9:9:1:1:8:8:2:6:0:1:2:6:0:1 chr6 31324491 . C A 68.21 PASS AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.158363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.6609;QD=30.3163;RBI=0.161818;REFB=-0.085459;REVB=0.0332614;RO=1;SAF=6;SAR=2;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174483;STB=0.599732;TYPE=snp;VARB=0.0352656;OID=.;OPOS=31324491;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:9:9:1:1:8:8:2:6:0:1:2:6:0:1 chr6 31324497 . T G 57.5 PASS AO=7;DP=8;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00161973;FXX=0.110988;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.3915;QD=28.7518;RBI=0.113215;REFB=0.0195951;REVB=0.113204;RO=1;SAF=6;SAR=1;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.2842;STB=0.666107;TYPE=snp;VARB=0.00645854;OID=.;OPOS=31324497;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:8:8:1:1:7:7:1:6:0:1:1:6:0:1 chr6 31324506 . C T 34.84 PASS AO=11;DP=12;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.093938;FXX=0.41632;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.235;QD=19.9082;RBI=0.0981383;REFB=-0.0438102;REVB=0.0284039;RO=1;SAF=8;SAR=3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127515;STB=0.748924;TYPE=snp;VARB=0.0427081;OID=.;OPOS=31324506;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:12:7:1:2:11:5:3:8:0:1:1:4:0:2 chr6 31324528 . G T 107.8 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.108905;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.0856;QD=35.9348;RBI=0.113226;REFB=0;REVB=-0.030983;RO=0;SAF=8;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00881174;OID=.;OPOS=31324528;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:4:8:0:0:4:8:0:0 chr6 31324536 . T C 107.82 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0317927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.778;QD=35.9384;RBI=0.0318864;REFB=0;REVB=-0.00244353;RO=0;SAF=8;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000529139;OID=.;OPOS=31324536;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:4:8:0:0:4:8:0:0 chr6 31324547 . G C 107.74 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0377402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.1208;QD=35.9137;RBI=0.039091;REFB=0;REVB=0.0101874;RO=0;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00308308;OID=.;OPOS=31324547;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:5:7:0:0:5:7:0:0 chr6 31324549 . T C 107.78 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.203981;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.8461;QD=35.9258;RBI=0.210372;REFB=0;REVB=-0.0514601;RO=0;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0183165;OID=.;OPOS=31324549;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:5:7:0:0:5:7:0:0 chr6 31324641 . T A 99.27 PASS AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00436515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.588;QD=39.7062;RBI=0.0186133;REFB=0;REVB=-0.0180942;RO=0;SAF=3;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000508356;OID=.;OPOS=31324641;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:7:3:0:0:7:3:0:0 chr6 31324643 . G C 99.27 PASS AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00628979;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=149.247;QD=39.7067;RBI=0.00695114;REFB=0;REVB=-0.0029592;RO=0;SAF=3;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000190258;OID=.;OPOS=31324643;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:7:3:0:0:7:3:0:0 chr6 31324664 . T G 99.27 PASS AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0220467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.448;QD=39.7064;RBI=0.0221027;REFB=0;REVB=0.00157289;RO=0;SAF=1;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.8593e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000417885;OID=.;OPOS=31324664;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:9:1:0:0:9:1:0:0 chr6 31324666 . A T 99.24 PASS AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0292809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.6557;QD=39.6961;RBI=0.042136;REFB=0;REVB=0.0302996;RO=0;SAF=1;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.8593e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.96148e-05;OID=.;OPOS=31324666;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:9:1:0:0:9:1:0:0 chr6 31324711 . A G 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.994;QD=33.022;RBI=0.0373155;REFB=0;REVB=-0.0314846;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00027684;OID=.;OPOS=31324711;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:5:1:0:0:5:1:0:0 chr6 31371430 . T C 118.33 PASS AO=14;DP=14;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00130368;FXX=0.0713776;HRUN=3;LEN=1;MLLD=66.9738;QD=36.4083;RBI=0.0448951;REFB=0;REVB=0.0448762;RO=0;SAF=3;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00284597;OID=.;OPOS=31371430;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:14:13:0:0:14:13:11:3:0:0:11:2:0:0 chr6 31378387 . T C 1167.14 PASS AO=126;DP=130;FAO=126;FDP=129;FR=.;FRO=3;FSAF=41;FSAR=85;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0344815;FXX=0.00769172;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.4313;QD=36.1905;RBI=0.0496687;REFB=-0.0838965;REVB=0.0357492;RO=3;SAF=41;SAR=85;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170547;STB=0.508981;TYPE=snp;VARB=0.00550163;OID=.;OPOS=31378387;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:130:129:3:3:126:126:85:41:2:1:85:41:2:1 chr6 31378425 . A G 1170.53 PASS AO=123;DP=123;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00753008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.657;QD=38.066;RBI=0.0451922;REFB=0;REVB=0.0445604;RO=0;SAF=50;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.44602e-05;OID=.;OPOS=31378425;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:123:123:0:0:123:123:73:50:0:0:73:50:0:0 chr6 31378977 . G A 2218.98 PASS AO=228;DP=228;FAO=232;FDP=232;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=147;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000733737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.095;QD=38.2583;RBI=0.0154233;REFB=0;REVB=-0.0154058;RO=0;SAF=85;SAR=143;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.97439e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.03926e-06;OID=.;OPOS=31378977;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:228:232:0:0:228:232:143:85:0:0:147:85:0:0 chr6 31379109 . G A 1672.46 PASS AO=166;DP=166;FAO=176;FDP=176;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=122;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.013;QD=38.0104;RBI=0.059111;REFB=0;REVB=0.0561206;RO=0;SAF=52;SAR=114;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.562e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.39362e-05;OID=.;OPOS=31379109;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:166:176:0:0:166:176:114:52:0:0:122:54:0:0 chr6 31379752 . C T 748.01 PASS AO=78;DP=80;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0474003;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.9829;QD=37.8739;RBI=0.101813;REFB=0;REVB=0.0901066;RO=1;SAF=49;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0160409;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00160717;OID=.;OPOS=31379752;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:80:79:1:0:78:79:29:49:0:1:30:49:0:0 chr6 31379773 . C T 677.13 PASS AO=68;DP=69;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00963887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.763;QD=38.6932;RBI=0.0405155;REFB=0;REVB=0.0393522;RO=0;SAF=43;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.00933e-05;OID=.;OPOS=31379773;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:69:70:0:0:68:70:25:43:0:0:25:45:0:0 chr6 31379794 . C T 615.95 PASS AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0026374;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.18;QD=37.9047;RBI=0.0445036;REFB=0;REVB=0.0444254;RO=0;SAF=46;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.91737e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.44426e-05;OID=.;OPOS=31379794;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:65:65:0:0:65:65:19:46:0:0:19:46:0:0 chr6 31379795 . A G 595.19 PASS AO=64;DP=64;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00393781;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.983;QD=37.7898;RBI=0.0136881;REFB=0;REVB=-0.0131095;RO=0;SAF=46;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.12145e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.9893e-05;OID=.;OPOS=31379795;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:64:63:0:0:64:63:18:46:0:0:18:45:0:0 chr6 31379807 . C T 440.04 PASS AO=55;DP=63;FAO=55;FDP=62;FR=.;FRO=7;FSAF=38;FSAR=17;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=-0.00106143;FXX=0.0158705;HRUN=4;LEN=1;MLLD=147.838;QD=28.3896;RBI=0.00107607;REFB=-0.122936;REVB=-0.000176918;RO=1;SAF=38;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122458;STB=0.522338;TYPE=snp;VARB=0.00200789;OID=.;OPOS=31379807;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:63:62:1:7:55:55:17:38:1:0:17:38:6:1 chr6 31379817 . T C 431.4 PASS AO=51;DP=55;FAO=51;FDP=55;FR=.;FRO=4;FSAF=33;FSAR=18;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0134494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.334;QD=31.3747;RBI=0.014042;REFB=-0.00895453;REVB=0.00403602;RO=3;SAF=33;SAR=18;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.040906;STB=0.52856;TYPE=snp;VARB=0.000626253;OID=.;OPOS=31379817;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:55:55:3:4:51:51:18:33:3:0:18:33:4:0 chr6 31379823 . C G 507.57 PASS AO=56;DP=58;FAO=56;FDP=58;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=18;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0468245;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.5195;QD=35.0047;RBI=0.0476411;REFB=-0.096034;REVB=-0.00878268;RO=2;SAF=38;SAR=18;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0241716;STB=0.512816;TYPE=snp;VARB=0.0024082;OID=.;OPOS=31379823;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:58:58:2:2:56:56:18:38:2:0:18:38:2:0 chr6 31379931 . G A 554.44 PASS AO=56;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0129057;FXX=0.0333278;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.178;QD=38.237;RBI=0.0594094;REFB=0;REVB=0.0579907;RO=0;SAF=31;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000221053;OID=.;OPOS=31379931;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:57:58:0:0:56:58:25:31:0:0:29:29:0:0 chr6 31380157 . TGCTG T 747.96 PASS AO=75;DP=98;FAO=84;FDP=86;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=56;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0142565;FXX=0.0850973;HRUN=1;LEN=4;MLLD=221.985;QD=34.7888;RBI=0.0147624;REFB=-0.162847;REVB=0.00383169;RO=0;SAF=27;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.00823e-08;STB=0.517237;TYPE=del;VARB=1.22957e-05;OID=.;OPOS=31380158;OREF=GCTG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:75:86:84:86:2:28:56:2:0:22:0:27:48:0:0 chr6 31382882 . C A 1222.54 PASS AO=131;DP=134;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0381445;FXX=0.00746213;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.22;QD=36.7682;RBI=0.0412038;REFB=-0.101358;REVB=0.0155803;RO=3;SAF=59;SAR=72;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0235496;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000778447;OID=.;OPOS=31382882;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:134:133:3:0:131:133:72:59:3:0:72:61:0:0 chr6 31382911 . A G 1022.24 PASS AO=107;DP=109;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0896135;FXX=0.0442439;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.8232;QD=37.8607;RBI=0.0914604;REFB=0;REVB=-0.0182871;RO=0;SAF=43;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000199976;OID=.;OPOS=31382911;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:109:108:0:0:107:108:64:43:0:0:64:44:0:0 chr6 31473546 . A G 1017.07 PASS AO=115;DP=122;FAO=116;FDP=122;FR=.;FRO=6;FSAF=55;FSAR=61;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0181453;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=197.021;QD=33.3467;RBI=0.018635;REFB=-0.0503082;REVB=-0.00424402;RO=3;SAF=54;SAR=61;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0095405;STB=0.517677;TYPE=snp;VARB=0.000250115;OID=.;OPOS=31473546;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:122:122:3:6:115:116:61:54:2:1:61:55:5:1 chr6 31473561 . A G 196.29 PASS AO=50;DP=113;FAO=51;FDP=114;FR=.;FRO=63;FSAF=31;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=43;FWDB=0.0198168;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.583;QD=6.88729;RBI=0.0355319;REFB=-0.00594744;REVB=-0.0294926;RO=63;SAF=30;SAR=20;SRF=20;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.276251;STB=0.656853;TYPE=snp;VARB=0.00837061;OID=.;OPOS=31473561;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:114:63:63:50:51:20:30:20:43:20:31:20:43 chr6 31474000 . G A 463.99 PASS AO=105;DP=205;FAO=107;FDP=211;FR=.;FRO=104;FSAF=51;FSAR=56;FSRF=53;FSRR=51;FWDB=-0.0169771;FXX=0.00938923;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.8196;QD=8.79602;RBI=0.0182938;REFB=-0.0102324;REVB=-0.00681485;RO=99;SAF=51;SAR=54;SRF=53;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0439337;STB=0.516263;TYPE=snp;VARB=0.00869577;OID=.;OPOS=31474000;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:211:99:104:105:107:54:51:53:46:56:51:53:51 chr6 31477681 . A G 1034.42 PASS AO=107;DP=109;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.174119;FXX=0.0272702;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.007;QD=38.67;RBI=0.187224;REFB=0;REVB=-0.0688145;RO=0;SAF=57;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.67725e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000928939;OID=.;OPOS=31477681;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:109:107:0:0:107:107:50:57:0:0:50:57:0:0 chr6 31496925 . G A 647.86 PASS AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00182887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.95;QD=36.4993;RBI=0.0327542;REFB=-0.0261162;REVB=0.0327031;RO=1;SAF=18;SAR=52;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00900727;STB=0.504761;TYPE=snp;VARB=0.000183496;OID=.;OPOS=31496925;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:71:71:1:1:70:70:52:18:0:1:52:18:0:1 chr6 31497706 . C T 1692.42 PASS AO=180;DP=194;FAO=192;FDP=192;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.123883;FXX=0.0253794;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.829;QD=35.2588;RBI=0.123885;REFB=-0.157427;REVB=-0.000684172;RO=10;SAF=74;SAR=106;SRF=10;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0601105;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00196198;OID=.;OPOS=31497706;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:194:192:10:0:180:192:106:74:10:0:109:83:0:0 chr6 31500702 . A G 11.82 PASS AO=3;DP=13;FAO=3;FDP=13;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.050275;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.7381;QD=3.63684;RBI=0.0502839;REFB=0.0134777;REVB=-0.000943172;RO=8;SAF=1;SAR=2;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.047266;STB=0.630686;TYPE=snp;VARB=-0.00840427;OID=.;OPOS=31500702;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:13:13:8:10:3:3:2:1:3:5:2:1:5:5 chr6 31500747 . G T 11.7 PASS AO=3;DP=13;FAO=3;FDP=13;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=10;FSRR=0;FWDB=0.0113994;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=103.084;QD=3.60001;RBI=0.0113994;REFB=-0.0219671;REVB=0;RO=10;SAF=3;SAR=0;SRF=10;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00177492;OID=.;OPOS=31500747;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:13:13:10:10:3:3:0:3:10:0:0:3:10:0 chr6 31506624 . T C 1667.29 PASS AO=173;DP=175;FAO=174;FDP=174;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0016656;FXX=0.011363;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.438;QD=38.3285;RBI=0.0222418;REFB=0;REVB=0.0221794;RO=0;SAF=59;SAR=114;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.1411e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.49415e-05;OID=.;OPOS=31506624;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:175:174:0:0:173:174:114:59:0:0:115:59:0:0 chr6 31506648 . G T 1669.75 PASS AO=178;DP=180;FAO=179;FDP=179;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0446589;FXX=0.0110491;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4104;QD=37.3128;RBI=0.0447048;REFB=-0.0413944;REVB=-0.00202571;RO=0;SAF=68;SAR=110;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000763368;OID=.;OPOS=31506648;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:180:179:0:0:178:179:110:68:0:0:110:69:0:0 chr6 31509432 . G A 1108.81 PASS AO=116;DP=116;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00231109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.834;QD=38.2348;RBI=0.0130805;REFB=0;REVB=0.0128747;RO=0;SAF=73;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.14861e-05;OID=.;OPOS=31509432;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:116:116:0:0:116:116:43:73:0:0:43:73:0:0 chr6 31510105 . A G 1530.78 PASS AO=159;DP=159;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00317548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.262;QD=38.5101;RBI=0.00418441;REFB=0;REVB=-0.00272499;RO=0;SAF=96;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.48925e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.22097e-05;OID=.;OPOS=31510105;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:159:159:0:0:159:159:63:96:0:0:63:96:0:0 chr6 31525912 . C T 181.18 PASS AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0470367;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=134.591;QD=32.9414;RBI=0.0574817;REFB=-0.156974;REVB=0.0330408;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.526291;TYPE=snp;VARB=0.00215817;OID=.;OPOS=31525912;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:22:22:0:1:21:21:9:12:0:0:9:12:0:1 chr6 31556709 . A G 1277.38 PASS AO=134;DP=134;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00359613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.978;QD=38.1307;RBI=0.00502545;REFB=0;REVB=0.00351041;RO=0;SAF=58;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.72441e-08;OID=.;OPOS=31556709;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:134:134:0:0:134:134:76:58:0:0:76:58:0:0 chr6 31557905 . TG T 32.75 PASS AO=11;DP=37;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.0464282;FXX=0.0588062;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.315;QD=4.0933;RBI=0.146655;REFB=-0.0699475;REVB=-0.139112;RO=11;SAF=4;SAR=7;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235046;STB=0.653657;TYPE=del;VARB=0.0519039;OID=.;OPOS=31557906;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:11:34:16:32:16:6:10:11:5:32:11:4:7:7:4 chr6 31583155 . G A 310.28 PASS AO=36;DP=39;FAO=36;FDP=39;FR=.;FRO=3;FSAF=36;FSAR=0;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0286139;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.7437;QD=31.8236;RBI=0.0286139;REFB=0.0136739;REVB=0;RO=3;SAF=36;SAR=0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000577437;OID=.;OPOS=31583155;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:3:3:36:36:0:36:3:0:0:36:3:0 chr6 31590898 . C T 2405.8 PASS AO=253;DP=254;FAO=253;FDP=253;FR=.;FRO=0;FSAF=148;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0317554;FXX=0.00393685;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.0817;QD=38.0364;RBI=0.0333899;REFB=-0.0808662;REVB=-0.0103191;RO=1;SAF=148;SAR=105;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00321016;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000123423;OID=.;OPOS=31590898;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:254:253:1:0:253:253:105:148:1:0:105:148:0:0 chr6 31594628 . T A 1593.44 PASS AO=170;DP=174;FAO=171;FDP=171;FR=.;FRO=0;FSAF=117;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0038643;FXX=0.0172404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2368;QD=37.2735;RBI=0.00656562;REFB=-0.0655354;REVB=0.00530797;RO=0;SAF=117;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00020259;OID=.;OPOS=31594628;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:174:171:0:0:170:171:53:117:0:0:54:117:0:0 chr6 31595882 . C A 724.03 PASS AO=75;DP=75;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0471592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.405;QD=38.1066;RBI=0.047574;REFB=0;REVB=0.00626876;RO=0;SAF=19;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000101619;OID=.;OPOS=31595882;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:75:76:0:0:75:76:56:19:0:0:56:20:0:0 chr6 31601342 . G GC 225.54 PASS AO=9;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0720517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=5.83608;QD=16.1097;RBI=0.323072;REFB=0;REVB=0.314935;RO=45;SAF=8;SAR=1;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.456596;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00852021;OID=.;OPOS=31601343;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:9:56:56:56:0:36:20:0:0:27:45:8:1:26:19 chr6 31601344 . T C 474.23 PASS AO=43;DP=54;FAO=53;FDP=55;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.013825;FXX=0.017854;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0324;QD=34.4896;RBI=0.0849814;REFB=-0.0365192;REVB=0.0838493;RO=10;SAF=27;SAR=16;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0659378;STB=0.526306;TYPE=snp;VARB=0.0200011;OID=.;OPOS=31601344;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:54:55:10:2:43:53:16:27:8:2:18:35:0:2 chr6 31604010 . C G 479.17 PASS AO=68;DP=87;FAO=72;FDP=87;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=69;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=0.161531;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=47.014;QD=22.0308;RBI=0.161678;REFB=-0.157813;REVB=0.00689457;RO=6;SAF=2;SAR=66;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.449837;STB=0.630093;TYPE=snp;VARB=0.00927571;OID=.;OPOS=31604010;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:87:87:6:15:68:72:66:2:4:2:69:3:3:12 chr6 31604044 . T G 864.41 PASS AO=90;DP=92;FAO=95;FDP=97;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=68;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0092142;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.1632;QD=35.6458;RBI=0.00924244;REFB=-0.108517;REVB=0.000721928;RO=2;SAF=26;SAR=64;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0350639;STB=0.517853;TYPE=snp;VARB=0.010069;OID=.;OPOS=31604044;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:92:97:2:2:90:95:64:26:2:0:68:27:2:0 chr6 31608570 . TG T 210.26 PASS AO=39;DP=92;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.284628;FXX=0.0365809;HRUN=7;LEN=1;MLLD=5.80586;QD=10.6461;RBI=0.289812;REFB=0.109164;REVB=0.0545725;RO=21;SAF=31;SAR=8;SRF=20;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174089;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0169708;OID=.;OPOS=31608571;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:39:77:79:79:0:61:18:0:0:16:21:31:8:20:1 chr6 31610686 . A G 959.59 PASS AO=99;DP=100;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0249713;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.04;QD=38.0034;RBI=0.026995;REFB=0;REVB=0.0102548;RO=0;SAF=70;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.59141e-05;OID=.;OPOS=31610686;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:100:101:0:0:99:101:29:70:0:0:30:71:0:0 chr6 31617054 . AGG AG,A 281.77 PASS AO=11,6;DP=71;FAO=21,29;FDP=52;FR=.;FRO=2;FSAF=12,13;FSAR=9,16;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0988912,0.0511105;FXX=0.161264;HRUN=7,7;LEN=1,2;MLLD=11.1301,15.8391;QD=21.6745;RBI=0.182136,0.0973769;REFB=0.0812297,0.0655597;REVB=-0.152952,-0.0828853;RO=1;SAF=4,0;SAR=7,6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0994753,-0.782178;STB=0.538425,0.53569;TYPE=del,del;VARB=-0.0856673,0.0285651;OID=.,.;OPOS=31617055,31617055;OREF=G,GG;OALT=-,-;OMAPALT=AG,A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:11,6:22:21,29:52:2:12,13:9,16:2:0:26:1:4,0:7,6:1:0 chr6 31627523 . C T 2831.96 PASS AO=314;DP=328;FAO=315;FDP=327;FR=.;FRO=12;FSAF=138;FSAR=177;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.00475419;FXX=0.00304869;HRUN=4;LEN=1;MLLD=74.6549;QD=34.6417;RBI=0.0517658;REFB=-0.155689;REVB=0.0515471;RO=4;SAF=137;SAR=177;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00764153;STB=0.500799;TYPE=snp;VARB=0.0018282;OID=.;OPOS=31627523;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:328:327:4:12:314:315:177:137:3:1:177:138:5:7 chr6 31634758 . G A 2268.44 PASS AO=236;DP=239;FAO=237;FDP=237;FR=.;FRO=0;FSAF=122;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203689;FXX=0.0124995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.266;QD=38.2859;RBI=0.0208175;REFB=-0.0786742;REVB=0.00429871;RO=1;SAF=122;SAR=114;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00416233;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.79235e-05;OID=.;OPOS=31634758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:239:237:1:0:236:237:114:122:0:1:115:122:0:0 chr6 31657413 . T C 862.37 PASS AO=57;DP=92;FAO=90;FDP=91;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=35;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0342265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.384;QD=37.9063;RBI=0.0913927;REFB=0;REVB=0.0847418;RO=0;SAF=22;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00995663;OID=.;OPOS=31657413;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:91:91:0:0:57:90:35:22:0:0:55:35:0:0 chr6 31745284 . C T 138.07 PASS AO=44;DP=117;FAO=44;FDP=117;FR=.;FRO=73;FSAF=29;FSAR=15;FSRF=39;FSRR=34;FWDB=0.0144036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.625;QD=4.72035;RBI=0.0612802;REFB=-0.013337;REVB=-0.0595634;RO=72;SAF=29;SAR=15;SRF=38;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150153;STB=0.5821;TYPE=snp;VARB=0.0158194;OID=.;OPOS=31745284;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:72:73:44:44:15:29:38:34:15:29:39:34 chr6 31760010 . TG T 936.81 PASS AO=145;DP=242;FAO=210;FDP=236;FR=.;FRO=26;FSAF=99;FSAR=111;FSRF=26;FSRR=0;FWDB=0.240043;FXX=0.00840301;HRUN=4;LEN=1;MLLD=13.4923;QD=15.8782;RBI=0.333059;REFB=-0.153529;REVB=-0.230884;RO=52;SAF=61;SAR=84;SRF=52;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280759;STB=0.55803;TYPE=del;VARB=0.0632134;OID=.;OPOS=31760011;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:145:236:210:236:26:99:111:26:0:10:52:61:84:52:0 chr6 31762843 . G C 178.92 PASS AO=19;DP=21;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0128595;FXX=0.0951928;HRUN=3;LEN=1;MLLD=115.252;QD=37.6663;RBI=0.0435558;REFB=0;REVB=0.0416142;RO=0;SAF=18;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000308254;OID=.;OPOS=31762843;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:21:19:0:0:19:19:1:18:0:0:1:18:0:0 chr6 31762844 . G T 157.7 PASS AO=19;DP=21;FAO=19;FDP=21;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0585161;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.1551;QD=30.0374;RBI=0.0587785;REFB=-0.216761;REVB=0.00554767;RO=2;SAF=18;SAR=1;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.048464;STB=0.526289;TYPE=snp;VARB=0.0166945;OID=.;OPOS=31762844;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:21:21:2:2:19:19:1:18:2:0:1:18:2:0 chr6 31777946 . C T 1204.24 PASS AO=126;DP=129;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0149112;FXX=0.00769172;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.8119;QD=37.3408;RBI=0.0331203;REFB=-0.0576227;REVB=0.0295739;RO=2;SAF=34;SAR=92;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0102175;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000879872;OID=.;OPOS=31777946;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:129:129:2:0:126:129:92:34:0:2:94:35:0:0 chr6 31778272 . G A 1050.34 PASS AO=112;DP=113;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0523707;FXX=0.0175423;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.556;QD=37.5122;RBI=0.0553351;REFB=-0.0892299;REVB=0.0178685;RO=1;SAF=57;SAR=55;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00855451;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000463823;OID=.;OPOS=31778272;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:113:112:1:0:112:112:55:57:0:1:55:57:0:0 chr6 31779642 . GC G 261.09 PASS AO=34;DP=56;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.295141;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.6248;QD=20.8873;RBI=0.350416;REFB=-0.00989013;REVB=0.1889;RO=3;SAF=13;SAR=21;SRF=2;SRR=1;SSEN=0.367698;SSEP=0;SSSB=-0.0449576;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00177263;OID=.;OPOS=31779643;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:34:50:50:50:0:26:24:0:0:23:3:13:21:2:1 chr6 31797587 . C G 486.23 PASS AO=47;DP=47;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0419426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.723;QD=37.4026;RBI=0.0460694;REFB=0;REVB=0.019058;RO=0;SAF=32;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.45057e-05;OID=.;OPOS=31797587;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:47:52:0:0:47:52:15:32:0:0:15:37:0:0 chr6 31838441 . T C 481.19 PASS AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0389899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.663;QD=37.7405;RBI=0.0989428;REFB=0;REVB=0.0909366;RO=0;SAF=36;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.746e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000294072;OID=.;OPOS=31838441;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:51:51:0:0:51:51:15:36:0:0:15:36:0:0 chr6 31838713 . G A 677.1 PASS AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0148289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.111;QD=38.6915;RBI=0.0224208;REFB=0;REVB=0.0168165;RO=0;SAF=11;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.18623e-05;OID=.;OPOS=31838713;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:70:70:0:0:70:70:59:11:0:0:59:11:0:0 chr6 31839309 . C T 1039.72 PASS AO=108;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0286321;FXX=0.0180164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.0343;QD=38.1547;RBI=0.0378515;REFB=0;REVB=0.0247577;RO=0;SAF=29;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000215467;OID=.;OPOS=31839309;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:109:109:0:0:108:109:79:29:0:0:80:29:0:0 chr6 31839331 . C T 743.21 PASS AO=82;DP=87;FAO=84;FDP=89;FR=.;FRO=5;FSAF=24;FSAR=60;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.149383;FXX=0.0111099;HRUN=4;LEN=1;MLLD=100.825;QD=33.4026;RBI=0.151131;REFB=-0.106661;REVB=0.022922;RO=5;SAF=22;SAR=60;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0180506;STB=0.507811;TYPE=snp;VARB=0.00285069;OID=.;OPOS=31839331;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:87:89:5:5:82:84:60:22:2:3:60:24:2:3 chr6 31860337 . T C 1195.9 PASS AO=124;DP=126;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0601264;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.126;QD=38.2689;RBI=0.0675105;REFB=0;REVB=-0.0306999;RO=0;SAF=78;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000282465;OID=.;OPOS=31860337;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:126:125:0:0:124:125:46:78:0:0:46:79:0:0 chr6 31864547 . G T 340.69 PASS AO=43;DP=60;FAO=47;FDP=59;FR=.;FRO=12;FSAF=36;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0318773;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=37.5334;QD=23.0973;RBI=0.0369802;REFB=-0.0506035;REVB=0.018745;RO=13;SAF=29;SAR=14;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0473965;STB=0.589586;TYPE=snp;VARB=0.0120095;OID=.;OPOS=31864547;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:60:59:13:12:43:47:14:29:10:3:11:36:5:7 chr6 31914935 . A G 1493.79 PASS AO=156;DP=156;FAO=156;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.030022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.792;QD=38.3024;RBI=0.0325773;REFB=0;REVB=-0.0126476;RO=0;SAF=62;SAR=94;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.61999e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.26298e-05;OID=.;OPOS=31914935;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:156:156:0:0:156:156:94:62:0:0:94:62:0:0 chr6 31928799 . T C 1678.67 PASS AO=189;DP=193;FAO=187;FDP=193;FR=.;FRO=6;FSAF=120;FSAR=67;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.017417;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.2326;QD=34.7911;RBI=0.101909;REFB=-0.0199872;REVB=-0.100409;RO=3;SAF=122;SAR=67;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0115639;STB=0.506501;TYPE=snp;VARB=0.000117678;OID=.;OPOS=31928799;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:193:193:3:6:189:187:67:122:3:0:67:120:5:1 chr6 31929014 . A C 1569.19 PASS AO=164;DP=184;FAO=164;FDP=164;FR=.;FRO=0;FSAF=111;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00927915;FXX=0.10869;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.6691;QD=38.273;RBI=0.0390978;REFB=0;REVB=0.0379807;RO=0;SAF=111;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.58865e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00032027;OID=.;OPOS=31929014;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:184:164:0:0:164:164:53:111:0:0:53:111:0:0 chr6 31930351 . A G 389.04 PASS AO=82;DP=149;FAO=81;FDP=148;FR=.;FRO=67;FSAF=44;FSAR=37;FSRF=41;FSRR=26;FWDB=-0.0288807;FXX=0.0133324;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.604;QD=10.5147;RBI=0.0298702;REFB=-0.0141968;REVB=-0.00762446;RO=67;SAF=45;SAR=37;SRF=40;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0402787;STB=0.531512;TYPE=snp;VARB=0.00935563;OID=.;OPOS=31930351;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:148:67:67:82:81:37:45:40:27:37:44:41:26 chr6 31935567 . G A 360.1 PASS AO=86;DP=165;FAO=84;FDP=167;FR=.;FRO=83;FSAF=38;FSAR=46;FSRF=34;FSRR=49;FWDB=0.047537;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.5642;QD=8.62505;RBI=0.0536936;REFB=-0.0145981;REVB=0.0249646;RO=78;SAF=37;SAR=49;SRF=33;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00633936;STB=0.52152;TYPE=snp;VARB=0.0177616;OID=.;OPOS=31935567;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:167:78:83:86:84:49:37:33:45:46:38:34:49 chr6 31936668 . T C 481.18 PASS AO=50;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.287;QD=37.7396;RBI=0.018427;REFB=0;REVB=0.0140658;RO=0;SAF=41;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.62861e-05;OID=.;OPOS=31936668;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:50:51:0:0:50:51:9:41:0:0:9:42:0:0 chr6 31939345 . G A 336.67 PASS AO=94;DP=226;FAO=98;FDP=232;FR=.;FRO=134;FSAF=43;FSAR=55;FSRF=59;FSRR=75;FWDB=-0.00154651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.1967;QD=5.80463;RBI=0.0275205;REFB=-0.0239096;REVB=0.027477;RO=131;SAF=43;SAR=51;SRF=58;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154532;STB=0.500893;TYPE=snp;VARB=0.0219303;OID=.;OPOS=31939345;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:226:232:131:134:94:98:51:43:58:73:55:43:59:75 chr6 31977391 . C T 576.68 PASS AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0456492;FXX=0.031741;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.76;QD=37.8149;RBI=0.0573808;REFB=0;REVB=0.0347665;RO=0;SAF=22;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.01474e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000245406;OID=.;OPOS=31977391;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:61:61:0:0:61:61:39:22:0:0:39:22:0:0 chr6 31977528 . C G 73.34 PASS AO=24;DP=69;FAO=24;FDP=69;FR=.;FRO=45;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=-0.00840056;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=220.588;QD=4.25178;RBI=0.0107959;REFB=-0.00967769;REVB=0.00678093;RO=44;SAF=6;SAR=18;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.347197;STB=0.709741;TYPE=snp;VARB=0.0232579;OID=.;OPOS=31977528;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:69:69:44:45:24:24:18:6:24:20:18:6:25:20 chr6 31978746 . G A 76.08 PASS AO=19;DP=44;FAO=19;FDP=44;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=0.00285419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.502;QD=6.9168;RBI=0.0078604;REFB=-0.0168135;REVB=0.0073239;RO=22;SAF=8;SAR=11;SRF=16;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.28266;STB=0.664953;TYPE=snp;VARB=0.0161785;OID=.;OPOS=31978746;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:44:44:22:25:19:19:11:8:16:6:11:8:18:7 chr6 31978824 . G A 97.93 PASS AO=19;DP=34;FAO=19;FDP=34;FR=.;FRO=15;FSAF=17;FSAR=2;FSRF=15;FSRR=0;FWDB=0.00378736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.185;QD=11.5212;RBI=0.0292048;REFB=-0.0292686;REVB=0.0289582;RO=14;SAF=17;SAR=2;SRF=14;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267736;STB=0.652942;TYPE=snp;VARB=0.019475;OID=.;OPOS=31978824;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:34:34:14:15:19:19:2:17:14:0:2:17:15:0 chr6 31979037 . CG C 32.5 PASS AO=15;DP=37;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=3;FWDB=0.0583749;FXX=0.0270197;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.867;QD=3.6116;RBI=0.17751;REFB=-0.156294;REVB=-0.167637;RO=17;SAF=8;SAR=7;SRF=15;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0.325397;SSSB=-0.339777;STB=0.688435;TYPE=del;VARB=0.144827;OID=.;OPOS=31979038;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:15:37:18:36:18:8:10:15:3:32:17:8:7:15:2 chr6 32006317 . C T 45.76 PASS AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0839159;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.0458;QD=13.0755;RBI=0.0884976;REFB=-0.0560394;REVB=0.028106;RO=5;SAF=1;SAR=7;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.2967;STB=0.655787;TYPE=snp;VARB=0.0508707;OID=.;OPOS=32006317;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:14:14:5:6:8:8:7:1:2:3:7:1:2:4 chr6 32006337 . C A 99.23 PASS AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.1099;QD=39.692;RBI=0.103335;REFB=0;REVB=0.103335;RO=0;SAF=0;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00735642;OID=.;OPOS=32006337;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:10:0:0:0:10:0:0:0 chr6 32006858 . C A 211.41 PASS AO=26;DP=30;FAO=27;FDP=30;FR=.;FRO=3;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.109764;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.5309;QD=28.1879;RBI=0.130273;REFB=-0.0608934;REVB=0.0701632;RO=4;SAF=7;SAR=19;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00603969;STB=0.536559;TYPE=snp;VARB=0.0254315;OID=.;OPOS=32006858;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:30:30:4:3:26:27:19:7:1:3:19:8:0:3 chr6 32006886 . G A 210.28 PASS AO=29;DP=36;FAO=29;FDP=36;FR=.;FRO=7;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0488265;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.2733;QD=23.3639;RBI=0.0521035;REFB=0.018302;REVB=0.0181864;RO=6;SAF=9;SAR=20;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124789;STB=0.556705;TYPE=snp;VARB=-0.00437309;OID=.;OPOS=32006886;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:36:36:6:7:29:29:20:9:4:2:20:9:4:3 chr6 32008880 . TG T 109.71 PASS AO=14;DP=23;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.358224;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=9.39227;QD=17.5529;RBI=0.359053;REFB=-0.0269457;REVB=0.0243761;RO=8;SAF=10;SAR=4;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0.388489;SSSB=0.0681046;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0211943;OID=.;OPOS=32008881;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:14:25:25:25:0:15:10:0:0:9:8:10:4:5:3 chr6 32010272 . T A 151.94 PASS AO=40;DP=92;FAO=40;FDP=92;FR=.;FRO=52;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=26;FWDB=0.0016981;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.828;QD=6.60594;RBI=0.00555651;REFB=-0.0107422;REVB=0.00529068;RO=52;SAF=20;SAR=20;SRF=26;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0110531;OID=.;OPOS=32010272;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:52:52:40:40:20:20:26:26:20:20:26:26 chr6 32017105 . A G 112.33 PASS AO=21;DP=36;FAO=21;FDP=36;FR=.;FRO=15;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.0244647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.336;QD=12.4813;RBI=0.0440126;REFB=-0.0109442;REVB=-0.0365868;RO=14;SAF=14;SAR=7;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0391222;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00662267;OID=.;OPOS=32017105;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:36:36:14:15:21:21:7:14:10:4:7:14:10:5 chr6 32026105 . GCC GC,GCT 110.99 PASS AO=3,8;DP=19;FAO=10,8;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=6,3;FSAR=4,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.178273,0.0318042;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=12.3411,169.036;QD=24.6643;RBI=0.246389,0.0318832;REFB=0,0;REVB=0.170078,-0.00224351;RO=5;SAF=2,3;SAR=1,5;SRF=4;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.152533,-0.276405;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.210421,0.00619935;OID=.,.;OPOS=32026106,32026107;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=GC,GCT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:3,8:16:10,8:18:0:6,3:4,5:0:0:38:5:2,3:1,5:4:1 chr6 32029226 . A G 56.19 PASS AO=12;DP=29;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.00121464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.934;QD=7.49193;RBI=0.00933328;REFB=-0.0389039;REVB=-0.0092539;RO=15;SAF=7;SAR=5;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0832381;STB=0.516104;TYPE=snp;VARB=0.0435953;OID=.;OPOS=32029226;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:29:30:15:17:12:13:5:7:10:5:5:8:10:7 chr6 32029415 . T C 33.64 PASS AO=8;DP=21;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.0136628;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.8;QD=6.40846;RBI=0.0236765;REFB=-0.0361531;REVB=0.0193367;RO=13;SAF=3;SAR=5;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104179;STB=0.506313;TYPE=snp;VARB=0.0141443;OID=.;OPOS=32029415;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:21:21:13:13:8:8:5:3:5:8:5:3:5:8 chr6 32032743 . G A 273.19 PASS AO=37;DP=101;FAO=55;FDP=98;FR=.;FRO=43;FSAF=21;FSAR=34;FSRF=33;FSRR=10;FWDB=0.00228177;FXX=0.0392118;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.272;QD=11.1506;RBI=0.0262659;REFB=-0.0376021;REVB=0.0261666;RO=39;SAF=4;SAR=33;SRF=29;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.645711;STB=0.665159;TYPE=snp;VARB=0.0343483;OID=.;OPOS=32032743;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:98:39:43:37:55:33:4:29:10:34:21:33:10 chr6 32050067 . T C 175.23 PASS AO=58;DP=165;FAO=58;FDP=155;FR=.;FRO=97;FSAF=47;FSAR=11;FSRF=59;FSRR=38;FWDB=-0.00422529;FXX=0.071852;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.675;QD=4.52193;RBI=0.00496073;REFB=-0.00962911;REVB=-0.0025992;RO=91;SAF=47;SAR=11;SRF=55;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.284603;STB=0.663817;TYPE=snp;VARB=0.0206008;OID=.;OPOS=32050067;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:155:91:97:58:58:11:47:55:36:11:47:59:38 chr6 32088854 . G C 253.18 PASS AO=53;DP=98;FAO=53;FDP=98;FR=.;FRO=45;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=16;FSRR=29;FWDB=0.00738617;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=274.267;QD=10.334;RBI=0.00738705;REFB=-0.0071049;REVB=-0.000114232;RO=44;SAF=25;SAR=28;SRF=16;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0901568;STB=0.553808;TYPE=snp;VARB=0.00527439;OID=.;OPOS=32088854;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:44:45:53:53:28:25:16:28:28:25:16:29 chr6 32119898 . T C 2754.81 PASS AO=243;DP=366;FAO=332;FDP=364;FR=.;FRO=32;FSAF=176;FSAR=156;FSRF=31;FSRR=1;FWDB=-0.0171211;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.239;QD=30.2726;RBI=0.0275173;REFB=0.0202588;REVB=0.0215423;RO=0;SAF=156;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.12502e-08;STB=0.53888;TYPE=snp;VARB=-0.00381853;OID=.;OPOS=32119898;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:277:364:0:32:243:332:87:156:0:0:156:176:31:1 chr6 32122386 . C G 255.81 PASS AO=19;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0284125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.343;QD=37.8971;RBI=0.125773;REFB=0;REVB=0.122522;RO=0;SAF=8;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41338e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00456558;OID=.;OPOS=32122386;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:27:27:0:0:19:27:11:8:0:0:19:8:0:0 chr6 32151294 . T C 650.52 PASS AO=172;DP=386;FAO=177;FDP=398;FR=.;FRO=221;FSAF=88;FSAR=89;FSRF=91;FSRR=130;FWDB=-0.0218923;FXX=0.0025062;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.2955;QD=6.53789;RBI=0.0439337;REFB=-0.0170309;REVB=0.0380906;RO=210;SAF=88;SAR=84;SRF=86;SRR=124;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101413;STB=0.547448;TYPE=snp;VARB=0.0155625;OID=.;OPOS=32151294;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:386:398:210:221:172:177:84:88:86:124:89:88:91:130 chr6 32151994 . A T 488.58 PASS AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.35;QD=37.5832;RBI=0.0449652;REFB=0;REVB=-0.0397648;RO=0;SAF=30;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00014428;OID=.;OPOS=32151994;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:51:52:0:0:51:52:21:30:0:0:21:31:0:0 chr6 32159956 . T C 61.24 PASS AO=15;DP=35;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.0370643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.395;QD=6.99884;RBI=0.0396177;REFB=-0.0337733;REVB=0.0139928;RO=20;SAF=5;SAR=10;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.309894;STB=0.679009;TYPE=snp;VARB=0.023361;OID=.;OPOS=32159956;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:35:35:20:20:15:15:10:5:13:7:10:5:13:7 chr6 32172065 . T G 1221.26 PASS AO=129;DP=131;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00635159;FXX=0.0151504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.769;QD=37.5771;RBI=0.0142307;REFB=-0.0680857;REVB=-0.0127346;RO=0;SAF=81;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000116051;OID=.;OPOS=32172065;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:131:130:0:0:129:130:48:81:0:0:49:81:0:0 chr6 32184705 . G A 883.8 PASS AO=93;DP=94;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.035268;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.8335;QD=38.0129;RBI=0.0400133;REFB=0;REVB=0.0189005;RO=0;SAF=20;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.57802e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000121737;OID=.;OPOS=32184705;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:94:93:0:0:93:93:73:20:0:0:73:20:0:0 chr6 32188297 . G C 92.14 PASS AO=13;DP=51;FAO=15;FDP=54;FR=.,HEALED;FRO=30;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=0.0139761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.823;QD=6.82487;RBI=0.0330462;REFB=-0.0123362;REVB=0.0299452;RO=30;SAF=8;SAR=5;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208799;STB=0.566284;TYPE=snp;VARB=0.0323355;OID=.;OPOS=32188297;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:53:54:30:30:13:15:5:8:13:17:7:8:13:17 chr6 32188383 . T C 52.89 PASS AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.0680394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.022;QD=6.2222;RBI=0.0712331;REFB=-0.00675556;REVB=-0.0210901;RO=20;SAF=8;SAR=6;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122474;STB=0.571326;TYPE=snp;VARB=0.0121477;OID=.;OPOS=32188383;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:34:34:20:20:14:14:6:8:9:11:6:8:9:11 chr6 32188603 . C T 173 PASS AO=40;DP=82;FAO=40;FDP=82;FR=.;FRO=42;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=-0.0244968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.902;QD=8.43896;RBI=0.0244969;REFB=-0.00790723;REVB=-6.22877e-05;RO=42;SAF=19;SAR=21;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0885476;STB=0.549246;TYPE=snp;VARB=0.00729074;OID=.;OPOS=32188603;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:42:42:40:40:21:19:24:18:21:19:24:18 chr6 32188640 . T C 215.59 PASS AO=45;DP=83;FAO=45;FDP=83;FR=.;FRO=38;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=-0.0248299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.005;QD=10.3897;RBI=0.0303975;REFB=-0.003666;REVB=-0.0175351;RO=38;SAF=24;SAR=21;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0381998;STB=0.521026;TYPE=snp;VARB=0.00235201;OID=.;OPOS=32188640;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:38:38:45:45:21:24:22:16:21:24:22:16 chr6 32188642 . T C 220.73 PASS AO=44;DP=83;FAO=46;FDP=84;FR=.;FRO=38;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=0.0130006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.745;QD=10.5111;RBI=0.0137772;REFB=-0.00894032;REVB=0.00456036;RO=34;SAF=25;SAR=19;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0162535;STB=0.506326;TYPE=snp;VARB=0.00529585;OID=.;OPOS=32188642;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:84:34:38:44:46:19:25:20:14:20:26:22:16 chr6 32189032 . T C 285.73 PASS AO=78;DP=181;FAO=78;FDP=180;FR=.;FRO=102;FSAF=42;FSAR=36;FSRF=59;FSRR=43;FWDB=-0.0271372;FXX=0.00552456;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.993;QD=6.34961;RBI=0.0407774;REFB=-0.00855955;REVB=-0.0304364;RO=100;SAF=42;SAR=36;SRF=58;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0423154;STB=0.522859;TYPE=snp;VARB=0.0131515;OID=.;OPOS=32189032;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:180:100:102:78:78:36:42:58:42:36:42:59:43 chr6 32191658 . TAGCAGCAGCAGC T,TAGCAGCAGC 460.14 PASS AO=17,24;DP=68;FAO=20,32;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=15,28;FSAR=5,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00615157,0.0803526;FXX=0.0370302;HRUN=1,1;LEN=12,3;MLLD=350.574,78.1365;QD=35.3956;RBI=0.0485548,0.102776;REFB=0,0;REVB=0.0481636,0.0640816;RO=0;SAF=14,21;SAR=3,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.53656e-08,-4.86584e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.0117327,0.00923314;OID=.,.;OPOS=32191659,32191659;OREF=AGCAGCAGCAGC,AGC;OALT=-,-;OMAPALT=T,TAGCAGCAGC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:17,24:50:20,32:52:0:15,28:5,4:0:0:69:0:14,21:3,3:0:0 chr6 32261771 . A G 154.68 PASS AO=31;DP=101;FAO=46;FDP=111;FR=.;FRO=65;FSAF=40;FSAR=6;FSRF=44;FSRR=21;FWDB=0.0128552;FXX=0.0263135;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.413;QD=5.57386;RBI=0.0179794;REFB=-0.00401622;REVB=0.01257;RO=53;SAF=31;SAR=0;SRF=38;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.803072;STB=0.681724;TYPE=snp;VARB=0.00942454;OID=.;OPOS=32261771;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:111:53:65:31:46:0:31:38:15:6:40:44:21 chr6 32268501 . A T 458.45 PASS AO=108;DP=217;FAO=108;FDP=217;FR=.;FRO=109;FSAF=53;FSAR=55;FSRF=54;FSRR=55;FWDB=0.0316076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.233;QD=8.45064;RBI=0.033768;REFB=-0.00990347;REVB=-0.0118843;RO=107;SAF=53;SAR=55;SRF=53;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00415835;STB=0.502347;TYPE=snp;VARB=0.0093331;OID=.;OPOS=32268501;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:217:217:107:109:108:108:55:53:53:54:55:53:54:55 chr6 32290927 . G T 2358.95 PASS AO=247;DP=247;FAO=248;FDP=248;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=161;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00765485;FXX=0.0040159;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.569;QD=38.0475;RBI=0.0532896;REFB=-0.0230494;REVB=0.0527369;RO=0;SAF=88;SAR=159;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00210531;OID=.;OPOS=32290927;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:247:248:0:0:247:248:159:88:0:0:161:87:0:0 chr6 32291270 . CAG C 75.89 PASS AO=27;DP=88;FAO=27;FDP=81;FR=.;FRO=54;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=29;FSRR=25;FWDB=-0.0204671;FXX=0.0689576;HRUN=1;LEN=2;MLLD=215.691;QD=3.74785;RBI=0.0229593;REFB=-0.00836221;REVB=-0.0104031;RO=53;SAF=13;SAR=14;SRF=29;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0746426;STB=0.536959;TYPE=del;VARB=0.0144712;OID=.;OPOS=32291271;OREF=AG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:27:86:27:81:54:13:14:29:25:75:53:13:14:29:24 chr6 32291359 . T G 1143.32 PASS AO=142;DP=145;FAO=133;FDP=142;FR=.;FRO=9;FSAF=59;FSAR=74;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=-0.00122994;FXX=0.0138879;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2791;QD=32.2063;RBI=0.0123799;REFB=0.0338046;REVB=-0.0123187;RO=3;SAF=65;SAR=77;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00826912;STB=0.528398;TYPE=snp;VARB=-0.00839508;OID=.;OPOS=32291359;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:145:142:3:9:142:133:77:65:2:1:74:59:8:1 chr6 32298372 . A G 142.6 PASS AO=36;DP=80;FAO=36;FDP=81;FR=.;FRO=45;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=14;FSRR=31;FWDB=0.0151819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.963;QD=7.04195;RBI=0.0152543;REFB=-0.0176301;REVB=0.00148488;RO=44;SAF=14;SAR=22;SRF=13;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0989966;STB=0.530596;TYPE=snp;VARB=0.0216322;OID=.;OPOS=32298372;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:81:44:45:36:36:22:14:13:31:23:13:14:31 chr6 32299822 . G A 734.56 PASS AO=151;DP=268;FAO=151;FDP=268;FR=.;FRO=117;FSAF=92;FSAR=59;FSRF=55;FSRR=62;FWDB=-0.0032239;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.85;QD=10.9636;RBI=0.00397261;REFB=-0.00882969;REVB=-0.00232122;RO=117;SAF=92;SAR=59;SRF=55;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114208;STB=0.562072;TYPE=snp;VARB=0.00775432;OID=.;OPOS=32299822;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:268:268:117:117:151:151:59:92:55:62:59:92:55:62 chr6 32301804 . G C 341.13 PASS AO=86;DP=188;FAO=87;FDP=187;FR=.;FRO=100;FSAF=35;FSAR=52;FSRF=48;FSRR=52;FWDB=-0.00478807;FXX=0.0209413;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.989;QD=7.29694;RBI=0.00563843;REFB=-0.0112966;REVB=-0.00297763;RO=97;SAF=34;SAR=52;SRF=45;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0675772;STB=0.542474;TYPE=snp;VARB=0.0126703;OID=.;OPOS=32301804;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:187:97:100:86:87:52:34:45:52:52:35:48:52 chr6 32303672 . T A 355.56 PASS AO=88;DP=196;FAO=91;FDP=198;FR=.;FRO=107;FSAF=46;FSAR=45;FSRF=44;FSRR=63;FWDB=0.00784163;FXX=0.00502487;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.744;QD=7.18293;RBI=0.0100531;REFB=-0.0051059;REVB=0.00629074;RO=105;SAF=45;SAR=43;SRF=44;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0904849;STB=0.550887;TYPE=snp;VARB=0.00698991;OID=.;OPOS=32303672;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:198:105:107:88:91:43:45:44:61:45:46:44:63 chr6 32307260 . T G 427.74 PASS AO=108;DP=230;FAO=108;FDP=231;FR=.;FRO=123;FSAF=49;FSAR=59;FSRF=48;FSRR=75;FWDB=-0.00740107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.921;QD=7.4068;RBI=0.00969069;REFB=-0.00507521;REVB=0.00625569;RO=122;SAF=49;SAR=59;SRF=48;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0587939;STB=0.534293;TYPE=snp;VARB=0.00503812;OID=.;OPOS=32307260;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:230:231:122:123:108:108:59:49:48:74:59:49:48:75 chr6 32307382 . G A 218.09 PASS AO=61;DP=149;FAO=62;FDP=149;FR=.;FRO=87;FSAF=24;FSAR=38;FSRF=31;FSRR=56;FWDB=-0.0870711;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.4271;QD=5.85466;RBI=0.0884072;REFB=0.0154768;REVB=-0.0153118;RO=88;SAF=23;SAR=38;SRF=32;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.015067;STB=0.519092;TYPE=snp;VARB=-0.023742;OID=.;OPOS=32307382;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:88:87:61:62:38:23:32:56:38:24:31:56 chr6 32310986 . C G 272.58 PASS AO=60;DP=115;FAO=60;FDP=115;FR=.;FRO=55;FSAF=21;FSAR=39;FSRF=30;FSRR=25;FWDB=0.0153737;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.2694;QD=9.48114;RBI=0.0246722;REFB=-0.012482;REVB=-0.0192968;RO=55;SAF=21;SAR=39;SRF=30;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175467;STB=0.596727;TYPE=snp;VARB=0.0067045;OID=.;OPOS=32310986;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:55:55:60:60:39:21:30:25:39:21:30:25 chr6 32317859 . T C 362.32 PASS AO=100;DP=232;FAO=100;FDP=230;FR=.;FRO=130;FSAF=50;FSAR=50;FSRF=56;FSRR=74;FWDB=0.0184896;FXX=0.00862032;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.9348;QD=6.30123;RBI=0.0266551;REFB=-0.00165913;REVB=0.0191998;RO=126;SAF=50;SAR=50;SRF=53;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0797216;STB=0.539123;TYPE=snp;VARB=0.00184284;OID=.;OPOS=32317859;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:230:126:130:100:100:50:50:53:73:50:50:56:74 chr6 32317922 . TTTTC T 50 PASS AO=70;DP=198;LEN=4;RO=128;SAF=40;SAR=35;SRF=59;SRR=64;TYPE=del;FR=.;OID=.;OPOS=32317923;OREF=TTTC;OALT=-;OMAPALT=T GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR 0/1:99:198:128:70:35:40:59:64 chr6 32333093 . A G 274.93 PASS AO=84;DP=208;FAO=84;FDP=211;FR=.;FRO=127;FSAF=37;FSAR=47;FSRF=67;FSRR=60;FWDB=-0.0159325;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.761;QD=5.21189;RBI=0.0194221;REFB=-0.011487;REVB=-0.0111074;RO=124;SAF=37;SAR=47;SRF=64;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0806254;STB=0.552491;TYPE=snp;VARB=0.0164601;OID=.;OPOS=32333093;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:211:124:127:84:84:47:37:64:60:47:37:67:60 chr6 32333098 . C T 294.1 PASS AO=87;DP=214;FAO=87;FDP=212;FR=.;FRO=125;FSAF=38;FSAR=49;FSRF=67;FSRR=58;FWDB=-0.0111899;FXX=0.00934536;HRUN=3;LEN=1;MLLD=160.961;QD=5.54899;RBI=0.0135282;REFB=-0.00712263;REVB=-0.00760256;RO=124;SAF=38;SAR=49;SRF=67;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10875;STB=0.558558;TYPE=snp;VARB=0.0105111;OID=.;OPOS=32333098;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:212:124:125:87:87:49:38:67:57:49:38:67:58 chr6 32333955 . T C 241.76 PASS AO=59;DP=124;FAO=59;FDP=124;FR=.;FRO=65;FSAF=36;FSAR=23;FSRF=33;FSRR=32;FWDB=0.000310431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.3493;QD=7.79885;RBI=0.00905856;REFB=-0.0274496;REVB=0.00905324;RO=64;SAF=36;SAR=23;SRF=32;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105757;STB=0.555069;TYPE=snp;VARB=0.0347222;OID=.;OPOS=32333955;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:64:65:59:59:23:36:32:32:23:36:33:32 chr6 32334224 . C G 114.27 PASS AO=28;DP=62;FAO=28;FDP=62;FR=.;FRO=34;FSAF=7;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.0149468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.636;QD=7.37253;RBI=0.0150738;REFB=0.00475076;REVB=-0.00195221;RO=34;SAF=7;SAR=21;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215437;STB=0.622548;TYPE=snp;VARB=-0.00753599;OID=.;OPOS=32334224;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:34:34:28:28:21:7:15:19:21:7:15:19 chr6 32336586 . A G 828.48 PASS AO=195;DP=388;FAO=195;FDP=388;FR=.;FRO=193;FSAF=97;FSAR=98;FSRF=85;FSRR=108;FWDB=0.0267665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.732;QD=8.54107;RBI=0.0268988;REFB=7.47062e-05;REVB=0.00266424;RO=192;SAF=97;SAR=98;SRF=84;SRR=108;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0543761;STB=0.52837;TYPE=snp;VARB=-3.99178e-05;OID=.;OPOS=32336586;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:388:388:192:193:195:195:98:97:84:108:98:97:85:108 chr6 32337686 . A G 1146.59 PASS AO=125;DP=131;FAO=125;FDP=128;FR=.;FRO=3;FSAF=25;FSAR=100;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00956502;FXX=0.022899;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.5313;QD=35.8309;RBI=0.0219555;REFB=-0.106874;REVB=0.0197625;RO=1;SAF=25;SAR=100;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00472839;STB=0.516744;TYPE=snp;VARB=0.000699179;OID=.;OPOS=32337686;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:131:128:1:3:125:125:100:25:0:1:100:25:2:1 chr6 32363893 . G A 498.23 PASS AO=64;DP=153;FAO=79;FDP=161;FR=.,HEALED;FRO=54;FSAF=31;FSAR=48;FSRF=51;FSRR=3;FWDB=0.026334;FXX=0.024241;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.2422;QD=12.3784;RBI=0.0268342;REFB=-0.00958163;REVB=-0.00515707;RO=53;SAF=25;SAR=39;SRF=50;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.435521;STB=0.713383;TYPE=snp;VARB=0.0259341;OID=.;OPOS=32363893;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:161:53:54:64:79:39:25:50:3:48:31:51:3 chr6 32410987 . A G 1907.17 PASS AO=206;DP=210;FAO=209;FDP=212;FR=.;FRO=3;FSAF=128;FSAR=81;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.00737975;FXX=0.00934536;HRUN=3;LEN=1;MLLD=66.6272;QD=35.9843;RBI=0.0467615;REFB=-0.145097;REVB=-0.0461755;RO=4;SAF=127;SAR=79;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00512663;STB=0.500808;TYPE=snp;VARB=0.00174621;OID=.;OPOS=32410987;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:210:212:4:3:206:209:79:127:3:1:81:128:2:1 chr6 32411035 . A C 2796.9 PASS AO=289;DP=289;FAO=292;FDP=292;FR=.;FRO=0;FSAF=163;FSAR=129;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.005591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.018;QD=38.3137;RBI=0.0305926;REFB=0;REVB=0.0300773;RO=0;SAF=162;SAR=127;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.12907e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.45643e-05;OID=.;OPOS=32411035;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:289:292:0:0:289:292:127:162:0:0:129:163:0:0 chr6 32411646 . T G 2509.57 PASS AO=262;DP=263;FAO=264;FDP=264;FR=.;FRO=0;FSAF=127;FSAR=137;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0359755;FXX=0.00377344;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.6485;QD=38.0237;RBI=0.0369208;REFB=-0.0176726;REVB=-0.00830105;RO=1;SAF=126;SAR=136;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00376879;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.35175e-05;OID=.;OPOS=32411646;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:263:264:1:0:262:264:136:126:1:0:137:127:0:0 chr6 32412480 . G A 2425.57 PASS AO=254;DP=257;FAO=255;FDP=255;FR=.;FRO=0;FSAF=122;FSAR=133;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199445;FXX=0.0077818;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.642;QD=38.0482;RBI=0.0308471;REFB=-0.0283064;REVB=0.0235321;RO=0;SAF=122;SAR=132;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.26948e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.17702e-05;OID=.;OPOS=32412480;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:257:255:0:0:254:255:132:122:0:0:133:122:0:0 chr6 32486402 . C T 351.1 PASS AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0020883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.5672;QD=37.9572;RBI=0.0521245;REFB=0;REVB=0.0520826;RO=0;SAF=11;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000908775;OID=.;OPOS=32486402;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:37:37:0:0:37:37:26:11:0:0:26:11:0:0 chr6 32487214 . T C 856.23 PASS AO=91;DP=93;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0162024;FXX=0.0107515;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.523;QD=37.2272;RBI=0.0188268;REFB=-0.0437384;REVB=0.00958803;RO=2;SAF=35;SAR=56;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00496059;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.34023e-05;OID=.;OPOS=32487214;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:93:92:2:0:91:92:56:35:1:1:56:36:0:0 chr6 32487241 . G A 1193.1 PASS AO=126;DP=128;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0225232;FXX=0.0156238;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.7255;QD=37.8761;RBI=0.0242958;REFB=0.0195877;REVB=-0.00911007;RO=1;SAF=66;SAR=60;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0078537;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000403771;OID=.;OPOS=32487241;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:128:126:1:0:126:126:60:66:0:1:60:66:0:0 chr6 32487242 . G A 1178.59 PASS AO=126;DP=129;FAO=126;FDP=128;FR=.;FRO=2;FSAF=66;FSAR=60;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0162065;FXX=0.00775134;HRUN=3;LEN=1;MLLD=201.814;QD=36.8309;RBI=0.0171023;REFB=-0.106065;REVB=-0.00546236;RO=2;SAF=66;SAR=60;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000708389;STB=0.500373;TYPE=snp;VARB=0.000818077;OID=.;OPOS=32487242;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:129:128:2:2:126:126:60:66:1:1:60:66:1:1 chr6 32487309 . T C 1533.01 PASS AO=162;DP=164;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0253414;FXX=0.0240949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.433;QD=37.8521;RBI=0.0299008;REFB=-0.0172362;REVB=0.0158704;RO=1;SAF=97;SAR=65;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00488069;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.19246e-05;OID=.;OPOS=32487309;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:164:162:1:0:162:162:65:97:1:0:66:96:0:0 chr6 32489766 . A T 15.43 PASS AO=7;DP=34;FAO=7;FDP=33;FR=.;FRO=26;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=-0.0405835;FXX=0.0294031;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.083;QD=1.87084;RBI=0.0411531;REFB=-0.00238746;REVB=0.00682377;RO=24;SAF=1;SAR=6;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.58814;STB=0.889642;TYPE=snp;VARB=0.0286481;OID=.;OPOS=32489766;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:34:33:24:26:7:7:6:1:16:8:6:1:18:8 chr6 32489853 . A C 212.91 PASS AO=25;DP=27;FAO=25;FDP=27;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0293154;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.41;QD=31.5427;RBI=0.0316792;REFB=-0.0934917;REVB=-0.0120074;RO=1;SAF=5;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0226465;STB=0.533306;TYPE=snp;VARB=0.00881861;OID=.;OPOS=32489853;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:27:27:1:2:25:25:20:5:0:1:20:5:1:1 chr6 32489856 . C A,T 205.67 PASS AO=7,20;DP=27;FAO=5,20;FDP=27;FR=.;FRO=2;FSAF=0,4;FSAR=5,16;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0153218,0.0450918;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=22.7762,55.6505;QD=30.4702;RBI=0.041891,0.0459953;REFB=-0.0129192,-0.0298455;REVB=0.0389884,0.0090717;RO=0;SAF=2,4;SAR=5,16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.27427e-08,0;STB=0.997126,0.599891;TYPE=snp,snp;VARB=0.0315568,0.0335407;OID=.,.;OPOS=32489856,32489856;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:12:27:27:0:2:7,20:5,20:5,16:2,4:0:0:5,16:0,4:2:0 chr6 32489863 . T C 15.03 PASS AO=6;DP=27;FAO=6;FDP=27;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=17;FWDB=-0.060851;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.6219;QD=2.22677;RBI=0.0711694;REFB=-0.0242865;REVB=-0.0369086;RO=21;SAF=2;SAR=4;SRF=4;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212559;STB=0.635978;TYPE=snp;VARB=0.0593709;OID=.;OPOS=32489863;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:27:27:21:21:6:6:4:2:4:17:4:2:4:17 chr6 32489876 . T C 154.96 PASS AO=19;DP=22;FAO=20;FDP=23;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0454833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.0586;QD=26.9493;RBI=0.0591429;REFB=-0.0373236;REVB=-0.0378041;RO=3;SAF=3;SAR=16;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0788517;STB=0.540502;TYPE=snp;VARB=0.0333694;OID=.;OPOS=32489876;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:22:23:3:3:19:20:16:3:0:3:17:3:0:3 chr6 32489949 . G A 231.88 PASS AO=24;DP=24;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0412931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.703;QD=37.1001;RBI=0.0490289;REFB=0;REVB=0.0264333;RO=0;SAF=7;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000549901;OID=.;OPOS=32489949;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:24:25:0:0:24:25:17:7:0:0:17:8:0:0 chr6 32497961 . T A 158.92 PASS AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=69.1621;QD=37.3925;RBI=0.01684;REFB=0;REVB=0.01684;RO=0;SAF=0;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000509935;OID=.;OPOS=32497961;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:17:17:0:0:17:17:17:0:0:0:17:0:0:0 chr6 32497962 . T C 158.92 PASS AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=254.957;QD=37.3931;RBI=0.0209493;REFB=0;REVB=0.0209493;RO=0;SAF=0;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000186699;OID=.;OPOS=32497962;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:17:17:0:0:17:17:17:0:0:0:17:0:0:0 chr6 32546743 . C T 31.69 PASS AO=14;DP=54;FAO=14;FDP=54;FR=.;FRO=40;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=27;FSRR=13;FWDB=0.00613275;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.943;QD=2.34777;RBI=0.0572586;REFB=-0.00748748;REVB=-0.0569292;RO=40;SAF=12;SAR=2;SRF=27;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.310497;STB=0.697342;TYPE=snp;VARB=0.0261881;OID=.;OPOS=32546743;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:54:54:40:40:14:14:2:12:27:13:2:12:27:13 chr6 32546795 . T A 18.04 PASS AO=13;DP=68;FAO=13;FDP=68;FR=.;FRO=55;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=30;FSRR=25;FWDB=-0.000396892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.838;QD=1.06108;RBI=0.0583134;REFB=-0.0198388;REVB=-0.058312;RO=55;SAF=11;SAR=2;SRF=30;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.425032;STB=0.783154;TYPE=snp;VARB=0.0375231;OID=.;OPOS=32546795;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:68:68:55:55:13:13:2:11:30:25:2:11:30:25 chr6 32546828 . C T 13.51 PASS AO=11;DP=68;FAO=11;FDP=64;FR=.,HEALED;FRO=53;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=24;FSRR=29;FWDB=-0.0273011;FXX=0.0153822;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.363;QD=0.844496;RBI=0.0299424;REFB=-0.00648727;REVB=-0.0122963;RO=34;SAF=8;SAR=3;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112445;STB=0.72686;TYPE=snp;VARB=0.0243955;OID=.;OPOS=32546828;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:64:64:34:53:11:11:3:8:22:12:3:8:24:29 chr6 32546866 . T C 24.02 PASS AO=16;DP=76;FAO=16;FDP=77;FR=.;FRO=61;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=39;FWDB=0.00212248;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=95.1824;QD=1.24757;RBI=0.0140251;REFB=-0.0107599;REVB=-0.0138636;RO=60;SAF=8;SAR=8;SRF=21;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189259;STB=0.610258;TYPE=snp;VARB=0.0229837;OID=.;OPOS=32546866;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:76:77:60:61:16:16:8:8:21:39:8:8:22:39 chr6 32547988 . T C 19.42 PASS AO=22;DP=129;FAO=22;FDP=128;FR=.;FRO=106;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=83;FWDB=-0.0273715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.242;QD=0.606809;RBI=0.0274909;REFB=0.00348906;REVB=0.00255906;RO=106;SAF=6;SAR=16;SRF=23;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0959016;STB=0.603789;TYPE=snp;VARB=-0.0158317;OID=.;OPOS=32547988;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:129:128:106:106:22:22:16:6:23:83:15:7:23:83 chr6 32547991 . G A 37.36 PASS AO=30;DP=134;FAO=28;FDP=132;FR=.;FRO=104;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=83;FWDB=-0.0179435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.489;QD=1.13226;RBI=0.0187159;REFB=0.000885605;REVB=0.00532118;RO=100;SAF=9;SAR=21;SRF=20;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164745;STB=0.616863;TYPE=snp;VARB=-0.00204495;OID=.;OPOS=32547991;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:134:132:100:104:30:28:21:9:20:80:19:9:21:83 chr6 32548520 . C T 110.25 PASS AO=38;DP=104;FAO=37;FDP=103;FR=.;FRO=66;FSAF=10;FSAR=27;FSRF=40;FSRR=26;FWDB=0.0147144;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.882;QD=4.28165;RBI=0.0170027;REFB=0.000808372;REVB=-0.0085194;RO=66;SAF=11;SAR=27;SRF=40;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.353211;STB=0.717966;TYPE=snp;VARB=-0.00155134;OID=.;OPOS=32548520;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:103:66:66:38:37:27:11:40:26:27:10:40:26 chr6 32548632 . T A 94.05 PASS AO=45;DP=159;FAO=45;FDP=159;FR=.;FRO=114;FSAF=10;FSAR=35;FSRF=39;FSRR=75;FWDB=-0.0185891;FXX=0.0185174;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.422;QD=2.36592;RBI=0.022246;REFB=-0.00423955;REVB=-0.0122201;RO=110;SAF=10;SAR=35;SRF=38;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186485;STB=0.609184;TYPE=snp;VARB=0.0095626;OID=.;OPOS=32548632;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:159:159:110:114:45:45:35:10:38:72:35:10:39:75 chr6 32549401 . T C 59.26 PASS AO=35;DP=137;FAO=34;FDP=136;FR=.;FRO=102;FSAF=25;FSAR=9;FSRF=49;FSRR=53;FWDB=-0.0420678;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7039;QD=1.74304;RBI=0.0424441;REFB=-0.0074729;REVB=0.0056391;RO=101;SAF=26;SAR=9;SRF=48;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.343985;STB=0.699337;TYPE=snp;VARB=0.0210732;OID=.;OPOS=32549401;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:137:136:101:102:35:34:9:26:48:53:9:25:49:53 chr6 32549452 . C G 29.15 PASS AO=39;DP=207;FAO=36;FDP=203;FR=.;FRO=167;FSAF=28;FSAR=8;FSRF=95;FSRR=72;FWDB=-0.000529612;FXX=0.00490172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.476;QD=0.574431;RBI=0.0264344;REFB=-0.00414284;REVB=-0.0264291;RO=167;SAF=31;SAR=8;SRF=95;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.328239;STB=0.694672;TYPE=snp;VARB=0.0227582;OID=.;OPOS=32549452;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:207:203:167:167:39:36:8:31:95:72:8:28:95:72 chr6 32549464 . T C 80.08 PASS AO=53;DP=223;FAO=54;FDP=221;FR=.;FRO=167;FSAF=36;FSAR=18;FSRF=107;FSRR=60;FWDB=0.000163149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.3706;QD=1.44936;RBI=0.00616032;REFB=0.00435378;REVB=-0.00615815;RO=170;SAF=36;SAR=17;SRF=110;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0456071;STB=0.521731;TYPE=snp;VARB=-0.0073371;OID=.;OPOS=32549464;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:223:221:170:167:53:54:17:36:110:60:18:36:107:60 chr6 32549475 . T C 298.76 PASS AO=87;DP=222;FAO=92;FDP=228;FR=.;FRO=136;FSAF=64;FSAR=28;FSRF=83;FSRR=53;FWDB=0.0133378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.876;QD=5.24135;RBI=0.0219116;REFB=-0.0146594;REVB=-0.0173845;RO=124;SAF=60;SAR=27;SRF=74;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108252;STB=0.557406;TYPE=snp;VARB=0.0278454;OID=.;OPOS=32549475;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:228:124:136:87:92:27:60:74:50:28:64:83:53 chr6 32549481 . C T 17.15 PASS AO=37;DP=230;FAO=35;FDP=231;FR=.;FRO=196;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=119;FSRR=77;FWDB=-0.00678264;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.391;QD=0.296904;RBI=0.0162779;REFB=-0.00299137;REVB=-0.0147975;RO=193;SAF=26;SAR=11;SRF=116;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143051;STB=0.573091;TYPE=snp;VARB=0.0154915;OID=.;OPOS=32549481;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:230:231:193:196:37:35:11:26:116:77:11:24:119:77 chr6 32549497 . G A 20.39 PASS AO=40;DP=246;FAO=38;FDP=244;FR=.;FRO=206;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=126;FSRR=80;FWDB=-0.0118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.016;QD=0.334278;RBI=0.0126001;REFB=-0.00422653;REVB=-0.00441833;RO=201;SAF=27;SAR=13;SRF=124;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0816296;STB=0.542188;TYPE=snp;VARB=0.0274763;OID=.;OPOS=32549497;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:246:244:201:206:40:38:13:27:124:77:13:25:126:80 chr6 32549501 . A C 377.95 PASS AO=108;DP=247;FAO=105;FDP=243;FR=.;FRO=138;FSAF=65;FSAR=40;FSRF=85;FSRR=53;FWDB=-0.00137415;FXX=0.00816293;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.748;QD=6.22138;RBI=0.00196676;REFB=-0.00840021;REVB=0.00140707;RO=136;SAF=68;SAR=40;SRF=84;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0128455;STB=0.501868;TYPE=snp;VARB=0.0110287;OID=.;OPOS=32549501;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:247:243:136:138:108:105:40:68:84:52:40:65:85:53 chr6 32549548 . G A 41.49 PASS AO=58;DP=307;FAO=55;FDP=306;FR=.;FRO=251;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=133;FSRR=118;FWDB=-0.00991729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.638;QD=0.542314;RBI=0.0140056;REFB=-0.000901226;REVB=-0.00988953;RO=243;SAF=28;SAR=30;SRF=130;SRR=113;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.067391;STB=0.546764;TYPE=snp;VARB=0.00376531;OID=.;OPOS=32549548;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:307:306:243:251:58:55:30:28:130:113:29:26:133:118 chr6 32549557 . G C 39.94 PASS AO=57;DP=304;FAO=54;FDP=303;FR=.;FRO=249;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=133;FSRR=116;FWDB=-0.0169215;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.8;QD=0.527261;RBI=0.0169376;REFB=-0.00455456;REVB=0.000738075;RO=247;SAF=26;SAR=31;SRF=134;SRR=113;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111324;STB=0.573384;TYPE=snp;VARB=0.020565;OID=.;OPOS=32549557;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:304:303:247:249:57:54:31:26:134:113:30:24:133:116 chr6 32549589 . A C 104.82 PASS AO=68;DP=271;FAO=67;FDP=270;FR=.;FRO=203;FSAF=30;FSAR=37;FSRF=99;FSRR=104;FWDB=-0.000159236;FXX=0.00735267;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.436;QD=1.55284;RBI=0.0131159;REFB=-0.00745572;REVB=-0.013115;RO=202;SAF=31;SAR=37;SRF=100;SRR=102;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0492579;STB=0.530148;TYPE=snp;VARB=0.0254152;OID=.;OPOS=32549589;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:271:270:202:203:68:67:37:31:100:102:37:30:99:104 chr6 32549596 . T C 450.23 PASS AO=121;DP=261;FAO=117;FDP=255;FR=.;FRO=138;FSAF=45;FSAR=72;FSRF=70;FSRR=68;FWDB=-0.0495121;FXX=0.0077818;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.9297;QD=7.06246;RBI=0.0495341;REFB=-0.00426857;REVB=0.00147637;RO=137;SAF=48;SAR=73;SRF=70;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1118;STB=0.567889;TYPE=snp;VARB=0.00396194;OID=.;OPOS=32549596;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:261:255:137:138:121:117:73:48:70:67:72:45:70:68 chr6 32549607 . T G 98.56 PASS AO=64;DP=259;FAO=63;FDP=255;FR=.;FRO=192;FSAF=26;FSAR=37;FSRF=84;FSRR=108;FWDB=0.00457812;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.265;QD=1.54598;RBI=0.00848087;REFB=0.00235793;REVB=-0.00713904;RO=194;SAF=27;SAR=37;SRF=86;SRR=108;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0274516;STB=0.519127;TYPE=snp;VARB=-0.0102904;OID=.;OPOS=32549607;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:259:255:194:192:64:63:37:27:86:108:37:26:84:108 chr6 32549611 . T A 425.81 PASS AO=117;DP=254;FAO=113;FDP=251;FR=.;FRO=138;FSAF=39;FSAR=74;FSRF=68;FSRR=70;FWDB=0.00949604;FXX=0.0039681;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.097;QD=6.78581;RBI=0.00960897;REFB=0.00251151;REVB=-0.00146887;RO=137;SAF=42;SAR=75;SRF=68;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139012;STB=0.58503;TYPE=snp;VARB=-0.00367225;OID=.;OPOS=32549611;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:254:251:137:138:117:113:75:42:68:69:74:39:68:70 chr6 32551915 . A G 90.35 PASS AO=13;DP=19;FAO=13;FDP=18;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.00933514;FXX=0.0526039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.192;QD=20.0785;RBI=0.0142694;REFB=0.118227;REVB=0.0107922;RO=5;SAF=5;SAR=8;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0995427;STB=0.555473;TYPE=snp;VARB=-0.00341397;OID=.;OPOS=32551915;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:19:18:5:5:13:13:8:5:1:4:8:5:1:4 chr6 32551970 . T A 19.67 PASS AO=6;DP=26;FAO=6;FDP=22;FR=.;FRO=16;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.000278228;FXX=0.153787;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.847;QD=3.5764;RBI=0.0022415;REFB=-0.00802683;REVB=-0.00222416;RO=16;SAF=1;SAR=5;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.467764;STB=0.805374;TYPE=snp;VARB=0.0446718;OID=.;OPOS=32551970;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:26:22:16:16:6:6:5:1:9:7:5:1:9:7 chr6 32552029 . A T 266.84 PASS AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0127639;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.191;QD=38.1206;RBI=0.0155865;REFB=0;REVB=0.00894557;RO=0;SAF=14;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39874e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.66608e-05;OID=.;OPOS=32552029;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:27:28:0:0:27:28:13:14:0:0:13:15:0:0 chr6 32552059 . G T 18.53 PASS AO=7;DP=33;FAO=7;FDP=29;FR=.;FRO=22;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.00317627;FXX=0.121175;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.2338;QD=2.5563;RBI=0.044397;REFB=-0.0114182;REVB=0.0442832;RO=22;SAF=3;SAR=4;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0789762;STB=0.550878;TYPE=snp;VARB=0.0486047;OID=.;OPOS=32552059;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:33:29:22:22:7:7:4:3:8:14:4:3:8:14 chr6 32552060 . A T 15.4 PASS AO=7;DP=33;FAO=7;FDP=33;FR=.;FRO=26;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.00545392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.3059;QD=1.86704;RBI=0.00971699;REFB=-0.00820926;REVB=-0.00804206;RO=26;SAF=3;SAR=4;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0396396;STB=0.52624;TYPE=snp;VARB=0.0670605;OID=.;OPOS=32552060;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:33:33:26:26:7:7:4:3:12:14:4:3:12:14 chr6 32552067 . C T 11.61 PASS AO=6;DP=33;FAO=6;FDP=33;FR=.;FRO=27;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.0338185;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.6324;QD=1.40781;RBI=0.0581097;REFB=-0.0043373;REVB=0.0472551;RO=26;SAF=2;SAR=4;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1572;STB=0.624574;TYPE=snp;VARB=0.0180576;OID=.;OPOS=32552067;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:33:33:26:27:6:6:4:2:12:14:4:2:13:14 chr6 32552081 . A C 10.37 PASS AO=5;DP=28;FAO=5;FDP=28;FR=.;FRO=23;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.0182888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.1528;QD=1.48104;RBI=0.0296467;REFB=-0.0361825;REVB=0.0233334;RO=23;SAF=1;SAR=4;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.347454;STB=0.748931;TYPE=snp;VARB=0.0966981;OID=.;OPOS=32552081;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:28:28:23:23:5:5:4:1:11:12:4:1:11:12 chr6 32552087 . C G 10.37 PASS AO=5;DP=28;FAO=5;FDP=28;FR=.;FRO=23;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.027766;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.016;QD=1.4811;RBI=0.0284781;REFB=0.00665211;REVB=0.00632877;RO=23;SAF=1;SAR=4;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.347454;STB=0.748931;TYPE=snp;VARB=-0.0628825;OID=.;OPOS=32552087;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:28:28:23:23:5:5:4:1:11:12:4:1:11:12 chr6 32557435 . A C 125.83 PASS AO=13;DP=13;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0291319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9929;QD=35.9504;RBI=0.0549214;REFB=0;REVB=-0.0465585;RO=0;SAF=3;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00203201;OID=.;OPOS=32557435;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:14:0:0:13:14:10:3:0:0:11:3:0:0 chr6 32557483 . T C 11.11 PASS AO=4;DP=18;FAO=4;FDP=20;FR=.;FRO=16;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.185128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.038;QD=2.22204;RBI=0.186628;REFB=-0.0293295;REVB=-0.0236138;RO=14;SAF=1;SAR=3;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0559248;STB=0.562172;TYPE=snp;VARB=0.0749609;OID=.;OPOS=32557483;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:18:20:14:16:4:4:3:1:3:11:3:1:5:11 chr6 32605284 . G A 139.25 PASS AO=43;DP=115;FAO=43;FDP=112;FR=.;FRO=69;FSAF=12;FSAR=31;FSRF=15;FSRR=54;FWDB=0.0407232;FXX=0.0260847;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.921;QD=4.97314;RBI=0.0408965;REFB=-0.00584868;REVB=-0.00376137;RO=67;SAF=12;SAR=31;SRF=15;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.076817;STB=0.549251;TYPE=snp;VARB=0.0102315;OID=.;OPOS=32605284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:112:67:69:43:43:31:12:15:52:31:12:15:54 chr6 32605295 . C T 141.48 PASS AO=31;DP=117;FAO=47;FDP=123;FR=.;FRO=76;FSAF=14;FSAR=33;FSRF=17;FSRR=59;FWDB=0.126165;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=52.5235;QD=4.601;RBI=0.127237;REFB=-0.0589086;REVB=-0.0164819;RO=48;SAF=0;SAR=31;SRF=8;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.796777;STB=0.557311;TYPE=snp;VARB=0.0456417;OID=.;OPOS=32605295;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:123:48:76:31:47:31:0:8:40:33:14:17:59 chr6 32605309 . A G 240.44 PASS AO=63;DP=137;FAO=62;FDP=138;FR=.;FRO=76;FSAF=24;FSAR=38;FSRF=18;FSRR=58;FWDB=0.0125057;FXX=0.0142847;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.7742;QD=6.96916;RBI=0.0240685;REFB=0.00597849;REVB=-0.0205645;RO=73;SAF=24;SAR=39;SRF=18;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143712;STB=0.590742;TYPE=snp;VARB=-0.00820936;OID=.;OPOS=32605309;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:138:73:76:63:62:39:24:18:55:38:24:18:58 chr6 32606695 . T C 807.31 PASS AO=234;DP=482;FAO=196;FDP=400;FR=.;FRO=204;FSAF=110;FSAR=86;FSRF=109;FSRR=95;FWDB=0.0225033;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.236;QD=8.0731;RBI=0.023265;REFB=-0.0224132;REVB=0.00590453;RO=248;SAF=122;SAR=112;SRF=137;SRR=111;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0292239;STB=0.513885;TYPE=snp;VARB=0.0219969;OID=.;OPOS=32606695;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:482:400:248:204:234:196:112:122:137:111:86:110:109:95 chr6 32606701 . A G 3794.99 PASS AO=478;DP=481;FAO=396;FDP=396;FR=.;FRO=0;FSAF=208;FSAR=188;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0482328;FXX=0.00999975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.2329;QD=38.3332;RBI=0.0577906;REFB=0;REVB=-0.0318332;RO=1;SAF=249;SAR=229;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00191359;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.3363e-05;OID=.;OPOS=32606701;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:481:396:1:0:478:396:229:249:1:0:188:208:0:0 chr6 32609173 . C G 469.54 PASS AO=132;DP=299;FAO=131;FDP=300;FR=.;FRO=169;FSAF=75;FSAR=56;FSRF=105;FSRR=64;FWDB=0.0168531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.306;QD=6.26059;RBI=0.0222708;REFB=-0.00305339;REVB=-0.0145588;RO=164;SAF=76;SAR=56;SRF=100;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0350255;STB=0.528298;TYPE=snp;VARB=0.00334668;OID=.;OPOS=32609173;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:299:300:164:169:132:131:56:76:100:64:56:75:105:64 chr6 32609813 . T C 370.55 PASS AO=82;DP=157;FAO=82;FDP=157;FR=.;FRO=75;FSAF=51;FSAR=31;FSRF=62;FSRR=13;FWDB=-0.0099684;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=235.17;QD=9.44063;RBI=0.0103866;REFB=-0.000317593;REVB=0.00291758;RO=75;SAF=51;SAR=31;SRF=62;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201416;STB=0.609511;TYPE=snp;VARB=0.0002912;OID=.;OPOS=32609813;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:157:75:75:82:82:31:51:62:13:31:51:62:13 chr6 32610436 . T C 226.96 PASS AO=79;DP=216;FAO=78;FDP=215;FR=.;FRO=137;FSAF=37;FSAR=41;FSRF=61;FSRR=76;FWDB=0.0130519;FXX=0.0227262;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.667;QD=4.22248;RBI=0.0174156;REFB=-0.0213379;REVB=0.0115305;RO=132;SAF=38;SAR=41;SRF=59;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0377653;STB=0.518625;TYPE=snp;VARB=0.0152993;OID=.;OPOS=32610436;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:216:215:132:137:79:78:41:38:59:73:41:37:61:76 chr6 32610437 . G A 223.73 PASS AO=76;DP=217;FAO=78;FDP=214;FR=.;FRO=136;FSAF=37;FSAR=41;FSRF=60;FSRR=76;FWDB=0.0182182;FXX=0.0183478;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.637;QD=4.18195;RBI=0.0242521;REFB=-0.0316454;REVB=-0.0160082;RO=117;SAF=35;SAR=41;SRF=46;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0735628;STB=0.521184;TYPE=snp;VARB=0.0192751;OID=.;OPOS=32610437;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:217:214:117:136:76:78:41:35:46:71:41:37:60:76 chr6 32610461 . A G 264.55 PASS AO=81;DP=205;FAO=81;FDP=203;FR=.;FRO=122;FSAF=39;FSAR=42;FSRF=47;FSRR=75;FWDB=0.00235501;FXX=0.00975562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.711;QD=5.21279;RBI=0.0193333;REFB=-0.033156;REVB=-0.0191893;RO=122;SAF=39;SAR=42;SRF=47;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103697;STB=0.558151;TYPE=snp;VARB=0.0321876;OID=.;OPOS=32610461;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:203:122:122:81:81:42:39:47:75:42:39:47:75 chr6 32610704 . T C 79.56 PASS AO=39;DP=141;FAO=39;FDP=141;FR=.;FRO=102;FSAF=8;FSAR=31;FSRF=39;FSRR=63;FWDB=0.0207165;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.079;QD=2.25707;RBI=0.0237246;REFB=0.00596392;REVB=-0.0115623;RO=102;SAF=8;SAR=31;SRF=39;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.264861;STB=0.659484;TYPE=snp;VARB=-0.0134641;OID=.;OPOS=32610704;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:141:141:102:102:39:39:31:8:39:63:31:8:39:63 chr6 32610757 . A G 82.7 PASS AO=32;DP=101;FAO=32;FDP=101;FR=.;FRO=69;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=31;FSRR=38;FWDB=0.00717485;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.395;QD=3.2752;RBI=0.0205216;REFB=0.00391029;REVB=-0.0192265;RO=69;SAF=10;SAR=22;SRF=31;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171087;STB=0.600467;TYPE=snp;VARB=-0.0100957;OID=.;OPOS=32610757;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:101:101:69:69:32:32:22:10:31:38:22:10:31:38 chr6 32610769 . A C 103.2 PASS AO=36;DP=104;FAO=36;FDP=104;FR=.;FRO=68;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=34;FSRR=34;FWDB=-0.0208472;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.372;QD=3.96943;RBI=0.0222386;REFB=-0.0153166;REVB=-0.00774267;RO=68;SAF=14;SAR=22;SRF=34;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127919;STB=0.573871;TYPE=snp;VARB=0.0267081;OID=.;OPOS=32610769;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:68:68:36:36:22:14:34:34:22:14:34:34 chr6 32610948 . AG A 459.26 PASS AO=121;DP=359;FAO=148;FDP=371;FR=.;FRO=223;FSAF=59;FSAR=89;FSRF=93;FSRR=130;FWDB=0.00295572;FXX=0.0236836;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.606;QD=4.95153;RBI=0.0391631;REFB=-0.0140894;REVB=0.0390514;RO=221;SAF=52;SAR=69;SRF=95;SRR=126;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000130282;STB=0.511473;TYPE=del;VARB=0.0219145;OID=.;OPOS=32610949;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:121:358:148:371:223:59:89:93:130:99:221:52:69:95:126 chr6 32627988 . A G 147.36 PASS AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0483882;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.121;QD=36.839;RBI=0.0488347;REFB=0;REVB=-0.006589;RO=0;SAF=2;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000611692;OID=.;OPOS=32627988;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:16:0:0:16:16:14:2:0:0:14:2:0:0 chr6 32627991 . C T 127.13 PASS AO=15;DP=16;FAO=15;FDP=16;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0860635;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.1221;QD=31.7817;RBI=0.0952251;REFB=-0.033361;REVB=-0.0407541;RO=1;SAF=2;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0338159;STB=0.518494;TYPE=snp;VARB=0.0232811;OID=.;OPOS=32627991;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:16:16:1:1:15:15:13:2:0:1:13:2:0:1 chr6 32628001 . T C 254.91 PASS AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0570556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.24;QD=37.7637;RBI=0.0986414;REFB=0;REVB=0.0804661;RO=0;SAF=1;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000729769;OID=.;OPOS=32628001;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:27:27:0:0:27:27:26:1:0:0:26:1:0:0 chr6 32628045 . C G 177.41 PASS AO=42;DP=93;FAO=44;FDP=95;FR=.;FRO=51;FSAF=3;FSAR=41;FSRF=2;FSRR=49;FWDB=0.0219032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.634;QD=7.47002;RBI=0.0261007;REFB=-0.0142393;REVB=0.0141949;RO=51;SAF=3;SAR=39;SRF=2;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136183;STB=0.568394;TYPE=snp;VARB=0.0125816;OID=.;OPOS=32628045;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:95:51:51:42:44:39:3:2:49:41:3:2:49 chr6 32628057 . C T 231.23 PASS AO=50;DP=93;FAO=50;FDP=95;FR=.;FRO=45;FSAF=1;FSAR=49;FSRF=3;FSRR=42;FWDB=-0.0131445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.0454;QD=9.73601;RBI=0.0138078;REFB=-0.0206719;REVB=-0.00422833;RO=43;SAF=1;SAR=49;SRF=3;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.330685;STB=0.682829;TYPE=snp;VARB=0.0247817;OID=.;OPOS=32628057;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:95:43:45:50:50:49:1:3:40:49:1:3:42 chr6 32628058 . A T 226.54 PASS AO=49;DP=92;FAO=49;FDP=93;FR=.;FRO=44;FSAF=1;FSAR=48;FSRF=3;FSRR=41;FWDB=-0.0611242;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.1947;QD=9.7436;RBI=0.0611949;REFB=0.00471771;REVB=0.00293986;RO=34;SAF=1;SAR=48;SRF=3;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.369418;STB=0.683174;TYPE=snp;VARB=-0.00292854;OID=.;OPOS=32628058;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:93:34:44:49:49:48:1:3:31:48:1:3:41 chr6 32628660 . T C 272.46 PASS AO=66;DP=140;FAO=67;FDP=140;FR=.;FRO=73;FSAF=26;FSAR=41;FSRF=30;FSRR=43;FWDB=-0.0350093;FXX=0.0070917;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6419;QD=7.78442;RBI=0.0375258;REFB=-0.00838138;REVB=0.0135104;RO=74;SAF=26;SAR=40;SRF=31;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0247804;STB=0.512496;TYPE=snp;VARB=0.00789916;OID=.;OPOS=32628660;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:74:73:66:67:40:26:31:43:41:26:30:43 chr6 32629129 . T C 772.83 PASS AO=82;DP=82;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0271639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.116;QD=37.2449;RBI=0.0277444;REFB=0;REVB=0.00564566;RO=0;SAF=40;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000160814;OID=.;OPOS=32629129;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:82:83:0:0:82:83:42:40:0:0:42:41:0:0 chr6 32629155 . C A 738.46 PASS AO=79;DP=82;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0322489;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.2004;QD=35.1649;RBI=0.058164;REFB=-0.146982;REVB=0.0484051;RO=1;SAF=36;SAR=43;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108827;STB=0.505493;TYPE=snp;VARB=0.00483294;OID=.;OPOS=32629155;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:82:84:1:1:79:83:43:36:0:1:45:38:0:1 chr6 32629847 . A G 959.29 PASS AO=112;DP=119;FAO=111;FDP=119;FR=.;FRO=8;FSAF=82;FSAR=29;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0512367;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.0621;QD=32.2451;RBI=0.0512582;REFB=-0.0350744;REVB=-0.00148484;RO=7;SAF=83;SAR=29;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0443052;STB=0.520381;TYPE=snp;VARB=0.00883661;OID=.;OPOS=32629847;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:119:119:7:8:112:111:29:83:3:4:29:82:4:4 chr6 32629859 . A G 1147.71 PASS AO=120;DP=121;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0219524;FXX=0.0322555;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.552;QD=38.257;RBI=0.0242838;REFB=0;REVB=0.0103824;RO=0;SAF=85;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.53063e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000852543;OID=.;OPOS=32629859;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:121:120:0:0:120:120:35:85:0:0:35:85:0:0 chr6 32629867 . T TG 806.55 PASS AO=22;DP=125;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206924;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=52.3208;QD=26.2294;RBI=0.0264437;REFB=0;REVB=0.0164649;RO=102;SAF=9;SAR=13;SRF=77;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.431105;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.000337155;OID=.;OPOS=32629868;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:22:125:123:123:0:84:39:0:0:78:102:9:13:77:25 chr6 32629868 . A G 738.73 PASS AO=100;DP=122;FAO=101;FDP=123;FR=.;FRO=22;FSAF=75;FSAR=26;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.0180907;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.484;QD=24.0236;RBI=0.0203936;REFB=0.000746326;REVB=0.00941403;RO=22;SAF=75;SAR=25;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14197;STB=0.572504;TYPE=snp;VARB=-0.00133008;OID=.;OPOS=32629868;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:122:123:22:22:100:101:25:75:9:13:26:75:9:13 chr6 32629931 . C G 342.59 PASS AO=70;DP=125;FAO=70;FDP=125;FR=.;FRO=55;FSAF=36;FSAR=34;FSRF=20;FSRR=35;FWDB=0.00113569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.4656;QD=10.9628;RBI=0.017337;REFB=-0.0155701;REVB=-0.0172998;RO=55;SAF=36;SAR=34;SRF=20;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121095;STB=0.566071;TYPE=snp;VARB=0.0112116;OID=.;OPOS=32629931;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:55:55:70:70:34:36:20:35:34:36:20:35 chr6 32629936 . C T 981.81 PASS AO=116;DP=125;FAO=116;FDP=125;FR=.;FRO=9;FSAF=55;FSAR=61;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=0.103464;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.2355;QD=31.4179;RBI=0.103539;REFB=-0.0911818;REVB=0.00393852;RO=9;SAF=55;SAR=61;SRF=1;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0497857;STB=0.526275;TYPE=snp;VARB=0.0256268;OID=.;OPOS=32629936;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:125:125:9:9:116:116:61:55:1:8:61:55:1:8 chr6 32629963 . C T 1046.36 PASS AO=113;DP=116;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104879;FXX=0.0258598;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.9744;QD=37.0395;RBI=0.0290994;REFB=-0.0959864;REVB=-0.0271437;RO=1;SAF=44;SAR=69;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00683231;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000125131;OID=.;OPOS=32629963;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:116:113:1:0:113:113:69:44:0:1:69:44:0:0 chr6 32630027 . TG T,TA 759.79 PASS AO=16,65;DP=87;FAO=15,68;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=3,11;FSAR=12,57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0247193,-0.109223;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=81.3576,99.5338;QD=36.6164;RBI=0.0256416,0.110383;REFB=0,0;REVB=0.00681525,0.0159615;RO=0;SAF=3,9;SAR=13,56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.78418e-08,-5.13074e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0275747,-0.0116646;OID=.,.;OPOS=32630028,32630028;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=T,TA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:16,65:81:15,68:83:0:3,11:12,57:0:0:16:0:3,9:13,56:0:0 chr6 32632587 . A G 195.05 PASS AO=21;DP=21;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0487732;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.8777;QD=39.0096;RBI=0.0571923;REFB=0;REVB=-0.0298686;RO=0;SAF=14;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00282014;OID=.;OPOS=32632587;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:21:20:0:0:21:20:7:14:0:0:7:13:0:0 chr6 32632598 . A T 202.27 PASS AO=23;DP=24;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168897;FXX=0.0434594;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.258;QD=36.776;RBI=0.0199376;REFB=0;REVB=0.0105945;RO=0;SAF=15;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000190268;OID=.;OPOS=32632598;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:24:22:0:0:23:22:8:15:0:0:8:14:0:0 chr6 32632627 . C T 201.65 PASS AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0353183;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.02;QD=36.6635;RBI=0.059074;REFB=0;REVB=0.0473535;RO=0;SAF=9;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2029e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000564692;OID=.;OPOS=32632627;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:22:22:0:0:22:22:13:9:0:0:13:9:0:0 chr6 32632637 . T C 165.98 PASS AO=3;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.242478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.122;QD=36.8837;RBI=0.318784;REFB=0;REVB=0.206949;RO=0;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00528926;OID=.;OPOS=32632637;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:18:0:0:3:18:3:0:0:0:9:9:0:0 chr6 32632638 . C A,G 166.2 PASS AO=15,3;DP=18;FAO=15,3;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=9,0;FSAR=6,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0794936,0.0727123;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=70.728,29.5426;QD=36.9339;RBI=0.0989145,0.115084;REFB=0,0;REVB=0.0588629,0.0892028;RO=0;SAF=9,0;SAR=6,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=snp,snp;VARB=-0.0164009,0.0214949;OID=.,.;OPOS=32632638,32632638;OREF=C,C;OALT=A,G;OMAPALT=A,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:8:18:18:0:0:15,3:15,3:6,3:9,0:0:0:6,3:9,0:0:0 chr6 32632647 . T C 224.6 PASS AO=21;DP=26;FAO=25;FDP=25;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0444227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.493;QD=35.9357;RBI=0.0469809;REFB=0;REVB=0.0152913;RO=0;SAF=6;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00670254;OID=.;OPOS=32632647;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:25:25:0:0:21:25:15:6:0:0:16:9:0:0 chr6 32632687 . A G 281.44 PASS AO=31;DP=32;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0242556;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.5303;QD=37.5259;RBI=0.0297369;REFB=0;REVB=0.0172032;RO=0;SAF=3;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.7166e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000136437;OID=.;OPOS=32632687;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:32:30:0:0:31:30:28:3:0:0:27:3:0:0 chr6 32632714 . G C 306.11 PASS AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00384104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.679;QD=37.1047;RBI=0.00981138;REFB=0;REVB=0.00902826;RO=0;SAF=3;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.71483e-05;OID=.;OPOS=32632714;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:33:33:0:0:33:33:30:3:0:0:29:4:0:0 chr6 32632717 . G A 68.4 PASS AO=16;DP=34;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=15;FWDB=-0.0257035;FXX=0.0302939;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.352;QD=8.54999;RBI=0.0413255;REFB=-0.0112201;REVB=0.0323593;RO=15;SAF=2;SAR=14;SRF=2;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.015967;STB=0.518494;TYPE=snp;VARB=0.00874282;OID=.;OPOS=32632717;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:34:32:15:17:16:15:14:2:2:13:13:2:2:15 chr6 32632745 . G A 273.43 PASS AO=30;DP=32;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209076;FXX=0.0644953;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.869;QD=37.7145;RBI=0.0386527;REFB=0;REVB=0.0325101;RO=0;SAF=6;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000354662;OID=.;OPOS=32632745;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:32:29:0:0:30:29:24:6:0:0:23:6:0:0 chr6 32632770 . A G 223.49 PASS AO=25;DP=25;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0532496;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.2477;QD=37.2478;RBI=0.0536887;REFB=0;REVB=0.00685295;RO=0;SAF=4;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.661e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00196258;OID=.;OPOS=32632770;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:25:24:0:0:25:24:21:4:0:0:20:4:0:0 chr6 32632781 . A C 173.75 PASS AO=20;DP=21;FAO=19;FDP=20;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0711262;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.6862;QD=34.7504;RBI=0.0715188;REFB=-0.113303;REVB=-0.00748344;RO=1;SAF=1;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0236587;STB=0.513499;TYPE=snp;VARB=0.0335119;OID=.;OPOS=32632781;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:20:1:1:20:19:19:1:0:1:18:1:0:1 chr6 32632782 . G C 195.71 PASS AO=21;DP=21;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0306536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.593;QD=39.1419;RBI=0.0317393;REFB=0;REVB=0.0082305;RO=0;SAF=1;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.78928e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00028889;OID=.;OPOS=32632782;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:21:20:0:0:21:20:20:1:0:0:19:1:0:0 chr6 32632818 . T G 86.76 PASS AO=10;DP=10;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.448;QD=38.5592;RBI=0.0252974;REFB=0;REVB=0.0252974;RO=0;SAF=0;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0006107;OID=.;OPOS=32632818;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:9:0:0:10:9:10:0:0:0:9:0:0:0 chr6 32634302 . A G 237.12 PASS AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.225716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.1555;QD=28.7414;RBI=0.266703;REFB=0;REVB=0.142066;RO=0;SAF=18;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.64315e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0411748;OID=.;OPOS=32634302;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:34:33:0:0:33:33:15:18:0:0:15:18:0:0 chr6 32634313 . C G 339.21 PASS AO=37;DP=37;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.839;QD=37.6899;RBI=0.0204496;REFB=0;REVB=0.014324;RO=0;SAF=20;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71161e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000213631;OID=.;OPOS=32634313;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:37:36:0:0:37:36:17:20:0:0:16:20:0:0 chr6 32634369 . C A 497.85 PASS AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0030763;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.35;QD=37.5734;RBI=0.0150713;REFB=0;REVB=0.014754;RO=0;SAF=25;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.43226e-05;OID=.;OPOS=32634369;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:53:53:0:0:53:53:28:25:0:0:28:25:0:0 chr6 32634387 . C T 497.84 PASS AO=54;DP=54;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00819413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.131;QD=37.5732;RBI=0.0404385;REFB=0;REVB=0.0395996;RO=0;SAF=25;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000240547;OID=.;OPOS=32634387;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:54:53:0:0:54:53:29:25:0:0:28:25:0:0 chr6 32636040 . T C 1065.14 PASS AO=111;DP=111;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0149176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4639;QD=38.0408;RBI=0.0757043;REFB=0;REVB=0.07422;RO=0;SAF=75;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.88442e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000333481;OID=.;OPOS=32636040;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:111:112:0:0:111:112:36:75:0:0:37:75:0:0 chr6 32636073 . A G 1583.63 PASS AO=166;DP=168;FAO=167;FDP=167;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210685;FXX=0.00595203;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.5002;QD=37.9314;RBI=0.105288;REFB=-0.0231744;REVB=0.103159;RO=2;SAF=91;SAR=75;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125196;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000698081;OID=.;OPOS=32636073;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:168:167:2:0:166:167:75:91:0:2:76:91:0:0 chr6 32636093 . G A 421.42 PASS AO=106;DP=225;FAO=106;FDP=225;FR=.;FRO=119;FSAF=48;FSAR=58;FSRF=66;FSRR=53;FWDB=-0.0218324;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=268.002;QD=7.49199;RBI=0.0253697;REFB=-0.0133096;REVB=-0.0129217;RO=119;SAF=48;SAR=58;SRF=66;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0974013;STB=0.553759;TYPE=snp;VARB=0.0185463;OID=.;OPOS=32636093;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:225:225:119:119:106:106:58:48:66:53:58:48:66:53 chr6 32636364 . G A 351.7 PASS AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0500443;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.3685;QD=36.0714;RBI=0.073288;REFB=0.0198071;REVB=0.0535416;RO=1;SAF=7;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0148799;STB=0.507932;TYPE=snp;VARB=-0.000493179;OID=.;OPOS=32636364;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:39:39:1:1:38:38:31:7:0:1:31:7:0:1 chr6 32636379 . C G 56.86 PASS AO=15;DP=39;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=21;FWDB=-0.00446374;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.9946;QD=5.98505;RBI=0.0595451;REFB=-0.0313723;REVB=0.0593776;RO=23;SAF=4;SAR=11;SRF=2;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.282556;STB=0.659627;TYPE=snp;VARB=0.0802584;OID=.;OPOS=32636379;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:39:38:23:23:15:15:11:4:2:21:11:4:2:21 chr6 32636385 . A T 297.32 PASS AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0797672;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.7383;QD=37.1645;RBI=0.0814073;REFB=0;REVB=-0.0162586;RO=0;SAF=6;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000644828;OID=.;OPOS=32636385;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:33:32:0:0:32:32:26:6:0:0:26:6:0:0 chr6 32636433 . A G 273.29 PASS AO=32;DP=34;FAO=32;FDP=34;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00185041;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=199.891;QD=32.1517;RBI=0.0105181;REFB=-0.129874;REVB=0.010354;RO=2;SAF=10;SAR=22;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0405767;STB=0.521726;TYPE=snp;VARB=0.000823262;OID=.;OPOS=32636433;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:34:34:2:2:32:32:22:10:0:2:22:10:0:2 chr6 32709309 . A G 295.21 PASS AO=76;DP=166;FAO=76;FDP=166;FR=.;FRO=90;FSAF=45;FSAR=31;FSRF=25;FSRR=65;FWDB=0.00461847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.656;QD=7.1136;RBI=0.0242881;REFB=-0.0133494;REVB=-0.023845;RO=89;SAF=45;SAR=31;SRF=25;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.295836;STB=0.665598;TYPE=snp;VARB=0.015752;OID=.;OPOS=32709309;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:166:89:90:76:76:31:45:25:64:31:45:25:65 chr6 32726838 . C T 690.28 PASS AO=155;DP=297;FAO=155;FDP=297;FR=.;FRO=142;FSAF=68;FSAR=87;FSRF=63;FSRR=79;FWDB=-0.0444739;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.693;QD=9.29666;RBI=0.052777;REFB=-0.00609089;REVB=0.0284162;RO=141;SAF=68;SAR=87;SRF=63;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00716542;STB=0.502402;TYPE=snp;VARB=0.00519763;OID=.;OPOS=32726838;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:297:297:141:142:155:155:87:68:63:78:87:68:63:79 chr6 32796653 . C A 65.81 PASS AO=19;DP=54;FAO=20;FDP=55;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=27;FSRR=8;FWDB=-0.0178504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.066;QD=4.78651;RBI=0.0366373;REFB=-0.0103192;REVB=0.0319946;RO=34;SAF=15;SAR=4;SRF=26;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0396468;STB=0.5185;TYPE=snp;VARB=0.015103;OID=.;OPOS=32796653;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:54:55:34:35:19:20:4:15:26:8:5:15:27:8 chr6 32796685 . A G 94.11 PASS AO=27;DP=70;FAO=27;FDP=69;FR=.;FRO=42;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=31;FSRR=11;FWDB=-0.0363215;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.885;QD=5.45567;RBI=0.0460003;REFB=-0.0106472;REVB=-0.0282272;RO=42;SAF=20;SAR=7;SRF=31;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00365016;STB=0.502091;TYPE=snp;VARB=0.0105536;OID=.;OPOS=32796685;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:70:69:42:42:27:27:7:20:31:11:7:20:31:11 chr6 32796751 . T C 219.48 PASS AO=61;DP=149;FAO=63;FDP=152;FR=.;FRO=89;FSAF=18;FSAR=45;FSRF=29;FSRR=60;FWDB=-0.0407292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.9072;QD=5.77584;RBI=0.040764;REFB=-0.0284493;REVB=0.00168283;RO=85;SAF=18;SAR=43;SRF=29;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0558669;STB=0.528081;TYPE=snp;VARB=0.0417778;OID=.;OPOS=32796751;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:152:85:89:61:63:43:18:29:56:45:18:29:60 chr6 32796793 . G A 418.91 PASS AO=88;DP=160;FAO=88;FDP=161;FR=.;FRO=73;FSAF=26;FSAR=62;FSRF=23;FSRR=50;FWDB=-0.00919106;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=181.638;QD=10.4077;RBI=0.00923379;REFB=6.71121e-05;REVB=0.000887262;RO=72;SAF=26;SAR=62;SRF=23;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0234785;STB=0.510586;TYPE=snp;VARB=-6.74695e-05;OID=.;OPOS=32796793;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:161:72:73:88:88:62:26:23:49:62:26:23:50 chr6 32797297 . T C 106.51 PASS AO=23;DP=42;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=18;FWDB=-0.0146813;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.6279;QD=10.1439;RBI=0.142817;REFB=-0.000933186;REVB=-0.14206;RO=18;SAF=12;SAR=11;SRF=2;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.322607;STB=0.722046;TYPE=snp;VARB=-0.00364914;OID=.;OPOS=32797297;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:42:42:18:20:23:22:11:12:2:16:9:13:2:18 chr6 32798548 . G A 311.82 PASS AO=85;DP=194;FAO=85;FDP=194;FR=.;FRO=109;FSAF=39;FSAR=46;FSRF=31;FSRR=78;FWDB=-0.00928961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.086;QD=6.42922;RBI=0.00953075;REFB=-0.00370247;REVB=0.0021303;RO=107;SAF=39;SAR=46;SRF=30;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18412;STB=0.600276;TYPE=snp;VARB=0.00362518;OID=.;OPOS=32798548;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:194:107:109:85:85:46:39:30:77:46:39:31:78 chr6 32811629 . G T 47.22 PASS AO=10;DP=32;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.140094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.6558;QD=5.3968;RBI=0.144729;REFB=0.00178231;REVB=-0.0363328;RO=21;SAF=6;SAR=4;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0221961;STB=0.539937;TYPE=snp;VARB=-0.00145435;OID=.;OPOS=32811629;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:32:35:21:22:10:13:4:6:13:8:4:9:14:8 chr6 32821447 . C T 71.87 PASS AO=12;DP=20;FAO=12;FDP=20;FR=.;FRO=8;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0105552;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.8;QD=14.3737;RBI=0.0124216;REFB=-0.0311099;REVB=-0.00654864;RO=8;SAF=9;SAR=3;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.367814;STB=0.71016;TYPE=snp;VARB=0.012417;OID=.;OPOS=32821447;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:20:20:8:8:12:12:3:9:2:6:3:9:2:6 chr6 32904981 . G A 3394.2 PASS AO=396;DP=397;FAO=350;FDP=350;FR=.;FRO=0;FSAF=137;FSAR=213;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0264863;FXX=0.1206;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.261;QD=38.7908;RBI=0.026911;REFB=0;REVB=0.0047625;RO=1;SAF=183;SAR=213;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00260085;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00153094;OID=.;OPOS=32904981;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:397:350:1:0:396:350:213:183:1:0:213:137:0:0 chr6 32939894 . G T 38.64 PASS AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=6.19833e-06;FXX=0.221976;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.54;QD=22.0799;RBI=0.0301463;REFB=0.171547;REVB=-0.0301463;RO=2;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00387203;OID=.;OPOS=32939894;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:9:7:2:2:5:5:5:0:0:2:5:0:0:2 chr6 32939895 . C A 10.22 PASS AO=2;DP=9;FAO=2;FDP=9;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0.122455;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.211;QD=4.54071;RBI=0.122513;REFB=-0.000998082;REVB=0.00377763;RO=7;SAF=1;SAR=1;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.639247;STB=0.887323;TYPE=snp;VARB=0.0636569;OID=.;OPOS=32939895;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:7:7:2:2:1:1:0:7:1:1:0:7 chr6 32942302 . G A 223.02 PASS AO=40;DP=93;FAO=54;FDP=108;FR=.;FRO=54;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=29;FSRR=25;FWDB=0.020786;FXX=0.0270246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.444;QD=8.25985;RBI=0.0247458;REFB=-0.0127153;REVB=0.0134276;RO=52;SAF=19;SAR=21;SRF=28;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0637208;STB=0.509352;TYPE=snp;VARB=0.0141843;OID=.;OPOS=32942302;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:108:52:54:40:54:21:19:28:24:24:30:29:25 chr6 32942354 . G T 254.67 PASS AO=54;DP=101;FAO=55;FDP=102;FR=.;FRO=47;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=0.00289823;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.721;QD=9.98711;RBI=0.0067007;REFB=-0.0228685;REVB=-0.00604149;RO=47;SAF=26;SAR=28;SRF=27;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0785575;STB=0.528668;TYPE=snp;VARB=0.00604262;OID=.;OPOS=32942354;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:102:47:47:54:55:28:26:27:20:28:27:26:21 chr6 32944128 . C T 195.64 PASS AO=54;DP=127;FAO=54;FDP=127;FR=.;FRO=73;FSAF=19;FSAR=35;FSRF=28;FSRR=45;FWDB=-0.00952252;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.2547;QD=6.16194;RBI=0.0113111;REFB=-0.0171083;REVB=-0.0061043;RO=73;SAF=19;SAR=35;SRF=28;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0351611;STB=0.51974;TYPE=snp;VARB=0.0272099;OID=.;OPOS=32944128;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:73:73:54:54:35:19:28:45:35:19:28:45 chr6 32944575 . T C 368.37 PASS AO=83;DP=161;FAO=83;FDP=162;FR=.;FRO=79;FSAF=17;FSAR=66;FSRF=26;FSRR=53;FWDB=0.00487093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.311;QD=9.09548;RBI=0.0057558;REFB=-0.00531871;REVB=-0.00306648;RO=75;SAF=17;SAR=66;SRF=25;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152751;STB=0.583809;TYPE=snp;VARB=0.00627063;OID=.;OPOS=32944575;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:162:75:79:83:83:66:17:25:50:66:17:26:53 chr6 32946133 . T C 407.78 PASS AO=103;DP=217;FAO=102;FDP=216;FR=.;FRO=114;FSAF=48;FSAR=54;FSRF=49;FSRR=65;FWDB=-0.00913153;FXX=0.00460808;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.304;QD=7.55148;RBI=0.0393862;REFB=-0.00466967;REVB=0.038313;RO=114;SAF=49;SAR=54;SRF=49;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0439237;STB=0.52164;TYPE=snp;VARB=0.00496102;OID=.;OPOS=32946133;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:217:216:114:114:103:102:54:49:49:65:54:48:49:65 chr6 32948577 . G C 44.74 PASS AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0371167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.729;QD=7.78051;RBI=0.048044;REFB=-0.0239155;REVB=0.0305054;RO=10;SAF=5;SAR=5;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.26049;STB=0.565089;TYPE=snp;VARB=0.0273879;OID=.;OPOS=32948577;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:23:23:10:13:10:10:5:5:8:2:5:5:8:5 chr6 32948607 . C CT,T 340.3 PASS AO=4,13;DP=37;FAO=1,35;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=0,16;FSAR=1,19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00784226,0.00967926;FXX=0.199956;HRUN=0,9;LEN=1,1;MLLD=185.713,194.608;QD=37.8107;RBI=0.0149533,0.0157394;REFB=0,0;REVB=-0.0127318,-0.0124113;RO=0;SAF=4,6;SAR=0,7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=ins,snp;VARB=-0.0163751,-0.000434905;OID=.,.;OPOS=32948608,32948607;OREF=-,C;OALT=T,T;OMAPALT=CT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:3:20:36:0:0:4,13:1,35:0,7:4,6:0:0:1,19:0,16:0:0 chr6 32948804 . C T 1158.34 PASS AO=120;DP=120;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0275114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.7934;QD=38.6114;RBI=0.0319446;REFB=0;REVB=-0.0162352;RO=0;SAF=48;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.61151e-05;OID=.;OPOS=32948804;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:120:120:0:0:120:120:72:48:0:0:72:48:0:0 chr6 32974934 . G A 76.61 PASS AO=24;DP=66;FAO=24;FDP=66;FR=.;FRO=42;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=-0.0144472;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.6049;QD=4.64301;RBI=0.0290696;REFB=-0.0129082;REVB=0.0252254;RO=37;SAF=17;SAR=7;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.274667;STB=0.641386;TYPE=snp;VARB=0.0183537;OID=.;OPOS=32974934;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:66:66:37:42:24:24:7:17:17:20:7:17:21:21 chr6 32975014 . T C 72.72 PASS AO=25;DP=77;FAO=25;FDP=74;FR=.;FRO=49;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=28;FSRR=21;FWDB=-0.0345952;FXX=0.038956;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.2915;QD=3.93083;RBI=0.0430911;REFB=-0.0139759;REVB=-0.0256907;RO=47;SAF=15;SAR=10;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0539742;STB=0.519537;TYPE=snp;VARB=0.0342783;OID=.;OPOS=32975014;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:77:74:47:49:25:25:10:15:26:21:10:15:28:21 chr6 32975257 . C T 303.27 PASS AO=71;DP=152;FAO=75;FDP=159;FR=.;FRO=84;FSAF=25;FSAR=50;FSRF=42;FSRR=42;FWDB=0.00810715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.4277;QD=7.62935;RBI=0.010039;REFB=-0.0275095;REVB=-0.00592076;RO=80;SAF=25;SAR=46;SRF=42;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170649;STB=0.592895;TYPE=snp;VARB=0.027109;OID=.;OPOS=32975257;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:159:80:84:71:75:46:25:42:38:50:25:42:42 chr6 32975869 . GC G,AC 121.25 PASS AO=16,10;DP=52;FAO=17,19;FDP=50;FR=.;FRO=14;FSAF=17,9;FSAR=0,10;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0981799,0.0144045;FXX=0.0908926;HRUN=3,1;LEN=1,1;MLLD=11.6519,100.386;QD=9.70007;RBI=0.109846,0.074696;REFB=-0.180848,-0.0776428;REVB=-0.0492633,0.0732939;RO=11;SAF=16,0;SAR=0,10;SRF=3;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.850288,-0.772766;STB=0.999164,0.549788;TYPE=del,snp;VARB=0.129095,0.11766;OID=.,.;OPOS=32975870,32975869;OREF=C,G;OALT=-,A;OMAPALT=G,AC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:52:41:50:11:14:16,10:17,19:0,10:16,0:3:8:0,10:17,9:5:9 chr6 33048542 . C T 1130.97 PASS AO=119;DP=122;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00227317;FXX=0.0162588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.3638;QD=37.3873;RBI=0.00803446;REFB=-0.0913455;REVB=0.00770618;RO=2;SAF=40;SAR=79;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00575106;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00042602;OID=.;OPOS=33048542;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:122:121:2:0:119:121:79:40:1:1:80:41:0:0 chr6 33048599 . C A 664.6 PASS AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0410508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.99;QD=36.4164;RBI=0.0689498;REFB=0.00769885;REVB=0.0553977;RO=1;SAF=27;SAR=45;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171927;STB=0.509088;TYPE=snp;VARB=0.000160452;OID=.;OPOS=33048599;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:73:73:1:1:72:72:45:27:1:0:45:27:1:0 chr6 33048602 . C A 613.65 PASS AO=68;DP=73;FAO=68;FDP=70;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0550297;FXX=0.0410903;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.4713;QD=35.0659;RBI=0.0670823;REFB=-0.107401;REVB=0.0383636;RO=2;SAF=27;SAR=41;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00579477;STB=0.503067;TYPE=snp;VARB=0.00955473;OID=.;OPOS=33048602;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:73:70:2:2:68:68:41:27:1:1:41:27:1:1 chr6 33048640 . A G 137.1 PASS AO=30;DP=60;FAO=30;FDP=60;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=0.00840314;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1806;QD=9.13975;RBI=0.0343767;REFB=0.0490499;REVB=-0.0333338;RO=30;SAF=13;SAR=17;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0925813;STB=0.551572;TYPE=snp;VARB=-0.0602894;OID=.;OPOS=33048640;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:30:30:30:30:17:13:10:20:17:13:10:20 chr6 33052981 . C A 293.12 PASS AO=64;DP=125;FAO=66;FDP=130;FR=.;FRO=64;FSAF=21;FSAR=45;FSRF=19;FSRR=45;FWDB=-0.0297764;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.82;QD=9.01902;RBI=0.030794;REFB=-0.0173987;REVB=-0.00785104;RO=61;SAF=21;SAR=43;SRF=19;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0168463;STB=0.512191;TYPE=snp;VARB=0.0185332;OID=.;OPOS=33052981;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:130:61:64:64:66:43:21:19:42:45:21:19:45 chr6 33086249 . C T 509.94 PASS AO=97;DP=270;FAO=137;FDP=307;FR=.;FRO=170;FSAF=72;FSAR=65;FSRF=100;FSRR=70;FWDB=-0.0134662;FXX=0.0128613;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.245;QD=6.64415;RBI=0.0136923;REFB=-0.00743593;REVB=0.0024782;RO=118;SAF=60;SAR=37;SRF=80;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0634649;STB=0.534923;TYPE=snp;VARB=0.00974659;OID=.;OPOS=33086249;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:270:307:118:170:97:137:37:60:80:38:65:72:100:70 chr6 33138677 . G A 60.4 PASS AO=12;DP=32;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0210478;FXX=0.218682;HRUN=3;LEN=1;MLLD=138.084;QD=9.66449;RBI=0.0306628;REFB=0.000922163;REVB=-0.0222979;RO=8;SAF=4;SAR=8;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.370104;STB=0.638489;TYPE=snp;VARB=-0.00517564;OID=.;OPOS=33138677;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:28:25:8:12:12:13:8:4:7:1:9:4:7:5 chr6 33138955 . G A 794.18 PASS AO=86;DP=86;FAO=85;FDP=86;FR=.;FRO=1;FSAF=83;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0289312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.134;QD=36.9384;RBI=0.0570145;REFB=0.0536787;REVB=0.0491288;RO=0;SAF=84;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.8794e-08;STB=0.502993;TYPE=snp;VARB=8.96931e-05;OID=.;OPOS=33138955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:86:86:0:1:86:85:2:84:0:0:2:83:1:0 chr6 33139328 . C T 23.05 PASS AO=10;DP=51;FAO=12;FDP=53;FR=.;FRO=41;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=27;FWDB=-0.00440029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.505;QD=1.73984;RBI=0.0129651;REFB=-0.00533124;REVB=-0.0121955;RO=38;SAF=4;SAR=6;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0406768;STB=0.50703;TYPE=snp;VARB=0.0377516;OID=.;OPOS=33139328;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:51:53:38:41:10:12:6:4:14:24:8:4:14:27 chr6 33141161 . A G 342.83 PASS AO=35;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288957;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.435;QD=37.0627;RBI=0.035822;REFB=0;REVB=0.021172;RO=0;SAF=7;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000442896;OID=.;OPOS=33141161;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:36:37:0:0:35:37:28:7:0:0:28:9:0:0 chr6 33141475 . C T 327.58 PASS AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0468078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.5361;QD=37.4374;RBI=0.0832138;REFB=0;REVB=0.0688009;RO=0;SAF=22;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.39865e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00020613;OID=.;OPOS=33141475;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:35:35:0:0:35:35:13:22:0:0:13:22:0:0 chr6 33141920 . G C 482.58 PASS AO=45;DP=45;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.070079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.599;QD=38.6065;RBI=0.0751303;REFB=0;REVB=0.0270831;RO=0;SAF=5;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000131436;OID=.;OPOS=33141920;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:45:50:0:0:45:50:40:5:0:0:41:9:0:0 chr6 33141992 . AC A 227.74 PASS AO=28;DP=43;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0381212;FXX=0.0238039;HRUN=4;LEN=1;MLLD=12.3951;QD=22.2186;RBI=0.255807;REFB=-0.00845622;REVB=0.252951;RO=9;SAF=8;SAR=20;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0.383721;SSSB=0.0353949;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0152638;OID=.;OPOS=33141993;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:28:42:41:41:0:12:29:0:0:18:9:8:20:2:7 chr6 33144243 . T A 168.83 PASS AO=56;DP=153;FAO=56;FDP=154;FR=.;FRO=98;FSAF=11;FSAR=45;FSRF=38;FSRR=60;FWDB=-0.0273254;FXX=0.0374977;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.5275;QD=4.38527;RBI=0.0446903;REFB=-0.0253499;REVB=-0.0353631;RO=93;SAF=11;SAR=45;SRF=37;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.278629;STB=0.656188;TYPE=snp;VARB=0.0536993;OID=.;OPOS=33144243;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:154:93:98:56:56:45:11:37:56:45:11:38:60 chr6 33152835 . A T 52.65 PASS AO=9;DP=18;FAO=10;FDP=20;FR=.,HEALED;FRO=10;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.0496041;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7752;QD=10.5293;RBI=0.0538263;REFB=-0.0157544;REVB=0.0208976;RO=6;SAF=1;SAR=8;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.504538;STB=0.79339;TYPE=snp;VARB=0.0306405;OID=.;OPOS=33152835;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:20:20:6:10:9:10:8:1:4:2:9:1:5:5 chr6 33153528 . C T 185.36 PASS AO=43;DP=81;FAO=41;FDP=81;FR=.;FRO=40;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=0.0108797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.7462;QD=9.15348;RBI=0.0151364;REFB=-0.00164435;REVB=-0.0105235;RO=37;SAF=25;SAR=18;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125353;STB=0.542629;TYPE=snp;VARB=0.00605623;OID=.;OPOS=33153528;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:37:40:43:41:18:25:16:21:18:23:19:21 chr6 33163451 . G A 1062.02 PASS AO=105;DP=105;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.041973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.368;QD=37.9293;RBI=0.0647915;REFB=0;REVB=0.0493579;RO=0;SAF=53;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.20551e-05;OID=.;OPOS=33163451;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:105:112:0:0:105:112:52:53:0:0:52:60:0:0 chr6 33164129 . AG A 75.07 PASS AO=45;DP=176;FAO=61;FDP=154;FR=.;FRO=93;FSAF=49;FSAR=12;FSRF=68;FSRR=25;FWDB=0.0443372;FXX=0.0128197;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.3772;QD=1.94993;RBI=0.174916;REFB=-0.0913045;REVB=-0.169203;RO=72;SAF=37;SAR=8;SRF=53;SRR=19;SSEN=0.354839;SSEP=0;SSSB=0.141358;STB=0.563546;TYPE=del;VARB=0.121456;OID=.;OPOS=33164130;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:45:141:61:154:93:49:12:68:25:75:72:37:8:53:19 chr6 33169839 . C A 296.96 PASS AO=91;DP=227;FAO=91;FDP=228;FR=.;FRO=137;FSAF=43;FSAR=48;FSRF=71;FSRR=66;FWDB=-0.00708298;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=164.624;QD=5.20981;RBI=0.00774933;REFB=0.00555106;REVB=0.00314382;RO=120;SAF=43;SAR=48;SRF=65;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0704905;STB=0.527466;TYPE=snp;VARB=-0.00671179;OID=.;OPOS=33169839;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:227:228:120:137:91:91:48:43:65:55:48:43:71:66 chr6 33239905 . A G 76.51 PASS AO=20;DP=62;FAO=24;FDP=65;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=5;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=0.00112243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.221;QD=4.70855;RBI=0.00937575;REFB=-0.0112152;REVB=0.00930832;RO=41;SAF=18;SAR=2;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.553451;STB=0.703518;TYPE=snp;VARB=0.0261661;OID=.;OPOS=33239905;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:62:65:41:41:20:24:2:18:21:20:5:19:21:20 chr6 33240506 . A G 264.21 PASS AO=67;DP=145;FAO=67;FDP=145;FR=.;FRO=78;FSAF=25;FSAR=42;FSRF=29;FSRR=49;FWDB=-0.0249811;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.831;QD=7.28842;RBI=0.0274148;REFB=-0.0159959;REVB=-0.0112922;RO=78;SAF=25;SAR=42;SRF=29;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00138748;STB=0.50077;TYPE=snp;VARB=0.0229511;OID=.;OPOS=33240506;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:78:78:67:67:42:25:29:49:42:25:29:49 chr6 33246518 . G A 33.34 PASS AO=6;DP=13;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0282017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.672;QD=8.89112;RBI=0.0300819;REFB=-0.00987369;REVB=0.0104684;RO=7;SAF=1;SAR=5;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.303121;STB=0.749165;TYPE=snp;VARB=0.0173701;OID=.;OPOS=33246518;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:13:15:7:8:6:7:5:1:3:4:6:1:4:4 chr6 33247072 . AG A 223.03 PASS AO=21;DP=29;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.207767;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=17.2316;QD=28.7774;RBI=0.380305;REFB=0;REVB=-0.318536;RO=3;SAF=13;SAR=8;SRF=3;SRR=0;SSEN=0.610084;SSEP=0;SSSB=-0.0953017;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.00564328;OID=.;OPOS=33247073;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:21:29:31:31:0:17:14:0:0:21:3:13:8:3:0 chr6 33254665 . A G 138.76 PASS AO=32;DP=69;FAO=33;FDP=69;FR=.;FRO=36;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=-0.0196076;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.243;QD=8.04409;RBI=0.0289361;REFB=-0.0244119;REVB=-0.02128;RO=36;SAF=20;SAR=12;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197963;STB=0.615929;TYPE=snp;VARB=0.0226527;OID=.;OPOS=33254665;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:36:36:32:33:12:20:15:21:12:21:15:21 chr6 33256397 . G A 173.02 PASS AO=40;DP=82;FAO=40;FDP=82;FR=.;FRO=42;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=-0.0148112;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=255.919;QD=8.44015;RBI=0.0148505;REFB=0.00601097;REVB=-0.00108017;RO=41;SAF=18;SAR=22;SRF=16;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0553308;STB=0.523503;TYPE=snp;VARB=-0.00706451;OID=.;OPOS=33256397;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:41:42:40:40:22:18:16:25:22:18:17:25 chr6 33256471 . T C 317.02 PASS AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00881454;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.171;QD=37.2963;RBI=0.0123666;REFB=0;REVB=0.00867395;RO=0;SAF=17;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.68557e-05;OID=.;OPOS=33256471;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:34:0:0:34:34:17:17:0:0:17:17:0:0 chr6 33256653 . G A 151.25 PASS AO=40;DP=108;FAO=45;FDP=113;FR=.;FRO=68;FSAF=32;FSAR=13;FSRF=45;FSRR=23;FWDB=-0.011373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.4;QD=5.35405;RBI=0.0287415;REFB=-0.0190276;REVB=0.0263957;RO=66;SAF=31;SAR=9;SRF=45;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132527;STB=0.535051;TYPE=snp;VARB=0.0269654;OID=.;OPOS=33256653;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:113:66:68:40:45:9:31:45:21:13:32:45:23 chr6 33272855 . G C 1006.05 PASS AO=109;DP=111;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0069418;FXX=0.0180164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.223;QD=36.9192;RBI=0.0193478;REFB=-0.128631;REVB=0.0180596;RO=2;SAF=35;SAR=74;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00699677;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.3871e-05;OID=.;OPOS=33272855;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:111:109:2:0:109:109:74:35:1:1:74:35:0:0 chr6 33281842 . G T 93.72 PASS AO=17;DP=27;FAO=17;FDP=27;FR=.;FRO=10;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0324943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.09;QD=13.8842;RBI=0.090617;REFB=-0.0640649;REVB=0.0845905;RO=10;SAF=9;SAR=8;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151346;STB=0.584318;TYPE=snp;VARB=0.0250016;OID=.;OPOS=33281842;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:27:27:10:10:17:17:8:9:3:7:8:9:3:7 chr6 33281843 . A T 86.47 PASS AO=16;DP=28;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=-0.00674537;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0706;QD=12.3526;RBI=0.0423342;REFB=-0.0336808;REVB=0.0417934;RO=12;SAF=8;SAR=8;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126935;STB=0.571341;TYPE=snp;VARB=0.049674;OID=.;OPOS=33281843;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:28:28:12:12:16:16:8:8:4:8:8:8:4:8 chr6 33283766 . T C 1248.36 PASS AO=134;DP=136;FAO=134;FDP=136;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=91;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0196947;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.071;QD=36.7165;RBI=0.020002;REFB=-0.0840222;REVB=-0.00349238;RO=2;SAF=43;SAR=91;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00573025;STB=0.503015;TYPE=snp;VARB=0.000698297;OID=.;OPOS=33283766;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:136:136:2:2:134:134:91:43:1:1:91:43:1:1 chr6 33288271 . A G 208.63 PASS AO=55;DP=124;FAO=55;FDP=124;FR=.;FRO=69;FSAF=41;FSAR=14;FSRF=56;FSRR=13;FWDB=0.0247142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.982;QD=6.7299;RBI=0.0272311;REFB=-0.0227193;REVB=-0.0114342;RO=69;SAF=41;SAR=14;SRF=56;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0916896;STB=0.550895;TYPE=snp;VARB=0.0315675;OID=.;OPOS=33288271;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:69:69:55:55:14:41:56:13:14:41:56:13 chr6 33377484 . G C 248.29 PASS AO=28;DP=30;FAO=28;FDP=30;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0618152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5352;QD=33.1048;RBI=0.0698052;REFB=-0.13015;REVB=0.0324291;RO=2;SAF=10;SAR=18;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0191453;STB=0.510302;TYPE=snp;VARB=0.0104166;OID=.;OPOS=33377484;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:30:30:2:2:28:28:18:10:1:1:18:10:1:1 chr6 33382241 . T C 1197.5 PASS AO=132;DP=136;FAO=132;FDP=136;FR=.;FRO=4;FSAF=82;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.0732315;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.5219;QD=35.2206;RBI=0.107162;REFB=0.0485321;REVB=-0.0782361;RO=3;SAF=81;SAR=51;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0271342;STB=0.519228;TYPE=snp;VARB=-0.00713148;OID=.;OPOS=33382241;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:136:136:3:4:132:132:51:81:0:3:50:82:0:4 chr6 33382288 . G A 1334.26 PASS AO=143;DP=147;FAO=145;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0446312;FXX=0.0397325;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3489;QD=36.8071;RBI=0.0460356;REFB=-0.00527391;REVB=-0.0112842;RO=3;SAF=87;SAR=56;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0247886;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00100092;OID=.;OPOS=33382288;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:147:145:3:0:143:145:56:87:0:3:58:87:0:0 chr6 33385887 . A G 102.57 PASS AO=21;DP=45;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.0591473;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.8458;QD=8.72941;RBI=0.0775239;REFB=0.0411229;REVB=-0.0501154;RO=24;SAF=7;SAR=14;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125413;STB=0.535342;TYPE=snp;VARB=-0.0423828;OID=.;OPOS=33385887;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:47:24:24:21:23:14:7:11:13:14:9:11:13 chr6 33399720 . AG A 34.04 PASS AO=11;DP=26;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0168812;FXX=0.0714031;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.825;QD=5.2368;RBI=0.0591639;REFB=-0.0976005;REVB=-0.0567044;RO=12;SAF=3;SAR=8;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0.461538;SSSB=-0.224136;STB=0.638067;TYPE=del;VARB=0.111824;OID=.;OPOS=33399721;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:11:26:13:26:13:3:10:6:7:26:12:3:8:6:6 chr6 33399778 . C T 35.6 PASS AO=14;DP=51;FAO=14;FDP=50;FR=.;FRO=36;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=25;FWDB=0.104858;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.923;QD=2.84784;RBI=0.107096;REFB=-0.00755541;REVB=-0.021777;RO=36;SAF=4;SAR=10;SRF=11;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0282108;STB=0.517216;TYPE=snp;VARB=0.0214872;OID=.;OPOS=33399778;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:51:50:36:36:14:14:10:4:11:25:10:4:11:25 chr6 33416527 . AG A 22.7 PASS AO=8;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.0332846;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=15.1529;QD=5.675;RBI=0.111933;REFB=-0.147839;REVB=-0.10687;RO=8;SAF=7;SAR=1;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0.511335;SSSB=0.427785;STB=0.730929;TYPE=del;VARB=0.133311;OID=.;OPOS=33416528;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:8:16:7:16:9:6:1:5:4:22:8:7:1:4:4 chr6 33420399 . AG A 166.59 PASS AO=21;DP=41;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.19651;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.5601;QD=19.5986;RBI=0.289516;REFB=-0.0794589;REVB=0.212611;RO=8;SAF=18;SAR=3;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0.5;SSSB=0.100365;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0390031;OID=.;OPOS=33420400;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:21:31:34:34:0:29:5:0:0:11:8:18:3:6:2 chr6 33422976 . T G 689.77 PASS AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0313197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.7737;QD=37.7955;RBI=0.0461646;REFB=0;REVB=0.0339153;RO=0;SAF=51;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000701112;OID=.;OPOS=33422976;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:73:73:0:0:73:73:22:51:0:0:22:51:0:0 chr6 33541507 . A G 114.35 PASS AO=35;DP=92;FAO=35;FDP=92;FR=.;FRO=57;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=33;FSRR=24;FWDB=-0.0193327;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.633;QD=4.97181;RBI=0.0197972;REFB=-0.0127509;REVB=-0.00426325;RO=57;SAF=21;SAR=14;SRF=33;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0236394;STB=0.513506;TYPE=snp;VARB=0.0222796;OID=.;OPOS=33541507;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:57:57:35:35:14:21:33:24:14:21:33:24 chr6 33560896 . A G 55.22 PASS AO=15;DP=39;FAO=15;FDP=39;FR=.;FRO=24;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.0186318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.543;QD=5.66332;RBI=0.0321692;REFB=-0.0194448;REVB=0.0262243;RO=24;SAF=2;SAR=13;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.40384;STB=0.742473;TYPE=snp;VARB=0.0185087;OID=.;OPOS=33560896;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:39:39:24:24:15:15:13:2:10:14:13:2:10:14 chr6 33643558 . G A 1133.35 PASS AO=73;DP=137;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.073852;FXX=0.0165276;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.8286;QD=38.0957;RBI=0.0780896;REFB=0;REVB=0.0253746;RO=0;SAF=3;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.08962e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000762208;OID=.;OPOS=33643558;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:75:119:0:0:73:119:70:3:0:0:73:46:0:0 chr6 33648228 . C T 615.12 PASS AO=67;DP=69;FAO=67;FDP=69;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0205946;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=257.52;QD=35.6594;RBI=0.0391206;REFB=-0.0437091;REVB=0.0332609;RO=1;SAF=31;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129467;STB=0.501087;TYPE=snp;VARB=0.000491589;OID=.;OPOS=33648228;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:69:69:1:2:67:67:36:31:0:1:36:31:1:1 chr6 33703089 . C T 450.14 PASS AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0463538;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.9921;QD=38.3101;RBI=0.0606394;REFB=0;REVB=0.0390956;RO=0;SAF=19;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000917425;OID=.;OPOS=33703089;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:48:47:0:0:47:47:28:19:0:0:28:19:0:0 chr6 33703230 . G A 196.06 PASS AO=19;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.100463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5218;QD=39.2118;RBI=0.115365;REFB=0;REVB=0.0567121;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00609527;OID=.;OPOS=33703230;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:20:20:0:0:19:20:9:10:0:0:10:10:0:0 chr6 33740431 . AG A 714.31 PASS AO=100;DP=125;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0589354;FXX=0.00826378;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.9418;QD=23.8104;RBI=0.21041;REFB=0;REVB=0.201988;RO=13;SAF=60;SAR=40;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0.397173;SSSB=0.0820273;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00759291;OID=.;OPOS=33740432;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:100:121:120:120:0:66:54:0:0:58:13:60:40:3:10 chr6 33990447 . T C 47.94 PASS AO=8;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.0132803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.445;QD=11.9851;RBI=0.0148089;REFB=-0.045264;REVB=0.0065527;RO=7;SAF=4;SAR=4;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170899;STB=0.616187;TYPE=snp;VARB=0.0198525;OID=.;OPOS=33990447;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:16:16:7:7:8:9:4:4:2:5:4:5:2:5 chr6 34003685 . T C 138.18 PASS AO=34;DP=75;FAO=34;FDP=74;FR=.;FRO=40;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=27;FWDB=-0.0499253;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.833;QD=7.46936;RBI=0.0513118;REFB=-0.0189717;REVB=0.0118475;RO=40;SAF=17;SAR=17;SRF=13;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169181;STB=0.594541;TYPE=snp;VARB=0.0376543;OID=.;OPOS=34003685;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:74:40:40:34:34:17:17:13:27:17:17:13:27 chr6 34008006 . A G 98.26 PASS AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0179066;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.571;QD=10.3428;RBI=0.0179532;REFB=-0.0359061;REVB=0.0012923;RO=18;SAF=9;SAR=11;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00472505;STB=0.502657;TYPE=snp;VARB=0.0270804;OID=.;OPOS=34008006;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:38:38:18:18:20:20:11:9:8:10:11:9:8:10 chr6 34078463 . G A 193.92 PASS AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0100466;FXX=0.0454339;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.441;QD=36.9364;RBI=0.026748;REFB=0;REVB=0.0247895;RO=0;SAF=1;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.78928e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00102806;OID=.;OPOS=34078463;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:22:21:0:0:21:21:20:1:0:0:20:1:0:0 chr6 34212743 . A G 131.52 PASS AO=14;DP=14;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.3261;QD=35.0726;RBI=0.00542978;REFB=0;REVB=-0.00542978;RO=0;SAF=0;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00266631;OID=.;OPOS=34212743;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:14:15:0:0:14:15:14:0:0:0:15:0:0:0 chr6 34213296 . T C 435.32 PASS AO=48;DP=50;FAO=49;FDP=51;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00939218;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.173;QD=34.1426;RBI=0.0108493;REFB=-0.086641;REVB=-0.00543088;RO=2;SAF=27;SAR=21;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0427126;STB=0.52173;TYPE=snp;VARB=0.000216775;OID=.;OPOS=34213296;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:50:51:2:2:48:49:21:27:0:2:22:27:0:2 chr6 34213868 . A G 369.25 PASS AO=38;DP=40;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00275934;FXX=0.0499875;HRUN=3;LEN=1;MLLD=90.8124;QD=38.8685;RBI=0.0358879;REFB=0;REVB=0.0357816;RO=0;SAF=24;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76123e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000135212;OID=.;OPOS=34213868;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:40:38:0:0:38:38:14:24:0:0:14:24:0:0 chr6 34214322 . C G 388.51 PASS AO=42;DP=43;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0228723;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=133.576;QD=35.3193;RBI=0.0240669;REFB=-0.0937346;REVB=-0.0074885;RO=0;SAF=13;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.36943e-08;STB=0.508193;TYPE=snp;VARB=0.00045487;OID=.;OPOS=34214322;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:43:44:0:1:42:43:29:13:0:0:30:13:0:1 chr6 34215228 . G A 15.55 PASS AO=3;DP=8;FAO=3;FDP=8;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0374793;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=147.354;QD=7.77509;RBI=0.0374793;REFB=0.0142409;REVB=0;RO=5;SAF=3;SAR=0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0161368;OID=.;OPOS=34215228;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:8:8:5:5:3:3:0:3:5:0:0:3:5:0 chr6 34502687 . T C 820.27 PASS AO=82;DP=82;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0265102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.893;QD=38.1522;RBI=0.0265736;REFB=0;REVB=-0.00183514;RO=0;SAF=44;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.11453e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.26507e-05;OID=.;OPOS=34502687;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:82:86:0:0:82:86:38:44:0:0:40:46:0:0 chr6 34557374 . A G 328.32 PASS AO=40;DP=44;FAO=40;FDP=44;FR=.;FRO=4;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0106856;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.528;QD=29.8472;RBI=0.0110786;REFB=-0.103967;REVB=-0.00292466;RO=4;SAF=18;SAR=22;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0344709;STB=0.518424;TYPE=snp;VARB=0.00272837;OID=.;OPOS=34557374;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:44:44:4:4:40:40:22:18:1:3:22:18:1:3 chr6 34653268 . T C 56.93 PASS AO=11;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=11;FWDB=0.0104868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.415;QD=9.48797;RBI=0.0104928;REFB=-0.000355482;REVB=-0.000356111;RO=12;SAF=4;SAR=7;SRF=1;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.305339;STB=0.68157;TYPE=snp;VARB=0.000941584;OID=.;OPOS=34653268;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:24:24:12:12:11:12:7:4:1:11:7:5:1:11 chr6 34725658 . G T 52.86 PASS AO=26;DP=101;FAO=25;FDP=93;FR=.;FRO=68;FSAF=3;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=53;FWDB=-0.0222467;FXX=0.0882266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.109;QD=2.27351;RBI=0.0239979;REFB=-0.0159275;REVB=-0.00899918;RO=66;SAF=3;SAR=23;SRF=14;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22005;STB=0.637552;TYPE=snp;VARB=0.0158574;OID=.;OPOS=34725658;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:101:93:66:68:26:25:23:3:14:52:22:3:15:53 chr6 34803947 . C T 79.92 PASS AO=20;DP=41;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.0243974;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=137.024;QD=6.80184;RBI=0.0274466;REFB=-0.0564656;REVB=0.012573;RO=20;SAF=11;SAR=9;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132146;STB=0.503223;TYPE=snp;VARB=0.0233447;OID=.;OPOS=34803947;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:41:47:20:27:20:20:9:11:8:12:9:11:15:12 chr6 34824636 . A G 176.87 PASS AO=32;DP=89;FAO=45;FDP=101;FR=.;FRO=56;FSAF=12;FSAR=33;FSRF=22;FSRR=34;FWDB=0.00980145;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.714;QD=7.00481;RBI=0.0113414;REFB=-0.0148532;REVB=0.00570611;RO=54;SAF=12;SAR=20;SRF=22;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.037383;STB=0.582516;TYPE=snp;VARB=0.0163942;OID=.;OPOS=34824636;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:101:54:56:32:45:20:12:22:32:33:12:22:34 chr6 34825662 . T C 706.63 PASS AO=162;DP=329;FAO=166;FDP=331;FR=.;FRO=165;FSAF=81;FSAR=85;FSRF=89;FSRR=76;FWDB=0.0795254;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9808;QD=8.53929;RBI=0.0913835;REFB=0.00402714;REVB=0.0450184;RO=167;SAF=79;SAR=83;SRF=91;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0529332;STB=0.525624;TYPE=snp;VARB=-0.00377302;OID=.;OPOS=34825662;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:329:331:167:165:162:166:83:79:91:76:85:81:89:76 chr6 34827085 . A T 125.99 PASS AO=24;DP=42;FAO=24;FDP=42;FR=.;FRO=18;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.000252317;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.815;QD=11.9989;RBI=0.0165294;REFB=0.00550034;REVB=0.0165275;RO=18;SAF=15;SAR=9;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0113741;STB=0.506324;TYPE=snp;VARB=-0.00367448;OID=.;OPOS=34827085;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:42:42:18:18:24:24:9:15:11:7:9:15:11:7 chr6 34831866 . G A 644.1 PASS AO=146;DP=284;FAO=146;FDP=282;FR=.;FRO=136;FSAF=68;FSAR=78;FSRF=80;FSRR=56;FWDB=0.00655593;FXX=0.00704201;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.725;QD=9.13617;RBI=0.00915099;REFB=-0.00634962;REVB=0.00638439;RO=136;SAF=68;SAR=78;SRF=80;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107733;STB=0.558861;TYPE=snp;VARB=0.00696651;OID=.;OPOS=34831866;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:284:282:136:136:146:146:78:68:80:56:78:68:80:56 chr6 34949607 . C T 182.99 PASS AO=56;DP=146;FAO=56;FDP=144;FR=.;FRO=88;FSAF=31;FSAR=25;FSRF=46;FSRR=42;FWDB=0.0123981;FXX=0.0335548;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.82;QD=5.08315;RBI=0.0177679;REFB=-0.00775746;REVB=-0.0127274;RO=82;SAF=31;SAR=25;SRF=44;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0180832;STB=0.518984;TYPE=snp;VARB=0.0115195;OID=.;OPOS=34949607;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:144:82:88:56:56:25:31:44:38:25:31:46:42 chr6 34977663 . C A 45.7 PASS AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.0303369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.4566;QD=13.0563;RBI=0.0580302;REFB=-0.0295989;REVB=0.0494689;RO=6;SAF=5;SAR=3;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.330584;STB=0.68713;TYPE=snp;VARB=0.0212442;OID=.;OPOS=34977663;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:14:14:6:6:8:8:3:5:6:0:3:5:6:0 chr6 35027927 . T C 1777.96 PASS AO=188;DP=190;FAO=188;FDP=188;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0115957;FXX=0.0105258;HRUN=3;LEN=1;MLLD=149.927;QD=37.829;RBI=0.0128273;REFB=0.0358148;REVB=0.00548444;RO=2;SAF=89;SAR=99;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0105788;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.31949e-05;OID=.;OPOS=35027927;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:190:188:2:0:188:188:99:89:2:0:99:89:0:0 chr6 35050506 . G A 295.31 PASS AO=31;DP=31;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0925799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3175;QD=35.7945;RBI=0.0926094;REFB=0;REVB=-0.00233633;RO=0;SAF=12;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.47712e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00992469;OID=.;OPOS=35050506;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:31:33:0:0:31:33:19:12:0:0:19:14:0:0 chr6 35107820 . T A 152.76 PASS AO=44;DP=111;FAO=45;FDP=112;FR=.;FRO=67;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=43;FSRR=24;FWDB=0.0205407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.531;QD=5.45587;RBI=0.0232164;REFB=-0.00555977;REVB=0.0108203;RO=66;SAF=24;SAR=20;SRF=43;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115076;STB=0.552823;TYPE=snp;VARB=0.00584999;OID=.;OPOS=35107820;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:112:66:67:44:45:20:24:43:23:20:25:43:24 chr6 35203203 . T G 243.66 PASS AO=30;DP=35;FAO=31;FDP=36;FR=.;FRO=5;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.00137637;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=163.363;QD=27.0729;RBI=0.0334194;REFB=-0.0374928;REVB=0.033391;RO=5;SAF=20;SAR=10;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0403345;STB=0.519738;TYPE=snp;VARB=0.000432749;OID=.;OPOS=35203203;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:35:36:5:5:30:31:10:20:4:1:10:21:4:1 chr6 35260503 . C T 508.51 PASS AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0453714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.21;QD=37.6672;RBI=0.0465508;REFB=0;REVB=0.0104121;RO=0;SAF=30;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000181488;OID=.;OPOS=35260503;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:54:54:0:0:54:54:24:30:0:0:24:30:0:0 chr6 35260530 . C T 508.49 PASS AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0523501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.4465;QD=37.6658;RBI=0.0579195;REFB=0;REVB=0.0247816;RO=0;SAF=31;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6027e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000766527;OID=.;OPOS=35260530;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:54:54:0:0:54:54:23:31:0:0:23:31:0:0 chr6 35263555 . A G 435.74 PASS AO=48;DP=50;FAO=48;FDP=50;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0179407;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.2637;QD=34.8593;RBI=0.0555779;REFB=-0.00861553;REVB=-0.0526026;RO=2;SAF=17;SAR=31;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0293889;STB=0.515619;TYPE=snp;VARB=-0.000673083;OID=.;OPOS=35263555;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:50:50:2:2:48:48:31:17:0:2:31:17:0:2 chr6 35285720 . A C 181.74 PASS AO=21;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0657992;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.126;QD=31.606;RBI=0.0818245;REFB=-0.0317647;REVB=-0.0486386;RO=2;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0709089;STB=0.518502;TYPE=snp;VARB=0.00824915;OID=.;OPOS=35285720;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:23:23:2:1:21:22:12:9:0:2:13:9:0:1 chr6 35391787 . C T 423.69 PASS AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0578413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.533;QD=37.6611;RBI=0.0578469;REFB=0;REVB=0.000804893;RO=0;SAF=17;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.54734e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000127905;OID=.;OPOS=35391787;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:44:45:0:0:44:45:27:17:0:0:28:17:0:0 chr6 35395010 . C T 319.47 PASS AO=35;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0522803;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=208.909;QD=35.497;RBI=0.0567605;REFB=-0.100767;REVB=0.0221025;RO=0;SAF=28;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000767516;OID=.;OPOS=35395010;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:36:36:0:0:35:36:7:28:0:0:7:29:0:0 chr6 35395795 . G C 598.06 PASS AO=57;DP=58;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.034468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.773;QD=37.3785;RBI=0.0625635;REFB=0;REVB=0.0522126;RO=0;SAF=39;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000229277;OID=.;OPOS=35395795;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:58:64:0:0:57:64:18:39:0:0:21:43:0:0 chr6 35423662 . A C 130.58 PASS AO=13;DP=14;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.217;QD=34.8205;RBI=0.0149654;REFB=0;REVB=0.00738553;RO=0;SAF=1;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.00075e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00159924;OID=.;OPOS=35423662;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:14:15:0:0:13:15:12:1:0:0:13:2:0:0 chr6 35430686 . G A 195.31 PASS AO=48;DP=102;FAO=48;FDP=103;FR=.;FRO=55;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=34;FSRR=21;FWDB=0.00989486;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.861;QD=7.58499;RBI=0.0179248;REFB=-0.0104354;REVB=0.0149463;RO=54;SAF=23;SAR=25;SRF=34;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142647;STB=0.573872;TYPE=snp;VARB=0.0133103;OID=.;OPOS=35430686;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:103:54:55:48:48:25:23:34:20:25:23:34:21 chr6 35436571 . C T 108.51 PASS AO=15;DP=20;FAO=15;FDP=20;FR=.;FRO=5;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0890663;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=90.943;QD=21.7012;RBI=0.0909198;REFB=-0.0206694;REVB=-0.0182648;RO=5;SAF=9;SAR=6;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179999;STB=0.599866;TYPE=snp;VARB=0.0146324;OID=.;OPOS=35436571;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:20:20:5:5:15:15:6:9:1:4:6:9:1:4 chr6 35441404 . T G 331.76 PASS AO=96;DP=237;FAO=100;FDP=246;FR=.;FRO=146;FSAF=73;FSAR=27;FSRF=99;FSRR=47;FWDB=0.0221563;FXX=0.0159994;HRUN=3;LEN=1;MLLD=107.868;QD=5.39446;RBI=0.0694904;REFB=0.0144952;REVB=-0.0658636;RO=129;SAF=72;SAR=24;SRF=95;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0183905;STB=0.537719;TYPE=snp;VARB=-0.0360053;OID=.;OPOS=35441404;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:237:246:129:146:96:100:24:72:95:34:27:73:99:47 chr6 35443723 . AGGGGGC AGGGGC,AGGGG 178.9 PASS AO=18,10;DP=46;FAO=42,0;FDP=44;FR=.;FRO=2;FSAF=32,0;FSAR=10,0;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.1208,0.063929;FXX=0.0434688;HRUN=5,5;LEN=1,2;MLLD=11.2384,9.51174;QD=16.2638;RBI=0.155064,0.181434;REFB=-0.0547323,0.0990072;REVB=0.0972233,-0.169798;RO=4;SAF=17,4;SAR=1,6;SRF=3;SRR=1;SSEN=0.305263,0.305263;SSEP=0,0;SSSB=0.231738,-0.175933;STB=0.515144,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.00949115,0;OID=.,.;OPOS=35443724,35443728;OREF=G,GC;OALT=-,-;OMAPALT=AGGGGC,AGGGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:18,10:39:42,0:44:2:32,0:10,0:2:0:6:4:17,4:1,6:3:1 chr6 35465786 . A C 115.78 PASS AO=26;DP=53;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.028749;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.0682;QD=8.738;RBI=0.0438708;REFB=-0.00220088;REVB=-0.0331381;RO=26;SAF=9;SAR=17;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.513503;TYPE=snp;VARB=0.00114224;OID=.;OPOS=35465786;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:26:27:26:26:17:9:9:17:17:9:10:17 chr6 35477025 . C G 27.64 PASS AO=15;DP=66;FAO=15;FDP=66;FR=.;FRO=51;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=36;FWDB=-0.0405026;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.642;QD=1.67494;RBI=0.0566732;REFB=-0.00614053;REVB=0.0396408;RO=49;SAF=4;SAR=11;SRF=14;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0292846;STB=0.526412;TYPE=snp;VARB=0.0349726;OID=.;OPOS=35477025;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:66:66:49:51:15:15:11:4:14:35:11:4:15:36 chr6 35477032 . A G 20.25 PASS AO=13;DP=69;FAO=13;FDP=65;FR=.;FRO=52;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=37;FWDB=-0.0606728;FXX=0.0579626;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.924;QD=1.24602;RBI=0.0673226;REFB=-0.00555485;REVB=-0.0291744;RO=48;SAF=4;SAR=9;SRF=15;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0069357;STB=0.518282;TYPE=snp;VARB=0.019203;OID=.;OPOS=35477032;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:69:65:48:52:13:13:9:4:15:33:9:4:15:37 chr6 35542526 . T A 103.93 PASS AO=34;DP=94;FAO=34;FDP=94;FR=.;FRO=60;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=32;FSRR=28;FWDB=-0.000699881;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=239.937;QD=4.4227;RBI=0.0127971;REFB=-0.00255811;REVB=-0.0127779;RO=60;SAF=22;SAR=12;SRF=32;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131697;STB=0.575871;TYPE=snp;VARB=0.00328083;OID=.;OPOS=35542526;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:60:60:34:34:12:22:32:28:12:22:32:28 chr6 35705892 . T C 23.43 PASS AO=8;DP=29;FAO=8;FDP=29;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.0247595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.614;QD=3.2314;RBI=0.0265561;REFB=-0.0138604;REVB=0.00960171;RO=21;SAF=2;SAR=6;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.374078;STB=0.736241;TYPE=snp;VARB=0.053455;OID=.;OPOS=35705892;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:29:29:21:21:8:8:6:2:12:9:6:2:12:9 chr6 35745655 . C T 251.28 PASS AO=53;DP=98;FAO=53;FDP=99;FR=.;FRO=46;FSAF=12;FSAR=41;FSRF=9;FSRR=37;FWDB=0.0370319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.096;QD=10.1529;RBI=0.0377188;REFB=-0.000788679;REVB=0.007166;RO=45;SAF=12;SAR=41;SRF=8;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.060302;STB=0.52086;TYPE=snp;VARB=0.000655024;OID=.;OPOS=35745655;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:99:45:46:53:53:41:12:8:37:41:12:9:37 chr6 35755658 . A G 212.49 PASS AO=59;DP=139;FAO=59;FDP=139;FR=.;FRO=80;FSAF=33;FSAR=26;FSRF=42;FSRR=38;FWDB=-8.94812e-06;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.347;QD=6.11477;RBI=0.00874835;REFB=-0.0099763;REVB=-0.00874834;RO=80;SAF=33;SAR=26;SRF=42;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0355676;STB=0.519934;TYPE=snp;VARB=0.0155744;OID=.;OPOS=35755658;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:80:80:59:59:26:33:42:38:26:33:42:38 chr6 35960390 . C T 199.03 PASS AO=46;DP=92;FAO=46;FDP=93;FR=.;FRO=47;FSAF=29;FSAR=17;FSRF=31;FSRR=16;FWDB=-0.0235834;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.6098;QD=8.56045;RBI=0.035514;REFB=-0.0323209;REVB=0.0265531;RO=46;SAF=29;SAR=17;SRF=30;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0211855;STB=0.515926;TYPE=snp;VARB=0.0364813;OID=.;OPOS=35960390;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:93:46:47:46:46:17:29:30:16:17:29:31:16 chr6 35967772 . T C 79.99 PASS AO=25;DP=67;FAO=25;FDP=69;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=28;FWDB=0.0027407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.8408;QD=4.63691;RBI=0.0251237;REFB=-0.0223776;REVB=-0.0249737;RO=42;SAF=14;SAR=11;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217869;STB=0.623192;TYPE=snp;VARB=0.0185831;OID=.;OPOS=35967772;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:67:69:42:44:25:25:11:14:15:27:11:14:16:28 chr6 35980121 . C T 339.95 PASS AO=87;DP=190;FAO=87;FDP=189;FR=.;FRO=102;FSAF=36;FSAR=51;FSRF=44;FSRR=58;FWDB=-0.00058762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.717;QD=7.19463;RBI=0.0212814;REFB=-0.0270783;REVB=-0.0212733;RO=99;SAF=36;SAR=51;SRF=42;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0103377;STB=0.509743;TYPE=snp;VARB=0.0388471;OID=.;OPOS=35980121;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:189:99:102:87:87:51:36:42:57:51:36:44:58 chr6 36198577 . G C 811.23 PASS AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103595;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.188;QD=38.1757;RBI=0.0533733;REFB=0;REVB=-0.0523583;RO=0;SAF=40;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.79153e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.26128e-05;OID=.;OPOS=36198577;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:85:85:0:0:85:85:45:40:0:0:45:40:0:0 chr6 36260914 . C T 89.35 PASS AO=12;DP=19;FAO=14;FDP=21;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.0320486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.322;QD=17.0197;RBI=0.0836644;REFB=-0.104074;REVB=0.0772827;RO=6;SAF=2;SAR=10;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.274816;STB=0.646828;TYPE=snp;VARB=0.047997;OID=.;OPOS=36260914;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:19:21:6:7:12:14:10:2:3:3:11:3:4:3 chr6 36269725 . A G 215.62 PASS AO=52;DP=125;FAO=59;FDP=132;FR=.;FRO=73;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=35;FSRR=38;FWDB=-0.0266434;FXX=0.00751823;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.409;QD=6.53397;RBI=0.0336813;REFB=-0.00965823;REVB=0.0206049;RO=73;SAF=30;SAR=22;SRF=35;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101778;STB=0.516041;TYPE=snp;VARB=0.0118297;OID=.;OPOS=36269725;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:132:73:73:52:59:22:30:35:38:29:30:35:38 chr6 36270130 . C A 75.33 PASS AO=17;DP=36;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=17;FWDB=0.0231846;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=289.311;QD=8.37003;RBI=0.0231872;REFB=-0.00345962;REVB=-0.000351445;RO=19;SAF=10;SAR=7;SRF=2;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.430024;STB=0.740503;TYPE=snp;VARB=0.00934442;OID=.;OPOS=36270130;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:36:36:19:19:17:17:7:10:2:17:7:10:2:17 chr6 36274153 . C T 252.26 PASS AO=57;DP=108;FAO=54;FDP=102;FR=.;FRO=48;FSAF=9;FSAR=45;FSRF=12;FSRR=36;FWDB=0.027504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.184;QD=9.89251;RBI=0.0275043;REFB=0.00589547;REVB=-0.000122995;RO=51;SAF=9;SAR=48;SRF=12;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113374;STB=0.56449;TYPE=snp;VARB=-0.00665768;OID=.;OPOS=36274153;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:102:51:48:57:54:48:9:12:39:45:9:12:36 chr6 36275458 . T C 142.2 PASS AO=41;DP=99;FAO=40;FDP=98;FR=.;FRO=58;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=25;FSRR=33;FWDB=-0.0208978;FXX=0.0101;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.5175;QD=5.80415;RBI=0.0559342;REFB=0.00244239;REVB=-0.0518837;RO=58;SAF=21;SAR=20;SRF=25;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0841102;STB=0.540796;TYPE=snp;VARB=-0.00313118;OID=.;OPOS=36275458;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:98:58:58:41:40:20:21:25:33:20:20:25:33 chr6 36287312 . G C 246.49 PASS AO=63;DP=136;FAO=63;FDP=138;FR=.;FRO=75;FSAF=19;FSAR=44;FSRF=21;FSRR=54;FWDB=0.00266635;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=191.33;QD=7.14463;RBI=0.0155221;REFB=-0.0258142;REVB=0.0152914;RO=73;SAF=19;SAR=44;SRF=20;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0321659;STB=0.514076;TYPE=snp;VARB=0.029676;OID=.;OPOS=36287312;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:138:73:75:63:63:44:19:20:53:44:19:21:54 chr6 36294864 . A G 306.23 PASS AO=61;DP=111;FAO=63;FDP=113;FR=.;FRO=50;FSAF=32;FSAR=31;FSRF=31;FSRR=19;FWDB=0.05824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.157;QD=10.8402;RBI=0.0606726;REFB=-0.0118176;REVB=-0.0170079;RO=48;SAF=30;SAR=31;SRF=29;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0903553;STB=0.549661;TYPE=snp;VARB=0.00681764;OID=.;OPOS=36294864;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:113:48:50:61:63:31:30:29:19:31:32:31:19 chr6 36341294 . C T 214.12 PASS AO=38;DP=61;FAO=38;FDP=61;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=23;FWDB=0.0496635;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=86.3799;QD=14.0407;RBI=0.0514201;REFB=-0.0184437;REVB=0.013325;RO=23;SAF=6;SAR=32;SRF=0;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246128;STB=0.632129;TYPE=snp;VARB=0.0250015;OID=.;OPOS=36341294;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:61:61:23:23:38:38:32:6:0:23:32:6:0:23 chr6 36645696 . A G 3679.63 PASS AO=404;DP=417;FAO=396;FDP=396;FR=.;FRO=0;FSAF=209;FSAR=187;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177279;FXX=0.00999975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.1;QD=37.168;RBI=0.0245058;REFB=-0.0446105;REVB=0.016919;RO=4;SAF=236;SAR=168;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00801946;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00118961;OID=.;OPOS=36645696;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:417:396:4:0:404:396:168:236:4:0:187:209:0:0 chr6 36698556 . A C 14.08 PASS AO=8;DP=21;FAO=5;FDP=21;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=0.0433645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=324.785;QD=2.68191;RBI=0.0443353;REFB=-0.0132798;REVB=0.00922686;RO=13;SAF=5;SAR=3;SRF=1;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.529238;STB=0.788602;TYPE=snp;VARB=0.0323852;OID=.;OPOS=36698556;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:21:21:13:16:8:5:3:5:1:12:2:3:3:13 chr6 36698927 . C G 10.89 PASS AO=3;DP=14;FAO=3;FDP=14;FR=.;FRO=11;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=11;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.026;QD=3.11201;RBI=0.0160876;REFB=-0.0108391;REVB=-0.0160876;RO=11;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0162248;OID=.;OPOS=36698927;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:14:14:11:11:3:3:3:0:0:11:3:0:0:11 chr6 36713263 . A G 1273.24 PASS AO=122;DP=124;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0491907;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.0404;QD=38.0071;RBI=0.0593359;REFB=0;REVB=-0.0331816;RO=1;SAF=70;SAR=52;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0067388;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.12974e-06;OID=.;OPOS=36713263;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:124:134:1:0:122:134:52:70:1:0:63:71:0:0 chr6 36733132 . G A 188.71 PASS AO=35;DP=59;FAO=35;FDP=59;FR=.;FRO=24;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.00334327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.6772;QD=12.7937;RBI=0.0234893;REFB=-0.0253186;REVB=0.0232501;RO=24;SAF=16;SAR=19;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0318443;STB=0.5175;TYPE=snp;VARB=0.0116838;OID=.;OPOS=36733132;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:59:59:24:24:35:35:19:16:12:12:19:16:12:12 chr6 36766292 . C T 387.5 PASS AO=78;DP=139;FAO=78;FDP=138;FR=.;FRO=60;FSAF=32;FSAR=46;FSRF=33;FSRR=27;FWDB=0.0137006;FXX=0.00719373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.735;QD=11.2318;RBI=0.0167279;REFB=-0.0234409;REVB=0.00959771;RO=60;SAF=32;SAR=46;SRF=33;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112498;STB=0.561381;TYPE=snp;VARB=0.0213615;OID=.;OPOS=36766292;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:138:60:60:78:78:46:32:33:27:46:32:33:27 chr6 36882353 . A G 158.98 PASS AO=59;DP=166;FAO=57;FDP=163;FR=.;FRO=106;FSAF=38;FSAR=19;FSRF=70;FSRR=36;FWDB=-0.025865;FXX=0.0180712;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6041;QD=3.90131;RBI=0.0580729;REFB=0.000219522;REVB=-0.0519949;RO=106;SAF=40;SAR=19;SRF=69;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.034305;STB=0.504586;TYPE=snp;VARB=-0.00141933;OID=.;OPOS=36882353;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:163:106:106:59:57:19:40:69:37:19:38:70:36 chr6 36887476 . C T 151.85 PASS AO=39;DP=104;FAO=44;FDP=109;FR=.;FRO=65;FSAF=8;FSAR=36;FSRF=15;FSRR=50;FWDB=0.0977271;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.957;QD=5.57262;RBI=0.098292;REFB=-0.0032913;REVB=-0.0105225;RO=64;SAF=7;SAR=32;SRF=15;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0937649;STB=0.546152;TYPE=snp;VARB=0.0057512;OID=.;OPOS=36887476;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:109:64:65:39:44:32:7:15:49:36:8:15:50 chr6 36895835 . C T 319.26 PASS AO=82;DP=179;FAO=82;FDP=179;FR=.;FRO=97;FSAF=31;FSAR=51;FSRF=46;FSRR=51;FWDB=0.000605964;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.404;QD=7.13427;RBI=0.00219538;REFB=-0.0166397;REVB=-0.00211009;RO=89;SAF=31;SAR=51;SRF=44;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112833;STB=0.553943;TYPE=snp;VARB=0.0121287;OID=.;OPOS=36895835;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:179:89:97:82:82:51:31:44:45:51:31:46:51 chr6 36938432 . G A 75.31 PASS AO=17;DP=36;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.0257305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3706;QD=8.36788;RBI=0.0357431;REFB=-0.0257412;REVB=0.0248095;RO=19;SAF=4;SAR=13;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.345359;STB=0.698675;TYPE=snp;VARB=0.02618;OID=.;OPOS=36938432;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:36:36:19:19:17:17:13:4:11:8:13:4:11:8 chr6 36988364 . C T 174.87 PASS AO=36;DP=69;FAO=36;FDP=67;FR=.;FRO=31;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=0.00621116;FXX=0.0289813;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.225;QD=10.4397;RBI=0.00940028;REFB=0.010299;REVB=0.00705597;RO=28;SAF=23;SAR=13;SRF=19;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0345064;STB=0.503149;TYPE=snp;VARB=-0.0100349;OID=.;OPOS=36988364;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:67:28:31:36:36:13:23:19:9:13:23:20:11 chr6 37013127 . G A 99.8 PASS AO=27;DP=67;FAO=28;FDP=70;FR=.;FRO=42;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=-0.0234513;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.33;QD=5.70266;RBI=0.0301649;REFB=-0.0134732;REVB=-0.0189726;RO=40;SAF=8;SAR=19;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.275773;STB=0.639898;TYPE=snp;VARB=0.0236833;OID=.;OPOS=37013127;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:70:40:42:27:28:19:8:22:18:19:9:23:19 chr6 37180237 . G A 1505.54 PASS AO=157;DP=157;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0080694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.6768;QD=38.3577;RBI=0.0213265;REFB=0;REVB=0.0197409;RO=0;SAF=80;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.668e-05;OID=.;OPOS=37180237;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:157:157:0:0:157:157:77:80:0:0:77:80:0:0 chr6 37180355 . G A 1788.4 PASS AO=172;DP=173;FAO=187;FDP=187;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0356044;FXX=0.0105815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.327;QD=38.2546;RBI=0.0384954;REFB=0;REVB=0.0146363;RO=0;SAF=80;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00017933;OID=.;OPOS=37180355;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:173:187:0:0:172:187:92:80:0:0:102:85:0:0 chr6 37180523 . A G 2498.2 PASS AO=271;DP=276;FAO=272;FDP=272;FR=.;FRO=0;FSAF=153;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.101729;FXX=0.0144922;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.4271;QD=36.7382;RBI=0.103772;REFB=-0.0914134;REVB=-0.0204903;RO=3;SAF=155;SAR=116;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0121688;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000795115;OID=.;OPOS=37180523;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:276:272:3:0:271:272:116:155:0:3:119:153:0:0 chr6 37252210 . C T 307.71 PASS AO=75;DP=160;FAO=76;FDP=161;FR=.;FRO=85;FSAF=35;FSAR=41;FSRF=40;FSRR=45;FWDB=0.0309619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.36;QD=7.64496;RBI=0.0356236;REFB=-0.0172956;REVB=0.0176183;RO=85;SAF=34;SAR=41;SRF=40;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0166628;STB=0.50534;TYPE=snp;VARB=0.0192452;OID=.;OPOS=37252210;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:161:85:85:75:76:41:34:40:45:41:35:40:45 chr6 37288036 . A G 245.45 PASS AO=57;DP=123;FAO=59;FDP=123;FR=.;FRO=64;FSAF=20;FSAR=39;FSRF=30;FSRR=34;FWDB=0.00206643;FXX=0.0159987;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.41;QD=7.98194;RBI=0.00804328;REFB=-0.00885523;REVB=0.0077733;RO=63;SAF=20;SAR=37;SRF=30;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124458;STB=0.571822;TYPE=snp;VARB=0.00940525;OID=.;OPOS=37288036;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:63:64:57:59:37:20:30:33:39:20:30:34 chr6 37450914 . T C 1193.04 PASS AO=123;DP=124;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00498676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.386;QD=38.1771;RBI=0.0281709;REFB=0;REVB=0.027726;RO=0;SAF=57;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.44201e-05;OID=.;OPOS=37450914;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:124:125:0:0:123:125:66:57:0:0:68:57:0:0 chr6 37603102 . T C 599.69 PASS AO=63;DP=66;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00276952;FXX=0.0454477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.643;QD=38.0758;RBI=0.0411442;REFB=0;REVB=0.0410508;RO=0;SAF=17;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.30331e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.41032e-05;OID=.;OPOS=37603102;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:66:63:0:0:63:63:46:17:0:0:46:17:0:0 chr6 37603103 . G A 557.07 PASS AO=63;DP=66;FAO=63;FDP=66;FR=.;FRO=3;FSAF=17;FSAR=46;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.033365;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.04;QD=33.7616;RBI=0.0662923;REFB=-0.0426135;REVB=0.0572839;RO=3;SAF=17;SAR=46;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0763249;STB=0.540527;TYPE=snp;VARB=0.00514242;OID=.;OPOS=37603103;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:66:66:3:3:63:63:46:17:3:0:46:17:3:0 chr6 37623566 . C T 471.93 PASS AO=48;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0980414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.3686;QD=38.5248;RBI=0.0994514;REFB=0;REVB=0.0166873;RO=0;SAF=26;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46901e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000817724;OID=.;OPOS=37623566;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:48:49:0:0:48:49:22:26:0:0:23:26:0:0 chr6 37631768 . A G 78.26 PASS AO=15;DP=34;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=-0.0373645;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0795;QD=8.94403;RBI=0.041422;REFB=-0.0320476;REVB=-0.0178795;RO=16;SAF=14;SAR=1;SRF=13;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.29514;STB=0.509081;TYPE=snp;VARB=0.0617662;OID=.;OPOS=37631768;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:34:35:16:17:15:18:1:14:13:3:4:14:13:4 chr6 38110010 . G A 289.78 PASS AO=119;DP=363;FAO=119;FDP=363;FR=.;FRO=244;FSAF=66;FSAR=53;FSRF=119;FSRR=125;FWDB=0.00432808;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=226.596;QD=3.19313;RBI=0.00736687;REFB=-0.0114187;REVB=0.00596142;RO=240;SAF=66;SAR=53;SRF=115;SRR=125;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0882564;STB=0.545067;TYPE=snp;VARB=0.0247319;OID=.;OPOS=38110010;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:363:363:240:244:119:119:53:66:115:125:53:66:119:125 chr6 38120660 . C T 64.67 PASS AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=12;FWDB=0.14367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.557;QD=10.3479;RBI=0.14432;REFB=-0.0170808;REVB=-0.0136817;RO=12;SAF=4;SAR=9;SRF=0;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.361407;STB=0.699775;TYPE=snp;VARB=0.0238352;OID=.;OPOS=38120660;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:25:25:12:12:13:13:9:4:0:12:9:4:0:12 chr6 38121211 . A G 168.07 PASS AO=38;DP=77;FAO=38;FDP=76;FR=.;FRO=38;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=-0.0021058;FXX=0.0256377;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.288;QD=8.84583;RBI=0.0261698;REFB=-0.0159677;REVB=-0.0260849;RO=37;SAF=22;SAR=16;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153839;STB=0.591676;TYPE=snp;VARB=0.0196887;OID=.;OPOS=38121211;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:76:37:38:38:38:16:22:15:22:16:22:15:23 chr6 38139032 . G A 225.13 PASS AO=56;DP=121;FAO=56;FDP=121;FR=.;FRO=65;FSAF=36;FSAR=20;FSRF=36;FSRR=29;FWDB=0.0145502;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=197.156;QD=7.44221;RBI=0.0153212;REFB=-0.00350754;REVB=0.00479914;RO=65;SAF=36;SAR=20;SRF=36;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0907002;STB=0.550543;TYPE=snp;VARB=0.00363725;OID=.;OPOS=38139032;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:65:65:56:56:20:36:36:29:20:36:36:29 chr6 38147355 . A G 488.26 PASS AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.472;QD=37.5587;RBI=0.0271458;REFB=0;REVB=0.016952;RO=0;SAF=24;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000215067;OID=.;OPOS=38147355;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:51:52:0:0:51:52:27:24:0:0:28:24:0:0 chr6 38650628 . T G 1186.39 PASS AO=124;DP=126;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.472;QD=37.6631;RBI=0.0417565;REFB=0;REVB=0.0362886;RO=1;SAF=45;SAR=79;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00597677;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000182842;OID=.;OPOS=38650628;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:126:126:1:0:124:126:79:45:0:1:80:46:0:0 chr6 38670837 . G A 176.14 PASS AO=34;DP=60;FAO=34;FDP=60;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=25;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.0674438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.3214;QD=11.743;RBI=0.0753853;REFB=-0.0326152;REVB=0.0336789;RO=26;SAF=9;SAR=25;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.240051;STB=0.633177;TYPE=snp;VARB=0.0271904;OID=.;OPOS=38670837;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:26:26:34:34:25:9:14:12:25:9:14:12 chr6 38712040 . A G 991.58 PASS AO=76;DP=105;FAO=104;FDP=104;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=50;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143373;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.073;QD=38.1376;RBI=0.0715568;REFB=0;REVB=0.0701058;RO=0;SAF=49;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000236597;OID=.;OPOS=38712040;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:105:104:0:0:76:104:27:49:0:0:54:50:0:0 chr6 38747770 . G A 191.81 PASS AO=64;DP=173;FAO=64;FDP=173;FR=.;FRO=109;FSAF=47;FSAR=17;FSRF=45;FSRR=64;FWDB=0.00404355;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=193.335;QD=4.43486;RBI=0.0187365;REFB=-0.0161069;REVB=-0.018295;RO=109;SAF=47;SAR=17;SRF=45;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.366568;STB=0.70874;TYPE=snp;VARB=0.0191479;OID=.;OPOS=38747770;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:173:109:109:64:64:17:47:45:64:17:47:45:64 chr6 38750812 . T C 319.3 PASS AO=89;DP=208;FAO=89;FDP=207;FR=.;FRO=118;FSAF=34;FSAR=55;FSRF=35;FSRR=83;FWDB=-0.025273;FXX=0.00480746;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.19;QD=6.16996;RBI=0.0324041;REFB=-0.00641619;REVB=0.0202806;RO=117;SAF=34;SAR=55;SRF=35;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0919303;STB=0.552834;TYPE=snp;VARB=0.00845423;OID=.;OPOS=38750812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:207:117:118:89:89:55:34:35:82:55:34:35:83 chr6 38759379 . G A 479.38 PASS AO=109;DP=227;FAO=113;FDP=227;FR=.;FRO=114;FSAF=66;FSAR=47;FSRF=57;FSRR=57;FWDB=-0.00587016;FXX=0.00873324;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6568;QD=8.44715;RBI=0.0210689;REFB=-0.0180113;REVB=0.0202346;RO=111;SAF=62;SAR=47;SRF=54;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0761082;STB=0.542816;TYPE=snp;VARB=0.0279454;OID=.;OPOS=38759379;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:227:227:111:114:109:113:47:62:54:57:47:66:57:57 chr6 38773293 . G A 375.12 PASS AO=86;DP=167;FAO=85;FDP=166;FR=.;FRO=81;FSAF=19;FSAR=66;FSRF=41;FSRR=40;FWDB=0.0235279;FXX=0.00598767;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.9144;QD=9.03899;RBI=0.023535;REFB=0.0130202;REVB=0.000581222;RO=80;SAF=19;SAR=67;SRF=40;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.289939;STB=0.662831;TYPE=snp;VARB=-0.013125;OID=.;OPOS=38773293;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:166:80:81:86:85:67:19:40:40:66:19:41:40 chr6 38781866 . C G 269.29 PASS AO=60;DP=120;FAO=60;FDP=118;FR=.;FRO=58;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=23;FSRR=35;FWDB=-0.00343378;FXX=0.0166653;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.246;QD=9.12853;RBI=0.00404138;REFB=0.0180757;REVB=-0.00213118;RO=55;SAF=26;SAR=34;SRF=22;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0296347;STB=0.518491;TYPE=snp;VARB=-0.0111878;OID=.;OPOS=38781866;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:118:55:58:60:60:34:26:22:33:34:26:23:35 chr6 38800206 . GAAT GAT,GAAC 439.36 PASS AO=30,30;DP=139;FAO=34,55;FDP=115;FR=.;FRO=26;FSAF=0,9;FSAR=34,46;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=-0.112485,0.00913765;FXX=0.0872947;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=15.4957,59.1061;QD=15.2822;RBI=0.15446,0.013198;REFB=-0.137948,-0.0443889;REVB=-0.105854,0.00952313;RO=24;SAF=0,9;SAR=30,21;SRF=10;SRR=14;SSEN=0.26087,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.849786,-0.105774;STB=0.999509,0.61029;TYPE=del,snp;VARB=0.188041,0.0187021;OID=.,.;OPOS=38800207,38800209;OREF=A,T;OALT=-,C;OMAPALT=GAT,GAAC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:30,30:94:34,55:115:26:0,9:34,46:10:16:83:24:0,9:30,21:10:14 chr6 38825329 . C T 259.78 PASS AO=77;DP=187;FAO=77;FDP=189;FR=.;FRO=112;FSAF=36;FSAR=41;FSRF=68;FSRR=44;FWDB=-0.0218733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.6952;QD=5.498;RBI=0.0527482;REFB=-0.0105617;REVB=-0.0479993;RO=109;SAF=36;SAR=41;SRF=66;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143667;STB=0.582175;TYPE=snp;VARB=0.01628;OID=.;OPOS=38825329;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:189:109:112:77:77:41:36:66:43:41:36:68:44 chr6 38841101 . G A 234.4 PASS AO=48;DP=86;FAO=48;FDP=87;FR=.;FRO=39;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=-0.0208812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.997;QD=10.7768;RBI=0.0222624;REFB=-0.0104164;REVB=0.00771945;RO=38;SAF=27;SAR=21;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0294494;STB=0.510912;TYPE=snp;VARB=0.00623668;OID=.;OPOS=38841101;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:87:38:39:48:48:21:27:20:18:21:27:21:18 chr6 38843426 . C T 789.7 PASS AO=205;DP=417;FAO=194;FDP=400;FR=.;FRO=206;FSAF=110;FSAR=84;FSRF=78;FSRR=128;FWDB=0.00787604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.6275;QD=7.89697;RBI=0.0429031;REFB=-0.0200552;REVB=-0.042174;RO=207;SAF=115;SAR=90;SRF=85;SRR=122;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137488;STB=0.596227;TYPE=snp;VARB=0.0221974;OID=.;OPOS=38843426;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:417:400:207:206:205:194:90:115:85:122:84:110:78:128 chr6 38875752 . A G 69.67 PASS AO=27;DP=92;FAO=29;FDP=95;FR=.;FRO=66;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=31;FSRR=35;FWDB=-0.00595758;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.637;QD=2.9334;RBI=0.0414729;REFB=-0.0108388;REVB=0.0410428;RO=63;SAF=12;SAR=15;SRF=31;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0566786;STB=0.539456;TYPE=snp;VARB=0.0249555;OID=.;OPOS=38875752;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:92:95:63:66:27:29:15:12:31:32:17:12:31:35 chr6 38951998 . C T 316.11 PASS AO=75;DP=154;FAO=75;FDP=153;FR=.;FRO=78;FSAF=43;FSAR=32;FSRF=33;FSRR=45;FWDB=-0.0255162;FXX=0.0129024;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.179;QD=8.26426;RBI=0.0331606;REFB=-0.0205073;REVB=-0.0211789;RO=76;SAF=43;SAR=32;SRF=33;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127148;STB=0.576508;TYPE=snp;VARB=0.0194496;OID=.;OPOS=38951998;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:153:76:78:75:75:32:43:33:43:32:43:33:45 chr6 38980081 . A G 789.34 PASS AO=150;DP=263;FAO=158;FDP=273;FR=.;FRO=115;FSAF=90;FSAR=68;FSRF=75;FSRR=40;FWDB=0.00229034;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.297;QD=11.5654;RBI=0.0052548;REFB=0.00332354;REVB=0.0047294;RO=112;SAF=90;SAR=60;SRF=74;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0504406;STB=0.535812;TYPE=snp;VARB=-0.00252072;OID=.;OPOS=38980081;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:263:273:112:115:150:158:60:90:74:38:68:90:75:40 chr6 39033602 . A G 327.65 PASS AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000658591;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=229.595;QD=37.4458;RBI=0.00648533;REFB=0;REVB=0.0064518;RO=0;SAF=21;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.27896e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.28542e-05;OID=.;OPOS=39033602;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:35:35:0:0:35:35:14:21:0:0:14:21:0:0 chr6 39034072 . G A 173.42 PASS AO=38;DP=75;FAO=40;FDP=82;FR=.;FRO=42;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=-0.0374091;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.5004;QD=8.45955;RBI=0.0463336;REFB=-0.0341409;REVB=0.0273378;RO=37;SAF=17;SAR=21;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0378764;STB=0.500611;TYPE=snp;VARB=0.0297643;OID=.;OPOS=39034072;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:82:37:42:38:40:21:17:15:22:21:19:20:22 chr6 39040654 . A C 1398.96 PASS AO=144;DP=145;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00657666;FXX=0.00680226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.612;QD=38.3276;RBI=0.0254391;REFB=0;REVB=-0.0245743;RO=0;SAF=75;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.07191e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.66789e-05;OID=.;OPOS=39040654;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:145:146:0:0:144:146:69:75:0:0:69:77:0:0 chr6 39041502 . A C 1316.27 PASS AO=137;DP=138;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0352402;FXX=0.00724585;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.991;QD=38.4313;RBI=0.0407854;REFB=0;REVB=0.0205323;RO=0;SAF=41;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.73795e-05;OID=.;OPOS=39041502;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:138:137:0:0:137:137:96:41:0:0:96:41:0:0 chr6 39048491 . A C 1000.76 PASS AO=104;DP=104;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0249585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.266;QD=38.1242;RBI=0.0487775;REFB=0;REVB=-0.0419085;RO=0;SAF=60;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000135035;OID=.;OPOS=39048491;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:104:105:0:0:104:105:44:60:0:0:44:61:0:0 chr6 39271881 . C T 103.41 PASS AO=12;DP=39;FAO=19;FDP=32;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=0.178759;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=115.701;QD=12.9256;RBI=0.18079;REFB=-0.024268;REVB=0.0270283;RO=11;SAF=2;SAR=10;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125863;STB=0.561981;TYPE=snp;VARB=0.0143055;OID=.;OPOS=39271881;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:26:32:11:13:12:19:10:2:1:10:12:7:3:10 chr6 39282036 . T C 39.46 PASS AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2985;QD=15.7834;RBI=0.00271552;REFB=-0.0476789;REVB=0.00271552;RO=4;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0592768;OID=.;OPOS=39282036;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:10:10:4:4:6:6:6:0:0:4:6:0:0:4 chr6 39282806 . G T 54.24 PASS AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=0.00429917;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=194.123;QD=8.3451;RBI=0.0293132;REFB=-0.00151207;REVB=-0.0289962;RO=14;SAF=9;SAR=3;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0428589;STB=0.524957;TYPE=snp;VARB=0.00143341;OID=.;OPOS=39282806;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:26:26:14:14:12:12:3:9:10:4:3:9:10:4 chr6 39283083 . G A 312.48 PASS AO=62;DP=115;FAO=65;FDP=119;FR=.;FRO=54;FSAF=27;FSAR=38;FSRF=29;FSRR=25;FWDB=0.0179197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.4111;QD=10.5035;RBI=0.0306641;REFB=-0.0515308;REVB=0.0248832;RO=52;SAF=27;SAR=35;SRF=28;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0860257;STB=0.555741;TYPE=snp;VARB=0.0424572;OID=.;OPOS=39283083;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:119:52:54:62:65:35:27:28:24:38:27:29:25 chr6 39284050 . G T 160.04 PASS AO=27;DP=46;FAO=29;FDP=48;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=4;FWDB=9.86208e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.349;QD=13.3365;RBI=0.0770943;REFB=-0.00950911;REVB=0.0770942;RO=18;SAF=12;SAR=15;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.238113;STB=0.645473;TYPE=snp;VARB=0.00937507;OID=.;OPOS=39284050;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:46:48:18:19:27:29:15:12:14:4:17:12:15:4 chr6 39284184 . A G 210.71 PASS AO=53;DP=116;FAO=53;FDP=115;FR=.;FRO=62;FSAF=44;FSAR=9;FSRF=58;FSRR=4;FWDB=-0.00788321;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.963;QD=7.329;RBI=0.00788973;REFB=0.00136935;REVB=0.000320697;RO=63;SAF=44;SAR=9;SRF=59;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216528;STB=0.616071;TYPE=snp;VARB=-0.00167941;OID=.;OPOS=39284184;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:115:63:62:53:53:9:44:59:4:9:44:58:4 chr6 39286820 . A G 269.01 PASS AO=73;DP=166;FAO=73;FDP=167;FR=.;FRO=94;FSAF=22;FSAR=51;FSRF=34;FSRR=60;FWDB=-0.0143737;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=102.259;QD=6.44345;RBI=0.015937;REFB=-0.02327;REVB=-0.00688361;RO=93;SAF=22;SAR=51;SRF=34;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.07394;STB=0.53906;TYPE=snp;VARB=0.0245496;OID=.;OPOS=39286820;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:167:93:94:73:73:51:22:34:59:51:22:34:60 chr6 39286862 . A G 289.94 PASS AO=72;DP=149;FAO=72;FDP=153;FR=.;FRO=81;FSAF=27;FSAR=45;FSRF=31;FSRR=50;FWDB=-0.0172985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.788;QD=7.57999;RBI=0.0224537;REFB=-0.00199098;REVB=-0.0143154;RO=77;SAF=27;SAR=45;SRF=31;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0272987;STB=0.504347;TYPE=snp;VARB=0.00221124;OID=.;OPOS=39286862;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:153:77:81:72:72:45:27:31:46:45:27:31:50 chr6 39290200 . C T 151 PASS AO=25;DP=38;FAO=25;FDP=38;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.011314;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.371;QD=15.8945;RBI=0.0374455;REFB=-0.0431918;REVB=0.0356953;RO=13;SAF=10;SAR=15;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181712;STB=0.59992;TYPE=snp;VARB=0.0360162;OID=.;OPOS=39290200;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:38:38:13:13:25:25:15:10:9:4:15:10:9:4 chr6 39303166 . A T 145.06 PASS AO=45;DP=117;FAO=45;FDP=117;FR=.;FRO=72;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=36;FSRR=36;FWDB=-0.0215241;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9274;QD=4.95936;RBI=0.0295446;REFB=0.00481407;REVB=-0.0202385;RO=72;SAF=18;SAR=27;SRF=36;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109883;STB=0.562472;TYPE=snp;VARB=-0.00879343;OID=.;OPOS=39303166;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:72:72:45:45:27:18:36:36:27:18:36:36 chr6 39325078 . A G 681.64 PASS AO=185;DP=406;FAO=180;FDP=396;FR=.;FRO=216;FSAF=83;FSAR=97;FSRF=119;FSRR=97;FWDB=0.00868539;FXX=0.00999975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.58;QD=6.8852;RBI=0.0190835;REFB=-0.00922633;REVB=-0.0169925;RO=215;SAF=86;SAR=99;SRF=118;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0817598;STB=0.548908;TYPE=snp;VARB=0.0105375;OID=.;OPOS=39325078;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:406:396:215:216:185:180:99:86:118:97:97:83:119:97 chr6 39507889 . C T 124.77 PASS AO=48;DP=153;FAO=50;FDP=156;FR=.;FRO=106;FSAF=46;FSAR=4;FSRF=103;FSRR=3;FWDB=-0.0170081;FXX=0.00636902;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.3166;QD=3.19921;RBI=0.0648949;REFB=-0.0185922;REVB=-0.0626264;RO=99;SAF=45;SAR=3;SRF=96;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196328;STB=0.649194;TYPE=snp;VARB=0.0370117;OID=.;OPOS=39507889;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:156:99:106:48:50:3:45:96:3:4:46:103:3 chr6 39828862 . A C 167.99 PASS AO=41;DP=88;FAO=41;FDP=88;FR=.;FRO=47;FSAF=3;FSAR=38;FSRF=17;FSRR=30;FWDB=-0.00346459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.772;QD=7.63584;RBI=0.0123775;REFB=-0.00137777;REVB=-0.0118828;RO=47;SAF=3;SAR=38;SRF=17;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.499701;STB=0.788197;TYPE=snp;VARB=0.00113857;OID=.;OPOS=39828862;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:47:47:41:41:38:3:17:30:38:3:17:30 chr6 39847279 . G A 372.32 PASS AO=78;DP=136;FAO=78;FDP=145;FR=.;FRO=67;FSAF=56;FSAR=22;FSRF=48;FSRR=19;FWDB=-0.00162646;FXX=0.0136045;HRUN=3;LEN=1;MLLD=131.854;QD=10.2708;RBI=0.00180219;REFB=-0.0260031;REVB=-0.000776211;RO=57;SAF=56;SAR=22;SRF=47;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10779;STB=0.500872;TYPE=snp;VARB=0.0132183;OID=.;OPOS=39847279;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:145:57:67:78:78:22:56:47:10:22:56:48:19 chr6 39851818 . G A 198.7 PASS AO=42;DP=103;FAO=52;FDP=113;FR=.;FRO=61;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=33;FSRR=28;FWDB=0.0312967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.1;QD=7.03363;RBI=0.0318135;REFB=-0.00788248;REVB=-0.00571063;RO=61;SAF=19;SAR=23;SRF=33;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0927321;STB=0.501369;TYPE=snp;VARB=0.00882326;OID=.;OPOS=39851818;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:113:61:61:42:52:23:19:33:28:24:28:33:28 chr6 39864730 . C T 54.43 PASS AO=15;DP=43;FAO=16;FDP=44;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=20;FWDB=0.0137388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.758;QD=4.94809;RBI=0.017755;REFB=-0.0113529;REVB=0.0112466;RO=28;SAF=5;SAR=10;SRF=8;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0606357;STB=0.520109;TYPE=snp;VARB=0.0228066;OID=.;OPOS=39864730;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:43:44:28:28:15:16:10:5:8:20:11:5:8:20 chr6 39865047 . T C 153.03 PASS AO=30;DP=53;FAO=30;FDP=53;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0157725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.389;QD=11.5496;RBI=0.0162437;REFB=-0.0255859;REVB=-0.00388386;RO=22;SAF=10;SAR=20;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204543;STB=0.605191;TYPE=snp;VARB=0.0186468;OID=.;OPOS=39865047;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:53:53:22:23:30:30:20:10:13:9:20:10:13:10 chr6 39869952 . T A 100.41 PASS AO=33;DP=92;FAO=33;FDP=92;FR=.;FRO=59;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=30;FSRR=29;FWDB=-0.00638164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.967;QD=4.36552;RBI=0.0354977;REFB=-0.0154937;REVB=-0.0349194;RO=58;SAF=14;SAR=19;SRF=29;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0846274;STB=0.554344;TYPE=snp;VARB=0.0323199;OID=.;OPOS=39869952;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:58:59:33:33:19:14:29:29:19:14:30:29 chr6 39873399 . G C 363.24 PASS AO=69;DP=114;FAO=69;FDP=115;FR=.;FRO=46;FSAF=15;FSAR=54;FSRF=15;FSRR=31;FWDB=0.00104096;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=238.262;QD=12.6344;RBI=0.0114875;REFB=-0.00602555;REVB=-0.0114403;RO=45;SAF=15;SAR=54;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114465;STB=0.559567;TYPE=snp;VARB=0.00263792;OID=.;OPOS=39873399;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:115:45:46:69:69:54:15:15:30:54:15:15:31 chr6 39874728 . C T 104.45 PASS AO=29;DP=71;FAO=29;FDP=71;FR=.;FRO=42;FSAF=23;FSAR=6;FSRF=34;FSRR=8;FWDB=-0.0463643;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.2051;QD=5.88449;RBI=0.0492218;REFB=-0.00373999;REVB=-0.016527;RO=41;SAF=23;SAR=6;SRF=34;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0592761;STB=0.51505;TYPE=snp;VARB=0.00438814;OID=.;OPOS=39874728;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:41:42:29:29:6:23:34:7:6:23:34:8 chr6 40360465 . A G 497.71 PASS AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0508064;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2954;QD=37.5627;RBI=0.0520676;REFB=0;REVB=0.0113904;RO=0;SAF=32;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.81969e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000649402;OID=.;OPOS=40360465;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:53:53:0:0:53:53:21:32:0:0:21:32:0:0 chr6 41001859 . G A 219.03 PASS AO=49;DP=99;FAO=49;FDP=97;FR=.;FRO=48;FSAF=17;FSAR=32;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=-0.0388791;FXX=0.0202;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.0838;QD=9.03222;RBI=0.0494689;REFB=-0.0316228;REVB=0.0305873;RO=48;SAF=17;SAR=32;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105753;STB=0.558615;TYPE=snp;VARB=0.034684;OID=.;OPOS=41001859;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:97:48:48:49:49:32:17:22:26:32:17:22:26 chr6 41029109 . T C 229.41 PASS AO=74;DP=194;FAO=74;FDP=194;FR=.;FRO=120;FSAF=34;FSAR=40;FSRF=59;FSRR=61;FWDB=-0.0254227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.671;QD=4.7302;RBI=0.0270816;REFB=-0.00901217;REVB=0.00933274;RO=120;SAF=34;SAR=40;SRF=59;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0353645;STB=0.519983;TYPE=snp;VARB=0.0210786;OID=.;OPOS=41029109;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:194:120:120:74:74:40:34:59:61:40:34:59:61 chr6 41029342 . T C 304.24 PASS AO=60;DP=127;FAO=69;FDP=136;FR=.;FRO=67;FSAF=35;FSAR=34;FSRF=20;FSRR=47;FWDB=-0.0134903;FXX=0.00729874;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.016;QD=8.94835;RBI=0.0187758;REFB=-0.00508713;REVB=-0.0130593;RO=67;SAF=27;SAR=33;SRF=20;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148498;STB=0.602522;TYPE=snp;VARB=0.00566714;OID=.;OPOS=41029342;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:136:67:67:60:69:33:27:20:47:34:35:20:47 chr6 41037778 . C T 480.91 PASS AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00311043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.3714;QD=37.7185;RBI=0.040098;REFB=0;REVB=-0.0399772;RO=0;SAF=35;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.5765e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000110375;OID=.;OPOS=41037778;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:51:51:0:0:51:51:16:35:0:0:16:35:0:0 chr6 41038845 . C T 1702.74 PASS AO=177;DP=179;FAO=178;FDP=178;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00242566;FXX=0.0165737;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.28;QD=38.2639;RBI=0.00796656;REFB=0;REVB=0.00758829;RO=0;SAF=88;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.39664e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.40325e-05;OID=.;OPOS=41038845;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:179:178:0:0:177:178:89:88:0:0:90:88:0:0 chr6 41162518 . T C 1518.39 PASS AO=124;DP=159;FAO=158;FDP=158;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=45;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.109149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.259;QD=38.4402;RBI=0.109465;REFB=0;REVB=0.00830739;RO=0;SAF=13;SAR=111;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.64167e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000133413;OID=.;OPOS=41162518;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:157:158:0:0:124:158:111:13:0:0:113:45:0:0 chr6 41165877 . A G 58.24 PASS AO=24;DP=69;FAO=22;FDP=71;FR=.;FRO=49;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=0.00732197;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3583;QD=3.28113;RBI=0.0539117;REFB=-0.00335763;REVB=-0.0534122;RO=37;SAF=10;SAR=14;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214039;STB=0.538427;TYPE=snp;VARB=0.0306044;OID=.;OPOS=41165877;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:69:71:37:49:24:22:14:10:23:14:12:10:25:24 chr6 41196155 . TC T,TT 527.12 PASS AO=15,40;DP=56;FAO=15,42;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=8,24;FSAR=7,18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0315692,0.030059;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=172.853,184.059;QD=36.9906;RBI=0.0860112,0.0764103;REFB=0,0;REVB=0.0800081,0.0702495;RO=0;SAF=7,23;SAR=8,17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-6.4817e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.026934,0.00800625;OID=.,.;OPOS=41196156,41196156;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:15,40:55:15,42:57:0:8,24:7,18:0:0:25:0:7,23:8,17:0:0 chr6 41196605 . T C 167.37 PASS AO=40;DP=94;FAO=44;FDP=98;FR=.;FRO=54;FSAF=5;FSAR=39;FSRF=5;FSRR=49;FWDB=0.0562593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.415;QD=6.83145;RBI=0.0571618;REFB=-0.020339;REVB=-0.0101175;RO=54;SAF=2;SAR=38;SRF=5;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181865;STB=0.530107;TYPE=snp;VARB=0.0165952;OID=.;OPOS=41196605;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:98:54:54:40:44:38:2:5:49:39:5:5:49 chr6 41196727 . C T 103.76 PASS AO=27;DP=63;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=5;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=-0.0521161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.809;QD=6.58789;RBI=0.055106;REFB=-0.0169648;REVB=-0.017905;RO=36;SAF=5;SAR=22;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.297969;STB=0.671613;TYPE=snp;VARB=0.0276409;OID=.;OPOS=41196727;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:36:36:27:27:22:5:15:21:22:5:15:21 chr6 41197785 . T C 142.21 PASS AO=35;DP=76;FAO=35;FDP=76;FR=.;FRO=41;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=27;FSRR=14;FWDB=-0.0259424;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.141;QD=7.48488;RBI=0.0289672;REFB=-0.0220658;REVB=0.0128876;RO=41;SAF=12;SAR=23;SRF=27;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.301431;STB=0.668808;TYPE=snp;VARB=0.028941;OID=.;OPOS=41197785;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:41:41:35:35:23:12:27:14:23:12:27:14 chr6 41197857 . C T 201.49 PASS AO=39;DP=67;FAO=39;FDP=67;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=27;FSRF=28;FSRR=0;FWDB=0.0214751;FXX=0.0147037;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.119;QD=12.029;RBI=0.0362469;REFB=-0.0854996;REVB=0.0292003;RO=28;SAF=12;SAR=27;SRF=28;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.494725;STB=0.769107;TYPE=snp;VARB=0.0128892;OID=.;OPOS=41197857;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:28:28:39:39:27:12:28:0:27:12:28:0 chr6 41250179 . C T 205.58 PASS AO=45;DP=83;FAO=44;FDP=83;FR=.;FRO=39;FSAF=33;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=-0.0139594;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.3358;QD=9.90733;RBI=0.0151125;REFB=0.00801358;REVB=0.00579006;RO=38;SAF=34;SAR=11;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153469;STB=0.57774;TYPE=snp;VARB=-0.0183532;OID=.;OPOS=41250179;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:38:39:45:44:11:34:23:15:11:33:24:15 chr6 41303592 . T C 210.65 PASS AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0599034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.226;QD=36.6353;RBI=0.0601926;REFB=0;REVB=-0.00589351;RO=0;SAF=6;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.9951e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0004413;OID=.;OPOS=41303592;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:0:0:23:23:17:6:0:0:17:6:0:0 chr6 41309552 . T C 372.83 PASS AO=36;DP=36;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0405925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.108;QD=38.239;RBI=0.0490962;REFB=0;REVB=0.0276167;RO=0;SAF=9;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000128215;OID=.;OPOS=41309552;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:36:39:0:0:36:39:27:9:0:0:29:10:0:0 chr6 41318438 . A G 1794.72 PASS AO=187;DP=187;FAO=187;FDP=187;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0483117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.959;QD=38.3898;RBI=0.0518947;REFB=0;REVB=0.0189483;RO=0;SAF=97;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.85119e-05;OID=.;OPOS=41318438;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:187:187:0:0:187:187:90:97:0:0:90:97:0:0 chr6 41533579 . C A 106.34 PASS AO=31;DP=79;FAO=31;FDP=79;FR=.;FRO=48;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=0.000556792;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.576;QD=5.38449;RBI=0.00383301;REFB=-0.00744677;REVB=0.00379236;RO=48;SAF=11;SAR=20;SRF=21;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0928661;STB=0.55312;TYPE=snp;VARB=0.0105552;OID=.;OPOS=41533579;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:48:48:31:31:20:11:21:27:20:11:21:27 chr6 41621618 . A G 158.91 PASS AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0422543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.2663;QD=37.3914;RBI=0.0422543;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=17;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000854287;OID=.;OPOS=41621618;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:17:17:0:0:17:17:0:17:0:0:0:17:0:0 chr6 41621625 . G A 183.14 PASS AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0338276;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=212.408;QD=38.5549;RBI=0.0338276;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=19;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.80012e-05;OID=.;OPOS=41621625;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:19:19:0:0:19:19:0:19:0:0:0:19:0:0 chr6 41691296 . A G 24.77 PASS AO=6;DP=17;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.0186432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.246;QD=5.82906;RBI=0.0365787;REFB=-0.0112926;REVB=-0.0314712;RO=11;SAF=3;SAR=3;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141704;STB=0.58795;TYPE=snp;VARB=0.0214994;OID=.;OPOS=41691296;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:17:17:11:11:6:6:3:3:4:7:3:3:4:7 chr6 41739173 . C T 55.99 PASS AO=10;DP=19;FAO=11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.0178538;FXX=0.0454339;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.071;QD=10.6647;RBI=0.0369533;REFB=-0.0145098;REVB=-0.0323542;RO=6;SAF=10;SAR=0;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.80723;STB=0.832592;TYPE=snp;VARB=0.0547283;OID=.;OPOS=41739173;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:19:21:6:10:10:11:0:10:3:3:1:10:4:6 chr6 41773576 . G C 87.61 PASS AO=22;DP=51;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.040423;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.4486;QD=6.87137;RBI=0.0442747;REFB=-0.0262839;REVB=0.0180618;RO=27;SAF=7;SAR=15;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0953447;STB=0.559865;TYPE=snp;VARB=0.0612677;OID=.;OPOS=41773576;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:51:51:27:29:22:22:15:7:11:16:15:7:12:17 chr6 41773735 . G A 146.3 PASS AO=23;DP=40;FAO=26;FDP=42;FR=.;FRO=16;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.0170125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.893;QD=13.9333;RBI=0.0246629;REFB=-0.0432773;REVB=0.0178559;RO=12;SAF=18;SAR=5;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0291891;STB=0.54885;TYPE=snp;VARB=0.0180599;OID=.;OPOS=41773735;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:40:42:12:16:23:26:5:18:9:3:7:19:10:6 chr6 41898472 . GC G 1397.72 PASS AO=173;DP=211;FAO=203;FDP=203;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=177;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.200173;FXX=0.0193227;HRUN=2;LEN=1;MLLD=14.7411;QD=27.5413;RBI=0.338356;REFB=0;REVB=0.272793;RO=16;SAF=16;SAR=157;SRF=5;SRR=11;SSEN=0.306517;SSEP=0;SSSB=-0.096113;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0032771;OID=.;OPOS=41898473;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:173:196:203:203:0:26:177:0:0:99:16:16:157:5:11 chr6 41903782 . A C 46.46 PASS AO=11;DP=26;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.0185274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.05;QD=7.1479;RBI=0.0282127;REFB=-0.00189354;REVB=-0.0212765;RO=14;SAF=8;SAR=3;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.299689;STB=0.695286;TYPE=snp;VARB=0.00247829;OID=.;OPOS=41903782;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:26:26:14:15:11:11:3:8:6:8:3:8:6:9 chr6 42044945 . G A 485.94 PASS AO=96;DP=165;FAO=96;FDP=165;FR=.;FRO=69;FSAF=50;FSAR=46;FSRF=25;FSRR=44;FWDB=0.0113276;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.8514;QD=11.7805;RBI=0.0416526;REFB=-0.0326361;REVB=-0.0400827;RO=66;SAF=50;SAR=46;SRF=22;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140318;STB=0.566024;TYPE=snp;VARB=0.0185826;OID=.;OPOS=42044945;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:165:66:69:96:96:46:50:22:44:46:50:25:44 chr6 42110171 . C G 46.04 PASS AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=-0.0226767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.419;QD=10.2315;RBI=0.0383399;REFB=-0.0401251;REVB=-0.0309146;RO=9;SAF=1;SAR=8;SRF=1;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0483045;OID=.;OPOS=42110171;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:18:18:9:9:9:9:8:1:1:8:8:1:1:8 chr6 42123317 . A C 366.97 PASS AO=95;DP=209;FAO=95;FDP=208;FR=.;FRO=113;FSAF=60;FSAR=35;FSRF=75;FSRR=38;FWDB=-0.0207716;FXX=0.00478446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.968;QD=7.05717;RBI=0.0246339;REFB=-0.0189124;REVB=0.0132427;RO=112;SAF=60;SAR=35;SRF=74;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0308866;STB=0.518942;TYPE=snp;VARB=0.0190836;OID=.;OPOS=42123317;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:208:112:113:95:95:35:60:74:38:35:60:75:38 chr6 42162388 . A G 380.33 PASS AO=95;DP=202;FAO=95;FDP=202;FR=.;FRO=107;FSAF=38;FSAR=57;FSRF=46;FSRR=61;FWDB=0.0161001;FXX=0.00492587;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.488;QD=7.53121;RBI=0.016408;REFB=-0.0137596;REVB=-0.00316379;RO=107;SAF=38;SAR=57;SRF=46;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0296485;STB=0.51639;TYPE=snp;VARB=0.0173987;OID=.;OPOS=42162388;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:202:107:107:95:95:57:38:46:61:57:38:46:61 chr6 42185564 . A C 311.62 PASS AO=74;DP=162;FAO=78;FDP=166;FR=.;FRO=88;FSAF=30;FSAR=48;FSRF=26;FSRR=62;FWDB=-0.00660702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.298;QD=7.50882;RBI=0.0178304;REFB=-0.0174017;REVB=-0.0165611;RO=88;SAF=27;SAR=47;SRF=26;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0751146;STB=0.55109;TYPE=snp;VARB=0.0182179;OID=.;OPOS=42185564;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:166:88:88:74:78:47:27:26:62:48:30:26:62 chr6 42231220 . G A 36.71 PASS AO=9;DP=29;FAO=10;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=15;FWDB=0.0348529;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=141.024;QD=5.24375;RBI=0.0484771;REFB=-0.0303794;REVB=-0.0336944;RO=11;SAF=3;SAR=6;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0652168;STB=0.610917;TYPE=snp;VARB=0.051692;OID=.;OPOS=42231220;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:27:28:11:18:9:10:6:3:3:8:7:3:3:15 chr6 42232475 . G A 226.27 PASS AO=53;DP=111;FAO=54;FDP=112;FR=.;FRO=58;FSAF=23;FSAR=31;FSRF=27;FSRR=31;FWDB=0.00678676;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.1236;QD=8.08091;RBI=0.0521588;REFB=0.0197704;REVB=0.0517154;RO=56;SAF=23;SAR=30;SRF=27;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.045122;STB=0.520826;TYPE=snp;VARB=-0.0295308;OID=.;OPOS=42232475;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:112:56:58:53:54:30:23:27:29:31:23:27:31 chr6 42532102 . C T 147.19 PASS AO=15;DP=15;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0347851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.203;QD=36.7969;RBI=0.117694;REFB=0;REVB=0.112436;RO=0;SAF=13;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000861733;OID=.;OPOS=42532102;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:16:0:0:15:16:2:13:0:0:2:14:0:0 chr6 42600319 . A G 2552.1 PASS AO=265;DP=267;FAO=270;FDP=270;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=181;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106937;FXX=0.0109886;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.5811;QD=37.8089;RBI=0.0112003;REFB=-0.0529407;REVB=-0.00333044;RO=2;SAF=86;SAR=179;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00529705;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000156942;OID=.;OPOS=42600319;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:267:270:2:0:265:270:179:86:0:2:181:89:0:0 chr6 42625975 . TA T 30.66 PASS AO=14;DP=52;FAO=14;FDP=49;FR=.;FRO=35;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=28;FSRR=7;FWDB=0.0336225;FXX=0.109071;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.8204;QD=2.50294;RBI=0.0354509;REFB=-0.00124537;REVB=-0.011238;RO=32;SAF=0;SAR=14;SRF=26;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.847995;STB=0.949086;TYPE=del;VARB=0.0923806;OID=.;OPOS=42625976;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:14:52:14:49:35:1:13:28:7:30:32:0:14:26:6 chr6 42627430 . C T 346.43 PASS AO=49;DP=163;FAO=81;FDP=162;FR=.;FRO=81;FSAF=46;FSAR=35;FSRF=35;FSRR=46;FWDB=0.0856673;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=54.2748;QD=8.55386;RBI=0.0975205;REFB=-0.0487224;REVB=-0.046598;RO=64;SAF=46;SAR=3;SRF=29;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.670004;STB=0.567885;TYPE=snp;VARB=0.0760445;OID=.;OPOS=42627430;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:162:64:81:49:81:3:46:29:35:35:46:35:46 chr6 42627434 . G A 391.92 PASS AO=87;DP=170;FAO=88;FDP=170;FR=.;FRO=82;FSAF=51;FSAR=37;FSRF=32;FSRR=50;FWDB=-0.0990895;FXX=0.00584761;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.1412;QD=9.22173;RBI=0.0994894;REFB=-0.0127955;REVB=-0.0089114;RO=79;SAF=51;SAR=36;SRF=32;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157294;STB=0.590949;TYPE=snp;VARB=0.0134267;OID=.;OPOS=42627434;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:170:79:82:87:88:36:51:32:47:37:51:32:50 chr6 42666061 . T C 46.05 PASS AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.00729385;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.3666;QD=10.2329;RBI=0.0312849;REFB=0.00093878;REVB=0.0304228;RO=9;SAF=3;SAR=6;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101784;STB=0.559863;TYPE=snp;VARB=9.37172e-05;OID=.;OPOS=42666061;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:18:18:9:9:9:9:6:3:4:5:6:3:4:5 chr6 42666145 . C T 89.6 PASS AO=29;DP=81;FAO=29;FDP=81;FR=.;FRO=52;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=34;FWDB=0.0212485;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.8118;QD=4.42473;RBI=0.0381273;REFB=-0.0336692;REVB=0.0316574;RO=52;SAF=11;SAR=18;SRF=18;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0396451;STB=0.522836;TYPE=snp;VARB=0.0661995;OID=.;OPOS=42666145;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:81:81:52:52:29:29:18:11:18:34:18:11:18:34 chr6 42666164 . G C 137.82 PASS AO=40;DP=100;FAO=40;FDP=100;FR=.;FRO=60;FSAF=12;FSAR=28;FSRF=18;FSRR=42;FWDB=0.00516839;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.587;QD=5.51291;RBI=0.0176429;REFB=-0.0320401;REVB=-0.0168689;RO=60;SAF=12;SAR=28;SRF=18;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.78777e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0427176;OID=.;OPOS=42666164;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:60:60:40:40:28:12:18:42:28:12:18:42 chr6 42713618 . A G 549.06 PASS AO=61;DP=65;FAO=61;FDP=63;FR=.;FRO=2;FSAF=42;FSAR=19;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0152012;FXX=0.0307645;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.865;QD=34.8612;RBI=0.0212836;REFB=-0.000169514;REVB=-0.0148968;RO=2;SAF=42;SAR=19;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0219486;STB=0.511624;TYPE=snp;VARB=-9.36648e-08;OID=.;OPOS=42713618;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:65:63:2:2:61:61:19:42:2:0:19:42:2:0 chr6 42932200 . G T 107.67 PASS AO=39;DP=115;FAO=39;FDP=115;FR=.;FRO=76;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=37;FSRR=39;FWDB=0.00718502;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4802;QD=3.74499;RBI=0.01138;REFB=-0.00388566;REVB=0.00882499;RO=76;SAF=18;SAR=21;SRF=37;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0290507;STB=0.51677;TYPE=snp;VARB=0.00522133;OID=.;OPOS=42932200;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:76:76:39:39:21:18:37:39:21:18:37:39 chr6 42932202 . C T 1026.02 PASS AO=105;DP=106;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00138008;FXX=0.0178555;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.949;QD=37.3098;RBI=0.0542389;REFB=-0.0165077;REVB=0.0542214;RO=0;SAF=50;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.80947e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.35105e-06;OID=.;OPOS=42932202;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:106:110:0:0:105:110:55:50:0:0:58:52:0:0 chr6 42933464 . G A 235.53 PASS AO=42;DP=66;FAO=42;FDP=67;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=31;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.0211309;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=50.5403;QD=14.0617;RBI=0.0302572;REFB=0.0127771;REVB=-0.021656;RO=24;SAF=11;SAR=31;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154979;STB=0.579399;TYPE=snp;VARB=-0.0184079;OID=.;OPOS=42933464;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:66:67:24:25:42:42:31:11:11:13:31:11:11:14 chr6 42942779 . A G 297.89 PASS AO=67;DP=129;FAO=67;FDP=131;FR=.;FRO=64;FSAF=34;FSAR=33;FSRF=34;FSRR=30;FWDB=-0.0158236;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.4187;QD=9.09583;RBI=0.0368287;REFB=-0.017447;REVB=-0.0332561;RO=61;SAF=34;SAR=33;SRF=32;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0148617;STB=0.511624;TYPE=snp;VARB=0.0211268;OID=.;OPOS=42942779;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:131:61:64:67:67:33:34:32:29:33:34:34:30 chr6 42988841 . C T 54.8 PASS AO=17;DP=36;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=16;FWDB=-0.0971337;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=38.2532;QD=5.92479;RBI=0.0988047;REFB=-0.0598207;REVB=-0.0180943;RO=19;SAF=10;SAR=7;SRF=3;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.384774;STB=0.652294;TYPE=snp;VARB=0.070499;OID=.;OPOS=42988841;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:36:37:19:22:17:15:7:10:3:16:7:8:6:16 chr6 42989057 . T C 1025.16 PASS AO=107;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168404;FXX=0.0181802;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.195;QD=37.9689;RBI=0.0246913;REFB=-0.038693;REVB=0.0180571;RO=0;SAF=61;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.73491e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000149584;OID=.;OPOS=42989057;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:108:108:0:0:107:108:46:61:0:0:47:61:0:0 chr6 42992808 . T C 307.83 PASS AO=94;DP=237;FAO=94;FDP=234;FR=.;FRO=140;FSAF=40;FSAR=54;FSRF=80;FSRR=60;FWDB=-0.0305013;FXX=0.0126577;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.9187;QD=5.26208;RBI=0.0306679;REFB=-0.0148563;REVB=-0.00319217;RO=140;SAF=40;SAR=54;SRF=80;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155095;STB=0.586938;TYPE=snp;VARB=0.0252234;OID=.;OPOS=42992808;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:237:234:140:140:94:94:54:40:80:60:54:40:80:60 chr6 42992825 . C G 340.86 PASS AO=97;DP=227;FAO=97;FDP=227;FR=.;FRO=130;FSAF=38;FSAR=59;FSRF=74;FSRR=56;FWDB=0.00628385;FXX=0.00438577;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.708;QD=6.00635;RBI=0.00640281;REFB=-0.0121325;REVB=0.00122848;RO=125;SAF=38;SAR=59;SRF=72;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186836;STB=0.60191;TYPE=snp;VARB=0.0123977;OID=.;OPOS=42992825;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:227:227:125:130:97:97:59:38:72:53:59:38:74:56 chr6 42995211 . A G 73.78 PASS AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=-0.00900636;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=253.164;QD=8.94265;RBI=0.0101103;REFB=0.00344125;REVB=-0.00459384;RO=17;SAF=7;SAR=9;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134542;STB=0.576379;TYPE=snp;VARB=-0.0038436;OID=.;OPOS=42995211;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:33:33:17:17:16:16:9:7:5:12:9:7:5:12 chr6 43004132 . C T 141.43 PASS AO=18;DP=21;FAO=18;FDP=21;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00858995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.7628;QD=26.9382;RBI=0.0239109;REFB=-0.0307298;REVB=0.0223146;RO=3;SAF=4;SAR=14;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0407973;STB=0.522363;TYPE=snp;VARB=0.0057102;OID=.;OPOS=43004132;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:21:21:3:3:18:18:14:4:1:2:14:4:1:2 chr6 43008298 . C T 61.02 PASS AO=18;DP=49;FAO=18;FDP=49;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.00206916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.022;QD=4.98109;RBI=0.00710791;REFB=-0.00521393;REVB=-0.00680007;RO=31;SAF=10;SAR=8;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0778116;STB=0.545404;TYPE=snp;VARB=0.00841034;OID=.;OPOS=43008298;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:49:49:31:31:18:18:8:10:15:16:8:10:15:16 chr6 43014298 . T C 333.98 PASS AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0382567;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.1406;QD=37.1088;RBI=0.048787;REFB=0;REVB=0.0302754;RO=0;SAF=26;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.46857e-05;OID=.;OPOS=43014298;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:35:36:0:0:35:36:9:26:0:0:9:27:0:0 chr6 43014299 . T C 339.21 PASS AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00755243;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=256.298;QD=37.69;RBI=0.0554686;REFB=0;REVB=0.054952;RO=0;SAF=27;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000132541;OID=.;OPOS=43014299;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:36:36:0:0:36:36:9:27:0:0:9:27:0:0 chr6 43020062 . T A 251.32 PASS AO=61;DP=127;FAO=61;FDP=128;FR=.;FRO=67;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=32;FSRR=35;FWDB=-0.0254316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.243;QD=7.85379;RBI=0.0255936;REFB=-0.00599241;REVB=0.00287483;RO=66;SAF=27;SAR=34;SRF=32;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0399229;STB=0.518474;TYPE=snp;VARB=0.00859236;OID=.;OPOS=43020062;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:128:66:67:61:61:34:27:32:34:34:27:32:35 chr6 43020188 . G A 113.22 PASS AO=26;DP=54;FAO=26;FDP=54;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=-0.0104526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.382;QD=8.38658;RBI=0.0145802;REFB=-0.00479195;REVB=-0.0101649;RO=26;SAF=15;SAR=11;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203727;STB=0.594828;TYPE=snp;VARB=0.00441872;OID=.;OPOS=43020188;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:26:28:26:26:11:15:9:17:11:15:11:17 chr6 43040666 . A T 99.53 PASS AO=25;DP=61;FAO=25;FDP=58;FR=.;FRO=33;FSAF=3;FSAR=22;FSRF=8;FSRR=25;FWDB=-0.0253357;FXX=0.0491723;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.277;QD=6.86394;RBI=0.0274932;REFB=-0.0233325;REVB=0.0106763;RO=31;SAF=3;SAR=22;SRF=8;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.245327;STB=0.631731;TYPE=snp;VARB=0.0334043;OID=.;OPOS=43040666;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:58:31:33:25:25:22:3:8:23:22:3:8:25 chr6 43044620 . A G 99.1 PASS AO=36;DP=100;FAO=34;FDP=98;FR=.;FRO=64;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=38;FSRR=26;FWDB=-0.00418233;FXX=0.0392118;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.484;QD=4.04473;RBI=0.0126398;REFB=-0.0160424;REVB=-0.0119278;RO=63;SAF=25;SAR=11;SRF=38;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112723;STB=0.537253;TYPE=snp;VARB=0.0157243;OID=.;OPOS=43044620;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:98:63:64:36:34:11:25:38:25:12:22:38:26 chr6 43100537 . T G 78.7 PASS AO=17;DP=38;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=16;FSRF=5;FSRR=16;FWDB=-0.00312754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.211;QD=8.07145;RBI=0.0189282;REFB=-0.00903099;REVB=-0.018668;RO=21;SAF=1;SAR=16;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.41714;STB=0.636185;TYPE=snp;VARB=0.00782463;OID=.;OPOS=43100537;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:38:39:21:21:17:18:16:1:5:16:16:2:5:16 chr6 43109751 . G A 54.43 PASS AO=16;DP=44;FAO=16;FDP=44;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=0.00133729;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=173.903;QD=4.94839;RBI=0.00444834;REFB=-0.0093691;REVB=-0.00424257;RO=27;SAF=9;SAR=7;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165113;STB=0.584641;TYPE=snp;VARB=0.0136619;OID=.;OPOS=43109751;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:44:44:27:28:16:16:7:9:11:16:7:9:12:16 chr6 43152366 . C A 198.48 PASS AO=46;DP=96;FAO=48;FDP=102;FR=.;FRO=54;FSAF=11;FSAR=37;FSRF=37;FSRR=17;FWDB=0.0436753;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.597;QD=7.78353;RBI=0.0476245;REFB=-0.0306547;REVB=0.0189884;RO=50;SAF=10;SAR=36;SRF=37;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.494593;STB=0.74926;TYPE=snp;VARB=0.0172768;OID=.;OPOS=43152366;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:102:50:54:46:48:36:10:37:13:37:11:37:17 chr6 43154005 . AC A 20.24 PASS AO=23;DP=86;FAO=24;FDP=82;FR=.;FRO=58;FSAF=3;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=40;FWDB=0.110906;FXX=0.0238067;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.6989;QD=0.987196;RBI=0.124305;REFB=-0.0109418;REVB=0.0561391;RO=47;SAF=3;SAR=20;SRF=14;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0.518519;SSSB=-0.300841;STB=0.706524;TYPE=del;VARB=-0.000179436;OID=.;OPOS=43154006;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:23:82:24:82:58:3:21:18:40:20:47:3:20:14:33 chr6 43154091 . C G 786.12 PASS AO=82;DP=82;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00356232;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=248.519;QD=37.8853;RBI=0.0388875;REFB=0;REVB=0.038724;RO=0;SAF=33;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.22047e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.73439e-05;OID=.;OPOS=43154091;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:82:83:0:0:82:83:49:33:0:0:50:33:0:0 chr6 43155842 . A AC 10.16 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.067831;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=25.0281;QD=5.80723;RBI=0.120083;REFB=-0.054177;REVB=-0.0990907;RO=5;SAF=1;SAR=1;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.306614;STB=0.71253;TYPE=ins;VARB=0.0318051;OID=.;OPOS=43155843;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:2:7:2:7:5:1:1:4:1:10:5:1:1:4:1 chr6 43184132 . A C 47.97 PASS AO=9;DP=27;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.00381426;FXX=0.133289;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.568;QD=7.37939;RBI=0.0126374;REFB=-0.032039;REVB=-0.012048;RO=18;SAF=0;SAR=9;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.78121;STB=0.815611;TYPE=snp;VARB=0.0436774;OID=.;OPOS=43184132;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:27:26:18:15:9:11:9:0:10:8:10:1:7:8 chr6 43188940 . C T 75.94 PASS AO=19;DP=44;FAO=19;FDP=44;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=18;FWDB=-0.0301701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.1874;QD=6.90346;RBI=0.0351215;REFB=-0.00502924;REVB=0.01798;RO=25;SAF=4;SAR=15;SRF=7;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0961829;STB=0.555494;TYPE=snp;VARB=0.00731316;OID=.;OPOS=43188940;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:44:44:25:25:19:19:15:4:7:18:15:4:7:18 chr6 43190135 . C T 130.75 PASS AO=33;DP=73;FAO=33;FDP=74;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=-0.0217111;FXX=0.0263123;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.5908;QD=7.06738;RBI=0.0217832;REFB=-0.00589222;REVB=0.00177127;RO=38;SAF=19;SAR=14;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17172;STB=0.601889;TYPE=snp;VARB=0.00639502;OID=.;OPOS=43190135;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:74:38:41:33:33:14:19:15:23:14:19:16:25 chr6 43190322 . GC G 65.83 PASS AO=8;DP=19;FAO=17;FDP=20;FR=.;FRO=3;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.179513;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=9.60715;QD=13.165;RBI=0.366996;REFB=-0.0620247;REVB=0.320095;RO=9;SAF=3;SAR=5;SRF=2;SRR=7;SSEN=0.441176;SSEP=0;SSSB=0.153362;STB=0.54994;TYPE=del;VARB=0.0783468;OID=.;OPOS=43190323;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:8:19:17:20:3:6:11:2:1:4:9:3:5:2:7 chr6 43193503 . GC G 379.97 PASS AO=48;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.136499;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.8824;QD=22.685;RBI=0.351181;REFB=-0.0157844;REVB=0.323567;RO=7;SAF=36;SAR=12;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0.681818;SSSB=0.136183;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00585914;OID=.;OPOS=43193504;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:48:67:67:67:0:50:17:0:0:32:7:36:12:2:5 chr6 43220479 . GA G 52.45 PASS AO=25;DP=63;FAO=28;FDP=61;FR=.;FRO=33;FSAF=2;FSAR=26;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=0.0472852;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.4797;QD=3.43965;RBI=0.0878375;REFB=-0.0483227;REVB=0.0740238;RO=34;SAF=2;SAR=23;SRF=11;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.448424;STB=0.778539;TYPE=del;VARB=0.064197;OID=.;OPOS=43220480;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:25:63:28:61:33:2:26:11:22:52:34:2:23:11:23 chr6 43250710 . G C 174.57 PASS AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0401729;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.4291;QD=33.2515;RBI=0.0427462;REFB=-0.0526216;REVB=0.0146075;RO=1;SAF=3;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13066;STB=0.57135;TYPE=snp;VARB=0.00224924;OID=.;OPOS=43250710;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:1:1:20:20:17:3:1:0:17:3:1:0 chr6 43251118 . C T 147.38 PASS AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0279014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.459;QD=36.844;RBI=0.0280302;REFB=0;REVB=0.00268412;RO=0;SAF=5;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.36667e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000553504;OID=.;OPOS=43251118;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:16:0:0:16:16:11:5:0:0:11:5:0:0 chr6 43270097 . T C 280.24 PASS AO=31;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0153032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4596;QD=33.9686;RBI=0.0487615;REFB=-0.10902;REVB=0.0462979;RO=0;SAF=19;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.47712e-08;STB=0.518507;TYPE=snp;VARB=0.00831227;OID=.;OPOS=43270097;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:33:33:0:1:31:32:12:19:0:0:13:19:0:1 chr6 43270151 . C T 316.55 PASS AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0403423;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.815;QD=37.2412;RBI=0.0506654;REFB=0;REVB=0.0306509;RO=0;SAF=13;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000286333;OID=.;OPOS=43270151;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:34:0:0:34:34:21:13:0:0:21:13:0:0 chr6 43306346 . A G 1990.88 PASS AO=208;DP=210;FAO=210;FDP=210;FR=.;FRO=0;FSAF=124;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0323875;FXX=0.00943352;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.661;QD=37.9215;RBI=0.0389572;REFB=-0.0824408;REVB=0.0216498;RO=1;SAF=122;SAR=86;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00388887;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000140449;OID=.;OPOS=43306346;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:210:210:1:0:208:210:86:122:1:0:86:124:0:0 chr6 43307392 . T G 10.26 PASS AO=3;DP=17;FAO=3;FDP=15;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=12;FSRR=0;FWDB=0.00502816;FXX=0.117578;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.013;QD=2.73658;RBI=0.00502816;REFB=-0.0134271;REVB=0;RO=13;SAF=3;SAR=0;SRF=13;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0489427;OID=.;OPOS=43307392;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:17:15:13:12:3:3:0:3:13:0:0:3:12:0 chr6 43322525 . T C 740.82 PASS AO=165;DP=321;FAO=172;FDP=339;FR=.;FRO=167;FSAF=95;FSAR=77;FSRF=76;FSRR=91;FWDB=-0.00800333;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.7951;QD=8.74128;RBI=0.0228158;REFB=-0.00289852;REVB=-0.021366;RO=155;SAF=95;SAR=70;SRF=74;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0878573;STB=0.54794;TYPE=snp;VARB=0.00298247;OID=.;OPOS=43322525;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:321:339:155:167:165:172:70:95:74:81:77:95:76:91 chr6 43406501 . C T 842.58 PASS AO=91;DP=93;FAO=92;FDP=94;FR=.;FRO=2;FSAF=44;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00689177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.551;QD=35.8546;RBI=0.041813;REFB=-0.0358018;REVB=0.0412412;RO=2;SAF=43;SAR=48;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0193392;STB=0.510202;TYPE=snp;VARB=0.000426608;OID=.;OPOS=43406501;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:93:94:2:2:91:92:48:43:0:2:48:44:0:2 chr6 43496662 . A C 401.54 PASS AO=100;DP=221;FAO=104;FDP=225;FR=.;FRO=121;FSAF=36;FSAR=68;FSRF=53;FSRR=68;FWDB=-0.0149589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.118;QD=7.13844;RBI=0.0190416;REFB=-0.0029164;REVB=0.0117819;RO=119;SAF=33;SAR=67;SRF=53;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121758;STB=0.552785;TYPE=snp;VARB=0.00325754;OID=.;OPOS=43496662;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:225:119:121:100:104:67:33:53:66:68:36:53:68 chr6 43565568 . G T 380.87 PASS AO=116;DP=287;FAO=116;FDP=286;FR=.;FRO=170;FSAF=25;FSAR=91;FSRF=74;FSRR=96;FWDB=0.0103897;FXX=0.0069442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2379;QD=5.3269;RBI=0.0387416;REFB=-0.00516001;REVB=0.0373225;RO=151;SAF=24;SAR=92;SRF=63;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.266109;STB=0.65833;TYPE=snp;VARB=0.0240185;OID=.;OPOS=43565568;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:287:286:151:170:116:116:92:24:63:88:91:25:74:96 chr6 43638636 . G A 405.41 PASS AO=96;DP=194;FAO=96;FDP=194;FR=.;FRO=98;FSAF=63;FSAR=33;FSRF=55;FSRR=43;FWDB=-0.0133053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.243;QD=8.35894;RBI=0.0200476;REFB=-0.0234253;REVB=0.0149958;RO=97;SAF=63;SAR=33;SRF=55;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0874862;STB=0.551475;TYPE=snp;VARB=0.0236281;OID=.;OPOS=43638636;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:194:97:98:96:96:33:63:55:42:33:63:55:43 chr6 43640099 . A G 101.78 PASS AO=31;DP=82;FAO=31;FDP=82;FR=.;FRO=51;FSAF=7;FSAR=24;FSRF=25;FSRR=26;FWDB=-0.0383101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.854;QD=4.96461;RBI=0.045696;REFB=0.0100512;REVB=-0.0249092;RO=50;SAF=7;SAR=24;SRF=24;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.311255;STB=0.68681;TYPE=snp;VARB=-0.0122396;OID=.;OPOS=43640099;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:50:51:31:31:24:7:24:26:24:7:25:26 chr6 43745321 . GC G 58.99 PASS AO=27;DP=55;FAO=25;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.0129416;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=12.085;QD=4.45205;RBI=0.150552;REFB=-0.084185;REVB=-0.149995;RO=23;SAF=10;SAR=17;SRF=15;SRR=8;SSEN=0.665025;SSEP=0;SSSB=-0.232789;STB=0.608936;TYPE=del;VARB=0.0787579;OID=.;OPOS=43745322;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:27:52:25:53:28:10:15:17:11:56:23:10:17:15:8 chr6 44081718 . G A 497.79 PASS AO=97;DP=184;FAO=107;FDP=194;FR=.;FRO=87;FSAF=68;FSAR=39;FSRF=44;FSRR=43;FWDB=0.0267808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.7996;QD=10.2638;RBI=0.116238;REFB=-0.0214114;REVB=0.113111;RO=84;SAF=66;SAR=31;SRF=43;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154003;STB=0.560729;TYPE=snp;VARB=0.0272214;OID=.;OPOS=44081718;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:194:84:87:97:107:31:66:43:41:39:68:44:43 chr6 44108150 . T C 15.25 PASS AO=3;DP=9;FAO=3;FDP=9;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0654702;FXX=0.0999001;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.1814;QD=6.77888;RBI=0.0825262;REFB=-0.0264835;REVB=-0.0502416;RO=5;SAF=1;SAR=2;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.414454;STB=0.712925;TYPE=snp;VARB=0.0796037;OID=.;OPOS=44108150;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:9:9:5:6:3:3:2:1:4:1:2:1:4:2 chr6 44118378 . GGGCCC GCC,GGCC,GGG 575.67 PASS AO=26,15,20;DP=94;FAO=0,99,0;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=0,33,0;FSAR=0,66,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.164511,-0.119873,-0.516178;FXX=0.0480723;HRUN=4,4,4;LEN=3,2,3;MLLD=15.9277,16.6585,19.6121;QD=23.2596;RBI=0.2895,0.283892,0.517788;REFB=-0.0599158,-0.0795492,-0.0721816;REVB=-0.238215,-0.257342,0.040794;RO=8;SAF=0,0,20;SAR=26,15,0;SRF=0;SRR=8;SSEN=0.445161,0.445161,0.463768;SSEP=0,0,0.536585;SSSB=0,0,0.872336;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=del,del,del;VARB=-0.197028,-0.00562729,0;OID=.,.,.;OPOS=44118379,44118380,44118381;OREF=GGC,GC,CCC;OALT=-,-,-;OMAPALT=GCC,GGCC,GGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:26,15,20:82:0,99,0:99:0:0,33,0:0,66,0:0:0:38:8:0,0,20:26,15,0:0:8 chr6 44140054 . T C 89.2 PASS AO=11;DP=45;FAO=11;FDP=46;FR=.,HEALED;FRO=24;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.0399497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.8084;QD=7.75658;RBI=0.0698537;REFB=-0.01891;REVB=0.0573024;RO=21;SAF=2;SAR=9;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.416825;STB=0.700886;TYPE=snp;VARB=0.0252808;OID=.;OPOS=44140054;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:45:46:21:24:11:11:9:2:11:10:9:2:10:14 chr6 44141088 . G A 62.05 PASS AO=19;DP=53;FAO=19;FDP=53;FR=.;FRO=34;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=-0.0331227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.782;QD=4.68328;RBI=0.0331756;REFB=-0.00351449;REVB=0.00187289;RO=33;SAF=5;SAR=14;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231732;STB=0.647412;TYPE=snp;VARB=0.00433228;OID=.;OPOS=44141088;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:53:53:33:34:19:19:14:5:15:18:14:5:16:18 chr6 44145310 . A C 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0196509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.286;QD=35.0875;RBI=0.0765827;REFB=0;REVB=-0.0740186;RO=0;SAF=1;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00356851;OID=.;OPOS=44145310;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:6:1:0:0:6:1:0:0 chr6 44147821 . A G 273.2 PASS AO=69;DP=153;FAO=70;FDP=153;FR=.;FRO=83;FSAF=15;FSAR=55;FSRF=16;FSRR=67;FWDB=-0.000996663;FXX=0.0129024;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.064;QD=7.14241;RBI=0.015887;REFB=0.0122772;REVB=-0.0158557;RO=80;SAF=15;SAR=54;SRF=16;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.025153;STB=0.517675;TYPE=snp;VARB=-0.0153667;OID=.;OPOS=44147821;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:153:80:83:69:70:54:15:16:64:55:15:16:67 chr6 44151490 . G A 293.88 PASS AO=56;DP=105;FAO=60;FDP=108;FR=.;FRO=48;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=17;FSRR=31;FWDB=0.0114549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.905;QD=10.8844;RBI=0.0119222;REFB=-0.0285985;REVB=-0.00330526;RO=48;SAF=24;SAR=32;SRF=17;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0645335;STB=0.550545;TYPE=snp;VARB=0.0164489;OID=.;OPOS=44151490;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:108:48:48:56:60:32:24:17:31:32:28:17:31 chr6 44218120 . A G 264.77 PASS AO=37;DP=48;FAO=37;FDP=47;FR=.;FRO=10;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.0121898;FXX=0.020829;HRUN=5;LEN=1;MLLD=118.301;QD=22.5337;RBI=0.0247043;REFB=-0.00675351;REVB=-0.0214874;RO=9;SAF=16;SAR=21;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0855027;STB=0.557063;TYPE=snp;VARB=0.000296397;OID=.;OPOS=44218120;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:48:47:9:10:37:37:21:16:6:3:21:16:7:3 chr6 44218121 . C G 14.85 PASS AO=9;DP=47;FAO=9;FDP=47;FR=.;FRO=38;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=0.00594699;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.0467;QD=1.26362;RBI=0.00990945;REFB=-0.00452586;REVB=-0.00792657;RO=38;SAF=6;SAR=3;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.266078;STB=0.675668;TYPE=snp;VARB=0.00403913;OID=.;OPOS=44218121;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:47:47:38:38:9:9:3:6:17:21:3:6:17:21 chr6 44222047 . G A 665.87 PASS AO=175;DP=389;FAO=178;FDP=391;FR=.;FRO=213;FSAF=81;FSAR=97;FSRF=77;FSRR=136;FWDB=-0.0112845;FXX=0.00761402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.551;QD=6.81201;RBI=0.0192909;REFB=-0.00422893;REVB=-0.015646;RO=212;SAF=78;SAR=97;SRF=77;SRR=135;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0837415;STB=0.551853;TYPE=snp;VARB=0.00433264;OID=.;OPOS=44222047;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:389:391:212:213:175:178:97:78:77:135:97:81:77:136 chr6 44224180 . TG T 266.14 PASS AO=35;DP=50;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.222135;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.6186;QD=22.6506;RBI=0.366716;REFB=-0.0537142;REVB=0.291782;RO=11;SAF=14;SAR=21;SRF=3;SRR=8;SSEN=0.576;SSEP=0;SSSB=0.059404;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0348732;OID=.;OPOS=44224181;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:35:47:47:47:0:17:30:0:0:19:11:14:21:3:8 chr6 44247951 . T G 178.41 PASS AO=47;DP=106;FAO=47;FDP=107;FR=.;FRO=60;FSAF=30;FSAR=17;FSRF=29;FSRR=31;FWDB=0.0156355;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.688;QD=6.66959;RBI=0.0661319;REFB=-0.0194426;REVB=-0.064257;RO=58;SAF=30;SAR=17;SRF=29;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141107;STB=0.5894;TYPE=snp;VARB=0.0193585;OID=.;OPOS=44247951;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:107:58:60:47:47:17:30:29:29:17:30:29:31 chr6 44250165 . A G 169.85 PASS AO=32;DP=54;FAO=32;FDP=54;FR=.;FRO=22;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0233756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.499;QD=12.5813;RBI=0.0248969;REFB=-0.0326042;REVB=0.00856936;RO=22;SAF=15;SAR=17;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0105555;STB=0.50581;TYPE=snp;VARB=0.0184551;OID=.;OPOS=44250165;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:54:54:22:22:32:32:17:15:10:12:17:15:10:12 chr6 44253749 . A G 70.8 PASS AO=21;DP=56;FAO=21;FDP=56;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.00385397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.301;QD=5.05692;RBI=0.0191404;REFB=-0.00930083;REVB=-0.0187484;RO=35;SAF=15;SAR=6;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.289163;STB=0.668283;TYPE=snp;VARB=0.015223;OID=.;OPOS=44253749;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:56:56:35:35:21:21:6:15:16:19:6:15:16:19 chr6 44255459 . G A 300.91 PASS AO=89;DP=215;FAO=90;FDP=222;FR=.;FRO=132;FSAF=57;FSAR=33;FSRF=76;FSRR=56;FWDB=-0.00630966;FXX=0.0044841;HRUN=3;LEN=1;MLLD=124.41;QD=5.42174;RBI=0.0143337;REFB=-0.0177658;REVB=-0.0128703;RO=126;SAF=57;SAR=32;SRF=74;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0592195;STB=0.536136;TYPE=snp;VARB=0.0281005;OID=.;OPOS=44255459;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:222:126:132:89:90:32:57:74:52:33:57:76:56 chr6 44268135 . C T 93.47 PASS AO=29;DP=78;FAO=29;FDP=78;FR=.;FRO=49;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=29;FWDB=-0.0234701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.064;QD=4.79326;RBI=0.0247553;REFB=-0.00699778;REVB=0.00787268;RO=47;SAF=11;SAR=18;SRF=18;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00419511;STB=0.519056;TYPE=snp;VARB=0.0117644;OID=.;OPOS=44268135;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:78:78:47:49:29:29:18:11:18:29:18:11:20:29 chr6 44268371 . T C 167.53 PASS AO=39;DP=82;FAO=40;FDP=83;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=30;FSRF=13;FSRR=30;FWDB=0.0671789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.652;QD=8.07364;RBI=0.0672427;REFB=-0.0200882;REVB=-0.00292726;RO=42;SAF=9;SAR=30;SRF=12;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0687184;STB=0.534866;TYPE=snp;VARB=0.0117464;OID=.;OPOS=44268371;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:83:42:43:39:40:30:9:12:30:30:10:13:30 chr6 44269193 . C T 51.04 PASS AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.,HEALED;FRO=6;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.00504847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.283;QD=13.6111;RBI=0.00870582;REFB=0.00892295;REVB=0.00709254;RO=6;SAF=1;SAR=5;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.345446;STB=0.713468;TYPE=snp;VARB=0.0146195;OID=.;OPOS=44269193;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:15:15:6:6:6:6:5:1:3:3:5:1:3:3 chr6 44275003 . AG A 27.58 PASS AO=13;DP=37;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.0427065;FXX=0.0810592;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.4721;QD=3.2447;RBI=0.0860797;REFB=-0.0242076;REVB=-0.0747387;RO=18;SAF=1;SAR=12;SRF=10;SRR=8;SSEN=0.621918;SSEP=0;SSSB=-0.61175;STB=0.880664;TYPE=del;VARB=-0.0155588;OID=.;OPOS=44275004;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:13:36:13:34:21:1:12:12:9:27:18:1:12:10:8 chr6 44275011 . T C 35.47 PASS AO=12;DP=39;FAO=12;FDP=39;FR=.;FRO=27;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=0.000769339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.319;QD=3.6378;RBI=0.015718;REFB=-0.0179314;REVB=0.0156992;RO=26;SAF=4;SAR=8;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0161919;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0412636;OID=.;OPOS=44275011;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:39:39:26:27:12:12:8:4:9:17:8:4:9:18 chr6 44320548 . T A 1240.69 PASS AO=131;DP=133;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0454851;FXX=0.00746213;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.1436;QD=37.3139;RBI=0.052745;REFB=0;REVB=0.0267047;RO=0;SAF=71;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.93893e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00720561;OID=.;OPOS=44320548;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:133:133:0:0:131:133:60:71:0:0:62:71:0:0 chr6 44403438 . A G 142.88 PASS AO=32;DP=63;FAO=32;FDP=64;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.0412958;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.604;QD=8.93005;RBI=0.0418101;REFB=-0.00966473;REVB=-0.006538;RO=30;SAF=12;SAR=20;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112109;STB=0.564475;TYPE=snp;VARB=0.00789792;OID=.;OPOS=44403438;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:64:30:32:32:32:20:12:15:15:20:12:16:16 chr6 44403459 . GC G 208.88 PASS AO=28;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.103397;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=10.4105;QD=21.4232;RBI=0.323532;REFB=0;REVB=0.306565;RO=10;SAF=17;SAR=11;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102243;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0219232;OID=.;OPOS=44403460;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:28:39:39:39:0:21:18:0:0:20:10:17:11:4:6 chr6 44982593 . G A 1868.87 PASS AO=199;DP=201;FAO=199;FDP=199;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0225221;FXX=0.00994975;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.4771;QD=37.5651;RBI=0.0269346;REFB=-0.00412454;REVB=-0.0147725;RO=2;SAF=81;SAR=118;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00800363;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.99604e-05;OID=.;OPOS=44982593;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:201:199:2:0:199:199:118:81:0:2:119:80:0:0 chr6 45866427 . G C 170.59 PASS AO=58;DP=162;FAO=58;FDP=160;FR=.;FRO=102;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=57;FSRR=45;FWDB=0.0459352;FXX=0.0123449;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.7875;QD=4.26474;RBI=0.0489592;REFB=-0.000463799;REVB=-0.0169401;RO=100;SAF=26;SAR=32;SRF=57;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134828;STB=0.570178;TYPE=snp;VARB=0.000587645;OID=.;OPOS=45866427;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:160:100:102:58:58:32:26:57:43:32:26:57:45 chr6 46517742 . C T 268.49 PASS AO=76;DP=182;FAO=77;FDP=183;FR=.;FRO=106;FSAF=58;FSAR=19;FSRF=54;FSRR=52;FWDB=0.00349328;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.197;QD=5.86868;RBI=0.0180951;REFB=-0.0114456;REVB=-0.0177548;RO=106;SAF=58;SAR=18;SRF=54;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.297993;STB=0.659258;TYPE=snp;VARB=0.0164231;OID=.;OPOS=46517742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:183:106:106:76:77:18:58:54:52:19:58:54:52 chr6 46623698 . T C 276.81 PASS AO=91;DP=264;FAO=98;FDP=272;FR=.;FRO=174;FSAF=28;FSAR=70;FSRF=69;FSRR=105;FWDB=-0.0123916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.034;QD=4.07079;RBI=0.0336152;REFB=-0.0145192;REVB=0.0312479;RO=172;SAF=26;SAR=65;SRF=68;SRR=104;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142438;STB=0.580821;TYPE=snp;VARB=0.0278284;OID=.;OPOS=46623698;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:264:272:172:174:91:98:65:26:68:104:70:28:69:105 chr6 46657057 . A G 165.78 PASS AO=36;DP=82;FAO=41;FDP=88;FR=.;FRO=47;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=37;FSRR=10;FWDB=0.0368669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.221;QD=7.53531;RBI=0.0376207;REFB=-0.0190779;REVB=-0.00749322;RO=44;SAF=20;SAR=16;SRF=34;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223376;STB=0.604095;TYPE=snp;VARB=0.0133367;OID=.;OPOS=46657057;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:88:44:47:36:41:16:20:34:10:16:25:37:10 chr6 46672943 . A G 495.99 PASS AO=131;DP=288;FAO=131;FDP=289;FR=.;FRO=158;FSAF=65;FSAR=66;FSRF=66;FSRR=92;FWDB=0.00443283;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.486;QD=6.86491;RBI=0.0221469;REFB=-0.0117952;REVB=-0.0216988;RO=157;SAF=65;SAR=66;SRF=65;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0811158;STB=0.54292;TYPE=snp;VARB=0.0128265;OID=.;OPOS=46672943;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:288:289:157:158:131:131:66:65:65:92:66:65:66:92 chr6 46726500 . C A 295.3 PASS AO=50;DP=74;FAO=50;FDP=75;FR=.;FRO=25;FSAF=36;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.0247306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.854;QD=15.7495;RBI=0.0247457;REFB=-0.047438;REVB=0.000862875;RO=24;SAF=35;SAR=15;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107304;STB=0.577033;TYPE=snp;VARB=0.0274656;OID=.;OPOS=46726500;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:74:75:24:25:50:50:15:35:13:11:14:36:13:12 chr6 46793175 . G A 259.58 PASS AO=67;DP=149;FAO=67;FDP=148;FR=.;FRO=81;FSAF=15;FSAR=52;FSRF=26;FSRR=55;FWDB=0.000464555;FXX=0.00671096;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.163;QD=7.01571;RBI=0.0131993;REFB=-0.0104475;REVB=-0.0131911;RO=69;SAF=15;SAR=52;SRF=26;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178634;STB=0.570489;TYPE=snp;VARB=0.00788439;OID=.;OPOS=46793175;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:148:69:81:67:67:52:15:26:43:52:15:26:55 chr6 46801071 . G T 497.82 PASS AO=111;DP=209;FAO=110;FDP=207;FR=.;FRO=97;FSAF=53;FSAR=57;FSRF=43;FSRR=54;FWDB=0.0947359;FXX=0.00956892;HRUN=4;LEN=1;MLLD=40.2168;QD=9.61967;RBI=0.101144;REFB=-0.042328;REVB=0.0354279;RO=92;SAF=53;SAR=58;SRF=39;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0447269;STB=0.518094;TYPE=snp;VARB=0.035697;OID=.;OPOS=46801071;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:207:92:97:111:110:58:53:39:53:57:53:43:54 chr6 46801219 . G A 230.41 PASS AO=37;DP=92;FAO=48;FDP=89;FR=.;FRO=41;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=0.0115392;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.763;QD=10.3556;RBI=0.0173231;REFB=-0.01411;REVB=-0.0129203;RO=37;SAF=21;SAR=16;SRF=14;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168966;STB=0.522229;TYPE=snp;VARB=0.0142325;OID=.;OPOS=46801219;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:89:37:41:37:48:16:21:14:23:27:21:16:25 chr6 46802370 . G A 776.4 PASS AO=192;DP=400;FAO=193;FDP=400;FR=.;FRO=207;FSAF=124;FSAR=69;FSRF=114;FSRR=93;FWDB=-0.00799055;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.469;QD=7.76396;RBI=0.0334744;REFB=-0.0152729;REVB=0.0325067;RO=207;SAF=123;SAR=69;SRF=114;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0894868;STB=0.5502;TYPE=snp;VARB=0.0165955;OID=.;OPOS=46802370;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:400:400:207:207:192:193:69:123:114:93:69:124:114:93 chr6 46806809 . C T 347.59 PASS AO=76;DP=145;FAO=76;FDP=144;FR=.;FRO=68;FSAF=40;FSAR=36;FSRF=27;FSRR=41;FWDB=0.00794924;FXX=0.00689608;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.102;QD=9.65533;RBI=0.0179785;REFB=-0.019639;REVB=-0.0161257;RO=66;SAF=40;SAR=36;SRF=26;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11198;STB=0.5608;TYPE=snp;VARB=0.017351;OID=.;OPOS=46806809;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:144:66:68:76:76:36:40:26:40:36:40:27:41 chr6 46824448 . A G 190.56 PASS AO=58;DP=142;FAO=57;FDP=142;FR=.;FRO=85;FSAF=25;FSAR=32;FSRF=48;FSRR=37;FWDB=-0.018147;FXX=0.00699252;HRUN=5;LEN=1;MLLD=44.088;QD=5.36783;RBI=0.0381059;REFB=0.0159502;REVB=-0.0335074;RO=80;SAF=25;SAR=33;SRF=44;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12291;STB=0.575202;TYPE=snp;VARB=-0.0251733;OID=.;OPOS=46824448;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:80:85:58:57:33:25:44:36:32:25:48:37 chr6 46826508 . G A 188.51 PASS AO=41;DP=80;FAO=41;FDP=80;FR=.;FRO=39;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=0.0143229;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.498;QD=9.42532;RBI=0.0261341;REFB=0.0111947;REVB=-0.0218596;RO=38;SAF=24;SAR=17;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00573707;STB=0.502199;TYPE=snp;VARB=-0.0112166;OID=.;OPOS=46826508;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:38:39:41:41:17:24:22:16:17:24:23:16 chr6 46826715 . T A 473.43 PASS AO=112;DP=226;FAO=112;FDP=226;FR=.;FRO=114;FSAF=55;FSAR=57;FSRF=45;FSRR=69;FWDB=-0.0328206;FXX=0.00440509;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.788;QD=8.37933;RBI=0.0328444;REFB=0.0058099;REVB=-0.00125014;RO=107;SAF=55;SAR=57;SRF=40;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104897;STB=0.548685;TYPE=snp;VARB=-0.00621009;OID=.;OPOS=46826715;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:226:226:107:114:112:112:57:55:40:67:57:55:45:69 chr6 46826844 . T C 661.43 PASS AO=143;DP=265;FAO=143;FDP=265;FR=.;FRO=122;FSAF=85;FSAR=58;FSRF=55;FSRR=67;FWDB=0.0124344;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.282;QD=9.98384;RBI=0.0171261;REFB=-0.00443202;REVB=0.0117766;RO=122;SAF=85;SAR=58;SRF=55;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122528;STB=0.566808;TYPE=snp;VARB=0.00486732;OID=.;OPOS=46826844;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:265:265:122:122:143:143:58:85:55:67:58:85:55:67 chr6 46826910 . G A 412.73 PASS AO=112;DP=253;FAO=112;FDP=253;FR=.;FRO=141;FSAF=79;FSAR=33;FSRF=81;FSRR=60;FWDB=0.0117551;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.188;QD=6.52539;RBI=0.0150693;REFB=-0.00370937;REVB=-0.00942864;RO=140;SAF=79;SAR=33;SRF=81;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142182;STB=0.581833;TYPE=snp;VARB=0.00630017;OID=.;OPOS=46826910;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:253:253:140:141:112:112:33:79:81:59:33:79:81:60 chr6 46827073 . A G 817.17 PASS AO=173;DP=314;FAO=174;FDP=318;FR=.;FRO=144;FSAF=76;FSAR=98;FSRF=74;FSRR=70;FWDB=-0.00700371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.045;QD=10.2789;RBI=0.0144373;REFB=-0.00939481;REVB=0.0126248;RO=141;SAF=76;SAR=97;SRF=74;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0710028;STB=0.535164;TYPE=snp;VARB=0.00607237;OID=.;OPOS=46827073;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:314:318:141:144:173:174:97:76:74:67:98:76:74:70 chr6 46827126 . C T 698.28 PASS AO=141;DP=245;FAO=141;FDP=246;FR=.;FRO=105;FSAF=61;FSAR=80;FSRF=49;FSRR=56;FWDB=0.052658;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=130.901;QD=11.3542;RBI=0.0526983;REFB=-0.00625982;REVB=-0.00205872;RO=104;SAF=61;SAR=80;SRF=48;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229649;STB=0.514738;TYPE=snp;VARB=0.00539534;OID=.;OPOS=46827126;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:245:246:104:105:141:141:80:61:48:56:80:61:49:56 chr6 46832813 . G A 483.99 PASS AO=126;DP=275;FAO=126;FDP=275;FR=.;FRO=149;FSAF=71;FSAR=55;FSRF=83;FSRR=66;FWDB=0.00935458;FXX=0.00362306;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.22;QD=7.03988;RBI=0.0222449;REFB=-0.0133284;REVB=-0.0201823;RO=149;SAF=71;SAR=55;SRF=83;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00641357;STB=0.503546;TYPE=snp;VARB=0.0160055;OID=.;OPOS=46832813;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:275:275:149:149:126:126:55:71:83:66:55:71:83:66 chr6 46834685 . G A 737.46 PASS AO=147;DP=260;FAO=150;FDP=263;FR=.;FRO=113;FSAF=73;FSAR=77;FSRF=59;FSRR=54;FWDB=-0.0186176;FXX=0.00754688;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.442;QD=11.2161;RBI=0.0194674;REFB=-0.00882901;REVB=-0.00568896;RO=110;SAF=73;SAR=74;SRF=59;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0313683;STB=0.515231;TYPE=snp;VARB=0.00926927;OID=.;OPOS=46834685;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:260:263:110:113:147:150:74:73:59:51:77:73:59:54 chr6 46856100 . G A 257.02 PASS AO=75;DP=182;FAO=75;FDP=182;FR=.;FRO=107;FSAF=62;FSAR=13;FSRF=88;FSRR=19;FWDB=-0.0019528;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.939;QD=5.64874;RBI=0.0186886;REFB=-0.00817827;REVB=-0.0185863;RO=104;SAF=62;SAR=13;SRF=85;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0167215;STB=0.50432;TYPE=snp;VARB=0.0119565;OID=.;OPOS=46856100;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:182:104:107:75:75:13:62:85:19:13:62:88:19 chr6 46995508 . G GA 22.2 PASS AO=22;DP=71;FAO=24;FDP=57;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=-0.30882;FXX=0.149231;HRUN=8;LEN=1;MLLD=5.63082;QD=1.55796;RBI=0.310772;REFB=-0.157209;REVB=0.0347738;RO=40;SAF=10;SAR=12;SRF=12;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177362;STB=0.519464;TYPE=ins;VARB=0.12935;OID=.;OPOS=46995509;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:22:71:24:57:33:8:16:12:21:22:40:10:12:12:28 chr6 47563692 . C T 2348.8 PASS AO=241;DP=244;FAO=248;FDP=248;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=193;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0237857;FXX=0.00799968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.835;QD=37.8839;RBI=0.0321589;REFB=-0.0278458;REVB=0.0216433;RO=0;SAF=52;SAR=189;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.31517e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000185553;OID=.;OPOS=47563692;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:94:244:248:0:0:241:248:189:52:0:0:193:55:0:0 chr6 47594302 . T C 2059.4 PASS AO=214;DP=215;FAO=215;FDP=215;FR=.;FRO=0;FSAF=129;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00379768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.287;QD=38.3145;RBI=0.00398;REFB=0;REVB=0.0011908;RO=0;SAF=128;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.84806e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.16124e-06;OID=.;OPOS=47594302;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:97:215:215:0:0:214:215:86:128:0:0:86:129:0:0 chr6 47624239 . A G 17.61 PASS AO=6;DP=24;FAO=6;FDP=24;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=-0.0085105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.972;QD=2.93582;RBI=0.0422504;REFB=-0.00227666;REVB=-0.0413844;RO=17;SAF=3;SAR=3;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16883;STB=0.62461;TYPE=snp;VARB=0.012508;OID=.;OPOS=47624239;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:24:24:17:18:6:6:3:3:11:6:3:3:12:6 chr6 47624299 . A G 75.32 PASS AO=17;DP=36;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=-0.0358917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.3939;QD=8.36872;RBI=0.0901856;REFB=-0.0235211;REVB=-0.0827359;RO=19;SAF=6;SAR=11;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.301849;STB=0.671827;TYPE=snp;VARB=0.0200234;OID=.;OPOS=47624299;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:36:36:19:19:17:17:11:6:13:6:11:6:13:6 chr6 47626833 . C A 409.79 PASS AO=46;DP=156;FAO=85;FDP=153;FR=.;FRO=68;FSAF=43;FSAR=42;FSRF=36;FSRR=32;FWDB=-0.0184603;FXX=0.00649309;HRUN=4;LEN=1;MLLD=60.691;QD=10.7134;RBI=0.0214222;REFB=-0.00916098;REVB=0.0108686;RO=58;SAF=4;SAR=42;SRF=32;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.606421;STB=0.510459;TYPE=snp;VARB=0.0047085;OID=.;OPOS=47626833;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:153:58:68:46:85:42:4:32:26:42:43:36:32 chr6 47646842 . A G 249.49 PASS AO=55;DP=106;FAO=55;FDP=106;FR=.;FRO=51;FSAF=8;FSAR=47;FSRF=19;FSRR=32;FWDB=-0.0118186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.682;QD=9.41453;RBI=0.022541;REFB=-0.00369152;REVB=-0.0191942;RO=50;SAF=8;SAR=47;SRF=19;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.30467;STB=0.667472;TYPE=snp;VARB=0.00243327;OID=.;OPOS=47646842;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:50:51:55:55:47:8:19:31:47:8:19:32 chr6 47649222 . T G 223.52 PASS AO=58;DP=129;FAO=58;FDP=130;FR=.;FRO=72;FSAF=33;FSAR=25;FSRF=37;FSRR=35;FWDB=-0.0405943;FXX=0.00763301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6592;QD=6.87738;RBI=0.041232;REFB=0.0172488;REVB=-0.00722382;RO=68;SAF=33;SAR=25;SRF=33;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0816587;STB=0.53082;TYPE=snp;VARB=-0.00622385;OID=.;OPOS=47649222;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:130:68:72:58:58:25:33:33:35:25:33:37:35 chr6 47649265 . T A 251.59 PASS AO=61;DP=126;FAO=61;FDP=127;FR=.;FRO=66;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=30;FSRR=36;FWDB=-0.0498547;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.48;QD=7.92402;RBI=0.0520709;REFB=-0.0183137;REVB=-0.0150296;RO=65;SAF=29;SAR=32;SRF=30;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129671;STB=0.510877;TYPE=snp;VARB=0.0153459;OID=.;OPOS=47649265;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:127:65:66:61:61:32:29:30:35:32:29:30:36 chr6 47649573 . C T 102.81 PASS AO=28;DP=69;FAO=28;FDP=68;FR=.;FRO=40;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=-0.0100662;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.426;QD=6.04734;RBI=0.0110094;REFB=0.00422043;REVB=0.00445855;RO=40;SAF=13;SAR=15;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0369568;STB=0.521038;TYPE=snp;VARB=-0.0524027;OID=.;OPOS=47649573;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:68:40:40:28:28:15:13:20:20:15:13:20:20 chr6 47649574 . A G 102.25 PASS AO=29;DP=70;FAO=29;FDP=70;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=-0.00260062;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=160.589;QD=5.84273;RBI=0.00356797;REFB=9.17117e-05;REVB=-0.00244279;RO=41;SAF=14;SAR=15;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0303147;STB=0.517229;TYPE=snp;VARB=-0.00138897;OID=.;OPOS=47649574;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:41:41:29:29:15:14:21:20:15:14:21:20 chr6 47649694 . A G 536.78 PASS AO=124;DP=242;FAO=124;FDP=244;FR=.;FRO=120;FSAF=61;FSAR=63;FSRF=50;FSRR=70;FWDB=0.0140873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.5747;QD=8.79964;RBI=0.0211055;REFB=-0.00748125;REVB=-0.0157159;RO=118;SAF=61;SAR=63;SRF=50;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.060837;STB=0.537065;TYPE=snp;VARB=0.00645724;OID=.;OPOS=47649694;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:242:244:118:120:124:124:63:61:50:68:63:61:50:70 chr6 47654742 . A T 310.87 PASS AO=88;DP=207;FAO=88;FDP=207;FR=.;FRO=119;FSAF=65;FSAR=23;FSRF=49;FSRR=70;FWDB=0.0020065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.647;QD=6.00717;RBI=0.0107863;REFB=-0.00588735;REVB=0.0105981;RO=119;SAF=65;SAR=23;SRF=49;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.352351;STB=0.697426;TYPE=snp;VARB=0.00929072;OID=.;OPOS=47654742;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:207:119:119:88:88:23:65:49:70:23:65:49:70 chr6 47682604 . A C 480.27 PASS AO=116;DP=232;FAO=115;FDP=235;FR=.;FRO=120;FSAF=59;FSAR=56;FSRF=65;FSRR=55;FWDB=-0.0691673;FXX=0.0126045;HRUN=3;LEN=1;MLLD=118.108;QD=8.17488;RBI=0.0726417;REFB=-0.0226448;REVB=-0.022197;RO=115;SAF=60;SAR=56;SRF=64;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0357328;STB=0.514635;TYPE=snp;VARB=0.0173297;OID=.;OPOS=47682604;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:235:115:120:116:115:56:60:64:51:56:59:65:55 chr6 47684591 . G A 351.57 PASS AO=110;DP=274;FAO=108;FDP=271;FR=.;FRO=163;FSAF=64;FSAR=44;FSRF=86;FSRR=77;FWDB=0.0194771;FXX=0.0145449;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.03;QD=5.18923;RBI=0.0213316;REFB=-0.00314229;REVB=0.00869949;RO=163;SAF=66;SAR=44;SRF=86;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.078874;STB=0.53987;TYPE=snp;VARB=0.0070242;OID=.;OPOS=47684591;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:274:271:163:163:110:108:44:66:86:77:44:64:86:77 chr6 47847179 . A G 385.88 PASS AO=87;DP=170;FAO=87;FDP=170;FR=.;FRO=83;FSAF=39;FSAR=48;FSRF=47;FSRR=36;FWDB=0.0121399;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5256;QD=9.07945;RBI=0.0121841;REFB=-0.00661837;REVB=-0.00103732;RO=83;SAF=39;SAR=48;SRF=47;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104794;STB=0.557523;TYPE=snp;VARB=0.00513209;OID=.;OPOS=47847179;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:170:83:83:87:87:48:39:47:36:48:39:47:36 chr6 47847401 . A G 113.16 PASS AO=35;DP=94;FAO=36;FDP=95;FR=.;FRO=59;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=28;FSRR=31;FWDB=0.0156724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.774;QD=4.76464;RBI=0.015698;REFB=-0.00901477;REVB=-0.00089697;RO=57;SAF=16;SAR=19;SRF=26;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00109534;STB=0.501465;TYPE=snp;VARB=0.0142984;OID=.;OPOS=47847401;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:95:57:59:35:36:19:16:26:31:19:17:28:31 chr6 49459978 . A G 1048.58 PASS AO=94;DP=96;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0766943;FXX=0.0173898;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2405;QD=37.1177;RBI=0.0843535;REFB=-0.0103385;REVB=0.0351213;RO=1;SAF=50;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00938906;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000393172;OID=.;OPOS=49459978;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:96:113:1:0:94:113:44:50:1:0:62:51:0:0 chr6 49460152 . A G 852.23 PASS AO=93;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0997129;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.9488;QD=35.5095;RBI=0.10898;REFB=-0.177881;REVB=0.0439777;RO=3;SAF=32;SAR=61;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0423889;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0115125;OID=.;OPOS=49460152;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:96:96:3:0:93:96:61:32:3:0:61:35:0:0 chr6 49479750 . T C 551.01 PASS AO=156;DP=370;FAO=158;FDP=368;FR=.;FRO=210;FSAF=78;FSAR=80;FSRF=118;FSRR=92;FWDB=0.0269823;FXX=0.00540526;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.966;QD=5.98927;RBI=0.0294307;REFB=-0.0136236;REVB=0.0117524;RO=208;SAF=78;SAR=78;SRF=118;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0692581;STB=0.538901;TYPE=snp;VARB=0.0162583;OID=.;OPOS=49479750;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:370:368:208:210:156:158:78:78:118:90:80:78:118:92 chr6 49479775 . A T 517.36 PASS AO=145;DP=334;FAO=145;FDP=334;FR=.;FRO=189;FSAF=71;FSAR=74;FSRF=103;FSRR=86;FWDB=-0.0407415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4763;QD=6.19588;RBI=0.0479765;REFB=-0.0257006;REVB=-0.0253352;RO=188;SAF=71;SAR=74;SRF=102;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0537758;STB=0.531271;TYPE=snp;VARB=0.036949;OID=.;OPOS=49479775;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:334:334:188:189:145:145:74:71:102:86:74:71:103:86 chr6 49485266 . C A 518.34 PASS AO=120;DP=241;FAO=122;FDP=242;FR=.;FRO=120;FSAF=47;FSAR=75;FSRF=22;FSRR=98;FWDB=0.0157134;FXX=0.00819639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.933;QD=8.56762;RBI=0.0160463;REFB=-0.00901691;REVB=-0.00325163;RO=115;SAF=46;SAR=74;SRF=22;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191673;STB=0.611061;TYPE=snp;VARB=0.010194;OID=.;OPOS=49485266;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:241:242:115:120:120:122:74:46:22:93:75:47:22:98 chr6 49489397 . C A 492.17 PASS AO=118;DP=243;FAO=120;FDP=247;FR=.;FRO=127;FSAF=43;FSAR=77;FSRF=40;FSRR=87;FWDB=0.0577046;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.1466;QD=7.97037;RBI=0.0711173;REFB=-0.00664854;REVB=-0.0415674;RO=125;SAF=43;SAR=75;SRF=40;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.04548;STB=0.524581;TYPE=snp;VARB=0.00677211;OID=.;OPOS=49489397;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:243:247:125:127:118:120:75:43:40:85:77:43:40:87 chr6 49494241 . A G 120.19 PASS AO=37;DP=98;FAO=37;FDP=97;FR=.;FRO=60;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=37;FWDB=0.000220598;FXX=0.010203;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.046;QD=4.95623;RBI=0.0488876;REFB=-0.00938032;REVB=0.0488871;RO=60;SAF=16;SAR=21;SRF=23;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0547609;STB=0.53118;TYPE=snp;VARB=0.00750972;OID=.;OPOS=49494241;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:97:60:60:37:37:21:16:23:37:21:16:23:37 chr6 49518914 . C G 1421.88 PASS AO=148;DP=155;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0369577;FXX=0.0555521;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.0279;QD=37.1734;RBI=0.0369819;REFB=0;REVB=0.00133584;RO=0;SAF=63;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00182228;OID=.;OPOS=49518914;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:155:153:0:0:148:153:85:63:0:0:90:63:0:0 chr6 49701439 . C A 204.22 PASS AO=51;DP=111;FAO=51;FDP=111;FR=.;FRO=60;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=29;FSRR=31;FWDB=0.015692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.584;QD=7.35931;RBI=0.0177175;REFB=0.00206384;REVB=-0.00822625;RO=60;SAF=27;SAR=24;SRF=29;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0447034;STB=0.524911;TYPE=snp;VARB=-0.00303806;OID=.;OPOS=49701439;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:60:60:51:51:24:27:29:31:24:27:29:31 chr6 49701523 . A G 185.15 PASS AO=42;DP=103;FAO=49;FDP=110;FR=.;FRO=61;FSAF=14;FSAR=35;FSRF=25;FSRR=36;FWDB=-0.0227939;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.598;QD=6.73261;RBI=0.0420059;REFB=-0.0235253;REVB=0.0352836;RO=58;SAF=14;SAR=28;SRF=23;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0710413;STB=0.578601;TYPE=snp;VARB=0.0348536;OID=.;OPOS=49701523;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:110:58:61:42:49:28:14:23:35:35:14:25:36 chr6 51480486 . G T 293.26 PASS AO=63;DP=118;FAO=63;FDP=119;FR=.;FRO=56;FSAF=27;FSAR=36;FSRF=26;FSRR=30;FWDB=0.0174039;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.773;QD=9.85738;RBI=0.0218098;REFB=-0.0195597;REVB=0.0131444;RO=54;SAF=27;SAR=36;SRF=24;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0135992;STB=0.517068;TYPE=snp;VARB=0.012253;OID=.;OPOS=51480486;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:119:54:56:63:63:36:27:24:30:36:27:26:30 chr6 51483961 . T C 193.64 PASS AO=41;DP=81;FAO=42;FDP=81;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=12;FSRR=27;FWDB=0.00972659;FXX=0.0121936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.784;QD=9.56223;RBI=0.012099;REFB=-0.00926078;REVB=0.00719584;RO=37;SAF=16;SAR=25;SRF=12;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0603768;STB=0.538053;TYPE=snp;VARB=0.00940901;OID=.;OPOS=51483961;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:37:39:41:42:25:16:12:25:26:16:12:27 chr6 51491884 . T C 340 PASS AO=76;DP=159;FAO=77;FDP=152;FR=.;FRO=75;FSAF=21;FSAR=56;FSRF=29;FSRR=46;FWDB=-0.023376;FXX=0.0440224;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.143;QD=8.94736;RBI=0.0282742;REFB=0.00432217;REVB=0.0159057;RO=71;SAF=21;SAR=55;SRF=27;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107806;STB=0.566554;TYPE=snp;VARB=-0.00543544;OID=.;OPOS=51491884;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:152:71:75:76:77:55:21:27:44:56:21:29:46 chr6 51586771 . G A 279.41 PASS AO=47;DP=71;FAO=47;FDP=71;FR=.;FRO=24;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.0190741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.528;QD=15.7414;RBI=0.0236016;REFB=-0.000892779;REVB=-0.0139001;RO=24;SAF=22;SAR=25;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0584673;STB=0.531709;TYPE=snp;VARB=0.000541193;OID=.;OPOS=51586771;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:71:71:24:24:47:47:25:22:9:15:25:22:9:15 chr6 51613177 . C T 196.83 PASS AO=39;DP=70;FAO=39;FDP=70;FR=.;FRO=31;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=0.0437073;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.2388;QD=11.2475;RBI=0.0717844;REFB=0.0641966;REVB=0.0569445;RO=31;SAF=25;SAR=14;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207138;STB=0.614237;TYPE=snp;VARB=-0.0210082;OID=.;OPOS=51613177;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:31:31:39:39:14:25:12:19:14:25:12:19 chr6 51720838 . T C 349.3 PASS AO=89;DP=193;FAO=89;FDP=192;FR=.;FRO=103;FSAF=19;FSAR=70;FSRF=33;FSRR=70;FWDB=-0.00404712;FXX=0.00518108;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.057;QD=7.27709;RBI=0.00616036;REFB=-0.00639483;REVB=0.00464444;RO=97;SAF=19;SAR=70;SRF=32;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147328;STB=0.577759;TYPE=snp;VARB=0.00872371;OID=.;OPOS=51720838;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:192:97:103:89:89:70:19:32:65:70:19:33:70 chr6 51732807 . C T 398.2 PASS AO=101;DP=216;FAO=102;FDP=219;FR=.;FRO=117;FSAF=39;FSAR=63;FSRF=53;FSRR=64;FWDB=0.0318953;FXX=0.00454525;HRUN=3;LEN=1;MLLD=131.423;QD=7.27297;RBI=0.0320085;REFB=0.00748712;REVB=0.00268902;RO=114;SAF=38;SAR=63;SRF=53;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0883459;STB=0.539205;TYPE=snp;VARB=-0.0113992;OID=.;OPOS=51732807;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:216:219:114:117:101:102:63:38:53:61:63:39:53:64 chr6 51875250 . A C 1323.54 PASS AO=142;DP=145;FAO=142;FDP=144;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0273894;FXX=0.00689608;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.445;QD=36.7649;RBI=0.0280221;REFB=-0.037486;REVB=-0.00592113;RO=2;SAF=23;SAR=119;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00792484;STB=0.504166;TYPE=snp;VARB=0.00158035;OID=.;OPOS=51875250;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:145:144:2:2:142:142:119:23:0:2:119:23:0:2 chr6 51890823 . G A 342.65 PASS AO=77;DP=153;FAO=78;FDP=153;FR=.;FRO=75;FSAF=36;FSAR=42;FSRF=40;FSRR=35;FWDB=-0.0159639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.562;QD=8.95805;RBI=0.0178423;REFB=0.0033049;REVB=0.00796862;RO=75;SAF=35;SAR=42;SRF=40;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0707394;STB=0.535202;TYPE=snp;VARB=-0.00316421;OID=.;OPOS=51890823;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:153:75:75:77:78:42:35:40:35:42:36:40:35 chr6 51914956 . G A 157.66 PASS AO=37;DP=76;FAO=37;FDP=78;FR=.;FRO=41;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=-0.00267433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.536;QD=8.08521;RBI=0.0448788;REFB=-0.00380863;REVB=0.044799;RO=39;SAF=22;SAR=15;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0289111;STB=0.531233;TYPE=snp;VARB=0.00574937;OID=.;OPOS=51914956;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:78:39:41:37:37:15:22:22:17:15:22:22:19 chr6 51917968 . T G 376.52 PASS AO=93;DP=203;FAO=96;FDP=206;FR=.;FRO=110;FSAF=41;FSAR=55;FSRF=69;FSRR=41;FWDB=-0.0107568;FXX=0.00961492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.449;QD=7.31111;RBI=0.0136043;REFB=-0.0168943;REVB=-0.00832881;RO=89;SAF=41;SAR=52;SRF=56;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16669;STB=0.605826;TYPE=snp;VARB=0.017466;OID=.;OPOS=51917968;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:206:89:110:93:96:52:41:56:33:55:41:69:41 chr6 51924774 . A G 1589.35 PASS AO=166;DP=166;FAO=166;FDP=166;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0259393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.5637;QD=38.2975;RBI=0.0292236;REFB=0;REVB=-0.0134599;RO=0;SAF=90;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.08707e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.44437e-05;OID=.;OPOS=51924774;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:166:166:0:0:166:166:76:90:0:0:76:90:0:0 chr6 51947257 . G A 277.35 PASS AO=60;DP=115;FAO=60;FDP=114;FR=.;FRO=54;FSAF=42;FSAR=18;FSRF=46;FSRR=8;FWDB=-0.00739304;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.681;QD=9.73171;RBI=0.0221859;REFB=-0.0201695;REVB=0.0209179;RO=53;SAF=42;SAR=18;SRF=45;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163663;STB=0.591901;TYPE=snp;VARB=0.0128719;OID=.;OPOS=51947257;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:114:53:54:60:60:18:42:45:8:18:42:46:8 chr6 52051274 . G A 259.26 PASS AO=67;DP=151;FAO=68;FDP=152;FR=.;FRO=84;FSAF=26;FSAR=42;FSRF=57;FSRR=27;FWDB=0.0203484;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.652;QD=6.82271;RBI=0.0260105;REFB=-0.00661041;REVB=0.0162014;RO=84;SAF=26;SAR=41;SRF=57;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.284588;STB=0.660182;TYPE=snp;VARB=0.00540701;OID=.;OPOS=52051274;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:152:84:84:67:68:41:26:57:27:42:26:57:27 chr6 52101844 . T C 357.99 PASS AO=74;DP=138;FAO=75;FDP=138;FR=.;FRO=63;FSAF=35;FSAR=40;FSRF=35;FSRR=28;FWDB=-0.00204509;FXX=0.00719373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.993;QD=10.3765;RBI=0.00557079;REFB=-0.001134;REVB=0.00518182;RO=64;SAF=35;SAR=39;SRF=36;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0756779;STB=0.54053;TYPE=snp;VARB=0.000888311;OID=.;OPOS=52101844;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:64:63:74:75:39:35:36:28:40:35:35:28 chr6 52269151 . T C 392.15 PASS AO=71;DP=113;FAO=71;FDP=113;FR=.;FRO=42;FSAF=27;FSAR=44;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=-0.0147289;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=214.725;QD=13.8815;RBI=0.0158376;REFB=-0.015738;REVB=0.00582137;RO=42;SAF=27;SAR=44;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0517132;STB=0.528038;TYPE=snp;VARB=0.00893516;OID=.;OPOS=52269151;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:42:42:71:71:44:27:19:23:44:27:19:23 chr6 52269199 . T C 230.65 PASS AO=81;DP=226;FAO=81;FDP=225;FR=.;FRO=144;FSAF=36;FSAR=45;FSRF=49;FSRR=95;FWDB=-0.00215612;FXX=0.00442458;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.208;QD=4.10043;RBI=0.00951488;REFB=-0.0127828;REVB=0.00926737;RO=142;SAF=36;SAR=45;SRF=47;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131595;STB=0.568512;TYPE=snp;VARB=0.016625;OID=.;OPOS=52269199;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:226:225:142:144:81:81:45:36:47:95:45:36:49:95 chr6 52269685 . C A 287.79 PASS AO=65;DP=131;FAO=66;FDP=131;FR=.;FRO=65;FSAF=23;FSAR=43;FSRF=23;FSRR=42;FWDB=-0.01094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.431;QD=8.78758;RBI=0.0147372;REFB=-0.0139466;REVB=0.00987424;RO=65;SAF=23;SAR=42;SRF=23;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.502923;TYPE=snp;VARB=0.0163946;OID=.;OPOS=52269685;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:65:65:65:66:42:23:23:42:43:23:23:42 chr6 52270504 . G C 301.42 PASS AO=87;DP=207;FAO=87;FDP=208;FR=.;FRO=121;FSAF=35;FSAR=52;FSRF=45;FSRR=76;FWDB=-0.0219251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.648;QD=5.7966;RBI=0.022002;REFB=-0.0184607;REVB=0.00183804;RO=120;SAF=35;SAR=52;SRF=44;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0388013;STB=0.518514;TYPE=snp;VARB=0.0233296;OID=.;OPOS=52270504;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:208:120:121:87:87:52:35:44:76:52:35:45:76 chr6 52270992 . G A 290.1 PASS AO=66;DP=131;FAO=66;FDP=131;FR=.;FRO=65;FSAF=42;FSAR=24;FSRF=31;FSRR=34;FWDB=-0.00813605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.717;QD=8.85799;RBI=0.00890839;REFB=-0.0173736;REVB=0.00362824;RO=65;SAF=42;SAR=24;SRF=31;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147873;STB=0.581637;TYPE=snp;VARB=0.0171997;OID=.;OPOS=52270992;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:65:65:66:66:24:42:31:34:24:42:31:34 chr6 52271194 . AAG A 123.93 PASS AO=45;DP=125;FAO=50;FDP=113;FR=.;FRO=63;FSAF=34;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=32;FWDB=0.000746499;FXX=0.0341851;HRUN=4;LEN=2;MLLD=283.462;QD=4.38687;RBI=0.0088029;REFB=4.81461e-05;REVB=0.00877119;RO=54;SAF=33;SAR=12;SRF=32;SRR=22;SSEN=0.311111;SSEP=0;SSSB=0.159877;STB=0.610733;TYPE=del;VARB=0.000223318;OID=.;OPOS=52271195;OREF=AG;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:45:113:50:113:63:34:16:31:32:99:54:33:12:32:22 chr6 52271544 . A G 15.36 PASS AO=3;DP=9;FAO=3;FDP=9;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.000451946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=339.234;QD=6.82569;RBI=0.000451946;REFB=0.00297075;REVB=0;RO=6;SAF=3;SAR=0;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0037417;OID=.;OPOS=52271544;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:9:9:6:6:3:3:0:3:6:0:0:3:6:0 chr6 52271604 . GC G 57.82 PASS AO=18;DP=34;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=-0.0799951;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=17.3663;QD=6.80214;RBI=0.0823039;REFB=-0.0903425;REVB=-0.0193578;RO=16;SAF=14;SAR=4;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0.477876;SSSB=0.453092;STB=0.805382;TYPE=del;VARB=0.0767201;OID=.;OPOS=52271605;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:18:34:17:34:17:14:3:4:13:42:16:14:4:4:12 chr6 52272033 . C T 1476.23 PASS AO=164;DP=169;FAO=164;FDP=169;FR=.;FRO=5;FSAF=80;FSAR=84;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.00237602;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1294;QD=34.9403;RBI=0.0102674;REFB=-0.0413693;REVB=0.00998867;RO=4;SAF=80;SAR=84;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0107785;STB=0.508523;TYPE=snp;VARB=0.00564465;OID=.;OPOS=52272033;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:169:169:4:5:164:164:84:80:1:3:84:80:1:4 chr6 52272467 . C CTTGA 509.37 PASS AO=43;DP=103;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0433263;FXX=0.311794;HRUN=2;LEN=4;MLLD=165.071;QD=31.8359;RBI=0.0535967;REFB=0.0160272;REVB=0.0315507;RO=51;SAF=14;SAR=29;SRF=39;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.41048;STB=0.508194;TYPE=ins;VARB=-0.00155553;OID=.;OPOS=52272468;OREF=-;OALT=TTGA;OMAPALT=CTTGA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:43:103:63:64:1:30:33:1:0:12:51:14:29:39:12 chr6 52272471 . C A 124.48 PASS AO=39;DP=95;FAO=40;FDP=95;FR=.;FRO=55;FSAF=34;FSAR=6;FSRF=22;FSRR=33;FWDB=-0.00105724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.331;QD=5.24147;RBI=0.014879;REFB=-0.00446225;REVB=-0.0148414;RO=54;SAF=33;SAR=6;SRF=21;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.523606;STB=0.797669;TYPE=snp;VARB=0.0345313;OID=.;OPOS=52272471;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:54:55:39:40:6:33:21:33:6:34:22:33 chr6 52360283 . T A 903.85 PASS AO=94;DP=94;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0302834;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.751;QD=38.0569;RBI=0.0350728;REFB=0;REVB=0.0176923;RO=0;SAF=71;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000867224;OID=.;OPOS=52360283;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:94:95:0:0:94:95:23:71:0:0:24:71:0:0 chr6 52360331 . G A 261.13 PASS AO=64;DP=140;FAO=66;FDP=141;FR=.;FRO=75;FSAF=14;FSAR=52;FSRF=23;FSRR=52;FWDB=0.00279673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.969;QD=7.40802;RBI=0.0104582;REFB=0.00945611;REVB=0.0100773;RO=74;SAF=13;SAR=51;SRF=23;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144099;STB=0.569208;TYPE=snp;VARB=-0.0103252;OID=.;OPOS=52360331;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:141:74:75:64:66:51:13:23:51:52:14:23:52 chr6 52362405 . G A 172.76 PASS AO=41;DP=90;FAO=41;FDP=87;FR=.;FRO=46;FSAF=13;FSAR=28;FSRF=4;FSRR=42;FWDB=-0.00550958;FXX=0.0333296;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.015;QD=7.9428;RBI=0.0446165;REFB=-0.0146822;REVB=-0.044275;RO=46;SAF=13;SAR=28;SRF=4;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.286218;STB=0.656504;TYPE=snp;VARB=0.0139641;OID=.;OPOS=52362405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:87:46:46:41:41:28:13:4:42:28:13:4:42 chr6 52362865 . A T 235.84 PASS AO=53;DP=105;FAO=53;FDP=104;FR=.;FRO=51;FSAF=39;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=30;FWDB=-0.0322673;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.239;QD=9.07065;RBI=0.0336083;REFB=-0.0066665;REVB=-0.00939884;RO=52;SAF=39;SAR=14;SRF=21;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.317462;STB=0.671293;TYPE=snp;VARB=0.00774685;OID=.;OPOS=52362865;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:104:52:51:53:53:14:39:21:31:14:39:21:30 chr6 52617731 . C G 601.66 PASS AO=145;DP=298;FAO=145;FDP=296;FR=.;FRO=151;FSAF=55;FSAR=90;FSRF=60;FSRR=91;FWDB=0.033524;FXX=0.00671118;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.7382;QD=8.13059;RBI=0.0335858;REFB=0.00206451;REVB=0.00203663;RO=149;SAF=55;SAR=90;SRF=58;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00972912;STB=0.509725;TYPE=snp;VARB=-0.00230634;OID=.;OPOS=52617731;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:298:296:149:151:145:145:90:55:58:91:90:55:60:91 chr6 52658962 . T C 495.09 PASS AO=111;DP=227;FAO=120;FDP=243;FR=.;FRO=123;FSAF=39;FSAR=81;FSRF=33;FSRR=90;FWDB=0.0753458;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.2582;QD=8.14965;RBI=0.0772159;REFB=0.000473971;REVB=-0.0168909;RO=116;SAF=32;SAR=79;SRF=32;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141647;STB=0.533472;TYPE=snp;VARB=-0.000591305;OID=.;OPOS=52658962;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:227:243:116:123:111:120:79:32:32:84:81:39:33:90 chr6 52701143 . C T 1153.88 PASS AO=124;DP=124;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00516189;FXX=0.0241916;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.938;QD=38.1449;RBI=0.0190802;REFB=0;REVB=0.0183687;RO=0;SAF=32;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.56993e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.39459e-06;OID=.;OPOS=52701143;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:124:121:0:0:124:121:92:32:0:0:92:29:0:0 chr6 52843131 . G T 2560.38 PASS AO=263;DP=263;FAO=267;FDP=267;FR=.;FRO=0;FSAF=150;FSAR=117;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0242011;FXX=0.0037312;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.1267;QD=38.3578;RBI=0.0435454;REFB=0;REVB=0.0362009;RO=0;SAF=148;SAR=115;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000206391;OID=.;OPOS=52843131;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:263:267:0:0:263:267:115:148:0:0:117:150:0:0 chr6 52844045 . G A 1607.44 PASS AO=170;DP=171;FAO=170;FDP=170;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00148778;FXX=0.00584761;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.963;QD=37.8221;RBI=0.0321835;REFB=-0.0243225;REVB=0.0321491;RO=1;SAF=85;SAR=85;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00556671;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000194855;OID=.;OPOS=52844045;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:171:170:1:0:170:170:85:85:0:1:85:85:0:0 chr6 52963071 . A G 824.81 PASS AO=87;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00235564;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.761;QD=37.4914;RBI=0.00495753;REFB=0;REVB=0.00436211;RO=0;SAF=43;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.92144e-05;OID=.;OPOS=52963071;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:88:88:0:0:87:88:44:43:0:0:44:44:0:0 chr6 53362982 . C CA 117.63 PASS AO=60;DP=178;FAO=68;FDP=171;FR=.;FRO=103;FSAF=38;FSAR=30;FSRF=41;FSRR=62;FWDB=-0.0178514;FXX=0.0284075;HRUN=2;LEN=1;MLLD=18.7497;QD=2.75161;RBI=0.0916623;REFB=-0.0261327;REVB=-0.0899072;RO=97;SAF=39;SAR=21;SRF=43;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228269;STB=0.595949;TYPE=ins;VARB=0.0127427;OID=.;OPOS=53362983;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:60:178:68:171:103:38:30:41:62:99:97:39:21:43:54 chr6 53363487 . GGGCT G 101.19 PASS AO=36;DP=133;FAO=63;FDP=163;FR=.;FRO=100;FSAF=35;FSAR=28;FSRF=49;FSRR=51;FWDB=-0.0104876;FXX=0.0121205;HRUN=3;LEN=4;MLLD=178.445;QD=2.48316;RBI=0.0107346;REFB=-0.0270866;REVB=-0.00228963;RO=72;SAF=35;SAR=1;SRF=37;SRR=35;SSEN=0.38835;SSEP=0;SSSB=0.739427;STB=0.540343;TYPE=del;VARB=0.0448886;OID=.;OPOS=53363488;OREF=GGCT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:36:117:63:163:100:35:28:49:51:99:72:35:1:37:35 chr6 53370107 . T C 99.03 PASS AO=24;DP=53;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=21;FSAR=3;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=-0.00391429;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.2198;QD=7.47374;RBI=0.038369;REFB=-0.00572007;REVB=-0.0381688;RO=27;SAF=21;SAR=3;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.355411;STB=0.715112;TYPE=snp;VARB=0.0125233;OID=.;OPOS=53370107;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:27:29:24:24:3:21:17:10:3:21:18:11 chr6 53516876 . T G 147.38 PASS AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0035167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.93;QD=36.8439;RBI=0.0035167;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=16;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.96913e-05;OID=.;OPOS=53516876;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:16:0:0:16:16:0:16:0:0:0:16:0:0 chr6 53519062 . A G 2833.06 PASS AO=308;DP=312;FAO=307;FDP=307;FR=.;FRO=0;FSAF=144;FSAR=163;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0281965;FXX=0.0160251;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1233;QD=36.9128;RBI=0.0557314;REFB=0.0515363;REVB=-0.0480723;RO=4;SAF=144;SAR=164;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00693223;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00153389;OID=.;OPOS=53519062;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:312:307:4:0:308:307:164:144:3:1:163:144:0:0 chr6 53519605 . C T 2436.3 PASS AO=255;DP=257;FAO=255;FDP=255;FR=.;FRO=0;FSAF=109;FSAR=146;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170312;FXX=0.0116275;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.307;QD=38.2165;RBI=0.0511458;REFB=-0.0625434;REVB=0.0482269;RO=0;SAF=109;SAR=146;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.33258e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00023851;OID=.;OPOS=53519605;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:257:255:0:0:255:255:146:109:0:0:146:109:0:0 chr6 53519857 . G A 2053.75 PASS AO=214;DP=221;FAO=221;FDP=221;FR=.;FRO=0;FSAF=120;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014002;FXX=0.0133923;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9693;QD=37.172;RBI=0.0140404;REFB=0.0634696;REVB=0.00103823;RO=6;SAF=117;SAR=97;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00244698;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00274437;OID=.;OPOS=53519857;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:221:221:6:0:214:221:97:117:3:3:101:120:0:0 chr6 53989526 . G A 236.39 PASS AO=54;DP=107;FAO=54;FDP=108;FR=.;FRO=54;FSAF=32;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=37;FWDB=0.0289584;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.726;QD=8.7553;RBI=0.0326043;REFB=-0.0220058;REVB=0.0149817;RO=53;SAF=32;SAR=22;SRF=17;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240455;STB=0.636498;TYPE=snp;VARB=0.0247466;OID=.;OPOS=53989526;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:108:53:54:54:54:22:32:17:36:22:32:17:37 chr6 54025155 . T C 233.31 PASS AO=61;DP=136;FAO=61;FDP=136;FR=.;FRO=75;FSAF=50;FSAR=11;FSRF=65;FSRR=10;FWDB=0.00733566;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=251.742;QD=6.8619;RBI=0.0166682;REFB=-0.0115604;REVB=-0.0149672;RO=75;SAF=50;SAR=11;SRF=65;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0838694;STB=0.546422;TYPE=snp;VARB=0.0125025;OID=.;OPOS=54025155;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:75:75:61:61:11:50:65:10:11:50:65:10 chr6 54054686 . T A 109.57 PASS AO=42;DP=130;FAO=43;FDP=132;FR=.;FRO=89;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=60;FSRR=29;FWDB=0.00191189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.65;QD=3.32024;RBI=0.0080816;REFB=-0.0176686;REVB=-0.0078522;RO=88;SAF=15;SAR=27;SRF=60;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.366219;STB=0.695979;TYPE=snp;VARB=0.0323905;OID=.;OPOS=54054686;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:132:88:89:42:43:27:15:60:28:27:16:60:29 chr6 54079968 . G A 553.9 PASS AO=134;DP=274;FAO=134;FDP=274;FR=.;FRO=140;FSAF=65;FSAR=69;FSRF=75;FSRR=65;FWDB=-0.00781028;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.191;QD=8.08611;RBI=0.0209824;REFB=-0.00284066;REVB=0.0194746;RO=140;SAF=65;SAR=69;SRF=75;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0470579;STB=0.525854;TYPE=snp;VARB=0.00286298;OID=.;OPOS=54079968;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:274:274:140:140:134:134:69:65:75:65:69:65:75:65 chr6 54095524 . C T 252.28 PASS AO=80;DP=206;FAO=80;FDP=206;FR=.;FRO=126;FSAF=51;FSAR=29;FSRF=53;FSRR=73;FWDB=0.00361907;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=199.184;QD=4.8986;RBI=0.0212313;REFB=-0.0143898;REVB=-0.0209205;RO=126;SAF=51;SAR=29;SRF=53;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235897;STB=0.632967;TYPE=snp;VARB=0.017975;OID=.;OPOS=54095524;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:206:206:126:126:80:80:29:51:53:73:29:51:53:73 chr6 54186147 . T C 1918.27 PASS AO=209;DP=213;FAO=208;FDP=208;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=143;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183279;FXX=0.0234731;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9616;QD=36.8899;RBI=0.035218;REFB=0.00762215;REVB=-0.0300732;RO=4;SAF=66;SAR=143;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00759892;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000338691;OID=.;OPOS=54186147;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:213:208:4:0:209:208:143:66:2:2:143:65:0:0 chr6 54191970 . T A 1051.87 PASS AO=108;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.066688;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.7696;QD=38.6006;RBI=0.0673642;REFB=0;REVB=0.00952068;RO=0;SAF=63;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.69741e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000371846;OID=.;OPOS=54191970;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:109:109:0:0:108:109:45:63:0:0:46:63:0:0 chr6 54735122 . A G 109.65 PASS AO=38;DP=109;FAO=38;FDP=109;FR=.;FRO=71;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=34;FSRR=37;FWDB=-0.0178819;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.152;QD=4.02374;RBI=0.0180969;REFB=-0.00999128;REVB=-0.00278159;RO=71;SAF=16;SAR=22;SRF=34;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0662088;STB=0.53814;TYPE=snp;VARB=0.0157779;OID=.;OPOS=54735122;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:71:71:38:38:22:16:34:37:22:16:34:37 chr6 54735344 . A G 568.57 PASS AO=146;DP=314;FAO=146;FDP=313;FR=.;FRO=167;FSAF=64;FSAR=82;FSRF=66;FSRR=101;FWDB=0.0285138;FXX=0.00318461;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.8225;QD=7.26604;RBI=0.0298544;REFB=-0.023391;REVB=0.00884598;RO=168;SAF=64;SAR=82;SRF=66;SRR=102;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0451169;STB=0.523508;TYPE=snp;VARB=0.0359455;OID=.;OPOS=54735344;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:314:313:168:167:146:146:82:64:66:102:82:64:66:101 chr6 54805688 . A C 186.98 PASS AO=64;DP=176;FAO=64;FDP=176;FR=.;FRO=112;FSAF=40;FSAR=24;FSRF=54;FSRR=58;FWDB=-0.0215615;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=197.946;QD=4.24962;RBI=0.0340516;REFB=-0.0162126;REVB=-0.0263554;RO=110;SAF=40;SAR=24;SRF=52;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171664;STB=0.592456;TYPE=snp;VARB=0.0266971;OID=.;OPOS=54805688;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:176:110:112:64:64:24:40:52:58:24:40:54:58 chr6 54806489 . C A 111.95 PASS AO=33;DP=83;FAO=34;FDP=88;FR=.;FRO=54;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=32;FWDB=0.0614836;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=39.9136;QD=5.08883;RBI=0.080969;REFB=-0.0168078;REVB=-0.0526853;RO=50;SAF=14;SAR=19;SRF=22;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170069;STB=0.502761;TYPE=snp;VARB=0.0222506;OID=.;OPOS=54806489;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:88:50:54:33:34:19:14:22:28:20:14:22:32 chr6 55142337 . A G 1323.85 PASS AO=137;DP=140;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0362983;FXX=0.021427;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.123;QD=38.6527;RBI=0.0395746;REFB=0;REVB=-0.0157663;RO=1;SAF=51;SAR=86;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00549644;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0003356;OID=.;OPOS=55142337;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:140:137:1:0:137:137:86:51:0:1:86:51:0:0 chr6 55266625 . T C 516.04 PASS AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0380591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.0746;QD=37.5305;RBI=0.0425583;REFB=0;REVB=-0.0190451;RO=0;SAF=37;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.85968e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000425176;OID=.;OPOS=55266625;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:55:55:0:0:55:55:18:37:0:0:18:37:0:0 chr6 55428658 . A C 241.06 PASS AO=25;DP=32;FAO=30;FDP=32;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0135621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.675;QD=30.1321;RBI=0.112862;REFB=-0.106642;REVB=0.112045;RO=1;SAF=23;SAR=2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0197596;STB=0.52082;TYPE=snp;VARB=0.00249296;OID=.;OPOS=55428658;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:32:1:2:25:30:2:23:1:0:7:23:2:0 chr6 55428724 . A C 101.36 PASS AO=23;DP=48;FAO=23;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=-0.000775495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.126;QD=8.44703;RBI=0.0399481;REFB=-0.0297873;REVB=0.0399406;RO=24;SAF=7;SAR=16;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0729128;STB=0.533304;TYPE=snp;VARB=0.0561827;OID=.;OPOS=55428724;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:24:25:23:23:16:7:9:15:16:7:9:16 chr6 55739553 . A G 1663.21 PASS AO=187;DP=197;FAO=188;FDP=197;FR=.;FRO=9;FSAF=79;FSAR=109;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=0.0192783;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=113.875;QD=33.7708;RBI=0.0222831;REFB=-0.233713;REVB=0.0111752;RO=1;SAF=78;SAR=109;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0060654;STB=0.514556;TYPE=snp;VARB=0.001541;OID=.;OPOS=55739553;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:197:197:1:9:187:188:109:78:1:0:109:79:1:8 chr6 55942956 . C G 260.39 PASS AO=65;DP=140;FAO=65;FDP=140;FR=.;FRO=75;FSAF=30;FSAR=35;FSRF=29;FSRR=46;FWDB=0.00580372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.874;QD=7.43968;RBI=0.0267227;REFB=0.0041553;REVB=0.0260848;RO=72;SAF=30;SAR=35;SRF=27;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0832675;STB=0.540588;TYPE=snp;VARB=-0.00406697;OID=.;OPOS=55942956;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:72:75:65:65:35:30:27:45:35:30:29:46 chr6 55988932 . T C 375.63 PASS AO=116;DP=297;FAO=118;FDP=299;FR=.;FRO=181;FSAF=61;FSAR=57;FSRF=62;FSRR=119;FWDB=-0.0124079;FXX=0.00333322;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.304;QD=5.02512;RBI=0.0227166;REFB=-0.0333784;REVB=0.0190286;RO=177;SAF=59;SAR=57;SRF=61;SRR=116;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176739;STB=0.60493;TYPE=snp;VARB=0.0297193;OID=.;OPOS=55988932;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:297:299:177:181:116:118:57:59:61:116:57:61:62:119 chr6 56323489 . TG T 129.46 PASS AO=40;DP=70;FAO=42;FDP=69;FR=.;FRO=27;FSAF=1;FSAR=41;FSRF=8;FSRR=19;FWDB=0.0177335;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=15.0287;QD=7.5047;RBI=0.0248692;REFB=-0.108766;REVB=-0.0174357;RO=28;SAF=1;SAR=39;SRF=8;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.620162;STB=0.859877;TYPE=del;VARB=0.0912773;OID=.;OPOS=56323490;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:40:69:42:69:27:1:41:8:19:50:28:1:39:8:20 chr6 56327849 . C T 355.33 PASS AO=84;DP=170;FAO=84;FDP=170;FR=.;FRO=86;FSAF=46;FSAR=38;FSRF=57;FSRR=29;FWDB=0.00783889;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.76;QD=8.36066;RBI=0.0246623;REFB=-0.0199003;REVB=-0.0233834;RO=86;SAF=46;SAR=38;SRF=57;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108196;STB=0.559449;TYPE=snp;VARB=0.023524;OID=.;OPOS=56327849;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:170:86:86:84:84:38:46:57:29:38:46:57:29 chr6 56333747 . A G 135.94 PASS AO=33;DP=74;FAO=34;FDP=75;FR=.;FRO=41;FSAF=25;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=0.0104006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.326;QD=7.25003;RBI=0.0989836;REFB=-0.00929688;REVB=0.0984357;RO=41;SAF=24;SAR=9;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209557;STB=0.623253;TYPE=snp;VARB=0.00882121;OID=.;OPOS=56333747;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:75:41:41:33:34:9:24:22:19:9:25:22:19 chr6 56417282 . C T 628.74 PASS AO=91;DP=201;FAO=94;FDP=196;FR=.,HEALED;FRO=69;FSAF=36;FSAR=58;FSRF=54;FSRR=15;FWDB=0.00680209;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.273;QD=12.8314;RBI=0.00834838;REFB=-0.0370689;REVB=0.00484015;RO=63;SAF=34;SAR=57;SRF=53;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.342456;STB=0.665104;TYPE=snp;VARB=0.00863967;OID=.;OPOS=56417282;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:196:63:69:91:94:57:34:53:10:58:36:54:15 chr6 56417545 . T C 203.58 PASS AO=45;DP=92;FAO=47;FDP=95;FR=.;FRO=48;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=19;FSRR=29;FWDB=0.00916603;FXX=0.0104156;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.355;QD=8.57188;RBI=0.0267798;REFB=-0.0160259;REVB=-0.0251623;RO=45;SAF=22;SAR=23;SRF=18;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0804353;STB=0.536812;TYPE=snp;VARB=0.0230627;OID=.;OPOS=56417545;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:95:45:48:45:47:23:22:18:27:25:22:19:29 chr6 56420538 . C T 558.86 PASS AO=119;DP=221;FAO=120;FDP=222;FR=.;FRO=102;FSAF=48;FSAR=72;FSRF=41;FSRR=61;FWDB=0.0362549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.552;QD=10.0696;RBI=0.0419071;REFB=-0.00817477;REVB=-0.0210188;RO=102;SAF=48;SAR=71;SRF=41;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.001231;STB=0.500938;TYPE=snp;VARB=0.00645839;OID=.;OPOS=56420538;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:222:102:102:119:120:71:48:41:61:72:48:41:61 chr6 56426931 . C T 1158.02 PASS AO=119;DP=119;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00998501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.324;QD=38.6005;RBI=0.0458238;REFB=0;REVB=0.0447227;RO=0;SAF=55;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.98352e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000308692;OID=.;OPOS=56426931;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:119:120:0:0:119:120:64:55:0:0:64:56:0:0 chr6 56463409 . CT C,CC 1795.3 PASS AO=63,129;DP=198;FAO=45,150;FDP=195;FR=.;FRO=0;FSAF=40,47;FSAR=5,103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136683,0.0570232;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=38.0522,46.6392;QD=36.8267;RBI=0.020775,0.0656415;REFB=0,0;REVB=0.0156454,-0.0325141;RO=0;SAF=63,21;SAR=0,108;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.6372e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.0783177,0.0442732;OID=.,.;OPOS=56463410,56463410;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:63,129:194:45,150:195:0:40,47:5,103:0:0:25:0:63,21:0,108:0:0 chr6 56470551 . T A 552.62 PASS AO=61;DP=65;FAO=61;FDP=63;FR=.;FRO=2;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00536047;FXX=0.0454477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8062;QD=35.0872;RBI=0.00875615;REFB=0.00954579;REVB=-0.00692354;RO=1;SAF=30;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.014984;STB=0.50026;TYPE=snp;VARB=-0.00237521;OID=.;OPOS=56470551;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:65:63:1:2:61:61:31:30:0:1:31:30:1:1 chr6 56470690 . G A 1363.82 PASS AO=148;DP=152;FAO=149;FDP=151;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00887602;FXX=0.00657851;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.174;QD=36.1277;RBI=0.0515292;REFB=-0.0832909;REVB=0.050759;RO=3;SAF=34;SAR=114;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0123507;STB=0.50431;TYPE=snp;VARB=0.00175419;OID=.;OPOS=56470690;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:152:151:3:2:148:149:114:34:0:3:115:34:0:2 chr6 56471103 . C T 63.87 PASS AO=27;DP=92;FAO=27;FDP=92;FR=.;FRO=65;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=40;FSRR=25;FWDB=-0.0112349;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=260.708;QD=2.77713;RBI=0.0173674;REFB=-0.00681461;REVB=-0.0132439;RO=64;SAF=18;SAR=9;SRF=39;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0741187;STB=0.539653;TYPE=snp;VARB=0.0152332;OID=.;OPOS=56471103;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:92:92:64:65:27:27:9:18:39:25:9:18:40:25 chr6 56471402 . G A 1705.35 PASS AO=180;DP=182;FAO=180;FDP=180;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00166049;FXX=0.0217379;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.049;QD=37.8966;RBI=0.0526747;REFB=-0.014129;REVB=-0.0526485;RO=1;SAF=93;SAR=87;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0054408;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000200387;OID=.;OPOS=56471402;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:182:180:1:0:180:180:87:93:0:1:87:93:0:0 chr6 56471588 . TA T 31.38 PASS AO=21;DP=82;FAO=23;FDP=72;FR=.;FRO=49;FSAF=2;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=33;FWDB=0.0839494;FXX=0.0399947;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.7273;QD=1.74309;RBI=0.0865464;REFB=-0.0775053;REVB=0.0210423;RO=45;SAF=2;SAR=19;SRF=14;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.411103;STB=0.777469;TYPE=del;VARB=0.141047;OID=.;OPOS=56471589;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:21:73:23:72:49:2:21:16:33:31:45:2:19:14:31 chr6 56471995 . C T 1106.53 PASS AO=116;DP=117;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0562371;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.1498;QD=37.8301;RBI=0.0614129;REFB=-0.0915394;REVB=-0.0246765;RO=1;SAF=60;SAR=56;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00784965;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000463867;OID=.;OPOS=56471995;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:117:117:1:0:116:117:56:60:1:0:56:61:0:0 chr6 56482801 . C G 1801.21 PASS AO=186;DP=188;FAO=187;FDP=187;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=142;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0278595;FXX=0.0105815;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.117;QD=38.5285;RBI=0.0304349;REFB=0;REVB=0.0122527;RO=0;SAF=44;SAR=142;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.38448e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.52487e-06;OID=.;OPOS=56482801;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:188:187:0:0:186:187:142:44:0:0:142:45:0:0 chr6 56484758 . C T 2933.49 PASS AO=304;DP=305;FAO=308;FDP=308;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=204;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226943;FXX=0.00323614;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.118;QD=38.0973;RBI=0.0443951;REFB=-0.0546261;REVB=0.0381562;RO=1;SAF=100;SAR=204;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00474554;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000735653;OID=.;OPOS=56484758;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:305:308:1:0:304:308:204:100:1:0:204:104:0:0 chr6 56810539 . G A 412.47 PASS AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00752294;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.414;QD=37.4975;RBI=0.0303776;REFB=0;REVB=0.0294313;RO=0;SAF=21;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2717e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000139081;OID=.;OPOS=56810539;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:44:44:0:0:44:44:23:21:0:0:23:21:0:0 chr6 56917520 . T C 139.21 PASS AO=21;DP=42;FAO=24;FDP=41;FR=.,HEALED;FRO=16;FSAF=20;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.00304339;FXX=0.0238039;HRUN=6;LEN=1;MLLD=250.259;QD=13.5818;RBI=0.0499058;REFB=-0.00902344;REVB=-0.0498129;RO=9;SAF=18;SAR=3;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0820309;STB=0.624883;TYPE=snp;VARB=-0.000179801;OID=.;OPOS=56917520;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:39:41:9:16:21:24:3:18:7:2:4:20:10:6 chr6 57244780 . G A 328.1 PASS AO=91;DP=211;FAO=91;FDP=211;FR=.;FRO=120;FSAF=36;FSAR=55;FSRF=46;FSRR=74;FWDB=-0.0504474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.606;QD=6.21993;RBI=0.0506578;REFB=-0.00647685;REVB=-0.00461271;RO=120;SAF=36;SAR=55;SRF=46;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0131401;STB=0.507318;TYPE=snp;VARB=0.00846814;OID=.;OPOS=57244780;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:211:120:120:91:91:55:36:46:74:55:36:46:74 chr6 57246884 . A G 873.38 PASS AO=270;DP=538;FAO=203;FDP=400;FR=.;FRO=197;FSAF=109;FSAR=94;FSRF=122;FSRR=75;FWDB=-0.00579403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.628;QD=8.73381;RBI=0.00979371;REFB=-0.00591731;REVB=-0.00789595;RO=266;SAF=145;SAR=125;SRF=160;SRR=106;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0591758;STB=0.54102;TYPE=snp;VARB=0.00447916;OID=.;OPOS=57246884;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:538:400:266:197:270:203:125:145:160:106:94:109:122:75 chr6 57246969 . G A 558.88 PASS AO=202;DP=483;FAO=166;FDP=400;FR=.;FRO=234;FSAF=81;FSAR=85;FSRF=124;FSRR=110;FWDB=-0.012558;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.024;QD=5.5888;RBI=0.0125681;REFB=-0.00676794;REVB=-0.000503322;RO=276;SAF=101;SAR=101;SRF=146;SRR=130;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0301147;STB=0.52453;TYPE=snp;VARB=0.0113939;OID=.;OPOS=57246969;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:483:400:276:234:202:166:101:101:146:130:85:81:124:110 chr6 57246982 . G T 432.61 PASS AO=170;DP=437;FAO=148;FDP=397;FR=.;FRO=249;FSAF=84;FSAR=64;FSRF=126;FSRR=123;FWDB=0.00504297;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.105;QD=4.35878;RBI=0.0167361;REFB=-0.0189176;REVB=0.0159582;RO=261;SAF=92;SAR=78;SRF=132;SRR=129;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0384273;STB=0.5389;TYPE=snp;VARB=0.0199354;OID=.;OPOS=57246982;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:437:397:261:249:170:148:78:92:132:129:64:84:126:123 chr6 57254927 . A G 97.94 PASS AO=53;DP=206;FAO=54;FDP=206;FR=.;FRO=152;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=73;FSRR=79;FWDB=0.0247928;FXX=0.00961492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.412;QD=1.9018;RBI=0.0269658;REFB=-0.00747702;REVB=0.0106052;RO=149;SAF=25;SAR=28;SRF=71;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00598839;STB=0.5009;TYPE=snp;VARB=0.0233464;OID=.;OPOS=57254927;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:206:206:149:152:53:54:28:25:71:78:28:26:73:79 chr6 57254950 . A AT 35.54 PASS AO=39;DP=165;FAO=37;FDP=137;FR=.;FRO=100;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=60;FSRR=40;FWDB=0.00872689;FXX=0.0419551;HRUN=1;LEN=1;MLLD=23.2369;QD=1.03758;RBI=0.113544;REFB=0.00889039;REVB=-0.113208;RO=125;SAF=16;SAR=23;SRF=71;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196737;STB=0.620465;TYPE=ins;VARB=-0.0378325;OID=.;OPOS=57254951;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:39:165:37:137:100:16:21:60:40:35:125:16:23:71:54 chr6 57254955 . G A 23.02 PASS AO=23;DP=139;FAO=23;FDP=129;FR=.;FRO=106;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=61;FSRR=45;FWDB=-0.00790188;FXX=0.0652127;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.297;QD=0.713673;RBI=0.0146751;REFB=-0.00146261;REVB=-0.012366;RO=76;SAF=13;SAR=10;SRF=43;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000726009;STB=0.508584;TYPE=snp;VARB=0.0183032;OID=.;OPOS=57254955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:139:129:76:106:23:23:10:13:43:33:10:13:61:45 chr6 57254986 . G A 61.48 PASS AO=30;DP=106;FAO=29;FDP=105;FR=.;FRO=76;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=45;FSRR=31;FWDB=0.0222111;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.222;QD=2.34194;RBI=0.0273209;REFB=-0.00507641;REVB=0.0159092;RO=75;SAF=19;SAR=11;SRF=45;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0425616;STB=0.521724;TYPE=snp;VARB=0.0177079;OID=.;OPOS=57254986;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:106:105:75:76:30:29:11:19:45:30:11:18:45:31 chr6 57255001 . C A 35.88 PASS AO=21;DP=84;FAO=20;FDP=84;FR=.;FRO=64;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=42;FSRR=22;FWDB=0.00850837;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.0136;QD=1.7084;RBI=0.076204;REFB=0.00531785;REVB=-0.0757276;RO=63;SAF=15;SAR=6;SRF=42;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0687359;STB=0.538422;TYPE=snp;VARB=-0.0471867;OID=.;OPOS=57255001;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:84:84:63:64:21:20:6:15:42:21:6:14:42:22 chr6 57255015 . G C 24.77 PASS AO=17;DP=79;FAO=16;FDP=76;FR=.;FRO=60;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=36;FSRR=24;FWDB=-0.0116156;FXX=0.0256377;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.5576;QD=1.3035;RBI=0.0218787;REFB=-0.0256783;REVB=-0.0185406;RO=40;SAF=13;SAR=4;SRF=25;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195906;STB=0.636181;TYPE=snp;VARB=0.0692131;OID=.;OPOS=57255015;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:79:76:40:60:17:16:4:13:25:15:4:12:36:24 chr6 57372361 . C A 1462.07 PASS AO=262;DP=411;FAO=259;FDP=399;FR=.;FRO=140;FSAF=81;FSAR=178;FSRF=53;FSRR=87;FWDB=0.0591305;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.7608;QD=14.6573;RBI=0.0615201;REFB=-0.00812797;REVB=0.0169795;RO=147;SAF=82;SAR=180;SRF=55;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.046652;STB=0.526335;TYPE=snp;VARB=0.00622666;OID=.;OPOS=57372361;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:411:399:147:140:262:259:180:82:55:92:178:81:53:87 chr6 57393125 . A G 467.61 PASS AO=89;DP=152;FAO=91;FDP=154;FR=.;FRO=63;FSAF=41;FSAR=50;FSRF=22;FSRR=41;FWDB=0.022263;FXX=0.0064512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.846;QD=12.1458;RBI=0.0350422;REFB=-0.0370352;REVB=0.0270613;RO=63;SAF=40;SAR=49;SRF=22;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0779988;STB=0.542209;TYPE=snp;VARB=0.0305309;OID=.;OPOS=57393125;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:154:63:63:89:91:49:40:22:41:50:41:22:41 chr6 57393144 . A T 20.8 PASS AO=31;DP=188;FAO=31;FDP=189;FR=.;FRO=158;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=63;FSRR=95;FWDB=-0.0185626;FXX=0.00526288;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.821;QD=0.440121;RBI=0.0584285;REFB=-0.000802257;REVB=-0.0554015;RO=150;SAF=12;SAR=19;SRF=61;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0262172;STB=0.510197;TYPE=snp;VARB=0.00907442;OID=.;OPOS=57393144;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:188:189:150:158:31:31:19:12:61:89:19:12:63:95 chr6 57393160 . G A 82.92 PASS AO=54;DP=237;FAO=71;FDP=330;FR=.;FRO=259;FSAF=28;FSAR=43;FSRF=115;FSRR=144;FWDB=0.0208972;FXX=0.0149249;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.011;QD=1.0051;RBI=0.0212501;REFB=-0.00348451;REVB=-0.00385641;RO=183;SAF=19;SAR=35;SRF=73;SRR=110;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0638731;STB=0.540085;TYPE=snp;VARB=0.0123919;OID=.;OPOS=57393160;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:237:330:183:259:54:71:35:19:73:110:43:28:115:144 chr6 57398154 . T C 920.52 PASS AO=258;DP=488;FAO=208;FDP=400;FR=.;FRO=192;FSAF=99;FSAR=109;FSRF=105;FSRR=87;FWDB=-0.00161799;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.8838;QD=9.20518;RBI=0.0189397;REFB=-0.0328783;REVB=-0.0188705;RO=230;SAF=121;SAR=137;SRF=127;SRR=103;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0719243;STB=0.534002;TYPE=snp;VARB=0.0305745;OID=.;OPOS=57398154;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:488:400:230:192:258:208:137:121:127:103:109:99:105:87 chr6 57398157 . A G 913.87 PASS AO=265;DP=499;FAO=207;FDP=399;FR=.;FRO=192;FSAF=100;FSAR=107;FSRF=103;FSRR=89;FWDB=0.000950661;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.369;QD=9.16159;RBI=0.012148;REFB=-0.0443398;REVB=-0.0121107;RO=232;SAF=128;SAR=137;SRF=128;SRR=104;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0588849;STB=0.525662;TYPE=snp;VARB=0.0452848;OID=.;OPOS=57398157;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:499:399:232:192:265:207:137:128:128:104:107:100:103:89 chr6 57398163 . A G 941.97 PASS AO=270;DP=516;FAO=210;FDP=400;FR=.;FRO=190;FSAF=97;FSAR=113;FSRF=105;FSRR=85;FWDB=-0.0144114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.528;QD=9.41965;RBI=0.0260155;REFB=-0.0252199;REVB=-0.0216591;RO=246;SAF=127;SAR=143;SRF=138;SRR=108;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0791518;STB=0.543058;TYPE=snp;VARB=0.0362453;OID=.;OPOS=57398163;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:516:400:246:190:270:210:143:127:138:108:113:97:105:85 chr6 57398201 . T C 1077.99 PASS AO=332;DP=615;FAO=224;FDP=400;FR=.;FRO=176;FSAF=105;FSAR=119;FSRF=90;FSRR=86;FWDB=-0.0100904;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=61.7393;QD=10.7799;RBI=0.0195628;REFB=-0.0302922;REVB=-0.0167597;RO=280;SAF=158;SAR=174;SRF=151;SRR=129;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0533678;STB=0.518778;TYPE=snp;VARB=0.0372076;OID=.;OPOS=57398201;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:615:400:280:176:332:224:174:158:151:129:119:105:90:86 chr6 57398226 . T A 214.34 PASS AO=145;DP=610;FAO=89;FDP=277;FR=.;FRO=188;FSAF=43;FSAR=46;FSRF=106;FSRR=82;FWDB=-0.0683295;FXX=0.307492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=44.4981;QD=3.09516;RBI=0.0686194;REFB=-0.0107414;REVB=0.0063008;RO=293;SAF=69;SAR=76;SRF=167;SRR=126;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109874;STB=0.554608;TYPE=snp;VARB=0.0267284;OID=.;OPOS=57398226;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:610:277:293:188:145:89:76:69:167:126:46:43:106:82 chr6 57398264 . A G 832.19 PASS AO=293;DP=577;FAO=198;FDP=398;FR=.;FRO=200;FSAF=89;FSAR=109;FSRF=118;FSRR=82;FWDB=-0.00763262;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.983;QD=8.36369;RBI=0.0191474;REFB=-0.00650581;REVB=-0.0175604;RO=280;SAF=134;SAR=159;SRF=161;SRR=119;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105097;STB=0.570313;TYPE=snp;VARB=0.006499;OID=.;OPOS=57398264;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:577:398:280:200:293:198:159:134:161:119:109:89:118:82 chr6 57398270 . C T 92.74 PASS AO=116;DP=561;FAO=85;FDP=400;FR=.;FRO=315;FSAF=45;FSAR=40;FSRF=163;FSRR=152;FWDB=0.00725306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.1279;QD=0.927438;RBI=0.0187447;REFB=-0.00841792;REVB=-0.0172846;RO=442;SAF=60;SAR=56;SRF=231;SRR=211;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00696812;STB=0.509432;TYPE=snp;VARB=0.034864;OID=.;OPOS=57398270;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:561:400:442:315:116:85:56:60:231:211:40:45:163:152 chr6 57467084 . A G 70.12 PASS AO=85;DP=455;FAO=78;FDP=398;FR=.;FRO=320;FSAF=38;FSAR=40;FSRF=141;FSRR=179;FWDB=-0.0020092;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.068;QD=0.704693;RBI=0.0118128;REFB=-0.00557129;REVB=-0.0116407;RO=367;SAF=43;SAR=42;SRF=167;SRR=200;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0659978;STB=0.537518;TYPE=snp;VARB=0.0217643;OID=.;OPOS=57467084;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:455:398:367:320:85:78:42:43:167:200:40:38:141:179 chr6 57467093 . A G 66.14 PASS AO=87;DP=467;FAO=77;FDP=400;FR=.;FRO=323;FSAF=38;FSAR=39;FSRF=148;FSRR=175;FWDB=-0.00968126;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.621;QD=0.661371;RBI=0.0148704;REFB=0.00058676;REVB=0.0112872;RO=380;SAF=43;SAR=44;SRF=171;SRR=209;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0575805;STB=0.528525;TYPE=snp;VARB=-0.00145672;OID=.;OPOS=57467093;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:467:400:380:323:87:77:44:43:171:209:39:38:148:175 chr6 57467100 . G C 950.28 PASS AO=244;DP=468;FAO=210;FDP=396;FR=.;FRO=186;FSAF=100;FSAR=110;FSRF=85;FSRR=101;FWDB=0.00458149;FXX=0.00999975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.382;QD=9.59879;RBI=0.0052373;REFB=-0.020703;REVB=-0.00253758;RO=216;SAF=115;SAR=129;SRF=100;SRR=116;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00722647;STB=0.509046;TYPE=snp;VARB=0.0178222;OID=.;OPOS=57467100;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:468:396:216:186:244:210:129:115:100:116:110:100:85:101 chr6 57467107 . C T 57.18 PASS AO=90;DP=480;FAO=74;FDP=400;FR=.;FRO=326;FSAF=33;FSAR=41;FSRF=155;FSRR=171;FWDB=-0.000385216;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.607;QD=0.57175;RBI=0.0458445;REFB=-0.00329123;REVB=-0.0458429;RO=384;SAF=40;SAR=50;SRF=173;SRR=211;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00797353;STB=0.524204;TYPE=snp;VARB=0.0239349;OID=.;OPOS=57467107;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:480:400:384:326:90:74:50:40:173:211:41:33:155:171 chr6 57467175 . A G 235.02 PASS AO=117;DP=404;FAO=116;FDP=398;FR=.;FRO=282;FSAF=44;FSAR=72;FSRF=131;FSRR=151;FWDB=-0.0237973;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.747;QD=2.36202;RBI=0.0252119;REFB=-0.00787525;REVB=-0.00832615;RO=285;SAF=44;SAR=73;SRF=130;SRR=155;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100744;STB=0.562188;TYPE=snp;VARB=0.0166194;OID=.;OPOS=57467175;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:404:398:285:282:117:116:73:44:130:155:72:44:131:151 chr6 57512476 . G A 1033.85 PASS AO=435;DP=774;FAO=219;FDP=398;FR=.;FRO=179;FSAF=111;FSAR=108;FSRF=95;FSRR=84;FWDB=-0.0161038;FXX=0.00499988;HRUN=3;LEN=1;MLLD=151.98;QD=10.3904;RBI=0.0173336;REFB=-0.0172718;REVB=0.00641266;RO=334;SAF=229;SAR=206;SRF=182;SRR=152;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.014883;STB=0.510743;TYPE=snp;VARB=0.0134908;OID=.;OPOS=57512476;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:774:398:334:179:435:219:206:229:182:152:108:111:95:84 chr6 57512510 . T G 1881.8 PASS AO=632;DP=813;FAO=288;FDP=388;FR=.;FRO=100;FSAF=121;FSAR=167;FSRF=46;FSRR=54;FWDB=-0.0629872;FXX=0.0299992;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.004;QD=19.4;RBI=0.0635972;REFB=-0.0559743;REVB=0.00878699;RO=170;SAF=298;SAR=334;SRF=81;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00198844;STB=0.510506;TYPE=snp;VARB=0.0130831;OID=.;OPOS=57512510;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:813:388:170:100:632:288:334:298:81:89:167:121:46:54 chr6 57512529 . C A 171.57 PASS AO=208;DP=835;FAO=104;FDP=400;FR=.;FRO=296;FSAF=55;FSAR=49;FSRF=132;FSRR=164;FWDB=-0.0091687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.512;QD=1.71565;RBI=0.0426736;REFB=-0.0013815;REVB=-0.041677;RO=616;SAF=108;SAR=100;SRF=277;SRR=339;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0877033;STB=0.561105;TYPE=snp;VARB=0.00340447;OID=.;OPOS=57512529;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:835:400:616:296:208:104:100:108:277:339:49:55:132:164 chr6 57512565 . T C 1040.99 PASS AO=302;DP=594;FAO=226;FDP=397;FR=.;FRO=171;FSAF=90;FSAR=136;FSRF=78;FSRR=93;FWDB=0.0338648;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.486;QD=10.4886;RBI=0.0397221;REFB=0.014534;REVB=-0.0207611;RO=290;SAF=83;SAR=219;SRF=129;SRR=161;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174096;STB=0.525747;TYPE=snp;VARB=-0.00923349;OID=.;OPOS=57512565;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:594:397:290:171:302:226:219:83:129:161:136:90:78:93 chr6 57512678 . G A 593.7 PASS AO=115;DP=191;FAO=114;FDP=191;FR=.;FRO=77;FSAF=23;FSAR=91;FSRF=5;FSRR=72;FWDB=-0.0109412;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.357;QD=12.4335;RBI=0.0119566;REFB=-0.0312836;REVB=-0.00482179;RO=76;SAF=23;SAR=92;SRF=5;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173034;STB=0.595348;TYPE=snp;VARB=0.0291027;OID=.;OPOS=57512678;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:191:191:76:77:115:114:92:23:5:71:91:23:5:72 chr6 58141876 . C T 1192.88 PASS AO=147;DP=167;FAO=148;FDP=167;FR=.;FRO=19;FSAF=75;FSAR=73;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.00723113;FXX=0.0118336;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.928;QD=28.5719;RBI=0.0308467;REFB=-0.0113433;REVB=0.0299872;RO=19;SAF=76;SAR=71;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00939091;STB=0.503763;TYPE=snp;VARB=0.000952362;OID=.;OPOS=58141876;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:167:167:19:19:147:148:71:76:9:10:73:75:9:10 chr6 58141886 . G C 976.96 PASS AO=136;DP=170;FAO=136;FDP=170;FR=.;FRO=34;FSAF=62;FSAR=74;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=0.0124734;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=219.125;QD=22.9872;RBI=0.0367599;REFB=-0.0264519;REVB=0.034579;RO=34;SAF=62;SAR=74;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0720209;STB=0.538269;TYPE=snp;VARB=0.00280894;OID=.;OPOS=58141886;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:170:170:34:34:136:136:74:62:22:12:74:62:22:12 chr6 58141946 . C T 218.73 PASS AO=60;DP=144;FAO=64;FDP=147;FR=.;FRO=83;FSAF=35;FSAR=29;FSRF=30;FSRR=53;FWDB=0.0603384;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=39.0201;QD=5.95183;RBI=0.0844724;REFB=-0.0243253;REVB=0.0591173;RO=84;SAF=34;SAR=26;SRF=30;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215181;STB=0.603544;TYPE=snp;VARB=0.0292665;OID=.;OPOS=58141946;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:147:84:83:60:64:26:34:30:54:29:35:30:53 chr6 58196684 . G A 167.76 PASS AO=67;DP=205;FAO=67;FDP=205;FR=.;FRO=138;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=78;FSRR=60;FWDB=0.00933048;FXX=0.00485413;HRUN=3;LEN=1;MLLD=198.912;QD=3.27337;RBI=0.0176813;REFB=-0.00989173;REVB=-0.015019;RO=137;SAF=33;SAR=34;SRF=78;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.089645;STB=0.548851;TYPE=snp;VARB=0.017811;OID=.;OPOS=58196684;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:205:137:138:67:67:34:33:78:59:34:33:78:60 chr6 62282965 . C T 1453.92 PASS AO=154;DP=155;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0435935;FXX=0.0064512;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.556;QD=37.764;RBI=0.0457152;REFB=-0.066233;REVB=0.0137656;RO=1;SAF=73;SAR=81;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0058371;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000168544;OID=.;OPOS=62282965;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:155:154:1:0:154:154:81:73:0:1:81:73:0:0 chr6 62283016 . T G 845.11 PASS AO=90;DP=92;FAO=92;FDP=94;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=61;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0451572;FXX=0.0105252;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.605;QD=35.9621;RBI=0.0460882;REFB=0.00826049;REVB=0.00921678;RO=2;SAF=29;SAR=61;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0315635;STB=0.515622;TYPE=snp;VARB=-3.87093e-05;OID=.;OPOS=62283016;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:92:94:2:2:90:92:61:29:2:0:61:31:2:0 chr6 62284247 . T G 2257.9 PASS AO=193;DP=249;FAO=246;FDP=247;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=141;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0211197;FXX=0.00803181;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.554;QD=36.5652;RBI=0.172992;REFB=-0.0453745;REVB=0.171698;RO=2;SAF=135;SAR=58;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00462461;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00258398;OID=.;OPOS=62284247;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:248:247:2:0:193:246:58:135:1:1:105:141:0:0 chr6 62284487 . C T 1298.77 PASS AO=137;DP=138;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169505;FXX=0.00724585;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.534;QD=37.9204;RBI=0.0262834;REFB=-0.0877134;REVB=0.0200872;RO=1;SAF=96;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114528;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00102664;OID=.;OPOS=62284487;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:138:137:1:0:137:137:41:96:0:1:41:96:0:0 chr6 62284512 . T C 1132.04 PASS AO=117;DP=118;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00433093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.083;QD=38.3743;RBI=0.0062578;REFB=0;REVB=0.00451698;RO=0;SAF=87;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.06503e-05;OID=.;OPOS=62284512;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:118:118:0:0:117:118:30:87:0:0:31:87:0:0 chr6 62390916 . T C 3245.04 PASS AO=343;DP=348;FAO=344;FDP=344;FR=.;FRO=0;FSAF=178;FSAR=166;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00977303;FXX=0.0114939;HRUN=3;LEN=1;MLLD=266.09;QD=37.733;RBI=0.0163793;REFB=-0.0332925;REVB=0.0131442;RO=3;SAF=177;SAR=166;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00801671;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.13253e-05;OID=.;OPOS=62390916;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:348:344:3:0:343:344:166:177:3:0:166:178:0:0 chr6 62887099 . C T 1249.37 PASS AO=132;DP=132;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00285512;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.8139;QD=38.1487;RBI=0.0161817;REFB=0;REVB=0.0159278;RO=0;SAF=71;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00016278;OID=.;OPOS=62887099;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:132:131:0:0:132:131:61:71:0:0:61:70:0:0 chr6 63921853 . A G 548.99 PASS AO=110;DP=196;FAO=112;FDP=197;FR=.;FRO=85;FSAF=68;FSAR=44;FSRF=46;FSRR=39;FWDB=0.012321;FXX=0.00505025;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.249;QD=11.147;RBI=0.0199352;REFB=-0.0292755;REVB=-0.0156718;RO=86;SAF=68;SAR=42;SRF=46;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0697844;STB=0.529451;TYPE=snp;VARB=0.0162408;OID=.;OPOS=63921853;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:197:86:85:110:112:42:68:46:40:44:68:46:39 chr6 63921873 . A T 417.09 PASS AO=92;DP=175;FAO=92;FDP=175;FR=.;FRO=83;FSAF=52;FSAR=40;FSRF=43;FSRR=40;FWDB=0.0185063;FXX=0.0112988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.06;QD=9.53339;RBI=0.0206381;REFB=-0.0144439;REVB=-0.00913493;RO=82;SAF=54;SAR=38;SRF=43;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0549271;STB=0.522608;TYPE=snp;VARB=0.0167911;OID=.;OPOS=63921873;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:175:82:83:92:92:38:54:43:39:40:52:43:40 chr6 63921924 . A G 249.23 PASS AO=31;DP=141;FAO=59;FDP=125;FR=.,HEALED;FRO=66;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=29;FSRR=37;FWDB=0.0104054;FXX=0.00793588;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.5287;QD=7.97522;RBI=0.0263323;REFB=-0.00489711;REVB=0.0241892;RO=38;SAF=4;SAR=27;SRF=1;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.283001;STB=0.52755;TYPE=snp;VARB=0.00753553;OID=.;OPOS=63921924;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:125:38:66:31:59:27:4:1:37:30:29:29:37 chr6 63922023 . C T 272.86 PASS AO=55;DP=98;FAO=55;FDP=98;FR=.;FRO=43;FSAF=8;FSAR=47;FSRF=9;FSRR=34;FWDB=0.0214961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.439;QD=11.1369;RBI=0.0215258;REFB=-0.000921795;REVB=0.00113089;RO=42;SAF=8;SAR=47;SRF=9;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100291;STB=0.552157;TYPE=snp;VARB=0.000720823;OID=.;OPOS=63922023;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:42:43:55:55:47:8:9:33:47:8:9:34 chr6 63922916 . T C 175.55 PASS AO=33;DP=57;FAO=33;FDP=56;FR=.;FRO=23;FSAF=1;FSAR=32;FSRF=2;FSRR=21;FWDB=0.0297687;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.922;QD=12.539;RBI=0.0329387;REFB=-0.00161133;REVB=0.014099;RO=23;SAF=1;SAR=32;SRF=2;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.255951;STB=0.644184;TYPE=snp;VARB=0.00100735;OID=.;OPOS=63922916;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:57:56:23:23:33:33:32:1:2:21:32:1:2:21 chr6 64694354 . C T 238.1 PASS AO=80;DP=220;FAO=81;FDP=220;FR=.;FRO=139;FSAF=42;FSAR=39;FSRF=62;FSRR=77;FWDB=0.0082321;FXX=0.00452468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.415;QD=4.32915;RBI=0.0102748;REFB=-0.00683305;REVB=0.00614843;RO=139;SAF=42;SAR=38;SRF=63;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0801544;STB=0.545688;TYPE=snp;VARB=0.0122331;OID=.;OPOS=64694354;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:220:220:139:139:80:81:38:42:63:76:39:42:62:77 chr6 65016977 . TGA T 95.52 PASS AO=26;DP=126;FAO=27;FDP=68;FR=.;FRO=41;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=-0.0714874;FXX=0.0684838;HRUN=1;LEN=2;MLLD=83.6271;QD=5.61865;RBI=0.0898653;REFB=-0.121158;REVB=-0.0544547;RO=34;SAF=8;SAR=18;SRF=12;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0516717;STB=0.564307;TYPE=del;VARB=0.143591;OID=.;OPOS=65016978;OREF=GA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:26:67:27:68:41:8:19:16:25:95:34:8:18:12:22 chr6 65149185 . T A 382.12 PASS AO=100;DP=213;FAO=99;FDP=216;FR=.;FRO=117;FSAF=30;FSAR=69;FSRF=52;FSRR=65;FWDB=-0.111301;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.701;QD=7.07623;RBI=0.111652;REFB=-0.00915719;REVB=-0.00884518;RO=113;SAF=31;SAR=69;SRF=49;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130657;STB=0.584607;TYPE=snp;VARB=0.00784434;OID=.;OPOS=65149185;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:213:216:113:117:100:99:69:31:49:64:69:30:52:65 chr6 65300869 . G A 244.67 PASS AO=82;DP=209;FAO=80;FDP=209;FR=.;FRO=129;FSAF=44;FSAR=36;FSRF=56;FSRR=73;FWDB=0.0620051;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.6711;QD=4.68268;RBI=0.0930747;REFB=-0.00972117;REVB=0.0694138;RO=116;SAF=46;SAR=36;SRF=53;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10891;STB=0.571207;TYPE=snp;VARB=0.0284718;OID=.;OPOS=65300869;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:209:116:129:82:80:36:46:53:63:36:44:56:73 chr6 65301504 . A G 453.05 PASS AO=115;DP=246;FAO=115;FDP=247;FR=.;FRO=132;FSAF=49;FSAR=66;FSRF=76;FSRR=56;FWDB=0.0385437;FXX=0.00803181;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.203;QD=7.33682;RBI=0.0386849;REFB=-0.0070606;REVB=-0.00330202;RO=129;SAF=49;SAR=66;SRF=76;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15573;STB=0.579829;TYPE=snp;VARB=0.0107189;OID=.;OPOS=65301504;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:246:247:129:132:115:115:66:49:76:53:66:49:76:56 chr6 66005888 . C T 2636.85 PASS AO=275;DP=275;FAO=275;FDP=275;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=179;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00609908;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.094;QD=38.3542;RBI=0.0101834;REFB=0;REVB=-0.00815496;RO=0;SAF=96;SAR=179;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.63519e-06;OID=.;OPOS=66005888;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:275:275:0:0:275:275:179:96:0:0:179:96:0:0 chr6 66005970 . G A 1530.15 PASS AO=160;DP=160;FAO=161;FDP=161;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0128504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.07;QD=38.0162;RBI=0.0175386;REFB=0;REVB=0.0119361;RO=0;SAF=66;SAR=94;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40181e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.51244e-05;OID=.;OPOS=66005970;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:160:161:0:0:160:161:94:66:0:0:94:67:0:0 chr6 66044927 . T C 124.94 PASS AO=35;DP=85;FAO=35;FDP=85;FR=.;FRO=50;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=34;FSRR=16;FWDB=-0.0169526;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.405;QD=5.8793;RBI=0.0207112;REFB=-0.011104;REVB=0.011898;RO=49;SAF=14;SAR=21;SRF=34;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.296057;STB=0.660462;TYPE=snp;VARB=0.0195196;OID=.;OPOS=66044927;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:49:50:35:35:21:14:34:15:21:14:34:16 chr6 66063513 . G A 633.7 PASS AO=65;DP=65;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0385135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.796;QD=37.8327;RBI=0.0539791;REFB=0;REVB=0.0378213;RO=0;SAF=18;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.05661e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000302289;OID=.;OPOS=66063513;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:65:67:0:0:65:67:47:18:0:0:48:19:0:0 chr6 69666684 . A G 2033.85 PASS AO=213;DP=213;FAO=213;FDP=213;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=150;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020751;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.1615;QD=38.1943;RBI=0.0238893;REFB=0;REVB=-0.0118361;RO=0;SAF=63;SAR=150;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.69134e-05;OID=.;OPOS=69666684;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:96:213:213:0:0:213:213:150:63:0:0:150:63:0:0 chr6 69942506 . G A 290.33 PASS AO=75;DP=168;FAO=76;FDP=169;FR=.;FRO=93;FSAF=35;FSAR=41;FSRF=34;FSRR=59;FWDB=0.0286246;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.6325;QD=6.87162;RBI=0.0290916;REFB=-0.00744121;REVB=0.00519167;RO=93;SAF=35;SAR=40;SRF=34;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101989;STB=0.552996;TYPE=snp;VARB=0.0115773;OID=.;OPOS=69942506;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:169:93:93:75:76:40:35:34:59:41:35:34:59 chr6 70071173 . G A 281.29 PASS AO=69;DP=145;FAO=69;FDP=145;FR=.;FRO=76;FSAF=23;FSAR=46;FSRF=43;FSRR=33;FWDB=-0.0241809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.59;QD=7.75965;RBI=0.0467232;REFB=-0.0129606;REVB=-0.0399792;RO=72;SAF=23;SAR=46;SRF=39;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200156;STB=0.625555;TYPE=snp;VARB=0.0229275;OID=.;OPOS=70071173;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:72:76:69:69:46:23:39:33:46:23:43:33 chr6 70407465 . A T 284.9 PASS AO=71;DP=147;FAO=70;FDP=147;FR=.;FRO=77;FSAF=42;FSAR=28;FSRF=54;FSRR=23;FWDB=0.0103695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.221;QD=7.75234;RBI=0.0173144;REFB=-0.0163876;REVB=0.0138659;RO=76;SAF=43;SAR=28;SRF=53;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0919994;STB=0.556506;TYPE=snp;VARB=0.0152644;OID=.;OPOS=70407465;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:147:76:77:71:70:28:43:53:23:28:42:54:23 chr6 70778297 . G A 942.3 PASS AO=101;DP=102;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0663812;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.765;QD=37.3188;RBI=0.0664159;REFB=-0.0836059;REVB=0.00214627;RO=1;SAF=46;SAR=55;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00854831;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000971174;OID=.;OPOS=70778297;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:102:101:1:0:101:101:55:46:0:1:55:46:0:0 chr6 70812123 . A G 882.28 PASS AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0354153;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.718;QD=37.9475;RBI=0.0378132;REFB=0;REVB=0.0132512;RO=0;SAF=12;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.66053e-05;OID=.;OPOS=70812123;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:93:93:0:0:93:93:81:12:0:0:81:12:0:0 chr6 70856536 . C T 356.05 PASS AO=86;DP=207;FAO=98;FDP=218;FR=.;FRO=120;FSAF=54;FSAR=44;FSRF=68;FSRR=52;FWDB=0.00561219;FXX=0.0090905;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.133;QD=6.5331;RBI=0.0145456;REFB=-0.00542019;REVB=0.0134193;RO=93;SAF=48;SAR=38;SRF=58;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0630855;STB=0.508717;TYPE=snp;VARB=0.00837409;OID=.;OPOS=70856536;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:218:93:120:86:98:38:48:58:35:44:54:68:52 chr6 70866609 . C T 387.86 PASS AO=105;DP=237;FAO=105;FDP=237;FR=.;FRO=132;FSAF=53;FSAR=52;FSRF=70;FSRR=62;FWDB=-0.0306353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9203;QD=6.54615;RBI=0.0354858;REFB=-0.010684;REVB=-0.0179088;RO=129;SAF=53;SAR=52;SRF=68;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0222469;STB=0.514228;TYPE=snp;VARB=0.0243998;OID=.;OPOS=70866609;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:237:237:129:132:105:105:52:53:68:61:52:53:70:62 chr6 70916888 . A C 69.27 PASS AO=20;DP=60;FAO=23;FDP=63;FR=.;FRO=40;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=0.0213886;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.251;QD=4.39833;RBI=0.0271132;REFB=-0.00414738;REVB=-0.0166628;RO=40;SAF=9;SAR=11;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168818;STB=0.603736;TYPE=snp;VARB=0.00878338;OID=.;OPOS=70916888;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:60:63:40:40:20:23:11:9:24:16:13:10:24:16 chr6 70917559 . A AT 756.04 PASS AO=89;DP=103;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00308241;FXX=0.029997;HRUN=0;LEN=1;MLLD=145.611;QD=31.1767;RBI=0.0209392;REFB=0;REVB=0.0207111;RO=7;SAF=35;SAR=54;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0255722;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=3.66641e-05;OID=.;OPOS=70917560;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:89:103:97:97:0:38:59:0:0:67:7:35:54:4:3 chr6 70963124 . A C 224.57 PASS AO=68;DP=160;FAO=64;FDP=155;FR=.;FRO=91;FSAF=36;FSAR=28;FSRF=69;FSRR=22;FWDB=0.0109148;FXX=0.031248;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.913;QD=5.79525;RBI=0.0115661;REFB=-0.0124117;REVB=0.00382649;RO=91;SAF=40;SAR=28;SRF=69;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187741;STB=0.620219;TYPE=snp;VARB=0.0132392;OID=.;OPOS=70963124;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:155:91:91:68:64:28:40:69:22:28:36:69:22 chr6 70980035 . A AG,G 47.46 PASS AO=22,11;DP=53;FAO=22,0;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=2,0;FSAR=20,0;FSRF=6;FSRR=24;FWDB=0.330211,0.00861795;FXX=0.0188644;HRUN=6,1;LEN=1,1;MLLD=8.51245,136.309;QD=3.65109;RBI=0.342256,0.0113638;REFB=-0.171969,-0.000718831;REVB=-0.0900009,0.0074072;RO=17;SAF=2,0;SAR=20,11;SRF=3;SRR=14;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.168121,-0.750401;STB=0.645002,0.5;TYPE=ins,snp;VARB=0.133727,0;OID=.,.;OPOS=70980036,70980035;OREF=-,A;OALT=G,G;OMAPALT=AG,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:53:52:17:30:22,11:22,0:20,11:2,0:3:14:20,0:2,0:6:24 chr6 70984436 . A G 395.48 PASS AO=94;DP=237;FAO=110;FDP=252;FR=.;FRO=142;FSAF=50;FSAR=60;FSRF=61;FSRR=81;FWDB=0.0460552;FXX=0.0117642;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.457;QD=6.27738;RBI=0.0462065;REFB=0.00760382;REVB=0.00373677;RO=116;SAF=42;SAR=52;SRF=48;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0333763;STB=0.514221;TYPE=snp;VARB=-0.0111394;OID=.;OPOS=70984436;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:237:252:116:142:94:110:52:42:48:68:60:50:61:81 chr6 70989703 . A G 320.67 PASS AO=91;DP=213;FAO=91;FDP=212;FR=.;FRO=121;FSAF=41;FSAR=50;FSRF=43;FSRR=78;FWDB=-0.00761344;FXX=0.00469462;HRUN=4;LEN=1;MLLD=79.4096;QD=6.05037;RBI=0.0556466;REFB=-0.0121952;REVB=-0.0551233;RO=119;SAF=41;SAR=50;SRF=43;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0927886;STB=0.55545;TYPE=snp;VARB=0.0128613;OID=.;OPOS=70989703;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:213:212:119:121:91:91:50:41:43:76:50:41:43:78 chr6 70990705 . ACC AC,ACCG 181.35 PASS AO=40,23;DP=191;FAO=75,0;FDP=155;FR=.;FRO=80;FSAF=60,0;FSAR=15,0;FSRF=70;FSRR=10;FWDB=0.0527522,-0.124922;FXX=0.109189;HRUN=2,6;LEN=1,1;MLLD=20.4709,9.59044;QD=4.67988;RBI=0.0667111,0.231836;REFB=0.0452352,-0.0258019;REVB=-0.040836,0.195301;RO=37;SAF=40,23;SAR=0,0;SRF=36;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.824678,0.76815;STB=0.565202,0.5;TYPE=del,ins;VARB=-0.0465106,0.0194858;OID=.,.;OPOS=70990706,70990708;OREF=C,-;OALT=-,G;OMAPALT=AC,ACCG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:40,23:148:75,0:155:80:60,0:15,0:70:10:99:37:40,23:0,0:36:1 chr6 71238105 . A G 709.86 PASS AO=74;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0454692;FXX=0.0259707;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.504;QD=37.8594;RBI=0.0521269;REFB=0;REVB=-0.0254905;RO=0;SAF=10;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000357645;OID=.;OPOS=71238105;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:75:75:0:0:74:75:64:10:0:0:64:11:0:0 chr6 71569090 . T C 239.51 PASS AO=64;DP=145;FAO=64;FDP=145;FR=.;FRO=81;FSAF=29;FSAR=35;FSRF=34;FSRR=47;FWDB=-0.00252785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.92;QD=6.60714;RBI=0.014595;REFB=0.00129818;REVB=0.0143744;RO=81;SAF=29;SAR=35;SRF=34;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0338499;STB=0.518868;TYPE=snp;VARB=-0.00138656;OID=.;OPOS=71569090;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:81:81:64:64:35:29:34:47:35:29:34:47 chr6 72889472 . A G 43.84 PASS AO=20;DP=79;FAO=21;FDP=80;FR=.;FRO=59;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=35;FWDB=-0.0307078;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.318;QD=2.19216;RBI=0.0307682;REFB=-0.00454493;REVB=0.0019267;RO=59;SAF=5;SAR=15;SRF=24;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218554;STB=0.645191;TYPE=snp;VARB=0.0110147;OID=.;OPOS=72889472;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:79:80:59:59:20:21:15:5:24:35:16:5:24:35 chr6 72892257 . A G 169.84 PASS AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0503244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.5823;QD=37.7428;RBI=0.0538487;REFB=0;REVB=-0.0191607;RO=0;SAF=10;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000705627;OID=.;OPOS=72892257;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:18:0:0:18:18:8:10:0:0:8:10:0:0 chr6 72962456 . T C 300.68 PASS AO=66;DP=126;FAO=66;FDP=126;FR=.;FRO=60;FSAF=5;FSAR=61;FSRF=4;FSRR=56;FWDB=-0.0151817;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.471;QD=9.54533;RBI=0.0163553;REFB=-0.0103176;REVB=-0.00608368;RO=60;SAF=5;SAR=61;SRF=4;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0289542;STB=0.515868;TYPE=snp;VARB=0.0106507;OID=.;OPOS=72962456;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:60:60:66:66:61:5:4:56:61:5:4:56 chr6 73102442 . C T 733.69 PASS AO=157;DP=296;FAO=160;FDP=298;FR=.;FRO=138;FSAF=62;FSAR=98;FSRF=64;FSRR=74;FWDB=-0.0321174;FXX=0.00334437;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.2337;QD=9.84813;RBI=0.0381789;REFB=-0.0221886;REVB=-0.0206422;RO=137;SAF=60;SAR=97;SRF=63;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0689908;STB=0.536585;TYPE=snp;VARB=0.0230031;OID=.;OPOS=73102442;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:296:298:137:138:157:160:97:60:63:74:98:62:64:74 chr6 73752821 . T C 327.52 PASS AO=107;DP=287;FAO=108;FDP=288;FR=.;FRO=180;FSAF=45;FSAR=63;FSRF=70;FSRR=110;FWDB=0.0192163;FXX=0.0495033;HRUN=3;LEN=1;MLLD=205.068;QD=4.54885;RBI=0.0251877;REFB=-0.00423782;REVB=0.0162835;RO=177;SAF=45;SAR=62;SRF=69;SRR=108;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0350774;STB=0.517961;TYPE=snp;VARB=0.00728183;OID=.;OPOS=73752821;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:287:288:177:180:107:108:62:45:69:108:63:45:70:110 chr6 73935135 . G C 249.78 PASS AO=68;DP=156;FAO=68;FDP=156;FR=.;FRO=88;FSAF=35;FSAR=33;FSRF=57;FSRR=31;FWDB=0.0331085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.5807;QD=6.40464;RBI=0.0353995;REFB=-0.0238825;REVB=0.0125282;RO=88;SAF=35;SAR=33;SRF=57;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135537;STB=0.575414;TYPE=snp;VARB=0.0365818;OID=.;OPOS=73935135;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:156:88:88:68:68:33:35:57:31:33:35:57:31 chr6 74019338 . G A 284.69 PASS AO=66;DP=133;FAO=66;FDP=133;FR=.;FRO=67;FSAF=49;FSAR=17;FSRF=63;FSRR=4;FWDB=0.0136553;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.232;QD=8.56196;RBI=0.0335852;REFB=0.0019267;REVB=0.0306838;RO=66;SAF=49;SAR=17;SRF=62;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.271803;STB=0.649129;TYPE=snp;VARB=-0.00267632;OID=.;OPOS=74019338;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:66:67:66:66:17:49:62:4:17:49:63:4 chr6 74019376 . T C 229.42 PASS AO=56;DP=121;FAO=57;FDP=121;FR=.;FRO=64;FSAF=50;FSAR=7;FSRF=62;FSRR=2;FWDB=-0.0161867;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.442;QD=7.58413;RBI=0.0211459;REFB=-0.00905826;REVB=0.0136066;RO=62;SAF=49;SAR=7;SRF=60;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246419;STB=0.635296;TYPE=snp;VARB=0.00829478;OID=.;OPOS=74019376;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:62:64:56:57:7:49:60:2:7:50:62:2 chr6 74073531 . C G 139.66 PASS AO=28;DP=51;FAO=28;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=23;FWDB=0.0403201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.537;QD=10.9539;RBI=0.0459839;REFB=-0.0244311;REVB=0.0221091;RO=23;SAF=6;SAR=22;SRF=0;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.317245;STB=0.671551;TYPE=snp;VARB=0.0148236;OID=.;OPOS=74073531;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:51:51:23:23:28:28:22:6:0:23:22:6:0:23 chr6 74079024 . A G 273.05 PASS AO=85;DP=217;FAO=86;FDP=218;FR=.;FRO=132;FSAF=29;FSAR=57;FSRF=51;FSRR=81;FWDB=-0.01169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.971;QD=5.01005;RBI=0.0583234;REFB=-0.00349641;REVB=-0.0571399;RO=132;SAF=28;SAR=57;SRF=52;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0764104;STB=0.532578;TYPE=snp;VARB=0.005522;OID=.;OPOS=74079024;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:217:218:132:132:85:86:57:28:52:80:57:29:51:81 chr6 74079041 . A C 2035.25 PASS AO=204;DP=204;FAO=213;FDP=213;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=137;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.127497;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.6685;QD=38.2207;RBI=0.14666;REFB=0;REVB=0.0724833;RO=0;SAF=69;SAR=135;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=9.09019e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000719751;OID=.;OPOS=74079041;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:96:204:213:0:0:204:213:135:69:0:0:137:76:0:0 chr6 74125875 . A G 238.34 PASS AO=58;DP=122;FAO=58;FDP=122;FR=.;FRO=64;FSAF=32;FSAR=26;FSRF=17;FSRR=47;FWDB=-0.00711892;FXX=0.0239981;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.776;QD=7.81451;RBI=0.0162594;REFB=-0.0342687;REVB=0.0146181;RO=59;SAF=32;SAR=26;SRF=13;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.297355;STB=0.647044;TYPE=snp;VARB=0.0336119;OID=.;OPOS=74125875;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:59:64:58:58:26:32:13:46:26:32:17:47 chr6 74125888 . A G 180.84 PASS AO=45;DP=108;FAO=48;FDP=111;FR=.;FRO=63;FSAF=16;FSAR=32;FSRF=21;FSRR=42;FWDB=-0.00226665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.374;QD=6.51689;RBI=0.0293982;REFB=-0.00377986;REVB=-0.0293107;RO=56;SAF=16;SAR=29;SRF=15;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0981717;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00817307;OID=.;OPOS=74125888;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:111:56:63:45:48:29:16:15:41:32:16:21:42 chr6 74135016 . C T 239.32 PASS AO=66;DP=150;FAO=65;FDP=150;FR=.;FRO=85;FSAF=37;FSAR=28;FSRF=39;FSRR=46;FWDB=0.0075241;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.8184;QD=6.38196;RBI=0.0488149;REFB=0.00335691;REVB=0.0482315;RO=83;SAF=38;SAR=28;SRF=37;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129989;STB=0.562661;TYPE=snp;VARB=-0.00577947;OID=.;OPOS=74135016;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:150:83:85:66:65:28:38:37:46:28:37:39:46 chr6 74155346 . G T 3254.53 PASS AO=341;DP=345;FAO=344;FDP=344;FR=.;FRO=0;FSAF=155;FSAR=189;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00578658;FXX=0.00864528;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.341;QD=37.8434;RBI=0.00687638;REFB=0.0261896;REVB=-0.00371484;RO=2;SAF=154;SAR=187;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00507501;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000176881;OID=.;OPOS=74155346;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:345:344:2:0:341:344:187:154:0:2:189:155:0:0 chr6 74161762 . G T 89.65 PASS AO=14;DP=21;FAO=14;FDP=21;FR=.;FRO=7;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0398623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.557;QD=17.0766;RBI=0.102016;REFB=-0.0685082;REVB=0.0939055;RO=7;SAF=10;SAR=4;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0985854;STB=0.555473;TYPE=snp;VARB=0.0236666;OID=.;OPOS=74161762;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:21:21:7:7:14:14:4:10:4:3:4:10:4:3 chr6 74161801 . G T 258.76 PASS AO=28;DP=28;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00400113;FXX=0.0357015;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3797;QD=38.3348;RBI=0.126138;REFB=0;REVB=0.126075;RO=0;SAF=10;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00505932;OID=.;OPOS=74161801;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:28:27:0:0:28:27:18:10:0:0:18:9:0:0 chr6 74521947 . C T 958.54 PASS AO=99;DP=99;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0025759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.792;QD=38.3417;RBI=0.0535739;REFB=0;REVB=-0.053512;RO=0;SAF=55;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.83572e-05;OID=.;OPOS=74521947;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:99:100:0:0:99:100:44:55:0:0:45:55:0:0 chr6 74533192 . T G 1066.91 PASS AO=111;DP=111;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0404442;FXX=0.0260847;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.397;QD=38.1038;RBI=0.0451433;REFB=0;REVB=0.0200546;RO=0;SAF=56;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000221069;OID=.;OPOS=74533192;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:111:112:0:0:111:112:55:56:0:0:56:56:0:0 chr6 75797302 . C T 1772.88 PASS AO=191;DP=194;FAO=191;FDP=194;FR=.;FRO=3;FSAF=101;FSAR=90;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0480545;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1737;QD=36.5542;RBI=0.0482956;REFB=-0.0363291;REVB=-0.00481965;RO=3;SAF=101;SAR=90;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0057719;STB=0.503031;TYPE=snp;VARB=0.00142604;OID=.;OPOS=75797302;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:194:194:3:3:191:191:90:101:1:2:90:101:1:2 chr6 75834971 . T A 355.26 PASS AO=85;DP=173;FAO=84;FDP=170;FR=.;FRO=86;FSAF=30;FSAR=54;FSRF=42;FSRR=44;FWDB=0.0148653;FXX=0.01734;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.917;QD=8.35903;RBI=0.0367359;REFB=-0.0159259;REVB=-0.0335938;RO=84;SAF=30;SAR=55;SRF=41;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127901;STB=0.569403;TYPE=snp;VARB=0.0151565;OID=.;OPOS=75834971;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:170:84:86:85:84:55:30:41:43:54:30:42:44 chr6 75841722 . A T 1740.52 PASS AO=182;DP=184;FAO=182;FDP=182;FR=.;FRO=0;FSAF=119;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00868209;FXX=0.010869;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.642;QD=38.2532;RBI=0.0175504;REFB=0;REVB=0.0152525;RO=0;SAF=119;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.63975e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.49879e-05;OID=.;OPOS=75841722;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:82:184:182:0:0:182:182:63:119:0:0:63:119:0:0 chr6 75994151 . A G 187.24 PASS AO=47;DP=103;FAO=48;FDP=103;FR=.;FRO=55;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=32;FSRR=23;FWDB=-0.0071647;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=206.934;QD=7.27162;RBI=0.0165478;REFB=-0.0110951;REVB=-0.0149163;RO=54;SAF=20;SAR=27;SRF=32;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159603;STB=0.576752;TYPE=snp;VARB=0.00985087;OID=.;OPOS=75994151;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:54:55:47:48:27:20:32:22:27:21:32:23 chr6 76138146 . C CAG 232.3 PASS AO=72;DP=187;FAO=72;FDP=183;FR=.;FRO=111;FSAF=41;FSAR=31;FSRF=56;FSRR=55;FWDB=0.00762182;FXX=0.00543449;HRUN=1;LEN=2;MLLD=251.96;QD=5.07766;RBI=0.0101135;REFB=-0.0157116;REVB=-0.00664756;RO=114;SAF=41;SAR=31;SRF=56;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0854087;STB=0.53971;TYPE=ins;VARB=0.0220793;OID=.;OPOS=76138147;OREF=-;OALT=AG;OMAPALT=CAG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:72:187:72:183:111:41:31:56:55:99:114:41:31:56:58 chr6 76344431 . C T 192.34 PASS AO=44;DP=86;FAO=43;FDP=85;FR=.;FRO=42;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=-0.0292983;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.913;QD=9.05113;RBI=0.0313183;REFB=-0.0217146;REVB=-0.0110657;RO=41;SAF=16;SAR=28;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134049;STB=0.565334;TYPE=snp;VARB=0.0229033;OID=.;OPOS=76344431;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:85:41:42:44:43:28:16:21:20:27:16:21:21 chr6 76369054 . A G 2515.01 PASS AO=262;DP=263;FAO=263;FDP=263;FR=.;FRO=0;FSAF=119;FSAR=144;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00164578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.712;QD=38.251;RBI=0.0201441;REFB=0;REVB=0.0200767;RO=0;SAF=119;SAR=143;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.6781e-05;OID=.;OPOS=76369054;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:263:263:0:0:262:263:143:119:0:0:144:119:0:0 chr6 76376552 . G A 793.45 PASS AO=177;DP=341;FAO=178;FDP=340;FR=.;FRO=162;FSAF=50;FSAR=128;FSRF=55;FSRR=107;FWDB=-0.00824851;FXX=0.00584778;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9053;QD=9.33471;RBI=0.00843422;REFB=-0.0282967;REVB=0.00176016;RO=162;SAF=50;SAR=127;SRF=55;SRR=107;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0596981;STB=0.533541;TYPE=snp;VARB=0.0351747;OID=.;OPOS=76376552;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:341:340:162:162:177:178:127:50:55:107:128:50:55:107 chr6 76425288 . A G 511.27 PASS AO=116;DP=225;FAO=116;FDP=225;FR=.;FRO=109;FSAF=60;FSAR=56;FSRF=53;FSRR=56;FWDB=0.00667836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.3519;QD=9.08927;RBI=0.0182004;REFB=-0.00650206;REVB=0.0169309;RO=109;SAF=60;SAR=56;SRF=53;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0274303;STB=0.515019;TYPE=snp;VARB=0.00648859;OID=.;OPOS=76425288;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:225:225:109:109:116:116:56:60:53:56:56:60:53:56 chr6 76425594 . A C 406.36 PASS AO=92;DP=177;FAO=91;FDP=177;FR=.;FRO=86;FSAF=49;FSAR=42;FSRF=43;FSRR=43;FWDB=0.0182452;FXX=0.0220982;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.86;QD=9.18327;RBI=0.0245541;REFB=-0.00512082;REVB=0.0164322;RO=85;SAF=52;SAR=40;SRF=42;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0627725;STB=0.51874;TYPE=snp;VARB=0.00600048;OID=.;OPOS=76425594;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:177:85:86:92:91:40:52:42:43:42:49:43:43 chr6 76477825 . ATCT A 352.43 PASS AO=77;DP=164;FAO=79;FDP=153;FR=.;FRO=74;FSAF=20;FSAR=59;FSRF=30;FSRR=44;FWDB=-0.00114391;FXX=0.0316436;HRUN=1;LEN=3;MLLD=185.573;QD=9.21391;RBI=0.00774034;REFB=-0.00695021;REVB=0.00765534;RO=67;SAF=19;SAR=58;SRF=25;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13301;STB=0.588799;TYPE=del;VARB=0.00838772;OID=.;OPOS=76477826;OREF=TCT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:77:154:79:153:74:20:59:30:44:99:67:19:58:25:42 chr6 76545684 . T C 347.72 PASS AO=95;DP=211;FAO=96;FDP=222;FR=.;FRO=126;FSAF=24;FSAR=72;FSRF=46;FSRR=80;FWDB=-0.041604;FXX=0.0263146;HRUN=5;LEN=1;MLLD=71.9972;QD=6.26519;RBI=0.0593306;REFB=0.00180652;REVB=-0.0422993;RO=115;SAF=24;SAR=71;SRF=43;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14505;STB=0.580093;TYPE=snp;VARB=-0.00387206;OID=.;OPOS=76545684;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:222:115:126:95:96:71:24:43:72:72:24:46:80 chr6 76604573 . T G 1662.81 PASS AO=174;DP=174;FAO=174;FDP=174;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=112;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00162601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.777;QD=38.2256;RBI=0.00764024;REFB=0;REVB=0.00746521;RO=0;SAF=62;SAR=112;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.04272e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.76951e-06;OID=.;OPOS=76604573;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:174:174:0:0:174:174:112:62:0:0:112:62:0:0 chr6 76626756 . T C 2568.83 PASS AO=269;DP=271;FAO=272;FDP=272;FR=.;FRO=0;FSAF=136;FSAR=136;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00266143;FXX=0.0109087;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.251;QD=37.777;RBI=0.0177768;REFB=-0.0400054;REVB=0.0175764;RO=2;SAF=135;SAR=134;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.61278e-05;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000140474;OID=.;OPOS=76626756;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:271:272:2:0:269:272:134:135:1:1:136:136:0:0 chr6 76627598 . TGGTT TGTT,TGT,TG 512.68 PASS AO=19,22,14;DP=94;FAO=3,80,0;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=0,10,0;FSAR=3,70,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.725778,0.163085,-0.0681016;FXX=0.0119033;HRUN=2,2,2;LEN=1,2,3;MLLD=12.7661,14.3231,13.2352;QD=24.7072;RBI=0.768289,0.288308,0.170791;REFB=0,0,0;REVB=0.25202,0.23775,0.156626;RO=11;SAF=0,0,0;SAR=19,22,14;SRF=7;SRR=4;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.852559,-0.859441,-0.836026;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=del,del,del;VARB=-0.0844432,0.0467176,-0.0496764;OID=.,.,.;OPOS=76627599,76627600,76627600;OREF=G,GT,GTT;OALT=-,-,-;OMAPALT=TGTT,TGT,TG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:19,22,14:89:3,80,0:83:0:0,10,0:3,70,0:0:0:6:11:0,0,0:19,22,14:7:4 chr6 76638318 . T A 288.1 PASS AO=90;DP=220;FAO=87;FDP=217;FR=.;FRO=130;FSAF=33;FSAR=54;FSRF=69;FSRR=61;FWDB=0.00611313;FXX=0.0136357;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.8555;QD=5.31066;RBI=0.0401577;REFB=-0.00513544;REVB=-0.0396897;RO=129;SAF=36;SAR=54;SRF=68;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135007;STB=0.592046;TYPE=snp;VARB=0.00751437;OID=.;OPOS=76638318;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:220:217:129:130:90:87:54:36:68:61:54:33:69:61 chr6 76640803 . G A 351.23 PASS AO=83;DP=171;FAO=83;FDP=169;FR=.;FRO=86;FSAF=36;FSAR=47;FSRF=32;FSRR=54;FWDB=0.00408065;FXX=0.0231201;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.1893;QD=8.31301;RBI=0.00909391;REFB=0.00497182;REVB=-0.00812697;RO=86;SAF=36;SAR=47;SRF=32;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0584887;STB=0.532194;TYPE=snp;VARB=-0.0043499;OID=.;OPOS=76640803;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:169:86:86:83:83:47:36:32:54:47:36:32:54 chr6 78172260 . C G 230.4 PASS AO=48;DP=89;FAO=48;FDP=89;FR=.;FRO=41;FSAF=38;FSAR=10;FSRF=33;FSRR=8;FWDB=-0.0107514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.6578;QD=10.3551;RBI=0.0391128;REFB=0.00309659;REVB=-0.0376061;RO=41;SAF=38;SAR=10;SRF=33;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0169553;STB=0.509322;TYPE=snp;VARB=-0.00326023;OID=.;OPOS=78172260;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:41:41:48:48:10:38:33:8:10:38:33:8 chr6 78172992 . G A 342.52 PASS AO=86;DP=182;FAO=86;FDP=183;FR=.;FRO=97;FSAF=44;FSAR=42;FSRF=55;FSRR=42;FWDB=0.0167389;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.42;QD=7.48687;RBI=0.0167506;REFB=-0.0113311;REVB=0.00062629;RO=96;SAF=44;SAR=42;SRF=55;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0586266;STB=0.529405;TYPE=snp;VARB=0.0127231;OID=.;OPOS=78172992;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:183:96:97:86:86:42:44:55:41:42:44:55:42 chr6 79595167 . A ACTTAT 469.72 PASS AO=62;DP=85;FAO=66;FDP=82;FR=.;FRO=16;FSAF=24;FSAR=42;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.0144707;FXX=0.0238067;HRUN=1;LEN=5;MLLD=215.513;QD=22.913;RBI=0.0159825;REFB=-0.0780373;REVB=-0.00678521;RO=17;SAF=23;SAR=39;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0668939;STB=0.528293;TYPE=ins;VARB=0.0160698;OID=.;OPOS=79595168;OREF=-;OALT=CTTAT;OMAPALT=ACTTAT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:62:85:66:82:16:24:42:8:8:21:17:23:39:9:8 chr6 79612800 . G A 1822.36 PASS AO=188;DP=189;FAO=189;FDP=189;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=128;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0239446;FXX=0.00526288;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.984;QD=38.5684;RBI=0.0337843;REFB=0;REVB=0.0238336;RO=0;SAF=60;SAR=128;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.50754e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.03068e-05;OID=.;OPOS=79612800;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:189:189:0:0:188:189:128:60:0:0:128:61:0:0 chr6 79650265 . G T 18.95 PASS AO=10;DP=31;FAO=7;FDP=27;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=18;FSRR=2;FWDB=-0.0176948;FXX=0.128991;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.3781;QD=2.80716;RBI=0.019745;REFB=0.021039;REVB=-0.00876107;RO=15;SAF=7;SAR=3;SRF=14;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.33714;STB=0.571246;TYPE=snp;VARB=-0.0880303;OID=.;OPOS=79650265;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:31:27:15:20:10:7:3:7:14:1:1:6:18:2 chr6 79657391 . G A 1693.38 PASS AO=177;DP=177;FAO=177;FDP=177;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176097;FXX=0.00561766;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.056;QD=38.2684;RBI=0.0297881;REFB=0;REVB=-0.0240256;RO=0;SAF=71;SAR=106;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.61606e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000116875;OID=.;OPOS=79657391;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:177:177:0:0:177:177:106:71:0:0:106:71:0:0 chr6 79679577 . A G 1039.56 PASS AO=109;DP=112;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0304008;FXX=0.0263135;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.775;QD=37.4617;RBI=0.0373941;REFB=-0.04267;REVB=0.021774;RO=1;SAF=69;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0117188;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000129961;OID=.;OPOS=79679577;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:112:111:1:0:109:111:40:69:0:1:42:69:0:0 chr6 79708000 . A C 1332.23 PASS AO=144;DP=145;FAO=143;FDP=145;FR=.;FRO=2;FSAF=82;FSAR=61;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0162231;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.7255;QD=36.7511;RBI=0.0182953;REFB=-0.0287294;REVB=-0.00845732;RO=1;SAF=83;SAR=61;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0077319;STB=0.501035;TYPE=snp;VARB=0.000338303;OID=.;OPOS=79708000;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:145:145:1:2:144:143:61:83:0:1:61:82:1:1 chr6 79918309 . G A 1401.39 PASS AO=170;DP=186;FAO=169;FDP=185;FR=.;FRO=16;FSAF=81;FSAR=88;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.073187;FXX=0.00537606;HRUN=3;LEN=1;MLLD=36.8177;QD=30.3003;RBI=0.0900183;REFB=-0.137989;REVB=0.0524114;RO=10;SAF=83;SAR=87;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00931845;STB=0.507204;TYPE=snp;VARB=0.0116654;OID=.;OPOS=79918309;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:186:185:10:16:170:169:87:83:4:6:88:81:9:7 chr6 80228541 . A G 3768.36 PASS AO=419;DP=423;FAO=397;FDP=397;FR=.;FRO=0;FSAF=169;FSAR=228;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.010751;FXX=0.00749981;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.582;QD=37.9684;RBI=0.0122526;REFB=-0.0163347;REVB=0.00587717;RO=4;SAF=179;SAR=240;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0105444;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.32772e-05;OID=.;OPOS=80228541;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:423:397:4:0:419:397:240:179:4:0:228:169:0:0 chr6 80580038 . T G 1222.01 PASS AO=133;DP=137;FAO=134;FDP=138;FR=.;FRO=4;FSAF=76;FSAR=58;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0363462;FXX=0.0142847;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.938;QD=35.4206;RBI=0.0431776;REFB=-0.181173;REVB=-0.023308;RO=2;SAF=75;SAR=58;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125054;STB=0.501981;TYPE=snp;VARB=0.00169471;OID=.;OPOS=80580038;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:137:138:2:4:133:134:58:75:2:0:58:76:2:2 chr6 82461727 . ACCGCCGAAGTCGCCGCCGCCGAAGTCGCCG A 36.63 PASS AO=9;DP=46;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.0221232;FXX=0.173837;HRUN=2;LEN=30;MLLD=537.141;QD=7.71054;RBI=0.0352125;REFB=-0.0113842;REVB=0.027395;RO=9;SAF=0;SAR=9;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.811404;STB=0.839197;TYPE=del;VARB=0.0163591;OID=.;OPOS=82461728;OREF=CCGCCGAAGTCGCCGCCGCCGAAGTCGCCG;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:9:23:10:19:9:1:9:6:3:31:9:0:9:6:3 chr6 82900811 . G A 233.08 PASS AO=84;DP=238;FAO=84;FDP=237;FR=.;FRO=153;FSAF=50;FSAR=34;FSRF=98;FSRR=55;FWDB=-0.00509048;FXX=0.00836785;HRUN=5;LEN=1;MLLD=167.998;QD=3.93382;RBI=0.0106504;REFB=-0.00210207;REVB=-0.00935511;RO=144;SAF=50;SAR=34;SRF=90;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0347202;STB=0.530683;TYPE=snp;VARB=0.00341695;OID=.;OPOS=82900811;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:238:237:144:153:84:84:34:50:90:54:34:50:98:55 chr6 82933309 . C T 223.94 PASS AO=62;DP=150;FAO=64;FDP=153;FR=.;FRO=89;FSAF=27;FSAR=37;FSRF=36;FSRR=53;FWDB=-0.0759438;FXX=0.00649309;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.6728;QD=5.8546;RBI=0.0800906;REFB=0.0115654;REVB=0.0254372;RO=78;SAF=28;SAR=34;SRF=32;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0419084;STB=0.510394;TYPE=snp;VARB=-0.0225083;OID=.;OPOS=82933309;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:153:78:89:62:64:34:28:32:46:37:27:36:53 chr6 83075914 . G A 1002.38 PASS AO=101;DP=107;FAO=113;FDP=117;FR=.;FRO=4;FSAF=37;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0289564;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8361;QD=34.2693;RBI=0.120112;REFB=0.0538004;REVB=0.116569;RO=5;SAF=35;SAR=66;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145277;STB=0.512818;TYPE=snp;VARB=-6.57991e-05;OID=.;OPOS=83075914;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:107:117:5:4:101:113:66:35:1:4:76:37:0:4 chr6 83076791 . T C 2196.81 PASS AO=241;DP=249;FAO=243;FDP=249;FR=.;FRO=6;FSAF=119;FSAR=124;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.0050749;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=57.0928;QD=35.2901;RBI=0.0361068;REFB=-0.175036;REVB=0.0357484;RO=3;SAF=119;SAR=122;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00376024;STB=0.50828;TYPE=snp;VARB=0.00248118;OID=.;OPOS=83076791;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:249:249:3:6:241:243:122:119:1:2:124:119:5:1 chr6 83078575 . T C 775.06 PASS AO=82;DP=85;FAO=88;FDP=92;FR=.;FRO=4;FSAF=32;FSAR=56;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.140907;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.6303;QD=33.698;RBI=0.150463;REFB=-0.0623062;REVB=0.0527653;RO=3;SAF=26;SAR=56;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00125307;STB=0.505352;TYPE=snp;VARB=0.0113096;OID=.;OPOS=83078575;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:85:92:3:4:82:88:56:26:1:2:56:32:1:3 chr6 83080386 . C CTTTG 843.52 PASS AO=149;DP=257;FAO=155;FDP=249;FR=.;FRO=94;FSAF=77;FSAR=78;FSRF=58;FSRR=36;FWDB=-0.00851253;FXX=0.0273427;HRUN=3;LEN=4;MLLD=227.474;QD=13.5504;RBI=0.00889231;REFB=0.000273956;REVB=-0.00257098;RO=94;SAF=74;SAR=75;SRF=61;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109156;STB=0.545364;TYPE=ins;VARB=-0.000142204;OID=.;OPOS=83080387;OREF=-;OALT=TTTG;OMAPALT=CTTTG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:149:257:155:249:94:77:78:58:36:99:94:74:75:61:33 chr6 83667038 . G T 217.13 PASS AO=46;DP=86;FAO=46;FDP=86;FR=.;FRO=40;FSAF=37;FSAR=9;FSRF=36;FSRR=4;FWDB=-0.000292634;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.721;QD=10.0992;RBI=0.0178924;REFB=-0.0053468;REVB=0.01789;RO=40;SAF=37;SAR=9;SRF=36;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141691;STB=0.577299;TYPE=snp;VARB=0.00441698;OID=.;OPOS=83667038;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:40:40:46:46:9:37:36:4:9:37:36:4 chr6 83863694 . GA G 78.26 PASS AO=51;DP=230;FAO=87;FDP=211;FR=.;FRO=124;FSAF=22;FSAR=65;FSRF=26;FSRR=98;FWDB=-0.0135339;FXX=0.0409072;HRUN=6;LEN=1;MLLD=8.08666;QD=1.48357;RBI=0.0413048;REFB=-0.0785199;REVB=-0.0390246;RO=87;SAF=24;SAR=27;SRF=22;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0.666667;SSSB=0.248664;STB=0.534737;TYPE=del;VARB=0.0744205;OID=.;OPOS=83863695;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:51:169:87:211:124:22:65:26:98:78:87:24:27:22:65 chr6 84233831 . G A 191.35 PASS AO=21;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0160451;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=104.92;QD=34.7916;RBI=0.0837141;REFB=0;REVB=0.0821621;RO=0;SAF=19;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.98875e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00230676;OID=.;OPOS=84233831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:22:22:0:0:21:22:2:19:0:0:3:19:0:0 chr6 84234144 . C T 105.02 PASS AO=32;DP=83;FAO=32;FDP=84;FR=.;FRO=52;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=31;FSRR=21;FWDB=0.0104045;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.79;QD=5.00106;RBI=0.0115098;REFB=0.00581588;REVB=-0.0049217;RO=51;SAF=15;SAR=17;SRF=31;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148863;STB=0.578354;TYPE=snp;VARB=-0.0118978;OID=.;OPOS=84234144;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:84:51:52:32:32:17:15:31:20:17:15:31:21 chr6 84300997 . A G 742.55 PASS AO=174;DP=347;FAO=174;FDP=347;FR=.;FRO=173;FSAF=81;FSAR=93;FSRF=82;FSRR=91;FWDB=0.0105389;FXX=0.00573049;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.621;QD=8.55964;RBI=0.0495858;REFB=-0.027853;REVB=0.0484529;RO=164;SAF=81;SAR=93;SRF=81;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0252709;STB=0.504241;TYPE=snp;VARB=0.0299147;OID=.;OPOS=84300997;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:347:347:164:173:174:174:93:81:81:83:93:81:82:91 chr6 84303342 . T C 137.58 PASS AO=21;DP=35;FAO=24;FDP=37;FR=.;FRO=13;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.00853203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.547;QD=14.8739;RBI=0.0381542;REFB=-0.0300088;REVB=0.037188;RO=12;SAF=11;SAR=10;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0156396;STB=0.528193;TYPE=snp;VARB=0.00870337;OID=.;OPOS=84303342;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:35:37:12:13:21:24:10:11:6:6:11:13:6:7 chr6 84311055 . G A 216.37 PASS AO=70;DP=184;FAO=70;FDP=184;FR=.;FRO=114;FSAF=36;FSAR=34;FSRF=45;FSRR=69;FWDB=0.0149812;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.988;QD=4.70362;RBI=0.0405237;REFB=-0.0222934;REVB=0.0376529;RO=113;SAF=36;SAR=34;SRF=45;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126604;STB=0.573795;TYPE=snp;VARB=0.0317359;OID=.;OPOS=84311055;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:184:113:114:70:70:34:36:45:68:34:36:45:69 chr6 84669951 . T C 336.66 PASS AO=95;DP=216;FAO=92;FDP=211;FR=.;FRO=119;FSAF=53;FSAR=39;FSRF=71;FSRR=48;FWDB=-0.019086;FXX=0.0231471;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.018;QD=6.38216;RBI=0.0193446;REFB=-0.0299945;REVB=0.00315245;RO=118;SAF=56;SAR=39;SRF=70;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00386497;STB=0.511906;TYPE=snp;VARB=0.0354639;OID=.;OPOS=84669951;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:216:211:118:119:95:92:39:56:70:48:39:53:71:48 chr6 84799059 . C T 335.65 PASS AO=81;DP=167;FAO=81;FDP=167;FR=.;FRO=86;FSAF=34;FSAR=47;FSRF=44;FSRR=42;FWDB=0.00748055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.5019;QD=8.0394;RBI=0.0199034;REFB=-0.0155716;REVB=0.0184442;RO=85;SAF=34;SAR=47;SRF=44;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0917056;STB=0.547806;TYPE=snp;VARB=0.0169047;OID=.;OPOS=84799059;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:167:85:86:81:81:47:34:44:41:47:34:44:42 chr6 84799185 . C T 111.72 PASS AO=36;DP=97;FAO=38;FDP=107;FR=.;FRO=69;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=30;FSRR=39;FWDB=0.0160606;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.718;QD=4.17631;RBI=0.0391784;REFB=0.000157431;REVB=-0.0357352;RO=59;SAF=13;SAR=23;SRF=30;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16418;STB=0.563678;TYPE=snp;VARB=-0.000470476;OID=.;OPOS=84799185;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:107:59:69:36:38:23:13:30:29:25:13:30:39 chr6 84896313 . TTTC T 71.75 PASS AO=21;DP=83;FAO=29;FDP=65;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=0.00561509;FXX=0.121605;HRUN=3;LEN=3;MLLD=233.75;QD=4.41559;RBI=0.0087752;REFB=0.0115006;REVB=-0.00674351;RO=30;SAF=9;SAR=12;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0395583;STB=0.536716;TYPE=del;VARB=-0.0112185;OID=.;OPOS=84896314;OREF=TTC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:21:69:29:65:36:14:15:15:21:71:30:9:12:14:16 chr6 86199233 . A G 2411.15 PASS AO=252;DP=252;FAO=252;FDP=252;FR=.;FRO=0;FSAF=132;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0014228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.94;QD=38.2722;RBI=0.0440226;REFB=0;REVB=0.0439996;RO=0;SAF=132;SAR=120;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.35693e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.76374e-05;OID=.;OPOS=86199233;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:252:252:0:0:252:252:120:132:0:0:120:132:0:0 chr6 86205323 . T G 225.72 PASS AO=59;DP=136;FAO=61;FDP=138;FR=.;FRO=77;FSAF=40;FSAR=21;FSRF=33;FSRR=44;FWDB=-2.31273e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.718;QD=6.54265;RBI=0.0265892;REFB=0.00448181;REVB=0.0265892;RO=75;SAF=40;SAR=19;SRF=32;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.258116;STB=0.62904;TYPE=snp;VARB=-0.0025508;OID=.;OPOS=86205323;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:138:75:77:59:61:19:40:32:43:21:40:33:44 chr6 86275079 . CA C 28.37 PASS AO=40;DP=101;FAO=39;FDP=90;FR=.;FRO=51;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=28;FWDB=-0.247059;FXX=0.0109878;HRUN=7;LEN=1;MLLD=6.80469;QD=1.26097;RBI=0.247144;REFB=-0.114079;REVB=0.00647259;RO=36;SAF=16;SAR=24;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0148107;STB=0.538987;TYPE=del;VARB=0.0831443;OID=.;OPOS=86275080;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:40:89:39:90:51:15:24:23:28:28:36:16:24:15:21 chr6 86303091 . G A 142.62 PASS AO=31;DP=65;FAO=33;FDP=67;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=0.0721567;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.4076;QD=8.51477;RBI=0.0935366;REFB=-0.0418981;REVB=0.0595189;RO=34;SAF=11;SAR=20;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0568372;STB=0.525996;TYPE=snp;VARB=0.0527688;OID=.;OPOS=86303091;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:67:34:34:31:33:20:11:14:20:21:12:14:20 chr6 87967434 . AGG AG,A,AAG 1283.56 PASS AO=97,29,30;DP=189;FAO=172,0,20;FDP=192;FR=.;FRO=0;FSAF=56,0,5;FSAR=116,0,15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.359503,0.179459,0.210514;FXX=0.039998;HRUN=3,3,3;LEN=1,2,1;MLLD=13.5685,11.1489,9.21262;QD=26.7408;RBI=0.463188,0.231611,0.210514;REFB=0,0,0;REVB=-0.292064,-0.146418,0.00039534;RO=19;SAF=34,0,11;SAR=63,29,19;SRF=16;SRR=3;SSEN=0,0,0;SSEP=0.243056,0.243056,0;SSSB=-0.157832,-0.879565,-0.327168;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=del,del,snp;VARB=-0.0125519,0.0429669,0.0211083;OID=.,.,.;OPOS=87967435,87967435,87967435;OREF=G,GG,G;OALT=-,-,A;OMAPALT=AG,A,AAG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/3:97,29,30:183:172,0,20:192:0:56,0,5:116,0,15:0:0:4:19:34,0,11:63,29,19:16:3 chr6 88108048 . AGAT A 326.79 PASS AO=37;DP=43;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0269707;FXX=0.0714116;HRUN=1;LEN=3;MLLD=195.432;QD=33.517;RBI=0.0313821;REFB=0.011541;REVB=0.0160443;RO=2;SAF=16;SAR=21;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0549974;STB=0.514278;TYPE=del;VARB=0.000338969;OID=.;OPOS=88108049;OREF=GAT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:37:42:38:39:1:17:21:1:0:10:2:16:21:2:0 chr6 88221892 . T G 352.41 PASS AO=77;DP=146;FAO=77;FDP=145;FR=.;FRO=68;FSAF=31;FSAR=46;FSRF=28;FSRR=40;FWDB=-0.0161182;FXX=0.00684885;HRUN=4;LEN=1;MLLD=157.906;QD=9.72178;RBI=0.0184643;REFB=-0.0221293;REVB=-0.00900756;RO=66;SAF=31;SAR=46;SRF=28;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0188837;STB=0.50446;TYPE=snp;VARB=0.0228564;OID=.;OPOS=88221892;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:145:66:68:77:77:46:31:28:38:46:31:28:40 chr6 88315741 . TA T 537.18 PASS AO=171;DP=365;FAO=184;FDP=331;FR=.;FRO=147;FSAF=74;FSAR=110;FSRF=52;FSRR=95;FWDB=-0.111906;FXX=0.0293247;HRUN=5;LEN=1;MLLD=16.9158;QD=6.49158;RBI=0.122899;REFB=0.0312122;REVB=-0.0508074;RO=142;SAF=65;SAR=106;SRF=50;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0249545;STB=0.52256;TYPE=del;VARB=-0.0410301;OID=.;OPOS=88315742;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:171:337:184:331:147:74:110:52:95:99:142:65:106:50:92 chr6 88853635 . C T 297.12 PASS AO=77;DP=170;FAO=77;FDP=170;FR=.;FRO=93;FSAF=37;FSAR=40;FSRF=41;FSRR=52;FWDB=0.00485484;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.234;QD=6.99109;RBI=0.00574064;REFB=-0.0124196;REVB=-0.00306358;RO=92;SAF=37;SAR=40;SRF=41;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.034301;STB=0.52176;TYPE=snp;VARB=0.0134002;OID=.;OPOS=88853635;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:170:92:93:77:77:40:37:41:51:40:37:41:52 chr6 89424010 . G C 241.01 PASS AO=70;DP=170;FAO=70;FDP=170;FR=.;FRO=100;FSAF=30;FSAR=40;FSRF=60;FSRR=40;FWDB=-0.0108556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.558;QD=5.67086;RBI=0.0216162;REFB=-0.000861264;REVB=-0.0186927;RO=100;SAF=30;SAR=40;SRF=60;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17847;STB=0.599972;TYPE=snp;VARB=0.0012362;OID=.;OPOS=89424010;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:170:100:100:70:70:40:30:60:40:40:30:60:40 chr6 89676206 . T G 195.77 PASS AO=51;DP=119;FAO=52;FDP=119;FR=.;FRO=67;FSAF=15;FSAR=37;FSRF=31;FSRR=36;FWDB=-0.0134277;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.1866;QD=6.58061;RBI=0.0537194;REFB=0.00581454;REVB=-0.0520141;RO=68;SAF=15;SAR=36;SRF=31;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180839;STB=0.608465;TYPE=snp;VARB=-0.00924825;OID=.;OPOS=89676206;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:68:67:51:52:36:15:31:37:37:15:31:36 chr6 89676500 . G C 50.26 PASS AO=12;DP=35;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=18;FWDB=0.0554022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.5409;QD=5.58459;RBI=0.0616256;REFB=0.0397657;REVB=0.0269873;RO=23;SAF=2;SAR=10;SRF=5;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0917322;STB=0.583225;TYPE=snp;VARB=-0.0694857;OID=.;OPOS=89676500;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:35:36:23:22:12:14:10:2:5:18:10:4:4:18 chr6 89806689 . T C 1310.74 PASS AO=134;DP=136;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0336438;FXX=0.0142847;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.3691;QD=37.9923;RBI=0.055785;REFB=-0.0297476;REVB=0.0444978;RO=1;SAF=52;SAR=82;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00576214;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000350693;OID=.;OPOS=89806689;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:136:138:1:0:134:138:82:52:0:1:83:55:0:0 chr6 89907873 . G A 1588.5 PASS AO=168;DP=170;FAO=170;FDP=170;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0387292;FXX=0.0116272;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.693;QD=37.3765;RBI=0.0450012;REFB=-0.00747265;REVB=0.0229163;RO=2;SAF=88;SAR=80;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0117479;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000125282;OID=.;OPOS=89907873;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:170:170:2:0:168:170:80:88:0:2:81:89:0:0 chr6 89914439 . A G 787.37 PASS AO=90;DP=93;FAO=89;FDP=93;FR=.;FRO=4;FSAF=70;FSAR=19;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.00110102;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=177.032;QD=33.8652;RBI=0.0110522;REFB=-0.182468;REVB=-0.0109972;RO=2;SAF=71;SAR=19;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0131646;STB=0.513886;TYPE=snp;VARB=-0.000412717;OID=.;OPOS=89914439;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:93:93:2:4:90:89:19:71:2:0:19:70:4:0 chr6 89981413 . T C 385.46 PASS AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00230571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.511;QD=37.6057;RBI=0.0249379;REFB=0;REVB=-0.0248311;RO=0;SAF=25;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.1719e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000217717;OID=.;OPOS=89981413;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:41:41:0:0:41:41:16:25:0:0:16:25:0:0 chr6 90188072 . C T 96.13 PASS AO=26;DP=63;FAO=26;FDP=63;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.106;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.345;QD=6.10319;RBI=0.107059;REFB=0.0138862;REVB=0.015024;RO=37;SAF=10;SAR=16;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162119;STB=0.592521;TYPE=snp;VARB=-0.0149358;OID=.;OPOS=90188072;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:63:63:37:37:26:26:16:10:20:17:16:10:20:17 chr6 90315789 . A G 132.23 PASS AO=42;DP=113;FAO=42;FDP=112;FR=.;FRO=70;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=23;FSRR=47;FWDB=-0.00326764;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.205;QD=4.72244;RBI=0.0180383;REFB=-0.00134592;REVB=-0.0177399;RO=70;SAF=16;SAR=26;SRF=23;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0620426;STB=0.535272;TYPE=snp;VARB=0.00188164;OID=.;OPOS=90315789;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:112:70:70:42:42:26:16:23:47:26:16:23:47 chr6 90333599 . A G 945.37 PASS AO=100;DP=107;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177151;FXX=0.0733878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.76;QD=37.4405;RBI=0.0209373;REFB=-0.0853746;REVB=0.0111601;RO=1;SAF=30;SAR=70;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0155482;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0019852;OID=.;OPOS=90333599;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:107:101:1:0:100:101:70:30:1:0:70:31:0:0 chr6 90340446 . C T 107.42 PASS AO=23;DP=45;FAO=23;FDP=45;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=6;FWDB=-4.49177e-05;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=197.607;QD=9.54811;RBI=0.013051;REFB=-0.0365201;REVB=0.0130509;RO=22;SAF=14;SAR=9;SRF=16;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111774;STB=0.562448;TYPE=snp;VARB=0.0261154;OID=.;OPOS=90340446;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:45:45:22:22:23:23:9:14:16:6:9:14:16:6 chr6 90347511 . T C 590.63 PASS AO=139;DP=278;FAO=139;FDP=278;FR=.;FRO=139;FSAF=78;FSAR=61;FSRF=83;FSRR=56;FWDB=-0.0344912;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.8295;QD=8.49832;RBI=0.0550233;REFB=-0.0224415;REVB=-0.0428709;RO=138;SAF=78;SAR=61;SRF=82;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0306298;STB=0.518338;TYPE=snp;VARB=0.0223882;OID=.;OPOS=90347511;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:278:278:138:139:139:139:61:78:82:56:61:78:83:56 chr6 90368380 . G A 145.11 PASS AO=47;DP=126;FAO=47;FDP=126;FR=.;FRO=79;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=26;FSRR=53;FWDB=0.0176898;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.179;QD=4.60654;RBI=0.0228919;REFB=-0.0196216;REVB=0.0145296;RO=78;SAF=28;SAR=19;SRF=26;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.281903;STB=0.662656;TYPE=snp;VARB=0.0222209;OID=.;OPOS=90368380;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:78:79:47:47:19:28:26:52:19:28:26:53 chr6 90372574 . A C 391.22 PASS AO=105;DP=235;FAO=106;FDP=239;FR=.;FRO=133;FSAF=32;FSAR=74;FSRF=78;FSRR=55;FWDB=-0.0112623;FXX=0.0123962;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.558;QD=6.5476;RBI=0.0328465;REFB=-0.0184665;REVB=-0.0308554;RO=128;SAF=31;SAR=74;SRF=76;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.305222;STB=0.663483;TYPE=snp;VARB=0.0237802;OID=.;OPOS=90372574;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:235:239:128:133:105:106:74:31:76:52:74:32:78:55 chr6 90374283 . A G 324.03 PASS AO=76;DP=155;FAO=76;FDP=153;FR=.;FRO=77;FSAF=38;FSAR=38;FSRF=42;FSRR=35;FWDB=0.0101198;FXX=0.0129024;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.896;QD=8.47125;RBI=0.0157286;REFB=-0.0153308;REVB=0.0120406;RO=77;SAF=38;SAR=38;SRF=42;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0415154;STB=0.52287;TYPE=snp;VARB=0.016733;OID=.;OPOS=90374283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:153:77:77:76:76:38:38:42:35:38:38:42:35 chr6 90397132 . G C 218.77 PASS AO=60;DP=132;FAO=57;FDP=129;FR=.;FRO=72;FSAF=34;FSAR=23;FSRF=29;FSRR=43;FWDB=-0.00418795;FXX=0.0227256;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.119;QD=6.7835;RBI=0.00482641;REFB=-0.00238885;REVB=-0.00239902;RO=70;SAF=37;SAR=23;SRF=29;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196624;STB=0.607598;TYPE=snp;VARB=0.00423338;OID=.;OPOS=90397132;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:129:70:72:60:57:23:37:29:41:23:34:29:43 chr6 90402840 . C G 327.65 PASS AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108639;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.822;QD=37.4456;RBI=0.0117725;REFB=0;REVB=0.00453518;RO=0;SAF=8;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00010503;OID=.;OPOS=90402840;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:35:35:0:0:35:35:27:8:0:0:27:8:0:0 chr6 90408589 . A G 1458.24 PASS AO=153;DP=156;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00613998;FXX=0.0128197;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.401;QD=37.8763;RBI=0.027916;REFB=-0.0824855;REVB=0.0272324;RO=0;SAF=63;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71982e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.22721e-05;OID=.;OPOS=90408589;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:156:154:0:0:153:154:90:63:0:0:91:63:0:0 chr6 90418262 . C T 2762.34 PASS AO=291;DP=294;FAO=292;FDP=292;FR=.;FRO=0;FSAF=170;FSAR=122;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0110912;FXX=0.00680249;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.376;QD=37.8402;RBI=0.032958;REFB=-0.112784;REVB=0.0310358;RO=2;SAF=170;SAR=121;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00781645;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000277508;OID=.;OPOS=90418262;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:294:292:2:0:291:292:121:170:0:2:122:170:0:0 chr6 90448092 . C T 2389.36 PASS AO=242;DP=243;FAO=249;FDP=249;FR=.;FRO=0;FSAF=120;FSAR=129;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229041;FXX=0.00399984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.119;QD=38.3833;RBI=0.0445453;REFB=0;REVB=0.0382058;RO=0;SAF=114;SAR=128;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.81293e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000439218;OID=.;OPOS=90448092;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:243:249:0:0:242:249:128:114:0:0:129:120:0:0 chr6 90455078 . C T 265.38 PASS AO=64;DP=133;FAO=64;FDP=133;FR=.;FRO=69;FSAF=16;FSAR=48;FSRF=30;FSRR=39;FWDB=-0.0142212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.5492;QD=7.9812;RBI=0.0154837;REFB=0.000297177;REVB=-0.00612387;RO=69;SAF=16;SAR=48;SRF=30;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203345;STB=0.613295;TYPE=snp;VARB=-0.000491214;OID=.;OPOS=90455078;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:69:69:64:64:48:16:30:39:48:16:30:39 chr6 90455084 . A G 1247.77 PASS AO=131;DP=132;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0312637;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.81;QD=38.0997;RBI=0.0351409;REFB=0;REVB=0.0160456;RO=0;SAF=46;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.99652e-05;OID=.;OPOS=90455084;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:132:131:0:0:131:131:85:46:0:0:85:46:0:0 chr6 90565242 . A G 453.76 PASS AO=52;DP=56;FAO=52;FDP=55;FR=.;FRO=3;FSAF=33;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0077636;FXX=0.017854;HRUN=6;LEN=1;MLLD=58.4153;QD=33.0009;RBI=0.0170742;REFB=-0.128227;REVB=0.0152071;RO=1;SAF=33;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140615;STB=0.517544;TYPE=snp;VARB=0.00309923;OID=.;OPOS=90565242;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:56:55:1:3:52:52:19:33:1:0:19:33:1:2 chr6 90577706 . TG T 337.35 PASS AO=34;DP=48;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00123759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.982;QD=37.4838;RBI=0.0955781;REFB=0;REVB=0.0955701;RO=0;SAF=10;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00218784;OID=.;OPOS=90577707;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:34:35:36:36:0:11:25:0:0:16:0:10:24:0:0 chr6 90577711 . TCTTTGCCCAGACATGGA T 290.01 PASS AO=31;DP=35;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00943724;FXX=0;HRUN=1;LEN=17;MLLD=529.659;QD=37.4205;RBI=0.0159593;REFB=0;REVB=0.01287;RO=0;SAF=10;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=4.65066e-06;OID=.;OPOS=90577712;OREF=CTTTGCCCAGACATGGA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:31:31:31:31:0:10:21:0:0:14:0:10:21:0:0 chr6 90608054 . C G 277.65 PASS AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115697;FXX=0.0624805;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.2799;QD=37.0194;RBI=0.0141217;REFB=0;REVB=-0.00809712;RO=0;SAF=13;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.63861e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000115685;OID=.;OPOS=90608054;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:30:30:0:0:30:30:17:13:0:0:17:13:0:0 chr6 90641341 . C A 11.23 PASS AO=2;DP=9;FAO=2;FDP=8;FR=.;FRO=6;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0;FXX=0.110988;HRUN=6;LEN=1;MLLD=34.8665;QD=5.61462;RBI=0.078555;REFB=0.0676457;REVB=0.078555;RO=6;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.13126;OID=.;OPOS=90641341;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:9:8:6:6:2:2:2:0:0:6:2:0:0:6 chr6 90641674 . ATAT A 185.17 PASS AO=8;DP=41;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0258653;FXX=0.166597;HRUN=1;LEN=3;MLLD=87.5543;QD=37.0339;RBI=0.310289;REFB=0;REVB=0.309209;RO=21;SAF=8;SAR=0;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.809789;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00352077;OID=.;OPOS=90641675;OREF=TAT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:8:32:20:20:0:9:11:0:0:9:21:8:0:5:16 chr6 90660319 . T C 183.14 PASS AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0170255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.084;QD=38.5548;RBI=0.0410926;REFB=0;REVB=0.0373996;RO=0;SAF=9;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33753e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000126983;OID=.;OPOS=90660319;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:19:19:0:0:19:19:10:9:0:0:10:9:0:0 chr6 93967851 . C T 3014.69 PASS AO=300;DP=305;FAO=314;FDP=314;FR=.;FRO=0;FSAF=196;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0355136;FXX=0.0125782;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.0095;QD=38.4037;RBI=0.04189;REFB=0;REVB=0.0222161;RO=0;SAF=189;SAR=111;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.05052e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000139899;OID=.;OPOS=93967851;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:305:314:0:0:300:314:111:189:0:0:118:196:0:0 chr6 93982124 . A G 1319.55 PASS AO=140;DP=143;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0435355;FXX=0.0209776;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.254;QD=37.7016;RBI=0.0444647;REFB=-0.0483964;REVB=0.00904241;RO=1;SAF=43;SAR=97;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00487702;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000226919;OID=.;OPOS=93982124;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:143:140:1:0:140:140:97:43:0:1:97:43:0:0 chr6 94067981 . C T 527.98 PASS AO=108;DP=192;FAO=108;FDP=192;FR=.;FRO=84;FSAF=70;FSAR=38;FSRF=52;FSRR=32;FWDB=-0.0181996;FXX=0.00518108;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.213;QD=10.9996;RBI=0.0224405;REFB=-0.0116564;REVB=0.0131283;RO=84;SAF=70;SAR=38;SRF=52;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0254208;STB=0.51384;TYPE=snp;VARB=0.00918399;OID=.;OPOS=94067981;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:192:84:84:108:108:38:70:52:32:38:70:52:32 chr6 95156918 . G A 396.01 PASS AO=89;DP=177;FAO=92;FDP=184;FR=.;FRO=92;FSAF=47;FSAR=45;FSRF=50;FSRR=42;FWDB=-0.0055538;FXX=0.0107521;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.623;QD=8.60898;RBI=0.0234327;REFB=0.00358112;REVB=0.0227651;RO=87;SAF=45;SAR=44;SRF=48;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0415093;STB=0.51632;TYPE=snp;VARB=-0.00444544;OID=.;OPOS=95156918;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:184:87:92:89:92:44:45:48:39:45:47:50:42 chr6 96034881 . A ATATG,G 3060.84 PASS AO=338,246;DP=813;FAO=239,106;FDP=351;FR=.;FRO=6;FSAF=167,52;FSAR=72,54;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.0116612,0.0287194;FXX=0.122497;HRUN=1,1;LEN=4,1;MLLD=109.665,75.278;QD=34.8813;RBI=0.0116622,0.0342509;REFB=-0.0850494,0.0271863;REVB=0.000153771,-0.0186633;RO=185;SAF=250,96;SAR=88,150;SRF=174;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.190304,-0.416887;STB=0.508823,0.527268;TYPE=ins,snp;VARB=0.0263271,-0.00170362;OID=.,.;OPOS=96034882,96034881;OREF=-,A;OALT=TATG,G;OMAPALT=ATATG,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:813:351:185:6:338,246:239,106:88,150:250,96:174:11:72,54:167,52:6:0 chr6 96035175 . T C 3111.8 PASS AO=328;DP=330;FAO=328;FDP=328;FR=.;FRO=0;FSAF=134;FSAR=194;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208767;FXX=0.00906317;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.118;QD=37.9487;RBI=0.0377066;REFB=-0.049605;REVB=0.0313999;RO=2;SAF=134;SAR=194;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00109405;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000488806;OID=.;OPOS=96035175;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:330:328:2:0:328:328:194:134:1:1:194:134:0:0 chr6 96055915 . G C 3806.73 PASS AO=569;DP=571;FAO=397;FDP=397;FR=.;FRO=0;FSAF=102;FSAR=295;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0380622;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.0866;QD=38.3549;RBI=0.0630761;REFB=-0.0225302;REVB=0.0502977;RO=1;SAF=138;SAR=431;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00344784;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.77865e-05;OID=.;OPOS=96055915;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:571:397:1:0:569:397:431:138:1:0:295:102:0:0 chr6 96386151 . G A 1658.39 PASS AO=179;DP=182;FAO=179;FDP=182;FR=.;FRO=3;FSAF=60;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0294142;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.764;QD=36.4482;RBI=0.0371542;REFB=-0.0424176;REVB=0.0226989;RO=3;SAF=60;SAR=119;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0118489;STB=0.506223;TYPE=snp;VARB=0.000478774;OID=.;OPOS=96386151;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:182:182:3:3:179:179:119:60:0:3:119:60:0:3 chr6 96651740 . A G 869.39 PASS AO=94;DP=98;FAO=94;FDP=96;FR=.;FRO=2;FSAF=49;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0101384;FXX=0.0204061;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.0414;QD=36.2244;RBI=0.0107669;REFB=-0.064681;REVB=-0.00362486;RO=2;SAF=49;SAR=45;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000841791;STB=0.500444;TYPE=snp;VARB=-8.7589e-05;OID=.;OPOS=96651740;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:98:96:2:2:94:94:45:49:1:1:45:49:1:1 chr6 96652371 . T C 584.89 PASS AO=69;DP=74;FAO=69;FDP=74;FR=.;FRO=5;FSAF=39;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.000352533;FXX=0.038956;HRUN=6;LEN=1;MLLD=171.604;QD=31.6158;RBI=0.00117564;REFB=-0.0438635;REVB=-0.00112154;RO=4;SAF=39;SAR=30;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0330025;STB=0.524933;TYPE=snp;VARB=0.000331916;OID=.;OPOS=96652371;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:74:74:4:5:69:69:30:39:1:3:30:39:1:4 chr6 96652582 . G T 1144.33 PASS AO=120;DP=121;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00827262;FXX=0.00826378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.8;QD=38.1445;RBI=0.0147039;REFB=0;REVB=0.012156;RO=0;SAF=52;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.43581e-05;OID=.;OPOS=96652582;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:121:120:0:0:120:120:68:52:0:0:68:52:0:0 chr6 96652706 . G A 1260.81 PASS AO=135;DP=137;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01481;FXX=0.0145975;HRUN=3;LEN=1;MLLD=234.809;QD=37.3574;RBI=0.0312937;REFB=-0.110595;REVB=0.0275673;RO=2;SAF=75;SAR=60;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00156067;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.63937e-06;OID=.;OPOS=96652706;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:137:135:2:0:135:135:60:75:1:1:60:75:0:0 chr6 96653037 . GT G,GC 3612.35 PASS AO=298,287;DP=608;FAO=400,0;FDP=400;FR=.;FRO=0;FSAF=158,0;FSAR=242,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0869991,-0.459027;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=52.6319,42.9049;QD=36.1235;RBI=0.0921821,0.459067;REFB=0,0;REVB=0.0304746,-0.00609276;RO=3;SAF=7,230;SAR=291,57;SRF=0;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.00489131,0.0244311;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.000982033,0;OID=.,.;OPOS=96653038,96653038;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=G,GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:298,287:596:400,0:400:0:158,0:242,0:0:0:99:3:7,230:291,57:0:3 chr6 96653208 . C G 1723.33 PASS AO=178;DP=178;FAO=179;FDP=179;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0114662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.5985;QD=38.5102;RBI=0.0129826;REFB=0;REVB=-0.00608876;RO=0;SAF=80;SAR=98;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.39152e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.99475e-05;OID=.;OPOS=96653208;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:178:179:0:0:178:179:98:80:0:0:99:80:0:0 chr6 96661315 . T C 290 PASS AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0097526;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.3594;QD=37.4194;RBI=0.0131901;REFB=0;REVB=0.0088807;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000254622;OID=.;OPOS=96661315;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:31:31:0:0:31:31:17:14:0:0:17:14:0:0 chr6 96661410 . A G 1058.95 PASS AO=113;DP=114;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00302822;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.586;QD=37.4851;RBI=0.0336141;REFB=0.0260136;REVB=-0.0334774;RO=1;SAF=62;SAR=51;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00759727;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.64626e-05;OID=.;OPOS=96661410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:114:113:1:0:113:113:51:62:1:0:51:62:0:0 chr6 96999725 . C T 755.78 PASS AO=171;DP=337;FAO=174;FDP=341;FR=.;FRO=167;FSAF=92;FSAR=82;FSRF=70;FSRR=97;FWDB=0.0296184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.1014;QD=8.86542;RBI=0.032097;REFB=-0.0408445;REVB=0.0123679;RO=153;SAF=91;SAR=80;SRF=67;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0814845;STB=0.553503;TYPE=snp;VARB=0.035702;OID=.;OPOS=96999725;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:337:341:153:167:171:174:80:91:67:86:82:92:70:97 chr6 97052754 . C T 603.19 PASS AO=137;DP=265;FAO=137;FDP=265;FR=.;FRO=128;FSAF=69;FSAR=68;FSRF=62;FSRR=66;FWDB=0.0139483;FXX=0.00375926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.005;QD=9.10473;RBI=0.0139882;REFB=0.00553373;REVB=-0.00105551;RO=128;SAF=69;SAR=68;SRF=62;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0170204;STB=0.509308;TYPE=snp;VARB=-0.00505998;OID=.;OPOS=97052754;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:265:265:128:128:137:137:68:69:62:66:68:69:62:66 chr6 97058553 . A G 451.67 PASS AO=118;DP=260;FAO=118;FDP=259;FR=.;FRO=141;FSAF=57;FSAR=61;FSRF=80;FSRR=61;FWDB=0.00595949;FXX=0.00384601;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.89;QD=6.97561;RBI=0.0305668;REFB=-0.0114115;REVB=-0.0299802;RO=139;SAF=57;SAR=61;SRF=80;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0903163;STB=0.545809;TYPE=snp;VARB=0.013178;OID=.;OPOS=97058553;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:260:259:139:141:118:118:61:57:80:59:61:57:80:61 chr6 97058567 . A G 426.86 PASS AO=112;DP=251;FAO=115;FDP=253;FR=.;FRO=138;FSAF=53;FSAR=62;FSRF=78;FSRR=60;FWDB=0.022804;FXX=0.00784283;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.761;QD=6.74881;RBI=0.0248448;REFB=-0.00658173;REVB=0.00986121;RO=127;SAF=50;SAR=62;SRF=68;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0857608;STB=0.556749;TYPE=snp;VARB=0.00813483;OID=.;OPOS=97058567;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:251:253:127:138:112:115:62:50:68:59:62:53:78:60 chr6 97063522 . C G 665.66 PASS AO=149;DP=287;FAO=150;FDP=288;FR=.;FRO=138;FSAF=75;FSAR=75;FSRF=70;FSRR=68;FWDB=0.0225203;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.2027;QD=9.24524;RBI=0.0350612;REFB=0.0158009;REVB=-0.0268724;RO=137;SAF=75;SAR=74;SRF=70;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00665779;STB=0.503472;TYPE=snp;VARB=-0.0155263;OID=.;OPOS=97063522;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:287:288:137:138:149:150:74:75:70:67:75:75:70:68 chr6 97063555 . A G 640.32 PASS AO=146;DP=284;FAO=146;FDP=284;FR=.;FRO=138;FSAF=75;FSAR=71;FSRF=67;FSRR=71;FWDB=0.0137374;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=100.121;QD=9.0186;RBI=0.0218246;REFB=-0.0269407;REVB=-0.0169587;RO=138;SAF=75;SAR=71;SRF=67;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0250422;STB=0.513697;TYPE=snp;VARB=0.0189321;OID=.;OPOS=97063555;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:284:284:138:138:146:146:71:75:67:71:71:75:67:71 chr6 97247566 . T A 357.79 PASS AO=70;DP=126;FAO=73;FDP=131;FR=.;FRO=58;FSAF=28;FSAR=45;FSRF=24;FSRR=34;FWDB=0.00539811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.993;QD=10.9251;RBI=0.0193849;REFB=0.0148876;REVB=0.0186181;RO=56;SAF=27;SAR=43;SRF=24;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0364015;STB=0.514056;TYPE=snp;VARB=-0.0105122;OID=.;OPOS=97247566;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:131:56:58:70:73:43:27:24:32:45:28:24:34 chr6 97339078 . A G 325.68 PASS AO=97;DP=238;FAO=97;FDP=237;FR=.;FRO=140;FSAF=30;FSAR=67;FSRF=62;FSRR=78;FWDB=0.0224438;FXX=0.0042015;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.306;QD=5.49671;RBI=0.0268233;REFB=-0.0154139;REVB=0.0146889;RO=139;SAF=30;SAR=67;SRF=61;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14883;STB=0.586248;TYPE=snp;VARB=0.0275902;OID=.;OPOS=97339078;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:238:237:139:140:97:97:67:30:61:78:67:30:62:78 chr6 97339088 . C T 371.39 PASS AO=106;DP=250;FAO=106;FDP=250;FR=.;FRO=144;FSAF=33;FSAR=73;FSRF=61;FSRR=83;FWDB=-0.00923383;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9585;QD=5.94221;RBI=0.0188299;REFB=0.0070751;REVB=-0.0164104;RO=143;SAF=33;SAR=73;SRF=61;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130397;STB=0.571343;TYPE=snp;VARB=-0.0106339;OID=.;OPOS=97339088;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:250:250:143:144:106:106:73:33:61:82:73:33:61:83 chr6 97613163 . T C 218.05 PASS AO=68;DP=176;FAO=68;FDP=174;FR=.;FRO=106;FSAF=42;FSAR=26;FSRF=56;FSRR=50;FWDB=0.0107533;FXX=0.011363;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.974;QD=5.01261;RBI=0.0123947;REFB=-0.00926472;REVB=0.00616388;RO=104;SAF=42;SAR=26;SRF=54;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1084;STB=0.556081;TYPE=snp;VARB=0.0107821;OID=.;OPOS=97613163;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:174:104:106:68:68:26:42:54:50:26:42:56:50 chr6 97626374 . A G 130.26 PASS AO=38;DP=95;FAO=38;FDP=95;FR=.;FRO=57;FSAF=33;FSAR=5;FSRF=44;FSRR=13;FWDB=-0.00439485;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.809;QD=5.48478;RBI=0.00691606;REFB=0.0138082;REVB=0.00534015;RO=57;SAF=33;SAR=5;SRF=44;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185175;STB=0.606678;TYPE=snp;VARB=-0.0172533;OID=.;OPOS=97626374;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:57:57:38:38:5:33:44:13:5:33:44:13 chr6 97677118 . G A 135.13 PASS AO=37;DP=90;FAO=37;FDP=89;FR=.;FRO=52;FSAF=31;FSAR=6;FSRF=44;FSRR=8;FWDB=0.00754815;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.063;QD=6.07306;RBI=0.0554351;REFB=0.000179974;REVB=-0.0549188;RO=52;SAF=31;SAR=6;SRF=44;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.016023;STB=0.509045;TYPE=snp;VARB=-0.00032534;OID=.;OPOS=97677118;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:89:52:52:37:37:6:31:44:8:6:31:44:8 chr6 97694582 . A ATAG 99.76 PASS AO=35;DP=114;FAO=37;FDP=110;FR=.;FRO=73;FSAF=10;FSAR=27;FSRF=23;FSRR=50;FWDB=-0.0437637;FXX=0.0265463;HRUN=1;LEN=3;MLLD=260.346;QD=3.62765;RBI=0.0441928;REFB=0.00213944;REVB=-0.00614327;RO=75;SAF=10;SAR=25;SRF=25;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.065705;STB=0.536404;TYPE=ins;VARB=-0.00381652;OID=.;OPOS=97694583;OREF=-;OALT=TAG;OMAPALT=ATAG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:35:114:37:110:73:10:27:23:50:99:75:10:25:25:50 chr6 99771540 . T C 1117.32 PASS AO=116;DP=119;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0222158;FXX=0.025208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.101;QD=38.5282;RBI=0.0286047;REFB=0;REVB=-0.0180191;RO=0;SAF=53;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.14374e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00011134;OID=.;OPOS=99771540;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:119:116:0:0:116:116:63:53:0:0:63:53:0:0 chr6 99817419 . T TC 1111.71 PASS AO=107;DP=133;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167618;FXX=0.0245881;HRUN=0;LEN=1;MLLD=243.474;QD=37.3682;RBI=0.017634;REFB=-0.0988573;REVB=-0.00547736;RO=14;SAF=48;SAR=59;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0113371;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.000115213;OID=.;OPOS=99817420;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:107:133:119:119:0:51:68:0:0:45:14:48:59:7:7 chr6 99817601 . A G 1193.12 PASS AO=125;DP=125;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0276164;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.13;QD=38.1799;RBI=0.0276313;REFB=0;REVB=-0.000908377;RO=0;SAF=52;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.6626e-05;OID=.;OPOS=99817601;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:125:125:0:0:125:125:73:52:0:0:73:52:0:0 chr6 99819379 . T C 844.51 PASS AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0188228;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.1965;QD=38.3869;RBI=0.0198524;REFB=0;REVB=0.00631037;RO=0;SAF=52;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.57365e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.31448e-05;OID=.;OPOS=99819379;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:88:88:0:0:88:88:36:52:0:0:36:52:0:0 chr6 99883704 . T C 1405.74 PASS AO=149;DP=151;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00721674;FXX=0.0132442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.464;QD=37.738;RBI=0.0105353;REFB=0.0564156;REVB=0.00767533;RO=1;SAF=48;SAR=101;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0046864;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.02233e-06;OID=.;OPOS=99883704;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:151:149:1:0:149:149:101:48:0:1:101:48:0:0 chr6 99893938 . T C 266.74 PASS AO=78;DP=208;FAO=84;FDP=214;FR=.;FRO=130;FSAF=47;FSAR=37;FSRF=57;FSRR=73;FWDB=0.0101889;FXX=0.00925883;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.864;QD=4.98577;RBI=0.0106033;REFB=-0.0103771;REVB=0.00293557;RO=130;SAF=43;SAR=35;SRF=57;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124201;STB=0.57328;TYPE=snp;VARB=0.0137527;OID=.;OPOS=99893938;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:214:130:130:78:84:35:43:57:73:37:47:57:73 chr6 99894086 . C G 929.22 PASS AO=190;DP=339;FAO=192;FDP=341;FR=.;FRO=149;FSAF=67;FSAR=125;FSRF=77;FSRR=72;FWDB=0.000264285;FXX=0.00292389;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3456;QD=10.8999;RBI=0.0173619;REFB=-0.0209104;REVB=-0.0173599;RO=148;SAF=67;SAR=123;SRF=77;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141199;STB=0.576933;TYPE=snp;VARB=0.020052;OID=.;OPOS=99894086;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:339:341:148:149:190:192:123:67:77:71:125:67:77:72 chr6 99956560 . T C 315.77 PASS AO=77;DP=162;FAO=77;FDP=161;FR=.;FRO=84;FSAF=38;FSAR=39;FSRF=48;FSRR=36;FWDB=0.00619018;FXX=0.00617246;HRUN=4;LEN=1;MLLD=224.269;QD=7.84515;RBI=0.00619031;REFB=-0.0107324;REVB=-3.93979e-05;RO=84;SAF=38;SAR=39;SRF=48;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0735139;STB=0.540608;TYPE=snp;VARB=0.0123208;OID=.;OPOS=99956560;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:161:84:84:77:77:39:38:48:36:39:38:48:36 chr6 99974020 . T G 500.55 PASS AO=125;DP=263;FAO=125;FDP=263;FR=.;FRO=138;FSAF=69;FSAR=56;FSRF=73;FSRR=65;FWDB=-0.00561558;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.7894;QD=7.61286;RBI=0.0201838;REFB=0.0105327;REVB=0.0193869;RO=138;SAF=69;SAR=56;SRF=73;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0220921;STB=0.512175;TYPE=snp;VARB=-0.0112416;OID=.;OPOS=99974020;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:263:263:138:138:125:125:56:69:73:65:56:69:73:65 chr6 99990856 . T C 522.51 PASS AO=121;DP=240;FAO=121;FDP=240;FR=.;FRO=119;FSAF=60;FSAR=61;FSRF=58;FSRR=61;FWDB=0.0418884;FXX=0.00414921;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.57;QD=8.70849;RBI=0.0421449;REFB=-0.0367586;REVB=0.00464315;RO=110;SAF=60;SAR=61;SRF=58;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0273474;STB=0.504201;TYPE=snp;VARB=0.0417416;OID=.;OPOS=99990856;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:240:240:110:119:121:121:61:60:58:52:61:60:58:61 chr6 100964147 . G C 488.56 PASS AO=118;DP=242;FAO=118;FDP=242;FR=.;FRO=124;FSAF=61;FSAR=57;FSRF=66;FSRR=58;FWDB=-0.00163858;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.414;QD=8.07535;RBI=0.0233981;REFB=0.000693777;REVB=0.0233407;RO=122;SAF=61;SAR=57;SRF=66;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0222727;STB=0.507856;TYPE=snp;VARB=-0.000667134;OID=.;OPOS=100964147;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:242:242:122:124:118:118:57:61:66:56:57:61:66:58 chr6 101094554 . A G 413.54 PASS AO=78;DP=175;FAO=101;FDP=198;FR=.;FRO=97;FSAF=48;FSAR=53;FSRF=38;FSRR=59;FWDB=-0.0298875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.645;QD=8.35425;RBI=0.0300839;REFB=-0.0291179;REVB=0.00343201;RO=81;SAF=46;SAR=32;SRF=36;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134903;STB=0.541164;TYPE=snp;VARB=0.0268697;OID=.;OPOS=101094554;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:198:81:97:78:101:32:46:36:45:53:48:38:59 chr6 101166095 . G A 543.97 PASS AO=141;DP=305;FAO=141;FDP=305;FR=.;FRO=164;FSAF=64;FSAR=77;FSRF=72;FSRR=92;FWDB=-0.00998871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.95;QD=7.13397;RBI=0.0131633;REFB=-0.00795706;REVB=-0.00857308;RO=164;SAF=64;SAR=77;SRF=72;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0146375;STB=0.508079;TYPE=snp;VARB=0.00897684;OID=.;OPOS=101166095;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:305:305:164:164:141:141:77:64:72:92:77:64:72:92 chr6 101296389 . G A 734.09 PASS AO=143;DP=285;FAO=164;FDP=307;FR=.;FRO=143;FSAF=64;FSAR=100;FSRF=56;FSRR=87;FWDB=0.010466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.717;QD=9.56465;RBI=0.0285426;REFB=-0.0214133;REVB=0.0265546;RO=142;SAF=61;SAR=82;SRF=55;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0367008;STB=0.500667;TYPE=snp;VARB=0.0201644;OID=.;OPOS=101296389;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:285:307:142:143:143:164:82:61:55:87:100:64:56:87 chr6 101405050 . T G 344.68 PASS AO=72;DP=132;FAO=72;FDP=132;FR=.;FRO=60;FSAF=40;FSAR=32;FSRF=31;FSRR=29;FWDB=0.00950423;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=252.979;QD=10.4447;RBI=0.0144668;REFB=-0.0313749;REVB=-0.0109068;RO=60;SAF=40;SAR=32;SRF=31;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.032563;STB=0.517822;TYPE=snp;VARB=0.0249929;OID=.;OPOS=101405050;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:60:60:72:72:32:40:31:29:32:40:31:29 chr6 105300262 . C CAG,G 243.11 PASS AO=16,14;DP=38;FAO=17,14;FDP=35;FR=.;FRO=4;FSAF=4,3;FSAR=13,11;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0213921,0.0208269;FXX=0.0789266;HRUN=3,1;LEN=2,1;MLLD=184.92,71.0628;QD=27.7843;RBI=0.0220453,0.0208627;REFB=-0.00578459,-0.0432228;REVB=-0.00532632,-0.00122068;RO=4;SAF=4,3;SAR=12,11;SRF=3;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.211686,-0.261891;STB=0.618896,0.646828;TYPE=ins,snp;VARB=-0.00613118,0.0324976;OID=.,.;OPOS=105300263,105300262;OREF=-,C;OALT=AG,G;OMAPALT=CAG,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:62:38:35:4:4:16,14:17,14:12,11:4,3:3:1:13,11:4,3:3:1 chr6 105307258 . CG C,CC 240.2 PASS AO=12,10;DP=53;FAO=39,9;FDP=50;FR=.;FRO=2;FSAF=0,0;FSAR=39,9;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0,0;FXX=0.019604;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=9.97389,10.2242;QD=19.2163;RBI=0.488471,0.253518;REFB=-0.0348533,-0.112522;REVB=0.488471,0.253518;RO=17;SAF=0,0;SAR=12,10;SRF=0;SRR=17;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.088154,-0.091578;OID=.,.;OPOS=105307259,105307259;OREF=G,G;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:12,10:50:39,9:50:2:0,0:39,9:0:2:8:17:0,0:12,10:0:17 chr6 106352349 . T C 221.41 PASS AO=52;DP=123;FAO=58;FDP=130;FR=.;FRO=72;FSAF=43;FSAR=15;FSRF=45;FSRR=27;FWDB=0.0203332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.7665;QD=6.81265;RBI=0.0595708;REFB=-0.0257864;REVB=0.0559933;RO=71;SAF=40;SAR=12;SRF=44;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189743;STB=0.577707;TYPE=snp;VARB=0.03376;OID=.;OPOS=106352349;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:130:71:72:52:58:12:40:44:27:15:43:45:27 chr6 106547372 . C G 474.43 PASS AO=121;DP=262;FAO=122;FDP=262;FR=.;FRO=140;FSAF=36;FSAR=86;FSRF=32;FSRR=108;FWDB=0.0243433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.756;QD=7.24327;RBI=0.0252004;REFB=-0.00262695;REVB=0.00651645;RO=137;SAF=36;SAR=85;SRF=31;SRR=106;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.085482;STB=0.544257;TYPE=snp;VARB=0.00287641;OID=.;OPOS=106547372;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:262:262:137:140:121:122:85:36:31:106:86:36:32:108 chr6 106553096 . G A 75.09 PASS AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=0.00933728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.785;QD=10.3573;RBI=0.0107503;REFB=-0.00358721;REVB=-0.00532765;RO=12;SAF=9;SAR=6;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.330375;STB=0.679775;TYPE=snp;VARB=0.00304568;OID=.;OPOS=106553096;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:29:29:12:14:15:15:6:9:2:10:6:9:3:11 chr6 106967185 . A C 190.46 PASS AO=37;DP=63;FAO=37;FDP=63;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=29;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.0501984;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.2338;QD=12.0927;RBI=0.0578408;REFB=0.0315383;REVB=0.0287347;RO=26;SAF=8;SAR=29;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230443;STB=0.62763;TYPE=snp;VARB=-0.0138308;OID=.;OPOS=106967185;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:63:63:26:26:37:37:29:8:12:14:29:8:12:14 chr6 106967778 . T C 161.21 PASS AO=37;DP=75;FAO=37;FDP=75;FR=.;FRO=38;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=-0.0699167;FXX=0.0259707;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.3602;QD=8.59803;RBI=0.0700127;REFB=-0.0398744;REVB=0.0036659;RO=37;SAF=16;SAR=21;SRF=13;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0751988;STB=0.533316;TYPE=snp;VARB=0.0271741;OID=.;OPOS=106967778;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:37:38:37:37:21:16:13:24:21:16:14:24 chr6 106987370 . A C 2749.78 PASS AO=283;DP=283;FAO=286;FDP=286;FR=.;FRO=0;FSAF=141;FSAR=145;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00146981;FXX=0.0103803;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.262;QD=38.4585;RBI=0.0161726;REFB=0;REVB=0.0161057;RO=0;SAF=138;SAR=145;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.24474e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.55339e-05;OID=.;OPOS=106987370;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:283:286:0:0:283:286:145:138:0:0:145:141:0:0 chr6 106992464 . A G 2410.8 PASS AO=265;DP=274;FAO=266;FDP=274;FR=.;FRO=8;FSAF=130;FSAR=136;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.0126937;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=198.981;QD=35.1942;RBI=0.0148291;REFB=-0.0468927;REVB=0.00766627;RO=6;SAF=129;SAR=136;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0135205;STB=0.510629;TYPE=snp;VARB=0.000191959;OID=.;OPOS=106992464;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:274:274:6:8:265:266:136:129:1:5:136:130:1:7 chr6 106999822 . G A 439.17 PASS AO=122;DP=281;FAO=122;FDP=281;FR=.;FRO=159;FSAF=63;FSAR=59;FSRF=58;FSRR=101;FWDB=0.0263858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.652;QD=6.25152;RBI=0.0264623;REFB=0.00195339;REVB=0.00201112;RO=159;SAF=63;SAR=59;SRF=58;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154042;STB=0.585386;TYPE=snp;VARB=-0.00318286;OID=.;OPOS=106999822;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:281:281:159:159:122:122:59:63:58:101:59:63:58:101 chr6 107113715 . G A 731.39 PASS AO=197;DP=419;FAO=187;FDP=400;FR=.;FRO=213;FSAF=94;FSAR=93;FSRF=89;FSRR=124;FWDB=-0.0550275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.849;QD=7.31391;RBI=0.0583056;REFB=-0.00939494;REVB=0.0192746;RO=217;SAF=99;SAR=98;SRF=87;SRR=130;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0969127;STB=0.545148;TYPE=snp;VARB=0.0114639;OID=.;OPOS=107113715;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:419:400:217:213:197:187:98:99:87:130:93:94:89:124 chr6 107388504 . C T 3078.08 PASS AO=320;DP=320;FAO=321;FDP=321;FR=.;FRO=0;FSAF=140;FSAR=181;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0249204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.585;QD=38.3561;RBI=0.025948;REFB=0;REVB=-0.00722981;RO=0;SAF=139;SAR=181;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.37915e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.3313e-05;OID=.;OPOS=107388504;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:320:321:0:0:320:321:181:139:0:0:181:140:0:0 chr6 107454303 . A C 236.57 PASS AO=50;DP=93;FAO=50;FDP=93;FR=.;FRO=43;FSAF=38;FSAR=12;FSRF=36;FSRR=7;FWDB=-0.00405567;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=207.986;QD=10.1751;RBI=0.0272025;REFB=-0.00286677;REVB=-0.0268985;RO=43;SAF=38;SAR=12;SRF=36;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0941935;STB=0.551533;TYPE=snp;VARB=0.00223829;OID=.;OPOS=107454303;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:43:43:50:50:12:38:36:7:12:38:36:7 chr6 107565060 . T C 252.97 PASS AO=43;DP=65;FAO=43;FDP=65;FR=.;FRO=22;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.0925728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.854;QD=15.5671;RBI=0.0933394;REFB=-0.033555;REVB=0.0119382;RO=22;SAF=20;SAR=23;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0217837;STB=0.511839;TYPE=snp;VARB=0.0140928;OID=.;OPOS=107565060;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:65:65:22:22:43:43:23:20:11:11:23:20:11:11 chr6 107980406 . A T 1444.13 PASS AO=148;DP=152;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0340195;FXX=0.0192295;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.232;QD=37.755;RBI=0.0569121;REFB=-0.0281018;REVB=0.0456252;RO=2;SAF=65;SAR=83;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0144071;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000344684;OID=.;OPOS=107980406;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:152:153:2:0:148:153:83:65:2:0:84:69:0:0 chr6 108026146 . C T 1065.84 PASS AO=115;DP=119;FAO=117;FDP=120;FR=.;FRO=3;FSAF=82;FSAR=35;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0177904;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.99;QD=35.5281;RBI=0.0228434;REFB=-0.0748742;REVB=-0.014329;RO=2;SAF=81;SAR=34;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00793405;STB=0.501018;TYPE=snp;VARB=0.000708958;OID=.;OPOS=108026146;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:119:120:2:3:115:117:34:81:1:1:35:82:2:1 chr6 108026317 . G T 3564.59 PASS AO=361;DP=361;FAO=375;FDP=375;FR=.;FRO=0;FSAF=163;FSAR=212;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0742464;FXX=0.0053049;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.921;QD=38.0223;RBI=0.0893171;REFB=0;REVB=0.049649;RO=0;SAF=156;SAR=205;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.32112e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0008949;OID=.;OPOS=108026317;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:361:375:0:0:361:375:205:156:0:0:212:163:0:0 chr6 108026402 . A C 2594.22 PASS AO=285;DP=299;FAO=286;FDP=294;FR=.;FRO=8;FSAF=61;FSAR=225;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0262743;FXX=0.0167218;HRUN=6;LEN=1;MLLD=195.755;QD=35.2955;RBI=0.033572;REFB=-0.125092;REVB=0.0208984;RO=1;SAF=60;SAR=225;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00788049;STB=0.501486;TYPE=snp;VARB=0.000127093;OID=.;OPOS=108026402;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:299:294:1:8:285:286:225:60:1:0:225:61:2:6 chr6 108026455 . A G 2036.11 PASS AO=200;DP=200;FAO=214;FDP=214;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=172;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0271925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.118;QD=38.0582;RBI=0.0344766;REFB=0;REVB=0.0211945;RO=0;SAF=42;SAR=158;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18929e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.71232e-05;OID=.;OPOS=108026455;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:96:200:214:0:0:200:214:158:42:0:0:172:42:0:0 chr6 108066241 . G A 140.22 PASS AO=37;DP=85;FAO=37;FDP=85;FR=.;FRO=48;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=29;FWDB=0.0288492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.1153;QD=6.59845;RBI=0.0420053;REFB=-0.0335364;REVB=0.0305314;RO=47;SAF=16;SAR=21;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0286895;STB=0.521161;TYPE=snp;VARB=0.0607824;OID=.;OPOS=108066241;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:47:48:37:37:21:16:19:28:21:16:19:29 chr6 108068003 . C T 204.27 PASS AO=38;DP=63;FAO=38;FDP=63;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.00709974;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.637;QD=12.9697;RBI=0.0263285;REFB=-0.0447428;REVB=-0.0253532;RO=25;SAF=13;SAR=25;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0457534;STB=0.525101;TYPE=snp;VARB=0.0580089;OID=.;OPOS=108068003;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:63:63:25:25:38:38:25:13:10:15:25:13:10:15 chr6 108214694 . C T 202.93 PASS AO=42;DP=79;FAO=42;FDP=78;FR=.;FRO=36;FSAF=27;FSAR=15;FSRF=27;FSRR=9;FWDB=-0.0210094;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.9313;QD=10.4067;RBI=0.0293393;REFB=-0.00395366;REVB=-0.0204793;RO=36;SAF=27;SAR=15;SRF=27;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101082;STB=0.55553;TYPE=snp;VARB=0.0012238;OID=.;OPOS=108214694;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:78:36:36:42:42:15:27:27:9:15:27:27:9 chr6 108233929 . G A 1004.37 PASS AO=93;DP=100;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00287413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.136;QD=37.9008;RBI=0.0464305;REFB=0;REVB=-0.0463415;RO=0;SAF=64;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00158432;OID=.;OPOS=108233929;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:100:106:0:0:93:106:29:64:0:0:31:75:0:0 chr6 108277287 . C A 3673.63 PASS AO=377;DP=382;FAO=385;FDP=385;FR=.;FRO=0;FSAF=179;FSAR=206;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00436137;FXX=0.00773176;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.4173;QD=38.1676;RBI=0.0574796;REFB=0;REVB=-0.0573139;RO=0;SAF=176;SAR=201;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.38505e-05;OID=.;OPOS=108277287;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:382:385:0:0:377:385:201:176:0:0:206:179:0:0 chr6 108306914 . G A 225.72 PASS AO=55;DP=128;FAO=59;FDP=132;FR=.;FRO=73;FSAF=21;FSAR=38;FSRF=35;FSRR=38;FWDB=0.00819284;FXX=0.00751823;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.899;QD=6.83997;RBI=0.0206118;REFB=-0.00582743;REVB=-0.0189136;RO=72;SAF=22;SAR=33;SRF=35;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0889196;STB=0.571404;TYPE=snp;VARB=0.00771105;OID=.;OPOS=108306914;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:132:72:73:55:59:33:22:35:37:38:21:35:38 chr6 108798498 . A G 365.55 PASS AO=105;DP=248;FAO=105;FDP=249;FR=.;FRO=144;FSAF=37;FSAR=68;FSRF=67;FSRR=77;FWDB=-0.0652026;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.979;QD=5.87222;RBI=0.065535;REFB=-0.00548875;REVB=0.00659281;RO=143;SAF=37;SAR=68;SRF=66;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118549;STB=0.568613;TYPE=snp;VARB=0.00811491;OID=.;OPOS=108798498;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:248:249:143:144:105:105:68:37:66:77:68:37:67:77 chr6 109286336 . AT A 80.22 PASS AO=63;DP=163;FAO=63;FDP=153;FR=.;FRO=90;FSAF=27;FSAR=36;FSRF=24;FSRR=66;FWDB=-0.0370894;FXX=0.0129024;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.9765;QD=2.09713;RBI=0.112456;REFB=-0.117456;REVB=-0.106164;RO=87;SAF=27;SAR=36;SRF=22;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192801;STB=0.59997;TYPE=del;VARB=0.152891;OID=.;OPOS=109286337;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:63:154:63:153:90:27:36:24:66:80:87:27:36:22:65 chr6 109578916 . T C 183.17 PASS AO=31;DP=50;FAO=32;FDP=51;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=25;FSRF=2;FSRR=17;FWDB=0.000255094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.065;QD=14.3664;RBI=0.00233703;REFB=-0.00119506;REVB=-0.00232306;RO=19;SAF=6;SAR=25;SRF=2;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10542;STB=0.566436;TYPE=snp;VARB=0.00072419;OID=.;OPOS=109578916;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:50:51:19:19:31:32:25:6:2:17:25:7:2:17 chr6 109583186 . A G 2081.17 PASS AO=214;DP=217;FAO=217;FDP=217;FR=.;FRO=0;FSAF=110;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0127612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.809;QD=38.3626;RBI=0.0494117;REFB=0;REVB=-0.0477354;RO=0;SAF=107;SAR=107;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.21921e-05;OID=.;OPOS=109583186;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:217:217:0:0:214:217:107:107:0:0:107:110:0:0 chr6 109586062 . C T 1434.93 PASS AO=157;DP=161;FAO=157;FDP=161;FR=.;FRO=4;FSAF=147;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0181683;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.57;QD=35.6504;RBI=0.0376809;REFB=0.044465;REVB=0.0330116;RO=3;SAF=147;SAR=10;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0829537;STB=0.542096;TYPE=snp;VARB=-0.000599135;OID=.;OPOS=109586062;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:161:161:3:4:157:157:10:147:1:2:10:147:2:2 chr6 109591433 . T C 531.51 PASS AO=46;DP=46;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.069743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.967;QD=37.9648;RBI=0.0697966;REFB=0;REVB=0.00273348;RO=0;SAF=5;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000155873;OID=.;OPOS=109591433;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:46:56:0:0:46:56:41:5:0:0:51:5:0:0 chr6 109615603 . G T 2658.01 PASS AO=270;DP=271;FAO=278;FDP=278;FR=.;FRO=0;FSAF=165;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130731;FXX=0.0035841;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.812;QD=38.2448;RBI=0.0171275;REFB=0;REVB=0.0110656;RO=0;SAF=161;SAR=109;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.18173e-05;OID=.;OPOS=109615603;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:271:278:0:0:270:278:109:161:0:0:113:165:0:0 chr6 109616762 . A G 2874.86 PASS AO=307;DP=312;FAO=310;FDP=310;FR=.;FRO=0;FSAF=165;FSAR=145;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00716769;FXX=0.00641005;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.474;QD=37.095;RBI=0.0454877;REFB=-0.0672232;REVB=0.0449194;RO=4;SAF=165;SAR=142;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00708661;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000355086;OID=.;OPOS=109616762;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:312:310:4:0:307:310:142:165:1:3:145:165:0:0 chr6 109621494 . T C 907.3 PASS AO=72;DP=116;FAO=99;FDP=99;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=23;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.224301;FXX=0.0660315;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5148;QD=36.6586;RBI=0.233861;REFB=0;REVB=-0.0661834;RO=0;SAF=0;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.128176;OID=.;OPOS=109621494;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:105:99:0:0:72:99:72:0:0:0:76:23:0:0 chr6 109627262 . ATTTTTG ATTTTG,ATTTTGC 52.61 PASS AO=9,6;DP=39;FAO=8,6;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=3,0;FSAR=5,6;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0988863,0.0864404;FXX=0.176419;HRUN=5,5;LEN=1,2;MLLD=13.2808,21.5353;QD=7.5162;RBI=0.102275,0.0991586;REFB=0.023576,0.0550221;REVB=-0.0261079,-0.0485847;RO=12;SAF=4,0;SAR=5,6;SRF=5;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0271144,-0.725845;STB=0.535624,0.997668;TYPE=del,mnp;VARB=0.0632732,-0.135295;OID=.,.;OPOS=109627263,109627267;OREF=T,TG;OALT=-,GC;OMAPALT=ATTTTG,ATTTTGC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:9,6:33:8,6:28:14:3,0:5,6:6:8:24:12:4,0:5,6:5:7 chr6 109674055 . C T 723.9 PASS AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0320217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.652;QD=38.1002;RBI=0.0323528;REFB=0;REVB=-0.00461725;RO=0;SAF=25;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.70396e-05;OID=.;OPOS=109674055;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:76:76:0:0:76:76:51:25:0:0:51:25:0:0 chr6 109689431 . A G 1541.73 PASS AO=157;DP=157;FAO=160;FDP=160;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.748;QD=38.5432;RBI=0.0179608;REFB=0;REVB=-0.0101602;RO=0;SAF=89;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.42865e-05;OID=.;OPOS=109689431;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:157:160:0:0:157:160:68:89:0:0:68:92:0:0 chr6 109761437 . A G 520.04 PASS AO=31;DP=60;FAO=58;FDP=59;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=0;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0.0483793;HRUN=4;LEN=1;MLLD=27.1977;QD=35.2569;RBI=0.139825;REFB=0;REVB=0.139825;RO=0;SAF=0;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00653158;OID=.;OPOS=109761437;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:55:59:0:0:31:58:31:0:0:0:58:0:0:0 chr6 109764535 . G T 894.3 PASS AO=109;DP=121;FAO=109;FDP=120;FR=.;FRO=11;FSAF=29;FSAR=80;FSRF=1;FSRR=10;FWDB=0.00180552;FXX=0.0163921;HRUN=4;LEN=1;MLLD=196.385;QD=29.8101;RBI=0.00708403;REFB=-0.0492054;REVB=-0.00685008;RO=10;SAF=29;SAR=80;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0557373;STB=0.520954;TYPE=snp;VARB=0.00147828;OID=.;OPOS=109764535;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:121:120:10:11:109:109:80:29:0:10:80:29:1:10 chr6 109767631 . T TGTGGTCTGGTCAGTGACCTGCCCAGG 51.53 PASS AO=6;DP=16;FAO=9;FDP=14;FR=.;FRO=5;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0050016;FXX=0.0666222;HRUN=1;LEN=26;MLLD=478.38;QD=14.7226;RBI=0.0164677;REFB=-0.0197737;REVB=0.0156898;RO=6;SAF=6;SAR=0;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.740222;STB=0.511602;TYPE=ins;VARB=0.00715468;OID=.;OPOS=109767632;OREF=-;OALT=GTGGTCTGGTCAGTGACCTGCCCAGG;OMAPALT=TGTGGTCTGGTCAGTGACCTGCCCAGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:6:16:9:14:5:7:2:4:1:23:6:6:0:4:2 chr6 109767930 . G T 2117.73 PASS AO=209;DP=210;FAO=226;FDP=226;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=131;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00601924;FXX=0.00877155;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.447;QD=37.4819;RBI=0.0443984;REFB=0;REVB=0.0439884;RO=0;SAF=90;SAR=119;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000599132;OID=.;OPOS=109767930;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:210:226:0:0:209:226:119:90:0:0:131:95:0:0 chr6 109767931 . C T 1717.6 PASS AO=224;DP=224;FAO=207;FDP=224;FR=.;FRO=17;FSAF=88;FSAR=119;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.000776294;FXX=0.00884917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.505;QD=30.6714;RBI=0.0235917;REFB=0.211976;REVB=0.0235789;RO=0;SAF=96;SAR=128;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.44884e-08;STB=0.501037;TYPE=snp;VARB=0.000866421;OID=.;OPOS=109767931;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:224:224:0:17:224:207:128:96:0:0:119:88:7:10 chr6 109768295 . G A 654.98 PASS AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00614943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.8634;QD=36.3879;RBI=0.0292543;REFB=-0.0185275;REVB=0.0286006;RO=1;SAF=40;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0150093;STB=0.507934;TYPE=snp;VARB=0.000112936;OID=.;OPOS=109768295;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:72:72:1:1:71:71:31:40:0:1:31:40:0:1 chr6 109775436 . T C 316.55 PASS AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0349589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.063;QD=37.241;RBI=0.0444388;REFB=0;REVB=0.027435;RO=0;SAF=11;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.71863e-05;OID=.;OPOS=109775436;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:34:0:0:34:34:23:11:0:0:23:11:0:0 chr6 109827716 . C T 2363.99 PASS AO=245;DP=250;FAO=247;FDP=247;FR=.;FRO=0;FSAF=106;FSAR=141;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201608;FXX=0.027558;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.7746;QD=38.2832;RBI=0.0251668;REFB=0;REVB=0.0150635;RO=0;SAF=105;SAR=140;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.77088e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000703911;OID=.;OPOS=109827716;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:250:247:0:0:245:247:140:105:0:0:141:106:0:0 chr6 109885475 . G A 2166.87 PASS AO=227;DP=228;FAO=228;FDP=228;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=137;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0182697;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.388;QD=38.0153;RBI=0.0211787;REFB=-0.0254758;REVB=0.0107123;RO=0;SAF=90;SAR=137;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.8751e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000106849;OID=.;OPOS=109885475;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:96:228:228:0:0:227:228:137:90:0:0:137:91:0:0 chr6 109906329 . GCTTCTTCTTCTTC GCTTCTTCTTCT,GCTTCTTCTTC 1997.75 PASS AO=45,87;DP=319;FAO=73,190;FDP=263;FR=.;FRO=0;FSAF=40,135;FSAR=33,55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220664,0.0222859;FXX=0.0673735;HRUN=2,2;LEN=2,3;MLLD=200.073,201.256;QD=30.384;RBI=0.0350313,0.026696;REFB=0,0;REVB=-0.0272078,0.0146974;RO=0;SAF=32,82;SAR=13,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.18015e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=-0.00182926,-0.00387432;OID=.,.;OPOS=109906341,109906330;OREF=TC,CTT;OALT=-,-;OMAPALT=GCTTCTTCTTCT,GCTTCTTCTTC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:45,87:227:73,190:263:0:40,135:33,55:0:0:9:0:32,82:13,5:0:0 chr6 109954252 . C T 1768.22 PASS AO=180;DP=199;FAO=187;FDP=187;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172918;FXX=0.0966137;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.732;QD=37.8229;RBI=0.0285537;REFB=0;REVB=0.0227224;RO=0;SAF=93;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000792805;OID=.;OPOS=109954252;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:199:187:0:0:180:187:87:93:0:0:90:97:0:0 chr6 110053824 . G GT,T 78.22 PASS AO=15,10;DP=40;FAO=21,10;FDP=37;FR=.;FRO=6;FSAF=18,8;FSAR=3,2;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.010723,-0.00934875;FXX=0.0512689;HRUN=13,1;LEN=1,1;MLLD=4.62456,242.827;QD=8.45597;RBI=0.0938255,0.0290108;REFB=-0.183823,0.0148154;REVB=-0.0932107,-0.0274632;RO=11;SAF=12,8;SAR=3,2;SRF=7;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.167708,0.19417;STB=0.576842,0.571275;TYPE=ins,snp;VARB=0.0687372,-0.0273864;OID=.,.;OPOS=110053825,110053824;OREF=-,G;OALT=T,T;OMAPALT=GT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:34:40:37:11:6:15,10:21,10:3,2:12,8:7:4:3,2:18,8:4:2 chr6 110106234 . A G 2425.79 PASS AO=251;DP=251;FAO=254;FDP=254;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=151;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000760198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.764;QD=38.2014;RBI=0.0216791;REFB=0;REVB=0.0216658;RO=0;SAF=103;SAR=148;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.56617e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00012342;OID=.;OPOS=110106234;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:251:254:0:0:251:254:148:103:0:0:151:103:0:0 chr6 110146303 . G A 729.13 PASS AO=76;DP=76;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126581;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.747;QD=37.8769;RBI=0.0243097;REFB=0;REVB=0.0207542;RO=0;SAF=19;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00015795;OID=.;OPOS=110146303;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:76:77:0:0:76:77:57:19:0:0:57:20:0:0 chr6 110301661 . A G 915.83 PASS AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00201037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.15;QD=38.1597;RBI=0.0137224;REFB=0;REVB=0.0135744;RO=0;SAF=56;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.7857e-05;OID=.;OPOS=110301661;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:96:96:0:0:96:96:40:56:0:0:40:56:0:0 chr6 110421361 . C T 1076.1 PASS AO=113;DP=114;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00499273;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.5269;QD=38.0922;RBI=0.0480234;REFB=0;REVB=-0.0477631;RO=0;SAF=61;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.30758e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000212248;OID=.;OPOS=110421361;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:114:113:0:0:113:113:52:61:0:0:52:61:0:0 chr6 110746526 . T C 2163.44 PASS AO=226;DP=228;FAO=227;FDP=227;FR=.;FRO=0;FSAF=121;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0266448;FXX=0.00438577;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.0381;QD=38.1223;RBI=0.0573641;REFB=-0.0270956;REVB=0.0508005;RO=2;SAF=120;SAR=106;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00787501;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000316447;OID=.;OPOS=110746526;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:94:228:227:2:0:226:227:106:120:2:0:106:121:0:0 chr6 110777962 . A G 466.03 PASS AO=106;DP=210;FAO=107;FDP=211;FR=.;FRO=104;FSAF=42;FSAR=65;FSRF=31;FSRR=73;FWDB=0.0360425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5201;QD=8.83461;RBI=0.0380852;REFB=-0.0206712;REVB=0.0123054;RO=100;SAF=42;SAR=64;SRF=30;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0911542;STB=0.549844;TYPE=snp;VARB=0.0189843;OID=.;OPOS=110777962;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:210:211:100:104:106:107:64:42:30:70:65:42:31:73 chr6 110778128 . T C 254.63 PASS AO=72;DP=182;FAO=75;FDP=183;FR=.;FRO=108;FSAF=26;FSAR=49;FSRF=41;FSRR=67;FWDB=-0.0119237;FXX=0.0108102;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.836;QD=5.56577;RBI=0.0126185;REFB=-0.0176221;REVB=0.00412943;RO=107;SAF=26;SAR=46;SRF=40;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.014583;STB=0.521188;TYPE=snp;VARB=0.0229981;OID=.;OPOS=110778128;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:183:107:108:72:75:46:26:40:67:49:26:41:67 chr6 110935430 . C T 301.41 PASS AO=61;DP=109;FAO=61;FDP=109;FR=.;FRO=48;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=0.0255569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.8077;QD=11.0608;RBI=0.0259892;REFB=-0.020541;REVB=-0.00472042;RO=48;SAF=27;SAR=34;SRF=27;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0965532;STB=0.552828;TYPE=snp;VARB=0.0341071;OID=.;OPOS=110935430;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:48:48:61:61:34:27:27:21:34:27:27:21 chr6 111527803 . T C 176.24 PASS AO=55;DP=148;FAO=56;FDP=147;FR=.;FRO=91;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=45;FSRR=46;FWDB=0.0441846;FXX=0.0067563;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.592;QD=4.79554;RBI=0.0452345;REFB=-0.0100783;REVB=0.00968935;RO=91;SAF=28;SAR=27;SRF=45;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0160121;STB=0.514454;TYPE=snp;VARB=0.0111938;OID=.;OPOS=111527803;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:147:91:91:55:56:27:28:45:46:27:29:45:46 chr6 111585121 . C T 430.71 PASS AO=100;DP=211;FAO=105;FDP=217;FR=.;FRO=112;FSAF=47;FSAR=58;FSRF=51;FSRR=61;FWDB=0.0346966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.412;QD=7.93939;RBI=0.0365828;REFB=-0.0340951;REVB=0.0115953;RO=111;SAF=44;SAR=56;SRF=50;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0100894;STB=0.504034;TYPE=snp;VARB=0.0363426;OID=.;OPOS=111585121;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:217:111:112:100:105:56:44:50:61:58:47:51:61 chr6 111587266 . T C 541.31 PASS AO=125;DP=246;FAO=125;FDP=246;FR=.;FRO=121;FSAF=64;FSAR=61;FSRF=64;FSRR=57;FWDB=0.000902007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.945;QD=8.80185;RBI=0.0107272;REFB=-0.00577581;REVB=-0.0106892;RO=121;SAF=64;SAR=61;SRF=64;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0152075;STB=0.508332;TYPE=snp;VARB=0.00516216;OID=.;OPOS=111587266;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:246:246:121:121:125:125:61:64:64:57:61:64:64:57 chr6 111589293 . A C 124.97 PASS AO=42;DP=113;FAO=42;FDP=117;FR=.;FRO=75;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=31;FSRR=44;FWDB=-0.0631674;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=41.6545;QD=4.27241;RBI=0.0662727;REFB=-0.0186672;REVB=-0.0200488;RO=71;SAF=23;SAR=19;SRF=29;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152292;STB=0.585414;TYPE=snp;VARB=0.0224107;OID=.;OPOS=111589293;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:117:71:75:42:42:19:23:29:42:19:23:31:44 chr6 111620758 . G A 171.87 PASS AO=50;DP=123;FAO=50;FDP=123;FR=.;FRO=73;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=36;FSRR=37;FWDB=0.0464215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.098;QD=5.58934;RBI=0.0470218;REFB=-0.0112146;REVB=-0.00748924;RO=72;SAF=27;SAR=23;SRF=35;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0564965;STB=0.527848;TYPE=snp;VARB=0.0177906;OID=.;OPOS=111620758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:72:73:50:50:23:27:35:37:23:27:36:37 chr6 111695073 . C T 191.58 PASS AO=48;DP=106;FAO=48;FDP=105;FR=.;FRO=57;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=28;FSRR=29;FWDB=0.0135411;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.195;QD=7.29824;RBI=0.017464;REFB=-0.00883173;REVB=0.0110285;RO=57;SAF=20;SAR=28;SRF=28;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0735118;STB=0.541046;TYPE=snp;VARB=0.0111316;OID=.;OPOS=111695073;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:105:57:57:48:48:28:20:28:29:28:20:28:29 chr6 111695268 . C T 507.61 PASS AO=111;DP=210;FAO=111;FDP=210;FR=.;FRO=99;FSAF=86;FSAR=25;FSRF=70;FSRR=29;FWDB=0.00509933;FXX=0.00473911;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.043;QD=9.66882;RBI=0.0256786;REFB=-0.0361646;REVB=-0.0251672;RO=99;SAF=86;SAR=25;SRF=70;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0793553;STB=0.543531;TYPE=snp;VARB=0.0319908;OID=.;OPOS=111695268;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:210:210:99:99:111:111:25:86:70:29:25:86:70:29 chr6 111695887 . G A 87.71 PASS AO=26;DP=67;FAO=26;FDP=68;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=-0.123729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.137;QD=5.15939;RBI=0.123759;REFB=-0.00977303;REVB=0.00271806;RO=41;SAF=11;SAR=15;SRF=16;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0361152;STB=0.511619;TYPE=snp;VARB=0.0197497;OID=.;OPOS=111695887;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:67:68:41:42:26:26:15:11:16:25:15:11:17:25 chr6 111696257 . G A 451.74 PASS AO=115;DP=245;FAO=116;FDP=248;FR=.;FRO=132;FSAF=61;FSAR=55;FSRF=53;FSRR=79;FWDB=-0.0344572;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.1531;QD=7.28611;RBI=0.044888;REFB=-0.0016426;REVB=0.0287686;RO=129;SAF=61;SAR=54;SRF=51;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128929;STB=0.565898;TYPE=snp;VARB=-0.000591956;OID=.;OPOS=111696257;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:245:248:129:132:115:116:54:61:51:78:55:61:53:79 chr6 111696852 . T C 353.03 PASS AO=79;DP=153;FAO=80;FDP=153;FR=.;FRO=73;FSAF=21;FSAR=59;FSRF=31;FSRR=42;FWDB=0.00763442;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.3977;QD=9.22953;RBI=0.0649722;REFB=-0.00847222;REVB=-0.0645221;RO=72;SAF=20;SAR=59;SRF=30;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169593;STB=0.591227;TYPE=snp;VARB=0.00672887;OID=.;OPOS=111696852;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:153:72:73:79:80:59:20:30:42:59:21:31:42 chr6 111901453 . G T 1064.8 PASS AO=111;DP=111;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0251234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.399;QD=38.0286;RBI=0.0417973;REFB=0;REVB=-0.0334041;RO=0;SAF=52;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41849e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.82488e-05;OID=.;OPOS=111901453;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:111:112:0:0:111:112:59:52:0:0:60:52:0:0 chr6 111913262 . C T 570.78 PASS AO=144;DP=298;FAO=142;FDP=298;FR=.;FRO=156;FSAF=52;FSAR=90;FSRF=71;FSRR=85;FWDB=-0.0491713;FXX=0.00666644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.264;QD=7.66151;RBI=0.0583401;REFB=-0.000691582;REVB=-0.0313968;RO=149;SAF=52;SAR=92;SRF=66;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0800035;STB=0.548828;TYPE=snp;VARB=0.000358259;OID=.;OPOS=111913262;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:298:298:149:156:144:142:92:52:66:83:90:52:71:85 chr6 112386008 . C G 371.18 PASS AO=89;DP=189;FAO=90;FDP=187;FR=.;FRO=97;FSAF=60;FSAR=30;FSRF=46;FSRR=51;FWDB=0.0129873;FXX=0.0105815;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.094;QD=7.93962;RBI=0.0134799;REFB=-0.00357176;REVB=-0.00361089;RO=97;SAF=59;SAR=30;SRF=46;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185598;STB=0.604454;TYPE=snp;VARB=0.00324032;OID=.;OPOS=112386008;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:187:97:97:89:90:30:59:46:51:30:60:46:51 chr6 112435912 . A T 404.53 PASS AO=106;DP=237;FAO=108;FDP=241;FR=.;FRO=133;FSAF=39;FSAR=69;FSRF=53;FSRR=80;FWDB=-0.019844;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.4434;QD=6.71418;RBI=0.0608445;REFB=-0.0109066;REVB=0.0575176;RO=130;SAF=37;SAR=69;SRF=50;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0383275;STB=0.522078;TYPE=snp;VARB=0.0136716;OID=.;OPOS=112435912;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:237:241:130:133:106:108:69:37:50:80:69:39:53:80 chr6 112457390 . C T 2095.84 PASS AO=218;DP=218;FAO=218;FDP=218;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=145;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167127;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.958;QD=38.4557;RBI=0.0270571;REFB=0;REVB=-0.0212785;RO=0;SAF=73;SAR=145;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.00261e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.21558e-06;OID=.;OPOS=112457390;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:218:218:0:0:218:218:145:73:0:0:145:73:0:0 chr6 112493872 . A G 1951.55 PASS AO=205;DP=205;FAO=204;FDP=204;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0110245;FXX=0.00487781;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.677;QD=38.2656;RBI=0.0130367;REFB=0;REVB=-0.00695822;RO=0;SAF=106;SAR=99;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.2004e-05;OID=.;OPOS=112493872;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:92:205:204:0:0:205:204:99:106:0:0:99:105:0:0 chr6 112522852 . G A 322.99 PASS AO=79;DP=166;FAO=79;FDP=166;FR=.;FRO=87;FSAF=33;FSAR=46;FSRF=45;FSRR=42;FWDB=-0.00265235;FXX=0.00598767;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.529;QD=7.78277;RBI=0.0260871;REFB=-0.0186622;REVB=-0.0259519;RO=86;SAF=33;SAR=46;SRF=45;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100376;STB=0.552667;TYPE=snp;VARB=0.0212262;OID=.;OPOS=112522852;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:166:86:87:79:79:46:33:45:41:46:33:45:42 chr6 112671921 . T C 317.23 PASS AO=79;DP=173;FAO=81;FDP=173;FR=.;FRO=92;FSAF=32;FSAR=49;FSRF=37;FSRR=55;FWDB=0.0110357;FXX=0.0057468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.0767;QD=7.33469;RBI=0.0149036;REFB=0.00497505;REVB=-0.0100165;RO=91;SAF=32;SAR=47;SRF=37;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00153299;STB=0.503949;TYPE=snp;VARB=-0.00597262;OID=.;OPOS=112671921;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:173:91:92:79:81:47:32:37:54:49:32:37:55 chr6 112672198 . CAG C 264.64 PASS AO=59;DP=155;FAO=65;FDP=138;FR=.;FRO=73;FSAF=29;FSAR=36;FSRF=34;FSRR=39;FWDB=-0.0134971;FXX=0.0738206;HRUN=1;LEN=2;MLLD=134.223;QD=7.67074;RBI=0.0135522;REFB=-0.0301308;REVB=-0.00122101;RO=67;SAF=26;SAR=33;SRF=32;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0356832;STB=0.510463;TYPE=del;VARB=0.0262061;OID=.;OPOS=112672199;OREF=AG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:59:136:65:138:73:29:36:34:39:99:67:26:33:32:35 chr6 114378970 . C T 158.15 PASS AO=52;DP=141;FAO=52;FDP=141;FR=.;FRO=89;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=42;FSRR=47;FWDB=-0.0336892;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.636;QD=4.48656;RBI=0.03573;REFB=-0.0272268;REVB=-0.0119026;RO=89;SAF=23;SAR=29;SRF=42;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0330977;STB=0.518848;TYPE=snp;VARB=0.0120607;OID=.;OPOS=114378970;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:89:89:52:52:29:23:42:47:29:23:42:47 chr6 116262976 . G A 258.37 PASS AO=62;DP=132;FAO=62;FDP=130;FR=.;FRO=68;FSAF=25;FSAR=37;FSRF=25;FSRR=43;FWDB=-0.00531135;FXX=0.0370343;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.201;QD=7.94973;RBI=0.00706936;REFB=-0.00181319;REVB=0.00466534;RO=62;SAF=25;SAR=37;SRF=22;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0460334;STB=0.519474;TYPE=snp;VARB=0.00185894;OID=.;OPOS=116262976;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:130:62:68:62:62:37:25:22:40:37:25:25:43 chr6 116263181 . T C 223.77 PASS AO=49;DP=96;FAO=50;FDP=97;FR=.;FRO=47;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=28;FSRR=19;FWDB=-0.0388117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.107;QD=9.22763;RBI=0.0552979;REFB=-0.0200399;REVB=0.0393892;RO=47;SAF=23;SAR=26;SRF=28;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111562;STB=0.565477;TYPE=snp;VARB=0.0208117;OID=.;OPOS=116263181;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:97:47:47:49:50:26:23:28:19:27:23:28:19 chr6 116323910 . T A 562.65 PASS AO=106;DP=167;FAO=106;FDP=174;FR=.;FRO=68;FSAF=37;FSAR=69;FSRF=14;FSRR=54;FWDB=-0.0870083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.0953;QD=12.9346;RBI=0.0886119;REFB=-0.0210179;REVB=-0.016782;RO=61;SAF=37;SAR=69;SRF=12;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118258;STB=0.563929;TYPE=snp;VARB=0.0158012;OID=.;OPOS=116323910;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:174:61:68:106:106:69:37:12:49:69:37:14:54 chr6 116325142 . C T 304.75 PASS AO=70;DP=140;FAO=70;FDP=140;FR=.;FRO=70;FSAF=31;FSAR=39;FSRF=27;FSRR=43;FWDB=-0.03289;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.844;QD=8.70716;RBI=0.0335583;REFB=-0.0122788;REVB=0.00666363;RO=70;SAF=31;SAR=39;SRF=27;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0529121;STB=0.529134;TYPE=snp;VARB=0.0123475;OID=.;OPOS=116325142;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:70:70:70:70:39:31:27:43:39:31:27:43 chr6 116441470 . C G 367.28 PASS AO=92;DP=208;FAO=95;FDP=208;FR=.;FRO=113;FSAF=68;FSAR=27;FSRF=59;FSRR=54;FWDB=0.0102481;FXX=0.00952336;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.193;QD=7.06313;RBI=0.0126814;REFB=-0.00968837;REVB=-0.00746955;RO=114;SAF=65;SAR=27;SRF=60;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196038;STB=0.616288;TYPE=snp;VARB=0.0125082;OID=.;OPOS=116441470;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:208:114:113:92:95:27:65:60:54:27:68:59:54 chr6 116571255 . G A 1150.34 PASS AO=121;DP=123;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00663023;FXX=0.0314936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.4764;QD=37.4093;RBI=0.0222402;REFB=-0.0456484;REVB=-0.021229;RO=1;SAF=54;SAR=67;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0087158;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00032276;OID=.;OPOS=116571255;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:123:123:1:0:121:123:67:54:1:0:68:55:0:0 chr6 116574455 . G A 488.26 PASS AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.7978;QD=37.5586;RBI=0.0154684;REFB=0;REVB=0.00436298;RO=0;SAF=28;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000172485;OID=.;OPOS=116574455;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:52:52:0:0:52:52:24:28:0:0:24:28:0:0 chr6 116575083 . C A 327.86 PASS AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0253518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.265;QD=35.4438;RBI=0.0267051;REFB=-0.0963591;REVB=0.00839338;RO=1;SAF=16;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0283532;STB=0.515143;TYPE=snp;VARB=-8.66698e-05;OID=.;OPOS=116575083;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:37:37:1:1:36:36:20:16:1:0:20:16:1:0 chr6 116599665 . T C 167.85 PASS AO=40;DP=84;FAO=40;FDP=84;FR=.;FRO=44;FSAF=33;FSAR=7;FSRF=30;FSRR=14;FWDB=-0.0758324;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.2947;QD=7.99263;RBI=0.133213;REFB=-0.0188261;REVB=-0.109522;RO=43;SAF=33;SAR=7;SRF=29;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203819;STB=0.611049;TYPE=snp;VARB=0.0164939;OID=.;OPOS=116599665;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:43:44:40:40:7:33:29:14:7:33:30:14 chr6 116600465 . T TCAC 86.88 PASS AO=13;DP=21;FAO=13;FDP=19;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.0190332;FXX=0.0951928;HRUN=1;LEN=3;MLLD=237.775;QD=18.29;RBI=0.0312625;REFB=-0.0314408;REVB=0.0248008;RO=7;SAF=4;SAR=9;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.415839;STB=0.713963;TYPE=ins;VARB=0.00478851;OID=.;OPOS=116600466;OREF=-;OALT=CAC;OMAPALT=TCAC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:13:21:13:19:6:4:9:6:0:22:7:4:9:7:0 chr6 116720487 . C T 402.32 PASS AO=99;DP=208;FAO=101;FDP=215;FR=.;FRO=114;FSAF=38;FSAR=63;FSRF=43;FSRR=71;FWDB=0.00933879;FXX=0.0227262;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.413;QD=7.48505;RBI=0.0212836;REFB=-0.0207997;REVB=-0.0191253;RO=106;SAF=36;SAR=63;SRF=42;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0326781;STB=0.500539;TYPE=snp;VARB=0.0179005;OID=.;OPOS=116720487;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:215:106:114:99:101:63:36:42:64:63:38:43:71 chr6 116757557 . T C 409.87 PASS AO=44;DP=48;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.097467;FXX=0.081616;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.109;QD=36.4329;RBI=0.10443;REFB=-0.0643325;REVB=0.0374937;RO=1;SAF=14;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0323695;STB=0.517233;TYPE=snp;VARB=0.00108906;OID=.;OPOS=116757557;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:48:45:1:1:44:44:30:14:1:0:30:14:1:0 chr6 116875427 . G A 2682.89 PASS AO=282;DP=286;FAO=284;FDP=284;FR=.;FRO=0;FSAF=108;FSAR=176;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0424461;FXX=0.00699276;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.611;QD=37.7871;RBI=0.0470318;REFB=-0.0505909;REVB=0.0202564;RO=1;SAF=107;SAR=175;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00271727;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000163476;OID=.;OPOS=116875427;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:286:284:1:0:282:284:175:107:0:1:176:108:0:0 chr6 117113653 . T C 164.23 PASS AO=46;DP=107;FAO=45;FDP=106;FR=.;FRO=61;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=29;FSRR=32;FWDB=-0.0102028;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.416;QD=6.19728;RBI=0.0323728;REFB=-0.00072853;REVB=0.0307229;RO=60;SAF=16;SAR=30;SRF=29;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142877;STB=0.572085;TYPE=snp;VARB=0.000996319;OID=.;OPOS=117113653;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:106:60:61:46:45:30:16:29:31:29:16:29:32 chr6 117114025 . G A 357.36 PASS AO=60;DP=107;FAO=69;FDP=113;FR=.;FRO=44;FSAF=37;FSAR=32;FSRF=13;FSRR=31;FWDB=0.00764664;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.1942;QD=12.6499;RBI=0.0314217;REFB=-0.019834;REVB=-0.0304771;RO=47;SAF=30;SAR=30;SRF=16;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128289;STB=0.592952;TYPE=snp;VARB=0.0153704;OID=.;OPOS=117114025;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:113:47:44:60:69:30:30:16:31:32:37:13:31 chr6 117114223 . T A 351.76 PASS AO=88;DP=187;FAO=88;FDP=187;FR=.;FRO=99;FSAF=38;FSAR=50;FSRF=53;FSRR=46;FWDB=-0.00106855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.927;QD=7.5242;RBI=0.0082558;REFB=-0.00927498;REVB=-0.00818636;RO=99;SAF=38;SAR=50;SRF=53;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0994635;STB=0.555001;TYPE=snp;VARB=0.00622126;OID=.;OPOS=117114223;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:187:99:99:88:88:50:38:53:46:50:38:53:46 chr6 117114403 . G A 387.96 PASS AO=93;DP=186;FAO=92;FDP=187;FR=.;FRO=95;FSAF=36;FSAR=56;FSRF=34;FSRR=61;FWDB=0.0194586;FXX=0.00531887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.2036;QD=8.29863;RBI=0.0195033;REFB=0.00159723;REVB=-0.00131967;RO=91;SAF=37;SAR=56;SRF=32;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0438786;STB=0.51795;TYPE=snp;VARB=-0.00155355;OID=.;OPOS=117114403;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:187:91:95:93:92:56:37:32:59:56:36:34:61 chr6 117121894 . G A 2242.28 PASS AO=234;DP=235;FAO=234;FDP=234;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=136;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00814513;FXX=0.00425514;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.817;QD=38.3295;RBI=0.0181668;REFB=0;REVB=0.0162386;RO=0;SAF=98;SAR=136;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.36219e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.46811e-06;OID=.;OPOS=117121894;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:235:234:0:0:234:234:136:98:0:0:136:98:0:0 chr6 117130704 . G A 126.65 PASS AO=56;DP=188;FAO=56;FDP=185;FR=.;FRO=129;FSAF=39;FSAR=17;FSRF=49;FSRR=80;FWDB=-0.0480621;FXX=0.0159566;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.6512;QD=2.73847;RBI=0.0512691;REFB=-0.00507829;REVB=0.017848;RO=129;SAF=39;SAR=17;SRF=49;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.373051;STB=0.716537;TYPE=snp;VARB=0.0167108;OID=.;OPOS=117130704;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:185:129:129:56:56:17:39:49:80:17:39:49:80 chr6 117842669 . T A 608.15 PASS AO=124;DP=222;FAO=128;FDP=227;FR=.;FRO=99;FSAF=69;FSAR=59;FSRF=42;FSRR=57;FWDB=0.0365507;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.3557;QD=10.7163;RBI=0.059763;REFB=-0.0236473;REVB=0.0472828;RO=97;SAF=70;SAR=54;SRF=41;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114538;STB=0.549982;TYPE=snp;VARB=0.021447;OID=.;OPOS=117842669;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:227:97:99:124:128:54:70:41:56:59:69:42:57 chr6 117869424 . G A 15.89 PASS AO=5;DP=20;FAO=5;FDP=20;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=3;FWDB=-0.0545116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.91;QD=3.17854;RBI=0.0552995;REFB=0.00926548;REVB=-0.00930181;RO=13;SAF=2;SAR=3;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.396358;STB=0.776913;TYPE=snp;VARB=-0.051666;OID=.;OPOS=117869424;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:20:20:13:15:5:5:3:2:10:3:3:2:12:3 chr6 117869491 . G A 51.04 PASS AO=14;DP=38;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=19;FSRR=4;FWDB=-0.0122821;FXX=0.0263089;HRUN=3;LEN=1;MLLD=200.76;QD=5.51738;RBI=0.0178753;REFB=-0.0141658;REVB=-0.0129876;RO=23;SAF=12;SAR=2;SRF=19;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0629604;STB=0.537257;TYPE=snp;VARB=0.0233425;OID=.;OPOS=117869491;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:38:37:23:23:14:14:2:12:19:4:2:12:19:4 chr6 118786486 . T C 269.01 PASS AO=87;DP=228;FAO=87;FDP=225;FR=.;FRO=138;FSAF=50;FSAR=37;FSRF=64;FSRR=74;FWDB=-0.0296672;FXX=0.0174665;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.787;QD=4.78236;RBI=0.0390627;REFB=-0.0117575;REVB=-0.0254116;RO=137;SAF=51;SAR=36;SRF=64;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129823;STB=0.568166;TYPE=snp;VARB=0.0208631;OID=.;OPOS=118786486;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:228:225:137:138:87:87:36:51:64:73:37:50:64:74 chr6 118880640 . T G 762.31 PASS AO=160;DP=334;FAO=177;FDP=349;FR=.;FRO=172;FSAF=86;FSAR=91;FSRF=94;FSRR=78;FWDB=0.0160743;FXX=0.00569784;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.691;QD=8.73702;RBI=0.0263578;REFB=-0.0152498;REVB=0.020889;RO=160;SAF=79;SAR=81;SRF=89;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0570032;STB=0.529854;TYPE=snp;VARB=0.0106917;OID=.;OPOS=118880640;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:334:349:160:172:160:177:81:79:89:71:91:86:94:78 chr6 118881822 . C T 388.52 PASS AO=119;DP=296;FAO=119;FDP=295;FR=.;FRO=176;FSAF=48;FSAR=71;FSRF=91;FSRR=85;FWDB=0.0327544;FXX=0.00337826;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.611;QD=5.26809;RBI=0.0344695;REFB=-0.0176808;REVB=-0.0107376;RO=175;SAF=48;SAR=71;SRF=91;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125284;STB=0.568577;TYPE=snp;VARB=0.0241178;OID=.;OPOS=118881822;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:296:295:175:176:119:119:71:48:91:84:71:48:91:85 chr6 118886961 . G T 403.64 PASS AO=82;DP=145;FAO=82;FDP=145;FR=.;FRO=63;FSAF=52;FSAR=30;FSRF=31;FSRR=32;FWDB=-0.0300028;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.699;QD=11.135;RBI=0.0400599;REFB=-0.010954;REVB=-0.0265447;RO=62;SAF=52;SAR=30;SRF=30;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12315;STB=0.564212;TYPE=snp;VARB=0.0104848;OID=.;OPOS=118886961;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:62:63:82:82:30:52:30:32:30:52:31:32 chr6 118887303 . T C 462.47 PASS AO=122;DP=278;FAO=125;FDP=281;FR=.;FRO=156;FSAF=67;FSAR=58;FSRF=101;FSRR=55;FWDB=0.0139922;FXX=0.00354597;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.797;QD=6.58325;RBI=0.0270721;REFB=-0.00261577;REVB=0.0231758;RO=152;SAF=66;SAR=56;SRF=100;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119375;STB=0.562739;TYPE=snp;VARB=0.00343468;OID=.;OPOS=118887303;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:278:281:152:156:122:125:56:66:100:52:58:67:101:55 chr6 118973953 . A G 377.49 PASS AO=81;DP=156;FAO=83;FDP=158;FR=.;FRO=75;FSAF=24;FSAR=59;FSRF=39;FSRR=36;FWDB=-0.0180341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.762;QD=9.55668;RBI=0.0279468;REFB=0.00762671;REVB=-0.0213494;RO=75;SAF=23;SAR=58;SRF=39;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225867;STB=0.61978;TYPE=snp;VARB=-0.00639128;OID=.;OPOS=118973953;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:158:75:75:81:83:58:23:39:36:59:24:39:36 chr6 119149149 . C G 1581.26 PASS AO=162;DP=162;FAO=165;FDP=165;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301534;FXX=0.00602373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.148;QD=38.3335;RBI=0.0427098;REFB=0;REVB=-0.0302472;RO=0;SAF=78;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.95041e-06;OID=.;OPOS=119149149;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:162:165:0:0:162:165:84:78:0:0:85:80:0:0 chr6 120336327 . C A 838.24 PASS AO=313;DP=619;FAO=202;FDP=396;FR=.;FRO=194;FSAF=91;FSAR=111;FSRF=101;FSRR=93;FWDB=0.0114009;FXX=0.00999975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.3219;QD=8.46705;RBI=0.0120111;REFB=-0.0140042;REVB=0.00377963;RO=297;SAF=156;SAR=157;SRF=158;SRR=139;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0299689;STB=0.534453;TYPE=snp;VARB=0.0132795;OID=.;OPOS=120336327;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:619:396:297:194:313:202:157:156:158:139:111:91:101:93 chr6 120336384 . G A 589.3 PASS AO=423;DP=898;FAO=170;FDP=400;FR=.;FRO=230;FSAF=52;FSAR=118;FSRF=108;FSRR=122;FWDB=-0.0126179;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.126;QD=5.89303;RBI=0.0189691;REFB=-0.0121188;REVB=-0.0141639;RO=474;SAF=154;SAR=269;SRF=226;SRR=248;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112977;STB=0.602028;TYPE=snp;VARB=0.0181422;OID=.;OPOS=120336384;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:898:400:474:230:423:170:269:154:226:248:118:52:108:122 chr6 121007775 . C G 61.25 PASS AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.051626;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.2903;QD=7.00018;RBI=0.0896253;REFB=-0.0166529;REVB=-0.0732629;RO=19;SAF=9;SAR=6;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17311;STB=0.586091;TYPE=snp;VARB=0.0163707;OID=.;OPOS=121007775;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:34:35:19:20:15:15:6:9:8:11:6:9:9:11 chr6 121451095 . C T 180.51 PASS AO=36;DP=63;FAO=36;FDP=64;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=26;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.0161045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.1632;QD=11.2819;RBI=0.0701715;REFB=0.0147219;REVB=-0.0682985;RO=27;SAF=10;SAR=26;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117903;STB=0.559392;TYPE=snp;VARB=-0.00617448;OID=.;OPOS=121451095;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:64:27:28:36:36:26:10:11:16:26:10:11:17 chr6 121577370 . T C 694 PASS AO=164;DP=328;FAO=164;FDP=328;FR=.;FRO=164;FSAF=93;FSAR=71;FSRF=76;FSRR=88;FWDB=-0.00247031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.809;QD=8.46343;RBI=0.0189379;REFB=-0.0124351;REVB=0.0187761;RO=164;SAF=93;SAR=71;SRF=76;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0949478;STB=0.552036;TYPE=snp;VARB=0.0106125;OID=.;OPOS=121577370;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:328:328:164:164:164:164:71:93:76:88:71:93:76:88 chr6 121620608 . G T 737.59 PASS AO=69;DP=69;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0324601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.012;QD=36.8794;RBI=0.0392212;REFB=0;REVB=0.0220147;RO=0;SAF=29;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00167695;OID=.;OPOS=121620608;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:69:80:0:0:69:80:40:29:0:0:47:33:0:0 chr6 121632008 . T A 1834.08 PASS AO=192;DP=192;FAO=192;FDP=192;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0160359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.2081;QD=38.2101;RBI=0.0633906;REFB=0;REVB=0.0613287;RO=0;SAF=72;SAR=120;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000123562;OID=.;OPOS=121632008;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:87:192:192:0:0:192:192:120:72:0:0:120:72:0:0 chr6 121642851 . C T 767.99 PASS AO=180;DP=357;FAO=180;FDP=357;FR=.;FRO=177;FSAF=86;FSAR=94;FSRF=98;FSRR=79;FWDB=-0.00182053;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=267.405;QD=8.60489;RBI=0.00806323;REFB=-0.00994945;REVB=-0.00785502;RO=176;SAF=86;SAR=94;SRF=98;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0713161;STB=0.537573;TYPE=snp;VARB=0.0107699;OID=.;OPOS=121642851;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:357:357:176:177:180:180:94:86:98:78:94:86:98:79 chr6 121699975 . A G 340.22 PASS AO=73;DP=176;FAO=89;FDP=190;FR=.;FRO=101;FSAF=50;FSAR=39;FSRF=60;FSRR=41;FWDB=0.000796179;FXX=0.0155432;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.193;QD=7.1625;RBI=0.0212248;REFB=-0.0104187;REVB=0.0212098;RO=103;SAF=44;SAR=29;SRF=60;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0219199;STB=0.517487;TYPE=snp;VARB=0.0145635;OID=.;OPOS=121699975;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:190:103:101:73:89:29:44:60:43:39:50:60:41 chr6 121770464 . A T 375.25 PASS AO=88;DP=177;FAO=88;FDP=177;FR=.;FRO=89;FSAF=53;FSAR=35;FSRF=53;FSRR=36;FWDB=0.0124117;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.592;QD=8.48018;RBI=0.0365086;REFB=-0.0070507;REVB=0.0343341;RO=84;SAF=53;SAR=35;SRF=48;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0284357;STB=0.503545;TYPE=snp;VARB=0.00756797;OID=.;OPOS=121770464;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:177:84:89:88:88:35:53:48:36:35:53:53:36 chr6 121901599 . A G 394.03 PASS AO=74;DP=146;FAO=87;FDP=161;FR=.;FRO=74;FSAF=15;FSAR=72;FSRF=30;FSRR=44;FWDB=0.10114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=45.9115;QD=9.78952;RBI=0.10338;REFB=-0.0511025;REVB=-0.0214058;RO=72;SAF=4;SAR=70;SRF=29;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.591212;STB=0.650563;TYPE=snp;VARB=0.0433008;OID=.;OPOS=121901599;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:161:72:74:74:87:70:4:29:43:72:15:30:44 chr6 122532808 . G A 364.34 PASS AO=85;DP=222;FAO=87;FDP=216;FR=.,HEALED;FRO=109;FSAF=45;FSAR=42;FSRF=53;FSRR=56;FWDB=0.0274607;FXX=0.0226234;HRUN=4;LEN=1;MLLD=35.9322;QD=6.7471;RBI=0.0344362;REFB=-0.0859315;REVB=0.0207789;RO=79;SAF=44;SAR=41;SRF=48;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0793879;STB=0.517237;TYPE=snp;VARB=0.0127105;OID=.;OPOS=122532808;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:218:216:79:109:85:87:41:44:48:31:42:45:53:56 chr6 122766138 . G A 201.22 PASS AO=50;DP=109;FAO=50;FDP=109;FR=.;FRO=59;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=32;FSRR=27;FWDB=0.00239739;FXX=0.0353951;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.15;QD=7.38416;RBI=0.010206;REFB=-0.0168622;REVB=-0.00992044;RO=57;SAF=25;SAR=25;SRF=30;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0251809;STB=0.522927;TYPE=snp;VARB=0.0215136;OID=.;OPOS=122766138;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:57:59:50:50:25:25:30:27:25:25:32:27 chr6 123066514 . T C 791.93 PASS AO=85;DP=86;FAO=85;FDP=86;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0163905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.166;QD=36.8338;RBI=0.024067;REFB=-0.0259874;REVB=0.0176231;RO=1;SAF=42;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011146;STB=0.505881;TYPE=snp;VARB=5.21908e-05;OID=.;OPOS=123066514;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:86:86:1:1:85:85:43:42:1:0:43:42:1:0 chr6 123066585 . G A 447.24 PASS AO=49;DP=49;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0215314;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.1552;QD=36.5092;RBI=0.0546399;REFB=0.0236427;REVB=-0.0502187;RO=0;SAF=26;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511106;TYPE=snp;VARB=-0.00445028;OID=.;OPOS=123066585;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:49:49:0:1:49:48:23:26:0:0:22:26:0:1 chr6 123687288 . A C 2326.12 PASS AO=251;DP=266;FAO=255;FDP=261;FR=.;FRO=6;FSAF=148;FSAR=107;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.00471928;FXX=0.0187963;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.514;QD=35.6493;RBI=0.0125011;REFB=0.0287815;REVB=-0.0115761;RO=3;SAF=147;SAR=104;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.013549;STB=0.509732;TYPE=snp;VARB=-0.000865577;OID=.;OPOS=123687288;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:266:261:3:6:251:255:104:147:0:3:107:148:1:5 chr6 123699042 . T C 829.69 PASS AO=94;DP=101;FAO=97;FDP=101;FR=.;FRO=4;FSAF=22;FSAR=75;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0181144;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.32;QD=32.859;RBI=0.0181308;REFB=-0.0835203;REVB=0.000771039;RO=3;SAF=22;SAR=72;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0603732;STB=0.541658;TYPE=snp;VARB=0.000349218;OID=.;OPOS=123699042;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:101:101:3:4:94:97:72:22:3:0:75:22:4:0 chr6 123833457 . G C 2260.79 PASS AO=235;DP=236;FAO=236;FDP=236;FR=.;FRO=0;FSAF=155;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0232465;FXX=0.00840301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.478;QD=38.3184;RBI=0.0270543;REFB=0;REVB=0.0138396;RO=0;SAF=154;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000316928;OID=.;OPOS=123833457;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:236:236:0:0:235:236:81:154:0:0:81:155:0:0 chr6 124603390 . A G 141.74 PASS AO=41;DP=103;FAO=41;FDP=101;FR=.;FRO=60;FSAF=6;FSAR=35;FSRF=14;FSRR=46;FWDB=-0.0773463;FXX=0.0194156;HRUN=4;LEN=1;MLLD=49.3896;QD=5.61335;RBI=0.0796506;REFB=-0.0321802;REVB=-0.0190202;RO=55;SAF=6;SAR=35;SRF=13;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158011;STB=0.59017;TYPE=snp;VARB=0.0294844;OID=.;OPOS=124603390;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:101:55:60:41:41:35:6:13:42:35:6:14:46 chr6 125144352 . T G 1009.67 PASS AO=112;DP=116;FAO=112;FDP=116;FR=.;FRO=4;FSAF=52;FSAR=60;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.00274565;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=206.42;QD=34.8162;RBI=0.00377221;REFB=-0.0506096;REVB=-0.00258669;RO=4;SAF=52;SAR=60;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00234767;STB=0.501237;TYPE=snp;VARB=0.000186517;OID=.;OPOS=125144352;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:116:116:4:4:112:112:60:52:2:2:60:52:2:2 chr6 125284457 . T C 691.39 PASS AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140311;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.662;QD=37.8846;RBI=0.0368226;REFB=0;REVB=0.0340446;RO=0;SAF=34;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000147527;OID=.;OPOS=125284457;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:74:73:0:0:73:73:39:34:0:0:39:34:0:0 chr6 125475139 . G A 106.34 PASS AO=29;DP=63;FAO=26;FDP=58;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.0368016;FXX=0.0793525;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.877;QD=7.33408;RBI=0.0375616;REFB=-0.0232121;REVB=0.00751753;RO=34;SAF=21;SAR=8;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207576;STB=0.578884;TYPE=snp;VARB=0.0420906;OID=.;OPOS=125475139;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:58:34:32:29:26:8:21:18:16:8:18:18:14 chr6 125573194 . A G 157.57 PASS AO=37;DP=76;FAO=37;FDP=77;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=0.00405196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.835;QD=8.18535;RBI=0.0200177;REFB=-0.0125568;REVB=-0.0196033;RO=36;SAF=14;SAR=23;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135544;STB=0.562865;TYPE=snp;VARB=0.0130653;OID=.;OPOS=125573194;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:77:36:40:37:37:23:14:19:17:22:15:21:19 chr6 125614100 . C A 447.55 PASS AO=112;DP=240;FAO=113;FDP=241;FR=.;FRO=128;FSAF=70;FSAR=43;FSRF=57;FSRR=71;FWDB=0.00304899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.812;QD=7.42818;RBI=0.00438962;REFB=-0.00955043;REVB=-0.0031579;RO=128;SAF=69;SAR=43;SRF=57;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166667;STB=0.593689;TYPE=snp;VARB=0.0138374;OID=.;OPOS=125614100;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:240:241:128:128:112:113:43:69:57:71:43:70:57:71 chr6 125614121 . C A 399.07 PASS AO=97;DP=212;FAO=102;FDP=217;FR=.;FRO=115;FSAF=57;FSAR=45;FSRF=51;FSRR=64;FWDB=0.0150097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.807;QD=7.3562;RBI=0.0180051;REFB=-0.0138899;REVB=0.00994444;RO=115;SAF=54;SAR=43;SRF=51;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110778;STB=0.561083;TYPE=snp;VARB=0.0163563;OID=.;OPOS=125614121;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:217:115:115:97:102:43:54:51:64:45:57:51:64 chr6 126080856 . T G 324.75 PASS AO=34;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=34.1732;QD=30.9281;RBI=0.292955;REFB=-0.0589328;REVB=0.292955;RO=7;SAF=0;SAR=34;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0140319;OID=.;OPOS=126080856;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:41:42:7:0:34:42:34:0:0:7:42:0:0:0 chr6 126080861 . A C 389.1 PASS AO=40;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.2432;QD=33.1152;RBI=0.304376;REFB=-0.176218;REVB=0.304376;RO=4;SAF=0;SAR=40;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0109953;OID=.;OPOS=126080861;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:47:47:4:1:40:46:40:0:0:4:46:0:0:1 chr6 126210395 . T G 310.42 PASS AO=35;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0227456;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.327;QD=33.5589;RBI=0.0257273;REFB=-0.0376506;REVB=-0.0120222;RO=1;SAF=14;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0217573;STB=0.511105;TYPE=snp;VARB=0.0022276;OID=.;OPOS=126210395;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:37:37:1:1:35:36:21:14:0:1:22:14:0:1 chr6 126250397 . T A 162.84 PASS AO=28;DP=42;FAO=29;FDP=43;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=26;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.00295446;FXX=0;HRUN=13;LEN=1;MLLD=133.254;QD=15.1476;RBI=0.00356967;REFB=-0.0186014;REVB=0.00200343;RO=14;SAF=3;SAR=25;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.34787;STB=0.696262;TYPE=snp;VARB=0.00354557;OID=.;OPOS=126250397;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:42:43:14:14:28:29:25:3:6:8:26:3:6:8 chr6 126250398 . T A 29.24 PASS AO=36;DP=41;FAO=12;FDP=42;FR=.;FRO=30;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=25;FWDB=0.046563;FXX=0;HRUN=13;LEN=1;MLLD=64.5005;QD=2.78453;RBI=0.0470401;REFB=-0.0177129;REVB=-0.00668262;RO=4;SAF=7;SAR=29;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0855379;STB=0.646855;TYPE=snp;VARB=0.00636065;OID=.;OPOS=126250398;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:41:42:4:30:36:12:29:7:2:2:8:4:5:25 chr6 126278230 . G C 195.14 PASS AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0761356;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.013;QD=37.1691;RBI=0.113782;REFB=0;REVB=0.0845558;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000335085;OID=.;OPOS=126278230;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:21:21:0:0:21:21:9:12:0:0:9:12:0:0 chr6 126329791 . C T 62.76 PASS AO=13;DP=31;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=16;FWDB=0.0598126;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.303;QD=8.09798;RBI=0.0666074;REFB=-0.0113801;REVB=0.0293086;RO=18;SAF=7;SAR=6;SRF=1;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.480861;STB=0.764922;TYPE=snp;VARB=0.0122517;OID=.;OPOS=126329791;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:31:31:18:17:13:14:6:7:1:17:6:8:1:16 chr6 126661502 . G T 340.37 PASS AO=77;DP=151;FAO=77;FDP=151;FR=.;FRO=74;FSAF=53;FSAR=24;FSRF=49;FSRR=25;FWDB=-0.00962767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.4159;QD=9.01632;RBI=0.0136813;REFB=-0.0334162;REVB=-0.00972036;RO=73;SAF=53;SAR=24;SRF=48;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0313134;STB=0.514763;TYPE=snp;VARB=0.028534;OID=.;OPOS=126661502;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:151:73:74:77:77:24:53:48:25:24:53:49:25 chr6 127476516 . G A 796.9 PASS AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0395128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.2896;QD=37.9477;RBI=0.0405453;REFB=0;REVB=0.0090917;RO=0;SAF=39;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.93822e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000193988;OID=.;OPOS=127476516;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:84:84:0:0:84:84:45:39:0:0:45:39:0:0 chr6 127609691 . C T 481.19 PASS AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0537274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.545;QD=37.7406;RBI=0.0541275;REFB=0;REVB=-0.00656923;RO=0;SAF=8;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.72506e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000186285;OID=.;OPOS=127609691;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:51:51:0:0:51:51:43:8:0:0:43:8:0:0 chr6 127768762 . G A 1416.88 PASS AO=145;DP=168;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0081718;FXX=0.149992;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.704;QD=37.0427;RBI=0.0195403;REFB=-0.090118;REVB=0.0177495;RO=1;SAF=59;SAR=86;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00549808;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00189655;OID=.;OPOS=127768762;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:168:153:1:0:145:153:86:59:0:1:91:62:0:0 chr6 127771452 . T G 1024.64 PASS AO=108;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0219554;FXX=0.0180164;HRUN=3;LEN=1;MLLD=112.767;QD=37.6014;RBI=0.0221992;REFB=-0.0590813;REVB=0.00328126;RO=1;SAF=53;SAR=55;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00887197;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000927192;OID=.;OPOS=127771452;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:109:109:1:0:108:109:55:53:1:0:56:53:0:0 chr6 127797179 . G A 113.28 PASS AO=26;DP=55;FAO=26;FDP=55;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=0.0131203;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.776;QD=8.23866;RBI=0.059588;REFB=-0.0268719;REVB=0.0581256;RO=28;SAF=16;SAR=10;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.236258;STB=0.62386;TYPE=snp;VARB=0.0264423;OID=.;OPOS=127797179;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:28:29:26:26:10:16:10:18:10:16:11:18 chr6 127797374 . G A 458.59 PASS AO=85;DP=139;FAO=85;FDP=139;FR=.;FRO=54;FSAF=40;FSAR=45;FSRF=26;FSRR=28;FWDB=0.0101943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.323;QD=13.1967;RBI=0.0107344;REFB=-0.019715;REVB=-0.0033621;RO=53;SAF=40;SAR=45;SRF=26;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0141997;STB=0.504243;TYPE=snp;VARB=0.0140487;OID=.;OPOS=127797374;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:53:54:85:85:45:40:26:27:45:40:26:28 chr6 128040839 . T C 2137.09 PASS AO=226;DP=228;FAO=226;FDP=226;FR=.;FRO=0;FSAF=154;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101609;FXX=0.00877155;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.2722;QD=37.8246;RBI=0.0113169;REFB=-0.0354088;REVB=0.00498296;RO=2;SAF=154;SAR=72;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00348756;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000366515;OID=.;OPOS=128040839;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:228:226:2:0:226:226:72:154:1:1:72:154:0:0 chr6 128388799 . G T 748.27 PASS AO=83;DP=223;FAO=78;FDP=220;FR=.,HEALED;FRO=79;FSAF=11;FSAR=67;FSRF=18;FSRR=61;FWDB=0.000551654;FXX=0.0090086;HRUN=6;LEN=1;MLLD=63.927;QD=13.6048;RBI=0.020321;REFB=-0.00219107;REVB=-0.0203135;RO=79;SAF=11;SAR=72;SRF=19;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176473;STB=0.579804;TYPE=snp;VARB=0.0386227;OID=.;OPOS=128388799;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:220:79:79:83:78:72:11:19:60:67:11:18:61 chr6 128403745 . A G 595.31 PASS AO=139;DP=286;FAO=143;FDP=290;FR=.;FRO=147;FSAF=53;FSAR=90;FSRF=56;FSRR=91;FWDB=-0.017323;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.8274;QD=8.21113;RBI=0.0177596;REFB=0.00273146;REVB=-0.00391372;RO=147;SAF=50;SAR=89;SRF=56;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0214024;STB=0.505591;TYPE=snp;VARB=-0.0032959;OID=.;OPOS=128403745;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:286:290:147:147:139:143:89:50:56:91:90:53:56:91 chr6 128934390 . G C 255.86 PASS AO=65;DP=143;FAO=66;FDP=145;FR=.;FRO=79;FSAF=50;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=54;FWDB=0.0169614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.249;QD=7.05832;RBI=0.0187719;REFB=-0.01694;REVB=-0.00804333;RO=78;SAF=50;SAR=15;SRF=25;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.450777;STB=0.744605;TYPE=snp;VARB=0.0244232;OID=.;OPOS=128934390;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:145:78:79:65:66:15:50:25:53:16:50:25:54 chr6 129371106 . C T 685.59 PASS AO=159;DP=314;FAO=160;FDP=316;FR=.;FRO=156;FSAF=80;FSAR=80;FSRF=86;FSRR=70;FWDB=0.00104121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.62;QD=8.67841;RBI=0.0363894;REFB=-0.00819859;REVB=-0.0363745;RO=155;SAF=79;SAR=80;SRF=86;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.052278;STB=0.525313;TYPE=snp;VARB=0.00966752;OID=.;OPOS=129371106;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:314:316:155:156:159:160:80:79:86:69:80:80:86:70 chr6 129381026 . C A 1008.87 PASS AO=112;DP=116;FAO=112;FDP=116;FR=.;FRO=4;FSAF=44;FSAR=68;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0269244;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=284.323;QD=34.7885;RBI=0.0269253;REFB=-0.0525929;REVB=0.000214772;RO=3;SAF=44;SAR=68;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0312702;STB=0.521735;TYPE=snp;VARB=0.00132821;OID=.;OPOS=129381026;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:116:116:3:4:112:112:68:44:3:0:68:44:4:0 chr6 129571330 . G A 183.3 PASS AO=52;DP=126;FAO=52;FDP=125;FR=.;FRO=73;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=17;FSRR=56;FWDB=-0.0192395;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.0451;QD=5.86552;RBI=0.0237656;REFB=-0.0126849;REVB=-0.0139516;RO=73;SAF=23;SAR=29;SRF=17;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229212;STB=0.627564;TYPE=snp;VARB=0.0141461;OID=.;OPOS=129571330;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:125:73:73:52:52:29:23:17:56:29:23:17:56 chr6 129612808 . A G 293.76 PASS AO=68;DP=136;FAO=68;FDP=136;FR=.;FRO=68;FSAF=33;FSAR=35;FSRF=34;FSRR=34;FWDB=-0.00491427;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=243.782;QD=8.63997;RBI=0.0224394;REFB=-0.00968002;REVB=0.0218947;RO=68;SAF=33;SAR=35;SRF=34;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133393;STB=0.507354;TYPE=snp;VARB=0.00983315;OID=.;OPOS=129612808;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:68:68:68:68:35:33:34:34:35:33:34:34 chr6 129722389 . A G 554.69 PASS AO=62;DP=65;FAO=63;FDP=65;FR=.;FRO=2;FSAF=16;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00893354;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=255.543;QD=34.1348;RBI=0.0187762;REFB=-0.0556353;REVB=0.0165148;RO=2;SAF=16;SAR=46;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200865;STB=0.509888;TYPE=snp;VARB=0.000264427;OID=.;OPOS=129722389;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:65:65:2:2:62:63:46:16:0:2:47:16:1:1 chr6 129722425 . G A 725.11 PASS AO=76;DP=78;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0530272;FXX=0.0126566;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.5558;QD=37.1851;RBI=0.079528;REFB=0.0190895;REVB=0.0592691;RO=1;SAF=24;SAR=52;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0090147;STB=0.504672;TYPE=snp;VARB=-0.000504245;OID=.;OPOS=129722425;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:78:78:1:1:76:77:52:24:0:1:53:24:0:1 chr6 129762112 . G A 281.34 PASS AO=79;DP=190;FAO=81;FDP=191;FR=.;FRO=110;FSAF=25;FSAR=56;FSRF=36;FSRR=74;FWDB=0.00225757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.559;QD=5.89187;RBI=0.00225757;REFB=0.0081319;REVB=-5.04142e-06;RO=107;SAF=25;SAR=54;SRF=36;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.02354;STB=0.512448;TYPE=snp;VARB=-0.0112514;OID=.;OPOS=129762112;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:191:107:110:79:81:54:25:36:71:56:25:36:74 chr6 129807629 . C T 942.18 PASS AO=99;DP=101;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0280168;FXX=0.0198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.869;QD=38.0677;RBI=0.0550199;REFB=0;REVB=0.0473524;RO=0;SAF=54;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000321751;OID=.;OPOS=129807629;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:101:99:0:0:99:99:45:54:0:0:45:54:0:0 chr6 129807699 . G C 1136.44 PASS AO=117;DP=118;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0390354;FXX=0.00840265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.134;QD=38.5233;RBI=0.0408565;REFB=0;REVB=-0.0120619;RO=0;SAF=41;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.82302e-05;OID=.;OPOS=129807699;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:118:118:0:0:117:118:76:41:0:0:76:42:0:0 chr6 129837610 . T C 2431.73 PASS AO=257;DP=265;FAO=267;FDP=271;FR=.;FRO=4;FSAF=146;FSAR=121;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0143566;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.865;QD=35.8928;RBI=0.081596;REFB=-0.04539;REVB=0.0803231;RO=8;SAF=141;SAR=116;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00282251;STB=0.503027;TYPE=snp;VARB=0.00120476;OID=.;OPOS=129837610;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:265:271:8:4:257:267:116:141:4:4:121:146:3:1 chr6 130031215 . T C 1945.42 PASS AO=193;DP=193;FAO=205;FDP=205;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=116;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8897;QD=37.9595;RBI=0.0762706;REFB=0;REVB=0.074066;RO=0;SAF=85;SAR=108;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000218688;OID=.;OPOS=130031215;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:92:193:205:0:0:193:205:108:85:0:0:116:89:0:0 chr6 130152479 . T C 793.65 PASS AO=86;DP=88;FAO=86;FDP=88;FR=.;FRO=2;FSAF=50;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00647268;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=219.816;QD=36.0749;RBI=0.020989;REFB=-0.0602623;REVB=0.0199661;RO=2;SAF=50;SAR=36;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0255906;STB=0.51351;TYPE=snp;VARB=0.000755893;OID=.;OPOS=130152479;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:88:88:2:2:86:86:36:50:0:2:36:50:0:2 chr6 130152520 . A C 65.39 PASS AO=26;DP=85;FAO=26;FDP=85;FR=.;FRO=59;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=36;FSRR=23;FWDB=-0.00661974;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.662;QD=3.07735;RBI=0.0292697;REFB=-0.00233455;REVB=0.0285113;RO=59;SAF=11;SAR=15;SRF=36;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217528;STB=0.627687;TYPE=snp;VARB=0.00552678;OID=.;OPOS=130152520;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:85:85:59:59:26:26:15:11:36:23:15:11:36:23 chr6 130154667 . T C 225.35 PASS AO=46;DP=83;FAO=46;FDP=83;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=31;FSRF=12;FSRR=25;FWDB=-0.0781938;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2499;QD=10.86;RBI=0.0934649;REFB=-0.0098639;REVB=-0.0511998;RO=37;SAF=15;SAR=31;SRF=12;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00162696;STB=0.500894;TYPE=snp;VARB=0.00613303;OID=.;OPOS=130154667;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:37:37:46:46:31:15:12:25:31:15:12:25 chr6 130154686 . A G 806.24 PASS AO=86;DP=87;FAO=86;FDP=87;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0243513;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=212.162;QD=37.0683;RBI=0.0259884;REFB=-0.0767317;REVB=-0.00907809;RO=0;SAF=29;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504347;TYPE=snp;VARB=5.70549e-05;OID=.;OPOS=130154686;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:87:87:0:1:86:86:57:29:0:0:57:29:0:1 chr6 130374102 . C A 174.65 PASS AO=42;DP=89;FAO=42;FDP=90;FR=.;FRO=48;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=0.05546;FXX=0.0109878;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.703;QD=7.76214;RBI=0.0951607;REFB=-0.00783702;REVB=-0.0773288;RO=47;SAF=21;SAR=21;SRF=27;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0705466;STB=0.522212;TYPE=snp;VARB=0.00607701;OID=.;OPOS=130374102;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:90:47:48:42:42:21:21:27:20:21:21:26:22 chr6 130381246 . T C 299.43 PASS AO=78;DP=180;FAO=80;FDP=180;FR=.;FRO=100;FSAF=29;FSAR=51;FSRF=38;FSRR=62;FWDB=-0.0238924;FXX=0.0217379;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.535;QD=6.65409;RBI=0.0268347;REFB=-0.00530677;REVB=0.012217;RO=99;SAF=25;SAR=53;SRF=37;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0597811;STB=0.510454;TYPE=snp;VARB=0.00570613;OID=.;OPOS=130381246;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:180:99:100:78:80:53:25:37:62:51:29:38:62 chr6 130537005 . G A 165.68 PASS AO=61;DP=185;FAO=62;FDP=183;FR=.;FRO=121;FSAF=21;FSAR=41;FSRF=63;FSRR=58;FWDB=0.023976;FXX=0.0108102;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.462;QD=3.62151;RBI=0.0266312;REFB=0.000399626;REVB=0.011592;RO=116;SAF=22;SAR=39;SRF=63;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210872;STB=0.623533;TYPE=snp;VARB=-0.000995733;OID=.;OPOS=130537005;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:183:116:121:61:62:39:22:63:53:41:21:63:58 chr6 131148737 . G A 489.06 PASS AO=53;DP=249;FAO=117;FDP=241;FR=.,HEALED;FRO=124;FSAF=69;FSAR=48;FSRF=82;FSRR=42;FWDB=0.00279731;FXX=0.00823011;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.84;QD=8.11715;RBI=0.0148208;REFB=-0.0247861;REVB=-0.0145544;RO=45;SAF=14;SAR=39;SRF=5;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181745;STB=0.538558;TYPE=snp;VARB=0.031585;OID=.;OPOS=131148737;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:241:45:124:53:117:39:14:5:40:48:69:82:42 chr6 131156102 . G T 341.83 PASS AO=82;DP=169;FAO=82;FDP=169;FR=.;FRO=87;FSAF=43;FSAR=39;FSRF=41;FSRR=46;FWDB=0.00461857;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=289.988;QD=8.09055;RBI=0.0158738;REFB=-0.00268192;REVB=-0.0151871;RO=87;SAF=43;SAR=39;SRF=41;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0495478;STB=0.527334;TYPE=snp;VARB=0.00261023;OID=.;OPOS=131156102;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:169:87:87:82:82:39:43:41:46:39:43:41:46 chr6 131160876 . G T 355.34 PASS AO=84;DP=175;FAO=86;FDP=177;FR=.;FRO=91;FSAF=38;FSAR=48;FSRF=51;FSRR=40;FWDB=0.0101875;FXX=0.00561766;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.083;QD=8.03019;RBI=0.0129915;REFB=-0.00311027;REVB=0.0080618;RO=91;SAF=39;SAR=45;SRF=51;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.090384;STB=0.56091;TYPE=snp;VARB=0.00331246;OID=.;OPOS=131160876;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:177:91:91:84:86:45:39:51:40:48:38:51:40 chr6 131161504 . T C 244.85 PASS AO=42;DP=64;FAO=42;FDP=64;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.01827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.497;QD=15.3033;RBI=0.0219509;REFB=-0.0204535;REVB=0.0121675;RO=22;SAF=14;SAR=28;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0527343;STB=0.528722;TYPE=snp;VARB=0.00948102;OID=.;OPOS=131161504;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:64:64:22:22:42:42:28:14:9:13:28:14:9:13 chr6 131184770 . T G 230.51 PASS AO=56;DP=118;FAO=56;FDP=118;FR=.;FRO=62;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=30;FSRR=32;FWDB=-0.000784785;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.491;QD=7.81373;RBI=0.00901371;REFB=-0.00600328;REVB=-0.00897949;RO=62;SAF=27;SAR=29;SRF=30;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00163755;STB=0.500909;TYPE=snp;VARB=0.00694484;OID=.;OPOS=131184770;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:62:62:56:56:29:27:30:32:29:27:30:32 chr6 131190838 . G A 551.45 PASS AO=132;DP=268;FAO=133;FDP=271;FR=.;FRO=138;FSAF=63;FSAR=70;FSRF=55;FSRR=83;FWDB=0.0137438;FXX=0.0145449;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.441;QD=8.13949;RBI=0.0150201;REFB=-0.0112441;REVB=0.00605897;RO=136;SAF=62;SAR=70;SRF=55;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0608316;STB=0.538516;TYPE=snp;VARB=0.0126125;OID=.;OPOS=131190838;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:268:271:136:138:132:133:70:62:55:81:70:63:55:83 chr6 132859609 . T A 2874.88 PASS AO=294;DP=297;FAO=302;FDP=302;FR=.;FRO=0;FSAF=196;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0302124;FXX=0.00983574;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.968;QD=38.0779;RBI=0.0463505;REFB=-0.0363511;REVB=-0.0351508;RO=0;SAF=193;SAR=101;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.61792e-05;OID=.;OPOS=132859609;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:297:302:0:0:294:302:101:193:0:0:106:196:0:0 chr6 132910612 . G A 647.82 PASS AO=67;DP=68;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00915697;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.8701;QD=36.4968;RBI=0.0779379;REFB=-0.0318808;REVB=0.0773981;RO=1;SAF=23;SAR=44;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106206;STB=0.505262;TYPE=snp;VARB=0.00165686;OID=.;OPOS=132910612;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:68:71:1:1:67:70:44:23:0:1:47:23:0:1 chr6 132966279 . T C 207.28 PASS AO=66;DP=174;FAO=66;FDP=172;FR=.;FRO=106;FSAF=37;FSAR=29;FSRF=62;FSRR=44;FWDB=-0.00229015;FXX=0.0114936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.28;QD=4.82043;RBI=0.0337711;REFB=-0.0137933;REVB=0.0336934;RO=103;SAF=37;SAR=29;SRF=60;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.024112;STB=0.51525;TYPE=snp;VARB=0.0194117;OID=.;OPOS=132966279;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:172:103:106:66:66:29:37:60:43:29:37:62:44 chr6 133015271 . T C 2834.93 PASS AO=302;DP=306;FAO=303;FDP=303;FR=.;FRO=0;FSAF=116;FSAR=187;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00406167;FXX=0.0098036;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.342;QD=37.4248;RBI=0.0149336;REFB=-0.0439432;REVB=-0.0143707;RO=3;SAF=115;SAR=187;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122768;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.5889e-05;OID=.;OPOS=133015271;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:306:303:3:0:302:303:187:115:3:0:187:116:0:0 chr6 133035098 . G A 676.14 PASS AO=126;DP=208;FAO=127;FDP=209;FR=.;FRO=82;FSAF=57;FSAR=70;FSRF=46;FSRR=36;FWDB=-0.00363001;FXX=0.00476168;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.731;QD=12.9405;RBI=0.0484043;REFB=0.00496012;REVB=0.048268;RO=81;SAF=57;SAR=69;SRF=46;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0836549;STB=0.544062;TYPE=snp;VARB=-0.00317552;OID=.;OPOS=133035098;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:209:81:82:126:127:69:57:46:35:70:57:46:36 chr6 133045812 . G A 459.89 PASS AO=132;DP=316;FAO=132;FDP=311;FR=.;FRO=179;FSAF=36;FSAR=96;FSRF=86;FSRR=93;FWDB=-0.0283527;FXX=0.0158223;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.773;QD=5.91504;RBI=0.0285091;REFB=-0.011268;REVB=0.00298198;RO=176;SAF=36;SAR=96;SRF=83;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226552;STB=0.632513;TYPE=snp;VARB=0.0126834;OID=.;OPOS=133045812;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:316:311:176:179:132:132:96:36:83:93:96:36:86:93 chr6 133045902 . A G 410.33 PASS AO=104;DP=224;FAO=105;FDP=226;FR=.;FRO=121;FSAF=30;FSAR=75;FSRF=55;FSRR=66;FWDB=0.0115155;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.9363;QD=7.26246;RBI=0.0378654;REFB=0.00979729;REVB=0.0360718;RO=120;SAF=30;SAR=74;SRF=54;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174226;STB=0.601111;TYPE=snp;VARB=-0.0145548;OID=.;OPOS=133045902;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:224:226:120:121:104:105:74:30:54:66:75:30:55:66 chr6 133052616 . C T 319.85 PASS AO=74;DP=148;FAO=74;FDP=148;FR=.;FRO=74;FSAF=30;FSAR=44;FSRF=29;FSRR=45;FWDB=-0.000982903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.846;QD=8.64469;RBI=0.00912059;REFB=-0.0125122;REVB=-0.00906748;RO=73;SAF=30;SAR=44;SRF=29;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00763139;STB=0.507024;TYPE=snp;VARB=0.0171557;OID=.;OPOS=133052616;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:73:74:74:74:44:30:29:44:44:30:29:45 chr6 133070995 . G T 1614.5 PASS AO=237;DP=237;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00970788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.89;QD=38.4404;RBI=0.0227963;REFB=0;REVB=0.0206259;RO=0;SAF=101;SAR=136;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.08698e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.27691e-05;OID=.;OPOS=133070995;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:237:168:0:0:237:168:136:101:0:0:104:64:0:0 chr6 133072650 . A G 435.12 PASS AO=103;DP=211;FAO=104;FDP=212;FR=.;FRO=108;FSAF=45;FSAR=59;FSRF=59;FSRR=49;FWDB=0.00112261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.063;QD=8.20983;RBI=0.0115079;REFB=-0.0164274;REVB=-0.0114531;RO=106;SAF=45;SAR=58;SRF=58;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101843;STB=0.55801;TYPE=snp;VARB=0.0149551;OID=.;OPOS=133072650;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:212:106:108:103:104:58:45:58:48:59:45:59:49 chr6 133074645 . A G 155.67 PASS AO=46;DP=115;FAO=46;FDP=115;FR=.;FRO=69;FSAF=9;FSAR=37;FSRF=11;FSRR=58;FWDB=0.0033355;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.243;QD=5.41451;RBI=0.00737351;REFB=0.000158654;REVB=0.00657594;RO=68;SAF=9;SAR=37;SRF=10;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0869639;STB=0.536035;TYPE=snp;VARB=-0.000266652;OID=.;OPOS=133074645;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:68:69:46:46:37:9:10:58:37:9:11:58 chr6 133074663 . T C 830.39 PASS AO=93;DP=100;FAO=95;FDP=100;FR=.;FRO=5;FSAF=14;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0764445;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.6193;QD=33.2156;RBI=0.103762;REFB=-0.060277;REVB=-0.0701625;RO=4;SAF=11;SAR=82;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0225661;STB=0.514967;TYPE=snp;VARB=0.00249892;OID=.;OPOS=133074663;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:100:100:4:5:93:95:82:11:0:4:81:14:0:5 chr6 133077063 . T C 434.19 PASS AO=137;DP=347;FAO=137;FDP=346;FR=.;FRO=209;FSAF=75;FSAR=62;FSRF=107;FSRR=102;FWDB=0.0509643;FXX=0.00288176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.3852;QD=5.01951;RBI=0.0551494;REFB=-0.0151913;REVB=0.0210737;RO=209;SAF=75;SAR=62;SRF=107;SRR=102;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0384277;STB=0.521537;TYPE=snp;VARB=0.0289279;OID=.;OPOS=133077063;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:347:346:209:209:137:137:62:75:107:102:62:75:107:102 chr6 133105120 . C T 463.68 PASS AO=104;DP=200;FAO=104;FDP=201;FR=.;FRO=97;FSAF=54;FSAR=50;FSRF=59;FSRR=38;FWDB=0.0162901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.439;QD=9.22745;RBI=0.0167802;REFB=-0.0189818;REVB=-0.00402593;RO=95;SAF=54;SAR=50;SRF=57;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.070805;STB=0.543157;TYPE=snp;VARB=0.0135855;OID=.;OPOS=133105120;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:200:201:95:97:104:104:50:54:57:38:50:54:59:38 chr6 133118214 . C T 631.15 PASS AO=182;DP=418;FAO=175;FDP=399;FR=.;FRO=224;FSAF=70;FSAR=105;FSRF=104;FSRR=120;FWDB=-0.0130727;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.503;QD=6.32735;RBI=0.0143944;REFB=-0.00149242;REVB=-0.00602542;RO=233;SAF=74;SAR=108;SRF=108;SRR=125;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0589914;STB=0.537033;TYPE=snp;VARB=0.0022814;OID=.;OPOS=133118214;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:418:399:233:224:182:175:108:74:108:125:105:70:104:120 chr6 133119564 . C A 234.7 PASS AO=49;DP=91;FAO=49;FDP=91;FR=.;FRO=42;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=14;FSRR=28;FWDB=0.0555763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.1733;QD=10.3163;RBI=0.0573611;REFB=-0.0217163;REVB=0.0141973;RO=41;SAF=20;SAR=29;SRF=13;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0795008;STB=0.536204;TYPE=snp;VARB=0.0267911;OID=.;OPOS=133119564;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:41:42:49:49:29:20:13:28:29:20:14:28 chr6 133135886 . A G 23.57 PASS AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.0173707;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.082;QD=5.2386;RBI=0.0364959;REFB=-0.0151999;REVB=-0.0320969;RO=12;SAF=4;SAR=2;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0366754;OID=.;OPOS=133135886;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:18:18:12:12:6:6:2:4:8:4:2:4:8:4 chr6 133136906 . C T 148.69 PASS AO=42;DP=100;FAO=42;FDP=101;FR=.;FRO=59;FSAF=13;FSAR=29;FSRF=20;FSRR=39;FWDB=0.00608305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.186;QD=5.88877;RBI=0.0160852;REFB=-0.00881923;REVB=0.0148907;RO=57;SAF=13;SAR=29;SRF=20;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0483231;STB=0.519817;TYPE=snp;VARB=0.0121989;OID=.;OPOS=133136906;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:101:57:59:42:42:29:13:20:37:29:13:20:39 chr6 133789728 . G A 184.45 PASS AO=49;DP=112;FAO=49;FDP=112;FR=.;FRO=63;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=37;FWDB=-0.00256337;FXX=0.0260847;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.129;QD=6.58742;RBI=0.00297667;REFB=-0.018468;REVB=-0.00151318;RO=62;SAF=29;SAR=20;SRF=25;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187383;STB=0.600395;TYPE=snp;VARB=0.0176839;OID=.;OPOS=133789728;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:62:63:49:49:20:29:25:37:20:29:26:37 chr6 133849966 . C T 430.18 PASS AO=113;DP=248;FAO=113;FDP=250;FR=.;FRO=137;FSAF=33;FSAR=80;FSRF=52;FSRR=85;FWDB=0.00327517;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.09;QD=6.88285;RBI=0.0123735;REFB=-0.00131072;REVB=-0.0119321;RO=133;SAF=33;SAR=80;SRF=51;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102584;STB=0.555319;TYPE=snp;VARB=0.00167115;OID=.;OPOS=133849966;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:248:250:133:137:113:113:80:33:51:82:80:33:52:85 chr6 133850246 . AC A 178.77 PASS AO=67;DP=148;FAO=69;FDP=145;FR=.;FRO=76;FSAF=36;FSAR=33;FSRF=40;FSRR=36;FWDB=0.0470689;FXX=0.00684885;HRUN=3;LEN=1;MLLD=21.2066;QD=4.93167;RBI=0.115268;REFB=-0.0204443;REVB=-0.10522;RO=57;SAF=36;SAR=31;SRF=25;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0.414462;SSSB=0.0826963;STB=0.502403;TYPE=del;VARB=0.022468;OID=.;OPOS=133850247;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:67:142:69:145:76:36:33:40:36:99:57:36:31:25:32 chr6 133850669 . C A 41.56 PASS AO=22;DP=47;FAO=15;FDP=48;FR=.;FRO=33;FSAF=1;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=24;FWDB=0.0138051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.103;QD=3.46323;RBI=0.0154131;REFB=0.00415926;REVB=0.00685434;RO=14;SAF=6;SAR=16;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0531424;STB=0.786007;TYPE=snp;VARB=-0.0109695;OID=.;OPOS=133850669;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:47:48:14:33:22:15:16:6:3:11:14:1:9:24 chr6 133852127 . A T 98.2 PASS AO=26;DP=62;FAO=26;FDP=62;FR=.;FRO=36;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=26;FWDB=0.00281956;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.6063;QD=6.33555;RBI=0.0187669;REFB=-0.0323542;REVB=-0.0185539;RO=36;SAF=7;SAR=19;SRF=10;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0109987;STB=0.506265;TYPE=snp;VARB=0.021359;OID=.;OPOS=133852127;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:62:62:36:36:26:26:19:7:10:26:19:7:10:26 chr6 134304023 . C T 198.51 PASS AO=55;DP=131;FAO=55;FDP=130;FR=.;FRO=75;FSAF=18;FSAR=37;FSRF=27;FSRR=48;FWDB=0.00368;FXX=0.00763301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.662;QD=6.1081;RBI=0.00373133;REFB=-0.00613179;REVB=-0.000616751;RO=75;SAF=18;SAR=37;SRF=27;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0375972;STB=0.521119;TYPE=snp;VARB=0.00547645;OID=.;OPOS=134304023;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:130:75:75:55:55:37:18:27:48:37:18:27:48 chr6 134454784 . G T 117.45 PASS AO=26;DP=55;FAO=27;FDP=56;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.00449508;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.396;QD=8.38907;RBI=0.0600518;REFB=-0.00547561;REVB=0.0598833;RO=29;SAF=10;SAR=16;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0944744;STB=0.560394;TYPE=snp;VARB=0.00653005;OID=.;OPOS=134454784;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:56:29:29:26:27:16:10:14:15:17:10:14:15 chr6 134454835 . C T 118.1 PASS AO=29;DP=67;FAO=30;FDP=68;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=-0.0209178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.5358;QD=6.94681;RBI=0.0547841;REFB=0.0178121;REVB=-0.0506334;RO=38;SAF=12;SAR=17;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139351;STB=0.585741;TYPE=snp;VARB=-0.0184462;OID=.;OPOS=134454835;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:68:38:38:29:30:17:12:21:17:18:12:21:17 chr6 134493397 . G A 366.89 PASS AO=70;DP=125;FAO=73;FDP=128;FR=.;FRO=55;FSAF=27;FSAR=46;FSRF=25;FSRR=30;FWDB=0.0004396;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.571;QD=11.4652;RBI=0.0123328;REFB=-0.00669021;REVB=0.0123249;RO=54;SAF=27;SAR=43;SRF=24;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0487766;STB=0.538243;TYPE=snp;VARB=0.00421435;OID=.;OPOS=134493397;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:128:54:55:70:73:43:27:24:30:46:27:25:30 chr6 135523774 . A G 127.9 PASS AO=34;DP=79;FAO=34;FDP=80;FR=.;FRO=46;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=-0.0226736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.212;QD=6.39475;RBI=0.0293651;REFB=-0.00705789;REVB=-0.0186605;RO=43;SAF=21;SAR=13;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107896;STB=0.581538;TYPE=snp;VARB=0.00741431;OID=.;OPOS=135523774;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:80:43:46:34:34:13:21:22:21:13:21:22:24 chr6 136582401 . A T 12.11 PASS AO=17;DP=112;FAO=17;FDP=112;FR=.;FRO=95;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=67;FSRR=28;FWDB=0.0138924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.222;QD=0.432432;RBI=0.0145774;REFB=0.00222346;REVB=0.00441597;RO=94;SAF=8;SAR=9;SRF=67;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.310093;STB=0.69496;TYPE=snp;VARB=-0.0105961;OID=.;OPOS=136582401;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:112:112:94:95:17:17:9:8:67:27:9:8:67:28 chr6 136582417 . G A 64.61 PASS AO=42;DP=176;FAO=42;FDP=176;FR=.;FRO=134;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=81;FSRR=53;FWDB=-0.0419567;FXX=0.0056494;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.209;QD=1.46848;RBI=0.0644363;REFB=-0.0201962;REVB=-0.0489048;RO=131;SAF=25;SAR=17;SRF=81;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0303118;STB=0.507316;TYPE=snp;VARB=0.0500253;OID=.;OPOS=136582417;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:176:176:131:134:42:42:17:25:81:50:17:25:81:53 chr6 136582497 . G T 354.03 PASS AO=111;DP=320;FAO=124;FDP=333;FR=.;FRO=209;FSAF=78;FSAR=46;FSRF=100;FSRR=109;FWDB=0.00591626;FXX=0.00596997;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.172;QD=4.25258;RBI=0.00612961;REFB=-0.00950743;REVB=-0.00160315;RO=206;SAF=68;SAR=43;SRF=98;SRR=108;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157964;STB=0.596197;TYPE=snp;VARB=0.0137702;OID=.;OPOS=136582497;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:320:333:206:209:111:124:43:68:98:108:46:78:100:109 chr6 136589448 . C A 23.2 PASS AO=22;DP=120;FAO=22;FDP=120;FR=.;FRO=98;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=36;FSRR=62;FWDB=0.0315989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.743;QD=0.773269;RBI=0.0386112;REFB=-0.00063966;REVB=0.0221887;RO=98;SAF=5;SAR=17;SRF=36;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211129;STB=0.638142;TYPE=snp;VARB=0.00231799;OID=.;OPOS=136589448;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:120:120:98:98:22:22:17:5:36:62:17:5:36:62 chr6 136597004 . A G 64.81 PASS AO=52;DP=280;FAO=62;FDP=290;FR=.;FRO=228;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=116;FSRR=112;FWDB=0.00429077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.29;QD=0.893963;RBI=0.040475;REFB=-0.00302452;REVB=0.0402469;RO=221;SAF=28;SAR=24;SRF=116;SRR=105;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0175904;STB=0.544954;TYPE=snp;VARB=0.0145116;OID=.;OPOS=136597004;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:280:290:221:228:52:62:24:28:116:105:34:28:116:112 chr6 136597262 . T C 364.01 PASS AO=97;DP=222;FAO=99;FDP=224;FR=.;FRO=125;FSAF=44;FSAR=55;FSRF=53;FSRR=72;FWDB=0.0400363;FXX=0.00444425;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.63;QD=6.50019;RBI=0.0400702;REFB=-0.00999871;REVB=0.00164676;RO=122;SAF=44;SAR=53;SRF=53;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0194459;STB=0.511579;TYPE=snp;VARB=0.00905142;OID=.;OPOS=136597262;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:224:122:125:97:99:53:44:53:69:55:44:53:72 chr6 136597281 . A T 254.51 PASS AO=78;DP=196;FAO=78;FDP=196;FR=.;FRO=118;FSAF=38;FSAR=40;FSRF=54;FSRR=64;FWDB=0.000958548;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.177;QD=5.19406;RBI=0.0227922;REFB=-0.0032969;REVB=-0.022772;RO=117;SAF=38;SAR=40;SRF=53;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0365689;STB=0.517815;TYPE=snp;VARB=0.0097704;OID=.;OPOS=136597281;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:196:117:118:78:78:40:38:53:64:40:38:54:64 chr6 136597288 . A C 198.9 PASS AO=67;DP=182;FAO=67;FDP=182;FR=.;FRO=115;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=49;FSRR=66;FWDB=-0.00427074;FXX=0.00546418;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.602;QD=4.37144;RBI=0.0158367;REFB=-0.000222689;REVB=-0.01525;RO=112;SAF=33;SAR=34;SRF=47;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0806856;STB=0.542037;TYPE=snp;VARB=0.00241173;OID=.;OPOS=136597288;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:182:112:115:67:67:34:33:47:65:34:33:49:66 chr6 136599393 . G C 278.48 PASS AO=62;DP=121;FAO=62;FDP=121;FR=.;FRO=59;FSAF=29;FSAR=33;FSRF=40;FSRR=19;FWDB=-0.00350467;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.361;QD=9.20592;RBI=0.00395277;REFB=-0.0258373;REVB=0.00182803;RO=59;SAF=29;SAR=33;SRF=40;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184879;STB=0.601553;TYPE=snp;VARB=0.0152106;OID=.;OPOS=136599393;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:59:59:62:62:33:29:40:19:33:29:40:19 chr6 136599404 . T C 65.57 PASS AO=36;DP=140;FAO=36;FDP=140;FR=.;FRO=104;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=63;FSRR=41;FWDB=-0.0341861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.534;QD=1.87336;RBI=0.0367685;REFB=-0.0154274;REVB=0.0135365;RO=104;SAF=13;SAR=23;SRF=63;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.297511;STB=0.677424;TYPE=snp;VARB=0.0276717;OID=.;OPOS=136599404;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:140:140:104:104:36:36:23:13:63:41:23:13:63:41 chr6 136599822 . C G 205.07 PASS AO=89;DP=293;FAO=93;FDP=305;FR=.;FRO=212;FSAF=39;FSAR=54;FSRF=92;FSRR=120;FWDB=-0.0282849;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.936;QD=2.68948;RBI=0.0296596;REFB=-0.0184254;REVB=-0.00892491;RO=204;SAF=36;SAR=53;SRF=86;SRR=118;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0211814;STB=0.510387;TYPE=snp;VARB=0.0536053;OID=.;OPOS=136599822;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:293:305:204:212:89:93:53:36:86:118:54:39:92:120 chr6 136599836 . G A 190.2 PASS AO=86;DP=289;FAO=89;FDP=297;FR=.;FRO=208;FSAF=40;FSAR=49;FSRF=90;FSRR=118;FWDB=-0.0864145;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.507;QD=2.56162;RBI=0.0864246;REFB=-0.0202836;REVB=-0.00131906;RO=201;SAF=37;SAR=49;SRF=83;SRR=118;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.021364;STB=0.511875;TYPE=snp;VARB=0.0392063;OID=.;OPOS=136599836;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:289:297:201:208:86:89:49:37:83:118:49:40:90:118 chr6 136599842 . G A 200.59 PASS AO=90;DP=293;FAO=90;FDP=293;FR=.;FRO=203;FSAF=41;FSAR=49;FSRF=92;FSRR=111;FWDB=-0.0431328;FXX=0.00340124;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.9051;QD=2.73848;RBI=0.0433106;REFB=-0.00825538;REVB=-0.00392115;RO=201;SAF=41;SAR=49;SRF=91;SRR=110;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00339692;STB=0.501644;TYPE=snp;VARB=0.0149264;OID=.;OPOS=136599842;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:293:293:201:203:90:90:49:41:91:110:49:41:92:111 chr6 136664990 . AT A 190.84 PASS AO=25;DP=89;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.229989;FXX=0.0681741;HRUN=8;LEN=1;MLLD=5.07273;QD=9.30925;RBI=0.372052;REFB=0.0400661;REVB=0.292452;RO=27;SAF=15;SAR=10;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177543;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.000457048;OID=.;OPOS=136664991;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:25:68:82:82:0:38:44:0:0:16:27:15:10:11:16 chr6 136682172 . G A 92.83 PASS AO=9;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.053722;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.573;QD=37.1326;RBI=0.106587;REFB=0;REVB=0.0920583;RO=0;SAF=7;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00648932;OID=.;OPOS=136682172;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:9:10:2:7:0:0:2:8:0:0 chr6 136977568 . T C 70.62 PASS AO=24;DP=71;FAO=24;FDP=71;FR=.;FRO=47;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=34;FWDB=-0.0128302;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.458;QD=3.9786;RBI=0.0131709;REFB=0.0049183;REVB=0.0029761;RO=46;SAF=7;SAR=17;SRF=13;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012439;STB=0.512185;TYPE=snp;VARB=-0.0091315;OID=.;OPOS=136977568;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:71:71:46:47:24:24:17:7:13:33:17:7:13:34 chr6 137321402 . G C 320.77 PASS AO=62;DP=107;FAO=62;FDP=106;FR=.;FRO=44;FSAF=33;FSAR=29;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=-0.0175468;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.1754;QD=12.1045;RBI=0.0309865;REFB=-0.0331016;REVB=0.0255396;RO=44;SAF=33;SAR=29;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0418957;STB=0.522845;TYPE=snp;VARB=0.0242996;OID=.;OPOS=137321402;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:106:44:44:62:62:29:33:21:23:29:33:21:23 chr6 137323213 . G A 221.71 PASS AO=59;DP=139;FAO=61;FDP=141;FR=.;FRO=80;FSAF=35;FSAR=26;FSRF=49;FSRR=31;FWDB=0.00817849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.883;QD=6.28958;RBI=0.00943308;REFB=-0.0182823;REVB=-0.00470057;RO=79;SAF=34;SAR=25;SRF=48;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0329888;STB=0.522606;TYPE=snp;VARB=0.0260437;OID=.;OPOS=137323213;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:141:79:80:59:61:25:34:48:31:26:35:49:31 chr6 137325847 . C T 981.06 PASS AO=67;DP=117;FAO=111;FDP=111;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=55;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0591954;FXX=0.0176975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.3133;QD=35.3536;RBI=0.0632594;REFB=-0.00861602;REVB=0.0223083;RO=1;SAF=11;SAR=56;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00836606;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000516313;OID=.;OPOS=137325847;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:114:111:1:0:67:111:56:11:0:1:56:55:0:0 chr6 137519588 . A C 287.77 PASS AO=89;DP=226;FAO=90;FDP=228;FR=.;FRO=138;FSAF=52;FSAR=38;FSRF=72;FSRR=66;FWDB=-0.0176595;FXX=0.00436662;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9716;QD=5.04864;RBI=0.038938;REFB=-0.0219765;REVB=-0.0347031;RO=134;SAF=52;SAR=37;SRF=70;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0672328;STB=0.53438;TYPE=snp;VARB=0.0309375;OID=.;OPOS=137519588;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:226:228:134:138:89:90:37:52:70:64:38:52:72:66 chr6 137536455 . G A 220.88 PASS AO=57;DP=136;FAO=63;FDP=143;FR=.;FRO=80;FSAF=24;FSAR=39;FSRF=49;FSRR=31;FWDB=0.0027195;FXX=0.0137922;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.296;QD=6.17847;RBI=0.00453839;REFB=-0.00679714;REVB=-0.00363337;RO=78;SAF=24;SAR=33;SRF=48;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198385;STB=0.628853;TYPE=snp;VARB=0.00781411;OID=.;OPOS=137536455;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:143:78:80:57:63:33:24:48:30:39:24:49:31 chr6 138413269 . A G 256.08 PASS AO=65;DP=147;FAO=67;FDP=150;FR=.;FRO=83;FSAF=29;FSAR=38;FSRF=27;FSRR=56;FWDB=0.0178369;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.4647;QD=6.82872;RBI=0.0251248;REFB=0.00241539;REVB=0.0176946;RO=82;SAF=29;SAR=36;SRF=27;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120389;STB=0.561581;TYPE=snp;VARB=-0.00198118;OID=.;OPOS=138413269;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:150:82:83:65:67:36:29:27:55:38:29:27:56 chr6 138413333 . G C 409.92 PASS AO=61;DP=129;FAO=62;FDP=129;FR=.,HEALED;FRO=47;FSAF=19;FSAR=43;FSRF=28;FSRR=19;FWDB=0.0253046;FXX=0.015266;HRUN=3;LEN=1;MLLD=172.152;QD=12.7106;RBI=0.0265571;REFB=-0.00956479;REVB=-0.00805962;RO=41;SAF=18;SAR=43;SRF=27;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280987;STB=0.631716;TYPE=snp;VARB=0.00828897;OID=.;OPOS=138413333;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:129:41:47:61:62:43:18:27:14:43:19:28:19 chr6 138584685 . T G 189.24 PASS AO=66;DP=188;FAO=67;FDP=189;FR=.;FRO=122;FSAF=26;FSAR=41;FSRF=57;FSRR=65;FWDB=-0.0270185;FXX=0.00526288;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.133;QD=4.00505;RBI=0.0285979;REFB=-0.00139843;REVB=-0.00937228;RO=120;SAF=26;SAR=40;SRF=57;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0937169;STB=0.552509;TYPE=snp;VARB=0.00169616;OID=.;OPOS=138584685;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:189:120:122:66:67:40:26:57:63:41:26:57:65 chr6 138754323 . A G 347.16 PASS AO=85;DP=180;FAO=85;FDP=179;FR=.;FRO=94;FSAF=36;FSAR=49;FSRF=33;FSRR=61;FWDB=-0.00601099;FXX=0.00555525;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.361;QD=7.75766;RBI=0.0063947;REFB=-0.00162411;REVB=-0.00218178;RO=94;SAF=36;SAR=49;SRF=33;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0714781;STB=0.539427;TYPE=snp;VARB=0.00176524;OID=.;OPOS=138754323;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:179:94:94:85:85:49:36:33:61:49:36:33:61 chr6 139013188 . C T 424.74 PASS AO=94;DP=201;FAO=103;FDP=212;FR=.;FRO=109;FSAF=54;FSAR=49;FSRF=55;FSRR=54;FWDB=0.00882302;FXX=0.0139528;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.156;QD=8.0139;RBI=0.0214231;REFB=-0.0140041;REVB=0.0195219;RO=106;SAF=51;SAR=43;SRF=52;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0499706;STB=0.510133;TYPE=snp;VARB=0.0143083;OID=.;OPOS=139013188;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:212:106:109:94:103:43:51:52:54:49:54:55:54 chr6 139017780 . G A 111.17 PASS AO=45;DP=186;FAO=47;FDP=166;FR=.;FRO=119;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=60;FSRR=59;FWDB=0.038041;FXX=0.112293;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.026;QD=2.67885;RBI=0.0383751;REFB=-0.00676033;REVB=-0.00505322;RO=86;SAF=18;SAR=27;SRF=34;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00553747;STB=0.588106;TYPE=snp;VARB=0.0151477;OID=.;OPOS=139017780;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:166:86:119:45:47:27:18:34:52:29:18:60:59 chr6 139017815 . A G 200.55 PASS AO=64;DP=165;FAO=65;FDP=170;FR=.;FRO=105;FSAF=35;FSAR=30;FSRF=49;FSRR=56;FWDB=0.000364073;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.815;QD=4.71874;RBI=0.00946493;REFB=-0.0110033;REVB=-0.00945793;RO=101;SAF=35;SAR=29;SRF=44;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120115;STB=0.54429;TYPE=snp;VARB=0.0189196;OID=.;OPOS=139017815;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:170:101:105:64:65:29:35:44:57:30:35:49:56 chr6 139113869 . T TTAAC 205.53 PASS AO=56;DP=141;FAO=59;FDP=141;FR=.;FRO=82;FSAF=36;FSAR=23;FSRF=50;FSRR=32;FWDB=0.0021445;FXX=0;HRUN=2;LEN=4;MLLD=241.398;QD=5.83068;RBI=0.00407075;REFB=-0.00544237;REVB=0.00346008;RO=83;SAF=36;SAR=20;SRF=50;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0458999;STB=0.500253;TYPE=ins;VARB=0.00729176;OID=.;OPOS=139113870;OREF=-;OALT=TAAC;OMAPALT=TTAAC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:56:141:59:141:82:36:23:50:32:99:83:36:20:50:33 chr6 139180200 . T C 193.86 PASS AO=58;DP=145;FAO=58;FDP=144;FR=.;FRO=86;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=26;FSRR=60;FWDB=-0.0106449;FXX=0.00689608;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.5077;QD=5.38499;RBI=0.0212331;REFB=-0.00319151;REVB=-0.0183721;RO=86;SAF=26;SAR=32;SRF=26;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160171;STB=0.589714;TYPE=snp;VARB=0.00449764;OID=.;OPOS=139180200;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:144:86:86:58:58:32:26:26:60:32:26:26:60 chr6 139229872 . C T 890.45 PASS AO=203;DP=399;FAO=205;FDP=399;FR=.;FRO=194;FSAF=89;FSAR=116;FSRF=83;FSRR=111;FWDB=-0.00791904;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.4131;QD=8.92683;RBI=0.0321317;REFB=-0.0117214;REVB=-0.0311406;RO=191;SAF=87;SAR=116;SRF=83;SRR=108;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00541693;STB=0.503125;TYPE=snp;VARB=0.0168157;OID=.;OPOS=139229872;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:399:399:191:194:203:205:116:87:83:108:116:89:83:111 chr6 139355580 . A T 336.59 PASS AO=76;DP=152;FAO=77;FDP=152;FR=.;FRO=75;FSAF=32;FSAR=45;FSRF=34;FSRR=41;FWDB=-0.0119143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.613;QD=8.8575;RBI=0.0131188;REFB=0.000864145;REVB=0.005491;RO=75;SAF=32;SAR=44;SRF=34;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0297029;STB=0.519044;TYPE=snp;VARB=-0.000791684;OID=.;OPOS=139355580;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:152:75:75:76:77:44:32:34:41:45:32:34:41 chr6 139487836 . T C 22.29 PASS AO=9;DP=36;FAO=9;FDP=36;FR=.;FRO=27;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=-0.0358014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.956;QD=2.47615;RBI=0.0366523;REFB=-0.00439319;REVB=-0.00785183;RO=27;SAF=4;SAR=5;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136882;STB=0.585805;TYPE=snp;VARB=0.0106052;OID=.;OPOS=139487836;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:36:36:27:27:9:9:5:4:9:18:5:4:9:18 chr6 139693582 . TAAA T 203.76 PASS AO=75;DP=193;FAO=80;FDP=178;FR=.;FRO=98;FSAF=16;FSAR=64;FSRF=31;FSRR=67;FWDB=-0.00640338;FXX=0.08247;HRUN=5;LEN=3;MLLD=43.5952;QD=4.57878;RBI=0.00853163;REFB=0.0066692;REVB=-0.00563786;RO=88;SAF=14;SAR=61;SRF=29;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195487;STB=0.589318;TYPE=del;VARB=-0.0089516;OID=.;OPOS=139693583;OREF=AAA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:75:176:80:178:98:16:64:31:67:99:88:14:61:29:59 chr6 141004964 . G GT,T 2244.66 PASS AO=166,67;DP=256;FAO=208,45;FDP=253;FR=.;FRO=0;FSAF=62,27;FSAR=146,18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0757651,-0.0182884;FXX=0.00784283;HRUN=0,2;LEN=1,1;MLLD=33.5921,24.7914;QD=35.4887;RBI=0.079163,0.085465;REFB=0,0;REVB=0.0229441,0.0834853;RO=7;SAF=27,49;SAR=139,18;SRF=6;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0913859,-0.0289388;STB=0.5,0.5;TYPE=ins,snp;VARB=0.00121526,-0.0107787;OID=.,.;OPOS=141004965,141004964;OREF=-,G;OALT=T,T;OMAPALT=GT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:23:256:253:7:0:166,67:208,45:139,18:27,49:6:1:146,18:62,27:0:0 chr6 141807392 . G A 303.62 PASS AO=77;DP=166;FAO=77;FDP=166;FR=.;FRO=89;FSAF=30;FSAR=47;FSRF=54;FSRR=35;FWDB=0.0107574;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.834;QD=7.31619;RBI=0.011652;REFB=-0.014383;REVB=0.00447743;RO=89;SAF=30;SAR=47;SRF=54;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.209518;STB=0.616075;TYPE=snp;VARB=0.00857714;OID=.;OPOS=141807392;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:166:89:89:77:77:47:30:54:35:47:30:54:35 chr6 142718801 . G A 1129.57 PASS AO=125;DP=130;FAO=125;FDP=130;FR=.;FRO=5;FSAF=62;FSAR=63;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.0087007;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.847;QD=34.756;RBI=0.0167421;REFB=0.0205474;REVB=0.0143037;RO=5;SAF=62;SAR=63;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0221886;STB=0.511689;TYPE=snp;VARB=5.89606e-06;OID=.;OPOS=142718801;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:130:130:5:5:125:125:63:62:4:1:63:62:4:1 chr6 142758631 . A G 1096.77 PASS AO=115;DP=115;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0590859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.3517;QD=38.1484;RBI=0.0754185;REFB=0;REVB=-0.0468701;RO=0;SAF=40;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.4984e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.04892e-05;OID=.;OPOS=142758631;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:115:115:0:0:115:115:75:40:0:0:75:40:0:0 chr6 143074700 . T C 539.21 PASS AO=100;DP=163;FAO=100;FDP=162;FR=.;FRO=62;FSAF=46;FSAR=54;FSRF=24;FSRR=38;FWDB=-0.0233225;FXX=0.00613459;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.347;QD=13.3138;RBI=0.0242682;REFB=-0.0432503;REVB=0.00670882;RO=61;SAF=46;SAR=54;SRF=23;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0588404;STB=0.528202;TYPE=snp;VARB=0.0267802;OID=.;OPOS=143074700;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:162:61:62:100:100:54:46:23:38:54:46:24:38 chr6 143074759 . AG A 103.81 PASS AO=61;DP=150;FAO=71;FDP=137;FR=.;FRO=66;FSAF=22;FSAR=49;FSRF=38;FSRR=28;FWDB=-0.035857;FXX=0.0143875;HRUN=4;LEN=1;MLLD=11.3571;QD=3.03107;RBI=0.0768671;REFB=-0.135015;REVB=-0.0679914;RO=54;SAF=19;SAR=42;SRF=31;SRR=23;SSEN=0.397849;SSEP=0;SSSB=-0.235282;STB=0.634402;TYPE=del;VARB=0.0982871;OID=.;OPOS=143074760;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:61:133:71:137:66:22:49:38:28:99:54:19:42:31:23 chr6 143090734 . T C 296.34 PASS AO=72;DP=146;FAO=71;FDP=146;FR=.;FRO=75;FSAF=35;FSAR=36;FSRF=9;FSRR=66;FWDB=-0.0193978;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9034;QD=8.11882;RBI=0.0423227;REFB=-0.0120101;REVB=-0.0376156;RO=74;SAF=36;SAR=36;SRF=8;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.365406;STB=0.69262;TYPE=snp;VARB=0.0130908;OID=.;OPOS=143090734;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:74:75:72:71:36:36:8:66:36:35:9:66 chr6 143091263 . A G 925.93 PASS AO=97;DP=99;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00207028;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.079;QD=37.7929;RBI=0.00864343;REFB=-0.0715977;REVB=0.00839183;RO=1;SAF=56;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0083945;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.17052e-06;OID=.;OPOS=143091263;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:99:98:1:0:97:98:41:56:1:0:41:57:0:0 chr6 143091769 . G A 94.4 PASS AO=23;DP=53;FAO=24;FDP=55;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.0276719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.716;QD=6.86538;RBI=0.0285159;REFB=-0.0148362;REVB=-0.00688656;RO=30;SAF=10;SAR=13;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16315;STB=0.586395;TYPE=snp;VARB=0.0209167;OID=.;OPOS=143091769;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:53:55:30:31:23:24:13:10:18:12:13:11:19:12 chr6 143745915 . A G 1438.22 PASS AO=158;DP=162;FAO=158;FDP=162;FR=.;FRO=4;FSAF=54;FSAR=104;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0484145;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.0728;QD=35.5116;RBI=0.0497924;REFB=-0.0858523;REVB=-0.0116328;RO=2;SAF=54;SAR=104;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00417575;STB=0.511121;TYPE=snp;VARB=0.00349487;OID=.;OPOS=143745915;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:162:162:2:4:158:158:104:54:1:1:104:54:3:1 chr6 144081609 . C T 1650.71 PASS AO=178;DP=181;FAO=178;FDP=178;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173401;FXX=0.0165737;HRUN=3;LEN=1;MLLD=117.764;QD=37.0947;RBI=0.0174619;REFB=-0.01136;REVB=-0.00205854;RO=2;SAF=68;SAR=110;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00264087;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.03962e-05;OID=.;OPOS=144081609;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:181:178:2:0:178:178:110:68:1:1:110:68:0:0 chr6 144151314 . T A 95.6 PASS AO=24;DP=50;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=9;FSRR=24;FWDB=0.0191546;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=28.96;QD=6.37322;RBI=0.0248326;REFB=-0.0411682;REVB=-0.0158038;RO=26;SAF=10;SAR=14;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144451;STB=0.559303;TYPE=snp;VARB=0.0155123;OID=.;OPOS=144151314;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:50:60:26:33:24:27:14:10:7:19:17:10:9:24 chr6 144508698 . G A 162.04 PASS AO=24;DP=32;FAO=24;FDP=32;FR=.;FRO=8;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.00539609;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=159.752;QD=20.2552;RBI=0.00541831;REFB=-0.0123793;REVB=-0.000490184;RO=8;SAF=12;SAR=12;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00530937;OID=.;OPOS=144508698;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:32:32:8:8:24:24:12:12:4:4:12:12:4:4 chr6 144509510 . T C 308.11 PASS AO=94;DP=229;FAO=93;FDP=229;FR=.;FRO=136;FSAF=41;FSAR=52;FSRF=92;FSRR=44;FWDB=-0.0105965;FXX=0.00434764;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.5378;QD=5.38179;RBI=0.0116422;REFB=-0.00498962;REVB=0.00482247;RO=135;SAF=42;SAR=52;SRF=91;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23639;STB=0.637274;TYPE=snp;VARB=0.00776265;OID=.;OPOS=144509510;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:229:229:135:136:94:93:52:42:91:44:52:41:92:44 chr6 144537771 . T C 181.78 PASS AO=49;DP=117;FAO=51;FDP=122;FR=.;FRO=71;FSAF=7;FSAR=44;FSRF=9;FSRR=62;FWDB=-0.0205707;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=132.552;QD=5.96006;RBI=0.024342;REFB=0.00130738;REVB=0.0130146;RO=67;SAF=7;SAR=42;SRF=8;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0514712;STB=0.513135;TYPE=snp;VARB=-0.00237092;OID=.;OPOS=144537771;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:122:67:71:49:51:42:7:8:59:44:7:9:62 chr6 144869849 . G A 334.12 PASS AO=88;DP=195;FAO=88;FDP=195;FR=.;FRO=107;FSAF=43;FSAR=45;FSRF=54;FSRR=53;FWDB=-0.014376;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.697;QD=6.85374;RBI=0.017225;REFB=-0.0120858;REVB=0.00948843;RO=107;SAF=43;SAR=45;SRF=54;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0158563;STB=0.508799;TYPE=snp;VARB=0.0136735;OID=.;OPOS=144869849;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:195:107:107:88:88:45:43:54:53:45:43:54:53 chr6 144904655 . G A 503.87 PASS AO=141;DP=323;FAO=141;FDP=325;FR=.;FRO=184;FSAF=61;FSAR=80;FSRF=91;FSRR=93;FWDB=0.00125476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.746;QD=6.20147;RBI=0.0348258;REFB=-0.00905255;REVB=0.0348031;RO=181;SAF=61;SAR=80;SRF=90;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0659859;STB=0.535371;TYPE=snp;VARB=0.0142219;OID=.;OPOS=144904655;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:323:325:181:184:141:141:80:61:90:91:80:61:91:93 chr6 145051594 . G A 241.41 PASS AO=53;DP=108;FAO=54;FDP=107;FR=.;FRO=53;FSAF=13;FSAR=41;FSRF=21;FSRR=32;FWDB=-0.0246078;FXX=0.0272702;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.977;QD=9.02467;RBI=0.0246385;REFB=-0.00160802;REVB=0.00122955;RO=49;SAF=13;SAR=40;SRF=19;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152307;STB=0.594926;TYPE=snp;VARB=0.000718121;OID=.;OPOS=145051594;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:107:49:53:53:54:40:13:19:30:41:13:21:32 chr6 145822992 . A G 1273.61 PASS AO=135;DP=136;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010567;FXX=0.0073524;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.1587;QD=37.7365;RBI=0.058733;REFB=-0.0443509;REVB=-0.0577746;RO=1;SAF=48;SAR=87;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00979983;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00010845;OID=.;OPOS=145822992;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:136:135:1:0:135:135:87:48:1:0:87:48:0:0 chr6 145823642 . G A 1159.89 PASS AO=121;DP=122;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0421925;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.984;QD=38.0291;RBI=0.0434675;REFB=0;REVB=-0.0104508;RO=0;SAF=56;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.98565e-05;OID=.;OPOS=145823642;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:122:122:0:0:121:122:65:56:0:0:66:56:0:0 chr6 146125793 . A T 472.83 PASS AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0477731;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=66.2673;QD=35.6855;RBI=0.0493474;REFB=-0.122303;REVB=0.0123651;RO=1;SAF=37;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125628;STB=0.506664;TYPE=snp;VARB=0.00176271;OID=.;OPOS=146125793;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:53:53:1:1:52:52:15:37:1:0:15:37:1:0 chr6 146126419 . C T 639.75 PASS AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00220056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.188;QD=38.1941;RBI=0.0124113;REFB=0;REVB=-0.0122147;RO=0;SAF=45;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.84864e-05;OID=.;OPOS=146126419;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:67:67:0:0:67:67:22:45:0:0:22:45:0:0 chr6 146207563 . A G 1546.05 PASS AO=161;DP=161;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=114;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0510578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.934;QD=38.174;RBI=0.072222;REFB=0;REVB=0.0510796;RO=0;SAF=47;SAR=114;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.93928e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000126732;OID=.;OPOS=146207563;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:161:162:0:0:161:162:114:47:0:0:114:48:0:0 chr6 146234644 . G A 182.43 PASS AO=50;DP=117;FAO=50;FDP=117;FR=.;FRO=67;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=30;FSRR=37;FWDB=-0.0310236;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.9852;QD=6.23693;RBI=0.0312404;REFB=-0.0131566;REVB=-0.00367451;RO=66;SAF=20;SAR=30;SRF=30;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0568487;STB=0.528158;TYPE=snp;VARB=0.0207175;OID=.;OPOS=146234644;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:66:67:50:50:30:20:30:36:30:20:30:37 chr6 146755140 . G A 1189.91 PASS AO=114;DP=119;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.125774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.0327;QD=38.0772;RBI=0.125978;REFB=0;REVB=0.00717189;RO=0;SAF=36;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.73698e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000350916;OID=.;OPOS=146755140;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:119:125:0:0:114:125:78:36:0:0:82:43:0:0 chr6 146755324 . T C 219.59 PASS AO=22;DP=22;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0420603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.6307;QD=36.5984;RBI=0.0492413;REFB=0;REVB=0.0256055;RO=0;SAF=6;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17051e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.35545e-05;OID=.;OPOS=146755324;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:22:24:0:0:22:24:16:6:0:0:18:6:0:0 chr6 146755515 . T G 70.67 PASS AO=7;DP=7;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0180364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.229;QD=35.3334;RBI=0.0418225;REFB=0;REVB=0.0377334;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000559327;OID=.;OPOS=146755515;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:8:0:0:7:8:4:3:0:0:5:3:0:0 chr6 146755560 . T G 36.33 PASS AO=8;DP=19;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.00646222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.5268;QD=7.64831;RBI=0.0173762;REFB=-0.0463886;REVB=-0.0161298;RO=11;SAF=5;SAR=3;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166061;STB=0.599747;TYPE=snp;VARB=0.028395;OID=.;OPOS=146755560;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:19:19:11:11:8:8:3:5:5:6:3:5:5:6 chr6 146755842 . C A 459.03 PASS AO=59;DP=70;FAO=59;FDP=70;FR=.;FRO=11;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=10;FWDB=0.0452499;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=167.531;QD=26.2304;RBI=0.0466423;REFB=-0.141913;REVB=0.0113119;RO=10;SAF=25;SAR=34;SRF=1;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0915307;STB=0.554418;TYPE=snp;VARB=0.00175776;OID=.;OPOS=146755842;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:70:70:10:11:59:59:34:25:1:9:34:25:1:10 chr6 146993445 . T C 295.28 PASS AO=71;DP=148;FAO=71;FDP=147;FR=.;FRO=76;FSAF=28;FSAR=43;FSRF=34;FSRR=42;FWDB=-0.00581579;FXX=0.0067563;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.2772;QD=8.03472;RBI=0.0347011;REFB=0.00014166;REVB=0.0342103;RO=76;SAF=28;SAR=43;SRF=34;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0512212;STB=0.528331;TYPE=snp;VARB=0.000105104;OID=.;OPOS=146993445;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:147:76:76:71:71:43:28:34:42:43:28:34:42 chr6 147049868 . G A 286.92 PASS AO=65;DP=135;FAO=67;FDP=135;FR=.;FRO=68;FSAF=18;FSAR=49;FSRF=5;FSRR=63;FWDB=0.0284857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.271;QD=8.50133;RBI=0.033458;REFB=-0.00505992;REVB=-0.0175501;RO=68;SAF=16;SAR=49;SRF=5;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249049;STB=0.641391;TYPE=snp;VARB=0.00506981;OID=.;OPOS=147049868;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:68:68:65:67:49:16:5:63:49:18:5:63 chr6 147106841 . A G 220.86 PASS AO=53;DP=110;FAO=53;FDP=110;FR=.;FRO=57;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=22;FSRR=35;FWDB=0.0198692;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=43.2721;QD=8.03127;RBI=0.0234536;REFB=-0.00571913;REVB=-0.0124615;RO=53;SAF=27;SAR=26;SRF=20;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119308;STB=0.563824;TYPE=snp;VARB=0.00927784;OID=.;OPOS=147106841;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:53:57:53:53:26:27:20:33:26:27:22:35 chr6 147136212 . A T 373.11 PASS AO=108;DP=257;FAO=108;FDP=257;FR=.;FRO=149;FSAF=74;FSAR=34;FSRF=81;FSRR=68;FWDB=0.0145162;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.073;QD=5.80715;RBI=0.0157871;REFB=-0.00539888;REVB=0.00620576;RO=149;SAF=74;SAR=34;SRF=81;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158677;STB=0.588842;TYPE=snp;VARB=0.0110671;OID=.;OPOS=147136212;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:257:257:149:149:108:108:34:74:81:68:34:74:81:68 chr6 147136244 . A G 328.28 PASS AO=96;DP=247;FAO=101;FDP=247;FR=.;FRO=146;FSAF=53;FSAR=48;FSRF=76;FSRR=70;FWDB=-0.000822293;FXX=0.0040321;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.4209;QD=5.31622;RBI=0.00729977;REFB=-0.0197904;REVB=-0.00725331;RO=148;SAF=49;SAR=47;SRF=78;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.017943;STB=0.50249;TYPE=snp;VARB=0.0720244;OID=.;OPOS=147136244;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:247:247:148:146:96:101:47:49:78:70:48:53:76:70 chr6 147635385 . C G 1657.76 PASS AO=174;DP=176;FAO=175;FDP=175;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00250147;FXX=0.0056815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.683;QD=37.8917;RBI=0.0333547;REFB=-0.0421495;REVB=0.0332608;RO=0;SAF=66;SAR=108;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.11862e-05;OID=.;OPOS=147635385;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:176:175:0:0:174:175:108:66:0:0:109:66:0:0 chr6 147635413 . A G 1467 PASS AO=159;DP=162;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029369;FXX=0.0185174;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.939;QD=36.9057;RBI=0.0294047;REFB=-0.0551863;REVB=0.00144791;RO=2;SAF=58;SAR=101;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00932792;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.68213e-05;OID=.;OPOS=147635413;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:162:159:2:0:159:159:101:58:0:2:101:58:0:0 chr6 147635709 . A G 143.2 PASS AO=41;DP=101;FAO=41;FDP=101;FR=.;FRO=60;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=33;FSRR=27;FWDB=0.00494241;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.341;QD=5.67136;RBI=0.0132109;REFB=-0.00325024;REVB=0.0122516;RO=59;SAF=20;SAR=21;SRF=32;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0569105;STB=0.536885;TYPE=snp;VARB=0.00610187;OID=.;OPOS=147635709;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:59:60:41:41:21:20:32:27:21:20:33:27 chr6 147680359 . A G 1989.89 PASS AO=207;DP=208;FAO=207;FDP=207;FR=.;FRO=0;FSAF=116;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00282818;FXX=0.00480746;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.847;QD=38.4521;RBI=0.0199992;REFB=0;REVB=0.0197983;RO=0;SAF=116;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.38333e-05;OID=.;OPOS=147680359;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:94:208:207:0:0:207:207:91:116:0:0:91:116:0:0 chr6 148792617 . A G 81.04 PASS AO=29;DP=90;FAO=36;FDP=104;FR=.;FRO=68;FSAF=7;FSAR=29;FSRF=9;FSRR=59;FWDB=-0.0091721;FXX=0.0095229;HRUN=2;LEN=1;MLLD=35.6801;QD=3.11693;RBI=0.0296823;REFB=-0.0369477;REVB=-0.0282297;RO=61;SAF=6;SAR=23;SRF=10;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0807693;STB=0.570335;TYPE=snp;VARB=0.0840549;OID=.;OPOS=148792617;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:90:104:61:68:29:36:23:6:10:51:29:7:9:59 chr6 148865257 . A G 116.47 PASS AO=22;DP=42;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.0284114;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.576;QD=11.0919;RBI=0.0289754;REFB=-0.0163227;REVB=0.0056892;RO=19;SAF=15;SAR=7;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.093987;STB=0.559387;TYPE=snp;VARB=0.0118932;OID=.;OPOS=148865257;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:42:42:19:19:22:23:7:15:11:8:7:16:11:8 chr6 149722040 . A G 846.55 PASS AO=91;DP=92;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0211412;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.127;QD=37.2111;RBI=0.0257004;REFB=-0.0503315;REVB=-0.0146138;RO=1;SAF=39;SAR=52;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119989;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000127036;OID=.;OPOS=149722040;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:92:91:1:0:91:91:52:39:1:0:52:39:0:0 chr6 149771838 . GC G 53.75 PASS AO=30;DP=57;FAO=31;FDP=60;FR=.;FRO=29;FSAF=28;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.0803579;FXX=0.0769112;HRUN=5;LEN=1;MLLD=9.66344;QD=3.58314;RBI=0.083361;REFB=-0.116167;REVB=0.0221734;RO=29;SAF=28;SAR=2;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0.311111;SSSB=0.660176;STB=0.823276;TYPE=del;VARB=0.101743;OID=.;OPOS=149771839;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:30:63:31:60:29:28:3:12:17:52:29:28:2:11:18 chr6 150211123 . A T 1318.56 PASS AO=135;DP=135;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0290506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.729;QD=38.2192;RBI=0.0299736;REFB=0;REVB=0.00738097;RO=0;SAF=65;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.62647e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.10147e-05;OID=.;OPOS=150211123;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:135:138:0:0:135:138:70:65:0:0:71:67:0:0 chr6 150267527 . A C 257.26 PASS AO=67;DP=147;FAO=68;FDP=153;FR=.;FRO=85;FSAF=49;FSAR=19;FSRF=46;FSRR=39;FWDB=-0.000698938;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.0647;QD=6.72561;RBI=0.0258717;REFB=-0.0232263;REVB=0.0258623;RO=79;SAF=49;SAR=18;SRF=46;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167743;STB=0.611543;TYPE=snp;VARB=0.0304262;OID=.;OPOS=150267527;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:153:79:85:67:68:18:49:46:33:19:49:46:39 chr6 150342232 . G A 3285.29 PASS AO=347;DP=350;FAO=348;FDP=348;FR=.;FRO=0;FSAF=181;FSAR=167;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00475358;FXX=0.00854676;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.0418;QD=37.762;RBI=0.0223058;REFB=-0.0190623;REVB=0.0217934;RO=2;SAF=180;SAR=167;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00527144;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.58209e-05;OID=.;OPOS=150342232;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:350:348:2:0:347:348:167:180:2:0:167:181:0:0 chr6 150346531 . CT C,CC 191.24 PASS AO=5,13;DP=20;FAO=3,17;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=3,9;FSAR=0,8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0289869,0.0384109;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=179.811,192.383;QD=38.2479;RBI=0.049506,0.0542611;REFB=0,0;REVB=0.0401323,0.0383258;RO=0;SAF=5,5;SAR=0,8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.60098e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.00296119,0.0011616;OID=.,.;OPOS=150346532,150346532;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:5,13:19:3,17:20:0:3,9:0,8:0:0:7:0:5,5:0,8:0:0 chr6 150385730 . T G 2141.8 PASS AO=223;DP=223;FAO=223;FDP=223;FR=.;FRO=0;FSAF=175;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0183236;FXX=0.0132737;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.33;QD=38.4179;RBI=0.0622184;REFB=0;REVB=0.059459;RO=0;SAF=175;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.58705e-05;OID=.;OPOS=150385730;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:223:223:0:0:223:223:48:175:0:0:48:175:0:0 chr6 150715308 . G A 257.45 PASS AO=55;DP=103;FAO=55;FDP=103;FR=.;FRO=48;FSAF=34;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=-0.00991754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.252;QD=9.99795;RBI=0.0105951;REFB=-0.00520302;REVB=0.00372811;RO=47;SAF=34;SAR=21;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146245;STB=0.585544;TYPE=snp;VARB=0.005147;OID=.;OPOS=150715308;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:47:48:55:55:21:34:21:26:21:34:21:27 chr6 150716696 . T C 458.38 PASS AO=46;DP=46;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0304652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.144;QD=38.1987;RBI=0.0426692;REFB=0;REVB=0.0298753;RO=0;SAF=16;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.31553e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000143972;OID=.;OPOS=150716696;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:46:48:0:0:46:48:30:16:0:0:32:16:0:0 chr6 150722187 . T C 1232.68 PASS AO=128;DP=129;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=112;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0065966;FXX=0.00775134;HRUN=3;LEN=1;MLLD=202.489;QD=38.5214;RBI=0.0090446;REFB=0;REVB=0.00618786;RO=0;SAF=112;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.3173e-06;OID=.;OPOS=150722187;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:129:128:0:0:128:128:16:112:0:0:16:112:0:0 chr6 151152059 . G A 281.23 PASS AO=76;DP=173;FAO=76;FDP=173;FR=.;FRO=97;FSAF=32;FSAR=44;FSRF=30;FSRR=67;FWDB=0.0313673;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.7111;QD=6.50232;RBI=0.0321984;REFB=0.0114558;REVB=-0.00726842;RO=97;SAF=32;SAR=44;SRF=30;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118209;STB=0.565588;TYPE=snp;VARB=-0.0171421;OID=.;OPOS=151152059;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:173:97:97:76:76:44:32:30:67:44:32:30:67 chr6 151152257 . A G 407.96 PASS AO=110;DP=250;FAO=110;FDP=248;FR=.;FRO=138;FSAF=55;FSAR=55;FSRF=69;FSRR=69;FWDB=-0.0364892;FXX=0.0119517;HRUN=4;LEN=1;MLLD=262.348;QD=6.58004;RBI=0.0418525;REFB=-0.0164794;REVB=-0.020498;RO=135;SAF=55;SAR=55;SRF=69;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0110446;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0209018;OID=.;OPOS=151152257;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:250:248:135:138:110:110:55:55:69:66:55:55:69:69 chr6 151152656 . T C 1439.16 PASS AO=145;DP=145;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.858;QD=38.3776;RBI=0.0251462;REFB=0;REVB=0.0184973;RO=0;SAF=63;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.07944e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.74824e-05;OID=.;OPOS=151152656;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:145:150:0:0:145:150:82:63:0:0:83:67:0:0 chr6 151161018 . A G 138.91 PASS AO=40;DP=121;FAO=46;FDP=127;FR=.;FRO=81;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=44;FSRR=37;FWDB=0.00881182;FXX=0.0155027;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.197;QD=4.37525;RBI=0.0330457;REFB=-0.014077;REVB=-0.0318492;RO=78;SAF=20;SAR=20;SRF=44;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0734792;STB=0.51422;TYPE=snp;VARB=0.0229085;OID=.;OPOS=151161018;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:127:78:81:40:46:20:20:44:34:20:26:44:37 chr6 151198895 . T C 567.03 PASS AO=146;DP=314;FAO=146;FDP=314;FR=.;FRO=168;FSAF=66;FSAR=80;FSRF=82;FSRR=86;FWDB=0.0342078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.247;QD=7.2233;RBI=0.0361942;REFB=-0.0198372;REVB=-0.0118255;RO=166;SAF=66;SAR=80;SRF=82;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0406426;STB=0.519387;TYPE=snp;VARB=0.0226368;OID=.;OPOS=151198895;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:314:314:166:168:146:146:80:66:82:84:80:66:82:86 chr6 151260361 . C T 88.71 PASS AO=25;DP=63;FAO=25;FDP=63;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=35;FSRR=3;FWDB=-0.0108357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.603;QD=5.63254;RBI=0.0450452;REFB=-0.0121958;REVB=0.0437225;RO=38;SAF=14;SAR=11;SRF=35;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.420932;STB=0.733195;TYPE=snp;VARB=0.0126801;OID=.;OPOS=151260361;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:63:63:38:38:25:25:11:14:35:3:11:14:35:3 chr6 151336739 . C G 302.26 PASS AO=111;DP=320;FAO=112;FDP=317;FR=.;FRO=205;FSAF=69;FSAR=43;FSRF=110;FSRR=95;FWDB=0.0386141;FXX=0.00937471;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.9603;QD=3.81395;RBI=0.0428056;REFB=-0.0129637;REVB=0.0184736;RO=205;SAF=69;SAR=42;SRF=110;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100114;STB=0.552984;TYPE=snp;VARB=0.0282547;OID=.;OPOS=151336739;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:320:317:205:205:111:112:42:69:110:95:43:69:110:95 chr6 151362895 . CTTG C 462.63 PASS AO=60;DP=74;FAO=62;FDP=64;FR=.;FRO=2;FSAF=49;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00254265;FXX=0.238067;HRUN=2;LEN=3;MLLD=180.92;QD=28.9141;RBI=0.012394;REFB=-0.00465524;REVB=-0.0121304;RO=0;SAF=48;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509997;TYPE=del;VARB=-0.000243153;OID=.;OPOS=151362896;OREF=TTG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:60:63:62:64:2:49:13:2:0:28:0:48:12:0:0 chr6 151362942 . T C 1148.96 PASS AO=118;DP=121;FAO=127;FDP=131;FR=.;FRO=4;FSAF=81;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.01809;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.042;QD=35.0827;RBI=0.0229896;REFB=0.0160726;REVB=-0.0141872;RO=3;SAF=80;SAR=38;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0360234;STB=0.52083;TYPE=snp;VARB=-0.000292537;OID=.;OPOS=151362942;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:121:131:3:4:118:127:38:80:0:3:46:81:0:4 chr6 151422750 . A G 1506.49 PASS AO=161;DP=163;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00455381;FXX=0.00613459;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.813;QD=37.1972;RBI=0.0358172;REFB=-0.111009;REVB=0.0355265;RO=2;SAF=83;SAR=78;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0120428;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000340463;OID=.;OPOS=151422750;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:163:162:2:0:161:162:78:83:0:2:79:83:0:0 chr6 151627034 . A G 284.69 PASS AO=73;DP=162;FAO=74;FDP=163;FR=.;FRO=89;FSAF=27;FSAR=47;FSRF=37;FSRR=52;FWDB=0.0148242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.117;QD=6.98626;RBI=0.0203458;REFB=-0.0172016;REVB=0.0139354;RO=89;SAF=27;SAR=46;SRF=37;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0478833;STB=0.529476;TYPE=snp;VARB=0.0212606;OID=.;OPOS=151627034;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:163:89:89:73:74:46:27:37:52:47:27:37:52 chr6 151669875 . A G 178.36 PASS AO=39;DP=77;FAO=39;FDP=77;FR=.;FRO=38;FSAF=28;FSAR=11;FSRF=27;FSRR=11;FWDB=-0.0281994;FXX=0.0253133;HRUN=4;LEN=1;MLLD=175.154;QD=9.26526;RBI=0.0312044;REFB=-0.0261844;REVB=0.0133608;RO=38;SAF=28;SAR=11;SRF=27;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00810983;STB=0.504502;TYPE=snp;VARB=0.0247817;OID=.;OPOS=151669875;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:38:38:39:39:11:28:27:11:11:28:27:11 chr6 151670897 . T C 345.95 PASS AO=87;DP=187;FAO=87;FDP=186;FR=.;FRO=99;FSAF=40;FSAR=47;FSRF=55;FSRR=44;FWDB=-0.0271625;FXX=0.00534731;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.574;QD=7.43986;RBI=0.0274664;REFB=-0.0318432;REVB=-0.00407433;RO=99;SAF=40;SAR=47;SRF=55;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0920041;STB=0.550883;TYPE=snp;VARB=0.0325752;OID=.;OPOS=151670897;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:186:99:99:87:87:47:40:55:44:47:40:55:44 chr6 151672285 . A G 202.08 PASS AO=55;DP=131;FAO=56;FDP=132;FR=.;FRO=76;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=38;FSRR=38;FWDB=-0.0226546;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2665;QD=6.12366;RBI=0.0683814;REFB=0.00657171;REVB=-0.0645197;RO=76;SAF=25;SAR=30;SRF=38;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.047114;STB=0.5206;TYPE=snp;VARB=-0.0104981;OID=.;OPOS=151672285;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:132:76:76:55:56:30:25:38:38:30:26:38:38 chr6 151673074 . C G 260.56 PASS AO=63;DP=140;FAO=66;FDP=143;FR=.;FRO=77;FSAF=34;FSAR=32;FSRF=32;FSRR=45;FWDB=0.0193264;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.874;QD=7.28848;RBI=0.0484121;REFB=-0.0113515;REVB=-0.0443872;RO=77;SAF=34;SAR=29;SRF=32;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122087;STB=0.553472;TYPE=snp;VARB=0.013346;OID=.;OPOS=151673074;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:143:77:77:63:66:29:34:32:45:32:34:32:45 chr6 151673363 . AT A 22.56 PASS AO=30;DP=99;FAO=28;FDP=95;FR=.;FRO=67;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=38;FSRR=29;FWDB=-0.107731;FXX=0.0104156;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.276;QD=0.949751;RBI=0.147175;REFB=-0.102187;REVB=-0.100273;RO=57;SAF=15;SAR=15;SRF=30;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0297621;STB=0.596946;TYPE=del;VARB=0.152824;OID=.;OPOS=151673364;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:30:90:28:95:67:12:16:38:29:22:57:15:15:30:27 chr6 151674116 . T TGAG 212.49 PASS AO=48;DP=99;FAO=49;FDP=98;FR=.;FRO=49;FSAF=35;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=-0.00190241;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=3;MLLD=245.708;QD=8.67297;RBI=0.00329357;REFB=0.00456177;REVB=-0.00268858;RO=49;SAF=35;SAR=13;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.276147;STB=0.642572;TYPE=ins;VARB=-0.00429308;OID=.;OPOS=151674117;OREF=-;OALT=GAG;OMAPALT=TGAG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:48:99:49:98:49:35:14:22:27:99:49:35:13:22:27 chr6 151859314 . A G 177.64 PASS AO=49;DP=115;FAO=49;FDP=115;FR=.;FRO=66;FSAF=16;FSAR=33;FSRF=27;FSRR=39;FWDB=0.00922775;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.464;QD=6.17891;RBI=0.0281768;REFB=0.0016253;REVB=0.0266229;RO=66;SAF=16;SAR=33;SRF=27;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0921878;STB=0.551904;TYPE=snp;VARB=-0.00174636;OID=.;OPOS=151859314;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:66:66:49:49:33:16:27:39:33:16:27:39 chr6 151894340 . C T 205.02 PASS AO=50;DP=107;FAO=50;FDP=107;FR=.;FRO=57;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=34;FWDB=0.00164612;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.529;QD=7.66418;RBI=0.0037214;REFB=-0.0109912;REVB=0.00333753;RO=57;SAF=28;SAR=22;SRF=23;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149013;STB=0.582867;TYPE=snp;VARB=0.0116941;OID=.;OPOS=151894340;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:57:57:50:50:22:28:23:34:22:28:23:34 chr6 151894505 . T C 1026.3 PASS AO=115;DP=115;FAO=114;FDP=117;FR=.;FRO=3;FSAF=74;FSAR=40;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.00203732;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.7587;QD=35.0872;RBI=0.0269396;REFB=-0.00630958;REVB=-0.0268624;RO=0;SAF=74;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.91839e-08;STB=0.500494;TYPE=snp;VARB=0.00152311;OID=.;OPOS=151894505;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:115:117:0:3:115:114:41:74:0:0:40:74:2:1 chr6 151917660 . G A 298.64 PASS AO=65;DP=126;FAO=66;FDP=127;FR=.;FRO=61;FSAF=36;FSAR=30;FSRF=28;FSRR=33;FWDB=0.0025271;FXX=0.00781189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.263;QD=9.40596;RBI=0.0093723;REFB=-0.022463;REVB=0.00902517;RO=61;SAF=35;SAR=30;SRF=28;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.069889;STB=0.541535;TYPE=snp;VARB=0.0192639;OID=.;OPOS=151917660;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:127:61:61:65:66:30:35:28:33:30:36:28:33 chr6 151936677 . G A 1349.41 PASS AO=144;DP=145;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00092371;FXX=0.0137922;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.672;QD=37.7458;RBI=0.00839684;REFB=-0.0334503;REVB=0.00834588;RO=0;SAF=48;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.46872e-05;OID=.;OPOS=151936677;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:145:143:0:0:144:143:96:48:0:0:95:48:0:0 chr6 151939181 . G A 1068.69 PASS AO=114;DP=116;FAO=115;FDP=117;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=77;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0197019;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.716;QD=36.5363;RBI=0.0503948;REFB=-0.0994515;REVB=0.0463839;RO=1;SAF=38;SAR=76;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00620776;STB=0.503267;TYPE=snp;VARB=0.0012186;OID=.;OPOS=151939181;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:116:117:1:2:114:115:76:38:0:1:77:38:1:1 chr6 152129077 . T C 236.28 PASS AO=42;DP=79;FAO=47;FDP=82;FR=.;FRO=35;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.01101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.118;QD=11.5256;RBI=0.0372377;REFB=-0.0110376;REVB=-0.0355728;RO=32;SAF=27;SAR=15;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142207;STB=0.571996;TYPE=snp;VARB=0.00595614;OID=.;OPOS=152129077;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:82:32:35:42:47:15:27:15:17:19:28:15:20 chr6 152201875 . T C 1328.46 PASS AO=135;DP=138;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0330682;FXX=0.0275843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.315;QD=37.6869;RBI=0.0330737;REFB=0;REVB=0.000607447;RO=0;SAF=53;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84364e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00194324;OID=.;OPOS=152201875;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:138:141:0:0:135:141:82:53:0:0:82:59:0:0 chr6 152265522 . G C 665.32 PASS AO=111;DP=242;FAO=154;FDP=285;FR=.;FRO=131;FSAF=69;FSAR=85;FSRF=53;FSRR=78;FWDB=0.0721346;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.47;QD=9.33783;RBI=0.0758036;REFB=-0.04156;REVB=0.0232979;RO=130;SAF=40;SAR=71;SRF=53;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0492502;STB=0.520282;TYPE=snp;VARB=0.0366783;OID=.;OPOS=152265522;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:242:285:130:131:111:154:71:40:53:77:85:69:53:78 chr6 152420095 . G A 192.44 PASS AO=46;DP=96;FAO=46;FDP=96;FR=.;FRO=50;FSAF=41;FSAR=5;FSRF=38;FSRR=12;FWDB=-0.00591383;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.423;QD=8.01847;RBI=0.0144677;REFB=-0.0192885;REVB=-0.0132039;RO=50;SAF=41;SAR=5;SRF=38;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.244181;STB=0.638207;TYPE=snp;VARB=0.0186521;OID=.;OPOS=152420095;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:50:50:46:46:5:41:38:12:5:41:38:12 chr6 152422335 . C T 2670.42 PASS AO=279;DP=280;FAO=279;FDP=279;FR=.;FRO=0;FSAF=147;FSAR=132;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131236;FXX=0.0035713;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.949;QD=38.2856;RBI=0.0300957;REFB=-0.0563854;REVB=0.0270836;RO=0;SAF=147;SAR=132;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-8.75361e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.75801e-05;OID=.;OPOS=152422335;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:280:279:0:0:279:279:132:147:0:0:132:147:0:0 chr6 152464839 . A G 1646.5 PASS AO=180;DP=188;FAO=180;FDP=185;FR=.;FRO=5;FSAF=105;FSAR=75;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.00781971;FXX=0.0159566;HRUN=4;LEN=1;MLLD=130.086;QD=35.6;RBI=0.015281;REFB=0.0167556;REVB=0.0131287;RO=0;SAF=105;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505087;TYPE=snp;VARB=-0.000148852;OID=.;OPOS=152464839;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:188:185:0:5:180:180:75:105:0:0:75:105:2:3 chr6 152466674 . T C 268.74 PASS AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0214638;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=171.896;QD=35.8313;RBI=0.0253147;REFB=-0.0223648;REVB=0.0134215;RO=1;SAF=20;SAR=9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0227272;STB=0.512187;TYPE=snp;VARB=0.000114385;OID=.;OPOS=152466674;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:30:30:1:1:29:29:9:20:1:0:9:20:1:0 chr6 152469188 . C G 1054 PASS AO=106;DP=107;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0383314;FXX=0.00884877;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.0077;QD=37.643;RBI=0.038361;REFB=0;REVB=-0.00150868;RO=1;SAF=76;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0155547;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000570749;OID=.;OPOS=152469188;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:107:112:1:0:106:112:30:76:0:1:36:76:0:0 chr6 152469331 . C T 850.5 PASS AO=95;DP=114;FAO=99;FDP=106;FR=.;FRO=7;FSAF=38;FSAR=61;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0560078;FXX=0.0782541;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.323;QD=32.0942;RBI=0.0726793;REFB=-0.131372;REVB=0.0463186;RO=6;SAF=37;SAR=58;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0265073;STB=0.516951;TYPE=snp;VARB=0.00757321;OID=.;OPOS=152469331;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:114:106:6:7:95:99:58:37:1:5:61:38:1:6 chr6 152489294 . T C 89.81 PASS AO=29;DP=83;FAO=30;FDP=84;FR=.;FRO=54;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=30;FSRR=24;FWDB=-0.0120737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.771;QD=4.27667;RBI=0.0157438;REFB=-0.0234039;REVB=0.0101041;RO=53;SAF=15;SAR=14;SRF=29;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0335528;STB=0.514367;TYPE=snp;VARB=0.0597313;OID=.;OPOS=152489294;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:83:84:53:54:29:30:14:15:29:24:14:16:30:24 chr6 152540278 . A C 1420.55 PASS AO=165;DP=179;FAO=168;FDP=180;FR=.;FRO=12;FSAF=80;FSAR=88;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.0055796;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=178.548;QD=31.5677;RBI=0.00885355;REFB=-0.133017;REVB=-0.00687411;RO=13;SAF=80;SAR=85;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00743495;STB=0.51271;TYPE=snp;VARB=0.000778558;OID=.;OPOS=152540278;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:179:180:13:12:165:168:85:80:7:6:88:80:8:4 chr6 152647194 . C T 474.56 PASS AO=119;DP=252;FAO=119;FDP=252;FR=.;FRO=133;FSAF=56;FSAR=63;FSRF=61;FSRR=72;FWDB=-0.00196931;FXX=0.00395241;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.0122;QD=7.53272;RBI=0.00684293;REFB=-0.00724345;REVB=-0.00655343;RO=133;SAF=56;SAR=63;SRF=61;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114756;STB=0.506328;TYPE=snp;VARB=0.00790599;OID=.;OPOS=152647194;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:252:252:133:133:119:119:63:56:61:72:63:56:61:72 chr6 152647681 . A T 2827.77 PASS AO=300;DP=302;FAO=299;FDP=299;FR=.;FRO=0;FSAF=128;FSAR=171;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00149936;FXX=0.00993345;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.0316;QD=37.8297;RBI=0.0135047;REFB=-0.117191;REVB=0.0134212;RO=1;SAF=129;SAR=171;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00278106;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000803862;OID=.;OPOS=152647681;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:302:299:1:0:300:299:171:129:0:1:171:128:0:0 chr6 152650903 . G A 164.32 PASS AO=39;DP=82;FAO=39;FDP=82;FR=.;FRO=43;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=0.0379037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.383;QD=8.01559;RBI=0.039326;REFB=-0.0372129;REVB=-0.0104807;RO=42;SAF=25;SAR=14;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179495;STB=0.594806;TYPE=snp;VARB=0.0420069;OID=.;OPOS=152650903;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:42:43:39:39:14:25:19:23:14:25:20:23 chr6 152652034 . A T 1972.33 PASS AO=209;DP=213;FAO=211;FDP=211;FR=.;FRO=0;FSAF=110;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155696;FXX=0.0321086;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.171;QD=37.3902;RBI=0.0191637;REFB=-0.145173;REVB=0.0111731;RO=3;SAF=108;SAR=101;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0130463;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000144266;OID=.;OPOS=152652034;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:213:211:3:0:209:211:101:108:3:0:101:110:0:0 chr6 152652599 . G A 568.18 PASS AO=139;DP=287;FAO=139;FDP=287;FR=.;FRO=148;FSAF=88;FSAR=51;FSRF=96;FSRR=52;FWDB=0.000394223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.968;QD=7.9189;RBI=0.00549978;REFB=-0.00756853;REVB=0.00548563;RO=147;SAF=88;SAR=51;SRF=96;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0202241;STB=0.508672;TYPE=snp;VARB=0.00938755;OID=.;OPOS=152652599;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:287:287:147:148:139:139:51:88:96:51:51:88:96:52 chr6 152658141 . C A 92.01 PASS AO=33;DP=98;FAO=33;FDP=98;FR=.;FRO=65;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=46;FWDB=0.00319747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.136;QD=3.75538;RBI=0.00484003;REFB=-0.00497186;REVB=-0.00363347;RO=65;SAF=11;SAR=22;SRF=19;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0540795;STB=0.531232;TYPE=snp;VARB=0.0156313;OID=.;OPOS=152658141;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:98:98:65:65:33:33:22:11:19:46:22:11:19:46 chr6 152658142 . T C 620.11 PASS AO=96;DP=98;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=52;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0732455;FXX=0.183655;HRUN=4;LEN=1;MLLD=33.9928;QD=31.0057;RBI=0.0781818;REFB=-0.0190555;REVB=0.0273404;RO=2;SAF=28;SAR=68;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0326669;STB=0.509089;TYPE=snp;VARB=0.0481105;OID=.;OPOS=152658142;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:98:80:2:1:96:79:68:28:2:0:52:27:1:0 chr6 152660451 . G A 527.16 PASS AO=111;DP=202;FAO=111;FDP=202;FR=.;FRO=91;FSAF=53;FSAR=58;FSRF=37;FSRR=54;FWDB=-0.0373598;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.0212;QD=10.4389;RBI=0.101335;REFB=0.0181349;REVB=0.0941963;RO=90;SAF=53;SAR=58;SRF=36;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0640441;STB=0.532085;TYPE=snp;VARB=-0.0152352;OID=.;OPOS=152660451;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:202:90:91:111:111:58:53:36:54:58:53:37:54 chr6 152665261 . C A 342.59 PASS AO=83;DP=174;FAO=84;FDP=174;FR=.;FRO=90;FSAF=35;FSAR=49;FSRF=61;FSRR=29;FWDB=-0.00825866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.591;QD=7.87557;RBI=0.00896743;REFB=-0.00721102;REVB=-0.00349419;RO=89;SAF=35;SAR=48;SRF=61;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24348;STB=0.632738;TYPE=snp;VARB=0.00587875;OID=.;OPOS=152665261;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:174:89:90:83:84:48:35:61:28:49:35:61:29 chr6 152675854 . A G 1058 PASS AO=231;DP=432;FAO=222;FDP=398;FR=.;FRO=176;FSAF=93;FSAR=129;FSRF=89;FSRR=87;FWDB=-0.0148757;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.726;QD=10.6332;RBI=0.015153;REFB=0.00707906;REVB=0.00288589;RO=196;SAF=95;SAR=136;SRF=96;SRR=100;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0675178;STB=0.538903;TYPE=snp;VARB=-0.0042879;OID=.;OPOS=152675854;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:432:398:196:176:231:222:136:95:96:100:129:93:89:87 chr6 152683413 . G T 402.73 PASS AO=91;DP=178;FAO=91;FDP=178;FR=.;FRO=87;FSAF=38;FSAR=53;FSRF=28;FSRR=59;FWDB=-0.00559817;FXX=0.00558628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.282;QD=9.05007;RBI=0.0237566;REFB=-0.00321321;REVB=0.0230876;RO=85;SAF=38;SAR=53;SRF=27;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0921777;STB=0.548868;TYPE=snp;VARB=0.00259726;OID=.;OPOS=152683413;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:178:85:87:91:91:53:38:27:58:53:38:28:59 chr6 152694184 . T C 631.59 PASS AO=153;DP=316;FAO=154;FDP=317;FR=.;FRO=163;FSAF=102;FSAR=52;FSRF=135;FSRR=28;FWDB=0.0139685;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.037;QD=7.96956;RBI=0.0750783;REFB=0.0126128;REVB=0.0737674;RO=163;SAF=102;SAR=51;SRF=135;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1836;STB=0.601628;TYPE=snp;VARB=-0.0154932;OID=.;OPOS=152694184;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:316:317:163:163:153:154:51:102:135:28:52:102:135:28 chr6 152772264 . A G 2359.65 PASS AO=245;DP=245;FAO=246;FDP=246;FR=.;FRO=0;FSAF=133;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0677209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.7313;QD=38.3682;RBI=0.0690617;REFB=0;REVB=0.0135424;RO=0;SAF=132;SAR=113;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000113487;OID=.;OPOS=152772264;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:245:246:0:0:245:246:113:132:0:0:113:133:0:0 chr6 152777819 . G A 1349.66 PASS AO=142;DP=143;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0242789;FXX=0.0138879;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.072;QD=38.0187;RBI=0.0590164;REFB=0;REVB=0.053791;RO=0;SAF=72;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000128176;OID=.;OPOS=152777819;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:143:142:0:0:142:142:70:72:0:0:70:72:0:0 chr6 152784621 . T C 355.73 PASS AO=77;DP=148;FAO=78;FDP=149;FR=.;FRO=71;FSAF=19;FSAR=59;FSRF=26;FSRR=45;FWDB=0.0297587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.713;QD=9.54969;RBI=0.0305057;REFB=-0.00607313;REVB=0.00670962;RO=69;SAF=18;SAR=59;SRF=24;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126357;STB=0.57329;TYPE=snp;VARB=0.00497777;OID=.;OPOS=152784621;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:149:69:71:77:78:59:18:24:45:59:19:26:45 chr6 153080061 . T C 293.89 PASS AO=77;DP=174;FAO=77;FDP=171;FR=.;FRO=94;FSAF=42;FSAR=35;FSRF=49;FSRR=45;FWDB=-0.00746213;FXX=0.0172404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1985;QD=6.8746;RBI=0.00752387;REFB=-0.00469397;REVB=-0.000961824;RO=93;SAF=42;SAR=35;SRF=48;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0290304;STB=0.513366;TYPE=snp;VARB=0.016148;OID=.;OPOS=153080061;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:171:93:94:77:77:35:42:48:45:35:42:49:45 chr6 153296541 . G C 142.64 PASS AO=42;DP=105;FAO=42;FDP=105;FR=.;FRO=63;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=30;FSRR=33;FWDB=-0.0162392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.2151;QD=5.43382;RBI=0.0196005;REFB=-0.00101695;REVB=-0.0109759;RO=63;SAF=22;SAR=20;SRF=30;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0504163;STB=0.528545;TYPE=snp;VARB=0.00316865;OID=.;OPOS=153296541;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:63:63:42:42:20:22:30:33:20:22:30:33 chr6 153315921 . G A 161.35 PASS AO=39;DP=82;FAO=39;FDP=83;FR=.;FRO=44;FSAF=10;FSAR=29;FSRF=14;FSRR=30;FWDB=-0.094083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.189;QD=7.776;RBI=0.0961516;REFB=-0.0349298;REVB=0.0198375;RO=41;SAF=10;SAR=29;SRF=13;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0701542;STB=0.541191;TYPE=snp;VARB=0.0300875;OID=.;OPOS=153315921;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:83:41:44:39:39:29:10:13:28:29:10:14:30 chr6 153323594 . C T 201.21 PASS AO=47;DP=96;FAO=47;FDP=96;FR=.;FRO=49;FSAF=8;FSAR=39;FSRF=9;FSRR=40;FWDB=0.00797716;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=68.0846;QD=8.38367;RBI=0.0500389;REFB=-0.00571601;REVB=0.0493989;RO=49;SAF=8;SAR=39;SRF=9;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.021531;STB=0.511964;TYPE=snp;VARB=0.00709103;OID=.;OPOS=153323594;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:49:49:47:47:39:8:9:40:39:8:9:40 chr6 153323709 . T C 22.75 PASS AO=4;DP=8;FAO=4;FDP=8;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.455;QD=11.3734;RBI=0.0272425;REFB=-0.0152878;REVB=-0.0272425;RO=4;SAF=0;SAR=4;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0707772;OID=.;OPOS=153323709;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:8:8:4:4:4:4:4:0:0:4:4:0:0:4 chr6 153365100 . A C 235.59 PASS AO=63;DP=144;FAO=63;FDP=143;FR=.;FRO=80;FSAF=45;FSAR=18;FSRF=55;FSRR=25;FWDB=-0.00456986;FXX=0.00694396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.859;QD=6.58994;RBI=0.00747116;REFB=-0.00220798;REVB=-0.00591055;RO=79;SAF=45;SAR=18;SRF=55;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218442;STB=0.518066;TYPE=snp;VARB=0.0037328;OID=.;OPOS=153365100;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:143:79:80:63:63:18:45:55:24:18:45:55:25 chr6 153741613 . G C 380 PASS AO=95;DP=205;FAO=96;FDP=205;FR=.;FRO=109;FSAF=50;FSAR=46;FSRF=52;FSRR=57;FWDB=0.0596242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.7761;QD=7.41468;RBI=0.0612944;REFB=-0.00908313;REVB=0.0142111;RO=110;SAF=50;SAR=45;SRF=53;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0431592;STB=0.523263;TYPE=snp;VARB=0.0112707;OID=.;OPOS=153741613;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:205:110:109:95:96:45:50:53:57:46:50:52:57 chr6 153987576 . G A 148.05 PASS AO=40;DP=95;FAO=41;FDP=96;FR=.;FRO=55;FSAF=11;FSAR=30;FSRF=27;FSRR=28;FWDB=-0.0102153;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3657;QD=6.16884;RBI=0.0400446;REFB=0.0150612;REVB=-0.0387197;RO=55;SAF=11;SAR=29;SRF=27;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24199;STB=0.641097;TYPE=snp;VARB=-0.0252443;OID=.;OPOS=153987576;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:96:55:55:40:41:29:11:27:28:30:11:27:28 chr6 154002660 . T C 33.96 PASS AO=14;DP=52;FAO=14;FDP=52;FR=.;FRO=38;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.00018408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.917;QD=2.61222;RBI=0.020312;REFB=-0.0116459;REVB=0.0203111;RO=36;SAF=7;SAR=7;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0328152;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0174084;OID=.;OPOS=154002660;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:52:52:36:38:14:14:7:7:17:19:7:7:19:19 chr6 154414446 . A T 3293.8 PASS AO=346;DP=349;FAO=346;FDP=346;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=245;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00971114;FXX=0.00859574;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.9371;QD=38.0787;RBI=0.0334419;REFB=-0.0314616;REVB=-0.0320009;RO=1;SAF=101;SAR=245;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00470029;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.78916e-05;OID=.;OPOS=154414446;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:349:346:1:0:346:346:245:101:1:0:245:101:0:0 chr6 154414563 . A G 1851.39 PASS AO=180;DP=181;FAO=194;FDP=194;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=136;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.047117;FXX=0.00512794;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.211;QD=38.1729;RBI=0.0471567;REFB=0;REVB=-0.00193481;RO=0;SAF=46;SAR=134;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000185647;OID=.;OPOS=154414563;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:181:194:0:0:180:194:134:46:0:0:136:58:0:0 chr6 154414573 . C T 1676 PASS AO=182;DP=187;FAO=183;FDP=188;FR=.;FRO=5;FSAF=53;FSAR=130;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0630464;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.4316;QD=35.6596;RBI=0.0642779;REFB=-0.0677894;REVB=0.0125223;RO=4;SAF=52;SAR=130;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0230238;STB=0.509946;TYPE=snp;VARB=0.00496727;OID=.;OPOS=154414573;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:187:188:4:5:182:183:130:52:3:1:130:53:3:2 chr6 154771277 . A G 188.5 PASS AO=57;DP=149;FAO=59;FDP=151;FR=.;FRO=92;FSAF=15;FSAR=44;FSRF=32;FSRR=60;FWDB=0.0157436;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3896;QD=4.9933;RBI=0.0296369;REFB=-0.00690809;REVB=0.0251095;RO=91;SAF=13;SAR=44;SRF=31;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155547;STB=0.569986;TYPE=snp;VARB=0.00963043;OID=.;OPOS=154771277;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:151:91:92:57:59:44:13:31:60:44:15:32:60 chr6 154831176 . AC A 35.59 PASS AO=14;DP=53;FAO=23;FDP=45;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.104987;FXX=0.0217344;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.87676;QD=3.16379;RBI=0.122271;REFB=-0.0522201;REVB=-0.0626733;RO=17;SAF=5;SAR=9;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0552695;STB=0.511618;TYPE=del;VARB=0.0756859;OID=.;OPOS=154831177;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:14:42:23:45:22:11:12:10:12:32:17:5:9:7:10 chr6 155155039 . C T 320.82 PASS AO=76;DP=151;FAO=76;FDP=156;FR=.;FRO=80;FSAF=23;FSAR=53;FSRF=31;FSRR=49;FWDB=-0.0162432;FXX=0.0249984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.6811;QD=8.2262;RBI=0.050956;REFB=-0.0217539;REVB=-0.0482977;RO=75;SAF=23;SAR=53;SRF=31;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112161;STB=0.549526;TYPE=snp;VARB=0.029555;OID=.;OPOS=155155039;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:156:75:80:76:76:53:23:31:44:53:23:31:49 chr6 155486519 . G A 365.97 PASS AO=80;DP=157;FAO=82;FDP=159;FR=.;FRO=77;FSAF=25;FSAR=57;FSRF=33;FSRR=44;FWDB=0.0486063;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.6526;QD=9.20685;RBI=0.0618748;REFB=-0.00999406;REVB=0.0382873;RO=77;SAF=24;SAR=56;SRF=33;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128373;STB=0.566953;TYPE=snp;VARB=0.0108528;OID=.;OPOS=155486519;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:159:77:77:80:82:56:24:33:44:57:25:33:44 chr6 155561760 . T C 953.7 PASS AO=87;DP=87;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145496;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.0792;QD=38.1481;RBI=0.129525;REFB=0;REVB=0.128705;RO=0;SAF=28;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000573748;OID=.;OPOS=155561760;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:87:100:0:0:87:100:59:28:0:0:70:30:0:0 chr6 155561796 . C T 220.08 PASS AO=54;DP=115;FAO=54;FDP=115;FR=.;FRO=61;FSAF=20;FSAR=34;FSRF=12;FSRR=49;FWDB=-0.0106549;FXX=0.00861995;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.956;QD=7.6551;RBI=0.0124008;REFB=-0.00464392;REVB=0.00634445;RO=59;SAF=20;SAR=34;SRF=11;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19786;STB=0.604041;TYPE=snp;VARB=0.00605024;OID=.;OPOS=155561796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:59:61:54:54:34:20:11:48:34:20:12:49 chr6 155569168 . C T 244.19 PASS AO=46;DP=80;FAO=47;FDP=81;FR=.;FRO=34;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.00449707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.2454;QD=12.0589;RBI=0.0107747;REFB=-0.00721881;REVB=-0.0097913;RO=34;SAF=26;SAR=20;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0510312;STB=0.531652;TYPE=snp;VARB=0.00678132;OID=.;OPOS=155569168;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:81:34:34:46:47:20:26:17:17:20:27:17:17 chr6 155571697 . T C 1548.92 PASS AO=162;DP=166;FAO=163;FDP=163;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0331763;FXX=0.0239507;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.835;QD=38.0103;RBI=0.0331903;REFB=0.0461772;REVB=-0.000962565;RO=1;SAF=96;SAR=66;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00715494;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.00252e-05;OID=.;OPOS=155571697;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:166:163:1:0:162:163:66:96:0:1:66:97:0:0 chr6 155575607 . G A 1470.02 PASS AO=139;DP=144;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0309303;FXX=0.0187488;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.635;QD=37.4529;RBI=0.0349808;REFB=0.094291;REVB=0.0163394;RO=5;SAF=56;SAR=83;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0277782;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000493593;OID=.;OPOS=155575607;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:144:157:5:0:139:157:83:56:0:5:93:64:0:0 chr6 155606325 . C T 374.95 PASS AO=92;DP=196;FAO=93;FDP=196;FR=.;FRO=103;FSAF=41;FSAR=52;FSRF=22;FSRR=81;FWDB=-0.00664631;FXX=0.00507588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.59;QD=7.65194;RBI=0.0190151;REFB=-0.018941;REVB=-0.0178157;RO=101;SAF=40;SAR=52;SRF=21;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.227835;STB=0.624675;TYPE=snp;VARB=0.0261477;OID=.;OPOS=155606325;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:196:101:103:92:93:52:40:21:80:52:41:22:81 chr6 155750035 . C T 126.86 PASS AO=36;DP=84;FAO=35;FDP=84;FR=.;FRO=49;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=0.037196;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.7301;QD=6.04098;RBI=0.0400269;REFB=0.00174407;REVB=0.0147854;RO=47;SAF=18;SAR=18;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106882;STB=0.526158;TYPE=snp;VARB=-0.00577872;OID=.;OPOS=155750035;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:47:49:36:35:18:18:24:23:18:17:26:23 chr6 157405930 . G A 384.44 PASS AO=97;DP=204;FAO=97;FDP=206;FR=.;FRO=109;FSAF=47;FSAR=50;FSRF=69;FSRR=40;FWDB=-0.029976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.228;QD=7.4648;RBI=0.0305844;REFB=-0.0102649;REVB=0.00606976;RO=107;SAF=47;SAR=50;SRF=68;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143162;STB=0.578249;TYPE=snp;VARB=0.0155007;OID=.;OPOS=157405930;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:206:107:109:97:97:50:47:68:39:50:47:69:40 chr6 157522382 . AGG AG,A 261.4 PASS AO=34,9;DP=50;FAO=39,9;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=9,0;FSAR=30,9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0590803,0.0325656;FXX=0.019996;HRUN=3,3;LEN=1,2;MLLD=12.8022,14.9955;QD=21.3384;RBI=0.093519,0.0503339;REFB=-0.0198337,-0.018412;REVB=-0.0724936,-0.0383795;RO=3;SAF=8,0;SAR=26,9;SRF=0;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0.201149,0.201149;SSSB=0.0509586,0;STB=0.508193,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.0187991,0.00847776;OID=.,.;OPOS=157522383,157522383;OREF=G,GG;OALT=-,-;OMAPALT=AG,A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:34,9:47:39,9:49:1:9,0:30,9:0:1:5:3:8,0:26,9:0:3 chr6 157801040 . T A 894.84 PASS AO=94;DP=95;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0763432;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.558;QD=38.0785;RBI=0.084022;REFB=0;REVB=-0.0350914;RO=0;SAF=6;SAR=88;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.94812e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.62379e-05;OID=.;OPOS=157801040;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:95:94:0:0:94:94:88:6:0:0:88:6:0:0 chr6 157801186 . G A 174.57 PASS AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0512221;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=248.268;QD=33.2519;RBI=0.0524103;REFB=0.0184019;REVB=0.0110971;RO=1;SAF=2;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182146;STB=0.599885;TYPE=snp;VARB=-0.000719811;OID=.;OPOS=157801186;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:1:1:20:20:18:2:1:0:18:2:1:0 chr6 157801516 . A G 267.96 PASS AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0203612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.645;QD=34.5754;RBI=0.0207705;REFB=-0.0593201;REVB=-0.00410311;RO=1;SAF=17;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0266361;STB=0.514276;TYPE=snp;VARB=-0.000658429;OID=.;OPOS=157801516;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:31:31:1:1:30:30:13:17:1:0:13:17:1:0 chr6 158132992 . G A 318.96 PASS AO=85;DP=191;FAO=85;FDP=191;FR=.;FRO=106;FSAF=24;FSAR=61;FSRF=33;FSRR=73;FWDB=-0.0950539;FXX=0.00520806;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.127;QD=6.67971;RBI=0.0998686;REFB=-0.00194979;REVB=0.0306349;RO=106;SAF=25;SAR=60;SRF=33;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0204691;STB=0.519493;TYPE=snp;VARB=0.00196242;OID=.;OPOS=158132992;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:191:191:106:106:85:85:60:25:33:73:61:24:33:73 chr6 158133074 . A AT 136.44 PASS AO=72;DP=191;FAO=72;FDP=183;FR=.;FRO=111;FSAF=11;FSAR=61;FSRF=34;FSRR=77;FWDB=-0.00705285;FXX=0.0317444;HRUN=1;LEN=1;MLLD=22.7154;QD=2.98231;RBI=0.0304064;REFB=-0.00982026;REVB=0.0295772;RO=117;SAF=11;SAR=61;SRF=36;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.256207;STB=0.643867;TYPE=ins;VARB=0.0190999;OID=.;OPOS=158133075;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:72:191:72:183:111:11:61:34:77:99:117:11:61:36:81 chr6 158497717 . T C 90.79 PASS AO=37;DP=119;FAO=37;FDP=120;FR=.;FRO=83;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=39;FSRR=44;FWDB=-0.0364966;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.7484;QD=3.02647;RBI=0.0367018;REFB=-0.0162574;REVB=0.00387589;RO=78;SAF=16;SAR=21;SRF=34;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00411277;STB=0.526182;TYPE=snp;VARB=0.0394361;OID=.;OPOS=158497717;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:119:120:78:83:37:37:21:16:34:44:21:16:39:44 chr6 158499302 . G T 205.65 PASS AO=62;DP=168;FAO=66;FDP=172;FR=.;FRO=106;FSAF=45;FSAR=21;FSRF=43;FSRR=63;FWDB=0.0016241;FXX=0.00578001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.471;QD=4.78256;RBI=0.0345781;REFB=-0.0200708;REVB=0.0345399;RO=105;SAF=41;SAR=21;SRF=42;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.28884;STB=0.671589;TYPE=snp;VARB=0.020138;OID=.;OPOS=158499302;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:172:105:106:62:66:21:41:42:63:21:45:43:63 chr6 158505088 . A G 953.28 PASS AO=69;DP=98;FAO=99;FDP=99;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=62;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0839489;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.895;QD=38.5162;RBI=0.0915323;REFB=0;REVB=0.0364794;RO=0;SAF=41;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000375477;OID=.;OPOS=158505088;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:99:99:0:0:69:99:28:41:0:0:37:62:0:0 chr6 158507981 . G A 153.85 PASS AO=28;DP=46;FAO=28;FDP=46;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=0.00108304;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.8139;QD=13.3781;RBI=0.00325762;REFB=-0.0253037;REVB=0.00307231;RO=17;SAF=12;SAR=16;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0957971;STB=0.561248;TYPE=snp;VARB=0.0292385;OID=.;OPOS=158507981;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:46:46:17:18:28:28:16:12:5:12:16:12:5:13 chr6 158509750 . A G 1445.41 PASS AO=75;DP=154;FAO=151;FDP=151;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=60;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.183204;FXX=0.00657851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=38.9453;QD=38.2889;RBI=0.289292;REFB=0;REVB=0.223888;RO=0;SAF=44;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0025298;OID=.;OPOS=158509750;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:152:151:0:0:75:151:31:44:0:0:91:60:0:0 chr6 158517308 . A G 167.34 PASS AO=40;DP=84;FAO=40;FDP=84;FR=.;FRO=44;FSAF=5;FSAR=35;FSRF=4;FSRR=40;FWDB=-0.0753277;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.7365;QD=7.96859;RBI=0.0764546;REFB=0.0270965;REVB=0.0130783;RO=44;SAF=5;SAR=35;SRF=4;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0784965;STB=0.543458;TYPE=snp;VARB=-0.0305104;OID=.;OPOS=158517308;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:44:44:40:40:35:5:4:40:35:5:4:40 chr6 158571501 . G A 90.71 PASS AO=38;DP=127;FAO=39;FDP=127;FR=.;FRO=88;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=43;FSRR=45;FWDB=-0.0287359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.1089;QD=2.85696;RBI=0.0383391;REFB=-0.028676;REVB=-0.0253798;RO=86;SAF=23;SAR=15;SRF=41;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153311;STB=0.570521;TYPE=snp;VARB=0.0488099;OID=.;OPOS=158571501;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:127:127:86:88:38:39:15:23:41:45:16:23:43:45 chr6 158735087 . C T 920.63 PASS AO=98;DP=101;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0155855;FXX=0.0198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.5042;QD=37.1973;RBI=0.0249494;REFB=0.0407282;REVB=0.0194824;RO=0;SAF=43;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.423e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000848377;OID=.;OPOS=158735087;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:101:99:0:0:98:99:55:43:0:0:56:43:0:0 chr6 158735090 . T C 941.59 PASS AO=95;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00798636;FXX=0.0101;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.899;QD=38.4324;RBI=0.0497934;REFB=0;REVB=0.0491487;RO=0;SAF=43;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.67486e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.62851e-05;OID=.;OPOS=158735090;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:98:98:0:0:95:98:52:43:0:0:54:44:0:0 chr6 158870081 . A G 249 PASS AO=57;DP=113;FAO=57;FDP=113;FR=.;FRO=56;FSAF=21;FSAR=36;FSRF=30;FSRR=26;FWDB=-0.0150174;FXX=0.00877116;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8724;QD=8.81417;RBI=0.0685256;REFB=-0.00274756;REVB=-0.0668598;RO=56;SAF=21;SAR=36;SRF=30;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153847;STB=0.585056;TYPE=snp;VARB=0.00141297;OID=.;OPOS=158870081;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:56:56:57:57:36:21:30:26:36:21:30:26 chr6 158910698 . G A 563.92 PASS AO=135;DP=276;FAO=136;FDP=277;FR=.;FRO=141;FSAF=49;FSAR=87;FSRF=64;FSRR=77;FWDB=-0.0285299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.6726;QD=8.14317;RBI=0.0286926;REFB=-0.031335;REVB=0.00305134;RO=139;SAF=49;SAR=86;SRF=62;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0808349;STB=0.550225;TYPE=snp;VARB=0.0278269;OID=.;OPOS=158910698;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:276:277:139:141:135:136:86:49:62:77:87:49:64:77 chr6 158923434 . G C 481.7 PASS AO=50;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0638284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.414;QD=37.0538;RBI=0.0666242;REFB=0;REVB=-0.0190976;RO=0;SAF=23;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000170987;OID=.;OPOS=158923434;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:51:52:0:0:50:52:27:23:0:0:27:25:0:0 chr6 158924088 . T C 893.05 PASS AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0198367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.883;QD=38.002;RBI=0.0375804;REFB=0;REVB=0.0319185;RO=0;SAF=69;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.61817e-05;OID=.;OPOS=158924088;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:94:94:0:0:94:94:25:69:0:0:25:69:0:0 chr6 159065758 . C G 190.99 PASS AO=23;DP=25;FAO=23;FDP=25;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0855395;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=180.652;QD=30.558;RBI=0.0875842;REFB=-0.025702;REVB=-0.0188145;RO=2;SAF=2;SAR=21;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0420974;STB=0.522708;TYPE=snp;VARB=0.0018889;OID=.;OPOS=159065758;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:25:25:2:2:23:23:21:2:0:2:21:2:0:2 chr6 159184462 . A G 579.51 PASS AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0193477;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.4602;QD=36.2195;RBI=0.0219614;REFB=-0.00345236;REVB=-0.0103908;RO=1;SAF=49;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00954189;STB=0.505049;TYPE=snp;VARB=0.000147079;OID=.;OPOS=159184462;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:64:64:1:1:63:63:14:49:1:0:14:49:1:0 chr6 159185563 . T A 848.85 PASS AO=88;DP=88;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.01;QD=38.1505;RBI=0.0595297;REFB=0;REVB=0.055395;RO=0;SAF=45;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.39218e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000450929;OID=.;OPOS=159185563;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:88:89:0:0:88:89:43:45:0:0:44:45:0:0 chr6 159205668 . G A 123.4 PASS AO=46;DP=137;FAO=46;FDP=137;FR=.;FRO=91;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=44;FSRR=47;FWDB=9.29167e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.43;QD=3.60287;RBI=0.0411788;REFB=-0.0156052;REVB=-0.0411787;RO=91;SAF=23;SAR=23;SRF=44;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0189915;STB=0.510944;TYPE=snp;VARB=0.028158;OID=.;OPOS=159205668;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:91:91:46:46:23:23:44:47:23:23:44:47 chr6 159262953 . T C 730.86 PASS AO=183;DP=382;FAO=183;FDP=383;FR=.;FRO=200;FSAF=92;FSAR=91;FSRF=77;FSRR=123;FWDB=-0.000845073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.7598;QD=7.63298;RBI=0.0019514;REFB=0.00190656;REVB=-0.00175892;RO=198;SAF=92;SAR=91;SRF=76;SRR=122;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112505;STB=0.561433;TYPE=snp;VARB=-0.00194429;OID=.;OPOS=159262953;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:382:383:198:200:183:183:91:92:76:122:91:92:77:123 chr6 159398633 . T C 509.22 PASS AO=119;DP=237;FAO=119;FDP=237;FR=.;FRO=118;FSAF=67;FSAR=52;FSRF=73;FSRR=45;FWDB=-0.0132257;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.263;QD=8.59436;RBI=0.0227326;REFB=-0.0258467;REVB=0.0184892;RO=117;SAF=67;SAR=52;SRF=73;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0564309;STB=0.528336;TYPE=snp;VARB=0.0277679;OID=.;OPOS=159398633;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:237:237:117:118:119:119:52:67:73:44:52:67:73:45 chr6 159398700 . C T 338.24 PASS AO=99;DP=236;FAO=99;FDP=239;FR=.;FRO=140;FSAF=63;FSAR=36;FSRF=89;FSRR=51;FWDB=-0.0117239;FXX=0.00416649;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.241;QD=5.6609;RBI=0.0119082;REFB=-0.00294489;REVB=0.0020868;RO=137;SAF=63;SAR=36;SRF=89;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149832;STB=0.500411;TYPE=snp;VARB=0.00336945;OID=.;OPOS=159398700;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:236:239:137:140:99:99:36:63:89:48:36:63:89:51 chr6 159398764 . G A 168.31 PASS AO=60;DP=178;FAO=62;FDP=180;FR=.;FRO=118;FSAF=43;FSAR=19;FSRF=60;FSRR=58;FWDB=0.0124298;FXX=0.00552456;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.0085;QD=3.7402;RBI=0.0125611;REFB=-0.00153557;REVB=0.00181103;RO=117;SAF=43;SAR=17;SRF=60;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.251213;STB=0.628469;TYPE=snp;VARB=0.00157241;OID=.;OPOS=159398764;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:180:117:118:60:62:17:43:60:57:19:43:60:58 chr6 159399348 . A G 176.07 PASS AO=42;DP=90;FAO=42;FDP=89;FR=.;FRO=47;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=31;FSRR=16;FWDB=0.0147015;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.855;QD=7.91318;RBI=0.0149784;REFB=-0.00364686;REVB=0.00286669;RO=47;SAF=25;SAR=17;SRF=31;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0641856;STB=0.535718;TYPE=snp;VARB=0.0036424;OID=.;OPOS=159399348;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:89:47:47:42:42:17:25:31:16:17:25:31:16 chr6 159407446 . C T 222.48 PASS AO=67;DP=167;FAO=67;FDP=167;FR=.;FRO=100;FSAF=47;FSAR=20;FSRF=42;FSRR=58;FWDB=0.0150969;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.756;QD=5.32885;RBI=0.0225962;REFB=-0.00911157;REVB=-0.0168129;RO=99;SAF=47;SAR=20;SRF=41;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.31156;STB=0.673102;TYPE=snp;VARB=0.01676;OID=.;OPOS=159407446;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:167:99:100:67:67:20:47:41:58:20:47:42:58 chr6 159414899 . T C 286.28 PASS AO=78;DP=179;FAO=78;FDP=179;FR=.;FRO=101;FSAF=34;FSAR=44;FSRF=37;FSRR=64;FWDB=-0.00635634;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.61;QD=6.39721;RBI=0.00847557;REFB=-0.00913757;REVB=0.00560645;RO=101;SAF=34;SAR=44;SRF=37;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0724562;STB=0.540308;TYPE=snp;VARB=0.00783996;OID=.;OPOS=159414899;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:179:101:101:78:78:44:34:37:64:44:34:37:64 chr6 159420574 . T C 73.53 PASS AO=11;DP=19;FAO=12;FDP=19;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=-0.0455773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.7989;QD=15.4808;RBI=0.102917;REFB=0.00908872;REVB=0.0922742;RO=7;SAF=6;SAR=5;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.32916;STB=0.683945;TYPE=snp;VARB=-0.00314287;OID=.;OPOS=159420574;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:19:19:7:7:11:12:5:6:7:0:6:6:7:0 chr6 159457773 . G A 269 PASS AO=66;DP=140;FAO=66;FDP=140;FR=.;FRO=74;FSAF=43;FSAR=23;FSRF=52;FSRR=22;FWDB=-0.0144482;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=206.268;QD=7.68564;RBI=0.0506121;REFB=-0.0106138;REVB=0.048506;RO=74;SAF=43;SAR=23;SRF=52;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0548431;STB=0.530331;TYPE=snp;VARB=0.0121074;OID=.;OPOS=159457773;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:74:74:66:66:23:43:52:22:23:43:52:22 chr6 159650978 . A G 504.4 PASS AO=125;DP=258;FAO=124;FDP=258;FR=.;FRO=134;FSAF=49;FSAR=75;FSRF=64;FSRR=70;FWDB=-0.00421855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4582;QD=7.82012;RBI=0.0625049;REFB=-0.0097245;REVB=-0.0623623;RO=133;SAF=49;SAR=76;SRF=64;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0857881;STB=0.543959;TYPE=snp;VARB=0.0117049;OID=.;OPOS=159650978;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:258:258:133:134:125:124:76:49:64:69:75:49:64:70 chr6 159652931 . G C 1120.96 PASS AO=117;DP=117;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0197563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.3482;QD=38.3234;RBI=0.0232668;REFB=0;REVB=0.0122895;RO=0;SAF=67;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.50014e-05;OID=.;OPOS=159652931;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:117:117:0:0:117:117:50:67:0:0:50:67:0:0 chr6 159653635 . C G 21.1 PASS AO=5;DP=15;FAO=5;FDP=15;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=1;FWDB=-0.0187099;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.881;QD=5.62559;RBI=0.0662475;REFB=-0.0155778;REVB=0.0635506;RO=10;SAF=2;SAR=3;SRF=9;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.506841;STB=0.804003;TYPE=snp;VARB=0.0101097;OID=.;OPOS=159653635;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:15:15:10:10:5:5:3:2:9:1:3:2:9:1 chr6 159654487 . G T 235.86 PASS AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.114312;FXX=0.0740466;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.501;QD=37.7373;RBI=0.117407;REFB=0;REVB=0.02678;RO=0;SAF=5;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00185454;OID=.;OPOS=159654487;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:26:25:0:0:25:25:20:5:0:0:20:5:0:0 chr6 159654551 . C G 73.57 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=44.947;QD=36.7869;RBI=0.0278269;REFB=0;REVB=-0.0278269;RO=0;SAF=0;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00184723;OID=.;OPOS=159654551;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:8:0:0:0:8:0:0:0 chr6 159655084 . C G 912.13 PASS AO=94;DP=94;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.2269;QD=38.0055;RBI=0.0218922;REFB=0;REVB=0.019395;RO=0;SAF=22;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000178717;OID=.;OPOS=159655084;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:94:96:0:0:94:96:72:22:0:0:74:22:0:0 chr6 159655102 . A G 1002.35 PASS AO=82;DP=90;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0287338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.629;QD=37.4711;RBI=0.0400029;REFB=0;REVB=0.0278317;RO=0;SAF=16;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.93134e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.8531e-05;OID=.;OPOS=159655102;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:90:107:0:0:82:107:66:16:0:0:85:22:0:0 chr6 159655190 . G A 340.63 PASS AO=73;DP=136;FAO=73;FDP=136;FR=.;FRO=63;FSAF=12;FSAR=61;FSRF=16;FSRR=47;FWDB=-0.0307436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.22;QD=10.0184;RBI=0.0504755;REFB=-0.00134407;REVB=0.0400326;RO=60;SAF=12;SAR=61;SRF=14;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0956599;STB=0.568555;TYPE=snp;VARB=0.00117133;OID=.;OPOS=159655190;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:60:63:73:73:61:12:14:46:61:12:16:47 chr6 159655326 . T C 149.92 PASS AO=15;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0626069;FXX=0.0587889;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.374;QD=37.4798;RBI=0.0701775;REFB=0;REVB=0.0317059;RO=0;SAF=2;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00156303;OID=.;OPOS=159655326;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:16:0:0:15:16:13:2:0:0:14:2:0:0 chr6 159655402 . A G 136.31 PASS AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0598688;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.8;QD=36.3483;RBI=0.0647051;REFB=0;REVB=0.0245455;RO=0;SAF=9;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000677114;OID=.;OPOS=159655402;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:15:0:0:15:15:6:9:0:0:6:9:0:0 chr6 159660879 . C A 125.69 PASS AO=12;DP=13;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.634;QD=35.911;RBI=0.0214625;REFB=0;REVB=0.0214625;RO=1;SAF=0;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.18662e-05;OID=.;OPOS=159660879;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:14:1:0:12:14:12:0:0:1:14:0:0:0 chr6 159667961 . T G 551.02 PASS AO=114;DP=210;FAO=116;FDP=211;FR=.;FRO=95;FSAF=64;FSAR=52;FSRF=56;FSRR=39;FWDB=0.0271819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.505;QD=10.4458;RBI=0.0424479;REFB=-0.0315741;REVB=0.0326031;RO=93;SAF=63;SAR=51;SRF=56;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0415089;STB=0.517238;TYPE=snp;VARB=0.0237235;OID=.;OPOS=159667961;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:210:211:93:95:114:116:51:63:56:37:52:64:56:39 chr6 159672419 . G C 440.15 PASS AO=93;DP=170;FAO=93;FDP=171;FR=.;FRO=78;FSAF=20;FSAR=73;FSRF=27;FSRR=51;FWDB=0.0150657;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.863;QD=10.2958;RBI=0.0157428;REFB=-0.0215369;REVB=0.00456733;RO=77;SAF=20;SAR=73;SRF=27;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150027;STB=0.580425;TYPE=snp;VARB=0.0215523;OID=.;OPOS=159672419;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:171:77:78:93:93:73:20:27:50:73:20:27:51 chr6 159672455 . C T 229.55 PASS AO=66;DP=162;FAO=67;FDP=163;FR=.;FRO=96;FSAF=18;FSAR=49;FSRF=20;FSRR=76;FWDB=0.0474482;FXX=0.00609719;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.667;QD=5.63322;RBI=0.0474589;REFB=-0.00693597;REVB=-0.00101058;RO=96;SAF=18;SAR=48;SRF=20;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0900283;STB=0.547166;TYPE=snp;VARB=0.00995041;OID=.;OPOS=159672455;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:163:96:96:66:67:48:18:20:76:49:18:20:76 chr6 159672542 . C T 188.73 PASS AO=43;DP=91;FAO=44;FDP=91;FR=.;FRO=47;FSAF=3;FSAR=41;FSRF=12;FSRR=35;FWDB=-0.00394059;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.67;QD=8.29584;RBI=0.00646077;REFB=-0.0134517;REVB=0.0051199;RO=47;SAF=3;SAR=40;SRF=12;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.395768;STB=0.729401;TYPE=snp;VARB=0.0131938;OID=.;OPOS=159672542;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:47:47:43:44:40:3:12:35:41:3:12:35 chr6 160113872 . A G 40.81 PASS AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.,HEALED;FRO=11;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=-0.213306;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=132.132;QD=8.16244;RBI=0.213981;REFB=-0.0100995;REVB=0.0169808;RO=8;SAF=2;SAR=6;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15636;STB=0.517197;TYPE=snp;VARB=0.0143342;OID=.;OPOS=160113872;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:20:20:8:11:8:8:6:2:1:7:6:2:3:8 chr6 160174456 . T G 2605.11 PASS AO=282;DP=291;FAO=285;FDP=285;FR=.;FRO=0;FSAF=162;FSAR=123;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.13763;FXX=0.0206178;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.371;QD=36.5629;RBI=0.137671;REFB=-0.0859689;REVB=0.00337411;RO=5;SAF=162;SAR=120;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012692;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000342836;OID=.;OPOS=160174456;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:291:285:5:0:282:285:120:162:1:4:123:162:0:0 chr6 160196215 . CA C 27.1 PASS AO=21;DP=104;FAO=27;FDP=80;FR=.;FRO=53;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=31;FWDB=-0.0575113;FXX=0.215665;HRUN=6;LEN=1;MLLD=8.83489;QD=1.35485;RBI=0.0598704;REFB=-0.0686658;REVB=0.0166406;RO=43;SAF=9;SAR=12;SRF=15;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0.380435;SSSB=0.0948139;STB=0.64111;TYPE=del;VARB=0.0382005;OID=.;OPOS=160196216;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:21:90:27:80:53:17:10:22:31:27:43:9:12:15:28 chr6 160196343 . A G 1124.43 PASS AO=126;DP=133;FAO=126;FDP=131;FR=.;FRO=5;FSAF=64;FSAR=62;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0154819;FXX=0.0150365;HRUN=4;LEN=1;MLLD=253.634;QD=34.3337;RBI=0.0156441;REFB=-0.200238;REVB=-0.00224676;RO=2;SAF=64;SAR=62;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0146156;STB=0.518794;TYPE=snp;VARB=0.000852639;OID=.;OPOS=160196343;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:133:131:2:5:126:126:62:64:2:0:62:64:5:0 chr6 160198395 . G A 2099.48 PASS AO=225;DP=230;FAO=227;FDP=227;FR=.;FRO=0;FSAF=138;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00371176;FXX=0.0130429;HRUN=3;LEN=1;MLLD=77.7701;QD=36.9952;RBI=0.0516963;REFB=-0.0596517;REVB=0.0515628;RO=2;SAF=138;SAR=87;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108264;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00100276;OID=.;OPOS=160198395;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:230:227:2:0:225:227:87:138:0:2:89:138:0:0 chr6 160201295 . C A 1429.78 PASS AO=154;DP=158;FAO=154;FDP=157;FR=.;FRO=3;FSAF=90;FSAR=64;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0115252;FXX=0.00632871;HRUN=3;LEN=1;MLLD=143.981;QD=36.4275;RBI=0.0192517;REFB=-0.0616527;REVB=-0.0154207;RO=2;SAF=90;SAR=64;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0146316;STB=0.50493;TYPE=snp;VARB=0.000140845;OID=.;OPOS=160201295;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:158:157:2:3:154:154:64:90:0:2:64:90:1:2 chr6 160206631 . T C 977.71 PASS AO=98;DP=98;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189707;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.4404;QD=37.6042;RBI=0.0405453;REFB=0;REVB=-0.0358334;RO=0;SAF=49;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000426633;OID=.;OPOS=160206631;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:98:104:0:0:98:104:49:49:0:0:49:55:0:0 chr6 160211636 . G A 2460.7 PASS AO=259;DP=263;FAO=259;FDP=259;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=168;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121436;FXX=0.0152085;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.726;QD=38.0031;RBI=0.0530487;REFB=-0.0358579;REVB=0.0516401;RO=0;SAF=91;SAR=168;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.75406e-05;OID=.;OPOS=160211636;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:263:259:0:0:259:259:168:91:0:0:168:91:0:0 chr6 160211645 . GGTT G 1858.4 PASS AO=182;DP=236;FAO=237;FDP=237;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=163;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0172958;FXX=0.0246903;HRUN=5;LEN=3;MLLD=259.325;QD=31.3654;RBI=0.0180841;REFB=0;REVB=0.00528095;RO=0;SAF=56;SAR=126;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-2.54037e-05;OID=.;OPOS=160211646;OREF=GTT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:182:214:237:237:0:74:163:0:0:99:0:56:126:0:0 chr6 160224346 . T C 1223.72 PASS AO=128;DP=129;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00711056;FXX=0.00763301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.342;QD=37.653;RBI=0.0363334;REFB=-0.0808028;REVB=0.0356309;RO=0;SAF=57;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000533987;OID=.;OPOS=160224346;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:129:130:0:0:128:130:71:57:0:0:71:59:0:0 chr6 160225012 . T G 2714.21 PASS AO=289;DP=292;FAO=289;FDP=289;FR=.;FRO=0;FSAF=112;FSAR=177;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0296117;FXX=0.0102736;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.107;QD=37.5669;RBI=0.0343374;REFB=-0.0644096;REVB=0.0173839;RO=2;SAF=112;SAR=177;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00535792;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.15059e-05;OID=.;OPOS=160225012;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:292:289:2:0:289:289:177:112:0:2:177:112:0:0 chr6 160328620 . C T 399.86 PASS AO=69;DP=108;FAO=70;FDP=109;FR=.;FRO=39;FSAF=36;FSAR=34;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=-0.000976316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.148;QD=14.6737;RBI=0.0108133;REFB=0.0019478;REVB=0.0107691;RO=39;SAF=36;SAR=33;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0572083;STB=0.528017;TYPE=snp;VARB=-0.000915466;OID=.;OPOS=160328620;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:109:39:39:69:70:33:36:17:22:34:36:17:22 chr6 160468278 . A G 67.07 PASS AO=37;DP=151;FAO=37;FDP=152;FR=.;FRO=115;FSAF=28;FSAR=9;FSRF=62;FSRR=53;FWDB=-0.00057816;FXX=0.0843323;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.7211;QD=1.76504;RBI=0.00816097;REFB=-0.00126967;REVB=0.00814047;RO=112;SAF=28;SAR=9;SRF=60;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.30064;STB=0.681749;TYPE=snp;VARB=0.0128778;OID=.;OPOS=160468278;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:151:152:112:115:37:37:9:28:60:52:9:28:62:53 chr6 160494409 . A G 1057.43 PASS AO=107;DP=108;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0146151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.01;QD=38.1057;RBI=0.027104;REFB=0;REVB=0.0228259;RO=0;SAF=23;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.26632e-05;OID=.;OPOS=160494409;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:108:111:0:0:107:111:84:23:0:0:86:25:0:0 chr6 160505199 . C G 890.42 PASS AO=95;DP=96;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.100626;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.008;QD=37.4914;RBI=0.100684;REFB=-0.060857;REVB=0.00342026;RO=1;SAF=17;SAR=78;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00604162;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000117267;OID=.;OPOS=160505199;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:96:95:1:0:95:95:78:17:0:1:78:17:0:0 chr6 160551204 . G C 2109.73 PASS AO=219;DP=227;FAO=220;FDP=220;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=129;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00970297;FXX=0.047617;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.6482;QD=38.3588;RBI=0.0102397;REFB=0;REVB=-0.00327167;RO=0;SAF=91;SAR=128;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.37658e-05;OID=.;OPOS=160551204;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:227:220:0:0:219:220:128:91:0:0:129:91:0:0 chr6 160560845 . A G 188.78 PASS AO=48;DP=116;FAO=51;FDP=116;FR=.;FRO=65;FSAF=11;FSAR=40;FSRF=31;FSRR=34;FWDB=0.0243336;FXX=0.00854628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.316;QD=6.50965;RBI=0.0275823;REFB=-0.00922514;REVB=0.0129869;RO=64;SAF=11;SAR=37;SRF=31;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.29765;STB=0.673542;TYPE=snp;VARB=0.00827383;OID=.;OPOS=160560845;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:64:65:48:51:37:11:31:33:40:11:31:34 chr6 160560880 . CATG C 133.79 PASS AO=36;DP=92;FAO=36;FDP=85;FR=.;FRO=49;FSAF=7;FSAR=29;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=-0.00837441;FXX=0.0449388;HRUN=1;LEN=3;MLLD=188.628;QD=6.29609;RBI=0.0236178;REFB=0.00217009;REVB=-0.0220832;RO=49;SAF=6;SAR=30;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.421403;STB=0.714264;TYPE=del;VARB=-0.00379119;OID=.;OPOS=160560881;OREF=ATG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:36:87:36:85:49:7:29:25:24:99:49:6:30:25:24 chr6 160560897 . CTGGTAAGT C 136.06 PASS AO=33;DP=83;FAO=34;FDP=75;FR=.;FRO=41;FSAF=3;FSAR=31;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=-0.0330115;FXX=0;HRUN=1;LEN=8;MLLD=265.933;QD=7.25671;RBI=0.0337259;REFB=-0.00766824;REVB=0.00690503;RO=29;SAF=2;SAR=31;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.555467;STB=0.800514;TYPE=del;VARB=0.010132;OID=.;OPOS=160560898;OREF=TGGTAAGT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:33:66:34:75:41:3:31:18:23:99:29:2:31:12:17 chr6 160645832 . C T 837.71 PASS AO=90;DP=93;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0118017;FXX=0.0215031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.263;QD=36.8223;RBI=0.0185557;REFB=-0.0681356;REVB=-0.014319;RO=1;SAF=33;SAR=57;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00824369;STB=0.504347;TYPE=snp;VARB=0.000418691;OID=.;OPOS=160645832;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:93:91:1:1:90:90:57:33:0:1:57:33:0:1 chr6 160670282 . A C 3616.79 PASS AO=481;DP=493;FAO=390;FDP=390;FR=.;FRO=0;FSAF=174;FSAR=216;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0128501;FXX=0.0249994;HRUN=3;LEN=1;MLLD=173.46;QD=37.0952;RBI=0.0197266;REFB=-0.0724903;REVB=0.0149671;RO=10;SAF=221;SAR=260;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00158576;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.63817e-05;OID=.;OPOS=160670282;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:493:390:10:0:481:390:260:221:5:5:216:174:0:0 chr6 160679400 . C A 171.53 PASS AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0641141;FXX=0.0526039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.979;QD=38.1169;RBI=0.0837357;REFB=0;REVB=0.0538614;RO=0;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00172226;OID=.;OPOS=160679400;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:19:18:0:0:18:18:9:9:0:0:9:9:0:0 chr6 160858188 . G A 138.82 PASS AO=138;DP=251;FAO=35;FDP=78;FR=.;FRO=43;FSAF=7;FSAR=28;FSRF=9;FSRR=34;FWDB=-0.00602759;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.398;QD=7.11873;RBI=0.0151632;REFB=-0.0133233;REVB=0.0139137;RO=113;SAF=40;SAR=98;SRF=42;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0790268;STB=0.507932;TYPE=snp;VARB=0.0146834;OID=.;OPOS=160858188;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:251:78:113:43:138:35:98:40:42:71:28:7:9:34 chr6 160872151 . C T 624.01 PASS AO=114;DP=182;FAO=114;FDP=182;FR=.;FRO=68;FSAF=49;FSAR=65;FSRF=18;FSRR=50;FWDB=0.00261876;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.055;QD=13.7146;RBI=0.0250911;REFB=-0.018122;REVB=-0.0249541;RO=68;SAF=49;SAR=65;SRF=18;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118962;STB=0.564053;TYPE=snp;VARB=0.0106324;OID=.;OPOS=160872151;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:182:68:68:114:114:65:49:18:50:65:49:18:50 chr6 160952838 . G A 933.07 PASS AO=248;DP=488;FAO=209;FDP=399;FR=.;FRO=190;FSAF=106;FSAR=103;FSRF=102;FSRR=88;FWDB=-0.022162;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.411;QD=9.35407;RBI=0.0295309;REFB=-0.00828542;REVB=-0.0195172;RO=237;SAF=121;SAR=127;SRF=129;SRR=108;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0504371;STB=0.514134;TYPE=snp;VARB=0.00655328;OID=.;OPOS=160952838;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:488:399:237:190:248:209:127:121:129:108:103:106:102:88 chr6 160969629 . A G 1855.59 PASS AO=192;DP=192;FAO=194;FDP=194;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0281299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.349;QD=38.2595;RBI=0.0434241;REFB=0;REVB=-0.0330812;RO=0;SAF=78;SAR=114;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.34047e-06;OID=.;OPOS=160969629;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:192:194:0:0:192:194:114:78:0:0:115:79:0:0 chr6 161026197 . G A 532.44 PASS AO=121;DP=234;FAO=121;FDP=235;FR=.;FRO=114;FSAF=57;FSAR=64;FSRF=55;FSRR=59;FWDB=0.00478261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.41;QD=9.06272;RBI=0.008034;REFB=-0.0140054;REVB=0.00645537;RO=112;SAF=57;SAR=64;SRF=55;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0176061;STB=0.505535;TYPE=snp;VARB=0.0149952;OID=.;OPOS=161026197;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:234:235:112:114:121:121:64:57:55:57:64:57:55:59 chr6 161085267 . C T 512.64 PASS AO=102;DP=216;FAO=104;FDP=211;FR=.,HEALED;FRO=93;FSAF=46;FSAR=58;FSRF=17;FSRR=76;FWDB=-0.0107348;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=168.046;QD=9.7182;RBI=0.0196967;REFB=-0.0239376;REVB=0.0165143;RO=72;SAF=44;SAR=58;SRF=3;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.321113;STB=0.627804;TYPE=snp;VARB=0.0161591;OID=.;OPOS=161085267;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:210:211:72:93:102:104:58:44:3:69:58:46:17:76 chr6 161137779 . T C 182.43 PASS AO=42;DP=85;FAO=42;FDP=85;FR=.;FRO=43;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=-0.0660501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.6435;QD=8.58473;RBI=0.0667686;REFB=-0.00985235;REVB=0.0097683;RO=42;SAF=18;SAR=24;SRF=17;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0219787;STB=0.505152;TYPE=snp;VARB=0.00353456;OID=.;OPOS=161137779;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:42:43:42:42:24:18:17:25:24:18:18:25 chr6 161139480 . C T 360.77 PASS AO=91;DP=200;FAO=94;FDP=204;FR=.;FRO=110;FSAF=28;FSAR=66;FSRF=46;FSRR=64;FWDB=0.0556141;FXX=0.00970827;HRUN=4;LEN=1;MLLD=41.2224;QD=7.07387;RBI=0.0662658;REFB=-0.0407852;REVB=0.0360309;RO=109;SAF=26;SAR=65;SRF=47;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160946;STB=0.572954;TYPE=snp;VARB=0.0426589;OID=.;OPOS=161139480;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:200:204:109:110:91:94:65:26:47:62:66:28:46:64 chr6 161469774 . G A 1223.53 PASS AO=128;DP=131;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0043056;FXX=0.0227256;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.5046;QD=37.9388;RBI=0.0155242;REFB=0;REVB=0.0149152;RO=0;SAF=64;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.72343e-05;OID=.;OPOS=161469774;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:131:129:0:0:128:129:64:64:0:0:64:65:0:0 chr6 161536240 . GC G 1556.05 PASS AO=187;DP=264;FAO=260;FDP=260;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=156;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.132116;FXX=0.0151509;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.3891;QD=23.9392;RBI=0.297312;REFB=0;REVB=0.266346;RO=54;SAF=76;SAR=111;SRF=14;SRR=40;SSEN=0.392523;SSEP=0;SSSB=0.0651927;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00655943;OID=.;OPOS=161536241;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:187:261:260:260:0:104:156:0:0:99:54:76:111:14:40 chr6 161538250 . G A 484.67 PASS AO=177;DP=456;FAO=156;FDP=400;FR=.;FRO=244;FSAF=86;FSAR=70;FSRF=132;FSRR=112;FWDB=0.00802645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.874;QD=4.84665;RBI=0.0155201;REFB=-0.00861261;REVB=0.0132835;RO=276;SAF=99;SAR=78;SRF=150;SRR=126;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0174244;STB=0.50634;TYPE=snp;VARB=0.00998453;OID=.;OPOS=161538250;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:456:400:276:244:177:156:78:99:150:126:70:86:132:112 chr6 161557662 . G A 215.7 PASS AO=51;DP=105;FAO=51;FDP=105;FR=.;FRO=54;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=34;FWDB=0.000899184;FXX=0.00943307;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.089;QD=8.21694;RBI=0.0222746;REFB=-0.00433637;REVB=0.0222564;RO=53;SAF=30;SAR=21;SRF=20;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192722;STB=0.611068;TYPE=snp;VARB=0.00617697;OID=.;OPOS=161557662;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:53:54:51:51:21:30:20:33:21:30:20:34 chr6 161582535 . T C 128.74 PASS AO=26;DP=48;FAO=26;FDP=48;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=22;FSRF=5;FSRR=17;FWDB=-0.0257191;FXX=0.058812;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.853;QD=10.7282;RBI=0.0260361;REFB=-0.0415316;REVB=-0.00405033;RO=20;SAF=4;SAR=22;SRF=3;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00580966;STB=0.559273;TYPE=snp;VARB=0.0241203;OID=.;OPOS=161582535;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:48:48:20:22:26:26:22:4:3:17:22:4:5:17 chr6 163587146 . C G 1430.62 PASS AO=118;DP=155;FAO=151;FDP=151;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=90;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0759533;FXX=0.00657851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.779;QD=37.8972;RBI=0.125405;REFB=0;REVB=0.0997867;RO=0;SAF=80;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00106013;OID=.;OPOS=163587146;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:149:151:0:0:118:151:38:80:0:0:61:90:0:0 chr6 163600225 . C A 488.13 PASS AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0287366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.672;QD=37.5481;RBI=0.0339416;REFB=0;REVB=0.018062;RO=0;SAF=28;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.38976e-05;OID=.;OPOS=163600225;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:52:52:0:0:52:52:24:28:0:0:24:28:0:0 chr6 163612783 . C A 838.87 PASS AO=91;DP=91;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=89;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0871384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.6921;QD=36.8735;RBI=0.0872364;REFB=0.0100801;REVB=0.00413396;RO=0;SAF=2;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.66657e-08;STB=0.666617;TYPE=snp;VARB=-0.00020721;OID=.;OPOS=163612783;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:91:91:0:1:91:90:89:2:0:0:89:1:1:0 chr6 163736204 . T C 576.6 PASS AO=114;DP=201;FAO=116;FDP=202;FR=.;FRO=86;FSAF=61;FSAR=55;FSRF=46;FSRR=40;FWDB=0.00070148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.785;QD=11.4178;RBI=0.00314678;REFB=0.00391866;REVB=-0.00306759;RO=86;SAF=59;SAR=55;SRF=46;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0137446;STB=0.503852;TYPE=snp;VARB=-0.00254151;OID=.;OPOS=163736204;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:202:86:86:114:116:55:59:46:40:55:61:46:40 chr6 165703523 . C T 278.3 PASS AO=57;DP=105;FAO=58;FDP=106;FR=.;FRO=48;FSAF=3;FSAR=55;FSRF=11;FSRR=37;FWDB=-0.0899972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.185;QD=10.5018;RBI=0.0931714;REFB=-0.0010271;REVB=-0.0241126;RO=45;SAF=2;SAR=55;SRF=10;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.502419;STB=0.736028;TYPE=snp;VARB=0.000390581;OID=.;OPOS=165703523;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:106:45:48:57:58:55:2:10:35:55:3:11:37 chr6 165706935 . C G 166.41 PASS AO=35;DP=65;FAO=35;FDP=66;FR=.;FRO=31;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.0193216;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.161;QD=10.0854;RBI=0.0197947;REFB=-0.0231357;REVB=-0.00430208;RO=30;SAF=24;SAR=11;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0799492;STB=0.554881;TYPE=snp;VARB=0.0328778;OID=.;OPOS=165706935;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:66:30:31:35:35:11:24:18:12:11:24:18:13 chr6 165713917 . C T 284.98 PASS AO=55;DP=117;FAO=66;FDP=128;FR=.;FRO=62;FSAF=28;FSAR=38;FSRF=27;FSRR=35;FWDB=0.0578239;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.3026;QD=8.90568;RBI=0.136979;REFB=-0.0107582;REVB=0.124176;RO=62;SAF=26;SAR=29;SRF=27;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0357088;STB=0.505562;TYPE=snp;VARB=0.0113227;OID=.;OPOS=165713917;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:128:62:62:55:66:29:26:27:35:38:28:27:35 chr6 165713961 . A C 956.28 PASS AO=104;DP=107;FAO=105;FDP=107;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=66;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0290714;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.811;QD=35.7489;RBI=0.0362618;REFB=-0.0590931;REVB=0.0216743;RO=2;SAF=38;SAR=66;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0243162;STB=0.512498;TYPE=snp;VARB=0.00199318;OID=.;OPOS=165713961;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:107:107:2:2:104:105:66:38:2:0:66:39:2:0 chr6 165715460 . G C 80.87 PASS AO=7;DP=51;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=-0.00798533;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=203.813;QD=7.70223;RBI=0.0151664;REFB=-0.00510109;REVB=-0.012894;RO=14;SAF=1;SAR=6;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237013;STB=0.519979;TYPE=snp;VARB=0.00754201;OID=.;OPOS=165715460;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:30:42:14:23:7:19:6:1:4:10:13:6:8:15 chr6 165715673 . A G 285.81 PASS AO=72;DP=156;FAO=72;FDP=155;FR=.;FRO=83;FSAF=32;FSAR=40;FSRF=44;FSRR=39;FWDB=-0.0355013;FXX=0.00640985;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.436;QD=7.37564;RBI=0.0358394;REFB=-0.0139423;REVB=-0.0049113;RO=83;SAF=32;SAR=40;SRF=44;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0828868;STB=0.545964;TYPE=snp;VARB=0.0145005;OID=.;OPOS=165715673;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:155:83:83:72:72:40:32:44:39:40:32:44:39 chr6 165746031 . A G 1362.04 PASS AO=142;DP=143;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235202;FXX=0.0204068;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.751;QD=37.8344;RBI=0.0422547;REFB=-0.00934879;REVB=0.0351036;RO=1;SAF=53;SAR=89;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00531326;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.2024e-05;OID=.;OPOS=165746031;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:143:144:1:0:142:144:89:53:0:1:89:55:0:0 chr6 165801790 . G A 263.91 PASS AO=83;DP=199;FAO=81;FDP=200;FR=.;FRO=119;FSAF=39;FSAR=42;FSRF=55;FSRR=64;FWDB=0.0559012;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4153;QD=5.27821;RBI=0.0630422;REFB=-0.0296899;REVB=0.0291442;RO=115;SAF=39;SAR=44;SRF=54;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000327702;STB=0.511504;TYPE=snp;VARB=0.0604843;OID=.;OPOS=165801790;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:199:200:115:119:83:81:44:39:54:61:42:39:55:64 chr6 166307718 . T C 2348.14 PASS AO=245;DP=245;FAO=245;FDP=245;FR=.;FRO=0;FSAF=151;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0215138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.152;QD=38.337;RBI=0.051915;REFB=0;REVB=0.0472474;RO=0;SAF=151;SAR=94;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.68139e-05;OID=.;OPOS=166307718;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:245:245:0:0:245:245:94:151:0:0:94:151:0:0 chr6 166308090 . A T 2672.95 PASS AO=426;DP=454;FAO=339;FDP=339;FR=.;FRO=0;FSAF=133;FSAR=206;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0333617;FXX=0.152496;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.398;QD=31.5393;RBI=0.243532;REFB=-0.058657;REVB=0.241237;RO=1;SAF=217;SAR=209;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00219462;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00390738;OID=.;OPOS=166308090;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:454:339:1:0:426:339:209:217:1:0:206:133:0:0 chr6 166308584 . C A 1946.54 PASS AO=198;DP=205;FAO=209;FDP=209;FR=.;FRO=0;FSAF=109;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.159945;FXX=0.0279057;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.5949;QD=37.2544;RBI=0.16014;REFB=-0.0915639;REVB=0.00788974;RO=5;SAF=100;SAR=98;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0232134;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00126539;OID=.;OPOS=166308584;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:205:209:5:0:198:209:98:100:5:0:100:109:0:0 chr6 166308611 . G C 1617.35 PASS AO=179;DP=193;FAO=180;FDP=186;FR=.;FRO=6;FSAF=88;FSAR=92;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0483286;FXX=0.0362676;HRUN=3;LEN=1;MLLD=239.302;QD=34.7816;RBI=0.0487112;REFB=-0.0773733;REVB=0.00609308;RO=5;SAF=87;SAR=92;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.02657;STB=0.51111;TYPE=snp;VARB=0.00177424;OID=.;OPOS=166308611;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:193:186:5:6:179:180:92:87:5:0:92:88:5:1 chr6 166308682 . G GAAAT 958.79 PASS AO=120;DP=189;FAO=137;FDP=172;FR=.;FRO=35;FSAF=105;FSAR=32;FSRF=7;FSRR=28;FWDB=-0.0109315;FXX=0.0899423;HRUN=3;LEN=4;MLLD=270.286;QD=22.2973;RBI=0.0131569;REFB=-0.0298702;REVB=0.00732164;RO=34;SAF=93;SAR=27;SRF=7;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280767;STB=0.637372;TYPE=ins;VARB=0.00808058;OID=.;OPOS=166308683;OREF=-;OALT=AAAT;OMAPALT=GAAAT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:120:189:137:172:35:105:32:7:28:40:34:93:27:7:27 chr6 166308924 . G A 858.18 PASS AO=91;DP=92;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106911;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.7018;QD=36.9108;RBI=0.0180558;REFB=0;REVB=0.0145503;RO=0;SAF=52;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000247859;OID=.;OPOS=166308924;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:92:93:0:0:91:93:39:52:0:0:39:54:0:0 chr6 166309167 . G A 376.67 PASS AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0507471;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.898;QD=37.6674;RBI=0.0534641;REFB=0;REVB=-0.0168268;RO=0;SAF=22;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19993e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.87434e-05;OID=.;OPOS=166309167;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:41:40:0:0:40:40:18:22:0:0:18:22:0:0 chr6 166309245 . A T 209.89 PASS AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00298644;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.611;QD=33.5823;RBI=0.0113038;REFB=-0.0791413;REVB=-0.0109021;RO=1;SAF=13;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0343222;STB=0.518503;TYPE=snp;VARB=0.00047678;OID=.;OPOS=166309245;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:25:25:1:1:24:24:11:13:1:0:11:13:1:0 chr6 166309249 . G T 220.97 PASS AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0227111;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=67.3194;QD=33.9956;RBI=0.028878;REFB=-0.100433;REVB=-0.0178366;RO=0;SAF=16;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.515139;TYPE=snp;VARB=0.00359206;OID=.;OPOS=166309249;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:26:26:0:1:25:25:9:16:0:0:9:16:1:0 chr6 166309288 . T C 1057.48 PASS AO=111;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.4607;QD=38.1073;RBI=0.0433825;REFB=0;REVB=-0.0406449;RO=0;SAF=27;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000119462;OID=.;OPOS=166309288;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:111:111:0:0:111:111:84:27:0:0:84:27:0:0 chr6 166571157 . G A 909.19 PASS AO=94;DP=96;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00582321;FXX=0.0306091;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.501;QD=38.2817;RBI=0.0262412;REFB=0;REVB=0.025587;RO=0;SAF=59;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.06074e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000491419;OID=.;OPOS=166571157;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:96:95:0:0:94:95:35:59:0:0:35:60:0:0 chr6 166571164 . T G 926.99 PASS AO=98;DP=99;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0021391;FXX=0.0101;HRUN=4;LEN=1;MLLD=127.531;QD=37.8363;RBI=0.0236498;REFB=-0.0694222;REVB=0.0235529;RO=1;SAF=62;SAR=36;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00758961;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000159089;OID=.;OPOS=166571164;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:99:98:1:0:98:98:36:62:1:0:36:62:0:0 chr6 166571935 . C T 77.25 PASS AO=16;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.0101086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.955;QD=7.72463;RBI=0.0143613;REFB=-0.0198594;REVB=-0.0102011;RO=16;SAF=7;SAR=9;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216783;STB=0.610988;TYPE=snp;VARB=0.0214388;OID=.;OPOS=166571935;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:37:40:16:22:16:18:9:7:11:5:11:7:13:9 chr6 166579270 . C T 828.95 PASS AO=101;DP=114;FAO=102;FDP=114;FR=.;FRO=12;FSAF=25;FSAR=77;FSRF=1;FSRR=11;FWDB=0.00537293;FXX=0.0420133;HRUN=5;LEN=1;MLLD=129.124;QD=29.086;RBI=0.00893454;REFB=-0.146297;REVB=0.00713846;RO=12;SAF=25;SAR=76;SRF=1;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0453386;STB=0.523556;TYPE=snp;VARB=0.00246019;OID=.;OPOS=166579270;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:114:114:12:12:101:102:76:25:1:11:77:25:1:11 chr6 166580188 . G A 69.09 PASS AO=17;DP=35;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0398872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.126;QD=7.89555;RBI=0.0444836;REFB=-0.0140199;REVB=0.0196927;RO=18;SAF=10;SAR=7;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130349;STB=0.548326;TYPE=snp;VARB=0.0133024;OID=.;OPOS=166580188;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:35:35:18:19:17:16:7:10:8:10:7:9:9:10 chr6 166736362 . C T 360.07 PASS AO=81;DP=159;FAO=81;FDP=158;FR=.;FRO=77;FSAF=46;FSAR=35;FSRF=26;FSRR=51;FWDB=0.0149951;FXX=0.00628891;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.088;QD=9.11578;RBI=0.0152206;REFB=-0.0146904;REVB=-0.0026108;RO=76;SAF=46;SAR=35;SRF=25;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208368;STB=0.610844;TYPE=snp;VARB=0.00872996;OID=.;OPOS=166736362;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:158:76:77:81:81:35:46:25:51:35:46:26:51 chr6 166739589 . A C 88.62 PASS AO=20;DP=41;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.0305297;FXX=0.0243843;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.8425;QD=8.86211;RBI=0.0867595;REFB=0.0114611;REVB=0.0812105;RO=21;SAF=14;SAR=6;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216171;STB=0.615473;TYPE=snp;VARB=-0.0114747;OID=.;OPOS=166739589;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:41:40:21:21:20:19:6:14:10:11:6:13:10:11 chr6 166739684 . G A 613.64 PASS AO=60;DP=61;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00472797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.353;QD=37.7625;RBI=0.0279096;REFB=0;REVB=0.0275062;RO=0;SAF=22;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.41273e-05;OID=.;OPOS=166739684;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:61:65:0:0:60:65:38:22:0:0:41:24:0:0 chr6 166755975 . T C 136.11 PASS AO=14;DP=14;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131524;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.2896;QD=36.2946;RBI=0.0159713;REFB=0;REVB=-0.00906085;RO=0;SAF=4;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.63386e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000193909;OID=.;OPOS=166755975;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:14:15:0:0:14:15:10:4:0:0:10:5:0:0 chr6 166755979 . A C 136.31 PASS AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0607697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.295;QD=36.3484;RBI=0.0662069;REFB=0;REVB=-0.0262754;RO=0;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000946403;OID=.;OPOS=166755979;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:15:0:0:15:15:10:5:0:0:10:5:0:0 chr6 166778679 . T G 464.47 PASS AO=92;DP=160;FAO=93;FDP=161;FR=.;FRO=68;FSAF=43;FSAR=50;FSRF=31;FSRR=37;FWDB=0.00146315;FXX=0.00617246;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.3926;QD=11.5396;RBI=0.0147909;REFB=-0.0145655;REVB=0.0147184;RO=67;SAF=43;SAR=49;SRF=31;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00366275;STB=0.502754;TYPE=snp;VARB=0.0144905;OID=.;OPOS=166778679;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:161:67:68:92:93:49:43:31:36:50:43:31:37 chr6 166826304 . T C 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.964;QD=35.0875;RBI=0.0245684;REFB=0;REVB=0.0192333;RO=0;SAF=6;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000536872;OID=.;OPOS=166826304;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:6:0:0:1:6:0:0 chr6 166862233 . T C 322.56 PASS AO=66;DP=119;FAO=66;FDP=119;FR=.;FRO=53;FSAF=30;FSAR=36;FSRF=29;FSRR=24;FWDB=-0.00766644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.241;QD=10.8422;RBI=0.0649088;REFB=-0.0134787;REVB=-0.0644544;RO=52;SAF=30;SAR=36;SRF=28;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0677269;STB=0.541272;TYPE=snp;VARB=0.0123837;OID=.;OPOS=166862233;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:52:53:66:66:36:30:28:24:36:30:29:24 chr6 166873010 . C T 212.74 PASS AO=52;DP=111;FAO=52;FDP=111;FR=.;FRO=59;FSAF=33;FSAR=19;FSRF=41;FSRR=18;FWDB=-0.0104159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.938;QD=7.66622;RBI=0.0129381;REFB=0.00563802;REVB=-0.00767498;RO=59;SAF=33;SAR=19;SRF=41;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0634426;STB=0.535198;TYPE=snp;VARB=-0.00601618;OID=.;OPOS=166873010;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:59:59:52:52:19:33:41:18:19:33:41:18 chr6 166889281 . T A 72.67 PASS AO=20;DP=51;FAO=20;FDP=51;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=-0.0179562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.573;QD=5.69985;RBI=0.0228498;REFB=0.0143689;REVB=-0.0141311;RO=28;SAF=13;SAR=7;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121791;STB=0.58478;TYPE=snp;VARB=-0.0132706;OID=.;OPOS=166889281;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:51:51:28:31:20:20:7:13:15:13:7:13:16:15 chr6 166889331 . CAG C 28.41 PASS AO=14;DP=60;FAO=15;FDP=63;FR=.;FRO=48;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=33;FWDB=-0.0475376;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=93.4389;QD=1.80367;RBI=0.0842842;REFB=-0.00345274;REVB=-0.0695988;RO=44;SAF=9;SAR=5;SRF=15;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.355824;STB=0.70884;TYPE=del;VARB=0.00726389;OID=.;OPOS=166889332;OREF=AG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:14:60:15:63:48:9:6:15:33:28:44:9:5:15:29 chr6 166912062 . C T 954.19 PASS AO=103;DP=106;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114822;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.982;QD=36.3502;RBI=0.0499731;REFB=-0.139548;REVB=0.0486361;RO=3;SAF=51;SAR=52;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0265856;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00125145;OID=.;OPOS=166912062;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:106:105:3:0:103:105:52:51:0:3:54:51:0:0 chr6 166952264 . G A 1010.14 PASS AO=107;DP=108;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000576383;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.2319;QD=37.7622;RBI=0.00786356;REFB=-0.056617;REVB=0.00784241;RO=0;SAF=56;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.66952e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000433307;OID=.;OPOS=166952264;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:108:107:0:0:107:107:51:56:0:0:51:56:0:0 chr6 167271632 . C G 2601.58 PASS AO=276;DP=279;FAO=276;FDP=276;FR=.;FRO=0;FSAF=160;FSAR=116;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0257698;FXX=0.0107523;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.689;QD=37.7041;RBI=0.0474816;REFB=0.00510981;REVB=-0.0398801;RO=2;SAF=160;SAR=116;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00112184;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.16291e-05;OID=.;OPOS=167271632;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:279:276:2:0:276:276:116:160:1:1:116:160:0:0 chr6 167271711 . T C 2267.88 PASS AO=126;DP=265;FAO=252;FDP=254;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=133;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0211;FXX=0.0193043;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.4203;QD=35.7146;RBI=0.0248129;REFB=0;REVB=0.0130564;RO=1;SAF=101;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00468209;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000859798;OID=.;OPOS=167271711;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:82:255:254:1:0:126:252:25:101:1:0:119:133:0:0 chr6 167271712 . G C 538.49 PASS AO=127;DP=254;FAO=128;FDP=259;FR=.;FRO=131;FSAF=31;FSAR=97;FSRF=103;FSRR=28;FWDB=-0.0708881;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.176;QD=8.31647;RBI=0.0790371;REFB=-0.0281202;REVB=0.0349534;RO=126;SAF=31;SAR=96;SRF=103;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.506736;STB=0.770302;TYPE=snp;VARB=0.00384567;OID=.;OPOS=167271712;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:254:259:126:131:127:128:96:31:103:23:97:31:103:28 chr6 167343141 . G A 260.67 PASS AO=66;DP=141;FAO=66;FDP=143;FR=.;FRO=77;FSAF=16;FSAR=50;FSRF=14;FSRR=63;FWDB=0.0603624;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.4138;QD=7.29144;RBI=0.0609429;REFB=-0.023281;REVB=-0.00839148;RO=72;SAF=16;SAR=50;SRF=11;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124058;STB=0.54654;TYPE=snp;VARB=0.0370231;OID=.;OPOS=167343141;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:143:72:77:66:66:50:16:11:61:50:16:14:63 chr6 167344583 . A G 207.31 PASS AO=45;DP=87;FAO=46;FDP=88;FR=.;FRO=42;FSAF=15;FSAR=31;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=-0.0892895;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.297;QD=9.42333;RBI=0.0907027;REFB=-0.00168815;REVB=0.0159486;RO=40;SAF=14;SAR=31;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194699;STB=0.610946;TYPE=snp;VARB=0.00245219;OID=.;OPOS=167344583;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:88:40:42:45:46:31:14:21:19:31:15:23:19 chr6 167411298 . T C 11.29 PASS AO=5;DP=25;FAO=5;FDP=26;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.0118237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.971;QD=1.73738;RBI=0.0599916;REFB=-0.0186804;REVB=-0.0588149;RO=20;SAF=2;SAR=3;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.284472;STB=0.670992;TYPE=snp;VARB=0.0879107;OID=.;OPOS=167411298;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:25:26:20:21:5:5:3:2:13:7:3:2:13:8 chr6 167411300 . T C 11.56 PASS AO=5;DP=26;FAO=5;FDP=26;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.0145924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.486;QD=1.7788;RBI=0.0155567;REFB=-0.000239986;REVB=-0.00539182;RO=21;SAF=3;SAR=2;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0341667;STB=0.523714;TYPE=snp;VARB=0.00020454;OID=.;OPOS=167411300;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:26:26:21:21:5:5:2:3:12:9:2:3:12:9 chr6 167411301 . G A 11.54 PASS AO=5;DP=26;FAO=5;FDP=26;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.012746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.012;QD=1.77516;RBI=0.0228993;REFB=0.00199197;REVB=0.0190241;RO=21;SAF=3;SAR=2;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0341667;STB=0.523714;TYPE=snp;VARB=-0.00524142;OID=.;OPOS=167411301;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:26:26:21:21:5:5:2:3:12:9:2:3:12:9 chr6 167413539 . T C 360.25 PASS AO=103;DP=244;FAO=103;FDP=244;FR=.;FRO=141;FSAF=76;FSAR=27;FSRF=86;FSRR=55;FWDB=-0.000574881;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=256.967;QD=5.90566;RBI=0.0192518;REFB=0.00579234;REVB=-0.0192432;RO=141;SAF=76;SAR=27;SRF=86;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156096;STB=0.587574;TYPE=snp;VARB=-0.00703473;OID=.;OPOS=167413539;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:244:141:141:103:103:27:76:86:55:27:76:86:55 chr6 167424293 . T C 98.85 PASS AO=26;DP=63;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.00996089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.137;QD=6.2763;RBI=0.0548403;REFB=-0.0158713;REVB=0.0539281;RO=37;SAF=17;SAR=9;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150644;STB=0.560394;TYPE=snp;VARB=0.0216712;OID=.;OPOS=167424293;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:63:63:37:36:26:27:9:17:19:18:10:17:19:17 chr6 167571048 . T C 327.65 PASS AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.3172;QD=37.4452;RBI=0.0246068;REFB=0;REVB=0.0223104;RO=0;SAF=12;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00041587;OID=.;OPOS=167571048;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:35:35:0:0:35:35:23:12:0:0:23:12:0:0 chr6 167571430 . A T 542.29 PASS AO=122;DP=241;FAO=125;FDP=244;FR=.;FRO=119;FSAF=63;FSAR=62;FSRF=76;FSRR=43;FWDB=-0.00944767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.772;QD=8.88996;RBI=0.00965794;REFB=-0.00205996;REVB=0.00200434;RO=118;SAF=63;SAR=59;SRF=75;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107628;STB=0.565735;TYPE=snp;VARB=0.0020247;OID=.;OPOS=167571430;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:241:244:118:119:122:125:59:63:75:43:62:63:76:43 chr6 167590541 . G A 1008.81 PASS AO=109;DP=114;FAO=110;FDP=112;FR=.;FRO=2;FSAF=52;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00286107;FXX=0.0175423;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.1387;QD=36.0288;RBI=0.0193803;REFB=-0.120911;REVB=0.019168;RO=0;SAF=51;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508473;TYPE=snp;VARB=0.000756177;OID=.;OPOS=167590541;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:114:112:0:2:109:110:58:51:0:0:58:52:0:2 chr6 167590574 . G C 614.04 PASS AO=63;DP=64;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0252646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.235;QD=37.7869;RBI=0.0331233;REFB=0;REVB=0.0214208;RO=0;SAF=25;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.85389e-05;OID=.;OPOS=167590574;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:64:65:0:0:63:65:38:25:0:0:39:26:0:0 chr6 167719436 . G A 72.71 PASS AO=34;DP=121;FAO=34;FDP=121;FR=.;FRO=87;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=40;FSRR=47;FWDB=-0.0222104;FXX=0.0162588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.0776;QD=2.40367;RBI=0.0365731;REFB=-0.0214914;REVB=0.0290566;RO=85;SAF=17;SAR=17;SRF=40;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0355258;STB=0.528909;TYPE=snp;VARB=0.0476055;OID=.;OPOS=167719436;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:121:121:85:87:34:34:17:17:40:45:17:17:40:47 chr6 167728774 . T C 326.47 PASS AO=35;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.020988;FXX=0.116252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.036;QD=34.3654;RBI=0.0746732;REFB=-0.135081;REVB=0.071663;RO=0;SAF=22;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.39865e-08;STB=0.511105;TYPE=snp;VARB=0.00272344;OID=.;OPOS=167728774;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:38:38:0:1:35:37:13:22:0:0:15:22:1:0 chr6 167728775 . G A 59 PASS AO=15;DP=42;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.0014598;FXX=0.159055;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.381;QD=6.37876;RBI=0.0728104;REFB=0.00824716;REVB=-0.0727957;RO=18;SAF=10;SAR=5;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.576817;TYPE=snp;VARB=-0.00629173;OID=.;OPOS=167728775;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:42:37:18:22:15:15:5:10:12:6:5:10:12:10 chr6 167728791 . G A 81.41 PASS AO=28;DP=77;FAO=27;FDP=77;FR=.;FRO=50;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=27;FWDB=0.00317851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.131;QD=4.22901;RBI=0.0137233;REFB=-0.0222763;REVB=0.0133501;RO=45;SAF=13;SAR=15;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.050362;STB=0.513972;TYPE=snp;VARB=0.0183265;OID=.;OPOS=167728791;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:77:77:45:50:28:27:15:13:23:22:14:13:23:27 chr6 167738723 . C T 105.59 PASS AO=26;DP=58;FAO=26;FDP=58;FR=.;FRO=32;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=0.0567332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.5044;QD=7.28194;RBI=0.057232;REFB=-0.0375296;REVB=0.00753961;RO=31;SAF=6;SAR=20;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.281002;STB=0.654077;TYPE=snp;VARB=0.0325251;OID=.;OPOS=167738723;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:31:32:26:26:20:6:15:16:20:6:15:17 chr6 167754419 . A C 732.57 PASS AO=142;DP=240;FAO=142;FDP=240;FR=.;FRO=98;FSAF=58;FSAR=84;FSRF=43;FSRR=55;FWDB=-0.0168501;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=180.874;QD=12.2096;RBI=0.0182838;REFB=-0.0249167;REVB=-0.00709718;RO=98;SAF=58;SAR=84;SRF=43;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0235515;STB=0.512751;TYPE=snp;VARB=0.0182237;OID=.;OPOS=167754419;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:240:240:98:98:142:142:84:58:43:55:84:58:43:55 chr6 167754661 . A G 331.24 PASS AO=66;DP=169;FAO=89;FDP=190;FR=.;FRO=101;FSAF=41;FSAR=48;FSRF=45;FSRR=56;FWDB=0.00180579;FXX=0.0256397;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.533;QD=6.97355;RBI=0.00467959;REFB=-0.0167766;REVB=-0.00431713;RO=103;SAF=36;SAR=30;SRF=46;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106505;STB=0.508101;TYPE=snp;VARB=0.0207003;OID=.;OPOS=167754661;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:190:103:101:66:89:30:36:46:57:48:41:45:56 chr6 167789473 . C T 536.14 PASS AO=72;DP=87;FAO=72;FDP=87;FR=.;FRO=15;FSAF=29;FSAR=43;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=0.0358259;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.422;QD=24.6502;RBI=0.0399879;REFB=-0.0536327;REVB=0.0177634;RO=15;SAF=29;SAR=43;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0692216;STB=0.536846;TYPE=snp;VARB=0.0121334;OID=.;OPOS=167789473;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:87:87:15:15:72:72:43:29:3:12:43:29:3:12 chr6 167797844 . C T 1279.6 PASS AO=151;DP=164;FAO=152;FDP=165;FR=.;FRO=13;FSAF=56;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=13;FWDB=0.00632158;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=187.975;QD=31.0206;RBI=0.00800224;REFB=-0.114366;REVB=0.00490648;RO=3;SAF=56;SAR=95;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0147821;STB=0.531703;TYPE=snp;VARB=0.000979369;OID=.;OPOS=167797844;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:164:165:3:13:151:152:95:56:0:3:96:56:0:13 chr6 168352105 . G A 147.38 PASS AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0130202;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.76;QD=36.8441;RBI=0.0323584;REFB=0;REVB=0.0296234;RO=0;SAF=2;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.8379e-05;OID=.;OPOS=168352105;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:16:0:0:16:16:14:2:0:0:14:2:0:0 chr6 168370489 . TGGGGCCC TGGCCC,TGGCC,TGGGG 658.68 PASS AO=34,15,15;DP=135;FAO=0,87,0;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=0,24,0;FSAR=0,63,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.854859,0.300728,-0.6309;FXX=0.0224694;HRUN=4,4,4;LEN=2,3,3;MLLD=24.1746,35.6668,21.0319;QD=30.2841;RBI=0.855786,0.320174,0.67008;REFB=-0.114721,-0.126772,-0.0483483;REVB=-0.0398025,0.109881,0.225771;RO=0;SAF=0,0,15;SAR=34,15,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.412698,0.412698,0.309218;SSEP=0,0,0.475325;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=del,del,del;VARB=0.0165309,0.00223511,0;OID=.,.,.;OPOS=168370490,168370492,168370494;OREF=GG,GGC,CCC;OALT=-,-,-;OMAPALT=TGGCCC,TGGCC,TGGGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:34,15,15:87:0,87,0:87:0:0,24,0:0,63,0:0:0:52:0:0,0,15:34,15,0:0:0 chr6 168377261 . T G 34.46 PASS AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0519037;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.2017;QD=22.9731;RBI=0.0519037;REFB=-0.104236;REVB=0;RO=1;SAF=5;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0404947;OID=.;OPOS=168377261;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:6:6:1:1:5:5:0:5:1:0:0:5:1:0 chr6 168442765 . G A 77.27 PASS AO=12;DP=39;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.00879974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.047;QD=7.72668;RBI=0.0832749;REFB=-0.0339923;REVB=0.0828087;RO=12;SAF=6;SAR=6;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.292983;STB=0.604282;TYPE=snp;VARB=0.0307864;OID=.;OPOS=168442765;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:31:40:12:22:12:18:6:6:2:10:8:10:8:14 chr6 168457801 . A G 210.68 PASS AO=22;DP=22;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0178093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.069;QD=36.6392;RBI=0.0195071;REFB=0;REVB=-0.00795947;RO=0;SAF=22;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000145795;OID=.;OPOS=168457801;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:22:23:0:0:22:23:0:22:0:0:1:22:0:0 chr6 168457966 . G A 65.36 PASS AO=10;DP=17;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0513935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.27;QD=14.5237;RBI=0.0519251;REFB=-0.0440344;REVB=0.0074107;RO=7;SAF=6;SAR=4;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.318367;STB=0.653205;TYPE=snp;VARB=0.0337877;OID=.;OPOS=168457966;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:17:18:7:7:10:11:4:6:1:6:5:6:1:6 chr6 168459845 . G C 615.2 PASS AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0388913;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=161.823;QD=37.8585;RBI=0.0585063;REFB=0;REVB=0.0437087;RO=0;SAF=19;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.91737e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.92886e-05;OID=.;OPOS=168459845;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:65:65:0:0:65:65:46:19:0:0:46:19:0:0 chr6 168462626 . G A 404.91 PASS AO=78;DP=128;FAO=78;FDP=132;FR=.;FRO=54;FSAF=35;FSAR=43;FSRF=36;FSRR=18;FWDB=-0.0131388;FXX=0.0149243;HRUN=3;LEN=1;MLLD=115.84;QD=12.2699;RBI=0.0131467;REFB=-0.0385019;REVB=-0.000455261;RO=48;SAF=35;SAR=43;SRF=34;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180992;STB=0.588451;TYPE=snp;VARB=0.0243722;OID=.;OPOS=168462626;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:132:48:54:78:78:43:35:34:14:43:35:36:18 chr6 168479604 . G A 484.75 PASS AO=49;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00661788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.384;QD=38.7799;RBI=0.0482752;REFB=0;REVB=0.0478195;RO=0;SAF=25;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000128337;OID=.;OPOS=168479604;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:49:50:0:0:49:50:24:25:0:0:25:25:0:0 chr6 168482110 . C T 688.58 PASS AO=52;DP=84;FAO=78;FDP=80;FR=.,HEALED;FRO=2;FSAF=54;FSAR=24;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0519911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.911;QD=34.4289;RBI=0.0525531;REFB=-0.0795206;REVB=0.00766517;RO=2;SAF=43;SAR=9;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0214078;STB=0.509089;TYPE=snp;VARB=0.00270808;OID=.;OPOS=168482110;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:74:80:2:2:52:78:9:43:2:0:24:54:2:0 chr6 168482111 . G T 34.8 PASS AO=19;DP=80;FAO=19;FDP=80;FR=.;FRO=61;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=51;FSRR=10;FWDB=-0.00355767;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=82.4777;QD=1.73992;RBI=0.0286789;REFB=-0.0459714;REVB=0.0284574;RO=60;SAF=5;SAR=14;SRF=51;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.641767;STB=0.866984;TYPE=snp;VARB=0.0329056;OID=.;OPOS=168482111;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:80:80:60:61:19:19:14:5:51:9:14:5:51:10 chr6 168694594 . C T 216.74 PASS AO=75;DP=203;FAO=74;FDP=202;FR=.;FRO=128;FSAF=45;FSAR=29;FSRF=69;FSRR=59;FWDB=0.0259235;FXX=0.00492587;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.4567;QD=4.29179;RBI=0.0612161;REFB=0.0166423;REVB=-0.0554561;RO=128;SAF=46;SAR=29;SRF=68;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0937622;STB=0.544992;TYPE=snp;VARB=-0.0343077;OID=.;OPOS=168694594;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:202:128:128:75:74:29:46:68:60:29:45:69:59 chr6 168708274 . C T 21.11 PASS AO=3;DP=9;FAO=4;FDP=10;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0160614;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.083;QD=8.44498;RBI=0.0162581;REFB=-0.00740939;REVB=-0.00252118;RO=6;SAF=1;SAR=2;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.317885;STB=0.748749;TYPE=snp;VARB=0.006109;OID=.;OPOS=168708274;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:9:10:6:6:3:4:2:1:4:2:3:1:4:2 chr6 168708751 . A G 10.47 PASS AO=2;DP=6;FAO=2;FDP=6;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0408105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.676;QD=6.97934;RBI=0.0408187;REFB=0.0135394;REVB=-0.000820903;RO=3;SAF=1;SAR=1;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142842;STB=0.665181;TYPE=snp;VARB=-0.0332566;OID=.;OPOS=168708751;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:3:4:2:2:1:1:2:1:1:1:3:1 chr6 168709385 . T C 100.06 PASS AO=21;DP=67;FAO=31;FDP=77;FR=.;FRO=46;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=0.0250087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.423;QD=5.19806;RBI=0.0336543;REFB=-0.0259352;REVB=-0.0225206;RO=44;SAF=8;SAR=13;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0872007;STB=0.561512;TYPE=snp;VARB=0.0411626;OID=.;OPOS=168709385;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:77:44:46:21:31:13:8:20:24:13:18:22:24 chr6 169064933 . T C 357.79 PASS AO=87;DP=181;FAO=87;FDP=181;FR=.;FRO=94;FSAF=34;FSAR=53;FSRF=38;FSRR=56;FWDB=0.0268758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.033;QD=7.90689;RBI=0.0277191;REFB=-0.00183044;REVB=-0.00678531;RO=93;SAF=34;SAR=53;SRF=38;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0174216;STB=0.50731;TYPE=snp;VARB=0.00227449;OID=.;OPOS=169064933;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:181:93:94:87:87:53:34:38:55:53:34:38:56 chr6 169619933 . T TTTCCTTCC 307.1 PASS AO=43;DP=78;FAO=47;FDP=63;FR=.;FRO=16;FSAF=1;FSAR=46;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.115137;FXX=0.0869439;HRUN=3;LEN=8;MLLD=218.667;QD=19.4983;RBI=0.115138;REFB=-0.0110241;REVB=-0.000444475;RO=26;SAF=1;SAR=42;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.781987;STB=0.915155;TYPE=ins;VARB=0.00240274;OID=.;OPOS=169619934;OREF=-;OALT=TTCCTTCC;OMAPALT=TTTCCTTCC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:43:78:47:63:16:1:46:11:5:34:26:1:42:18:8 chr6 169621536 . A G 1500.4 PASS AO=157;DP=157;FAO=156;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148812;FXX=0.0126574;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.5;QD=38.4718;RBI=0.0260765;REFB=0;REVB=0.0214134;RO=0;SAF=82;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.86153e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.60699e-05;OID=.;OPOS=169621536;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:157:156:0:0:157:156:75:82:0:0:76:80:0:0 chr6 169622490 . G A 769.25 PASS AO=84;DP=86;FAO=84;FDP=86;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0472679;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.8261;QD=35.7792;RBI=0.0574269;REFB=0.0812833;REVB=-0.0326128;RO=2;SAF=33;SAR=51;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0182123;STB=0.509613;TYPE=snp;VARB=-0.00483666;OID=.;OPOS=169622490;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:86:86:2:2:84:84:51:33:0:2:51:33:0:2 chr6 169626274 . C T 24.43 PASS AO=13;DP=57;FAO=13;FDP=57;FR=.;FRO=44;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=-0.000652646;FXX=0.0172384;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.721;QD=1.71421;RBI=0.0440022;REFB=-0.0087623;REVB=0.0439973;RO=43;SAF=2;SAR=11;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.476446;STB=0.799495;TYPE=snp;VARB=0.137448;OID=.;OPOS=169626274;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:57:57:43:44:13:13:11:2:22:21:11:2:22:22 chr6 169648623 . GC G 48.76 PASS AO=51;DP=130;FAO=44;FDP=131;FR=.;FRO=87;FSAF=5;FSAR=39;FSRF=35;FSRR=52;FWDB=0.0471644;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.8951;QD=1.48872;RBI=0.134373;REFB=-0.0815766;REVB=-0.125823;RO=76;SAF=6;SAR=45;SRF=32;SRR=44;SSEN=0.411765;SSEP=0;SSSB=-0.453205;STB=0.774042;TYPE=del;VARB=0.104242;OID=.;OPOS=169648624;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:51:129:44:131:87:5:39:35:52:48:76:6:45:32:44 chr6 170179291 . TC T 22.45 PASS AO=15;DP=82;FAO=19;FDP=63;FR=.;FRO=44;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=28;FWDB=-0.102573;FXX=0.0454477;HRUN=4;LEN=1;MLLD=16.2918;QD=1.42517;RBI=0.121561;REFB=0.0321162;REVB=-0.0652381;RO=43;SAF=9;SAR=6;SRF=16;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0.472222;SSSB=0.269825;STB=0.681635;TYPE=del;VARB=-0.120265;OID=.;OPOS=170179292;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:15:66:19:63:44:12:7:16:28:22:43:9:6:16:27 chr6 170485648 . G T 18.09 PASS AO=3;DP=7;FAO=3;FDP=6;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.00720018;FXX=0.142653;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.273;QD=12.0578;RBI=0.00720018;REFB=-0.0238948;REVB=0;RO=4;SAF=3;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0196245;OID=.;OPOS=170485648;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:7:6:4:3:3:3:0:3:4:0:0:3:3:0 chr6 170485708 . G C 119 PASS AO=17;DP=22;FAO=17;FDP=22;FR=.;FRO=5;FSAF=16;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.00904636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.2844;QD=21.6356;RBI=0.120507;REFB=-0.0234136;REVB=0.120167;RO=5;SAF=16;SAR=1;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205433;STB=0.615222;TYPE=snp;VARB=0.0309068;OID=.;OPOS=170485708;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:22:22:5:5:17:17:1:16:4:1:1:16:4:1 chr6 170591923 . T G 1023.12 PASS AO=114;DP=119;FAO=114;FDP=119;FR=.;FRO=5;FSAF=50;FSAR=64;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0214122;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=120.198;QD=34.3907;RBI=0.023015;REFB=-0.146815;REVB=0.00843832;RO=5;SAF=50;SAR=64;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00312388;STB=0.501647;TYPE=snp;VARB=0.000872663;OID=.;OPOS=170591923;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:119:119:5:5:114:114:64:50:2:3:64:50:2:3 chr6 170626943 . T C 662.43 PASS AO=74;DP=77;FAO=74;FDP=77;FR=.;FRO=3;FSAF=38;FSAR=36;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0798346;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.8938;QD=34.4121;RBI=0.0811136;REFB=-0.193198;REVB=-0.0143476;RO=3;SAF=38;SAR=36;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0112898;STB=0.505972;TYPE=snp;VARB=0.00479945;OID=.;OPOS=170626943;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:77:77:3:3:74:74:36:38:2:1:36:38:2:1 chr6 170627586 . G T 371.03 PASS AO=39;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0557482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.8838;QD=37.1025;RBI=0.06113;REFB=-0.0630371;REVB=0.0250802;RO=1;SAF=26;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0346908;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0101635;OID=.;OPOS=170627586;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:40:40:1:0:39:40:13:26:0:1:14:26:0:0 chr6 170627614 . T C 146.05 PASS AO=19;DP=24;FAO=20;FDP=24;FR=.;FRO=4;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.295162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.64;QD=24.3423;RBI=0.297346;REFB=-0.0713132;REVB=0.0359664;RO=5;SAF=8;SAR=11;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0875305;STB=0.576849;TYPE=snp;VARB=0.0152434;OID=.;OPOS=170627614;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:24:24:5:4:19:20:11:8:1:4:11:9:0:4 chr6 170627739 . G C 14.28 PASS AO=8;DP=32;FAO=7;FDP=36;FR=.;FRO=29;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=23;FWDB=-0.049746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.744;QD=1.58651;RBI=0.0800206;REFB=-0.0328458;REVB=-0.0626788;RO=23;SAF=1;SAR=7;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.258438;STB=0.591258;TYPE=snp;VARB=0.0594434;OID=.;OPOS=170627739;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:32:36:23:29:8:7:7:1:6:17:6:1:6:23 chr6 170627761 . A G 184.16 PASS AO=22;DP=26;FAO=23;FDP=26;FR=.;FRO=3;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.115046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.762;QD=28.3327;RBI=0.116146;REFB=0.0115039;REVB=-0.015947;RO=3;SAF=9;SAR=13;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0173683;STB=0.55168;TYPE=snp;VARB=-0.000831869;OID=.;OPOS=170627761;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:26:26:3:3:22:23:13:9:1:2:13:10:0:3 chr6 170627797 . A G 106.26 PASS AO=16;DP=22;FAO=16;FDP=22;FR=.;FRO=6;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.0736139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.578;QD=19.3206;RBI=0.0740932;REFB=-0.00913705;REVB=0.00841323;RO=6;SAF=12;SAR=4;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.384538;STB=0.714007;TYPE=snp;VARB=0.00736335;OID=.;OPOS=170627797;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:22:22:6:6:16:16:4:12:0:6:4:12:0:6 chr6 170628009 . T G 1210.49 PASS AO=127;DP=128;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0279197;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.535;QD=37.8278;RBI=0.0320082;REFB=-0.0046562;REVB=-0.0156529;RO=1;SAF=44;SAR=83;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106765;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.74271e-05;OID=.;OPOS=170628009;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:128:128:1:0:127:128:83:44:1:0:83:45:0:0 chr6 170845354 . A G 230.36 PASS AO=53;DP=108;FAO=53;FDP=107;FR=.;FRO=54;FSAF=35;FSAR=18;FSRF=35;FSRR=19;FWDB=0.00166794;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.555;QD=8.61168;RBI=0.0713692;REFB=-0.0167401;REVB=0.0713498;RO=54;SAF=35;SAR=18;SRF=35;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0123684;STB=0.506847;TYPE=snp;VARB=0.0172839;OID=.;OPOS=170845354;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:107:54:54:53:53:18:35:35:19:18:35:35:19 chr6 170862300 . G C 107.29 PASS AO=33;DP=86;FAO=33;FDP=87;FR=.;FRO=54;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=28;FSRR=26;FWDB=-0.0597719;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.844;QD=4.93272;RBI=0.0618786;REFB=-0.0136228;REVB=0.0160088;RO=53;SAF=13;SAR=20;SRF=28;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146194;STB=0.578231;TYPE=snp;VARB=0.0235222;OID=.;OPOS=170862300;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:87:53:54:33:33:20:13:28:25:20:13:28:26 chr6 170878793 . T C 647.45 PASS AO=158;DP=339;FAO=167;FDP=360;FR=.;FRO=193;FSAF=68;FSAR=99;FSRF=102;FSRR=91;FWDB=-0.00318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.154;QD=7.19389;RBI=0.0206394;REFB=-0.0217595;REVB=0.020393;RO=181;SAF=68;SAR=90;SRF=102;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128896;STB=0.565706;TYPE=snp;VARB=0.0296595;OID=.;OPOS=170878793;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:339:360:181:193:158:167:90:68:102:79:99:68:102:91 chr6 170887693 . G C 238.35 PASS AO=42;DP=66;FAO=42;FDP=66;FR=.;FRO=24;FSAF=29;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=5;FWDB=0.00952065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.924;QD=14.4453;RBI=0.0154628;REFB=-0.0248625;REVB=-0.0121843;RO=24;SAF=29;SAR=13;SRF=19;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.081888;STB=0.544482;TYPE=snp;VARB=0.0118502;OID=.;OPOS=170887693;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:66:66:24:24:42:42:13:29:19:5:13:29:19:5 chr7 228527 . TG T,GT 115.28 PASS AO=8,7;DP=31;FAO=19,5;FDP=27;FR=.;FRO=3;FSAF=0,0;FSAR=19,5;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0,0;FXX=0;HRUN=5,1;LEN=1,2;MLLD=11.0478,33.2621;QD=17.0782;RBI=0.269035,0.0258019;REFB=-0.0682466,-0.0179029;REVB=0.269035,0.0258019;RO=11;SAF=0,0;SAR=8,7;SRF=0;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0.516484,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,mnp;VARB=0.107131,0.0136879;OID=.,.;OPOS=228528,228527;OREF=G,TG;OALT=-,GT;OMAPALT=T,GT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:13:27:27:11:3:8,7:19,5:8,7:0,0:0:11:19,5:0,0:0:3 chr7 299850 . G T 38.27 PASS AO=11;DP=32;FAO=11;FDP=32;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.00174402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.346;QD=4.78421;RBI=0.0281643;REFB=-0.00559139;REVB=-0.0281103;RO=21;SAF=8;SAR=3;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.42004;STB=0.750938;TYPE=snp;VARB=0.00477961;OID=.;OPOS=299850;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:32:32:21:21:11:11:3:8:7:14:3:8:7:14 chr7 299881 . A G 50.97 PASS AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.0816185;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.1151;QD=7.28138;RBI=0.0819318;REFB=0.00685784;REVB=-0.00715862;RO=16;SAF=9;SAR=3;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.270626;STB=0.659715;TYPE=snp;VARB=-0.0152925;OID=.;OPOS=299881;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:28:28:16:16:12:12:3:9:8:8:3:9:8:8 chr7 331427 . C A 15.78 PASS AO=3;DP=7;FAO=3;FDP=7;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.096;QD=9.01796;RBI=0.000140326;REFB=0.00321351;REVB=0.000140326;RO=4;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00339324;OID=.;OPOS=331427;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:7:7:4:4:3:3:3:0:0:4:3:0:0:4 chr7 470239 . A G 164.88 PASS AO=32;DP=67;FAO=36;FDP=71;FR=.;FRO=35;FSAF=7;FSAR=29;FSRF=3;FSRR=32;FWDB=0.107972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.55;QD=9.289;RBI=0.109004;REFB=-0.00128032;REVB=-0.014959;RO=35;SAF=4;SAR=28;SRF=3;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0908584;STB=0.595491;TYPE=snp;VARB=0.00151386;OID=.;OPOS=470239;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:71:35:35:32:36:28:4:3:32:29:7:3:32 chr7 470281 . A G 412.47 PASS AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.308;QD=37.4975;RBI=0.0273947;REFB=0;REVB=0.023522;RO=0;SAF=3;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000125267;OID=.;OPOS=470281;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:43:44:0:0:43:44:40:3:0:0:41:3:0:0 chr7 470316 . A G 117.01 PASS AO=18;DP=28;FAO=19;FDP=29;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=10;FWDB=0.0105792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.2935;QD=16.1389;RBI=0.0282758;REFB=-0.0292689;REVB=-0.0262221;RO=10;SAF=2;SAR=16;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218315;STB=0.613539;TYPE=snp;VARB=0.0144127;OID=.;OPOS=470316;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:28:29:10:10:18:19:16:2:0:10:17:2:0:10 chr7 540741 . G A 419.74 PASS AO=95;DP=186;FAO=95;FDP=185;FR=.;FRO=90;FSAF=41;FSAR=54;FSRF=47;FSRR=43;FWDB=-0.000992946;FXX=0.00537606;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.7963;QD=9.0754;RBI=0.0897438;REFB=-0.0174373;REVB=0.0897383;RO=87;SAF=41;SAR=54;SRF=46;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0852561;STB=0.544383;TYPE=snp;VARB=0.0263229;OID=.;OPOS=540741;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:185:87:90:95:95:54:41:46:41:54:41:47:43 chr7 618938 . A G 78.14 PASS AO=21;DP=51;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=21;FSRR=10;FWDB=-0.00779752;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.875;QD=6.01072;RBI=0.0198058;REFB=-0.00315222;REVB=0.0182063;RO=30;SAF=14;SAR=7;SRF=21;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0390746;STB=0.50724;TYPE=snp;VARB=0.0111361;OID=.;OPOS=618938;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:51:52:30:31:21:21:7:14:21:9:7:14:21:10 chr7 624221 . T G 309.33 PASS AO=81;DP=231;FAO=96;FDP=242;FR=.;FRO=146;FSAF=47;FSAR=49;FSRF=63;FSRR=83;FWDB=0.0617682;FXX=0.0241926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.242;QD=5.11292;RBI=0.0637995;REFB=-0.00850923;REVB=0.0159708;RO=122;SAF=40;SAR=41;SRF=54;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0548323;STB=0.535097;TYPE=snp;VARB=0.0141195;OID=.;OPOS=624221;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:231:242:122:146:81:96:41:40:54:68:49:47:63:83 chr7 772174 . G A 786.12 PASS AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.211;QD=37.8853;RBI=0.0386173;REFB=0;REVB=0.0314472;RO=0;SAF=31;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.42687e-05;OID=.;OPOS=772174;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:83:83:0:0:83:83:52:31:0:0:52:31:0:0 chr7 808810 . C G 81.13 PASS AO=15;DP=26;FAO=15;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=-0.0337519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.638;QD=12.4817;RBI=0.0369779;REFB=-0.0450446;REVB=0.0151053;RO=11;SAF=4;SAR=11;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00578055;STB=0.503264;TYPE=snp;VARB=0.0205156;OID=.;OPOS=808810;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:26:26:11:11:15:15:11:4:3:8:11:4:3:8 chr7 810219 . T C 119.1 PASS AO=32;DP=72;FAO=31;FDP=72;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=-0.109963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.96;QD=6.6167;RBI=0.110602;REFB=-0.0173987;REVB=0.0118712;RO=39;SAF=18;SAR=14;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123327;STB=0.548356;TYPE=snp;VARB=0.015602;OID=.;OPOS=810219;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:39:41:32:31:14:18:17:22:14:17:19:22 chr7 814788 . G A 754.31 PASS AO=80;DP=81;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0264521;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.122;QD=36.7954;RBI=0.0360792;REFB=-0.0653125;REVB=0.0245356;RO=1;SAF=33;SAR=47;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00996796;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00146449;OID=.;OPOS=814788;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:81:82:1:0:80:82:47:33:0:1:49:33:0:0 chr7 881668 . C T 430.82 PASS AO=49;DP=53;FAO=50;FDP=53;FR=.;FRO=3;FSAF=10;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0893488;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.887;QD=32.5144;RBI=0.0895404;REFB=-0.0522554;REVB=0.005854;RO=1;SAF=9;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116232;STB=0.518065;TYPE=snp;VARB=0.00119766;OID=.;OPOS=881668;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:53:53:1:3:49:50:40:9:0:1:40:10:0:3 chr7 882829 . G T 25.04 PASS AO=8;DP=34;FAO=12;FDP=40;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=0.0140526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.816;QD=2.5036;RBI=0.0148647;REFB=-0.0018321;REVB=-0.0048459;RO=17;SAF=6;SAR=2;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203766;STB=0.730376;TYPE=snp;VARB=0.00667533;OID=.;OPOS=882829;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:34:40:17:28:8:12:2:6:10:7:3:9:12:16 chr7 882895 . C G 555.78 PASS AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.4065;QD=38.3295;RBI=0.0263622;REFB=0;REVB=-0.0233103;RO=0;SAF=30;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.86963e-05;OID=.;OPOS=882895;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:58:58:0:0:58:58:28:30:0:0:28:30:0:0 chr7 889592 . G A 446.41 PASS AO=81;DP=130;FAO=81;FDP=130;FR=.;FRO=49;FSAF=24;FSAR=57;FSRF=21;FSRR=28;FWDB=-0.0289583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.58;QD=13.7357;RBI=0.0340523;REFB=-0.0463492;REVB=-0.0179158;RO=49;SAF=24;SAR=57;SRF=21;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104985;STB=0.556989;TYPE=snp;VARB=0.0344515;OID=.;OPOS=889592;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:49:49:81:81:57:24:21:28:57:24:21:28 chr7 912958 . C A 658.14 PASS AO=146;DP=277;FAO=146;FDP=277;FR=.;FRO=131;FSAF=71;FSAR=75;FSRF=85;FSRR=46;FWDB=-0.0214747;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.1318;QD=9.50384;RBI=0.0269047;REFB=-0.00740545;REVB=0.016208;RO=130;SAF=71;SAR=75;SRF=84;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137705;STB=0.5766;TYPE=snp;VARB=0.00384836;OID=.;OPOS=912958;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:277:277:130:131:146:146:75:71:84:46:75:71:85:46 chr7 926827 . T C 506.68 PASS AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0228229;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.829;QD=36.1915;RBI=0.06175;REFB=-0.0037687;REVB=-0.0573775;RO=0;SAF=39;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11947e-08;STB=0.515146;TYPE=snp;VARB=-0.000219788;OID=.;OPOS=926827;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:56:56:0:1:55:55:16:39:0:0:16:39:0:1 chr7 940181 . C T 221.2 PASS AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0116812;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.4438;QD=34.0315;RBI=0.0861815;REFB=-0.116599;REVB=0.0853862;RO=1;SAF=11;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0403161;STB=0.521722;TYPE=snp;VARB=0.00234149;OID=.;OPOS=940181;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:26:26:1:1:25:25:14:11:1:0:14:11:1:0 chr7 940258 . G GGGCAAAGGCA,GGCAAAGGCA 46.45 PASS AO=6,4;DP=23;FAO=10,0;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=3,0;FSAR=7,0;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=-0.0428021,-0.0568975;FXX=0.0832986;HRUN=4,4;LEN=10,9;MLLD=266.414,264.244;QD=8.44505;RBI=0.0462738,0.0603598;REFB=-0.0267669,-0.029206;REVB=-0.0175855,-0.020149;RO=12;SAF=2,2;SAR=4,2;SRF=5;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0946031,0.0918015;STB=0.521233,0.5;TYPE=ins,ins;VARB=0.0376657,0.0139296;OID=.,.;OPOS=940259,940259;OREF=-,-;OALT=GGCAAAGGCA,GCAAAGGCA;OMAPALT=GGGCAAAGGCA,GGCAAAGGCA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:6,4:23:10,0:22:12:3,0:7,0:4:8:43:12:2,2:4,2:5:7 chr7 1023013 . C T 34.21 PASS AO=5;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.,HEALED;FRO=6;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0849393;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.6607;QD=11.4039;RBI=0.110526;REFB=0.0165372;REVB=-0.0707192;RO=3;SAF=2;SAR=3;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.2842;STB=0.599699;TYPE=snp;VARB=-0.0167968;OID=.;OPOS=1023013;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:11:12:3:6:5:6:3:2:0:3:4:2:1:5 chr7 1024855 . G A 89.52 PASS AO=13;DP=20;FAO=13;FDP=19;FR=.;FRO=6;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0163843;FXX=0.049975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.9339;QD=18.846;RBI=0.02456;REFB=-0.0400821;REVB=0.0182961;RO=6;SAF=11;SAR=2;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.284443;STB=0.662361;TYPE=snp;VARB=0.0169051;OID=.;OPOS=1024855;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:20:19:6:6:13:13:2:11:3:3:2:11:3:3 chr7 1097952 . C T 130.88 PASS AO=28;DP=54;FAO=28;FDP=54;FR=.;FRO=26;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=-0.0329256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.972;QD=9.69508;RBI=0.043571;REFB=-0.0302312;REVB=-0.0285366;RO=26;SAF=19;SAR=9;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136648;STB=0.507617;TYPE=snp;VARB=0.0266728;OID=.;OPOS=1097952;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:26:26:28:28:9:19:18:8:9:19:18:8 chr7 1098372 . G A 126.54 PASS AO=36;DP=89;FAO=36;FDP=89;FR=.;FRO=53;FSAF=27;FSAR=9;FSRF=25;FSRR=28;FWDB=-0.0454625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.518;QD=5.68718;RBI=0.0457968;REFB=-0.0262564;REVB=0.00552306;RO=52;SAF=27;SAR=9;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.306451;STB=0.680875;TYPE=snp;VARB=0.0312906;OID=.;OPOS=1098372;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:52:53:36:36:9:27:25:27:9:27:25:28 chr7 1131411 . C T 130.08 PASS AO=26;DP=46;FAO=26;FDP=48;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=-0.0148275;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=149.879;QD=10.8398;RBI=0.0148282;REFB=-0.00386547;REVB=-0.000142975;RO=20;SAF=10;SAR=16;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115066;STB=0.532621;TYPE=snp;VARB=0.00229775;OID=.;OPOS=1131411;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:46:48:20:22:26:26:16:10:5:15:16:10:7:15 chr7 1132456 . C T 78.34 PASS AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.000149529;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.9388;QD=7.28745;RBI=0.0170542;REFB=-0.00254115;REVB=0.0170535;RO=24;SAF=11;SAR=8;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00439071;STB=0.50251;TYPE=snp;VARB=0.00549041;OID=.;OPOS=1132456;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:43:43:24:24:19:19:8:11:14:10:8:11:14:10 chr7 1132505 . G A 90.79 PASS AO=12;DP=57;FAO=23;FDP=55;FR=.,HEALED;FRO=32;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=0.00924089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.5068;QD=6.60316;RBI=0.0450712;REFB=-0.0348906;REVB=0.0441137;RO=20;SAF=9;SAR=3;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.067063;STB=0.519983;TYPE=snp;VARB=0.0548302;OID=.;OPOS=1132505;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:44:55:20:32:12:23:3:9:14:6:13:10:15:17 chr7 1132748 . G A 97.76 PASS AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0197166;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.5622;QD=30.0812;RBI=0.0796722;REFB=0.024156;REVB=0.077194;RO=1;SAF=8;SAR=4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0998765;STB=0.55546;TYPE=snp;VARB=-0.00084165;OID=.;OPOS=1132748;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:13:13:1:1:12:12:4:8:0:1:4:8:0:1 chr7 1133305 . C G 121.48 PASS AO=33;DP=79;FAO=33;FDP=79;FR=.;FRO=46;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=-0.035224;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.6752;QD=6.15079;RBI=0.038759;REFB=-0.00793142;REVB=0.0161719;RO=45;SAF=16;SAR=17;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0946005;STB=0.546679;TYPE=snp;VARB=0.0123919;OID=.;OPOS=1133305;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:45:46:33:33:17:16:26:19:17:16:26:20 chr7 1481919 . C A 383.89 PASS AO=46;DP=51;FAO=47;FDP=52;FR=.;FRO=5;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0130456;FXX=0.0188644;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.996;QD=29.5302;RBI=0.0454107;REFB=-0.15805;REVB=0.0434965;RO=2;SAF=27;SAR=19;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00700837;STB=0.536408;TYPE=snp;VARB=0.00208331;OID=.;OPOS=1481919;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:51:52:2:5:46:47:19:27:1:1:20:27:1:4 chr7 1484572 . A G 79.13 PASS AO=3;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0701849;FXX=0.0999001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5998;QD=35.1673;RBI=0.0723319;REFB=0;REVB=0.0174921;RO=0;SAF=2;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00401938;OID=.;OPOS=1484572;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:9:0:0:3:9:1:2:0:0:4:5:0:0 chr7 1484573 . C G 29.54 PASS AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.00437923;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=162.55;QD=11.8167;RBI=0.0164028;REFB=0.00209984;REVB=0.0158074;RO=4;SAF=3;SAR=2;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0744193;STB=0.599599;TYPE=snp;VARB=-4.82907e-05;OID=.;OPOS=1484573;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:9:10:4:5:5:5:2:3:2:2:2:3:2:3 chr7 1498946 . GC G 166.38 PASS AO=23;DP=38;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243356;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.7089;QD=25.5974;RBI=0.0378143;REFB=0;REVB=-0.0289431;RO=2;SAF=2;SAR=21;SRF=2;SRR=0;SSEN=0.588235;SSEP=0;SSSB=-0.302562;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.00490413;OID=.;OPOS=1498947;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:23:26:26:26:0:5:21:0:0:15:2:2:21:2:0 chr7 1513844 . GC G 43.43 PASS AO=10;DP=20;FAO=12;FDP=18;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0340201;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.9171;QD=9.6503;RBI=0.0549752;REFB=-0.0418702;REVB=-0.0431845;RO=7;SAF=4;SAR=6;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0211612;STB=0.559897;TYPE=del;VARB=0.0168948;OID=.;OPOS=1513845;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:10:18:12:18:6:4:8:3:3:13:7:4:6:3:4 chr7 1538021 . G A 60.49 PASS AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=2;FWDB=-0.0248578;FXX=0.0357015;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.2713;QD=8.96216;RBI=0.0293967;REFB=-0.028162;REVB=0.0156925;RO=14;SAF=9;SAR=4;SRF=12;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19147;STB=0.608548;TYPE=snp;VARB=0.020285;OID=.;OPOS=1538021;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:27:27:14:14:13:13:4:9:12:2:4:9:12:2 chr7 1588515 . TGGGGGG TGGGGG,TGGGGGGGC,GGGGGGG 25.73 PASS AO=3,2,2;DP=14;FAO=1,3,2;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=1,3,2;FSAR=0,0,0;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.0226994,0.0878171,-0.00176833;FXX=0;HRUN=6,6,1;LEN=1,2,1;MLLD=6.38956,22.8385,157.934;QD=8.5769;RBI=0.0226994,0.0878171,0.00176833;REFB=-0.219087,0.134198,-0.0192797;REVB=0,0,0;RO=3;SAF=3,2,2;SAR=0,0,0;SRF=3;SRR=0;SSEN=1,0,0;SSEP=0.494118,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=del,ins,snp;VARB=0.17192,0.0736263,0.0304732;OID=.,.,.;OPOS=1588516,1588522,1588515;OREF=G,-,T;OALT=-,GC,G;OMAPALT=TGGGGG,TGGGGGGGC,GGGGGGG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:14:13:12:3:6:3,2,2:1,3,2:0,0,0:3,2,2:3:0:0,0,0:1,3,2:6:0 chr7 1733102 . G T 135.44 PASS AO=29;DP=54;FAO=29;FDP=56;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=26;FWDB=-0.0318797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.602;QD=9.67389;RBI=0.0414862;REFB=-0.00570781;REVB=0.0265478;RO=25;SAF=10;SAR=19;SRF=1;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.317525;STB=0.682755;TYPE=snp;VARB=0.00666592;OID=.;OPOS=1733102;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:56:25:27:29:29:19:10:1:24:19:10:1:26 chr7 1733182 . C T 148.46 PASS AO=38;DP=89;FAO=39;FDP=90;FR=.;FRO=51;FSAF=7;FSAR=32;FSRF=14;FSRR=37;FWDB=-0.0140727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.245;QD=6.59826;RBI=0.0257408;REFB=-0.0132436;REVB=-0.0215533;RO=51;SAF=7;SAR=31;SRF=14;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136419;STB=0.581773;TYPE=snp;VARB=0.0175218;OID=.;OPOS=1733182;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:90:51:51:38:39:31:7:14:37:32:7:14:37 chr7 1733192 . C T 140.45 PASS AO=37;DP=85;FAO=37;FDP=85;FR=.;FRO=48;FSAF=10;FSAR=27;FSRF=14;FSRR=34;FWDB=0.0401019;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.3826;QD=6.6094;RBI=0.0402788;REFB=-0.00950022;REVB=0.00377096;RO=47;SAF=10;SAR=27;SRF=14;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0341238;STB=0.515095;TYPE=snp;VARB=0.0154994;OID=.;OPOS=1733192;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:47:48:37:37:27:10:14:33:27:10:14:34 chr7 1785738 . G A 69.5 PASS AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=0;FWDB=-0.0465527;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.4143;QD=10.297;RBI=0.0539023;REFB=-0.0433289;REVB=0.0271716;RO=13;SAF=10;SAR=4;SRF=13;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.357042;STB=0.696765;TYPE=snp;VARB=0.0278714;OID=.;OPOS=1785738;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:27:27:13:13:14:14:4:10:13:0:4:10:13:0 chr7 1878377 . A G 860.96 PASS AO=89;DP=90;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00116675;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.77;QD=38.695;RBI=0.0115663;REFB=0;REVB=0.0115073;RO=0;SAF=46;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000328186;OID=.;OPOS=1878377;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:90:89:0:0:89:89:43:46:0:0:43:46:0:0 chr7 1878453 . T A 842.11 PASS AO=89;DP=93;FAO=91;FDP=92;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0294786;FXX=0.0212743;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.8862;QD=36.6136;RBI=0.0448317;REFB=-0.0556139;REVB=0.0337772;RO=0;SAF=46;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505154;TYPE=snp;VARB=0.00161403;OID=.;OPOS=1878453;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:93:92:0:1:89:91:43:46:0:0:43:48:1:0 chr7 1886937 . C T 1302.12 PASS AO=137;DP=139;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00196601;FXX=0.0143875;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.233;QD=38.0181;RBI=0.0272925;REFB=-0.0530634;REVB=-0.0272216;RO=1;SAF=84;SAR=53;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00888519;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00022617;OID=.;OPOS=1886937;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:139:137:1:0:137:137:53:84:0:1:53:84:0:0 chr7 1887362 . G A 465.1 PASS AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0133329;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=221.352;QD=35.7768;RBI=0.0321647;REFB=-0.0193922;REVB=0.0292712;RO=1;SAF=22;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0209217;STB=0.511107;TYPE=snp;VARB=0.000147284;OID=.;OPOS=1887362;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:52:52:1:1:51:51:29:22:1:0:29:22:1:0 chr7 1976457 . C T 481.19 PASS AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0540091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.362;QD=37.7403;RBI=0.060397;REFB=0;REVB=0.0270336;RO=0;SAF=28;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97956e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000500742;OID=.;OPOS=1976457;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:51:51:0:0:51:51:23:28:0:0:23:28:0:0 chr7 2257612 . G A 121.43 PASS AO=44;DP=129;FAO=44;FDP=129;FR=.;FRO=85;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=52;FSRR=33;FWDB=-0.0430526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.9062;QD=3.76519;RBI=0.052049;REFB=-0.0159064;REVB=0.0292501;RO=85;SAF=27;SAR=17;SRF=52;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00225659;STB=0.501299;TYPE=snp;VARB=0.0329236;OID=.;OPOS=2257612;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:85:85:44:44:17:27:52:33:17:27:52:33 chr7 2290522 . C T 404.01 PASS AO=89;DP=173;FAO=90;FDP=173;FR=.;FRO=83;FSAF=28;FSAR=62;FSRF=22;FSRR=61;FWDB=-0.0161092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.526;QD=9.34126;RBI=0.0163992;REFB=-0.0238375;REVB=0.00307081;RO=81;SAF=28;SAR=61;SRF=22;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0442025;STB=0.526278;TYPE=snp;VARB=0.0229916;OID=.;OPOS=2290522;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:173:81:83:89:90:61:28:22:59:62:28:22:61 chr7 2297006 . A G 73.78 PASS AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.00792581;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.344;QD=8.94256;RBI=0.0171052;REFB=-0.0213093;REVB=-0.0151582;RO=17;SAF=6;SAR=10;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0894054;STB=0.551116;TYPE=snp;VARB=0.0197383;OID=.;OPOS=2297006;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:33:33:17:17:16:16:10:6:8:9:10:6:8:9 chr7 2303986 . T C 56.76 PASS AO=19;DP=53;FAO=18;FDP=52;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=-0.027758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.658;QD=4.366;RBI=0.0556741;REFB=-0.0191057;REVB=0.0482607;RO=32;SAF=11;SAR=8;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152096;STB=0.593118;TYPE=snp;VARB=0.0210602;OID=.;OPOS=2303986;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:53:52:32:34:19:18:8:11:14:18:8:10:14:20 chr7 2349470 . T C 45.96 PASS AO=4;DP=11;FAO=5;FDP=10;FR=.,HEALED;FRO=3;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0288073;FXX=0.0908265;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.7446;QD=18.3825;RBI=0.0320663;REFB=-0.0229764;REVB=-0.0140849;RO=3;SAF=4;SAR=0;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.705357;STB=0.57112;TYPE=snp;VARB=0.00363348;OID=.;OPOS=2349470;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:10:10:3:3:4:5:0:4:2:1:1:4:2:1 chr7 2473804 . G T 31.88 PASS AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=5;FSAR=0;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0317267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.423;QD=15.9406;RBI=0.0317267;REFB=-0.00444622;REVB=0;RO=3;SAF=5;SAR=0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00078742;OID=.;OPOS=2473804;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:8:8:3:3:5:5:0:5:3:0:0:5:3:0 chr7 2552881 . A AGATG 254.18 PASS AO=34;DP=109;FAO=43;FDP=64;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=33;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.0301016;FXX=0.272696;HRUN=1;LEN=4;MLLD=121.441;QD=15.886;RBI=0.0302188;REFB=-0.0780793;REVB=0.00265884;RO=51;SAF=9;SAR=25;SRF=18;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111746;STB=0.563536;TYPE=ins;VARB=0.0551753;OID=.;OPOS=2552882;OREF=-;OALT=GATG;OMAPALT=AGATG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:34:109:43:64:21:10:33:8:13:58:51:9:25:18:33 chr7 2567941 . GT G 62.27 PASS AO=30;DP=91;FAO=36;FDP=89;FR=.;FRO=53;FSAF=3;FSAR=33;FSRF=24;FSRR=29;FWDB=0.0265674;FXX=0.0111099;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.4595;QD=2.79882;RBI=0.10599;REFB=-0.0392583;REVB=-0.102607;RO=53;SAF=2;SAR=28;SRF=25;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.62227;STB=0.827069;TYPE=del;VARB=0.0694718;OID=.;OPOS=2567942;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:30:89:36:89:53:3:33:24:29:62:53:2:28:25:28 chr7 2577781 . T C 41.05 PASS AO=11;DP=30;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.00118495;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=218.912;QD=5.47295;RBI=0.00532606;REFB=-0.0079182;REVB=-0.00519258;RO=19;SAF=5;SAR=6;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0933329;STB=0.555457;TYPE=snp;VARB=0.0156836;OID=.;OPOS=2577781;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:30:30:19:19:11:11:6:5:7:12:6:5:7:12 chr7 2611878 . T C 346.18 PASS AO=69;DP=120;FAO=69;FDP=121;FR=.;FRO=52;FSAF=27;FSAR=42;FSRF=20;FSRR=32;FWDB=-0.0261068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.8637;QD=11.4441;RBI=0.0344533;REFB=-0.0250944;REVB=0.0224825;RO=47;SAF=27;SAR=42;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.026572;STB=0.50302;TYPE=snp;VARB=0.0211545;OID=.;OPOS=2611878;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:121:47:52:69:69:42:27:20:27:42:27:20:32 chr7 2613042 . G C 722.97 PASS AO=158;DP=303;FAO=160;FDP=302;FR=.;FRO=142;FSAF=92;FSAR=68;FSRF=63;FSRR=79;FWDB=0.00110674;FXX=0.022653;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.405;QD=9.57571;RBI=0.0243426;REFB=-0.0188979;REVB=-0.0243174;RO=136;SAF=92;SAR=66;SRF=61;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114267;STB=0.561994;TYPE=snp;VARB=0.0145028;OID=.;OPOS=2613042;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:303:302:136:142:158:160:66:92:61:75:68:92:63:79 chr7 2623351 . G A 101.46 PASS AO=24;DP=52;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.0790471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.7383;QD=7.80419;RBI=0.0930533;REFB=-0.00679272;REVB=0.0490966;RO=26;SAF=9;SAR=15;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0829761;STB=0.569248;TYPE=snp;VARB=0.00899686;OID=.;OPOS=2623351;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:26:28:24:24:15:9:12:14:15:9:14:14 chr7 2629729 . G A 101.35 PASS AO=21;DP=41;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=2;FSAR=19;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=-0.0024888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.186;QD=9.88781;RBI=0.0498372;REFB=-0.00190394;REVB=0.049775;RO=20;SAF=2;SAR=19;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280384;STB=0.661504;TYPE=snp;VARB=0.00418155;OID=.;OPOS=2629729;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:41:41:20:20:21:21:19:2:5:15:19:2:5:15 chr7 2644519 . C T 52.31 PASS AO=9;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.031186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.216;QD=13.9488;RBI=0.035897;REFB=0.0120778;REVB=-0.0177773;RO=6;SAF=6;SAR=3;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.437865;STB=0.749499;TYPE=snp;VARB=-0.00280219;OID=.;OPOS=2644519;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:15:15:6:6:9:9:3:6:0:6:3:6:0:6 chr7 2644607 . G T 18.62 PASS AO=4;DP=12;FAO=4;FDP=12;FR=.;FRO=8;FSAF=0;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.085;QD=6.20777;RBI=0.0102954;REFB=-0.00946772;REVB=-0.0102954;RO=8;SAF=0;SAR=4;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0174372;OID=.;OPOS=2644607;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:12:12:8:8:4:4:4:0:0:8:4:0:0:8 chr7 2645552 . A G 100.91 PASS AO=25;DP=56;FAO=25;FDP=56;FR=.;FRO=31;FSAF=5;FSAR=20;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=-0.0518267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.0223;QD=7.20748;RBI=0.0738367;REFB=-0.00694142;REVB=-0.0525913;RO=31;SAF=5;SAR=20;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236069;STB=0.635394;TYPE=snp;VARB=0.00496957;OID=.;OPOS=2645552;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:31:31:25:25:20:5:12:19:20:5:12:19 chr7 2646796 . G A 54.06 PASS AO=18;DP=54;FAO=18;FDP=54;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=1;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.109082;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.5801;QD=4.00439;RBI=0.109087;REFB=0.0109705;REVB=0.0010342;RO=36;SAF=17;SAR=1;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.657313;STB=0.901681;TYPE=snp;VARB=-0.0257253;OID=.;OPOS=2646796;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:54:54:36:36:18:18:1:17:18:18:1:17:18:18 chr7 2646950 . T G 67.68 PASS AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=12;FWDB=0.0420768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.784;QD=9.66808;RBI=0.0426162;REFB=-0.0123985;REVB=0.0067587;RO=14;SAF=6;SAR=8;SRF=2;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.269989;STB=0.651985;TYPE=snp;VARB=0.00728291;OID=.;OPOS=2646950;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:28:28:14:14:14:14:8:6:2:12:8:6:2:12 chr7 2649704 . T G 209.98 PASS AO=51;DP=111;FAO=53;FDP=115;FR=.;FRO=62;FSAF=14;FSAR=39;FSRF=25;FSRR=37;FWDB=0.0232076;FXX=0.00861995;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.909;QD=7.3037;RBI=0.0240806;REFB=-0.00973343;REVB=0.00642516;RO=60;SAF=12;SAR=39;SRF=23;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177106;STB=0.588359;TYPE=snp;VARB=0.0112139;OID=.;OPOS=2649704;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:115:60:62:51:53:39:12:23:37:39:14:25:37 chr7 2702099 . C T 10.47 PASS AO=2;DP=6;FAO=2;FDP=6;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.027982;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.311;QD=6.97938;RBI=0.027982;REFB=0.000363349;REVB=0;RO=4;SAF=2;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000786706;OID=.;OPOS=2702099;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:4:4:2:2:0:2:4:0:0:2:4:0 chr7 2752330 . C T 71.25 PASS AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.00625087;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.427;QD=8.38215;RBI=0.0195077;REFB=-0.0020243;REVB=-0.0184791;RO=18;SAF=7;SAR=9;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0459956;STB=0.526283;TYPE=snp;VARB=0.00132706;OID=.;OPOS=2752330;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:34:34:18:18:16:16:9:7:7:11:9:7:7:11 chr7 2853995 . C T 523.09 PASS AO=101;DP=182;FAO=107;FDP=190;FR=.;FRO=83;FSAF=50;FSAR=57;FSRF=45;FSRR=38;FWDB=0.025981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.4061;QD=11.0124;RBI=0.0393993;REFB=-0.00863242;REVB=0.0296191;RO=80;SAF=47;SAR=54;SRF=44;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0686568;STB=0.532704;TYPE=snp;VARB=0.00341798;OID=.;OPOS=2853995;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:190:80:83:101:107:54:47:44:36:57:50:45:38 chr7 2854010 . G A 233.49 PASS AO=66;DP=165;FAO=69;FDP=169;FR=.;FRO=100;FSAF=29;FSAR=40;FSRF=40;FSRR=60;FWDB=-0.0457376;FXX=0.00588201;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.215;QD=5.52635;RBI=0.0473181;REFB=0.00044421;REVB=-0.0121277;RO=96;SAF=28;SAR=38;SRF=39;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.019491;STB=0.512364;TYPE=snp;VARB=-0.000736366;OID=.;OPOS=2854010;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:169:96:100:66:69:38:28:39:57:40:29:40:60 chr7 2946461 . T C 53.42 PASS AO=16;DP=44;FAO=16;FDP=44;FR=.;FRO=28;FSAF=1;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=27;FWDB=0.054639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.123;QD=4.85608;RBI=0.0593892;REFB=0.00683803;REVB=-0.0232737;RO=28;SAF=1;SAR=15;SRF=1;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14516;STB=0.583244;TYPE=snp;VARB=-0.0123664;OID=.;OPOS=2946461;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:44:44:28:28:16:16:15:1:1:27:15:1:1:27 chr7 2966445 . T G 85.2 PASS AO=11;DP=42;FAO=13;FDP=39;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=0.0084042;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.418;QD=8.73834;RBI=0.00845888;REFB=-0.00404849;REVB=0.000960262;RO=20;SAF=6;SAR=5;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.261867;STB=0.684416;TYPE=snp;VARB=0.0214159;OID=.;OPOS=2966445;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:40:39:20:20:11:13:5:6:6:14:5:8:6:14 chr7 3197867 . T C 282.72 PASS AO=81;DP=197;FAO=82;FDP=197;FR=.;FRO=115;FSAF=32;FSAR=50;FSRF=50;FSRR=65;FWDB=-0.0237605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.675;QD=5.74043;RBI=0.0322151;REFB=-0.000625553;REVB=-0.0217543;RO=113;SAF=31;SAR=50;SRF=48;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0457375;STB=0.526986;TYPE=snp;VARB=0.000699572;OID=.;OPOS=3197867;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:197:113:115:81:82:50:31:48:65:50:32:50:65 chr7 4026944 . C G 1085.46 PASS AO=115;DP=117;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00895298;FXX=0.0170926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.7851;QD=37.7551;RBI=0.0422232;REFB=0.00620726;REVB=0.0412631;RO=1;SAF=40;SAR=75;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011723;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000120802;OID=.;OPOS=4026944;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:117:115:1:0:115:115:75:40:1:0:75:40:0:0 chr7 4116665 . G A 781.94 PASS AO=80;DP=81;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0561323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.9272;QD=36.7973;RBI=0.103562;REFB=0;REVB=0.0870296;RO=0;SAF=60;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00243501;OID=.;OPOS=4116665;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:81:85:0:0:80:85:20:60:0:0:22:63:0:0 chr7 4172006 . C T 130.83 PASS AO=26;DP=47;FAO=26;FDP=47;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=0.017772;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.203;QD=11.1344;RBI=0.0215002;REFB=-0.00581093;REVB=0.0121002;RO=21;SAF=8;SAR=18;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0209189;STB=0.511619;TYPE=snp;VARB=0.00626121;OID=.;OPOS=4172006;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:47:47:21:21:26:26:18:8:6:15:18:8:6:15 chr7 4189075 . G C 36.1 PASS AO=12;DP=32;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=0.00603041;FXX=0.0937207;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.083;QD=4.97946;RBI=0.0570321;REFB=-0.0195919;REVB=0.0567123;RO=19;SAF=5;SAR=7;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.32414;STB=0.767256;TYPE=snp;VARB=0.0307251;OID=.;OPOS=4189075;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:32:29:19:19:12:10:7:5:14:5:7:3:14:5 chr7 4213877 . T C 200.03 PASS AO=52;DP=122;FAO=53;FDP=121;FR=.;FRO=68;FSAF=31;FSAR=22;FSRF=29;FSRR=39;FWDB=0.00450512;FXX=0.0162588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.657;QD=6.61249;RBI=0.0223695;REFB=-0.0078408;REVB=0.0219112;RO=67;SAF=31;SAR=21;SRF=29;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164487;STB=0.58888;TYPE=snp;VARB=0.00735056;OID=.;OPOS=4213877;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:121:67:68:52:53:21:31:29:38:22:31:29:39 chr7 4213940 . T C 243.51 PASS AO=62;DP=135;FAO=62;FDP=135;FR=.;FRO=73;FSAF=27;FSAR=35;FSRF=26;FSRR=47;FWDB=0.00501079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.572;QD=7.21514;RBI=0.00571462;REFB=-0.000725784;REVB=0.00274751;RO=73;SAF=27;SAR=35;SRF=26;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0794846;STB=0.5441;TYPE=snp;VARB=0.00106662;OID=.;OPOS=4213940;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:73:73:62:62:35:27:26:47:35:27:26:47 chr7 4213975 . A G 208.62 PASS AO=55;DP=124;FAO=55;FDP=124;FR=.;FRO=69;FSAF=22;FSAR=33;FSRF=24;FSRR=45;FWDB=-0.0132314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.538;QD=6.72979;RBI=0.0142258;REFB=-0.0121423;REVB=0.00522545;RO=69;SAF=22;SAR=33;SRF=24;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0548884;STB=0.530601;TYPE=snp;VARB=0.0121493;OID=.;OPOS=4213975;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:69:69:55:55:33:22:24:45:33:22:24:45 chr7 4267072 . T A 923.28 PASS AO=72;DP=126;FAO=124;FDP=125;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=43;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.164861;FXX=0.00793588;HRUN=8;LEN=1;MLLD=23.7367;QD=29.5451;RBI=0.308753;REFB=-0.204273;REVB=0.261054;RO=19;SAF=26;SAR=46;SRF=4;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0650879;STB=0.503067;TYPE=snp;VARB=0.0171961;OID=.;OPOS=4267072;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:126:125:19:1:72:124:46:26:4:15:81:43:0:1 chr7 4304929 . C T 49.01 PASS AO=6;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000291311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=35.192;QD=28.0031;RBI=0.111879;REFB=-0.0541864;REVB=0.111879;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0160542;OID=.;OPOS=4304929;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:7:7:0:0:6:7:5:1:0:0:6:1:0:0 chr7 4780514 . G T 556.18 PASS AO=111;DP=196;FAO=115;FDP=201;FR=.;FRO=86;FSAF=47;FSAR=68;FSRF=37;FSRR=49;FWDB=0.0147652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.977;QD=11.0683;RBI=0.0150773;REFB=-0.0200305;REVB=0.0030518;RO=83;SAF=43;SAR=68;SRF=34;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0183658;STB=0.509498;TYPE=snp;VARB=0.0244522;OID=.;OPOS=4780514;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:201:83:86:111:115:68:43:34:49:68:47:37:49 chr7 4780628 . C A 126.04 PASS AO=30;DP=66;FAO=30;FDP=64;FR=.;FRO=34;FSAF=4;FSAR=26;FSRF=10;FSRR=24;FWDB=0.0101886;FXX=0.0302984;HRUN=4;LEN=1;MLLD=148.2;QD=7.87727;RBI=0.0122063;REFB=-0.00913573;REVB=0.00672202;RO=28;SAF=4;SAR=26;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.306677;STB=0.645277;TYPE=snp;VARB=0.00779971;OID=.;OPOS=4780628;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:64:28:34:30:30:26:4:10:18:26:4:10:24 chr7 4802029 . T G 116.19 PASS AO=12;DP=12;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0506315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.243;QD=35.7501;RBI=0.05569;REFB=0;REVB=0.0231912;RO=0;SAF=9;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000559944;OID=.;OPOS=4802029;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:12:13:0:0:12:13:3:9:0:0:4:9:0:0 chr7 4841470 . T C 165.96 PASS AO=16;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.08;QD=36.8793;RBI=0.0246254;REFB=0;REVB=0.0119654;RO=0;SAF=4;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07465e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.93056e-05;OID=.;OPOS=4841470;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:18:0:0:16:18:12:4:0:0:13:5:0:0 chr7 4874420 . G C 551.73 PASS AO=62;DP=67;FAO=63;FDP=66;FR=.;FRO=3;FSAF=26;FSAR=37;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0747109;FXX=0.043472;HRUN=4;LEN=1;MLLD=127.729;QD=33.4382;RBI=0.0820843;REFB=-0.0468251;REVB=0.0340018;RO=3;SAF=26;SAR=36;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0220115;STB=0.511854;TYPE=snp;VARB=0.00133532;OID=.;OPOS=4874420;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:67:66:3:3:62:63:36:26:2:1:37:26:2:1 chr7 4876057 . C T 126.72 PASS AO=14;DP=15;FAO=15;FDP=16;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0315536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.3191;QD=31.6799;RBI=0.0552163;REFB=-0.0817843;REVB=0.0453124;RO=1;SAF=8;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0534678;STB=0.526281;TYPE=snp;VARB=0.00812462;OID=.;OPOS=4876057;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:15:16:1:1:14:15:6:8:1:0:6:9:1:0 chr7 4900095 . A G 1458.17 PASS AO=158;DP=163;FAO=158;FDP=161;FR=.;FRO=3;FSAF=80;FSAR=78;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.042884;FXX=0.0122692;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.957;QD=36.2278;RBI=0.0446943;REFB=-0.0467748;REVB=-0.0125916;RO=3;SAF=80;SAR=78;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00613182;STB=0.503223;TYPE=snp;VARB=0.000430527;OID=.;OPOS=4900095;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:163:161:3:3:158:158:78:80:1:2:78:80:1:2 chr7 4900341 . G A 1947.55 PASS AO=203;DP=204;FAO=205;FDP=205;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00729701;FXX=0.00485413;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.082;QD=38.0009;RBI=0.0179697;REFB=-0.0292824;REVB=0.0164215;RO=1;SAF=83;SAR=120;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00395301;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000220176;OID=.;OPOS=4900341;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:204:205:1:0:203:205:120:83:0:1:120:85:0:0 chr7 4901142 . C G 152.12 PASS AO=54;DP=158;FAO=54;FDP=154;FR=.;FRO=100;FSAF=15;FSAR=39;FSRF=36;FSRR=64;FWDB=-0.00276443;FXX=0.0253149;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.166;QD=3.95112;RBI=0.00833064;REFB=0.00683911;REVB=0.0078586;RO=103;SAF=15;SAR=39;SRF=35;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.084207;STB=0.562794;TYPE=snp;VARB=-0.0134962;OID=.;OPOS=4901142;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:154:103:100:54:54:39:15:35:68:39:15:36:64 chr7 4901385 . A C 270.09 PASS AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.057235;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.053;QD=38.5838;RBI=0.0707461;REFB=0;REVB=0.0415832;RO=0;SAF=3;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.13441e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000383828;OID=.;OPOS=4901385;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:29:28:0:0:28:28:25:3:0:0:25:3:0:0 chr7 4959807 . G A 195.16 PASS AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0316852;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.267;QD=37.1733;RBI=0.0449272;REFB=0;REVB=0.0318513;RO=0;SAF=15;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.04394e-06;OID=.;OPOS=4959807;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:21:21:0:0:21:21:6:15:0:0:6:15:0:0 chr7 5096958 . T C 159.35 PASS AO=42;DP=98;FAO=43;FDP=99;FR=.;FRO=56;FSAF=15;FSAR=28;FSRF=25;FSRR=31;FWDB=-0.00761779;FXX=0.009999;HRUN=3;LEN=1;MLLD=195.605;QD=6.43855;RBI=0.0120446;REFB=-0.0104709;REVB=-0.0093296;RO=56;SAF=15;SAR=27;SRF=25;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0954837;STB=0.558576;TYPE=snp;VARB=0.0136934;OID=.;OPOS=5096958;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:99:56:56:42:43:27:15:25:31:28:15:25:31 chr7 5105133 . C T 316.55 PASS AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000608393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.239;QD=37.2412;RBI=0.00952431;REFB=0;REVB=-0.00950486;RO=0;SAF=5;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.83463e-05;OID=.;OPOS=5105133;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:34:0:0:34:34:29:5:0:0:29:5:0:0 chr7 5105622 . A T 561.91 PASS AO=142;DP=310;FAO=149;FDP=321;FR=.;FRO=172;FSAF=60;FSAR=89;FSRF=89;FSRR=83;FWDB=-0.00837927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.034;QD=7.002;RBI=0.0193013;REFB=-0.0271684;REVB=0.0173876;RO=168;SAF=59;SAR=83;SRF=89;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112884;STB=0.562351;TYPE=snp;VARB=0.0278215;OID=.;OPOS=5105622;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:310:321:168:172:142:149:83:59:89:79:89:60:89:83 chr7 5112108 . G T 45.13 PASS AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0651695;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.258;QD=25.786;RBI=0.0663273;REFB=-0.101238;REVB=-0.0123393;RO=1;SAF=4;SAR=2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0962265;STB=0.555378;TYPE=snp;VARB=0.00702945;OID=.;OPOS=5112108;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:7:7:1:1:6:6:2:4:1:0:2:4:1:0 chr7 5112554 . A C 220.87 PASS AO=16;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0493429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.9872;QD=36.8109;RBI=0.0782899;REFB=0;REVB=0.0607832;RO=0;SAF=12;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07465e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000158209;OID=.;OPOS=5112554;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:16:24:0:0:16:24:4:12:0:0:5:19:0:0 chr7 5161512 . G T 943.28 PASS AO=99;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00517194;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.776;QD=37.7312;RBI=0.0274317;REFB=0;REVB=-0.0269398;RO=0;SAF=61;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.5137e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000199205;OID=.;OPOS=5161512;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:100:100:0:0:99:100:38:61:0:0:39:61:0:0 chr7 5161552 . G A 550.66 PASS AO=122;DP=242;FAO=126;FDP=247;FR=.;FRO=121;FSAF=69;FSAR=57;FSRF=70;FSRR=51;FWDB=0.0116812;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.476;QD=8.91753;RBI=0.0549692;REFB=-0.00445997;REVB=0.0537137;RO=119;SAF=69;SAR=53;SRF=69;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.013093;STB=0.515315;TYPE=snp;VARB=0.00464209;OID=.;OPOS=5161552;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:242:247:119:121:122:126:53:69:69:50:57:69:70:51 chr7 5161640 . G C 473.94 PASS AO=128;DP=290;FAO=128;FDP=288;FR=.;FRO=160;FSAF=62;FSAR=66;FSRF=80;FSRR=80;FWDB=0.00400913;FXX=0.00689631;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.521;QD=6.58246;RBI=0.00868543;REFB=0.0015555;REVB=0.00770478;RO=155;SAF=62;SAR=66;SRF=80;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0314209;STB=0.508683;TYPE=snp;VARB=-0.00181548;OID=.;OPOS=5161640;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:290:288:155:160:128:128:66:62:80:75:66:62:80:80 chr7 5172115 . A G 10.48 PASS AO=4;DP=21;FAO=4;FDP=21;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.0559555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.52;QD=1.99572;RBI=0.0561789;REFB=-0.00293309;REVB=0.00500569;RO=17;SAF=3;SAR=1;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137231;STB=0.599468;TYPE=snp;VARB=0.013295;OID=.;OPOS=5172115;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:21:21:17:17:4:4:1:3:11:6:1:3:11:6 chr7 5254227 . C G 1836.28 PASS AO=192;DP=192;FAO=193;FDP=193;FR=.;FRO=0;FSAF=124;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0825939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.9361;QD=38.0576;RBI=0.108846;REFB=0;REVB=0.0708918;RO=0;SAF=124;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.12281e-06;OID=.;OPOS=5254227;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:87:192:193:0:0:192:193:68:124:0:0:69:124:0:0 chr7 5257573 . G A 136.04 PASS AO=34;DP=75;FAO=34;FDP=75;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=26;FSRR=15;FWDB=-0.00394598;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.323;QD=7.25553;RBI=0.0312815;REFB=-0.0100369;REVB=0.0310316;RO=40;SAF=15;SAR=19;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199089;STB=0.604284;TYPE=snp;VARB=0.00847846;OID=.;OPOS=5257573;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:40:41:34:34:19:15:26:14:19:15:26:15 chr7 5271656 . GCTTCC G 181.74 PASS AO=45;DP=136;FAO=53;FDP=132;FR=.;FRO=79;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=41;FSRR=38;FWDB=-0.0174603;FXX=0.0364937;HRUN=1;LEN=5;MLLD=191.831;QD=5.50741;RBI=0.0221636;REFB=-0.00460038;REVB=-0.0136515;RO=53;SAF=22;SAR=23;SRF=23;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0533103;STB=0.516998;TYPE=del;VARB=0.00462768;OID=.;OPOS=5271657;OREF=CTTCC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:45:125:53:132:79:26:27:41:38:99:53:22:23:23:30 chr7 5352659 . G T 45.03 PASS AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0168526;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.245;QD=25.7327;RBI=0.0168526;REFB=-0.0941088;REVB=0;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00618563;OID=.;OPOS=5352659;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:7:7:0:1:6:6:0:6:0:0:0:6:1:0 chr7 5391702 . C G 176.56 PASS AO=48;DP=112;FAO=48;FDP=112;FR=.;FRO=64;FSAF=32;FSAR=16;FSRF=41;FSRR=23;FWDB=0.00440267;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.0099;QD=6.30586;RBI=0.0151676;REFB=-0.00924417;REVB=-0.0145145;RO=64;SAF=32;SAR=16;SRF=41;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0294533;STB=0.516549;TYPE=snp;VARB=0.0109465;OID=.;OPOS=5391702;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:64:64:48:48:16:32:41:23:16:32:41:23 chr7 5396715 . T C 320.29 PASS AO=88;DP=206;FAO=89;FDP=206;FR=.;FRO=117;FSAF=44;FSAR=45;FSRF=74;FSRR=43;FWDB=0.00552848;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8778;QD=6.21917;RBI=0.0288194;REFB=0.00775887;REVB=0.0282841;RO=118;SAF=43;SAR=45;SRF=75;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150782;STB=0.578288;TYPE=snp;VARB=-0.00958028;OID=.;OPOS=5396715;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:206:206:118:117:88:89:45:43:75:43:45:44:74:43 chr7 5410425 . G C 41.12 PASS AO=6;DP=13;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0736152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.322;QD=10.966;RBI=0.0801157;REFB=-0.012965;REVB=-0.031612;RO=7;SAF=0;SAR=6;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.71172;STB=0.571264;TYPE=snp;VARB=0.0167653;OID=.;OPOS=5410425;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:13:15:7:7:6:8:6:0:1:6:6:2:1:6 chr7 5427720 . A G 220.75 PASS AO=21;DP=22;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0286255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.2382;QD=36.7917;RBI=0.0308728;REFB=0;REVB=-0.0115633;RO=0;SAF=5;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.78933e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00018813;OID=.;OPOS=5427720;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:22:24:0:0:21:24:16:5:0:0:16:8:0:0 chr7 5434135 . A G 84.69 PASS AO=16;DP=28;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=-0.0727341;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.3754;QD=11.6809;RBI=0.0845217;REFB=0.00325075;REVB=-0.0430542;RO=11;SAF=11;SAR=5;SRF=0;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.470642;STB=0.730016;TYPE=snp;VARB=-0.00819166;OID=.;OPOS=5434135;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:28:29:11:13:16:16:5:11:0:11:5:11:2:11 chr7 5487458 . T C 195.75 PASS AO=15;DP=24;FAO=22;FDP=23;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0648371;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.061;QD=34.0438;RBI=0.0684499;REFB=0;REVB=0.0219439;RO=0;SAF=4;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33019e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000141008;OID=.;OPOS=5487458;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:23:23:0:0:15:22:11:4:0:0:12:10:0:0 chr7 5515624 . T G 292.99 PASS AO=71;DP=148;FAO=71;FDP=148;FR=.;FRO=77;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=42;FSRR=35;FWDB=-0.0340816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.347;QD=7.91875;RBI=0.0432864;REFB=-0.00163271;REVB=-0.0266863;RO=77;SAF=36;SAR=35;SRF=42;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0361657;STB=0.519994;TYPE=snp;VARB=0.00168828;OID=.;OPOS=5515624;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:77:77:71:71:35:36:42:35:35:36:42:35 chr7 5518331 . A G 27.31 PASS AO=10;DP=33;FAO=9;FDP=32;FR=.;FRO=23;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=23;FWDB=-0.0538463;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.9459;QD=3.41328;RBI=0.0793404;REFB=-0.0202078;REVB=-0.0582706;RO=22;SAF=1;SAR=9;SRF=0;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.496231;STB=0.794572;TYPE=snp;VARB=0.0273063;OID=.;OPOS=5518331;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:33:32:22:23:10:9:9:1:0:22:8:1:0:23 chr7 5540769 . A C 51.04 PASS AO=15;DP=42;FAO=15;FDP=42;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=2;FSRF=20;FSRR=7;FWDB=-0.0347716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.8728;QD=4.86062;RBI=0.053287;REFB=-0.0305433;REVB=-0.0403787;RO=27;SAF=13;SAR=2;SRF=20;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230556;STB=0.639129;TYPE=snp;VARB=0.0742363;OID=.;OPOS=5540769;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:42:42:27:27:15:15:2:13:20:7:2:13:20:7 chr7 5959485 . G A 1557.69 PASS AO=184;DP=200;FAO=184;FDP=200;FR=.;FRO=16;FSAF=148;FSAR=36;FSRF=13;FSRR=3;FWDB=-0.008137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.741;QD=31.1538;RBI=0.0106757;REFB=-0.0133044;REVB=0.0069109;RO=15;SAF=148;SAR=36;SRF=12;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000987549;STB=0.501037;TYPE=snp;VARB=0.000988592;OID=.;OPOS=5959485;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:200:200:15:16:184:184:36:148:12:3:36:148:13:3 chr7 5983012 . A G 1300.88 PASS AO=136;DP=136;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00123492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.57;QD=38.2612;RBI=0.0257912;REFB=0;REVB=0.0257616;RO=0;SAF=58;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.65362e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.87942e-05;OID=.;OPOS=5983012;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:136:136:0:0:136:136:78:58:0:0:78:58:0:0 chr7 5983063 . C T 58.04 PASS AO=33;DP=132;FAO=33;FDP=132;FR=.;FRO=99;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=34;FSRR=65;FWDB=0.00684856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161;QD=1.75886;RBI=0.0448401;REFB=-0.01134;REVB=0.044314;RO=98;SAF=20;SAR=13;SRF=34;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.313653;STB=0.689548;TYPE=snp;VARB=0.0224615;OID=.;OPOS=5983063;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:132:132:98:99:33:33:13:20:34:64:13:20:34:65 chr7 6017370 . GC G 120.57 PASS AO=14;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.174396;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=19.3423;QD=28.3697;RBI=0.334335;REFB=0;REVB=0.285247;RO=3;SAF=11;SAR=3;SRF=0;SRR=3;SSEN=0.252174;SSEP=0;SSSB=0.297839;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0372521;OID=.;OPOS=6017371;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:14:17:17:17:0:11:6:0:0:11:3:11:3:0:3 chr7 6026775 . T C 277.6 PASS AO=31;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.126001;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=126.1;QD=33.6488;RBI=0.126439;REFB=-0.1258;REVB=0.0105056;RO=0;SAF=5;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509428;TYPE=snp;VARB=0.00212848;OID=.;OPOS=6026775;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:33:33:0:1:31:32:26:5:0:0:26:6:0:1 chr7 6026988 . G A 1206.32 PASS AO=130;DP=133;FAO=130;FDP=132;FR=.;FRO=2;FSAF=72;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0313011;FXX=0.00751823;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.924;QD=36.5553;RBI=0.0498214;REFB=-0.0303587;REVB=0.0387609;RO=2;SAF=72;SAR=58;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0161036;STB=0.508473;TYPE=snp;VARB=0.000979418;OID=.;OPOS=6026988;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:133:132:2:2:130:130:58:72:0:2:58:72:0:2 chr7 6036980 . G C 451.45 PASS AO=51;DP=55;FAO=52;FDP=55;FR=.;FRO=3;FSAF=16;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.076341;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.5102;QD=32.8325;RBI=0.102229;REFB=-0.0180397;REVB=-0.0679917;RO=4;SAF=14;SAR=37;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0783192;STB=0.501639;TYPE=snp;VARB=-0.00135881;OID=.;OPOS=6036980;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:55:55:4:3:51:52:37:14:3:1:36:16:1:2 chr7 6063283 . C T 1605.28 PASS AO=169;DP=171;FAO=171;FDP=171;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0187622;FXX=0.00581362;HRUN=2;LEN=1;MLLD=263.605;QD=37.5505;RBI=0.0221766;REFB=-0.047796;REVB=0.0118229;RO=0;SAF=82;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.92111e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.82768e-05;OID=.;OPOS=6063283;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:171:171:0:0:169:171:87:82:0:0:88:83:0:0 chr7 6063674 . G A 480.5 PASS AO=87;DP=186;FAO=109;FDP=207;FR=.;FRO=98;FSAF=72;FSAR=37;FSRF=72;FSRR=26;FWDB=0.105326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.1778;QD=9.28493;RBI=0.10553;REFB=-0.0384969;REVB=0.00655865;RO=98;SAF=51;SAR=36;SRF=72;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151603;STB=0.540139;TYPE=snp;VARB=0.0312144;OID=.;OPOS=6063674;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:207:98:98:87:109:36:51:72:26:37:72:72:26 chr7 6071060 . G A 2112.61 PASS AO=217;DP=222;FAO=223;FDP=223;FR=.;FRO=0;FSAF=113;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0324827;FXX=0.00446409;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.83;QD=37.8944;RBI=0.0340266;REFB=0;REVB=0.0101336;RO=0;SAF=108;SAR=109;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000952557;OID=.;OPOS=6071060;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:222:223:0:0:217:223:109:108:0:0:110:113:0:0 chr7 6075823 . A T 1193.22 PASS AO=125;DP=125;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=107;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.867;QD=38.1829;RBI=0.0322348;REFB=0;REVB=0.0299199;RO=0;SAF=107;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.17931e-05;OID=.;OPOS=6075823;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:125:125:0:0:125:125:18:107:0:0:18:107:0:0 chr7 6204999 . A C 267.05 PASS AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.107916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.392;QD=38.15;RBI=0.115896;REFB=0;REVB=0.042261;RO=0;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39874e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000482475;OID=.;OPOS=6204999;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:27:28:0:0:27:28:14:13:0:0:15:13:0:0 chr7 6370144 . G A 415.32 PASS AO=90;DP=170;FAO=90;FDP=170;FR=.;FRO=80;FSAF=29;FSAR=61;FSRF=40;FSRR=40;FWDB=-0.00518986;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.852;QD=9.77225;RBI=0.0312558;REFB=-0.00840221;REVB=0.0308219;RO=76;SAF=29;SAR=61;SRF=39;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170464;STB=0.58964;TYPE=snp;VARB=0.00772838;OID=.;OPOS=6370144;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:170:76:80:90:90:61:29:39:37:61:29:40:40 chr7 6370194 . C T 1245.38 PASS AO=129;DP=130;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0454121;FXX=0.00769172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.6846;QD=38.6164;RBI=0.0573717;REFB=0;REVB=0.0350607;RO=0;SAF=50;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000279372;OID=.;OPOS=6370194;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:130:129:0:0:129:129:79:50:0:0:79:50:0:0 chr7 6370305 . C G 451.24 PASS AO=46;DP=49;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0763312;FXX=0.0943218;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5586;QD=37.6029;RBI=0.0772262;REFB=0;REVB=0.0117236;RO=0;SAF=17;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0028309;OID=.;OPOS=6370305;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:49:48:0:0:46:48:29:17:0:0:31:17:0:0 chr7 6370406 . C T 236.17 PASS AO=27;DP=29;FAO=27;FDP=29;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0510404;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.282;QD=32.5751;RBI=0.0510461;REFB=-0.087237;REVB=0.000763101;RO=1;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0320562;STB=0.501278;TYPE=snp;VARB=0.00217531;OID=.;OPOS=6370406;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:1:2:27:27:14:13:0:1:14:13:1:1 chr7 6370575 . C T 217.71 PASS AO=41;DP=70;FAO=41;FDP=70;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.0237781;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=60.5441;QD=12.4406;RBI=0.0317006;REFB=-0.00798872;REVB=0.0209651;RO=29;SAF=17;SAR=24;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130148;STB=0.571394;TYPE=snp;VARB=0.00730607;OID=.;OPOS=6370575;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:29:29:41:41:24:17:17:12:24:17:17:12 chr7 6501830 . GTAAT G 48.33 PASS AO=5;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0439887;FXX=0;HRUN=1;LEN=4;MLLD=157.086;QD=32.2218;RBI=0.0439887;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=5;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.000663826;OID=.;OPOS=6501831;OREF=TAAT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:5:6:6:6:0:6:0:0:0:4:0:5:0:0:0 chr7 6502367 . T C 79.21 PASS AO=25;DP=70;FAO=25;FDP=70;FR=.;FRO=45;FSAF=5;FSAR=20;FSRF=8;FSRR=37;FWDB=-0.00954277;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.3797;QD=4.52603;RBI=0.0361884;REFB=-0.0143668;REVB=0.0349076;RO=44;SAF=5;SAR=20;SRF=8;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0320937;STB=0.522918;TYPE=snp;VARB=0.017979;OID=.;OPOS=6502367;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:70:70:44:45:25:25:20:5:8:36:20:5:8:37 chr7 6505901 . T C 1676.77 PASS AO=174;DP=178;FAO=175;FDP=175;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0166909;FXX=0.016853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.941;QD=38.3261;RBI=0.0287398;REFB=0;REVB=0.0233963;RO=0;SAF=56;SAR=118;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19743e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.64806e-06;OID=.;OPOS=6505901;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:178:175:0:0:174:175:118:56:0:0:118:57:0:0 chr7 6537821 . G C 709.34 PASS AO=77;DP=78;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00541283;FXX=0.0256377;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.164;QD=37.3338;RBI=0.0195324;REFB=-0.0783557;REVB=0.0187674;RO=1;SAF=1;SAR=76;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00618834;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000655485;OID=.;OPOS=6537821;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:78:76:1:0:77:76:76:1:0:1:75:1:0:0 chr7 6591008 . C T 81.98 PASS AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.0237444;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.228;QD=8.86309;RBI=0.0275594;REFB=-0.0100349;REVB=0.0139902;RO=19;SAF=11;SAR=7;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0302987;STB=0.517222;TYPE=snp;VARB=0.00747319;OID=.;OPOS=6591008;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:37:37:19:19:18:18:7:11:11:8:7:11:11:8 chr7 6621277 . G A 320.87 PASS AO=92;DP=220;FAO=92;FDP=219;FR=.;FRO=127;FSAF=37;FSAR=55;FSRF=66;FSRR=61;FWDB=-0.0235599;FXX=0.00454525;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9543;QD=5.8607;RBI=0.0268671;REFB=0.00632128;REVB=-0.0129141;RO=126;SAF=37;SAR=55;SRF=65;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119097;STB=0.568931;TYPE=snp;VARB=-0.00887301;OID=.;OPOS=6621277;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:220:219:126:127:92:92:55:37:65:61:55:37:66:61 chr7 6647738 . T C 157.56 PASS AO=10;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.1289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.202;QD=37.0728;RBI=0.145181;REFB=0;REVB=0.0668017;RO=0;SAF=2;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00996971;OID=.;OPOS=6647738;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:17:0:0:10:17:8:2:0:0:9:8:0:0 chr7 6656830 . G A 373.52 PASS AO=28;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000153424;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=190.796;QD=37.3518;RBI=0.0497033;REFB=0;REVB=0.0497031;RO=0;SAF=24;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000140718;OID=.;OPOS=6656830;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:29:40:0:0:28:40:4:24:0:0:15:25:0:0 chr7 6656897 . A G 497.85 PASS AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0245202;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.0277;QD=37.5733;RBI=0.0606373;REFB=0;REVB=-0.0554585;RO=0;SAF=26;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000365519;OID=.;OPOS=6656897;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:53:53:0:0:53:53:27:26:0:0:27:26:0:0 chr7 6660790 . G A 54.08 PASS AO=15;DP=48;FAO=17;FDP=49;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=22;FSRR=10;FWDB=0.0118719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.015;QD=4.41467;RBI=0.0202243;REFB=-0.00279975;REVB=0.0163732;RO=32;SAF=9;SAR=6;SRF=22;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107174;STB=0.529378;TYPE=snp;VARB=0.00577553;OID=.;OPOS=6660790;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:48:49:32:32:15:17:6:9:22:10:6:11:22:10 chr7 6713985 . A G 758.81 PASS AO=87;DP=92;FAO=88;FDP=92;FR=.;FRO=4;FSAF=38;FSAR=50;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0193719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.1512;QD=32.9917;RBI=0.0340967;REFB=-0.140331;REVB=0.0280592;RO=5;SAF=37;SAR=50;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0183145;STB=0.503017;TYPE=snp;VARB=0.00300842;OID=.;OPOS=6713985;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:92:92:5:4:87:88:50:37:3:2:50:38:2:2 chr7 6776797 . AAAG A 91.98 PASS AO=51;DP=173;FAO=59;FDP=167;FR=.;FRO=108;FSAF=35;FSAR=24;FSRF=71;FSRR=37;FWDB=0.0101796;FXX=0.017646;HRUN=6;LEN=3;MLLD=51.5927;QD=2.20304;RBI=0.0497383;REFB=0.0105237;REVB=0.0486855;RO=111;SAF=30;SAR=21;SRF=71;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0.424242;SSSB=-0.0636308;STB=0.543691;TYPE=del;VARB=-0.0154118;OID=.;OPOS=6776798;OREF=AAG;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:51:173:59:167:108:35:24:71:37:91:111:30:21:71:40 chr7 6821050 . T C 101.96 PASS AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.272;QD=37.0752;RBI=0.0269122;REFB=0;REVB=-0.0153742;RO=0;SAF=1;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.49634e-05;OID=.;OPOS=6821050;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:11:11:10:1:0:0:10:1:0:0 chr7 6844574 . C G 413.07 PASS AO=46;DP=48;FAO=46;FDP=48;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00952535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.5852;QD=34.4228;RBI=0.0156772;REFB=-0.0495186;REVB=0.0124517;RO=1;SAF=38;SAR=8;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122151;STB=0.512815;TYPE=snp;VARB=0.000650974;OID=.;OPOS=6844574;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:48:48:1:2:46:46:8:38:1:0:8:38:2:0 chr7 6859453 . C G 806.87 PASS AO=87;DP=89;FAO=87;FDP=89;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0283408;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.9114;QD=36.2637;RBI=0.0342215;REFB=-0.089182;REVB=0.019181;RO=2;SAF=18;SAR=69;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0135367;STB=0.507141;TYPE=snp;VARB=0.00197726;OID=.;OPOS=6859453;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:89:89:2:2:87:87:69:18:0:2:69:18:0:2 chr7 7283569 . G A 212.75 PASS AO=65;DP=164;FAO=65;FDP=164;FR=.;FRO=99;FSAF=32;FSAR=33;FSRF=44;FSRR=55;FWDB=-0.00185594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.1682;QD=5.18891;RBI=0.0141495;REFB=-0.00245974;REVB=0.0140272;RO=97;SAF=32;SAR=33;SRF=43;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0522134;STB=0.528917;TYPE=snp;VARB=0.00351662;OID=.;OPOS=7283569;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:164:97:99:65:65:33:32:43:54:33:32:44:55 chr7 7495735 . T C 175.3 PASS AO=50;DP=195;FAO=72;FDP=215;FR=.;FRO=143;FSAF=30;FSAR=42;FSRF=55;FSRR=88;FWDB=0.0150378;FXX=0.0137608;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.876;QD=3.26142;RBI=0.0155128;REFB=0.0014249;REVB=-0.00380909;RO=139;SAF=8;SAR=42;SRF=52;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.344231;STB=0.522082;TYPE=snp;VARB=-0.00269144;OID=.;OPOS=7495735;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:215:139:143:50:72:42:8:52:87:42:30:55:88 chr7 7514235 . C G 333.29 PASS AO=72;DP=139;FAO=72;FDP=136;FR=.;FRO=64;FSAF=23;FSAR=49;FSRF=16;FSRR=48;FWDB=0.032098;FXX=0.0215812;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.7065;QD=9.80268;RBI=0.0333283;REFB=-0.0256758;REVB=-0.00897165;RO=64;SAF=23;SAR=49;SRF=16;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0706202;STB=0.538618;TYPE=snp;VARB=0.0231043;OID=.;OPOS=7514235;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:136:64:64:72:72:49:23:16:48:49:23:16:48 chr7 7545691 . G C 305.37 PASS AO=78;DP=170;FAO=78;FDP=170;FR=.;FRO=92;FSAF=33;FSAR=45;FSRF=49;FSRR=43;FWDB=0.0276838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.033;QD=7.1851;RBI=0.0277839;REFB=0.0066036;REVB=0.00235624;RO=92;SAF=33;SAR=45;SRF=49;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107386;STB=0.559584;TYPE=snp;VARB=-0.00480713;OID=.;OPOS=7545691;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:170:92:92:78:78:45:33:49:43:45:33:49:43 chr7 7571094 . G C 2497.96 PASS AO=257;DP=259;FAO=261;FDP=261;FR=.;FRO=0;FSAF=124;FSAR=137;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00496501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.461;QD=38.2829;RBI=0.0276872;REFB=0;REVB=0.0272384;RO=0;SAF=122;SAR=135;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.85213e-05;OID=.;OPOS=7571094;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:259:261:0:0:257:261:135:122:0:0:137:124:0:0 chr7 7613039 . C T 284.28 PASS AO=66;DP=142;FAO=70;FDP=148;FR=.;FRO=78;FSAF=33;FSAR=37;FSRF=25;FSRR=53;FWDB=-0.0162874;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=176.629;QD=7.68316;RBI=0.0172743;REFB=0.00308553;REVB=-0.00575539;RO=76;SAF=33;SAR=33;SRF=25;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16548;STB=0.580509;TYPE=snp;VARB=-0.00406;OID=.;OPOS=7613039;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:148:76:78:66:70:33:33:25:51:37:33:25:53 chr7 7646651 . G T 1787.71 PASS AO=189;DP=193;FAO=193;FDP=193;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00889555;FXX=0.0203035;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.519;QD=37.051;RBI=0.0114499;REFB=-0.00276409;REVB=0.007209;RO=3;SAF=84;SAR=105;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0166991;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.83354e-05;OID=.;OPOS=7646651;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:193:193:3:0:189:193:105:84:3:0:105:88:0:0 chr7 7841338 . C G 231.18 PASS AO=54;DP=140;FAO=64;FDP=145;FR=.;FRO=81;FSAF=27;FSAR=37;FSRF=40;FSRR=41;FWDB=0.00957802;FXX=0.0202689;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.241;QD=6.37738;RBI=0.0117183;REFB=-0.00592741;REVB=-0.0067513;RO=77;SAF=20;SAR=34;SRF=38;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132313;STB=0.540663;TYPE=snp;VARB=0.0161916;OID=.;OPOS=7841338;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:145:77:81:54:64:34:20:38:39:37:27:40:41 chr7 8125964 . C T 364.26 PASS AO=90;DP=190;FAO=90;FDP=190;FR=.;FRO=100;FSAF=39;FSAR=51;FSRF=38;FSRR=62;FWDB=0.00415131;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=205.031;QD=7.66854;RBI=0.0158035;REFB=-0.0145557;REVB=0.0152485;RO=100;SAF=39;SAR=51;SRF=38;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.052174;STB=0.528791;TYPE=snp;VARB=0.0162295;OID=.;OPOS=8125964;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:190:100:100:90:90:51:39:38:62:51:39:38:62 chr7 8132252 . T C 1335.7 PASS AO=133;DP=134;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00402711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.471;QD=38.4374;RBI=0.00754827;REFB=0;REVB=-0.00638426;RO=1;SAF=84;SAR=49;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00562555;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.2098e-05;OID=.;OPOS=8132252;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:134:139:1:0:133:139:49:84:1:0:50:89:0:0 chr7 8196529 . A T 1249 PASS AO=130;DP=130;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00962073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.747;QD=38.1374;RBI=0.011447;REFB=0;REVB=0.00620284;RO=0;SAF=89;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.12464e-06;OID=.;OPOS=8196529;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:130:131:0:0:130:131:41:89:0:0:41:90:0:0 chr7 8792148 . T C 1522.12 PASS AO=169;DP=171;FAO=169;FDP=175;FR=.;FRO=6;FSAF=58;FSAR=111;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0270403;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.006;QD=34.7914;RBI=0.0400155;REFB=-0.152207;REVB=0.0294968;RO=2;SAF=58;SAR=111;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0038661;STB=0.500375;TYPE=snp;VARB=0.00283465;OID=.;OPOS=8792148;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:171:175:2:6:169:169:111:58:1:1:111:58:2:4 chr7 11022230 . A G 113.92 PASS AO=24;DP=45;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=20;FSRF=4;FSRR=17;FWDB=0.0845514;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=45.4166;QD=10.1265;RBI=0.0998853;REFB=3.14826e-05;REVB=-0.0531801;RO=18;SAF=4;SAR=20;SRF=2;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0822523;STB=0.519464;TYPE=snp;VARB=0.00157605;OID=.;OPOS=11022230;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:45:45:18:21:24:24:20:4:2:16:20:4:4:17 chr7 11022564 . G A 223.87 PASS AO=45;DP=80;FAO=45;FDP=81;FR=.;FRO=36;FSAF=7;FSAR=38;FSRF=6;FSRR=30;FWDB=0.00833816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.333;QD=11.0554;RBI=0.0310953;REFB=-0.0431007;REVB=-0.0299565;RO=33;SAF=7;SAR=38;SRF=6;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0373808;STB=0.509274;TYPE=snp;VARB=0.0302712;OID=.;OPOS=11022564;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:81:33:36:45:45:38:7:6:27:38:7:6:30 chr7 11581121 . T C 2170.92 PASS AO=238;DP=246;FAO=239;FDP=239;FR=.;FRO=0;FSAF=107;FSAR=132;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0136084;FXX=0.0284541;HRUN=3;LEN=1;MLLD=294.598;QD=36.3334;RBI=0.0189891;REFB=-0.0043835;REVB=0.0132438;RO=6;SAF=107;SAR=131;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0102604;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.03139e-05;OID=.;OPOS=11581121;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:246:239:6:0:238:239:131:107:4:2:132:107:0:0 chr7 11676107 . G A 33.2 PASS AO=10;DP=31;FAO=10;FDP=31;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=18;FWDB=0.00333173;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=188.866;QD=4.28324;RBI=0.0139198;REFB=-0.00252719;REVB=-0.0135152;RO=20;SAF=3;SAR=7;SRF=3;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222928;STB=0.640792;TYPE=snp;VARB=0.00766246;OID=.;OPOS=11676107;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:31:31:20:21:10:10:7:3:3:17:7:3:3:18 chr7 12269417 . C G 291.04 PASS AO=75;DP=164;FAO=75;FDP=164;FR=.;FRO=89;FSAF=27;FSAR=48;FSRF=32;FSRR=57;FWDB=-0.00736254;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.01;QD=7.09858;RBI=0.00985763;REFB=0.00258323;REVB=-0.00655483;RO=89;SAF=27;SAR=48;SRF=32;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000476816;STB=0.500265;TYPE=snp;VARB=-0.00289021;OID=.;OPOS=12269417;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:164:89:89:75:75:48:27:32:57:48:27:32:57 chr7 12271666 . G T 243.71 PASS AO=55;DP=109;FAO=55;FDP=109;FR=.;FRO=54;FSAF=23;FSAR=32;FSRF=30;FSRR=24;FWDB=-0.0485227;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.1046;QD=8.94357;RBI=0.0614447;REFB=-0.000650793;REVB=-0.0376961;RO=54;SAF=23;SAR=32;SRF=30;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123708;STB=0.56834;TYPE=snp;VARB=-0.000387247;OID=.;OPOS=12271666;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:54:54:55:55:32:23:30:24:32:23:30:24 chr7 12271997 . G A 132.75 PASS AO=35;DP=100;FAO=40;FDP=101;FR=.;FRO=61;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=37;FSRR=24;FWDB=0.0259856;FXX=0.0288434;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2029;QD=5.25745;RBI=0.0631309;REFB=-0.0316476;REVB=0.0575348;RO=59;SAF=18;SAR=17;SRF=37;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124665;STB=0.549601;TYPE=snp;VARB=0.0440529;OID=.;OPOS=12271997;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:101:59:61:35:40:17:18:37:22:19:21:37:24 chr7 12274933 . A G 770.22 PASS AO=481;DP=1006;FAO=191;FDP=398;FR=.;FRO=207;FSAF=85;FSAR=106;FSRF=87;FSRR=120;FWDB=-0.00282574;FXX=0.00499988;HRUN=4;LEN=1;MLLD=141.602;QD=7.74086;RBI=0.00701754;REFB=-0.0195295;REVB=-0.00642348;RO=523;SAF=205;SAR=276;SRF=253;SRR=270;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0553689;STB=0.513059;TYPE=snp;VARB=0.0197641;OID=.;OPOS=12274933;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:1006:398:523:207:481:191:276:205:253:270:106:85:87:120 chr7 12370794 . T C 512.55 PASS AO=112;DP=212;FAO=112;FDP=211;FR=.;FRO=99;FSAF=71;FSAR=41;FSRF=64;FSRR=35;FWDB=-0.0278602;FXX=0.00471676;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.1078;QD=9.71654;RBI=0.0278625;REFB=-0.00417039;REVB=-0.000360601;RO=98;SAF=71;SAR=41;SRF=64;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177074;STB=0.506357;TYPE=snp;VARB=0.00477585;OID=.;OPOS=12370794;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:211:98:99:112:112:41:71:64:34:41:71:64:35 chr7 12376811 . A C 423.67 PASS AO=113;DP=250;FAO=113;FDP=252;FR=.;FRO=139;FSAF=68;FSAR=45;FSRF=54;FSRR=85;FWDB=-0.0121566;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=272.712;QD=6.72483;RBI=0.0154157;REFB=0.00234215;REVB=0.00947948;RO=137;SAF=68;SAR=45;SRF=52;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218266;STB=0.616867;TYPE=snp;VARB=-0.00421845;OID=.;OPOS=12376811;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:250:252:137:139:113:113:45:68:52:85:45:68:54:85 chr7 12393966 . A G 1277.89 PASS AO=136;DP=140;FAO=140;FDP=142;FR=.;FRO=2;FSAF=86;FSAR=54;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0267002;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.2611;QD=35.9968;RBI=0.107133;REFB=-0.109977;REVB=0.103752;RO=4;SAF=85;SAR=51;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0072226;STB=0.501697;TYPE=snp;VARB=0.00211153;OID=.;OPOS=12393966;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:140:142:4:2:136:140:51:85:2:2:54:86:1:1 chr7 12393974 . A C 1330.09 PASS AO=140;DP=141;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00189532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.33;QD=37.4672;RBI=0.00224344;REFB=0;REVB=0.00120033;RO=0;SAF=82;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.94754e-07;OID=.;OPOS=12393974;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:141:142:0:0:140:142:58:82:0:0:58:84:0:0 chr7 12394053 . G T 1433.27 PASS AO=149;DP=149;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0158966;FXX=0.00662208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.098;QD=38.2206;RBI=0.0195009;REFB=0;REVB=0.0112953;RO=0;SAF=88;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.92755e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.18004e-05;OID=.;OPOS=12394053;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:149:150:0:0:149:150:61:88:0:0:61:89:0:0 chr7 12395813 . T C 372.97 PASS AO=82;DP=156;FAO=82;FDP=156;FR=.;FRO=74;FSAF=49;FSAR=33;FSRF=37;FSRR=37;FWDB=-0.00699835;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.2344;QD=9.56339;RBI=0.0146352;REFB=-0.0217265;REVB=0.0128535;RO=74;SAF=49;SAR=33;SRF=37;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0860675;STB=0.547212;TYPE=snp;VARB=0.0245294;OID=.;OPOS=12395813;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:156:74:74:82:82:33:49:37:37:33:49:37:37 chr7 12396897 . C T 288.61 PASS AO=83;DP=200;FAO=84;FDP=201;FR=.;FRO=117;FSAF=55;FSAR=29;FSRF=40;FSRR=77;FWDB=-0.0441577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.434;QD=5.74344;RBI=0.0488733;REFB=-0.00836539;REVB=-0.020945;RO=117;SAF=55;SAR=28;SRF=40;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.330556;STB=0.67905;TYPE=snp;VARB=0.0169382;OID=.;OPOS=12396897;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:200:201:117:117:83:84:28:55:40:77:29:55:40:77 chr7 12400837 . G A 1603.22 PASS AO=167;DP=171;FAO=169;FDP=169;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00847336;FXX=0.0231201;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.681;QD=37.9461;RBI=0.0142355;REFB=0;REVB=0.011439;RO=0;SAF=88;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000193779;OID=.;OPOS=12400837;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:171:169:0:0:167:169:79:88:0:0:81:88:0:0 chr7 12406989 . C G 222.54 PASS AO=56;DP=172;FAO=72;FDP=188;FR=.;FRO=116;FSAF=45;FSAR=27;FSRF=85;FSRR=31;FWDB=-0.00736189;FXX=0.00529073;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.343;QD=4.73482;RBI=0.0619258;REFB=-0.0174897;REVB=0.0614866;RO=112;SAF=42;SAR=14;SRF=81;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0402969;STB=0.57351;TYPE=snp;VARB=0.0304594;OID=.;OPOS=12406989;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:188:112:116:56:72:14:42:81:31:27:45:85:31 chr7 12410112 . G A 916.37 PASS AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.952;QD=38.1819;RBI=0.022067;REFB=0;REVB=0.0124084;RO=0;SAF=47;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.53995e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.31465e-05;OID=.;OPOS=12410112;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:96:96:0:0:96:96:49:47:0:0:49:47:0:0 chr7 12417407 . C T 916.36 PASS AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0305394;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.508;QD=38.1818;RBI=0.0312972;REFB=0;REVB=-0.00684575;RO=0;SAF=51;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.12472e-05;OID=.;OPOS=12417407;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:96:96:0:0:96:96:45:51:0:0:45:51:0:0 chr7 12419108 . A T 1070.21 PASS AO=114;DP=115;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.061051;FXX=0.0086949;HRUN=3;LEN=1;MLLD=106.214;QD=37.5511;RBI=0.0616798;REFB=0.0157121;REVB=0.00878512;RO=1;SAF=55;SAR=59;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00798064;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000109504;OID=.;OPOS=12419108;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:115:114:1:0:114:114:59:55:0:1:59:55:0:0 chr7 12428608 . C A 182.01 PASS AO=45;DP=103;FAO=47;FDP=104;FR=.;FRO=57;FSAF=34;FSAR=13;FSRF=42;FSRR=15;FWDB=0.00481223;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.461;QD=7.00038;RBI=0.0161129;REFB=-0.00947037;REVB=0.0153775;RO=58;SAF=34;SAR=11;SRF=43;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0190274;STB=0.509274;TYPE=snp;VARB=0.00971242;OID=.;OPOS=12428608;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:104:58:57:45:47:11:34:43:15:13:34:42:15 chr7 12428803 . G A 244.57 PASS AO=68;DP=175;FAO=74;FDP=181;FR=.;FRO=107;FSAF=42;FSAR=32;FSRF=51;FSRR=56;FWDB=-0.0144442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.214;QD=5.40475;RBI=0.0243634;REFB=0.00365563;REVB=0.0196199;RO=100;SAF=39;SAR=29;SRF=48;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0995114;STB=0.553942;TYPE=snp;VARB=-0.00445754;OID=.;OPOS=12428803;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:181:100:107:68:74:29:39:48:52:32:42:51:56 chr7 12636026 . T C 560.58 PASS AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00563585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.2726;QD=36.1666;RBI=0.0777473;REFB=-0.0795309;REVB=0.0775428;RO=1;SAF=22;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0209702;STB=0.511107;TYPE=snp;VARB=0.00168339;OID=.;OPOS=12636026;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:62:62:1:1:61:61:39:22:1:0:39:22:1:0 chr7 12728977 . G A 239.16 PASS AO=63;DP=140;FAO=62;FDP=138;FR=.;FRO=76;FSAF=18;FSAR=44;FSRF=39;FSRR=37;FWDB=-0.00578106;FXX=0.0142847;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.163;QD=6.93227;RBI=0.00591049;REFB=0.00300704;REVB=-0.00123017;RO=75;SAF=18;SAR=45;SRF=38;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233675;STB=0.632331;TYPE=snp;VARB=-0.00562832;OID=.;OPOS=12728977;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:138:75:76:63:62:45:18:38:37:44:18:39:37 chr7 12729933 . T G 78.41 PASS AO=5;DP=34;FAO=11;FDP=23;FR=.,HEALED;FRO=6;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0102565;FXX=0.178508;HRUN=14;LEN=1;MLLD=202.057;QD=13.6362;RBI=0.0138562;REFB=-0.00269008;REVB=-0.00931656;RO=3;SAF=5;SAR=0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.54921;TYPE=snp;VARB=-0.00721216;OID=.;OPOS=12729933;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:21:23:3:6:5:11:0:5:3:0:3:8:5:1 chr7 13978809 . T C 306.03 PASS AO=87;DP=208;FAO=88;FDP=208;FR=.;FRO=120;FSAF=45;FSAR=43;FSRF=58;FSRR=62;FWDB=-0.00812885;FXX=0.00478446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.389;QD=5.88519;RBI=0.0183172;REFB=-0.0124556;REVB=0.0164147;RO=121;SAF=44;SAR=43;SRF=59;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0188784;STB=0.516164;TYPE=snp;VARB=0.0169563;OID=.;OPOS=13978809;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:208:121:120:87:88:43:44:59:62:43:45:58:62 chr7 14217673 . G A 87.47 PASS AO=16;DP=36;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.0253248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.529;QD=8.97135;RBI=0.0331307;REFB=-0.0406639;REVB=0.0213611;RO=20;SAF=6;SAR=10;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123809;STB=0.569758;TYPE=snp;VARB=0.0414429;OID=.;OPOS=14217673;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:36:39:20:20:16:19:10:6:10:10:12:7:10:10 chr7 14758273 . C T 377.79 PASS AO=93;DP=198;FAO=94;FDP=199;FR=.;FRO=105;FSAF=24;FSAR=70;FSRF=18;FSRR=87;FWDB=-0.0301655;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4487;QD=7.59378;RBI=0.0332877;REFB=-0.00603813;REVB=-0.0140753;RO=105;SAF=24;SAR=69;SRF=18;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11602;STB=0.561705;TYPE=snp;VARB=0.00626804;OID=.;OPOS=14758273;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:199:105:105:93:94:69:24:18:87:70:24:18:87 chr7 15651770 . C T 121.7 PASS AO=36;DP=92;FAO=36;FDP=92;FR=.;FRO=56;FSAF=6;FSAR=30;FSRF=15;FSRR=41;FWDB=0.00405567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.504;QD=5.29111;RBI=0.0317975;REFB=-0.0309097;REVB=-0.0315378;RO=56;SAF=6;SAR=30;SRF=15;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167513;STB=0.596532;TYPE=snp;VARB=0.0361006;OID=.;OPOS=15651770;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:56:56:36:36:30:6:15:41:30:6:15:41 chr7 16128995 . G GTACA,A 325.32 PASS AO=28,10;DP=45;FAO=32,10;FDP=45;FR=.;FRO=3;FSAF=28,10;FSAR=4,0;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0480893,-0.00196539;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=4,1;MLLD=93.6203,52.7045;QD=28.9175;RBI=0.064301,0.0254698;REFB=0.0401275,-0.198286;REVB=0.0426854,-0.0253939;RO=5;SAF=25,10;SAR=3,0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0845284,0;STB=0.525408,0.5;TYPE=ins,snp;VARB=0.00603792,0.0944703;OID=.,.;OPOS=16128996,16128995;OREF=-,G;OALT=TACA,A;OMAPALT=GTACA,A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:22:45:45:5:3:28,10:32,10:3,0:25,10:5:0:4,0:28,10:3:0 chr7 16129153 . C T 773.37 PASS AO=84;DP=86;FAO=85;FDP=86;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=71;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0303779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.461;QD=35.9708;RBI=0.0458139;REFB=-0.158363;REVB=0.0342943;RO=1;SAF=13;SAR=71;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0350395;STB=0.517237;TYPE=snp;VARB=0.00126539;OID=.;OPOS=16129153;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:86:86:1:1:84:85:71:13:1:0:71:14:1:0 chr7 16129172 . A G 95.92 PASS AO=28;DP=73;FAO=28;FDP=72;FR=.;FRO=44;FSAF=4;FSAR=24;FSRF=7;FSRR=37;FWDB=-0.0348546;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.989;QD=5.32894;RBI=0.0355331;REFB=-0.0384996;REVB=-0.00691056;RO=43;SAF=4;SAR=24;SRF=7;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0414521;STB=0.519671;TYPE=snp;VARB=0.0643264;OID=.;OPOS=16129172;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:73:72:43:44:28:28:24:4:7:36:24:4:7:37 chr7 16639615 . A C 1782.1 PASS AO=186;DP=186;FAO=186;FDP=186;FR=.;FRO=0;FSAF=109;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00971847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2059;QD=38.3248;RBI=0.0757487;REFB=0;REVB=0.0751227;RO=0;SAF=109;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000219242;OID=.;OPOS=16639615;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:186:186:0:0:186:186:77:109:0:0:77:109:0:0 chr7 16655387 . C T 682.09 PASS AO=159;DP=317;FAO=161;FDP=317;FR=.;FRO=156;FSAF=97;FSAR=64;FSRF=83;FSRR=73;FWDB=0.00339797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.757;QD=8.60686;RBI=0.00589292;REFB=0.00228053;REVB=0.00481459;RO=155;SAF=96;SAR=63;SRF=82;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0692548;STB=0.535648;TYPE=snp;VARB=-0.00183031;OID=.;OPOS=16655387;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:317:317:155:156:159:161:63:96:82:73:64:97:83:73 chr7 16666741 . T G 286.3 PASS AO=87;DP=217;FAO=89;FDP=222;FR=.;FRO=133;FSAF=42;FSAR=47;FSRF=59;FSRR=74;FWDB=-0.00708763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.607;QD=5.15848;RBI=0.0231725;REFB=0.00764457;REVB=0.022062;RO=129;SAF=40;SAR=47;SRF=57;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192235;STB=0.517038;TYPE=snp;VARB=-0.0106405;OID=.;OPOS=16666741;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:217:222:129:133:87:89:47:40:57:72:47:42:59:74 chr7 16666759 . G C 297.63 PASS AO=85;DP=198;FAO=84;FDP=199;FR=.;FRO=115;FSAF=34;FSAR=50;FSRF=45;FSRR=70;FWDB=-0.0130354;FXX=0.00499975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.9704;QD=5.98241;RBI=0.0151195;REFB=-0.0124765;REVB=-0.00766003;RO=112;SAF=35;SAR=50;SRF=45;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0105278;STB=0.508093;TYPE=snp;VARB=0.0179265;OID=.;OPOS=16666759;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:199:112:115:85:84:50:35:45:67:50:34:45:70 chr7 16793668 . A G 193.52 PASS AO=46;DP=94;FAO=46;FDP=94;FR=.;FRO=48;FSAF=13;FSAR=33;FSRF=29;FSRR=19;FWDB=-0.0278005;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.731;QD=8.23509;RBI=0.0308854;REFB=-0.0136867;REVB=-0.0134551;RO=46;SAF=14;SAR=32;SRF=27;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265432;STB=0.672085;TYPE=snp;VARB=0.00854193;OID=.;OPOS=16793668;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:46:48:46:46:32:14:27:19:33:13:29:19 chr7 16816000 . T C 637.76 PASS AO=163;DP=349;FAO=164;FDP=352;FR=.;FRO=188;FSAF=79;FSAR=85;FSRF=67;FSRR=121;FWDB=-0.00522386;FXX=0.0140052;HRUN=6;LEN=1;MLLD=200.508;QD=7.24728;RBI=0.0144913;REFB=-0.0116355;REVB=-0.0135169;RO=173;SAF=82;SAR=81;SRF=66;SRR=107;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114002;STB=0.567347;TYPE=snp;VARB=0.0119056;OID=.;OPOS=16816000;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:349:352:173:188:163:164:81:82:66:107:85:79:67:121 chr7 16823095 . G A 103.98 PASS AO=23;DP=63;FAO=28;FDP=67;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=0.00609437;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.243;QD=6.20766;RBI=0.00676657;REFB=-0.03012;REVB=0.00294028;RO=39;SAF=16;SAR=7;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127384;STB=0.533006;TYPE=snp;VARB=0.0423504;OID=.;OPOS=16823095;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:67:39:39:23:28:7:16:23:16:10:18:23:16 chr7 16834551 . C A 2501.77 PASS AO=255;DP=256;FAO=261;FDP=261;FR=.;FRO=0;FSAF=143;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105836;FXX=0.0113632;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.846;QD=38.3412;RBI=0.0319652;REFB=0;REVB=-0.0301622;RO=0;SAF=140;SAR=115;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.27098e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000120505;OID=.;OPOS=16834551;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:256:261:0:0:255:261:115:140:0:0:118:143:0:0 chr7 16834597 . A G 301.69 PASS AO=90;DP=240;FAO=95;FDP=242;FR=.;FRO=147;FSAF=41;FSAR=54;FSRF=92;FSRR=55;FWDB=-0.00354028;FXX=0.00411506;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.6898;QD=4.98664;RBI=0.0352611;REFB=-0.0180312;REVB=-0.0350829;RO=141;SAF=37;SAR=53;SRF=86;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213507;STB=0.616404;TYPE=snp;VARB=0.0174425;OID=.;OPOS=16834597;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:240:242:141:147:90:95:53:37:86:55:54:41:92:55 chr7 16872913 . G A 310.5 PASS AO=76;DP=168;FAO=78;FDP=166;FR=.;FRO=88;FSAF=48;FSAR=30;FSRF=35;FSRR=53;FWDB=-0.00278143;FXX=0.0119041;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.5818;QD=7.48182;RBI=0.0482597;REFB=-0.00399226;REVB=-0.0481794;RO=85;SAF=48;SAR=28;SRF=34;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22187;STB=0.615355;TYPE=snp;VARB=0.00405265;OID=.;OPOS=16872913;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:166:85:88:76:78:28:48:34:51:30:48:35:53 chr7 16899197 . C T 998.22 PASS AO=106;DP=107;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00422694;FXX=0.00934492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.16;QD=37.6688;RBI=0.00937038;REFB=-0.0358271;REVB=0.00836283;RO=0;SAF=46;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.34199e-05;OID=.;OPOS=16899197;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:107:106:0:0:106:106:60:46:0:0:60:46:0:0 chr7 16913394 . A G 867.09 PASS AO=106;DP=112;FAO=104;FDP=112;FR=.;FRO=8;FSAF=75;FSAR=29;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.0889211;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.0075;QD=30.9673;RBI=0.0903086;REFB=-0.126202;REVB=0.0157697;RO=6;SAF=77;SAR=29;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00759887;STB=0.502567;TYPE=snp;VARB=0.0221504;OID=.;OPOS=16913394;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:112:112:6:8:106:104:29:77:4:2:29:75:6:2 chr7 17379128 . AAT A,AA 72.3 PASS AO=22,24;DP=137;FAO=40,8;FDP=119;FR=.;FRO=71;FSAF=11,1;FSAR=29,7;FSRF=34;FSRR=37;FWDB=0.022602,0.203249;FXX=0.0846089;HRUN=5,5;LEN=2,1;MLLD=19.98,10.5008;QD=2.43035;RBI=0.163873,0.325762;REFB=-0.0499629,-0.115829;REVB=-0.162307,-0.254579;RO=65;SAF=5,1;SAR=17,23;SRF=41;SRR=24;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.48343,-0.748138;STB=0.642466,0.846814;TYPE=del,del;VARB=0.0280826,0.20113;OID=.,.;OPOS=17379129,17379130;OREF=AT,T;OALT=-,-;OMAPALT=A,AA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:22,24:122:40,8:119:71:11,1:29,7:34:37:48:65:5,1:17,23:41:24 chr7 17831806 . C T 301.24 PASS AO=65;DP=133;FAO=69;FDP=136;FR=.;FRO=67;FSAF=22;FSAR=47;FSRF=38;FSRR=29;FWDB=0.0129442;FXX=0.0144917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.068;QD=8.85992;RBI=0.0159067;REFB=-0.0266279;REVB=-0.00924493;RO=67;SAF=19;SAR=46;SRF=37;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253841;STB=0.627745;TYPE=snp;VARB=0.0302853;OID=.;OPOS=17831806;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:136:67:67:65:69:46:19:37:30:47:22:38:29 chr7 17854532 . G T 210.72 PASS AO=68;DP=160;FAO=68;FDP=180;FR=.;FRO=112;FSAF=30;FSAR=38;FSRF=37;FSRR=75;FWDB=-0.00360618;FXX=0.0217379;HRUN=5;LEN=1;MLLD=174.374;QD=4.68274;RBI=0.0244748;REFB=-0.0194371;REVB=-0.0242077;RO=92;SAF=30;SAR=38;SRF=34;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.075506;STB=0.571072;TYPE=snp;VARB=0.0326537;OID=.;OPOS=17854532;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:180:92:112:68:68:38:30:34:58:38:30:37:75 chr7 17937038 . AG A 546.49 PASS AO=52;DP=97;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0482823;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=15.9981;QD=26.3369;RBI=0.38469;REFB=0;REVB=0.381648;RO=21;SAF=12;SAR=40;SRF=0;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0.308901;SSSB=0.194637;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0111255;OID=.;OPOS=17937039;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:52:81:83:83:0:13:70:0:0:50:21:12:40:0:21 chr7 18067479 . ACT A 96.86 PASS AO=24;DP=60;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.0491984;FXX=0.0357079;HRUN=1;LEN=2;MLLD=139.353;QD=7.17519;RBI=0.0539125;REFB=0.00754521;REVB=-0.0220471;RO=28;SAF=7;SAR=17;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246887;STB=0.642968;TYPE=del;VARB=-0.0121242;OID=.;OPOS=18067480;OREF=CT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:24:53:24:54:30:7:17:16:14:96:28:7:17:15:13 chr7 18687542 . A T 300.68 PASS AO=65;DP=127;FAO=65;FDP=123;FR=.;FRO=58;FSAF=21;FSAR=44;FSRF=24;FSRR=34;FWDB=-0.0241404;FXX=0.0314936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.8549;QD=9.77831;RBI=0.0260684;REFB=-0.036766;REVB=0.00983879;RO=56;SAF=21;SAR=44;SRF=24;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.097637;STB=0.547249;TYPE=snp;VARB=0.0284492;OID=.;OPOS=18687542;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:123:56:58:65:65:44:21:24:32:44:21:24:34 chr7 18767343 . A G 242.14 PASS AO=73;DP=180;FAO=73;FDP=180;FR=.;FRO=107;FSAF=24;FSAR=49;FSRF=29;FSRR=78;FWDB=-0.00600121;FXX=0.0109884;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.305;QD=5.38086;RBI=0.00768059;REFB=-0.00413621;REVB=-0.00479342;RO=106;SAF=24;SAR=49;SRF=28;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0799139;STB=0.539936;TYPE=snp;VARB=0.00696495;OID=.;OPOS=18767343;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:180:106:107:73:73:49:24:28:78:49:24:29:78 chr7 18977653 . G A 313.72 PASS AO=81;DP=179;FAO=81;FDP=178;FR=.;FRO=97;FSAF=42;FSAR=39;FSRF=49;FSRR=48;FWDB=0.0197465;FXX=0.00558628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.0057;QD=7.04994;RBI=0.0566236;REFB=-0.0156529;REVB=0.0530689;RO=95;SAF=42;SAR=39;SRF=48;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129154;STB=0.507287;TYPE=snp;VARB=0.0207775;OID=.;OPOS=18977653;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:178:95:97:81:81:39:42:48:47:39:42:49:48 chr7 18993870 . C T 1152.89 PASS AO=120;DP=120;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.926;QD=37.19;RBI=0.0238798;REFB=0;REVB=0.0176097;RO=0;SAF=41;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.48571e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.91371e-05;OID=.;OPOS=18993870;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:120:124:0:0:120:124:79:41:0:0:79:45:0:0 chr7 19184746 . C CTCT 384.04 PASS AO=54;DP=81;FAO=58;FDP=77;FR=.;FRO=19;FSAF=35;FSAR=23;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=-0.0183364;FXX=0.0722804;HRUN=1;LEN=3;MLLD=176.309;QD=19.9499;RBI=0.0485342;REFB=-0.00195393;REVB=0.0449371;RO=20;SAF=32;SAR=22;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0832913;STB=0.520993;TYPE=ins;VARB=0.000512359;OID=.;OPOS=19184747;OREF=-;OALT=TCT;OMAPALT=CTCT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:54:81:58:77:19:35:23:13:6:37:20:32:22:15:5 chr7 20178175 . C T 1201.22 PASS AO=78;DP=133;FAO=129;FDP=129;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=33;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00710399;FXX=0.00769172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.245;QD=37.2471;RBI=0.0300506;REFB=0;REVB=0.0291988;RO=0;SAF=24;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.01268e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.12582e-05;OID=.;OPOS=20178175;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:103:129:0:0:78:129:54:24:0:0:96:33:0:0 chr7 20180717 . C G 1409.71 PASS AO=147;DP=147;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0280019;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.13;QD=38.3594;RBI=0.0281328;REFB=0;REVB=0.00271062;RO=0;SAF=48;SAR=99;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.1144e-05;OID=.;OPOS=20180717;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:147:147:0:0:147:147:99:48:0:0:99:48:0:0 chr7 20198440 . G A 475.13 PASS AO=134;DP=312;FAO=135;FDP=315;FR=.;FRO=180;FSAF=71;FSAR=64;FSRF=87;FSRR=93;FWDB=-0.0144603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.4588;QD=6.03342;RBI=0.0190577;REFB=-0.0103049;REVB=0.0124134;RO=178;SAF=71;SAR=63;SRF=86;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0479419;STB=0.524339;TYPE=snp;VARB=0.0131496;OID=.;OPOS=20198440;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:312:315:178:180:134:135:63:71:86:92:64:71:87:93 chr7 20689734 . G A 317.34 PASS AO=90;DP=227;FAO=95;FDP=232;FR=.;FRO=137;FSAF=38;FSAR=57;FSRF=54;FSRR=83;FWDB=-0.00287514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.792;QD=5.47144;RBI=0.0226187;REFB=-0.0067883;REVB=-0.0224352;RO=133;SAF=33;SAR=57;SRF=51;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0191023;STB=0.503596;TYPE=snp;VARB=0.00963023;OID=.;OPOS=20689734;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:227:232:133:137:90:95:57:33:51:82:57:38:54:83 chr7 20698270 . A G 819.28 PASS AO=177;DP=327;FAO=177;FDP=327;FR=.;FRO=150;FSAF=65;FSAR=112;FSRF=68;FSRR=82;FWDB=-0.00429676;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.89;QD=10.0218;RBI=0.0246406;REFB=-0.0158076;REVB=0.0242631;RO=150;SAF=65;SAR=112;SRF=68;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0762475;STB=0.54155;TYPE=snp;VARB=0.0151299;OID=.;OPOS=20698270;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:327:327:150:150:177:177:112:65:68:82:112:65:68:82 chr7 20762646 . G T 226.82 PASS AO=50;DP=94;FAO=49;FDP=93;FR=.;FRO=44;FSAF=34;FSAR=15;FSRF=27;FSRR=17;FWDB=-0.0170504;FXX=0.0106372;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.5269;QD=9.75548;RBI=0.0243801;REFB=0.0043249;REVB=-0.0174262;RO=43;SAF=35;SAR=15;SRF=26;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0912537;STB=0.543167;TYPE=snp;VARB=-0.00500342;OID=.;OPOS=20762646;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:93:43:44:50:49:15:35:26:17:15:34:27:17 chr7 20768013 . G A 428.27 PASS AO=106;DP=222;FAO=106;FDP=222;FR=.;FRO=116;FSAF=48;FSAR=58;FSRF=56;FSRR=60;FWDB=-0.0608099;FXX=0.0044841;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.563;QD=7.71663;RBI=0.0636149;REFB=-0.0177712;REVB=-0.0186816;RO=115;SAF=48;SAR=58;SRF=55;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0241563;STB=0.515729;TYPE=snp;VARB=0.0234304;OID=.;OPOS=20768013;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:222:115:116:106:106:58:48:55:60:58:48:56:60 chr7 20778646 . G A 1824.06 PASS AO=180;DP=180;FAO=193;FDP=193;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181927;FXX=0.0102559;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.883;QD=37.8044;RBI=0.0210433;REFB=0;REVB=0.0105758;RO=0;SAF=85;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000741218;OID=.;OPOS=20778646;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:87:180:193:0:0:180:193:95:85:0:0:101:92:0:0 chr7 20822196 . A AC 957.41 PASS AO=133;DP=153;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0522388;FXX=0.0134219;HRUN=2;LEN=1;MLLD=16.1142;QD=26.0519;RBI=0.0522542;REFB=0;REVB=0.00127101;RO=14;SAF=60;SAR=73;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171421;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00114734;OID=.;OPOS=20822197;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:133:153:147:147:0:64:83:0:0:83:14:60:73:5:9 chr7 20822304 . C CA 432.95 PASS AO=55;DP=67;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.129383;FXX=0.0327815;HRUN=2;LEN=1;MLLD=22.0612;QD=29.3528;RBI=0.147473;REFB=0;REVB=0.0707685;RO=8;SAF=32;SAR=23;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109582;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00632755;OID=.;OPOS=20822305;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:55:67:59:59:0:32:27:0:0:38:8:32:23:1:7 chr7 20826450 . CT C 40.28 PASS AO=16;DP=45;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.163634;FXX=0.0277701;HRUN=6;LEN=1;MLLD=10.5794;QD=4.60381;RBI=0.363832;REFB=-0.097713;REVB=0.324958;RO=17;SAF=15;SAR=1;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0.365385;SSSB=0.58764;STB=0.666455;TYPE=del;VARB=0.116446;OID=.;OPOS=20826451;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:16:35:18:35:17:15:3:10:7:32:17:15:1:9:8 chr7 21582963 . G T 34.08 PASS AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.083409;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.9446;QD=11.3593;RBI=0.0892555;REFB=-0.00940899;REVB=0.0317723;RO=6;SAF=5;SAR=1;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0193407;OID=.;OPOS=21582963;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:12:12:6:6:6:6:1:5:5:1:1:5:5:1 chr7 21582964 . A T 34.08 PASS AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0475911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.843;QD=11.3602;RBI=0.0519778;REFB=-0.0555405;REVB=-0.0208992;RO=6;SAF=5;SAR=1;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0476562;OID=.;OPOS=21582964;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:12:12:6:6:6:6:1:5:5:1:1:5:5:1 chr7 21628237 . C T 2879.45 PASS AO=295;DP=299;FAO=302;FDP=302;FR=.;FRO=0;FSAF=164;FSAR=138;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000375262;FXX=0.00330022;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.834;QD=38.1384;RBI=0.0111686;REFB=0;REVB=0.0111623;RO=0;SAF=160;SAR=135;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000120861;OID=.;OPOS=21628237;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:299:302:0:0:295:302:135:160:0:0:138:164:0:0 chr7 21640361 . T C 208.99 PASS AO=68;DP=189;FAO=71;FDP=194;FR=.;FRO=123;FSAF=41;FSAR=30;FSRF=69;FSRR=54;FWDB=-0.0534657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.4688;QD=4.309;RBI=0.0607968;REFB=-0.0329575;REVB=0.0289424;RO=120;SAF=41;SAR=27;SRF=69;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0324661;STB=0.510673;TYPE=snp;VARB=0.0549644;OID=.;OPOS=21640361;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:194:120:123:68:71:27:41:69:51:30:41:69:54 chr7 21640405 . A G 305.77 PASS AO=97;DP=250;FAO=97;FDP=249;FR=.;FRO=152;FSAF=49;FSAR=48;FSRF=83;FSRR=69;FWDB=0.00830975;FXX=0.00399984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.3743;QD=4.91189;RBI=0.0365346;REFB=-0.0136519;REVB=0.035577;RO=152;SAF=49;SAR=48;SRF=83;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0444207;STB=0.524976;TYPE=snp;VARB=0.0187505;OID=.;OPOS=21640405;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:250:249:152:152:97:97:48:49:83:69:48:49:83:69 chr7 21641218 . G A 176.3 PASS AO=46;DP=103;FAO=46;FDP=104;FR=.;FRO=58;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=33;FSRR=25;FWDB=-0.0307829;FXX=0.0095229;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9331;QD=6.78062;RBI=0.0307892;REFB=-0.00102357;REVB=-0.000619789;RO=57;SAF=18;SAR=28;SRF=32;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169151;STB=0.599453;TYPE=snp;VARB=-0.00552566;OID=.;OPOS=21641218;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:104:57:58:46:46:28:18:32:25:28:18:33:25 chr7 21678643 . A G 526.38 PASS AO=99;DP=182;FAO=108;FDP=192;FR=.;FRO=84;FSAF=41;FSAR=67;FSRF=51;FSRR=33;FWDB=0.023779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.338;QD=10.9663;RBI=0.0239555;REFB=-0.0181989;REVB=-0.00290319;RO=78;SAF=35;SAR=64;SRF=46;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19565;STB=0.600527;TYPE=snp;VARB=0.0115022;OID=.;OPOS=21678643;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:192:78:84:99:108:64:35:46:32:67:41:51:33 chr7 21723431 . G A 559.01 PASS AO=120;DP=222;FAO=120;FDP=222;FR=.;FRO=102;FSAF=65;FSAR=55;FSRF=44;FSRR=58;FWDB=-0.0286807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.454;QD=10.0722;RBI=0.0290799;REFB=-0.0339162;REVB=-0.00480183;RO=101;SAF=65;SAR=55;SRF=43;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.096997;STB=0.550591;TYPE=snp;VARB=0.0286335;OID=.;OPOS=21723431;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:222:101:102:120:120:55:65:43:58:55:65:44:58 chr7 21765497 . G A 1642.44 PASS AO=180;DP=188;FAO=182;FDP=187;FR=.;FRO=5;FSAF=111;FSAR=71;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0137095;FXX=0.00531887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.6244;QD=35.1324;RBI=0.0303858;REFB=-0.125444;REVB=-0.0271173;RO=7;SAF=109;SAR=71;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0295907;STB=0.511012;TYPE=snp;VARB=0.00347856;OID=.;OPOS=21765497;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:188:187:7:5:180:182:71:109:7:0:71:111:5:0 chr7 21775443 . G A 276.54 PASS AO=73;DP=166;FAO=74;FDP=167;FR=.;FRO=93;FSAF=13;FSAR=61;FSRF=28;FSRR=65;FWDB=0.0110603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.641;QD=6.62361;RBI=0.0199801;REFB=-0.00870373;REVB=0.0166395;RO=93;SAF=12;SAR=61;SRF=28;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20808;STB=0.604221;TYPE=snp;VARB=0.0163184;OID=.;OPOS=21775443;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:167:93:93:73:74:61:12:28:65:61:13:28:65 chr7 21778449 . C T 1298.42 PASS AO=138;DP=141;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0252754;FXX=0.028167;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.319;QD=37.6353;RBI=0.0351308;REFB=0.0066691;REVB=-0.0243993;RO=0;SAF=64;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000312774;OID=.;OPOS=21778449;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:141:138:0:0:138:138:74:64:0:0:74:64:0:0 chr7 21779278 . A G 379.51 PASS AO=94;DP=198;FAO=94;FDP=198;FR=.;FRO=104;FSAF=52;FSAR=42;FSRF=40;FSRR=64;FWDB=0.0111723;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.27;QD=7.66693;RBI=0.0346739;REFB=0.00353116;REVB=-0.0328247;RO=104;SAF=52;SAR=42;SRF=40;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159332;STB=0.587865;TYPE=snp;VARB=-0.00312338;OID=.;OPOS=21779278;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:198:104:104:94:94:42:52:40:64:42:52:40:64 chr7 21856151 . G A 2260.22 PASS AO=238;DP=242;FAO=238;FDP=238;FR=.;FRO=0;FSAF=113;FSAR=125;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00702688;FXX=0.0165282;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.964;QD=37.9869;RBI=0.0254687;REFB=-0.0110101;REVB=-0.0244802;RO=1;SAF=113;SAR=125;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00379766;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.1302e-06;OID=.;OPOS=21856151;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:242:238:1:0:238:238:125:113:0:1:125:113:0:0 chr7 21893993 . G T 241.67 PASS AO=75;DP=198;FAO=77;FDP=199;FR=.;FRO=122;FSAF=36;FSAR=41;FSRF=61;FSRR=61;FWDB=-0.000260824;FXX=0.00499975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.177;QD=4.85761;RBI=0.0241302;REFB=-0.0131586;REVB=-0.0241288;RO=120;SAF=35;SAR=40;SRF=61;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0454611;STB=0.519932;TYPE=snp;VARB=0.0143843;OID=.;OPOS=21893993;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:199:120:122:75:77:40:35:61:59:41:36:61:61 chr7 21901540 . T C 331.76 PASS AO=95;DP=229;FAO=96;FDP=230;FR=.;FRO=134;FSAF=44;FSAR=52;FSRF=55;FSRR=79;FWDB=-0.0308616;FXX=0.00862032;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.545;QD=5.76979;RBI=0.0314875;REFB=0.000808905;REVB=0.00624672;RO=133;SAF=44;SAR=51;SRF=55;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0523466;STB=0.52822;TYPE=snp;VARB=-0.000989519;OID=.;OPOS=21901540;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:229:230:133:134:95:96:51:44:55:78:52:44:55:79 chr7 21901566 . T C 1769.61 PASS AO=186;DP=188;FAO=186;FDP=186;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=123;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0464709;FXX=0.0106377;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.872;QD=38.056;RBI=0.046476;REFB=-0.0417123;REVB=0.000684961;RO=1;SAF=63;SAR=123;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00749753;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.53208e-05;OID=.;OPOS=21901566;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:188:186:1:0:186:186:123:63:1:0:123:63:0:0 chr7 21924014 . A G 1068.44 PASS AO=117;DP=121;FAO=117;FDP=120;FR=.;FRO=3;FSAF=55;FSAR=62;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0117303;FXX=0.00826378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.7382;QD=35.6147;RBI=0.0398809;REFB=-0.12447;REVB=-0.0381167;RO=3;SAF=55;SAR=62;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0251974;STB=0.513272;TYPE=snp;VARB=0.0010347;OID=.;OPOS=21924014;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:121:120:3:3:117:117:62:55:3:0:62:55:3:0 chr7 21932044 . C T 1036.91 PASS AO=108;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0108308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.32;QD=38.4042;RBI=0.0155649;REFB=0;REVB=0.0111785;RO=0;SAF=62;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.67537e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.89553e-07;OID=.;OPOS=21932044;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:108:108:0:0:108:108:46:62:0:0:46:62:0:0 chr7 21941374 . CCTCCAGTG C,CC 1120.92 PASS AO=56,84;DP=171;FAO=0,144;FDP=168;FR=.;FRO=24;FSAF=0,57;FSAR=0,87;FSRF=18;FSRR=6;FWDB=0.00269446,-0.00259319;FXX=0.0232545;HRUN=2,1;LEN=8,7;MLLD=227.167,247.562;QD=26.6886;RBI=0.0521148,0.0764815;REFB=-0.0498356,-0.0571021;REVB=0.0520451,0.0764376;RO=0;SAF=2,54;SAR=54,30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.383747,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.551743;TYPE=del,del;VARB=0,0.00854314;OID=.,.;OPOS=21941375,21941376;OREF=CTCCAGTG,TCCAGTG;OALT=-,-;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:56,84:144:0,144:168:24:0,57:0,87:18:6:11:0:2,54:54,30:0:0 chr7 21941375 . CTCCAGTG C 16 PASS AO=39;DP=178;LEN=7;RO=139;SAF=57;SAR=54;SRF=23;SRR=44;TYPE=del;FR=.;OID=.;OPOS=21941376;OREF=TCCAGTG;OALT=-;OMAPALT=C GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR 0/1:99:178:139:39:54:57:23:44 chr7 21941439 . A G 1640.84 PASS AO=185;DP=197;FAO=191;FDP=204;FR=.;FRO=13;FSAF=77;FSAR=114;FSRF=0;FSRR=13;FWDB=-0.00353811;FXX=0.00970827;HRUN=4;LEN=1;MLLD=69.6607;QD=32.1734;RBI=0.0188731;REFB=-0.0986786;REVB=0.0185384;RO=11;SAF=75;SAR=110;SRF=0;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0452654;STB=0.526968;TYPE=snp;VARB=0.00239142;OID=.;OPOS=21941439;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:197:204:11:13:185:191:110:75:0:11:114:77:0:13 chr7 21943842 . G A 434.52 PASS AO=94;DP=174;FAO=95;FDP=180;FR=.;FRO=85;FSAF=61;FSAR=34;FSRF=48;FSRR=37;FWDB=-0.0167911;FXX=0.0109884;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.6414;QD=9.6561;RBI=0.0561326;REFB=-0.0143043;REVB=-0.0535623;RO=80;SAF=60;SAR=34;SRF=46;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0566193;STB=0.538874;TYPE=snp;VARB=0.0296315;OID=.;OPOS=21943842;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:180:80:85:94:95:34:60:46:34:34:61:48:37 chr7 22197507 . A G 1754.68 PASS AO=184;DP=185;FAO=185;FDP=185;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=141;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00297373;FXX=0.00537606;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.1656;QD=37.9389;RBI=0.0320565;REFB=-0.0463839;REVB=-0.0319183;RO=1;SAF=44;SAR=140;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00338907;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000303387;OID=.;OPOS=22197507;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:185:185:1:0:184:185:140:44:0:1:141:44:0:0 chr7 22202117 . G A 1557.22 PASS AO=163;DP=164;FAO=163;FDP=163;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145299;FXX=0.00609719;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.308;QD=38.2139;RBI=0.0147724;REFB=0;REVB=-0.00266615;RO=0;SAF=67;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.28207e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.95178e-06;OID=.;OPOS=22202117;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:164:163:0:0:163:163:96:67:0:0:96:67:0:0 chr7 22478207 . G T 2512.1 PASS AO=262;DP=267;FAO=268;FDP=268;FR=.;FRO=0;FSAF=131;FSAR=137;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00762425;FXX=0.0110697;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4898;QD=37.494;RBI=0.0208844;REFB=0.0258405;REVB=0.019443;RO=3;SAF=128;SAR=134;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0033518;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.11864e-05;OID=.;OPOS=22478207;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:267:268:3:0:262:268:134:128:1:2:137:131:0:0 chr7 22532321 . T C 167.69 PASS AO=33;DP=67;FAO=40;FDP=74;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=-0.006485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.102;QD=9.06422;RBI=0.0169848;REFB=-0.0210544;REVB=0.015698;RO=34;SAF=9;SAR=24;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.327808;STB=0.612188;TYPE=snp;VARB=0.0310325;OID=.;OPOS=22532321;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:74:34:34:33:40:24:9:21:13:25:15:21:13 chr7 22533452 . C T 104.48 PASS AO=40;DP=117;FAO=38;FDP=114;FR=.;FRO=76;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=37;FSRR=39;FWDB=0.0727934;FXX=0.0256388;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.315;QD=3.66582;RBI=0.0744756;REFB=0.00165806;REVB=-0.0157396;RO=76;SAF=26;SAR=14;SRF=37;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19001;STB=0.598254;TYPE=snp;VARB=-0.00223196;OID=.;OPOS=22533452;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:114:76:76:40:38:14:26:37:39:14:24:37:39 chr7 23015831 . T C 1152.49 PASS AO=124;DP=126;FAO=124;FDP=126;FR=.;FRO=2;FSAF=65;FSAR=59;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00346876;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.8137;QD=36.5868;RBI=0.0206243;REFB=0.0223729;REVB=0.0203306;RO=2;SAF=65;SAR=59;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000731243;STB=0.500385;TYPE=snp;VARB=-0.000533038;OID=.;OPOS=23015831;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:126:126:2:2:124:124:59:65:1:1:59:65:1:1 chr7 23053545 . AG A 239.7 PASS AO=37;DP=52;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0545682;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=8.27436;QD=19.176;RBI=0.297956;REFB=0;REVB=0.292916;RO=6;SAF=25;SAR=12;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0.348568;SSSB=0.14241;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0169024;OID=.;OPOS=23053546;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:37:50:50:50:0:32:18:0:0:24:6:25:12:1:5 chr7 23164526 . C G 1177.15 PASS AO=122;DP=125;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175335;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.2068;QD=37.9727;RBI=0.0311949;REFB=0;REVB=0.0258012;RO=0;SAF=44;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.06142e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000571732;OID=.;OPOS=23164526;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:125:124:0:0:122:124:78:44:0:0:78:46:0:0 chr7 23164701 . C T 201.29 PASS AO=59;DP=147;FAO=60;FDP=148;FR=.;FRO=88;FSAF=34;FSAR=26;FSRF=45;FSRR=43;FWDB=-0.00217209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.732;QD=5.44016;RBI=0.016376;REFB=-0.0129631;REVB=-0.0162313;RO=87;SAF=34;SAR=25;SRF=44;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0753618;STB=0.533171;TYPE=snp;VARB=0.0203094;OID=.;OPOS=23164701;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:148:87:88:59:60:25:34:44:43:26:34:45:43 chr7 23296533 . G A 1923.59 PASS AO=202;DP=205;FAO=204;FDP=204;FR=.;FRO=0;FSAF=138;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00530512;FXX=0.0144921;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.8888;QD=37.7175;RBI=0.044931;REFB=-0.103851;REVB=0.0446167;RO=1;SAF=138;SAR=64;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00738364;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00102872;OID=.;OPOS=23296533;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:205:204:1:0:202:204:64:138:0:1:66:138:0:0 chr7 23530694 . AG A,AC 262.38 PASS AO=4,6;DP=38;FAO=40,1;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=9,0;FSAR=31,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.256089,-0.00651472;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=12.4172,59.1119;QD=25.5981;RBI=0.359469,0.139094;REFB=0,0;REVB=0.252263,-0.138942;RO=2;SAF=1,0;SAR=3,6;SRF=1;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.161039,-0.767694;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0412887,0.0364528;OID=.,.;OPOS=23530695,23530695;OREF=G,G;OALT=-,C;OMAPALT=A,AC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:4,6:18:40,1:41:0:9,0:31,1:0:0:8:2:1,0:3,6:1:1 chr7 23775454 . G A 423.69 PASS AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.539;QD=37.661;RBI=0.0223929;REFB=0;REVB=0.0143282;RO=0;SAF=20;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.09779e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000156052;OID=.;OPOS=23775454;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:45:45:0:0:45:45:25:20:0:0:25:20:0:0 chr7 23775477 . G T 327.65 PASS AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0546357;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.725;QD=37.4458;RBI=0.0546799;REFB=0;REVB=0.00219817;RO=0;SAF=17;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11116e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000512048;OID=.;OPOS=23775477;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:35:35:0:0:35:35:18:17:0:0:18:17:0:0 chr7 23811795 . T G 1871.53 PASS AO=196;DP=202;FAO=196;FDP=196;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0367451;FXX=0.0297015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.4204;QD=38.1946;RBI=0.0545221;REFB=0;REVB=0.0402797;RO=0;SAF=92;SAR=104;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.76904e-05;OID=.;OPOS=23811795;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:202:196:0:0:196:196:104:92:0:0:104:92:0:0 chr7 23811800 . G T 1881.85 PASS AO=188;DP=190;FAO=199;FDP=199;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0289087;FXX=0.00994975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.16;QD=37.8261;RBI=0.030587;REFB=-0.0513986;REVB=0.00999269;RO=1;SAF=87;SAR=101;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00469136;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000137416;OID=.;OPOS=23811800;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:190:199:1:0:188:199:101:87:0:1:105:94:0:0 chr7 23854838 . G GA 1064.72 PASS AO=122;DP=159;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0769402;FXX=0.0696158;HRUN=1;LEN=1;MLLD=21.2955;QD=28.9719;RBI=0.122856;REFB=0.000429465;REVB=-0.0957803;RO=36;SAF=43;SAR=79;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00404758;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00302733;OID=.;OPOS=23854839;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:122:159:147:147:0:51:96:0:0:91:36:43:79:13:23 chr7 23934657 . A C 123.42 PASS AO=30;DP=65;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=0.00385773;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.258;QD=7.59506;RBI=0.0100733;REFB=-0.00246733;REVB=-0.00930536;RO=35;SAF=15;SAR=15;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0684038;STB=0.538436;TYPE=snp;VARB=0.00497532;OID=.;OPOS=23934657;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:35:35:30:30:15:15:15:20:15:15:15:20 chr7 24325009 . G A 82.31 PASS AO=17;DP=32;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=14;FWDB=0.0329325;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.479;QD=9.97757;RBI=0.0356988;REFB=-0.00429613;REVB=0.013779;RO=15;SAF=9;SAR=8;SRF=2;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.326553;STB=0.69211;TYPE=snp;VARB=0.00559737;OID=.;OPOS=24325009;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:32:33:15:16:17:17:8:9:2:13:8:9:2:14 chr7 24329133 . C T 214.98 PASS AO=48;DP=95;FAO=48;FDP=94;FR=.;FRO=46;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=0.00725748;FXX=0.0105252;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.973;QD=9.14818;RBI=0.0222613;REFB=-0.0218694;REVB=-0.0210451;RO=46;SAF=22;SAR=26;SRF=26;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0944447;STB=0.552191;TYPE=snp;VARB=0.0285447;OID=.;OPOS=24329133;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:94:46:46:48:48:26:22:26:20:26:22:26:20 chr7 24703298 . G A 427.06 PASS AO=102;DP=214;FAO=104;FDP=215;FR=.;FRO=111;FSAF=39;FSAR=65;FSRF=43;FSRR=68;FWDB=-0.00897816;FXX=0.00462942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.126;QD=7.94536;RBI=0.0207656;REFB=-0.00343825;REVB=0.0187244;RO=109;SAF=39;SAR=63;SRF=41;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00617001;STB=0.506797;TYPE=snp;VARB=0.00264785;OID=.;OPOS=24703298;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:215:109:111:102:104:63:39:41:68:65:39:43:68 chr7 24742436 . T C 315.53 PASS AO=77;DP=169;FAO=79;FDP=169;FR=.;FRO=90;FSAF=27;FSAR=52;FSRF=34;FSRR=56;FWDB=-0.0331767;FXX=0.00588201;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.3189;QD=7.46806;RBI=0.0358359;REFB=-0.0207879;REVB=0.0135467;RO=91;SAF=26;SAR=51;SRF=35;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0502298;STB=0.52102;TYPE=snp;VARB=0.025671;OID=.;OPOS=24742436;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:169:91:90:77:79:51:26:35:56:52:27:34:56 chr7 24758753 . C T 174.54 PASS AO=58;DP=157;FAO=58;FDP=157;FR=.;FRO=99;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=66;FSRR=33;FWDB=0.0623107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.925;QD=4.44694;RBI=0.0629192;REFB=9.82216e-05;REVB=-0.00872963;RO=99;SAF=30;SAR=28;SRF=66;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167863;STB=0.594922;TYPE=snp;VARB=-0.000227936;OID=.;OPOS=24758753;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:157:99:99:58:58:28:30:66:33:28:30:66:33 chr7 24758795 . T C 1284.81 PASS AO=138;DP=141;FAO=141;FDP=143;FR=.;FRO=2;FSAF=78;FSAR=63;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0709718;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.7113;QD=35.9388;RBI=0.0808945;REFB=0.0422698;REVB=-0.0388193;RO=2;SAF=76;SAR=62;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00139173;STB=0.500752;TYPE=snp;VARB=-0.00301563;OID=.;OPOS=24758795;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:141:143:2:2:138:141:62:76:1:1:63:78:1:1 chr7 24758818 . G T 141.53 PASS AO=44;DP=118;FAO=44;FDP=115;FR=.;FRO=71;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=44;FSRR=27;FWDB=-0.0154639;FXX=0.0254216;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.73;QD=4.92273;RBI=0.0193944;REFB=-0.0115456;REVB=-0.0117051;RO=70;SAF=20;SAR=24;SRF=44;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186592;STB=0.600894;TYPE=snp;VARB=0.0185999;OID=.;OPOS=24758818;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:115:70:71:44:44:24:20:44:26:24:20:44:27 chr7 24854765 . G A 221.81 PASS AO=68;DP=172;FAO=68;FDP=172;FR=.;FRO=104;FSAF=42;FSAR=26;FSRF=53;FSRR=51;FWDB=-0.0303093;FXX=0.00578001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.431;QD=5.15845;RBI=0.0303162;REFB=-0.018135;REVB=0.00064949;RO=102;SAF=42;SAR=26;SRF=53;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107319;STB=0.566951;TYPE=snp;VARB=0.0287086;OID=.;OPOS=24854765;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:172:102:104:68:68:26:42:53:49:26:42:53:51 chr7 25181912 . T C 2082.85 PASS AO=215;DP=216;FAO=217;FDP=217;FR=.;FRO=0;FSAF=108;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189434;FXX=0.009132;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.768;QD=38.3935;RBI=0.0200044;REFB=0;REVB=-0.00642832;RO=0;SAF=106;SAR=109;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.14824e-05;OID=.;OPOS=25181912;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:216:217:0:0:215:217:109:106:0:0:109:108:0:0 chr7 25194665 . G C 2518.56 PASS AO=266;DP=271;FAO=269;FDP=269;FR=.;FRO=0;FSAF=163;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00650617;FXX=0.0073798;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.916;QD=37.4506;RBI=0.0810525;REFB=-0.0378552;REVB=0.0807909;RO=2;SAF=162;SAR=104;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00907907;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00049881;OID=.;OPOS=25194665;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:271:269:2:0:266:269:104:162:0:2:106:163:0:0 chr7 25194753 . C T 3256.22 PASS AO=331;DP=333;FAO=343;FDP=343;FR=.;FRO=0;FSAF=177;FSAR=166;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.304;QD=37.9734;RBI=0.0150012;REFB=0;REVB=0.00313924;RO=1;SAF=176;SAR=155;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00270296;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000119485;OID=.;OPOS=25194753;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:333:343:1:0:331:343:155:176:1:0:166:177:0:0 chr7 25267963 . G C 1133.3 PASS AO=119;DP=122;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104378;FXX=0.0245881;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.8983;QD=38.0941;RBI=0.0156598;REFB=0;REVB=0.011674;RO=0;SAF=42;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000173046;OID=.;OPOS=25267963;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:122:119:0:0:119:119:77:42:0:0:77:42:0:0 chr7 25304395 . A G 1449.6 PASS AO=152;DP=153;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00261812;FXX=0.00653552;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.628;QD=38.1474;RBI=0.00298749;REFB=0;REVB=0.00143894;RO=0;SAF=70;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6741e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.88716e-05;OID=.;OPOS=25304395;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:153:152:0:0:152:152:82:70:0:0:82:70:0:0 chr7 26224736 . G C 412.85 PASS AO=105;DP=225;FAO=105;FDP=225;FR=.;FRO=120;FSAF=34;FSAR=71;FSRF=39;FSRR=81;FWDB=0.0165306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5698;QD=7.33957;RBI=0.0241514;REFB=-0.0139906;REVB=0.0176077;RO=117;SAF=34;SAR=71;SRF=36;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177041;STB=0.500724;TYPE=snp;VARB=0.0168685;OID=.;OPOS=26224736;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:225:225:117:120:105:105:71:34:36:81:71:34:39:81 chr7 26576535 . T C 1054.73 PASS AO=120;DP=127;FAO=120;FDP=127;FR=.;FRO=7;FSAF=59;FSAR=61;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=0.0308534;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=77.5354;QD=33.2199;RBI=0.034818;REFB=-0.150979;REVB=0.0161357;RO=7;SAF=59;SAR=61;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0530919;STB=0.527995;TYPE=snp;VARB=0.00494551;OID=.;OPOS=26576535;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:127:127:7:7:120:120:61:59:7:0:61:59:7:0 chr7 26778406 . A G 65.47 PASS AO=19;DP=51;FAO=19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=27;FSRR=5;FWDB=-0.000623495;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.034;QD=5.13481;RBI=0.0262808;REFB=-0.00953504;REVB=0.0262734;RO=32;SAF=12;SAR=7;SRF=27;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.272042;STB=0.65454;TYPE=snp;VARB=0.017019;OID=.;OPOS=26778406;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:51:51:32:32:19:19:7:12:27:5:7:12:27:5 chr7 27135314 . C T 231.66 PASS AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0801511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.8157;QD=37.0648;RBI=0.0804957;REFB=0;REVB=-0.00744011;RO=0;SAF=11;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99383e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000803502;OID=.;OPOS=27135314;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:25:25:0:0:25:25:14:11:0:0:14:11:0:0 chr7 27169093 . T G 1180.02 PASS AO=125;DP=130;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00162298;FXX=0.0307669;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.949;QD=37.4611;RBI=0.0135238;REFB=-0.10265;REVB=0.013426;RO=0;SAF=61;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000220408;OID=.;OPOS=27169093;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:130:126:0:0:125:126:64:61:0:0:64:62:0:0 chr7 27196069 . A C 196.86 PASS AO=63;DP=169;FAO=64;FDP=170;FR=.;FRO=106;FSAF=29;FSAR=35;FSRF=33;FSRR=73;FWDB=-0.0846621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.014;QD=4.63194;RBI=0.089304;REFB=-0.023569;REVB=-0.028417;RO=103;SAF=29;SAR=34;SRF=31;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179675;STB=0.590694;TYPE=snp;VARB=0.0362683;OID=.;OPOS=27196069;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:170:103:106:63:64:34:29:31:72:35:29:33:73 chr7 27196113 . C T 193.54 PASS AO=69;DP=193;FAO=69;FDP=195;FR=.;FRO=126;FSAF=26;FSAR=43;FSRF=33;FSRR=93;FWDB=0.0792068;FXX=0.00510178;HRUN=5;LEN=1;MLLD=52.1923;QD=3.96996;RBI=0.0792751;REFB=-0.0235839;REVB=0.00328985;RO=124;SAF=26;SAR=43;SRF=33;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139125;STB=0.582227;TYPE=snp;VARB=0.0450539;OID=.;OPOS=27196113;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:195:124:126:69:69:43:26:33:91:43:26:33:93 chr7 27202289 . A G 307.3 PASS AO=56;DP=91;FAO=56;FDP=91;FR=.;FRO=35;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.0112006;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.127;QD=13.5076;RBI=0.0228009;REFB=-0.00892038;REVB=0.0198603;RO=34;SAF=32;SAR=24;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0910389;STB=0.544288;TYPE=snp;VARB=0.00471302;OID=.;OPOS=27202289;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:34:35:56:56:24:32:15:19:24:32:16:19 chr7 27210428 . A AG 196.27 PASS AO=63;DP=264;FAO=102;FDP=252;FR=.;FRO=150;FSAF=47;FSAR=55;FSRF=63;FSRR=87;FWDB=0.128636;FXX=0.0117642;HRUN=1;LEN=1;MLLD=25.8495;QD=3.11546;RBI=0.142567;REFB=0.00114374;REVB=0.0614678;RO=196;SAF=20;SAR=43;SRF=97;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230956;STB=0.524516;TYPE=ins;VARB=0.0027741;OID=.;OPOS=27210429;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:63:264:102:252:150:47:55:63:87:99:196:20:43:97:99 chr7 27221227 . C T 297.75 PASS AO=76;DP=165;FAO=76;FDP=165;FR=.;FRO=89;FSAF=23;FSAR=53;FSRF=18;FSRR=71;FWDB=-0.0464562;FXX=0.00602373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.925;QD=7.21817;RBI=0.0467733;REFB=0.00343875;REVB=0.00543656;RO=88;SAF=23;SAR=53;SRF=17;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133763;STB=0.567546;TYPE=snp;VARB=-0.00471955;OID=.;OPOS=27221227;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:165:88:89:76:76:53:23:17:71:53:23:18:71 chr7 27279191 . T G 25.44 PASS AO=7;DP=22;FAO=7;FDP=22;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=14;FWDB=-0.0205581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.118;QD=4.6256;RBI=0.0213002;REFB=-4.48394e-05;REVB=-0.00557378;RO=15;SAF=2;SAR=5;SRF=1;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.370142;STB=0.716554;TYPE=snp;VARB=-1.61455e-05;OID=.;OPOS=27279191;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:22:22:15:15:7:7:5:2:1:14:5:2:1:14 chr7 27886170 . TA T,TG 1515.24 PASS AO=108,59;DP=172;FAO=116,61;FDP=179;FR=.;FRO=2;FSAF=8,45;FSAR=108,16;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0466932,0.0345363;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=82.9035,81.0189;QD=33.8602;RBI=0.0622874,0.0490221;REFB=-0.0692194,-0.0536083;REVB=0.0412245,0.0347909;RO=6;SAF=4,45;SAR=104,14;SRF=6;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.398623,-0.0588824;STB=0.555545,0.510866;TYPE=del,snp;VARB=0.00448165,0.00939772;OID=.,.;OPOS=27886171,27886171;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=T,TG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:108,59:179:116,61:179:2:8,45:108,16:2:0:99:6:4,45:104,14:6:0 chr7 28319007 . T A 281.33 PASS AO=70;DP=151;FAO=71;FDP=153;FR=.;FRO=82;FSAF=40;FSAR=31;FSRF=37;FSRR=45;FWDB=-0.00547435;FXX=0.0129024;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.885;QD=7.35496;RBI=0.010715;REFB=0.00134146;REVB=0.00921101;RO=81;SAF=40;SAR=30;SRF=36;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12287;STB=0.560145;TYPE=snp;VARB=-0.00154205;OID=.;OPOS=28319007;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:153:81:82:70:71:30:40:36:45:31:40:37:45 chr7 28319234 . A C 79.87 PASS AO=26;DP=66;FAO=24;FDP=64;FR=.;FRO=40;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=30;FSRR=10;FWDB=-0.0507339;FXX=0.0302984;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.0821;QD=4.99199;RBI=0.0688612;REFB=0.00143565;REVB=0.046561;RO=40;SAF=16;SAR=10;SRF=30;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158003;STB=0.611026;TYPE=snp;VARB=-0.00224567;OID=.;OPOS=28319234;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:66:64:40:40:26:24:10:16:30:10:10:14:30:10 chr7 28450170 . GC G 250.19 PASS AO=29;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0975241;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.8442;QD=26.3356;RBI=0.131524;REFB=0;REVB=0.0882479;RO=3;SAF=3;SAR=26;SRF=0;SRR=3;SSEN=0.22249;SSEP=0;SSSB=0.0508009;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0146747;OID=.;OPOS=28450171;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:29:37:38:38:0:6:32:0:0:22:3:3:26:0:3 chr7 29070209 . G A 188.26 PASS AO=46;DP=101;FAO=47;FDP=101;FR=.;FRO=54;FSAF=11;FSAR=36;FSRF=31;FSRR=23;FWDB=0.0027146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.886;QD=7.45589;RBI=0.0290089;REFB=0.00122401;REVB=0.0288817;RO=54;SAF=11;SAR=35;SRF=31;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.351203;STB=0.699585;TYPE=snp;VARB=-0.00135671;OID=.;OPOS=29070209;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:54:54:46:47:35:11:31:23:36:11:31:23 chr7 29152371 . G A 270.4 PASS AO=83;DP=212;FAO=84;FDP=213;FR=.;FRO=129;FSAF=35;FSAR=49;FSRF=57;FSRR=72;FWDB=0.00538766;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.838;QD=5.07787;RBI=0.0171497;REFB=-0.00806893;REVB=0.0162814;RO=129;SAF=35;SAR=48;SRF=57;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0222566;STB=0.515609;TYPE=snp;VARB=0.0118958;OID=.;OPOS=29152371;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:213:129:129:83:84:48:35:57:72:49:35:57:72 chr7 29152416 . G A 244.05 PASS AO=72;DP=176;FAO=72;FDP=176;FR=.;FRO=104;FSAF=28;FSAR=44;FSRF=45;FSRR=59;FWDB=-0.00479341;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=192.169;QD=5.54659;RBI=0.0133866;REFB=0.00433593;REVB=0.012499;RO=103;SAF=28;SAR=44;SRF=44;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0417923;STB=0.526895;TYPE=snp;VARB=-0.00507255;OID=.;OPOS=29152416;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:176:103:104:72:72:44:28:44:59:44:28:45:59 chr7 29160604 . C T 246.88 PASS AO=57;DP=120;FAO=59;FDP=122;FR=.;FRO=63;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=32;FSRR=31;FWDB=0.0612367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.896;QD=8.09425;RBI=0.0612568;REFB=-0.0122236;REVB=-0.0015679;RO=62;SAF=31;SAR=26;SRF=32;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0261823;STB=0.509042;TYPE=snp;VARB=0.014826;OID=.;OPOS=29160604;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:122:62:63:57:59:26:31:32:30:28:31:32:31 chr7 29186576 . A G 260.69 PASS AO=56;DP=109;FAO=57;FDP=110;FR=.;FRO=53;FSAF=9;FSAR=48;FSRF=9;FSRR=44;FWDB=-0.024337;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.436;QD=9.47951;RBI=0.0243727;REFB=-0.0195236;REVB=-0.00131906;RO=51;SAF=9;SAR=47;SRF=8;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00621;STB=0.510634;TYPE=snp;VARB=0.0157868;OID=.;OPOS=29186576;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:110:51:53:56:57:47:9:8:43:48:9:9:44 chr7 29523563 . G A 229.9 PASS AO=64;DP=154;FAO=65;FDP=154;FR=.;FRO=89;FSAF=40;FSAR=25;FSRF=36;FSRR=53;FWDB=-0.0170183;FXX=0.0064512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.091;QD=5.97142;RBI=0.0175782;REFB=-0.0180977;REVB=-0.00440143;RO=89;SAF=39;SAR=25;SRF=35;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222811;STB=0.621477;TYPE=snp;VARB=0.015819;OID=.;OPOS=29523563;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:154:89:89:64:65:25:39:35:54:25:40:36:53 chr7 29605975 . C G 16.08 PASS AO=3;DP=6;FAO=3;FDP=6;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0148666;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.0433;QD=10.7181;RBI=0.0875796;REFB=-0.0134635;REVB=-0.0863086;RO=3;SAF=2;SAR=1;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.483116;STB=0.798389;TYPE=snp;VARB=0.0125268;OID=.;OPOS=29605975;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:6:6:3:3:3:3:1:2:0:3:1:2:0:3 chr7 29606288 . C T 38.28 PASS AO=11;DP=32;FAO=11;FDP=32;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.00470067;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=201.909;QD=4.78486;RBI=0.00693051;REFB=-0.00981539;REVB=0.00509272;RO=21;SAF=5;SAR=6;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0819168;STB=0.549045;TYPE=snp;VARB=0.0207687;OID=.;OPOS=29606288;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:32:32:21:21:11:11:6:5:8:13:6:5:8:13 chr7 29771597 . A C 2279.82 PASS AO=245;DP=247;FAO=245;FDP=245;FR=.;FRO=0;FSAF=131;FSAR=114;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0423579;FXX=0.0239034;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.5561;QD=37.2216;RBI=0.0449564;REFB=-0.106292;REVB=-0.0150628;RO=2;SAF=133;SAR=112;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00711314;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00147773;OID=.;OPOS=29771597;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:247:245:2:0:245:245:112:133:2:0:114:131:0:0 chr7 29952207 . C G 237.12 PASS AO=63;DP=142;FAO=63;FDP=143;FR=.;FRO=80;FSAF=49;FSAR=14;FSRF=54;FSRR=26;FWDB=-0.010723;FXX=0.00694396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.9605;QD=6.63285;RBI=0.0251317;REFB=-0.0426032;REVB=-0.0227293;RO=79;SAF=49;SAR=14;SRF=53;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139787;STB=0.576106;TYPE=snp;VARB=0.0506001;OID=.;OPOS=29952207;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:143:79:80:63:63:14:49:53:26:14:49:54:26 chr7 29954137 . A G 555.5 PASS AO=120;DP=232;FAO=124;FDP=237;FR=.;FRO=113;FSAF=60;FSAR=64;FSRF=33;FSRR=80;FWDB=0.0380075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.754;QD=9.37548;RBI=0.0388585;REFB=-0.00414933;REVB=-0.00808803;RO=111;SAF=58;SAR=62;SRF=31;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181289;STB=0.592091;TYPE=snp;VARB=0.00720372;OID=.;OPOS=29954137;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:237:111:113:120:124:62:58:31:80:64:60:33:80 chr7 30113706 . A G 3042.16 PASS AO=323;DP=336;FAO=334;FDP=334;FR=.;FRO=0;FSAF=195;FSAR=139;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00120961;FXX=0.00890181;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.703;QD=36.4331;RBI=0.00419101;REFB=-0.0255191;REVB=0.00401266;RO=0;SAF=195;SAR=128;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.10182e-05;OID=.;OPOS=30113706;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:336:334:0:0:323:334:128:195:0:0:139:195:0:0 chr7 30174773 . C G 553.99 PASS AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0107689;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.01;QD=38.2065;RBI=0.0173815;REFB=0;REVB=0.0136436;RO=0;SAF=36;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.38508e-05;OID=.;OPOS=30174773;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:58:58:0:0:58:58:22:36:0:0:22:36:0:0 chr7 30406471 . A G 615.9 PASS AO=176;DP=409;FAO=173;FDP=399;FR=.;FRO=226;FSAF=80;FSAR=93;FSRF=106;FSRR=120;FWDB=0.0145565;FXX=0.00249994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.343;QD=6.17442;RBI=0.0153167;REFB=-0.0110653;REVB=-0.00476563;RO=207;SAF=81;SAR=95;SRF=89;SRR=118;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0299319;STB=0.503756;TYPE=snp;VARB=0.0123129;OID=.;OPOS=30406471;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:409:399:207:226:176:173:95:81:89:118:93:80:106:120 chr7 30491311 . C T 158.03 PASS AO=29;DP=51;FAO=29;FDP=49;FR=.;FRO=20;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=0.00849484;FXX=0.039208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.888;QD=12.9005;RBI=0.0277698;REFB=-0.0249982;REVB=-0.0264386;RO=20;SAF=15;SAR=14;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136318;STB=0.57502;TYPE=snp;VARB=0.0151872;OID=.;OPOS=30491311;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:51:49:20:20:29:29:14:15:14:6:14:15:14:6 chr7 30492550 . G A 80.89 PASS AO=23;DP=59;FAO=23;FDP=59;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.0229602;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.48;QD=5.4844;RBI=0.0457718;REFB=0.00462589;REVB=0.0395965;RO=36;SAF=17;SAR=6;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.276076;STB=0.660047;TYPE=snp;VARB=-0.00666046;OID=.;OPOS=30492550;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:59:59:36:36:23:23:6:17:18:18:6:17:18:18 chr7 30496382 . G C 173.25 PASS AO=42;DP=103;FAO=46;FDP=107;FR=.;FRO=61;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=32;FSRR=29;FWDB=0.00847544;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.9471;QD=6.47665;RBI=0.036606;REFB=-0.035535;REVB=-0.0356113;RO=61;SAF=20;SAR=22;SRF=33;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0677911;STB=0.514013;TYPE=snp;VARB=0.0434499;OID=.;OPOS=30496382;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:107:61:61:42:46:22:20:33:28:23:23:32:29 chr7 30538651 . T C 1081.02 PASS AO=119;DP=124;FAO=121;FDP=126;FR=.;FRO=5;FSAF=58;FSAR=63;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0108778;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.909;QD=34.3181;RBI=0.0123918;REFB=-0.0121227;REVB=0.00593536;RO=2;SAF=58;SAR=61;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0153168;STB=0.504794;TYPE=snp;VARB=0.000479681;OID=.;OPOS=30538651;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:124:126:2:5:119:121:61:58:0:2:63:58:3:2 chr7 30795330 . GA G,GG 992.22 PASS AO=43,50;DP=94;FAO=102,1;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=50,0;FSAR=52,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.206634,-0.202513;FXX=0.0282992;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=233.547,218.314;QD=38.5328;RBI=0.208119,0.20383;REFB=0,0;REVB=0.0248161,0.023135;RO=0;SAF=2,48;SAR=41,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=7.75439e-08,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.000254763,0.00720376;OID=.,.;OPOS=30795331,30795331;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:43,50:93:102,1:103:0:50,0:52,1:0:0:31:0:2,48:41,2:0:0 chr7 30795436 . T G 673.07 PASS AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0114539;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.539;QD=37.9194;RBI=0.0122129;REFB=0;REVB=0.0042383;RO=0;SAF=32;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.92706e-06;OID=.;OPOS=30795436;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:71:71:0:0:71:71:39:32:0:0:39:32:0:0 chr7 30831082 . C T 99.37 PASS AO=28;DP=74;FAO=29;FDP=74;FR=.;FRO=45;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=0.0216981;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.8815;QD=5.37154;RBI=0.0245796;REFB=-0.0177505;REVB=0.0115476;RO=45;SAF=13;SAR=15;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.074136;STB=0.530705;TYPE=snp;VARB=0.0162032;OID=.;OPOS=30831082;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:45:45:28:29:15:13:24:21:15:14:24:21 chr7 30880413 . G A 267.06 PASS AO=74;DP=173;FAO=74;FDP=172;FR=.;FRO=98;FSAF=44;FSAR=30;FSRF=53;FSRR=45;FWDB=0.0192072;FXX=0.00578001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.1749;QD=6.21063;RBI=0.0220236;REFB=-0.0205891;REVB=-0.010776;RO=98;SAF=44;SAR=30;SRF=53;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0561916;STB=0.531392;TYPE=snp;VARB=0.0275468;OID=.;OPOS=30880413;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:172:98:98:74:74:30:44:53:45:30:44:53:45 chr7 30961790 . G A 128.82 PASS AO=22;DP=34;FAO=22;FDP=34;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=12;FWDB=0.01176;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=298.935;QD=15.1554;RBI=0.0325687;REFB=-0.0239565;REVB=0.0303715;RO=12;SAF=2;SAR=20;SRF=0;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212818;STB=0.6153;TYPE=snp;VARB=0.0180055;OID=.;OPOS=30961790;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:34:34:12:12:22:22:20:2:0:12:20:2:0:12 chr7 31592733 . C A 1241.89 PASS AO=130;DP=134;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00902441;FXX=0.0364937;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.73;QD=37.6329;RBI=0.0973555;REFB=0;REVB=0.0969364;RO=0;SAF=65;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000640777;OID=.;OPOS=31592733;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:134:132:0:0:130:132:65:65:0:0:67:65:0:0 chr7 31611758 . G T 305.33 PASS AO=84;DP=193;FAO=84;FDP=193;FR=.;FRO=109;FSAF=34;FSAR=50;FSRF=49;FSRR=60;FWDB=-0.0473694;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=193.594;QD=6.32815;RBI=0.0486409;REFB=-0.00109657;REVB=0.0110487;RO=108;SAF=34;SAR=50;SRF=49;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0507103;STB=0.525976;TYPE=snp;VARB=0.00117463;OID=.;OPOS=31611758;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:193:108:109:84:84:50:34:49:59:50:34:49:60 chr7 31617733 . T C 602.09 PASS AO=68;DP=78;FAO=75;FDP=81;FR=.;FRO=6;FSAF=32;FSAR=43;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.0698263;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.457;QD=29.7327;RBI=0.0756717;REFB=0.0114218;REVB=-0.0291634;RO=8;SAF=27;SAR=41;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0466532;STB=0.505541;TYPE=snp;VARB=-0.0105441;OID=.;OPOS=31617733;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:81:8:6:68:75:41:27:5:3:43:32:3:3 chr7 31618008 . A G 595.62 PASS AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.676;QD=37.8168;RBI=0.0158339;REFB=0;REVB=0.0158339;RO=0;SAF=0;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.8773e-06;OID=.;OPOS=31618008;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:63:63:0:0:63:63:63:0:0:0:63:0:0:0 chr7 31682453 . C T 1075.64 PASS AO=112;DP=112;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0563183;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.8233;QD=38.0757;RBI=0.0863217;REFB=0;REVB=0.0654194;RO=0;SAF=57;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34603e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000651002;OID=.;OPOS=31682453;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:112:113:0:0:112:113:55:57:0:0:55:58:0:0 chr7 31683410 . G A 1173.99 PASS AO=123;DP=125;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00784366;FXX=0.0159987;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.262;QD=38.1785;RBI=0.0498235;REFB=0;REVB=0.0492022;RO=0;SAF=76;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.88373e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.07985e-05;OID=.;OPOS=31683410;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:125:123:0:0:123:123:47:76:0:0:47:76:0:0 chr7 31732084 . T G 235.47 PASS AO=55;DP=118;FAO=57;FDP=120;FR=.;FRO=63;FSAF=10;FSAR=47;FSRF=12;FSRR=51;FWDB=0.010945;FXX=0.00826378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.439;QD=7.84899;RBI=0.0202429;REFB=-0.0147693;REVB=-0.0170289;RO=63;SAF=10;SAR=45;SRF=12;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0138177;STB=0.513401;TYPE=snp;VARB=0.0177469;OID=.;OPOS=31732084;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:120:63:63:55:57:45:10:12:51:47:10:12:51 chr7 31848706 . A G 2139.2 PASS AO=220;DP=231;FAO=224;FDP=224;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=128;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0437226;FXX=0.0427332;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.7416;QD=38.2;RBI=0.0456197;REFB=0;REVB=0.0130189;RO=0;SAF=95;SAR=125;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000116376;OID=.;OPOS=31848706;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:231:224:0:0:220:224:125:95:0:0:128:96:0:0 chr7 31855569 . G A 577.06 PASS AO=60;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0198243;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.4424;QD=37.8398;RBI=0.019889;REFB=0;REVB=0.00160354;RO=0;SAF=4;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000158081;OID=.;OPOS=31855569;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:61:61:0:0:60:61:56:4:0:0:56:5:0:0 chr7 31855578 . G A 593.34 PASS AO=58;DP=61;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0133417;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.83;QD=37.6723;RBI=0.041831;REFB=0;REVB=0.0396463;RO=0;SAF=3;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.22903e-05;OID=.;OPOS=31855578;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:61:63:0:0:58:63:55:3:0:0:58:5:0:0 chr7 32209425 . A G 2163.56 PASS AO=220;DP=220;FAO=226;FDP=226;FR=.;FRO=0;FSAF=127;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0425175;FXX=0.00440509;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.586;QD=38.2931;RBI=0.0466678;REFB=0;REVB=0.019239;RO=0;SAF=122;SAR=98;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.42718e-05;OID=.;OPOS=32209425;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:220:226:0:0:220:226:98:122:0:0:99:127:0:0 chr7 32209459 . C T 460.22 PASS AO=106;DP=226;FAO=113;FDP=232;FR=.;FRO=119;FSAF=67;FSAR=46;FSRF=63;FSRR=56;FWDB=0.00532078;FXX=0.0127654;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.184;QD=7.9348;RBI=0.00600232;REFB=-0.0119412;REVB=-0.00277798;RO=119;SAF=64;SAR=42;SRF=64;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0649837;STB=0.533317;TYPE=snp;VARB=0.0100796;OID=.;OPOS=32209459;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:226:232:119:119:106:113:42:64:64:55:46:67:63:56 chr7 32338337 . G A 318.6 PASS AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0862686;FXX=0.0285633;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.2062;QD=37.4823;RBI=0.0863041;REFB=0;REVB=0.00247663;RO=0;SAF=5;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00072477;OID=.;OPOS=32338337;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:35:34:0:0:34:34:29:5:0:0:29:5:0:0 chr7 32529936 . G C 375.64 PASS AO=39;DP=39;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0355746;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=145.395;QD=36.6474;RBI=0.0362675;REFB=0;REVB=0.00705556;RO=0;SAF=16;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43889e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.001987;OID=.;OPOS=32529936;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:39:41:0:0:39:41:23:16:0:0:23:18:0:0 chr7 32530105 . G C 722.93 PASS AO=78;DP=80;FAO=78;FDP=80;FR=.;FRO=2;FSAF=46;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0589561;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=122.025;QD=36.1462;RBI=0.0606765;REFB=-0.057006;REVB=0.0143462;RO=2;SAF=46;SAR=32;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00438272;STB=0.502316;TYPE=snp;VARB=0.000484455;OID=.;OPOS=32530105;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:80:80:2:2:78:78:32:46:1:1:32:46:1:1 chr7 32530198 . A T 1032.74 PASS AO=106;DP=110;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0778624;FXX=0.0350846;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.318;QD=37.5543;RBI=0.0922469;REFB=0;REVB=-0.0494666;RO=0;SAF=43;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000426352;OID=.;OPOS=32530198;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:110:110:0:0:106:110:63:43:0:0:63:47:0:0 chr7 32530199 . A C 1075.99 PASS AO=113;DP=114;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0560636;FXX=0.00877116;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.0396;QD=38.0883;RBI=0.0563638;REFB=0;REVB=-0.00580924;RO=0;SAF=50;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33068e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000343787;OID=.;OPOS=32530199;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:114:113:0:0:113:113:63:50:0:0:63:50:0:0 chr7 32598630 . T A 380.47 PASS AO=83;DP=154;FAO=82;FDP=153;FR=.;FRO=71;FSAF=20;FSAR=62;FSRF=17;FSRR=54;FWDB=-0.0168808;FXX=0.00649309;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.011;QD=9.94702;RBI=0.0309829;REFB=-0.00970848;REVB=0.0259804;RO=71;SAF=21;SAR=62;SRF=17;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0152687;STB=0.502817;TYPE=snp;VARB=0.00877674;OID=.;OPOS=32598630;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:153:71:71:83:82:62:21:17:54:62:20:17:54 chr7 32598656 . C T 391.94 PASS AO=84;DP=156;FAO=84;FDP=156;FR=.;FRO=72;FSAF=28;FSAR=56;FSRF=22;FSRR=50;FWDB=-0.0189269;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.399;QD=10.0496;RBI=0.019509;REFB=-0.0245211;REVB=-0.0047301;RO=72;SAF=28;SAR=56;SRF=22;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0266441;STB=0.51456;TYPE=snp;VARB=0.0251399;OID=.;OPOS=32598656;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:156:72:72:84:84:56:28:22:50:56:28:22:50 chr7 32613020 . A G 160.95 PASS AO=46;DP=112;FAO=46;FDP=112;FR=.;FRO=66;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=32;FSRR=34;FWDB=-0.0400371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9372;QD=5.74814;RBI=0.0412753;REFB=-0.046752;REVB=-0.010034;RO=63;SAF=23;SAR=23;SRF=30;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0244586;STB=0.508925;TYPE=snp;VARB=0.0569065;OID=.;OPOS=32613020;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:63:66:46:46:23:23:30:33:23:23:32:34 chr7 32623477 . C G 456.09 PASS AO=105;DP=207;FAO=105;FDP=207;FR=.;FRO=102;FSAF=45;FSAR=60;FSRF=40;FSRR=62;FWDB=-0.00817313;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.476;QD=8.81334;RBI=0.0382547;REFB=0.00190418;REVB=-0.0373714;RO=102;SAF=45;SAR=60;SRF=40;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0335778;STB=0.51841;TYPE=snp;VARB=-0.00190666;OID=.;OPOS=32623477;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:207:102:102:105:105:60:45:40:62:60:45:40:62 chr7 32623796 . C T 1239.58 PASS AO=122;DP=122;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=100;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0639161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.502;QD=38.4367;RBI=0.0734494;REFB=0;REVB=0.0361876;RO=0;SAF=95;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.09622e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.41385e-05;OID=.;OPOS=32623796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:122:129:0:0:122:129:27:95:0:0:29:100:0:0 chr7 32908287 . T C 1409.56 PASS AO=144;DP=144;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.398;QD=38.3555;RBI=0.0232782;REFB=0;REVB=0.00380135;RO=0;SAF=63;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-8.25873e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.83664e-05;OID=.;OPOS=32908287;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:144:147:0:0:144:147:81:63:0:0:82:65:0:0 chr7 32956941 . C T 155.43 PASS AO=16;DP=16;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00920537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.3791;QD=36.5712;RBI=0.0664528;REFB=0;REVB=0.0658121;RO=0;SAF=3;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.78418e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00462548;OID=.;OPOS=32956941;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:17:0:0:16:17:13:3:0:0:14:3:0:0 chr7 33054112 . A G 489.88 PASS AO=55;DP=58;FAO=54;FDP=56;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=33;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0460312;FXX=0.0344768;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.89;QD=34.9917;RBI=0.0484102;REFB=-0.0473348;REVB=0.0149891;RO=2;SAF=22;SAR=33;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0409364;STB=0.522719;TYPE=snp;VARB=0.00012182;OID=.;OPOS=33054112;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:58:56:2:2:55:54:33:22:2:0:33:21:2:0 chr7 33054117 . T TAAGA 152.82 PASS AO=18;DP=59;FAO=29;FDP=47;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.0055542;FXX=0.189622;HRUN=3;LEN=4;MLLD=239.136;QD=13.0063;RBI=0.0568078;REFB=-7.14147e-05;REVB=-0.0565356;RO=23;SAF=6;SAR=12;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.271173;STB=0.569229;TYPE=ins;VARB=-0.00032144;OID=.;OPOS=33054118;OREF=-;OALT=AAGA;OMAPALT=TAAGA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:18:59:29:47:18:11:18:10:8:65:23:6:12:14:9 chr7 33060946 . A G 991.61 PASS AO=108;DP=111;FAO=109;FDP=112;FR=.;FRO=3;FSAF=64;FSAR=45;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0558361;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.2182;QD=35.4148;RBI=0.0601196;REFB=-0.208145;REVB=0.0222867;RO=2;SAF=64;SAR=44;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0146011;STB=0.502198;TYPE=snp;VARB=0.00349801;OID=.;OPOS=33060946;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:111:112:2:3:108:109:44:64:2:0:45:64:2:1 chr7 33385852 . C T 1061.2 PASS AO=112;DP=113;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162223;FXX=0.0170926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.63;QD=36.9112;RBI=0.0242275;REFB=-0.0217702;REVB=-0.0179946;RO=1;SAF=52;SAR=60;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00904314;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000414813;OID=.;OPOS=33385852;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:113:115:1:0:112:115:60:52:1:0:60:55:0:0 chr7 33388713 . G A 182.23 PASS AO=52;DP=166;FAO=64;FDP=172;FR=.;FRO=108;FSAF=42;FSAR=22;FSRF=51;FSRR=57;FWDB=-0.00860927;FXX=0.028247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.818;QD=4.23781;RBI=0.021004;REFB=-0.00735783;REVB=0.0191585;RO=108;SAF=39;SAR=13;SRF=52;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.334445;STB=0.618531;TYPE=snp;VARB=0.0148401;OID=.;OPOS=33388713;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:172:108:108:52:64:13:39:52:56:22:42:51:57 chr7 33391089 . G A 150.3 PASS AO=48;DP=128;FAO=48;FDP=127;FR=.;FRO=79;FSAF=12;FSAR=36;FSRF=30;FSRR=49;FWDB=-0.0354913;FXX=0.00781189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.4653;QD=4.73369;RBI=0.0355785;REFB=-0.022696;REVB=0.00248993;RO=79;SAF=12;SAR=36;SRF=30;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169518;STB=0.597113;TYPE=snp;VARB=0.0635366;OID=.;OPOS=33391089;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:127:79:79:48:48:36:12:30:49:36:12:30:49 chr7 33945320 . CG C 27.66 PASS AO=13;DP=68;FAO=25;FDP=56;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=0.167578;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.8704;QD=1.9755;RBI=0.168388;REFB=-0.09493;REVB=-0.01649;RO=52;SAF=1;SAR=12;SRF=22;SRR=30;SSEN=0.305556;SSEP=0;SSSB=-0.544547;STB=0.599914;TYPE=del;VARB=0.0951008;OID=.;OPOS=33945321;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:13:67:25:56:31:6:19:12:19:27:52:1:12:22:30 chr7 34009946 . C T 631.98 PASS AO=153;DP=314;FAO=153;FDP=313;FR=.;FRO=160;FSAF=82;FSAR=71;FSRF=59;FSRR=101;FWDB=-0.0194702;FXX=0.006349;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.58;QD=8.07639;RBI=0.0387662;REFB=-0.00102282;REVB=-0.0335221;RO=158;SAF=82;SAR=71;SRF=57;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161193;STB=0.584853;TYPE=snp;VARB=0.00152858;OID=.;OPOS=34009946;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:314:313:158:160:153:153:71:82:57:101:71:82:59:101 chr7 34125420 . G T 747.8 PASS AO=138;DP=222;FAO=138;FDP=222;FR=.;FRO=84;FSAF=73;FSAR=65;FSRF=36;FSRR=48;FWDB=0.00444227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.694;QD=13.4739;RBI=0.0634685;REFB=-0.0473473;REVB=0.0633128;RO=84;SAF=73;SAR=65;SRF=36;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0703549;STB=0.537949;TYPE=snp;VARB=0.024681;OID=.;OPOS=34125420;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:222:84:84:138:138:65:73:36:48:65:73:36:48 chr7 34192762 . G C 1630.36 PASS AO=164;DP=164;FAO=169;FDP=169;FR=.;FRO=0;FSAF=119;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0540154;FXX=0.00588201;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.333;QD=38.5883;RBI=0.0567032;REFB=0;REVB=0.0172506;RO=0;SAF=116;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000162271;OID=.;OPOS=34192762;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:164:169:0:0:164:169:48:116:0:0:50:119:0:0 chr7 34725322 . T A 161.25 PASS AO=40;DP=86;FAO=40;FDP=87;FR=.;FRO=47;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=28;FSRR=19;FWDB=-0.0428353;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.6794;QD=7.41366;RBI=0.0434458;REFB=-0.00371199;REVB=0.00725766;RO=46;SAF=22;SAR=18;SRF=27;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.035885;STB=0.525075;TYPE=snp;VARB=0.00421884;OID=.;OPOS=34725322;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:87:46:47:40:40:18:22:27:19:18:22:28:19 chr7 34818113 . A T 269.25 PASS AO=73;DP=159;FAO=70;FDP=155;FR=.;FRO=85;FSAF=41;FSAR=29;FSRF=45;FSRR=40;FWDB=-0.0398514;FXX=0.0189861;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.975;QD=6.94843;RBI=0.0487228;REFB=-0.0016624;REVB=-0.0280317;RO=83;SAF=43;SAR=30;SRF=43;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0693512;STB=0.531458;TYPE=snp;VARB=0.00196674;OID=.;OPOS=34818113;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:155:83:85:73:70:30:43:43:40:29:41:45:40 chr7 34968498 . A T 361.51 PASS AO=79;DP=153;FAO=80;FDP=153;FR=.;FRO=73;FSAF=45;FSAR=35;FSRF=33;FSRR=40;FWDB=0.0261681;FXX=0.00649309;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.965;QD=9.45131;RBI=0.0275608;REFB=-0.00132075;REVB=0.00865037;RO=74;SAF=44;SAR=35;SRF=34;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0860471;STB=0.552812;TYPE=snp;VARB=0.00125885;OID=.;OPOS=34968498;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:153:74:73:79:80:35:44:34:40:35:45:33:40 chr7 34982211 . C G 128.42 PASS AO=41;DP=110;FAO=41;FDP=111;FR=.;FRO=70;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=41;FSRR=29;FWDB=-0.01487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.4065;QD=4.62764;RBI=0.0164419;REFB=-0.0149181;REVB=0.00701567;RO=69;SAF=23;SAR=18;SRF=41;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0372845;STB=0.51589;TYPE=snp;VARB=0.0264059;OID=.;OPOS=34982211;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:111:69:70:41:41:18:23:41:28:18:23:41:29 chr7 35142669 . T C 578.16 PASS AO=123;DP=236;FAO=128;FDP=242;FR=.;FRO=114;FSAF=36;FSAR=92;FSRF=54;FSRR=60;FWDB=-0.00838608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.654;QD=9.55633;RBI=0.011415;REFB=-0.0106908;REVB=-0.00774437;RO=111;SAF=33;SAR=90;SRF=51;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189904;STB=0.602077;TYPE=snp;VARB=0.00957433;OID=.;OPOS=35142669;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:236:242:111:114:123:128:90:33:51:60:92:36:54:60 chr7 35180667 . G T 71.58 PASS AO=26;DP=80;FAO=26;FDP=80;FR=.;FRO=54;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=-0.0101319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.0298;QD=3.57895;RBI=0.0248337;REFB=-0.0186602;REVB=-0.0226729;RO=54;SAF=19;SAR=7;SRF=25;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.321918;STB=0.689365;TYPE=snp;VARB=0.0407;OID=.;OPOS=35180667;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:80:80:54:54:26:26:7:19:25:29:7:19:25:29 chr7 35293193 . A G 292.22 PASS AO=29;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000379269;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.905;QD=38.9627;RBI=0.0331356;REFB=0;REVB=0.0331334;RO=0;SAF=14;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.92057e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.16264e-05;OID=.;OPOS=35293193;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:29:30:0:0:29:30:15:14:0:0:16:14:0:0 chr7 35840898 . G GC 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142377;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=141.18;QD=35.0873;RBI=0.0258501;REFB=0;REVB=-0.0215758;RO=0;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.27427e-08;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-0.00021094;OID=.;OPOS=35840899;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:7:7:7:7:0:2:5:0:0:4:0:2:5:0:0 chr7 36124231 . G GT 84.46 PASS AO=32;DP=79;FAO=34;FDP=75;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=0.0931497;FXX=0.0259707;HRUN=1;LEN=1;MLLD=21.4466;QD=4.5047;RBI=0.0937593;REFB=0.0134422;REVB=-0.0106748;RO=46;SAF=14;SAR=18;SRF=27;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154351;STB=0.607414;TYPE=ins;VARB=-0.0121213;OID=.;OPOS=36124232;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:32:79:34:75:41:14:20:25:16:84:46:14:18:27:19 chr7 36124292 . G A 700.66 PASS AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0426158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.744;QD=37.8735;RBI=0.0494179;REFB=0;REVB=0.0250205;RO=0;SAF=35;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.80413e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000623472;OID=.;OPOS=36124292;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:74:74:0:0:74:74:39:35:0:0:39:35:0:0 chr7 36320821 . G A 1049.47 PASS AO=109;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.768;QD=38.5128;RBI=0.0183793;REFB=0;REVB=-0.0025878;RO=0;SAF=52;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53715e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.30184e-05;OID=.;OPOS=36320821;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:109:109:0:0:109:109:57:52:0:0:57:52:0:0 chr7 36338749 . T C 1579.81 PASS AO=164;DP=165;FAO=165;FDP=165;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00548654;FXX=0.00602373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.634;QD=38.2983;RBI=0.0325715;REFB=0;REVB=0.0321061;RO=0;SAF=54;SAR=110;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.62969e-05;OID=.;OPOS=36338749;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:165:165:0:0:164:165:110:54:0:0:110:55:0:0 chr7 36339269 . C G 21.47 PASS AO=8;DP=36;FAO=9;FDP=37;FR=.;FRO=28;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=23;FSRR=5;FWDB=-0.0678945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.5519;QD=2.32065;RBI=0.0901615;REFB=-0.0076128;REVB=-0.0593248;RO=27;SAF=2;SAR=6;SRF=22;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.604401;STB=0.824864;TYPE=snp;VARB=0.0132494;OID=.;OPOS=36339269;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:36:37:27:28:8:9:6:2:22:5:6:3:23:5 chr7 36396480 . A G 274.19 PASS AO=82;DP=206;FAO=83;FDP=204;FR=.;FRO=121;FSAF=43;FSAR=40;FSRF=60;FSRR=61;FWDB=-0.0386027;FXX=0.00970827;HRUN=5;LEN=1;MLLD=52.9774;QD=5.37631;RBI=0.0403093;REFB=0.00107496;REVB=0.011605;RO=112;SAF=43;SAR=39;SRF=55;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0344413;STB=0.513172;TYPE=snp;VARB=-0.00254045;OID=.;OPOS=36396480;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:206:204:112:121:82:83:39:43:55:57:40:43:60:61 chr7 36445856 . G A 2146.84 PASS AO=219;DP=219;FAO=226;FDP=226;FR=.;FRO=0;FSAF=113;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0709212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.757;QD=37.9971;RBI=0.0743954;REFB=0;REVB=-0.0224689;RO=0;SAF=107;SAR=112;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000129095;OID=.;OPOS=36445856;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:219:226:0:0:219:226:112:107:0:0:113:113:0:0 chr7 36447349 . A ACTT 133.63 PASS AO=46;DP=151;FAO=47;FDP=135;FR=.;FRO=88;FSAF=29;FSAR=18;FSRF=39;FSRR=49;FWDB=0.0120394;FXX=0.117639;HRUN=1;LEN=3;MLLD=198.96;QD=3.95929;RBI=0.0162045;REFB=-0.00935568;REVB=0.0108461;RO=89;SAF=29;SAR=17;SRF=40;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208379;STB=0.613466;TYPE=ins;VARB=0.014959;OID=.;OPOS=36447350;OREF=-;OALT=CTT;OMAPALT=ACTT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:46:151:47:135:88:29:18:39:49:99:89:29:17:40:49 chr7 36459076 . G A 391.72 PASS AO=89;DP=174;FAO=89;FDP=174;FR=.;FRO=85;FSAF=43;FSAR=46;FSRF=47;FSRR=38;FWDB=0.0081438;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.884;QD=9.00505;RBI=0.0147078;REFB=-0.00206528;REVB=0.0122474;RO=85;SAF=43;SAR=46;SRF=47;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0620421;STB=0.534048;TYPE=snp;VARB=0.0022128;OID=.;OPOS=36459076;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:174:85:85:89:89:46:43:47:38:46:43:47:38 chr7 36552656 . G A 756.9 PASS AO=83;DP=85;FAO=83;FDP=85;FR=.;FRO=2;FSAF=44;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0145103;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.279;QD=35.6189;RBI=0.0164602;REFB=0.037163;REVB=-0.00777114;RO=2;SAF=44;SAR=39;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0236664;STB=0.512497;TYPE=snp;VARB=-0.00160604;OID=.;OPOS=36552656;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:85:85:2:2:83:83:39:44:0:2:39:44:0:2 chr7 36552790 . G GT,T 1377.05 PASS AO=80,69;DP=162;FAO=151,0;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=79,0;FSAR=72,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0796778,0.126214;FXX=0;HRUN=2,3;LEN=1,1;MLLD=19.8948,4.97891;QD=36.4782;RBI=0.108609,0.525971;REFB=0,0;REVB=-0.0738066,-0.510602;RO=11;SAF=76,0;SAR=4,69;SRF=8;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.210317,-0.896103;STB=0.5,0.5;TYPE=ins,snp;VARB=0.000122537,0;OID=.,.;OPOS=36552791,36552790;OREF=-,G;OALT=T,T;OMAPALT=GT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:162:151:11:0:80,69:151,0:4,69:76,0:8:3:72,0:79,0:0:0 chr7 36729757 . T C 247.23 PASS AO=73;DP=179;FAO=73;FDP=179;FR=.;FRO=106;FSAF=34;FSAR=39;FSRF=36;FSRR=70;FWDB=0.00969363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.22;QD=5.52471;RBI=0.0141205;REFB=-0.00518754;REVB=-0.0102675;RO=105;SAF=34;SAR=39;SRF=36;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131587;STB=0.575803;TYPE=snp;VARB=0.00801268;OID=.;OPOS=36729757;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:179:105:106:73:73:39:34:36:69:39:34:36:70 chr7 37209284 . G A 123.24 PASS AO=38;DP=100;FAO=38;FDP=100;FR=.;FRO=62;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=27;FSRR=35;FWDB=0.014224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.859;QD=4.92961;RBI=0.0143556;REFB=-0.00316365;REVB=-0.00193938;RO=62;SAF=24;SAR=14;SRF=27;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214112;STB=0.622158;TYPE=snp;VARB=0.00693599;OID=.;OPOS=37209284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:62:62:38:38:14:24:27:35:14:24:27:35 chr7 37298800 . C T 1536.23 PASS AO=164;DP=166;FAO=164;FDP=164;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0378157;FXX=0.0120475;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.4068;QD=37.4691;RBI=0.0539828;REFB=-0.145267;REVB=0.0385242;RO=1;SAF=53;SAR=111;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00426818;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00191512;OID=.;OPOS=37298800;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:166:164:1:0:164:164:111:53:0:1:111:53:0:0 chr7 37355590 . C CT 611.4 PASS AO=79;DP=90;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0803374;FXX=0.0348797;HRUN=2;LEN=1;MLLD=20.5881;QD=29.4652;RBI=0.104072;REFB=0;REVB=-0.0661587;RO=9;SAF=42;SAR=37;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00463007;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00399218;OID=.;OPOS=37355591;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:79:90:83:83:0:43:40:0:0:51:9:42:37:5:4 chr7 37907304 . T C 410.65 PASS AO=107;DP=234;FAO=107;FDP=234;FR=.;FRO=127;FSAF=56;FSAR=51;FSRF=52;FSRR=75;FWDB=-0.00270979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.182;QD=7.0196;RBI=0.0244855;REFB=-0.0184689;REVB=0.0243351;RO=118;SAF=56;SAR=51;SRF=52;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0784915;STB=0.561593;TYPE=snp;VARB=0.0262969;OID=.;OPOS=37907304;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:234:234:118:127:107:107:51:56:52:66:51:56:52:75 chr7 37916455 . A G 591.78 PASS AO=124;DP=223;FAO=124;FDP=224;FR=.;FRO=100;FSAF=58;FSAR=66;FSRF=41;FSRR=59;FWDB=0.0116469;FXX=0.00444425;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.277;QD=10.5676;RBI=0.0687661;REFB=0.0120714;REVB=-0.0677726;RO=98;SAF=58;SAR=66;SRF=41;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0403635;STB=0.525968;TYPE=snp;VARB=-0.0080008;OID=.;OPOS=37916455;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:224:98:100:124:124:66:58:41:57:66:58:41:59 chr7 37934146 . T C 150.08 PASS AO=46;DP=124;FAO=47;FDP=123;FR=.;FRO=76;FSAF=33;FSAR=14;FSRF=39;FSRR=37;FWDB=0.00676076;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.265;QD=4.88074;RBI=0.00830754;REFB=-0.00685566;REVB=0.00482777;RO=73;SAF=33;SAR=13;SRF=38;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230841;STB=0.625362;TYPE=snp;VARB=0.0077148;OID=.;OPOS=37934146;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:123:73:76:46:47:13:33:38:35:14:33:39:37 chr7 37936530 . T C 316.52 PASS AO=78;DP=164;FAO=78;FDP=164;FR=.;FRO=86;FSAF=42;FSAR=36;FSRF=29;FSRR=57;FWDB=0.00742717;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.668;QD=7.72007;RBI=0.0166556;REFB=-0.00609567;REVB=-0.0149079;RO=86;SAF=42;SAR=36;SRF=29;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189391;STB=0.604431;TYPE=snp;VARB=0.00628677;OID=.;OPOS=37936530;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:164:86:86:78:78:36:42:29:57:36:42:29:57 chr7 37951726 . G A 2390.56 PASS AO=249;DP=251;FAO=253;FDP=253;FR=.;FRO=0;FSAF=149;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120882;FXX=0.00393685;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.63;QD=37.7955;RBI=0.0151337;REFB=0.0287224;REVB=-0.0091052;RO=0;SAF=148;SAR=101;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.67598e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.12414e-05;OID=.;OPOS=37951726;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:251:253:0:0:249:253:101:148:0:0:104:149:0:0 chr7 37988589 . C G,T 1775.41 PASS AO=31,145;DP=176;FAO=30,160;FDP=190;FR=.;FRO=0;FSAF=0,67;FSAR=30,93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00808504,0.0202657;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=147.222,173.977;QD=37.3771;RBI=0.00823966,0.0230167;REFB=0,0;REVB=0.00158875,0.0109119;RO=0;SAF=1,54;SAR=30,91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,4.28865e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=snp,snp;VARB=0.0274009,0.00480701;OID=.,.;OPOS=37988589,37988589;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:16:176:190:0:0:31,145:30,160:30,91:1,54:0:0:30,93:0,67:0:0 chr7 37991129 . C A 2160.58 PASS AO=204;DP=215;FAO=231;FDP=231;FR=.;FRO=0;FSAF=132;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164309;FXX=0.0334714;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.526;QD=37.4126;RBI=0.0382931;REFB=-0.102798;REVB=0.0345888;RO=2;SAF=120;SAR=84;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0112044;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000117642;OID=.;OPOS=37991129;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:215:231:2:0:204:231:84:120:0:2:99:132:0:0 chr7 37991186 . C T 2337.61 PASS AO=265;DP=288;FAO=278;FDP=299;FR=.;FRO=21;FSAF=154;FSAR=124;FSRF=1;FSRR=20;FWDB=0.0736053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.7542;QD=31.2723;RBI=0.0889426;REFB=-0.0361165;REVB=0.0499305;RO=22;SAF=145;SAR=120;SRF=1;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0732087;STB=0.535701;TYPE=snp;VARB=0.00300645;OID=.;OPOS=37991186;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:288:299:22:21:265:278:120:145:1:21:124:154:1:20 chr7 38356849 . C T 289.24 PASS AO=85;DP=206;FAO=85;FDP=206;FR=.;FRO=121;FSAF=37;FSAR=48;FSRF=59;FSRR=62;FWDB=0.00958169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.016;QD=5.61621;RBI=0.0118835;REFB=-0.012588;REVB=0.00702918;RO=121;SAF=37;SAR=48;SRF=59;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0553385;STB=0.530991;TYPE=snp;VARB=0.0161484;OID=.;OPOS=38356849;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:206:206:121:121:85:85:48:37:59:62:48:37:59:62 chr7 38357075 . T C 178.75 PASS AO=41;DP=83;FAO=41;FDP=83;FR=.;FRO=42;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=-0.029023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.945;QD=8.61467;RBI=0.0292468;REFB=-0.017684;REVB=-0.00361168;RO=41;SAF=23;SAR=18;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0448934;STB=0.517667;TYPE=snp;VARB=0.0210106;OID=.;OPOS=38357075;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:41:42:41:41:18:23:25:16:18:23:25:17 chr7 38389410 . G C 80.66 PASS AO=40;DP=144;FAO=40;FDP=145;FR=.;FRO=105;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=45;FSRR=60;FWDB=-0.00639952;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.0778;QD=2.22504;RBI=0.0124479;REFB=0.0070719;REVB=-0.0106769;RO=102;SAF=24;SAR=16;SRF=42;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226305;STB=0.62289;TYPE=snp;VARB=-0.0229125;OID=.;OPOS=38389410;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:144:145:102:105:40:40:16:24:42:60:16:24:45:60 chr7 38398101 . T C 253.27 PASS AO=58;DP=117;FAO=59;FDP=120;FR=.;FRO=61;FSAF=23;FSAR=36;FSRF=30;FSRR=31;FWDB=-0.0118859;FXX=0.00826378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.106;QD=8.44237;RBI=0.0123563;REFB=-0.0128636;REVB=0.00337688;RO=58;SAF=21;SAR=37;SRF=29;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129526;STB=0.553186;TYPE=snp;VARB=0.013982;OID=.;OPOS=38398101;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:120:58:61:58:59:37:21:29:29:36:23:30:31 chr7 38398372 . T G 388.26 PASS AO=71;DP=224;FAO=112;FDP=264;FR=.;FRO=152;FSAF=47;FSAR=65;FSRF=77;FSRR=75;FWDB=0.0262666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.5505;QD=5.88265;RBI=0.026476;REFB=-0.0387722;REVB=-0.00332326;RO=151;SAF=35;SAR=36;SRF=77;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200154;STB=0.550537;TYPE=snp;VARB=0.0603299;OID=.;OPOS=38398372;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:224:264:151:152:71:112:36:35:77:74:65:47:77:75 chr7 38402496 . A G 145.02 PASS AO=52;DP=150;FAO=52;FDP=150;FR=.;FRO=98;FSAF=32;FSAR=20;FSRF=49;FSRR=49;FWDB=-0.00428432;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=179.479;QD=3.86721;RBI=0.0101918;REFB=-0.00890782;REVB=0.0092476;RO=97;SAF=32;SAR=20;SRF=48;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13912;STB=0.576773;TYPE=snp;VARB=0.0111594;OID=.;OPOS=38402496;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:150:97:98:52:52:20:32:48:49:20:32:49:49 chr7 38402517 . C T 231.83 PASS AO=69;DP=178;FAO=71;FDP=179;FR=.;FRO=108;FSAF=43;FSAR=28;FSRF=55;FSRR=53;FWDB=0.0225023;FXX=0.00555525;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.4061;QD=5.18055;RBI=0.0291855;REFB=-0.0128355;REVB=0.0185861;RO=109;SAF=41;SAR=28;SRF=56;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0886642;STB=0.559322;TYPE=snp;VARB=0.0104431;OID=.;OPOS=38402517;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:179:109:108:69:71:28:41:56:53:28:43:55:53 chr7 38467842 . A G 1061.35 PASS AO=127;DP=139;FAO=127;FDP=139;FR=.;FRO=12;FSAF=34;FSAR=93;FSRF=12;FSRR=0;FWDB=0.108279;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.5214;QD=30.5424;RBI=0.11102;REFB=-0.033971;REVB=0.0245174;RO=12;SAF=34;SAR=93;SRF=12;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14164;STB=0.574988;TYPE=snp;VARB=0.00890415;OID=.;OPOS=38467842;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:139:139:12:12:127:127:93:34:12:0:93:34:12:0 chr7 38467923 . A G 904.53 PASS AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.036597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.183;QD=38.0857;RBI=0.0613537;REFB=0;REVB=0.0492437;RO=0;SAF=20;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.48433e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000279415;OID=.;OPOS=38467923;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:95:95:0:0:95:95:75:20:0:0:75:20:0:0 chr7 38468463 . C T 1305.93 PASS AO=140;DP=143;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0261112;FXX=0.013985;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.358;QD=37.0478;RBI=0.026856;REFB=-0.037597;REVB=-0.00628061;RO=1;SAF=84;SAR=56;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00562713;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00020781;OID=.;OPOS=38468463;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:143:141:1:0:140:141:56:84:1:0:56:85:0:0 chr7 38468695 . C T 508.5 PASS AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166997;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.693;QD=37.6665;RBI=0.0187434;REFB=0;REVB=-0.00851078;RO=0;SAF=10;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.54901e-05;OID=.;OPOS=38468695;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:54:54:0:0:54:54:44:10:0:0:44:10:0:0 chr7 38469039 . C A 196.56 PASS AO=55;DP=123;FAO=53;FDP=123;FR=.;FRO=70;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=41;FSRR=29;FWDB=-0.00289428;FXX=0.00806387;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.1751;QD=6.39207;RBI=0.0178173;REFB=0.000948123;REVB=0.0175806;RO=68;SAF=29;SAR=26;SRF=39;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0461023;STB=0.543482;TYPE=snp;VARB=-0.00451824;OID=.;OPOS=38469039;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:68:70:55:53:26:29:39:29:26:27:41:29 chr7 38471753 . A G 197.62 PASS AO=56;DP=134;FAO=56;FDP=134;FR=.;FRO=78;FSAF=44;FSAR=12;FSRF=65;FSRR=13;FWDB=0.0048976;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.6684;QD=5.89899;RBI=0.0562425;REFB=-0.0105832;REVB=-0.0560289;RO=78;SAF=44;SAR=12;SRF=65;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0773553;STB=0.543175;TYPE=snp;VARB=0.00697979;OID=.;OPOS=38471753;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:78:78:56:56:12:44:65:13:12:44:65:13 chr7 38570923 . G A 170.86 PASS AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0760404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.727;QD=37.9681;RBI=0.0784364;REFB=0;REVB=0.0192385;RO=0;SAF=5;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00079597;OID=.;OPOS=38570923;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:18:0:0:18:18:13:5:0:0:13:5:0:0 chr7 38725804 . C T 1000.58 PASS AO=105;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00902863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.547;QD=38.1172;RBI=0.00991348;REFB=0;REVB=-0.00409401;RO=0;SAF=47;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.43789e-06;OID=.;OPOS=38725804;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:105:105:0:0:105:105:58:47:0:0:58:47:0:0 chr7 38765785 . T C 1739.88 PASS AO=184;DP=185;FAO=184;FDP=184;FR=.;FRO=0;FSAF=112;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.020484;FXX=0.00540511;HRUN=4;LEN=1;MLLD=94.8798;QD=37.8235;RBI=0.0343832;REFB=-0.0284604;REVB=-0.0276154;RO=1;SAF=112;SAR=72;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00423241;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.7614e-05;OID=.;OPOS=38765785;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:185:184:1:0:184:184:72:112:1:0:72:112:0:0 chr7 38908856 . G A 351.01 PASS AO=84;DP=158;FAO=83;FDP=169;FR=.;FRO=86;FSAF=36;FSAR=47;FSRF=27;FSRR=59;FWDB=-0.0959205;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2016;QD=8.30786;RBI=0.099703;REFB=-0.0339413;REVB=0.0272019;RO=74;SAF=37;SAR=47;SRF=16;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20088;STB=0.563066;TYPE=snp;VARB=0.0357363;OID=.;OPOS=38908856;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:169:74:86:84:83:47:37:16:58:47:36:27:59 chr7 39368609 . T C 558.78 PASS AO=135;DP=282;FAO=137;FDP=282;FR=.;FRO=145;FSAF=68;FSAR=69;FSRF=85;FSRR=60;FWDB=-0.00175212;FXX=0.00704201;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.2;QD=7.92596;RBI=0.00303045;REFB=-0.0110997;REVB=0.0024726;RO=145;SAF=68;SAR=67;SRF=87;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0907996;STB=0.546167;TYPE=snp;VARB=0.010415;OID=.;OPOS=39368609;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:282:282:145:145:135:137:67:68:87:58:69:68:85:60 chr7 39649275 . G A 258.73 PASS AO=51;DP=90;FAO=51;FDP=90;FR=.;FRO=39;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=0.00265448;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=244.468;QD=11.4991;RBI=0.0114754;REFB=0.00492308;REVB=0.0111642;RO=39;SAF=20;SAR=31;SRF=15;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00626395;STB=0.503431;TYPE=snp;VARB=-0.00336371;OID=.;OPOS=39649275;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:39:39:51:51:31:20:15:24:31:20:15:24 chr7 40108906 . C T 142.48 PASS AO=30;DP=57;FAO=30;FDP=57;FR=.;FRO=27;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=7;FWDB=0.0113576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.535;QD=9.99888;RBI=0.0322735;REFB=-0.0101884;REVB=0.030209;RO=27;SAF=21;SAR=9;SRF=20;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0421417;STB=0.523389;TYPE=snp;VARB=0.00596884;OID=.;OPOS=40108906;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:27:27:30:30:9:21:20:7:9:21:20:7 chr7 40134678 . A G 11.52 PASS AO=4;DP=20;FAO=4;FDP=20;FR=.;FRO=16;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.0021626;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.335;QD=2.30311;RBI=0.020428;REFB=0.00754421;REVB=-0.0203132;RO=15;SAF=1;SAR=3;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.506051;STB=0.816795;TYPE=snp;VARB=-0.0346675;OID=.;OPOS=40134678;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:20:20:15:16:4:4:3:1:11:4:3:1:11:5 chr7 40314243 . A G 247.72 PASS AO=72;DP=174;FAO=72;FDP=174;FR=.;FRO=102;FSAF=34;FSAR=38;FSRF=40;FSRR=62;FWDB=0.00608692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.946;QD=5.69479;RBI=0.0145183;REFB=0.00774449;REVB=0.0131806;RO=102;SAF=34;SAR=38;SRF=40;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.084552;STB=0.547315;TYPE=snp;VARB=-0.0108191;OID=.;OPOS=40314243;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:174:102:102:72:72:38:34:40:62:38:34:40:62 chr7 40899967 . G C 193.87 PASS AO=27;DP=46;FAO=35;FDP=54;FR=.;FRO=19;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=0.0204484;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.316;QD=14.3605;RBI=0.0207135;REFB=-0.0361186;REVB=0.00330334;RO=17;SAF=13;SAR=14;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115686;STB=0.569581;TYPE=snp;VARB=0.0136124;OID=.;OPOS=40899967;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:46:54:17:19:27:35:14:13:11:6:18:17:13:6 chr7 42003680 . A T 83.39 PASS AO=25;DP=76;FAO=27;FDP=80;FR=.;FRO=53;FSAF=2;FSAR=25;FSRF=28;FSRR=25;FWDB=-0.0491606;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=16.5327;QD=4.16969;RBI=0.0515334;REFB=-0.0100349;REVB=-0.0154575;RO=51;SAF=2;SAR=23;SRF=26;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.615226;STB=0.882016;TYPE=snp;VARB=0.0251124;OID=.;OPOS=42003680;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:76:80:51:53:25:27:23:2:26:25:25:2:28:25 chr7 42950640 . C T 1638.91 PASS AO=184;DP=195;FAO=184;FDP=192;FR=.;FRO=8;FSAF=72;FSAR=112;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.0409538;FXX=0.0153838;HRUN=3;LEN=1;MLLD=74.2208;QD=34.144;RBI=0.0411595;REFB=0.0674688;REVB=-0.0041096;RO=8;SAF=72;SAR=112;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00901885;STB=0.504743;TYPE=snp;VARB=-0.00257511;OID=.;OPOS=42950640;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:195:192:8:8:184:184:112:72:4:4:112:72:4:4 chr7 42970733 . C T 1388.31 PASS AO=145;DP=145;FAO=145;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00860403;FXX=0.00684885;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7327;QD=38.2982;RBI=0.00878739;REFB=0;REVB=0.00178572;RO=0;SAF=63;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.07944e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000377437;OID=.;OPOS=42970733;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:145:145:0:0:145:145:82:63:0:0:82:63:0:0 chr7 42976789 . A G 2475.26 PASS AO=255;DP=256;FAO=262;FDP=262;FR=.;FRO=0;FSAF=108;FSAR=154;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0223799;FXX=0.00380214;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.591;QD=37.7903;RBI=0.0306191;REFB=0;REVB=0.0208967;RO=0;SAF=105;SAR=150;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000270511;OID=.;OPOS=42976789;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:256:262:0:0:255:262:150:105:0:0:154:108:0:0 chr7 42977091 . G A 807.7 PASS AO=89;DP=91;FAO=89;FDP=91;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00298713;FXX=0.0108684;HRUN=3;LEN=1;MLLD=89.5064;QD=35.5031;RBI=0.0226698;REFB=-0.000831244;REVB=0.0224721;RO=2;SAF=31;SAR=58;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0160613;STB=0.508473;TYPE=snp;VARB=-4.5301e-05;OID=.;OPOS=42977091;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:91:91:2:2:89:89:58:31:0:2:58:31:0:2 chr7 43916631 . GCCCCG GCCCG,GCCC 549.59 PASS AO=67,35;DP=146;FAO=126,0;FDP=135;FR=.;FRO=9;FSAF=53,0;FSAR=73,0;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.158078,-0.00795234;FXX=0.0425502;HRUN=4,4;LEN=1,2;MLLD=10.7103,61.1949;QD=16.2843;RBI=0.234791,0.0323764;REFB=-0.204701,-0.0284322;REVB=0.173603,0.0313846;RO=29;SAF=31,9;SAR=36,26;SRF=11;SRR=18;SSEN=0,0;SSEP=0.333333,0.333333;SSSB=0.0472234,-0.121795;STB=0.501627,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.140477,0;OID=.,.;OPOS=43916632,43916635;OREF=C,CG;OALT=-,-;OMAPALT=GCCCG,GCCC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:67,35:139:126,0:135:9:53,0:73,0:4:5:22:29:31,9:36,26:11:18 chr7 44046934 . G A 218.62 PASS AO=79;DP=223;FAO=79;FDP=224;FR=.;FRO=145;FSAF=73;FSAR=6;FSRF=98;FSRR=47;FWDB=0.00846565;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.425;QD=3.90396;RBI=0.0227666;REFB=0.0091818;REVB=-0.0211341;RO=144;SAF=73;SAR=6;SRF=97;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.49339;STB=0.790302;TYPE=snp;VARB=-0.0147506;OID=.;OPOS=44046934;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:224:144:145:79:79:6:73:97:47:6:73:98:47 chr7 44148553 . A G 673 PASS AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0281853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.954;QD=37.9153;RBI=0.0283189;REFB=0;REVB=0.00274819;RO=0;SAF=19;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00014425;OID=.;OPOS=44148553;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:71:71:0:0:71:71:52:19:0:0:52:19:0:0 chr7 44150626 . C T 56.55 PASS AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0631195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.5576;QD=9.04752;RBI=0.103619;REFB=-0.0636151;REVB=-0.0821756;RO=13;SAF=6;SAR=6;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0345229;STB=0.519967;TYPE=snp;VARB=0.0677283;OID=.;OPOS=44150626;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:25:25:13:13:12:12:6:6:6:7:6:6:6:7 chr7 44153780 . A G 387.19 PASS AO=33;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0575027;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.4445;QD=38.7191;RBI=0.151201;REFB=0;REVB=0.13984;RO=0;SAF=22;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00434859;OID=.;OPOS=44153780;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:40:40:0:0:33:40:11:22:0:0:18:22:0:0 chr7 44153825 . G A 38.24 PASS AO=11;DP=32;FAO=11;FDP=32;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=16;FWDB=0.0218338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.487;QD=4.77985;RBI=0.0347601;REFB=0.0030557;REVB=0.0270472;RO=21;SAF=5;SAR=6;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249062;STB=0.646821;TYPE=snp;VARB=-0.00430243;OID=.;OPOS=44153825;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:32:32:21:21:11:11:6:5:5:16:6:5:5:16 chr7 44180044 . T A 44.02 PASS AO=15;DP=45;FAO=15;FDP=47;FR=.;FRO=32;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=0.0190603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.862;QD=3.74664;RBI=0.0197568;REFB=-0.00292113;REVB=0.00519997;RO=27;SAF=5;SAR=10;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0444977;STB=0.507926;TYPE=snp;VARB=0.0101278;OID=.;OPOS=44180044;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:45:47:27:32:15:15:10:5:10:17:10:5:11:21 chr7 44180079 . A AG 231.76 PASS AO=30;DP=39;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00783767;FXX=0.0526177;HRUN=2;LEN=1;MLLD=13.3828;QD=25.7512;RBI=0.0732287;REFB=0;REVB=-0.0728081;RO=6;SAF=8;SAR=22;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.087679;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-0.0129582;OID=.;OPOS=44180080;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:30:39:36:36:0:11:25:0:0:22:6:8:22:3:3 chr7 44258964 . G T 35.24 PASS AO=12;DP=28;FAO=11;FDP=33;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=22;FSRR=0;FWDB=0.00850934;FXX=0.0571265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.637;QD=4.27155;RBI=0.0367148;REFB=-0.005523;REVB=0.0357151;RO=15;SAF=8;SAR=4;SRF=15;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.435916;STB=0.789195;TYPE=snp;VARB=0.0139549;OID=.;OPOS=44258964;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:28:33:15:22:12:11:4:8:15:0:3:8:22:0 chr7 44259706 . G A 41.09 PASS AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0326247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.842;QD=10.2732;RBI=0.0328641;REFB=-0.00341711;REVB=0.00395963;RO=7;SAF=4;SAR=4;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0566609;STB=0.562346;TYPE=snp;VARB=0.00451944;OID=.;OPOS=44259706;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:16:16:7:8:8:8:4:4:3:4:4:4:3:5 chr7 44259871 . C T 13.43 PASS AO=3;DP=11;FAO=3;FDP=11;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0727005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.947;QD=4.88264;RBI=0.0876269;REFB=-0.0166721;REVB=-0.0489195;RO=8;SAF=2;SAR=1;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177018;STB=0.624149;TYPE=snp;VARB=0.0532655;OID=.;OPOS=44259871;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:11:11:8:8:3:3:1:2:4:4:1:2:4:4 chr7 44266184 . C T 13.38 PASS AO=4;DP=17;FAO=4;FDP=17;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.0488929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.721;QD=3.14785;RBI=0.0525201;REFB=-0.00473311;REVB=-0.0191795;RO=11;SAF=3;SAR=1;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0319232;STB=0.555265;TYPE=snp;VARB=0.0281279;OID=.;OPOS=44266184;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:17:17:11:13:4:4:1:3:8:3:1:3:9:4 chr7 44279249 . G T 15.56 PASS AO=3;DP=8;FAO=3;FDP=8;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.0344409;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.623;QD=7.77795;RBI=0.0344409;REFB=-0.0457853;REVB=0;RO=5;SAF=3;SAR=0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00780065;OID=.;OPOS=44279249;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:8:8:5:5:3:3:0:3:5:0:0:3:5:0 chr7 44282868 . A G 485.49 PASS AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0827265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.758;QD=37.3455;RBI=0.083583;REFB=0;REVB=-0.0119352;RO=0;SAF=24;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000550625;OID=.;OPOS=44282868;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:51:52:0:0:51:52:27:24:0:0:28:24:0:0 chr7 44282877 . A G 168.41 PASS AO=30;DP=49;FAO=30;FDP=49;FR=.;FRO=19;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=15;FWDB=-0.0086784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.207;QD=13.7481;RBI=0.0260425;REFB=0.012119;REVB=-0.0245539;RO=19;SAF=20;SAR=10;SRF=4;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.319386;STB=0.675559;TYPE=snp;VARB=-0.0207451;OID=.;OPOS=44282877;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:49:49:19:19:30:30:10:20:4:15:10:20:4:15 chr7 44284564 . A G 1638.54 PASS AO=171;DP=172;FAO=172;FDP=172;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.837;QD=38.1057;RBI=0.0354782;REFB=0;REVB=0.0328997;RO=0;SAF=68;SAR=103;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.991e-05;OID=.;OPOS=44284564;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:172:172:0:0:171:172:103:68:0:0:104:68:0:0 chr7 44442296 . A C 776.94 PASS AO=82;DP=83;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020974;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.94;QD=37.8995;RBI=0.0209741;REFB=0;REVB=-7.47701e-05;RO=0;SAF=34;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.58448e-08;OID=.;OPOS=44442296;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:83:82:0:0:82:82:48:34:0:0:48:34:0:0 chr7 44444122 . G A 325.52 PASS AO=53;DP=77;FAO=53;FDP=77;FR=.;FRO=24;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.000954896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.977;QD=16.9099;RBI=0.0290382;REFB=-0.00524149;REVB=-0.0290225;RO=22;SAF=22;SAR=31;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0470796;STB=0.540054;TYPE=snp;VARB=0.00277083;OID=.;OPOS=44444122;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:77:77:22:24:53:53:31:22:11:11:31:22:13:11 chr7 44530193 . T G 555.05 PASS AO=55;DP=55;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.208931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.591;QD=38.279;RBI=0.208936;REFB=0;REVB=0.00136992;RO=0;SAF=1;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.9503e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0002867;OID=.;OPOS=44530193;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:55:58:0:0:55:58:54:1:0:0:55:3:0:0 chr7 44553238 . A G 90.75 PASS AO=25;DP=61;FAO=25;FDP=62;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=25;FWDB=-0.0200093;FXX=0.0158705;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.347;QD=5.85459;RBI=0.0314136;REFB=-0.0109672;REVB=-0.0242165;RO=35;SAF=10;SAR=15;SRF=10;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125926;STB=0.547908;TYPE=snp;VARB=0.0108641;OID=.;OPOS=44553238;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:61:62:35:37:25:25:15:10:10:25:15:10:12:25 chr7 44555406 . G A 75.33 PASS AO=17;DP=36;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.00125108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.973;QD=8.3701;RBI=0.00278424;REFB=-0.0505353;REVB=0.00248732;RO=18;SAF=9;SAR=8;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.074462;STB=0.554393;TYPE=snp;VARB=0.0389296;OID=.;OPOS=44555406;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:36:36:18:19:17:17:8:9:11:7:8:9:12:7 chr7 44579180 . G C 641.69 PASS AO=71;DP=74;FAO=72;FDP=74;FR=.;FRO=2;FSAF=51;FSAR=21;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0101479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9114;QD=34.686;RBI=0.110295;REFB=-0.0988975;REVB=0.109828;RO=3;SAF=51;SAR=20;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00487494;STB=0.509613;TYPE=snp;VARB=0.00215824;OID=.;OPOS=44579180;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:74:74:3:2:71:72:20:51:2:1:21:51:2:0 chr7 44606098 . C T 86.46 PASS AO=12;DP=15;FAO=12;FDP=15;FR=.;FRO=3;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0350825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.878;QD=23.0547;RBI=0.0484411;REFB=-0.0639361;REVB=-0.0334029;RO=3;SAF=5;SAR=7;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0308588;STB=0.517213;TYPE=snp;VARB=0.023758;OID=.;OPOS=44606098;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:15:15:3:3:12:12:7:5:1:2:7:5:1:2 chr7 44612229 . G A 485.75 PASS AO=121;DP=256;FAO=122;FDP=257;FR=.;FRO=135;FSAF=48;FSAR=74;FSRF=67;FSRR=68;FWDB=0.00127315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.018;QD=7.56024;RBI=0.0164713;REFB=-0.00870369;REVB=0.016422;RO=133;SAF=47;SAR=74;SRF=66;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104895;STB=0.555256;TYPE=snp;VARB=0.00951002;OID=.;OPOS=44612229;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:256:257:133:135:121:122:74:47:66:67:74:48:67:68 chr7 44620836 . C A 213 PASS AO=46;DP=88;FAO=46;FDP=88;FR=.;FRO=42;FSAF=7;FSAR=39;FSRF=8;FSRR=34;FWDB=0.0155067;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.605;QD=9.68174;RBI=0.0203577;REFB=9.46113e-05;REVB=0.0131901;RO=42;SAF=7;SAR=39;SRF=8;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0608704;STB=0.533744;TYPE=snp;VARB=7.87627e-06;OID=.;OPOS=44620836;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:42:42:46:46:39:7:8:34:39:7:8:34 chr7 44748477 . C T 91.64 PASS AO=18;DP=35;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=16;FWDB=-0.0207066;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3273;QD=9.90656;RBI=0.0529909;REFB=-0.0307797;REVB=0.0487778;RO=17;SAF=7;SAR=11;SRF=2;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.265363;STB=0.644607;TYPE=snp;VARB=0.0277294;OID=.;OPOS=44748477;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:35:37:17:18:18:19:11:7:2:15:12:7:2:16 chr7 44800176 . G T 43.58 PASS AO=17;DP=57;FAO=17;FDP=58;FR=.;FRO=41;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=30;FWDB=-0.00857873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.666;QD=3.00583;RBI=0.0145172;REFB=-0.000806297;REVB=-0.0117113;RO=38;SAF=4;SAR=13;SRF=9;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00248433;STB=0.531297;TYPE=snp;VARB=0.00213625;OID=.;OPOS=44800176;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:57:58:38:41:17:17:13:4:9:29:13:4:11:30 chr7 44919200 . G A 828.88 PASS AO=100;DP=106;FAO=98;FDP=106;FR=.;FRO=8;FSAF=38;FSAR=60;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.0140069;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0225;QD=31.2784;RBI=0.0334547;REFB=-0.0513665;REVB=0.0303813;RO=6;SAF=39;SAR=61;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0123512;STB=0.508883;TYPE=snp;VARB=0.0447415;OID=.;OPOS=44919200;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:106:106:6:8:100:98:61:39:3:3:60:38:4:4 chr7 45004063 . T C 286.39 PASS AO=68;DP=138;FAO=67;FDP=137;FR=.;FRO=70;FSAF=34;FSAR=33;FSRF=37;FSRR=33;FWDB=0.00680181;FXX=0.0143875;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.73;QD=8.3616;RBI=0.00712868;REFB=-0.0135987;REVB=-0.00213387;RO=69;SAF=35;SAR=33;SRF=37;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0196798;STB=0.510788;TYPE=snp;VARB=0.0143186;OID=.;OPOS=45004063;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:137:69:70:68:67:33:35:37:32:33:34:37:33 chr7 45009341 . A G 65.11 PASS AO=21;DP=60;FAO=21;FDP=60;FR=.;FRO=39;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=-0.0137232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.1875;QD=4.34034;RBI=0.0145471;REFB=-0.0497311;REVB=-0.00482625;RO=38;SAF=11;SAR=10;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113255;STB=0.556908;TYPE=snp;VARB=0.054217;OID=.;OPOS=45009341;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:60:60:38:39:21:21:10:11:16:22:10:11:17:22 chr7 45009723 . G A 49.15 PASS AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0270745;FXX=0.133244;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.689;QD=15.1221;RBI=0.0505642;REFB=-0.00401424;REVB=-0.0427049;RO=5;SAF=6;SAR=2;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260045;STB=0.646763;TYPE=snp;VARB=-0.000876751;OID=.;OPOS=45009723;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:14:13:5:5:8:8:2:6:5:0:2:6:5:0 chr7 45018546 . T C 124.57 PASS AO=33;DP=84;FAO=36;FDP=86;FR=.;FRO=50;FSAF=5;FSAR=31;FSRF=7;FSRR=43;FWDB=0.137275;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0553;QD=5.79386;RBI=0.138159;REFB=0.0102111;REVB=0.0156045;RO=50;SAF=3;SAR=30;SRF=7;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135092;STB=0.501347;TYPE=snp;VARB=-0.0328886;OID=.;OPOS=45018546;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:86:50:50:33:36:30:3:7:43:31:5:7:43 chr7 45023503 . T A 238.82 PASS AO=53;DP=106;FAO=53;FDP=103;FR=.;FRO=50;FSAF=21;FSAR=32;FSRF=20;FSRR=30;FWDB=0.0210933;FXX=0.0282992;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.125;QD=9.27459;RBI=0.0324577;REFB=0.000814572;REVB=-0.0246693;RO=45;SAF=21;SAR=32;SRF=19;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0225674;STB=0.501912;TYPE=snp;VARB=-0.00115261;OID=.;OPOS=45023503;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:103:45:50:53:53:32:21:19:26:32:21:20:30 chr7 45104131 . G A 358.91 PASS AO=74;DP=133;FAO=74;FDP=133;FR=.;FRO=59;FSAF=44;FSAR=30;FSRF=28;FSRR=31;FWDB=0.0163907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.156;QD=10.7942;RBI=0.020393;REFB=-0.00870075;REVB=0.0121334;RO=56;SAF=44;SAR=30;SRF=26;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104358;STB=0.554073;TYPE=snp;VARB=0.00543594;OID=.;OPOS=45104131;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:56:59:74:74:30:44:26:30:30:44:28:31 chr7 45113170 . G A 19.52 PASS AO=6;DP=22;FAO=6;FDP=22;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=13;FSRR=3;FWDB=0.0320733;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.7249;QD=3.54832;RBI=0.0649279;REFB=-0.0185356;REVB=0.056453;RO=16;SAF=4;SAR=2;SRF=13;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207018;STB=0.629258;TYPE=snp;VARB=0.0489255;OID=.;OPOS=45113170;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:22:22:16:16:6:6:2:4:13:3:2:4:13:3 chr7 45115773 . T C 22.49 PASS AO=6;DP=19;FAO=6;FDP=19;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.0123245;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.036;QD=4.73397;RBI=0.0196671;REFB=-0.00376325;REVB=-0.0153265;RO=11;SAF=2;SAR=4;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.308307;STB=0.642374;TYPE=snp;VARB=0.0256627;OID=.;OPOS=45115773;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:19:19:11:13:6:6:4:2:7:4:4:2:7:6 chr7 45118198 . G A 18.62 PASS AO=4;DP=12;FAO=4;FDP=12;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.0314031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.943;QD=6.20784;RBI=0.0374031;REFB=-0.0300226;REVB=0.0203185;RO=8;SAF=1;SAR=3;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.37999;STB=0.74875;TYPE=snp;VARB=0.0308615;OID=.;OPOS=45118198;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:12:12:8:8:4:4:3:1:5:3:3:1:5:3 chr7 45122324 . C A 51.58 PASS AO=9;DP=23;FAO=11;FDP=23;FR=.,HEALED;FRO=12;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0606379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.533;QD=8.97112;RBI=0.0607241;REFB=-0.00894014;REVB=-0.0032358;RO=7;SAF=2;SAR=7;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0657708;STB=0.671941;TYPE=snp;VARB=0.00883086;OID=.;OPOS=45122324;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:23:23:7:12:9:11:7:2:2:5:8:3:7:5 chr7 45122464 . A C 125.84 PASS AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.011016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.301;QD=35.9531;RBI=0.0373279;REFB=0;REVB=0.0356654;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000219551;OID=.;OPOS=45122464;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:14:14:0:0:14:14:9:5:0:0:9:5:0:0 chr7 45122723 . G A 290.01 PASS AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.013134;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.9915;QD=37.4202;RBI=0.136831;REFB=0;REVB=0.136199;RO=0;SAF=17;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00270365;OID=.;OPOS=45122723;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:31:31:0:0:31:31:14:17:0:0:14:17:0:0 chr7 45123090 . G A 125.84 PASS AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0524106;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=286.476;QD=35.9535;RBI=0.0582133;REFB=0;REVB=0.0253363;RO=0;SAF=4;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.63386e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000278473;OID=.;OPOS=45123090;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:14:14:0:0:14:14:10:4:0:0:10:4:0:0 chr7 45123906 . T G 97.78 PASS AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0188037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.987;QD=30.0855;RBI=0.0188037;REFB=-0.177514;REVB=0;RO=1;SAF=12;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00497513;OID=.;OPOS=45123906;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:13:13:1:1:12:12:0:12:1:0:0:12:1:0 chr7 45123925 . C T 132.59 PASS AO=14;DP=14;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.99;QD=35.3585;RBI=0.0140092;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=14;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.96696e-05;OID=.;OPOS=45123925;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:14:15:0:0:14:15:0:14:0:0:0:15:0:0 chr7 45123937 . T C 195.16 PASS AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0157159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.549;QD=37.1733;RBI=0.0157159;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=21;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000270408;OID=.;OPOS=45123937;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:21:21:0:0:21:21:0:21:0:0:0:21:0:0 chr7 45124008 . T C 655.35 PASS AO=64;DP=72;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.038872;FXX=0.013887;HRUN=3;LEN=1;MLLD=68.2605;QD=36.9208;RBI=0.161613;REFB=0;REVB=0.156868;RO=3;SAF=47;SAR=17;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0763387;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00126147;OID=.;OPOS=45124008;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:72:71:3:0:64:71:17:47:0:3:20:51:0:0 chr7 45124286 . A G 735.98 PASS AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0339197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.507;QD=38.2329;RBI=0.0341048;REFB=0;REVB=0.00354816;RO=0;SAF=43;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.11157e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000115854;OID=.;OPOS=45124286;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:77:77:0:0:77:77:34:43:0:0:34:43:0:0 chr7 45124465 . A T 227.78 PASS AO=24;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0349586;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.735;QD=36.445;RBI=0.035039;REFB=0;REVB=-0.00237295;RO=0;SAF=20;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.83186e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000253802;OID=.;OPOS=45124465;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:25:25:0:0:24:25:4:20:0:0:4:21:0:0 chr7 45125652 . AG A 273.79 PASS AO=31;DP=39;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0560734;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=17.3878;QD=28.8203;RBI=0.36149;REFB=0;REVB=-0.357115;RO=0;SAF=29;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.487805;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.0124534;OID=.;OPOS=45125653;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:31:35:38:38:0:32:6:0:0:25:0:29:2:0:0 chr7 45148667 . G A 234.6 PASS AO=45;DP=75;FAO=45;FDP=77;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=9;FSRR=23;FWDB=0.0148741;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.737;QD=12.1872;RBI=0.0165576;REFB=-0.00683076;REVB=0.00727413;RO=30;SAF=19;SAR=26;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0932755;STB=0.561155;TYPE=snp;VARB=0.00516867;OID=.;OPOS=45148667;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:77:30:32:45:45:26:19:9:21:26:19:9:23 chr7 45148773 . C A 317.04 PASS AO=43;DP=79;FAO=43;FDP=77;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=10;FSAR=33;FSRF=3;FSRR=15;FWDB=0.0192604;FXX=0.0253133;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.976;QD=16.4697;RBI=0.0261359;REFB=-0.0596831;REVB=0.017667;RO=19;SAF=10;SAR=33;SRF=3;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0614047;STB=0.52804;TYPE=snp;VARB=0.0197461;OID=.;OPOS=45148773;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:79:77:19:18:43:43:33:10:3:16:33:10:3:15 chr7 45703971 . G A 1153.64 PASS AO=121;DP=121;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0422366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.248;QD=38.1369;RBI=0.0927888;REFB=0;REVB=0.0826186;RO=0;SAF=28;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00019441;OID=.;OPOS=45703971;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:121:121:0:0:121:121:93:28:0:0:93:28:0:0 chr7 45765234 . G T 377.74 PASS AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0351451;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.2359;QD=35.1386;RBI=0.0416176;REFB=-0.0848392;REVB=0.0222901;RO=1;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218287;STB=0.511622;TYPE=snp;VARB=0.0059115;OID=.;OPOS=45765234;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:43:43:1:1:42:42:21:21:0:1:21:21:0:1 chr7 46732428 . A G 1830.44 PASS AO=200;DP=206;FAO=200;FDP=200;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0205522;FXX=0.0338148;HRUN=4;LEN=1;MLLD=124.459;QD=36.6087;RBI=0.0212095;REFB=-0.18401;REVB=-0.00523947;RO=1;SAF=104;SAR=96;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00493556;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000273844;OID=.;OPOS=46732428;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:206:200:1:0:200:200:96:104:0:1:96:104:0:0 chr7 47323456 . A G 134.37 PASS AO=34;DP=77;FAO=34;FDP=76;FR=.;FRO=42;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=26;FWDB=0.0298425;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.424;QD=7.07205;RBI=0.0434733;REFB=0.00981637;REVB=-0.0316126;RO=40;SAF=17;SAR=17;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0964199;STB=0.565751;TYPE=snp;VARB=-0.00904465;OID=.;OPOS=47323456;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:76:40:42:34:34:17:17:16:24:17:17:16:26 chr7 47408029 . A G 487.29 PASS AO=50;DP=52;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00157062;FXX=0.166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.4989;QD=38.9832;RBI=0.0152121;REFB=0;REVB=-0.0151308;RO=0;SAF=18;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000712384;OID=.;OPOS=47408029;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:52:50:0:0:50:50:32:18:0:0:32:18:0:0 chr7 47408443 . C G 47.14 PASS AO=7;DP=11;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0221759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.737;QD=17.1414;RBI=0.0479299;REFB=-0.047833;REVB=-0.0424912;RO=4;SAF=5;SAR=2;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149414;STB=0.58797;TYPE=snp;VARB=0.049998;OID=.;OPOS=47408443;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:11:11:4:4:7:7:2:5:2:2:2:5:2:2 chr7 47408974 . T A 484.6 PASS AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0608714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.191;QD=38.7676;RBI=0.06327;REFB=0;REVB=0.0172558;RO=0;SAF=20;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000212405;OID=.;OPOS=47408974;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:50:50:0:0:50:50:30:20:0:0:30:20:0:0 chr7 47481602 . G A 723.91 PASS AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00450268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.507;QD=38.1004;RBI=0.0296601;REFB=0;REVB=0.0293163;RO=0;SAF=32;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.50716e-05;OID=.;OPOS=47481602;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:76:76:0:0:76:76:44:32:0:0:44:32:0:0 chr7 47546547 . G A 132.51 PASS AO=35;DP=68;FAO=39;FDP=72;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=8;FSRR=25;FWDB=-0.00461261;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.8202;QD=7.36145;RBI=0.0633939;REFB=-0.043819;REVB=-0.0632259;RO=22;SAF=15;SAR=20;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114289;STB=0.571061;TYPE=snp;VARB=0.0119313;OID=.;OPOS=47546547;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:68:72:22:33:35:39:20:15:6:16:24:15:8:25 chr7 47568718 . C T 328.98 PASS AO=86;DP=191;FAO=86;FDP=190;FR=.;FRO=104;FSAF=29;FSAR=57;FSRF=38;FSRR=66;FWDB=-0.035727;FXX=0.00523533;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.842;QD=6.92595;RBI=0.0384336;REFB=-0.012042;REVB=-0.0141677;RO=102;SAF=29;SAR=57;SRF=36;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171036;STB=0.517055;TYPE=snp;VARB=0.0128089;OID=.;OPOS=47568718;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:191:190:102:104:86:86:57:29:36:66:57:29:38:66 chr7 47698685 . A G 940.79 PASS AO=97;DP=97;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00842716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.666;QD=38.3996;RBI=0.0140035;REFB=0;REVB=0.011184;RO=0;SAF=33;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.48762e-06;OID=.;OPOS=47698685;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:97:98:0:0:97:98:64:33:0:0:64:34:0:0 chr7 47851623 . C T 120.99 PASS AO=24;DP=52;FAO=27;FDP=53;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=6;FSRR=20;FWDB=-0.0433092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.2235;QD=9.13096;RBI=0.0484185;REFB=0.00335049;REVB=0.0216487;RO=26;SAF=7;SAR=17;SRF=6;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0704917;STB=0.518505;TYPE=snp;VARB=-0.000920286;OID=.;OPOS=47851623;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:53:26:26:24:27:17:7:6:20:20:7:6:20 chr7 47852837 . C T 377.32 PASS AO=82;DP=170;FAO=83;FDP=161;FR=.;FRO=78;FSAF=34;FSAR=49;FSRF=27;FSRR=51;FWDB=-0.0106802;FXX=0.0584761;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.264;QD=9.37446;RBI=0.0119862;REFB=-0.000924379;REVB=-0.00544067;RO=65;SAF=33;SAR=49;SRF=26;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00205544;STB=0.532157;TYPE=snp;VARB=0.0017843;OID=.;OPOS=47852837;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:161:65:78:82:83:49:33:26:39:49:34:27:51 chr7 47854956 . C T 221.02 PASS AO=72;DP=195;FAO=73;FDP=193;FR=.;FRO=120;FSAF=68;FSAR=5;FSRF=80;FSRR=40;FWDB=0.0157689;FXX=0.0153053;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.706;QD=4.58067;RBI=0.0158502;REFB=-0.000269822;REVB=0.00160324;RO=97;SAF=67;SAR=5;SRF=77;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.346377;STB=0.805152;TYPE=snp;VARB=0.000883859;OID=.;OPOS=47854956;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:193:97:120:72:73:5:67:77:20:5:68:80:40 chr7 47872845 . A G 156.77 PASS AO=32;DP=73;FAO=39;FDP=83;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=7;FSRR=37;FWDB=-0.0368063;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.202;QD=7.55536;RBI=0.044938;REFB=-0.043235;REVB=0.0257821;RO=41;SAF=13;SAR=19;SRF=7;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.25993;STB=0.62306;TYPE=snp;VARB=0.0503343;OID=.;OPOS=47872845;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:83:41:44:32:39:19:13:7:34:25:14:7:37 chr7 47879049 . G A 293.17 PASS AO=59;DP=105;FAO=59;FDP=104;FR=.;FRO=45;FSAF=37;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=-0.00742738;FXX=0.0188661;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.348;QD=11.2758;RBI=0.0161357;REFB=-0.00467441;REVB=-0.0143246;RO=45;SAF=37;SAR=22;SRF=19;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165131;STB=0.590394;TYPE=snp;VARB=0.00488192;OID=.;OPOS=47879049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:104:45:45:59:59:22:37:19:26:22:37:19:26 chr7 47913579 . T C 1144.42 PASS AO=122;DP=123;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00537909;FXX=0.00812942;HRUN=3;LEN=1;MLLD=255.269;QD=37.5219;RBI=0.0177024;REFB=-0.101574;REVB=0.0168654;RO=0;SAF=48;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.91599e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.73443e-06;OID=.;OPOS=47913579;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:123:122:0:0:122:122:74:48:0:0:74:48:0:0 chr7 47921682 . A T 1459.18 PASS AO=151;DP=151;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.914;QD=38.1486;RBI=0.058847;REFB=0;REVB=0.0509956;RO=0;SAF=51;SAR=100;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.63597e-05;OID=.;OPOS=47921682;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:151:153:0:0:151:153:100:51:0:0:102:51:0:0 chr7 47968927 . C A 1055.32 PASS AO=107;DP=107;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0434512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.093;QD=38.0295;RBI=0.0515726;REFB=0;REVB=0.0277801;RO=0;SAF=44;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.78072e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00030145;OID=.;OPOS=47968927;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:107:111:0:0:107:111:63:44:0:0:65:46:0:0 chr7 47971575 . A G 1364.92 PASS AO=143;DP=144;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0372799;FXX=0.00694396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.393;QD=38.1796;RBI=0.0413084;REFB=0;REVB=0.0177932;RO=0;SAF=57;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.29822e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.6634e-05;OID=.;OPOS=47971575;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:144:143:0:0:143:143:86:57:0:0:86:57:0:0 chr7 48004962 . C T 543.51 PASS AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.979;QD=38.1412;RBI=0.0236182;REFB=0;REVB=-0.0211564;RO=0;SAF=33;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.25003e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000195215;OID=.;OPOS=48004962;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:57:57:0:0:57:57:24:33:0:0:24:33:0:0 chr7 48086077 . C T 1120.97 PASS AO=117;DP=117;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00717765;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.03;QD=38.3236;RBI=0.0266964;REFB=0;REVB=0.0257134;RO=0;SAF=53;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.09512e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.67534e-05;OID=.;OPOS=48086077;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:117:117:0:0:117:117:64:53:0:0:64:53:0:0 chr7 48086161 . T C 723.91 PASS AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0160926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.287;QD=38.1007;RBI=0.0354257;REFB=0;REVB=0.0315596;RO=0;SAF=28;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.86654e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.67705e-05;OID=.;OPOS=48086161;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:76:76:0:0:76:76:48:28:0:0:48:28:0:0 chr7 48089541 . ATC AC,A,ACC 524.4 PASS AO=26,10,21;DP=61;FAO=32,7,19;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=32,7,6;FSAR=0,0,13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00609648,0.0122001,0.00169096;FXX=0;HRUN=1,1,1;LEN=1,2,1;MLLD=66.8667,52.0537,64.8461;QD=36.1658;RBI=0.00627502,0.0199364,0.0134694;REFB=0,0,0;REVB=0.00148623,0.0157676,-0.0133629;RO=0;SAF=26,10,8;SAR=0,0,13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=del,del,snp;VARB=0.00252556,0.0480322,0.0399426;OID=.,.,.;OPOS=48089542,48089542,48089542;OREF=T,TC,T;OALT=-,-,C;OMAPALT=AC,A,ACC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/3:26,10,21:57:32,7,19:58:0:32,7,6:0,0,13:0:0:58:0:26,10,8:0,0,13:0:0 chr7 48089571 . C A 401.9 PASS AO=23;DP=36;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108699;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=148.536;QD=37.3859;RBI=0.019754;REFB=0;REVB=0.0164943;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.22007e-05;OID=.;OPOS=48089571;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:23:43:0:0:23:43:12:11:0:0:12:31:0:0 chr7 48092486 . T C 488.74 PASS AO=53;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.107626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.416;QD=36.203;RBI=0.109756;REFB=-0.061628;REVB=0.0215176;RO=1;SAF=17;SAR=36;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0269038;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00225885;OID=.;OPOS=48092486;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:54:54:1:0:53:54:36:17:1:0:36:18:0:0 chr7 48285485 . C T 440.88 PASS AO=122;DP=279;FAO=122;FDP=280;FR=.;FRO=158;FSAF=96;FSAR=26;FSRF=133;FSRR=25;FWDB=0.00243818;FXX=0.00355859;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.436;QD=6.29828;RBI=0.00263946;REFB=-0.0230431;REVB=-0.00101097;RO=155;SAF=96;SAR=26;SRF=131;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0933811;STB=0.548748;TYPE=snp;VARB=0.0302163;OID=.;OPOS=48285485;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:279:280:155:158:122:122:26:96:131:24:26:96:133:25 chr7 48312674 . G A 287.65 PASS AO=85;DP=208;FAO=85;FDP=208;FR=.;FRO=123;FSAF=27;FSAR=58;FSRF=45;FSRR=78;FWDB=-0.0287572;FXX=0.0142173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.224;QD=5.53177;RBI=0.029185;REFB=-0.00208406;REVB=0.00497845;RO=121;SAF=27;SAR=58;SRF=44;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0543016;STB=0.532102;TYPE=snp;VARB=0.00178084;OID=.;OPOS=48312674;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:208:121:123:85:85:58:27:44:77:58:27:45:78 chr7 48313510 . A G 233.53 PASS AO=64;DP=150;FAO=64;FDP=149;FR=.;FRO=85;FSAF=31;FSAR=33;FSRF=35;FSRR=50;FWDB=0.00141586;FXX=0.00666622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.886;QD=6.26919;RBI=0.0129047;REFB=-0.0193025;REVB=-0.0128268;RO=84;SAF=31;SAR=33;SRF=35;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0690478;STB=0.541557;TYPE=snp;VARB=0.0260069;OID=.;OPOS=48313510;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:149:84:85:64:64:33:31:35:49:33:31:35:50 chr7 48314798 . G T 685.51 PASS AO=107;DP=242;FAO=111;FDP=232;FR=.,HEALED;FRO=78;FSAF=49;FSAR=62;FSRF=59;FSRR=19;FWDB=0.0444256;FXX=0.00854664;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.4786;QD=11.8191;RBI=0.0458858;REFB=-0.182253;REVB=-0.0114834;RO=58;SAF=47;SAR=60;SRF=58;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.356735;STB=0.627826;TYPE=snp;VARB=0.00958918;OID=.;OPOS=48314798;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:230:232:58:78:107:111:60:47:58:0:62:49:59:19 chr7 48315796 . C A 254.01 PASS AO=61;DP=129;FAO=62;FDP=130;FR=.;FRO=68;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=33;FSRR=35;FWDB=0.0136509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.382;QD=7.81582;RBI=0.0190804;REFB=-0.0101298;REVB=0.013331;RO=65;SAF=33;SAR=28;SRF=32;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0454682;STB=0.53309;TYPE=snp;VARB=0.0128134;OID=.;OPOS=48315796;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:130:65:68:61:62:28:33:32:33:28:34:33:35 chr7 48315930 . G C 216.75 PASS AO=56;DP=123;FAO=56;FDP=124;FR=.;FRO=68;FSAF=31;FSAR=25;FSRF=34;FSRR=34;FWDB=-0.0260747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.201;QD=6.99177;RBI=0.0325396;REFB=-0.0184102;REVB=-0.0194661;RO=67;SAF=31;SAR=25;SRF=34;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0453396;STB=0.52952;TYPE=snp;VARB=0.019006;OID=.;OPOS=48315930;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:124:67:68:56:56:25:31:34:33:25:31:34:34 chr7 48318811 . C T 837.98 PASS AO=87;DP=89;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0031472;FXX=0.0224694;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.578;QD=38.528;RBI=0.00778383;REFB=0;REVB=-0.00711922;RO=0;SAF=26;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.71534e-05;OID=.;OPOS=48318811;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:89:87:0:0:87:87:61:26:0:0:61:26:0:0 chr7 48336844 . C T 369.96 PASS AO=76;DP=158;FAO=87;FDP=175;FR=.;FRO=88;FSAF=34;FSAR=53;FSRF=48;FSRR=40;FWDB=-0.0955762;FXX=0.0056815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.9146;QD=8.45615;RBI=0.096832;REFB=-0.036183;REVB=0.0155445;RO=80;SAF=33;SAR=43;SRF=48;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153334;STB=0.578831;TYPE=snp;VARB=0.018517;OID=.;OPOS=48336844;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:175:80:88:76:87:43:33:48:32:53:34:48:40 chr7 48443570 . G A 1288.82 PASS AO=132;DP=133;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0431534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.8657;QD=38.1873;RBI=0.0434697;REFB=0;REVB=0.00523463;RO=0;SAF=59;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.88567e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00018173;OID=.;OPOS=48443570;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:133:135:0:0:132:135:73:59:0:0:74:61:0:0 chr7 48450157 . T C 1080.93 PASS AO=117;DP=118;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00384901;FXX=0.0169477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.346;QD=37.2733;RBI=0.00554505;REFB=0.000856585;REVB=0.00399158;RO=1;SAF=45;SAR=72;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00655121;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.95159e-06;OID=.;OPOS=48450157;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:118:116:1:0:117:116:72:45:0:1:72:44:0:0 chr7 48545976 . A G 1446.13 PASS AO=160;DP=167;FAO=162;FDP=169;FR=.;FRO=7;FSAF=87;FSAR=75;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.000156468;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.023;QD=34.2278;RBI=0.0336721;REFB=-0.0336858;REVB=0.0336717;RO=6;SAF=87;SAR=73;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00302783;STB=0.504514;TYPE=snp;VARB=0.00194857;OID=.;OPOS=48545976;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:167:169:6:7:160:162:73:87:3:3:75:87:3:4 chr7 48964322 . G T 632.32 PASS AO=65;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166151;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.235;QD=38.3223;RBI=0.0303416;REFB=0;REVB=0.025388;RO=1;SAF=40;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011665;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000113908;OID=.;OPOS=48964322;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:66:66:1:0:65:66:25:40:1:0:25:41:0:0 chr7 48964751 . G A 381.89 PASS AO=92;DP=190;FAO=92;FDP=190;FR=.;FRO=98;FSAF=53;FSAR=39;FSRF=44;FSRR=54;FWDB=-1.934e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.191;QD=8.03969;RBI=2.37081e-05;REFB=-0.00521332;REVB=-1.37127e-05;RO=96;SAF=53;SAR=39;SRF=43;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11916;STB=0.565757;TYPE=snp;VARB=0.00497148;OID=.;OPOS=48964751;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:190:96:98:92:92:39:53:43:53:39:53:44:54 chr7 48965000 . G A 1120.93 PASS AO=117;DP=117;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0273465;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.803;QD=38.3223;RBI=0.0380432;REFB=0;REVB=0.0264472;RO=0;SAF=67;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.34223e-07;OID=.;OPOS=48965000;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:117:117:0:0:117:117:50:67:0:0:50:67:0:0 chr7 48965427 . A G 99.13 PASS AO=8;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=0;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.275;QD=39.6527;RBI=0.0145707;REFB=0;REVB=0.0145707;RO=0;SAF=0;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00518603;OID=.;OPOS=48965427;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:8:10:8:0:0:0:10:0:0:0 chr7 48965435 . C T 10.93 PASS AO=5;DP=26;FAO=5;FDP=27;FR=.;FRO=22;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=19;FWDB=-0.00432601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.7751;QD=1.61935;RBI=0.0841148;REFB=-0.0189678;REVB=-0.0840034;RO=21;SAF=3;SAR=2;SRF=3;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.533096;STB=0.839153;TYPE=snp;VARB=0.0478619;OID=.;OPOS=48965435;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:26:27:21:22:5:5:2:3:3:18:2:3:3:19 chr7 50173777 . A G 284.14 PASS AO=71;DP=152;FAO=71;FDP=152;FR=.;FRO=81;FSAF=35;FSAR=36;FSRF=30;FSRR=51;FWDB=-0.00844767;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=147.656;QD=7.47738;RBI=0.0116545;REFB=-0.0148423;REVB=-0.00802897;RO=65;SAF=35;SAR=36;SRF=27;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0676222;STB=0.565441;TYPE=snp;VARB=0.0138368;OID=.;OPOS=50173777;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:152:65:81:71:71:36:35:27:38:36:35:30:51 chr7 50175681 . C T 582.43 PASS AO=136;DP=270;FAO=136;FDP=270;FR=.;FRO=134;FSAF=83;FSAR=53;FSRF=91;FSRR=43;FWDB=0.00708251;FXX=0.00735267;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.551;QD=8.62863;RBI=0.0136211;REFB=-0.0174593;REVB=-0.011635;RO=132;SAF=83;SAR=53;SRF=91;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0762985;STB=0.536469;TYPE=snp;VARB=0.0276286;OID=.;OPOS=50175681;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:270:270:132:134:136:136:53:83:91:41:53:83:91:43 chr7 50180972 . C T 269.28 PASS AO=82;DP=208;FAO=82;FDP=207;FR=.;FRO=125;FSAF=28;FSAR=54;FSRF=61;FSRR=64;FWDB=-0.000412169;FXX=0.0235838;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.161;QD=5.20353;RBI=0.00129856;REFB=-0.016367;REVB=0.00123141;RO=121;SAF=28;SAR=54;SRF=61;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179289;STB=0.592579;TYPE=snp;VARB=0.0265744;OID=.;OPOS=50180972;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:207:121:125:82:82:54:28:61:60:54:28:61:64 chr7 50435777 . T G 661.58 PASS AO=152;DP=301;FAO=154;FDP=304;FR=.;FRO=150;FSAF=59;FSAR=95;FSRF=68;FSRR=82;FWDB=-0.0118639;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.328;QD=8.70499;RBI=0.013166;REFB=-0.0080363;REVB=0.00570892;RO=149;SAF=59;SAR=93;SRF=68;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0638257;STB=0.536027;TYPE=snp;VARB=0.0073876;OID=.;OPOS=50435777;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:301:304:149:150:152:154:93:59:68:81:95:59:68:82 chr7 50436033 . A G 1265.09 PASS AO=133;DP=135;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0061262;FXX=0.0147048;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.039;QD=37.7638;RBI=0.0149953;REFB=0.0117805;REVB=-0.0136868;RO=1;SAF=47;SAR=86;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00549553;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.90498e-05;OID=.;OPOS=50436033;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:135:134:1:0:133:134:86:47:0:1:87:47:0:0 chr7 50467767 . C A 37.33 PASS AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.0135224;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=207.7;QD=6.4929;RBI=0.015604;REFB=-0.00530382;REVB=-0.00778648;RO=14;SAF=4;SAR=5;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19924;STB=0.618791;TYPE=snp;VARB=0.00936582;OID=.;OPOS=50467767;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:23:23:14:14:9:9:5:4:9:5:5:4:9:5 chr7 50470604 . T G 63.76 PASS AO=19;DP=52;FAO=19;FDP=52;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=0.0110552;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.746;QD=4.90478;RBI=0.0187028;REFB=-0.00919748;REVB=-0.0150856;RO=33;SAF=7;SAR=12;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00560478;STB=0.503265;TYPE=snp;VARB=0.0278645;OID=.;OPOS=50470604;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:52:52:33:33:19:19:12:7:12:21:12:7:12:21 chr7 50471613 . G A 477.97 PASS AO=120;DP=258;FAO=120;FDP=255;FR=.;FRO=135;FSAF=57;FSAR=63;FSRF=53;FSRR=82;FWDB=-0.057984;FXX=0.0116275;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.9153;QD=7.49753;RBI=0.0582391;REFB=-0.00549945;REVB=0.00544531;RO=134;SAF=57;SAR=63;SRF=52;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0838585;STB=0.543922;TYPE=snp;VARB=0.00592226;OID=.;OPOS=50471613;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:258:255:134:135:120:120:63:57:52:82:63:57:53:82 chr7 50611735 . T C 1633.98 PASS AO=170;DP=170;FAO=171;FDP=171;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2078;QD=38.2217;RBI=0.0331881;REFB=0;REVB=-0.0218828;RO=0;SAF=72;SAR=98;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.99351e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.76654e-06;OID=.;OPOS=50611735;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:170:171:0:0:170:171:98:72:0:0:99:72:0:0 chr7 50660438 . T C 1508.76 PASS AO=154;DP=155;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00986154;FXX=0.00632871;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.429;QD=38.4397;RBI=0.0352059;REFB=0;REVB=0.0337965;RO=0;SAF=75;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.75112e-05;OID=.;OPOS=50660438;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:155:157:0:0:154:157:79:75:0:0:80:77:0:0 chr7 50673029 . T C 447.3 PASS AO=46;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00290247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.052;QD=38.0679;RBI=0.00409749;REFB=0;REVB=0.00289224;RO=0;SAF=26;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.66485e-05;OID=.;OPOS=50673029;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:47:47:0:0:46:47:20:26:0:0:21:26:0:0 chr7 50742180 . C T 159.47 PASS AO=40;DP=91;FAO=40;FDP=89;FR=.;FRO=49;FSAF=29;FSAR=11;FSRF=30;FSRR=19;FWDB=0.0054151;FXX=0.0326052;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.984;QD=7.16717;RBI=0.01201;REFB=-0.0106273;REVB=0.0107199;RO=45;SAF=29;SAR=11;SRF=28;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114588;STB=0.572707;TYPE=snp;VARB=0.00951936;OID=.;OPOS=50742180;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:89:45:49:40:40:11:29:28:17:11:29:30:19 chr7 51093013 . A T 86.76 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00886815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.393;QD=38.5593;RBI=0.025265;REFB=0;REVB=0.0236575;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000623817;OID=.;OPOS=51093013;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:5:4:0:0:5:4:0:0 chr7 51094269 . G A 94.6 PASS AO=21;DP=46;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=0.00146725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.5437;QD=8.05116;RBI=0.0629638;REFB=-0.0121343;REVB=0.0629467;RO=24;SAF=8;SAR=13;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0481383;STB=0.525401;TYPE=snp;VARB=0.0101577;OID=.;OPOS=51094269;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:46:47:24:25:21:22:13:8:8:16:14:8:8:17 chr7 51096036 . G C 137.28 PASS AO=28;DP=51;FAO=28;FDP=52;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.076058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.6875;QD=10.5599;RBI=0.100216;REFB=-0.0460421;REVB=-0.0652571;RO=23;SAF=12;SAR=16;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0677289;STB=0.525406;TYPE=snp;VARB=0.0376883;OID=.;OPOS=51096036;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:52:23:24:28:28:16:12:8:15:16:12:9:15 chr7 51096974 . C T 332.15 PASS AO=88;DP=198;FAO=89;FDP=201;FR=.;FRO=112;FSAF=36;FSAR=53;FSRF=63;FSRR=49;FWDB=0.0397535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.667;QD=6.6099;RBI=0.0415471;REFB=-0.0179678;REVB=-0.0120757;RO=110;SAF=36;SAR=52;SRF=63;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163567;STB=0.588275;TYPE=snp;VARB=0.0227503;OID=.;OPOS=51096974;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:201:110:112:88:89:52:36:63:47:53:36:63:49 chr7 51097063 . T G 1196.17 PASS AO=119;DP=119;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0350301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.795;QD=37.9738;RBI=0.0350476;REFB=0;REVB=0.0011049;RO=0;SAF=44;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000524848;OID=.;OPOS=51097063;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:119:126:0:0:119:126:75:44:0:0:75:51:0:0 chr7 51098567 . GTCT G 2753.78 PASS AO=275;DP=313;FAO=287;FDP=287;FR=.;FRO=0;FSAF=153;FSAR=134;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00176698;FXX=0.0651445;HRUN=1;LEN=3;MLLD=212.892;QD=38.3803;RBI=0.00182304;REFB=0;REVB=-0.000448616;RO=0;SAF=146;SAR=129;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.50874e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=2.00659e-05;OID=.;OPOS=51098568;OREF=TCT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:275:301:287:287:0:153:134:0:0:99:0:146:129:0:0 chr7 51111340 . C T 46.49 PASS AO=11;DP=31;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.0128062;FXX=0.222161;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.2002;QD=6.64188;RBI=0.0341968;REFB=-0.0475874;REVB=0.0317083;RO=13;SAF=5;SAR=6;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140078;STB=0.562803;TYPE=snp;VARB=0.02011;OID=.;OPOS=51111340;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:31:28:13:17:11:11:6:5:4:9:6:5:6:11 chr7 51111341 . G T 11.46 PASS AO=6;DP=36;FAO=6;FDP=33;FR=.;FRO=27;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.0347953;FXX=0.0833102;HRUN=4;LEN=1;MLLD=84.5744;QD=1.38923;RBI=0.0378045;REFB=-0.0366007;REVB=-0.0147805;RO=27;SAF=3;SAR=3;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155579;STB=0.605723;TYPE=snp;VARB=0.0510071;OID=.;OPOS=51111341;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:36:33:27:27:6:6:3:3:10:17:3:3:10:17 chr7 51287470 . A G 125.07 PASS AO=35;DP=85;FAO=35;FDP=85;FR=.;FRO=50;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=-0.00856736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.9828;QD=5.88577;RBI=0.0113177;REFB=-0.00496124;REVB=-0.00739534;RO=50;SAF=14;SAR=21;SRF=24;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0847269;STB=0.548049;TYPE=snp;VARB=0.00698752;OID=.;OPOS=51287470;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:50:50:35:35:21:14:24:26:21:14:24:26 chr7 51287561 . TG T 31.34 PASS AO=29;DP=84;FAO=36;FDP=75;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=13;FSRR=26;FWDB=-0.00322234;FXX=0.0259707;HRUN=7;LEN=1;MLLD=6.0006;QD=1.67137;RBI=0.159653;REFB=-0.162579;REVB=-0.15962;RO=30;SAF=5;SAR=24;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24844;STB=0.515781;TYPE=del;VARB=0.0949294;OID=.;OPOS=51287562;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:29:74:36:75:39:13:23:13:26:31:30:5:24:11:19 chr7 53103371 . G T 137.76 PASS AO=27;DP=50;FAO=27;FDP=49;FR=.;FRO=22;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.0811728;FXX=0.039208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.484;QD=11.2457;RBI=0.0822678;REFB=-0.0613796;REVB=-0.0133777;RO=21;SAF=19;SAR=8;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157163;STB=0.600588;TYPE=snp;VARB=0.0498635;OID=.;OPOS=53103371;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:50:49:21:22:27:27:8:19:11:10:8:19:11:11 chr7 53103382 . G T 200.27 PASS AO=36;DP=59;FAO=37;FDP=60;FR=.;FRO=23;FSAF=27;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.0237612;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.892;QD=13.3511;RBI=0.055998;REFB=-0.0259039;REVB=0.0507068;RO=22;SAF=26;SAR=10;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174585;STB=0.609793;TYPE=snp;VARB=0.0123174;OID=.;OPOS=53103382;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:59:60:22:23:36:37:10:26:11:11:10:27:11:12 chr7 53103554 . C G 91.09 PASS AO=23;DP=53;FAO=23;FDP=53;FR=.;FRO=30;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=7;FSRR=23;FWDB=0.0400181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.997;QD=6.87484;RBI=0.0443546;REFB=-0.00709864;REVB=0.019128;RO=30;SAF=5;SAR=18;SRF=7;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0228898;STB=0.513053;TYPE=snp;VARB=0.0175819;OID=.;OPOS=53103554;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:53:53:30:30:23:23:18:5:7:23:18:5:7:23 chr7 53103571 . G A 57.97 PASS AO=16;DP=42;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=20;FWDB=-0.0910775;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=94.534;QD=5.52056;RBI=0.0923174;REFB=-0.000711098;REVB=0.0150799;RO=22;SAF=4;SAR=12;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0297311;STB=0.516109;TYPE=snp;VARB=0.000559964;OID=.;OPOS=53103571;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:42:42:22:26:16:16:12:4:6:16:12:4:6:20 chr7 53103673 . C A 18.78 PASS AO=4;DP=13;FAO=4;FDP=12;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=-0.0021063;FXX=0.076864;HRUN=3;LEN=1;MLLD=176.165;QD=6.26109;RBI=0.0647582;REFB=-0.00848877;REVB=-0.064724;RO=8;SAF=2;SAR=2;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260267;STB=0.665925;TYPE=snp;VARB=0.0684941;OID=.;OPOS=53103673;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:13:12:8:8:4:4:2:2:6:2:2:2:6:2 chr7 53103946 . G C 73.97 PASS AO=12;DP=19;FAO=12;FDP=19;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=-0.0381735;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=32.5954;QD=15.5724;RBI=0.0528477;REFB=0.00324095;REVB=0.0365468;RO=7;SAF=1;SAR=11;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218297;STB=0.620528;TYPE=snp;VARB=-0.00490115;OID=.;OPOS=53103946;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:19:19:7:7:12:12:11:1:0:7:11:1:0:7 chr7 53104078 . G A 52.31 PASS AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=0;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=19;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.435;QD=6.53917;RBI=0.0118208;REFB=-0.00233191;REVB=0.0118208;RO=18;SAF=0;SAR=13;SRF=0;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0118756;OID=.;OPOS=53104078;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:31:32:18:19:13:13:13:0:0:18:13:0:0:19 chr7 53433863 . G A 310.42 PASS AO=69;DP=144;FAO=73;FDP=149;FR=.;FRO=76;FSAF=35;FSAR=38;FSRF=40;FSRR=36;FWDB=0.0380221;FXX=0.00666622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.721;QD=8.33347;RBI=0.0405094;REFB=-0.016541;REVB=0.0139762;RO=75;SAF=32;SAR=37;SRF=40;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0654779;STB=0.52389;TYPE=snp;VARB=0.0166553;OID=.;OPOS=53433863;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:149:75:76:69:73:37:32:40:35:38:35:40:36 chr7 53557963 . A G 1672.29 PASS AO=175;DP=176;FAO=176;FDP=176;FR=.;FRO=0;FSAF=100;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216489;FXX=0.0167588;HRUN=3;LEN=1;MLLD=149.509;QD=38.0067;RBI=0.0235049;REFB=-0.163734;REVB=-0.00915454;RO=1;SAF=100;SAR=75;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00473664;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.56281e-05;OID=.;OPOS=53557963;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:176:176:1:0:175:176:75:100:1:0:76:100:0:0 chr7 53558015 . G T 1379.74 PASS AO=148;DP=151;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00105221;FXX=0.0198662;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.552;QD=37.2903;RBI=0.0203449;REFB=0.037781;REVB=0.0203177;RO=2;SAF=68;SAR=80;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0137812;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.86032e-05;OID=.;OPOS=53558015;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:151:148:2:0:148:148:80:68:2:0:80:68:0:0 chr7 55214348 . C T 264.48 PASS AO=47;DP=73;FAO=47;FDP=74;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=33;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=0.0542626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.91;QD=14.2962;RBI=0.0579711;REFB=-0.0292203;REVB=-0.0204013;RO=26;SAF=14;SAR=33;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0658021;STB=0.530818;TYPE=snp;VARB=0.0143106;OID=.;OPOS=55214348;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:73:74:26:27:47:47:33:14:10:16:33:14:10:17 chr7 55229231 . AG A 298.27 PASS AO=37;DP=45;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.28145;FXX=0.0444346;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.4405;QD=27.7458;RBI=0.29327;REFB=0;REVB=-0.0824203;RO=3;SAF=25;SAR=12;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0.366849;SSSB=0.00143933;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00988259;OID=.;OPOS=55229232;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:37:43:43:43:0:28:15:0:0:26:3:25:12:2:1 chr7 55238874 . T A 258.5 PASS AO=64;DP=138;FAO=64;FDP=138;FR=.;FRO=74;FSAF=50;FSAR=14;FSRF=41;FSRR=33;FWDB=0.0282253;FXX=0.028167;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.4262;QD=7.49279;RBI=0.036619;REFB=-0.0133402;REVB=0.0233298;RO=68;SAF=50;SAR=14;SRF=38;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252621;STB=0.648404;TYPE=snp;VARB=0.0181792;OID=.;OPOS=55238874;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:68:74:64:64:14:50:38:30:14:50:41:33 chr7 55249063 . G A 835.3 PASS AO=85;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0716301;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.757;QD=38.4046;RBI=0.0798078;REFB=0;REVB=0.0351912;RO=0;SAF=48;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000360143;OID=.;OPOS=55249063;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:87:87:0:0:85:87:37:48:0:0:37:50:0:0 chr7 55266417 . T C 1707.38 PASS AO=175;DP=178;FAO=177;FDP=177;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0117973;FXX=0.0166657;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.489;QD=38.5848;RBI=0.0148847;REFB=0;REVB=0.0090763;RO=1;SAF=66;SAR=109;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00715753;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000135419;OID=.;OPOS=55266417;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:178:177:1:0:175:177:109:66:1:0:110:67:0:0 chr7 55459563 . A G 137.32 PASS AO=35;DP=78;FAO=35;FDP=79;FR=.;FRO=44;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=0.00132254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.149;QD=6.95312;RBI=0.0485017;REFB=-0.00370861;REVB=0.0484837;RO=41;SAF=22;SAR=13;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161892;STB=0.598472;TYPE=snp;VARB=0.00418336;OID=.;OPOS=55459563;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:79:41:44:35:35:13:22:19:22:13:22:20:24 chr7 55499058 . A G 248.07 PASS AO=55;DP=108;FAO=56;FDP=109;FR=.;FRO=53;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=24;FSRR=29;FWDB=0.00755657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.665;QD=9.10348;RBI=0.035686;REFB=-0.018219;REVB=0.0348768;RO=51;SAF=22;SAR=33;SRF=23;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0458535;STB=0.530159;TYPE=snp;VARB=0.0154357;OID=.;OPOS=55499058;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:109:51:53:55:56:33:22:23:28:34:22:24:29 chr7 55606342 . G C 278.49 PASS AO=55;DP=97;FAO=55;FDP=96;FR=.;FRO=41;FSAF=23;FSAR=32;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=-0.00235425;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.622;QD=11.6037;RBI=0.00473311;REFB=-0.0124088;REVB=0.00410608;RO=41;SAF=23;SAR=32;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0743687;STB=0.540692;TYPE=snp;VARB=0.00745818;OID=.;OPOS=55606342;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:96:41:41:55:55:32:23:21:20:32:23:21:20 chr7 55750390 . A G 178.63 PASS AO=78;DP=247;FAO=77;FDP=246;FR=.;FRO=169;FSAF=50;FSAR=27;FSRF=114;FSRR=55;FWDB=-0.00703714;FXX=0.00404842;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.725;QD=2.90449;RBI=0.044088;REFB=-0.00421508;REVB=-0.0435227;RO=167;SAF=51;SAR=27;SRF=113;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0301351;STB=0.519226;TYPE=snp;VARB=0.00908653;OID=.;OPOS=55750390;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:247:246:167:169:78:77:27:51:113:54:27:50:114:55 chr7 56047572 . C T 390.69 PASS AO=81;DP=157;FAO=85;FDP=160;FR=.;FRO=75;FSAF=24;FSAR=61;FSRF=30;FSRR=45;FWDB=0.015289;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0291;QD=9.76733;RBI=0.01535;REFB=-0.010116;REVB=0.00136799;RO=75;SAF=21;SAR=60;SRF=30;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147213;STB=0.564219;TYPE=snp;VARB=0.00843342;OID=.;OPOS=56047572;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:160:75:75:81:85:60:21:30:45:61:24:30:45 chr7 56087319 . T G 20.44 PASS AO=29;DP=158;FAO=26;FDP=154;FR=.;FRO=128;FSAF=21;FSAR=5;FSRF=54;FSRR=74;FWDB=-0.04726;FXX=0.0064512;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.2783;QD=0.53102;RBI=0.0599117;REFB=-0.00539437;REVB=0.0368227;RO=129;SAF=24;SAR=5;SRF=55;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.513529;STB=0.815396;TYPE=snp;VARB=0.0183868;OID=.;OPOS=56087319;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:158:154:129:128:29:26:5:24:55:74:5:21:54:74 chr7 56087374 . C T 14.22 PASS AO=29;DP=169;FAO=25;FDP=164;FR=.;FRO=139;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=51;FSRR=88;FWDB=-0.0223643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.4376;QD=0.346708;RBI=0.0289815;REFB=-0.00385626;REVB=-0.0184327;RO=135;SAF=19;SAR=10;SRF=49;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.361736;STB=0.720024;TYPE=snp;VARB=0.0089565;OID=.;OPOS=56087374;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:169:164:135:139:29:25:10:19:49:86:9:16:51:88 chr7 56087379 . T C 11.62 PASS AO=28;DP=165;FAO=23;FDP=161;FR=.;FRO=138;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=53;FSRR=85;FWDB=-0.0461483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.038;QD=0.288669;RBI=0.0464001;REFB=-0.00310806;REVB=-0.00482675;RO=136;SAF=19;SAR=9;SRF=52;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.367176;STB=0.752737;TYPE=snp;VARB=0.0209331;OID=.;OPOS=56087379;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:165:161:136:138:28:23:9:19:52:84:7:16:53:85 chr7 56088786 . A T 36.41 PASS AO=44;DP=237;FAO=43;FDP=234;FR=.;FRO=191;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=90;FSRR=101;FWDB=0.00691653;FXX=0.00847422;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.449;QD=0.622444;RBI=0.018305;REFB=0.00162332;REVB=0.016948;RO=191;SAF=17;SAR=27;SRF=90;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111307;STB=0.582853;TYPE=snp;VARB=-0.00402709;OID=.;OPOS=56088786;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:237:234:191:191:44:43:27:17:90:101:27:16:90:101 chr7 56088789 . G A 33.83 PASS AO=43;DP=236;FAO=42;FDP=234;FR=.;FRO=192;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=91;FSRR=101;FWDB=0.00400536;FXX=0.0126577;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.984;QD=0.578252;RBI=0.0570618;REFB=-0.000163181;REVB=0.056921;RO=188;SAF=15;SAR=28;SRF=91;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177966;STB=0.619411;TYPE=snp;VARB=0.00222013;OID=.;OPOS=56088789;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:236:234:188:192:43:42:28:15:91:97:28:14:91:101 chr7 56088811 . T C 55.7 PASS AO=52;DP=247;FAO=51;FDP=247;FR=.;FRO=196;FSAF=16;FSAR=35;FSRF=91;FSRR=105;FWDB=-0.00490909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.8192;QD=0.901989;RBI=0.0355646;REFB=-0.00474108;REVB=0.0352242;RO=193;SAF=18;SAR=34;SRF=90;SRR=103;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159057;STB=0.62568;TYPE=snp;VARB=0.0165105;OID=.;OPOS=56088811;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:247:247:193:196:52:51:34:18:90:103:35:16:91:105 chr7 56088825 . T A 62.04 PASS AO=54;DP=250;FAO=53;FDP=249;FR=.;FRO=196;FSAF=17;FSAR=36;FSRF=85;FSRR=111;FWDB=-0.00852082;FXX=0.00399984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.996;QD=0.996553;RBI=0.0176153;REFB=-0.011103;REVB=0.0154174;RO=196;SAF=18;SAR=36;SRF=85;SRR=111;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135635;STB=0.595004;TYPE=snp;VARB=0.0581314;OID=.;OPOS=56088825;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:250:249:196:196:54:53:36:18:85:111:36:17:85:111 chr7 56088902 . C T 28.67 PASS AO=32;DP=175;FAO=32;FDP=176;FR=.;FRO=144;FSAF=4;FSAR=28;FSRF=51;FSRR=93;FWDB=-0.0296984;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.831;QD=0.651596;RBI=0.0403797;REFB=-0.000780439;REVB=0.0273592;RO=143;SAF=4;SAR=28;SRF=50;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.387766;STB=0.760675;TYPE=snp;VARB=0.00304561;OID=.;OPOS=56088902;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:175:176:143:144:32:32:28:4:50:93:28:4:51:93 chr7 56126360 . T C 729.99 PASS AO=86;DP=96;FAO=90;FDP=96;FR=.;FRO=6;FSAF=42;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.120356;FXX=0.0103082;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.506;QD=30.4161;RBI=0.139743;REFB=-0.22205;REVB=0.0710101;RO=7;SAF=41;SAR=45;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0682037;STB=0.529405;TYPE=snp;VARB=0.0077635;OID=.;OPOS=56126360;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:96:96:7:6:86:90:45:41:0:7:48:42:0:6 chr7 56130951 . TTA T 74.82 PASS AO=22;DP=139;FAO=46;FDP=110;FR=.;FRO=64;FSAF=31;FSAR=15;FSRF=35;FSRR=29;FWDB=-0.0270781;FXX=0.0350846;HRUN=5;LEN=2;MLLD=18.4081;QD=2.72084;RBI=0.144564;REFB=-0.101385;REVB=-0.142005;RO=49;SAF=13;SAR=9;SRF=27;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0475729;STB=0.579404;TYPE=del;VARB=0.150862;OID=.;OPOS=56130952;OREF=TA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:22:110:46:110:64:31:15:35:29:74:49:13:9:27:22 chr7 56136260 . C A 2926.57 PASS AO=301;DP=305;FAO=305;FDP=305;FR=.;FRO=0;FSAF=145;FSAR=160;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0269002;FXX=0.00973994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.868;QD=38.3813;RBI=0.0353547;REFB=0;REVB=0.022942;RO=0;SAF=145;SAR=156;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000283939;OID=.;OPOS=56136260;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:305:305:0:0:301:305:156:145:0:0:160:145:0:0 chr7 56149939 . G A 78.04 PASS AO=19;DP=44;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=3;FSRR=21;FWDB=-0.0850226;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.4957;QD=7.25999;RBI=0.0987944;REFB=-0.0342578;REVB=0.050314;RO=24;SAF=5;SAR=14;SRF=3;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195178;STB=0.609656;TYPE=snp;VARB=0.028199;OID=.;OPOS=56149939;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:44:43:24:24:19:19:14:5:3:21:14:5:3:21 chr7 56174115 . A C 292.03 PASS AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.124231;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.7693;QD=38.9373;RBI=0.124545;REFB=0;REVB=-0.00884146;RO=0;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00196254;OID=.;OPOS=56174115;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:30:30:0:0:30:30:15:15:0:0:15:15:0:0 chr7 56879527 . A G 53.82 PASS AO=14;DP=35;FAO=14;FDP=35;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=1;FSRF=20;FSRR=1;FWDB=-0.0245503;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=289.454;QD=6.15137;RBI=0.0506595;REFB=-0.0169526;REVB=-0.0443133;RO=21;SAF=13;SAR=1;SRF=20;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102996;STB=0.559245;TYPE=snp;VARB=0.0237124;OID=.;OPOS=56879527;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:35:35:21:21:14:14:1:13:20:1:1:13:20:1 chr7 56879554 . T G 82.28 PASS AO=16;DP=32;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=1;FWDB=0.0256787;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.719;QD=9.97306;RBI=0.0349931;REFB=0.00496745;REVB=0.0237724;RO=15;SAF=14;SAR=2;SRF=14;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127426;STB=0.608285;TYPE=snp;VARB=-0.00977908;OID=.;OPOS=56879554;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:32:33:15:16:16:17:2:14:14:1:3:14:15:1 chr7 56879620 . T C 83.18 PASS AO=12;DP=19;FAO=13;FDP=20;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.0531158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.076;QD=16.6361;RBI=0.0531216;REFB=-0.0478277;REVB=-0.000784112;RO=7;SAF=4;SAR=8;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162618;STB=0.59984;TYPE=snp;VARB=0.0516256;OID=.;OPOS=56879620;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:19:20:7:7:12:13:8:4:4:3:9:4:4:3 chr7 57257162 . A C 594.47 PASS AO=131;DP=248;FAO=131;FDP=248;FR=.;FRO=117;FSAF=77;FSAR=54;FSRF=58;FSRR=59;FWDB=0.00291015;FXX=0.0158724;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.506;QD=9.58816;RBI=0.00933703;REFB=0.00974653;REVB=-0.00887193;RO=117;SAF=77;SAR=54;SRF=58;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0807266;STB=0.544112;TYPE=snp;VARB=-0.00672652;OID=.;OPOS=57257162;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:248:248:117:117:131:131:54:77:58:59:54:77:58:59 chr7 57265510 . AC A 493.98 PASS AO=118;DP=260;FAO=122;FDP=252;FR=.;FRO=130;FSAF=69;FSAR=53;FSRF=84;FSRR=46;FWDB=0.00905147;FXX=0.0232549;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.27;QD=7.84099;RBI=0.00913953;REFB=0.0059142;REVB=-0.00126566;RO=128;SAF=66;SAR=52;SRF=83;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0865021;STB=0.542764;TYPE=del;VARB=-0.00639481;OID=.;OPOS=57265511;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:118:258:122:252:130:69:53:84:46:99:128:66:52:83:45 chr7 57529392 . A C 79.93 PASS AO=12;DP=16;FAO=11;FDP=14;FR=.;FRO=3;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.133706;FXX=0.176367;HRUN=3;LEN=1;MLLD=25.9842;QD=22.8378;RBI=0.134524;REFB=-0.209772;REVB=-0.0148172;RO=2;SAF=5;SAR=7;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149612;STB=0.545372;TYPE=snp;VARB=0.0491377;OID=.;OPOS=57529392;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:16:14:2:3:12:11:7:5:2:0:6:5:2:1 chr7 63225624 . G C 53.8 PASS AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.138398;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.3381;QD=23.9092;RBI=0.168689;REFB=0.0925416;REVB=0.0964478;RO=2;SAF=6;SAR=1;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125389;STB=0.571243;TYPE=snp;VARB=-0.0392248;OID=.;OPOS=63225624;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:2:2:7:7:1:6:2:0:1:6:2:0 chr7 63225803 . T A 209.88 PASS AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0221756;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.424;QD=33.5803;RBI=0.0383374;REFB=-0.0669208;REVB=0.0312731;RO=1;SAF=6;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0250636;STB=0.513502;TYPE=snp;VARB=0.00275948;OID=.;OPOS=63225803;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:25:25:1:1:24:24:18:6:0:1:18:6:0:1 chr7 63225842 . A T 485.59 PASS AO=51;DP=53;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0186565;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.3528;QD=37.3532;RBI=0.0222916;REFB=0;REVB=-0.0122004;RO=0;SAF=11;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000163695;OID=.;OPOS=63225842;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:53:52:0:0:51:52:40:11:0:0:41:11:0:0 chr7 63225873 . C T 92.43 PASS AO=26;DP=66;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=2;FSAR=24;FSRF=9;FSRR=30;FWDB=0.0345714;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.509;QD=5.68804;RBI=0.0347713;REFB=-0.011626;REVB=0.00372294;RO=37;SAF=2;SAR=24;SRF=8;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.328675;STB=0.709471;TYPE=snp;VARB=0.0136176;OID=.;OPOS=63225873;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:66:65:37:39:26:26:24:2:8:29:24:2:9:30 chr7 63529956 . G A 355.61 PASS AO=65;DP=109;FAO=67;FDP=111;FR=.;FRO=44;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=16;FSRR=28;FWDB=-0.0186483;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.926;QD=12.8147;RBI=0.020191;REFB=-0.020135;REVB=0.00774069;RO=43;SAF=33;SAR=32;SRF=15;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116195;STB=0.55117;TYPE=snp;VARB=0.0162024;OID=.;OPOS=63529956;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:111:43:44:65:67:32:33:15:28:34:33:16:28 chr7 63537849 . G A 385.56 PASS AO=87;DP=171;FAO=87;FDP=170;FR=.;FRO=83;FSAF=41;FSAR=46;FSRF=43;FSRR=40;FWDB=0.0130433;FXX=0.00584761;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.966;QD=9.07202;RBI=0.0142752;REFB=0.00448371;REVB=0.00580127;RO=83;SAF=41;SAR=46;SRF=43;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.041645;STB=0.522864;TYPE=snp;VARB=-0.0038389;OID=.;OPOS=63537849;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:170:83:83:87:87:46:41:43:40:46:41:43:40 chr7 63538924 . G A 237.98 PASS AO=50;DP=95;FAO=51;FDP=96;FR=.;FRO=45;FSAF=19;FSAR=32;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=-0.0206893;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.981;QD=9.91599;RBI=0.0224443;REFB=-0.00170544;REVB=-0.0087005;RO=44;SAF=19;SAR=31;SRF=26;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180932;STB=0.59772;TYPE=snp;VARB=0.000881472;OID=.;OPOS=63538924;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:96:44:45:50:51:31:19:26:18:32:19:26:19 chr7 63674464 . T G 334.9 PASS AO=84;DP=177;FAO=84;FDP=177;FR=.;FRO=93;FSAF=44;FSAR=40;FSRF=49;FSRR=44;FWDB=0.0111374;FXX=0.0111726;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.5788;QD=7.56836;RBI=0.038618;REFB=-0.0295206;REVB=0.0369772;RO=91;SAF=46;SAR=38;SRF=48;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0191035;STB=0.501618;TYPE=snp;VARB=0.0274287;OID=.;OPOS=63674464;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:177:91:93:84:84:38:46:48:43:40:44:49:44 chr7 63679733 . A G 324.57 PASS AO=81;DP=197;FAO=90;FDP=204;FR=.;FRO=114;FSAF=55;FSAR=35;FSRF=60;FSRR=54;FWDB=-0.0106637;FXX=0.00970827;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.175;QD=6.36421;RBI=0.0377711;REFB=-0.0175681;REVB=0.0362346;RO=116;SAF=55;SAR=26;SRF=60;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180187;STB=0.548756;TYPE=snp;VARB=0.0223115;OID=.;OPOS=63679733;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:204:116:114:81:90:26:55:60:56:35:55:60:54 chr7 63680098 . C T 119.36 PASS AO=28;DP=61;FAO=28;FDP=60;FR=.;FRO=32;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=0.0319879;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.716;QD=7.95748;RBI=0.050812;REFB=0.00981708;REVB=-0.0394795;RO=32;SAF=20;SAR=8;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249167;STB=0.64092;TYPE=snp;VARB=-0.0118445;OID=.;OPOS=63680098;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:60:32:32:28:28:8:20:15:17:8:20:15:17 chr7 63680099 . C A 120.45 PASS AO=29;DP=60;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.0390017;FXX=0.0166639;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.8098;QD=8.16615;RBI=0.0961976;REFB=-0.0139065;REVB=-0.0879366;RO=31;SAF=21;SAR=8;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212713;STB=0.614887;TYPE=snp;VARB=0.00492135;OID=.;OPOS=63680099;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:59:31:31:29:28:8:21:16:15:8:20:16:15 chr7 63726993 . G A 20.71 PASS AO=5;DP=23;FAO=7;FDP=25;FR=.;FRO=18;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0223531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.457;QD=3.31411;RBI=0.0415823;REFB=-0.0315866;REVB=0.0350632;RO=18;SAF=0;SAR=5;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.679095;STB=0.624625;TYPE=snp;VARB=0.0967676;OID=.;OPOS=63726993;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:23:25:18:18:5:7:5:0:8:10:5:2:8:10 chr7 63981563 . A G 103.49 PASS AO=29;DP=72;FAO=29;FDP=72;FR=.;FRO=43;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=30;FSRR=13;FWDB=0.00685475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8792;QD=5.74963;RBI=0.0144521;REFB=-0.0117099;REVB=-0.012723;RO=42;SAF=21;SAR=8;SRF=30;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0127135;STB=0.519421;TYPE=snp;VARB=0.018418;OID=.;OPOS=63981563;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:42:43:29:29:8:21:30:12:8:21:30:13 chr7 63986829 . G C 118.21 PASS AO=32;DP=76;FAO=32;FDP=76;FR=.;FRO=44;FSAF=6;FSAR=26;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=0.0129068;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=259.186;QD=6.22139;RBI=0.0175967;REFB=-0.0104022;REVB=0.0119608;RO=44;SAF=6;SAR=26;SRF=18;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.289973;STB=0.66655;TYPE=snp;VARB=0.0118631;OID=.;OPOS=63986829;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:44:44:32:32:26:6:18:26:26:6:18:26 chr7 64152353 . A G 179.33 PASS AO=30;DP=45;FAO=30;FDP=45;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.021214;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=242.555;QD=15.9402;RBI=0.0409495;REFB=-0.0181023;REVB=0.0350262;RO=15;SAF=11;SAR=19;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0220082;STB=0.512031;TYPE=snp;VARB=0.00905836;OID=.;OPOS=64152353;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:45:45:15:15:30:30:19:11:5:10:19:11:5:10 chr7 64168806 . T C 47.91 PASS AO=15;DP=44;FAO=15;FDP=44;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=0.0184882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.468;QD=4.35517;RBI=0.0185382;REFB=-0.00284083;REVB=0.00136084;RO=29;SAF=8;SAR=7;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138278;STB=0.581434;TYPE=snp;VARB=0.00559181;OID=.;OPOS=64168806;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:44:44:29:29:15:15:7:8:19:10:7:8:19:10 chr7 64169019 . G A 476 PASS AO=50;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0805857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.157;QD=37.3332;RBI=0.0977067;REFB=0;REVB=0.0552498;RO=0;SAF=12;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000581173;OID=.;OPOS=64169019;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:50:51:0:0:50:51:38:12:0:0:39:12:0:0 chr7 64254901 . T C 115.58 PASS AO=23;DP=43;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=19;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0496521;FXX=0.0232504;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.046;QD=11.0078;RBI=0.050682;REFB=-0.00406356;REVB=0.0101652;RO=17;SAF=19;SAR=4;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.346821;STB=0.72497;TYPE=snp;VARB=0.00541751;OID=.;OPOS=64254901;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:43:42:17:19:23:23:4:19:8:9:4:19:8:11 chr7 64291333 . T A 1555.72 PASS AO=163;DP=163;FAO=163;FDP=163;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=112;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0293016;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=255.018;QD=38.1772;RBI=0.0294598;REFB=0;REVB=0.00304949;RO=0;SAF=51;SAR=112;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.6491e-05;OID=.;OPOS=64291333;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:163:163:0:0:163:163:112:51:0:0:112:51:0:0 chr7 64291976 . G A 182.5 PASS AO=44;DP=85;FAO=42;FDP=85;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=31;FSRR=12;FWDB=0.0623487;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.6866;QD=8.58802;RBI=0.0659389;REFB=-0.00582494;REVB=-0.0214611;RO=41;SAF=18;SAR=26;SRF=29;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.255902;STB=0.667682;TYPE=snp;VARB=0.00716127;OID=.;OPOS=64291976;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:41:43:44:42:26:18:29:12:26:16:31:12 chr7 64291991 . T A 760.4 PASS AO=82;DP=83;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00742778;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=257.24;QD=36.6456;RBI=0.0177789;REFB=0.0387575;REVB=0.016153;RO=1;SAF=42;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111424;STB=0.505881;TYPE=snp;VARB=-0.000294491;OID=.;OPOS=64291991;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:83:83:1:1:82:82:40:42:1:0:40:42:1:0 chr7 64389089 . A C 448.82 PASS AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00616941;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0908;QD=36.6382;RBI=0.0204238;REFB=-0.118211;REVB=0.0194697;RO=1;SAF=14;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136387;STB=0.507243;TYPE=snp;VARB=0.00404843;OID=.;OPOS=64389089;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:49:49:1:1:48:48:34:14:0:1:34:14:0:1 chr7 64438667 . G A 376.49 PASS AO=42;DP=44;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00141494;FXX=0.0227221;HRUN=2;LEN=1;MLLD=257.046;QD=35.022;RBI=0.0136784;REFB=-0.20335;REVB=0.013605;RO=1;SAF=24;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0253627;STB=0.513507;TYPE=snp;VARB=0.000900955;OID=.;OPOS=64438667;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:44:43:1:1:42:42:18:24:0:1:18:24:0:1 chr7 64451699 . T C 2507.55 PASS AO=270;DP=275;FAO=271;FDP=271;FR=.;FRO=0;FSAF=150;FSAR=121;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0302478;FXX=0.0145449;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.42;QD=37.0118;RBI=0.0321428;REFB=0.0115793;REVB=0.0108733;RO=5;SAF=150;SAR=120;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0194469;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000291832;OID=.;OPOS=64451699;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:275:271:5:0:270:271:120:150:0:5:121:150:0:0 chr7 64451963 . T C 1875.65 PASS AO=197;DP=198;FAO=197;FDP=197;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161727;FXX=0.00505025;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.3002;QD=38.0842;RBI=0.0192149;REFB=-0.015652;REVB=0.0103758;RO=1;SAF=90;SAR=107;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00526245;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.82887e-05;OID=.;OPOS=64451963;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:198:197:1:0:197:197:107:90:1:0:107:90:0:0 chr7 64452830 . C T 2921.58 PASS AO=304;DP=307;FAO=304;FDP=304;FR=.;FRO=0;FSAF=122;FSAR=182;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0267815;FXX=0.00977167;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.5145;QD=38.4419;RBI=0.030257;REFB=0;REVB=-0.0140796;RO=0;SAF=122;SAR=182;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.62977e-05;OID=.;OPOS=64452830;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:307:304:0:0:304:304:182:122:0:0:182:122:0:0 chr7 64453136 . G A 1133.3 PASS AO=118;DP=118;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00438095;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.418;QD=38.4168;RBI=0.0318388;REFB=0;REVB=0.031536;RO=0;SAF=54;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.75792e-05;OID=.;OPOS=64453136;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:118:118:0:0:118:118:64:54:0:0:64:54:0:0 chr7 64453615 . T C 580.76 PASS AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00573073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.489;QD=38.7172;RBI=0.0191909;REFB=0;REVB=0.0183153;RO=0;SAF=46;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.09256e-05;OID=.;OPOS=64453615;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:60:60:0:0:60:60:14:46:0:0:14:46:0:0 chr7 64453634 . G A 618.76 PASS AO=71;DP=75;FAO=71;FDP=75;FR=.;FRO=4;FSAF=47;FSAR=24;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0191543;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=259.035;QD=33.0004;RBI=0.0532848;REFB=-0.0369909;REVB=0.0497231;RO=0;SAF=47;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.520402;TYPE=snp;VARB=0.000286668;OID=.;OPOS=64453634;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:75:75:0:4:71:71:24:47:0:0:24:47:4:0 chr7 64865881 . G C 1607.36 PASS AO=170;DP=171;FAO=170;FDP=170;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0348987;FXX=0.00584761;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.296;QD=37.8202;RBI=0.0351856;REFB=-0.0436768;REVB=0.00448357;RO=1;SAF=66;SAR=104;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00455478;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000338634;OID=.;OPOS=64865881;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:171:170:1:0:170:170:104:66:0:1:104:66:0:0 chr7 65159983 . A G 59.86 PASS AO=27;DP=108;FAO=28;FDP=101;FR=.;FRO=73;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=31;FSRR=42;FWDB=0.0104154;FXX=0.0733878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.318;QD=2.37059;RBI=0.01076;REFB=0.000202175;REVB=0.00270124;RO=66;SAF=10;SAR=17;SRF=30;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10419;STB=0.551532;TYPE=snp;VARB=-0.00135769;OID=.;OPOS=65159983;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:108:101:66:73:27:28:17:10:30:36:18:10:31:42 chr7 65279676 . A T 254.55 PASS AO=105;DP=324;FAO=105;FDP=322;FR=.;FRO=217;FSAF=51;FSAR=54;FSRF=91;FSRR=126;FWDB=-0.00421055;FXX=0.00617265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.762;QD=3.1621;RBI=0.0686093;REFB=-0.0285434;REVB=-0.0684799;RO=217;SAF=51;SAR=54;SRF=91;SRR=126;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0783334;STB=0.544863;TYPE=snp;VARB=0.04898;OID=.;OPOS=65279676;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:324:322:217:217:105:105:54:51:91:126:54:51:91:126 chr7 65279757 . A T 51.02 PASS AO=34;DP=200;FAO=47;FDP=216;FR=.;FRO=169;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=66;FSRR=103;FWDB=0.00620034;FXX=0.0399982;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.769;QD=0.944821;RBI=0.0283106;REFB=-0.00445293;REVB=0.0276233;RO=151;SAF=14;SAR=20;SRF=59;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0280986;STB=0.528229;TYPE=snp;VARB=0.0330388;OID=.;OPOS=65279757;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:200:216:151:169:34:47:20:14:59:92:27:20:66:103 chr7 65425894 . A G 390.11 PASS AO=84;DP=163;FAO=87;FDP=166;FR=.;FRO=79;FSAF=24;FSAR=63;FSRF=36;FSRR=43;FWDB=-0.00915672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0501;QD=9.40022;RBI=0.00985935;REFB=-0.00789672;REVB=0.0036553;RO=74;SAF=23;SAR=61;SRF=35;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192677;STB=0.597699;TYPE=snp;VARB=0.00985877;OID=.;OPOS=65425894;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:166:74:79:84:87:61:23:35:39:63:24:36:43 chr7 65445385 . G A 80.87 PASS AO=24;DP=63;FAO=24;FDP=63;FR=.;FRO=39;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=30;FWDB=0.01966;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.7349;QD=5.13446;RBI=0.0312498;REFB=-0.0147867;REVB=0.0242906;RO=38;SAF=10;SAR=14;SRF=9;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207219;STB=0.623137;TYPE=snp;VARB=0.0255078;OID=.;OPOS=65445385;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:63:63:38:39:24:24:14:10:9:29:14:10:9:30 chr7 65842543 . C CAT 48.98 PASS AO=13;DP=41;FAO=14;FDP=39;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.00898194;FXX=0.0487686;HRUN=0;LEN=2;MLLD=188.558;QD=5.02339;RBI=0.0360401;REFB=0.0131617;REVB=0.0349029;RO=25;SAF=9;SAR=4;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157691;STB=0.555903;TYPE=ins;VARB=-0.0298285;OID=.;OPOS=65842544;OREF=-;OALT=AT;OMAPALT=CAT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:13:41:14:39:25:9:5:14:11:48:25:9:4:14:11 chr7 65842545 . T C 59.79 PASS AO=16;DP=41;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.00010638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8696;QD=5.83285;RBI=0.00731927;REFB=-0.0360155;REVB=-0.0073185;RO=25;SAF=11;SAR=5;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144556;STB=0.584608;TYPE=snp;VARB=0.0691785;OID=.;OPOS=65842545;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:41:41:25:25:16:16:5:11:14:11:5:11:14:11 chr7 65860213 . T TAGAG 171.72 PASS AO=39;DP=79;FAO=39;FDP=79;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=-0.00627119;FXX=0;HRUN=1;LEN=4;MLLD=300.325;QD=8.69474;RBI=0.00849509;REFB=-0.00410853;REVB=-0.00573051;RO=40;SAF=16;SAR=23;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127972;STB=0.571205;TYPE=ins;VARB=0.00528294;OID=.;OPOS=65860214;OREF=-;OALT=AGAG;OMAPALT=TAGAG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:39:79:39:79:40:16:23:22:18:99:40:16:23:22:18 chr7 65860264 . CCATAT C 73.29 PASS AO=31;DP=81;FAO=28;FDP=63;FR=.;FRO=35;FSAF=4;FSAR=24;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.0189409;FXX=0.159979;HRUN=2;LEN=5;MLLD=247.216;QD=4.6531;RBI=0.0190387;REFB=-0.0152053;REVB=0.00192772;RO=35;SAF=8;SAR=23;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187434;STB=0.735998;TYPE=del;VARB=0.0216565;OID=.;OPOS=65860265;OREF=CATAT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:31:70:28:63:35:4:24:16:19:73:35:8:23:15:20 chr7 66015630 . C G 92.9 PASS AO=19;DP=36;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=16;FSAR=3;FSRF=16;FSRR=1;FWDB=0.0188289;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=144.801;QD=10.3227;RBI=0.0209736;REFB=-0.0158914;REVB=-0.00923924;RO=16;SAF=16;SAR=3;SRF=15;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16682;STB=0.599911;TYPE=snp;VARB=0.0116997;OID=.;OPOS=66015630;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:36:36:16:17:19:19:3:16:15:1:3:16:16:1 chr7 66105163 . C G 353.65 PASS AO=90;DP=209;FAO=96;FDP=218;FR=.;FRO=122;FSAF=24;FSAR=72;FSRF=31;FSRR=91;FWDB=-0.0143282;FXX=0.0090905;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.44;QD=6.48905;RBI=0.0236327;REFB=-0.00642399;REVB=-0.0187939;RO=118;SAF=19;SAR=71;SRF=29;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0510637;STB=0.503048;TYPE=snp;VARB=0.00601424;OID=.;OPOS=66105163;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:218:118:122:90:96:71:19:29:89:72:24:31:91 chr7 66147057 . T C 459.47 PASS AO=47;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0262295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.527;QD=38.2889;RBI=0.0354207;REFB=0;REVB=0.0238042;RO=0;SAF=16;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000190016;OID=.;OPOS=66147057;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:47:48:0:0:47:48:31:16:0:0:32:16:0:0 chr7 66147101 . G A 119.02 PASS AO=17;DP=22;FAO=17;FDP=22;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0161626;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=248.001;QD=21.6393;RBI=0.023605;REFB=-0.0499214;REVB=-0.0172037;RO=5;SAF=4;SAR=13;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0204601;STB=0.511265;TYPE=snp;VARB=0.0100539;OID=.;OPOS=66147101;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:22:22:5:5:17:17:13:4:1:4:13:4:1:4 chr7 66147110 . C A 62 PASS AO=8;DP=12;FAO=10;FDP=14;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0414967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.216;QD=17.715;RBI=0.0446774;REFB=-0.0366185;REVB=-0.0165558;RO=4;SAF=3;SAR=5;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0788369;STB=0.517207;TYPE=snp;VARB=0.0464759;OID=.;OPOS=66147110;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:12:14:4:4:8:10:5:3:1:3:7:3:1:3 chr7 66147149 . A G 33.04 PASS AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0175003;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=271.554;QD=18.8792;RBI=0.0706261;REFB=-0.00946425;REVB=0.0684236;RO=0;SAF=2;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.666029;TYPE=snp;VARB=0.00337969;OID=.;OPOS=66147149;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:5:7:0:2:5:5:3:2:0:0:3:2:2:0 chr7 66147656 . G C 41 PASS AO=11;DP=30;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0127675;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=210.508;QD=5.46706;RBI=0.0160826;REFB=-0.00228613;REVB=0.00977961;RO=19;SAF=6;SAR=5;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0760866;STB=0.545372;TYPE=snp;VARB=0.00486768;OID=.;OPOS=66147656;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:30:30:19:19:11:11:5:6:9:10:5:6:9:10 chr7 66147746 . C G 41.69 PASS AO=12;DP=34;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=16;FWDB=-0.00128045;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=40.2946;QD=4.90488;RBI=0.023255;REFB=0.0369184;REVB=0.0232197;RO=22;SAF=6;SAR=6;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249809;STB=0.646835;TYPE=snp;VARB=-0.0685227;OID=.;OPOS=66147746;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:34:34:22:22:12:12:6:6:6:16:6:6:6:16 chr7 66463938 . G A 142.13 PASS AO=45;DP=121;FAO=46;FDP=123;FR=.;FRO=77;FSAF=10;FSAR=36;FSRF=12;FSRR=65;FWDB=0.0197237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.7219;QD=4.62218;RBI=0.0418177;REFB=-0.0253186;REVB=-0.036874;RO=74;SAF=9;SAR=36;SRF=10;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121163;STB=0.560464;TYPE=snp;VARB=0.0327569;OID=.;OPOS=66463938;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:123:74:77:45:46:36:9:10:64:36:10:12:65 chr7 66648157 . C T 479.31 PASS AO=121;DP=260;FAO=121;FDP=258;FR=.;FRO=137;FSAF=61;FSAR=60;FSRF=54;FSRR=83;FWDB=0.0349417;FXX=0.00769201;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.6327;QD=7.43117;RBI=0.0349435;REFB=-0.00361948;REVB=-0.000354315;RO=135;SAF=61;SAR=60;SRF=53;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106691;STB=0.558334;TYPE=snp;VARB=0.00431755;OID=.;OPOS=66648157;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:260:258:135:137:121:121:60:61:53:82:60:61:54:83 chr7 66648199 . G A 278.33 PASS AO=80;DP=196;FAO=81;FDP=196;FR=.;FRO=115;FSAF=34;FSAR=47;FSRF=35;FSRR=80;FWDB=0.136472;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=38.4463;QD=5.68023;RBI=0.197599;REFB=-0.0381099;REVB=0.142901;RO=110;SAF=34;SAR=46;SRF=32;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146284;STB=0.571072;TYPE=snp;VARB=0.0505405;OID=.;OPOS=66648199;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:196:110:115:80:81:46:34:32:78:47:34:35:80 chr7 66703328 . G A 946.26 PASS AO=196;DP=351;FAO=198;FDP=353;FR=.;FRO=155;FSAF=129;FSAR=69;FSRF=89;FSRR=66;FWDB=-0.0189684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.2732;QD=10.7225;RBI=0.0376962;REFB=-0.0202439;REVB=0.0325761;RO=155;SAF=129;SAR=67;SRF=89;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0738678;STB=0.536552;TYPE=snp;VARB=0.0149006;OID=.;OPOS=66703328;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:351:353:155:155:196:198:67:129:89:66:69:129:89:66 chr7 66774604 . G C 177.29 PASS AO=47;DP=113;FAO=49;FDP=115;FR=.;FRO=66;FSAF=46;FSAR=3;FSRF=50;FSRR=16;FWDB=-0.00848101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.797;QD=6.16674;RBI=0.0141519;REFB=-0.0168167;REVB=-0.0113292;RO=64;SAF=44;SAR=3;SRF=49;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.411154;STB=0.752014;TYPE=snp;VARB=0.0219314;OID=.;OPOS=66774604;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:115:64:66:47:49:3:44:49:15:3:46:50:16 chr7 66785137 . C A 36.35 PASS AO=13;DP=48;FAO=14;FDP=49;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=-0.00365898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.638;QD=2.96701;RBI=0.0164033;REFB=-0.00906635;REVB=-0.01599;RO=34;SAF=10;SAR=3;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212776;STB=0.591967;TYPE=snp;VARB=0.0211062;OID=.;OPOS=66785137;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:48:49:34:35:13:14:3:10:21:13:4:10:21:14 chr7 66785634 . T A 603.72 PASS AO=67;DP=68;FAO=66;FDP=68;FR=.;FRO=2;FSAF=12;FSAR=54;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0456528;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.8715;QD=35.5129;RBI=0.0523228;REFB=-0.0239018;REVB=-0.0255637;RO=0;SAF=13;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.515414;TYPE=snp;VARB=0.00100582;OID=.;OPOS=66785634;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:68:68:0:2:67:66:54:13:0:0:54:12:1:1 chr7 68527448 . C G 169.1 PASS AO=61;DP=177;FAO=61;FDP=175;FR=.;FRO=114;FSAF=23;FSAR=38;FSRF=56;FSRR=58;FWDB=0.00328937;FXX=0.0112988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.144;QD=3.86505;RBI=0.0164777;REFB=-0.00479059;REVB=-0.016146;RO=111;SAF=23;SAR=38;SRF=53;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116665;STB=0.576174;TYPE=snp;VARB=0.00798887;OID=.;OPOS=68527448;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:175:111:114:61:61:38:23:53:58:38:23:56:58 chr7 68527587 . A G 31.58 PASS AO=15;DP=57;FAO=15;FDP=60;FR=.;FRO=45;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=-0.0537409;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=138.184;QD=2.10528;RBI=0.0619082;REFB=-0.00475196;REVB=-0.0307334;RO=42;SAF=3;SAR=12;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.320019;STB=0.726942;TYPE=snp;VARB=0.0384446;OID=.;OPOS=68527587;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:57:60:42:45:15:15:12:3:18:24:12:3:21:24 chr7 68796377 . G A 211.41 PASS AO=51;DP=107;FAO=51;FDP=107;FR=.;FRO=56;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=34;FSRR=22;FWDB=0.00762941;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=217.87;QD=7.90308;RBI=0.00830061;REFB=-0.00941783;REVB=-0.00326989;RO=56;SAF=26;SAR=25;SRF=34;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0920165;STB=0.551046;TYPE=snp;VARB=0.0103221;OID=.;OPOS=68796377;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:56:56:51:51:25:26:34:22:25:26:34:22 chr7 70228179 . C T 56.27 PASS AO=7;DP=8;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.462;QD=28.1364;RBI=0.151575;REFB=-0.0435689;REVB=0.151575;RO=1;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00463841;OID=.;OPOS=70228179;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:8:8:1:1:7:7:7:0:0:1:7:0:0:1 chr7 70231263 . G A 233.89 PASS AO=39;DP=59;FAO=39;FDP=59;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=31;FSRF=3;FSRR=17;FWDB=0.0215489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.702;QD=15.8571;RBI=0.025262;REFB=-0.0127365;REVB=-0.0131839;RO=20;SAF=8;SAR=31;SRF=3;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0546135;STB=0.52964;TYPE=snp;VARB=0.00881046;OID=.;OPOS=70231263;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:59:59:20:20:39:39:31:8:3:17:31:8:3:17 chr7 70257628 . TA T 365.09 PASS AO=64;DP=101;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.015293;FXX=0.049995;HRUN=8;LEN=1;MLLD=7.68185;QD=15.3723;RBI=0.186632;REFB=0.0200783;REVB=0.186004;RO=23;SAF=36;SAR=28;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0632879;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.020138;OID=.;OPOS=70257629;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:64:98:95:95:0:52:43:0:0:27:23:36:28:10:13 chr7 70885993 . C T 276.85 PASS AO=61;DP=120;FAO=62;FDP=121;FR=.;FRO=59;FSAF=27;FSAR=35;FSRF=23;FSRR=36;FWDB=0.0233053;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.519;QD=9.15203;RBI=0.0331957;REFB=-0.0147489;REVB=-0.0236394;RO=59;SAF=27;SAR=34;SRF=23;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0480322;STB=0.522763;TYPE=snp;VARB=0.0105798;OID=.;OPOS=70885993;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:121:59:59:61:62:34:27:23:36:35:27:23:36 chr7 71134983 . C A 177.29 PASS AO=51;DP=126;FAO=51;FDP=124;FR=.;FRO=73;FSAF=34;FSAR=17;FSRF=30;FSRR=43;FWDB=-0.0151422;FXX=0.0312476;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.6867;QD=5.71889;RBI=0.0198132;REFB=0.00614326;REVB=0.0127781;RO=73;SAF=34;SAR=17;SRF=30;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.269877;STB=0.652114;TYPE=snp;VARB=-0.00942435;OID=.;OPOS=71134983;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:124:73:73:51:51:17:34:30:43:17:34:30:43 chr7 71150706 . A T 701.77 PASS AO=79;DP=82;FAO=79;FDP=82;FR=.;FRO=3;FSAF=26;FSAR=53;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0384382;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.046;QD=34.2327;RBI=0.0403473;REFB=-0.0985944;REVB=0.0122639;RO=2;SAF=26;SAR=53;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0175289;STB=0.500175;TYPE=snp;VARB=0.0019421;OID=.;OPOS=71150706;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:82:82:2:3:79:79:53:26:0:2:53:26:1:2 chr7 71248676 . C T 174.66 PASS AO=47;DP=109;FAO=47;FDP=109;FR=.;FRO=62;FSAF=33;FSAR=14;FSRF=50;FSRR=12;FWDB=-0.0305804;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.8952;QD=6.40941;RBI=0.0719023;REFB=0.0115229;REVB=-0.0650752;RO=62;SAF=33;SAR=14;SRF=50;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135209;STB=0.575218;TYPE=snp;VARB=-0.0195111;OID=.;OPOS=71248676;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:62:62:47:47:14:33:50:12:14:33:50:12 chr7 72093957 . A G 87.42 PASS AO=44;DP=160;FAO=44;FDP=160;FR=.;FRO=116;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=60;FSRR=56;FWDB=-0.0192045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.7699;QD=2.18541;RBI=0.0240699;REFB=-0.00967909;REVB=-0.0145102;RO=116;SAF=16;SAR=28;SRF=60;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190403;STB=0.612851;TYPE=snp;VARB=0.0246735;OID=.;OPOS=72093957;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:160:160:116:116:44:44:28:16:60:56:28:16:60:56 chr7 72193864 . T C 500.6 PASS AO=109;DP=211;FAO=112;FDP=214;FR=.;FRO=102;FSAF=66;FSAR=46;FSRF=60;FSRR=42;FWDB=-0.000625349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.8;QD=9.35704;RBI=0.00314574;REFB=-0.0190143;REVB=-0.00308296;RO=102;SAF=63;SAR=46;SRF=60;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0092909;STB=0.500517;TYPE=snp;VARB=0.0200527;OID=.;OPOS=72193864;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:214:102:102:109:112:46:63:60:42:46:66:60:42 chr7 72193868 . G A 515.53 PASS AO=113;DP=213;FAO=113;FDP=213;FR=.;FRO=100;FSAF=63;FSAR=50;FSRF=59;FSRR=41;FWDB=0.0112137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.913;QD=9.68129;RBI=0.0146254;REFB=-0.0230088;REVB=0.0093892;RO=96;SAF=63;SAR=50;SRF=58;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0400143;STB=0.515505;TYPE=snp;VARB=0.0152856;OID=.;OPOS=72193868;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:213:213:96:100:113:113:50:63:58:38:50:63:59:41 chr7 72209527 . CA C 262.82 PASS AO=108;DP=252;FAO=111;FDP=246;FR=.;FRO=135;FSAF=49;FSAR=62;FSRF=32;FSRR=103;FWDB=0.0153814;FXX=0.0159994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=27.7307;QD=4.27351;RBI=0.0172789;REFB=0.0111455;REVB=-0.00787234;RO=134;SAF=46;SAR=62;SRF=31;SRR=103;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206981;STB=0.616827;TYPE=del;VARB=-0.0129453;OID=.;OPOS=72209528;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:108:250:111:246:135:49:62:32:103:99:134:46:62:31:103 chr7 72297549 . G A 346.46 PASS AO=103;DP=252;FAO=103;FDP=251;FR=.;FRO=148;FSAF=51;FSAR=52;FSRF=68;FSRR=80;FWDB=-0.044302;FXX=0.0039681;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.653;QD=5.5212;RBI=0.0447768;REFB=-0.0035366;REVB=-0.00650325;RO=145;SAF=51;SAR=52;SRF=66;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.041866;STB=0.521049;TYPE=snp;VARB=0.00573695;OID=.;OPOS=72297549;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:252:251:145:148:103:103:52:51:66:79:52:51:68:80 chr7 72409197 . G A 313.88 PASS AO=80;DP=174;FAO=80;FDP=173;FR=.;FRO=93;FSAF=17;FSAR=63;FSRF=17;FSRR=76;FWDB=0.00343558;FXX=0.0057468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.781;QD=7.25731;RBI=0.00611323;REFB=0.0200005;REVB=0.00505652;RO=93;SAF=17;SAR=63;SRF=17;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0443836;STB=0.524522;TYPE=snp;VARB=-0.0215132;OID=.;OPOS=72409197;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:173:93:93:80:80:63:17:17:76:63:17:17:76 chr7 72717933 . C T 48.23 PASS AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.0165668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.288;QD=7.71698;RBI=0.0345786;REFB=-0.0231973;REVB=-0.0303516;RO=14;SAF=10;SAR=1;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.425352;STB=0.758894;TYPE=snp;VARB=0.0364678;OID=.;OPOS=72717933;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:25:25:14:14:11:11:1:10:9:5:1:10:9:5 chr7 72738749 . A G 159.83 PASS AO=14;DP=15;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.153067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.429;QD=37.6071;RBI=0.154197;REFB=0;REVB=-0.018626;RO=0;SAF=7;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00181669;OID=.;OPOS=72738749;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:15:17:0:0:14:17:7:7:0:0:7:10:0:0 chr7 72738762 . C T 97.76 PASS AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0575181;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.338;QD=30.0813;RBI=0.0588207;REFB=-0.0434191;REVB=-0.0123103;RO=1;SAF=6;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.069361;STB=0.538398;TYPE=snp;VARB=0.00362912;OID=.;OPOS=72738762;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:13:13:1:1:12:12:6:6:1:0:6:6:1:0 chr7 72738763 . A G 116.4 PASS AO=12;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.116323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.1335;QD=35.814;RBI=0.122451;REFB=0;REVB=-0.0382532;RO=0;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00226971;OID=.;OPOS=72738763;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:13:0:0:12:13:6:6:0:0:6:7:0:0 chr7 72891754 . C T 167.48 PASS AO=49;DP=122;FAO=49;FDP=122;FR=.;FRO=73;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=40;FSRR=33;FWDB=0.0225985;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.289;QD=5.49103;RBI=0.0226192;REFB=0.00544077;REVB=0.000967972;RO=72;SAF=26;SAR=23;SRF=39;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0117086;STB=0.510419;TYPE=snp;VARB=-0.00770574;OID=.;OPOS=72891754;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:72:73:49:49:23:26:39:33:23:26:40:33 chr7 73020301 . T C 726.58 PASS AO=80;DP=82;FAO=80;FDP=82;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=54;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0178605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.449;QD=35.443;RBI=0.0256581;REFB=0.0200527;REVB=-0.0184213;RO=2;SAF=26;SAR=54;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00917347;STB=0.504846;TYPE=snp;VARB=-9.44955e-05;OID=.;OPOS=73020301;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:82:82:2:2:80:80:54:26:1:1:54:26:1:1 chr7 73096993 . T C 31.63 PASS AO=7;DP=17;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=0;FWDB=-0.0595736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.66;QD=7.44144;RBI=0.0619709;REFB=-0.0167019;REVB=0.0170696;RO=10;SAF=5;SAR=2;SRF=10;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.440886;STB=0.749554;TYPE=snp;VARB=0.0188373;OID=.;OPOS=73096993;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:17:17:10:10:7:7:2:5:10:0:2:5:10:0 chr7 73097654 . C T 334.66 PASS AO=91;DP=207;FAO=91;FDP=207;FR=.;FRO=116;FSAF=39;FSAR=52;FSRF=51;FSRR=65;FWDB=0.0146738;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.2148;QD=6.46682;RBI=0.0331815;REFB=0.021303;REVB=0.0297606;RO=116;SAF=39;SAR=52;SRF=51;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0113773;STB=0.506328;TYPE=snp;VARB=-0.0264617;OID=.;OPOS=73097654;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:207:116:116:91:91:52:39:51:65:52:39:51:65 chr7 73108310 . T C 125.42 PASS AO=26;DP=50;FAO=26;FDP=50;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0589093;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=66.5865;QD=10.0338;RBI=0.059992;REFB=-0.0171277;REVB=0.0113461;RO=24;SAF=8;SAR=18;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104497;STB=0.558574;TYPE=snp;VARB=0.00717823;OID=.;OPOS=73108310;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:24:24:26:26:18:8:10:14:18:8:10:14 chr7 73122923 . A G 179.3 PASS AO=38;DP=72;FAO=38;FDP=72;FR=.;FRO=34;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.0201469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.346;QD=9.96122;RBI=0.0359325;REFB=-0.00968346;REVB=-0.0297531;RO=34;SAF=24;SAR=14;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0909868;STB=0.550432;TYPE=snp;VARB=0.00722217;OID=.;OPOS=73122923;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:34:34:38:38:14:24:18:16:14:24:18:16 chr7 73147068 . G A 167.41 PASS AO=37;DP=71;FAO=36;FDP=70;FR=.;FRO=34;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=-0.0152442;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.11;QD=9.56647;RBI=0.0250701;REFB=0.00984232;REVB=-0.0199028;RO=33;SAF=20;SAR=17;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124297;STB=0.569582;TYPE=snp;VARB=-0.0123198;OID=.;OPOS=73147068;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:70:33:34:37:36:17:20:13:20:16:20:14:20 chr7 73151644 . A G 150.67 PASS AO=34;DP=68;FAO=34;FDP=69;FR=.;FRO=35;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.0642907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.526;QD=8.73453;RBI=0.0698524;REFB=-0.0231207;REVB=-0.0273142;RO=34;SAF=19;SAR=15;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131544;STB=0.565919;TYPE=snp;VARB=0.0297634;OID=.;OPOS=73151644;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:69:34:35:34:34:15:19:14:20:15:19:15:20 chr7 73246461 . A G 288.99 PASS AO=58;DP=129;FAO=72;FDP=145;FR=.;FRO=73;FSAF=32;FSAR=40;FSRF=56;FSRR=17;FWDB=0.0113296;FXX=0.00684885;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.478;QD=7.97217;RBI=0.039968;REFB=-0.0409651;REVB=0.0383286;RO=70;SAF=22;SAR=36;SRF=55;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.383632;STB=0.658642;TYPE=snp;VARB=0.0396899;OID=.;OPOS=73246461;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:145:70:73:58:72:36:22:55:15:40:32:56:17 chr7 73246496 . C T 476.6 PASS AO=99;DP=179;FAO=99;FDP=179;FR=.;FRO=80;FSAF=35;FSAR=64;FSRF=60;FSRR=20;FWDB=0.0544587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.344;QD=10.6504;RBI=0.0624503;REFB=-0.00726686;REVB=0.0305662;RO=80;SAF=35;SAR=64;SRF=60;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.319808;STB=0.674023;TYPE=snp;VARB=0.00292808;OID=.;OPOS=73246496;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:179:80:80:99:99:64:35:60:20:64:35:60:20 chr7 73246555 . C G 560.68 PASS AO=106;DP=172;FAO=106;FDP=175;FR=.;FRO=69;FSAF=31;FSAR=75;FSRF=56;FSRR=13;FWDB=-0.0157338;FXX=0.0056815;HRUN=2;LEN=1;MLLD=258.938;QD=12.8156;RBI=0.0180149;REFB=-0.0268499;REVB=0.00877408;RO=65;SAF=31;SAR=75;SRF=52;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.361005;STB=0.705138;TYPE=snp;VARB=0.0224789;OID=.;OPOS=73246555;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:175:65:69:106:106:75:31:52:13:75:31:56:13 chr7 73249165 . T A 98.35 PASS AO=26;DP=62;FAO=26;FDP=62;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=-0.0602264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.3705;QD=6.34484;RBI=0.061783;REFB=-0.0188537;REVB=0.0137814;RO=36;SAF=15;SAR=11;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00670139;STB=0.503814;TYPE=snp;VARB=0.0207133;OID=.;OPOS=73249165;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:62:62:36:36:26:26:11:15:21:15:11:15:21:15 chr7 73249299 . G C 28.16 PASS AO=9;DP=30;FAO=9;FDP=30;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=-0.000457542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.205;QD=3.75463;RBI=0.0164556;REFB=-0.00621767;REVB=-0.0164492;RO=21;SAF=4;SAR=5;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189188;STB=0.615148;TYPE=snp;VARB=0.00996757;OID=.;OPOS=73249299;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:30:30:21:21:9:9:5:4:6:15:5:4:6:15 chr7 73254812 . T C 22.3 PASS AO=4;DP=9;FAO=4;FDP=9;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0515815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.825;QD=9.91263;RBI=0.0552997;REFB=0.0220891;REVB=-0.0199351;RO=5;SAF=1;SAR=3;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0609289;STB=0.538276;TYPE=snp;VARB=-0.00457469;OID=.;OPOS=73254812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:9:9:5:5:4:4:3:1:1:4:3:1:1:4 chr7 73275565 . T A 43.05 PASS AO=6;DP=11;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.00312845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.774;QD=14.3491;RBI=0.0113089;REFB=-0.0268664;REVB=-0.0108675;RO=5;SAF=4;SAR=2;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0553146;STB=0.55539;TYPE=snp;VARB=0.0284559;OID=.;OPOS=73275565;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:11:12:5:5:6:7:2:4:3:2:2:5:3:2 chr7 73279361 . C T 399.96 PASS AO=44;DP=44;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0854141;FXX=0.0227221;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.3322;QD=37.2057;RBI=0.095267;REFB=0;REVB=0.0421927;RO=0;SAF=20;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30465e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00774098;OID=.;OPOS=73279361;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:44:43:0:0:44:43:24:20:0:0:24:19:0:0 chr7 73470714 . G A 140.45 PASS AO=37;DP=85;FAO=37;FDP=85;FR=.;FRO=48;FSAF=6;FSAR=31;FSRF=11;FSRR=37;FWDB=0.00947407;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.367;QD=6.60961;RBI=0.0106891;REFB=0.000283661;REVB=0.0049496;RO=48;SAF=6;SAR=31;SRF=11;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112042;STB=0.563599;TYPE=snp;VARB=-0.000323898;OID=.;OPOS=73470714;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:48:48:37:37:31:6:11:37:31:6:11:37 chr7 73483689 . G C 193.51 PASS AO=49;DP=106;FAO=50;FDP=111;FR=.;FRO=61;FSAF=11;FSAR=39;FSRF=26;FSRR=35;FWDB=-0.116484;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.9888;QD=6.97321;RBI=0.128838;REFB=-0.0246626;REVB=-0.0550529;RO=57;SAF=10;SAR=39;SRF=22;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226829;STB=0.639283;TYPE=snp;VARB=0.0237526;OID=.;OPOS=73483689;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:111:57:61:49:50:39:10:22:35:39:11:26:35 chr7 73753100 . GC G 203.21 PASS AO=22;DP=47;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.336769;FXX=0.0217344;HRUN=3;LEN=1;MLLD=9.36614;QD=18.0627;RBI=0.380744;REFB=-0.065419;REVB=0.17763;RO=20;SAF=18;SAR=4;SRF=17;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0470564;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0403798;OID=.;OPOS=73753101;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:22:45:45:45:0:38:7:0:0:15:20:18:4:17:3 chr7 73753250 . T C 255.58 PASS AO=46;DP=76;FAO=47;FDP=77;FR=.;FRO=30;FSAF=34;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=22;FWDB=-0.0351427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.509;QD=13.2769;RBI=0.0357004;REFB=-0.0266048;REVB=-0.00628565;RO=30;SAF=34;SAR=12;SRF=8;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.358212;STB=0.685402;TYPE=snp;VARB=0.0217097;OID=.;OPOS=73753250;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:77:30:30:46:47:12:34:8:22:13:34:8:22 chr7 73814749 . G C 927.31 PASS AO=67;DP=102;FAO=100;FDP=100;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=39;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.355677;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=37.4193;QD=37.0925;RBI=0.357939;REFB=0;REVB=-0.0401829;RO=0;SAF=8;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0040348;OID=.;OPOS=73814749;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:94:100:0:0:67:100:59:8:0:0:61:39:0:0 chr7 73818281 . C G 128.22 PASS AO=36;DP=91;FAO=36;FDP=89;FR=.;FRO=53;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=33;FSRR=20;FWDB=-0.000450635;FXX=0.0631512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.699;QD=5.76286;RBI=0.0131411;REFB=-0.0106937;REVB=-0.0131333;RO=50;SAF=23;SAR=13;SRF=30;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.042685;STB=0.510418;TYPE=snp;VARB=0.0178548;OID=.;OPOS=73818281;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:89:50:53:36:36:13:23:30:20:13:23:33:20 chr7 73901807 . C T 311.74 PASS AO=68;DP=131;FAO=68;FDP=130;FR=.;FRO=62;FSAF=50;FSAR=18;FSRF=48;FSRR=14;FWDB=0.00589749;FXX=0.00763301;HRUN=3;LEN=1;MLLD=197.309;QD=9.59205;RBI=0.00599259;REFB=-0.00926565;REVB=0.00106336;RO=60;SAF=50;SAR=18;SRF=47;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0543289;STB=0.524369;TYPE=snp;VARB=0.00874463;OID=.;OPOS=73901807;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:130:60:62:68:68:18:50:47:13:18:50:48:14 chr7 73932558 . GAA GA,GAG 165.53 PASS AO=17,17;DP=52;FAO=16,18;FDP=48;FR=.;FRO=14;FSAF=0,4;FSAR=16,14;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=-0.00288096,0.0869995;FXX=0.020404;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=15.9885,24.4821;QD=13.7937;RBI=0.0326304,0.0972867;REFB=-0.152651,-0.124248;REVB=-0.032503,-0.0435406;RO=12;SAF=1,3;SAR=16,14;SRF=4;SRR=8;SSEN=0.59901,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.46149,-0.171802;STB=0.998913,0.538417;TYPE=del,snp;VARB=0.188732,0.0641152;OID=.,.;OPOS=73932559,73932560;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=GA,GAG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:17,17:49:16,18:48:14:0,4:16,14:4:10:49:12:1,3:16,14:4:8 chr7 73944095 . C T 24.41 PASS AO=15;DP=70;FAO=15;FDP=70;FR=.;FRO=55;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=32;FWDB=-0.00796815;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=159.016;QD=1.39506;RBI=0.0152637;REFB=-0.00214257;REVB=0.0130188;RO=55;SAF=5;SAR=10;SRF=23;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112184;STB=0.571331;TYPE=snp;VARB=0.0126095;OID=.;OPOS=73944095;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:70:70:55:55:15:15:10:5:23:32:10:5:23:32 chr7 73944185 . T C 483.9 PASS AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00672361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.794;QD=37.2227;RBI=0.0112108;REFB=0;REVB=0.00897085;RO=0;SAF=15;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.71493e-05;OID=.;OPOS=73944185;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:52:52:0:0:52:52:37:15:0:0:37:15:0:0 chr7 73949411 . T C 165.69 PASS AO=46;DP=110;FAO=46;FDP=110;FR=.;FRO=64;FSAF=16;FSAR=30;FSRF=41;FSRR=23;FWDB=-0.00339535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.9444;QD=6.02509;RBI=0.0135604;REFB=-0.0103121;REVB=0.0131285;RO=64;SAF=16;SAR=30;SRF=41;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.299587;STB=0.668419;TYPE=snp;VARB=0.0189083;OID=.;OPOS=73949411;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:64:64:46:46:30:16:41:23:30:16:41:23 chr7 73969541 . A G 290.01 PASS AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.052789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.795;QD=37.42;RBI=0.0587715;REFB=0;REVB=0.0258343;RO=0;SAF=9;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.15349e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000189122;OID=.;OPOS=73969541;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:31:31:0:0:31:31:22:9:0:0:22:9:0:0 chr7 74197598 . T A 57.32 PASS AO=6;DP=7;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.10788;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.5529;QD=28.6625;RBI=0.109516;REFB=-0.115047;REVB=0.0188644;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.571224;TYPE=snp;VARB=0.0136929;OID=.;OPOS=74197598;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:7:8:0:1:6:7:4:2:0:0:4:3:1:0 chr7 75045694 . C T 81.48 PASS AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.0124807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.524;QD=7.76012;RBI=0.0229603;REFB=-0.0153656;REVB=0.019272;RO=23;SAF=12;SAR=7;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0213728;STB=0.512182;TYPE=snp;VARB=0.0157773;OID=.;OPOS=75045694;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:42:42:23:23:19:19:7:12:15:8:7:12:15:8 chr7 75046785 . T C 18.4 PASS AO=8;DP=35;FAO=8;FDP=35;FR=.;FRO=27;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.000491571;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.718;QD=2.10233;RBI=0.0115923;REFB=-0.00150654;REVB=0.0115818;RO=27;SAF=5;SAR=3;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.29611;STB=0.689207;TYPE=snp;VARB=0.00323112;OID=.;OPOS=75046785;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:35:35:27:27:8:8:3:5:10:17:3:5:10:17 chr7 75051375 . T C 18.6 PASS AO=5;DP=17;FAO=5;FDP=17;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=-0.0126405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.835;QD=4.37705;RBI=0.0313106;REFB=-0.0621557;REVB=-0.0286457;RO=12;SAF=4;SAR=1;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0783381;STB=0.551506;TYPE=snp;VARB=0.148594;OID=.;OPOS=75051375;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:17:17:12:12:5:5:1:4:9:3:1:4:9:3 chr7 75124581 . G A 39.78 PASS AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0226078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.404;QD=12.2395;RBI=0.0247195;REFB=-0.0257453;REVB=-0.00999709;RO=6;SAF=6;SAR=1;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0364235;STB=0.521675;TYPE=snp;VARB=0.00724437;OID=.;OPOS=75124581;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:13:13:6:6:7:7:1:6:5:1:1:6:5:1 chr7 75441111 . G T 18.3 PASS AO=7;DP=29;FAO=7;FDP=29;FR=.;FRO=22;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=4;FWDB=-0.0285405;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=178.026;QD=2.52469;RBI=0.028552;REFB=-0.00326849;REVB=-0.000811286;RO=22;SAF=2;SAR=5;SRF=18;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.569371;STB=0.846726;TYPE=snp;VARB=0.00719377;OID=.;OPOS=75441111;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:29:29:22:22:7:7:5:2:18:4:5:2:18:4 chr7 75513062 . A G 792.48 PASS AO=88;DP=91;FAO=88;FDP=91;FR=.;FRO=3;FSAF=33;FSAR=55;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0190694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.726;QD=34.8343;RBI=0.0630064;REFB=-0.160221;REVB=0.0600514;RO=3;SAF=33;SAR=55;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0411444;STB=0.521734;TYPE=snp;VARB=0.0023898;OID=.;OPOS=75513062;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:91:91:3:3:88:88:55:33:3:0:55:33:3:0 chr7 75597545 . C T 475.4 PASS AO=50;DP=52;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0380876;FXX=0.0908926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.9522;QD=38.032;RBI=0.0544355;REFB=0;REVB=0.0388917;RO=0;SAF=31;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00116235;OID=.;OPOS=75597545;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:52:50:0:0:50:50:19:31:0:0:19:31:0:0 chr7 75609677 . A G 124.94 PASS AO=30;DP=62;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=10;FWDB=-0.0123066;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.366;QD=8.19296;RBI=0.0155844;REFB=-0.0132101;REVB=-0.00956142;RO=32;SAF=21;SAR=9;SRF=22;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136142;STB=0.523529;TYPE=snp;VARB=0.0159221;OID=.;OPOS=75609677;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:61:32:32:30:29:9:21:22:10:8:21:22:10 chr7 75614953 . T C 257.96 PASS AO=23;DP=24;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0483837;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.7562;QD=38.2161;RBI=0.172117;REFB=0;REVB=0.165177;RO=0;SAF=10;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00609269;OID=.;OPOS=75614953;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:24:27:0:0:23:27:13:10:0:0:17:10:0:0 chr7 75617223 . G A 167.39 PASS AO=36;DP=72;FAO=37;FDP=72;FR=.;FRO=35;FSAF=26;FSAR=11;FSRF=25;FSRR=10;FWDB=0.0210889;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.509;QD=9.2992;RBI=0.0716397;REFB=-0.0090528;REVB=0.0684654;RO=35;SAF=26;SAR=10;SRF=25;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00872693;STB=0.506771;TYPE=snp;VARB=0.0071115;OID=.;OPOS=75617223;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:35:35:36:37:10:26:25:10:11:26:25:10 chr7 75621827 . A G 256.67 PASS AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0078376;FXX=0.0357015;HRUN=3;LEN=1;MLLD=150.152;QD=38.0255;RBI=0.013167;REFB=0;REVB=0.0105803;RO=0;SAF=19;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.06954e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000116064;OID=.;OPOS=75621827;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:28:27:0:0:27:27:8:19:0:0:8:19:0:0 chr7 75629777 . CT C,CC 659.64 PASS AO=25,44;DP=75;FAO=68,0;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=44,0;FSAR=24,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0477162,-0.0624241;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=192.692,181.895;QD=38.8023;RBI=0.0938314,0.15702;REFB=0,0;REVB=-0.0807929,-0.144078;RO=0;SAF=24,20;SAR=1,24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.20334e-08,-5.30465e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.000370467,0.0370945;OID=.,.;OPOS=75629778,75629778;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:25,44:69:68,0:68:0:44,0:24,0:0:0:31:0:24,20:1,24:0:0 chr7 75630274 . T C 432.54 PASS AO=41;DP=50;FAO=48;FDP=50;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00519717;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7202;QD=34.6033;RBI=0.0362018;REFB=-0.0233964;REVB=-0.0358268;RO=5;SAF=30;SAR=11;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0334643;STB=0.513152;TYPE=snp;VARB=0.00881015;OID=.;OPOS=75630274;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:50:50:5:2:41:48:11:30:3:2:12:36:1:1 chr7 75634687 . G A 913.67 PASS AO=186;DP=336;FAO=190;FDP=339;FR=.;FRO=149;FSAF=153;FSAR=37;FSRF=125;FSRR=24;FWDB=-0.00184215;FXX=0.00586493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.403;QD=10.7808;RBI=0.0844398;REFB=-0.0093805;REVB=-0.0844197;RO=146;SAF=152;SAR=34;SRF=123;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0351495;STB=0.524285;TYPE=snp;VARB=0.00597736;OID=.;OPOS=75634687;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:336:339:146:149:186:190:34:152:123:23:37:153:125:24 chr7 75659815 . T C 3197.87 PASS AO=336;DP=339;FAO=336;FDP=336;FR=.;FRO=0;FSAF=141;FSAR=195;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00433623;FXX=0.0088493;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.378;QD=38.0699;RBI=0.0244974;REFB=-0.0337191;REVB=0.0241105;RO=2;SAF=141;SAR=195;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0067183;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.51337e-06;OID=.;OPOS=75659815;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:339:336:2:0:336:336:195:141:2:0:195:141:0:0 chr7 75914934 . G GC 277 PASS AO=36;DP=48;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0941589;FXX=0.0222173;HRUN=2;LEN=1;MLLD=15.2735;QD=25.1821;RBI=0.354711;REFB=0;REVB=0.341985;RO=8;SAF=20;SAR=16;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0612244;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.0168623;OID=.;OPOS=75914935;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:36:48:44:44:0:22:22:0:0:23:8:20:16:3:5 chr7 75915038 . G C 10.38 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.0305;QD=5.93336;RBI=0.00866506;REFB=0.0626099;REVB=0.00866506;RO=5;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00661189;OID=.;OPOS=75915038;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:5:5:2:2:2:0:0:5:2:0:0:5 chr7 75959188 . G A 106.98 PASS AO=24;DP=49;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.00409904;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.187;QD=8.55833;RBI=0.0197614;REFB=-0.0195345;REVB=0.0193316;RO=25;SAF=8;SAR=16;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212062;STB=0.630026;TYPE=snp;VARB=0.0334406;OID=.;OPOS=75959188;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:50:25:26:24:24:16:8:14:11:16:8:15:11 chr7 76029695 . C T 63.24 PASS AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=15;FWDB=0.0432844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.103;QD=7.43962;RBI=0.0503927;REFB=-0.0135772;REVB=-0.0258049;RO=19;SAF=10;SAR=5;SRF=4;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.421563;STB=0.740447;TYPE=snp;VARB=0.0228563;OID=.;OPOS=76029695;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:34:34:19:19:15:15:5:10:4:15:5:10:4:15 chr7 76069811 . T C 286.9 PASS AO=81;DP=189;FAO=81;FDP=189;FR=.;FRO=108;FSAF=11;FSAR=70;FSRF=22;FSRR=86;FWDB=-0.0204925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.797;QD=6.07193;RBI=0.0228918;REFB=-0.0277216;REVB=-0.0102026;RO=106;SAF=11;SAR=70;SRF=22;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136571;STB=0.57375;TYPE=snp;VARB=0.0342237;OID=.;OPOS=76069811;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:189:106:108:81:81:70:11:22:84:70:11:22:86 chr7 76112060 . C T 91.28 PASS AO=17;DP=32;FAO=18;FDP=33;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=0.0323766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.703;QD=11.0643;RBI=0.0399823;REFB=-0.0181994;REVB=0.0234593;RO=15;SAF=4;SAR=13;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0352672;STB=0.528269;TYPE=snp;VARB=0.0150247;OID=.;OPOS=76112060;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:32:33:15:15:17:18:13:4:4:11:14:4:4:11 chr7 76131645 . A G 412.47 PASS AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0335865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.588;QD=37.497;RBI=0.0757193;REFB=0;REVB=-0.0678628;RO=0;SAF=20;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30465e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0002583;OID=.;OPOS=76131645;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:44:44:0:0:44:44:24:20:0:0:24:20:0:0 chr7 76131650 . G A 49.57 PASS AO=15;DP=42;FAO=15;FDP=43;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=-0.0073383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.562;QD=4.61091;RBI=0.0111546;REFB=-0.00756968;REVB=-0.00840092;RO=27;SAF=10;SAR=5;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.318642;STB=0.696714;TYPE=snp;VARB=0.013663;OID=.;OPOS=76131650;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:42:43:27:28:15:15:5:10:10:17:5:10:10:18 chr7 76131695 . A G 43.43 PASS AO=16;DP=53;FAO=16;FDP=53;FR=.;FRO=37;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=28;FWDB=0.023829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.933;QD=3.27803;RBI=0.0248743;REFB=-0.00245752;REVB=-0.00713506;RO=37;SAF=9;SAR=7;SRF=9;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.36538;STB=0.714055;TYPE=snp;VARB=0.00521192;OID=.;OPOS=76131695;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:53:53:37:37:16:16:7:9:9:28:7:9:9:28 chr7 76132898 . T C 61.31 PASS AO=17;DP=43;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=22;FWDB=-0.0547034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.894;QD=5.57323;RBI=0.054707;REFB=-0.00823834;REVB=-0.000630573;RO=26;SAF=8;SAR=9;SRF=5;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.302331;STB=0.679272;TYPE=snp;VARB=0.023732;OID=.;OPOS=76132898;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:43:44:26:27:17:17:9:8:5:21:9:8:5:22 chr7 76135134 . G A 68.36 PASS AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=0.0906807;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3651;QD=8.54516;RBI=0.0916082;REFB=-0.0296572;REVB=-0.0130032;RO=17;SAF=8;SAR=7;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.273825;STB=0.655546;TYPE=snp;VARB=0.0440649;OID=.;OPOS=76135134;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:32:32:17:17:15:15:7:8:4:13:7:8:4:13 chr7 76140210 . G A 27.77 PASS AO=12;DP=48;FAO=12;FDP=47;FR=.;FRO=35;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=0.0143035;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.0283;QD=2.36318;RBI=0.0143722;REFB=-0.0176055;REVB=0.00140369;RO=35;SAF=3;SAR=9;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.238755;STB=0.650334;TYPE=snp;VARB=0.0389213;OID=.;OPOS=76140210;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:48:47:35:35:12:12:9:3:15:20:9:3:15:20 chr7 76144455 . A C 212.28 PASS AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00207006;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.418;QD=36.9181;RBI=0.021987;REFB=0;REVB=-0.0218894;RO=0;SAF=1;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.47154e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.90525e-05;OID=.;OPOS=76144455;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:24:23:0:0:23:23:22:1:0:0:22:1:0:0 chr7 76144560 . T C 109.75 PASS AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.055759;FXX=0.076864;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2161;QD=36.5819;RBI=0.0622165;REFB=0;REVB=0.0276012;RO=0;SAF=1;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.23983e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00247017;OID=.;OPOS=76144560;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:13:12:0:0:12:12:11:1:0:0:11:1:0:0 chr7 76239503 . G GC 75.74 PASS AO=25;DP=83;FAO=40;FDP=82;FR=.;FRO=42;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=-0.140212;FXX=0.0120467;HRUN=4;LEN=1;MLLD=13.2593;QD=3.6948;RBI=0.193136;REFB=-0.0340408;REVB=0.132824;RO=41;SAF=18;SAR=7;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.241938;STB=0.538821;TYPE=ins;VARB=0.0190823;OID=.;OPOS=76239504;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:25:83:40:82:42:23:17:21:21:75:41:18:7:21:20 chr7 76240785 . CA C 281.23 PASS AO=67;DP=139;FAO=68;FDP=138;FR=.;FRO=70;FSAF=48;FSAR=20;FSRF=43;FSRR=27;FWDB=0.0167245;FXX=0.0212751;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.276;QD=8.1515;RBI=0.0298965;REFB=-0.0197081;REVB=-0.0247809;RO=70;SAF=47;SAR=20;SRF=43;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.092036;STB=0.553468;TYPE=del;VARB=0.0322338;OID=.;OPOS=76240786;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:67:139:68:138:70:48:20:43:27:99:70:47:20:43:27 chr7 76240888 . A G 226.13 PASS AO=71;DP=192;FAO=75;FDP=196;FR=.;FRO=121;FSAF=66;FSAR=9;FSRF=85;FSRR=36;FWDB=0.0213119;FXX=0.00507588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.3841;QD=4.61483;RBI=0.0218193;REFB=-0.00916743;REVB=0.00467832;RO=120;SAF=64;SAR=7;SRF=84;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.388139;STB=0.686011;TYPE=snp;VARB=0.0249917;OID=.;OPOS=76240888;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:196:120:121:71:75:7:64:84:36:9:66:85:36 chr7 76241068 . C T 487.77 PASS AO=145;DP=342;FAO=143;FDP=342;FR=.;FRO=199;FSAF=74;FSAR=69;FSRF=111;FSRR=88;FWDB=0.00636413;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5759;QD=5.70496;RBI=0.0163348;REFB=-0.000137755;REVB=0.0150441;RO=196;SAF=76;SAR=69;SRF=108;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0278899;STB=0.523517;TYPE=snp;VARB=-0.000127842;OID=.;OPOS=76241068;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:342:342:196:199:145:143:69:76:108:88:69:74:111:88 chr7 76247669 . TG T 375.8 PASS AO=49;DP=59;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.231964;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=19.5509;QD=27.837;RBI=0.305631;REFB=-0.0345605;REVB=0.199005;RO=5;SAF=16;SAR=33;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0.511335;SSSB=0.0661551;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0056532;OID=.;OPOS=76247670;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:49:54:54:54:0:16:38:0:0:31:5:16:33:0:5 chr7 76247805 . A G 10.3 PASS AO=2;DP=8;FAO=2;FDP=8;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0320506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.9322;QD=5.15063;RBI=0.033272;REFB=-0.0169677;REVB=0.00893243;RO=6;SAF=1;SAR=1;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168213;STB=0.623829;TYPE=snp;VARB=0.0830842;OID=.;OPOS=76247805;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:8:6:6:2:2:1:1:4:2:1:1:4:2 chr7 76885769 . A G 405.31 PASS AO=50;DP=56;FAO=50;FDP=56;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=46;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.0360583;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.1048;QD=28.9507;RBI=0.0409717;REFB=-0.0587798;REVB=0.0194545;RO=1;SAF=4;SAR=46;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104047;STB=0.687613;TYPE=snp;VARB=0.00275353;OID=.;OPOS=76885769;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:56:56:1:6:50:50:46:4:1:0:46:4:5:1 chr7 77035392 . T C 836 PASS AO=89;DP=91;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.062062;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.951;QD=37.1557;RBI=0.0705983;REFB=0;REVB=0.0336516;RO=0;SAF=44;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000410221;OID=.;OPOS=77035392;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:91:90:0:0:89:90:45:44:0:0:46:44:0:0 chr7 77053084 . T C 68.13 PASS AO=19;DP=49;FAO=19;FDP=49;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.00100305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4144;QD=5.56137;RBI=0.0567793;REFB=-0.0209875;REVB=0.0567705;RO=30;SAF=13;SAR=6;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204447;STB=0.618918;TYPE=snp;VARB=0.0507161;OID=.;OPOS=77053084;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:49:49:30:30:19:19:6:13:15:15:6:13:15:15 chr7 77200392 . A T 190.08 PASS AO=47;DP=102;FAO=47;FDP=102;FR=.;FRO=55;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=35;FWDB=0.0788851;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.9464;QD=7.45428;RBI=0.0955272;REFB=0.00178524;REVB=0.0538757;RO=55;SAF=27;SAR=20;SRF=20;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201765;STB=0.612324;TYPE=snp;VARB=-0.00133036;OID=.;OPOS=77200392;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:55:55:47:47:20:27:20:35:20:27:20:35 chr7 77247821 . G A 2026.74 PASS AO=212;DP=212;FAO=212;FDP=212;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=121;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216679;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.3274;QD=38.2404;RBI=0.0369938;REFB=0;REVB=0.0299841;RO=0;SAF=91;SAR=121;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.24884e-05;OID=.;OPOS=77247821;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:96:212:212:0:0:212:212:121:91:0:0:121:91:0:0 chr7 77256713 . A G 192.87 PASS AO=38;DP=67;FAO=38;FDP=67;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=0.0329313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.395;QD=11.5148;RBI=0.0330359;REFB=-0.0111054;REVB=-0.00262662;RO=29;SAF=17;SAR=21;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0824142;STB=0.545285;TYPE=snp;VARB=0.00995395;OID=.;OPOS=77256713;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:29:29:38:38:21:17:10:19:21:17:10:19 chr7 77365770 . A G 113.46 PASS AO=25;DP=51;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=0.0131792;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=234.208;QD=8.89891;RBI=0.027308;REFB=-0.0153407;REVB=-0.0239173;RO=26;SAF=13;SAR=12;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15717;STB=0.588075;TYPE=snp;VARB=0.0120646;OID=.;OPOS=77365770;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:26:26:25:25:12:13:9:17:12:13:9:17 chr7 77423574 . G A 466.49 PASS AO=106;DP=212;FAO=108;FDP=214;FR=.;FRO=106;FSAF=57;FSAR=51;FSRF=60;FSRR=46;FWDB=-0.0321883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.393;QD=8.71936;RBI=0.032627;REFB=-0.00370811;REVB=0.00533248;RO=103;SAF=57;SAR=49;SRF=59;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0317834;STB=0.519047;TYPE=snp;VARB=0.00344838;OID=.;OPOS=77423574;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:214:103:106:106:108:49:57:59:44:51:57:60:46 chr7 77525199 . T C 387.69 PASS AO=90;DP=182;FAO=91;FDP=183;FR=.;FRO=92;FSAF=49;FSAR=42;FSRF=55;FSRR=37;FWDB=-0.0138506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.42;QD=8.47406;RBI=0.014677;REFB=-0.0174541;REVB=0.00485537;RO=83;SAF=49;SAR=41;SRF=50;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0514236;STB=0.530155;TYPE=snp;VARB=0.0202894;OID=.;OPOS=77525199;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:183:83:92:90:91:41:49:50:33:42:49:55:37 chr7 77552127 . G A 297.54 PASS AO=78;DP=173;FAO=78;FDP=173;FR=.;FRO=95;FSAF=23;FSAR=55;FSRF=29;FSRR=66;FWDB=0.00235241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.361;QD=6.87942;RBI=0.0118686;REFB=-0.00463852;REVB=0.0116331;RO=94;SAF=23;SAR=55;SRF=28;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.003544;STB=0.506821;TYPE=snp;VARB=0.00528721;OID=.;OPOS=77552127;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:173:94:95:78:78:55:23:28:66:55:23:29:66 chr7 77569625 . T C 705.53 PASS AO=147;DP=268;FAO=148;FDP=268;FR=.;FRO=120;FSAF=40;FSAR=108;FSRF=41;FSRR=79;FWDB=0.0682323;FXX=0.00371733;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.4;QD=10.5303;RBI=0.0693222;REFB=-0.0051881;REVB=0.0122442;RO=120;SAF=39;SAR=108;SRF=41;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0774806;STB=0.539063;TYPE=snp;VARB=0.00292833;OID=.;OPOS=77569625;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:268:268:120:120:147:148:108:39:41:79:108:40:41:79 chr7 77649033 . C G 12.85 PASS AO=3;DP=11;FAO=3;FDP=12;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=9;FSRR=0;FWDB=0.0228452;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=29.5398;QD=4.28318;RBI=0.0228452;REFB=0.0371187;REVB=0;RO=8;SAF=3;SAR=0;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0853507;OID=.;OPOS=77649033;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:11:12:8:9:3:3:0:3:8:0:0:3:9:0 chr7 77756580 . T C 618.9 PASS AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184371;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.623;QD=38.0859;RBI=0.0562227;REFB=0;REVB=0.0531137;RO=0;SAF=25;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00021121;OID=.;OPOS=77756580;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:65:65:0:0:65:65:40:25:0:0:40:25:0:0 chr7 77756724 . C T 1108.84 PASS AO=116;DP=116;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0279704;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=255.882;QD=38.2358;RBI=0.0293794;REFB=0;REVB=-0.00898926;RO=0;SAF=53;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.14374e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.64509e-05;OID=.;OPOS=77756724;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:116:116:0:0:116:116:63:53:0:0:63:53:0:0 chr7 80088041 . G A 401.68 PASS AO=88;DP=161;FAO=87;FDP=163;FR=.;FRO=76;FSAF=58;FSAR=29;FSRF=55;FSRR=21;FWDB=-0.00275131;FXX=0.00609719;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.648;QD=9.85707;RBI=0.0264297;REFB=-0.0296759;REVB=0.0262861;RO=72;SAF=59;SAR=29;SRF=51;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0358413;STB=0.53051;TYPE=snp;VARB=0.0191578;OID=.;OPOS=80088041;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:163:72:76:88:87:29:59:51:21:29:58:55:21 chr7 80374342 . A G 2809.03 PASS AO=295;DP=306;FAO=296;FDP=296;FR=.;FRO=0;FSAF=130;FSAR=166;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146635;FXX=0.0326787;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.6552;QD=37.9598;RBI=0.01553;REFB=-0.0969904;REVB=-0.00511487;RO=2;SAF=129;SAR=166;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00733584;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000347384;OID=.;OPOS=80374342;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:306:296:2:0:295:296:166:129:2:0:166:130:0:0 chr7 80374438 . T C 2270.79 PASS AO=232;DP=255;FAO=239;FDP=239;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=145;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.016744;FXX=0.0946934;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.971;QD=38.0049;RBI=0.0182123;REFB=0;REVB=0.00716422;RO=0;SAF=92;SAR=140;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.29147e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000317066;OID=.;OPOS=80374438;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:255:239:0:0:232:239:140:92:0:0:145:94:0:0 chr7 80378319 . G C 2306.83 PASS AO=241;DP=243;FAO=241;FDP=241;FR=.;FRO=0;FSAF=109;FSAR=132;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00422456;FXX=0.00823011;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.175;QD=38.2876;RBI=0.00441982;REFB=0;REVB=0.00129921;RO=0;SAF=109;SAR=132;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.39681e-06;OID=.;OPOS=80378319;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:243:241:0:0:241:241:132:109:0:0:132:109:0:0 chr7 80418689 . A G 3355.12 PASS AO=348;DP=349;FAO=349;FDP=349;FR=.;FRO=0;FSAF=236;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.01982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.5165;QD=38.4541;RBI=0.049781;REFB=0;REVB=0.0456653;RO=0;SAF=236;SAR=112;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.19047e-05;OID=.;OPOS=80418689;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:349:349:0:0:348:349:112:236:0:0:113:236:0:0 chr7 80466586 . T C 288.81 PASS AO=78;DP=177;FAO=77;FDP=173;FR=.;FRO=96;FSAF=44;FSAR=33;FSRF=50;FSRR=46;FWDB=0.00498704;FXX=0.0280883;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.56;QD=6.67761;RBI=0.00973335;REFB=0.000986766;REVB=0.00835868;RO=91;SAF=45;SAR=33;SRF=49;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0379899;STB=0.528421;TYPE=snp;VARB=-0.000276946;OID=.;OPOS=80466586;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:173:91:96:78:77:33:45:49:42:33:44:50:46 chr7 80805263 . C T 157.7 PASS AO=51;DP=136;FAO=51;FDP=136;FR=.;FRO=85;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=41;FSRR=44;FWDB=-0.000891985;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.106;QD=4.63821;RBI=0.0038892;REFB=-0.00349983;REVB=0.00378553;RO=85;SAF=27;SAR=24;SRF=41;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0517264;STB=0.5294;TYPE=snp;VARB=0.00588337;OID=.;OPOS=80805263;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:85:85:51:51:24:27:41:44:24:27:41:44 chr7 80962963 . A T 3335.99 PASS AO=356;DP=366;FAO=358;FDP=358;FR=.;FRO=0;FSAF=145;FSAR=213;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00442155;FXX=0.0245225;HRUN=3;LEN=1;MLLD=165.121;QD=37.2736;RBI=0.00521785;REFB=0.00557301;REVB=0.00277053;RO=2;SAF=144;SAR=212;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0044799;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.00908e-05;OID=.;OPOS=80962963;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:366:358:2:0:356:358:212:144:0:2:213:145:0:0 chr7 81588636 . G A 238.09 PASS AO=69;DP=165;FAO=70;FDP=170;FR=.;FRO=100;FSAF=26;FSAR=44;FSRF=60;FSRR=40;FWDB=-0.0100243;FXX=0.0116272;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.269;QD=5.60209;RBI=0.0176194;REFB=-0.0209087;REVB=0.0144898;RO=96;SAF=26;SAR=43;SRF=56;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214751;STB=0.63401;TYPE=snp;VARB=0.0276632;OID=.;OPOS=81588636;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:170:96:100:69:70:43:26:56:40:44:26:60:40 chr7 82453708 . A C 428.26 PASS AO=113;DP=250;FAO=115;FDP=257;FR=.;FRO=142;FSAF=43;FSAR=72;FSRF=69;FSRR=73;FWDB=-0.0229598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.258;QD=6.6655;RBI=0.0271475;REFB=-0.0216744;REVB=0.0144858;RO=135;SAF=43;SAR=70;SRF=67;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116842;STB=0.563944;TYPE=snp;VARB=0.0282341;OID=.;OPOS=82453708;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:250:257:135:142:113:115:70:43:67:68:72:43:69:73 chr7 82455895 . A G 282.02 PASS AO=64;DP=126;FAO=64;FDP=126;FR=.;FRO=62;FSAF=38;FSAR=26;FSRF=35;FSRR=27;FWDB=-0.000619579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=304.299;QD=8.95296;RBI=0.0134632;REFB=-0.00197329;REVB=0.013449;RO=62;SAF=38;SAR=26;SRF=35;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0268907;STB=0.514822;TYPE=snp;VARB=0.00187356;OID=.;OPOS=82455895;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:62:62:64:64:26:38:35:27:26:38:35:27 chr7 82581488 . T TTCA 576.43 PASS AO=63;DP=99;FAO=73;FDP=81;FR=.;FRO=8;FSAF=42;FSAR=31;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.0153302;FXX=0.0240935;HRUN=5;LEN=3;MLLD=215.008;QD=28.4656;RBI=0.0172098;REFB=0.0439642;REVB=-0.00782055;RO=13;SAF=41;SAR=22;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0390703;STB=0.505025;TYPE=ins;VARB=-0.0031273;OID=.;OPOS=82581489;OREF=-;OALT=TCA;OMAPALT=TTCA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:63:99:73:81:8:42:31:5:3:3:13:41:22:7:6 chr7 82581859 . C T 102.4 PASS AO=20;DP=36;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=17;FSRF=2;FSRR=14;FWDB=0.0109672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.1934;QD=11.3778;RBI=0.0251959;REFB=-0.0558762;REVB=0.0226838;RO=16;SAF=3;SAR=17;SRF=2;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0402281;STB=0.52245;TYPE=snp;VARB=0.0340692;OID=.;OPOS=82581859;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:36:36:16:16:20:20:17:3:2:14:17:3:2:14 chr7 82582846 . C T 336.44 PASS AO=58;DP=170;FAO=80;FDP=163;FR=.;FRO=83;FSAF=24;FSAR=56;FSRF=40;FSRR=43;FWDB=0.0154416;FXX=0.00609719;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.163;QD=8.25626;RBI=0.0155168;REFB=-0.00378176;REVB=-0.00152538;RO=76;SAF=24;SAR=34;SRF=39;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101693;STB=0.601316;TYPE=snp;VARB=0.00373899;OID=.;OPOS=82582846;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:163:76:83:58:80:34:24:39:37:56:24:40:43 chr7 82583609 . A C 595.11 PASS AO=124;DP=231;FAO=134;FDP=249;FR=.;FRO=115;FSAF=70;FSAR=64;FSRF=45;FSRR=70;FWDB=-0.0219772;FXX=0.00399984;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.0789;QD=9.55992;RBI=0.0250305;REFB=-0.0348743;REVB=-0.0119803;RO=106;SAF=68;SAR=56;SRF=46;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0966056;STB=0.560326;TYPE=snp;VARB=0.0270728;OID=.;OPOS=82583609;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:231:249:106:115:124:134:56:68:46:60:64:70:45:70 chr7 82595379 . G T 205.93 PASS AO=44;DP=75;FAO=42;FDP=75;FR=.;FRO=33;FSAF=30;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=9;FWDB=-0.0707087;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=32.2942;QD=10.983;RBI=0.0768518;REFB=-0.0129458;REVB=0.0301078;RO=26;SAF=31;SAR=13;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0216775;STB=0.507039;TYPE=snp;VARB=0.00810761;OID=.;OPOS=82595379;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:26:33:44:42:13:31:19:7:12:30:24:9 chr7 82764425 . C G 1552.58 PASS AO=152;DP=156;FAO=164;FDP=164;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00374109;FXX=0.00606024;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.696;QD=37.8679;RBI=0.0340271;REFB=0;REVB=0.0338209;RO=0;SAF=78;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.65373e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000279907;OID=.;OPOS=82764425;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:156:164:0:0:152:164:74:78:0:0:85:79:0:0 chr7 82784832 . C G 195.16 PASS AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.909;QD=37.1731;RBI=0.0261006;REFB=0;REVB=-0.0240752;RO=0;SAF=14;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000432538;OID=.;OPOS=82784832;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:21:21:0:0:21:21:7:14:0:0:7:14:0:0 chr7 83023587 . TAC T 1295.29 PASS AO=118;DP=155;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0286963;FXX=0.103889;HRUN=1;LEN=2;MLLD=151.517;QD=37.5447;RBI=0.0524157;REFB=0;REVB=0.0438626;RO=0;SAF=55;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.000190608;OID=.;OPOS=83023588;OREF=AC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:118:129:138:138:0:69:69:0:0:62:0:55:63:0:0 chr7 83037731 . C G 1057.95 PASS AO=98;DP=99;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0490209;FXX=0.0172399;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.6087;QD=37.121;RBI=0.0490432;REFB=-0.0562515;REVB=-0.00147705;RO=0;SAF=50;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.35849e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00124084;OID=.;OPOS=83037731;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:99:114:0:0:98:114:48:50:0:0:56:58:0:0 chr7 83634713 . A G 2546.21 PASS AO=273;DP=279;FAO=276;FDP=276;FR=.;FRO=0;FSAF=141;FSAR=135;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0138895;FXX=0.0315778;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.6704;QD=36.9016;RBI=0.0542013;REFB=-0.064282;REVB=0.0523914;RO=6;SAF=141;SAR=132;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000676269;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000261021;OID=.;OPOS=83634713;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:279:276:6:0:273:276:132:141:3:3:135:141:0:0 chr7 84624924 . T C 165.59 PASS AO=48;DP=118;FAO=48;FDP=118;FR=.;FRO=70;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=33;FSRR=37;FWDB=-0.0147285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.2168;QD=5.61336;RBI=0.0253044;REFB=0.0119126;REVB=0.0205763;RO=68;SAF=20;SAR=28;SRF=31;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0416143;STB=0.533032;TYPE=snp;VARB=-0.020142;OID=.;OPOS=84624924;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:68:70:48:48:28:20:31:37:28:20:33:37 chr7 84628989 . T G 605.74 PASS AO=150;DP=310;FAO=150;FDP=312;FR=.;FRO=162;FSAF=45;FSAR=105;FSRF=81;FSRR=81;FWDB=0.00354922;FXX=0.00319479;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.123;QD=7.76591;RBI=0.0175962;REFB=-0.0199927;REVB=-0.0172345;RO=143;SAF=45;SAR=105;SRF=68;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171697;STB=0.612484;TYPE=snp;VARB=0.0202058;OID=.;OPOS=84628989;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:310:312:143:162:150:150:105:45:68:75:105:45:81:81 chr7 84644500 . C T 337.73 PASS AO=78;DP=154;FAO=78;FDP=154;FR=.;FRO=76;FSAF=35;FSAR=43;FSRF=33;FSRR=43;FWDB=0.0120046;FXX=0.0128197;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.757;QD=8.77217;RBI=0.0148615;REFB=0.00116901;REVB=0.00876089;RO=74;SAF=35;SAR=43;SRF=33;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00248268;STB=0.507245;TYPE=snp;VARB=-0.00105272;OID=.;OPOS=84644500;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:154:74:76:78:78:43:35:33:41:43:35:33:43 chr7 86800351 . A G 234.21 PASS AO=59;DP=128;FAO=59;FDP=128;FR=.;FRO=69;FSAF=26;FSAR=33;FSRF=41;FSRR=28;FWDB=0.0197575;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.894;QD=7.31892;RBI=0.0199544;REFB=-0.00139793;REVB=0.00279635;RO=68;SAF=26;SAR=33;SRF=41;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155443;STB=0.582274;TYPE=snp;VARB=0.00177047;OID=.;OPOS=86800351;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:68:69:59:59:33:26:41:27:33:26:41:28 chr7 87079406 . T A 406.21 PASS AO=90;DP=178;FAO=92;FDP=180;FR=.;FRO=88;FSAF=34;FSAR=58;FSRF=33;FSRR=55;FWDB=0.002423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.348;QD=9.0268;RBI=0.0175092;REFB=-0.026434;REVB=0.0173407;RO=88;SAF=32;SAR=58;SRF=33;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0189626;STB=0.502846;TYPE=snp;VARB=0.022897;OID=.;OPOS=87079406;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:180:88:88:90:92:58:32:33:55:58:34:33:55 chr7 87082292 . G A 509.14 PASS AO=127;DP=269;FAO=127;FDP=268;FR=.;FRO=141;FSAF=67;FSAR=60;FSRF=54;FSRR=87;FWDB=-0.0133581;FXX=0.00740713;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.1932;QD=7.59909;RBI=0.0308141;REFB=-0.00229555;REVB=-0.0277681;RO=137;SAF=67;SAR=60;SRF=51;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145776;STB=0.57565;TYPE=snp;VARB=0.00104997;OID=.;OPOS=87082292;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:269:268:137:141:127:127:60:67:51:86:60:67:54:87 chr7 87092185 . G A 249.24 PASS AO=75;DP=183;FAO=75;FDP=186;FR=.;FRO=111;FSAF=21;FSAR=54;FSRF=27;FSRR=84;FWDB=-0.0241242;FXX=0.00534731;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.367;QD=5.35988;RBI=0.0269697;REFB=-0.000983156;REVB=-0.0120577;RO=108;SAF=21;SAR=54;SRF=26;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0527166;STB=0.527862;TYPE=snp;VARB=0.00171454;OID=.;OPOS=87092185;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:186:108:111:75:75:54:21:26:82:54:21:27:84 chr7 87138645 . A G 259.37 PASS AO=75;DP=181;FAO=75;FDP=181;FR=.;FRO=106;FSAF=31;FSAR=44;FSRF=41;FSRR=65;FWDB=-0.0216538;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.7145;QD=5.73198;RBI=0.0230904;REFB=-0.0150443;REVB=0.00801752;RO=106;SAF=31;SAR=44;SRF=41;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0287803;STB=0.51611;TYPE=snp;VARB=0.0179885;OID=.;OPOS=87138645;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:181:106:106:75:75:44:31:41:65:44:31:41:65 chr7 87160618 . A C 495.52 PASS AO=110;DP=212;FAO=110;FDP=210;FR=.;FRO=100;FSAF=54;FSAR=56;FSRF=61;FSRR=39;FWDB=0.00851464;FXX=0.00943352;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.225;QD=9.43844;RBI=0.00855186;REFB=-0.00643814;REVB=0.000796969;RO=100;SAF=54;SAR=56;SRF=61;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10357;STB=0.556602;TYPE=snp;VARB=0.00532402;OID=.;OPOS=87160618;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:210:100:100:110:110:56:54:61:39:56:54:61:39 chr7 87229501 . T C 1405.7 PASS AO=178;DP=191;FAO=172;FDP=191;FR=.;FRO=19;FSAF=43;FSAR=129;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=-0.0665902;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.3327;QD=29.4388;RBI=0.081308;REFB=7.53682e-05;REVB=-0.0466555;RO=13;SAF=43;SAR=135;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0248651;STB=0.501742;TYPE=snp;VARB=-0.000319298;OID=.;OPOS=87229501;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:191:191:13:19:178:172:135:43:5:8:129:43:5:14 chr7 87840263 . T C 351.67 PASS AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0054444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4858;QD=36.0687;RBI=0.0228728;REFB=-0.0893728;REVB=-0.0222154;RO=0;SAF=15;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510633;TYPE=snp;VARB=0.00328043;OID=.;OPOS=87840263;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:39:39:0:1:38:38:23:15:0:0:23:15:0:1 chr7 87913361 . C T 292.51 PASS AO=76;DP=173;FAO=79;FDP=177;FR=.;FRO=98;FSAF=32;FSAR=47;FSRF=37;FSRR=61;FWDB=0.0943469;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.1031;QD=6.61037;RBI=0.095164;REFB=-0.0114836;REVB=-0.0124439;RO=97;SAF=30;SAR=46;SRF=36;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0250188;STB=0.515894;TYPE=snp;VARB=0.0149503;OID=.;OPOS=87913361;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:177:97:98:76:79:46:30:36:61:47:32:37:61 chr7 88423881 . T C 347.76 PASS AO=79;DP=171;FAO=79;FDP=159;FR=.;FRO=80;FSAF=37;FSAR=42;FSRF=42;FSRR=38;FWDB=0.0011346;FXX=0.106736;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.982;QD=8.74856;RBI=0.00520212;REFB=-0.00115834;REVB=0.00507689;RO=63;SAF=37;SAR=42;SRF=29;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00655989;STB=0.528505;TYPE=snp;VARB=0.00149228;OID=.;OPOS=88423881;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:159:63:80:79:79:42:37:29:34:42:37:42:38 chr7 88424115 . C G 567.51 PASS AO=140;DP=291;FAO=140;FDP=291;FR=.;FRO=151;FSAF=43;FSAR=97;FSRF=64;FSRR=87;FWDB=-0.0019378;FXX=0.00682571;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.6505;QD=7.80085;RBI=0.0110797;REFB=0.00582869;REVB=-0.0109089;RO=148;SAF=43;SAR=97;SRF=63;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122973;STB=0.567428;TYPE=snp;VARB=-0.00712631;OID=.;OPOS=88424115;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:291:291:148:151:140:140:97:43:63:85:97:43:64:87 chr7 88424291 . C T 221.44 PASS AO=50;DP=104;FAO=52;FDP=105;FR=.;FRO=53;FSAF=12;FSAR=40;FSRF=19;FSRR=34;FWDB=0.0193452;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.176;QD=8.43586;RBI=0.0207732;REFB=-0.0139685;REVB=0.00756899;RO=52;SAF=11;SAR=39;SRF=19;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172386;STB=0.582673;TYPE=snp;VARB=0.0151537;OID=.;OPOS=88424291;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:105:52:53:50:52:39:11:19:33:40:12:19:34 chr7 88964000 . C T 214.86 PASS AO=46;DP=95;FAO=49;FDP=98;FR=.;FRO=49;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=26;FWDB=0.0326708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.227;QD=8.76961;RBI=0.0341114;REFB=-0.0345605;REVB=0.00980848;RO=49;SAF=28;SAR=18;SRF=23;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131254;STB=0.561895;TYPE=snp;VARB=0.0333677;OID=.;OPOS=88964000;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:98:49:49:46:49:18:28:23:26:20:29:23:26 chr7 88964196 . T A 274.96 PASS AO=88;DP=226;FAO=88;FDP=228;FR=.;FRO=140;FSAF=44;FSAR=44;FSRF=64;FSRR=76;FWDB=-0.00516364;FXX=0.00436662;HRUN=3;LEN=1;MLLD=231.789;QD=4.8239;RBI=0.0079416;REFB=-0.00462318;REVB=0.00603372;RO=137;SAF=44;SAR=44;SRF=61;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0592605;STB=0.52631;TYPE=snp;VARB=0.00619977;OID=.;OPOS=88964196;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:226:228:137:140:88:88:44:44:61:76:44:44:64:76 chr7 88964226 . C A 388.6 PASS AO=103;DP=231;FAO=104;FDP=233;FR=.;FRO=129;FSAF=54;FSAR=50;FSRF=47;FSRR=82;FWDB=-0.000217855;FXX=0.0168769;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.599;QD=6.67125;RBI=0.0125124;REFB=-0.0202689;REVB=-0.0125105;RO=127;SAF=53;SAR=50;SRF=47;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143568;STB=0.585302;TYPE=snp;VARB=0.0257139;OID=.;OPOS=88964226;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:231:233:127:129:103:104:50:53:47:80:50:54:47:82 chr7 88964227 . C G 389.77 PASS AO=104;DP=236;FAO=104;FDP=232;FR=.;FRO=128;FSAF=54;FSAR=50;FSRF=47;FSRR=81;FWDB=0.013934;FXX=0.0169484;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.2954;QD=6.72021;RBI=0.0173358;REFB=-0.0172395;REVB=-0.0103139;RO=121;SAF=54;SAR=50;SRF=40;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182852;STB=0.583455;TYPE=snp;VARB=0.0228721;OID=.;OPOS=88964227;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:236:232:121:128:104:104:50:54:40:81:50:54:47:81 chr7 88965141 . A G 188.52 PASS AO=41;DP=80;FAO=41;FDP=80;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=29;FSRF=9;FSRR=30;FWDB=0.00160319;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=199.825;QD=9.42598;RBI=0.00399324;REFB=0.000916782;REVB=0.00365729;RO=38;SAF=12;SAR=29;SRF=9;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0603899;STB=0.537568;TYPE=snp;VARB=-0.000920729;OID=.;OPOS=88965141;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:38:39:41:41:29:12:9:29:29:12:9:30 chr7 88965609 . A G 65.54 PASS AO=19;DP=51;FAO=19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=0.049799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.0807;QD=5.14032;RBI=0.0548336;REFB=-0.0217793;REVB=0.0229518;RO=31;SAF=10;SAR=9;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.023668;STB=0.503102;TYPE=snp;VARB=0.056371;OID=.;OPOS=88965609;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:51:51:31:32:19:19:9:10:17:14:9:10:17:15 chr7 89797144 . G T 1857.44 PASS AO=194;DP=195;FAO=194;FDP=194;FR=.;FRO=0;FSAF=185;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00721008;FXX=0.00512794;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.888;QD=38.2976;RBI=0.0454172;REFB=0;REVB=0.0448412;RO=0;SAF=185;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17669e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.06153e-05;OID=.;OPOS=89797144;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:195:194:0:0:194:194:9:185:0:0:9:185:0:0 chr7 89854446 . T G 2365.9 PASS AO=254;DP=259;FAO=255;FDP=255;FR=.;FRO=0;FSAF=110;FSAR=145;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00252862;FXX=0.0154434;HRUN=6;LEN=1;MLLD=159.504;QD=37.1122;RBI=0.00846547;REFB=0.00798924;REVB=-0.00807901;RO=5;SAF=110;SAR=144;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00874148;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.94572e-06;OID=.;OPOS=89854446;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:259:255:5:0:254:255:144:110:1:4:145:110:0:0 chr7 89856608 . C T 2931.89 PASS AO=311;DP=315;FAO=314;FDP=314;FR=.;FRO=0;FSAF=154;FSAR=160;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.027018;FXX=0.00946342;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.609;QD=37.3489;RBI=0.0401855;REFB=-0.0798909;REVB=-0.0297474;RO=4;SAF=151;SAR=160;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.012465;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000287811;OID=.;OPOS=89856608;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:315:314:4:0:311:314:160:151:4:0:160:154:0:0 chr7 89861832 . G A 1792.05 PASS AO=179;DP=179;FAO=187;FDP=187;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0689063;FXX=0.00531887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.165;QD=38.3326;RBI=0.0827756;REFB=0;REVB=0.0458662;RO=0;SAF=70;SAR=109;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.5403e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.44895e-05;OID=.;OPOS=89861832;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:179:187:0:0:179:187:109:70:0:0:111:76:0:0 chr7 89861890 . G T 882.01 PASS AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.053245;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.2397;QD=37.9359;RBI=0.05887;REFB=0;REVB=0.0251126;RO=0;SAF=31;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000720397;OID=.;OPOS=89861890;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:93:93:0:0:93:93:62:31:0:0:62:31:0:0 chr7 89867446 . T TCTG 656.49 PASS AO=80;DP=130;FAO=91;FDP=111;FR=.;FRO=20;FSAF=57;FSAR=34;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=0.0634982;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=3;MLLD=184.575;QD=23.6573;RBI=0.0662213;REFB=-0.0797988;REVB=0.0187946;RO=44;SAF=52;SAR=28;SRF=30;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0231484;STB=0.504557;TYPE=ins;VARB=0.0180439;OID=.;OPOS=89867447;OREF=-;OALT=CTG;OMAPALT=TCTG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:80:130:91:111:20:57:34:13:7:21:44:52:28:30:14 chr7 89912301 . G A 982.75 PASS AO=102;DP=106;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0248495;FXX=0.0370336;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.55;QD=37.7981;RBI=0.0251603;REFB=-0.0166234;REVB=0.00394262;RO=1;SAF=71;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0150571;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.13421e-05;OID=.;OPOS=89912301;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:106:104:1:0:102:104:31:71:0:1:31:73:0:0 chr7 89938588 . C G 1232.18 PASS AO=125;DP=128;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0555369;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.6335;QD=38.2072;RBI=0.0557357;REFB=0;REVB=0.00470275;RO=3;SAF=51;SAR=74;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0271256;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000846575;OID=.;OPOS=89938588;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:128:129:3:0:125:129:74:51:3:0:75:54:0:0 chr7 89938680 . C T 1614.52 PASS AO=168;DP=168;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0205293;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.417;QD=38.441;RBI=0.0240124;REFB=0;REVB=0.0124557;RO=0;SAF=64;SAR=104;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.36374e-05;OID=.;OPOS=89938680;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:168:168:0:0:168:168:104:64:0:0:104:64:0:0 chr7 89969831 . A G 2636.9 PASS AO=275;DP=275;FAO=275;FDP=275;FR=.;FRO=0;FSAF=162;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.87;QD=38.3549;RBI=0.0491888;REFB=0;REVB=0.0441834;RO=0;SAF=162;SAR=113;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.10087e-05;OID=.;OPOS=89969831;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:275:275:0:0:275:275:113:162:0:0:113:162:0:0 chr7 89969878 . A G 2179.08 PASS AO=238;DP=244;FAO=238;FDP=244;FR=.;FRO=6;FSAF=137;FSAR=101;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=-0.0105332;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.0411;QD=35.7226;RBI=0.0197606;REFB=-0.0526961;REVB=0.0167192;RO=3;SAF=136;SAR=102;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00576069;STB=0.510259;TYPE=snp;VARB=0.000972451;OID=.;OPOS=89969878;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:244:244:3:6:238:238:102:136:1:2:101:137:1:5 chr7 89983808 . T G 1000.76 PASS AO=103;DP=103;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00109513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.08;QD=38.1243;RBI=0.0252576;REFB=0;REVB=0.0252338;RO=0;SAF=23;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.69118e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.90375e-05;OID=.;OPOS=89983808;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:103:105:0:0:103:105:80:23:0:0:82:23:0:0 chr7 89984409 . A G 1603.56 PASS AO=166;DP=170;FAO=166;FDP=166;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0229606;FXX=0.023528;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.244;QD=38.6399;RBI=0.0246528;REFB=0;REVB=0.00897622;RO=0;SAF=88;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000172149;OID=.;OPOS=89984409;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:170:166:0:0:166:166:78:88:0:0:78:88:0:0 chr7 90042857 . G T 1174.79 PASS AO=122;DP=123;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190524;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.7697;QD=37.5932;RBI=0.0408702;REFB=-0.0785654;REVB=0.0361577;RO=0;SAF=44;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.06142e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000632568;OID=.;OPOS=90042857;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:123:125:0:0:122:125:78:44:0:0:80:45:0:0 chr7 90043182 . A G 1587.07 PASS AO=170;DP=172;FAO=170;FDP=170;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00543976;FXX=0.0116272;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.824;QD=37.3429;RBI=0.00544394;REFB=-0.0414071;REVB=0.000213279;RO=1;SAF=88;SAR=82;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00537804;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0002928;OID=.;OPOS=90043182;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:172:170:1:0:170:170:82:88:1:0:82:88:0:0 chr7 90043304 . C T 1791.16 PASS AO=189;DP=191;FAO=189;FDP=189;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=123;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229111;FXX=0.0104707;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.3535;QD=37.9081;RBI=0.0356067;REFB=-0.0596402;REVB=-0.0272566;RO=1;SAF=66;SAR=123;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00385601;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000190409;OID=.;OPOS=90043304;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:191:189:1:0:189:189:123:66:0:1:123:66:0:0 chr7 90043314 . C T 2013 PASS AO=211;DP=211;FAO=211;FDP=211;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=127;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012324;FXX=0.00471676;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.405;QD=38.1611;RBI=0.0124096;REFB=0;REVB=0.00145489;RO=0;SAF=84;SAR=127;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.43776e-06;OID=.;OPOS=90043314;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:211:211:0:0:211:211:127:84:0:0:127:84:0:0 chr7 90236415 . A G 941.67 PASS AO=104;DP=112;FAO=107;FDP=112;FR=.;FRO=5;FSAF=38;FSAR=69;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0234072;FXX=0.0588186;HRUN=4;LEN=1;MLLD=163.585;QD=33.6311;RBI=0.0263438;REFB=-0.0577757;REVB=0.012087;RO=5;SAF=38;SAR=66;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.058445;STB=0.530858;TYPE=snp;VARB=0.00229703;OID=.;OPOS=90236415;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:112:112:5:5:104:107:66:38:5:0:69:38:5:0 chr7 90338850 . C T 188.94 PASS AO=47;DP=102;FAO=47;FDP=102;FR=.;FRO=55;FSAF=32;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=36;FWDB=-0.0218736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.27;QD=7.4093;RBI=0.0255723;REFB=-0.026989;REVB=-0.0132473;RO=55;SAF=32;SAR=15;SRF=19;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.324128;STB=0.680774;TYPE=snp;VARB=0.020065;OID=.;OPOS=90338850;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:55:55:47:47:15:32:19:36:15:32:19:36 chr7 90837216 . G A 279.84 PASS AO=72;DP=161;FAO=73;FDP=162;FR=.;FRO=89;FSAF=39;FSAR=34;FSRF=40;FSRR=49;FWDB=-0.00734839;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.127;QD=6.90956;RBI=0.0142395;REFB=-0.0034482;REVB=0.0121969;RO=89;SAF=38;SAR=34;SRF=40;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0777058;STB=0.546501;TYPE=snp;VARB=0.00452922;OID=.;OPOS=90837216;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:162:89:89:72:73:34:38:40:49:34:39:40:49 chr7 90838866 . G A 133.47 PASS AO=39;DP=99;FAO=39;FDP=98;FR=.;FRO=59;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=30;FSRR=29;FWDB=-0.0384272;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.496;QD=5.44776;RBI=0.0404043;REFB=-0.00252597;REVB=0.0124841;RO=57;SAF=22;SAR=17;SRF=29;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0584485;STB=0.533738;TYPE=snp;VARB=0.00236498;OID=.;OPOS=90838866;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:98:57:59:39:39:17:22:29:28:17:22:30:29 chr7 90838869 . G C 990.35 PASS AO=104;DP=105;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0293911;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7996;QD=38.0903;RBI=0.0581016;REFB=0;REVB=-0.0501194;RO=0;SAF=58;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00013471;OID=.;OPOS=90838869;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:105:104:0:0:104:104:46:58:0:0:46:58:0:0 chr7 91503228 . C T 351.99 PASS AO=65;DP=106;FAO=65;FDP=106;FR=.;FRO=41;FSAF=35;FSAR=30;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=0.0142553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.875;QD=13.2825;RBI=0.0156779;REFB=-0.00831844;REVB=-0.00652561;RO=41;SAF=35;SAR=30;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0361639;STB=0.519645;TYPE=snp;VARB=0.00527967;OID=.;OPOS=91503228;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:41:41:65:65:30:35:20:21:30:35:20:21 chr7 91599825 . A C 67.19 PASS AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.00879016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.705;QD=7.46537;RBI=0.0448962;REFB=-0.000334473;REVB=-0.0440273;RO=20;SAF=10;SAR=6;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171002;STB=0.598467;TYPE=snp;VARB=-0.000202063;OID=.;OPOS=91599825;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:36:36:20:20:16:16:6:10:9:11:6:10:9:11 chr7 91630620 . G T 38.95 PASS AO=15;DP=52;FAO=15;FDP=52;FR=.;FRO=37;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=0.0220195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.368;QD=2.996;RBI=0.0374061;REFB=-0.0175746;REVB=0.0302384;RO=33;SAF=6;SAR=9;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00725741;STB=0.503995;TYPE=snp;VARB=0.0243701;OID=.;OPOS=91630620;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:52:52:33:37:15:15:9:6:13:20:9:6:15:22 chr7 91632306 . C T 316.31 PASS AO=63;DP=111;FAO=63;FDP=111;FR=.;FRO=48;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=31;FSRR=17;FWDB=-0.0241749;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.182;QD=11.3984;RBI=0.039354;REFB=-0.023536;REVB=0.0310534;RO=47;SAF=30;SAR=33;SRF=31;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142936;STB=0.572992;TYPE=snp;VARB=0.0135781;OID=.;OPOS=91632306;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:47:48:63:63:33:30:31:16:33:30:31:17 chr7 91641928 . A G 299.18 PASS AO=65;DP=123;FAO=65;FDP=123;FR=.;FRO=58;FSAF=16;FSAR=49;FSRF=15;FSRR=43;FWDB=0.0287982;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.946;QD=9.72932;RBI=0.0307015;REFB=-0.00360058;REVB=0.0106417;RO=57;SAF=16;SAR=49;SRF=15;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192713;STB=0.507854;TYPE=snp;VARB=0.00432192;OID=.;OPOS=91641928;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:57:58:65:65:49:16:15:42:49:16:15:43 chr7 91652178 . A AAAC 135.92 PASS AO=36;DP=102;FAO=38;FDP=92;FR=.;FRO=54;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=36;FSRR=18;FWDB=0.00642799;FXX=0.0107515;HRUN=3;LEN=3;MLLD=251.696;QD=5.90961;RBI=0.019967;REFB=0.0109845;REVB=0.018904;RO=66;SAF=19;SAR=17;SRF=44;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159076;STB=0.583291;TYPE=ins;VARB=-0.013073;OID=.;OPOS=91652179;OREF=-;OALT=AAC;OMAPALT=AAAC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:36:102:38:92:54:20:18:36:18:99:66:19:17:44:22 chr7 91691601 . C T 276.63 PASS AO=67;DP=145;FAO=69;FDP=147;FR=.;FRO=78;FSAF=26;FSAR=43;FSRF=38;FSRR=40;FWDB=-0.0222003;FXX=0.0067563;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.393;QD=7.52741;RBI=0.0358101;REFB=-0.0196075;REVB=-0.0280982;RO=77;SAF=27;SAR=40;SRF=38;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0888166;STB=0.560471;TYPE=snp;VARB=0.0233272;OID=.;OPOS=91691601;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:147:77:78:67:69:40:27:38:39:43:26:38:40 chr7 91708898 . A G 180.77 PASS AO=37;DP=68;FAO=37;FDP=68;FR=.;FRO=31;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.0270029;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=190.486;QD=10.6333;RBI=0.0294187;REFB=-0.00915999;REVB=0.0116749;RO=31;SAF=19;SAR=18;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0510298;STB=0.528182;TYPE=snp;VARB=0.0080963;OID=.;OPOS=91708898;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:31:31:37:37:18:19:14:17:18:19:14:17 chr7 91712698 . A G 211.11 PASS AO=58;DP=135;FAO=58;FDP=135;FR=.;FRO=77;FSAF=20;FSAR=38;FSRF=43;FSRR=34;FWDB=-0.000706223;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.207;QD=6.255;RBI=0.0147437;REFB=-0.0268345;REVB=0.0147268;RO=77;SAF=20;SAR=38;SRF=43;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.2218;STB=0.62437;TYPE=snp;VARB=0.0240496;OID=.;OPOS=91712698;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:77:77:58:58:38:20:43:34:38:20:43:34 chr7 91713972 . C T 515.75 PASS AO=131;DP=276;FAO=131;FDP=276;FR=.;FRO=145;FSAF=84;FSAR=47;FSRF=84;FSRR=61;FWDB=-0.00712147;FXX=0.00360998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.393;QD=7.47466;RBI=0.00763472;REFB=-0.00704481;REVB=-0.00275201;RO=144;SAF=84;SAR=47;SRF=83;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.065512;STB=0.534648;TYPE=snp;VARB=0.00829963;OID=.;OPOS=91713972;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:276:276:144:145:131:131:47:84:83:61:47:84:84:61 chr7 91714911 . C T 1745.2 PASS AO=190;DP=198;FAO=193;FDP=200;FR=.;FRO=7;FSAF=149;FSAR=44;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0294607;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.399;QD=34.904;RBI=0.03393;REFB=0.0366725;REVB=0.0168319;RO=7;SAF=148;SAR=42;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0336724;STB=0.516761;TYPE=snp;VARB=-0.000841336;OID=.;OPOS=91714911;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:198:200:7:7:190:193:42:148:3:4:44:149:3:4 chr7 91715662 . C T 444.23 PASS AO=93;DP=167;FAO=92;FDP=166;FR=.;FRO=74;FSAF=37;FSAR=55;FSRF=36;FSRR=38;FWDB=-0.0196414;FXX=0.0119041;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.669;QD=10.7044;RBI=0.039083;REFB=-0.0244193;REVB=-0.033789;RO=73;SAF=38;SAR=55;SRF=35;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0584231;STB=0.538484;TYPE=snp;VARB=0.0208336;OID=.;OPOS=91715662;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:166:73:74:93:92:55:38:35:38:55:37:36:38 chr7 91726927 . A C 206.14 PASS AO=44;DP=83;FAO=44;FDP=83;FR=.;FRO=39;FSAF=35;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=-0.0155425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.139;QD=9.93425;RBI=0.0212956;REFB=-0.023451;REVB=0.014558;RO=39;SAF=35;SAR=9;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.316032;STB=0.676127;TYPE=snp;VARB=0.018116;OID=.;OPOS=91726927;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:39:39:44:44:9:35:19:20:9:35:19:20 chr7 91743150 . A G 291.14 PASS AO=80;DP=192;FAO=83;FDP=194;FR=.;FRO=111;FSAF=26;FSAR=57;FSRF=58;FSRR=53;FWDB=-0.0083905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.3761;QD=6.00279;RBI=0.0155397;REFB=0.00189006;REVB=-0.0130798;RO=111;SAF=24;SAR=56;SRF=58;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.244036;STB=0.626015;TYPE=snp;VARB=-0.00264616;OID=.;OPOS=91743150;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:194:111:111:80:83:56:24:58:53:57:26:58:53 chr7 91779242 . G A 322.28 PASS AO=85;DP=184;FAO=89;FDP=206;FR=.;FRO=117;FSAF=43;FSAR=46;FSRF=55;FSRR=62;FWDB=-0.00958615;FXX=0.00483068;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.676;QD=6.25777;RBI=0.0114838;REFB=-0.0235154;REVB=-0.00632325;RO=98;SAF=43;SAR=42;SRF=54;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0436957;STB=0.507428;TYPE=snp;VARB=0.0262651;OID=.;OPOS=91779242;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:206:98:117:85:89:42:43:54:44:46:43:55:62 chr7 91779971 . T G 452.76 PASS AO=102;DP=200;FAO=102;FDP=199;FR=.;FRO=97;FSAF=5;FSAR=97;FSRF=8;FSRR=89;FWDB=0.0292842;FXX=0.00499975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.0909;QD=9.10078;RBI=0.0293559;REFB=-0.035532;REVB=-0.00204945;RO=96;SAF=5;SAR=97;SRF=7;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101064;STB=0.57552;TYPE=snp;VARB=0.0320806;OID=.;OPOS=91779971;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:200:199:96:97:102:102:97:5:7:89:97:5:8:89 chr7 92028039 . C A 122.18 PASS AO=23;DP=40;FAO=24;FDP=43;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=21;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=0.00111896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.831;QD=11.3652;RBI=0.012189;REFB=-0.0101935;REVB=0.0121376;RO=17;SAF=2;SAR=21;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.391873;STB=0.649338;TYPE=snp;VARB=0.00640931;OID=.;OPOS=92028039;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:40:43:17:19:23:24:21:2:6:11:21:3:6:13 chr7 92028239 . GC G,GT 73.48 PASS AO=5,2;DP=8;FAO=8,0;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0;FSAR=8,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0,0;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=24.1355,5.23303;QD=36.7409;RBI=0.353971,0.0635322;REFB=0,0;REVB=0.353971,0.0635322;RO=1;SAF=0,0;SAR=5,2;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0452342,0;OID=.,.;OPOS=92028240,92028240;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=G,GT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:5,2:8:8,0:8:0:0,0:8,0:0:0:4:1:0,0:5,2:0:1 chr7 92029302 . G A 461.11 PASS AO=109;DP=221;FAO=109;FDP=220;FR=.;FRO=111;FSAF=34;FSAR=75;FSRF=42;FSRR=69;FWDB=0.0170246;FXX=0.00452468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.8759;QD=8.38388;RBI=0.0179968;REFB=-0.0150935;REVB=0.00583515;RO=110;SAF=34;SAR=75;SRF=42;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0720467;STB=0.537932;TYPE=snp;VARB=0.0092842;OID=.;OPOS=92029302;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:220:110:111:109:109:75:34:42:68:75:34:42:69 chr7 92098776 . C T 188.14 PASS AO=56;DP=136;FAO=55;FDP=135;FR=.;FRO=80;FSAF=39;FSAR=16;FSRF=47;FSRR=33;FWDB=0.000189875;FXX=0.0073524;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.267;QD=5.57462;RBI=0.0214973;REFB=0.009638;REVB=-0.0214964;RO=80;SAF=39;SAR=17;SRF=47;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126606;STB=0.58135;TYPE=snp;VARB=-0.0137124;OID=.;OPOS=92098776;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:135:80:80:56:55:17:39:47:33:16:39:47:33 chr7 92131289 . G T 1453.68 PASS AO=151;DP=157;FAO=151;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165908;FXX=0.044301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.297;QD=38.508;RBI=0.0173815;REFB=0;REVB=-0.00518293;RO=0;SAF=60;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000102208;OID=.;OPOS=92131289;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:157:151:0:0:151:151:91:60:0:0:91:60:0:0 chr7 92163629 . T C 67.9 PASS AO=30;DP=102;FAO=30;FDP=105;FR=.;FRO=75;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=32;FSRR=43;FWDB=0.00547412;FXX=0.0186898;HRUN=7;LEN=1;MLLD=64.4022;QD=2.58653;RBI=0.0152083;REFB=-0.00633897;REVB=-0.014189;RO=72;SAF=16;SAR=14;SRF=29;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155285;STB=0.575708;TYPE=snp;VARB=0.0123834;OID=.;OPOS=92163629;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:102:105:72:75:30:30:14:16:29:43:14:16:32:43 chr7 92205151 . T C 36.55 PASS AO=10;DP=28;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=15;FWDB=-0.0264104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.221;QD=5.2211;RBI=0.027256;REFB=-0.0236559;REVB=0.0067368;RO=17;SAF=1;SAR=9;SRF=3;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178962;STB=0.599771;TYPE=snp;VARB=0.023324;OID=.;OPOS=92205151;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:28:28:17:18:10:10:9:1:3:14:9:1:3:15 chr7 92241633 . G C 293.8 PASS AO=60;DP=108;FAO=60;FDP=108;FR=.;FRO=48;FSAF=35;FSAR=25;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=0.015802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.551;QD=10.8814;RBI=0.0199454;REFB=-0.00809284;REVB=-0.0121702;RO=47;SAF=35;SAR=25;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0593262;STB=0.537605;TYPE=snp;VARB=0.0056708;OID=.;OPOS=92241633;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:47:48:60:60:25:35:24:23:25:35:24:24 chr7 92734451 . A G 350.36 PASS AO=92;DP=203;FAO=92;FDP=203;FR=.;FRO=111;FSAF=45;FSAR=47;FSRF=30;FSRR=81;FWDB=-0.0489015;FXX=0.00490172;HRUN=3;LEN=1;MLLD=64.4555;QD=6.90369;RBI=0.0546287;REFB=-0.0216036;REVB=-0.0243504;RO=108;SAF=45;SAR=47;SRF=29;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217633;STB=0.620331;TYPE=snp;VARB=0.0182155;OID=.;OPOS=92734451;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:203:108:111:92:92:47:45:29:79:47:45:30:81 chr7 92734983 . A G 777.99 PASS AO=165;DP=301;FAO=165;FDP=301;FR=.;FRO=136;FSAF=76;FSAR=89;FSRF=61;FSRR=75;FWDB=0.00850031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3635;QD=10.3388;RBI=0.0134263;REFB=-0.0101997;REVB=0.0103928;RO=135;SAF=76;SAR=89;SRF=61;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00729427;STB=0.505495;TYPE=snp;VARB=0.0131019;OID=.;OPOS=92734983;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:301:301:135:136:165:165:89:76:61:74:89:76:61:75 chr7 92760738 . T G 458.83 PASS AO=109;DP=296;FAO=118;FDP=263;FR=.;FRO=145;FSAF=73;FSAR=45;FSRF=85;FSRR=60;FWDB=0.00583875;FXX=0.0931002;HRUN=8;LEN=1;MLLD=81.3678;QD=6.97847;RBI=0.0649651;REFB=0.000151799;REVB=-0.0647022;RO=74;SAF=69;SAR=40;SRF=48;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125936;STB=0.518779;TYPE=snp;VARB=-0.000944627;OID=.;OPOS=92760738;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:263:74:145:109:118:40:69:48:26:45:73:85:60 chr7 92764982 . C T 141.94 PASS AO=51;DP=176;FAO=59;FDP=181;FR=.;FRO=122;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=63;FSRR=59;FWDB=0.0211157;FXX=0.0163035;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.242;QD=3.13679;RBI=0.0219438;REFB=0.00155776;REVB=0.00597171;RO=124;SAF=24;SAR=27;SRF=62;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0355956;STB=0.505338;TYPE=snp;VARB=-0.00280568;OID=.;OPOS=92764982;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:181:124:122:51:59:27:24:62:62:29:30:63:59 chr7 92844960 . AGG A,AGA 3358.24 PASS AO=117,70;DP=408;FAO=306,70;FDP=385;FR=.;FRO=9;FSAF=135,0;FSAR=171,70;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=0.932401,0.35778;FXX=0.00773176;HRUN=3,3;LEN=2,1;MLLD=32.0282,126.871;QD=34.8908;RBI=0.944275,0.357885;REFB=-0.20027,-0.0652782;REVB=0.14928,0.00868108;RO=139;SAF=0,0;SAR=117,70;SRF=130;SRR=9;SSEN=0.683616,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.905136,-0.899729;STB=0.51282,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0163538,0.00283693;OID=.,.;OPOS=92844961,92844962;OREF=GG,G;OALT=-,A;OMAPALT=A,AGA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:117,70:381:306,70:385:9:135,0:171,70:0:9:55:139:0,0:117,70:130:9 chr7 92970847 . C T 2447.21 PASS AO=257;DP=258;FAO=256;FDP=256;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=161;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0337432;FXX=0.015384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.29;QD=38.2376;RBI=0.0357572;REFB=-0.0623418;REVB=-0.0118311;RO=0;SAF=98;SAR=159;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.56374e-05;OID=.;OPOS=92970847;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:258:256:0:0:257:256:159:98:0:0:161:95:0:0 chr7 93055753 . A G 182.44 PASS AO=41;DP=82;FAO=42;FDP=85;FR=.;FRO=43;FSAF=27;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=-0.0111614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.772;QD=8.58553;RBI=0.0114919;REFB=-0.0162467;REVB=0.00273631;RO=41;SAF=27;SAR=14;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182303;STB=0.60408;TYPE=snp;VARB=0.0210147;OID=.;OPOS=93055753;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:85:41:43:41:42:14:27:19:22:15:27:19:24 chr7 93116299 . A G 220.95 PASS AO=52;DP=118;FAO=55;FDP=119;FR=.;FRO=64;FSAF=22;FSAR=33;FSRF=37;FSRR=27;FWDB=-0.0120443;FXX=0.0245881;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.962;QD=7.42672;RBI=0.0283369;REFB=-0.00941705;REVB=0.0256499;RO=50;SAF=20;SAR=32;SRF=25;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105115;STB=0.595925;TYPE=snp;VARB=0.00946833;OID=.;OPOS=93116299;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:119:50:64:52:55:32:20:25:25:33:22:37:27 chr7 93515993 . T G 496.7 PASS AO=77;DP=114;FAO=78;FDP=107;FR=.;FRO=29;FSAF=47;FSAR=31;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=-0.0218293;FXX=0.0613981;HRUN=6;LEN=1;MLLD=99.242;QD=18.5683;RBI=0.0218946;REFB=-0.122057;REVB=-0.00168924;RO=4;SAF=46;SAR=31;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.039392;STB=0.505138;TYPE=snp;VARB=0.00346536;OID=.;OPOS=93515993;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:114:107:4:29:77:78:31:46:4:0:31:47:18:11 chr7 93540153 . G C 511.13 PASS AO=104;DP=187;FAO=105;FDP=187;FR=.;FRO=82;FSAF=60;FSAR=45;FSRF=48;FSRR=34;FWDB=-0.0065492;FXX=0.00531887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.75;QD=10.9333;RBI=0.0145559;REFB=-0.0143048;REVB=0.0129993;RO=82;SAF=60;SAR=44;SRF=48;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00700934;STB=0.506249;TYPE=snp;VARB=0.00999775;OID=.;OPOS=93540153;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:187:82:82:104:105:44:60:48:34:45:60:48:34 chr7 94028427 . G A 325.31 PASS AO=107;DP=283;FAO=108;FDP=285;FR=.;FRO=177;FSAF=53;FSAR=55;FSRF=86;FSRR=91;FWDB=0.0173116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.973;QD=4.56581;RBI=0.0219364;REFB=0.00158661;REVB=0.0134727;RO=176;SAF=53;SAR=54;SRF=85;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136479;STB=0.503022;TYPE=snp;VARB=-0.00262309;OID=.;OPOS=94028427;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:283:285:176:177:107:108:54:53:85:91:55:53:86:91 chr7 94038934 . C T 3843.79 PASS AO=415;DP=416;FAO=399;FDP=399;FR=.;FRO=0;FSAF=172;FSAR=227;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0659008;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.1591;QD=38.5343;RBI=0.0662798;REFB=0;REVB=-0.0070771;RO=0;SAF=180;SAR=235;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.20806e-05;OID=.;OPOS=94038934;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:416:399:0:0:415:399:235:180:0:0:227:172:0:0 chr7 94039032 . C T 1624.52 PASS AO=172;DP=173;FAO=172;FDP=172;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114348;FXX=0.00578001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.013;QD=37.7796;RBI=0.0343203;REFB=-0.0887271;REVB=0.0323594;RO=1;SAF=84;SAR=88;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00563282;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000150084;OID=.;OPOS=94039032;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:173:172:1:0:172:172:88:84:1:0:88:84:0:0 chr7 94041937 . A C 110.64 PASS AO=26;DP=59;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=-0.00106165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.224;QD=7.37619;RBI=0.00574624;REFB=-0.00773043;REVB=0.00564731;RO=33;SAF=13;SAR=13;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0448534;STB=0.535116;TYPE=snp;VARB=0.0157373;OID=.;OPOS=94041937;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:60:33:33:26:27:13:13:15:18:13:14:15:18 chr7 94043239 . C G 2139.88 PASS AO=154;DP=231;FAO=227;FDP=227;FR=.;FRO=0;FSAF=129;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0038276;FXX=0.00438577;HRUN=5;LEN=1;MLLD=245.357;QD=37.7072;RBI=0.00806051;REFB=-0.0395949;REVB=0.00709375;RO=0;SAF=112;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48413e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.53281e-05;OID=.;OPOS=94043239;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:87:156:227:0:0:154:227:42:112:0:0:98:129:0:0 chr7 94296769 . T C 1635.29 PASS AO=168;DP=169;FAO=172;FDP=172;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249908;FXX=0.0114936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.624;QD=38.03;RBI=0.0657942;REFB=0;REVB=0.0608633;RO=0;SAF=96;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0554e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000156082;OID=.;OPOS=94296769;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:169:172:0:0:168:172:72:96:0:0:75:97:0:0 chr7 94297293 . GT G 700.82 PASS AO=106;DP=137;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0786362;FXX=0.0222206;HRUN=7;LEN=1;MLLD=10.8566;QD=21.237;RBI=0.0935278;REFB=0;REVB=-0.0506339;RO=7;SAF=66;SAR=40;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00638121;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.00288095;OID=.;OPOS=94297294;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:106:128:132:132:0:83:49:0:0:62:7:66:40:4:3 chr7 94341759 . A G 442.83 PASS AO=100;DP=197;FAO=101;FDP=197;FR=.;FRO=96;FSAF=47;FSAR=54;FSRF=50;FSRR=46;FWDB=-0.00389605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.42;QD=8.99136;RBI=0.0155599;REFB=0.00769142;REVB=-0.0150643;RO=96;SAF=46;SAR=54;SRF=51;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0636561;STB=0.527062;TYPE=snp;VARB=-0.00620466;OID=.;OPOS=94341759;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:197:96:96:100:101:54:46:51:45:54:47:50:46 chr7 94540527 . G A 281.44 PASS AO=61;DP=123;FAO=64;FDP=126;FR=.;FRO=62;FSAF=34;FSAR=30;FSRF=31;FSRR=31;FWDB=-0.0192539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.054;QD=8.93448;RBI=0.0193463;REFB=0.0177367;REVB=-0.00188915;RO=62;SAF=32;SAR=29;SRF=31;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.02246;STB=0.515403;TYPE=snp;VARB=-0.0160613;OID=.;OPOS=94540527;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:126:62:62:61:64:29:32:31:31:30:34:31:31 chr7 94898811 . G A 131.04 PASS AO=26;DP=47;FAO=26;FDP=47;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=2;FSRR=19;FWDB=0.0260243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.471;QD=11.1525;RBI=0.0576492;REFB=-0.00255111;REVB=0.0514409;RO=21;SAF=9;SAR=17;SRF=2;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.244464;STB=0.633962;TYPE=snp;VARB=0.00109611;OID=.;OPOS=94898811;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:47:47:21:21:26:26:17:9:2:19:17:9:2:19 chr7 94924538 . G T 321.32 PASS AO=81;DP=178;FAO=82;FDP=178;FR=.;FRO=96;FSAF=51;FSAR=31;FSRF=47;FSRR=49;FWDB=0.0150224;FXX=0.00558628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.91;QD=7.22068;RBI=0.0153437;REFB=-0.00313314;REVB=-0.0031236;RO=96;SAF=51;SAR=30;SRF=47;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140618;STB=0.573177;TYPE=snp;VARB=0.00377795;OID=.;OPOS=94924538;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:178:96:96:81:82:30:51:47:49:31:51:47:49 chr7 94937446 . T C 344.62 PASS AO=79;DP=156;FAO=79;FDP=156;FR=.;FRO=77;FSAF=42;FSAR=37;FSRF=32;FSRR=45;FWDB=0.013723;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.475;QD=8.83649;RBI=0.0149898;REFB=-0.00387455;REVB=0.00603093;RO=77;SAF=42;SAR=37;SRF=32;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103866;STB=0.557087;TYPE=snp;VARB=0.00532407;OID=.;OPOS=94937446;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:156:77:77:79:79:37:42:32:45:37:42:32:45 chr7 95001555 . C T 562.66 PASS AO=129;DP=254;FAO=129;FDP=252;FR=.;FRO=123;FSAF=83;FSAR=46;FSRF=50;FSRR=73;FWDB=-0.0680606;FXX=0.00787371;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.1669;QD=8.93104;RBI=0.069484;REFB=-0.00573736;REVB=-0.013992;RO=115;SAF=83;SAR=46;SRF=43;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234602;STB=0.617487;TYPE=snp;VARB=0.00671759;OID=.;OPOS=95001555;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:254:252:115:123:129:129:46:83:43:72:46:83:50:73 chr7 95024046 . A G 68.67 PASS AO=41;DP=165;FAO=41;FDP=165;FR=.;FRO=124;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=34;FSRR=90;FWDB=0.0199424;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.522;QD=1.66465;RBI=0.0293308;REFB=-0.00833838;REVB=-0.021508;RO=120;SAF=19;SAR=22;SRF=31;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.267647;STB=0.645959;TYPE=snp;VARB=0.0268916;OID=.;OPOS=95024046;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:165:165:120:124:41:41:22:19:31:89:22:19:34:90 chr7 95025600 . G A 158.82 PASS AO=54;DP=150;FAO=54;FDP=150;FR=.;FRO=96;FSAF=11;FSAR=43;FSRF=40;FSRR=56;FWDB=0.0620467;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2613;QD=4.2352;RBI=0.0709593;REFB=-0.022532;REVB=0.0344301;RO=92;SAF=11;SAR=43;SRF=37;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.272207;STB=0.668121;TYPE=snp;VARB=0.0757224;OID=.;OPOS=95025600;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:150:92:96:54:54:43:11:37:55:43:11:40:56 chr7 95212804 . C T 235.7 PASS AO=58;DP=123;FAO=58;FDP=122;FR=.;FRO=64;FSAF=47;FSAR=11;FSRF=40;FSRR=24;FWDB=0.022844;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.5892;QD=7.72773;RBI=0.036952;REFB=0.00429102;REVB=-0.0290448;RO=63;SAF=47;SAR=11;SRF=40;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223835;STB=0.632155;TYPE=snp;VARB=-0.00467119;OID=.;OPOS=95212804;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:122:63:64:58:58:11:47:40:23:11:47:40:24 chr7 95213059 . G A 231.44 PASS AO=70;DP=172;FAO=69;FDP=171;FR=.;FRO=102;FSAF=25;FSAR=44;FSRF=49;FSRR=53;FWDB=-0.00924037;FXX=0.01156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.109;QD=5.41369;RBI=0.0093802;REFB=-0.00894238;REVB=0.00161358;RO=90;SAF=26;SAR=44;SRF=49;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177102;STB=0.573117;TYPE=snp;VARB=0.00699498;OID=.;OPOS=95213059;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:171:90:102:70:69:44:26:49:41:44:25:49:53 chr7 95213953 . A C 384.01 PASS AO=96;DP=200;FAO=96;FDP=203;FR=.;FRO=107;FSAF=39;FSAR=57;FSRF=42;FSRR=65;FWDB=-0.0117177;FXX=0.00490172;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.939;QD=7.56676;RBI=0.0248041;REFB=-0.0125084;REVB=-0.0218618;RO=102;SAF=39;SAR=57;SRF=38;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0328944;STB=0.507518;TYPE=snp;VARB=0.0120281;OID=.;OPOS=95213953;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:200:203:102:107:96:96:57:39:38:64:57:39:42:65 chr7 95216394 . T G 203.24 PASS AO=60;DP=146;FAO=59;FDP=144;FR=.;FRO=85;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=45;FSRR=40;FWDB=-0.00243013;FXX=0.0136977;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.8601;QD=5.64546;RBI=0.0168261;REFB=0.0014554;REVB=-0.0166496;RO=86;SAF=26;SAR=34;SRF=45;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0945465;STB=0.562626;TYPE=snp;VARB=-0.00365752;OID=.;OPOS=95216394;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:144:86:85:60:59:34:26:45:41:34:25:45:40 chr7 95499234 . A G 513.55 PASS AO=112;DP=211;FAO=112;FDP=211;FR=.;FRO=99;FSAF=51;FSAR=61;FSRF=48;FSRR=51;FWDB=0.0394737;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.0571;QD=9.73544;RBI=0.046043;REFB=-0.0208194;REVB=0.0237021;RO=97;SAF=51;SAR=61;SRF=47;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0249347;STB=0.513911;TYPE=snp;VARB=0.0236899;OID=.;OPOS=95499234;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:211:97:99:112:112:61:51:47:50:61:51:48:51 chr7 95668664 . C A 720.71 PASS AO=98;DP=279;FAO=146;FDP=271;FR=.,HEALED;FRO=117;FSAF=64;FSAR=82;FSRF=41;FSRR=76;FWDB=0.0167669;FXX=0.00367634;HRUN=3;LEN=1;MLLD=108.503;QD=10.6377;RBI=0.0214016;REFB=-0.0051041;REVB=0.0133003;RO=55;SAF=60;SAR=38;SRF=38;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0559992;STB=0.540108;TYPE=snp;VARB=0.00477984;OID=.;OPOS=95668664;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:227:271:55:117:98:146:38:60:38:17:82:64:41:76 chr7 95800820 . T C 701.09 PASS AO=75;DP=77;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00862643;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.571;QD=36.8994;RBI=0.01571;REFB=-0.0458393;REVB=-0.0131297;RO=0;SAF=31;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505616;TYPE=snp;VARB=-0.00013025;OID=.;OPOS=95800820;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:77:76:0:1:75:75:44:31:0:0:44:31:0:1 chr7 96339061 . C T 101.95 PASS AO=18;DP=38;FAO=22;FDP=43;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.00502558;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.422;QD=9.48376;RBI=0.043176;REFB=-0.00977293;REVB=-0.0428825;RO=20;SAF=12;SAR=6;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.250214;STB=0.602013;TYPE=snp;VARB=0.00459677;OID=.;OPOS=96339061;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:38:43:20:21:18:22:6:12:8:12:9:13:8:13 chr7 96639166 . G C 85.73 PASS AO=22;DP=52;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.0168287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.487;QD=6.59435;RBI=0.0423894;REFB=-0.00161339;REVB=0.0389057;RO=30;SAF=11;SAR=11;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.067306;STB=0.538427;TYPE=snp;VARB=0.00235863;OID=.;OPOS=96639166;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:52:52:30:30:22:22:11:11:13:17:11:11:13:17 chr7 97488569 . A T 337.07 PASS AO=101;DP=234;FAO=97;FDP=231;FR=.;FRO=134;FSAF=62;FSAR=35;FSRF=77;FSRR=57;FWDB=0.0127354;FXX=0.01282;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.078;QD=5.83672;RBI=0.0322382;REFB=-0.00467112;REVB=-0.0296161;RO=133;SAF=65;SAR=36;SRF=77;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0701629;STB=0.539683;TYPE=snp;VARB=0.00663493;OID=.;OPOS=97488569;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:234:231:133:134:101:97:36:65:77:56:35:62:77:57 chr7 97822115 . T A 1389.89 PASS AO=149;DP=151;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0269155;FXX=0.0197355;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.989;QD=37.3126;RBI=0.0333837;REFB=-0.0194203;REVB=0.0197491;RO=1;SAF=87;SAR=62;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00543599;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00012527;OID=.;OPOS=97822115;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:151:149:1:0:149:149:62:87:1:0:62:87:0:0 chr7 97822210 . G A 1341.36 PASS AO=142;DP=146;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144448;FXX=0.0205465;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.152;QD=37.5205;RBI=0.0167872;REFB=0.000459713;REVB=0.00855321;RO=1;SAF=96;SAR=46;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.010224;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.1851e-05;OID=.;OPOS=97822210;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:146:143:1:0:142:143:46:96:0:1:47:96:0:0 chr7 97847251 . G C 14.17 PASS AO=5;DP=25;FAO=6;FDP=25;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0171208;FXX=0.0384468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.882;QD=2.26786;RBI=0.0310985;REFB=-0.00485698;REVB=0.0259614;RO=19;SAF=5;SAR=0;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.712843;STB=0.820818;TYPE=snp;VARB=0.181586;OID=.;OPOS=97847251;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:25:25:19:19:5:6:0:5:8:11:1:5:8:11 chr7 97854393 . G A 63.71 PASS AO=9;DP=12;FAO=9;FDP=12;FR=.;FRO=3;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0226902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.524;QD=21.237;RBI=0.0523343;REFB=-0.00783802;REVB=0.0471596;RO=3;SAF=6;SAR=3;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154191;STB=0.588033;TYPE=snp;VARB=0.00574438;OID=.;OPOS=97854393;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:12:12:3:3:9:9:3:6:1:2:3:6:1:2 chr7 97863145 . G A 89.63 PASS AO=17;DP=31;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=13;FWDB=0.0783832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.294;QD=11.5653;RBI=0.0788193;REFB=-0.0114798;REVB=-0.00827979;RO=12;SAF=7;SAR=10;SRF=1;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.266631;STB=0.667884;TYPE=snp;VARB=0.0211059;OID=.;OPOS=97863145;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:31:31:12:14:17:17:10:7:1:11:10:7:1:13 chr7 97921941 . C T 368.64 PASS AO=53;DP=69;FAO=53;FDP=69;FR=.;FRO=16;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.000728204;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=244.315;QD=21.3704;RBI=0.00410229;REFB=0.00690964;REVB=0.00403714;RO=15;SAF=28;SAR=25;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0800064;STB=0.535506;TYPE=snp;VARB=-0.00228237;OID=.;OPOS=97921941;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:69:69:15:16:53:53:25:28:5:10:25:28:6:10 chr7 97922851 . C T 510.14 PASS AO=99;DP=168;FAO=99;FDP=168;FR=.;FRO=69;FSAF=45;FSAR=54;FSRF=13;FSRR=56;FWDB=0.0263062;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.92;QD=12.1462;RBI=0.0366628;REFB=-0.0186887;REVB=0.0255371;RO=68;SAF=45;SAR=54;SRF=12;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216181;STB=0.612451;TYPE=snp;VARB=0.0154467;OID=.;OPOS=97922851;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:68:69:99:99:54:45:12:56:54:45:13:56 chr7 97933601 . C T 99.75 PASS AO=22;DP=47;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.0335263;FXX=0.081616;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.1248;QD=8.86663;RBI=0.0337473;REFB=-0.0198454;REVB=-0.00385622;RO=21;SAF=8;SAR=14;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143335;STB=0.604841;TYPE=snp;VARB=0.0251895;OID=.;OPOS=97933601;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:45:21:23:22:22:14:8:11:10:14:8:13:10 chr7 98460824 . C A 631.3 PASS AO=69;DP=71;FAO=70;FDP=72;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0595264;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.4743;QD=35.072;RBI=0.0687151;REFB=-0.0474282;REVB=0.0343275;RO=2;SAF=43;SAR=26;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00696729;STB=0.503344;TYPE=snp;VARB=0.00607045;OID=.;OPOS=98460824;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:71:72:2:2:69:70:26:43:1:1:27:43:1:1 chr7 98495408 . G C 498.73 PASS AO=147;DP=361;FAO=151;FDP=365;FR=.;FRO=214;FSAF=90;FSAR=61;FSRF=112;FSRR=102;FWDB=-0.0161109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.4757;QD=5.4655;RBI=0.048183;REFB=0.0152642;REVB=0.0454097;RO=210;SAF=90;SAR=57;SRF=109;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100713;STB=0.543489;TYPE=snp;VARB=-0.0147746;OID=.;OPOS=98495408;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:361:365:210:214:147:151:57:90:109:101:61:90:112:102 chr7 98498308 . T C 222.48 PASS AO=61;DP=142;FAO=61;FDP=142;FR=.;FRO=81;FSAF=26;FSAR=35;FSRF=48;FSRR=33;FWDB=0.00172538;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=277.057;QD=6.26703;RBI=0.0216961;REFB=-0.0115277;REVB=0.0216274;RO=81;SAF=26;SAR=35;SRF=48;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168675;STB=0.594279;TYPE=snp;VARB=0.0145434;OID=.;OPOS=98498308;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:81:81:61:61:35:26:48:33:35:26:48:33 chr7 98602961 . GT G 44.17 PASS AO=15;DP=41;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=16;FWDB=0.139613;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.9256;QD=4.53062;RBI=0.168998;REFB=-0.0276767;REVB=-0.0952287;RO=22;SAF=2;SAR=13;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.295199;STB=0.543435;TYPE=del;VARB=0.0980561;OID=.;OPOS=98602962;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:15:39:19:39:20:5:14:4:16:39:22:2:13:7:15 chr7 98606106 . C T 159.96 PASS AO=28;DP=44;FAO=28;FDP=44;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.0285362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.16;QD=14.5421;RBI=0.0337961;REFB=-0.0356488;REVB=0.0181069;RO=16;SAF=12;SAR=16;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0363951;STB=0.519986;TYPE=snp;VARB=0.00848882;OID=.;OPOS=98606106;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:44:44:16:16:28:28:16:12:6:10:16:12:6:10 chr7 98650051 . G C 148.65 PASS AO=42;DP=94;FAO=42;FDP=94;FR=.;FRO=52;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=14;FSRR=38;FWDB=-0.0274431;FXX=0.0105252;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.3503;QD=6.32552;RBI=0.0657937;REFB=-0.0230009;REVB=0.0597971;RO=52;SAF=14;SAR=28;SRF=14;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0733799;STB=0.540965;TYPE=snp;VARB=0.0279634;OID=.;OPOS=98650051;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:52:52:42:42:28:14:14:38:28:14:14:38 chr7 98782750 . C T 380.37 PASS AO=79;DP=144;FAO=80;FDP=144;FR=.;FRO=64;FSAF=43;FSAR=37;FSRF=42;FSRR=22;FWDB=0.0135797;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=125.642;QD=10.5657;RBI=0.0147658;REFB=-0.0189456;REVB=-0.00579837;RO=64;SAF=42;SAR=37;SRF=42;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103395;STB=0.553489;TYPE=snp;VARB=0.017277;OID=.;OPOS=98782750;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:144:64:64:79:80:37:42:42:22:37:43:42:22 chr7 99306685 . C G 2296.91 PASS AO=238;DP=238;FAO=239;FDP=239;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=134;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0054521;FXX=0.00416649;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0754;QD=38.442;RBI=0.0289743;REFB=0;REVB=0.0284567;RO=0;SAF=104;SAR=134;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000171107;OID=.;OPOS=99306685;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:238:239:0:0:238:239:134:104:0:0:134:105:0:0 chr7 99474427 . A G 252.35 PASS AO=65;DP=143;FAO=65;FDP=143;FR=.;FRO=78;FSAF=44;FSAR=21;FSRF=39;FSRR=39;FWDB=-0.00421575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.228;QD=7.0588;RBI=0.00424604;REFB=-0.0148253;REVB=-0.00050633;RO=75;SAF=44;SAR=21;SRF=37;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186959;STB=0.602295;TYPE=snp;VARB=0.0170068;OID=.;OPOS=99474427;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:75:78:65:65:21:44:37:38:21:44:39:39 chr7 99569394 . G A 2261.52 PASS AO=240;DP=242;FAO=241;FDP=241;FR=.;FRO=0;FSAF=147;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0273027;FXX=0.0242905;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.165;QD=37.5356;RBI=0.027309;REFB=-0.126086;REVB=-0.000585946;RO=0;SAF=145;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.15722e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00090612;OID=.;OPOS=99569394;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:242:241:0:0:240:241:95:145:0:0:94:147:0:0 chr7 99580907 . C G 1047.32 PASS AO=112;DP=115;FAO=113;FDP=115;FR=.;FRO=2;FSAF=58;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.091236;FXX=0.00861995;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.6649;QD=36.4284;RBI=0.0912368;REFB=0.0537001;REVB=-0.000381665;RO=1;SAF=57;SAR=55;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00855451;STB=0.500231;TYPE=snp;VARB=-0.000258627;OID=.;OPOS=99580907;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:115:115:1:2:112:113:55:57:0:1:55:58:1:1 chr7 99654689 . G A 415.61 PASS AO=47;DP=49;FAO=46;FDP=48;FR=.;FRO=2;FSAF=32;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0874942;FXX=0.020404;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2438;QD=34.6342;RBI=0.104322;REFB=-0.0760682;REVB=-0.0568148;RO=2;SAF=32;SAR=15;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0158556;STB=0.533318;TYPE=snp;VARB=0.00250845;OID=.;OPOS=99654689;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:49:48:2:2:47:46:15:32:1:1:14:32:0:2 chr7 99693078 . G A 1065.54 PASS AO=103;DP=103;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.030568;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.283;QD=38.0551;RBI=0.038819;REFB=0;REVB=0.0239272;RO=0;SAF=48;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000175984;OID=.;OPOS=99693078;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:103:112:0:0:103:112:55:48:0:0:62:50:0:0 chr7 99747130 . G A 1048.82 PASS AO=111;DP=112;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.002;QD=37.4579;RBI=0.0207131;REFB=0;REVB=-0.0180939;RO=1;SAF=68;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0069312;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.41488e-05;OID=.;OPOS=99747130;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:112:112:1:0:111:112:43:68:1:0:43:69:0:0 chr7 99751281 . G T 210.66 PASS AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0303021;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.6074;QD=36.6368;RBI=0.0423346;REFB=0;REVB=0.0295635;RO=0;SAF=6;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.9951e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.57116e-05;OID=.;OPOS=99751281;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:0:0:23:23:17:6:0:0:17:6:0:0 chr7 99757612 . G A 1289.43 PASS AO=134;DP=134;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0208796;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.595;QD=38.2053;RBI=0.0505277;REFB=0;REVB=0.0460119;RO=0;SAF=63;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.23637e-05;OID=.;OPOS=99757612;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:134:135:0:0:134:135:71:63:0:0:71:64:0:0 chr7 99758136 . T G 635.59 PASS AO=66;DP=68;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0320659;FXX=0.043472;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.313;QD=38.5208;RBI=0.0573322;REFB=0;REVB=0.0475264;RO=0;SAF=36;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000237585;OID=.;OPOS=99758136;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:68:66:0:0:66:66:30:36:0:0:31:35:0:0 chr7 99768957 . C T 148.52 PASS AO=22;DP=32;FAO=23;FDP=32;FR=.;FRO=9;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.205806;FXX=0.0302939;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.0741;QD=18.5646;RBI=0.216892;REFB=-0.0576759;REVB=0.0684545;RO=9;SAF=14;SAR=8;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105832;STB=0.561904;TYPE=snp;VARB=0.0392947;OID=.;OPOS=99768957;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:32:32:9:9:22:23:8:14:4:5:8:15:4:5 chr7 99771503 . A T 84.49 PASS AO=9;DP=11;FAO=10;FDP=11;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.210504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=40.4846;QD=30.7249;RBI=0.210504;REFB=-0.233149;REVB=0;RO=2;SAF=9;SAR=0;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0628994;OID=.;OPOS=99771503;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:11:11:2:1:9:10:0:9:2:0:0:10:1:0 chr7 99772298 . A C 890.87 PASS AO=75;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=28;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0360836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.548;QD=37.9094;RBI=0.0425781;REFB=0;REVB=0.0226024;RO=0;SAF=24;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00118955;OID=.;OPOS=99772298;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:93:94:0:0:75:94:51:24:0:0:66:28:0:0 chr7 99778227 . G T 255.71 PASS AO=82;DP=213;FAO=82;FDP=213;FR=.;FRO=131;FSAF=26;FSAR=56;FSRF=38;FSRR=93;FWDB=-0.0143086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.529;QD=4.80208;RBI=0.0198539;REFB=-0.00326317;REVB=-0.0137637;RO=124;SAF=26;SAR=56;SRF=38;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0132119;STB=0.519438;TYPE=snp;VARB=0.00481912;OID=.;OPOS=99778227;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:213:213:124:131:82:82:56:26:38:86:56:26:38:93 chr7 99778285 . A C 157.42 PASS AO=48;DP=154;FAO=59;FDP=166;FR=.;FRO=107;FSAF=10;FSAR=49;FSRF=41;FSRR=66;FWDB=0.0418386;FXX=0.0514256;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.535;QD=3.79335;RBI=0.0418389;REFB=-0.00714506;REVB=0.000163512;RO=104;SAF=0;SAR=48;SRF=38;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.805522;STB=0.684774;TYPE=snp;VARB=0.0243963;OID=.;OPOS=99778285;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:166:104:107:48:59:48:0:38:66:49:10:41:66 chr7 99796146 . A C 276.94 PASS AO=62;DP=144;FAO=69;FDP=149;FR=.;FRO=80;FSAF=29;FSAR=40;FSRF=38;FSRR=42;FWDB=0.00763137;FXX=0.0197355;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.147;QD=7.43473;RBI=0.0185526;REFB=-0.00429962;REVB=-0.0169103;RO=79;SAF=22;SAR=40;SRF=38;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132049;STB=0.529845;TYPE=snp;VARB=0.00306379;OID=.;OPOS=99796146;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:149:79:80:62:69:40:22:38:41:40:29:38:42 chr7 99816256 . C A 11.48 PASS AO=9;DP=54;FAO=9;FDP=54;FR=.;FRO=45;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=37;FSRR=8;FWDB=0.0302944;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.586;QD=0.850332;RBI=0.0333214;REFB=0.00237697;REVB=-0.0138769;RO=44;SAF=6;SAR=3;SRF=36;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.242003;STB=0.661248;TYPE=snp;VARB=-0.00844873;OID=.;OPOS=99816256;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:54:54:44:45:9:9:3:6:36:8:3:6:37:8 chr7 99816272 . A G 334.79 PASS AO=36;DP=41;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00128889;FXX=0.142823;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.3648;QD=37.1992;RBI=0.0139416;REFB=0;REVB=-0.0138819;RO=0;SAF=28;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00249574;OID=.;OPOS=99816272;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:41:36:0:0:36:36:8:28:0:0:8:28:0:0 chr7 99816275 . G C 383.22 PASS AO=29;DP=42;FAO=40;FDP=41;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=31;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0640085;FXX=0.0465008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.257;QD=37.3868;RBI=0.0759947;REFB=0;REVB=0.0409647;RO=0;SAF=21;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.4007e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00122322;OID=.;OPOS=99816275;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:41:41:0:0:29:40:8:21:0:0:9:31:0:0 chr7 99817585 . G T 500.33 PASS AO=92;DP=146;FAO=92;FDP=146;FR=.;FRO=54;FSAF=38;FSAR=54;FSRF=18;FSRR=36;FWDB=0.00456139;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.171;QD=13.7077;RBI=0.00570128;REFB=-0.0203744;REVB=0.00342028;RO=48;SAF=38;SAR=54;SRF=15;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0668581;STB=0.53072;TYPE=snp;VARB=0.0103054;OID=.;OPOS=99817585;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:48:54:92:92:54:38:15:33:54:38:18:36 chr7 99817859 . A G 116.18 PASS AO=5;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0212586;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.1366;QD=35.7491;RBI=0.0717084;REFB=0;REVB=-0.0684848;RO=0;SAF=3;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00523057;OID=.;OPOS=99817859;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:5:13:0:0:5:13:2:3:0:0:2:11:0:0 chr7 99821685 . C T 315.9 PASS AO=33;DP=36;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0651242;FXX=0.0833102;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.31;QD=38.2913;RBI=0.0651248;REFB=0;REVB=-0.000274898;RO=0;SAF=20;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.82173e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00153091;OID=.;OPOS=99821685;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:36:33:0:0:33:33:13:20:0:0:13:20:0:0 chr7 99917237 . A T 92.7 PASS AO=34;DP=102;FAO=34;FDP=102;FR=.;FRO=68;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=30;FSRR=38;FWDB=-0.0324292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.1476;QD=3.6352;RBI=0.0669692;REFB=0.00775267;REVB=-0.0585937;RO=63;SAF=15;SAR=19;SRF=30;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0397484;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0190409;OID=.;OPOS=99917237;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:102:102:63:68:34:34:19:15:30:33:19:15:30:38 chr7 99917416 . G A 108.93 PASS AO=21;DP=39;FAO=21;FDP=38;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=19;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=-0.0250624;FXX=0.0256345;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.837;QD=11.4662;RBI=0.0251675;REFB=-0.00682321;REVB=0.00229811;RO=17;SAF=2;SAR=19;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24579;STB=0.64029;TYPE=snp;VARB=0.00278944;OID=.;OPOS=99917416;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:39:38:17:17:21:21:19:2:4:13:19:2:4:13 chr7 99954393 . G A 434.63 PASS AO=79;DP=146;FAO=89;FDP=156;FR=.;FRO=67;FSAF=32;FSAR=57;FSRF=35;FSRR=32;FWDB=0.113944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.0733;QD=11.1445;RBI=0.119976;REFB=-0.0833747;REVB=0.0375647;RO=59;SAF=26;SAR=53;SRF=27;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109271;STB=0.572805;TYPE=snp;VARB=0.0653094;OID=.;OPOS=99954393;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:156:59:67:79:89:53:26:27:32:57:32:35:32 chr7 99954457 . G T 419.06 PASS AO=82;DP=141;FAO=82;FDP=141;FR=.;FRO=59;FSAF=23;FSAR=59;FSRF=25;FSRR=34;FWDB=-0.0204332;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=141.438;QD=11.8881;RBI=0.0228625;REFB=0.00667262;REVB=0.0102557;RO=59;SAF=23;SAR=59;SRF=25;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12766;STB=0.569687;TYPE=snp;VARB=-0.00468128;OID=.;OPOS=99954457;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:59:59:82:82:59:23:25:34:59:23:25:34 chr7 99955866 . G A 98.83 PASS AO=27;DP=66;FAO=27;FDP=66;FR=.;FRO=39;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=0.00990883;FXX=0.0149231;HRUN=3;LEN=1;MLLD=70.366;QD=5.98986;RBI=0.0401377;REFB=-0.0120261;REVB=0.0388953;RO=35;SAF=11;SAR=16;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107586;STB=0.57782;TYPE=snp;VARB=0.0200041;OID=.;OPOS=99955866;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:66:66:35:39:27:27:16:11:18:17:16:11:21:18 chr7 99957128 . GCCT G 95.4 PASS AO=26;DP=76;FAO=35;FDP=75;FR=.;FRO=40;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=26;FSRR=14;FWDB=-0.0451987;FXX=0.0131562;HRUN=2;LEN=3;MLLD=142.992;QD=5.08821;RBI=0.0539392;REFB=-0.0201051;REVB=-0.0294366;RO=23;SAF=11;SAR=15;SRF=15;SRR=8;SSEN=0.319864;SSEP=0;SSSB=-0.191123;STB=0.663033;TYPE=del;VARB=0.0267122;OID=.;OPOS=99957129;OREF=CCT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:26:61:35:75:40:12:23:26:14:95:23:11:15:15:8 chr7 99971313 . T C 602.87 PASS AO=59;DP=61;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=50;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0876747;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.1995;QD=35.4631;RBI=0.0915116;REFB=-0.0927725;REVB=-0.0262205;RO=1;SAF=11;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0409638;STB=0.514281;TYPE=snp;VARB=0.0114563;OID=.;OPOS=99971313;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:61:68:1:1:59:67:48:11:1:0:50:17:1:0 chr7 99971834 . A G 3733.61 PASS AO=549;DP=554;FAO=394;FDP=394;FR=.;FRO=0;FSAF=150;FSAR=244;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00213946;FXX=0.0149996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.122;QD=37.9047;RBI=0.0118323;REFB=0.00511039;REVB=-0.0116373;RO=0;SAF=206;SAR=343;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.86372e-05;OID=.;OPOS=99971834;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:554:394:0:0:549:394:343:206:0:0:244:150:0:0 chr7 100064719 . A G 37.33 PASS AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.046141;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.552;QD=6.49217;RBI=0.0462239;REFB=-0.00918418;REVB=-0.00276741;RO=13;SAF=7;SAR=2;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.406226;STB=0.76178;TYPE=snp;VARB=0.0336864;OID=.;OPOS=100064719;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:23:23:13:14:9:9:2:7:5:8:2:7:5:9 chr7 100086400 . TG T 28.91 PASS AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.0904756;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=17.4814;QD=7.70956;RBI=0.23281;REFB=-0.0488888;REVB=-0.21451;RO=6;SAF=2;SAR=6;SRF=5;SRR=1;SSEN=0.269327;SSEP=0;SSSB=-0.426988;STB=0.72356;TYPE=del;VARB=-0.00411725;OID=.;OPOS=100086401;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:8:15:8:15:7:2:6:5:2:23:6:2:6:5:1 chr7 100172559 . G A 41.11 PASS AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=0.0109618;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=174.348;QD=10.2777;RBI=0.0591462;REFB=-0.0112801;REVB=0.0581215;RO=7;SAF=7;SAR=1;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0313286;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00735388;OID=.;OPOS=100172559;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:16:16:7:8:8:8:1:7:6:1:1:7:7:1 chr7 100175473 . T C,G 122.28 PASS AO=7,2;DP=9;FAO=10,4;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=7,1;FSAR=3,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0921032,0.0450848;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=73.3728,73.1801;QD=34.9369;RBI=0.167742,0.157018;REFB=0,0;REVB=0.140195,0.150406;RO=0;SAF=4,0;SAR=3,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=snp,snp;VARB=0.0123969,0.019786;OID=.,.;OPOS=100175473,100175473;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:12:9:14:0:0:7,2:10,4:3,2:4,0:0:0:3,3:7,1:0:0 chr7 100180060 . G A 52.55 PASS AO=12;DP=27;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=15;FWDB=0.0285697;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=177.43;QD=7.78523;RBI=0.0286786;REFB=-0.0314107;REVB=-0.0024973;RO=15;SAF=1;SAR=11;SRF=0;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.367145;STB=0.702487;TYPE=snp;VARB=0.0245124;OID=.;OPOS=100180060;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:27:27:15:15:12:12:11:1:0:15:11:1:0:15 chr7 100278657 . A G 138.06 PASS AO=15;DP=16;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0310259;FXX=0.062461;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.998;QD=36.8167;RBI=0.0457635;REFB=0;REVB=-0.0336406;RO=0;SAF=13;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000227423;OID=.;OPOS=100278657;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:15:0:0:15:15:2:13:0:0:2:13:0:0 chr7 100353013 . TACA T 330.04 PASS AO=69;DP=158;FAO=72;FDP=137;FR=.;FRO=65;FSAF=30;FSAR=42;FSRF=25;FSRR=40;FWDB=-0.0297911;FXX=0.0616396;HRUN=1;LEN=3;MLLD=229.016;QD=9.63623;RBI=0.0304128;REFB=-0.0141097;REVB=-0.00611794;RO=63;SAF=27;SAR=42;SRF=24;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00946258;STB=0.515719;TYPE=del;VARB=0.0129478;OID=.;OPOS=100353014;OREF=ACA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:69:139:72:137:65:30:42:25:40:99:63:27:42:24:39 chr7 100363015 . G A 184.5 PASS AO=42;DP=90;FAO=44;FDP=92;FR=.;FRO=48;FSAF=7;FSAR=37;FSRF=5;FSRR=43;FWDB=-0.00262551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.591;QD=8.02164;RBI=0.00996809;REFB=0.00455929;REVB=-0.00961611;RO=48;SAF=6;SAR=36;SRF=5;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0808588;STB=0.557745;TYPE=snp;VARB=-0.00462382;OID=.;OPOS=100363015;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:92:48:48:42:44:36:6:5:43:37:7:5:43 chr7 100371100 . C A 70.94 PASS AO=11;DP=29;FAO=15;FDP=31;FR=.,HEALED;FRO=16;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=15;FWDB=0.0704619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.3481;QD=9.15393;RBI=0.0709254;REFB=-0.00733114;REVB=-0.00809545;RO=11;SAF=2;SAR=9;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148371;STB=0.653925;TYPE=snp;VARB=0.0355261;OID=.;OPOS=100371100;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:27:31:11:16:11:15:9:2:1:10:11:4:1:15 chr7 100371114 . C T 73.46 PASS AO=11;DP=26;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=15;FWDB=0.0732447;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=220.404;QD=9.79409;RBI=0.0738107;REFB=0.019405;REVB=0.00912287;RO=15;SAF=2;SAR=9;SRF=0;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.409743;STB=0.702512;TYPE=snp;VARB=-0.0181596;OID=.;OPOS=100371114;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:26:30:15:15:11:15:9:2:0:15:11:4:0:15 chr7 100371417 . G A 295.68 PASS AO=58;DP=101;FAO=58;FDP=101;FR=.;FRO=43;FSAF=35;FSAR=23;FSRF=28;FSRR=15;FWDB=-0.00181189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.199;QD=11.7099;RBI=0.00305411;REFB=-0.0087391;REVB=0.00245859;RO=43;SAF=35;SAR=23;SRF=28;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0392076;STB=0.521403;TYPE=snp;VARB=0.00870445;OID=.;OPOS=100371417;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:43:43:58:58:23:35:28:15:23:35:28:15 chr7 100374087 . A G 246.11 PASS AO=53;DP=101;FAO=53;FDP=101;FR=.;FRO=48;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=-0.00858131;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.977;QD=9.7469;RBI=0.0127636;REFB=0.00559776;REVB=0.00944825;RO=47;SAF=26;SAR=27;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0534351;STB=0.534142;TYPE=snp;VARB=-0.00478538;OID=.;OPOS=100374087;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:47:48:53:53:27:26:26:21:27:26:27:21 chr7 100385561 . GGCTTCAGCTACCGCTTGCAAGGCCGCATGACCTAT G 50 PASS AO=29;DP=126;LEN=35;RO=97;SAF=14;SAR=22;SRF=30;SRR=60;TYPE=del;FR=.;OID=.;OPOS=100385562;OREF=GCTTCAGCTACCGCTTGCAAGGCCGCATGACCTAT;OALT=-;OMAPALT=G GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR 0/1:99:126:97:29:22:14:30:60 chr7 100386900 . T C 173.37 PASS AO=44;DP=103;FAO=45;FDP=103;FR=.;FRO=58;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=36;FSRR=22;FWDB=-0.0327481;FXX=0.0636306;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.2726;QD=6.7326;RBI=0.0328079;REFB=-0.00746283;REVB=0.00197975;RO=50;SAF=17;SAR=27;SRF=29;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185474;STB=0.623023;TYPE=snp;VARB=0.0127598;OID=.;OPOS=100386900;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:50:58:44:45:27:17:29:21:27:18:36:22 chr7 100391581 . T C 137.68 PASS AO=30;DP=83;FAO=32;FDP=78;FR=.,HEALED;FRO=42;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=29;FSRR=13;FWDB=-0.0531011;FXX=0.0249969;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.9431;QD=7.06072;RBI=0.0615821;REFB=-0.0112105;REVB=-0.0311868;RO=32;SAF=10;SAR=20;SRF=29;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.493371;STB=0.691811;TYPE=snp;VARB=0.0143879;OID=.;OPOS=100391581;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:32:42:30:32:20:10:29:3:21:11:29:13 chr7 100391644 . T C 1106.44 PASS AO=113;DP=115;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0261203;FXX=0.0169477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.761;QD=38.1531;RBI=0.0288258;REFB=0;REVB=0.0121924;RO=0;SAF=76;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.00571e-05;OID=.;OPOS=100391644;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:115:116:0:0:113:116:37:76:0:0:41:75:0:0 chr7 100395003 . G C 472.14 PASS AO=54;DP=54;FAO=53;FDP=55;FR=.;FRO=2;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0381984;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.0272;QD=34.3377;RBI=0.0469312;REFB=-0.109148;REVB=0.0272657;RO=0;SAF=29;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.520825;TYPE=snp;VARB=0.0046768;OID=.;OPOS=100395003;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:54:55:0:2:54:53:25:29:0:0:23:30:0:2 chr7 100411278 . T C 965.22 PASS AO=99;DP=99;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0308428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.4458;QD=38.6087;RBI=0.0309253;REFB=0;REVB=0.00225746;RO=0;SAF=36;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.61321e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000153161;OID=.;OPOS=100411278;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:99:100:0:0:99:100:63:36:0:0:64:36:0:0 chr7 100416250 . A G 593.81 PASS AO=58;DP=58;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0567681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.53;QD=37.7024;RBI=0.0572963;REFB=0;REVB=-0.00776174;RO=0;SAF=15;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00020341;OID=.;OPOS=100416250;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:58:63:0:0:58:63:43:15:0:0:47:16:0:0 chr7 100420155 . A G 77.93 PASS AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.0228359;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.752;QD=11.1334;RBI=0.0550655;REFB=-0.0282609;REVB=0.0501072;RO=12;SAF=9;SAR=6;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126749;STB=0.545395;TYPE=snp;VARB=0.0295114;OID=.;OPOS=100420155;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:29:28:12:13:15:15:6:9:9:3:6:9:9:4 chr7 100424585 . CCG C,CC,CCC 233.32 PASS AO=6,8,19;DP=34;FAO=0,25,0;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=0,5,0;FSAR=0,20,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0911738,0.14611,0.18103;FXX=0.0384468;HRUN=9,1,1;LEN=2,1,1;MLLD=193.85,196.558,192.648;QD=37.3313;RBI=0.0936219,0.14762,0.182201;REFB=0,0,0;REVB=-0.0212697,-0.0210589,-0.0206269;RO=0;SAF=3,0,0;SAR=3,8,19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=del,del,snp;VARB=0.00716337,-0.00133036,-0.0151831;OID=.,.,.;OPOS=100424586,100424587,100424587;OREF=CG,G,G;OALT=-,-,C;OMAPALT=C,CC,CCC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:6,8,19:33:0,25,0:25:0:0,5,0:0,20,0:0:0:10:0:3,0,0:3,8,19:0:0 chr7 100458795 . T C 1392.38 PASS AO=147;DP=148;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00909847;FXX=0.0067563;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.351;QD=37.8878;RBI=0.00910895;REFB=-0.0415196;REVB=0.00043683;RO=1;SAF=69;SAR=78;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00605862;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.60789e-05;OID=.;OPOS=100458795;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:148:147:1:0:147:147:78:69:0:1:78:69:0:0 chr7 100466441 . G A 121.34 PASS AO=33;DP=79;FAO=33;FDP=79;FR=.;FRO=46;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=31;FWDB=0.0161154;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=128.301;QD=6.14388;RBI=0.0171518;REFB=-0.0253246;REVB=0.00587201;RO=44;SAF=11;SAR=22;SRF=14;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0173578;STB=0.504759;TYPE=snp;VARB=0.0285655;OID=.;OPOS=100466441;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:44:46:33:33:22:11:14:30:22:11:15:31 chr7 100468284 . A G 943.71 PASS AO=97;DP=97;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0111174;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.1633;QD=38.5188;RBI=0.0198516;REFB=0;REVB=-0.0164465;RO=0;SAF=39;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000180041;OID=.;OPOS=100468284;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:97:98:0:0:97:98:58:39:0:0:59:39:0:0 chr7 100482026 . T C 365.79 PASS AO=42;DP=44;FAO=42;FDP=44;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0914265;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.8887;QD=33.254;RBI=0.121912;REFB=-0.108889;REVB=-0.0806456;RO=1;SAF=29;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0347354;STB=0.510045;TYPE=snp;VARB=0.0180382;OID=.;OPOS=100482026;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:44:44:1:2:42:42:13:29:0:1:13:29:1:1 chr7 100486656 . T G 367.54 PASS AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0410779;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.4441;QD=38.6883;RBI=0.0417652;REFB=0;REVB=0.00754548;RO=0;SAF=5;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00174951;OID=.;OPOS=100486656;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:38:38:0:0:38:38:33:5:0:0:33:5:0:0 chr7 100486754 . G C 52.83 PASS AO=8;DP=12;FAO=8;FDP=12;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0775587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.688;QD=17.611;RBI=0.0891986;REFB=-0.0657002;REVB=0.0440573;RO=4;SAF=4;SAR=4;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0235287;OID=.;OPOS=100486754;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:12:12:4:4:8:8:4:4:2:2:4:4:2:2 chr7 100494222 . G GC 694.07 PASS AO=82;DP=97;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104395;FXX=0.0215031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=21.5555;QD=30.5087;RBI=0.0664465;REFB=0;REVB=0.0656213;RO=11;SAF=59;SAR=23;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138473;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-0.000658355;OID=.;OPOS=100494223;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:82:97:91:91:0:62:29:0:0:62:11:59:23:2:9 chr7 100549573 . G T 18.34 PASS AO=17;DP=89;FAO=16;FDP=88;FR=.;FRO=72;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=36;FSRR=36;FWDB=-0.0256015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.842;QD=0.83383;RBI=0.0283216;REFB=-0.00764179;REVB=-0.0121111;RO=71;SAF=13;SAR=4;SRF=36;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.341048;STB=0.714007;TYPE=snp;VARB=0.0340855;OID=.;OPOS=100549573;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:89:88:71:72:17:16:4:13:36:35:4:12:36:36 chr7 100549583 . G A 18.4 PASS AO=16;DP=82;FAO=15;FDP=81;FR=.;FRO=66;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=36;FSRR=30;FWDB=-0.0148139;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=203.8;QD=0.908544;RBI=0.0148519;REFB=-0.00943136;REVB=-0.00106149;RO=66;SAF=13;SAR=3;SRF=36;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.373565;STB=0.732996;TYPE=snp;VARB=0.0326354;OID=.;OPOS=100549583;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:82:81:66:66:16:15:3:13:36:30:3:12:36:30 chr7 100549592 . T A 17.1 PASS AO=16;DP=85;FAO=15;FDP=84;FR=.;FRO=69;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=39;FSRR=30;FWDB=0.00557197;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.711;QD=0.814419;RBI=0.0216435;REFB=0.00871509;REVB=-0.020914;RO=69;SAF=13;SAR=3;SRF=39;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.352863;STB=0.720989;TYPE=snp;VARB=-0.00632742;OID=.;OPOS=100549592;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:85:84:69:69:16:15:3:13:39:30:3:12:39:30 chr7 100549593 . T A 17.01 PASS AO=16;DP=85;FAO=15;FDP=84;FR=.;FRO=69;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=39;FSRR=30;FWDB=-0.0136531;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.271;QD=0.809985;RBI=0.0146798;REFB=0.00212215;REVB=-0.00539336;RO=65;SAF=13;SAR=3;SRF=36;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.365072;STB=0.720989;TYPE=snp;VARB=-0.0129265;OID=.;OPOS=100549593;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:85:84:65:69:16:15:3:13:36:29:3:12:39:30 chr7 100549650 . A G 338.78 PASS AO=80;DP=161;FAO=79;FDP=159;FR=.;FRO=80;FSAF=49;FSAR=30;FSRF=42;FSRR=38;FWDB=0.00429348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.527;QD=8.52282;RBI=0.0358512;REFB=-0.042654;REVB=0.0355932;RO=81;SAF=50;SAR=30;SRF=42;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100707;STB=0.549641;TYPE=snp;VARB=0.034116;OID=.;OPOS=100549650;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:159:81:80:80:79:30:50:42:39:30:49:42:38 chr7 100549697 . A G 369.87 PASS AO=86;DP=169;FAO=85;FDP=168;FR=.;FRO=83;FSAF=44;FSAR=41;FSRF=38;FSRR=45;FWDB=0.0142541;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.623;QD=8.80643;RBI=0.0150457;REFB=-0.0110619;REVB=0.0048161;RO=82;SAF=44;SAR=42;SRF=38;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0428334;STB=0.52952;TYPE=snp;VARB=0.0241174;OID=.;OPOS=100549697;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:168:82:83:86:85:42:44:38:44:41:44:38:45 chr7 100549703 . C T 340.23 PASS AO=83;DP=171;FAO=82;FDP=170;FR=.;FRO=88;FSAF=43;FSAR=39;FSRF=42;FSRR=46;FWDB=0.0157981;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.326;QD=8.00546;RBI=0.0202503;REFB=-0.0265579;REVB=0.0126686;RO=88;SAF=43;SAR=40;SRF=42;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0380468;STB=0.524384;TYPE=snp;VARB=0.0612103;OID=.;OPOS=100549703;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:170:88:88:83:82:40:43:42:46:39:43:42:46 chr7 100549787 . C T 165.46 PASS AO=53;DP=138;FAO=53;FDP=138;FR=.;FRO=85;FSAF=13;FSAR=40;FSRF=50;FSRR=35;FWDB=0.00259505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.399;QD=4.79581;RBI=0.00377442;REFB=-0.00875247;REVB=0.0027408;RO=85;SAF=13;SAR=40;SRF=50;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.388151;STB=0.720943;TYPE=snp;VARB=0.0149935;OID=.;OPOS=100549787;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:85:85:53:53:40:13:50:35:40:13:50:35 chr7 100549788 . A G 163.09 PASS AO=53;DP=135;FAO=51;FDP=133;FR=.;FRO=82;FSAF=13;FSAR=38;FSRF=48;FSRR=34;FWDB=-0.0304192;FXX=0.00746213;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.509;QD=4.90483;RBI=0.0318008;REFB=-0.00176362;REVB=-0.00927153;RO=82;SAF=13;SAR=40;SRF=48;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.382219;STB=0.712268;TYPE=snp;VARB=0.00300332;OID=.;OPOS=100549788;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:133:82:82:53:51:40:13:48:34:38:13:48:34 chr7 100549840 . C T 44.16 PASS AO=20;DP=121;FAO=28;FDP=121;FR=.;FRO=93;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=50;FSRR=43;FWDB=-0.0182435;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=224.396;QD=1.45967;RBI=0.0207771;REFB=-0.00640488;REVB=0.00994299;RO=47;SAF=4;SAR=16;SRF=17;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24088;STB=0.610999;TYPE=snp;VARB=0.0232792;OID=.;OPOS=100549840;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:94:121:47:93:20:28:16:4:17:30:17:11:50:43 chr7 100549873 . G A 165.04 PASS AO=49;DP=123;FAO=50;FDP=128;FR=.;FRO=78;FSAF=19;FSAR=31;FSRF=41;FSRR=37;FWDB=-0.00427625;FXX=0.0153834;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.781;QD=5.15761;RBI=0.00467039;REFB=-0.0146889;REVB=-0.00187784;RO=72;SAF=18;SAR=31;SRF=35;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129196;STB=0.590065;TYPE=snp;VARB=0.0163627;OID=.;OPOS=100549873;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:128:72:78:49:50:31:18:35:37:31:19:41:37 chr7 100549884 . C T 155.41 PASS AO=45;DP=120;FAO=48;FDP=123;FR=.;FRO=75;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=40;FSRR=35;FWDB=0.0119782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.022;QD=5.05399;RBI=0.0123936;REFB=-0.0170299;REVB=-0.00318215;RO=75;SAF=19;SAR=26;SRF=40;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122189;STB=0.584522;TYPE=snp;VARB=0.0208303;OID=.;OPOS=100549884;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:123:75:75:45:48:26:19:40:35:29:19:40:35 chr7 100549894 . T C 127.61 PASS AO=42;DP=119;FAO=43;FDP=120;FR=.;FRO=77;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=40;FSRR=37;FWDB=0.00516771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.377;QD=4.2536;RBI=0.00631546;REFB=-0.0176656;REVB=0.0036304;RO=75;SAF=19;SAR=23;SRF=39;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0757012;STB=0.534868;TYPE=snp;VARB=0.0211993;OID=.;OPOS=100549894;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:120:75:77:42:43:23:19:39:36:23:20:40:37 chr7 100549896 . G C 122.82 PASS AO=43;DP=122;FAO=43;FDP=123;FR=.;FRO=80;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=43;FSRR=37;FWDB=-0.00856555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.4607;QD=3.99414;RBI=0.0175118;REFB=-0.0346391;REVB=-0.0152739;RO=79;SAF=20;SAR=23;SRF=42;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0749873;STB=0.546977;TYPE=snp;VARB=0.0236086;OID=.;OPOS=100549896;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:123:79:80:43:43:23:20:42:37:23:20:43:37 chr7 100549902 . C T 116.56 PASS AO=43;DP=129;FAO=43;FDP=128;FR=.;FRO=85;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=43;FSRR=42;FWDB=0.0325419;FXX=0.00775134;HRUN=3;LEN=1;MLLD=110.932;QD=3.64239;RBI=0.0343517;REFB=-0.010536;REVB=0.0110029;RO=85;SAF=19;SAR=24;SRF=43;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0739079;STB=0.54265;TYPE=snp;VARB=0.0112319;OID=.;OPOS=100549902;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:128:85:85:43:43:24:19:43:42:24:19:43:42 chr7 100549914 . G A 148.56 PASS AO=44;DP=120;FAO=47;FDP=122;FR=.;FRO=75;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=38;FSRR=37;FWDB=-0.00790264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.021;QD=4.87092;RBI=0.00792488;REFB=-0.0228515;REVB=-0.000593334;RO=70;SAF=23;SAR=21;SRF=37;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00633184;STB=0.510634;TYPE=snp;VARB=0.0329781;OID=.;OPOS=100549914;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:122:70:75:44:47:21:23:37:33:24:23:38:37 chr7 100549935 . T G 144.2 PASS AO=39;DP=114;FAO=45;FDP=120;FR=.;FRO=75;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=36;FSRR=39;FWDB=0.0513434;FXX=0.0163921;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.384;QD=4.80673;RBI=0.05552;REFB=-0.0306312;REVB=0.0211264;RO=72;SAF=18;SAR=21;SRF=35;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0278059;STB=0.533319;TYPE=snp;VARB=0.0409718;OID=.;OPOS=100549935;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:120:72:75:39:45:21:18:35:37:21:24:36:39 chr7 100549942 . T C 169.96 PASS AO=49;DP=124;FAO=50;FDP=123;FR=.;FRO=73;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=34;FSRR=39;FWDB=-0.0423479;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.29;QD=5.52704;RBI=0.0457281;REFB=-0.010464;REVB=-0.0172545;RO=75;SAF=26;SAR=23;SRF=36;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0541019;STB=0.544019;TYPE=snp;VARB=0.0123678;OID=.;OPOS=100549942;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:123:75:73:49:50:23:26:36:39:23:27:34:39 chr7 100549979 . C T 244 PASS AO=65;DP=147;FAO=65;FDP=147;FR=.;FRO=82;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=45;FSRR=37;FWDB=0.050296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.851;QD=6.63955;RBI=0.085023;REFB=-0.0116281;REVB=0.0685509;RO=79;SAF=33;SAR=32;SRF=42;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0236261;STB=0.522934;TYPE=snp;VARB=0.0146099;OID=.;OPOS=100549979;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:147:79:82:65:65:32:33:42:37:32:33:45:37 chr7 100550032 . C CCCT 105.33 PASS AO=43;DP=156;FAO=45;FDP=148;FR=.;FRO=103;FSAF=14;FSAR=31;FSRF=67;FSRR=36;FWDB=-0.0357716;FXX=0.0133324;HRUN=3;LEN=3;MLLD=167.552;QD=2.84668;RBI=0.0368019;REFB=-0.00950929;REVB=0.00864686;RO=111;SAF=14;SAR=29;SRF=72;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.381714;STB=0.72794;TYPE=ins;VARB=0.0208536;OID=.;OPOS=100550033;OREF=-;OALT=CCT;OMAPALT=CCCT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:43:156:45:148:103:14:31:67:36:99:111:14:29:72:39 chr7 100550079 . A C,G 565.8 PASS AO=41,45;DP=117;FAO=42,49;FDP=122;FR=.;FRO=31;FSAF=16,26;FSAR=26,23;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=0.0102366,0.0428616;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=112.462,102.087;QD=18.5509;RBI=0.0173291,0.0451904;REFB=-0.0179456,-0.0212263;REVB=0.0139825,0.0143199;RO=30;SAF=15,22;SAR=26,23;SRF=18;SRR=12;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.183385,-0.0811953;STB=0.599425,0.532121;TYPE=snp,snp;VARB=0.0216613,0.0110051;OID=.,.;OPOS=100550079,100550079;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:117:122:30:31:41,45:42,49:26,23:15,22:18:12:26,23:16,26:19:12 chr7 100550133 . A G 141.64 PASS AO=40;DP=100;FAO=41;FDP=102;FR=.;FRO=61;FSAF=10;FSAR=31;FSRF=20;FSRR=41;FWDB=-0.0140291;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.035;QD=5.55452;RBI=0.020705;REFB=-0.0111368;REVB=0.0152277;RO=60;SAF=10;SAR=30;SRF=19;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0888588;STB=0.563604;TYPE=snp;VARB=0.0221228;OID=.;OPOS=100550133;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:102:60:61:40:41:30:10:19:41:31:10:20:41 chr7 100550138 . C T 165.76 PASS AO=45;DP=106;FAO=45;FDP=105;FR=.;FRO=60;FSAF=13;FSAR=32;FSRF=17;FSRR=43;FWDB=-0.00564624;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.952;QD=6.31471;RBI=0.017578;REFB=-0.00338948;REVB=-0.0166465;RO=59;SAF=13;SAR=32;SRF=17;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000926603;STB=0.503874;TYPE=snp;VARB=0.00275264;OID=.;OPOS=100550138;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:105:59:60:45:45:32:13:17:42:32:13:17:43 chr7 100550184 . C A 68.18 PASS AO=35;DP=121;FAO=33;FDP=120;FR=.;FRO=87;FSAF=6;FSAR=27;FSRF=29;FSRR=58;FWDB=-0.0480546;FXX=0.00826378;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.2018;QD=2.27278;RBI=0.0575537;REFB=0.0175022;REVB=-0.031673;RO=85;SAF=7;SAR=28;SRF=27;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188223;STB=0.649383;TYPE=snp;VARB=-0.0384595;OID=.;OPOS=100550184;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:121:120:85:87:35:33:28:7:27:58:27:6:29:58 chr7 100550191 . C T 110.27 PASS AO=40;DP=118;FAO=40;FDP=118;FR=.;FRO=78;FSAF=8;FSAR=32;FSRF=24;FSRR=54;FWDB=-0.0151556;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=196.6;QD=3.73798;RBI=0.0195329;REFB=-0.0109271;REVB=0.0123225;RO=78;SAF=8;SAR=32;SRF=24;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167988;STB=0.598077;TYPE=snp;VARB=0.0239636;OID=.;OPOS=100550191;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:78:78:40:40:32:8:24:54:32:8:24:54 chr7 100550203 . T A 63.7 PASS AO=33;DP=126;FAO=33;FDP=125;FR=.;FRO=92;FSAF=6;FSAR=27;FSRF=23;FSRR=69;FWDB=-0.110811;FXX=0.0157468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.791;QD=2.03847;RBI=0.110907;REFB=0.0101769;REVB=-0.00460389;RO=91;SAF=6;SAR=27;SRF=22;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111685;STB=0.576109;TYPE=snp;VARB=-0.0299167;OID=.;OPOS=100550203;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:126:125:91:92:33:33:27:6:22:69:27:6:23:69 chr7 100550205 . A C 66.73 PASS AO=35;DP=127;FAO=34;FDP=127;FR=.;FRO=93;FSAF=6;FSAR=28;FSRF=23;FSRR=70;FWDB=-0.0750511;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5585;QD=2.10167;RBI=0.0757643;REFB=0.000592197;REVB=0.0103715;RO=92;SAF=7;SAR=28;SRF=22;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0702799;STB=0.579949;TYPE=snp;VARB=-0.00192769;OID=.;OPOS=100550205;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:127:127:92:93:35:34:28:7:22:70:28:6:23:70 chr7 100550245 . G A 34.85 PASS AO=23;DP=104;FAO=23;FDP=104;FR=.;FRO=81;FSAF=2;FSAR=21;FSRF=12;FSRR=69;FWDB=-0.137264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.4698;QD=1.34023;RBI=0.141898;REFB=-0.0286845;REVB=-0.0359684;RO=68;SAF=2;SAR=21;SRF=10;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183213;STB=0.62013;TYPE=snp;VARB=0.0584911;OID=.;OPOS=100550245;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:104:104:68:81:23:23:21:2:10:58:21:2:12:69 chr7 100550252 . A G 14.65 PASS AO=16;DP=97;FAO=16;FDP=97;FR=.;FRO=81;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=69;FWDB=-0.00789217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.598;QD=0.604245;RBI=0.0140532;REFB=0.000325207;REVB=0.0116279;RO=81;SAF=2;SAR=14;SRF=12;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0615923;STB=0.541382;TYPE=snp;VARB=-0.00186928;OID=.;OPOS=100550252;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:97:97:81:81:16:16:14:2:12:69:14:2:12:69 chr7 100551565 . A G 17.17 PASS AO=26;DP=151;FAO=24;FDP=149;FR=.;FRO=125;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=35;FSRR=90;FWDB=0.010515;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.248;QD=0.460906;RBI=0.0453846;REFB=-0.00586563;REVB=0.0441497;RO=125;SAF=7;SAR=19;SRF=35;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0172695;STB=0.511952;TYPE=snp;VARB=0.0385374;OID=.;OPOS=100551565;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:151:149:125:125:26:24:19:7:35:90:17:7:35:90 chr7 100551566 . T C 17.5 PASS AO=26;DP=152;FAO=24;FDP=148;FR=.;FRO=124;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=33;FSRR=91;FWDB=-0.00936233;FXX=0.0133324;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.4201;QD=0.472864;RBI=0.0162251;REFB=-0.000196542;REVB=0.0132515;RO=124;SAF=7;SAR=19;SRF=33;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0050559;STB=0.526441;TYPE=snp;VARB=0.00222446;OID=.;OPOS=100551566;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:152:148:124:124:26:24:19:7:33:91:17:7:33:91 chr7 100551578 . T G 18.19 PASS AO=30;DP=180;FAO=28;FDP=176;FR=.;FRO=148;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=39;FSRR=109;FWDB=-0.0316387;FXX=0.0112353;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.7023;QD=0.413465;RBI=0.0526187;REFB=-0.0128875;REVB=-0.0420443;RO=147;SAF=8;SAR=22;SRF=39;SRR=108;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00223383;STB=0.52331;TYPE=snp;VARB=0.0707751;OID=.;OPOS=100551578;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:180:176:147:148:30:28:22:8:39:108:20:8:39:109 chr7 100551626 . T C 13.15 PASS AO=36;DP=237;FAO=33;FDP=234;FR=.;FRO=201;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=67;FSRR=134;FWDB=-0.00539142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.1066;QD=0.224745;RBI=0.0379755;REFB=-0.0017194;REVB=-0.0375908;RO=199;SAF=15;SAR=21;SRF=67;SRR=132;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109245;STB=0.58186;TYPE=snp;VARB=0.014384;OID=.;OPOS=100551626;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:237:234:199:201:36:33:21:15:67:132:19:14:67:134 chr7 100551662 . C T 20.46 PASS AO=42;DP=261;FAO=40;FDP=259;FR=.;FRO=219;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=81;FSRR=138;FWDB=0.0200494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.939;QD=0.315925;RBI=0.0335218;REFB=-0.004887;REVB=-0.0268651;RO=215;SAF=19;SAR=23;SRF=78;SRR=137;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119303;STB=0.589881;TYPE=snp;VARB=0.0691273;OID=.;OPOS=100551662;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:261:259:215:219:42:40:23:19:78:137:21:19:81:138 chr7 100551666 . A T 27.13 PASS AO=45;DP=257;FAO=42;FDP=252;FR=.;FRO=210;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=82;FSRR=128;FWDB=-0.0196478;FXX=0.00787371;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.543;QD=0.430646;RBI=0.0418221;REFB=-0.0167969;REVB=-0.0369196;RO=204;SAF=20;SAR=25;SRF=77;SRR=127;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0890979;STB=0.552556;TYPE=snp;VARB=0.0530865;OID=.;OPOS=100551666;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:257:252:204:210:45:42:25:20:77:127:23:19:82:128 chr7 100551687 . T C 20.07 PASS AO=40;DP=244;FAO=37;FDP=240;FR=.;FRO=203;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=75;FSRR=128;FWDB=0.00135809;FXX=0.0204073;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.572;QD=0.334495;RBI=0.0067623;REFB=-0.00339888;REVB=-0.00662452;RO=200;SAF=16;SAR=24;SRF=72;SRR=128;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0546875;STB=0.577554;TYPE=snp;VARB=0.0310321;OID=.;OPOS=100551687;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:244:240:200:203:40:37:24:16:72:128:20:17:75:128 chr7 100551692 . C T 20.63 PASS AO=40;DP=243;FAO=37;FDP=239;FR=.;FRO=202;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=76;FSRR=126;FWDB=0.0062007;FXX=0.00416649;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.004;QD=0.345273;RBI=0.0295956;REFB=-0.0170106;REVB=-0.0289388;RO=201;SAF=19;SAR=21;SRF=75;SRR=126;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133884;STB=0.593673;TYPE=snp;VARB=0.0509567;OID=.;OPOS=100551692;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:243:239:201:202:40:37:21:19:75:126:19:18:76:126 chr7 100551719 . C T 27.69 PASS AO=45;DP=266;FAO=44;FDP=265;FR=.;FRO=221;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=93;FSRR=128;FWDB=-0.0170739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.025;QD=0.418014;RBI=0.0347168;REFB=-0.00759911;REVB=0.0302281;RO=221;SAF=21;SAR=24;SRF=93;SRR=128;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0599194;STB=0.528499;TYPE=snp;VARB=0.0355259;OID=.;OPOS=100551719;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:266:265:221:221:45:44:24:21:93:128:24:20:93:128 chr7 100551729 . C T 30.16 PASS AO=46;DP=267;FAO=45;FDP=265;FR=.;FRO=220;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=92;FSRR=128;FWDB=-0.0133275;FXX=0.00375926;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.1794;QD=0.45526;RBI=0.0198257;REFB=-0.00179712;REVB=0.0146776;RO=220;SAF=24;SAR=22;SRF=92;SRR=128;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133653;STB=0.57689;TYPE=snp;VARB=0.00817841;OID=.;OPOS=100551729;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:267:265:220:220:46:45:22:24:92:128:22:23:92:128 chr7 100551773 . C A 93.05 PASS AO=62;DP=259;FAO=63;FDP=260;FR=.;FRO=197;FSAF=35;FSAR=28;FSRF=100;FSRR=97;FWDB=-0.0302295;FXX=0.0076333;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.956;QD=1.4315;RBI=0.0326443;REFB=-0.0104715;REVB=-0.012322;RO=195;SAF=37;SAR=25;SRF=98;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120003;STB=0.536469;TYPE=snp;VARB=0.055761;OID=.;OPOS=100551773;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:259:260:195:197:62:63:25:37:98:97:28:35:100:97 chr7 100551778 . G A 111.4 PASS AO=67;DP=260;FAO=67;FDP=262;FR=.;FRO=195;FSAF=37;FSAR=30;FSRF=99;FSRR=96;FWDB=-0.0589456;FXX=0.0113203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.1033;QD=1.70069;RBI=0.0676244;REFB=-0.0136588;REVB=-0.0331433;RO=189;SAF=38;SAR=29;SRF=93;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0937628;STB=0.533278;TYPE=snp;VARB=0.0440051;OID=.;OPOS=100551778;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:260:262:189:195:67:67:29:38:93:96:30:37:99:96 chr7 100551793 . G T 65.95 PASS AO=60;DP=264;FAO=56;FDP=264;FR=.;FRO=208;FSAF=39;FSAR=17;FSRF=108;FSRR=100;FWDB=-0.0325579;FXX=0.00377344;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.6172;QD=0.999254;RBI=0.0342709;REFB=-0.00387026;REVB=-0.0106994;RO=201;SAF=42;SAR=18;SRF=105;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.236349;STB=0.64608;TYPE=snp;VARB=0.0225165;OID=.;OPOS=100551793;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:264:264:201:208:60:56:18:42:105:96:17:39:108:100 chr7 100551840 . T A 247.54 PASS AO=70;DP=172;FAO=72;FDP=174;FR=.;FRO=102;FSAF=34;FSAR=38;FSRF=50;FSRR=52;FWDB=0.000120451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.516;QD=5.69058;RBI=0.0238725;REFB=-0.00761489;REVB=-0.0238722;RO=100;SAF=32;SAR=38;SRF=48;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0240826;STB=0.510554;TYPE=snp;VARB=0.00531343;OID=.;OPOS=100551840;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:174:100:102:70:72:38:32:48:52:38:34:50:52 chr7 100551849 . A T 296.53 PASS AO=80;DP=188;FAO=82;FDP=188;FR=.;FRO=106;FSAF=35;FSAR=47;FSRF=54;FSRR=52;FWDB=0.00729855;FXX=0.0208322;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.459;QD=6.30922;RBI=0.0176448;REFB=-0.00662808;REVB=-0.0160645;RO=107;SAF=33;SAR=47;SRF=53;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0860367;STB=0.546929;TYPE=snp;VARB=0.00770788;OID=.;OPOS=100551849;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:188:107:106:80:82:47:33:53:54:47:35:54:52 chr7 100552017 . C T 54.98 PASS AO=39;DP=184;FAO=42;FDP=186;FR=.;FRO=144;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=79;FSRR=65;FWDB=0.031557;FXX=0.0106377;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.668;QD=1.18246;RBI=0.0317077;REFB=-0.0176969;REVB=-0.00308756;RO=145;SAF=25;SAR=14;SRF=79;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126914;STB=0.556233;TYPE=snp;VARB=0.0379229;OID=.;OPOS=100552017;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:184:186:145:144:39:42:14:25:79:66:16:26:79:65 chr7 100552018 . T G 375.06 PASS AO=90;DP=185;FAO=90;FDP=184;FR=.;FRO=94;FSAF=45;FSAR=45;FSRF=57;FSRR=37;FWDB=0.00856919;FXX=0.00540511;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.211;QD=8.15354;RBI=0.0199528;REFB=-0.0101876;REVB=-0.018019;RO=92;SAF=45;SAR=45;SRF=55;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0899082;STB=0.554336;TYPE=snp;VARB=0.0471247;OID=.;OPOS=100552018;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:184:92:94:90:90:45:45:55:37:45:45:57:37 chr7 100552020 . C T 363.82 PASS AO=88;DP=182;FAO=88;FDP=182;FR=.;FRO=94;FSAF=43;FSAR=45;FSRF=60;FSRR=34;FWDB=0.0162538;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.171;QD=7.99601;RBI=0.0162549;REFB=-0.0132743;REVB=-0.00018759;RO=90;SAF=43;SAR=45;SRF=58;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142915;STB=0.57705;TYPE=snp;VARB=0.0138849;OID=.;OPOS=100552020;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:182:90:94:88:88:45:43:58:32:45:43:60:34 chr7 100552044 . T G 340.8 PASS AO=80;DP=167;FAO=82;FDP=170;FR=.;FRO=88;FSAF=40;FSAR=42;FSRF=60;FSRR=28;FWDB=0.00109129;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.806;QD=8.0189;RBI=0.00482406;REFB=-0.00992488;REVB=0.004699;RO=87;SAF=38;SAR=42;SRF=59;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190624;STB=0.599976;TYPE=snp;VARB=0.0116993;OID=.;OPOS=100552044;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:170:87:88:80:82:42:38:59:28:42:40:60:28 chr7 100552094 . G C 179.01 PASS AO=55;DP=145;FAO=56;FDP=144;FR=.;FRO=88;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=57;FSRR=31;FWDB=-0.115955;FXX=0.00689608;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.6919;QD=4.97251;RBI=0.116221;REFB=-0.00287428;REVB=-0.0078488;RO=88;SAF=26;SAR=29;SRF=57;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189207;STB=0.600557;TYPE=snp;VARB=0.00356831;OID=.;OPOS=100552094;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:144:88:88:55:56:29:26:57:31:29:27:57:31 chr7 100552117 . G T 125.04 PASS AO=44;DP=126;FAO=44;FDP=126;FR=.;FRO=82;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=57;FSRR=25;FWDB=-0.021918;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.083;QD=3.96953;RBI=0.0239761;REFB=-0.0157816;REVB=-0.00971888;RO=80;SAF=24;SAR=20;SRF=55;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165023;STB=0.599957;TYPE=snp;VARB=0.0286727;OID=.;OPOS=100552117;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:80:82:44:44:20:24:55:25:20:24:57:25 chr7 100552135 . T C 186.74 PASS AO=53;DP=132;FAO=54;FDP=132;FR=.;FRO=78;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=55;FSRR=23;FWDB=-0.0240818;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.7172;QD=5.65867;RBI=0.0397817;REFB=0.000562867;REVB=-0.0316647;RO=79;SAF=27;SAR=26;SRF=56;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21405;STB=0.611293;TYPE=snp;VARB=-0.00164482;OID=.;OPOS=100552135;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:79:78:53:54:26:27:56:23:26:28:55:23 chr7 100552251 . T C 409.38 PASS AO=78;DP=132;FAO=80;FDP=135;FR=.;FRO=55;FSAF=18;FSAR=62;FSRF=22;FSRR=33;FWDB=0.0230925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.031;QD=12.1297;RBI=0.0350364;REFB=-0.0213352;REVB=-0.0263492;RO=53;SAF=15;SAR=63;SRF=22;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224609;STB=0.591861;TYPE=snp;VARB=0.0178045;OID=.;OPOS=100552251;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:135:53:55:78:80:63:15:22:31:62:18:22:33 chr7 100552311 . C T 472.49 PASS AO=89;DP=147;FAO=89;FDP=147;FR=.;FRO=58;FSAF=27;FSAR=62;FSRF=1;FSRR=57;FWDB=0.0373212;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=212.29;QD=12.857;RBI=0.0387948;REFB=-0.00622166;REVB=0.0105906;RO=58;SAF=27;SAR=62;SRF=1;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.279263;STB=0.649195;TYPE=snp;VARB=0.00400456;OID=.;OPOS=100552311;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:147:58:58:89:89:62:27:1:57:62:27:1:57 chr7 100552338 . C T 330.22 PASS AO=72;DP=136;FAO=72;FDP=136;FR=.;FRO=64;FSAF=16;FSAR=56;FSRF=6;FSRR=58;FWDB=-0.0267658;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.714;QD=9.7123;RBI=0.0277158;REFB=-0.00894904;REVB=0.00719436;RO=63;SAF=16;SAR=56;SRF=6;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174755;STB=0.596835;TYPE=snp;VARB=0.0125138;OID=.;OPOS=100552338;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:63:64:72:72:56:16:6:57:56:16:6:58 chr7 100552358 . C G 315.21 PASS AO=67;DP=129;FAO=69;FDP=131;FR=.;FRO=62;FSAF=16;FSAR=53;FSRF=12;FSRR=50;FWDB=0.0490847;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.3611;QD=9.6248;RBI=0.0492784;REFB=-0.0231806;REVB=-0.00436476;RO=62;SAF=14;SAR=53;SRF=12;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0206632;STB=0.526174;TYPE=snp;VARB=0.0293747;OID=.;OPOS=100552358;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:131:62:62:67:69:53:14:12:50:53:16:12:50 chr7 100552371 . C G 247.76 PASS AO=59;DP=122;FAO=59;FDP=122;FR=.;FRO=63;FSAF=16;FSAR=43;FSRF=14;FSRR=49;FWDB=-0.00632438;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.344;QD=8.12332;RBI=0.0122027;REFB=-0.0197491;REVB=0.0104359;RO=62;SAF=16;SAR=43;SRF=13;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0750638;STB=0.532936;TYPE=snp;VARB=0.0234209;OID=.;OPOS=100552371;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:62:63:59:59:43:16:13:49:43:16:14:49 chr7 100552384 . A G 274.64 PASS AO=62;DP=122;FAO=62;FDP=122;FR=.;FRO=60;FSAF=19;FSAR=43;FSRF=16;FSRR=44;FWDB=0.0564901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.758;QD=9.00471;RBI=0.0569297;REFB=-0.02812;REVB=0.00706089;RO=60;SAF=19;SAR=43;SRF=16;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0425842;STB=0.523425;TYPE=snp;VARB=0.0160237;OID=.;OPOS=100552384;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:60:60:62:62:43:19:16:44:43:19:16:44 chr7 100552390 . T C 281.29 PASS AO=63;DP=124;FAO=63;FDP=123;FR=.;FRO=60;FSAF=21;FSAR=42;FSRF=18;FSRR=42;FWDB=-0.023754;FXX=0.0159987;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.8551;QD=9.14755;RBI=0.0240742;REFB=-0.0189371;REVB=-0.00391348;RO=60;SAF=21;SAR=42;SRF=18;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.033661;STB=0.518513;TYPE=snp;VARB=0.0231104;OID=.;OPOS=100552390;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:123:60:60:63:63:42:21:18:42:42:21:18:42 chr7 100552412 . T C 202.96 PASS AO=55;DP=127;FAO=55;FDP=127;FR=.;FRO=72;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=37;FSRR=35;FWDB=-0.00718416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.815;QD=6.39243;RBI=0.0167156;REFB=-0.00904572;REVB=-0.015093;RO=72;SAF=30;SAR=25;SRF=37;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0321169;STB=0.517979;TYPE=snp;VARB=0.0150888;OID=.;OPOS=100552412;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:72:72:55:55:25:30:37:35:25:30:37:35 chr7 100552435 . T A 130.46 PASS AO=42;DP=114;FAO=42;FDP=113;FR=.;FRO=71;FSAF=29;FSAR=13;FSRF=40;FSRR=31;FWDB=0.00615263;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.367;QD=4.61796;RBI=0.0198024;REFB=-0.0265009;REVB=-0.0188223;RO=69;SAF=29;SAR=13;SRF=39;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148791;STB=0.587163;TYPE=snp;VARB=0.0140701;OID=.;OPOS=100552435;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:113:69:71:42:42:13:29:39:30:13:29:40:31 chr7 100552440 . C T 134.4 PASS AO=44;DP=120;FAO=44;FDP=120;FR=.;FRO=76;FSAF=31;FSAR=13;FSRF=46;FSRR=30;FWDB=0.0130748;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=250.513;QD=4.47993;RBI=0.0254673;REFB=-0.0128295;REVB=0.0218548;RO=76;SAF=31;SAR=13;SRF=46;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123884;STB=0.571089;TYPE=snp;VARB=0.0225531;OID=.;OPOS=100552440;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:76:76:44:44:13:31:46:30:13:31:46:30 chr7 100552535 . G A 168.9 PASS AO=38;DP=80;FAO=38;FDP=77;FR=.;FRO=39;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=28;FSRR=11;FWDB=0.00848284;FXX=0.0493766;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.455;QD=8.77381;RBI=0.00908513;REFB=0.00202843;REVB=-0.00325286;RO=35;SAF=20;SAR=18;SRF=25;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165302;STB=0.573851;TYPE=snp;VARB=-0.00152751;OID=.;OPOS=100552535;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:77:35:39:38:38:18:20:25:10:16:22:28:11 chr7 100552536 . T C 161.34 PASS AO=38;DP=79;FAO=38;FDP=80;FR=.;FRO=42;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=30;FSRR=12;FWDB=-0.0147707;FXX=0.0123442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.608;QD=8.06697;RBI=0.0159109;REFB=0.00233186;REVB=-0.00591452;RO=40;SAF=20;SAR=18;SRF=29;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18635;STB=0.59995;TYPE=snp;VARB=-0.0026798;OID=.;OPOS=100552536;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:80:40:42:38:38:18:20:29:11:18:20:30:12 chr7 100552549 . C A 130.73 PASS AO=34;DP=77;FAO=34;FDP=78;FR=.;FRO=44;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=19;FWDB=-0.0317483;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=142.553;QD=6.70428;RBI=0.0332356;REFB=0.000141382;REVB=-0.00983093;RO=35;SAF=19;SAR=15;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.038176;STB=0.505357;TYPE=snp;VARB=-0.00027552;OID=.;OPOS=100552549;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:78:35:44:34:34:15:19:21:14:15:19:25:19 chr7 100552644 . C A 276.93 PASS AO=41;DP=54;FAO=41;FDP=54;FR=.;FRO=13;FSAF=0;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=13;FWDB=0;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=170.281;QD=20.5132;RBI=0.0107606;REFB=-0.0253604;REVB=0.0107606;RO=10;SAF=0;SAR=41;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00538467;OID=.;OPOS=100552644;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:54:54:10:13:41:41:41:0:0:10:41:0:0:13 chr7 100552675 . C T 98.16 PASS AO=31;DP=84;FAO=31;FDP=84;FR=.;FRO=53;FSAF=2;FSAR=29;FSRF=9;FSRR=44;FWDB=0.0460611;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.15;QD=4.67433;RBI=0.0600552;REFB=-0.0162444;REVB=0.0385358;RO=53;SAF=2;SAR=29;SRF=9;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.312575;STB=0.685868;TYPE=snp;VARB=0.010867;OID=.;OPOS=100552675;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:84:84:53:53:31:31:29:2:9:44:29:2:9:44 chr7 100552711 . T A 31.06 PASS AO=33;DP=125;FAO=23;FDP=115;FR=.;FRO=92;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=69;FWDB=0.0199941;FXX=0.0799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.164;QD=1.08025;RBI=0.0246805;REFB=-0.040004;REVB=0.0144694;RO=92;SAF=12;SAR=21;SRF=23;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161033;STB=0.656407;TYPE=snp;VARB=0.0535185;OID=.;OPOS=100552711;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:125:115:92:92:33:23:21:12:23:69:13:10:23:69 chr7 100552713 . A G 61.9 PASS AO=34;DP=128;FAO=33;FDP=127;FR=.;FRO=94;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=71;FWDB=0.0066742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2185;QD=1.94974;RBI=0.0501195;REFB=-0.0118418;REVB=0.0496731;RO=94;SAF=12;SAR=22;SRF=23;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155621;STB=0.577596;TYPE=snp;VARB=0.0174766;OID=.;OPOS=100552713;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:128:127:94:94:34:33:22:12:23:71:22:11:23:71 chr7 100552727 . G C 108.78 PASS AO=49;DP=161;FAO=48;FDP=160;FR=.;FRO=112;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=33;FSRR=79;FWDB=-0.0151049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.19;QD=2.71938;RBI=0.0212799;REFB=-0.00415713;REVB=-0.0149892;RO=112;SAF=19;SAR=30;SRF=33;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121556;STB=0.561831;TYPE=snp;VARB=0.0104606;OID=.;OPOS=100552727;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:160:112:112:49:48:30:19:33:79:30:18:33:79 chr7 100552738 . C T 61.23 PASS AO=39;DP=158;FAO=38;FDP=157;FR=.;FRO=119;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=38;FSRR=81;FWDB=-0.00385293;FXX=0.00632871;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.011;QD=1.56001;RBI=0.0104374;REFB=-0.0062802;REVB=-0.00970018;RO=119;SAF=19;SAR=20;SRF=38;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.213899;STB=0.61873;TYPE=snp;VARB=0.0669339;OID=.;OPOS=100552738;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:158:157:119:119:39:38:20:19:38:81:20:18:38:81 chr7 100552739 . A G 61.19 PASS AO=40;DP=160;FAO=38;FDP=158;FR=.;FRO=120;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=39;FSRR=81;FWDB=-0.019143;FXX=0.00628891;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.41;QD=1.54902;RBI=0.0448564;REFB=-0.00850602;REVB=-0.0405665;RO=119;SAF=19;SAR=21;SRF=39;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187948;STB=0.614548;TYPE=snp;VARB=0.0474389;OID=.;OPOS=100552739;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:160:158:119:120:40:38:21:19:39:80:20:18:39:81 chr7 100552915 . A C 2002.83 PASS AO=209;DP=209;FAO=210;FDP=210;FR=.;FRO=0;FSAF=106;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0205801;FXX=0.00943352;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.719;QD=38.1491;RBI=0.0305877;REFB=0;REVB=-0.0226289;RO=0;SAF=107;SAR=102;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.88022e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.5454e-05;OID=.;OPOS=100552915;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:209:210:0:0:209:210:102:107:0:0:104:106:0:0 chr7 100552978 . T C 127.43 PASS AO=58;DP=196;FAO=57;FDP=192;FR=.;FRO=135;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=71;FSRR=64;FWDB=0.00616925;FXX=0.0541845;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.561;QD=2.65478;RBI=0.0200418;REFB=-0.00622154;REVB=-0.0190686;RO=118;SAF=32;SAR=26;SRF=64;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.010986;STB=0.512675;TYPE=snp;VARB=0.0138798;OID=.;OPOS=100552978;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:192:118:135:58:57:26:32:64:54:26:31:71:64 chr7 100552984 . T C 173.4 PASS AO=69;DP=206;FAO=67;FDP=202;FR=.;FRO=135;FSAF=31;FSAR=36;FSRF=67;FSRR=68;FWDB=-0.0323848;FXX=0.0146334;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.1481;QD=3.43368;RBI=0.0342095;REFB=-0.0100853;REVB=0.0110233;RO=135;SAF=33;SAR=36;SRF=67;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208411;STB=0.522505;TYPE=snp;VARB=0.0222052;OID=.;OPOS=100552984;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:206:202:135:135:69:67:36:33:67:68:36:31:67:68 chr7 100553002 . A G 152.06 PASS AO=65;DP=204;FAO=64;FDP=203;FR=.;FRO=139;FSAF=35;FSAR=29;FSRF=67;FSRR=72;FWDB=-0.00355669;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=153.025;QD=2.99634;RBI=0.0346916;REFB=-0.0118189;REVB=-0.0345088;RO=138;SAF=36;SAR=29;SRF=67;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0805891;STB=0.544419;TYPE=snp;VARB=0.028642;OID=.;OPOS=100553002;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:203:138:139:65:64:29:36:67:71:29:35:67:72 chr7 100607851 . C G 154.92 PASS AO=33;DP=63;FAO=33;FDP=63;FR=.;FRO=30;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=0.0285505;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.244;QD=9.8359;RBI=0.0346973;REFB=-0.0109315;REVB=-0.0197174;RO=30;SAF=15;SAR=18;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106139;STB=0.558789;TYPE=snp;VARB=0.0164411;OID=.;OPOS=100607851;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:30:30:33:33:18:15:10:20:18:15:10:20 chr7 100607871 . C T 123 PASS AO=28;DP=60;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=-0.010258;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.216;QD=8.33874;RBI=0.0148283;REFB=-0.0137692;REVB=-0.0107075;RO=31;SAF=12;SAR=16;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103125;STB=0.557749;TYPE=snp;VARB=0.0115589;OID=.;OPOS=100607871;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:59:31:31:28:28:16:12:10:21:16:12:10:21 chr7 100608370 . A C 58.26 PASS AO=17;DP=47;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=0.0233818;FXX=0.0212721;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.48;QD=5.06606;RBI=0.0253874;REFB=-0.0102314;REVB=-0.00988981;RO=29;SAF=4;SAR=13;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147455;STB=0.586987;TYPE=snp;VARB=0.0127579;OID=.;OPOS=100608370;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:47:46:29:29:17:17:13:4:10:19:13:4:10:19 chr7 100608375 . G A 59.61 PASS AO=14;DP=42;FAO=17;FDP=45;FR=.;FRO=28;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=-0.00777991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.266;QD=5.29845;RBI=0.00832625;REFB=-0.00112587;REVB=-0.00296638;RO=28;SAF=4;SAR=10;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0925852;STB=0.594652;TYPE=snp;VARB=0.00312296;OID=.;OPOS=100608375;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:42:45:28:28:14:17:10:4:10:18:13:4:10:18 chr7 100608823 . G T 11.52 PASS AO=8;DP=42;FAO=8;FDP=47;FR=.;FRO=39;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=27;FWDB=-0.035939;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=93.1658;QD=0.98059;RBI=0.0359457;REFB=-0.0353936;REVB=0.000695615;RO=34;SAF=5;SAR=3;SRF=7;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.490728;STB=0.745737;TYPE=snp;VARB=0.0739268;OID=.;OPOS=100608823;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:42:47:34:39:8:8:3:5:7:27:3:5:12:27 chr7 100608826 . C G 57.44 PASS AO=17;DP=43;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=0.0492625;FXX=0.0666519;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.727;QD=5.47092;RBI=0.0492627;REFB=-0.0203571;REVB=-0.000115358;RO=26;SAF=8;SAR=9;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173408;STB=0.62313;TYPE=snp;VARB=0.0422053;OID=.;OPOS=100608826;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:43:42:26:25:17:17:9:8:8:18:8:9:8:17 chr7 100608868 . A G 59.22 PASS AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.0598035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.363;QD=6.57972;RBI=0.0603534;REFB=-0.0357174;REVB=-0.00812855;RO=21;SAF=8;SAR=7;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199743;STB=0.615237;TYPE=snp;VARB=0.0453618;OID=.;OPOS=100608868;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:36:36:21:21:15:15:7:8:7:14:7:8:7:14 chr7 100608884 . G A 39.26 PASS AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0657028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.8548;QD=7.13783;RBI=0.0972239;REFB=-0.0326983;REVB=0.0716632;RO=11;SAF=5;SAR=4;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00947861;STB=0.555432;TYPE=snp;VARB=0.0594934;OID=.;OPOS=100608884;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:22:22:11:13:9:9:4:5:6:5:4:5:6:7 chr7 100610069 . C T 414.36 PASS AO=72;DP=111;FAO=72;FDP=111;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=56;FSRF=9;FSRR=30;FWDB=0.0193083;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.545;QD=14.932;RBI=0.0193756;REFB=-0.0303012;REVB=0.00161357;RO=38;SAF=16;SAR=56;SRF=9;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0134022;STB=0.504322;TYPE=snp;VARB=0.0128626;OID=.;OPOS=100610069;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:38:39:72:72:56:16:9:29:56:16:9:30 chr7 100612898 . T C 48.7 PASS AO=21;DP=77;FAO=21;FDP=75;FR=.;FRO=54;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=31;FWDB=-0.0237453;FXX=0.0259707;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.117;QD=2.59723;RBI=0.0238013;REFB=-0.0014115;REVB=0.00163214;RO=51;SAF=8;SAR=13;SRF=23;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0857137;STB=0.533742;TYPE=snp;VARB=0.00299081;OID=.;OPOS=100612898;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:77:75:51:54:21:21:13:8:23:28:13:8:23:31 chr7 100612945 . C T 45.33 PASS AO=20;DP=68;FAO=19;FDP=67;FR=.;FRO=48;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=29;FWDB=0.0686249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.77;QD=2.70636;RBI=0.0686258;REFB=-0.00422077;REVB=0.000339677;RO=48;SAF=6;SAR=14;SRF=19;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125824;STB=0.56319;TYPE=snp;VARB=0.0103192;OID=.;OPOS=100612945;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:68:67:48:48:20:19:14:6:19:29:13:6:19:29 chr7 100612952 . G A 39.82 PASS AO=17;DP=64;FAO=17;FDP=62;FR=.;FRO=45;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=27;FWDB=-0.000982389;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.719;QD=2.56883;RBI=0.020544;REFB=-0.00452148;REVB=0.0205205;RO=45;SAF=5;SAR=12;SRF=18;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140679;STB=0.585882;TYPE=snp;VARB=0.0168833;OID=.;OPOS=100612952;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:64:62:45:45:17:17:12:5:18:27:12:5:18:27 chr7 100612955 . A ACTG 15.22 PASS AO=11;DP=63;FAO=11;FDP=60;FR=.;FRO=49;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=28;FWDB=-0.0398502;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=3;MLLD=238.187;QD=1.01459;RBI=0.0438373;REFB=-0.010409;REVB=-0.0182666;RO=50;SAF=2;SAR=9;SRF=21;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.339861;STB=0.736177;TYPE=ins;VARB=0.0367011;OID=.;OPOS=100612956;OREF=-;OALT=CTG;OMAPALT=ACTG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:11:63:11:60:49:2:9:21:28:15:50:2:9:21:29 chr7 100612961 . G C 20.68 PASS AO=13;DP=58;FAO=12;FDP=57;FR=.;FRO=45;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=-0.0108436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.774;QD=1.45099;RBI=0.013795;REFB=-0.00201025;REVB=-0.00852749;RO=45;SAF=1;SAR=12;SRF=19;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.548776;STB=0.855312;TYPE=snp;VARB=0.0104479;OID=.;OPOS=100612961;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:58:57:45:45:13:12:12:1:19:26:11:1:19:26 chr7 100612969 . A G 16.42 PASS AO=11;DP=52;FAO=10;FDP=51;FR=.;FRO=41;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=-0.0491717;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.065;QD=1.28786;RBI=0.0528322;REFB=0.00187036;REVB=-0.0193232;RO=40;SAF=2;SAR=9;SRF=15;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.291461;STB=0.685303;TYPE=snp;VARB=-0.00845725;OID=.;OPOS=100612969;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:52:51:40:41:11:10:9:2:15:25:8:2:16:25 chr7 100615387 . C T 20.66 PASS AO=25;DP=140;FAO=25;FDP=146;FR=.;FRO=121;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=67;FSRR=54;FWDB=0.0323115;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.4854;QD=0.566158;RBI=0.0374446;REFB=0.00627954;REVB=0.0189226;RO=115;SAF=5;SAR=20;SRF=61;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.433607;STB=0.759792;TYPE=snp;VARB=-0.0276956;OID=.;OPOS=100615387;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:140:146:115:121:25:25:20:5:61:54:19:6:67:54 chr7 100624718 . G C 100.53 PASS AO=36;DP=98;FAO=35;FDP=99;FR=.;FRO=64;FSAF=27;FSAR=8;FSRF=31;FSRR=33;FWDB=-0.00513102;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=38.2104;QD=4.06162;RBI=0.00642439;REFB=-0.0120187;REVB=-0.00386594;RO=62;SAF=28;SAR=8;SRF=29;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.373015;STB=0.704522;TYPE=snp;VARB=0.0213418;OID=.;OPOS=100624718;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:99:62:64:36:35:8:28:29:33:8:27:31:33 chr7 100634476 . C G 73.98 PASS AO=21;DP=54;FAO=21;FDP=54;FR=.;FRO=33;FSAF=3;FSAR=18;FSRF=8;FSRR=25;FWDB=0.0369405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8344;QD=5.48012;RBI=0.054244;REFB=-0.0161865;REVB=-0.0397216;RO=32;SAF=3;SAR=18;SRF=8;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189508;STB=0.605391;TYPE=snp;VARB=0.0257041;OID=.;OPOS=100634476;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:54:54:32:33:21:21:18:3:8:24:18:3:8:25 chr7 100634640 . T G 259.68 PASS AO=62;DP=132;FAO=63;FDP=132;FR=.;FRO=69;FSAF=29;FSAR=34;FSRF=40;FSRR=29;FWDB=-0.0175546;FXX=0.00751823;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.559;QD=7.86904;RBI=0.0184335;REFB=-0.00953938;REVB=0.00562406;RO=67;SAF=28;SAR=34;SRF=38;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108144;STB=0.562166;TYPE=snp;VARB=0.00807388;OID=.;OPOS=100634640;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:67:69:62:63:34:28:38:29:34:29:40:29 chr7 100634964 . C A 248.59 PASS AO=40;DP=60;FAO=41;FDP=61;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=32;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.0144279;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=151.861;QD=16.301;RBI=0.0327296;REFB=-0.00683754;REVB=0.0293779;RO=20;SAF=8;SAR=32;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.303571;STB=0.651082;TYPE=snp;VARB=0.00413942;OID=.;OPOS=100634964;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:60:61:20:20:40:41:32:8:12:8:32:9:12:8 chr7 100635375 . A C 244.35 PASS AO=41;DP=62;FAO=42;FDP=64;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=35;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=0.0562344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.837;QD=15.2718;RBI=0.0563426;REFB=-0.019241;REVB=0.0034903;RO=20;SAF=7;SAR=34;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0792754;STB=0.58329;TYPE=snp;VARB=0.00905593;OID=.;OPOS=100635375;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:62:64:20:22:41:42:34:7:5:15:35:7:7:15 chr7 100635661 . T C 240.12 PASS AO=50;DP=93;FAO=51;FDP=94;FR=.;FRO=43;FSAF=6;FSAR=45;FSRF=2;FSRR=41;FWDB=-0.0168359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.0349;QD=10.2179;RBI=0.0538516;REFB=-0.0018042;REVB=0.0511522;RO=42;SAF=6;SAR=44;SRF=1;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228876;STB=0.589011;TYPE=snp;VARB=0.00131173;OID=.;OPOS=100635661;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:94:42:43:50:51:44:6:1:41:45:6:2:41 chr7 100635679 . C G 281.29 PASS AO=56;DP=99;FAO=56;FDP=99;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=46;FSRF=4;FSRR=39;FWDB=0.0766774;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.973;QD=11.3652;RBI=0.0823235;REFB=-0.043239;REVB=0.0299623;RO=43;SAF=10;SAR=46;SRF=4;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127028;STB=0.56892;TYPE=snp;VARB=0.0317229;OID=.;OPOS=100635679;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:43:43:56:56:46:10:4:39:46:10:4:39 chr7 100639012 . C T 117.34 PASS AO=25;DP=54;FAO=27;FDP=56;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=20;FWDB=0.182321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.5345;QD=8.38173;RBI=0.183033;REFB=-0.00641644;REVB=0.0161395;RO=28;SAF=7;SAR=18;SRF=8;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00661147;STB=0.513504;TYPE=snp;VARB=0.00914849;OID=.;OPOS=100639012;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:56:28:29:25:27:18:7:8:20:18:9:9:20 chr7 100639040 . C T 108.57 PASS AO=24;DP=49;FAO=24;FDP=49;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=6;FSRR=19;FWDB=0.0179608;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.688;QD=8.86268;RBI=0.0182593;REFB=-0.0201066;REVB=-0.00328795;RO=25;SAF=7;SAR=17;SRF=6;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0584059;STB=0.532743;TYPE=snp;VARB=0.0162103;OID=.;OPOS=100639040;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:25:25:24:24:17:7:6:19:17:7:6:19 chr7 100639049 . G C 83.59 PASS AO=19;DP=37;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=19;FWDB=-0.072483;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.024;QD=8.15485;RBI=0.0853765;REFB=-0.0158247;REVB=-0.045115;RO=18;SAF=8;SAR=11;SRF=3;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.236942;STB=0.664673;TYPE=snp;VARB=0.0467799;OID=.;OPOS=100639049;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:37:41:18:22:19:19:11:8:3:15:11:8:3:19 chr7 100639054 . G A 77.36 PASS AO=17;DP=35;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=17;FWDB=0.00509498;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.303;QD=8.84147;RBI=0.00510794;REFB=-0.00868749;REVB=-0.000363543;RO=18;SAF=6;SAR=11;SRF=1;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.335029;STB=0.685544;TYPE=snp;VARB=0.00756044;OID=.;OPOS=100639054;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:35:35:18:18:17:17:11:6:1:17:11:6:1:17 chr7 100639066 . C T 74.95 PASS AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=14;FWDB=0.0148071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.899;QD=9.36913;RBI=0.0191658;REFB=-0.00457137;REVB=-0.0121687;RO=15;SAF=6;SAR=10;SRF=1;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.311271;STB=0.618683;TYPE=snp;VARB=0.010462;OID=.;OPOS=100639066;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:31:32:15:16:16:16:10:6:1:14:11:5:2:14 chr7 100639095 . A C 18.71 PASS AO=5;DP=17;FAO=5;FDP=17;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=12;FWDB=0.0315472;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2658;QD=4.40178;RBI=0.0372936;REFB=0.0188727;REVB=0.0198894;RO=12;SAF=1;SAR=4;SRF=0;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.524917;STB=0.799423;TYPE=snp;VARB=-0.039398;OID=.;OPOS=100639095;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:17:17:12:12:5:5:4:1:0:12:4:1:0:12 chr7 100643477 . A C 24.02 PASS AO=74;DP=461;FAO=60;FDP=400;FR=.;FRO=340;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=84;FSRR=256;FWDB=-0.00286027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.725;QD=0.240187;RBI=0.024734;REFB=-0.00320444;REVB=0.0245681;RO=377;SAF=29;SAR=45;SRF=91;SRR=286;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223888;STB=0.655952;TYPE=snp;VARB=0.016899;OID=.;OPOS=100643477;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:461:400:377:340:74:60:45:29:91:286:35:25:84:256 chr7 100647676 . C T 45.01 PASS AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.568;QD=25.7205;RBI=0.00673454;REFB=0.00509866;REVB=0.00673454;RO=1;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000705859;OID=.;OPOS=100647676;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:7:7:1:1:6:6:6:0:0:1:6:0:0:1 chr7 100647774 . C G 139.51 PASS AO=24;DP=38;FAO=24;FDP=38;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=-0.0169919;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.294;QD=14.6856;RBI=0.0269641;REFB=0.0192912;REVB=0.0209365;RO=14;SAF=7;SAR=17;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0645036;STB=0.535491;TYPE=snp;VARB=-0.0137707;OID=.;OPOS=100647774;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:38:38:14:14:24:24:17:7:3:11:17:7:3:11 chr7 100647819 . C T 136.23 PASS AO=34;DP=75;FAO=34;FDP=75;FR=.;FRO=41;FSAF=8;FSAR=26;FSRF=11;FSRR=30;FWDB=-0.0524916;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.84;QD=7.26551;RBI=0.0569895;REFB=-0.0681562;REVB=0.0221906;RO=41;SAF=8;SAR=26;SRF=11;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0433299;STB=0.524401;TYPE=snp;VARB=0.0705154;OID=.;OPOS=100647819;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:41:41:34:34:26:8:11:30:26:8:11:30 chr7 100647875 . C A 233.35 PASS AO=48;DP=88;FAO=48;FDP=88;FR=.;FRO=40;FSAF=8;FSAR=40;FSRF=13;FSRR=27;FWDB=-0.00243182;FXX=0.0112347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.868;QD=10.6066;RBI=0.0334699;REFB=-0.0109581;REVB=0.0333814;RO=39;SAF=8;SAR=40;SRF=13;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205291;STB=0.610414;TYPE=snp;VARB=0.0119181;OID=.;OPOS=100647875;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:39:40:48:48:40:8:13:26:40:8:13:27 chr7 100647920 . A C 218.48 PASS AO=46;DP=87;FAO=46;FDP=86;FR=.;FRO=40;FSAF=9;FSAR=37;FSRF=11;FSRR=29;FWDB=0.0324288;FXX=0.0227247;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.1538;QD=10.1619;RBI=0.03946;REFB=-0.0151703;REVB=-0.0224826;RO=41;SAF=9;SAR=37;SRF=12;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120174;STB=0.554697;TYPE=snp;VARB=0.0175631;OID=.;OPOS=100647920;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:86:41:40:46:46:37:9:12:29:37:9:11:29 chr7 100647976 . C G 219.84 PASS AO=45;DP=82;FAO=45;FDP=82;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=33;FSRF=10;FSRR=27;FWDB=0.0607736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.554;QD=10.7239;RBI=0.0631112;REFB=-0.0213786;REVB=0.0170175;RO=36;SAF=12;SAR=33;SRF=10;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114075;STB=0.502074;TYPE=snp;VARB=0.0177272;OID=.;OPOS=100647976;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:36:37:45:45:33:12:10:26:33:12:10:27 chr7 100648029 . G A 218.45 PASS AO=42;DP=73;FAO=42;FDP=72;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=-0.0312109;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.2893;QD=12.1359;RBI=0.0318579;REFB=-0.0511253;REVB=0.00638778;RO=30;SAF=17;SAR=25;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0570465;STB=0.531235;TYPE=snp;VARB=0.0303052;OID=.;OPOS=100648029;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:72:30:30:42:42:25:17:10:20:25:17:10:20 chr7 100648117 . C G 149.62 PASS AO=26;DP=49;FAO=31;FDP=56;FR=.;FRO=25;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.042999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.5911;QD=10.6871;RBI=0.0541535;REFB=-0.0140373;REVB=0.0329193;RO=21;SAF=16;SAR=10;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0760601;STB=0.540514;TYPE=snp;VARB=0.0174674;OID=.;OPOS=100648117;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:56:21:25:26:31:10:16:11:10:11:20:14:11 chr7 100675976 . G A 89.94 PASS AO=22;DP=50;FAO=22;FDP=50;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=-0.0115718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.819;QD=7.19538;RBI=0.0116102;REFB=-0.0137706;REVB=-0.000943263;RO=28;SAF=14;SAR=8;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0306992;STB=0.517494;TYPE=snp;VARB=0.018838;OID=.;OPOS=100675976;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:50:50:28:28:22:22:8:14:17:11:8:14:17:11 chr7 100679366 . A G 188.97 PASS AO=47;DP=102;FAO=47;FDP=102;FR=.;FRO=55;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=33;FSRR=22;FWDB=0.0229592;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.765;QD=7.41057;RBI=0.0233964;REFB=-0.018597;REVB=-0.00450171;RO=54;SAF=21;SAR=26;SRF=33;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156618;STB=0.582055;TYPE=snp;VARB=0.0279151;OID=.;OPOS=100679366;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:54:55:47:47:26:21:33:21:26:21:33:22 chr7 100679902 . A G 154.89 PASS AO=22;DP=63;FAO=33;FDP=63;FR=.,HEALED;FRO=30;FSAF=24;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.176077;FXX=0.0156226;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.009;QD=9.83416;RBI=0.176496;REFB=-0.0555747;REVB=0.012157;RO=27;SAF=15;SAR=7;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.271298;STB=0.666561;TYPE=snp;VARB=0.0671318;OID=.;OPOS=100679902;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:27:30:22:33:7:15:11:16:9:24:12:18 chr7 100681359 . C G 14.12 PASS AO=7;DP=35;FAO=7;FDP=35;FR=.;FRO=28;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=21;FWDB=-0.0123917;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.2662;QD=1.61369;RBI=0.0130687;REFB=-0.00139553;REVB=0.00415176;RO=28;SAF=2;SAR=5;SRF=7;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0543568;STB=0.535983;TYPE=snp;VARB=0.00603836;OID=.;OPOS=100681359;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:35:35:28:28:7:7:5:2:7:21:5:2:7:21 chr7 100681762 . A G 365.73 PASS AO=75;DP=133;FAO=75;FDP=134;FR=.;FRO=59;FSAF=34;FSAR=41;FSRF=33;FSRR=26;FWDB=0.0335014;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.928;QD=10.9172;RBI=0.0342399;REFB=-0.0233532;REVB=0.00707289;RO=58;SAF=34;SAR=41;SRF=32;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0786734;STB=0.546654;TYPE=snp;VARB=0.0202722;OID=.;OPOS=100681762;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:134:58:59:75:75:41:34:32:26:41:34:33:26 chr7 100692680 . T G 648.17 PASS AO=144;DP=272;FAO=144;FDP=271;FR=.;FRO=127;FSAF=59;FSAR=85;FSRF=55;FSRR=72;FWDB=0.00025233;FXX=0.0109485;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.854;QD=9.56711;RBI=0.0022446;REFB=0.0086222;REVB=0.00223037;RO=119;SAF=59;SAR=85;SRF=55;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0446571;STB=0.511263;TYPE=snp;VARB=-0.00675931;OID=.;OPOS=100692680;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:272:271:119:127:144:144:85:59:55:64:85:59:55:72 chr7 100693849 . C T 228.28 PASS AO=43;DP=72;FAO=43;FDP=72;FR=.;FRO=29;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=0.00692849;FXX=0.0136968;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.712;QD=12.6821;RBI=0.0213606;REFB=-0.0192867;REVB=-0.0202057;RO=28;SAF=21;SAR=22;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0950162;STB=0.544021;TYPE=snp;VARB=0.0148577;OID=.;OPOS=100693849;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:28:29:43:43:22:21:10:18:22:21:11:18 chr7 100701610 . T A 246.83 PASS AO=49;DP=86;FAO=49;FDP=86;FR=.;FRO=37;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=-0.0150109;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=182.925;QD=11.4805;RBI=0.0252174;REFB=-0.00805459;REVB=-0.020263;RO=37;SAF=23;SAR=26;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0346803;STB=0.519004;TYPE=snp;VARB=0.00610397;OID=.;OPOS=100701610;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:37:37:49:49:26:23:19:18:26:23:19:18 chr7 100701676 . C T 319.67 PASS AO=74;DP=149;FAO=74;FDP=149;FR=.;FRO=75;FSAF=30;FSAR=44;FSRF=24;FSRR=51;FWDB=0.0335934;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=206.023;QD=8.58176;RBI=0.0408178;REFB=0.0155165;REVB=0.0231856;RO=73;SAF=30;SAR=44;SRF=23;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0862153;STB=0.545338;TYPE=snp;VARB=-0.0173256;OID=.;OPOS=100701676;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:73:75:74:74:44:30:23:50:44:30:24:51 chr7 100731829 . T C 245.6 PASS AO=67;DP=152;FAO=66;FDP=151;FR=.;FRO=85;FSAF=39;FSAR=27;FSRF=42;FSRR=43;FWDB=-0.0192498;FXX=0.013071;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.676;QD=6.50595;RBI=0.0314642;REFB=-0.0088698;REVB=0.0248885;RO=82;SAF=41;SAR=26;SRF=40;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125021;STB=0.5552;TYPE=snp;VARB=0.0109309;OID=.;OPOS=100731829;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:151:82:85:67:66:26:41:40:42:27:39:42:43 chr7 100732262 . G A 322.07 PASS AO=64;DP=114;FAO=64;FDP=113;FR=.;FRO=49;FSAF=12;FSAR=52;FSRF=11;FSRR=38;FWDB=0.0607399;FXX=0.0341851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.5552;QD=11.4006;RBI=0.0837572;REFB=-0.0157143;REVB=0.0576708;RO=39;SAF=12;SAR=52;SRF=4;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104717;STB=0.525475;TYPE=snp;VARB=0.0121044;OID=.;OPOS=100732262;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:113:39:49:64:64:52:12:4:35:52:12:11:38 chr7 100732521 . GC G 137.07 PASS AO=22;DP=47;FAO=33;FDP=42;FR=.;FRO=9;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0369729;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.5803;QD=13.0544;RBI=0.218195;REFB=-0.165884;REVB=-0.21504;RO=7;SAF=15;SAR=7;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0.352941;SSSB=0.0547568;STB=0.551692;TYPE=del;VARB=0.0915153;OID=.;OPOS=100732522;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:22:37:33:42:9:22:11:4:5:4:7:15:7:4:3 chr7 100733100 . G A 58.23 PASS AO=14;DP=37;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=19;FWDB=0.0439477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.02;QD=6.29468;RBI=0.045633;REFB=-0.034098;REVB=-0.012287;RO=22;SAF=4;SAR=10;SRF=3;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215631;STB=0.644283;TYPE=snp;VARB=0.057523;OID=.;OPOS=100733100;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:37:37:22:22:14:15:10:4:3:19:10:5:3:19 chr7 100802404 . TG T 99.19 PASS AO=46;DP=110;FAO=68;FDP=100;FR=.;FRO=32;FSAF=20;FSAR=48;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=0.132685;FXX=0.0196059;HRUN=8;LEN=1;MLLD=5.79836;QD=3.96755;RBI=0.312922;REFB=-0.0382404;REVB=-0.283399;RO=32;SAF=11;SAR=35;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231367;STB=0.530378;TYPE=del;VARB=0.0801557;OID=.;OPOS=100802405;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:46:100:68:100:32:20:48:12:20:18:32:11:35:16:16 chr7 100804240 . T TACCTCC 281.55 PASS AO=43;DP=68;FAO=46;FDP=67;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=37;FSRF=16;FSRR=5;FWDB=0.00573019;FXX=0.0289813;HRUN=1;LEN=6;MLLD=268.253;QD=16.8092;RBI=0.00788928;REFB=-0.00647906;REVB=-0.00542269;RO=21;SAF=9;SAR=34;SRF=16;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.379721;STB=0.709799;TYPE=ins;VARB=0.00262446;OID=.;OPOS=100804241;OREF=-;OALT=ACCTCC;OMAPALT=TACCTCC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:43:68:46:67:21:9:37:16:5:57:21:9:34:16:5 chr7 100861213 . T C 230.7 PASS AO=40;DP=62;FAO=40;FDP=62;FR=.;FRO=22;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.00277482;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.393;QD=14.8842;RBI=0.016569;REFB=-0.0279494;REVB=-0.016335;RO=22;SAF=19;SAR=21;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0431162;STB=0.523489;TYPE=snp;VARB=0.0184325;OID=.;OPOS=100861213;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:62:62:22:22:40:40:21:19:9:13:21:19:9:13 chr7 100861452 . T C 235.19 PASS AO=68;DP=164;FAO=68;FDP=164;FR=.;FRO=96;FSAF=39;FSAR=29;FSRF=50;FSRR=46;FWDB=-0.0106866;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.071;QD=5.73635;RBI=0.0170677;REFB=-0.001329;REVB=0.0133079;RO=94;SAF=39;SAR=29;SRF=50;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0437199;STB=0.531229;TYPE=snp;VARB=0.00193854;OID=.;OPOS=100861452;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:164:94:96:68:68:29:39:50:44:29:39:50:46 chr7 100875772 . T G 31.58 PASS AO=6;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.0562314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.196;QD=9.71795;RBI=0.0809762;REFB=-0.00625115;REVB=-0.0582681;RO=7;SAF=1;SAR=5;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.505451;STB=0.809724;TYPE=snp;VARB=0.017593;OID=.;OPOS=100875772;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:13:13:7:7:6:6:5:1:5:2:5:1:5:2 chr7 101200669 . A AG 496.11 PASS AO=60;DP=83;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0335416;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=17.2518;QD=25.7717;RBI=0.0344527;REFB=0;REVB=0.0078706;RO=23;SAF=35;SAR=25;SRF=5;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187392;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-7.39522e-05;OID=.;OPOS=101200670;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:60:83:77:77:0:36:41:0:0:46:23:35:25:5:18 chr7 101200727 . G A 692.19 PASS AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0061371;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.92;QD=37.9285;RBI=0.0272305;REFB=0;REVB=0.0265299;RO=0;SAF=27;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1792e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00012029;OID=.;OPOS=101200727;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:73:73:0:0:73:73:46:27:0:0:46:27:0:0 chr7 101286843 . T C 101.62 PASS AO=22;DP=47;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=20;FWDB=0.0289467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.021;QD=8.64879;RBI=0.0293203;REFB=-0.026349;REVB=0.0046662;RO=24;SAF=10;SAR=12;SRF=4;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.279302;STB=0.66153;TYPE=snp;VARB=0.0289086;OID=.;OPOS=101286843;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:24:24:22:23:12:10:4:20:12:11:4:20 chr7 101837149 . G A 180.3 PASS AO=44;DP=97;FAO=45;FDP=98;FR=.;FRO=53;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=32;FSRR=21;FWDB=-0.0137305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.05;QD=7.35921;RBI=0.0259099;REFB=-0.0211994;REVB=-0.0219726;RO=53;SAF=22;SAR=22;SRF=32;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101513;STB=0.550228;TYPE=snp;VARB=0.0301422;OID=.;OPOS=101837149;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:98:53:53:44:45:22:22:32:21:22:23:32:21 chr7 101844851 . A G 143.53 PASS AO=39;DP=93;FAO=39;FDP=92;FR=.;FRO=53;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=15;FSRR=38;FWDB=-0.0039542;FXX=0.0212743;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.314;QD=6.24026;RBI=0.0414816;REFB=-0.00271017;REVB=-0.0412927;RO=52;SAF=13;SAR=26;SRF=14;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0754996;STB=0.533317;TYPE=snp;VARB=0.000888585;OID=.;OPOS=101844851;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:92:52:53:39:39:26:13:14:38:26:13:15:38 chr7 101892833 . C T 359.2 PASS AO=85;DP=170;FAO=84;FDP=169;FR=.;FRO=85;FSAF=24;FSAR=60;FSRF=19;FSRR=66;FWDB=-0.0138287;FXX=0.00588201;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.306;QD=8.50178;RBI=0.0140056;REFB=0.0110343;REVB=-0.00221891;RO=84;SAF=25;SAR=60;SRF=18;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0908371;STB=0.539605;TYPE=snp;VARB=-0.0127254;OID=.;OPOS=101892833;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:169:84:85:85:84:60:25:18:66:60:24:19:66 chr7 101916647 . A G 316.55 PASS AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.742;QD=37.2412;RBI=0.021801;REFB=0;REVB=-0.0188071;RO=0;SAF=28;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.73777e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.27344e-05;OID=.;OPOS=101916647;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:34:0:0:34:34:6:28:0:0:6:28:0:0 chr7 101917521 . G A 222.22 PASS AO=23;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0280904;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.841;QD=37.0368;RBI=0.0414529;REFB=0;REVB=0.030484;RO=0;SAF=9;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84921e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000959686;OID=.;OPOS=101917521;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:24:24:0:0:23:24:14:9:0:0:15:9:0:0 chr7 101928495 . G C 794.39 PASS AO=65;DP=89;FAO=83;FDP=83;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=17;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.254137;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.145;QD=38.2841;RBI=0.254554;REFB=0;REVB=-0.0145611;RO=1;SAF=0;SAR=65;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.896624;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000680084;OID=.;OPOS=101928495;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:85:83:1:0:65:83:65:0:1:0:66:17:0:0 chr7 101952374 . A G 270.24 PASS AO=54;DP=101;FAO=56;FDP=102;FR=.;FRO=46;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=14;FSRR=32;FWDB=-0.00147941;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.029;QD=10.5977;RBI=0.0378615;REFB=-0.00241978;REVB=-0.0378326;RO=46;SAF=27;SAR=27;SRF=14;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164235;STB=0.588205;TYPE=snp;VARB=0.00152498;OID=.;OPOS=101952374;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:102:46:46:54:56:27:27:14:32:28:28:14:32 chr7 102063527 . G C 615.83 PASS AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00196412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.782;QD=37.8972;RBI=0.0160443;REFB=0;REVB=0.0159236;RO=0;SAF=25;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.12115e-05;OID=.;OPOS=102063527;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:65:65:0:0:65:65:40:25:0:0:40:25:0:0 chr7 102065651 . C T 179.61 PASS AO=39;DP=75;FAO=39;FDP=75;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=27;FSRF=8;FSRR=28;FWDB=0.0195868;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=97.8874;QD=9.57936;RBI=0.0198645;REFB=-0.0146489;REVB=0.00330992;RO=36;SAF=12;SAR=27;SRF=8;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0906571;STB=0.549976;TYPE=snp;VARB=0.0145731;OID=.;OPOS=102065651;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:36:36:39:39:27:12:8:28:27:12:8:28 chr7 102066539 . A G 147.38 PASS AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0546375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.302;QD=36.8438;RBI=0.0725682;REFB=0;REVB=0.0477586;RO=0;SAF=5;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.36667e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00147668;OID=.;OPOS=102066539;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:16:0:0:16:16:11:5:0:0:11:5:0:0 chr7 102105984 . T G 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00447026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=384.629;QD=35.0875;RBI=0.00447026;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=7;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.27168e-05;OID=.;OPOS=102105984;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:0:7:0:0:0:7:0:0 chr7 102111936 . G A 479.09 PASS AO=90;DP=150;FAO=91;FDP=150;FR=.;FRO=59;FSAF=12;FSAR=79;FSRF=16;FSRR=43;FWDB=0.00417;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=184.217;QD=12.7758;RBI=0.00805123;REFB=-0.000257094;REVB=0.00688719;RO=59;SAF=12;SAR=78;SRF=16;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183867;STB=0.601716;TYPE=snp;VARB=0.000338461;OID=.;OPOS=102111936;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:150:59:59:90:91:78:12:16:43:79:12:16:43 chr7 102119322 . T C 267.05 PASS AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0531894;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.21;QD=38.1506;RBI=0.0536636;REFB=0;REVB=0.00711855;RO=0;SAF=11;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31638e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000295878;OID=.;OPOS=102119322;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:28:28:0:0:28:28:17:11:0:0:17:11:0:0 chr7 102210320 . G C 205.95 PASS AO=34;DP=51;FAO=34;FDP=51;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=0.0032284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.2846;QD=16.1531;RBI=0.0212192;REFB=-0.0371905;REVB=0.0209721;RO=17;SAF=10;SAR=24;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0441959;STB=0.524065;TYPE=snp;VARB=0.016877;OID=.;OPOS=102210320;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:51:51:17:17:34:34:24:10:4:13:24:10:4:13 chr7 102279621 . C T 51.82 PASS AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0594468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.545;QD=10.3634;RBI=0.0636369;REFB=-0.00901558;REVB=-0.0227099;RO=10;SAF=9;SAR=1;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.319145;STB=0.691833;TYPE=snp;VARB=0.0180326;OID=.;OPOS=102279621;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:20:20:10:10:10:10:1:9:7:3:1:9:7:3 chr7 102427889 . C T 689.54 PASS AO=72;DP=72;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0403683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.151;QD=37.7832;RBI=0.051346;REFB=0;REVB=0.0317302;RO=0;SAF=32;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.05346e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000117077;OID=.;OPOS=102427889;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:72:73:0:0:72:73:40:32:0:0:41:32:0:0 chr7 102462636 . T C 393.99 PASS AO=108;DP=246;FAO=108;FDP=246;FR=.;FRO=138;FSAF=45;FSAR=63;FSRF=62;FSRR=76;FWDB=0.0083036;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.318;QD=6.40635;RBI=0.0102221;REFB=-0.027267;REVB=-0.00596173;RO=134;SAF=45;SAR=63;SRF=58;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165457;STB=0.518695;TYPE=snp;VARB=0.0261844;OID=.;OPOS=102462636;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:246:246:134:138:108:108:63:45:58:76:63:45:62:76 chr7 102574999 . TGAA T 1214.08 PASS AO=114;DP=139;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0262376;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=3;MLLD=275.398;QD=37.9399;RBI=0.0465963;REFB=0;REVB=-0.0385072;RO=0;SAF=62;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-4.41246e-05;OID=.;OPOS=102575000;OREF=GAA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:114:124:128:128:0:70:58:0:0:57:0:62:52:0:0 chr7 102668001 . A C 2042.89 PASS AO=219;DP=222;FAO=219;FDP=219;FR=.;FRO=0;FSAF=108;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0261962;FXX=0.0135129;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.297;QD=37.313;RBI=0.0264853;REFB=-0.111878;REVB=-0.00390247;RO=3;SAF=108;SAR=111;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0044676;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.72739e-05;OID=.;OPOS=102668001;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:222:219:3:0:219:219:111:108:2:1:111:108:0:0 chr7 102738862 . T C 628.32 PASS AO=127;DP=227;FAO=129;FDP=228;FR=.;FRO=99;FSAF=76;FSAR=53;FSRF=58;FSRR=41;FWDB=0.0140589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.218;QD=11.0232;RBI=0.0141986;REFB=-0.0150906;REVB=0.00198685;RO=99;SAF=74;SAR=53;SRF=58;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00263679;STB=0.501474;TYPE=snp;VARB=0.0108446;OID=.;OPOS=102738862;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:227:228:99:99:127:129:53:74:58:41:53:76:58:41 chr7 102740683 . G A 1097.65 PASS AO=125;DP=134;FAO=128;FDP=137;FR=.;FRO=9;FSAF=55;FSAR=73;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=9.90351e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.178;QD=32.0482;RBI=0.0223118;REFB=0.0318992;REVB=-0.0223116;RO=9;SAF=55;SAR=70;SRF=1;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0427239;STB=0.521476;TYPE=snp;VARB=-0.000343942;OID=.;OPOS=102740683;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:134:137:9:9:125:128:70:55:1:8:73:55:1:8 chr7 102742144 . C T 894.59 PASS AO=93;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.018312;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.432;QD=38.0675;RBI=0.0321903;REFB=0;REVB=0.0264742;RO=0;SAF=34;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.20828e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.61608e-05;OID=.;OPOS=102742144;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:94:94:0:0:93:94:59:34:0:0:60:34:0:0 chr7 102743893 . C T 1063.08 PASS AO=108;DP=108;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.111694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9386;QD=37.6312;RBI=0.113768;REFB=0;REVB=0.0216219;RO=0;SAF=51;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60583e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000702532;OID=.;OPOS=102743893;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:108:113:0:0:108:113:57:51:0:0:58:55:0:0 chr7 102938153 . C G 10.22 PASS AO=2;DP=9;FAO=2;FDP=9;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=0.00611302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.292;QD=4.5413;RBI=0.00611302;REFB=-0.00360435;REVB=0;RO=7;SAF=2;SAR=0;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00022453;OID=.;OPOS=102938153;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:7:7:2:2:0:2:7:0:0:2:7:0 chr7 102938154 . T G 10.21 PASS AO=2;DP=9;FAO=2;FDP=9;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=0.0248062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.967;QD=4.53798;RBI=0.0248062;REFB=-0.0307643;REVB=0;RO=7;SAF=2;SAR=0;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00330083;OID=.;OPOS=102938154;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:7:7:2:2:0:2:7:0:0:2:7:0 chr7 102948040 . T C 1331.25 PASS AO=144;DP=147;FAO=144;FDP=147;FR=.;FRO=3;FSAF=83;FSAR=61;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0262065;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.504;QD=36.2245;RBI=0.0292318;REFB=-0.0956324;REVB=0.0129506;RO=0;SAF=83;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508874;TYPE=snp;VARB=0.000204281;OID=.;OPOS=102948040;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:147:147:0:3:144:144:61:83:0:0:61:83:3:0 chr7 103007949 . A C 2412.65 PASS AO=251;DP=252;FAO=252;FDP=252;FR=.;FRO=0;FSAF=192;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00896105;FXX=0.00395241;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.58;QD=38.2961;RBI=0.037187;REFB=0;REVB=0.0360912;RO=0;SAF=192;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.86668e-05;OID=.;OPOS=103007949;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:252:252:0:0:251:252:59:192:0:0:60:192:0:0 chr7 103073964 . T C 85.55 PASS AO=27;DP=74;FAO=27;FDP=74;FR=.;FRO=47;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=29;FWDB=-0.0125115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.444;QD=4.62444;RBI=0.0287652;REFB=0.00340767;REVB=0.0259017;RO=46;SAF=11;SAR=16;SRF=18;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0183118;STB=0.516151;TYPE=snp;VARB=-0.00659193;OID=.;OPOS=103073964;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:74:74:46:47:27:27:16:11:18:28:16:11:18:29 chr7 103073979 . G C 78.76 PASS AO=26;DP=76;FAO=26;FDP=75;FR=.;FRO=49;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=30;FWDB=-0.00303134;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.859;QD=4.20028;RBI=0.0206215;REFB=-0.00285199;REVB=-0.0203974;RO=49;SAF=11;SAR=15;SRF=19;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0410294;STB=0.523791;TYPE=snp;VARB=0.0181173;OID=.;OPOS=103073979;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:76:75:49:49:26:26:15:11:19:30:15:11:19:30 chr7 103073993 . T C 85.01 PASS AO=27;DP=78;FAO=28;FDP=79;FR=.;FRO=51;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=32;FWDB=0.0256559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.075;QD=4.30436;RBI=0.0265369;REFB=-0.0029569;REVB=-0.00678121;RO=50;SAF=10;SAR=17;SRF=19;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0115173;STB=0.513813;TYPE=snp;VARB=0.00506532;OID=.;OPOS=103073993;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:78:79:50:51:27:28:17:10:19:31:17:11:19:32 chr7 103155705 . A G 72.53 PASS AO=19;DP=50;FAO=20;FDP=51;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=-0.00916258;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.925;QD=5.68859;RBI=0.00920853;REFB=-5.74819e-05;REVB=-0.000918805;RO=30;SAF=9;SAR=10;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0428847;STB=0.548971;TYPE=snp;VARB=-0.00019192;OID=.;OPOS=103155705;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:50:51:30:31:19:20:10:9:13:17:10:10:13:18 chr7 104110492 . C T 804.34 PASS AO=83;DP=84;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.42;QD=37.8513;RBI=0.05567;REFB=0;REVB=0.0547632;RO=0;SAF=75;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.34096e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.8817e-05;OID=.;OPOS=104110492;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:84:85:0:0:83:85:8:75:0:0:8:77:0:0 chr7 104263425 . T C 400.95 PASS AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.066587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.96;QD=37.2981;RBI=0.0740262;REFB=0;REVB=0.0323428;RO=0;SAF=16;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000117716;OID=.;OPOS=104263425;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:43:43:0:0:43:43:27:16:0:0:27:16:0:0 chr7 104536783 . C T 304.31 PASS AO=63;DP=114;FAO=63;FDP=114;FR=.;FRO=51;FSAF=4;FSAR=59;FSRF=5;FSRR=46;FWDB=0.00321823;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=258.931;QD=10.6776;RBI=0.0339643;REFB=0.00106923;REVB=0.0338115;RO=51;SAF=4;SAR=59;SRF=5;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105674;STB=0.558339;TYPE=snp;VARB=-0.000830928;OID=.;OPOS=104536783;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:51:51:63:63:59:4:5:46:59:4:5:46 chr7 104758250 . T C 557.24 PASS AO=136;DP=280;FAO=136;FDP=281;FR=.;FRO=145;FSAF=71;FSAR=65;FSRF=74;FSRR=71;FWDB=0.0248985;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=75.6232;QD=7.93223;RBI=0.0307712;REFB=-0.0234302;REVB=-0.0180812;RO=144;SAF=71;SAR=65;SRF=73;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.014155;STB=0.506052;TYPE=snp;VARB=0.0303267;OID=.;OPOS=104758250;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:280:281:144:145:136:136:65:71:73:71:65:71:74:71 chr7 104785779 . T G 689.99 PASS AO=72;DP=72;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00214473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.948;QD=37.8074;RBI=0.00920054;REFB=0;REVB=0.00894707;RO=0;SAF=33;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.07977e-06;OID=.;OPOS=104785779;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:72:73:0:0:72:73:39:33:0:0:39:34:0:0 chr7 105177041 . A T 878.03 PASS AO=200;DP=389;FAO=200;FDP=387;FR=.;FRO=187;FSAF=89;FSAR=111;FSRF=84;FSRR=103;FWDB=0.00396641;FXX=0.00514126;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.403;QD=9.07525;RBI=0.0246704;REFB=-0.0134436;REVB=-0.0243495;RO=185;SAF=89;SAR=111;SRF=84;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00806028;STB=0.502052;TYPE=snp;VARB=0.0123145;OID=.;OPOS=105177041;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:389:387:185:187:200:200:111:89:84:101:111:89:84:103 chr7 105658451 . G A 358.74 PASS AO=66;DP=107;FAO=66;FDP=107;FR=.;FRO=41;FSAF=18;FSAR=48;FSRF=8;FSRR=33;FWDB=0.00812482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.819;QD=13.4108;RBI=0.0116945;REFB=-0.00226577;REVB=0.00841126;RO=39;SAF=18;SAR=48;SRF=6;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108634;STB=0.538791;TYPE=snp;VARB=0.00396688;OID=.;OPOS=105658451;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:39:41:66:66:48:18:6:33:48:18:8:33 chr7 105658460 . C G 320.07 PASS AO=59;DP=96;FAO=59;FDP=97;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=44;FSRF=3;FSRR=35;FWDB=-0.0448936;FXX=0.010203;HRUN=5;LEN=1;MLLD=180.712;QD=13.1989;RBI=0.0448959;REFB=-0.00723646;REVB=0.000453875;RO=37;SAF=15;SAR=44;SRF=3;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178862;STB=0.599364;TYPE=snp;VARB=0.00595477;OID=.;OPOS=105658460;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:97:37:38:59:59:44:15:3:34:44:15:3:35 chr7 105662690 . T C 295.34 PASS AO=80;DP=183;FAO=80;FDP=182;FR=.;FRO=102;FSAF=63;FSAR=17;FSRF=87;FSRR=15;FWDB=0.0379108;FXX=0.00546418;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.413;QD=6.49108;RBI=0.0381765;REFB=-0.0171592;REVB=-0.00449638;RO=102;SAF=63;SAR=17;SRF=87;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105836;STB=0.558462;TYPE=snp;VARB=0.0369547;OID=.;OPOS=105662690;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:182:102:102:80:80:17:63:87:15:17:63:87:15 chr7 105903904 . T C 411.45 PASS AO=114;DP=262;FAO=114;FDP=262;FR=.;FRO=148;FSAF=64;FSAR=50;FSRF=68;FSRR=80;FWDB=-0.0164509;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.9326;QD=6.28168;RBI=0.0178138;REFB=0.000293885;REVB=-0.00683386;RO=147;SAF=64;SAR=50;SRF=67;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107109;STB=0.557631;TYPE=snp;VARB=-0.000561762;OID=.;OPOS=105903904;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:262:262:147:148:114:114:50:64:67:80:50:64:68:80 chr7 106508978 . A G 1717.48 PASS AO=179;DP=182;FAO=181;FDP=181;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126306;FXX=0.0054942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.27;QD=37.9553;RBI=0.13443;REFB=0;REVB=0.133835;RO=1;SAF=75;SAR=104;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00630514;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000474735;OID=.;OPOS=106508978;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:182:181:1:0:179:181:104:75:1:0:105:76:0:0 chr7 106508987 . T C 1766.93 PASS AO=183;DP=190;FAO=187;FDP=187;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.009563;FXX=0.0209413;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.515;QD=37.7952;RBI=0.0113181;REFB=0;REVB=0.00605388;RO=0;SAF=77;SAR=106;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000327744;OID=.;OPOS=106508987;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:190:187:0:0:183:187:106:77:0:0:109:78:0:0 chr7 106799997 . G A 90.41 PASS AO=18;DP=39;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.0511904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.656;QD=9.04132;RBI=0.0713592;REFB=-0.00699774;REVB=0.049716;RO=20;SAF=7;SAR=11;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19497;STB=0.626775;TYPE=snp;VARB=0.00604575;OID=.;OPOS=106799997;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:39:40:20:20:18:20:11:7:12:8:13:7:12:8 chr7 106842981 . CTGAT C 153.44 PASS AO=36;DP=116;FAO=40;FDP=91;FR=.;FRO=51;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=17;FSRR=34;FWDB=-0.00433098;FXX=0.0421008;HRUN=1;LEN=4;MLLD=165.099;QD=6.74469;RBI=0.0210759;REFB=-0.00665708;REVB=0.0206261;RO=46;SAF=12;SAR=24;SRF=16;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0161369;STB=0.510323;TYPE=del;VARB=0.0085267;OID=.;OPOS=106842982;OREF=TGAT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:36:90:40:91:51:14:26:17:34:99:46:12:24:16:30 chr7 107002504 . T C 301.72 PASS AO=78;DP=173;FAO=78;FDP=171;FR=.;FRO=93;FSAF=44;FSAR=34;FSRF=43;FSRR=50;FWDB=-0.00301842;FXX=0.01156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.162;QD=7.05767;RBI=0.00602736;REFB=-0.0181654;REVB=-0.0052171;RO=92;SAF=44;SAR=34;SRF=43;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.094603;STB=0.555441;TYPE=snp;VARB=0.0211931;OID=.;OPOS=107002504;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:171:92:93:78:78:34:44:43:49:34:44:43:50 chr7 107002806 . A G 367.2 PASS AO=99;DP=225;FAO=99;FDP=223;FR=.;FRO=124;FSAF=45;FSAR=54;FSRF=76;FSRR=48;FWDB=0.0415657;FXX=0.00888849;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.7421;QD=6.58648;RBI=0.0420515;REFB=-0.0250331;REVB=0.00637328;RO=123;SAF=45;SAR=54;SRF=76;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161967;STB=0.587361;TYPE=snp;VARB=0.0297837;OID=.;OPOS=107002806;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:225:223:123:124:99:99:54:45:76:47:54:45:76:48 chr7 107188719 . G T 473.85 PASS AO=103;DP=194;FAO=103;FDP=193;FR=.;FRO=90;FSAF=41;FSAR=62;FSRF=30;FSRR=60;FWDB=-0.0126765;FXX=0.00515437;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.8353;QD=9.82068;RBI=0.0130278;REFB=-0.0201502;REVB=0.00300487;RO=90;SAF=41;SAR=62;SRF=30;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0584514;STB=0.531895;TYPE=snp;VARB=0.0209547;OID=.;OPOS=107188719;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:193:90:90:103:103:62:41:30:60:62:41:30:60 chr7 107208250 . T C 238.52 PASS AO=51;DP=108;FAO=55;FDP=110;FR=.;FRO=55;FSAF=19;FSAR=36;FSRF=34;FSRR=21;FWDB=0.0125085;FXX=0.0178555;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.743;QD=8.67363;RBI=0.0129797;REFB=-0.0153999;REVB=-0.00346537;RO=57;SAF=15;SAR=36;SRF=36;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.327106;STB=0.637863;TYPE=snp;VARB=0.0118336;OID=.;OPOS=107208250;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:110:57:55:51:55:36:15:36:21:36:19:34:21 chr7 107217020 . G A 156.33 PASS AO=33;DP=65;FAO=34;FDP=66;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=11;FWDB=0.0218578;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.108;QD=9.47447;RBI=0.0293023;REFB=-0.0148074;REVB=0.0195156;RO=32;SAF=15;SAR=18;SRF=21;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176949;STB=0.603115;TYPE=snp;VARB=0.0118649;OID=.;OPOS=107217020;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:66:32:32:33:34:18:15:21:11:19:15:21:11 chr7 107414419 . A G 1946.2 PASS AO=214;DP=231;FAO=224;FDP=229;FR=.;FRO=5;FSAF=124;FSAR=100;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.0214714;FXX=0.00865763;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.066;QD=33.9947;RBI=0.0243925;REFB=-0.187804;REVB=-0.0115746;RO=2;SAF=124;SAR=90;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00143735;STB=0.507796;TYPE=snp;VARB=0.000477381;OID=.;OPOS=107414419;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:231:229:2:5:214:224:90:124:1:1:100:124:1:4 chr7 107423329 . T TA,TAA 39.43 PASS AO=42,24;DP=143;FAO=42,5;FDP=130;FR=.;FRO=83;FSAF=21,2;FSAR=21,3;FSRF=35;FSRR=48;FWDB=-0.052776,-0.0242655;FXX=0.00763301;HRUN=7,7;LEN=1,2;MLLD=6.53419,12.154;QD=1.21324;RBI=0.256803,0.128099;REFB=-0.0947173,-0.0473469;REVB=-0.251321,-0.12578;RO=65;SAF=13,12;SAR=29,12;SRF=37;SRR=28;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.284353,-0.0842529;STB=0.551975,0.521042;TYPE=ins,ins;VARB=-0.246926,0.0485008;OID=.,.;OPOS=107423330,107423330;OREF=-,-;OALT=A,AA;OMAPALT=TA,TAA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:42,24:143:42,5:130:83:21,2:21,3:35:48:18:65:13,12:29,12:37:28 chr7 107423773 . G A 189.09 PASS AO=51;DP=121;FAO=52;FDP=122;FR=.;FRO=70;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=41;FSRR=29;FWDB=-0.000519715;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.862;QD=6.19958;RBI=0.00118309;REFB=-0.0244367;REVB=-0.00106283;RO=70;SAF=26;SAR=25;SRF=41;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0784007;STB=0.538301;TYPE=snp;VARB=0.0370397;OID=.;OPOS=107423773;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:122:70:70:51:52:25:26:41:29:25:27:41:29 chr7 107559911 . G A 411.2 PASS AO=102;DP=214;FAO=102;FDP=214;FR=.;FRO=112;FSAF=42;FSAR=60;FSRF=57;FSRR=55;FWDB=0.0187077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.082;QD=7.68606;RBI=0.0189925;REFB=-0.0115976;REVB=0.00327691;RO=112;SAF=42;SAR=60;SRF=57;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0933385;STB=0.551522;TYPE=snp;VARB=0.0206759;OID=.;OPOS=107559911;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:214:112:112:102:102:60:42:57:55:60:42:57:55 chr7 107569517 . A G 520.16 PASS AO=111;DP=205;FAO=111;FDP=204;FR=.;FRO=93;FSAF=52;FSAR=59;FSRF=65;FSRR=28;FWDB=0.0138788;FXX=0.00487781;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.316;QD=10.1992;RBI=0.0194677;REFB=-0.0146896;REVB=0.0136518;RO=93;SAF=52;SAR=59;SRF=65;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191329;STB=0.604077;TYPE=snp;VARB=0.0124861;OID=.;OPOS=107569517;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:204:93:93:111:111:59:52:65:28:59:52:65:28 chr7 107593989 . T C 69.39 PASS AO=18;DP=48;FAO=19;FDP=48;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.0146742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.532;QD=5.78273;RBI=0.0574776;REFB=-0.00689374;REVB=0.0555728;RO=29;SAF=13;SAR=5;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163357;STB=0.60548;TYPE=snp;VARB=0.008315;OID=.;OPOS=107593989;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:48:48:29:29:18:19:5:13:17:12:5:14:17:12 chr7 107603431 . A C 659.16 PASS AO=165;DP=366;FAO=171;FDP=368;FR=.;FRO=197;FSAF=91;FSAR=80;FSRF=113;FSRR=84;FWDB=-0.0103094;FXX=0.00808604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.418;QD=7.1648;RBI=0.0114168;REFB=-0.0190946;REVB=-0.00490509;RO=182;SAF=87;SAR=78;SRF=100;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.021232;STB=0.522338;TYPE=snp;VARB=0.0249633;OID=.;OPOS=107603431;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:366:368:182:197:165:171:78:87:100:82:80:91:113:84 chr7 107671364 . GC G 1705.11 PASS AO=200;DP=290;FAO=275;FDP=275;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=179;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.275774;FXX=0.0143364;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.971;QD=24.8016;RBI=0.328402;REFB=0;REVB=0.178315;RO=48;SAF=61;SAR=139;SRF=18;SRR=30;SSEN=0.647059;SSEP=0;SSSB=-0.029745;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00406635;OID=.;OPOS=107671365;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:200:277:275:275:0:96:179:0:0:99:48:61:139:18:30 chr7 107808775 . TC T 264.56 PASS AO=27;DP=56;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.132838;FXX=0.019996;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.3732;QD=21.5963;RBI=0.397564;REFB=0;REVB=0.374715;RO=7;SAF=23;SAR=4;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0.41;SSSB=0.373369;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0156942;OID=.;OPOS=107808776;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:27:47:49:49:0:31:18:0:0:23:7:23:4:1:6 chr7 107818851 . T C 1153.06 PASS AO=124;DP=126;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0125259;FXX=0.0158718;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.257;QD=37.1956;RBI=0.0323755;REFB=-0.0733382;REVB=0.0298543;RO=0;SAF=69;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000115914;OID=.;OPOS=107818851;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:126:124:0:0:124:124:55:69:0:0:55:69:0:0 chr7 107824678 . A G 1802.05 PASS AO=135;DP=190;FAO=184;FDP=187;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=107;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.155681;FXX=0.0105815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.711;QD=38.5465;RBI=0.160745;REFB=0;REVB=0.0400315;RO=1;SAF=61;SAR=74;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00772922;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000776477;OID=.;OPOS=107824678;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:189:187:1:0:135:184:74:61:1:0:77:107:0:0 chr7 107824888 . AC A,AG 706.12 PASS AO=18,58;DP=80;FAO=9,68;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=4,48;FSAR=5,20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0103371,-0.0172877;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=71.2227,77.5728;QD=36.6816;RBI=0.102421,0.0363798;REFB=0,0;REVB=0.101898,0.0320098;RO=0;SAF=14,38;SAR=4,20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.38905e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.0143936,0.0748759;OID=.,.;OPOS=107824889,107824889;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=A,AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:18,58:77:9,68:77:0:4,48:5,20:0:0:5:0:14,38:4,20:0:0 chr7 107834613 . G C 1981.15 PASS AO=208;DP=210;FAO=208;FDP=208;FR=.;FRO=0;FSAF=111;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.125039;FXX=0.00952336;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.811;QD=38.0991;RBI=0.125529;REFB=0.0101668;REVB=0.0110877;RO=1;SAF=111;SAR=97;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00427243;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000191907;OID=.;OPOS=107834613;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:210:208:1:0:208:208:97:111:1:0:97:111:0:0 chr7 107834734 . C T 1973.21 PASS AO=201;DP=201;FAO=206;FDP=206;FR=.;FRO=0;FSAF=127;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0299085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.203;QD=38.3148;RBI=0.0400999;REFB=0;REVB=0.0267111;RO=0;SAF=122;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.39205e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.50524e-05;OID=.;OPOS=107834734;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:201:206:0:0:201:206:79:122:0:0:79:127:0:0 chr7 107838464 . G T 1915.64 PASS AO=199;DP=199;FAO=199;FDP=199;FR=.;FRO=0;FSAF=107;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114211;FXX=0.00499975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.127;QD=38.5054;RBI=0.0196723;REFB=0;REVB=-0.0160175;RO=0;SAF=107;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00011094;OID=.;OPOS=107838464;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:199:199:0:0:199:199:92:107:0:0:92:107:0:0 chr7 107849908 . G A 1671.43 PASS AO=170;DP=186;FAO=177;FDP=177;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00611203;FXX=0.157135;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.489;QD=37.7724;RBI=0.014726;REFB=0;REVB=-0.0133977;RO=0;SAF=96;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000219121;OID=.;OPOS=107849908;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:186:177:0:0:170:177:74:96:0:0:76:101:0:0 chr7 107875170 . T C 1602.4 PASS AO=174;DP=179;FAO=175;FDP=178;FR=.;FRO=3;FSAF=91;FSAR=84;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0118468;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.836;QD=36.009;RBI=0.0123088;REFB=-0.0468358;REVB=-0.00334049;RO=2;SAF=89;SAR=85;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0105754;STB=0.50315;TYPE=snp;VARB=4.97131e-05;OID=.;OPOS=107875170;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:179:178:2:3:174:175:85:89:2:0:84:91:1:2 chr7 112101909 . T A 307 PASS AO=98;DP=210;FAO=91;FDP=226;FR=.;FRO=135;FSAF=62;FSAR=29;FSRF=80;FSRR=55;FWDB=-0.00166098;FXX=0.0300416;HRUN=11;LEN=1;MLLD=141.604;QD=5.43362;RBI=0.0145189;REFB=0.0006096;REVB=0.0144235;RO=109;SAF=69;SAR=29;SRF=61;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153193;STB=0.558426;TYPE=snp;VARB=-0.000443723;OID=.;OPOS=112101909;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:210:226:109:135:98:91:29:69:61:48:29:62:80:55 chr7 112101910 . T A 199.63 PASS AO=78;DP=228;FAO=79;FDP=237;FR=.;FRO=158;FSAF=45;FSAR=34;FSRF=101;FSRR=57;FWDB=0.000123434;FXX=0.0042015;HRUN=11;LEN=1;MLLD=98.6937;QD=3.36924;RBI=0.036246;REFB=0.00249106;REVB=0.0362458;RO=149;SAF=45;SAR=33;SRF=96;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.080614;STB=0.547951;TYPE=snp;VARB=-0.00130363;OID=.;OPOS=112101910;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:228:237:149:158:78:79:33:45:96:53:34:45:101:57 chr7 112102355 . T G 732.77 PASS AO=158;DP=292;FAO=158;FDP=292;FR=.;FRO=134;FSAF=88;FSAR=70;FSRF=66;FSRR=68;FWDB=0.00539933;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.4846;QD=10.0379;RBI=0.00801824;REFB=-0.00373851;REVB=0.00592785;RO=134;SAF=88;SAR=70;SRF=66;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0546134;STB=0.529747;TYPE=snp;VARB=0.00263846;OID=.;OPOS=112102355;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:292:292:134:134:158:158:70:88:66:68:70:88:66:68 chr7 112112279 . G A 175.62 PASS AO=57;DP=152;FAO=57;FDP=152;FR=.;FRO=95;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=55;FSRR=40;FWDB=0.00674751;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=290.765;QD=4.62165;RBI=0.00734142;REFB=0.000693125;REVB=0.00289267;RO=95;SAF=31;SAR=26;SRF=55;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0391028;STB=0.522178;TYPE=snp;VARB=-0.00120468;OID=.;OPOS=112112279;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:152:95:95:57:57:26:31:55:40:26:31:55:40 chr7 112112892 . G A 386.27 PASS AO=103;DP=228;FAO=102;FDP=227;FR=.;FRO=125;FSAF=56;FSAR=46;FSRF=48;FSRR=77;FWDB=0.00506503;FXX=0.00873324;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.762;QD=6.80646;RBI=0.0156252;REFB=-0.00490679;REVB=0.0147815;RO=124;SAF=56;SAR=47;SRF=48;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153476;STB=0.590113;TYPE=snp;VARB=0.0107377;OID=.;OPOS=112112892;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:228:227:124:125:103:102:47:56:48:76:46:56:48:77 chr7 112405982 . TA T 67.19 PASS AO=64;DP=209;FAO=77;FDP=195;FR=.;FRO=118;FSAF=53;FSAR=24;FSRF=83;FSRR=35;FWDB=0.121405;FXX=0.0101518;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.85915;QD=1.37828;RBI=0.153749;REFB=-0.0284042;REVB=0.0943387;RO=80;SAF=44;SAR=20;SRF=63;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1227;STB=0.510715;TYPE=del;VARB=0.00658267;OID=.;OPOS=112405983;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:64:182:77:195:118:53:24:83:35:67:80:44:20:63:17 chr7 112406507 . C T 235.37 PASS AO=53;DP=112;FAO=56;FDP=115;FR=.;FRO=59;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=25;FSRR=34;FWDB=0.0136523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.502;QD=8.18665;RBI=0.0369015;REFB=0.00092404;REVB=0.0342832;RO=58;SAF=30;SAR=23;SRF=25;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126906;STB=0.557255;TYPE=snp;VARB=-0.000834096;OID=.;OPOS=112406507;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:115:58:59:53:56:23:30:25:33:26:30:25:34 chr7 112459652 . T A 182.57 PASS AO=49;DP=113;FAO=49;FDP=113;FR=.;FRO=64;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=39;FSRR=25;FWDB=-0.00478004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.156;QD=6.46269;RBI=0.0354014;REFB=-0.0189285;REVB=0.0350772;RO=63;SAF=31;SAR=18;SRF=39;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0146241;STB=0.514071;TYPE=snp;VARB=0.0266122;OID=.;OPOS=112459652;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:63:64:49:49:18:31:39:24:18:31:39:25 chr7 112460444 . CACA C 182.6 PASS AO=42;DP=96;FAO=42;FDP=87;FR=.;FRO=45;FSAF=32;FSAR=10;FSRF=27;FSRR=18;FWDB=0.0209578;FXX=0.0543419;HRUN=1;LEN=3;MLLD=240.194;QD=8.39541;RBI=0.0286054;REFB=0.00314623;REVB=0.019469;RO=44;SAF=32;SAR=10;SRF=27;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168222;STB=0.602908;TYPE=del;VARB=-0.00316128;OID=.;OPOS=112460445;OREF=ACA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:42:89:42:87:45:32:10:27:18:99:44:32:10:27:17 chr7 112461370 . C T 77.73 PASS AO=25;DP=71;FAO=25;FDP=71;FR=.;FRO=46;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=-0.000310729;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.367;QD=4.37888;RBI=0.0247081;REFB=-0.00916864;REVB=-0.0247062;RO=45;SAF=16;SAR=9;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0980942;STB=0.565318;TYPE=snp;VARB=0.0168583;OID=.;OPOS=112461370;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:71:71:45:46:25:25:9:16:25:20:9:16:25:21 chr7 112575285 . G A 159.35 PASS AO=37;DP=76;FAO=37;FDP=76;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=25;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=0.000960778;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.176;QD=8.38679;RBI=0.00358516;REFB=0.00124435;REVB=0.00345402;RO=39;SAF=12;SAR=25;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183053;STB=0.602352;TYPE=snp;VARB=-0.00170131;OID=.;OPOS=112575285;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:39:39:37:37:25:12:20:19:25:12:20:19 chr7 112722278 . A AC,C 549.42 PASS AO=11,43;DP=61;FAO=9,50;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=4,26;FSAR=5,24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194555,0.0315677;FXX=0.0166639;HRUN=0,9;LEN=1,1;MLLD=78.8931,81.8869;QD=37.2485;RBI=0.0300956,0.0407678;REFB=0,0;REVB=0.0229615,0.0257971;RO=2;SAF=6,21;SAR=5,22;SRF=2;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.128043,-0.0426412;STB=0.5,0.5;TYPE=ins,snp;VARB=-0.00534914,0.0109452;OID=.,.;OPOS=112722279,112722278;OREF=-,A;OALT=C,C;OMAPALT=AC,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:5:61:59:2:0:11,43:9,50:5,22:6,21:2:0:5,24:4,26:0:0 chr7 112723093 . T C 344.29 PASS AO=93;DP=211;FAO=93;FDP=211;FR=.;FRO=118;FSAF=50;FSAR=43;FSRF=61;FSRR=57;FWDB=0.0224999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.5927;QD=6.5268;RBI=0.0288424;REFB=-0.00639753;REVB=-0.0180454;RO=117;SAF=50;SAR=43;SRF=60;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0249634;STB=0.511611;TYPE=snp;VARB=0.0130529;OID=.;OPOS=112723093;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:211:117:118:93:93:43:50:60:57:43:50:61:57 chr7 112724417 . A G 1170.62 PASS AO=127;DP=131;FAO=128;FDP=130;FR=.;FRO=2;FSAF=60;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0136295;FXX=0.00763301;HRUN=3;LEN=1;MLLD=71.6816;QD=36.0191;RBI=0.0144735;REFB=-0.169242;REVB=0.00487041;RO=2;SAF=60;SAR=67;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0139719;STB=0.507245;TYPE=snp;VARB=0.00266681;OID=.;OPOS=112724417;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:131:130:2:2:127:128:67:60:0:2:68:60:0:2 chr7 112724525 . A G 836.41 PASS AO=101;DP=111;FAO=101;FDP=111;FR=.;FRO=10;FSAF=41;FSAR=60;FSRF=9;FSRR=1;FWDB=0.0195715;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.649;QD=30.141;RBI=0.0224981;REFB=-0.0264462;REVB=0.0110961;RO=9;SAF=41;SAR=60;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0934729;STB=0.545346;TYPE=snp;VARB=0.00138804;OID=.;OPOS=112724525;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:111:111:9:10:101:101:60:41:9:0:60:41:9:1 chr7 112724795 . G T 114.26 PASS AO=28;DP=62;FAO=28;FDP=62;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=-0.00153235;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.875;QD=7.37158;RBI=0.00175201;REFB=-0.00886912;REVB=-0.000849378;RO=34;SAF=11;SAR=17;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0775368;STB=0.543807;TYPE=snp;VARB=0.0167629;OID=.;OPOS=112724795;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:34:34:28:28:17:11:16:18:17:11:16:18 chr7 113518502 . A T 1189 PASS AO=125;DP=127;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0228555;FXX=0.0078734;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.007;QD=37.746;RBI=0.0228571;REFB=-0.0348932;REVB=0.000270253;RO=0;SAF=63;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.36986e-05;OID=.;OPOS=113518502;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:127:126:0:0:125:126:62:63:0:0:62:64:0:0 chr7 113519719 . A T 2176.81 PASS AO=214;DP=215;FAO=234;FDP=234;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=138;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029027;FXX=0.00425514;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.439;QD=37.2105;RBI=0.0313458;REFB=0.0249301;REVB=0.011832;RO=1;SAF=85;SAR=129;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00367908;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.8343e-05;OID=.;OPOS=113519719;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:96:215:234:1:0:214:234:129:85:0:1:138:96:0:0 chr7 113519796 . C T 2217.24 PASS AO=228;DP=228;FAO=230;FDP=230;FR=.;FRO=0;FSAF=100;FSAR=130;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0207692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.5934;QD=38.5607;RBI=0.0242892;REFB=0;REVB=-0.0125938;RO=0;SAF=100;SAR=128;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.36797e-05;OID=.;OPOS=113519796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:228:230:0:0:228:230:128:100:0:0:130:100:0:0 chr7 114296545 . A C 265.03 PASS AO=66;DP=141;FAO=66;FDP=141;FR=.;FRO=75;FSAF=18;FSAR=48;FSRF=27;FSRR=48;FWDB=-0.0713913;FXX=0.00704176;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.4648;QD=7.51846;RBI=0.0743363;REFB=-0.0358854;REVB=0.0207163;RO=75;SAF=18;SAR=48;SRF=27;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0997523;STB=0.555538;TYPE=snp;VARB=0.0413889;OID=.;OPOS=114296545;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:75:75:66:66:48:18:27:48:48:18:27:48 chr7 114619598 . C A 414.58 PASS AO=45;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0228218;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=272.38;QD=36.0501;RBI=0.0807747;REFB=-0.0725404;REVB=0.0774836;RO=1;SAF=41;SAR=4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0113289;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000477364;OID=.;OPOS=114619598;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:46:46:1:0:45:46:4:41:1:0:4:42:0:0 chr7 115578104 . T C 115.16 PASS AO=32;DP=78;FAO=32;FDP=78;FR=.;FRO=46;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=0.00214148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.89;QD=5.90583;RBI=0.0348687;REFB=-0.00430955;REVB=-0.0348029;RO=46;SAF=12;SAR=20;SRF=18;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0179542;STB=0.510198;TYPE=snp;VARB=0.00590923;OID=.;OPOS=115578104;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:46:46:32:32:20:12:18:28:20:12:18:28 chr7 115578124 . G T 735.87 PASS AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.0933;QD=38.2272;RBI=0.060572;REFB=0;REVB=-0.0587781;RO=0;SAF=30;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000266278;OID=.;OPOS=115578124;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:77:77:0:0:77:77:47:30:0:0:47:30:0:0 chr7 115892650 . T G 2034.61 PASS AO=215;DP=219;FAO=215;FDP=215;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=136;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113933;FXX=0.018264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.238;QD=37.8533;RBI=0.0116681;REFB=-0.0706909;REVB=-0.00251744;RO=2;SAF=79;SAR=136;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119065;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.57422e-05;OID=.;OPOS=115892650;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:219:215:2:0:215:215:136:79:2:0:136:79:0:0 chr7 115897392 . G C 1331.76 PASS AO=142;DP=145;FAO=144;FDP=147;FR=.;FRO=3;FSAF=73;FSAR=71;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0349726;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.835;QD=36.2382;RBI=0.0404978;REFB=-0.178971;REVB=0.0204203;RO=3;SAF=73;SAR=69;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0191369;STB=0.510066;TYPE=snp;VARB=0.000491193;OID=.;OPOS=115897392;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:145:147:3:3:142:144:69:73:3:0:71:73:3:0 chr7 116146074 . C G 618.63 PASS AO=147;DP=296;FAO=147;FDP=296;FR=.;FRO=149;FSAF=63;FSAR=84;FSRF=44;FSRR=105;FWDB=0.0401703;FXX=0.00336689;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.777;QD=8.35981;RBI=0.0403193;REFB=-0.0260054;REVB=-0.00346409;RO=148;SAF=63;SAR=84;SRF=44;SRR=104;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125413;STB=0.56984;TYPE=snp;VARB=0.0317729;OID=.;OPOS=116146074;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:296:296:148:149:147:147:84:63:44:104:84:63:44:105 chr7 116165233 . C T 106.89 PASS AO=32;DP=83;FAO=32;FDP=83;FR=.;FRO=51;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=34;FSRR=17;FWDB=0.00417475;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=259.029;QD=5.15113;RBI=0.0114653;REFB=-0.0109664;REVB=0.0106782;RO=51;SAF=21;SAR=11;SRF=34;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0124724;STB=0.50712;TYPE=snp;VARB=0.00675716;OID=.;OPOS=116165233;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:51:51:32:32:11:21:34:17:11:21:34:17 chr7 116165237 . G GCC 57 PASS AO=18;DP=83;FAO=31;FDP=80;FR=.;FRO=49;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=32;FSRR=17;FWDB=-0.0694345;FXX=0.0243873;HRUN=4;LEN=2;MLLD=22.8382;QD=2.84993;RBI=0.131419;REFB=-0.0186109;REVB=0.111579;RO=51;SAF=14;SAR=4;SRF=30;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.267004;STB=0.516853;TYPE=ins;VARB=0.0266722;OID=.;OPOS=116165238;OREF=-;OALT=CC;OMAPALT=GCC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:18:83:31:80:49:21:10:32:17:56:51:14:4:30:21 chr7 116165360 . A C 135.04 PASS AO=27;DP=57;FAO=28;FDP=53;FR=.;FRO=25;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=-0.0222505;FXX=0.086192;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.623;QD=10.1913;RBI=0.0248112;REFB=0.0157293;REVB=-0.0109778;RO=22;SAF=20;SAR=7;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14444;STB=0.562454;TYPE=snp;VARB=-0.0124374;OID=.;OPOS=116165360;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:53:22:25:27:28:7:20:13:9:8:20:15:10 chr7 116339672 . C T 167.65 PASS AO=53;DP=139;FAO=53;FDP=139;FR=.;FRO=86;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=46;FSRR=40;FWDB=-0.036687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.18;QD=4.82453;RBI=0.0372075;REFB=-0.0110417;REVB=-0.00620162;RO=84;SAF=26;SAR=27;SRF=44;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.035973;STB=0.527391;TYPE=snp;VARB=0.0157374;OID=.;OPOS=116339672;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:84:86:53:53:27:26:44:40:27:26:46:40 chr7 116364823 . CA C 277.28 PASS AO=50;DP=83;FAO=50;FDP=81;FR=.;FRO=31;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.00435267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.767;QD=13.6928;RBI=0.0138625;REFB=-0.00311336;REVB=-0.0131614;RO=30;SAF=29;SAR=21;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0789677;STB=0.549606;TYPE=del;VARB=0.00307022;OID=.;OPOS=116364824;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:50:81:50:81:31:29:21:14:17:99:30:29:21:14:16 chr7 116435768 . C T 463.72 PASS AO=124;DP=276;FAO=124;FDP=276;FR=.;FRO=152;FSAF=56;FSAR=68;FSRF=80;FSRR=72;FWDB=0.00994664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.859;QD=6.72062;RBI=0.0109975;REFB=-0.00725734;REVB=-0.00469153;RO=151;SAF=56;SAR=68;SRF=79;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0710836;STB=0.541192;TYPE=snp;VARB=0.00978208;OID=.;OPOS=116435768;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:276:276:151:152:124:124:68:56:79:72:68:56:80:72 chr7 116436022 . G A 691.6 PASS AO=170;DP=359;FAO=173;FDP=362;FR=.;FRO=189;FSAF=63;FSAR=110;FSRF=78;FSRR=111;FWDB=0.00394684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.976;QD=7.64193;RBI=0.0286878;REFB=-0.0172634;REVB=0.028415;RO=187;SAF=60;SAR=110;SRF=78;SRR=109;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0653706;STB=0.526956;TYPE=snp;VARB=0.01886;OID=.;OPOS=116436022;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:359:362:187:189:170:173:110:60:78:109:110:63:78:111 chr7 116436097 . G A 859.71 PASS AO=227;DP=446;FAO=201;FDP=397;FR=.;FRO=196;FSAF=83;FSAR=118;FSRF=76;FSRR=120;FWDB=0.00793092;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7522;QD=8.66209;RBI=0.0216455;REFB=-0.0284278;REVB=0.0201402;RO=217;SAF=96;SAR=131;SRF=84;SRR=133;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0330212;STB=0.512877;TYPE=snp;VARB=0.0258147;OID=.;OPOS=116436097;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:446:397:217:196:227:201:131:96:84:133:118:83:76:120 chr7 116437606 . G A 737.84 PASS AO=190;DP=413;FAO=187;FDP=397;FR=.;FRO=210;FSAF=108;FSAR=79;FSRF=109;FSRR=101;FWDB=0.000810381;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.783;QD=7.43417;RBI=0.0169028;REFB=-0.0117009;REVB=0.0168834;RO=219;SAF=109;SAR=81;SRF=113;SRR=106;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0567532;STB=0.531391;TYPE=snp;VARB=0.0139286;OID=.;OPOS=116437606;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:413:397:219:210:190:187:81:109:113:106:79:108:109:101 chr7 116558716 . G A 134.93 PASS AO=66;DP=231;FAO=66;FDP=230;FR=.;FRO=164;FSAF=8;FSAR=58;FSRF=89;FSRR=75;FWDB=-0.0446131;FXX=0.00862032;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.801;QD=2.3466;RBI=0.0453542;REFB=-0.0105083;REVB=0.0081657;RO=163;SAF=8;SAR=58;SRF=88;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.571272;STB=0.840842;TYPE=snp;VARB=0.012734;OID=.;OPOS=116558716;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:231:230:163:164:66:66:58:8:88:75:58:8:89:75 chr7 116596697 . A G 2076.48 PASS AO=215;DP=223;FAO=219;FDP=219;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=132;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.005678;FXX=0.0309721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.843;QD=37.9265;RBI=0.00889978;REFB=0;REVB=0.00685319;RO=1;SAF=85;SAR=130;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00557201;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000187899;OID=.;OPOS=116596697;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:97:223:219:1:0:215:219:130:85:1:0:132:87:0:0 chr7 116598735 . A G 2492.42 PASS AO=259;DP=261;FAO=263;FDP=263;FR=.;FRO=0;FSAF=114;FSAR=149;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288867;FXX=0.0112778;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.098;QD=37.9076;RBI=0.0304469;REFB=-0.0826923;REVB=0.00962127;RO=0;SAF=111;SAR=148;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00032608;OID=.;OPOS=116598735;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:261:263:0:0:259:263:148:111:0:0:149:114:0:0 chr7 116608501 . A G 664.75 PASS AO=229;DP=515;FAO=179;FDP=399;FR=.;FRO=220;FSAF=75;FSAR=104;FSRF=113;FSRR=107;FWDB=-0.024598;FXX=0.00249994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.224;QD=6.6642;RBI=0.0261394;REFB=-0.000888041;REVB=0.0088435;RO=282;SAF=92;SAR=137;SRF=145;SRR=137;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113827;STB=0.55267;TYPE=snp;VARB=0.000820691;OID=.;OPOS=116608501;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:515:399:282:220:229:179:137:92:145:137:104:75:113:107 chr7 116863860 . C A 632.4 PASS AO=155;DP=319;FAO=156;FDP=322;FR=.;FRO=166;FSAF=85;FSAR=71;FSRF=97;FSRR=69;FWDB=-0.00513018;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.135;QD=7.85589;RBI=0.014072;REFB=-0.0127522;REVB=0.0131035;RO=164;SAF=85;SAR=70;SRF=95;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0292709;STB=0.520584;TYPE=snp;VARB=0.0143933;OID=.;OPOS=116863860;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:319:322:164:166:155:156:70:85:95:69:71:85:97:69 chr7 117865028 . G A 98.3 PASS AO=25;DP=59;FAO=25;FDP=59;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.0102775;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.856;QD=6.66425;RBI=0.027893;REFB=-0.0106956;REVB=0.0259306;RO=32;SAF=10;SAR=15;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131021;STB=0.575282;TYPE=snp;VARB=0.0137132;OID=.;OPOS=117865028;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:59:59:32:34:25:25:15:10:17:15:15:10:18:16 chr7 120428799 . C A 197.13 PASS AO=61;DP=158;FAO=61;FDP=157;FR=.;FRO=96;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=62;FSRR=34;FWDB=-0.00653226;FXX=0.00632871;HRUN=4;LEN=1;MLLD=153.956;QD=5.02247;RBI=0.0108302;REFB=-0.00711946;REVB=0.00863843;RO=92;SAF=28;SAR=33;SRF=60;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204333;STB=0.612841;TYPE=snp;VARB=0.00964544;OID=.;OPOS=120428799;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:157:92:96:61:61:33:28:60:32:33:28:62:34 chr7 120704289 . C T 1131.36 PASS AO=112;DP=115;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0488749;FXX=0.0161277;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.338;QD=37.0939;RBI=0.0525265;REFB=-0.0584986;REVB=0.0192425;RO=0;SAF=65;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.8673e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000463933;OID=.;OPOS=120704289;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:115:122:0:0:112:122:47:65:0:0:54:68:0:0 chr7 120740103 . G T 3154.12 PASS AO=330;DP=341;FAO=330;FDP=330;FR=.;FRO=0;FSAF=184;FSAR=146;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115677;FXX=0.043477;HRUN=3;LEN=1;MLLD=107.763;QD=38.2318;RBI=0.020054;REFB=0.0140246;REVB=0.0163814;RO=1;SAF=184;SAR=146;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00325636;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000232417;OID=.;OPOS=120740103;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:341:330:1:0:330:330:146:184:0:1:146:184:0:0 chr7 120901695 . G A 409.63 PASS AO=106;DP=228;FAO=105;FDP=227;FR=.;FRO=122;FSAF=49;FSAR=56;FSRF=51;FSRR=71;FWDB=-0.00133591;FXX=0.00438577;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.393;QD=7.21812;RBI=0.015465;REFB=0.00253162;REVB=-0.0154072;RO=122;SAF=50;SAR=56;SRF=51;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0523207;STB=0.526342;TYPE=snp;VARB=-0.00300337;OID=.;OPOS=120901695;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:228:227:122:122:106:105:56:50:51:71:56:49:51:71 chr7 120969769 . G A 427.58 PASS AO=45;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0388342;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=147.467;QD=37.1813;RBI=0.06138;REFB=0;REVB=0.0475332;RO=0;SAF=15;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000476617;OID=.;OPOS=120969769;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:45:46:0:0:45:46:30:15:0:0:31:15:0:0 chr7 120972015 . G A 149.39 PASS AO=33;DP=65;FAO=33;FDP=65;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=8;FSRR=24;FWDB=-0.0277762;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.2694;QD=9.19298;RBI=0.0285636;REFB=-0.0442419;REVB=0.00666075;RO=31;SAF=11;SAR=22;SRF=8;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0760719;STB=0.547591;TYPE=snp;VARB=0.0831138;OID=.;OPOS=120972015;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:31:32:33:33:22:11:8:23:22:11:8:24 chr7 120979089 . C T 1204.99 PASS AO=125;DP=127;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00455273;FXX=0.0310053;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.853;QD=38.5596;RBI=0.00870056;REFB=0;REVB=0.00741434;RO=0;SAF=79;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.78502e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000245204;OID=.;OPOS=120979089;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:127:125:0:0:125:125:46:79:0:0:46:79:0:0 chr7 121513561 . T G 44.38 PASS AO=18;DP=63;FAO=18;FDP=64;FR=.;FRO=46;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=-0.0334946;FXX=0.0588149;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.4582;QD=2.77389;RBI=0.0485313;REFB=-0.0206254;REVB=-0.0351197;RO=44;SAF=6;SAR=12;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202702;STB=0.638142;TYPE=snp;VARB=0.0575044;OID=.;OPOS=121513561;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:63:64:44:46:18:18:12:6:22:22:12:6:24:22 chr7 121616250 . G A 531.31 PASS AO=115;DP=214;FAO=115;FDP=214;FR=.;FRO=99;FSAF=61;FSAR=54;FSRF=44;FSRR=55;FWDB=-0.00793667;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.74;QD=9.93102;RBI=0.0216787;REFB=-0.00261116;REVB=-0.0201736;RO=99;SAF=61;SAR=54;SRF=44;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0728038;STB=0.539728;TYPE=snp;VARB=0.00221729;OID=.;OPOS=121616250;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:214:99:99:115:115:54:61:44:55:54:61:44:55 chr7 121653374 . GTGA G 159.37 PASS AO=28;DP=79;FAO=36;FDP=71;FR=.;FRO=35;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.0365975;FXX=0.0405351;HRUN=1;LEN=3;MLLD=161.408;QD=8.9788;RBI=0.050825;REFB=-0.0159536;REVB=-0.0352676;RO=28;SAF=18;SAR=10;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0678472;STB=0.579954;TYPE=del;VARB=0.0145105;OID=.;OPOS=121653375;OREF=TGA;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:28:65:36:71:35:24:12:18:17:99:28:18:10:16:12 chr7 121653398 . G A 702.71 PASS AO=76;DP=80;FAO=78;FDP=79;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0071152;FXX=0.0246883;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.434;QD=35.5803;RBI=0.00714502;REFB=-0.116228;REVB=0.000652133;RO=1;SAF=44;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145578;STB=0.50769;TYPE=snp;VARB=0.000745035;OID=.;OPOS=121653398;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:80:79:1:1:76:78:32:44:0:1:32:46:0:1 chr7 122303321 . C T 1765.4 PASS AO=190;DP=194;FAO=190;FDP=193;FR=.;FRO=3;FSAF=108;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.000292571;FXX=0.00515437;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.572;QD=36.5886;RBI=0.0308835;REFB=-0.119691;REVB=0.0308821;RO=3;SAF=108;SAR=82;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0170991;STB=0.508981;TYPE=snp;VARB=0.000614739;OID=.;OPOS=122303321;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:194:193:3:3:190:190:82:108:0:3:82:108:0:3 chr7 123097583 . G A 424.01 PASS AO=35;DP=122;FAO=60;FDP=136;FR=.,HEALED;FRO=39;FSAF=52;FSAR=8;FSRF=34;FSRR=5;FWDB=0.00948552;FXX=0.0215812;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.764;QD=12.4708;RBI=0.00950198;REFB=-0.0402001;REVB=-0.000559037;RO=24;SAF=28;SAR=7;SRF=18;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0555103;STB=0.504397;TYPE=snp;VARB=0.0359472;OID=.;OPOS=123097583;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:136:24:39:35:60:7:28:18:6:8:52:34:5 chr7 123102829 . G A 473.27 PASS AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0418683;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.568;QD=37.8613;RBI=0.0503699;REFB=0;REVB=0.028003;RO=0;SAF=29;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.20481e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.99111e-05;OID=.;OPOS=123102829;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:50:50:0:0:50:50:21:29:0:0:21:29:0:0 chr7 123256427 . C T 2155.21 PASS AO=232;DP=233;FAO=229;FDP=229;FR=.;FRO=0;FSAF=117;FSAR=112;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0498564;FXX=0.0171666;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0404;QD=37.6455;RBI=0.0499462;REFB=0.0403768;REVB=0.00299368;RO=1;SAF=118;SAR=114;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00416208;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00117207;OID=.;OPOS=123256427;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:233:229:1:0:232:229:114:118:0:1:112:117:0:0 chr7 123264804 . C T 2397.02 PASS AO=248;DP=249;FAO=249;FDP=249;FR=.;FRO=0;FSAF=102;FSAR=147;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00960318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.3406;QD=38.5064;RBI=0.0390419;REFB=0;REVB=0.0378424;RO=0;SAF=101;SAR=147;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.06387e-05;OID=.;OPOS=123264804;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:249:249:0:0:248:249:147:101:0:0:147:102:0:0 chr7 123269118 . G C 1561.69 PASS AO=179;DP=181;FAO=175;FDP=182;FR=.;FRO=7;FSAF=65;FSAR=110;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=-0.0322436;FXX=0.00546418;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.1389;QD=34.3228;RBI=0.035875;REFB=0.0263375;REVB=0.0157279;RO=2;SAF=71;SAR=108;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0132191;STB=0.525545;TYPE=snp;VARB=-0.00685459;OID=.;OPOS=123269118;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:181:182:2:7:179:175:108:71:2:0:110:65:7:0 chr7 123296266 . G C 206.54 PASS AO=51;DP=110;FAO=51;FDP=110;FR=.;FRO=59;FSAF=17;FSAR=34;FSRF=21;FSRR=38;FWDB=0.00249683;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.976;QD=7.51057;RBI=0.01522;REFB=0.0167559;REVB=0.0150138;RO=59;SAF=17;SAR=34;SRF=21;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0242409;STB=0.513508;TYPE=snp;VARB=-0.0106336;OID=.;OPOS=123296266;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:59:59:51:51:34:17:21:38:34:17:21:38 chr7 123301940 . A G 1004.44 PASS AO=108;DP=109;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00910274;FXX=0.00917347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.853;QD=37.2016;RBI=0.0129043;REFB=0.0356517;REVB=0.00914669;RO=1;SAF=56;SAR=52;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00840107;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000189927;OID=.;OPOS=123301940;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:109:108:1:0:108:108:52:56:1:0:52:56:0:0 chr7 123302569 . TG T 362.95 PASS AO=60;DP=96;FAO=83;FDP=91;FR=.;FRO=8;FSAF=53;FSAR=30;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.131187;FXX=0.0215031;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.6769;QD=15.9538;RBI=0.290257;REFB=-0.00690711;REVB=0.258919;RO=23;SAF=41;SAR=19;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0.369369;SSSB=0.139365;STB=0.524746;TYPE=del;VARB=0.0564326;OID=.;OPOS=123302570;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:60:91:83:91:8:53:30:3:5:11:23:41:19:10:13 chr7 123321978 . C A 700.76 PASS AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.056;QD=37.8788;RBI=0.0215323;REFB=0;REVB=0.00376067;RO=0;SAF=41;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.97088e-05;OID=.;OPOS=123321978;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:74:74:0:0:74:74:33:41:0:0:33:41:0:0 chr7 123324546 . AAT A 99.09 PASS AO=29;DP=112;FAO=43;FDP=99;FR=.;FRO=56;FSAF=28;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=38;FWDB=0.0310329;FXX=0.123883;HRUN=5;LEN=2;MLLD=151.597;QD=4.00345;RBI=0.0353345;REFB=-0.0170404;REVB=-0.0168964;RO=2;SAF=22;SAR=7;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0404935;STB=0.68253;TYPE=del;VARB=0.05769;OID=.;OPOS=123324547;OREF=AT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:29:55:43:99:56:28:15:18:38:99:2:22:7:2:0 chr7 123388732 . G A 678.62 PASS AO=75;DP=78;FAO=75;FDP=78;FR=.;FRO=3;FSAF=42;FSAR=33;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0243657;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.877;QD=34.8011;RBI=0.0318542;REFB=-0.0536912;REVB=-0.0205184;RO=1;SAF=42;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141217;STB=0.504166;TYPE=snp;VARB=0.000554425;OID=.;OPOS=123388732;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:78:78:1:3:75:75:33:42:0:1:33:42:2:1 chr7 123514896 . G T 184.52 PASS AO=59;DP=162;FAO=61;FDP=164;FR=.;FRO=103;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=43;FSRR=60;FWDB=0.0060406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.566;QD=4.50043;RBI=0.00700398;REFB=-0.0051982;REVB=-0.00354498;RO=102;SAF=25;SAR=34;SRF=42;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136766;STB=0.516058;TYPE=snp;VARB=0.00766604;OID=.;OPOS=123514896;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:164:102:103:59:61:34:25:42:60:34:27:43:60 chr7 124387092 . C G 1448.24 PASS AO=159;DP=165;FAO=161;FDP=164;FR=.;FRO=3;FSAF=78;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0293729;FXX=0.00606024;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0502;QD=35.323;RBI=0.0331798;REFB=-0.0778515;REVB=0.0154316;RO=1;SAF=78;SAR=81;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00583795;STB=0.508875;TYPE=snp;VARB=0.001262;OID=.;OPOS=124387092;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:165:164:1:3:159:161:81:78:0:1:83:78:0:3 chr7 124387374 . A G 316.52 PASS AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209678;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=66.0292;QD=37.2373;RBI=0.0268884;REFB=0;REVB=-0.0168325;RO=0;SAF=11;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.20088e-05;OID=.;OPOS=124387374;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:34:0:0:34:34:23:11:0:0:23:11:0:0 chr7 124486980 . T C 461.03 PASS AO=75;DP=180;FAO=100;FDP=185;FR=.;FRO=85;FSAF=61;FSAR=39;FSRF=53;FSRR=32;FWDB=0.00930356;FXX=0.0159566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.396;QD=9.96823;RBI=0.0362341;REFB=-0.0220401;REVB=0.0350194;RO=51;SAF=51;SAR=24;SRF=39;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0747846;STB=0.50655;TYPE=snp;VARB=0.0248815;OID=.;OPOS=124486980;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:185:51:85:75:100:24:51:39:12:39:61:53:32 chr7 124540841 . A C 107.48 PASS AO=22;DP=40;FAO=22;FDP=41;FR=.;FRO=19;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=-0.0216029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.3934;QD=10.4861;RBI=0.0426964;REFB=-0.0544779;REVB=-0.036828;RO=18;SAF=15;SAR=7;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.285098;STB=0.670984;TYPE=snp;VARB=0.0398816;OID=.;OPOS=124540841;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:40:41:18:19:22:22:7:15:6:12:7:15:6:13 chr7 124540872 . C T 115.65 PASS AO=26;DP=54;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=20;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=19;FWDB=0.00772723;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.706;QD=8.72861;RBI=0.0231123;REFB=-0.0180253;REVB=-0.0217823;RO=26;SAF=20;SAR=6;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.454243;STB=0.748306;TYPE=snp;VARB=0.0316465;OID=.;OPOS=124540872;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:53:26:27:26:26:6:20:7:19:6:20:8:19 chr7 127222278 . G A 190.86 PASS AO=44;DP=90;FAO=44;FDP=90;FR=.;FRO=46;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=17;FSRR=29;FWDB=-0.00459487;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.8073;QD=8.48272;RBI=0.0259911;REFB=0.00524974;REVB=0.0255817;RO=46;SAF=19;SAR=25;SRF=16;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0798251;STB=0.532696;TYPE=snp;VARB=-0.00626044;OID=.;OPOS=127222278;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:46:46:44:44:25:19:16:30:25:19:17:29 chr7 127224414 . AG A 243.3 PASS AO=28;DP=48;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.302119;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=12.7154;QD=21.1563;RBI=0.30842;REFB=-0.0724495;REVB=0.0620261;RO=7;SAF=17;SAR=11;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0.308901;SSSB=-0.041846;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0363966;OID=.;OPOS=127224415;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:28:42:46:46:0:26:20:0:0:15:7:17:11:5:2 chr7 127250907 . T C 213.57 PASS AO=47;DP=103;FAO=51;FDP=106;FR=.;FRO=55;FSAF=33;FSAR=18;FSRF=40;FSRR=15;FWDB=-0.00351173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5543;QD=8.05913;RBI=0.09618;REFB=-0.0254009;REVB=0.0961159;RO=55;SAF=32;SAR=15;SRF=40;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0528459;STB=0.546799;TYPE=snp;VARB=0.0245185;OID=.;OPOS=127250907;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:106:55:55:47:51:15:32:40:15:18:33:40:15 chr7 127251188 . T G 70.15 PASS AO=24;DP=83;FAO=27;FDP=86;FR=.;FRO=59;FSAF=24;FSAR=3;FSRF=48;FSRR=11;FWDB=-0.000258853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.76;QD=3.26276;RBI=0.0117422;REFB=-0.0172184;REVB=0.0117394;RO=58;SAF=22;SAR=2;SRF=47;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.282856;STB=0.608603;TYPE=snp;VARB=0.0333169;OID=.;OPOS=127251188;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:83:86:58:59:24:27:2:22:47:11:3:24:48:11 chr7 127721507 . T C 151.83 PASS AO=36;DP=75;FAO=36;FDP=75;FR=.;FRO=39;FSAF=6;FSAR=30;FSRF=10;FSRR=29;FWDB=-0.000221298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.305;QD=8.09744;RBI=0.000393561;REFB=-0.0132906;REVB=0.000325449;RO=39;SAF=6;SAR=30;SRF=10;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134024;STB=0.575494;TYPE=snp;VARB=0.0115495;OID=.;OPOS=127721507;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:39:39:36:36:30:6:10:29:30:6:10:29 chr7 127999645 . C T 55.25 PASS AO=10;DP=18;FAO=10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0200258;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.584;QD=12.2782;RBI=0.0223865;REFB=-0.0184953;REVB=-0.0100061;RO=8;SAF=6;SAR=4;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.264286;STB=0.651879;TYPE=snp;VARB=0.0280108;OID=.;OPOS=127999645;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:18:18:8:8:10:10:4:6:2:6:4:6:2:6 chr7 128119514 . G A 151.52 PASS AO=83;DP=305;FAO=83;FDP=306;FR=.;FRO=223;FSAF=22;FSAR=61;FSRF=114;FSRR=109;FWDB=0.107115;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.4611;QD=1.98061;RBI=0.117835;REFB=-0.00156121;REVB=0.049106;RO=221;SAF=22;SAR=61;SRF=114;SRR=107;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.324113;STB=0.689218;TYPE=snp;VARB=0.00565592;OID=.;OPOS=128119514;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:305:306:221:223:83:83:61:22:114:107:61:22:114:109 chr7 128133984 . G A 1665.01 PASS AO=171;DP=173;FAO=176;FDP=176;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0341402;FXX=0.0056494;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.378;QD=37.8412;RBI=0.0358093;REFB=0.00343779;REVB=-0.0108052;RO=1;SAF=67;SAR=104;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00705079;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.42749e-05;OID=.;OPOS=128133984;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:173:176:1:0:171:176:104:67:1:0:104:72:0:0 chr7 128140982 . T C 2594.9 PASS AO=271;DP=272;FAO=271;FDP=271;FR=.;FRO=0;FSAF=117;FSAR=154;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00762316;FXX=0.00367634;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.116;QD=38.301;RBI=0.018017;REFB=0;REVB=0.0163249;RO=0;SAF=117;SAR=154;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.71235e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.67807e-06;OID=.;OPOS=128140982;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:272:271:0:0:271:271:154:117:0:0:154:117:0:0 chr7 128141865 . T C 2059.23 PASS AO=215;DP=215;FAO=215;FDP=215;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00699653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.5;QD=38.3113;RBI=0.0164582;REFB=0;REVB=0.014897;RO=0;SAF=96;SAR=119;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.84018e-06;OID=.;OPOS=128141865;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:97:215:215:0:0:215:215:119:96:0:0:119:96:0:0 chr7 128364873 . G A 225.27 PASS AO=64;DP=131;FAO=57;FDP=125;FR=.;FRO=68;FSAF=16;FSAR=41;FSRF=36;FSRR=32;FWDB=0.00637735;FXX=0.0530263;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.9347;QD=7.20867;RBI=0.00686995;REFB=-0.0238591;REVB=0.00255452;RO=66;SAF=22;SAR=42;SRF=36;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191375;STB=0.646007;TYPE=snp;VARB=0.0550821;OID=.;OPOS=128364873;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:125:66:68:64:57:42:22:36:30:41:16:36:32 chr7 128394606 . C T 710.71 PASS AO=178;DP=375;FAO=178;FDP=373;FR=.;FRO=195;FSAF=99;FSAR=79;FSRF=79;FSRR=116;FWDB=-0.0260188;FXX=0.00533319;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.9598;QD=7.62152;RBI=0.0550826;REFB=-0.022104;REVB=-0.0485502;RO=189;SAF=99;SAR=79;SRF=78;SRR=111;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13408;STB=0.578557;TYPE=snp;VARB=0.0224515;OID=.;OPOS=128394606;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:375:373:189:195:178:178:79:99:78:111:79:99:79:116 chr7 128401466 . A G 130.36 PASS AO=24;DP=41;FAO=24;FDP=41;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.0536146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.2066;QD=12.7176;RBI=0.0554154;REFB=-0.0351142;REVB=-0.0140122;RO=17;SAF=9;SAR=15;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204271;STB=0.613402;TYPE=snp;VARB=0.0245466;OID=.;OPOS=128401466;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:41:41:17:17:24:24:15:9:11:6:15:9:11:6 chr7 128415195 . T G 230.1 PASS AO=62;DP=141;FAO=62;FDP=142;FR=.;FRO=80;FSAF=19;FSAR=43;FSRF=25;FSRR=55;FWDB=-0.0280548;FXX=0.00699252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.598;QD=6.48158;RBI=0.0370402;REFB=-0.00587641;REVB=-0.0241849;RO=79;SAF=19;SAR=43;SRF=25;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0117439;STB=0.503994;TYPE=snp;VARB=0.00882119;OID=.;OPOS=128415195;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:142:79:80:62:62:43:19:25:54:43:19:25:55 chr7 128455767 . C G 339.81 PASS AO=21;DP=38;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00327793;FXX=0.0526177;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.056;QD=37.7569;RBI=0.00484321;REFB=0;REVB=0.00356537;RO=0;SAF=7;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.24123e-05;OID=.;OPOS=128455767;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:22:36:0:0:21:36:14:7:0:0:22:14:0:0 chr7 128487866 . T C 248.62 PASS AO=25;DP=27;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000492425;FXX=0.0714031;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.69;QD=38.2492;RBI=0.050899;REFB=0;REVB=0.0508966;RO=0;SAF=11;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99383e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000506135;OID=.;OPOS=128487866;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:27:26:0:0:25:26:14:11:0:0:14:12:0:0 chr7 128524104 . TG T 28.83 PASS AO=18;DP=52;FAO=18;FDP=46;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=21;FSRR=7;FWDB=0.0936681;FXX=0.079984;HRUN=7;LEN=1;MLLD=9.30372;QD=2.50661;RBI=0.137978;REFB=-0.134817;REVB=-0.101313;RO=25;SAF=10;SAR=8;SRF=20;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.262005;STB=0.592497;TYPE=del;VARB=0.140579;OID=.;OPOS=128524105;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:18:50:18:46:28:11:7:21:7:28:25:10:8:20:5 chr7 128533514 . T TC 445.96 PASS AO=57;DP=75;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00502288;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=13.7505;QD=24.4361;RBI=0.204188;REFB=0;REVB=0.204126;RO=15;SAF=26;SAR=31;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0818614;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00744989;OID=.;OPOS=128533515;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:57:75:73:73:0:36:37:0:0:40:15:26:31:10:5 chr7 128587381 . T C 25.79 PASS AO=3;DP=7;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0230694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.187;QD=12.8952;RBI=0.1008;REFB=0.0108051;REVB=0.0981245;RO=4;SAF=3;SAR=0;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.642277;STB=0.666107;TYPE=snp;VARB=0.0022076;OID=.;OPOS=128587381;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:7:8:4:3:3:5:0:3:3:1:2:3:3:0 chr7 128607384 . G A 634.99 PASS AO=177;DP=408;FAO=175;FDP=397;FR=.;FRO=222;FSAF=98;FSAR=77;FSRF=111;FSRR=111;FWDB=-0.0355352;FXX=0.00749981;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.0972;QD=6.39786;RBI=0.0409418;REFB=-0.00700715;REVB=-0.0203343;RO=228;SAF=98;SAR=79;SRF=115;SRR=113;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.05032;STB=0.533762;TYPE=snp;VARB=0.00988743;OID=.;OPOS=128607384;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:408:397:228:222:177:175:79:98:115:113:77:98:111:111 chr7 128611035 . G A 124.88 PASS AO=37;DP=97;FAO=37;FDP=94;FR=.;FRO=57;FSAF=10;FSAR=27;FSRF=28;FSRR=29;FWDB=-0.0372288;FXX=0.0309246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.1215;QD=5.31394;RBI=0.0471661;REFB=-0.0147347;REVB=0.0289596;RO=55;SAF=10;SAR=27;SRF=26;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235322;STB=0.646827;TYPE=snp;VARB=0.0286802;OID=.;OPOS=128611035;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:94:55:57:37:37:27:10:26:29:27:10:28:29 chr7 128630227 . C T 1965.5 PASS AO=205;DP=206;FAO=205;FDP=205;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=126;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170373;FXX=0.00485413;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.372;QD=38.3512;RBI=0.0190793;REFB=0;REVB=0.00858789;RO=0;SAF=79;SAR=126;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.25355e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.00145e-05;OID=.;OPOS=128630227;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:206:205:0:0:205:205:126:79:0:0:126:79:0:0 chr7 128641226 . G C 190.33 PASS AO=50;DP=113;FAO=50;FDP=113;FR=.;FRO=63;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=31;FSRR=32;FWDB=-0.0177232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.0588;QD=6.73736;RBI=0.0759398;REFB=-0.027846;REVB=-0.0738427;RO=63;SAF=27;SAR=23;SRF=31;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0478617;STB=0.526772;TYPE=snp;VARB=0.0337984;OID=.;OPOS=128641226;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:63:63:50:50:23:27:31:32:23:27:31:32 chr7 128767410 . A G 368.84 PASS AO=37;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120539;FXX=0.0487686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.9434;QD=37.8297;RBI=0.0562815;REFB=0;REVB=0.0549755;RO=0;SAF=27;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.67388e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00099686;OID=.;OPOS=128767410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:39:39:0:0:37:39:10:27:0:0:10:29:0:0 chr7 128767490 . T C 608.74 PASS AO=63;DP=69;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00313457;FXX=0.0869439;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.968;QD=38.6503;RBI=0.00570611;REFB=0;REVB=-0.00476804;RO=0;SAF=35;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.56126e-05;OID=.;OPOS=128767490;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:69:63:0:0:63:63:28:35:0:0:28:35:0:0 chr7 128767506 . T G 685.26 PASS AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00138766;FXX=0.0399947;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.5681;QD=38.0698;RBI=0.019281;REFB=0;REVB=0.019231;RO=0;SAF=46;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00116265;OID=.;OPOS=128767506;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:73:72:0:0:72:72:26:46:0:0:28:44:0:0 chr7 128804780 . C G 849.44 PASS AO=86;DP=88;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.194857;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.1711;QD=37.7531;RBI=0.194969;REFB=0;REVB=0.00658488;RO=1;SAF=27;SAR=59;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0172216;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00133681;OID=.;OPOS=128804780;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:88:90:1:0:86:90:59:27:1:0:62:28:0:0 chr7 128846328 . G C 1880.86 PASS AO=206;DP=213;FAO=207;FDP=213;FR=.;FRO=6;FSAF=115;FSAR=92;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0129206;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=268.364;QD=35.3213;RBI=0.0141191;REFB=-0.0926532;REVB=0.00569276;RO=1;SAF=115;SAR=91;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00520586;STB=0.511063;TYPE=snp;VARB=0.000196953;OID=.;OPOS=128846328;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:213:213:1:6:206:207:91:115:0:1:92:115:1:5 chr7 129067053 . T C 126.69 PASS AO=37;DP=94;FAO=39;FDP=102;FR=.;FRO=63;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=31;FSRR=32;FWDB=-0.0311039;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.374;QD=4.96839;RBI=0.0311281;REFB=-0.00792959;REVB=0.00122724;RO=56;SAF=19;SAR=18;SRF=31;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0425655;STB=0.503017;TYPE=snp;VARB=0.0165944;OID=.;OPOS=129067053;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:102:56:63:37:39:18:19:31:25:20:19:31:32 chr7 129142694 . C G 86.75 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.431;QD=38.556;RBI=0.04406;REFB=0;REVB=0.04406;RO=0;SAF=0;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00315779;OID=.;OPOS=129142694;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:9:0:0:0:9:0:0:0 chr7 129504866 . C G 274.41 PASS AO=87;DP=225;FAO=87;FDP=223;FR=.;FRO=136;FSAF=52;FSAR=35;FSRF=62;FSRR=74;FWDB=0.0543332;FXX=0.00888849;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.4842;QD=4.92215;RBI=0.056515;REFB=-0.0098498;REVB=0.0155515;RO=135;SAF=52;SAR=35;SRF=62;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15033;STB=0.586851;TYPE=snp;VARB=0.0174655;OID=.;OPOS=129504866;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:225:223:135:136:87:87:35:52:62:73:35:52:62:74 chr7 129664312 . T C 1071.11 PASS AO=115;DP=119;FAO=116;FDP=119;FR=.;FRO=3;FSAF=58;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0378285;FXX=0.00833264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.168;QD=36.0036;RBI=0.0400343;REFB=-0.0323081;REVB=0.0131052;RO=3;SAF=57;SAR=58;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239259;STB=0.512603;TYPE=snp;VARB=0.00100478;OID=.;OPOS=129664312;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:119:119:3:3:115:116:58:57:0:3:58:58:0:3 chr7 129813738 . T C 1369.05 PASS AO=146;DP=154;FAO=153;FDP=154;FR=.;FRO=1;FSAF=82;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0300662;FXX=0.0128197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.5871;QD=35.5598;RBI=0.17333;REFB=-0.115068;REVB=0.170703;RO=1;SAF=81;SAR=65;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00726045;STB=0.503496;TYPE=snp;VARB=0.00537005;OID=.;OPOS=129813738;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:154:154:1:1:146:153:65:81:0:1:71:82:0:1 chr7 129913535 . G GT,T 221.66 PASS AO=16,36;DP=101;FAO=64,3;FDP=102;FR=.;FRO=35;FSAF=21,2;FSAR=43,1;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=0.341933,-0.015424;FXX=0.0727207;HRUN=6,1;LEN=1,1;MLLD=9.57451,176.672;QD=8.69252;RBI=0.367514,0.0156269;REFB=-0.137646,-0.00909217;REVB=0.134715,0.00251006;RO=49;SAF=3,8;SAR=13,28;SRF=29;SRR=20;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.497549,-0.403648;STB=0.591383,0.591961;TYPE=ins,snp;VARB=0.131438,0.0211938;OID=.,.;OPOS=129913536,129913535;OREF=-,G;OALT=T,T;OMAPALT=GT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:101:102:49:35:16,36:64,3:13,28:3,8:29:20:43,1:21,2:20:15 chr7 129962360 . A G 844.5 PASS AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0661866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.359;QD=38.3862;RBI=0.0674951;REFB=0;REVB=0.0132256;RO=0;SAF=55;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.74869e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000245156;OID=.;OPOS=129962360;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:88:88:0:0:88:88:33:55:0:0:33:55:0:0 chr7 129962682 . A G 760.4 PASS AO=82;DP=83;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00951256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.474;QD=36.6455;RBI=0.0228868;REFB=-0.0565873;REVB=0.0208162;RO=1;SAF=35;SAR=47;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00997022;STB=0.505262;TYPE=snp;VARB=0.000240244;OID=.;OPOS=129962682;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:83:83:1:1:82:82:47:35:0:1:47:35:0:1 chr7 129989878 . T C 1060.61 PASS AO=111;DP=111;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150149;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.601;QD=37.8788;RBI=0.0242458;REFB=0;REVB=0.0190371;RO=0;SAF=58;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000197864;OID=.;OPOS=129989878;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:111:112:0:0:111:112:53:58:0:0:53:59:0:0 chr7 130002317 . T C 180.52 PASS AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0610978;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.2149;QD=32.8208;RBI=0.0953206;REFB=-0.107862;REVB=0.0731647;RO=1;SAF=14;SAR=7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0318424;STB=0.517225;TYPE=snp;VARB=0.00793716;OID=.;OPOS=130002317;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:22:22:1:1:21:21:7:14:1:0:7:14:1:0 chr7 130007381 . T C 113.37 PASS AO=29;DP=66;FAO=29;FDP=66;FR=.;FRO=37;FSAF=1;FSAR=28;FSRF=5;FSRR=32;FWDB=0.0148294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.279;QD=6.87073;RBI=0.021929;REFB=0.00182859;REVB=0.0161546;RO=37;SAF=1;SAR=28;SRF=5;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.400739;STB=0.736615;TYPE=snp;VARB=-0.000475007;OID=.;OPOS=130007381;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:37:37:29:29:28:1:5:32:28:1:5:32 chr7 130007388 . G T 133.59 PASS AO=28;DP=54;FAO=28;FDP=53;FR=.;FRO=25;FSAF=1;FSAR=27;FSRF=4;FSRR=21;FWDB=0.000194258;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.098;QD=10.0825;RBI=0.00088842;REFB=-0.00990546;REVB=0.000866923;RO=24;SAF=1;SAR=27;SRF=3;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.334537;STB=0.737469;TYPE=snp;VARB=0.0105729;OID=.;OPOS=130007388;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:53:24:25:28:28:27:1:3:21:27:1:4:21 chr7 130008285 . T C 165.18 PASS AO=40;DP=85;FAO=40;FDP=85;FR=.;FRO=45;FSAF=28;FSAR=12;FSRF=27;FSRR=18;FWDB=-0.00190812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.196;QD=7.77327;RBI=0.0109408;REFB=-0.0237687;REVB=-0.0107731;RO=43;SAF=28;SAR=12;SRF=26;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100436;STB=0.559969;TYPE=snp;VARB=0.0326515;OID=.;OPOS=130008285;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:43:45:40:40:12:28:26:17:12:28:27:18 chr7 130021488 . G C 150.42 PASS AO=30;DP=104;FAO=45;FDP=111;FR=.;FRO=66;FSAF=13;FSAR=32;FSRF=30;FSRR=36;FWDB=0.00248432;FXX=0.00892777;HRUN=5;LEN=1;MLLD=31.1983;QD=5.42056;RBI=0.00707238;REFB=-0.0124617;REVB=0.00662168;RO=39;SAF=13;SAR=17;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.028557;STB=0.608799;TYPE=snp;VARB=0.0163873;OID=.;OPOS=130021488;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:111:39:66:30:45:17:13:18:21:32:13:30:36 chr7 130022041 . C T 419.59 PASS AO=100;DP=204;FAO=100;FDP=203;FR=.;FRO=103;FSAF=50;FSAR=50;FSRF=66;FSRR=37;FWDB=0.0697347;FXX=0.00975562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.985;QD=8.26772;RBI=0.0698811;REFB=-0.0202848;REVB=-0.00452112;RO=102;SAF=50;SAR=50;SRF=65;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126232;STB=0.571415;TYPE=snp;VARB=0.0183116;OID=.;OPOS=130022041;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:203:102:103:100:100:50:50:65:37:50:50:66:37 chr7 131185995 . C A 313.63 PASS AO=73;DP=148;FAO=73;FDP=147;FR=.;FRO=74;FSAF=34;FSAR=39;FSRF=44;FSRR=30;FWDB=-0.00628079;FXX=0.0067563;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.565;QD=8.53401;RBI=0.00939272;REFB=-0.0073455;REVB=-0.0069839;RO=74;SAF=34;SAR=39;SRF=44;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11723;STB=0.56457;TYPE=snp;VARB=0.00671856;OID=.;OPOS=131185995;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:147:74:74:73:73:39:34:44:30:39:34:44:30 chr7 131190696 . T C 253.77 PASS AO=59;DP=120;FAO=59;FDP=120;FR=.;FRO=61;FSAF=17;FSAR=42;FSRF=32;FSRR=29;FWDB=-0.00993556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.5816;QD=8.45902;RBI=0.0157491;REFB=-0.00656549;REVB=-0.0122196;RO=58;SAF=17;SAR=42;SRF=30;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223434;STB=0.630275;TYPE=snp;VARB=0.00912881;OID=.;OPOS=131190696;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:58:61:59:59:42:17:30:28:42:17:32:29 chr7 131195712 . G A 393.32 PASS AO=116;DP=287;FAO=119;FDP=290;FR=.;FRO=171;FSAF=110;FSAR=9;FSRF=162;FSRR=9;FWDB=0.0381563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.3358;QD=5.42512;RBI=0.0791323;REFB=-0.0281119;REVB=0.0693254;RO=167;SAF=107;SAR=9;SRF=159;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123647;STB=0.552837;TYPE=snp;VARB=0.028605;OID=.;OPOS=131195712;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:287:290:167:171:116:119:9:107:159:8:9:110:162:9 chr7 131812922 . T C 1055.14 PASS AO=111;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151543;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.6198;QD=38.0232;RBI=0.0288886;REFB=0;REVB=0.0245948;RO=0;SAF=55;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000236523;OID=.;OPOS=131812922;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:111:111:0:0:111:111:56:55:0:0:56:55:0:0 chr7 131814185 . A G 1292.7 PASS AO=135;DP=136;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00288592;FXX=0.0073524;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.897;QD=38.3023;RBI=0.0928796;REFB=0;REVB=0.0928348;RO=0;SAF=98;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.83227e-05;OID=.;OPOS=131814185;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:136:135:0:0:135:135:37:98:0:0:37:98:0:0 chr7 131814529 . G A 49.69 PASS AO=15;DP=42;FAO=15;FDP=43;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=9;FWDB=0.0136997;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=166.303;QD=4.62231;RBI=0.0321274;REFB=-0.00321777;REVB=0.02906;RO=27;SAF=7;SAR=8;SRF=18;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216769;STB=0.635914;TYPE=snp;VARB=0.00700277;OID=.;OPOS=131814529;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:42:43:27:28:15:15:8:7:18:9:8:7:19:9 chr7 131815310 . A G 968.64 PASS AO=102;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.1669;QD=37.9859;RBI=0.0112628;REFB=0;REVB=0.00258963;RO=0;SAF=29;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.48303e-05;OID=.;OPOS=131815310;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:102:102:0:0:102:102:73:29:0:0:73:29:0:0 chr7 131817850 . T C 452.02 PASS AO=78;DP=118;FAO=78;FDP=118;FR=.;FRO=40;FSAF=44;FSAR=34;FSRF=26;FSRR=14;FWDB=0.00076777;FXX=0.00840265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.9793;QD=15.3225;RBI=0.0719988;REFB=-0.0424183;REVB=0.0719947;RO=39;SAF=44;SAR=34;SRF=26;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0650969;STB=0.529823;TYPE=snp;VARB=0.024888;OID=.;OPOS=131817850;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:39:40:78:78:34:44:26:13:34:44:26:14 chr7 131864591 . T C 615.95 PASS AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.836;QD=37.9049;RBI=0.017751;REFB=0;REVB=0.00967341;RO=0;SAF=11;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.35335e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.54906e-05;OID=.;OPOS=131864591;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:65:65:0:0:65:65:54:11:0:0:54:11:0:0 chr7 132070054 . T C 1122.31 PASS AO=112;DP=113;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0561184;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.159;QD=38.3697;RBI=0.0880899;REFB=0;REVB=0.067901;RO=0;SAF=31;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000120439;OID=.;OPOS=132070054;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:113:117:0:0:112:117:81:31:0:0:84:33:0:0 chr7 132470394 . GT G 119.31 PASS AO=87;DP=297;FAO=111;FDP=277;FR=.;FRO=166;FSAF=35;FSAR=76;FSRF=61;FSRR=105;FWDB=0.0267139;FXX=0.0212007;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.3629;QD=1.72295;RBI=0.0601974;REFB=-0.0748661;REVB=-0.0539453;RO=155;SAF=24;SAR=63;SRF=53;SRR=102;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0886379;STB=0.535244;TYPE=del;VARB=0.0635303;OID=.;OPOS=132470395;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:87:271:111:277:166:35:76:61:105:99:155:24:63:53:102 chr7 132767617 . C A 254.96 PASS AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000726372;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2206;QD=37.7712;RBI=0.0407665;REFB=0;REVB=-0.0407601;RO=0;SAF=17;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00119242;OID=.;OPOS=132767617;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:27:27:0:0:27:27:10:17:0:0:10:17:0:0 chr7 133580447 . G A 352.05 PASS AO=99;DP=234;FAO=100;FDP=235;FR=.;FRO=135;FSAF=52;FSAR=48;FSRF=76;FSRR=59;FWDB=0.014435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.858;QD=5.99242;RBI=0.0159521;REFB=-0.012526;REVB=-0.00678975;RO=135;SAF=51;SAR=48;SRF=76;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0495979;STB=0.524764;TYPE=snp;VARB=0.0202262;OID=.;OPOS=133580447;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:234:235:135:135:99:100:48:51:76:59:48:52:76:59 chr7 133749164 . G A 805.82 PASS AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.028668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.843;QD=37.9208;RBI=0.0289064;REFB=0;REVB=0.00370486;RO=0;SAF=30;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.81426e-05;OID=.;OPOS=133749164;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:85:85:0:0:85:85:55:30:0:0:55:30:0:0 chr7 133868507 . C T 2799.33 PASS AO=303;DP=310;FAO=303;FDP=310;FR=.;FRO=7;FSAF=141;FSAR=162;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=0.00983823;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=269.085;QD=36.1203;RBI=0.0100043;REFB=0.00214387;REVB=0.00181521;RO=6;SAF=141;SAR=162;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.019858;STB=0.508878;TYPE=snp;VARB=-1.25282e-05;OID=.;OPOS=133868507;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:310:310:6:7:303:303:162:141:6:0:162:141:6:1 chr7 134225788 . C T 443.53 PASS AO=39;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=30;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.704;QD=37.7475;RBI=0.0457582;REFB=0;REVB=0.0418054;RO=0;SAF=27;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000581295;OID=.;OPOS=134225788;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:47:47:0:0:39:47:12:27:0:0:17:30:0:0 chr7 134225827 . A G 524.81 PASS AO=61;DP=65;FAO=61;FDP=65;FR=.;FRO=4;FSAF=37;FSAR=24;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0209567;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.552;QD=32.2961;RBI=0.0385678;REFB=-0.0299165;REVB=-0.0323773;RO=4;SAF=37;SAR=24;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129015;STB=0.506847;TYPE=snp;VARB=0.00301425;OID=.;OPOS=134225827;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:65:65:4:4:61:61:24:37:2:2:24:37:2:2 chr7 134576441 . T C 434.88 PASS AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00167539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.3142;QD=37.8154;RBI=0.0432661;REFB=0;REVB=0.0432336;RO=0;SAF=32;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000118494;OID=.;OPOS=134576441;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:46:46:0:0:46:46:14:32:0:0:14:32:0:0 chr7 134618113 . C A 10.44 PASS AO=2;DP=6;FAO=2;FDP=6;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=37.2974;QD=6.96086;RBI=0.128288;REFB=-0.0411328;REVB=0.128288;RO=4;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.10594;OID=.;OPOS=134618113;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:4:4:2:2:2:0:0:4:2:0:0:4 chr7 134618710 . A G 150.06 PASS AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.000998533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.42;QD=33.3469;RBI=0.00188058;REFB=-0.139252;REVB=0.00159359;RO=1;SAF=5;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0366754;STB=0.519977;TYPE=snp;VARB=0.000588317;OID=.;OPOS=134618710;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:18:18:1:1:17:17:12:5:0:1:12:5:0:1 chr7 134653930 . T C 169.09 PASS AO=46;DP=109;FAO=46;FDP=108;FR=.;FRO=62;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=31;FSRR=31;FWDB=-0.0764636;FXX=0.00917347;HRUN=4;LEN=1;MLLD=92.1808;QD=6.26259;RBI=0.0792905;REFB=-0.0220589;REVB=-0.0209835;RO=61;SAF=20;SAR=26;SRF=30;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0583434;STB=0.537696;TYPE=snp;VARB=0.0460127;OID=.;OPOS=134653930;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:108:61:62:46:46:26:20:30:31:26:20:31:31 chr7 134678253 . T A 370.8 PASS AO=104;DP=242;FAO=104;FDP=242;FR=.;FRO=138;FSAF=43;FSAR=61;FSRF=71;FSRR=67;FWDB=-0.00678764;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=231.432;QD=6.12896;RBI=0.00679168;REFB=-0.0164006;REVB=0.000234225;RO=138;SAF=43;SAR=61;SRF=71;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104441;STB=0.558184;TYPE=snp;VARB=0.0180656;OID=.;OPOS=134678253;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:242:242:138:138:104:104:61:43:71:67:61:43:71:67 chr7 134701856 . G C 2860.21 PASS AO=303;DP=308;FAO=303;FDP=303;FR=.;FRO=0;FSAF=217;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00553616;FXX=0.0194168;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.826;QD=37.7586;RBI=0.0265646;REFB=-0.0029156;REVB=-0.0259813;RO=3;SAF=217;SAR=86;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00654762;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.35475e-06;OID=.;OPOS=134701856;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:308:303:3:0:303:303:86:217:3:0:86:217:0:0 chr7 134719551 . C G 3329.42 PASS AO=346;DP=347;FAO=347;FDP=347;FR=.;FRO=0;FSAF=181;FSAR=166;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207819;FXX=0.0113957;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1345;QD=38.3794;RBI=0.0257183;REFB=0;REVB=-0.0151507;RO=0;SAF=180;SAR=166;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.67099e-05;OID=.;OPOS=134719551;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:347:347:0:0:346:347:166:180:0:0:166:181:0:0 chr7 134849213 . G A 75.5 PASS AO=20;DP=48;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=0.0132039;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.415;QD=6.16361;RBI=0.0133299;REFB=-0.0111145;REVB=0.00182822;RO=28;SAF=6;SAR=14;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.348157;STB=0.691165;TYPE=snp;VARB=0.0205809;OID=.;OPOS=134849213;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:48:49:28:29:20:20:14:6:18:10:14:6:18:11 chr7 134849280 . T A 732.89 PASS AO=82;DP=88;FAO=83;FDP=88;FR=.;FRO=5;FSAF=49;FSAR=34;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0249844;FXX=0.0222198;HRUN=4;LEN=1;MLLD=159.711;QD=33.3132;RBI=0.0268597;REFB=-0.0988403;REVB=0.00986007;RO=4;SAF=49;SAR=33;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0139821;STB=0.500566;TYPE=snp;VARB=-4.27915e-06;OID=.;OPOS=134849280;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:88:88:4:5:82:83:33:49:3:1:34:49:3:2 chr7 134849577 . A C 122.14 PASS AO=26;DP=54;FAO=27;FDP=54;FR=.;FRO=27;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=7;FWDB=-0.00238181;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.868;QD=9.04721;RBI=0.0141069;REFB=-0.0322096;REVB=-0.0139044;RO=27;SAF=17;SAR=9;SRF=20;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0901474;STB=0.561413;TYPE=snp;VARB=0.0206115;OID=.;OPOS=134849577;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:27:27:26:27:9:17:20:7:10:17:20:7 chr7 134850465 . C T 1273.24 PASS AO=134;DP=134;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0058835;FXX=0.0144917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.244;QD=37.4482;RBI=0.0733222;REFB=-0.119434;REVB=0.0730858;RO=0;SAF=84;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00145926;OID=.;OPOS=134850465;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:134:136:0:0:134:136:50:84:0:0:53:83:0:0 chr7 134850469 . A G 1309.49 PASS AO=137;DP=138;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00202095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.443;QD=37.4141;RBI=0.0207335;REFB=-0.0392716;REVB=-0.0206348;RO=1;SAF=82;SAR=55;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00576287;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.03371e-05;OID=.;OPOS=134850469;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:138:140:1:0:137:140:55:82:1:0:57:83:0:0 chr7 134871775 . C T 805.63 PASS AO=86;DP=89;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000711421;FXX=0.0112347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.372;QD=36.6197;RBI=0.0127359;REFB=-0.0830225;REVB=0.012716;RO=3;SAF=30;SAR=56;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0247041;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.13545e-05;OID=.;OPOS=134871775;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:89:88:3:0:86:88:56:30:0:3:58:30:0:0 chr7 134879830 . G A 1335.04 PASS AO=135;DP=135;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166376;FXX=0.0070917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.024;QD=38.1441;RBI=0.046092;REFB=0;REVB=0.0429844;RO=0;SAF=57;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000221268;OID=.;OPOS=134879830;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:135:140:0:0:135:140:78:57:0:0:79:61:0:0 chr7 134881033 . G GC 23.31 PASS AO=5;DP=20;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=-0.000857432;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=62.866;QD=5.18014;RBI=0.0623243;REFB=-0.0318119;REVB=-0.0623184;RO=15;SAF=3;SAR=2;SRF=12;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260866;STB=0.565012;TYPE=ins;VARB=0.174833;OID=.;OPOS=134881034;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:5:20:6:18:12:4:2:9:3:23:15:3:2:12:3 chr7 134889141 . G A 673.02 PASS AO=65;DP=65;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142382;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.6551;QD=37.9168;RBI=0.0142523;REFB=0;REVB=-0.000633027;RO=0;SAF=34;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.90682e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00013735;OID=.;OPOS=134889141;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:65:71:0:0:65:71:31:34:0:0:37:34:0:0 chr7 135048804 . C T 301.9 PASS AO=59;DP=107;FAO=61;FDP=109;FR=.;FRO=48;FSAF=21;FSAR=40;FSRF=17;FSRR=31;FWDB=-0.00214893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.49;QD=11.079;RBI=0.0219007;REFB=-0.0188955;REVB=-0.0217951;RO=48;SAF=21;SAR=38;SRF=17;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0015767;STB=0.504814;TYPE=snp;VARB=0.0132155;OID=.;OPOS=135048804;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:109:48:48:59:61:38:21:17:31:40:21:17:31 chr7 135082953 . G C 373.92 PASS AO=77;DP=139;FAO=77;FDP=139;FR=.;FRO=62;FSAF=39;FSAR=38;FSRF=30;FSRR=32;FWDB=-0.0240474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.4521;QD=10.7603;RBI=0.040705;REFB=-0.00128282;REVB=0.0328423;RO=62;SAF=39;SAR=38;SRF=30;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184685;STB=0.510087;TYPE=snp;VARB=0.00133701;OID=.;OPOS=135082953;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:62:62:77:77:38:39:30:32:38:39:30:32 chr7 135095270 . A G 2229.49 PASS AO=241;DP=248;FAO=241;FDP=246;FR=.;FRO=5;FSAF=128;FSAR=113;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0562907;FXX=0.00806419;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.144;QD=36.2519;RBI=0.0570891;REFB=-0.0548766;REVB=0.00951441;RO=5;SAF=128;SAR=113;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00509523;STB=0.502674;TYPE=snp;VARB=0.000884213;OID=.;OPOS=135095270;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:248:246:5:5:241:241:113:128:2:3:113:128:2:3 chr7 135269655 . T C 389.28 PASS AO=108;DP=249;FAO=108;FDP=249;FR=.;FRO=141;FSAF=58;FSAR=50;FSRF=63;FSRR=78;FWDB=-0.0186991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.874;QD=6.25354;RBI=0.0194469;REFB=-0.00874071;REVB=-0.00534087;RO=137;SAF=58;SAR=50;SRF=63;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0776528;STB=0.550978;TYPE=snp;VARB=0.033145;OID=.;OPOS=135269655;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:249:249:137:141:108:108:50:58:63:74:50:58:63:78 chr7 135269656 . G A 405.39 PASS AO=110;DP=248;FAO=110;FDP=249;FR=.;FRO=139;FSAF=58;FSAR=52;FSRF=63;FSRR=76;FWDB=-0.0195267;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.809;QD=6.51231;RBI=0.041367;REFB=-0.0244278;REVB=-0.0364683;RO=137;SAF=58;SAR=52;SRF=63;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0673415;STB=0.541258;TYPE=snp;VARB=0.0392871;OID=.;OPOS=135269656;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:248:249:137:139:110:110:52:58:63:74:52:58:63:76 chr7 135276293 . GC G 1479.69 PASS AO=164;DP=215;FAO=219;FDP=219;FR=.;FRO=0;FSAF=110;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.223472;FXX=0.00904936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=17.7895;QD=27.0262;RBI=0.360197;REFB=0.00695191;REVB=0.282493;RO=30;SAF=90;SAR=74;SRF=14;SRR=16;SSEN=0.239411;SSEP=0;SSSB=0.0241541;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00443018;OID=.;OPOS=135276294;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:164:209:219:219:0:110:109:0:0:99:30:90:74:14:16 chr7 135279315 . A C 141.4 PASS AO=25;DP=62;FAO=34;FDP=70;FR=.;FRO=36;FSAF=4;FSAR=30;FSRF=23;FSRR=13;FWDB=-0.00239776;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.352;QD=8.07972;RBI=0.0220197;REFB=-0.0147362;REVB=0.0218888;RO=37;SAF=3;SAR=22;SRF=24;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.604162;STB=0.824628;TYPE=snp;VARB=0.017202;OID=.;OPOS=135279315;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:70:37:36:25:34:22:3:24:13:30:4:23:13 chr7 135292080 . G A 419.37 PASS AO=82;DP=141;FAO=82;FDP=141;FR=.;FRO=59;FSAF=27;FSAR=55;FSRF=23;FSRR=36;FWDB=0.00420434;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.207;QD=11.8969;RBI=0.00423898;REFB=-0.0259264;REVB=-0.000540849;RO=58;SAF=27;SAR=55;SRF=23;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0567221;STB=0.528128;TYPE=snp;VARB=0.0163195;OID=.;OPOS=135292080;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:58:59:82:82:55:27:23:35:55:27:23:36 chr7 135292098 . G A 512.15 PASS AO=88;DP=135;FAO=89;FDP=136;FR=.;FRO=47;FSAF=28;FSAR=61;FSRF=20;FSRR=27;FWDB=0.00678572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.986;QD=15.0631;RBI=0.0219786;REFB=-0.0158516;REVB=-0.0209049;RO=47;SAF=27;SAR=61;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0866119;STB=0.543017;TYPE=snp;VARB=0.00687561;OID=.;OPOS=135292098;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:136:47:47:88:89:61:27:20:27:61:28:20:27 chr7 135304215 . C T 398.29 PASS AO=103;DP=232;FAO=104;FDP=228;FR=.;FRO=124;FSAF=50;FSAR=54;FSRF=79;FSRR=45;FWDB=0.0027831;FXX=0.0214583;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.152;QD=6.9875;RBI=0.00738897;REFB=-0.0184874;REVB=-0.0068448;RO=114;SAF=49;SAR=54;SRF=73;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156086;STB=0.584576;TYPE=snp;VARB=0.0152991;OID=.;OPOS=135304215;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:228:114:124:103:104:54:49:73:41:54:50:79:45 chr7 135304273 . G C 2586.59 PASS AO=287;DP=299;FAO=287;FDP=298;FR=.;FRO=11;FSAF=145;FSAR=142;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.00418481;FXX=0.00334437;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.861;QD=34.7194;RBI=0.00891213;REFB=-0.0217018;REVB=0.00786851;RO=10;SAF=145;SAR=142;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00607984;STB=0.501485;TYPE=snp;VARB=0.00033064;OID=.;OPOS=135304273;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:299:298:10:11:287:287:142:145:6:4:142:145:6:5 chr7 135329690 . T C 447.06 PASS AO=114;DP=251;FAO=117;FDP=253;FR=.;FRO=136;FSAF=61;FSAR=56;FSRF=60;FSRR=76;FWDB=-0.0112362;FXX=0.0117183;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.809;QD=7.06821;RBI=0.011251;REFB=-0.0154981;REVB=-0.000576568;RO=137;SAF=61;SAR=53;SRF=60;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.095554;STB=0.543019;TYPE=snp;VARB=0.0173526;OID=.;OPOS=135329690;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:251:253:137:136:114:117:53:61:60:77:56:61:60:76 chr7 135333172 . C T 137.26 PASS AO=37;DP=87;FAO=37;FDP=87;FR=.;FRO=50;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=35;FSRR=15;FWDB=-0.0158544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.9636;QD=6.31063;RBI=0.0171674;REFB=-0.0262138;REVB=0.00658471;RO=47;SAF=19;SAR=18;SRF=35;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233656;STB=0.607825;TYPE=snp;VARB=0.0316518;OID=.;OPOS=135333172;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:47:50:37:37:18:19:35:12:18:19:35:15 chr7 136699625 . A G 349.18 PASS AO=83;DP=170;FAO=83;FDP=170;FR=.;FRO=87;FSAF=28;FSAR=55;FSRF=35;FSRR=52;FWDB=0.00112206;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.633;QD=8.21591;RBI=0.00603465;REFB=-0.0113886;REVB=0.00592941;RO=87;SAF=28;SAR=55;SRF=35;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0656985;STB=0.536286;TYPE=snp;VARB=0.0138145;OID=.;OPOS=136699625;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:170:87:87:83:83:55:28:35:52:55:28:35:52 chr7 136701308 . T A 131.46 PASS AO=28;DP=53;FAO=28;FDP=54;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.0296616;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.1573;QD=9.73771;RBI=0.0346544;REFB=-0.0139882;REVB=0.0179198;RO=25;SAF=11;SAR=17;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143077;STB=0.589269;TYPE=snp;VARB=0.0145546;OID=.;OPOS=136701308;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:54:25:26:28:28:17:11:14:11:17:11:15:11 chr7 136701563 . G C 311.69 PASS AO=61;DP=106;FAO=61;FDP=105;FR=.;FRO=44;FSAF=26;FSAR=35;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=-0.01377;FXX=0.00943307;HRUN=2;LEN=1;MLLD=264.123;QD=11.8739;RBI=0.0151299;REFB=-0.0210854;REVB=-0.00626901;RO=43;SAF=26;SAR=35;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0477671;STB=0.531299;TYPE=snp;VARB=0.0152812;OID=.;OPOS=136701563;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:105:43:44:61:61:35:26:21:22:35:26:22:22 chr7 136701935 . T A 182.46 PASS AO=57;DP=148;FAO=57;FDP=148;FR=.;FRO=91;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=47;FSRR=44;FWDB=0.0242389;FXX=0.0133324;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.139;QD=4.93125;RBI=0.025549;REFB=0.00598731;REVB=-0.0080762;RO=91;SAF=28;SAR=29;SRF=47;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0274223;STB=0.504742;TYPE=snp;VARB=-0.0129976;OID=.;OPOS=136701935;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:91:91:57:57:29:28:47:44:28:29:47:44 chr7 136702044 . T A 60.43 PASS AO=23;DP=74;FAO=23;FDP=74;FR=.;FRO=51;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=30;FWDB=0.0190221;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=182.102;QD=3.26657;RBI=0.0259644;REFB=-0.00383429;REVB=-0.0176722;RO=51;SAF=13;SAR=10;SRF=21;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17764;STB=0.604562;TYPE=snp;VARB=0.00709553;OID=.;OPOS=136702044;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:74:74:51:51:23:23:10:13:21:30:10:13:21:30 chr7 136703000 . G A 165.52 PASS AO=50;DP=127;FAO=50;FDP=127;FR=.;FRO=77;FSAF=13;FSAR=37;FSRF=29;FSRR=48;FWDB=-0.0150668;FXX=0.00781189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.727;QD=5.21328;RBI=0.0223198;REFB=-0.00246768;REVB=-0.0164671;RO=75;SAF=13;SAR=37;SRF=29;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158579;STB=0.584395;TYPE=snp;VARB=0.0044357;OID=.;OPOS=136703000;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:75:77:50:50:37:13:29:46:37:13:29:48 chr7 136703376 . T C 325.2 PASS AO=95;DP=230;FAO=95;FDP=229;FR=.;FRO=134;FSAF=40;FSAR=55;FSRF=46;FSRR=88;FWDB=0.0196351;FXX=0.0129305;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.6997;QD=5.6803;RBI=0.0536355;REFB=-0.0251976;REVB=0.0499123;RO=123;SAF=40;SAR=55;SRF=37;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128385;STB=0.547359;TYPE=snp;VARB=0.0356351;OID=.;OPOS=136703376;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:230:229:123:134:95:95:55:40:37:86:55:40:46:88 chr7 136703707 . C T 1870.07 PASS AO=195;DP=196;FAO=195;FDP=195;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176287;FXX=0.00510178;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.998;QD=38.3605;RBI=0.0176312;REFB=0;REVB=0.000294903;RO=0;SAF=95;SAR=100;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000321119;OID=.;OPOS=136703707;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:196:195:0:0:195:195:100:95:0:0:100:95:0:0 chr7 136704531 . T A 211.06 PASS AO=58;DP=134;FAO=58;FDP=135;FR=.;FRO=77;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=42;FSRR=35;FWDB=-0.0236403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.1423;QD=6.25366;RBI=0.048245;REFB=-0.0118996;REVB=0.0420561;RO=76;SAF=29;SAR=29;SRF=41;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0400202;STB=0.525917;TYPE=snp;VARB=0.0289648;OID=.;OPOS=136704531;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:135:76:77:58:58:29:29:41:35:29:29:42:35 chr7 136912380 . GA G 49.86 PASS AO=25;DP=73;FAO=36;FDP=69;FR=.;FRO=33;FSAF=6;FSAR=30;FSRF=7;FSRR=26;FWDB=-0.0823643;FXX=0.028165;HRUN=7;LEN=1;MLLD=6.31767;QD=2.89054;RBI=0.0824123;REFB=-0.129932;REVB=0.00281385;RO=32;SAF=4;SAR=21;SRF=7;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0989015;STB=0.537168;TYPE=del;VARB=0.147533;OID=.;OPOS=136912381;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:25:69:36:69:33:6:30:7:26:31:32:4:21:7:25 chr7 137075847 . T A 1352.75 PASS AO=144;DP=148;FAO=147;FDP=150;FR=.;FRO=3;FSAF=52;FSAR=95;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0453165;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1616;QD=36.0734;RBI=0.0491003;REFB=-0.00670715;REVB=-0.0189012;RO=4;SAF=50;SAR=94;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0226446;STB=0.506816;TYPE=snp;VARB=0.000801482;OID=.;OPOS=137075847;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:148:150:4:3:144:147:94:50:3:1:95:52:2:1 chr7 137564501 . C G 1426.68 PASS AO=146;DP=146;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0325739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.9993;QD=38.3;RBI=0.0473767;REFB=0;REVB=0.0344019;RO=0;SAF=61;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000817935;OID=.;OPOS=137564501;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:146:149:0:0:146:149:85:61:0:0:88:61:0:0 chr7 137600690 . C T 3813.11 PASS AO=577;DP=578;FAO=398;FDP=398;FR=.;FRO=0;FSAF=173;FSAR=225;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130145;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.4433;QD=38.3227;RBI=0.0160105;REFB=0;REVB=-0.00932515;RO=1;SAF=242;SAR=335;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00196937;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.54149e-05;OID=.;OPOS=137600690;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:578:398:1:0:577:398:335:242:1:0:225:173:0:0 chr7 137801413 . A C 1865.15 PASS AO=162;DP=180;FAO=198;FDP=198;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0607388;FXX=0.0246293;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.437;QD=37.6798;RBI=0.119662;REFB=0;REVB=0.103101;RO=0;SAF=82;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00391122;OID=.;OPOS=137801413;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:89:180:198:0:0:162:198:80:82:0:0:111:87:0:0 chr7 138270657 . G A 119.99 PASS AO=44;DP=138;FAO=44;FDP=133;FR=.;FRO=89;FSAF=10;FSAR=34;FSRF=31;FSRR=58;FWDB=-0.00731001;FXX=0.0699252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.1766;QD=3.60869;RBI=0.00742713;REFB=-0.00193909;REVB=0.00131376;RO=75;SAF=10;SAR=34;SRF=26;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166489;STB=0.60237;TYPE=snp;VARB=0.00658589;OID=.;OPOS=138270657;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:133:75:89:44:44:34:10:26:49:34:10:31:58 chr7 138281906 . T C 291.05 PASS AO=69;DP=140;FAO=69;FDP=140;FR=.;FRO=71;FSAF=45;FSAR=24;FSRF=33;FSRR=38;FWDB=-0.0160022;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=120.345;QD=8.31562;RBI=0.0271834;REFB=-0.0208439;REVB=0.0219742;RO=69;SAF=45;SAR=24;SRF=33;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16387;STB=0.598426;TYPE=snp;VARB=0.0155202;OID=.;OPOS=138281906;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:69:71:69:69:24:45:33:36:24:45:33:38 chr7 138305806 . T C 124.81 PASS AO=29;DP=57;FAO=28;FDP=57;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=6;FSRR=23;FWDB=-0.0436669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.913;QD=8.75851;RBI=0.0437704;REFB=-0.0311084;REVB=0.00300868;RO=28;SAF=12;SAR=17;SRF=5;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.224725;STB=0.603499;TYPE=snp;VARB=0.0228961;OID=.;OPOS=138305806;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:28:29:29:28:17:12:5:23:17:11:6:23 chr7 138312122 . A C 352.83 PASS AO=95;DP=216;FAO=95;FDP=214;FR=.;FRO=119;FSAF=49;FSAR=46;FSRF=50;FSRR=69;FWDB=-0.00668139;FXX=0.00925883;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.896;QD=6.59491;RBI=0.00797116;REFB=-0.000263201;REVB=-0.00434723;RO=118;SAF=49;SAR=46;SRF=50;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0917102;STB=0.553036;TYPE=snp;VARB=0.000319695;OID=.;OPOS=138312122;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:216:214:118:119:95:95:46:49:50:68:46:49:50:69 chr7 138363767 . A G 263.75 PASS AO=39;DP=195;FAO=43;FDP=192;FR=.,HEALED;FRO=110;FSAF=34;FSAR=9;FSRF=52;FSRR=58;FWDB=0.00786359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.028;QD=5.49484;RBI=0.0130032;REFB=-0.0106316;REVB=-0.0103561;RO=110;SAF=32;SAR=7;SRF=52;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.46275;STB=0.746274;TYPE=snp;VARB=0.0176693;OID=.;OPOS=138363767;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:191:192:110:110:39:43:7:32:52:58:9:34:52:58 chr7 138400526 . AG A 1128.61 PASS AO=151;DP=214;FAO=203;FDP=203;FR=.;FRO=0;FSAF=121;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0984213;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.7484;QD=22.2385;RBI=0.110499;REFB=0.0105975;REVB=0.0502319;RO=9;SAF=100;SAR=51;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0.303743;SSSB=0.0257549;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00557148;OID=.;OPOS=138400527;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:151:203:203:203:0:121:82:0:0:90:9:100:51:4:5 chr7 138486096 . G C 102.22 PASS AO=23;DP=55;FAO=25;FDP=55;FR=.;FRO=30;FSAF=4;FSAR=21;FSRF=4;FSRR=26;FWDB=-0.0204145;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.13;QD=7.4345;RBI=0.0211931;REFB=0.0058366;REVB=-0.00569162;RO=30;SAF=3;SAR=20;SRF=4;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0063095;STB=0.528068;TYPE=snp;VARB=-0.00647299;OID=.;OPOS=138486096;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:30:30:23:25:20:3:4:26:21:4:4:26 chr7 138561175 . C G 166.4 PASS AO=41;DP=89;FAO=41;FDP=89;FR=.;FRO=48;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=0.00866672;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.554;QD=7.47872;RBI=0.0431958;REFB=-0.0119102;REVB=-0.0423174;RO=47;SAF=21;SAR=20;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.062463;STB=0.54021;TYPE=snp;VARB=0.0113356;OID=.;OPOS=138561175;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:47:48:41:41:20:21:21:26:20:21:21:27 chr7 138583840 . C A 2086.92 PASS AO=224;DP=233;FAO=224;FDP=224;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=156;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0045094;FXX=0.038625;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.356;QD=37.2664;RBI=0.0195819;REFB=-0.149543;REVB=0.0190556;RO=1;SAF=68;SAR=156;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00304493;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000210079;OID=.;OPOS=138583840;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:233:224:1:0:224:224:156:68:0:1:156:68:0:0 chr7 138596064 . G A 373.98 PASS AO=73;DP=126;FAO=73;FDP=125;FR=.;FRO=52;FSAF=26;FSAR=47;FSRF=21;FSRR=31;FWDB=0.0340261;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.678;QD=11.9673;RBI=0.0371635;REFB=-0.00858681;REVB=-0.0149449;RO=52;SAF=26;SAR=47;SRF=21;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.039194;STB=0.521354;TYPE=snp;VARB=0.00574204;OID=.;OPOS=138596064;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:125:52:52:73:73:47:26:21:31:47:26:21:31 chr7 138731687 . A G 171.29 PASS AO=21;DP=23;FAO=21;FDP=23;FR=.;FRO=2;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0441749;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.351;QD=29.789;RBI=0.0517427;REFB=0.065911;REVB=0.0269423;RO=2;SAF=14;SAR=7;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0296733;STB=0.516113;TYPE=snp;VARB=-0.00103003;OID=.;OPOS=138731687;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:23:23:2:2:21:21:7:14:1:1:7:14:1:1 chr7 138732457 . G A 2615.61 PASS AO=270;DP=271;FAO=273;FDP=273;FR=.;FRO=0;FSAF=157;FSAR=116;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00610055;FXX=0.0036495;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.695;QD=38.324;RBI=0.0197721;REFB=0;REVB=0.0188074;RO=0;SAF=157;SAR=113;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.92243e-06;OID=.;OPOS=138732457;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:271:273:0:0:270:273:113:157:0:0:116:157:0:0 chr7 138732497 . G A 2047.8 PASS AO=214;DP=214;FAO=214;FDP=214;FR=.;FRO=0;FSAF=125;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.134;QD=38.2767;RBI=0.0182131;REFB=0;REVB=0.00785046;RO=0;SAF=125;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.40879e-05;OID=.;OPOS=138732497;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:97:214:214:0:0:214:214:89:125:0:0:89:125:0:0 chr7 138740037 . G C 1531.28 PASS AO=159;DP=160;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00629327;FXX=0.00624961;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.5899;QD=38.5228;RBI=0.0246391;REFB=0;REVB=-0.0238219;RO=0;SAF=63;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.48925e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000133197;OID=.;OPOS=138740037;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:160:159:0:0:159:159:96:63:0:0:96:63:0:0 chr7 139252780 . T C 212.03 PASS AO=49;DP=100;FAO=49;FDP=100;FR=.;FRO=51;FSAF=13;FSAR=36;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=0.00974105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.935;QD=8.48123;RBI=0.0224058;REFB=-0.0473371;REVB=0.0201775;RO=51;SAF=13;SAR=36;SRF=24;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213683;STB=0.619195;TYPE=snp;VARB=0.0525917;OID=.;OPOS=139252780;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:51:51:49:49:36:13:24:27:36:13:24:27 chr7 139316360 . C T 332.91 PASS AO=91;DP=209;FAO=91;FDP=209;FR=.;FRO=118;FSAF=47;FSAR=44;FSRF=56;FSRR=62;FWDB=0.0223944;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.346;QD=6.37152;RBI=0.0425666;REFB=-0.0108118;REVB=-0.0361995;RO=117;SAF=47;SAR=44;SRF=55;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0468776;STB=0.523644;TYPE=snp;VARB=0.0118121;OID=.;OPOS=139316360;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:209:117:118:91:91:44:47:55:62:44:47:56:62 chr7 139653196 . A C 1051.13 PASS AO=114;DP=114;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0592674;FXX=0.0175423;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.9573;QD=37.5405;RBI=0.0823235;REFB=-0.00946026;REVB=-0.0571361;RO=0;SAF=46;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000129339;OID=.;OPOS=139653196;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:114:112:0:0:114:112:68:46:0:0:67:45:0:0 chr7 139724358 . G A 489.15 PASS AO=106;DP=200;FAO=106;FDP=199;FR=.;FRO=93;FSAF=72;FSAR=34;FSRF=64;FSRR=29;FWDB=0.0070008;FXX=0.00499975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.078;QD=9.83207;RBI=0.0188965;REFB=-0.0235946;REVB=-0.0175518;RO=93;SAF=72;SAR=34;SRF=64;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00879174;STB=0.504803;TYPE=snp;VARB=0.0199865;OID=.;OPOS=139724358;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:200:199:93:93:106:106:34:72:64:29:34:72:64:29 chr7 139724555 . C T 331.49 PASS AO=74;DP=143;FAO=74;FDP=143;FR=.;FRO=69;FSAF=34;FSAR=40;FSRF=33;FSRR=36;FWDB=0.0227286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.6058;QD=9.27237;RBI=0.0300506;REFB=-0.0366294;REVB=-0.0196583;RO=69;SAF=34;SAR=40;SRF=33;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165946;STB=0.509116;TYPE=snp;VARB=0.0241264;OID=.;OPOS=139724555;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:69:69:74:74:40:34:33:36:40:34:33:36 chr7 139727135 . G A 191.06 PASS AO=52;DP=128;FAO=54;FDP=130;FR=.;FRO=76;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=40;FSRR=36;FWDB=-0.00452886;FXX=0.0151504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.851;QD=5.8788;RBI=0.0231172;REFB=0.000451502;REVB=0.0226692;RO=74;SAF=22;SAR=30;SRF=39;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10894;STB=0.547927;TYPE=snp;VARB=-0.000326686;OID=.;OPOS=139727135;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:130:74:76:52:54:30:22:39:35:30:24:40:36 chr7 139784641 . A G 1425.35 PASS AO=156;DP=161;FAO=156;FDP=160;FR=.;FRO=4;FSAF=64;FSAR=92;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0282608;FXX=0.00621079;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.008;QD=35.6338;RBI=0.0325337;REFB=-0.0831618;REVB=0.0161174;RO=4;SAF=64;SAR=92;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00788367;STB=0.504145;TYPE=snp;VARB=0.000185194;OID=.;OPOS=139784641;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:161:160:4:4:156:156:92:64:1:3:92:64:1:3 chr7 139784904 . A C 15.36 PASS AO=4;DP=9;FAO=3;FDP=9;FR=.;FRO=6;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=294.53;QD=6.8257;RBI=0.024715;REFB=-0.00205746;REVB=0.024715;RO=5;SAF=0;SAR=4;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00405985;OID=.;OPOS=139784904;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:9:9:5:6:4:3:4:0:0:5:3:0:0:6 chr7 139797431 . G T 268.94 PASS AO=55;DP=100;FAO=55;FDP=100;FR=.;FRO=45;FSAF=17;FSAR=38;FSRF=13;FSRR=32;FWDB=0.0142226;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.6847;QD=10.7577;RBI=0.0157965;REFB=-0.0183639;REVB=0.00687369;RO=45;SAF=17;SAR=38;SRF=13;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0195695;STB=0.510726;TYPE=snp;VARB=0.0177811;OID=.;OPOS=139797431;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:45:45:55:55:38:17:13:32:38:17:13:32 chr7 139801777 . T G 843.76 PASS AO=173;DP=305;FAO=173;FDP=307;FR=.;FRO=134;FSAF=69;FSAR=104;FSRF=60;FSRR=74;FWDB=-0.00965024;FXX=0.00967711;HRUN=4;LEN=1;MLLD=151.657;QD=10.9937;RBI=0.0114767;REFB=-0.00534362;REVB=-0.00621186;RO=131;SAF=69;SAR=104;SRF=58;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.036069;STB=0.522061;TYPE=snp;VARB=0.0038532;OID=.;OPOS=139801777;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:305:307:131:134:173:173:104:69:58:73:104:69:60:74 chr7 140051089 . AGG AG,AGA 612.75 PASS AO=42,65;DP=144;FAO=43,68;FDP=143;FR=.;FRO=32;FSAF=43,30;FSAR=0,38;FSRF=5;FSRR=27;FWDB=-0.0114518,0.0194601;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=21.3048,66.3445;QD=17.1397;RBI=0.0682333,0.0385896;REFB=-0.128016,-0.0520607;REVB=0.0672655,0.0333236;RO=32;SAF=42,30;SAR=0,35;SRF=6;SRR=26;SSEN=0,0;SSEP=0.222054,0;SSSB=0.885887,0.171358;STB=0.999702,0.594486;TYPE=del,snp;VARB=0.163112,-0.00458473;OID=.,.;OPOS=140051090,140051091;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=AG,AGA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:42,65:142:43,68:143:32:43,30:0,38:5:27:99:32:42,30:0,35:6:26 chr7 140080087 . C G 384.05 PASS AO=101;DP=223;FAO=101;FDP=223;FR=.;FRO=122;FSAF=39;FSAR=62;FSRF=56;FSRR=66;FWDB=0.0405547;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.8554;QD=6.88879;RBI=0.0417414;REFB=-0.009797;REVB=0.00988267;RO=122;SAF=39;SAR=62;SRF=56;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0743571;STB=0.541253;TYPE=snp;VARB=0.0105184;OID=.;OPOS=140080087;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:223:122:122:101:101:62:39:56:66:62:39:56:66 chr7 140110781 . G C 121.27 PASS AO=32;DP=79;FAO=33;FDP=79;FR=.;FRO=46;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=4;FSRR=42;FWDB=0.0350033;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.1871;QD=6.14;RBI=0.0728387;REFB=0.00596973;REVB=0.0638768;RO=47;SAF=17;SAR=15;SRF=5;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.444167;STB=0.756517;TYPE=snp;VARB=-0.00714299;OID=.;OPOS=140110781;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:47:46:32:33:15:17:5:42:15:18:4:42 chr7 140125750 . T C 227.39 PASS AO=56;DP=120;FAO=56;FDP=120;FR=.;FRO=64;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=37;FSRR=27;FWDB=-0.00778712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.669;QD=7.57975;RBI=0.0181335;REFB=-0.0083026;REVB=0.0163763;RO=64;SAF=27;SAR=29;SRF=37;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0919184;STB=0.551051;TYPE=snp;VARB=0.00686398;OID=.;OPOS=140125750;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:64:64:56:56:29:27:37:27:29:27:37:27 chr7 140244560 . C T 555.77 PASS AO=54;DP=55;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0773007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.621;QD=37.0516;RBI=0.091794;REFB=0.0115496;REVB=0.0495049;RO=1;SAF=22;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145012;STB=0.50704;TYPE=snp;VARB=0.000119785;OID=.;OPOS=140244560;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:55:60:1:1:54:59:32:22:0:1:35:24:0:1 chr7 140301731 . G T 471.98 PASS AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00470453;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=239.564;QD=38.5286;RBI=0.0415591;REFB=0;REVB=0.0412919;RO=0;SAF=30;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48867e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.27075e-05;OID=.;OPOS=140301731;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:49:49:0:0:49:49:19:30:0:0:19:30:0:0 chr7 140426257 . A G 982.41 PASS AO=103;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0127091;FXX=0.0185168;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2555;QD=37.0721;RBI=0.025355;REFB=-0.0795251;REVB=0.0219397;RO=1;SAF=46;SAR=57;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00825224;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000111858;OID=.;OPOS=140426257;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:106:106:1:0:103:106:57:46:0:1:60:46:0:0 chr7 140774467 . C G 73.81 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.109981;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=51.5567;QD=36.9068;RBI=0.111887;REFB=0;REVB=0.0205638;RO=0;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.58669e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00699409;OID=.;OPOS=140774467;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:6:2:0:0:6:2:0:0 chr7 141420768 . A G 214.42 PASS AO=64;DP=162;FAO=65;FDP=163;FR=.;FRO=98;FSAF=37;FSAR=28;FSRF=53;FSRR=45;FWDB=-0.00552781;FXX=0.0121205;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.348;QD=5.26174;RBI=0.0425697;REFB=-0.0262923;REVB=0.0422093;RO=95;SAF=36;SAR=28;SRF=51;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0275529;STB=0.517329;TYPE=snp;VARB=0.0338773;OID=.;OPOS=141420768;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:163:95:98:64:65:28:36:51:44:28:37:53:45 chr7 141464765 . C T 1648.22 PASS AO=172;DP=174;FAO=173;FDP=173;FR=.;FRO=0;FSAF=100;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177108;FXX=0.0057468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.508;QD=38.109;RBI=0.0180155;REFB=0;REVB=0.00329943;RO=0;SAF=100;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.86819e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.33733e-05;OID=.;OPOS=141464765;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:174:173:0:0:172:173:72:100:0:0:73:100:0:0 chr7 141478308 . T C 1007.41 PASS AO=111;DP=114;FAO=113;FDP=115;FR=.;FRO=2;FSAF=79;FSAR=34;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0825056;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.8655;QD=35.0402;RBI=0.0832774;REFB=-0.192268;REVB=0.011312;RO=1;SAF=77;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00612653;STB=0.506249;TYPE=snp;VARB=0.00483897;OID=.;OPOS=141478308;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:114:115:1:2:111:113:34:77:1:0:34:79:2:0 chr7 141478574 . G C 1222.26 PASS AO=130;DP=132;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183994;FXX=0.0151504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.8271;QD=37.6079;RBI=0.0184721;REFB=-0.0532294;REVB=0.00163769;RO=1;SAF=33;SAR=97;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0141816;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000633148;OID=.;OPOS=141478574;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:132:130:1:0:130:130:97:33:1:0:97:33:0:0 chr7 141478800 . G A 2400.04 PASS AO=248;DP=250;FAO=249;FDP=249;FR=.;FRO=0;FSAF=154;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00701911;FXX=0.00399984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.501;QD=38.5549;RBI=0.0120865;REFB=0;REVB=-0.00983946;RO=0;SAF=153;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.54782e-05;OID=.;OPOS=141478800;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:250:249:0:0:248:249:95:153:0:0:95:154:0:0 chr7 141490238 . G T 1012.43 PASS AO=70;DP=125;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0290681;FXX=0.0176975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.382;QD=36.4838;RBI=0.0903777;REFB=-0.042395;REVB=0.0855755;RO=1;SAF=19;SAR=51;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0091821;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000659055;OID=.;OPOS=141490238;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:75:111:1:0:70:111:51:19:0:1:54:57:0:0 chr7 141537735 . T G 1960.7 PASS AO=181;DP=187;FAO=205;FDP=205;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00942297;FXX=0.00485413;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.097;QD=38.2575;RBI=0.0570345;REFB=0;REVB=0.0562507;RO=0;SAF=84;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.1888e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000120483;OID=.;OPOS=141537735;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:187:205:0:0:181:205:97:84:0:0:118:87:0:0 chr7 141537942 . T TCAA 1381.09 PASS AO=108;DP=196;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0617601;FXX=0.0335548;HRUN=1;LEN=3;MLLD=253.695;QD=38.3637;RBI=0.0701722;REFB=0;REVB=0.0333139;RO=71;SAF=16;SAR=92;SRF=45;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.453032;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.000101463;OID=.;OPOS=141537943;OREF=-;OALT=CAA;OMAPALT=TCAA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:108:196:144:144:0:45:99:0:0:65:71:16:92:45:26 chr7 141537945 . T A 133.38 PASS AO=60;DP=189;FAO=58;FDP=189;FR=.;FRO=131;FSAF=41;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=112;FWDB=0.0305345;FXX=0.00526288;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.126;QD=2.8228;RBI=0.0307143;REFB=-0.0164954;REVB=0.00331802;RO=128;SAF=43;SAR=17;SRF=17;SRR=111;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.615169;STB=0.838238;TYPE=snp;VARB=0.0241729;OID=.;OPOS=141537945;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:189:128:131:60:58:17:43:17:111:17:41:19:112 chr7 141618874 . GC G 1930.16 PASS AO=262;DP=321;FAO=312;FDP=312;FR=.;FRO=0;FSAF=112;FSAR=200;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.238032;FXX=0.00636922;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.182;QD=24.7456;RBI=0.262525;REFB=0;REVB=0.110725;RO=39;SAF=86;SAR=176;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0.364486;SSSB=-0.0365928;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00298649;OID=.;OPOS=141618875;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:262:311:312:312:0:112:200:0:0:99:39:86:176:18:21 chr7 141672604 . T C 309.45 PASS AO=20;DP=39;FAO=35;FDP=35;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.29102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.2593;QD=35.3655;RBI=0.291981;REFB=0;REVB=-0.0236759;RO=0;SAF=1;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97126e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00551768;OID=.;OPOS=141672604;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:39:35:0:0:20:35:19:1:0:0:15:20:0:0 chr7 141673345 . C G 921.78 PASS AO=99;DP=102;FAO=101;FDP=103;FR=.;FRO=2;FSAF=54;FSAR=47;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.08819;FXX=0.00961446;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.3485;QD=35.7972;RBI=0.101974;REFB=-0.191012;REVB=-0.0511986;RO=1;SAF=52;SAR=47;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00903516;STB=0.509089;TYPE=snp;VARB=0.0110739;OID=.;OPOS=141673345;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:102:103:1:2:99:101:47:52:1:0:47:54:2:0 chr7 141747658 . A G 1049.29 PASS AO=110;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0305529;FXX=0.0176975;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.8442;QD=37.8123;RBI=0.0314813;REFB=0;REVB=-0.0075887;RO=1;SAF=49;SAR=61;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00771937;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00243467;OID=.;OPOS=141747658;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:111:111:1:0:110:111:61:49:0:1:62:49:0:0 chr7 141796131 . G A 928.71 PASS AO=101;DP=104;FAO=101;FDP=103;FR=.;FRO=2;FSAF=70;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.017033;FXX=0.00961446;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.686;QD=36.0664;RBI=0.0232089;REFB=0.0401934;REVB=0.0157648;RO=2;SAF=70;SAR=31;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00832732;STB=0.50439;TYPE=snp;VARB=-0.000941598;OID=.;OPOS=141796131;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:104:103:2:2:101:101:31:70:1:1:31:70:1:1 chr7 141857846 . A G 3826.19 PASS AO=412;DP=414;FAO=398;FDP=398;FR=.;FRO=0;FSAF=188;FSAR=210;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026381;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.791;QD=38.4541;RBI=0.0273614;REFB=0;REVB=-0.00725873;RO=0;SAF=193;SAR=219;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000169211;OID=.;OPOS=141857846;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:414:398:0:0:412:398:219:193:0:0:210:188:0:0 chr7 141872523 . T A 199.85 PASS AO=69;DP=191;FAO=69;FDP=191;FR=.;FRO=122;FSAF=35;FSAR=34;FSRF=65;FSRR=57;FWDB=-0.0131416;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=234.508;QD=4.18528;RBI=0.0155986;REFB=-0.00750074;REVB=-0.0084033;RO=117;SAF=35;SAR=34;SRF=60;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00618389;STB=0.51632;TYPE=snp;VARB=0.0122852;OID=.;OPOS=141872523;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:191:191:117:122:69:69:34:35:60:57:34:35:65:57 chr7 141896059 . A G 280.07 PASS AO=75;DP=166;FAO=74;FDP=165;FR=.;FRO=91;FSAF=37;FSAR=37;FSRF=50;FSRR=41;FWDB=0.0237319;FXX=0.00602373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.463;QD=6.78947;RBI=0.029097;REFB=-0.00693473;REVB=-0.0168355;RO=91;SAF=37;SAR=38;SRF=50;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0553347;STB=0.527265;TYPE=snp;VARB=0.0102914;OID=.;OPOS=141896059;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:165:91:91:75:74:38:37:50:41:37:37:50:41 chr7 141898522 . T A 709.17 PASS AO=72;DP=72;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00919258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.899;QD=37.8225;RBI=0.0284254;REFB=0;REVB=0.026898;RO=0;SAF=28;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21139e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000127901;OID=.;OPOS=141898522;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:72:75:0:0:72:75:44:28:0:0:46:29:0:0 chr7 141920097 . G C 10.24 PASS AO=10;DP=57;FAO=9;FDP=57;FR=.;FRO=48;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=-0.138282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.4297;QD=0.718846;RBI=0.145145;REFB=-0.0145918;REVB=-0.0441026;RO=47;SAF=4;SAR=6;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00544859;STB=0.574829;TYPE=snp;VARB=0.186844;OID=.;OPOS=141920097;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:57:57:47:48:10:9:6:4:19:28:6:3:20:28 chr7 141920414 . G A 10.45 PASS AO=80;DP=341;FAO=45;FDP=355;FR=.;FRO=310;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=84;FSRR=226;FWDB=0.00890574;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.5244;QD=0.117746;RBI=0.155345;REFB=-0.0195408;REVB=-0.155089;RO=261;SAF=28;SAR=52;SRF=84;SRR=177;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0400237;STB=0.781251;TYPE=snp;VARB=0.14473;OID=.;OPOS=141920414;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:341:355:261:310:80:45:52:28:84:177:17:28:84:226 chr7 142001030 . A G 1326 PASS AO=141;DP=142;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0261084;FXX=0.00704176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.667;QD=37.6171;RBI=0.050443;REFB=-0.0186597;REVB=0.0431607;RO=1;SAF=66;SAR=75;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00714996;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000161589;OID=.;OPOS=142001030;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:142:141:1:0:141:141:75:66:1:0:75:66:0:0 chr7 142013384 . G C 1416.75 PASS AO=142;DP=148;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0377972;FXX=0.0134219;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.951;QD=38.5511;RBI=0.0379433;REFB=0;REVB=-0.00332701;RO=0;SAF=61;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.26383e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.82224e-05;OID=.;OPOS=142013384;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:148:147:0:0:142:147:81:61:0:0:81:66:0:0 chr7 142045613 . G T 289.55 PASS AO=60;DP=181;FAO=73;FDP=173;FR=.,HEALED;FRO=94;FSAF=48;FSAR=25;FSRF=52;FSRR=42;FWDB=-0.0320899;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=137.864;QD=6.69485;RBI=0.0341752;REFB=-0.0276097;REVB=0.0117553;RO=63;SAF=40;SAR=20;SRF=36;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0954393;STB=0.562614;TYPE=snp;VARB=0.0214408;OID=.;OPOS=142045613;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:173:63:94:60:73:20:40:36:27:25:48:52:42 chr7 142045678 . A G 266.08 PASS AO=76;DP=183;FAO=76;FDP=181;FR=.;FRO=105;FSAF=46;FSAR=30;FSRF=61;FSRR=44;FWDB=-0.0134253;FXX=0.0109284;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.899;QD=5.88017;RBI=0.0144007;REFB=-0.00445318;REVB=0.00520978;RO=104;SAF=46;SAR=30;SRF=60;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0304001;STB=0.514662;TYPE=snp;VARB=0.0226234;OID=.;OPOS=142045678;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:181:104:105:76:76:30:46:60:44:30:46:61:44 chr7 142045683 . A G 293.91 PASS AO=80;DP=180;FAO=80;FDP=183;FR=.;FRO=103;FSAF=49;FSAR=31;FSRF=59;FSRR=44;FWDB=0.0038627;FXX=0.00543449;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.679;QD=6.42421;RBI=0.0175618;REFB=-0.0108287;REVB=-0.0171318;RO=99;SAF=49;SAR=31;SRF=59;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.01725;STB=0.523275;TYPE=snp;VARB=0.0203543;OID=.;OPOS=142045683;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:183:99:103:80:80:31:49:59:40:31:49:59:44 chr7 142045690 . A G 305.69 PASS AO=73;DP=167;FAO=79;FDP=173;FR=.;FRO=94;FSAF=49;FSAR=30;FSRF=60;FSRR=34;FWDB=0.00365169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.451;QD=7.06797;RBI=0.0221593;REFB=0.0163814;REVB=-0.0218564;RO=91;SAF=48;SAR=25;SRF=59;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101224;STB=0.510456;TYPE=snp;VARB=-0.0115604;OID=.;OPOS=142045690;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:173:91:94:73:79:25:48:59:32:30:49:60:34 chr7 142045692 . A G 266.9 PASS AO=77;DP=171;FAO=72;FDP=165;FR=.;FRO=93;FSAF=49;FSAR=23;FSRF=58;FSRR=35;FWDB=0.00591612;FXX=0.0406953;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1431;QD=6.47029;RBI=0.00595506;REFB=0.00978341;REVB=-0.000679924;RO=91;SAF=48;SAR=29;SRF=58;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.014602;STB=0.535913;TYPE=snp;VARB=-0.0165954;OID=.;OPOS=142045692;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:165:91:93:77:72:29:48:58:33:23:49:58:35 chr7 142045693 . C T 274.39 PASS AO=76;DP=171;FAO=73;FDP=167;FR=.;FRO=94;FSAF=49;FSAR=24;FSRF=58;FSRR=36;FWDB=0.0122787;FXX=0.0233904;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.635;QD=6.57232;RBI=0.0158574;REFB=0.00404106;REVB=0.0100345;RO=94;SAF=48;SAR=28;SRF=58;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154716;STB=0.53376;TYPE=snp;VARB=-0.00330441;OID=.;OPOS=142045693;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:167:94:94:76:73:28:48:58:36:24:49:58:36 chr7 142045802 . T C 218.13 PASS AO=61;DP=144;FAO=61;FDP=144;FR=.;FRO=83;FSAF=10;FSAR=51;FSRF=19;FSRR=64;FWDB=-0.0529855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.4806;QD=6.0591;RBI=0.0589162;REFB=-0.0180952;REVB=-0.0257614;RO=83;SAF=10;SAR=51;SRF=19;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110775;STB=0.562549;TYPE=snp;VARB=0.0258454;OID=.;OPOS=142045802;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:144:83:83:61:61:51:10:19:64:51:10:19:64 chr7 142045848 . T C 430.87 PASS AO=76;DP=119;FAO=76;FDP=119;FR=.;FRO=43;FSAF=21;FSAR=55;FSRF=4;FSRR=39;FWDB=-0.0188251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.739;QD=14.4831;RBI=0.0220957;REFB=-0.024204;REVB=0.0115687;RO=43;SAF=21;SAR=55;SRF=4;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16663;STB=0.589409;TYPE=snp;VARB=0.0240071;OID=.;OPOS=142045848;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:43:43:76:76:55:21:4:39:55:21:4:39 chr7 142045897 . C T 72.73 PASS AO=31;DP=113;FAO=33;FDP=115;FR=.;FRO=82;FSAF=5;FSAR=28;FSRF=13;FSRR=69;FWDB=0.0242404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.669;QD=2.52989;RBI=0.0245556;REFB=-0.00437319;REVB=0.00392136;RO=82;SAF=5;SAR=26;SRF=13;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00623289;STB=0.5096;TYPE=snp;VARB=0.00920467;OID=.;OPOS=142045897;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:113:115:82:82:31:33:26:5:13:69:28:5:13:69 chr7 142045899 . A G 102.87 PASS AO=38;DP=114;FAO=38;FDP=114;FR=.;FRO=76;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=5;FSRR=71;FWDB=0.0622428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.503;QD=3.6093;RBI=0.0645333;REFB=0.0134111;REVB=-0.0170406;RO=76;SAF=13;SAR=25;SRF=5;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.424524;STB=0.734898;TYPE=snp;VARB=-0.0386486;OID=.;OPOS=142045899;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:76:76:38:38:25:13:5:71:25:13:5:71 chr7 142045912 . A G 80.13 PASS AO=33;DP=108;FAO=33;FDP=108;FR=.;FRO=75;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=5;FSRR=70;FWDB=0.00925176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.283;QD=2.96793;RBI=0.0171524;REFB=-0.00614951;REVB=-0.0144433;RO=75;SAF=12;SAR=21;SRF=5;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.455695;STB=0.753523;TYPE=snp;VARB=0.0136644;OID=.;OPOS=142045912;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:108:108:75:75:33:33:21:12:5:70:21:12:5:70 chr7 142045924 . A G 62.94 PASS AO=28;DP=98;FAO=28;FDP=98;FR=.;FRO=70;FSAF=5;FSAR=23;FSRF=12;FSRR=58;FWDB=0.0306383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.4;QD=2.56911;RBI=0.033035;REFB=-0.0137759;REVB=-0.0123533;RO=70;SAF=5;SAR=23;SRF=12;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0148308;STB=0.508788;TYPE=snp;VARB=0.0432542;OID=.;OPOS=142045924;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:98:98:70:70:28:28:23:5:12:58:23:5:12:58 chr7 142099484 . G C 16.89 PASS AO=16;DP=102;FAO=17;FDP=97;FR=.,HEALED;FRO=80;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=34;FSRR=46;FWDB=-0.19641;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=37.0243;QD=0.696699;RBI=0.199402;REFB=-0.0307644;REVB=0.0344139;RO=60;SAF=10;SAR=6;SRF=15;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.448324;STB=0.679129;TYPE=snp;VARB=0.0714998;OID=.;OPOS=142099484;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:102:97:60:80:16:17:6:10:15:45:6:11:34:46 chr7 142119831 . G A 1136.11 PASS AO=115;DP=116;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01806;FXX=0.00819605;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.068;QD=37.5572;RBI=0.0694233;REFB=-0.050461;REVB=0.0670331;RO=1;SAF=69;SAR=46;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0102112;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000319162;OID=.;OPOS=142119831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:116:121:1:0:115:121:46:69:0:1:52:69:0:0 chr7 142124170 . C T 1179.81 PASS AO=137;DP=153;FAO=137;FDP=146;FR=.;FRO=9;FSAF=91;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=0.00446681;FXX=0.0457486;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.908;QD=32.3235;RBI=0.0204556;REFB=-0.0379173;REVB=0.0199619;RO=8;SAF=91;SAR=46;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0758171;STB=0.537279;TYPE=snp;VARB=0.00114581;OID=.;OPOS=142124170;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:153:146:8:9:137:137:46:91:0:8:46:91:1:8 chr7 142124424 . T G 2063.44 PASS AO=214;DP=217;FAO=222;FDP=222;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=131;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0164527;FXX=0.0176983;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.843;QD=37.1791;RBI=0.0219412;REFB=-0.0280507;REVB=0.0145164;RO=3;SAF=90;SAR=124;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.011385;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000157127;OID=.;OPOS=142124424;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:217:222:3:0:214:222:124:90:0:3:131:91:0:0 chr7 142139348 . C T 1705.67 PASS AO=180;DP=184;FAO=180;FDP=180;FR=.;FRO=0;FSAF=108;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00485346;FXX=0.0217379;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.2;QD=37.9039;RBI=0.0293807;REFB=-0.0326142;REVB=0.028977;RO=1;SAF=108;SAR=72;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00438799;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000192525;OID=.;OPOS=142139348;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:184:180:1:0:180:180:72:108:1:0:72:108:0:0 chr7 142139773 . C T 150.03 PASS AO=29;DP=53;FAO=30;FDP=54;FR=.;FRO=24;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=0.0124637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.694;QD=11.1131;RBI=0.0149762;REFB=-0.0211719;REVB=-0.00830321;RO=24;SAF=15;SAR=14;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149614;STB=0.588178;TYPE=snp;VARB=0.02494;OID=.;OPOS=142139773;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:53:54:24:24:29:30:14:15:8:16:14:16:8:16 chr7 142139783 . C A 440.68 PASS AO=50;DP=53;FAO=50;FDP=52;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00382633;FXX=0.0188644;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.998;QD=33.8982;RBI=0.0124417;REFB=0.0424227;REVB=-0.0118388;RO=2;SAF=21;SAR=29;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00593352;STB=0.503153;TYPE=snp;VARB=8.2598e-05;OID=.;OPOS=142139783;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:53:52:2:2:50:50:29:21:1:1:29:21:1:1 chr7 142143804 . A C 1491.72 PASS AO=163;DP=170;FAO=163;FDP=168;FR=.;FRO=5;FSAF=110;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.0344047;FXX=0.011764;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.267;QD=35.517;RBI=0.0344101;REFB=0.0437454;REVB=-0.000609442;RO=6;SAF=110;SAR=53;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0508757;STB=0.52252;TYPE=snp;VARB=-0.000698002;OID=.;OPOS=142143804;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:170:168:6:5:163:163:53:110:0:6:53:110:0:5 chr7 142143941 . T C 43.5 PASS AO=53;DP=287;FAO=53;FDP=287;FR=.;FRO=234;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=96;FSRR=138;FWDB=0.00988588;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.082;QD=0.606249;RBI=0.0107308;REFB=2.04591e-05;REVB=0.00417354;RO=234;SAF=28;SAR=25;SRF=96;SRR=138;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152228;STB=0.595476;TYPE=snp;VARB=-6.67e-05;OID=.;OPOS=142143941;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:287:287:234:234:53:53:25:28:96:138:25:28:96:138 chr7 142144022 . T C 23.42 PASS AO=21;DP=133;FAO=27;FDP=139;FR=.;FRO=112;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=55;FSRR=57;FWDB=-0.00165959;FXX=0.00714235;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.848;QD=0.673963;RBI=0.00793897;REFB=-0.00499951;REVB=0.00776358;RO=112;SAF=10;SAR=11;SRF=56;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0302341;STB=0.582069;TYPE=snp;VARB=0.0410649;OID=.;OPOS=142144022;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:133:139:112:112:21:27:11:10:56:56:11:16:55:57 chr7 142144059 . A C 21.11 PASS AO=19;DP=106;FAO=19;FDP=105;FR=.;FRO=86;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=42;FSRR=44;FWDB=-0.0103866;FXX=0.0186898;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.859;QD=0.804275;RBI=0.0105094;REFB=-0.00206822;REVB=-0.00160161;RO=86;SAF=13;SAR=6;SRF=43;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237961;STB=0.663091;TYPE=snp;VARB=0.012443;OID=.;OPOS=142144059;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:106:105:86:86:19:19:6:13:43:43:6:13:42:44 chr7 142144091 . G A 14.2 PASS AO=11;DP=62;FAO=11;FDP=62;FR=.;FRO=51;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=31;FSRR=20;FWDB=-0.00205186;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=171.361;QD=0.915833;RBI=0.0223201;REFB=-0.000613543;REVB=-0.0222255;RO=51;SAF=8;SAR=3;SRF=31;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165115;STB=0.611082;TYPE=snp;VARB=0.0228595;OID=.;OPOS=142144091;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:62:62:51:51:11:11:3:8:31:20:3:8:31:20 chr7 142144092 . G A 14.25 PASS AO=11;DP=62;FAO=11;FDP=62;FR=.;FRO=51;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=31;FSRR=20;FWDB=0.00167681;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=157.56;QD=0.919266;RBI=0.0164785;REFB=0.000782469;REVB=-0.0163929;RO=51;SAF=8;SAR=3;SRF=31;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165115;STB=0.611082;TYPE=snp;VARB=-0.0126736;OID=.;OPOS=142144092;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:62:62:51:51:11:11:3:8:31:20:3:8:31:20 chr7 142144101 . C T 14.25 PASS AO=10;DP=56;FAO=10;FDP=55;FR=.;FRO=45;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=28;FSRR=17;FWDB=0.0142995;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.5206;QD=1.03624;RBI=0.0322879;REFB=-0.0228727;REVB=-0.0289488;RO=41;SAF=7;SAR=3;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121991;STB=0.57128;TYPE=snp;VARB=0.0323693;OID=.;OPOS=142144101;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:56:55:41:45:10:10:3:7:25:16:3:7:28:17 chr7 142149160 . T G 1975.71 PASS AO=209;DP=213;FAO=213;FDP=213;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=146;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000367193;FXX=0.0184323;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.795;QD=37.1026;RBI=0.0136942;REFB=0.0232683;REVB=0.0136893;RO=4;SAF=67;SAR=142;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00290017;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.72633e-05;OID=.;OPOS=142149160;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:213:213:4:0:209:213:142:67:1:3:146:67:0:0 chr7 142149349 . A C 497.38 PASS AO=49;DP=50;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.597;QD=37.5382;RBI=0.0324782;REFB=0;REVB=0.0296501;RO=0;SAF=31;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58521e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.50168e-05;OID=.;OPOS=142149349;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:50:53:0:0:49:53:18:31:0:0:18:35:0:0 chr7 142162001 . A C 2574.8 PASS AO=267;DP=269;FAO=268;FDP=268;FR=.;FRO=0;FSAF=132;FSAR=136;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00237039;FXX=0.00371733;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.56;QD=38.4298;RBI=0.0113623;REFB=0;REVB=0.0111123;RO=0;SAF=132;SAR=135;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.76412e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.97532e-05;OID=.;OPOS=142162001;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:269:268:0:0:267:268:135:132:0:0:136:132:0:0 chr7 142162148 . C T 3275.49 PASS AO=343;DP=349;FAO=344;FDP=344;FR=.;FRO=0;FSAF=140;FSAR=204;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00442949;FXX=0.0143262;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.052;QD=38.0871;RBI=0.0087791;REFB=-0.0162851;REVB=-0.00757973;RO=2;SAF=139;SAR=204;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00465431;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.43509e-05;OID=.;OPOS=142162148;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:349:344:2:0:343:344:204:139:0:2:204:140:0:0 chr7 142162306 . A G 830.88 PASS AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0255662;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.19;QD=38.2014;RBI=0.0322899;REFB=0;REVB=-0.0197232;RO=0;SAF=38;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.33389e-05;OID=.;OPOS=142162306;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:87:87:0:0:87:87:49:38:0:0:50:37:0:0 chr7 142168429 . A G 571.25 PASS AO=60;DP=61;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0291942;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.278;QD=38.729;RBI=0.0293785;REFB=0;REVB=-0.00328546;RO=0;SAF=41;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31043e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000110854;OID=.;OPOS=142168429;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:61:59:0:0:60:59:19:41:0:0:18:41:0:0 chr7 142168452 . C A 758.73 PASS AO=78;DP=78;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0362689;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.3003;QD=38.4167;RBI=0.0496897;REFB=0;REVB=0.0339652;RO=0;SAF=55;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11101e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000240614;OID=.;OPOS=142168452;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:78:79:0:0:78:79:23:55:0:0:22:57:0:0 chr7 142168662 . C T 1249.82 PASS AO=131;DP=131;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000558309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.587;QD=38.1623;RBI=0.021233;REFB=0;REVB=0.0212256;RO=0;SAF=35;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.13093e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.71263e-05;OID=.;OPOS=142168662;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:131:131:0:0:131:131:96:35:0:0:96:35:0:0 chr7 142168663 . G C 549.11 PASS AO=131;DP=131;FAO=103;FDP=107;FR=.;FRO=4;FSAF=11;FSAR=92;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0242111;FXX=0.183192;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.7655;QD=20.5275;RBI=0.156666;REFB=-0.0469749;REVB=0.154784;RO=0;SAF=37;SAR=94;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.04941e-08;STB=0.536315;TYPE=snp;VARB=0.0780556;OID=.;OPOS=142168663;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:131:107:0:4:131:103:94:37:0:0:92:11:2:2 chr7 142168819 . G A 156.12 PASS AO=20;DP=24;FAO=21;FDP=25;FR=.;FRO=4;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0235325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.552;QD=24.9798;RBI=0.0976076;REFB=-0.070159;REVB=0.0947284;RO=3;SAF=13;SAR=7;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0951769;STB=0.515137;TYPE=snp;VARB=0.0179143;OID=.;OPOS=142168819;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:24:25:3:4:20:21:7:13:3:0:7:14:3:1 chr7 142168856 . C G 143.56 PASS AO=15;DP=24;FAO=22;FDP=28;FR=.;FRO=6;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0642885;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=30.3483;QD=20.508;RBI=0.234654;REFB=-0.105442;REVB=0.225676;RO=8;SAF=13;SAR=2;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.343571;STB=0.516877;TYPE=snp;VARB=0.098113;OID=.;OPOS=142168856;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:24:28:8:6:15:22:2:13:4:4:9:13:4:2 chr7 142176378 . A G 906.89 PASS AO=95;DP=96;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124268;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.155;QD=38.185;RBI=0.0263392;REFB=0;REVB=0.0232235;RO=0;SAF=43;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.67486e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.09087e-05;OID=.;OPOS=142176378;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:96:95:0:0:95:95:52:43:0:0:52:43:0:0 chr7 142180647 . G T 20.46 PASS AO=49;DP=303;FAO=45;FDP=298;FR=.;FRO=253;FSAF=41;FSAR=4;FSRF=141;FSRR=112;FWDB=-0.0361171;FXX=0.00334437;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.461;QD=0.274615;RBI=0.0381489;REFB=-0.00153715;REVB=-0.0122839;RO=249;SAF=45;SAR=4;SRF=139;SRR=110;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.55701;STB=0.86706;TYPE=snp;VARB=0.0100318;OID=.;OPOS=142180647;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:303:298:249:253:49:45:4:45:139:110:4:41:141:112 chr7 142180704 . G T 354.79 PASS AO=201;DP=585;FAO=137;FDP=400;FR=.;FRO=263;FSAF=57;FSAR=80;FSRF=93;FSRR=170;FWDB=0.00142545;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.257;QD=3.54788;RBI=0.00876795;REFB=0.00320303;REVB=-0.0086513;RO=379;SAF=87;SAR=114;SRF=128;SRR=251;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113876;STB=0.542851;TYPE=snp;VARB=-0.00571528;OID=.;OPOS=142180704;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:585:400:379:263:201:137:114:87:128:251:80:57:93:170 chr7 142180737 . T A 414.45 PASS AO=177;DP=507;FAO=146;FDP=400;FR=.;FRO=254;FSAF=62;FSAR=84;FSRF=91;FSRR=163;FWDB=-0.0159463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.126;QD=4.14452;RBI=0.0159834;REFB=-0.00930535;REVB=-0.00108786;RO=328;SAF=76;SAR=101;SRF=114;SRR=214;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0974037;STB=0.543699;TYPE=snp;VARB=0.0311741;OID=.;OPOS=142180737;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:507:400:328:254:177:146:101:76:114:214:84:62:91:163 chr7 142180770 . T C 362.31 PASS AO=130;DP=381;FAO=136;FDP=387;FR=.;FRO=251;FSAF=50;FSAR=86;FSRF=99;FSRR=152;FWDB=0.00810279;FXX=0.00257725;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.662;QD=3.74479;RBI=0.0121803;REFB=-0.00209614;REVB=-0.00909421;RO=250;SAF=45;SAR=85;SRF=98;SRR=152;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0572027;STB=0.518489;TYPE=snp;VARB=0.0039216;OID=.;OPOS=142180770;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:381:387:250:251:130:136:85:45:98:152:86:50:99:152 chr7 142223967 . T C 245.15 PASS AO=70;DP=166;FAO=70;FDP=167;FR=.;FRO=97;FSAF=33;FSAR=37;FSRF=49;FSRR=48;FWDB=-0.0332305;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.563;QD=5.87174;RBI=0.033354;REFB=-0.0139543;REVB=0.00286857;RO=96;SAF=33;SAR=37;SRF=48;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0295579;STB=0.519604;TYPE=snp;VARB=0.0225966;OID=.;OPOS=142223967;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:167:96:97:70:70:37:33:48:48:37:33:49:48 chr7 142224011 . G A 224.98 PASS AO=61;DP=140;FAO=61;FDP=141;FR=.;FRO=80;FSAF=25;FSAR=36;FSRF=41;FSRR=39;FWDB=-0.0154811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.729;QD=6.38242;RBI=0.0223436;REFB=-0.0159879;REVB=0.0161113;RO=78;SAF=25;SAR=36;SRF=39;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0918294;STB=0.558908;TYPE=snp;VARB=0.0204376;OID=.;OPOS=142224011;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:141:78:80:61:61:36:25:39:39:36:25:41:39 chr7 142224024 . T C 188.07 PASS AO=55;DP=134;FAO=55;FDP=135;FR=.;FRO=80;FSAF=23;FSAR=32;FSRF=40;FSRR=40;FWDB=0.00061713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.044;QD=5.57231;RBI=0.0033262;REFB=0.00482833;REVB=0.00326845;RO=76;SAF=23;SAR=32;SRF=37;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0718706;STB=0.549002;TYPE=snp;VARB=-0.0052199;OID=.;OPOS=142224024;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:135:76:80:55:55:32:23:37:39:32:23:40:40 chr7 142231625 . C A 235.47 PASS AO=52;DP=101;FAO=52;FDP=101;FR=.;FRO=49;FSAF=45;FSAR=7;FSRF=42;FSRR=7;FWDB=0.0337896;FXX=0.00980296;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.228;QD=9.32551;RBI=0.0358504;REFB=0.0112105;REVB=0.0119797;RO=48;SAF=45;SAR=7;SRF=41;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0205731;STB=0.508471;TYPE=snp;VARB=-0.00862929;OID=.;OPOS=142231625;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:48:49:52:52:7:45:41:7:7:45:42:7 chr7 142231701 . G T 295.96 PASS AO=68;DP=136;FAO=68;FDP=135;FR=.;FRO=67;FSAF=61;FSAR=7;FSRF=54;FSRR=13;FWDB=-0.0127031;FXX=0.0073524;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.1385;QD=8.76909;RBI=0.0245163;REFB=-0.0125762;REVB=0.0209685;RO=67;SAF=61;SAR=7;SRF=54;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183476;STB=0.602435;TYPE=snp;VARB=0.0139444;OID=.;OPOS=142231701;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:135:67:67:68:68:7:61:54:13:7:61:54:13 chr7 142242442 . C A 532.32 PASS AO=79;DP=148;FAO=83;FDP=143;FR=.,HEALED;FRO=44;FSAF=28;FSAR=55;FSRF=28;FSRR=16;FWDB=-0.0179485;FXX=0.0337815;HRUN=4;LEN=1;MLLD=229.919;QD=14.8901;RBI=0.0189656;REFB=-0.0382502;REVB=-0.0061277;RO=32;SAF=26;SAR=53;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117319;STB=0.607708;TYPE=snp;VARB=0.0103587;OID=.;OPOS=142242442;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:143:32:44:79:83:53:26:17:15:55:28:28:16 chr7 142247125 . A G 267.63 PASS AO=51;DP=86;FAO=51;FDP=86;FR=.;FRO=35;FSAF=32;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=10;FWDB=-0.0264547;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.815;QD=12.4478;RBI=0.0596646;REFB=-0.011609;REVB=-0.0534791;RO=34;SAF=32;SAR=19;SRF=25;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.086796;STB=0.538523;TYPE=snp;VARB=0.00585986;OID=.;OPOS=142247125;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:34:35:51:51:19:32:25:9:19:32:25:10 chr7 142247134 . T C 738.17 PASS AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00562028;FXX=0.0493766;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.478;QD=38.3463;RBI=0.0631608;REFB=0;REVB=0.0629102;RO=0;SAF=51;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0011594;OID=.;OPOS=142247134;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:78:77:0:0:77:77:26:51:0:0:26:51:0:0 chr7 142247148 . C T 164.88 PASS AO=41;DP=90;FAO=41;FDP=90;FR=.;FRO=49;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=0.0110265;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=85.8625;QD=7.32804;RBI=0.0164473;REFB=-0.0136271;REVB=-0.0122037;RO=46;SAF=25;SAR=16;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106262;STB=0.544367;TYPE=snp;VARB=0.0223197;OID=.;OPOS=142247148;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:46:49:41:41:16:25:23:23:16:25:26:23 chr7 142247213 . G T 131.2 PASS AO=25;DP=54;FAO=29;FDP=58;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.011632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.641;QD=9.04846;RBI=0.0149701;REFB=-0.0313067;REVB=0.0094234;RO=29;SAF=13;SAR=12;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.068086;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0642487;OID=.;OPOS=142247213;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:58:29:29:25:29:12:13:13:16:16:13:13:16 chr7 142247288 . T C 22.07 PASS AO=13;DP=60;FAO=13;FDP=61;FR=.;FRO=48;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=32;FWDB=-0.0397627;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=264.694;QD=1.44731;RBI=0.0415724;REFB=-0.00741568;REVB=-0.0121322;RO=47;SAF=3;SAR=10;SRF=16;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165576;STB=0.601098;TYPE=snp;VARB=0.0346249;OID=.;OPOS=142247288;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:60:61:47:48:13:13:10:3:16:31:10:3:16:32 chr7 142247347 . A C 171.05 PASS AO=36;DP=68;FAO=36;FDP=68;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=28;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.0741931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.5744;QD=10.0615;RBI=0.0761625;REFB=0.00833406;REVB=0.0172078;RO=29;SAF=8;SAR=28;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.308853;STB=0.656155;TYPE=snp;VARB=-0.00464245;OID=.;OPOS=142247347;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:29:32:36:36:28:8:16:13:28:8:16:16 chr7 142247348 . T C 34.06 PASS AO=17;DP=66;FAO=17;FDP=69;FR=.;FRO=52;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=31;FWDB=-0.0106127;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=55.2339;QD=1.97447;RBI=0.0836777;REFB=0.0103826;REVB=-0.083002;RO=49;SAF=3;SAR=14;SRF=21;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.363193;STB=0.713092;TYPE=snp;VARB=-0.0531227;OID=.;OPOS=142247348;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:66:69:49:52:17:17:14:3:21:28:14:3:21:31 chr7 142247380 . T A 25.46 PASS AO=12;DP=51;FAO=12;FDP=50;FR=.;FRO=38;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.00979469;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.356;QD=2.03673;RBI=0.0266806;REFB=0.000134167;REVB=0.0248177;RO=38;SAF=3;SAR=9;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.345903;STB=0.718373;TYPE=snp;VARB=0.000282458;OID=.;OPOS=142247380;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:51:50:38:38:12:12:9:3:20:18:9:3:20:18 chr7 142247396 . A T 22.38 PASS AO=11;DP=48;FAO=11;FDP=48;FR=.;FRO=37;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.0175191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.317;QD=1.86528;RBI=0.0223957;REFB=-0.00994393;REVB=-0.0139516;RO=34;SAF=3;SAR=8;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253121;STB=0.65544;TYPE=snp;VARB=0.045417;OID=.;OPOS=142247396;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:48:48:34:37:11:11:8:3:16:18:8:3:17:20 chr7 142247546 . C A 12.83 PASS AO=9;DP=51;FAO=9;FDP=51;FR=.;FRO=42;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=13;FSRR=29;FWDB=0.0027057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.099;QD=1.00657;RBI=0.0160915;REFB=-0.0044011;REVB=-0.0158624;RO=41;SAF=7;SAR=2;SRF=13;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.525202;STB=0.843707;TYPE=snp;VARB=0.0360512;OID=.;OPOS=142247546;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:51:51:41:42:9:9:2:7:13:28:2:7:13:29 chr7 142247554 . C G 53.44 PASS AO=13;DP=47;FAO=17;FDP=49;FR=.;FRO=32;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.0106822;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.9697;QD=4.36264;RBI=0.0389407;REFB=-0.0430213;REVB=0.0374469;RO=33;SAF=5;SAR=8;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119819;STB=0.578852;TYPE=snp;VARB=0.0868916;OID=.;OPOS=142247554;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:47:49:33:32:13:17:8:5:16:17:11:6:15:17 chr7 142247567 . A G 58.6 PASS AO=18;DP=51;FAO=18;FDP=51;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=0.00546513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.521;QD=4.59587;RBI=0.00826536;REFB=-0.00117686;REVB=0.00620068;RO=33;SAF=10;SAR=8;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176893;STB=0.603336;TYPE=snp;VARB=0.00403185;OID=.;OPOS=142247567;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:51:51:33:33:18:18:8:10:13:20:8:10:13:20 chr7 142247571 . A G 50.85 PASS AO=15;DP=49;FAO=17;FDP=51;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=-0.0036947;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.415;QD=3.98803;RBI=0.0194268;REFB=-0.0302416;REVB=0.0190722;RO=34;SAF=10;SAR=5;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.323073;STB=0.634766;TYPE=snp;VARB=0.0376891;OID=.;OPOS=142247571;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:49:51:34:34:15:17:5:10:13:21:7:10:13:21 chr7 142250938 . T G 1248.81 PASS AO=130;DP=130;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0546735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.225;QD=38.1315;RBI=0.0650942;REFB=0;REVB=0.0353279;RO=0;SAF=41;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000155883;OID=.;OPOS=142250938;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:130:131:0:0:130:131:89:41:0:0:90:41:0:0 chr7 142250988 . G A 945.41 PASS AO=99;DP=100;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0545614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.6214;QD=37.075;RBI=0.0640021;REFB=-0.0425709;REVB=0.0334562;RO=1;SAF=31;SAR=68;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00692557;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00086208;OID=.;OPOS=142250988;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:100:102:1:0:99:102:68:31:0:1:71:31:0:0 chr7 142251132 . G T 484.6 PASS AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0388493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.6;QD=38.7677;RBI=0.0640041;REFB=0;REVB=0.050865;RO=0;SAF=20;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000224111;OID=.;OPOS=142251132;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:50:50:0:0:50:50:30:20:0:0:30:20:0:0 chr7 142326783 . A G 200.9 PASS AO=50;DP=107;FAO=50;FDP=108;FR=.;FRO=58;FSAF=32;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=38;FWDB=-0.0184912;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=103.932;QD=7.44064;RBI=0.018851;REFB=-0.0031863;REVB=0.00366564;RO=57;SAF=32;SAR=18;SRF=19;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.290075;STB=0.656829;TYPE=snp;VARB=0.00555489;OID=.;OPOS=142326783;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:108:57:58:50:50:18:32:19:38:18:32:20:38 chr7 142326909 . C G 1190.22 PASS AO=126;DP=131;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00422466;FXX=0.038165;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.4949;QD=37.7848;RBI=0.0351806;REFB=-0.110252;REVB=0.034926;RO=1;SAF=60;SAR=66;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0071454;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000972165;OID=.;OPOS=142326909;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:131:126:1:0:126:126:66:60:0:1:66:60:0:0 chr7 142334744 . C A 319.35 PASS AO=71;DP=196;FAO=97;FDP=223;FR=.;FRO=126;FSAF=35;FSAR=62;FSRF=43;FSRR=83;FWDB=0.0188798;FXX=0.0132737;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.023;QD=5.72822;RBI=0.0205386;REFB=-0.0185466;REVB=0.00808632;RO=125;SAF=32;SAR=39;SRF=43;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123022;STB=0.512055;TYPE=snp;VARB=0.0276731;OID=.;OPOS=142334744;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:223:125:126:71:97:39:32:43:82:62:35:43:83 chr7 142364553 . G A 136.97 PASS AO=43;DP=112;FAO=43;FDP=113;FR=.;FRO=70;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=46;FWDB=0.00306533;FXX=0.0173898;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.635;QD=4.84861;RBI=0.0526717;REFB=-0.0122762;REVB=-0.0525824;RO=69;SAF=23;SAR=20;SRF=24;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201299;STB=0.617523;TYPE=snp;VARB=0.0188989;OID=.;OPOS=142364553;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:113:69:70:43:43:20:23:24:45:20:23:24:46 chr7 142373010 . C T 191.55 PASS AO=58;DP=146;FAO=58;FDP=146;FR=.;FRO=88;FSAF=31;FSAR=27;FSRF=42;FSRR=46;FWDB=0.0277882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.395;QD=5.2479;RBI=0.028332;REFB=-0.0149755;REVB=-0.00552413;RO=87;SAF=31;SAR=27;SRF=42;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0550634;STB=0.534471;TYPE=snp;VARB=0.0264906;OID=.;OPOS=142373010;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:87:88:58:58:27:31:42:45:27:31:42:46 chr7 142374072 . C A 436.53 PASS AO=84;DP=139;FAO=83;FDP=139;FR=.;FRO=56;FSAF=48;FSAR=35;FSRF=26;FSRR=30;FWDB=-0.048469;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.3977;QD=12.5621;RBI=0.0520548;REFB=0.0161346;REVB=0.0189857;RO=54;SAF=49;SAR=35;SRF=25;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0878868;STB=0.546399;TYPE=snp;VARB=-0.0112119;OID=.;OPOS=142374072;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:54:56:84:83:35:49:25:29:35:48:26:30 chr7 142374083 . A G 444.29 PASS AO=84;DP=141;FAO=84;FDP=140;FR=.;FRO=56;FSAF=52;FSAR=32;FSRF=26;FSRR=30;FWDB=0.0236957;FXX=0.0070917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.058;QD=12.6941;RBI=0.0237156;REFB=-0.0126206;REVB=0.000971591;RO=54;SAF=52;SAR=32;SRF=25;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115714;STB=0.563621;TYPE=snp;VARB=0.00844916;OID=.;OPOS=142374083;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:140:54:56:84:84:32:52:25:29:32:52:26:30 chr7 142378831 . C G 1118.77 PASS AO=115;DP=119;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0262991;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.804;QD=36.0895;RBI=0.0339924;REFB=-0.0460418;REVB=0.0215368;RO=3;SAF=67;SAR=48;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0287522;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000684606;OID=.;OPOS=142378831;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:119:124:3:0:115:124:48:67:0:3:56:68:0:0 chr7 142423289 . C A 175.56 PASS AO=43;DP=94;FAO=46;FDP=102;FR=.;FRO=56;FSAF=16;FSAR=30;FSRF=18;FSRR=38;FWDB=0.0115234;FXX=0.0192289;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5246;QD=6.88466;RBI=0.0135838;REFB=-0.0122701;REVB=0.00719239;RO=48;SAF=14;SAR=29;SRF=11;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108839;STB=0.516122;TYPE=snp;VARB=0.0119259;OID=.;OPOS=142423289;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:102:48:56:43:46:29:14:11:37:30:16:18:38 chr7 142423562 . C T 1467.2 PASS AO=154;DP=156;FAO=156;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0194239;FXX=0.00636902;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.4708;QD=37.6206;RBI=0.0582628;REFB=-0.0339474;REVB=0.0549297;RO=2;SAF=38;SAR=116;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0081313;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000645213;OID=.;OPOS=142423562;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:156:156:2:0:154:156:116:38:0:2:118:38:0:0 chr7 142458697 . T A 11.95 PASS AO=16;DP=105;FAO=16;FDP=105;FR=.;FRO=89;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=41;FSRR=48;FWDB=-0.00557732;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.099;QD=0.455197;RBI=0.0059894;REFB=-0.00738165;REVB=-0.00218322;RO=88;SAF=6;SAR=10;SRF=41;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11664;STB=0.574477;TYPE=snp;VARB=0.0407758;OID=.;OPOS=142458697;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:105:105:88:89:16:16:10:6:41:47:10:6:41:48 chr7 142458700 . G T 12.26 PASS AO=16;DP=103;FAO=16;FDP=104;FR=.;FRO=88;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=40;FSRR=48;FWDB=0.027639;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.619;QD=0.471711;RBI=0.027766;REFB=-0.00796491;REVB=0.00265343;RO=87;SAF=6;SAR=10;SRF=40;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109086;STB=0.569219;TYPE=snp;VARB=0.0544279;OID=.;OPOS=142458700;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:103:104:87:88:16:16:10:6:40:47:10:6:40:48 chr7 142460313 . T C 244.95 PASS AO=98;DP=288;FAO=97;FDP=291;FR=.;FRO=194;FSAF=41;FSAR=56;FSRF=101;FSRR=93;FWDB=-0.0224262;FXX=0.00342454;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.48;QD=3.36699;RBI=0.0224431;REFB=-0.00798882;REVB=0.000871316;RO=189;SAF=42;SAR=56;SRF=100;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116145;STB=0.565522;TYPE=snp;VARB=0.0201848;OID=.;OPOS=142460313;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:288:291:189:194:98:97:56:42:100:89:56:41:101:93 chr7 142460335 . A G 73.68 PASS AO=59;DP=277;FAO=61;FDP=280;FR=.;FRO=219;FSAF=41;FSAR=20;FSRF=94;FSRR=125;FWDB=0.00262955;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.7264;QD=1.0526;RBI=0.0250551;REFB=-0.000491662;REVB=0.0249167;RO=218;SAF=41;SAR=18;SRF=94;SRR=124;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.335564;STB=0.68762;TYPE=snp;VARB=0.004139;OID=.;OPOS=142460335;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:277:280:218:219:59:61:18:41:94:124:20:41:94:125 chr7 142460865 . T C 330.96 PASS AO=64;DP=110;FAO=64;FDP=110;FR=.;FRO=46;FSAF=34;FSAR=30;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=-0.0010155;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.514;QD=12.0349;RBI=0.00932523;REFB=-0.0124885;REVB=-0.00926977;RO=45;SAF=34;SAR=30;SRF=18;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0991692;STB=0.558306;TYPE=snp;VARB=0.0062448;OID=.;OPOS=142460865;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:45:46:64:64:30:34:18:27:30:34:18:28 chr7 142470290 . T C 141.15 PASS AO=51;DP=148;FAO=51;FDP=148;FR=.;FRO=97;FSAF=32;FSAR=19;FSRF=59;FSRR=38;FWDB=0.0145436;FXX=0.00671096;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.366;QD=3.81474;RBI=0.0192362;REFB=-0.00894054;REVB=-0.0125903;RO=96;SAF=32;SAR=19;SRF=58;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0280972;STB=0.513364;TYPE=snp;VARB=0.0179557;OID=.;OPOS=142470290;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:96:97:51:51:19:32:58:38:19:32:59:38 chr7 142478897 . T C 412.44 PASS AO=45;DP=45;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0483364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.568;QD=37.4945;RBI=0.0488966;REFB=0;REVB=0.00737981;RO=0;SAF=2;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.70478e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.49442e-05;OID=.;OPOS=142478897;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:45:44:0:0:45:44:43:2:0:0:42:2:0:0 chr7 142479915 . T C 203.93 PASS AO=67;DP=191;FAO=71;FDP=197;FR=.;FRO=126;FSAF=35;FSAR=36;FSRF=55;FSRR=71;FWDB=-0.0123613;FXX=0.00505025;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.056;QD=4.14061;RBI=0.0183135;REFB=-0.0070867;REVB=-0.0135123;RO=112;SAF=32;SAR=35;SRF=48;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0544346;STB=0.536139;TYPE=snp;VARB=0.00412875;OID=.;OPOS=142479915;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:191:197:112:126:67:71:35:32:48:64:36:35:55:71 chr7 142479940 . C T 654.17 PASS AO=126;DP=211;FAO=126;FDP=211;FR=.;FRO=85;FSAF=57;FSAR=69;FSRF=48;FSRR=37;FWDB=0.0413844;FXX=0.00938923;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.236;QD=12.4013;RBI=0.0417762;REFB=-0.0101371;REVB=-0.00570836;RO=85;SAF=56;SAR=70;SRF=48;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0896308;STB=0.545263;TYPE=snp;VARB=0.0111196;OID=.;OPOS=142479940;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:211:85:85:126:126:70:56:48:37:69:57:48:37 chr7 142479954 . C T 421.04 PASS AO=100;DP=223;FAO=100;FDP=203;FR=.;FRO=103;FSAF=63;FSAR=37;FSRF=44;FSRR=59;FWDB=0.0223407;FXX=0.0896821;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.104;QD=8.29634;RBI=0.02415;REFB=0.00474426;REVB=-0.00917143;RO=103;SAF=63;SAR=37;SRF=44;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189501;STB=0.604356;TYPE=snp;VARB=-0.0045754;OID=.;OPOS=142479954;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:203:103:103:100:100:37:63:44:59:37:63:44:59 chr7 142480002 . C A 523.26 PASS AO=115;DP=221;FAO=116;FDP=221;FR=.;FRO=105;FSAF=74;FSAR=42;FSRF=43;FSRR=62;FWDB=-0.0028929;FXX=0.00896821;HRUN=3;LEN=1;MLLD=182.738;QD=9.47073;RBI=0.00565951;REFB=-0.0149266;REVB=0.00486427;RO=103;SAF=73;SAR=42;SRF=42;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198966;STB=0.61029;TYPE=snp;VARB=0.0102294;OID=.;OPOS=142480002;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:221:103:105:115:116:42:73:42:61:42:74:43:62 chr7 142480012 . C T 400.54 PASS AO=103;DP=225;FAO=103;FDP=223;FR=.;FRO=120;FSAF=46;FSAR=57;FSRF=74;FSRR=46;FWDB=0.0267295;FXX=0.00888849;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.212;QD=7.18455;RBI=0.0278294;REFB=0.00751476;REVB=0.0077466;RO=118;SAF=46;SAR=57;SRF=73;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165055;STB=0.590758;TYPE=snp;VARB=-0.00348153;OID=.;OPOS=142480012;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:225:223:118:120:103:103:57:46:73:45:57:46:74:46 chr7 142480034 . C A 327.06 PASS AO=80;DP=198;FAO=92;FDP=210;FR=.;FRO=118;FSAF=46;FSAR=46;FSRF=72;FSRR=46;FWDB=0.0320947;FXX=0.00473911;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.485;QD=6.22973;RBI=0.0334734;REFB=-0.0226394;REVB=0.00950769;RO=113;SAF=36;SAR=44;SRF=67;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148619;STB=0.561891;TYPE=snp;VARB=0.0291471;OID=.;OPOS=142480034;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:210:113:118:80:92:44:36:67:46:46:46:72:46 chr7 142480067 . C T 350.08 PASS AO=80;DP=156;FAO=80;FDP=158;FR=.;FRO=78;FSAF=49;FSAR=31;FSRF=40;FSRR=38;FWDB=-0.00251066;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.875;QD=8.86286;RBI=0.00953085;REFB=0.00208825;REVB=0.00919421;RO=76;SAF=49;SAR=31;SRF=40;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.078838;STB=0.550639;TYPE=snp;VARB=-0.00111234;OID=.;OPOS=142480067;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:158:76:78:80:80:31:49:40:36:31:49:40:38 chr7 142481234 . T C 624.82 PASS AO=68;DP=75;FAO=72;FDP=74;FR=.;FRO=2;FSAF=32;FSAR=40;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00843104;FXX=0.0133316;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.163;QD=33.7738;RBI=0.021554;REFB=-0.0628296;REVB=0.0198367;RO=2;SAF=32;SAR=36;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0286232;STB=0.515147;TYPE=snp;VARB=0.00156276;OID=.;OPOS=142481234;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:75:74:2:2:68:72:36:32:2:0:40:32:2:0 chr7 142481376 . T A 100.79 PASS AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0.0832639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.601;QD=36.6506;RBI=0.0170633;REFB=0;REVB=0.0170633;RO=0;SAF=0;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000104568;OID=.;OPOS=142481376;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:11:11:11:0:0:0:11:0:0:0 chr7 142481807 . C T 860.71 PASS AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0392716;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.807;QD=38.6835;RBI=0.0430523;REFB=0;REVB=0.0176421;RO=0;SAF=39;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000343982;OID=.;OPOS=142481807;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:89:89:0:0:89:89:50:39:0:0:50:39:0:0 chr7 142481867 . C G 769.12 PASS AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.1445;QD=37.981;RBI=0.0297817;REFB=0;REVB=-0.0255706;RO=0;SAF=34;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.25769e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.5527e-05;OID=.;OPOS=142481867;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:81:81:0:0:81:81:47:34:0:0:47:34:0:0 chr7 142495126 . G A 25.85 PASS AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0169687;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=183.117;QD=8.61635;RBI=0.0327969;REFB=-0.00652019;REVB=-0.028066;RO=7;SAF=3;SAR=2;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0274957;STB=0.517172;TYPE=snp;VARB=0.013668;OID=.;OPOS=142495126;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:12:12:7:7:5:5:2:3:4:3:2:3:4:3 chr7 142495127 . G T 27.94 PASS AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=11;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0872655;FXX=0.0832639;HRUN=5;LEN=1;MLLD=63.4948;QD=10.1597;RBI=0.0886348;REFB=0.024073;REVB=0.0155194;RO=6;SAF=3;SAR=2;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0621951;STB=0.538311;TYPE=snp;VARB=-0.00534004;OID=.;OPOS=142495127;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:12:11:6:6:5:5:2:3:4:2:2:3:4:2 chr7 142495156 . T G 37.67 PASS AO=8;DP=17;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.0305825;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.1909;QD=8.37141;RBI=0.120342;REFB=-0.0396662;REVB=-0.116391;RO=9;SAF=3;SAR=5;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162764;STB=0.571247;TYPE=snp;VARB=0.035759;OID=.;OPOS=142495156;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:17:18:9:10:8:8:5:3:5:4:5:3:5:5 chr7 142498735 . A C 33.9 PASS AO=16;DP=63;FAO=16;FDP=63;FR=.;FRO=47;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=32;FWDB=-0.0125904;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=249.889;QD=2.15212;RBI=0.0155098;REFB=-0.00487226;REVB=0.00905737;RO=47;SAF=9;SAR=7;SRF=15;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.29142;STB=0.676099;TYPE=snp;VARB=0.0126696;OID=.;OPOS=142498735;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:63:63:47:47:16:16:7:9:15:32:7:9:15:32 chr7 142498738 . C G 33.89 PASS AO=16;DP=63;FAO=16;FDP=63;FR=.;FRO=47;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=32;FWDB=-0.0183784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.732;QD=2.15179;RBI=0.0198279;REFB=0.00136683;REVB=0.00744184;RO=45;SAF=9;SAR=7;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.272685;STB=0.676099;TYPE=snp;VARB=-0.00456328;OID=.;OPOS=142498738;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:63:63:45:47:16:16:7:9:15:30:7:9:15:32 chr7 142498897 . A G 95.56 PASS AO=32;DP=91;FAO=32;FDP=91;FR=.;FRO=59;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=46;FWDB=0.00886643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.317;QD=4.20047;RBI=0.0299837;REFB=-0.0122319;REVB=-0.0286427;RO=58;SAF=18;SAR=14;SRF=12;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.389142;STB=0.713227;TYPE=snp;VARB=0.0152183;OID=.;OPOS=142498897;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:91:91:58:59:32:32:14:18:12:46:14:18:13:46 chr7 142499071 . T C 104.98 PASS AO=32;DP=82;FAO=32;FDP=84;FR=.;FRO=52;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=33;FSRR=19;FWDB=-0.0999499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.056;QD=4.99895;RBI=0.100025;REFB=-0.00333423;REVB=-0.0038871;RO=48;SAF=19;SAR=13;SRF=31;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0576922;STB=0.526463;TYPE=snp;VARB=0.00493868;OID=.;OPOS=142499071;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:84:48:52:32:32:13:19:31:17:13:19:33:19 chr7 142510309 . A G 501.79 PASS AO=96;DP=161;FAO=96;FDP=161;FR=.;FRO=65;FSAF=61;FSAR=35;FSRF=52;FSRR=13;FWDB=-0.032552;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.5941;QD=12.4669;RBI=0.0345223;REFB=0.0191715;REVB=0.011496;RO=65;SAF=61;SAR=35;SRF=52;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138202;STB=0.574589;TYPE=snp;VARB=-0.0145096;OID=.;OPOS=142510309;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:161:65:65:96:96:35:61:52:13:35:61:52:13 chr7 142724062 . C T 413.13 PASS AO=107;DP=292;FAO=130;FDP=329;FR=.;FRO=199;FSAF=59;FSAR=71;FSRF=128;FSRR=71;FWDB=-0.00454952;FXX=0.00303021;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.295;QD=5.02279;RBI=0.0220045;REFB=-0.000174888;REVB=-0.021529;RO=179;SAF=59;SAR=48;SRF=123;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155675;STB=0.613098;TYPE=snp;VARB=0.000172099;OID=.;OPOS=142724062;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:292:329:179:199:107:130:48:59:123:56:71:59:128:71 chr7 142749737 . C T 323.39 PASS AO=60;DP=104;FAO=63;FDP=109;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=46;FSRF=14;FSRR=32;FWDB=0.04619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.0787;QD=11.8676;RBI=0.0528924;REFB=-0.0285428;REVB=0.02577;RO=44;SAF=15;SAR=45;SRF=14;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0676259;STB=0.518163;TYPE=snp;VARB=0.0263541;OID=.;OPOS=142749737;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:109:44:46:60:63:45:15:14:30:46:17:14:32 chr7 142749953 . C T 72.36 PASS AO=19;DP=46;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.0190294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.503;QD=6.29208;RBI=0.0213032;REFB=-0.0198686;REVB=-0.00957644;RO=27;SAF=4;SAR=15;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.32112;STB=0.687115;TYPE=snp;VARB=0.0260519;OID=.;OPOS=142749953;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:46:46:27:27:19:19:15:4:13:14:15:4:13:14 chr7 142750147 . C T 313.61 PASS AO=81;DP=182;FAO=83;FDP=185;FR=.;FRO=102;FSAF=30;FSAR=53;FSRF=61;FSRR=41;FWDB=0.0756683;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.9988;QD=6.78067;RBI=0.0759352;REFB=-0.024277;REVB=0.00636074;RO=101;SAF=28;SAR=53;SRF=60;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.250173;STB=0.631003;TYPE=snp;VARB=0.0346401;OID=.;OPOS=142750147;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:185:101:102:81:83:53:28:60:41:53:30:61:41 chr7 142919731 . C A 206.74 PASS AO=50;DP=105;FAO=50;FDP=105;FR=.;FRO=55;FSAF=10;FSAR=40;FSRF=18;FSRR=37;FWDB=-0.00888283;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.681;QD=7.87568;RBI=0.0103592;REFB=0.0248512;REVB=0.0053299;RO=55;SAF=10;SAR=40;SRF=18;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165144;STB=0.592552;TYPE=snp;VARB=-0.0173056;OID=.;OPOS=142919731;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:55:55:50:50:40:10:18:37:40:10:18:37 chr7 143016928 . C T 350.36 PASS AO=72;DP=131;FAO=72;FDP=130;FR=.;FRO=58;FSAF=27;FSAR=45;FSRF=27;FSRR=31;FWDB=-0.00594265;FXX=0.00763301;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.1751;QD=10.7801;RBI=0.00688046;REFB=-0.0178355;REVB=-0.00346779;RO=58;SAF=27;SAR=45;SRF=27;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0770398;STB=0.542157;TYPE=snp;VARB=0.0141185;OID=.;OPOS=143016928;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:130:58:58:72:72:45:27:27:31:45:27:27:31 chr7 143017807 . G T 1262.43 PASS AO=142;DP=149;FAO=142;FDP=149;FR=.;FRO=7;FSAF=136;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=-0.0497049;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=235.553;QD=33.8906;RBI=0.0512218;REFB=-0.104873;REVB=0.0123732;RO=7;SAF=136;SAR=6;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0238446;STB=0.512543;TYPE=snp;VARB=0.000409382;OID=.;OPOS=143017807;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:149:149:7:7:142:142:6:136:7:0:6:136:7:0 chr7 143042837 . C T 61.38 PASS AO=10;DP=19;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=0;FWDB=0.0288473;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.617;QD=12.2765;RBI=0.0549957;REFB=-0.015045;REVB=0.0468226;RO=9;SAF=6;SAR=4;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.382088;STB=0.713979;TYPE=snp;VARB=0.0179609;OID=.;OPOS=143042837;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:19:20:9:9:10:11:4:6:9:0:5:6:9:0 chr7 143053260 . A G 329.93 PASS AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.016;QD=36.6593;RBI=0.0225301;REFB=0;REVB=0.0172618;RO=0;SAF=6;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.61498e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000801979;OID=.;OPOS=143053260;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:35:36:0:0:35:36:29:6:0:0:29:7:0:0 chr7 143085978 . AG A 168.8 PASS AO=20;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.271898;FXX=0.0344709;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.861;QD=24.1144;RBI=0.341634;REFB=0;REVB=0.206847;RO=7;SAF=7;SAR=13;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0.335196;SSSB=-0.0401159;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0376091;OID=.;OPOS=143085979;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:20:28:28:28:0:10:18:0:0:15:7:7:13:3:4 chr7 143088823 . T C 137.46 PASS AO=14;DP=16;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00806652;FXX=0.062461;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.566;QD=36.6562;RBI=0.033742;REFB=0;REVB=0.0327636;RO=0;SAF=3;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0112261;OID=.;OPOS=143088823;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:15:0:0:14:15:11:3:0:0:12:3:0:0 chr7 143088867 . T C 99.27 PASS AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0205509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.812;QD=39.7067;RBI=0.0259872;REFB=0;REVB=-0.0159059;RO=0;SAF=2;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000883409;OID=.;OPOS=143088867;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:8:2:0:0:8:2:0:0 chr7 143093538 . G A 1481.91 PASS AO=144;DP=144;FAO=156;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0138965;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=38.53;QD=37.9976;RBI=0.0437929;REFB=0;REVB=-0.0415296;RO=0;SAF=80;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000235983;OID=.;OPOS=143093538;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:144:156:0:0:144:156:64:80:0:0:76:80:0:0 chr7 143097100 . A G 519.76 PASS AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.754;QD=37.8008;RBI=0.0180408;REFB=0;REVB=0.00439758;RO=0;SAF=27;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4002e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00018377;OID=.;OPOS=143097100;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:55:55:0:0:55:55:28:27:0:0:28:27:0:0 chr7 143140675 . G A 564.23 PASS AO=123;DP=232;FAO=123;FDP=231;FR=.;FRO=108;FSAF=67;FSAR=56;FSRF=53;FSRR=55;FWDB=-0.0155875;FXX=0.00431016;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.293;QD=9.77025;RBI=0.0265476;REFB=-0.0143378;REVB=-0.0214897;RO=108;SAF=67;SAR=56;SRF=53;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0463703;STB=0.525319;TYPE=snp;VARB=0.0123381;OID=.;OPOS=143140675;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:231:108:108:123:123:56:67:53:55:56:67:53:55 chr7 143140930 . GTCT G 223.11 PASS AO=53;DP=128;FAO=57;FDP=122;FR=.;FRO=65;FSAF=17;FSAR=40;FSRF=30;FSRR=35;FWDB=-0.0100594;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=3;MLLD=232.354;QD=7.31507;RBI=0.0244012;REFB=-0.0134775;REVB=-0.0222312;RO=55;SAF=15;SAR=38;SRF=22;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124029;STB=0.595844;TYPE=del;VARB=0.0109209;OID=.;OPOS=143140931;OREF=TCT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:53:116:57:122:65:17:40:30:35:99:55:15:38:22:33 chr7 143747870 . A G 361.5 PASS AO=80;DP=153;FAO=80;FDP=153;FR=.;FRO=73;FSAF=61;FSAR=19;FSRF=49;FSRR=24;FWDB=0.0116124;FXX=0.00649309;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.939;QD=9.45093;RBI=0.0168912;REFB=-0.027783;REVB=0.0122665;RO=72;SAF=61;SAR=19;SRF=48;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10676;STB=0.556531;TYPE=snp;VARB=0.0221628;OID=.;OPOS=143747870;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:153:72:73:80:80:19:61:48:24:19:61:49:24 chr7 143748098 . G T 134.33 PASS AO=25;DP=44;FAO=26;FDP=45;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.0140319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.215;QD=11.9404;RBI=0.0669152;REFB=-0.0238757;REVB=0.0654275;RO=19;SAF=11;SAR=14;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148128;STB=0.587667;TYPE=snp;VARB=0.021613;OID=.;OPOS=143748098;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:44:45:19:19:25:26:14:11:12:7:15:11:12:7 chr7 143748257 . G A 304.45 PASS AO=76;DP=164;FAO=76;FDP=162;FR=.;FRO=86;FSAF=41;FSAR=35;FSRF=35;FSRR=51;FWDB=-0.0134585;FXX=0.0121944;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.021;QD=7.51737;RBI=0.0568895;REFB=-0.0121619;REVB=0.0552746;RO=82;SAF=41;SAR=35;SRF=34;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116847;STB=0.569978;TYPE=snp;VARB=0.0156471;OID=.;OPOS=143748257;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:162:82:86:76:76:35:41:34:48:35:41:35:51 chr7 143748364 . T C 282.77 PASS AO=78;DP=181;FAO=78;FDP=181;FR=.;FRO=103;FSAF=36;FSAR=42;FSRF=39;FSRR=64;FWDB=-0.0228838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.424;QD=6.24902;RBI=0.0353675;REFB=-0.0217494;REVB=-0.0269665;RO=103;SAF=36;SAR=42;SRF=39;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0858181;STB=0.547792;TYPE=snp;VARB=0.0261964;OID=.;OPOS=143748364;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:181:103:103:78:78:42:36:39:64:42:36:39:64 chr7 143771536 . G A 360.24 PASS AO=76;DP=142;FAO=77;FDP=143;FR=.;FRO=66;FSAF=36;FSAR=41;FSRF=29;FSRR=37;FWDB=-0.023876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.718;QD=10.0765;RBI=0.0242752;REFB=-0.0228593;REVB=0.00438413;RO=66;SAF=36;SAR=40;SRF=29;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0292292;STB=0.513061;TYPE=snp;VARB=0.0199556;OID=.;OPOS=143771536;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:143:66:66:76:77:40:36:29:37:41:36:29:37 chr7 143807515 . T G 125.61 PASS AO=38;DP=98;FAO=38;FDP=98;FR=.;FRO=60;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=16;FSRR=44;FWDB=-0.0135212;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.474;QD=5.12679;RBI=0.0339767;REFB=-0.040969;REVB=-0.0311703;RO=57;SAF=15;SAR=23;SRF=15;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151954;STB=0.584941;TYPE=snp;VARB=0.0422272;OID=.;OPOS=143807515;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:57:60:38:38:23:15:15:42:23:15:16:44 chr7 143807518 . T C 131.42 PASS AO=35;DP=96;FAO=39;FDP=98;FR=.;FRO=59;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=16;FSRR=43;FWDB=0.0147777;FXX=0.019998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.147;QD=5.36411;RBI=0.0310846;REFB=-0.00883162;REVB=-0.0273472;RO=61;SAF=11;SAR=24;SRF=16;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0690365;STB=0.574578;TYPE=snp;VARB=0.0151062;OID=.;OPOS=143807518;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:98:61:59:35:39:24:11:16:45:24:15:16:43 chr7 143826603 . G T 94.53 PASS AO=43;DP=136;FAO=43;FDP=147;FR=.;FRO=104;FSAF=36;FSAR=7;FSRF=65;FSRR=39;FWDB=-0.00176206;FXX=0.0067563;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.262;QD=2.57212;RBI=0.00184501;REFB=-0.0145186;REVB=-0.000546994;RO=90;SAF=36;SAR=7;SRF=52;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.379649;STB=0.700697;TYPE=snp;VARB=0.0271645;OID=.;OPOS=143826603;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:136:147:90:104:43:43:7:36:52:38:7:36:65:39 chr7 143826729 . ACTT A 20.37 PASS AO=8;DP=47;FAO=9;FDP=39;FR=.;FRO=30;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=26;FWDB=-0.0115669;FXX=0.0930016;HRUN=1;LEN=3;MLLD=178.616;QD=2.08918;RBI=0.0167009;REFB=0.00193425;REVB=-0.0120469;RO=27;SAF=1;SAR=7;SRF=3;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0395568;STB=0.540445;TYPE=del;VARB=-0.00851711;OID=.;OPOS=143826730;OREF=CTT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:8:43:9:39:30:1:8:4:26:20:27:1:7:3:24 chr7 143882673 . C T 66.66 PASS AO=18;DP=45;FAO=18;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=24;FSRR=3;FWDB=0.0324684;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.2462;QD=5.92548;RBI=0.0615685;REFB=0.000140139;REVB=-0.0523114;RO=27;SAF=15;SAR=3;SRF=24;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114148;STB=0.565152;TYPE=snp;VARB=-0.000885218;OID=.;OPOS=143882673;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:45:45:27:27:18:18:3:15:24:3:3:15:24:3 chr7 143956742 . C G 95.19 PASS AO=66;DP=281;FAO=66;FDP=279;FR=.;FRO=213;FSAF=37;FSAR=29;FSRF=102;FSRR=111;FWDB=0.00965088;FXX=0.0141338;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.3867;QD=1.36477;RBI=0.0383807;REFB=-0.00338657;REVB=-0.0371475;RO=210;SAF=37;SAR=29;SRF=99;SRR=111;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112689;STB=0.562352;TYPE=snp;VARB=0.0116644;OID=.;OPOS=143956742;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:281:279:210:213:66:66:29:37:99:111:29:37:102:111 chr7 144015434 . A G 40.02 PASS AO=15;DP=51;FAO=15;FDP=51;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=0.00959816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.9655;QD=3.13921;RBI=0.0213055;REFB=-0.0200079;REVB=-0.019021;RO=35;SAF=11;SAR=4;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209703;STB=0.620008;TYPE=snp;VARB=0.0422105;OID=.;OPOS=144015434;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:51:51:35:36:15:15:4:11:20:15:4:11:21:15 chr7 144015437 . C T 40.03 PASS AO=15;DP=51;FAO=15;FDP=51;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=0.0116799;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=82.9405;QD=3.13956;RBI=0.0121205;REFB=0.0099818;REVB=0.00323807;RO=36;SAF=11;SAR=4;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196936;STB=0.620008;TYPE=snp;VARB=-0.0324766;OID=.;OPOS=144015437;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:51:51:36:36:15:15:4:11:21:15:4:11:21:15 chr7 144061119 . C T 133.53 PASS AO=17;DP=23;FAO=19;FDP=24;FR=.;FRO=5;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0181778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.407;QD=22.2552;RBI=0.0460589;REFB=-0.050882;REVB=0.0423201;RO=4;SAF=13;SAR=4;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214712;STB=0.607359;TYPE=snp;VARB=0.0160889;OID=.;OPOS=144061119;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:23:24:4:5:17:19:4:13:1:3:6:13:1:4 chr7 144094613 . G T 37.72 PASS AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.0434517;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=132.755;QD=8.38188;RBI=0.0435068;REFB=0.0155117;REVB=-0.00218768;RO=9;SAF=5;SAR=3;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0401081;STB=0.514669;TYPE=snp;VARB=-0.0249477;OID=.;OPOS=144094613;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:18:18:9:10:8:8:3:5:6:3:3:5:6:4 chr7 144095600 . A G 53.78 PASS AO=9;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.021688;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.7111;QD=23.9044;RBI=0.0509358;REFB=0.0035938;REVB=0.0460877;RO=0;SAF=7;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.583115;TYPE=snp;VARB=-0.00983999;OID=.;OPOS=144095600;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:0:2:9:7:2:7:0:0:2:5:2:0 chr7 144096068 . C T 45.22 PASS AO=13;DP=36;FAO=13;FDP=36;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.00241902;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.619;QD=5.02488;RBI=0.00243026;REFB=-0.00834694;REVB=-0.000233492;RO=23;SAF=7;SAR=6;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204005;STB=0.620076;TYPE=snp;VARB=0.0150047;OID=.;OPOS=144096068;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:36:36:23:23:13:13:6:7:8:15:6:7:8:15 chr7 144098992 . G A 672.79 PASS AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00226249;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.2549;QD=37.9038;RBI=0.1552;REFB=0;REVB=0.155184;RO=0;SAF=68;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17784e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00190594;OID=.;OPOS=144098992;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:71:71:0:0:71:71:3:68:0:0:3:68:0:0 chr7 144107279 . A G 273.76 PASS AO=72;DP=161;FAO=72;FDP=162;FR=.;FRO=90;FSAF=20;FSAR=52;FSRF=51;FSRR=39;FWDB=-0.0028675;FXX=0.0635801;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.57;QD=6.75951;RBI=0.0028741;REFB=-0.0117609;REVB=-0.000194645;RO=73;SAF=20;SAR=52;SRF=36;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217642;STB=0.669762;TYPE=snp;VARB=0.0139409;OID=.;OPOS=144107279;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:162:73:90:72:72:52:20:36:37:52:20:51:39 chr7 144546971 . G A 385.62 PASS AO=108;DP=264;FAO=112;FDP=266;FR=.;FRO=154;FSAF=41;FSAR=71;FSRF=60;FSRR=94;FWDB=-0.0155561;FXX=0.00374518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.703;QD=5.79883;RBI=0.0157269;REFB=-0.00780639;REVB=0.00231125;RO=154;SAF=38;SAR=70;SRF=60;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0428558;STB=0.514564;TYPE=snp;VARB=0.0103908;OID=.;OPOS=144546971;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:264:266:154:154:108:112:70:38:60:94:71:41:60:94 chr7 144547130 . G C 185.18 PASS AO=44;DP=92;FAO=44;FDP=92;FR=.;FRO=48;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=14;FSRR=34;FWDB=-0.0161553;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=247.431;QD=8.05116;RBI=0.02279;REFB=-0.0127353;REVB=0.0160746;RO=48;SAF=16;SAR=28;SRF=14;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0747347;STB=0.541466;TYPE=snp;VARB=0.0118469;OID=.;OPOS=144547130;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:48:48:44:44:28:16:14:34:28:16:14:34 chr7 148113623 . ATAGTT A 1096.63 PASS AO=108;DP=135;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011354;FXX=0.105255;HRUN=1;LEN=5;MLLD=251.383;QD=36.8616;RBI=0.015359;REFB=-0.0436414;REVB=0.0103434;RO=0;SAF=56;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.59964e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.00278566;OID=.;OPOS=148113624;OREF=TAGTT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:108:114:119:119:0:56:63:0:0:44:0:56:52:0:0 chr7 148143136 . A G 712.11 PASS AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00156494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8027;QD=37.9791;RBI=0.00418001;REFB=0;REVB=-0.003876;RO=0;SAF=18;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.51788e-05;OID=.;OPOS=148143136;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:75:75:0:0:75:75:57:18:0:0:57:18:0:0 chr7 148481488 . G A 138.06 PASS AO=27;DP=50;FAO=27;FDP=49;FR=.;FRO=22;FSAF=21;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=-0.0119244;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.826;QD=11.2699;RBI=0.038838;REFB=-0.0178237;REVB=0.0369621;RO=21;SAF=21;SAR=6;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116783;STB=0.558237;TYPE=snp;VARB=0.014518;OID=.;OPOS=148481488;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:50:49:21:22:27:27:6:21:14:7:6:21:15:7 chr7 148638572 . G A 3057.23 PASS AO=321;DP=322;FAO=321;FDP=321;FR=.;FRO=0;FSAF=182;FSAR=139;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0538478;FXX=0.00310549;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.4984;QD=38.0964;RBI=0.0704895;REFB=-0.069458;REVB=-0.0454884;RO=1;SAF=182;SAR=139;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00261389;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00021919;OID=.;OPOS=148638572;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:322:321:1:0:321:321:139:182:1:0:139:182:0:0 chr7 148801091 . G A 342.34 PASS AO=38;DP=40;FAO=38;FDP=40;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0106908;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.783;QD=34.2344;RBI=0.0243898;REFB=0.0141673;REVB=-0.0219219;RO=2;SAF=21;SAR=17;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00497733;STB=0.502658;TYPE=snp;VARB=-1.60892e-05;OID=.;OPOS=148801091;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:40:40:2:2:38:38:17:21:1:1:17:21:1:1 chr7 148801658 . C T 556.03 PASS AO=57;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00441996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.202;QD=38.3465;RBI=0.0430658;REFB=0;REVB=0.0428384;RO=0;SAF=37;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000104771;OID=.;OPOS=148801658;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:57:58:0:0:57:58:20:37:0:0:20:38:0:0 chr7 148822810 . C T 1313.67 PASS AO=136;DP=136;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0385722;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.876;QD=38.3552;RBI=0.0400279;REFB=0;REVB=-0.0106965;RO=0;SAF=65;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56186e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.58959e-05;OID=.;OPOS=148822810;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:136:137:0:0:136:137:71:65:0:0:72:65:0:0 chr7 148848358 . G A 645.97 PASS AO=69;DP=71;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0209748;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.522;QD=36.3929;RBI=0.0336829;REFB=-0.0284002;REVB=0.0263552;RO=1;SAF=46;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101673;STB=0.505375;TYPE=snp;VARB=0.000270555;OID=.;OPOS=148848358;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:71:71:1:1:69:70:23:46:1:0:24:46:1:0 chr7 148851213 . G A 914.65 PASS AO=101;DP=104;FAO=101;FDP=104;FR=.;FRO=3;FSAF=48;FSAR=53;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00711011;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.769;QD=35.1788;RBI=0.00865926;REFB=0.0244332;REVB=0.00494259;RO=2;SAF=48;SAR=53;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0175643;STB=0.504105;TYPE=snp;VARB=5.43589e-05;OID=.;OPOS=148851213;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:104:104:2:3:101:101:53:48:0:2:53:48:1:2 chr7 148937136 . C A 100.36 PASS AO=27;DP=68;FAO=27;FDP=65;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=28;FWDB=0.0414072;FXX=0.0441112;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.544;QD=6.17608;RBI=0.041643;REFB=-0.00573741;REVB=-0.00442561;RO=40;SAF=12;SAR=15;SRF=13;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129042;STB=0.609853;TYPE=snp;VARB=0.0064668;OID=.;OPOS=148937136;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:65:40:38:27:27:15:12:13:27:15:12:10:28 chr7 148979649 . G T 533.6 PASS AO=146;DP=333;FAO=147;FDP=334;FR=.;FRO=187;FSAF=46;FSAR=101;FSRF=85;FSRR=102;FWDB=-0.000704325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.616;QD=6.39038;RBI=0.00588892;REFB=-0.0147389;REVB=0.00584665;RO=170;SAF=45;SAR=101;SRF=71;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118366;STB=0.586234;TYPE=snp;VARB=0.0188847;OID=.;OPOS=148979649;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:333:334:170:187:146:147:101:45:71:99:101:46:85:102 chr7 149074599 . AGGGGGGGC AGGGGGC,AGGGGGGGG 169.34 PASS AO=24,17;DP=111;FAO=66,0;FDP=105;FR=.;FRO=39;FSAF=7,0;FSAR=59,0;FSRF=39;FSRR=0;FWDB=0.236713,-0.16388;FXX=0.0540492;HRUN=7,1;LEN=2,1;MLLD=10.4467,108.378;QD=6.45106;RBI=0.265431,0.164775;REFB=-0.0799141,-0.0408056;REVB=-0.120084,-0.0171512;RO=25;SAF=0,17;SAR=24,0;SRF=25;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.890126,0;STB=0.867803,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.133793,0;OID=.,.;OPOS=149074600,149074607;OREF=GG,C;OALT=-,G;OMAPALT=AGGGGGC,AGGGGGGGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:24,17:87:66,0:105:39:7,0:59,0:39:0:57:25:0,17:24,0:25:0 chr7 149112306 . A G 562.95 PASS AO=57;DP=59;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00682628;FXX=0.0333278;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.242;QD=38.8243;RBI=0.0213463;REFB=0;REVB=-0.0202254;RO=0;SAF=20;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.74908e-05;OID=.;OPOS=149112306;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:59:58:0:0:57:58:37:20:0:0:37:21:0:0 chr7 149152770 . A G 33.19 PASS AO=10;DP=31;FAO=10;FDP=31;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=0.0079228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.186;QD=4.28256;RBI=0.0211537;REFB=-0.000455106;REVB=-0.019614;RO=21;SAF=8;SAR=2;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132357;STB=0.581641;TYPE=snp;VARB=0.000861977;OID=.;OPOS=149152770;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:31:31:21:21:10:10:2:8:15:6:2:8:15:6 chr7 149152906 . G A 186.91 PASS AO=49;DP=112;FAO=49;FDP=111;FR=.;FRO=62;FSAF=36;FSAR=13;FSRF=42;FSRR=20;FWDB=0.0154538;FXX=0.00892777;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.61;QD=6.73546;RBI=0.0160108;REFB=-0.0112974;REVB=0.00418636;RO=62;SAF=36;SAR=13;SRF=42;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0703396;STB=0.539493;TYPE=snp;VARB=0.0129627;OID=.;OPOS=149152906;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:111:62:62:49:49:13:36:42:20:13:36:42:20 chr7 149243619 . C T 100.43 PASS AO=37;DP=111;FAO=39;FDP=113;FR=.;FRO=74;FSAF=36;FSAR=3;FSRF=66;FSRR=8;FWDB=0.0397166;FXX=0.0583285;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.1773;QD=3.55501;RBI=0.0682428;REFB=-0.0506705;REVB=-0.0554948;RO=74;SAF=34;SAR=3;SRF=66;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.093657;STB=0.564066;TYPE=snp;VARB=0.0958458;OID=.;OPOS=149243619;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:113:74:74:37:39:3:34:66:8:3:36:66:8 chr7 149317062 . C T 488.04 PASS AO=142;DP=339;FAO=142;FDP=338;FR=.;FRO=196;FSAF=70;FSAR=72;FSRF=79;FSRR=117;FWDB=-0.00222496;FXX=0.00294977;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.4043;QD=5.77562;RBI=0.0028367;REFB=-0.0224688;REVB=-0.00175966;RO=195;SAF=70;SAR=72;SRF=79;SRR=116;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0915277;STB=0.552209;TYPE=snp;VARB=0.0300285;OID=.;OPOS=149317062;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:339:338:195:196:142:142:72:70:79:116:72:70:79:117 chr7 149344105 . A G 593.79 PASS AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0328834;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.029;QD=37.701;RBI=0.033552;REFB=0;REVB=-0.00666488;RO=0;SAF=5;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.9168e-05;OID=.;OPOS=149344105;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:63:63:0:0:63:63:58:5:0:0:58:5:0:0 chr7 149426305 . G GC 198.97 PASS AO=24;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.033762;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=18.8675;QD=27.444;RBI=0.136911;REFB=0;REVB=0.132683;RO=3;SAF=6;SAR=18;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0224923;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00998637;OID=.;OPOS=149426306;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:24:29:29:29:0:8:21:0:0:17:3:6:18:1:2 chr7 149427409 . T G 612 PASS AO=65;DP=66;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0210031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.592;QD=36.5374;RBI=0.0246375;REFB=-0.0240309;REVB=0.0128793;RO=1;SAF=44;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0219605;STB=0.511624;TYPE=snp;VARB=7.10407e-05;OID=.;OPOS=149427409;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:66:67:1:1:65:66:21:44:0:1:21:45:0:1 chr7 149427569 . C A 221.61 PASS AO=62;DP=150;FAO=63;FDP=151;FR=.;FRO=88;FSAF=39;FSAR=24;FSRF=45;FSRR=43;FWDB=-0.007862;FXX=0.00657851;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.308;QD=5.87033;RBI=0.0157626;REFB=-0.0327889;REVB=-0.0136619;RO=85;SAF=38;SAR=24;SRF=43;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112859;STB=0.564464;TYPE=snp;VARB=0.0297516;OID=.;OPOS=149427569;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:151:85:88:62:63:24:38:43:42:24:39:45:43 chr7 149430578 . TG T 240.72 PASS AO=22;DP=42;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.067482;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.2428;QD=25.3392;RBI=0.113624;REFB=0;REVB=-0.0914148;RO=1;SAF=8;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0.465517;SSEP=0;SSSB=-0.0542958;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00234672;OID=.;OPOS=149430579;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:22:25:38:38:0:17:21:0:0:21:1:8:14:1:0 chr7 149431022 . CG C 123.1 PASS AO=12;DP=24;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.323171;FXX=0.0454339;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.0475;QD=23.4473;RBI=0.368985;REFB=0;REVB=0.178073;RO=7;SAF=7;SAR=5;SRF=5;SRR=2;SSEN=0.266975;SSEP=0;SSSB=-0.0892086;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0400199;OID=.;OPOS=149431023;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:12:21:21:21:0:13:8:0:0:11:7:7:5:5:2 chr7 149461715 . GC G 486.78 PASS AO=56;DP=78;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0401659;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.8549;QD=27.0432;RBI=0.385743;REFB=0;REVB=0.383646;RO=14;SAF=21;SAR=35;SRF=0;SRR=14;SSEN=0.434251;SSEP=0;SSSB=0.156281;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0121774;OID=.;OPOS=149461716;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:56:71:72:72:0:23:49:0:0:44:14:21:35:0:14 chr7 149474082 . TG T 37.96 PASS AO=50;DP=165;FAO=51;FDP=149;FR=.;FRO=98;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=62;FSRR=36;FWDB=0.142327;FXX=0.0448689;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.71139;QD=1.01896;RBI=0.147254;REFB=-0.128026;REVB=-0.0377716;RO=86;SAF=22;SAR=28;SRF=55;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218795;STB=0.617816;TYPE=del;VARB=0.150286;OID=.;OPOS=149474083;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:50:155:51:149:98:23:28:62:36:37:86:22:28:55:31 chr7 149481994 . G T 99.43 PASS AO=18;DP=32;FAO=19;FDP=33;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.00839205;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.655;QD=12.0525;RBI=0.016231;REFB=-0.0284729;REVB=0.0138931;RO=14;SAF=5;SAR=13;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.299453;STB=0.643409;TYPE=snp;VARB=0.015914;OID=.;OPOS=149481994;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:32:33:14:14:18:19:13:5:9:5:13:6:9:5 chr7 149500817 . GC G 23.6 PASS AO=10;DP=25;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.224016;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.3237;QD=3.93412;RBI=0.226499;REFB=-0.0633266;REVB=-0.0334493;RO=10;SAF=2;SAR=8;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.452485;STB=0.586311;TYPE=del;VARB=0.120293;OID=.;OPOS=149500818;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:10:24:11:24:13:5:6:8:5:23:10:2:8:7:3 chr7 149503843 . T G 34.74 PASS AO=14;DP=48;FAO=14;FDP=51;FR=.;FRO=37;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=-0.0552266;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.5095;QD=2.72476;RBI=0.0602168;REFB=-0.00383794;REVB=-0.0240018;RO=34;SAF=5;SAR=9;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267411;STB=0.669184;TYPE=snp;VARB=0.00537208;OID=.;OPOS=149503843;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:48:51:34:37:14:14:9:5:20:14:9:5:22:15 chr7 149506211 . G GC 582.43 PASS AO=72;DP=89;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.273726;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=19.6666;QD=28.0691;RBI=0.273727;REFB=-0.0091444;REVB=0.000836038;RO=15;SAF=32;SAR=40;SRF=14;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157211;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00866449;OID=.;OPOS=149506212;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:72:89:83:83:0:40:43:0:0:46:15:32:40:14:1 chr7 149511985 . A G 13.09 PASS AO=5;DP=24;FAO=5;FDP=24;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=-0.120026;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.329;QD=2.18171;RBI=0.120515;REFB=0.000292838;REVB=-0.0108423;RO=17;SAF=2;SAR=3;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214099;STB=0.571157;TYPE=snp;VARB=-0.00317166;OID=.;OPOS=149511985;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:24:24:17:19:5:5:3:2:4:13:3:2:6:13 chr7 149513152 . C T 51.06 PASS AO=7;DP=10;FAO=7;FDP=10;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00661643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.725;QD=20.4253;RBI=0.00905831;REFB=0.0534173;REVB=0.00618675;RO=3;SAF=1;SAR=6;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168825;STB=0.599677;TYPE=snp;VARB=-0.0362009;OID=.;OPOS=149513152;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:10:10:3:3:7:7:6:1:1:2:6:1:1:2 chr7 149513560 . T C 63.19 PASS AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=-0.038591;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.554;QD=9.72164;RBI=0.0442606;REFB=-0.00174318;REVB=-0.0216733;RO=14;SAF=4;SAR=9;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0234553;STB=0.546694;TYPE=snp;VARB=0.00116516;OID=.;OPOS=149513560;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:27:26:14:13:13:13:9:4:4:10:9:4:3:10 chr7 149515103 . C T 50.29 PASS AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=-0.0334455;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.013;QD=8.38187;RBI=0.0346978;REFB=-0.0129243;REVB=0.00923764;RO=13;SAF=2;SAR=9;SRF=2;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0452513;STB=0.526269;TYPE=snp;VARB=0.00575733;OID=.;OPOS=149515103;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:24:24:13:13:11:11:9:2:2:11:9:2:2:11 chr7 149515775 . C G 25.89 PASS AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.00334306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.917;QD=8.63083;RBI=0.0345344;REFB=0.0104916;REVB=0.0343723;RO=7;SAF=1;SAR=4;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112423;STB=0.571121;TYPE=snp;VARB=-0.010326;OID=.;OPOS=149515775;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:12:12:7:7:5:5:4:1:2:5:4:1:2:5 chr7 149515796 . C T 21.9 PASS AO=4;DP=11;FAO=4;FDP=10;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=-0.0659827;FXX=0.0908265;HRUN=4;LEN=1;MLLD=118.032;QD=8.75969;RBI=0.0659904;REFB=0.00749678;REVB=-0.00100697;RO=6;SAF=1;SAR=3;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113038;STB=0.5711;TYPE=snp;VARB=-0.00876991;OID=.;OPOS=149515796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:11:10:6:6:4:4:3:1:1:5:3:1:1:5 chr7 149516486 . A G 77.52 PASS AO=17;DP=44;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=6;FSRR=21;FWDB=0.00118323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.647;QD=6.59705;RBI=0.0110071;REFB=-0.0388534;REVB=0.0109433;RO=27;SAF=3;SAR=14;SRF=6;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0774905;STB=0.519461;TYPE=snp;VARB=0.0513396;OID=.;OPOS=149516486;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:44:47:27:27:17:20:14:3:6:21:16:4:6:21 chr7 149516881 . G T 140.3 PASS AO=33;DP=70;FAO=33;FDP=70;FR=.;FRO=37;FSAF=24;FSAR=9;FSRF=27;FSRR=10;FWDB=-0.0080473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.503;QD=8.0169;RBI=0.0323756;REFB=-0.0414456;REVB=0.0313595;RO=36;SAF=24;SAR=9;SRF=26;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00591407;STB=0.501638;TYPE=snp;VARB=0.0449525;OID=.;OPOS=149516881;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:36:37:33:33:9:24:26:10:9:24:27:10 chr7 149518961 . T C 169.72 PASS AO=67;DP=190;FAO=64;FDP=188;FR=.;FRO=124;FSAF=9;FSAR=55;FSRF=20;FSRR=104;FWDB=0.0217393;FXX=0.0105258;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7444;QD=3.61108;RBI=0.072854;REFB=0.000993377;REVB=0.069535;RO=123;SAF=11;SAR=56;SRF=20;SRR=103;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00327;STB=0.52709;TYPE=snp;VARB=-0.000740399;OID=.;OPOS=149518961;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:188:123:124:67:64:56:11:20:103:55:9:20:104 chr7 149519184 . C T 55.22 PASS AO=9;DP=14;FAO=9;FDP=14;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.00590585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.005;QD=15.7763;RBI=0.0144467;REFB=0.0220679;REVB=-0.0131844;RO=5;SAF=3;SAR=6;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0970608;STB=0.555438;TYPE=snp;VARB=-0.00972998;OID=.;OPOS=149519184;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:14:14:5:5:9:9:6:3:1:4:6:3:1:4 chr7 149521183 . G A 190.68 PASS AO=43;DP=87;FAO=44;FDP=90;FR=.;FRO=46;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=30;FSRR=16;FWDB=-0.0364262;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.325;QD=8.47458;RBI=0.0394328;REFB=-0.0338195;REVB=0.0151023;RO=44;SAF=21;SAR=22;SRF=28;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13462;STB=0.588816;TYPE=snp;VARB=0.0324502;OID=.;OPOS=149521183;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:90:44:46:43:44:22:21:28:16:23:21:30:16 chr7 149521544 . C T 62.97 PASS AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.077805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.835;QD=7.40847;RBI=0.0791893;REFB=-0.0190741;REVB=-0.0147419;RO=19;SAF=9;SAR=6;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123511;STB=0.571332;TYPE=snp;VARB=0.0259376;OID=.;OPOS=149521544;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:34:34:19:19:15:15:6:9:9:10:6:9:9:10 chr7 149522162 . G T 304.26 PASS AO=70;DP=163;FAO=77;FDP=166;FR=.;FRO=89;FSAF=39;FSAR=38;FSRF=60;FSRR=29;FWDB=0.0195195;FXX=0.00598767;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.917;QD=7.33159;RBI=0.0210669;REFB=-0.0102121;REVB=0.00792489;RO=87;SAF=35;SAR=35;SRF=58;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166447;STB=0.590095;TYPE=snp;VARB=0.0185272;OID=.;OPOS=149522162;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:166:87:89:70:77:35:35:58:29:38:39:60:29 chr7 149522366 . T G 143.23 PASS AO=29;DP=53;FAO=29;FDP=53;FR=.;FRO=24;FSAF=26;FSAR=3;FSRF=22;FSRR=2;FWDB=-0.0272102;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.6782;QD=10.8096;RBI=0.0435544;REFB=-0.00395441;REVB=-0.0340087;RO=24;SAF=26;SAR=3;SRF=22;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0461961;STB=0.525531;TYPE=snp;VARB=0.00167656;OID=.;OPOS=149522366;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:53:53:24:24:29:29:3:26:22:2:3:26:22:2 chr7 149523277 . A G 236.02 PASS AO=58;DP=123;FAO=58;FDP=123;FR=.;FRO=65;FSAF=18;FSAR=40;FSRF=27;FSRR=38;FWDB=-0.0184808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.984;QD=7.67548;RBI=0.0340542;REFB=-0.0206088;REVB=-0.0286033;RO=65;SAF=18;SAR=40;SRF=27;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110938;STB=0.561776;TYPE=snp;VARB=0.0251391;OID=.;OPOS=149523277;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:65:65:58:58:40:18:27:38:40:18:27:38 chr7 149528262 . C T 124.26 PASS AO=32;DP=73;FAO=32;FDP=73;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=15;FWDB=0.0177193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.3873;QD=6.80853;RBI=0.0486105;REFB=-0.0243701;REVB=0.045266;RO=41;SAF=14;SAR=18;SRF=26;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193816;STB=0.60907;TYPE=snp;VARB=0.0398866;OID=.;OPOS=149528262;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:41:41:32:32:18:14:26:15:18:14:26:15 chr7 149530894 . G A 156.54 PASS AO=37;DP=78;FAO=37;FDP=78;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=29;FSRR=12;FWDB=-0.00139834;FXX=0.0126566;HRUN=3;LEN=1;MLLD=153.812;QD=8.02786;RBI=0.0019179;REFB=-0.0183144;REVB=-0.00131262;RO=41;SAF=17;SAR=20;SRF=29;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230915;STB=0.628349;TYPE=snp;VARB=0.00994016;OID=.;OPOS=149530894;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:41:41:37:37:20:17:29:12:20:17:29:12 chr7 149556518 . C T 300.68 PASS AO=66;DP=126;FAO=66;FDP=126;FR=.;FRO=60;FSAF=54;FSAR=12;FSRF=30;FSRR=30;FWDB=0.0142775;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.974;QD=9.54532;RBI=0.0158305;REFB=-0.0136532;REVB=-0.00683776;RO=59;SAF=54;SAR=12;SRF=30;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.336874;STB=0.692242;TYPE=snp;VARB=0.0112636;OID=.;OPOS=149556518;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:59:60:66:66:12:54:30:29:12:54:30:30 chr7 149558409 . G C 78.7 PASS AO=13;DP=21;FAO=13;FDP=21;FR=.;FRO=8;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=-0.0221341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.147;QD=14.9903;RBI=0.053086;REFB=0.00468336;REVB=0.0482515;RO=8;SAF=9;SAR=4;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.37587;STB=0.71191;TYPE=snp;VARB=-0.0017228;OID=.;OPOS=149558409;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:21:21:8:8:13:13:4:9:1:7:4:9:1:7 chr7 149559273 . C T 248.24 PASS AO=55;DP=109;FAO=56;FDP=110;FR=.;FRO=54;FSAF=21;FSAR=35;FSRF=22;FSRR=32;FWDB=0.0105049;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.717;QD=9.02697;RBI=0.0155284;REFB=-0.0137684;REVB=0.0114358;RO=54;SAF=20;SAR=35;SRF=22;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0418304;STB=0.516821;TYPE=snp;VARB=0.019104;OID=.;OPOS=149559273;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:110:54:54:55:56:35:20:22:32:35:21:22:32 chr7 149559465 . C T 197.54 PASS AO=42;DP=80;FAO=42;FDP=80;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.0557751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.8436;QD=9.87682;RBI=0.0557952;REFB=-0.0187723;REVB=0.00149831;RO=37;SAF=19;SAR=23;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.052012;STB=0.535186;TYPE=snp;VARB=0.0283748;OID=.;OPOS=149559465;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:37:38:42:42:23:19:19:18:23:19:20:18 chr7 149576818 . A G 73.45 PASS AO=15;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=0.0167928;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.852;QD=9.7933;RBI=0.0187017;REFB=-0.0369541;REVB=0.00823135;RO=15;SAF=4;SAR=11;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0781246;STB=0.544322;TYPE=snp;VARB=0.0351576;OID=.;OPOS=149576818;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:30:30:15:15:15:15:11:4:3:12:11:4:3:12 chr7 150028958 . A G 1277.96 PASS AO=134;DP=134;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=112;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0139098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.5;QD=38.1481;RBI=0.0147934;REFB=0;REVB=0.00503588;RO=0;SAF=112;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.27107e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.42613e-06;OID=.;OPOS=150028958;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:134:134:0:0:134:134:22:112:0:0:22:112:0:0 chr7 150034184 . T C 195.71 PASS AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0383083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.614;QD=39.1415;RBI=0.039978;REFB=0;REVB=-0.0114331;RO=0;SAF=13;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00018875;OID=.;OPOS=150034184;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:20:20:0:0:20:20:7:13:0:0:7:13:0:0 chr7 150034378 . A G 241.48 PASS AO=27;DP=32;FAO=29;FDP=31;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0555071;FXX=0.0312402;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.5787;QD=31.1584;RBI=0.0579365;REFB=-0.0904774;REVB=-0.0166012;RO=2;SAF=20;SAR=7;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0392413;STB=0.52224;TYPE=snp;VARB=0.00201771;OID=.;OPOS=150034378;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:32:31:2:2:27:29:7:20:1:1:7:22:1:1 chr7 150035183 . C T 429.81 PASS AO=51;DP=57;FAO=52;FDP=58;FR=.;FRO=6;FSAF=9;FSAR=43;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0764957;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=276.091;QD=29.642;RBI=0.0766893;REFB=-0.166514;REVB=0.00544671;RO=4;SAF=9;SAR=42;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170648;STB=0.554816;TYPE=snp;VARB=0.00109492;OID=.;OPOS=150035183;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:57:58:4:6:51:52:42:9:1:3:43:9:3:3 chr7 150035459 . T G 290.28 PASS AO=28;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0370508;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.2531;QD=38.7046;RBI=0.0382144;REFB=0;REVB=-0.00935861;RO=1;SAF=12;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0372036;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000608372;OID=.;OPOS=150035459;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:29:30:1:0:28:30:16:12:1:0:16:14:0:0 chr7 150035500 . C G 195.66 PASS AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0296631;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=79.4725;QD=39.1312;RBI=0.0389401;REFB=0;REVB=-0.0252276;RO=0;SAF=8;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000775363;OID=.;OPOS=150035500;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:20:20:0:0:20:20:12:8:0:0:12:8:0:0 chr7 150035526 . T G 107.82 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0333623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.108;QD=35.9384;RBI=0.0416858;REFB=0;REVB=-0.0249932;RO=0;SAF=3;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000927419;OID=.;OPOS=150035526;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:9:3:0:0:9:3:0:0 chr7 150037660 . A G 170.46 PASS AO=15;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=2;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0250528;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.1494;QD=37.8792;RBI=0.0502119;REFB=0;REVB=0.0435155;RO=0;SAF=1;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00168401;OID=.;OPOS=150037660;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:18:0:0:15:18:14:1:0:0:16:2:0:0 chr7 150066845 . TG T 78.43 PASS AO=22;DP=48;FAO=29;FDP=46;FR=.;FRO=17;FSAF=24;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.057783;FXX=0.0212721;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.7291;QD=6.82041;RBI=0.060638;REFB=-0.137734;REVB=0.0183872;RO=20;SAF=18;SAR=4;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0.309091;SSSB=0.251106;STB=0.628721;TYPE=del;VARB=0.168785;OID=.;OPOS=150066846;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:22:45:29:46:17:24:5:10:7:24:20:18:4:12:8 chr7 150068371 . T C 386.87 PASS AO=34;DP=34;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0501959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.51;QD=38.6872;RBI=0.051572;REFB=0;REVB=0.0118342;RO=0;SAF=11;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000150447;OID=.;OPOS=150068371;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:34:40:0:0:34:40:23:11:0:0:24:16:0:0 chr7 150068605 . G A 528.88 PASS AO=54;DP=58;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0992077;FXX=0.0508388;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.1287;QD=37.7771;RBI=0.11944;REFB=0;REVB=0.0665116;RO=0;SAF=17;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.08382e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000660089;OID=.;OPOS=150068605;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:58:56:0:0:54:56:37:17:0:0:38:18:0:0 chr7 150068620 . C T 344.09 PASS AO=30;DP=54;FAO=49;FDP=53;FR=.;FRO=4;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.109043;FXX=0.0185151;HRUN=5;LEN=1;MLLD=85.8421;QD=25.9692;RBI=0.115814;REFB=-0.0895622;REVB=0.0390177;RO=0;SAF=8;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.519622;TYPE=snp;VARB=0.0129555;OID=.;OPOS=150068620;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:35:53:0:4:30:49:22:8:0:0:24:25:1:3 chr7 150068933 . T C 86.75 PASS AO=8;DP=8;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0502922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.0147;QD=38.5552;RBI=0.0512939;REFB=0;REVB=0.0100877;RO=0;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.58669e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00202376;OID=.;OPOS=150068933;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:9:0:0:8:9:6:2:0:0:7:2:0:0 chr7 150069009 . C G 12.29 PASS AO=2;DP=12;FAO=2;FDP=12;FR=.,HEALED;FRO=9;FSAF=1;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0864765;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=34.7627;QD=4.09785;RBI=0.12788;REFB=-0.0269259;REVB=-0.0942075;RO=8;SAF=1;SAR=1;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128706;STB=0.635105;TYPE=snp;VARB=0.118196;OID=.;OPOS=150069009;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:12:12:8:9:2:2:1:1:3:5:1:1:3:6 chr7 150070630 . A G 254.96 PASS AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201707;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.3497;QD=37.7719;RBI=0.0333011;REFB=0;REVB=0.0264974;RO=0;SAF=2;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.18567e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000600071;OID=.;OPOS=150070630;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:27:27:0:0:27:27:25:2:0:0:25:2:0:0 chr7 150070663 . T C 231.59 PASS AO=24;DP=24;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00346894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.4911;QD=37.0544;RBI=0.083845;REFB=0;REVB=0.0837732;RO=0;SAF=2;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.48349e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000903091;OID=.;OPOS=150070663;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:24:25:0:0:24:25:22:2:0:0:23:2:0:0 chr7 150070814 . G A 1481.69 PASS AO=155;DP=156;FAO=156;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189752;FXX=0.0126574;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.2649;QD=37.9921;RBI=0.0373555;REFB=-0.0316724;REVB=0.0321772;RO=1;SAF=85;SAR=70;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00556424;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00121578;OID=.;OPOS=150070814;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:156:156:1:0:155:156:70:85:1:0:71:85:0:0 chr7 150093701 . A C 568.91 PASS AO=59;DP=59;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104064;FXX=0.0624902;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.19;QD=37.9272;RBI=0.0275472;REFB=0;REVB=-0.0255059;RO=0;SAF=27;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.96591e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000307761;OID=.;OPOS=150093701;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:59:60:0:0:59:60:32:27:0:0:32:28:0:0 chr7 150171710 . T C 361.29 PASS AO=107;DP=260;FAO=107;FDP=260;FR=.;FRO=153;FSAF=47;FSAR=60;FSRF=76;FSRR=77;FWDB=-0.0385833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.941;QD=5.55827;RBI=0.0389425;REFB=-0.0100763;REVB=0.00527714;RO=153;SAF=47;SAR=60;SRF=76;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0608774;STB=0.534041;TYPE=snp;VARB=0.00944595;OID=.;OPOS=150171710;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:260:260:153:153:107:107:60:47:76:77:60:47:76:77 chr7 150217248 . A G 409.02 PASS AO=99;DP=207;FAO=100;FDP=208;FR=.;FRO=108;FSAF=38;FSAR=62;FSRF=53;FSRR=55;FWDB=-0.0153053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.534;QD=7.86568;RBI=0.018937;REFB=-0.0147777;REVB=-0.0111515;RO=107;SAF=37;SAR=62;SRF=52;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109319;STB=0.559266;TYPE=snp;VARB=0.0180711;OID=.;OPOS=150217248;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:208:107:108:99:100:62:37:52:55:62:38:53:55 chr7 150217335 . G T 283.74 PASS AO=76;DP=181;FAO=76;FDP=174;FR=.;FRO=98;FSAF=26;FSAR=50;FSRF=37;FSRR=61;FWDB=0.0160287;FXX=0.0491776;HRUN=3;LEN=1;MLLD=134.871;QD=6.52264;RBI=0.0260109;REFB=-0.00553706;REVB=-0.0204853;RO=81;SAF=26;SAR=50;SRF=36;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102161;STB=0.521863;TYPE=snp;VARB=0.00552422;OID=.;OPOS=150217335;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:174:81:98:76:76:50:26:36:45:50:26:37:61 chr7 150269542 . G T 261.35 PASS AO=71;DP=169;FAO=73;FDP=171;FR=.;FRO=98;FSAF=28;FSAR=45;FSRF=36;FSRR=62;FWDB=0.00619253;FXX=0.01156;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.651;QD=6.1135;RBI=0.00785693;REFB=-0.0139371;REVB=-0.00483569;RO=96;SAF=28;SAR=43;SRF=36;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.020953;STB=0.509868;TYPE=snp;VARB=0.0224654;OID=.;OPOS=150269542;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:171:96:98:71:73:43:28:36:60:45:28:36:62 chr7 150324825 . C T 177.22 PASS AO=33;DP=55;FAO=33;FDP=55;FR=.;FRO=22;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.000589875;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=126.347;QD=12.889;RBI=0.00125564;REFB=-0.0307581;REVB=-0.00110846;RO=21;SAF=18;SAR=15;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0528535;STB=0.518384;TYPE=snp;VARB=0.00982312;OID=.;OPOS=150324825;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:55:55:21:22:33:33:15:18:13:8:15:18:13:9 chr7 150326191 . A G 114.3 PASS AO=28;DP=62;FAO=28;FDP=62;FR=.;FRO=34;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=11;FWDB=-0.0065864;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.784;QD=7.37418;RBI=0.00699367;REFB=-0.00586175;REVB=-0.00235173;RO=34;SAF=19;SAR=9;SRF=23;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00233611;STB=0.501318;TYPE=snp;VARB=0.00857121;OID=.;OPOS=150326191;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:34:34:28:28:9:19:23:11:9:19:23:11 chr7 150327024 . C T 239.5 PASS AO=59;DP=127;FAO=59;FDP=126;FR=.;FRO=67;FSAF=43;FSAR=16;FSRF=52;FSRR=15;FWDB=-0.0294396;FXX=0.0156238;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.2692;QD=7.60309;RBI=0.0388854;REFB=-0.0295141;REVB=-0.0254044;RO=54;SAF=43;SAR=16;SRF=42;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0554247;STB=0.532762;TYPE=snp;VARB=0.0383755;OID=.;OPOS=150327024;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:126:54:67:59:59:16:43:42:12:16:43:52:15 chr7 150488616 . A G 639.74 PASS AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0282943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.668;QD=38.1937;RBI=0.0283455;REFB=0;REVB=0.00170337;RO=0;SAF=29;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.75851e-05;OID=.;OPOS=150488616;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:67:67:0:0:67:67:38:29:0:0:38:29:0:0 chr7 150490376 . C T 423.64 PASS AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0641688;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.3517;QD=37.6565;RBI=0.0648215;REFB=0;REVB=-0.00917542;RO=0;SAF=16;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.49331e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000990609;OID=.;OPOS=150490376;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:45:45:0:0:45:45:29:16:0:0:29:16:0:0 chr7 150491084 . T G 170.86 PASS AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00451766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.054;QD=37.9686;RBI=0.0439118;REFB=0;REVB=0.0436788;RO=0;SAF=12;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000864863;OID=.;OPOS=150491084;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:18:0:0:18:18:6:12:0:0:6:12:0:0 chr7 150498809 . G A 63.7 PASS AO=9;DP=12;FAO=9;FDP=12;FR=.;FRO=3;FSAF=0;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.1883;QD=21.235;RBI=0.0423126;REFB=0.0195865;REVB=0.0423126;RO=3;SAF=0;SAR=9;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00377335;OID=.;OPOS=150498809;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:12:12:3:3:9:9:9:0:0:3:9:0:0:3 chr7 150500520 . C T 34.21 PASS AO=11;DP=35;FAO=11;FDP=35;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=0.0236546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4839;QD=3.90957;RBI=0.0290048;REFB=-0.0190216;REVB=-0.0167851;RO=24;SAF=7;SAR=4;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.332306;STB=0.699657;TYPE=snp;VARB=0.0352736;OID=.;OPOS=150500520;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:35:35:24:24:11:11:4:7:8:16:4:7:8:16 chr7 150500729 . A G 497.85 PASS AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216947;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.958;QD=37.5735;RBI=0.0759393;REFB=0;REVB=0.0727744;RO=0;SAF=39;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00040288;OID=.;OPOS=150500729;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:53:53:0:0:53:53:14:39:0:0:14:39:0:0 chr7 150501455 . G T 302.51 PASS AO=69;DP=147;FAO=71;FDP=143;FR=.;FRO=72;FSAF=41;FSAR=30;FSRF=23;FSRR=49;FWDB=-0.00401267;FXX=0.0402658;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.118;QD=8.46174;RBI=0.009181;REFB=-0.00996617;REVB=0.00825768;RO=77;SAF=40;SAR=29;SRF=23;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.262813;STB=0.6278;TYPE=snp;VARB=0.00931374;OID=.;OPOS=150501455;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:143:77:72:69:71:29:40:23:54:30:41:23:49 chr7 150501516 . A G 1659.43 PASS AO=148;DP=151;FAO=173;FDP=173;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0109178;FXX=0.0114279;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.5299;QD=38.3682;RBI=0.0117688;REFB=0;REVB=-0.00439387;RO=0;SAF=79;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.86736e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000280724;OID=.;OPOS=150501516;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:151:173:0:0:148:173:69:79:0:0:87:86:0:0 chr7 150553605 . C T 261.17 PASS AO=64;DP=135;FAO=65;FDP=141;FR=.;FRO=76;FSAF=34;FSAR=31;FSRF=39;FSRR=37;FWDB=-0.0078503;FXX=0.0275843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.2304;QD=7.40913;RBI=0.0197839;REFB=-0.0426708;REVB=0.0181597;RO=67;SAF=34;SAR=30;SRF=34;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0220551;STB=0.505354;TYPE=snp;VARB=0.0567044;OID=.;OPOS=150553605;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:141:67:76:64:65:30:34:34:33:31:34:39:37 chr7 150556002 . T C 179.22 PASS AO=49;DP=116;FAO=50;FDP=116;FR=.;FRO=66;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=23;FSRR=43;FWDB=-0.0219476;FXX=0.00854628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.483;QD=6.18011;RBI=0.0267088;REFB=-0.00187655;REVB=-0.0152205;RO=66;SAF=23;SAR=26;SRF=24;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109553;STB=0.586173;TYPE=snp;VARB=0.00164914;OID=.;OPOS=150556002;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:66:66:49:50:26:23:24:42:25:25:23:43 chr7 150556055 . C G 368.66 PASS AO=72;DP=73;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.161297;FXX=0.16214;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.452;QD=23.7844;RBI=0.192383;REFB=-0.143463;REVB=0.104855;RO=1;SAF=15;SAR=57;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0304803;STB=0.516124;TYPE=snp;VARB=0.025416;OID=.;OPOS=150556055;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:73:62:1:1:72:61:57:15:1:0:46:15:1:0 chr7 150557578 . G A 140.58 PASS AO=34;DP=73;FAO=34;FDP=73;FR=.;FRO=39;FSAF=8;FSAR=26;FSRF=11;FSRR=28;FWDB=-0.00268133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.113;QD=7.70293;RBI=0.00767019;REFB=-0.0606877;REVB=0.00718626;RO=39;SAF=8;SAR=26;SRF=11;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0595043;STB=0.533457;TYPE=snp;VARB=0.0594751;OID=.;OPOS=150557578;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:39:39:34:34:26:8:11:28:26:8:11:28 chr7 150644597 . AG A 478.46 PASS AO=61;DP=73;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.161392;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=18.3532;QD=26.5811;RBI=0.299925;REFB=-0.0514651;REVB=0.2528;RO=8;SAF=55;SAR=6;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0.206434;SSSB=0.147268;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0144198;OID=.;OPOS=150644598;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:61:71:72:72:0:63:9:0:0:36:8:55:6:5:3 chr7 150645534 . T G 103.76 PASS AO=27;DP=63;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=11;FWDB=0.00994923;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.568;QD=6.58803;RBI=0.0303302;REFB=0.00441703;REVB=0.0286519;RO=36;SAF=15;SAR=12;SRF=25;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144835;STB=0.58176;TYPE=snp;VARB=-0.00802043;OID=.;OPOS=150645534;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:36:36:27:27:12:15:25:11:12:15:25:11 chr7 150648198 . A G 35.55 PASS AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0167123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.1094;QD=5.92505;RBI=0.0194328;REFB=-0.0685897;REVB=-0.00991636;RO=11;SAF=2;SAR=7;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.255081;STB=0.713775;TYPE=snp;VARB=0.0996561;OID=.;OPOS=150648198;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:23:24:11:15:9:9:7:2:5:6:7:2:8:7 chr7 150693568 . GC G 34.15 PASS AO=8;DP=39;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.306953;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=12.6444;QD=4.01801;RBI=0.321543;REFB=0.0333669;REVB=-0.0957572;RO=12;SAF=3;SAR=5;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0.826087;SSSB=-0.0434779;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.00644423;OID=.;OPOS=150693569;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:8:33:16:34:18:8:8:9:9:33:12:3:5:5:7 chr7 150742390 . C T 205.16 PASS AO=55;DP=126;FAO=55;FDP=126;FR=.;FRO=71;FSAF=18;FSAR=37;FSRF=20;FSRR=51;FWDB=0.0106082;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.444;QD=6.51297;RBI=0.0118239;REFB=-0.00453909;REVB=-0.0052221;RO=68;SAF=18;SAR=37;SRF=19;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0551039;STB=0.529755;TYPE=snp;VARB=0.0140973;OID=.;OPOS=150742390;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:68:71:55:55:37:18:19:49:37:18:20:51 chr7 150746338 . C T 169.77 PASS AO=29;DP=44;FAO=29;FDP=45;FR=.;FRO=16;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.036539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.5442;QD=15.0904;RBI=0.0380049;REFB=-0.0237469;REVB=-0.0104535;RO=14;SAF=16;SAR=13;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0734172;STB=0.540679;TYPE=snp;VARB=0.0108793;OID=.;OPOS=150746338;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:44:45:14:16:29:29:13:16:6:8:13:16:7:9 chr7 150752608 . T G 137.19 PASS AO=38;DP=92;FAO=38;FDP=92;FR=.;FRO=54;FSAF=10;FSAR=28;FSRF=14;FSRR=40;FWDB=-0.0103825;FXX=0.0107515;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.5923;QD=5.96472;RBI=0.0601244;REFB=-0.00418489;REVB=0.0592212;RO=54;SAF=10;SAR=28;SRF=14;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00523175;STB=0.502957;TYPE=snp;VARB=0.0108809;OID=.;OPOS=150752608;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:54:54:38:38:28:10:14:40:28:10:14:40 chr7 150761314 . G A 18.71 PASS AO=5;DP=17;FAO=5;FDP=17;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.0261287;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=136.635;QD=4.40252;RBI=0.0469506;REFB=-0.0240915;REVB=-0.0390084;RO=12;SAF=4;SAR=1;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.356344;STB=0.735816;TYPE=snp;VARB=0.0455739;OID=.;OPOS=150761314;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:17:17:12:12:5:5:1:4:6:6:1:4:6:6 chr7 150761808 . G C 72.3 PASS AO=6;DP=21;FAO=8;FDP=18;FR=.,HEALED;FRO=6;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.0183521;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=29.9514;QD=16.0674;RBI=0.0586214;REFB=-0.043498;REVB=0.0556746;RO=6;SAF=2;SAR=4;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.513504;STB=0.799313;TYPE=snp;VARB=0.0695323;OID=.;OPOS=150761808;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:18:18:6:6:6:8:4:2:6:0:6:2:6:0 chr7 150763655 . T A 73.84 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0480921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.706;QD=36.9178;RBI=0.110954;REFB=0;REVB=0.0999892;RO=0;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.58669e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00174121;OID=.;OPOS=150763655;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:6:2:0:0:6:2:0:0 chr7 150765065 . T C 388.92 PASS AO=101;DP=222;FAO=101;FDP=221;FR=.;FRO=120;FSAF=48;FSAR=53;FSRF=63;FSRR=57;FWDB=-0.0188514;FXX=0.0045043;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.408;QD=7.03922;RBI=0.0306273;REFB=-0.0181598;REVB=-0.0241383;RO=120;SAF=48;SAR=53;SRF=63;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0487723;STB=0.527004;TYPE=snp;VARB=0.0203393;OID=.;OPOS=150765065;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:221:120:120:101:101:53:48:63:57:53:48:63:57 chr7 150768786 . G A 21.81 PASS AO=7;DP=26;FAO=7;FDP=25;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.0358228;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.3025;QD=3.49015;RBI=0.0361451;REFB=-0.00972894;REVB=-0.00481566;RO=17;SAF=4;SAR=3;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0475485;STB=0.511595;TYPE=snp;VARB=0.0863383;OID=.;OPOS=150768786;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:26:25:17:18:7:7:3:4:9:8:3:4:10:8 chr7 150773807 . AC A,TC 226.38 PASS AO=17,13;DP=60;FAO=27,14;FDP=43;FR=.;FRO=2;FSAF=27,11;FSAR=0,3;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0620002,0.0105788;FXX=0.218142;HRUN=4,2;LEN=1,1;MLLD=11.7034,123.432;QD=21.0587;RBI=0.0632141,0.0426292;REFB=-0.0556385,-0.00345807;REVB=0.0123288,0.0412958;RO=3;SAF=17,10;SAR=0,3;SRF=3;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0.6,0;SSSB=0,-0.118166;STB=0.999268,0.549925;TYPE=del,snp;VARB=0.0424764,0.0102042;OID=.,.;OPOS=150773808,150773807;OREF=C,A;OALT=-,T;OMAPALT=A,TC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:48:39:43:3:2:17,13:27,14:0,3:17,10:3:0:0,3:27,11:1:1 chr7 150873754 . G A 61.64 PASS AO=21;DP=63;FAO=21;FDP=63;FR=.;FRO=42;FSAF=2;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=30;FWDB=-0.0164491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.9946;QD=3.91333;RBI=0.0169577;REFB=-0.0252767;REVB=0.00412185;RO=41;SAF=2;SAR=19;SRF=11;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.355262;STB=0.730493;TYPE=snp;VARB=0.0484623;OID=.;OPOS=150873754;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:63:63:41:42:21:21:19:2:11:30:19:2:12:30 chr7 150878260 . C G 41.7 PASS AO=11;DP=34;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=5;FWDB=-0.0251398;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.2777;QD=4.90594;RBI=0.0271955;REFB=-0.00991831;REVB=0.0103723;RO=22;SAF=1;SAR=10;SRF=17;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.710093;STB=0.92456;TYPE=snp;VARB=0.0190845;OID=.;OPOS=150878260;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:34:34:22:22:11:12:10:1:17:5:11:1:17:5 chr7 150878332 . G A 107.01 PASS AO=21;DP=38;FAO=21;FDP=38;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.0225301;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.797;QD=11.2639;RBI=0.0563458;REFB=-0.0479954;REVB=0.0516453;RO=17;SAF=7;SAR=14;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164856;STB=0.592502;TYPE=snp;VARB=0.038706;OID=.;OPOS=150878332;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:38:38:17:17:21:21:14:7:9:8:14:7:9:8 chr7 150915948 . C T 91.8 PASS AO=12;DP=17;FAO=13;FDP=17;FR=.;FRO=4;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0109984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.948;QD=21.6003;RBI=0.0121826;REFB=0.0752788;REVB=-0.0052393;RO=4;SAF=6;SAR=6;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509077;TYPE=snp;VARB=-0.0237948;OID=.;OPOS=150915948;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:17:17:4:4:12:13:6:6:2:2:6:7:2:2 chr7 150916228 . G A 121.92 PASS AO=32;DP=75;FAO=32;FDP=74;FR=.;FRO=42;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=-0.00867449;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.462;QD=6.59013;RBI=0.0100108;REFB=-0.0246637;REVB=-0.00499691;RO=42;SAF=18;SAR=14;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.063165;STB=0.535692;TYPE=snp;VARB=0.0362645;OID=.;OPOS=150916228;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:74:42:42:32:32:14:18:21:21:14:18:21:21 chr7 150921950 . A G 2194.2 PASS AO=233;DP=236;FAO=234;FDP=234;FR=.;FRO=0;FSAF=137;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0487052;FXX=0.0126577;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.084;QD=37.5077;RBI=0.0487771;REFB=0.0520544;REVB=0.00264717;RO=2;SAF=136;SAR=97;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00972333;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00033609;OID=.;OPOS=150921950;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:236:234:2:0:233:234:97:136:0:2:97:137:0:0 chr7 150931268 . C G 295.98 PASS AO=66;DP=128;FAO=66;FDP=128;FR=.;FRO=62;FSAF=36;FSAR=30;FSRF=24;FSRR=38;FWDB=-0.0313311;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.046;QD=9.24925;RBI=0.0328398;REFB=0.00816173;REVB=-0.00983948;RO=61;SAF=36;SAR=30;SRF=23;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146303;STB=0.576248;TYPE=snp;VARB=-0.00894575;OID=.;OPOS=150931268;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:61:62:66:66:30:36:23:38:30:36:24:38 chr7 150934975 . C G 126.11 PASS AO=32;DP=74;FAO=32;FDP=72;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=27;FWDB=0.0248821;FXX=0.0270234;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.726;QD=7.00581;RBI=0.0378154;REFB=-0.0231278;REVB=-0.0284761;RO=40;SAF=16;SAR=16;SRF=13;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173202;STB=0.597164;TYPE=snp;VARB=0.0280195;OID=.;OPOS=150934975;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:72:40:40:32:32:16:16:13:27:16:16:13:27 chr7 150972189 . G A 160.27 PASS AO=40;DP=84;FAO=39;FDP=83;FR=.;FRO=44;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=19;FWDB=0.0151346;FXX=0.0119033;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.1024;QD=7.72379;RBI=0.0346987;REFB=0.00467818;REVB=0.0312242;RO=41;SAF=25;SAR=15;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0610247;STB=0.540962;TYPE=snp;VARB=-0.00926134;OID=.;OPOS=150972189;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:83:41:44:40:39:15:25:23:18:14:25:25:19 chr7 151049231 . C T 435.16 PASS AO=90;DP=160;FAO=91;FDP=166;FR=.;FRO=75;FSAF=39;FSAR=52;FSRF=23;FSRR=52;FWDB=-0.0132038;FXX=0.0177504;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.247;QD=10.4858;RBI=0.0189609;REFB=-0.016682;REVB=0.0136079;RO=69;SAF=39;SAR=51;SRF=17;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1557;STB=0.557131;TYPE=snp;VARB=0.0109053;OID=.;OPOS=151049231;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:166:69:75:90:91:51:39:17:52:52:39:23:52 chr7 151097323 . A G 577.73 PASS AO=150;DP=326;FAO=150;FDP=325;FR=.;FRO=175;FSAF=73;FSAR=77;FSRF=68;FSRR=107;FWDB=0.0103326;FXX=0.00914606;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.479;QD=7.1105;RBI=0.0470396;REFB=-0.0175414;REVB=-0.0458907;RO=172;SAF=73;SAR=77;SRF=66;SRR=106;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10021;STB=0.553001;TYPE=snp;VARB=0.0211951;OID=.;OPOS=151097323;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:326:325:172:175:150:150:77:73:66:106:77:73:68:107 chr7 151106066 . C T 440.59 PASS AO=94;DP=173;FAO=94;FDP=173;FR=.;FRO=79;FSAF=44;FSAR=50;FSRF=45;FSRR=34;FWDB=0.0133646;FXX=0.0057468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.1;QD=10.187;RBI=0.033223;REFB=-0.0106394;REVB=0.0304164;RO=79;SAF=44;SAR=50;SRF=45;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0847541;STB=0.546271;TYPE=snp;VARB=0.00882195;OID=.;OPOS=151106066;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:173:79:79:94:94:50:44:45:34:50:44:45:34 chr7 151168534 . G A 314.89 PASS AO=67;DP=130;FAO=68;FDP=129;FR=.;FRO=61;FSAF=39;FSAR=29;FSRF=29;FSRR=32;FWDB=-0.00350136;FXX=0.00769172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.217;QD=9.76396;RBI=0.0137266;REFB=-0.00270594;REVB=0.0132726;RO=60;SAF=39;SAR=28;SRF=28;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10015;STB=0.546757;TYPE=snp;VARB=0.00191641;OID=.;OPOS=151168534;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:129:60:61:67:68:28:39:28:32:29:39:29:32 chr7 151504019 . T C 133.4 PASS AO=22;DP=41;FAO=27;FDP=46;FR=.;FRO=19;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.0139194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.323;QD=11.5996;RBI=0.036078;REFB=-0.0378027;REVB=0.0332847;RO=19;SAF=15;SAR=7;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.093987;STB=0.580208;TYPE=snp;VARB=0.0169761;OID=.;OPOS=151504019;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:41:46:19:19:22:27:7:15:11:8:7:20:11:8 chr7 151504499 . G A 231.17 PASS AO=58;DP=125;FAO=58;FDP=125;FR=.;FRO=67;FSAF=22;FSAR=36;FSRF=38;FSRR=29;FWDB=0.0126253;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.3841;QD=7.39758;RBI=0.0194438;REFB=-0.0295117;REVB=0.0147873;RO=67;SAF=22;SAR=36;SRF=38;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182711;STB=0.601636;TYPE=snp;VARB=0.0273715;OID=.;OPOS=151504499;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:67:67:58:58:36:22:38:29:36:22:38:29 chr7 151597429 . C T 113.29 PASS AO=35;DP=93;FAO=35;FDP=93;FR=.;FRO=58;FSAF=7;FSAR=28;FSRF=27;FSRR=31;FWDB=0.00182905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.6937;QD=4.87273;RBI=0.0317153;REFB=-0.00519419;REVB=-0.0316625;RO=57;SAF=7;SAR=28;SRF=27;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.347325;STB=0.697311;TYPE=snp;VARB=0.00645996;OID=.;OPOS=151597429;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:57:58:35:35:28:7:27:30:28:7:27:31 chr7 151680072 . T C 3000.14 PASS AO=319;DP=322;FAO=320;FDP=320;FR=.;FRO=0;FSAF=137;FSAR=183;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0329516;FXX=0.0123453;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.192;QD=37.5017;RBI=0.0611123;REFB=-0.0463807;REVB=0.0514675;RO=3;SAF=136;SAR=183;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104042;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00019655;OID=.;OPOS=151680072;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:322:320:3:0:319:320:183:136:3:0:183:137:0:0 chr7 151684256 . A G 157.36 PASS AO=57;DP=150;FAO=56;FDP=161;FR=.;FRO=105;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=67;FSRR=38;FWDB=-0.0629026;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=39.4471;QD=3.90963;RBI=0.0762342;REFB=0.0130525;REVB=-0.0430687;RO=93;SAF=27;SAR=30;SRF=63;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22178;STB=0.590031;TYPE=snp;VARB=-0.0251643;OID=.;OPOS=151684256;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:161:93:105:57:56:30:27:63:30:28:28:67:38 chr7 151684322 . AGG AG,AGA 1094.07 PASS AO=48,26;DP=155;FAO=119,26;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=68,0;FSAR=51,26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.819132,0.16214;FXX=0.0202689;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=17.0406,194.195;QD=30.1811;RBI=0.821589,0.166549;REFB=0.0261555,0.0378488;REVB=-0.0634908,-0.0380686;RO=59;SAF=10,0;SAR=38,26;SRF=57;SRR=2;SSEN=0.666667,0;SSEP=0.300429,0;SSSB=-0.664325,-0.89413;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.016348,0.0268375;OID=.,.;OPOS=151684323,151684324;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=AG,AGA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:48,26:147:119,26:145:0:68,0:51,26:0:0:24:59:10,0:38,26:57:2 chr7 151722338 . G A 1533.87 PASS AO=158;DP=159;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249567;FXX=0.00624961;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.794;QD=38.5879;RBI=0.0365528;REFB=0;REVB=-0.0267072;RO=0;SAF=103;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.72482e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.31784e-06;OID=.;OPOS=151722338;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:159:159:0:0:158:159:55:103:0:0:55:104:0:0 chr7 151873853 . C T 442.59 PASS AO=83;DP=133;FAO=82;FDP=133;FR=.;FRO=51;FSAF=24;FSAR=58;FSRF=22;FSRR=29;FWDB=-0.0480449;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.4463;QD=13.311;RBI=0.0545881;REFB=-0.0229721;REVB=-0.0259141;RO=50;SAF=25;SAR=58;SRF=21;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0937996;STB=0.56096;TYPE=snp;VARB=0.0162677;OID=.;OPOS=151873853;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:50:51:83:82:58:25:21:29:58:24:22:29 chr7 151932908 . T C 48 PASS AO=20;DP=70;FAO=20;FDP=70;FR=.;FRO=50;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=-0.0218529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.1979;QD=2.74314;RBI=0.0678976;REFB=-0.0255942;REVB=-0.0642848;RO=47;SAF=16;SAR=4;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.458178;STB=0.770801;TYPE=snp;VARB=0.0518997;OID=.;OPOS=151932908;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:70:70:47:50:20:20:4:16:20:27:4:16:22:28 chr7 151945007 . C T 662.67 PASS AO=228;DP=507;FAO=179;FDP=400;FR=.;FRO=221;FSAF=169;FSAR=10;FSRF=215;FSRR=6;FWDB=-0.00557681;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=244.024;QD=6.62672;RBI=0.00943566;REFB=-0.0144981;REVB=-0.00761124;RO=277;SAF=216;SAR=12;SRF=270;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159918;STB=0.586789;TYPE=snp;VARB=0.0158707;OID=.;OPOS=151945007;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:507:400:277:221:228:179:12:216:270:7:10:169:215:6 chr7 151945071 . G GT 63.69 PASS AO=268;DP=1121;FAO=101;FDP=397;FR=.;FRO=296;FSAF=59;FSAR=42;FSRF=127;FSRR=169;FWDB=0.0933655;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=26.8481;QD=0.641762;RBI=0.148069;REFB=0.0124271;REVB=-0.114922;RO=837;SAF=140;SAR=128;SRF=366;SRR=471;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108088;STB=0.614409;TYPE=ins;VARB=-0.0383376;OID=.;OPOS=151945072;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:268:1121:101:397:296:59:42:127:169:63:837:140:128:366:471 chr7 151945140 . C T 104.65 PASS AO=173;DP=791;FAO=88;FDP=399;FR=.;FRO=311;FSAF=36;FSAR=52;FSRF=138;FSRR=173;FWDB=-0.0298527;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7365;QD=1.04908;RBI=0.0449494;REFB=-0.0105853;REVB=-0.0336046;RO=613;SAF=76;SAR=97;SRF=300;SRR=313;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0648042;STB=0.527635;TYPE=snp;VARB=0.0408267;OID=.;OPOS=151945140;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:791:399:613:311:173:88:97:76:300:313:52:36:138:173 chr7 151945167 . G T 543.69 PASS AO=220;DP=560;FAO=164;FDP=400;FR=.;FRO=236;FSAF=86;FSAR=78;FSRF=106;FSRR=130;FWDB=0.0140896;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=213.651;QD=5.43685;RBI=0.0153407;REFB=-0.0162313;REVB=-0.006068;RO=337;SAF=116;SAR=104;SRF=153;SRR=184;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.079119;STB=0.544298;TYPE=snp;VARB=0.0201842;OID=.;OPOS=151945167;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:560:400:337:236:220:164:104:116:153:184:78:86:106:130 chr7 151945204 . G A 451.11 PASS AO=114;DP=250;FAO=117;FDP=253;FR=.;FRO=136;FSAF=97;FSAR=20;FSRF=38;FSRR=98;FWDB=0.0119774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8328;QD=7.13222;RBI=0.0745338;REFB=-0.00405237;REVB=0.0735651;RO=136;SAF=95;SAR=19;SRF=38;SRR=98;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.566536;STB=0.809078;TYPE=snp;VARB=0.00695301;OID=.;OPOS=151945204;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:250:253:136:136:114:117:19:95:38:98:20:97:38:98 chr7 151945215 . T C 20.69 PASS AO=30;DP=183;FAO=30;FDP=183;FR=.;FRO=153;FSAF=23;FSAR=7;FSRF=62;FSRR=91;FWDB=0.0169237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.465;QD=0.452153;RBI=0.0187002;REFB=-0.0116296;REVB=0.00795536;RO=152;SAF=23;SAR=7;SRF=62;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.448258;STB=0.790969;TYPE=snp;VARB=0.0562263;OID=.;OPOS=151945215;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:183:183:152:153:30:30:7:23:62:90:7:23:62:91 chr7 151970856 . T A 1845.73 PASS AO=550;DP=785;FAO=288;FDP=395;FR=.;FRO=107;FSAF=148;FSAR=140;FSRF=56;FSRR=51;FWDB=0.0151384;FXX=0.0124997;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.9638;QD=18.691;RBI=0.0265543;REFB=0.000864492;REVB=0.0218165;RO=225;SAF=268;SAR=282;SRF=115;SRR=110;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129939;STB=0.502569;TYPE=snp;VARB=-0.000219612;OID=.;OPOS=151970856;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:785:395:225:107:550:288:282:268:115:110:140:148:56:51 chr7 151970931 . G A 341.13 PASS AO=123;DP=354;FAO=126;FDP=355;FR=.;FRO=229;FSAF=37;FSAR=89;FSRF=101;FSRR=128;FWDB=-0.0269888;FXX=0.00837965;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.2966;QD=3.84366;RBI=0.0751454;REFB=-0.0132817;REVB=-0.0701315;RO=231;SAF=37;SAR=86;SRF=100;SRR=131;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165683;STB=0.60468;TYPE=snp;VARB=0.0229563;OID=.;OPOS=151970931;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:354:355:231:229:123:126:86:37:100:131:89:37:101:128 chr7 152099906 . T A 1378.28 PASS AO=228;DP=335;FAO=229;FDP=334;FR=.;FRO=105;FSAF=136;FSAR=93;FSRF=70;FSRR=35;FWDB=0.0196955;FXX=0.0059522;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.398;QD=16.5064;RBI=0.0293007;REFB=-0.0294916;REVB=0.0216937;RO=104;SAF=135;SAR=93;SRF=69;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0436587;STB=0.523927;TYPE=snp;VARB=0.0132217;OID=.;OPOS=152099906;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:335:334:104:105:228:229:93:135:69:35:93:136:70:35 chr7 152099917 . G A 1426.79 PASS AO=230;DP=328;FAO=233;FDP=331;FR=.;FRO=98;FSAF=136;FSAR=97;FSRF=63;FSRR=35;FWDB=0.0196404;FXX=0.00301196;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.338;QD=17.2422;RBI=0.0196985;REFB=-0.0158602;REVB=0.00151229;RO=96;SAF=136;SAR=94;SRF=63;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0373409;STB=0.51813;TYPE=snp;VARB=0.00883378;OID=.;OPOS=152099917;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:328:331:96:98:230:233:94:136:63:33:97:136:63:35 chr7 152099924 . T C 1351.03 PASS AO=226;DP=334;FAO=227;FDP=333;FR=.;FRO=106;FSAF=131;FSAR=96;FSRF=68;FSRR=38;FWDB=-0.0130184;FXX=0.00596997;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.272;QD=16.2286;RBI=0.0130963;REFB=0.00345284;REVB=0.00142596;RO=104;SAF=130;SAR=96;SRF=66;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0360217;STB=0.52114;TYPE=snp;VARB=-0.00168204;OID=.;OPOS=152099924;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:334:333:104:106:226:227:96:130:66:38:96:131:68:38 chr7 152290144 . A G 158.84 PASS AO=38;DP=81;FAO=38;FDP=81;FR=.;FRO=43;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=-0.0267194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.696;QD=7.84404;RBI=0.0269259;REFB=-0.00130283;REVB=0.0033278;RO=40;SAF=18;SAR=20;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0472221;STB=0.544724;TYPE=snp;VARB=0.00163669;OID=.;OPOS=152290144;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:40:43:38:38:20:18:21:19:20:18:24:19 chr7 153922104 . A G 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0351466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.317;QD=33.022;RBI=0.0351466;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00132711;OID=.;OPOS=153922104;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:0:6:0:0:0:6:0:0 chr7 154002650 . TGGGGGTCC TGGGGTCC,TGGGGGTCCGT 86.17 PASS AO=5,9;DP=47;FAO=2,14;FDP=27;FR=.;FRO=11;FSAF=2,9;FSAR=0,5;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.0771564,0.0725347;FXX=0.181763;HRUN=5,1;LEN=1,2;MLLD=8.51866,119.194;QD=12.7652;RBI=0.210831,0.0726823;REFB=-0.154544,-0.0419306;REVB=-0.196206,-0.00462943;RO=7;SAF=2,6;SAR=3,3;SRF=3;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0274957,0.186168;STB=0.995406,0.624098;TYPE=del,ins;VARB=0.0777356,0.0938138;OID=.,.;OPOS=154002651,154002659;OREF=G,-;OALT=-,GT;OMAPALT=TGGGGTCC,TGGGGGTCCGT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:5,9:27:2,14:27:11:2,9:0,5:4:7:38:7:2,6:3,3:3:4 chr7 154172154 . G A 859.15 PASS AO=197;DP=388;FAO=198;FDP=388;FR=.;FRO=190;FSAF=79;FSAR=119;FSRF=91;FSRR=99;FWDB=-0.00979976;FXX=0.00257063;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.109;QD=8.85721;RBI=0.0112282;REFB=-0.00106696;REVB=-0.00548062;RO=190;SAF=79;SAR=118;SRF=91;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0716471;STB=0.540154;TYPE=snp;VARB=0.000844989;OID=.;OPOS=154172154;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:388:388:190:190:197:198:118:79:91:99:119:79:91:99 chr7 154461112 . A G 2949.56 PASS AO=325;DP=337;FAO=326;FDP=336;FR=.;FRO=10;FSAF=160;FSAR=166;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.000822581;FXX=0.00296727;HRUN=4;LEN=1;MLLD=57.3982;QD=35.1138;RBI=0.0264661;REFB=-0.034402;REVB=0.0264533;RO=5;SAF=160;SAR=165;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00311249;STB=0.505681;TYPE=snp;VARB=0.00408933;OID=.;OPOS=154461112;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:337:336:5:10:325:326:165:160:3:2:166:160:3:7 chr7 154561188 . C T 251.53 PASS AO=65;DP=144;FAO=65;FDP=144;FR=.;FRO=79;FSAF=19;FSAR=46;FSRF=29;FSRR=50;FWDB=0.0074525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.6884;QD=6.98685;RBI=0.0433636;REFB=-0.015789;REVB=0.0427184;RO=74;SAF=19;SAR=46;SRF=25;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0514318;STB=0.547604;TYPE=snp;VARB=0.0210807;OID=.;OPOS=154561188;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:144:74:79:65:65:46:19:25:49:46:19:29:50 chr7 154667628 . A G 95.77 PASS AO=12;DP=36;FAO=20;FDP=38;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=-0.047774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=43.6342;QD=10.0808;RBI=0.137407;REFB=-0.0486102;REVB=0.128835;RO=16;SAF=6;SAR=6;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122388;STB=0.64985;TYPE=snp;VARB=0.0520912;OID=.;OPOS=154667628;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:37:38:16:18:12:20:6:6:10:6:13:7:12:6 chr7 154667643 . G A 114.16 PASS AO=22;DP=39;FAO=22;FDP=39;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.00606948;FXX=0.0487686;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.832;QD=11.7084;RBI=0.0132792;REFB=-0.0335143;REVB=-0.0118109;RO=17;SAF=8;SAR=14;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22272;STB=0.624299;TYPE=snp;VARB=0.0236216;OID=.;OPOS=154667643;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:39:39:17:17:22:22:14:8:11:6:14:8:11:6 chr7 154679447 . G A 1135.6 PASS AO=119;DP=120;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00390319;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4259;QD=37.5404;RBI=0.0104977;REFB=-0.0348408;REVB=0.00974512;RO=1;SAF=39;SAR=80;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00590105;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.04273e-05;OID=.;OPOS=154679447;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:120:121:1:0:119:121:80:39:0:1:80:41:0:0 chr7 154685612 . G T 81.81 PASS AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=18;FWDB=0.0515927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9751;QD=7.27226;RBI=0.0620914;REFB=-0.00761686;REVB=0.0345476;RO=25;SAF=7;SAR=13;SRF=7;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0771303;STB=0.543817;TYPE=snp;VARB=0.00872302;OID=.;OPOS=154685612;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:45:45:25:25:20:20:13:7:7:18:13:7:7:18 chr7 154760369 . A G 15.75 PASS AO=3;DP=6;FAO=3;FDP=7;FR=.,HEALED;FRO=4;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.194432;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.471;QD=9.00108;RBI=0.201113;REFB=-0.101459;REVB=-0.0514065;RO=0;SAF=1;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.725852;TYPE=snp;VARB=0.0414492;OID=.;OPOS=154760369;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:6:7:0:4:3:3:2:1:0:0:2:1:3:1 chr7 154973603 . G A 320.98 PASS AO=35;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0200355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.618;QD=35.664;RBI=0.0480541;REFB=-0.0715396;REVB=0.0436781;RO=0;SAF=23;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00129444;OID=.;OPOS=154973603;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:36:36:0:0:35:36:12:23:0:0:13:23:0:0 chr7 154988991 . G A 235.89 PASS AO=67;DP=173;FAO=71;FDP=175;FR=.;FRO=104;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=48;FSRR=56;FWDB=0.0116725;FXX=0.0112988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.2552;QD=5.39185;RBI=0.0193745;REFB=0.0086499;REVB=0.0154636;RO=101;SAF=32;SAR=35;SRF=47;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0131316;STB=0.527019;TYPE=snp;VARB=-0.0133518;OID=.;OPOS=154988991;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:175:101:104:67:71:35:32:47:54:35:36:48:56 chr7 154989982 . G A 602.49 PASS AO=60;DP=60;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.110224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1791;QD=37.6558;RBI=0.110303;REFB=0;REVB=0.00417636;RO=0;SAF=5;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00117317;OID=.;OPOS=154989982;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:60:64:0:0:60:64:55:5:0:0:56:8:0:0 chr7 155150472 . G A 340.28 PASS AO=66;DP=112;FAO=65;FDP=110;FR=.;FRO=45;FSAF=48;FSAR=17;FSRF=35;FSRR=10;FWDB=0.0117224;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.137;QD=12.3737;RBI=0.0497243;REFB=-0.0183622;REVB=0.0483228;RO=44;SAF=49;SAR=17;SRF=34;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0296211;STB=0.521235;TYPE=snp;VARB=0.0152289;OID=.;OPOS=155150472;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:110:44:45:66:65:17:49:34:10:17:48:35:10 chr7 155150560 . A G 64.39 PASS AO=25;DP=72;FAO=23;FDP=71;FR=.;FRO=48;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=-0.0116343;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.455;QD=3.62763;RBI=0.0292019;REFB=0.000700512;REVB=-0.0267842;RO=45;SAF=17;SAR=8;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147995;STB=0.564145;TYPE=snp;VARB=-0.00413067;OID=.;OPOS=155150560;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:72:71:45:48:25:23:8:17:25:20:8:15:27:21 chr7 155150602 . T C 107.75 PASS AO=16;DP=55;FAO=17;FDP=51;FR=.,HEALED;FRO=26;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=-0.0113454;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.011;QD=8.45076;RBI=0.0115126;REFB=-0.00613836;REVB=0.00195494;RO=29;SAF=7;SAR=9;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0654798;STB=0.552425;TYPE=snp;VARB=0.0312679;OID=.;OPOS=155150602;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:55:51:29:26:16:17:9:7:11:18:9:8:10:16 chr7 155150765 . C T 117.07 PASS AO=28;DP=61;FAO=28;FDP=61;FR=.;FRO=33;FSAF=25;FSAR=3;FSRF=28;FSRR=5;FWDB=0.00887291;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.276;QD=7.677;RBI=0.0157257;REFB=0.00613823;REVB=0.0129834;RO=33;SAF=25;SAR=3;SRF=28;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100317;STB=0.557059;TYPE=snp;VARB=-0.00575339;OID=.;OPOS=155150765;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:33:33:28:28:3:25:28:5:3:25:28:5 chr7 155151018 . G A 179.24 PASS AO=31;DP=52;FAO=33;FDP=54;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=0.0642463;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.8565;QD=13.2768;RBI=0.0653534;REFB=-0.0286245;REVB=0.0119784;RO=21;SAF=12;SAR=19;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.080055;STB=0.544884;TYPE=snp;VARB=0.0210696;OID=.;OPOS=155151018;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:52:54:21:21:31:33:19:12:6:15:20:13:6:15 chr7 155151194 . G A 135.08 PASS AO=29;DP=56;FAO=29;FDP=56;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=4;FSRR=23;FWDB=0.0614609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.6981;QD=9.64825;RBI=0.0876189;REFB=-0.025727;REVB=0.062447;RO=27;SAF=11;SAR=18;SRF=4;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.227819;STB=0.625444;TYPE=snp;VARB=0.0154442;OID=.;OPOS=155151194;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:27:27:29:29:18:11:4:23:18:11:4:23 chr7 155151307 . A G 120.81 PASS AO=29;DP=61;FAO=30;FDP=68;FR=.;FRO=38;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=26;FWDB=0.00410198;FXX=0.0285673;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.811;QD=7.10616;RBI=0.0118968;REFB=-0.0248701;REVB=-0.0111673;RO=30;SAF=17;SAR=12;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168621;STB=0.655073;TYPE=snp;VARB=0.0402793;OID=.;OPOS=155151307;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:68:30:38:29:30:12:17:12:18:12:18:12:26 chr7 155151367 . G T 59.3 PASS AO=23;DP=49;FAO=15;FDP=40;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=0.0491329;FXX=0.19996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.712;QD=5.92956;RBI=0.0500085;REFB=-0.0195526;REVB=0.0093171;RO=22;SAF=16;SAR=7;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.3311;STB=0.56748;TYPE=snp;VARB=0.051446;OID=.;OPOS=155151367;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:49:40:22:25:23:15:7:16:7:15:8:7:9:16 chr7 155151369 . C T 98.3 PASS AO=23;DP=50;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=0.0424627;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=194.189;QD=7.86422;RBI=0.0426434;REFB=-0.0204172;REVB=0.00392124;RO=27;SAF=16;SAR=7;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.314332;STB=0.678288;TYPE=snp;VARB=0.0207271;OID=.;OPOS=155151369;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:50:50:27:27:23:23:7:16:10:17:7:16:10:17 chr7 155151433 . T C 49.9 PASS AO=5;DP=33;FAO=7;FDP=27;FR=.,HEALED;FRO=15;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=0.138877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.2507;QD=7.39248;RBI=0.139897;REFB=0.00140054;REVB=-0.0168587;RO=15;SAF=0;SAR=5;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.652156;STB=0.637842;TYPE=snp;VARB=0.0027388;OID=.;OPOS=155151433;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:26:27:15:15:5:7:5:0:4:11:6:1:4:11 chr7 155151437 . G A 56.21 PASS AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=0.0282009;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.9656;QD=8.99295;RBI=0.0282124;REFB=0.00152224;REVB=-0.000807483;RO=12;SAF=6;SAR=6;SRF=1;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.369373;STB=0.679738;TYPE=snp;VARB=-0.00150292;OID=.;OPOS=155151437;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:25:25:12:13:12:12:6:6:1:11:6:6:2:11 chr7 155255332 . T C 108.1 PASS AO=18;DP=28;FAO=18;FDP=28;FR=.;FRO=10;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.0824265;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2797;QD=15.4434;RBI=0.088478;REFB=-0.0340775;REVB=-0.0321593;RO=10;SAF=10;SAR=8;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16281;STB=0.590452;TYPE=snp;VARB=0.014537;OID=.;OPOS=155255332;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:28:28:10:10:18:18:8:10:3:7:8:10:3:7 chr7 155503920 . A T 27.11 PASS AO=10;DP=36;FAO=10;FDP=36;FR=.;FRO=26;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=25;FWDB=0.0183339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.1446;QD=3.01209;RBI=0.0189572;REFB=-0.00810812;REVB=0.00482102;RO=25;SAF=3;SAR=7;SRF=1;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.47156;STB=0.773878;TYPE=snp;VARB=0.0124465;OID=.;OPOS=155503920;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:36:36:25:26:10:10:7:3:1:24:7:3:1:25 chr7 155530954 . T C 147.98 PASS AO=22;DP=65;FAO=23;FDP=65;FR=.,HEALED;FRO=31;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=4;FSRR=27;FWDB=-0.0247941;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=36.0979;QD=9.10615;RBI=0.0260261;REFB=0.0290379;REVB=-0.00791289;RO=29;SAF=6;SAR=16;SRF=4;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188553;STB=0.608213;TYPE=snp;VARB=0.00173379;OID=.;OPOS=155530954;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:65:65:29:31:22:23:16:6:4:25:17:6:4:27 chr7 155531080 . A G 39.24 PASS AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=-0.00663928;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.203;QD=6.03695;RBI=0.0444431;REFB=-0.0354598;REVB=0.0439444;RO=16;SAF=3;SAR=7;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14995;STB=0.588075;TYPE=snp;VARB=0.0465284;OID=.;OPOS=155531080;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:26:26:16:16:10:10:7:3:3:13:7:3:3:13 chr7 155755826 . A G 459.54 PASS AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00811605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.162;QD=38.2946;RBI=0.014287;REFB=0;REVB=-0.0117579;RO=0;SAF=20;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.56477e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.2436e-05;OID=.;OPOS=155755826;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:48:48:0:0:48:48:28:20:0:0:28:20:0:0 chr7 155757502 . T C 339.83 PASS AO=31;DP=31;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0736497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.613;QD=37.7589;RBI=0.0737797;REFB=0;REVB=-0.0043784;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000461575;OID=.;OPOS=155757502;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:31:36:0:0:31:36:17:14:0:0:20:16:0:0 chr7 156469133 . C G 182.06 PASS AO=55;DP=139;FAO=55;FDP=139;FR=.;FRO=84;FSAF=11;FSAR=44;FSRF=11;FSRR=73;FWDB=-0.00370543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.0925;QD=5.23905;RBI=0.0121089;REFB=0.00786541;REVB=-0.011528;RO=84;SAF=11;SAR=44;SRF=11;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126627;STB=0.570708;TYPE=snp;VARB=-0.013538;OID=.;OPOS=156469133;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:84:84:55:55:44:11:11:73:44:11:11:73 chr7 156469179 . C T 202.18 PASS AO=52;DP=115;FAO=52;FDP=115;FR=.;FRO=63;FSAF=18;FSAR=34;FSRF=19;FSRR=44;FWDB=0.0387864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7065;QD=7.03218;RBI=0.0387887;REFB=-0.0281243;REVB=-0.000422843;RO=63;SAF=18;SAR=34;SRF=19;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0492378;STB=0.527413;TYPE=snp;VARB=0.0293796;OID=.;OPOS=156469179;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:63:63:52:52:34:18:19:44:34:18:19:44 chr7 156469190 . A G 184.78 PASS AO=43;DP=97;FAO=46;FDP=100;FR=.;FRO=54;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=24;FSRR=30;FWDB=-0.0034849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.878;QD=7.39113;RBI=0.0108549;REFB=-0.0138859;REVB=-0.0102803;RO=52;SAF=18;SAR=25;SRF=24;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0427737;STB=0.529717;TYPE=snp;VARB=0.0221181;OID=.;OPOS=156469190;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:100:52:54:43:46:25:18:24:28:28:18:24:30 chr7 156476861 . CA C 31.69 PASS AO=6;DP=33;FAO=15;FDP=25;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.325243;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=6.98684;QD=5.07011;RBI=0.338619;REFB=-0.0562917;REVB=0.0942325;RO=12;SAF=1;SAR=5;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243254;STB=0.542318;TYPE=del;VARB=0.135687;OID=.;OPOS=156476862;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:6:24:15:25:10:6:9:3:7:14:12:1:5:4:8 chr7 156664783 . C T 168.72 PASS AO=43;DP=95;FAO=43;FDP=95;FR=.;FRO=52;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=26;FSRR=26;FWDB=-0.0224243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.451;QD=7.10398;RBI=0.0244913;REFB=0.000205536;REVB=-0.00984755;RO=51;SAF=18;SAR=25;SRF=26;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0893674;STB=0.545073;TYPE=snp;VARB=-0.00030327;OID=.;OPOS=156664783;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:51:52:43:43:25:18:26:25:25:18:26:26 chr7 156761818 . G A 190.65 PASS AO=61;DP=173;FAO=63;FDP=170;FR=.;FRO=107;FSAF=35;FSAR=28;FSRF=39;FSRR=68;FWDB=-0.0199991;FXX=0.0395458;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2858;QD=4.48588;RBI=0.0220058;REFB=-0.00518905;REVB=-0.00918108;RO=96;SAF=34;SAR=27;SRF=34;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217345;STB=0.61852;TYPE=snp;VARB=0.00684745;OID=.;OPOS=156761818;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:170:96:107:61:63:27:34:34:62:28:35:39:68 chr7 156762224 . G C 394.33 PASS AO=104;DP=229;FAO=104;FDP=229;FR=.;FRO=125;FSAF=58;FSAR=46;FSRF=89;FSRR=36;FWDB=0.00281309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.5951;QD=6.88783;RBI=0.00298038;REFB=-0.028354;REVB=0.000984497;RO=124;SAF=58;SAR=46;SRF=88;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154984;STB=0.587065;TYPE=snp;VARB=0.0356016;OID=.;OPOS=156762224;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:229:229:124:125:104:104:46:58:88:36:46:58:89:36 chr7 156762248 . G A 262.78 PASS AO=93;DP=239;FAO=79;FDP=198;FR=.;FRO=119;FSAF=36;FSAR=43;FSRF=67;FSRR=52;FWDB=0.0020928;FXX=0.0246293;HRUN=5;LEN=1;MLLD=196.012;QD=5.30861;RBI=0.00809595;REFB=0.00367015;REVB=0.00782078;RO=131;SAF=48;SAR=45;SRF=81;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107617;STB=0.56426;TYPE=snp;VARB=-0.0046455;OID=.;OPOS=156762248;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:239:198:131:119:93:79:45:48:81:50:43:36:67:52 chr7 156981672 . A G 288.89 PASS AO=72;DP=153;FAO=72;FDP=153;FR=.;FRO=81;FSAF=33;FSAR=39;FSRF=57;FSRR=24;FWDB=0.0104972;FXX=0.00649309;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.943;QD=7.55257;RBI=0.0139143;REFB=-0.00844107;REVB=-0.0091333;RO=70;SAF=33;SAR=39;SRF=46;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17673;STB=0.627985;TYPE=snp;VARB=0.00880309;OID=.;OPOS=156981672;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:153:70:81:72:72:39:33:46:24:39:33:57:24 chr7 157000176 . T C 280.27 PASS AO=77;DP=181;FAO=78;FDP=182;FR=.;FRO=104;FSAF=27;FSAR=51;FSRF=43;FSRR=61;FWDB=-0.0087623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.123;QD=6.15975;RBI=0.0113756;REFB=-0.013019;REVB=0.00725445;RO=104;SAF=26;SAR=51;SRF=43;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0842655;STB=0.54139;TYPE=snp;VARB=0.015134;OID=.;OPOS=157000176;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:182:104:104:77:78:51:26:43:61:51:27:43:61 chr7 157061474 . T C 222.24 PASS AO=67;DP=169;FAO=67;FDP=168;FR=.;FRO=101;FSAF=39;FSAR=28;FSRF=56;FSRR=45;FWDB=-0.00256723;FXX=0.00591681;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.458;QD=5.29143;RBI=0.0037697;REFB=-0.0030307;REVB=-0.00276043;RO=101;SAF=39;SAR=28;SRF=56;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0301372;STB=0.516973;TYPE=snp;VARB=0.00438952;OID=.;OPOS=157061474;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:168:101:101:67:67:28:39:56:45:28:39:56:45 chr7 157162068 . T C 1382.67 PASS AO=162;DP=181;FAO=163;FDP=176;FR=.;FRO=13;FSAF=87;FSAR=76;FSRF=1;FSRR=12;FWDB=-0.0408007;FXX=0.0276228;HRUN=3;LEN=1;MLLD=116.329;QD=31.4244;RBI=0.0408579;REFB=-0.0235187;REVB=0.00216272;RO=12;SAF=87;SAR=75;SRF=0;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0702876;STB=0.533738;TYPE=snp;VARB=0.000725084;OID=.;OPOS=157162068;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:181:176:12:13:162:163:75:87:0:12:76:87:1:12 chr7 157162103 . A G 1654.04 PASS AO=171;DP=172;FAO=173;FDP=173;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0202027;FXX=0.0057468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6224;QD=38.2437;RBI=0.0355318;REFB=0;REVB=0.0292294;RO=0;SAF=82;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.78894e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000155367;OID=.;OPOS=157162103;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:172:173:0:0:171:173:89:82:0:0:89:84:0:0 chr7 157319423 . G C 39.3 PASS AO=17;DP=59;FAO=18;FDP=68;FR=.;FRO=50;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=33;FWDB=-0.0525012;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.047;QD=2.31156;RBI=0.0528399;REFB=-0.00322586;REVB=0.00597345;RO=42;SAF=7;SAR=10;SRF=17;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00855879;STB=0.53842;TYPE=snp;VARB=0.0100207;OID=.;OPOS=157319423;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:59:68:42:50:17:18:10:7:17:25:11:7:17:33 chr7 157319570 . C G 73.5 PASS AO=18;DP=41;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=-0.0403259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.5207;QD=7.1706;RBI=0.0459438;REFB=-0.0430145;REVB=0.0220148;RO=23;SAF=10;SAR=8;SRF=17;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187675;STB=0.606631;TYPE=snp;VARB=0.0498915;OID=.;OPOS=157319570;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:41:41:23:23:18:18:8:10:17:6:8:10:17:6 chr7 157396697 . G A 24.23 PASS AO=8;DP=40;FAO=10;FDP=41;FR=.,HEALED;FRO=31;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.0299984;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=208.094;QD=2.36423;RBI=0.0316697;REFB=-0.0334341;REVB=-0.010152;RO=21;SAF=4;SAR=4;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0273308;STB=0.515121;TYPE=snp;VARB=0.0593091;OID=.;OPOS=157396697;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:38:41:21:31:8:10:4:4:11:10:4:6:18:13 chr7 157414064 . G A 584.76 PASS AO=75;DP=87;FAO=75;FDP=87;FR=.;FRO=12;FSAF=25;FSAR=50;FSRF=10;FSRR=2;FWDB=-0.0166698;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.672;QD=26.8854;RBI=0.0507846;REFB=-0.0200841;REVB=0.0479708;RO=12;SAF=25;SAR=50;SRF=10;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13849;STB=0.57375;TYPE=snp;VARB=0.00448937;OID=.;OPOS=157414064;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:87:87:12:12:75:75:50:25:10:2:50:25:10:2 chr7 157903538 . A G 102.82 PASS AO=20;DP=36;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.0493842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.475;QD=11.4243;RBI=0.0493846;REFB=-0.00662109;REVB=0.000199584;RO=16;SAF=4;SAR=16;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.340925;STB=0.693119;TYPE=snp;VARB=0.016734;OID=.;OPOS=157903538;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:36:36:16:16:20:20:16:4:9:7:16:4:9:7 chr7 157959620 . C T 435.31 PASS AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0299192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.118;QD=37.8533;RBI=0.030499;REFB=0;REVB=0.00591868;RO=0;SAF=24;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.06996e-05;OID=.;OPOS=157959620;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:46:46:0:0:46:46:22:24:0:0:22:24:0:0 chr7 157959636 . G A 488.33 PASS AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0149996;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.762;QD=37.5639;RBI=0.0878596;REFB=0;REVB=0.0865697;RO=0;SAF=27;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00024436;OID=.;OPOS=157959636;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:51:52:0:0:51:52:24:27:0:0:25:27:0:0 chr7 157959879 . C T 244.74 PASS AO=18;DP=30;FAO=29;FDP=29;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0103719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.5318;QD=33.7574;RBI=0.0334333;REFB=0;REVB=0.0317838;RO=0;SAF=14;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00628657;OID=.;OPOS=157959879;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:29:29:0:0:18:29:4:14:0:0:15:14:0:0 chr7 157959895 . C T 246.95 PASS AO=26;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0640297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.395;QD=34.0615;RBI=0.0711877;REFB=-0.100145;REVB=0.0311108;RO=0;SAF=9;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.521723;TYPE=snp;VARB=0.0106023;OID=.;OPOS=157959895;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:29:29:0:1:26:28:17:9:0:0:17:11:1:0 chr7 157959911 . A G 181.54 PASS AO=15;DP=23;FAO=19;FDP=20;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0692706;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.9709;QD=36.3071;RBI=0.118186;REFB=0;REVB=0.0957579;RO=0;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00618858;OID=.;OPOS=157959911;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:21:20:0:0:15:19:10:5:0:0:13:6:0:0 chr7 158263331 . T C 354.81 PASS AO=39;DP=40;FAO=41;FDP=43;FR=.;FRO=2;FSAF=8;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00734846;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.4516;QD=33.0059;RBI=0.00915786;REFB=0.177642;REVB=0.00546502;RO=1;SAF=9;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0153742;STB=0.521957;TYPE=snp;VARB=-0.00620424;OID=.;OPOS=158263331;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:40:43:1:2:39:41:30:9:0:1:33:8:1:1 chr7 158263336 . G C 403.52 PASS AO=40;DP=40;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0389721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.362;QD=36.6837;RBI=0.0439544;REFB=0;REVB=0.0203264;RO=0;SAF=8;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00160575;OID=.;OPOS=158263336;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:40:44:0:0:40:44:32:8:0:0:35:9:0:0 chr7 158263344 . T A 388.56 PASS AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0170247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.675;QD=35.324;RBI=0.0210188;REFB=0.0315253;REVB=0.0123268;RO=1;SAF=8;SAR=35;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0132325;STB=0.507039;TYPE=snp;VARB=-0.00130106;OID=.;OPOS=158263344;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:44:44:1:1:43:43:35:8:0:1:35:8:0:1 chr7 158534424 . A G 126.93 PASS AO=31;DP=69;FAO=31;FDP=68;FR=.;FRO=37;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=28;FSRR=9;FWDB=0.0221577;FXX=0.0144907;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.635;QD=7.46673;RBI=0.0485583;REFB=-0.0215304;REVB=-0.0432082;RO=37;SAF=21;SAR=10;SRF=28;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.091395;STB=0.55115;TYPE=snp;VARB=0.0325772;OID=.;OPOS=158534424;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:68:37:37:31:31:10:21:28:9:10:21:28:9 chr7 158672476 . C G 613.37 PASS AO=63;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0427224;FXX=0.0298463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.3181;QD=37.7455;RBI=0.0594783;REFB=0;REVB=0.041382;RO=0;SAF=18;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18913e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00032004;OID=.;OPOS=158672476;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:65:65:0:0:63:65:45:18:0:0:46:19:0:0 chr7 158672619 . A G 74.48 PASS AO=21;DP=52;FAO=21;FDP=54;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=-0.02357;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=127.146;QD=5.51703;RBI=0.0354449;REFB=-0.00903442;REVB=0.0264726;RO=31;SAF=8;SAR=13;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0758736;STB=0.546573;TYPE=snp;VARB=0.0187033;OID=.;OPOS=158672619;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:52:54:31:33:21:21:13:8:14:17:13:8:15:18 chr7 158715219 . A G 1416.59 PASS AO=153;DP=157;FAO=155;FDP=157;FR=.;FRO=2;FSAF=45;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00875142;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.112;QD=36.0915;RBI=0.0328237;REFB=-0.202905;REVB=0.0316356;RO=1;SAF=44;SAR=109;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106873;STB=0.504504;TYPE=snp;VARB=0.00274155;OID=.;OPOS=158715219;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:157:157:1:2:153:155:109:44:1:0:110:45:0:2 chr7 158719084 . C T 77.14 PASS AO=27;DP=84;FAO=28;FDP=85;FR=.;FRO=57;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=31;FWDB=0.0159988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.306;QD=3.63018;RBI=0.0203363;REFB=-0.0115674;REVB=-0.0125541;RO=56;SAF=14;SAR=13;SRF=25;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0830513;STB=0.553189;TYPE=snp;VARB=0.021707;OID=.;OPOS=158719084;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:84:85:56:57:27:28:13:14:25:31:13:15:26:31 chr7 158727230 . C A 302.2 PASS AO=81;DP=164;FAO=76;FDP=163;FR=.;FRO=87;FSAF=26;FSAR=50;FSRF=29;FSRR=58;FWDB=0.0164592;FXX=0.00609719;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5216;QD=7.41603;RBI=0.0230584;REFB=-0.00655006;REVB=-0.0161488;RO=82;SAF=31;SAR=50;SRF=23;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101751;STB=0.505216;TYPE=snp;VARB=0.0110343;OID=.;OPOS=158727230;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:163:82:87:81:76:50:31:23:59:50:26:29:58 chr7 158851234 . T G 528.72 PASS AO=53;DP=53;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00390489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.743;QD=37.7657;RBI=0.0376658;REFB=0;REVB=0.0374628;RO=0;SAF=36;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.19417e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.4894e-05;OID=.;OPOS=158851234;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:53:56:0:0:53:56:17:36:0:0:19:37:0:0 chr7 158896517 . G A 462.17 PASS AO=103;DP=199;FAO=103;FDP=198;FR=.;FRO=95;FSAF=38;FSAR=65;FSRF=45;FSRR=50;FWDB=0.0345128;FXX=0.00502487;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.4189;QD=9.33671;RBI=0.0352836;REFB=-0.0216806;REVB=-0.00733465;RO=95;SAF=38;SAR=65;SRF=45;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0956899;STB=0.552473;TYPE=snp;VARB=0.0180938;OID=.;OPOS=158896517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:199:198:95:95:103:103:65:38:45:50:65:38:45:50 chr8 196274 . T G 94.46 PASS AO=31;DP=87;FAO=31;FDP=87;FR=.;FRO=56;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=35;FWDB=-0.0629438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.419;QD=4.34285;RBI=0.0633223;REFB=-0.00337841;REVB=-0.00691348;RO=54;SAF=14;SAR=17;SRF=20;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0917276;STB=0.550233;TYPE=snp;VARB=0.00660102;OID=.;OPOS=196274;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:87:87:54:56:31:31:17:14:20:34:17:14:21:35 chr8 565232 . C G 318.26 PASS AO=67;DP=126;FAO=70;FDP=132;FR=.;FRO=62;FSAF=43;FSAR=27;FSRF=33;FSRR=29;FWDB=0.066684;FXX=0.0149243;HRUN=4;LEN=1;MLLD=43.159;QD=9.64431;RBI=0.0877739;REFB=-0.0537476;REVB=-0.0570745;RO=58;SAF=41;SAR=26;SRF=32;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0528865;STB=0.539899;TYPE=snp;VARB=0.0431574;OID=.;OPOS=565232;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:132:58:62:67:70:26:41:32:26:27:43:33:29 chr8 566615 . G C 66.11 PASS AO=13;DP=22;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.00964716;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=42.881;QD=10.5775;RBI=0.0281106;REFB=-0.123872;REVB=-0.0264034;RO=9;SAF=5;SAR=8;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125599;STB=0.516104;TYPE=snp;VARB=0.0677603;OID=.;OPOS=566615;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:22:25:9:12:13:13:8:5:5:4:8:5:5:7 chr8 566619 . A G 68.62 PASS AO=8;DP=21;FAO=7;FDP=20;FR=.,HEALED;FRO=8;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0442282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.182;QD=13.7232;RBI=0.0456081;REFB=-0.032488;REVB=0.0111341;RO=8;SAF=4;SAR=4;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105859;STB=0.603481;TYPE=snp;VARB=0.0372662;OID=.;OPOS=566619;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:21:20:8:8:8:7:4:4:3:5:3:4:3:5 chr8 577101 . A G 216.74 PASS AO=50;DP=107;FAO=52;FDP=109;FR=.;FRO=57;FSAF=34;FSAR=18;FSRF=30;FSRR=27;FWDB=0.00471632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9101;QD=7.95367;RBI=0.0691715;REFB=0.010239;REVB=-0.0690105;RO=57;SAF=34;SAR=16;SRF=30;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157668;STB=0.570442;TYPE=snp;VARB=-0.00975431;OID=.;OPOS=577101;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:109:57:57:50:52:16:34:30:27:18:34:30:27 chr8 607566 . C T 255.45 PASS AO=73;DP=174;FAO=73;FDP=174;FR=.;FRO=101;FSAF=29;FSAR=44;FSRF=64;FSRR=37;FWDB=-0.0287651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.663;QD=5.87243;RBI=0.0287736;REFB=-0.0062552;REVB=-0.000695842;RO=101;SAF=29;SAR=44;SRF=64;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.242196;STB=0.635269;TYPE=snp;VARB=0.00481895;OID=.;OPOS=607566;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:174:101:101:73:73:44:29:64:37:44:29:64:37 chr8 607766 . C G 1045.93 PASS AO=102;DP=104;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0350804;FXX=0.0178555;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.2363;QD=38.0337;RBI=0.0423728;REFB=0;REVB=0.023766;RO=0;SAF=40;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000369399;OID=.;OPOS=607766;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:104:110:0:0:102:110:62:40:0:0:70:40:0:0 chr8 608018 . C T 64.47 PASS AO=12;DP=22;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.0100568;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=125.738;QD=11.7227;RBI=0.0157322;REFB=-0.0341261;REVB=-0.0120981;RO=10;SAF=1;SAR=11;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.513399;STB=0.804228;TYPE=snp;VARB=0.0091469;OID=.;OPOS=608018;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:22:22:10:10:12:12:11:1:5:5:11:1:5:5 chr8 608034 . T C 220.87 PASS AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0177379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.049;QD=36.8113;RBI=0.0260958;REFB=0;REVB=0.0191405;RO=0;SAF=7;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.05382e-06;OID=.;OPOS=608034;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:24:24:0:0:24:24:17:7:0:0:17:7:0:0 chr8 609879 . A C 118.84 PASS AO=31;DP=72;FAO=31;FDP=72;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=34;FSRR=7;FWDB=-0.0177315;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.6599;QD=6.60195;RBI=0.0717358;REFB=-0.00559624;REVB=-0.0695099;RO=40;SAF=10;SAR=21;SRF=34;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.492112;STB=0.76729;TYPE=snp;VARB=0.017608;OID=.;OPOS=609879;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:40:41:31:31:21:10:34:6:21:10:34:7 chr8 609880 . T C 129.23 PASS AO=33;DP=72;FAO=32;FDP=71;FR=.;FRO=39;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=33;FSRR=6;FWDB=0.0127519;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.568;QD=7.28076;RBI=0.0128293;REFB=-0.0199979;REVB=-0.00140721;RO=37;SAF=11;SAR=22;SRF=33;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.492657;STB=0.756616;TYPE=snp;VARB=0.0165173;OID=.;OPOS=609880;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:71:37:39:33:32:22:11:33:4:21:11:33:6 chr8 609901 . A G 242.1 PASS AO=53;DP=102;FAO=53;FDP=102;FR=.;FRO=49;FSAF=35;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=34;FWDB=0.00143626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.728;QD=9.494;RBI=0.0138865;REFB=-0.0111848;REVB=0.013812;RO=48;SAF=35;SAR=18;SRF=14;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.315337;STB=0.669054;TYPE=snp;VARB=0.00778463;OID=.;OPOS=609901;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:48:49:53:53:18:35:14:34:18:35:15:34 chr8 618728 . A G 116.25 PASS AO=34;DP=88;FAO=35;FDP=91;FR=.;FRO=56;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=18;FSRR=38;FWDB=-0.0237263;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.573;QD=5.11009;RBI=0.0313587;REFB=-0.00994828;REVB=-0.0205043;RO=53;SAF=11;SAR=23;SRF=18;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0194734;STB=0.505077;TYPE=snp;VARB=0.0102496;OID=.;OPOS=618728;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:91:53:56:34:35:23:11:18:35:24:11:18:38 chr8 623593 . G A 164.03 PASS AO=21;DP=24;FAO=21;FDP=24;FR=.;FRO=3;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0176614;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.301;QD=27.3374;RBI=0.0535674;REFB=-0.0164294;REVB=0.0505721;RO=3;SAF=5;SAR=16;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210682;STB=0.615266;TYPE=snp;VARB=0.00451976;OID=.;OPOS=623593;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:24:24:3:3:21:21:16:5:3:0:16:5:3:0 chr8 623696 . G A 80.62 PASS AO=15;DP=26;FAO=15;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.00529836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.547;QD=12.4038;RBI=0.0305867;REFB=-0.0476662;REVB=0.0301243;RO=11;SAF=7;SAR=8;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.058982;STB=0.533289;TYPE=snp;VARB=0.0449144;OID=.;OPOS=623696;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:26:26:11:11:15:15:8:7:6:5:8:7:6:5 chr8 977316 . A G 220.83 PASS AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.97;QD=36.8044;RBI=0.0252132;REFB=0;REVB=0.0132626;RO=0;SAF=16;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000260089;OID=.;OPOS=977316;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:24:24:0:0:24:24:8:16:0:0:8:16:0:0 chr8 1906630 . G T 893.11 PASS AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0030613;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.623;QD=38.0048;RBI=0.0134333;REFB=0;REVB=0.0130798;RO=0;SAF=20;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.51148e-05;OID=.;OPOS=1906630;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:94:94:0:0:94:94:74:20:0:0:74:20:0:0 chr8 1953194 . T G 814.71 PASS AO=89;DP=91;FAO=89;FDP=91;FR=.;FRO=2;FSAF=66;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0168316;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.669;QD=35.8113;RBI=0.017282;REFB=0.0381241;REVB=0.00391964;RO=1;SAF=66;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0201557;STB=0.506878;TYPE=snp;VARB=-2.93936e-05;OID=.;OPOS=1953194;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:91:91:1:2:89:89:23:66:0:1:23:66:1:1 chr8 1953223 . C T 1032.42 PASS AO=105;DP=106;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00718175;FXX=0.0180164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.836;QD=37.8871;RBI=0.063854;REFB=0;REVB=0.0634489;RO=0;SAF=84;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000751966;OID=.;OPOS=1953223;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:106:109:0:0:105:109:21:84:0:0:26:83:0:0 chr8 1953567 . C A 1971.87 PASS AO=168;DP=212;FAO=206;FDP=206;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=130;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0419365;FXX=0.00961492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.274;QD=38.2887;RBI=0.0426556;REFB=0;REVB=-0.00779923;RO=0;SAF=93;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.43729e-05;OID=.;OPOS=1953567;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:205:206:0:0:168:206:75:93:0:0:76:130:0:0 chr8 1953642 . CAG C 1414.95 PASS AO=134;DP=163;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=111;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-6.81564e-05;FXX=0.0384591;HRUN=1;LEN=2;MLLD=257.643;QD=37.7319;RBI=0.0207954;REFB=0;REVB=-0.0207953;RO=0;SAF=95;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.68093e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.000362543;OID=.;OPOS=1953643;OREF=AG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:134:155:150:150:0:111:39:0:0:67:0:95:39:0:0 chr8 1953759 . A T 400.63 PASS AO=50;DP=54;FAO=49;FDP=54;FR=.;FRO=5;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.000214483;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.4906;QD=29.6763;RBI=0.0447503;REFB=-0.00248273;REVB=-0.0447498;RO=3;SAF=24;SAR=26;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0512726;STB=0.506451;TYPE=snp;VARB=0.00268385;OID=.;OPOS=1953759;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:54:54:3:5:50:49:26:24:0:3:26:23:2:3 chr8 1954237 . G C 1826.4 PASS AO=188;DP=189;FAO=191;FDP=191;FR=.;FRO=0;FSAF=129;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0305353;FXX=0.0103622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.617;QD=38.2492;RBI=0.0335858;REFB=0;REVB=0.0139856;RO=0;SAF=127;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.33895e-05;OID=.;OPOS=1954237;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:87:189:191:0:0:188:191:61:127:0:0:62:129:0:0 chr8 1954587 . G A 573.31 PASS AO=63;DP=66;FAO=63;FDP=65;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00110514;FXX=0.0844951;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.504;QD=35.2808;RBI=0.0374952;REFB=-0.159182;REVB=0.0374789;RO=1;SAF=29;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136873;STB=0.501228;TYPE=snp;VARB=0.000134174;OID=.;OPOS=1954587;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:66:65:1:2:63:63:34:29:0:1:34:29:1:1 chr8 2040337 . T C 1652.98 PASS AO=173;DP=174;FAO=173;FDP=173;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=126;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000181958;FXX=0.0057468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.5392;QD=38.2192;RBI=0.0437296;REFB=0;REVB=-0.0437292;RO=0;SAF=47;SAR=126;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.56755e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000156428;OID=.;OPOS=2040337;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:174:173:0:0:173:173:126:47:0:0:126:47:0:0 chr8 2041894 . G A 535.65 PASS AO=118;DP=223;FAO=118;FDP=223;FR=.;FRO=105;FSAF=23;FSAR=95;FSRF=21;FSRR=84;FWDB=0.00615883;FXX=0.00446409;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.783;QD=9.60801;RBI=0.00986591;REFB=-0.0281734;REVB=0.00770746;RO=105;SAF=23;SAR=95;SRF=21;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00694528;STB=0.503796;TYPE=snp;VARB=0.0252981;OID=.;OPOS=2041894;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:223:105:105:118:118:95:23:21:84:95:23:21:84 chr8 2048811 . A C 1878.8 PASS AO=195;DP=195;FAO=196;FDP=196;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=114;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0211528;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=162.715;QD=38.3429;RBI=0.0245645;REFB=0;REVB=0.0124889;RO=0;SAF=82;SAR=113;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.77966e-05;OID=.;OPOS=2048811;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:89:195:196:0:0:195:196:113:82:0:0:114:82:0:0 chr8 2048831 . A G 272.73 PASS AO=71;DP=156;FAO=71;FDP=157;FR=.;FRO=86;FSAF=29;FSAR=42;FSRF=36;FSRR=50;FWDB=-0.018414;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.017;QD=6.94851;RBI=0.0184948;REFB=-0.00114457;REVB=0.00172685;RO=84;SAF=29;SAR=42;SRF=35;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00828004;STB=0.505741;TYPE=snp;VARB=0.0010339;OID=.;OPOS=2048831;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:157:84:86:71:71:42:29:35:49:42:29:36:50 chr8 2054171 . C T 372.68 PASS AO=84;DP=174;FAO=89;FDP=178;FR=.;FRO=89;FSAF=23;FSAR=66;FSRF=37;FSRR=52;FWDB=0.0186292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.9657;QD=8.37482;RBI=0.0192224;REFB=-0.0105353;REVB=0.00473877;RO=78;SAF=20;SAR=64;SRF=36;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232251;STB=0.593325;TYPE=snp;VARB=0.0102441;OID=.;OPOS=2054171;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:178:78:89:84:89:64:20:36:42:66:23:37:52 chr8 2088797 . C T 133.79 PASS AO=35;DP=81;FAO=35;FDP=81;FR=.;FRO=46;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=20;FSRR=26;FWDB=-0.0610631;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.2144;QD=6.60674;RBI=0.0666081;REFB=-0.00212889;REVB=0.0266071;RO=46;SAF=11;SAR=24;SRF=20;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132347;STB=0.574917;TYPE=snp;VARB=0.00192556;OID=.;OPOS=2088797;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:46:46:35:35:24:11:20:26:24:11:20:26 chr8 2091307 . G C 270 PASS AO=70;DP=156;FAO=70;FDP=155;FR=.;FRO=85;FSAF=25;FSAR=45;FSRF=32;FSRR=53;FWDB=0.0128122;FXX=0.00640985;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.35;QD=6.96784;RBI=0.0138323;REFB=-0.00447347;REVB=-0.0052135;RO=85;SAF=25;SAR=45;SRF=32;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0206031;STB=0.511462;TYPE=snp;VARB=0.00537878;OID=.;OPOS=2091307;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:155:85:85:70:70:45:25:32:53:45:25:32:53 chr8 2092803 . A G 194.41 PASS AO=44;DP=93;FAO=46;FDP=95;FR=.;FRO=49;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=12;FSRR=37;FWDB=0.0283709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.923;QD=8.18551;RBI=0.0285693;REFB=-0.016755;REVB=-0.00336179;RO=47;SAF=19;SAR=25;SRF=11;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194027;STB=0.602253;TYPE=snp;VARB=0.0164306;OID=.;OPOS=2092803;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:95:47:49:44:46:25:19:11:36:26:20:12:37 chr8 2148550 . G A 953.26 PASS AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00922305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.096;QD=38.5157;RBI=0.0307039;REFB=0;REVB=0.029286;RO=0;SAF=44;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000113175;OID=.;OPOS=2148550;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:99:99:0:0:99:99:55:44:0:0:55:44:0:0 chr8 2148771 . C T 773.07 PASS AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0334287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.747;QD=38.6534;RBI=0.0337787;REFB=0;REVB=0.00485051;RO=0;SAF=25;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000128464;OID=.;OPOS=2148771;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:80:80:0:0:80:80:55:25:0:0:55:25:0:0 chr8 2792964 . AT A 77.01 PASS AO=47;DP=171;FAO=63;FDP=136;FR=.;FRO=73;FSAF=32;FSAR=31;FSRF=30;FSRR=43;FWDB=0.063413;FXX=0.0144917;HRUN=7;LEN=1;MLLD=6.76364;QD=2.26501;RBI=0.0634917;REFB=-0.0824093;REVB=-0.00316079;RO=65;SAF=20;SAR=27;SRF=29;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0216609;STB=0.551965;TYPE=del;VARB=0.0749976;OID=.;OPOS=2792965;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:47:135:63:136:73:32:31:30:43:75:65:20:27:29:36 chr8 2795430 . T G 257.64 PASS AO=58;DP=111;FAO=58;FDP=112;FR=.;FRO=54;FSAF=18;FSAR=40;FSRF=29;FSRR=25;FWDB=0.0265932;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.966;QD=9.2013;RBI=0.0266148;REFB=-0.0033597;REVB=-0.00107399;RO=53;SAF=19;SAR=39;SRF=27;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167134;STB=0.616352;TYPE=snp;VARB=0.00379303;OID=.;OPOS=2795430;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:112:53:54:58:58:39:19:27:26:40:18:29:25 chr8 2795835 . T C 1368.11 PASS AO=145;DP=148;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300784;FXX=0.0201329;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.379;QD=37.4826;RBI=0.0374618;REFB=-0.0368639;REVB=0.022331;RO=2;SAF=47;SAR=98;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00960611;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000367672;OID=.;OPOS=2795835;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:148:146:2:0:145:146:98:47:0:2:99:47:0:0 chr8 2820043 . G T 430.79 PASS AO=95;DP=187;FAO=97;FDP=188;FR=.;FRO=91;FSAF=41;FSAR=56;FSRF=59;FSRR=32;FWDB=0.0468332;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.3093;QD=9.16568;RBI=0.0557777;REFB=0.0096331;REVB=0.0302952;RO=90;SAF=39;SAR=56;SRF=58;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205856;STB=0.608145;TYPE=snp;VARB=-0.00881188;OID=.;OPOS=2820043;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:188:90:91:95:97:56:39:58:32:56:41:59:32 chr8 2820745 . G C 644.52 PASS AO=134;DP=241;FAO=134;FDP=241;FR=.;FRO=107;FSAF=89;FSAR=45;FSRF=66;FSRR=41;FWDB=0.00209727;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=271.148;QD=10.6975;RBI=0.0138715;REFB=-0.00579792;REVB=0.013712;RO=107;SAF=89;SAR=45;SRF=66;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0426198;STB=0.523204;TYPE=snp;VARB=0.00485485;OID=.;OPOS=2820745;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:241:241:107:107:134:134:45:89:66:41:45:89:66:41 chr8 2832139 . C G 1781.17 PASS AO=181;DP=181;FAO=186;FDP=186;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=131;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00116224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.941;QD=38.3047;RBI=0.00684676;REFB=0;REVB=0.0067474;RO=0;SAF=55;SAR=126;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.05039e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.9514e-05;OID=.;OPOS=2832139;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:181:186:0:0:181:186:126:55:0:0:131:55:0:0 chr8 2855580 . TG T 470.62 PASS AO=63;DP=80;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.206733;FXX=0.0253133;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.5953;QD=24.4479;RBI=0.305184;REFB=-0.0130625;REVB=0.224496;RO=10;SAF=30;SAR=33;SRF=2;SRR=8;SSEN=0.34565;SSEP=0;SSSB=0.0714797;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0162495;OID=.;OPOS=2855581;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:63:79:77:77:0:35:42:0:0:41:10:30:33:2:8 chr8 2909992 . G A 2027.3 PASS AO=216;DP=219;FAO=216;FDP=216;FR=.;FRO=0;FSAF=140;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00512309;FXX=0.013698;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.345;QD=37.5427;RBI=0.0447703;REFB=-0.0450629;REVB=-0.0444762;RO=1;SAF=140;SAR=76;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00339118;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.71913e-05;OID=.;OPOS=2909992;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:219:216:1:0:216:216:76:140:1:0:76:140:0:0 chr8 2910020 . A G 2083.77 PASS AO=225;DP=230;FAO=225;FDP=230;FR=.;FRO=5;FSAF=143;FSAR=82;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.00150665;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.26;QD=36.2395;RBI=0.0173051;REFB=-0.084346;REVB=-0.0172394;RO=5;SAF=143;SAR=82;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.016366;STB=0.50859;TYPE=snp;VARB=0.00132043;OID=.;OPOS=2910020;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:230:230:5:5:225:225:82:143:5:0:82:143:5:0 chr8 2965244 . T C 145.02 PASS AO=46;DP=122;FAO=46;FDP=121;FR=.;FRO=75;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=36;FSRR=39;FWDB=-0.0278637;FXX=0.0319974;HRUN=3;LEN=1;MLLD=150.239;QD=4.7939;RBI=0.0278642;REFB=-0.0045186;REVB=-0.000159803;RO=75;SAF=21;SAR=25;SRF=36;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0257165;STB=0.51462;TYPE=snp;VARB=0.00806644;OID=.;OPOS=2965244;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:121:75:75:46:46:25:21:36:39:25:21:36:39 chr8 3072107 . G C 1394.34 PASS AO=95;DP=148;FAO=145;FDP=145;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=68;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.140025;FXX=0.00684885;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.901;QD=38.4644;RBI=0.145333;REFB=0;REVB=0.0389179;RO=0;SAF=19;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00421169;OID=.;OPOS=3072107;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:146:145:0:0:95:145:76:19:0:0:77:68:0:0 chr8 3200877 . C T 555.04 PASS AO=146;DP=315;FAO=145;FDP=314;FR=.;FRO=169;FSAF=48;FSAR=97;FSRF=71;FSRR=98;FWDB=-0.0253647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.357;QD=7.07057;RBI=0.0349247;REFB=-0.0203543;REVB=-0.0240076;RO=168;SAF=49;SAR=97;SRF=70;SRR=98;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0852159;STB=0.55221;TYPE=snp;VARB=0.020494;OID=.;OPOS=3200877;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:315:314:168:169:146:145:97:49:70:98:97:48:71:98 chr8 3253768 . C T 1944.86 PASS AO=203;DP=209;FAO=205;FDP=205;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=108;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0361403;FXX=0.0330173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.329;QD=37.9484;RBI=0.0555377;REFB=0;REVB=-0.0421702;RO=0;SAF=97;SAR=106;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000219794;OID=.;OPOS=3253768;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:92:209:205:0:0:203:205:106:97:0:0:108:97:0:0 chr8 3265590 . C T 1018.84 PASS AO=105;DP=105;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0258059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.793;QD=38.0875;RBI=0.0300302;REFB=0;REVB=-0.015358;RO=0;SAF=44;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.19972e-06;OID=.;OPOS=3265590;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:105:107:0:0:105:107:61:44:0:0:61:46:0:0 chr8 3558050 . G A 883.15 PASS AO=101;DP=107;FAO=101;FDP=107;FR=.;FRO=6;FSAF=23;FSAR=78;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0115111;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.434;QD=33.0151;RBI=0.0257301;REFB=-0.063392;REVB=0.0230116;RO=6;SAF=23;SAR=78;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0157888;STB=0.50834;TYPE=snp;VARB=0.00654718;OID=.;OPOS=3558050;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:107:107:6:6:101:101:78:23:2:4:78:23:2:4 chr8 3807528 . C T 1204.8 PASS AO=128;DP=130;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00169344;FXX=0.022899;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.691;QD=37.6498;RBI=0.0240493;REFB=-0.0639957;REVB=0.0239896;RO=1;SAF=60;SAR=68;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00693745;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.67465e-05;OID=.;OPOS=3807528;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:130:128:1:0:128:128:68:60:0:1:68:60:0:0 chr8 5768667 . A T 279.79 PASS AO=60;DP=115;FAO=61;FDP=116;FR=.;FRO=55;FSAF=35;FSAR=26;FSRF=27;FSRR=28;FWDB=-0.0101987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.643;QD=9.648;RBI=0.0102003;REFB=-0.0152827;REVB=0.000184791;RO=55;SAF=35;SAR=25;SRF=27;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0813285;STB=0.539679;TYPE=snp;VARB=0.0154405;OID=.;OPOS=5768667;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:116:55:55:60:61:25:35:27:28:26:35:27:28 chr8 6296550 . G T 2171.28 PASS AO=237;DP=245;FAO=237;FDP=243;FR=.;FRO=6;FSAF=115;FSAR=122;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=-0.0465993;FXX=0.00816293;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.926;QD=35.7413;RBI=0.0488061;REFB=-0.0210273;REVB=0.0145098;RO=6;SAF=115;SAR=122;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0228571;STB=0.511999;TYPE=snp;VARB=0.000229029;OID=.;OPOS=6296550;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:245:243:6:6:237:237:122:115:0:6:122:115:0:6 chr8 6302154 . G T 943.65 PASS AO=99;DP=101;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0119861;FXX=0.0196059;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.9606;QD=37.746;RBI=0.0204693;REFB=0;REVB=0.0165929;RO=0;SAF=36;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.61321e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.6951e-05;OID=.;OPOS=6302154;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:101:100:0:0:99:100:63:36:0:0:63:37:0:0 chr8 6302418 . A G 315.87 PASS AO=33;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0418319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.4689;QD=37.1614;RBI=0.0724415;REFB=0;REVB=-0.0591427;RO=0;SAF=7;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.44409e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000194471;OID=.;OPOS=6302418;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:34:0:0:33:34:26:7:0:0:26:8:0:0 chr8 6319260 . T C 243.43 PASS AO=74;DP=185;FAO=74;FDP=185;FR=.;FRO=111;FSAF=28;FSAR=46;FSRF=48;FSRR=63;FWDB=-0.0273384;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=181.575;QD=5.26337;RBI=0.0339705;REFB=-0.00350132;REVB=-0.0201644;RO=109;SAF=28;SAR=46;SRF=48;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0684556;STB=0.533894;TYPE=snp;VARB=0.00516931;OID=.;OPOS=6319260;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:185:109:111:74:74:46:28:48:61:46:28:48:63 chr8 6319284 . T C 314.07 PASS AO=80;DP=173;FAO=80;FDP=173;FR=.;FRO=93;FSAF=25;FSAR=55;FSRF=43;FSRR=50;FWDB=-0.0181141;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.985;QD=7.26179;RBI=0.0187135;REFB=-0.00822493;REVB=0.00469828;RO=93;SAF=25;SAR=55;SRF=43;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15745;STB=0.587566;TYPE=snp;VARB=0.00770497;OID=.;OPOS=6319284;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:173:93:93:80:80:55:25:43:50:55:25:43:50 chr8 6338306 . C A 486.7 PASS AO=126;DP=273;FAO=127;FDP=277;FR=.;FRO=150;FSAF=70;FSAR=57;FSRF=105;FSRR=45;FWDB=0.0263488;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0387;QD=7.02814;RBI=0.0408356;REFB=-0.00692432;REVB=-0.0311976;RO=146;SAF=69;SAR=57;SRF=105;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172147;STB=0.58281;TYPE=snp;VARB=0.00845431;OID=.;OPOS=6338306;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:273:277:146:150:126:127:57:69:105:41:57:70:105:45 chr8 6377433 . C T 2658.82 PASS AO=269;DP=271;FAO=277;FDP=277;FR=.;FRO=0;FSAF=121;FSAR=156;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0250497;FXX=0.0107139;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.477;QD=38.3945;RBI=0.0479578;REFB=0;REVB=0.0408957;RO=1;SAF=117;SAR=152;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00312656;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.44187e-05;OID=.;OPOS=6377433;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:271:277:1:0:269:277:152:117:0:1:156:121:0:0 chr8 6378763 . C T 2018.99 PASS AO=203;DP=203;FAO=212;FDP=212;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0351676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.314;QD=38.0941;RBI=0.0496783;REFB=0;REVB=0.0350881;RO=0;SAF=85;SAR=118;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000291824;OID=.;OPOS=6378763;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:96:203:212:0:0:203:212:118:85:0:0:120:92:0:0 chr8 6389889 . C A 2539.94 PASS AO=276;DP=282;FAO=276;FDP=282;FR=.;FRO=6;FSAF=159;FSAR=117;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0152315;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.308;QD=36.0275;RBI=0.0481946;REFB=-0.185374;REVB=0.0457244;RO=4;SAF=159;SAR=117;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0160186;STB=0.508893;TYPE=snp;VARB=0.00110736;OID=.;OPOS=6389889;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:282:282:4:6:276:276:117:159:0:4:117:159:1:5 chr8 6474473 . C G 485.45 PASS AO=124;DP=266;FAO=124;FDP=267;FR=.;FRO=143;FSAF=65;FSAR=59;FSRF=56;FSRR=87;FWDB=0.00557863;FXX=0.0037312;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.047;QD=7.2727;RBI=0.00625229;REFB=-0.017197;REVB=-0.00282312;RO=142;SAF=65;SAR=59;SRF=56;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125142;STB=0.570678;TYPE=snp;VARB=0.0248183;OID=.;OPOS=6474473;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:266:267:142:143:124:124:59:65:56:86:59:65:56:87 chr8 6478986 . C T 95.28 PASS AO=28;DP=73;FAO=29;FDP=73;FR=.;FRO=44;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=0.0202561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2875;QD=5.22101;RBI=0.0223986;REFB=-0.00933234;REVB=-0.00955955;RO=44;SAF=10;SAR=18;SRF=18;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0590631;STB=0.518874;TYPE=snp;VARB=0.00978631;OID=.;OPOS=6478986;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:73:73:44:44:28:29:18:10:18:26:18:11:18:26 chr8 6479042 . C T 58.88 PASS AO=21;DP=65;FAO=21;FDP=65;FR=.;FRO=44;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=0.00950527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.169;QD=3.6234;RBI=0.00964237;REFB=-0.0192663;REVB=-0.00162022;RO=44;SAF=8;SAR=13;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0872007;STB=0.551465;TYPE=snp;VARB=0.0336349;OID=.;OPOS=6479042;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:65:65:44:44:21:21:13:8:20:24:13:8:20:24 chr8 6479178 . C A 110.15 PASS AO=25;DP=52;FAO=25;FDP=52;FR=.;FRO=27;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=23;FSRR=4;FWDB=0.0352653;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.2783;QD=8.47325;RBI=0.0547832;REFB=-0.0226399;REVB=0.0419233;RO=27;SAF=17;SAR=8;SRF=23;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199183;STB=0.610609;TYPE=snp;VARB=0.0297131;OID=.;OPOS=6479178;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:27:27:25:25:8:17:23:4:8:17:23:4 chr8 6500544 . C T 432.88 PASS AO=91;DP=167;FAO=91;FDP=166;FR=.;FRO=75;FSAF=55;FSAR=36;FSRF=42;FSRR=33;FWDB=-0.0100809;FXX=0.00598767;HRUN=4;LEN=1;MLLD=228.238;QD=10.4307;RBI=0.0227536;REFB=-0.0196681;REVB=-0.0203986;RO=73;SAF=55;SAR=36;SRF=40;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0476115;STB=0.520786;TYPE=snp;VARB=0.0175031;OID=.;OPOS=6500544;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:166:73:75:91:91:36:55:40:33:36:55:42:33 chr8 6615663 . A G 1337.82 PASS AO=140;DP=142;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108544;FXX=0.0138879;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.191;QD=37.685;RBI=0.0235127;REFB=0.0219677;REVB=-0.0208574;RO=1;SAF=71;SAR=69;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00684118;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.52232e-05;OID=.;OPOS=6615663;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:142:142:1:0:140:142:69:71:0:1:69:73:0:0 chr8 6673377 . CA C 592.19 PASS AO=61;DP=71;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0563604;FXX=0.0447694;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.478;QD=37.0119;RBI=0.0644092;REFB=0;REVB=-0.0311778;RO=0;SAF=28;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.000114257;OID=.;OPOS=6673378;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:61:69:64:64:0:29:35:0:0:28:0:28:33:0:0 chr8 6735300 . T A 519.8 PASS AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.042067;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.906;QD=37.8035;RBI=0.0523572;REFB=0;REVB=0.0311713;RO=0;SAF=39;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11947e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.10669e-05;OID=.;OPOS=6735300;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:55:55:0:0:55:55:16:39:0:0:16:39:0:0 chr8 6793540 . C T 1013.66 PASS AO=107;DP=109;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0242089;FXX=0.0183469;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.239;QD=37.8937;RBI=0.0267089;REFB=-0.0660414;REVB=-0.0112825;RO=1;SAF=61;SAR=46;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0102062;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.31902e-05;OID=.;OPOS=6793540;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:109:107:1:0:107:107:46:61:0:1:46:61:0:0 chr8 6793581 . A G 244.61 PASS AO=56;DP=112;FAO=56;FDP=112;FR=.;FRO=56;FSAF=35;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=30;FWDB=0.015959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.629;QD=8.7361;RBI=0.026716;REFB=-0.0227717;REVB=-0.0214256;RO=56;SAF=35;SAR=21;SRF=26;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148497;STB=0.582162;TYPE=snp;VARB=0.0388636;OID=.;OPOS=6793581;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:56:56:56:56:21:35:26:30:21:35:26:30 chr8 6913031 . G A 150.43 PASS AO=57;DP=170;FAO=57;FDP=170;FR=.;FRO=113;FSAF=35;FSAR=22;FSRF=59;FSRR=54;FWDB=-0.00105847;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.295;QD=3.53949;RBI=0.0109082;REFB=0.000833949;REVB=-0.0108568;RO=113;SAF=35;SAR=22;SRF=59;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1087;STB=0.562584;TYPE=snp;VARB=-0.00193001;OID=.;OPOS=6913031;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:170:113:113:57:57:22:35:59:54:22:35:59:54 chr8 7154617 . T A 210.47 PASS AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2733;QD=36.6029;RBI=0.0762059;REFB=0;REVB=0.0728755;RO=0;SAF=19;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00228482;OID=.;OPOS=7154617;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:0:0:23:23:4:19:0:0:4:19:0:0 chr8 7308386 . T C 130.68 PASS AO=67;DP=244;FAO=68;FDP=246;FR=.;FRO=178;FSAF=30;FSAR=38;FSRF=95;FSRR=83;FWDB=-0.0240729;FXX=0.0199195;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.3122;QD=2.12482;RBI=0.0243062;REFB=-0.0182517;REVB=-0.00335905;RO=167;SAF=30;SAR=37;SRF=92;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125272;STB=0.566806;TYPE=snp;VARB=0.0533476;OID=.;OPOS=7308386;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:246:167:178:67:68:37:30:92:75:38:30:95:83 chr8 7308729 . G C 308.01 PASS AO=243;DP=743;FAO=129;FDP=398;FR=.;FRO=269;FSAF=65;FSAR=64;FSRF=157;FSRR=112;FWDB=0.00260923;FXX=0.00499988;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.1893;QD=3.09555;RBI=0.00390463;REFB=-0.00493208;REVB=-0.00290483;RO=488;SAF=128;SAR=115;SRF=290;SRR=198;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0798022;STB=0.553953;TYPE=snp;VARB=0.010013;OID=.;OPOS=7308729;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:743:398:488:269:243:129:115:128:290:198:64:65:157:112 chr8 7752255 . C T 60.29 PASS AO=58;DP=289;FAO=58;FDP=287;FR=.;FRO=229;FSAF=44;FSAR=14;FSRF=170;FSRR=59;FWDB=-0.002659;FXX=0.0103445;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.777;QD=0.840325;RBI=0.0264245;REFB=-0.00995113;REVB=-0.0262904;RO=226;SAF=44;SAR=14;SRF=168;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0262746;STB=0.517391;TYPE=snp;VARB=0.0429678;OID=.;OPOS=7752255;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:289:287:226:229:58:58:14:44:168:58:14:44:170:59 chr8 8098577 . G A 285.78 PASS AO=65;DP=128;FAO=65;FDP=129;FR=.;FRO=64;FSAF=27;FSAR=38;FSRF=31;FSRR=33;FWDB=-0.00265444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.905;QD=8.86147;RBI=0.00689095;REFB=-0.00653737;REVB=0.00635918;RO=62;SAF=27;SAR=38;SRF=30;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.061746;STB=0.534811;TYPE=snp;VARB=0.00691442;OID=.;OPOS=8098577;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:129:62:64:65:65:38:27:30:32:38:27:31:33 chr8 8099397 . T C 30.81 PASS AO=15;DP=60;FAO=15;FDP=61;FR=.;FRO=46;FSAF=14;FSAR=1;FSRF=30;FSRR=16;FWDB=0.00230924;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.091;QD=2.02057;RBI=0.0059612;REFB=0.00337007;REVB=0.00549575;RO=45;SAF=14;SAR=1;SRF=29;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.531334;STB=0.843374;TYPE=snp;VARB=-0.00599005;OID=.;OPOS=8099397;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:60:61:45:46:15:15:1:14:29:16:1:14:30:16 chr8 8099463 . C T 55.5 PASS AO=29;DP=113;FAO=29;FDP=112;FR=.;FRO=83;FSAF=22;FSAR=7;FSRF=52;FSRR=31;FWDB=-0.0297142;FXX=0.00884877;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.119;QD=1.98209;RBI=0.0424821;REFB=0.000227639;REVB=0.030361;RO=83;SAF=22;SAR=7;SRF=52;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192672;STB=0.617343;TYPE=snp;VARB=-0.0020215;OID=.;OPOS=8099463;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:113:112:83:83:29:29:7:22:52:31:7:22:52:31 chr8 8099464 . C A 60.4 PASS AO=30;DP=112;FAO=30;FDP=112;FR=.;FRO=82;FSAF=23;FSAR=7;FSRF=52;FSRR=30;FWDB=-0.0489164;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.524;QD=2.1572;RBI=0.0624354;REFB=-0.000643031;REVB=0.0387991;RO=81;SAF=23;SAR=7;SRF=51;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200841;STB=0.618374;TYPE=snp;VARB=0.00779574;OID=.;OPOS=8099464;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:112:112:81:82:30:30:7:23:51:30:7:23:52:30 chr8 8099514 . A G 55.36 PASS AO=34;DP=143;FAO=34;FDP=143;FR=.;FRO=109;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=63;FSRR=46;FWDB=0.0128064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.896;QD=1.54859;RBI=0.0128064;REFB=-0.00213208;REVB=1.73216e-05;RO=109;SAF=23;SAR=11;SRF=63;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132314;STB=0.58081;TYPE=snp;VARB=0.00852261;OID=.;OPOS=8099514;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:143:143:109:109:34:34:11:23:63:46:11:23:63:46 chr8 8099556 . G A 16.76 PASS AO=22;DP=135;FAO=22;FDP=135;FR=.;FRO=113;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=62;FSRR=51;FWDB=-0.0105482;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.282;QD=0.4966;RBI=0.0135158;REFB=-0.00275419;REVB=0.00845047;RO=111;SAF=11;SAR=11;SRF=61;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0631485;STB=0.540704;TYPE=snp;VARB=0.0189262;OID=.;OPOS=8099556;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:135:135:111:113:22:22:11:11:61:50:11:11:62:51 chr8 8176221 . C T 64.47 PASS AO=12;DP=22;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0270991;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.357;QD=11.7226;RBI=0.0271196;REFB=-0.0188482;REVB=0.00105398;RO=10;SAF=6;SAR=6;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00836931;OID=.;OPOS=8176221;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:22:22:10:10:12:12:6:6:5:5:6:6:5:5 chr8 8176554 . C T 92.95 PASS AO=25;DP=61;FAO=25;FDP=61;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=0.0369721;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.3771;QD=6.09538;RBI=0.0534391;REFB=-0.0250018;REVB=-0.038585;RO=36;SAF=15;SAR=10;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243402;STB=0.638601;TYPE=snp;VARB=0.0285945;OID=.;OPOS=8176554;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:61:61:36:36:25:25:10:15:13:23:10:15:13:23 chr8 8185746 . T C 145.27 PASS AO=33;DP=67;FAO=33;FDP=67;FR=.;FRO=34;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=-0.0403548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.918;QD=8.67254;RBI=0.0481398;REFB=-0.0215007;REVB=0.0262475;RO=33;SAF=17;SAR=16;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136999;STB=0.567233;TYPE=snp;VARB=0.0147493;OID=.;OPOS=8185746;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:33:34:33:33:16:17:22:11:16:17:22:12 chr8 8234077 . G C 41.81 PASS AO=10;DP=25;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=15;FWDB=0.0365889;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.3828;QD=6.43288;RBI=0.0726147;REFB=-0.0502987;REVB=0.0627227;RO=15;SAF=2;SAR=8;SRF=0;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.43467;STB=0.727016;TYPE=snp;VARB=0.0907172;OID=.;OPOS=8234077;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:25:26:15:15:10:11:8:2:0:15:9:2:0:15 chr8 8234192 . G C 118.26 PASS AO=24;DP=43;FAO=24;FDP=44;FR=.;FRO=20;FSAF=19;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.0227346;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.8365;QD=10.7514;RBI=0.0312525;REFB=-0.0431801;REVB=-0.0214443;RO=19;SAF=19;SAR=5;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.413723;STB=0.724374;TYPE=snp;VARB=0.028216;OID=.;OPOS=8234192;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:43:44:19:20:24:24:5:19:6:13:5:19:7:13 chr8 8234218 . C T 173.32 PASS AO=32;DP=52;FAO=32;FDP=53;FR=.;FRO=21;FSAF=29;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.00256266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.637;QD=13.0811;RBI=0.00428902;REFB=-0.0139725;REVB=-0.00343925;RO=17;SAF=29;SAR=3;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.555044;STB=0.820053;TYPE=snp;VARB=0.0132188;OID=.;OPOS=8234218;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:52:53:17:21:32:32:3:29:5:12:3:29:7:14 chr8 8234219 . G A 177.72 PASS AO=32;DP=50;FAO=32;FDP=52;FR=.;FRO=20;FSAF=29;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.00263646;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.551;QD=13.6705;RBI=0.00811878;REFB=-0.0152406;REVB=-0.00767879;RO=18;SAF=29;SAR=3;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.572054;STB=0.810948;TYPE=snp;VARB=0.0099927;OID=.;OPOS=8234219;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:50:52:18:20:32:32:3:29:5:13:3:29:7:13 chr8 8234714 . C T 20.93 PASS AO=4;DP=14;FAO=4;FDP=11;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=-0.0100748;FXX=0.214133;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.2137;QD=7.61239;RBI=0.0140874;REFB=-0.0121663;REVB=-0.0098465;RO=6;SAF=3;SAR=1;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.623982;STB=0.887626;TYPE=snp;VARB=0.00748337;OID=.;OPOS=8234714;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:14:11:6:7:4:4:1:3:0:6:1:3:0:7 chr8 8234868 . C CGCCGCT 42.79 PASS AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.00338603;FXX=0.076864;HRUN=1;LEN=6;MLLD=190.285;QD=14.2634;RBI=0.0146929;REFB=0.00548853;REVB=0.0142974;RO=5;SAF=4;SAR=3;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171168;STB=0.599732;TYPE=ins;VARB=-0.00238855;OID=.;OPOS=8234869;OREF=-;OALT=GCCGCT;OMAPALT=CGCCGCT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:7:13:7:12:5:4:3:4:1:25:5:4:3:4:1 chr8 8235523 . G A 126.16 PASS AO=18;DP=23;FAO=18;FDP=23;FR=.;FRO=5;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.0245101;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.07;QD=21.9407;RBI=0.0245805;REFB=-0.0106892;REVB=-0.00185847;RO=5;SAF=8;SAR=10;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0991674;STB=0.554396;TYPE=snp;VARB=0.00386484;OID=.;OPOS=8235523;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:23:23:5:5:18:18:10:8:1:4:10:8:1:4 chr8 8439879 . A G 104.76 PASS AO=25;DP=54;FAO=25;FDP=54;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=-0.0341706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.4561;QD=7.75981;RBI=0.0916281;REFB=-0.00944461;REVB=-0.0850181;RO=29;SAF=16;SAR=9;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0521665;STB=0.529389;TYPE=snp;VARB=0.00778022;OID=.;OPOS=8439879;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:29:29:25:25:9:16:20:9:9:16:20:9 chr8 8440074 . G A 262.12 PASS AO=43;DP=98;FAO=44;FDP=91;FR=.,HEALED;FRO=35;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=27;FSRR=8;FWDB=-0.0233601;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.099;QD=11.5216;RBI=0.0272594;REFB=-0.0292731;REVB=0.0140493;RO=31;SAF=20;SAR=23;SRF=24;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233987;STB=0.629004;TYPE=snp;VARB=0.0213146;OID=.;OPOS=8440074;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:31:35:43:44:23:20:24:7:23:21:27:8 chr8 8560602 . C T 61.39 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.10999;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.4145;QD=35.0794;RBI=0.110545;REFB=0;REVB=0.0110642;RO=0;SAF=6;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0111267;OID=.;OPOS=8560602;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:6:0:0:1:6:0:0 chr8 8560909 . G C 756.77 PASS AO=83;DP=84;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212826;FXX=0.03529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.0751;QD=36.9154;RBI=0.0644797;REFB=-0.0191163;REVB=0.0608661;RO=1;SAF=52;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0150318;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000727796;OID=.;OPOS=8560909;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:84:82:1:0:83:82:31:52:0:1:32:50:0:0 chr8 8561391 . A AT 357.47 PASS AO=50;DP=69;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.003903;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.0584;QD=21.3413;RBI=0.308896;REFB=-0.0224485;REVB=0.308871;RO=14;SAF=31;SAR=19;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0511375;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.0173061;OID=.;OPOS=8561392;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:50:69:67:67:0:41:26:0:0:25:14:31:19:7:7 chr8 8561399 . G T 614.27 PASS AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0272715;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.435;QD=36.6728;RBI=0.0424194;REFB=-0.0157076;REVB=0.032491;RO=1;SAF=41;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0185226;STB=0.509801;TYPE=snp;VARB=0.00116147;OID=.;OPOS=8561399;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:67:67:1:1:66:66:25:41:0:1:25:41:0:1 chr8 8561442 . A G 627.42 PASS AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0392914;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.7214;QD=38.0252;RBI=0.0398667;REFB=0;REVB=-0.0067484;RO=0;SAF=30;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000678631;OID=.;OPOS=8561442;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:66:66:0:0:66:66:36:30:0:0:36:30:0:0 chr8 8561452 . A G 527.79 PASS AO=55;DP=58;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00957007;FXX=0.0499917;HRUN=3;LEN=1;MLLD=80.6853;QD=37.0382;RBI=0.0157371;REFB=-0.00931913;REVB=-0.0124928;RO=2;SAF=23;SAR=32;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00555122;STB=0.510634;TYPE=snp;VARB=0.000706214;OID=.;OPOS=8561452;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:58:57:2:1:55:56:32:23:1:1:33:23:1:0 chr8 8561536 . T C 289.97 PASS AO=22;DP=34;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.109916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4167;QD=37.4157;RBI=0.109961;REFB=0;REVB=-0.00313519;RO=0;SAF=2;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.80459e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0016934;OID=.;OPOS=8561536;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:22:31:0:0:22:31:20:2:0:0:25:6:0:0 chr8 8561537 . G A 290.01 PASS AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0402919;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.894;QD=37.4203;RBI=0.0428816;REFB=0;REVB=0.0146765;RO=0;SAF=6;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.16261e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.63771e-05;OID=.;OPOS=8561537;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:31:31:0:0:31:31:25:6:0:0:25:6:0:0 chr8 8561552 . T C 232.44 PASS AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0527532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.7088;QD=34.4356;RBI=0.0556552;REFB=0.0416544;REVB=0.0177369;RO=1;SAF=5;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.021616;STB=0.511619;TYPE=snp;VARB=-0.000502627;OID=.;OPOS=8561552;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:27:27:1:1:26:26:21:5:0:1:21:5:0:1 chr8 8643582 . C G 1363.29 PASS AO=143;DP=147;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0661957;FXX=0.0270252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.2523;QD=37.8691;RBI=0.074991;REFB=-0.0754474;REVB=0.035239;RO=0;SAF=47;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.66974e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000952623;OID=.;OPOS=8643582;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:147:144:0:0:143:144:96:47:0:0:96:48:0:0 chr8 8747894 . A G 1644.62 PASS AO=177;DP=179;FAO=176;FDP=179;FR=.;FRO=3;FSAF=86;FSAR=90;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0641634;FXX=0.00555525;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.8518;QD=36.7512;RBI=0.0647362;REFB=-0.0533091;REVB=-0.00859242;RO=1;SAF=87;SAR=90;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00526014;STB=0.502604;TYPE=snp;VARB=0.000340167;OID=.;OPOS=8747894;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:179:179:1:3:177:176:90:87:0:1:90:86:1:2 chr8 8860620 . T C 147.56 PASS AO=15;DP=15;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0229505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.933;QD=36.8901;RBI=0.0342118;REFB=0;REVB=0.0253717;RO=0;SAF=4;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33019e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.88754e-05;OID=.;OPOS=8860620;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:16:0:0:15:16:11:4:0:0:11:5:0:0 chr8 9145082 . T C 1202.71 PASS AO=127;DP=128;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0291511;FXX=0.00781189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.868;QD=37.8806;RBI=0.0384558;REFB=-0.0625721;REVB=0.025081;RO=0;SAF=33;SAR=94;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.38953e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.97204e-05;OID=.;OPOS=9145082;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:128:127:0:0:127:127:94:33:0:0:94:33:0:0 chr8 9413875 . T C 152.11 PASS AO=37;DP=83;FAO=39;FDP=85;FR=.;FRO=46;FSAF=3;FSAR=36;FSRF=9;FSRR=37;FWDB=-0.00279009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.034;QD=7.15801;RBI=0.00280179;REFB=0.0020202;REVB=-0.0002558;RO=46;SAF=1;SAR=36;SRF=9;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.558811;STB=0.663491;TYPE=snp;VARB=0.000965404;OID=.;OPOS=9413875;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:85:46:46:37:39:36:1:9:37:36:3:9:37 chr8 9414502 . C G 351.63 PASS AO=74;DP=141;FAO=74;FDP=137;FR=.;FRO=63;FSAF=24;FSAR=50;FSRF=25;FSRR=38;FWDB=-0.022481;FXX=0.0283668;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.301;QD=10.2665;RBI=0.025494;REFB=-0.00595032;REVB=0.0120229;RO=58;SAF=24;SAR=50;SRF=22;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.04945;STB=0.537035;TYPE=snp;VARB=0.00333112;OID=.;OPOS=9414502;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:137:58:63:74:74:50:24:22:36:50:24:25:38 chr8 9414642 . G A 458.8 PASS AO=105;DP=210;FAO=106;FDP=210;FR=.;FRO=104;FSAF=42;FSAR=64;FSRF=42;FSRR=62;FWDB=0.0124562;FXX=0.00473911;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.809;QD=8.73915;RBI=0.0125054;REFB=-0.0167095;REVB=0.0011081;RO=103;SAF=42;SAR=63;SRF=42;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00728601;STB=0.503936;TYPE=snp;VARB=0.0150599;OID=.;OPOS=9414642;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:210:210:103:104:105:106:63:42:42:61:64:42:42:62 chr8 9415168 . G A 2487.63 PASS AO=252;DP=252;FAO=259;FDP=259;FR=.;FRO=0;FSAF=132;FSAR=127;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.033362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.832;QD=38.4191;RBI=0.0354236;REFB=0;REVB=0.0119084;RO=0;SAF=128;SAR=124;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.34613e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000129181;OID=.;OPOS=9415168;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:252:259:0:0:252:259:124:128:0:0:127:132:0:0 chr8 9564437 . A G 388.05 PASS AO=101;DP=228;FAO=103;FDP=229;FR=.;FRO=126;FSAF=30;FSAR=73;FSRF=58;FSRR=68;FWDB=0.0111001;FXX=0.0213666;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.905;QD=6.77812;RBI=0.0146063;REFB=-0.00513548;REVB=-0.00949374;RO=124;SAF=30;SAR=71;SRF=56;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169085;STB=0.602945;TYPE=snp;VARB=0.00705615;OID=.;OPOS=9564437;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:228:229:124:126:101:103:71:30:56:68:73:30:58:68 chr8 9577940 . T C 1351.44 PASS AO=141;DP=141;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00132019;FXX=0.0208319;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.698;QD=38.3388;RBI=0.0782014;REFB=0;REVB=0.0781903;RO=0;SAF=80;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000599398;OID=.;OPOS=9577940;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:141:141:0:0:141:141:61:80:0:0:64:77:0:0 chr8 9734267 . A C 506.8 PASS AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00204528;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=267.367;QD=36.1997;RBI=0.00831706;REFB=-0.127102;REVB=0.00806166;RO=0;SAF=29;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.40922e-08;STB=0.509431;TYPE=snp;VARB=0.000212595;OID=.;OPOS=9734267;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:56:56:0:1:55:55:26:29:0:0:26:29:0:1 chr8 9734284 . G A 437.38 PASS AO=48;DP=50;FAO=48;FDP=50;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00242161;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=186.923;QD=34.9903;RBI=0.0149711;REFB=-0.0343333;REVB=0.014774;RO=0;SAF=23;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.519223;TYPE=snp;VARB=0.000122785;OID=.;OPOS=9734284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:50:50:0:2:48:48:25:23:0:0:25:23:0:2 chr8 10285825 . T G 399.63 PASS AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0122821;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=157.335;QD=35.5225;RBI=0.0159144;REFB=-0.0331855;REVB=-0.0101201;RO=1;SAF=16;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0164853;STB=0.508768;TYPE=snp;VARB=0.000191317;OID=.;OPOS=10285825;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:45:45:1:1:44:44:28:16:0:1:28:16:0:1 chr8 10383138 . G A 401.04 PASS AO=45;DP=47;FAO=45;FDP=47;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0938804;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=253.561;QD=34.1307;RBI=0.0945236;REFB=-0.0218233;REVB=0.0110082;RO=1;SAF=2;SAR=43;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108083;STB=0.594421;TYPE=snp;VARB=0.000725132;OID=.;OPOS=10383138;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:47:47:1:2:45:45:43:2:0:1:43:2:1:1 chr8 10396054 . A C 866.16 PASS AO=92;DP=93;FAO=93;FDP=94;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0966234;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.5847;QD=36.8578;RBI=0.103757;REFB=-0.124691;REVB=-0.0378069;RO=1;SAF=41;SAR=51;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00920527;STB=0.504853;TYPE=snp;VARB=0.00309029;OID=.;OPOS=10396054;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:93:94:1:1:92:93:51:41:0:1:51:42:0:1 chr8 10464885 . T C 147.06 PASS AO=28;DP=49;FAO=28;FDP=49;FR=.;FRO=21;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=0.0003011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.79;QD=12.0053;RBI=0.00209281;REFB=-0.0415735;REVB=-0.00207103;RO=21;SAF=20;SAR=8;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0440978;STB=0.524458;TYPE=snp;VARB=0.0355478;OID=.;OPOS=10464885;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:49:49:21:21:28:28:8:20:14:7:8:20:14:7 chr8 10465097 . C T 16.26 PASS AO=6;DP=14;FAO=4;FDP=14;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.0448219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.87;QD=4.64565;RBI=0.0450018;REFB=-0.02894;REVB=0.0040207;RO=6;SAF=3;SAR=3;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.798629;TYPE=snp;VARB=0.041737;OID=.;OPOS=10465097;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:14:14:6:10:6:4:3:3:3:3:3:1:7:3 chr8 10465190 . C T 15.49 PASS AO=3;DP=8;FAO=3;FDP=8;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.131543;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=39.2447;QD=7.74536;RBI=0.170924;REFB=-0.049961;REVB=0.109139;RO=5;SAF=1;SAR=2;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.584388;STB=0.855601;TYPE=snp;VARB=0.103674;OID=.;OPOS=10465190;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:8:8:5:5:3:3:2:1:5:0:2:1:5:0 chr8 10465344 . C A 105.68 PASS AO=14;DP=17;FAO=14;FDP=17;FR=.;FRO=3;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.00916761;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.864;QD=24.8669;RBI=0.169701;REFB=-0.00279902;REVB=0.169453;RO=3;SAF=12;SAR=2;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101073;STB=0.555482;TYPE=snp;VARB=0.00175269;OID=.;OPOS=10465344;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:17:17:3:3:14:14:2:12:3:0:2:12:3:0 chr8 10465748 . T C 17.4 PASS AO=4;DP=13;FAO=4;FDP=13;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.0938588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.0595;QD=5.35458;RBI=0.0985465;REFB=-0.0153212;REVB=-0.0300325;RO=8;SAF=1;SAR=3;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.37999;STB=0.776449;TYPE=snp;VARB=0.0676376;OID=.;OPOS=10465748;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:13:13:8:9:4:4:3:1:5:3:3:1:6:3 chr8 10465771 . G T 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0998227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.646;QD=35.0875;RBI=0.0998615;REFB=0;REVB=0.00278218;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00315659;OID=.;OPOS=10465771;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:3:4:0:0:3:4:0:0 chr8 10466482 . G A 26.02 PASS AO=15;DP=70;FAO=15;FDP=68;FR=.;FRO=53;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=35;FWDB=-0.0167198;FXX=0.0285673;HRUN=4;LEN=1;MLLD=131.267;QD=1.53062;RBI=0.021531;REFB=-0.00938558;REVB=0.0135658;RO=46;SAF=4;SAR=11;SRF=17;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145056;STB=0.56798;TYPE=snp;VARB=0.0411973;OID=.;OPOS=10466482;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:70:68:46:53:15:15:11:4:17:29:11:4:18:35 chr8 10467207 . C A 782.84 PASS AO=83;DP=84;FAO=84;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=70;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0777903;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.0389;QD=36.8394;RBI=0.0951453;REFB=-0.0868602;REVB=0.054784;RO=1;SAF=69;SAR=14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0326237;STB=0.517237;TYPE=snp;VARB=0.0012742;OID=.;OPOS=10467207;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:84:85:1:1:83:84:14:69:0:1:14:70:0:1 chr8 10467605 . C T 70.5 PASS AO=11;DP=16;FAO=11;FDP=16;FR=.;FRO=5;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0358072;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=176.578;QD=17.6255;RBI=0.0359434;REFB=-0.0394455;REVB=-0.00312702;RO=5;SAF=7;SAR=4;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240587;STB=0.636115;TYPE=snp;VARB=0.025361;OID=.;OPOS=10467605;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:16:16:5:5:11:11:4:7:1:4:4:7:1:4 chr8 10467627 . T C 10.97 PASS AO=2;DP=9;FAO=2;FDP=9;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=-0.0044925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.9954;QD=4.87709;RBI=0.252515;REFB=-0.0765134;REVB=-0.252475;RO=7;SAF=1;SAR=1;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.402818;STB=0.775849;TYPE=snp;VARB=0.0640943;OID=.;OPOS=10467627;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:7:7:2:2:1:1:1:6:1:1:1:6 chr8 10467629 . T C 43.04 PASS AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.00165415;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=99.5354;QD=14.3458;RBI=0.0706217;REFB=-0.0219411;REVB=-0.0706023;RO=4;SAF=2;SAR=5;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0275654;STB=0.55539;TYPE=snp;VARB=0.0263381;OID=.;OPOS=10467629;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:12:12:4:5:7:7:5:2:1:3:5:2:2:3 chr8 10467636 . T C 48.75 PASS AO=8;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0195815;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.664;QD=15.0008;RBI=0.0270862;REFB=-0.014433;REVB=0.0187144;RO=5;SAF=3;SAR=5;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151251;STB=0.588011;TYPE=snp;VARB=0.0263374;OID=.;OPOS=10467636;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:13:13:5:5:8:8:5:3:3:2:5:3:3:2 chr8 10467637 . T C 97.74 PASS AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0200008;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.706;QD=30.075;RBI=0.0242977;REFB=0.0181343;REVB=0.0137967;RO=1;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.069361;STB=0.538398;TYPE=snp;VARB=-0.000109425;OID=.;OPOS=10467637;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:13:13:1:1:12:12:6:6:0:1:6:6:0:1 chr8 10468172 . G A 34.58 PASS AO=13;DP=50;FAO=14;FDP=51;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=-0.0162656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.182;QD=2.71188;RBI=0.0174222;REFB=-0.00428832;REVB=0.00624214;RO=37;SAF=11;SAR=2;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.428154;STB=0.780364;TYPE=snp;VARB=0.0044614;OID=.;OPOS=10468172;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:50:51:37:37:13:14:2:11:20:17:2:12:20:17 chr8 10469233 . A G 13.38 PASS AO=4;DP=17;FAO=4;FDP=17;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=2;FWDB=-0.0058548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.641;QD=3.14786;RBI=0.0120176;REFB=-0.00601288;REVB=0.010495;RO=13;SAF=3;SAR=1;SRF=11;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163891;STB=0.608227;TYPE=snp;VARB=0.0239269;OID=.;OPOS=10469233;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:17:17:13:13:4:4:1:3:11:2:1:3:11:2 chr8 10469454 . G T 131.08 PASS AO=44;DP=118;FAO=43;FDP=118;FR=.;FRO=75;FSAF=6;FSAR=37;FSRF=29;FSRR=46;FWDB=0.0654094;FXX=0.00840265;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.6753;QD=4.44328;RBI=0.0942317;REFB=-0.0345371;REVB=0.0678324;RO=72;SAF=6;SAR=38;SRF=26;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.355631;STB=0.722131;TYPE=snp;VARB=0.0705396;OID=.;OPOS=10469454;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:72:75:44:43:38:6:26:46:37:6:29:46 chr8 10469817 . G A 277.97 PASS AO=70;DP=152;FAO=71;FDP=152;FR=.;FRO=81;FSAF=29;FSAR=42;FSRF=30;FSRR=51;FWDB=0.00849343;FXX=0.0318451;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.734;QD=7.31491;RBI=0.0159369;REFB=-0.0153775;REVB=0.0134851;RO=64;SAF=29;SAR=41;SRF=15;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167144;STB=0.521154;TYPE=snp;VARB=0.0187286;OID=.;OPOS=10469817;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:152:64:81:70:71:41:29:15:49:42:29:30:51 chr8 10470068 . C T 36.3 PASS AO=14;DP=49;FAO=14;FDP=49;FR=.;FRO=35;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=27;FSRR=8;FWDB=0.000981625;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.697;QD=2.96317;RBI=0.0162378;REFB=-0.0103699;REVB=-0.0162081;RO=35;SAF=7;SAR=7;SRF=27;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.327624;STB=0.693642;TYPE=snp;VARB=0.0239154;OID=.;OPOS=10470068;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:49:49:35:35:14:14:7:7:27:8:7:7:27:8 chr8 10474042 . T G 135.37 PASS AO=35;DP=93;FAO=39;FDP=96;FR=.;FRO=57;FSAF=8;FSAR=31;FSRF=18;FSRR=39;FWDB=0.0332225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.413;QD=5.6403;RBI=0.0378742;REFB=-0.0208799;REVB=0.0181857;RO=57;SAF=8;SAR=27;SRF=18;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122861;STB=0.589994;TYPE=snp;VARB=0.028111;OID=.;OPOS=10474042;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:96:57:57:35:39:27:8:18:39:31:8:18:39 chr8 10530218 . C T 384.8 PASS AO=41;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0401279;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.777;QD=36.6472;RBI=0.0402004;REFB=0;REVB=0.00241299;RO=0;SAF=21;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02085e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00289549;OID=.;OPOS=10530218;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:42:42:0:0:41:42:20:21:0:0:21:21:0:0 chr8 10583506 . A G 162.47 PASS AO=33;DP=61;FAO=33;FDP=61;FR=.;FRO=28;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=8;FWDB=-0.0336925;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=246.147;QD=10.6535;RBI=0.0337295;REFB=-0.00565862;REVB=0.00157989;RO=28;SAF=22;SAR=11;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0451957;STB=0.524985;TYPE=snp;VARB=0.00401467;OID=.;OPOS=10583506;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:28:28:33:33:11:22:20:8:11:22:20:8 chr8 10689212 . C T 188.08 PASS AO=50;DP=115;FAO=50;FDP=114;FR=.;FRO=64;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=33;FSRR=31;FWDB=-0.0387483;FXX=0.0086949;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.323;QD=6.59928;RBI=0.0398915;REFB=-0.0135213;REVB=-0.00948151;RO=64;SAF=25;SAR=25;SRF=33;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.015666;STB=0.508768;TYPE=snp;VARB=0.0119347;OID=.;OPOS=10689212;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:114:64:64:50:50:25:25:33:31:25:25:33:31 chr8 10754511 . C T 2975.77 PASS AO=308;DP=309;FAO=313;FDP=313;FR=.;FRO=0;FSAF=119;FSAR=194;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0376215;FXX=0.00318461;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.5963;QD=38.029;RBI=0.0387703;REFB=-0.0888342;REVB=0.00936816;RO=1;SAF=114;SAR=194;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00416552;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000459755;OID=.;OPOS=10754511;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:309:313:1:0:308:313:194:114:1:0:194:119:0:0 chr8 11155423 . GC G 1052.52 PASS AO=140;DP=185;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=145;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.164997;FXX=0.0129024;HRUN=3;LEN=1;MLLD=17.0481;QD=27.5168;RBI=0.203197;REFB=0;REVB=0.118595;RO=8;SAF=4;SAR=136;SRF=1;SRR=7;SSEN=0.491228;SSEP=0;SSSB=-0.0815162;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00386122;OID=.;OPOS=11155424;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:140:155:153:153:0:8:145:0:0:95:8:4:136:1:7 chr8 11162496 . A C 393.06 PASS AO=119;DP=286;FAO=119;FDP=292;FR=.;FRO=173;FSAF=35;FSAR=84;FSRF=80;FSRR=93;FWDB=-0.0774257;FXX=0.0101691;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.493;QD=5.3844;RBI=0.0795049;REFB=0.00452585;REVB=0.0180639;RO=165;SAF=35;SAR=84;SRF=73;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170592;STB=0.609252;TYPE=snp;VARB=-0.00524247;OID=.;OPOS=11162496;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:286:292:165:173:119:119:84:35:73:92:84:35:80:93 chr8 11184937 . G A 3224.16 PASS AO=315;DP=323;FAO=341;FDP=341;FR=.;FRO=0;FSAF=143;FSAR=198;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00247364;FXX=0.00292389;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.3154;QD=37.82;RBI=0.0171588;REFB=0;REVB=0.0169796;RO=0;SAF=120;SAR=195;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.63276e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00052238;OID=.;OPOS=11184937;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:323:341:0:0:315:341:195:120:0:0:198:143:0:0 chr8 11188743 . C T 315.71 PASS AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0236295;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=155.401;QD=35.0783;RBI=0.0242417;REFB=-0.0719069;REVB=-0.00541384;RO=1;SAF=18;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0252795;STB=0.513506;TYPE=snp;VARB=0.000731062;OID=.;OPOS=11188743;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:36:36:1:1:35:35:17:18:1:0:17:18:1:0 chr8 11188752 . G A 340.32 PASS AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00378039;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=172.731;QD=35.8233;RBI=0.0630599;REFB=-0.126007;REVB=0.0629465;RO=1;SAF=17;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0267496;STB=0.514278;TYPE=snp;VARB=0.000858019;OID=.;OPOS=11188752;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:38:38:1:1:37:37:20:17:1:0:20:17:1:0 chr8 11189316 . G C 248.51 PASS AO=28;DP=32;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0397484;FXX=0.0937207;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2333;QD=34.2771;RBI=0.0438518;REFB=0.0361524;REVB=-0.0185215;RO=1;SAF=7;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0216544;STB=0.51162;TYPE=snp;VARB=-0.0010749;OID=.;OPOS=11189316;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:32:29:1:1:28:28:21:7:0:1:21:7:0:1 chr8 11189488 . T C 686.98 PASS AO=76;DP=79;FAO=76;FDP=79;FR=.;FRO=3;FSAF=41;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0815172;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.943;QD=34.7837;RBI=0.0824154;REFB=-0.116098;REVB=-0.0121342;RO=3;SAF=41;SAR=35;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0388441;STB=0.520543;TYPE=snp;VARB=0.00131336;OID=.;OPOS=11189488;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:79:79:3:3:76:76:35:41:0:3:35:41:0:3 chr8 11189535 . T C 544.86 PASS AO=59;DP=62;FAO=61;FDP=63;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0571086;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.3653;QD=34.5942;RBI=0.0892708;REFB=-0.189347;REVB=0.0686141;RO=3;SAF=33;SAR=26;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00994043;STB=0.502392;TYPE=snp;VARB=0.00733193;OID=.;OPOS=11189535;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:62:63:3:2:59:61:26:33:2:1:26:35:1:1 chr8 11189591 . C T 22.51 PASS AO=10;DP=47;FAO=11;FDP=47;FR=.,HEALED;FRO=36;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=12;FWDB=-0.0296535;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=152.207;QD=1.91554;RBI=0.0314229;REFB=-0.0155394;REVB=-0.0103958;RO=28;SAF=1;SAR=9;SRF=19;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.659416;STB=0.918397;TYPE=snp;VARB=0.0420435;OID=.;OPOS=11189591;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:46:47:28:36:10:11:9:1:19:9:10:1:24:12 chr8 11204165 . C T 670.54 PASS AO=69;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.9104;QD=38.3166;RBI=0.0201733;REFB=0;REVB=-0.00650811;RO=0;SAF=41;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.54051e-05;OID=.;OPOS=11204165;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:70:70:0:0:69:70:28:41:0:0:29:41:0:0 chr8 11204184 . G A 657.38 PASS AO=67;DP=67;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00304509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.473;QD=38.1088;RBI=0.0331419;REFB=0;REVB=0.0330017;RO=0;SAF=37;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.62623e-05;OID=.;OPOS=11204184;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:67:69:0:0:67:69:30:37:0:0:30:39:0:0 chr8 11301753 . A C 1285.89 PASS AO=134;DP=136;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0170464;FXX=0.0218962;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.7731;QD=38.3848;RBI=0.0170647;REFB=0;REVB=-0.000788978;RO=0;SAF=67;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000342763;OID=.;OPOS=11301753;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:136:134:0:0:134:134:67:67:0:0:67:67:0:0 chr8 11405607 . AG A 39.3 PASS AO=26;DP=69;FAO=25;FDP=64;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=25;FSRR=14;FWDB=0.029002;FXX=0.0153822;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.7882;QD=2.45653;RBI=0.0400444;REFB=-0.0712933;REVB=-0.0276123;RO=34;SAF=15;SAR=11;SRF=23;SRR=11;SSEN=0.342857;SSEP=0;SSSB=-0.103975;STB=0.500678;TYPE=del;VARB=0.109327;OID=.;OPOS=11405608;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:26:62:25:64:39:16:9:25:14:39:34:15:11:23:11 chr8 11406593 . T C 189.9 PASS AO=55;DP=133;FAO=55;FDP=134;FR=.;FRO=79;FSAF=17;FSAR=38;FSRF=42;FSRR=37;FWDB=-0.0502255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.456;QD=5.66869;RBI=0.0528402;REFB=-0.0194566;REVB=0.0164163;RO=78;SAF=17;SAR=38;SRF=42;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.249086;STB=0.637424;TYPE=snp;VARB=0.0195363;OID=.;OPOS=11406593;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:134:78:79:55:55:38:17:42:36:38:17:42:37 chr8 11410987 . C A 353.31 PASS AO=72;DP=129;FAO=72;FDP=129;FR=.;FRO=57;FSAF=35;FSAR=37;FSRF=23;FSRR=34;FWDB=0.0115556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.328;QD=10.9552;RBI=0.0253807;REFB=-0.0310528;REVB=0.0225975;RO=57;SAF=35;SAR=37;SRF=23;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0670305;STB=0.536591;TYPE=snp;VARB=0.0272114;OID=.;OPOS=11410987;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:57:57:72:72:37:35:23:34:37:35:23:34 chr8 11414237 . T C 306.1 PASS AO=68;DP=128;FAO=67;FDP=128;FR=.;FRO=61;FSAF=27;FSAR=40;FSRF=32;FSRR=29;FWDB=-0.0459318;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.4289;QD=9.56551;RBI=0.054575;REFB=0.00986387;REVB=0.0294736;RO=60;SAF=28;SAR=40;SRF=31;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0907948;STB=0.558827;TYPE=snp;VARB=-0.00926939;OID=.;OPOS=11414237;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:60:61:68:67:40:28:31:29:40:27:32:29 chr8 11416171 . T C 319.87 PASS AO=77;DP=153;FAO=77;FDP=155;FR=.;FRO=78;FSAF=50;FSAR=27;FSRF=55;FSRR=23;FWDB=-0.0202682;FXX=0.0189861;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.9168;QD=8.25469;RBI=0.0289857;REFB=-0.0193768;REVB=0.0207214;RO=76;SAF=51;SAR=26;SRF=54;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0495607;STB=0.531388;TYPE=snp;VARB=0.0123322;OID=.;OPOS=11416171;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:155:76:78:77:77:26:51:54:22:27:50:55:23 chr8 11416428 . C T 32.58 PASS AO=9;DP=26;FAO=9;FDP=26;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=15;FWDB=0.0548546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.6964;QD=5.01205;RBI=0.0555093;REFB=-0.0392762;REVB=-0.00850027;RO=17;SAF=3;SAR=6;SRF=2;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.30335;STB=0.67711;TYPE=snp;VARB=0.0749538;OID=.;OPOS=11416428;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:26:26:17:17:9:9:6:3:2:15:6:3:2:15 chr8 11418385 . G A 338.17 PASS AO=57;DP=85;FAO=57;FDP=85;FR=.;FRO=28;FSAF=24;FSAR=33;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=-0.0225216;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=179.727;QD=15.9141;RBI=0.0283095;REFB=-0.00601404;REVB=0.0171525;RO=28;SAF=24;SAR=33;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0707042;STB=0.538255;TYPE=snp;VARB=0.00293489;OID=.;OPOS=11418385;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:85:85:28:28:57:57:33:24:15:13:33:24:15:13 chr8 11418766 . G A 301.34 PASS AO=68;DP=133;FAO=68;FDP=133;FR=.;FRO=65;FSAF=19;FSAR=49;FSRF=17;FSRR=48;FWDB=-0.0288285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.311;QD=9.06298;RBI=0.0316366;REFB=-0.0312916;REVB=0.0130305;RO=65;SAF=19;SAR=49;SRF=17;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.019913;STB=0.510948;TYPE=snp;VARB=0.0190894;OID=.;OPOS=11418766;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:65:65:68:68:49:19:17:48:49:19:17:48 chr8 11418773 . C T 209.62 PASS AO=54;DP=120;FAO=55;FDP=126;FR=.;FRO=71;FSAF=13;FSAR=42;FSRF=19;FSRR=52;FWDB=0.0618192;FXX=0.0156238;HRUN=5;LEN=1;MLLD=47.6155;QD=6.65472;RBI=0.0624233;REFB=-0.0407563;REVB=-0.00866327;RO=65;SAF=12;SAR=42;SRF=18;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0736407;STB=0.523764;TYPE=snp;VARB=0.0500964;OID=.;OPOS=11418773;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:126:65:71:54:55:42:12:18:47:42:13:19:52 chr8 11421793 . C T 222.33 PASS AO=40;DP=64;FAO=40;FDP=64;FR=.;FRO=24;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=0.013629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.38;QD=13.8955;RBI=0.0167367;REFB=-0.0116171;REVB=-0.00971426;RO=23;SAF=24;SAR=16;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197176;STB=0.59995;TYPE=snp;VARB=0.00393807;OID=.;OPOS=11421793;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:64:64:23:24:40:40:16:24:7:16:16:24:8:16 chr8 11616836 . G A 119.31 PASS AO=33;DP=80;FAO=33;FDP=80;FR=.;FRO=47;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=-0.0112004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.823;QD=5.96531;RBI=0.0440962;REFB=0.00398891;REVB=0.0426501;RO=46;SAF=14;SAR=19;SRF=24;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100714;STB=0.56346;TYPE=snp;VARB=-0.00670797;OID=.;OPOS=11616836;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:46:47:33:33:19:14:24:22:19:14:25:22 chr8 11617505 . C G 303.64 PASS AO=73;DP=148;FAO=72;FDP=147;FR=.;FRO=75;FSAF=30;FSAR=42;FSRF=19;FSRR=56;FWDB=0.00321735;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.6688;QD=8.26243;RBI=0.00905977;REFB=-0.00140731;REVB=-0.00846924;RO=75;SAF=31;SAR=42;SRF=19;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166385;STB=0.588212;TYPE=snp;VARB=0.00170354;OID=.;OPOS=11617505;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:147:75:75:73:72:42:31:19:56:42:30:19:56 chr8 11618997 . T TC 102.85 PASS AO=3;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0962398;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=142.928;QD=34.2819;RBI=0.132167;REFB=0;REVB=0.0905876;RO=9;SAF=0;SAR=3;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.780801;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00228509;OID=.;OPOS=11618998;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:3:12:12:12:0:8:4:0:0:5:9:0:3:8:1 chr8 11618998 . G C 63.95 PASS AO=9;DP=12;FAO=9;FDP=12;FR=.;FRO=3;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0248277;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=120.324;QD=21.3166;RBI=0.130768;REFB=-0.117895;REVB=0.12839;RO=3;SAF=8;SAR=1;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.513504;STB=0.799197;TYPE=snp;VARB=0.00669835;OID=.;OPOS=11618998;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:12:12:3:3:9:9:1:8:0:3:1:8:0:3 chr8 11619163 . A G 292.01 PASS AO=71;DP=150;FAO=71;FDP=149;FR=.;FRO=78;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=40;FSRR=38;FWDB=0.00536774;FXX=0.0132442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.995;QD=7.83926;RBI=0.0124752;REFB=0.00725641;REVB=-0.0112614;RO=78;SAF=37;SAR=34;SRF=40;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00786762;STB=0.504353;TYPE=snp;VARB=-0.00685741;OID=.;OPOS=11619163;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:149:78:78:71:71:34:37:40:38:34:37:40:38 chr8 11619231 . C T 417.35 PASS AO=116;DP=267;FAO=116;FDP=267;FR=.;FRO=151;FSAF=56;FSAR=60;FSRF=49;FSRR=102;FWDB=-0.0116364;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.7544;QD=6.25236;RBI=0.0214355;REFB=-0.0146455;REVB=-0.018002;RO=150;SAF=56;SAR=60;SRF=49;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160168;STB=0.590149;TYPE=snp;VARB=0.0169006;OID=.;OPOS=11619231;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:267:267:150:151:116:116:60:56:49:101:60:56:49:102 chr8 11619261 . T A 2790.41 PASS AO=287;DP=290;FAO=293;FDP=293;FR=.;FRO=0;FSAF=115;FSAR=178;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000436536;FXX=0.00677943;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.6326;QD=38.0943;RBI=0.0752963;REFB=-0.00310786;REVB=0.075295;RO=1;SAF=112;SAR=175;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00271736;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000248114;OID=.;OPOS=11619261;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:290:293:1:0:287:293:175:112:0:1:178:115:0:0 chr8 11619334 . C T 732.97 PASS AO=156;DP=284;FAO=156;FDP=284;FR=.;FRO=128;FSAF=44;FSAR=112;FSRF=65;FSRR=63;FWDB=0.0796991;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.6132;QD=10.3235;RBI=0.100909;REFB=-0.0108865;REVB=0.0618928;RO=126;SAF=44;SAR=112;SRF=63;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199299;STB=0.613205;TYPE=snp;VARB=0.0092648;OID=.;OPOS=11619334;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:284:284:126:128:156:156:112:44:63:63:112:44:65:63 chr8 11619397 . G A 533.06 PASS AO=126;DP=253;FAO=126;FDP=253;FR=.;FRO=127;FSAF=63;FSAR=63;FSRF=47;FSRR=80;FWDB=0.0293243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.384;QD=8.42782;RBI=0.0303078;REFB=-0.0279015;REVB=-0.00765839;RO=126;SAF=63;SAR=63;SRF=46;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123142;STB=0.565207;TYPE=snp;VARB=0.0272817;OID=.;OPOS=11619397;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:253:253:126:127:126:126:63:63:46:80:63:63:47:80 chr8 11619504 . T A 104.37 PASS AO=30;DP=78;FAO=31;FDP=79;FR=.;FRO=48;FSAF=8;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=0.000160819;FXX=0.0595167;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.938;QD=5.28454;RBI=0.000504189;REFB=-0.0117719;REVB=-0.000477853;RO=42;SAF=7;SAR=23;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.285006;STB=0.637613;TYPE=snp;VARB=0.0208909;OID=.;OPOS=11619504;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:79:42:48:30:31:23:7:20:22:23:8:22:26 chr8 11619635 . T A 42.69 PASS AO=11;DP=30;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=4;FWDB=0.0179539;FXX=0.0333222;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.075;QD=5.88815;RBI=0.0250796;REFB=-0.000648913;REVB=0.0175113;RO=18;SAF=4;SAR=7;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.412848;STB=0.740789;TYPE=snp;VARB=0.00181503;OID=.;OPOS=11619635;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:30:29:18:18:11:11:7:4:14:4:7:4:14:4 chr8 11620055 . A AAC 155.1 PASS AO=17;DP=33;FAO=20;FDP=23;FR=.;FRO=3;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.105429;FXX=0.079968;HRUN=3;LEN=2;MLLD=77.0298;QD=26.9739;RBI=0.226262;REFB=-0.179269;REVB=0.200198;RO=15;SAF=16;SAR=1;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.617547;STB=0.526289;TYPE=ins;VARB=0.056385;OID=.;OPOS=11620056;OREF=-;OALT=AC;OMAPALT=AAC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:17:33:20:23:3:16:4:2:1:5:15:16:1:7:8 chr8 11620315 . T C 432.16 PASS AO=95;DP=175;FAO=95;FDP=181;FR=.;FRO=86;FSAF=35;FSAR=60;FSRF=40;FSRR=46;FWDB=-0.00266028;FXX=0.0054942;HRUN=3;LEN=1;MLLD=179.718;QD=9.55048;RBI=0.029733;REFB=-0.022219;REVB=-0.0296138;RO=79;SAF=35;SAR=60;SRF=39;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108266;STB=0.548102;TYPE=snp;VARB=0.0216008;OID=.;OPOS=11620315;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:181:79:86:95:95:60:35:39:40:60:35:40:46 chr8 11620461 . G A 91.56 PASS AO=10;DP=12;FAO=12;FDP=14;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0526819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.8737;QD=26.1588;RBI=0.0957331;REFB=-0.0628085;REVB=0.079934;RO=2;SAF=5;SAR=5;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0188757;OID=.;OPOS=11620461;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:12:14:2:2:10:12:5:5:1:1:6:6:1:1 chr8 11620769 . T C 756.28 PASS AO=194;DP=414;FAO=190;FDP=400;FR=.;FRO=210;FSAF=105;FSAR=85;FSRF=105;FSRR=105;FWDB=0.00865669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.712;QD=7.56279;RBI=0.0237001;REFB=-0.011639;REVB=0.0220626;RO=219;SAF=109;SAR=85;SRF=111;SRR=108;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0533974;STB=0.527775;TYPE=snp;VARB=0.0120126;OID=.;OPOS=11620769;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:414:400:219:210:194:190:85:109:111:108:85:105:105:105 chr8 11621351 . C G 724.84 PASS AO=67;DP=67;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0881705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.4117;QD=37.1711;RBI=0.0977064;REFB=0;REVB=0.042101;RO=0;SAF=27;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00171761;OID=.;OPOS=11621351;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:67:78:0:0:67:78:40:27:0:0:41:37:0:0 chr8 11621450 . G A 167.09 PASS AO=42;DP=90;FAO=42;FDP=90;FR=.;FRO=48;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=12;FSRR=36;FWDB=-0.00261886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.4125;QD=7.42614;RBI=0.0197488;REFB=-0.0227622;REVB=0.0195744;RO=48;SAF=21;SAR=21;SRF=12;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240589;STB=0.633274;TYPE=snp;VARB=0.0320516;OID=.;OPOS=11621450;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:48:48:42:42:21:21:12:36:21:21:12:36 chr8 11666218 . GTCCCACTCCCA GTCCCA,GTCCCAC 90.42 PASS AO=9,4;DP=38;FAO=19,0;FDP=31;FR=.;FRO=12;FSAF=12,0;FSAR=7,0;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.0439619,0.0122641;FXX=0.184162;HRUN=1,1;LEN=6,5;MLLD=103.52,105.371;QD=11.6674;RBI=0.0828326,0.05786;REFB=-0.049816,-0.039261;REVB=-0.0702039,-0.0565453;RO=0;SAF=4,4;SAR=5,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.616315,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.0389353,0;OID=.,.;OPOS=11666219,11666225;OREF=TCCCAC,TCCCA;OALT=-,-;OMAPALT=GTCCCA,GTCCCAC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:9,4:19:19,0:31:12:12,0:7,0:4:8:48:0:4,4:5,0:0:0 chr8 11683653 . T C 1906.24 PASS AO=204;DP=207;FAO=204;FDP=204;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=183;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0266661;FXX=0.0144921;HRUN=5;LEN=1;MLLD=331.398;QD=37.3772;RBI=0.0266677;REFB=0.00831847;REVB=0.000286145;RO=2;SAF=21;SAR=183;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0195411;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.88915e-06;OID=.;OPOS=11683653;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:207:204:2:0:204:204:183:21:1:1:183:21:0:0 chr8 11701842 . A C 1877.7 PASS AO=206;DP=215;FAO=208;FDP=215;FR=.;FRO=7;FSAF=133;FSAR=75;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=-0.049202;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=51.8598;QD=34.934;RBI=0.0518288;REFB=-0.103839;REVB=0.0162907;RO=7;SAF=131;SAR=75;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0234839;STB=0.517359;TYPE=snp;VARB=0.00268155;OID=.;OPOS=11701842;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:215:215:7:7:206:208:75:131:2:5:75:133:1:6 chr8 11702542 . T C 1732.86 PASS AO=184;DP=184;FAO=183;FDP=183;FR=.;FRO=0;FSAF=112;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0458999;FXX=0.00543449;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.395;QD=37.8766;RBI=0.0462456;REFB=0;REVB=-0.00564403;RO=0;SAF=112;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.24391e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.01551e-05;OID=.;OPOS=11702542;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:82:184:183:0:0:184:183:72:112:0:0:71:112:0:0 chr8 11705273 . TG T 203.87 PASS AO=24;DP=57;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.29901;FXX=0.118624;HRUN=5;LEN=1;MLLD=8.33082;QD=15.6819;RBI=0.299998;REFB=0;REVB=0.024323;RO=14;SAF=11;SAR=13;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0.540541;SSSB=-0.169533;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0110215;OID=.;OPOS=11705274;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:24:51:52:52:0:24:28:0:0:18:14:11:13:10:4 chr8 11793447 . T C 1807.02 PASS AO=188;DP=188;FAO=188;FDP=188;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=174;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.055038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.6199;QD=38.4471;RBI=0.0595625;REFB=0;REVB=0.022771;RO=0;SAF=14;SAR=174;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000177052;OID=.;OPOS=11793447;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:188:188:0:0:188:188:174:14:0:0:174:14:0:0 chr8 11832079 . A G 998.23 PASS AO=106;DP=107;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=7.29828e-05;FXX=0.00934492;HRUN=5;LEN=1;MLLD=242.528;QD=37.669;RBI=0.00483676;REFB=-0.00778015;REVB=0.00483621;RO=1;SAF=70;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129995;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.34804e-05;OID=.;OPOS=11832079;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:107:106:1:0:106:106:36:70:0:1:36:70:0:0 chr8 11872239 . C A 107.82 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.175;QD=35.9384;RBI=0.075789;REFB=0;REVB=0.075789;RO=0;SAF=0;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00421445;OID=.;OPOS=11872239;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:12:0:0:0:12:0:0:0 chr8 11995062 . G A 201.65 PASS AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.725;QD=36.6632;RBI=0.0259318;REFB=0;REVB=0.0155483;RO=0;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000446996;OID=.;OPOS=11995062;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:22:22:0:0:22:22:12:10:0:0:12:10:0:0 chr8 11995274 . G A 195.71 PASS AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.044831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.6548;QD=39.1417;RBI=0.0468177;REFB=0;REVB=0.0134938;RO=0;SAF=13;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000591598;OID=.;OPOS=11995274;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:20:20:0:0:20:20:7:13:0:0:7:13:0:0 chr8 11996086 . G A 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0277297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.08;QD=35.0875;RBI=0.0409814;REFB=0;REVB=0.0301751;RO=0;SAF=5;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.27427e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.17141e-05;OID=.;OPOS=11996086;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:2:5:0:0:2:5:0:0 chr8 11996150 . C G 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.10661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.112;QD=33.0192;RBI=0.107878;REFB=0;REVB=0.0164879;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.009142;OID=.;OPOS=11996150;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:2:4:0:0:2:4:0:0 chr8 12042851 . C G 76.41 PASS AO=12;DP=18;FAO=12;FDP=18;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0102862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.532;QD=16.981;RBI=0.0324634;REFB=0.0210109;REVB=-0.0307907;RO=6;SAF=4;SAR=8;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105799;STB=0.559897;TYPE=snp;VARB=-0.00797088;OID=.;OPOS=12042851;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:18:18:6:6:12:12:8:4:3:3:8:4:3:3 chr8 12285161 . T C 31.88 PASS AO=4;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0430285;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.5011;QD=15.9406;RBI=0.0442879;REFB=0.0035749;REVB=-0.0104866;RO=2;SAF=2;SAR=2;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.277405;STB=0.666107;TYPE=snp;VARB=-0.0115587;OID=.;OPOS=12285161;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:7:8:2:3:4:5:2:2:2:0:2:3:3:0 chr8 12516729 . T G 77.94 PASS AO=7;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272603;FXX=0.110988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.3428;QD=38.9725;RBI=0.0413159;REFB=0;REVB=0.0310464;RO=0;SAF=6;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00414883;OID=.;OPOS=12516729;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:7:8:1:6:0:0:2:6:0:0 chr8 12516857 . T C 86.76 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0283757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.856;QD=38.5592;RBI=0.030071;REFB=0;REVB=-0.00995425;RO=0;SAF=7;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000566918;OID=.;OPOS=12516857;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:2:7:0:0:2:7:0:0 chr8 12580049 . G A 750.66 PASS AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0312843;FXX=0.0365809;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.4076;QD=38.0079;RBI=0.0318523;REFB=0;REVB=-0.00598825;RO=0;SAF=43;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00042152;OID=.;OPOS=12580049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:79:79:0:0:79:79:36:43:0:0:36:43:0:0 chr8 12809667 . A T 1863.83 PASS AO=202;DP=208;FAO=203;FDP=208;FR=.;FRO=5;FSAF=109;FSAR=94;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0336073;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.498;QD=35.8429;RBI=0.0380157;REFB=-0.0399771;REVB=0.0177691;RO=3;SAF=109;SAR=93;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129268;STB=0.506363;TYPE=snp;VARB=0.00140794;OID=.;OPOS=12809667;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:208:208:3:5:202:203:93:109:3:0:94:109:4:1 chr8 12809700 . G A 1703.59 PASS AO=198;DP=215;FAO=199;FDP=212;FR=.;FRO=13;FSAF=106;FSAR=93;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=0.00728039;FXX=0.0139528;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.7;QD=32.1432;RBI=0.0472303;REFB=-0.0585822;REVB=0.0466658;RO=7;SAF=106;SAR=92;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0162792;STB=0.523256;TYPE=snp;VARB=0.00222147;OID=.;OPOS=12809700;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:215:212:7:13:198:199:92:106:2:5:93:106:2:11 chr8 12878637 . A G 1614.15 PASS AO=168;DP=168;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00797626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.0357;QD=38.4321;RBI=0.0490351;REFB=0;REVB=-0.048382;RO=0;SAF=64;SAR=104;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000144601;OID=.;OPOS=12878637;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:168:168:0:0:168:168:104:64:0:0:104:64:0:0 chr8 12878677 . T C 2189.17 PASS AO=226;DP=227;FAO=238;FDP=238;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=162;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0013385;FXX=0.0124476;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.745;QD=36.7927;RBI=0.0416064;REFB=-0.0665621;REVB=0.0415849;RO=1;SAF=68;SAR=158;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00300658;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00149821;OID=.;OPOS=12878677;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:227:238:1:0:226:238:158:68:0:1:162:76:0:0 chr8 12878807 . T G 755.64 PASS AO=161;DP=307;FAO=165;FDP=309;FR=.;FRO=144;FSAF=37;FSAR=128;FSRF=35;FSRR=109;FWDB=-0.00447191;FXX=0.00643066;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.133;QD=9.78178;RBI=0.00575282;REFB=0.00849067;REVB=0.00361897;RO=144;SAF=35;SAR=126;SRF=34;SRR=110;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0234315;STB=0.512425;TYPE=snp;VARB=-0.00708174;OID=.;OPOS=12878807;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:307:309:144:144:161:165:126:35:34:110:128:37:35:109 chr8 12878843 . C A 430.13 PASS AO=113;DP=248;FAO=113;FDP=249;FR=.;FRO=136;FSAF=24;FSAR=89;FSRF=26;FSRR=110;FWDB=-0.0331557;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0976;QD=6.90966;RBI=0.0363847;REFB=-0.0174429;REVB=-0.0149848;RO=135;SAF=24;SAR=89;SRF=25;SRR=110;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0411381;STB=0.517664;TYPE=snp;VARB=0.020736;OID=.;OPOS=12878843;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:248:249:135:136:113:113:89:24:25:110:89:24:26:110 chr8 12879062 . T C 647.87 PASS AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0238092;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.478;QD=36.4999;RBI=0.0259573;REFB=-0.0675327;REVB=0.0103395;RO=1;SAF=28;SAR=42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111254;STB=0.505881;TYPE=snp;VARB=-3.33621e-05;OID=.;OPOS=12879062;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:71:71:1:1:70:70:42:28:0:1:42:28:0:1 chr8 12879099 . G A 832.23 PASS AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0051122;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=278.415;QD=38.2633;RBI=0.00527513;REFB=0;REVB=-0.00130095;RO=0;SAF=50;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.50816e-06;OID=.;OPOS=12879099;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:87:87:0:0:87:87:37:50:0:0:37:50:0:0 chr8 12879334 . T C 1059.81 PASS AO=114;DP=116;FAO=115;FDP=116;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0143539;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3517;QD=36.5451;RBI=0.0495579;REFB=-0.101559;REVB=0.0474336;RO=1;SAF=41;SAR=73;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00646095;STB=0.503355;TYPE=snp;VARB=0.00280802;OID=.;OPOS=12879334;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:116:116:1:1:114:115:73:41:0:1:74:41:0:1 chr8 12879539 . A G 296.8 PASS AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0195815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.581;QD=37.0999;RBI=0.020452;REFB=0;REVB=-0.00590314;RO=0;SAF=12;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.17711e-05;OID=.;OPOS=12879539;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:32:32:0:0:32:32:20:12:0:0:20:12:0:0 chr8 12888743 . A G 367.3 PASS AO=72;DP=127;FAO=72;FDP=124;FR=.;FRO=52;FSAF=35;FSAR=37;FSRF=24;FSRR=28;FWDB=-0.00232365;FXX=0.0236202;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.001;QD=11.8482;RBI=0.00345156;REFB=-0.0216646;REVB=-0.00255224;RO=52;SAF=35;SAR=37;SRF=24;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0189417;STB=0.510316;TYPE=snp;VARB=0.0199195;OID=.;OPOS=12888743;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:124:52:52:72:72:37:35:24:28:37:35:24:28 chr8 12888908 . T G 184.52 PASS AO=40;DP=77;FAO=40;FDP=77;FR=.;FRO=37;FSAF=8;FSAR=32;FSRF=4;FSRR=33;FWDB=0.0659314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.497;QD=9.58531;RBI=0.0664421;REFB=-0.00391058;REVB=0.0082226;RO=36;SAF=8;SAR=32;SRF=3;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176436;STB=0.575188;TYPE=snp;VARB=0.00594555;OID=.;OPOS=12888908;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:36:37:40:40:32:8:3:33:32:8:4:33 chr8 12943065 . T C 431.77 PASS AO=50;DP=54;FAO=51;FDP=54;FR=.;FRO=3;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0346361;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=159.876;QD=31.9828;RBI=0.0373244;REFB=-0.00957154;REVB=-0.0139087;RO=3;SAF=20;SAR=30;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0655245;STB=0.514536;TYPE=snp;VARB=0.000186767;OID=.;OPOS=12943065;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:54:54:3:3:50:51:30:20:3:0:30:21:2:1 chr8 12950315 . G T 122.17 PASS AO=24;DP=43;FAO=24;FDP=43;FR=.;FRO=19;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=0.0257624;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.93;QD=11.3645;RBI=0.0296301;REFB=-0.0233664;REVB=0.014637;RO=19;SAF=13;SAR=11;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177809;STB=0.598768;TYPE=snp;VARB=0.0215899;OID=.;OPOS=12950315;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:43:43:19:19:24:24:11:13:6:13:11:13:6:13 chr8 12952293 . C T 290.29 PASS AO=71;DP=151;FAO=71;FDP=150;FR=.;FRO=79;FSAF=40;FSAR=31;FSRF=40;FSRR=39;FWDB=0.00589037;FXX=0.00662208;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.714;QD=7.74118;RBI=0.0117501;REFB=-0.0226262;REVB=0.010167;RO=79;SAF=40;SAR=31;SRF=40;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0547003;STB=0.530294;TYPE=snp;VARB=0.0284309;OID=.;OPOS=12952293;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:150:79:79:71:71:31:40:40:39:31:40:40:39 chr8 12957475 . C T 270.71 PASS AO=72;DP=162;FAO=72;FDP=162;FR=.;FRO=90;FSAF=27;FSAR=45;FSRF=41;FSRR=49;FWDB=0.0255014;FXX=0.00613459;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.209;QD=6.68412;RBI=0.0282906;REFB=-0.00327213;REVB=0.012249;RO=90;SAF=27;SAR=45;SRF=41;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0836058;STB=0.546611;TYPE=snp;VARB=0.00388913;OID=.;OPOS=12957475;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:162:90:90:72:72:45:27:41:49:45:27:41:49 chr8 12960281 . T C 305.85 PASS AO=80;DP=177;FAO=80;FDP=177;FR=.;FRO=97;FSAF=36;FSAR=44;FSRF=39;FSRR=58;FWDB=0.00106445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.275;QD=6.91185;RBI=0.0156512;REFB=-0.0136527;REVB=-0.0156149;RO=97;SAF=36;SAR=44;SRF=39;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0480734;STB=0.526672;TYPE=snp;VARB=0.0169142;OID=.;OPOS=12960281;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:177:97:97:80:80:44:36:39:58:44:36:39:58 chr8 13017687 . G C 116.6 PASS AO=32;DP=77;FAO=32;FDP=77;FR=.;FRO=45;FSAF=8;FSAR=24;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=-0.00114526;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=250.52;QD=6.05703;RBI=0.00555337;REFB=0.00604985;REVB=0.005434;RO=45;SAF=8;SAR=24;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.274377;STB=0.656829;TYPE=snp;VARB=-0.00660447;OID=.;OPOS=13017687;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:45:45:32:32:24:8:22:23:24:8:22:23 chr8 13072177 . C T 335.15 PASS AO=73;DP=152;FAO=79;FDP=158;FR=.;FRO=79;FSAF=56;FSAR=23;FSRF=52;FSRR=27;FWDB=-0.00325285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.75;QD=8.4848;RBI=0.019099;REFB=-0.0085731;REVB=0.0188199;RO=79;SAF=53;SAR=20;SRF=52;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0767771;STB=0.529894;TYPE=snp;VARB=0.0081926;OID=.;OPOS=13072177;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:158:79:79:73:79:20:53:52:27:23:56:52:27 chr8 13356802 . G A 804.94 PASS AO=84;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212145;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.32;QD=37.8794;RBI=0.0306629;REFB=0;REVB=0.0221394;RO=0;SAF=46;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.981e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000131932;OID=.;OPOS=13356802;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:85:85:0:0:84:85:38:46:0:0:39:46:0:0 chr8 13356818 . T C 855.26 PASS AO=90;DP=91;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229355;FXX=0.0109878;HRUN=4;LEN=1;MLLD=178.2;QD=38.0117;RBI=0.0338624;REFB=0;REVB=0.0249123;RO=0;SAF=51;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.24868e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000100073;OID=.;OPOS=13356818;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:91:90:0:0:90:90:39:51:0:0:39:51:0:0 chr8 13356819 . T G 846.58 PASS AO=91;DP=92;FAO=91;FDP=92;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.000292844;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=216.118;QD=36.808;RBI=0.0135662;REFB=-0.0878324;REVB=0.013563;RO=1;SAF=52;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00902916;STB=0.504761;TYPE=snp;VARB=0.000313206;OID=.;OPOS=13356819;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:92:92:1:1:91:91:39:52:1:0:39:52:1:0 chr8 13357340 . G C 398.86 PASS AO=104;DP=228;FAO=104;FDP=228;FR=.;FRO=124;FSAF=64;FSAR=40;FSRF=69;FSRR=55;FWDB=-0.0394922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.772;QD=6.99758;RBI=0.0406663;REFB=0.00204038;REVB=0.00970107;RO=123;SAF=64;SAR=40;SRF=68;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0635396;STB=0.533327;TYPE=snp;VARB=-0.0021849;OID=.;OPOS=13357340;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:228:228:123:124:104:104:40:64:68:55:40:64:69:55 chr8 13424583 . C T 998.81 PASS AO=100;DP=100;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00630101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.832;QD=38.05;RBI=0.0173653;REFB=0;REVB=0.0161818;RO=0;SAF=63;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.51876e-05;OID=.;OPOS=13424583;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:100:105:0:0:100:105:37:63:0:0:41:64:0:0 chr8 13425353 . T A 1269.45 PASS AO=135;DP=136;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00190847;FXX=0.0073524;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.13;QD=37.6134;RBI=0.0229755;REFB=-0.0551593;REVB=0.0228961;RO=1;SAF=74;SAR=61;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00772922;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000236304;OID=.;OPOS=13425353;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:136:135:1:0:135:135:61:74:0:1:61:74:0:0 chr8 15095082 . AC A 23.55 PASS AO=14;DP=71;FAO=16;FDP=61;FR=.;FRO=45;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=30;FWDB=-0.116134;FXX=0.164361;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.2162;QD=1.54404;RBI=0.220995;REFB=-0.0793906;REVB=0.18802;RO=55;SAF=12;SAR=2;SRF=23;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0.383333;SSSB=0.550527;STB=0.705644;TYPE=del;VARB=0.0837654;OID=.;OPOS=15095083;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:14:71:16:61:45:10:6:15:30:23:55:12:2:23:32 chr8 15095085 . C G 38.26 PASS AO=20;DP=75;FAO=19;FDP=75;FR=.;FRO=56;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=21;FSRR=35;FWDB=0.0482417;FXX=0.0259707;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.4506;QD=2.0407;RBI=0.0491338;REFB=0.00702567;REVB=-0.00932049;RO=54;SAF=14;SAR=6;SRF=21;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.369292;STB=0.722977;TYPE=snp;VARB=-0.0164215;OID=.;OPOS=15095085;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:75:75:54:56:20:19:6:14:21:33:6:13:21:35 chr8 15590866 . T G 149.65 PASS AO=48;DP=128;FAO=48;FDP=128;FR=.;FRO=80;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=45;FSRR=35;FWDB=-0.00277498;FXX=0;HRUN=13;LEN=1;MLLD=194.204;QD=4.67653;RBI=0.0115888;REFB=0.00585461;REVB=-0.0112517;RO=74;SAF=22;SAR=26;SRF=42;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116621;STB=0.564824;TYPE=snp;VARB=-0.0073518;OID=.;OPOS=15590866;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:74:80:48:48:26:22:42:32:26:22:45:35 chr8 15978063 . C T 574.61 PASS AO=36;DP=96;FAO=68;FDP=71;FR=.;FRO=3;FSAF=29;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.00225644;FXX=0.268014;HRUN=3;LEN=1;MLLD=207.987;QD=32.3722;RBI=0.0140064;REFB=-0.0295707;REVB=-0.0138235;RO=0;SAF=0;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504026;TYPE=snp;VARB=0.00380213;OID=.;OPOS=15978063;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:38:71:0:3:36:68:36:0:0:0:39:29:1:2 chr8 16043667 . C T 137.38 PASS AO=43;DP=116;FAO=45;FDP=121;FR=.;FRO=76;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=50;FSRR=26;FWDB=-0.0022139;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.15;QD=4.54139;RBI=0.0646303;REFB=-0.00221176;REVB=-0.0645924;RO=68;SAF=28;SAR=15;SRF=48;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0666447;STB=0.5241;TYPE=snp;VARB=0.00487769;OID=.;OPOS=16043667;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:121:68:76:43:45:15:28:48:20:17:28:50:26 chr8 16927250 . A C 680.41 PASS AO=138;DP=242;FAO=138;FDP=242;FR=.;FRO=104;FSAF=48;FSAR=90;FSRF=36;FSRR=68;FWDB=0.0736817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.776;QD=11.2464;RBI=0.0736842;REFB=-0.0218697;REVB=0.000603902;RO=103;SAF=48;SAR=90;SRF=36;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00146481;STB=0.500792;TYPE=snp;VARB=0.0154464;OID=.;OPOS=16927250;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:242:242:103:104:138:138:90:48:36:67:90:48:36:68 chr8 16939284 . G A 69.18 PASS AO=26;DP=82;FAO=26;FDP=82;FR=.;FRO=56;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=30;FSRR=26;FWDB=0.0246369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.4343;QD=3.3745;RBI=0.0274448;REFB=-0.00555505;REVB=-0.012093;RO=56;SAF=9;SAR=17;SRF=30;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223387;STB=0.631326;TYPE=snp;VARB=0.00998306;OID=.;OPOS=16939284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:82:82:56:56:26:26:17:9:30:26:17:9:30:26 chr8 16939299 . C CA 28.42 PASS AO=22;DP=82;FAO=22;FDP=77;FR=.;FRO=55;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=0.0232133;FXX=0.0609682;HRUN=0;LEN=1;MLLD=214.613;QD=1.4762;RBI=0.0233504;REFB=-0.00119256;REVB=0.0025264;RO=55;SAF=6;SAR=16;SRF=29;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.315424;STB=0.689477;TYPE=ins;VARB=0.00275423;OID=.;OPOS=16939300;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:22:82:22:77:55:6:16:29:26:28:55:6:16:29:26 chr8 16979116 . A C 455.34 PASS AO=104;DP=212;FAO=108;FDP=216;FR=.;FRO=108;FSAF=58;FSAR=50;FSRF=68;FSRR=40;FWDB=-0.00347275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.175;QD=8.43228;RBI=0.0293044;REFB=-0.00713251;REVB=0.0290979;RO=108;SAF=54;SAR=50;SRF=68;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102964;STB=0.546866;TYPE=snp;VARB=0.007094;OID=.;OPOS=16979116;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:216:108:108:104:108:50:54:68:40:50:58:68:40 chr8 17092164 . G T 2294.25 PASS AO=238;DP=240;FAO=238;FDP=238;FR=.;FRO=0;FSAF=138;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120649;FXX=0.00833299;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.4695;QD=38.5587;RBI=0.0217384;REFB=0;REVB=0.018083;RO=0;SAF=138;SAR=100;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07279e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.34258e-05;OID=.;OPOS=17092164;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:240:238:0:0:238:238:100:138:0:0:100:138:0:0 chr8 17137413 . G A 377.58 PASS AO=98;DP=220;FAO=100;FDP=222;FR=.;FRO=122;FSAF=41;FSAR=59;FSRF=33;FSRR=89;FWDB=-0.0119192;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3107;QD=6.80318;RBI=0.0355055;REFB=-0.0168524;REVB=-0.0334451;RO=119;SAF=40;SAR=58;SRF=30;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166162;STB=0.581545;TYPE=snp;VARB=0.0192512;OID=.;OPOS=17137413;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:220:222:119:122:98:100:58:40:30:89:59:41:33:89 chr8 17152857 . T G 135.92 PASS AO=34;DP=75;FAO=34;FDP=75;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=0.0071466;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=73.148;QD=7.2491;RBI=0.0145475;REFB=-0.017143;REVB=-0.0126711;RO=41;SAF=15;SAR=19;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.021866;STB=0.512285;TYPE=snp;VARB=0.0113979;OID=.;OPOS=17152857;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:41:41:34:34:19:15:19:22:19:15:19:22 chr8 17157259 . G A 1983.23 PASS AO=195;DP=195;FAO=208;FDP=208;FR=.;FRO=0;FSAF=110;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.043052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.652;QD=38.1391;RBI=0.0950412;REFB=0;REVB=0.084731;RO=0;SAF=105;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.47789e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000510601;OID=.;OPOS=17157259;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:94:195:208:0:0:195:208:90:105:0:0:98:110:0:0 chr8 17166765 . A G 472.66 PASS AO=50;DP=53;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00531991;FXX=0.0188644;HRUN=4;LEN=1;MLLD=132.835;QD=36.3586;RBI=0.0258853;REFB=0;REVB=0.0253328;RO=2;SAF=36;SAR=14;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0626057;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.34198e-05;OID=.;OPOS=17166765;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:53:52:2:0:50:52:14:36:0:2:16:36:0:0 chr8 17198953 . T C 60.83 PASS AO=27;DP=95;FAO=27;FDP=95;FR=.;FRO=68;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=42;FSRR=26;FWDB=-0.00741823;FXX=0.0206164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.46;QD=2.56127;RBI=0.0121701;REFB=-0.0112941;REVB=-0.00964782;RO=68;SAF=10;SAR=17;SRF=42;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.291878;STB=0.672631;TYPE=snp;VARB=0.0407439;OID=.;OPOS=17198953;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:95:95:68:68:27:27:17:10:42:26:17:10:42:26 chr8 17218629 . G A 467.04 PASS AO=114;DP=238;FAO=114;FDP=236;FR=.;FRO=122;FSAF=79;FSAR=35;FSRF=71;FSRR=51;FWDB=-0.0447462;FXX=0.00840301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.416;QD=7.9159;RBI=0.0546674;REFB=-0.00695759;REVB=-0.0314054;RO=121;SAF=79;SAR=35;SRF=71;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110875;STB=0.564087;TYPE=snp;VARB=0.00813853;OID=.;OPOS=17218629;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:238:236:121:122:114:114:35:79:71:50:35:79:71:51 chr8 17230644 . G C 1999.43 PASS AO=211;DP=212;FAO=211;FDP=211;FR=.;FRO=0;FSAF=111;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0047193;FXX=0.00471676;HRUN=3;LEN=1;MLLD=263.16;QD=37.9039;RBI=0.00841551;REFB=0.0282512;REVB=-0.00696771;RO=1;SAF=111;SAR=100;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00474022;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.49706e-06;OID=.;OPOS=17230644;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:212:211:1:0:211:211:100:111:0:1:100:111:0:0 chr8 17270763 . G C 96.46 PASS AO=10;DP=16;FAO=10;FDP=10;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=0;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0.374766;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.666;QD=38.5827;RBI=0.0106315;REFB=0;REVB=-0.0106315;RO=3;SAF=0;SAR=10;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.43988e-05;OID=.;OPOS=17270763;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:16:10:3:0:10:10:10:0:0:3:10:0:0:0 chr8 17270764 . C A 26.14 PASS AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=10;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.865;QD=6.535;RBI=0.018482;REFB=-0.00654663;REVB=0.018482;RO=10;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0123883;OID=.;OPOS=17270764;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:16:16:10:10:6:6:6:0:0:10:6:0:0:10 chr8 17270770 . T C 26.07 PASS AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=10;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=39.8331;QD=6.5183;RBI=0.0613139;REFB=-0.0793776;REVB=-0.0613139;RO=10;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.122749;OID=.;OPOS=17270770;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:16:16:10:10:6:6:6:0:0:10:6:0:0:10 chr8 17270787 . A G 150.17 PASS AO=16;DP=17;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0.0587889;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.159;QD=37.5432;RBI=0.0321585;REFB=0;REVB=-0.0321585;RO=0;SAF=0;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000334106;OID=.;OPOS=17270787;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:17:16:0:0:16:16:16:0:0:0:16:0:0:0 chr8 17270837 . G C 27.76 PASS AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=11;FR=.;FRO=6;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.271;QD=10.0955;RBI=0.00113131;REFB=-0.0149129;REVB=-0.00113131;RO=6;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0188916;OID=.;OPOS=17270837;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:11:11:6:6:5:5:5:0:0:6:5:0:0:6 chr8 17424920 . T C 462.28 PASS AO=47;DP=49;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00572975;FXX=0.020404;HRUN=3;LEN=1;MLLD=150.312;QD=38.523;RBI=0.0216181;REFB=0;REVB=0.020845;RO=1;SAF=19;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.016502;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.18822e-05;OID=.;OPOS=17424920;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:49:48:1:0:47:48:28:19:0:1:29:19:0:0 chr8 17425296 . C T 2973.35 PASS AO=308;DP=310;FAO=311;FDP=311;FR=.;FRO=0;FSAF=178;FSAR=133;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00313316;FXX=0.00320503;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7232;QD=38.2424;RBI=0.00345287;REFB=0;REVB=0.00145106;RO=0;SAF=176;SAR=132;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000296993;OID=.;OPOS=17425296;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:310:311:0:0:308:311:132:176:0:0:133:178:0:0 chr8 17486282 . T C 843.22 PASS AO=87;DP=89;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0.0222198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.722;QD=38.3281;RBI=0.0140412;REFB=0;REVB=0.0140412;RO=0;SAF=0;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.64363e-05;OID=.;OPOS=17486282;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:89:88:0:0:87:88:87:0:0:0:88:0:0:0 chr8 17500223 . T C 588.31 PASS AO=153;DP=332;FAO=153;FDP=332;FR=.;FRO=179;FSAF=63;FSAR=90;FSRF=72;FSRR=107;FWDB=-0.0455113;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.1615;QD=7.08802;RBI=0.047425;REFB=-0.0185664;REVB=-0.0133362;RO=176;SAF=63;SAR=90;SRF=71;SRR=105;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00837959;STB=0.505313;TYPE=snp;VARB=0.0188872;OID=.;OPOS=17500223;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:332:332:176:179:153:153:90:63:71:105:90:63:72:107 chr8 17503125 . C T 430.81 PASS AO=115;DP=247;FAO=113;FDP=247;FR=.;FRO=134;FSAF=21;FSAR=92;FSRF=48;FSRR=86;FWDB=0.108005;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=36.703;QD=6.97674;RBI=0.123295;REFB=0.0103149;REVB=0.0594693;RO=131;SAF=22;SAR=93;SRF=47;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219339;STB=0.629362;TYPE=snp;VARB=-0.0125788;OID=.;OPOS=17503125;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:247:247:131:134:115:113:93:22:47:84:92:21:48:86 chr8 17503270 . G C 1109.45 PASS AO=117;DP=120;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0484628;FXX=0.0325177;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.68;QD=37.2923;RBI=0.0663867;REFB=-0.0790876;REVB=0.0453713;RO=1;SAF=14;SAR=103;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00458948;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000391475;OID=.;OPOS=17503270;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:120:119:1:0:117:119:103:14:0:1:105:14:0:0 chr8 17541999 . T C 462.89 PASS AO=105;DP=212;FAO=108;FDP=214;FR=.;FRO=106;FSAF=41;FSAR=67;FSRF=32;FSRR=74;FWDB=-0.00313315;FXX=0.0138242;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.461;QD=8.65219;RBI=0.0143971;REFB=-0.0236907;REVB=0.014052;RO=106;SAF=39;SAR=66;SRF=32;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0695615;STB=0.54169;TYPE=snp;VARB=0.0322223;OID=.;OPOS=17541999;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:214:106:106:105:108:66:39:32:74:67:41:32:74 chr8 17581700 . C T 39.26 PASS AO=8;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0343818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.395;QD=9.23736;RBI=0.0779375;REFB=0.00106663;REVB=-0.0699439;RO=9;SAF=3;SAR=5;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0401081;STB=0.523751;TYPE=snp;VARB=-0.00111961;OID=.;OPOS=17581700;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:17:17:9:9:8:8:5:3:3:6:5:3:3:6 chr8 17612456 . C T 757.06 PASS AO=92;DP=101;FAO=92;FDP=101;FR=.;FRO=9;FSAF=45;FSAR=47;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0174612;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.2294;QD=29.9824;RBI=0.0191069;REFB=-0.00638699;REVB=0.00775761;RO=7;SAF=45;SAR=47;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00810195;STB=0.503984;TYPE=snp;VARB=0.00522137;OID=.;OPOS=17612456;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:101:101:7:9:92:92:47:45:3:4:47:45:4:5 chr8 17612518 . A G 1018.6 PASS AO=98;DP=98;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.106677;FXX=0.0090082;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.4721;QD=37.0401;RBI=0.123812;REFB=-0.0381995;REVB=-0.0628438;RO=0;SAF=36;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00255218;OID=.;OPOS=17612518;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:98:110:0:0:98:110:62:36:0:0:64:46:0:0 chr8 17612875 . A G 856.47 PASS AO=87;DP=87;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0262689;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.448;QD=38.0653;RBI=0.0594568;REFB=0;REVB=0.0533391;RO=0;SAF=30;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.04997e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000148962;OID=.;OPOS=17612875;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:87:90:0:0:87:90:57:30:0:0:60:30:0:0 chr8 17731961 . G A 942.4 PASS AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0309246;FXX=0.0294089;HRUN=3;LEN=1;MLLD=158.555;QD=38.0769;RBI=0.031552;REFB=0;REVB=-0.00626095;RO=0;SAF=43;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000175121;OID=.;OPOS=17731961;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:99:99:0:0:99:99:56:43:0:0:56:43:0:0 chr8 17743020 . G A 1241.3 PASS AO=129;DP=129;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.035895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.165;QD=38.49;RBI=0.0359044;REFB=0;REVB=-0.00082352;RO=0;SAF=73;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.14538e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.22049e-05;OID=.;OPOS=17743020;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:129:129:0:0:129:129:56:73:0:0:56:73:0:0 chr8 17794792 . G A 818.72 PASS AO=92;DP=97;FAO=92;FDP=96;FR=.;FRO=4;FSAF=33;FSAR=59;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0458152;FXX=0.0495;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.323;QD=34.1132;RBI=0.0569211;REFB=-0.0140135;REVB=0.0337783;RO=4;SAF=33;SAR=59;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0332037;STB=0.51754;TYPE=snp;VARB=0.000239114;OID=.;OPOS=17794792;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:97:96:4:4:92:92:59:33:3:1:59:33:3:1 chr8 17796382 . A G 1002.18 PASS AO=113;DP=136;FAO=114;FDP=119;FR=.;FRO=5;FSAF=55;FSAR=59;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.031161;FXX=0.124991;HRUN=3;LEN=1;MLLD=67.0444;QD=33.6869;RBI=0.0430284;REFB=-0.0325262;REVB=0.0296721;RO=4;SAF=55;SAR=58;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0153712;STB=0.503469;TYPE=snp;VARB=0.00151855;OID=.;OPOS=17796382;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:136:119:4:5:113:114:58:55:1:3:59:55:2:3 chr8 17796383 . C T 918.66 PASS AO=116;DP=136;FAO=117;FDP=134;FR=.;FRO=17;FSAF=56;FSAR=61;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=-0.000593132;FXX=0.0147048;HRUN=6;LEN=1;MLLD=190.18;QD=27.4226;RBI=0.0110343;REFB=-0.106772;REVB=0.0110184;RO=17;SAF=56;SAR=60;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.053816;STB=0.528807;TYPE=snp;VARB=0.00132208;OID=.;OPOS=17796383;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:136:134:17:17:116:117:60:56:12:5:61:56:12:5 chr8 17814915 . A G 1400.9 PASS AO=149;DP=154;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0242461;FXX=0.0259723;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.73;QD=37.3573;RBI=0.0271151;REFB=-0.022479;REVB=0.012139;RO=1;SAF=55;SAR=94;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00856893;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.78621e-06;OID=.;OPOS=17814915;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:154:150:1:0:149:150:94:55:1:0:95:55:0:0 chr8 17817553 . G T 1016.09 PASS AO=103;DP=104;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00866941;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.785;QD=38.343;RBI=0.0259838;REFB=0;REVB=0.0244949;RO=0;SAF=54;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.95759e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000119372;OID=.;OPOS=17817553;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:104:106:0:0:103:106:49:54:0:0:50:56:0:0 chr8 17820714 . A T 626.43 PASS AO=67;DP=68;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00777551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.6323;QD=36.849;RBI=0.0119627;REFB=-0.0525292;REVB=0.00909108;RO=1;SAF=39;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0165774;STB=0.508769;TYPE=snp;VARB=0.000684386;OID=.;OPOS=17820714;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:68:68:1:1:67:67:28:39:0:1:28:39:0:1 chr8 17885406 . C G 499.29 PASS AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.061245;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.7217;QD=37.682;RBI=0.0684252;REFB=0;REVB=-0.0305132;RO=0;SAF=9;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00114462;OID=.;OPOS=17885406;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:54:53:0:0:53:53:44:9:0:0:44:9:0:0 chr8 17918934 . A G 3821.68 PASS AO=1064;DP=1075;FAO=397;FDP=397;FR=.;FRO=0;FSAF=168;FSAR=229;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0277891;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.3136;QD=38.5056;RBI=0.0402542;REFB=0;REVB=0.0291234;RO=1;SAF=447;SAR=617;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00106787;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000343872;OID=.;OPOS=17918934;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:1075:397:1:0:1064:397:617:447:1:0:229:168:0:0 chr8 17927294 . C T 171.16 PASS AO=17;DP=17;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00298486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.582;QD=38.0347;RBI=0.0518085;REFB=0;REVB=0.0517225;RO=0;SAF=15;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.95117e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000194581;OID=.;OPOS=17927294;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:17:18:0:0:17:18:2:15:0:0:3:15:0:0 chr8 17927327 . T C 163.01 PASS AO=18;DP=20;FAO=20;FDP=22;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00811641;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=203.313;QD=29.6386;RBI=0.0274724;REFB=-0.10308;REVB=-0.026246;RO=2;SAF=11;SAR=7;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0764328;STB=0.535679;TYPE=snp;VARB=0.000787092;OID=.;OPOS=17927327;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:20:22:2:2:18:20:7:11:2:0:7:13:2:0 chr8 17928811 . C T 2189.69 PASS AO=225;DP=227;FAO=229;FDP=229;FR=.;FRO=0;FSAF=119;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00271197;FXX=0.00434764;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.6495;QD=38.2479;RBI=0.00739757;REFB=-0.0518471;REVB=0.00688254;RO=0;SAF=119;SAR=106;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.88288e-05;OID=.;OPOS=17928811;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:227:229:0:0:225:229:106:119:0:0:110:119:0:0 chr8 17930727 . G A 670.13 PASS AO=71;DP=73;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0389709;FXX=0.0273935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.447;QD=37.7539;RBI=0.0425423;REFB=0;REVB=-0.017062;RO=0;SAF=23;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000186676;OID=.;OPOS=17930727;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:73:71:0:0:71:71:48:23:0:0:48:23:0:0 chr8 17930734 . C A 514.55 PASS AO=68;DP=68;FAO=61;FDP=67;FR=.;FRO=6;FSAF=19;FSAR=42;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0468134;FXX=0.0289813;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.4069;QD=30.7191;RBI=0.130999;REFB=0.0403018;REVB=-0.122348;RO=0;SAF=24;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.552311;TYPE=snp;VARB=-0.0222625;OID=.;OPOS=17930734;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:68:67:0:6:68:61:44:24:0:0:42:19:5:1 chr8 17930772 . C T 555.78 PASS AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0450035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.5717;QD=38.3298;RBI=0.0458926;REFB=0;REVB=0.00899014;RO=0;SAF=19;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.47594e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000527645;OID=.;OPOS=17930772;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:58:58:0:0:58:58:39:19:0:0:39:19:0:0 chr8 17942204 . C T 627.68 PASS AO=65;DP=65;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0576597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.889;QD=38.0412;RBI=0.113108;REFB=0;REVB=0.0973078;RO=0;SAF=55;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000429204;OID=.;OPOS=17942204;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:65:66:0:0:65:66:10:55:0:0:10:56:0:0 chr8 18077007 . G C 1473.51 PASS AO=161;DP=166;FAO=161;FDP=161;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00790644;FXX=0.0301187;HRUN=3;LEN=1;MLLD=236.458;QD=36.6089;RBI=0.0108529;REFB=0.028913;REVB=0.00743467;RO=3;SAF=43;SAR=118;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.017598;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000104302;OID=.;OPOS=18077007;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:166:161:3:0:161:161:118:43:2:1:118:43:0:0 chr8 18080644 . A T 1569.8 PASS AO=173;DP=178;FAO=172;FDP=177;FR=.;FRO=5;FSAF=55;FSAR=117;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.00689971;FXX=0.0166657;HRUN=6;LEN=1;MLLD=183.274;QD=35.4757;RBI=0.00830748;REFB=-0.0792892;REVB=-0.00462691;RO=4;SAF=57;SAR=116;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00827068;STB=0.5026;TYPE=snp;VARB=0.000112229;OID=.;OPOS=18080644;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:178:177:4:5:173:172:116:57:2:2:117:55:2:3 chr8 18080651 . A C 1359.93 PASS AO=145;DP=150;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0031384;FXX=0.0519447;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.7;QD=37.2583;RBI=0.00848791;REFB=-0.0322236;REVB=0.00788639;RO=0;SAF=46;SAR=99;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000561279;OID=.;OPOS=18080651;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:150:146:0:0:145:146:99:46:0:0:99:47:0:0 chr8 18080923 . G A 1759.04 PASS AO=182;DP=185;FAO=183;FDP=183;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.035569;FXX=0.0213892;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.5077;QD=38.4489;RBI=0.0535463;REFB=0;REVB=0.0400256;RO=0;SAF=72;SAR=110;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.33854e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.90494e-05;OID=.;OPOS=18080923;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:185:183:0:0:182:183:110:72:0:0:111:72:0:0 chr8 18257795 . C T 119.59 PASS AO=34;DP=85;FAO=34;FDP=84;FR=.;FRO=50;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=29;FSRR=21;FWDB=0.0256592;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.562;QD=5.69455;RBI=0.0265279;REFB=0.0172235;REVB=-0.00673306;RO=48;SAF=11;SAR=23;SRF=27;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252759;STB=0.655178;TYPE=snp;VARB=-0.0107663;OID=.;OPOS=18257795;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:84:48:50:34:34:23:11:27:21:23:11:29:21 chr8 18257854 . T C 234.12 PASS AO=38;DP=55;FAO=38;FDP=55;FR=.;FRO=17;FSAF=26;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.0542695;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.6264;QD=17.0266;RBI=0.062539;REFB=-0.023174;REVB=0.0310797;RO=17;SAF=26;SAR=12;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166806;STB=0.590859;TYPE=snp;VARB=0.0112437;OID=.;OPOS=18257854;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:55:55:17:17:38:38:12:26:7:10:12:26:7:10 chr8 18257994 . C T 166.69 PASS AO=37;DP=73;FAO=37;FDP=73;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=10;FSRR=26;FWDB=-0.00941139;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.2173;QD=9.13377;RBI=0.0101601;REFB=0.0272112;REVB=-0.00382796;RO=36;SAF=13;SAR=24;SRF=10;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0735762;STB=0.540744;TYPE=snp;VARB=-0.0237511;OID=.;OPOS=18257994;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:36:36:37:37:24:13:10:26:24:13:10:26 chr8 18258103 . G A 295.58 PASS AO=62;DP=113;FAO=61;FDP=111;FR=.;FRO=50;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=-0.0112973;FXX=0.0263135;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.825;QD=10.6514;RBI=0.0147011;REFB=-0.0334344;REVB=0.00940704;RO=51;SAF=29;SAR=33;SRF=26;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0346994;STB=0.527522;TYPE=snp;VARB=0.0243104;OID=.;OPOS=18258103;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:111:51:50:62:61:33:29:26:25:33:28:26:24 chr8 18258316 . G A 423.93 PASS AO=66;DP=109;FAO=77;FDP=119;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=66;FSRF=27;FSRR=15;FWDB=-0.000597189;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.913;QD=14.2497;RBI=0.0195452;REFB=-0.0119741;REVB=0.0195361;RO=38;SAF=10;SAR=56;SRF=24;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.421341;STB=0.737792;TYPE=snp;VARB=0.0167757;OID=.;OPOS=18258316;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:119:38:42:66:77:56:10:24:14:66:11:27:15 chr8 18388177 . T G 1488.91 PASS AO=157;DP=159;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0237834;FXX=0.0248432;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.6917;QD=37.934;RBI=0.0469376;REFB=-0.0129177;REVB=0.0404658;RO=1;SAF=69;SAR=88;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00537605;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000300757;OID=.;OPOS=18388177;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:159:157:1:0:157:157:88:69:0:1:88:69:0:0 chr8 18457957 . A G 1370.31 PASS AO=126;DP=157;FAO=175;FDP=176;FR=.;FRO=1;FSAF=86;FSAR=89;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0421397;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=29.9168;QD=31.1434;RBI=0.340555;REFB=0.0292635;REVB=0.337937;RO=31;SAF=70;SAR=56;SRF=7;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122246;STB=0.50289;TYPE=snp;VARB=0.00620782;OID=.;OPOS=18457957;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:157:176:31:1:126:175:56:70:7:24:89:86:1:0 chr8 18620570 . T C 375 PASS AO=90;DP=175;FAO=88;FDP=174;FR=.;FRO=86;FSAF=22;FSAR=66;FSRF=31;FSRR=55;FWDB=-0.0447832;FXX=0.00571396;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.2755;QD=8.62076;RBI=0.108144;REFB=-0.0205729;REVB=-0.098436;RO=83;SAF=24;SAR=66;SRF=29;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0880804;STB=0.567841;TYPE=snp;VARB=0.0191493;OID=.;OPOS=18620570;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:174:83:86:90:88:66:24:29:54:66:22:31:55 chr8 18656805 . G A 332.85 PASS AO=73;DP=140;FAO=73;FDP=140;FR=.;FRO=67;FSAF=39;FSAR=34;FSRF=35;FSRR=32;FWDB=0.00139534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.002;QD=9.51007;RBI=0.0240052;REFB=-0.0237388;REVB=0.0239646;RO=67;SAF=39;SAR=34;SRF=35;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.010374;STB=0.505696;TYPE=snp;VARB=0.019069;OID=.;OPOS=18656805;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:67:67:73:73:34:39:35:32:34:39:35:32 chr8 18656875 . T C 139.01 PASS AO=42;DP=111;FAO=44;FDP=113;FR=.;FRO=69;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=29;FSRR=40;FWDB=0.0215274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.3406;QD=4.92085;RBI=0.0332027;REFB=-0.0151413;REVB=0.0252782;RO=69;SAF=16;SAR=26;SRF=29;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0448905;STB=0.53661;TYPE=snp;VARB=0.0288549;OID=.;OPOS=18656875;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:113:69:69:42:44:26:16:29:40:28:16:29:40 chr8 18729459 . T C 529.82 PASS AO=116;DP=219;FAO=116;FDP=219;FR=.;FRO=103;FSAF=24;FSAR=92;FSRF=33;FSRR=70;FWDB=-0.0164173;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.003;QD=9.67705;RBI=0.016603;REFB=-0.0127374;REVB=0.00247627;RO=103;SAF=24;SAR=92;SRF=33;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135052;STB=0.574231;TYPE=snp;VARB=0.0115944;OID=.;OPOS=18729459;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:219:219:103:103:116:116:92:24:33:70:92:24:33:70 chr8 18729496 . G A 277.35 PASS AO=62;DP=123;FAO=63;FDP=125;FR=.;FRO=62;FSAF=15;FSAR=48;FSRF=22;FSRR=40;FWDB=-0.00743703;FXX=0.045798;HRUN=3;LEN=1;MLLD=165.568;QD=8.87532;RBI=0.0164519;REFB=-0.00624519;REVB=-0.014675;RO=61;SAF=14;SAR=48;SRF=21;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13858;STB=0.573619;TYPE=snp;VARB=0.00975103;OID=.;OPOS=18729496;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:125:61:62:62:63:48:14:21:40:48:15:22:40 chr8 18729817 . G A 200.93 PASS AO=73;DP=209;FAO=73;FDP=209;FR=.;FRO=136;FSAF=31;FSAR=42;FSRF=53;FSRR=83;FWDB=-0.0177788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.582;QD=3.84559;RBI=0.017862;REFB=-0.00425719;REVB=0.00172116;RO=115;SAF=31;SAR=42;SRF=44;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0470839;STB=0.52343;TYPE=snp;VARB=0.00664912;OID=.;OPOS=18729817;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:209:115:136:73:73:42:31:44:71:42:31:53:83 chr8 19190491 . A G 255.03 PASS AO=25;DP=139;FAO=65;FDP=142;FR=.;FRO=77;FSAF=55;FSAR=10;FSRF=63;FSRR=14;FWDB=0.00608747;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=162.446;QD=7.18407;RBI=0.0305957;REFB=-0.0216131;REVB=-0.029984;RO=70;SAF=15;SAR=10;SRF=57;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.301491;STB=0.527991;TYPE=snp;VARB=0.024347;OID=.;OPOS=19190491;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:142:70:77:25:65:10:15:57:13:10:55:63:14 chr8 19252272 . GAAAGT G 195.09 PASS AO=54;DP=113;FAO=58;FDP=105;FR=.;FRO=47;FSAF=4;FSAR=54;FSRF=11;FSRR=36;FWDB=0.00327612;FXX=0.0366939;HRUN=3;LEN=5;MLLD=217.733;QD=7.43202;RBI=0.0438902;REFB=0.0192317;REVB=-0.0437678;RO=40;SAF=4;SAR=50;SRF=10;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.333001;STB=0.692223;TYPE=del;VARB=-0.014979;OID=.;OPOS=19252273;OREF=AAAGT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:54:100:58:105:47:4:54:11:36:99:40:4:50:10:30 chr8 19362768 . C T 236.64 PASS AO=61;DP=138;FAO=62;FDP=139;FR=.;FRO=77;FSAF=27;FSAR=35;FSRF=45;FSRR=32;FWDB=0.00525642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.915;QD=6.80971;RBI=0.0261416;REFB=-0.0248274;REVB=0.0256077;RO=77;SAF=27;SAR=34;SRF=45;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141156;STB=0.582094;TYPE=snp;VARB=0.03035;OID=.;OPOS=19362768;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:139:77:77:61:62:34:27:45:32:35:27:45:32 chr8 19677915 . G A 720.45 PASS AO=150;DP=270;FAO=150;FDP=270;FR=.;FRO=120;FSAF=69;FSAR=81;FSRF=65;FSRR=55;FWDB=0.00148262;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=178.673;QD=10.6734;RBI=0.0109271;REFB=-0.00360589;REVB=0.010826;RO=120;SAF=69;SAR=81;SRF=65;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0668013;STB=0.536313;TYPE=snp;VARB=0.00272454;OID=.;OPOS=19677915;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:270:270:120:120:150:150:81:69:65:55:81:69:65:55 chr8 20006070 . T C 821.66 PASS AO=95;DP=101;FAO=95;FDP=101;FR=.;FRO=6;FSAF=44;FSAR=51;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.000839553;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.118;QD=32.5411;RBI=0.0109651;REFB=-0.103404;REVB=0.0109329;RO=5;SAF=44;SAR=51;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0508905;STB=0.531908;TYPE=snp;VARB=0.00271522;OID=.;OPOS=20006070;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:101:101:5:6:95:95:51:44:5:0:51:44:6:0 chr8 20036015 . A AT 142.25 PASS AO=11;DP=40;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0536417;FXX=0.257069;HRUN=2;LEN=1;MLLD=13.3998;QD=21.885;RBI=0.150502;REFB=0;REVB=0.140618;RO=27;SAF=3;SAR=8;SRF=7;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0198927;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.0119528;OID=.;OPOS=20036016;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:11:40:26:26:0:9:17:0:0:15:27:3:8:7:20 chr8 20036713 . A G 1344.77 PASS AO=141;DP=141;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186843;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.155;QD=38.1495;RBI=0.0214604;REFB=0;REVB=0.0105568;RO=0;SAF=52;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.55169e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.89311e-05;OID=.;OPOS=20036713;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:141:141:0:0:141:141:89:52:0:0:89:52:0:0 chr8 20068163 . T G 3125.44 PASS AO=304;DP=305;FAO=327;FDP=327;FR=.;FRO=0;FSAF=113;FSAR=214;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.432;QD=38.2317;RBI=0.0334032;REFB=0;REVB=0.0280432;RO=0;SAF=105;SAR=199;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.15287e-05;OID=.;OPOS=20068163;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:305:327:0:0:304:327:199:105:0:0:214:113:0:0 chr8 20077880 . C T 187.24 PASS AO=39;DP=81;FAO=42;FDP=82;FR=.;FRO=40;FSAF=3;FSAR=39;FSRF=5;FSRR=35;FWDB=-0.000398215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.1038;QD=9.13343;RBI=0.0368351;REFB=-0.0226924;REVB=0.036833;RO=40;SAF=2;SAR=37;SRF=5;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.250475;STB=0.584224;TYPE=snp;VARB=0.0259822;OID=.;OPOS=20077880;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:82:40:40:39:42:37:2:5:35:39:3:5:35 chr8 20104985 . G T 338.15 PASS AO=69;DP=123;FAO=69;FDP=123;FR=.;FRO=54;FSAF=52;FSAR=17;FSRF=42;FSRR=12;FWDB=-0.056671;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.739;QD=10.9966;RBI=0.0582959;REFB=-0.0420981;REVB=0.0136677;RO=53;SAF=52;SAR=17;SRF=42;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.042663;STB=0.514484;TYPE=snp;VARB=0.0315229;OID=.;OPOS=20104985;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:53:54:69:69:17:52:42:11:17:52:42:12 chr8 20110641 . C T 56.72 PASS AO=17;DP=47;FAO=17;FDP=47;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=24;FWDB=0.000374104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.314;QD=4.82755;RBI=0.0163593;REFB=-0.0186896;REVB=0.0163551;RO=30;SAF=8;SAR=9;SRF=6;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.308281;STB=0.676745;TYPE=snp;VARB=0.0283948;OID=.;OPOS=20110641;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:47:47:30:30:17:17:9:8:6:24:9:8:6:24 chr8 21455978 . GT G 290.18 PASS AO=39;DP=55;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0652124;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=13.9898;QD=26.3798;RBI=0.146731;REFB=0;REVB=-0.131443;RO=1;SAF=26;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0.375;SSEP=0;SSSB=-0.0176923;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.00330501;OID=.;OPOS=21455979;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:39:44:44:44:0:30:14:0:0:28:1:26:13:1:0 chr8 21455993 . C T 351.11 PASS AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171911;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=174.052;QD=37.9582;RBI=0.0382166;REFB=0;REVB=0.0341317;RO=0;SAF=30;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.00464e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000137771;OID=.;OPOS=21455993;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:37:37:0:0:37:37:7:30:0:0:7:30:0:0 chr8 21456116 . G A 841.63 PASS AO=90;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0341183;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=96.1384;QD=36.5924;RBI=0.0564924;REFB=-0.0587493;REVB=0.045026;RO=2;SAF=45;SAR=45;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00165289;OID=.;OPOS=21456116;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:92:92:2:0:90:92:45:45:1:1:46:46:0:0 chr8 21550800 . A T 510.85 PASS AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.038724;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.754;QD=37.8407;RBI=0.0588102;REFB=0;REVB=0.0442617;RO=0;SAF=18;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000127124;OID=.;OPOS=21550800;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:55:54:0:0:54:54:36:18:0:0:36:18:0:0 chr8 21766970 . CG C 22.67 PASS AO=17;DP=61;FAO=24;FDP=59;FR=.;FRO=35;FSAF=2;FSAR=22;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.151333;FXX=0.0327815;HRUN=4;LEN=1;MLLD=10.1782;QD=1.53668;RBI=0.208345;REFB=-0.083565;REVB=-0.143199;RO=30;SAF=1;SAR=16;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.661867;STB=0.828108;TYPE=del;VARB=0.0927717;OID=.;OPOS=21766971;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:17:58:24:59:35:2:22:16:19:22:30:1:16:16:14 chr8 21767119 . G A 96.15 PASS AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=51;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=3;FSRR=25;FWDB=0.000897223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9222;QD=7.54115;RBI=0.0150575;REFB=0.0281669;REVB=-0.0150308;RO=28;SAF=5;SAR=18;SRF=3;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17704;STB=0.598811;TYPE=snp;VARB=-0.0147543;OID=.;OPOS=21767119;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:51:51:28:28:23:23:18:5:3:25:18:5:3:25 chr8 21767275 . C G 97.08 PASS AO=17;DP=28;FAO=17;FDP=28;FR=.;FRO=11;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=0;FWDB=0.00311396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.814;QD=13.8692;RBI=0.018067;REFB=0.0166309;REVB=0.0177966;RO=11;SAF=14;SAR=3;SRF=11;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.25786;STB=0.640896;TYPE=snp;VARB=-0.00704522;OID=.;OPOS=21767275;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:28:28:11:11:17:17:3:14:11:0:3:14:11:0 chr8 21833965 . C T 1153.9 PASS AO=119;DP=119;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0421937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.707;QD=38.1456;RBI=0.0433045;REFB=0;REVB=-0.00974516;RO=0;SAF=47;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.20685e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.21285e-05;OID=.;OPOS=21833965;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:119:121:0:0:119:121:72:47:0:0:72:49:0:0 chr8 21846586 . G C 956.33 PASS AO=99;DP=100;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0252404;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.195;QD=38.6395;RBI=0.0278433;REFB=0;REVB=0.0117547;RO=0;SAF=42;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.37041e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.46458e-05;OID=.;OPOS=21846586;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:100:99:0:0:99:99:57:42:0:0:57:42:0:0 chr8 21862551 . A G 267.06 PASS AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0157243;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.5497;QD=38.1519;RBI=0.0961383;REFB=0;REVB=0.0948436;RO=0;SAF=14;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00194012;OID=.;OPOS=21862551;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:28:28:0:0:28:28:14:14:0:0:14:14:0:0 chr8 21927460 . C G 162.47 PASS AO=33;DP=61;FAO=33;FDP=61;FR=.;FRO=28;FSAF=3;FSAR=30;FSRF=7;FSRR=21;FWDB=-0.0146324;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=196.715;QD=10.6539;RBI=0.0160278;REFB=0.00449414;REVB=-0.00654099;RO=27;SAF=3;SAR=30;SRF=6;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.245283;STB=0.662132;TYPE=snp;VARB=-0.00324793;OID=.;OPOS=21927460;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:27:28:33:33:30:3:6:21:30:3:7:21 chr8 21939435 . C T 276.33 PASS AO=51;DP=82;FAO=51;FDP=82;FR=.;FRO=31;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=0.0974829;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.09;QD=13.4795;RBI=0.0987814;REFB=-0.0325718;REVB=-0.0159635;RO=31;SAF=16;SAR=35;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129582;STB=0.527037;TYPE=snp;VARB=0.0283511;OID=.;OPOS=21939435;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:31:31:51:51:35:16:15:16:33:18:13:18 chr8 21955116 . C T 65.35 PASS AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.0645065;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9557;QD=14.5214;RBI=0.0875021;REFB=0.0583364;REVB=0.0591231;RO=7;SAF=10;SAR=1;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.407764;STB=0.740184;TYPE=snp;VARB=-0.0393682;OID=.;OPOS=21955116;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:18:18:7:7:11:11:1:10:4:3:1:10:4:3 chr8 21956108 . A G 106.99 PASS AO=24;DP=50;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=0.0235827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.429;QD=8.55925;RBI=0.0328179;REFB=-0.0189356;REVB=-0.0228226;RO=25;SAF=14;SAR=10;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235357;STB=0.64041;TYPE=snp;VARB=0.0103939;OID=.;OPOS=21956108;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:25:26:24:24:10:14:8:17:10:14:8:18 chr8 21961834 . G A 361.46 PASS AO=78;DP=144;FAO=78;FDP=146;FR=.;FRO=68;FSAF=33;FSAR=45;FSRF=31;FSRR=37;FWDB=-0.0109295;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.943;QD=9.90308;RBI=0.0263933;REFB=-0.0309311;REVB=0.024024;RO=66;SAF=33;SAR=45;SRF=30;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0268668;STB=0.515571;TYPE=snp;VARB=0.0306045;OID=.;OPOS=21961834;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:146:66:68:78:78:45:33:30:36:45:33:31:37 chr8 21965113 . T C 176.39 PASS AO=41;DP=87;FAO=42;FDP=88;FR=.;FRO=46;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=-0.0522456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.8954;QD=8.01778;RBI=0.0640087;REFB=-0.00388864;REVB=-0.0369798;RO=45;SAF=17;SAR=24;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132735;STB=0.560232;TYPE=snp;VARB=0.00467002;OID=.;OPOS=21965113;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:88:45:46:41:42:24:17:25:20:24:18:25:21 chr8 21967304 . C T 66.54 PASS AO=20;DP=64;FAO=22;FDP=65;FR=.,HEALED;FRO=43;FSAF=4;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=0.0718935;FXX=0.0298463;HRUN=5;LEN=1;MLLD=33.0772;QD=4.09463;RBI=0.238157;REFB=-0.0506948;REVB=-0.227047;RO=21;SAF=4;SAR=16;SRF=18;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.572452;STB=0.74975;TYPE=snp;VARB=0.078131;OID=.;OPOS=21967304;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:63:65:21:43:20:22:16:4:18:3:18:4:22:21 chr8 21967309 . A C 37.22 PASS AO=19;DP=74;FAO=19;FDP=76;FR=.;FRO=57;FSAF=1;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=32;FWDB=-0.0110338;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.6123;QD=1.95881;RBI=0.0162268;REFB=0.0204481;REVB=0.0118981;RO=53;SAF=1;SAR=18;SRF=23;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.628969;STB=0.902942;TYPE=snp;VARB=-0.0637159;OID=.;OPOS=21967309;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:74:76:53:57:19:19:18:1:23:30:18:1:25:32 chr8 21974427 . G T 39.61 PASS AO=10;DP=27;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=-0.0885416;FXX=0.0370233;HRUN=5;LEN=1;MLLD=125.14;QD=6.09432;RBI=0.0896832;REFB=0.00170184;REVB=-0.0142638;RO=16;SAF=1;SAR=9;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.293452;STB=0.681372;TYPE=snp;VARB=-0.0107566;OID=.;OPOS=21974427;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:27:26:16:16:10:10:9:1:4:12:9:1:4:12 chr8 21982826 . TC T 73.43 PASS AO=12;DP=21;FAO=19;FDP=23;FR=.;FRO=4;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0100136;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.7678;QD=12.7701;RBI=0.130961;REFB=-0.11341;REVB=0.130578;RO=6;SAF=11;SAR=1;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0.8;SSSB=0.529426;STB=0.582;TYPE=del;VARB=0.0758476;OID=.;OPOS=21982827;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:12:20:19:23:4:13:6:1:3:6:6:11:1:2:4 chr8 21984650 . A G 214.72 PASS AO=22;DP=22;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0811269;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=32.5163;QD=33.0342;RBI=0.151041;REFB=0.138354;REVB=-0.127404;RO=0;SAF=13;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2029e-08;STB=0.529388;TYPE=snp;VARB=-0.0152456;OID=.;OPOS=21984650;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:22:26:0:1:22:25:9:13:0:0:8:17:0:1 chr8 21984945 . C T 147.54 PASS AO=24;DP=42;FAO=27;FDP=43;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.00174579;FXX=0.0444346;HRUN=5;LEN=1;MLLD=150.246;QD=13.7242;RBI=0.00680016;REFB=0.00376232;REVB=-0.00657224;RO=16;SAF=9;SAR=15;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22549;STB=0.634819;TYPE=snp;VARB=-0.00386247;OID=.;OPOS=21984945;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:42:43:16:16:24:27:15:9:11:5:18:9:11:5 chr8 21995811 . ACATTGTGGGTGCATCCCTG A,ACATTGTGGTGCATCCCTG 95.63 PASS AO=12,6;DP=47;FAO=12,7;FDP=26;FR=.;FRO=7;FSAF=6,0;FSAR=6,7;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=-0.00237311,-0.182028;FXX=0.133289;HRUN=1,3;LEN=19,1;MLLD=414.184,17.5309;QD=14.7131;RBI=0.0123047,0.18497;REFB=-0.0188422,0.0189246;REVB=-0.0120737,-0.0328568;RO=7;SAF=6,0;SAR=6,6;SRF=6;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.233815,-0.808918;STB=0.631374,0.998366;TYPE=del,del;VARB=0.0171755,0.083932;OID=.,.;OPOS=21995812,21995818;OREF=CATTGTGGGTGCATCCCTG,G;OALT=-,-;OMAPALT=A,ACATTGTGGTGCATCCCTG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:12,6:25:12,7:26:7:6,0:6,7:6:1:33:7:6,0:6,6:6:1 chr8 22021933 . C T 121.96 PASS AO=32;DP=74;FAO=32;FDP=74;FR=.;FRO=42;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=0.0693772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.7085;QD=6.59226;RBI=0.0709987;REFB=-0.0297266;REVB=0.015087;RO=42;SAF=21;SAR=11;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0911207;STB=0.551597;TYPE=snp;VARB=0.0270485;OID=.;OPOS=22021933;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:42:42:32:32:11:21:24:18:11:21:24:18 chr8 22059323 . C T 182.61 PASS AO=34;DP=57;FAO=34;FDP=57;FR=.;FRO=23;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.0378835;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.425;QD=12.8144;RBI=0.0410286;REFB=-0.0198283;REVB=0.0157541;RO=23;SAF=20;SAR=14;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0819107;STB=0.545047;TYPE=snp;VARB=0.010295;OID=.;OPOS=22059323;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:57:57:23:23:34:34:14:20:11:12:14:20:11:12 chr8 22079355 . A G 210.67 PASS AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00236963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.19;QD=36.639;RBI=0.081043;REFB=0;REVB=-0.0810083;RO=0;SAF=13;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000797663;OID=.;OPOS=22079355;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:0:0:23:23:10:13:0:0:10:13:0:0 chr8 22084503 . C T 558.09 PASS AO=59;DP=61;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0813674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.6767;QD=34.3443;RBI=0.0847526;REFB=-0.0932378;REVB=0.0237139;RO=1;SAF=14;SAR=45;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0325048;STB=0.512816;TYPE=snp;VARB=0.00699673;OID=.;OPOS=22084503;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:61:65:1:1:59:64:45:14:1:0:45:19:1:0 chr8 22105502 . T C 911.97 PASS AO=90;DP=90;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.362;QD=37.9989;RBI=0.0500151;REFB=0;REVB=0.0489261;RO=0;SAF=33;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.80122e-05;OID=.;OPOS=22105502;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:90:96:0:0:90:96:57:33:0:0:61:35:0:0 chr8 22108611 . A C 295.66 PASS AO=67;DP=131;FAO=67;FDP=131;FR=.;FRO=64;FSAF=35;FSAR=32;FSRF=46;FSRR=18;FWDB=-0.0201041;FXX=0.0223864;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.7251;QD=9.02764;RBI=0.0416339;REFB=0.00245447;REVB=-0.0364583;RO=53;SAF=35;SAR=32;SRF=35;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112497;STB=0.596932;TYPE=snp;VARB=-0.00502228;OID=.;OPOS=22108611;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:53:64:67:67:32:35:35:18:32:35:46:18 chr8 22262228 . AGCTGCT A 79.28 PASS AO=24;DP=77;FAO=26;FDP=73;FR=.;FRO=47;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=34;FSRR=13;FWDB=-0.0111129;FXX=0.0640943;HRUN=1;LEN=6;MLLD=268.892;QD=4.34412;RBI=0.011644;REFB=-0.00714618;REVB=0.00347637;RO=43;SAF=14;SAR=10;SRF=32;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191903;STB=0.621944;TYPE=del;VARB=0.0142644;OID=.;OPOS=22262229;OREF=GCTGCT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:24:73:26:73:47:14:12:34:13:79:43:14:10:32:11 chr8 22262320 . CT C,CC 230 PASS AO=27,24;DP=106;FAO=30,23;FDP=101;FR=.;FRO=48;FSAF=28,2;FSAR=2,21;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=-0.00497563,-0.00974755;FXX=0.0288434;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=96.4126,105.244;QD=9.10875;RBI=0.0493083,0.0375436;REFB=-0.00319875,0.000930228;REVB=-0.0490566,-0.0362562;RO=48;SAF=27,2;SAR=0,22;SRF=21;SRR=27;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.833424,-0.557613;STB=0.891993,0.833838;TYPE=del,snp;VARB=0.00629528,-0.0060452;OID=.,.;OPOS=22262321,22262321;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:27,24:103:30,23:101:48:28,2:2,21:21:27:88:48:27,2:0,22:21:27 chr8 22262379 . C T 210.51 PASS AO=52;DP=113;FAO=52;FDP=112;FR=.;FRO=60;FSAF=20;FSAR=32;FSRF=19;FSRR=41;FWDB=0.0318412;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.5621;QD=7.5183;RBI=0.0382173;REFB=-0.0417152;REVB=0.0211351;RO=58;SAF=20;SAR=32;SRF=18;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0760567;STB=0.539129;TYPE=snp;VARB=0.0567003;OID=.;OPOS=22262379;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:112:58:60:52:52:32:20:18:40:32:20:19:41 chr8 22262418 . A G 134.09 PASS AO=40;DP=102;FAO=40;FDP=102;FR=.;FRO=62;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=15;FSRR=47;FWDB=-0.00863033;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.42;QD=5.25822;RBI=0.0093753;REFB=0.0054298;REVB=-0.00366247;RO=55;SAF=15;SAR=25;SRF=8;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275382;STB=0.590122;TYPE=snp;VARB=-0.00841883;OID=.;OPOS=22262418;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:55:62:40:40:25:15:8:47:25:15:15:47 chr8 22273687 . T C 169.09 PASS AO=43;DP=93;FAO=43;FDP=95;FR=.;FRO=52;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=16;FSRR=36;FWDB=-0.00718106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.2442;QD=7.11945;RBI=0.00830208;REFB=0.0151886;REVB=-0.00416616;RO=49;SAF=16;SAR=27;SRF=15;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0688724;STB=0.538444;TYPE=snp;VARB=-0.0160479;OID=.;OPOS=22273687;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:95:49:52:43:43:27:16:15:34:27:16:16:36 chr8 22279010 . G GGGA 354.85 PASS AO=92;DP=208;FAO=94;FDP=209;FR=.;FRO=115;FSAF=43;FSAR=51;FSRF=61;FSRR=54;FWDB=0.000174042;FXX=0.0141503;HRUN=3;LEN=3;MLLD=155.734;QD=6.79136;RBI=0.023341;REFB=-0.0114497;REVB=-0.0233404;RO=113;SAF=42;SAR=50;SRF=62;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0914048;STB=0.540169;TYPE=ins;VARB=0.0130076;OID=.;OPOS=22279011;OREF=-;OALT=GGA;OMAPALT=GGGA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:92:208:94:209:115:43:51:61:54:99:113:42:50:62:51 chr8 22428658 . T C 61.32 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.608;QD=35.0381;RBI=0.0356988;REFB=0;REVB=-0.0236127;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.00833e-05;OID=.;OPOS=22428658;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:3:4:0:0:3:4:0:0 chr8 22459874 . G A 16.08 PASS AO=3;DP=6;FAO=3;FDP=6;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.00544767;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=178.779;QD=10.72;RBI=0.00544767;REFB=0.0276701;REVB=0;RO=3;SAF=3;SAR=0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00171376;OID=.;OPOS=22459874;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:6:6:3:3:3:3:0:3:3:0:0:3:3:0 chr8 22477975 . CA C 23.76 PASS AO=10;DP=22;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.0768871;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.2431;QD=4.13233;RBI=0.078635;REFB=-0.0659901;REVB=0.0164876;RO=10;SAF=1;SAR=9;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.548441;STB=0.841353;TYPE=del;VARB=0.0884577;OID=.;OPOS=22477976;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:10:21:11:23:12:1:10:7:5:23:10:1:9:6:4 chr8 22479011 . G A 62.16 PASS AO=28;DP=70;FAO=18;FDP=48;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=3.24189e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.5027;QD=5.18013;RBI=0.0119154;REFB=-0.01898;REVB=0.0119153;RO=42;SAF=18;SAR=10;SRF=29;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0556023;STB=0.583243;TYPE=snp;VARB=0.0301669;OID=.;OPOS=22479011;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:70:48:42:30:28:18:10:18:29:13:9:9:19:11 chr8 22482851 . A C 511.09 PASS AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0337475;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.265;QD=37.8582;RBI=0.0344912;REFB=0;REVB=-0.00712358;RO=0;SAF=42;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.61345e-05;OID=.;OPOS=22482851;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:54:54:0:0:54:54:12:42:0:0:12:42:0:0 chr8 22491980 . G T 1629.84 PASS AO=178;DP=180;FAO=176;FDP=180;FR=.;FRO=4;FSAF=111;FSAR=65;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0156299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.444;QD=36.2187;RBI=0.0207855;REFB=0.00146559;REVB=0.013702;RO=2;SAF=113;SAR=65;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00307289;STB=0.50285;TYPE=snp;VARB=-8.62735e-05;OID=.;OPOS=22491980;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:180:180:2:4:178:176:65:113:1:1:65:111:3:1 chr8 22492052 . G A 1312.18 PASS AO=149;DP=157;FAO=149;FDP=157;FR=.;FRO=8;FSAF=68;FSAR=81;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=0.0308014;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.003;QD=33.4313;RBI=0.0376414;REFB=-0.0728728;REVB=0.0216366;RO=5;SAF=68;SAR=81;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0336903;STB=0.527774;TYPE=snp;VARB=0.000758871;OID=.;OPOS=22492052;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:157:157:5:8:149:149:81:68:5:0:81:68:8:0 chr8 22526609 . G A 104.24 PASS AO=30;DP=77;FAO=31;FDP=78;FR=.;FRO=47;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=30;FSRR=17;FWDB=-0.0152387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.959;QD=5.34549;RBI=0.0317691;REFB=-0.0177067;REVB=0.0278757;RO=46;SAF=12;SAR=18;SRF=29;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.241104;STB=0.629699;TYPE=snp;VARB=0.0171501;OID=.;OPOS=22526609;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:78:46:47:30:31:18:12:29:17:18:13:30:17 chr8 22584718 . T C 369.09 PASS AO=99;DP=225;FAO=100;FDP=226;FR=.;FRO=126;FSAF=38;FSAR=62;FSRF=57;FSRR=69;FWDB=-0.0396417;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.382;QD=6.53254;RBI=0.0397968;REFB=-0.0066509;REVB=-0.0035106;RO=126;SAF=37;SAR=62;SRF=58;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0906593;STB=0.54195;TYPE=snp;VARB=0.00801462;OID=.;OPOS=22584718;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:225:226:126:126:99:100:62:37:58:68:62:38:57:69 chr8 22864622 . T C 941.81 PASS AO=97;DP=99;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0511939;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9172;QD=37.6725;RBI=0.0543408;REFB=-0.0225683;REVB=0.018224;RO=2;SAF=63;SAR=34;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00627521;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000291001;OID=.;OPOS=22864622;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:99:100:2:0:97:100:34:63:1:1:35:65:0:0 chr8 22875909 . A G 287.44 PASS AO=35;DP=37;FAO=36;FDP=41;FR=.;FRO=5;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0345941;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=90.9666;QD=28.0424;RBI=0.0348198;REFB=-0.139701;REVB=-0.00395819;RO=2;SAF=13;SAR=22;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0666614;STB=0.556156;TYPE=snp;VARB=0.0061879;OID=.;OPOS=22875909;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:37:41:2:5:35:36:22:13:2:0:23:13:4:1 chr8 22886020 . A G 1361.14 PASS AO=140;DP=140;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00527242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.65;QD=38.074;RBI=0.00536598;REFB=0;REVB=-0.000997704;RO=0;SAF=64;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.33035e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.04341e-06;OID=.;OPOS=22886020;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:140:143:0:0:140:143:76:64:0:0:77:66:0:0 chr8 22900701 . G A 188.54 PASS AO=55;DP=139;FAO=55;FDP=136;FR=.;FRO=81;FSAF=45;FSAR=10;FSRF=55;FSRR=26;FWDB=0.0110938;FXX=0.0354585;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.738;QD=5.54533;RBI=0.0267946;REFB=-0.00454375;REVB=-0.0243901;RO=81;SAF=45;SAR=10;SRF=55;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207327;STB=0.618273;TYPE=snp;VARB=0.0108238;OID=.;OPOS=22900701;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:136:81:81:55:55:10:45:55:26:10:45:55:26 chr8 22926313 . G A 33.04 PASS AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0058442;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=337.929;QD=18.8793;RBI=0.0177471;REFB=-0.0624899;REVB=0.0167572;RO=2;SAF=4;SAR=1;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171367;STB=0.59965;TYPE=snp;VARB=0.0101057;OID=.;OPOS=22926313;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:2:2:5:5:1:4:2:0:1:4:2:0 chr8 22960704 . G C 385.01 PASS AO=39;DP=40;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.184583;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.231;QD=34.2235;RBI=0.187344;REFB=-0.0597781;REVB=0.0320451;RO=0;SAF=3;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506326;TYPE=snp;VARB=0.012198;OID=.;OPOS=22960704;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:40:45:0:1:39:44:36:3:0:0:39:5:0:1 chr8 22974324 . C A 15.82 PASS AO=3;DP=7;FAO=3;FDP=7;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=83.1744;QD=9.03814;RBI=0.0499905;REFB=-0.0498614;REVB=0.0499905;RO=4;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0112727;OID=.;OPOS=22974324;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:7:7:4:4:3:3:3:0:0:4:3:0:0:4 chr8 22974325 . G A 34.89 PASS AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.,HEALED;FRO=2;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0570145;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=175.391;QD=19.9375;RBI=0.0706226;REFB=-0.177286;REVB=0.0416761;RO=0;SAF=1;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.59965;TYPE=snp;VARB=0.0215146;OID=.;OPOS=22974325;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:7:7:0:2:5:5:4:1:0:0:4:1:0:2 chr8 22974450 . T C 212.51 PASS AO=24;DP=26;FAO=25;FDP=27;FR=.;FRO=2;FSAF=1;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0289479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.406;QD=31.4833;RBI=0.037745;REFB=0.0254241;REVB=-0.0242219;RO=2;SAF=1;SAR=23;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0386406;STB=0.519984;TYPE=snp;VARB=-0.0019723;OID=.;OPOS=22974450;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:26:27:2:2:24:25:23:1:0:2:24:1:0:2 chr8 22989773 . T C 101.18 PASS AO=41;DP=131;FAO=41;FDP=132;FR=.;FRO=91;FSAF=9;FSAR=32;FSRF=28;FSRR=63;FWDB=-0.00010541;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.943;QD=3.0659;RBI=0.0557643;REFB=-0.00574509;REVB=-0.0557642;RO=89;SAF=9;SAR=32;SRF=28;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145984;STB=0.580635;TYPE=snp;VARB=0.0148004;OID=.;OPOS=22989773;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:132:89:91:41:41:32:9:28:61:32:9:28:63 chr8 23001988 . A G 840.55 PASS AO=87;DP=87;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0266392;FXX=0.0112347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.623;QD=38.2069;RBI=0.108644;REFB=0;REVB=-0.105327;RO=0;SAF=39;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.57206e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0001264;OID=.;OPOS=23001988;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:87:88:0:0:87:88:48:39:0:0:49:39:0:0 chr8 23021346 . G A 62.65 PASS AO=14;DP=39;FAO=16;FDP=39;FR=.,HEALED;FRO=23;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=-0.0169633;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=167.831;QD=6.42593;RBI=0.0304186;REFB=-0.0215916;REVB=-0.0252495;RO=15;SAF=10;SAR=4;SRF=13;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186103;STB=0.545399;TYPE=snp;VARB=0.0250906;OID=.;OPOS=23021346;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:37:39:15:23:14:16:4:10:13:2:6:10:16:7 chr8 23049292 . C T 382.53 PASS AO=91;DP=204;FAO=99;FDP=212;FR=.;FRO=113;FSAF=40;FSAR=59;FSRF=48;FSRR=65;FWDB=0.0204509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.038;QD=7.21756;RBI=0.0222524;REFB=-0.0156152;REVB=0.00877091;RO=111;SAF=37;SAR=54;SRF=46;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00800975;STB=0.511424;TYPE=snp;VARB=0.0176994;OID=.;OPOS=23049292;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:212:111:113:91:99:54:37:46:65:59:40:48:65 chr8 23059324 . C G 339.2 PASS AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0765027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.2965;QD=37.6892;RBI=0.0785147;REFB=0;REVB=0.0176602;RO=0;SAF=15;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00119287;OID=.;OPOS=23059324;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:36:36:0:0:36:36:21:15:0:0:21:15:0:0 chr8 23060256 . T C 2281.35 PASS AO=240;DP=241;FAO=240;FDP=240;FR=.;FRO=0;FSAF=110;FSAR=130;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0127373;FXX=0.00414921;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.72;QD=38.0226;RBI=0.0127509;REFB=-0.0603322;REVB=0.000587866;RO=1;SAF=110;SAR=130;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0043132;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000138732;OID=.;OPOS=23060256;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:241:240:1:0:240:240:130:110:1:0:130:110:0:0 chr8 23115841 . AG A 188.36 PASS AO=19;DP=31;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.13092;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=15.5878;QD=25.1143;RBI=0.326666;REFB=0;REVB=0.299283;RO=7;SAF=13;SAR=6;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205582;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0279737;OID=.;OPOS=23115842;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:19:29:30:30:0:15:15:0:0:17:7:13:6:2:5 chr8 23118494 . T TC 22.49 PASS AO=53;DP=195;FAO=52;FDP=184;FR=.;FRO=132;FSAF=10;FSAR=42;FSRF=47;FSRR=85;FWDB=0.304509;FXX=0.0160419;HRUN=6;LEN=1;MLLD=8.83868;QD=0.488832;RBI=0.319541;REFB=-0.0473932;REVB=-0.0968534;RO=107;SAF=7;SAR=46;SRF=36;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.350601;STB=0.653318;TYPE=ins;VARB=-0.0321154;OID=.;OPOS=23118495;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:53:195:52:184:132:10:42:47:85:22:107:7:46:36:71 chr8 23146095 . A G 111.03 PASS AO=26;DP=59;FAO=26;FDP=56;FR=.;FRO=30;FSAF=3;FSAR=23;FSRF=5;FSRR=25;FWDB=-0.00888871;FXX=0.0508388;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.727;QD=7.93051;RBI=0.0236394;REFB=-2.66903e-05;REVB=-0.0219046;RO=28;SAF=3;SAR=23;SRF=4;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0585391;STB=0.560925;TYPE=snp;VARB=-0.000362521;OID=.;OPOS=23146095;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:56:28:30:26:26:23:3:4:24:23:3:5:25 chr8 23147564 . G A 119.5 PASS AO=27;DP=55;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=26;FSRR=2;FWDB=0.0266537;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.1534;QD=8.69106;RBI=0.0673988;REFB=0.00106059;REVB=0.0619046;RO=28;SAF=19;SAR=8;SRF=26;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.281457;STB=0.654453;TYPE=snp;VARB=0.00131363;OID=.;OPOS=23147564;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:28:28:27:27:8:19:26:2:8:19:26:2 chr8 23148930 . A G 398.08 PASS AO=104;DP=230;FAO=105;FDP=231;FR=.;FRO=126;FSAF=39;FSAR=66;FSRF=76;FSRR=50;FWDB=-0.0167021;FXX=0.0253154;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.731;QD=6.89308;RBI=0.0208264;REFB=-0.0200981;REVB=-0.012441;RO=126;SAF=39;SAR=65;SRF=76;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225549;STB=0.626524;TYPE=snp;VARB=0.0120506;OID=.;OPOS=23148930;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:230:231:126:126:104:105:65:39:76:50:66:39:76:50 chr8 23148940 . G A 395.64 PASS AO=110;DP=255;FAO=110;FDP=254;FR=.;FRO=144;FSAF=42;FSAR=68;FSRF=81;FSRR=63;FWDB=-0.00564776;FXX=0.00781219;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.024;QD=6.23059;RBI=0.0256497;REFB=-0.00451527;REVB=0.0250202;RO=141;SAF=42;SAR=68;SRF=80;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188751;STB=0.603183;TYPE=snp;VARB=0.00586679;OID=.;OPOS=23148940;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:255:254:141:144:110:110:68:42:80:61:68:42:81:63 chr8 23148978 . G T 663.26 PASS AO=121;DP=271;FAO=126;FDP=268;FR=.,HEALED;FRO=112;FSAF=47;FSAR=79;FSRF=82;FSRR=30;FWDB=-0.0169631;FXX=0.00740713;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.376;QD=9.89941;RBI=0.0200836;REFB=-0.0227333;REVB=0.010752;RO=98;SAF=45;SAR=76;SRF=78;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.339046;STB=0.665444;TYPE=snp;VARB=-0.0214717;OID=.;OPOS=23148978;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:267:268:98:112:121:126:76:45:78:20:79:47:82:30 chr8 23150878 . T G 226.45 PASS AO=39;DP=65;FAO=41;FDP=67;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.001751;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3542;QD=13.5196;RBI=0.0496877;REFB=-0.0685968;REVB=-0.0496569;RO=22;SAF=14;SAR=25;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0295742;STB=0.523613;TYPE=snp;VARB=0.0428027;OID=.;OPOS=23150878;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:65:67:22:26:39:41:25:14:7:15:26:15:11:15 chr8 23152334 . A G 291.93 PASS AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.57;QD=38.9234;RBI=0.0223777;REFB=0;REVB=0.0111463;RO=0;SAF=9;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000134374;OID=.;OPOS=23152334;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:30:30:0:0:30:30:21:9:0:0:21:9:0:0 chr8 23153022 . T C 656.94 PASS AO=157;DP=319;FAO=157;FDP=318;FR=.;FRO=161;FSAF=50;FSAR=107;FSRF=92;FSRR=69;FWDB=-0.0300996;FXX=0.0093455;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.359;QD=8.26334;RBI=0.0316686;REFB=-0.0201606;REVB=0.00984448;RO=151;SAF=50;SAR=107;SRF=82;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211606;STB=0.633224;TYPE=snp;VARB=0.0215581;OID=.;OPOS=23153022;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:319:318:151:161:157:157:107:50:82:69:107:50:92:69 chr8 23154982 . C T 63.24 PASS AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=13;FSAR=2;FSRF=15;FSRR=4;FWDB=-0.00544622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.991;QD=7.44001;RBI=0.0122283;REFB=0.00388795;REVB=0.0109485;RO=19;SAF=13;SAR=2;SRF=15;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140104;STB=0.581968;TYPE=snp;VARB=-0.00626305;OID=.;OPOS=23154982;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:34:34:19:19:15:15:2:13:15:4:2:13:15:4 chr8 23154989 . T G 73.44 PASS AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=5;FWDB=0.00167788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.489;QD=7.93983;RBI=0.0296221;REFB=-0.00533988;REVB=0.0295746;RO=18;SAF=13;SAR=4;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0514284;STB=0.510904;TYPE=snp;VARB=0.00333505;OID=.;OPOS=23154989;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:37:37:18:20:17:17:4:13:13:5:4:13:15:5 chr8 23167353 . T G 80.08 PASS AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.00712807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.3379;QD=10.333;RBI=0.0262256;REFB=-0.01794;REVB=-0.0252383;RO=15;SAF=5;SAR=11;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253096;STB=0.644166;TYPE=snp;VARB=0.03939;OID=.;OPOS=23167353;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:31:31:15:15:16:16:11:5:9:6:11:5:9:6 chr8 23186007 . T C 488.26 PASS AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0650257;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.333;QD=37.5582;RBI=0.0656121;REFB=0;REVB=0.00875199;RO=0;SAF=20;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.00761e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.87042e-05;OID=.;OPOS=23186007;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:52:52:0:0:52:52:32:20:0:0:32:20:0:0 chr8 23190941 . T C 712.13 PASS AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00251281;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.005;QD=37.9804;RBI=0.0610947;REFB=0;REVB=-0.061043;RO=0;SAF=41;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00012587;OID=.;OPOS=23190941;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:75:75:0:0:75:75:34:41:0:0:34:41:0:0 chr8 23225559 . G A 52.65 PASS AO=15;DP=41;FAO=15;FDP=41;FR=.;FRO=26;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=-0.00897417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.683;QD=5.13701;RBI=0.015089;REFB=-0.0103475;REVB=0.0121303;RO=26;SAF=2;SAR=13;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.242785;STB=0.646181;TYPE=snp;VARB=0.0138434;OID=.;OPOS=23225559;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:41:41:26:26:15:15:13:2:7:19:13:2:7:19 chr8 23291835 . T C 447.13 PASS AO=123;DP=281;FAO=123;FDP=281;FR=.;FRO=158;FSAF=66;FSAR=57;FSRF=79;FSRR=79;FWDB=0.00246231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.965;QD=6.36488;RBI=0.00261765;REFB=-0.00736731;REVB=-0.000888332;RO=157;SAF=66;SAR=57;SRF=79;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0338239;STB=0.520616;TYPE=snp;VARB=0.007978;OID=.;OPOS=23291835;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:281:281:157:158:123:123:57:66:79:78:57:66:79:79 chr8 23392733 . C T 163.58 PASS AO=37;DP=73;FAO=37;FDP=73;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=28;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=0.0330465;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.4622;QD=8.96337;RBI=0.0428225;REFB=-0.0407515;REVB=0.0272342;RO=36;SAF=9;SAR=28;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130639;STB=0.572981;TYPE=snp;VARB=0.0390457;OID=.;OPOS=23392733;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:36:36:37:37:28:9:13:23:28:9:13:23 chr8 23423758 . G A 403.16 PASS AO=98;DP=204;FAO=99;FDP=207;FR=.;FRO=108;FSAF=51;FSAR=48;FSRF=53;FSRR=55;FWDB=-0.00917008;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.923;QD=7.79057;RBI=0.012665;REFB=0.00057288;REVB=-0.00873566;RO=106;SAF=50;SAR=48;SRF=52;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0185028;STB=0.512735;TYPE=snp;VARB=-0.000654578;OID=.;OPOS=23423758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:207:106:108:98:99:48:50:52:54:48:51:53:55 chr8 23432326 . T A 801.83 PASS AO=82;DP=83;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0100835;FXX=0.0232531;HRUN=3;LEN=1;MLLD=145.244;QD=38.1824;RBI=0.0269797;REFB=0;REVB=0.0250245;RO=0;SAF=32;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.06651e-05;OID=.;OPOS=23432326;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:83:84:0:0:82:84:50:32:0:0:52:32:0:0 chr8 23432332 . C T 264.82 PASS AO=50;DP=89;FAO=52;FDP=91;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=34;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=-0.0174464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.42;QD=11.6406;RBI=0.017449;REFB=-0.0190471;REVB=-0.000304514;RO=39;SAF=18;SAR=32;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0855594;STB=0.552825;TYPE=snp;VARB=0.0125778;OID=.;OPOS=23432332;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:91:39:39:50:52:32:18:18:21:34:18:18:21 chr8 23432776 . A C 2254.73 PASS AO=241;DP=244;FAO=241;FDP=241;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=146;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00747848;FXX=0.0122946;HRUN=2;LEN=1;MLLD=260.253;QD=37.4229;RBI=0.00887398;REFB=0.0248912;REVB=0.00477701;RO=3;SAF=95;SAR=146;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00667362;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.39461e-06;OID=.;OPOS=23432776;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:244:241:3:0:241:241:146:95:2:1:146:95:0:0 chr8 23563908 . A G 17.62 PASS AO=6;DP=24;FAO=6;FDP=24;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=15;FSRR=3;FWDB=0.00866298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.327;QD=2.93584;RBI=0.0140063;REFB=-0.0171229;REVB=-0.0110058;RO=18;SAF=5;SAR=1;SRF=15;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0555415;OID=.;OPOS=23563908;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:24:24:18:18:6:6:1:5:15:3:1:5:15:3 chr8 23934616 . C A 318.8 PASS AO=85;DP=183;FAO=85;FDP=191;FR=.;FRO=106;FSAF=53;FSAR=32;FSRF=23;FSRR=83;FWDB=-0.0210103;FXX=0.00520806;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.9481;QD=6.6764;RBI=0.0465783;REFB=-0.0523522;REVB=-0.0415704;RO=98;SAF=53;SAR=32;SRF=15;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.43295;STB=0.714742;TYPE=snp;VARB=0.0388259;OID=.;OPOS=23934616;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:191:98:106:85:85:32:53:15:83:32:53:23:83 chr8 24171051 . C T 607.26 PASS AO=111;DP=180;FAO=114;FDP=184;FR=.;FRO=70;FSAF=41;FSAR=73;FSRF=22;FSRR=48;FWDB=-0.0314129;FXX=0.0315773;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.158;QD=13.2013;RBI=0.0848749;REFB=-0.0498207;REVB=-0.0788478;RO=61;SAF=39;SAR=72;SRF=22;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00670144;STB=0.51893;TYPE=snp;VARB=0.0351537;OID=.;OPOS=24171051;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:184:61:70:111:114:72:39:22:39:73:41:22:48 chr8 24199218 . C A 880.01 PASS AO=183;DP=322;FAO=178;FDP=310;FR=.;FRO=132;FSAF=80;FSAR=98;FSRF=46;FSRR=86;FWDB=0.0286594;FXX=0.00321533;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.423;QD=11.3549;RBI=0.0296879;REFB=-0.00922425;REVB=0.00774636;RO=132;SAF=82;SAR=101;SRF=46;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.078723;STB=0.543811;TYPE=snp;VARB=0.00760812;OID=.;OPOS=24199218;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:322:310:132:132:183:178:101:82:46:86:98:80:46:86 chr8 24207399 . G C 576.88 PASS AO=139;DP=282;FAO=139;FDP=282;FR=.;FRO=143;FSAF=42;FSAR=97;FSRF=43;FSRR=100;FWDB=-0.015262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.734;QD=8.1827;RBI=0.0153841;REFB=-0.031779;REVB=0.00193413;RO=141;SAF=42;SAR=97;SRF=42;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00467359;STB=0.500878;TYPE=snp;VARB=0.0287458;OID=.;OPOS=24207399;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:282:282:141:143:139:139:97:42:42:99:97:42:43:100 chr8 24207438 . G A 606.36 PASS AO=151;DP=317;FAO=151;FDP=316;FR=.;FRO=165;FSAF=39;FSAR=112;FSRF=42;FSRR=123;FWDB=0.000351672;FXX=0.00315447;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.507;QD=7.67547;RBI=0.0307765;REFB=-0.0133971;REVB=0.0307745;RO=165;SAF=39;SAR=112;SRF=42;SRR=123;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00463457;STB=0.502549;TYPE=snp;VARB=0.0124381;OID=.;OPOS=24207438;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:317:316:165:165:151:151:112:39:42:123:112:39:42:123 chr8 24208847 . G A 385.6 PASS AO=102;DP=232;FAO=104;FDP=234;FR=.;FRO=130;FSAF=56;FSAR=48;FSRF=83;FSRR=47;FWDB=-0.00829017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.671;QD=6.59152;RBI=0.0165765;REFB=-0.0283464;REVB=-0.0143546;RO=130;SAF=55;SAR=47;SRF=83;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101803;STB=0.55636;TYPE=snp;VARB=0.0356058;OID=.;OPOS=24208847;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:234:130:130:102:104:47:55:83:47:48:56:83:47 chr8 24211278 . C T 412.46 PASS AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.833;QD=37.4961;RBI=0.0250063;REFB=0;REVB=0.00998401;RO=0;SAF=21;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2717e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.30597e-05;OID=.;OPOS=24211278;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:44:44:0:0:44:44:23:21:0:0:23:21:0:0 chr8 24211331 . G A 555.78 PASS AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00213775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.187;QD=38.3298;RBI=0.0477906;REFB=0;REVB=-0.0477427;RO=0;SAF=25;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000202302;OID=.;OPOS=24211331;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:58:58:0:0:58:58:33:25:0:0:33:25:0:0 chr8 24211884 . A ATGTC 683.59 PASS AO=113;DP=196;FAO=123;FDP=189;FR=.;FRO=66;FSAF=52;FSAR=71;FSRF=37;FSRR=29;FWDB=-0.0206392;FXX=0.0307677;HRUN=1;LEN=4;MLLD=196.361;QD=14.4675;RBI=0.0210344;REFB=-0.0171842;REVB=-0.00405819;RO=73;SAF=46;SAR=67;SRF=44;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142737;STB=0.548564;TYPE=ins;VARB=0.00753752;OID=.;OPOS=24211885;OREF=-;OALT=TGTC;OMAPALT=ATGTC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:113:196:123:189:66:52:71:37:29:99:73:46:67:44:29 chr8 24256470 . C T 424.41 PASS AO=83;DP=142;FAO=83;FDP=142;FR=.;FRO=59;FSAF=63;FSAR=20;FSRF=33;FSRR=26;FWDB=-0.0531294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.823;QD=11.9552;RBI=0.0550543;REFB=-0.0170728;REVB=-0.0144308;RO=59;SAF=63;SAR=20;SRF=33;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185571;STB=0.601468;TYPE=snp;VARB=0.0152479;OID=.;OPOS=24256470;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:59:59:83:83:20:63:33:26:20:63:33:26 chr8 24261526 . A G 548.12 PASS AO=155;DP=361;FAO=155;FDP=360;FR=.;FRO=205;FSAF=84;FSAR=71;FSRF=105;FSRR=100;FWDB=-0.00429565;FXX=0.00277001;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.192;QD=6.09018;RBI=0.0090021;REFB=0.00139658;REVB=0.00791109;RO=205;SAF=84;SAR=71;SRF=105;SRR=100;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0306135;STB=0.517005;TYPE=snp;VARB=-0.00188912;OID=.;OPOS=24261526;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:361:360:205:205:155:155:71:84:105:100:71:84:105:100 chr8 24321386 . CT C 149.71 PASS AO=35;DP=90;FAO=49;FDP=80;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=41;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=0.0184333;FXX=0.0908988;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.4309;QD=7.48537;RBI=0.251629;REFB=-0.0560386;REVB=-0.250953;RO=34;SAF=4;SAR=31;SRF=23;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.589656;STB=0.722952;TYPE=del;VARB=0.0568561;OID=.;OPOS=24321387;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:35:87:49:80:31:8:41:19:12:35:34:4:31:23:11 chr8 24339679 . G A 317.09 PASS AO=80;DP=172;FAO=80;FDP=172;FR=.;FRO=92;FSAF=33;FSAR=47;FSRF=47;FSRR=45;FWDB=-0.0677895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.678;QD=7.37411;RBI=0.0678926;REFB=0.0102333;REVB=0.00374049;RO=92;SAF=33;SAR=47;SRF=47;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0960839;STB=0.553253;TYPE=snp;VARB=-0.00966495;OID=.;OPOS=24339679;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:172:92:92:80:80:47:33:47:45:47:33:47:45 chr8 24356818 . A C 153.15 PASS AO=47;DP=124;FAO=48;FDP=125;FR=.;FRO=77;FSAF=2;FSAR=46;FSRF=34;FSRR=43;FWDB=-0.0184814;FXX=0.00793588;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.8187;QD=4.90076;RBI=0.0262223;REFB=-0.00163647;REVB=0.0186023;RO=76;SAF=2;SAR=45;SRF=34;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.68201;STB=0.902719;TYPE=snp;VARB=0.00208989;OID=.;OPOS=24356818;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:125:76:77:47:48:45:2:34:42:46:2:34:43 chr8 24359068 . G A 229.49 PASS AO=61;DP=139;FAO=61;FDP=139;FR=.;FRO=78;FSAF=22;FSAR=39;FSRF=17;FSRR=61;FWDB=-0.0315391;FXX=0.00714235;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.76;QD=6.60407;RBI=0.031611;REFB=-0.0101696;REVB=-0.00213151;RO=78;SAF=22;SAR=39;SRF=17;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164753;STB=0.591211;TYPE=snp;VARB=0.0111715;OID=.;OPOS=24359068;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:78:78:61:61:39:22:17:61:39:22:17:61 chr8 24366020 . T C 366.68 PASS AO=92;DP=197;FAO=93;FDP=197;FR=.;FRO=104;FSAF=53;FSAR=40;FSRF=48;FSRR=56;FWDB=-0.000364405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.526;QD=7.44518;RBI=0.0348647;REFB=-0.0132356;REVB=0.0348628;RO=102;SAF=53;SAR=39;SRF=46;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119426;STB=0.557393;TYPE=snp;VARB=0.0102929;OID=.;OPOS=24366020;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:197:102:104:92:93:39:53:46:56:40:53:48:56 chr8 24774683 . C A 1415.98 PASS AO=143;DP=150;FAO=158;FDP=161;FR=.;FRO=3;FSAF=76;FSAR=82;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.129864;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=36.8113;QD=35.1796;RBI=0.167487;REFB=0.0372344;REVB=0.10577;RO=7;SAF=67;SAR=76;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218285;STB=0.502756;TYPE=snp;VARB=0.000943183;OID=.;OPOS=24774683;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:150:161:7:3:143:158:76:67:5:2:82:76:1:2 chr8 24810088 . T A 1668.04 PASS AO=174;DP=175;FAO=174;FDP=174;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0031686;FXX=0.011363;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.9178;QD=38.3457;RBI=0.0306679;REFB=0;REVB=0.0305038;RO=0;SAF=54;SAR=120;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00019278;OID=.;OPOS=24810088;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:175:174:0:0:174:174:120:54:0:0:120:54:0:0 chr8 25159885 . G A 297.78 PASS AO=60;DP=104;FAO=60;FDP=106;FR=.;FRO=46;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=17;FSRR=29;FWDB=0.0152762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.1921;QD=11.2371;RBI=0.0157565;REFB=-0.0182516;REVB=-0.00386063;RO=43;SAF=25;SAR=35;SRF=16;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0353175;STB=0.521166;TYPE=snp;VARB=0.0182325;OID=.;OPOS=25159885;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:106:43:46:60:60:35:25:16:27:35:25:17:29 chr8 25182969 . C T 751.24 PASS AO=110;DP=161;FAO=115;FDP=157;FR=.;FRO=42;FSAF=41;FSAR=74;FSRF=34;FSRR=8;FWDB=0.0137961;FXX=0.0248432;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.001;QD=19.14;RBI=0.0148268;REFB=-0.0165052;REVB=-0.00543145;RO=0;SAF=39;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.622734;TYPE=snp;VARB=0.00725105;OID=.;OPOS=25182969;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:117:157:0:42:110:115:71:39:0:0:74:41:34:8 chr8 25203022 . A G 627.69 PASS AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.232;QD=38.0416;RBI=0.0184456;REFB=0;REVB=0.00556184;RO=0;SAF=30;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.54625e-05;OID=.;OPOS=25203022;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:66:66:0:0:66:66:36:30:0:0:36:30:0:0 chr8 25222165 . A G 126.34 PASS AO=47;DP=140;FAO=47;FDP=140;FR=.;FRO=93;FSAF=14;FSAR=33;FSRF=49;FSRR=44;FWDB=0.00764247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.668;QD=3.60978;RBI=0.0122562;REFB=-0.00597818;REVB=-0.00958165;RO=93;SAF=14;SAR=33;SRF=49;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.273906;STB=0.658467;TYPE=snp;VARB=0.0205652;OID=.;OPOS=25222165;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:93:93:47:47:33:14:49:44:33:14:49:44 chr8 25230168 . C T 438.86 PASS AO=88;DP=164;FAO=93;FDP=167;FR=.;FRO=74;FSAF=37;FSAR=56;FSRF=26;FSRR=48;FWDB=-0.00257792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.204;QD=10.5115;RBI=0.0114175;REFB=-0.0275414;REVB=-0.0111227;RO=74;SAF=35;SAR=53;SRF=26;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0408647;STB=0.521687;TYPE=snp;VARB=0.0219417;OID=.;OPOS=25230168;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:167:74:74:88:93:53:35:26:48:56:37:26:48 chr8 25231117 . C CT 28.65 PASS AO=64;DP=324;FAO=66;FDP=259;FR=.;FRO=193;FSAF=31;FSAR=35;FSRF=102;FSRR=91;FWDB=-0.132915;FXX=0.127942;HRUN=8;LEN=1;MLLD=6.26473;QD=0.442462;RBI=0.147312;REFB=-0.0697108;REVB=0.0635168;RO=156;SAF=38;SAR=26;SRF=80;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0994111;STB=0.543732;TYPE=ins;VARB=-0.0578505;OID=.;OPOS=25231118;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:64:324:66:259:193:31:35:102:91:28:156:38:26:80:76 chr8 25234858 . A G 1925.32 PASS AO=220;DP=232;FAO=222;FDP=232;FR=.;FRO=10;FSAF=58;FSAR=164;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=0.0599448;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.3163;QD=33.1952;RBI=0.0669577;REFB=-0.0771148;REVB=-0.0298321;RO=8;SAF=56;SAR=164;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.053031;STB=0.529236;TYPE=snp;VARB=0.0156078;OID=.;OPOS=25234858;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:232:232:8:10:220:222:164:56:7:1:164:58:8:2 chr8 25258442 . C T 840.74 PASS AO=88;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107337;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.22;QD=37.7863;RBI=0.0116206;REFB=0;REVB=0.00445243;RO=0;SAF=51;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.78635e-05;OID=.;OPOS=25258442;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:89:89:0:0:88:89:37:51:0:0:37:52:0:0 chr8 25287397 . T C 771.95 PASS AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00557587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.7783;QD=38.5972;RBI=0.0576002;REFB=0;REVB=0.0573297;RO=0;SAF=37;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000454428;OID=.;OPOS=25287397;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:80:80:0:0:80:80:43:37:0:0:43:37:0:0 chr8 25317824 . A T 2190.38 PASS AO=229;DP=229;FAO=229;FDP=229;FR=.;FRO=0;FSAF=99;FSAR=130;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0478847;FXX=0.0129305;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.853;QD=38.2598;RBI=0.0483374;REFB=0;REVB=0.0065998;RO=0;SAF=98;SAR=131;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000177247;OID=.;OPOS=25317824;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:229:229:0:0:229:229:131:98:0:0:130:99:0:0 chr8 25323777 . T C 880.38 PASS AO=92;DP=95;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153823;FXX=0.0416623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.324;QD=38.2773;RBI=0.0267551;REFB=0;REVB=0.0218911;RO=0;SAF=41;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.99529e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.67611e-05;OID=.;OPOS=25323777;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:95:92:0:0:92:92:51:41:0:0:51:41:0:0 chr8 25325730 . T C 3094.39 PASS AO=315;DP=352;FAO=351;FDP=351;FR=.;FRO=0;FSAF=201;FSAR=150;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0153314;FXX=0.00284083;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.128;QD=35.2637;RBI=0.183039;REFB=0;REVB=0.182396;RO=35;SAF=201;SAR=114;SRF=0;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126242;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00190037;OID=.;OPOS=25325730;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:352:351:35:0:315:351:114:201:0:35:150:201:0:0 chr8 25364834 . A T 2072.64 PASS AO=223;DP=228;FAO=227;FDP=227;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=137;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0200523;FXX=0.0299133;HRUN=3;LEN=1;MLLD=203.718;QD=36.5223;RBI=0.0203212;REFB=-0.100362;REVB=0.00329468;RO=2;SAF=87;SAR=136;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108261;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000373421;OID=.;OPOS=25364834;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:228:227:2:0:223:227:136:87:2:0:137:90:0:0 chr8 25364960 . A G 722.39 PASS AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0718495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.4845;QD=37.0457;RBI=0.0718677;REFB=-0.0289967;REVB=-0.00161689;RO=1;SAF=28;SAR=49;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00956196;STB=0.505049;TYPE=snp;VARB=0.000868267;OID=.;OPOS=25364960;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:78:78:1:1:77:77:49:28:0:1:49:28:0:1 chr8 25701661 . G A 1234.01 PASS AO=129;DP=134;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0226486;FXX=0.0373106;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.3786;QD=38.2638;RBI=0.0312315;REFB=0;REVB=-0.0215046;RO=0;SAF=52;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000960989;OID=.;OPOS=25701661;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:134:129:0:0:129:129:77:52:0:0:77:52:0:0 chr8 25708267 . T C 1518.69 PASS AO=140;DP=141;FAO=161;FDP=161;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0264117;FXX=0.00617246;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.274;QD=37.7313;RBI=0.0265496;REFB=-0.0450406;REVB=0.00270236;RO=0;SAF=64;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.33035e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000430213;OID=.;OPOS=25708267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:141:161:0:0:140:161:76:64:0:0:96:65:0:0 chr8 26362201 . A T 2041.52 PASS AO=219;DP=222;FAO=219;FDP=219;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=122;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0174758;FXX=0.0135129;HRUN=3;LEN=1;MLLD=100.835;QD=37.288;RBI=0.0243262;REFB=-0.098439;REVB=-0.0169222;RO=0;SAF=97;SAR=122;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.58033e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000177578;OID=.;OPOS=26362201;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:222:219:0:0:219:219:122:97:0:0:122:97:0:0 chr8 26481771 . T C 1683.49 PASS AO=178;DP=179;FAO=178;FDP=178;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.015578;FXX=0.0219768;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8885;QD=37.8312;RBI=0.0212538;REFB=-0.00262529;REVB=0.0144585;RO=1;SAF=87;SAR=91;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00544061;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.75397e-05;OID=.;OPOS=26481771;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:179:178:1:0:178:178:91:87:1:0:91:87:0:0 chr8 26500974 . GC G 1082.8 PASS AO=136;DP=179;FAO=173;FDP=174;FR=.;FRO=1;FSAF=93;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.360538;FXX=0.0169482;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.2202;QD=24.8918;RBI=0.36799;REFB=0.039148;REVB=-0.073683;RO=32;SAF=63;SAR=73;SRF=28;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0.27422;SSSB=-0.146895;STB=0.503105;TYPE=del;VARB=0.00508768;OID=.;OPOS=26500975;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:136:175:173:174:1:93:80:0:1:77:32:63:73:28:4 chr8 26510789 . ACCT ACT,ACC 134.65 PASS AO=25,34;DP=162;FAO=4,47;FDP=134;FR=.;FRO=83;FSAF=4,39;FSAR=0,8;FSRF=59;FSRR=24;FWDB=-0.166104,-0.011879;FXX=0.118413;HRUN=2,1;LEN=1,1;MLLD=17.7704,158.136;QD=4.01943;RBI=0.219728,0.0292511;REFB=-0.139404,-0.00530853;REVB=-0.143839,-0.0267304;RO=63;SAF=24,33;SAR=1,1;SRF=41;SRR=22;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.624021,0.674082;STB=0.996401,0.614119;TYPE=del,del;VARB=0.0767437,0.00655931;OID=.,.;OPOS=26510790,26510792;OREF=C,T;OALT=-,-;OMAPALT=ACT,ACC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:25,34:152:4,47:134:83:4,39:0,8:59:24:99:63:24,33:1,1:41:22 chr8 26514231 . C G 171.65 PASS AO=44;DP=96;FAO=44;FDP=98;FR=.;FRO=54;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=30;FWDB=0.0117633;FXX=0.0101;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.014;QD=7.00607;RBI=0.0387677;REFB=-0.0222538;REVB=-0.0369399;RO=52;SAF=27;SAR=17;SRF=23;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167524;STB=0.594058;TYPE=snp;VARB=0.0261651;OID=.;OPOS=26514231;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:98:52:54:44:44:17:27:23:29:17:27:24:30 chr8 26515458 . T C 580.67 PASS AO=148;DP=314;FAO=148;FDP=316;FR=.;FRO=168;FSAF=32;FSAR=116;FSRF=43;FSRR=125;FWDB=-0.0152764;FXX=0.00628911;HRUN=3;LEN=1;MLLD=68.4067;QD=7.35019;RBI=0.0257093;REFB=-0.0475178;REVB=-0.0206785;RO=164;SAF=32;SAR=116;SRF=40;SRR=124;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0379791;STB=0.530096;TYPE=snp;VARB=0.0488057;OID=.;OPOS=26515458;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:314:316:164:168:148:148:116:32:40:124:116:32:43:125 chr8 26628028 . A G 989.24 PASS AO=103;DP=103;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0234021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.501;QD=38.0476;RBI=0.0328461;REFB=0;REVB=0.023048;RO=0;SAF=54;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.95759e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000103551;OID=.;OPOS=26628028;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:103:104:0:0:103:104:49:54:0:0:50:54:0:0 chr8 26636925 . T C 1655.31 PASS AO=180;DP=182;FAO=179;FDP=179;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0672153;FXX=0.0164826;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.5645;QD=36.9901;RBI=0.0890803;REFB=0.0395682;REVB=-0.0584585;RO=2;SAF=71;SAR=109;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00231012;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00383859;OID=.;OPOS=26636925;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:182:179:2:0:180:179:109:71:1:1:109:70:0:0 chr8 27101204 . T A 311.47 PASS AO=94;DP=234;FAO=94;FDP=232;FR=.;FRO=138;FSAF=72;FSAR=22;FSRF=99;FSRR=39;FWDB=-0.00739469;FXX=0.0127654;HRUN=2;LEN=1;MLLD=257.64;QD=5.37018;RBI=0.0217597;REFB=-0.000510652;REVB=-0.0204646;RO=137;SAF=72;SAR=22;SRF=99;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0614026;STB=0.538623;TYPE=snp;VARB=0.000519569;OID=.;OPOS=27101204;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:234:232:137:138:94:94:22:72:99:38:22:72:99:39 chr8 27101206 . A C 334.26 PASS AO=98;DP=236;FAO=98;FDP=236;FR=.;FRO=138;FSAF=75;FSAR=23;FSRF=98;FSRR=40;FWDB=0.00626755;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.7145;QD=5.66539;RBI=0.0615979;REFB=-0.0010861;REVB=-0.0612783;RO=138;SAF=75;SAR=23;SRF=98;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0763517;STB=0.542845;TYPE=snp;VARB=0.0032047;OID=.;OPOS=27101206;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:236:236:138:138:98:98:23:75:98:40:23:75:98:40 chr8 27147716 . A C 689.77 PASS AO=93;DP=117;FAO=94;FDP=115;FR=.;FRO=21;FSAF=21;FSAR=73;FSRF=3;FSRR=18;FWDB=-0.0384276;FXX=0.0170926;HRUN=7;LEN=1;MLLD=151.711;QD=23.9919;RBI=0.0391248;REFB=-0.129049;REVB=-0.00735356;RO=10;SAF=21;SAR=72;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.019224;STB=0.521699;TYPE=snp;VARB=0.00138331;OID=.;OPOS=27147716;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:117:115:10:21:93:94:72:21:3:7:73:21:3:18 chr8 27255128 . T C 1440.91 PASS AO=150;DP=150;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00508549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.221;QD=38.4243;RBI=0.0434424;REFB=0;REVB=0.0431437;RO=0;SAF=68;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.78142e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.01486e-05;OID=.;OPOS=27255128;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:150:150:0:0:150:150:82:68:0:0:82:68:0:0 chr8 27255146 . G A 1422.33 PASS AO=142;DP=143;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000565502;FXX=0.0132442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.239;QD=38.1832;RBI=0.0230268;REFB=0;REVB=0.0230199;RO=0;SAF=65;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.2093e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.80722e-05;OID=.;OPOS=27255146;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:143:149:0:0:142:149:77:65:0:0:84:65:0:0 chr8 27255263 . A G 1589.09 PASS AO=170;DP=172;FAO=170;FDP=170;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=126;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00272111;FXX=0.0116272;HRUN=5;LEN=1;MLLD=246.995;QD=37.3903;RBI=0.0119785;REFB=-0.0573545;REVB=-0.0116653;RO=1;SAF=44;SAR=126;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106928;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.64454e-05;OID=.;OPOS=27255263;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:172:170:1:0:170:170:126:44:1:0:126:44:0:0 chr8 27301725 . C G 243.08 PASS AO=57;DP=116;FAO=57;FDP=116;FR=.;FRO=59;FSAF=22;FSAR=35;FSRF=17;FSRR=42;FWDB=0.0241517;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=138.813;QD=8.38201;RBI=0.0434142;REFB=-0.0197118;REVB=0.0360762;RO=57;SAF=22;SAR=35;SRF=16;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103456;STB=0.553758;TYPE=snp;VARB=0.0173695;OID=.;OPOS=27301725;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:57:59:57:57:35:22:16:41:35:22:17:42 chr8 27308585 . A C 519.03 PASS AO=53;DP=53;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0393841;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.643;QD=37.7474;RBI=0.0502837;REFB=0;REVB=-0.0312625;RO=0;SAF=12;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.37267e-05;OID=.;OPOS=27308585;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:53:55:0:0:53:55:41:12:0:0:42:13:0:0 chr8 27311703 . T C 734.67 PASS AO=82;DP=83;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0211382;FXX=0.0722804;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.904;QD=38.1646;RBI=0.0276397;REFB=0;REVB=0.0178082;RO=0;SAF=36;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.14462e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00020402;OID=.;OPOS=27311703;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:83:77:0:0:82:77:46:36:0:0:40:37:0:0 chr8 27312040 . C T 172.44 PASS AO=26;DP=64;FAO=27;FDP=64;FR=.,HEALED;FRO=24;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=0.0694459;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=32.8926;QD=10.7772;RBI=0.0867534;REFB=-0.00372838;REVB=0.0519944;RO=20;SAF=17;SAR=9;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240761;STB=0.638626;TYPE=snp;VARB=0.00239733;OID=.;OPOS=27312040;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:63:64:20:24:26:27:9:17:7:13:10:17:8:16 chr8 27312135 . G A 171.12 PASS AO=42;DP=91;FAO=42;FDP=91;FR=.;FRO=49;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=30;FWDB=-0.008279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.887;QD=7.52181;RBI=0.0200619;REFB=-0.0164691;REVB=0.018274;RO=49;SAF=21;SAR=21;SRF=19;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108309;STB=0.560411;TYPE=snp;VARB=0.0299507;OID=.;OPOS=27312135;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:49:49:42:42:21:21:19:30:21:21:19:30 chr8 27315876 . A G 676.97 PASS AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00496886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.638;QD=38.6839;RBI=0.0228767;REFB=0;REVB=0.0223306;RO=0;SAF=30;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.55226e-05;OID=.;OPOS=27315876;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:70:70:0:0:70:70:40:30:0:0:40:30:0:0 chr8 27315900 . A G 638.86 PASS AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0475011;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.146;QD=37.0355;RBI=0.0504205;REFB=-0.05174;REVB=0.0169078;RO=1;SAF=26;SAR=42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111219;STB=0.505881;TYPE=snp;VARB=0.000110429;OID=.;OPOS=27315900;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:69:69:1:1:68:68:42:26:0:1:42:26:0:1 chr8 27316117 . G A 30.72 PASS AO=10;DP=33;FAO=10;FDP=33;FR=.;FRO=23;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.0192474;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=200.979;QD=3.72362;RBI=0.0217933;REFB=0.00739774;REVB=0.0102219;RO=21;SAF=3;SAR=7;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0430323;STB=0.538383;TYPE=snp;VARB=-0.0189471;OID=.;OPOS=27316117;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:33:33:21:23:10:10:7:3:7:14:7:3:8:15 chr8 27316136 . C A 54.03 PASS AO=14;DP=40;FAO=15;FDP=40;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=19;FWDB=0.0598495;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.8582;QD=5.40271;RBI=0.0769035;REFB=0.00122361;REVB=0.0482926;RO=26;SAF=4;SAR=10;SRF=6;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.077181;STB=0.521711;TYPE=snp;VARB=0.00359107;OID=.;OPOS=27316136;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:40:40:26:25:14:15:10:4:6:20:11:4:6:19 chr8 27321189 . G A 222.79 PASS AO=50;DP=98;FAO=50;FDP=99;FR=.;FRO=49;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=0.0211281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.924;QD=9.0015;RBI=0.0270997;REFB=-0.0066997;REVB=0.0169704;RO=48;SAF=27;SAR=23;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0170682;STB=0.514801;TYPE=snp;VARB=0.0117509;OID=.;OPOS=27321189;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:99:48:49:50:50:23:27:25:23:23:27:25:24 chr8 27324822 . T C 182.23 PASS AO=48;DP=114;FAO=48;FDP=110;FR=.;FRO=62;FSAF=14;FSAR=34;FSRF=12;FSRR=50;FWDB=0.0132718;FXX=0.0677909;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.984;QD=6.62636;RBI=0.0146449;REFB=-0.015017;REVB=0.00619137;RO=62;SAF=14;SAR=34;SRF=12;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127465;STB=0.570846;TYPE=snp;VARB=0.0128145;OID=.;OPOS=27324822;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:110:62:62:48:48:34:14:12:50:34:14:12:50 chr8 27462481 . A G 241.48 PASS AO=58;DP=121;FAO=58;FDP=121;FR=.;FRO=63;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=41;FSRR=22;FWDB=-0.0145885;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.611;QD=7.98284;RBI=0.0181836;REFB=0.00582097;REVB=0.0108544;RO=62;SAF=30;SAR=28;SRF=41;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13555;STB=0.569931;TYPE=snp;VARB=-0.00670768;OID=.;OPOS=27462481;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:62:63:58:58:28:30:41:21:28:30:41:22 chr8 27559214 . G A 362.73 PASS AO=62;DP=91;FAO=63;FDP=96;FR=.;FRO=33;FSAF=21;FSAR=42;FSRF=5;FSRR=28;FWDB=0.0304472;FXX=0.0103082;HRUN=3;LEN=1;MLLD=162.981;QD=15.1137;RBI=0.0355098;REFB=-0.0691689;REVB=0.0182732;RO=28;SAF=21;SAR=41;SRF=5;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107285;STB=0.573749;TYPE=snp;VARB=0.01993;OID=.;OPOS=27559214;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:91:96:28:33:62:63:41:21:5:23:42:21:5:28 chr8 27598042 . GA G 295.27 PASS AO=47;DP=74;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.102694;FXX=0.054787;HRUN=7;LEN=1;MLLD=9.18915;QD=17.117;RBI=0.151555;REFB=-0.0115008;REVB=-0.111459;RO=11;SAF=20;SAR=27;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107174;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.00126779;OID=.;OPOS=27598043;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:47:71:69:69:0:31:38:0:0:23:11:20:27:8:3 chr8 27667969 . C G 222.09 PASS AO=50;DP=126;FAO=60;FDP=136;FR=.;FRO=76;FSAF=41;FSAR=19;FSRF=50;FSRR=26;FWDB=0.0266618;FXX=0.0144917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.627;QD=6.53218;RBI=0.0288802;REFB=-0.0129422;REVB=-0.0111002;RO=74;SAF=37;SAR=13;SRF=48;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116837;STB=0.516223;TYPE=snp;VARB=0.0193328;OID=.;OPOS=27667969;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:136:74:76:50:60:13:37:48:26:19:41:50:26 chr8 27737180 . G A 121.52 PASS AO=25;DP=49;FAO=26;FDP=49;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.0188573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.227;QD=9.91976;RBI=0.0336396;REFB=-0.0187943;REVB=0.0278572;RO=23;SAF=7;SAR=18;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189681;STB=0.611716;TYPE=snp;VARB=0.0213289;OID=.;OPOS=27737180;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:23:23:25:26:18:7:11:12:19:7:11:12 chr8 27737198 . A G 107.77 PASS AO=21;DP=40;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.00897797;FXX=0.0249938;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.566;QD=11.0533;RBI=0.0315467;REFB=-0.0197489;REVB=-0.0302422;RO=18;SAF=5;SAR=16;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203967;STB=0.615266;TYPE=snp;VARB=0.0104853;OID=.;OPOS=27737198;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:40:39:18:18:21:21:16:5:8:10:16:5:8:10 chr8 27767171 . G A 213.45 PASS AO=55;DP=122;FAO=55;FDP=122;FR=.;FRO=67;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=36;FSRR=31;FWDB=0.00717999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.9974;QD=6.9983;RBI=0.0328568;REFB=-0.00840327;REVB=0.0320627;RO=66;SAF=30;SAR=25;SRF=35;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149258;STB=0.504503;TYPE=snp;VARB=0.0230736;OID=.;OPOS=27767171;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:66:67:55:55:25:30:35:31:25:30:36:31 chr8 27886903 . C T 64.95 PASS AO=17;DP=43;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=0.0009704;FXX=0.0232504;HRUN=3;LEN=1;MLLD=130.963;QD=6.18565;RBI=0.0184169;REFB=-0.0121271;REVB=-0.0183913;RO=24;SAF=11;SAR=6;SRF=18;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119634;STB=0.54884;TYPE=snp;VARB=0.0230028;OID=.;OPOS=27886903;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:43:42:24:25:17:17:6:11:18:6:6:11:18:7 chr8 27915830 . T C 2855.15 PASS AO=430;DP=476;FAO=346;FDP=382;FR=.;FRO=36;FSAF=145;FSAR=201;FSRF=11;FSRR=25;FWDB=-0.0784745;FXX=0.0449989;HRUN=5;LEN=1;MLLD=53.3767;QD=29.8969;RBI=0.0824564;REFB=-0.0978833;REVB=-0.0253141;RO=42;SAF=186;SAR=244;SRF=12;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0254029;STB=0.511025;TYPE=snp;VARB=0.0088672;OID=.;OPOS=27915830;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:476:382:42:36:430:346:244:186:12:30:201:145:11:25 chr8 27918057 . T C 652.01 PASS AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0197686;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.949;QD=38.3533;RBI=0.0276362;REFB=0;REVB=0.0193122;RO=0;SAF=31;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.4012e-07;OID=.;OPOS=27918057;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:68:68:0:0:68:68:37:31:0:0:37:31:0:0 chr8 27927849 . C G 1127.14 PASS AO=117;DP=118;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00225433;FXX=0.0249979;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.738;QD=38.5346;RBI=0.041965;REFB=0;REVB=0.0419044;RO=0;SAF=56;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00214387;OID=.;OPOS=27927849;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:118:117:0:0:117:117:61:56:0:0:61:56:0:0 chr8 28203188 . AAT A 30.37 PASS AO=16;DP=77;FAO=23;FDP=63;FR=.;FRO=40;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=-0.120888;FXX=0.0869439;HRUN=6;LEN=2;MLLD=17.2211;QD=1.92794;RBI=0.178358;REFB=-0.0795446;REVB=-0.131141;RO=39;SAF=9;SAR=7;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0285714;STB=0.529629;TYPE=del;VARB=0.0470616;OID=.;OPOS=28203189;OREF=AT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:16:73:23:63:40:12:11:19:21:30:39:9:7:21:18 chr8 28384712 . A G 630.29 PASS AO=162;DP=348;FAO=163;FDP=350;FR=.;FRO=187;FSAF=71;FSAR=92;FSRF=108;FSRR=79;FWDB=-0.0174534;FXX=0.00849834;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.432;QD=7.20335;RBI=0.0336582;REFB=-0.0122908;REVB=-0.0287793;RO=183;SAF=72;SAR=90;SRF=107;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134542;STB=0.575614;TYPE=snp;VARB=0.0151914;OID=.;OPOS=28384712;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:348:350:183:187:162:163:90:72:107:76:92:71:108:79 chr8 28574803 . G A 104.15 PASS AO=23;DP=65;FAO=30;FDP=72;FR=.;FRO=42;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=-0.0426607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.325;QD=5.78614;RBI=0.0517526;REFB=-0.0160682;REVB=0.0292984;RO=40;SAF=9;SAR=14;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226616;STB=0.663681;TYPE=snp;VARB=0.017657;OID=.;OPOS=28574803;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:72:40:42:23:30:14:9:24:16:21:9:24:18 chr8 28908874 . T TAACC 947.45 PASS AO=106;DP=183;FAO=114;FDP=123;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=0.000885096;FXX=0.0751823;HRUN=2;LEN=4;MLLD=189.7;QD=30.8112;RBI=0.00816607;REFB=0.0222727;REVB=0.00811796;RO=68;SAF=3;SAR=103;SRF=5;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224022;STB=0.519477;TYPE=ins;VARB=-4.66185e-05;OID=.;OPOS=28908875;OREF=-;OALT=AACC;OMAPALT=TAACC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:106:183:114:123:9:3:111:0:9:8:68:3:103:5:63 chr8 28929342 . C T 10.47 PASS AO=2;DP=6;FAO=2;FDP=6;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=214.044;QD=6.97934;RBI=0.00114576;REFB=-0.00511841;REVB=0.00114576;RO=4;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00755303;OID=.;OPOS=28929342;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:4:4:2:2:2:0:0:4:2:0:0:4 chr8 28980933 . C T 187.71 PASS AO=36;DP=62;FAO=36;FDP=62;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=0.0314542;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.678;QD=12.1106;RBI=0.0322403;REFB=-0.017125;REVB=0.00707638;RO=26;SAF=13;SAR=23;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.019285;STB=0.510612;TYPE=snp;VARB=0.0121441;OID=.;OPOS=28980933;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:62:62:26:26:36:36:23:13:10:16:23:13:10:16 chr8 29005093 . A G 1846.2 PASS AO=215;DP=228;FAO=213;FDP=227;FR=.;FRO=14;FSAF=78;FSAR=135;FSRF=12;FSRR=2;FWDB=0.0950841;FXX=0.00438577;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4665;QD=32.5322;RBI=0.0960351;REFB=0.0029622;REVB=-0.0134813;RO=13;SAF=78;SAR=137;SRF=12;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0644115;STB=0.532052;TYPE=snp;VARB=-9.48912e-05;OID=.;OPOS=29005093;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:228:227:13:14:215:213:137:78:12:1:135:78:12:2 chr8 29048477 . C T 964.17 PASS AO=107;DP=112;FAO=109;FDP=114;FR=.;FRO=5;FSAF=49;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0310779;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.104;QD=33.8305;RBI=0.0313795;REFB=-0.0857747;REVB=0.00434054;RO=0;SAF=49;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.519996;TYPE=snp;VARB=0.00116721;OID=.;OPOS=29048477;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:112:114:0:5:107:109:58:49:0:0:60:49:0:5 chr8 29197672 . A G 51.08 PASS AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=0.00954227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.234;QD=7.29775;RBI=0.00976297;REFB=0.000145789;REVB=-0.00206416;RO=16;SAF=9;SAR=3;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000152736;OID=.;OPOS=29197672;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:28:28:16:16:12:12:3:9:12:4:3:9:12:4 chr8 29927300 . C G 1521.69 PASS AO=143;DP=144;FAO=166;FDP=166;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0549834;FXX=0.0292381;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.712;QD=36.6671;RBI=0.0559784;REFB=0;REVB=-0.0105075;RO=0;SAF=30;SAR=113;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.10765e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00346429;OID=.;OPOS=29927300;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:144:166:0:0:143:166:113:30:0:0:113:53:0:0 chr8 29927321 . A G 1431.92 PASS AO=152;DP=153;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206939;FXX=0.00653552;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.483;QD=37.6822;RBI=0.0453207;REFB=-0.0302612;REVB=0.0403203;RO=1;SAF=47;SAR=105;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00450921;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000243366;OID=.;OPOS=29927321;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:153:152:1:0:152:152:105:47:0:1:105:47:0:0 chr8 29965519 . T C 873.04 PASS AO=92;DP=93;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0901531;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5054;QD=37.9581;RBI=0.0901855;REFB=0;REVB=0.00241695;RO=0;SAF=25;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.11795e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000566085;OID=.;OPOS=29965519;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:93:92:0:0:92:92:67:25:0:0:67:25:0:0 chr8 29989564 . A G 1831.19 PASS AO=169;DP=175;FAO=201;FDP=201;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0031192;FXX=0.0195112;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.54;QD=36.4416;RBI=0.113692;REFB=-0.173606;REVB=0.113649;RO=3;SAF=90;SAR=79;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00447164;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00828737;OID=.;OPOS=29989564;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:175:201:3:0:169:201:79:90:2:1:109:92:0:0 chr8 29996158 . A G 541.12 PASS AO=55;DP=55;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0231914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.484;QD=37.9734;RBI=0.040138;REFB=0;REVB=0.0327599;RO=0;SAF=37;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.85968e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.19212e-05;OID=.;OPOS=29996158;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:55:57:0:0:55:57:18:37:0:0:19:38:0:0 chr8 29996256 . T C 296.56 PASS AO=29;DP=29;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00793899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.961;QD=37.0705;RBI=0.176687;REFB=0;REVB=0.176509;RO=0;SAF=19;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00126165;OID=.;OPOS=29996256;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:29:32:0:0:29:32:10:19:0:0:13:19:0:0 chr8 30423886 . C CAG 1003.09 PASS AO=128;DP=168;FAO=131;FDP=153;FR=.;FRO=22;FSAF=43;FSAR=88;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.0237078;FXX=0.0613459;HRUN=1;LEN=2;MLLD=141.391;QD=26.2245;RBI=0.0417389;REFB=-0.062178;REVB=0.0343522;RO=29;SAF=42;SAR=86;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0853228;STB=0.541592;TYPE=ins;VARB=0.00675968;OID=.;OPOS=30423887;OREF=-;OALT=AG;OMAPALT=CAG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:128:168:131:153:22:43:88:13:9:11:29:42:86:16:13 chr8 30501232 . C T 534.68 PASS AO=55;DP=58;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.036127;FXX=0.0666556;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.025;QD=38.191;RBI=0.042314;REFB=0;REVB=-0.0220298;RO=0;SAF=25;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000398214;OID=.;OPOS=30501232;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:58:56:0:0:55:56:30:25:0:0:31:25:0:0 chr8 30608976 . C T 1347.23 PASS AO=141;DP=141;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=112;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.837;QD=37.9501;RBI=0.027828;REFB=0;REVB=0.0207977;RO=0;SAF=112;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.2428e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000437047;OID=.;OPOS=30608976;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:141:142:0:0:141:142:29:112:0:0:30:112:0:0 chr8 30620840 . G GT 1159.07 PASS AO=161;DP=201;FAO=193;FDP=193;FR=.;FRO=0;FSAF=102;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0652558;FXX=0.0102559;HRUN=4;LEN=1;MLLD=13.6906;QD=24.0221;RBI=0.0884057;REFB=0.0228317;REVB=0.0596426;RO=21;SAF=88;SAR=73;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0259349;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.000799304;OID=.;OPOS=30620841;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:161:201:193:193:0:102:91:0:0:89:21:88:73:9:12 chr8 30695226 . C T 639.75 PASS AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0251189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.795;QD=38.1938;RBI=0.0252462;REFB=0;REVB=-0.00253239;RO=0;SAF=24;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.04698e-05;OID=.;OPOS=30695226;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:67:67:0:0:67:67:43:24:0:0:43:24:0:0 chr8 30924557 . C T 1326.52 PASS AO=140;DP=141;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0323854;FXX=0.0275843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.403;QD=37.6317;RBI=0.0326514;REFB=-0.0485846;REVB=0.00415947;RO=0;SAF=73;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00035416;OID=.;OPOS=30924557;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:141:141:0:0:140:141:67:73:0:0:68:73:0:0 chr8 30973957 . G T 396.69 PASS AO=100;DP=214;FAO=100;FDP=213;FR=.;FRO=113;FSAF=45;FSAR=55;FSRF=51;FSRR=62;FWDB=0.0248766;FXX=0.00467268;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.588;QD=7.44961;RBI=0.0284608;REFB=0.00851138;REVB=0.0138263;RO=110;SAF=45;SAR=55;SRF=50;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00435599;STB=0.500711;TYPE=snp;VARB=-0.0121688;OID=.;OPOS=30973957;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:213:110:113:100:100:55:45:50:60:55:45:51:62 chr8 30999280 . G T 298.79 PASS AO=70;DP=144;FAO=71;FDP=145;FR=.;FRO=74;FSAF=27;FSAR=44;FSRF=26;FSRR=48;FWDB=-0.0117862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.404;QD=8.24256;RBI=0.0155034;REFB=-0.00337942;REVB=-0.0100718;RO=74;SAF=27;SAR=43;SRF=26;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0340401;STB=0.515776;TYPE=snp;VARB=0.00321788;OID=.;OPOS=30999280;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:145:74:74:70:71:43:27:26:48:44:27:26:48 chr8 31024638 . C T 349.18 PASS AO=90;DP=197;FAO=90;FDP=196;FR=.;FRO=106;FSAF=43;FSAR=47;FSRF=49;FSRR=57;FWDB=-0.0259101;FXX=0.00507588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.4251;QD=7.12607;RBI=0.0461026;REFB=0.00144075;REVB=-0.0381329;RO=104;SAF=43;SAR=47;SRF=48;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0157722;STB=0.508411;TYPE=snp;VARB=-0.00256947;OID=.;OPOS=31024638;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:196:104:106:90:90:47:43:48:56:47:43:49:57 chr8 32606181 . CTG C 222.04 PASS AO=49;DP=120;FAO=57;FDP=124;FR=.;FRO=67;FSAF=16;FSAR=41;FSRF=24;FSRR=43;FWDB=0.00180785;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=154.819;QD=7.16264;RBI=0.00851662;REFB=-0.0165838;REVB=-0.00832253;RO=65;SAF=13;SAR=36;SRF=24;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125728;STB=0.54958;TYPE=del;VARB=0.0219824;OID=.;OPOS=32606182;OREF=TG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:49:120:57:124:67:16:41:24:43:99:65:13:36:24:41 chr8 32663420 . A G 2025.88 PASS AO=212;DP=213;FAO=213;FDP=213;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=140;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0384238;FXX=0.0184323;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.225;QD=38.0447;RBI=0.0392761;REFB=0.0304472;REVB=0.00813744;RO=1;SAF=71;SAR=141;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00336695;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.50215e-06;OID=.;OPOS=32663420;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:87:213:213:1:0:212:213:141:71:0:1:140:73:0:0 chr8 32874571 . T C 135.95 PASS AO=22;DP=93;FAO=39;FDP=96;FR=.;FRO=57;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=36;FWDB=0.00614436;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.767;QD=5.66467;RBI=0.0288259;REFB=-0.0175901;REVB=-0.0281635;RO=52;SAF=6;SAR=16;SRF=19;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127393;STB=0.614597;TYPE=snp;VARB=0.0160839;OID=.;OPOS=32874571;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:96:52:57:22:39:16:6:19:33:17:22:21:36 chr8 33449588 . GC G 48.62 PASS AO=6;DP=61;FAO=30;FDP=55;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=4;FWDB=0.166814;FXX=0.0517152;HRUN=4;LEN=1;MLLD=9.35716;QD=3.53632;RBI=0.183777;REFB=-0.108024;REVB=0.0771165;RO=18;SAF=6;SAR=0;SRF=18;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.679092;TYPE=del;VARB=0.133285;OID=.;OPOS=33449589;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:6:29:30:55:25:13:17:21:4:45:18:6:0:18:0 chr8 33573577 . A G 76.91 PASS AO=20;DP=54;FAO=22;FDP=55;FR=.;FRO=33;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=-0.0483704;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.828;QD=5.59329;RBI=0.0494374;REFB=-0.00481837;REVB=-0.0102155;RO=34;SAF=5;SAR=15;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203648;STB=0.623096;TYPE=snp;VARB=0.00529423;OID=.;OPOS=33573577;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:54:55:34:33:20:22:15:5:14:20:17:5:13:20 chr8 35583692 . T C 442.46 PASS AO=79;DP=125;FAO=79;FDP=124;FR=.;FRO=45;FSAF=54;FSAR=25;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=0.0075865;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.207;QD=14.273;RBI=0.0110571;REFB=-0.0346677;REVB=0.00804387;RO=46;SAF=54;SAR=25;SRF=26;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0895051;STB=0.551632;TYPE=snp;VARB=0.018027;OID=.;OPOS=35583692;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:124:46:45:79:79:25:54:26:20:25:54:25:20 chr8 35583815 . G C 510.38 PASS AO=105;DP=189;FAO=105;FDP=188;FR=.;FRO=83;FSAF=49;FSAR=56;FSRF=38;FSRR=45;FWDB=-0.0247827;FXX=0.0208322;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.1331;QD=10.8591;RBI=0.0259673;REFB=-0.00646801;REVB=-0.00775363;RO=80;SAF=49;SAR=56;SRF=37;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00332813;STB=0.503919;TYPE=snp;VARB=0.00335923;OID=.;OPOS=35583815;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:188:80:83:105:105:56:49:37:43:56:49:38:45 chr8 35606168 . T C 259.03 PASS AO=74;DP=175;FAO=74;FDP=176;FR=.;FRO=102;FSAF=47;FSAR=27;FSRF=50;FSRR=52;FWDB=0.0244028;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.774;QD=5.88708;RBI=0.056912;REFB=-0.0171849;REVB=0.0514148;RO=101;SAF=47;SAR=27;SRF=49;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158662;STB=0.586363;TYPE=snp;VARB=0.018079;OID=.;OPOS=35606168;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:176:101:102:74:74:27:47:49:52:27:47:50:52 chr8 35624434 . C A 342.97 PASS AO=81;DP=164;FAO=81;FDP=164;FR=.;FRO=83;FSAF=23;FSAR=58;FSRF=8;FSRR=75;FWDB=0.023731;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=193.94;QD=8.36516;RBI=0.0289547;REFB=-0.0144499;REVB=-0.0165895;RO=81;SAF=23;SAR=58;SRF=8;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232707;STB=0.629786;TYPE=snp;VARB=0.0167351;OID=.;OPOS=35624434;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:164:81:83:81:81:58:23:8:73:58:23:8:75 chr8 35649884 . T G 337.3 PASS AO=72;DP=131;FAO=71;FDP=131;FR=.;FRO=60;FSAF=44;FSAR=27;FSRF=27;FSRR=33;FWDB=-0.0232386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.2256;QD=10.2993;RBI=0.0329515;REFB=-0.00308424;REVB=-0.0233617;RO=58;SAF=45;SAR=27;SRF=26;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147442;STB=0.579306;TYPE=snp;VARB=0.00227704;OID=.;OPOS=35649884;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:58:60:72:71:27:45:26:32:27:44:27:33 chr8 36925165 . A G 133.18 PASS AO=32;DP=69;FAO=32;FDP=69;FR=.;FRO=37;FSAF=26;FSAR=6;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=-0.0133547;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.8037;QD=7.72069;RBI=0.0272307;REFB=-0.0125764;REVB=-0.023731;RO=36;SAF=26;SAR=6;SRF=23;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223544;STB=0.638724;TYPE=snp;VARB=0.0165653;OID=.;OPOS=36925165;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:36:37:32:32:6:26:23:13:6:26:23:14 chr8 37455990 . G C 58.72 PASS AO=11;DP=21;FAO=11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=9;FWDB=-0.086903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.505;QD=11.1839;RBI=0.119978;REFB=0.00573904;REVB=-0.0827195;RO=10;SAF=1;SAR=10;SRF=1;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.02212;STB=0.512796;TYPE=snp;VARB=-0.0190451;OID=.;OPOS=37455990;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:21:21:10:10:11:11:10:1:1:9:10:1:1:9 chr8 37456438 . A G 37.87 PASS AO=15;DP=53;FAO=15;FDP=53;FR=.;FRO=38;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=-0.0236738;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=262.67;QD=2.85777;RBI=0.026588;REFB=-0.0071097;REVB=-0.0121026;RO=38;SAF=8;SAR=7;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0703954;STB=0.542657;TYPE=snp;VARB=0.0183345;OID=.;OPOS=37456438;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:53:53:38:38:15:15:7:8:18:20:7:8:18:20 chr8 37635649 . A G 220.91 PASS AO=55;DP=124;FAO=57;FDP=126;FR=.;FRO=69;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=36;FSRR=33;FWDB=-0.0082959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.157;QD=7.01301;RBI=0.00838081;REFB=-0.00331196;REVB=-0.00118996;RO=67;SAF=27;SAR=28;SRF=36;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0456666;STB=0.507103;TYPE=snp;VARB=0.0035538;OID=.;OPOS=37635649;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:126:67:69:55:57:28:27:36:31:28:29:36:33 chr8 37699776 . AG A,AA 128.39 PASS AO=5,6;DP=26;FAO=20,6;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=15,3;FSAR=5,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.711605,0.356587;FXX=0.0714031;HRUN=6,6;LEN=1,1;MLLD=10.4267,17.2854;QD=19.7527;RBI=0.714685,0.362419;REFB=-0.0230246,-0.0385847;REVB=0.0662764,0.0647589;RO=13;SAF=1,3;SAR=4,3;SRF=13;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0.513514,0;SSSB=-0.745388,-0.598384;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.151304,-0.0854121;OID=.,.;OPOS=37699777,37699777;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:5,6:26:20,6:26:0:15,3:5,3:0:0:15:13:1,3:4,3:13:0 chr8 37719133 . TA T 44.34 PASS AO=68;DP=293;FAO=84;FDP=255;FR=.;FRO=171;FSAF=27;FSAR=57;FSRF=62;FSRR=109;FWDB=0.326041;FXX=0.0925234;HRUN=7;LEN=1;MLLD=5.40032;QD=0.695541;RBI=0.337871;REFB=-0.090221;REVB=-0.0886241;RO=120;SAF=11;SAR=57;SRF=58;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.433006;STB=0.530919;TYPE=del;VARB=0.0290001;OID=.;OPOS=37719134;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:68:274:84:255:171:27:57:62:109:44:120:11:57:58:62 chr8 37728017 . A G 144.04 PASS AO=43;DP=105;FAO=42;FDP=105;FR=.;FRO=63;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=35;FSRR=28;FWDB=0.0741896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.76;QD=5.48727;RBI=0.0759094;REFB=-0.025014;REVB=0.0160668;RO=62;SAF=28;SAR=15;SRF=35;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0961502;STB=0.571394;TYPE=snp;VARB=0.035302;OID=.;OPOS=37728017;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:62:63:43:42:15:28:35:27:14:28:35:28 chr8 37728019 . T G 152.18 PASS AO=43;DP=104;FAO=43;FDP=104;FR=.;FRO=61;FSAF=28;FSAR=15;FSRF=34;FSRR=27;FWDB=-0.066113;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.7684;QD=5.85303;RBI=0.0662243;REFB=-0.00313282;REVB=0.00383744;RO=61;SAF=28;SAR=15;SRF=34;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103214;STB=0.558377;TYPE=snp;VARB=0.00438407;OID=.;OPOS=37728019;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:61:61:43:43:15:28:34:27:15:28:34:27 chr8 37730365 . AGGG AGG,AGGA 760.42 PASS AO=54,81;DP=184;FAO=54,84;FDP=172;FR=.;FRO=34;FSAF=1,21;FSAR=53,63;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.0581411,0.00851461;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=14.9695,53.7935;QD=17.6842;RBI=0.0586912,0.0313625;REFB=-0.132482,-0.0146882;REVB=-0.00801695,0.0301845;RO=33;SAF=2,20;SAR=52,61;SRF=16;SRR=17;SSEN=0.409557,0;SSEP=0.221264,0;SSSB=-0.659491,-0.156985;STB=0.931399,0.587607;TYPE=del,snp;VARB=0.124866,0.0112164;OID=.,.;OPOS=37730366,37730368;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=AGG,AGGA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:54,81:170:54,84:172:34:1,21:53,63:17:17:99:33:2,20:52,61:16:17 chr8 37979919 . G C 849.87 PASS AO=85;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183819;FXX=0.0222198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.252;QD=38.6305;RBI=0.0325077;REFB=0;REVB=-0.0268115;RO=0;SAF=40;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.79153e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.07426e-06;OID=.;OPOS=37979919;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:88:88:0:0:85:88:45:40:0:0:46:42:0:0 chr8 37985897 . A G 643.71 PASS AO=76;DP=84;FAO=78;FDP=84;FR=.;FRO=6;FSAF=19;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=-0.0884387;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.4841;QD=30.6526;RBI=0.104471;REFB=-0.057548;REVB=-0.055612;RO=8;SAF=19;SAR=57;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0619381;STB=0.524188;TYPE=snp;VARB=0.00646433;OID=.;OPOS=37985897;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:84:84:8:6:76:78:57:19:0:8:59:19:0:6 chr8 38005835 . T C 1139.56 PASS AO=124;DP=125;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00913111;FXX=0.0476153;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.335;QD=37.9852;RBI=0.0453821;REFB=0;REVB=0.044454;RO=0;SAF=77;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.7983e-05;OID=.;OPOS=38005835;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:125:120:0:0:124:120:47:77:0:0:48:72:0:0 chr8 38095662 . C T 2690.37 PASS AO=274;DP=282;FAO=282;FDP=282;FR=.;FRO=0;FSAF=173;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0209766;FXX=0.0309268;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.885;QD=38.1613;RBI=0.02118;REFB=0;REVB=-0.00292879;RO=0;SAF=172;SAR=102;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000826671;OID=.;OPOS=38095662;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:282:282:0:0:274:282:102:172:0:0:109:173:0:0 chr8 38373924 . T G 195.85 PASS AO=50;DP=111;FAO=50;FDP=111;FR=.;FRO=61;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=34;FSRR=27;FWDB=-0.0129982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.95;QD=7.05757;RBI=0.0778537;REFB=-0.00261616;REVB=-0.0767609;RO=61;SAF=26;SAR=24;SRF=34;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.036905;STB=0.520599;TYPE=snp;VARB=0.00113716;OID=.;OPOS=38373924;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:61:61:50:50:24:26:34:27:24:26:34:27 chr8 38458371 . G T 523.26 PASS AO=134;DP=287;FAO=134;FDP=288;FR=.;FRO=154;FSAF=45;FSAR=89;FSRF=51;FSRR=103;FWDB=0.0274253;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.914;QD=7.26747;RBI=0.0274416;REFB=-0.00600216;REVB=-0.000945701;RO=152;SAF=45;SAR=89;SRF=51;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000318193;STB=0.502793;TYPE=snp;VARB=0.0058428;OID=.;OPOS=38458371;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:287:288:152:154:134:134:89:45:51:101:89:45:51:103 chr8 38458552 . G GTCT 1716.87 PASS AO=172;DP=203;FAO=179;FDP=179;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124622;FXX=0.0628239;HRUN=0;LEN=3;MLLD=174.964;QD=38.3658;RBI=0.0243928;REFB=0;REVB=0.0209691;RO=16;SAF=83;SAR=89;SRF=14;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0632862;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-5.86148e-05;OID=.;OPOS=38458553;OREF=-;OALT=TCT;OMAPALT=GTCT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:172:203:179:179:0:85:94:0:0:81:16:83:89:14:2 chr8 38458659 . C T 627.7 PASS AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157214;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=223.999;QD=38.0426;RBI=0.0193018;REFB=0;REVB=-0.0111982;RO=0;SAF=19;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.10837e-06;OID=.;OPOS=38458659;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:66:66:0:0:66:66:47:19:0:0:47:19:0:0 chr8 38677932 . A G 841.1 PASS AO=87;DP=90;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00165797;FXX=0.0107515;HRUN=3;LEN=1;MLLD=231.572;QD=36.5697;RBI=0.00362935;REFB=-0.0269809;REVB=-0.00322852;RO=1;SAF=27;SAR=60;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0172233;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000203338;OID=.;OPOS=38677932;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:90:92:1:0:87:92:60:27:1:0:63:29:0:0 chr8 38684853 . T C 2379.25 PASS AO=198;DP=259;FAO=247;FDP=247;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=94;FSAR=153;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.130877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.335;QD=38.5304;RBI=0.140385;REFB=0;REVB=-0.0507845;RO=0;SAF=38;SAR=160;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.48054e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00105261;OID=.;OPOS=38684853;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:254:247:0:0:198:247:160:38:0:0:153:94:0:0 chr8 38695996 . T C 97.54 PASS AO=24;DP=57;FAO=25;FDP=58;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=0.0249002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.519;QD=6.72714;RBI=0.0305495;REFB=-0.0403882;REVB=0.0176989;RO=33;SAF=8;SAR=16;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0340876;STB=0.527928;TYPE=snp;VARB=0.0355267;OID=.;OPOS=38695996;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:57:58:33:33:24:25:16:8:12:21:17:8:12:21 chr8 38707452 . A T 432.51 PASS AO=103;DP=204;FAO=102;FDP=204;FR=.;FRO=102;FSAF=53;FSAR=49;FSRF=45;FSRR=57;FWDB=0.0196163;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.9939;QD=8.4806;RBI=0.0210154;REFB=-0.00869433;REVB=0.00753976;RO=92;SAF=54;SAR=49;SRF=41;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.067737;STB=0.539148;TYPE=snp;VARB=0.01841;OID=.;OPOS=38707452;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:204:92:102:103:102:49:54:41:51:49:53:45:57 chr8 38709451 . TTGAC T 236.35 PASS AO=81;DP=209;FAO=90;FDP=193;FR=.;FRO=103;FSAF=51;FSAR=39;FSRF=35;FSRR=68;FWDB=-0.0129035;FXX=0.0445523;HRUN=3;LEN=4;MLLD=285.256;QD=4.8984;RBI=0.0154261;REFB=0.00457035;REVB=-0.00845364;RO=101;SAF=49;SAR=32;SRF=32;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.281995;STB=0.619314;TYPE=del;VARB=-0.00557709;OID=.;OPOS=38709452;OREF=TGAC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:81:200:90:193:103:51:39:35:68:99:101:49:32:32:69 chr8 38827185 . GC G 727.73 PASS AO=93;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.13667;FXX=0.0103082;HRUN=2;LEN=1;MLLD=24.1048;QD=30.3221;RBI=0.147933;REFB=0;REVB=0.0566172;RO=2;SAF=33;SAR=60;SRF=2;SRR=0;SSEN=0.319864;SSEP=0;SSSB=-0.0278632;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00332994;OID=.;OPOS=38827186;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:93:97:96:96:0:35:61:0:0:65:2:33:60:2:0 chr8 38835666 . T C 893.11 PASS AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.041397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.53;QD=38.0048;RBI=0.0435554;REFB=0;REVB=0.0135411;RO=0;SAF=33;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.19147e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.15316e-05;OID=.;OPOS=38835666;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:94:94:0:0:94:94:61:33:0:0:61:33:0:0 chr8 38848850 . C T 1290.84 PASS AO=124;DP=124;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.025198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.081;QD=37.4155;RBI=0.0474893;REFB=0;REVB=0.0402529;RO=0;SAF=53;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00136874;OID=.;OPOS=38848850;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:124:138:0:0:124:138:71:53:0:0:79:59:0:0 chr8 38964647 . G A 1938.94 PASS AO=207;DP=210;FAO=210;FDP=210;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=132;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0198598;FXX=0.0140838;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.109;QD=36.9322;RBI=0.0212207;REFB=-0.107482;REVB=0.00747694;RO=3;SAF=75;SAR=132;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00893623;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000487051;OID=.;OPOS=38964647;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:210:210:3:0:207:210:132:75:2:1:132:78:0:0 chr8 38965271 . C T 303.56 PASS AO=36;DP=40;FAO=36;FDP=40;FR=.;FRO=4;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0271;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=264.412;QD=30.356;RBI=0.0549759;REFB=-0.144055;REVB=0.0478323;RO=0;SAF=11;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58193e-08;STB=0.576879;TYPE=snp;VARB=0.00123961;OID=.;OPOS=38965271;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:40:40:0:4:36:36:25:11:0:0:25:11:4:0 chr8 39080632 . C G 2071.22 PASS AO=220;DP=224;FAO=223;FDP=223;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=132;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020954;FXX=0.00888849;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.225;QD=37.1519;RBI=0.0258574;REFB=-0.105732;REVB=-0.0151504;RO=1;SAF=89;SAR=131;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00532341;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000342065;OID=.;OPOS=39080632;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:224:223:1:0:220:223:131:89:1:0:132:91:0:0 chr8 39091526 . T C 931.39 PASS AO=212;DP=406;FAO=209;FDP=399;FR=.;FRO=190;FSAF=10;FSAR=199;FSRF=14;FSRR=176;FWDB=-0.00990464;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.428;QD=9.33722;RBI=0.013277;REFB=-0.0119285;REVB=0.00884171;RO=194;SAF=10;SAR=202;SRF=14;SRR=180;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107772;STB=0.560163;TYPE=snp;VARB=0.0108842;OID=.;OPOS=39091526;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:406:399:194:190:212:209:202:10:14:180:199:10:14:176 chr8 39128387 . C T 250 PASS AO=30;DP=95;FAO=41;FDP=99;FR=.,HEALED;FRO=45;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=15;FSRR=30;FWDB=0.00357363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.876;QD=10.1009;RBI=0.0144972;REFB=0.00784872;REVB=0.0140498;RO=30;SAF=7;SAR=23;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150576;STB=0.51851;TYPE=snp;VARB=0.0067989;OID=.;OPOS=39128387;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:90:99:30:45:30:41:23:7:11:19:26:15:15:30 chr8 39311600 . C T 1123.77 PASS AO=117;DP=118;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=100;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121339;FXX=0.00847386;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.983;QD=38.4194;RBI=0.0251;REFB=0;REVB=-0.0219722;RO=0;SAF=100;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.08784e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.39935e-05;OID=.;OPOS=39311600;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:118:117:0:0:117:117:17:100:0:0:17:100:0:0 chr8 39312886 . G A 1410.56 PASS AO=129;DP=129;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0484295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.377;QD=38.1232;RBI=0.0836934;REFB=0;REVB=0.0682581;RO=0;SAF=78;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.28766e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00203631;OID=.;OPOS=39312886;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:129:148:0:0:129:148:51:78:0:0:55:93:0:0 chr8 39325207 . G A 459.54 PASS AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000547366;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=229.406;QD=38.2947;RBI=0.0191355;REFB=0;REVB=0.0191277;RO=0;SAF=7;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.31996e-05;OID=.;OPOS=39325207;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:48:48:0:0:48:48:41:7:0:0:41:7:0:0 chr8 39463823 . T C 279.9 PASS AO=91;DP=246;FAO=92;FDP=242;FR=.;FRO=150;FSAF=41;FSAR=51;FSRF=80;FSRR=70;FWDB=-0.0147736;FXX=0.0162595;HRUN=4;LEN=1;MLLD=156.455;QD=4.62639;RBI=0.02638;REFB=-0.0245651;REVB=-0.0218552;RO=149;SAF=41;SAR=50;SRF=80;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0949222;STB=0.554336;TYPE=snp;VARB=0.0357273;OID=.;OPOS=39463823;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:246:242:149:150:91:92:50:41:80:69:51:41:80:70 chr8 39496029 . T C 248.6 PASS AO=73;DP=178;FAO=73;FDP=178;FR=.;FRO=105;FSAF=27;FSAR=46;FSRF=45;FSRR=60;FWDB=0.0101001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.981;QD=5.58649;RBI=0.0123804;REFB=-0.0054008;REVB=-0.00715977;RO=105;SAF=27;SAR=46;SRF=45;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0648604;STB=0.536433;TYPE=snp;VARB=0.00957166;OID=.;OPOS=39496029;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:178:105:105:73:73:46:27:45:60:46:27:45:60 chr8 39840234 . A G 313.76 PASS AO=73;DP=146;FAO=73;FDP=145;FR=.;FRO=72;FSAF=48;FSAR=25;FSRF=35;FSRR=37;FWDB=0.0279141;FXX=0.00684885;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.5589;QD=8.6553;RBI=0.0284461;REFB=0.000979786;REVB=-0.00547555;RO=72;SAF=48;SAR=25;SRF=35;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161564;STB=0.589165;TYPE=snp;VARB=-0.000673704;OID=.;OPOS=39840234;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:145:72:72:73:73:25:48:35:37:25:48:35:37 chr8 39862881 . C T 469.38 PASS AO=120;DP=258;FAO=120;FDP=258;FR=.;FRO=138;FSAF=64;FSAR=56;FSRF=69;FSRR=69;FWDB=-0.00258847;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.039;QD=7.27713;RBI=0.0105571;REFB=0.00346307;REVB=-0.0102349;RO=135;SAF=64;SAR=56;SRF=68;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.028496;STB=0.517863;TYPE=snp;VARB=-0.00352557;OID=.;OPOS=39862881;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:258:258:135:138:120:120:56:64:68:67:56:64:69:69 chr8 39872866 . A C 1407.66 PASS AO=146;DP=148;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129637;FXX=0.0067563;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.8448;QD=38.3036;RBI=0.0130754;REFB=0;REVB=-0.00170501;RO=0;SAF=67;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.98198e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.28379e-05;OID=.;OPOS=39872866;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:148:147:0:0:146:147:79:67:0:0:80:67:0:0 chr8 39872935 . T A 500.59 PASS AO=98;DP=165;FAO=97;FDP=164;FR=.;FRO=67;FSAF=41;FSAR=56;FSRF=37;FSRR=30;FWDB=-0.0213645;FXX=0.00606024;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.199;QD=12.2096;RBI=0.0248267;REFB=-0.032595;REVB=-0.012646;RO=67;SAF=42;SAR=56;SRF=37;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0931091;STB=0.553321;TYPE=snp;VARB=0.0217275;OID=.;OPOS=39872935;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:164:67:67:98:97:56:42:37:30:56:41:37:30 chr8 39873478 . T C 232.33 PASS AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0308459;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=67.66;QD=34.4192;RBI=0.0510431;REFB=-0.0660727;REVB=-0.0406685;RO=1;SAF=16;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0441872;STB=0.523791;TYPE=snp;VARB=0.00182834;OID=.;OPOS=39873478;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:27:27:1:1:26:26:10:16:0:1:10:16:0:1 chr8 39873483 . T A 31.4 PASS AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=27;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=0.00560619;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.072;QD=4.65253;RBI=0.017423;REFB=-0.0133949;REVB=0.0164965;RO=16;SAF=4;SAR=5;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189101;STB=0.644856;TYPE=snp;VARB=0.00958553;OID=.;OPOS=39873483;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:25:27:16:18:9:9:5:4:10:6:5:4:12:6 chr8 39873484 . T A 28.59 PASS AO=9;DP=27;FAO=9;FDP=27;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=0.0503819;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.163;QD=4.23497;RBI=0.0505617;REFB=-0.0271735;REVB=0.00426028;RO=13;SAF=4;SAR=5;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.316785;STB=0.644856;TYPE=snp;VARB=0.0129508;OID=.;OPOS=39873484;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:27:27:13:18:9:9:5:4:10:3:5:4:12:6 chr8 40011079 . G A 652.03 PASS AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0320315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.176;QD=38.3549;RBI=0.0321437;REFB=0;REVB=0.0026829;RO=0;SAF=28;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000138683;OID=.;OPOS=40011079;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:68:68:0:0:68:68:40:28:0:0:40:28:0:0 chr8 41355096 . C T 280.8 PASS AO=87;DP=219;FAO=87;FDP=220;FR=.;FRO=133;FSAF=36;FSAR=51;FSRF=59;FSRR=74;FWDB=0.0212986;FXX=0.0090086;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8568;QD=5.10536;RBI=0.0462712;REFB=-0.00127581;REVB=-0.0410779;RO=127;SAF=36;SAR=51;SRF=56;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0294397;STB=0.518455;TYPE=snp;VARB=0.000986282;OID=.;OPOS=41355096;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:219:220:127:133:87:87:51:36:56:71:51:36:59:74 chr8 41367882 . A G 773.76 PASS AO=357;DP=774;FAO=192;FDP=400;FR=.;FRO=208;FSAF=102;FSAR=90;FSRF=113;FSRR=95;FWDB=-0.00120281;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=215.715;QD=7.73758;RBI=0.00992075;REFB=0.00394757;REVB=-0.00984757;RO=416;SAF=170;SAR=187;SRF=205;SRR=211;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0162522;STB=0.506279;TYPE=snp;VARB=-0.00491698;OID=.;OPOS=41367882;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:774:400:416:208:357:192:187:170:205:211:90:102:113:95 chr8 41391704 . A G 621.12 PASS AO=177;DP=408;FAO=174;FDP=400;FR=.;FRO=226;FSAF=94;FSAR=80;FSRF=107;FSRR=119;FWDB=0.00576813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.1739;QD=6.21115;RBI=0.0243204;REFB=-0.00406746;REVB=0.0236265;RO=231;SAF=96;SAR=81;SRF=107;SRR=124;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0807755;STB=0.537741;TYPE=snp;VARB=0.00608798;OID=.;OPOS=41391704;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:408:400:231:226:177:174:81:96:107:124:80:94:107:119 chr8 41391761 . A T 193.24 PASS AO=82;DP=271;FAO=97;FDP=314;FR=.;FRO=217;FSAF=50;FSAR=47;FSRF=107;FSRR=110;FWDB=-0.0316401;FXX=0.0031745;HRUN=8;LEN=1;MLLD=28.6766;QD=2.4617;RBI=0.0326601;REFB=-0.0219314;REVB=0.00809851;RO=189;SAF=47;SAR=35;SRF=95;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0853289;STB=0.515461;TYPE=snp;VARB=0.0680008;OID=.;OPOS=41391761;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:271:314:189:217:82:97:35:47:95:94:47:50:107:110 chr8 41512581 . CACAGCAGAGTCTAT C 150.15 PASS AO=16;DP=37;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0231733;FXX=0.0587889;HRUN=1;LEN=14;MLLD=470.886;QD=37.5377;RBI=0.0256518;REFB=0;REVB=0.0110006;RO=0;SAF=3;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.78418e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-2.28035e-05;OID=.;OPOS=41512582;OREF=ACAGCAGAGTCTAT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:16:16:16:16:0:3:13:0:0:7:0:3:13:0:0 chr8 41517958 . A AG 902.7 PASS AO=111;DP=161;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.108818;FXX=0.0482725;HRUN=1;LEN=1;MLLD=15.6682;QD=26.1652;RBI=0.141584;REFB=0;REVB=-0.0905793;RO=33;SAF=49;SAR=62;SRF=27;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160982;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00590767;OID=.;OPOS=41517959;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:111:161:138:138:0:74:64:0:0:81:33:49:62:27:6 chr8 41519462 . A G 306.11 PASS AO=31;DP=31;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.249;QD=37.1039;RBI=0.0179729;REFB=0;REVB=0.00391441;RO=0;SAF=7;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71661e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000130588;OID=.;OPOS=41519462;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:31:33:0:0:31:33:24:7:0:0:25:8:0:0 chr8 41583294 . C T 52.69 PASS AO=11;DP=23;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.0200282;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.189;QD=9.16304;RBI=0.0335045;REFB=-0.00560312;REVB=0.0268593;RO=11;SAF=7;SAR=4;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235046;STB=0.65597;TYPE=snp;VARB=0.00445691;OID=.;OPOS=41583294;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:23:23:11:12:11:11:4:7:4:7:4:7:4:8 chr8 41585438 . G A 302.87 PASS AO=79;DP=174;FAO=79;FDP=174;FR=.;FRO=95;FSAF=35;FSAR=44;FSRF=49;FSRR=46;FWDB=-0.0581263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.946;QD=6.96245;RBI=0.0622875;REFB=-0.015245;REVB=-0.0223844;RO=95;SAF=35;SAR=44;SRF=49;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.071801;STB=0.539867;TYPE=snp;VARB=0.0159995;OID=.;OPOS=41585438;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:174:95:95:79:79:44:35:49:46:44:35:49:46 chr8 41787702 . GCCCTCATT GCCTCATT,GCCC 168.02 PASS AO=9,22;DP=55;FAO=7,26;FDP=48;FR=.;FRO=15;FSAF=0,2;FSAR=7,24;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0853856,-0.0438936;FXX=0.039992;HRUN=3,1;LEN=1,5;MLLD=13.989,271.537;QD=14.0018;RBI=0.10374,0.0461878;REFB=-0.142126,-0.0297306;REVB=-0.0589175,-0.014376;RO=10;SAF=0,1;SAR=9,21;SRF=5;SRR=5;SSEN=0.41519,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.790552,-0.57535;STB=0.997923,0.743942;TYPE=del,del;VARB=0.195417,0.0125657;OID=.,.;OPOS=41787703,41787706;OREF=C,TCATT;OALT=-,-;OMAPALT=GCCTCATT,GCCC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:9,22:49:7,26:48:15:0,2:7,24:6:9:47:10:0,1:9,21:5:5 chr8 42013563 . T TATG 1220.85 PASS AO=140;DP=159;FAO=144;FDP=156;FR=.;FRO=12;FSAF=79;FSAR=65;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.00358528;FXX=0.0188667;HRUN=1;LEN=3;MLLD=257.735;QD=31.3038;RBI=0.00361944;REFB=-0.0540649;REVB=-0.000496094;RO=12;SAF=77;SAR=63;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00504113;STB=0.502697;TYPE=ins;VARB=5.63375e-05;OID=.;OPOS=42013564;OREF=-;OALT=ATG;OMAPALT=TATG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:140:159:144:156:12:79:65:7:5:9:12:77:63:7:5 chr8 42044954 . G A 165.67 PASS AO=35;DP=66;FAO=35;FDP=66;FR=.;FRO=31;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.00410556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.97;QD=10.0407;RBI=0.0120869;REFB=-0.0213212;REVB=0.0113682;RO=31;SAF=22;SAR=13;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0429081;STB=0.523796;TYPE=snp;VARB=0.0188215;OID=.;OPOS=42044954;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:31:31:35:35:13:22:18:13:13:22:18:13 chr8 42562648 . G C 296.17 PASS AO=65;DP=123;FAO=65;FDP=124;FR=.;FRO=59;FSAF=17;FSAR=48;FSRF=25;FSRR=34;FWDB=0.0143173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.801;QD=9.55373;RBI=0.0157631;REFB=-0.0181588;REVB=0.00659472;RO=57;SAF=17;SAR=48;SRF=25;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176046;STB=0.591173;TYPE=snp;VARB=0.017435;OID=.;OPOS=42562648;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:124:57:59:65:65:48:17:25:32:48:17:25:34 chr8 42882555 . A ATTTGT 2256.76 PASS AO=230;DP=308;FAO=271;FDP=294;FR=.;FRO=23;FSAF=129;FSAR=142;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.0206335;FXX=0.0328937;HRUN=3;LEN=5;MLLD=243.757;QD=30.7042;RBI=0.0225211;REFB=-0.0180745;REVB=-0.00902554;RO=31;SAF=112;SAR=118;SRF=23;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0573585;STB=0.513794;TYPE=ins;VARB=-0.000253123;OID=.;OPOS=42882556;OREF=-;OALT=TTTGT;OMAPALT=ATTTGT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:230:308:271:294:23:129:142:15:8:12:31:112:118:23:8 chr8 43054553 . T C 1531.4 PASS AO=160;DP=161;FAO=163;FDP=163;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00437378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.075;QD=37.5804;RBI=0.00476562;REFB=-0.00703727;REVB=-0.0018924;RO=1;SAF=90;SAR=70;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00525775;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.05001e-05;OID=.;OPOS=43054553;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:161:163:1:0:160:163:70:90:1:0:72:91:0:0 chr8 46951721 . C G 1052.52 PASS AO=109;DP=110;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0579154;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.9739;QD=38.6246;RBI=0.061082;REFB=0;REVB=0.0194116;RO=0;SAF=41;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000336673;OID=.;OPOS=46951721;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:110:109:0:0:109:109:68:41:0:0:68:41:0:0 chr8 46951809 . G A 161.85 PASS AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023844;FXX=0.0555247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9747;QD=38.0821;RBI=0.0308234;REFB=0;REVB=0.0195332;RO=0;SAF=6;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00168625;OID=.;OPOS=46951809;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:17:0:0:17:17:11:6:0:0:11:6:0:0 chr8 46951813 . G T 169.83 PASS AO=5;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.088994;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=34.3137;QD=35.7538;RBI=0.119731;REFB=0;REVB=0.0800978;RO=0;SAF=4;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00777807;OID=.;OPOS=46951813;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:8:19:0:0:5:19:1:4:0:0:11:8:0:0 chr8 47979781 . G C 1289.97 PASS AO=134;DP=135;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0325829;FXX=0.0073524;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.5249;QD=38.2214;RBI=0.0327113;REFB=0;REVB=0.00289558;RO=0;SAF=55;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00016979;OID=.;OPOS=47979781;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:135:135:0:0:134:135:79:55:0:0:80:55:0:0 chr8 48102786 . C T 2313.91 PASS AO=243;DP=243;FAO=242;FDP=242;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=168;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00792219;FXX=0.00819639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.81;QD=38.2464;RBI=0.00880851;REFB=0;REVB=-0.0038508;RO=0;SAF=75;SAR=168;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.36609e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.97457e-06;OID=.;OPOS=48102786;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:243:242:0:0:243:242:168:75:0:0:168:74:0:0 chr8 48102987 . A G 1200.66 PASS AO=127;DP=128;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0231911;FXX=0.00781189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.204;QD=37.816;RBI=0.0543032;REFB=-0.0422484;REVB=0.0491021;RO=1;SAF=59;SAR=68;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00693714;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000759812;OID=.;OPOS=48102987;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:128:127:1:0:127:127:68:59:0:1:68:59:0:0 chr8 48104722 . G T 1108.79 PASS AO=112;DP=115;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00574434;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.4781;QD=38.2342;RBI=0.0295237;REFB=0;REVB=-0.0289594;RO=0;SAF=53;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.35459e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000145261;OID=.;OPOS=48104722;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:115:116:0:0:112:116:59:53:0:0:60:56:0:0 chr8 48805816 . A AG,G 260.5 PASS AO=17,12;DP=35;FAO=31,1;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=11,0;FSAR=20,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156073,0.0456224;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=1,1;MLLD=20.2971,8.88486;QD=32.5628;RBI=0.112106,0.221609;REFB=-0.0173293,-0.0220862;REVB=-0.111014,-0.216862;RO=6;SAF=9,0;SAR=8,12;SRF=5;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.145644,-0.841148;STB=0.5,0.5;TYPE=ins,snp;VARB=-0.00616164,0.0610997;OID=.,.;OPOS=48805817,48805816;OREF=-,A;OALT=G,G;OMAPALT=AG,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:35:32:6:0:17,12:31,1:8,12:9,0:5:1:20,1:11,0:0:0 chr8 48885436 . T A 1222.14 PASS AO=132;DP=136;FAO=134;FDP=135;FR=.;FRO=1;FSAF=67;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00880768;FXX=0.0073524;HRUN=2;LEN=1;MLLD=263.706;QD=36.2116;RBI=0.0481598;REFB=-0.163172;REVB=0.0473475;RO=0;SAF=67;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.83182e-08;STB=0.503703;TYPE=snp;VARB=0.000671449;OID=.;OPOS=48885436;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:136:135:0:1:132:134:65:67:0:0:67:67:0:1 chr8 50242815 . C T 187.38 PASS AO=47;DP=104;FAO=48;FDP=105;FR=.;FRO=57;FSAF=31;FSAR=17;FSRF=40;FSRR=17;FWDB=0.0471638;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.2932;QD=7.13816;RBI=0.0707452;REFB=-0.012327;REVB=-0.05273;RO=57;SAF=31;SAR=16;SRF=40;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0469153;STB=0.533821;TYPE=snp;VARB=0.0170378;OID=.;OPOS=50242815;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:105:57:57:47:48:16:31:40:17:17:31:40:17 chr8 50242991 . G T 861.49 PASS AO=89;DP=90;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00232892;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.246;QD=38.7188;RBI=0.0242313;REFB=0;REVB=0.0241191;RO=0;SAF=53;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.47001e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00013095;OID=.;OPOS=50242991;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:90:89:0:0:89:89:36:53:0:0:36:53:0:0 chr8 51571172 . G A 101.06 PASS AO=25;DP=57;FAO=25;FDP=56;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=23;FWDB=0.0688685;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.5549;QD=7.2186;RBI=0.0708686;REFB=-0.0248566;REVB=-0.0167176;RO=31;SAF=15;SAR=10;SRF=8;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.324875;STB=0.682622;TYPE=snp;VARB=0.0246823;OID=.;OPOS=51571172;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:56:31:31:25:25:10:15:8:23:10:15:8:23 chr8 52232487 . G T 191.85 PASS AO=47;DP=101;FAO=47;FDP=101;FR=.;FRO=54;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=27;FSRR=27;FWDB=-0.0118411;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2914;QD=7.59815;RBI=0.0244784;REFB=0.00349304;REVB=0.0214239;RO=54;SAF=27;SAR=20;SRF=27;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0721229;STB=0.540213;TYPE=snp;VARB=-0.00325378;OID=.;OPOS=52232487;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:54:54:47:47:20:27:27:27:20:27:27:27 chr8 52233408 . C T 392.83 PASS AO=115;DP=264;FAO=112;FDP=261;FR=.;FRO=149;FSAF=43;FSAR=69;FSRF=62;FSRR=87;FWDB=-0.00125081;FXX=0.0150938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.069;QD=6.02033;RBI=0.00429945;REFB=-0.00650026;REVB=-0.00411349;RO=149;SAF=45;SAR=70;SRF=62;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0262562;STB=0.51924;TYPE=snp;VARB=0.00847321;OID=.;OPOS=52233408;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:264:261:149:149:115:112:70:45:62:87:69:43:62:87 chr8 52321243 . T C 856.09 PASS AO=85;DP=85;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0319447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.88;QD=38.4757;RBI=0.0322032;REFB=0;REVB=-0.00407181;RO=0;SAF=10;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.47492e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000360101;OID=.;OPOS=52321243;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:85:89:0:0:85:89:75:10:0:0:75:14:0:0 chr8 52321686 . C T 22.3 PASS AO=4;DP=9;FAO=4;FDP=9;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0303703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.6538;QD=9.91248;RBI=0.0387617;REFB=0.0143958;REVB=0.0240855;RO=5;SAF=1;SAR=3;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0609289;STB=0.538276;TYPE=snp;VARB=-0.00625638;OID=.;OPOS=52321686;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:9:9:5:5:4:4:3:1:1:4:3:1:1:4 chr8 52325767 . T G 465.48 PASS AO=97;DP=175;FAO=97;FDP=175;FR=.;FRO=78;FSAF=57;FSAR=40;FSRF=41;FSRR=37;FWDB=0.0138988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.768;QD=10.6396;RBI=0.018489;REFB=-0.0213605;REVB=0.0121929;RO=78;SAF=57;SAR=40;SRF=41;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0517344;STB=0.528217;TYPE=snp;VARB=0.0184357;OID=.;OPOS=52325767;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:175:78:78:97:97:40:57:41:37:40:57:41:37 chr8 52366200 . G A 2953.79 PASS AO=310;DP=311;FAO=310;FDP=310;FR=.;FRO=0;FSAF=148;FSAR=162;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196364;FXX=0.00321533;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.843;QD=38.1134;RBI=0.0307782;REFB=0.00189843;REVB=0.0237005;RO=1;SAF=148;SAR=162;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00293531;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.47091e-05;OID=.;OPOS=52366200;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:311:310:1:0:310:310:162:148:0:1:162:148:0:0 chr8 52730441 . T C 89.2 PASS AO=100;DP=484;FAO=84;FDP=400;FR=.;FRO=316;FSAF=36;FSAR=48;FSRF=128;FSRR=188;FWDB=-0.027382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.5668;QD=0.892032;RBI=0.0401525;REFB=0.00233579;REVB=0.0293675;RO=382;SAF=41;SAR=59;SRF=160;SRR=222;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0117739;STB=0.519057;TYPE=snp;VARB=-0.00996744;OID=.;OPOS=52730441;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:484:400:382:316:100:84:59:41:160:222:48:36:128:188 chr8 52730521 . C T 2454.35 PASS AO=255;DP=255;FAO=256;FDP=256;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=164;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135211;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2703;QD=38.3493;RBI=0.0216787;REFB=0;REVB=0.0169455;RO=0;SAF=91;SAR=164;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.68632e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.83272e-05;OID=.;OPOS=52730521;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:255:256:0:0:255:256:164:91:0:0:164:92:0:0 chr8 52730627 . A G 75.63 PASS AO=42;DP=169;FAO=43;FDP=168;FR=.;FRO=125;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=56;FSRR=69;FWDB=0.00850522;FXX=0.0175428;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.27;QD=1.80062;RBI=0.0352922;REFB=-0.0119822;REVB=0.034252;RO=122;SAF=22;SAR=20;SRF=55;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0905618;STB=0.564349;TYPE=snp;VARB=0.0387491;OID=.;OPOS=52730627;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:169:168:122:125:42:43:20:22:55:67:20:23:56:69 chr8 52730864 . T C 637.26 PASS AO=95;DP=126;FAO=95;FDP=126;FR=.;FRO=31;FSAF=57;FSAR=38;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=0.00992174;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.494;QD=20.2305;RBI=0.0105471;REFB=-0.0247719;REVB=0.00357772;RO=31;SAF=57;SAR=38;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0246131;STB=0.513155;TYPE=snp;VARB=0.0104168;OID=.;OPOS=52730864;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:126:126:31:31:95:95:38:57:17:14:38:57:17:14 chr8 52731975 . C A 55.47 PASS AO=25;DP=90;FAO=25;FDP=90;FR=.;FRO=65;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=23;FSRR=42;FWDB=0.0283;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=129.649;QD=2.46554;RBI=0.0359033;REFB=0.00363433;REVB=0.0220944;RO=65;SAF=17;SAR=8;SRF=23;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.381893;STB=0.726324;TYPE=snp;VARB=-0.00799899;OID=.;OPOS=52731975;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:90:90:65:65:25:25:8:17:23:42:8:17:23:42 chr8 52731980 . C G 17.47 PASS AO=16;DP=90;FAO=16;FDP=90;FR=.;FRO=74;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=31;FSRR=43;FWDB=0.0122827;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=198.732;QD=0.776332;RBI=0.0219269;REFB=-0.0027947;REVB=0.0181639;RO=74;SAF=10;SAR=6;SRF=31;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.25555;STB=0.66556;TYPE=snp;VARB=0.0126063;OID=.;OPOS=52731980;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:90:90:74:74:16:16:6:10:31:43:6:10:31:43 chr8 52731999 . C T 58.62 PASS AO=25;DP=86;FAO=25;FDP=86;FR=.;FRO=61;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=39;FWDB=-0.00921413;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.229;QD=2.72664;RBI=0.00981673;REFB=-0.00112399;REVB=0.00338646;RO=60;SAF=17;SAR=8;SRF=22;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.363989;STB=0.719004;TYPE=snp;VARB=0.00306307;OID=.;OPOS=52731999;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:86:86:60:61:25:25:8:17:22:38:8:17:22:39 chr8 52733128 . T G 18.22 PASS AO=7;DP=32;FAO=8;FDP=32;FR=.;FRO=24;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=20;FWDB=-0.0176783;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.0296;QD=2.27729;RBI=0.160505;REFB=0.0215815;REVB=0.159528;RO=25;SAF=1;SAR=6;SRF=4;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0395403;STB=0.56434;TYPE=snp;VARB=-0.0507955;OID=.;OPOS=52733128;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:32:32:25:24:7:8:6:1:4:21:7:1:4:20 chr8 53055496 . A G 328.85 PASS AO=91;DP=213;FAO=92;FDP=214;FR=.;FRO=122;FSAF=68;FSAR=24;FSRF=77;FSRR=45;FWDB=-0.00993044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=308.293;QD=6.14674;RBI=0.00995523;REFB=0.000383139;REVB=0.000702049;RO=122;SAF=68;SAR=23;SRF=77;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144325;STB=0.574139;TYPE=snp;VARB=-0.000506484;OID=.;OPOS=53055496;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:213:214:122:122:91:92:23:68:77:45:24:68:77:45 chr8 53071461 . G A 150.09 PASS AO=31;DP=57;FAO=31;FDP=58;FR=.;FRO=27;FSAF=26;FSAR=5;FSRF=23;FSRR=4;FWDB=0.0271358;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.986;QD=10.3512;RBI=0.0371095;REFB=-0.0298558;REVB=0.0253132;RO=26;SAF=26;SAR=5;SRF=22;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114196;STB=0.511475;TYPE=snp;VARB=0.0283286;OID=.;OPOS=53071461;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:58:26:27:31:31:5:26:22:4:5:26:23:4 chr8 53537316 . A G 633.73 PASS AO=126;DP=219;FAO=126;FDP=218;FR=.;FRO=92;FSAF=73;FSAR=53;FSRF=37;FSRR=55;FWDB=-0.029248;FXX=0.004566;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.8653;QD=11.628;RBI=0.0356931;REFB=-0.00856257;REVB=0.0204586;RO=92;SAF=73;SAR=53;SRF=37;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138007;STB=0.574875;TYPE=snp;VARB=0.00781357;OID=.;OPOS=53537316;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:219:218:92:92:126:126:53:73:37:55:53:73:37:55 chr8 53555069 . A G 304.64 PASS AO=96;DP=248;FAO=97;FDP=248;FR=.;FRO=151;FSAF=53;FSAR=44;FSRF=73;FSRR=78;FWDB=-0.00105693;FXX=0.0040159;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9048;QD=4.91355;RBI=0.00509948;REFB=0.00564575;REVB=-0.00498875;RO=150;SAF=52;SAR=44;SRF=72;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0668867;STB=0.538377;TYPE=snp;VARB=-0.00903772;OID=.;OPOS=53555069;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:248:248:150:151:96:97:44:52:72:78:44:53:73:78 chr8 53586706 . A G 505.31 PASS AO=108;DP=204;FAO=109;FDP=203;FR=.;FRO=94;FSAF=48;FSAR=61;FSRF=38;FSRR=56;FWDB=0.0156795;FXX=0.00975562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.633;QD=9.95687;RBI=0.0157161;REFB=-0.0368745;REVB=0.00107169;RO=93;SAF=47;SAR=61;SRF=37;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0323372;STB=0.517029;TYPE=snp;VARB=0.0249703;OID=.;OPOS=53586706;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:203:93:94:108:109:61:47:37:56:61:48:38:56 chr8 54745538 . C G 1576.86 PASS AO=163;DP=163;FAO=165;FDP=165;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0522885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.6959;QD=38.2269;RBI=0.0524443;REFB=0;REVB=-0.00403866;RO=0;SAF=67;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.28207e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00027756;OID=.;OPOS=54745538;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:163:165:0:0:163:165:96:67:0:0:96:69:0:0 chr8 55539395 . A T 1513.28 PASS AO=159;DP=162;FAO=163;FDP=163;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00850685;FXX=0.00609719;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.5467;QD=37.1358;RBI=0.0551485;REFB=-0.0363885;REVB=0.0544884;RO=3;SAF=73;SAR=86;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00735509;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00164318;OID=.;OPOS=55539395;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:162:163:3:0:159:163:86:73:2:1:88:75:0:0 chr8 55542540 . G A 1099.33 PASS AO=83;DP=112;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.024495;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.6103;QD=38.2375;RBI=0.0487676;REFB=0;REVB=0.0421696;RO=0;SAF=50;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.15707e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.6464e-05;OID=.;OPOS=55542540;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:83:115:0:0:83:115:33:50:0:0:61:54:0:0 chr8 56651746 . G A 34.06 PASS AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.0168434;FXX=0.0384468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.961;QD=5.44973;RBI=0.0195414;REFB=-0.00744052;REVB=-0.00990774;RO=15;SAF=4;SAR=5;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160115;STB=0.575055;TYPE=snp;VARB=0.0184884;OID=.;OPOS=56651746;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:25:25:15:16:9:9:5:4:9:6:5:4:9:7 chr8 56652048 . CAT C 744.07 PASS AO=309;DP=711;FAO=186;FDP=389;FR=.;FRO=203;FSAF=97;FSAR=89;FSRF=97;FSRR=106;FWDB=-0.0077446;FXX=0.0274993;HRUN=1;LEN=2;MLLD=232.811;QD=7.65111;RBI=0.021391;REFB=-0.00413621;REVB=0.0199398;RO=375;SAF=151;SAR=158;SRF=173;SRR=202;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0272079;STB=0.522786;TYPE=del;VARB=0.00416315;OID=.;OPOS=56652049;OREF=AT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:309:703:186:389:203:97:89:97:106:99:375:151:158:173:202 chr8 56657801 . C T 354.33 PASS AO=82;DP=163;FAO=82;FDP=163;FR=.;FRO=81;FSAF=45;FSAR=37;FSRF=42;FSRR=39;FWDB=0.0123464;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.204;QD=8.69523;RBI=0.0677878;REFB=-0.0253842;REVB=-0.066654;RO=81;SAF=45;SAR=37;SRF=42;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0275102;STB=0.515134;TYPE=snp;VARB=0.0251425;OID=.;OPOS=56657801;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:163:81:81:82:82:37:45:42:39:37:45:42:39 chr8 56686224 . T C 818.58 PASS AO=88;DP=90;FAO=88;FDP=90;FR=.;FRO=2;FSAF=41;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0120906;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.3546;QD=36.3815;RBI=0.0129377;REFB=-0.0378241;REVB=0.00460454;RO=2;SAF=41;SAR=47;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0197362;STB=0.510414;TYPE=snp;VARB=0.00156594;OID=.;OPOS=56686224;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:90:90:2:2:88:88:47:41:0:2:47:41:0:2 chr8 56821700 . T G 1131.61 PASS AO=119;DP=120;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000141905;FXX=0.00833264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.63;QD=38.0372;RBI=0.0277388;REFB=-0.0598255;REVB=0.0277384;RO=1;SAF=53;SAR=66;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00714286;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.107e-05;OID=.;OPOS=56821700;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:120:119:1:0:119:119:66:53:0:1:66:53:0:0 chr8 56821795 . T G 1455.79 PASS AO=145;DP=145;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0311027;FXX=0.0064512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.367;QD=37.8126;RBI=0.0311435;REFB=0;REVB=-0.00159392;RO=0;SAF=52;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000411776;OID=.;OPOS=56821795;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:145:154:0:0:145:154:93:52:0:0:94:60:0:0 chr8 56821809 . C T 1530.83 PASS AO=159;DP=159;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0066839;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.836;QD=38.5114;RBI=0.00780341;REFB=0;REVB=0.00402725;RO=0;SAF=67;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.42359e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.08391e-05;OID=.;OPOS=56821809;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:159:159:0:0:159:159:92:67:0:0:92:67:0:0 chr8 56821945 . G A 669.42 PASS AO=70;DP=72;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00840634;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.4879;QD=36.6807;RBI=0.0677598;REFB=0;REVB=0.0672363;RO=2;SAF=42;SAR=28;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0325738;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000827486;OID=.;OPOS=56821945;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:72:73:2:0:70:73:28:42:0:2:30:43:0:0 chr8 57075769 . C T 15.77 PASS AO=4;DP=18;FAO=6;FDP=20;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.114437;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=22.2838;QD=3.15364;RBI=0.160738;REFB=-0.0459798;REVB=0.112876;RO=12;SAF=3;SAR=1;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.288654;STB=0.571184;TYPE=snp;VARB=0.180616;OID=.;OPOS=57075769;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:18:20:12:14:4:6:1:3:6:6:2:4:8:6 chr8 57129291 . A T 585.98 PASS AO=131;DP=257;FAO=133;FDP=258;FR=.;FRO=125;FSAF=55;FSAR=78;FSRF=52;FSRR=73;FWDB=0.0202858;FXX=0.0114938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.154;QD=9.08503;RBI=0.020543;REFB=-0.019456;REVB=0.00324096;RO=126;SAF=52;SAR=79;SRF=53;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0220259;STB=0.501231;TYPE=snp;VARB=0.0174982;OID=.;OPOS=57129291;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:257:258:126:125:131:133:79:52:53:73:78:55:52:73 chr8 57335956 . C T 22.2 PASS AO=4;DP=8;FAO=4;FDP=9;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0218447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.377;QD=9.86577;RBI=0.0757038;REFB=-0.00625084;REVB=0.0724836;RO=2;SAF=3;SAR=1;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161039;STB=0.555281;TYPE=snp;VARB=0.00879658;OID=.;OPOS=57335956;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:8:9:2:5:4:4:1:3:1:1:2:2:2:3 chr8 57829649 . G T 46.94 PASS AO=16;DP=50;FAO=16;FDP=50;FR=.;FRO=34;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=0.000454467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.169;QD=3.75554;RBI=0.0358146;REFB=0.00983023;REVB=-0.0358117;RO=30;SAF=4;SAR=12;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193429;STB=0.585253;TYPE=snp;VARB=-0.0228888;OID=.;OPOS=57829649;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:50:50:30:34:16:16:12:4:12:18:12:4:12:22 chr8 59060275 . A G 1690.63 PASS AO=173;DP=176;FAO=178;FDP=178;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0100421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.573;QD=37.9916;RBI=0.0189384;REFB=0;REVB=0.0160568;RO=1;SAF=82;SAR=91;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00576947;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.79288e-05;OID=.;OPOS=59060275;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:176:178:1:0:173:178:91:82:1:0:95:83:0:0 chr8 59496490 . A G 882.2 PASS AO=90;DP=90;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0401462;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.695;QD=37.9441;RBI=0.0416092;REFB=0;REVB=-0.0109363;RO=0;SAF=38;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.28321e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.19649e-05;OID=.;OPOS=59496490;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:90:93:0:0:90:93:52:38:0:0:55:38:0:0 chr8 59508166 . A G 354.66 PASS AO=100;DP=236;FAO=100;FDP=235;FR=.;FRO=135;FSAF=30;FSAR=70;FSRF=43;FSRR=92;FWDB=0.041029;FXX=0.00843846;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.11;QD=6.0368;RBI=0.0412455;REFB=-0.00947753;REVB=0.00422117;RO=130;SAF=30;SAR=70;SRF=43;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0365509;STB=0.512535;TYPE=snp;VARB=0.022116;OID=.;OPOS=59508166;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:236:235:130:135:100:100:70:30:43:87:70:30:43:92 chr8 59512334 . G A 1599.89 PASS AO=168;DP=169;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.012132;FXX=0.00591681;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.371;QD=38.0927;RBI=0.0412985;REFB=-0.00585915;REVB=0.0394763;RO=1;SAF=91;SAR=77;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00520149;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.34728e-05;OID=.;OPOS=59512334;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:169:168:1:0:168:168:77:91:1:0:77:91:0:0 chr8 59547804 . C A 548.35 PASS AO=127;DP=253;FAO=128;FDP=254;FR=.;FRO=126;FSAF=66;FSAR=62;FSRF=65;FSRR=61;FWDB=0.0144052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.691;QD=8.63543;RBI=0.0374065;REFB=-0.020203;REVB=0.0345216;RO=123;SAF=65;SAR=62;SRF=65;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149592;STB=0.500123;TYPE=snp;VARB=0.018911;OID=.;OPOS=59547804;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:253:254:123:126:127:128:62:65:65:58:62:66:65:61 chr8 61178574 . T C 173.49 PASS AO=46;DP=103;FAO=46;FDP=105;FR=.;FRO=59;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=42;FWDB=-0.00547136;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.802;QD=6.60929;RBI=0.019795;REFB=-0.00520604;REVB=-0.0190238;RO=57;SAF=25;SAR=21;SRF=16;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.256881;STB=0.640968;TYPE=snp;VARB=0.00837435;OID=.;OPOS=61178574;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:105:57:59:46:46:21:25:16:41:21:25:17:42 chr8 61488824 . T C 253.19 PASS AO=79;DP=212;FAO=82;FDP=213;FR=.;FRO=131;FSAF=42;FSAR=40;FSRF=71;FSRR=60;FWDB=-0.00465794;FXX=0.00930189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.945;QD=4.75471;RBI=0.0192687;REFB=-0.0155301;REVB=-0.0186972;RO=131;SAF=40;SAR=39;SRF=71;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0393652;STB=0.518344;TYPE=snp;VARB=0.0236135;OID=.;OPOS=61488824;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:213:131:131:79:82:39:40:71:60:40:42:71:60 chr8 61488859 . A G 312.64 PASS AO=94;DP=228;FAO=93;FDP=227;FR=.;FRO=134;FSAF=42;FSAR=51;FSRF=73;FSRR=61;FWDB=0.0257384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.0401;QD=5.50904;RBI=0.0284678;REFB=-0.0227429;REVB=-0.0121636;RO=133;SAF=42;SAR=52;SRF=73;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106797;STB=0.554913;TYPE=snp;VARB=0.0294452;OID=.;OPOS=61488859;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:228:227:133:134:94:93:52:42:73:60:51:42:73:61 chr8 61654600 . TG T 40.08 PASS AO=10;DP=20;FAO=12;FDP=20;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.052774;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=16.727;QD=8.01591;RBI=0.0619683;REFB=-0.139482;REVB=-0.0324804;RO=8;SAF=0;SAR=10;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.79271;STB=0.624765;TYPE=del;VARB=0.157703;OID=.;OPOS=61654601;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:10:20:12:20:8:2:10:3:5:19:8:0:10:3:5 chr8 61765496 . AC A 62.74 PASS AO=16;DP=36;FAO=22;FDP=34;FR=.;FRO=12;FSAF=20;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=0.0869486;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=9.73497;QD=7.3816;RBI=0.317271;REFB=0.0222327;REVB=0.305124;RO=15;SAF=15;SAR=1;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0.650794;SSSB=0.4105;STB=0.632767;TYPE=del;VARB=0.0620851;OID=.;OPOS=61765497;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:16:34:22:34:12:20:2:9:3:17:15:15:1:11:4 chr8 62490978 . T C 428.92 PASS AO=45;DP=47;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00317217;FXX=0.0425441;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.409;QD=38.126;RBI=0.00720311;REFB=0;REVB=0.006467;RO=0;SAF=26;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.15971e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.55843e-05;OID=.;OPOS=62490978;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:47:45:0:0:45:45:19:26:0:0:19:26:0:0 chr8 62491095 . C T 266.98 PASS AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0569489;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.068;QD=38.1403;RBI=0.0682931;REFB=0;REVB=-0.0376932;RO=0;SAF=13;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000363094;OID=.;OPOS=62491095;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:29:28:0:0:28:28:15:13:0:0:15:13:0:0 chr8 62491107 . G A 243.17 PASS AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00864697;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.011;QD=37.4115;RBI=0.012098;REFB=0;REVB=-0.00846118;RO=0;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.62747e-05;OID=.;OPOS=62491107;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:26:26:0:0:26:26:12:14:0:0:12:14:0:0 chr8 62491170 . T C 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0230803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.262;QD=33.022;RBI=0.0598711;REFB=0;REVB=0.0552435;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00105868;OID=.;OPOS=62491170;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:2:4:0:0:2:4:0:0 chr8 62491943 . G A 359.08 PASS AO=39;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.118313;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.7771;QD=35.9076;RBI=0.17301;REFB=-0.0394535;REVB=0.126232;RO=0;SAF=17;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00666133;OID=.;OPOS=62491943;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:41:40:0:0:39:40:22:17:0:0:23:17:0:0 chr8 62491985 . A G 327.22 PASS AO=35;DP=36;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0133103;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.6593;QD=35.3749;RBI=0.0274154;REFB=-0.0943074;REVB=-0.0239674;RO=1;SAF=13;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0207916;STB=0.510632;TYPE=snp;VARB=0.00206334;OID=.;OPOS=62491985;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:36:37:1:1:35:36:22:13:0:1:23:13:0:1 chr8 62544428 . G T 1184.48 PASS AO=120;DP=121;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.031376;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.023;QD=38.2091;RBI=0.0329345;REFB=0;REVB=0.0100112;RO=0;SAF=35;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53063e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.81668e-05;OID=.;OPOS=62544428;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:121:124:0:0:120:124:85:35:0:0:86:38:0:0 chr8 62595068 . C T 1187.32 PASS AO=127;DP=127;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0376123;FXX=0.0390594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.858;QD=38.612;RBI=0.0379303;REFB=0;REVB=0.00490116;RO=0;SAF=58;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000389118;OID=.;OPOS=62595068;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:127:123:0:0:127:123:69:58:0:0:70:53:0:0 chr8 63659610 . G A 3481.06 PASS AO=362;DP=364;FAO=363;FDP=363;FR=.;FRO=0;FSAF=151;FSAR=212;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0368317;FXX=0.00274718;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.244;QD=38.3588;RBI=0.0504627;REFB=0;REVB=0.0344951;RO=0;SAF=150;SAR=212;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.95501e-05;OID=.;OPOS=63659610;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:364:363:0:0:362:363:212:150:0:0:212:151:0:0 chr8 63775832 . T C 131.71 PASS AO=26;DP=48;FAO=26;FDP=48;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=-0.0277583;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.296;QD=10.9759;RBI=0.0359787;REFB=-0.0474073;REVB=-0.0228899;RO=22;SAF=8;SAR=18;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0100769;STB=0.505614;TYPE=snp;VARB=0.0210923;OID=.;OPOS=63775832;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:48:48:22:22:26:26:18:8:7:15:18:8:7:15 chr8 63942717 . C T 52.89 PASS AO=16;DP=45;FAO=16;FDP=45;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=1;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.0402954;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.4874;QD=4.70101;RBI=0.0442502;REFB=0.000379549;REVB=-0.0182854;RO=29;SAF=15;SAR=1;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.625407;STB=0.881753;TYPE=snp;VARB=-5.69091e-05;OID=.;OPOS=63942717;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:45:45:29:29:16:16:1:15:15:14:1:15:15:14 chr8 63978658 . TA T 572.1 PASS AO=84;DP=139;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.195689;FXX=0.00740686;HRUN=8;LEN=1;MLLD=7.87847;QD=17.0775;RBI=0.206372;REFB=0;REVB=-0.0655401;RO=22;SAF=27;SAR=57;SRF=16;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168926;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00208066;OID=.;OPOS=63978659;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:84:131:134:134:0:58:76:0:0:54:22:27:57:16:6 chr8 64098729 . A AG 2072.72 PASS AO=212;DP=226;FAO=219;FDP=219;FR=.;FRO=0;FSAF=110;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00949123;FXX=0.0309721;HRUN=0;LEN=1;MLLD=207.722;QD=37.8579;RBI=0.0244087;REFB=-0.00204961;REVB=0.0224878;RO=9;SAF=106;SAR=106;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0301315;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.000163009;OID=.;OPOS=64098730;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:212:226:219:219:0:110:109:0:0:89:9:106:106:8:1 chr8 65290650 . C T 83.8 PASS AO=15;DP=23;FAO=14;FDP=22;FR=.;FRO=8;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.0257072;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.407;QD=15.2362;RBI=0.0294633;REFB=-0.0364122;REVB=0.0143954;RO=8;SAF=10;SAR=5;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.331985;STB=0.713979;TYPE=snp;VARB=0.0301674;OID=.;OPOS=65290650;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:23:22:8:8:15:14:5:10:1:7:4:10:1:7 chr8 66515063 . G GT,T 302.56 PASS AO=22,64;DP=132;FAO=53,52;FDP=122;FR=.;FRO=17;FSAF=25,23;FSAR=28,29;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=0.0315162,0.000207446;FXX=0.0239981;HRUN=12,1;LEN=1,1;MLLD=3.41781,170.093;QD=9.91982;RBI=0.505489,0.0533547;REFB=-0.357222,-0.0106938;REVB=-0.504506,-0.0533543;RO=24;SAF=13,28;SAR=9,36;SRF=17;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.115193,-0.137044;STB=0.542503,0.550511;TYPE=ins,snp;VARB=-0.18872,0.0276169;OID=.,.;OPOS=66515064,66515063;OREF=-,G;OALT=T,T;OMAPALT=GT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:132:122:24:17:22,64:53,52:9,36:13,28:17:7:28,29:25,23:11:6 chr8 66515086 . G A 148.04 PASS AO=50;DP=137;FAO=50;FDP=137;FR=.;FRO=87;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=42;FSRR=45;FWDB=-0.0543569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.2908;QD=4.32218;RBI=0.0821258;REFB=0.00519993;REVB=-0.0615628;RO=81;SAF=22;SAR=28;SRF=36;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00490784;STB=0.527358;TYPE=snp;VARB=-0.00830458;OID=.;OPOS=66515086;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:81:87:50:50:28:22:36:45:28:22:42:45 chr8 66515783 . G A 2058.04 PASS AO=223;DP=229;FAO=224;FDP=230;FR=.;FRO=6;FSAF=107;FSAR=117;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.030295;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.1743;QD=35.7921;RBI=0.0305156;REFB=-0.00534713;REVB=0.00366258;RO=6;SAF=106;SAR=117;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00123338;STB=0.500583;TYPE=snp;VARB=-4.15613e-05;OID=.;OPOS=66515783;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:229:230:6:6:223:224:117:106:3:3:117:107:3:3 chr8 66516490 . C T 1937.19 PASS AO=202;DP=203;FAO=204;FDP=204;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.6244;QD=37.984;RBI=0.0215517;REFB=0;REVB=0.0111226;RO=1;SAF=100;SAR=102;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00464693;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.34086e-05;OID=.;OPOS=66516490;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:92:203:204:1:0:202:204:102:100:0:1:103:101:0:0 chr8 66517486 . C T 1240.48 PASS AO=130;DP=133;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0012697;FXX=0.0298485;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.1488;QD=38.1686;RBI=0.0859914;REFB=0;REVB=-0.085982;RO=0;SAF=80;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000419862;OID=.;OPOS=66517486;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:133:130:0:0:130:130:50:80:0:0:50:80:0:0 chr8 66525548 . T C 430.65 PASS AO=84;DP=146;FAO=85;FDP=145;FR=.;FRO=60;FSAF=48;FSAR=37;FSRF=27;FSRR=33;FWDB=-0.0147379;FXX=0.00684885;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.162;QD=11.8801;RBI=0.0186621;REFB=-0.0120501;REVB=0.0114485;RO=60;SAF=48;SAR=36;SRF=27;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.093562;STB=0.547666;TYPE=snp;VARB=0.00938315;OID=.;OPOS=66525548;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:145:60:60:84:85:36:48:27:33:37:48:27:33 chr8 66609549 . A G 148.83 PASS AO=36;DP=77;FAO=36;FDP=77;FR=.;FRO=41;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=-0.0907392;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.0583;QD=7.73119;RBI=0.0907486;REFB=-0.0065338;REVB=-0.00130569;RO=41;SAF=12;SAR=24;SRF=16;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.059427;STB=0.533314;TYPE=snp;VARB=0.00732834;OID=.;OPOS=66609549;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:41:41:36:36:24:12:16:25:24:12:16:25 chr8 66621411 . G A 380.72 PASS AO=108;DP=242;FAO=109;FDP=259;FR=.;FRO=150;FSAF=53;FSAR=56;FSRF=54;FSRR=96;FWDB=0.0217009;FXX=0.0189387;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.566;QD=5.87984;RBI=0.0353991;REFB=-0.0305096;REVB=-0.0279672;RO=133;SAF=52;SAR=56;SRF=53;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0830813;STB=0.573449;TYPE=snp;VARB=0.0431833;OID=.;OPOS=66621411;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:242:259:133:150:108:109:56:52:53:80:56:53:54:96 chr8 67342186 . G A 64.53 PASS AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.0534864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.084;QD=8.60335;RBI=0.0571844;REFB=-0.00437892;REVB=-0.0202303;RO=16;SAF=4;SAR=10;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0298506;STB=0.517216;TYPE=snp;VARB=0.00727176;OID=.;OPOS=67342186;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:30:30:16:16:14:14:10:4:5:11:10:4:5:11 chr8 67428368 . A G 186.12 PASS AO=66;DP=185;FAO=66;FDP=187;FR=.;FRO=121;FSAF=38;FSAR=28;FSRF=39;FSRR=82;FWDB=-0.0216247;FXX=0.0157886;HRUN=5;LEN=1;MLLD=241.538;QD=3.9812;RBI=0.0250714;REFB=0.00137154;REVB=0.0126866;RO=115;SAF=38;SAR=28;SRF=33;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.315459;STB=0.659677;TYPE=snp;VARB=-0.0030136;OID=.;OPOS=67428368;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:187:115:121:66:66:28:38:33:82:28:38:39:82 chr8 67590460 . C T 145.38 PASS AO=41;DP=100;FAO=41;FDP=100;FR=.;FRO=59;FSAF=9;FSAR=32;FSRF=18;FSRR=41;FWDB=-0.00454376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.279;QD=5.815;RBI=0.0125439;REFB=0.000110543;REVB=0.011692;RO=58;SAF=9;SAR=32;SRF=17;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103387;STB=0.568012;TYPE=snp;VARB=-0.000169222;OID=.;OPOS=67590460;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:58:59:41:41:32:9:17:41:32:9:18:41 chr8 67592152 . T C 169.04 PASS AO=70;DP=210;FAO=68;FDP=209;FR=.;FRO=141;FSAF=46;FSAR=22;FSRF=93;FSRR=48;FWDB=0.0121045;FXX=0.00476168;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.214;QD=3.23522;RBI=0.0708453;REFB=0.00461755;REVB=0.0698036;RO=139;SAF=47;SAR=23;SRF=92;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0124869;STB=0.512898;TYPE=snp;VARB=-0.00896949;OID=.;OPOS=67592152;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:210:209:139:141:70:68:23:47:92:47:22:46:93:48 chr8 67774115 . C T 294.34 PASS AO=79;DP=179;FAO=79;FDP=179;FR=.;FRO=100;FSAF=31;FSAR=48;FSRF=42;FSRR=58;FWDB=-0.00392548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.198;QD=6.57741;RBI=0.0149104;REFB=-0.00597866;REVB=0.0143844;RO=100;SAF=31;SAR=48;SRF=42;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.02882;STB=0.516049;TYPE=snp;VARB=0.0101462;OID=.;OPOS=67774115;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:179:100:100:79:79:48:31:42:58:48:31:42:58 chr8 67998470 . A G 409.08 PASS AO=88;DP=167;FAO=89;FDP=166;FR=.;FRO=77;FSAF=35;FSAR=54;FSRF=37;FSRR=40;FWDB=0.0511241;FXX=0.0119041;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.219;QD=9.85727;RBI=0.0524823;REFB=-0.0369828;REVB=0.0118625;RO=76;SAF=34;SAR=54;SRF=36;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.076442;STB=0.541646;TYPE=snp;VARB=0.0417297;OID=.;OPOS=67998470;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:166:76:77:88:89:54:34:36:40:54:35:37:40 chr8 68968166 . C A 282.89 PASS AO=91;DP=241;FAO=92;FDP=241;FR=.;FRO=149;FSAF=42;FSAR=50;FSRF=84;FSRR=65;FWDB=0.000620601;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=254.355;QD=4.6953;RBI=0.000667335;REFB=-0.0108248;REVB=-0.000245339;RO=149;SAF=42;SAR=49;SRF=84;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112081;STB=0.566023;TYPE=snp;VARB=0.0189888;OID=.;OPOS=68968166;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:241:241:149:149:91:92:49:42:84:65:50:42:84:65 chr8 68968171 . G A 255.86 PASS AO=91;DP=240;FAO=88;FDP=239;FR=.;FRO=151;FSAF=41;FSAR=47;FSRF=84;FSRR=67;FWDB=-0.0153321;FXX=0.00829841;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.701;QD=4.28218;RBI=0.0154081;REFB=-0.00495297;REVB=0.001529;RO=149;SAF=42;SAR=49;SRF=83;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104773;STB=0.556912;TYPE=snp;VARB=0.00960715;OID=.;OPOS=68968171;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:240:239:149:151:91:88:49:42:83:66:47:41:84:67 chr8 68993013 . A G 130.04 PASS AO=47;DP=133;FAO=46;FDP=131;FR=.;FRO=85;FSAF=16;FSAR=30;FSRF=47;FSRR=38;FWDB=0.0133798;FXX=0.0965451;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.6683;QD=3.97065;RBI=0.0140077;REFB=-0.00770357;REVB=-0.00414693;RO=74;SAF=17;SAR=30;SRF=46;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.277525;STB=0.634595;TYPE=snp;VARB=0.0650644;OID=.;OPOS=68993013;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:131:74:85:47:46:30:17:46:28:30:16:47:38 chr8 68993014 . T C 210.85 PASS AO=60;DP=135;FAO=60;FDP=145;FR=.;FRO=85;FSAF=18;FSAR=42;FSRF=46;FSRR=39;FWDB=0.00233081;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.887;QD=5.81652;RBI=0.0104949;REFB=-0.0506465;REVB=0.0102328;RO=73;SAF=18;SAR=42;SRF=45;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.317819;STB=0.648285;TYPE=snp;VARB=0.0203228;OID=.;OPOS=68993014;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:145:73:85:60:60:42:18:45:28:42:18:46:39 chr8 69009268 . C T 404.66 PASS AO=100;DP=214;FAO=102;FDP=217;FR=.;FRO=115;FSAF=55;FSAR=47;FSRF=65;FSRR=50;FWDB=-0.000825322;FXX=0.0136357;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.05;QD=7.45908;RBI=0.0128656;REFB=-0.00170383;REVB=-0.0128391;RO=109;SAF=56;SAR=44;SRF=64;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0261516;STB=0.513893;TYPE=snp;VARB=0.00220179;OID=.;OPOS=69009268;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:217:109:115:100:102:44:56:64:45:47:55:65:50 chr8 69012364 . G A 219.79 PASS AO=83;DP=233;FAO=80;FDP=229;FR=.;FRO=149;FSAF=36;FSAR=44;FSRF=85;FSRR=64;FWDB=0.0130963;FXX=0.0213666;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.606;QD=3.83905;RBI=0.0244872;REFB=-0.0127849;REVB=-0.0206908;RO=146;SAF=37;SAR=46;SRF=84;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144786;STB=0.577922;TYPE=snp;VARB=0.0235263;OID=.;OPOS=69012364;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:233:229:146:149:83:80:46:37:84:62:44:36:85:64 chr8 69020496 . T C 348.67 PASS AO=71;DP=129;FAO=71;FDP=127;FR=.;FRO=56;FSAF=24;FSAR=47;FSRF=30;FSRR=26;FWDB=-0.0490377;FXX=0.0155027;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.6937;QD=10.9818;RBI=0.058361;REFB=-0.00761214;REVB=0.0316435;RO=57;SAF=24;SAR=47;SRF=30;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161162;STB=0.591582;TYPE=snp;VARB=0.0039209;OID=.;OPOS=69020496;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:127:57:56:71:71:47:24:30:27:47:24:30:26 chr8 69434195 . T C 197.39 PASS AO=38;DP=97;FAO=52;FDP=111;FR=.;FRO=59;FSAF=35;FSAR=17;FSRF=46;FSRR=13;FWDB=-0.0424834;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9688;QD=7.11319;RBI=0.0544822;REFB=-0.0260533;REVB=0.0341096;RO=56;SAF=34;SAR=4;SRF=44;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234111;STB=0.567343;TYPE=snp;VARB=0.0268524;OID=.;OPOS=69434195;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:111:56:59:38:52:4:34:44:12:17:35:46:13 chr8 69442819 . G A 98.36 PASS AO=35;DP=103;FAO=35;FDP=103;FR=.;FRO=68;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=30;FSRR=38;FWDB=-0.00407388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1569;QD=3.81968;RBI=0.0113788;REFB=-0.0125486;REVB=-0.0106245;RO=67;SAF=11;SAR=24;SRF=30;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162836;STB=0.590583;TYPE=snp;VARB=0.0242517;OID=.;OPOS=69442819;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:103:103:67:68:35:35:24:11:30:37:24:11:30:38 chr8 69730432 . G A 76.93 PASS AO=26;DP=78;FAO=26;FDP=76;FR=.;FRO=50;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=36;FSRR=14;FWDB=-0.00502772;FXX=0.0256377;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.4755;QD=4.04881;RBI=0.00569723;REFB=-0.00855262;REVB=0.00267963;RO=50;SAF=15;SAR=11;SRF=36;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172383;STB=0.599288;TYPE=snp;VARB=0.0278452;OID=.;OPOS=69730432;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:78:76:50:50:26:26:11:15:36:14:11:15:36:14 chr8 69730488 . G C 148.05 PASS AO=41;DP=98;FAO=41;FDP=98;FR=.;FRO=57;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=35;FSRR=22;FWDB=0.00807582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.404;QD=6.04301;RBI=0.00858368;REFB=-0.0150526;REVB=-0.00290871;RO=56;SAF=16;SAR=25;SRF=34;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220848;STB=0.628946;TYPE=snp;VARB=0.0157976;OID=.;OPOS=69730488;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:56:57:41:41:25:16:34:22:25:16:35:22 chr8 70072423 . G A 349.12 PASS AO=85;DP=201;FAO=93;FDP=208;FR=.;FRO=115;FSAF=40;FSAR=53;FSRF=49;FSRR=66;FWDB=0.0141835;FXX=0.0142173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.888;QD=6.71376;RBI=0.0203923;REFB=-0.0130432;REVB=0.0146518;RO=113;SAF=32;SAR=53;SRF=48;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0518304;STB=0.502268;TYPE=snp;VARB=0.0198568;OID=.;OPOS=70072423;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:208:113:115:85:93:53:32:48:65:53:40:49:66 chr8 70584628 . T C 141.5 PASS AO=44;DP=117;FAO=45;FDP=117;FR=.;FRO=72;FSAF=29;FSAR=16;FSRF=46;FSRR=26;FWDB=-0.00229861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.7866;QD=4.83776;RBI=0.0116567;REFB=-0.00541052;REVB=-0.0114278;RO=73;SAF=28;SAR=16;SRF=47;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0088686;STB=0.50372;TYPE=snp;VARB=0.0222414;OID=.;OPOS=70584628;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:73:72:44:45:16:28:47:26:16:29:46:26 chr8 70602299 . A G 377.47 PASS AO=42;DP=50;FAO=50;FDP=58;FR=.;FRO=8;FSAF=34;FSAR=16;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.00793462;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.385;QD=26.0326;RBI=0.0339659;REFB=-0.0215867;REVB=0.0330261;RO=7;SAF=32;SAR=10;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114155;STB=0.527939;TYPE=snp;VARB=0.00594948;OID=.;OPOS=70602299;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:50:58:7:8:42:50:10:32:3:4:16:34:4:4 chr8 70602341 . A G 2720.94 PASS AO=297;DP=313;FAO=298;FDP=306;FR=.;FRO=8;FSAF=212;FSAR=86;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0174928;FXX=0.0254769;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.537;QD=35.5678;RBI=0.0208337;REFB=-0.0327992;REVB=0.0113157;RO=8;SAF=211;SAR=86;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00517772;STB=0.502744;TYPE=snp;VARB=0.000438099;OID=.;OPOS=70602341;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:313:306:8:8:297:298:86:211:5:3:86:212:5:3 chr8 70602526 . A G 48.06 PASS AO=20;DP=73;FAO=20;FDP=70;FR=.;FRO=50;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=-0.00509026;FXX=0.0410903;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8409;QD=2.74641;RBI=0.0119952;REFB=-0.00906892;REVB=-0.0108616;RO=45;SAF=5;SAR=15;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.346592;STB=0.692105;TYPE=snp;VARB=0.0233285;OID=.;OPOS=70602526;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:73:70:45:50:20:20:15:5:24:21:15:5:25:25 chr8 70602529 . A G 28.45 PASS AO=15;DP=64;FAO=15;FDP=64;FR=.;FRO=49;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=0.0230161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.422;QD=1.77835;RBI=0.0236005;REFB=0.000734272;REVB=-0.0052196;RO=45;SAF=7;SAR=8;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0539682;STB=0.517722;TYPE=snp;VARB=-0.00309857;OID=.;OPOS=70602529;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:64:64:45:49:15:15:8:7:23:22:8:7:24:25 chr8 70602538 . T A 32.61 PASS AO=13;DP=50;FAO=13;FDP=48;FR=.;FRO=35;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.000961586;FXX=0.039992;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.294;QD=2.7179;RBI=0.0256358;REFB=-0.0167353;REVB=-0.0256178;RO=34;SAF=8;SAR=5;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237704;STB=0.634715;TYPE=snp;VARB=0.0486751;OID=.;OPOS=70602538;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:50:48:34:35:13:13:5:8:14:20:5:8:15:20 chr8 70612637 . C A 174.53 PASS AO=49;DP=117;FAO=49;FDP=117;FR=.;FRO=68;FSAF=12;FSAR=37;FSRF=13;FSRR=55;FWDB=-0.00616882;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.202;QD=5.96701;RBI=0.00656057;REFB=-0.00197377;REVB=-0.0022331;RO=66;SAF=12;SAR=37;SRF=12;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0923307;STB=0.544093;TYPE=snp;VARB=0.00203526;OID=.;OPOS=70612637;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:66:68:49:49:37:12:12:54:37:12:13:55 chr8 70612692 . G A 73.09 PASS AO=23;DP=66;FAO=24;FDP=67;FR=.;FRO=43;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=35;FWDB=0.0219728;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.3474;QD=4.36333;RBI=0.0467946;REFB=0.0110667;REVB=0.041315;RO=43;SAF=9;SAR=14;SRF=8;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.261925;STB=0.638198;TYPE=snp;VARB=-0.0275405;OID=.;OPOS=70612692;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:66:67:43:43:23:24:14:9:8:35:15:9:8:35 chr8 70964399 . A G 256.65 PASS AO=54;DP=108;FAO=58;FDP=113;FR=.;FRO=55;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=36;FSRR=19;FWDB=-0.00633125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.975;QD=9.08486;RBI=0.0244474;REFB=-0.00701684;REVB=-0.0236133;RO=54;SAF=24;SAR=30;SRF=36;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198946;STB=0.599362;TYPE=snp;VARB=0.00648062;OID=.;OPOS=70964399;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:113:54:55:54:58:30:24:36:18:32:26:36:19 chr8 70967607 . T C 194.22 PASS AO=44;DP=90;FAO=45;FDP=92;FR=.;FRO=47;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=16;FSRR=31;FWDB=0.0766028;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.8697;QD=8.44413;RBI=0.0808381;REFB=-0.0198731;REVB=-0.0258228;RO=46;SAF=22;SAR=22;SRF=16;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140306;STB=0.586867;TYPE=snp;VARB=0.0212324;OID=.;OPOS=70967607;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:92:46:47:44:45:22:22:16:30:22:23:16:31 chr8 71486568 . G C 92.66 PASS AO=22;DP=51;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.00237743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.752;QD=7.12767;RBI=0.0344264;REFB=0.00373555;REVB=0.0343442;RO=29;SAF=8;SAR=14;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0883814;STB=0.55945;TYPE=snp;VARB=-0.00214385;OID=.;OPOS=71486568;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:51:52:29:29:22:23:14:8:13:16:15:8:13:16 chr8 71573033 . C T 21.46 PASS AO=3;DP=13;FAO=3;FDP=12;FR=.,HEALED;FRO=7;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.7832;QD=7.15437;RBI=0.00171699;REFB=0.00985787;REVB=-0.00171699;RO=6;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00292978;OID=.;OPOS=71573033;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:12:12:6:7:3:3:3:0:0:6:3:0:0:7 chr8 71573094 . C T 14.36 PASS AO=4;DP=16;FAO=4;FDP=16;FR=.;FRO=12;FSAF=0;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=12;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.6738;QD=3.59069;RBI=0.107799;REFB=-0.135952;REVB=-0.107799;RO=12;SAF=0;SAR=4;SRF=0;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.246192;OID=.;OPOS=71573094;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:16:16:12:12:4:4:4:0:0:12:4:0:0:12 chr8 71575184 . A G 78.39 PASS AO=20;DP=46;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=6;FWDB=-0.0335113;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=113.162;QD=6.67151;RBI=0.050676;REFB=-0.00310716;REVB=0.0380138;RO=26;SAF=11;SAR=9;SRF=20;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226935;STB=0.635639;TYPE=snp;VARB=0.0241881;OID=.;OPOS=71575184;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:46:47:26:27:20:20:9:11:20:6:9:11:21:6 chr8 72111599 . A G 68.98 PASS AO=24;DP=72;FAO=24;FDP=72;FR=.;FRO=48;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=0.098746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7989;QD=3.83245;RBI=0.108205;REFB=-0.00167927;REVB=-0.0442439;RO=38;SAF=13;SAR=11;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100217;STB=0.514007;TYPE=snp;VARB=0.0031509;OID=.;OPOS=72111599;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:72:72:38:48:24:24:11:13:17:21:11:13:27:21 chr8 72129009 . G A 342.34 PASS AO=95;DP=227;FAO=96;FDP=223;FR=.;FRO=127;FSAF=45;FSAR=51;FSRF=63;FSRR=64;FWDB=-0.0091264;FXX=0.0387914;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.2701;QD=6.14053;RBI=0.0102731;REFB=-0.0108658;REVB=-0.00471659;RO=119;SAF=44;SAR=51;SRF=57;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.015914;STB=0.515582;TYPE=snp;VARB=0.0190243;OID=.;OPOS=72129009;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:227:223:119:127:95:96:51:44:57:62:51:45:63:64 chr8 72211295 . T C 456.63 PASS AO=190;DP=509;FAO=151;FDP=393;FR=.;FRO=242;FSAF=65;FSAR=86;FSRF=150;FSRR=92;FWDB=0.0334462;FXX=0.0174996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.308;QD=4.64762;RBI=0.0355268;REFB=-0.0130241;REVB=-0.0119796;RO=316;SAF=69;SAR=121;SRF=199;SRR=117;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.291781;STB=0.615088;TYPE=snp;VARB=0.0217186;OID=.;OPOS=72211295;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:509:393:316:242:190:151:121:69:199:117:86:65:150:92 chr8 72932259 . C T 238.46 PASS AO=71;DP=177;FAO=72;FDP=180;FR=.;FRO=108;FSAF=41;FSAR=31;FSRF=47;FSRR=61;FWDB=0.0187049;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1113;QD=5.29901;RBI=0.0207373;REFB=0.0200338;REVB=-0.00895315;RO=106;SAF=41;SAR=30;SRF=46;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152452;STB=0.580285;TYPE=snp;VARB=-0.0340642;OID=.;OPOS=72932259;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:180:106:108:71:72:30:41:46:60:31:41:47:61 chr8 72935008 . C T 152.76 PASS AO=56;DP=164;FAO=56;FDP=163;FR=.;FRO=107;FSAF=33;FSAR=23;FSRF=72;FSRR=35;FWDB=0.00915573;FXX=0.00609719;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.548;QD=3.74864;RBI=0.0138967;REFB=-0.0166564;REVB=-0.0104543;RO=107;SAF=33;SAR=23;SRF=72;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101341;STB=0.557846;TYPE=snp;VARB=0.0209142;OID=.;OPOS=72935008;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:163:107:107:56:56:23:33:72:35:23:33:72:35 chr8 72935039 . C T 180.4 PASS AO=65;DP=191;FAO=66;FDP=192;FR=.;FRO=126;FSAF=38;FSAR=28;FSRF=83;FSRR=43;FWDB=-0.00817894;FXX=0.0253794;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.497;QD=3.75823;RBI=0.0151528;REFB=-0.0110118;REVB=0.0127559;RO=107;SAF=37;SAR=28;SRF=70;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0968946;STB=0.556671;TYPE=snp;VARB=0.0217665;OID=.;OPOS=72935039;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:191:192:107:126:65:66:28:37:70:37:28:38:83:43 chr8 72935045 . G C 171.31 PASS AO=67;DP=205;FAO=67;FDP=202;FR=.;FRO=135;FSAF=41;FSAR=26;FSRF=82;FSRR=53;FWDB=0.0164543;FXX=0.0146334;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5089;QD=3.39223;RBI=0.0259534;REFB=-0.000994805;REVB=0.0200708;RO=135;SAF=41;SAR=26;SRF=82;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00554117;STB=0.503184;TYPE=snp;VARB=0.00274153;OID=.;OPOS=72935045;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:202:135:135:67:67:26:41:82:53:26:41:82:53 chr8 72942210 . G T 1034.77 PASS AO=101;DP=101;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0469115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.0542;QD=38.3248;RBI=0.0573562;REFB=0;REVB=0.0330007;RO=0;SAF=43;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000602148;OID=.;OPOS=72942210;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:101:108:0:0:101:108:58:43:0:0:61:47:0:0 chr8 72948588 . C T 187.64 PASS AO=48;DP=107;FAO=48;FDP=107;FR=.;FRO=59;FSAF=32;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=33;FWDB=0.0215324;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.916;QD=7.01466;RBI=0.0319967;REFB=-0.00674272;REVB=-0.0236674;RO=59;SAF=32;SAR=16;SRF=26;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228773;STB=0.628151;TYPE=snp;VARB=0.00697895;OID=.;OPOS=72948588;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:59:59:48:48:16:32:26:33:16:32:26:33 chr8 72958799 . G A 170.56 PASS AO=35;DP=133;FAO=52;FDP=133;FR=.;FRO=81;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=38;FSRR=43;FWDB=-0.00851685;FXX=0.00746213;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.363;QD=5.12956;RBI=0.009711;REFB=-0.000384255;REVB=0.0046655;RO=55;SAF=21;SAR=14;SRF=27;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118406;STB=0.553959;TYPE=snp;VARB=0.000615307;OID=.;OPOS=72958799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:133:55:81:35:52:14:21:27:28:23:29:38:43 chr8 72963109 . G A 104.84 PASS AO=25;DP=55;FAO=26;FDP=56;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.039;QD=7.48879;RBI=0.138747;REFB=0.0169432;REVB=-0.0143817;RO=30;SAF=6;SAR=19;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.312891;STB=0.654066;TYPE=snp;VARB=-0.0119035;OID=.;OPOS=72963109;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:56:30:30:25:26:19:6:16:14:19:7:16:14 chr8 72966002 . G A 167.27 PASS AO=56;DP=152;FAO=56;FDP=153;FR=.;FRO=97;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=45;FSRR=52;FWDB=-0.0278047;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.1409;QD=4.37321;RBI=0.0351168;REFB=-0.00056753;REVB=-0.0214497;RO=96;SAF=32;SAR=24;SRF=44;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125538;STB=0.5682;TYPE=snp;VARB=-0.000514587;OID=.;OPOS=72966002;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:153:96:97:56:56:24:32:44:52:24:32:45:52 chr8 72975801 . T G 407.37 PASS AO=84;DP=152;FAO=85;FDP=152;FR=.;FRO=67;FSAF=41;FSAR=44;FSRF=17;FSRR=50;FWDB=0.0209337;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=259.294;QD=10.7202;RBI=0.0226133;REFB=-0.00104205;REVB=-0.00855228;RO=65;SAF=40;SAR=44;SRF=15;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199801;STB=0.601601;TYPE=snp;VARB=0.000919597;OID=.;OPOS=72975801;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:152:65:67:84:85:44:40:15:50:44:41:17:50 chr8 72981327 . A G 251.19 PASS AO=60;DP=131;FAO=62;FDP=132;FR=.;FRO=70;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=51;FSRR=19;FWDB=0.00497986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.662;QD=7.61175;RBI=0.00678109;REFB=0.0011495;REVB=0.00460263;RO=68;SAF=27;SAR=33;SRF=50;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.269133;STB=0.644081;TYPE=snp;VARB=-0.00157181;OID=.;OPOS=72981327;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:132:68:70:60:62:33:27:50:18:34:28:51:19 chr8 73850203 . G A 262.42 PASS AO=58;DP=113;FAO=58;FDP=112;FR=.;FRO=54;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=29;FSRR=25;FWDB=0.00159651;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.408;QD=9.37216;RBI=0.00608231;REFB=-0.0205827;REVB=0.00586904;RO=55;SAF=30;SAR=28;SRF=29;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0088704;STB=0.509559;TYPE=snp;VARB=0.0116083;OID=.;OPOS=73850203;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:112:55:54:58:58:28:30:29:26:28:30:29:25 chr8 73982160 . CA C,CG 1427.74 PASS AO=33,119;DP=165;FAO=33,123;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=11,54;FSAR=22,69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.108607,0.0636418;FXX=0.0487775;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=63.8692,76.38;QD=36.6088;RBI=0.120975,0.0824458;REFB=0,0;REVB=0.0532858,0.052412;RO=0;SAF=10,52;SAR=23,67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-6.0287e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.009119,-0.00213811;OID=.,.;OPOS=73982161,73982161;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:33,119:160:33,123:156:0:11,54:22,69:0:0:36:0:10,52:23,67:0:0 chr8 74005131 . A G 60.44 PASS AO=19;DP=54;FAO=19;FDP=54;FR=.;FRO=35;FSAF=2;FSAR=17;FSRF=4;FSRR=31;FWDB=-0.102799;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.1772;QD=4.47711;RBI=0.109269;REFB=0.0179589;REVB=-0.0370424;RO=34;SAF=2;SAR=17;SRF=3;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0523671;STB=0.515135;TYPE=snp;VARB=-0.0517734;OID=.;OPOS=74005131;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:54:54:34:35:19:19:17:2:3:31:17:2:4:31 chr8 74527996 . C T 609.02 PASS AO=64;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.232;QD=37.478;RBI=0.0155405;REFB=0;REVB=2.62444e-05;RO=1;SAF=24;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.011663;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.26387e-05;OID=.;OPOS=74527996;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:65:65:1:0:64:65:40:24:0:1:41:24:0:0 chr8 74581290 . A AG 1263.84 PASS AO=129;DP=145;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0306381;FXX=0.0684885;HRUN=0;LEN=1;MLLD=189.513;QD=37.1719;RBI=0.0308699;REFB=-0.013073;REVB=0.00377609;RO=3;SAF=65;SAR=64;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00702908;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-7.56712e-06;OID=.;OPOS=74581291;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:129:145:136:136:0:70:66:0:0:51:3:65:64:2:1 chr8 74888616 . G C 56.19 PASS AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.000664871;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.8796;QD=8.99001;RBI=0.117639;REFB=3.22319e-05;REVB=0.117637;RO=13;SAF=2;SAR=10;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.271519;STB=0.660072;TYPE=snp;VARB=0.00794938;OID=.;OPOS=74888616;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:25:25:13:13:12:12:10:2:5:8:10:2:5:8 chr8 74893821 . A G 276.83 PASS AO=82;DP=201;FAO=82;FDP=201;FR=.;FRO=119;FSAF=46;FSAR=36;FSRF=81;FSRR=38;FWDB=1.69846e-05;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=205.526;QD=5.5091;RBI=0.00481471;REFB=-0.0092143;REVB=-0.00481468;RO=118;SAF=46;SAR=36;SRF=80;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127708;STB=0.573202;TYPE=snp;VARB=0.012371;OID=.;OPOS=74893821;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:201:118:119:82:82:36:46:80:38:36:46:81:38 chr8 74893850 . C G 209.29 PASS AO=69;DP=185;FAO=69;FDP=184;FR=.;FRO=115;FSAF=46;FSAR=23;FSRF=86;FSRR=29;FWDB=-0.00969046;FXX=0.00540511;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.565;QD=4.54982;RBI=0.0217633;REFB=-0.0107725;REVB=0.0194869;RO=111;SAF=46;SAR=23;SRF=82;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0919755;STB=0.559306;TYPE=snp;VARB=0.0253491;OID=.;OPOS=74893850;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:184:111:115:69:69:23:46:82:29:23:46:86:29 chr8 74893880 . C T 179.49 PASS AO=59;DP=164;FAO=60;FDP=163;FR=.;FRO=103;FSAF=42;FSAR=18;FSRF=88;FSRR=15;FWDB=-0.0180368;FXX=0.00609719;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.099;QD=4.4047;RBI=0.0208955;REFB=-0.0127998;REVB=0.0105495;RO=100;SAF=41;SAR=18;SRF=85;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226388;STB=0.627983;TYPE=snp;VARB=0.0275205;OID=.;OPOS=74893880;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:163:100:103:59:60:18:41:85:15:18:42:88:15 chr8 74894627 . G A 62.29 PASS AO=18;DP=48;FAO=18;FDP=48;FR=.;FRO=30;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=23;FWDB=0.0171922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.26;QD=5.19058;RBI=0.0228069;REFB=-0.00267468;REVB=-0.0149861;RO=30;SAF=5;SAR=13;SRF=7;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0616006;STB=0.535676;TYPE=snp;VARB=0.00279664;OID=.;OPOS=74894627;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:48:48:30:30:18:18:13:5:7:23:13:5:7:23 chr8 74917084 . A G 2715.33 PASS AO=290;DP=294;FAO=290;FDP=290;FR=.;FRO=0;FSAF=123;FSAR=167;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0272391;FXX=0.013605;HRUN=4;LEN=1;MLLD=42.5004;QD=37.4528;RBI=0.0399745;REFB=-0.0850194;REVB=-0.0292574;RO=3;SAF=123;SAR=167;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00484321;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000934876;OID=.;OPOS=74917084;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:294:290:3:0:290:290:167:123:2:1:167:123:0:0 chr8 74960935 . G A 234.65 PASS AO=56;DP=117;FAO=56;FDP=116;FR=.;FRO=60;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=27;FSRR=33;FWDB=-0.0448165;FXX=0.00854628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.456;QD=8.09122;RBI=0.044966;REFB=-0.00542895;REVB=-0.00366453;RO=49;SAF=25;SAR=31;SRF=16;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104439;STB=0.501867;TYPE=snp;VARB=0.00471569;OID=.;OPOS=74960935;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:116:49:60:56:56:31:25:16:33:31:25:27:33 chr8 75262798 . G C 447.26 PASS AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.5787;QD=38.0646;RBI=0.055607;REFB=0;REVB=0.0545377;RO=0;SAF=13;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000657369;OID=.;OPOS=75262798;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:47:47:0:0:47:47:34:13:0:0:34:13:0:0 chr8 75274141 . T G 182.43 PASS AO=43;DP=89;FAO=43;FDP=90;FR=.;FRO=47;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=-0.0316962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.175;QD=8.10811;RBI=0.0345424;REFB=-0.0163957;REVB=0.0137307;RO=46;SAF=20;SAR=23;SRF=18;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0693437;STB=0.532067;TYPE=snp;VARB=0.0205677;OID=.;OPOS=75274141;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:90:46:47:43:43:23:20:18:28:23:20:19:28 chr8 75460784 . T TG,G 1783.24 PASS AO=144,50;DP=327;FAO=185,32;FDP=217;FR=.;FRO=0;FSAF=79,24;FSAR=106,8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0395024,0.00882275;FXX=0.0523995;HRUN=1,5;LEN=1,1;MLLD=16.3285,10.8767;QD=32.8708;RBI=0.0416378,0.0208752;REFB=0,0;REVB=-0.013163,0.0189192;RO=115;SAF=63,37;SAR=81,13;SRF=89;SRR=26;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.269983,-0.0545238;STB=0.5,0.5;TYPE=ins,snp;VARB=-0.00665983,0.0499944;OID=.,.;OPOS=75460785,75460784;OREF=-,T;OALT=G,G;OMAPALT=TG,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:11:327:217:115:0:144,50:185,32:81,13:63,37:89:26:106,8:79,24:0:0 chr8 75460789 . A AG 1242.77 PASS AO=148;DP=213;FAO=184;FDP=184;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0853442;FXX=0.0659865;HRUN=1;LEN=1;MLLD=17.9435;QD=27.0168;RBI=0.0994012;REFB=0;REVB=-0.0509605;RO=54;SAF=65;SAR=83;SRF=35;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104768;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00808165;OID=.;OPOS=75460790;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:148:213:184:184:0:92:92:0:0:99:54:65:83:35:19 chr8 76452313 . G A 1457.64 PASS AO=140;DP=143;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0488618;FXX=0.00640985;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.8367;QD=37.6165;RBI=0.127691;REFB=0;REVB=0.117973;RO=0;SAF=86;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00139379;OID=.;OPOS=76452313;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:143:155:0:0:140:155:54:86:0:0:67:88:0:0 chr8 76468282 . G A 3692.21 PASS AO=420;DP=439;FAO=386;FDP=386;FR=.;FRO=0;FSAF=238;FSAR=148;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0838352;FXX=0.0349991;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0984;QD=38.2612;RBI=0.0912291;REFB=-0.0180205;REVB=0.0359779;RO=3;SAF=259;SAR=161;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00880936;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000143277;OID=.;OPOS=76468282;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:439:386:3:0:420:386:161:259:0:3:148:238:0:0 chr8 77048621 . C A 384.99 PASS AO=74;DP=130;FAO=77;FDP=133;FR=.;FRO=56;FSAF=34;FSAR=43;FSRF=28;FSRR=28;FWDB=0.01634;FXX=0.0148137;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.317;QD=11.5786;RBI=0.0210109;REFB=-0.0202605;REVB=-0.0132085;RO=56;SAF=33;SAR=41;SRF=28;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0429661;STB=0.524797;TYPE=snp;VARB=0.0138958;OID=.;OPOS=77048621;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:133:56:56:74:77:41:33:28:28:43:34:28:28 chr8 77690563 . T C 2226.82 PASS AO=234;DP=235;FAO=234;FDP=234;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=130;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00453111;FXX=0.00847422;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.303;QD=38.0653;RBI=0.0141462;REFB=-0.0695767;REVB=0.0134009;RO=1;SAF=104;SAR=130;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00365196;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000136402;OID=.;OPOS=77690563;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:97:235:234:1:0:234:234:130:104:0:1:130:104:0:0 chr8 77745635 . G A 397.53 PASS AO=91;DP=177;FAO=91;FDP=180;FR=.;FRO=89;FSAF=28;FSAR=63;FSRF=43;FSRR=46;FWDB=-0.0324555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.459;QD=8.83392;RBI=0.0339154;REFB=-0.00591553;REVB=-0.00984383;RO=86;SAF=29;SAR=62;SRF=40;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140504;STB=0.594397;TYPE=snp;VARB=0.00427477;OID=.;OPOS=77745635;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:180:86:89:91:91:62:29:40:46:63:28:43:46 chr8 77763248 . G T 780.73 PASS AO=255;DP=529;FAO=192;FDP=397;FR=.;FRO=205;FSAF=9;FSAR=183;FSRF=20;FSRR=185;FWDB=-0.0277768;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.68;QD=7.86625;RBI=0.0286597;REFB=0.00590515;REVB=0.00705924;RO=268;SAF=17;SAR=238;SRF=25;SRR=243;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0906185;STB=0.615718;TYPE=snp;VARB=-0.00545455;OID=.;OPOS=77763248;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:529:397:268:205:255:192:238:17:25:243:183:9:20:185 chr8 77764594 . CA C 39.96 PASS AO=21;DP=41;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=16;FWDB=-0.148012;FXX=0.0487686;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.8664;QD=4.09845;RBI=0.154219;REFB=-0.118483;REVB=-0.0433133;RO=18;SAF=7;SAR=14;SRF=3;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165308;STB=0.572298;TYPE=del;VARB=0.102523;OID=.;OPOS=77764595;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:21:41:19:39:20:6:13:4:16:39:18:7:14:3:15 chr8 77765865 . C T 435.67 PASS AO=99;DP=193;FAO=99;FDP=193;FR=.;FRO=94;FSAF=39;FSAR=60;FSRF=38;FSRR=56;FWDB=-0.000364984;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=265.468;QD=9.02937;RBI=0.00606448;REFB=-0.0290599;REVB=0.00605349;RO=94;SAF=39;SAR=60;SRF=38;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00956956;STB=0.505248;TYPE=snp;VARB=0.0272929;OID=.;OPOS=77765865;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:193:94:94:99:99:60:39:38:56:60:39:38:56 chr8 77777735 . C G 152.68 PASS AO=49;DP=143;FAO=49;FDP=133;FR=.;FRO=84;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=52;FSRR=32;FWDB=-0.00314705;FXX=0.0699252;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.019;QD=4.59193;RBI=0.0284175;REFB=0.000746439;REVB=-0.0282427;RO=60;SAF=20;SAR=29;SRF=37;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20388;STB=0.631145;TYPE=snp;VARB=-0.00194133;OID=.;OPOS=77777735;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:133:60:84:49:49:29:20:37:23:29:20:52:32 chr8 77895865 . A G 1206.84 PASS AO=125;DP=126;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0334709;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.152;QD=38.3123;RBI=0.0345177;REFB=0;REVB=0.00843621;RO=0;SAF=50;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.18642e-05;OID=.;OPOS=77895865;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:126:126:0:0:125:126:75:50:0:0:76:50:0:0 chr8 77912230 . G T 279.75 PASS AO=53;DP=90;FAO=53;FDP=90;FR=.;FRO=37;FSAF=23;FSAR=30;FSRF=12;FSRR=25;FWDB=0.0159468;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.112;QD=12.4335;RBI=0.0159698;REFB=-0.05043;REVB=0.000855203;RO=37;SAF=23;SAR=30;SRF=12;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0851602;STB=0.546419;TYPE=snp;VARB=0.0329265;OID=.;OPOS=77912230;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:37:37:53:53:30:23:12:25:30:23:12:25 chr8 79609647 . G A 158.73 PASS AO=40;DP=90;FAO=40;FDP=89;FR=.;FRO=49;FSAF=27;FSAR=13;FSRF=33;FSRR=16;FWDB=0.0146977;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.317;QD=7.13403;RBI=0.0165874;REFB=-0.0155683;REVB=0.00768902;RO=48;SAF=27;SAR=13;SRF=32;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00921116;STB=0.500959;TYPE=snp;VARB=0.0155956;OID=.;OPOS=79609647;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:89:48:49:40:40:13:27:32:16:13:27:33:16 chr8 79610710 . A G 170.45 PASS AO=48;DP=115;FAO=48;FDP=115;FR=.;FRO=67;FSAF=16;FSAR=32;FSRF=33;FSRR=34;FWDB=-0.0121098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.27;QD=5.92882;RBI=0.0177078;REFB=-0.0185063;REVB=-0.0129197;RO=65;SAF=16;SAR=32;SRF=33;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186159;STB=0.597519;TYPE=snp;VARB=0.0221456;OID=.;OPOS=79610710;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:65:67:48:48:32:16:33:32:32:16:33:34 chr8 79624242 . GC G 1541.26 PASS AO=213;DP=265;FAO=262;FDP=262;FR=.;FRO=0;FSAF=113;FSAR=149;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.248648;FXX=0.00380214;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.5611;QD=23.5307;RBI=0.316584;REFB=0.0432132;REVB=0.195958;RO=23;SAF=93;SAR=120;SRF=5;SRR=18;SSEN=0.310078;SSEP=0;SSSB=0.0414393;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00901263;OID=.;OPOS=79624243;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:213:262:262:262:0:113:149:0:0:99:23:93:120:5:18 chr8 81116920 . G C 1629.86 PASS AO=169;DP=169;FAO=169;FDP=169;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0083221;FXX=0.00588201;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.3652;QD=38.5766;RBI=0.0501319;REFB=0;REVB=0.0494363;RO=0;SAF=72;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000144381;OID=.;OPOS=81116920;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:169:169:0:0:169:169:97:72:0:0:97:72:0:0 chr8 81884480 . G C 158.73 PASS AO=36;DP=81;FAO=39;FDP=83;FR=.;FRO=44;FSAF=11;FSAR=28;FSRF=17;FSRR=27;FWDB=0.00808965;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.761;QD=7.64955;RBI=0.0418585;REFB=-0.0260669;REVB=0.0410693;RO=44;SAF=9;SAR=27;SRF=17;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160714;STB=0.5644;TYPE=snp;VARB=0.035561;OID=.;OPOS=81884480;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:83:44:44:36:39:27:9:17:27:28:11:17:27 chr8 82606782 . A G 301.81 PASS AO=83;DP=190;FAO=83;FDP=190;FR=.;FRO=107;FSAF=41;FSAR=42;FSRF=52;FSRR=55;FWDB=0.0163625;FXX=0.0155432;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.876;QD=6.35394;RBI=0.0174113;REFB=-0.0132135;REVB=-0.00595158;RO=105;SAF=41;SAR=42;SRF=51;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0082951;STB=0.504502;TYPE=snp;VARB=0.0263875;OID=.;OPOS=82606782;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:190:105:107:83:83:42:41:51:54:42:41:52:55 chr8 82607752 . G C 467.19 PASS AO=87;DP=142;FAO=87;FDP=142;FR=.;FRO=55;FSAF=45;FSAR=42;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=-0.041086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.1517;QD=13.1604;RBI=0.0411631;REFB=-0.0270647;REVB=0.00251782;RO=54;SAF=45;SAR=42;SRF=29;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140248;STB=0.50389;TYPE=snp;VARB=0.016381;OID=.;OPOS=82607752;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:54:55:87:87:42:45:29:25:42:45:29:26 chr8 82608238 . A T 342.07 PASS AO=100;DP=241;FAO=100;FDP=241;FR=.;FRO=141;FSAF=50;FSAR=50;FSRF=52;FSRR=89;FWDB=0.0255661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.5097;QD=5.67749;RBI=0.0306786;REFB=0.00306515;REVB=0.0169572;RO=141;SAF=50;SAR=50;SRF=52;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137696;STB=0.576748;TYPE=snp;VARB=-0.00336414;OID=.;OPOS=82608238;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:241:241:141:141:100:100:50:50:52:89:50:50:52:89 chr8 82633452 . C G 39.78 PASS AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.000836616;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=200.192;QD=12.2404;RBI=0.0201395;REFB=-0.0229736;REVB=-0.0201221;RO=6;SAF=1;SAR=6;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23478;STB=0.642384;TYPE=snp;VARB=0.0182545;OID=.;OPOS=82633452;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:13:13:6:6:7:7:6:1:2:4:6:1:2:4 chr8 82670412 . G A 267.24 PASS AO=70;DP=151;FAO=69;FDP=152;FR=.;FRO=83;FSAF=41;FSAR=28;FSRF=44;FSRR=39;FWDB=0.0283974;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3904;QD=7.03261;RBI=0.0496336;REFB=-0.00317726;REVB=-0.0407073;RO=81;SAF=42;SAR=28;SRF=43;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0684994;STB=0.53578;TYPE=snp;VARB=0.0037151;OID=.;OPOS=82670412;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:152:81:83:70:69:28:42:43:38:28:41:44:39 chr8 82712929 . A C 295.48 PASS AO=58;DP=109;FAO=61;FDP=111;FR=.;FRO=50;FSAF=35;FSAR=26;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=0.0222547;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.533;QD=10.648;RBI=0.0223079;REFB=0.00269605;REVB=0.00153959;RO=50;SAF=32;SAR=26;SRF=22;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0941592;STB=0.560478;TYPE=snp;VARB=-0.00228963;OID=.;OPOS=82712929;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:111:50:50:58:61:26:32:22:28:26:35:22:28 chr8 82727569 . T C 84.53 PASS AO=28;DP=67;FAO=25;FDP=66;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=-0.00242082;FXX=0.0149231;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8334;QD=5.12318;RBI=0.00835358;REFB=0.00491503;REVB=-0.00799512;RO=39;SAF=13;SAR=15;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101896;STB=0.614367;TYPE=snp;VARB=-0.0102031;OID=.;OPOS=82727569;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:67:66:39:41:28:25:15:13:22:17:15:10:24:17 chr8 86057894 . GTATT G 1395.98 PASS AO=143;DP=162;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0158903;FXX=0.0925869;HRUN=1;LEN=4;MLLD=221.584;QD=37.9858;RBI=0.0427709;REFB=0;REVB=0.0397096;RO=15;SAF=76;SAR=67;SRF=12;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0486499;STB=0.5;TYPE=del;VARB=5.4933e-05;OID=.;OPOS=86057895;OREF=TATT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:143:159:147:147:0:79:68:0:0:64:15:76:67:12:3 chr8 86126827 . C CAACATT 1396.52 PASS AO=148;DP=188;FAO=159;FDP=167;FR=.;FRO=8;FSAF=72;FSAR=87;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.00929914;FXX=0.0874269;HRUN=2;LEN=6;MLLD=265.057;QD=33.4496;RBI=0.0264328;REFB=-0.0304594;REVB=0.0247431;RO=14;SAF=71;SAR=77;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0318769;STB=0.503764;TYPE=ins;VARB=0.000794499;OID=.;OPOS=86126828;OREF=-;OALT=AACATT;OMAPALT=CAACATT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:148:188:159:167:8:72:87:3:5:23:14:71:77:4:10 chr8 86351997 . G A 177.22 PASS AO=56;DP=149;FAO=57;FDP=149;FR=.;FRO=92;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=46;FSRR=46;FWDB=0.0196981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.067;QD=4.75757;RBI=0.0225155;REFB=0.00556615;REVB=0.0109056;RO=91;SAF=31;SAR=25;SRF=46;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0527464;STB=0.53812;TYPE=snp;VARB=-0.0080067;OID=.;OPOS=86351997;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:91:92:56:57:25:31:46:45:25:32:46:46 chr8 86389403 . T C 730.19 PASS AO=160;DP=296;FAO=158;FDP=294;FR=.;FRO=136;FSAF=84;FSAR=74;FSRF=62;FSRR=74;FWDB=0.017235;FXX=0.0134224;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8886;QD=9.93452;RBI=0.0320906;REFB=0.00627187;REVB=-0.0270695;RO=136;SAF=86;SAR=74;SRF=63;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0626824;STB=0.535027;TYPE=snp;VARB=-0.00786437;OID=.;OPOS=86389403;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:296:294:136:136:160:158:74:86:63:73:74:84:62:74 chr8 86747811 . G T 15.56 PASS AO=3;DP=8;FAO=3;FDP=8;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.8612;QD=7.7779;RBI=0.107786;REFB=0.0144725;REVB=0.107786;RO=5;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00306887;OID=.;OPOS=86747811;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:8:8:5:5:3:3:3:0:0:5:3:0:0:5 chr8 87076520 . C A 445.49 PASS AO=84;DP=140;FAO=84;FDP=140;FR=.;FRO=56;FSAF=43;FSAR=41;FSRF=29;FSRR=27;FWDB=0.0173157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.029;QD=12.7283;RBI=0.0204711;REFB=-0.0258748;REVB=0.0109193;RO=56;SAF=43;SAR=41;SRF=29;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00438999;STB=0.502382;TYPE=snp;VARB=0.0157721;OID=.;OPOS=87076520;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:56:56:84:84:41:43:29:27:41:43:29:27 chr8 87111252 . C T 199.63 PASS AO=50;DP=108;FAO=50;FDP=109;FR=.;FRO=59;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=36;FWDB=0.0329218;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.576;QD=7.32603;RBI=0.0331339;REFB=-0.0234611;REVB=-0.00374262;RO=58;SAF=28;SAR=22;SRF=23;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156641;STB=0.59137;TYPE=snp;VARB=0.0231313;OID=.;OPOS=87111252;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:109:58:59:50:50:22:28:23:35:22:28:23:36 chr8 87484640 . T C 162.42 PASS AO=27;DP=45;FAO=29;FDP=47;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.00367142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.408;QD=13.8227;RBI=0.00569126;REFB=-0.0295482;REVB=0.00434869;RO=17;SAF=12;SAR=15;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100692;STB=0.562183;TYPE=snp;VARB=0.0299649;OID=.;OPOS=87484640;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:45:47:17:18:27:29:15:12:10:7:16:13:11:7 chr8 87519315 . T G 452.78 PASS AO=96;DP=177;FAO=96;FDP=177;FR=.;FRO=81;FSAF=59;FSAR=37;FSRF=37;FSRR=44;FWDB=-0.0237439;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=184.133;QD=10.2324;RBI=0.024998;REFB=-0.00782683;REVB=-0.00781833;RO=80;SAF=59;SAR=37;SRF=37;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129181;STB=0.573625;TYPE=snp;VARB=0.00618676;OID=.;OPOS=87519315;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:177:80:81:96:96:37:59:37:43:37:59:37:44 chr8 87540872 . G A 360.89 PASS AO=95;DP=219;FAO=96;FDP=214;FR=.;FRO=118;FSAF=31;FSAR=65;FSRF=29;FSRR=89;FWDB=-0.00318247;FXX=0.053095;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.887;QD=6.74558;RBI=0.011534;REFB=0.000249142;REVB=-0.0110863;RO=105;SAF=30;SAR=65;SRF=23;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111857;STB=0.55037;TYPE=snp;VARB=-0.000504471;OID=.;OPOS=87540872;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:219:214:105:118:95:96:65:30:23:82:65:31:29:89 chr8 87679303 . A C 2192.66 PASS AO=245;DP=251;FAO=242;FDP=246;FR=.;FRO=4;FSAF=82;FSAR=160;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0451241;FXX=0.0199195;HRUN=4;LEN=1;MLLD=39.8868;QD=35.653;RBI=0.0671063;REFB=-0.208357;REVB=0.0496696;RO=5;SAF=85;SAR=160;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00619093;STB=0.501614;TYPE=snp;VARB=0.00608338;OID=.;OPOS=87679303;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:251:246:5:4:245:242:160:85:1:4:160:82:1:3 chr8 88622043 . T G 170.25 PASS AO=53;DP=137;FAO=53;FDP=137;FR=.;FRO=84;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=36;FSRR=48;FWDB=-0.00929726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.765;QD=4.97085;RBI=0.0105383;REFB=-0.016373;REVB=0.00496159;RO=84;SAF=29;SAR=24;SRF=36;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12787;STB=0.572341;TYPE=snp;VARB=0.0348156;OID=.;OPOS=88622043;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:84:84:53:53:24:29:36:48:24:29:36:48 chr8 88886280 . A T 215.26 PASS AO=53;DP=110;FAO=53;FDP=113;FR=.;FRO=60;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=24;FSRR=36;FWDB=0.0481489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.9627;QD=7.61968;RBI=0.0483819;REFB=-0.0196015;REVB=-0.00474205;RO=56;SAF=22;SAR=31;SRF=24;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0128259;STB=0.508273;TYPE=snp;VARB=0.0248711;OID=.;OPOS=88886280;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:113:56:60:53:53:31:22:24:32:31:22:24:36 chr8 89081734 . T TA 207.41 PASS AO=93;DP=226;FAO=95;FDP=217;FR=.;FRO=122;FSAF=18;FSAR=77;FSRF=26;FSRR=96;FWDB=0.0263342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=25.9678;QD=3.82318;RBI=0.0270426;REFB=0.00964235;REVB=-0.00614925;RO=132;SAF=17;SAR=76;SRF=32;SRR=100;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0967889;STB=0.521066;TYPE=ins;VARB=-0.0211874;OID=.;OPOS=89081735;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:93:226:95:217:122:18:77:26:96:99:132:17:76:32:100 chr8 89340162 . G C 102.29 PASS AO=17;DP=27;FAO=17;FDP=27;FR=.;FRO=10;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.00181454;FXX=0.128991;HRUN=3;LEN=1;MLLD=162.572;QD=15.1542;RBI=0.00834079;REFB=-0.0297002;REVB=-0.00814102;RO=9;SAF=14;SAR=3;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0470477;STB=0.571338;TYPE=snp;VARB=0.0178512;OID=.;OPOS=89340162;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:27:27:9:10:17:17:3:14:7:2:3:14:7:3 chr8 90996804 . AG A 122.73 PASS AO=19;DP=23;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0987501;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.1727;QD=23.3776;RBI=0.143285;REFB=-0.100508;REVB=-0.103822;RO=2;SAF=5;SAR=14;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0.444606;SSSB=-0.0518128;STB=0.555497;TYPE=del;VARB=0.0187393;OID=.;OPOS=90996805;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:19:22:20:21:1:4:16:1:0:7:2:5:14:1:1 chr8 92021036 . C T 769.84 PASS AO=80;DP=87;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00160601;FXX=0.0908988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.3087;QD=38.4918;RBI=0.0137593;REFB=0;REVB=0.0136653;RO=0;SAF=38;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.26068e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000161516;OID=.;OPOS=92021036;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:87:80:0:0:80:80:42:38:0:0:42:38:0:0 chr8 92083424 . A G 871.79 PASS AO=98;DP=103;FAO=98;FDP=102;FR=.;FRO=4;FSAF=42;FSAR=56;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0415883;FXX=0.0192289;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.7507;QD=34.1876;RBI=0.0415895;REFB=-0.0480319;REVB=0.000314201;RO=3;SAF=42;SAR=56;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00547858;STB=0.502857;TYPE=snp;VARB=0.00197701;OID=.;OPOS=92083424;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:103:102:3:4:98:98:56:42:1:2:56:42:2:2 chr8 92136728 . C T 1346.01 PASS AO=141;DP=141;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00689326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.104;QD=38.1846;RBI=0.00697299;REFB=0;REVB=0.00105146;RO=0;SAF=67;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.93749e-06;OID=.;OPOS=92136728;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:141:141:0:0:141:141:74:67:0:0:74:67:0:0 chr8 92971404 . GT G 28.46 PASS AO=14;DP=84;FAO=19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.0600432;FXX=0.13557;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.5094;QD=2.23218;RBI=0.133108;REFB=-0.0335538;REVB=-0.118796;RO=28;SAF=9;SAR=5;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124419;STB=0.602537;TYPE=del;VARB=-0.0384482;OID=.;OPOS=92971405;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:14:54:19:51:32:13:6:17:15:28:28:9:5:15:13 chr8 94738629 . G A 340.27 PASS AO=84;DP=171;FAO=83;FDP=170;FR=.;FRO=87;FSAF=41;FSAR=42;FSRF=39;FSRR=48;FWDB=0.0209749;FXX=0.01734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.9564;QD=8.00632;RBI=0.0325118;REFB=-0.0232179;REVB=0.0248409;RO=86;SAF=41;SAR=43;SRF=38;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0425439;STB=0.523399;TYPE=snp;VARB=0.0477096;OID=.;OPOS=94738629;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:170:86:87:84:83:43:41:38:48:42:41:39:48 chr8 94794620 . C T 196.01 PASS AO=49;DP=107;FAO=49;FDP=106;FR=.;FRO=57;FSAF=33;FSAR=16;FSRF=40;FSRR=17;FWDB=0.00711778;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.036;QD=7.39657;RBI=0.0287061;REFB=-0.0280915;REVB=0.0278097;RO=56;SAF=33;SAR=16;SRF=39;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.025263;STB=0.517494;TYPE=snp;VARB=0.0355265;OID=.;OPOS=94794620;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:106:56:57:49:49:16:33:39:17:16:33:40:17 chr8 94808165 . A G 200.88 PASS AO=66;DP=179;FAO=66;FDP=176;FR=.;FRO=110;FSAF=21;FSAR=45;FSRF=67;FSRR=43;FWDB=0.00932996;FXX=0.0112353;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.0001;QD=4.5654;RBI=0.0190022;REFB=-0.0118673;REVB=-0.0165541;RO=108;SAF=21;SAR=45;SRF=66;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.321169;STB=0.681763;TYPE=snp;VARB=0.0206493;OID=.;OPOS=94808165;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:176:108:110:66:66:45:21:66:42:45:21:67:43 chr8 94935937 . T C 167.46 PASS AO=47;DP=114;FAO=47;FDP=113;FR=.;FRO=66;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=48;FWDB=-0.00616994;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.9807;QD=5.92779;RBI=0.0646267;REFB=0.00151749;REVB=0.0643315;RO=65;SAF=24;SAR=23;SRF=17;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.257625;STB=0.638148;TYPE=snp;VARB=-0.000739854;OID=.;OPOS=94935937;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:113:65:66:47:47:23:24:17:48:23:24:18:48 chr8 94936532 . G C 393.36 PASS AO=83;DP=154;FAO=83;FDP=152;FR=.;FRO=69;FSAF=31;FSAR=52;FSRF=28;FSRR=41;FWDB=-0.00130341;FXX=0.0193536;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.616;QD=10.3515;RBI=0.00962604;REFB=-0.00589375;REVB=-0.00953739;RO=69;SAF=31;SAR=52;SRF=28;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0284231;STB=0.51554;TYPE=snp;VARB=0.00525938;OID=.;OPOS=94936532;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:152:69:69:83:83:52:31:28:41:52:31:28:41 chr8 95142963 . T C 121.75 PASS AO=34;DP=86;FAO=35;FDP=87;FR=.;FRO=52;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=30;FSRR=22;FWDB=-0.00320288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.119;QD=5.59782;RBI=0.0121243;REFB=-0.00742236;REVB=0.0116936;RO=52;SAF=12;SAR=22;SRF=30;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.239306;STB=0.641353;TYPE=snp;VARB=0.0125855;OID=.;OPOS=95142963;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:87:52:52:34:35:22:12:30:22:23:12:30:22 chr8 95143172 . T G 129.83 PASS AO=27;DP=56;FAO=27;FDP=54;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.0246968;FXX=0.114735;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.558;QD=9.61693;RBI=0.02493;REFB=0.0059092;REVB=-0.00340203;RO=26;SAF=14;SAR=13;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0162503;STB=0.518505;TYPE=snp;VARB=-0.0027403;OID=.;OPOS=95143172;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:54:26:27:27:27:13:14:13:13:13:14:13:14 chr8 95143186 . C G 533.62 PASS AO=59;DP=61;FAO=59;FDP=61;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0193194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.605;QD=34.9912;RBI=0.0193905;REFB=-0.13915;REVB=-0.00165839;RO=0;SAF=27;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.96591e-08;STB=0.515146;TYPE=snp;VARB=0.00155001;OID=.;OPOS=95143186;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:61:61:0:2:59:59:32:27:0:0:32:27:0:2 chr8 95158382 . C T 244.2 PASS AO=68;DP=160;FAO=68;FDP=160;FR=.;FRO=92;FSAF=23;FSAR=45;FSRF=33;FSRR=59;FWDB=-0.0126448;FXX=0.00621079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.975;QD=6.10508;RBI=0.0146952;REFB=0.0072679;REVB=0.00748717;RO=89;SAF=22;SAR=46;SRF=32;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0410274;STB=0.513025;TYPE=snp;VARB=-0.010029;OID=.;OPOS=95158382;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:160:89:92:68:68:46:22:32:57:45:23:33:59 chr8 95188850 . T C 3183.98 PASS AO=346;DP=356;FAO=346;FDP=346;FR=.;FRO=0;FSAF=144;FSAR=202;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000577641;FXX=0.0280891;HRUN=4;LEN=1;MLLD=199.973;QD=36.809;RBI=0.0119387;REFB=0.0101375;REVB=-0.0119247;RO=6;SAF=144;SAR=202;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00836583;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.35222e-06;OID=.;OPOS=95188850;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:356:346:6:0:346:346:202:144:4:2:202:144:0:0 chr8 95272605 . G C 110.95 PASS AO=26;DP=55;FAO=26;FDP=55;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.0230666;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.9767;QD=8.06915;RBI=0.0230763;REFB=-0.0195586;REVB=0.000669954;RO=29;SAF=9;SAR=17;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197452;STB=0.611423;TYPE=snp;VARB=0.021483;OID=.;OPOS=95272605;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:29:29:26:26:17:9:16:13:17:9:16:13 chr8 95419698 . A G 441.93 PASS AO=118;DP=268;FAO=118;FDP=263;FR=.;FRO=145;FSAF=65;FSAR=53;FSRF=77;FSRR=68;FWDB=-0.00352767;FXX=0.018656;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.898;QD=6.72137;RBI=0.0320113;REFB=-0.0072742;REVB=-0.0318163;RO=138;SAF=65;SAR=53;SRF=72;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0285842;STB=0.511011;TYPE=snp;VARB=0.00762134;OID=.;OPOS=95419698;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:268:263:138:145:118:118:53:65:72:66:53:65:77:68 chr8 95541302 . A G 142.37 PASS AO=37;DP=85;FAO=37;FDP=84;FR=.;FRO=47;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=0.0143413;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.4646;QD=6.77953;RBI=0.0235045;REFB=-0.0206075;REVB=0.0186222;RO=46;SAF=19;SAR=18;SRF=26;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0511396;STB=0.534175;TYPE=snp;VARB=0.0280047;OID=.;OPOS=95541302;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:84:46:47:37:37:18:19:26:20:18:19:27:20 chr8 95541371 . T A 181.33 PASS AO=52;DP=126;FAO=52;FDP=126;FR=.;FRO=74;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=55;FSRR=19;FWDB=-0.00778877;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.802;QD=5.7564;RBI=0.0108242;REFB=-0.0212107;REVB=0.00751647;RO=71;SAF=30;SAR=22;SRF=53;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185658;STB=0.603189;TYPE=snp;VARB=0.0316397;OID=.;OPOS=95541371;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:71:74:52:52:22:30:53:18:22:30:55:19 chr8 95559092 . T C 241.28 PASS AO=63;DP=141;FAO=63;FDP=141;FR=.;FRO=78;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=38;FSRR=40;FWDB=-0.0147179;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.248;QD=6.84476;RBI=0.0205816;REFB=-0.0275048;REVB=-0.014387;RO=78;SAF=30;SAR=33;SRF=38;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0109251;STB=0.506087;TYPE=snp;VARB=0.0328438;OID=.;OPOS=95559092;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:78:78:63:63:33:30:38:40:33:30:38:40 chr8 95680229 . C T 443.12 PASS AO=85;DP=223;FAO=109;FDP=224;FR=.;FRO=115;FSAF=51;FSAR=58;FSRF=60;FSRR=55;FWDB=-0.0709038;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.3982;QD=7.91291;RBI=0.0743467;REFB=-0.032063;REVB=-0.0223625;RO=85;SAF=27;SAR=58;SRF=37;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117145;STB=0.527657;TYPE=snp;VARB=0.0373577;OID=.;OPOS=95680229;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:200:224:85:115:85:109:58:27:37:48:58:51:60:55 chr8 95690579 . T C 2226.49 PASS AO=238;DP=241;FAO=238;FDP=238;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=162;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0449253;FXX=0.0124476;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.7572;QD=37.4199;RBI=0.0716717;REFB=-0.0686742;REVB=-0.055844;RO=3;SAF=76;SAR=162;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000382067;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000409555;OID=.;OPOS=95690579;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:82:241:238:3:0:238:238:162:76:1:2:162:76:0:0 chr8 95719387 . A T 331.87 PASS AO=96;DP=233;FAO=96;FDP=230;FR=.;FRO=134;FSAF=55;FSAR=41;FSRF=63;FSRR=71;FWDB=-0.0162887;FXX=0.0170933;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.572;QD=5.77164;RBI=0.0227096;REFB=-0.0240095;REVB=-0.0158242;RO=125;SAF=55;SAR=41;SRF=55;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134991;STB=0.560089;TYPE=snp;VARB=0.0360317;OID=.;OPOS=95719387;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:233:230:125:134:96:96:41:55:55:70:41:55:63:71 chr8 95877787 . T C 2488.41 PASS AO=265;DP=273;FAO=267;FDP=267;FR=.;FRO=0;FSAF=124;FSAR=143;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0215034;FXX=0.0255465;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.208;QD=37.2796;RBI=0.0442103;REFB=-0.137562;REVB=0.0386284;RO=0;SAF=123;SAR=142;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00029922;OID=.;OPOS=95877787;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:273:267:0:0:265:267:142:123:0:0:143:124:0:0 chr8 95878574 . G A 85.74 PASS AO=17;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=-0.0416947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.119;QD=10.7177;RBI=0.0498717;REFB=-0.0403984;REVB=-0.0273631;RO=15;SAF=3;SAR=14;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116477;STB=0.56639;TYPE=snp;VARB=0.0372694;OID=.;OPOS=95878574;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:32:32:15:15:17:17:14:3:4:11:14:3:4:11 chr8 95888307 . C T 198.25 PASS AO=62;DP=162;FAO=62;FDP=160;FR=.;FRO=98;FSAF=39;FSAR=23;FSRF=52;FSRR=46;FWDB=-0.00300583;FXX=0.0123449;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.3011;QD=4.95617;RBI=0.0340497;REFB=-0.00127797;REVB=0.0339168;RO=97;SAF=39;SAR=23;SRF=51;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115227;STB=0.56248;TYPE=snp;VARB=0.00155865;OID=.;OPOS=95888307;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:160:97:98:62:62:23:39:51:46:23:39:52:46 chr8 95918288 . C T 173.08 PASS AO=46;DP=107;FAO=46;FDP=106;FR=.;FRO=60;FSAF=15;FSAR=31;FSRF=21;FSRR=39;FWDB=-0.0381772;FXX=0.0275204;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.842;QD=6.53142;RBI=0.0381869;REFB=-0.0114195;REVB=0.000859887;RO=57;SAF=15;SAR=31;SRF=20;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0275553;STB=0.515229;TYPE=snp;VARB=0.015607;OID=.;OPOS=95918288;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:106:57:60:46:46:31:15:20:37:31:15:21:39 chr8 95938422 . C A 320.22 PASS AO=80;DP=171;FAO=80;FDP=171;FR=.;FRO=91;FSAF=42;FSAR=38;FSRF=30;FSRR=61;FWDB=0.00857054;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=257.913;QD=7.49043;RBI=0.0139999;REFB=-0.00541595;REVB=0.0110699;RO=91;SAF=42;SAR=38;SRF=30;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186855;STB=0.603108;TYPE=snp;VARB=0.00622126;OID=.;OPOS=95938422;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:171:91:91:80:80:38:42:30:61:38:42:30:61 chr8 95938660 . A C 18.08 PASS AO=4;DP=7;FAO=3;FDP=6;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0865139;FXX=0.142653;HRUN=14;LEN=1;MLLD=239.633;QD=12.0523;RBI=0.0869652;REFB=0.0145349;REVB=0.00884752;RO=0;SAF=1;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.86674e-08;STB=0.713247;TYPE=snp;VARB=-0.0126514;OID=.;OPOS=95938660;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:7:6:0:3:4:3:3:1:0:0:2:1:0:3 chr8 95942244 . G A 376.29 PASS AO=86;DP=170;FAO=86;FDP=170;FR=.;FRO=84;FSAF=47;FSAR=39;FSRF=41;FSRR=43;FWDB=-0.0029717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.2195;QD=8.85394;RBI=0.00878222;REFB=-0.02022;REVB=0.00826416;RO=84;SAF=47;SAR=39;SRF=41;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0526748;STB=0.528953;TYPE=snp;VARB=0.0177966;OID=.;OPOS=95942244;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:170:84:84:86:86:39:47:41:43:39:47:41:43 chr8 95951916 . GTGAC G 217.23 PASS AO=45;DP=99;FAO=48;FDP=94;FR=.;FRO=46;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=40;FSRR=6;FWDB=-0.0111539;FXX=0.0408122;HRUN=1;LEN=4;MLLD=248.69;QD=9.24384;RBI=0.0113079;REFB=-0.010833;REVB=-0.00185974;RO=43;SAF=26;SAR=19;SRF=38;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.294835;STB=0.665995;TYPE=del;VARB=0.0143084;OID=.;OPOS=95951917;OREF=TGAC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:45:95:48:94:46:26:22:40:6:99:43:26:19:38:5 chr8 96053782 . GCT G 1811.72 PASS AO=181;DP=213;FAO=188;FDP=188;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00161738;FXX=0.104757;HRUN=1;LEN=2;MLLD=200.363;QD=38.5472;RBI=0.0132833;REFB=0;REVB=-0.0131844;RO=0;SAF=97;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.1888e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.000362208;OID=.;OPOS=96053783;OREF=CT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:181:207:188:188:0:101:87:0:0:86:0:97:84:0:0 chr8 97343326 . ATCTTGT A 692.29 PASS AO=88;DP=131;FAO=91;FDP=105;FR=.;FRO=14;FSAF=26;FSAR=65;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0483047;FXX=0.0707902;HRUN=1;LEN=6;MLLD=255.703;QD=26.3731;RBI=0.0500485;REFB=-0.0227447;REVB=0.013096;RO=0;SAF=25;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.522871;TYPE=del;VARB=0.0036338;OID=.;OPOS=97343327;OREF=TCTTGT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:88:96:91:105:14:26:65:6:8:8:0:25:63:0:0 chr8 97384408 . C T 1348.97 PASS AO=139;DP=139;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00861476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.321;QD=38.542;RBI=0.0627468;REFB=0;REVB=-0.0621526;RO=0;SAF=97;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.58509e-05;OID=.;OPOS=97384408;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:139:140:0:0:139:140:42:97:0:0:43:97:0:0 chr8 97614625 . G A 197.39 PASS AO=38;DP=87;FAO=47;FDP=98;FR=.;FRO=51;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=18;FSRR=33;FWDB=0.0335039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.692;QD=8.05661;RBI=0.0664031;REFB=-0.0558916;REVB=0.0573311;RO=48;SAF=22;SAR=16;SRF=18;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200658;STB=0.560607;TYPE=snp;VARB=0.038381;OID=.;OPOS=97614625;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:98:48:51:38:47:16:22:18:30:25:22:18:33 chr8 97847358 . G T 345.63 PASS AO=96;DP=214;FAO=96;FDP=221;FR=.;FRO=125;FSAF=36;FSAR=60;FSRF=38;FSRR=87;FWDB=0.0180478;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=44.3186;QD=6.25582;RBI=0.0195047;REFB=-0.00266283;REVB=0.00739681;RO=118;SAF=35;SAR=61;SRF=34;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0843219;STB=0.543764;TYPE=snp;VARB=0.000595585;OID=.;OPOS=97847358;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:221:118:125:96:96:61:35:34:84:60:36:38:87 chr8 98289986 . C T 459.16 PASS AO=45;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122426;FXX=0.020404;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.591;QD=38.2635;RBI=0.0377772;REFB=0;REVB=0.0357384;RO=0;SAF=24;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.55325e-05;OID=.;OPOS=98289986;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:47:48:0:0:45:48:21:24:0:0:24:24:0:0 chr8 98787994 . A G 231.76 PASS AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0390814;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.403;QD=37.0816;RBI=0.0444032;REFB=0;REVB=0.0210783;RO=0;SAF=2;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.34264e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000454529;OID=.;OPOS=98787994;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:25:25:0:0:25:25:23:2:0:0:23:2:0:0 chr8 98788033 . G C 125.83 PASS AO=13;DP=13;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.0859;QD=35.9521;RBI=0.0632736;REFB=0;REVB=0.0632736;RO=0;SAF=0;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00271514;OID=.;OPOS=98788033;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:14:0:0:13:14:13:0:0:0:14:0:0:0 chr8 98827531 . G A 37.8 PASS AO=12;DP=52;FAO=16;FDP=56;FR=.;FRO=40;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=25;FWDB=0.0132162;FXX=0.0344768;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.577;QD=2.70018;RBI=0.0202971;REFB=-0.0095216;REVB=0.0154047;RO=40;SAF=11;SAR=1;SRF=15;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.659535;STB=0.812109;TYPE=snp;VARB=0.0312525;OID=.;OPOS=98827531;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:52:56:40:40:12:16:1:11:15:25:3:13:15:25 chr8 98943545 . A G 568.24 PASS AO=58;DP=58;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00171292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.041;QD=38.5248;RBI=0.00819561;REFB=0;REVB=0.00801461;RO=0;SAF=14;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.59363e-05;OID=.;OPOS=98943545;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:58:59:0:0:58:59:44:14:0:0:45:14:0:0 chr8 98954012 . T C 926.04 PASS AO=99;DP=101;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0105535;FXX=0.0198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.162;QD=37.4159;RBI=0.0370766;REFB=-0.0164355;REVB=0.0355429;RO=1;SAF=55;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00854702;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.377e-05;OID=.;OPOS=98954012;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:101:99:1:0:99:99:44:55:1:0:44:55:0:0 chr8 98991221 . A G 964.61 PASS AO=107;DP=118;FAO=116;FDP=126;FR=.;FRO=10;FSAF=26;FSAR=90;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=0.014177;FXX=0.0666617;HRUN=7;LEN=1;MLLD=122.515;QD=30.6226;RBI=0.0159579;REFB=-0.0732509;REVB=0.0073257;RO=11;SAF=24;SAR=83;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108309;STB=0.502762;TYPE=snp;VARB=0.00527819;OID=.;OPOS=98991221;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:118:126:11:10:107:116:83:24:2:9:90:26:2:8 chr8 99006736 . C T 2487.55 PASS AO=257;DP=260;FAO=259;FDP=259;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=158;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0223717;FXX=0.0299614;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.403;QD=38.4177;RBI=0.0223944;REFB=0;REVB=0.00100794;RO=0;SAF=99;SAR=158;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000215621;OID=.;OPOS=99006736;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:260:259:0:0:257:259:158:99:0:0:158:101:0:0 chr8 99006748 . C T 2538.28 PASS AO=265;DP=265;FAO=265;FDP=265;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=160;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00825609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.049;QD=38.3137;RBI=0.0175748;REFB=0;REVB=-0.0155149;RO=0;SAF=105;SAR=160;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.05304e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.6995e-05;OID=.;OPOS=99006748;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:265:265:0:0:265:265:160:105:0:0:160:105:0:0 chr8 99030280 . T C 1730.79 PASS AO=179;DP=181;FAO=181;FDP=181;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.042809;FXX=0.0109284;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.9502;QD=38.2495;RBI=0.127461;REFB=0;REVB=0.120057;RO=0;SAF=82;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000185982;OID=.;OPOS=99030280;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:82:181:181:0:0:179:181:97:82:0:0:99:82:0:0 chr8 99045978 . A C 1221.41 PASS AO=129;DP=131;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00284134;FXX=0.0151504;HRUN=3;LEN=1;MLLD=69.9478;QD=37.5819;RBI=0.00849583;REFB=-0.0257828;REVB=0.00800661;RO=1;SAF=54;SAR=75;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0087192;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.34144e-05;OID=.;OPOS=99045978;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:131:130:1:0:129:130:75:54:1:0:76:54:0:0 chr8 99139955 . AG A 328.08 PASS AO=40;DP=64;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=53;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0516302;FXX=0.0158705;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.9355;QD=21.1663;RBI=0.2686;REFB=-0.0247657;REVB=0.263591;RO=8;SAF=5;SAR=35;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0.243808;SSSB=0;STB=0.529402;TYPE=del;VARB=0.021244;OID=.;OPOS=99139956;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:40:63:61:62:1:8:53:1:0:19:8:5:35:1:7 chr8 99205612 . C T 469.71 PASS AO=126;DP=283;FAO=127;FDP=285;FR=.;FRO=158;FSAF=52;FSAR=75;FSRF=72;FSRR=86;FWDB=-0.108695;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.73;QD=6.59241;RBI=0.111768;REFB=0.00370514;REVB=-0.0260281;RO=156;SAF=52;SAR=74;SRF=70;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0368056;STB=0.526252;TYPE=snp;VARB=-0.0060749;OID=.;OPOS=99205612;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:283:285:156:158:126:127:74:52:70:86:75:52:72:86 chr8 99208244 . G T 167.71 PASS AO=37;DP=79;FAO=38;FDP=78;FR=.;FRO=40;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=-0.00126953;FXX=0.0249969;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.082;QD=8.60046;RBI=0.0117729;REFB=-0.00945213;REVB=-0.0117043;RO=39;SAF=24;SAR=13;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222582;STB=0.619502;TYPE=snp;VARB=0.0100611;OID=.;OPOS=99208244;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:78:39:40:37:38:13:24:16:23:14:24:16:24 chr8 99441904 . G T 1853.27 PASS AO=181;DP=184;FAO=195;FDP=195;FR=.;FRO=0;FSAF=144;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141896;FXX=0.0101518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.904;QD=38.0158;RBI=0.025841;REFB=0;REVB=0.0215966;RO=0;SAF=132;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.15139e-05;OID=.;OPOS=99441904;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:184:195:0:0:181:195:49:132:0:0:51:144:0:0 chr8 100133706 . T G 207.93 PASS AO=56;DP=129;FAO=56;FDP=129;FR=.;FRO=73;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=20;FSRR=53;FWDB=-0.0120179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.754;QD=6.44736;RBI=0.0172455;REFB=-0.0168485;REVB=-0.0123684;RO=73;SAF=28;SAR=28;SRF=20;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230161;STB=0.627864;TYPE=snp;VARB=0.0183881;OID=.;OPOS=100133706;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:73:73:56:56:28:28:20:53:28:28:20:53 chr8 100626066 . C G 261.38 PASS AO=55;DP=130;FAO=66;FDP=141;FR=.;FRO=75;FSAF=37;FSAR=29;FSRF=42;FSRR=33;FWDB=0.00697446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.275;QD=7.41505;RBI=0.00786975;REFB=-0.0124245;REVB=-0.00364554;RO=75;SAF=29;SAR=26;SRF=42;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0338317;STB=0.500327;TYPE=snp;VARB=0.01444;OID=.;OPOS=100626066;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:141:75:75:55:66:26:29:42:33:29:37:42:33 chr8 100975002 . A G 653.04 PASS AO=75;DP=80;FAO=76;FDP=81;FR=.;FRO=5;FSAF=41;FSAR=35;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0248205;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=162.094;QD=32.2489;RBI=0.0295848;REFB=-0.221918;REVB=0.0160997;RO=5;SAF=41;SAR=34;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0302548;STB=0.51622;TYPE=snp;VARB=0.00130201;OID=.;OPOS=100975002;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:80:81:5:5:75:76:34:41:4:1:35:41:4:1 chr8 101586133 . T C 255.41 PASS AO=62;DP=132;FAO=63;FDP=133;FR=.;FRO=70;FSAF=29;FSAR=34;FSRF=18;FSRR=52;FWDB=0.00565738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.924;QD=7.68134;RBI=0.0113924;REFB=-0.00846662;REVB=-0.00988842;RO=70;SAF=29;SAR=33;SRF=18;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206389;STB=0.609449;TYPE=snp;VARB=0.00983004;OID=.;OPOS=101586133;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:133:70:70:62:63:33:29:18:52:34:29:18:52 chr8 101608919 . T C 195.46 PASS AO=43;DP=88;FAO=44;FDP=88;FR=.;FRO=44;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=27;FSRR=17;FWDB=-0.0131904;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.529;QD=8.88438;RBI=0.0193603;REFB=0.0146876;REVB=-0.0141715;RO=41;SAF=26;SAR=17;SRF=27;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0503176;STB=0.511797;TYPE=snp;VARB=-0.0173125;OID=.;OPOS=101608919;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:41:44:43:44:17:26:27:14:18:26:27:17 chr8 101648164 . C G 541.04 PASS AO=118;DP=223;FAO=118;FDP=221;FR=.;FRO=103;FSAF=39;FSAR=79;FSRF=40;FSRR=63;FWDB=0.0207531;FXX=0.0133923;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2939;QD=9.79258;RBI=0.0216209;REFB=0.00957291;REVB=0.00606389;RO=103;SAF=39;SAR=79;SRF=40;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0545721;STB=0.529836;TYPE=snp;VARB=-0.00836596;OID=.;OPOS=101648164;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:221:103:103:118:118:79:39:40:63:79:39:40:63 chr8 101718932 . C G 14.94 PASS AO=22;DP=142;FAO=22;FDP=141;FR=.;FRO=119;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=53;FSRR=66;FWDB=-0.00384985;FXX=0.00704176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.604;QD=0.423845;RBI=0.0600502;REFB=-0.000275881;REVB=-0.0599267;RO=116;SAF=16;SAR=6;SRF=51;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.362166;STB=0.73542;TYPE=snp;VARB=0.000122694;OID=.;OPOS=101718932;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:142:141:116:119:22:22:6:16:51:65:6:16:53:66 chr8 101718965 . G A 16.21 PASS AO=24;DP=150;FAO=24;FDP=152;FR=.;FRO=128;FSAF=19;FSAR=5;FSRF=55;FSRR=73;FWDB=-0.00117981;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.007;QD=0.426508;RBI=0.0128765;REFB=-0.00191941;REVB=-0.0128224;RO=126;SAF=19;SAR=5;SRF=55;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.450031;STB=0.79997;TYPE=snp;VARB=0.0291424;OID=.;OPOS=101718965;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:150:152:126:128:24:24:5:19:55:71:5:19:55:73 chr8 101718968 . C T 16.02 PASS AO=24;DP=152;FAO=24;FDP=152;FR=.;FRO=128;FSAF=19;FSAR=5;FSRF=55;FSRR=73;FWDB=-0.0117048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.3616;QD=0.421667;RBI=0.0808974;REFB=0.000685721;REVB=-0.0800462;RO=127;SAF=19;SAR=5;SRF=54;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.460386;STB=0.79997;TYPE=snp;VARB=-0.00491041;OID=.;OPOS=101718968;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:152:152:127:128:24:24:5:19:54:73:5:19:55:73 chr8 101752155 . C T 410.47 PASS AO=93;DP=170;FAO=92;FDP=179;FR=.;FRO=87;FSAF=31;FSAR=61;FSRF=24;FSRR=63;FWDB=-0.0240359;FXX=0.00555525;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.6262;QD=9.17246;RBI=0.0573954;REFB=-0.0213158;REVB=-0.0521201;RO=76;SAF=33;SAR=60;SRF=23;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0477638;STB=0.533956;TYPE=snp;VARB=0.0209305;OID=.;OPOS=101752155;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:179:76:87:93:92:60:33:23:53:61:31:24:63 chr8 102150294 . C T 266.97 PASS AO=58;DP=111;FAO=58;FDP=111;FR=.;FRO=53;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=29;FSRR=24;FWDB=-0.00384487;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.5517;QD=9.6206;RBI=0.0369585;REFB=0.000708043;REVB=0.036758;RO=52;SAF=27;SAR=31;SRF=29;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0791209;STB=0.53895;TYPE=snp;VARB=-0.000353437;OID=.;OPOS=102150294;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:52:53:58:58:31:27:29:23:31:27:29:24 chr8 102150411 . G A 243.38 PASS AO=68;DP=161;FAO=69;FDP=163;FR=.;FRO=94;FSAF=38;FSAR=31;FSRF=39;FSRR=55;FWDB=0.0034875;FXX=0.00609719;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.831;QD=5.97251;RBI=0.0105853;REFB=0.0013422;REVB=0.00999425;RO=92;SAF=38;SAR=30;SRF=40;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127155;STB=0.577873;TYPE=snp;VARB=-0.00169263;OID=.;OPOS=102150411;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:163:92:94:68:69:30:38:40:52:31:38:39:55 chr8 102209357 . A T 1275.56 PASS AO=138;DP=142;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00694671;FXX=0.0140835;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.345;QD=36.4447;RBI=0.00888108;REFB=-0.0297559;REVB=0.00553324;RO=2;SAF=74;SAR=64;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126747;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00010724;OID=.;OPOS=102209357;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:142:140:2:0:138:140:64:74:2:0:65:75:0:0 chr8 102504974 . C G 265.89 PASS AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.462;QD=37.9838;RBI=0.0349603;REFB=0;REVB=0.0297329;RO=0;SAF=6;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000136678;OID=.;OPOS=102504974;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:28:28:0:0:28:28:22:6:0:0:22:6:0:0 chr8 102631814 . AG A,AA 979.5 PASS AO=46,20;DP=141;FAO=127,12;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=56,8;FSAR=71,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.67172,0.384848;FXX=0.0413765;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=13.3736,9.52756;QD=28.187;RBI=0.680861,0.394733;REFB=-0.017752,-0.00688723;REVB=0.111195,0.0877846;RO=43;SAF=0,15;SAR=46,5;SRF=40;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.895876,-0.347361;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0379638,-0.131819;OID=.,.;OPOS=102631815,102631815;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:46,20:127:127,12:139:0:56,8:71,4:0:0:3:43:0,15:46,5:40:3 chr8 103305865 . T C 466.31 PASS AO=137;DP=327;FAO=137;FDP=327;FR=.;FRO=190;FSAF=84;FSAR=53;FSRF=111;FSRR=79;FWDB=0.0113385;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2009;QD=5.70406;RBI=0.0456852;REFB=-0.0208114;REVB=0.0442558;RO=187;SAF=84;SAR=53;SRF=111;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.021242;STB=0.517572;TYPE=snp;VARB=0.0387282;OID=.;OPOS=103305865;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:327:327:187:190:137:137:53:84:111:76:53:84:111:79 chr8 103572992 . C G 901.77 PASS AO=97;DP=98;FAO=96;FDP=97;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=57;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0191369;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=161.661;QD=37.1865;RBI=0.0232767;REFB=0.0342364;REVB=0.0132507;RO=1;SAF=39;SAR=58;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.012005;STB=0.506328;TYPE=snp;VARB=-0.000282547;OID=.;OPOS=103572992;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:98:97:1:1:97:96:58:39:1:0:57:39:1:0 chr8 103573001 . C G 164.7 PASS AO=42;DP=95;FAO=43;FDP=94;FR=.;FRO=51;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=22;FSRR=29;FWDB=0.0170871;FXX=0.0105252;HRUN=4;LEN=1;MLLD=127.999;QD=7.00853;RBI=0.0186088;REFB=-0.0284598;REVB=0.00737011;RO=51;SAF=19;SAR=23;SRF=22;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0208142;STB=0.505773;TYPE=snp;VARB=0.0436832;OID=.;OPOS=103573001;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:94:51:51:42:43:23:19:22:29:24:19:22:29 chr8 103573006 . G A 180.71 PASS AO=42;DP=96;FAO=43;FDP=90;FR=.;FRO=47;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=-0.0130147;FXX=0.0816243;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.498;QD=8.03156;RBI=0.0149681;REFB=-0.0470109;REVB=0.00739325;RO=48;SAF=17;SAR=25;SRF=21;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0322075;STB=0.515048;TYPE=snp;VARB=0.0139199;OID=.;OPOS=103573006;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:90:48:47:42:43:25:17:21:27:25:18:21:26 chr8 103573010 . CTGCAACCCCTGCAGCCCCTGCAACCCG C 78.08 PASS AO=19;DP=89;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=2;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=-0.0573008;FXX=0.133311;HRUN=1;LEN=27;MLLD=478.604;QD=6.00644;RBI=0.0578235;REFB=-0.0227658;REVB=-0.00775709;RO=20;SAF=0;SAR=19;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.809617;STB=0.759688;TYPE=del;VARB=0.0245521;OID=.;OPOS=103573011;OREF=TGCAACCCCTGCAGCCCCTGCAACCCG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:19:49:21:52:31:2:19:11:20:78:20:0:19:5:15 chr8 103663390 . C T 671.28 PASS AO=166;DP=349;FAO=167;FDP=349;FR=.;FRO=182;FSAF=89;FSAR=78;FSRF=92;FSRR=90;FWDB=0.0103763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.7598;QD=7.6937;RBI=0.0144982;REFB=0.00187638;REVB=-0.0101258;RO=182;SAF=88;SAR=78;SRF=92;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0234582;STB=0.514343;TYPE=snp;VARB=-0.00184146;OID=.;OPOS=103663390;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:349:349:182:182:166:167:78:88:92:90:78:89:92:90 chr8 103663912 . T G 156.09 PASS AO=32;DP=60;FAO=32;FDP=60;FR=.;FRO=28;FSAF=26;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=0.0323757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.9728;QD=10.4058;RBI=0.0336279;REFB=-0.0110195;REVB=-0.00909122;RO=28;SAF=26;SAR=6;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.327823;STB=0.684081;TYPE=snp;VARB=0.0119426;OID=.;OPOS=103663912;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:28:28:32:32:6:26:14:14:6:26:14:14 chr8 104081226 . A G 286.13 PASS AO=78;DP=179;FAO=78;FDP=179;FR=.;FRO=101;FSAF=34;FSAR=44;FSRF=54;FSRR=47;FWDB=-0.0105443;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=193.536;QD=6.39401;RBI=0.0241101;REFB=-0.014381;REVB=-0.0216822;RO=101;SAF=34;SAR=44;SRF=54;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100165;STB=0.555828;TYPE=snp;VARB=0.0179295;OID=.;OPOS=104081226;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:179:101:101:78:78:44:34:54:47:44:34:54:47 chr8 104082307 . C T 276.67 PASS AO=77;DP=181;FAO=77;FDP=180;FR=.;FRO=103;FSAF=45;FSAR=32;FSRF=33;FSRR=70;FWDB=-0.00965321;FXX=0.0109884;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.378;QD=6.14811;RBI=0.0107384;REFB=-0.0160156;REVB=0.00470403;RO=103;SAF=45;SAR=32;SRF=33;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.265682;STB=0.647719;TYPE=snp;VARB=0.0187636;OID=.;OPOS=104082307;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:180:103:103:77:77:32:45:33:70:32:45:33:70 chr8 104312341 . A G 288.8 PASS AO=76;DP=170;FAO=76;FDP=170;FR=.;FRO=94;FSAF=59;FSAR=17;FSRF=74;FSRR=20;FWDB=-0.0210292;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.527;QD=6.79527;RBI=0.0212744;REFB=-0.00863097;REVB=0.00322057;RO=94;SAF=59;SAR=17;SRF=74;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0157936;STB=0.508774;TYPE=snp;VARB=0.0103862;OID=.;OPOS=104312341;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:170:94:94:76:76:17:59:74:20:17:59:74:20 chr8 104337096 . A G 608.71 PASS AO=127;DP=251;FAO=138;FDP=262;FR=.;FRO=124;FSAF=82;FSAR=56;FSRF=59;FSRR=65;FWDB=0.012642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.764;QD=9.29327;RBI=0.0132958;REFB=-0.00976034;REVB=-0.00411814;RO=120;SAF=74;SAR=53;SRF=56;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103806;STB=0.556844;TYPE=snp;VARB=0.0164769;OID=.;OPOS=104337096;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:251:262:120:124:127:138:53:74:56:64:56:82:59:65 chr8 104337367 . A C 255.78 PASS AO=65;DP=142;FAO=65;FDP=142;FR=.;FRO=77;FSAF=30;FSAR=35;FSRF=40;FSRR=37;FWDB=-0.0124965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.4607;QD=7.20515;RBI=0.012569;REFB=-0.00646435;REVB=0.00134728;RO=77;SAF=30;SAR=35;SRF=40;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0565732;STB=0.531444;TYPE=snp;VARB=0.0101093;OID=.;OPOS=104337367;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:77:77:65:65:35:30:40:37:35:30:40:37 chr8 104343686 . G A 242.28 PASS AO=68;DP=161;FAO=68;FDP=161;FR=.;FRO=93;FSAF=32;FSAR=36;FSRF=46;FSRR=47;FWDB=-0.0238512;FXX=0.0122692;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.682;QD=6.01932;RBI=0.0253983;REFB=-0.0111745;REVB=-0.00872913;RO=90;SAF=32;SAR=36;SRF=45;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0300225;STB=0.513905;TYPE=snp;VARB=0.0141313;OID=.;OPOS=104343686;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:161:90:93:68:68:36:32:45:45:36:32:46:47 chr8 104343822 . A G 937.69 PASS AO=97;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.028866;FXX=0.0198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.759;QD=37.8865;RBI=0.0310198;REFB=0;REVB=-0.0113569;RO=0;SAF=35;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.81934e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00048447;OID=.;OPOS=104343822;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:99:99:0:0:97:99:62:35:0:0:63:36:0:0 chr8 104394744 . T C 623.07 PASS AO=162;DP=525;FAO=167;FDP=393;FR=.,HEALED;FRO=218;FSAF=82;FSAR=85;FSRF=104;FSRR=114;FWDB=-0.0131698;FXX=0.0174996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.028;QD=6.34164;RBI=0.0378097;REFB=-0.0147777;REVB=0.0354419;RO=160;SAF=93;SAR=69;SRF=112;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119434;STB=0.507905;TYPE=snp;VARB=0.0197293;OID=.;OPOS=104394744;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:447:393:160:218:162:167:69:93:112:48:85:82:104:114 chr8 104411282 . T C 176.61 PASS AO=43;DP=92;FAO=43;FDP=92;FR=.;FRO=49;FSAF=14;FSAR=29;FSRF=31;FSRR=18;FWDB=-0.042039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.077;QD=7.67854;RBI=0.0443336;REFB=0.0010395;REVB=0.0140781;RO=49;SAF=14;SAR=29;SRF=31;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.295092;STB=0.664722;TYPE=snp;VARB=-0.00121388;OID=.;OPOS=104411282;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:49:49:43:43:29:14:31:18:29:14:31:18 chr8 104412388 . C A 355.17 PASS AO=95;DP=212;FAO=95;FDP=213;FR=.;FRO=118;FSAF=44;FSAR=51;FSRF=43;FSRR=75;FWDB=-0.0533502;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.219;QD=6.66986;RBI=0.0533617;REFB=-0.0147472;REVB=0.00110648;RO=117;SAF=44;SAR=51;SRF=43;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0965512;STB=0.555444;TYPE=snp;VARB=0.0213099;OID=.;OPOS=104412388;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:213:117:118:95:95:51:44:43:74:51:44:43:75 chr8 104427359 . A C 15.1 PASS AO=5;DP=21;FAO=5;FDP=21;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=0;FSRF=16;FSRR=0;FWDB=0.0079007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.4667;QD=2.87685;RBI=0.0079007;REFB=0.0133706;REVB=0;RO=16;SAF=5;SAR=0;SRF=16;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.026431;OID=.;OPOS=104427359;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:21:21:16:16:5:5:0:5:16:0:0:5:16:0 chr8 104427541 . C T 40.26 PASS AO=12;DP=35;FAO=12;FDP=35;FR=.;FRO=23;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.0158579;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.607;QD=4.60169;RBI=0.0263565;REFB=-0.01222;REVB=-0.0210522;RO=23;SAF=1;SAR=11;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.536348;STB=0.833787;TYPE=snp;VARB=0.0318342;OID=.;OPOS=104427541;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:35:35:23:23:12:12:11:1:10:13:11:1:10:13 chr8 104427578 . T C 100.38 PASS AO=26;DP=62;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.0275547;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.973;QD=6.58253;RBI=0.0275591;REFB=-0.0181612;REVB=-0.00049392;RO=33;SAF=15;SAR=11;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00117732;STB=0.519882;TYPE=snp;VARB=0.0216619;OID=.;OPOS=104427578;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:61:33:35:26:26:11:15:19:14:11:15:19:16 chr8 104432545 . A G 723.74 PASS AO=160;DP=308;FAO=161;FDP=307;FR=.;FRO=146;FSAF=78;FSAR=83;FSRF=71;FSRR=75;FWDB=0.0127587;FXX=0.00647228;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.093;QD=9.42986;RBI=0.0132004;REFB=-0.00173201;REVB=-0.00338597;RO=145;SAF=78;SAR=82;SRF=70;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00413231;STB=0.500871;TYPE=snp;VARB=0.00198115;OID=.;OPOS=104432545;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:308:307:145:146:160:161:82:78:70:75:83:78:71:75 chr8 104934028 . G A 2961.75 PASS AO=310;DP=315;FAO=311;FDP=311;FR=.;FRO=0;FSAF=117;FSAR=194;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0180666;FXX=0.0158223;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.07;QD=38.0932;RBI=0.019644;REFB=-0.0483695;REVB=0.00771256;RO=0;SAF=117;SAR=193;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.36973e-05;OID=.;OPOS=104934028;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:315:311:0:0:310:311:193:117:0:0:194:117:0:0 chr8 105263928 . C T 248.36 PASS AO=57;DP=165;FAO=73;FDP=181;FR=.;FRO=108;FSAF=33;FSAR=40;FSRF=49;FSRR=59;FWDB=0.0148436;FXX=0.0054942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.2772;QD=5.48854;RBI=0.11112;REFB=-0.0421003;REVB=0.110124;RO=108;SAF=33;SAR=24;SRF=50;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132611;STB=0.500993;TYPE=snp;VARB=0.0469548;OID=.;OPOS=105263928;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:181:108:108:57:73:24:33:50:58:40:33:49:59 chr8 105263979 . C T 167.66 PASS AO=45;DP=104;FAO=45;FDP=104;FR=.;FRO=59;FSAF=11;FSAR=34;FSRF=7;FSRR=52;FWDB=-0.0233173;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=246.614;QD=6.44852;RBI=0.0233763;REFB=-0.00467453;REVB=-0.0016596;RO=58;SAF=11;SAR=34;SRF=6;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219052;STB=0.607148;TYPE=snp;VARB=0.007993;OID=.;OPOS=105263979;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:58:59:45:45:34:11:6:52:34:11:7:52 chr8 105368408 . A G 175.3 PASS AO=39;DP=77;FAO=39;FDP=77;FR=.;FRO=38;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=0.00880593;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.565;QD=9.10646;RBI=0.0230163;REFB=-0.0130273;REVB=0.0212651;RO=38;SAF=22;SAR=17;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0103496;STB=0.505744;TYPE=snp;VARB=0.0165918;OID=.;OPOS=105368408;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:38:38:39:39:17:22:21:17:17:22:21:17 chr8 105405202 . GT G 80.37 PASS AO=44;DP=157;FAO=65;FDP=151;FR=.;FRO=86;FSAF=43;FSAR=22;FSRF=39;FSRR=47;FWDB=-0.00143236;FXX=0.044301;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.2413;QD=2.12904;RBI=0.166711;REFB=-0.0978764;REVB=-0.166705;RO=80;SAF=25;SAR=19;SRF=38;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105066;STB=0.621844;TYPE=del;VARB=0.0970306;OID=.;OPOS=105405203;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:44:152:65:151:86:43:22:39:47:80:80:25:19:38:42 chr8 105478933 . G A 48.73 PASS AO=7;DP=16;FAO=9;FDP=17;FR=.,HEALED;FRO=8;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0511975;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=30.1331;QD=11.466;RBI=0.221927;REFB=-0.0598927;REVB=0.215941;RO=6;SAF=5;SAR=2;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183303;STB=0.65587;TYPE=snp;VARB=0.0547117;OID=.;OPOS=105478933;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:17:17:6:8:7:9:2:5:3:3:2:7:4:4 chr8 107710044 . T A 1620.74 PASS AO=171;DP=174;FAO=174;FDP=177;FR=.;FRO=3;FSAF=90;FSAR=84;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0393702;FXX=0.00561766;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.9908;QD=36.6269;RBI=0.0431313;REFB=-0.0898696;REVB=0.0176153;RO=2;SAF=90;SAR=81;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000580651;STB=0.50312;TYPE=snp;VARB=0.00335685;OID=.;OPOS=107710044;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:174:177:2:3:171:174:81:90:1:1:84:90:1:2 chr8 107764543 . TTG T,TT 148.68 PASS AO=12,17;DP=50;FAO=31,0;FDP=42;FR=.;FRO=11;FSAF=1,0;FSAR=30,0;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.0181266,-0.0241474;FXX=0.0232504;HRUN=3,2;LEN=2,1;MLLD=22.9193,14.0074;QD=14.1597;RBI=0.0377969,0.442319;REFB=-0.0886095,0.0611497;REVB=0.0331667,-0.441659;RO=11;SAF=1,0;SAR=11,17;SRF=4;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.424425,-0.828766;STB=0.801853,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.0375234,0;OID=.,.;OPOS=107764544,107764545;OREF=TG,G;OALT=-,-;OMAPALT=T,TT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:12,17:43:31,0:42:11:1,0:30,0:4:7:13:11:1,0:11,17:4:7 chr8 107782335 . G A 261.72 PASS AO=37;DP=54;FAO=43;FDP=61;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=29;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=-0.00619935;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.4245;QD=17.162;RBI=0.0496947;REFB=-0.0709019;REVB=0.0493065;RO=17;SAF=14;SAR=23;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0526239;STB=0.516235;TYPE=snp;VARB=0.0149183;OID=.;OPOS=107782335;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:54:61:17:18:37:43:23:14:5:12:29:14:5:13 chr8 107782395 . G A 150.62 PASS AO=12;DP=52;FAO=29;FDP=51;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.00427525;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.0132;QD=11.8131;RBI=0.0059182;REFB=-0.00891468;REVB=-0.00409235;RO=7;SAF=6;SAR=6;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0463935;STB=0.628649;TYPE=snp;VARB=0.0119064;OID=.;OPOS=107782395;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:28:51:7:22:12:29:6:6:3:4:21:8:12:10 chr8 108970367 . A G 507.25 PASS AO=124;DP=258;FAO=124;FDP=257;FR=.;FRO=133;FSAF=75;FSAR=49;FSRF=82;FSRR=51;FWDB=-0.000244949;FXX=0.00772171;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.313;QD=7.89491;RBI=0.0110032;REFB=0.00593353;REVB=-0.0110004;RO=134;SAF=75;SAR=49;SRF=82;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00701943;STB=0.506351;TYPE=snp;VARB=-0.00681522;OID=.;OPOS=108970367;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:258:257:134:133:124:124:49:75:82:52:49:75:82:51 chr8 110131552 . C T 450.97 PASS AO=98;DP=188;FAO=99;FDP=187;FR=.;FRO=88;FSAF=36;FSAR=63;FSRF=34;FSRR=54;FWDB=0.0619991;FXX=0.00531887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.145;QD=9.64642;RBI=0.0627421;REFB=-0.00594532;REVB=0.00962689;RO=88;SAF=36;SAR=62;SRF=34;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0175859;STB=0.51148;TYPE=snp;VARB=0.00552633;OID=.;OPOS=110131552;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:187:88:88:98:99:62:36:34:54:63:36:34:54 chr8 110505963 . A G 484.82 PASS AO=97;DP=170;FAO=97;FDP=170;FR=.;FRO=73;FSAF=43;FSAR=54;FSRF=32;FSRR=41;FWDB=-0.00281156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.228;QD=11.4076;RBI=0.00328103;REFB=0.0064324;REVB=0.00169125;RO=73;SAF=43;SAR=54;SRF=32;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00395419;STB=0.502151;TYPE=snp;VARB=-0.00490067;OID=.;OPOS=110505963;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:170:73:73:97:97:54:43:32:41:54:43:32:41 chr8 110657514 . G A 392.42 PASS AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0851648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.98;QD=37.3735;RBI=0.0883966;REFB=0;REVB=0.0236837;RO=0;SAF=5;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43317e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000380717;OID=.;OPOS=110657514;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:42:42:0:0:42:42:37:5:0:0:37:5:0:0 chr8 111946844 . G C 832.08 PASS AO=83;DP=83;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00970965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.7756;QD=38.2566;RBI=0.0741233;REFB=0;REVB=0.0734846;RO=0;SAF=46;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.12122e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000679682;OID=.;OPOS=111946844;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:83:87:0:0:83:87:37:46:0:0:40:47:0:0 chr8 116423424 . T C 720.61 PASS AO=83;DP=92;FAO=85;FDP=89;FR=.;FRO=4;FSAF=60;FSAR=25;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0270856;FXX=0.0326052;HRUN=4;LEN=1;MLLD=151.695;QD=32.3871;RBI=0.0275495;REFB=-0.0455167;REVB=-0.0050345;RO=3;SAF=58;SAR=25;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0282978;STB=0.511038;TYPE=snp;VARB=0.00157733;OID=.;OPOS=116423424;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:92:89:3:4:83:85:25:58:1:2:25:60:2:2 chr8 116423490 . A T 796.18 PASS AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0237057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.23;QD=37.9134;RBI=0.0576066;REFB=0;REVB=0.052503;RO=0;SAF=43;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000137351;OID=.;OPOS=116423490;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:84:84:0:0:84:84:41:43:0:0:41:43:0:0 chr8 116424270 . A AC 189.91 PASS AO=29;DP=95;FAO=46;FDP=92;FR=.;FRO=46;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=-0.00651796;FXX=0.0107515;HRUN=0;LEN=1;MLLD=221.537;QD=8.25715;RBI=0.0107845;REFB=-0.00825392;REVB=0.00859196;RO=48;SAF=12;SAR=17;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0493014;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00812521;OID=.;OPOS=116424271;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:29:95:46:92:46:21:25:21:25:99:48:12:17:22:26 chr8 116635872 . T TA 1623.08 PASS AO=191;DP=213;FAO=207;FDP=207;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0382381;FXX=0.00956892;HRUN=1;LEN=1;MLLD=27.4575;QD=31.3638;RBI=0.0399108;REFB=0;REVB=-0.0114331;RO=7;SAF=80;SAR=111;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000671531;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-0.000398211;OID=.;OPOS=116635873;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:191:213:207:207:0:89:118:0:0:99:7:80:111:3:4 chr8 117035009 . C T 1523.69 PASS AO=162;DP=165;FAO=164;FDP=167;FR=.;FRO=3;FSAF=75;FSAR=89;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0264675;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.897;QD=36.4956;RBI=0.0269854;REFB=-0.00824923;REVB=-0.00526165;RO=2;SAF=75;SAR=87;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000864133;STB=0.503785;TYPE=snp;VARB=0.000109492;OID=.;OPOS=117035009;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:165:167:2:3:162:164:87:75:1:1:89:75:2:1 chr8 117791733 . T C 786.11 PASS AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00736364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.301;QD=37.8847;RBI=0.0470182;REFB=0;REVB=0.046438;RO=0;SAF=40;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000113698;OID=.;OPOS=117791733;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:83:83:0:0:83:83:43:40:0:0:43:40:0:0 chr8 117858389 . G A 2048.52 PASS AO=221;DP=225;FAO=221;FDP=225;FR=.;FRO=4;FSAF=128;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.008011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.345;QD=36.4182;RBI=0.0344472;REFB=-0.0624113;REVB=0.0335028;RO=2;SAF=128;SAR=93;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.010135;STB=0.510525;TYPE=snp;VARB=0.000100159;OID=.;OPOS=117858389;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:225:225:2:4:221:221:93:128:0:2:93:128:0:4 chr8 118030275 . T G 376.17 PASS AO=92;DP=196;FAO=94;FDP=200;FR=.;FRO=106;FSAF=40;FSAR=54;FSRF=61;FSRR=45;FWDB=0.00559374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.358;QD=7.52332;RBI=0.0159287;REFB=-0.0176773;REVB=0.0149142;RO=102;SAF=40;SAR=52;SRF=61;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154666;STB=0.579333;TYPE=snp;VARB=0.0285456;OID=.;OPOS=118030275;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:200:102:106:92:94:52:40:61:41:54:40:61:45 chr8 118184783 . C T 165.6 PASS AO=45;DP=105;FAO=45;FDP=105;FR=.;FRO=60;FSAF=34;FSAR=11;FSRF=30;FSRR=30;FWDB=-0.000180145;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.712;QD=6.30873;RBI=0.0228074;REFB=9.9871e-05;REVB=-0.0228066;RO=57;SAF=34;SAR=11;SRF=29;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.277451;STB=0.664364;TYPE=snp;VARB=-0.000450161;OID=.;OPOS=118184783;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:57:60:45:45:11:34:29:28:11:34:30:30 chr8 118819578 . C T 261.38 PASS AO=48;DP=92;FAO=55;FDP=100;FR=.;FRO=45;FSAF=20;FSAR=35;FSRF=11;FSRR=34;FWDB=0.0249404;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.189;QD=10.4552;RBI=0.0266139;REFB=-0.009779;REVB=0.00928873;RO=44;SAF=13;SAR=35;SRF=11;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0231443;STB=0.559817;TYPE=snp;VARB=0.00927246;OID=.;OPOS=118819578;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:100:44:45:48:55:35:13:11:33:35:20:11:34 chr8 118847782 . G A 100.77 PASS AO=27;DP=64;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=28;FSRR=8;FWDB=-0.114315;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.1692;QD=6.39811;RBI=0.18656;REFB=-0.0383836;REVB=0.147434;RO=36;SAF=19;SAR=8;SRF=28;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0938061;STB=0.552904;TYPE=snp;VARB=0.0507529;OID=.;OPOS=118847782;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:63:36:36:27:27:8:19:28:8:8:19:28:8 chr8 119964052 . G C 213.2 PASS AO=45;DP=84;FAO=45;FDP=84;FR=.;FRO=39;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=-0.0163736;FXX=0.0344788;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.892;QD=10.1523;RBI=0.0479091;REFB=-0.0178385;REVB=0.0450243;RO=37;SAF=21;SAR=24;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0605623;STB=0.521453;TYPE=snp;VARB=0.0192963;OID=.;OPOS=119964052;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:37:39:45:45:24:21:20:17:24:21:20:19 chr8 120101938 . A G 347.03 PASS AO=88;DP=190;FAO=89;FDP=191;FR=.;FRO=102;FSAF=41;FSAR=48;FSRF=44;FSRR=58;FWDB=-0.0237083;FXX=0.00520806;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.694;QD=7.26757;RBI=0.0279423;REFB=-0.005415;REVB=0.014788;RO=102;SAF=41;SAR=47;SRF=44;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0337387;STB=0.515781;TYPE=snp;VARB=0.00629498;OID=.;OPOS=120101938;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:191:102:102:88:89:47:41:44:58:48:41:44:58 chr8 120252555 . GC G,GT 440.83 PASS AO=25,17;DP=59;FAO=41,17;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=12,0;FSAR=29,17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.90187,0.16624;FXX=0.0169463;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=17.6857,132.677;QD=30.4023;RBI=0.916127,0.168562;REFB=0,0;REVB=0.160992,0.0278843;RO=13;SAF=0,0;SAR=25,17;SRF=11;SRR=2;SSEN=0.317518,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.874878,-0.862315;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0814505,0.146013;OID=.,.;OPOS=120252556,120252556;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=G,GT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:25,17:58:41,17:58:0:12,0:29,17:0:0:43:13:0,0:25,17:11:2 chr8 120431506 . G A 252.98 PASS AO=71;DP=167;FAO=71;FDP=167;FR=.;FRO=96;FSAF=23;FSAR=48;FSRF=53;FSRR=43;FWDB=0.0244483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.913;QD=6.05948;RBI=0.0254713;REFB=-0.0101199;REVB=0.00714633;RO=96;SAF=23;SAR=48;SRF=53;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.241556;STB=0.63539;TYPE=snp;VARB=0.0167923;OID=.;OPOS=120431506;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:167:96:96:71:71:48:23:53:43:48:23:53:43 chr8 120575184 . G A 344.87 PASS AO=79;DP=180;FAO=89;FDP=190;FR=.;FRO=101;FSAF=24;FSAR=65;FSRF=32;FSRR=69;FWDB=0.0127538;FXX=0.0104161;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.6609;QD=7.26032;RBI=0.103569;REFB=-0.0152108;REVB=0.102781;RO=95;SAF=24;SAR=55;SRF=32;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0377195;STB=0.530915;TYPE=snp;VARB=0.0155611;OID=.;OPOS=120575184;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:190:95:101:79:89:55:24:32:63:65:24:32:69 chr8 120594802 . A G 361.17 PASS AO=99;DP=226;FAO=99;FDP=226;FR=.;FRO=127;FSAF=43;FSAR=56;FSRF=52;FSRR=75;FWDB=-0.00505697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=303.926;QD=6.39246;RBI=0.00565015;REFB=0.00180134;REVB=-0.00252017;RO=126;SAF=43;SAR=56;SRF=52;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0222722;STB=0.514285;TYPE=snp;VARB=-0.00211174;OID=.;OPOS=120594802;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:226:226:126:127:99:99:56:43:52:74:56:43:52:75 chr8 120596023 . A G 1160.59 PASS AO=120;DP=120;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00457086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.794;QD=38.0523;RBI=0.0135292;REFB=0;REVB=-0.0127337;RO=0;SAF=58;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.84183e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.39893e-05;OID=.;OPOS=120596023;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:120:122:0:0:120:122:62:58:0:0:63:59:0:0 chr8 120724209 . T C 194.54 PASS AO=58;DP=146;FAO=59;FDP=149;FR=.;FRO=90;FSAF=20;FSAR=39;FSRF=25;FSRR=65;FWDB=-0.0361649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.957;QD=5.22253;RBI=0.0361835;REFB=-0.00244629;REVB=0.00116082;RO=87;SAF=20;SAR=38;SRF=24;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0839357;STB=0.542359;TYPE=snp;VARB=0.00380417;OID=.;OPOS=120724209;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:149:87:90:58:59:38:20:24:63:39:20:25:65 chr8 120790304 . T C 208.99 PASS AO=56;DP=129;FAO=56;FDP=129;FR=.;FRO=73;FSAF=16;FSAR=40;FSRF=45;FSRR=28;FWDB=-0.0159044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.908;QD=6.48036;RBI=0.0243676;REFB=-0.00556722;REVB=0.0184616;RO=69;SAF=16;SAR=40;SRF=41;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.316106;STB=0.69154;TYPE=snp;VARB=0.00457513;OID=.;OPOS=120790304;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:69:73:56:56:40:16:41:28:40:16:45:28 chr8 120803637 . C G 297.33 PASS AO=84;DP=199;FAO=84;FDP=198;FR=.;FRO=114;FSAF=29;FSAR=55;FSRF=55;FSRR=59;FWDB=0.0178954;FXX=0.00502487;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.3182;QD=6.00671;RBI=0.0179363;REFB=-0.0168902;REVB=-0.00121094;RO=113;SAF=29;SAR=55;SRF=55;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151943;STB=0.582872;TYPE=snp;VARB=0.0228605;OID=.;OPOS=120803637;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:199:198:113:114:84:84:55:29:55:58:55:29:55:59 chr8 120847078 . C G 328.86 PASS AO=81;DP=171;FAO=81;FDP=171;FR=.;FRO=90;FSAF=43;FSAR=38;FSRF=57;FSRR=33;FWDB=0.00114412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.439;QD=7.69253;RBI=0.00857273;REFB=-0.0133147;REVB=0.00849604;RO=88;SAF=43;SAR=38;SRF=55;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0897434;STB=0.554488;TYPE=snp;VARB=0.0159365;OID=.;OPOS=120847078;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:171:88:90:81:81:38:43:55:33:38:43:57:33 chr8 120847123 . C T 444.35 PASS AO=104;DP=210;FAO=104;FDP=209;FR=.;FRO=105;FSAF=50;FSAR=54;FSRF=63;FSRR=42;FWDB=0.00734963;FXX=0.00476168;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.86;QD=8.50424;RBI=0.00989365;REFB=-0.00136709;REVB=-0.00662324;RO=103;SAF=50;SAR=54;SRF=61;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100784;STB=0.559702;TYPE=snp;VARB=0.000921305;OID=.;OPOS=120847123;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:210:209:103:105:104:104:54:50:61:42:54:50:63:42 chr8 120847188 . T C 488.92 PASS AO=119;DP=249;FAO=120;FDP=250;FR=.;FRO=130;FSAF=46;FSAR=74;FSRF=61;FSRR=69;FWDB=-0.0169849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.006;QD=7.82278;RBI=0.0170202;REFB=-0.0096481;REVB=-0.00109618;RO=129;SAF=45;SAR=74;SRF=60;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0851982;STB=0.546212;TYPE=snp;VARB=0.00966186;OID=.;OPOS=120847188;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:249:250:129:130:119:120:74:45:60:69:74:46:61:69 chr8 120903471 . C CA 951.59 PASS AO=89;DP=108;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0496709;FXX=0.0288434;HRUN=0;LEN=1;MLLD=184.886;QD=37.6867;RBI=0.0844394;REFB=0;REVB=0.0682847;RO=9;SAF=48;SAR=41;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0613394;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.000542977;OID=.;OPOS=120903472;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:89:108:101:101:0:55:46:0:0:45:9:48:41:8:1 chr8 121013770 . A G 1016.21 PASS AO=107;DP=110;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166679;FXX=0.0272702;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.871;QD=37.9893;RBI=0.0417444;REFB=-0.0878349;REVB=0.0382723;RO=0;SAF=63;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.78072e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000952108;OID=.;OPOS=121013770;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:110:107:0:0:107:107:44:63:0:0:44:63:0:0 chr8 121061879 . G A 568.25 PASS AO=117;DP=234;FAO=128;FDP=243;FR=.;FRO=115;FSAF=69;FSAR=59;FSRF=53;FSRR=62;FWDB=-0.00260135;FXX=0.00409819;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.919;QD=9.35398;RBI=0.0269395;REFB=-0.0237046;REVB=0.0268136;RO=114;SAF=66;SAR=51;SRF=53;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0895901;STB=0.537011;TYPE=snp;VARB=0.0261178;OID=.;OPOS=121061879;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:234:243:114:115:117:128:51:66:53:61:59:69:53:62 chr8 121210069 . T C 363.7 PASS AO=68;DP=112;FAO=68;FDP=112;FR=.;FRO=44;FSAF=33;FSAR=35;FSRF=10;FSRR=34;FWDB=0.0317608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.916;QD=12.9894;RBI=0.0334466;REFB=-0.0278694;REVB=-0.0104847;RO=44;SAF=33;SAR=35;SRF=10;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188531;STB=0.602034;TYPE=snp;VARB=0.0220007;OID=.;OPOS=121210069;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:44:44:68:68:35:33:10:34:35:33:10:34 chr8 121215991 . T C 315.79 PASS AO=87;DP=201;FAO=87;FDP=201;FR=.;FRO=114;FSAF=37;FSAR=50;FSRF=46;FSRR=68;FWDB=-0.0130608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.709;QD=6.28445;RBI=0.0135104;REFB=0.00104181;REVB=-0.00345643;RO=114;SAF=37;SAR=50;SRF=46;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0227699;STB=0.512679;TYPE=snp;VARB=-0.00152637;OID=.;OPOS=121215991;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:201:114:114:87:87:50:37:46:68:50:37:46:68 chr8 121226143 . C CT 37.32 PASS AO=34;DP=139;FAO=54;FDP=138;FR=.;FRO=84;FSAF=32;FSAR=22;FSRF=47;FSRR=37;FWDB=-0.0374797;FXX=0.00719373;HRUN=8;LEN=1;MLLD=5.81188;QD=1.0816;RBI=0.121222;REFB=-0.0449196;REVB=0.115282;RO=81;SAF=29;SAR=5;SRF=34;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.550487;STB=0.520676;TYPE=ins;VARB=-0.0129325;OID=.;OPOS=121226144;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:34:139:54:138:84:32:22:47:37:37:81:29:5:34:47 chr8 121228679 . A C 650.23 PASS AO=163;DP=356;FAO=168;FDP=362;FR=.;FRO=194;FSAF=60;FSAR=108;FSRF=64;FSRR=130;FWDB=0.00582151;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3528;QD=7.18489;RBI=0.0400626;REFB=-0.000580059;REVB=0.0396374;RO=193;SAF=55;SAR=108;SRF=64;SRR=129;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00640283;STB=0.516043;TYPE=snp;VARB=0.000899374;OID=.;OPOS=121228679;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:356:362:193:194:163:168:108:55:64:129:108:60:64:130 chr8 121383048 . T C 636.45 PASS AO=76;DP=80;FAO=74;FDP=80;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=69;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0240962;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.0617;QD=31.8227;RBI=0.0390861;REFB=-0.0112012;REVB=-0.0307749;RO=3;SAF=5;SAR=71;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150034;STB=0.569554;TYPE=snp;VARB=0.00525079;OID=.;OPOS=121383048;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:80:80:3:6:76:74:71:5:2:1:69:5:2:4 chr8 121530190 . A G 324 PASS AO=84;DP=184;FAO=84;FDP=184;FR=.;FRO=100;FSAF=40;FSAR=44;FSRF=27;FSRR=73;FWDB=0.0241525;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.417;QD=7.04356;RBI=0.0244676;REFB=-0.0150622;REVB=0.00391413;RO=98;SAF=40;SAR=44;SRF=26;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208934;STB=0.613504;TYPE=snp;VARB=0.0159403;OID=.;OPOS=121530190;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:184:98:100:84:84:44:40:26:72:44:40:27:73 chr8 123964011 . G A 301 PASS AO=62;DP=110;FAO=62;FDP=112;FR=.;FRO=50;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=19;FSRR=31;FWDB=-0.000349455;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.016;QD=10.7501;RBI=0.0297898;REFB=-0.0184448;REVB=0.0297877;RO=46;SAF=28;SAR=34;SRF=17;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0651013;STB=0.532465;TYPE=snp;VARB=0.00972458;OID=.;OPOS=123964011;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:112:46:50:62:62:34:28:17:29:34:28:19:31 chr8 123964431 . G A 198.62 PASS AO=41;DP=75;FAO=41;FDP=75;FR=.;FRO=34;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.00364943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.505;QD=10.5929;RBI=0.00773037;REFB=-0.0139075;REVB=0.00681471;RO=34;SAF=23;SAR=18;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0505231;STB=0.527855;TYPE=snp;VARB=0.00972189;OID=.;OPOS=123964431;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:34:34:41:41:18:23:17:17:18:23:17:17 chr8 123964912 . G A 137.22 PASS AO=28;DP=57;FAO=30;FDP=59;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=0.00237768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.162;QD=9.3033;RBI=0.016063;REFB=-0.00660539;REVB=-0.015886;RO=29;SAF=16;SAR=12;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203557;STB=0.591868;TYPE=snp;VARB=0.00560801;OID=.;OPOS=123964912;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:59:29:29:28:30:12:16:10:19:14:16:10:19 chr8 123964953 . C T 77.24 PASS AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.0299562;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.934;QD=7.72448;RBI=0.0313895;REFB=-0.00885184;REVB=0.00937669;RO=22;SAF=7;SAR=11;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0651628;STB=0.537314;TYPE=snp;VARB=0.00887462;OID=.;OPOS=123964953;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:40:40:22:22:18:18:11:7:10:12:11:7:10:12 chr8 123965193 . C T 164.16 PASS AO=38;DP=78;FAO=38;FDP=78;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=0.024298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.533;QD=8.41838;RBI=0.0288973;REFB=-0.0262982;REVB=0.0156417;RO=40;SAF=18;SAR=20;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115888;STB=0.564483;TYPE=snp;VARB=0.0243074;OID=.;OPOS=123965193;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:40:40:38:38:20:18:24:16:20:18:24:16 chr8 123966159 . G C 174.16 PASS AO=36;DP=67;FAO=36;FDP=67;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=0.0140761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.5183;QD=10.3975;RBI=0.104599;REFB=-0.0457399;REVB=0.103647;RO=30;SAF=11;SAR=25;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0265736;STB=0.509209;TYPE=snp;VARB=0.0354945;OID=.;OPOS=123966159;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:30:31:36:36:25:11:10:20:25:11:10:21 chr8 124027628 . T C 1389.57 PASS AO=147;DP=148;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0136799;FXX=0.0197355;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.093;QD=37.3038;RBI=0.0507471;REFB=-0.0906745;REVB=0.0488685;RO=0;SAF=52;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00033421;OID=.;OPOS=124027628;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:148:149:0:0:147:149:95:52:0:0:96:53:0:0 chr8 124138855 . G A 200.61 PASS AO=50;DP=114;FAO=52;FDP=116;FR=.;FRO=64;FSAF=36;FSAR=16;FSRF=46;FSRR=18;FWDB=0.0319828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.146;QD=6.91761;RBI=0.045969;REFB=-0.0307868;REVB=-0.033019;RO=64;SAF=34;SAR=16;SRF=46;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0455532;STB=0.517344;TYPE=snp;VARB=0.0356592;OID=.;OPOS=124138855;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:116:64:64:50:52:16:34:46:18:16:36:46:18 chr8 124142489 . T C 507.81 PASS AO=110;DP=216;FAO=113;FDP=210;FR=.;FRO=97;FSAF=68;FSAR=45;FSRF=48;FSRR=49;FWDB=0.00688949;FXX=0.0277765;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.971;QD=9.67258;RBI=0.0364007;REFB=-0.0172089;REVB=0.0357428;RO=97;SAF=68;SAR=42;SRF=48;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108732;STB=0.550456;TYPE=snp;VARB=0.0176946;OID=.;OPOS=124142489;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:216:210:97:97:110:113:42:68:48:49:45:68:48:49 chr8 124154697 . G T 179.12 PASS AO=36;DP=69;FAO=37;FDP=69;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=28;FSRF=6;FSRR=26;FWDB=0.00558791;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.7432;QD=10.3836;RBI=0.0113172;REFB=-0.0121948;REVB=-0.00984147;RO=32;SAF=8;SAR=28;SRF=6;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0439259;STB=0.536405;TYPE=snp;VARB=0.0304337;OID=.;OPOS=124154697;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:32:32:36:37:28:8:6:26:28:9:6:26 chr8 124169554 . G A 343.48 PASS AO=96;DP=223;FAO=96;FDP=223;FR=.;FRO=127;FSAF=67;FSAR=29;FSRF=88;FSRR=39;FWDB=0.0117745;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=285.636;QD=6.16114;RBI=0.0147136;REFB=-0.00451316;REVB=-0.00882336;RO=126;SAF=67;SAR=29;SRF=87;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00895401;STB=0.503369;TYPE=snp;VARB=0.00507099;OID=.;OPOS=124169554;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:223:126:127:96:96:29:67:87:39:29:67:88:39 chr8 124206324 . G A 396.12 PASS AO=101;DP=221;FAO=102;FDP=221;FR=.;FRO=119;FSAF=60;FSAR=42;FSRF=72;FSRR=47;FWDB=-0.0100499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.02;QD=7.16965;RBI=0.0249621;REFB=0.00464939;REVB=0.0228497;RO=117;SAF=59;SAR=42;SRF=71;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0227543;STB=0.50937;TYPE=snp;VARB=-0.00529203;OID=.;OPOS=124206324;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:221:117:119:101:102:42:59:71:46:42:60:72:47 chr8 124221723 . T C 421.93 PASS AO=96;DP=188;FAO=96;FDP=188;FR=.;FRO=92;FSAF=65;FSAR=31;FSRF=56;FSRR=36;FWDB=-0.0037159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.575;QD=8.97718;RBI=0.0103808;REFB=-0.00908772;REVB=-0.00969297;RO=92;SAF=65;SAR=31;SRF=56;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0677617;STB=0.537248;TYPE=snp;VARB=0.0121543;OID=.;OPOS=124221723;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:188:92:92:96:96:31:65:56:36:31:65:56:36 chr8 124440174 . A G 593.07 PASS AO=63;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0110536;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.487;QD=36.4967;RBI=0.0440743;REFB=0;REVB=0.0426657;RO=1;SAF=42;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0219527;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000489058;OID=.;OPOS=124440174;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:65:65:1:0:63:65:21:42:0:1:22:43:0:0 chr8 124448736 . A G 1527.38 PASS AO=161;DP=163;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026626;FXX=0.00613459;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.3588;QD=37.713;RBI=0.0298561;REFB=-0.0355489;REVB=-0.013507;RO=1;SAF=64;SAR=97;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00737651;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000159694;OID=.;OPOS=124448736;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:163:162:1:0:161:162:97:64:1:0:97:65:0:0 chr8 124448804 . T A 1372.87 PASS AO=145;DP=147;FAO=145;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124613;FXX=0.0136045;HRUN=3;LEN=1;MLLD=92.24;QD=37.8722;RBI=0.0196854;REFB=0.0190379;REVB=0.0152391;RO=1;SAF=64;SAR=81;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00583531;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.16544e-05;OID=.;OPOS=124448804;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:147:145:1:0:145:145:81:64:0:1:81:64:0:0 chr8 124449466 . C T 543.51 PASS AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0460799;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.895;QD=38.1408;RBI=0.0461741;REFB=0;REVB=-0.00294723;RO=0;SAF=35;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000202598;OID=.;OPOS=124449466;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:57:57:0:0:57:57:22:35:0:0:22:35:0:0 chr8 124453543 . T A 1348.77 PASS AO=169;DP=189;FAO=169;FDP=187;FR=.;FRO=18;FSAF=103;FSAR=66;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=0.0276498;FXX=0.0105815;HRUN=7;LEN=1;MLLD=46.7209;QD=28.8507;RBI=0.0440968;REFB=-0.126617;REVB=0.0343514;RO=0;SAF=104;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.12435e-08;STB=0.533045;TYPE=snp;VARB=0.0162076;OID=.;OPOS=124453543;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:189:187:0:18:169:169:65:104:0:0:66:103:5:13 chr8 124553222 . G C 64.52 PASS AO=12;DP=28;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=0;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=16;FWDB=0;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=47.3538;QD=8.60269;RBI=0.0567867;REFB=0.0268923;REVB=0.0567867;RO=16;SAF=0;SAR=12;SRF=0;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0276175;OID=.;OPOS=124553222;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:28:30:16:16:12:14:12:0:0:16:14:0:0:16 chr8 124594546 . T C 97.88 PASS AO=21;DP=42;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.00372238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.264;QD=9.32201;RBI=0.00647154;REFB=-0.012595;REVB=-0.00529384;RO=21;SAF=5;SAR=16;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202691;STB=0.615266;TYPE=snp;VARB=0.0150119;OID=.;OPOS=124594546;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:42:42:21:21:21:21:16:5:9:12:16:5:9:12 chr8 124664130 . C T 129.83 PASS AO=40;DP=118;FAO=43;FDP=118;FR=.;FRO=75;FSAF=28;FSAR=15;FSRF=37;FSRR=38;FWDB=0.0320473;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.4568;QD=4.40083;RBI=0.123516;REFB=0.0136327;REVB=-0.119286;RO=77;SAF=25;SAR=15;SRF=40;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123607;STB=0.603448;TYPE=snp;VARB=-0.0331614;OID=.;OPOS=124664130;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:77:75:40:43:15:25:40:37:15:28:37:38 chr8 124664167 . T C 1235.1 PASS AO=129;DP=132;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00987883;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.367;QD=37.713;RBI=0.0257081;REFB=0;REVB=0.0237342;RO=0;SAF=70;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000421897;OID=.;OPOS=124664167;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:132:131:0:0:129:131:59:70:0:0:61:70:0:0 chr8 124664594 . C T 346.49 PASS AO=68;DP=121;FAO=69;FDP=121;FR=.;FRO=52;FSAF=35;FSAR=34;FSRF=30;FSRR=22;FWDB=-0.0108896;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=211.855;QD=11.4543;RBI=0.0179856;REFB=-0.0247386;REVB=-0.0143143;RO=51;SAF=34;SAR=34;SRF=30;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0693224;STB=0.529967;TYPE=snp;VARB=0.0128858;OID=.;OPOS=124664594;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:51:52:68:69:34:34:30:21:34:35:30:22 chr8 124664792 . C T 187.35 PASS AO=36;DP=70;FAO=37;FDP=67;FR=.;FRO=30;FSAF=26;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=0.0142279;FXX=0.0563301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.3;QD=11.185;RBI=0.0186906;REFB=-0.0313978;REVB=-0.0121205;RO=30;SAF=25;SAR=11;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0576121;STB=0.536062;TYPE=snp;VARB=0.0179295;OID=.;OPOS=124664792;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:67:30:30:36:37:11:25:19:11:11:26:19:11 chr8 124664873 . A G 710.23 PASS AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0325569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.527;QD=36.8952;RBI=0.040005;REFB=-0.128334;REVB=-0.0232475;RO=1;SAF=40;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129635;STB=0.506848;TYPE=snp;VARB=-0.000183525;OID=.;OPOS=124664873;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:77:77:1:1:76:76:36:40:0:1:36:40:0:1 chr8 124664874 . T C 710.24 PASS AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.028022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.136;QD=36.8955;RBI=0.0282844;REFB=0.0624299;REVB=0.0038438;RO=1;SAF=40;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129635;STB=0.506848;TYPE=snp;VARB=-0.000377164;OID=.;OPOS=124664874;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:77:77:1:1:76:76:36:40:0:1:36:40:0:1 chr8 124665124 . C T 49.68 PASS AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=11;FWDB=0.136992;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.154;QD=9.46286;RBI=0.137257;REFB=0.00482838;REVB=-0.00851588;RO=10;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.444441;STB=0.761523;TYPE=snp;VARB=-0.0113263;OID=.;OPOS=124665124;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:21:21:10:11:10:10:5:5:0:10:5:5:0:11 chr8 124696867 . C T 2479.03 PASS AO=256;DP=256;FAO=258;FDP=258;FR=.;FRO=0;FSAF=124;FSAR=134;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00691822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.324;QD=38.4346;RBI=0.0277173;REFB=0;REVB=0.02684;RO=0;SAF=124;SAR=132;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.5958e-05;OID=.;OPOS=124696867;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:256:258:0:0:256:258:132:124:0:0:134:124:0:0 chr8 124710729 . C T 825.77 PASS AO=85;DP=88;FAO=87;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=58;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0230957;FXX=0.0927739;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.483;QD=37.5352;RBI=0.0392541;REFB=-0.0386784;REVB=0.0317407;RO=0;SAF=29;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.20959e-08;STB=0.508473;TYPE=snp;VARB=0.000520945;OID=.;OPOS=124710729;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:88:88:0:1:85:87:56:29:0:0:58:29:1:0 chr8 124749610 . C T 1002.77 PASS AO=106;DP=109;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00751734;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.2497;QD=37.1396;RBI=0.0382389;REFB=0;REVB=0.0374927;RO=2;SAF=63;SAR=43;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0215591;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00276958;OID=.;OPOS=124749610;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:109:108:2:0:106:108:43:63:0:2:45:63:0:0 chr8 124824826 . G A 1723.26 PASS AO=179;DP=179;FAO=179;FDP=179;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00252496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.0462;QD=38.5086;RBI=0.00682207;REFB=0;REVB=0.0063376;RO=0;SAF=81;SAR=98;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.13839e-05;OID=.;OPOS=124824826;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:179:179:0:0:179:179:98:81:0:0:98:81:0:0 chr8 124987478 . T C 255.35 PASS AO=73;DP=174;FAO=73;FDP=174;FR=.;FRO=101;FSAF=27;FSAR=46;FSRF=47;FSRR=54;FWDB=0.0273591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.697;QD=5.8702;RBI=0.029677;REFB=-0.026559;REVB=0.011498;RO=100;SAF=27;SAR=46;SRF=47;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107306;STB=0.557651;TYPE=snp;VARB=0.0310027;OID=.;OPOS=124987478;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:174:100:101:73:73:46:27:47:53:46:27:47:54 chr8 125061895 . G A 745.05 PASS AO=155;DP=298;FAO=163;FDP=304;FR=.;FRO=141;FSAF=83;FSAR=80;FSRF=70;FSRR=71;FWDB=0.0167144;FXX=0.00977167;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.867;QD=9.80327;RBI=0.0177167;REFB=-0.0101844;REVB=0.00587453;RO=143;SAF=83;SAR=72;SRF=72;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0281727;STB=0.505913;TYPE=snp;VARB=0.00812463;OID=.;OPOS=125061895;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:298:304:143:141:155:163:72:83:72:71:80:83:70:71 chr8 125072426 . T C 603.85 PASS AO=64;DP=67;FAO=67;FDP=70;FR=.;FRO=3;FSAF=35;FSAR=32;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0184514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.873;QD=34.5056;RBI=0.0543274;REFB=-0.0267202;REVB=0.0510981;RO=3;SAF=34;SAR=30;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0398659;STB=0.520542;TYPE=snp;VARB=0.000265548;OID=.;OPOS=125072426;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:67:70:3:3:64:67:30:34:3:0:32:35:3:0 chr8 125076589 . T G 240.65 PASS AO=57;DP=117;FAO=57;FDP=117;FR=.;FRO=60;FSAF=24;FSAR=33;FSRF=29;FSRR=31;FWDB=0.0480826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.1821;QD=8.22733;RBI=0.0484337;REFB=-0.0238974;REVB=-0.00582069;RO=59;SAF=24;SAR=33;SRF=28;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0499828;STB=0.532409;TYPE=snp;VARB=0.0185444;OID=.;OPOS=125076589;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:59:60:57:57:33:24:28:31:33:24:29:31 chr8 125107201 . G A 229.5 PASS AO=82;DP=233;FAO=83;FDP=235;FR=.;FRO=152;FSAF=52;FSAR=31;FSRF=79;FSRR=73;FWDB=-0.00385898;FXX=0.00843846;HRUN=2;LEN=1;MLLD=259.193;QD=3.90646;RBI=0.00897076;REFB=0.00700983;REVB=0.00809831;RO=149;SAF=52;SAR=30;SRF=79;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121952;STB=0.571109;TYPE=snp;VARB=-0.0114585;OID=.;OPOS=125107201;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:233:235:149:152:82:83:30:52:79:70:31:52:79:73 chr8 125107207 . C T 234.9 PASS AO=82;DP=231;FAO=84;FDP=236;FR=.;FRO=152;FSAF=51;FSAR=33;FSRF=79;FSRR=73;FWDB=-0.00149465;FXX=0.00421923;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.9933;QD=3.98132;RBI=0.0015747;REFB=0.00948536;REVB=0.000495695;RO=145;SAF=50;SAR=32;SRF=78;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0829969;STB=0.557536;TYPE=snp;VARB=-0.0251467;OID=.;OPOS=125107207;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:231:236:145:152:82:84:32:50:78:67:33:51:79:73 chr8 125272972 . T A 134.77 PASS AO=32;DP=68;FAO=32;FDP=68;FR=.;FRO=36;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=-0.0146663;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.381;QD=7.92786;RBI=0.0150347;REFB=-0.0100779;REVB=0.00330785;RO=36;SAF=20;SAR=12;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222867;STB=0.624922;TYPE=snp;VARB=0.0101381;OID=.;OPOS=125272972;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:36:36:32:32:12:20:14:22:12:20:14:22 chr8 125463250 . T C 856.59 PASS AO=140;DP=202;FAO=140;FDP=201;FR=.;FRO=61;FSAF=47;FSAR=93;FSRF=18;FSRR=43;FWDB=-0.000949991;FXX=0.00495025;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.268;QD=17.0466;RBI=0.0131256;REFB=-0.0376728;REVB=0.0130912;RO=61;SAF=47;SAR=93;SRF=18;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0260654;STB=0.513948;TYPE=snp;VARB=0.0115468;OID=.;OPOS=125463250;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:201:61:61:140:140:93:47:18:43:93:47:18:43 chr8 125463544 . T C 323.78 PASS AO=74;DP=145;FAO=74;FDP=146;FR=.;FRO=72;FSAF=43;FSAR=31;FSRF=42;FSRR=30;FWDB=0.00310831;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.83;QD=8.87064;RBI=0.00474865;REFB=-0.0395573;REVB=0.00358999;RO=70;SAF=43;SAR=31;SRF=40;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00875093;STB=0.501141;TYPE=snp;VARB=0.0291871;OID=.;OPOS=125463544;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:146:70:72:74:74:31:43:40:30:31:43:42:30 chr8 125498547 . C T 315.72 PASS AO=83;DP=184;FAO=83;FDP=184;FR=.;FRO=101;FSAF=45;FSAR=38;FSRF=47;FSRR=54;FWDB=0.012215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.837;QD=6.86351;RBI=0.03506;REFB=-0.0116605;REVB=-0.0328633;RO=100;SAF=45;SAR=38;SRF=47;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0710813;STB=0.542158;TYPE=snp;VARB=0.0151066;OID=.;OPOS=125498547;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:184:100:101:83:83:38:45:47:53:38:45:47:54 chr8 125551364 . A G 112.33 PASS AO=21;DP=36;FAO=21;FDP=36;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=-0.0366913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.153;QD=12.4814;RBI=0.039271;REFB=0.00795696;REVB=-0.0139986;RO=15;SAF=7;SAR=14;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0573739;STB=0.531885;TYPE=snp;VARB=-0.0041049;OID=.;OPOS=125551364;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:36:36:15:15:21:21:14:7:4:11:14:7:4:11 chr8 125565328 . T C 308.69 PASS AO=95;DP=239;FAO=95;FDP=238;FR=.;FRO=143;FSAF=52;FSAR=43;FSRF=53;FSRR=90;FWDB=-0.0449121;FXX=0.00833299;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.295;QD=5.18807;RBI=0.0471809;REFB=-0.00712083;REVB=0.0144548;RO=142;SAF=52;SAR=43;SRF=53;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184453;STB=0.605;TYPE=snp;VARB=0.0121496;OID=.;OPOS=125565328;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:239:238:142:143:95:95:43:52:53:89:43:52:53:90 chr8 125568093 . C T 106.42 PASS AO=20;DP=48;FAO=21;FDP=42;FR=.,HEALED;FRO=21;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.00611984;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=76.8413;QD=10.1347;RBI=0.0194111;REFB=-0.0565669;REVB=0.0184212;RO=11;SAF=10;SAR=10;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0873047;STB=0.523895;TYPE=snp;VARB=0.0355184;OID=.;OPOS=125568093;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:40:42:11:21:20:21:10:10:7:4:10:11:12:9 chr8 125579973 . C T 1411.15 PASS AO=149;DP=151;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00424607;FXX=0.0261421;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.618;QD=37.8832;RBI=0.00472367;REFB=0;REVB=0.00206977;RO=0;SAF=71;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.70067e-05;OID=.;OPOS=125579973;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:151:149:0:0:149:149:78:71:0:0:78:71:0:0 chr8 125579990 . C T 1638.96 PASS AO=173;DP=174;FAO=173;FDP=173;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00867546;FXX=0.0114279;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.281;QD=37.895;RBI=0.0563748;REFB=-0.0256155;REVB=-0.0557033;RO=1;SAF=80;SAR=93;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00509093;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000410303;OID=.;OPOS=125579990;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:174:173:1:0:173:173:93:80:0:1:93:80:0:0 chr8 126283111 . G T 472.48 PASS AO=49;DP=51;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163695;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.693;QD=37.7985;RBI=0.0516265;REFB=0;REVB=0.0489626;RO=0;SAF=16;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00015991;OID=.;OPOS=126283111;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:51:50:0:0:49:50:33:16:0:0:33:17:0:0 chr8 126448845 . C T 239.08 PASS AO=67;DP=158;FAO=67;FDP=158;FR=.;FRO=91;FSAF=27;FSAR=40;FSRF=46;FSRR=45;FWDB=0.0357953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.41;QD=6.05253;RBI=0.0406224;REFB=-0.0251837;REVB=0.019206;RO=90;SAF=27;SAR=40;SRF=45;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100948;STB=0.559905;TYPE=snp;VARB=0.0254718;OID=.;OPOS=126448845;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:158:90:91:67:67:40:27:45:45:40:27:46:45 chr8 126449406 . C T 213.66 PASS AO=64;DP=161;FAO=64;FDP=160;FR=.;FRO=96;FSAF=38;FSAR=26;FSRF=58;FSRR=38;FWDB=-0.0408009;FXX=0.00621079;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.409;QD=5.34136;RBI=0.0476266;REFB=-0.00280039;REVB=0.0245678;RO=94;SAF=38;SAR=26;SRF=58;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0256662;STB=0.506491;TYPE=snp;VARB=0.00398344;OID=.;OPOS=126449406;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:160:94:96:64:64:26:38:58:36:26:38:58:38 chr8 126450286 . ATTTTG A 58.79 PASS AO=37;DP=148;FAO=41;FDP=128;FR=.;FRO=87;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=41;FSRR=46;FWDB=-0.0311851;FXX=0.0857082;HRUN=4;LEN=5;MLLD=186.644;QD=1.83709;RBI=0.0312305;REFB=0.00475403;REVB=-0.00168267;RO=32;SAF=21;SAR=16;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0832901;STB=0.577723;TYPE=del;VARB=-0.0106756;OID=.;OPOS=126450287;OREF=TTTTG;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:37:97:41:128:87:24:17:41:46:58:32:21:16:15:17 chr8 127683774 . G T 243.42 PASS AO=52;DP=135;FAO=63;FDP=130;FR=.;FRO=67;FSAF=38;FSAR=25;FSRF=34;FSRR=33;FWDB=-0.00422442;FXX=0.0370343;HRUN=3;LEN=1;MLLD=134.198;QD=7.48978;RBI=0.0104115;REFB=-0.00433033;REVB=0.00951597;RO=65;SAF=38;SAR=14;SRF=32;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.259092;STB=0.550433;TYPE=snp;VARB=0.0107572;OID=.;OPOS=127683774;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:130:65:67:52:63:14:38:32:33:25:38:34:33 chr8 127683850 . T C 1741.91 PASS AO=183;DP=184;FAO=184;FDP=184;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0158145;FXX=0.00540511;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.032;QD=37.8676;RBI=0.0454569;REFB=0;REVB=0.0426172;RO=0;SAF=82;SAR=101;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.10554e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.13155e-05;OID=.;OPOS=127683850;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:184:184:0:0:183:184:101:82:0:0:102:82:0:0 chr8 128428656 . A C 2723.42 PASS AO=294;DP=306;FAO=295;FDP=301;FR=.;FRO=6;FSAF=150;FSAR=145;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=-0.00512964;FXX=0.0163393;HRUN=4;LEN=1;MLLD=69.3338;QD=36.1916;RBI=0.0287235;REFB=-0.170029;REVB=0.0282618;RO=1;SAF=150;SAR=144;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00330043;STB=0.510134;TYPE=snp;VARB=0.00158862;OID=.;OPOS=128428656;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:306:301:1:6:294:295:144:150:0:1:145:150:0:6 chr8 128428751 . A G 696.53 PASS AO=156;DP=296;FAO=156;FDP=299;FR=.;FRO=143;FSAF=74;FSAR=82;FSRF=56;FSRR=87;FWDB=0.0101957;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.224;QD=9.31808;RBI=0.0329575;REFB=0.012373;REVB=-0.0313408;RO=140;SAF=74;SAR=82;SRF=54;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.077433;STB=0.539838;TYPE=snp;VARB=-0.00863065;OID=.;OPOS=128428751;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:296:299:140:143:156:156:82:74:54:86:82:74:56:87 chr8 128429262 . G C 30.18 PASS AO=14;DP=53;FAO=14;FDP=55;FR=.;FRO=41;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=0.0201562;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.3647;QD=2.19456;RBI=0.0383982;REFB=-0.0112169;REVB=0.0326825;RO=38;SAF=7;SAR=7;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0313834;STB=0.509078;TYPE=snp;VARB=0.0428361;OID=.;OPOS=128429262;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:53:55:38:41:14:14:7:7:20:18:7:7:20:21 chr8 128429660 . T C 404.06 PASS AO=85;DP=154;FAO=85;FDP=155;FR=.;FRO=70;FSAF=31;FSAR=54;FSRF=33;FSRR=37;FWDB=0.00373829;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.009;QD=10.4272;RBI=0.0298397;REFB=0.0124654;REVB=0.0296046;RO=67;SAF=31;SAR=54;SRF=31;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0832186;STB=0.550569;TYPE=snp;VARB=-0.00974915;OID=.;OPOS=128429660;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:155:67:70:85:85:54:31:31:36:54:31:33:37 chr8 128429779 . T G 50.75 PASS AO=14;DP=37;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=-0.00888288;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=193.835;QD=5.4869;RBI=0.0284533;REFB=-0.0124598;REVB=-0.0270312;RO=23;SAF=6;SAR=8;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0887419;STB=0.551928;TYPE=snp;VARB=0.0248977;OID=.;OPOS=128429779;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:37:37:23:23:14:14:8:6:8:15:8:6:8:15 chr8 128430501 . C T 100.21 PASS AO=20;DP=37;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=20;FSAR=0;FSRF=17;FSRR=0;FWDB=-0.00988687;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.91;QD=10.8335;RBI=0.00988687;REFB=-0.000191824;REVB=0;RO=17;SAF=20;SAR=0;SRF=17;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.57181e-05;OID=.;OPOS=128430501;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:37:37:17:17:20:20:0:20:17:0:0:20:17:0 chr8 128431694 . A G 539.8 PASS AO=103;DP=178;FAO=105;FDP=179;FR=.;FRO=74;FSAF=47;FSAR=58;FSRF=40;FSRR=34;FWDB=0.0135497;FXX=0.00555525;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.499;QD=12.0625;RBI=0.0140256;REFB=-0.0370912;REVB=-0.00362262;RO=74;SAF=45;SAR=58;SRF=40;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.080177;STB=0.53852;TYPE=snp;VARB=0.0343256;OID=.;OPOS=128431694;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:179:74:74:103:105:58:45:40:34:58:47:40:34 chr8 128431768 . A G 224.79 PASS AO=64;DP=153;FAO=64;FDP=153;FR=.;FRO=89;FSAF=35;FSAR=29;FSRF=43;FSRR=46;FWDB=-0.00575134;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.243;QD=5.87697;RBI=0.00640567;REFB=-0.0108878;REVB=0.0028204;RO=89;SAF=35;SAR=29;SRF=43;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0662254;STB=0.537128;TYPE=snp;VARB=0.0159286;OID=.;OPOS=128431768;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:153:89:89:64:64:29:35:43:46:29:35:43:46 chr8 128432206 . C A 157.68 PASS AO=40;DP=107;FAO=47;FDP=113;FR=.;FRO=66;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=26;FSRR=40;FWDB=0.00678818;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.76;QD=5.58169;RBI=0.0132852;REFB=-0.00118438;REVB=0.01142;RO=64;SAF=21;SAR=19;SRF=25;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144768;STB=0.531428;TYPE=snp;VARB=0.00146247;OID=.;OPOS=128432206;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:113:64:66:40:47:19:21:25:39:26:21:26:40 chr8 129021179 . G A 220.92 PASS AO=59;DP=135;FAO=59;FDP=134;FR=.;FRO=75;FSAF=21;FSAR=38;FSRF=39;FSRR=36;FWDB=0.0118286;FXX=0.00740686;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.675;QD=6.59467;RBI=0.0144459;REFB=-0.00704311;REVB=-0.0082926;RO=70;SAF=21;SAR=38;SRF=37;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173;STB=0.594646;TYPE=snp;VARB=0.0106141;OID=.;OPOS=129021179;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:134:70:75:59:59:38:21:37:33:38:21:39:36 chr8 129022785 . T C 1642.07 PASS AO=172;DP=172;FAO=172;FDP=172;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00690486;FXX=0.00578001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.928;QD=38.1876;RBI=0.0094248;REFB=0;REVB=-0.0064148;RO=0;SAF=76;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.14094e-05;OID=.;OPOS=129022785;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:172:172:0:0:172:172:96:76:0:0:96:76:0:0 chr8 129022816 . G A 499.93 PASS AO=101;DP=178;FAO=101;FDP=178;FR=.;FRO=77;FSAF=43;FSAR=58;FSRF=33;FSRR=44;FWDB=0.00743286;FXX=0.0111105;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.628;QD=11.2345;RBI=0.0301595;REFB=-0.0149048;REVB=0.0292293;RO=77;SAF=43;SAR=58;SRF=33;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00229885;STB=0.501251;TYPE=snp;VARB=0.00442728;OID=.;OPOS=129022816;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:178:77:77:101:101:58:43:33:44:58:43:33:44 chr8 129022818 . T A 483.1 PASS AO=99;DP=176;FAO=99;FDP=176;FR=.;FRO=77;FSAF=43;FSAR=56;FSRF=33;FSRR=44;FWDB=0.00749717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.636;QD=10.9795;RBI=0.021535;REFB=-0.0093507;REVB=0.0201879;RO=76;SAF=43;SAR=56;SRF=33;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00010789;STB=0.502571;TYPE=snp;VARB=0.00500942;OID=.;OPOS=129022818;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:176:76:77:99:99:56:43:33:43:56:43:33:44 chr8 130760850 . A G 113.41 PASS AO=44;DP=78;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=-0.0147206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.804;QD=8.89479;RBI=0.0333088;REFB=-0.0287723;REVB=-0.0298794;RO=34;SAF=8;SAR=36;SRF=11;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16548;STB=0.536812;TYPE=snp;VARB=0.0300439;OID=.;OPOS=130760850;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:51:34:26:44:25:36:8:11:23:17:8:10:16 chr8 130762291 . G A 339.11 PASS AO=100;DP=243;FAO=100;FDP=242;FR=.;FRO=142;FSAF=50;FSAR=50;FSRF=71;FSRR=71;FWDB=-0.00610913;FXX=0.00411506;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.145;QD=5.60517;RBI=0.0143127;REFB=-0.0201686;REVB=0.0129434;RO=132;SAF=50;SAR=50;SRF=67;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00774096;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0205156;OID=.;OPOS=130762291;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:243:242:132:142:100:100:50:50:67:65:50:50:71:71 chr8 131353139 . T C 662.67 PASS AO=81;DP=92;FAO=85;FDP=92;FR=.;FRO=7;FSAF=49;FSAR=36;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=0.124834;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.609;QD=28.8117;RBI=0.126884;REFB=-0.202742;REVB=0.0227173;RO=11;SAF=45;SAR=36;SRF=11;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102729;STB=0.533326;TYPE=snp;VARB=0.00951366;OID=.;OPOS=131353139;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:92:92:11:7:81:85:36:45:11:0:36:49:7:0 chr8 131921956 . A G 554.19 PASS AO=147;DP=307;FAO=140;FDP=299;FR=.;FRO=159;FSAF=62;FSAR=78;FSRF=70;FSRR=89;FWDB=0.0422971;FXX=0.0323614;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.339;QD=7.41392;RBI=0.0451571;REFB=0.00337936;REVB=-0.0158149;RO=149;SAF=69;SAR=78;SRF=62;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0492655;STB=0.501404;TYPE=snp;VARB=-0.00317047;OID=.;OPOS=131921956;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:307:299:149:159:147:140:78:69:62:87:78:62:70:89 chr8 132982824 . A G 183.72 PASS AO=64;DP=179;FAO=64;FDP=179;FR=.;FRO=115;FSAF=20;FSAR=44;FSRF=19;FSRR=96;FWDB=-0.0144198;FXX=0.0110491;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.7674;QD=4.10553;RBI=0.0148701;REFB=-0.00888711;REVB=-0.00363154;RO=115;SAF=20;SAR=44;SRF=19;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214133;STB=0.619985;TYPE=snp;VARB=0.0183821;OID=.;OPOS=132982824;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:179:115:115:64:64:44:20:19:96:44:20:19:96 chr8 133048593 . C T 471.94 PASS AO=60;DP=67;FAO=59;FDP=67;FR=.;FRO=8;FSAF=54;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0102847;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.7914;QD=28.1753;RBI=0.0426065;REFB=-0.0113599;REVB=-0.0413466;RO=7;SAF=55;SAR=5;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18372;STB=0.594186;TYPE=snp;VARB=0.0155652;OID=.;OPOS=133048593;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:67:67:7:8:60:59:5:55:4:3:5:54:5:3 chr8 133048619 . T C 602.82 PASS AO=66;DP=68;FAO=66;FDP=68;FR=.;FRO=2;FSAF=61;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.011417;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=183.019;QD=35.4598;RBI=0.0117697;REFB=-0.0390217;REVB=0.00285973;RO=2;SAF=61;SAR=5;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0779265;STB=0.541407;TYPE=snp;VARB=-1.79483e-05;OID=.;OPOS=133048619;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:68:68:2:2:66:66:5:61:1:1:5:61:1:1 chr8 133053309 . T C 150.66 PASS AO=36;DP=76;FAO=36;FDP=76;FR=.;FRO=40;FSAF=26;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=-0.0246801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.281;QD=7.92924;RBI=0.0369902;REFB=-0.00912252;REVB=0.0275529;RO=40;SAF=26;SAR=10;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229429;STB=0.628957;TYPE=snp;VARB=0.0085592;OID=.;OPOS=133053309;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:40:40:36:36:10:26:20:20:10:26:20:20 chr8 133053318 . T C 140.45 PASS AO=35;DP=77;FAO=35;FDP=77;FR=.;FRO=42;FSAF=26;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=0.0288671;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.245;QD=7.29611;RBI=0.0291229;REFB=0.001837;REVB=0.00385155;RO=41;SAF=26;SAR=9;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.248898;STB=0.648289;TYPE=snp;VARB=-0.00214051;OID=.;OPOS=133053318;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:41:42:35:35:9:26:21:20:9:26:21:21 chr8 133067315 . G A 213.34 PASS AO=41;DP=71;FAO=41;FDP=71;FR=.;FRO=30;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=0.00327272;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.787;QD=12.0192;RBI=0.0118175;REFB=-0.00863527;REVB=0.0113553;RO=30;SAF=19;SAR=22;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104809;STB=0.557506;TYPE=snp;VARB=0.00797472;OID=.;OPOS=133067315;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:30:30:41:41:22:19:18:12:22:19:18:12 chr8 133089975 . A G 158.85 PASS AO=38;DP=81;FAO=38;FDP=81;FR=.;FRO=43;FSAF=8;FSAR=30;FSRF=14;FSRR=29;FWDB=0.00407372;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.6286;QD=7.84445;RBI=0.0200184;REFB=-0.00882213;REVB=-0.0195995;RO=42;SAF=8;SAR=30;SRF=13;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127454;STB=0.582992;TYPE=snp;VARB=0.0142386;OID=.;OPOS=133089975;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:42:43:38:38:30:8:13:29:30:8:14:29 chr8 133092138 . G A 322.23 PASS AO=78;DP=162;FAO=78;FDP=162;FR=.;FRO=84;FSAF=27;FSAR=51;FSRF=39;FSRR=45;FWDB=-0.00248968;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=151.449;QD=7.95627;RBI=0.00921134;REFB=0.0018951;REVB=-0.0088685;RO=84;SAF=27;SAR=51;SRF=39;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11731;STB=0.564938;TYPE=snp;VARB=-0.0025515;OID=.;OPOS=133092138;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:162:84:84:78:78:51:27:39:45:51:27:39:45 chr8 133101818 . G A 1838.63 PASS AO=193;DP=193;FAO=192;FDP=192;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=123;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00697935;FXX=0.0103087;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.486;QD=38.3049;RBI=0.00717579;REFB=0;REVB=-0.00166753;RO=0;SAF=70;SAR=123;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.91417e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000184626;OID=.;OPOS=133101818;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:87:193:192:0:0:193:192:123:70:0:0:123:69:0:0 chr8 133107830 . T C 1874.07 PASS AO=172;DP=172;FAO=196;FDP=196;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00278197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.219;QD=38.2464;RBI=0.0720421;REFB=0;REVB=0.0719884;RO=0;SAF=101;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000109134;OID=.;OPOS=133107830;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:172:196:0:0:172:196:71:101:0:0:95:101:0:0 chr8 133112392 . G A 999.25 PASS AO=101;DP=101;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0437049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.995;QD=38.0666;RBI=0.0442463;REFB=0;REVB=0.00690057;RO=0;SAF=29;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.81124e-05;OID=.;OPOS=133112392;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:101:105:0:0:101:105:72:29:0:0:73:32:0:0 chr8 133113531 . A T 784.89 PASS AO=92;DP=102;FAO=94;FDP=103;FR=.;FRO=9;FSAF=54;FSAR=40;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=-0.0218326;FXX=0.00961446;HRUN=4;LEN=1;MLLD=85.2703;QD=30.4813;RBI=0.0278824;REFB=-0.107215;REVB=-0.0173425;RO=6;SAF=53;SAR=39;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0481533;STB=0.531178;TYPE=snp;VARB=0.00758994;OID=.;OPOS=133113531;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:102:103:6:9:92:94:39:53:1:5:40:54:2:7 chr8 133637659 . G A 636.37 PASS AO=139;DP=261;FAO=139;FDP=261;FR=.;FRO=122;FSAF=50;FSAR=89;FSRF=50;FSRR=72;FWDB=-0.0120316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.394;QD=9.75275;RBI=0.0122628;REFB=-0.0147278;REVB=0.00237032;RO=121;SAF=50;SAR=89;SRF=49;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0413348;STB=0.52507;TYPE=snp;VARB=0.0104101;OID=.;OPOS=133637659;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:261:261:121:122:139:139:89:50:49:72:89:50:50:72 chr8 133723166 . A G 444.31 PASS AO=108;DP=220;FAO=107;FDP=220;FR=.;FRO=113;FSAF=68;FSAR=39;FSRF=61;FSRR=52;FWDB=0.00587875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.45;QD=8.0784;RBI=0.00613208;REFB=-0.0183144;REVB=-0.00174434;RO=110;SAF=68;SAR=40;SRF=61;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0722732;STB=0.551555;TYPE=snp;VARB=0.0209622;OID=.;OPOS=133723166;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:220:220:110:113:108:107:40:68:61:49:39:68:61:52 chr8 133759318 . A G 156.73 PASS AO=30;DP=133;FAO=39;FDP=128;FR=.,HEALED;FRO=78;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=34;FSRR=44;FWDB=-0.00950588;FXX=0.022899;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.152;QD=4.89792;RBI=0.0296538;REFB=-0.0281778;REVB=0.0280889;RO=79;SAF=16;SAR=14;SRF=35;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109461;STB=0.517543;TYPE=snp;VARB=0.0638389;OID=.;OPOS=133759318;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:132:128:79:78:30:39:14:16:35:44:23:16:34:44 chr8 133844508 . C T 477.83 PASS AO=118;DP=240;FAO=115;FDP=236;FR=.;FRO=121;FSAF=49;FSAR=66;FSRF=61;FSRR=60;FWDB=0.00921786;FXX=0.020746;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.136;QD=8.09883;RBI=0.00926325;REFB=-0.000763658;REVB=0.000915805;RO=119;SAF=52;SAR=66;SRF=61;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0661134;STB=0.540413;TYPE=snp;VARB=0.000886573;OID=.;OPOS=133844508;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:240:236:119:121:118:115:66:52:61:58:66:49:61:60 chr8 133858712 . G A 585.19 PASS AO=145;DP=306;FAO=146;FDP=306;FR=.;FRO=160;FSAF=59;FSAR=87;FSRF=65;FSRR=95;FWDB=-0.000220905;FXX=0.00970842;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.2;QD=7.64947;RBI=0.00440095;REFB=-0.0123448;REVB=0.0043954;RO=157;SAF=59;SAR=86;SRF=63;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00551064;STB=0.501161;TYPE=snp;VARB=0.0150292;OID=.;OPOS=133858712;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:306:306:157:160:145:146:86:59:63:94:87:59:65:95 chr8 133859877 . G T 283.82 PASS AO=58;DP=107;FAO=59;FDP=108;FR=.;FRO=49;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=20;FSRR=29;FWDB=0.018099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.8479;QD=10.5118;RBI=0.0286652;REFB=-0.00627109;REVB=0.0222288;RO=48;SAF=30;SAR=28;SRF=20;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0829022;STB=0.553034;TYPE=snp;VARB=0.00830856;OID=.;OPOS=133859877;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:108:48:49:58:59:28:30:20:28:28:31:20:29 chr8 133900252 . T G 955.46 PASS AO=95;DP=95;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0454009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.385;QD=38.2185;RBI=0.0756412;REFB=0;REVB=0.0605008;RO=0;SAF=29;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000207997;OID=.;OPOS=133900252;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:95:100:0:0:95:100:66:29:0:0:70:30:0:0 chr8 133900386 . T C 604.55 PASS AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00841429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.922;QD=37.7841;RBI=0.0162936;REFB=0;REVB=0.0139528;RO=0;SAF=34;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.81878e-05;OID=.;OPOS=133900386;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:64:64:0:0:64:64:30:34:0:0:30:34:0:0 chr8 133909974 . A G 465.4 PASS AO=50;DP=56;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196049;FXX=0.109071;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.432;QD=37.9915;RBI=0.0326873;REFB=0;REVB=-0.0261554;RO=0;SAF=16;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000490019;OID=.;OPOS=133909974;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:56:49:0:0:50:49:34:16:0:0:34:15:0:0 chr8 133918937 . G A 122.47 PASS AO=26;DP=51;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.00420478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.133;QD=9.60558;RBI=0.0276313;REFB=-0.0268508;REVB=-0.0273095;RO=25;SAF=19;SAR=7;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275515;STB=0.655046;TYPE=snp;VARB=0.0186626;OID=.;OPOS=133918937;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:25:25:26:26:7:19:11:14:7:19:11:14 chr8 133920518 . A G 1097.23 PASS AO=113;DP=113;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0153945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.985;QD=38.1645;RBI=0.0281097;REFB=0;REVB=-0.0235194;RO=0;SAF=48;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.71507e-05;OID=.;OPOS=133920518;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:113:115:0:0:113:115:65:48:0:0:65:50:0:0 chr8 133931748 . T C 1856.32 PASS AO=191;DP=194;FAO=194;FDP=194;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=128;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0221765;FXX=0.0102036;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.716;QD=38.2747;RBI=0.0247767;REFB=0;REVB=-0.0110494;RO=0;SAF=65;SAR=126;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.16555e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.12191e-05;OID=.;OPOS=133931748;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:194:194:0:0:191:194:126:65:0:0:128:66:0:0 chr8 133975282 . AG A,AA 1035.95 PASS AO=45,62;DP=110;FAO=17,93;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=3,47;FSAR=14,46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0549328,0.0743127;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=194.833,198.621;QD=37.671;RBI=0.0591006,0.0771109;REFB=0,0;REVB=0.0218006,0.0205844;RO=0;SAF=22,27;SAR=23,35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-5.46408e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.0281453,0.00610206;OID=.,.;OPOS=133975283,133975283;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:45,62:107:17,93:110:0:3,47:14,46:0:0:16:0:22,27:23,35:0:0 chr8 133984058 . C T 647.44 PASS AO=135;DP=249;FAO=137;FDP=250;FR=.;FRO=113;FSAF=40;FSAR=97;FSRF=49;FSRR=64;FWDB=0.0266435;FXX=0.00793619;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.666;QD=10.3591;RBI=0.0270626;REFB=-0.0334664;REVB=0.00474423;RO=111;SAF=38;SAR=97;SRF=49;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151414;STB=0.572735;TYPE=snp;VARB=0.0224066;OID=.;OPOS=133984058;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:249:250:111:113:135:137:97:38:49:62:97:40:49:64 chr8 134024278 . C T 134.45 PASS AO=43;DP=119;FAO=44;FDP=120;FR=.;FRO=76;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=56;FWDB=0.0379342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.679;QD=4.48169;RBI=0.0547326;REFB=-0.0176687;REVB=0.0394544;RO=72;SAF=21;SAR=22;SRF=20;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234976;STB=0.649938;TYPE=snp;VARB=0.0311858;OID=.;OPOS=134024278;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:120:72:76:43:44:22:21:20:52:22:22:20:56 chr8 134108453 . C T 250.23 PASS AO=74;DP=181;FAO=74;FDP=181;FR=.;FRO=107;FSAF=35;FSAR=39;FSRF=67;FSRR=40;FWDB=0.0358225;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.677;QD=5.52997;RBI=0.0483779;REFB=0.0213295;REVB=-0.0325141;RO=107;SAF=35;SAR=39;SRF=67;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160696;STB=0.589921;TYPE=snp;VARB=-0.0370597;OID=.;OPOS=134108453;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:181:107:107:74:74:39:35:67:40:39:35:67:40 chr8 134125682 . G A 124.91 PASS AO=33;DP=78;FAO=33;FDP=77;FR=.;FRO=44;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=15;FWDB=-0.00579105;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.635;QD=6.48905;RBI=0.034544;REFB=0.00345135;REVB=-0.0340551;RO=45;SAF=18;SAR=15;SRF=29;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103112;STB=0.566226;TYPE=snp;VARB=-0.00764329;OID=.;OPOS=134125682;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:77:45:44:33:33:15:18:29:16:15:18:29:15 chr8 134144113 . C T 273.96 PASS AO=56;DP=102;FAO=56;FDP=101;FR=.;FRO=45;FSAF=3;FSAR=53;FSRF=2;FSRR=43;FWDB=0.00410259;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.673;QD=10.85;RBI=0.00872491;REFB=-0.0200672;REVB=-0.00770018;RO=45;SAF=3;SAR=53;SRF=2;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0380572;STB=0.520788;TYPE=snp;VARB=0.0103751;OID=.;OPOS=134144113;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:101:45:45:56:56:53:3:2:43:53:3:2:43 chr8 134146978 . TG T 954.42 PASS AO=121;DP=174;FAO=163;FDP=163;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.204554;FXX=0.0632148;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.6915;QD=23.4214;RBI=0.353469;REFB=0;REVB=0.288267;RO=33;SAF=61;SAR=60;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0.612613;SSSB=0.0199601;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00715881;OID=.;OPOS=134146979;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:121:173:163:163:0:80:83:0:0:85:33:61:60:15:18 chr8 134237635 . G T 112.4 PASS AO=38;DP=111;FAO=39;FDP=111;FR=.;FRO=72;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=29;FSRR=43;FWDB=-0.000449275;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.208;QD=4.05061;RBI=0.0146712;REFB=-0.0213835;REVB=0.0146643;RO=69;SAF=17;SAR=21;SRF=26;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0810343;STB=0.521954;TYPE=snp;VARB=0.0317614;OID=.;OPOS=134237635;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:69:72:38:39:21:17:26:43:22:17:29:43 chr8 134239770 . T C 508.56 PASS AO=114;DP=228;FAO=118;FDP=233;FR=.;FRO=115;FSAF=61;FSAR=57;FSRF=45;FSRR=70;FWDB=0.0359026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.0558;QD=8.7307;RBI=0.043049;REFB=0.0367497;REVB=-0.0237534;RO=114;SAF=59;SAR=55;SRF=44;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119555;STB=0.561814;TYPE=snp;VARB=-0.020835;OID=.;OPOS=134239770;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:228:233:114:115:114:118:55:59:44:70:57:61:45:70 chr8 134260948 . A G 47.12 PASS AO=15;DP=42;FAO=14;FDP=41;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=-0.0183872;FXX=0.0238039;HRUN=4;LEN=1;MLLD=35.1707;QD=4.59727;RBI=0.0194991;REFB=-0.0493058;REVB=0.00649038;RO=27;SAF=10;SAR=5;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.354133;STB=0.696702;TYPE=snp;VARB=0.0732691;OID=.;OPOS=134260948;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:42:41:27:27:15:14:5:10:9:18:5:9:9:18 chr8 134292516 . A G 642.25 PASS AO=71;DP=76;FAO=74;FDP=79;FR=.;FRO=5;FSAF=24;FSAR=50;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.121968;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=43.2855;QD=32.5188;RBI=0.126364;REFB=-0.0667294;REVB=-0.0330409;RO=5;SAF=23;SAR=48;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0176851;STB=0.509031;TYPE=snp;VARB=0.0114313;OID=.;OPOS=134292516;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:76:79:5:5:71:74:48:23:1:4:50:24:1:4 chr8 134474148 . C T 260.83 PASS AO=59;DP=119;FAO=60;FDP=118;FR=.;FRO=58;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=37;FSRR=21;FWDB=0.012608;FXX=0.00840265;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.368;QD=8.84184;RBI=0.0229211;REFB=-0.0080445;REVB=0.019142;RO=58;SAF=27;SAR=32;SRF=36;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145669;STB=0.591567;TYPE=snp;VARB=0.0131924;OID=.;OPOS=134474148;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:118:58:58:59:60:32:27:36:22:33:27:37:21 chr8 134488007 . G A 83.98 PASS AO=20;DP=44;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.0094116;FXX=0.0222173;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.884;QD=7.63499;RBI=0.0112914;REFB=-0.0120384;REVB=-0.00623845;RO=23;SAF=14;SAR=6;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0521471;STB=0.521255;TYPE=snp;VARB=0.0112459;OID=.;OPOS=134488007;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:44:44:23:24:20:20:6:14:15:8:6:14:16:8 chr8 135522364 . A G 130.59 PASS AO=52;DP=163;FAO=52;FDP=161;FR=.;FRO=109;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=52;FSRR=57;FWDB=0.032077;FXX=0.035926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.154;QD=3.24458;RBI=0.0537142;REFB=-0.0242236;REVB=-0.0430846;RO=106;SAF=21;SAR=31;SRF=50;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0803708;STB=0.550455;TYPE=snp;VARB=0.0417525;OID=.;OPOS=135522364;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:161:106:109:52:52:31:21:50:56:31:21:52:57 chr8 135524797 . G T 375.82 PASS AO=70;DP=118;FAO=71;FDP=119;FR=.;FRO=48;FSAF=31;FSAR=40;FSRF=12;FSRR=36;FWDB=-0.0119894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.706;QD=12.6328;RBI=0.0197139;REFB=-0.0310745;REVB=-0.015649;RO=48;SAF=31;SAR=39;SRF=12;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14932;STB=0.577997;TYPE=snp;VARB=0.027257;OID=.;OPOS=135524797;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:119:48:48:70:71:39:31:12:36:40:31:12:36 chr8 135612595 . A G 102.27 PASS AO=20;DP=36;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=18;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.00974849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.971;QD=11.3634;RBI=0.0449922;REFB=-0.00384526;REVB=0.0439234;RO=16;SAF=18;SAR=2;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.382352;STB=0.719726;TYPE=snp;VARB=0.00450849;OID=.;OPOS=135612595;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:36:36:16:16:20:20:2:18:10:6:2:18:10:6 chr8 135612745 . A G 501.26 PASS AO=107;DP=203;FAO=110;FDP=206;FR=.;FRO=96;FSAF=59;FSAR=51;FSRF=40;FSRR=56;FWDB=0.0155944;FXX=0.00483068;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.363;QD=9.73316;RBI=0.0155944;REFB=-0.021175;REVB=-4.39673e-05;RO=94;SAF=56;SAR=51;SRF=38;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101678;STB=0.555614;TYPE=snp;VARB=0.0157143;OID=.;OPOS=135612745;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:206:94:96:107:110:51:56:38:56:51:59:40:56 chr8 135614705 . A G 88.04 PASS AO=21;DP=46;FAO=21;FDP=46;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=-0.0304538;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.647;QD=7.65528;RBI=0.0324758;REFB=0.00457671;REVB=-0.0112804;RO=25;SAF=16;SAR=5;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.431025;STB=0.745524;TYPE=snp;VARB=-0.00798004;OID=.;OPOS=135614705;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:46:46:25:25:21:21:5:16:8:17:5:16:8:17 chr8 135614972 . A G 165.92 PASS AO=51;DP=132;FAO=51;FDP=132;FR=.;FRO=81;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=37;FSRR=44;FWDB=-0.0603337;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.1721;QD=5.02791;RBI=0.061565;REFB=0.00555698;REVB=-0.0122511;RO=81;SAF=27;SAR=24;SRF=37;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0785054;STB=0.544467;TYPE=snp;VARB=-0.00883826;OID=.;OPOS=135614972;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:81:81:51:51:24:27:37:44:24:27:37:44 chr8 135649848 . G A 198.54 PASS AO=40;DP=72;FAO=40;FDP=72;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=29;FSRF=8;FSRR=24;FWDB=-0.0100349;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=222.142;QD=11.0302;RBI=0.0236337;REFB=-0.010433;REVB=0.0213975;RO=32;SAF=11;SAR=29;SRF=8;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0256391;STB=0.514102;TYPE=snp;VARB=0.00844517;OID=.;OPOS=135649848;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:32:32:40:40:29:11:8:24:29:11:8:24 chr8 136659426 . G A 554.98 PASS AO=54;DP=54;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0493194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.998;QD=38.2742;RBI=0.0499965;REFB=0;REVB=0.00820071;RO=0;SAF=27;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.37568e-05;OID=.;OPOS=136659426;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:54:58:0:0:54:58:27:27:0:0:29:29:0:0 chr8 139143942 . A G 1218.4 PASS AO=131;DP=133;FAO=131;FDP=133;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0452281;FXX=0.0148137;HRUN=3;LEN=1;MLLD=61.4552;QD=36.6437;RBI=0.0527828;REFB=0.0123053;REVB=0.027211;RO=2;SAF=27;SAR=104;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00905242;STB=0.504761;TYPE=snp;VARB=-0.00125221;OID=.;OPOS=139143942;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:133:133:2:2:131:131:104:27:0:2:104:27:0:2 chr8 139143958 . T C 188.79 PASS AO=52;DP=128;FAO=54;FDP=128;FR=.;FRO=74;FSAF=13;FSAR=41;FSRF=7;FSRR=67;FWDB=0.0466128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.984;QD=5.89958;RBI=0.0490494;REFB=-0.00564816;REVB=0.0152671;RO=74;SAF=11;SAR=41;SRF=8;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183655;STB=0.631255;TYPE=snp;VARB=0.0100539;OID=.;OPOS=139143958;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:74:74:52:54:41:11:8:66:41:13:7:67 chr8 139149406 . G A 293.38 PASS AO=71;DP=152;FAO=73;FDP=153;FR=.;FRO=80;FSAF=43;FSAR=30;FSRF=29;FSRR=51;FWDB=-0.0089895;FXX=0.00649309;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.727;QD=7.66993;RBI=0.0386397;REFB=-0.0297798;REVB=0.0375795;RO=80;SAF=41;SAR=30;SRF=29;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203575;STB=0.617193;TYPE=snp;VARB=0.0217489;OID=.;OPOS=139149406;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:153:80:80:71:73:30:41:29:51:30:43:29:51 chr8 139165272 . T C 277.2 PASS AO=75;DP=175;FAO=76;FDP=175;FR=.;FRO=99;FSAF=50;FSAR=26;FSRF=52;FSRR=47;FWDB=0.00120746;FXX=0.0056815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.94;QD=6.33595;RBI=0.0205034;REFB=-0.0149102;REVB=0.0204678;RO=98;SAF=49;SAR=26;SRF=51;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141396;STB=0.57916;TYPE=snp;VARB=0.0182428;OID=.;OPOS=139165272;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:175:98:99:75:76:26:49:51:47:26:50:52:47 chr8 139165289 . T C 263.72 PASS AO=78;DP=193;FAO=78;FDP=191;FR=.;FRO=113;FSAF=51;FSAR=27;FSRF=51;FSRR=62;FWDB=-0.0163499;FXX=0.0103622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.316;QD=5.52294;RBI=0.0219065;REFB=-0.0145258;REVB=-0.01458;RO=110;SAF=51;SAR=27;SRF=50;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212704;STB=0.622346;TYPE=snp;VARB=0.0195284;OID=.;OPOS=139165289;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:191:110:113:78:78:27:51:50:60:27:51:51:62 chr8 139626176 . C G 1852.76 PASS AO=184;DP=187;FAO=196;FDP=196;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0322711;FXX=0.0150746;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.6348;QD=37.8115;RBI=0.0326198;REFB=0.000247224;REVB=-0.00475699;RO=0;SAF=89;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.5751e-05;OID=.;OPOS=139626176;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:187:196:0:0:184:196:95:89:0:0:105:91:0:0 chr8 139647262 . A G 361.49 PASS AO=35;DP=36;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189085;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.519;QD=38.0512;RBI=0.0383842;REFB=0;REVB=0.0334038;RO=0;SAF=33;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00109217;OID=.;OPOS=139647262;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:36:38:0:0:35:38:2:33:0:0:5:33:0:0 chr8 139672671 . T C 633.76 PASS AO=65;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00700235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.977;QD=37.8365;RBI=0.0274418;REFB=0;REVB=0.0265334;RO=0;SAF=44;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000601106;OID=.;OPOS=139672671;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:67:67:0:0:65:67:21:44:0:0:22:45:0:0 chr8 139697478 . T C 483.89 PASS AO=157;DP=413;FAO=150;FDP=379;FR=.;FRO=229;FSAF=48;FSAR=102;FSRF=80;FSRR=149;FWDB=0.0564335;FXX=0.0524987;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.7699;QD=5.10703;RBI=0.056443;REFB=-0.00744544;REVB=-0.00103707;RO=229;SAF=53;SAR=104;SRF=81;SRR=148;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0190128;STB=0.520074;TYPE=snp;VARB=0.0112709;OID=.;OPOS=139697478;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:413:379:229:229:157:150:104:53:81:148:102:48:80:149 chr8 139701209 . G T 257.53 PASS AO=77;DP=185;FAO=76;FDP=186;FR=.;FRO=110;FSAF=34;FSAR=42;FSRF=61;FSRR=49;FWDB=-0.0318745;FXX=0.0106377;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.005;QD=5.53827;RBI=0.0325068;REFB=-0.0175272;REVB=0.00637999;RO=106;SAF=34;SAR=43;SRF=58;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109308;STB=0.563224;TYPE=snp;VARB=0.0246264;OID=.;OPOS=139701209;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:186:106:110:77:76:43:34:58:48:42:34:61:49 chr8 139712323 . A G 475.93 PASS AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174204;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.23;QD=38.8512;RBI=0.0420854;REFB=0;REVB=0.0383108;RO=0;SAF=29;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000146881;OID=.;OPOS=139712323;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:50:49:0:0:49:49:20:29:0:0:20:29:0:0 chr8 139712346 . A G 140.43 PASS AO=31;DP=64;FAO=32;FDP=65;FR=.;FRO=33;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=0.0177428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.1937;QD=8.64193;RBI=0.0257612;REFB=-0.0479185;REVB=0.018677;RO=32;SAF=20;SAR=11;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165237;STB=0.605902;TYPE=snp;VARB=0.0410259;OID=.;OPOS=139712346;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:65:32:33:31:32:11:20:15:17:11:21:15:18 chr8 139736933 . C A 546.22 PASS AO=61;DP=63;FAO=61;FDP=63;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0339816;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=236.436;QD=34.6806;RBI=0.0420766;REFB=-0.00717257;REVB=0.024813;RO=2;SAF=15;SAR=46;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200828;STB=0.510635;TYPE=snp;VARB=0.000170882;OID=.;OPOS=139736933;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:63:63:2:2:61:61:46:15:0:2:46:15:0:2 chr8 139768085 . G A 241.87 PASS AO=24;DP=24;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0421344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.264;QD=37.211;RBI=0.0622078;REFB=0;REVB=0.0457658;RO=0;SAF=15;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000923513;OID=.;OPOS=139768085;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:24:26:0:0:24:26:9:15:0:0:9:17:0:0 chr8 139824057 . G A 59.47 PASS AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.017382;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=121.718;QD=6.60777;RBI=0.0204913;REFB=-0.00520208;REVB=0.0108517;RO=21;SAF=8;SAR=7;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199743;STB=0.615237;TYPE=snp;VARB=0.0461627;OID=.;OPOS=139824057;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:36:36:21:21:15:15:7:8:7:14:7:8:7:14 chr8 139838912 . T C 1109.23 PASS AO=120;DP=122;FAO=120;FDP=122;FR=.;FRO=2;FSAF=61;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0123024;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.522;QD=36.3683;RBI=0.0123887;REFB=-0.120209;REVB=-0.0014599;RO=2;SAF=61;SAR=59;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0158278;STB=0.508332;TYPE=snp;VARB=0.000613519;OID=.;OPOS=139838912;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:122:122:2:2:120:120:59:61:0:2:59:61:0:2 chr8 140630990 . A G 86.06 PASS AO=14;DP=49;FAO=21;FDP=45;FR=.,HEALED;FRO=24;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.00186503;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.0194;QD=7.64978;RBI=0.0583739;REFB=-0.0128295;REVB=0.0583441;RO=14;SAF=10;SAR=4;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.538425;TYPE=snp;VARB=0.0129124;OID=.;OPOS=140630990;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:41:45:14:24:14:21:4:10:10:4:9:12:12:12 chr8 141263015 . G A 266.52 PASS AO=74;DP=174;FAO=74;FDP=172;FR=.;FRO=98;FSAF=38;FSAR=36;FSRF=58;FSRR=40;FWDB=-0.0474211;FXX=0.0114936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.4468;QD=6.19813;RBI=0.0476327;REFB=-0.0174472;REVB=0.004485;RO=95;SAF=38;SAR=36;SRF=57;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0876192;STB=0.544755;TYPE=snp;VARB=0.0233296;OID=.;OPOS=141263015;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:172:95:98:74:74:36:38:57:38:36:38:58:40 chr8 141461062 . G A 1528.26 PASS AO=154;DP=155;FAO=161;FDP=161;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0715349;FXX=0.00617246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2093;QD=37.9693;RBI=0.0758768;REFB=0;REVB=0.0252991;RO=0;SAF=67;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000270424;OID=.;OPOS=141461062;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:155:161:0:0:154:161:87:67:0:0:88:73:0:0 chr8 141461185 . A G 720.19 PASS AO=64;DP=87;FAO=84;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0251947;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=150.868;QD=33.8911;RBI=0.0387793;REFB=0.0108133;REVB=0.0294798;RO=0;SAF=44;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506328;TYPE=snp;VARB=0.00408824;OID=.;OPOS=141461185;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:65:85:0:1:64:84:20:44:0:0:39:45:0:1 chr8 141461266 . A G 1456.41 PASS AO=123;DP=156;FAO=154;FDP=154;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=75;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0064608;FXX=0.0128197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.7867;QD=37.8289;RBI=0.0289863;REFB=0;REVB=0.028257;RO=0;SAF=49;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.79611e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000368413;OID=.;OPOS=141461266;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:152:154:0:0:123:154:74:49:0:0:79:75:0:0 chr8 141461267 . C G 20.78 PASS AO=27;DP=160;FAO=27;FDP=161;FR=.;FRO=134;FSAF=23;FSAR=4;FSRF=54;FSRR=80;FWDB=-0.00749061;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=71.5982;QD=0.516247;RBI=0.00869061;REFB=-0.0249717;REVB=0.00440653;RO=133;SAF=23;SAR=4;SRF=53;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.564969;STB=0.86224;TYPE=snp;VARB=0.0106287;OID=.;OPOS=141461267;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:160:161:133:134:27:27:4:23:53:80:4:23:54:80 chr8 141551407 . G A 121.1 PASS AO=27;DP=55;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.0429719;FXX=0.0517152;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.8255;QD=8.80719;RBI=0.0429753;REFB=-0.0127478;REVB=0.000540928;RO=28;SAF=9;SAR=18;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126903;STB=0.571374;TYPE=snp;VARB=0.0144997;OID=.;OPOS=141551407;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:28:28:27:27:18:9:13:15:18:9:13:15 chr8 141679817 . T C 491.69 PASS AO=52;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00645115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.511;QD=37.1089;RBI=0.0211938;REFB=0;REVB=-0.0201881;RO=0;SAF=20;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.00761e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.22019e-07;OID=.;OPOS=141679817;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:53:53:0:0:52:53:32:20:0:0:32:21:0:0 chr8 142146708 . T C 35.89 PASS AO=13;DP=42;FAO=13;FDP=44;FR=.;FRO=31;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=25;FSRR=6;FWDB=-0.0188178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.83;QD=3.26241;RBI=0.0317337;REFB=-0.00367366;REVB=0.0255522;RO=28;SAF=5;SAR=8;SRF=23;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.473013;STB=0.773856;TYPE=snp;VARB=0.00863642;OID=.;OPOS=142146708;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:42:44:28:31:13:13:8:5:23:5:8:5:25:6 chr8 142170884 . C T 527.58 PASS AO=92;DP=177;FAO=112;FDP=200;FR=.;FRO=88;FSAF=54;FSAR=58;FSRF=38;FSRR=50;FWDB=0.0309089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.189;QD=10.5516;RBI=0.0867826;REFB=-0.0422553;REVB=0.0810917;RO=85;SAF=52;SAR=40;SRF=38;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103725;STB=0.522202;TYPE=snp;VARB=0.0398535;OID=.;OPOS=142170884;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:200:85:88:92:112:40:52:38:47:58:54:38:50 chr8 142200467 . G A 105.49 PASS AO=26;DP=58;FAO=26;FDP=58;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=24;FWDB=0.00382142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.006;QD=7.27506;RBI=0.00406787;REFB=-0.00556647;REVB=-0.00139441;RO=31;SAF=17;SAR=9;SRF=7;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.395979;STB=0.713586;TYPE=snp;VARB=0.0050423;OID=.;OPOS=142200467;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:31:32:26:26:9:17:7:24:9:17:8:24 chr8 142202856 . C T 80.06 PASS AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=0.0703907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.595;QD=10.3305;RBI=0.0739281;REFB=-0.0210487;REVB=-0.0225943;RO=15;SAF=8;SAR=8;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199849;STB=0.612769;TYPE=snp;VARB=0.0201355;OID=.;OPOS=142202856;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:31:31:15:15:16:16:8:8:4:11:8:8:4:11 chr8 142202884 . T C 56.74 PASS AO=15;DP=39;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=19;FWDB=-0.03426;FXX=0.0256345;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.267;QD=5.97279;RBI=0.0347679;REFB=-0.0102454;REVB=-0.0059211;RO=22;SAF=7;SAR=8;SRF=3;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.357327;STB=0.682104;TYPE=snp;VARB=0.0114588;OID=.;OPOS=142202884;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:39:38:22:23:15:15:8:7:3:19:8:7:4:19 chr8 142218119 . G A 93.53 PASS AO=16;DP=25;FAO=16;FDP=25;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=-0.057858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.148;QD=14.9653;RBI=0.0618398;REFB=-0.0207043;REVB=0.0218315;RO=9;SAF=2;SAR=14;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126337;STB=0.57133;TYPE=snp;VARB=0.0676792;OID=.;OPOS=142218119;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:25:25:9:9:16:16:14:2:2:7:14:2:2:7 chr8 142221361 . C G 30.85 PASS AO=7;DP=19;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0183311;FXX=0.049975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.012;QD=6.49508;RBI=0.0188372;REFB=-0.00511332;REVB=-0.00433682;RO=12;SAF=1;SAR=6;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.500083;STB=0.812575;TYPE=snp;VARB=0.0120909;OID=.;OPOS=142221361;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:19:19:12:12:7:7:6:1:7:5:6:1:7:5 chr8 142222374 . A G 178.43 PASS AO=42;DP=90;FAO=43;FDP=90;FR=.;FRO=47;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=27;FWDB=-0.0600358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.8783;QD=7.93009;RBI=0.0687525;REFB=-0.0243556;REVB=-0.0335055;RO=47;SAF=20;SAR=22;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0482194;STB=0.532869;TYPE=snp;VARB=0.0141592;OID=.;OPOS=142222374;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:47:47:42:43:22:20:20:27:22:21:20:27 chr8 142222445 . T C 174.25 PASS AO=50;DP=122;FAO=50;FDP=122;FR=.;FRO=72;FSAF=19;FSAR=31;FSRF=26;FSRR=46;FWDB=-0.0427854;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.0963;QD=5.71298;RBI=0.0429245;REFB=-0.0156315;REVB=-0.00345309;RO=70;SAF=19;SAR=31;SRF=25;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0253375;STB=0.511892;TYPE=snp;VARB=0.0185729;OID=.;OPOS=142222445;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:70:72:50:50:31:19:25:45:31:19:26:46 chr8 142228809 . T C 58.38 PASS AO=8;DP=11;FAO=8;FDP=11;FR=.;FRO=3;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0708002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.807;QD=21.2276;RBI=0.0765431;REFB=-0.0247565;REVB=-0.029089;RO=3;SAF=5;SAR=3;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141139;STB=0.581188;TYPE=snp;VARB=0.0131693;OID=.;OPOS=142228809;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:11:11:3:3:8:8:3:5:1:2:3:5:1:2 chr8 142229891 . A G 379.08 PASS AO=72;DP=121;FAO=73;FDP=123;FR=.;FRO=50;FSAF=40;FSAR=33;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=0.0101899;FXX=0.00806387;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.103;QD=12.3279;RBI=0.0411873;REFB=-0.0184368;REVB=-0.0399068;RO=47;SAF=40;SAR=32;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0329278;STB=0.52772;TYPE=snp;VARB=0.0139131;OID=.;OPOS=142229891;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:123:47:50:72:73:32:40:24:23:33:40:24:26 chr8 142266691 . A C 1968.55 PASS AO=201;DP=201;FAO=207;FDP=207;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=121;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0143813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.757;QD=38.0396;RBI=0.0157564;REFB=0;REVB=0.00643763;RO=0;SAF=86;SAR=115;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.28014e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000130015;OID=.;OPOS=142266691;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:201:207:0:0:201:207:115:86:0:0:121:86:0:0 chr8 142367335 . T C 19.52 PASS AO=6;DP=22;FAO=6;FDP=22;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=1;FWDB=-0.0691055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.6993;QD=3.54893;RBI=0.0885262;REFB=0.0200575;REVB=0.0553292;RO=16;SAF=2;SAR=4;SRF=15;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.633002;STB=0.871056;TYPE=snp;VARB=-0.0398129;OID=.;OPOS=142367335;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:22:22:16:16:6:6:4:2:15:1:4:2:15:1 chr8 142367400 . G A 12.17 PASS AO=5;DP=25;FAO=5;FDP=25;FR=.;FRO=20;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=0.0340259;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=207.769;QD=1.94765;RBI=0.0410867;REFB=-0.00505696;REVB=-0.0230294;RO=20;SAF=2;SAR=3;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.284472;STB=0.691598;TYPE=snp;VARB=0.0169327;OID=.;OPOS=142367400;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:25:25:20:20:5:5:3:2:13:7:3:2:13:7 chr8 142367559 . G A 39.14 PASS AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=1;FWDB=0.00837591;FXX=0.0434594;HRUN=3;LEN=1;MLLD=215.086;QD=7.11653;RBI=0.0267285;REFB=-0.0141301;REVB=-0.0253822;RO=13;SAF=8;SAR=1;SRF=12;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0943105;STB=0.555442;TYPE=snp;VARB=0.0159327;OID=.;OPOS=142367559;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:23:22:13:13:9:9:1:8:12:1:1:8:12:1 chr8 142437934 . C T 243.17 PASS AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0325166;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.7393;QD=37.4102;RBI=0.0327933;REFB=0;REVB=0.00425106;RO=0;SAF=9;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000526114;OID=.;OPOS=142437934;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:26:26:0:0:26:26:17:9:0:0:17:9:0:0 chr8 142441642 . A G 195.16 PASS AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.268;QD=37.1733;RBI=0.0146788;REFB=0;REVB=-0.0146788;RO=0;SAF=0;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000123258;OID=.;OPOS=142441642;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:21:21:0:0:21:21:21:0:0:0:21:0:0:0 chr8 142458039 . C T 172.89 PASS AO=39;DP=74;FAO=38;FDP=74;FR=.;FRO=36;FSAF=29;FSAR=9;FSRF=24;FSRR=12;FWDB=0.0340789;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.4451;QD=9.34523;RBI=0.0358937;REFB=-0.0104346;REVB=-0.0112688;RO=35;SAF=30;SAR=9;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124143;STB=0.56074;TYPE=snp;VARB=0.0166118;OID=.;OPOS=142458039;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:35:36:39:38:9:30:23:12:9:29:24:12 chr8 142459814 . C T 663.28 PASS AO=72;DP=75;FAO=73;FDP=75;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.024658;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=139.997;QD=35.3747;RBI=0.0301037;REFB=-0.076964;REVB=0.0172688;RO=2;SAF=24;SAR=48;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192984;STB=0.510201;TYPE=snp;VARB=0.000489604;OID=.;OPOS=142459814;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:75:75:2:2:72:73:48:24:0:2:48:25:0:2 chr8 142476529 . G A 123.77 PASS AO=19;DP=27;FAO=19;FDP=27;FR=.;FRO=8;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0284613;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.129;QD=18.3363;RBI=0.0583466;REFB=0.0349535;REVB=0.0509341;RO=8;SAF=12;SAR=7;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141464;STB=0.578229;TYPE=snp;VARB=-0.00345796;OID=.;OPOS=142476529;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:27:27:8:8:19:19:7:12:3:5:7:12:3:5 chr8 142476555 . A G 46.83 PASS AO=13;DP=35;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.0148399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.817;QD=5.35225;RBI=0.0463862;REFB=0.00411962;REVB=-0.0439484;RO=22;SAF=7;SAR=6;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0409598;STB=0.524192;TYPE=snp;VARB=-0.0124883;OID=.;OPOS=142476555;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:35:35:22:22:13:13:6:7:11:11:6:7:11:11 chr8 142476611 . G A 96.39 PASS AO=22;DP=46;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=-0.00807636;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=197.875;QD=8.38145;RBI=0.0215215;REFB=-0.0149476;REVB=0.0199486;RO=24;SAF=7;SAR=15;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.287106;STB=0.662501;TYPE=snp;VARB=0.0210892;OID=.;OPOS=142476611;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:46:46:24:24:22:22:15:7:15:9:15:7:15:9 chr8 142477517 . G A 156.46 PASS AO=19;DP=32;FAO=24;FDP=33;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.0185694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.275;QD=18.965;RBI=0.0231463;REFB=-0.00890383;REVB=0.0138178;RO=5;SAF=6;SAR=13;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195171;STB=0.599911;TYPE=snp;VARB=0.00401868;OID=.;OPOS=142477517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:27:33:5:9:19:24:13:6:4:1:18:6:5:4 chr8 142477553 . T C 189.79 PASS AO=30;DP=44;FAO=31;FDP=45;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=24;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=-0.0425747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.2847;QD=16.8702;RBI=0.063675;REFB=-0.0135047;REVB=0.0473488;RO=14;SAF=7;SAR=23;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.316472;STB=0.675374;TYPE=snp;VARB=0.016702;OID=.;OPOS=142477553;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:44:45:14:14:30:31:23:7:10:4:24:7:10:4 chr8 142477563 . C T 157.29 PASS AO=29;DP=49;FAO=29;FDP=49;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=23;FSRF=16;FSRR=4;FWDB=0.044771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.5117;QD=12.8401;RBI=0.0853558;REFB=-0.000841933;REVB=0.0726717;RO=20;SAF=6;SAR=23;SRF=16;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.464036;STB=0.757298;TYPE=snp;VARB=0.00389082;OID=.;OPOS=142477563;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:49:49:20:20:29:29:23:6:16:4:23:6:16:4 chr8 142477588 . C T 167.33 PASS AO=32;DP=56;FAO=32;FDP=55;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=25;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.0592551;FXX=0.017854;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.4496;QD=12.1691;RBI=0.0593541;REFB=0.000120608;REVB=0.00342636;RO=22;SAF=7;SAR=25;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.379578;STB=0.704087;TYPE=snp;VARB=0.000119338;OID=.;OPOS=142477588;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:56:55:22:23:32:32:25:7:15:7:25:7:15:8 chr8 142477592 . G A 161.7 PASS AO=31;DP=56;FAO=32;FDP=57;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=25;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.0473137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.504;QD=11.3472;RBI=0.0561505;REFB=-0.0131349;REVB=0.0302372;RO=25;SAF=7;SAR=24;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.367403;STB=0.707117;TYPE=snp;VARB=0.0277113;OID=.;OPOS=142477592;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:56:57:25:25:31:32:24:7:16:9:25:7:16:9 chr8 142477614 . C T 137.55 PASS AO=29;DP=55;FAO=29;FDP=55;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=23;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.0141384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.897;QD=10.0037;RBI=0.0261847;REFB=-0.0136921;REVB=-0.0220397;RO=26;SAF=6;SAR=23;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.361081;STB=0.702903;TYPE=snp;VARB=0.0121536;OID=.;OPOS=142477614;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:26:26:29:29:23:6:15:11:23:6:15:11 chr8 142488837 . G A 579.34 PASS AO=77;DP=92;FAO=77;FDP=91;FR=.;FRO=14;FSAF=25;FSAR=52;FSRF=12;FSRR=2;FWDB=-0.0249871;FXX=0.0108684;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.671;QD=25.4653;RBI=0.0372279;REFB=-0.0522736;REVB=0.0275964;RO=14;SAF=25;SAR=52;SRF=12;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164413;STB=0.587637;TYPE=snp;VARB=0.00290228;OID=.;OPOS=142488837;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:92:91:14:14:77:77:52:25:12:2:52:25:12:2 chr8 142490079 . G A 831.98 PASS AO=51;DP=91;FAO=89;FDP=89;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=28;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0559363;FXX=0.0326052;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.444;QD=37.3926;RBI=0.0665297;REFB=0;REVB=0.0360186;RO=0;SAF=17;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000166076;OID=.;OPOS=142490079;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:88:89:0:0:51:89:34:17:0:0:61:28:0:0 chr8 142490080 . T A 126.18 PASS AO=36;DP=92;FAO=37;FDP=92;FR=.;FRO=55;FSAF=12;FSAR=25;FSRF=18;FSRR=37;FWDB=-0.00828392;FXX=0.0212743;HRUN=7;LEN=1;MLLD=106.075;QD=5.48586;RBI=0.0381104;REFB=-0.032946;REVB=0.0371992;RO=55;SAF=12;SAR=24;SRF=18;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00726851;STB=0.502007;TYPE=snp;VARB=0.0113595;OID=.;OPOS=142490080;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:55:55:36:37:24:12:18:37:25:12:18:37 chr8 142490120 . G T 774.96 PASS AO=83;DP=85;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020186;FXX=0.0117633;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.034;QD=36.903;RBI=0.0230507;REFB=-0.0944431;REVB=0.0111293;RO=0;SAF=26;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.51495e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000450915;OID=.;OPOS=142490120;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:85:84:0:0:83:84:57:26:0:0:58:26:0:0 chr8 142505038 . T C 396.92 PASS AO=42;DP=47;FAO=46;FDP=49;FR=.;FRO=3;FSAF=15;FSAR=31;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.00168117;FXX=0.039208;HRUN=3;LEN=1;MLLD=215.141;QD=32.4013;RBI=0.012428;REFB=-0.0744953;REVB=0.0123138;RO=3;SAF=15;SAR=27;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0850536;STB=0.545434;TYPE=snp;VARB=0.00360962;OID=.;OPOS=142505038;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:47:49:3:3:42:46:27:15:3:0:31:15:3:0 chr8 142505578 . C A 1890.88 PASS AO=192;DP=192;FAO=197;FDP=197;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.010693;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.758;QD=38.3935;RBI=0.0106933;REFB=0;REVB=-8.38788e-05;RO=0;SAF=98;SAR=94;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.59275e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.20407e-05;OID=.;OPOS=142505578;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:89:192:197:0:0:192:197:94:98:0:0:99:98:0:0 chr8 142506461 . A G 664.25 PASS AO=67;DP=68;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.997;QD=38.5073;RBI=0.0496902;REFB=0;REVB=-0.0400595;RO=0;SAF=32;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.62221e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.27711e-05;OID=.;OPOS=142506461;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:68:69:0:0:67:69:35:32:0:0:36:33:0:0 chr8 142517222 . A G 31.65 PASS AO=5;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.140829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.2896;QD=10.5487;RBI=0.141131;REFB=-0.0523124;REVB=-0.00921466;RO=7;SAF=0;SAR=5;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.748008;STB=0.713468;TYPE=snp;VARB=0.0415333;OID=.;OPOS=142517222;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:12:12:7:6:5:6:5:0:4:3:5:1:3:3 chr8 143257760 . G C 62.51 PASS AO=14;DP=29;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0361358;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=78.1398;QD=8.06565;RBI=0.03618;REFB=-0.0166767;REVB=0.00178721;RO=15;SAF=6;SAR=8;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0946828;STB=0.523331;TYPE=snp;VARB=0.059149;OID=.;OPOS=143257760;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:29:31:15:17:14:14:8:6:8:7:8:6:8:9 chr8 143353038 . C T 225.46 PASS AO=44;DP=77;FAO=44;FDP=77;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=31;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=0.000108195;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5918;QD=11.7122;RBI=0.0291388;REFB=-0.00849594;REVB=0.0291386;RO=33;SAF=13;SAR=31;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139282;STB=0.562849;TYPE=snp;VARB=0.00746818;OID=.;OPOS=143353038;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:33:33:44:44:31:13:15:18:31:13:14:19 chr8 143603418 . G C 337.9 PASS AO=39;DP=41;FAO=39;FDP=41;FR=.;FRO=2;FSAF=11;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.040263;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.423;QD=32.966;RBI=0.0520417;REFB=0.0836383;REVB=-0.0329732;RO=2;SAF=11;SAR=28;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0323178;STB=0.517233;TYPE=snp;VARB=-0.018034;OID=.;OPOS=143603418;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:41:41:2:2:39:39:28:11:0:2:28:11:0:2 chr8 143623459 . G T 845.18 PASS AO=83;DP=86;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0738643;FXX=0.0333296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.886;QD=38.8589;RBI=0.0766978;REFB=0;REVB=0.0206547;RO=0;SAF=32;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000123593;OID=.;OPOS=143623459;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:86:87:0:0:83:87:51:32:0:0:53:34:0:0 chr8 143694775 . G C 140.13 PASS AO=27;DP=50;FAO=28;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.00590542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.322;QD=10.9906;RBI=0.00596612;REFB=-0.0168694;REVB=0.000848892;RO=23;SAF=10;SAR=17;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198756;STB=0.615301;TYPE=snp;VARB=0.0113197;OID=.;OPOS=143694775;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:50:51:23:23:27:28:17:10:14:9:18:10:14:9 chr8 143695144 . G A 67.68 PASS AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.0282161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.207;QD=9.66821;RBI=0.0301787;REFB=-0.0315772;REVB=0.0107053;RO=14;SAF=8;SAR=6;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.245508;STB=0.639808;TYPE=snp;VARB=0.0265315;OID=.;OPOS=143695144;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:28:28:14:14:14:14:6:8:4:10:6:8:4:10 chr8 143746050 . C T 51.85 PASS AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.00231622;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.488;QD=10.3697;RBI=0.00489845;REFB=-0.0149431;REVB=0.00431624;RO=9;SAF=4;SAR=6;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0575228;STB=0.553088;TYPE=snp;VARB=0.0387323;OID=.;OPOS=143746050;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:20:20:9:10:10:10:6:4:3:6:6:4:3:7 chr8 143746069 . T C 61.38 PASS AO=11;DP=20;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.0593635;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=94.9356;QD=12.2768;RBI=0.0791975;REFB=0.0179058;REVB=-0.0524235;RO=9;SAF=3;SAR=8;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0576918;STB=0.533271;TYPE=snp;VARB=-0.0661386;OID=.;OPOS=143746069;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:20:20:9:9:11:11:8:3:3:6:8:3:3:6 chr8 143746087 . CCA C 106.14 PASS AO=15;DP=20;FAO=15;FDP=16;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.000867062;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=264.43;QD=26.5353;RBI=0.0203427;REFB=0.0842612;REVB=0.0203242;RO=0;SAF=6;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.53841;TYPE=del;VARB=-0.00122209;OID=.;OPOS=143746088;OREF=CA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:15:15:15:16:1:6:9:1:0:5:0:6:9:0:0 chr8 143746416 . A G 95.17 PASS AO=18;DP=32;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.103687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.607;QD=11.896;RBI=0.103771;REFB=-0.0018886;REVB=0.00417623;RO=14;SAF=7;SAR=11;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0322033;STB=0.518096;TYPE=snp;VARB=0.00218411;OID=.;OPOS=143746416;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:32:32:14:14:18:18:11:7:6:8:11:7:6:8 chr8 143746701 . A G 85.19 PASS AO=23;DP=56;FAO=23;FDP=56;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=23;FSRR=10;FWDB=-0.00381816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.8536;QD=6.08485;RBI=0.00413473;REFB=-0.0109303;REVB=-0.00158671;RO=33;SAF=16;SAR=7;SRF=23;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00160199;STB=0.500917;TYPE=snp;VARB=0.00631292;OID=.;OPOS=143746701;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:56:56:33:33:23:23:7:16:23:10:7:16:23:10 chr8 143747271 . C G 128.7 PASS AO=39;DP=100;FAO=39;FDP=101;FR=.;FRO=62;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=39;FSRR=23;FWDB=0.0523741;FXX=0.00980296;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.4649;QD=5.09703;RBI=0.0523962;REFB=0.00132563;REVB=0.00152355;RO=61;SAF=20;SAR=19;SRF=39;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136807;STB=0.571611;TYPE=snp;VARB=-0.0022442;OID=.;OPOS=143747271;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:101:61:62:39:39:19:20:39:22:19:20:39:23 chr8 143833850 . G A 303.02 PASS AO=64;DP=120;FAO=64;FDP=119;FR=.;FRO=55;FSAF=6;FSAR=58;FSRF=6;FSRR=49;FWDB=0.00657184;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.2904;QD=10.1855;RBI=0.0522724;REFB=-0.033342;REVB=0.0518576;RO=50;SAF=6;SAR=58;SRF=2;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144636;STB=0.520173;TYPE=snp;VARB=0.0304681;OID=.;OPOS=143833850;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:119:50:55:64:64:58:6:2:48:58:6:6:49 chr8 143833856 . C T 253.09 PASS AO=57;DP=113;FAO=57;FDP=112;FR=.;FRO=55;FSAF=5;FSAR=52;FSRF=5;FSRR=50;FWDB=0.012635;FXX=0.00884877;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.267;QD=9.0388;RBI=0.0126358;REFB=-0.0249156;REVB=0.000146454;RO=54;SAF=5;SAR=52;SRF=4;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0390732;STB=0.504853;TYPE=snp;VARB=0.0250316;OID=.;OPOS=143833856;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:112:54:55:57:57:52:5:4:50:52:5:5:50 chr8 143959174 . T C 20.27 PASS AO=20;DP=114;FAO=21;FDP=116;FR=.;FRO=95;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=45;FSRR=50;FWDB=-0.0356733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.922;QD=0.698849;RBI=0.0508077;REFB=-0.00901735;REVB=-0.0361778;RO=92;SAF=14;SAR=6;SRF=45;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.27215;STB=0.699807;TYPE=snp;VARB=0.042133;OID=.;OPOS=143959174;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:114:116:92:95:20:21:6:14:45:47:6:15:45:50 chr8 143959250 . T C 318.38 PASS AO=64;DP=123;FAO=67;FDP=123;FR=.;FRO=56;FSAF=34;FSAR=33;FSRF=12;FSRR=44;FWDB=0.0146494;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.726;QD=10.3539;RBI=0.0662264;REFB=0.000443421;REVB=-0.0645858;RO=59;SAF=31;SAR=33;SRF=15;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203327;STB=0.632942;TYPE=snp;VARB=-0.000948844;OID=.;OPOS=143959250;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:59:56:64:67:33:31:15:44:33:34:12:44 chr8 143994702 . G T 68.22 PASS AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00631704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.032;QD=30.3215;RBI=0.0388566;REFB=-0.0262058;REVB=0.0383396;RO=1;SAF=4;SAR=4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0978599;STB=0.555418;TYPE=snp;VARB=0.0015821;OID=.;OPOS=143994702;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:9:9:1:1:8:8:4:4:1:0:4:4:1:0 chr8 143995743 . C T 316.88 PASS AO=73;DP=145;FAO=73;FDP=145;FR=.;FRO=72;FSAF=45;FSAR=28;FSRF=33;FSRR=39;FWDB=0.00212127;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.4645;QD=8.74153;RBI=0.0121403;REFB=-0.0181945;REVB=0.0119536;RO=72;SAF=45;SAR=28;SRF=33;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144952;STB=0.579897;TYPE=snp;VARB=0.0141908;OID=.;OPOS=143995743;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:72:72:73:73:28:45:33:39:28:45:33:39 chr8 143995761 . C T 1403.31 PASS AO=149;DP=152;FAO=151;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0280501;FXX=0.00657851;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.218;QD=37.1739;RBI=0.0283439;REFB=-0.036366;REVB=0.00407009;RO=2;SAF=80;SAR=69;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0117411;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000263485;OID=.;OPOS=143995761;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:152:151:2:0:149:151:69:80:2:0:70:81:0:0 chr8 144063784 . G A 181.84 PASS AO=35;DP=63;FAO=38;FDP=67;FR=.;FRO=29;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=4;FWDB=0.00683563;FXX=0.0147037;HRUN=4;LEN=1;MLLD=193.775;QD=10.8561;RBI=0.0230163;REFB=-0.00569325;REVB=0.0219779;RO=27;SAF=23;SAR=12;SRF=25;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260114;STB=0.622241;TYPE=snp;VARB=0.00622878;OID=.;OPOS=144063784;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:67:27:29:35:38:12:23:25:2:15:23:25:4 chr8 144239859 . A G 258.62 PASS AO=51;DP=90;FAO=51;FDP=90;FR=.;FRO=39;FSAF=31;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=-0.0182633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.035;QD=11.4941;RBI=0.019156;REFB=-0.0469552;REVB=0.00577946;RO=39;SAF=31;SAR=20;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0359419;STB=0.519702;TYPE=snp;VARB=0.036644;OID=.;OPOS=144239859;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:39:39:51:51:20:31:22:17:20:31:22:17 chr8 144240257 . C G 121.41 PASS AO=31;DP=70;FAO=31;FDP=70;FR=.;FRO=39;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=0.0612035;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.9333;QD=6.93783;RBI=0.108178;REFB=-0.0039592;REVB=0.0891993;RO=38;SAF=19;SAR=12;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163217;STB=0.585378;TYPE=snp;VARB=0.0106774;OID=.;OPOS=144240257;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:38:39:31:31:12:19:17:21:12:19:18:21 chr8 144295154 . C T 15.78 PASS AO=3;DP=7;FAO=3;FDP=7;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.00457485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.667;QD=9.01792;RBI=0.0189966;REFB=-0.018504;REVB=-0.0184375;RO=2;SAF=2;SAR=1;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.39997;STB=0.599313;TYPE=snp;VARB=0.0345005;OID=.;OPOS=144295154;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:7:7:2:4:3:3:1:2:0:2:1:2:2:2 chr8 144351632 . A G 752.92 PASS AO=76;DP=77;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203511;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.536;QD=37.1811;RBI=0.0212413;REFB=0;REVB=-0.0060849;RO=0;SAF=15;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000842787;OID=.;OPOS=144351632;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:77:81:0:0:76:81:61:15:0:0:66:15:0:0 chr8 144620183 . T C 42.8 PASS AO=13;DP=38;FAO=13;FDP=38;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=1;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.00459826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.9486;QD=4.50494;RBI=0.00722334;REFB=-0.0256709;REVB=-0.00557069;RO=25;SAF=12;SAR=1;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.497086;STB=0.810192;TYPE=snp;VARB=0.0472772;OID=.;OPOS=144620183;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:38:38:25:25:13:13:1:12:16:9:1:12:16:9 chr8 144621122 . AG A 392.62 PASS AO=56;DP=79;FAO=75;FDP=84;FR=.;FRO=9;FSAF=31;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=0.305549;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=16.8323;QD=18.696;RBI=0.331847;REFB=-0.0757773;REVB=0.129468;RO=24;SAF=21;SAR=35;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.54638;TYPE=del;VARB=0.0426686;OID=.;OPOS=144621123;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:56:84:75:84:9:31:44:0:9:7:24:21:35:9:15 chr8 144623574 . T C 88.03 PASS AO=21;DP=46;FAO=21;FDP=46;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=-0.0475158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.938;QD=7.65513;RBI=0.0716612;REFB=0.00341399;REVB=-0.053643;RO=25;SAF=10;SAR=11;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151504;STB=0.585695;TYPE=snp;VARB=-0.00368302;OID=.;OPOS=144623574;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:46:46:25:25:21:21:11:10:8:17:11:10:8:17 chr8 144642178 . T C 638.19 PASS AO=65;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00420544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.265;QD=38.1009;RBI=0.0043353;REFB=0;REVB=-0.00105316;RO=0;SAF=4;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.29895e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.03174e-06;OID=.;OPOS=144642178;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:67:67:0:0:65:67:61:4:0:0:63:4:0:0 chr8 144642593 . CTTTC CTTC,CTT,CTTCC 118.06 PASS AO=5,4,4;DP=14;FAO=7,0,7;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6,0,3;FSAR=1,0,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.102278,-0.189672,0.308273;FXX=0;HRUN=3,3,3;LEN=1,2,1;MLLD=20.31,5.52238,21.784;QD=33.7327;RBI=0.194585,0.195958,0.342903;REFB=0,0,0;REVB=-0.165538,-0.0492324,-0.150168;RO=1;SAF=4,4,0;SAR=1,0,4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.0951258,0,-0.749895;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=del,del,snp;VARB=-0.0243256,0,0.0190988;OID=.,.,.;OPOS=144642594,144642596,144642596;OREF=T,TC,T;OALT=-,-,C;OMAPALT=CTTC,CTT,CTTCC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/3:5,4,4:14:7,0,7:14:0:6,0,3:1,0,4:0:0:30:1:4,4,0:1,0,4:1:0 chr8 144642626 . A G 170.86 PASS AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0379213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.209;QD=37.9683;RBI=0.0944665;REFB=0;REVB=-0.0865211;RO=0;SAF=15;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.32e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000864212;OID=.;OPOS=144642626;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:18:0:0:18:18:3:15:0:0:3:15:0:0 chr8 144642986 . T C 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=313.956;QD=33.022;RBI=0.0329788;REFB=0;REVB=0.0329788;RO=0;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000388149;OID=.;OPOS=144642986;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:6:0:0:0:6:0:0:0 chr8 144643603 . G A 135.87 PASS AO=31;DP=57;FAO=29;FDP=56;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.00663975;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.272;QD=9.70521;RBI=0.0107232;REFB=-0.0219197;REVB=-0.00842032;RO=26;SAF=16;SAR=15;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0448687;STB=0.500616;TYPE=snp;VARB=0.0166213;OID=.;OPOS=144643603;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:56:26:27:31:29:15:16:12:14:15:14:13:14 chr8 144649968 . C T 310.65 PASS AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206605;FXX=0.0833102;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.9899;QD=37.654;RBI=0.0628428;REFB=0;REVB=0.0593494;RO=0;SAF=23;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0011384;OID=.;OPOS=144649968;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:33:0:0:33:33:10:23:0:0:10:23:0:0 chr8 144654249 . G A 92.95 PASS AO=19;DP=36;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=0.048495;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=143.976;QD=10.3277;RBI=0.0626413;REFB=-0.0479889;REVB=0.0396505;RO=16;SAF=5;SAR=14;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.40048;STB=0.714483;TYPE=snp;VARB=0.0317508;OID=.;OPOS=144654249;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:36:36:16:17:19:19:14:5:12:4:14:5:12:5 chr8 144654255 . A G 351.11 PASS AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0355199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.1065;QD=37.9579;RBI=0.0361302;REFB=0;REVB=0.0066126;RO=0;SAF=16;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.7558e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000639593;OID=.;OPOS=144654255;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:37:37:0:0:37:37:21:16:0:0:21:16:0:0 chr8 144654594 . G T 16.23 PASS AO=4;DP=14;FAO=4;FDP=14;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=-0.0113757;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.2057;QD=4.63803;RBI=0.0681971;REFB=0.000232587;REVB=0.0672416;RO=10;SAF=3;SAR=1;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0756169;STB=0.549764;TYPE=snp;VARB=0.00699953;OID=.;OPOS=144654594;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:14:14:10:10:4:4:1:3:8:2:1:3:8:2 chr8 144654693 . G C 22.37 PASS AO=9;DP=34;FAO=9;FDP=37;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=24;FSRR=4;FWDB=-0.0420074;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=111.155;QD=2.41853;RBI=0.0542301;REFB=-0.0167202;REVB=0.0342971;RO=25;SAF=5;SAR=4;SRF=22;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.432197;STB=0.743198;TYPE=snp;VARB=0.0528773;OID=.;OPOS=144654693;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:34:37:25:28:9:9:4:5:22:3:4:5:24:4 chr8 144658711 . G A 198.55 PASS AO=41;DP=75;FAO=41;FDP=75;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=0.0638072;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.8486;QD=10.5893;RBI=0.0775913;REFB=0.0396875;REVB=0.044148;RO=34;SAF=16;SAR=25;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140517;STB=0.57752;TYPE=snp;VARB=-0.0290276;OID=.;OPOS=144658711;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:34:34:41:41:25:16:19:15:25:16:19:15 chr8 144662353 . G A 186.64 PASS AO=35;DP=60;FAO=35;FDP=60;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=29;FSRF=6;FSRR=19;FWDB=0.0199064;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=235.844;QD=12.4428;RBI=0.0252978;REFB=-0.011681;REVB=0.0156113;RO=25;SAF=6;SAR=29;SRF=6;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0852557;STB=0.547141;TYPE=snp;VARB=0.00713388;OID=.;OPOS=144662353;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:60:60:25:25:35:35:29:6:6:19:29:6:6:19 chr8 144671685 . G C 141.15 PASS AO=11;DP=18;FAO=16;FDP=17;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00611806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.254;QD=33.2117;RBI=0.266592;REFB=-0.077252;REVB=0.266522;RO=1;SAF=11;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.518496;TYPE=snp;VARB=0.00286264;OID=.;OPOS=144671685;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:17:1:1:11:16:0:11:1:0:3:13:1:0 chr8 144671922 . G A 25.85 PASS AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.0146881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.7476;QD=8.61674;RBI=0.0392874;REFB=-0.0142993;REVB=-0.0364384;RO=7;SAF=3;SAR=2;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.286688;STB=0.676751;TYPE=snp;VARB=0.0146691;OID=.;OPOS=144671922;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:12:12:7:7:5:5:2:3:2:5:2:3:2:5 chr8 144681777 . G T 177.2 PASS AO=37;DP=71;FAO=38;FDP=72;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=0.00876166;FXX=0.0270234;HRUN=6;LEN=1;MLLD=39.3643;QD=9.84434;RBI=0.0249424;REFB=-0.0306474;REVB=-0.0233529;RO=34;SAF=13;SAR=24;SRF=12;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0015053;STB=0.507882;TYPE=snp;VARB=0.0272848;OID=.;OPOS=144681777;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:72:34:34:37:38:24:13:12:22:24:14:12:22 chr8 144682311 . G C 308.08 PASS AO=75;DP=160;FAO=76;FDP=161;FR=.;FRO=85;FSAF=53;FSAR=23;FSRF=62;FSRR=23;FWDB=0.00482146;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=193.079;QD=7.65425;RBI=0.0145944;REFB=-0.00989567;REVB=-0.0137749;RO=85;SAF=53;SAR=22;SRF=62;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0266627;STB=0.520357;TYPE=snp;VARB=0.0100501;OID=.;OPOS=144682311;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:161:85:85:75:76:22:53:62:23:23:53:62:23 chr8 144688736 . C G 46.46 PASS AO=11;DP=26;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.0197574;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.226;QD=7.14781;RBI=0.0374951;REFB=-0.0222565;REVB=-0.0318674;RO=15;SAF=2;SAR=9;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.397116;STB=0.737225;TYPE=snp;VARB=0.0630781;OID=.;OPOS=144688736;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:26:26:15:15:11:11:9:2:8:7:9:2:8:7 chr8 144689146 . C T 225.16 PASS AO=50;DP=97;FAO=50;FDP=98;FR=.;FRO=48;FSAF=38;FSAR=12;FSRF=31;FSRR=17;FWDB=-0.00211899;FXX=0.019998;HRUN=4;LEN=1;MLLD=167.723;QD=9.19026;RBI=0.0124786;REFB=-0.0118848;REVB=0.0122974;RO=46;SAF=38;SAR=12;SRF=29;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140867;STB=0.570954;TYPE=snp;VARB=0.012334;OID=.;OPOS=144689146;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:98:46:48:50:50:12:38:29:17:12:38:31:17 chr8 144732363 . T C 1395.52 PASS AO=144;DP=146;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0468157;FXX=0.013157;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.9165;QD=37.2138;RBI=0.0519472;REFB=-0.0832452;REVB=0.0225123;RO=2;SAF=68;SAR=76;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000725768;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00270316;OID=.;OPOS=144732363;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:146:150:2:0:144:150:76:68:1:1:76:74:0:0 chr8 144732418 . A G 1385.59 PASS AO=146;DP=147;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0490013;FXX=0.0135126;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.199;QD=37.9612;RBI=0.0517467;REFB=-0.0876251;REVB=-0.0166309;RO=1;SAF=55;SAR=91;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00856805;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000199939;OID=.;OPOS=144732418;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:147:146:1:0:146:146:91:55:1:0:91:55:0:0 chr8 144732450 . G A 286.76 PASS AO=64;DP=124;FAO=64;FDP=124;FR=.;FRO=60;FSAF=20;FSAR=44;FSRF=27;FSRR=33;FWDB=-0.00552015;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.483;QD=9.25031;RBI=0.00685982;REFB=-0.0130675;REVB=0.00407247;RO=60;SAF=20;SAR=44;SRF=27;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132512;STB=0.573147;TYPE=snp;VARB=0.0106049;OID=.;OPOS=144732450;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:60:60:64:64:44:20:27:33:44:20:27:33 chr8 144733805 . C T 143.37 PASS AO=28;DP=52;FAO=29;FDP=53;FR=.;FRO=24;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=-0.00724823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.142;QD=10.8201;RBI=0.00725722;REFB=-0.00997262;REVB=0.000361253;RO=23;SAF=16;SAR=12;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214277;STB=0.616097;TYPE=snp;VARB=0.00787917;OID=.;OPOS=144733805;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:52:53:23:24:28:29:12:16:7:16:13:16:7:17 chr8 144735347 . C T 65.33 PASS AO=19;DP=52;FAO=19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=0.00215494;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.1523;QD=5.12377;RBI=0.0551309;REFB=-0.0318396;REVB=0.0550888;RO=31;SAF=10;SAR=9;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148108;STB=0.574871;TYPE=snp;VARB=0.0313198;OID=.;OPOS=144735347;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:52:51:31:32:19:19:9:10:12:19:9:10:13:19 chr8 144735977 . T C 1053.62 PASS AO=112;DP=117;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0963335;FXX=0.00854628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.8287;QD=36.3316;RBI=0.110566;REFB=-0.0502365;REVB=0.0542653;RO=4;SAF=49;SAR=63;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0291905;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00165863;OID=.;OPOS=144735977;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:117:116:4:0:112:116:63:49:0:4:67:49:0:0 chr8 144774233 . T C 479.7 PASS AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0261082;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.029;QD=37.6237;RBI=0.052162;REFB=0;REVB=0.0451579;RO=0;SAF=29;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000155265;OID=.;OPOS=144774233;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:52:51:0:0:51:51:22:29:0:0:22:29:0:0 chr8 144775871 . C A 540.11 PASS AO=57;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.000614996;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.074;QD=36.6179;RBI=0.0117094;REFB=-0.138369;REVB=0.0116933;RO=1;SAF=33;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192443;STB=0.510201;TYPE=snp;VARB=0.00106762;OID=.;OPOS=144775871;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:59:59:1:1:57:58:24:33:0:1:24:34:0:1 chr8 144776109 . A G 195.83 PASS AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0255941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.934;QD=35.6054;RBI=0.0278563;REFB=0;REVB=0.0109961;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00177621;OID=.;OPOS=144776109;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:21:22:0:0:21:22:10:11:0:0:10:12:0:0 chr8 144801243 . C T 328.85 PASS AO=40;DP=44;FAO=40;FDP=44;FR=.;FRO=4;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0180363;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=169.307;QD=29.8955;RBI=0.0282616;REFB=-0.0859114;REVB=0.0217579;RO=2;SAF=19;SAR=21;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00223561;STB=0.502277;TYPE=snp;VARB=0.0009349;OID=.;OPOS=144801243;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:44:44:2:4:40:40:21:19:1:1:21:19:2:2 chr8 144804299 . T C 176.08 PASS AO=51;DP=131;FAO=53;FDP=133;FR=.;FRO=80;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=36;FSRR=44;FWDB=-0.0329883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.8;QD=5.29571;RBI=0.0339901;REFB=-0.0158913;REVB=0.00819132;RO=79;SAF=21;SAR=30;SRF=35;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0344009;STB=0.521454;TYPE=snp;VARB=0.0229266;OID=.;OPOS=144804299;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:133:79:80:51:53:30:21:35:44:31:22:36:44 chr8 144811338 . C G 632.71 PASS AO=67;DP=67;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0397171;FXX=0.0294074;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.065;QD=38.3459;RBI=0.051618;REFB=0;REVB=0.0329693;RO=0;SAF=36;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000292449;OID=.;OPOS=144811338;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:67:66:0:0:67:66:31:36:0:0:30:36:0:0 chr8 144874957 . G A 57.53 PASS AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0184854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.619;QD=7.93566;RBI=0.0191383;REFB=-0.00434209;REVB=0.00495625;RO=16;SAF=7;SAR=6;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0366376;STB=0.521244;TYPE=snp;VARB=0.00599841;OID=.;OPOS=144874957;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:29:29:16:16:13:13:6:7:8:8:6:7:8:8 chr8 144885580 . A G 548.91 PASS AO=56;DP=56;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0227178;FXX=0.0327815;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.5122;QD=37.2143;RBI=0.0233435;REFB=0;REVB=-0.00536835;RO=0;SAF=27;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00639777;OID=.;OPOS=144885580;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:56:59:0:0:56:59:29:27:0:0:31:28:0:0 chr8 144886809 . C T 39.93 PASS AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=1;FWDB=-0.00228923;FXX=0.0370233;HRUN=4;LEN=1;MLLD=123.045;QD=6.14342;RBI=0.114131;REFB=-0.0156459;REVB=-0.114108;RO=13;SAF=6;SAR=4;SRF=13;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.464404;STB=0.736505;TYPE=snp;VARB=0.0180957;OID=.;OPOS=144886809;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:26:26:13:16:10:10:4:6:13:0:4:6:15:1 chr8 144889172 . A G 435.03 PASS AO=45;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0298842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.849;QD=37.829;RBI=0.0319451;REFB=0;REVB=0.0112882;RO=0;SAF=13;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000176294;OID=.;OPOS=144889172;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:45:46:0:0:45:46:32:13:0:0:32:14:0:0 chr8 144890873 . A T 550.68 PASS AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0.0338926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.414;QD=38.6439;RBI=0.0200437;REFB=0;REVB=0.0200437;RO=0;SAF=0;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000435689;OID=.;OPOS=144890873;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:57:57:0:0:57:57:57:0:0:0:57:0:0:0 chr8 144894496 . G A 595.7 PASS AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0403813;FXX=0.0156226;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.887;QD=37.822;RBI=0.0469854;REFB=0;REVB=0.0240205;RO=0;SAF=26;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000110816;OID=.;OPOS=144894496;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:63:63:0:0:63:63:37:26:0:0:37:26:0:0 chr8 144895553 . G A 82.02 PASS AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.0611997;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.0918;QD=8.8665;RBI=0.0615534;REFB=-0.00814066;REVB=-0.00658922;RO=17;SAF=14;SAR=4;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.304364;STB=0.704453;TYPE=snp;VARB=0.00992844;OID=.;OPOS=144895553;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:37:37:17:19:18:18:4:14:8:9:4:14:8:11 chr8 144895816 . TC T 46.14 PASS AO=7;DP=16;FAO=12;FDP=18;FR=.;FRO=6;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0966955;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=10.5467;QD=10.2536;RBI=0.297273;REFB=-0.0947876;REVB=0.281107;RO=7;SAF=7;SAR=0;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.781753;STB=0.528799;TYPE=del;VARB=0.101041;OID=.;OPOS=144895817;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:7:16:12:18:6:7:5:4:2:8:7:7:0:3:4 chr8 144904690 . A G 147.37 PASS AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0530418;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.0774;QD=36.8425;RBI=0.0612876;REFB=0;REVB=-0.0307041;RO=0;SAF=2;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000429228;OID=.;OPOS=144904690;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:16:0:0:16:16:14:2:0:0:14:2:0:0 chr8 144940222 . A C 19.89 PASS AO=12;DP=55;FAO=12;FDP=58;FR=.;FRO=46;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=26;FWDB=-0.0242578;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.204;QD=1.37143;RBI=0.0349561;REFB=-0.00606776;REVB=-0.0251692;RO=42;SAF=2;SAR=10;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.400532;STB=0.752951;TYPE=snp;VARB=0.0222171;OID=.;OPOS=144940222;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:55:58:42:46:12:12:10:2:19:23:10:2:20:26 chr8 144940230 . G C 37.9 PASS AO=17;DP=64;FAO=17;FDP=64;FR=.;FRO=47;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=27;FWDB=-0.00172812;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.049;QD=2.36876;RBI=0.00338487;REFB=-0.0208874;REVB=0.00291048;RO=47;SAF=7;SAR=10;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170567;STB=0.510385;TYPE=snp;VARB=0.0357417;OID=.;OPOS=144940230;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:64:64:47:47:17:17:10:7:20:27:10:7:20:27 chr8 144940290 . C G 15.36 PASS AO=17;DP=104;FAO=17;FDP=103;FR=.;FRO=86;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=31;FSRR=55;FWDB=0.0454858;FXX=0.0190458;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.3169;QD=0.596603;RBI=0.054663;REFB=-0.0038343;REVB=-0.0303164;RO=85;SAF=14;SAR=3;SRF=30;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.55892;STB=0.857062;TYPE=snp;VARB=0.0304591;OID=.;OPOS=144940290;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:104:103:85:86:17:17:3:14:30:55:3:14:31:55 chr8 144940300 . G A 264.08 PASS AO=55;DP=104;FAO=56;FDP=104;FR=.;FRO=48;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=-0.0291331;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.701;QD=10.1568;RBI=0.0309064;REFB=-0.00461897;REVB=0.0103181;RO=48;SAF=26;SAR=29;SRF=21;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0300022;STB=0.512444;TYPE=snp;VARB=0.00399127;OID=.;OPOS=144940300;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:48:48:55:56:29:26:21:27:30:26:21:27 chr8 144941181 . G C 152.29 PASS AO=29;DP=52;FAO=30;FDP=53;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.0227841;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.019;QD=11.4938;RBI=0.022787;REFB=-0.00822181;REVB=-0.000364501;RO=23;SAF=10;SAR=19;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0771368;STB=0.547912;TYPE=snp;VARB=0.00693642;OID=.;OPOS=144941181;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:52:53:23:23:29:30:19:10:10:13:20:10:10:13 chr8 144942903 . T C 254.96 PASS AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0413171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.252;QD=37.7716;RBI=0.0415535;REFB=0;REVB=-0.00442604;RO=0;SAF=10;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000240488;OID=.;OPOS=144942903;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:27:27:0:0:27:27:17:10:0:0:17:10:0:0 chr8 144944161 . C T 96.07 PASS AO=24;DP=59;FAO=24;FDP=55;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=0.0175735;FXX=0.0677851;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.207;QD=6.98688;RBI=0.0178384;REFB=-0.00103207;REVB=0.0030627;RO=31;SAF=9;SAR=15;SRF=20;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.264654;STB=0.650101;TYPE=snp;VARB=0.00186085;OID=.;OPOS=144944161;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:59:55:31:31:24:24:15:9:20:11:15:9:20:11 chr8 144944176 . T C 133.58 PASS AO=30;DP=62;FAO=30;FDP=61;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=-0.00633588;FXX=0.0161264;HRUN=3;LEN=1;MLLD=186.696;QD=8.75915;RBI=0.00741554;REFB=-0.0180952;REVB=-0.00385316;RO=31;SAF=9;SAR=21;SRF=20;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.319155;STB=0.678808;TYPE=snp;VARB=0.0195487;OID=.;OPOS=144944176;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:61:31:31:30:30:21:9:20:11:21:9:20:11 chr8 144945284 . C T 173.03 PASS AO=26;DP=35;FAO=26;FDP=35;FR=.;FRO=9;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0259635;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=113.047;QD=19.7746;RBI=0.0438495;REFB=0.0169312;REVB=0.0353366;RO=9;SAF=18;SAR=8;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182638;STB=0.59992;TYPE=snp;VARB=-0.00359267;OID=.;OPOS=144945284;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:35:35:9:9:26:26:8:18:3:6:8:18:3:6 chr8 144945792 . T C 129.11 PASS AO=34;DP=79;FAO=34;FDP=79;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=0.015934;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.791;QD=6.53717;RBI=0.0162363;REFB=-0.0193301;REVB=0.00311803;RO=45;SAF=18;SAR=16;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0855544;STB=0.548263;TYPE=snp;VARB=0.0253205;OID=.;OPOS=144945792;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:45:45:34:34:16:18:20:25:16:18:20:25 chr8 144946252 . C T 18.71 PASS AO=5;DP=17;FAO=5;FDP=17;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=2;FWDB=-0.00540834;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.941;QD=4.40247;RBI=0.0515321;REFB=-0.00372081;REVB=-0.0512475;RO=12;SAF=2;SAR=3;SRF=10;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.458348;STB=0.78174;TYPE=snp;VARB=0.0253516;OID=.;OPOS=144946252;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:17:17:12:12:5:5:3:2:10:2:3:2:10:2 chr8 144946345 . G A 82.62 PASS AO=22;DP=56;FAO=23;FDP=58;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=25;FSRR=10;FWDB=0.00988273;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.456;QD=5.69784;RBI=0.0625813;REFB=-0.0125498;REVB=0.0617961;RO=34;SAF=15;SAR=7;SRF=24;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0296429;STB=0.542337;TYPE=snp;VARB=0.022583;OID=.;OPOS=144946345;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:56:58:34:35:22:23:7:15:24:10:8:15:25:10 chr8 144946818 . C T 98.69 PASS AO=29;DP=81;FAO=31;FDP=83;FR=.;FRO=52;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=26;FWDB=0.0687211;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.3098;QD=4.75635;RBI=0.113552;REFB=-0.0244532;REVB=0.0903959;RO=52;SAF=16;SAR=13;SRF=26;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0577094;STB=0.550987;TYPE=snp;VARB=0.0396825;OID=.;OPOS=144946818;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:81:83:52:52:29:31:13:16:26:26:13:18:26:26 chr8 144990528 . A G 10.38 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.0361252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.674;QD=5.93125;RBI=0.0420981;REFB=-0.00977751;REVB=-0.0216153;RO=5;SAF=1;SAR=1;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.306614;STB=0.71253;TYPE=snp;VARB=0.0388721;OID=.;OPOS=144990528;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:5:5:2:2:1:1:4:1:1:1:4:1 chr8 144991176 . T C 16.77 PASS AO=5;DP=19;FAO=5;FDP=19;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=13;FSRR=1;FWDB=-0.00851106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.111;QD=3.52954;RBI=0.0263667;REFB=-0.0119309;REVB=-0.0249552;RO=13;SAF=3;SAR=2;SRF=13;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.59662;STB=0.779793;TYPE=snp;VARB=0.0144902;OID=.;OPOS=144991176;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:19:19:13:14:5:5:2:3:13:0:2:3:13:1 chr8 144992103 . T C 226.45 PASS AO=49;DP=96;FAO=50;FDP=97;FR=.;FRO=47;FSAF=17;FSAR=33;FSRF=20;FSRR=27;FWDB=-0.0240424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.145;QD=9.33819;RBI=0.0247594;REFB=-0.00431578;REVB=-0.0059151;RO=47;SAF=16;SAR=33;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0957636;STB=0.544828;TYPE=snp;VARB=0.00315679;OID=.;OPOS=144992103;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:97:47:47:49:50:33:16:20:27:33:17:20:27 chr8 144992361 . T C 30.03 PASS AO=8;DP=28;FAO=9;FDP=28;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=-0.0747785;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.966;QD=4.28932;RBI=0.0751692;REFB=-0.00733273;REVB=-0.00765413;RO=19;SAF=3;SAR=5;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0731589;STB=0.513484;TYPE=snp;VARB=0.0140247;OID=.;OPOS=144992361;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:28:28:19:19:8:9:5:3:6:13:6:3:6:13 chr8 144992862 . A G 40.83 PASS AO=5;DP=20;FAO=6;FDP=20;FR=.,HEALED;FRO=11;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.00249166;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236;QD=8.16542;RBI=0.0320972;REFB=-0.00373588;REVB=-0.0320004;RO=11;SAF=2;SAR=3;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247279;STB=0.58795;TYPE=snp;VARB=-4.99393e-05;OID=.;OPOS=144992862;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:20:20:11:11:5:6:3:2:7:4:3:3:7:4 chr8 144993324 . C T 122.8 PASS AO=23;DP=42;FAO=23;FDP=41;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.104443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.5508;QD=11.9805;RBI=0.105369;REFB=-0.0116865;REVB=-0.0139322;RO=19;SAF=11;SAR=12;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0813913;STB=0.558089;TYPE=snp;VARB=0.00534253;OID=.;OPOS=144993324;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:42:41:19:18:23:23:12:11:11:8:12:11:11:7 chr8 144993377 . A G 63.04 PASS AO=19;DP=60;FAO=21;FDP=62;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=-0.0121305;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7395;QD=4.06741;RBI=0.0427376;REFB=-0.0273963;REVB=0.0409799;RO=41;SAF=11;SAR=8;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0495626;STB=0.588059;TYPE=snp;VARB=0.0274922;OID=.;OPOS=144993377;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:60:62:41:41:19:21:8:11:22:19:8:13:20:21 chr8 144994888 . G A 152.99 PASS AO=22;DP=61;FAO=31;FDP=57;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=24;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.0172013;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.7442;QD=10.736;RBI=0.0516188;REFB=-0.0377836;REVB=0.0486685;RO=19;SAF=0;SAR=22;SRF=3;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.817184;STB=0.572231;TYPE=snp;VARB=0.0457506;OID=.;OPOS=144994888;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:57:19:26:22:31:22:0:3:16:24:7:9:17 chr8 144995494 . C T 201.19 PASS AO=37;DP=63;FAO=38;FDP=64;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=0.0780474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.746;QD=12.5746;RBI=0.0781338;REFB=-0.0425846;REVB=-0.00367253;RO=25;SAF=14;SAR=23;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0167992;STB=0.507039;TYPE=snp;VARB=0.0262714;OID=.;OPOS=144995494;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:63:64:25:26:37:38:23:14:10:15:24:14:10:16 chr8 144995736 . G A 89.69 PASS AO=14;DP=21;FAO=14;FDP=21;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.0366474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.271;QD=17.0836;RBI=0.0431564;REFB=-0.0183299;REVB=0.0227913;RO=6;SAF=2;SAR=12;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.385962;STB=0.749583;TYPE=snp;VARB=0.0116382;OID=.;OPOS=144995736;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:21:21:6:7:14:14:12:2:4:2:12:2:5:2 chr8 144996029 . A G 51.06 PASS AO=7;DP=10;FAO=7;FDP=10;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0285426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.804;QD=20.4248;RBI=0.0323797;REFB=-0.0416581;REVB=-0.0152892;RO=3;SAF=3;SAR=4;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0505826;STB=0.529328;TYPE=snp;VARB=0.0286149;OID=.;OPOS=144996029;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:10:10:3:3:7:7:4:3:1:2:4:3:1:2 chr8 144996408 . T G 103.79 PASS AO=20;DP=40;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=0.00138999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.315;QD=9.88439;RBI=0.0670016;REFB=-0.0294687;REVB=-0.0669871;RO=20;SAF=9;SAR=11;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218818;STB=0.615283;TYPE=snp;VARB=0.025881;OID=.;OPOS=144996408;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:40:42:20:20:20:22:11:9:14:6:12:10:14:6 chr8 144997656 . C T 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.4384;QD=33.022;RBI=0.0440517;REFB=0;REVB=-0.0440517;RO=0;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00180198;OID=.;OPOS=144997656;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:6:0:0:0:6:0:0:0 chr8 145001031 . T C 319.18 PASS AO=59;DP=100;FAO=59;FDP=98;FR=.;FRO=39;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=0.0567115;FXX=0.019998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.261;QD=13.0279;RBI=0.0613096;REFB=-0.0615749;REVB=0.0232955;RO=38;SAF=27;SAR=32;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0306302;STB=0.511818;TYPE=snp;VARB=0.0312356;OID=.;OPOS=145001031;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:98:38:39:59:59:32:27:19:19:32:27:19:20 chr8 145008560 . A G 39.74 PASS AO=11;DP=31;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=5;FWDB=-0.0168815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.081;QD=5.12774;RBI=0.0354834;REFB=-0.0149272;REVB=-0.0312104;RO=19;SAF=5;SAR=6;SRF=15;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.352516;STB=0.685413;TYPE=snp;VARB=0.0400303;OID=.;OPOS=145008560;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:31:31:19:20:11:11:6:5:15:4:6:5:15:5 chr8 145011204 . A G 117.98 PASS AO=22;DP=38;FAO=22;FDP=38;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.0232868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.391;QD=12.4184;RBI=0.0301094;REFB=-0.0604884;REVB=-0.0190867;RO=15;SAF=12;SAR=10;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0900794;STB=0.53395;TYPE=snp;VARB=0.0371468;OID=.;OPOS=145011204;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:38:38:15:16:22:22:10:12:10:5:10:12:10:6 chr8 145057868 . A G 112.44 PASS AO=32;DP=80;FAO=32;FDP=80;FR=.;FRO=48;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=-0.0166613;FXX=0.0243873;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.0332;QD=5.62173;RBI=0.0945167;REFB=-0.0249245;REVB=-0.0930366;RO=46;SAF=17;SAR=15;SRF=24;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00990571;STB=0.506266;TYPE=snp;VARB=0.0348451;OID=.;OPOS=145057868;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:46:48:32:32:15:17:24:22:15:17:25:23 chr8 145058986 . A G 135.88 PASS AO=26;DP=45;FAO=26;FDP=45;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=18;FWDB=0.0453361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.069;QD=12.0783;RBI=0.0499049;REFB=-0.0105186;REVB=-0.0208599;RO=18;SAF=11;SAR=15;SRF=1;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.296162;STB=0.668399;TYPE=snp;VARB=0.0118283;OID=.;OPOS=145058986;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:45:45:18:19:26:26:15:11:1:17:15:11:1:18 chr8 145059425 . T C 71.25 PASS AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=16;FWDB=-0.00829797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.447;QD=8.38283;RBI=0.0219549;REFB=0.00582109;REVB=-0.0203264;RO=18;SAF=8;SAR=8;SRF=2;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.36734;STB=0.705668;TYPE=snp;VARB=-0.00632026;OID=.;OPOS=145059425;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:34:34:18:18:16:16:8:8:2:16:8:8:2:16 chr8 145060112 . G A 30.6 PASS AO=10;DP=29;FAO=9;FDP=28;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0176172;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.8864;QD=4.37091;RBI=0.0485785;REFB=-0.00647247;REVB=0.0452714;RO=18;SAF=2;SAR=8;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.45528;STB=0.777161;TYPE=snp;VARB=0.0121604;OID=.;OPOS=145060112;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:29:28:18:19:10:9:8:2:11:7:7:2:12:7 chr8 145066886 . A G 459.48 PASS AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00748916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.783;QD=38.2897;RBI=0.0129005;REFB=0;REVB=-0.0105041;RO=0;SAF=27;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.18509e-05;OID=.;OPOS=145066886;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:48:48:0:0:48:48:21:27:0:0:21:27:0:0 chr8 145101753 . G A 35.02 PASS AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=-0.0450626;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.4911;QD=9.33909;RBI=0.0795782;REFB=-0.0427805;REVB=-0.06559;RO=8;SAF=2;SAR=5;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196457;STB=0.615099;TYPE=snp;VARB=0.0319455;OID=.;OPOS=145101753;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:15:15:8:8:7:7:5:2:1:7:5:2:1:7 chr8 145106301 . AC A 60.21 PASS AO=18;DP=37;FAO=21;FDP=35;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.308768;FXX=0.0540395;HRUN=4;LEN=1;MLLD=12.4182;QD=6.88086;RBI=0.315074;REFB=-0.0445595;REVB=-0.0627209;RO=12;SAF=1;SAR=17;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.581815;STB=0.688987;TYPE=del;VARB=0.0967436;OID=.;OPOS=145106302;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:18:35:21:35:14:4:17:8:6:26:12:1:17:6:6 chr8 145107795 . G A 201.65 PASS AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0405316;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.122;QD=36.6633;RBI=0.0475241;REFB=0;REVB=0.024814;RO=0;SAF=5;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.58081e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000473379;OID=.;OPOS=145107795;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:22:22:0:0:22:22:17:5:0:0:17:5:0:0 chr8 145111529 . A G 23.32 PASS AO=4;DP=7;FAO=4;FDP=7;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.078441;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=100.419;QD=13.325;RBI=0.0838215;REFB=-0.0210113;REVB=-0.0295475;RO=3;SAF=2;SAR=2;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115334;STB=0.571077;TYPE=snp;VARB=4.59415e-05;OID=.;OPOS=145111529;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:7:7:3:3:4:4:2:2:2:1:2:2:2:1 chr8 145112983 . C T 255.33 PASS AO=55;DP=108;FAO=58;FDP=114;FR=.;FRO=56;FSAF=20;FSAR=38;FSRF=22;FSRR=34;FWDB=0.0496103;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.038;QD=8.95897;RBI=0.0518853;REFB=-0.0249929;REVB=0.0151957;RO=53;SAF=17;SAR=38;SRF=20;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0688258;STB=0.525683;TYPE=snp;VARB=0.0295228;OID=.;OPOS=145112983;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:114:53:56:55:58:38:17:20:33:38:20:22:34 chr8 145114643 . G A 156.76 PASS AO=29;DP=51;FAO=30;FDP=52;FR=.;FRO=22;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.0305268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.505;QD=12.0586;RBI=0.0310821;REFB=-0.0221537;REVB=-0.00584895;RO=22;SAF=15;SAR=14;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0134403;STB=0.514129;TYPE=snp;VARB=0.0259094;OID=.;OPOS=145114643;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:51:52:22:22:29:30:14:15:11:11:14:16:11:11 chr8 145114844 . C T 203.11 PASS AO=44;DP=100;FAO=48;FDP=100;FR=.;FRO=52;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=35;FSRR=17;FWDB=0.00299571;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=150.779;QD=8.12422;RBI=0.0179299;REFB=-0.0115074;REVB=-0.0176779;RO=36;SAF=22;SAR=22;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0681544;STB=0.600125;TYPE=snp;VARB=0.0128207;OID=.;OPOS=145114844;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:100:36:52:44:48:22:22:21:15:25:23:35:17 chr8 145114924 . G C 130.49 PASS AO=28;DP=52;FAO=28;FDP=55;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.107189;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=43.4803;QD=9.49005;RBI=0.108358;REFB=-0.0311464;REVB=0.0158749;RO=24;SAF=10;SAR=18;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0886367;STB=0.58215;TYPE=snp;VARB=0.0188188;OID=.;OPOS=145114924;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:55:24:27:28:28:18:10:11:13:18:10:14:13 chr8 145134792 . G A 205.89 PASS AO=42;DP=76;FAO=42;FDP=76;FR=.;FRO=34;FSAF=32;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=10;FWDB=0.0245485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.556;QD=10.8363;RBI=0.0335589;REFB=-0.0145723;REVB=0.0228816;RO=33;SAF=32;SAR=10;SRF=24;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.037278;STB=0.533317;TYPE=snp;VARB=0.0147535;OID=.;OPOS=145134792;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:33:34:42:42:10:32:24:9:10:32:24:10 chr8 145138840 . AG A 287.26 PASS AO=37;DP=44;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.28728;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=18.5044;QD=27.3582;RBI=0.287538;REFB=0;REVB=0.0121889;RO=4;SAF=19;SAR=18;SRF=4;SRR=0;SSEN=0.598214;SSEP=0;SSSB=-0.0889307;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0146694;OID=.;OPOS=145138841;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:37:42:42:42:0:24:18:0:0:24:4:19:18:4:0 chr8 145139727 . C T 96.53 PASS AO=26;DP=67;FAO=27;FDP=67;FR=.;FRO=40;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=0.0151103;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.112;QD=5.76314;RBI=0.0472429;REFB=-0.0214982;REVB=-0.0447613;RO=37;SAF=10;SAR=16;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.022457;STB=0.510824;TYPE=snp;VARB=0.0317815;OID=.;OPOS=145139727;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:67:67:37:40:26:27:16:10:15:22:16:11:17:23 chr8 145150832 . A G 101.96 PASS AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0722057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.684;QD=37.0752;RBI=0.08055;REFB=0;REVB=0.0357022;RO=0;SAF=9;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00211857;OID=.;OPOS=145150832;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:11:11:2:9:0:0:2:9:0:0 chr8 145154257 . C G 46.05 PASS AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.0109618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.849;QD=10.2329;RBI=0.011066;REFB=-0.0257306;REVB=-0.00151487;RO=9;SAF=5;SAR=4;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0973785;STB=0.556839;TYPE=snp;VARB=0.0478923;OID=.;OPOS=145154257;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:18:18:9:9:9:9:4:5:6:3:4:5:6:3 chr8 145154910 . G A 123.04 PASS AO=29;DP=65;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=22;FSAR=8;FSRF=31;FSRR=4;FWDB=0.0648993;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=44.3521;QD=7.57186;RBI=0.0649647;REFB=-0.0402226;REVB=-0.00291371;RO=33;SAF=22;SAR=7;SRF=28;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125715;STB=0.616213;TYPE=snp;VARB=0.0543541;OID=.;OPOS=145154910;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:33:35:29:30:7:22:28:5:8:22:31:4 chr8 145160646 . T C 573.85 PASS AO=63;DP=63;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0231529;FXX=0.031741;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.67;QD=37.6296;RBI=0.0273462;REFB=0;REVB=0.014552;RO=0;SAF=42;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000188293;OID=.;OPOS=145160646;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:63:61:0:0:63:61:21:42:0:0:20:41:0:0 chr8 145161823 . G A 32.42 PASS AO=3;DP=17;FAO=7;FDP=17;FR=.,HEALED;FRO=10;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=0;FWDB=0.000135821;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=200.773;QD=7.62856;RBI=0.05346;REFB=-0.00935943;REVB=0.0534598;RO=11;SAF=1;SAR=2;SRF=10;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.604151;STB=0.8119;TYPE=snp;VARB=0.0321991;OID=.;OPOS=145161823;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:17:17:11:10:3:7:2:1:10:1:4:3:10:0 chr8 145161896 . T C 38.57 PASS AO=8;DP=23;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=2;FWDB=0.0274187;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.6943;QD=6.42791;RBI=0.0296077;REFB=-0.0406827;REVB=0.0111727;RO=14;SAF=3;SAR=5;SRF=12;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.478584;STB=0.749583;TYPE=snp;VARB=0.0370395;OID=.;OPOS=145161896;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:23:24:14:14:8:10:5:3:12:2:6:4:12:2 chr8 145162372 . C T 75.07 PASS AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.0223661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.8767;QD=10.3545;RBI=0.0280927;REFB=-0.0589618;REVB=-0.0169987;RO=14;SAF=5;SAR=10;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208276;STB=0.618885;TYPE=snp;VARB=0.0396529;OID=.;OPOS=145162372;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:29:29:14:14:15:15:10:5:8:6:10:5:8:6 chr8 145168611 . A G 148.27 PASS AO=23;DP=36;FAO=24;FDP=35;FR=.;FRO=11;FSAF=19;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=11;FWDB=0.0151148;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=158.213;QD=16.9447;RBI=0.0206672;REFB=-0.0895463;REVB=0.0140952;RO=0;SAF=19;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.761676;TYPE=snp;VARB=0.00508551;OID=.;OPOS=145168611;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:23:35:0:11:23:24:4:19:0:0:5:19:0:11 chr8 145170353 . T A 316.04 PASS AO=52;DP=76;FAO=52;FDP=76;FR=.;FRO=24;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=2;FSRR=22;FWDB=0.0607613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.8259;QD=16.6335;RBI=0.0733924;REFB=-0.0236455;REVB=0.0411643;RO=24;SAF=28;SAR=24;SRF=2;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.262626;STB=0.641383;TYPE=snp;VARB=0.0108533;OID=.;OPOS=145170353;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:76:76:24:24:52:52:24:28:2:22:24:28:2:22 chr8 145170440 . A C 91.36 PASS AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=4;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=-0.0713603;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.155;QD=7.45773;RBI=0.0713657;REFB=9.28164e-05;REVB=-0.000875158;RO=27;SAF=4;SAR=18;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206532;STB=0.618927;TYPE=snp;VARB=-0.000564109;OID=.;OPOS=145170440;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:49:49:27:27:22:22:18:4:9:18:18:4:9:18 chr8 145170704 . A T 95.07 PASS AO=10;DP=11;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.04191;FXX=0.0908265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.0057;QD=38.0263;RBI=0.0552891;REFB=0;REVB=0.0360616;RO=0;SAF=7;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000216694;OID=.;OPOS=145170704;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:10:0:0:10:10:3:7:0:0:3:7:0:0 chr8 145223288 . C T 279.43 PASS AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.122324;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.669;QD=38.5414;RBI=0.125551;REFB=0;REVB=0.0282828;RO=0;SAF=12;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.0947e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00106258;OID=.;OPOS=145223288;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:29:29:0:0:29:29:17:12:0:0:17:12:0:0 chr8 145557309 . C CG 42.44 PASS AO=4;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=65.7149;QD=24.2497;RBI=0.0494728;REFB=-0.0546254;REVB=0.0494728;RO=3;SAF=0;SAR=4;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.260876;OID=.;OPOS=145557310;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:4:7:6:7:1:0:6:0:1:6:3:0:4:0:3 chr8 145578296 . A G 69.51 PASS AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=14;FSAR=0;FSRF=13;FSRR=0;FWDB=0.00758793;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=184.035;QD=10.297;RBI=0.00758793;REFB=0.014241;REVB=0;RO=13;SAF=14;SAR=0;SRF=13;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00752495;OID=.;OPOS=145578296;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:27:27:13:13:14:14:0:14:13:0:0:14:13:0 chr8 145603114 . A C 117.1 PASS AO=29;DP=65;FAO=29;FDP=64;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=-0.0215493;FXX=0.0153822;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.878;QD=7.31846;RBI=0.0279754;REFB=-0.00631442;REVB=-0.0178395;RO=35;SAF=12;SAR=17;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232851;STB=0.630877;TYPE=snp;VARB=0.00579629;OID=.;OPOS=145603114;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:64:35:35:29:29:17:12:23:12:17:12:23:12 chr8 145618597 . G A 24.08 PASS AO=4;DP=6;FAO=4;FDP=6;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0446686;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=194.345;QD=16.0537;RBI=0.0465381;REFB=0.00158841;REVB=0.0130582;RO=2;SAF=3;SAR=1;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.407562;STB=0.748744;TYPE=snp;VARB=-0.00627216;OID=.;OPOS=145618597;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:2:2:4:4:1:3:0:2:1:3:0:2 chr8 145623963 . G A 74.34 PASS AO=21;DP=54;FAO=21;FDP=54;FR=.;FRO=33;FSAF=4;FSAR=17;FSRF=9;FSRR=24;FWDB=0.0764196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.34;QD=5.50658;RBI=0.0787372;REFB=-0.0238247;REVB=0.0189629;RO=33;SAF=4;SAR=17;SRF=9;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126881;STB=0.57395;TYPE=snp;VARB=0.0327528;OID=.;OPOS=145623963;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:54:54:33:33:21:21:17:4:9:24:17:4:9:24 chr8 145640411 . A G 290.75 PASS AO=32;DP=33;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0059024;FXX=0.0605877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.472;QD=37.5162;RBI=0.0303882;REFB=0;REVB=-0.0298095;RO=0;SAF=21;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.58977e-05;OID=.;OPOS=145640411;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:33:31:0:0:32:31:11:21:0:0:10:21:0:0 chr8 145641328 . C T 164.46 PASS AO=25;DP=34;FAO=25;FDP=34;FR=.;FRO=9;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.024198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.0957;QD=19.3484;RBI=0.0241997;REFB=-0.0657203;REVB=-0.000287449;RO=9;SAF=12;SAR=13;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143758;STB=0.578393;TYPE=snp;VARB=0.0171491;OID=.;OPOS=145641328;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:34:34:9:9:25:25:13:12:7:2:13:12:7:2 chr8 145641564 . T G 66.95 PASS AO=18;DP=45;FAO=18;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=3;FSAR=15;FSRF=5;FSRR=22;FWDB=-0.00792739;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=239.078;QD=5.95077;RBI=0.0145089;REFB=-0.00803864;REVB=-0.0121517;RO=26;SAF=3;SAR=15;SRF=5;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0453562;STB=0.519458;TYPE=snp;VARB=0.0121594;OID=.;OPOS=145641564;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:45:45:26:27:18:18:15:3:5:21:15:3:5:22 chr8 145642002 . C T 41.47 PASS AO=6;DP=9;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.015811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9731;QD=18.4323;RBI=0.0409632;REFB=-0.0304572;REVB=-0.0377889;RO=3;SAF=1;SAR=5;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.502096;STB=0.79893;TYPE=snp;VARB=0.00814007;OID=.;OPOS=145642002;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:9:9:3:3:6:6:5:1:3:0:5:1:3:0 chr8 145650330 . CG C 41.8 PASS AO=23;DP=56;FAO=23;FDP=55;FR=.;FRO=32;FSAF=1;FSAR=22;FSRF=8;FSRR=24;FWDB=-0.111619;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=17.7868;QD=3.03998;RBI=0.169607;REFB=-0.037982;REVB=-0.127701;RO=31;SAF=0;SAR=23;SRF=8;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.805771;STB=0.81109;TYPE=del;VARB=0.0255802;OID=.;OPOS=145650331;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:23:55:23:55:32:1:22:8:24:41:31:0:23:8:23 chr8 145661320 . G A 13.37 PASS AO=3;DP=12;FAO=3;FDP=11;FR=.,HEALED;FRO=8;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.00790845;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.59;QD=4.86214;RBI=0.0346624;REFB=-0.0257671;REVB=0.0337481;RO=6;SAF=2;SAR=1;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.317885;STB=0.624149;TYPE=snp;VARB=0.0930896;OID=.;OPOS=145661320;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:11:11:6:8:3:3:1:2:2:4:1:2:4:4 chr8 145661675 . G A 41.32 PASS AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=1;FWDB=0.0217863;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.9588;QD=7.87052;RBI=0.061758;REFB=-0.0252757;REVB=0.0577877;RO=12;SAF=6;SAR=3;SRF=11;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.313558;STB=0.679688;TYPE=snp;VARB=0.0376582;OID=.;OPOS=145661675;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:21:21:12:12:9:9:3:6:11:1:3:6:11:1 chr8 145665516 . T C 138.86 PASS AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146698;FXX=0.062461;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.827;QD=37.0298;RBI=0.0164483;REFB=0;REVB=0.00743934;RO=0;SAF=9;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000193609;OID=.;OPOS=145665516;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:15:0:0:15:15:6:9:0:0:6:9:0:0 chr8 145665544 . TG T 23.32 PASS AO=3;DP=16;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0228181;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=14.0249;QD=6.21774;RBI=0.105838;REFB=-0.0885988;REVB=-0.103349;RO=7;SAF=2;SAR=1;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240731;STB=0.592984;TYPE=del;VARB=0.0629037;OID=.;OPOS=145665545;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:3:12:8:15:7:5:3:3:4:20:7:2:1:3:4 chr8 145665761 . G A 105.11 PASS AO=23;DP=46;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.0279642;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=206.91;QD=9.13968;RBI=0.0547894;REFB=-0.0270284;REVB=0.0471156;RO=22;SAF=17;SAR=6;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0622978;STB=0.55344;TYPE=snp;VARB=0.0198558;OID=.;OPOS=145665761;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:22:23:23:23:6:17:15:7:6:17:15:8 chr8 145689915 . G A 327.64 PASS AO=33;DP=33;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0255425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.041;QD=37.4441;RBI=0.0777003;REFB=0;REVB=0.073382;RO=0;SAF=14;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.71297e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00103951;OID=.;OPOS=145689915;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:33:35:0:0:33:35:19:14:0:0:21:14:0:0 chr8 145690279 . GGC G,GG 50.83 PASS AO=9,12;DP=58;FAO=0,22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=0,11;FSAR=0,11;FSRF=26;FSRR=1;FWDB=-0.0244873,-0.0250144;FXX=0.019996;HRUN=5,2;LEN=2,1;MLLD=18.151,14.7886;QD=4.14941;RBI=0.321547,0.0310647;REFB=-0.0312179,-0.0812817;REVB=-0.320613,0.0184199;RO=28;SAF=1,9;SAR=8,3;SRF=26;SRR=2;SSEN=0.3125,0.228763;SSEP=0,0;SSSB=-0.78613,-0.347168;STB=0.5,0.75493;TYPE=del,del;VARB=0,0.111889;OID=.,.;OPOS=145690280,145690281;OREF=GC,C;OALT=-,-;OMAPALT=G,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:9,12:54:0,22:49:27:0,11:0,11:26:1:50:28:1,9:8,3:26:2 chr8 145690308 . C T 877.99 PASS AO=90;DP=93;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0312989;FXX=0.0416623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.124;QD=38.1737;RBI=0.0533308;REFB=0;REVB=0.0431805;RO=0;SAF=63;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000201382;OID=.;OPOS=145690308;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:93:92:0:0:90:92:27:63:0:0:27:65:0:0 chr8 145690348 . G A 832.51 PASS AO=93;DP=98;FAO=93;FDP=97;FR=.;FRO=4;FSAF=68;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0139403;FXX=0.010203;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3632;QD=34.3302;RBI=0.0859135;REFB=-0.0742467;REVB=0.084775;RO=5;SAF=67;SAR=26;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.037702;STB=0.524657;TYPE=snp;VARB=0.0151739;OID=.;OPOS=145690348;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:98:97:5:4:93:93:26:67:2:3:25:68:1:3 chr8 145690396 . A C 953.11 PASS AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0313807;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.0473;QD=38.5094;RBI=0.0314352;REFB=0;REVB=-0.00185173;RO=0;SAF=68;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000150009;OID=.;OPOS=145690396;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:99:99:0:0:99:99:31:68:0:0:31:68:0:0 chr8 145693720 . A G 991.34 PASS AO=105;DP=105;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0289264;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.32;QD=38.1285;RBI=0.0304861;REFB=0;REVB=0.00962627;RO=0;SAF=67;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11471e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.61329e-05;OID=.;OPOS=145693720;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:105:104:0:0:105:104:38:67:0:0:38:66:0:0 chr8 145723419 . T G 72.43 PASS AO=13;DP=80;FAO=16;FDP=79;FR=.,HEALED;FRO=52;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=36;FWDB=-0.0448047;FXX=0.0124984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=32.209;QD=3.66734;RBI=0.0525945;REFB=-0.0158153;REVB=0.0275448;RO=44;SAF=4;SAR=9;SRF=15;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0464631;STB=0.504286;TYPE=snp;VARB=0.0688864;OID=.;OPOS=145723419;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:80:79:44:52:13:16:9:4:15:29:11:5:16:36 chr8 145724275 . T C 40.69 PASS AO=12;DP=34;FAO=11;FDP=33;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=4;FWDB=0.0280544;FXX=0.0571265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0269;QD=4.93206;RBI=0.0389688;REFB=-0.0495093;REVB=-0.0270466;RO=21;SAF=9;SAR=3;SRF=17;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0902602;STB=0.640806;TYPE=snp;VARB=0.0685818;OID=.;OPOS=145724275;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:34:33:21:22:12:11:3:9:17:4:4:7:18:4 chr8 145729727 . C A 36.65 PASS AO=12;DP=43;FAO=13;FDP=43;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=0.0263324;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.532;QD=3.40961;RBI=0.0275769;REFB=-0.0116752;REVB=-0.00819073;RO=31;SAF=10;SAR=2;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.479288;STB=0.724826;TYPE=snp;VARB=0.0361488;OID=.;OPOS=145729727;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:43:43:31:30:12:13:2:10:14:17:3:10:14:16 chr8 145737636 . A G 297.13 PASS AO=33;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.127224;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.0627;QD=34.9569;RBI=0.131038;REFB=-0.0377309;REVB=0.0313871;RO=1;SAF=8;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0183273;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000950477;OID=.;OPOS=145737636;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:34:34:1:0:33:34:25:8:0:1:26:8:0:0 chr8 145737816 . C T 51.06 PASS AO=7;DP=10;FAO=7;FDP=10;FR=.;FRO=3;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0121901;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=133.45;QD=20.4255;RBI=0.0216698;REFB=-0.112098;REVB=0.017916;RO=3;SAF=5;SAR=2;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202067;STB=0.615098;TYPE=snp;VARB=0.0402708;OID=.;OPOS=145737816;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:10:10:3:3:7:7:2:5:3:0:2:5:3:0 chr8 145738767 . CG C 254.21 PASS AO=29;DP=31;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0698141;FXX=0.0294031;HRUN=2;LEN=1;MLLD=23.5798;QD=30.8134;RBI=0.0734955;REFB=0;REVB=-0.0229691;RO=0;SAF=10;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00214967;OID=.;OPOS=145738768;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:29:31:33:33:0:14:19:0:0:23:0:10:19:0:0 chr8 145741765 . G A 128.99 PASS AO=26;DP=48;FAO=26;FDP=48;FR=.;FRO=22;FSAF=22;FSAR=4;FSRF=21;FSRR=1;FWDB=-0.00744605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2758;QD=10.7494;RBI=0.0390157;REFB=-0.0210644;REVB=-0.0382986;RO=21;SAF=22;SAR=4;SRF=20;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190663;STB=0.609859;TYPE=snp;VARB=0.01597;OID=.;OPOS=145741765;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:48:48:21:22:26:26:4:22:20:1:4:22:21:1 chr8 145742514 . A G 892.85 PASS AO=91;DP=93;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00597627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.876;QD=37.9938;RBI=0.044311;REFB=0;REVB=0.0439062;RO=0;SAF=43;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000354629;OID=.;OPOS=145742514;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:93:94:0:0:91:94:48:43:0:0:49:45:0:0 chr8 145745182 . T C 578.05 PASS AO=59;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0180032;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=35.9023;QD=37.2934;RBI=0.0225091;REFB=0;REVB=0.0135109;RO=2;SAF=23;SAR=36;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0392692;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.34157e-06;OID=.;OPOS=145745182;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:61:62:2:0:59:62:36:23:2:0:36:26:0:0 chr8 145756170 . G A 117.98 PASS AO=22;DP=38;FAO=22;FDP=38;FR=.;FRO=16;FSAF=17;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.021019;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.661;QD=12.4185;RBI=0.0510688;REFB=-0.00211856;REVB=0.0465427;RO=16;SAF=17;SAR=5;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197167;STB=0.610669;TYPE=snp;VARB=0.00119242;OID=.;OPOS=145756170;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:38:38:16:16:22:22:5:17:9:7:5:17:9:7 chr8 146010776 . T C 229.68 PASS AO=64;DP=150;FAO=64;FDP=151;FR=.;FRO=87;FSAF=27;FSAR=37;FSRF=42;FSRR=45;FWDB=-0.00453094;FXX=0.00657851;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.097;QD=6.08429;RBI=0.0195293;REFB=-0.0132735;REVB=0.0189964;RO=82;SAF=27;SAR=37;SRF=41;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0794036;STB=0.535546;TYPE=snp;VARB=0.0171482;OID=.;OPOS=146010776;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:151:82:87:64:64:37:27:41:41:37:27:42:45 chr8 146010817 . C A 139.34 PASS AO=52;DP=155;FAO=52;FDP=154;FR=.;FRO=102;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=45;FSRR=57;FWDB=0.00509091;FXX=0.0128197;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.281;QD=3.61932;RBI=0.0312614;REFB=-0.003407;REVB=-0.0308441;RO=91;SAF=22;SAR=30;SRF=40;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0187687;STB=0.512228;TYPE=snp;VARB=0.00696044;OID=.;OPOS=146010817;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:154:91:102:52:52:30:22:40:51:30:22:45:57 chr8 146045868 . T C 125.64 PASS AO=29;DP=61;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.0233683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.336;QD=8.23867;RBI=0.0402182;REFB=-0.0104138;REVB=-0.0327326;RO=31;SAF=18;SAR=11;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0693006;STB=0.531893;TYPE=snp;VARB=0.00775476;OID=.;OPOS=146045868;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:31:32:29:29:11:18:17:14:11:18:18:14 chr8 146067054 . G A 272.39 PASS AO=58;DP=111;FAO=59;FDP=112;FR=.;FRO=53;FSAF=21;FSAR=38;FSRF=19;FSRR=34;FWDB=-0.00321895;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.222;QD=9.72818;RBI=0.00832305;REFB=-0.0291632;REVB=0.00767539;RO=53;SAF=21;SAR=37;SRF=19;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00336309;STB=0.501319;TYPE=snp;VARB=0.0286692;OID=.;OPOS=146067054;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:112:53:53:58:59:37:21:19:34:38:21:19:34 chr8 146068322 . C T 250.39 PASS AO=73;DP=176;FAO=73;FDP=177;FR=.;FRO=104;FSAF=23;FSAR=50;FSRF=36;FSRR=68;FWDB=0.0112711;FXX=0.00561766;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.0882;QD=5.65845;RBI=0.0185063;REFB=-0.00417498;REVB=0.0146781;RO=102;SAF=23;SAR=50;SRF=35;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0333262;STB=0.520828;TYPE=snp;VARB=0.00577084;OID=.;OPOS=146068322;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:177:102:104:73:73:50:23:35:67:50:23:36:68 chr8 146068594 . T C 194.75 PASS AO=40;DP=73;FAO=40;FDP=73;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=0.0145607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.1071;QD=10.6714;RBI=0.019793;REFB=-0.0149653;REVB=0.0134071;RO=33;SAF=16;SAR=24;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0961318;STB=0.553046;TYPE=snp;VARB=0.0143568;OID=.;OPOS=146068594;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:33:33:40:40:24:16:17:16:24:16:17:16 chr8 146076314 . AG A 28.53 PASS AO=9;DP=20;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0.0666805;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=21.4075;QD=7.13212;RBI=0.074327;REFB=-0.0154769;REVB=0.032836;RO=7;SAF=6;SAR=3;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0.337143;SSSB=0.471797;STB=0.832637;TYPE=del;VARB=0.0321434;OID=.;OPOS=146076315;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:9:16:8:16:8:6:2:0:8:26:7:6:3:0:7 chr8 146076708 . C T 337.88 PASS AO=89;DP=196;FAO=89;FDP=198;FR=.;FRO=109;FSAF=34;FSAR=55;FSRF=54;FSRR=55;FWDB=0.0222335;FXX=0.0099995;HRUN=5;LEN=1;MLLD=89.9854;QD=6.82589;RBI=0.0501525;REFB=-0.0209741;REVB=-0.044955;RO=105;SAF=34;SAR=55;SRF=50;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0948481;STB=0.564088;TYPE=snp;VARB=0.0409808;OID=.;OPOS=146076708;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:198:105:109:89:89:55:34:50:55:55:34:54:55 chr8 146115367 . A G 245.18 PASS AO=52;DP=121;FAO=61;FDP=131;FR=.;FRO=70;FSAF=37;FSAR=24;FSRF=32;FSRR=38;FWDB=0.0197312;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.8083;QD=7.48646;RBI=0.118034;REFB=-0.0231311;REVB=-0.116373;RO=61;SAF=33;SAR=19;SRF=31;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126769;STB=0.580733;TYPE=snp;VARB=0.030147;OID=.;OPOS=146115367;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:131:61:70:52:61:19:33:31:30:24:37:32:38 chr8 146229161 . T A 299.86 PASS AO=35;DP=41;FAO=37;FDP=40;FR=.;FRO=3;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0135766;FXX=0.0476077;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.659;QD=29.9855;RBI=0.0164037;REFB=0.00991462;REVB=0.00920646;RO=3;SAF=18;SAR=17;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.075665;STB=0.538441;TYPE=snp;VARB=-0.00285394;OID=.;OPOS=146229161;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:41:40:3:3:35:37:17:18:0:3:18:19:0:3 chr9 118173 . C G 201 PASS AO=33;DP=35;FAO=28;FDP=35;FR=.;FRO=7;FSAF=21;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.110456;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=65.3293;QD=22.9708;RBI=0.113966;REFB=-0.0360735;REVB=-0.028065;RO=0;SAF=22;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.639238;TYPE=snp;VARB=0.00547027;OID=.;OPOS=118173;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:35:35:0:7:33:28:11:22:0:0:7:21:1:6 chr9 154795 . T C 188.3 PASS AO=114;DP=433;FAO=107;FDP=398;FR=.;FRO=291;FSAF=56;FSAR=51;FSRF=138;FSRR=153;FWDB=-0.0184775;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.27;QD=1.89248;RBI=0.019069;REFB=-2.41943e-05;REVB=0.00471293;RO=316;SAF=59;SAR=55;SRF=147;SRR=169;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.06522;STB=0.535878;TYPE=snp;VARB=0.000152854;OID=.;OPOS=154795;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:433:398:316:291:114:107:55:59:147:169:51:56:138:153 chr9 162405 . C G 27.48 PASS AO=13;DP=53;FAO=13;FDP=53;FR=.;FRO=40;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=0.00691932;FXX=0.036357;HRUN=3;LEN=1;MLLD=75.9263;QD=2.07413;RBI=0.0246972;REFB=-0.00894048;REVB=-0.0237081;RO=40;SAF=4;SAR=9;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15313;STB=0.596061;TYPE=snp;VARB=0.0152025;OID=.;OPOS=162405;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:53:53:40:40:13:13:9:4:17:23:9:4:17:23 chr9 215269 . A C 67.26 PASS AO=13;DP=24;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.00113828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.513;QD=11.2106;RBI=0.0131606;REFB=0.00353198;REVB=0.0131113;RO=11;SAF=11;SAR=2;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252667;STB=0.646799;TYPE=snp;VARB=-0.00422308;OID=.;OPOS=215269;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:24:24:11:11:13:13:2:11:7:4:2:11:7:4 chr9 215534 . C T 259.81 PASS AO=60;DP=128;FAO=63;FDP=132;FR=.;FRO=69;FSAF=27;FSAR=36;FSRF=34;FSRR=35;FWDB=0.00783394;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.848;QD=7.87292;RBI=0.00805156;REFB=-0.0134521;REVB=-0.00185931;RO=68;SAF=27;SAR=33;SRF=34;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0480499;STB=0.533906;TYPE=snp;VARB=0.0148361;OID=.;OPOS=215534;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:132:68:69:60:63:33:27:34:34:36:27:34:35 chr9 271638 . C T 123.7 PASS AO=48;DP=148;FAO=48;FDP=148;FR=.;FRO=100;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=41;FSRR=59;FWDB=-0.0173106;FXX=0.0133324;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.3445;QD=3.34332;RBI=0.0425855;REFB=0.00334854;REVB=0.0389084;RO=96;SAF=21;SAR=27;SRF=37;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0618239;STB=0.518958;TYPE=snp;VARB=-0.00797022;OID=.;OPOS=271638;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:96:100:48:48:27:21:37:59:27:21:41:59 chr9 286593 . C A 2076.73 PASS AO=228;DP=236;FAO=230;FDP=230;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=177;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00427226;FXX=0.033612;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.5424;QD=36.117;RBI=0.0147689;REFB=-0.0336184;REVB=0.0141375;RO=7;SAF=53;SAR=175;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0588862;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00010085;OID=.;OPOS=286593;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:236:230:7:0:228:230:175:53:7:0:177:53:0:0 chr9 334337 . A G 558.16 PASS AO=130;DP=258;FAO=130;FDP=258;FR=.;FRO=128;FSAF=73;FSAR=57;FSRF=68;FSRR=60;FWDB=-0.0130142;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.658;QD=8.6536;RBI=0.0507928;REFB=-0.00496203;REVB=0.0490973;RO=128;SAF=73;SAR=57;SRF=68;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0277187;STB=0.515199;TYPE=snp;VARB=0.00464992;OID=.;OPOS=334337;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:258:258:128:128:130:130:57:73:68:60:57:73:68:60 chr9 390512 . C T 592.8 PASS AO=145;DP=299;FAO=145;FDP=300;FR=.;FRO=155;FSAF=66;FSAR=79;FSRF=76;FSRR=79;FWDB=-0.0101377;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=244.379;QD=7.90399;RBI=0.0255025;REFB=-0.0112085;REVB=-0.023401;RO=152;SAF=66;SAR=79;SRF=75;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0357866;STB=0.518246;TYPE=snp;VARB=0.0126177;OID=.;OPOS=390512;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:299:300:152:155:145:145:79:66:75:77:79:66:76:79 chr9 421032 . C G 217.61 PASS AO=44;DP=79;FAO=44;FDP=80;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=31;FSRF=12;FSRR=24;FWDB=0.00238271;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.004;QD=10.8803;RBI=0.00917759;REFB=-0.0341596;REVB=-0.00886289;RO=35;SAF=13;SAR=31;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0448585;STB=0.520125;TYPE=snp;VARB=0.0228145;OID=.;OPOS=421032;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:80:35:36:44:44:31:13:12:23:31:13:12:24 chr9 429719 . T C 1817.33 PASS AO=191;DP=192;FAO=192;FDP=192;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0281877;FXX=0.0103087;HRUN=3;LEN=1;MLLD=65.2073;QD=37.861;RBI=0.0341343;REFB=0.0129475;REVB=0.019251;RO=1;SAF=104;SAR=87;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00544213;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.58176e-05;OID=.;OPOS=429719;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:192:192:1:0:191:192:87:104:0:1:88:104:0:0 chr9 433978 . A G 1403.39 PASS AO=152;DP=155;FAO=152;FDP=155;FR=.;FRO=3;FSAF=71;FSAR=81;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00583913;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.466;QD=36.2165;RBI=0.0110051;REFB=0.0883595;REVB=-0.00932833;RO=3;SAF=71;SAR=81;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00494682;STB=0.502601;TYPE=snp;VARB=-0.00073018;OID=.;OPOS=433978;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:155:155:3:3:152:152:81:71:1:2:81:71:1:2 chr9 441952 . G A 1301.32 PASS AO=134;DP=134;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0107401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.823;QD=38.2742;RBI=0.011419;REFB=0;REVB=0.00387866;RO=0;SAF=55;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.47665e-06;OID=.;OPOS=441952;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:134:136:0:0:134:136:79:55:0:0:81:55:0:0 chr9 449798 . G A 299.17 PASS AO=77;DP=164;FAO=76;FDP=164;FR=.;FRO=88;FSAF=39;FSAR=37;FSRF=54;FSRR=34;FWDB=-0.0126127;FXX=0.00606024;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.75;QD=7.2968;RBI=0.0126201;REFB=-0.0102153;REVB=-0.000432981;RO=87;SAF=40;SAR=37;SRF=54;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0976696;STB=0.554092;TYPE=snp;VARB=0.0111225;OID=.;OPOS=449798;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:164:87:88:77:76:37:40:54:33:37:39:54:34 chr9 676954 . T C 264.94 PASS AO=63;DP=132;FAO=64;FDP=133;FR=.;FRO=69;FSAF=28;FSAR=36;FSRF=35;FSRR=34;FWDB=-0.0109998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.368;QD=7.96824;RBI=0.0128646;REFB=-0.000200371;REVB=-0.00667092;RO=69;SAF=28;SAR=35;SRF=35;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0595306;STB=0.536412;TYPE=snp;VARB=0.000153563;OID=.;OPOS=676954;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:133:69:69:63:64:35:28:35:34:36:28:35:34 chr9 712060 . G C 521.14 PASS AO=98;DP=164;FAO=99;FDP=164;FR=.;FRO=65;FSAF=42;FSAR=57;FSRF=40;FSRR=25;FWDB=0.00439718;FXX=0.00606024;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3459;QD=12.7106;RBI=0.0711231;REFB=-0.0158545;REVB=0.070987;RO=65;SAF=42;SAR=56;SRF=40;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137343;STB=0.575742;TYPE=snp;VARB=0.010738;OID=.;OPOS=712060;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:164:65:65:98:99:56:42:40:25:57:42:40:25 chr9 712599 . C T 201.84 PASS AO=44;DP=84;FAO=44;FDP=85;FR=.;FRO=41;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=0.0332646;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.708;QD=9.49854;RBI=0.0500072;REFB=-0.00352739;REVB=-0.0373388;RO=39;SAF=24;SAR=20;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0381758;STB=0.507556;TYPE=snp;VARB=0.00673522;OID=.;OPOS=712599;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:85:39:41:44:44:20:24:23:16:20:24:23:18 chr9 742341 . GA G,GG 165.96 PASS AO=8,10;DP=18;FAO=7,11;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=0,10;FSAR=7,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0380474,-0.0189825;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=45.31,58.1268;QD=36.8793;RBI=0.0546103,0.0372027;REFB=0,0;REVB=0.039175,0.0319954;RO=0;SAF=0,10;SAR=8,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.021747,0.0424711;OID=.,.;OPOS=742342,742342;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:8,10:18:7,11:18:0:0,10:7,1:0:0:19:0:0,10:8,0:0:0 chr9 841971 . T A 59.67 PASS AO=10;DP=16;FAO=10;FDP=16;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0122381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.095;QD=14.9183;RBI=0.0336702;REFB=-0.0488746;REVB=0.0313674;RO=6;SAF=2;SAR=8;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.354335;STB=0.705427;TYPE=snp;VARB=0.0128372;OID=.;OPOS=841971;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:16:16:6:6:10:10:8:2:4:2:8:2:4:2 chr9 990840 . C T 78.33 PASS AO=11;DP=19;FAO=13;FDP=21;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0422788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.541;QD=14.9199;RBI=0.0668645;REFB=-0.0283;REVB=0.0518012;RO=7;SAF=4;SAR=7;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.238684;STB=0.592449;TYPE=snp;VARB=0.0196025;OID=.;OPOS=990840;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:19:21:7:8:11:13:7:4:5:2:8:5:5:3 chr9 991114 . A G 1509.84 PASS AO=161;DP=162;FAO=160;FDP=160;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0278275;FXX=0.0123449;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.2624;QD=37.7461;RBI=0.0288894;REFB=-0.0479049;REVB=0.00776057;RO=0;SAF=87;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000878621;OID=.;OPOS=991114;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:162:160:0:0:161:160:74:87:0:0:74:86:0:0 chr9 1056959 . G C 239.84 PASS AO=50;DP=98;FAO=50;FDP=93;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=40;FSRF=12;FSRR=31;FWDB=0.0175078;FXX=0.0605999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.74;QD=10.3159;RBI=0.0189513;REFB=-0.00443628;REVB=-0.00725438;RO=42;SAF=10;SAR=40;SRF=12;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103026;STB=0.553437;TYPE=snp;VARB=0.0029764;OID=.;OPOS=1056959;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:93:42:43:50:50:40:10:12:30:40:10:12:31 chr9 1057204 . A G 290.97 PASS AO=48;DP=126;FAO=48;FDP=116;FR=.,HEALED;FRO=49;FSAF=2;FSAR=46;FSRF=12;FSRR=37;FWDB=0.00973825;FXX=0.0719942;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.3518;QD=10.0335;RBI=0.0195237;REFB=0.00146322;REVB=0.0169216;RO=46;SAF=2;SAR=46;SRF=10;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.471773;STB=0.794887;TYPE=snp;VARB=-0.00424598;OID=.;OPOS=1057204;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:116:46:49:48:48:46:2:10:36:46:2:12:37 chr9 1057555 . T C 283.66 PASS AO=79;DP=183;FAO=79;FDP=184;FR=.;FRO=105;FSAF=29;FSAR=50;FSRF=40;FSRR=65;FWDB=-0.0107032;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=132.814;QD=6.16658;RBI=0.0215702;REFB=-0.00698113;REVB=-0.0187274;RO=104;SAF=29;SAR=50;SRF=40;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0190945;STB=0.508472;TYPE=snp;VARB=0.00988791;OID=.;OPOS=1057555;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:184:104:105:79:79:50:29:40:64:50:29:40:65 chr9 2039793 . A C 32.88 PASS AO=4;DP=6;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0243763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.9274;QD=18.7905;RBI=0.0556818;REFB=-0.0952466;REVB=0.0500626;RO=2;SAF=1;SAR=3;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161039;STB=0.529293;TYPE=snp;VARB=0.0408683;OID=.;OPOS=2039793;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:7:2:2:4:5:3:1:1:1:3:2:1:1 chr9 2162831 . T C 326.62 PASS AO=73;DP=152;FAO=76;FDP=152;FR=.;FRO=76;FSAF=21;FSAR=55;FSRF=23;FSRR=53;FWDB=-0.0115635;FXX=0.0193536;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.683;QD=8.59525;RBI=0.0148848;REFB=-0.0141168;REVB=-0.00937245;RO=78;SAF=21;SAR=52;SRF=23;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00817721;STB=0.516207;TYPE=snp;VARB=0.0147002;OID=.;OPOS=2162831;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:152:78:76:73:76:52:21:23:55:55:21:23:53 chr9 2162878 . A T 304.15 PASS AO=68;DP=146;FAO=74;FDP=151;FR=.;FRO=77;FSAF=23;FSAR=51;FSRF=22;FSRR=55;FWDB=-0.0191953;FXX=0.00657851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.465;QD=8.05696;RBI=0.019333;REFB=-0.0115875;REVB=-0.00230348;RO=76;SAF=23;SAR=45;SRF=21;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0676551;STB=0.515103;TYPE=snp;VARB=0.0144665;OID=.;OPOS=2162878;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:151:76:77:68:74:45:23:21:55:51:23:22:55 chr9 2717922 . C G 597.82 PASS AO=59;DP=59;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127991;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.434;QD=37.957;RBI=0.0222428;REFB=0;REVB=0.0181913;RO=0;SAF=26;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.00382e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000613335;OID=.;OPOS=2717922;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:59:63:0:0:59:63:33:26:0:0:33:30:0:0 chr9 2718534 . C G 195.7 PASS AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.131862;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.2813;QD=39.1401;RBI=0.1383;REFB=0;REVB=-0.0417028;RO=0;SAF=6;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5931e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00222766;OID=.;OPOS=2718534;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:20:20:0:0:20:20:14:6:0:0:14:6:0:0 chr9 2804393 . A G 219.59 PASS AO=64;DP=156;FAO=64;FDP=156;FR=.;FRO=92;FSAF=38;FSAR=26;FSRF=39;FSRR=53;FWDB=-0.0125023;FXX=0.0126574;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.212;QD=5.63045;RBI=0.0127736;REFB=-0.00492823;REVB=-0.00261893;RO=88;SAF=38;SAR=26;SRF=36;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189963;STB=0.599889;TYPE=snp;VARB=0.0147098;OID=.;OPOS=2804393;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:156:88:92:64:64:26:38:36:52:26:38:39:53 chr9 2811505 . G A 360.04 PASS AO=81;DP=158;FAO=81;FDP=158;FR=.;FRO=77;FSAF=26;FSAR=55;FSRF=34;FSRR=43;FWDB=-0.0413414;FXX=0.00628891;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.423;QD=9.11485;RBI=0.0576601;REFB=-0.0457887;REVB=-0.0401943;RO=75;SAF=26;SAR=55;SRF=32;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101675;STB=0.564279;TYPE=snp;VARB=0.0456526;OID=.;OPOS=2811505;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:158:75:77:81:81:55:26:32:43:55:26:34:43 chr9 3824936 . T A 337.42 PASS AO=27;DP=31;FAO=42;FDP=47;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=38;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0230133;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.155;QD=28.7165;RBI=0.0277351;REFB=-0.0180103;REVB=0.0154797;RO=2;SAF=4;SAR=23;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184038;STB=0.581589;TYPE=snp;VARB=0.00228988;OID=.;OPOS=3824936;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:31:47:2:5:27:42:23:4:2:0:38:4:2:3 chr9 4117942 . G T 94.36 PASS AO=27;DP=69;FAO=27;FDP=69;FR=.;FRO=42;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=9;FSRR=33;FWDB=0.0832749;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.8475;QD=5.47015;RBI=0.0833758;REFB=0.0145684;REVB=0.00409896;RO=40;SAF=7;SAR=20;SRF=8;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0849207;STB=0.536877;TYPE=snp;VARB=-0.0229625;OID=.;OPOS=4117942;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:69:69:40:42:27:27:20:7:8:32:20:7:9:33 chr9 4564432 . G A 596.37 PASS AO=106;DP=165;FAO=106;FDP=165;FR=.;FRO=59;FSAF=53;FSAR=53;FSRF=25;FSRR=34;FWDB=0.0489258;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.663;QD=14.4575;RBI=0.0502857;REFB=0.00628001;REVB=0.0116152;RO=59;SAF=53;SAR=53;SRF=25;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0505878;STB=0.527268;TYPE=snp;VARB=-0.00250438;OID=.;OPOS=4564432;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:165:59:59:106:106:53:53:25:34:53:53:25:34 chr9 4576680 . T C 345.22 PASS AO=92;DP=201;FAO=90;FDP=198;FR=.;FRO=108;FSAF=29;FSAR=61;FSRF=57;FSRR=51;FWDB=-0.0131895;FXX=0.0149246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.077;QD=6.97408;RBI=0.0184423;REFB=-0.0060155;REVB=0.0128901;RO=107;SAF=31;SAR=61;SRF=57;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197087;STB=0.617586;TYPE=snp;VARB=0.0072671;OID=.;OPOS=4576680;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:198:107:108:92:90:61:31:57:50:61:29:57:51 chr9 4586284 . G A 549.89 PASS AO=130;DP=259;FAO=130;FDP=261;FR=.;FRO=131;FSAF=51;FSAR=79;FSRF=84;FSRR=47;FWDB=-0.0219997;FXX=0.00381665;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.219;QD=8.42736;RBI=0.0231076;REFB=-0.0112763;REVB=0.00706946;RO=129;SAF=51;SAR=79;SRF=83;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226521;STB=0.623994;TYPE=snp;VARB=0.00849427;OID=.;OPOS=4586284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:259:261:129:131:130:130:79:51:83:46:79:51:84:47 chr9 4706214 . C T 1302.2 PASS AO=124;DP=127;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0077536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.1835;QD=38.0204;RBI=0.0537835;REFB=0;REVB=0.0532217;RO=0;SAF=76;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000752998;OID=.;OPOS=4706214;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:127:137:0:0:124:137:48:76:0:0:55:82:0:0 chr9 4860300 . A G 213.04 PASS AO=83;DP=248;FAO=83;FDP=248;FR=.;FRO=165;FSAF=43;FSAR=40;FSRF=88;FSRR=77;FWDB=0.0263289;FXX=0.0040159;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.5247;QD=3.43616;RBI=0.0362509;REFB=-0.00825021;REVB=0.0249182;RO=165;SAF=43;SAR=40;SRF=88;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177634;STB=0.510172;TYPE=snp;VARB=0.0194048;OID=.;OPOS=4860300;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:248:248:165:165:83:83:40:43:88:77:40:43:88:77 chr9 5050706 . C T 1664.34 PASS AO=174;DP=174;FAO=174;FDP=174;FR=.;FRO=0;FSAF=146;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00892499;FXX=0.00571396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.4346;QD=38.2606;RBI=0.0965787;REFB=0;REVB=-0.0961654;RO=0;SAF=146;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.16845e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000232361;OID=.;OPOS=5050706;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:174:174:0:0:174:174:28:146:0:0:28:146:0:0 chr9 5081780 . G A 945.97 PASS AO=124;DP=150;FAO=129;FDP=155;FR=.;FRO=26;FSAF=83;FSAR=46;FSRF=20;FSRR=6;FWDB=-0.0211997;FXX=0.0189861;HRUN=4;LEN=1;MLLD=79.6071;QD=24.4122;RBI=0.0234848;REFB=-0.0339434;REVB=0.0101048;RO=26;SAF=83;SAR=41;SRF=20;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0373689;STB=0.523301;TYPE=snp;VARB=0.00255317;OID=.;OPOS=5081780;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:150:155:26:26:124:129:41:83:20:6:46:83:20:6 chr9 5090840 . G A 225.42 PASS AO=46;DP=83;FAO=46;FDP=83;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=33;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.0127815;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=218.958;QD=10.8636;RBI=0.0136293;REFB=-0.0120742;REVB=-0.00473193;RO=37;SAF=13;SAR=33;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184873;STB=0.602072;TYPE=snp;VARB=0.00732952;OID=.;OPOS=5090840;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:37:37:46:46:33:13:18:19:33:13:18:19 chr9 5092466 . G A 1816.98 PASS AO=196;DP=201;FAO=197;FDP=201;FR=.;FRO=4;FSAF=88;FSAR=109;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0307346;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.256;QD=36.1588;RBI=0.0377541;REFB=-0.0955749;REVB=0.0219262;RO=3;SAF=88;SAR=108;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159556;STB=0.51111;TYPE=snp;VARB=0.000895156;OID=.;OPOS=5092466;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:201:201:3:4:196:197:108:88:3:0:109:88:4:0 chr9 5094034 . G A 807.52 PASS AO=91;DP=95;FAO=91;FDP=95;FR=.;FRO=4;FSAF=41;FSAR=50;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0232838;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.916;QD=34.0007;RBI=0.0335398;REFB=-0.0113226;REVB=0.024141;RO=4;SAF=41;SAR=50;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0161742;STB=0.50854;TYPE=snp;VARB=0.00057358;OID=.;OPOS=5094034;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:95:95:4:4:91:91:50:41:1:3:50:41:1:3 chr9 5095095 . A C 581.35 PASS AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00470676;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.504;QD=36.3344;RBI=0.0160247;REFB=-0.0410994;REVB=0.0153179;RO=1;SAF=46;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101571;STB=0.505375;TYPE=snp;VARB=2.6363e-06;OID=.;OPOS=5095095;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:64:64:1:1:63:63:17:46:1:0:17:46:1:0 chr9 5095167 . A C 279.43 PASS AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00198286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.477;QD=38.5422;RBI=0.0263555;REFB=0;REVB=0.0262808;RO=0;SAF=8;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.4007e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.54802e-05;OID=.;OPOS=5095167;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:29:29:0:0:29:29:21:8:0:0:21:8:0:0 chr9 5095191 . T A 349.21 PASS AO=39;DP=41;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0238053;FXX=0.0243843;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.51;QD=34.9215;RBI=0.0317998;REFB=-0.0289504;REVB=0.021084;RO=0;SAF=18;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.34792e-08;STB=0.511622;TYPE=snp;VARB=0.000108702;OID=.;OPOS=5095191;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:41:40:0:1:39:39:21:18:0:0:21:18:0:1 chr9 5096433 . A G 1952.33 PASS AO=205;DP=208;FAO=205;FDP=205;FR=.;FRO=0;FSAF=99;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157009;FXX=0.0144224;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.862;QD=38.0943;RBI=0.0395123;REFB=-0.0448952;REVB=-0.0362588;RO=1;SAF=99;SAR=106;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0047873;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.20206e-05;OID=.;OPOS=5096433;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:208:205:1:0:205:205:106:99:1:0:106:99:0:0 chr9 5098223 . T C 1017.63 PASS AO=106;DP=108;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0174622;FXX=0.0185168;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2612;QD=38.4012;RBI=0.071228;REFB=0;REVB=0.0690544;RO=2;SAF=62;SAR=44;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0150623;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000413857;OID=.;OPOS=5098223;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:108:106:2:0:106:106:44:62:2:0:44:62:0:0 chr9 5231712 . T A 344.45 PASS AO=36;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.117851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.5222;QD=37.2378;RBI=0.130165;REFB=0;REVB=0.0552647;RO=0;SAF=6;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.50008e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00207035;OID=.;OPOS=5231712;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:37:37:0:0:36:37:30:6:0:0:31:6:0:0 chr9 5557672 . T C 2906.23 PASS AO=318;DP=319;FAO=313;FDP=319;FR=.;FRO=6;FSAF=122;FSAR=191;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0434137;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.3684;QD=36.4418;RBI=0.0754655;REFB=0.102764;REVB=-0.0617275;RO=1;SAF=125;SAR=193;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00380077;STB=0.50546;TYPE=snp;VARB=-0.00985918;OID=.;OPOS=5557672;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:91:319:319:1:6:318:313:193:125:1:0:191:122:4:2 chr9 5732483 . T C 580.09 PASS AO=134;DP=264;FAO=134;FDP=264;FR=.;FRO=130;FSAF=53;FSAR=81;FSRF=50;FSRR=80;FWDB=0.00254347;FXX=0.0112355;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.359;QD=8.78922;RBI=0.0204405;REFB=-0.00111517;REVB=0.0202816;RO=128;SAF=53;SAR=81;SRF=48;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192411;STB=0.505628;TYPE=snp;VARB=0.00124222;OID=.;OPOS=5732483;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:264:264:128:130:134:134:81:53:48:80:81:53:50:80 chr9 5762600 . G A 267.11 PASS AO=65;DP=136;FAO=65;FDP=136;FR=.;FRO=71;FSAF=26;FSAR=39;FSRF=40;FSRR=31;FWDB=0.0006026;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=259.734;QD=7.85615;RBI=0.00240297;REFB=-0.00911637;REVB=0.00232619;RO=71;SAF=26;SAR=39;SRF=40;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154844;STB=0.585772;TYPE=snp;VARB=0.00992519;OID=.;OPOS=5762600;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:71:71:65:65:39:26:40:31:39:26:40:31 chr9 5774225 . T G 552.56 PASS AO=141;DP=306;FAO=144;FDP=313;FR=.;FRO=169;FSAF=67;FSAR=77;FSRF=70;FSRR=99;FWDB=0.00546043;FXX=0.00318461;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.346;QD=7.06143;RBI=0.0392464;REFB=0.00104594;REVB=0.0388647;RO=164;SAF=66;SAR=75;SRF=70;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0404798;STB=0.527815;TYPE=snp;VARB=-0.00136246;OID=.;OPOS=5774225;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:306:313:164:169:141:144:75:66:70:94:77:67:70:99 chr9 5890162 . G T 236.05 PASS AO=56;DP=115;FAO=56;FDP=115;FR=.;FRO=59;FSAF=31;FSAR=25;FSRF=25;FSRR=34;FWDB=0.0561705;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.1528;QD=8.21041;RBI=0.0583566;REFB=0.0167737;REVB=0.0158231;RO=58;SAF=31;SAR=25;SRF=24;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128056;STB=0.566406;TYPE=snp;VARB=-0.0173117;OID=.;OPOS=5890162;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:58:59:56:56:25:31:24:34:25:31:25:34 chr9 5892525 . C T 456.81 PASS AO=89;DP=153;FAO=90;FDP=153;FR=.;FRO=63;FSAF=21;FSAR=69;FSRF=20;FSRR=43;FWDB=-0.0125143;FXX=0.00649309;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.832;QD=11.9429;RBI=0.0131753;REFB=0.00539234;REVB=-0.00412077;RO=62;SAF=21;SAR=68;SRF=20;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.086021;STB=0.546023;TYPE=snp;VARB=-0.00253735;OID=.;OPOS=5892525;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:153:62:63:89:90:68:21:20:42:69:21:20:43 chr9 5909152 . T G 179.28 PASS AO=57;DP=159;FAO=60;FDP=162;FR=.;FRO=102;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=45;FSRR=57;FWDB=-0.0307787;FXX=0.00613459;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.1744;QD=4.42662;RBI=0.0312843;REFB=-0.00930146;REVB=0.00560166;RO=102;SAF=30;SAR=27;SRF=45;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0955141;STB=0.547418;TYPE=snp;VARB=0.0145568;OID=.;OPOS=5909152;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:162:102:102:57:60:27:30:45:57:29:31:45:57 chr9 5968416 . A G 712.12 PASS AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00162872;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.825;QD=37.9799;RBI=0.0378758;REFB=0;REVB=0.0378408;RO=0;SAF=39;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6999e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.96966e-05;OID=.;OPOS=5968416;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:75:75:0:0:75:75:36:39:0:0:36:39:0:0 chr9 5969249 . A G 1393.75 PASS AO=154;DP=160;FAO=154;FDP=160;FR=.;FRO=6;FSAF=75;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.00190784;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.063;QD=34.8437;RBI=0.0247252;REFB=-0.0664512;REVB=0.0246515;RO=3;SAF=75;SAR=79;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177192;STB=0.51829;TYPE=snp;VARB=0.00180548;OID=.;OPOS=5969249;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:160:160:3:6:154:154:79:75:0:3:79:75:0:6 chr9 6328947 . T C 265.42 PASS AO=32;DP=35;FAO=32;FDP=35;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0183222;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=268.158;QD=30.3335;RBI=0.0250119;REFB=0.0015138;REVB=-0.0170262;RO=2;SAF=3;SAR=29;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0311289;STB=0.554986;TYPE=snp;VARB=-0.000277429;OID=.;OPOS=6328947;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:35:35:2:3:32:32:29:3:0:2:29:3:1:2 chr9 6329888 . A G 1622.81 PASS AO=173;DP=176;FAO=173;FDP=173;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0491841;FXX=0.0170445;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.949;QD=37.5217;RBI=0.0500786;REFB=-0.0950208;REVB=0.00942292;RO=2;SAF=69;SAR=104;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0135944;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000163961;OID=.;OPOS=6329888;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:176:173:2:0:173:173:104:69:2:0:104:69:0:0 chr9 6330915 . G A 1000.75 PASS AO=105;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00125078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.803;QD=38.1238;RBI=0.0316978;REFB=0;REVB=0.0316731;RO=0;SAF=38;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11471e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.6131e-05;OID=.;OPOS=6330915;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:105:105:0:0:105:105:67:38:0:0:67:38:0:0 chr9 6331421 . C A 54.71 PASS AO=12;DP=30;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.0108073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.738;QD=7.05938;RBI=0.0133022;REFB=-0.00358168;REVB=-0.00775571;RO=17;SAF=8;SAR=4;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218026;STB=0.552988;TYPE=snp;VARB=0.00464874;OID=.;OPOS=6331421;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:30:31:17:18:12:13:4:8:11:6:4:9:11:7 chr9 6536199 . C G 102.42 PASS AO=28;DP=68;FAO=28;FDP=68;FR=.;FRO=40;FSAF=4;FSAR=24;FSRF=8;FSRR=32;FWDB=-0.018312;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=64.7742;QD=6.02448;RBI=0.0458598;REFB=0.00473939;REVB=0.0420451;RO=40;SAF=4;SAR=24;SRF=8;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108659;STB=0.562452;TYPE=snp;VARB=-0.0103105;OID=.;OPOS=6536199;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:40:40:28:28:24:4:8:32:24:4:8:32 chr9 6748784 . C A 52.89 PASS AO=16;DP=45;FAO=16;FDP=45;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=20;FWDB=0.011697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.119;QD=4.70102;RBI=0.0259075;REFB=-0.0168935;REVB=-0.0231166;RO=28;SAF=11;SAR=5;SRF=8;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.418295;STB=0.733057;TYPE=snp;VARB=0.0266562;OID=.;OPOS=6748784;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:45:45:28:29:16:16:5:11:8:20:5:11:9:20 chr9 6981041 . G A 249.09 PASS AO=54;DP=106;FAO=56;FDP=108;FR=.;FRO=52;FSAF=16;FSAR=40;FSRF=14;FSRR=38;FWDB=-0.00325716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.0995;QD=9.22566;RBI=0.0113928;REFB=-0.00403797;REVB=-0.0109173;RO=49;SAF=16;SAR=38;SRF=12;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0546618;STB=0.5098;TYPE=snp;VARB=0.00253916;OID=.;OPOS=6981041;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:108:49:52:54:56:38:16:12:37:40:16:14:38 chr9 7076463 . G A 151.97 PASS AO=40;DP=92;FAO=40;FDP=92;FR=.;FRO=52;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=30;FWDB=0.00120838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.495;QD=6.60752;RBI=0.0194454;REFB=-0.0150433;REVB=-0.0194078;RO=52;SAF=17;SAR=23;SRF=22;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00197791;STB=0.501112;TYPE=snp;VARB=0.0157174;OID=.;OPOS=7076463;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:52:52:40:40:23:17:22:30:23:17:22:30 chr9 7103816 . C T 468.4 PASS AO=119;DP=257;FAO=120;FDP=259;FR=.;FRO=139;FSAF=47;FSAR=73;FSRF=44;FSRR=95;FWDB=-0.0234718;FXX=0.00766254;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.958;QD=7.23402;RBI=0.0244647;REFB=-0.0139873;REVB=0.00689885;RO=138;SAF=47;SAR=72;SRF=44;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0789952;STB=0.543084;TYPE=snp;VARB=0.0186606;OID=.;OPOS=7103816;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:257:259:138:139:119:120:72:47:44:94:73:47:44:95 chr9 7174673 . G A 2141.39 PASS AO=226;DP=236;FAO=232;FDP=232;FR=.;FRO=0;FSAF=100;FSAR=132;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143866;FXX=0.0169484;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.987;QD=36.9205;RBI=0.0176929;REFB=-0.0858538;REVB=0.0102987;RO=3;SAF=100;SAR=126;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0112086;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000328194;OID=.;OPOS=7174673;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:236:232:3:0:226:232:126:100:0:3:132:100:0:0 chr9 7798435 . C T 1233.67 PASS AO=125;DP=125;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00952393;FXX=0.00769172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.578;QD=38.2533;RBI=0.0120539;REFB=0;REVB=0.00738851;RO=0;SAF=86;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.13398e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000179466;OID=.;OPOS=7798435;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:125:129:0:0:125:129:39:86:0:0:43:86:0:0 chr9 7798518 . G C 1561.27 PASS AO=167;DP=169;FAO=167;FDP=167;FR=.;FRO=0;FSAF=106;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0537817;FXX=0.0290681;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.326;QD=37.3956;RBI=0.0600909;REFB=-0.102021;REVB=0.026804;RO=2;SAF=106;SAR=61;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00326883;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000619369;OID=.;OPOS=7798518;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:169:167:2:0:167:167:61:106:1:1:61:106:0:0 chr9 7799606 . C A 48.24 PASS AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=0.00807154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.196;QD=7.71877;RBI=0.016359;REFB=-0.00246664;REVB=0.014229;RO=14;SAF=4;SAR=7;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.326299;STB=0.689811;TYPE=snp;VARB=0.0027561;OID=.;OPOS=7799606;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:25:25:14:14:11:11:7:4:10:4:7:4:10:4 chr9 7799653 . G T 33.67 PASS AO=8;DP=23;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=1;FWDB=-0.0142015;FXX=0.0869187;HRUN=5;LEN=1;MLLD=67.8461;QD=6.41376;RBI=0.0210484;REFB=-0.0497819;REVB=0.0155356;RO=12;SAF=6;SAR=2;SRF=11;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.264459;STB=0.666347;TYPE=snp;VARB=0.0323576;OID=.;OPOS=7799653;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:23:21:12:13:8:8:2:6:11:1:2:6:12:1 chr9 8389364 . C G 480.35 PASS AO=131;DP=250;FAO=131;FDP=301;FR=.;FRO=170;FSAF=42;FSAR=89;FSRF=59;FSRR=111;FWDB=-0.0814503;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=206.33;QD=6.38342;RBI=0.0823629;REFB=-0.0447115;REVB=0.0122271;RO=118;SAF=42;SAR=89;SRF=8;SRR=110;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.283638;STB=0.516933;TYPE=snp;VARB=0.0404602;OID=.;OPOS=8389364;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:250:301:118:170:131:131:89:42:8:110:89:42:59:111 chr9 8460277 . T C 130.67 PASS AO=49;DP=145;FAO=49;FDP=146;FR=.;FRO=97;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=41;FSRR=56;FWDB=-0.019755;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.7259;QD=3.58006;RBI=0.0785387;REFB=-0.000636954;REVB=-0.0760137;RO=96;SAF=20;SAR=29;SRF=41;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.022404;STB=0.509941;TYPE=snp;VARB=-0.000354792;OID=.;OPOS=8460277;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:146:96:97:49:49:29:20:41:55:29:20:41:56 chr9 8485834 . G A 404.24 PASS AO=96;DP=197;FAO=97;FDP=199;FR=.;FRO=102;FSAF=51;FSAR=46;FSRF=47;FSRR=55;FWDB=0.00473073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.199;QD=8.12532;RBI=0.0215614;REFB=-0.0292367;REVB=-0.021036;RO=101;SAF=50;SAR=46;SRF=46;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0607975;STB=0.533278;TYPE=snp;VARB=0.0271562;OID=.;OPOS=8485834;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:199:101:102:96:97:46:50:46:55:46:51:47:55 chr9 8486482 . T C 477.3 PASS AO=113;DP=228;FAO=113;FDP=228;FR=.;FRO=115;FSAF=55;FSAR=58;FSRF=47;FSRR=68;FWDB=-0.0201129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.621;QD=8.37369;RBI=0.0298618;REFB=0.00609661;REVB=0.0220726;RO=114;SAF=55;SAR=58;SRF=47;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0682942;STB=0.539461;TYPE=snp;VARB=-0.00714309;OID=.;OPOS=8486482;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:228:228:114:115:113:113:58:55:47:67:58:55:47:68 chr9 9442184 . G A 244.36 PASS AO=28;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00705957;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.048;QD=27.9272;RBI=0.268928;REFB=-0.194945;REVB=0.268835;RO=6;SAF=19;SAR=9;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230274;STB=0.51612;TYPE=snp;VARB=0.0200018;OID=.;OPOS=9442184;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:35:35:6:1:28:34:9:19:0:6:15:19:0:1 chr9 12764879 . C T 610.2 PASS AO=144;DP=289;FAO=144;FDP=289;FR=.;FRO=145;FSAF=59;FSAR=85;FSRF=57;FSRR=88;FWDB=0.0209685;FXX=0.00344816;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.068;QD=8.44568;RBI=0.0236072;REFB=-0.00590723;REVB=-0.0108453;RO=143;SAF=59;SAR=85;SRF=56;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0170832;STB=0.508645;TYPE=snp;VARB=0.00508912;OID=.;OPOS=12764879;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:289:289:143:145:144:144:85:59:56:87:85:59:57:88 chr9 12821761 . G GAC 126.01 PASS AO=49;DP=162;FAO=51;FDP=160;FR=.;FRO=109;FSAF=13;FSAR=38;FSRF=65;FSRR=44;FWDB=0.022699;FXX=0.00621079;HRUN=1;LEN=2;MLLD=169.905;QD=3.15018;RBI=0.0227013;REFB=-0.000934434;REVB=-0.000321134;RO=110;SAF=12;SAR=37;SRF=66;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.425589;STB=0.735391;TYPE=ins;VARB=0.002753;OID=.;OPOS=12821762;OREF=-;OALT=AC;OMAPALT=GAC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:49:162:51:160:109:13:38:65:44:99:110:12:37:66:44 chr9 12821829 . T C 141.82 PASS AO=33;DP=69;FAO=33;FDP=69;FR=.;FRO=36;FSAF=6;FSAR=27;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=-0.0115374;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=187.982;QD=8.22149;RBI=0.0273128;REFB=0.00958986;REVB=-0.0247564;RO=36;SAF=6;SAR=27;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.28758;STB=0.663046;TYPE=snp;VARB=-0.00978909;OID=.;OPOS=12821829;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:36:36:33:33:27:6:15:21:27:6:15:21 chr9 12822143 . C T 117.32 PASS AO=43;DP=127;FAO=43;FDP=127;FR=.;FRO=84;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=33;FSRR=51;FWDB=-0.0378613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.0435;QD=3.69512;RBI=0.0554497;REFB=-0.0201797;REVB=-0.0405116;RO=84;SAF=23;SAR=20;SRF=33;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162061;STB=0.593129;TYPE=snp;VARB=0.0404077;OID=.;OPOS=12822143;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:84:84:43:43:20:23:33:51:20:23:33:51 chr9 12822151 . A C 117.39 PASS AO=43;DP=127;FAO=43;FDP=127;FR=.;FRO=84;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=32;FSRR=52;FWDB=0.0168191;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=205.779;QD=3.69728;RBI=0.017823;REFB=-0.00694584;REVB=-0.00589727;RO=84;SAF=22;SAR=21;SRF=32;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149891;STB=0.586092;TYPE=snp;VARB=0.0167277;OID=.;OPOS=12822151;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:84:84:43:43:21:22:32:52:21:22:32:52 chr9 13105959 . T G 1516.93 PASS AO=160;DP=161;FAO=161;FDP=161;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0245109;FXX=0.0122692;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7895;QD=37.6878;RBI=0.0257137;REFB=-0.0554057;REVB=0.00777223;RO=1;SAF=83;SAR=77;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00613936;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.82647e-05;OID=.;OPOS=13105959;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:161:161:1:0:160:161:77:83:0:1:78:83:0:0 chr9 13112116 . A G 3082.37 PASS AO=328;DP=334;FAO=330;FDP=330;FR=.;FRO=0;FSAF=150;FSAR=180;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.032859;FXX=0.0119757;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.222;QD=37.3621;RBI=0.0411666;REFB=-0.095783;REVB=-0.0247987;RO=4;SAF=148;SAR=180;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0127158;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000691923;OID=.;OPOS=13112116;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:334:330:4:0:328:330:180:148:4:0:180:150:0:0 chr9 13150531 . T C 408.54 PASS AO=129;DP=302;FAO=129;FDP=329;FR=.;FRO=200;FSAF=50;FSAR=79;FSRF=96;FSRR=104;FWDB=-0.00412436;FXX=0.0120117;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.67;QD=4.96704;RBI=0.010266;REFB=-0.017031;REVB=-0.00940113;RO=171;SAF=50;SAR=79;SRF=93;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161748;STB=0.55762;TYPE=snp;VARB=0.0209456;OID=.;OPOS=13150531;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:302:329:171:200:129:129:79:50:93:78:79:50:96:104 chr9 13176312 . C T 458.92 PASS AO=112;DP=233;FAO=112;FDP=232;FR=.;FRO=120;FSAF=44;FSAR=68;FSRF=71;FSRR=49;FWDB=0.00047408;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.746;QD=7.91239;RBI=0.0163266;REFB=-0.00489383;REVB=0.0163197;RO=120;SAF=44;SAR=68;SRF=71;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187032;STB=0.603004;TYPE=snp;VARB=0.00350846;OID=.;OPOS=13176312;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:233:232:120:120:112:112:68:44:71:49:68:44:71:49 chr9 13219570 . T C 918.27 PASS AO=206;DP=395;FAO=207;FDP=395;FR=.;FRO=188;FSAF=124;FSAR=83;FSRF=75;FSRR=113;FWDB=0.00687621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.138;QD=9.29889;RBI=0.0240645;REFB=-0.00394462;REVB=0.0230612;RO=185;SAF=124;SAR=82;SRF=75;SRR=110;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17116;STB=0.595371;TYPE=snp;VARB=0.00410224;OID=.;OPOS=13219570;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:395:395:185:188:206:207:82:124:75:110:83:124:75:113 chr9 13928028 . T C 137.66 PASS AO=39;DP=95;FAO=39;FDP=95;FR=.;FRO=56;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=29;FSRR=27;FWDB=-0.00250688;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.458;QD=5.79634;RBI=0.0386545;REFB=-0.00239062;REVB=0.0385731;RO=56;SAF=15;SAR=24;SRF=29;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141035;STB=0.57986;TYPE=snp;VARB=0.00527164;OID=.;OPOS=13928028;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:56:56:39:39:24:15:29:27:24:15:29:27 chr9 13928080 . TATTC T 79.71 PASS AO=29;DP=99;FAO=28;FDP=85;FR=.;FRO=57;FSAF=7;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=31;FWDB=0.00640552;FXX=0.0760787;HRUN=1;LEN=4;MLLD=266.331;QD=3.75107;RBI=0.00653174;REFB=-0.000290801;REVB=-0.00127786;RO=58;SAF=7;SAR=22;SRF=27;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.286397;STB=0.65551;TYPE=del;VARB=0.000550229;OID=.;OPOS=13928081;OREF=ATTC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:29:89:28:85:57:7:21:26:31:79:58:7:22:27:31 chr9 14082784 . G A 45.95 PASS AO=35;DP=96;FAO=28;FDP=101;FR=.;FRO=73;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=37;FSRR=36;FWDB=0.0142751;FXX=0.0560695;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.038;QD=1.81985;RBI=0.0160009;REFB=0.00234632;REVB=0.0072284;RO=52;SAF=21;SAR=14;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126785;STB=0.530764;TYPE=snp;VARB=-0.0101918;OID=.;OPOS=14082784;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:96:101:52:73:35:28:14:21:25:27:15:13:37:36 chr9 14618316 . G C 370.73 PASS AO=96;DP=210;FAO=96;FDP=210;FR=.;FRO=114;FSAF=43;FSAR=53;FSRF=46;FSRR=68;FWDB=0.00614909;FXX=0.00943352;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.2788;QD=7.06147;RBI=0.0122844;REFB=-0.0183433;REVB=0.0106346;RO=114;SAF=43;SAR=53;SRF=46;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0442501;STB=0.524491;TYPE=snp;VARB=0.0289203;OID=.;OPOS=14618316;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:210:210:114:114:96:96:53:43:46:68:53:43:46:68 chr9 14737506 . T G 180.01 PASS AO=60;DP=161;FAO=59;FDP=158;FR=.;FRO=99;FSAF=22;FSAR=37;FSRF=41;FSRR=58;FWDB=-0.0613111;FXX=0.0186324;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.15;QD=4.55722;RBI=0.0632441;REFB=-0.0119596;REVB=0.0155165;RO=100;SAF=23;SAR=37;SRF=40;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0193052;STB=0.527247;TYPE=snp;VARB=0.0214936;OID=.;OPOS=14737506;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:158:100:99:60:59:37:23:40:60:37:22:41:58 chr9 14747412 . A G 416.4 PASS AO=95;DP=186;FAO=95;FDP=186;FR=.;FRO=91;FSAF=34;FSAR=61;FSRF=43;FSRR=48;FWDB=-0.0286188;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=251.986;QD=8.9549;RBI=0.0287546;REFB=0.000842359;REVB=-0.00279105;RO=91;SAF=34;SAR=61;SRF=43;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107253;STB=0.558954;TYPE=snp;VARB=-0.000838866;OID=.;OPOS=14747412;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:186:91:91:95:95:61:34:43:48:61:34:43:48 chr9 14775853 . A G 1617.49 PASS AO=168;DP=169;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0624543;FXX=0.00591681;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.388;QD=38.5116;RBI=0.0628445;REFB=0;REVB=0.00699242;RO=0;SAF=67;SAR=101;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000120603;OID=.;OPOS=14775853;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:169:168:0:0:168:168:101:67:0:0:101:67:0:0 chr9 14775859 . G A 423.21 PASS AO=93;DP=179;FAO=93;FDP=177;FR=.;FRO=84;FSAF=34;FSAR=59;FSRF=35;FSRR=49;FWDB=0.0392107;FXX=0.0111726;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.631;QD=9.56417;RBI=0.0402477;REFB=-0.0079705;REVB=0.00907764;RO=83;SAF=34;SAR=59;SRF=35;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0512498;STB=0.52576;TYPE=snp;VARB=0.00807422;OID=.;OPOS=14775859;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:177:83:84:93:93:59:34:35:48:59:34:35:49 chr9 14797516 . A T 737.77 PASS AO=156;DP=280;FAO=154;FDP=277;FR=.;FRO=123;FSAF=73;FSAR=81;FSRF=64;FSRR=59;FWDB=0.00811837;FXX=0.0177299;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.096;QD=10.6537;RBI=0.0083638;REFB=-0.0110434;REVB=-0.00201129;RO=124;SAF=75;SAR=81;SRF=63;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0222556;STB=0.520568;TYPE=snp;VARB=0.0207433;OID=.;OPOS=14797516;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:280:277:124:123:156:154:81:75:63:61:81:73:64:59 chr9 14801687 . T C 265.78 PASS AO=70;DP=158;FAO=71;FDP=161;FR=.;FRO=90;FSAF=34;FSAR=37;FSRF=40;FSRR=50;FWDB=-0.0299187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.071;QD=6.60317;RBI=0.0304867;REFB=-0.0142809;REVB=-0.00585764;RO=88;SAF=34;SAR=36;SRF=40;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0312226;STB=0.519306;TYPE=snp;VARB=0.0172567;OID=.;OPOS=14801687;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:161:88:90:70:71:36:34:40:48:37:34:40:50 chr9 14842658 . C G 322.83 PASS AO=38;DP=105;FAO=48;FDP=98;FR=.,HEALED;FRO=26;FSAF=15;FSAR=33;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=0.00945344;FXX=0.0666603;HRUN=6;LEN=1;MLLD=161.667;QD=13.1766;RBI=0.0113334;REFB=-0.0209928;REVB=-0.00625129;RO=23;SAF=14;SAR=24;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226442;STB=0.639025;TYPE=snp;VARB=0.00558055;OID=.;OPOS=14842658;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:84:98:23:26:38:48:24:14:16:7:33:15:18:8 chr9 14846036 . C G 337.1 PASS AO=79;DP=160;FAO=79;FDP=160;FR=.;FRO=81;FSAF=43;FSAR=36;FSRF=37;FSRR=44;FWDB=0.00130348;FXX=0.00621079;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.068;QD=8.42743;RBI=0.00852253;REFB=-0.0154087;REVB=0.00842226;RO=80;SAF=43;SAR=36;SRF=36;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0860836;STB=0.544293;TYPE=snp;VARB=0.017034;OID=.;OPOS=14846036;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:160:80:81:79:79:36:43:36:44:36:43:37:44 chr9 15188106 . T C 355.58 PASS AO=89;DP=190;FAO=89;FDP=190;FR=.;FRO=101;FSAF=42;FSAR=47;FSRF=32;FSRR=69;FWDB=-0.0131362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.552;QD=7.48579;RBI=0.0148659;REFB=0.000175315;REVB=-0.0069595;RO=101;SAF=42;SAR=47;SRF=32;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15145;STB=0.583455;TYPE=snp;VARB=-0.000386033;OID=.;OPOS=15188106;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:190:101:101:89:89:47:42:32:69:47:42:32:69 chr9 15464898 . C A 796.33 PASS AO=91;DP=94;FAO=90;FDP=94;FR=.;FRO=4;FSAF=36;FSAR=54;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0416745;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8075;QD=33.8862;RBI=0.0951847;REFB=-0.0244232;REVB=-0.0855766;RO=3;SAF=37;SAR=54;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.016236;STB=0.515415;TYPE=snp;VARB=-1.42347e-05;OID=.;OPOS=15464898;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:94:94:3:4:91:90:54:37:2:1:54:36:3:1 chr9 15486870 . A G 406.57 PASS AO=105;DP=235;FAO=107;FDP=233;FR=.;FRO=126;FSAF=52;FSAR=55;FSRF=67;FSRR=59;FWDB=-0.0115182;FXX=0.00851028;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.441;QD=6.9798;RBI=0.0182441;REFB=-0.01197;REVB=0.0141485;RO=125;SAF=51;SAR=54;SRF=67;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0493285;STB=0.524729;TYPE=snp;VARB=0.0159743;OID=.;OPOS=15486870;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:235:233:125:126:105:107:54:51:67:58:55:52:67:59 chr9 15544214 . G A 409.86 PASS AO=94;DP=203;FAO=101;FDP=210;FR=.;FRO=109;FSAF=58;FSAR=43;FSRF=66;FSRR=43;FWDB=0.0078578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.828;QD=7.80679;RBI=0.0435311;REFB=-0.0178237;REVB=0.042816;RO=105;SAF=57;SAR=37;SRF=65;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0127106;STB=0.516663;TYPE=snp;VARB=0.0195604;OID=.;OPOS=15544214;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:210:105:109:94:101:37:57:65:40:43:58:66:43 chr9 15571630 . T A 133.05 PASS AO=45;DP=125;FAO=45;FDP=125;FR=.;FRO=80;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=29;FSRR=51;FWDB=-0.00393353;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5772;QD=4.25758;RBI=0.0470738;REFB=0.000291145;REVB=-0.0469092;RO=80;SAF=20;SAR=25;SRF=29;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0941866;STB=0.553711;TYPE=snp;VARB=-0.00156065;OID=.;OPOS=15571630;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:80:80:45:45:25:20:29:51:25:20:29:51 chr9 15784631 . A G 318.45 PASS AO=67;DP=123;FAO=67;FDP=123;FR=.;FRO=56;FSAF=31;FSAR=36;FSRF=20;FSRR=36;FWDB=-0.0100786;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=182.974;QD=10.3559;RBI=0.0140779;REFB=-0.00285264;REVB=0.00982895;RO=54;SAF=31;SAR=36;SRF=18;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107236;STB=0.548658;TYPE=snp;VARB=0.00231936;OID=.;OPOS=15784631;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:54:56:67:67:36:31:18:36:36:31:20:36 chr9 15922137 . A G 432.39 PASS AO=101;DP=206;FAO=103;FDP=210;FR=.;FRO=107;FSAF=50;FSAR=53;FSRF=55;FSRR=52;FWDB=0.00338874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.421;QD=8.23606;RBI=0.0363795;REFB=-0.0229794;REVB=0.0362214;RO=105;SAF=50;SAR=51;SRF=55;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0266296;STB=0.51456;TYPE=snp;VARB=0.0214898;OID=.;OPOS=15922137;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:206:210:105:107:101:103:51:50:55:50:53:50:55:52 chr9 16410956 . G C 94.31 PASS AO=20;DP=59;FAO=26;FDP=64;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=29;FWDB=0.0207385;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.732;QD=5.8941;RBI=0.0225169;REFB=-0.012994;REVB=-0.00877078;RO=38;SAF=6;SAR=14;SRF=9;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0881608;STB=0.636941;TYPE=snp;VARB=0.0214035;OID=.;OPOS=16410956;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:59:64:38:38:20:26:14:6:9:29:14:12:9:29 chr9 16411463 . G T 1392.15 PASS AO=154;DP=157;FAO=153;FDP=157;FR=.;FRO=4;FSAF=43;FSAR=110;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0510416;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9996;QD=35.4688;RBI=0.0554734;REFB=0.0497183;REVB=0.0217268;RO=3;SAF=44;SAR=110;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0313277;STB=0.522219;TYPE=snp;VARB=-0.0113419;OID=.;OPOS=16411463;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:157:157:3:4:154:153:110:44:3:0:110:43:4:0 chr9 16417431 . G A 3068.41 PASS AO=318;DP=319;FAO=321;FDP=321;FR=.;FRO=0;FSAF=136;FSAR=185;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108202;FXX=0.00310549;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.461;QD=38.2356;RBI=0.0116988;REFB=0;REVB=-0.00444805;RO=0;SAF=136;SAR=182;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.48468e-06;OID=.;OPOS=16417431;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:319:321:0:0:318:321:182:136:0:0:185:136:0:0 chr9 16418440 . TGGCCCCTCAA T 676.65 PASS AO=83;DP=98;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175538;FXX=0.114571;HRUN=2;LEN=10;MLLD=238.323;QD=31.8423;RBI=0.0187331;REFB=0;REVB=0.00654155;RO=0;SAF=43;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=4.96386e-05;OID=.;OPOS=16418441;OREF=GGCCCCTCAA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:83:89:85:85:0:44:41:0:0:59:0:43:40:0:0 chr9 16418662 . C CTG 18.49 PASS AO=6;DP=39;FAO=6;FDP=25;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0244104;FXX=0.166611;HRUN=1;LEN=2;MLLD=74.3454;QD=2.95889;RBI=0.0572953;REFB=-0.0773922;REVB=-0.0518352;RO=30;SAF=5;SAR=1;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.39016;STB=0.796042;TYPE=ins;VARB=0.189848;OID=.;OPOS=16418663;OREF=-;OALT=TG;OMAPALT=CTG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:6:39:6:25:19:5:1:9:10:18:30:5:1:16:14 chr9 16685539 . T C 316.54 PASS AO=31;DP=31;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0309613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9942;QD=37.24;RBI=0.0355556;REFB=0;REVB=-0.0174813;RO=0;SAF=21;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000781206;OID=.;OPOS=16685539;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:31:34:0:0:31:34:10:21:0:0:10:24:0:0 chr9 17001122 . C A 366.83 PASS AO=103;DP=242;FAO=104;FDP=244;FR=.;FRO=140;FSAF=76;FSAR=28;FSRF=106;FSRR=34;FWDB=0.00294681;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.0262;QD=6.01363;RBI=0.00963275;REFB=-0.0214505;REVB=0.00917094;RO=139;SAF=76;SAR=27;SRF=105;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0236757;STB=0.519572;TYPE=snp;VARB=0.031808;OID=.;OPOS=17001122;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:242:244:139:140:103:104:27:76:105:34:28:76:106:34 chr9 17001200 . C A 592.98 PASS AO=153;DP=330;FAO=153;FDP=331;FR=.;FRO=178;FSAF=93;FSAR=60;FSRF=111;FSRR=67;FWDB=-0.0163918;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.429;QD=7.16595;RBI=0.0231816;REFB=0.00496535;REVB=0.016392;RO=176;SAF=93;SAR=60;SRF=110;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0175325;STB=0.508917;TYPE=snp;VARB=-0.00541988;OID=.;OPOS=17001200;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:330:331:176:178:153:153:60:93:110:66:60:93:111:67 chr9 17001216 . A C 568.14 PASS AO=146;DP=314;FAO=146;FDP=314;FR=.;FRO=168;FSAF=92;FSAR=54;FSRF=104;FSRR=64;FWDB=-0.0014594;FXX=0.0031745;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.895;QD=7.23741;RBI=0.00877094;REFB=-0.0157504;REVB=-0.00864867;RO=164;SAF=92;SAR=54;SRF=103;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00214892;STB=0.506342;TYPE=snp;VARB=0.011568;OID=.;OPOS=17001216;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:314:314:164:168:146:146:54:92:103:61:54:92:104:64 chr9 17053994 . G A 584.53 PASS AO=61;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00220241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.035;QD=37.7116;RBI=0.0148692;REFB=0;REVB=0.0147052;RO=0;SAF=35;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.17369e-05;OID=.;OPOS=17053994;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:61:62:0:0:61:62:26:35:0:0:27:35:0:0 chr9 17054142 . A G 1641.86 PASS AO=111;DP=175;FAO=172;FDP=172;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=81;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0351603;FXX=0.00578001;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.1462;QD=38.1829;RBI=0.193494;REFB=0;REVB=0.190273;RO=0;SAF=75;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.88442e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000861723;OID=.;OPOS=17054142;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:169:172:0:0:111:172:36:75:0:0:91:81:0:0 chr9 17135115 . C T 113.76 PASS AO=17;DP=25;FAO=18;FDP=26;FR=.;FRO=8;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.076723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.7553;QD=17.5015;RBI=0.076928;REFB=-0.0130011;REVB=-0.00561208;RO=8;SAF=9;SAR=8;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0886834;STB=0.538419;TYPE=snp;VARB=0.00807236;OID=.;OPOS=17135115;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:25:26:8:8:17:18:8:9:3:5:9:9:3:5 chr9 17273731 . A G 221 PASS AO=59;DP=134;FAO=59;FDP=134;FR=.;FRO=75;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=47;FSRR=28;FWDB=0.0110739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.548;QD=6.59711;RBI=0.0164078;REFB=0.00597614;REVB=0.0121073;RO=72;SAF=30;SAR=29;SRF=45;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115409;STB=0.566298;TYPE=snp;VARB=-0.00739443;OID=.;OPOS=17273731;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:72:75:59:59:29:30:45:27:29:30:47:28 chr9 17342383 . C T 882.21 PASS AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.917;QD=37.9447;RBI=0.0220919;REFB=0;REVB=0.0100425;RO=0;SAF=53;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.92821e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000101646;OID=.;OPOS=17342383;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:93:93:0:0:93:93:40:53:0:0:40:53:0:0 chr9 17394536 . C T 412.47 PASS AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.585;QD=37.4973;RBI=0.0249851;REFB=0;REVB=-0.0117483;RO=0;SAF=21;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.45524e-05;OID=.;OPOS=17394536;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:43:44:0:0:43:44:22:21:0:0:22:22:0:0 chr9 17394996 . T C 1215.99 PASS AO=131;DP=133;FAO=131;FDP=133;FR=.;FRO=2;FSAF=61;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0167355;FXX=0.00746213;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.964;QD=36.5713;RBI=0.0320649;REFB=-0.0607155;REVB=0.027351;RO=2;SAF=61;SAR=70;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0133844;STB=0.507041;TYPE=snp;VARB=0.000746586;OID=.;OPOS=17394996;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:133:133:2:2:131:131:70:61:0:2:70:61:0:2 chr9 17394997 . T A 235.4 PASS AO=61;DP=136;FAO=61;FDP=135;FR=.;FRO=74;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=28;FSRR=46;FWDB=0.0130196;FXX=0.0073524;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.0905;QD=6.97476;RBI=0.0256354;REFB=-0.0128418;REVB=-0.0220831;RO=74;SAF=33;SAR=28;SRF=28;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15905;STB=0.588405;TYPE=snp;VARB=0.019659;OID=.;OPOS=17394997;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:135:74:74:61:61:28:33:28:46:28:33:28:46 chr9 17409366 . G A 1131.02 PASS AO=128;DP=134;FAO=128;FDP=134;FR=.;FRO=6;FSAF=48;FSAR=80;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.0152886;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.249;QD=33.7618;RBI=0.0215145;REFB=-0.00680547;REVB=0.0151371;RO=5;SAF=48;SAR=80;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00190203;STB=0.501992;TYPE=snp;VARB=-7.07972e-06;OID=.;OPOS=17409366;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:134:134:5:6:128:128:80:48:2:3:80:48:2:4 chr9 18573360 . G A 635.46 PASS AO=48;DP=86;FAO=74;FDP=78;FR=.;FRO=4;FSAF=44;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.000555921;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=37.1282;QD=32.5877;RBI=0.00193374;REFB=-0.103269;REVB=0.00185211;RO=0;SAF=25;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.518196;TYPE=snp;VARB=0.00610558;OID=.;OPOS=18573360;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:56:78:0:4:48:74:23:25:0:0:30:44:1:3 chr9 18651156 . C T 345.28 PASS AO=70;DP=125;FAO=70;FDP=124;FR=.;FRO=54;FSAF=48;FSAR=22;FSRF=33;FSRR=21;FWDB=0.0276968;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.185;QD=11.1381;RBI=0.0276968;REFB=-0.0104947;REVB=2.67067e-05;RO=54;SAF=48;SAR=22;SRF=33;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0670089;STB=0.536651;TYPE=snp;VARB=0.00475506;OID=.;OPOS=18651156;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:124:54:54:70:70:22:48:33:21:22:48:33:21 chr9 18651282 . A G 275.61 PASS AO=78;DP=187;FAO=79;FDP=189;FR=.;FRO=110;FSAF=38;FSAR=41;FSRF=50;FSRR=60;FWDB=-0.00184856;FXX=0.00526288;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.661;QD=5.83303;RBI=0.0263483;REFB=-0.00855891;REVB=-0.0262834;RO=108;SAF=38;SAR=40;SRF=48;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0444582;STB=0.515441;TYPE=snp;VARB=0.00940213;OID=.;OPOS=18651282;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:189:108:110:78:79:40:38:48:60:41:38:50:60 chr9 18681821 . A G 273.38 PASS AO=64;DP=132;FAO=64;FDP=130;FR=.;FRO=66;FSAF=24;FSAR=40;FSRF=24;FSRR=42;FWDB=-0.0319432;FXX=0.0151504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.0973;QD=8.4116;RBI=0.0380813;REFB=-0.0249769;REVB=-0.0207321;RO=65;SAF=24;SAR=40;SRF=24;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00562507;STB=0.506171;TYPE=snp;VARB=0.0202768;OID=.;OPOS=18681821;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:130:65:66:64:64:40:24:24:41:40:24:24:42 chr9 18775810 . C A 291.64 PASS AO=66;DP=133;FAO=67;FDP=133;FR=.;FRO=66;FSAF=14;FSAR=53;FSRF=30;FSRR=36;FWDB=0.0059499;FXX=0.00746213;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.11;QD=8.77115;RBI=0.00874049;REFB=0.00176338;REVB=0.00640273;RO=66;SAF=14;SAR=52;SRF=30;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.2694;STB=0.651711;TYPE=snp;VARB=-0.00153765;OID=.;OPOS=18775810;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:66:66:66:67:52:14:30:36:53:14:30:36 chr9 18776840 . A C 51.79 PASS AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=1;FWDB=-0.014137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.694;QD=10.3584;RBI=0.0357202;REFB=0.00466174;REVB=-0.0328036;RO=10;SAF=7;SAR=3;SRF=9;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230767;STB=0.631356;TYPE=snp;VARB=-0.0082766;OID=.;OPOS=18776840;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:20:20:10:10:10:10:3:7:9:1:3:7:9:1 chr9 18777196 . A C 80.32 PASS AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.0446703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.114;QD=8.45485;RBI=0.0453455;REFB=-0.0147713;REVB=0.00779573;RO=20;SAF=6;SAR=12;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115484;STB=0.565962;TYPE=snp;VARB=0.0132149;OID=.;OPOS=18777196;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:38:38:20:20:18:18:12:6:9:11:12:6:9:11 chr9 18777368 . T C 111.15 PASS AO=20;DP=33;FAO=20;FDP=33;FR=.;FRO=13;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=-0.00171639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.877;QD=13.4722;RBI=0.120931;REFB=-0.0459445;REVB=-0.120919;RO=12;SAF=14;SAR=6;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0409645;STB=0.533301;TYPE=snp;VARB=0.0246703;OID=.;OPOS=18777368;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:33:33:12:13:20:20:6:14:9:3:6:14:10:3 chr9 18777422 . G A 92.23 PASS AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=5;FWDB=0.0161335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.112;QD=8.38476;RBI=0.0223213;REFB=-0.00956499;REVB=-0.0154256;RO=23;SAF=13;SAR=8;SRF=18;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16874;STB=0.594641;TYPE=snp;VARB=0.00843989;OID=.;OPOS=18777422;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:44:44:23:23:21:21:8:13:18:5:8:13:18:5 chr9 18950787 . G A 3242.08 PASS AO=184;DP=393;FAO=343;FDP=343;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=164;FSAR=179;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0474149;FXX=0.00290689;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.1348;QD=37.8086;RBI=0.0609716;REFB=0;REVB=0.0383323;RO=0;SAF=8;SAR=176;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.75416e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0155482;OID=.;OPOS=18950787;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:235:343:0:0:184:343:176:8:0:0:179:164:0:0 chr9 18950895 . T C 2912.04 PASS AO=305;DP=307;FAO=305;FDP=305;FR=.;FRO=0;FSAF=107;FSAR=198;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300383;FXX=0.00651445;HRUN=4;LEN=1;MLLD=239.066;QD=38.1907;RBI=0.0396774;REFB=0.00381326;REVB=0.0259229;RO=0;SAF=107;SAR=198;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.34154e-05;OID=.;OPOS=18950895;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:307:305:0:0:305:305:198:107:0:0:198:107:0:0 chr9 19056147 . T TA 236.63 PASS AO=83;DP=182;FAO=89;FDP=176;FR=.;FRO=87;FSAF=42;FSAR=47;FSRF=45;FSRR=42;FWDB=0.0491778;FXX=0.0167588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=21.9266;QD=5.37803;RBI=0.0596771;REFB=-0.0011497;REVB=-0.0338067;RO=98;SAF=39;SAR=44;SRF=51;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.049354;STB=0.522417;TYPE=ins;VARB=0.0152917;OID=.;OPOS=19056148;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:83:182:89:176:87:42:47:45:42:99:98:39:44:51:47 chr9 19058425 . G A 280.33 PASS AO=34;DP=38;FAO=34;FDP=38;FR=.;FRO=4;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0630747;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.2395;QD=29.5081;RBI=0.0741709;REFB=-0.172914;REVB=-0.0390244;RO=1;SAF=16;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0283217;STB=0.529394;TYPE=snp;VARB=0.0186576;OID=.;OPOS=19058425;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:38:38:1:4:34:34:18:16:1:0:18:16:3:1 chr9 19058743 . G C 573.28 PASS AO=129;DP=251;FAO=130;FDP=252;FR=.;FRO=122;FSAF=56;FSAR=74;FSRF=42;FSRR=80;FWDB=-0.00803092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.264;QD=9.09972;RBI=0.0274684;REFB=-0.0290777;REVB=-0.0262682;RO=121;SAF=56;SAR=73;SRF=42;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0793319;STB=0.543203;TYPE=snp;VARB=0.0252018;OID=.;OPOS=19058743;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:251:252:121:122:129:130:73:56:42:79:74:56:42:80 chr9 19058821 . A G 556.94 PASS AO=122;DP=235;FAO=125;FDP=240;FR=.;FRO=115;FSAF=48;FSAR=77;FSRF=43;FSRR=72;FWDB=0.00376588;FXX=0.0123452;HRUN=4;LEN=1;MLLD=54.7225;QD=9.28229;RBI=0.0225847;REFB=-0.0176459;REVB=-0.0222685;RO=113;SAF=45;SAR=77;SRF=42;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00266767;STB=0.50512;TYPE=snp;VARB=0.0183601;OID=.;OPOS=19058821;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:235:240:113:115:122:125:77:45:42:71:77:48:43:72 chr9 19060046 . C T 370.34 PASS AO=87;DP=163;FAO=84;FDP=164;FR=.;FRO=80;FSAF=47;FSAR=37;FSRF=40;FSRR=40;FWDB=-0.00657253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.8455;QD=9.03256;RBI=0.0171511;REFB=-0.00638652;REVB=0.0158418;RO=75;SAF=50;SAR=37;SRF=36;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0808675;STB=0.529241;TYPE=snp;VARB=0.00855306;OID=.;OPOS=19060046;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:164:75:80:87:84:37:50:36:39:37:47:40:40 chr9 19063765 . A G 646.98 PASS AO=148;DP=293;FAO=148;FDP=289;FR=.;FRO=141;FSAF=49;FSAR=99;FSRF=64;FSRR=77;FWDB=-0.0162812;FXX=0.0170062;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.156;QD=8.95477;RBI=0.0206965;REFB=0.00702397;REVB=0.0127776;RO=140;SAF=49;SAR=99;SRF=64;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120521;STB=0.564677;TYPE=snp;VARB=-0.0048351;OID=.;OPOS=19063765;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:293:289:140:141:148:148:99:49:64:76:99:49:64:77 chr9 19341045 . A G 3853.81 PASS AO=866;DP=872;FAO=400;FDP=400;FR=.;FRO=0;FSAF=218;FSAR=182;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0086165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.329;QD=38.5381;RBI=0.0112478;REFB=0;REVB=0.00722967;RO=0;SAF=448;SAR=418;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.65869e-06;OID=.;OPOS=19341045;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:872:400:0:0:866:400:418:448:0:0:182:218:0:0 chr9 19380239 . A T 117.59 PASS AO=25;DP=49;FAO=25;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=21;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.00218237;FXX=0.019996;HRUN=2;LEN=1;MLLD=250.287;QD=9.59885;RBI=0.00240575;REFB=-0.0162845;REVB=0.00101237;RO=24;SAF=4;SAR=21;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.311436;STB=0.677256;TYPE=snp;VARB=0.0109137;OID=.;OPOS=19380239;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:24:24:25:25:21:4:10:14:21:4:10:14 chr9 19461193 . G T 583.73 PASS AO=131;DP=252;FAO=132;FDP=254;FR=.;FRO=122;FSAF=62;FSAR=70;FSRF=45;FSRR=77;FWDB=0.0199649;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.7955;QD=9.19256;RBI=0.0516612;REFB=-0.0160758;REVB=-0.0476475;RO=121;SAF=61;SAR=70;SRF=44;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0907372;STB=0.548897;TYPE=snp;VARB=0.0139681;OID=.;OPOS=19461193;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:252:254:121:122:131:132:70:61:44:77:70:62:45:77 chr9 19492914 . GGTGGTCTACCA G 270.72 PASS AO=89;DP=206;FAO=92;FDP=183;FR=.;FRO=91;FSAF=38;FSAR=54;FSRF=35;FSRR=56;FWDB=-0.00888677;FXX=0.0663231;HRUN=2;LEN=11;MLLD=318.3;QD=5.91739;RBI=0.0239438;REFB=-0.0120876;REVB=-0.0222335;RO=83;SAF=38;SAR=51;SRF=30;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0595314;STB=0.514648;TYPE=del;VARB=0.0122347;OID=.;OPOS=19492915;OREF=GTGGTCTACCA;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:89:196:92:183:91:38:54:35:56:99:83:38:51:30:53 chr9 19576949 . T G 1196.72 PASS AO=129;DP=133;FAO=129;FDP=131;FR=.;FRO=2;FSAF=67;FSAR=62;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0258199;FXX=0.0150365;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.779;QD=36.5411;RBI=0.0364382;REFB=-0.141264;REVB=0.0257113;RO=2;SAF=67;SAR=62;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000563111;STB=0.500296;TYPE=snp;VARB=0.000398311;OID=.;OPOS=19576949;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:133:131:2:2:129:129:62:67:1:1:62:67:1:1 chr9 19622268 . T C 366.93 PASS AO=42;DP=44;FAO=42;FDP=44;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.000109399;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.5394;QD=33.3572;RBI=0.00505067;REFB=-0.0045807;REVB=-0.00504949;RO=1;SAF=20;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0228919;STB=0.501084;TYPE=snp;VARB=2.89733e-05;OID=.;OPOS=19622268;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:44:44:1:2:42:42:22:20:1:0:22:20:1:1 chr9 20418323 . T C 225.4 PASS AO=55;DP=121;FAO=55;FDP=117;FR=.;FRO=62;FSAF=37;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=36;FWDB=0.000295237;FXX=0.0330551;HRUN=3;LEN=1;MLLD=248.507;QD=7.70589;RBI=0.0134547;REFB=-0.0195154;REVB=-0.0134515;RO=62;SAF=37;SAR=18;SRF=26;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.247664;STB=0.63788;TYPE=snp;VARB=0.0222863;OID=.;OPOS=20418323;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:117:62:62:55:55:18:37:26:36:18:37:26:36 chr9 20786994 . G C 2196.04 PASS AO=213;DP=213;FAO=229;FDP=229;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=149;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0582507;FXX=0.00434764;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.28;QD=38.3587;RBI=0.061446;REFB=0;REVB=0.0195569;RO=0;SAF=67;SAR=146;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.33013e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.0481e-05;OID=.;OPOS=20786994;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:213:229:0:0:213:229:146:67:0:0:149:80:0:0 chr9 20866974 . C G 1064.6 PASS AO=112;DP=112;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0337992;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.4848;QD=38.0215;RBI=0.0727412;REFB=0;REVB=0.0644119;RO=0;SAF=59;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.35459e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000732827;OID=.;OPOS=20866974;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:112:112:0:0:112:112:53:59:0:0:53:59:0:0 chr9 20953049 . A G 1146.79 PASS AO=120;DP=123;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0973155;FXX=0.0162588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.522;QD=37.9104;RBI=0.0977725;REFB=0;REVB=-0.00944148;RO=1;SAF=49;SAR=71;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00959528;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.04233e-05;OID=.;OPOS=20953049;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:123:121:1:0:120:121:71:49:1:0:71:50:0:0 chr9 20988426 . A G 1217.79 PASS AO=128;DP=130;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0379012;FXX=0.0153834;HRUN=2;LEN=1;MLLD=221.021;QD=38.0559;RBI=0.037979;REFB=-0.0578967;REVB=0.00243014;RO=1;SAF=65;SAR=63;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00725512;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.21173e-05;OID=.;OPOS=20988426;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:130:128:1:0:128:128:63:65:1:0:63:65:0:0 chr9 21077716 . G A 215.96 PASS AO=49;DP=99;FAO=50;FDP=101;FR=.;FRO=51;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=27;FSRR=24;FWDB=-0.0205148;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.376;QD=8.55306;RBI=0.0257756;REFB=-0.0222288;REVB=0.0156052;RO=50;SAF=24;SAR=25;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0275206;STB=0.524931;TYPE=snp;VARB=0.0128125;OID=.;OPOS=21077716;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:101:50:51:49:50:25:24:26:24:26:24:27:24 chr9 21187311 . C T 402.48 PASS AO=101;DP=195;FAO=101;FDP=215;FR=.;FRO=114;FSAF=48;FSAR=53;FSRF=44;FSRR=70;FWDB=0.00393072;FXX=0.00921617;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.721;QD=7.48805;RBI=0.0430377;REFB=-0.0200392;REVB=-0.0428578;RO=91;SAF=48;SAR=53;SRF=43;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00236184;STB=0.547672;TYPE=snp;VARB=0.0244761;OID=.;OPOS=21187311;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:215:91:114:101:101:53:48:43:48:53:48:44:70 chr9 21206743 . G T 209.23 PASS AO=74;DP=214;FAO=76;FDP=216;FR=.;FRO=140;FSAF=41;FSAR=35;FSRF=70;FSRR=70;FWDB=-0.039512;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.2267;QD=3.87463;RBI=0.0470276;REFB=-0.00206225;REVB=0.025503;RO=139;SAF=41;SAR=33;SRF=70;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0579151;STB=0.525634;TYPE=snp;VARB=0.00382713;OID=.;OPOS=21206743;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:216:139:140:74:76:33:41:70:69:35:41:70:70 chr9 21207037 . A T 26.09 PASS AO=31;DP=169;FAO=31;FDP=174;FR=.;FRO=143;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=72;FSRR=71;FWDB=-0.0316851;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.251;QD=0.599862;RBI=0.0633535;REFB=-0.00661902;REVB=-0.0548609;RO=138;SAF=18;SAR=13;SRF=72;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0761983;STB=0.563717;TYPE=snp;VARB=0.0550025;OID=.;OPOS=21207037;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:169:174:138:143:31:31:13:18:72:66:13:18:72:71 chr9 21216864 . A G 244.42 PASS AO=73;DP=177;FAO=73;FDP=181;FR=.;FRO=108;FSAF=30;FSAR=43;FSRF=45;FSRR=63;FWDB=0.0186275;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.4638;QD=5.40155;RBI=0.0606975;REFB=0.00434909;REVB=-0.0577686;RO=104;SAF=29;SAR=44;SRF=45;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0383937;STB=0.503512;TYPE=snp;VARB=-0.00687331;OID=.;OPOS=21216864;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:181:104:108:73:73:44:29:45:59:43:30:45:63 chr9 21216908 . C G 299.17 PASS AO=65;DP=163;FAO=81;FDP=180;FR=.;FRO=99;FSAF=45;FSAR=36;FSRF=46;FSRR=53;FWDB=0.0291203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.395;QD=6.64828;RBI=0.0310761;REFB=-0.00799004;REVB=0.0108505;RO=95;SAF=29;SAR=36;SRF=45;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0293025;STB=0.550049;TYPE=snp;VARB=0.0246086;OID=.;OPOS=21216908;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:180:95:99:65:81:36:29:45:50:36:45:46:53 chr9 21216910 . A G 279.69 PASS AO=77;DP=177;FAO=77;FDP=178;FR=.;FRO=101;FSAF=42;FSAR=35;FSRF=49;FSRR=52;FWDB=0.00522795;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.635;QD=6.28526;RBI=0.00561961;REFB=-0.00357919;REVB=0.00206121;RO=100;SAF=42;SAR=35;SRF=48;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0664189;STB=0.53428;TYPE=snp;VARB=0.00150403;OID=.;OPOS=21216910;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:178:100:101:77:77:35:42:48:52:35:42:49:52 chr9 21216934 . G A 463.22 PASS AO=101;DP=193;FAO=102;FDP=193;FR=.;FRO=91;FSAF=60;FSAR=42;FSRF=37;FSRR=54;FWDB=-0.00512949;FXX=0.00515437;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.544;QD=9.6005;RBI=0.00610601;REFB=0.0010106;REVB=-0.00331237;RO=89;SAF=59;SAR=42;SRF=36;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153909;STB=0.585706;TYPE=snp;VARB=-0.00142338;OID=.;OPOS=21216934;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:193:89:91:101:102:42:59:36:53:42:60:37:54 chr9 21217022 . C G 615.52 PASS AO=120;DP=203;FAO=120;FDP=203;FR=.;FRO=83;FSAF=58;FSAR=62;FSRF=36;FSRR=47;FWDB=-0.00833444;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.0115;QD=12.1284;RBI=0.0120166;REFB=0.00988422;REVB=-0.00865655;RO=83;SAF=58;SAR=62;SRF=36;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0375261;STB=0.520326;TYPE=snp;VARB=-0.011833;OID=.;OPOS=21217022;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:203:83:83:120:120:62:58:36:47:62:58:36:47 chr9 21217111 . A T 245.42 PASS AO=69;DP=166;FAO=70;FDP=167;FR=.;FRO=97;FSAF=29;FSAR=41;FSRF=46;FSRR=51;FWDB=0.00199122;FXX=0.00595203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2057;QD=5.87824;RBI=0.012662;REFB=-0.0109405;REVB=0.0125044;RO=92;SAF=29;SAR=40;SRF=45;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0712465;STB=0.535424;TYPE=snp;VARB=0.036921;OID=.;OPOS=21217111;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:167:92:97:69:70:40:29:45:47:41:29:46:51 chr9 21217166 . T C 296.9 PASS AO=74;DP=167;FAO=76;FDP=167;FR=.;FRO=91;FSAF=30;FSAR=46;FSRF=48;FSRR=43;FWDB=-0.0165627;FXX=0.0233904;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.204;QD=7.1113;RBI=0.0168261;REFB=-0.0232098;REVB=0.00296523;RO=89;SAF=30;SAR=44;SRF=48;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132607;STB=0.573327;TYPE=snp;VARB=0.0261481;OID=.;OPOS=21217166;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:167:89:91:74:76:44:30:48:41:46:30:48:43 chr9 21227622 . A C 49.84 PASS AO=44;DP=217;FAO=44;FDP=213;FR=.;FRO=169;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=95;FSRR=74;FWDB=-0.0104357;FXX=0.0229347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.1394;QD=0.935892;RBI=0.0128467;REFB=-0.00225043;REVB=0.00749222;RO=142;SAF=18;SAR=26;SRF=79;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184561;STB=0.620039;TYPE=snp;VARB=0.00538173;OID=.;OPOS=21227622;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:217:213:142:169:44:44:26:18:79:63:26:18:95:74 chr9 21227651 . A G 40.24 PASS AO=42;DP=242;FAO=45;FDP=241;FR=.;FRO=196;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=103;FSRR=93;FWDB=-0.0114923;FXX=0.0203244;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.677;QD=0.667947;RBI=0.0136836;REFB=-0.00220852;REVB=-0.00742757;RO=195;SAF=22;SAR=20;SRF=105;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0189673;STB=0.529745;TYPE=snp;VARB=0.00689368;OID=.;OPOS=21227651;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:242:241:195:196:42:45:20:22:105:90:23:22:103:93 chr9 21228002 . A AT 239.24 PASS AO=81;DP=173;FAO=82;FDP=162;FR=.;FRO=80;FSAF=26;FSAR=56;FSRF=26;FSRR=54;FWDB=-0.0402036;FXX=0.00613459;HRUN=1;LEN=1;MLLD=28.3597;QD=5.90724;RBI=0.0450737;REFB=0.00361536;REVB=0.0203792;RO=92;SAF=25;SAR=56;SRF=31;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0314054;STB=0.504503;TYPE=ins;VARB=-0.00470213;OID=.;OPOS=21228003;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:81:173:82:162:80:26:56:26:54:99:92:25:56:31:61 chr9 21304803 . G A 532.62 PASS AO=109;DP=195;FAO=110;FDP=195;FR=.;FRO=85;FSAF=65;FSAR=45;FSRF=37;FSRR=48;FWDB=0.00741422;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=210.694;QD=10.9255;RBI=0.0247543;REFB=0.00312859;REVB=0.0236179;RO=84;SAF=64;SAR=45;SRF=37;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118258;STB=0.568394;TYPE=snp;VARB=-0.00204262;OID=.;OPOS=21304803;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:195:84:85:109:110:45:64:37:47:45:65:37:48 chr9 21333254 . T C 584.76 PASS AO=156;DP=345;FAO=156;FDP=345;FR=.;FRO=189;FSAF=64;FSAR=92;FSRF=77;FSRR=112;FWDB=0.000955994;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=246.36;QD=6.7798;RBI=0.00855507;REFB=-0.00436913;REVB=-0.00850149;RO=189;SAF=64;SAR=92;SRF=77;SRR=112;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00291871;STB=0.501613;TYPE=snp;VARB=0.00571538;OID=.;OPOS=21333254;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:345:345:189:189:156:156:92:64:77:112:92:64:77:112 chr9 21334998 . G A 410.51 PASS AO=108;DP=237;FAO=110;FDP=245;FR=.;FRO=135;FSAF=33;FSAR=77;FSRF=64;FSRR=71;FWDB=-0.0235382;FXX=0.0823939;HRUN=3;LEN=1;MLLD=160.64;QD=6.70219;RBI=0.0270945;REFB=-0.0130721;REVB=0.0134188;RO=126;SAF=33;SAR=75;SRF=55;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14058;STB=0.604611;TYPE=snp;VARB=0.0182919;OID=.;OPOS=21334998;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:237:245:126:135:108:110:75:33:55:71:77:33:64:71 chr9 21335200 . C A 105.97 PASS AO=21;DP=39;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.0894638;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.3911;QD=10.8688;RBI=0.0912515;REFB=-0.000457253;REVB=0.0179742;RO=18;SAF=6;SAR=15;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.239236;STB=0.634786;TYPE=snp;VARB=0.00195417;OID=.;OPOS=21335200;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:39:39:18:18:21:21:15:6:10:8:15:6:10:8 chr9 21335321 . CTGGGCCTGGGCT C 31.74 PASS AO=7;DP=22;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.00402886;FXX=0;HRUN=1;LEN=12;MLLD=265.149;QD=7.46759;RBI=0.0046354;REFB=0.0127433;REVB=-0.00229242;RO=10;SAF=2;SAR=5;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22218;STB=0.576693;TYPE=del;VARB=-0.0142781;OID=.;OPOS=21335322;OREF=TGGGCCTGGGCT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:7:18:7:17:10:2:5:4:6:31:10:2:5:5:5 chr9 21368036 . C G 196.29 PASS AO=43;DP=85;FAO=44;FDP=87;FR=.;FRO=43;FSAF=12;FSAR=32;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=0.0468265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.1047;QD=9.02469;RBI=0.112128;REFB=-0.00488432;REVB=-0.101882;RO=42;SAF=12;SAR=31;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.278195;STB=0.652988;TYPE=snp;VARB=0.00439143;OID=.;OPOS=21368036;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:87:42:43:43:44:31:12:24:18:32:12:24:19 chr9 21440535 . T C 10.97 PASS AO=11;DP=71;FAO=11;FDP=71;FR=.;FRO=60;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=28;FSRR=32;FWDB=-0.0475006;FXX=0.0273935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.122;QD=0.618078;RBI=0.0592313;REFB=-0.00383376;REVB=-0.0353842;RO=60;SAF=3;SAR=8;SRF=28;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251535;STB=0.673583;TYPE=snp;VARB=0.0239941;OID=.;OPOS=21440535;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:71:71:60:60:11:11:8:3:28:32:8:3:28:32 chr9 21440994 . C G 207.48 PASS AO=40;DP=78;FAO=48;FDP=91;FR=.;FRO=43;FSAF=14;FSAR=34;FSRF=13;FSRR=30;FWDB=0.0195142;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=31.3526;QD=9.12017;RBI=0.0198815;REFB=-0.103876;REVB=0.00380404;RO=38;SAF=13;SAR=27;SRF=13;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170056;STB=0.506061;TYPE=snp;VARB=0.100026;OID=.;OPOS=21440994;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:91:38:43:40:48:27:13:13:25:34:14:13:30 chr9 21441116 . C T 621.78 PASS AO=140;DP=269;FAO=140;FDP=269;FR=.;FRO=129;FSAF=64;FSAR=76;FSRF=70;FSRR=59;FWDB=-0.00209617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.593;QD=9.24575;RBI=0.0357453;REFB=-0.0251096;REVB=-0.0356838;RO=129;SAF=64;SAR=76;SRF=70;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0750281;STB=0.541006;TYPE=snp;VARB=0.0240332;OID=.;OPOS=21441116;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:269:269:129:129:140:140:76:64:70:59:76:64:70:59 chr9 21482089 . G A 1566.06 PASS AO=148;DP=171;FAO=178;FDP=178;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0141478;FXX=0.0777162;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.977;QD=35.1923;RBI=0.0228907;REFB=0;REVB=0.0179951;RO=0;SAF=75;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.85041e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000752062;OID=.;OPOS=21482089;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:171:178:0:0:148:178:73:75:0:0:82:96:0:0 chr9 21482125 . T TA 289.29 PASS AO=122;DP=295;FAO=125;FDP=282;FR=.;FRO=157;FSAF=72;FSAR=53;FSRF=70;FSRR=87;FWDB=-0.0263038;FXX=0.0440663;HRUN=1;LEN=1;MLLD=24.5467;QD=4.10338;RBI=0.056067;REFB=0.0019384;REVB=0.0495138;RO=164;SAF=70;SAR=52;SRF=74;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126364;STB=0.57252;TYPE=ins;VARB=-0.00364505;OID=.;OPOS=21482126;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:122:295:125:282:157:72:53:70:87:99:164:70:52:74:90 chr9 21968199 . C G 1095.94 PASS AO=122;DP=125;FAO=122;FDP=125;FR=.;FRO=3;FSAF=71;FSAR=51;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0130537;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.9678;QD=35.0699;RBI=0.019212;REFB=0.10439;REVB=-0.0140962;RO=0;SAF=71;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.80326e-08;STB=0.50209;TYPE=snp;VARB=-0.00230601;OID=.;OPOS=21968199;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:125:125:0:3:122:122:51:71:0:0:51:71:2:1 chr9 22029445 . G A 1213.99 PASS AO=128;DP=128;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00955091;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.871;QD=37.937;RBI=0.128607;REFB=-0.0516781;REVB=0.128252;RO=0;SAF=66;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000320535;OID=.;OPOS=22029445;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:128:128:0:0:128:128:62:66:0:0:63:65:0:0 chr9 23762176 . G A 694.41 PASS AO=202;DP=442;FAO=183;FDP=400;FR=.;FRO=217;FSAF=76;FSAR=107;FSRF=101;FSRR=116;FWDB=-0.00676719;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.825;QD=6.94407;RBI=0.00889755;REFB=-0.00678584;REVB=0.0057768;RO=238;SAF=86;SAR=116;SRF=115;SRR=123;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0570462;STB=0.527737;TYPE=snp;VARB=0.0078331;OID=.;OPOS=23762176;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:442:400:238:217:202:183:116:86:115:123:107:76:101:116 chr9 24545513 . G A 387.55 PASS AO=85;DP=164;FAO=87;FDP=167;FR=.;FRO=80;FSAF=38;FSAR=49;FSRF=39;FSRR=41;FWDB=-0.0074346;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=159.255;QD=9.28255;RBI=0.00983392;REFB=-0.0222289;REVB=0.00643682;RO=77;SAF=37;SAR=48;SRF=39;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0622152;STB=0.524532;TYPE=snp;VARB=0.0210405;OID=.;OPOS=24545513;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:167:77:80:85:87:48:37:39:38:49:38:39:41 chr9 24545957 . G C 202.97 PASS AO=55;DP=127;FAO=55;FDP=127;FR=.;FRO=72;FSAF=14;FSAR=41;FSRF=20;FSRR=52;FWDB=-0.0242061;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=131.933;QD=6.39279;RBI=0.0244781;REFB=0.0112846;REVB=0.00363838;RO=72;SAF=14;SAR=41;SRF=20;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.030423;STB=0.517056;TYPE=snp;VARB=-0.0175913;OID=.;OPOS=24545957;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:72:72:55:55:41:14:20:52:41:14:20:52 chr9 24905556 . A G 2049.89 PASS AO=214;DP=215;FAO=214;FDP=214;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=133;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226455;FXX=0.00465095;HRUN=3;LEN=1;MLLD=161.4;QD=38.3158;RBI=0.0228563;REFB=0;REVB=0.00309694;RO=0;SAF=81;SAR=133;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.89241e-05;OID=.;OPOS=24905556;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:97:215:214:0:0:214:214:133:81:0:0:133:81:0:0 chr9 25678639 . G A 82.9 PASS AO=21;DP=49;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=0.0176167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.498;QD=6.76701;RBI=0.0380984;REFB=-0.0215378;REVB=0.0337808;RO=28;SAF=8;SAR=13;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.025414;STB=0.514509;TYPE=snp;VARB=0.0717741;OID=.;OPOS=25678639;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:49:49:28:28:21:21:13:8:10:18:13:8:10:18 chr9 26116150 . G T 68.51 PASS AO=18;DP=44;FAO=18;FDP=44;FR=.;FRO=26;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.00995649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.537;QD=6.22863;RBI=0.0193211;REFB=-0.0163903;REVB=0.0165582;RO=26;SAF=4;SAR=14;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.285067;STB=0.666465;TYPE=snp;VARB=0.0266852;OID=.;OPOS=26116150;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:44:44:26:26:18:18:14:4:12:14:14:4:12:14 chr9 26998090 . C T 283.08 PASS AO=77;DP=169;FAO=75;FDP=169;FR=.;FRO=94;FSAF=44;FSAR=31;FSRF=36;FSRR=58;FWDB=-0.00550181;FXX=0.0116952;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.329;QD=6.70018;RBI=0.0131811;REFB=-0.0166699;REVB=-0.0119779;RO=91;SAF=44;SAR=33;SRF=34;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191423;STB=0.612228;TYPE=snp;VARB=0.0254414;OID=.;OPOS=26998090;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:169:91:94:77:75:33:44:34:57:31:44:36:58 chr9 27183463 . A C 1048.11 PASS AO=111;DP=112;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00282886;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.266;QD=37.4324;RBI=0.00285686;REFB=0.0213633;REVB=-0.00039906;RO=0;SAF=48;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.46823e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.25563e-05;OID=.;OPOS=27183463;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:112:112:0:0:111:112:63:48:0:0:64:48:0:0 chr9 27190655 . G A 439.31 PASS AO=98;DP=189;FAO=99;FDP=191;FR=.;FRO=92;FSAF=36;FSAR=63;FSRF=44;FSRR=48;FWDB=-0.0327166;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.233;QD=9.20025;RBI=0.0327265;REFB=0.00246784;REVB=-0.000803839;RO=88;SAF=35;SAR=63;SRF=42;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10902;STB=0.557757;TYPE=snp;VARB=-0.00274883;OID=.;OPOS=27190655;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:191:88:92:98:99:63:35:42:46:63:36:44:48 chr9 27296705 . A G 206.03 PASS AO=48;DP=101;FAO=49;FDP=102;FR=.;FRO=53;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=33;FWDB=0.00715567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.777;QD=8.07956;RBI=0.00978313;REFB=0.0138646;REVB=0.00667127;RO=52;SAF=27;SAR=21;SRF=19;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18289;STB=0.589484;TYPE=snp;VARB=-0.0131023;OID=.;OPOS=27296705;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:102:52:53:48:49:21:27:19:33:22:27:20:33 chr9 27328886 . C A 2424.56 PASS AO=234;DP=234;FAO=258;FDP=258;FR=.;FRO=0;FSAF=135;FSAR=123;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0374251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.054;QD=37.5901;RBI=0.037791;REFB=0;REVB=-0.00524581;RO=0;SAF=116;SAR=118;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.85185e-06;OID=.;OPOS=27328886;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:234:258:0:0:234:258:118:116:0:0:123:135:0:0 chr9 27328964 . C T 835.38 PASS AO=209;DP=415;FAO=198;FDP=397;FR=.;FRO=199;FSAF=83;FSAR=115;FSRF=84;FSRR=115;FWDB=0.0130721;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.962;QD=8.41691;RBI=0.0178306;REFB=-0.0122946;REVB=-0.0121265;RO=200;SAF=89;SAR=120;SRF=85;SRR=115;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000766246;STB=0.501501;TYPE=snp;VARB=0.0140183;OID=.;OPOS=27328964;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:415:397:200:199:209:198:120:89:85:115:115:83:84:115 chr9 27378301 . A G 92.45 PASS AO=27;DP=74;FAO=28;FDP=74;FR=.;FRO=46;FSAF=23;FSAR=5;FSRF=38;FSRR=8;FWDB=0.0271193;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.845;QD=4.99732;RBI=0.0439883;REFB=-0.0293495;REVB=0.0346339;RO=46;SAF=22;SAR=5;SRF=38;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0207671;STB=0.504963;TYPE=snp;VARB=0.0474607;OID=.;OPOS=27378301;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:74:74:46:46:27:28:5:22:38:8:5:23:38:8 chr9 27455135 . G A 225.35 PASS AO=59;DP=132;FAO=59;FDP=132;FR=.;FRO=73;FSAF=35;FSAR=24;FSRF=38;FSRR=35;FWDB=-0.00260717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.674;QD=6.82863;RBI=0.0768663;REFB=-0.0310657;REVB=0.076822;RO=73;SAF=35;SAR=24;SRF=38;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0734441;STB=0.540987;TYPE=snp;VARB=0.037308;OID=.;OPOS=27455135;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:73:73:59:59:24:35:38:35:24:35:38:35 chr9 27524731 . A G 1100.36 PASS AO=131;DP=143;FAO=132;FDP=143;FR=.;FRO=11;FSAF=62;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=11;FWDB=-0.0234567;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.444;QD=30.7792;RBI=0.0304064;REFB=-0.209844;REVB=0.0193477;RO=2;SAF=62;SAR=69;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0135754;STB=0.536418;TYPE=snp;VARB=0.00509305;OID=.;OPOS=27524731;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:143:143:2:11:131:132:69:62:0:2:70:62:0:11 chr9 32069857 . T G 613.27 PASS AO=63;DP=63;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.101658;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.5656;QD=37.1679;RBI=0.105952;REFB=0;REVB=-0.0298572;RO=0;SAF=34;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00122148;OID=.;OPOS=32069857;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:63:66:0:0:63:66:29:34:0:0:29:37:0:0 chr9 32459450 . T G 464.28 PASS AO=95;DP=212;FAO=114;FDP=230;FR=.;FRO=116;FSAF=45;FSAR=69;FSRF=43;FSRR=73;FWDB=0.0448647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.872;QD=8.07441;RBI=0.0448668;REFB=-0.00318913;REVB=-0.000436115;RO=115;SAF=30;SAR=65;SRF=43;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.064518;STB=0.512757;TYPE=snp;VARB=0.00314461;OID=.;OPOS=32459450;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:230:115:116:95:114:65:30:43:72:69:45:43:73 chr9 32480251 . A T 591.41 PASS AO=123;DP=222;FAO=123;FDP=221;FR=.;FRO=98;FSAF=53;FSAR=70;FSRF=54;FSRR=44;FWDB=-0.00803845;FXX=0.0045043;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.482;QD=10.7043;RBI=0.0109178;REFB=0.0167853;REVB=-0.00738787;RO=99;SAF=53;SAR=70;SRF=54;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0942918;STB=0.553494;TYPE=snp;VARB=-0.0121441;OID=.;OPOS=32480251;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:221:99:98:123:123:70:53:54:45:70:53:54:44 chr9 32498291 . A G 877.42 PASS AO=88;DP=89;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0330596;FXX=0.0212743;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.645;QD=38.1489;RBI=0.0437184;REFB=0;REVB=0.028607;RO=0;SAF=45;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.39218e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000117474;OID=.;OPOS=32498291;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:89:92:0:0:88:92:43:45:0:0:44:48:0:0 chr9 32538146 . G A 354.14 PASS AO=83;DP=174;FAO=86;FDP=178;FR=.;FRO=92;FSAF=25;FSAR=61;FSRF=31;FSRR=61;FWDB=0.00355956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.8536;QD=7.95817;RBI=0.0495345;REFB=-0.0120005;REVB=-0.0494065;RO=91;SAF=24;SAR=59;SRF=31;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0575654;STB=0.528295;TYPE=snp;VARB=0.0113866;OID=.;OPOS=32538146;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:178:91:92:83:86:59:24:31:60:61:25:31:61 chr9 32567655 . T G 309.73 PASS AO=74;DP=152;FAO=74;FDP=152;FR=.;FRO=78;FSAF=32;FSAR=42;FSRF=33;FSRR=45;FWDB=0.0252025;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.2947;QD=8.15071;RBI=0.0444791;REFB=-0.00550294;REVB=-0.0366501;RO=78;SAF=32;SAR=42;SRF=33;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00886864;STB=0.504895;TYPE=snp;VARB=0.00612823;OID=.;OPOS=32567655;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:152:78:78:74:74:42:32:33:45:42:32:33:45 chr9 32568024 . A G 97.46 PASS AO=16;DP=24;FAO=16;FDP=24;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.0186569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.361;QD=16.2433;RBI=0.0229137;REFB=-0.00149484;REVB=0.0133026;RO=8;SAF=7;SAR=9;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111987;STB=0.562422;TYPE=snp;VARB=0.000358051;OID=.;OPOS=32568024;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:24:24:8:8:16:16:9:7:5:3:9:7:5:3 chr9 32568168 . A T 270.81 PASS AO=56;DP=102;FAO=56;FDP=102;FR=.;FRO=46;FSAF=33;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=0.0254667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.635;QD=10.62;RBI=0.0255977;REFB=-0.0306339;REVB=0.00258628;RO=46;SAF=33;SAR=23;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0385794;STB=0.52117;TYPE=snp;VARB=0.0250756;OID=.;OPOS=32568168;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:46:46:56:56:23:33:25:21:23:33:25:21 chr9 32568327 . G C 213.58 PASS AO=50;DP=107;FAO=51;FDP=107;FR=.;FRO=56;FSAF=33;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=34;FWDB=-0.0220455;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.1203;QD=7.9843;RBI=0.0234239;REFB=-0.0465962;REVB=0.0079166;RO=56;SAF=33;SAR=17;SRF=22;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.256516;STB=0.634093;TYPE=snp;VARB=0.0515099;OID=.;OPOS=32568327;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:56:56:50:51:17:33:22:34:18:33:22:34 chr9 32635351 . AGGC AGC,AG 675.32 PASS AO=54,24;DP=112;FAO=98,0;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=41,0;FSAR=57,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.243433,0.00629216;FXX=0.0392118;HRUN=2,2;LEN=1,2;MLLD=16.8978,79.5056;QD=27.564;RBI=0.320033,0.125666;REFB=0,0;REVB=0.207754,-0.125508;RO=12;SAF=32,0;SAR=22,24;SRF=8;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0.241372,0.241372;SSSB=-0.0262024,-0.864263;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.00625641,0;OID=.,.;OPOS=32635352,32635353;OREF=G,GC;OALT=-,-;OMAPALT=AGC,AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:54,24:101:98,0:98:0:41,0:57,0:0:0:61:12:32,0:22,24:8:4 chr9 32785399 . C T 2368.89 PASS AO=250;DP=259;FAO=255;FDP=255;FR=.;FRO=0;FSAF=169;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00181555;FXX=0.0340896;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.713;QD=37.1591;RBI=0.0723075;REFB=-0.0199088;REVB=-0.0722847;RO=2;SAF=168;SAR=82;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114821;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00025233;OID=.;OPOS=32785399;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:259:255:2:0:250:255:82:168:0:2:86:169:0:0 chr9 32785888 . G C 71.84 PASS AO=24;DP=70;FAO=24;FDP=70;FR=.;FRO=46;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=27;FWDB=-0.0202615;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=318.996;QD=4.10508;RBI=0.0204131;REFB=-0.0121264;REVB=-0.00248381;RO=46;SAF=7;SAR=17;SRF=19;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152216;STB=0.589255;TYPE=snp;VARB=0.0202558;OID=.;OPOS=32785888;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:70:70:46:46:24:24:17:7:19:27:17:7:19:27 chr9 32786221 . G A 385.19 PASS AO=86;DP=169;FAO=87;FDP=170;FR=.;FRO=83;FSAF=46;FSAR=41;FSRF=48;FSRR=35;FWDB=0.0108004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.152;QD=9.06334;RBI=0.0205955;REFB=-0.0248722;REVB=0.0175364;RO=83;SAF=45;SAR=41;SRF=48;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0494717;STB=0.524348;TYPE=snp;VARB=0.0180571;OID=.;OPOS=32786221;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:170:83:83:86:87:41:45:48:35:41:46:48:35 chr9 32786553 . T C 856.09 PASS AO=91;DP=92;FAO=92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=56;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.014552;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=91.8403;QD=36.8212;RBI=0.0480035;REFB=-0.0164024;REVB=0.0457447;RO=0;SAF=36;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506848;TYPE=snp;VARB=0.000228225;OID=.;OPOS=32786553;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:92:93:0:1:91:92:55:36:0:0:56:36:1:0 chr9 32786586 . G T 209.66 PASS AO=46;DP=93;FAO=48;FDP=96;FR=.;FRO=48;FSAF=13;FSAR=35;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=0.0167134;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.838;QD=8.73583;RBI=0.016731;REFB=-0.0114779;REVB=0.000765569;RO=47;SAF=13;SAR=33;SRF=22;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188357;STB=0.617595;TYPE=snp;VARB=0.0124988;OID=.;OPOS=32786586;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:96:47:48:46:48:33:13:22:25:35:13:23:25 chr9 32786653 . G T 262.84 PASS AO=52;DP=93;FAO=53;FDP=94;FR=.;FRO=41;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=0.00526656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.168;QD=11.1847;RBI=0.00949507;REFB=-0.0104862;REVB=0.00790062;RO=38;SAF=27;SAR=25;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00547708;STB=0.501204;TYPE=snp;VARB=0.00784025;OID=.;OPOS=32786653;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:94:38:41:52:53:25:27:20:18:26:27:21:20 chr9 32820257 . C T 1833.46 PASS AO=216;DP=234;FAO=216;FDP=233;FR=.;FRO=17;FSAF=91;FSAR=125;FSRF=15;FSRR=2;FWDB=0.0279486;FXX=0.00427332;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.44;QD=31.4758;RBI=0.0295011;REFB=0.0102404;REVB=0.00944428;RO=17;SAF=91;SAR=125;SRF=15;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0648023;STB=0.53412;TYPE=snp;VARB=-0.00097416;OID=.;OPOS=32820257;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:234:233:17:17:216:216:125:91:15:2:125:91:15:2 chr9 32986041 . C A 225.07 PASS AO=19;DP=34;FAO=38;FDP=53;FR=.;FRO=15;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=0.011701;FXX=0.036357;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.967;QD=16.9862;RBI=0.0275159;REFB=-0.021798;REVB=0.024904;RO=14;SAF=12;SAR=7;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.309741;STB=0.552605;TYPE=snp;VARB=0.0174241;OID=.;OPOS=32986041;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:34:53:14:15:19:38:7:12:3:11:24:14:3:12 chr9 33026572 . T C 1449.56 PASS AO=152;DP=152;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162827;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.3665;QD=38.1462;RBI=0.0489501;REFB=0;REVB=0.0461626;RO=0;SAF=75;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000286378;OID=.;OPOS=33026572;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:152:152:0:0:152:152:77:75:0:0:77:75:0:0 chr9 33240225 . G A 116.81 PASS AO=34;DP=86;FAO=34;FDP=85;FR=.;FRO=51;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=32;FWDB=0.00317172;FXX=0.0229859;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.104;QD=5.49692;RBI=0.00633948;REFB=-0.0252408;REVB=0.005489;RO=51;SAF=18;SAR=16;SRF=19;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164722;STB=0.593353;TYPE=snp;VARB=0.0329103;OID=.;OPOS=33240225;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:85:51:51:34:34:16:18:19:32:16:18:19:32 chr9 33255942 . T G 327.66 PASS AO=76;DP=152;FAO=76;FDP=152;FR=.;FRO=76;FSAF=13;FSAR=63;FSRF=15;FSRR=61;FWDB=0.0335103;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.8065;QD=8.62266;RBI=0.0344949;REFB=-0.0196138;REVB=0.00818289;RO=74;SAF=13;SAR=63;SRF=15;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0481375;STB=0.522506;TYPE=snp;VARB=0.0236981;OID=.;OPOS=33255942;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:152:74:76:76:76:63:13:15:59:63:13:15:61 chr9 33352826 . C CAAA 192.85 PASS AO=48;DP=132;FAO=51;FDP=117;FR=.;FRO=66;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=30;FSRR=36;FWDB=0.00654642;FXX=0.0999923;HRUN=0;LEN=3;MLLD=180.175;QD=6.593;RBI=0.016406;REFB=0.00769205;REVB=0.0150433;RO=77;SAF=24;SAR=24;SRF=38;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00704639;STB=0.520126;TYPE=ins;VARB=-0.00947929;OID=.;OPOS=33352827;OREF=-;OALT=AAA;OMAPALT=CAAA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:48:132:51:117:66:25:26:30:36:99:77:24:24:38:39 chr9 33386989 . C G 17.4 PASS AO=4;DP=13;FAO=4;FDP=13;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.00631469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.638;QD=5.35326;RBI=0.0361209;REFB=-0.00973918;REVB=-0.0355646;RO=9;SAF=2;SAR=2;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.300398;STB=0.691487;TYPE=snp;VARB=0.0304727;OID=.;OPOS=33386989;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:13:13:9:9:4:4:2:2:7:2:2:2:7:2 chr9 33387004 . T C 22.51 PASS AO=5;DP=14;FAO=5;FDP=14;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.0169953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.493;QD=6.43169;RBI=0.0291461;REFB=-0.00335059;REVB=-0.0236781;RO=9;SAF=2;SAR=3;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.371228;STB=0.72893;TYPE=snp;VARB=0.00781386;OID=.;OPOS=33387004;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:14:14:9:9:5:5:3:2:7:2:3:2:7:2 chr9 33387047 . T G 34.76 PASS AO=6;DP=19;FAO=7;FDP=19;FR=.,HEALED;FRO=11;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.016037;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=204.456;QD=7.31736;RBI=0.0249063;REFB=0.014945;REVB=-0.0190562;RO=5;SAF=1;SAR=5;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247547;STB=0.791508;TYPE=snp;VARB=-0.0188537;OID=.;OPOS=33387047;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:18:19:5:11:6:7:5:1:2:3:6:1:6:5 chr9 33395196 . A G 231.77 PASS AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0379863;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.155;QD=37.0833;RBI=0.0592504;REFB=0;REVB=-0.0454715;RO=0;SAF=15;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000941942;OID=.;OPOS=33395196;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:25:25:0:0:25:25:10:15:0:0:10:15:0:0 chr9 33465849 . TG T 33.16 PASS AO=17;DP=63;FAO=22;FDP=57;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.00266309;FXX=0.0338926;HRUN=4;LEN=1;MLLD=10.7517;QD=2.32721;RBI=0.022546;REFB=-0.0907455;REVB=0.0223882;RO=34;SAF=9;SAR=8;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0.341801;SSSB=0.0991854;STB=0.565158;TYPE=del;VARB=0.117222;OID=.;OPOS=33465850;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:17:58:22:57:35:13:9:17:18:33:34:9:8:15:19 chr9 33524684 . G A 136.41 PASS AO=14;DP=14;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0394873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.482;QD=36.375;RBI=0.0619812;REFB=0;REVB=0.0477748;RO=0;SAF=8;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000572682;OID=.;OPOS=33524684;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:14:15:0:0:14:15:6:8:0:0:6:9:0:0 chr9 33566234 . C T 198.54 PASS AO=40;DP=72;FAO=40;FDP=72;FR=.;FRO=32;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=0.0189558;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.982;QD=11.0302;RBI=0.0288609;REFB=-0.0370264;REVB=-0.0217631;RO=31;SAF=24;SAR=16;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218424;STB=0.613203;TYPE=snp;VARB=0.0264613;OID=.;OPOS=33566234;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:31:32:40:40:16:24:10:21:16:24:11:21 chr9 33568789 . T G 267.31 PASS AO=69;DP=152;FAO=69;FDP=152;FR=.;FRO=83;FSAF=32;FSAR=37;FSRF=48;FSRR=35;FWDB=0.014662;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.792;QD=7.03456;RBI=0.0146902;REFB=-0.0092134;REVB=0.0009086;RO=82;SAF=32;SAR=37;SRF=48;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118421;STB=0.562292;TYPE=snp;VARB=0.00949789;OID=.;OPOS=33568789;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:152:82:83:69:69:37:32:48:34:37:32:48:35 chr9 33572347 . T C 214.19 PASS AO=47;DP=109;FAO=55;FDP=118;FR=.;FRO=63;FSAF=34;FSAR=21;FSRF=36;FSRR=27;FWDB=0.0901311;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.8967;QD=7.26066;RBI=0.0908278;REFB=-0.0363042;REVB=0.0112284;RO=62;SAF=26;SAR=21;SRF=35;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116244;STB=0.526103;TYPE=snp;VARB=0.0462852;OID=.;OPOS=33572347;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:118:62:63:47:55:21:26:35:27:21:34:36:27 chr9 33618358 . A G 607.65 PASS AO=135;DP=257;FAO=135;FDP=257;FR=.;FRO=122;FSAF=57;FSAR=78;FSRF=56;FSRR=66;FWDB=0.000331214;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.554;QD=9.45764;RBI=0.00758509;REFB=-0.0129574;REVB=-0.00757785;RO=122;SAF=57;SAR=78;SRF=56;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0325715;STB=0.517798;TYPE=snp;VARB=0.0106254;OID=.;OPOS=33618358;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:257:257:122:122:135:135:78:57:56:66:78:57:56:66 chr9 33618460 . A T 289.43 PASS AO=71;DP=153;FAO=72;FDP=153;FR=.;FRO=81;FSAF=31;FSAR=41;FSRF=33;FSRR=48;FWDB=0.0404502;FXX=0.00649309;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.898;QD=7.56688;RBI=0.0404637;REFB=-0.0286175;REVB=0.00104298;RO=81;SAF=30;SAR=41;SRF=33;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149408;STB=0.512536;TYPE=snp;VARB=0.0274596;OID=.;OPOS=33618460;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:153:81:81:71:72:41:30:33:48:41:31:33:48 chr9 33618497 . G A 202.17 PASS AO=50;DP=109;FAO=51;FDP=110;FR=.;FRO=59;FSAF=19;FSAR=32;FSRF=28;FSRR=31;FWDB=0.0338785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.4236;QD=7.35173;RBI=0.041156;REFB=-0.0295735;REVB=-0.0233679;RO=59;SAF=19;SAR=31;SRF=28;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0947892;STB=0.556808;TYPE=snp;VARB=0.0247546;OID=.;OPOS=33618497;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:110:59:59:50:51:31:19:28:31:32:19:28:31 chr9 33625185 . C T 631.74 PASS AO=129;DP=251;FAO=138;FDP=260;FR=.;FRO=122;FSAF=84;FSAR=54;FSRF=63;FSRR=59;FWDB=0.0409922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.009;QD=9.71913;RBI=0.0477194;REFB=-0.0198763;REVB=0.024429;RO=121;SAF=78;SAR=51;SRF=62;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0836184;STB=0.544572;TYPE=snp;VARB=0.0189029;OID=.;OPOS=33625185;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:251:260:121:122:129:138:51:78:62:59:54:84:63:59 chr9 33662424 . G A 297.37 PASS AO=92;DP=234;FAO=91;FDP=227;FR=.;FRO=136;FSAF=41;FSAR=50;FSRF=67;FSRR=69;FWDB=-0.0203191;FXX=0.0299133;HRUN=4;LEN=1;MLLD=60.0025;QD=5.23992;RBI=0.0315376;REFB=-0.0273544;REVB=0.0241196;RO=134;SAF=42;SAR=50;SRF=65;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0303503;STB=0.525337;TYPE=snp;VARB=0.0409628;OID=.;OPOS=33662424;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:234:227:134:136:92:91:50:42:65:69:50:41:67:69 chr9 33662557 . G C 125.82 PASS AO=58;DP=176;FAO=56;FDP=175;FR=.;FRO=119;FSAF=21;FSAR=35;FSRF=47;FSRR=72;FWDB=0.00823019;FXX=0.0056815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.945;QD=2.87582;RBI=0.0130922;REFB=-0.0113236;REVB=0.0101818;RO=116;SAF=23;SAR=35;SRF=44;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.020995;STB=0.514367;TYPE=snp;VARB=0.0324173;OID=.;OPOS=33662557;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:175:116:119:58:56:35:23:44:72:35:21:47:72 chr9 33662593 . G A 116.77 PASS AO=42;DP=123;FAO=43;FDP=126;FR=.;FRO=83;FSAF=13;FSAR=30;FSRF=29;FSRR=54;FWDB=-0.00471407;FXX=0.0156238;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.424;QD=3.707;RBI=0.00490897;REFB=0.00161399;REVB=-0.0013695;RO=78;SAF=12;SAR=30;SRF=27;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0800956;STB=0.535697;TYPE=snp;VARB=-0.0101154;OID=.;OPOS=33662593;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:126:78:83:42:43:30:12:27:51:30:13:29:54 chr9 33675629 . A C 718.8 PASS AO=180;DP=379;FAO=181;FDP=379;FR=.;FRO=198;FSAF=77;FSAR=104;FSRF=76;FSRR=122;FWDB=-0.0198274;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=283.013;QD=7.58632;RBI=0.0260416;REFB=0.000661462;REVB=-0.016883;RO=196;SAF=77;SAR=103;SRF=74;SRR=122;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0490651;STB=0.522361;TYPE=snp;VARB=-0.000867225;OID=.;OPOS=33675629;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:379:379:196:198:180:181:103:77:74:122:104:77:76:122 chr9 33676094 . C G 662.63 PASS AO=250;DP=566;FAO=179;FDP=400;FR=.;FRO=221;FSAF=89;FSAR=90;FSRF=92;FSRR=129;FWDB=0.00081519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.864;QD=6.62625;RBI=0.0057917;REFB=-0.0170856;REVB=0.00573405;RO=316;SAF=127;SAR=123;SRF=132;SRR=184;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0910787;STB=0.544725;TYPE=snp;VARB=0.0233661;OID=.;OPOS=33676094;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:566:400:316:221:250:179:123:127:132:184:90:89:92:129 chr9 33676173 . C T 482.02 PASS AO=229;DP=594;FAO=156;FDP=400;FR=.;FRO=244;FSAF=72;FSAR=84;FSRF=112;FSRR=132;FWDB=-0.000192109;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2201;QD=4.82019;RBI=0.00854736;REFB=0.0159041;REVB=0.0085452;RO=363;SAF=114;SAR=115;SRF=167;SRR=196;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0413261;STB=0.501548;TYPE=snp;VARB=-0.0266538;OID=.;OPOS=33676173;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:594:400:363:244:229:156:115:114:167:196:84:72:112:132 chr9 33750845 . G C 128.95 PASS AO=21;DP=32;FAO=22;FDP=32;FR=.;FRO=10;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0147736;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=168.157;QD=16.1186;RBI=0.0149289;REFB=0.00390533;REVB=0.00214753;RO=9;SAF=10;SAR=11;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163524;STB=0.562444;TYPE=snp;VARB=-0.000969653;OID=.;OPOS=33750845;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:32:32:9:10:21:22:11:10:7:2:11:11:7:3 chr9 33798017 . A G 590.36 PASS AO=68;DP=76;FAO=68;FDP=73;FR=.;FRO=5;FSAF=25;FSAR=43;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0355448;FXX=0.0874891;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.816;QD=32.3482;RBI=0.0356396;REFB=-0.0694498;REVB=-0.00259883;RO=5;SAF=25;SAR=43;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00448738;STB=0.502379;TYPE=snp;VARB=0.0015212;OID=.;OPOS=33798017;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:76:73:5:5:68:68:43:25:2:3:43:25:2:3 chr9 33831038 . TTTC T 90.82 PASS AO=47;DP=137;FAO=50;FDP=133;FR=.;FRO=83;FSAF=12;FSAR=38;FSRF=44;FSRR=39;FWDB=0.00409063;FXX=0.029195;HRUN=3;LEN=3;MLLD=237.106;QD=2.73152;RBI=0.00423322;REFB=0.0139796;REVB=-0.00108943;RO=59;SAF=11;SAR=36;SRF=25;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225391;STB=0.697164;TYPE=del;VARB=-0.016553;OID=.;OPOS=33831039;OREF=TTC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:47:117:50:133:83:12:38:44:39:90:59:11:36:25:34 chr9 33917348 . AAC A 40.19 PASS AO=20;DP=78;FAO=24;FDP=73;FR=.;FRO=49;FSAF=1;FSAR=23;FSRF=5;FSRR=44;FWDB=-0.0315263;FXX=0.0266631;HRUN=3;LEN=2;MLLD=231.249;QD=2.2024;RBI=0.0333736;REFB=-0.00643126;REVB=-0.0109495;RO=39;SAF=1;SAR=19;SRF=5;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.298212;STB=0.672984;TYPE=del;VARB=0.0139684;OID=.;OPOS=33917349;OREF=AC;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:20:69:24:73:49:1:23:5:44:40:39:1:19:5:34 chr9 33917498 . T C 138.31 PASS AO=46;DP=135;FAO=46;FDP=126;FR=.;FRO=80;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=55;FWDB=-0.00399012;FXX=0.0666617;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.8108;QD=4.39074;RBI=0.00400549;REFB=-0.00811275;REVB=0.000350559;RO=76;SAF=24;SAR=22;SRF=21;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.268187;STB=0.631525;TYPE=snp;VARB=0.00530407;OID=.;OPOS=33917498;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:126:76:80:46:46:22:24:21:55:22:24:25:55 chr9 33917715 . A G 26.8 PASS AO=22;DP=105;FAO=22;FDP=105;FR=.;FRO=83;FSAF=3;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=71;FWDB=-0.00894836;FXX=0;HRUN=15;LEN=1;MLLD=172.49;QD=1.02103;RBI=0.00898637;REFB=0.00356536;REVB=-0.000825667;RO=62;SAF=3;SAR=19;SRF=12;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128707;STB=0.513501;TYPE=snp;VARB=-0.0113551;OID=.;OPOS=33917715;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:105:105:62:83:22:22:19:3:12:50:19:3:12:71 chr9 33927899 . G A 863.81 PASS AO=97;DP=101;FAO=97;FDP=101;FR=.;FRO=4;FSAF=53;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0548381;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.2175;QD=34.2104;RBI=0.0549217;REFB=-0.147178;REVB=-0.00302983;RO=4;SAF=53;SAR=44;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0223799;STB=0.511812;TYPE=snp;VARB=0.00256178;OID=.;OPOS=33927899;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:101:101:4:4:97:97:44:53:1:3:44:53:1:3 chr9 33935736 . A G 1266.5 PASS AO=135;DP=136;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142941;FXX=0.0147048;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.751;QD=37.8061;RBI=0.028952;REFB=-0.0528256;REVB=0.0251773;RO=0;SAF=82;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84364e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000223879;OID=.;OPOS=33935736;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:136:134:0:0:135:134:53:82:0:0:52:82:0:0 chr9 33941759 . T C 675.42 PASS AO=152;DP=293;FAO=152;FDP=292;FR=.;FRO=140;FSAF=76;FSAR=76;FSRF=79;FSRR=61;FWDB=0.00904813;FXX=0.00680249;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.881;QD=9.25226;RBI=0.00934519;REFB=-0.0132492;REVB=0.0023375;RO=138;SAF=76;SAR=76;SRF=77;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0505314;STB=0.530818;TYPE=snp;VARB=0.0116443;OID=.;OPOS=33941759;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:293:292:138:140:152:152:76:76:77:61:76:76:79:61 chr9 33971740 . A G 178.47 PASS AO=55;DP=143;FAO=56;FDP=144;FR=.;FRO=88;FSAF=33;FSAR=23;FSRF=36;FSRR=52;FWDB=-0.0202425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.287;QD=4.95744;RBI=0.0249696;REFB=-0.00727551;REVB=0.0146192;RO=87;SAF=32;SAR=23;SRF=35;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192792;STB=0.609267;TYPE=snp;VARB=0.00908534;OID=.;OPOS=33971740;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:144:87:88:55:56:23:32:35:52:23:33:36:52 chr9 34017106 . C T 418.01 PASS AO=84;DP=149;FAO=84;FDP=148;FR=.;FRO=64;FSAF=29;FSAR=55;FSRF=26;FSRR=38;FWDB=0.0342498;FXX=0.00671096;HRUN=3;LEN=1;MLLD=171.768;QD=11.2975;RBI=0.0353829;REFB=-0.0345576;REVB=-0.00888263;RO=63;SAF=29;SAR=55;SRF=26;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0574953;STB=0.528654;TYPE=snp;VARB=0.0119775;OID=.;OPOS=34017106;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:148:63:64:84:84:55:29:26:37:55:29:26:38 chr9 34088022 . G GAAAGA 104.91 PASS AO=10;DP=17;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000941093;FXX=0.312305;HRUN=0;LEN=5;MLLD=227.305;QD=38.1501;RBI=0.00407158;REFB=0;REVB=-0.00396132;RO=2;SAF=4;SAR=6;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0305955;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-0.000118502;OID=.;OPOS=34088023;OREF=-;OALT=AAAGA;OMAPALT=GAAAGA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:10:17:11:11:0:4:7:0:0:5:2:4:6:1:1 chr9 34107504 . C T 364.46 PASS AO=92;DP=197;FAO=92;FDP=197;FR=.;FRO=105;FSAF=48;FSAR=44;FSRF=53;FSRR=52;FWDB=0.00144459;FXX=0.00505025;HRUN=3;LEN=1;MLLD=92.1354;QD=7.40028;RBI=0.00750447;REFB=-0.00466574;REVB=0.00736412;RO=102;SAF=48;SAR=44;SRF=52;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0113753;STB=0.509057;TYPE=snp;VARB=0.00121845;OID=.;OPOS=34107504;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:197:102:105:92:92:44:48:52:50:44:48:53:52 chr9 34107505 . C T 433.09 PASS AO=99;DP=196;FAO=99;FDP=194;FR=.;FRO=95;FSAF=51;FSAR=48;FSRF=49;FSRR=46;FWDB=0.00800021;FXX=0.0102036;HRUN=3;LEN=1;MLLD=92.8233;QD=8.92973;RBI=0.0208715;REFB=-0.0203384;REVB=-0.0192773;RO=95;SAF=51;SAR=48;SRF=49;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000569923;STB=0.500313;TYPE=snp;VARB=0.0109063;OID=.;OPOS=34107505;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:194:95:95:99:99:48:51:49:46:48:51:49:46 chr9 34206206 . G A 393.7 PASS AO=90;DP=184;FAO=92;FDP=184;FR=.;FRO=92;FSAF=42;FSAR=50;FSRF=41;FSRR=51;FWDB=-0.000836139;FXX=0.0107521;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.003;QD=8.55867;RBI=0.00391707;REFB=-0.0123974;REVB=-0.00382679;RO=94;SAF=41;SAR=49;SRF=42;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00818165;STB=0.50548;TYPE=snp;VARB=0.0128341;OID=.;OPOS=34206206;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:184:94:92:90:92:49:41:42:52:50:42:41:51 chr9 34251943 . G C 107.16 PASS AO=28;DP=65;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=32;FSRR=5;FWDB=-0.0358357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.3775;QD=6.5942;RBI=0.0368515;REFB=0.00247673;REVB=-0.0085929;RO=37;SAF=20;SAR=8;SRF=32;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206848;STB=0.615313;TYPE=snp;VARB=-0.00435776;OID=.;OPOS=34251943;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:37:37:28:28:8:20:32:5:8:20:32:5 chr9 34252466 . GCTAA G 1298.71 PASS AO=118;DP=163;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144453;FXX=0.0140835;HRUN=1;LEN=4;MLLD=287.649;QD=37.106;RBI=0.0178971;REFB=0;REVB=0.0105659;RO=0;SAF=45;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.000206574;OID=.;OPOS=34252467;OREF=CTAA;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:118:130:140:140:0:58:82:0:0:62:0:45:73:0:0 chr9 34256347 . C T 107.41 PASS AO=29;DP=70;FAO=29;FDP=70;FR=.;FRO=41;FSAF=22;FSAR=7;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=-0.0290235;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=221.288;QD=6.13781;RBI=0.0292824;REFB=-0.0120927;REVB=-0.00388518;RO=41;SAF=22;SAR=7;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.285223;STB=0.663566;TYPE=snp;VARB=0.0160854;OID=.;OPOS=34256347;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:41:41:29:29:7:22:21:20:7:22:21:20 chr9 34310927 . T C 419.17 PASS AO=119;DP=280;FAO=119;FDP=279;FR=.;FRO=160;FSAF=53;FSAR=66;FSRF=67;FSRR=93;FWDB=-0.00523813;FXX=0.0035713;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.285;QD=6.00954;RBI=0.033622;REFB=-0.00678898;REVB=0.0332114;RO=160;SAF=53;SAR=66;SRF=67;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0278666;STB=0.515505;TYPE=snp;VARB=0.00925457;OID=.;OPOS=34310927;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:280:279:160:160:119:119:66:53:67:93:66:53:67:93 chr9 34370020 . T A 47.05 PASS AO=11;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=16;FWDB=-0.0195597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2437;QD=6.07116;RBI=0.0585851;REFB=-0.0774695;REVB=0.0552234;RO=19;SAF=2;SAR=9;SRF=3;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0443035;STB=0.509788;TYPE=snp;VARB=0.0972864;OID=.;OPOS=34370020;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:31:31:19:19:11:12:9:2:3:16:10:2:3:16 chr9 34371788 . A T 434.97 PASS AO=84;DP=141;FAO=84;FDP=142;FR=.;FRO=58;FSAF=29;FSAR=55;FSRF=19;FSRR=39;FWDB=-8.14805e-06;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.66;QD=12.2527;RBI=0.00860039;REFB=-0.0394986;REVB=-0.00860039;RO=57;SAF=29;SAR=55;SRF=19;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00983691;STB=0.508012;TYPE=snp;VARB=0.0276449;OID=.;OPOS=34371788;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:142:57:58:84:84:55:29:19:38:55:29:19:39 chr9 34372783 . G C 296.79 PASS AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226082;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.102;QD=37.0993;RBI=0.0278552;REFB=0;REVB=-0.016272;RO=0;SAF=20;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.14672e-05;OID=.;OPOS=34372783;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:32:32:0:0:32:32:12:20:0:0:12:20:0:0 chr9 34372873 . C G 471.11 PASS AO=49;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020736;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.738;QD=37.6884;RBI=0.0216512;REFB=0;REVB=-0.0062283;RO=0;SAF=39;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000636084;OID=.;OPOS=34372873;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:49:50:0:0:49:50:10:39:0:0:10:40:0:0 chr9 34382726 . A G 2465.28 PASS AO=237;DP=241;FAO=263;FDP=263;FR=.;FRO=0;FSAF=145;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0887647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.5245;QD=37.4948;RBI=0.0922692;REFB=0;REVB=-0.0251878;RO=0;SAF=126;SAR=111;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0318e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000182814;OID=.;OPOS=34382726;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:241:263:0:0:237:263:111:126:0:0:118:145:0:0 chr9 34459025 . G T 746.52 PASS AO=133;DP=300;FAO=135;FDP=291;FR=.,HEALED;FRO=122;FSAF=57;FSAR=78;FSRF=46;FSRR=76;FWDB=-0.00508459;FXX=0.00342454;HRUN=2;LEN=1;MLLD=279.619;QD=10.2615;RBI=0.00667537;REFB=0.00610431;REVB=0.00432522;RO=97;SAF=55;SAR=78;SRF=35;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0426191;STB=0.522124;TYPE=snp;VARB=-0.00108915;OID=.;OPOS=34459025;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:290:291:97:122:133:135:78:55:35:62:78:57:46:76 chr9 34517414 . TG T 609.99 PASS AO=85;DP=117;FAO=98;FDP=99;FR=.;FRO=1;FSAF=53;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.193104;FXX=0.0833256;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.2122;QD=24.6459;RBI=0.300791;REFB=-0.0210663;REVB=0.230621;RO=10;SAF=51;SAR=34;SRF=2;SRR=8;SSEN=0.605263;SSEP=0;SSSB=0.0812548;STB=0.504672;TYPE=del;VARB=0.0120893;OID=.;OPOS=34517415;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:85:105:98:99:1:53:45:1:0:46:10:51:34:2:8 chr9 34521148 . G A 804.44 PASS AO=89;DP=92;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208777;FXX=0.0344788;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.597;QD=38.3066;RBI=0.0282389;REFB=0;REVB=0.0190146;RO=0;SAF=29;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.99908e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.42784e-05;OID=.;OPOS=34521148;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:92:84:0:0:89:84:60:29:0:0:58:26:0:0 chr9 34552018 . G C 245.46 PASS AO=26;DP=29;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.149269;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=37.6143;QD=31.6721;RBI=0.149392;REFB=-0.0818646;REVB=-0.00607042;RO=3;SAF=11;SAR=15;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111014;STB=0.518506;TYPE=snp;VARB=0.010283;OID=.;OPOS=34552018;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:29:31:3:1:26:30:15:11:3:0:17:13:1:0 chr9 34557899 . T G 10.3 PASS AO=3;DP=8;FAO=2;FDP=8;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.00794522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.998;QD=5.1483;RBI=0.00794522;REFB=-0.00213027;REVB=0;RO=3;SAF=3;SAR=0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00524734;OID=.;OPOS=34557899;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:8:3:6:3:2:0:3:3:0:0:2:6:0 chr9 34622389 . A C 367.77 PASS AO=37;DP=37;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0682885;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.3408;QD=37.7201;RBI=0.0696632;REFB=0;REVB=0.0137711;RO=0;SAF=15;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.82408e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000814912;OID=.;OPOS=34622389;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:37:39:0:0:37:39:22:15:0:0:24:15:0:0 chr9 34723988 . C A 337.96 PASS AO=36;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0286398;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.5747;QD=36.5357;RBI=0.109277;REFB=0;REVB=0.105457;RO=1;SAF=24;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0374036;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00302577;OID=.;OPOS=34723988;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:37:37:1:0:36:37:12:24:0:1:13:24:0:0 chr9 34725116 . G A 473.77 PASS AO=48;DP=58;FAO=53;FDP=56;FR=.;FRO=3;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0137118;FXX=0.0508388;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.6527;QD=33.8404;RBI=0.0352818;REFB=-0.0509202;REVB=0.0325084;RO=8;SAF=21;SAR=27;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0838243;STB=0.508426;TYPE=snp;VARB=0.035124;OID=.;OPOS=34725116;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:58:56:8:3:48:53:27:21:6:2:27:26:1:2 chr9 34725742 . T C 188.68 PASS AO=20;DP=20;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0403993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.279;QD=35.9393;RBI=0.121595;REFB=0;REVB=0.114688;RO=0;SAF=16;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00893185;OID=.;OPOS=34725742;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:20:21:0:0:20:21:4:16:0:0:4:17:0:0 chr9 34726182 . A G 1873.38 PASS AO=197;DP=200;FAO=198;FDP=198;FR=.;FRO=0;FSAF=100;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.032045;FXX=0.0099995;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.425;QD=37.846;RBI=0.0358218;REFB=-0.0187917;REVB=0.0160101;RO=2;SAF=99;SAR=98;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00961933;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.85547e-05;OID=.;OPOS=34726182;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:200:198:2:0:197:198:98:99:0:2:98:100:0:0 chr9 34726418 . T C 459.53 PASS AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0561004;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.5452;QD=38.2943;RBI=0.0580658;REFB=0;REVB=0.0149797;RO=0;SAF=46;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000920948;OID=.;OPOS=34726418;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:48:48:0:0:48:48:2:46:0:0:2:46:0:0 chr9 34726524 . G A 2225.46 PASS AO=242;DP=250;FAO=243;FDP=249;FR=.;FRO=6;FSAF=129;FSAR=114;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=-0.0130336;FXX=0.0119043;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.9816;QD=35.7503;RBI=0.0470129;REFB=-0.102127;REVB=0.0451701;RO=6;SAF=129;SAR=113;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.02463;STB=0.512819;TYPE=snp;VARB=0.00216265;OID=.;OPOS=34726524;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:250:249:6:6:242:243:113:129:0:6:114:129:0:6 chr9 34834686 . G T 11.7 PASS AO=3;DP=13;FAO=3;FDP=13;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=10;FSRR=0;FWDB=-0.0249291;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.5207;QD=3.59934;RBI=0.0249291;REFB=-0.0299819;REVB=0;RO=10;SAF=3;SAR=0;SRF=10;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00905356;OID=.;OPOS=34834686;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:13:13:10:10:3:3:0:3:10:0:0:3:10:0 chr9 34978431 . G A 256.84 PASS AO=73;DP=179;FAO=74;FDP=178;FR=.;FRO=104;FSAF=29;FSAR=45;FSRF=44;FSRR=60;FWDB=0.0108905;FXX=0.00558628;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.251;QD=5.77158;RBI=0.0158684;REFB=0.000316371;REVB=-0.0115413;RO=103;SAF=28;SAR=45;SRF=43;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0370531;STB=0.518952;TYPE=snp;VARB=-0.00114609;OID=.;OPOS=34978431;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:178:103:104:73:74:45:28:43:60:45:29:44:60 chr9 34997569 . C G 317.78 PASS AO=87;DP=203;FAO=88;FDP=203;FR=.;FRO=115;FSAF=24;FSAR=64;FSRF=45;FSRR=70;FWDB=-0.00652798;FXX=0.00975562;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.339;QD=6.26163;RBI=0.00712487;REFB=0.00548129;REVB=-0.00285469;RO=108;SAF=24;SAR=63;SRF=43;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141074;STB=0.578598;TYPE=snp;VARB=-0.00817861;OID=.;OPOS=34997569;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:203:108:115:87:88:63:24:43:65:64:24:45:70 chr9 34998028 . GC G 567.04 PASS AO=73;DP=90;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0572348;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=14.6051;QD=25.7746;RBI=0.137796;REFB=0;REVB=0.125348;RO=7;SAF=48;SAR=25;SRF=3;SRR=4;SSEN=0.429066;SSEP=0;SSSB=0.0413233;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00363451;OID=.;OPOS=34998029;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:73:88:88:88:0:57:31:0:0:51:7:48:25:3:4 chr9 35042295 . TG T 121.21 PASS AO=15;DP=23;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.393692;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=11.5708;QD=23.0869;RBI=0.395702;REFB=0;REVB=0.0398287;RO=3;SAF=5;SAR=10;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0.307692;SSSB=-0.208412;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.03691;OID=.;OPOS=35042296;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:15:21:21:21:0:9:12:0:0:11:3:5:10:3:0 chr9 35043291 . G T 289.78 PASS AO=76;DP=171;FAO=79;FDP=179;FR=.;FRO=100;FSAF=22;FSAR=57;FSRF=40;FSRR=60;FWDB=-0.0803058;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9288;QD=6.47559;RBI=0.0812493;REFB=0.0140579;REVB=-0.0123457;RO=94;SAF=20;SAR=56;SRF=34;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11785;STB=0.578565;TYPE=snp;VARB=-0.029588;OID=.;OPOS=35043291;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:179:94:100:76:79:56:20:34:60:57:22:40:60 chr9 35049468 . C T 134.46 PASS AO=30;DP=61;FAO=30;FDP=61;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=7;FSRR=24;FWDB=0.0301145;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.53;QD=8.81712;RBI=0.0361592;REFB=0.00868036;REVB=-0.0200152;RO=31;SAF=8;SAR=22;SRF=7;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0487878;STB=0.527203;TYPE=snp;VARB=-0.0143414;OID=.;OPOS=35049468;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:31:31:30:30:22:8:7:24:22:8:7:24 chr9 35062972 . C T 379.98 PASS AO=80;DP=151;FAO=81;FDP=150;FR=.;FRO=69;FSAF=39;FSAR=42;FSRF=40;FSRR=29;FWDB=0.00979309;FXX=0.013157;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.46;QD=10.1327;RBI=0.00979309;REFB=-0.00409988;REVB=7.35185e-06;RO=68;SAF=39;SAR=41;SRF=40;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0844937;STB=0.545085;TYPE=snp;VARB=0.00362132;OID=.;OPOS=35062972;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:150:68:69:80:81:41:39:40:28:42:39:40:29 chr9 35107858 . C T 381.57 PASS AO=36;DP=49;FAO=47;FDP=52;FR=.;FRO=5;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0523864;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=245.81;QD=29.3512;RBI=0.0536985;REFB=-0.142237;REVB=0.0117983;RO=0;SAF=18;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.541578;TYPE=snp;VARB=0.000987328;OID=.;OPOS=35107858;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:40:52:0:5:36:47:18:18:0:0:29:18:4:1 chr9 35480564 . T C 3773.85 PASS AO=391;DP=393;FAO=395;FDP=395;FR=.;FRO=0;FSAF=177;FSAR=218;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0292972;FXX=0.0124997;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.179;QD=38.2162;RBI=0.0473511;REFB=0;REVB=0.0371995;RO=1;SAF=184;SAR=207;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00230001;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000778257;OID=.;OPOS=35480564;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:393:395:1:0:391:395:207:184:0:1:218:177:0:0 chr9 35482075 . T C 2158.95 PASS AO=216;DP=220;FAO=225;FDP=225;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=135;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00214444;FXX=0.00881018;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.528;QD=38.3813;RBI=0.0291069;REFB=0;REVB=0.0290278;RO=0;SAF=83;SAR=133;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.83763e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.38658e-05;OID=.;OPOS=35482075;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:220:225:0:0:216:225:133:83:0:0:135:90:0:0 chr9 35482149 . C T 547.74 PASS AO=130;DP=267;FAO=133;FDP=273;FR=.;FRO=140;FSAF=59;FSAR=74;FSRF=41;FSRR=99;FWDB=-0.00174439;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.1916;QD=8.02555;RBI=0.052562;REFB=-6.33416e-05;REVB=0.0525331;RO=134;SAF=58;SAR=72;SRF=39;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148109;STB=0.579701;TYPE=snp;VARB=0.000213858;OID=.;OPOS=35482149;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:267:273:134:140:130:133:72:58:39:95:74:59:41:99 chr9 35482233 . C T 389.12 PASS AO=83;DP=158;FAO=85;FDP=160;FR=.;FRO=75;FSAF=32;FSAR=53;FSRF=36;FSRR=39;FWDB=0.024975;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3167;QD=9.72806;RBI=0.0423095;REFB=-0.0165974;REVB=0.0341517;RO=75;SAF=31;SAR=52;SRF=36;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.095777;STB=0.550385;TYPE=snp;VARB=0.0155353;OID=.;OPOS=35482233;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:160:75:75:83:85:52:31:36:39:53:32:36:39 chr9 35546735 . A G 584.38 PASS AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0195912;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.186;QD=37.7022;RBI=0.0286993;REFB=0;REVB=-0.0209722;RO=0;SAF=40;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000160699;OID=.;OPOS=35546735;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:62:62:0:0:62:62:22:40:0:0:22:40:0:0 chr9 35546923 . C T 306.06 PASS AO=61;DP=107;FAO=61;FDP=107;FR=.;FRO=46;FSAF=36;FSAR=25;FSRF=11;FSRR=35;FWDB=0.0749905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.8425;QD=11.4413;RBI=0.0765038;REFB=-0.0180703;REVB=0.0151411;RO=46;SAF=36;SAR=25;SRF=11;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.271036;STB=0.647629;TYPE=snp;VARB=0.0239916;OID=.;OPOS=35546923;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:46:46:61:61:25:36:11:35:25:36:11:35 chr9 35560540 . GA G 29.84 PASS AO=18;DP=62;FAO=20;FDP=56;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=25;FSRR=11;FWDB=0.0583468;FXX=0.0175408;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.5974;QD=2.13126;RBI=0.0669833;REFB=-0.088809;REVB=0.0328999;RO=32;SAF=11;SAR=7;SRF=22;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0903685;STB=0.595498;TYPE=del;VARB=0.147003;OID=.;OPOS=35560541;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:18:53:20:56:36:11:9:25:11:29:32:11:7:22:10 chr9 35562549 . G A 228.16 PASS AO=29;DP=33;FAO=29;FDP=33;FR=.;FRO=4;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0409708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.336;QD=27.6551;RBI=0.116334;REFB=-0.00495274;REVB=0.108881;RO=3;SAF=14;SAR=15;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0844685;STB=0.558784;TYPE=snp;VARB=0.000751582;OID=.;OPOS=35562549;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:33:33:3:4:29:29:15:14:0:3:15:14:0:4 chr9 35606884 . G A 1029.12 PASS AO=107;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0410709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.972;QD=38.1156;RBI=0.0469631;REFB=0;REVB=-0.0227752;RO=0;SAF=44;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.78072e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.53979e-05;OID=.;OPOS=35606884;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:108:108:0:0:107:108:63:44:0:0:63:45:0:0 chr9 35609494 . GC G 217.85 PASS AO=26;DP=31;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.36256;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=20.2259;QD=29.0464;RBI=0.375703;REFB=0;REVB=-0.0985025;RO=4;SAF=4;SAR=22;SRF=4;SRR=0;SSEN=0.328704;SSEP=0;SSSB=-0.304347;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0151852;OID=.;OPOS=35609495;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:26:30:30:30:0:8:22:0:0:20:4:4:22:4:0 chr9 35660990 . A G 846.24 PASS AO=89;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0112664;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.182;QD=37.1974;RBI=0.0305912;REFB=0.00730733;REVB=0.028441;RO=1;SAF=51;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00920269;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.9135e-05;OID=.;OPOS=35660990;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:91:91:1:0:89:91:38:51:1:0:39:52:0:0 chr9 35662251 . T C 415.29 PASS AO=92;DP=181;FAO=93;FDP=180;FR=.;FRO=87;FSAF=39;FSAR=54;FSRF=34;FSRR=53;FWDB=-0.0654381;FXX=0.0109884;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.9975;QD=9.22874;RBI=0.0671655;REFB=-0.0265161;REVB=0.0151348;RO=84;SAF=38;SAR=54;SRF=32;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0290007;STB=0.51423;TYPE=snp;VARB=0.0284108;OID=.;OPOS=35662251;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:180:84:87:92:93:54:38:32:52:54:39:34:53 chr9 35663228 . G C 165.04 PASS AO=44;DP=96;FAO=44;FDP=102;FR=.;FRO=58;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=27;FSRR=31;FWDB=-0.020335;FXX=0.0192289;HRUN=3;LEN=1;MLLD=126.228;QD=6.47203;RBI=0.0211849;REFB=-0.0311667;REVB=-0.00594052;RO=52;SAF=24;SAR=20;SRF=24;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0813426;STB=0.545434;TYPE=snp;VARB=0.0308787;OID=.;OPOS=35663228;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:102:52:58:44:44:20:24:24:28:20:24:27:31 chr9 35674053 . G A 187.9 PASS AO=31;DP=46;FAO=31;FDP=46;FR=.;FRO=15;FSAF=24;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0227131;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.934;QD=16.3389;RBI=0.0417022;REFB=-0.0484059;REVB=0.0349741;RO=14;SAF=24;SAR=7;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149531;STB=0.59993;TYPE=snp;VARB=0.0197208;OID=.;OPOS=35674053;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:46:46:14:15:31:31:7:24:8:6:7:24:8:7 chr9 35704150 . C T 41.09 PASS AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.0481485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.776;QD=10.2736;RBI=0.0502342;REFB=-0.0282361;REVB=-0.0143245;RO=8;SAF=2;SAR=6;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15636;STB=0.590707;TYPE=snp;VARB=0.0237161;OID=.;OPOS=35704150;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:16:16:8:8:8:8:6:2:1:7:6:2:1:7 chr9 35725280 . TG T,TT 576.71 PASS AO=28,18;DP=77;FAO=58,18;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=18,16;FSAR=40,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.252355,0.126634;FXX=0.0617208;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=16.2215,13.9123;QD=30.3531;RBI=0.295937,0.12857;REFB=0,0;REVB=-0.154583,0.0222317;RO=6;SAF=0,15;SAR=28,3;SRF=5;SRR=1;SSEN=0.432432,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.87569,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.00879635,0.0336403;OID=.,.;OPOS=35725281,35725281;OREF=G,G;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:28,18:71:58,18:76:0:18,16:40,2:0:0:29:6:0,15:28,3:5:1 chr9 35740902 . C T 218.12 PASS AO=56;DP=129;FAO=57;FDP=129;FR=.;FRO=72;FSAF=33;FSAR=24;FSRF=35;FSRR=37;FWDB=-0.00270583;FXX=0.015266;HRUN=4;LEN=1;MLLD=128.751;QD=6.76339;RBI=0.00891745;REFB=-0.0341194;REVB=0.00849702;RO=67;SAF=32;SAR=24;SRF=31;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106647;STB=0.552245;TYPE=snp;VARB=0.0525924;OID=.;OPOS=35740902;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:67:72:56:57:24:32:31:36:24:33:35:37 chr9 35754104 . GC G 393.46 PASS AO=51;DP=64;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.352885;FXX=0.0161264;HRUN=3;LEN=1;MLLD=17.4808;QD=25.8004;RBI=0.359737;REFB=-0.026607;REVB=0.0698808;RO=9;SAF=6;SAR=45;SRF=5;SRR=4;SSEN=0.339763;SSEP=0;SSSB=-0.235801;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0274732;OID=.;OPOS=35754105;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:51:62:61:61:0:11:50:0:0:31:9:6:45:5:4 chr9 35826104 . G T 10.39 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.623;QD=5.93765;RBI=0.00935971;REFB=-0.0820186;REVB=0.00935971;RO=5;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0129665;OID=.;OPOS=35826104;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:5:5:2:2:2:0:0:5:2:0:0:5 chr9 35841783 . G A 368.86 PASS AO=37;DP=38;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0399927;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.462;QD=35.1297;RBI=0.0434207;REFB=-0.0775108;REVB=0.0169098;RO=1;SAF=9;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0164365;STB=0.507689;TYPE=snp;VARB=0.00384851;OID=.;OPOS=35841783;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:38:42:1:1:37:41:28:9:0:1:32:9:0:1 chr9 35910690 . G A 456.8 PASS AO=47;DP=50;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00851926;FXX=0.059988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1715;QD=38.8767;RBI=0.0899752;REFB=0;REVB=0.089571;RO=0;SAF=14;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00126825;OID=.;OPOS=35910690;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:50:47:0:0:47:47:33:14:0:0:33:14:0:0 chr9 36105264 . A G 1611.58 PASS AO=177;DP=185;FAO=179;FDP=186;FR=.;FRO=7;FSAF=83;FSAR=96;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=0.00431805;FXX=0.0106377;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.845;QD=34.6576;RBI=0.00919123;REFB=-0.0302841;REVB=0.00811376;RO=7;SAF=83;SAR=94;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0384653;STB=0.520229;TYPE=snp;VARB=8.3591e-05;OID=.;OPOS=36105264;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:185:186:7:7:177:179:94:83:7:0:96:83:7:0 chr9 36110063 . T A 1103.38 PASS AO=114;DP=115;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.084499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.6313;QD=37.7225;RBI=0.0864639;REFB=0;REVB=-0.0183281;RO=0;SAF=54;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.23871e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000622739;OID=.;OPOS=36110063;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:115:117:0:0:114:117:60:54:0:0:61:56:0:0 chr9 36219881 . G A 465.44 PASS AO=99;DP=184;FAO=99;FDP=182;FR=.;FRO=83;FSAF=54;FSAR=45;FSRF=42;FSRR=41;FWDB=-0.0060021;FXX=0.0162153;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.538;QD=10.2295;RBI=0.00679313;REFB=-0.0248043;REVB=-0.00318143;RO=81;SAF=54;SAR=45;SRF=40;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.042758;STB=0.518069;TYPE=snp;VARB=0.0161073;OID=.;OPOS=36219881;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:182:81:83:99:99:45:54:40:41:45:54:42:41 chr9 36674842 . C T 989.31 PASS AO=104;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.718;QD=38.0504;RBI=0.0292229;REFB=0;REVB=0.0265421;RO=0;SAF=70;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000150834;OID=.;OPOS=36674842;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:104:104:0:0:104:104:34:70:0:0:34:70:0:0 chr9 36840623 . G A 49.43 PASS AO=14;DP=38;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.0321014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.188;QD=5.20342;RBI=0.0541101;REFB=-0.0163279;REVB=0.0435592;RO=24;SAF=7;SAR=7;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0446326;STB=0.526278;TYPE=snp;VARB=0.0304871;OID=.;OPOS=36840623;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:38:38:24:24:14:14:7:7:11:13:7:7:11:13 chr9 37429799 . G T 122 PASS AO=29;DP=63;FAO=29;FDP=62;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=23;FWDB=-0.00651496;FXX=0.0158705;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.611;QD=7.8708;RBI=0.0127619;REFB=-0.0230435;REVB=-0.0109736;RO=30;SAF=10;SAR=19;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0115994;STB=0.524983;TYPE=snp;VARB=0.0218146;OID=.;OPOS=37429799;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:62:30:33:29:29:19:10:10:20:19:10:10:23 chr9 37429814 . A G 594.91 PASS AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0105016;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.653;QD=37.7717;RBI=0.0148227;REFB=0;REVB=-0.0104608;RO=0;SAF=18;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18913e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.86534e-05;OID=.;OPOS=37429814;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:63:63:0:0:63:63:45:18:0:0:45:18:0:0 chr9 37439785 . G GAAAC 131.26 PASS AO=33;DP=94;FAO=37;FDP=91;FR=.;FRO=54;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=31;FWDB=0.00381001;FXX=0.0215031;HRUN=3;LEN=4;MLLD=229.381;QD=5.76974;RBI=0.0115759;REFB=0.0225758;REVB=0.0109309;RO=55;SAF=12;SAR=21;SRF=24;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0833;STB=0.503935;TYPE=ins;VARB=-0.0324464;OID=.;OPOS=37439786;OREF=-;OALT=AAAC;OMAPALT=GAAAC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:33:94:37:91:54:16:21:23:31:99:55:12:21:24:31 chr9 37441650 . T C 200.4 PASS AO=44;DP=111;FAO=53;FDP=120;FR=.;FRO=67;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=37;FSRR=30;FWDB=0.0053625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.471;QD=6.67988;RBI=0.0054043;REFB=-0.0117622;REVB=0.000670833;RO=66;SAF=17;SAR=27;SRF=37;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185374;STB=0.544867;TYPE=snp;VARB=0.0141209;OID=.;OPOS=37441650;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:120:66:67:44:53:27:17:37:29:28:25:37:30 chr9 37441808 . A G 1037.04 PASS AO=106;DP=106;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00868454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.959;QD=38.409;RBI=0.0391564;REFB=0;REVB=-0.0381812;RO=0;SAF=59;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000140998;OID=.;OPOS=37441808;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:106:108:0:0:106:108:47:59:0:0:49:59:0:0 chr9 37486092 . GC G 148.7 PASS AO=23;DP=29;FAO=28;FDP=30;FR=.;FRO=2;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.197117;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.6806;QD=19.826;RBI=0.198606;REFB=0.0720548;REVB=0.0242711;RO=6;SAF=6;SAR=17;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0.276576;SSSB=-0.304035;STB=0.541637;TYPE=del;VARB=0.0399242;OID=.;OPOS=37486093;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:23:29:28:30:2:11:17:2:0:7:6:6:17:6:0 chr9 37486603 . A G 195.45 PASS AO=48;DP=103;FAO=49;FDP=106;FR=.;FRO=57;FSAF=3;FSAR=46;FSRF=11;FSRR=46;FWDB=-0.0951809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.3938;QD=7.37543;RBI=0.0973767;REFB=-0.0258604;REVB=-0.0205625;RO=53;SAF=3;SAR=45;SRF=10;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.330454;STB=0.699894;TYPE=snp;VARB=0.0161469;OID=.;OPOS=37486603;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:106:53:57:48:49:45:3:10:43:46:3:11:46 chr9 37503124 . G A 1091.37 PASS AO=110;DP=110;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0502802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.756;QD=37.9608;RBI=0.0583384;REFB=0;REVB=0.0295849;RO=0;SAF=37;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00043068;OID=.;OPOS=37503124;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:110:115:0:0:110:115:73:37:0:0:74:41:0:0 chr9 37521777 . G A 269.03 PASS AO=67;DP=143;FAO=67;FDP=143;FR=.;FRO=76;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=41;FSRR=35;FWDB=-0.00111339;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.868;QD=7.52521;RBI=0.00328358;REFB=-0.0142811;REVB=-0.00308905;RO=74;SAF=33;SAR=34;SRF=41;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0582605;STB=0.524925;TYPE=snp;VARB=0.0148177;OID=.;OPOS=37521777;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:74:76:67:67:34:33:41:33:34:33:41:35 chr9 37537557 . G A 158.9 PASS AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0253212;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8323;QD=37.3883;RBI=0.0629735;REFB=0;REVB=0.0576584;RO=0;SAF=14;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.53656e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00384561;OID=.;OPOS=37537557;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:17:17:0:0:17:17:3:14:0:0:3:14:0:0 chr9 37592452 . G A 125.2 PASS AO=15;DP=39;FAO=22;FDP=38;FR=.,HEALED;FRO=15;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.0437316;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.9994;QD=13.1787;RBI=0.171957;REFB=-0.0833398;REVB=0.166304;RO=16;SAF=10;SAR=5;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101128;STB=0.523908;TYPE=snp;VARB=0.0770553;OID=.;OPOS=37592452;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:37:38:16:15:15:22:5:10:9:7:9:13:8:7 chr9 37661858 . C A 148.99 PASS AO=42;DP=102;FAO=42;FDP=102;FR=.;FRO=60;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=35;FSRR=25;FWDB=-0.00387653;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=256.304;QD=5.84266;RBI=0.0272722;REFB=-0.00278867;REVB=0.0269953;RO=60;SAF=26;SAR=16;SRF=35;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0389748;STB=0.522027;TYPE=snp;VARB=0.00322693;OID=.;OPOS=37661858;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:60:60:42:42:16:26:35:25:16:26:35:25 chr9 37735680 . G A 289 PASS AO=90;DP=234;FAO=92;FDP=236;FR=.;FRO=144;FSAF=54;FSAR=38;FSRF=74;FSRR=70;FWDB=-0.00739754;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.912;QD=4.8983;RBI=0.00741567;REFB=-0.0109232;REVB=0.000518237;RO=144;SAF=53;SAR=37;SRF=74;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0830726;STB=0.545241;TYPE=snp;VARB=0.0182465;OID=.;OPOS=37735680;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:234:236:144:144:90:92:37:53:74:70:38:54:74:70 chr9 37740637 . T C 871.53 PASS AO=90;DP=90;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0284602;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.094;QD=37.8925;RBI=0.036076;REFB=0;REVB=0.0221696;RO=0;SAF=60;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000130933;OID=.;OPOS=37740637;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:90:92:0:0:90:92:30:60:0:0:31:61:0:0 chr9 37745413 . G A 162.75 PASS AO=42;DP=91;FAO=41;FDP=91;FR=.;FRO=50;FSAF=35;FSAR=6;FSRF=37;FSRR=13;FWDB=0.0131313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.423;QD=7.15404;RBI=0.0132001;REFB=-0.0171624;REVB=-0.00134628;RO=48;SAF=36;SAR=6;SRF=35;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205263;STB=0.60614;TYPE=snp;VARB=0.017248;OID=.;OPOS=37745413;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:48:50:42:41:6:36:35:13:6:35:37:13 chr9 37780558 . C A 179.21 PASS AO=51;DP=124;FAO=51;FDP=123;FR=.;FRO=72;FSAF=40;FSAR=11;FSRF=55;FSRR=17;FWDB=-0.0104365;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.461;QD=5.82783;RBI=0.0218137;REFB=-0.0137903;REVB=0.0191551;RO=72;SAF=40;SAR=11;SRF=55;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.030712;STB=0.517314;TYPE=snp;VARB=0.0219881;OID=.;OPOS=37780558;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:123:72:72:51:51:11:40:55:17:11:40:55:17 chr9 37782111 . C T 64.01 PASS AO=29;DP=115;FAO=32;FDP=119;FR=.;FRO=87;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=37;FSRR=50;FWDB=0.00840877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.851;QD=2.15157;RBI=0.0132127;REFB=-0.00260335;REVB=-0.0101916;RO=84;SAF=15;SAR=14;SRF=35;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123943;STB=0.576976;TYPE=snp;VARB=0.00711209;OID=.;OPOS=37782111;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:115:119:84:87:29:32:14:15:35:49:15:17:37:50 chr9 37862124 . A T 276.83 PASS AO=84;DP=204;FAO=83;FDP=203;FR=.;FRO=120;FSAF=55;FSAR=28;FSRF=69;FSRR=51;FWDB=-0.0451252;FXX=0.00490172;HRUN=4;LEN=1;MLLD=40.1911;QD=5.45481;RBI=0.0470361;REFB=-0.0247802;REVB=-0.0132708;RO=118;SAF=56;SAR=28;SRF=68;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101845;STB=0.555826;TYPE=snp;VARB=0.0357461;OID=.;OPOS=37862124;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:203:118:120:84:83:28:56:68:50:28:55:69:51 chr9 37862178 . A T 189.18 PASS AO=60;DP=154;FAO=59;FDP=153;FR=.;FRO=94;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=44;FSRR=50;FWDB=0.0223502;FXX=0.00649309;HRUN=7;LEN=1;MLLD=181.289;QD=4.94587;RBI=0.0252664;REFB=0.00859119;REVB=-0.0117839;RO=90;SAF=29;SAR=31;SRF=43;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00592221;STB=0.514408;TYPE=snp;VARB=-0.0132487;OID=.;OPOS=37862178;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:153:90:94:60:59:31:29:43:47:30:29:44:50 chr9 37865943 . A G 420.35 PASS AO=119;DP=275;FAO=119;FDP=278;FR=.;FRO=159;FSAF=47;FSAR=72;FSRF=55;FSRR=104;FWDB=-0.00557332;FXX=0.0106758;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.258;QD=6.04824;RBI=0.0104931;REFB=-0.00281209;REVB=0.0088906;RO=151;SAF=47;SAR=72;SRF=54;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0397735;STB=0.529708;TYPE=snp;VARB=0.00427394;OID=.;OPOS=37865943;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:275:278:151:159:119:119:72:47:54:97:72:47:55:104 chr9 37866739 . AT A 63.11 PASS AO=48;DP=119;FAO=57;FDP=110;FR=.;FRO=53;FSAF=37;FSAR=20;FSRF=28;FSRR=25;FWDB=-0.0612003;FXX=0.0090082;HRUN=8;LEN=1;MLLD=6.50369;QD=2.2949;RBI=0.0848124;REFB=-0.135336;REVB=0.0587168;RO=47;SAF=35;SAR=13;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199394;STB=0.561529;TYPE=del;VARB=0.131517;OID=.;OPOS=37866740;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:48:109:57:110:53:37:20:28:25:60:47:35:13:25:22 chr9 37884237 . A G 356.03 PASS AO=75;DP=138;FAO=75;FDP=138;FR=.;FRO=63;FSAF=37;FSAR=38;FSRF=29;FSRR=34;FWDB=0.0386947;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.0144;QD=10.3196;RBI=0.0405912;REFB=0.00399506;REVB=0.0122624;RO=63;SAF=37;SAR=38;SRF=29;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.027561;STB=0.515077;TYPE=snp;VARB=-0.00291756;OID=.;OPOS=37884237;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:63:63:75:75:38:37:29:34:38:37:29:34 chr9 37974743 . T C 317.95 PASS AO=65;DP=113;FAO=64;FDP=113;FR=.;FRO=49;FSAF=43;FSAR=21;FSRF=37;FSRR=12;FWDB=-0.0132017;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.235;QD=11.2549;RBI=0.0151434;REFB=-0.0152371;REVB=0.0074187;RO=48;SAF=44;SAR=21;SRF=36;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0668621;STB=0.542098;TYPE=snp;VARB=0.00970041;OID=.;OPOS=37974743;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:48:49:65:64:21:44:36:12:21:43:37:12 chr9 38395940 . T C 106.04 PASS AO=20;DP=55;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=26;FWDB=-0.0673046;FXX=0.0565931;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.0284;QD=8.48351;RBI=0.067933;REFB=-0.00826149;REVB=-0.00921874;RO=0;SAF=13;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.782432;TYPE=snp;VARB=0.0136556;OID=.;OPOS=38395940;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:23:50:0:26:20:24:7:13:0:0:10:14:0:26 chr9 38396065 . G T 459.53 PASS AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.173;QD=38.2938;RBI=0.0766078;REFB=0;REVB=0.0755115;RO=0;SAF=15;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000553172;OID=.;OPOS=38396065;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:48:48:0:0:48:48:33:15:0:0:33:15:0:0 chr9 38396502 . G A 423.53 PASS AO=45;DP=46;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0676709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.518;QD=36.0453;RBI=0.0700396;REFB=-0.109629;REVB=0.0180606;RO=0;SAF=19;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.15971e-08;STB=0.509087;TYPE=snp;VARB=0.00177622;OID=.;OPOS=38396502;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:46:47:0:1:45:46:26:19:0:0:27:19:0:1 chr9 38397236 . TG T 928.79 PASS AO=132;DP=171;FAO=164;FDP=168;FR=.;FRO=4;FSAF=75;FSAR=89;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.148984;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.7374;QD=22.114;RBI=0.31114;REFB=0.0489162;REVB=0.273152;RO=33;SAF=70;SAR=62;SRF=9;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0966995;STB=0.512985;TYPE=del;VARB=0.00996489;OID=.;OPOS=38397237;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:132:168:164:168:4:75:89:4:0:59:33:70:62:9:24 chr9 38397355 . G C 785.56 PASS AO=76;DP=76;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0198438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.503;QD=37.8583;RBI=0.0302947;REFB=0;REVB=0.0228909;RO=0;SAF=25;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000105028;OID=.;OPOS=38397355;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:76:83:0:0:76:83:51:25:0:0:58:25:0:0 chr9 38397915 . G A 677.13 PASS AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0203652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.253;QD=38.6933;RBI=0.0244117;REFB=0;REVB=0.0134607;RO=0;SAF=26;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.74062e-05;OID=.;OPOS=38397915;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:70:70:0:0:70:70:44:26:0:0:44:26:0:0 chr9 38571986 . C G 1873.09 PASS AO=193;DP=195;FAO=195;FDP=195;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0246231;FXX=0.0101518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.956;QD=38.4223;RBI=0.0255051;REFB=0;REVB=0.00664926;RO=0;SAF=76;SAR=117;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.75832e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000168733;OID=.;OPOS=38571986;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:195:195:0:0:193:195:117:76:0:0:118:77:0:0 chr9 38588602 . T C 872.47 PASS AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0383716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.108;QD=37.9334;RBI=0.0672802;REFB=0;REVB=0.0552653;RO=0;SAF=47;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.9386e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000264377;OID=.;OPOS=38588602;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:92:92:0:0:92:92:45:47:0:0:45:47:0:0 chr9 38595886 . T C 2400.4 PASS AO=259;DP=264;FAO=260;FDP=260;FR=.;FRO=0;FSAF=135;FSAR=125;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00964819;FXX=0.0188672;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.557;QD=36.9293;RBI=0.0175054;REFB=-0.0344636;REVB=0.0146066;RO=5;SAF=134;SAR=125;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.017452;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.51356e-05;OID=.;OPOS=38595886;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:264:260:5:0:259:260:125:134:5:0:125:135:0:0 chr9 38603140 . A AT 1432.69 PASS AO=142;DP=150;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159706;FXX=0.00666622;HRUN=0;LEN=1;MLLD=236.121;QD=38.4615;RBI=0.019212;REFB=0;REVB=-0.010679;RO=2;SAF=61;SAR=81;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0115951;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-1.89677e-05;OID=.;OPOS=38603141;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:142:150:149:149:0:62:87:0:0:67:2:61:81:0:2 chr9 38615698 . C T 589.53 PASS AO=149;DP=317;FAO=149;FDP=317;FR=.;FRO=168;FSAF=77;FSAR=72;FSRF=67;FSRR=101;FWDB=-0.0245213;FXX=0.00314456;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1794;QD=7.43885;RBI=0.0337095;REFB=0.00556024;REVB=0.0231308;RO=165;SAF=77;SAR=72;SRF=66;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111219;STB=0.56232;TYPE=snp;VARB=-0.00648642;OID=.;OPOS=38615698;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:317:317:165:168:149:149:72:77:66:99:72:77:67:101 chr9 38621344 . G A 33.2 PASS AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0207179;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=180.687;QD=8.30009;RBI=0.0238328;REFB=-0.0221186;REVB=0.0117803;RO=9;SAF=6;SAR=1;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.45597;STB=0.781686;TYPE=snp;VARB=0.0375166;OID=.;OPOS=38621344;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:16:16:9:9:7:7:1:6:4:5:1:6:4:5 chr9 39118196 . C A 522.25 PASS AO=57;DP=60;FAO=57;FDP=59;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0243652;FXX=0.0166639;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.3557;QD=35.4068;RBI=0.146479;REFB=0.00732031;REVB=-0.144438;RO=2;SAF=29;SAR=28;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0314166;STB=0.516661;TYPE=snp;VARB=-0.00574602;OID=.;OPOS=39118196;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:60:59:2:2:57:57:28:29:2:0:28:29:2:0 chr9 39118205 . G T 530.71 PASS AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00747801;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.031;QD=36.6004;RBI=0.0601051;REFB=-0.0198257;REVB=-0.0596381;RO=1;SAF=29;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159856;STB=0.508472;TYPE=snp;VARB=-1.94472e-05;OID=.;OPOS=39118205;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:58:58:1:1:57:57:28:29:1:0:28:29:1:0 chr9 39118207 . A G 530.7 PASS AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0368935;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.0689;QD=36.6;RBI=0.0402152;REFB=-0.0230887;REVB=0.0160042;RO=1;SAF=29;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159856;STB=0.508472;TYPE=snp;VARB=0.0031567;OID=.;OPOS=39118207;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:58:58:1:1:57:57:28:29:1:0:28:29:1:0 chr9 39287976 . C T 624.73 PASS AO=109;DP=169;FAO=110;FDP=169;FR=.;FRO=59;FSAF=59;FSAR=51;FSRF=36;FSRR=23;FWDB=-0.0271926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.896;QD=14.7865;RBI=0.0278292;REFB=-0.0144867;REVB=0.00591855;RO=50;SAF=58;SAR=51;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00464189;STB=0.525997;TYPE=snp;VARB=0.00725685;OID=.;OPOS=39287976;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:169:50:59:109:110:51:58:27:23:51:59:36:23 chr9 40503105 . G C 158.54 PASS AO=11;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=1;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.154091;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.673;QD=37.3042;RBI=0.20732;REFB=0;REVB=0.1387;RO=0;SAF=0;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0146766;OID=.;OPOS=40503105;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:17:17:0:0:11:17:11:0:0:0:16:1:0:0 chr9 40784183 . A G 244.54 PASS AO=67;DP=170;FAO=72;FDP=174;FR=.;FRO=102;FSAF=32;FSAR=40;FSRF=31;FSRR=71;FWDB=0.00125378;FXX=0.00571396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.966;QD=5.62156;RBI=0.00368824;REFB=-0.00453428;REVB=0.0034686;RO=101;SAF=31;SAR=36;SRF=30;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181689;STB=0.584958;TYPE=snp;VARB=0.00787459;OID=.;OPOS=40784183;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:174:101:102:67:72:36:31:30:71:40:32:31:71 chr9 42713921 . GTCAA G 50 PASS AO=79;DP=437;LEN=4;RO=358;SAF=64;SAR=30;SRF=236;SRR=107;TYPE=del;FR=.;OID=.;OPOS=42713922;OREF=TCAA;OALT=-;OMAPALT=G GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR 0/1:99:437:358:79:30:64:236:107 chr9 43822686 . C A 122.62 PASS AO=15;DP=19;FAO=16;FDP=20;FR=.;FRO=4;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0418623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.354;QD=24.5236;RBI=0.0504867;REFB=-0.0225051;REVB=0.0282215;RO=4;SAF=11;SAR=4;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106638;STB=0.542199;TYPE=snp;VARB=0.00734271;OID=.;OPOS=43822686;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:19:20:4:4:15:16:4:11:2:2:5:11:2:2 chr9 43822704 . G A 70.19 PASS AO=10;DP=13;FAO=10;FDP=13;FR=.;FRO=3;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0299881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.916;QD=21.5957;RBI=0.0793273;REFB=0.00346277;REVB=0.0734407;RO=3;SAF=9;SAR=1;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209237;STB=0.620405;TYPE=snp;VARB=-0.000105096;OID=.;OPOS=43822704;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:13:13:3:3:10:10:1:9:2:1:1:9:2:1 chr9 43849812 . T G 155.06 PASS AO=18;DP=20;FAO=18;FDP=20;FR=.;FRO=2;FSAF=16;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0192967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.221;QD=31.0126;RBI=0.0200849;REFB=-0.106853;REVB=-0.00557118;RO=2;SAF=16;SAR=2;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154695;STB=0.585259;TYPE=snp;VARB=0.0145968;OID=.;OPOS=43849812;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:20:20:2:2:18:18:2:16:1:1:2:16:1:1 chr9 43849817 . A G 141.49 PASS AO=16;DP=17;FAO=16;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0516609;FXX=0.0555247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.4938;QD=33.2905;RBI=0.0761744;REFB=0.024453;REVB=-0.0559794;RO=1;SAF=15;SAR=1;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.297837;STB=0.666403;TYPE=snp;VARB=-0.00106049;OID=.;OPOS=43849817;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:17:17:1:1:16:16:1:15:0:1:1:15:0:1 chr9 46386994 . C T 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=257.612;QD=35.0875;RBI=0.0338397;REFB=0;REVB=0.0338397;RO=0;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000535092;OID=.;OPOS=46386994;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:7:0:0:0:7:0:0:0 chr9 46386995 . C A 61.39 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.671;QD=35.0812;RBI=0.00248903;REFB=0;REVB=-0.00248903;RO=0;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.57473e-05;OID=.;OPOS=46386995;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:7:0:0:0:7:0:0:0 chr9 66457027 . T A 10.92 PASS AO=6;DP=40;FAO=6;FDP=34;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=20;FSRR=8;FWDB=-0.00999416;FXX=0.149963;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.432;QD=1.28527;RBI=0.0295647;REFB=-0.000131151;REVB=-0.0278242;RO=28;SAF=5;SAR=1;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198337;STB=0.642318;TYPE=snp;VARB=0.000827683;OID=.;OPOS=66457027;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:40:34:28:28:6:6:1:5:20:8:1:5:20:8 chr9 66457051 . G C 20.84 PASS AO=9;DP=44;FAO=9;FDP=38;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=21;FSRR=8;FWDB=0.0199738;FXX=0.136333;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.6118;QD=2.19342;RBI=0.0226255;REFB=0.018662;REVB=0.0106283;RO=29;SAF=6;SAR=3;SRF=21;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0805025;STB=0.550912;TYPE=snp;VARB=-0.0249582;OID=.;OPOS=66457051;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:44:38:29:29:9:9:3:6:21:8:3:6:21:8 chr9 66457076 . T C 33.69 PASS AO=12;DP=41;FAO=12;FDP=41;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=-0.0146278;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.0924;QD=3.28634;RBI=0.0191512;REFB=0.00155106;REVB=0.0123611;RO=29;SAF=5;SAR=7;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.271382;STB=0.663774;TYPE=snp;VARB=-0.00504247;OID=.;OPOS=66457076;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:41:41:29:29:12:12:7:5:19:10:7:5:19:10 chr9 66457267 . C A 23.85 PASS AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.0307633;FXX=0.0526039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.978;QD=5.30035;RBI=0.0866919;REFB=-0.0186476;REVB=-0.08105;RO=12;SAF=3;SAR=3;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177981;STB=0.610759;TYPE=snp;VARB=0.0548247;OID=.;OPOS=66457267;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:18:18:12:12:6:6:3:3:8:4:3:3:8:4 chr9 66457313 . G A 22.48 PASS AO=6;DP=19;FAO=6;FDP=19;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=1;FWDB=-0.000564617;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.131;QD=4.73283;RBI=0.00915561;REFB=-0.00876468;REVB=0.00913818;RO=13;SAF=2;SAR=4;SRF=12;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.590332;STB=0.847705;TYPE=snp;VARB=0.0232129;OID=.;OPOS=66457313;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:19:19:13:13:6:6:4:2:12:1:4:2:12:1 chr9 66457451 . T C 33.59 PASS AO=15;DP=53;FAO=14;FDP=52;FR=.;FRO=38;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=35;FSRR=3;FWDB=0.0516933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3174;QD=2.58415;RBI=0.0517479;REFB=0.0127836;REVB=0.002376;RO=37;SAF=5;SAR=10;SRF=34;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.629037;STB=0.882015;TYPE=snp;VARB=-0.00477288;OID=.;OPOS=66457451;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:53:52:37:38:15:14:10:5:34:3:10:4:35:3 chr9 66457460 . G A 19.41 PASS AO=11;DP=48;FAO=10;FDP=46;FR=.;FRO=36;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=32;FSRR=4;FWDB=-0.00816798;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.871;QD=1.68799;RBI=0.0175846;REFB=0.001403;REVB=0.0155724;RO=37;SAF=3;SAR=8;SRF=32;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.641878;STB=0.918416;TYPE=snp;VARB=-0.00518756;OID=.;OPOS=66457460;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:48:46:37:36:11:10:8:3:32:5:8:2:32:4 chr9 66457465 . T G 48.38 PASS AO=17;DP=46;FAO=15;FDP=44;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=25;FSRR=4;FWDB=0.00482988;FXX=0.0638162;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.145;QD=4.3986;RBI=0.0220995;REFB=-0.0026827;REVB=-0.0215652;RO=29;SAF=8;SAR=9;SRF=25;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.424335;STB=0.752681;TYPE=snp;VARB=0.0145847;OID=.;OPOS=66457465;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:46:44:29:29:17:15:9:8:25:4:8:7:25:4 chr9 66457475 . C T 106.68 PASS AO=25;DP=49;FAO=25;FDP=48;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=-0.0499615;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=32.4891;QD=8.88993;RBI=0.11711;REFB=-0.035866;REVB=0.105918;RO=24;SAF=9;SAR=16;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.299936;STB=0.658853;TYPE=snp;VARB=0.0525307;OID=.;OPOS=66457475;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:49:48:24:23:25:25:16:9:17:7:16:9:16:7 chr9 66457480 . G A 107.05 PASS AO=26;DP=59;FAO=26;FDP=57;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=10;FWDB=0.0670393;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.0189;QD=7.51206;RBI=0.122047;REFB=0.00648304;REVB=0.101986;RO=33;SAF=11;SAR=15;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236876;STB=0.635661;TYPE=snp;VARB=-0.00300239;OID=.;OPOS=66457480;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:57:33:31:26:26:15:11:22:11:15:11:21:10 chr9 66457498 . G T 64.25 PASS AO=23;DP=77;FAO=22;FDP=66;FR=.;FRO=44;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=18;FWDB=0.00840755;FXX=0.108094;HRUN=5;LEN=1;MLLD=245.196;QD=3.89398;RBI=0.0443745;REFB=-0.00973751;REVB=-0.0435708;RO=46;SAF=8;SAR=15;SRF=26;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.248392;STB=0.681653;TYPE=snp;VARB=0.0207893;OID=.;OPOS=66457498;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:77:66:46:44:23:22:15:8:26:20:15:7:26:18 chr9 66457549 . A G 26.12 PASS AO=22;DP=116;FAO=19;FDP=93;FR=.;FRO=74;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=45;FSRR=29;FWDB=-0.00750592;FXX=0.184194;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.345;QD=1.12343;RBI=0.0764661;REFB=-0.00849213;REVB=-0.0760969;RO=72;SAF=13;SAR=9;SRF=44;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0261843;STB=0.566553;TYPE=snp;VARB=0.0338794;OID=.;OPOS=66457549;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:116:93:72:74:22:19:9:13:44:28:6:13:45:29 chr9 66457562 . C T 55.8 PASS AO=23;DP=112;FAO=24;FDP=107;FR=.,HEALED;FRO=78;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=48;FSRR=30;FWDB=0.00192192;FXX=0.0183469;HRUN=4;LEN=1;MLLD=160.207;QD=2.08593;RBI=0.0258864;REFB=-0.0363437;REVB=-0.025815;RO=59;SAF=12;SAR=11;SRF=44;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.279135;STB=0.588164;TYPE=snp;VARB=0.0334141;OID=.;OPOS=66457562;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:108:107:59:78:23:24:11:12:44:15:12:12:48:30 chr9 66457585 . G T 33.08 PASS AO=24;DP=91;FAO=20;FDP=88;FR=.;FRO=68;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=39;FSRR=29;FWDB=-0.0230208;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.587;QD=1.50347;RBI=0.0252588;REFB=-0.0119085;REVB=0.0103946;RO=67;SAF=10;SAR=14;SRF=39;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200039;STB=0.556762;TYPE=snp;VARB=0.0415047;OID=.;OPOS=66457585;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:91:88:67:68:24:20:14:10:39:28:10:10:39:29 chr9 66457594 . A G 208.68 PASS AO=54;DP=75;FAO=38;FDP=64;FR=.;FRO=26;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.0220416;FXX=0.135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.606;QD=13.0422;RBI=0.022073;REFB=-0.0267894;REVB=0.00117659;RO=20;SAF=28;SAR=26;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0662778;STB=0.54185;TYPE=snp;VARB=0.0216976;OID=.;OPOS=66457594;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:75:64:20:26:54:38:26:28:13:7:20:18:15:11 chr9 66457598 . GC G 211.88 PASS AO=38;DP=76;FAO=48;FDP=58;FR=.;FRO=10;FSAF=30;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=10;FWDB=0.250996;FXX=0.159397;HRUN=2;LEN=1;MLLD=13.2183;QD=14.6125;RBI=0.301544;REFB=0.0122145;REVB=-0.167122;RO=18;SAF=21;SAR=17;SRF=7;SRR=11;SSEN=0.302763;SSEP=0;SSSB=0.0967447;STB=0.60865;TYPE=del;VARB=-0.0157484;OID=.;OPOS=66457599;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:38:69:48:58:10:30:18:0:10:5:18:21:17:7:11 chr9 66457652 . C T 11.91 PASS AO=8;DP=49;FAO=8;FDP=46;FR=.;FRO=38;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=-0.00202127;FXX=0.061212;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.557;QD=1.03523;RBI=0.0133863;REFB=-0.00337123;REVB=0.0132328;RO=38;SAF=3;SAR=5;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0582436;STB=0.539672;TYPE=snp;VARB=0.0212031;OID=.;OPOS=66457652;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:49:46:38:38:8:8:5:3:16:22:5:3:16:22 chr9 66458195 . T G 10.36 PASS AO=16;DP=102;FAO=15;FDP=103;FR=.;FRO=88;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=40;FSRR=48;FWDB=-0.026376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.3084;QD=0.402354;RBI=0.0266399;REFB=-0.000176363;REVB=-0.00374054;RO=82;SAF=4;SAR=12;SRF=35;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243881;STB=0.741032;TYPE=snp;VARB=-0.00041968;OID=.;OPOS=66458195;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:102:103:82:88:16:15:12:4:35:47:12:3:40:48 chr9 66458231 . GC G 161.37 PASS AO=28;DP=71;FAO=44;FDP=60;FR=.;FRO=16;FSAF=14;FSAR=30;FSRF=14;FSRR=2;FWDB=0.0775547;FXX=0.11763;HRUN=2;LEN=1;MLLD=15.7036;QD=10.758;RBI=0.0798684;REFB=-0.0777225;REVB=0.0190846;RO=18;SAF=12;SAR=16;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206164;STB=0.652103;TYPE=del;VARB=0.0535022;OID=.;OPOS=66458232;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:28:62:44:60:16:14:30:14:2:19:18:12:16:13:5 chr9 66458245 . G A 16.64 PASS AO=11;DP=51;FAO=11;FDP=58;FR=.;FRO=47;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=33;FWDB=0.0275022;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.935;QD=1.14769;RBI=0.0590329;REFB=-0.0194284;REVB=-0.0522352;RO=40;SAF=6;SAR=5;SRF=14;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237722;STB=0.69481;TYPE=snp;VARB=0.0766206;OID=.;OPOS=66458245;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:51:58:40:47:11:11:5:6:14:26:5:6:14:33 chr9 66499356 . G A 19.4 PASS AO=10;DP=46;FAO=10;FDP=46;FR=.;FRO=36;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=26;FWDB=-0.0160684;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=247.583;QD=1.68696;RBI=0.0169987;REFB=0.000510745;REVB=0.00554662;RO=36;SAF=5;SAR=5;SRF=10;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.277444;STB=0.673607;TYPE=snp;VARB=-0.00206477;OID=.;OPOS=66499356;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:46:46:36:36:10:10:5:5:10:26:5:5:10:26 chr9 68415386 . G A 106.04 PASS AO=44;DP=159;FAO=47;FDP=154;FR=.;FRO=107;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=43;FSRR=64;FWDB=-0.0547671;FXX=0.0552113;HRUN=2;LEN=1;MLLD=35.2576;QD=2.75434;RBI=0.0602573;REFB=-0.0309308;REVB=-0.0251299;RO=115;SAF=19;SAR=25;SRF=42;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.084421;STB=0.501721;TYPE=snp;VARB=0.0692689;OID=.;OPOS=68415386;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:154:115:107:44:47:25:19:42:73:28:19:43:64 chr9 68415388 . A T 310.6 PASS AO=97;DP=158;FAO=76;FDP=156;FR=.;FRO=80;FSAF=32;FSAR=44;FSRF=28;FSRR=52;FWDB=-0.0576302;FXX=0.0126574;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.266;QD=7.96416;RBI=0.0578332;REFB=-0.0228262;REVB=0.00484121;RO=61;SAF=38;SAR=59;SRF=23;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0110349;STB=0.537805;TYPE=snp;VARB=0.0194331;OID=.;OPOS=68415388;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:156:61:80:97:76:59:38:23:38:44:32:28:52 chr9 68415397 . T C 12.85 PASS AO=24;DP=157;FAO=23;FDP=156;FR=.;FRO=133;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=52;FSRR=81;FWDB=-0.0080096;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.671;QD=0.329369;RBI=0.0107579;REFB=-0.00356925;REVB=-0.00718181;RO=131;SAF=8;SAR=16;SRF=50;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0668204;STB=0.539533;TYPE=snp;VARB=0.0260193;OID=.;OPOS=68415397;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:157:156:131:133:24:23:16:8:50:81:15:8:52:81 chr9 68686074 . G A 59.41 PASS AO=40;DP=166;FAO=39;FDP=166;FR=.;FRO=127;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=57;FSRR=70;FWDB=-0.00120295;FXX=0.00598767;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.742;QD=1.43161;RBI=0.0211708;REFB=-0.00686673;REVB=0.0211366;RO=124;SAF=22;SAR=18;SRF=56;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122839;STB=0.568231;TYPE=snp;VARB=0.0239813;OID=.;OPOS=68686074;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:166:166:124:127:40:39:18:22:56:68:18:21:57:70 chr9 69002317 . T C 16.14 PASS AO=12;DP=66;FAO=12;FDP=65;FR=.;FRO=53;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=29;FSRR=24;FWDB=0.0349768;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.442;QD=0.993124;RBI=0.0589082;REFB=-0.00730075;REVB=-0.0474005;RO=52;SAF=11;SAR=1;SRF=29;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.539262;STB=0.872288;TYPE=snp;VARB=0.0542088;OID=.;OPOS=69002317;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:66:65:52:53:12:12:1:11:29:23:1:11:29:24 chr9 69181562 . A T 10.47 PASS AO=2;DP=6;FAO=2;FDP=6;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0119132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7912;QD=6.97913;RBI=0.0119132;REFB=-0.00912525;REVB=0;RO=4;SAF=2;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0146573;OID=.;OPOS=69181562;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:4:4:2:2:0:2:4:0:0:2:4:0 chr9 69206924 . T A 22.75 PASS AO=4;DP=8;FAO=4;FDP=8;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0211625;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.031;QD=11.3748;RBI=0.0219255;REFB=-0.0218341;REVB=0.0057339;RO=3;SAF=1;SAR=3;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0725463;STB=0.64209;TYPE=snp;VARB=0.0212802;OID=.;OPOS=69206924;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:8:8:3:4:4:4:3:1:1:2:3:1:2:2 chr9 69256816 . G A 633.87 PASS AO=145;DP=286;FAO=146;FDP=286;FR=.;FRO=140;FSAF=58;FSAR=88;FSRF=83;FSRR=57;FWDB=0.00621982;FXX=0.0103803;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.987;QD=8.86532;RBI=0.0218186;REFB=0.00105397;REVB=-0.0209133;RO=136;SAF=58;SAR=87;SRF=79;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160822;STB=0.596009;TYPE=snp;VARB=-0.00111524;OID=.;OPOS=69256816;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:286:286:136:140:145:146:87:58:79:57:88:58:83:57 chr9 69256833 . A G 588.15 PASS AO=147;DP=309;FAO=147;FDP=309;FR=.;FRO=162;FSAF=84;FSAR=63;FSRF=60;FSRR=102;FWDB=0.0476617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.3915;QD=7.61363;RBI=0.0874372;REFB=-0.0219955;REVB=0.073305;RO=162;SAF=84;SAR=63;SRF=60;SRR=102;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189862;STB=0.604382;TYPE=snp;VARB=0.0289323;OID=.;OPOS=69256833;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:309:309:162:162:147:147:63:84:60:102:63:84:60:102 chr9 70912541 . G T 93.94 PASS AO=32;DP=92;FAO=32;FDP=92;FR=.;FRO=60;FSAF=0;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=60;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7812;QD=4.08447;RBI=0.0333236;REFB=-0.0158319;REVB=-0.0333236;RO=60;SAF=0;SAR=32;SRF=0;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0287271;OID=.;OPOS=70912541;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:92:92:60:60:32:32:32:0:0:60:32:0:0:60 chr9 70919325 . C A 12.86 PASS AO=6;DP=30;FAO=6;FDP=30;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.000346526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1424;QD=1.71401;RBI=0.0145166;REFB=-0.00233811;REVB=0.0145124;RO=24;SAF=4;SAR=2;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0536394;STB=0.536461;TYPE=snp;VARB=0.0147809;OID=.;OPOS=70919325;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:30:30:24:24:6:6:2:4:15:9:2:4:15:9 chr9 70919375 . TAGAA T 25 PASS AO=28;DP=172;LEN=4;RO=144;SAF=17;SAR=15;SRF=74;SRR=66;TYPE=del;FR=.;OID=.;OPOS=70919376;OREF=AGAA;OALT=-;OMAPALT=T GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR 0/1:99:172:144:28:15:17:74:66 chr9 70919413 . C A 19.62 PASS AO=6;DP=21;FAO=6;FDP=22;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0373188;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.4432;QD=3.56662;RBI=0.0473243;REFB=0.0049483;REVB=0.0291015;RO=15;SAF=4;SAR=2;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154555;STB=0.580369;TYPE=snp;VARB=-0.00627604;OID=.;OPOS=70919413;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:21:22:15:16:6:6:2:4:8:7:2:4:9:7 chr9 70999315 . T C 360.47 PASS AO=76;DP=142;FAO=77;FDP=143;FR=.;FRO=66;FSAF=23;FSAR=54;FSRF=22;FSRR=44;FWDB=-0.0499536;FXX=0.00694396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.971;QD=10.0831;RBI=0.0503572;REFB=-0.01315;REVB=0.00636258;RO=65;SAF=22;SAR=54;SRF=21;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0338095;STB=0.518782;TYPE=snp;VARB=0.00924423;OID=.;OPOS=70999315;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:143:65:66:76:77:54:22:21:44:54:23:22:44 chr9 71396239 . C T 1563 PASS AO=162;DP=164;FAO=165;FDP=165;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0468703;FXX=0.0119753;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.135;QD=37.891;RBI=0.0516016;REFB=-0.0207391;REVB=-0.0215849;RO=1;SAF=77;SAR=85;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00613977;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.48898e-05;OID=.;OPOS=71396239;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:164:165:1:0:162:165:85:77:1:0:86:79:0:0 chr9 71396746 . A G 1242.06 PASS AO=129;DP=129;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0524449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.071;QD=38.5135;RBI=0.0535303;REFB=0;REVB=0.0107245;RO=0;SAF=66;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000123815;OID=.;OPOS=71396746;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:129:129:0:0:129:129:63:66:0:0:63:66:0:0 chr9 71397734 . A G 1153.45 PASS AO=121;DP=121;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0436029;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.461;QD=38.1306;RBI=0.0449326;REFB=0;REVB=0.01085;RO=0;SAF=46;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.04499e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.12287e-05;OID=.;OPOS=71397734;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:121:121:0:0:121:121:75:46:0:0:75:46:0:0 chr9 71397747 . T C 847.02 PASS AO=90;DP=92;FAO=91;FDP=92;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0726602;FXX=0.0107515;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.484;QD=36.8271;RBI=0.0727502;REFB=-0.0974809;REVB=-0.0036183;RO=1;SAF=36;SAR=54;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00869721;STB=0.504503;TYPE=snp;VARB=0.00032408;OID=.;OPOS=71397747;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:92:92:1:1:90:91:54:36:0:1:55:36:0:1 chr9 71549847 . G A 386.03 PASS AO=108;DP=251;FAO=109;FDP=252;FR=.;FRO=143;FSAF=54;FSAR=55;FSRF=70;FSRR=73;FWDB=-0.00324016;FXX=0.0117642;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.074;QD=6.12746;RBI=0.00350439;REFB=-0.00834443;REVB=-0.00133497;RO=140;SAF=54;SAR=54;SRF=70;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503349;TYPE=snp;VARB=0.0105782;OID=.;OPOS=71549847;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:251:252:140:143:108:109:54:54:70:70:55:54:70:73 chr9 71843023 . C A 1011.16 PASS AO=100;DP=100;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0857764;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=34.7247;QD=37.8003;RBI=0.0907833;REFB=0;REVB=0.0297323;RO=0;SAF=48;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.19274e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000956799;OID=.;OPOS=71843023;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:100:107:0:0:100:107:52:48:0:0:56:51:0:0 chr9 71851893 . GC G 456.49 PASS AO=59;DP=108;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.191575;FXX=0.0360328;HRUN=3;LEN=1;MLLD=8.491;QD=17.0651;RBI=0.285114;REFB=-0.0208271;REVB=0.21116;RO=25;SAF=39;SAR=20;SRF=20;SRR=5;SSEN=0.209302;SSEP=0;SSSB=-0.0884573;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0145834;OID=.;OPOS=71851894;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:59:106:107:107:0:71:36:0:0:39:25:39:20:20:5 chr9 71862975 . C T 305.54 PASS AO=78;DP=170;FAO=78;FDP=170;FR=.;FRO=92;FSAF=46;FSAR=32;FSRF=22;FSRR=70;FWDB=0.0498803;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.356;QD=7.1892;RBI=0.0501501;REFB=-0.0116978;REVB=0.00519521;RO=91;SAF=46;SAR=32;SRF=21;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.338677;STB=0.683125;TYPE=snp;VARB=0.0193494;OID=.;OPOS=71862975;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:170:91:92:78:78:32:46:21:70:32:46:22:70 chr9 71862987 . G A 339.63 PASS AO=82;DP=170;FAO=82;FDP=170;FR=.;FRO=88;FSAF=46;FSAR=36;FSRF=20;FSRR=68;FWDB=0.0200883;FXX=0.00584761;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.63;QD=7.99118;RBI=0.0339504;REFB=-0.00112318;REVB=0.0273696;RO=88;SAF=46;SAR=36;SRF=20;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.30675;STB=0.668119;TYPE=snp;VARB=0.00206272;OID=.;OPOS=71862987;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:170:88:88:82:82:36:46:20:68:36:46:20:68 chr9 71986315 . T C 1279.52 PASS AO=61;DP=140;FAO=142;FDP=143;FR=.;FRO=1;FSAF=88;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0223441;FXX=0.128041;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.768;QD=35.7907;RBI=0.0336911;REFB=-0.065336;REVB=0.0252157;RO=0;SAF=47;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.92147e-08;STB=0.504587;TYPE=snp;VARB=0.00489349;OID=.;OPOS=71986315;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:66:143:0:1:61:142:14:47:0:0:54:88:0:1 chr9 71986316 . G A 1518.6 PASS AO=141;DP=144;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=99;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119676;FXX=0.0181807;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.799;QD=37.4962;RBI=0.0561962;REFB=0;REVB=0.0549071;RO=0;SAF=94;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00145183;OID=.;OPOS=71986316;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:144:162:0:0:141:162:47:94:0:0:63:99:0:0 chr9 72003036 . T C 1795.78 PASS AO=192;DP=196;FAO=193;FDP=196;FR=.;FRO=3;FSAF=81;FSAR=112;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00702051;FXX=0.00507588;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.7008;QD=36.6485;RBI=0.00706522;REFB=-0.00454011;REVB=0.000793619;RO=2;SAF=81;SAR=111;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00850244;STB=0.501357;TYPE=snp;VARB=0.000458159;OID=.;OPOS=72003036;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:196:196:2:3:192:193:111:81:0:2:112:81:1:2 chr9 72373624 . A G 2539.7 PASS AO=267;DP=268;FAO=266;FDP=266;FR=.;FRO=0;FSAF=132;FSAR=134;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0284088;FXX=0.00746241;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.63;QD=38.191;RBI=0.0306478;REFB=-0.0120467;REVB=-0.0114991;RO=0;SAF=133;SAR=134;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.76358e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.81212e-07;OID=.;OPOS=72373624;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:268:266:0:0:267:266:134:133:0:0:134:132:0:0 chr9 72472831 . C T 400.51 PASS AO=112;DP=263;FAO=113;FDP=263;FR=.;FRO=150;FSAF=56;FSAR=57;FSRF=75;FSRR=75;FWDB=0.0102271;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.412;QD=6.09135;RBI=0.0161635;REFB=0.00477349;REVB=0.0125166;RO=146;SAF=55;SAR=57;SRF=74;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0160581;STB=0.502523;TYPE=snp;VARB=-0.00720639;OID=.;OPOS=72472831;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:263:263:146:150:112:113:57:55:74:72:57:56:75:75 chr9 72741312 . G A 956.18 PASS AO=98;DP=98;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00415163;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.7389;QD=38.6334;RBI=0.00432062;REFB=0;REVB=0.00119654;RO=0;SAF=46;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000189837;OID=.;OPOS=72741312;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:98:99:0:0:98:99:52:46:0:0:52:47:0:0 chr9 72841360 . A T 1880.43 PASS AO=182;DP=184;FAO=201;FDP=201;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00576876;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.8917;QD=37.4214;RBI=0.0379613;REFB=0;REVB=0.0375204;RO=2;SAF=79;SAR=103;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00915415;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.82433e-05;OID=.;OPOS=72841360;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:89:184:201:2:0:182:201:103:79:0:2:119:82:0:0 chr9 72897434 . G A 509.36 PASS AO=124;DP=257;FAO=126;FDP=263;FR=.;FRO=137;FSAF=79;FSAR=47;FSRF=56;FSRR=81;FWDB=-0.0178217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.577;QD=7.74686;RBI=0.0335466;REFB=-0.010254;REVB=0.0284212;RO=132;SAF=79;SAR=45;SRF=56;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202279;STB=0.614432;TYPE=snp;VARB=0.0103455;OID=.;OPOS=72897434;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:257:263:132:137:124:126:45:79:56:76:47:79:56:81 chr9 73150873 . T G 174.75 PASS AO=41;DP=87;FAO=42;FDP=89;FR=.;FRO=47;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=0.0313868;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.731;QD=7.85386;RBI=0.0463671;REFB=0.00474005;REVB=0.0341289;RO=46;SAF=19;SAR=22;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0347433;STB=0.519625;TYPE=snp;VARB=-0.00310412;OID=.;OPOS=73150873;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:89:46:47:41:42:22:19:23:23:23:19:23:24 chr9 73150918 . C T 232.29 PASS AO=55;DP=124;FAO=59;FDP=128;FR=.;FRO=69;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=33;FSRR=36;FWDB=-0.0219629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.956;QD=7.259;RBI=0.0374038;REFB=-0.0176988;REVB=0.0302767;RO=69;SAF=27;SAR=28;SRF=33;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126066;STB=0.511178;TYPE=snp;VARB=0.0217567;OID=.;OPOS=73150918;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:128:69:69:55:59:28:27:33:36:32:27:33:36 chr9 73150984 . C T 398.65 PASS AO=100;DP=222;FAO=103;FDP=224;FR=.;FRO=121;FSAF=51;FSAR=52;FSRF=55;FSRR=66;FWDB=0.03647;FXX=0.00444425;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.034;QD=7.11872;RBI=0.0364961;REFB=-0.0196729;REVB=-0.00137917;RO=121;SAF=49;SAR=51;SRF=55;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0350678;STB=0.521939;TYPE=snp;VARB=0.0309079;OID=.;OPOS=73150984;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:224:121:121:100:103:51:49:55:66:52:51:55:66 chr9 73151715 . C T 1640.75 PASS AO=180;DP=185;FAO=180;FDP=185;FR=.;FRO=5;FSAF=101;FSAR=79;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.00571531;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=187.233;QD=35.4757;RBI=0.00612941;REFB=-0.0851556;REVB=0.0022147;RO=3;SAF=101;SAR=79;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0033451;STB=0.506564;TYPE=snp;VARB=0.000231542;OID=.;OPOS=73151715;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:185:185:3:5:180:180:79:101:2:1:79:101:4:1 chr9 73151970 . C T 315.59 PASS AO=89;DP=209;FAO=89;FDP=209;FR=.;FRO=120;FSAF=48;FSAR=41;FSRF=60;FSRR=60;FWDB=-0.0170584;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.754;QD=6.03994;RBI=0.0177067;REFB=-0.0149885;REVB=0.00474737;RO=119;SAF=48;SAR=41;SRF=60;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0361344;STB=0.522634;TYPE=snp;VARB=0.021029;OID=.;OPOS=73151970;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:209:119:120:89:89:41:48:60:59:41:48:60:60 chr9 73376414 . G T 332.31 PASS AO=91;DP=210;FAO=91;FDP=210;FR=.;FRO=119;FSAF=39;FSAR=52;FSRF=49;FSRR=70;FWDB=0.0117316;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.696;QD=6.32981;RBI=0.023101;REFB=0.00940752;REVB=0.0199004;RO=119;SAF=39;SAR=52;SRF=49;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0175105;STB=0.509747;TYPE=snp;VARB=-0.0116642;OID=.;OPOS=73376414;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:210:210:119:119:91:91:52:39:49:70:52:39:49:70 chr9 73391369 . T C 181.78 PASS AO=41;DP=80;FAO=40;FDP=79;FR=.;FRO=39;FSAF=27;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=-0.0253843;FXX=0.0124984;HRUN=6;LEN=1;MLLD=252.424;QD=9.20382;RBI=0.0295311;REFB=-0.00229735;REVB=-0.0150904;RO=39;SAF=27;SAR=14;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0656063;STB=0.546382;TYPE=snp;VARB=0.0022514;OID=.;OPOS=73391369;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:79:39:39:41:40:14:27:23:16:13:27:23:16 chr9 73391409 . C CA 44.13 PASS AO=34;DP=84;FAO=38;FDP=77;FR=.;FRO=39;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=0.082608;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=7.37777;QD=2.29234;RBI=0.125349;REFB=-0.0883276;REVB=-0.0942772;RO=44;SAF=20;SAR=14;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0893845;STB=0.559803;TYPE=ins;VARB=0.0599494;OID=.;OPOS=73391410;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:34:84:38:77:39:22:16:18:21:44:44:20:14:22:22 chr9 73408518 . T G 731.16 PASS AO=237;DP=484;FAO=187;FDP=399;FR=.;FRO=212;FSAF=100;FSAR=87;FSRF=122;FSRR=90;FWDB=0.0275024;FXX=0.00249994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.532;QD=7.32994;RBI=0.0287673;REFB=-0.00324891;REVB=0.00843658;RO=247;SAF=130;SAR=107;SRF=134;SRR=113;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00564778;STB=0.5218;TYPE=snp;VARB=0.0032856;OID=.;OPOS=73408518;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:484:399:247:212:237:187:107:130:134:113:87:100:122:90 chr9 73461337 . T A 2533.4 PASS AO=271;DP=281;FAO=272;FDP=272;FR=.;FRO=0;FSAF=108;FSAR=164;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0402459;FXX=0.0320273;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.98;QD=37.2559;RBI=0.0542639;REFB=-0.0840164;REVB=0.0363983;RO=3;SAF=108;SAR=163;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0086935;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000519548;OID=.;OPOS=73461337;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:281:272:3:0:271:272:163:108:0:3:164:108:0:0 chr9 74332970 . G A 3344.26 PASS AO=363;DP=371;FAO=363;FDP=371;FR=.;FRO=8;FSAF=173;FSAR=190;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=-0.00775501;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=226.234;QD=36.0567;RBI=0.00828727;REFB=-0.0341824;REVB=0.00292208;RO=7;SAF=173;SAR=190;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0137527;STB=0.505905;TYPE=snp;VARB=0.000286451;OID=.;OPOS=74332970;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:371:371:7:8:363:363:190:173:6:1:190:173:6:2 chr9 74671719 . T C 488.88 PASS AO=107;DP=208;FAO=114;FDP=224;FR=.;FRO=110;FSAF=66;FSAR=48;FSRF=45;FSRR=65;FWDB=-0.0884579;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=37.4317;QD=8.73006;RBI=0.0960524;REFB=-0.0452747;REVB=-0.0374335;RO=100;SAF=62;SAR=45;SRF=40;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157915;STB=0.58328;TYPE=snp;VARB=0.0371084;OID=.;OPOS=74671719;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:224:100:110:107:114:45:62:40:60:48:66:45:65 chr9 74834384 . C T 304.34 PASS AO=69;DP=138;FAO=70;FDP=139;FR=.;FRO=69;FSAF=32;FSAR=38;FSRF=24;FSRR=45;FWDB=0.0081251;FXX=0.00714235;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.466;QD=8.758;RBI=0.00824332;REFB=-0.0122526;REVB=-0.0013911;RO=65;SAF=32;SAR=37;SRF=22;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112326;STB=0.555169;TYPE=snp;VARB=0.0110677;OID=.;OPOS=74834384;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:139:65:69:69:70:37:32:22:43:38:32:24:45 chr9 74846104 . A G 358.89 PASS AO=95;DP=214;FAO=96;FDP=215;FR=.;FRO=119;FSAF=43;FSAR=53;FSRF=55;FSRR=64;FWDB=0.00738277;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.409;QD=6.67709;RBI=0.00773712;REFB=-0.00816187;REVB=-0.00231467;RO=117;SAF=42;SAR=53;SRF=53;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0109548;STB=0.507969;TYPE=snp;VARB=0.0114099;OID=.;OPOS=74846104;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:215:117:119:95:96:53:42:53:64:53:43:55:64 chr9 74969864 . T C 155.06 PASS AO=39;DP=87;FAO=39;FDP=86;FR=.;FRO=47;FSAF=9;FSAR=30;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=0.0149793;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.0847;QD=7.21201;RBI=0.021244;REFB=-0.0336873;REVB=0.0150642;RO=47;SAF=9;SAR=30;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.249316;STB=0.640947;TYPE=snp;VARB=0.0532885;OID=.;OPOS=74969864;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:86:47:47:39:39:30:9:21:26:30:9:21:26 chr9 74975136 . T C 1820.46 PASS AO=194;DP=196;FAO=194;FDP=194;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=114;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0924468;FXX=0.0102036;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.4567;QD=37.5353;RBI=0.0972947;REFB=-0.0578896;REVB=-0.0303291;RO=2;SAF=80;SAR=114;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00175632;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.49995e-05;OID=.;OPOS=74975136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:196:194:2:0:194:194:114:80:1:1:114:80:0:0 chr9 75303653 . C T 107.38 PASS AO=34;DP=92;FAO=34;FDP=92;FR=.;FRO=58;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=38;FWDB=-0.0109631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.516;QD=4.66851;RBI=0.0125485;REFB=0.0134736;REVB=-0.00610535;RO=58;SAF=14;SAR=20;SRF=20;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0773733;STB=0.54421;TYPE=snp;VARB=-0.0245876;OID=.;OPOS=75303653;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:58:58:34:34:20:14:20:38:20:14:20:38 chr9 75315438 . G A 224.58 PASS AO=47;DP=95;FAO=50;FDP=97;FR=.;FRO=47;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=0.0197681;FXX=0.0202;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.894;QD=9.2611;RBI=0.0228318;REFB=-0.0195852;REVB=0.0114243;RO=46;SAF=26;SAR=21;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0477856;STB=0.51428;TYPE=snp;VARB=0.0189532;OID=.;OPOS=75315438;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:97:46:47:47:50:21:26:23:23:23:27:24:23 chr9 75545882 . G A 293.93 PASS AO=83;DP=195;FAO=83;FDP=195;FR=.;FRO=112;FSAF=33;FSAR=50;FSRF=46;FSRR=66;FWDB=0.0106462;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=259.909;QD=6.02931;RBI=0.0107744;REFB=-0.00843196;REVB=0.00165709;RO=112;SAF=33;SAR=50;SRF=46;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140422;STB=0.507841;TYPE=snp;VARB=0.0119468;OID=.;OPOS=75545882;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:195:112:112:83:83:50:33:46:66:50:33:46:66 chr9 75775235 . A G 261.17 PASS AO=63;DP=126;FAO=61;FDP=124;FR=.;FRO=63;FSAF=37;FSAR=24;FSRF=39;FSRR=24;FWDB=0.00423603;FXX=0.0158718;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.836;QD=8.42487;RBI=0.0047916;REFB=-0.0103336;REVB=-0.00223952;RO=62;SAF=39;SAR=24;SRF=39;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00954465;STB=0.506665;TYPE=snp;VARB=0.00941022;OID=.;OPOS=75775235;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:124:62:63:63:61:24:39:39:23:24:37:39:24 chr9 77376647 . T C 528.78 PASS AO=148;DP=342;FAO=148;FDP=341;FR=.;FRO=193;FSAF=69;FSAR=79;FSRF=88;FSRR=105;FWDB=0.0052071;FXX=0.00292389;HRUN=3;LEN=1;MLLD=242.788;QD=6.20265;RBI=0.0156994;REFB=-0.0116684;REVB=0.0148107;RO=191;SAF=69;SAR=79;SRF=88;SRR=103;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00559624;STB=0.505836;TYPE=snp;VARB=0.0150815;OID=.;OPOS=77376647;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:342:341:191:193:148:148:79:69:88:103:79:69:88:105 chr9 77377410 . C T 157.36 PASS AO=35;DP=86;FAO=40;FDP=90;FR=.;FRO=50;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=12;FSRR=38;FWDB=-0.0216874;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.281;QD=6.99393;RBI=0.0294271;REFB=0.00702167;REVB=-0.0198899;RO=50;SAF=16;SAR=19;SRF=12;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234644;STB=0.596109;TYPE=snp;VARB=-0.0047932;OID=.;OPOS=77377410;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:90:50:50:35:40:19:16:12:38:24:16:12:38 chr9 77391060 . T C 213.22 PASS AO=51;DP=104;FAO=51;FDP=106;FR=.;FRO=55;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=14;FSRR=41;FWDB=-0.0103859;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=207.45;QD=8.04589;RBI=0.0446784;REFB=-0.011437;REVB=-0.0434545;RO=53;SAF=22;SAR=29;SRF=14;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161383;STB=0.59594;TYPE=snp;VARB=0.0103264;OID=.;OPOS=77391060;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:106:53:55:51:51:29:22:14:39:29:22:14:41 chr9 77397519 . T C 258.88 PASS AO=93;DP=264;FAO=94;FDP=264;FR=.;FRO=170;FSAF=62;FSAR=32;FSRF=100;FSRR=70;FWDB=0.013964;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.1763;QD=3.92238;RBI=0.0145826;REFB=-0.00196384;REVB=-0.00420231;RO=170;SAF=61;SAR=32;SRF=100;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0825019;STB=0.54952;TYPE=snp;VARB=0.0033916;OID=.;OPOS=77397519;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:264:264:170:170:93:94:32:61:100:70:32:62:100:70 chr9 77415000 . T C 817.5 PASS AO=81;DP=82;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.031;QD=38.0233;RBI=0.0200153;REFB=0;REVB=0.0127314;RO=0;SAF=30;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40248e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000135711;OID=.;OPOS=77415000;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:82:86:0:0:81:86:51:30:0:0:55:31:0:0 chr9 77415284 . A C 2038.5 PASS AO=218;DP=221;FAO=217;FDP=217;FR=.;FRO=0;FSAF=111;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0106538;FXX=0.0136357;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.0708;QD=37.5761;RBI=0.016338;REFB=-0.0177438;REVB=0.0123865;RO=3;SAF=111;SAR=107;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0131685;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.91569e-05;OID=.;OPOS=77415284;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:221:217:3:0:218:217:107:111:0:3:106:111:0:0 chr9 77472604 . T C 952.19 PASS AO=100;DP=101;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0303483;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.453;QD=38.0876;RBI=0.0322331;REFB=0;REVB=0.0108606;RO=0;SAF=47;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.91867e-05;OID=.;OPOS=77472604;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:101:100:0:0:100:100:53:47:0:0:53:47:0:0 chr9 77563087 . C T 1562.89 PASS AO=162;DP=163;FAO=165;FDP=165;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=114;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134655;FXX=0.00602373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.071;QD=37.8883;RBI=0.0205123;REFB=0.00898229;REVB=0.0154737;RO=1;SAF=51;SAR=111;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00426795;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.62804e-05;OID=.;OPOS=77563087;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:163:165:1:0:162:165:111:51:0:1:114:51:0:0 chr9 78291861 . G T 187.93 PASS AO=46;DP=127;FAO=56;FDP=137;FR=.;FRO=81;FSAF=39;FSAR=17;FSRF=40;FSRR=41;FWDB=0.0281231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.692;QD=5.4871;RBI=0.0300405;REFB=-0.00308462;REVB=0.0105603;RO=78;SAF=29;SAR=17;SRF=39;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147345;STB=0.627415;TYPE=snp;VARB=0.00569573;OID=.;OPOS=78291861;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:137:78:81:46:56:17:29:39:39:17:39:40:41 chr9 78506187 . T C 82.53 PASS AO=22;DP=54;FAO=23;FDP=56;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=9;FWDB=-0.0713297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.847;QD=5.89518;RBI=0.0787932;REFB=-0.0245653;REVB=-0.0334729;RO=30;SAF=9;SAR=13;SRF=23;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.350232;STB=0.667538;TYPE=snp;VARB=0.0435997;OID=.;OPOS=78506187;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:54:56:30:33:22:23:13:9:23:7:13:10:24:9 chr9 78790153 . A G 72.88 PASS AO=17;DP=40;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0788211;FXX=0.0238039;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.0546;QD=7.11062;RBI=0.0882264;REFB=-0.00493471;REVB=-0.0396374;RO=23;SAF=7;SAR=10;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152993;STB=0.567493;TYPE=snp;VARB=0.00420767;OID=.;OPOS=78790153;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:40:41:23:23:17:18:10:7:13:10:10:8:13:10 chr9 78803512 . C T 376.27 PASS AO=84;DP=164;FAO=85;FDP=165;FR=.;FRO=80;FSAF=49;FSAR=36;FSRF=50;FSRR=30;FWDB=0.0186865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.472;QD=9.12166;RBI=0.0192317;REFB=0.00534929;REVB=-0.00454653;RO=80;SAF=49;SAR=35;SRF=50;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0383607;STB=0.524266;TYPE=snp;VARB=-0.00488098;OID=.;OPOS=78803512;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:165:80:80:84:85:35:49:50:30:36:49:50:30 chr9 78907125 . C T 204.21 PASS AO=48;DP=108;FAO=52;FDP=111;FR=.;FRO=59;FSAF=19;FSAR=33;FSRF=30;FSRR=29;FWDB=-0.00234436;FXX=0.0263135;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.38;QD=7.35908;RBI=0.0637073;REFB=0.0111195;REVB=0.0636642;RO=54;SAF=17;SAR=31;SRF=27;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14413;STB=0.578502;TYPE=snp;VARB=-0.0130937;OID=.;OPOS=78907125;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:111:54:59:48:52:31:17:27:27:33:19:30:29 chr9 78936358 . G A 385.45 PASS AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167607;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.855;QD=37.6045;RBI=0.0349755;REFB=0;REVB=0.030698;RO=0;SAF=29;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000184334;OID=.;OPOS=78936358;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:41:41:0:0:41:41:12:29:0:0:12:29:0:0 chr9 78936492 . A G 509.72 PASS AO=56;DP=60;FAO=57;FDP=60;FR=.;FRO=3;FSAF=41;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.104439;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.6126;QD=33.9816;RBI=0.104496;REFB=-0.110887;REVB=0.00346132;RO=2;SAF=40;SAR=16;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0169178;STB=0.542842;TYPE=snp;VARB=0.0214036;OID=.;OPOS=78936492;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:60:60:2:3:56:57:16:40:1:1:16:41:0:3 chr9 78937974 . C T 1408.69 PASS AO=149;DP=151;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0329728;FXX=0.00662208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.2673;QD=37.5651;RBI=0.0347463;REFB=-0.0339319;REVB=0.010959;RO=0;SAF=77;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.80287e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000349168;OID=.;OPOS=78937974;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:151:150:0:0:149:150:72:77:0:0:73:77:0:0 chr9 78938043 . G A 2116.56 PASS AO=224;DP=228;FAO=226;FDP=226;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=139;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0465171;FXX=0.0300416;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.78;QD=37.4613;RBI=0.0465666;REFB=-0.129658;REVB=-0.0021462;RO=2;SAF=85;SAR=139;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0110779;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00362057;OID=.;OPOS=78938043;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:228:226:2:0:224:226:139:85:2:0:139:87:0:0 chr9 78938186 . G C 1145.72 PASS AO=122;DP=124;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0188059;FXX=0.0161277;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.671;QD=37.5645;RBI=0.0253532;REFB=0.0129122;REVB=0.0170037;RO=1;SAF=59;SAR=63;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00798408;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.87448e-06;OID=.;OPOS=78938186;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:124:122:1:0:122:122:63:59:1:0:63:59:0:0 chr9 78942944 . G C 175.16 PASS AO=45;DP=101;FAO=45;FDP=101;FR=.;FRO=56;FSAF=32;FSAR=13;FSRF=37;FSRR=19;FWDB=0.00913932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.4689;QD=6.93719;RBI=0.0197582;REFB=-0.0265517;REVB=-0.0175174;RO=55;SAF=32;SAR=13;SRF=36;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0653856;STB=0.533041;TYPE=snp;VARB=0.0231089;OID=.;OPOS=78942944;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:55:56:45:45:13:32:36:19:13:32:37:19 chr9 78942956 . A G 1077.84 PASS AO=113;DP=116;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0379144;FXX=0.0258598;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.4081;QD=38.1538;RBI=0.0679114;REFB=0;REVB=0.0563423;RO=0;SAF=74;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000266595;OID=.;OPOS=78942956;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:116:113:0:0:113:113:39:74:0:0:39:74:0:0 chr9 78969059 . C A 663.68 PASS AO=69;DP=69;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0261952;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.993;QD=37.9244;RBI=0.0352137;REFB=0;REVB=0.0235333;RO=0;SAF=48;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00023039;OID=.;OPOS=78969059;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:69:70:0:0:69:70:21:48:0:0:22:48:0:0 chr9 79118661 . A G 496.58 PASS AO=96;DP=162;FAO=96;FDP=162;FR=.;FRO=66;FSAF=42;FSAR=54;FSRF=30;FSRR=36;FWDB=0.0021221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.322;QD=12.2613;RBI=0.0101903;REFB=-0.0220195;REVB=0.00996692;RO=66;SAF=42;SAR=54;SRF=30;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129769;STB=0.507041;TYPE=snp;VARB=0.0153077;OID=.;OPOS=79118661;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:162:66:66:96:96:54:42:30:36:54:42:30:36 chr9 79119752 . C T 193.92 PASS AO=45;DP=92;FAO=45;FDP=92;FR=.;FRO=47;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=15;FSRR=32;FWDB=0.0744406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.043;QD=8.43114;RBI=0.0746652;REFB=-0.0139536;REVB=-0.00578673;RO=47;SAF=17;SAR=28;SRF=15;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0583702;STB=0.532345;TYPE=snp;VARB=0.0168962;OID=.;OPOS=79119752;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:47:47:45:45:28:17:15:32:28:17:15:32 chr9 79120552 . C CAGT 79.64 PASS AO=18;DP=41;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.0642871;FXX=0.0487686;HRUN=1;LEN=3;MLLD=202.161;QD=8.16835;RBI=0.0650967;REFB=-0.0150034;REVB=0.010235;RO=21;SAF=7;SAR=11;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0389249;STB=0.52223;TYPE=ins;VARB=0.0179334;OID=.;OPOS=79120553;OREF=-;OALT=AGT;OMAPALT=CAGT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:18:41:18:39:21:7:11:9:12:79:21:7:11:9:12 chr9 79121085 . G T 3610.63 PASS AO=391;DP=400;FAO=392;FDP=400;FR=.;FRO=8;FSAF=173;FSAR=219;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0.0445462;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.9594;QD=36.1063;RBI=0.0446222;REFB=0.0295361;REVB=0.00260365;RO=9;SAF=172;SAR=219;SRF=1;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0143437;STB=0.508968;TYPE=snp;VARB=-0.000295771;OID=.;OPOS=79121085;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:400:400:9:8:391:392:219:172:1:8:219:173:0:8 chr9 79121783 . G A 186.53 PASS AO=56;DP=141;FAO=56;FDP=141;FR=.;FRO=85;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=27;FSRR=58;FWDB=-0.00260504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.638;QD=5.29173;RBI=0.0128929;REFB=-0.0103901;REVB=-0.012627;RO=84;SAF=29;SAR=27;SRF=26;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221245;STB=0.619773;TYPE=snp;VARB=0.00723961;OID=.;OPOS=79121783;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:84:85:56:56:27:29:26:58:27:29:27:58 chr9 79121906 . C T 873.02 PASS AO=92;DP=93;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164069;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.85;QD=37.9575;RBI=0.016543;REFB=0;REVB=0.00211742;RO=0;SAF=46;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.99887e-05;OID=.;OPOS=79121906;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:93:92:0:0:92:92:46:46:0:0:46:46:0:0 chr9 79186750 . G T 76 PASS AO=10;DP=12;FAO=10;FDP=12;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=0;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0417536;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=137.558;QD=25.3327;RBI=0.0417536;REFB=-0.0518987;REVB=0;RO=1;SAF=10;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00990826;OID=.;OPOS=79186750;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:12:12:1:2:10:10:0:10:1:0:0:10:2:0 chr9 79186765 . C G 84.57 PASS AO=9;DP=10;FAO=10;FDP=11;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0237928;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.392;QD=30.7525;RBI=0.0237928;REFB=-0.0548318;REVB=0;RO=1;SAF=9;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000723486;OID=.;OPOS=79186765;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:10:11:1:1:9:10:0:9:1:0:0:10:1:0 chr9 79186781 . T C 70.18 PASS AO=9;DP=12;FAO=10;FDP=13;FR=.;FRO=3;FSAF=10;FSAR=0;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.00567922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.1174;QD=21.5953;RBI=0.00567922;REFB=-0.0451819;REVB=0;RO=3;SAF=9;SAR=0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0166692;OID=.;OPOS=79186781;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:12:13:3:3:9:10:0:9:3:0:0:10:3:0 chr9 79186820 . A C 52.3 PASS AO=9;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.00528335;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3203;QD=13.9458;RBI=0.0559667;REFB=-0.0297852;REVB=0.0557167;RO=6;SAF=8;SAR=1;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243413;STB=0.636127;TYPE=snp;VARB=0.0374193;OID=.;OPOS=79186820;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:15:15:6:6:9:9:1:8:6:0:1:8:6:0 chr9 79326058 . G C 460.5 PASS AO=101;DP=190;FAO=102;FDP=198;FR=.;FRO=96;FSAF=61;FSAR=41;FSRF=49;FSRR=47;FWDB=-0.00594417;FXX=0.0526291;HRUN=6;LEN=1;MLLD=94.5269;QD=9.30298;RBI=0.00691545;REFB=-0.00566952;REVB=-0.00353415;RO=87;SAF=60;SAR=41;SRF=45;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0664818;STB=0.543421;TYPE=snp;VARB=0.00633933;OID=.;OPOS=79326058;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:198:87:96:101:102:41:60:45:42:41:61:49:47 chr9 79471995 . T C 239.38 PASS AO=45;DP=75;FAO=45;FDP=75;FR=.;FRO=30;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=-0.0168436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.397;QD=12.767;RBI=0.0168813;REFB=-0.0245666;REVB=0.00112731;RO=30;SAF=27;SAR=18;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.09671e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0132618;OID=.;OPOS=79471995;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:30:30:45:45:18:27:18:12:18:27:18:12 chr9 79520846 . GT G 461.76 PASS AO=62;DP=99;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.194754;FXX=0.0119033;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.3047;QD=22.2536;RBI=0.195621;REFB=-0.017175;REVB=0.0183993;RO=13;SAF=23;SAR=39;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13326;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00881516;OID=.;OPOS=79520847;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:62:82:83:83:0:37:46:0:0:35:13:23:39:10:3 chr9 80049298 . C T 280.27 PASS AO=78;DP=186;FAO=78;FDP=182;FR=.;FRO=104;FSAF=50;FSAR=28;FSRF=60;FSRR=44;FWDB=0.0104616;FXX=0.0215042;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.558;QD=6.15981;RBI=0.0242043;REFB=-0.00663308;REVB=0.0218267;RO=102;SAF=50;SAR=28;SRF=58;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.077821;STB=0.538912;TYPE=snp;VARB=0.00913194;OID=.;OPOS=80049298;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:182:102:104:78:78:28:50:58:44:28:50:60:44 chr9 80250143 . C T 508.76 PASS AO=53;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0497262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.996;QD=37.6861;RBI=0.063546;REFB=0;REVB=0.0395651;RO=0;SAF=6;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.55111e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000196844;OID=.;OPOS=80250143;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:53:54:0:0:53:54:47:6:0:0:48:6:0:0 chr9 80335288 . C T 602.62 PASS AO=66;DP=68;FAO=66;FDP=68;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=27;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00646595;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.964;QD=35.4485;RBI=0.0148958;REFB=-0.0158037;REVB=-0.0134193;RO=2;SAF=39;SAR=27;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0236133;STB=0.512496;TYPE=snp;VARB=0.00144309;OID=.;OPOS=80335288;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:68:68:2:2:66:66:27:39:2:0:27:39:2:0 chr9 80912115 . G C 31.58 PASS AO=6;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=-0.0318507;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.731;QD=9.71823;RBI=0.0325952;REFB=-0.0110596;REVB=-0.00692682;RO=7;SAF=5;SAR=1;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0392853;STB=0.523732;TYPE=snp;VARB=0.00725835;OID=.;OPOS=80912115;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:13:13:7:7:6:6:1:5:6:1:1:5:6:1 chr9 80919756 . T G 1730.45 PASS AO=179;DP=179;FAO=181;FDP=181;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=122;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.014213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.022;QD=38.2419;RBI=0.0174315;REFB=0;REVB=-0.010092;RO=0;SAF=59;SAR=120;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.7666e-05;OID=.;OPOS=80919756;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:82:179:181:0:0:179:181:120:59:0:0:122:59:0:0 chr9 80943928 . A C 279.8 PASS AO=61;DP=116;FAO=61;FDP=116;FR=.;FRO=55;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=14;FSRR=41;FWDB=-0.0204364;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.801;QD=9.64825;RBI=0.0217366;REFB=-0.00666954;REVB=-0.00740502;RO=55;SAF=33;SAR=28;SRF=14;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.244323;STB=0.633691;TYPE=snp;VARB=0.00516284;OID=.;OPOS=80943928;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:55:55:61:61:28:33:14:41:28:33:14:41 chr9 82187750 . A G 136.4 PASS AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00714666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.594;QD=36.3733;RBI=0.0121023;REFB=0;REVB=0.00976678;RO=0;SAF=9;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000117586;OID=.;OPOS=82187750;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:15:0:0:15:15:6:9:0:0:6:9:0:0 chr9 82341457 . GAAAA G 50 PASS AO=103;DP=272;LEN=4;RO=169;SAF=63;SAR=159;SRF=29;SRR=21;TYPE=del;FR=.;OID=.;OPOS=82341458;OREF=AAAA;OALT=-;OMAPALT=G GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR 0/1:99:272:169:103:159:63:29:21 chr9 84267147 . T C 296.9 PASS AO=74;DP=176;FAO=80;FDP=182;FR=.;FRO=102;FSAF=41;FSAR=39;FSRF=49;FSRR=53;FWDB=0.0298763;FXX=0.00546418;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2641;QD=6.52524;RBI=0.0298777;REFB=-0.0396762;REVB=0.00029004;RO=101;SAF=36;SAR=38;SRF=49;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00138181;STB=0.517985;TYPE=snp;VARB=0.0489398;OID=.;OPOS=84267147;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:182:101:102:74:80:38:36:49:52:39:41:49:53 chr9 84268878 . A G 171.98 PASS AO=41;DP=87;FAO=41;FDP=86;FR=.;FRO=45;FSAF=29;FSAR=12;FSRF=38;FSRR=7;FWDB=0.00580234;FXX=0.0114929;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.519;QD=7.99928;RBI=0.00844662;REFB=-0.00344721;REVB=0.00613826;RO=38;SAF=29;SAR=12;SRF=35;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254216;STB=0.593317;TYPE=snp;VARB=0.00365565;OID=.;OPOS=84268878;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:86:38:45:41:41:12:29:35:3:12:29:38:7 chr9 84528567 . CA C 450.25 PASS AO=168;DP=350;FAO=173;FDP=329;FR=.;FRO=156;FSAF=61;FSAR=112;FSRF=50;FSRR=106;FWDB=-0.158759;FXX=0.0120117;HRUN=4;LEN=1;MLLD=16.1206;QD=5.47419;RBI=0.180255;REFB=-0.0793373;REVB=-0.0853666;RO=142;SAF=58;SAR=110;SRF=42;SRR=100;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0468246;STB=0.516827;TYPE=del;VARB=0.0546324;OID=.;OPOS=84528568;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:168:331:173:329:156:61:112:50:106:99:142:58:110:42:100 chr9 84530366 . A G 264.19 PASS AO=68;DP=150;FAO=68;FDP=150;FR=.;FRO=82;FSAF=25;FSAR=43;FSRF=33;FSRR=49;FWDB=0.038074;FXX=0.00662208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.008;QD=7.04495;RBI=0.0508638;REFB=-0.00450976;REVB=-0.0337268;RO=81;SAF=25;SAR=43;SRF=33;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0412689;STB=0.520228;TYPE=snp;VARB=0.00272208;OID=.;OPOS=84530366;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:150:81:82:68:68:43:25:33:48:43:25:33:49 chr9 84530412 . A C 285.95 PASS AO=73;DP=158;FAO=74;FDP=160;FR=.;FRO=86;FSAF=30;FSAR=44;FSRF=31;FSRR=55;FWDB=-0.0597305;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.3439;QD=7.14883;RBI=0.0649774;REFB=-0.0143282;REVB=0.0255799;RO=84;SAF=29;SAR=44;SRF=29;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0531245;STB=0.525285;TYPE=snp;VARB=0.0182191;OID=.;OPOS=84530412;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:160:84:86:73:74:44:29:29:55:44:30:31:55 chr9 84607758 . T A 394.27 PASS AO=86;DP=162;FAO=86;FDP=161;FR=.;FRO=75;FSAF=52;FSAR=34;FSRF=43;FSRR=32;FWDB=-0.0426969;FXX=0.00617246;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.386;QD=9.79563;RBI=0.0436515;REFB=-0.0346907;REVB=0.00907931;RO=75;SAF=52;SAR=34;SRF=43;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0276877;STB=0.515157;TYPE=snp;VARB=0.0266537;OID=.;OPOS=84607758;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:161:75:75:86:86:34:52:43:32:34:52:43:32 chr9 84609057 . C T 275.26 PASS AO=60;DP=114;FAO=60;FDP=114;FR=.;FRO=54;FSAF=36;FSAR=24;FSRF=30;FSRR=24;FWDB=-0.00174403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.242;QD=9.65832;RBI=0.0397869;REFB=-0.00284622;REVB=-0.0397486;RO=53;SAF=36;SAR=24;SRF=29;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0464531;STB=0.521732;TYPE=snp;VARB=0.00207668;OID=.;OPOS=84609057;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:53:54:60:60:24:36:29:24:24:36:30:24 chr9 84609913 . C T 92.2 PASS AO=26;DP=65;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=5;FSAR=21;FSRF=11;FSRR=28;FWDB=0.00714882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.526;QD=5.67357;RBI=0.0169007;REFB=-0.000788254;REVB=-0.0153143;RO=39;SAF=5;SAR=21;SRF=11;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135484;STB=0.578248;TYPE=snp;VARB=0.001183;OID=.;OPOS=84609913;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:65:65:39:39:26:26:21:5:11:28:21:5:11:28 chr9 84676599 . C T 367.81 PASS AO=100;DP=229;FAO=101;FDP=231;FR=.;FRO=130;FSAF=45;FSAR=56;FSRF=49;FSRR=81;FWDB=-0.00122884;FXX=0.00431016;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.88;QD=6.36896;RBI=0.0067064;REFB=-0.00744908;REVB=0.00659286;RO=121;SAF=45;SAR=55;SRF=48;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.053547;STB=0.53941;TYPE=snp;VARB=0.00815705;OID=.;OPOS=84676599;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:229:231:121:130:100:101:55:45:48:73:56:45:49:81 chr9 85627408 . G A 316.56 PASS AO=95;DP=244;FAO=96;FDP=238;FR=.;FRO=142;FSAF=39;FSAR=57;FSRF=51;FSRR=91;FWDB=-0.0201026;FXX=0.0517908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.323;QD=5.32041;RBI=0.0237052;REFB=-0.00308541;REVB=0.0125628;RO=135;SAF=38;SAR=57;SRF=48;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0491883;STB=0.529438;TYPE=snp;VARB=0.00621116;OID=.;OPOS=85627408;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:238:135:142:95:96:57:38:48:87:57:39:51:91 chr9 86241489 . A G 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0027117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.094;QD=35.0875;RBI=0.0027117;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=7;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000100813;OID=.;OPOS=86241489;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:0:7:0:0:0:7:0:0 chr9 86278817 . C A 664.08 PASS AO=140;DP=256;FAO=140;FDP=254;FR=.;FRO=114;FSAF=84;FSAR=56;FSRF=58;FSRR=56;FWDB=0.00293162;FXX=0.00781219;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.075;QD=10.4579;RBI=0.00303149;REFB=-0.0196823;REVB=-0.000771725;RO=116;SAF=83;SAR=57;SRF=58;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0787055;STB=0.541929;TYPE=snp;VARB=0.0175584;OID=.;OPOS=86278817;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:256:254:116:114:140:140:57:83:58:58:56:84:58:56 chr9 86284178 . C A 1942.85 PASS AO=202;DP=203;FAO=203;FDP=203;FR=.;FRO=0;FSAF=114;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00272626;FXX=0.00490172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.127;QD=38.2827;RBI=0.03714;REFB=0;REVB=0.0370398;RO=0;SAF=113;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.38251e-06;OID=.;OPOS=86284178;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:92:203:203:0:0:202:203:89:113:0:0:89:114:0:0 chr9 86327898 . C T 1137.81 PASS AO=112;DP=113;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0256636;FXX=0.0165276;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.189;QD=38.2459;RBI=0.0365771;REFB=0;REVB=0.0260627;RO=0;SAF=33;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.02371e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.6871e-05;OID=.;OPOS=86327898;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:113:119:0:0:112:119:79:33:0:0:82:37:0:0 chr9 86468715 . A T 1262.26 PASS AO=133;DP=135;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0327984;FXX=0.00729874;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.945;QD=37.1252;RBI=0.0351727;REFB=0.0226326;REVB=0.0127037;RO=2;SAF=50;SAR=83;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0186297;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0003557;OID=.;OPOS=86468715;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:135:136:2:0:133:136:83:50:2:0:85:51:0:0 chr9 86504005 . C T 268.85 PASS AO=74;DP=161;FAO=71;FDP=159;FR=.;FRO=88;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=47;FSRR=41;FWDB=-0.0061612;FXX=0.0185174;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.5131;QD=6.76358;RBI=0.0107213;REFB=-0.025268;REVB=-0.00877417;RO=87;SAF=40;SAR=34;SRF=46;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0115575;STB=0.50719;TYPE=snp;VARB=0.0286941;OID=.;OPOS=86504005;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:159:87:88:74:71:34:40:46:41:34:37:47:41 chr9 86618233 . C A,T 789.34 PASS AO=63,14;DP=78;FAO=75,12;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=34,2;FSAR=41,10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0261763,0.0301766;FXX=0.0112347;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=52.0931,30.8055;QD=35.8792;RBI=0.0923054,0.0375626;REFB=-0.0537548,-0.120431;REVB=0.088516,0.0223677;RO=1;SAF=24,4;SAR=39,10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0192676,-0.100543;STB=0.507244,0.599814;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00242325,0.0399017;OID=.,.;OPOS=86618233,86618233;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:7:78:88:1:1:63,14:75,12:39,10:24,4:1:0:41,10:34,2:1:0 chr9 86900369 . T A 437.5 PASS AO=103;DP=216;FAO=105;FDP=217;FR=.;FRO=112;FSAF=62;FSAR=43;FSRF=56;FSRR=56;FWDB=0.0120195;FXX=0.0136357;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.53;QD=8.06447;RBI=0.0137657;REFB=-0.0122472;REVB=0.00671014;RO=112;SAF=63;SAR=40;SRF=57;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0995107;STB=0.54744;TYPE=snp;VARB=0.0118009;OID=.;OPOS=86900369;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:216:217:112:112:103:105:40:63:57:55:43:62:56:56 chr9 86917301 . T C 121.94 PASS AO=27;DP=54;FAO=27;FDP=54;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=0.011243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.96;QD=9.03289;RBI=0.0116476;REFB=-0.0304769;REVB=-0.00304312;RO=27;SAF=13;SAR=14;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.099885;STB=0.555821;TYPE=snp;VARB=0.023808;OID=.;OPOS=86917301;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:27:27:27:27:14:13:10:17:14:13:10:17 chr9 86920236 . T C 248.17 PASS AO=80;DP=209;FAO=80;FDP=209;FR=.;FRO=129;FSAF=40;FSAR=40;FSRF=55;FSRR=74;FWDB=-0.0245439;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.807;QD=4.74966;RBI=0.0283259;REFB=-0.00632532;REVB=-0.0141404;RO=129;SAF=40;SAR=40;SRF=55;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0805985;STB=0.545443;TYPE=snp;VARB=0.00987894;OID=.;OPOS=86920236;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:209:129:129:80:80:40:40:55:74:40:40:55:74 chr9 87488597 . C T 362 PASS AO=70;DP=120;FAO=70;FDP=120;FR=.;FRO=50;FSAF=20;FSAR=50;FSRF=30;FSRR=20;FWDB=-0.00773892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.417;QD=12.0666;RBI=0.00781606;REFB=-0.0357935;REVB=0.00109541;RO=49;SAF=20;SAR=50;SRF=30;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.264099;STB=0.640983;TYPE=snp;VARB=0.0155428;OID=.;OPOS=87488597;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:49:50:70:70:50:20:30:19:50:20:30:20 chr9 87570230 . AG A 226.23 PASS AO=23;DP=38;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.280541;FXX=0.0270197;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.6934;QD=25.1365;RBI=0.399429;REFB=0;REVB=0.284324;RO=9;SAF=11;SAR=12;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0.303743;SSSB=-0.039625;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.030069;OID=.;OPOS=87570231;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:23:37:36:36:0:20:16:0:0:21:9:11:12:5:4 chr9 88897377 . C A 18.62 PASS AO=4;DP=12;FAO=4;FDP=12;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.00920394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.258;QD=6.20777;RBI=0.0197664;REFB=0.00356488;REVB=0.0174928;RO=8;SAF=1;SAR=3;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149602;STB=0.599466;TYPE=snp;VARB=-0.00912574;OID=.;OPOS=88897377;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:12:12:8:8:4:4:3:1:3:5:3:1:3:5 chr9 89772284 . A G 69.08 PASS AO=16;DP=35;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=3;FWDB=-0.0209953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.469;QD=7.8953;RBI=0.0270187;REFB=-0.00376774;REVB=0.017006;RO=19;SAF=11;SAR=5;SRF=16;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186261;STB=0.605264;TYPE=snp;VARB=0.0117278;OID=.;OPOS=89772284;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:35:35:19:19:16:16:5:11:16:3:5:11:16:3 chr9 90322023 . G A 826.1 PASS AO=81;DP=83;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0139244;FXX=0.0227247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.067;QD=38.4231;RBI=0.0354701;REFB=0;REVB=0.0326227;RO=0;SAF=56;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.84457e-05;OID=.;OPOS=90322023;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:83:86:0:0:81:86:25:56:0:0:29:57:0:0 chr9 90343780 . A C 1099.9 PASS AO=114;DP=114;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0452468;FXX=0.00861995;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.6049;QD=38.2573;RBI=0.0452603;REFB=0;REVB=0.0011055;RO=0;SAF=32;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000145619;OID=.;OPOS=90343780;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:114:115:0:0:114:115:82:32:0:0:83:32:0:0 chr9 90388370 . G A 262.96 PASS AO=69;DP=155;FAO=70;FDP=157;FR=.;FRO=87;FSAF=47;FSAR=23;FSRF=56;FSRR=31;FWDB=0.0205099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.4123;QD=6.69961;RBI=0.0284976;REFB=-0.0124067;REVB=-0.0197853;RO=86;SAF=46;SAR=23;SRF=56;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0172529;STB=0.517215;TYPE=snp;VARB=0.0253698;OID=.;OPOS=90388370;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:157:86:87:69:70:23:46:56:30:23:47:56:31 chr9 90388539 . T A 1625.41 PASS AO=142;DP=198;FAO=185;FDP=187;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=92;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0261959;FXX=0.0157886;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.546;QD=34.7682;RBI=0.0267056;REFB=-0.013054;REVB=0.005193;RO=8;SAF=57;SAR=85;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0622003;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000902104;OID=.;OPOS=90388539;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:187:187:8:0:142:185:85:57:8:0:93:92:0:0 chr9 90388540 . C A 19.12 PASS AO=30;DP=188;FAO=32;FDP=190;FR=.;FRO=158;FSAF=29;FSAR=3;FSRF=67;FSRR=91;FWDB=0.0187827;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.8644;QD=0.402477;RBI=0.0191458;REFB=-0.00994884;REVB=-0.00371079;RO=145;SAF=29;SAR=1;SRF=54;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.735093;STB=0.904191;TYPE=snp;VARB=0.161246;OID=.;OPOS=90388540;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:188:190:145:158:30:32:1:29:54:91:3:29:67:91 chr9 90396135 . G A 189.57 PASS AO=41;DP=82;FAO=41;FDP=79;FR=.;FRO=38;FSAF=34;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=-0.0287343;FXX=0.0365809;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.4647;QD=9.59866;RBI=0.0403589;REFB=-0.00555699;REVB=-0.0283404;RO=36;SAF=34;SAR=7;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.400271;STB=0.737893;TYPE=snp;VARB=0.00818036;OID=.;OPOS=90396135;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:79:36:38:41:41:7:34:16:20:7:34:16:22 chr9 90500193 . C G 354.26 PASS AO=90;DP=192;FAO=90;FDP=193;FR=.;FRO=103;FSAF=33;FSAR=57;FSRF=40;FSRR=63;FWDB=0.0302371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.885;QD=7.34225;RBI=0.0302638;REFB=-0.00587387;REVB=-0.00127054;RO=101;SAF=33;SAR=57;SRF=39;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0199249;STB=0.512373;TYPE=snp;VARB=0.0108105;OID=.;OPOS=90500193;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:193:101:103:90:90:57:33:39:62:57:33:40:63 chr9 90500224 . C T 246.06 PASS AO=70;DP=169;FAO=70;FDP=167;FR=.;FRO=97;FSAF=26;FSAR=44;FSRF=35;FSRR=62;FWDB=0.0279348;FXX=0.0118336;HRUN=4;LEN=1;MLLD=108.598;QD=5.89373;RBI=0.0358626;REFB=-0.0175799;REVB=-0.0224895;RO=92;SAF=26;SAR=44;SRF=31;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0379976;STB=0.506616;TYPE=snp;VARB=0.0144751;OID=.;OPOS=90500224;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:167:92:97:70:70:44:26:31:61:44:26:35:62 chr9 90500405 . A C 141.71 PASS AO=39;DP=109;FAO=44;FDP=115;FR=.;FRO=71;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=42;FSRR=29;FWDB=0.0182427;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.617;QD=4.92915;RBI=0.0209351;REFB=-0.0147737;REVB=-0.0102705;RO=70;SAF=24;SAR=15;SRF=41;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0347094;STB=0.529398;TYPE=snp;VARB=0.0253486;OID=.;OPOS=90500405;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:115:70:71:39:44:15:24:41:29:16:28:42:29 chr9 90500627 . G A 55.65 PASS AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.0139795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.598;QD=6.54686;RBI=0.015378;REFB=-0.00895685;REVB=0.00640752;RO=19;SAF=6;SAR=8;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00761006;STB=0.517217;TYPE=snp;VARB=0.0152036;OID=.;OPOS=90500627;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:33:34:19:20:14:14:8:6:8:11:8:6:8:12 chr9 90500909 . C T 67.3 PASS AO=12;DP=21;FAO=12;FDP=21;FR=.;FRO=9;FSAF=0;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=0;FXX=0.0454339;HRUN=4;LEN=1;MLLD=125.315;QD=12.8199;RBI=0.0184566;REFB=-0.0718058;REVB=-0.0184566;RO=9;SAF=0;SAR=12;SRF=0;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00637881;OID=.;OPOS=90500909;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:21:21:9:9:12:12:12:0:0:9:12:0:0:9 chr9 90501448 . C A 202.49 PASS AO=58;DP=157;FAO=63;FDP=162;FR=.;FRO=99;FSAF=35;FSAR=28;FSRF=43;FSRR=56;FWDB=0.00402297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.549;QD=4.99963;RBI=0.0041995;REFB=-0.0104512;REVB=-0.00120478;RO=94;SAF=30;SAR=28;SRF=40;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0999301;STB=0.573747;TYPE=snp;VARB=0.0126829;OID=.;OPOS=90501448;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:162:94:99:58:63:28:30:40:54:28:35:43:56 chr9 90501500 . G A 188.99 PASS AO=75;DP=226;FAO=75;FDP=227;FR=.;FRO=152;FSAF=61;FSAR=14;FSRF=90;FSRR=62;FWDB=-0.0158222;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.004;QD=3.33028;RBI=0.0436134;REFB=-0.00777825;REVB=-0.0406422;RO=151;SAF=61;SAR=14;SRF=90;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.315484;STB=0.686759;TYPE=snp;VARB=0.0197829;OID=.;OPOS=90501500;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:226:227:151:152:75:75:14:61:90:61:14:61:90:62 chr9 90501514 . C G 191.36 PASS AO=83;DP=262;FAO=82;FDP=262;FR=.;FRO=180;FSAF=70;FSAR=12;FSRF=94;FSRR=86;FWDB=0.0158913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.1663;QD=2.92146;RBI=0.0351323;REFB=-0.00329167;REVB=-0.0313328;RO=174;SAF=70;SAR=13;SRF=92;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.443171;STB=0.776996;TYPE=snp;VARB=0.00827732;OID=.;OPOS=90501514;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:262:262:174:180:83:82:13:70:92:82:12:70:94:86 chr9 90501609 . C T 463.39 PASS AO=144;DP=361;FAO=145;FDP=362;FR=.;FRO=217;FSAF=80;FSAR=65;FSRF=104;FSRR=113;FWDB=-0.00675388;FXX=0.00275475;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.685;QD=5.12029;RBI=0.0278582;REFB=-0.00571675;REVB=0.0270271;RO=215;SAF=80;SAR=64;SRF=102;SRR=113;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0869682;STB=0.543505;TYPE=snp;VARB=0.00893919;OID=.;OPOS=90501609;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:361:362:215:217:144:145:64:80:102:113:65:80:104:113 chr9 90502458 . T A 80.29 PASS AO=19;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.0148409;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.712;QD=8.45206;RBI=0.0332841;REFB=-0.0542413;REVB=-0.0297922;RO=19;SAF=10;SAR=9;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0467664;STB=0.502955;TYPE=snp;VARB=0.0360519;OID=.;OPOS=90502458;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:38:38:19:20:19:18:9:10:11:8:8:10:11:9 chr9 90502819 . T C 141.09 PASS AO=39;DP=96;FAO=40;FDP=97;FR=.;FRO=57;FSAF=29;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=35;FWDB=-0.00632873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.263;QD=5.81816;RBI=0.0265132;REFB=-0.0277684;REVB=-0.0257468;RO=57;SAF=29;SAR=10;SRF=22;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.38547;STB=0.703854;TYPE=snp;VARB=0.0301912;OID=.;OPOS=90502819;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:97:57:57:39:40:10:29:22:35:11:29:22:35 chr9 90503007 . A G 144.09 PASS AO=34;DP=78;FAO=37;FDP=81;FR=.;FRO=44;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=0.00501267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.3098;QD=7.11572;RBI=0.0397129;REFB=-0.0169025;REVB=-0.0393953;RO=43;SAF=19;SAR=15;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138459;STB=0.585611;TYPE=snp;VARB=0.01969;OID=.;OPOS=90503007;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:81:43:44:34:37:15:19:18:25:16:21:18:26 chr9 90503451 . G A 430.91 PASS AO=68;DP=95;FAO=68;FDP=95;FR=.;FRO=27;FSAF=27;FSAR=41;FSRF=6;FSRR=21;FWDB=0.0101519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2801;QD=18.1437;RBI=0.0330524;REFB=0.00240385;REVB=0.0314547;RO=27;SAF=27;SAR=41;SRF=6;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0988322;STB=0.553008;TYPE=snp;VARB=-0.00101292;OID=.;OPOS=90503451;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:95:95:27:27:68:68:41:27:6:21:41:27:6:21 chr9 90588903 . C T 769.75 PASS AO=84;DP=88;FAO=85;FDP=87;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=65;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0573546;FXX=0.0113623;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0828;QD=35.3908;RBI=0.0608365;REFB=-0.0649855;REVB=0.0202864;RO=2;SAF=19;SAR=65;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0472764;STB=0.523804;TYPE=snp;VARB=0.00744062;OID=.;OPOS=90588903;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:88:87:2:2:84:85:65:19:2:0:65:20:2:0 chr9 90654517 . C G 366.41 PASS AO=105;DP=250;FAO=105;FDP=249;FR=.;FRO=144;FSAF=51;FSAR=54;FSRF=92;FSRR=52;FWDB=-0.0200892;FXX=0.00399984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.3863;QD=5.88617;RBI=0.0385843;REFB=-0.0261688;REVB=-0.032942;RO=143;SAF=51;SAR=54;SRF=92;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162777;STB=0.588192;TYPE=snp;VARB=0.037673;OID=.;OPOS=90654517;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:250:249:143:144:105:105:54:51:92:51:54:51:92:52 chr9 90746246 . C G 373.24 PASS AO=84;DP=163;FAO=84;FDP=163;FR=.;FRO=79;FSAF=48;FSAR=36;FSRF=38;FSRR=41;FWDB=0.0229932;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.227;QD=9.15921;RBI=0.0231119;REFB=0.00303444;REVB=-0.0023395;RO=78;SAF=48;SAR=36;SRF=38;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.074553;STB=0.544159;TYPE=snp;VARB=-0.00278158;OID=.;OPOS=90746246;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:163:78:79:84:84:36:48:38:40:36:48:38:41 chr9 91262343 . A ATGG 76.59 PASS AO=17;DP=73;FAO=26;FDP=72;FR=.;FRO=46;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=29;FSRR=17;FWDB=0.0172806;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=3;MLLD=170.33;QD=4.25493;RBI=0.0658519;REFB=-0.0242027;REVB=0.0635441;RO=46;SAF=10;SAR=7;SRF=29;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.053058;STB=0.606686;TYPE=ins;VARB=0.0481661;OID=.;OPOS=91262344;OREF=-;OALT=TGG;OMAPALT=ATGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:17:73:26:72:46:12:14:29:17:76:46:10:7:29:17 chr9 91262493 . A C 103.98 PASS AO=41;DP=123;FAO=40;FDP=123;FR=.;FRO=83;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=58;FWDB=-0.0241044;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.503;QD=3.38133;RBI=0.024347;REFB=-0.00625512;REVB=-0.00342804;RO=78;SAF=24;SAR=17;SRF=21;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.349914;STB=0.693661;TYPE=snp;VARB=0.036063;OID=.;OPOS=91262493;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:78:83:41:40:17:24:21:57:16:24:25:58 chr9 91262494 . G T 115.08 PASS AO=42;DP=122;FAO=42;FDP=124;FR=.;FRO=82;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=57;FWDB=-0.01159;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.531;QD=3.71233;RBI=0.0129994;REFB=-0.0305576;REVB=-0.00588708;RO=80;SAF=25;SAR=17;SRF=23;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.340543;STB=0.685103;TYPE=snp;VARB=0.0225444;OID=.;OPOS=91262494;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:124:80:82:42:42:17:25:23:57:17:25:25:57 chr9 91619274 . G A 479.3 PASS AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300278;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.824;QD=37.5918;RBI=0.0713385;REFB=0;REVB=0.064711;RO=0;SAF=34;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000567005;OID=.;OPOS=91619274;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:52:51:0:0:51:51:17:34:0:0:17:34:0:0 chr9 91619784 . C T 473.97 PASS AO=108;DP=212;FAO=108;FDP=211;FR=.;FRO=103;FSAF=36;FSAR=72;FSRF=55;FSRR=48;FWDB=0.0278843;FXX=0.00471676;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3906;QD=8.98518;RBI=0.0338691;REFB=-0.0142883;REVB=0.0192245;RO=99;SAF=36;SAR=72;SRF=54;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193307;STB=0.602629;TYPE=snp;VARB=0.0151183;OID=.;OPOS=91619784;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:211:99:103:108:108:72:36:54:45:72:36:55:48 chr9 91652414 . A T 248.58 PASS AO=46;DP=102;FAO=56;FDP=110;FR=.;FRO=54;FSAF=33;FSAR=23;FSRF=26;FSRR=28;FWDB=0.030936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.279;QD=9.03929;RBI=0.0309361;REFB=0.00130806;REVB=4.5997e-05;RO=54;SAF=23;SAR=23;SRF=26;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0179145;STB=0.553599;TYPE=snp;VARB=-0.00081477;OID=.;OPOS=91652414;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:110:54:54:46:56:23:23:26:28:23:33:26:28 chr9 91656963 . T C 893.24 PASS AO=97;DP=104;FAO=97;FDP=99;FR=.;FRO=2;FSAF=55;FSAR=42;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0291009;FXX=0.0480723;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.858;QD=36.0904;RBI=0.0291298;REFB=0.0534381;REVB=0.0012977;RO=2;SAF=55;SAR=42;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0169324;STB=0.508927;TYPE=snp;VARB=3.69484e-05;OID=.;OPOS=91656963;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:104:99:2:2:97:97:42:55:2:0:42:55:2:0 chr9 92003679 . C T 262.98 PASS AO=52;DP=92;FAO=52;FDP=91;FR=.;FRO=39;FSAF=33;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=0.0297073;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.1717;QD=11.5597;RBI=0.0300451;REFB=-0.0182948;REVB=0.00449298;RO=39;SAF=33;SAR=19;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139797;STB=0.576641;TYPE=snp;VARB=0.0142285;OID=.;OPOS=92003679;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:91:39:39:52:52:19:33:18:21:19:33:18:21 chr9 94398581 . T C 208.45 PASS AO=37;DP=60;FAO=37;FDP=60;FR=.;FRO=23;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=4;FSRR=19;FWDB=0.0340182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.396;QD=13.8966;RBI=0.0392396;REFB=-0.0214533;REVB=-0.019558;RO=23;SAF=18;SAR=19;SRF=4;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221601;STB=0.620629;TYPE=snp;VARB=0.00687839;OID=.;OPOS=94398581;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:60:60:23:23:37:37:19:18:4:19:19:18:4:19 chr9 94456643 . G C 940.75 PASS AO=98;DP=100;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00660349;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.727;QD=38.0101;RBI=0.0195488;REFB=-0.0664798;REVB=0.0183997;RO=2;SAF=41;SAR=57;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0163503;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000272736;OID=.;OPOS=94456643;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:100:99:2:0:98:99:57:41:0:2:58:41:0:0 chr9 94456705 . T A 730.58 PASS AO=45;DP=100;FAO=81;FDP=81;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=41;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0545693;FXX=0.0689576;HRUN=3;LEN=1;MLLD=26.1048;QD=36.0782;RBI=0.0636386;REFB=0;REVB=-0.0327424;RO=0;SAF=17;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0151449;OID=.;OPOS=94456705;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:77:81:0:0:45:81:28:17:0:0:40:41:0:0 chr9 94456713 . TC T,TT 748.58 PASS AO=25,56;DP=84;FAO=23,58;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=4,38;FSAR=19,20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118701,0.0112056;FXX=0.0240935;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=247.847,255.863;QD=36.9668;RBI=0.0152772,0.0153836;REFB=0,0;REVB=0.00961735,0.0105399;RO=0;SAF=4,38;SAR=21,18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.661e-08,3.76069e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.00592206,-0.00112773;OID=.,.;OPOS=94456714,94456714;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:25,56:83:23,58:81:0:4,38:19,20:0:0:33:0:4,38:21,18:0:0 chr9 94486321 . C T 307.72 PASS AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0569486;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.721;QD=37.2989;RBI=0.0582357;REFB=0;REVB=-0.0121763;RO=0;SAF=27;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.86929e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000442854;OID=.;OPOS=94486321;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:33:0:0:33:33:6:27:0:0:6:27:0:0 chr9 94487066 . C T 60.44 PASS AO=19;DP=54;FAO=19;FDP=54;FR=.;FRO=35;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=0.0027355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.0538;QD=4.47708;RBI=0.0107629;REFB=-0.0361738;REVB=0.0104095;RO=34;SAF=8;SAR=11;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0439867;STB=0.514041;TYPE=snp;VARB=0.0541719;OID=.;OPOS=94487066;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:54:54:34:35:19:19:11:8:13:21:11:8:14:21 chr9 94495608 . T C 53.26 PASS AO=6;DP=19;FAO=10;FDP=18;FR=.,HEALED;FRO=8;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.248649;FXX=0.0526039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=35.9511;QD=11.8355;RBI=0.248664;REFB=0.00546265;REVB=-0.00269501;RO=7;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.360263;STB=0.66637;TYPE=snp;VARB=0.0144044;OID=.;OPOS=94495608;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:19:18:7:8:6:10:5:1:0:7:5:5:1:7 chr9 94499797 . A G 343.78 PASS AO=90;DP=197;FAO=90;FDP=199;FR=.;FRO=109;FSAF=54;FSAR=36;FSRF=64;FSRR=45;FWDB=0.0235008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.87;QD=6.91009;RBI=0.0250666;REFB=-0.00932287;REVB=-0.00872054;RO=107;SAF=54;SAR=36;SRF=62;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.020881;STB=0.507305;TYPE=snp;VARB=0.0105281;OID=.;OPOS=94499797;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:199:107:109:90:90:36:54:62:45:36:54:64:45 chr9 94518328 . C T 289.79 PASS AO=72;DP=153;FAO=72;FDP=153;FR=.;FRO=81;FSAF=31;FSAR=41;FSRF=42;FSRR=39;FWDB=-0.00372802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.207;QD=7.57625;RBI=0.0227634;REFB=0.00215638;REVB=-0.0224561;RO=80;SAF=31;SAR=41;SRF=42;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0902419;STB=0.546853;TYPE=snp;VARB=-0.0046039;OID=.;OPOS=94518328;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:153:80:81:72:72:41:31:42:38:41:31:42:39 chr9 95068046 . C T 2589.71 PASS AO=271;DP=271;FAO=270;FDP=270;FR=.;FRO=0;FSAF=144;FSAR=126;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00272862;FXX=0.0036899;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.447;QD=38.3661;RBI=0.0308078;REFB=0;REVB=0.0306867;RO=0;SAF=145;SAR=126;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.64735e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.1314e-05;OID=.;OPOS=95068046;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:271:270:0:0:271:270:126:145:0:0:126:144:0:0 chr9 95218829 . G T 822.73 PASS AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0215227;FXX=0.0114929;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.255;QD=38.2663;RBI=0.0393406;REFB=0;REVB=0.0329311;RO=0;SAF=48;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00030594;OID=.;OPOS=95218829;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:86:86:0:0:86:86:38:48:0:0:38:48:0:0 chr9 95219597 . G A 1350.72 PASS AO=140;DP=140;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.14;QD=38.592;RBI=0.0286417;REFB=0;REVB=-0.0259009;RO=0;SAF=54;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.14898e-05;OID=.;OPOS=95219597;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:140:140:0:0:140:140:86:54:0:0:86:54:0:0 chr9 95237024 . C CTCA,A 303.55 PASS AO=21,15;DP=78;FAO=38,6;FDP=56;FR=.;FRO=12;FSAF=22,3;FSAR=16,3;FSRF=10;FSRR=2;FWDB=0.057826,-0.00613819;FXX=0.0666556;HRUN=1,2;LEN=3,1;MLLD=105.306,88.3465;QD=21.6819;RBI=0.117688,0.030222;REFB=-0.176247,-0.0743633;REVB=0.102502,0.0295921;RO=41;SAF=16,5;SAR=5,10;SRF=20;SRR=21;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.334593,-0.190912;STB=0.563844,0.721627;TYPE=ins,snp;VARB=0.0489707,0.00212066;OID=.,.;OPOS=95237025,95237024;OREF=-,C;OALT=TCA,A;OMAPALT=CTCA,A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:78:56:41:12:21,15:38,6:5,10:16,5:20:21:16,3:22,3:10:2 chr9 95274338 . A G 1416.68 PASS AO=148;DP=148;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00504668;FXX=0.0198662;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.579;QD=38.2886;RBI=0.00548384;REFB=0;REVB=0.00214558;RO=0;SAF=52;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.14574e-05;OID=.;OPOS=95274338;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:148:148:0:0:148:148:96:52:0:0:96:52:0:0 chr9 95279985 . C A 1304.63 PASS AO=141;DP=147;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=115;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00259978;FXX=0.0408136;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.539;QD=37.0107;RBI=0.0184095;REFB=-0.0680451;REVB=0.018225;RO=3;SAF=115;SAR=26;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0310593;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000299265;OID=.;OPOS=95279985;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:147:141:3:0:141:141:26:115:1:2:26:115:0:0 chr9 95284873 . A G 1839.26 PASS AO=194;DP=195;FAO=194;FDP=194;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017099;FXX=0.00512794;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.1997;QD=37.9229;RBI=0.0180751;REFB=-0.0615843;REVB=-0.00585965;RO=1;SAF=83;SAR=111;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00427126;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.53318e-05;OID=.;OPOS=95284873;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:195:194:1:0:194:194:111:83:0:1:111:83:0:0 chr9 95284982 . T G 2710.97 PASS AO=275;DP=276;FAO=283;FDP=283;FR=.;FRO=0;FSAF=134;FSAR=149;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011421;FXX=0.003521;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.706;QD=38.3176;RBI=0.0329898;REFB=0;REVB=0.0309498;RO=0;SAF=128;SAR=147;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.51305e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000107718;OID=.;OPOS=95284982;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:276:283:0:0:275:283:147:128:0:0:149:134:0:0 chr9 95362801 . AG A 93.44 PASS AO=21;DP=42;FAO=25;FDP=38;FR=.;FRO=13;FSAF=22;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.0735696;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=17.3378;QD=9.83536;RBI=0.0945319;REFB=-0.0385158;REVB=0.0593614;RO=12;SAF=18;SAR=3;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0.457792;SSSB=0.395259;STB=0.771668;TYPE=del;VARB=0.041821;OID=.;OPOS=95362802;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:21:38:25:38:13:22:3:4:9:23:12:18:3:5:7 chr9 95420983 . A G 2003.67 PASS AO=217;DP=224;FAO=218;FDP=218;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=139;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00925403;FXX=0.0267845;HRUN=3;LEN=1;MLLD=97.4606;QD=36.7646;RBI=0.0108563;REFB=-0.166658;REVB=0.00567641;RO=3;SAF=78;SAR=139;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0179676;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.91763e-05;OID=.;OPOS=95420983;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:224:218:3:0:217:218:139:78:3:0:139:79:0:0 chr9 95572006 . C T 91.02 PASS AO=18;DP=35;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=17;FSAR=2;FSRF=14;FSRR=3;FWDB=0.0099777;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.5933;QD=10.1137;RBI=0.0312235;REFB=-0.0540581;REVB=0.0295864;RO=17;SAF=16;SAR=2;SRF=14;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124711;STB=0.578139;TYPE=snp;VARB=0.0544485;OID=.;OPOS=95572006;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:35:36:17:17:18:19:2:16:14:3:2:17:14:3 chr9 95738781 . C A 227.21 PASS AO=50;DP=100;FAO=51;FDP=101;FR=.;FRO=50;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=-0.0161387;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=156.889;QD=8.99834;RBI=0.0262512;REFB=-0.0164512;REVB=-0.0207044;RO=50;SAF=20;SAR=30;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127882;STB=0.564017;TYPE=snp;VARB=0.0146185;OID=.;OPOS=95738781;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:101:50:50:50:51:30:20:27:23:30:21:27:23 chr9 95780465 . A G 2852.51 PASS AO=287;DP=287;FAO=298;FDP=298;FR=.;FRO=0;FSAF=143;FSAR=155;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0111127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.039;QD=38.2888;RBI=0.0347023;REFB=0;REVB=-0.0328749;RO=0;SAF=142;SAR=145;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000323209;OID=.;OPOS=95780465;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:287:298:0:0:287:298:145:142:0:0:155:143:0:0 chr9 95797999 . C T 71.99 PASS AO=17;DP=35;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0052835;FXX=0.114253;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.3283;QD=9.28859;RBI=0.0443884;REFB=-0.00447418;REVB=0.0440729;RO=16;SAF=5;SAR=12;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243487;STB=0.622055;TYPE=snp;VARB=0.00411592;OID=.;OPOS=95797999;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:35:31:16:16:17:15:12:5:9:7:10:5:9:7 chr9 95887320 . G T 149.23 PASS AO=25;DP=42;FAO=27;FDP=44;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.0253002;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.733;QD=13.5661;RBI=0.0313684;REFB=-0.0224014;REVB=0.018544;RO=17;SAF=8;SAR=17;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246799;STB=0.643383;TYPE=snp;VARB=0.0075447;OID=.;OPOS=95887320;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:42:44:17:17:25:27:17:8:11:6:19:8:11:6 chr9 95993170 . A G 305.98 PASS AO=68;DP=141;FAO=72;FDP=143;FR=.;FRO=71;FSAF=29;FSAR=43;FSRF=42;FSRR=29;FWDB=-0.000300321;FXX=0.0137922;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.315;QD=8.55881;RBI=0.00794971;REFB=-0.0284846;REVB=0.00794403;RO=71;SAF=29;SAR=39;SRF=42;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152199;STB=0.593827;TYPE=snp;VARB=0.0280463;OID=.;OPOS=95993170;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:143:71:71:68:72:39:29:42:29:43:29:42:29 chr9 95993326 . T C 510.14 PASS AO=119;DP=238;FAO=119;FDP=237;FR=.;FRO=118;FSAF=58;FSAR=61;FSRF=67;FSRR=51;FWDB=-0.00998756;FXX=0.0042015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.92;QD=8.61;RBI=0.0100739;REFB=-0.00704353;REVB=-0.00131616;RO=118;SAF=58;SAR=61;SRF=67;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0728828;STB=0.539969;TYPE=snp;VARB=0.00723209;OID=.;OPOS=95993326;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:238:237:118:118:119:119:61:58:67:51:61:58:67:51 chr9 96026243 . G A 206.81 PASS AO=46;DP=91;FAO=46;FDP=91;FR=.;FRO=45;FSAF=32;FSAR=14;FSRF=27;FSRR=18;FWDB=0.0171934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2243;QD=9.09039;RBI=0.115427;REFB=-0.0456802;REVB=0.11414;RO=45;SAF=32;SAR=14;SRF=27;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0963382;STB=0.553489;TYPE=snp;VARB=0.0339853;OID=.;OPOS=96026243;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:45:45:46:46:14:32:27:18:14:32:27:18 chr9 96051521 . A G 73.84 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150559;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.2791;QD=36.9199;RBI=0.0322875;REFB=0;REVB=-0.0285622;RO=0;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.78849e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000676606;OID=.;OPOS=96051521;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:7:1:0:0:7:1:0:0 chr9 96055063 . C T 47.12 PASS AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=12;FWDB=0.051504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.285;QD=8.56728;RBI=0.0652854;REFB=0.00315235;REVB=0.0401188;RO=10;SAF=1;SAR=9;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.320847;STB=0.69974;TYPE=snp;VARB=-0.00301851;OID=.;OPOS=96055063;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:22:22:10:12:10:10:9:1:0:10:9:1:0:12 chr9 96080699 . C T 27.46 PASS AO=10;DP=37;FAO=10;FDP=36;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=0.00257074;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.666;QD=3.05114;RBI=0.0297286;REFB=0.00866817;REVB=-0.0296173;RO=26;SAF=8;SAR=2;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.262625;STB=0.666296;TYPE=snp;VARB=-0.0178053;OID=.;OPOS=96080699;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:37:36:26:26:10:10:2:8:16:10:2:8:16:10 chr9 96097669 . C T 147.09 PASS AO=28;DP=49;FAO=28;FDP=49;FR=.;FRO=21;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=0.0356458;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.991;QD=12.0077;RBI=0.0424372;REFB=-0.0218391;REVB=0.0230282;RO=21;SAF=19;SAR=9;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0321124;STB=0.517754;TYPE=snp;VARB=0.0140095;OID=.;OPOS=96097669;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:49:49:21:21:28:28:9:19:15:6:9:19:15:6 chr9 96097673 . G A 60.95 PASS AO=18;DP=49;FAO=18;FDP=50;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=-0.00327577;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.782;QD=4.87594;RBI=0.0134464;REFB=-0.0190799;REVB=0.0130413;RO=28;SAF=14;SAR=4;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178847;STB=0.622074;TYPE=snp;VARB=0.0150947;OID=.;OPOS=96097673;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:49:50:28:32:18:18:4:14:18:10:4:14:20:12 chr9 96097747 . C T 182.19 PASS AO=39;DP=74;FAO=39;FDP=74;FR=.;FRO=35;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=0.0291515;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.767;QD=9.84829;RBI=0.0464439;REFB=-0.0485895;REVB=-0.0361557;RO=35;SAF=23;SAR=16;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0901423;STB=0.549904;TYPE=snp;VARB=0.0356712;OID=.;OPOS=96097747;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:35:35:39:39:16:23:17:18:16:23:17:18 chr9 96238578 . C T 367.64 PASS AO=93;DP=200;FAO=93;FDP=200;FR=.;FRO=107;FSAF=47;FSAR=46;FSRF=57;FSRR=50;FWDB=0.0110058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.648;QD=7.35286;RBI=0.0162906;REFB=-0.00182346;REVB=0.0120107;RO=107;SAF=47;SAR=46;SRF=57;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0264453;STB=0.514627;TYPE=snp;VARB=0.00217009;OID=.;OPOS=96238578;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:200:200:107:107:93:93:46:47:57:50:46:47:57:50 chr9 96327691 . A C 757.99 PASS AO=240;DP=510;FAO=189;FDP=396;FR=.;FRO=207;FSAF=98;FSAR=91;FSRF=104;FSRR=103;FWDB=-0.0441923;FXX=0.00999975;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.3394;QD=7.65647;RBI=0.0555242;REFB=0.00723177;REVB=-0.0336151;RO=265;SAF=124;SAR=116;SRF=129;SRR=136;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0285285;STB=0.508423;TYPE=snp;VARB=-0.00879605;OID=.;OPOS=96327691;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:510:396:265:207:240:189:116:124:129:136:91:98:104:103 chr9 96407920 . C T 87.68 PASS AO=28;DP=77;FAO=28;FDP=77;FR=.;FRO=49;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=30;FSRR=19;FWDB=0.00116671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.438;QD=4.55493;RBI=0.0455668;REFB=-0.00514812;REVB=-0.0455519;RO=49;SAF=17;SAR=11;SRF=30;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0059084;STB=0.503406;TYPE=snp;VARB=0.0107531;OID=.;OPOS=96407920;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:77:77:49:49:28:28:11:17:30:19:11:17:30:19 chr9 96407983 . C T 278.94 PASS AO=55;DP=100;FAO=56;FDP=99;FR=.;FRO=43;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=0.0233212;FXX=0.009999;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.094;QD=11.2701;RBI=0.0503817;REFB=0.0161087;REVB=0.0446591;RO=43;SAF=27;SAR=28;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0352074;STB=0.515146;TYPE=snp;VARB=-0.0105717;OID=.;OPOS=96407983;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:99:43:43:55:56:28:27:23:20:28:28:23:20 chr9 96415482 . A T 360.6 PASS AO=67;DP=111;FAO=67;FDP=110;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=52;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=0.00825086;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.2851;QD=13.1127;RBI=0.0194245;REFB=-0.0231498;REVB=0.0175851;RO=42;SAF=15;SAR=52;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.221592;STB=0.617958;TYPE=snp;VARB=0.0212059;OID=.;OPOS=96415482;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:110:42:43:67:67:52:15:20:22:52:15:20:23 chr9 96438998 . T C 14.72 PASS AO=3;DP=11;FAO=3;FDP=10;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0.0908265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.6419;QD=5.88962;RBI=0.0316922;REFB=0.00798954;REVB=-0.0316922;RO=8;SAF=0;SAR=3;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.576989;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0553716;OID=.;OPOS=96438998;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:11:10:8:7:3:3:3:0:1:7:3:0:0:7 chr9 96439004 . C CCCTGCCTCCACCACA,A 66.61 PASS AO=2,3;DP=10;FAO=6,1;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0;FSAR=6,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0,0;FXX=0.2997;HRUN=4,4;LEN=15,1;MLLD=351.861,244.174;QD=38.0625;RBI=0.0579255,0.056319;REFB=0,0;REVB=0.0579255,0.056319;RO=3;SAF=0,0;SAR=2,3;SRF=0;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=ins,snp;VARB=0.00461855,0.0118288;OID=.,.;OPOS=96439005,96439004;OREF=-,C;OALT=CCTGCCTCCACCACA,A;OMAPALT=CCCTGCCTCCACCACA,A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:5:10:7:3:0:2,3:6,1:2,3:0,0:0:3:6,1:0,0:0:0 chr9 96439007 . G T 14.36 PASS AO=3;DP=10;FAO=3;FDP=10;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5605;QD=5.74537;RBI=0.0289979;REFB=0.00596546;REVB=-0.0289979;RO=7;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00283284;OID=.;OPOS=96439007;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:10:10:7:7:3:3:3:0:0:7:3:0:0:7 chr9 96439019 . C A 10.22 PASS AO=2;DP=9;FAO=2;FDP=9;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=191.557;QD=4.5413;RBI=0.00790869;REFB=-0.0151412;REVB=-0.00790869;RO=7;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0402401;OID=.;OPOS=96439019;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:7:7:2:2:2:0:0:7:2:0:0:7 chr9 96441555 . C T 254.2 PASS AO=52;DP=98;FAO=53;FDP=96;FR=.;FRO=43;FSAF=51;FSAR=2;FSRF=17;FSRR=26;FWDB=0.00265817;FXX=0.0204061;HRUN=3;LEN=1;MLLD=82.0005;QD=10.5917;RBI=0.0375225;REFB=-0.0146096;REVB=-0.0374282;RO=42;SAF=50;SAR=2;SRF=17;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.723956;STB=0.912834;TYPE=snp;VARB=0.0242704;OID=.;OPOS=96441555;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:96:42:43:52:53:2:50:17:25:2:51:17:26 chr9 96441750 . C T 304.42 PASS AO=74;DP=154;FAO=74;FDP=154;FR=.;FRO=80;FSAF=34;FSAR=40;FSRF=28;FSRR=52;FWDB=0.0218147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.649;QD=7.90706;RBI=0.0218483;REFB=-0.00894516;REVB=-0.00121092;RO=80;SAF=34;SAR=40;SRF=28;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104735;STB=0.557759;TYPE=snp;VARB=0.0120385;OID=.;OPOS=96441750;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:154:80:80:74:74:40:34:28:52:40:34:28:52 chr9 97055310 . C T 455.79 PASS AO=79;DP=110;FAO=75;FDP=110;FR=.;FRO=35;FSAF=53;FSAR=22;FSRF=30;FSRR=5;FWDB=-0.00462767;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.31;QD=16.5743;RBI=0.0479156;REFB=-0.00739324;REVB=0.0476916;RO=31;SAF=55;SAR=24;SRF=28;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136516;STB=0.560623;TYPE=snp;VARB=0.00812431;OID=.;OPOS=97055310;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:110:110:31:35:79:75:24:55:28:3:22:53:30:5 chr9 97080944 . GAGA G 18.62 PASS AO=4;DP=12;FAO=4;FDP=12;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-1.90413e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=196.697;QD=6.20777;RBI=0.0649818;REFB=-0.0157154;REVB=-0.0649818;RO=8;SAF=1;SAR=3;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.37999;STB=0.74875;TYPE=del;VARB=0.0262408;OID=.;OPOS=97080945;OREF=AGA;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:4:12:4:12:8:1:3:5:3:18:8:1:3:5:3 chr9 97222891 . C T 210.55 PASS AO=67;DP=179;FAO=67;FDP=175;FR=.;FRO=108;FSAF=31;FSAR=36;FSRF=51;FSRR=57;FWDB=0.00842988;FXX=0.0331473;HRUN=3;LEN=1;MLLD=171.289;QD=4.81249;RBI=0.00960739;REFB=0.00065052;REVB=-0.00460858;RO=107;SAF=31;SAR=36;SRF=50;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00503461;STB=0.505911;TYPE=snp;VARB=-0.011495;OID=.;OPOS=97222891;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:175:107:108:67:67:36:31:50:57:36:31:51:57 chr9 97222892 . C G 221.78 PASS AO=70;DP=182;FAO=70;FDP=181;FR=.;FRO=111;FSAF=34;FSAR=36;FSRF=51;FSRR=60;FWDB=-0.00463844;FXX=0.0109284;HRUN=3;LEN=1;MLLD=97.8692;QD=4.90113;RBI=0.0143422;REFB=0.00323265;REVB=0.0135714;RO=106;SAF=34;SAR=36;SRF=49;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0251319;STB=0.516124;TYPE=snp;VARB=-0.0175935;OID=.;OPOS=97222892;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:181:106:111:70:70:36:34:49:57:36:34:51:60 chr9 97270084 . G C 91.55 PASS AO=18;DP=33;FAO=18;FDP=33;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=0.0513604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.4928;QD=11.097;RBI=0.0525025;REFB=0.00126144;REVB=0.0108914;RO=15;SAF=11;SAR=7;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.322852;STB=0.680592;TYPE=snp;VARB=0.00148528;OID=.;OPOS=97270084;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:33:33:15:15:18:18:7:11:3:12:7:11:3:12 chr9 97349666 . C G 903.51 PASS AO=93;DP=94;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0240466;FXX=0.0104156;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.134;QD=38.0425;RBI=0.0612974;REFB=0;REVB=0.0563838;RO=0;SAF=77;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000143065;OID=.;OPOS=97349666;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:94:95:0:0:93:95:16:77:0:0:16:79:0:0 chr9 97365720 . T C 162.84 PASS AO=37;DP=100;FAO=47;FDP=111;FR=.;FRO=64;FSAF=37;FSAR=10;FSRF=43;FSRR=21;FWDB=0.00123744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.48;QD=5.86816;RBI=0.0541927;REFB=-0.0136204;REVB=0.0541786;RO=60;SAF=32;SAR=5;SRF=41;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.304938;STB=0.589071;TYPE=snp;VARB=0.0159926;OID=.;OPOS=97365720;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:111:60:64:37:47:5:32:41:19:10:37:43:21 chr9 97369149 . C T 1652.74 PASS AO=181;DP=184;FAO=180;FDP=184;FR=.;FRO=4;FSAF=83;FSAR=97;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0843334;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.6821;QD=35.9292;RBI=0.0850837;REFB=0.0321972;REVB=-0.0112743;RO=2;SAF=84;SAR=97;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000751001;STB=0.506312;TYPE=snp;VARB=-0.00213854;OID=.;OPOS=97369149;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:184:184:2:4:181:180:97:84:1:1:97:83:3:1 chr9 97369151 . G A 407.96 PASS AO=93;DP=184;FAO=93;FDP=182;FR=.;FRO=89;FSAF=45;FSAR=48;FSRF=40;FSRR=49;FWDB=-0.0079116;FXX=0.010869;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.282;QD=8.96621;RBI=0.0166583;REFB=-0.0114831;REVB=0.0146597;RO=89;SAF=45;SAR=48;SRF=40;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0307487;STB=0.51687;TYPE=snp;VARB=0.0111487;OID=.;OPOS=97369151;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:182:89:89:93:93:48:45:40:49:48:45:40:49 chr9 97768286 . T C 224.46 PASS AO=61;DP=142;FAO=61;FDP=141;FR=.;FRO=80;FSAF=41;FSAR=20;FSRF=37;FSRR=43;FWDB=0.00604572;FXX=0.00704176;HRUN=3;LEN=1;MLLD=210.019;QD=6.36756;RBI=0.00656266;REFB=-0.00999449;REVB=0.00255299;RO=77;SAF=41;SAR=20;SRF=37;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199965;STB=0.62342;TYPE=snp;VARB=0.0104193;OID=.;OPOS=97768286;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:141:77:80:61:61:20:41:37:40:20:41:37:43 chr9 97849090 . A G 615.95 PASS AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0158842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.883;QD=37.9047;RBI=0.0193039;REFB=0;REVB=-0.0109696;RO=0;SAF=31;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.90682e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.65576e-05;OID=.;OPOS=97849090;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:65:65:0:0:65:65:34:31:0:0:34:31:0:0 chr9 98231084 . T C 94.13 PASS AO=23;DP=55;FAO=24;FDP=56;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=-0.0282934;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.632;QD=6.72357;RBI=0.0287142;REFB=-0.0223023;REVB=-0.00489736;RO=31;SAF=15;SAR=8;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.296197;STB=0.657766;TYPE=snp;VARB=0.0499461;OID=.;OPOS=98231084;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:55:56:31:32:23:24:8:15:11:20:9:15:11:21 chr9 98238379 . A G 216.76 PASS AO=52;DP=109;FAO=52;FDP=109;FR=.;FRO=57;FSAF=40;FSAR=12;FSRF=36;FSRR=21;FWDB=0.0162368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.738;QD=7.95446;RBI=0.0522987;REFB=-0.0147977;REVB=0.0497144;RO=57;SAF=40;SAR=12;SRF=36;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163369;STB=0.59136;TYPE=snp;VARB=0.0143154;OID=.;OPOS=98238379;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:57:57:52:52:12:40:36:21:12:40:36:21 chr9 98638306 . C T 224.12 PASS AO=31;DP=39;FAO=31;FDP=40;FR=.;FRO=9;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.00591398;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=217.05;QD=22.412;RBI=0.00676632;REFB=-0.0172571;REVB=-0.00328753;RO=7;SAF=15;SAR=16;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0188777;STB=0.50888;TYPE=snp;VARB=0.00356783;OID=.;OPOS=98638306;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:39:40:7:9:31:31:16:15:3:4:16:15:4:5 chr9 98734670 . C T 98.72 PASS AO=22;DP=46;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=0.00800217;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.116;QD=8.77503;RBI=0.0173154;REFB=-0.00729907;REVB=-0.0153554;RO=23;SAF=9;SAR=13;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100462;STB=0.556453;TYPE=snp;VARB=0.00574506;OID=.;OPOS=98734670;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:46:45:23:23:22:22:13:9:7:16:13:9:7:16 chr9 98775459 . G A 202.21 PASS AO=52;DP=115;FAO=52;FDP=115;FR=.;FRO=63;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=24;FSRR=39;FWDB=0.00622318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.606;QD=7.0332;RBI=0.00968422;REFB=-0.0087573;REVB=0.00741998;RO=62;SAF=27;SAR=25;SRF=24;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128548;STB=0.575396;TYPE=snp;VARB=0.0115784;OID=.;OPOS=98775459;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:62:63:52:52:25:27:24:38:25:27:24:39 chr9 98997810 . C T 254.39 PASS AO=53;DP=100;FAO=53;FDP=98;FR=.;FRO=45;FSAF=20;FSAR=33;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=-0.0504783;FXX=0.019998;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.882;QD=10.3832;RBI=0.0517008;REFB=-0.0329919;REVB=0.0111763;RO=45;SAF=20;SAR=33;SRF=19;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0394211;STB=0.521678;TYPE=snp;VARB=0.0310137;OID=.;OPOS=98997810;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:98:45:45:53:53:33:20:19:26:33:20:19:26 chr9 99150582 . G T 207.99 PASS AO=48;DP=97;FAO=48;FDP=97;FR=.;FRO=49;FSAF=16;FSAR=32;FSRF=21;FSRR=28;FWDB=-0.0426784;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.307;QD=8.57706;RBI=0.0487107;REFB=-0.0348272;REVB=-0.0234793;RO=49;SAF=16;SAR=32;SRF=21;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.094001;STB=0.552216;TYPE=snp;VARB=0.0351256;OID=.;OPOS=99150582;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:49:49:48:48:32:16:21:28:32:16:21:28 chr9 99250463 . C T 417.1 PASS AO=94;DP=186;FAO=99;FDP=200;FR=.;FRO=101;FSAF=35;FSAR=64;FSRF=65;FSRR=36;FWDB=-0.0301645;FXX=0.00497488;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.8143;QD=8.34204;RBI=0.0623991;REFB=0.00318373;REVB=0.0546237;RO=92;SAF=32;SAR=62;SRF=57;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254566;STB=0.646435;TYPE=snp;VARB=-0.00380799;OID=.;OPOS=99250463;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:200:92:101:94:99:62:32:57:35:64:35:65:36 chr9 99252464 . A G 484.09 PASS AO=108;DP=233;FAO=119;FDP=242;FR=.;FRO=123;FSAF=57;FSAR=62;FSRF=48;FSRR=75;FWDB=0.0407017;FXX=0.0122444;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.313;QD=8.00155;RBI=0.0438295;REFB=-0.00726903;REVB=0.0162602;RO=120;SAF=55;SAR=53;SRF=47;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112085;STB=0.545352;TYPE=snp;VARB=0.00873936;OID=.;OPOS=99252464;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:233:242:120:123:108:119:53:55:47:73:62:57:48:75 chr9 99262788 . T TA 112.33 PASS AO=41;DP=88;FAO=44;FDP=86;FR=.;FRO=42;FSAF=31;FSAR=13;FSRF=29;FSRR=13;FWDB=0.0735533;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=18.5506;QD=5.22451;RBI=0.0797914;REFB=-0.0967791;REVB=-0.0309286;RO=46;SAF=28;SAR=13;SRF=32;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140071;STB=0.508193;TYPE=ins;VARB=0.0961173;OID=.;OPOS=99262789;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:41:88:44:86:42:31:13:29:13:99:46:28:13:32:14 chr9 99263937 . T C 236.3 PASS AO=54;DP=108;FAO=54;FDP=108;FR=.;FRO=54;FSAF=36;FSAR=18;FSRF=30;FSRR=24;FWDB=0.000231337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.361;QD=8.75179;RBI=0.00061663;REFB=0.0115476;REVB=-0.00057159;RO=54;SAF=36;SAR=18;SRF=30;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108226;STB=0.559977;TYPE=snp;VARB=-0.0121477;OID=.;OPOS=99263937;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:54:54:54:54:18:36:30:24:18:36:30:24 chr9 99581568 . T C 130.9 PASS AO=35;DP=83;FAO=35;FDP=82;FR=.;FRO=47;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=-0.0113846;FXX=0.0120467;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.656;QD=6.38516;RBI=0.0226677;REFB=-0.00729535;REVB=-0.0196014;RO=46;SAF=21;SAR=14;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0584271;STB=0.539977;TYPE=snp;VARB=0.0108531;OID=.;OPOS=99581568;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:82:46:47:35:35:14:21:25:21:14:21:25:22 chr9 99699485 . G C 81.11 PASS AO=14;DP=25;FAO=15;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=13;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=0;FWDB=0.0364375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.6057;QD=12.478;RBI=0.037575;REFB=-0.0292009;REVB=0.00917528;RO=11;SAF=12;SAR=2;SRF=11;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.285648;STB=0.648499;TYPE=snp;VARB=0.0265804;OID=.;OPOS=99699485;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:25:26:11:11:14:15:2:12:11:0:2:13:11:0 chr9 100049970 . G C 351.88 PASS AO=100;DP=241;FAO=102;FDP=243;FR=.;FRO=141;FSAF=44;FSAR=58;FSRF=49;FSRR=92;FWDB=0.00190681;FXX=0.0121946;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3964;QD=5.79233;RBI=0.00901233;REFB=-0.0255509;REVB=-0.0088083;RO=137;SAF=43;SAR=57;SRF=47;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0934462;STB=0.550265;TYPE=snp;VARB=0.0453657;OID=.;OPOS=100049970;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:241:243:137:141:100:102:57:43:47:90:58:44:49:92 chr9 100049972 . A C 362.55 PASS AO=104;DP=247;FAO=104;FDP=246;FR=.;FRO=142;FSAF=46;FSAR=58;FSRF=49;FSRR=93;FWDB=-0.0259991;FXX=0.00404842;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.734;QD=5.89517;RBI=0.0261098;REFB=-0.0121576;REVB=-0.00240205;RO=137;SAF=46;SAR=58;SRF=47;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104378;STB=0.557632;TYPE=snp;VARB=0.0236043;OID=.;OPOS=100049972;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:247:246:137:142:104:104:58:46:47:90:58:46:49:93 chr9 100070351 . G C 101.36 PASS AO=25;DP=56;FAO=25;FDP=56;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.0383364;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.082;QD=7.23971;RBI=0.0525531;REFB=-0.0325451;REVB=0.0359466;RO=31;SAF=12;SAR=13;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12946;STB=0.5732;TYPE=snp;VARB=0.0312213;OID=.;OPOS=100070351;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:31:31:25:25:13:12:19:12:13:12:19:12 chr9 100071728 . G A 139.4 PASS AO=53;DP=156;FAO=53;FDP=155;FR=.;FRO=102;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=51;FSRR=51;FWDB=0.0369934;FXX=0.00640985;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0826;QD=3.59728;RBI=0.0376788;REFB=-0.0121081;REVB=0.00715404;RO=101;SAF=31;SAR=22;SRF=51;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0923338;STB=0.569284;TYPE=snp;VARB=0.0336632;OID=.;OPOS=100071728;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:155:101:102:53:53:22:31:51:50:21:32:51:51 chr9 100074446 . C T 66.81 PASS AO=18;DP=45;FAO=18;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=2;FSAR=16;FSRF=5;FSRR=22;FWDB=-0.0726477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.424;QD=5.93898;RBI=0.0726838;REFB=-0.0146777;REVB=-0.00229104;RO=26;SAF=2;SAR=16;SRF=4;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0995256;STB=0.595624;TYPE=snp;VARB=0.0173974;OID=.;OPOS=100074446;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:45:45:26:27:18:18:16:2:4:22:16:2:5:22 chr9 100087345 . A G 306.11 PASS AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0796058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.5122;QD=37.1042;RBI=0.0808746;REFB=0;REVB=-0.0142694;RO=0;SAF=19;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.71297e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000862824;OID=.;OPOS=100087345;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:33:33:0:0:33:33:14:19:0:0:14:19:0:0 chr9 100092968 . A AGAGGAG 11.74 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=6;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0451784;FXX=0.142653;HRUN=1;LEN=6;MLLD=169.478;QD=7.82408;RBI=0.0451784;REFB=0.0441458;REVB=0;RO=5;SAF=2;SAR=0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-0.0612088;OID=.;OPOS=100092969;OREF=-;OALT=GAGGAG;OMAPALT=AGAGGAG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:2:7:2:6:4:2:0:4:0:11:5:2:0:5:0 chr9 100105735 . T C 1559.84 PASS AO=163;DP=165;FAO=163;FDP=163;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00787658;FXX=0.0121205;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.416;QD=38.2783;RBI=0.0111474;REFB=0;REVB=0.00788827;RO=0;SAF=85;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.22613e-05;OID=.;OPOS=100105735;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:165:163:0:0:163:163:78:85:0:0:78:85:0:0 chr9 100105782 . C G 377.9 PASS AO=85;DP=167;FAO=85;FDP=165;FR=.;FRO=80;FSAF=36;FSAR=49;FSRF=44;FSRR=36;FWDB=-0.00543379;FXX=0.0119753;HRUN=2;LEN=1;MLLD=250.091;QD=9.16124;RBI=0.0209409;REFB=-0.0226022;REVB=-0.0202236;RO=80;SAF=36;SAR=49;SRF=44;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11219;STB=0.56159;TYPE=snp;VARB=0.0197005;OID=.;OPOS=100105782;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:165:80:80:85:85:49:36:44:36:49:36:44:36 chr9 100122291 . T C 300.22 PASS AO=57;DP=98;FAO=58;FDP=100;FR=.;FRO=42;FSAF=36;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=0.0267407;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.8993;QD=12.0087;RBI=0.0422596;REFB=-0.0383503;REVB=-0.0327232;RO=41;SAF=35;SAR=22;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117988;STB=0.562478;TYPE=snp;VARB=0.0258756;OID=.;OPOS=100122291;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:100:41:42:57:58:22:35:19:22:22:36:20:22 chr9 100139161 . A G 72.4 PASS AO=21;DP=55;FAO=21;FDP=55;FR=.;FRO=34;FSAF=3;FSAR=18;FSRF=3;FSRR=31;FWDB=0.122444;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.8315;QD=5.26554;RBI=0.128475;REFB=0.00321461;REVB=0.0389021;RO=29;SAF=3;SAR=18;SRF=3;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0880986;STB=0.576406;TYPE=snp;VARB=-0.000796573;OID=.;OPOS=100139161;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:55:55:29:34:21:21:18:3:3:26:18:3:3:31 chr9 100227262 . C T 427.91 PASS AO=107;DP=226;FAO=107;FDP=226;FR=.;FRO=119;FSAF=55;FSAR=52;FSRF=64;FSRR=55;FWDB=0.00287762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.6615;QD=7.57366;RBI=0.0181498;REFB=-0.0280612;REVB=-0.0179203;RO=116;SAF=55;SAR=52;SRF=63;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0274975;STB=0.512546;TYPE=snp;VARB=0.03125;OID=.;OPOS=100227262;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:226:226:116:119:107:107:52:55:63:53:52:55:64:55 chr9 100388197 . C T 2059.63 PASS AO=220;DP=223;FAO=221;FDP=221;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=129;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0367266;FXX=0.00896821;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.24;QD=37.2784;RBI=0.0539625;REFB=-0.0925418;REVB=0.0395362;RO=1;SAF=92;SAR=128;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00370807;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000958893;OID=.;OPOS=100388197;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:223:221:1:0:220:221:128:92:0:1:129:92:0:0 chr9 100616583 . T C 296.78 PASS AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0443593;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.3277;QD=37.0979;RBI=0.0504276;REFB=0;REVB=0.0239832;RO=0;SAF=6;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000671852;OID=.;OPOS=100616583;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:32:32:0:0:32:32:26:6:0:0:26:6:0:0 chr9 100617375 . T C 1352.88 PASS AO=137;DP=138;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0365988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.839;QD=38.1092;RBI=0.0416129;REFB=0;REVB=0.0198031;RO=0;SAF=86;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.02118e-05;OID=.;OPOS=100617375;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:138:142:0:0:137:142:51:86:0:0:54:88:0:0 chr9 100617479 . G T 505.8 PASS AO=37;DP=83;FAO=58;FDP=61;FR=.;FRO=3;FSAF=22;FSAR=36;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0517655;FXX=0.0161264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.0827;QD=33.167;RBI=0.0615679;REFB=-0.110775;REVB=-0.0333307;RO=0;SAF=4;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.7801e-08;STB=0.531904;TYPE=snp;VARB=0.0115501;OID=.;OPOS=100617479;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:39:61:0:3:37:58:33:4:0:0:36:22:3:0 chr9 100617583 . T C 1148.76 PASS AO=120;DP=122;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103742;FXX=0.0162588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.675;QD=37.9756;RBI=0.0263673;REFB=0;REVB=-0.0242407;RO=0;SAF=70;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.00207e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000110199;OID=.;OPOS=100617583;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:122:121:0:0:120:121:50:70:0:0:50:71:0:0 chr9 100675816 . A G 205.17 PASS AO=51;DP=117;FAO=52;FDP=115;FR=.;FRO=63;FSAF=15;FSAR=37;FSRF=23;FSRR=40;FWDB=0.0381272;FXX=0.0416632;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.09;QD=7.13644;RBI=0.0401578;REFB=-0.0019699;REVB=0.012608;RO=55;SAF=15;SAR=36;SRF=19;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0561606;STB=0.548985;TYPE=snp;VARB=0.00285354;OID=.;OPOS=100675816;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:115:55:63:51:52:36:15:19:36:37:15:23:40 chr9 100684719 . A C 54.26 PASS AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.00919094;FXX=0.0312402;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.476;QD=7.00165;RBI=0.0224437;REFB=-0.00785336;REVB=-0.0204755;RO=18;SAF=4;SAR=9;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0904412;STB=0.552988;TYPE=snp;VARB=0.00486985;OID=.;OPOS=100684719;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:32:31:18:18:13:13:9:4:7:11:9:4:7:11 chr9 100684757 . A G 31.32 PASS AO=9;DP=27;FAO=9;FDP=27;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=14;FWDB=-0.0117608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.283;QD=4.63953;RBI=0.0743624;REFB=-0.0245697;REVB=-0.0734265;RO=18;SAF=3;SAR=6;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14663;STB=0.588056;TYPE=snp;VARB=0.0485347;OID=.;OPOS=100684757;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:27:27:18:18:9:9:6:3:4:14:6:3:4:14 chr9 100895443 . C T 478.88 PASS AO=86;DP=137;FAO=86;FDP=136;FR=.;FRO=50;FSAF=40;FSAR=46;FSRF=28;FSRR=22;FWDB=-0.00743189;FXX=0.0144917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133;QD=14.0847;RBI=0.00842611;REFB=-0.0305442;REVB=-0.00397068;RO=51;SAF=40;SAR=46;SRF=29;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0711999;STB=0.534876;TYPE=snp;VARB=0.0125828;OID=.;OPOS=100895443;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:136:51:50:86:86:46:40:29:22:46:40:28:22 chr9 100991430 . C A 595.05 PASS AO=124;DP=228;FAO=125;FDP=227;FR=.;FRO=102;FSAF=44;FSAR=81;FSRF=29;FSRR=73;FWDB=-0.0229406;FXX=0.00438577;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.183;QD=10.4855;RBI=0.0272579;REFB=-0.0102395;REVB=0.0147213;RO=102;SAF=44;SAR=80;SRF=29;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.06526;STB=0.534001;TYPE=snp;VARB=0.0103074;OID=.;OPOS=100991430;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:228:227:102:102:124:125:80:44:29:73:81:44:29:73 chr9 100995721 . A G 371.92 PASS AO=67;DP=106;FAO=67;FDP=107;FR=.;FRO=40;FSAF=20;FSAR=47;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=-0.00481688;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.902;QD=13.9034;RBI=0.0538899;REFB=-0.00787967;REVB=-0.0536742;RO=38;SAF=20;SAR=47;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0543543;STB=0.543688;TYPE=snp;VARB=0.00607798;OID=.;OPOS=100995721;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:107:38:40:67:67:47:20:14:24:47:20:16:24 chr9 100995758 . G T 519.04 PASS AO=89;DP=140;FAO=90;FDP=138;FR=.;FRO=48;FSAF=31;FSAR=59;FSRF=16;FSRR=32;FWDB=0.00891389;FXX=0.0212751;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.202;QD=15.0446;RBI=0.0786852;REFB=0.0566136;REVB=-0.0781787;RO=48;SAF=30;SAR=59;SRF=16;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00272368;STB=0.504289;TYPE=snp;VARB=-0.0192545;OID=.;OPOS=100995758;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:138:48:48:89:90:59:30:16:32:59:31:16:32 chr9 101051309 . A G 541.29 PASS AO=113;DP=206;FAO=114;FDP=208;FR=.;FRO=94;FSAF=53;FSAR=61;FSRF=46;FSRR=48;FWDB=0.0154606;FXX=0.00478446;HRUN=3;LEN=1;MLLD=177.841;QD=10.4094;RBI=0.0251873;REFB=-0.0221875;REVB=-0.0198839;RO=90;SAF=52;SAR=61;SRF=44;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0234789;STB=0.511085;TYPE=snp;VARB=0.0159815;OID=.;OPOS=101051309;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:206:208:90:94:113:114:61:52:44:46:61:53:46:48 chr9 101051879 . G A 445.01 PASS AO=105;DP=215;FAO=106;FDP=215;FR=.;FRO=109;FSAF=24;FSAR=82;FSRF=21;FSRR=88;FWDB=-0.00563374;FXX=0.00462942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.1898;QD=8.27918;RBI=0.0568431;REFB=-0.00693416;REVB=-0.0565632;RO=109;SAF=23;SAR=82;SRF=21;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0365826;STB=0.525092;TYPE=snp;VARB=0.0072223;OID=.;OPOS=101051879;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:215:109:109:105:106:82:23:21:88:82:24:21:88 chr9 101056122 . T C 679.2 PASS AO=184;DP=411;FAO=181;FDP=400;FR=.;FRO=219;FSAF=93;FSAR=88;FSRF=114;FSRR=105;FWDB=0.0323294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.286;QD=6.79197;RBI=0.0323331;REFB=-0.0115979;REVB=0.000486575;RO=226;SAF=93;SAR=91;SRF=118;SRR=108;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0166452;STB=0.503691;TYPE=snp;VARB=0.0132134;OID=.;OPOS=101056122;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:411:400:226:219:184:181:91:93:118:108:88:93:114:105 chr9 101068580 . G A 449.76 PASS AO=95;DP=174;FAO=97;FDP=181;FR=.;FRO=84;FSAF=50;FSAR=47;FSRF=28;FSRR=56;FWDB=0.0311518;FXX=0.0109284;HRUN=4;LEN=1;MLLD=142.169;QD=9.93939;RBI=0.0352101;REFB=-0.0345076;REVB=0.0164108;RO=79;SAF=48;SAR=47;SRF=27;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136004;STB=0.584148;TYPE=snp;VARB=0.0364277;OID=.;OPOS=101068580;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:181:79:84:95:97:47:48:27:52:47:50:28:56 chr9 101340301 . A C 677.03 PASS AO=168;DP=351;FAO=169;FDP=351;FR=.;FRO=182;FSAF=91;FSAR=78;FSRF=104;FSRR=78;FWDB=-0.0536379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.989;QD=7.71547;RBI=0.0557775;REFB=-0.00872283;REVB=-0.0153005;RO=183;SAF=91;SAR=77;SRF=104;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0254989;STB=0.517239;TYPE=snp;VARB=0.00905318;OID=.;OPOS=101340301;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:351:351:183:182:168:169:77:91:104:79:78:91:104:78 chr9 101533220 . C T 691.11 PASS AO=76;DP=78;FAO=77;FDP=79;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=52;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0210008;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=216.615;QD=34.993;RBI=0.0210359;REFB=-0.102958;REVB=0.00121419;RO=2;SAF=24;SAR=52;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0378057;STB=0.519226;TYPE=snp;VARB=0.000856138;OID=.;OPOS=101533220;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:78:79:2:2:76:77:52:24:2:0:52:25:2:0 chr9 101611335 . G C 306.86 PASS AO=78;DP=167;FAO=78;FDP=169;FR=.;FRO=91;FSAF=31;FSAR=47;FSRF=40;FSRR=51;FWDB=-0.000779723;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.7625;QD=7.26293;RBI=0.0125858;REFB=0.00113673;REVB=-0.0125616;RO=89;SAF=31;SAR=47;SRF=40;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0515761;STB=0.523445;TYPE=snp;VARB=-0.00148437;OID=.;OPOS=101611335;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:169:89:91:78:78:47:31:40:49:47:31:40:51 chr9 101611545 . A G 467.77 PASS AO=120;DP=259;FAO=120;FDP=259;FR=.;FRO=139;FSAF=56;FSAR=64;FSRF=56;FSRR=83;FWDB=0.000155908;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.548;QD=7.2242;RBI=0.0151627;REFB=-0.0238812;REVB=-0.0151619;RO=139;SAF=56;SAR=64;SRF=56;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0625843;STB=0.53454;TYPE=snp;VARB=0.0275785;OID=.;OPOS=101611545;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:259:259:139:139:120:120:64:56:56:83:64:56:56:83 chr9 101748234 . G A 127.86 PASS AO=33;DP=75;FAO=33;FDP=75;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=-0.00469456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.018;QD=6.81905;RBI=0.0171334;REFB=-0.00141804;REVB=0.0164777;RO=42;SAF=11;SAR=22;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102011;STB=0.557656;TYPE=snp;VARB=0.00305998;OID=.;OPOS=101748234;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:42:42:33:33:22:11:18:24:22:11:18:24 chr9 101748356 . A G 137.85 PASS AO=15;DP=16;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.079999;FXX=0.062461;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.241;QD=36.7596;RBI=0.0807399;REFB=0;REVB=0.0109125;RO=0;SAF=7;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000872488;OID=.;OPOS=101748356;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:15:0:0:15:15:8:7:0:0:8:7:0:0 chr9 101765795 . G A 211.17 PASS AO=37;DP=59;FAO=37;FDP=59;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=29;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.0270092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.266;QD=14.3164;RBI=0.0284535;REFB=-0.0304893;REVB=-0.00895006;RO=22;SAF=8;SAR=29;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171901;STB=0.594637;TYPE=snp;VARB=0.0135836;OID=.;OPOS=101765795;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:59:59:22:22:37:37:29:8:9:13:29:8:9:13 chr9 101767315 . G A 37.72 PASS AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=-0.0187791;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=134.242;QD=8.38188;RBI=0.0241365;REFB=-0.0221546;REVB=0.015163;RO=10;SAF=1;SAR=7;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136846;STB=0.583101;TYPE=snp;VARB=0.0363952;OID=.;OPOS=101767315;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:18:18:10:10:8:8:7:1:2:8:7:1:2:8 chr9 101784438 . A G 410.45 PASS AO=97;DP=196;FAO=97;FDP=197;FR=.;FRO=100;FSAF=27;FSAR=70;FSRF=33;FSRR=67;FWDB=-0.0132719;FXX=0.00505025;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.67;QD=8.33399;RBI=0.0162571;REFB=-0.0163109;REVB=-0.00938882;RO=95;SAF=27;SAR=70;SRF=33;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0743725;STB=0.531706;TYPE=snp;VARB=0.0159643;OID=.;OPOS=101784438;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:197:95:100:97:97:70:27:33:62:70:27:33:67 chr9 101797679 . C G 289 PASS AO=65;DP=129;FAO=65;FDP=128;FR=.;FRO=63;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=22;FSRR=41;FWDB=0.0229249;FXX=0.0153834;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.6266;QD=9.03116;RBI=0.0316519;REFB=-0.0174065;REVB=-0.0218242;RO=63;SAF=33;SAR=32;SRF=22;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141545;STB=0.577813;TYPE=snp;VARB=0.00925221;OID=.;OPOS=101797679;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:128:63:63:65:65:32:33:22:41:32:33:22:41 chr9 101798636 . TG T 528.33 PASS AO=69;DP=96;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.202089;FXX=0.0104156;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.2889;QD=22.2453;RBI=0.320882;REFB=-0.0634372;REVB=0.24925;RO=16;SAF=38;SAR=31;SRF=6;SRR=10;SSEN=0.441558;SSEP=0;SSSB=0.0621725;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0234109;OID=.;OPOS=101798637;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:69:93:95:95:0:54:41:0:0:36:16:38:31:6:10 chr9 101822220 . C T 223.88 PASS AO=54;DP=113;FAO=54;FDP=113;FR=.;FRO=59;FSAF=10;FSAR=44;FSRF=25;FSRR=34;FWDB=-0.0245547;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=252.125;QD=7.92478;RBI=0.0247275;REFB=-0.00361273;REVB=0.00291816;RO=56;SAF=10;SAR=44;SRF=23;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.273834;STB=0.663725;TYPE=snp;VARB=0.00336719;OID=.;OPOS=101822220;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:56:59:54:54:44:10:23:33:44:10:25:34 chr9 101831995 . G A 66.89 PASS AO=19;DP=51;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=25;FSRR=6;FWDB=-0.0338722;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.6368;QD=5.35091;RBI=0.0586282;REFB=-0.0286122;REVB=-0.0478534;RO=32;SAF=15;SAR=4;SRF=26;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0384505;STB=0.516112;TYPE=snp;VARB=0.0336549;OID=.;OPOS=101831995;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:51:50:32:31:19:19:4:15:26:6:4:15:25:6 chr9 102067887 . G A 292.01 PASS AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00962065;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.1431;QD=38.9349;RBI=0.0658198;REFB=0;REVB=0.0651129;RO=0;SAF=23;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0010148;OID=.;OPOS=102067887;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:30:30:0:0:30:30:7:23:0:0:7:23:0:0 chr9 102068344 . C G 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0439705;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.2536;QD=35.087;RBI=0.0482992;REFB=0;REVB=-0.0199853;RO=0;SAF=6;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00421241;OID=.;OPOS=102068344;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:6:0:0:1:6:0:0 chr9 102068770 . T C 121.4 PASS AO=25;DP=47;FAO=25;FDP=47;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.0182097;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=133.096;QD=10.3317;RBI=0.0186501;REFB=-0.054753;REVB=-0.00402916;RO=22;SAF=10;SAR=15;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123338;STB=0.56891;TYPE=snp;VARB=0.0324908;OID=.;OPOS=102068770;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:47:47:22:22:25:25:15:10:12:10:15:10:12:10 chr9 102068832 . G A 676.23 PASS AO=70;DP=70;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0373953;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.8083;QD=37.5682;RBI=0.082809;REFB=0;REVB=0.0738846;RO=0;SAF=27;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00127139;OID=.;OPOS=102068832;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:70:72:0:0:70:72:43:27:0:0:44:28:0:0 chr9 102595685 . C T 318.14 PASS AO=83;DP=183;FAO=83;FDP=183;FR=.;FRO=100;FSAF=35;FSAR=48;FSRF=34;FSRR=66;FWDB=-0.000315048;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=268.31;QD=6.95382;RBI=0.0161408;REFB=-0.00394497;REVB=0.0161377;RO=100;SAF=35;SAR=48;SRF=34;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0838337;STB=0.546415;TYPE=snp;VARB=0.00443874;OID=.;OPOS=102595685;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:183:100:100:83:83:48:35:34:66:48:35:34:66 chr9 102708055 . A T 26.19 PASS AO=27;DP=118;FAO=31;FDP=137;FR=.;FRO=106;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=43;FSRR=63;FWDB=-0.0151233;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=22.8291;QD=0.764755;RBI=0.0405438;REFB=-0.0106866;REVB=-0.0376176;RO=59;SAF=19;SAR=8;SRF=28;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.276906;STB=0.680973;TYPE=snp;VARB=0.0530842;OID=.;OPOS=102708055;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:118:137:59:106:27:31:8:19:28:31:11:20:43:63 chr9 102713580 . G A 1437.09 PASS AO=151;DP=151;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=123;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0235654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.939;QD=37.8181;RBI=0.0242769;REFB=0;REVB=-0.00583441;RO=0;SAF=29;SAR=122;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.96023e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.99193e-05;OID=.;OPOS=102713580;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:151:152:0:0:151:152:122:29:0:0:123:29:0:0 chr9 102732237 . T C 738.87 PASS AO=76;DP=78;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0477831;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.237;QD=38.383;RBI=0.047798;REFB=0;REVB=-0.00119177;RO=0;SAF=9;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30898e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000163377;OID=.;OPOS=102732237;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:78:77:0:0:76:77:67:9:0:0:68:9:0:0 chr9 102733504 . G A 389.51 PASS AO=99;DP=204;FAO=97;FDP=204;FR=.;FRO=107;FSAF=56;FSAR=41;FSRF=72;FSRR=35;FWDB=0.0569091;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.9276;QD=7.63744;RBI=0.0628598;REFB=-0.00877793;REVB=0.0266967;RO=99;SAF=58;SAR=41;SRF=68;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.096663;STB=0.552178;TYPE=snp;VARB=0.00988429;OID=.;OPOS=102733504;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:204:99:107:99:97:41:58:68:31:41:56:72:35 chr9 102736844 . A G 1277.78 PASS AO=141;DP=147;FAO=142;FDP=146;FR=.;FRO=4;FSAF=49;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.00893221;FXX=0.00680226;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.228;QD=35.0076;RBI=0.016216;REFB=-0.129904;REVB=0.0135342;RO=5;SAF=48;SAR=93;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.010208;STB=0.510525;TYPE=snp;VARB=0.000575686;OID=.;OPOS=102736844;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:147:146:5:4:141:142:93:48:1:4:93:49:0:4 chr9 103054951 . T C 339.45 PASS AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00821458;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.065;QD=37.7173;RBI=0.0142154;REFB=0;REVB=0.0116017;RO=0;SAF=16;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1382e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.98583e-06;OID=.;OPOS=103054951;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:35:36:0:0:35:36:19:16:0:0:20:16:0:0 chr9 104086500 . GC G 32.9 PASS AO=58;DP=194;FAO=54;FDP=182;FR=.;FRO=128;FSAF=13;FSAR=41;FSRF=69;FSRR=59;FWDB=0.0602471;FXX=0.00546418;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.6897;QD=0.723025;RBI=0.13273;REFB=-0.0392415;REVB=-0.118269;RO=114;SAF=12;SAR=46;SRF=67;SRR=47;SSEN=0.435071;SSEP=0;SSSB=-0.458838;STB=0.721064;TYPE=del;VARB=-0.0012322;OID=.;OPOS=104086501;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:58:180:54:182:128:13:41:69:59:32:114:12:46:67:47 chr9 104123252 . C T 147.79 PASS AO=56;DP=168;FAO=56;FDP=168;FR=.;FRO=112;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=51;FSRR=61;FWDB=-0.00646936;FXX=0.0175428;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.023;QD=3.51869;RBI=0.0117872;REFB=-0.00912895;REVB=-0.00985317;RO=108;SAF=29;SAR=27;SRF=48;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0841263;STB=0.541581;TYPE=snp;VARB=0.0171023;OID=.;OPOS=104123252;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:108:112:56:56:27:29:48:60:27:29:51:61 chr9 104130469 . C G 175.05 PASS AO=36;DP=71;FAO=38;FDP=73;FR=.;FRO=35;FSAF=6;FSAR=32;FSRF=6;FSRR=29;FWDB=0.0194598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.814;QD=9.59167;RBI=0.0260705;REFB=-0.0212646;REVB=0.0173491;RO=33;SAF=6;SAR=30;SRF=5;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239715;STB=0.511994;TYPE=snp;VARB=0.0196726;OID=.;OPOS=104130469;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:73:33:35:36:38:30:6:5:28:32:6:6:29 chr9 104133628 . C T 164.2 PASS AO=34;DP=75;FAO=38;FDP=79;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=-0.000481865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.523;QD=8.31404;RBI=0.102983;REFB=-0.012707;REVB=0.102982;RO=41;SAF=13;SAR=21;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128943;STB=0.592285;TYPE=snp;VARB=0.0144486;OID=.;OPOS=104133628;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:79:41:41:34:38:21:13:21:20:25:13:21:20 chr9 104302625 . A G 315.12 PASS AO=81;DP=179;FAO=81;FDP=177;FR=.;FRO=96;FSAF=46;FSAR=35;FSRF=58;FSRR=38;FWDB=-0.0290031;FXX=0.0111726;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0184;QD=7.12138;RBI=0.0290031;REFB=-0.0185898;REVB=4.4207e-05;RO=96;SAF=46;SAR=35;SRF=58;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0363479;STB=0.520144;TYPE=snp;VARB=0.0184786;OID=.;OPOS=104302625;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:177:96:96:81:81:35:46:58:38:35:46:58:38 chr9 104333172 . C T 389.26 PASS AO=108;DP=248;FAO=108;FDP=249;FR=.;FRO=141;FSAF=48;FSAR=60;FSRF=80;FSRR=61;FWDB=0.0151163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.4074;QD=6.25317;RBI=0.0164733;REFB=-0.0167524;REVB=0.00654732;RO=140;SAF=48;SAR=60;SRF=80;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128531;STB=0.569382;TYPE=snp;VARB=0.0214379;OID=.;OPOS=104333172;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:248:249:140:141:108:108:60:48:80:60:60:48:80:61 chr9 104335586 . T A 470.22 PASS AO=124;DP=272;FAO=124;FDP=273;FR=.;FRO=149;FSAF=83;FSAR=41;FSRF=103;FSRR=46;FWDB=0.0221541;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.644;QD=6.8896;RBI=0.0240855;REFB=-0.00396258;REVB=0.00945031;RO=147;SAF=83;SAR=41;SRF=102;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.027481;STB=0.513637;TYPE=snp;VARB=0.00538751;OID=.;OPOS=104335586;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:272:273:147:149:124:124:41:83:102:45:41:83:103:46 chr9 104335690 . C T 429.56 PASS AO=134;DP=336;FAO=134;FDP=334;FR=.;FRO=200;FSAF=67;FSAR=67;FSRF=82;FSRR=118;FWDB=-0.0206708;FXX=0.0059522;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.933;QD=5.14438;RBI=0.029773;REFB=-0.00987307;REVB=-0.0214277;RO=198;SAF=67;SAR=67;SRF=81;SRR=117;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0970449;STB=0.553884;TYPE=snp;VARB=0.0139557;OID=.;OPOS=104335690;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:336:334:198:200:134:134:67:67:81:117:67:67:82:118 chr9 104432873 . T G 501.19 PASS AO=64;DP=196;FAO=66;FDP=196;FR=.,HEALED;FRO=85;FSAF=43;FSAR=23;FSRF=39;FSRR=46;FWDB=0.00659697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.784;QD=10.2284;RBI=0.0262195;REFB=-0.0315655;REVB=0.025376;RO=84;SAF=42;SAR=22;SRF=39;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200418;STB=0.61134;TYPE=snp;VARB=0.0131482;OID=.;OPOS=104432873;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:196:84:85:64:66:22:42:39:45:23:43:39:46 chr9 104433034 . A G 424.23 PASS AO=108;DP=232;FAO=108;FDP=232;FR=.;FRO=124;FSAF=64;FSAR=44;FSRF=67;FSRR=57;FWDB=-0.00461237;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.327;QD=7.31434;RBI=0.0187449;REFB=-0.00685098;REVB=-0.0181686;RO=123;SAF=64;SAR=44;SRF=66;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0552304;STB=0.528618;TYPE=snp;VARB=0.00666673;OID=.;OPOS=104433034;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:232:123:124:108:108:44:64:66:57:44:64:67:57 chr9 104433235 . C T 167.33 PASS AO=54;DP=183;FAO=61;FDP=177;FR=.;FRO=116;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=79;FSRR=37;FWDB=-0.00742052;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=229.71;QD=3.78152;RBI=0.00970898;REFB=-0.0136385;REVB=0.00626101;RO=70;SAF=25;SAR=29;SRF=43;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151796;STB=0.61369;TYPE=snp;VARB=0.0217709;OID=.;OPOS=104433235;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:177:70:116:54:61:29:25:43:27:30:31:79:37 chr9 104433347 . G A 62.61 PASS AO=16;DP=39;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=2;FSRF=21;FSRR=2;FWDB=0.0321045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.6861;QD=6.42167;RBI=0.036238;REFB=-0.00627873;REVB=-0.0168075;RO=23;SAF=14;SAR=2;SRF=21;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0969547;STB=0.555492;TYPE=snp;VARB=0.010004;OID=.;OPOS=104433347;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:39:39:23:23:16:16:2:14:21:2:2:14:21:2 chr9 104449063 . C T 1124.07 PASS AO=97;DP=254;FAO=131;FDP=243;FR=.,HEALED;FRO=56;FSAF=48;FSAR=83;FSRF=2;FSRR=54;FWDB=0.00284204;FXX=0.0121946;HRUN=3;LEN=1;MLLD=107.329;QD=18.5032;RBI=0.0457832;REFB=0.0173665;REVB=-0.0456949;RO=55;SAF=47;SAR=50;SRF=1;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.31916;STB=0.613074;TYPE=snp;VARB=0.0073332;OID=.;OPOS=104449063;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:243:55:56:97:131:50:47:1:54:83:48:2:54 chr9 104449294 . G A 136.09 PASS AO=48;DP=135;FAO=48;FDP=137;FR=.;FRO=89;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=40;FSRR=49;FWDB=0.0445247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.057;QD=3.97346;RBI=0.0470123;REFB=-0.00126648;REVB=-0.0150899;RO=84;SAF=17;SAR=31;SRF=36;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0877616;STB=0.565051;TYPE=snp;VARB=0.00321488;OID=.;OPOS=104449294;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:137:84:89:48:48:31:17:36:48:31:17:40:49 chr9 104499575 . T C 1158.4 PASS AO=120;DP=120;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0484168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.5106;QD=38.6134;RBI=0.0487041;REFB=0;REVB=0.0052816;RO=0;SAF=62;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.84183e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000226551;OID=.;OPOS=104499575;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:120:120:0:0:120:120:58:62:0:0:58:62:0:0 chr9 105419603 . AT A 69.06 PASS AO=27;DP=58;FAO=33;FDP=56;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.0835853;FXX=0.0175408;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.3987;QD=4.93284;RBI=0.123086;REFB=-0.14053;REVB=-0.0903532;RO=25;SAF=7;SAR=20;SRF=10;SRR=15;SSEN=0.319444;SSEP=0;SSSB=-0.144516;STB=0.541486;TYPE=del;VARB=0.118626;OID=.;OPOS=105419604;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:27:57:33:56:23:10:23:9:14:42:25:7:20:10:15 chr9 105780618 . G A 756.96 PASS AO=181;DP=363;FAO=180;FDP=362;FR=.;FRO=182;FSAF=83;FSAR=97;FSRF=72;FSRR=110;FWDB=0.0121228;FXX=0.00275475;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7425;QD=8.36421;RBI=0.0122184;REFB=0.00746572;REVB=-0.00152488;RO=181;SAF=84;SAR=97;SRF=72;SRR=109;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0611771;STB=0.533303;TYPE=snp;VARB=-0.00794866;OID=.;OPOS=105780618;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:363:362:181:182:181:180:97:84:72:109:97:83:72:110 chr9 106896809 . G A 507.69 PASS AO=284;DP=717;FAO=159;FDP=399;FR=.;FRO=240;FSAF=58;FSAR=101;FSRF=97;FSRR=143;FWDB=0.0068799;FXX=0.00249994;HRUN=3;LEN=1;MLLD=131.25;QD=5.08966;RBI=0.0225875;REFB=-0.00470524;REVB=0.0215142;RO=431;SAF=104;SAR=180;SRF=177;SRR=254;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0508386;STB=0.525209;TYPE=snp;VARB=0.00636186;OID=.;OPOS=106896809;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:717:399:431:240:284:159:180:104:177:254:101:58:97:143 chr9 107266596 . T C 395.07 PASS AO=101;DP=216;FAO=101;FDP=216;FR=.;FRO=115;FSAF=52;FSAR=49;FSRF=73;FSRR=42;FWDB=-0.0196201;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=212.58;QD=7.31614;RBI=0.0204869;REFB=-0.00708201;REVB=0.0058964;RO=110;SAF=52;SAR=49;SRF=70;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115608;STB=0.56414;TYPE=snp;VARB=0.00758961;OID=.;OPOS=107266596;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:216:216:110:115:101:101:49:52:70:40:49:52:73:42 chr9 107266774 . C G 388.48 PASS AO=100;DP=214;FAO=99;FDP=213;FR=.;FRO=114;FSAF=31;FSAR=68;FSRF=48;FSRR=66;FWDB=0.00202582;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=201.557;QD=7.29545;RBI=0.00514855;REFB=-0.00692982;REVB=0.00473324;RO=113;SAF=32;SAR=68;SRF=47;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101272;STB=0.563917;TYPE=snp;VARB=0.00565211;OID=.;OPOS=107266774;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:213:113:114:100:99:68:32:47:66:68:31:48:66 chr9 107266844 . A G 199.75 PASS AO=66;DP=182;FAO=68;FDP=184;FR=.;FRO=116;FSAF=29;FSAR=39;FSRF=30;FSRR=86;FWDB=0.0215996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.384;QD=4.34232;RBI=0.027018;REFB=-0.0116196;REVB=-0.0162305;RO=109;SAF=27;SAR=39;SRF=24;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.227599;STB=0.611681;TYPE=snp;VARB=0.0247784;OID=.;OPOS=107266844;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:184:109:116:66:68:39:27:24:85:39:29:30:86 chr9 107266943 . G A 146.79 PASS AO=55;DP=158;FAO=54;FDP=157;FR=.;FRO=103;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=40;FSRR=63;FWDB=-0.00783635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.323;QD=3.73989;RBI=0.0259049;REFB=-0.0110531;REVB=0.0246912;RO=103;SAF=25;SAR=30;SRF=40;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0767331;STB=0.537559;TYPE=snp;VARB=0.0170845;OID=.;OPOS=107266943;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:157:103:103:55:54:30:25:40:63:30:24:40:63 chr9 107267304 . C T 596.63 PASS AO=156;DP=354;FAO=158;FDP=347;FR=.;FRO=189;FSAF=69;FSAR=89;FSRF=84;FSRR=105;FWDB=0.0032955;FXX=0.0225346;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.5126;QD=6.87762;RBI=0.00478844;REFB=-0.0128579;REVB=-0.00347403;RO=186;SAF=69;SAR=87;SRF=84;SRR=102;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00927204;STB=0.504277;TYPE=snp;VARB=0.0132801;OID=.;OPOS=107267304;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:354:347:186:189:156:158:87:69:84:102:89:69:84:105 chr9 107331504 . C A 310.38 PASS AO=81;DP=168;FAO=81;FDP=180;FR=.;FRO=99;FSAF=39;FSAR=42;FSRF=32;FSRR=67;FWDB=-0.026359;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=118.325;QD=6.8973;RBI=0.0359466;REFB=-0.0450335;REVB=-0.024441;RO=87;SAF=39;SAR=42;SRF=24;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195632;STB=0.587702;TYPE=snp;VARB=0.0435158;OID=.;OPOS=107331504;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:180:87:99:81:81:42:39:24:63:42:39:32:67 chr9 107360922 . A G 663.49 PASS AO=150;DP=290;FAO=150;FDP=290;FR=.;FRO=140;FSAF=72;FSAR=78;FSRF=53;FSRR=87;FWDB=-0.0218603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.4594;QD=9.15158;RBI=0.0296945;REFB=-0.0174469;REVB=-0.020097;RO=135;SAF=72;SAR=78;SRF=50;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0957953;STB=0.549231;TYPE=snp;VARB=0.0148745;OID=.;OPOS=107360922;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:290:290:135:140:150:150:78:72:50:85:78:72:53:87 chr9 107361312 . T C 300.86 PASS AO=47;DP=213;FAO=89;FDP=217;FR=.;FRO=128;FSAF=39;FSAR=50;FSRF=82;FSRR=46;FWDB=-0.0146073;FXX=0.009132;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.564;QD=5.54572;RBI=0.0207736;REFB=-0.0171333;REVB=-0.0147705;RO=112;SAF=0;SAR=47;SRF=69;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.837687;STB=0.617699;TYPE=snp;VARB=0.0330557;OID=.;OPOS=107361312;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:217:112:128:47:89:47:0:69:43:50:39:82:46 chr9 107361439 . G C 161.83 PASS AO=52;DP=136;FAO=52;FDP=138;FR=.;FRO=86;FSAF=17;FSAR=35;FSRF=56;FSRR=30;FWDB=-0.0131887;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.106;QD=4.69084;RBI=0.0169496;REFB=0.00344345;REVB=-0.0106465;RO=83;SAF=17;SAR=35;SRF=53;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.334277;STB=0.698013;TYPE=snp;VARB=-0.0133121;OID=.;OPOS=107361439;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:138:83:86:52:52:35:17:53:30:35:17:56:30 chr9 107361449 . T C 21.18 PASS AO=50;DP=127;FAO=18;FDP=96;FR=.;FRO=78;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=51;FSRR=27;FWDB=0.0187745;FXX=0.24998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.754;QD=0.882647;RBI=0.0193462;REFB=0.000825508;REVB=-0.00466859;RO=76;SAF=15;SAR=35;SRF=49;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.365713;STB=0.625209;TYPE=snp;VARB=-0.00119824;OID=.;OPOS=107361449;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:127:96:76:78:50:18:35:15:49:27:4:14:51:27 chr9 107361460 . G A 163.73 PASS AO=46;DP=111;FAO=46;FDP=111;FR=.;FRO=65;FSAF=15;FSAR=31;FSRF=41;FSRR=24;FWDB=0.0468283;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.8924;QD=5.90028;RBI=0.0571053;REFB=-0.0198783;REVB=0.0326822;RO=65;SAF=15;SAR=31;SRF=41;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.315648;STB=0.677783;TYPE=snp;VARB=0.0298904;OID=.;OPOS=107361460;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:65:65:46:46:31:15:41:24:31:15:41:24 chr9 107361490 . A T 111.41 PASS AO=28;DP=64;FAO=28;FDP=63;FR=.;FRO=35;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=27;FSRR=8;FWDB=0.00494789;FXX=0.0156226;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.3812;QD=7.07356;RBI=0.077621;REFB=-0.0132118;REVB=0.0774631;RO=35;SAF=8;SAR=20;SRF=27;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.458538;STB=0.757402;TYPE=snp;VARB=0.0156469;OID=.;OPOS=107361490;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:63:35:35:28:28:20:8:27:8:20:8:27:8 chr9 107361642 . G A 374.17 PASS AO=94;DP=211;FAO=97;FDP=211;FR=.;FRO=114;FSAF=40;FSAR=57;FSRF=54;FSRR=60;FWDB=-0.00388909;FXX=0.0186038;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.913;QD=7.09324;RBI=0.0187522;REFB=0.00571975;REVB=-0.0183444;RO=114;SAF=39;SAR=55;SRF=53;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0503842;STB=0.533765;TYPE=snp;VARB=-0.00712872;OID=.;OPOS=107361642;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:211:114:114:94:97:55:39:53:61:57:40:54:60 chr9 107367132 . G A 366.03 PASS AO=105;DP=258;FAO=109;FDP=265;FR=.;FRO=156;FSAF=53;FSAR=56;FSRF=95;FSRR=61;FWDB=-0.0207735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.8512;QD=5.525;RBI=0.0233498;REFB=-0.057389;REVB=0.0106617;RO=151;SAF=49;SAR=56;SRF=90;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13583;STB=0.572007;TYPE=snp;VARB=0.0715237;OID=.;OPOS=107367132;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:258:265:151:156:105:109:56:49:90:61:56:53:95:61 chr9 107379895 . G T 252.97 PASS AO=64;DP=139;FAO=64;FDP=139;FR=.;FRO=75;FSAF=48;FSAR=16;FSRF=40;FSRR=35;FWDB=0.00215211;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.789;QD=7.27967;RBI=0.00331471;REFB=-0.0207397;REVB=-0.00252106;RO=75;SAF=48;SAR=16;SRF=40;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240926;STB=0.63481;TYPE=snp;VARB=0.0354463;OID=.;OPOS=107379895;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:75:75:64:64:16:48:40:35:16:48:40:35 chr9 107380396 . T G 133.32 PASS AO=50;DP=149;FAO=50;FDP=149;FR=.;FRO=99;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=46;FSRR=53;FWDB=0.0375974;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.15;QD=3.57892;RBI=0.0395562;REFB=-0.00344856;REVB=0.0122934;RO=98;SAF=20;SAR=30;SRF=46;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0815013;STB=0.543938;TYPE=snp;VARB=0.0073314;OID=.;OPOS=107380396;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:98:99:50:50:30:20:46:52:30:20:46:53 chr9 107515214 . G A 2308.06 PASS AO=241;DP=241;FAO=241;FDP=241;FR=.;FRO=0;FSAF=106;FSAR=135;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180384;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.521;QD=38.308;RBI=0.0214525;REFB=0;REVB=0.0116114;RO=0;SAF=106;SAR=135;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.23361e-05;OID=.;OPOS=107515214;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:241:241:0:0:241:241:135:106:0:0:135:106:0:0 chr9 107562804 . T C 276.31 PASS AO=69;DP=149;FAO=69;FDP=148;FR=.;FRO=79;FSAF=26;FSAR=43;FSRF=38;FSRR=41;FWDB=0.00545901;FXX=0.00671096;HRUN=5;LEN=1;MLLD=262.032;QD=7.46787;RBI=0.00600954;REFB=-0.00609904;REVB=-0.00251271;RO=78;SAF=26;SAR=43;SRF=38;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108953;STB=0.55752;TYPE=snp;VARB=0.0071609;OID=.;OPOS=107562804;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:148:78:79:69:69:43:26:38:40:43:26:38:41 chr9 107602678 . G A 374.41 PASS AO=92;DP=196;FAO=95;FDP=204;FR=.;FRO=109;FSAF=41;FSAR=54;FSRF=50;FSRR=59;FWDB=-0.0195284;FXX=0.0377341;HRUN=3;LEN=1;MLLD=178.216;QD=7.3414;RBI=0.0211809;REFB=-0.00700816;REVB=0.00820195;RO=95;SAF=38;SAR=54;SRF=38;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0124417;STB=0.514714;TYPE=snp;VARB=0.00704913;OID=.;OPOS=107602678;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:204:95:109:92:95:54:38:38:57:54:41:50:59 chr9 107620867 . C T 253.53 PASS AO=90;DP=250;FAO=90;FDP=251;FR=.;FRO=161;FSAF=40;FSAR=50;FSRF=65;FSRR=96;FWDB=0.0407774;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.175;QD=4.04039;RBI=0.0410164;REFB=-0.0234561;REVB=-0.00442142;RO=158;SAF=40;SAR=50;SRF=63;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0523917;STB=0.526595;TYPE=snp;VARB=0.0472723;OID=.;OPOS=107620867;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:250:251:158:161:90:90:50:40:63:95:50:40:65:96 chr9 107624029 . C T 818.19 PASS AO=169;DP=299;FAO=169;FDP=301;FR=.;FRO=132;FSAF=86;FSAR=83;FSRF=79;FSRR=53;FWDB=0.0365461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.5615;QD=10.873;RBI=0.0398692;REFB=-0.0107265;REVB=0.0159353;RO=128;SAF=86;SAR=83;SRF=76;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0675866;STB=0.53936;TYPE=snp;VARB=0.009092;OID=.;OPOS=107624029;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:299:301:128:132:169:169:83:86:76:52:83:86:79:53 chr9 108152199 . G A 985.09 PASS AO=106;DP=108;FAO=106;FDP=108;FR=.;FRO=2;FSAF=61;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0125567;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=241.742;QD=36.485;RBI=0.0174293;REFB=-0.0224844;REVB=-0.0120876;RO=2;SAF=61;SAR=45;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0206228;STB=0.510868;TYPE=snp;VARB=-2.56744e-05;OID=.;OPOS=108152199;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:108:108:2:2:106:106:45:61:0:2:45:61:0:2 chr9 108366734 . G A 418.29 PASS AO=95;DP=212;FAO=105;FDP=223;FR=.;FRO=118;FSAF=49;FSAR=56;FSRF=65;FSRR=53;FWDB=0.073929;FXX=0.00446409;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.6439;QD=7.50297;RBI=0.0827545;REFB=-0.0155872;REVB=0.037186;RO=102;SAF=42;SAR=53;SRF=55;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0913286;STB=0.544469;TYPE=snp;VARB=0.0212937;OID=.;OPOS=108366734;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:223:102:118:95:105:53:42:55:47:56:49:65:53 chr9 108380355 . C A 244.87 PASS AO=79;DP=178;FAO=69;FDP=162;FR=.;FRO=93;FSAF=28;FSAR=41;FSRF=28;FSRR=65;FWDB=0.00672735;FXX=0.0121944;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.9912;QD=6.04624;RBI=0.00682245;REFB=-0.0207678;REVB=-0.00113515;RO=94;SAF=38;SAR=41;SRF=29;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171079;STB=0.563812;TYPE=snp;VARB=0.0263178;OID=.;OPOS=108380355;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:162:94:93:79:69:41:38:29:65:41:28:28:65 chr9 109442359 . C A 327.54 PASS AO=69;DP=130;FAO=70;FDP=131;FR=.;FRO=61;FSAF=22;FSAR=48;FSRF=18;FSRR=43;FWDB=0.0130412;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2575;QD=10.0013;RBI=0.0154361;REFB=-0.0219723;REVB=-0.00825828;RO=60;SAF=21;SAR=48;SRF=17;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0212555;STB=0.510451;TYPE=snp;VARB=0.0224547;OID=.;OPOS=109442359;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:131:60:61:69:70:48:21:17:43:48:22:18:43 chr9 109622255 . C T 507.39 PASS AO=111;DP=210;FAO=111;FDP=210;FR=.;FRO=99;FSAF=70;FSAR=41;FSRF=57;FSRR=42;FWDB=-0.0240433;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=233.607;QD=9.66453;RBI=0.024329;REFB=0.00879691;REVB=0.00371732;RO=99;SAF=70;SAR=41;SRF=57;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0500102;STB=0.527362;TYPE=snp;VARB=-0.00756741;OID=.;OPOS=109622255;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:210:210:99:99:111:111:41:70:57:42:41:70:57:42 chr9 109687403 . A G 353.31 PASS AO=72;DP=129;FAO=72;FDP=129;FR=.;FRO=57;FSAF=46;FSAR=26;FSRF=38;FSRR=19;FWDB=0.0165626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.771;QD=10.9553;RBI=0.0433483;REFB=-0.00431264;REVB=0.0400594;RO=57;SAF=46;SAR=26;SRF=38;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0245405;STB=0.513395;TYPE=snp;VARB=0.00338154;OID=.;OPOS=109687403;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:57:57:72:72:26:46:38:19:26:46:38:19 chr9 109689752 . C T 272.16 PASS AO=59;DP=111;FAO=59;FDP=112;FR=.;FRO=53;FSAF=13;FSAR=46;FSRF=10;FSRR=43;FWDB=0.0243824;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.4296;QD=9.72007;RBI=0.0612866;REFB=0.00945971;REVB=0.0562276;RO=52;SAF=13;SAR=46;SRF=9;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.061035;STB=0.52234;TYPE=snp;VARB=-0.00732637;OID=.;OPOS=109689752;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:112:52:53:59:59:46:13:9:43:46:13:10:43 chr9 109689859 . T C 185.6 PASS AO=43;DP=91;FAO=44;FDP=91;FR=.;FRO=47;FSAF=9;FSAR=35;FSRF=13;FSRR=34;FWDB=-0.0434135;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.428;QD=8.15837;RBI=0.0440096;REFB=-0.0343327;REVB=-0.00721899;RO=41;SAF=9;SAR=34;SRF=13;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13047;STB=0.553533;TYPE=snp;VARB=0.0434549;OID=.;OPOS=109689859;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:41:47:43:44:34:9:13:28:35:9:13:34 chr9 109691676 . A G 192.44 PASS AO=46;DP=96;FAO=46;FDP=96;FR=.;FRO=50;FSAF=15;FSAR=31;FSRF=30;FSRR=20;FWDB=0.0134092;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.496;QD=8.01843;RBI=0.0162395;REFB=0.0107588;REVB=0.00916044;RO=50;SAF=15;SAR=31;SRF=30;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.261691;STB=0.645769;TYPE=snp;VARB=-0.0124645;OID=.;OPOS=109691676;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:50:50:46:46:31:15:30:20:31:15:30:20 chr9 110084261 . C T 111.14 PASS AO=35;DP=96;FAO=36;FDP=96;FR=.;FRO=60;FSAF=26;FSAR=10;FSRF=33;FSRR=27;FWDB=-0.00579002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.764;QD=4.63065;RBI=0.0420595;REFB=-0.00463465;REVB=-0.0416591;RO=60;SAF=26;SAR=9;SRF=33;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.238748;STB=0.619775;TYPE=snp;VARB=0.00241028;OID=.;OPOS=110084261;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:60:60:35:36:9:26:33:27:10:26:33:27 chr9 110084328 . C T 381.81 PASS AO=77;DP=144;FAO=80;FDP=147;FR=.;FRO=67;FSAF=39;FSAR=41;FSRF=38;FSRR=29;FWDB=0.00172215;FXX=0.0199987;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.594;QD=10.3894;RBI=0.0103014;REFB=-0.00923746;REVB=0.0101564;RO=66;SAF=37;SAR=40;SRF=38;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.080161;STB=0.536257;TYPE=snp;VARB=0.00615222;OID=.;OPOS=110084328;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:147:66:67:77:80:40:37:38:28:41:39:38:29 chr9 110425506 . A T 119.51 PASS AO=27;DP=55;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.00849224;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=240.495;QD=8.69127;RBI=0.0141707;REFB=-0.0123315;REVB=-0.0113441;RO=28;SAF=12;SAR=15;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0477169;STB=0.526729;TYPE=snp;VARB=0.0111548;OID=.;OPOS=110425506;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:28:28:27:27:15:12:11:17:15:12:11:17 chr9 111618617 . T A 324.61 PASS AO=62;DP=104;FAO=62;FDP=104;FR=.;FRO=42;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=0.0192967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.162;QD=12.4852;RBI=0.0428309;REFB=-0.0238928;REVB=0.0382377;RO=42;SAF=28;SAR=34;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0183573;STB=0.509997;TYPE=snp;VARB=0.0123881;OID=.;OPOS=111618617;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:42:42:62:62:34:28:20:22:34:28:20:22 chr9 111625913 . A G 130.45 PASS AO=39;DP=103;FAO=40;FDP=104;FR=.;FRO=64;FSAF=28;FSAR=12;FSRF=44;FSRR=20;FWDB=-0.0142644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.738;QD=5.01746;RBI=0.0142771;REFB=0.00338827;REVB=0.000600785;RO=64;SAF=27;SAR=12;SRF=44;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00612754;STB=0.509086;TYPE=snp;VARB=-0.00344461;OID=.;OPOS=111625913;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:104:64:64:39:40:12:27:44:20:12:28:44:20 chr9 111653574 . C G 373.1 PASS AO=90;DP=185;FAO=90;FDP=185;FR=.;FRO=95;FSAF=35;FSAR=55;FSRF=37;FSRR=58;FWDB=0.020952;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.7371;QD=8.06711;RBI=0.0361473;REFB=-0.0153388;REVB=-0.0294557;RO=92;SAF=35;SAR=55;SRF=35;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00818406;STB=0.500316;TYPE=snp;VARB=0.0165874;OID=.;OPOS=111653574;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:185:92:95:90:90:55:35:35:57:55:35:37:58 chr9 111754288 . T C 1549.27 PASS AO=165;DP=168;FAO=165;FDP=165;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00537987;FXX=0.0178561;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.282;QD=37.558;RBI=0.022899;REFB=-0.0604513;REVB=0.0222581;RO=0;SAF=81;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.10315e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.45711e-05;OID=.;OPOS=111754288;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:168:165:0:0:165:165:84:81:0:0:84:81:0:0 chr9 111934261 . A G 345.18 PASS AO=79;DP=157;FAO=79;FDP=156;FR=.;FRO=77;FSAF=46;FSAR=33;FSRF=45;FSRR=32;FWDB=0.000774861;FXX=0.00636902;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.115;QD=8.85078;RBI=0.00620063;REFB=-0.0125606;REVB=0.00615202;RO=77;SAF=46;SAR=33;SRF=45;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0019719;STB=0.501084;TYPE=snp;VARB=0.0102522;OID=.;OPOS=111934261;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:156:77:77:79:79:33:46:45:32:33:46:45:32 chr9 111936788 . C T 202.65 PASS AO=48;DP=101;FAO=48;FDP=100;FR=.;FRO=52;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=30;FSRR=22;FWDB=0.00145746;FXX=0.0196059;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.36;QD=8.10608;RBI=0.0168834;REFB=0.00201445;REVB=-0.0168204;RO=52;SAF=26;SAR=22;SRF=30;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0333333;STB=0.518511;TYPE=snp;VARB=-0.00166655;OID=.;OPOS=111936788;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:100:52:52:48:48:22:26:30:22:22:26:30:22 chr9 111945049 . T G 615.75 PASS AO=149;DP=319;FAO=155;FDP=326;FR=.;FRO=171;FSAF=68;FSAR=87;FSRF=59;FSRR=112;FWDB=0.0282998;FXX=0.00305801;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.1617;QD=7.55516;RBI=0.0416131;REFB=-0.00245413;REVB=-0.0305085;RO=170;SAF=63;SAR=86;SRF=58;SRR=112;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.082124;STB=0.5505;TYPE=snp;VARB=0.00290177;OID=.;OPOS=111945049;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:319:326:170:171:149:155:86:63:58:112:87:68:59:112 chr9 111956599 . G A 251.78 PASS AO=65;DP=144;FAO=65;FDP=143;FR=.;FRO=78;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=34;FSRR=44;FWDB=0.00184075;FXX=0.00694396;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.955;QD=7.04287;RBI=0.0204499;REFB=-0.017164;REVB=0.0203669;RO=78;SAF=33;SAR=32;SRF=34;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.070365;STB=0.539111;TYPE=snp;VARB=0.0228555;OID=.;OPOS=111956599;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:143:78:78:65:65:32:33:34:44:32:33:34:44 chr9 112069477 . T A 289.41 PASS AO=72;DP=154;FAO=72;FDP=153;FR=.;FRO=81;FSAF=27;FSAR=45;FSRF=52;FSRR=29;FWDB=-0.0436329;FXX=0.00649309;HRUN=3;LEN=1;MLLD=166.857;QD=7.56625;RBI=0.0440066;REFB=-0.0289372;REVB=-0.00572273;RO=74;SAF=27;SAR=45;SRF=45;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214807;STB=0.640156;TYPE=snp;VARB=0.0226319;OID=.;OPOS=112069477;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:153:74:81:72:72:45:27:45:29:45:27:52:29 chr9 112629397 . G A 472.69 PASS AO=49;DP=59;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.024343;FXX=0.169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.3212;QD=38.587;RBI=0.0243846;REFB=0;REVB=-0.00142339;RO=0;SAF=24;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000458412;OID=.;OPOS=112629397;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:59:49:0:0:49:49:25:24:0:0:25:24:0:0 chr9 112629858 . A G 838.68 PASS AO=65;DP=95;FAO=92;FDP=93;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=41;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0200949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.859;QD=36.0723;RBI=0.0563603;REFB=0;REVB=0.0526562;RO=0;SAF=40;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00915155;OID=.;OPOS=112629858;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:92:93:0:0:65:92:25:40:0:0:51:41:0:0 chr9 112687334 . C T 408.63 PASS AO=106;DP=240;FAO=110;FDP=243;FR=.;FRO=133;FSAF=39;FSAR=71;FSRF=61;FSRR=72;FWDB=0.0369688;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.3811;QD=6.72642;RBI=0.037087;REFB=-0.000851311;REVB=0.00295794;RO=133;SAF=39;SAR=67;SRF=61;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.094881;STB=0.560058;TYPE=snp;VARB=0.00189265;OID=.;OPOS=112687334;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:240:243:133:133:106:110:67:39:61:72:71:39:61:72 chr9 112852717 . C T 202.02 PASS AO=59;DP=143;FAO=59;FDP=143;FR=.;FRO=84;FSAF=12;FSAR=47;FSRF=13;FSRR=71;FWDB=0.0346515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.0195;QD=5.651;RBI=0.0364944;REFB=-0.0154911;REVB=0.0114505;RO=83;SAF=12;SAR=47;SRF=12;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101623;STB=0.546492;TYPE=snp;VARB=0.059371;OID=.;OPOS=112852717;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:83:84:59:59:47:12:12:71:47:12:13:71 chr9 112899361 . A C 180.34 PASS AO=34;DP=57;FAO=34;FDP=58;FR=.;FRO=24;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.0359138;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.644;QD=12.437;RBI=0.0369947;REFB=-0.0636338;REVB=-0.00887766;RO=23;SAF=20;SAR=14;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0819107;STB=0.554383;TYPE=snp;VARB=0.039505;OID=.;OPOS=112899361;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:57:58:23:24:34:34:14:20:11:12:14:20:11:13 chr9 112931499 . C T 129.17 PASS AO=36;DP=87;FAO=36;FDP=87;FR=.;FRO=51;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=31;FWDB=-0.000812956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.149;QD=5.9387;RBI=0.0181806;REFB=-0.0102983;REVB=-0.0181624;RO=51;SAF=21;SAR=15;SRF=20;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196358;STB=0.610945;TYPE=snp;VARB=0.0301121;OID=.;OPOS=112931499;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:51:51:36:36:15:21:20:31:15:21:20:31 chr9 112932329 . G A 1957.21 PASS AO=209;DP=209;FAO=211;FDP=211;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=126;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136305;FXX=0.014018;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.201;QD=37.1035;RBI=0.0159782;REFB=-0.00112429;REVB=0.00833736;RO=0;SAF=84;SAR=125;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.03322e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000121362;OID=.;OPOS=112932329;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:209:211:0:0:209:211:125:84:0:0:126:85:0:0 chr9 112960869 . A G 495.74 PASS AO=110;DP=210;FAO=110;FDP=210;FR=.;FRO=100;FSAF=51;FSAR=59;FSRF=60;FSRR=40;FWDB=0.00815463;FXX=0.00943352;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.467;QD=9.44271;RBI=0.00866216;REFB=-0.0271334;REVB=-0.00292149;RO=95;SAF=51;SAR=59;SRF=57;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115337;STB=0.564655;TYPE=snp;VARB=0.0263302;OID=.;OPOS=112960869;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:210:210:95:100:110:110:59:51:57:38:59:51:60:40 chr9 112963504 . A G 1735.85 PASS AO=178;DP=178;FAO=180;FDP=180;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00954371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.791;QD=38.5745;RBI=0.0159624;REFB=0;REVB=-0.0127951;RO=0;SAF=78;SAR=100;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.4611e-06;OID=.;OPOS=112963504;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:178:180:0:0:178:180:100:78:0:0:101:79:0:0 chr9 112963702 . G A 187.85 PASS AO=33;DP=53;FAO=33;FDP=52;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=18;FWDB=-0.0205615;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.916;QD=14.4498;RBI=0.0320917;REFB=8.58824e-05;REVB=0.0246395;RO=19;SAF=2;SAR=31;SRF=1;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239373;STB=0.513081;TYPE=snp;VARB=-0.0001241;OID=.;OPOS=112963702;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:53:52:19:19:33:33:31:2:1:18:31:2:1:18 chr9 113006420 . A G 147.04 PASS AO=38;DP=170;FAO=62;FDP=191;FR=.,HEALED;FRO=129;FSAF=53;FSAR=9;FSRF=59;FSRR=70;FWDB=0.00135235;FXX=0.0154631;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.876;QD=3.07938;RBI=0.020972;REFB=-0.00345277;REVB=-0.0209284;RO=82;SAF=35;SAR=3;SRF=54;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.498703;STB=0.805858;TYPE=snp;VARB=0.0141465;OID=.;OPOS=113006420;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:191:82:129:38:62:3:35:54:28:9:53:59:70 chr9 113128561 . TGAGGGTAG T 49.16 PASS AO=32;DP=154;FAO=33;FDP=144;FR=.;FRO=111;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=63;FSRR=48;FWDB=0.0016076;FXX=0.0270252;HRUN=1;LEN=8;MLLD=301.79;QD=1.36554;RBI=0.0234049;REFB=-0.00703957;REVB=-0.0233496;RO=98;SAF=20;SAR=12;SRF=58;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0434132;STB=0.555521;TYPE=del;VARB=0.0254026;OID=.;OPOS=113128562;OREF=GAGGGTAG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:32:143:33:144:111:21:12:63:48:49:98:20:12:58:40 chr9 113132221 . G A 267.14 PASS AO=79;DP=194;FAO=79;FDP=193;FR=.;FRO=114;FSAF=52;FSAR=27;FSRF=71;FSRR=43;FWDB=-0.00704156;FXX=0.00515437;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.4006;QD=5.53661;RBI=0.0205262;REFB=-0.00552621;REVB=0.0192806;RO=114;SAF=52;SAR=27;SRF=71;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0408096;STB=0.522907;TYPE=snp;VARB=0.00754281;OID=.;OPOS=113132221;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:193:114:114:79:79:27:52:71:43:27:52:71:43 chr9 113166792 . A T 386.45 PASS AO=102;DP=226;FAO=102;FDP=226;FR=.;FRO=124;FSAF=58;FSAR=44;FSRF=53;FSRR=71;FWDB=-0.047936;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.5212;QD=6.83974;RBI=0.0499408;REFB=-0.0141157;REVB=0.0140079;RO=123;SAF=58;SAR=44;SRF=52;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143505;STB=0.577274;TYPE=snp;VARB=0.0191843;OID=.;OPOS=113166792;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:226:226:123:124:102:102:44:58:52:71:44:58:53:71 chr9 113169126 . G A 79.34 PASS AO=33;DP=111;FAO=34;FDP=112;FR=.;FRO=78;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=36;FSRR=42;FWDB=0.0118982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6945;QD=2.83365;RBI=0.0210076;REFB=-0.0106195;REVB=0.0173133;RO=76;SAF=12;SAR=21;SRF=35;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119154;STB=0.5789;TYPE=snp;VARB=0.0292044;OID=.;OPOS=113169126;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:111:112:76:78:33:34:21:12:35:41:22:12:36:42 chr9 113192655 . T G 568.11 PASS AO=135;DP=273;FAO=135;FDP=272;FR=.;FRO=137;FSAF=71;FSAR=64;FSRF=61;FSRR=76;FWDB=0.0237922;FXX=0.00366287;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.179;QD=8.35452;RBI=0.0239256;REFB=-0.00326478;REVB=-0.00252296;RO=136;SAF=71;SAR=64;SRF=60;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0774037;STB=0.540564;TYPE=snp;VARB=0.00341386;OID=.;OPOS=113192655;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:273:272:136:137:135:135:64:71:60:76:64:71:61:76 chr9 113220820 . C T 468.45 PASS AO=92;DP=157;FAO=92;FDP=157;FR=.;FRO=65;FSAF=45;FSAR=47;FSRF=24;FSRR=41;FWDB=0.0330066;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.4267;QD=11.9351;RBI=0.0330268;REFB=-0.0286304;REVB=-0.00115416;RO=65;SAF=45;SAR=47;SRF=24;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0917091;STB=0.54976;TYPE=snp;VARB=0.0215001;OID=.;OPOS=113220820;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:157:65:65:92:92:47:45:24:41:47:45:24:41 chr9 113233720 . G A 603.69 PASS AO=129;DP=233;FAO=128;FDP=233;FR=.;FRO=105;FSAF=88;FSAR=40;FSRF=81;FSRR=24;FWDB=0.00726472;FXX=0.00427332;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.684;QD=10.3638;RBI=0.032112;REFB=-0.0245304;REVB=0.0312795;RO=103;SAF=89;SAR=40;SRF=79;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0760238;STB=0.545506;TYPE=snp;VARB=0.0246396;OID=.;OPOS=113233720;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:233:233:103:105:129:128:40:89:79:24:40:88:81:24 chr9 113259152 . T G 502.28 PASS AO=126;DP=265;FAO=126;FDP=266;FR=.;FRO=140;FSAF=66;FSAR=60;FSRF=76;FSRR=64;FWDB=0.0291407;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.788;QD=7.55311;RBI=0.0337575;REFB=0.0105452;REVB=0.0170408;RO=139;SAF=66;SAR=60;SRF=76;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0219265;STB=0.510056;TYPE=snp;VARB=-0.0105949;OID=.;OPOS=113259152;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:265:266:139:140:126:126:60:66:76:63:60:66:76:64 chr9 113276356 . C G 406.42 PASS AO=107;DP=247;FAO=110;FDP=249;FR=.;FRO=139;FSAF=48;FSAR=62;FSRF=63;FSRR=76;FWDB=0.0164885;FXX=0.00796781;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.1576;QD=6.52877;RBI=0.0165572;REFB=0.0129185;REVB=0.00150671;RO=138;SAF=46;SAR=61;SRF=63;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0273831;STB=0.50955;TYPE=snp;VARB=-0.0175823;OID=.;OPOS=113276356;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:247:249:138:139:107:110:61:46:63:75:62:48:63:76 chr9 113302016 . G A 3807.82 PASS AO=881;DP=906;FAO=400;FDP=400;FR=.;FRO=0;FSAF=242;FSAR=158;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0353964;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.6056;QD=38.0782;RBI=0.0354539;REFB=0;REVB=-0.00201772;RO=23;SAF=512;SAR=369;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000795127;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.30435e-05;OID=.;OPOS=113302016;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:906:400:23:0:881:400:369:512:13:10:158:242:0:0 chr9 113524511 . AT A 103.98 PASS AO=60;DP=203;FAO=63;FDP=177;FR=.;FRO=114;FSAF=24;FSAR=39;FSRF=43;FSRR=71;FWDB=0.113242;FXX=0.110547;HRUN=2;LEN=1;MLLD=23.894;QD=2.34991;RBI=0.113312;REFB=-0.0148284;REVB=0.00399655;RO=94;SAF=23;SAR=37;SRF=38;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0237334;STB=0.502569;TYPE=del;VARB=0.0291858;OID=.;OPOS=113524512;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:60:171:63:177:114:24:39:43:71:99:94:23:37:38:56 chr9 113550168 . T C 619.55 PASS AO=70;DP=75;FAO=72;FDP=75;FR=.;FRO=3;FSAF=33;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0120541;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.2455;QD=33.0427;RBI=0.0555802;REFB=0.00814378;REVB=-0.0542573;RO=4;SAF=31;SAR=39;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00590301;STB=0.505038;TYPE=snp;VARB=-0.00215066;OID=.;OPOS=113550168;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:75:75:4:3:70:72:39:31:2:2:39:33:1:2 chr9 113636387 . ATTTTTTTA ATTTTTTA,ATTTTTT,ATTTTTTT 111.29 PASS AO=12,17,12;DP=88;FAO=13,28,5;FDP=56;FR=.;FRO=10;FSAF=4,11,1;FSAR=9,17,4;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=-0.175837,-0.152686,-0.118777;FXX=0.211238;HRUN=7,7,7;LEN=1,2,1;MLLD=6.77711,11.5212,7.93695;QD=7.94947;RBI=0.189869,0.379227,0.618613;REFB=-0.0217159,0.0838957,0.180385;REVB=-0.0716347,-0.347131,-0.607104;RO=8;SAF=10,0,0;SAR=2,17,12;SRF=6;SRR=2;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.0967732,-0.854338,-0.837201;STB=0.557293,0.554398,0.5;TYPE=del,del,del;VARB=0.187764,-0.00400384,-0.0538692;OID=.,.,.;OPOS=113636388,113636394,113636395;OREF=T,TA,A;OALT=-,-,-;OMAPALT=ATTTTTTA,ATTTTTT,ATTTTTTT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:12,17,12:65:13,28,5:56:10:4,11,1:9,17,4:2:8:8:8:10,0,0:2,17,12:6:2 chr9 114090279 . A G 181.23 PASS AO=39;DP=78;FAO=39;FDP=75;FR=.;FRO=36;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=0.0465733;FXX=0.0384566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.9895;QD=9.66551;RBI=0.0465981;REFB=-0.0295548;REVB=-0.00152182;RO=37;SAF=17;SAR=22;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0273308;STB=0.535252;TYPE=snp;VARB=0.0291473;OID=.;OPOS=114090279;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:75:37:36:39:39:22:17:15:22:21:18:14:22 chr9 114174415 . T C 505.37 PASS AO=105;DP=189;FAO=105;FDP=190;FR=.;FRO=85;FSAF=34;FSAR=71;FSRF=32;FSRR=53;FWDB=-0.00481345;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.676;QD=10.6394;RBI=0.00685843;REFB=-0.0162573;REVB=0.00488556;RO=83;SAF=34;SAR=71;SRF=32;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0558316;STB=0.526393;TYPE=snp;VARB=0.0122641;OID=.;OPOS=114174415;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:190:83:85:105:105:71:34:32:51:71:34:32:53 chr9 114304275 . G A 502.3 PASS AO=107;DP=200;FAO=108;FDP=201;FR=.;FRO=93;FSAF=79;FSAR=29;FSRF=67;FSRR=26;FWDB=-0.0165612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.091;QD=9.99598;RBI=0.0176016;REFB=-0.00539774;REVB=0.00596169;RO=91;SAF=78;SAR=29;SRF=65;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0155147;STB=0.506468;TYPE=snp;VARB=0.00523838;OID=.;OPOS=114304275;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:200:201:91:93:107:108:29:78:65:26:29:79:67:26 chr9 114359624 . C A 416.84 PASS AO=110;DP=243;FAO=110;FDP=243;FR=.;FRO=133;FSAF=63;FSAR=47;FSRF=59;FSRR=74;FWDB=-0.00575522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.644;QD=6.86155;RBI=0.0129193;REFB=-0.00180262;REVB=-0.0115666;RO=131;SAF=63;SAR=47;SRF=59;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120344;STB=0.570699;TYPE=snp;VARB=0.00246065;OID=.;OPOS=114359624;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:243:243:131:133:110:110:47:63:59:72:47:63:59:74 chr9 114366094 . G C 310.08 PASS AO=70;DP=137;FAO=70;FDP=137;FR=.;FRO=67;FSAF=23;FSAR=47;FSRF=28;FSRR=39;FWDB=-0.0132476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.461;QD=9.05341;RBI=0.0139687;REFB=-0.0300149;REVB=0.00443014;RO=67;SAF=23;SAR=47;SRF=28;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0868223;STB=0.547872;TYPE=snp;VARB=0.025528;OID=.;OPOS=114366094;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:67:67:70:70:47:23:28:39:47:23:28:39 chr9 114371322 . T C 408.01 PASS AO=100;DP=208;FAO=100;FDP=209;FR=.;FRO=109;FSAF=35;FSAR=65;FSRF=36;FSRR=73;FWDB=0.00965406;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.175;QD=7.80872;RBI=0.0133555;REFB=-0.00723855;REVB=0.00922861;RO=106;SAF=35;SAR=65;SRF=35;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0204855;STB=0.511379;TYPE=snp;VARB=0.00854688;OID=.;OPOS=114371322;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:209:106:109:100:100:65:35:35:71:65:35:36:73 chr9 114454580 . A G 2291.62 PASS AO=248;DP=256;FAO=253;FDP=255;FR=.;FRO=2;FSAF=146;FSAR=107;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0373052;FXX=0.0039061;HRUN=4;LEN=1;MLLD=102.391;QD=35.9469;RBI=0.0388091;REFB=-0.0162422;REVB=-0.0106989;RO=3;SAF=146;SAR=102;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00599981;STB=0.500619;TYPE=snp;VARB=0.000342338;OID=.;OPOS=114454580;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:256:255:3:2:248:253:102:146:1:2:107:146:1:1 chr9 114466189 . A G 167.33 PASS AO=40;DP=84;FAO=40;FDP=84;FR=.;FRO=44;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=26;FSRR=18;FWDB=-0.0191505;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.004;QD=7.9682;RBI=0.022005;REFB=-0.00899686;REVB=0.0108387;RO=44;SAF=26;SAR=14;SRF=26;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0596562;STB=0.533316;TYPE=snp;VARB=0.0083134;OID=.;OPOS=114466189;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:44:44:40:40:14:26:26:18:14:26:26:18 chr9 115024775 . AG A 1073.25 PASS AO=135;DP=166;FAO=160;FDP=160;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0644925;FXX=0.00621079;HRUN=3;LEN=1;MLLD=17.1329;QD=26.8313;RBI=0.213999;REFB=0.00498921;REVB=0.20405;RO=17;SAF=67;SAR=68;SRF=3;SRR=14;SSEN=0.451327;SSEP=0;SSSB=0.0677278;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00533666;OID=.;OPOS=115024776;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:135:160:160:160:0:73:87:0:0:91:17:67:68:3:14 chr9 115567184 . T C 2012.05 PASS AO=214;DP=219;FAO=216;FDP=216;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=144;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0606184;FXX=0.013698;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.127;QD=37.2603;RBI=0.0643018;REFB=-0.011654;REVB=0.0214505;RO=4;SAF=71;SAR=143;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00661287;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000419083;OID=.;OPOS=115567184;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:219:216:4:0:214:216:143:71:2:2:144:72:0:0 chr9 115580008 . G C 1397.15 PASS AO=145;DP=145;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0315629;FXX=0.00680226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.706;QD=38.2781;RBI=0.0319213;REFB=0;REVB=-0.00477009;RO=0;SAF=72;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.00959e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00026523;OID=.;OPOS=115580008;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:145:146:0:0:145:146:73:72:0:0:74:72:0:0 chr9 115600848 . T C 1949.41 PASS AO=206;DP=214;FAO=207;FDP=207;FR=.;FRO=0;FSAF=100;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00999521;FXX=0.0416647;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.908;QD=37.6697;RBI=0.0229739;REFB=0.0223137;REVB=0.0206857;RO=2;SAF=99;SAR=107;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0095248;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000243147;OID=.;OPOS=115600848;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:214:207:2:0:206:207:107:99:2:0:107:100:0:0 chr9 115617061 . T C 965.24 PASS AO=99;DP=99;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.045927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.77;QD=37.8524;RBI=0.0497878;REFB=0;REVB=-0.0192234;RO=0;SAF=50;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000108846;OID=.;OPOS=115617061;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:99:102:0:0:99:102:49:50:0:0:51:51:0:0 chr9 115632898 . G A 484.47 PASS AO=132;DP=302;FAO=134;FDP=306;FR=.;FRO=172;FSAF=50;FSAR=84;FSRF=57;FSRR=115;FWDB=-0.0185833;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.743;QD=6.333;RBI=0.0224358;REFB=-0.0186562;REVB=0.0125708;RO=170;SAF=49;SAR=83;SRF=56;SRR=114;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0460685;STB=0.525395;TYPE=snp;VARB=0.0252584;OID=.;OPOS=115632898;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:302:306:170:172:132:134:83:49:56:114:84:50:57:115 chr9 115632969 . A G 2710.8 PASS AO=277;DP=282;FAO=287;FDP=287;FR=.;FRO=0;FSAF=117;FSAR=170;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0911354;FXX=0.0034721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.5;QD=37.7812;RBI=0.0986756;REFB=-0.0224297;REVB=0.0378315;RO=2;SAF=114;SAR=163;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00829094;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00027201;OID=.;OPOS=115632969;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:282:287:2:0:277:287:163:114:2:0:170:117:0:0 chr9 115635641 . C G 2387.5 PASS AO=248;DP=249;FAO=248;FDP=248;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=145;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152567;FXX=0.0040159;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.844;QD=38.5081;RBI=0.0167356;REFB=0;REVB=-0.00687855;RO=0;SAF=103;SAR=145;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.68071e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.82385e-05;OID=.;OPOS=115635641;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:249:248:0:0:248:248:145:103:0:0:145:103:0:0 chr9 115637050 . G GT,GTT 752.11 PASS AO=88,51;DP=202;FAO=159,18;FDP=177;FR=.;FRO=0;FSAF=82,12;FSAR=77,6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0336084,-0.0174263;FXX=0.092303;HRUN=7,7;LEN=1,2;MLLD=9.00613,10.3337;QD=16.9968;RBI=0.13907,0.0702643;REFB=0.0566692,0.0680779;REVB=-0.134948,-0.068069;RO=52;SAF=40,32;SAR=48,19;SRF=31;SRR=21;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0971447,0.0302276;STB=0.5,0.5;TYPE=ins,ins;VARB=-0.0715561,-0.0264849;OID=.,.;OPOS=115637051,115637051;OREF=-,-;OALT=T,TT;OMAPALT=GT,GTT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:88,51:202:159,18:177:0:82,12:77,6:0:0:8:52:40,32:48,19:31:21 chr9 115652836 . G A 72.9 PASS AO=18;DP=42;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.00510396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.9836;QD=6.94252;RBI=0.0129285;REFB=-0.00654777;REVB=-0.0118784;RO=24;SAF=7;SAR=11;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153275;STB=0.588136;TYPE=snp;VARB=0.00464024;OID=.;OPOS=115652836;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:42:42:24:24:18:18:11:7:13:11:11:7:13:11 chr9 115818949 . A T 26.7 PASS AO=7;DP=21;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.0688249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.837;QD=5.08643;RBI=0.069322;REFB=0.00638847;REVB=0.00828668;RO=14;SAF=1;SAR=6;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237013;STB=0.651669;TYPE=snp;VARB=-0.00728359;OID=.;OPOS=115818949;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:21:21:14:14:7:7:6:1:4:10:6:1:4:10 chr9 115913321 . G A 15.36 PASS AO=3;DP=9;FAO=3;FDP=9;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.00342627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.245;QD=6.82572;RBI=0.00342627;REFB=-0.000204607;REVB=0;RO=6;SAF=3;SAR=0;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000686067;OID=.;OPOS=115913321;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:9:9:6:6:3:3:0:3:6:0:0:3:6:0 chr9 115925104 . C T 490.46 PASS AO=120;DP=249;FAO=120;FDP=249;FR=.;FRO=129;FSAF=42;FSAR=78;FSRF=62;FSRR=67;FWDB=0.012048;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.519;QD=7.87879;RBI=0.0248533;REFB=-0.011313;REVB=-0.0217378;RO=125;SAF=42;SAR=78;SRF=58;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111726;STB=0.571175;TYPE=snp;VARB=0.013226;OID=.;OPOS=115925104;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:249:249:125:129:120:120:78:42:58:67:78:42:62:67 chr9 115926197 . TG T 1070.42 PASS AO=131;DP=147;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130136;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=24.1421;QD=30.1528;RBI=0.159593;REFB=0;REVB=-0.159061;RO=1;SAF=83;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0.677419;SSEP=0;SSSB=-0.00569237;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.00172177;OID=.;OPOS=115926198;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:131:142:142:142:0:88:54:0:0:96:1:83:48:1:0 chr9 115926263 . C G 310.15 PASS AO=79;DP=171;FAO=79;FDP=171;FR=.;FRO=92;FSAF=42;FSAR=37;FSRF=46;FSRR=46;FWDB=0.0263057;FXX=0.01156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.582;QD=7.25495;RBI=0.0289274;REFB=-0.018013;REVB=-0.0120336;RO=92;SAF=42;SAR=37;SRF=46;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0307657;STB=0.517053;TYPE=snp;VARB=0.0116897;OID=.;OPOS=115926263;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:171:92:92:79:79:37:42:46:46:37:42:46:46 chr9 115928275 . T C 895.49 PASS AO=96;DP=100;FAO=96;FDP=98;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0246744;FXX=0.019998;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.899;QD=36.5505;RBI=0.0383382;REFB=-0.0196309;REVB=0.0293426;RO=2;SAF=33;SAR=63;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0148164;STB=0.507811;TYPE=snp;VARB=0.000399781;OID=.;OPOS=115928275;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:100:98:2:2:96:96:63:33:0:2:63:33:0:2 chr9 115931692 . A G 101.3 PASS AO=34;DP=96;FAO=34;FDP=96;FR=.;FRO=62;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=44;FWDB=0.0620097;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3302;QD=4.22069;RBI=0.0883562;REFB=-0.0123587;REVB=-0.0629413;RO=56;SAF=18;SAR=16;SRF=15;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.283138;STB=0.652091;TYPE=snp;VARB=0.0316079;OID=.;OPOS=115931692;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:56:62:34:34:16:18:15:41:16:18:18:44 chr9 115931703 . G A 274.16 PASS AO=57;DP=104;FAO=57;FDP=104;FR=.;FRO=47;FSAF=20;FSAR=37;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=0.00303448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.554;QD=10.5446;RBI=0.024497;REFB=-0.0139232;REVB=0.0243083;RO=47;SAF=20;SAR=37;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0474602;STB=0.526057;TYPE=snp;VARB=0.0126846;OID=.;OPOS=115931703;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:47:47:57:57:37:20:19:28:37:20:19:28 chr9 115950706 . A C 121.48 PASS AO=33;DP=79;FAO=33;FDP=79;FR=.;FRO=46;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=-0.0113601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.627;QD=6.15086;RBI=0.0128876;REFB=-0.0103138;REVB=-0.00608601;RO=43;SAF=15;SAR=18;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106691;STB=0.51388;TYPE=snp;VARB=0.0148235;OID=.;OPOS=115950706;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:43:46:33:33:18:15:20:23:18:15:22:24 chr9 115968797 . C T 427.73 PASS AO=109;DP=235;FAO=110;FDP=236;FR=.;FRO=126;FSAF=67;FSAR=43;FSRF=59;FSRR=67;FWDB=0.0036063;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.624;QD=7.24972;RBI=0.0100858;REFB=-5.89136e-05;REVB=-0.00941904;RO=126;SAF=66;SAR=43;SRF=59;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134826;STB=0.576308;TYPE=snp;VARB=0.000202277;OID=.;OPOS=115968797;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:235:236:126:126:109:110:43:66:59:67:43:67:59:67 chr9 115985499 . G C 264.27 PASS AO=65;DP=135;FAO=64;FDP=134;FR=.;FRO=70;FSAF=39;FSAR=25;FSRF=49;FSRR=21;FWDB=-0.00771919;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.42;QD=7.8886;RBI=0.0178747;REFB=-0.000881281;REVB=-0.016122;RO=69;SAF=39;SAR=26;SRF=49;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109796;STB=0.550811;TYPE=snp;VARB=0.00137859;OID=.;OPOS=115985499;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:134:69:70:65:64:26:39:49:20:25:39:49:21 chr9 116028559 . C A 153.04 PASS AO=41;DP=95;FAO=41;FDP=95;FR=.;FRO=54;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=20;FSRR=34;FWDB=0.00519218;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=229.806;QD=6.44375;RBI=0.00987669;REFB=-0.00643133;REVB=-0.0084018;RO=53;SAF=15;SAR=26;SRF=20;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0123864;STB=0.502761;TYPE=snp;VARB=0.00848748;OID=.;OPOS=116028559;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:53:54:41:41:26:15:20:33:26:15:20:34 chr9 116044998 . A G 99.78 PASS AO=23;DP=49;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=6;FWDB=0.0133357;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=252.769;QD=8.14512;RBI=0.0197015;REFB=-0.0171715;REVB=-0.0145021;RO=26;SAF=14;SAR=9;SRF=20;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165817;STB=0.592948;TYPE=snp;VARB=0.0172641;OID=.;OPOS=116044998;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:26:26:23:23:9:14:20:6:9:14:20:6 chr9 116060124 . T C 50.33 PASS AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=2;FWDB=-0.0170833;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.5489;QD=8.38809;RBI=0.0746983;REFB=0.0411237;REVB=0.0727186;RO=11;SAF=9;SAR=2;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.526269;TYPE=snp;VARB=-0.0416104;OID=.;OPOS=116060124;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:24:24:11:13:11:11:2:9:9:2:2:9:11:2 chr9 116060221 . C T 85.5 PASS AO=17;DP=33;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=2;FWDB=0.0344761;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8731;QD=10.6871;RBI=0.0418179;REFB=-0.0368586;REVB=0.0236672;RO=14;SAF=11;SAR=6;SRF=13;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.273766;STB=0.620565;TYPE=snp;VARB=0.0274658;OID=.;OPOS=116060221;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:33:32:14:15:17:17:6:11:13:1:6:11:13:2 chr9 116060487 . T C 68.08 PASS AO=20;DP=51;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=-0.0520647;FXX=0.019604;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3297;QD=5.44609;RBI=0.0578091;REFB=0.00917163;REVB=0.0251229;RO=31;SAF=6;SAR=14;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103332;STB=0.59047;TYPE=snp;VARB=-0.0111495;OID=.;OPOS=116060487;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:51:50:31:31:20:19:14:6:12:19:14:5:12:19 chr9 116061628 . T C 238.66 PASS AO=56;DP=114;FAO=56;FDP=114;FR=.;FRO=58;FSAF=39;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=33;FWDB=-0.0271834;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.3211;QD=8.37397;RBI=0.027402;REFB=-0.0595894;REVB=0.00345389;RO=56;SAF=39;SAR=17;SRF=25;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.238742;STB=0.641817;TYPE=snp;VARB=0.055042;OID=.;OPOS=116061628;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:56:58:56:56:17:39:25:31:17:39:25:33 chr9 116078520 . T C 249.68 PASS AO=61;DP=129;FAO=61;FDP=129;FR=.;FRO=68;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=37;FSRR=31;FWDB=-0.000215493;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.5103;QD=7.74196;RBI=0.0332634;REFB=-0.0125199;REVB=-0.0332627;RO=67;SAF=27;SAR=34;SRF=36;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.089554;STB=0.553531;TYPE=snp;VARB=0.0160257;OID=.;OPOS=116078520;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:67:68:61:61:34:27:36:31:34:27:37:31 chr9 116091227 . C T 323.36 PASS AO=72;DP=140;FAO=72;FDP=140;FR=.;FRO=68;FSAF=40;FSAR=32;FSRF=27;FSRR=41;FWDB=-0.0167546;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.195;QD=9.23872;RBI=0.0180757;REFB=-0.0221536;REVB=-0.00678331;RO=66;SAF=40;SAR=32;SRF=26;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140141;STB=0.576598;TYPE=snp;VARB=0.0245049;OID=.;OPOS=116091227;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:66:68:72:72:32:40:26:40:32:40:27:41 chr9 116122954 . A G 101.41 PASS AO=29;DP=73;FAO=29;FDP=73;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=28;FSRR=16;FWDB=-0.0109723;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=190.004;QD=5.55672;RBI=0.026521;REFB=0.00205979;REVB=-0.0241448;RO=44;SAF=16;SAR=13;SRF=28;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0915106;STB=0.552088;TYPE=snp;VARB=-0.00374469;OID=.;OPOS=116122954;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:44:44:29:29:13:16:28:16:13:16:28:16 chr9 116356373 . G C 748.25 PASS AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0678756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.4612;QD=38.3719;RBI=0.0692046;REFB=0;REVB=0.0134973;RO=0;SAF=1;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.22111e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000680369;OID=.;OPOS=116356373;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:78:78:0:0:78:78:77:1:0:0:77:1:0:0 chr9 116356516 . A G 86.76 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0317365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.707;QD=38.5593;RBI=0.034235;REFB=0;REVB=-0.0128386;RO=0;SAF=1;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000659084;OID=.;OPOS=116356516;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:8:1:0:0:8:1:0:0 chr9 116764283 . C T 156.1 PASS AO=43;DP=103;FAO=43;FDP=102;FR=.;FRO=59;FSAF=12;FSAR=31;FSRF=22;FSRR=37;FWDB=0.026937;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.33;QD=6.1216;RBI=0.0285454;REFB=-0.00940882;REVB=0.00944674;RO=59;SAF=12;SAR=31;SRF=22;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112424;STB=0.563605;TYPE=snp;VARB=0.019454;OID=.;OPOS=116764283;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:102:59:59:43:43:31:12:22:37:31:12:22:37 chr9 116770776 . C T 59.69 PASS AO=13;DP=31;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.0105852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.062;QD=7.46184;RBI=0.0107444;REFB=0.00100379;REVB=0.00184286;RO=17;SAF=5;SAR=8;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0861396;STB=0.540482;TYPE=snp;VARB=-0.000818866;OID=.;OPOS=116770776;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:31:32:17:18:13:14:8:5:8:9:8:6:9:9 chr9 116770785 . G A 62.51 PASS AO=14;DP=31;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.0392839;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.138;QD=8.06571;RBI=0.0395202;REFB=0.0026332;REVB=0.0043155;RO=17;SAF=6;SAR=8;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0960359;STB=0.555476;TYPE=snp;VARB=-0.00140505;OID=.;OPOS=116770785;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:31:31:17:17:14:14:8:6:9:8:8:6:9:8 chr9 116791161 . T C 173.51 PASS AO=52;DP=132;FAO=52;FDP=132;FR=.;FRO=80;FSAF=17;FSAR=35;FSRF=25;FSRR=55;FWDB=-0.101725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.6953;QD=5.25776;RBI=0.102866;REFB=-0.00871147;REVB=0.0152809;RO=77;SAF=17;SAR=35;SRF=22;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0506377;STB=0.509996;TYPE=snp;VARB=0.0131459;OID=.;OPOS=116791161;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:77:80:52:52:35:17:22:55:35:17:25:55 chr9 116813001 . T C 1189.69 PASS AO=125;DP=128;FAO=127;FDP=129;FR=.;FRO=2;FSAF=48;FSAR=79;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0437466;FXX=0.00769172;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.6533;QD=36.8896;RBI=0.0457685;REFB=-0.135117;REVB=0.0134534;RO=2;SAF=46;SAR=79;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00423996;STB=0.50201;TYPE=snp;VARB=0.00156978;OID=.;OPOS=116813001;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:128:129:2:2:125:127:79:46:1:1:79:48:1:1 chr9 116818033 . A C 29 PASS AO=25;DP=122;FAO=24;FDP=121;FR=.;FRO=97;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=54;FSRR=43;FWDB=-0.00280576;FXX=0.00819605;HRUN=8;LEN=1;MLLD=168.35;QD=0.958797;RBI=0.0245031;REFB=0.00246618;REVB=-0.0243419;RO=97;SAF=18;SAR=7;SRF=54;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222556;STB=0.630918;TYPE=snp;VARB=-0.00805631;OID=.;OPOS=116818033;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:122:121:97:97:25:24:7:18:54:43:7:17:54:43 chr9 116930100 . G A 207.19 PASS AO=40;DP=70;FAO=40;FDP=70;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=8;FWDB=0.011072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.273;QD=11.8394;RBI=0.0157884;REFB=-0.0342042;REVB=0.0112554;RO=29;SAF=17;SAR=23;SRF=21;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225972;STB=0.629853;TYPE=snp;VARB=0.0257625;OID=.;OPOS=116930100;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:29:30:40:40:23:17:21:8:23:17:22:8 chr9 116930194 . A G 121.76 PASS AO=24;DP=54;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=0.0355014;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.032;QD=8.25476;RBI=0.0409376;REFB=-0.0154806;REVB=-0.0203846;RO=30;SAF=4;SAR=20;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236457;STB=0.523239;TYPE=snp;VARB=0.0182662;OID=.;OPOS=116930194;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:59:30:31:24:28:20:4:10:20:20:8:10:21 chr9 116931099 . G A 76.44 PASS AO=12;DP=18;FAO=12;FDP=18;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0615923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.6418;QD=16.9856;RBI=0.0704947;REFB=0.0324749;REVB=0.0342914;RO=4;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.224255;STB=0.610935;TYPE=snp;VARB=-0.0124662;OID=.;OPOS=116931099;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:18:18:4:6:12:12:6:6:0:4:6:6:1:5 chr9 116931445 . T C 70.5 PASS AO=11;DP=16;FAO=11;FDP=16;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.799;QD=17.6256;RBI=0.0410071;REFB=-0.0177692;REVB=0.0410071;RO=5;SAF=0;SAR=11;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00648133;OID=.;OPOS=116931445;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:16:16:5:5:11:11:11:0:0:5:11:0:0:5 chr9 116931666 . A T 39.78 PASS AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0609414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.083;QD=12.2392;RBI=0.0609514;REFB=-0.00942265;REVB=0.0011028;RO=6;SAF=1;SAR=6;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0364235;STB=0.521675;TYPE=snp;VARB=0.0108347;OID=.;OPOS=116931666;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:13:13:6:6:7:7:6:1:1:5:6:1:1:5 chr9 116958216 . C T 279.67 PASS AO=73;DP=162;FAO=73;FDP=162;FR=.;FRO=89;FSAF=35;FSAR=38;FSRF=40;FSRR=49;FWDB=0.00470077;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=172.794;QD=6.90532;RBI=0.014065;REFB=-0.0218261;REVB=-0.0132562;RO=89;SAF=35;SAR=38;SRF=40;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0297527;STB=0.516535;TYPE=snp;VARB=0.0133447;OID=.;OPOS=116958216;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:162:89:89:73:73:38:35:40:49:38:35:40:49 chr9 116980052 . C T 926.65 PASS AO=96;DP=96;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0152807;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6917;QD=38.2123;RBI=0.0152818;REFB=0;REVB=-0.0001829;RO=0;SAF=43;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000115096;OID=.;OPOS=116980052;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:96:97:0:0:96:97:53:43:0:0:54:43:0:0 chr9 117033022 . T C 1012.54 PASS AO=106;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00594814;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.8296;QD=38.2092;RBI=0.0453838;REFB=0;REVB=-0.0449923;RO=0;SAF=60;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000253358;OID=.;OPOS=117033022;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:106:106:0:0:106:106:46:60:0:0:46:60:0:0 chr9 117044751 . T C 83.25 PASS AO=21;DP=49;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=24;FWDB=-0.00666446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.083;QD=6.79571;RBI=0.0139137;REFB=-0.0168405;REVB=-0.0122138;RO=28;SAF=7;SAR=14;SRF=4;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237491;STB=0.633225;TYPE=snp;VARB=0.0198703;OID=.;OPOS=117044751;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:49:49:28:28:21:21:14:7:4:24:14:7:4:24 chr9 117063396 . G A 182.71 PASS AO=55;DP=139;FAO=55;FDP=139;FR=.;FRO=84;FSAF=13;FSAR=42;FSRF=38;FSRR=46;FWDB=-0.0130428;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=220.432;QD=5.25786;RBI=0.013519;REFB=-0.00587495;REVB=0.0035564;RO=84;SAF=13;SAR=42;SRF=38;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.266369;STB=0.651797;TYPE=snp;VARB=0.0117779;OID=.;OPOS=117063396;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:84:84:55:55:42:13:38:46:42:13:38:46 chr9 117064345 . G A 249.63 PASS AO=42;DP=65;FAO=42;FDP=63;FR=.;FRO=21;FSAF=29;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.0205467;FXX=0.0307645;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.833;QD=15.8495;RBI=0.0387663;REFB=-0.0150261;REVB=0.0328734;RO=20;SAF=29;SAR=13;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.027775;STB=0.527259;TYPE=snp;VARB=0.00862546;OID=.;OPOS=117064345;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:65:63:20:21:42:42:13:29:13:7:13:29:13:8 chr9 117085526 . G A 310.36 PASS AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00356133;FXX=0.0571265;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.334;QD=37.6196;RBI=0.0114902;REFB=0;REVB=0.0109244;RO=0;SAF=9;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000323974;OID=.;OPOS=117085526;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:33:0:0:33:33:24:9:0:0:24:9:0:0 chr9 117103973 . A G 88.15 PASS AO=19;DP=42;FAO=21;FDP=46;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.00164823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.545;QD=7.66563;RBI=0.00701542;REFB=-0.0259376;REVB=0.00681905;RO=23;SAF=10;SAR=9;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170466;STB=0.592505;TYPE=snp;VARB=0.0187734;OID=.;OPOS=117103973;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:42:46:23:25:19:21:9:10:8:15:9:12:10:15 chr9 117110046 . C T 15.55 PASS AO=3;DP=8;FAO=3;FDP=8;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0113838;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.841;QD=7.77524;RBI=0.0229804;REFB=-0.0234408;REVB=-0.0199626;RO=5;SAF=1;SAR=2;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0671606;STB=0.545144;TYPE=snp;VARB=0.0421494;OID=.;OPOS=117110046;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:8:8:5:5:3:3:2:1:2:3:2:1:2:3 chr9 117122202 . C T 860.7 PASS AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00840397;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.507;QD=38.6831;RBI=0.0469101;REFB=0;REVB=0.0461512;RO=0;SAF=47;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.28712e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000333414;OID=.;OPOS=117122202;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:89:89:0:0:89:89:42:47:0:0:42:47:0:0 chr9 117124731 . G A 254.96 PASS AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0503609;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.241;QD=37.7718;RBI=0.0645201;REFB=0;REVB=0.0403314;RO=0;SAF=7;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.63811e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00221306;OID=.;OPOS=117124731;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:26:27:0:0:26:27:19:7:0:0:19:8:0:0 chr9 117124785 . G A 44.87 PASS AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.0329955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.9365;QD=7.804;RBI=0.063826;REFB=-0.0184578;REVB=0.0546356;RO=12;SAF=1;SAR=9;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.370239;STB=0.713752;TYPE=snp;VARB=0.0533979;OID=.;OPOS=117124785;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:23:23:12:13:10:10:9:1:4:8:9:1:4:9 chr9 117138278 . C T 183.14 PASS AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.49;QD=38.5548;RBI=0.000269311;REFB=0;REVB=-0.000269311;RO=0;SAF=0;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.00971e-06;OID=.;OPOS=117138278;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:19:19:0:0:19:19:19:0:0:0:19:0:0:0 chr9 117166206 . G T 172.84 PASS AO=32;DP=72;FAO=40;FDP=79;FR=.;FRO=39;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=0.108359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.1233;QD=8.75134;RBI=0.111478;REFB=-0.0446842;REVB=0.026182;RO=39;SAF=13;SAR=19;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0803639;STB=0.531094;TYPE=snp;VARB=0.0615174;OID=.;OPOS=117166206;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:79:39:39:32:40:19:13:19:20:23:17:19:20 chr9 117166246 . A G 675.53 PASS AO=71;DP=73;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0246803;FXX=0.0533262;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.296;QD=38.0581;RBI=0.0289669;REFB=0;REVB=-0.0151646;RO=0;SAF=36;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11607e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000144666;OID=.;OPOS=117166246;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:73:71:0:0:71:71:35:36:0:0:35:36:0:0 chr9 117166338 . G C 395.63 PASS AO=43;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0139109;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.519;QD=35.9666;RBI=0.0227555;REFB=0;REVB=0.0180083;RO=1;SAF=17;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177216;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000204349;OID=.;OPOS=117166338;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:44:44:1:0:43:44:26:17:0:1:27:17:0:0 chr9 117169033 . A G 465.11 PASS AO=51;DP=53;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0291027;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.2241;QD=35.7777;RBI=0.0432164;REFB=0.00607142;REVB=0.0319482;RO=1;SAF=25;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184631;STB=0.5098;TYPE=snp;VARB=0.00041295;OID=.;OPOS=117169033;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:53:52:1:1:51:51:26:25:1:0:26:25:1:0 chr9 117170241 . G C 116.12 PASS AO=27;DP=58;FAO=27;FDP=57;FR=.;FRO=30;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=0.00296282;FXX=0.0172384;HRUN=3;LEN=1;MLLD=216.723;QD=8.14854;RBI=0.0035887;REFB=-0.00770873;REVB=-0.00202497;RO=29;SAF=15;SAR=12;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0613203;STB=0.523792;TYPE=snp;VARB=0.00783355;OID=.;OPOS=117170241;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:57:29:30:27:27:12:15:18:11:12:15:18:12 chr9 117186677 . A G 686.34 PASS AO=72;DP=74;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157584;FXX=0.0399947;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.21;QD=38.1302;RBI=0.0157982;REFB=0;REVB=-0.00112049;RO=0;SAF=32;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.05346e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000666276;OID=.;OPOS=117186677;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:74:72:0:0:72:72:40:32:0:0:40:32:0:0 chr9 117186712 . C T 146.45 PASS AO=31;DP=60;FAO=31;FDP=60;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.0135465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.192;QD=9.76355;RBI=0.0195508;REFB=-0.00361087;REVB=0.0140969;RO=28;SAF=16;SAR=15;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0167405;STB=0.500538;TYPE=snp;VARB=0.00635324;OID=.;OPOS=117186712;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:28:29:31:31:15:16:15:13:15:16:15:14 chr9 117188566 . C T 1048.04 PASS AO=91;DP=112;FAO=111;FDP=111;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=69;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00786777;FXX=0.0176975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.676;QD=37.7672;RBI=0.0303038;REFB=0;REVB=0.0292646;RO=0;SAF=67;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.25281e-05;OID=.;OPOS=117188566;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:110:111:0:0:91:111:24:67:0:0:42:69:0:0 chr9 117377843 . G C 216.77 PASS AO=56;DP=124;FAO=56;FDP=124;FR=.;FRO=68;FSAF=45;FSAR=11;FSRF=44;FSRR=24;FWDB=-0.0219821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.078;QD=6.99256;RBI=0.0288762;REFB=-0.013055;REVB=0.0187249;RO=67;SAF=45;SAR=11;SRF=43;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211957;STB=0.616634;TYPE=snp;VARB=0.0151948;OID=.;OPOS=117377843;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:67:68:56:56:11:45:43:24:11:45:44:24 chr9 117429019 . A G 139.26 PASS AO=39;DP=93;FAO=39;FDP=94;FR=.;FRO=55;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=31;FWDB=-0.0161017;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.12;QD=5.92587;RBI=0.0252833;REFB=-0.0248159;REVB=0.019493;RO=51;SAF=13;SAR=26;SRF=20;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0648608;STB=0.564851;TYPE=snp;VARB=0.0296737;OID=.;OPOS=117429019;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:94:51:55:39:39:26:13:20:31:26:13:24:31 chr9 117430611 . A T 240.3 PASS AO=88;DP=250;FAO=88;FDP=250;FR=.;FRO=162;FSAF=76;FSAR=12;FSRF=77;FSRR=85;FWDB=-0.0141593;FXX=0.00398391;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.4;QD=3.84484;RBI=0.0620569;REFB=-0.0307651;REVB=-0.06042;RO=158;SAF=76;SAR=12;SRF=75;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.518416;STB=0.800531;TYPE=snp;VARB=0.0310354;OID=.;OPOS=117430611;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:250:250:158:162:88:88:12:76:75:83:12:76:77:85 chr9 117552885 . T C 3005.73 PASS AO=315;DP=316;FAO=315;FDP=315;FR=.;FRO=0;FSAF=143;FSAR=172;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229372;FXX=0.00316446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.805;QD=38.168;RBI=0.0230311;REFB=-0.0092945;REVB=-0.00207744;RO=1;SAF=143;SAR=172;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00276529;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.08037e-05;OID=.;OPOS=117552885;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:316:315:1:0:315:315:172:143:0:1:172:143:0:0 chr9 117553249 . T C 569.59 PASS AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00954185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.136;QD=36.1646;RBI=0.0206992;REFB=-0.0651549;REVB=0.0183687;RO=0;SAF=27;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.46408e-08;STB=0.509088;TYPE=snp;VARB=0.000345836;OID=.;OPOS=117553249;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:63:63:0:1:62:62:35:27:0:0:35:27:1:0 chr9 117554285 . AGG AG,A,AGA 1699.68 PASS AO=32,34,55;DP=206;FAO=108,39,55;FDP=202;FR=.;FRO=0;FSAF=84,2,0;FSAR=24,37,55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.699038,0.347873,0.147396;FXX=0.0288448;HRUN=3,3,3;LEN=1,2,1;MLLD=17.239,21.6871,121.358;QD=33.657;RBI=0.725126,0.360584,0.166266;REFB=0,0,0;REVB=-0.192753,-0.0948959,-0.0769326;RO=65;SAF=15,0,0;SAR=17,34,55;SRF=65;SRR=0;SSEN=0.539522,0.539522,0;SSEP=0.366849,0.366849,0;SSSB=-0.627347,-0.903094,-0.905405;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=del,del,snp;VARB=-0.0562796,0.0269999,0.0634;OID=.,.,.;OPOS=117554286,117554286,117554287;OREF=G,GG,G;OALT=-,-,A;OMAPALT=AG,A,AGA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/3:32,34,55:206:108,39,55:202:0:84,2,0:24,37,55:0:0:99:65:15,0,0:17,34,55:65:0 chr9 117792583 . C G 1550.95 PASS AO=164;DP=165;FAO=164;FDP=164;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00305882;FXX=0.00606024;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.7062;QD=37.8281;RBI=0.0291782;REFB=-0.01697;REVB=0.0290174;RO=1;SAF=87;SAR=77;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00543858;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000365885;OID=.;OPOS=117792583;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:165:164:1:0:164:164:77:87:1:0:77:87:0:0 chr9 117797597 . T C 142.32 PASS AO=35;DP=78;FAO=36;FDP=81;FR=.;FRO=45;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=13;FSRR=32;FWDB=-0.00971226;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.518;QD=7.02813;RBI=0.0115955;REFB=-0.00353874;REVB=0.00633456;RO=42;SAF=13;SAR=22;SRF=14;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0401422;STB=0.528287;TYPE=snp;VARB=0.00362645;OID=.;OPOS=117797597;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:81:42:45:35:36:22:13:14:28:24:12:13:32 chr9 117804544 . T C 385.14 PASS AO=92;DP=194;FAO=96;FDP=203;FR=.;FRO=107;FSAF=34;FSAR=62;FSRF=36;FSRR=71;FWDB=0.00332348;FXX=0.00490172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.227;QD=7.58889;RBI=0.0039796;REFB=0.000529379;REVB=0.00218898;RO=101;SAF=34;SAR=58;SRF=36;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0134099;STB=0.510266;TYPE=snp;VARB=-0.000482112;OID=.;OPOS=117804544;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:203:101:107:92:96:58:34:36:65:62:34:36:71 chr9 117808785 . T A 246.12 PASS AO=91;DP=263;FAO=91;FDP=261;FR=.;FRO=170;FSAF=77;FSAR=14;FSRF=137;FSRR=33;FWDB=-0.00879123;FXX=0.00760427;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.572;QD=3.77199;RBI=0.00941141;REFB=-0.00561268;REVB=0.00335988;RO=169;SAF=77;SAR=14;SRF=136;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0841003;STB=0.547079;TYPE=snp;VARB=0.0108914;OID=.;OPOS=117808785;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:263:261:169:170:91:91:14:77:136:33:14:77:137:33 chr9 117815273 . G A 349.31 PASS AO=67;DP=115;FAO=68;FDP=114;FR=.;FRO=46;FSAF=30;FSAR=38;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=-0.0264922;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.482;QD=12.2564;RBI=0.0288849;REFB=-0.00738004;REVB=0.0115111;RO=46;SAF=30;SAR=37;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0393079;STB=0.523926;TYPE=snp;VARB=0.00684947;OID=.;OPOS=117815273;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:114:46:46:67:68:37:30:23:23:38:30:23:23 chr9 117846570 . C T 499.83 PASS AO=93;DP=153;FAO=94;FDP=154;FR=.;FRO=60;FSAF=46;FSAR=48;FSRF=27;FSRR=33;FWDB=0.00832574;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.312;QD=12.9825;RBI=0.0084195;REFB=-0.00766659;REVB=0.00125297;RO=59;SAF=45;SAR=48;SRF=27;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0188444;STB=0.515349;TYPE=snp;VARB=0.00658118;OID=.;OPOS=117846570;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:154:59:60:93:94:48:45:27:32:48:46:27:33 chr9 117846580 . T C 175.69 PASS AO=55;DP=153;FAO=58;FDP=156;FR=.;FRO=98;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=47;FSRR=51;FWDB=-0.0122317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.435;QD=4.50492;RBI=0.012877;REFB=-0.00133967;REVB=-0.00402521;RO=91;SAF=26;SAR=29;SRF=46;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0359969;STB=0.519797;TYPE=snp;VARB=0.00254886;OID=.;OPOS=117846580;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:156:91:98:55:58:29:26:46:45:32:26:47:51 chr9 117848394 . T C 310.06 PASS AO=26;DP=36;FAO=34;FDP=34;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0707949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.188;QD=36.4772;RBI=0.0724797;REFB=0;REVB=0.0155365;RO=0;SAF=12;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00129828;OID=.;OPOS=117848394;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:34:0:0:26:34:14:12:0:0:14:20:0:0 chr9 117849314 . T C 190.96 PASS AO=35;DP=58;FAO=35;FDP=58;FR=.;FRO=23;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.0427463;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=94.1774;QD=13.1698;RBI=0.0452515;REFB=-0.0169755;REVB=-0.0148478;RO=22;SAF=17;SAR=18;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0863011;STB=0.537528;TYPE=snp;VARB=0.0109021;OID=.;OPOS=117849314;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:58:58:22:23:35:35:18:17:8:14:18:17:9:14 chr9 117853022 . C T 431.36 PASS AO=79;DP=128;FAO=79;FDP=129;FR=.;FRO=50;FSAF=32;FSAR=47;FSRF=21;FSRR=29;FWDB=0.00601479;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.1921;QD=13.3755;RBI=0.0307703;REFB=-0.0229286;REVB=-0.0301767;RO=47;SAF=32;SAR=47;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000577568;STB=0.505991;TYPE=snp;VARB=0.0108724;OID=.;OPOS=117853022;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:129:47:50:79:79:47:32:19:28:47:32:21:29 chr9 118163563 . C T 474.28 PASS AO=123;DP=268;FAO=124;FDP=271;FR=.;FRO=147;FSAF=26;FSAR=98;FSRF=36;FSRR=111;FWDB=0.0128786;FXX=0.0109485;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.6918;QD=7.00048;RBI=0.0235537;REFB=-0.00724633;REVB=-0.019721;RO=145;SAF=25;SAR=98;SRF=36;SRR=109;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0648718;STB=0.527884;TYPE=snp;VARB=0.00648315;OID=.;OPOS=118163563;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:268:271:145:147:123:124:98:25:36:109:98:26:36:111 chr9 119106881 . C A 1449.31 PASS AO=160;DP=168;FAO=160;FDP=166;FR=.;FRO=6;FSAF=74;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.045983;FXX=0.0177504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.101;QD=34.9231;RBI=0.0585364;REFB=-0.212632;REVB=0.0362225;RO=0;SAF=74;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.31629e-08;STB=0.516852;TYPE=snp;VARB=0.00187734;OID=.;OPOS=119106881;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:168:166:0:6:160:160:86:74:0:0:86:74:0:6 chr9 119158814 . T C 1591.91 PASS AO=152;DP=153;FAO=169;FDP=169;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0191753;FXX=0.00588201;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.325;QD=37.6783;RBI=0.0558537;REFB=-0.0569206;REVB=0.0524589;RO=0;SAF=60;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.94679e-06;OID=.;OPOS=119158814;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:153:169:0:0:152:169:92:60:0:0:109:60:0:0 chr9 119159751 . T C 383.26 PASS AO=109;DP=256;FAO=109;FDP=256;FR=.;FRO=147;FSAF=65;FSAR=44;FSRF=88;FSRR=59;FWDB=-0.00233327;FXX=0.0038909;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.223;QD=5.98841;RBI=0.00584252;REFB=-0.0156955;REVB=-0.00535638;RO=146;SAF=65;SAR=44;SRF=87;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000469591;STB=0.501378;TYPE=snp;VARB=0.0212166;OID=.;OPOS=119159751;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:256:256:146:147:109:109:44:65:87:59:44:65:88:59 chr9 119162545 . C A 842.57 PASS AO=88;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0077148;FXX=0.0111099;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.46;QD=37.8684;RBI=0.00899036;REFB=0.0122891;REVB=0.0046161;RO=1;SAF=46;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101908;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.16981e-06;OID=.;OPOS=119162545;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:89:89:1:0:88:89:42:46:1:0:43:46:0:0 chr9 119199820 . C G 687.29 PASS AO=76;DP=81;FAO=77;FDP=80;FR=.;FRO=3;FSAF=40;FSAR=37;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00188321;FXX=0.0123442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1243;QD=34.3643;RBI=0.0191175;REFB=-0.00178912;REVB=-0.0190245;RO=5;SAF=39;SAR=37;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0334956;STB=0.505529;TYPE=snp;VARB=0.00017431;OID=.;OPOS=119199820;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:81:80:5:3:76:77:37:39:4:1:37:40:2:1 chr9 119448979 . C T 294.13 PASS AO=54;DP=90;FAO=54;FDP=89;FR=.;FRO=35;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.00519695;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.61;QD=13.2195;RBI=0.0097037;REFB=-0.0193028;REVB=-0.00819472;RO=36;SAF=29;SAR=25;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136736;STB=0.502301;TYPE=snp;VARB=0.00935347;OID=.;OPOS=119448979;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:89:36:35:54:54:25:29:20:16:25:29:19:16 chr9 119460338 . G A 190.54 PASS AO=46;DP=97;FAO=46;FDP=97;FR=.;FRO=51;FSAF=32;FSAR=14;FSRF=35;FSRR=16;FWDB=-0.0172126;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.7774;QD=7.85719;RBI=0.0227382;REFB=0.00350151;REVB=-0.0148577;RO=50;SAF=32;SAR=14;SRF=34;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171636;STB=0.505793;TYPE=snp;VARB=-0.00444376;OID=.;OPOS=119460338;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:50:51:46:46:14:32:34:16:14:32:35:16 chr9 119461275 . G A 340.6 PASS AO=81;DP=165;FAO=81;FDP=165;FR=.;FRO=84;FSAF=52;FSAR=29;FSRF=54;FSRR=30;FWDB=-0.0345005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.409;QD=8.25695;RBI=0.0370699;REFB=-0.0074322;REVB=-0.0135607;RO=83;SAF=52;SAR=29;SRF=54;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00864356;STB=0.500488;TYPE=snp;VARB=0.00803643;OID=.;OPOS=119461275;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:165:83:84:81:81:29:52:54:29:29:52:54:30 chr9 119462112 . C T 1373.04 PASS AO=143;DP=143;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00510623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.455;QD=37.6176;RBI=0.00582148;REFB=0;REVB=0.00279571;RO=0;SAF=46;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.72207e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000134927;OID=.;OPOS=119462112;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:143:146:0:0:143:146:97:46:0:0:97:49:0:0 chr9 119463189 . T C 340.12 PASS AO=83;DP=175;FAO=83;FDP=173;FR=.;FRO=90;FSAF=48;FSAR=35;FSRF=31;FSRR=59;FWDB=-0.00998158;FXX=0.0114279;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.839;QD=7.86399;RBI=0.0271271;REFB=-0.00887243;REVB=-0.0252239;RO=87;SAF=48;SAR=35;SRF=30;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214302;STB=0.620007;TYPE=snp;VARB=0.00863788;OID=.;OPOS=119463189;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:173:87:90:83:83:35:48:30:57:35:48:31:59 chr9 119495697 . T C 1003.57 PASS AO=105;DP=107;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00834472;FXX=0.0186898;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.075;QD=38.2311;RBI=0.0165424;REFB=0;REVB=0.0142834;RO=0;SAF=58;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000219366;OID=.;OPOS=119495697;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:107:105:0:0:105:105:47:58:0:0:46:59:0:0 chr9 119770480 . C T 1648.45 PASS AO=214;DP=261;FAO=218;FDP=257;FR=.;FRO=39;FSAF=120;FSAR=98;FSRF=2;FSRR=37;FWDB=0.000305155;FXX=0.0228128;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.131;QD=25.6569;RBI=0.00680639;REFB=-0.0186611;REVB=0.00679955;RO=36;SAF=118;SAR=96;SRF=1;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142035;STB=0.575359;TYPE=snp;VARB=0.00128649;OID=.;OPOS=119770480;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:261:257:36:39:214:218:96:118:1:35:98:120:2:37 chr9 120039299 . T C 1673.02 PASS AO=163;DP=164;FAO=185;FDP=185;FR=.;FRO=0;FSAF=113;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0232823;FXX=0.0106946;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.859;QD=36.1733;RBI=0.0580163;REFB=-0.13007;REVB=0.0531397;RO=1;SAF=103;SAR=60;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00786449;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00195375;OID=.;OPOS=120039299;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:164:185:1:0:163:185:60:103:0:1:72:113:0:0 chr9 120053776 . T C 989.55 PASS AO=103;DP=103;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00155122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.942;QD=38.0595;RBI=0.0312496;REFB=0;REVB=0.0312111;RO=0;SAF=50;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.95161e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.85088e-05;OID=.;OPOS=120053776;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:103:104:0:0:103:104:53:50:0:0:54:50:0:0 chr9 120470358 . G A 1155.78 PASS AO=122;DP=124;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0376566;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.776;QD=37.5865;RBI=0.0458204;REFB=0;REVB=0.0261054;RO=0;SAF=45;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03226e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000221443;OID=.;OPOS=120470358;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:124:123:0:0:122:123:77:45:0:0:77:46:0:0 chr9 122001000 . G A 1715.12 PASS AO=170;DP=171;FAO=179;FDP=179;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=114;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.61;QD=38.3267;RBI=0.0167874;REFB=0;REVB=0.00198958;RO=0;SAF=64;SAR=106;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.11354e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000327584;OID=.;OPOS=122001000;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:171:179:0:0:170:179:106:64:0:0:114:65:0:0 chr9 123163053 . G A 256.64 PASS AO=51;DP=90;FAO=52;FDP=93;FR=.;FRO=41;FSAF=31;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=13;FWDB=0.00604365;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=224.308;QD=11.0383;RBI=0.0215028;REFB=-0.00900709;REVB=0.020636;RO=39;SAF=31;SAR=20;SRF=27;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0713636;STB=0.540325;TYPE=snp;VARB=0.00805323;OID=.;OPOS=123163053;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:93:39:41:51:52:20:31:27:12:21:31:28:13 chr9 123170733 . C G 118.89 PASS AO=31;DP=72;FAO=31;FDP=72;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=0.00975757;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.562;QD=6.6052;RBI=0.02876;REFB=-0.0225891;REVB=0.0270541;RO=41;SAF=15;SAR=16;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0206287;STB=0.511662;TYPE=snp;VARB=0.0200367;OID=.;OPOS=123170733;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:41:41:31:31:16:15:19:22:16:15:19:22 chr9 123182202 . C T 112.23 PASS AO=35;DP=94;FAO=35;FDP=93;FR=.;FRO=58;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=40;FWDB=-0.0566569;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.0864;QD=4.82703;RBI=0.0567382;REFB=0.0150538;REVB=0.00303711;RO=58;SAF=14;SAR=21;SRF=18;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104749;STB=0.5596;TYPE=snp;VARB=-0.0217246;OID=.;OPOS=123182202;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:93:58:58:35:35:21:14:18:40:21:14:18:40 chr9 123205912 . C G 617.59 PASS AO=128;DP=232;FAO=129;FDP=232;FR=.;FRO=103;FSAF=85;FSAR=44;FSRF=77;FSRR=26;FWDB=0.00516785;FXX=0.00429166;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.0615;QD=10.6481;RBI=0.0418455;REFB=-0.0264462;REVB=0.0415251;RO=103;SAF=85;SAR=43;SRF=77;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0790577;STB=0.545031;TYPE=snp;VARB=0.0218203;OID=.;OPOS=123205912;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:232:103:103:128:129:43:85:77:26:44:85:77:26 chr9 123205981 . C T 215.69 PASS AO=55;DP=121;FAO=55;FDP=121;FR=.;FRO=66;FSAF=14;FSAR=41;FSRF=40;FSRR=26;FWDB=0.0338742;FXX=0.00819605;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6988;QD=7.13015;RBI=0.0375068;REFB=0.0151157;REVB=0.0161028;RO=66;SAF=14;SAR=41;SRF=40;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.361514;STB=0.702334;TYPE=snp;VARB=-0.0158221;OID=.;OPOS=123205981;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:66:66:55:55:41:14:40:26:41:14:40:26 chr9 123220829 . A G 663.85 PASS AO=135;DP=239;FAO=137;FDP=244;FR=.;FRO=107;FSAF=68;FSAR=69;FSRF=61;FSRR=46;FWDB=-0.00811292;FXX=0.00408147;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.991;QD=10.8827;RBI=0.0104231;REFB=-0.0174784;REVB=0.00654381;RO=101;SAF=68;SAR=67;SRF=60;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.071326;STB=0.53232;TYPE=snp;VARB=0.0134145;OID=.;OPOS=123220829;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:239:244:101:107:135:137:67:68:60:41:69:68:61:46 chr9 123291036 . C G 1763.48 PASS AO=181;DP=181;FAO=184;FDP=184;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00531279;FXX=0.0107521;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.904;QD=38.3365;RBI=0.0146604;REFB=0;REVB=-0.0136639;RO=0;SAF=92;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.01627e-05;OID=.;OPOS=123291036;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:181:184:0:0:181:184:89:92:0:0:89:95:0:0 chr9 123342259 . C A 385.46 PASS AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0524738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.923;QD=37.6058;RBI=0.064593;REFB=0;REVB=0.0376665;RO=0;SAF=8;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.8059e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000260611;OID=.;OPOS=123342259;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:41:41:0:0:41:41:33:8:0:0:33:8:0:0 chr9 123342275 . A G 327.65 PASS AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0472865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.666;QD=37.4452;RBI=0.0687343;REFB=0;REVB=-0.0498838;RO=0;SAF=7;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.13325e-05;OID=.;OPOS=123342275;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:35:35:0:0:35:35:28:7:0:0:28:7:0:0 chr9 123367681 . C G 666.35 PASS AO=172;DP=377;FAO=173;FDP=374;FR=.;FRO=201;FSAF=81;FSAR=92;FSRF=96;FSRR=105;FWDB=-0.00579653;FXX=0.0131923;HRUN=5;LEN=1;MLLD=180.065;QD=7.1267;RBI=0.00976255;REFB=-0.0103511;REVB=0.00785543;RO=185;SAF=80;SAR=92;SRF=85;SRR=100;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0053626;STB=0.505071;TYPE=snp;VARB=0.0109509;OID=.;OPOS=123367681;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:377:374:185:201:172:173:92:80:85:100:92:81:96:105 chr9 123618971 . A G 365.04 PASS AO=77;DP=142;FAO=77;FDP=142;FR=.;FRO=65;FSAF=25;FSAR=52;FSRF=20;FSRR=45;FWDB=-0.0222547;FXX=0.00699252;HRUN=3;LEN=1;MLLD=72.317;QD=10.2828;RBI=0.0520005;REFB=-0.0228361;REVB=-0.0469976;RO=65;SAF=25;SAR=52;SRF=20;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0163086;STB=0.508917;TYPE=snp;VARB=0.0207386;OID=.;OPOS=123618971;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:65:65:77:77:52:25:20:45:52:25:20:45 chr9 123626311 . C A 196.55 PASS AO=44;DP=87;FAO=44;FDP=87;FR=.;FRO=43;FSAF=12;FSAR=32;FSRF=4;FSRR=39;FWDB=-0.00865652;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=214.172;QD=9.03655;RBI=0.0175408;REFB=-0.00912649;REVB=-0.0152559;RO=42;SAF=12;SAR=32;SRF=4;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222388;STB=0.624586;TYPE=snp;VARB=0.00844215;OID=.;OPOS=123626311;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:42:43:44:44:32:12:4:38:32:12:4:39 chr9 123632013 . GC G 301.41 PASS AO=36;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0796176;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.616;QD=26.2096;RBI=0.0903722;REFB=0;REVB=0.0427572;RO=6;SAF=30;SAR=6;SRF=5;SRR=1;SSEN=0.513158;SSEP=0;SSSB=2.9943e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00685518;OID=.;OPOS=123632014;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:36:43:46:46:0:36:10:0:0:26:6:30:6:5:1 chr9 123632045 . A G 80.45 PASS AO=21;DP=52;FAO=22;FDP=54;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=5;FSRF=21;FSRR=11;FWDB=-0.043843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.4088;QD=5.95917;RBI=0.0571109;REFB=-0.0527435;REVB=0.0365984;RO=29;SAF=17;SAR=4;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170532;STB=0.588658;TYPE=snp;VARB=0.0428934;OID=.;OPOS=123632045;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:52:54:29:32:21:22:4:17:20:9:5:17:21:11 chr9 123671520 . G A 568.58 PASS AO=59;DP=61;FAO=63;FDP=65;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.002499;FXX=0.0151492;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.6742;QD=34.9893;RBI=0.0458136;REFB=0.0924482;REVB=-0.0457454;RO=2;SAF=24;SAR=35;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0261996;STB=0.512816;TYPE=snp;VARB=-0.004755;OID=.;OPOS=123671520;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:61:65:2:2:59:63:35:24:0:2:38:25:0:2 chr9 123675801 . G A 76.88 PASS AO=20;DP=48;FAO=20;FDP=48;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.0369978;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.936;QD=6.40682;RBI=0.0371047;REFB=-0.00650385;REVB=-0.00281401;RO=27;SAF=10;SAR=10;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0185573;STB=0.520813;TYPE=snp;VARB=0.0170853;OID=.;OPOS=123675801;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:48:48:27:28:20:20:10:10:14:13:10:10:15:13 chr9 123725971 . C T 255.96 PASS AO=58;DP=117;FAO=59;FDP=117;FR=.;FRO=58;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=26;FSRR=32;FWDB=0.000383347;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.75;QD=8.75072;RBI=0.00357569;REFB=-0.0179463;REVB=-0.00355508;RO=58;SAF=29;SAR=29;SRF=26;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0468237;STB=0.521454;TYPE=snp;VARB=0.0248613;OID=.;OPOS=123725971;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:58:58:58:59:29:29:26:32:30:29:26:32 chr9 123734287 . GAAAC G 70.5 PASS AO=30;DP=82;FAO=30;FDP=74;FR=.;FRO=44;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=0.0192749;FXX=0.038956;HRUN=3;LEN=4;MLLD=259.867;QD=3.81077;RBI=0.0203721;REFB=0.00570408;REVB=-0.00659554;RO=38;SAF=21;SAR=9;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.236785;STB=0.664692;TYPE=del;VARB=-0.0081322;OID=.;OPOS=123734288;OREF=AAAC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:30:73:30:74:44:21:9:19:25:70:38:21:9:18:20 chr9 123769200 . C T 362.2 PASS AO=93;DP=202;FAO=93;FDP=202;FR=.;FRO=109;FSAF=58;FSAR=35;FSRF=56;FSRR=53;FWDB=-0.00921936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.961;QD=7.17228;RBI=0.0103687;REFB=-0.0136181;REVB=-0.00474482;RO=109;SAF=58;SAR=35;SRF=56;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110435;STB=0.561236;TYPE=snp;VARB=0.0215392;OID=.;OPOS=123769200;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:202:109:109:93:93:35:58:56:53:35:58:56:53 chr9 123780005 . G A 655.69 PASS AO=152;DP=300;FAO=152;FDP=300;FR=.;FRO=148;FSAF=83;FSAR=69;FSRF=81;FSRR=67;FWDB=-0.0246139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.4917;QD=8.74254;RBI=0.0273818;REFB=-0.0267471;REVB=-0.0119966;RO=146;SAF=83;SAR=69;SRF=79;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0044733;STB=0.500619;TYPE=snp;VARB=0.0297735;OID=.;OPOS=123780005;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:300:300:146:148:152:152:69:83:79:67:69:83:81:67 chr9 123783934 . T C 321.04 PASS AO=66;DP=146;FAO=77;FDP=157;FR=.;FRO=80;FSAF=30;FSAR=47;FSRF=40;FSRR=40;FWDB=0.0277325;FXX=0.0187488;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.815;QD=8.17927;RBI=0.0280413;REFB=-0.00667264;REVB=-0.00415006;RO=80;SAF=24;SAR=42;SRF=40;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138681;STB=0.557612;TYPE=snp;VARB=0.00778777;OID=.;OPOS=123783934;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:157:80:80:66:77:42:24:40:40:47:30:40:40 chr9 123800218 . C T 285.66 PASS AO=95;DP=243;FAO=93;FDP=243;FR=.;FRO=150;FSAF=32;FSAR=61;FSRF=74;FSRR=76;FWDB=0.0049992;FXX=0.00816293;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.8791;QD=4.70223;RBI=0.0234275;REFB=-0.0260459;REVB=-0.0228879;RO=147;SAF=33;SAR=62;SRF=71;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152692;STB=0.595924;TYPE=snp;VARB=0.0373719;OID=.;OPOS=123800218;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:243:243:147:150:95:93:62:33:71:76:61:32:74:76 chr9 123850770 . G A 557.48 PASS AO=141;DP=318;FAO=146;FDP=319;FR=.;FRO=173;FSAF=71;FSAR=75;FSRF=82;FSRR=91;FWDB=-0.00509656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.513;QD=6.99034;RBI=0.00599351;REFB=-0.00857176;REVB=0.00315393;RO=166;SAF=66;SAR=75;SRF=76;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.010086;STB=0.506684;TYPE=snp;VARB=0.0089985;OID=.;OPOS=123850770;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:318:319:166:173:141:146:75:66:76:90:75:71:82:91 chr9 123860689 . C T 237.53 PASS AO=67;DP=159;FAO=67;FDP=159;FR=.;FRO=92;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=25;FSRR=67;FWDB=-0.00145744;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.771;QD=5.97557;RBI=0.0567929;REFB=-0.0167765;REVB=-0.0567742;RO=91;SAF=33;SAR=34;SRF=25;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22665;STB=0.62824;TYPE=snp;VARB=0.0230973;OID=.;OPOS=123860689;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:159:91:92:67:67:34:33:25:66:34:33:25:67 chr9 123917020 . T A 615.86 PASS AO=147;DP=297;FAO=147;FDP=297;FR=.;FRO=150;FSAF=80;FSAR=67;FSRF=78;FSRR=72;FWDB=0.0214158;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.273;QD=8.29444;RBI=0.0219718;REFB=-0.00323345;REVB=0.0049114;RO=145;SAF=80;SAR=67;SRF=78;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00573879;STB=0.512299;TYPE=snp;VARB=0.00291043;OID=.;OPOS=123917020;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:297:297:145:150:147:147:67:80:78:67:67:80:78:72 chr9 123929920 . G A 156.77 PASS AO=38;DP=86;FAO=40;FDP=88;FR=.;FRO=48;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=29;FSRR=19;FWDB=-0.017771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.313;QD=7.12597;RBI=0.0186083;REFB=-0.00951101;REVB=-0.00551915;RO=48;SAF=18;SAR=20;SRF=29;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129128;STB=0.58348;TYPE=snp;VARB=0.00921254;OID=.;OPOS=123929920;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:88:48:48:38:40:20:18:29:19:22:18:29:19 chr9 123965650 . TG T 32.28 PASS AO=19;DP=61;FAO=21;FDP=56;FR=.;FRO=35;FSAF=2;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.0688607;FXX=0.0344768;HRUN=3;LEN=1;MLLD=17.7099;QD=2.30556;RBI=0.192206;REFB=-0.0463634;REVB=-0.179448;RO=33;SAF=2;SAR=17;SRF=16;SRR=17;SSEN=0.490566;SSEP=0;SSSB=-0.530737;STB=0.81781;TYPE=del;VARB=0.0280721;OID=.;OPOS=123965651;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:19:58:21:56:35:2:19:16:19:32:33:2:17:16:17 chr9 124045949 . GTTCA G 134.68 PASS AO=59;DP=95;FAO=41;FDP=72;FR=.;FRO=31;FSAF=4;FSAR=37;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=-0.227003;FXX=0.265279;HRUN=2;LEN=4;MLLD=112.956;QD=7.48212;RBI=0.227757;REFB=-0.0299677;REVB=0.0185262;RO=0;SAF=23;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.708685;TYPE=del;VARB=0.0370709;OID=.;OPOS=124045950;OREF=TTCA;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:59:70:41:72:31:4:37:11:20:83:0:23:36:0:0 chr9 124046691 . G T 216.72 PASS AO=48;DP=104;FAO=52;FDP=109;FR=.;FRO=57;FSAF=31;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=31;FWDB=0.012261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.121;QD=7.95307;RBI=0.0249868;REFB=-0.0376422;REVB=0.0217717;RO=55;SAF=29;SAR=19;SRF=25;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144727;STB=0.573841;TYPE=snp;VARB=0.0357279;OID=.;OPOS=124046691;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:109:55:57:48:52:19:29:25:30:21:31:26:31 chr9 124047237 . T C 91.34 PASS AO=16;DP=26;FAO=16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=0.0860983;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.919;QD=14.0518;RBI=0.0865255;REFB=-0.0153793;REVB=0.00858744;RO=10;SAF=5;SAR=11;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0937528;STB=0.552263;TYPE=snp;VARB=0.00397983;OID=.;OPOS=124047237;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:26:26:10:10:16:16:11:5:2:8:11:5:2:8 chr9 124047246 . A C 61.44 PASS AO=11;DP=20;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=-0.0146014;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=294.082;QD=12.2875;RBI=0.0203484;REFB=-0.0140325;REVB=0.0141724;RO=9;SAF=3;SAR=8;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0512816;STB=0.52936;TYPE=snp;VARB=0.00976782;OID=.;OPOS=124047246;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:20:20:9:9:11:11:8:3:2:7:8:3:2:7 chr9 124083614 . C T 212.73 PASS AO=53;DP=114;FAO=53;FDP=114;FR=.;FRO=61;FSAF=39;FSAR=14;FSRF=33;FSRR=28;FWDB=-0.00693693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.623;QD=7.46407;RBI=0.00720309;REFB=-0.00601124;REVB=0.00194;RO=61;SAF=39;SAR=14;SRF=33;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212546;STB=0.619;TYPE=snp;VARB=0.00959415;OID=.;OPOS=124083614;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:61:61:53:53:14:39:33:28:14:39:33:28 chr9 124218133 . C T 1329.99 PASS AO=141;DP=143;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185216;FXX=0.0208319;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.274;QD=37.7303;RBI=0.0256166;REFB=0.0046988;REVB=0.0176964;RO=1;SAF=41;SAR=100;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114546;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000345022;OID=.;OPOS=124218133;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:143:141:1:0:141:141:100:41:1:0:100:41:0:0 chr9 124241369 . T G 338.79 PASS AO=81;DP=167;FAO=81;FDP=166;FR=.;FRO=85;FSAF=54;FSAR=27;FSRF=57;FSRR=28;FWDB=0.00662159;FXX=0.00598767;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.183;QD=8.16349;RBI=0.0531323;REFB=-0.00369804;REVB=-0.052718;RO=85;SAF=54;SAR=27;SRF=57;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00410201;STB=0.502262;TYPE=snp;VARB=0.00419764;OID=.;OPOS=124241369;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:166:85:85:81:81:27:54:57:28:27:54:57:28 chr9 124256817 . C T 87.36 PASS AO=19;DP=39;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.007193;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.103;QD=8.96045;RBI=0.0134632;REFB=-0.0132356;REVB=-0.0113806;RO=20;SAF=13;SAR=6;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0846579;STB=0.548141;TYPE=snp;VARB=0.0173716;OID=.;OPOS=124256817;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:39:39:20:20:19:19:6:13:12:8:6:13:12:8 chr9 124256975 . G T 198.68 PASS AO=62;DP=160;FAO=62;FDP=160;FR=.;FRO=98;FSAF=29;FSAR=33;FSRF=48;FSRR=50;FWDB=0.00863288;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.436;QD=4.96687;RBI=0.0278048;REFB=-0.00853056;REVB=-0.0264307;RO=98;SAF=29;SAR=33;SRF=48;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.023953;STB=0.513536;TYPE=snp;VARB=0.0137398;OID=.;OPOS=124256975;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:160:98:98:62:62:33:29:48:50:33:29:48:50 chr9 124257091 . C T 301.63 PASS AO=64;DP=127;FAO=66;FDP=126;FR=.,HEALED;FRO=60;FSAF=32;FSAR=34;FSRF=26;FSRR=34;FWDB=0.0882878;FXX=0.0156238;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.0838;QD=9.57555;RBI=0.166268;REFB=-0.0240684;REVB=-0.140891;RO=40;SAF=31;SAR=33;SRF=25;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.099383;STB=0.524583;TYPE=snp;VARB=0.022016;OID=.;OPOS=124257091;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:126:40:60:64:66:33:31:25:15:34:32:26:34 chr9 124519406 . C G 97.46 PASS AO=21;DP=41;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=0.0552292;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.7554;QD=9.50829;RBI=0.05523;REFB=-0.0715109;REVB=-0.000280832;RO=19;SAF=11;SAR=10;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219369;STB=0.608196;TYPE=snp;VARB=0.043344;OID=.;OPOS=124519406;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:41:41:19:20:21:21:10:11:5:14:10:11:6:14 chr9 124976075 . C T 147.43 PASS AO=16;DP=18;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.6254;QD=32.762;RBI=0.0764691;REFB=-0.0675125;REVB=0.0764691;RO=2;SAF=0;SAR=16;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00321193;OID=.;OPOS=124976075;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:18:18:2:1:16:17:16:0:0:2:17:0:0:1 chr9 124976081 . C T 195.71 PASS AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.645;QD=39.1411;RBI=0.0786735;REFB=0;REVB=0.0786735;RO=0;SAF=0;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000785325;OID=.;OPOS=124976081;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:20:20:0:0:20:20:20:0:0:0:20:0:0:0 chr9 125133479 . T C 396.82 PASS AO=41;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.281642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.018;QD=36.9134;RBI=0.281715;REFB=0;REVB=0.00643733;RO=0;SAF=6;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02085e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00149377;OID=.;OPOS=125133479;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:42:43:0:0:41:43:35:6:0:0:37:6:0:0 chr9 125239253 . T C 33.16 PASS AO=14;DP=52;FAO=14;FDP=52;FR=.;FRO=38;FSAF=13;FSAR=1;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=-0.0389229;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.505;QD=2.55103;RBI=0.0629715;REFB=-0.012871;REVB=-0.0495017;RO=38;SAF=13;SAR=1;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.646022;STB=0.904413;TYPE=snp;VARB=0.0209031;OID=.;OPOS=125239253;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:52:52:38:38:14:14:1:13:17:21:1:13:17:21 chr9 125289083 . A G 89.17 PASS AO=27;DP=72;FAO=27;FDP=72;FR=.;FRO=45;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=34;FWDB=0.0432063;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.0495;QD=4.95391;RBI=0.0433558;REFB=-0.00656702;REVB=0.00359692;RO=44;SAF=8;SAR=19;SRF=11;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0618502;STB=0.540099;TYPE=snp;VARB=0.00973922;OID=.;OPOS=125289083;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:72:72:44:45:27:27:19:8:11:33:19:8:11:34 chr9 125289521 . G A 71.31 PASS AO=16;DP=38;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.0715805;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.182;QD=7.31358;RBI=0.0719506;REFB=0.000633029;REVB=0.00728892;RO=22;SAF=7;SAR=9;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108015;STB=0.575668;TYPE=snp;VARB=-0.00165521;OID=.;OPOS=125289521;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:38:39:22:22:16:17:9:7:12:10:10:7:12:10 chr9 125315542 . C T 179.27 PASS AO=42;DP=98;FAO=45;FDP=99;FR=.;FRO=54;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=30;FSRR=24;FWDB=0.0193259;FXX=0.0198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.455;QD=7.24319;RBI=0.0219265;REFB=-0.0166306;REVB=0.0103575;RO=56;SAF=25;SAR=17;SRF=30;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.061833;STB=0.53794;TYPE=snp;VARB=0.0183568;OID=.;OPOS=125315542;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:99:56:54:42:45:17:25:30:26:17:28:30:24 chr9 125315557 . T C 1023.83 PASS AO=106;DP=110;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0766621;FXX=0.0661102;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.484;QD=36.2418;RBI=0.144218;REFB=-0.0897091;REVB=0.122155;RO=1;SAF=51;SAR=55;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00855122;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0117834;OID=.;OPOS=125315557;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:110:113:1:0:106:113:55:51:0:1:56:57:0:0 chr9 125315778 . G C 1332.41 PASS AO=140;DP=141;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0318569;FXX=0.00699252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.3163;QD=37.5328;RBI=0.0365988;REFB=-0.0306653;REVB=-0.018017;RO=1;SAF=36;SAR=104;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00455036;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.61251e-05;OID=.;OPOS=125315778;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:141:142:1:0:140:142:104:36:0:1:106:36:0:0 chr9 125316033 . T C 614.35 PASS AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=61;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00406811;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.891;QD=36.6775;RBI=0.0116698;REFB=-0.107794;REVB=0.0109378;RO=1;SAF=5;SAR=61;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0855462;STB=0.54544;TYPE=snp;VARB=0.00123392;OID=.;OPOS=125316033;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:67:67:1:1:66:66:61:5:1:0:61:5:1:0 chr9 125316042 . T C 720.7 PASS AO=70;DP=72;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0955594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.941;QD=37.9313;RBI=0.10264;REFB=0;REVB=-0.0374628;RO=0;SAF=2;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000220009;OID=.;OPOS=125316042;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:72:76:0:0:70:76:68:2:0:0:69:7:0:0 chr9 125316179 . T G 1675.71 PASS AO=180;DP=183;FAO=181;FDP=181;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0408071;FXX=0.0163035;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9804;QD=37.0322;RBI=0.0695506;REFB=0.023865;REVB=-0.0563211;RO=2;SAF=82;SAR=98;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000937118;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00011386;OID=.;OPOS=125316179;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:183:181:2:0:180:181:98:82:1:1:100:81:0:0 chr9 125316350 . C T 2151.96 PASS AO=225;DP=226;FAO=226;FDP=226;FR=.;FRO=0;FSAF=107;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168466;FXX=0.00440509;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.6691;QD=38.0878;RBI=0.0526324;REFB=-0.0922924;REVB=-0.0498634;RO=1;SAF=106;SAR=119;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00447417;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000213285;OID=.;OPOS=125316350;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:226:226:1:0:225:226:119:106:1:0:119:107:0:0 chr9 125316455 . C T 406.06 PASS AO=95;DP=191;FAO=95;FDP=191;FR=.;FRO=96;FSAF=45;FSAR=50;FSRF=45;FSRR=51;FWDB=-0.0968242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.648;QD=8.50383;RBI=0.0971459;REFB=-0.00708141;REVB=-0.00790004;RO=92;SAF=45;SAR=50;SRF=42;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154368;STB=0.502487;TYPE=snp;VARB=0.00668108;OID=.;OPOS=125316455;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:191:191:92:96:95:95:50:45:42:50:50:45:45:51 chr9 125330125 . C G 490.22 PASS AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0496267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.069;QD=36.9976;RBI=0.0524531;REFB=0;REVB=-0.016986;RO=0;SAF=16;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.33586e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000679648;OID=.;OPOS=125330125;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:53:53:0:0:53:53:37:16:0:0:37:16:0:0 chr9 125330184 . A C 81.12 PASS AO=15;DP=26;FAO=15;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=10;FWDB=0.0154927;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.4501;QD=12.4806;RBI=0.0265828;REFB=-0.0469794;REVB=-0.0216014;RO=11;SAF=6;SAR=9;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.258891;STB=0.643901;TYPE=snp;VARB=0.0358197;OID=.;OPOS=125330184;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:26:26:11:11:15:15:9:6:1:10:9:6:1:10 chr9 125330325 . C G 97.08 PASS AO=17;DP=28;FAO=17;FDP=28;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.00353324;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.481;QD=13.8693;RBI=0.0167314;REFB=-0.00777275;REVB=-0.0163541;RO=11;SAF=8;SAR=9;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0112978;STB=0.506322;TYPE=snp;VARB=0.00404177;OID=.;OPOS=125330325;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:28:28:11:11:17:17:9:8:5:6:9:8:5:6 chr9 125330678 . T G 2771.77 PASS AO=289;DP=291;FAO=291;FDP=291;FR=.;FRO=0;FSAF=171;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0439739;FXX=0.0102037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.091;QD=38.1;RBI=0.0444127;REFB=-0.0052677;REVB=-0.00622728;RO=0;SAF=171;SAR=118;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.2101e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.69921e-06;OID=.;OPOS=125330678;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:291:291:0:0:289:291:118:171:0:0:120:171:0:0 chr9 125330739 . G A 3288.07 PASS AO=342;DP=343;FAO=343;FDP=343;FR=.;FRO=0;FSAF=138;FSAR=205;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0129281;FXX=0.00290689;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2363;QD=38.3448;RBI=0.013638;REFB=0;REVB=0.00434283;RO=0;SAF=138;SAR=204;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.29741e-05;OID=.;OPOS=125330739;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:343:343:0:0:342:343:204:138:0:0:205:138:0:0 chr9 125377087 . A G 193.35 PASS AO=49;DP=109;FAO=49;FDP=108;FR=.;FRO=59;FSAF=7;FSAR=42;FSRF=17;FSRR=42;FWDB=0.00816295;FXX=0.00917347;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.332;QD=7.1611;RBI=0.0426216;REFB=-0.00801701;REVB=0.0418326;RO=59;SAF=7;SAR=42;SRF=17;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232093;STB=0.631517;TYPE=snp;VARB=0.0133084;OID=.;OPOS=125377087;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:108:59:59:49:49:42:7:17:42:42:7:17:42 chr9 125377505 . A G 223.34 PASS AO=35;DP=58;FAO=40;FDP=63;FR=.;FRO=23;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.0124363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.522;QD=14.1807;RBI=0.0168778;REFB=-0.0218137;REVB=-0.0114105;RO=23;SAF=17;SAR=18;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100108;STB=0.564395;TYPE=snp;VARB=0.0098125;OID=.;OPOS=125377505;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:58:63:23:23:35:40:18:17:8:15:19:21:8:15 chr9 125377734 . A G 192.78 PASS AO=35;DP=60;FAO=36;FDP=61;FR=.;FRO=25;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=7;FSRR=18;FWDB=0.0217499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.663;QD=12.641;RBI=0.022434;REFB=-0.00520482;REVB=-0.00549746;RO=24;SAF=19;SAR=16;SRF=6;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21459;STB=0.600668;TYPE=snp;VARB=0.00253574;OID=.;OPOS=125377734;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:60:61:24:25:35:36:16:19:6:18:17:19:7:18 chr9 125377775 . C T 288.92 PASS AO=56;DP=97;FAO=56;FDP=96;FR=.;FRO=40;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=8;FSRR=32;FWDB=-0.00504848;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.567;QD=12.0381;RBI=0.0166285;REFB=-0.0162834;REVB=-0.0158436;RO=40;SAF=27;SAR=29;SRF=8;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218521;STB=0.618668;TYPE=snp;VARB=0.0126389;OID=.;OPOS=125377775;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:96:40:40:56:56:29:27:8:32:29:27:8:32 chr9 125378014 . T G 130.59 PASS AO=30;DP=63;FAO=30;FDP=62;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=-0.0210411;FXX=0.0312451;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.381;QD=8.42541;RBI=0.0214105;REFB=-0.00343461;REVB=-0.00396004;RO=33;SAF=14;SAR=16;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0686269;STB=0.531433;TYPE=snp;VARB=0.00332412;OID=.;OPOS=125378014;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:62:33:32:30:30:16:14:13:20:16:14:13:19 chr9 125390874 . A C 393.69 PASS AO=63;DP=137;FAO=86;FDP=160;FR=.;FRO=74;FSAF=35;FSAR=51;FSRF=42;FSRR=32;FWDB=0.0536361;FXX=0.00621079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.798;QD=9.84221;RBI=0.053833;REFB=-0.0391278;REVB=0.00460017;RO=71;SAF=14;SAR=49;SRF=41;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.373981;STB=0.574778;TYPE=snp;VARB=0.0346252;OID=.;OPOS=125390874;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:160:71:74:63:86:49:14:41:30:51:35:42:32 chr9 125391026 . A C 495.5 PASS AO=100;DP=180;FAO=102;FDP=182;FR=.;FRO=80;FSAF=58;FSAR=44;FSRF=30;FSRR=50;FWDB=0.00245663;FXX=0.00546418;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.28;QD=10.89;RBI=0.00826591;REFB=-0.0191003;REVB=0.00789241;RO=80;SAF=56;SAR=44;SRF=30;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150156;STB=0.584711;TYPE=snp;VARB=0.0143927;OID=.;OPOS=125391026;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:182:80:80:100:102:44:56:30:50:44:58:30:50 chr9 125391127 . C T 267.13 PASS AO=59;DP=114;FAO=59;FDP=114;FR=.;FRO=55;FSAF=40;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=34;FWDB=0.00857774;FXX=0.0172399;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.64;QD=9.37292;RBI=0.0494146;REFB=-0.0182402;REVB=-0.0486644;RO=55;SAF=40;SAR=19;SRF=21;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.265539;STB=0.646488;TYPE=snp;VARB=0.0223626;OID=.;OPOS=125391127;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:55:55:59:59:19:40:21:34:19:40:21:34 chr9 125391241 . G A 141.25 PASS AO=42;DP=106;FAO=42;FDP=106;FR=.;FRO=64;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=44;FWDB=0.020533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.484;QD=5.33024;RBI=0.0226013;REFB=-0.00811129;REVB=-0.00944549;RO=64;SAF=24;SAR=18;SRF=20;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.270836;STB=0.652563;TYPE=snp;VARB=0.0173448;OID=.;OPOS=125391241;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:64:64:42:42:18:24:20:44:18:24:20:44 chr9 125437935 . AT A 42.26 PASS AO=60;DP=215;FAO=64;FDP=172;FR=.;FRO=108;FSAF=31;FSAR=33;FSRF=58;FSRR=50;FWDB=-0.178291;FXX=0.00578001;HRUN=8;LEN=1;MLLD=6.08178;QD=0.982856;RBI=0.306433;REFB=-0.103383;REVB=0.249226;RO=79;SAF=39;SAR=21;SRF=37;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189461;STB=0.533021;TYPE=del;VARB=0.106613;OID=.;OPOS=125437936;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:60:167:64:172:108:31:33:58:50:42:79:39:21:37:42 chr9 125486968 . G A 2711.43 PASS AO=304;DP=322;FAO=309;FDP=321;FR=.;FRO=12;FSAF=69;FSAR=240;FSRF=0;FSRR=12;FWDB=0.0483434;FXX=0.00925897;HRUN=3;LEN=1;MLLD=132.236;QD=33.7873;RBI=0.0484423;REFB=-0.0650451;REVB=0.00309453;RO=9;SAF=67;SAR=237;SRF=0;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177636;STB=0.512194;TYPE=snp;VARB=0.000475041;OID=.;OPOS=125486968;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:322:321:9:12:304:309:237:67:0:9:240:69:0:12 chr9 125512080 . C T 314.7 PASS AO=59;DP=98;FAO=59;FDP=98;FR=.;FRO=39;FSAF=23;FSAR=36;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=0.0284635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.8148;QD=12.8448;RBI=0.0292406;REFB=-0.0118596;REVB=0.00669651;RO=37;SAF=23;SAR=36;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109205;STB=0.550285;TYPE=snp;VARB=0.00549496;OID=.;OPOS=125512080;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:37:39:59:59:36:23:20:17:36:23:20:19 chr9 125512193 . C A 1247.36 PASS AO=134;DP=158;FAO=151;FDP=163;FR=.;FRO=12;FSAF=28;FSAR=123;FSRF=0;FSRR=12;FWDB=0.195504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.1644;QD=30.6102;RBI=0.206003;REFB=-0.21692;REVB=0.0649263;RO=1;SAF=14;SAR=120;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00394538;STB=0.523253;TYPE=snp;VARB=0.0134001;OID=.;OPOS=125512193;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:158:163:1:12:134:151:120:14:0:1:123:28:0:12 chr9 125512575 . G A 893.07 PASS AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.98;QD=38.0031;RBI=0.0256197;REFB=0;REVB=0.0205029;RO=0;SAF=34;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.12276e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.08368e-05;OID=.;OPOS=125512575;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:94:94:0:0:94:94:60:34:0:0:60:34:0:0 chr9 125512770 . T C 902.9 PASS AO=96;DP=98;FAO=97;FDP=99;FR=.;FRO=2;FSAF=1;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0469508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.8571;QD=36.4809;RBI=0.0518244;REFB=-0.181614;REVB=0.0219406;RO=0;SAF=1;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4393e-08;STB=0.505154;TYPE=snp;VARB=0.00352393;OID=.;OPOS=125512770;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:98:99:0:2:96:97:95:1:0:0:96:1:0:2 chr9 125512788 . G A 1114 PASS AO=88;DP=115;FAO=116;FDP=116;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=5;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0530378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.4524;QD=38.4137;RBI=0.142426;REFB=0;REVB=0.132182;RO=0;SAF=5;SAR=83;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00176324;OID=.;OPOS=125512788;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:116:116:0:0:88:116:83:5:0:0:111:5:0:0 chr9 125512795 . G C 1232.31 PASS AO=128;DP=129;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=116;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0350869;FXX=0.00775134;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.252;QD=38.5096;RBI=0.0368392;REFB=0;REVB=-0.0112267;RO=0;SAF=12;SAR=116;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.81355e-05;OID=.;OPOS=125512795;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:129:128:0:0:128:128:116:12:0:0:116:12:0:0 chr9 125512826 . G A 1703.75 PASS AO=181;DP=185;FAO=184;FDP=184;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=135;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235667;FXX=0.0160419;HRUN=3;LEN=1;MLLD=65.957;QD=37.038;RBI=0.0457321;REFB=-0.0528861;REVB=0.0391922;RO=4;SAF=49;SAR=132;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0142061;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000154201;OID=.;OPOS=125512826;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:185:184:4:0:181:184:132:49:0:4:135:49:0:0 chr9 125512943 . C T 229.55 PASS AO=78;DP=210;FAO=78;FDP=212;FR=.;FRO=134;FSAF=19;FSAR=59;FSRF=40;FSRR=94;FWDB=0.0055518;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.511;QD=4.33108;RBI=0.00904164;REFB=-0.000752666;REVB=-0.00713643;RO=130;SAF=19;SAR=59;SRF=40;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0905237;STB=0.544916;TYPE=snp;VARB=0.000957635;OID=.;OPOS=125512943;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:210:212:130:134:78:78:59:19:40:90:59:19:40:94 chr9 125524836 . A G 1523.26 PASS AO=168;DP=173;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0087414;FXX=0.0289001;HRUN=3;LEN=1;MLLD=98.6368;QD=36.268;RBI=0.00910319;REFB=-0.0776433;REVB=0.00254089;RO=3;SAF=74;SAR=94;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00362968;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.04055e-05;OID=.;OPOS=125524836;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:173:168:3:0:168:168:94:74:1:2:94:74:0:0 chr9 125582173 . C T 1337.65 PASS AO=136;DP=136;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.8248;QD=37.6802;RBI=0.0826944;REFB=0;REVB=0.0820088;RO=0;SAF=68;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000230345;OID=.;OPOS=125582173;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:136:142:0:0:136:142:68:68:0:0:74:68:0:0 chr9 125611809 . A T 67.92 PASS AO=92;DP=179;FAO=46;FDP=242;FR=.;FRO=196;FSAF=2;FSAR=44;FSRF=64;FSRR=132;FWDB=-0.10883;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=21.4119;QD=1.12269;RBI=0.109713;REFB=-0.203671;REVB=-0.0138875;RO=87;SAF=0;SAR=92;SRF=39;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.867867;STB=0.891661;TYPE=snp;VARB=0.0308048;OID=.;OPOS=125611809;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:179:242:87:196:92:46:92:0:39:48:44:2:64:132 chr9 125618080 . T G 329.58 PASS AO=73;DP=141;FAO=73;FDP=141;FR=.;FRO=68;FSAF=44;FSAR=29;FSRF=41;FSRR=27;FWDB=0.0118645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.978;QD=9.3498;RBI=0.0257574;REFB=-0.0195707;REVB=-0.0228622;RO=66;SAF=44;SAR=29;SRF=40;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00300174;STB=0.500101;TYPE=snp;VARB=0.0196755;OID=.;OPOS=125618080;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:66:68:73:73:29:44:40:26:29:44:41:27 chr9 125637471 . A T 1354.79 PASS AO=145;DP=147;FAO=145;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00861044;FXX=0.0136045;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.4839;QD=37.3735;RBI=0.0151126;REFB=-0.0808248;REVB=-0.0124198;RO=2;SAF=64;SAR=81;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0146271;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.74419e-05;OID=.;OPOS=125637471;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:147:145:2:0:145:145:81:64:2:0:81:64:0:0 chr9 125637648 . T C 757.89 PASS AO=81;DP=83;FAO=83;FDP=85;FR=.;FRO=2;FSAF=30;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00795878;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.7337;QD=35.6653;RBI=0.0190904;REFB=-0.0413262;REVB=0.0173523;RO=2;SAF=29;SAR=52;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0178633;STB=0.509257;TYPE=snp;VARB=0.000970874;OID=.;OPOS=125637648;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:83:85:2:2:81:83:52:29:0:2:53:30:0:2 chr9 125652757 . G A 729.88 PASS AO=144;DP=246;FAO=144;FDP=246;FR=.;FRO=102;FSAF=69;FSAR=75;FSRF=52;FSRR=50;FWDB=-0.00506245;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.595;QD=11.8679;RBI=0.00513227;REFB=0.00121368;REVB=-0.000843639;RO=97;SAF=69;SAR=75;SRF=49;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0193546;STB=0.51271;TYPE=snp;VARB=-0.00105031;OID=.;OPOS=125652757;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:246:246:97:102:144:144:75:69:49:48:75:69:52:50 chr9 125866070 . G C 342.99 PASS AO=83;DP=172;FAO=83;FDP=172;FR=.;FRO=89;FSAF=59;FSAR=24;FSRF=55;FSRR=34;FWDB=-0.000310325;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.419;QD=7.97646;RBI=0.000310656;REFB=-0.0172816;REVB=1.43436e-05;RO=89;SAF=59;SAR=24;SRF=55;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100557;STB=0.555686;TYPE=snp;VARB=0.0219729;OID=.;OPOS=125866070;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:172:89:89:83:83:24:59:55:34:24:59:55:34 chr9 125920376 . G A 173.03 PASS AO=49;DP=121;FAO=49;FDP=118;FR=.;FRO=69;FSAF=16;FSAR=33;FSRF=20;FSRR=49;FWDB=0.0152551;FXX=0.0247913;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9617;QD=5.86555;RBI=0.0192207;REFB=0.00205672;REVB=0.0116926;RO=69;SAF=16;SAR=33;SRF=20;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0441424;STB=0.52479;TYPE=snp;VARB=-0.000916665;OID=.;OPOS=125920376;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:118:69:69:49:49:33:16:20:49:33:16:20:49 chr9 126028395 . C G 1293.68 PASS AO=139;DP=141;FAO=139;FDP=141;FR=.;FRO=2;FSAF=93;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0373264;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.871;QD=36.7001;RBI=0.0401154;REFB=-0.0890615;REVB=0.0146962;RO=2;SAF=93;SAR=46;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0202186;STB=0.510637;TYPE=snp;VARB=0.000422735;OID=.;OPOS=126028395;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:141:141:2:2:139:139:46:93:0:2:46:93:0:2 chr9 126125318 . C A 431.01 PASS AO=48;DP=50;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0487607;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.5854;QD=33.8044;RBI=0.0765517;REFB=-0.170547;REVB=0.0590132;RO=2;SAF=12;SAR=36;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0254237;STB=0.506664;TYPE=snp;VARB=0.00846932;OID=.;OPOS=126125318;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:50:51:2:1:48:50:36:12:0:2:37:13:0:1 chr9 126131161 . G A 161.97 PASS AO=32;DP=57;FAO=32;FDP=57;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=23;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.012547;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.183;QD=11.3666;RBI=0.012757;REFB=-0.022448;REVB=-0.00230509;RO=25;SAF=9;SAR=23;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.240284;STB=0.633445;TYPE=snp;VARB=0.0190116;OID=.;OPOS=126131161;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:57:57:25:25:32:32:23:9:14:11:23:9:14:11 chr9 126132568 . C T 59.55 PASS AO=17;DP=42;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=2;FWDB=0.0438633;FXX=0.0465008;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.6449;QD=5.80969;RBI=0.0465956;REFB=-0.00570892;REVB=-0.0157215;RO=25;SAF=5;SAR=12;SRF=23;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.582791;STB=0.825427;TYPE=snp;VARB=0.0113091;OID=.;OPOS=126132568;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:42:41:25:25:17:16:12:5:23:2:11:5:23:2 chr9 126132919 . G A 36.88 PASS AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.00242744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.405;QD=13.4095;RBI=0.0502271;REFB=-0.0405936;REVB=-0.0501684;RO=5;SAF=3;SAR=3;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0757641;STB=0.545304;TYPE=snp;VARB=0.0261826;OID=.;OPOS=126132919;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:11:11:5:5:6:6:3:3:3:2:3:3:3:2 chr9 126133497 . C T 68.18 PASS AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.0124313;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.108;QD=8.5229;RBI=0.0124341;REFB=-0.0288892;REVB=-0.00026497;RO=17;SAF=12;SAR=3;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249131;STB=0.644946;TYPE=snp;VARB=0.0340331;OID=.;OPOS=126133497;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:32:32:17:17:15:15:3:12:10:7:3:12:10:7 chr9 126133547 . T C 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.872;QD=33.0212;RBI=0.0252802;REFB=0;REVB=0.0252802;RO=0;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000493784;OID=.;OPOS=126133547;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:6:0:0:0:6:0:0:0 chr9 126134542 . G A 186.69 PASS AO=40;DP=76;FAO=40;FDP=76;FR=.;FRO=36;FSAF=6;FSAR=34;FSRF=8;FSRR=28;FWDB=0.00271847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.8811;QD=9.82563;RBI=0.0190224;REFB=-0.0148884;REVB=0.0188271;RO=35;SAF=6;SAR=34;SRF=7;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0773809;STB=0.561288;TYPE=snp;VARB=0.0212488;OID=.;OPOS=126134542;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:35:36:40:40:34:6:7:28:34:6:8:28 chr9 126136247 . A G 46.31 PASS AO=11;DP=26;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=0;FWDB=-0.035084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.2368;QD=7.12453;RBI=0.0746907;REFB=-0.0113999;REVB=-0.065938;RO=15;SAF=7;SAR=4;SRF=15;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.46429;STB=0.758317;TYPE=snp;VARB=0.033886;OID=.;OPOS=126136247;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:26:26:15:15:11:11:4:7:15:0:4:7:15:0 chr9 126140150 . G A 426.64 PASS AO=102;DP=208;FAO=102;FDP=208;FR=.;FRO=106;FSAF=38;FSAR=64;FSRF=61;FSRR=45;FWDB=0.0100724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.9774;QD=8.20455;RBI=0.0136571;REFB=-0.00720389;REVB=0.00922297;RO=102;SAF=38;SAR=64;SRF=61;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206614;STB=0.604675;TYPE=snp;VARB=0.0104226;OID=.;OPOS=126140150;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:208:102:106:102:102:64:38:61:41:64:38:61:45 chr9 126220114 . C T 123.05 PASS AO=22;DP=34;FAO=22;FDP=37;FR=.;FRO=15;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.0398956;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5546;QD=13.3026;RBI=0.0415196;REFB=-0.0809336;REVB=-0.0114985;RO=12;SAF=16;SAR=6;SRF=10;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0895976;STB=0.530092;TYPE=snp;VARB=0.0255954;OID=.;OPOS=126220114;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:34:37:12:15:22:22:6:16:10:2:6:16:10:5 chr9 126520068 . T C 453.37 PASS AO=110;DP=229;FAO=111;FDP=231;FR=.;FRO=120;FSAF=37;FSAR=74;FSRF=52;FSRR=68;FWDB=-0.0404847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.941;QD=7.85051;RBI=0.0417646;REFB=-0.0144604;REVB=0.0102605;RO=119;SAF=36;SAR=74;SRF=51;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103906;STB=0.55624;TYPE=snp;VARB=0.0143124;OID=.;OPOS=126520068;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:229:231:119:120:110:111:74:36:51:68:74:37:52:68 chr9 126770250 . C G 377.16 PASS AO=100;DP=235;FAO=104;FDP=238;FR=.;FRO=134;FSAF=39;FSAR=65;FSRF=55;FSRR=79;FWDB=0.00244481;FXX=0.00418393;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.917;QD=6.33881;RBI=0.00803335;REFB=-0.00179527;REVB=0.00765229;RO=135;SAF=39;SAR=61;SRF=55;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0187544;STB=0.52106;TYPE=snp;VARB=0.00225741;OID=.;OPOS=126770250;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:235:238:135:134:100:104:61:39:55:80:65:39:55:79 chr9 126783433 . G C 161.13 PASS AO=36;DP=71;FAO=36;FDP=72;FR=.;FRO=36;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=11;FWDB=-0.00240256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.677;QD=8.95164;RBI=0.00245326;REFB=-0.0153182;REVB=-0.000496177;RO=34;SAF=20;SAR=16;SRF=24;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135861;STB=0.57139;TYPE=snp;VARB=0.00909465;OID=.;OPOS=126783433;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:72:34:36:36:36:16:20:24:10:16:20:25:11 chr9 127101921 . TCCC TCC,TCCT 1422.5 PASS AO=23,111;DP=155;FAO=22,134;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=11,35;FSAR=11,99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0645077,0.0562956;FXX=0.00636902;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=21.6169,37.015;QD=36.4744;RBI=0.267907,0.0688405;REFB=0,0;REVB=-0.260025,-0.039621;RO=0;SAF=10,30;SAR=13,81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.0851147,-0.00141337;OID=.,.;OPOS=127101922,127101924;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=TCC,TCCT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:23,111:140:22,134:156:0:11,35:11,99:0:0:11:0:10,30:13,81:0:0 chr9 127113660 . A G 510.85 PASS AO=123;DP=244;FAO=121;FDP=242;FR=.;FRO=121;FSAF=42;FSAR=79;FSRF=55;FSRR=66;FWDB=0.0179643;FXX=0.00819639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.682;QD=8.44373;RBI=0.0180054;REFB=-0.00556962;REVB=-0.00121504;RO=121;SAF=44;SAR=79;SRF=55;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0923568;STB=0.557178;TYPE=snp;VARB=0.00528265;OID=.;OPOS=127113660;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:242:121:121:123:121:79:44:55:66:79:42:55:66 chr9 127177161 . A G 230.63 PASS AO=45;DP=124;FAO=63;FDP=143;FR=.;FRO=80;FSAF=35;FSAR=28;FSRF=37;FSRR=43;FWDB=0.0218861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.672;QD=6.45111;RBI=0.0340425;REFB=-0.0212631;REVB=-0.0260746;RO=79;SAF=21;SAR=24;SRF=37;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00188899;STB=0.552083;TYPE=snp;VARB=0.0240489;OID=.;OPOS=127177161;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:143:79:80:45:63:24:21:37:42:28:35:37:43 chr9 127220952 . T C 584.24 PASS AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0316842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.765;QD=37.6927;RBI=0.0348592;REFB=0;REVB=0.0145352;RO=0;SAF=4;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.69482e-05;OID=.;OPOS=127220952;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:62:62:0:0:62:62:58:4:0:0:58:4:0:0 chr9 127228596 . A G 361.1 PASS AO=32;DP=33;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000667435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.0786;QD=38.0101;RBI=0.0786907;REFB=0;REVB=0.0786878;RO=0;SAF=15;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000500314;OID=.;OPOS=127228596;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:33:38:0:0:32:38:17:15:0:0:23:15:0:0 chr9 127230891 . G A 568.17 PASS AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0219451;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.951;QD=38.52;RBI=0.0392091;REFB=0;REVB=-0.0324926;RO=0;SAF=15;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.07814e-05;OID=.;OPOS=127230891;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:59:59:0:0:59:59:44:15:0:0:44:15:0:0 chr9 127231757 . G A 57.72 PASS AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=0.000246093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.312;QD=6.99599;RBI=0.0213848;REFB=0.00583666;REVB=-0.0213834;RO=19;SAF=6;SAR=8;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116789;STB=0.567475;TYPE=snp;VARB=-0.0120031;OID=.;OPOS=127231757;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:33:33:19:19:14:14:8:6:6:13:8:6:6:13 chr9 127231774 . C G 231.7 PASS AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0808314;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.2892;QD=37.0724;RBI=0.0896121;REFB=0;REVB=-0.038686;RO=0;SAF=9;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00129598;OID=.;OPOS=127231774;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:25:25:0:0:25:25:16:9:0:0:16:9:0:0 chr9 127369679 . C T 140.81 PASS AO=37;DP=86;FAO=37;FDP=86;FR=.;FRO=49;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=0.0058675;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.444;QD=6.54941;RBI=0.010753;REFB=-0.0241502;REVB=0.00901105;RO=49;SAF=20;SAR=17;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0513742;STB=0.528952;TYPE=snp;VARB=0.0295785;OID=.;OPOS=127369679;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:49:49:37:37:17:20:24:25:17:20:24:25 chr9 127563364 . G A 70.96 PASS AO=24;DP=70;FAO=24;FDP=71;FR=.;FRO=47;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=29;FSRR=18;FWDB=0.0457901;FXX=0.0273935;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.856;QD=3.99792;RBI=0.0685978;REFB=-0.0174254;REVB=-0.0510777;RO=44;SAF=16;SAR=8;SRF=29;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00944961;STB=0.536052;TYPE=snp;VARB=0.035555;OID=.;OPOS=127563364;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:70:71:44:47:24:24:8:16:29:15:8:16:29:18 chr9 127566378 . A G 70.5 PASS AO=11;DP=16;FAO=11;FDP=16;FR=.;FRO=5;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.0109741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.756;QD=17.6257;RBI=0.0317468;REFB=0.0109709;REVB=-0.0297897;RO=5;SAF=9;SAR=2;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195527;STB=0.608529;TYPE=snp;VARB=-0.00778135;OID=.;OPOS=127566378;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:16:16:5:5:11:11:2:9:5:0:2:9:5:0 chr9 127618776 . A G 116.19 PASS AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00382284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.7435;QD=35.7501;RBI=0.0220391;REFB=0;REVB=0.021705;RO=0;SAF=11;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00121981;OID=.;OPOS=127618776;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:13:0:0:13:13:2:11:0:0:2:11:0:0 chr9 127618839 . C G 232.45 PASS AO=24;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0500638;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=37.5183;QD=34.4363;RBI=0.0830526;REFB=0;REVB=0.0662672;RO=2;SAF=11;SAR=13;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0770585;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0044589;OID=.;OPOS=127618839;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:26:27:2:0:24:27:13:11:2:0:14:13:0:0 chr9 127639695 . C T 201.1 PASS AO=49;DP=107;FAO=50;FDP=108;FR=.;FRO=58;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=20;FSRR=38;FWDB=0.00268065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.166;QD=7.44818;RBI=0.0119118;REFB=-0.0129114;REVB=0.0116062;RO=57;SAF=21;SAR=28;SRF=20;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0776073;STB=0.541971;TYPE=snp;VARB=0.0136199;OID=.;OPOS=127639695;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:108:57:58:49:50:28:21:20:37:29:21:20:38 chr9 127642136 . A T 355.63 PASS AO=84;DP=205;FAO=101;FDP=222;FR=.;FRO=121;FSAF=41;FSAR=60;FSRF=35;FSRR=86;FWDB=0.0319093;FXX=0.00892817;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.013;QD=6.40771;RBI=0.0401079;REFB=-0.00942955;REVB=0.0242989;RO=118;SAF=28;SAR=56;SRF=35;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0439237;STB=0.567596;TYPE=snp;VARB=0.0151207;OID=.;OPOS=127642136;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:222:118:121:84:101:56:28:35:83:60:41:35:86 chr9 127674200 . A C 1731.81 PASS AO=183;DP=184;FAO=183;FDP=183;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=135;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0125499;FXX=0.00543449;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.578;QD=37.8537;RBI=0.0205278;REFB=-0.040291;REVB=0.0162446;RO=0;SAF=48;SAR=135;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00010214;OID=.;OPOS=127674200;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:184:183:0:0:183:183:135:48:0:0:135:48:0:0 chr9 127693666 . G C 256.66 PASS AO=81;DP=208;FAO=81;FDP=208;FR=.;FRO=127;FSAF=36;FSAR=45;FSRF=48;FSRR=79;FWDB=0.00232567;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.622;QD=4.93585;RBI=0.0202499;REFB=-0.0101563;REVB=0.0201159;RO=127;SAF=36;SAR=45;SRF=48;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0737629;STB=0.541475;TYPE=snp;VARB=0.0158775;OID=.;OPOS=127693666;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:208:127:127:81:81:45:36:48:79:45:36:48:79 chr9 127764305 . G A 143.04 PASS AO=30;DP=58;FAO=30;FDP=58;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=24;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=-0.0673185;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.821;QD=9.86462;RBI=0.0682542;REFB=-0.0241731;REVB=-0.0112627;RO=27;SAF=6;SAR=24;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15721;STB=0.603698;TYPE=snp;VARB=0.0191783;OID=.;OPOS=127764305;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:27:28:30:30:24:6:9:18:24:6:10:18 chr9 127951863 . G A 30.46 PASS AO=8;DP=23;FAO=8;FDP=23;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=15;FSRR=0;FWDB=-0.0112971;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3276;QD=5.29783;RBI=0.0328412;REFB=0.000190417;REVB=0.030837;RO=15;SAF=7;SAR=1;SRF=15;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.462021;STB=0.758272;TYPE=snp;VARB=0.00130429;OID=.;OPOS=127951863;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:23:23:15:15:8:8:1:7:15:0:1:7:15:0 chr9 127962916 . G A 16.14 PASS AO=7;DP=33;FAO=7;FDP=32;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=19;FWDB=0.0362275;FXX=0.0302939;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.615;QD=2.01801;RBI=0.0512236;REFB=-0.00305696;REVB=-0.0362137;RO=25;SAF=6;SAR=1;SRF=6;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.652374;STB=0.908161;TYPE=snp;VARB=0.0243781;OID=.;OPOS=127962916;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:33:32:25:25:7:7:1:6:6:19:1:6:6:19 chr9 127962972 . G A 124.3 PASS AO=30;DP=68;FAO=31;FDP=68;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=26;FWDB=0.0149256;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.727;QD=7.31192;RBI=0.0265263;REFB=-0.00946413;REVB=0.0219287;RO=38;SAF=11;SAR=19;SRF=12;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0552069;STB=0.55268;TYPE=snp;VARB=0.0110676;OID=.;OPOS=127962972;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:38:37:30:31:19:11:12:26:19:12:11:26 chr9 127975654 . C T 273.14 PASS AO=47;DP=146;FAO=65;FDP=140;FR=.,HEALED;FRO=74;FSAF=31;FSAR=34;FSRF=32;FSRR=42;FWDB=0.00765838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.595;QD=7.80388;RBI=0.0983544;REFB=-0.00882947;REVB=-0.0980558;RO=44;SAF=26;SAR=21;SRF=30;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115698;STB=0.523781;TYPE=snp;VARB=0.00990336;OID=.;OPOS=127975654;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:140:44:74:47:65:21:26:30:14:34:31:32:42 chr9 128003135 . GCC GC,G 402.93 PASS AO=42,16;DP=67;FAO=61,0;FDP=64;FR=.;FRO=3;FSAF=20,0;FSAR=41,0;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0442278,-0.0230972;FXX=0.0153822;HRUN=3,3;LEN=1,2;MLLD=16.748,10.106;QD=25.1829;RBI=0.379601,0.191112;REFB=0.0403296,0.0297815;REVB=-0.377015,-0.189711;RO=3;SAF=17,3;SAR=25,13;SRF=3;SRR=0;SSEN=0.443878,0.443878;SSEP=0,0;SSSB=-0.0759027,-0.299344;STB=0.534872,0.5;TYPE=del,del;VARB=-0.00643543,0.0428912;OID=.,.;OPOS=128003136,128003136;OREF=C,CC;OALT=-,-;OMAPALT=GC,G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:42,16:62:61,0:64:3:20,0:41,0:3:0:23:3:17,3:25,13:3:0 chr9 128074807 . T C 1157.37 PASS AO=124;DP=125;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00632851;FXX=0.0159987;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7025;QD=37.638;RBI=0.0220731;REFB=0.00378986;REVB=-0.0211464;RO=1;SAF=64;SAR=60;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00736617;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00117512;OID=.;OPOS=128074807;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:125:123:1:0:124:123:60:64:1:0:60:63:0:0 chr9 128199873 . C T 390.13 PASS AO=110;DP=255;FAO=110;FDP=255;FR=.;FRO=145;FSAF=56;FSAR=54;FSRF=63;FSRR=82;FWDB=-0.0290321;FXX=0.0039061;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.059;QD=6.11966;RBI=0.0577943;REFB=0.0221063;REVB=-0.0499731;RO=144;SAF=56;SAR=54;SRF=63;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0729249;STB=0.542365;TYPE=snp;VARB=-0.0310377;OID=.;OPOS=128199873;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:255:255:144:145:110:110:54:56:63:81:54:56:63:82 chr9 128246786 . G A 217.9 PASS AO=76;DP=211;FAO=76;FDP=211;FR=.;FRO=135;FSAF=45;FSAR=31;FSRF=68;FSRR=67;FWDB=0.00114213;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.654;QD=4.13079;RBI=0.00413911;REFB=-0.0114232;REVB=-0.00397841;RO=134;SAF=45;SAR=31;SRF=68;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.096313;STB=0.557296;TYPE=snp;VARB=0.0208109;OID=.;OPOS=128246786;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:211:134:135:76:76:31:45:68:66:31:45:68:67 chr9 128728395 . T TA 229.73 PASS AO=73;DP=175;FAO=116;FDP=151;FR=.;FRO=35;FSAF=35;FSAR=81;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=-0.100589;FXX=0.013071;HRUN=8;LEN=1;MLLD=7.59158;QD=6.08563;RBI=0.136812;REFB=-0.107024;REVB=-0.0927331;RO=72;SAF=18;SAR=55;SRF=33;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22319;STB=0.518881;TYPE=ins;VARB=0.0825528;OID=.;OPOS=128728396;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:73:175:116:151:35:35:81:13:22:19:72:18:55:33:39 chr9 129102840 . G A 644.75 PASS AO=67;DP=69;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.147051;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.896;QD=37.9267;RBI=0.147148;REFB=0;REVB=0.00533864;RO=1;SAF=5;SAR=62;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0855614;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000364493;OID=.;OPOS=129102840;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:69:68:1:0:67:68:62:5:1:0:62:6:0:0 chr9 129265715 . C G 639.49 PASS AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.0582;QD=38.1788;RBI=0.0608312;REFB=0;REVB=0.059132;RO=0;SAF=35;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.62221e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000843992;OID=.;OPOS=129265715;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:67:67:0:0:67:67:32:35:0:0:32:35:0:0 chr9 129453229 . A G 104.58 PASS AO=24;DP=51;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.0166915;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.805;QD=8.20269;RBI=0.0201845;REFB=-0.0387907;REVB=-0.0113494;RO=27;SAF=14;SAR=10;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0266285;STB=0.515038;TYPE=snp;VARB=0.0389692;OID=.;OPOS=129453229;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:27:27:24:24:10:14:15:12:10:14:15:12 chr9 129595895 . T C 110.31 PASS AO=28;DP=67;FAO=29;FDP=68;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=-0.0117537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.838;QD=6.48867;RBI=0.0178578;REFB=-0.00579674;REVB=0.0134444;RO=38;SAF=12;SAR=16;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0629988;STB=0.517338;TYPE=snp;VARB=0.00890771;OID=.;OPOS=129595895;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:68:38:39:28:29:16:12:14:24:17:12:15:24 chr9 129600083 . TGGGGA TGGGA,TGGA,TGGGAG 514.38 PASS AO=31,21,14;DP=98;FAO=68,0,18;FDP=88;FR=.;FRO=2;FSAF=23,0,17;FSAR=45,0,1;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.464258,0.250363,0.282618;FXX=0.0222198;HRUN=4,4,4;LEN=1,2,2;MLLD=11.5061,10.9795,12.6077;QD=23.3809;RBI=0.621783,0.332148,0.334264;REFB=0.0400306,0.0302737,0.035275;REVB=-0.413616,-0.218266,-0.178493;RO=14;SAF=9,0,14;SAR=22,21,0;SRF=13;SRR=1;SSEN=0.466245,0.466245,0;SSEP=0.5,0.5,0;SSSB=-0.366953,-0.875448,0.779853;STB=0.505144,0.5,0.653631;TYPE=del,del,mnp;VARB=0.0334919,0,-0.0319711;OID=.,.,.;OPOS=129600084,129600084,129600087;OREF=G,GG,GA;OALT=-,-,AG;OMAPALT=TGGGA,TGGA,TGGGAG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/3:31,21,14:86:68,0,18:88:2:23,0,17:45,0,1:1:1:21:14:9,0,14:22,21,0:13:1 chr9 129643296 . G T 107.26 PASS AO=21;DP=41;FAO=23;FDP=45;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=18;FWDB=-0.0139215;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3397;QD=9.53436;RBI=0.0167951;REFB=0.0106874;REVB=0.00939505;RO=20;SAF=9;SAR=12;SRF=4;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210923;STB=0.612677;TYPE=snp;VARB=-0.0104396;OID=.;OPOS=129643296;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:41:45:20:22:21:23:12:9:4:16:14:9:4:18 chr9 129644560 . T A 210.64 PASS AO=80;DP=241;FAO=82;FDP=244;FR=.;FRO=162;FSAF=16;FSAR=66;FSRF=46;FSRR=116;FWDB=0.0292666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.551;QD=3.45314;RBI=0.029532;REFB=-0.00683076;REVB=-0.00395051;RO=161;SAF=15;SAR=65;SRF=46;SRR=115;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16348;STB=0.584215;TYPE=snp;VARB=0.00895813;OID=.;OPOS=129644560;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:241:244:161:162:80:82:65:15:46:115:66:16:46:116 chr9 129644561 . C A 202.24 PASS AO=82;DP=242;FAO=80;FDP=241;FR=.;FRO=161;FSAF=16;FSAR=64;FSRF=46;FSRR=115;FWDB=0.00271954;FXX=0.00823011;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.436;QD=3.3566;RBI=0.00305429;REFB=-0.017098;REVB=-0.00139024;RO=158;SAF=16;SAR=66;SRF=46;SRR=112;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155137;STB=0.580774;TYPE=snp;VARB=0.0217593;OID=.;OPOS=129644561;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:242:241:158:161:82:80:66:16:46:112:64:16:46:115 chr9 129645251 . C T 648.59 PASS AO=154;DP=311;FAO=154;FDP=311;FR=.;FRO=157;FSAF=93;FSAR=61;FSRF=94;FSRR=63;FWDB=0.0105346;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=190.528;QD=8.34202;RBI=0.012678;REFB=-0.0173067;REVB=0.00705362;RO=153;SAF=93;SAR=61;SRF=91;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00865484;STB=0.502724;TYPE=snp;VARB=0.0153448;OID=.;OPOS=129645251;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:311:311:153:157:154:154:61:93:91:62:61:93:94:63 chr9 129646716 . GC G 1632.8 PASS AO=284;DP=362;FAO=252;FDP=252;FR=.;FRO=0;FSAF=108;FSAR=144;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0330616;FXX=0.030768;HRUN=2;LEN=1;MLLD=14.91;QD=25.9175;RBI=0.0948101;REFB=0.01751;REVB=-0.0888588;RO=13;SAF=87;SAR=197;SRF=11;SRR=2;SSEN=0.310377;SSEP=0;SSSB=-0.0517666;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00854267;OID=.;OPOS=129646717;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:284:348:252:252:0:108:144:0:0:99:13:87:197:11:2 chr9 129646734 . TTTG T 122.16 PASS AO=84;DP=366;FAO=80;FDP=228;FR=.;FRO=148;FSAF=32;FSAR=48;FSRF=51;FSRR=97;FWDB=-0.0045524;FXX=0.136358;HRUN=6;LEN=3;MLLD=183.121;QD=2.14318;RBI=0.00473195;REFB=-0.00823291;REVB=-0.00129114;RO=84;SAF=24;SAR=60;SRF=23;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0.566667;SSSB=0.013341;STB=0.538024;TYPE=del;VARB=0.0124389;OID=.;OPOS=129646735;OREF=TTG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:84:279:80:228:148:32:48:51:97:99:84:24:60:23:61 chr9 129646775 . A G 870.17 PASS AO=197;DP=362;FAO=183;FDP=329;FR=.;FRO=146;FSAF=60;FSAR=123;FSRF=23;FSRR=123;FWDB=-0.00634772;FXX=0.032352;HRUN=3;LEN=1;MLLD=178.105;QD=10.5796;RBI=0.00842217;REFB=-0.00319193;REVB=0.00553529;RO=156;SAF=58;SAR=139;SRF=25;SRR=131;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140531;STB=0.591124;TYPE=snp;VARB=0.00269877;OID=.;OPOS=129646775;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:362:329:156:146:197:183:139:58:25:131:123:60:23:123 chr9 129752239 . C T 1339.73 PASS AO=139;DP=140;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00766166;FXX=0.00714235;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.728;QD=38.5534;RBI=0.0403598;REFB=0;REVB=0.0396259;RO=0;SAF=65;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.37847e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000107275;OID=.;OPOS=129752239;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:140:139:0:0:139:139:74:65:0:0:74:65:0:0 chr9 129831659 . T A 1397.9 PASS AO=184;DP=220;FAO=185;FDP=219;FR=.;FRO=34;FSAF=65;FSAR=120;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=0.00410255;FXX=0.00454525;HRUN=9;LEN=1;MLLD=185.163;QD=25.5324;RBI=0.0068529;REFB=-0.0162176;REVB=-0.00548921;RO=34;SAF=65;SAR=119;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.009354;STB=0.505263;TYPE=snp;VARB=0.000236448;OID=.;OPOS=129831659;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:220:219:34:34:184:185:119:65:13:21:120:65:13:21 chr9 130164993 . C T 88.12 PASS AO=14;DP=22;FAO=14;FDP=21;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0389933;FXX=0.0454339;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.131;QD=16.7847;RBI=0.0398796;REFB=-0.0250697;REVB=0.00836103;RO=7;SAF=7;SAR=7;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0424322;STB=0.523776;TYPE=snp;VARB=0.0130662;OID=.;OPOS=130164993;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:22:21:7:7:14:14:7:7:4:3:7:7:4:3 chr9 130165995 . C T 198.09 PASS AO=37;DP=62;FAO=37;FDP=62;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=25;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.0621305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.9997;QD=12.7799;RBI=0.0667353;REFB=-0.014834;REVB=0.0243598;RO=25;SAF=12;SAR=25;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0617942;STB=0.533962;TYPE=snp;VARB=0.00940166;OID=.;OPOS=130165995;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:62:62:25:25:37:37:25:12:10:15:25:12:10:15 chr9 130169874 . A G 198.08 PASS AO=49;DP=109;FAO=50;FDP=110;FR=.;FRO=60;FSAF=17;FSAR=33;FSRF=26;FSRR=34;FWDB=-0.0106436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.439;QD=7.20278;RBI=0.0191139;REFB=0.000169276;REVB=-0.0158762;RO=59;SAF=16;SAR=33;SRF=25;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103458;STB=0.554708;TYPE=snp;VARB=-0.000296013;OID=.;OPOS=130169874;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:110:59:60:49:50:33:16:25:34:33:17:26:34 chr9 130191186 . C T 1325.55 PASS AO=138;DP=138;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0178089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.524;QD=38.4217;RBI=0.0179544;REFB=0;REVB=0.00228172;RO=0;SAF=31;SAR=107;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.87182e-05;OID=.;OPOS=130191186;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:138:138:0:0:138:138:107:31:0:0:107:31:0:0 chr9 130197414 . A G 2276.61 PASS AO=244;DP=246;FAO=242;FDP=242;FR=.;FRO=0;FSAF=120;FSAR=122;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0414803;FXX=0.0162595;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.6893;QD=37.63;RBI=0.0672301;REFB=-0.0250366;REVB=-0.0529081;RO=2;SAF=122;SAR=122;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000302233;OID=.;OPOS=130197414;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:97:246:242:2:0:244:242:122:122:1:1:122:120:0:0 chr9 130206669 . C T 177.32 PASS AO=31;DP=50;FAO=31;FDP=50;FR=.;FRO=19;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.000754819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.544;QD=14.1853;RBI=0.0419334;REFB=0.0109535;REVB=0.0419266;RO=19;SAF=17;SAR=14;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0584872;STB=0.53209;TYPE=snp;VARB=-0.0035113;OID=.;OPOS=130206669;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:50:50:19:19:31:31:14:17:12:7:14:17:12:7 chr9 130206762 . C T 235.36 PASS AO=48;DP=88;FAO=48;FDP=87;FR=.;FRO=39;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=0.0444163;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.314;QD=10.8212;RBI=0.0452853;REFB=-0.0343976;REVB=0.00882887;RO=39;SAF=20;SAR=28;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00538344;STB=0.502957;TYPE=snp;VARB=0.0312047;OID=.;OPOS=130206762;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:87:39:39:48:48:28:20:16:23:28:20:16:23 chr9 130219669 . C T 136.26 PASS AO=13;DP=13;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.325;QD=36.3352;RBI=0.0202275;REFB=0;REVB=0.00792396;RO=0;SAF=11;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000148084;OID=.;OPOS=130219669;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:13:15:0:0:13:15:2:11:0:0:2:13:0:0 chr9 130242166 . A G 347.7 PASS AO=34;DP=38;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0332456;FXX=0.0512689;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.5636;QD=37.589;RBI=0.0350755;REFB=0;REVB=0.0111813;RO=0;SAF=8;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000942978;OID=.;OPOS=130242166;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:38:37:0:0:34:37:26:8:0:0:29:8:0:0 chr9 130259618 . A C 651.41 PASS AO=73;DP=74;FAO=72;FDP=74;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0553328;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.4751;QD=35.2112;RBI=0.0737161;REFB=0.0377642;REVB=-0.0487067;RO=1;SAF=10;SAR=63;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0074508;STB=0.507934;TYPE=snp;VARB=-0.00518742;OID=.;OPOS=130259618;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:74:74:1:2:73:72:63:10:0:1:62:10:0:2 chr9 130267777 . C G 158.15 PASS AO=14;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0424695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.86;QD=37.212;RBI=0.0526247;REFB=0;REVB=0.0310756;RO=0;SAF=4;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.63386e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000798125;OID=.;OPOS=130267777;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:17:17:0:0:14:17:10:4:0:0:12:5:0:0 chr9 130286118 . C A 261.63 PASS AO=41;DP=58;FAO=41;FDP=58;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=33;FSRF=17;FSRR=0;FWDB=0.0419193;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=313.829;QD=18.0435;RBI=0.043961;REFB=-0.00663356;REVB=0.0132416;RO=16;SAF=8;SAR=33;SRF=16;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.459028;STB=0.757441;TYPE=snp;VARB=0.00242401;OID=.;OPOS=130286118;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:58:58:16:17:41:41:33:8:16:0:33:8:17:0 chr9 130341253 . A G 457.78 PASS AO=47;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.360623;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.2723;QD=38.1486;RBI=0.36088;REFB=0;REVB=-0.0136028;RO=0;SAF=0;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00377677;OID=.;OPOS=130341253;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:48:48:0:0:47:48:47:0:0:0:47:1:0:0 chr9 130475011 . T C 110.7 PASS AO=28;DP=68;FAO=29;FDP=68;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=-0.0541716;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.8892;QD=6.51205;RBI=0.0542143;REFB=-0.0299301;REVB=0.00215086;RO=39;SAF=18;SAR=10;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214275;STB=0.606667;TYPE=snp;VARB=0.041094;OID=.;OPOS=130475011;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:39:39:28:29:10:18:17:22:11:18:17:22 chr9 130475442 . A C 170.5 PASS AO=49;DP=120;FAO=49;FDP=120;FR=.;FRO=71;FSAF=14;FSAR=35;FSRF=33;FSRR=38;FWDB=-0.0200842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.6911;QD=5.68345;RBI=0.0470486;REFB=-0.0222885;REVB=-0.0425464;RO=71;SAF=14;SAR=35;SRF=33;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205919;STB=0.616748;TYPE=snp;VARB=0.0379092;OID=.;OPOS=130475442;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:71:71:49:49:35:14:33:38:35:14:33:38 chr9 130477768 . G A 161.34 PASS AO=39;DP=83;FAO=39;FDP=83;FR=.;FRO=44;FSAF=9;FSAR=30;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=-0.0392999;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.33;QD=7.77517;RBI=0.047941;REFB=0.00762796;REVB=0.0274564;RO=43;SAF=9;SAR=30;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21439;STB=0.629142;TYPE=snp;VARB=-0.00658597;OID=.;OPOS=130477768;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:43:44:39:39:30:9:18:25:30:9:19:25 chr9 130489373 . GC G 749.78 PASS AO=93;DP=163;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.134709;FXX=0.0129862;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.1365;QD=19.7311;RBI=0.392929;REFB=-0.0387891;REVB=0.369116;RO=45;SAF=30;SAR=63;SRF=6;SRR=39;SSEN=0.421687;SSEP=0;SSSB=0.13882;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0112403;OID=.;OPOS=130489374;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:93:152:152:152:0:45:107:0:0:47:45:30:63:6:39 chr9 130489558 . A G 168.13 PASS AO=50;DP=125;FAO=50;FDP=125;FR=.;FRO=75;FSAF=42;FSAR=8;FSRF=51;FSRR=24;FWDB=-0.0169743;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=165.444;QD=5.3803;RBI=0.0169825;REFB=-0.00317347;REVB=0.00052713;RO=74;SAF=42;SAR=8;SRF=51;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237855;STB=0.643613;TYPE=snp;VARB=0.0056837;OID=.;OPOS=130489558;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:74:75:50:50:8:42:51:23:8:42:51:24 chr9 130493513 . A G 102.41 PASS AO=20;DP=36;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=1;FWDB=0.0126117;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=212.713;QD=11.3786;RBI=0.0165045;REFB=-0.0521614;REVB=0.0106463;RO=14;SAF=16;SAR=4;SRF=13;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166764;STB=0.607752;TYPE=snp;VARB=0.0280184;OID=.;OPOS=130493513;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:36:36:14:16:20:20:4:16:13:1:4:16:15:1 chr9 130494811 . T C 18.71 PASS AO=5;DP=17;FAO=5;FDP=17;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=10;FSRR=2;FWDB=-0.0304966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.297;QD=4.40252;RBI=0.0315438;REFB=-0.0131604;REVB=0.00806022;RO=12;SAF=4;SAR=1;SRF=10;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.059687;STB=0.538315;TYPE=snp;VARB=0.0293158;OID=.;OPOS=130494811;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:17:17:12:12:5:5:1:4:10:2:1:4:10:2 chr9 130494957 . T C 519.8 PASS AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.066733;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.182;QD=37.8035;RBI=0.0687417;REFB=0;REVB=0.0164962;RO=0;SAF=37;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.85968e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000237987;OID=.;OPOS=130494957;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:55:55:0:0:55:55:18:37:0:0:18:37:0:0 chr9 130495627 . GCCCCCC GCCCCC,GCCCCCG 193.51 PASS AO=9,16;DP=51;FAO=15,22;FDP=50;FR=.;FRO=13;FSAF=14,17;FSAR=1,5;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.164545,0.0192129;FXX=0.019604;HRUN=7,7;LEN=1,1;MLLD=10.0245,209.445;QD=15.4808;RBI=0.25348,0.0694219;REFB=-0.142319,-0.0303803;REVB=0.192813,0.0667102;RO=12;SAF=9,14;SAR=0,2;SRF=11;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.733628,-0.0776876;STB=0.791932,0.576197;TYPE=del,snp;VARB=0.157301,0.0178861;OID=.,.;OPOS=130495628,130495633;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=GCCCCC,GCCCCCG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:9,16:48:15,22:50:13:14,17:1,5:8:5:54:12:9,14:0,2:11:1 chr9 130504070 . G A 86.94 PASS AO=31;DP=93;FAO=31;FDP=92;FR=.;FRO=61;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=40;FWDB=0.0363355;FXX=0.0107515;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.094;QD=3.77984;RBI=0.0409733;REFB=-0.0121804;REVB=0.0189351;RO=61;SAF=18;SAR=13;SRF=21;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.265231;STB=0.652883;TYPE=snp;VARB=0.0230819;OID=.;OPOS=130504070;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:93:92:61:61:31:31:13:18:21:40:13:18:21:40 chr9 130536484 . C T 131.89 PASS AO=27;DP=51;FAO=27;FDP=51;FR=.;FRO=24;FSAF=24;FSAR=3;FSRF=18;FSRR=6;FWDB=0.00182928;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=141.415;QD=10.3443;RBI=0.0179465;REFB=-0.00415858;REVB=0.017853;RO=23;SAF=24;SAR=3;SRF=17;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.241988;STB=0.631465;TYPE=snp;VARB=0.00477381;OID=.;OPOS=130536484;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:23:24:27:27:3:24:17:6:3:24:18:6 chr9 130536717 . G A 160.24 PASS AO=29;DP=51;FAO=30;FDP=51;FR=.;FRO=21;FSAF=1;FSAR=29;FSRF=2;FSRR=19;FWDB=-0.0111331;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.356;QD=12.5679;RBI=0.0416654;REFB=-0.0280361;REVB=0.0401504;RO=22;SAF=1;SAR=28;SRF=3;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.357192;STB=0.644323;TYPE=snp;VARB=0.0172232;OID=.;OPOS=130536717;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:51:51:22:21:29:30:28:1:3:19:29:1:2:19 chr9 130630639 . A G 780.38 PASS AO=68;DP=90;FAO=77;FDP=87;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=46;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0328843;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.56;QD=35.8793;RBI=0.0352397;REFB=-0.0836265;REVB=0.012667;RO=1;SAF=45;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0201037;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00184625;OID=.;OPOS=130630639;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:87:87:1:0:68:77:23:45:0:1:31:46:0:0 chr9 130647583 . T C 1045.73 PASS AO=110;DP=110;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00942399;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.3801;QD=38.0266;RBI=0.0447489;REFB=0;REVB=0.0437453;RO=0;SAF=52;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.4768e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000479796;OID=.;OPOS=130647583;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:110:110:0:0:110:110:58:52:0:0:58:52:0:0 chr9 130648680 . G A 392.42 PASS AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00480743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.43;QD=37.373;RBI=0.147553;REFB=0;REVB=0.147474;RO=0;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00128748;OID=.;OPOS=130648680;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:42:42:0:0:42:42:21:21:0:0:21:21:0:0 chr9 130670310 . A G 99.5 PASS AO=9;DP=9;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142958;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=316.077;QD=39.8017;RBI=0.0473574;REFB=0;REVB=0.0451481;RO=0;SAF=8;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000309859;OID=.;OPOS=130670310;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:10:0:0:9:10:1:8:0:0:2:8:0:0 chr9 130690412 . G C 116.17 PASS AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=242.968;QD=35.7434;RBI=0.017056;REFB=0;REVB=0.017056;RO=0;SAF=0;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.64762e-05;OID=.;OPOS=130690412;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:13:0:0:13:13:13:0:0:0:13:0:0:0 chr9 130698029 . G C 712.13 PASS AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00297369;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.284;QD=37.9805;RBI=0.0636536;REFB=0;REVB=0.0635841;RO=0;SAF=57;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000160789;OID=.;OPOS=130698029;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:75:75:0:0:75:75:18:57:0:0:18:57:0:0 chr9 130698043 . A G 724.57 PASS AO=77;DP=79;FAO=78;FDP=80;FR=.;FRO=2;FSAF=55;FSAR=23;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0274388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.74;QD=36.2285;RBI=0.0298003;REFB=-0.162336;REVB=0.0116265;RO=2;SAF=54;SAR=23;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0172064;STB=0.508926;TYPE=snp;VARB=0.00158942;OID=.;OPOS=130698043;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:79:80:2:2:77:78:23:54:2:0:23:55:2:0 chr9 130703789 . G A 745.48 PASS AO=72;DP=72;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123133;FXX=0.0253133;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.5616;QD=38.7262;RBI=0.177327;REFB=0;REVB=0.176899;RO=0;SAF=24;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00159654;OID=.;OPOS=130703789;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:72:77:0:0:72:77:48:24:0:0:55:22:0:0 chr9 130703852 . A AAAC 274.35 PASS AO=28;DP=41;FAO=32;FDP=34;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=26;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0939864;FXX=0.0285633;HRUN=4;LEN=3;MLLD=232.087;QD=32.2767;RBI=0.094059;REFB=0.0472264;REVB=0.00369601;RO=12;SAF=4;SAR=24;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.351036;STB=0.57138;TYPE=ins;VARB=-0.000462711;OID=.;OPOS=130703853;OREF=-;OALT=AAC;OMAPALT=AAAC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:28:41:32:34:2:6:26:2:0:5:12:4:24:7:5 chr9 130707081 . A G 522.23 PASS AO=56;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017797;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=190.76;QD=36.6476;RBI=0.0177976;REFB=-0.11134;REVB=-0.000154353;RO=1;SAF=21;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0219211;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000829801;OID=.;OPOS=130707081;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:57:57:1:0:56:57:35:21:1:0:35:22:0:0 chr9 130829039 . A G 133 PASS AO=14;DP=14;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0133573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.4447;QD=35.4674;RBI=0.0134279;REFB=0;REVB=-0.00137517;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00368914;OID=.;OPOS=130829039;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:14:15:0:0:14:15:8:6:0:0:9:6:0:0 chr9 130860866 . T C 978.45 PASS AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00744973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.864;QD=37.9982;RBI=0.0187688;REFB=0;REVB=0.017227;RO=0;SAF=53;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.95161e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.09234e-05;OID=.;OPOS=130860866;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:103:103:0:0:103:103:50:53:0:0:50:53:0:0 chr9 130864676 . T C 388.57 PASS AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0157463;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.8514;QD=35.3245;RBI=0.0386861;REFB=0.0261792;REVB=0.0353365;RO=1;SAF=20;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199809;STB=0.510633;TYPE=snp;VARB=0.000612436;OID=.;OPOS=130864676;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:44:44:1:1:43:43:23:20:0:1:23:20:0:1 chr9 130869499 . A T 760.25 PASS AO=78;DP=79;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0138023;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.1428;QD=38.0127;RBI=0.0280631;REFB=0;REVB=0.0244343;RO=0;SAF=40;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.42134e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000256189;OID=.;OPOS=130869499;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:79:80:0:0:78:80:38:40:0:0:38:42:0:0 chr9 130883511 . C T 811.05 PASS AO=88;DP=91;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0465089;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.214;QD=36.0469;RBI=0.0469982;REFB=-0.114983;REVB=0.00676385;RO=2;SAF=38;SAR=50;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0242847;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00142632;OID=.;OPOS=130883511;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:91:90:2:0:88:90:50:38:2:0:50:40:0:0 chr9 130886050 . C G 120.94 PASS AO=20;DP=31;FAO=20;FDP=31;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=10;FWDB=0.101596;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.0594;QD=15.6048;RBI=0.108734;REFB=0.00722949;REVB=0.0387473;RO=11;SAF=2;SAR=18;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0164112;STB=0.509082;TYPE=snp;VARB=0.000826607;OID=.;OPOS=130886050;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:31:31:11:11:20:20:18:2:1:10:18:2:1:10 chr9 130891060 . G A 89.63 PASS AO=17;DP=31;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=0.0179526;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.373;QD=11.5655;RBI=0.0203138;REFB=0.00440497;REVB=0.00950563;RO=14;SAF=7;SAR=10;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169878;STB=0.595037;TYPE=snp;VARB=-0.00336639;OID=.;OPOS=130891060;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:31:31:14:14:17:17:10:7:3:11:10:7:3:11 chr9 130913780 . TG T 34.46 PASS AO=19;DP=47;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.320108;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=9.86965;QD=2.99659;RBI=0.341003;REFB=-0.0829447;REVB=-0.117531;RO=24;SAF=1;SAR=18;SRF=12;SRR=12;SSEN=0.381579;SSEP=0;SSSB=-0.650016;STB=0.621831;TYPE=del;VARB=0.123161;OID=.;OPOS=130913781;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:19:46:22:46:24:5:17:10:14:34:24:1:18:12:12 chr9 130913917 . GA G 29.79 PASS AO=7;DP=34;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=17;FWDB=0.0660353;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=14.4972;QD=3.30958;RBI=0.158097;REFB=-0.06152;REVB=0.143645;RO=23;SAF=3;SAR=4;SRF=4;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.341664;STB=0.695425;TYPE=del;VARB=0.112489;OID=.;OPOS=130913918;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:7:34:15:36:21:8:7:4:17:29:23:3:4:4:19 chr9 130929405 . GC G 553.19 PASS AO=71;DP=102;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.131519;FXX=0.0396;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.6135;QD=22.8119;RBI=0.244509;REFB=-0.0155723;REVB=0.206124;RO=14;SAF=29;SAR=42;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0.365741;SSSB=-0.0064259;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0122069;OID=.;OPOS=130929406;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:71:100:97:97:0:40:57:0:0:46:14:29:42:6:8 chr9 130984755 . C T 137 PASS AO=32;DP=65;FAO=32;FDP=65;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=27;FSRR=6;FWDB=0.0285808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.14;QD=8.43043;RBI=0.0321964;REFB=-0.042626;REVB=0.0148237;RO=32;SAF=10;SAR=22;SRF=27;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.453368;STB=0.743916;TYPE=snp;VARB=0.0129676;OID=.;OPOS=130984755;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:32:33:32:32:22:10:27:5:22:10:27:6 chr9 131085373 . G C 173.76 PASS AO=19;DP=20;FAO=19;FDP=20;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00811932;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=154.409;QD=34.7514;RBI=0.0390401;REFB=0.121431;REVB=-0.0381864;RO=1;SAF=3;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0279067;STB=0.515136;TYPE=snp;VARB=-0.00240755;OID=.;OPOS=131085373;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:1:1:19:19:16:3:0:1:16:3:0:1 chr9 131115368 . A G 78.32 PASS AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=1.84935e-06;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=158.656;QD=7.28599;RBI=0.00922754;REFB=-0.0170767;REVB=-0.00922754;RO=24;SAF=11;SAR=8;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197124;STB=0.612474;TYPE=snp;VARB=0.0226013;OID=.;OPOS=131115368;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:43:43:24:24:19:19:8:11:9:15:8:11:9:15 chr9 131235321 . A G 211.09 PASS AO=11;DP=24;FAO=23;FDP=23;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=1;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0797952;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.964;QD=36.7117;RBI=0.0983258;REFB=0;REVB=0.0574517;RO=0;SAF=1;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000299641;OID=.;OPOS=131235321;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:13:23:0:0:11:23:10:1:0:0:22:1:0:0 chr9 131262911 . G GT 697.01 PASS AO=100;DP=159;FAO=144;FDP=145;FR=.;FRO=1;FSAF=89;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.128175;FXX=0.0136045;HRUN=6;LEN=1;MLLD=11.4007;QD=19.2279;RBI=0.268595;REFB=0.0272862;REVB=-0.236039;RO=35;SAF=64;SAR=36;SRF=26;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0550702;STB=0.504504;TYPE=ins;VARB=0.00729412;OID=.;OPOS=131262912;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:100:159:144:145:1:89:55:0:1:40:35:64:36:26:9 chr9 131346218 . A C 2332.71 PASS AO=224;DP=225;FAO=245;FDP=245;FR=.;FRO=0;FSAF=135;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0303825;FXX=0.00406488;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.428;QD=38.0851;RBI=0.0453977;REFB=0;REVB=0.0337321;RO=0;SAF=135;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5272e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00158298;OID=.;OPOS=131346218;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:225:245:0:0:224:245:89:135:0:0:110:135:0:0 chr9 131360750 . C T 1447.48 PASS AO=149;DP=149;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00576716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.745;QD=38.5996;RBI=0.0519748;REFB=0;REVB=0.0516539;RO=0;SAF=62;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.171e-05;OID=.;OPOS=131360750;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:149:150:0:0:149:150:87:62:0:0:88:62:0:0 chr9 131375701 . A G 1170.57 PASS AO=123;DP=123;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0259372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.63;QD=38.0674;RBI=0.0262998;REFB=0;REVB=-0.00435225;RO=0;SAF=64;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.5601e-05;OID=.;OPOS=131375701;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:123:123:0:0:123:123:59:64:0:0:59:64:0:0 chr9 131379967 . C T 747.41 PASS AO=82;DP=84;FAO=82;FDP=84;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.052198;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.075;QD=35.5907;RBI=0.0529216;REFB=-0.156329;REVB=0.00872113;RO=2;SAF=33;SAR=49;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0189361;STB=0.509998;TYPE=snp;VARB=0.000520509;OID=.;OPOS=131379967;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:84:84:2:2:82:82:49:33:0:2:49:33:0:2 chr9 131397479 . G A 885.37 PASS AO=95;DP=96;FAO=96;FDP=98;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=67;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0333777;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.755;QD=36.1374;RBI=0.0335181;REFB=-0.119339;REVB=-0.0030644;RO=1;SAF=29;SAR=66;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00713151;STB=0.50477;TYPE=snp;VARB=0.000811532;OID=.;OPOS=131397479;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:96:98:1:2:95:96:66:29:0:1:67:29:1:1 chr9 131398636 . C T 444.71 PASS AO=43;DP=43;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.808;QD=37.8479;RBI=0.043022;REFB=0;REVB=0.0307323;RO=0;SAF=24;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000278653;OID=.;OPOS=131398636;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:43:47:0:0:43:47:19:24:0:0:21:26:0:0 chr9 131403096 . A G 471.97 PASS AO=48;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00409007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.12;QD=38.5284;RBI=0.00951969;REFB=0;REVB=0.00859627;RO=0;SAF=15;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.62144e-05;OID=.;OPOS=131403096;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:48:49:0:0:48:49:33:15:0:0:33:16:0:0 chr9 131479023 . T C 1037.05 PASS AO=108;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00170675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.631;QD=38.4091;RBI=0.029916;REFB=0;REVB=0.0298673;RO=0;SAF=59;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.62579e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.55313e-05;OID=.;OPOS=131479023;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:108:108:0:0:108:108:49:59:0:0:49:59:0:0 chr9 131483551 . T A 44.59 PASS AO=16;DP=53;FAO=16;FDP=52;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.0077634;FXX=0.0188644;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.41;QD=3.42979;RBI=0.0126327;REFB=-0.00362011;REVB=0.00996565;RO=36;SAF=12;SAR=4;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.310163;STB=0.687252;TYPE=snp;VARB=0.0105515;OID=.;OPOS=131483551;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:53:52:36:36:16:16:4:12:18:18:4:12:18:18 chr9 131483749 . T A 201.65 PASS AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0113049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.175;QD=36.6634;RBI=0.0315735;REFB=0;REVB=0.0294803;RO=0;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000106482;OID=.;OPOS=131483749;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:22:22:0:0:22:22:12:10:0:0:12:10:0:0 chr9 131492850 . T C 195.44 PASS AO=17;DP=20;FAO=21;FDP=21;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.166317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.397;QD=37.2271;RBI=0.166582;REFB=0;REVB=0.00939058;RO=0;SAF=1;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00061139;OID=.;OPOS=131492850;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:20:21:0:0:17:21:16:1:0:0:16:5:0:0 chr9 131515547 . G T 121.8 PASS AO=30;DP=65;FAO=30;FDP=66;FR=.;FRO=36;FSAF=25;FSAR=5;FSRF=33;FSRR=3;FWDB=-0.0230823;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.2936;QD=7.3817;RBI=0.0252302;REFB=-0.0349706;REVB=0.0101868;RO=35;SAF=25;SAR=5;SRF=32;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15807;STB=0.591784;TYPE=snp;VARB=0.0191427;OID=.;OPOS=131515547;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:66:35:36:30:30:5:25:32:3:5:25:33:3 chr9 131565554 . T C 344.14 PASS AO=77;DP=150;FAO=77;FDP=150;FR=.;FRO=73;FSAF=57;FSAR=20;FSRF=47;FSRR=26;FWDB=-0.0531778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.7776;QD=9.17718;RBI=0.057342;REFB=-0.0152179;REVB=0.0214529;RO=72;SAF=57;SAR=20;SRF=47;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0946943;STB=0.557619;TYPE=snp;VARB=0.0159079;OID=.;OPOS=131565554;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:150:72:73:77:77:20:57:47:25:20:57:47:26 chr9 131570317 . C CCTT 27.88 PASS AO=5;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0739623;FXX=0;HRUN=2;LEN=3;MLLD=144.428;QD=7.9665;RBI=0.0930811;REFB=-0.0253299;REVB=0.0565125;RO=9;SAF=2;SAR=3;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0717807;STB=0.642419;TYPE=ins;VARB=0.0336386;OID=.;OPOS=131570318;OREF=-;OALT=CTT;OMAPALT=CCTT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:5:14:6:14:8:3:3:2:6:27:9:2:3:3:6 chr9 131585069 . A G 36.92 PASS AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.0472428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.342;QD=13.4258;RBI=0.0479454;REFB=-0.00748962;REVB=-0.00817762;RO=5;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.333798;STB=0.691819;TYPE=snp;VARB=0.0160157;OID=.;OPOS=131585069;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:11:11:5:5:6:6:4:2:0:5:4:2:0:5 chr9 131586374 . G A 103.91 PASS AO=26;DP=51;FAO=26;FDP=59;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=-0.140541;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.8598;QD=7.04483;RBI=0.144914;REFB=-0.0205877;REVB=0.0353305;RO=24;SAF=9;SAR=17;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102386;STB=0.630362;TYPE=snp;VARB=0.0169639;OID=.;OPOS=131586374;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:59:24:33:26:26:17:9:11:13:17:9:19:14 chr9 131588652 . T C 231.76 PASS AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0833871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.939;QD=37.0816;RBI=0.105507;REFB=0;REVB=-0.0646394;RO=0;SAF=8;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000331289;OID=.;OPOS=131588652;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:25:25:0:0:25:25:17:8:0:0:17:8:0:0 chr9 131588888 . G C 145.08 PASS AO=48;DP=126;FAO=47;FDP=126;FR=.;FRO=79;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=33;FSRR=46;FWDB=-0.00510263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9935;QD=4.60574;RBI=0.0335239;REFB=0.0103097;REVB=0.0331333;RO=77;SAF=24;SAR=24;SRF=33;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0775813;STB=0.558115;TYPE=snp;VARB=-0.00948024;OID=.;OPOS=131588888;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:77:79:48:47:24:24:33:44:23:24:33:46 chr9 131670919 . T C 65.36 PASS AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.000775274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.7455;QD=14.5241;RBI=0.011571;REFB=-0.0894229;REVB=0.011545;RO=7;SAF=4;SAR=7;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145526;STB=0.583179;TYPE=snp;VARB=0.0381963;OID=.;OPOS=131670919;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:18:18:7:7:11:11:7:4:4:3:7:4:4:3 chr9 131689361 . G A 1614.91 PASS AO=166;DP=167;FAO=171;FDP=171;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.037013;FXX=0.00581362;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.588;QD=37.7756;RBI=0.0469607;REFB=-0.0934757;REVB=0.0289024;RO=0;SAF=101;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000206134;OID=.;OPOS=131689361;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:167:171:0:0:166:171:65:101:0:0:70:101:0:0 chr9 131702891 . A G 1324.41 PASS AO=132;DP=133;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.117817;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.2389;QD=37.572;RBI=0.149841;REFB=0;REVB=0.0925823;RO=1;SAF=50;SAR=82;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00576157;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000785173;OID=.;OPOS=131702891;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:133:141:1:0:132:141:82:50:0:1:91:50:0:0 chr9 131767668 . A C 501.48 PASS AO=50;DP=53;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0124117;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.3903;QD=35.1918;RBI=0.0333281;REFB=-0.053539;REVB=-0.0309307;RO=3;SAF=8;SAR=42;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0931307;STB=0.505616;TYPE=snp;VARB=0.00203013;OID=.;OPOS=131767668;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:53:57:3:1:50:56:42:8:2:1:44:12:0:1 chr9 131771505 . C T 230.27 PASS AO=28;DP=31;FAO=28;FDP=31;FR=.;FRO=3;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0486335;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=196.027;QD=29.7119;RBI=0.0507987;REFB=-0.00144735;REVB=0.0146728;RO=2;SAF=10;SAR=18;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0191453;STB=0.531996;TYPE=snp;VARB=0.000135014;OID=.;OPOS=131771505;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:31:31:2:3:28:28:18:10:1:1:18:10:2:1 chr9 131823598 . AG A,CA 83.97 PASS AO=5,6;DP=19;FAO=11,6;FDP=20;FR=.;FRO=3;FSAF=4,0;FSAR=7,6;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.468475,0.0655889;FXX=0;HRUN=4,1;LEN=1,2;MLLD=14.2256,66.4357;QD=16.7946;RBI=0.471702,0.0695141;REFB=-0.0695066,0.0109117;REVB=-0.0550824,-0.0230281;RO=6;SAF=0,0;SAR=5,6;SRF=3;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.739739,-0.759974;STB=0.588086,0.5;TYPE=del,mnp;VARB=0.143922,-0.0488667;OID=.,.;OPOS=131823599,131823598;OREF=G,AG;OALT=-,CA;OMAPALT=A,CA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:20:19:20:6:3:5,6:11,6:5,6:0,0:3:3:7,6:4,0:0:3 chr9 131846957 . T C 371.04 PASS AO=38;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0470177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.642;QD=38.055;RBI=0.0749595;REFB=0;REVB=0.0583802;RO=0;SAF=13;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00054895;OID=.;OPOS=131846957;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:39:39:0:0:38:39:25:13:0:0:26:13:0:0 chr9 131860569 . TG T 269.46 PASS AO=35;DP=48;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.31647;FXX=0.0222173;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.8419;QD=24.496;RBI=0.321455;REFB=-0.0354002;REVB=0.0563912;RO=8;SAF=15;SAR=20;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0.494792;SSSB=-0.153555;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0217801;OID=.;OPOS=131860570;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:35:45:44:44:0:23:21:0:0:22:8:15:20:7:1 chr9 131860901 . G T 464.2 PASS AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0213613;FXX=0.0188644;HRUN=4;LEN=1;MLLD=201.692;QD=35.7075;RBI=0.0223598;REFB=-0.0696236;REVB=0.00660707;RO=1;SAF=30;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154392;STB=0.508194;TYPE=snp;VARB=0.000194729;OID=.;OPOS=131860901;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:52:52:1:1:51:51:21:30:1:0:21:30:1:0 chr9 131864813 . TCC TC,T 136.46 PASS AO=33,13;DP=87;FAO=64,0;FDP=75;FR=.;FRO=11;FSAF=33,0;FSAR=31,0;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.189106,-0.103313;FXX=0.0384566;HRUN=7,7;LEN=1,2;MLLD=6.42797,10.1218;QD=7.27766;RBI=0.204765,0.110288;REFB=-0.0523505,-0.0297717;REVB=0.0785322,0.0385981;RO=22;SAF=23,6;SAR=10,7;SRF=7;SRR=15;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.284974,0.156584;STB=0.508959,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.105571,-0.0555325;OID=.,.;OPOS=131864814,131864814;OREF=C,CC;OALT=-,-;OMAPALT=TC,T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:33,13:74:64,0:75:11:33,0:31,0:5:6:3:22:23,6:10,7:7:15 chr9 132375432 . C T 580 PASS AO=58;DP=58;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0762136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.436;QD=38.6665;RBI=0.080211;REFB=0;REVB=0.0250057;RO=0;SAF=24;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.31293e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000318553;OID=.;OPOS=132375432;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:58:60:0:0:58:60:34:24:0:0:34:26:0:0 chr9 132377900 . C T 222.43 PASS AO=18;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0675657;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4409;QD=37.0708;RBI=0.275266;REFB=0;REVB=0.266845;RO=0;SAF=18;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.010685;OID=.;OPOS=132377900;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:24:24:0:0:18:24:0:18:0:0:6:18:0:0 chr9 132402908 . C G 686.67 PASS AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0174733;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8641;QD=37.6256;RBI=0.018171;REFB=0;REVB=0.00498688;RO=0;SAF=56;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.45227e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000541005;OID=.;OPOS=132402908;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:73:73:0:0:73:73:17:56:0:0:17:56:0:0 chr9 132569553 . C T 433.18 PASS AO=73;DP=305;FAO=133;FDP=303;FR=.,HEALED;FRO=170;FSAF=50;FSAR=83;FSRF=68;FSRR=102;FWDB=0.00555786;FXX=0.0257226;HRUN=4;LEN=1;MLLD=135.426;QD=5.71854;RBI=0.0190501;REFB=0.000625334;REVB=-0.0182213;RO=95;SAF=48;SAR=25;SRF=61;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0172463;STB=0.514281;TYPE=snp;VARB=-0.00230552;OID=.;OPOS=132569553;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:242:303:95:170:73:133:25:48:61:34:83:50:68:102 chr9 132573536 . G T 259.57 PASS AO=71;DP=167;FAO=72;FDP=168;FR=.;FRO=96;FSAF=35;FSAR=37;FSRF=39;FSRR=57;FWDB=-0.000200254;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.9177;QD=6.18022;RBI=0.00872678;REFB=-0.00652455;REVB=-0.00872448;RO=96;SAF=34;SAR=37;SRF=39;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0751365;STB=0.545774;TYPE=snp;VARB=0.0160064;OID=.;OPOS=132573536;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:168:96:96:71:72:37:34:39:57:37:35:39:57 chr9 132618578 . T C 393.99 PASS AO=33;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.136319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.218;QD=37.5232;RBI=0.140637;REFB=0;REVB=-0.0345842;RO=0;SAF=0;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000667956;OID=.;OPOS=132618578;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:42:42:0:0:33:42:33:0:0:0:33:9:0:0 chr9 132620364 . T C 588.65 PASS AO=64;DP=67;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0882765;FXX=0.0298463;HRUN=3;LEN=1;MLLD=157.835;QD=36.2245;RBI=0.0915198;REFB=-0.0263673;REVB=0.024148;RO=0;SAF=27;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.1743e-08;STB=0.509088;TYPE=snp;VARB=-0.00013245;OID=.;OPOS=132620364;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:67:65:0:1:64:64:37:27:0:0:37:27:1:0 chr9 132623293 . C T 301.34 PASS AO=32;DP=36;FAO=35;FDP=38;FR=.;FRO=3;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0149863;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.5506;QD=31.7203;RBI=0.0652605;REFB=-0.108939;REVB=0.0635165;RO=3;SAF=14;SAR=18;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0716813;STB=0.533315;TYPE=snp;VARB=0.0069915;OID=.;OPOS=132623293;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:36:38:3:3:32:35:18:14:0:3:21:14:0:3 chr9 132623868 . T C 914.29 PASS AO=96;DP=97;FAO=97;FDP=98;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00251234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.4396;QD=37.3179;RBI=0.0568557;REFB=-0.0655143;REVB=0.0568002;RO=1;SAF=34;SAR=62;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0075884;STB=0.503936;TYPE=snp;VARB=0.000985008;OID=.;OPOS=132623868;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:97:98:1:1:96:97:62:34:0:1:63:34:0:1 chr9 132631680 . T C 179.05 PASS AO=19;DP=21;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195436;FXX=0.0951928;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.489;QD=37.6947;RBI=0.0459521;REFB=0;REVB=0.0415889;RO=0;SAF=7;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000355337;OID=.;OPOS=132631680;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:21:19:0:0:19:19:12:7:0:0:12:7:0:0 chr9 132636031 . A G 160.01 PASS AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.122349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.2161;QD=35.5572;RBI=0.127262;REFB=0;REVB=0.0350188;RO=0;SAF=12;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.007371;OID=.;OPOS=132636031;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:18:0:0:18:18:6:12:0:0:6:12:0:0 chr9 132636033 . T C 170.86 PASS AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00150576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.288;QD=37.9686;RBI=0.0221264;REFB=0;REVB=0.0220751;RO=0;SAF=12;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000362636;OID=.;OPOS=132636033;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:18:0:0:18:18:6:12:0:0:6:12:0:0 chr9 132636937 . AG A 133.36 PASS AO=41;DP=102;FAO=59;FDP=97;FR=.;FRO=38;FSAF=16;FSAR=43;FSRF=9;FSRR=29;FWDB=-0.0407482;FXX=0.029997;HRUN=4;LEN=1;MLLD=9.63958;QD=5.49917;RBI=0.128737;REFB=-0.0319995;REVB=0.122118;RO=39;SAF=13;SAR=28;SRF=8;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0.388889;SSSB=0.11992;STB=0.517282;TYPE=del;VARB=0.149668;OID=.;OPOS=132636938;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:41:98:59:97:38:16:43:9:29:39:39:13:28:8:31 chr9 132649662 . A G 787.3 PASS AO=84;DP=92;FAO=84;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00249791;FXX=0.0760787;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.278;QD=37.0492;RBI=0.0200789;REFB=0.051196;REVB=-0.0199229;RO=1;SAF=41;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114132;STB=0.506023;TYPE=snp;VARB=-0.000311133;OID=.;OPOS=132649662;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:92:85:1:1:84:84:43:41:1:0:43:41:1:0 chr9 132651362 . G GC 39.36 PASS AO=3;DP=10;FAO=6;FDP=8;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0304399;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=194.496;QD=19.6789;RBI=0.0490192;REFB=-0.0183202;REVB=-0.0384226;RO=7;SAF=2;SAR=1;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102358;STB=0.624528;TYPE=ins;VARB=0.00595164;OID=.;OPOS=132651363;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:3:10:6:8:2:5:1:1:1:10:7:2:1:4:3 chr9 132651363 . G C 29.54 PASS AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0126455;FXX=0;HRUN=12;LEN=1;MLLD=173.519;QD=11.8154;RBI=0.0413963;REFB=-0.00545693;REVB=-0.0394176;RO=5;SAF=3;SAR=2;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00232164;OID=.;OPOS=132651363;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:10:10:5:5:5:5:2:3:3:2:2:3:3:2 chr9 132662786 . C T 348.47 PASS AO=36;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.3466;QD=37.6728;RBI=0.072046;REFB=0;REVB=0.0660081;RO=0;SAF=11;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58193e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00108161;OID=.;OPOS=132662786;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:36:37:0:0:36:37:25:11:0:0:26:11:0:0 chr9 132671359 . T TG 328.83 PASS AO=61;DP=112;FAO=106;FDP=108;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=68;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0283799;FXX=0.00917347;HRUN=6;LEN=1;MLLD=7.93618;QD=12.1787;RBI=0.361351;REFB=0.0624599;REVB=0.360235;RO=40;SAF=29;SAR=32;SRF=9;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185201;STB=0.512818;TYPE=ins;VARB=0.00104246;OID=.;OPOS=132671360;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:61:112:106:108:2:38:68:2:0:12:40:29:32:9:31 chr9 132678283 . A G 25.31 PASS AO=6;DP=21;FAO=7;FDP=22;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=0.0199163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.903;QD=4.60129;RBI=0.0241188;REFB=-0.00462488;REVB=-0.0136036;RO=15;SAF=2;SAR=4;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184421;STB=0.576071;TYPE=snp;VARB=0.0425387;OID=.;OPOS=132678283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:21:22:15:15:6:7:4:2:3:12:5:2:3:12 chr9 132686186 . A G 1143.51 PASS AO=118;DP=119;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00660069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.842;QD=37.8021;RBI=0.0547921;REFB=0;REVB=0.0543931;RO=0;SAF=51;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.14594e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.51034e-05;OID=.;OPOS=132686186;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:119:121:0:0:118:121:67:51:0:0:69:52:0:0 chr9 132838016 . C T 222.25 PASS AO=62;DP=146;FAO=62;FDP=146;FR=.;FRO=84;FSAF=27;FSAR=35;FSRF=32;FSRR=52;FWDB=-0.00822263;FXX=0.00680226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.684;QD=6.08901;RBI=0.0288804;REFB=-0.0257719;REVB=-0.0276851;RO=83;SAF=27;SAR=35;SRF=31;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0651747;STB=0.53216;TYPE=snp;VARB=0.0329752;OID=.;OPOS=132838016;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:83:84:62:62:35:27:31:52:35:27:32:52 chr9 132872686 . A G 989.45 PASS AO=102;DP=102;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0597615;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.9022;QD=38.0557;RBI=0.0635833;REFB=0;REVB=0.0217117;RO=0;SAF=67;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46464e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000525654;OID=.;OPOS=132872686;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:102:104:0:0:102:104:35:67:0:0:37:67:0:0 chr9 132883161 . C CCTT 1750.15 PASS AO=194;DP=251;FAO=217;FDP=241;FR=.;FRO=24;FSAF=89;FSAR=128;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=-0.00218052;FXX=0.0242905;HRUN=3;LEN=3;MLLD=178.234;QD=29.0482;RBI=0.0273222;REFB=-0.0356173;REVB=0.027235;RO=31;SAF=73;SAR=121;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.064557;STB=0.521935;TYPE=ins;VARB=0.00321598;OID=.;OPOS=132883162;OREF=-;OALT=CTT;OMAPALT=CCTT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:194:251:217:241:24:89:128:15:9:4:31:73:121:19:12 chr9 132889813 . G A 355.65 PASS AO=68;DP=114;FAO=68;FDP=114;FR=.;FRO=46;FSAF=33;FSAR=35;FSRF=17;FSRR=29;FWDB=-0.00614881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3779;QD=12.4789;RBI=0.00767197;REFB=0.0105074;REVB=0.00458816;RO=46;SAF=33;SAR=35;SRF=17;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0862197;STB=0.546853;TYPE=snp;VARB=-0.00748749;OID=.;OPOS=132889813;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:46:46:68:68:35:33:17:29:35:33:17:29 chr9 132988709 . T G 203.04 PASS AO=35;DP=60;FAO=38;FDP=62;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=26;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.0502616;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.7172;QD=13.0992;RBI=0.0754772;REFB=-0.0404355;REVB=0.0563079;RO=24;SAF=12;SAR=23;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0261316;STB=0.525998;TYPE=snp;VARB=0.0338554;OID=.;OPOS=132988709;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:60:62:24:24:35:38:23:12:9:15:26:12:9:15 chr9 133048501 . G A 584.59 PASS AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0432016;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.456;QD=37.7158;RBI=0.0476948;REFB=0;REVB=0.0202092;RO=0;SAF=40;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000274941;OID=.;OPOS=133048501;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:63:62:0:0:62:62:22:40:0:0:22:40:0:0 chr9 133235901 . C A 131.43 PASS AO=36;DP=88;FAO=38;FDP=89;FR=.;FRO=51;FSAF=3;FSAR=35;FSRF=12;FSRR=39;FWDB=-0.0197446;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.031;QD=5.9069;RBI=0.0223058;REFB=-0.0121843;REVB=-0.0103778;RO=48;SAF=3;SAR=33;SRF=12;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.35293;STB=0.702676;TYPE=snp;VARB=0.0324602;OID=.;OPOS=133235901;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:89:48:51:36:38:33:3:12:36:35:3:12:39 chr9 133235927 . C T 118.41 PASS AO=35;DP=88;FAO=35;FDP=89;FR=.;FRO=54;FSAF=4;FSAR=31;FSRF=9;FSRR=45;FWDB=-0.0757597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145;QD=5.32193;RBI=0.0763168;REFB=-0.0215948;REVB=-0.00920403;RO=52;SAF=4;SAR=31;SRF=8;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0934376;STB=0.56997;TYPE=snp;VARB=0.0447858;OID=.;OPOS=133235927;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:89:52:54:35:35:31:4:8:44:31:4:9:45 chr9 133284310 . G A 110.24 PASS AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=0.06877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.6814;QD=9.18693;RBI=0.0697582;REFB=-0.0162552;REVB=0.0117002;RO=24;SAF=6;SAR=18;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135997;STB=0.576855;TYPE=snp;VARB=0.0161734;OID=.;OPOS=133284310;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:24:24:24:24:18:6:9:15:18:6:9:15 chr9 133294244 . G A 46.41 PASS AO=12;DP=47;FAO=16;FDP=51;FR=.;FRO=35;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=0.00522444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.788;QD=3.64033;RBI=0.0307873;REFB=-0.00975633;REVB=0.0303407;RO=33;SAF=4;SAR=8;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.502614;TYPE=snp;VARB=0.0191733;OID=.;OPOS=133294244;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:47:51:33:35:12:16:8:4:11:22:10:6:13:22 chr9 133305012 . G A 219.39 PASS AO=45;DP=82;FAO=45;FDP=82;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=32;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=0.00222954;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.416;QD=10.702;RBI=0.00285388;REFB=-0.00457123;REVB=0.0017815;RO=37;SAF=13;SAR=32;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.286571;STB=0.658213;TYPE=snp;VARB=0.00209309;OID=.;OPOS=133305012;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:37:37:45:45:32:13:23:14:32:13:23:14 chr9 133305911 . G A 47.39 PASS AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=0.0844844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.467;QD=7.89914;RBI=0.0844889;REFB=0.000209415;REVB=-0.000871953;RO=12;SAF=3;SAR=8;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129418;STB=0.52936;TYPE=snp;VARB=0.000368931;OID=.;OPOS=133305911;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:24:24:12:13:11:11:8:3:2:10:8:3:3:10 chr9 133346226 . C T 307.33 PASS AO=69;DP=138;FAO=71;FDP=137;FR=.;FRO=66;FSAF=38;FSAR=33;FSRF=36;FSRR=30;FWDB=0.00856515;FXX=0.00724585;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.638;QD=8.97304;RBI=0.0102394;REFB=0.0114034;REVB=0.00561103;RO=65;SAF=36;SAR=33;SRF=38;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0557349;STB=0.504961;TYPE=snp;VARB=-0.00851204;OID=.;OPOS=133346226;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:137:65:66:69:71:33:36:38:27:33:38:36:30 chr9 133346920 . A G 140.92 PASS AO=50;DP=143;FAO=50;FDP=143;FR=.;FRO=93;FSAF=10;FSAR=40;FSRF=30;FSRR=63;FWDB=0.00254559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.85;QD=3.94174;RBI=0.0131968;REFB=-0.0166795;REVB=-0.012949;RO=93;SAF=10;SAR=40;SRF=30;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186789;STB=0.608318;TYPE=snp;VARB=0.0302728;OID=.;OPOS=133346920;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:93:93:50:50:40:10:30:63:40:10:30:63 chr9 133553993 . C T 106.05 PASS AO=33;DP=88;FAO=33;FDP=88;FR=.;FRO=55;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=37;FSRR=18;FWDB=-0.00923436;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.596;QD=4.82062;RBI=0.0108657;REFB=-0.00685967;REVB=-0.00572622;RO=53;SAF=23;SAR=10;SRF=35;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0456424;STB=0.517674;TYPE=snp;VARB=0.0126838;OID=.;OPOS=133553993;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:53:55:33:33:10:23:35:18:10:23:37:18 chr9 133558282 . A G 2095.15 PASS AO=227;DP=233;FAO=228;FDP=228;FR=.;FRO=0;FSAF=116;FSAR=112;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146837;FXX=0.0214583;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.7;QD=36.7571;RBI=0.0157742;REFB=0.0542106;REVB=-0.00576297;RO=5;SAF=116;SAR=111;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00455859;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.1795e-06;OID=.;OPOS=133558282;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:233:228:5:0:227:228:111:116:2:3:112:116:0:0 chr9 133710804 . T C 68.22 PASS AO=6;DP=9;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00125019;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.8;QD=30.3215;RBI=0.0662188;REFB=-0.00568734;REVB=0.066207;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.555418;TYPE=snp;VARB=0.00146507;OID=.;OPOS=133710804;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:7:9:0:1:6:8:3:3:0:0:4:4:0:1 chr9 133710819 . T TC 116.32 PASS AO=12;DP=14;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000397191;FXX=0.0713776;HRUN=0;LEN=1;MLLD=38.5457;QD=35.7902;RBI=0.128417;REFB=0;REVB=0.128416;RO=1;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0531285;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.013395;OID=.;OPOS=133710820;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:12:14:13:13:0:4:9:0:0:6:1:4:8:0:1 chr9 133761001 . A G 956.26 PASS AO=102;DP=102;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00614342;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.285;QD=37.8715;RBI=0.0061448;REFB=0;REVB=0.000129956;RO=0;SAF=25;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000374525;OID=.;OPOS=133761001;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:102:101:0:0:102:101:77:25:0:0:77:24:0:0 chr9 133911598 . A G 115.05 PASS AO=23;DP=48;FAO=25;FDP=50;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=0.0304062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.099;QD=9.20379;RBI=0.0313128;REFB=-0.0159688;REVB=-0.00748;RO=25;SAF=10;SAR=13;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109815;STB=0.54234;TYPE=snp;VARB=0.0383591;OID=.;OPOS=133911598;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:50:25:25:23:25:13:10:8:17:15:10:8:17 chr9 133911706 . C T 45.73 PASS AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.00837985;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=112.129;QD=13.0663;RBI=0.0100674;REFB=-0.0489458;REVB=0.00557941;RO=6;SAF=4;SAR=4;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122361;STB=0.571253;TYPE=snp;VARB=0.0244313;OID=.;OPOS=133911706;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:14:14:6:6:8:8:4:4:4:2:4:4:4:2 chr9 133914570 . G A 168.44 PASS AO=30;DP=49;FAO=30;FDP=49;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.00904091;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.525;QD=13.7498;RBI=0.00923765;REFB=-0.0364228;REVB=0.00189634;RO=19;SAF=12;SAR=18;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12753;STB=0.570201;TYPE=snp;VARB=0.0206429;OID=.;OPOS=133914570;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:49:49:19:19:30:30:18:12:11:8:18:12:11:8 chr9 133924451 . C T 83.72 PASS AO=14;DP=22;FAO=15;FDP=25;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=0.0061955;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=212.495;QD=13.3948;RBI=0.0119339;REFB=-0.00251322;REVB=-0.0101997;RO=4;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181062;STB=0.608559;TYPE=snp;VARB=0.00255241;OID=.;OPOS=133924451;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:20:25:4:10:14:15:8:6:0:4:8:7:2:8 chr9 133927878 . A G 429.95 PASS AO=101;DP=202;FAO=100;FDP=200;FR=.;FRO=100;FSAF=85;FSAR=15;FSRF=71;FSRR=29;FWDB=-0.000682544;FXX=0.00497488;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.112;QD=8.59907;RBI=0.0138797;REFB=0.00454271;REVB=-0.0138629;RO=99;SAF=85;SAR=16;SRF=70;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192247;STB=0.615106;TYPE=snp;VARB=-0.00420736;OID=.;OPOS=133927878;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:200:99:100:101:100:16:85:70:29:15:85:71:29 chr9 133928345 . C T 16.27 PASS AO=4;DP=13;FAO=4;FDP=14;FR=.;FRO=10;FSAF=0;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=10;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=234.332;QD=4.6473;RBI=0.00751892;REFB=-0.022024;REVB=-0.00751892;RO=9;SAF=0;SAR=4;SRF=0;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0380597;OID=.;OPOS=133928345;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:13:14:9:10:4:4:4:0:0:9:4:0:0:10 chr9 133948049 . A G 1040.43 PASS AO=100;DP=100;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0275758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.823;QD=38.181;RBI=0.0392122;REFB=0;REVB=0.0278778;RO=0;SAF=41;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.3262e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.57034e-05;OID=.;OPOS=133948049;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:100:109:0:0:100:109:59:41:0:0:65:44:0:0 chr9 133951230 . C T 311.66 PASS AO=55;DP=86;FAO=55;FDP=86;FR=.;FRO=31;FSAF=45;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=9;FWDB=-0.00108821;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.308;QD=14.4957;RBI=0.0763127;REFB=-0.0241809;REVB=0.076305;RO=31;SAF=45;SAR=10;SRF=22;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111132;STB=0.560632;TYPE=snp;VARB=0.0290161;OID=.;OPOS=133951230;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:86:86:31:31:55:55:10:45:22:9:10:45:22:9 chr9 133962930 . C T 230.62 PASS AO=39;DP=61;FAO=40;FDP=62;FR=.;FRO=22;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=0.025267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.355;QD=14.8787;RBI=0.0270619;REFB=-0.0346925;REVB=-0.00969158;RO=22;SAF=15;SAR=24;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0469686;STB=0.530597;TYPE=snp;VARB=0.0308178;OID=.;OPOS=133962930;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:61:62:22:22:39:40:24:15:7:15:24:16:7:15 chr9 133986980 . T G 472.27 PASS AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151755;FXX=0.019604;HRUN=3;LEN=1;MLLD=174.56;QD=37.7812;RBI=0.0283581;REFB=0;REVB=-0.0239559;RO=0;SAF=26;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.10374e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.66282e-05;OID=.;OPOS=133986980;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:51:50:0:0:50:50:24:26:0:0:24:26:0:0 chr9 133987060 . G A 347.67 PASS AO=40;DP=42;FAO=40;FDP=42;FR=.;FRO=2;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00245721;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=195.516;QD=33.1114;RBI=0.0130751;REFB=0.000303739;REVB=0.0128422;RO=1;SAF=14;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177001;STB=0.518509;TYPE=snp;VARB=3.13031e-05;OID=.;OPOS=133987060;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:42:42:1:2:40:40:26:14:0:1:26:14:0:2 chr9 133996460 . T TG,G 616.95 PASS AO=29,52;DP=129;FAO=74,49;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=43,43;FSAR=31,6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.311803,-0.161283;FXX=0.00806387;HRUN=5,4;LEN=1,1;MLLD=7.90378,11.6786;QD=20.0634;RBI=0.921987,0.338496;REFB=0.0452644,0.0362601;REVB=0.867663,0.297602;RO=35;SAF=24,45;SAR=5,7;SRF=5;SRR=30;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.630235,0.592981;STB=0.5,0.5;TYPE=ins,snp;VARB=-0.0476964,0.0987072;OID=.,.;OPOS=133996461,133996460;OREF=-,T;OALT=G,G;OMAPALT=TG,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:129:123:35:0:29,52:74,49:5,7:24,45:5:30:31,6:43,43:0:0 chr9 133996503 . T A 238.03 PASS AO=65;DP=153;FAO=68;FDP=160;FR=.;FRO=92;FSAF=48;FSAR=20;FSRF=59;FSRR=33;FWDB=0.00719249;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.309;QD=5.95073;RBI=0.00949561;REFB=-0.0181676;REVB=0.00619958;RO=88;SAF=48;SAR=17;SRF=58;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.099472;STB=0.543112;TYPE=snp;VARB=0.0180677;OID=.;OPOS=133996503;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:160:88:92:65:68:17:48:58:30:20:48:59:33 chr9 134020092 . C T 138.59 PASS AO=38;DP=88;FAO=39;FDP=94;FR=.;FRO=55;FSAF=11;FSAR=28;FSRF=22;FSRR=33;FWDB=-0.0445445;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=87.8421;QD=5.89745;RBI=0.0653081;REFB=-0.01564;REVB=0.0477592;RO=49;SAF=11;SAR=27;SRF=16;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0440494;STB=0.579268;TYPE=snp;VARB=0.0331166;OID=.;OPOS=134020092;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:94:49:55:38:39:27:11:16:33:28:11:22:33 chr9 134021630 . A G 57.72 PASS AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=0;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=19;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.261;QD=6.99658;RBI=0.0141186;REFB=-0.0102813;REVB=-0.0141186;RO=19;SAF=0;SAR=14;SRF=0;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0260394;OID=.;OPOS=134021630;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:33:33:19:19:14:14:14:0:0:19:14:0:0:19 chr9 134133539 . G T 1399.47 PASS AO=125;DP=148;FAO=146;FDP=146;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=71;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0368449;FXX=0.0135126;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.189;QD=38.3418;RBI=0.093011;REFB=0;REVB=0.085402;RO=0;SAF=65;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000955715;OID=.;OPOS=134133539;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:148:146:0:0:125:146:60:65:0:0:75:71:0:0 chr9 134136515 . A G 1103.3 PASS AO=117;DP=120;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220061;FXX=0.0247913;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.81;QD=37.3999;RBI=0.0523057;REFB=-0.0343729;REVB=-0.0474512;RO=1;SAF=58;SAR=59;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00811835;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.28277e-05;OID=.;OPOS=134136515;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:120:118:1:0:117:118:59:58:1:0:59:59:0:0 chr9 134136677 . A G 584.22 PASS AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.508;QD=37.6915;RBI=0.0195385;REFB=0;REVB=-0.0124685;RO=0;SAF=22;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.5583e-05;OID=.;OPOS=134136677;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:62:62:0:0:62:62:40:22:0:0:40:22:0:0 chr9 134183379 . C T 423.09 PASS AO=50;DP=54;FAO=50;FDP=54;FR=.;FRO=4;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.050152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.7055;QD=31.3403;RBI=0.0943269;REFB=-0.14018;REVB=0.0798896;RO=3;SAF=26;SAR=24;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0552805;STB=0.519992;TYPE=snp;VARB=0.00788986;OID=.;OPOS=134183379;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:54:54:3:4:50:50:24:26:0:3:24:26:1:3 chr9 134183431 . CG C 47.43 PASS AO=23;DP=53;FAO=26;FDP=52;FR=.;FRO=26;FSAF=3;FSAR=23;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.0120386;FXX=0.0370302;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.4135;QD=3.64881;RBI=0.0659948;REFB=-0.0846691;REVB=-0.0648875;RO=24;SAF=4;SAR=19;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.432015;STB=0.80205;TYPE=del;VARB=0.0871973;OID=.;OPOS=134183432;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:23:50:26:52:26:3:23:15:11:47:24:4:19:14:10 chr9 134183503 . T C 595.44 PASS AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00922822;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.351;QD=37.8054;RBI=0.0369032;REFB=0;REVB=0.0357307;RO=0;SAF=31;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.52935e-05;OID=.;OPOS=134183503;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:64:63:0:0:63:63:32:31:0:0:32:31:0:0 chr9 134346315 . T C 798.04 PASS AO=83;DP=84;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0328902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.1258;QD=37.1184;RBI=0.0351708;REFB=0;REVB=-0.0124587;RO=0;SAF=45;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.04629e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000130951;OID=.;OPOS=134346315;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:84:86:0:0:83:86:38:45:0:0:40:46:0:0 chr9 134350323 . C G 210.67 PASS AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00373596;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=228.148;QD=36.639;RBI=0.04913;REFB=0;REVB=0.0489878;RO=0;SAF=18;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000225694;OID=.;OPOS=134350323;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:0:0:23:23:5:18:0:0:5:18:0:0 chr9 134350458 . C T 769.11 PASS AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0241018;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=130.332;QD=37.9808;RBI=0.0641771;REFB=0;REVB=0.0594794;RO=0;SAF=39;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00016332;OID=.;OPOS=134350458;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:81:81:0:0:81:81:42:39:0:0:42:39:0:0 chr9 134350647 . T C 691.54 PASS AO=71;DP=71;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170548;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.511;QD=37.8923;RBI=0.018488;REFB=0;REVB=-0.00713703;RO=0;SAF=27;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.94622e-05;OID=.;OPOS=134350647;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:71:73:0:0:71:73:44:27:0:0:46:27:0:0 chr9 134351065 . G T 302.9 PASS AO=36;DP=38;FAO=36;FDP=38;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0579831;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.1644;QD=31.8842;RBI=0.0859427;REFB=0.00941934;REVB=0.0634358;RO=2;SAF=24;SAR=12;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0183196;STB=0.541643;TYPE=snp;VARB=0.0053064;OID=.;OPOS=134351065;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:38:38:2:2:36:36:12:24:1:1:11:25:0:2 chr9 134353189 . TC T 28.7 PASS AO=14;DP=44;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=23;FSRR=3;FWDB=0.0686871;FXX=0.0232504;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.4559;QD=2.73369;RBI=0.0747908;REFB=-0.0742998;REVB=-0.029593;RO=25;SAF=10;SAR=4;SRF=22;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.255018;STB=0.658755;TYPE=del;VARB=0.137976;OID=.;OPOS=134353190;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:14:42:16:42:26:11:5:23:3:28:25:10:4:22:3 chr9 134373770 . G C 388.17 PASS AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.012753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.0196;QD=38.8165;RBI=0.0594455;REFB=0;REVB=0.0580615;RO=0;SAF=33;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.48559e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00080743;OID=.;OPOS=134373770;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:40:40:0:0:40:40:7:33:0:0:7:33:0:0 chr9 134385436 . A G 819.82 PASS AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0253231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.246;QD=38.1312;RBI=0.0365953;REFB=0;REVB=-0.0264188;RO=0;SAF=45;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000182434;OID=.;OPOS=134385436;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:86:86:0:0:86:86:41:45:0:0:41:45:0:0 chr9 134386744 . T C 851.07 PASS AO=84;DP=84;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000670678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.308;QD=38.2501;RBI=0.0292635;REFB=0;REVB=0.0292559;RO=0;SAF=13;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000643974;OID=.;OPOS=134386744;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:84:89:0:0:84:89:71:13:0:0:76:13:0:0 chr9 134387488 . T C 593.29 PASS AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.018784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.753;QD=37.6694;RBI=0.0218138;REFB=0;REVB=0.0110906;RO=0;SAF=30;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.76691e-05;OID=.;OPOS=134387488;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:63:63:0:0:63:63:33:30:0:0:33:30:0:0 chr9 134401335 . C T 368.11 PASS AO=38;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0286089;FXX=0.113611;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.9877;QD=37.7549;RBI=0.0629926;REFB=0;REVB=0.0561213;RO=0;SAF=22;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00383558;OID=.;OPOS=134401335;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:38:39:0:0:38:39:16:22:0:0:16:23:0:0 chr9 134406071 . C G 429.04 PASS AO=43;DP=43;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0200216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.716;QD=37.3078;RBI=0.0208794;REFB=0;REVB=0.0059232;RO=0;SAF=14;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.13233e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000749626;OID=.;OPOS=134406071;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:43:46:0:0:43:46:29:14:0:0:31:15:0:0 chr9 134453976 . G A 94.25 PASS AO=21;DP=46;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.00178898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.211;QD=8.02094;RBI=0.0731403;REFB=-0.0154444;REVB=0.0731185;RO=25;SAF=15;SAR=6;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203495;STB=0.623258;TYPE=snp;VARB=0.0122006;OID=.;OPOS=134453976;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:46:47:25:25:21:22:6:15:13:12:6:16:13:12 chr9 135073877 . C T 753.17 PASS AO=75;DP=75;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0348662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.862;QD=37.1934;RBI=0.0370452;REFB=0;REVB=0.012518;RO=0;SAF=39;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6999e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000119243;OID=.;OPOS=135073877;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:75:81:0:0:75:81:36:39:0:0:41:40:0:0 chr9 135102254 . C T 772.71 PASS AO=79;DP=79;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0324347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.606;QD=38.6356;RBI=0.0358284;REFB=0;REVB=0.0152206;RO=0;SAF=25;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000110039;OID=.;OPOS=135102254;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:79:80:0:0:79:80:54:25:0:0:55:25:0:0 chr9 135105964 . A G 301.7 PASS AO=32;DP=35;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0585928;FXX=0.0856898;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.4595;QD=37.7122;RBI=0.0594492;REFB=0;REVB=0.010054;RO=0;SAF=4;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00189607;OID=.;OPOS=135105964;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:35:32:0:0:32:32:28:4:0:0:28:4:0:0 chr9 135106870 . G C 12.07 PASS AO=5;DP=23;FAO=5;FDP=24;FR=.;FRO=19;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=19;FWDB=0;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=114.278;QD=2.01163;RBI=0.000910754;REFB=-0.00555425;REVB=-0.000910754;RO=18;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.125121;OID=.;OPOS=135106870;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:23:24:18:19:5:5:5:0:0:18:5:0:0:19 chr9 135139901 . T C 91.33 PASS AO=16;DP=26;FAO=16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.028379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.4639;QD=14.0515;RBI=0.0283992;REFB=-0.0425889;REVB=-0.00107148;RO=10;SAF=7;SAR=9;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0973223;STB=0.554389;TYPE=snp;VARB=0.0276775;OID=.;OPOS=135139901;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:26:26:10:10:16:16:9:7:3:7:9:7:3:7 chr9 135172412 . A G 229.55 PASS AO=78;DP=218;FAO=80;FDP=219;FR=.;FRO=139;FSAF=40;FSAR=40;FSRF=65;FSRR=74;FWDB=0.0323738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.201;QD=4.19267;RBI=0.035365;REFB=-0.0125806;REVB=-0.0142344;RO=139;SAF=39;SAR=39;SRF=65;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.036486;STB=0.520543;TYPE=snp;VARB=0.0211137;OID=.;OPOS=135172412;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:218:219:139:139:78:80:39:39:65:74:40:40:65:74 chr9 135173685 . T C 370.51 PASS AO=89;DP=180;FAO=89;FDP=183;FR=.;FRO=94;FSAF=20;FSAR=69;FSRF=34;FSRR=60;FWDB=-0.0213675;FXX=0.00543449;HRUN=4;LEN=1;MLLD=74.5361;QD=8.09866;RBI=0.0575968;REFB=-0.0394217;REVB=-0.0534866;RO=91;SAF=20;SAR=69;SRF=34;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174116;STB=0.590844;TYPE=snp;VARB=0.0318791;OID=.;OPOS=135173685;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:183:91:94:89:89:69:20:34:57:69:20:34:60 chr9 135176030 . G A 496.51 PASS AO=141;DP=329;FAO=141;FDP=329;FR=.;FRO=188;FSAF=61;FSAR=80;FSRF=74;FSRR=114;FWDB=0.00357133;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.501;QD=6.03662;RBI=0.00778549;REFB=0.000234534;REVB=0.00691806;RO=186;SAF=61;SAR=80;SRF=74;SRR=112;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0364819;STB=0.522839;TYPE=snp;VARB=-0.000521101;OID=.;OPOS=135176030;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:329:329:186:188:141:141:80:61:74:112:80:61:74:114 chr9 135202829 . T C 266.78 PASS AO=57;DP=110;FAO=58;FDP=111;FR=.;FRO=53;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=14;FSRR=39;FWDB=0.0100552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.122;QD=9.61382;RBI=0.0137835;REFB=-0.0343398;REVB=-0.00942755;RO=53;SAF=25;SAR=32;SRF=14;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158943;STB=0.590501;TYPE=snp;VARB=0.0291733;OID=.;OPOS=135202829;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:111:53:53:57:58:32:25:14:39:32:26:14:39 chr9 135203231 . C T 386.59 PASS AO=109;DP=253;FAO=109;FDP=253;FR=.;FRO=144;FSAF=58;FSAR=51;FSRF=66;FSRR=78;FWDB=0.00779709;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.8139;QD=6.11203;RBI=0.00831493;REFB=-0.00651335;REVB=0.0028885;RO=129;SAF=58;SAR=51;SRF=60;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0655858;STB=0.541931;TYPE=snp;VARB=0.0187376;OID=.;OPOS=135203231;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:253:253:129:144:109:109:51:58:60:69:51:58:66:78 chr9 135203409 . A C 423.49 PASS AO=106;DP=225;FAO=106;FDP=225;FR=.;FRO=119;FSAF=61;FSAR=45;FSRF=44;FSRR=75;FWDB=-0.00567428;FXX=0.00442458;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.238;QD=7.52869;RBI=0.011221;REFB=-0.0094241;REVB=0.00968051;RO=116;SAF=61;SAR=45;SRF=44;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184551;STB=0.607701;TYPE=snp;VARB=0.0125256;OID=.;OPOS=135203409;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:225:225:116:119:106:106:45:61:44:72:45:61:44:75 chr9 135203838 . G A 524.5 PASS AO=125;DP=256;FAO=126;FDP=255;FR=.;FRO=129;FSAF=53;FSAR=73;FSRF=63;FSRR=66;FWDB=-0.0140179;FXX=0.0077818;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.211;QD=8.22744;RBI=0.0145359;REFB=-0.0210512;REVB=-0.00384581;RO=126;SAF=53;SAR=72;SRF=61;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0557356;STB=0.534759;TYPE=snp;VARB=0.0221677;OID=.;OPOS=135203838;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:256:255:126:129:125:126:72:53:61:65:73:53:63:66 chr9 135206460 . A G 164.83 PASS AO=40;DP=85;FAO=40;FDP=85;FR=.;FRO=45;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=0.0177533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.809;QD=7.75648;RBI=0.0181314;REFB=0.00223549;REVB=0.00368306;RO=45;SAF=21;SAR=19;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0762618;STB=0.542551;TYPE=snp;VARB=-0.00273848;OID=.;OPOS=135206460;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:45:45:40:40:19:21:20:25:19:21:20:25 chr9 135263573 . G T 1057.06 PASS AO=111;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0213363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6286;QD=38.0922;RBI=0.03075;REFB=0;REVB=0.0221433;RO=0;SAF=47;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000201897;OID=.;OPOS=135263573;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:111:111:0:0:111:111:64:47:0:0:64:47:0:0 chr9 135273607 . C G 429.27 PASS AO=112;DP=247;FAO=113;FDP=248;FR=.;FRO=135;FSAF=57;FSAR=56;FSRF=70;FSRR=65;FWDB=0.01039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.072;QD=6.92367;RBI=0.0109541;REFB=-0.00336157;REVB=-0.00346987;RO=134;SAF=56;SAR=56;SRF=70;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0220308;STB=0.507672;TYPE=snp;VARB=0.00388828;OID=.;OPOS=135273607;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:247:248:134:135:112:113:56:56:70:64:56:57:70:65 chr9 135277341 . C A 49.9 PASS AO=11;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.144802;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.9262;QD=7.12801;RBI=0.146925;REFB=-0.0137464;REVB=-0.0248896;RO=17;SAF=3;SAR=8;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0973866;STB=0.513491;TYPE=snp;VARB=0.0514402;OID=.;OPOS=135277341;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:28:28:17:16:11:12:8:3:6:11:8:4:5:11 chr9 135277540 . C T 14.4 PASS AO=8;DP=48;FAO=8;FDP=47;FR=.,HEALED;FRO=39;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=-0.00732881;FXX=0.040808;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.752;QD=1.22512;RBI=0.00807721;REFB=-0.0030421;REVB=0.00339555;RO=25;SAF=4;SAR=4;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0235792;STB=0.574286;TYPE=snp;VARB=0.00981902;OID=.;OPOS=135277540;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:48:47:25:39:8:8:4:4:13:12:4:4:23:16 chr9 135296997 . TGAGAATCCTGGGTTCTCATGCTCTGGTTTCTCTTCAAATCGTATAAATCTTTCGCCTTTTACTAAAGATTTCTGTG T 50 PASS AO=162;DP=175;LEN=76;RO=13;SAF=75;SAR=77;SRF=7;SRR=16;TYPE=del;FR=.;OID=.;OPOS=135296998;OREF=GAGAATCCTGGGTTCTCATGCTCTGGTTTCTCTTCAAATCGTATAAATCTTTCGCCTTTTACTAAAGATTTCTGTG;OALT=-;OMAPALT=T GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR 1/1:99:175:13:162:77:75:7:16 chr9 135297013 . T TTCTC 242.33 PASS AO=25;DP=128;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0.456423;HRUN=1;LEN=4;MLLD=216.804;QD=38.7721;RBI=0.00175782;REFB=0;REVB=0.00175782;RO=98;SAF=0;SAR=25;SRF=82;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.85411;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=3.07285e-06;OID=.;OPOS=135297014;OREF=-;OALT=TCTC;OMAPALT=TTCTC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:25:128:25:25:0:0:25:0:0:11:98:0:25:82:16 chr9 135297016 . T G 119.69 PASS AO=25;DP=45;FAO=24;FDP=44;FR=.;FRO=20;FSAF=0;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=20;FWDB=0;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.645;QD=10.8806;RBI=0.000374646;REFB=0.0024165;REVB=0.000374646;RO=19;SAF=0;SAR=25;SRF=0;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000918984;OID=.;OPOS=135297016;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:45:44:19:20:25:24:25:0:0:19:24:0:0:20 chr9 135297019 . TC T,AG 221.69 PASS AO=21,14;DP=43;FAO=23,0;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0;FSAR=23,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0,0;FXX=0.206825;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=174.594,73.0268;QD=38.555;RBI=0.0346773,0.0271118;REFB=0,0;REVB=-0.0346773,-0.0271118;RO=1;SAF=0,0;SAR=21,14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,mnp;VARB=-0.000202575,0;OID=.,.;OPOS=135297020,135297019;OREF=C,TC;OALT=-,AG;OMAPALT=T,AG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:43:23:1:0:21,14:23,0:21,14:0,0:0:1:23,0:0,0:0:0 chr9 135297021 . T A 18.29 PASS AO=7;DP=29;FAO=7;FDP=29;FR=.;FRO=22;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=22;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.4603;QD=2.52299;RBI=0.0117043;REFB=-0.0123157;REVB=-0.0117043;RO=22;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0538024;OID=.;OPOS=135297021;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:29:29:22:22:7:7:7:0:0:22:7:0:0:22 chr9 135297022 . G C 169.48 PASS AO=23;DP=29;FAO=23;FDP=29;FR=.;FRO=6;FSAF=0;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=295.817;QD=23.3765;RBI=0.00225189;REFB=0.0171045;REVB=-0.00225189;RO=6;SAF=0;SAR=23;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00346509;OID=.;OPOS=135297022;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:29:29:6:6:23:23:23:0:0:6:23:0:0:6 chr9 135297024 . T TGACA,C 132.61 PASS AO=9,5;DP=29;FAO=9,5;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0;FSAR=9,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0,0;FXX=0.461361;HRUN=0,3;LEN=4,1;MLLD=158.795,51.4196;QD=37.8887;RBI=0.000954863,0.01838;REFB=0,0;REVB=-0.000954863,0.01838;RO=14;SAF=0,0;SAR=9,5;SRF=0;SRR=14;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=ins,snp;VARB=0.00491458,0.042843;OID=.,.;OPOS=135297025,135297024;OREF=-,T;OALT=GACA,C;OMAPALT=TGACA,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:23:29:14:14:0:9,5:9,5:9,5:0,0:0:14:9,5:0,0:0:0 chr9 135297025 . T G 46.46 PASS AO=11;DP=26;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=0;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=15;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=113.778;QD=7.14758;RBI=0.0271415;REFB=-0.00131033;REVB=-0.0271415;RO=15;SAF=0;SAR=11;SRF=0;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00486475;OID=.;OPOS=135297025;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:26:26:15:15:11:11:11:0:0:15:11:0:0:15 chr9 135297026 . T A 46.46 PASS AO=11;DP=26;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=0;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=15;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=83.7208;QD=7.14791;RBI=0.00916006;REFB=0.00133772;REVB=-0.00916006;RO=15;SAF=0;SAR=11;SRF=0;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00322937;OID=.;OPOS=135297026;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:26:26:15:15:11:11:11:0:0:15:11:0:0:15 chr9 135297029 . C CA,A 112.79 PASS AO=3,9;DP=17;FAO=5,9;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=0,0;FSAR=5,9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0,0;FXX=0.117578;HRUN=0,1;LEN=1,1;MLLD=225.499,213.525;QD=30.0784;RBI=0.0010134,0.00574241;REFB=-0.0347971,-0.0287421;REVB=-0.0010134,-0.00574241;RO=3;SAF=0,0;SAR=3,9;SRF=0;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=ins,snp;VARB=-0.0284193,0.0132574;OID=.,.;OPOS=135297030,135297029;OREF=-,C;OALT=A,A;OMAPALT=CA,A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:19:17:15:3:1:3,9:5,9:3,9:0,0:0:3:5,9:0,0:0:1 chr9 135297034 . A G,T 54.62 PASS AO=5,2;DP=8;FAO=5,2;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=0,0;FSAR=5,2;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0,0;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=83.542,221.638;QD=27.3086;RBI=0.0208524,0.018893;REFB=-0.0575721,-0.0457306;REVB=0.0208524,0.018893;RO=1;SAF=0,0;SAR=5,2;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=snp,snp;VARB=0.014181,-0.000527047;OID=.,.;OPOS=135297034,135297034;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:11:8:8:1:1:5,2:5,2:5,2:0,0:0:1:5,2:0,0:0:1 chr9 135374898 . T C 277.85 PASS AO=77;DP=178;FAO=77;FDP=179;FR=.;FRO=102;FSAF=20;FSAR=57;FSRF=36;FSRR=66;FWDB=-0.0579233;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.7474;QD=6.20897;RBI=0.0585517;REFB=-0.0125504;REVB=-0.00855531;RO=100;SAF=20;SAR=57;SRF=35;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111253;STB=0.564738;TYPE=snp;VARB=0.0203261;OID=.;OPOS=135374898;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:179:100:102:77:77:57:20:35:65:57:20:36:66 chr9 135448320 . C A 151.9 PASS AO=50;DP=129;FAO=50;FDP=138;FR=.;FRO=88;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=43;FSRR=45;FWDB=-0.000257373;FXX=0.0612203;HRUN=3;LEN=1;MLLD=191.625;QD=4.40296;RBI=0.00416917;REFB=-0.00794971;REVB=-0.00416122;RO=72;SAF=21;SAR=29;SRF=40;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141945;STB=0.544264;TYPE=snp;VARB=0.00879947;OID=.;OPOS=135448320;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:138:72:88:50:50:29:21:40:32:29:21:43:45 chr9 135470414 . T C 1425.63 PASS AO=147;DP=148;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0167106;FXX=0.00671096;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.771;QD=38.5305;RBI=0.0252051;REFB=0;REVB=0.0188694;RO=0;SAF=84;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.98315e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.17527e-05;OID=.;OPOS=135470414;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:148:148:0:0:147:148:63:84:0:0:64:84:0:0 chr9 135527871 . A G 30.9 PASS AO=29;DP=146;FAO=29;FDP=145;FR=.;FRO=116;FSAF=28;FSAR=1;FSRF=62;FSRR=54;FWDB=0.025372;FXX=0.00684885;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.7538;QD=0.852467;RBI=0.0340634;REFB=-0.00607968;REVB=-0.0227283;RO=113;SAF=28;SAR=1;SRF=59;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.686351;STB=0.944413;TYPE=snp;VARB=0.104388;OID=.;OPOS=135527871;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:146:145:113:116:29:29:1:28:59:54:1:28:62:54 chr9 135554490 . AG A 636.79 PASS AO=78;DP=131;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.238136;FXX=0.0243883;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.4201;QD=21.2264;RBI=0.253497;REFB=-0.00161892;REVB=0.0869021;RO=23;SAF=46;SAR=32;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0.335938;SSSB=0.085852;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0149701;OID=.;OPOS=135554491;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:78:117:120:120:0:59:61:0:0:52:23:46:32:9:14 chr9 135554566 . G A 1896.44 PASS AO=201;DP=205;FAO=203;FDP=203;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00601169;FXX=0.0145624;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0363;QD=37.3682;RBI=0.00668226;REFB=0.0227133;REVB=-0.00291756;RO=2;SAF=85;SAR=116;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00148205;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00112399;OID=.;OPOS=135554566;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:205:203:2:0:201:203:116:85:1:1:118:85:0:0 chr9 135771332 . GA G 104.63 PASS AO=15;DP=60;FAO=37;FDP=74;FR=.;FRO=37;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=12;FWDB=-0.0569676;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=19.7473;QD=5.65588;RBI=0.129494;REFB=-0.0569979;REVB=-0.116291;RO=35;SAF=15;SAR=0;SRF=25;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.753301;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0520655;OID=.;OPOS=135771333;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:15:59:37:74:37:25:12:25:12:95:35:15:0:25:10 chr9 135944524 . C T 14.45 PASS AO=3;DP=10;FAO=3;FDP=10;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=-0.0281267;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=36.2685;QD=5.77891;RBI=0.0281267;REFB=-0.0124939;REVB=0;RO=6;SAF=3;SAR=0;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0145977;OID=.;OPOS=135944524;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:10:10:6:7:3:3:0:3:6:0:0:3:7:0 chr9 135957117 . G T 180.07 PASS AO=49;DP=112;FAO=48;FDP=111;FR=.;FRO=63;FSAF=14;FSAR=34;FSRF=18;FSRR=45;FWDB=-0.0312592;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.027;QD=6.48898;RBI=0.0338446;REFB=-0.00845599;REVB=-0.0129738;RO=62;SAF=14;SAR=35;SRF=18;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00561603;STB=0.5041;TYPE=snp;VARB=0.00946156;OID=.;OPOS=135957117;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:111:62:63:49:48:35:14:18:44:34:14:18:45 chr9 135957227 . G C 98.7 PASS AO=30;DP=81;FAO=31;FDP=82;FR=.;FRO=51;FSAF=2;FSAR=29;FSRF=3;FSRR=48;FWDB=-0.050413;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.1571;QD=4.81478;RBI=0.058016;REFB=0.00590077;REVB=0.0287121;RO=51;SAF=2;SAR=28;SRF=3;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0359141;STB=0.515041;TYPE=snp;VARB=-0.0137024;OID=.;OPOS=135957227;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:81:82:51:51:30:31:28:2:3:48:29:2:3:48 chr9 135961787 . A G 247.57 PASS AO=58;DP=120;FAO=58;FDP=119;FR=.;FRO=61;FSAF=19;FSAR=39;FSRF=11;FSRR=50;FWDB=-0.0571614;FXX=0.0165276;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.8547;QD=8.32172;RBI=0.0572604;REFB=6.91979e-05;REVB=-0.00336582;RO=60;SAF=19;SAR=39;SRF=11;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160979;STB=0.591024;TYPE=snp;VARB=-0.000351732;OID=.;OPOS=135961787;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:119:60:61:58:58:39:19:11:49:39:19:11:50 chr9 135961796 . C T 230 PASS AO=51;DP=101;FAO=51;FDP=100;FR=.;FRO=49;FSAF=19;FSAR=32;FSRF=10;FSRR=39;FWDB=0.104429;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.7585;QD=9.19984;RBI=0.110407;REFB=-0.00943232;REVB=0.0358362;RO=49;SAF=19;SAR=32;SRF=10;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168561;STB=0.592413;TYPE=snp;VARB=0.0189222;OID=.;OPOS=135961796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:100:49:49:51:51:32:19:10:39:32:19:10:39 chr9 135961809 . T C 246.94 PASS AO=50;DP=89;FAO=50;FDP=89;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=32;FSRF=5;FSRR=34;FWDB=-0.024204;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.885;QD=11.0985;RBI=0.0242808;REFB=-0.000974027;REVB=-0.00192993;RO=39;SAF=19;SAR=31;SRF=5;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228456;STB=0.617422;TYPE=snp;VARB=0.00154001;OID=.;OPOS=135961809;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:39:39:50:50:31:19:5:34:32:18:5:34 chr9 135968511 . C CTG 170.28 PASS AO=53;DP=154;FAO=54;FDP=142;FR=.;FRO=88;FSAF=20;FSAR=34;FSRF=38;FSRR=50;FWDB=-0.00586546;FXX=0.0718907;HRUN=2;LEN=2;MLLD=243.639;QD=4.79669;RBI=0.012986;REFB=-0.0061311;REVB=-0.0115859;RO=88;SAF=19;SAR=34;SRF=39;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0977154;STB=0.539963;TYPE=ins;VARB=0.00982941;OID=.;OPOS=135968512;OREF=-;OALT=TG;OMAPALT=CTG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:53:154:54:142:88:20:34:38:50:99:88:19:34:39:49 chr9 135973678 . C T 30.06 PASS AO=8;DP=23;FAO=8;FDP=23;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0831504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.0517;QD=5.22805;RBI=0.083699;REFB=-0.0529905;REVB=0.00956774;RO=15;SAF=3;SAR=5;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100478;STB=0.561641;TYPE=snp;VARB=0.15979;OID=.;OPOS=135973678;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:23:23:15:15:8:8:5:3:7:8:5:3:7:8 chr9 135974079 . G C 185.88 PASS AO=43;DP=87;FAO=44;FDP=92;FR=.;FRO=48;FSAF=29;FSAR=15;FSRF=30;FSRR=18;FWDB=-0.0145612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.1816;QD=8.08156;RBI=0.0368089;REFB=-0.0205351;REVB=0.0338063;RO=43;SAF=29;SAR=14;SRF=30;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0241058;STB=0.519535;TYPE=snp;VARB=0.0261687;OID=.;OPOS=135974079;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:92:43:48:43:44:14:29:30:13:15:29:30:18 chr9 135976698 . G A 101 PASS AO=13;DP=37;FAO=17;FDP=36;FR=.,HEALED;FRO=14;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=1;FWDB=-0.00472162;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=223.306;QD=11.2222;RBI=0.0148169;REFB=-0.0171809;REVB=0.0140444;RO=11;SAF=4;SAR=9;SRF=10;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.4582;STB=0.721794;TYPE=snp;VARB=0.0136372;OID=.;OPOS=135976698;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:31:36:11:14:13:17:9:4:10:1:10:7:13:1 chr9 135982088 . A C 201.55 PASS AO=33;DP=81;FAO=43;FDP=80;FR=.;FRO=37;FSAF=14;FSAR=29;FSRF=12;FSRR=25;FWDB=-0.0161056;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.858;QD=10.0774;RBI=0.0173058;REFB=-0.0521138;REVB=-0.00633265;RO=23;SAF=12;SAR=21;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122477;STB=0.500662;TYPE=snp;VARB=0.0256634;OID=.;OPOS=135982088;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:80:23:37:33:43:21:12:12:11:29:14:12:25 chr9 135983504 . T C 290.78 PASS AO=58;DP=102;FAO=58;FDP=102;FR=.;FRO=44;FSAF=31;FSAR=27;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=-0.0332582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.241;QD=11.403;RBI=0.0361812;REFB=-0.0200786;REVB=0.0142469;RO=43;SAF=31;SAR=27;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000313807;STB=0.504757;TYPE=snp;VARB=0.0189006;OID=.;OPOS=135983504;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:43:44:58:58:27:31:23:20:27:31:24:20 chr9 135985796 . C T 171.27 PASS AO=29;DP=44;FAO=29;FDP=44;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=0.0351085;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.662;QD=15.5699;RBI=0.0471861;REFB=-0.00269751;REVB=0.0315265;RO=15;SAF=10;SAR=19;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0548977;STB=0.530015;TYPE=snp;VARB=0.00244618;OID=.;OPOS=135985796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:44:44:15:15:29:29:19:10:4:11:19:10:4:11 chr9 136031345 . GA G,GG 898.91 PASS AO=45,50;DP=98;FAO=86,9;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=27,2;FSAR=59,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0180089,-0.107978;FXX=0.0306091;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=172.685,158.375;QD=37.8489;RBI=0.062105,0.112845;REFB=0,0;REVB=0.0594366,0.0327838;RO=0;SAF=0,29;SAR=45,21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.20481e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.00153359,-0.0014464;OID=.,.;OPOS=136031346,136031346;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:45,50:98:86,9:95:0:27,2:59,7:0:0:5:0:0,29:45,21:0:0 chr9 136037742 . G A 176.82 PASS AO=31;DP=53;FAO=33;FDP=55;FR=.;FRO=22;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=-0.00847964;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.4663;QD=12.86;RBI=0.0740546;REFB=-0.0647455;REVB=0.0735675;RO=22;SAF=17;SAR=14;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102668;STB=0.543974;TYPE=snp;VARB=0.04864;OID=.;OPOS=136037742;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:53:55:22:22:31:33:14:17:15:7:14:19:15:7 chr9 136083580 . T G 176.6 PASS AO=42;DP=88;FAO=42;FDP=88;FR=.;FRO=46;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=27;FSRR=19;FWDB=-0.0224629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.6869;QD=8.02736;RBI=0.0232759;REFB=-0.0182238;REVB=0.00609825;RO=45;SAF=15;SAR=27;SRF=27;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22768;STB=0.621652;TYPE=snp;VARB=0.0162002;OID=.;OPOS=136083580;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:45:46:42:42:27:15:27:18:27:15:27:19 chr9 136131289 . C T 92.23 PASS AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.0118711;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.298;QD=8.3845;RBI=0.0149022;REFB=0.00224536;REVB=-0.00900848;RO=23;SAF=14;SAR=7;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149496;STB=0.508466;TYPE=snp;VARB=-0.00228953;OID=.;OPOS=136131289;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:44:44:23:23:21:21:7:14:15:8:7:14:15:8 chr9 136131347 . G A 39.12 PASS AO=14;DP=47;FAO=14;FDP=47;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=23;FWDB=-0.0132588;FXX=0.040808;HRUN=4;LEN=1;MLLD=134.792;QD=3.32975;RBI=0.0180372;REFB=0.00957571;REVB=-0.0122289;RO=32;SAF=8;SAR=6;SRF=10;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.293492;STB=0.682115;TYPE=snp;VARB=-0.0131217;OID=.;OPOS=136131347;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:47:47:32:33:14:14:6:8:10:22:6:8:10:23 chr9 136131437 . C T 20.97 PASS AO=10;DP=45;FAO=10;FDP=45;FR=.;FRO=35;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=0.0583398;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.399;QD=1.86395;RBI=0.0879757;REFB=0.00227811;REVB=0.0658497;RO=34;SAF=7;SAR=3;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.373763;STB=0.744218;TYPE=snp;VARB=0.000873903;OID=.;OPOS=136131437;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:45:45:34:35:10:10:3:7:13:21:3:7:13:22 chr9 136131472 . A T 35.09 PASS AO=12;DP=39;FAO=12;FDP=39;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.000158763;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.751;QD=3.5985;RBI=0.00688358;REFB=-0.00640807;REVB=-0.00688175;RO=27;SAF=8;SAR=4;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216083;STB=0.631355;TYPE=snp;VARB=0.0143771;OID=.;OPOS=136131472;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:39:39:27:27:12:12:4:8:13:14:4:8:13:14 chr9 136131651 . G A 72.69 PASS AO=21;DP=55;FAO=21;FDP=55;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=-0.00628877;FXX=0.017854;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.629;QD=5.28653;RBI=0.0227014;REFB=-0.0117343;REVB=0.021813;RO=34;SAF=9;SAR=12;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0509164;STB=0.529384;TYPE=snp;VARB=0.0201902;OID=.;OPOS=136131651;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:55:55:34:34:21:21:12:9:13:21:12:9:13:21 chr9 136132873 . T C 458.6 PASS AO=97;DP=178;FAO=97;FDP=178;FR=.;FRO=81;FSAF=43;FSAR=54;FSRF=39;FSRR=42;FWDB=-0.00863702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.27;QD=10.3056;RBI=0.0304684;REFB=-0.0265616;REVB=-0.0292186;RO=80;SAF=43;SAR=54;SRF=38;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0265064;STB=0.517528;TYPE=snp;VARB=0.0209239;OID=.;OPOS=136132873;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:178:80:81:97:97:54:43:38:42:54:43:39:42 chr9 136132908 . T TC 136.19 PASS AO=41;DP=134;FAO=43;FDP=118;FR=.;FRO=75;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=19;FSRR=56;FWDB=-0.0289351;FXX=0.0992291;HRUN=0;LEN=1;MLLD=218.189;QD=4.61667;RBI=0.0309888;REFB=-0.00581933;REVB=0.0110934;RO=77;SAF=19;SAR=22;SRF=20;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.239783;STB=0.624947;TYPE=ins;VARB=0.0140997;OID=.;OPOS=136132909;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:41:134:43:118:75:19:24:19:56:99:77:19:22:20:57 chr9 136133506 . A G 92.93 PASS AO=19;DP=36;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.0129602;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.961;QD=10.3254;RBI=0.0130207;REFB=0.00214199;REVB=0.00125379;RO=17;SAF=11;SAR=8;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00799136;STB=0.5045;TYPE=snp;VARB=-0.00164576;OID=.;OPOS=136133506;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:36:36:17:17:19:19:8:11:10:7:8:11:10:7 chr9 136135237 . A G 106.2 PASS AO=27;DP=62;FAO=27;FDP=62;FR=.;FRO=35;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=27;FSRR=8;FWDB=0.0146368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.7885;QD=6.85176;RBI=0.054409;REFB=-0.00505579;REVB=-0.0524032;RO=35;SAF=20;SAR=7;SRF=27;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0407675;STB=0.523036;TYPE=snp;VARB=0.00966735;OID=.;OPOS=136135237;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:35:35:27:27:7:20:27:8:7:20:27:8 chr9 136135238 . T C 106.2 PASS AO=27;DP=62;FAO=27;FDP=62;FR=.;FRO=35;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=27;FSRR=8;FWDB=0.0163564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.7925;QD=6.85175;RBI=0.0243504;REFB=-0.0242914;REVB=0.0180392;RO=35;SAF=20;SAR=7;SRF=27;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0407675;STB=0.523036;TYPE=snp;VARB=0.0214102;OID=.;OPOS=136135238;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:35:35:27:27:7:20:27:8:7:20:27:8 chr9 136136770 . A C 71.9 PASS AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=-0.0485864;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.3273;QD=7.5683;RBI=0.0804625;REFB=-0.0442203;REVB=-0.0641371;RO=19;SAF=2;SAR=15;SRF=4;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172185;STB=0.666432;TYPE=snp;VARB=0.0470821;OID=.;OPOS=136136770;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:37:38:19:21:17:17:15:2:4:15:15:2:6:15 chr9 136177961 . C T 360.01 PASS AO=84;DP=166;FAO=84;FDP=169;FR=.;FRO=85;FSAF=35;FSAR=49;FSRF=41;FSRR=44;FWDB=0.013715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.28;QD=8.52103;RBI=0.0157269;REFB=-0.00282834;REVB=-0.00769645;RO=80;SAF=35;SAR=49;SRF=39;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0639111;STB=0.533593;TYPE=snp;VARB=0.00369245;OID=.;OPOS=136177961;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:169:80:85:84:84:49:35:39:41:49:35:41:44 chr9 136177993 . G A 1610.12 PASS AO=166;DP=168;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00202266;FXX=0.011764;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.51;QD=38.3363;RBI=0.00226774;REFB=0;REVB=0.00102543;RO=0;SAF=70;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.28438e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.83521e-05;OID=.;OPOS=136177993;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:168:168:0:0:166:168:96:70:0:0:96:72:0:0 chr9 136227260 . A G 1446.39 PASS AO=64;DP=152;FAO=152;FDP=152;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=62;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0487461;FXX=0.00653552;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.516;QD=38.063;RBI=0.178461;REFB=-0.0344309;REVB=0.171675;RO=2;SAF=49;SAR=15;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0209073;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000681962;OID=.;OPOS=136227260;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:151:152:2:0:64:152:15:49:1:1:90:62:0:0 chr9 136230037 . GC G 83.91 PASS AO=44;DP=140;FAO=56;FDP=124;FR=.;FRO=68;FSAF=51;FSAR=5;FSRF=44;FSRR=24;FWDB=0.00797374;FXX=0.0158718;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.6561;QD=2.70682;RBI=0.0223806;REFB=-0.085268;REVB=0.020912;RO=48;SAF=40;SAR=4;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.520724;STB=0.756792;TYPE=del;VARB=0.092025;OID=.;OPOS=136230038;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:44:116:56:124:68:51:5:44:24:83:48:40:4:26:22 chr9 136237783 . C A 189.75 PASS AO=44;DP=92;FAO=44;FDP=90;FR=.;FRO=46;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=-0.00208823;FXX=0.0217368;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.13;QD=8.43341;RBI=0.0244117;REFB=-0.0308411;REVB=0.0243222;RO=46;SAF=20;SAR=24;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0419687;STB=0.523316;TYPE=snp;VARB=0.0338724;OID=.;OPOS=136237783;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:90:46:46:44:44:24:20:23:23:24:20:23:23 chr9 136268038 . C T 959.29 PASS AO=101;DP=102;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0604656;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.379;QD=37.9915;RBI=0.0617817;REFB=0;REVB=0.0126842;RO=0;SAF=33;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=9.32919e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000199673;OID=.;OPOS=136268038;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:102:101:0:0:101:101:68:33:0:0:68:33:0:0 chr9 136268912 . A G 90.47 PASS AO=15;DP=23;FAO=15;FDP=23;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0269065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.245;QD=15.7343;RBI=0.0269798;REFB=0.0100095;REVB=-0.00198677;RO=8;SAF=6;SAR=9;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0162296;STB=0.509079;TYPE=snp;VARB=-0.00937218;OID=.;OPOS=136268912;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:23:23:8:8:15:15:9:6:3:5:9:6:3:5 chr9 136277480 . A G 1074.71 PASS AO=108;DP=109;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0179212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.017;QD=38.0429;RBI=0.0355572;REFB=0;REVB=0.0307107;RO=0;SAF=52;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.59964e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.03927e-05;OID=.;OPOS=136277480;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:109:113:0:0:108:113:56:52:0:0:61:52:0:0 chr9 136287582 . C T 120.95 PASS AO=30;DP=68;FAO=30;FDP=67;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=12;FWDB=-0.0115185;FXX=0.0147037;HRUN=5;LEN=1;MLLD=56.5866;QD=7.22066;RBI=0.0573353;REFB=0.0128032;REVB=0.0561664;RO=36;SAF=15;SAR=15;SRF=24;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161959;STB=0.596953;TYPE=snp;VARB=-0.0174276;OID=.;OPOS=136287582;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:67:36:37:30:30:15:15:24:12:15:15:25:12 chr9 136291063 . C T 946.6 PASS AO=107;DP=112;FAO=107;FDP=112;FR=.;FRO=5;FSAF=68;FSAR=39;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.00975367;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=199.373;QD=33.8072;RBI=0.0526824;REFB=-0.0507992;REVB=0.0517716;RO=5;SAF=68;SAR=39;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0213705;STB=0.511276;TYPE=snp;VARB=0.000426652;OID=.;OPOS=136291063;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:112:112:5:5:107:107:39:68:2:3:39:68:2:3 chr9 136295290 . A C 423.06 PASS AO=44;DP=46;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0228252;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=59.478;QD=33.8444;RBI=0.0264855;REFB=-0.0710408;REVB=0.0134348;RO=2;SAF=27;SAR=17;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00975376;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00348301;OID=.;OPOS=136295290;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:46:50:2:0:44:50:17:27:1:1:19:31:0:0 chr9 136304497 . A G 966.24 PASS AO=99;DP=99;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0290288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.632;QD=38.6497;RBI=0.0303623;REFB=0;REVB=0.00889932;RO=0;SAF=42;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.37041e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000128574;OID=.;OPOS=136304497;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:99:100:0:0:99:100:57:42:0:0:57:43:0:0 chr9 136308542 . C T 426.4 PASS AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0534475;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.731;QD=37.9022;RBI=0.0600414;REFB=0;REVB=0.0273558;RO=0;SAF=20;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.09779e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.21347e-05;OID=.;OPOS=136308542;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:45:45:0:0:45:45:25:20:0:0:25:20:0:0 chr9 136328657 . T C 378.97 PASS AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0106916;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.042;QD=35.2533;RBI=0.0236626;REFB=-0.175884;REVB=0.0211094;RO=1;SAF=13;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.015915;STB=0.508471;TYPE=snp;VARB=0.000354176;OID=.;OPOS=136328657;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:43:43:1:1:42:42:29:13:0:1:29:13:0:1 chr9 136333487 . G A 112.63 PASS AO=25;DP=52;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=2;FSAR=23;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=-0.00929176;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.8058;QD=8.83337;RBI=0.0147701;REFB=-0.0264141;REVB=0.0114813;RO=25;SAF=2;SAR=23;SRF=7;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.373897;STB=0.711125;TYPE=snp;VARB=0.0310987;OID=.;OPOS=136333487;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:51:25:26:25:25:23:2:7:18:23:2:7:19 chr9 136335824 . C T 86 PASS AO=30;DP=88;FAO=30;FDP=88;FR=.;FRO=58;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=30;FSRR=28;FWDB=0.0466272;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.6514;QD=3.90911;RBI=0.0526867;REFB=-0.00160446;REVB=0.0245316;RO=58;SAF=14;SAR=16;SRF=30;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0574552;STB=0.533311;TYPE=snp;VARB=0.00503409;OID=.;OPOS=136335824;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:88:88:58:58:30:30:16:14:30:28:16:14:30:28 chr9 136340200 . T G 104.63 PASS AO=18;DP=28;FAO=17;FDP=26;FR=.;FRO=9;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.004411;FXX=0.0714031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.438;QD=16.0975;RBI=0.0227361;REFB=-0.0341091;REVB=-0.0223041;RO=5;SAF=13;SAR=5;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147775;STB=0.632264;TYPE=snp;VARB=0.0138461;OID=.;OPOS=136340200;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:28:26:5:9:18:17:5:13:5:0:4:13:4:5 chr9 136379890 . A G 116.26 PASS AO=23;DP=42;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=20;FSRF=3;FSRR=16;FWDB=-0.0116196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.626;QD=11.0727;RBI=0.0228686;REFB=0.00461089;REVB=-0.0196966;RO=19;SAF=3;SAR=20;SRF=3;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0469144;STB=0.526292;TYPE=snp;VARB=-0.00906932;OID=.;OPOS=136379890;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:42:42:19:19:23:23:20:3:3:16:20:3:3:16 chr9 136412170 . C T 1151.36 PASS AO=121;DP=123;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00158089;FXX=0.0162588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.778;QD=38.0614;RBI=0.00733801;REFB=0;REVB=0.0071657;RO=0;SAF=51;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.46676e-05;OID=.;OPOS=136412170;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:123:121:0:0:121:121:70:51:0:0:70:51:0:0 chr9 136412236 . A T 1076.16 PASS AO=113;DP=114;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0801498;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.687;QD=38.0942;RBI=0.0880538;REFB=0;REVB=0.0364622;RO=0;SAF=50;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33068e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000204556;OID=.;OPOS=136412236;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:114:113:0:0:113:113:63:50:0:0:63:50:0:0 chr9 136412255 . A C 971.93 PASS AO=100;DP=104;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0105278;FXX=0.0192289;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.826;QD=38.1147;RBI=0.0166051;REFB=0;REVB=-0.0128411;RO=0;SAF=46;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21299e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000282276;OID=.;OPOS=136412255;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:104:102:0:0:100:102:54:46:0:0:54:48:0:0 chr9 136505114 . A G 118.02 PASS AO=21;DP=34;FAO=21;FDP=34;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=-0.00848995;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0098;QD=13.885;RBI=0.008513;REFB=-0.0276744;REVB=-0.000625966;RO=12;SAF=5;SAR=16;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106884;STB=0.503872;TYPE=snp;VARB=0.0206877;OID=.;OPOS=136505114;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:34:34:12:13:21:21:16:5:3:9:16:5:3:10 chr9 136507444 . A G 200.27 PASS AO=51;DP=115;FAO=52;FDP=116;FR=.;FRO=64;FSAF=32;FSAR=20;FSRF=29;FSRR=35;FWDB=-0.00930359;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.823;QD=6.90584;RBI=0.0207403;REFB=-0.0238616;REVB=-0.0185365;RO=64;SAF=31;SAR=20;SRF=29;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155304;STB=0.590569;TYPE=snp;VARB=0.0181219;OID=.;OPOS=136507444;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:116:64:64:51:52:20:31:29:35:20:32:29:35 chr9 136532019 . GGC G 84.89 PASS AO=11;DP=43;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.154351;FXX=0.0951928;HRUN=4;LEN=2;MLLD=10.0972;QD=17.871;RBI=0.264033;REFB=0;REVB=-0.214218;RO=10;SAF=10;SAR=1;SRF=7;SRR=3;SSEN=0.527273;SSEP=0;SSSB=0.337697;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.00416781;OID=.;OPOS=136532020;OREF=GC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:11:24:19:19:0:10:9:0:0:8:10:10:1:7:3 chr9 136536679 . G A 121.03 PASS AO=19;DP=30;FAO=20;FDP=31;FR=.;FRO=11;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=-0.0035479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.315;QD=15.6173;RBI=0.0433799;REFB=-0.000673147;REVB=0.0432345;RO=11;SAF=11;SAR=8;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102358;STB=0.564294;TYPE=snp;VARB=0.00160066;OID=.;OPOS=136536679;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:30:31:11:11:19:20:8:11:8:3:9:11:8:3 chr9 136536793 . C G 120.5 PASS AO=28;DP=59;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.0514908;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=51.9314;QD=8.16928;RBI=0.0559542;REFB=-0.0339371;REVB=0.0218991;RO=28;SAF=13;SAR=15;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0319793;STB=0.544104;TYPE=snp;VARB=0.0212818;OID=.;OPOS=136536793;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:28:31:28:28:15:13:14:14:15:13:17:14 chr9 136561367 . G A 204.03 PASS AO=41;DP=91;FAO=49;FDP=98;FR=.;FRO=49;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=-0.00255577;FXX=0.0297;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.09;QD=8.32754;RBI=0.0672965;REFB=-0.0471165;REVB=0.067248;RO=48;SAF=20;SAR=21;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0318465;STB=0.551776;TYPE=snp;VARB=0.0475606;OID=.;OPOS=136561367;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:98:48:49:41:49:21:20:25:23:29:20:25:24 chr9 136573412 . G A 1316.42 PASS AO=137;DP=138;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0478292;FXX=0.00724585;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.132;QD=38.4356;RBI=0.0479306;REFB=0;REVB=0.00311712;RO=0;SAF=84;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.44156e-05;OID=.;OPOS=136573412;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:138:137:0:0:137:137:53:84:0:0:53:84:0:0 chr9 136577775 . GCC GC,G 211.81 PASS AO=24,11;DP=43;FAO=38,0;FDP=41;FR=.;FRO=3;FSAF=20,0;FSAR=18,0;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0251059,-0.0154226;FXX=0.0238039;HRUN=3,3;LEN=1,2;MLLD=15.448,12.8517;QD=20.6646;RBI=0.392185,0.203243;REFB=-0.00556654,-0.00234674;REVB=-0.391381,-0.202657;RO=5;SAF=16,2;SAR=8,9;SRF=3;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0235666,-0.298303;STB=0.514131,0.5;TYPE=del,del;VARB=-0.0201015,0.053186;OID=.,.;OPOS=136577776,136577776;OREF=C,CC;OALT=-,-;OMAPALT=GC,G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:24,11:42:38,0:41:3:20,0:18,0:1:2:8:5:16,2:8,9:3:2 chr9 136599146 . C T 264.88 PASS AO=63;DP=127;FAO=62;FDP=126;FR=.;FRO=64;FSAF=38;FSAR=24;FSRF=37;FSRR=27;FWDB=-0.0264924;FXX=0.0078734;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.1393;QD=8.40871;RBI=0.0474116;REFB=0.0301745;REVB=0.0393194;RO=63;SAF=39;SAR=24;SRF=37;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.030226;STB=0.518453;TYPE=snp;VARB=-0.0332807;OID=.;OPOS=136599146;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:126:63:64:63:62:24:39:37:26:24:38:37:27 chr9 136629256 . CTG C 425.46 PASS AO=75;DP=224;FAO=93;FDP=164;FR=.;FRO=71;FSAF=52;FSAR=41;FSRF=35;FSRR=36;FWDB=-0.0718387;FXX=0.103819;HRUN=1;LEN=2;MLLD=116.51;QD=10.377;RBI=0.0774457;REFB=-0.120328;REVB=-0.0289318;RO=61;SAF=43;SAR=32;SRF=27;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107682;STB=0.528854;TYPE=del;VARB=0.0800071;OID=.;OPOS=136629257;OREF=TG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:75:171:93:164:71:52:41:35:36:99:61:43:32:27:34 chr9 136633699 . G C 156.2 PASS AO=29;DP=53;FAO=32;FDP=58;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.00336049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.766;QD=10.772;RBI=0.0510212;REFB=-0.0188154;REVB=-0.0509105;RO=23;SAF=8;SAR=21;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251244;STB=0.591158;TYPE=snp;VARB=0.030729;OID=.;OPOS=136633699;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:58:23:26:29:32:21:8:13:10:21:11:14:12 chr9 136640116 . G A 38.92 PASS AO=12;DP=36;FAO=12;FDP=36;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.108855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.9918;QD=4.32471;RBI=0.111445;REFB=0.00472563;REVB=0.023884;RO=24;SAF=8;SAR=4;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.277332;STB=0.666389;TYPE=snp;VARB=-0.00101189;OID=.;OPOS=136640116;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:36:36:24:24:12:12:4:8:10:14:4:8:10:14 chr9 136643908 . G A 239.21 PASS AO=41;DP=64;FAO=41;FDP=63;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=35;FSRF=17;FSRR=5;FWDB=-0.0159458;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.9797;QD=15.1879;RBI=0.0188909;REFB=-0.0540509;REVB=0.0101292;RO=21;SAF=6;SAR=35;SRF=16;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.476279;STB=0.770184;TYPE=snp;VARB=0.0255164;OID=.;OPOS=136643908;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:64:63:21:22:41:41:35:6:16:5:35:6:17:5 chr9 136643994 . T C 583.98 PASS AO=59;DP=59;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0456515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.2329;QD=37.676;RBI=0.0555784;REFB=0;REVB=-0.0317001;RO=0;SAF=18;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.49224e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000146455;OID=.;OPOS=136643994;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:59:62:0:0:59:62:41:18:0:0:44:18:0:0 chr9 136645137 . G A 138.91 PASS AO=27;DP=48;FAO=27;FDP=48;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=25;FSRF=3;FSRR=18;FWDB=-0.0107242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.66;QD=11.5756;RBI=0.0114137;REFB=-0.0264272;REVB=0.0039069;RO=16;SAF=2;SAR=25;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217506;STB=0.592338;TYPE=snp;VARB=0.0158032;OID=.;OPOS=136645137;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:48:48:16:21:27:27:25:2:3:13:25:2:3:18 chr9 136662928 . A G 580.85 PASS AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0274308;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.2252;QD=38.7232;RBI=0.0540277;REFB=0;REVB=-0.0465461;RO=0;SAF=18;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41114e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00023565;OID=.;OPOS=136662928;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:60:60:0:0:60:60:42:18:0:0:42:18:0:0 chr9 136897990 . C CT,T 90.58 PASS AO=11,19;DP=47;FAO=37,7;FDP=48;FR=.;FRO=4;FSAF=10,2;FSAR=27,5;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0452093,0.00442916;FXX=0.020404;HRUN=13,1;LEN=1,1;MLLD=4.66053,203.177;QD=7.54869;RBI=0.167442,0.00710349;REFB=0.060916,0.0018942;REVB=0.161223,0.00555356;RO=10;SAF=4,3;SAR=7,16;SRF=2;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.154239,-0.0472405;STB=0.534465,0.64252;TYPE=ins,snp;VARB=0.00625298,0.000616774;OID=.,.;OPOS=136897991,136897990;OREF=-,C;OALT=T,T;OMAPALT=CT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:10:47:48:10:4:11,19:37,7:7,16:4,3:2:8:27,5:10,2:0:4 chr9 136898098 . G A 175.97 PASS AO=45;DP=100;FAO=45;FDP=100;FR=.;FRO=55;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=16;FSRR=39;FWDB=0.00635868;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.985;QD=7.03875;RBI=0.0142527;REFB=-0.00837181;REVB=0.0127557;RO=55;SAF=16;SAR=29;SRF=16;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0711382;STB=0.539665;TYPE=snp;VARB=0.00933547;OID=.;OPOS=136898098;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:55:55:45:45:29:16:16:39:29:16:16:39 chr9 136913355 . T C 392.41 PASS AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000388022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.474;QD=37.3726;RBI=0.0760847;REFB=0;REVB=0.0760837;RO=0;SAF=24;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000397697;OID=.;OPOS=136913355;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:42:42:0:0:42:42:18:24:0:0:18:24:0:0 chr9 137020431 . A G 60.05 PASS AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.020252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.12;QD=7.50568;RBI=0.0293616;REFB=-0.00292005;REVB=-0.0212594;RO=18;SAF=11;SAR=3;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.268157;STB=0.657361;TYPE=snp;VARB=0.00279822;OID=.;OPOS=137020431;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:32:32:18:18:14:14:3:11:10:8:3:11:10:8 chr9 137271318 . C A 118.2 PASS AO=16;DP=37;FAO=23;FDP=37;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.150624;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=101.409;QD=12.778;RBI=0.150655;REFB=-0.0790255;REVB=-0.00302389;RO=7;SAF=3;SAR=13;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.351396;STB=0.50239;TYPE=snp;VARB=0.0186579;OID=.;OPOS=137271318;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:30:37:7:14:16:23:13:3:5:2:13:10:6:8 chr9 137293785 . T C 31.01 PASS AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0122115;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.3604;QD=13.7802;RBI=0.0653367;REFB=0.00082648;REVB=-0.0641854;RO=4;SAF=4;SAR=1;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.28673;STB=0.666163;TYPE=snp;VARB=-0.0100724;OID=.;OPOS=137293785;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:9:9:4:4:5:5:1:4:4:0:1:4:4:0 chr9 137332311 . T G 312.91 PASS AO=104;DP=275;FAO=104;FDP=275;FR=.;FRO=171;FSAF=63;FSAR=41;FSRF=63;FSRR=108;FWDB=-0.0190407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.129;QD=4.55145;RBI=0.0193132;REFB=-0.0167995;REVB=0.00323258;RO=168;SAF=63;SAR=41;SRF=63;SRR=105;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249699;STB=0.644994;TYPE=snp;VARB=0.0191785;OID=.;OPOS=137332311;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:275:275:168:171:104:104:41:63:63:105:41:63:63:108 chr9 137619195 . C T 185.76 PASS AO=46;DP=100;FAO=46;FDP=100;FR=.;FRO=54;FSAF=14;FSAR=32;FSRF=32;FSRR=22;FWDB=-0.0171485;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=250.278;QD=7.43033;RBI=0.0411156;REFB=-0.0168999;REVB=0.0373688;RO=54;SAF=14;SAR=32;SRF=32;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.287072;STB=0.660611;TYPE=snp;VARB=0.01682;OID=.;OPOS=137619195;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:54:54:46:46:32:14:32:22:32:14:32:22 chr9 137630587 . T C 180.61 PASS AO=39;DP=68;FAO=37;FDP=68;FR=.;FRO=31;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=24;FWDB=-0.00172939;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.8154;QD=10.6241;RBI=0.00986414;REFB=0.0226524;REVB=-0.00971135;RO=29;SAF=25;SAR=14;SRF=5;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.353186;STB=0.675334;TYPE=snp;VARB=-0.0526792;OID=.;OPOS=137630587;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:29:31:39:37:14:25:5:24:14:23:7:24 chr9 137658894 . GC G 211.56 PASS AO=28;DP=35;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.251316;FXX=0.0294031;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.9859;QD=25.6435;RBI=0.279184;REFB=-0.028731;REVB=-0.12159;RO=1;SAF=5;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0.457143;SSEP=0;SSSB=-0.0842652;STB=0.538436;TYPE=del;VARB=0.0104448;OID=.;OPOS=137658895;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:28:33:32:33:1:6:26:1:0:15:1:5:23:1:0 chr9 137672012 . C T 379.03 PASS AO=56;DP=99;FAO=60;FDP=99;FR=.,HEALED;FRO=31;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=4;FSRR=27;FWDB=0.00460259;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.964;QD=15.3142;RBI=0.00904226;REFB=-0.068261;REVB=0.00778323;RO=20;SAF=24;SAR=32;SRF=4;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116431;STB=0.604256;TYPE=snp;VARB=0.00493266;OID=.;OPOS=137672012;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:95:99:20:31:56:60:32:24:4:16:35:25:4:27 chr9 137690318 . A T 96.75 PASS AO=25;DP=60;FAO=25;FDP=59;FR=.;FRO=34;FSAF=0;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=34;FWDB=0.000637791;FXX=0.0327815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.4176;QD=6.55899;RBI=0.0279128;REFB=-0.00300291;REVB=0.0279055;RO=26;SAF=0;SAR=25;SRF=0;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00449975;OID=.;OPOS=137690318;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:60:59:26:34:25:25:25:0:0:26:25:0:0:34 chr9 137708934 . T G 100.36 PASS AO=21;DP=53;FAO=25;FDP=58;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.0207173;FXX=0.0645057;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.086;QD=6.92137;RBI=0.0207181;REFB=-0.0278157;REVB=-0.000181357;RO=31;SAF=13;SAR=8;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109455;STB=0.519984;TYPE=snp;VARB=0.0297897;OID=.;OPOS=137708934;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:58:31:33:21:25:8:13:16:15:12:13:16:17 chr9 137710740 . GC G,GG 253.14 PASS AO=22,10;DP=40;FAO=30,9;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=15,6;FSAR=15,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.280662,0.162193;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=15.1324,16.0971;QD=25.963;RBI=0.286862,0.162782;REFB=-0.056555,-0.0162268;REVB=-0.0593206,-0.0138343;RO=8;SAF=7,7;SAR=15,3;SRF=7;SRR=1;SSEN=0.439394,0;SSEP=0.383721,0;SSSB=-0.276835,-0.175521;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0718021,-0.0671469;OID=.,.;OPOS=137710741,137710741;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:22,10:40:30,9:39:0:15,6:15,3:0:0:22:8:7,7:15,3:7:1 chr9 137711997 . G C 82.96 PASS AO=25;DP=67;FAO=25;FDP=67;FR=.;FRO=42;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=16;FWDB=-0.0463585;FXX=0.0147037;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.3767;QD=4.95294;RBI=0.0464735;REFB=-0.0227275;REVB=-0.00326733;RO=42;SAF=8;SAR=17;SRF=25;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.300432;STB=0.686312;TYPE=snp;VARB=0.0300102;OID=.;OPOS=137711997;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:67:67:42:42:25:25:17:8:25:17:17:8:26:16 chr9 137715300 . AC A 23.77 PASS AO=7;DP=28;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.160925;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=14.7411;QD=4.75314;RBI=0.244949;REFB=-0.0270482;REVB=-0.184671;RO=11;SAF=6;SAR=1;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.396358;STB=0.77345;TYPE=del;VARB=-0.00587975;OID=.;OPOS=137715301;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:7:20:9:20:11:8:1:6:5:23:11:6:1:6:5 chr9 137735232 . GCTAT G 491.08 PASS AO=141;DP=376;FAO=148;FDP=359;FR=.;FRO=211;FSAF=64;FSAR=84;FSRF=84;FSRR=127;FWDB=-0.00282735;FXX=0.0270995;HRUN=1;LEN=4;MLLD=230.903;QD=5.47166;RBI=0.00412896;REFB=-0.0203252;REVB=-0.00300905;RO=141;SAF=60;SAR=81;SRF=44;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10797;STB=0.520663;TYPE=del;VARB=0.0259222;OID=.;OPOS=137735233;OREF=CTAT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:141:324:148:359:211:64:84:84:127:99:141:60:81:44:97 chr9 137735274 . A T 550.59 PASS AO=54;DP=321;FAO=139;FDP=292;FR=.,HEALED;FRO=153;FSAF=51;FSAR=88;FSRF=54;FSRR=99;FWDB=-0.0287063;FXX=0.00680249;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.6617;QD=7.54239;RBI=0.0882146;REFB=-0.0338972;REVB=-0.0834132;RO=89;SAF=29;SAR=25;SRF=49;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149295;STB=0.507907;TYPE=snp;VARB=0.04667;OID=.;OPOS=137735274;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:229:292:89:153:54:139:25:29:49:40:88:51:54:99 chr9 137742096 . G C 12.42 PASS AO=5;DP=19;FAO=5;FDP=19;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.0255298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.3548;QD=2.61443;RBI=0.0696627;REFB=-0.00869536;REVB=-0.0648161;RO=14;SAF=4;SAR=1;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218754;STB=0.647989;TYPE=snp;VARB=0.268291;OID=.;OPOS=137742096;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:19:19:14:14:5:5:1:4:9:5:1:4:9:5 chr9 137742124 . G A 50.52 PASS AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.0283157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.9834;QD=8.41982;RBI=0.0781335;REFB=-0.0727884;REVB=-0.0728221;RO=13;SAF=7;SAR=4;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165392;STB=0.59672;TYPE=snp;VARB=0.0470254;OID=.;OPOS=137742124;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:24:24:13:13:11:11:4:7:6:7:4:7:6:7 chr9 137775212 . G A 146.87 PASS AO=30;DP=55;FAO=30;FDP=55;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=6;FSRR=19;FWDB=0.0470373;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.7361;QD=10.6815;RBI=0.0764508;REFB=0.0105768;REVB=0.0602679;RO=25;SAF=12;SAR=18;SRF=6;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141523;STB=0.578076;TYPE=snp;VARB=-0.005509;OID=.;OPOS=137775212;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:25:25:30:30:18:12:6:19:18:12:6:19 chr9 137779026 . C T 307.49 PASS AO=73;DP=150;FAO=73;FDP=150;FR=.;FRO=77;FSAF=41;FSAR=32;FSRF=55;FSRR=22;FWDB=0.0109885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.892;QD=8.19983;RBI=0.0110049;REFB=-0.0129438;REVB=0.000600658;RO=77;SAF=41;SAR=32;SRF=55;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147582;STB=0.581137;TYPE=snp;VARB=0.0142388;OID=.;OPOS=137779026;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:150:77:77:73:73:32:41:55:22:32:41:55:22 chr9 137801314 . A G 263.74 PASS AO=58;DP=114;FAO=58;FDP=114;FR=.;FRO=56;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=25;FSRR=31;FWDB=0.00115853;FXX=0.0256388;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.694;QD=9.25418;RBI=0.00733442;REFB=-0.0204447;REVB=0.00724234;RO=54;SAF=25;SAR=33;SRF=24;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119404;STB=0.50769;TYPE=snp;VARB=0.0148494;OID=.;OPOS=137801314;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:54:56:58:58:33:25:24:30:33:25:25:31 chr9 137801416 . T C 99.73 PASS AO=27;DP=66;FAO=27;FDP=65;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=0.0389876;FXX=0.0151492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.9023;QD=6.13695;RBI=0.0389994;REFB=-0.00388987;REVB=0.00095628;RO=38;SAF=12;SAR=15;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0799782;STB=0.545421;TYPE=snp;VARB=0.00378477;OID=.;OPOS=137801416;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:65:38:38:27:27:15:12:14:24:15:12:14:24 chr9 137801800 . T C 507.38 PASS AO=120;DP=258;FAO=126;FDP=263;FR=.;FRO=137;FSAF=75;FSAR=51;FSRF=58;FSRR=79;FWDB=0.0162524;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.3958;QD=7.71674;RBI=0.0386112;REFB=0.0123336;REVB=0.035024;RO=136;SAF=72;SAR=48;SRF=58;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167513;STB=0.589715;TYPE=snp;VARB=-0.0170399;OID=.;OPOS=137801800;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:258:263:136:137:120:126:48:72:58:78:51:75:58:79 chr9 137804360 . A G 37.33 PASS AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=-0.00897084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.7283;QD=6.49154;RBI=0.0762586;REFB=-0.0150539;REVB=-0.0757291;RO=13;SAF=3;SAR=6;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.346427;STB=0.721757;TYPE=snp;VARB=0.0167013;OID=.;OPOS=137804360;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:23:23:13:14:9:9:6:3:9:4:6:3:10:4 chr9 137809685 . C A 95.24 PASS AO=29;DP=72;FAO=29;FDP=77;FR=.;FRO=48;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=-0.0245248;FXX=0.0128189;HRUN=5;LEN=1;MLLD=152.742;QD=4.94768;RBI=0.0258275;REFB=-0.00648612;REVB=-0.00809888;RO=43;SAF=14;SAR=15;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0058837;STB=0.51525;TYPE=snp;VARB=0.0152169;OID=.;OPOS=137809685;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:72:77:43:48:29:29:15:14:21:22:15:14:22:26 chr9 137968919 . G GAA 1102.04 PASS AO=109;DP=128;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0253669;FXX=0.0915961;HRUN=0;LEN=2;MLLD=202.81;QD=37.0435;RBI=0.0255618;REFB=-0.011782;REVB=-0.00315058;RO=5;SAF=53;SAR=56;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00717744;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00099751;OID=.;OPOS=137968920;OREF=-;OALT=AA;OMAPALT=GAA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:109:128:119:119:0:59:60:0:0:45:5:53:56:2:3 chr9 137968951 . G A 191.75 PASS AO=61;DP=161;FAO=61;FDP=160;FR=.;FRO=99;FSAF=24;FSAR=37;FSRF=47;FSRR=52;FWDB=0.00674657;FXX=0.00621079;HRUN=3;LEN=1;MLLD=207.774;QD=4.7937;RBI=0.00687811;REFB=-0.00261509;REVB=0.00133872;RO=99;SAF=24;SAR=37;SRF=47;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0908922;STB=0.551526;TYPE=snp;VARB=0.00391959;OID=.;OPOS=137968951;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:160:99:99:61:61:37:24:47:52:37:24:47:52 chr9 137978552 . A G 155.81 PASS AO=41;DP=95;FAO=41;FDP=95;FR=.;FRO=54;FSAF=12;FSAR=29;FSRF=17;FSRR=37;FWDB=-0.0471413;FXX=0.0206164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.2923;QD=6.56021;RBI=0.0529749;REFB=-0.000512317;REVB=-0.0241669;RO=52;SAF=12;SAR=29;SRF=16;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0178853;STB=0.514996;TYPE=snp;VARB=-0.00191763;OID=.;OPOS=137978552;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:52:54:41:41:29:12:16:36:29:12:17:37 chr9 137982127 . T C 1192.19 PASS AO=118;DP=118;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00249223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.463;QD=38.15;RBI=0.0472679;REFB=0;REVB=0.0472021;RO=0;SAF=71;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.14664e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000152333;OID=.;OPOS=137982127;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:118:125:0:0:118:125:47:71:0:0:53:72:0:0 chr9 138236031 . A G 225.01 PASS AO=47;DP=84;FAO=47;FDP=84;FR=.;FRO=37;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=0.00849686;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.904;QD=10.7145;RBI=0.0123295;REFB=-0.032025;REVB=0.00893422;RO=36;SAF=24;SAR=23;SRF=23;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101792;STB=0.558115;TYPE=snp;VARB=0.0244268;OID=.;OPOS=138236031;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:36:37:47:47:23:24:23:13:24:23:23:14 chr9 138236212 . T G 1650.47 PASS AO=167;DP=172;FAO=177;FDP=177;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0068917;FXX=0.00561766;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.403;QD=37.2987;RBI=0.017853;REFB=-0.080918;REVB=0.0164692;RO=0;SAF=71;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.09819e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.656e-05;OID=.;OPOS=138236212;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:172:177:0:0:167:177:96:71:0:0:105:72:0:0 chr9 138378856 . A G 100.85 PASS AO=22;DP=44;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=18;FSRF=5;FSRR=17;FWDB=-0.00504356;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.805;QD=9.16791;RBI=0.0175301;REFB=-0.0179383;REVB=-0.0167889;RO=22;SAF=4;SAR=18;SRF=5;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0643273;STB=0.536389;TYPE=snp;VARB=0.0178092;OID=.;OPOS=138378856;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:44:44:22:22:22:22:18:4:5:17:18:4:5:17 chr9 138379002 . T G 158.91 PASS AO=16;DP=16;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0175829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.659;QD=37.3914;RBI=0.0178841;REFB=0;REVB=0.00326861;RO=0;SAF=6;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00012596;OID=.;OPOS=138379002;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:16:17:0:0:16:17:10:6:0:0:11:6:0:0 chr9 138391299 . T A 80.94 PASS AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=-0.0132029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.447;QD=8.51951;RBI=0.0496604;REFB=-0.0313274;REVB=0.0478732;RO=18;SAF=9;SAR=9;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197011;STB=0.605151;TYPE=snp;VARB=0.0223091;OID=.;OPOS=138391299;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:38:38:18:20:18:18:9:9:13:5:9:9:14:6 chr9 138392970 . G T 15.36 PASS AO=3;DP=9;FAO=3;FDP=9;FR=.;FRO=6;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.243;QD=6.82569;RBI=0.0158981;REFB=-0.00760852;REVB=-0.0158981;RO=6;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0292044;OID=.;OPOS=138392970;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:9:9:6:6:3:3:3:0:0:6:3:0:0:6 chr9 138440525 . C G 75.51 PASS AO=25;DP=72;FAO=25;FDP=72;FR=.;FRO=47;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=32;FSRR=15;FWDB=0.00549604;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.738;QD=4.19509;RBI=0.00586605;REFB=-0.00926606;REVB=-0.00205038;RO=46;SAF=13;SAR=12;SRF=32;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199818;STB=0.60598;TYPE=snp;VARB=0.048498;OID=.;OPOS=138440525;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:72:72:46:47:25:25:12:13:32:14:12:13:32:15 chr9 138440527 . T C 80.54 PASS AO=26;DP=73;FAO=26;FDP=73;FR=.;FRO=47;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=32;FSRR=15;FWDB=-0.0292483;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.798;QD=4.41299;RBI=0.0298186;REFB=-0.00237125;REVB=-0.00580379;RO=46;SAF=13;SAR=13;SRF=31;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193383;STB=0.616354;TYPE=snp;VARB=0.00669757;OID=.;OPOS=138440527;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:73:73:46:47:26:26:13:13:31:15:13:13:32:15 chr9 138440641 . T C 104.43 PASS AO=26;DP=66;FAO=28;FDP=66;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=0.00965848;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.933;QD=6.32899;RBI=0.0212744;REFB=-0.00642385;REVB=-0.0189556;RO=36;SAF=10;SAR=16;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00459492;STB=0.519986;TYPE=snp;VARB=0.0137055;OID=.;OPOS=138440641;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:36:38:26:28:16:10:14:22:16:12:15:23 chr9 138518010 . A G 2254.66 PASS AO=235;DP=235;FAO=235;FDP=235;FR=.;FRO=0;FSAF=140;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0357998;FXX=0.00423711;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.667;QD=38.3772;RBI=0.0524325;REFB=0;REVB=-0.0383085;RO=0;SAF=140;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18792e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00011984;OID=.;OPOS=138518010;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:235:235:0:0:235:235:95:140:0:0:95:140:0:0 chr9 138586198 . G A 238.13 PASS AO=25;DP=26;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.000319479;FXX=0.0999667;HRUN=6;LEN=1;MLLD=209.091;QD=35.2778;RBI=0.0133487;REFB=-0.102536;REVB=0.0133449;RO=1;SAF=11;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0403161;STB=0.519985;TYPE=snp;VARB=0.00104887;OID=.;OPOS=138586198;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:26:27:1:1:25:26:14:11:1:0:14:12:1:0 chr9 138586966 . G A 400.81 PASS AO=45;DP=47;FAO=45;FDP=47;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0894134;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=49.1362;QD=34.1117;RBI=0.0894716;REFB=-0.173514;REVB=0.00322556;RO=0;SAF=26;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.15971e-08;STB=0.51851;TYPE=snp;VARB=0.0107058;OID=.;OPOS=138586966;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:47:47:0:2:45:45:19:26:0:0:19:26:2:0 chr9 138586967 . C A 447.29 PASS AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.127876;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.7448;QD=38.0674;RBI=0.142603;REFB=0;REVB=0.0631148;RO=0;SAF=28;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00294996;OID=.;OPOS=138586967;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:47:47:0:0:47:47:19:28:0:0:19:28:0:0 chr9 138590928 . C T 189.02 PASS AO=4;DP=29;FAO=24;FDP=28;FR=.;FRO=4;FSAF=22;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0449448;FXX=0.0344709;HRUN=4;LEN=1;MLLD=89.2419;QD=27.0025;RBI=0.0453709;REFB=-0.0517356;REVB=-0.00620345;RO=0;SAF=2;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.64691;TYPE=snp;VARB=0.00326403;OID=.;OPOS=138590928;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:5:28:0:4:4:24:2:2:0:0:2:22:2:2 chr9 138591266 . A G 431.56 PASS AO=42;DP=45;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.031184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.356;QD=36.7288;RBI=0.0323274;REFB=0;REVB=0.00852155;RO=0;SAF=3;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000777048;OID=.;OPOS=138591266;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:45:47:0:0:42:47:39:3:0:0:44:3:0:0 chr9 138644203 . T C 112.56 PASS AO=32;DP=80;FAO=32;FDP=80;FR=.;FRO=48;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=-0.0230609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.5917;QD=5.62818;RBI=0.0456767;REFB=-0.0135428;REVB=0.0394278;RO=46;SAF=16;SAR=16;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0225724;STB=0.524984;TYPE=snp;VARB=0.016608;OID=.;OPOS=138644203;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:46:48:32:32:16:16:22:24:16:16:22:26 chr9 138669210 . C T 137.32 PASS AO=28;DP=52;FAO=28;FDP=52;FR=.;FRO=24;FSAF=3;FSAR=25;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.028885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.676;QD=10.5631;RBI=0.0317334;REFB=-0.0151496;REVB=0.0131401;RO=24;SAF=3;SAR=25;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.412975;STB=0.735086;TYPE=snp;VARB=0.00952638;OID=.;OPOS=138669210;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:24:24:28:28:25:3:10:14:25:3:10:14 chr9 138669261 . G A 349.69 PASS AO=42;DP=46;FAO=42;FDP=46;FR=.;FRO=4;FSAF=12;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.026152;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.9134;QD=30.4075;RBI=0.0650428;REFB=0.00941158;REVB=0.0595537;RO=3;SAF=12;SAR=30;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0446661;STB=0.531236;TYPE=snp;VARB=0.000479991;OID=.;OPOS=138669261;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:46:46:3:4:42:42:30:12:0:3:30:12:0:4 chr9 138817000 . T C 122.13 PASS AO=24;DP=43;FAO=24;FDP=43;FR=.;FRO=19;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0468594;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.2731;QD=11.3607;RBI=0.0485499;REFB=-0.0202527;REVB=-0.0127;RO=19;SAF=13;SAR=11;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0954796;STB=0.553147;TYPE=snp;VARB=0.0145842;OID=.;OPOS=138817000;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:43:43:19:19:24:24:11:13:8:11:11:13:8:11 chr9 138817003 . C G 131.94 PASS AO=24;DP=43;FAO=25;FDP=43;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.00660597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.809;QD=12.273;RBI=0.00661655;REFB=-0.00719008;REVB=-0.000374026;RO=18;SAF=13;SAR=11;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0749028;STB=0.531573;TYPE=snp;VARB=0.00725345;OID=.;OPOS=138817003;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:43:43:18:18:24:25:11:13:8:10:12:13:8:10 chr9 138836941 . GCCTC GC,G 32.12 PASS AO=6,6;DP=35;FAO=12,0;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=3,0;FSAR=9,0;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.0046005,0.0153468;FXX=0.0856898;HRUN=2,2;LEN=3,4;MLLD=180.7,186.421;QD=4.01454;RBI=0.0261443,0.0531735;REFB=-0.0179166,-0.0120519;REVB=-0.0257363,-0.0509106;RO=22;SAF=3,0;SAR=3,6;SRF=13;SRR=9;SSEN=0.4,0.4;SSEP=0,0;SSSB=-0.107049,-0.732137;STB=0.672108,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.025765,0;OID=.,.;OPOS=138836942,138836942;OREF=CCT,CCTC;OALT=-,-;OMAPALT=GC,G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:6,6:35:12,0:32:20:3,0:9,0:10:10:32:22:3,0:3,6:13:9 chr9 138838140 . T C 893.16 PASS AO=93;DP=93;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0675205;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.707;QD=38.0069;RBI=0.0705874;REFB=0;REVB=-0.0205808;RO=0;SAF=69;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.15453e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000122906;OID=.;OPOS=138838140;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:93:94:0:0:93:94:24:69:0:0:24:70:0:0 chr9 138898893 . C G 2407.27 PASS AO=251;DP=253;FAO=252;FDP=252;FR=.;FRO=0;FSAF=128;FSAR=124;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00581056;FXX=0.00395241;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.592;QD=38.2107;RBI=0.0275882;REFB=0;REVB=-0.0269693;RO=0;SAF=127;SAR=124;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.38803e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.52179e-06;OID=.;OPOS=138898893;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:253:252:0:0:251:252:124:127:0:0:124:128:0:0 chr9 138899253 . G GCA 19.9 PASS AO=4;DP=12;FAO=4;FDP=11;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=158.437;QD=7.23535;RBI=0.0362138;REFB=-0.0124886;REVB=-0.0362138;RO=8;SAF=0;SAR=4;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.0294581;OID=.;OPOS=138899254;OREF=-;OALT=CA;OMAPALT=GCA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:4:12:4:11:7:0:4:0:7:19:8:0:4:0:8 chr9 139100805 . T C 256.6 PASS AO=55;DP=119;FAO=59;FDP=119;FR=.;FRO=60;FSAF=39;FSAR=20;FSRF=33;FSRR=27;FWDB=-0.0382432;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.721;QD=8.62523;RBI=0.0383261;REFB=-0.0184527;REVB=0.00251873;RO=60;SAF=36;SAR=19;SRF=33;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104531;STB=0.560016;TYPE=snp;VARB=0.018728;OID=.;OPOS=139100805;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:60:60:55:59:19:36:33:27:20:39:33:27 chr9 139110654 . C T 18.55 PASS AO=6;DP=23;FAO=6;FDP=23;FR=.;FRO=17;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.0622583;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.709;QD=3.22526;RBI=0.0625356;REFB=-0.00192921;REVB=-0.00588362;RO=17;SAF=1;SAR=5;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.393166;STB=0.761737;TYPE=snp;VARB=0.00196869;OID=.;OPOS=139110654;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:23:23:17:17:6:6:5:1:8:9:5:1:8:9 chr9 139142710 . G A 200.07 PASS AO=21;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00934451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.75;QD=36.3768;RBI=0.0587276;REFB=0;REVB=0.0579794;RO=0;SAF=13;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000283571;OID=.;OPOS=139142710;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:22:22:0:0:21:22:8:13:0:0:9:13:0:0 chr9 139142808 . T C 371.02 PASS AO=38;DP=40;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.122777;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.8471;QD=34.5138;RBI=0.171261;REFB=-0.0138789;REVB=0.119399;RO=2;SAF=13;SAR=25;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0667634;STB=0.516121;TYPE=snp;VARB=0.00632646;OID=.;OPOS=139142808;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:40:43:2:1:38:42:25:13:2:0:27:15:1:0 chr9 139235415 . C T 75.97 PASS AO=10;DP=12;FAO=10;FDP=12;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.030934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.142;QD=25.3243;RBI=0.123863;REFB=-0.0582212;REVB=0.119938;RO=2;SAF=6;SAR=4;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0305955;STB=0.517207;TYPE=snp;VARB=0.00904374;OID=.;OPOS=139235415;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:12:12:2:2:10:10:4:6:1:1:4:6:1:1 chr9 139252495 . G A 173.07 PASS AO=41;DP=85;FAO=41;FDP=85;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=0.000494226;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.144;QD=8.14423;RBI=0.0711806;REFB=-0.0494276;REVB=0.0711789;RO=44;SAF=16;SAR=25;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125246;STB=0.569808;TYPE=snp;VARB=0.0695037;OID=.;OPOS=139252495;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:44:44:41:41:25:16:23:21:25:16:23:21 chr9 139266405 . G A 115.83 PASS AO=26;DP=77;FAO=35;FDP=76;FR=.;FRO=41;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=15;FWDB=0.0112931;FXX=0.0129853;HRUN=4;LEN=1;MLLD=150.287;QD=6.09614;RBI=0.0254506;REFB=-0.0136025;REVB=-0.0228079;RO=31;SAF=22;SAR=4;SRF=22;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207518;STB=0.503224;TYPE=snp;VARB=0.0130954;OID=.;OPOS=139266405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:76:31:41:26:35:4:22:22:9:13:22:26:15 chr9 139266496 . C T 183.78 PASS AO=36;DP=63;FAO=36;FDP=63;FR=.;FRO=27;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.0199155;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.589;QD=11.6684;RBI=0.0447735;REFB=-0.0535272;REVB=0.0401003;RO=27;SAF=20;SAR=16;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0383609;OID=.;OPOS=139266496;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:27:27:36:36:16:20:15:12:16:20:15:12 chr9 139272058 . A G 67.32 PASS AO=17;DP=41;FAO=17;FDP=41;FR=.;FRO=24;FSAF=1;FSAR=16;FSRF=4;FSRR=20;FWDB=-0.045212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.6817;QD=6.56742;RBI=0.0513697;REFB=0.00647974;REVB=-0.0243869;RO=24;SAF=1;SAR=16;SRF=4;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.315836;STB=0.689367;TYPE=snp;VARB=-0.0131108;OID=.;OPOS=139272058;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:41:41:24:24:17:17:16:1:4:20:16:1:4:20 chr9 139273700 . TG T 39.98 PASS AO=11;DP=18;FAO=10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=0.0844875;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=20.3168;QD=8.88372;RBI=0.340095;REFB=-0.0402305;REVB=-0.329434;RO=6;SAF=1;SAR=10;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0.296226;SSSB=-0.648558;STB=0.877228;TYPE=del;VARB=-0.000826799;OID=.;OPOS=139273701;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:11:18:10:18:8:1:9:7:1:24:6:1:10:6:0 chr9 139275204 . A C 37.33 PASS AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=-0.0107766;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.336;QD=6.492;RBI=0.123179;REFB=-0.0120804;REVB=-0.122706;RO=13;SAF=6;SAR=3;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120736;STB=0.533261;TYPE=snp;VARB=0.019392;OID=.;OPOS=139275204;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:23:23:13:14:9:9:3:6:10:3:3:6:10:4 chr9 139275294 . G C 52.52 PASS AO=12;DP=27;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.00570554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.787;QD=7.78007;RBI=0.0135451;REFB=-0.0361596;REVB=0.0122848;RO=15;SAF=6;SAR=6;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0953953;STB=0.555464;TYPE=snp;VARB=0.0335391;OID=.;OPOS=139275294;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:27:27:15:15:12:12:6:6:9:6:6:6:9:6 chr9 139279173 . G A 128.24 PASS AO=36;DP=89;FAO=36;FDP=88;FR=.;FRO=52;FSAF=30;FSAR=6;FSRF=40;FSRR=12;FWDB=0.0128115;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.809;QD=5.82896;RBI=0.0227546;REFB=-0.000610055;REVB=-0.0188052;RO=53;SAF=30;SAR=6;SRF=40;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132145;STB=0.562463;TYPE=snp;VARB=0.00112196;OID=.;OPOS=139279173;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:88:53:52:36:36:6:30:40:13:6:30:40:12 chr9 139288692 . T C 94.42 PASS AO=24;DP=55;FAO=24;FDP=55;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=23;FSRR=8;FWDB=-0.0531359;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=94.4532;QD=6.86682;RBI=0.0678577;REFB=-0.0113725;REVB=-0.0422047;RO=31;SAF=17;SAR=7;SRF=23;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0411862;STB=0.523345;TYPE=snp;VARB=0.0200684;OID=.;OPOS=139288692;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:55:55:31:31:24:24:7:17:23:8:7:17:23:8 chr9 139289825 . A G 25.4 PASS AO=12;DP=50;FAO=12;FDP=50;FR=.;FRO=38;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=25;FWDB=0.0693292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.465;QD=2.0321;RBI=0.0694508;REFB=-0.0419371;REVB=0.00410785;RO=36;SAF=8;SAR=4;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.356411;STB=0.733816;TYPE=snp;VARB=0.0371459;OID=.;OPOS=139289825;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:50:50:36:38:12:12:4:8:13:23:4:8:13:25 chr9 139298580 . C T 161.98 PASS AO=35;DP=72;FAO=37;FDP=74;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=12;FSRR=25;FWDB=0.00288183;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.854;QD=8.75584;RBI=0.00825415;REFB=-0.0149194;REVB=-0.00773473;RO=37;SAF=14;SAR=21;SRF=12;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0739339;STB=0.542703;TYPE=snp;VARB=0.0124373;OID=.;OPOS=139298580;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:74:37:37:35:37:21:14:12:25:22:15:12:25 chr9 139298593 . A G 173.52 PASS AO=38;DP=74;FAO=38;FDP=74;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=10;FSRR=26;FWDB=-0.00782233;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.17;QD=9.37943;RBI=0.10966;REFB=-0.0144647;REVB=-0.10938;RO=36;SAF=13;SAR=25;SRF=10;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0642237;STB=0.535523;TYPE=snp;VARB=0.0146253;OID=.;OPOS=139298593;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:36:36:38:38:25:13:10:26:25:13:10:26 chr9 139299637 . C T 162.78 PASS AO=38;DP=79;FAO=38;FDP=79;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=9;FSRR=32;FWDB=0.0328007;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.084;QD=8.24216;RBI=0.0362838;REFB=0.00741793;REVB=-0.0155122;RO=40;SAF=17;SAR=21;SRF=9;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.213801;STB=0.622608;TYPE=snp;VARB=-0.0106322;OID=.;OPOS=139299637;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:40:41:38:38:21:17:9:31:21:17:9:32 chr9 139306467 . C T 702.11 PASS AO=233;DP=508;FAO=184;FDP=400;FR=.;FRO=216;FSAF=53;FSAR=131;FSRF=66;FSRR=150;FWDB=0.0035345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2752;QD=7.02106;RBI=0.0520167;REFB=-0.0222983;REVB=-0.0518965;RO=274;SAF=66;SAR=167;SRF=91;SRR=183;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0572367;STB=0.511415;TYPE=snp;VARB=0.0248128;OID=.;OPOS=139306467;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:508:400:274:216:233:184:167:66:91:183:131:53:66:150 chr9 139324740 . C T 215.09 PASS AO=51;DP=109;FAO=51;FDP=106;FR=.;FRO=55;FSAF=33;FSAR=18;FSRF=32;FSRR=23;FWDB=0.00109778;FXX=0.0275204;HRUN=4;LEN=1;MLLD=175.05;QD=8.1164;RBI=0.0104012;REFB=-0.00985011;REVB=-0.0103431;RO=54;SAF=33;SAR=18;SRF=31;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0721944;STB=0.536252;TYPE=snp;VARB=0.010377;OID=.;OPOS=139324740;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:106:54:55:51:51:18:33:31:23:18:33:32:23 chr9 139326304 . G A 34.08 PASS AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.0123635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.475;QD=11.3602;RBI=0.0123635;REFB=-0.0454631;REVB=0;RO=6;SAF=6;SAR=0;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0513388;OID=.;OPOS=139326304;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:12:12:6:6:6:6:0:6:6:0:0:6:6:0 chr9 139327034 . A G 79.3 PASS AO=22;DP=55;FAO=22;FDP=55;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=-0.037018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.1014;QD=5.76753;RBI=0.0444489;REFB=-0.0304386;REVB=-0.0246044;RO=33;SAF=10;SAR=12;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0968991;STB=0.555506;TYPE=snp;VARB=0.0467176;OID=.;OPOS=139327034;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:55:55:33:33:22:22:12:10:12:21:12:10:12:21 chr9 139327439 . A G 114.03 PASS AO=25;DP=46;FAO=24;FDP=46;FR=.;FRO=22;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=4;FWDB=0.0105706;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.8146;QD=9.91566;RBI=0.0635328;REFB=0.00788816;REVB=-0.0626472;RO=21;SAF=17;SAR=8;SRF=17;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128985;STB=0.586141;TYPE=snp;VARB=-0.0137042;OID=.;OPOS=139327439;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:46:46:21:22:25:24:8:17:17:4:8:16:18:4 chr9 139343719 . C T 1084 PASS AO=90;DP=118;FAO=112;FDP=115;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=36;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0702067;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.99;QD=37.7044;RBI=0.0712648;REFB=0;REVB=0.0122348;RO=0;SAF=20;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00191298;OID=.;OPOS=139343719;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:113:115:0:0:90:112:70:20:0:0:76:36:0:0 chr9 139370294 . AG A 490.53 PASS AO=57;DP=86;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.343511;FXX=0.03529;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.2316;QD=23.9282;RBI=0.353153;REFB=0;REVB=0.081959;RO=20;SAF=42;SAR=15;SRF=20;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0.366849;SSSB=-0.180283;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0118769;OID=.;OPOS=139370295;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:57:83:82:82:0:67:15:0:0:45:20:42:15:20:0 chr9 139371234 . G A 159.59 PASS AO=36;DP=75;FAO=37;FDP=76;FR=.;FRO=39;FSAF=32;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=27;FWDB=-0.0211235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.831;QD=8.3993;RBI=0.0232033;REFB=-0.0111254;REVB=-0.00960153;RO=39;SAF=31;SAR=5;SRF=12;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.570611;STB=0.822959;TYPE=snp;VARB=0.0140629;OID=.;OPOS=139371234;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:76:39:39:36:37:5:31:12:27:5:32:12:27 chr9 139371786 . A C 33.99 PASS AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.00753369;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.34;QD=5.43859;RBI=0.0221727;REFB=-0.0142551;REVB=0.0208536;RO=16;SAF=4;SAR=5;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124271;STB=0.575055;TYPE=snp;VARB=0.0361617;OID=.;OPOS=139371786;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:25:25:16:16:9:9:5:4:9:7:5:4:9:7 chr9 139391636 . G A 148.55 PASS AO=38;DP=85;FAO=38;FDP=85;FR=.;FRO=47;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=17;FSRR=30;FWDB=-0.0138671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.842;QD=6.99053;RBI=0.0280331;REFB=-0.0149522;REVB=-0.024363;RO=46;SAF=13;SAR=25;SRF=16;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00618921;STB=0.511939;TYPE=snp;VARB=0.0164063;OID=.;OPOS=139391636;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:46:47:38:38:25:13:16:30:25:13:17:30 chr9 139397707 . G A 105.43 PASS AO=20;DP=35;FAO=20;FDP=35;FR=.;FRO=15;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0374745;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.106;QD=12.0493;RBI=0.0467592;REFB=-0.00987706;REVB=0.0279657;RO=15;SAF=14;SAR=6;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242757;STB=0.636222;TYPE=snp;VARB=0.0106124;OID=.;OPOS=139397707;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:35:35:15:15:20:20:6:14:6:9:6:14:6:9 chr9 139407932 . A G 339.21 PASS AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0306786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.802;QD=37.6899;RBI=0.0320758;REFB=0;REVB=-0.00936356;RO=0;SAF=15;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000218377;OID=.;OPOS=139407932;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:36:36:0:0:36:36:21:15:0:0:21:15:0:0 chr9 139409976 . C T 33.2 PASS AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.0719419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.5307;QD=8.29984;RBI=0.088463;REFB=0.0288853;REVB=0.0514786;RO=9;SAF=4;SAR=3;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206013;STB=0.622323;TYPE=snp;VARB=-0.0259486;OID=.;OPOS=139409976;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:16:16:9:9:7:7:3:4:7:2:3:4:7:2 chr9 139417369 . C T 10.47 PASS AO=2;DP=6;FAO=2;FDP=6;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0044587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.5476;QD=6.97943;RBI=0.0044587;REFB=-0.0108358;REVB=0;RO=4;SAF=2;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0176757;OID=.;OPOS=139417369;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:4:4:2:2:0:2:4:0:0:2:4:0 chr9 139418260 . A G 107.82 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0139136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.42;QD=35.9384;RBI=0.0210329;REFB=0;REVB=0.0157732;RO=0;SAF=8;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.80629e-05;OID=.;OPOS=139418260;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:4:8:0:0:4:8:0:0 chr9 139510793 . G A 329.88 PASS AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.022391;FXX=0.0277701;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.1519;QD=37.7;RBI=0.0504587;REFB=0;REVB=0.0452186;RO=0;SAF=14;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.27896e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000743785;OID=.;OPOS=139510793;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:36:35:0:0:35:35:21:14:0:0:21:14:0:0 chr9 139511247 . C A 241.49 PASS AO=16;DP=32;FAO=28;FDP=30;FR=.;FRO=2;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0742994;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=49.8639;QD=32.1984;RBI=0.0975595;REFB=0.0549672;REVB=0.0632254;RO=2;SAF=0;SAR=16;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.527758;TYPE=snp;VARB=0.000695809;OID=.;OPOS=139511247;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:30:2:2:16:28:16:0:0:2:17:11:0:2 chr9 139616742 . A G 290.01 PASS AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0132668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.691;QD=37.4205;RBI=0.0175195;REFB=0;REVB=-0.0114422;RO=0;SAF=3;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.7166e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.28278e-05;OID=.;OPOS=139616742;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:31:31:0:0:31:31:28:3:0:0:28:3:0:0 chr9 139700605 . T C 147.05 PASS AO=28;DP=49;FAO=28;FDP=49;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.0559307;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.8443;QD=12.0042;RBI=0.0595578;REFB=-0.0481522;REVB=-0.020467;RO=21;SAF=11;SAR=17;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00967708;STB=0.505356;TYPE=snp;VARB=0.0388703;OID=.;OPOS=139700605;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:49:49:21:21:28:28:17:11:8:13:17:11:8:13 chr9 139701108 . A C 177.06 PASS AO=37;DP=70;FAO=37;FDP=70;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.0267918;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.0745;QD=10.1175;RBI=0.0347864;REFB=0.00587301;REVB=0.0221876;RO=33;SAF=18;SAR=19;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0243978;STB=0.513506;TYPE=snp;VARB=-0.00552765;OID=.;OPOS=139701108;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:33:33:37:37:19:18:17:16:19:18:17:16 chr9 139726239 . A G 495.72 PASS AO=52;DP=52;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0511163;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=37.1327;QD=36.0526;RBI=0.0516025;REFB=-0.0380176;REVB=-0.00706691;RO=0;SAF=23;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.84538e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000293841;OID=.;OPOS=139726239;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:52:55:0:0:52:55:29:23:0:0:31:24:0:0 chr9 139732331 . G C 41.06 PASS AO=18;DP=66;FAO=18;FDP=66;FR=.;FRO=48;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=31;FWDB=0.00546986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.516;QD=2.48823;RBI=0.0228147;REFB=-0.0057645;REVB=0.0221493;RO=48;SAF=10;SAR=8;SRF=17;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.239211;STB=0.643413;TYPE=snp;VARB=0.02452;OID=.;OPOS=139732331;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:66:66:48:48:18:18:8:10:17:31:8:10:17:31 chr9 139732462 . C T 72.43 PASS AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=18;FWDB=0.101851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.2494;QD=7.62391;RBI=0.108348;REFB=-0.0103279;REVB=0.0369553;RO=21;SAF=5;SAR=12;SRF=3;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194397;STB=0.609643;TYPE=snp;VARB=0.0183267;OID=.;OPOS=139732462;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:38:38:21:21:17:17:12:5:3:18:12:5:3:18 chr9 139734195 . AG A 240.71 PASS AO=26;DP=40;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.179959;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.8164;QD=26.7455;RBI=0.310514;REFB=0;REVB=0.253049;RO=12;SAF=12;SAR=14;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0.478659;SSSB=-0.070136;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00449105;OID=.;OPOS=139734196;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:26:39:36:36:0:16:20:0:0:22:12:12:14:7:5 chr9 139739730 . AG A 148.02 PASS AO=17;DP=31;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.116126;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=11.2051;QD=20.4167;RBI=0.297353;REFB=0;REVB=0.27374;RO=6;SAF=7;SAR=10;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0.302763;SSSB=0.210377;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0107424;OID=.;OPOS=139739731;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:17:28:29:29:0:7:22:0:0:15:6:7:10:0:6 chr9 139743882 . C T 113.64 PASS AO=21;DP=40;FAO=22;FDP=40;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.0146911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.401;QD=11.3642;RBI=0.0369112;REFB=-0.00729062;REVB=0.0338616;RO=15;SAF=9;SAR=12;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218763;STB=0.541628;TYPE=snp;VARB=0.00457101;OID=.;OPOS=139743882;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:40:40:15:18:21:22:12:9:6:9:13:9:9:9 chr9 139743999 . G C 32.88 PASS AO=11;DP=36;FAO=11;FDP=36;FR=.;FRO=25;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=-0.0785762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.016;QD=3.65339;RBI=0.0788427;REFB=-0.043489;REVB=-0.00647732;RO=25;SAF=3;SAR=8;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0649935;STB=0.539803;TYPE=snp;VARB=0.0964607;OID=.;OPOS=139743999;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:36:36:25:25:11:11:8:3:8:17:8:3:8:17 chr9 139748675 . AC A 10.35 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=36.8377;QD=5.91254;RBI=0.048655;REFB=-0.0380265;REVB=-0.048655;RO=5;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0719097;OID=.;OPOS=139748676;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:2:7:2:7:5:0:2:0:5:10:5:0:2:0:5 chr9 139749067 . C T 283.33 PASS AO=29;DP=29;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.107847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4915;QD=34.3425;RBI=0.108051;REFB=-0.0489047;REVB=0.00663529;RO=0;SAF=12;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.0947e-08;STB=0.512188;TYPE=snp;VARB=0.0024068;OID=.;OPOS=139749067;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:29:33:0:1:29:32:17:12:0:0:20:12:0:1 chr9 139752898 . CT C,CG 365.66 PASS AO=8,27;DP=38;FAO=10,30;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=4,8;FSAR=6,22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.144483,0.128956;FXX=0.0243843;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=65.8082,77.8856;QD=36.5659;RBI=0.148757,0.132161;REFB=0,0;REVB=0.0354041,0.0289279;RO=0;SAF=1,6;SAR=7,21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.78849e-08,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0323758,-0.00690723;OID=.,.;OPOS=139752899,139752899;OREF=T,T;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:8,27:37:10,30:40:0:4,8:6,22:0:0:14:0:1,6:7,21:0:0 chr9 139839904 . T G 43.96 PASS AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.0231785;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.991;QD=8.79225;RBI=0.0398654;REFB=-0.0226868;REVB=-0.0324347;RO=10;SAF=3;SAR=6;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.322491;STB=0.666296;TYPE=snp;VARB=0.0181163;OID=.;OPOS=139839904;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:21:20:10:11:9:9:6:3:7:3:6:3:7:4 chr9 139840543 . A G 123.81 PASS AO=12;DP=12;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.486;QD=35.375;RBI=0.031573;REFB=0;REVB=-0.0248818;RO=0;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.36812e-05;OID=.;OPOS=139840543;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:12:14:0:0:12:14:6:6:0:0:8:6:0:0 chr9 139841212 . T C 67.68 PASS AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.0262061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.36;QD=9.66788;RBI=0.0626102;REFB=-0.00297586;REVB=-0.0568619;RO=14;SAF=7;SAR=7;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000349564;OID=.;OPOS=139841212;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:28:28:14:14:14:14:7:7:7:7:7:7:7:7 chr9 139848688 . C T 1236.58 PASS AO=123;DP=124;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00962863;FXX=0.00769172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.598;QD=38.3435;RBI=0.0299805;REFB=0;REVB=0.0283922;RO=0;SAF=90;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00152314;OID=.;OPOS=139848688;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:124:129:0:0:123:129:33:90:0:0:38:91:0:0 chr9 139863841 . C T 129.16 PASS AO=20;DP=31;FAO=22;FDP=33;FR=.;FRO=11;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.00435379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.238;QD=15.6557;RBI=0.0147035;REFB=-0.0270653;REVB=-0.0140441;RO=11;SAF=12;SAR=8;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0360297;STB=0.532134;TYPE=snp;VARB=0.0142372;OID=.;OPOS=139863841;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:31:33:11:11:20:22:8:12:6:5:8:14:6:5 chr9 139863909 . C T 99.49 PASS AO=17;DP=27;FAO=17;FDP=27;FR=.;FRO=10;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.00854667;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.823;QD=14.7393;RBI=0.0394534;REFB=-0.0186022;REVB=0.0385165;RO=10;SAF=11;SAR=6;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.033726;STB=0.518845;TYPE=snp;VARB=0.00879709;OID=.;OPOS=139863909;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:27:27:10:10:17:17:6:11:6:4:6:11:6:4 chr9 139864341 . A G 31.01 PASS AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0541904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.054;QD=13.7801;RBI=0.0600482;REFB=-0.0214097;REVB=-0.0258686;RO=4;SAF=3;SAR=2;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118169;STB=0.571155;TYPE=snp;VARB=0.0154596;OID=.;OPOS=139864341;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:9:9:4:4:5:5:2:3:3:1:2:3:3:1 chr9 139864438 . G C 133.04 PASS AO=17;DP=33;FAO=22;FDP=33;FR=.,HEALED;FRO=11;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.0136377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.622;QD=16.1259;RBI=0.0763115;REFB=-0.0243379;REVB=0.075083;RO=11;SAF=9;SAR=8;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115872;STB=0.515745;TYPE=snp;VARB=0.00741284;OID=.;OPOS=139864438;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:33:33:11:11:17:22:8:9:4:7:13:9:4:7 chr9 139872048 . A G 723.11 PASS AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0165575;FXX=0.0256377;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.894;QD=38.0582;RBI=0.0701754;REFB=0;REVB=-0.0681941;RO=0;SAF=42;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6391e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000573941;OID=.;OPOS=139872048;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:77:76:0:0:76:76:34:42:0:0:34:42:0:0 chr9 139878317 . C T 414.49 PASS AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0236801;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.988;QD=37.6812;RBI=0.0376904;REFB=0;REVB=0.0293226;RO=0;SAF=12;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000416598;OID=.;OPOS=139878317;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:45:44:0:0:44:44:32:12:0:0:32:12:0:0 chr9 139878828 . T C 388.32 PASS AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.453;QD=38.8319;RBI=0.02478;REFB=0;REVB=-0.0239205;RO=0;SAF=15;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.46874e-05;OID=.;OPOS=139878828;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:40:40:0:0:40:40:25:15:0:0:25:15:0:0 chr9 139902214 . A G 590.68 PASS AO=62;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.027962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.8187;QD=37.5036;RBI=0.116436;REFB=0;REVB=-0.113029;RO=0;SAF=44;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.25982e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00134448;OID=.;OPOS=139902214;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:63:63:0:0:62:63:18:44:0:0:18:45:0:0 chr9 139904037 . A G 86.72 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0623805;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.129;QD=38.5423;RBI=0.0750296;REFB=0;REVB=0.0416907;RO=0;SAF=7;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000797564;OID=.;OPOS=139904037;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:2:7:0:0:2:7:0:0 chr9 139906359 . G A 291.79 PASS AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.006949;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.294;QD=38.9057;RBI=0.0451536;REFB=0;REVB=0.0446156;RO=0;SAF=21;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000394168;OID=.;OPOS=139906359;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:30:30:0:0:30:30:9:21:0:0:9:21:0:0 chr9 139912484 . A G 219.4 PASS AO=23;DP=23;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.399;QD=36.5665;RBI=0.0194724;REFB=0;REVB=0.00703047;RO=0;SAF=16;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000137856;OID=.;OPOS=139912484;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:23:24:0:0:23:24:7:16:0:0:7:17:0:0 chr9 139913239 . T G 594.15 PASS AO=61;DP=61;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00478113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.857;QD=37.7235;RBI=0.0313277;REFB=0;REVB=0.0309607;RO=0;SAF=47;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.92147e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.05728e-05;OID=.;OPOS=139913239;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:61:63:0:0:61:63:14:47:0:0:16:47:0:0 chr9 139923265 . A G 194.18 PASS AO=19;DP=19;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.585;QD=36.9869;RBI=0.0158997;REFB=0;REVB=0.00624143;RO=0;SAF=7;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000237596;OID=.;OPOS=139923265;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:19:21:0:0:19:21:12:7:0:0:13:8:0:0 chr9 139926402 . T C 87.35 PASS AO=11;DP=13;FAO=12;FDP=14;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00429739;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.3245;QD=24.9561;RBI=0.0676739;REFB=0.00494179;REVB=0.0675373;RO=1;SAF=4;SAR=7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0994753;STB=0.526271;TYPE=snp;VARB=-0.00750867;OID=.;OPOS=139926402;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:13:14:1:2:11:12:7:4:1:0:8:4:1:1 chr9 139934141 . GT G 76.36 PASS AO=13;DP=25;FAO=17;FDP=22;FR=.;FRO=5;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.273924;FXX=0.0832986;HRUN=5;LEN=1;MLLD=14.0634;QD=13.8834;RBI=0.275793;REFB=-0.0537;REVB=-0.0320537;RO=8;SAF=4;SAR=9;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0.3125;SSSB=-0.141855;STB=0.608575;TYPE=del;VARB=0.0510199;OID=.;OPOS=139934142;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:13:24:17:22:5:8:9:0:5:7:8:4:9:4:4 chr9 139935631 . GGC G,GG 41.89 PASS AO=3,3;DP=20;FAO=0,13;FDP=15;FR=.;FRO=2;FSAF=0,4;FSAR=0,9;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0998712,0.288994;FXX=0.062461;HRUN=2,5;LEN=2,1;MLLD=11.4701,7.86909;QD=11.1702;RBI=0.13539,0.297912;REFB=0.138936,0.166551;REVB=-0.0914119,0.072344;RO=4;SAF=0,2;SAR=3,1;SRF=2;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.683038,0.149914;STB=0.5,0.529365;TYPE=del,del;VARB=0,0.0234986;OID=.,.;OPOS=139935632,139935633;OREF=GC,C;OALT=-,-;OMAPALT=G,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:3,3:14:0,13:15:2:0,4:0,9:1:1:4:4:0,2:3,1:2:2 chr9 139937489 . AG A 299.26 PASS AO=40;DP=49;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.204437;FXX=0.0217344;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.1794;QD=26.6007;RBI=0.223806;REFB=0;REVB=-0.0910762;RO=0;SAF=11;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0.299652;SSSB=3.97233e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.015279;OID=.;OPOS=139937490;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:40:46:45:45:0:11:34:0:0:28:0:11:29:0:0 chr9 139937795 . T C 604.16 PASS AO=62;DP=62;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.542;QD=37.7598;RBI=0.0266621;REFB=0;REVB=0.0179769;RO=0;SAF=12;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30297e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000228461;OID=.;OPOS=139937795;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:62:64:0:0:62:64:50:12:0:0:51:13:0:0 chr9 139937799 . G A 639.74 PASS AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.8194;QD=38.1931;RBI=0.0300147;REFB=0;REVB=0.0125599;RO=0;SAF=13;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000243716;OID=.;OPOS=139937799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:67:67:0:0:67:67:54:13:0:0:54:13:0:0 chr9 139959408 . C G 10.39 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=33.112;QD=5.93496;RBI=0.120279;REFB=0.0413344;REVB=-0.120279;RO=5;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0982681;OID=.;OPOS=139959408;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:5:5:2:2:2:0:0:5:2:0:0:5 chr9 139975195 . C T 173.44 PASS AO=39;DP=78;FAO=39;FDP=78;FR=.;FRO=39;FSAF=5;FSAR=34;FSRF=7;FSRR=32;FWDB=0.0220143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.733;QD=8.89428;RBI=0.0220279;REFB=-0.016306;REVB=-0.000773984;RO=39;SAF=5;SAR=34;SRF=7;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0943851;STB=0.552816;TYPE=snp;VARB=0.0158868;OID=.;OPOS=139975195;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:39:39:39:39:34:5:7:32:34:5:7:32 chr9 139981529 . GGC G 32.61 PASS AO=7;DP=26;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.070195;FXX=0.142806;HRUN=4;LEN=2;MLLD=19.2293;QD=5.43498;RBI=0.115286;REFB=-0.088736;REVB=-0.0914527;RO=17;SAF=1;SAR=6;SRF=11;SRR=6;SSEN=0.594203;SSEP=0;SSSB=-0.564383;STB=0.87642;TYPE=del;VARB=0.0995353;OID=.;OPOS=139981530;OREF=GC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:7:26:11:24:13:1:10:9:4:32:17:1:6:11:6 chr9 139981627 . A G 161.56 PASS AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.003319;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.944;QD=34.0128;RBI=0.00471836;REFB=0.0492013;REVB=0.00335368;RO=0;SAF=3;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.32e-08;STB=0.571342;TYPE=snp;VARB=-0.00119881;OID=.;OPOS=139981627;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:1:18:18:15:3:0:0:15:3:1:0 chr9 140002261 . A G 35.02 PASS AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.00630187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.137;QD=9.33869;RBI=0.129689;REFB=-0.00117304;REVB=-0.129536;RO=8;SAF=6;SAR=1;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.561098;STB=0.838983;TYPE=snp;VARB=-0.00289328;OID=.;OPOS=140002261;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:15:15:8:8:7:7:1:6:2:6:1:6:2:6 chr9 140002989 . T C 1120.92 PASS AO=117;DP=117;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00113213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6312;QD=38.3221;RBI=0.0135358;REFB=0;REVB=0.0134884;RO=0;SAF=69;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.2892e-05;OID=.;OPOS=140002989;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:117:117:0:0:117:117:48:69:0:0:48:69:0:0 chr9 140002995 . C T 304.6 PASS AO=64;DP=118;FAO=64;FDP=118;FR=.;FRO=54;FSAF=35;FSAR=29;FSRF=34;FSRR=20;FWDB=0.00822213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.135;QD=10.3254;RBI=0.0611839;REFB=-0.01403;REVB=0.060629;RO=54;SAF=35;SAR=29;SRF=34;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0702702;STB=0.53847;TYPE=snp;VARB=0.0127162;OID=.;OPOS=140002995;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:54:54:64:64:29:35:34:20:29:35:34:20 chr9 140003427 . A G 245.97 PASS AO=30;DP=38;FAO=34;FDP=42;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=26;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.0144769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.666;QD=23.4256;RBI=0.0340498;REFB=-0.0567918;REVB=0.030819;RO=8;SAF=7;SAR=23;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0734217;STB=0.535559;TYPE=snp;VARB=0.00425097;OID=.;OPOS=140003427;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:38:42:8:8:30:34:23:7:3:5:26:8:3:5 chr9 140006202 . G A 16.07 PASS AO=3;DP=6;FAO=3;FDP=6;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0402263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.144;QD=10.7137;RBI=0.0578532;REFB=-0.00407576;REVB=0.0415793;RO=3;SAF=1;SAR=2;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.483116;STB=0.798389;TYPE=snp;VARB=0.00698706;OID=.;OPOS=140006202;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:6:6:3:3:3:3:2:1:3:0:2:1:3:0 chr9 140006425 . C G 85.91 PASS AO=12;DP=15;FAO=12;FDP=15;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0649622;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.6501;QD=22.9085;RBI=0.0684668;REFB=-0.0372107;REVB=-0.0216243;RO=3;SAF=2;SAR=10;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117832;STB=0.565118;TYPE=snp;VARB=0.0586118;OID=.;OPOS=140006425;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:15:15:3:3:12:12:10:2:0:3:10:2:0:3 chr9 140051238 . A G 22.45 PASS AO=6;DP=17;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.0174003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.559;QD=5.2819;RBI=0.0184704;REFB=-0.0211066;REVB=-0.00619537;RO=10;SAF=2;SAR=4;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0726992;STB=0.521666;TYPE=snp;VARB=0.0269044;OID=.;OPOS=140051238;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:17:17:10:11:6:6:4:2:4:6:4:2:4:7 chr9 140051376 . G A 82.21 PASS AO=7;DP=28;FAO=10;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=11;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.035768;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=119.454;QD=11.7443;RBI=0.0368284;REFB=-0.020168;REVB=0.00877389;RO=12;SAF=4;SAR=3;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157904;STB=0.51996;TYPE=snp;VARB=0.00590044;OID=.;OPOS=140051376;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:26:28:12:11:7:10:3:4:5:7:6:4:4:7 chr9 140077639 . G A 159.49 PASS AO=30;DP=52;FAO=30;FDP=51;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.0182021;FXX=0.0377287;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.0646;QD=12.5089;RBI=0.0188681;REFB=-0.0242328;REVB=0.00496852;RO=21;SAF=12;SAR=18;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0220862;STB=0.512187;TYPE=snp;VARB=0.017746;OID=.;OPOS=140077639;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:52:51:21:21:30:30:18:12:9:12:18:12:9:12 chr9 140079522 . G A 324.73 PASS AO=63;DP=108;FAO=63;FDP=108;FR=.;FRO=45;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=0.0125548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.327;QD=12.027;RBI=0.0186445;REFB=-0.0282531;REVB=0.0137838;RO=45;SAF=36;SAR=27;SRF=19;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114266;STB=0.562314;TYPE=snp;VARB=0.0146316;OID=.;OPOS=140079522;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:45:45:63:63:27:36:19:26:27:36:19:26 chr9 140120396 . C T 65.56 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.10207;FXX=0.124844;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.283;QD=37.4631;RBI=0.10209;REFB=0;REVB=0.00202117;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00328103;OID=.;OPOS=140120396;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:7:7:0:0:7:7:3:4:0:0:3:4:0:0 chr9 140120459 . GCC GC,G 96.08 PASS AO=9,4;DP=24;FAO=20,0;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=14,0;FSAR=6,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0506538,-0.0306928;FXX=0;HRUN=7,7;LEN=1,2;MLLD=9.163,9.7314;QD=19.2155;RBI=0.385277,0.2325;REFB=-0.0312185,-0.0425272;REVB=0.381933,0.230466;RO=4;SAF=7,4;SAR=2,0;SRF=1;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.321495,0.755207;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.0170452,0.0185574;OID=.,.;OPOS=140120460,140120460;OREF=C,CC;OALT=-,-;OMAPALT=GC,G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:9,4:20:20,0:20:0:14,0:6,0:0:0:9:4:7,4:2,0:1:3 chr9 140128085 . T C 72.35 PASS AO=10;DP=19;FAO=13;FDP=22;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0772122;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.8432;QD=13.1542;RBI=0.133701;REFB=-0.0583589;REVB=0.109152;RO=9;SAF=6;SAR=4;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215579;STB=0.651933;TYPE=snp;VARB=0.0500073;OID=.;OPOS=140128085;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:19:22:9:9:10:13:4:6:3:6:4:9:3:6 chr9 140129063 . CG C 24.23 PASS AO=14;DP=43;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=0.134406;FXX=0.0232504;HRUN=4;LEN=1;MLLD=13.3585;QD=2.30785;RBI=0.13476;REFB=-0.028624;REVB=-0.00976065;RO=26;SAF=2;SAR=12;SRF=18;SRR=8;SSEN=0.451613;SSEP=0;SSSB=-0.602093;STB=0.767116;TYPE=del;VARB=0.072211;OID=.;OPOS=140129064;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:14:43:16:42:26:4:12:18:8:24:26:2:12:18:8 chr9 140130606 . A T 374.77 PASS AO=40;DP=42;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0473366;FXX=0.0476077;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.3077;QD=37.4769;RBI=0.0490252;REFB=0;REVB=-0.0127559;RO=0;SAF=15;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00102111;OID=.;OPOS=140130606;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:42:40:0:0:40:40:25:15:0:0:25:15:0:0 chr9 140139757 . G A 334.36 PASS AO=35;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247438;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.8684;QD=37.1511;RBI=0.170831;REFB=0;REVB=0.16903;RO=1;SAF=21;SAR=14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.032238;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00197491;OID=.;OPOS=140139757;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:36:36:1:0:35:36:14:21:0:1:15:21:0:0 chr9 140147152 . C G 210.66 PASS AO=22;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0736964;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.2518;QD=36.6372;RBI=0.111386;REFB=0;REVB=0.0835203;RO=1;SAF=18;SAR=4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0250044;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00450528;OID=.;OPOS=140147152;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:1:0:22:23:4:18:1:0:4:19:0:0 chr9 140167022 . G A 333.29 PASS AO=33;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.107133;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.691;QD=37.0318;RBI=0.10718;REFB=0;REVB=0.00319234;RO=0;SAF=9;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0010557;OID=.;OPOS=140167022;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:35:36:0:0:33:36:24:9:0:0:25:11:0:0 chr9 140176294 . G T 69.09 PASS AO=15;DP=38;FAO=17;FDP=40;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.0215235;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=234.362;QD=6.90932;RBI=0.0225303;REFB=-0.00360043;REVB=-0.00665995;RO=22;SAF=8;SAR=7;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.012446;STB=0.529377;TYPE=snp;VARB=0.00442732;OID=.;OPOS=140176294;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:38:40:22:23:15:17:7:8:12:10:9:8:12:11 chr9 140177040 . A T 393.32 PASS AO=89;DP=168;FAO=94;FDP=192;FR=.;FRO=98;FSAF=36;FSAR=58;FSRF=44;FSRR=54;FWDB=-0.0462414;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.6485;QD=8.19414;RBI=0.0699514;REFB=0.0128141;REVB=-0.0524874;RO=78;SAF=36;SAR=53;SRF=41;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104878;STB=0.535048;TYPE=snp;VARB=-0.0125675;OID=.;OPOS=140177040;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:192:78:98:89:94:53:36:41:37:58:36:44:54 chr9 140242564 . G A 221.05 PASS AO=55;DP=120;FAO=55;FDP=119;FR=.;FRO=64;FSAF=12;FSAR=43;FSRF=39;FSRR=25;FWDB=-0.0209499;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.266;QD=7.43028;RBI=0.034849;REFB=-0.021399;REVB=-0.0278487;RO=64;SAF=12;SAR=43;SRF=39;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.408397;STB=0.728725;TYPE=snp;VARB=0.0269804;OID=.;OPOS=140242564;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:119:64:64:55:55:43:12:39:25:43:12:39:25 chr9 140243844 . C T 70.24 PASS AO=13;DP=23;FAO=13;FDP=23;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.00396327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.222;QD=12.2159;RBI=0.012007;REFB=-0.0160313;REVB=0.011334;RO=9;SAF=4;SAR=9;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109623;STB=0.591095;TYPE=snp;VARB=0.0178873;OID=.;OPOS=140243844;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:23:23:9:10:13:13:9:4:4:5:9:4:5:5 chr9 140247143 . T G 378.03 PASS AO=36;DP=36;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0352229;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.0194;QD=37.8035;RBI=0.138267;REFB=0;REVB=0.133705;RO=0;SAF=26;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00377897;OID=.;OPOS=140247143;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:36:40:0:0:36:40:10:26:0:0:13:27:0:0 chr9 140250818 . C T 1454.57 PASS AO=155;DP=161;FAO=158;FDP=158;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=108;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00249779;FXX=0.0186324;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.232;QD=36.8246;RBI=0.0160496;REFB=-0.0621234;REVB=0.0158541;RO=4;SAF=50;SAR=105;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177754;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000102241;OID=.;OPOS=140250818;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:161:158:4:0:155:158:105:50:0:4:108:50:0:0 chr9 140262426 . C T 195.16 PASS AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00710316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.964;QD=37.1725;RBI=0.0216672;REFB=0;REVB=0.0204698;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000227025;OID=.;OPOS=140262426;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:21:21:0:0:21:21:12:9:0:0:12:9:0:0 chr9 140268046 . C T 78.59 PASS AO=28;DP=84;FAO=28;FDP=84;FR=.;FRO=56;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=30;FWDB=-0.0253574;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.652;QD=3.74258;RBI=0.0256532;REFB=-0.0104837;REVB=-0.00388467;RO=56;SAF=11;SAR=17;SRF=26;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0837329;STB=0.54883;TYPE=snp;VARB=0.0272443;OID=.;OPOS=140268046;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:84:84:56:56:28:28:17:11:26:30:17:11:26:30 chr9 140277826 . C T 187.65 PASS AO=41;DP=83;FAO=42;FDP=83;FR=.;FRO=41;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=14;FSRR=27;FWDB=0.0226753;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=78.5011;QD=9.04319;RBI=0.0233195;REFB=-0.000740186;REVB=0.00544342;RO=39;SAF=23;SAR=18;SRF=14;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176331;STB=0.600748;TYPE=snp;VARB=0.00164469;OID=.;OPOS=140277826;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:39:41:41:42:18:23:14:25:19:23:14:27 chr9 140327669 . TG T 33.5 PASS AO=12;DP=90;FAO=26;FDP=70;FR=.;FRO=44;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=0.20112;FXX=0.0410903;HRUN=7;LEN=1;MLLD=10.142;QD=1.91406;RBI=0.297119;REFB=0.0282029;REVB=0.218701;RO=29;SAF=3;SAR=9;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175811;STB=0.634808;TYPE=del;VARB=0.0392789;OID=.;OPOS=140327670;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:12:67:26:70:44:6:20:18:26:33:29:3:9:11:18 chr9 140330976 . T C 664.5 PASS AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.633;QD=38.5218;RBI=0.041268;REFB=0;REVB=-0.0373783;RO=0;SAF=50;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.45441e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.90299e-05;OID=.;OPOS=140330976;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:69:69:0:0:69:69:19:50:0:0:19:50:0:0 chr9 140332478 . A G 401.9 PASS AO=39;DP=39;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0358998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.867;QD=37.3859;RBI=0.0374522;REFB=0;REVB=0.010671;RO=0;SAF=26;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00026796;OID=.;OPOS=140332478;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:39:43:0:0:39:43:13:26:0:0:17:26:0:0 chr9 140349161 . C T 48.18 PASS AO=14;DP=39;FAO=14;FDP=39;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.119157;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=39.3027;QD=4.9416;RBI=0.12059;REFB=-0.0127152;REVB=0.018531;RO=25;SAF=5;SAR=9;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0943528;STB=0.555903;TYPE=snp;VARB=0.0274036;OID=.;OPOS=140349161;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:39:39:25:25:14:14:9:5:11:14:9:5:11:14 chr9 140357943 . G A 139.56 PASS AO=25;DP=42;FAO=25;FDP=41;FR=.;FRO=16;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.0323416;FXX=0.0238039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.99;QD=13.6154;RBI=0.0325428;REFB=-0.02386;REVB=0.00361339;RO=15;SAF=11;SAR=14;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0276753;STB=0.500989;TYPE=snp;VARB=0.0182184;OID=.;OPOS=140357943;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:42:41:15:16:25:25:14:11:6:9:14:11:7:9 chr9 140357972 . A G 279.4 PASS AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0427005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.6502;QD=38.538;RBI=0.0561064;REFB=0;REVB=-0.036395;RO=0;SAF=9;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00161098;OID=.;OPOS=140357972;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:29:29:0:0:29:29:20:9:0:0:20:9:0:0 chr9 140374861 . A G 243.17 PASS AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.882;QD=37.4109;RBI=0.0203482;REFB=0;REVB=0.00856788;RO=0;SAF=10;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000259028;OID=.;OPOS=140374861;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:25:26:0:0:25:26:15:10:0:0:16:10:0:0 chr9 140509302 . G T 130.61 PASS AO=43;DP=100;FAO=36;FDP=85;FR=.;FRO=49;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=28;FWDB=-0.0171257;FXX=0.0116266;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.3301;QD=6.14643;RBI=0.0191618;REFB=-0.0390123;REVB=0.00859562;RO=57;SAF=17;SAR=26;SRF=23;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0086313;STB=0.541154;TYPE=snp;VARB=0.0676872;OID=.;OPOS=140509302;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:85:57:49:43:36:26:17:23:34:18:18:21:28 chr9 140611436 . T C 120.52 PASS AO=19;DP=30;FAO=20;FDP=31;FR=.;FRO=11;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.0137024;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.558;QD=15.5515;RBI=0.0141227;REFB=-0.00360983;REVB=-0.00341976;RO=10;SAF=12;SAR=7;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0209336;STB=0.505295;TYPE=snp;VARB=0.00216921;OID=.;OPOS=140611436;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:30:31:10:11:19:20:7:12:6:4:7:13:7:4 chr9 140638461 . T C 89.09 PASS AO=26;DP=66;FAO=26;FDP=67;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=26;FWDB=-0.0224631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.8573;QD=5.31873;RBI=0.0297852;REFB=-0.032567;REVB=-0.0195594;RO=40;SAF=15;SAR=11;SRF=15;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21116;STB=0.627023;TYPE=snp;VARB=0.0543573;OID=.;OPOS=140638461;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:66:67:40:41:26:26:11:15:15:25:11:15:15:26 chr9 140648742 . C T 56.27 PASS AO=10;DP=25;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.0174123;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.5551;QD=9.37767;RBI=0.0335195;REFB=-0.0218879;REVB=-0.0286421;RO=12;SAF=3;SAR=7;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0360904;STB=0.543407;TYPE=snp;VARB=0.0290558;OID=.;OPOS=140648742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:25:24:12:12:10:12:7:3:4:8:7:5:4:8 chr9 140679695 . G C 126.09 PASS AO=36;DP=90;FAO=36;FDP=90;FR=.;FRO=54;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=33;FSRR=21;FWDB=0.0327461;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.666;QD=5.60389;RBI=0.0744765;REFB=-0.00743969;REVB=0.0668913;RO=54;SAF=22;SAR=14;SRF=33;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0137393;OID=.;OPOS=140679695;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:54:54:36:36:14:22:33:21:14:22:33:21 chr9 140687468 . A G 242.28 PASS AO=57;DP=120;FAO=58;FDP=121;FR=.;FRO=63;FSAF=33;FSAR=25;FSRF=27;FSRR=36;FWDB=-0.00108472;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.983;QD=8.00928;RBI=0.00755408;REFB=-0.0203103;REVB=0.0074758;RO=62;SAF=33;SAR=24;SRF=27;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134939;STB=0.572989;TYPE=snp;VARB=0.0165045;OID=.;OPOS=140687468;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:121:62:63:57:58:24:33:27:35:25:33:27:36 chr9 140777306 . C G 100.15 PASS AO=35;DP=112;FAO=38;FDP=116;FR=.;FRO=78;FSAF=6;FSAR=32;FSRF=40;FSRR=38;FWDB=0.00789537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.3017;QD=3.45342;RBI=0.0396425;REFB=-0.000309645;REVB=-0.0388483;RO=75;SAF=6;SAR=29;SRF=40;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.468175;STB=0.777849;TYPE=snp;VARB=0.000172523;OID=.;OPOS=140777306;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:116:75:78:35:38:29:6:40:35:32:6:40:38 chr9 140881314 . A C 26.24 PASS AO=8;DP=32;FAO=10;FDP=34;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=0.0151339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.483;QD=3.08712;RBI=0.016051;REFB=-0.022535;REVB=-0.00534784;RO=23;SAF=6;SAR=2;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.452256;STB=0.681478;TYPE=snp;VARB=0.068068;OID=.;OPOS=140881314;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:32:34:23:24:8:10:2:6:8:15:4:6:8:16 chr9 140911670 . C T 171.09 PASS AO=36;DP=68;FAO=36;FDP=68;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=29;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=0.0291338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.05;QD=10.064;RBI=0.0291747;REFB=0.0035156;REVB=-0.00154452;RO=30;SAF=7;SAR=29;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160939;STB=0.61626;TYPE=snp;VARB=-0.00165347;OID=.;OPOS=140911670;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:30:32:36:36:29:7:10:20:29:7:12:20 chr9 140927139 . GA G 27.08 PASS AO=16;DP=64;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=-0.0187271;FXX=0.232101;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.90119;QD=2.5194;RBI=0.145727;REFB=-0.0324851;REVB=0.144519;RO=18;SAF=11;SAR=5;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0790844;STB=0.508764;TYPE=del;VARB=0.0452191;OID=.;OPOS=140927140;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:16:51:21:43:22:14:7:15:7:26:18:11:5:11:7 chr9 140952560 . G A 346.22 PASS AO=90;DP=198;FAO=90;FDP=197;FR=.;FRO=107;FSAF=46;FSAR=44;FSRF=52;FSRR=55;FWDB=-0.0048875;FXX=0.00505025;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.6348;QD=7.02977;RBI=0.0631832;REFB=-0.0135076;REVB=0.0629939;RO=106;SAF=46;SAR=44;SRF=52;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200546;STB=0.513645;TYPE=snp;VARB=0.0160122;OID=.;OPOS=140952560;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:197:106:107:90:90:44:46:52:54:44:46:52:55 chr9 141008876 . C T 554.59 PASS AO=60;DP=63;FAO=63;FDP=66;FR=.;FRO=3;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.132991;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.335;QD=33.6117;RBI=0.134153;REFB=-0.0409158;REVB=0.017618;RO=3;SAF=30;SAR=30;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0448823;STB=0.523802;TYPE=snp;VARB=0.00679015;OID=.;OPOS=141008876;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:63:66:3:3:60:63:30:30:0:3:30:33:0:3 chr9 141016262 . T G 748.63 PASS AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=58;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0249086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.636;QD=37.4315;RBI=0.0257736;REFB=-0.122669;REVB=-0.00662125;RO=1;SAF=58;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00809358;STB=0.504272;TYPE=snp;VARB=0.00125871;OID=.;OPOS=141016262;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:80:80:1:1:79:79:21:58:1:0:21:58:1:0 chr9 141069905 . C T 10.89 PASS AO=3;DP=14;FAO=3;FDP=14;FR=.;FRO=11;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=0.0525067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.891;QD=3.11201;RBI=0.0542736;REFB=-0.0148805;REVB=-0.0137357;RO=10;SAF=1;SAR=2;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181205;STB=0.646241;TYPE=snp;VARB=0.0389757;OID=.;OPOS=141069905;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:14:14:10:11:3:3:2:1:2:8:2:1:2:9 chr9 141070283 . T C 57.36 PASS AO=16;DP=51;FAO=19;FDP=56;FR=.;FRO=37;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=-0.0373429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.124;QD=4.09734;RBI=0.0374031;REFB=-0.0226951;REVB=0.00212137;RO=34;SAF=6;SAR=10;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145217;STB=0.578864;TYPE=snp;VARB=0.045543;OID=.;OPOS=141070283;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:51:56:34:37:16:19:10:6:17:17:11:8:20:17 chr9 141070335 . T G 64.76 PASS AO=12;DP=24;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.0100648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.8228;QD=10.361;RBI=0.0118564;REFB=-0.0240729;REVB=0.00626689;RO=12;SAF=4;SAR=8;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.514264;TYPE=snp;VARB=0.0170999;OID=.;OPOS=141070335;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:24:25:12:12:12:13:8:4:4:8:9:4:4:8 chr9 141071438 . A G 369.25 PASS AO=98;DP=219;FAO=98;FDP=219;FR=.;FRO=121;FSAF=20;FSAR=78;FSRF=29;FSRR=92;FWDB=0.00339646;FXX=0.00454525;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.163;QD=6.74431;RBI=0.00621793;REFB=-0.00914514;REVB=0.00520833;RO=118;SAF=20;SAR=78;SRF=29;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.060492;STB=0.52921;TYPE=snp;VARB=0.00980617;OID=.;OPOS=141071438;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:219:219:118:121:98:98:78:20:29:89:78:20:29:92 chr9 141071475 . C G 481.85 PASS AO=117;DP=244;FAO=118;FDP=244;FR=.;FRO=126;FSAF=29;FSAR=89;FSRF=27;FSRR=99;FWDB=0.0468886;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3541;QD=7.8991;RBI=0.052536;REFB=0.020574;REVB=-0.0236959;RO=127;SAF=29;SAR=88;SRF=27;SRR=100;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0459332;STB=0.522419;TYPE=snp;VARB=-0.0205183;OID=.;OPOS=141071475;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:244:127:126:117:118:88:29:27:100:89:29:27:99 chr9 141107583 . CT C 25.85 PASS AO=8;DP=38;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.134277;FXX=0.0357015;HRUN=5;LEN=1;MLLD=9.55134;QD=3.82919;RBI=0.287953;REFB=-0.0699054;REVB=0.254729;RO=14;SAF=7;SAR=1;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.477517;STB=0.638051;TYPE=del;VARB=0.114516;OID=.;OPOS=141107584;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:8:26:12:27:15:9:3:8:7:25:14:7:1:7:7 chr10 93603 . C T 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0271436;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=134.859;QD=35.0875;RBI=0.134855;REFB=0;REVB=-0.132095;RO=0;SAF=5;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.27427e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00263154;OID=.;OPOS=93603;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:2:5:0:0:2:5:0:0 chr10 93816 . C T 231.5 PASS AO=64;DP=150;FAO=64;FDP=150;FR=.;FRO=86;FSAF=37;FSAR=27;FSRF=54;FSRR=32;FWDB=0.00718048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.21;QD=6.17336;RBI=0.0116866;REFB=-0.0132745;REVB=-0.00922047;RO=85;SAF=37;SAR=27;SRF=53;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0479247;STB=0.529517;TYPE=snp;VARB=0.0187979;OID=.;OPOS=93816;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:150:85:86:64:64:27:37:53:32:27:37:54:32 chr10 93945 . G A 281.6 PASS AO=33;DP=40;FAO=36;FDP=41;FR=.;FRO=5;FSAF=9;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0189492;FXX=0.0238039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.9335;QD=27.4732;RBI=0.0358825;REFB=-0.183686;REVB=0.030471;RO=4;SAF=9;SAR=24;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0717645;STB=0.54235;TYPE=snp;VARB=0.060325;OID=.;OPOS=93945;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:40:41:4:5:33:36:24:9:0:4:27:9:0:5 chr10 94026 . G A 104.93 PASS AO=28;DP=73;FAO=30;FDP=75;FR=.;FRO=45;FSAF=3;FSAR=27;FSRF=5;FSRR=40;FWDB=-0.00978257;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.177;QD=5.59626;RBI=0.0129166;REFB=-0.00585698;REVB=0.00843441;RO=45;SAF=3;SAR=25;SRF=5;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011019;STB=0.517973;TYPE=snp;VARB=0.0137798;OID=.;OPOS=94026;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:75:45:45:28:30:25:3:5:40:27:3:5:40 chr10 94545 . C T 378.53 PASS AO=40;DP=42;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0709556;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=160.759;QD=35.2119;RBI=0.0714717;REFB=-0.0615538;REVB=0.00857299;RO=0;SAF=16;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.513507;TYPE=snp;VARB=0.00068568;OID=.;OPOS=94545;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:42:43:0:1:40:42:24:16:0:0:24:18:1:0 chr10 294953 . A G 474.12 PASS AO=55;DP=57;FAO=53;FDP=55;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0282802;FXX=0.0350816;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.9667;QD=34.4816;RBI=0.0351129;REFB=0.040967;REVB=-0.0208123;RO=2;SAF=31;SAR=24;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0294432;STB=0.51666;TYPE=snp;VARB=-0.00418285;OID=.;OPOS=294953;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:57:55:2:2:55:53:24:31:2:0:24:29:2:0 chr10 323283 . A G 211.89 PASS AO=47;DP=88;FAO=46;FDP=89;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=31;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=-0.0113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.96;QD=9.52296;RBI=0.0113134;REFB=-0.0292999;REVB=0.000551932;RO=40;SAF=16;SAR=31;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0981254;STB=0.572527;TYPE=snp;VARB=0.0176241;OID=.;OPOS=323283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:89:40:43:47:46:31:16:18:22:31:15:20:23 chr10 402317 . C T 76.8 PASS AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=14;FWDB=0.0145012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.691;QD=9.60036;RBI=0.0340859;REFB=-0.0117422;REVB=-0.0308474;RO=15;SAF=7;SAR=9;SRF=2;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.277595;STB=0.665112;TYPE=snp;VARB=0.014405;OID=.;OPOS=402317;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:31:32:15:16:16:16:9:7:2:13:9:7:2:14 chr10 429977 . G A 85.84 PASS AO=22;DP=55;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=-0.000931771;FXX=0.0689536;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.336;QD=6.35869;RBI=0.040133;REFB=-0.0144962;REVB=-0.0401222;RO=30;SAF=5;SAR=17;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247078;STB=0.642721;TYPE=snp;VARB=0.0292725;OID=.;OPOS=429977;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:55:54:30:31:22:23:17:5:13:17:18:5:13:18 chr10 445061 . C T 296.8 PASS AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0299494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.453;QD=37.0998;RBI=0.0685056;REFB=0;REVB=0.0616122;RO=0;SAF=18;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000996273;OID=.;OPOS=445061;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:32:32:0:0:32:32:14:18:0:0:14:18:0:0 chr10 459940 . G A 55.52 PASS AO=11;DP=22;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=4.92439e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.138;QD=10.0938;RBI=0.0319916;REFB=-0.0369321;REVB=0.0319916;RO=11;SAF=3;SAR=8;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0933525;STB=0.554352;TYPE=snp;VARB=0.0155368;OID=.;OPOS=459940;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:22:22:11:11:11:11:8:3:4:7:8:3:4:7 chr10 696237 . G A 412.69 PASS AO=46;DP=48;FAO=46;FDP=48;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0193793;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=219.887;QD=34.391;RBI=0.0249342;REFB=-0.105044;REVB=0.0156893;RO=0;SAF=20;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.518511;TYPE=snp;VARB=0.000586355;OID=.;OPOS=696237;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:48:48:0:2:46:46:26:20:0:0:26:20:0:2 chr10 1060218 . G A 3135.58 PASS AO=329;DP=331;FAO=329;FDP=329;FR=.;FRO=0;FSAF=214;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0248415;FXX=0.00604211;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.737;QD=38.1226;RBI=0.0292107;REFB=-0.031566;REVB=0.0153677;RO=0;SAF=214;SAR=115;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.52143e-05;OID=.;OPOS=1060218;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:331:329:0:0:329:329:115:214:0:0:115:214:0:0 chr10 1061767 . G A 1796.11 PASS AO=187;DP=193;FAO=196;FDP=199;FR=.;FRO=3;FSAF=105;FSAR=91;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0431415;FXX=0.0148508;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.99;QD=36.1028;RBI=0.0435077;REFB=-0.10842;REVB=0.00563319;RO=2;SAF=103;SAR=84;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00915518;STB=0.503065;TYPE=snp;VARB=0.000311025;OID=.;OPOS=1061767;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:193:199:2:3:187:196:84:103:2:0:91:105:1:2 chr10 1066710 . C T 429.77 PASS AO=41;DP=41;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111646;FXX=0.0425441;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.972;QD=38.202;RBI=0.0216358;REFB=0;REVB=0.0185326;RO=0;SAF=26;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.90071e-05;OID=.;OPOS=1066710;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:41:45:0:0:41:45:15:26:0:0:20:25:0:0 chr10 1142208 . T C 1626.12 PASS AO=167;DP=167;FAO=170;FDP=170;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0269615;FXX=0.00584761;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.472;QD=38.2617;RBI=0.0437638;REFB=0;REVB=0.0344724;RO=0;SAF=79;SAR=88;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000106073;OID=.;OPOS=1142208;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:167:170:0:0:167:170:88:79:0:0:88:82:0:0 chr10 1175894 . A G 284.25 PASS AO=71;DP=154;FAO=72;FDP=155;FR=.;FRO=83;FSAF=32;FSAR=40;FSRF=35;FSRR=48;FWDB=-0.103272;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.1384;QD=7.33552;RBI=0.139657;REFB=-0.0169199;REVB=-0.0940159;RO=82;SAF=32;SAR=39;SRF=34;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0353458;STB=0.512369;TYPE=snp;VARB=0.0201387;OID=.;OPOS=1175894;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:155:82:83:71:72:39:32:34:48:40:32:35:48 chr10 1175939 . C T 410.3 PASS AO=92;DP=178;FAO=92;FDP=178;FR=.;FRO=86;FSAF=28;FSAR=64;FSRF=27;FSRR=59;FWDB=-0.010423;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=216.692;QD=9.22017;RBI=0.0168953;REFB=-0.00309038;REVB=0.013297;RO=84;SAF=28;SAR=64;SRF=26;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00531058;STB=0.505455;TYPE=snp;VARB=0.00284305;OID=.;OPOS=1175939;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:178:84:86:92:92:64:28:26:58:64:28:27:59 chr10 1230968 . C T 1157.13 PASS AO=123;DP=125;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0617535;FXX=0.0159987;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.762;QD=37.6302;RBI=0.0642409;REFB=-0.0847505;REVB=0.0177033;RO=1;SAF=38;SAR=85;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0123369;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000452515;OID=.;OPOS=1230968;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:125:123:1:0:123:123:85:38:1:0:85:38:0:0 chr10 1246189 . C T 266.72 PASS AO=58;DP=125;FAO=63;FDP=130;FR=.;FRO=67;FSAF=19;FSAR=44;FSRF=23;FSRR=44;FWDB=0.0423204;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.0723;QD=8.20664;RBI=0.151406;REFB=-0.0282261;REVB=0.145372;RO=67;SAF=19;SAR=39;SRF=23;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170517;STB=0.524992;TYPE=snp;VARB=0.032992;OID=.;OPOS=1246189;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:130:67:67:58:63:39:19:23:44:44:19:23:44 chr10 3143643 . A C 210.68 PASS AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00130194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.703;QD=36.6392;RBI=0.017206;REFB=0;REVB=0.0171567;RO=0;SAF=9;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84921e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000188692;OID=.;OPOS=3143643;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:0:0:23:23:14:9:0:0:14:9:0:0 chr10 3150973 . C T 129.77 PASS AO=38;DP=99;FAO=39;FDP=101;FR=.;FRO=62;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=35;FSRR=27;FWDB=0.0105749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.717;QD=5.13929;RBI=0.0121578;REFB=-0.010649;REVB=0.00599847;RO=61;SAF=20;SAR=18;SRF=34;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0337592;STB=0.53179;TYPE=snp;VARB=0.012604;OID=.;OPOS=3150973;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:101:61:62:38:39:18:20:34:27:19:20:35:27 chr10 3154461 . G A 246.54 PASS AO=58;DP=118;FAO=58;FDP=119;FR=.;FRO=61;FSAF=28;FSAR=30;FSRF=23;FSRR=38;FWDB=0.00770092;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.042;QD=8.28696;RBI=0.00770899;REFB=-0.00595918;REVB=-0.000352654;RO=60;SAF=28;SAR=30;SRF=23;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.091929;STB=0.554437;TYPE=snp;VARB=0.005224;OID=.;OPOS=3154461;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:119:60:61:58:58:30:28:23:37:30:28:23:38 chr10 3155620 . A G 311.24 PASS AO=48;DP=69;FAO=49;FDP=70;FR=.;FRO=21;FSAF=16;FSAR=33;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.029754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.2772;QD=17.7849;RBI=0.0342307;REFB=-0.0658273;REVB=-0.0169245;RO=21;SAF=16;SAR=32;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.502315;TYPE=snp;VARB=0.0230274;OID=.;OPOS=3155620;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:69:70:21:21:48:49:32:16:7:14:33:16:7:14 chr10 3155698 . C T 61.54 PASS AO=16;DP=43;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=20;FWDB=-0.00214331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.068;QD=5.59471;RBI=0.0121652;REFB=-0.00949328;REVB=-0.0119749;RO=27;SAF=2;SAR=14;SRF=7;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.248816;STB=0.658315;TYPE=snp;VARB=0.0362562;OID=.;OPOS=3155698;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:43:44:27:27:16:17:14:2:7:20:15:2:7:20 chr10 3179738 . G A 550.66 PASS AO=121;DP=230;FAO=121;FDP=229;FR=.;FRO=108;FSAF=63;FSAR=58;FSRF=56;FSRR=52;FWDB=0.00805495;FXX=0.00865763;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.097;QD=9.61854;RBI=0.0178063;REFB=-0.0211628;REVB=0.0158802;RO=106;SAF=63;SAR=58;SRF=55;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00153607;STB=0.501012;TYPE=snp;VARB=0.0182639;OID=.;OPOS=3179738;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:230:229:106:108:121:121:58:63:55:51:58:63:56:52 chr10 3180298 . C T 239.05 PASS AO=36;DP=79;FAO=50;FDP=91;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=37;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=-0.0205221;FXX=0.0215031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.819;QD=10.5075;RBI=0.0562722;REFB=-0.0359188;REVB=0.0523967;RO=43;SAF=10;SAR=26;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267645;STB=0.618177;TYPE=snp;VARB=0.0388992;OID=.;OPOS=3180298;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:91:43:41:36:50:26:10:23:20:37:13:20:21 chr10 3180316 . T C 250.43 PASS AO=42;DP=67;FAO=45;FDP=71;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=36;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.00158532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.771;QD=14.109;RBI=0.0505478;REFB=-0.0231278;REVB=0.050523;RO=25;SAF=9;SAR=33;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13464;STB=0.575964;TYPE=snp;VARB=0.00874208;OID=.;OPOS=3180316;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:67:71:25:26:42:45:33:9:9:16:36:9:9:17 chr10 3821327 . A T 86.12 PASS AO=22;DP=58;FAO=24;FDP=60;FR=.;FRO=36;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=26;FWDB=0.00304797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.506;QD=5.7411;RBI=0.010733;REFB=0.00258459;REVB=-0.0102912;RO=36;SAF=4;SAR=18;SRF=10;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15169;STB=0.521721;TYPE=snp;VARB=-0.00363948;OID=.;OPOS=3821327;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:58:60:36:36:22:24:18:4:10:26:18:6:10:26 chr10 4889403 . C T 241.61 PASS AO=58;DP=122;FAO=58;FDP=121;FR=.;FRO=63;FSAF=19;FSAR=39;FSRF=22;FSRR=41;FWDB=0.00490081;FXX=0.00819605;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.1901;QD=7.98704;RBI=0.00650661;REFB=-0.0106121;REVB=-0.00427996;RO=61;SAF=19;SAR=39;SRF=20;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000296979;STB=0.51266;TYPE=snp;VARB=0.0133351;OID=.;OPOS=4889403;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:121:61:63:58:58:39:19:20:41:39:19:22:41 chr10 5019959 . G A 124.8 PASS AO=33;DP=77;FAO=33;FDP=77;FR=.;FRO=44;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=17;FWDB=-0.00820102;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.994;QD=6.48331;RBI=0.0171106;REFB=-0.0184234;REVB=0.0150171;RO=41;SAF=17;SAR=16;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0693685;STB=0.556488;TYPE=snp;VARB=0.0236404;OID=.;OPOS=5019959;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:41:44:33:33:16:17:24:17:16:17:27:17 chr10 5041398 . T C 24.08 PASS AO=4;DP=6;FAO=4;FDP=6;FR=.;FRO=2;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0280264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.9464;QD=16.0537;RBI=0.0457094;REFB=-0.000974028;REVB=0.0361091;RO=2;SAF=1;SAR=3;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.407562;STB=0.748744;TYPE=snp;VARB=0.00238279;OID=.;OPOS=5041398;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:2:2:4:4:3:1:2:0:3:1:2:0 chr10 5046907 . A G 127.31 PASS AO=46;DP=134;FAO=46;FDP=134;FR=.;FRO=88;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=50;FSRR=38;FWDB=-0.00187014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.34;QD=3.80026;RBI=0.0162358;REFB=-0.0130279;REVB=0.0161277;RO=87;SAF=27;SAR=19;SRF=49;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0276974;STB=0.512653;TYPE=snp;VARB=0.036804;OID=.;OPOS=5046907;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:87:88:46:46:19:27:49:38:19:27:50:38 chr10 5046957 . A T 577.08 PASS AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0187928;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=272.493;QD=37.8415;RBI=0.0203432;REFB=0;REVB=0.00778939;RO=0;SAF=40;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.87774e-05;OID=.;OPOS=5046957;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:61:61:0:0:61:61:21:40:0:0:21:40:0:0 chr10 5120157 . G T 412.57 PASS AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.571;QD=37.506;RBI=0.0398439;REFB=0;REVB=0.0339226;RO=0;SAF=19;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000135707;OID=.;OPOS=5120157;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:43:44:0:0:43:44:24:19:0:0:25:19:0:0 chr10 5138607 . G A 458.95 PASS AO=123;DP=278;FAO=124;FDP=279;FR=.;FRO=155;FSAF=75;FSAR=49;FSRF=86;FSRR=69;FWDB=-0.000410403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.849;QD=6.57989;RBI=0.047357;REFB=0.00595084;REVB=0.0473552;RO=154;SAF=75;SAR=48;SRF=85;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0599415;STB=0.528701;TYPE=snp;VARB=-0.00948877;OID=.;OPOS=5138607;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:278:279:154:155:123:124:48:75:85:69:49:75:86:69 chr10 5138747 . A G 661.37 PASS AO=170;DP=363;FAO=170;FDP=364;FR=.;FRO=194;FSAF=46;FSAR=124;FSRF=80;FSRR=114;FWDB=0.00314174;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.6065;QD=7.26782;RBI=0.0663287;REFB=0.0286167;REVB=-0.0662542;RO=192;SAF=46;SAR=124;SRF=79;SRR=113;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157305;STB=0.587976;TYPE=snp;VARB=-0.0311823;OID=.;OPOS=5138747;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:363:364:192:194:170:170:124:46:79:113:124:46:80:114 chr10 5139685 . G A 1531.28 PASS AO=140;DP=140;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0245866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.125;QD=37.8093;RBI=0.0376548;REFB=0;REVB=0.0285199;RO=0;SAF=52;SAR=88;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.60289e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000302207;OID=.;OPOS=5139685;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:140:162:0:0:140:162:88:52:0:0:98:64:0:0 chr10 5149649 . T G 271.07 PASS AO=80;DP=196;FAO=80;FDP=195;FR=.;FRO=115;FSAF=30;FSAR=50;FSRF=73;FSRR=42;FWDB=-0.0250448;FXX=0.00510178;HRUN=4;LEN=1;MLLD=165.084;QD=5.56044;RBI=0.0275529;REFB=-0.011265;REVB=0.0114856;RO=112;SAF=30;SAR=50;SRF=72;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.275456;STB=0.651038;TYPE=snp;VARB=0.00932689;OID=.;OPOS=5149649;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:195:112:115:80:80:50:30:72:40:50:30:73:42 chr10 5149703 . G A 382.11 PASS AO=78;DP=137;FAO=79;FDP=143;FR=.;FRO=64;FSAF=32;FSAR=47;FSRF=21;FSRR=43;FWDB=-0.0109945;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=199.412;QD=10.6885;RBI=0.0112778;REFB=0.00252297;REVB=0.00251206;RO=58;SAF=31;SAR=47;SRF=15;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116772;STB=0.536204;TYPE=snp;VARB=-0.00193102;OID=.;OPOS=5149703;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:143:58:64:78:79:47:31:15:43:47:32:21:43 chr10 5200861 . C A 575.36 PASS AO=115;DP=206;FAO=118;FDP=209;FR=.;FRO=91;FSAF=52;FSAR=66;FSRF=27;FSRR=64;FWDB=0.00943121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.031;QD=11.0117;RBI=0.0100451;REFB=-0.0053704;REVB=-0.00345787;RO=91;SAF=50;SAR=65;SRF=27;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116186;STB=0.564546;TYPE=snp;VARB=0.0043288;OID=.;OPOS=5200861;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:206:209:91:91:115:118:65:50:27:64:66:52:27:64 chr10 5202104 . C T 339.2 PASS AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0158019;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.5208;QD=37.6885;RBI=0.0364739;REFB=0;REVB=-0.0328731;RO=0;SAF=21;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0010818;OID=.;OPOS=5202104;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:36:36:0:0:36:36:15:21:0:0:15:21:0:0 chr10 5202145 . T A 143.36 PASS AO=17;DP=19;FAO=17;FDP=19;FR=.;FRO=2;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0545646;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=104.977;QD=30.1809;RBI=0.0554791;REFB=-0.0469662;REVB=-0.0100316;RO=2;SAF=9;SAR=8;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00567123;STB=0.503102;TYPE=snp;VARB=0.0113626;OID=.;OPOS=5202145;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:19:19:2:2:17:17:8:9:1:1:8:9:1:1 chr10 5203748 . A G 256.14 PASS AO=64;DP=138;FAO=65;FDP=141;FR=.;FRO=76;FSAF=37;FSAR=28;FSRF=28;FSRR=48;FWDB=-0.00152389;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.9759;QD=7.26645;RBI=0.00158721;REFB=-0.0104773;REVB=0.000443837;RO=61;SAF=36;SAR=28;SRF=26;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120635;STB=0.607049;TYPE=snp;VARB=0.00981224;OID=.;OPOS=5203748;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:141:61:76:64:65:28:36:26:35:28:37:28:48 chr10 5203864 . C T 448.74 PASS AO=96;DP=178;FAO=96;FDP=178;FR=.;FRO=82;FSAF=42;FSAR=54;FSRF=46;FSRR=36;FWDB=-0.000972374;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=318.619;QD=10.084;RBI=0.00208134;REFB=0.000371921;REVB=-0.00184024;RO=82;SAF=42;SAR=54;SRF=46;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104238;STB=0.55695;TYPE=snp;VARB=-0.000345463;OID=.;OPOS=5203864;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:178:82:82:96:96:54:42:46:36:54:42:46:36 chr10 5204928 . C T 589.84 PASS AO=127;DP=236;FAO=127;FDP=236;FR=.;FRO=109;FSAF=53;FSAR=74;FSRF=59;FSRR=50;FWDB=0.0235333;FXX=0.00840301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.7612;QD=9.9972;RBI=0.0238357;REFB=0.0065657;REVB=-0.00378428;RO=109;SAF=53;SAR=74;SRF=59;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105801;STB=0.55773;TYPE=snp;VARB=-0.00570569;OID=.;OPOS=5204928;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:236:236:109:109:127:127:74:53:59:50:74:53:59:50 chr10 5242164 . A G 835.28 PASS AO=187;DP=359;FAO=187;FDP=357;FR=.;FRO=170;FSAF=86;FSAR=101;FSRF=70;FSRR=100;FWDB=-0.00136849;FXX=0.00557088;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.64;QD=9.35887;RBI=0.00392846;REFB=-0.017594;REVB=-0.0036824;RO=169;SAF=86;SAR=101;SRF=69;SRR=100;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.04541;STB=0.52315;TYPE=snp;VARB=0.0173352;OID=.;OPOS=5242164;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:359:357:169:170:187:187:101:86:69:100:101:86:70:100 chr10 5244441 . A G 184.99 PASS AO=48;DP=109;FAO=48;FDP=108;FR=.;FRO=60;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=31;FSRR=29;FWDB=0.00340713;FXX=0.00917347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.769;QD=6.85161;RBI=0.00805498;REFB=-0.0103837;REVB=-0.00729892;RO=59;SAF=18;SAR=30;SRF=31;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151303;STB=0.580535;TYPE=snp;VARB=0.0150231;OID=.;OPOS=5244441;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:108:59:60:48:48:30:18:31:28:30:18:31:29 chr10 5246584 . C A 468.16 PASS AO=95;DP=168;FAO=95;FDP=168;FR=.;FRO=73;FSAF=38;FSAR=57;FSRF=33;FSRR=40;FWDB=0.0272314;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.492;QD=11.1467;RBI=0.0287241;REFB=0.00569952;REVB=-0.00913932;RO=73;SAF=38;SAR=57;SRF=33;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.042843;STB=0.523337;TYPE=snp;VARB=-0.00430023;OID=.;OPOS=5246584;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:73:73:95:95:57:38:33:40:57:38:33:40 chr10 5246626 . G A 263.11 PASS AO=63;DP=131;FAO=63;FDP=131;FR=.;FRO=68;FSAF=29;FSAR=34;FSRF=35;FSRR=33;FWDB=-0.0218511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.521;QD=8.03381;RBI=0.0221171;REFB=-0.00130291;REVB=0.00342021;RO=68;SAF=29;SAR=34;SRF=35;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0510721;STB=0.528275;TYPE=snp;VARB=0.00134117;OID=.;OPOS=5246626;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:68:68:63:63:34:29:35:33:34:29:35:33 chr10 5255025 . A G 1105.47 PASS AO=142;DP=167;FAO=144;FDP=169;FR=.;FRO=25;FSAF=58;FSAR=86;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.0197084;FXX=0.0174408;HRUN=3;LEN=1;MLLD=119.682;QD=26.165;RBI=0.0497856;REFB=-0.0747581;REVB=-0.0457186;RO=21;SAF=58;SAR=84;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00506536;STB=0.517894;TYPE=snp;VARB=0.00194542;OID=.;OPOS=5255025;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:167:169:21:25:142:144:84:58:9:12:86:58:13:12 chr10 5415954 . A G 712.09 PASS AO=74;DP=74;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0443857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.684;QD=37.9783;RBI=0.0482946;REFB=0;REVB=0.0190337;RO=0;SAF=26;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.16077e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.20233e-05;OID=.;OPOS=5415954;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:74:75:0:0:74:75:48:26:0:0:49:26:0:0 chr10 5436097 . C T 272.12 PASS AO=64;DP=127;FAO=64;FDP=131;FR=.;FRO=67;FSAF=24;FSAR=40;FSRF=34;FSRR=33;FWDB=0.0264078;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.708;QD=8.30903;RBI=0.0292714;REFB=-0.00852354;REVB=-0.0126271;RO=62;SAF=24;SAR=40;SRF=34;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157742;STB=0.569722;TYPE=snp;VARB=0.00984568;OID=.;OPOS=5436097;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:131:62:67:64:64:40:24:34:28:40:24:34:33 chr10 5437365 . A G 215.78 PASS AO=46;DP=87;FAO=46;FDP=87;FR=.;FRO=41;FSAF=29;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=0.0223531;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.015;QD=9.92095;RBI=0.0303124;REFB=-0.00777253;REVB=-0.0204739;RO=41;SAF=29;SAR=17;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0188391;STB=0.510395;TYPE=snp;VARB=0.00709784;OID=.;OPOS=5437365;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:41:41:46:46:17:29:25:16:17:29:25:16 chr10 5437414 . C G 134.82 PASS AO=35;DP=84;FAO=37;FDP=86;FR=.;FRO=49;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=28;FSRR=21;FWDB=-0.0152998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.025;QD=6.27048;RBI=0.0304572;REFB=-0.000369324;REVB=0.0263354;RO=48;SAF=22;SAR=13;SRF=28;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0487757;STB=0.513611;TYPE=snp;VARB=0.00118264;OID=.;OPOS=5437414;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:86:48:49:35:37:13:22:28:20:15:22:28:21 chr10 5471200 . C T 1805.07 PASS AO=187;DP=188;FAO=188;FDP=188;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0322779;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.3076;QD=38.4057;RBI=0.0451981;REFB=0;REVB=-0.0316387;RO=0;SAF=81;SAR=106;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.59877e-06;OID=.;OPOS=5471200;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:188:188:0:0:187:188:106:81:0:0:107:81:0:0 chr10 5495218 . T C 1289.32 PASS AO=136;DP=137;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00346562;FXX=0.00724585;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.222;QD=37.6444;RBI=0.00629172;REFB=-0.0446288;REVB=0.00525121;RO=1;SAF=67;SAR=69;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00684004;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.49566e-05;OID=.;OPOS=5495218;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:137:137:1:0:136:137:69:67:0:1:69:68:0:0 chr10 5499705 . A T 1892.89 PASS AO=147;DP=305;FAO=202;FDP=202;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=89;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0578828;FXX=0.0560721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.146;QD=37.483;RBI=0.192942;REFB=0;REVB=0.184055;RO=24;SAF=49;SAR=98;SRF=18;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118912;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00143132;OID=.;OPOS=5499705;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:286:202:24:0:147:202:98:49:18:6:113:89:0:0 chr10 5567366 . G A 771.6 PASS AO=79;DP=79;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0192978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.6911;QD=38.5798;RBI=0.0573982;REFB=0;REVB=0.0540569;RO=0;SAF=31;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000628168;OID=.;OPOS=5567366;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:79:80:0:0:79:80:48:31:0:0:49:31:0:0 chr10 5567695 . G A 735.2 PASS AO=77;DP=81;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0478282;FXX=0.0493766;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.982;QD=38.1923;RBI=0.0642199;REFB=0;REVB=0.0428563;RO=0;SAF=52;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000244329;OID=.;OPOS=5567695;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:81:77:0:0:77:77:25:52:0:0:25:52:0:0 chr10 5567967 . G T 744.92 PASS AO=79;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0236939;FXX=0.0123442;HRUN=3;LEN=1;MLLD=285.692;QD=37.2462;RBI=0.0269204;REFB=-0.114955;REVB=0.012779;RO=1;SAF=35;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133333;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000165062;OID=.;OPOS=5567967;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:80:80:1:0:79:80:44:35:1:0:45:35:0:0 chr10 5682070 . C T 197.3 PASS AO=47;DP=98;FAO=47;FDP=98;FR=.;FRO=51;FSAF=13;FSAR=34;FSRF=22;FSRR=29;FWDB=-0.0134159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.0507;QD=8.05307;RBI=0.0282642;REFB=-0.0334956;REVB=-0.0248773;RO=51;SAF=13;SAR=34;SRF=22;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165185;STB=0.592293;TYPE=snp;VARB=0.0305958;OID=.;OPOS=5682070;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:51:51:47:47:34:13:22:29:34:13:22:29 chr10 5781628 . T G 308.51 PASS AO=82;DP=182;FAO=81;FDP=180;FR=.;FRO=99;FSAF=42;FSAR=39;FSRF=47;FSRR=52;FWDB=0.0281587;FXX=0.0109884;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6614;QD=6.85571;RBI=0.0377964;REFB=0.0120917;REVB=-0.0252122;RO=100;SAF=42;SAR=40;SRF=47;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0417226;STB=0.524058;TYPE=snp;VARB=-0.0193221;OID=.;OPOS=5781628;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:180:100:99:82:81:40:42:47:53:39:42:47:52 chr10 5781969 . A T 310.8 PASS AO=73;DP=148;FAO=73;FDP=148;FR=.;FRO=75;FSAF=39;FSAR=34;FSRF=24;FSRR=51;FWDB=0.00694265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.5818;QD=8.39991;RBI=0.00981271;REFB=-0.0257756;REVB=0.00693462;RO=75;SAF=39;SAR=34;SRF=24;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195406;STB=0.607448;TYPE=snp;VARB=0.0232675;OID=.;OPOS=5781969;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:75:75:73:73:34:39:24:51:34:39:24:51 chr10 5784151 . A G 277.57 PASS AO=67;DP=140;FAO=67;FDP=140;FR=.;FRO=73;FSAF=23;FSAR=44;FSRF=34;FSRR=39;FWDB=-0.0243225;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=85.7136;QD=7.93067;RBI=0.0285547;REFB=-0.00906972;REVB=-0.0149596;RO=73;SAF=23;SAR=44;SRF=34;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122189;STB=0.567785;TYPE=snp;VARB=0.0142411;OID=.;OPOS=5784151;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:73:73:67:67:44:23:34:39:44:23:34:39 chr10 5788608 . G C 86.31 PASS AO=23;DP=57;FAO=24;FDP=61;FR=.;FRO=37;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=-0.0335676;FXX=0.0468677;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.541;QD=5.65972;RBI=0.0381617;REFB=-0.020418;REVB=0.0181529;RO=34;SAF=6;SAR=17;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.29989;STB=0.660408;TYPE=snp;VARB=0.0382576;OID=.;OPOS=5788608;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:57:61:34:37:23:24:17:6:18:16:18:6:18:19 chr10 5790420 . T C 489.21 PASS AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210435;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.271;QD=37.6319;RBI=0.0273103;REFB=0;REVB=0.0174076;RO=0;SAF=21;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.93989e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000314745;OID=.;OPOS=5790420;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:53:52:0:0:52:52:31:21:0:0:31:21:0:0 chr10 5799613 . A G 742.35 PASS AO=187;DP=387;FAO=185;FDP=386;FR=.;FRO=201;FSAF=83;FSAR=102;FSRF=104;FSRR=97;FWDB=0.00448853;FXX=0.00258391;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4582;QD=7.69273;RBI=0.012278;REFB=0.0121096;REVB=-0.0114282;RO=200;SAF=84;SAR=103;SRF=103;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0621151;STB=0.535918;TYPE=snp;VARB=-0.0131935;OID=.;OPOS=5799613;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:387:386:200:201:187:185:103:84:103:97:102:83:104:97 chr10 5804531 . G A 344.24 PASS AO=102;DP=247;FAO=103;FDP=252;FR=.;FRO=149;FSAF=47;FSAR=56;FSRF=53;FSRR=96;FWDB=0.00360063;FXX=0.00787371;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.42;QD=5.46414;RBI=0.00609176;REFB=-0.00460785;REVB=0.00491375;RO=142;SAF=46;SAR=56;SRF=52;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0902879;STB=0.560566;TYPE=snp;VARB=0.00666052;OID=.;OPOS=5804531;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:247:252:142:149:102:103:56:46:52:90:56:47:53:96 chr10 5808086 . G A 473.26 PASS AO=112;DP=222;FAO=112;FDP=226;FR=.;FRO=114;FSAF=53;FSAR=59;FSRF=63;FSRR=51;FWDB=0.000196581;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.516;QD=8.37632;RBI=0.00259578;REFB=-0.0168827;REVB=-0.00258832;RO=109;SAF=53;SAR=59;SRF=61;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0775941;STB=0.539996;TYPE=snp;VARB=0.018961;OID=.;OPOS=5808086;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:226:109:114:112:112:59:53:61:48:59:53:63:51 chr10 5853817 . G C 254.96 PASS AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.594;QD=37.772;RBI=0.0191896;REFB=0;REVB=-0.00993487;RO=0;SAF=12;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.08263e-05;OID=.;OPOS=5853817;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:27:27:0:0:27:27:15:12:0:0:15:12:0:0 chr10 5895755 . G T 182.52 PASS AO=50;DP=117;FAO=50;FDP=117;FR=.;FRO=67;FSAF=18;FSAR=32;FSRF=16;FSRR=51;FWDB=0.0153202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.295;QD=6.24015;RBI=0.0242512;REFB=-0.00560174;REVB=-0.0187993;RO=67;SAF=18;SAR=32;SRF=16;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14108;STB=0.578592;TYPE=snp;VARB=0.0442971;OID=.;OPOS=5895755;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:67:67:50:50:32:18:16:51:32:18:16:51 chr10 5895756 . C A 182.51 PASS AO=50;DP=117;FAO=50;FDP=117;FR=.;FRO=67;FSAF=18;FSAR=32;FSRF=16;FSRR=51;FWDB=-0.00125708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.089;QD=6.23978;RBI=0.0341742;REFB=-0.0131448;REVB=-0.0341511;RO=67;SAF=18;SAR=32;SRF=16;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14108;STB=0.578592;TYPE=snp;VARB=0.0557337;OID=.;OPOS=5895756;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:67:67:50:50:32:18:16:51:32:18:16:51 chr10 5920120 . CT C,CC 258.3 PASS AO=7,20;DP=28;FAO=2,26;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=2,24;FSAR=0,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00338425,0.0102076;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=142.55,155.707;QD=36.9;RBI=0.0996225,0.103893;REFB=0,0;REVB=0.099565,0.10339;RO=0;SAF=5,20;SAR=2,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.27427e-08,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.00226889,0.00120829;OID=.,.;OPOS=5920121,5920121;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:7,20:28:2,26:28:0:2,24:0,2:0:0:3:0:5,20:2,0:0:0 chr10 5925971 . C A 489.42 PASS AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0202073;FXX=0.0188644;HRUN=3;LEN=1;MLLD=156.735;QD=37.6478;RBI=0.0343515;REFB=0;REVB=0.0277793;RO=0;SAF=31;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.13361e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000166679;OID=.;OPOS=5925971;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:51:52:0:0:51:52:20:31:0:0:21:31:0:0 chr10 5931068 . G A 69.15 PASS AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.4392;QD=30.7355;RBI=0.282527;REFB=-0.194451;REVB=0.282527;RO=6;SAF=0;SAR=8;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.773302;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0381128;OID=.;OPOS=5931068;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:14:9:6:1:8:8:8:0:2:4:8:0:0:1 chr10 5936425 . C G 242.18 PASS AO=68;DP=162;FAO=68;FDP=161;FR=.;FRO=93;FSAF=26;FSAR=42;FSRF=49;FSRR=44;FWDB=-0.0252564;FXX=0.00617246;HRUN=3;LEN=1;MLLD=197.771;QD=6.01694;RBI=0.0259407;REFB=-0.0128798;REVB=-0.00591917;RO=87;SAF=26;SAR=42;SRF=45;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138277;STB=0.584824;TYPE=snp;VARB=0.0161866;OID=.;OPOS=5936425;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:161:87:93:68:68:42:26:45:42:42:26:49:44 chr10 6002400 . G C 472.27 PASS AO=112;DP=226;FAO=112;FDP=226;FR=.;FRO=114;FSAF=63;FSAR=49;FSRF=67;FSRR=47;FWDB=0.0131169;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.565;QD=8.35868;RBI=0.0163354;REFB=-0.0150652;REVB=0.00973601;RO=112;SAF=63;SAR=49;SRF=65;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165594;STB=0.512963;TYPE=snp;VARB=0.0134218;OID=.;OPOS=6002400;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:226:226:112:114:112:112:49:63:65:47:49:63:67:47 chr10 6191735 . T C 1295.87 PASS AO=133;DP=134;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00508372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.8499;QD=38.1139;RBI=0.0544093;REFB=0;REVB=0.0541713;RO=0;SAF=51;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000153854;OID=.;OPOS=6191735;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:134:136:0:0:133:136:82:51:0:0:85:51:0:0 chr10 6265906 . C T 449.98 PASS AO=87;DP=149;FAO=87;FDP=148;FR=.;FRO=61;FSAF=41;FSAR=46;FSRF=28;FSRR=33;FWDB=0.00190297;FXX=0.0198662;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.87;QD=12.1617;RBI=0.0223373;REFB=-0.00486905;REVB=0.0222561;RO=60;SAF=41;SAR=46;SRF=28;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0034677;STB=0.505067;TYPE=snp;VARB=0.00358019;OID=.;OPOS=6265906;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:148:60:61:87:87:46:41:28:32:46:41:28:33 chr10 6287695 . G A 262.8 PASS AO=23;DP=24;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0483728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.496;QD=37.5432;RBI=0.0639263;REFB=0;REVB=0.0417929;RO=0;SAF=13;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000374235;OID=.;OPOS=6287695;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:24:28:0:0:23:28:10:13:0:0:12:16:0:0 chr10 6392848 . G A 980.57 PASS AO=102;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00402593;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.9;QD=38.0805;RBI=0.0111768;REFB=0;REVB=0.0104265;RO=1;SAF=61;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114312;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.03178e-05;OID=.;OPOS=6392848;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:103:103:1:0:102:103:41:61:0:1:43:60:0:0 chr10 6393009 . A G 1002.91 PASS AO=104;DP=104;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0125814;FXX=0.00943307;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.6025;QD=38.2061;RBI=0.0456966;REFB=0;REVB=-0.0439305;RO=0;SAF=34;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000202307;OID=.;OPOS=6393009;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:104:105:0:0:104:105:70:34:0:0:70:35:0:0 chr10 6393260 . C G 763.54 PASS AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0254286;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.155;QD=38.6603;RBI=0.037861;REFB=0;REVB=0.0280508;RO=0;SAF=48;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000312255;OID=.;OPOS=6393260;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:80:79:0:0:79:79:31:48:0:0:31:48:0:0 chr10 6393706 . ACAGG A 214.99 PASS AO=10;DP=37;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0345869;FXX=0.172354;HRUN=1;LEN=4;MLLD=128.081;QD=35.8315;RBI=0.0362001;REFB=0;REVB=-0.0106861;RO=24;SAF=6;SAR=4;SRF=7;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.34352;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.000239369;OID=.;OPOS=6393707;OREF=CAGG;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:10:35:24:24:0:8:16:0:0:10:24:6:4:7:17 chr10 6527143 . G A 1253.49 PASS AO=135;DP=139;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00216866;FXX=0.0357117;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.311;QD=37.1405;RBI=0.0129634;REFB=-0.0374779;REVB=0.0127808;RO=3;SAF=96;SAR=39;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0188249;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.04839e-05;OID=.;OPOS=6527143;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:139:135:3:0:135:135:39:96:1:2:39:96:0:0 chr10 6553071 . T C 499.16 PASS AO=133;DP=337;FAO=148;FDP=353;FR=.;FRO=205;FSAF=57;FSAR=91;FSRF=72;FSRR=133;FWDB=0.00158877;FXX=0.0112042;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.248;QD=5.65626;RBI=0.00716398;REFB=-0.00719286;REVB=0.00698558;RO=203;SAF=44;SAR=89;SRF=70;SRR=133;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0169214;STB=0.520991;TYPE=snp;VARB=0.00911259;OID=.;OPOS=6553071;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:337:353:203:205:133:148:89:44:70:133:91:57:72:133 chr10 7285632 . A G 288 PASS AO=62;DP=118;FAO=62;FDP=117;FR=.;FRO=55;FSAF=35;FSAR=27;FSRF=32;FSRR=23;FWDB=0.0603165;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.0448;QD=9.84617;RBI=0.0616782;REFB=-0.0143713;REVB=0.0128885;RO=55;SAF=35;SAR=27;SRF=32;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0150889;STB=0.508286;TYPE=snp;VARB=0.0148286;OID=.;OPOS=7285632;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:117:55:55:62:62:27:35:32:23:27:35:32:23 chr10 7528721 . A C 473.16 PASS AO=119;DP=252;FAO=119;FDP=253;FR=.;FRO=134;FSAF=65;FSAR=54;FSRF=45;FSRR=89;FWDB=-0.00991741;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.141;QD=7.48079;RBI=0.0272606;REFB=-0.0207528;REVB=0.0253926;RO=132;SAF=65;SAR=54;SRF=45;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194085;STB=0.61009;TYPE=snp;VARB=0.0259959;OID=.;OPOS=7528721;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:252:253:132:134:119:119:54:65:45:87:54:65:45:89 chr10 7528738 . G A 2314.31 PASS AO=241;DP=247;FAO=242;FDP=242;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=144;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00642771;FXX=0.0202421;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.1588;QD=38.2531;RBI=0.0289962;REFB=0;REVB=0.0282748;RO=1;SAF=98;SAR=143;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00332154;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.26688e-05;OID=.;OPOS=7528738;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:247:242:1:0:241:242:143:98:0:1:144:98:0:0 chr10 7601829 . T G 20.36 PASS AO=9;DP=45;FAO=11;FDP=51;FR=.;FRO=40;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=25;FSRR=15;FWDB=0.00356135;FXX=0;HRUN=9;LEN=1;MLLD=198.135;QD=1.59679;RBI=0.00599693;REFB=0.00238266;REVB=-0.00482494;RO=35;SAF=2;SAR=7;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.450188;STB=0.697255;TYPE=snp;VARB=-0.00545716;OID=.;OPOS=7601829;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:45:51:35:40:9:11:7:2:21:14:7:4:25:15 chr10 7605067 . C T 908.91 PASS AO=108;DP=120;FAO=109;FDP=120;FR=.;FRO=11;FSAF=35;FSAR=74;FSRF=10;FSRR=1;FWDB=0.0247278;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=139.092;QD=30.297;RBI=0.0637511;REFB=-0.0118043;REVB=0.05876;RO=11;SAF=35;SAR=73;SRF=10;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111677;STB=0.559183;TYPE=snp;VARB=0.000306287;OID=.;OPOS=7605067;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:120:120:11:11:108:109:73:35:10:1:74:35:10:1 chr10 7605077 . TC T 955.97 PASS AO=121;DP=131;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.100056;FXX=0.0396794;HRUN=2;LEN=1;MLLD=30.1114;QD=31.6025;RBI=0.107612;REFB=0;REVB=-0.0396123;RO=0;SAF=41;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.213368;SSEP=0;SSSB=3.20281e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00086568;OID=.;OPOS=7605078;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:121:125:121:121:0:41:80:0:0:84:0:41:80:0:0 chr10 7605101 . A G 1434.77 PASS AO=155;DP=160;FAO=159;FDP=164;FR=.;FRO=5;FSAF=57;FSAR=102;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0834889;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.5286;QD=34.9943;RBI=0.115719;REFB=0.0375814;REVB=-0.0801283;RO=4;SAF=54;SAR=101;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00519162;STB=0.501375;TYPE=snp;VARB=-0.00371322;OID=.;OPOS=7605101;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:160:164:4:5:155:159:101:54:1:3:102:57:2:3 chr10 7621771 . A G 58.21 PASS AO=17;DP=47;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.00763364;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.9237;QD=5.06201;RBI=0.0318285;REFB=-0.0127805;REVB=-0.0308995;RO=29;SAF=8;SAR=9;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0872883;STB=0.550961;TYPE=snp;VARB=0.0235713;OID=.;OPOS=7621771;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:47:46:29:29:17:17:9:8:16:13:9:8:16:13 chr10 7622009 . G A 38.37 PASS AO=14;DP=48;FAO=14;FDP=47;FR=.;FRO=33;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=28;FWDB=0.0798629;FXX=0.040808;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.9314;QD=3.26552;RBI=0.0839553;REFB=-0.016683;REVB=0.0258923;RO=32;SAF=1;SAR=13;SRF=5;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.256557;STB=0.655188;TYPE=snp;VARB=0.039993;OID=.;OPOS=7622009;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:48:47:32:33:14:14:13:1:5:27:13:1:5:28 chr10 7763661 . A G 1024.71 PASS AO=106;DP=106;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0340242;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.12;QD=38.307;RBI=0.0383215;REFB=0;REVB=0.017632;RO=0;SAF=63;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.18935e-05;OID=.;OPOS=7763661;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:106:107:0:0:106:107:43:63:0:0:43:64:0:0 chr10 7772035 . A G 654.29 PASS AO=141;DP=262;FAO=141;FDP=261;FR=.;FRO=120;FSAF=82;FSAR=59;FSRF=36;FSRR=84;FWDB=0.0446157;FXX=0.00381665;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.662;QD=10.0275;RBI=0.044748;REFB=-0.0153773;REVB=0.00343788;RO=118;SAF=82;SAR=59;SRF=36;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228379;STB=0.627444;TYPE=snp;VARB=0.0137347;OID=.;OPOS=7772035;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:262:261:118:120:141:141:59:82:36:82:59:82:36:84 chr10 7774358 . C G 333.9 PASS AO=88;DP=198;FAO=88;FDP=196;FR=.;FRO=108;FSAF=46;FSAR=42;FSRF=65;FSRR=43;FWDB=-0.014634;FXX=0.0344811;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.065;QD=6.81437;RBI=0.0157639;REFB=-0.0330265;REVB=0.00586066;RO=97;SAF=46;SAR=42;SRF=56;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0520872;STB=0.543854;TYPE=snp;VARB=0.0266522;OID=.;OPOS=7774358;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:196:97:108:88:88:42:46:56:41:42:46:65:43 chr10 7797903 . C CAACT 861.61 PASS AO=95;DP=106;FAO=95;FDP=98;FR=.;FRO=3;FSAF=52;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.00293573;FXX=0.0754646;HRUN=2;LEN=4;MLLD=259.113;QD=35.1676;RBI=0.00956666;REFB=-0.0301082;REVB=0.00910508;RO=4;SAF=52;SAR=43;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0420861;STB=0.51685;TYPE=ins;VARB=1.82231e-05;OID=.;OPOS=7797904;OREF=-;OALT=AACT;OMAPALT=CAACT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:95:106:95:98:3:52:43:0:3:23:4:52:43:0:4 chr10 7808086 . T C 188.86 PASS AO=50;DP=117;FAO=51;FDP=118;FR=.;FRO=67;FSAF=31;FSAR=20;FSRF=35;FSRR=32;FWDB=-0.00698348;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2035;QD=6.4021;RBI=0.00733478;REFB=0.0161994;REVB=0.00224277;RO=67;SAF=31;SAR=19;SRF=35;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102578;STB=0.549776;TYPE=snp;VARB=-0.025707;OID=.;OPOS=7808086;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:118:67:67:50:51:19:31:35:32:20:31:35:32 chr10 8006798 . A G 515.82 PASS AO=107;DP=193;FAO=107;FDP=192;FR=.;FRO=85;FSAF=61;FSAR=46;FSRF=44;FSRR=41;FWDB=0.0201112;FXX=0.00518108;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.052;QD=10.7462;RBI=0.0208215;REFB=-0.0180412;REVB=0.00539199;RO=84;SAF=61;SAR=46;SRF=44;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0379067;STB=0.523523;TYPE=snp;VARB=0.0113962;OID=.;OPOS=8006798;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:192:84:85:107:107:46:61:44:40:46:61:44:41 chr10 8007559 . G C 49.73 PASS AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=17;FWDB=-0.0403413;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.27;QD=6.85896;RBI=0.0437604;REFB=-0.0125573;REVB=0.0169573;RO=17;SAF=2;SAR=10;SRF=0;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.415616;STB=0.729496;TYPE=snp;VARB=0.0918711;OID=.;OPOS=8007559;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:29:29:17:17:12:12:10:2:0:17:10:2:0:17 chr10 8007560 . T C 49.59 PASS AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=17;FWDB=-0.0988977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.537;QD=6.84022;RBI=0.0995811;REFB=-0.0283926;REVB=0.0116462;RO=17;SAF=2;SAR=10;SRF=0;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.415616;STB=0.729496;TYPE=snp;VARB=0.0137001;OID=.;OPOS=8007560;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:29:29:17:17:12:12:10:2:0:17:10:2:0:17 chr10 8100647 . C T 244.34 PASS AO=47;DP=81;FAO=47;FDP=81;FR=.;FRO=34;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.0243106;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=201.288;QD=12.066;RBI=0.0264403;REFB=-0.0452292;REVB=0.0103964;RO=33;SAF=20;SAR=27;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0222772;STB=0.5067;TYPE=snp;VARB=0.0297184;OID=.;OPOS=8100647;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:33:34:47:47:27:20:15:18:27:20:15:19 chr10 11299735 . A T 591.06 PASS AO=105;DP=181;FAO=113;FDP=189;FR=.;FRO=76;FSAF=69;FSAR=44;FSRF=42;FSRR=34;FWDB=0.00472335;FXX=0.00526288;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.634;QD=12.5093;RBI=0.0243475;REFB=-0.0225205;REVB=0.0238849;RO=75;SAF=66;SAR=39;SRF=42;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0554324;STB=0.524251;TYPE=snp;VARB=0.0131511;OID=.;OPOS=11299735;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:189:75:76:105:113:39:66:42:33:44:69:42:34 chr10 11356160 . C T 451.63 PASS AO=113;DP=258;FAO=116;FDP=252;FR=.;FRO=136;FSAF=49;FSAR=67;FSRF=64;FSRR=72;FWDB=-0.00922633;FXX=0.0344814;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.683;QD=7.16865;RBI=0.0291687;REFB=-0.00235921;REVB=0.027671;RO=134;SAF=47;SAR=66;SRF=64;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0614852;STB=0.526417;TYPE=snp;VARB=0.00197317;OID=.;OPOS=11356160;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:258:252:134:136:113:116:66:47:64:70:67:49:64:72 chr10 11373418 . A ATC 544.08 PASS AO=98;DP=175;FAO=102;FDP=166;FR=.;FRO=64;FSAF=38;FSAR=64;FSRF=29;FSRR=35;FWDB=0.00987212;FXX=0.056815;HRUN=1;LEN=2;MLLD=194.54;QD=13.1104;RBI=0.00991978;REFB=-0.00100359;REVB=0.000971189;RO=65;SAF=37;SAR=61;SRF=30;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0645494;STB=0.532664;TYPE=ins;VARB=0.000537874;OID=.;OPOS=11373419;OREF=-;OALT=TC;OMAPALT=ATC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:98:175:102:166:64:38:64:29:35:99:65:37:61:30:35 chr10 11373420 . G C 65.71 PASS AO=39;DP=178;FAO=39;FDP=157;FR=.;FRO=118;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=45;FSRR=73;FWDB=-0.0139161;FXX=0.117971;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.4779;QD=1.67421;RBI=0.0214638;REFB=-0.0154467;REVB=-0.0163412;RO=115;SAF=19;SAR=20;SRF=42;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153526;STB=0.579875;TYPE=snp;VARB=0.0141802;OID=.;OPOS=11373420;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:178:157:115:118:39:39:20:19:42:73:20:19:45:73 chr10 11502634 . A C 27.95 PASS AO=18;DP=85;FAO=18;FDP=84;FR=.;FRO=66;FSAF=16;FSAR=2;FSRF=30;FSRR=36;FWDB=0.0480295;FXX=0.0454494;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.1922;QD=1.33114;RBI=0.0566942;REFB=-0.0112583;REVB=-0.0301231;RO=64;SAF=16;SAR=2;SRF=29;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.579544;STB=0.868133;TYPE=snp;VARB=0.0684723;OID=.;OPOS=11502634;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:85:84:64:66:18:18:2:16:29:35:2:16:30:36 chr10 11502640 . A G 13.5 PASS AO=19;DP=123;FAO=19;FDP=123;FR=.;FRO=104;FSAF=17;FSAR=2;FSRF=48;FSRR=56;FWDB=-0.00741902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.0481;QD=0.439121;RBI=0.0235306;REFB=-0.0128608;REVB=-0.0223304;RO=104;SAF=17;SAR=2;SRF=48;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.567394;STB=0.883091;TYPE=snp;VARB=0.103552;OID=.;OPOS=11502640;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:123:123:104:104:19:19:2:17:48:56:2:17:48:56 chr10 11502653 . TA T 20.59 PASS AO=49;DP=215;FAO=45;FDP=178;FR=.;FRO=133;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=68;FSRR=65;FWDB=-0.347033;FXX=0.156391;HRUN=5;LEN=1;MLLD=8.78335;QD=0.462678;RBI=0.355721;REFB=-0.104502;REVB=-0.0781405;RO=106;SAF=22;SAR=27;SRF=44;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0405912;STB=0.600813;TYPE=del;VARB=-0.142332;OID=.;OPOS=11502654;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:49:198:45:178:133:17:28:68:65:20:106:22:27:44:62 chr10 11504313 . C T 1174.43 PASS AO=123;DP=123;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.9683;QD=37.8848;RBI=0.0212578;REFB=0;REVB=0.0123537;RO=0;SAF=78;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000670452;OID=.;OPOS=11504313;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:123:124:0:0:123:124:45:78:0:0:45:79:0:0 chr10 11505051 . GC G 314.88 PASS AO=41;DP=56;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.083151;FXX=0.059988;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.5102;QD=26.7982;RBI=0.0932209;REFB=0;REVB=-0.042143;RO=0;SAF=9;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.356912;SSEP=0;SSSB=-4.40541e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.00384145;OID=.;OPOS=11505052;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:41:48:47:47:0:12:35:0:0:29:0:9:32:0:0 chr10 11789382 . G A 1266.54 PASS AO=133;DP=133;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0231475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8146;QD=38.0915;RBI=0.044004;REFB=0;REVB=-0.0374239;RO=0;SAF=75;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000326075;OID=.;OPOS=11789382;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:133:133:0:0:133:133:58:75:0:0:58:75:0:0 chr10 11789405 . G A 1440.19 PASS AO=147;DP=147;FAO=151;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0987685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.827;QD=38.1508;RBI=0.100012;REFB=0;REVB=0.0157228;RO=0;SAF=77;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000178113;OID=.;OPOS=11789405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:147:151:0:0:147:151:70:77:0:0:70:81:0:0 chr10 11797436 . T C 583.26 PASS AO=65;DP=70;FAO=67;FDP=70;FR=.;FRO=3;FSAF=27;FSAR=40;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0264394;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.6155;QD=33.3289;RBI=0.0489865;REFB=-0.229791;REVB=-0.0412388;RO=5;SAF=25;SAR=40;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0581782;STB=0.511686;TYPE=snp;VARB=0.0165833;OID=.;OPOS=11797436;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:70:70:5:3:65:67:40:25:4:1:40:27:2:1 chr10 11797467 . G A 630.11 PASS AO=68;DP=71;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014213;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.767;QD=36.0062;RBI=0.0923488;REFB=0;REVB=0.0912485;RO=0;SAF=27;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.6787e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000572773;OID=.;OPOS=11797467;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:71:70:0:0:68:70:41:27:0:0:43:27:0:0 chr10 11805339 . C T 616.28 PASS AO=61;DP=61;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0772656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.088;QD=37.9246;RBI=0.0785494;REFB=0;REVB=0.0141435;RO=0;SAF=14;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.92147e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000266939;OID=.;OPOS=11805339;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:61:65:0:0:61:65:47:14:0:0:48:17:0:0 chr10 11805354 . A G 577.07 PASS AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0352446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.292;QD=37.8404;RBI=0.0356469;REFB=0;REVB=-0.00534039;RO=0;SAF=17;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.89926e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000178088;OID=.;OPOS=11805354;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:61:61:0:0:61:61:44:17:0:0:44:17:0:0 chr10 11805357 . G A 532.18 PASS AO=58;DP=60;FAO=58;FDP=60;FR=.;FRO=2;FSAF=16;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.043426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.2525;QD=35.4784;RBI=0.0635592;REFB=-0.157128;REVB=0.0464107;RO=1;SAF=16;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0285653;STB=0.509269;TYPE=snp;VARB=0.00588108;OID=.;OPOS=11805357;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:60:60:1:2:58:58:42:16:1:0:42:16:1:1 chr10 11912431 . C T 70.49 PASS AO=26;DP=80;FAO=26;FDP=81;FR=.;FRO=55;FSAF=22;FSAR=4;FSRF=40;FSRR=15;FWDB=0.0128826;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=105.558;QD=3.48083;RBI=0.0128963;REFB=-0.0054953;REVB=0.00059467;RO=54;SAF=22;SAR=4;SRF=39;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220036;STB=0.627516;TYPE=snp;VARB=0.00641964;OID=.;OPOS=11912431;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:80:81:54:55:26:26:4:22:39:15:4:22:40:15 chr10 11913907 . A T 495.71 PASS AO=124;DP=259;FAO=123;FDP=258;FR=.;FRO=135;FSAF=61;FSAR=62;FSRF=59;FSRR=76;FWDB=0.00789217;FXX=0.00769201;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.4679;QD=7.68549;RBI=0.0119571;REFB=-0.0554005;REVB=0.00898249;RO=131;SAF=62;SAR=62;SRF=56;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0677647;STB=0.530831;TYPE=snp;VARB=0.0349523;OID=.;OPOS=11913907;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:259:258:131:135:124:123:62:62:56:75:62:61:59:76 chr10 12111090 . T C 101.94 PASS AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0420201;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.8811;QD=37.0679;RBI=0.0450279;REFB=0;REVB=0.0161809;RO=0;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00160969;OID=.;OPOS=12111090;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:11:11:7:4:0:0:7:4:0:0 chr10 12131081 . T G 160.04 PASS AO=35;DP=80;FAO=39;FDP=82;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=10;FSRR=33;FWDB=0.0102438;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.649;QD=7.80685;RBI=0.014254;REFB=0.00365764;REVB=-0.00991166;RO=44;SAF=9;SAR=26;SRF=11;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00930306;STB=0.561875;TYPE=snp;VARB=-0.00444038;OID=.;OPOS=12131081;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:82:44:43:35:39:26:9:11:33:26:13:10:33 chr10 12143105 . C G 2016.64 PASS AO=212;DP=212;FAO=211;FDP=211;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0391515;FXX=0.00471676;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.7368;QD=38.2301;RBI=0.1105;REFB=0;REVB=-0.103332;RO=0;SAF=93;SAR=119;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.82716e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000363317;OID=.;OPOS=12143105;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:212:211:0:0:212:211:119:93:0:0:118:93:0:0 chr10 12148259 . A C 987.39 PASS AO=100;DP=100;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0253154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.604;QD=37.6149;RBI=0.0376977;REFB=0;REVB=-0.027933;RO=0;SAF=49;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.18771e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.81846e-06;OID=.;OPOS=12148259;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:100:105:0:0:100:105:51:49:0:0:54:51:0:0 chr10 12148286 . T C 1134.38 PASS AO=121;DP=122;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0071299;FXX=0.00819605;HRUN=3;LEN=1;MLLD=77.7865;QD=37.5002;RBI=0.0103359;REFB=-0.0222124;REVB=-0.00748294;RO=0;SAF=60;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.74056e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.97732e-06;OID=.;OPOS=12148286;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:122:121:0:0:121:121:61:60:0:0:61:60:0:0 chr10 12149939 . C T 609.11 PASS AO=64;DP=66;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0419854;FXX=0.0302984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.139;QD=38.0696;RBI=0.0423599;REFB=0;REVB=0.00562023;RO=0;SAF=29;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.68466e-05;OID=.;OPOS=12149939;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:66:64:0:0:64:64:35:29:0:0:35:29:0:0 chr10 12172775 . G A 115.19 PASS AO=12;DP=12;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0055727;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.3534;QD=32.9104;RBI=0.0808847;REFB=0;REVB=0.0806925;RO=0;SAF=10;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00416035;OID=.;OPOS=12172775;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:12:14:0:0:12:14:2:10:0:0:4:10:0:0 chr10 12212186 . T A 1927.48 PASS AO=197;DP=197;FAO=200;FDP=200;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=131;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.038253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.474;QD=38.5495;RBI=0.0397887;REFB=0;REVB=0.0109475;RO=0;SAF=69;SAR=128;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.79178e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.14801e-05;OID=.;OPOS=12212186;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:197:200:0:0:197:200:128:69:0:0:131:69:0:0 chr10 12238325 . TGGGA T 61.84 PASS AO=18;DP=47;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0326122;FXX=0.113611;HRUN=3;LEN=4;MLLD=126.522;QD=6.34259;RBI=0.0654057;REFB=-0.0423158;REVB=-0.0566952;RO=18;SAF=3;SAR=15;SRF=15;SRR=3;SSEN=0.377643;SSEP=0;SSSB=-0.587569;STB=0.700703;TYPE=del;VARB=0.0411868;OID=.;OPOS=12238326;OREF=GGGA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:18:43:19:39:20:4:15:11:9:58:18:3:15:15:3 chr10 12292344 . A G 540.41 PASS AO=60;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0262911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.437;QD=34.8652;RBI=0.0293227;REFB=-0.0437128;REVB=0.0129845;RO=1;SAF=27;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171579;STB=0.508769;TYPE=snp;VARB=0.000644655;OID=.;OPOS=12292344;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:62:62:1:1:60:61:33:27:1:0:33:28:1:0 chr10 12292454 . A G 750.52 PASS AO=62;DP=81;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0635675;FXX=0.0365809;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.4704;QD=38.0012;RBI=0.0640122;REFB=0;REVB=0.00753171;RO=0;SAF=24;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000890158;OID=.;OPOS=12292454;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:65:79:0:0:62:79:38:24:0:0:39:40:0:0 chr10 12867598 . C G 88.86 PASS AO=27;DP=73;FAO=27;FDP=72;FR=.;FRO=45;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=5;FSRR=40;FWDB=-0.0526263;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.6252;QD=4.93641;RBI=0.0540274;REFB=-0.000878079;REVB=0.0122243;RO=45;SAF=11;SAR=16;SRF=5;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.369793;STB=0.706304;TYPE=snp;VARB=0.000901276;OID=.;OPOS=12867598;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:73:72:45:45:27:27:16:11:5:40:16:11:5:40 chr10 12940455 . A G 177.84 PASS AO=16;DP=16;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00581584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.3874;QD=35.5687;RBI=0.0310352;REFB=-0.0207927;REVB=-0.0304854;RO=0;SAF=9;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000805134;OID=.;OPOS=12940455;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:20:0:0:16:20:7:9:0:0:7:13:0:0 chr10 13151224 . G A 98.34 PASS AO=26;DP=63;FAO=26;FDP=62;FR=.;FRO=36;FSAF=4;FSAR=22;FSRF=6;FSRR=30;FWDB=0.0387499;FXX=0.0312451;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.425;QD=6.3448;RBI=0.0461471;REFB=-0.00703345;REVB=-0.0250599;RO=36;SAF=4;SAR=22;SRF=6;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0245528;STB=0.514008;TYPE=snp;VARB=0.00807863;OID=.;OPOS=13151224;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:63:62:36:36:26:26:22:4:6:30:22:4:6:30 chr10 13158262 . C T 502.62 PASS AO=50;DP=51;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.000212454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.022;QD=35.9012;RBI=0.060138;REFB=-0.126239;REVB=0.0601376;RO=1;SAF=32;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0254311;STB=0.511107;TYPE=snp;VARB=0.000611963;OID=.;OPOS=13158262;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:51:56:1:1:50:55:18:32:0:1:22:33:0:1 chr10 13166076 . A G 878.89 PASS AO=96;DP=99;FAO=96;FDP=99;FR=.;FRO=3;FSAF=46;FSAR=50;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.00619584;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=139.404;QD=35.5105;RBI=0.00960466;REFB=-0.16001;REVB=-0.00733901;RO=3;SAF=46;SAR=50;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00839292;STB=0.504428;TYPE=snp;VARB=-9.47087e-06;OID=.;OPOS=13166076;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:99:99:3:3:96:96:50:46:1:2:50:46:1:2 chr10 13206233 . A T 1672.58 PASS AO=173;DP=173;FAO=175;FDP=175;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185358;FXX=0.0112988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.02;QD=38.2304;RBI=0.033248;REFB=0;REVB=0.0276018;RO=0;SAF=87;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.64744e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.89314e-05;OID=.;OPOS=13206233;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:173:175:0:0:173:175:86:87:0:0:87:88:0:0 chr10 13230934 . C T 505.69 PASS AO=91;DP=146;FAO=92;FDP=146;FR=.;FRO=54;FSAF=27;FSAR=65;FSRF=19;FSRR=35;FWDB=-0.0512219;FXX=0.00680226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.008;QD=13.8544;RBI=0.0512845;REFB=-0.0295399;REVB=-0.00253363;RO=54;SAF=26;SAR=65;SRF=19;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0543046;STB=0.525478;TYPE=snp;VARB=0.0142731;OID=.;OPOS=13230934;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:54:54:91:92:65:26:19:35:65:27:19:35 chr10 13234356 . A T 259.64 PASS AO=61;DP=124;FAO=61;FDP=124;FR=.;FRO=63;FSAF=46;FSAR=15;FSRF=38;FSRR=25;FWDB=0.031571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.8852;QD=8.37533;RBI=0.0328925;REFB=-0.0109292;REVB=0.00922979;RO=63;SAF=46;SAR=15;SRF=38;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168136;STB=0.593516;TYPE=snp;VARB=0.00862882;OID=.;OPOS=13234356;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:63:63:61:61:15:46:38:25:15:46:38:25 chr10 13275553 . T G 221.08 PASS AO=23;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0356243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.882;QD=36.847;RBI=0.047783;REFB=0;REVB=0.0318454;RO=0;SAF=14;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84921e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000369249;OID=.;OPOS=13275553;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:24:24:0:0:23:24:9:14:0:0:9:15:0:0 chr10 13330402 . T C 47.34 PASS AO=19;DP=65;FAO=19;FDP=65;FR=.;FRO=46;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=27;FSRR=19;FWDB=-0.0163305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.737;QD=2.91308;RBI=0.023585;REFB=-0.00840826;REVB=0.0170167;RO=45;SAF=13;SAR=6;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135392;STB=0.575139;TYPE=snp;VARB=0.0298095;OID=.;OPOS=13330402;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:65:65:45:46:19:19:6:13:26:19:6:13:27:19 chr10 13337588 . G A 1406.91 PASS AO=147;DP=149;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0162963;FXX=0.0328926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.83;QD=38.2831;RBI=0.0187881;REFB=0;REVB=0.00935021;RO=0;SAF=60;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000245358;OID=.;OPOS=13337588;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:149:147:0:0:147:147:87:60:0:0:87:60:0:0 chr10 13350198 . G C 387.02 PASS AO=91;DP=184;FAO=91;FDP=183;FR=.;FRO=92;FSAF=51;FSAR=40;FSRF=64;FSRR=28;FWDB=0.00125432;FXX=0.00543449;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.3093;QD=8.4595;RBI=0.0132767;REFB=0.000168623;REVB=0.0132173;RO=92;SAF=51;SAR=40;SRF=64;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127926;STB=0.570139;TYPE=snp;VARB=-8.78828e-05;OID=.;OPOS=13350198;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:183:92:92:91:91:40:51:64:28:40:51:64:28 chr10 13364914 . C G 201.46 PASS AO=39;DP=81;FAO=46;FDP=89;FR=.;FRO=43;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=0.0745937;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.682;QD=9.05455;RBI=0.0753736;REFB=-0.00319808;REVB=-0.0108146;RO=41;SAF=20;SAR=19;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.067842;STB=0.507965;TYPE=snp;VARB=0.00541288;OID=.;OPOS=13364914;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:89:41:43:39:46:19:20:18:23:26:20:18:25 chr10 13375906 . T C 1429.56 PASS AO=148;DP=148;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0230871;FXX=0.00662208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.214;QD=38.1216;RBI=0.0520465;REFB=0;REVB=-0.0466457;RO=0;SAF=58;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.0385e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.64055e-05;OID=.;OPOS=13375906;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:148:150:0:0:148:150:90:58:0:0:91:59:0:0 chr10 13534851 . A G 177.27 PASS AO=56;DP=152;FAO=57;FDP=151;FR=.;FRO=94;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=36;FSRR=58;FWDB=-0.0176791;FXX=0.013071;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.955;QD=4.69577;RBI=0.0202005;REFB=0.017869;REVB=0.00977295;RO=96;SAF=32;SAR=24;SRF=36;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215482;STB=0.609696;TYPE=snp;VARB=-0.0232373;OID=.;OPOS=13534851;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:151:96:94:56:57:24:32:36:60:25:32:36:58 chr10 13653653 . A G 2051.64 PASS AO=221;DP=223;FAO=220;FDP=220;FR=.;FRO=0;FSAF=113;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0517609;FXX=0.0134523;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.1278;QD=37.3026;RBI=0.0522342;REFB=-0.00560192;REVB=0.00701631;RO=2;SAF=114;SAR=107;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000270948;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000234966;OID=.;OPOS=13653653;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:223:220:2:0:221:220:107:114:1:1:107:113:0:0 chr10 13685766 . G A 192.84 PASS AO=38;DP=67;FAO=38;FDP=67;FR=.;FRO=29;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=9;FSRR=20;FWDB=0.0204996;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.552;QD=11.5127;RBI=0.0414462;REFB=-0.0346189;REVB=-0.0360216;RO=29;SAF=21;SAR=17;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18875;STB=0.603676;TYPE=snp;VARB=0.0202172;OID=.;OPOS=13685766;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:29:29:38:38:17:21:9:20:17:21:9:20 chr10 13735887 . C A 107.24 PASS AO=35;DP=100;FAO=37;FDP=104;FR=.;FRO=67;FSAF=6;FSAR=31;FSRF=23;FSRR=44;FWDB=0.0407486;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.4591;QD=4.12477;RBI=0.0457686;REFB=-0.0377269;REVB=0.0208402;RO=65;SAF=6;SAR=29;SRF=23;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.278971;STB=0.666316;TYPE=snp;VARB=0.0694211;OID=.;OPOS=13735887;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:104:65:67:35:37:29:6:23:42:31:6:23:44 chr10 13735947 . A G 68.36 PASS AO=28;DP=96;FAO=29;FDP=97;FR=.;FRO=68;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=33;FSRR=35;FWDB=-0.007102;FXX=0.0490148;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.349;QD=2.81888;RBI=0.0106532;REFB=-0.0049288;REVB=0.00794055;RO=54;SAF=10;SAR=18;SRF=25;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124806;STB=0.575947;TYPE=snp;VARB=0.00701201;OID=.;OPOS=13735947;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:96:97:54:68:28:29:18:10:25:29:18:11:33:35 chr10 13769842 . A G 348.2 PASS AO=74;DP=135;FAO=74;FDP=137;FR=.;FRO=63;FSAF=38;FSAR=36;FSRF=33;FSRR=30;FWDB=-0.0137766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.727;QD=10.1665;RBI=0.0151376;REFB=-0.0223802;REVB=0.00627323;RO=61;SAF=38;SAR=36;SRF=33;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0227273;STB=0.504738;TYPE=snp;VARB=0.0159304;OID=.;OPOS=13769842;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:137:61:63:74:74:36:38:33:28:36:38:33:30 chr10 14425204 . T A 208.13 PASS AO=60;DP=145;FAO=60;FDP=145;FR=.;FRO=85;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=38;FSRR=47;FWDB=0.0258543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.4279;QD=5.7416;RBI=0.0270368;REFB=-0.0168157;REVB=0.00790849;RO=85;SAF=30;SAR=30;SRF=38;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0552718;STB=0.531024;TYPE=snp;VARB=0.0318641;OID=.;OPOS=14425204;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:85:85:60:60:30:30:38:47:30:30:38:47 chr10 14705494 . G C 999.88 PASS AO=104;DP=104;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0687959;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.8312;QD=38.0906;RBI=0.0944827;REFB=0;REVB=0.064762;RO=0;SAF=46;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.49062e-05;OID=.;OPOS=14705494;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:104:105:0:0:104:105:58:46:0:0:58:47:0:0 chr10 14867557 . T G 371.93 PASS AO=109;DP=266;FAO=110;FDP=265;FR=.;FRO=155;FSAF=68;FSAR=42;FSRF=79;FSRR=76;FWDB=0.0292207;FXX=0.00375926;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.9366;QD=5.61396;RBI=0.0333068;REFB=-0.0206518;REVB=-0.0159842;RO=150;SAF=68;SAR=41;SRF=77;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11807;STB=0.565138;TYPE=snp;VARB=0.0430717;OID=.;OPOS=14867557;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:266:265:150:155:109:110:41:68:77:73:42:68:79:76 chr10 15008493 . A C 145.35 PASS AO=54;DP=159;FAO=54;FDP=159;FR=.;FRO=105;FSAF=23;FSAR=31;FSRF=47;FSRR=58;FWDB=-0.0152978;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=239.114;QD=3.65654;RBI=0.0155895;REFB=-0.022877;REVB=0.0030021;RO=105;SAF=23;SAR=31;SRF=47;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0253745;STB=0.514578;TYPE=snp;VARB=0.0446955;OID=.;OPOS=15008493;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:159:105:105:54:54:31:23:47:58:31:23:47:58 chr10 15008554 . A G 142.48 PASS AO=54;DP=156;FAO=53;FDP=156;FR=.;FRO=103;FSAF=17;FSAR=36;FSRF=40;FSRR=63;FWDB=0.0196992;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.2906;QD=3.65342;RBI=0.0205549;REFB=0.00571618;REVB=0.00586925;RO=101;SAF=17;SAR=37;SRF=40;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102034;STB=0.549378;TYPE=snp;VARB=-0.0132875;OID=.;OPOS=15008554;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:156:101:103:54:53:37:17:40:61:36:17:40:63 chr10 15106441 . A G 497.3 PASS AO=122;DP=251;FAO=122;FDP=253;FR=.;FRO=131;FSAF=42;FSAR=80;FSRF=70;FSRR=61;FWDB=-0.011585;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=235.342;QD=7.86238;RBI=0.0118446;REFB=-0.0175605;REVB=-0.00246642;RO=128;SAF=42;SAR=80;SRF=69;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187524;STB=0.602053;TYPE=snp;VARB=0.0194757;OID=.;OPOS=15106441;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:251:253:128:131:122:122:80:42:69:59:80:42:70:61 chr10 15138615 . C T 407.46 PASS AO=94;DP=176;FAO=92;FDP=176;FR=.;FRO=84;FSAF=50;FSAR=42;FSRF=48;FSRR=36;FWDB=0.015151;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.7419;QD=9.2605;RBI=0.0443856;REFB=-0.00103577;REVB=-0.0417196;RO=80;SAF=52;SAR=42;SRF=44;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00271523;STB=0.51347;TYPE=snp;VARB=0.000964343;OID=.;OPOS=15138615;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:176:80:84:94:92:42:52:44:36:42:50:48:36 chr10 15145855 . C G 333.38 PASS AO=70;DP=137;FAO=75;FDP=145;FR=.;FRO=70;FSAF=36;FSAR=39;FSRF=31;FSRR=39;FWDB=-0.00323474;FXX=0.00684885;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.447;QD=9.19666;RBI=0.00671759;REFB=-0.00525108;REVB=0.00588748;RO=67;SAF=31;SAR=39;SRF=28;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.022534;STB=0.517981;TYPE=snp;VARB=0.00489076;OID=.;OPOS=15145855;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:145:67:70:70:75:39:31:28:39:39:36:31:39 chr10 15145948 . T C 250.93 PASS AO=67;DP=152;FAO=67;FDP=152;FR=.;FRO=85;FSAF=42;FSAR=25;FSRF=36;FSRR=49;FWDB=-0.00803412;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.481;QD=6.60353;RBI=0.0083749;REFB=-0.007285;REVB=0.00236474;RO=85;SAF=42;SAR=25;SRF=36;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205146;STB=0.614438;TYPE=snp;VARB=0.00836527;OID=.;OPOS=15145948;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:152:85:85:67:67:25:42:36:49:25:42:36:49 chr10 15149980 . C T 143.47 PASS AO=33;DP=68;FAO=33;FDP=68;FR=.;FRO=35;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.00915459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.5841;QD=8.43922;RBI=0.00998325;REFB=-0.0289511;REVB=-0.00398231;RO=34;SAF=19;SAR=14;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12257;STB=0.561288;TYPE=snp;VARB=0.0296325;OID=.;OPOS=15149980;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:34:35:33:33:14:19:15:19:14:19:16:19 chr10 15573050 . A G 2591.08 PASS AO=275;DP=278;FAO=275;FDP=275;FR=.;FRO=0;FSAF=183;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0294454;FXX=0.010791;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.412;QD=37.6884;RBI=0.0619467;REFB=-0.105723;REVB=0.054501;RO=2;SAF=183;SAR=92;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.010251;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000296216;OID=.;OPOS=15573050;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:278:275:2:0:275:275:92:183:0:2:92:183:0:0 chr10 15713667 . C G 311.27 PASS AO=33;DP=35;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0303003;FXX=0.0833102;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.146;QD=37.7294;RBI=0.0304814;REFB=0;REVB=0.00331742;RO=0;SAF=20;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.82173e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00086775;OID=.;OPOS=15713667;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:35:33:0:0:33:33:13:20:0:0:13:20:0:0 chr10 16556204 . C CAT 48.88 PASS AO=20;DP=84;FAO=21;FDP=75;FR=.;FRO=54;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=46;FWDB=0.0502452;FXX=0.0384566;HRUN=1;LEN=2;MLLD=167.579;QD=2.6071;RBI=0.0541324;REFB=-0.00473414;REVB=-0.020143;RO=63;SAF=10;SAR=10;SRF=12;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.398711;STB=0.742015;TYPE=ins;VARB=0.0121937;OID=.;OPOS=16556205;OREF=-;OALT=AT;OMAPALT=CAT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:20:84:21:75:54:10:11:8:46:48:63:10:10:12:51 chr10 16882518 . T C 447.54 PASS AO=102;DP=202;FAO=103;FDP=203;FR=.;FRO=100;FSAF=47;FSAR=56;FSRF=40;FSRR=60;FWDB=-0.00743569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.892;QD=8.81861;RBI=0.0186687;REFB=-0.0243842;REVB=0.017124;RO=100;SAF=47;SAR=55;SRF=40;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0554528;STB=0.528084;TYPE=snp;VARB=0.0214412;OID=.;OPOS=16882518;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:203:100:100:102:103:55:47:40:60:56:47:40:60 chr10 16918972 . A G 489.34 PASS AO=103;DP=187;FAO=102;FDP=185;FR=.;FRO=83;FSAF=45;FSAR=57;FSRF=41;FSRR=42;FWDB=-0.000715872;FXX=0.0106946;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.668;QD=10.5804;RBI=0.0071485;REFB=-0.00460259;REVB=0.00711257;RO=84;SAF=46;SAR=57;SRF=41;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0344329;STB=0.523881;TYPE=snp;VARB=0.00328043;OID=.;OPOS=16918972;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:185:84:83:103:102:57:46:41:43:57:45:41:42 chr10 16943371 . G C 1098.99 PASS AO=113;DP=115;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.024583;FXX=0.0170926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.344;QD=38.2259;RBI=0.0258221;REFB=0;REVB=0.00790282;RO=0;SAF=25;SAR=88;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.76892e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00016338;OID=.;OPOS=16943371;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:115:115:0:0:113:115:88:25:0:0:90:25:0:0 chr10 16948390 . G C 78.12 PASS AO=20;DP=50;FAO=20;FDP=48;FR=.;FRO=28;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.0293518;FXX=0.058812;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.5573;QD=6.51;RBI=0.0300889;REFB=-0.000602176;REVB=-0.00661912;RO=28;SAF=16;SAR=4;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.384952;STB=0.723565;TYPE=snp;VARB=0.00310346;OID=.;OPOS=16948390;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:50:48:28:28:20:20:4:16:13:15:4:16:13:15 chr10 16961995 . A C 223.75 PASS AO=51;DP=102;FAO=51;FDP=102;FR=.;FRO=51;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=37;FSRR=14;FWDB=-0.0206336;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=222.112;QD=8.77447;RBI=0.0263457;REFB=-0.0111159;REVB=0.0163815;RO=51;SAF=26;SAR=25;SRF=37;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19674;STB=0.608303;TYPE=snp;VARB=0.00984547;OID=.;OPOS=16961995;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:51:51:51:51:25:26:37:14:25:26:37:14 chr10 16967401 . C T 1117.84 PASS AO=116;DP=118;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193148;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.281;QD=38.2168;RBI=0.0195418;REFB=0;REVB=0.00296964;RO=0;SAF=49;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19736e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.61248e-05;OID=.;OPOS=16967401;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:118:117:0:0:116:117:67:49:0:0:68:49:0:0 chr10 16979661 . T C 330.75 PASS AO=73;DP=147;FAO=76;FDP=150;FR=.;FRO=74;FSAF=27;FSAR=49;FSRF=43;FSRR=31;FWDB=-0.0170358;FXX=0.013157;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.138;QD=8.82008;RBI=0.0223189;REFB=-0.00364423;REVB=-0.0144193;RO=74;SAF=26;SAR=47;SRF=43;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208761;STB=0.613565;TYPE=snp;VARB=0.00342653;OID=.;OPOS=16979661;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:150:74:74:73:76:47:26:43:31:49:27:43:31 chr10 17024503 . G A 580.87 PASS AO=120;DP=214;FAO=120;FDP=214;FR=.;FRO=94;FSAF=71;FSAR=49;FSRF=36;FSRR=58;FWDB=-0.0294713;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.483;QD=10.8574;RBI=0.0359714;REFB=-0.0116327;REVB=-0.0206249;RO=92;SAF=71;SAR=49;SRF=34;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177037;STB=0.591651;TYPE=snp;VARB=0.0113568;OID=.;OPOS=17024503;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:214:92:94:120:120:49:71:34:58:49:71:36:58 chr10 17024615 . A T 177.7 PASS AO=52;DP=132;FAO=53;FDP=133;FR=.;FRO=80;FSAF=21;FSAR=32;FSRF=19;FSRR=61;FWDB=0.0130752;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.659;QD=5.34437;RBI=0.0140814;REFB=-0.0030286;REVB=0.00522739;RO=80;SAF=20;SAR=32;SRF=19;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175734;STB=0.604047;TYPE=snp;VARB=0.0040705;OID=.;OPOS=17024615;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:133:80:80:52:53:32:20:19:61:32:21:19:61 chr10 17113563 . C T 293.18 PASS AO=88;DP=235;FAO=95;FDP=248;FR=.;FRO=153;FSAF=35;FSAR=60;FSRF=52;FSRR=101;FWDB=-0.0190129;FXX=0.0197621;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.7328;QD=4.72869;RBI=0.0244544;REFB=-0.00472557;REVB=-0.0153795;RO=143;SAF=35;SAR=53;SRF=52;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0394343;STB=0.519112;TYPE=snp;VARB=0.0055252;OID=.;OPOS=17113563;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:235:248:143:153:88:95:53:35:52:91:60:35:52:101 chr10 17147521 . G T 1699.95 PASS AO=195;DP=211;FAO=196;FDP=207;FR=.;FRO=11;FSAF=139;FSAR=57;FSRF=11;FSRR=0;FWDB=0.045977;FXX=0.0189564;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.0074;QD=32.8493;RBI=0.0507213;REFB=-0.0195493;REVB=0.0214188;RO=12;SAF=138;SAR=57;SRF=12;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.039627;STB=0.519029;TYPE=snp;VARB=0.00606837;OID=.;OPOS=17147521;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:211:207:12:11:195:196:57:138:12:0:57:139:11:0 chr10 17156151 . A G 242.17 PASS AO=48;DP=85;FAO=48;FDP=84;FR=.;FRO=36;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=12;FSRR=24;FWDB=-0.0314424;FXX=0.0117633;HRUN=4;LEN=1;MLLD=186.761;QD=11.532;RBI=0.0336178;REFB=0.000898435;REVB=-0.011897;RO=34;SAF=19;SAR=29;SRF=12;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0342649;STB=0.52832;TYPE=snp;VARB=-0.00087787;OID=.;OPOS=17156151;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:84:34:36:48:48:29:19:12:22:29:19:12:24 chr10 17187634 . G C 1394.94 PASS AO=148;DP=148;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000134731;FXX=0.0067563;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.498;QD=37.9577;RBI=0.00493789;REFB=0.0194842;REVB=-0.00493605;RO=0;SAF=76;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.85252e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.26854e-05;OID=.;OPOS=17187634;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:148:147:0:0:148:147:72:76:0:0:71:76:0:0 chr10 17204187 . G A 903.94 PASS AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0526905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.7064;QD=38.0604;RBI=0.0917318;REFB=0;REVB=0.0750895;RO=0;SAF=44;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000159419;OID=.;OPOS=17204187;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:95:95:0:0:95:95:51:44:0:0:51:44:0:0 chr10 17216556 . C T 1204.31 PASS AO=126;DP=126;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0457499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.8188;QD=38.232;RBI=0.0458493;REFB=0;REVB=-0.00301704;RO=0;SAF=71;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000280232;OID=.;OPOS=17216556;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:126:126:0:0:126:126:55:71:0:0:55:71:0:0 chr10 17256345 . A T 56.77 PASS AO=101;DP=313;FAO=70;FDP=394;FR=.;FRO=324;FSAF=7;FSAR=63;FSRF=140;FSRR=184;FWDB=-0.0682878;FXX=0.0149996;HRUN=6;LEN=1;MLLD=14.0605;QD=0.576379;RBI=0.103033;REFB=-0.0847298;REVB=-0.0771523;RO=212;SAF=11;SAR=90;SRF=101;SRR=111;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.544351;STB=0.84256;TYPE=snp;VARB=0.118824;OID=.;OPOS=17256345;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:313:394:212:324:101:70:90:11:101:111:63:7:140:184 chr10 17756596 . T C 207.58 PASS AO=43;DP=80;FAO=43;FDP=80;FR=.;FRO=37;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.0774313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.5918;QD=10.379;RBI=0.0775524;REFB=-0.0147632;REVB=-0.0043328;RO=36;SAF=21;SAR=22;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0133654;STB=0.513381;TYPE=snp;VARB=0.00977991;OID=.;OPOS=17756596;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:36:37:43:43:22:21:17:19:22:21:17:20 chr10 17891705 . A G 3812.51 PASS AO=521;DP=524;FAO=400;FDP=400;FR=.;FRO=0;FSAF=122;FSAR=278;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0585964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.914;QD=38.1251;RBI=0.0591217;REFB=0;REVB=-0.00786329;RO=1;SAF=156;SAR=365;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00305092;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.47755e-05;OID=.;OPOS=17891705;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:524:400:1:0:521:400:365:156:1:0:278:122:0:0 chr10 18087629 . CTG C,CT 306.71 PASS AO=26,7;DP=38;FAO=34,0;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=18,0;FSAR=16,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134659,0.0101178;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=210.539,185.363;QD=36.0838;RBI=0.0134706,0.0104439;REFB=0,0;REVB=0.000358318,0.00258942;RO=0;SAF=12,5;SAR=14,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.27427e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.000256551,-0.0216066;OID=.,.;OPOS=18087630,18087631;OREF=TG,G;OALT=-,-;OMAPALT=C,CT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:26,7:33:34,0:34:0:18,0:16,0:0:0:15:0:12,5:14,2:0:0 chr10 18129702 . C T 56.01 PASS AO=9;DP=15;FAO=9;FDP=14;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0873528;FXX=0.0666222;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.267;QD=16.0036;RBI=0.0884697;REFB=-0.0155492;REVB=0.0140134;RO=5;SAF=1;SAR=8;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.441617;STB=0.76119;TYPE=snp;VARB=0.0168565;OID=.;OPOS=18129702;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:15:14:5:5:9:9:8:1:3:2:8:1:3:2 chr10 18242304 . T C 435.32 PASS AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0404917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.998;QD=37.8537;RBI=0.0420852;REFB=0;REVB=0.0114713;RO=0;SAF=37;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.83101e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000337652;OID=.;OPOS=18242304;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:46:46:0:0:46:46:9:37:0:0:9:37:0:0 chr10 18254606 . C A 418.22 PASS AO=90;DP=168;FAO=90;FDP=168;FR=.;FRO=78;FSAF=24;FSAR=66;FSRF=38;FSRR=40;FWDB=-0.0389846;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=235.511;QD=9.95759;RBI=0.0441506;REFB=0.0106481;REVB=-0.0207237;RO=78;SAF=24;SAR=66;SRF=38;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21213;STB=0.616609;TYPE=snp;VARB=-0.00874754;OID=.;OPOS=18254606;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:78:78:90:90:66:24:38:40:66:24:38:40 chr10 18266989 . G A 311.19 PASS AO=62;DP=110;FAO=62;FDP=110;FR=.;FRO=48;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=15;FSRR=33;FWDB=-0.0166287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.414;QD=11.3159;RBI=0.0171299;REFB=-0.00696561;REVB=-0.00411356;RO=44;SAF=26;SAR=36;SRF=14;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0803149;STB=0.548609;TYPE=snp;VARB=0.00593513;OID=.;OPOS=18266989;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:44:48:62:62:36:26:14:30:36:26:15:33 chr10 18439808 . T G 53.78 PASS AO=19;DP=42;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=1;FSRF=16;FSRR=6;FWDB=0.00594247;FXX=0.142823;HRUN=25;LEN=1;MLLD=246.07;QD=5.97594;RBI=0.0223692;REFB=-0.00451446;REVB=-0.0215655;RO=22;SAF=13;SAR=6;SRF=16;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0479909;STB=0.757847;TYPE=snp;VARB=0.0131229;OID=.;OPOS=18439808;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:42:36:22:22:19:14:6:13:16:6:1:13:16:6 chr10 18829981 . A ATGTT 321.26 PASS AO=104;DP=350;FAO=119;FDP=332;FR=.;FRO=213;FSAF=40;FSAR=79;FSRF=96;FSRR=117;FWDB=0.0126532;FXX=0.0206484;HRUN=1;LEN=4;MLLD=228.801;QD=3.87054;RBI=0.0139035;REFB=-6.14353e-05;REVB=-0.00576228;RO=226;SAF=32;SAR=72;SRF=102;SRR=124;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183096;STB=0.578118;TYPE=ins;VARB=-5.78056e-05;OID=.;OPOS=18829982;OREF=-;OALT=TGTT;OMAPALT=ATGTT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:104:350:119:332:213:40:79:96:117:99:226:32:72:102:124 chr10 19492832 . A C 962.02 PASS AO=97;DP=97;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0558676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.615;QD=38.4806;RBI=0.0570785;REFB=0;REVB=-0.0116947;RO=0;SAF=25;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.80999e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.68e-05;OID=.;OPOS=19492832;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:97:100:0:0:97:100:72:25:0:0:74:26:0:0 chr10 19498278 . G A 1506.08 PASS AO=150;DP=150;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.271;QD=38.3716;RBI=0.0375547;REFB=0;REVB=0.032859;RO=0;SAF=73;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.14652e-05;OID=.;OPOS=19498278;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:150:157:0:0:150:157:77:73:0:0:82:75:0:0 chr10 19676553 . A G 271.41 PASS AO=96;DP=267;FAO=96;FDP=266;FR=.;FRO=170;FSAF=82;FSAR=14;FSRF=120;FSRR=50;FWDB=0.000472289;FXX=0.00746241;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.55;QD=4.08129;RBI=0.0407849;REFB=-0.0122008;REVB=-0.0407821;RO=170;SAF=82;SAR=14;SRF=120;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.259349;STB=0.649791;TYPE=snp;VARB=0.0239273;OID=.;OPOS=19676553;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:267:266:170:170:96:96:14:82:120:50:14:82:120:50 chr10 19676561 . G A 319.73 PASS AO=102;DP=262;FAO=103;FDP=263;FR=.;FRO=160;FSAF=83;FSAR=20;FSRF=115;FSRR=45;FWDB=0.000134246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.829;QD=4.86279;RBI=0.0190074;REFB=0.0197597;REVB=-0.0190069;RO=159;SAF=81;SAR=21;SRF=115;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108199;STB=0.576681;TYPE=snp;VARB=-0.00974656;OID=.;OPOS=19676561;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:262:263:159:160:102:103:21:81:115:44:20:83:115:45 chr10 19678286 . C T 400.33 PASS AO=112;DP=260;FAO=112;FDP=260;FR=.;FRO=148;FSAF=31;FSAR=81;FSRF=25;FSRR=123;FWDB=-0.014493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.058;QD=6.15895;RBI=0.0146214;REFB=-0.0324488;REVB=0.00193321;RO=148;SAF=31;SAR=81;SRF=25;SRR=123;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149365;STB=0.582307;TYPE=snp;VARB=0.0346449;OID=.;OPOS=19678286;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:260:260:148:148:112:112:81:31:25:123:81:31:25:123 chr10 19678497 . G A 418.79 PASS AO=108;DP=235;FAO=108;FDP=234;FR=.;FRO=126;FSAF=62;FSAR=46;FSRF=71;FSRR=55;FWDB=0.0227561;FXX=0.00425514;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.4522;QD=7.15871;RBI=0.0249671;REFB=-0.0164373;REVB=0.0102721;RO=126;SAF=62;SAR=46;SRF=71;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0105146;STB=0.505815;TYPE=snp;VARB=0.0242878;OID=.;OPOS=19678497;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:235:234:126:126:108:108:46:62:71:55:46:62:71:55 chr10 19778056 . G A 214.88 PASS AO=41;DP=129;FAO=52;FDP=121;FR=.,HEALED;FRO=60;FSAF=6;FSAR=46;FSRF=11;FSRR=49;FWDB=0.00158175;FXX=0.0319974;HRUN=4;LEN=1;MLLD=30.4075;QD=7.10346;RBI=0.0651921;REFB=-0.0312229;REVB=-0.0651729;RO=48;SAF=6;SAR=35;SRF=10;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108402;STB=0.578369;TYPE=snp;VARB=-0.0305818;OID=.;OPOS=19778056;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:121:48:60:41:52:35:6:10:38:46:6:11:49 chr10 19778072 . A G 1057.48 PASS AO=110;DP=110;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00773969;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=290.359;QD=38.1074;RBI=0.0123514;REFB=0;REVB=-0.00962577;RO=0;SAF=14;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.16288e-06;OID=.;OPOS=19778072;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:110:111:0:0:110:111:96:14:0:0:96:15:0:0 chr10 19787418 . T G 159.49 PASS AO=43;DP=102;FAO=44;FDP=104;FR=.;FRO=60;FSAF=31;FSAR=13;FSRF=34;FSRR=26;FWDB=0.00826475;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.355;QD=6.13423;RBI=0.0525711;REFB=-0.0158357;REVB=-0.0519174;RO=59;SAF=31;SAR=12;SRF=34;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168046;STB=0.588566;TYPE=snp;VARB=0.020335;OID=.;OPOS=19787418;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:104:59:60:43:44:12:31:34:25:13:31:34:26 chr10 19884264 . G A 431.21 PASS AO=103;DP=246;FAO=114;FDP=253;FR=.;FRO=139;FSAF=25;FSAR=89;FSRF=66;FSRR=73;FWDB=0.00804875;FXX=0.0155636;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.96;QD=6.81748;RBI=0.0136235;REFB=-0.015223;REVB=0.0109917;RO=100;SAF=16;SAR=87;SRF=35;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.262562;STB=0.666607;TYPE=snp;VARB=0.012797;OID=.;OPOS=19884264;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:246:253:100:139:103:114:87:16:35:65:89:25:66:73 chr10 19887292 . T G 653.39 PASS AO=152;DP=299;FAO=152;FDP=301;FR=.;FRO=149;FSAF=81;FSAR=71;FSRF=60;FSRR=89;FWDB=0.00786362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.976;QD=8.68294;RBI=0.0154792;REFB=-0.0128456;REVB=0.0133331;RO=147;SAF=81;SAR=71;SRF=59;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117725;STB=0.564181;TYPE=snp;VARB=0.0126342;OID=.;OPOS=19887292;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:299:301:147:149:152:152:71:81:59:88:71:81:60:89 chr10 19896830 . C A 189.48 PASS AO=56;DP=139;FAO=56;FDP=139;FR=.;FRO=83;FSAF=14;FSAR=42;FSRF=22;FSRR=61;FWDB=-0.0160932;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.393;QD=5.45272;RBI=0.0243336;REFB=-0.00363866;REVB=0.0182519;RO=82;SAF=14;SAR=42;SRF=21;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00853048;STB=0.511844;TYPE=snp;VARB=0.00546033;OID=.;OPOS=19896830;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:82:83:56:56:42:14:21:61:42:14:22:61 chr10 20036605 . A AGT 257.17 PASS AO=25;DP=76;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00766701;FXX=0.315706;HRUN=0;LEN=2;MLLD=116.913;QD=39.5651;RBI=0.0458188;REFB=0;REVB=0.0451728;RO=41;SAF=10;SAR=15;SRF=34;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.44373;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.000364663;OID=.;OPOS=20036606;OREF=-;OALT=GT;OMAPALT=AGT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:25:76:26:26:0:10:16:0:0:13:41:10:15:34:7 chr10 20036606 . T G 17.21 PASS AO=9;DP=43;FAO=9;FDP=43;FR=.;FRO=34;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=-0.00429914;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.8789;QD=1.60123;RBI=0.00949506;REFB=0.0031374;REVB=0.00846603;RO=34;SAF=3;SAR=6;SRF=12;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0263537;STB=0.517203;TYPE=snp;VARB=-0.00235656;OID=.;OPOS=20036606;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:43:43:34:34:9:9:6:3:12:22:6:3:12:22 chr10 20036609 . C A 149.45 PASS AO=22;DP=38;FAO=23;FDP=32;FR=.;FRO=9;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0689774;FXX=0.157853;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.6057;QD=18.6811;RBI=0.069146;REFB=-0.0631352;REVB=-0.0048261;RO=8;SAF=9;SAR=13;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.017199;STB=0.529223;TYPE=snp;VARB=0.0326113;OID=.;OPOS=20036609;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:38:32:8:9:22:23:13:9:3:5:13:10:3:6 chr10 20036610 . T A 11.12 PASS AO=12;DP=37;FAO=7;FDP=37;FR=.;FRO=30;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=-0.0059695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.376;QD=1.2026;RBI=0.0209336;REFB=-0.00652101;REVB=-0.0200645;RO=24;SAF=3;SAR=9;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.257001;STB=0.523742;TYPE=snp;VARB=0.0409054;OID=.;OPOS=20036610;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:37:37:24:30:12:7:9:3:11:13:4:3:12:18 chr10 20036633 . AC A 88.02 PASS AO=49;DP=104;FAO=49;FDP=102;FR=.;FRO=53;FSAF=16;FSAR=33;FSRF=25;FSRR=28;FWDB=-0.0107368;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=12.1372;QD=3.45166;RBI=0.0775856;REFB=-0.124133;REVB=-0.0768391;RO=49;SAF=17;SAR=32;SRF=23;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0.408991;SSSB=-0.116883;STB=0.580902;TYPE=del;VARB=0.139902;OID=.;OPOS=20036634;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:49:102:49:102:53:16:33:25:28:88:49:17:32:23:26 chr10 20357183 . A G 172 PASS AO=47;DP=119;FAO=49;FDP=120;FR=.;FRO=71;FSAF=14;FSAR=35;FSRF=24;FSRR=47;FWDB=0.00701667;FXX=0.0839631;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.465;QD=5.7332;RBI=0.00892983;REFB=-0.0086505;REVB=0.00552343;RO=66;SAF=14;SAR=33;SRF=19;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0124648;STB=0.536708;TYPE=snp;VARB=0.00647592;OID=.;OPOS=20357183;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:120:66:71:47:49:33:14:19:47:35:14:24:47 chr10 20500592 . T C 415.28 PASS AO=106;DP=229;FAO=106;FDP=229;FR=.;FRO=123;FSAF=55;FSAR=51;FSRF=72;FSRR=51;FWDB=0.00806805;FXX=0.00434764;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.395;QD=7.25373;RBI=0.0207433;REFB=-0.0079941;REVB=0.01911;RO=122;SAF=55;SAR=51;SRF=72;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0693736;STB=0.535858;TYPE=snp;VARB=0.00717015;OID=.;OPOS=20500592;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:229:229:122:123:106:106:51:55:72:50:51:55:72:51 chr10 20506418 . G A 218.32 PASS AO=66;DP=165;FAO=66;FDP=165;FR=.;FRO=99;FSAF=33;FSAR=33;FSRF=47;FSRR=52;FWDB=0.00349284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.774;QD=5.29267;RBI=0.0244828;REFB=0.013256;REVB=0.0242323;RO=99;SAF=33;SAR=33;SRF=47;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0269143;STB=0.515147;TYPE=snp;VARB=-0.0207307;OID=.;OPOS=20506418;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:165:99:99:66:66:33:33:47:52:33:33:47:52 chr10 20506426 . G A 201.15 PASS AO=62;DP=158;FAO=62;FDP=158;FR=.;FRO=96;FSAF=29;FSAR=33;FSRF=44;FSRR=52;FWDB=-0.0469928;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7856;QD=5.09247;RBI=0.0789173;REFB=0.00361646;REVB=0.0634005;RO=95;SAF=29;SAR=33;SRF=43;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0162972;STB=0.505743;TYPE=snp;VARB=-0.0162658;OID=.;OPOS=20506426;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:158:95:96:62:62:33:29:43:52:33:29:44:52 chr10 20534333 . A G 311.02 PASS AO=96;DP=246;FAO=98;FDP=250;FR=.;FRO=152;FSAF=43;FSAR=55;FSRF=66;FSRR=86;FWDB=-0.0125491;FXX=0.00398391;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8465;QD=4.97626;RBI=0.0126053;REFB=-0.0039839;REVB=0.0011888;RO=149;SAF=43;SAR=53;SRF=65;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0127879;STB=0.502819;TYPE=snp;VARB=0.00565169;OID=.;OPOS=20534333;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:246:250:149:152:96:98:53:43:65:84:55:43:66:86 chr10 21074344 . A G 611.05 PASS AO=139;DP=271;FAO=140;FDP=273;FR=.;FRO=133;FSAF=76;FSAR=64;FSRF=72;FSRR=61;FWDB=0.0133126;FXX=0.0036495;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.7293;QD=8.95304;RBI=0.0169962;REFB=-0.00501483;REVB=-0.0105663;RO=130;SAF=76;SAR=63;SRF=72;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00631873;STB=0.500738;TYPE=snp;VARB=0.00559392;OID=.;OPOS=21074344;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:271:273:130:133:139:140:63:76:72:58:64:76:72:61 chr10 21112137 . A T 187.12 PASS AO=62;DP=168;FAO=62;FDP=167;FR=.;FRO=105;FSAF=33;FSAR=29;FSRF=70;FSRR=35;FWDB=-0.00791961;FXX=0.00595203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.634;QD=4.48196;RBI=0.00891844;REFB=-0.0195251;REVB=-0.00410101;RO=100;SAF=33;SAR=29;SRF=66;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141937;STB=0.585775;TYPE=snp;VARB=0.0355881;OID=.;OPOS=21112137;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:167:100:105:62:62:29:33:66:34:29:33:70:35 chr10 21134282 . C G 389.16 PASS AO=105;DP=244;FAO=106;FDP=239;FR=.;FRO=133;FSAF=37;FSAR=69;FSRF=39;FSRR=94;FWDB=-0.0144657;FXX=0.020491;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.379;QD=6.51316;RBI=0.0147649;REFB=-0.00771024;REVB=0.00295732;RO=132;SAF=36;SAR=69;SRF=39;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0538717;STB=0.534894;TYPE=snp;VARB=0.0125949;OID=.;OPOS=21134282;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:239:132:133:105:106:69:36:39:93:69:37:39:94 chr10 21139389 . T C 185.39 PASS AO=41;DP=78;FAO=40;FDP=77;FR=.;FRO=37;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=0.019913;FXX=0.0128189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.5211;QD=9.63043;RBI=0.0205523;REFB=-0.0164315;REVB=-0.0050861;RO=37;SAF=16;SAR=25;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0376404;STB=0.516121;TYPE=snp;VARB=0.022545;OID=.;OPOS=21139389;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:77:37:37:41:40:25:16:16:21:24:16:16:21 chr10 21807000 . TTA T 78.42 PASS AO=14;DP=80;FAO=34;FDP=63;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.00949348;FXX=0.124983;HRUN=7;LEN=2;MLLD=14.143;QD=4.97929;RBI=0.0188115;REFB=-0.0470595;REVB=0.0162403;RO=36;SAF=1;SAR=13;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.647575;STB=0.517231;TYPE=del;VARB=0.0977618;OID=.;OPOS=21807001;OREF=TA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:14:72:34:63:29:14:20:13:16:57:36:1:13:20:16 chr10 21950592 . A G 52.58 PASS AO=14;DP=37;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=0.0212872;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.9156;QD=5.84191;RBI=0.0477851;REFB=-0.0117289;REVB=0.0427817;RO=22;SAF=9;SAR=5;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0449826;STB=0.526279;TYPE=snp;VARB=0.0219095;OID=.;OPOS=21950592;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:37:36:22:22:14:14:5:9:15:7:5:9:15:7 chr10 22048330 . C T 115.16 PASS AO=29;DP=65;FAO=29;FDP=65;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=0.0348902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.99;QD=7.08687;RBI=0.0369481;REFB=0.0180492;REVB=-0.0121586;RO=36;SAF=12;SAR=17;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00290231;STB=0.501638;TYPE=snp;VARB=-0.0125958;OID=.;OPOS=22048330;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:36:36:29:29:17:12:15:21:17:12:15:21 chr10 22498749 . A T 3334.9 PASS AO=342;DP=343;FAO=348;FDP=348;FR=.;FRO=0;FSAF=187;FSAR=161;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0528886;FXX=0.00286525;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.4426;QD=38.3322;RBI=0.0653257;REFB=0;REVB=0.0383438;RO=0;SAF=182;SAR=160;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.84168e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.81951e-05;OID=.;OPOS=22498749;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:343:348:0:0:342:348:160:182:0:0:161:187:0:0 chr10 22825596 . C T 484.46 PASS AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0455001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.6899;QD=38.7567;RBI=0.0459776;REFB=0;REVB=-0.00660932;RO=0;SAF=27;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000433527;OID=.;OPOS=22825596;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:50:50:0:0:50:50:23:27:0:0:23:27:0:0 chr10 22830827 . TG T 50.2 PASS AO=43;DP=152;FAO=54;FDP=128;FR=.;FRO=74;FSAF=35;FSAR=19;FSRF=50;FSRR=24;FWDB=0.00905057;FXX=0.00775134;HRUN=7;LEN=1;MLLD=6.82808;QD=1.56875;RBI=0.265645;REFB=-0.0856398;REVB=0.26549;RO=64;SAF=32;SAR=11;SRF=45;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0550659;STB=0.517622;TYPE=del;VARB=0.0962671;OID=.;OPOS=22830828;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:43:127:54:128:74:35:19:50:24:50:64:32:11:45:19 chr10 23003226 . A G 113.05 PASS AO=32;DP=76;FAO=31;FDP=75;FR=.;FRO=44;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=29;FWDB=0.0246153;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.8325;QD=6.02946;RBI=0.0527186;REFB=-0.00838075;REVB=-0.0466191;RO=44;SAF=11;SAR=21;SRF=15;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00322115;STB=0.512187;TYPE=snp;VARB=0.00691455;OID=.;OPOS=23003226;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:75:44:44:32:31:21:11:15:29:21:10:15:29 chr10 23297252 . G A 785.67 PASS AO=335;DP=715;FAO=194;FDP=398;FR=.;FRO=204;FSAF=52;FSAR=142;FSRF=53;FSRR=151;FWDB=0.00160871;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.6825;QD=7.8962;RBI=0.0161178;REFB=-0.010048;REVB=0.0160373;RO=371;SAF=83;SAR=252;SRF=95;SRR=276;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0105908;STB=0.505406;TYPE=snp;VARB=0.00934211;OID=.;OPOS=23297252;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:715:398:371:204:335:194:252:83:95:276:142:52:53:151 chr10 23408278 . C T 1127.81 PASS AO=120;DP=121;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=114;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0453776;FXX=0.00826378;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.83;QD=37.5937;RBI=0.0463522;REFB=-0.0954472;REVB=0.00945545;RO=1;SAF=114;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0728301;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000490718;OID=.;OPOS=23408278;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:121:120:1:0:120:120:6:114:0:1:6:114:0:0 chr10 24873150 . AAT A 32.06 PASS AO=27;DP=59;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=8;FWDB=-0.0799281;FXX=0.152517;HRUN=3;LEN=2;MLLD=88.9552;QD=2.56519;RBI=0.0807757;REFB=-0.0204796;REVB=0.0116713;RO=0;SAF=21;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.6915;TYPE=del;VARB=0.0286448;OID=.;OPOS=24873151;OREF=AT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:27:38:19:50:31:8:11:23:8:32:0:21:6:0:0 chr10 24873369 . C G 1136.17 PASS AO=118;DP=119;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0162452;FXX=0.00840265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.645;QD=38.5141;RBI=0.0183229;REFB=0;REVB=-0.00847468;RO=0;SAF=45;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.9421e-05;OID=.;OPOS=24873369;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:119:118:0:0:118:118:73:45:0:0:73:45:0:0 chr10 24879281 . A G 1336.44 PASS AO=121;DP=124;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00114878;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.847;QD=37.6462;RBI=0.00298658;REFB=0;REVB=0.00275681;RO=0;SAF=62;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00041588;OID=.;OPOS=24879281;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:124:142:0:0:121:142:59:62:0:0:74:68:0:0 chr10 24889841 . G A 245.39 PASS AO=57;DP=117;FAO=58;FDP=119;FR=.;FRO=61;FSAF=19;FSAR=39;FSRF=14;FSRR=47;FWDB=-0.0419169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.1525;QD=8.24829;RBI=0.0428502;REFB=-0.0251776;REVB=-0.00889493;RO=59;SAF=19;SAR=38;SRF=13;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122815;STB=0.559378;TYPE=snp;VARB=0.0262858;OID=.;OPOS=24889841;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:119:59:61:57:58:38:19:13:46:39:19:14:47 chr10 24908686 . T C 1635.95 PASS AO=173;DP=175;FAO=173;FDP=173;FR=.;FRO=0;FSAF=110;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021286;FXX=0.0114279;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.4635;QD=37.8254;RBI=0.0214527;REFB=-0.0957518;REVB=0.00266969;RO=1;SAF=110;SAR=63;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00430787;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.78826e-05;OID=.;OPOS=24908686;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:175:173:1:0:173:173:63:110:1:0:63:110:0:0 chr10 24929141 . G A 3211.4 PASS AO=339;DP=346;FAO=342;FDP=342;FR=.;FRO=0;FSAF=144;FSAR=198;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00104078;FXX=0.0115604;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.133;QD=37.5602;RBI=0.0811366;REFB=-0.0726557;REVB=0.0811299;RO=2;SAF=143;SAR=196;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00662511;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000142778;OID=.;OPOS=24929141;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:346:342:2:0:339:342:196:143:2:0:198:144:0:0 chr10 25701341 . C G 497.45 PASS AO=112;DP=277;FAO=125;FDP=269;FR=.,HEALED;FRO=144;FSAF=52;FSAR=73;FSRF=71;FSRR=73;FWDB=-0.143941;FXX=0.011029;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.7899;QD=7.39699;RBI=0.144403;REFB=0.00428597;REVB=-0.0115372;RO=111;SAF=39;SAR=73;SRF=39;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00312992;STB=0.541843;TYPE=snp;VARB=-0.0146947;OID=.;OPOS=25701341;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:274:269:111:144:112:125:73:39:39:72:73:52:71:73 chr10 26102829 . G A 300.16 PASS AO=72;DP=149;FAO=72;FDP=149;FR=.;FRO=77;FSAF=23;FSAR=49;FSRF=28;FSRR=49;FWDB=-0.0207091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.859;QD=8.05795;RBI=0.0214058;REFB=-0.0225577;REVB=0.00541668;RO=77;SAF=23;SAR=49;SRF=28;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.046559;STB=0.525766;TYPE=snp;VARB=0.0246262;OID=.;OPOS=26102829;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:77:77:72:72:49:23:28:49:49:23:28:49 chr10 26505822 . G A 134.33 PASS AO=27;DP=54;FAO=29;FDP=56;FR=.;FRO=27;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=9;FWDB=0.0277217;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.9103;QD=9.59496;RBI=0.108663;REFB=-0.0235613;REVB=0.105068;RO=27;SAF=16;SAR=11;SRF=18;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0695916;STB=0.556637;TYPE=snp;VARB=0.0258516;OID=.;OPOS=26505822;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:56:27:27:27:29:11:16:18:9:13:16:18:9 chr10 26790109 . T C 127.86 PASS AO=33;DP=72;FAO=33;FDP=75;FR=.;FRO=42;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=29;FWDB=-0.038784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.786;QD=6.81917;RBI=0.0399478;REFB=-0.0236758;REVB=-0.00957198;RO=39;SAF=14;SAR=19;SRF=10;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17163;STB=0.567049;TYPE=snp;VARB=0.0304504;OID=.;OPOS=26790109;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:75:39:42:33:33:19:14:10:29:19:14:13:29 chr10 26991067 . CG C 25.17 PASS AO=19;DP=98;FAO=19;FDP=95;FR=.;FRO=76;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=63;FWDB=0.0290974;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.323;QD=1.05987;RBI=0.0290974;REFB=-0.0068732;REVB=-1.70129e-05;RO=76;SAF=6;SAR=13;SRF=13;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243327;STB=0.64852;TYPE=del;VARB=0.02307;OID=.;OPOS=26991068;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:19:96:19:95:76:6:13:13:63:25:76:6:13:13:63 chr10 27303605 . A T 363.94 PASS AO=101;DP=212;FAO=102;FDP=238;FR=.;FRO=136;FSAF=56;FSAR=46;FSRF=58;FSRR=78;FWDB=-0.0684977;FXX=0.00833299;HRUN=3;LEN=1;MLLD=37.7122;QD=6.11658;RBI=0.0685329;REFB=-0.0633056;REVB=-0.00219686;RO=111;SAF=55;SAR=46;SRF=33;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232076;STB=0.569727;TYPE=snp;VARB=0.0546661;OID=.;OPOS=27303605;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:238:111:136:101:102:46:55:33:78:46:56:58:78 chr10 27317778 . T C 244.61 PASS AO=75;DP=189;FAO=75;FDP=189;FR=.;FRO=114;FSAF=40;FSAR=35;FSRF=57;FSRR=57;FWDB=-0.0132876;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.555;QD=5.17686;RBI=0.0148264;REFB=-0.0111683;REVB=0.0065773;RO=112;SAF=40;SAR=35;SRF=57;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0260646;STB=0.520136;TYPE=snp;VARB=0.0198087;OID=.;OPOS=27317778;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:189:112:114:75:75:35:40:57:55:35:40:57:57 chr10 27317840 . C T 191.79 PASS AO=69;DP=196;FAO=69;FDP=196;FR=.;FRO=127;FSAF=34;FSAR=35;FSRF=61;FSRR=66;FWDB=-0.014681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.2409;QD=3.91404;RBI=0.0147298;REFB=-0.0111585;REVB=-0.00119735;RO=125;SAF=34;SAR=35;SRF=60;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0144284;STB=0.508061;TYPE=snp;VARB=0.0221107;OID=.;OPOS=27317840;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:196:125:127:69:69:35:34:60:65:35:34:61:66 chr10 27332445 . A G 235.56 PASS AO=65;DP=153;FAO=66;FDP=155;FR=.;FRO=89;FSAF=58;FSAR=8;FSRF=72;FSRR=17;FWDB=0.00574098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.0092;QD=6.07895;RBI=0.0163108;REFB=-0.0102472;REVB=-0.015267;RO=87;SAF=57;SAR=8;SRF=70;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147987;STB=0.582302;TYPE=snp;VARB=0.014917;OID=.;OPOS=27332445;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:155:87:89:65:66:8:57:70:17:8:58:72:17 chr10 27381349 . T C 1247.79 PASS AO=135;DP=136;FAO=134;FDP=136;FR=.;FRO=2;FSAF=57;FSAR=77;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.017127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.0527;QD=36.6996;RBI=0.0534074;REFB=0.0589499;REVB=0.0505867;RO=1;SAF=58;SAR=77;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00613402;STB=0.501122;TYPE=snp;VARB=-0.000479057;OID=.;OPOS=27381349;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:136:136:1:2:135:134:77:58:0:1:77:57:1:1 chr10 27389197 . T C 195.71 PASS AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0113863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.455;QD=39.1418;RBI=0.0222947;REFB=0;REVB=0.0191679;RO=0;SAF=12;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.74346e-05;OID=.;OPOS=27389197;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:20:20:0:0:20:20:8:12:0:0:8:12:0:0 chr10 27400861 . G A 1518.32 PASS AO=158;DP=158;FAO=158;FDP=158;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00943953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.7731;QD=38.4384;RBI=0.042027;REFB=0;REVB=0.0409531;RO=0;SAF=85;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40066e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000164074;OID=.;OPOS=27400861;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:158:158:0:0:158:158:73:85:0:0:73:85:0:0 chr10 27423005 . G A 38.3 PASS AO=13;DP=42;FAO=13;FDP=42;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=21;FSRR=8;FWDB=-0.00373467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.443;QD=3.64808;RBI=0.0811023;REFB=-0.00477478;REVB=-0.0810163;RO=29;SAF=9;SAR=4;SRF=21;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0437464;STB=0.526276;TYPE=snp;VARB=0.00948464;OID=.;OPOS=27423005;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:42:42:29:29:13:13:4:9:21:8:4:9:21:8 chr10 27434483 . G A 455.68 PASS AO=117;DP=260;FAO=119;FDP=261;FR=.;FRO=142;FSAF=69;FSAR=50;FSRF=44;FSRR=98;FWDB=0.0232042;FXX=0.0150938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.823;QD=6.98356;RBI=0.0258569;REFB=-0.00393737;REVB=-0.0114079;RO=139;SAF=67;SAR=50;SRF=43;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.254201;STB=0.64378;TYPE=snp;VARB=0.00654795;OID=.;OPOS=27434483;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:260:261:139:142:117:119:50:67:43:96:50:69:44:98 chr10 27437964 . T C 202.81 PASS AO=50;DP=107;FAO=50;FDP=107;FR=.;FRO=57;FSAF=16;FSAR=34;FSRF=33;FSRR=24;FWDB=0.0245842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.416;QD=7.58155;RBI=0.0249417;REFB=-0.0033528;REVB=-0.00420825;RO=57;SAF=16;SAR=34;SRF=33;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254875;STB=0.642193;TYPE=snp;VARB=0.00254197;OID=.;OPOS=27437964;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:57:57:50:50:34:16:33:24:34:16:33:24 chr10 27442121 . A G 110.31 PASS AO=34;DP=90;FAO=34;FDP=90;FR=.;FRO=56;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=38;FWDB=-0.0225209;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.283;QD=4.90271;RBI=0.0280174;REFB=-0.00278508;REVB=0.0166669;RO=56;SAF=14;SAR=20;SRF=18;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103982;STB=0.559195;TYPE=snp;VARB=0.00588198;OID=.;OPOS=27442121;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:56:56:34:34:20:14:18:38:20:14:18:38 chr10 27459670 . C T 213.46 PASS AO=58;DP=144;FAO=58;FDP=138;FR=.;FRO=80;FSAF=20;FSAR=38;FSRF=39;FSRR=41;FWDB=0.00545649;FXX=0.0482725;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.36;QD=6.18724;RBI=0.00755159;REFB=-0.0194985;REVB=-0.00522047;RO=76;SAF=21;SAR=37;SRF=39;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157385;STB=0.586573;TYPE=snp;VARB=0.0161868;OID=.;OPOS=27459670;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:138:76:80:58:58:37:21:39:37:38:20:39:41 chr10 27475444 . T C 557.5 PASS AO=111;DP=199;FAO=114;FDP=202;FR=.;FRO=88;FSAF=49;FSAR=65;FSRF=28;FSRR=60;FWDB=0.0216506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.407;QD=11.0396;RBI=0.0216539;REFB=-0.0114064;REVB=-0.000376235;RO=88;SAF=47;SAR=64;SRF=28;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0890043;STB=0.550306;TYPE=snp;VARB=0.00837274;OID=.;OPOS=27475444;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:199:202:88:88:111:114:64:47:28:60:65:49:28:60 chr10 27475693 . T C 231.69 PASS AO=69;DP=171;FAO=69;FDP=171;FR=.;FRO=102;FSAF=33;FSAR=36;FSRF=50;FSRR=52;FWDB=-0.0326059;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.808;QD=5.41964;RBI=0.0332013;REFB=0.00392932;REVB=0.00625941;RO=102;SAF=33;SAR=36;SRF=50;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126776;STB=0.507126;TYPE=snp;VARB=-0.0050865;OID=.;OPOS=27475693;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:171:102:102:69:69:36:33:50:52:36:33:50:52 chr10 27538942 . T C 377.77 PASS AO=61;DP=88;FAO=61;FDP=88;FR=.;FRO=27;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.000945448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.0125;QD=17.1713;RBI=0.00147704;REFB=-0.0205335;REVB=0.0011348;RO=27;SAF=31;SAR=30;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0783395;STB=0.542227;TYPE=snp;VARB=0.00465851;OID=.;OPOS=27538942;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:88:88:27:27:61:61:30:31:10:17:30:31:10:17 chr10 27687225 . A G 1990.7 PASS AO=208;DP=208;FAO=207;FDP=207;FR=.;FRO=0;FSAF=113;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0079179;FXX=0.00480746;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.774;QD=38.4676;RBI=0.00812242;REFB=0;REVB=0.00181126;RO=0;SAF=114;SAR=94;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00015498;OID=.;OPOS=27687225;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:94:208:207:0:0:208:207:94:114:0:0:94:113:0:0 chr10 27687775 . T C 2274.02 PASS AO=241;DP=245;FAO=241;FDP=241;FR=.;FRO=0;FSAF=137;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0169865;FXX=0.0163259;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.9078;QD=37.7431;RBI=0.0376335;REFB=-0.0595981;REVB=-0.0335818;RO=2;SAF=137;SAR=104;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00109439;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000281946;OID=.;OPOS=27687775;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:91:245:241:2:0:241:241:104:137:1:1:104:137:0:0 chr10 27687965 . A G 893.85 PASS AO=94;DP=98;FAO=97;FDP=98;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=63;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.108105;FXX=0.019998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.004;QD=36.4837;RBI=0.10836;REFB=-0.0959304;REVB=0.0074341;RO=2;SAF=33;SAR=61;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0278655;STB=0.507245;TYPE=snp;VARB=0.000754;OID=.;OPOS=27687965;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:98:98:2:1:94:97:61:33:2:0:63:34:1:0 chr10 27687994 . A G 523.25 PASS AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195598;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.927;QD=38.0542;RBI=0.0200929;REFB=0;REVB=0.00459745;RO=0;SAF=17;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.97918e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00174337;OID=.;OPOS=27687994;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:55:55:0:0:55:55:38:17:0:0:39:16:0:0 chr10 27692279 . A C 2154.3 PASS AO=222;DP=222;FAO=225;FDP=225;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=168;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.939;QD=38.2986;RBI=0.0455227;REFB=0;REVB=0.0415399;RO=0;SAF=57;SAR=165;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.57407e-05;OID=.;OPOS=27692279;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:222:225:0:0:222:225:165:57:0:0:168:57:0:0 chr10 28228865 . A G 1920.58 PASS AO=204;DP=211;FAO=205;FDP=205;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00310092;FXX=0.0330173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.945;QD=37.4747;RBI=0.0113445;REFB=-0.0194643;REVB=-0.0109124;RO=2;SAF=96;SAR=108;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000545827;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000168569;OID=.;OPOS=28228865;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:211:205:2:0:204:205:108:96:1:1:109:96:0:0 chr10 28378758 . T C 2047.32 PASS AO=236;DP=251;FAO=236;FDP=251;FR=.;FRO=15;FSAF=113;FSAR=123;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.0138528;FXX=0.0039681;HRUN=5;LEN=1;MLLD=188.391;QD=32.6266;RBI=0.0138985;REFB=-0.167304;REVB=-0.00112619;RO=12;SAF=113;SAR=123;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0249811;STB=0.50725;TYPE=snp;VARB=0.000462723;OID=.;OPOS=28378758;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:251:251:12:15:236:236:123:113:9:3:123:113:9:6 chr10 28697028 . C T 205.06 PASS AO=53;DP=118;FAO=53;FDP=118;FR=.;FRO=65;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=29;FSRR=36;FWDB=0.0119612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.163;QD=6.95112;RBI=0.012066;REFB=-0.0176167;REVB=-0.00158692;RO=62;SAF=33;SAR=20;SRF=28;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167858;STB=0.598408;TYPE=snp;VARB=0.0215204;OID=.;OPOS=28697028;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:62:65:53:53:20:33:28:34:20:33:29:36 chr10 28731618 . T C 396.74 PASS AO=94;DP=193;FAO=95;FDP=194;FR=.;FRO=99;FSAF=31;FSAR=64;FSRF=46;FSRR=53;FWDB=-0.00898168;FXX=0.00512794;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.667;QD=8.18011;RBI=0.0116837;REFB=-0.025327;REVB=-0.00747251;RO=98;SAF=31;SAR=63;SRF=45;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128717;STB=0.576021;TYPE=snp;VARB=0.0334592;OID=.;OPOS=28731618;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:194:98:99:94:95:63:31:45:53:64:31:46:53 chr10 28731638 . A T 437 PASS AO=99;DP=194;FAO=100;FDP=196;FR=.;FRO=96;FSAF=48;FSAR=52;FSRF=34;FSRR=62;FWDB=-0.0109755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.957;QD=8.91831;RBI=0.0120136;REFB=-0.0137101;REVB=-0.00488532;RO=95;SAF=47;SAR=52;SRF=34;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105345;STB=0.562026;TYPE=snp;VARB=0.0151422;OID=.;OPOS=28731638;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:196:95:96:99:100:52:47:34:61:52:48:34:62 chr10 28909299 . GT G 1301.71 PASS AO=158;DP=179;FAO=169;FDP=169;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0142953;FXX=0.0231201;HRUN=2;LEN=1;MLLD=24.2737;QD=30.8097;RBI=0.0146401;REFB=0;REVB=0.00315846;RO=1;SAF=56;SAR=102;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00841985;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-4.65024e-05;OID=.;OPOS=28909300;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:158:172:169:169:0:65:104:0:0:99:1:56:102:1:0 chr10 28970487 . C T 178.58 PASS AO=33;DP=54;FAO=33;FDP=55;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0177198;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.479;QD=12.9874;RBI=0.0276825;REFB=-0.0399931;REVB=0.021268;RO=21;SAF=12;SAR=21;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0837946;STB=0.538438;TYPE=snp;VARB=0.0156839;OID=.;OPOS=28970487;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:54:55:21:22:33:33:21:12:10:11:21:12:10:12 chr10 28971525 . CT C 668.11 PASS AO=76;DP=111;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00269333;FXX=0.0194156;HRUN=4;LEN=1;MLLD=13.7915;QD=26.4598;RBI=0.0424209;REFB=0;REVB=0.0423353;RO=2;SAF=33;SAR=43;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0215001;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.000273865;OID=.;OPOS=28971526;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:76:101:101:101:0:49:52:0:0:63:2:33:43:0:2 chr10 29136228 . C G 183.75 PASS AO=46;DP=101;FAO=46;FDP=100;FR=.;FRO=54;FSAF=36;FSAR=10;FSRF=37;FSRR=17;FWDB=-0.0172065;FXX=0.0291234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.2046;QD=7.34994;RBI=0.0252053;REFB=-0.0194566;REVB=-0.0184186;RO=52;SAF=36;SAR=10;SRF=35;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13877;STB=0.57106;TYPE=snp;VARB=0.0205601;OID=.;OPOS=29136228;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:100:52:54:46:46:10:36:35:17:10:36:37:17 chr10 29163413 . G A 176.29 PASS AO=41;DP=84;FAO=41;FDP=84;FR=.;FRO=43;FSAF=8;FSAR=33;FSRF=12;FSRR=31;FWDB=-0.00746559;FXX=0.0117633;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.247;QD=8.39454;RBI=0.00773306;REFB=-0.00414658;REVB=-0.00201623;RO=42;SAF=8;SAR=33;SRF=12;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119714;STB=0.563107;TYPE=snp;VARB=0.00340819;OID=.;OPOS=29163413;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:42:43:41:41:33:8:12:30:33:8:12:31 chr10 29578084 . A G 68.6 PASS AO=28;DP=87;FAO=27;FDP=87;FR=.;FRO=60;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=44;FWDB=-0.00289431;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5778;QD=3.15417;RBI=0.0651444;REFB=0.000171981;REVB=-0.0650801;RO=51;SAF=14;SAR=14;SRF=8;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.39337;STB=0.6499;TYPE=snp;VARB=-0.00220108;OID=.;OPOS=29578084;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:87:87:51:60:28:27:14:14:8:43:14:13:16:44 chr10 29581524 . T C 482.29 PASS AO=111;DP=222;FAO=112;FDP=221;FR=.;FRO=109;FSAF=69;FSAR=43;FSRF=67;FSRR=42;FWDB=-0.0240914;FXX=0.0133923;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.075;QD=8.72917;RBI=0.024912;REFB=-0.0122711;REVB=0.00634126;RO=103;SAF=68;SAR=43;SRF=64;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00811762;STB=0.500726;TYPE=snp;VARB=0.0147816;OID=.;OPOS=29581524;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:221:103:109:111:112:43:68:64:39:43:69:67:42 chr10 29599972 . G A 1675.87 PASS AO=179;DP=182;FAO=179;FDP=179;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=116;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164192;FXX=0.0164826;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.9599;QD=37.4497;RBI=0.016676;REFB=-0.106866;REVB=-0.0029157;RO=2;SAF=63;SAR=116;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0148702;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00154128;OID=.;OPOS=29599972;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:182:179:2:0:179:179:116:63:2:0:116:63:0:0 chr10 29783856 . C T 43.29 PASS AO=37;DP=163;FAO=38;FDP=187;FR=.;FRO=149;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=87;FSRR=62;FWDB=-0.00584431;FXX=0.0157886;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.041;QD=0.926063;RBI=0.100133;REFB=-0.00476574;REVB=-0.0999625;RO=126;SAF=20;SAR=17;SRF=85;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175576;STB=0.546204;TYPE=snp;VARB=0.0455927;OID=.;OPOS=29783856;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:163:187:126:149:37:38:17:20:85:41:18:20:87:62 chr10 29783885 . A G 128.83 PASS AO=66;DP=236;FAO=66;FDP=236;FR=.;FRO=170;FSAF=31;FSAR=35;FSRF=100;FSRR=70;FWDB=-0.00631426;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.599;QD=2.18355;RBI=0.00673315;REFB=-0.004969;REVB=0.00233785;RO=168;SAF=31;SAR=35;SRF=100;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15298;STB=0.584796;TYPE=snp;VARB=0.00951241;OID=.;OPOS=29783885;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:236:236:168:170:66:66:35:31:100:68:35:31:100:70 chr10 29783908 . A G 394.43 PASS AO=111;DP=260;FAO=111;FDP=259;FR=.;FRO=148;FSAF=61;FSAR=50;FSRF=89;FSRR=59;FWDB=-0.00753938;FXX=0.00384601;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.235;QD=6.0916;RBI=0.029384;REFB=-0.020494;REVB=-0.0284003;RO=148;SAF=61;SAR=50;SRF=89;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0540696;STB=0.530067;TYPE=snp;VARB=0.0221194;OID=.;OPOS=29783908;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:260:259:148:148:111:111:50:61:89:59:50:61:89:59 chr10 29784072 . G C 706.6 PASS AO=115;DP=166;FAO=115;FDP=165;FR=.;FRO=50;FSAF=76;FSAR=39;FSRF=19;FSRR=31;FWDB=0.0143728;FXX=0.00602373;HRUN=3;LEN=1;MLLD=183.94;QD=17.1297;RBI=0.0372349;REFB=-0.0168332;REVB=0.0343491;RO=49;SAF=76;SAR=39;SRF=18;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171403;STB=0.589458;TYPE=snp;VARB=0.00786545;OID=.;OPOS=29784072;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:165:49:50:115:115:39:76:18:31:39:76:19:31 chr10 29784114 . T C 974.7 PASS AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00278585;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.3211;QD=37.8523;RBI=0.0342369;REFB=0;REVB=-0.0341234;RO=0;SAF=64;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.61171e-05;OID=.;OPOS=29784114;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:103:103:0:0:103:103:39:64:0:0:39:64:0:0 chr10 29821475 . G A 169.96 PASS AO=38;DP=74;FAO=38;FDP=75;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=28;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.026575;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.5616;QD=9.06461;RBI=0.0396552;REFB=-0.0211054;REVB=-0.029433;RO=36;SAF=10;SAR=28;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183886;STB=0.611588;TYPE=snp;VARB=0.0220195;OID=.;OPOS=29821475;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:75:36:37:38:38:28:10:16:20:28:10:17:20 chr10 29822032 . C T 826.24 PASS AO=90;DP=93;FAO=92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0327613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.9519;QD=35.5372;RBI=0.0711043;REFB=-0.0707081;REVB=0.0631072;RO=3;SAF=49;SAR=41;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129843;STB=0.505049;TYPE=snp;VARB=0.0018303;OID=.;OPOS=29822032;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:93:93:3:1:90:92:41:49:1:2:43:49:1:0 chr10 29839798 . A G 228.22 PASS AO=42;DP=137;FAO=60;FDP=137;FR=.,HEALED;FRO=77;FSAF=35;FSAR=25;FSRF=49;FSRR=28;FWDB=0.00159451;FXX=0.0143875;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.292;QD=6.66324;RBI=0.0240474;REFB=-0.0174841;REVB=-0.0239945;RO=51;SAF=24;SAR=18;SRF=37;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158846;STB=0.530963;TYPE=snp;VARB=0.0238637;OID=.;OPOS=29839798;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:137:51:77:42:60:18:24:37:14:25:35:49:28 chr10 29839864 . A C 470.42 PASS AO=120;DP=259;FAO=120;FDP=258;FR=.;FRO=138;FSAF=52;FSAR=68;FSRF=69;FSRR=69;FWDB=-0.131372;FXX=0.00386085;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.736;QD=7.29336;RBI=0.133426;REFB=-0.0196291;REVB=-0.0233256;RO=137;SAF=52;SAR=68;SRF=68;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0613615;STB=0.53595;TYPE=snp;VARB=0.0182961;OID=.;OPOS=29839864;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:259:258:137:138:120:120:68:52:68:69:68:52:69:69 chr10 29891260 . C T 2846.95 PASS AO=296;DP=297;FAO=296;FDP=296;FR=.;FRO=0;FSAF=139;FSAR=157;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00368433;FXX=0.00671118;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.737;QD=38.4723;RBI=0.00498764;REFB=0;REVB=0.00336188;RO=0;SAF=139;SAR=157;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.89347e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.94105e-06;OID=.;OPOS=29891260;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:297:296:0:0:296:296:157:139:0:0:157:139:0:0 chr10 30306804 . G A 292.91 PASS AO=58;DP=104;FAO=58;FDP=101;FR=.;FRO=43;FSAF=32;FSAR=26;FSRF=14;FSRR=29;FWDB=-0.00685275;FXX=0.0288434;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.6699;QD=11.6004;RBI=0.00751053;REFB=-0.0092509;REVB=0.00307375;RO=43;SAF=32;SAR=26;SRF=14;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174793;STB=0.595367;TYPE=snp;VARB=0.007827;OID=.;OPOS=30306804;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:101:43:43:58:58:26:32:14:29:26:32:14:29 chr10 30316072 . C G 297.55 PASS AO=76;DP=170;FAO=78;FDP=171;FR=.;FRO=93;FSAF=48;FSAR=30;FSRF=73;FSRR=20;FWDB=-0.0122192;FXX=0.0172404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.7829;QD=6.96033;RBI=0.0349885;REFB=-0.0342407;REVB=0.0327854;RO=92;SAF=48;SAR=28;SRF=73;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1821;STB=0.601966;TYPE=snp;VARB=0.04286;OID=.;OPOS=30316072;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:171:92:93:76:78:28:48:73:19:30:48:73:20 chr10 30317073 . G A 297.09 PASS AO=66;DP=133;FAO=66;FDP=129;FR=.;FRO=63;FSAF=30;FSAR=36;FSRF=25;FSRR=38;FWDB=0.0178236;FXX=0.0300729;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.831;QD=9.21202;RBI=0.0242885;REFB=-0.0255385;REVB=0.0165001;RO=63;SAF=30;SAR=36;SRF=25;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.051932;STB=0.528563;TYPE=snp;VARB=0.0164077;OID=.;OPOS=30317073;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:129:63:63:66:66:36:30:25:38:36:30:25:38 chr10 30317949 . C T 99.94 PASS AO=26;DP=64;FAO=27;FDP=65;FR=.;FRO=38;FSAF=23;FSAR=4;FSRF=32;FSRR=6;FWDB=0.00439246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.561;QD=6.15034;RBI=0.0100423;REFB=-0.00820903;REVB=0.00903077;RO=38;SAF=22;SAR=4;SRF=32;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00802165;STB=0.511103;TYPE=snp;VARB=0.0110754;OID=.;OPOS=30317949;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:65:38:38:26:27:4:22:32:6:4:23:32:6 chr10 30629226 . G A 348.78 PASS AO=85;DP=177;FAO=85;FDP=177;FR=.;FRO=92;FSAF=50;FSAR=35;FSRF=43;FSRR=49;FWDB=0.0116482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.06;QD=7.88203;RBI=0.0186042;REFB=-0.0126721;REVB=0.0145065;RO=92;SAF=50;SAR=35;SRF=43;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114721;STB=0.563365;TYPE=snp;VARB=0.0143644;OID=.;OPOS=30629226;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:177:92:92:85:85:35:50:43:49:35:50:43:49 chr10 30901756 . G A 181.07 PASS AO=50;DP=122;FAO=51;FDP=122;FR=.;FRO=71;FSAF=12;FSAR=39;FSRF=46;FSRR=25;FWDB=-0.00285967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.009;QD=5.93679;RBI=0.00337578;REFB=-0.0135544;REVB=-0.00179393;RO=69;SAF=12;SAR=38;SRF=44;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.421765;STB=0.746436;TYPE=snp;VARB=0.0174917;OID=.;OPOS=30901756;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:69:71:50:51:38:12:44:25:39:12:46:25 chr10 30918549 . G C 96.33 PASS AO=48;DP=190;FAO=52;FDP=194;FR=.;FRO=142;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=83;FSRR=59;FWDB=0.0039058;FXX=0.00512794;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.8;QD=1.98628;RBI=0.0155051;REFB=-0.0124457;REVB=-0.0150051;RO=140;SAF=22;SAR=26;SRF=81;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149073;STB=0.575574;TYPE=snp;VARB=0.0310258;OID=.;OPOS=30918549;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:190:194:140:142:48:52:26:22:81:59:27:25:83:59 chr10 30918597 . T C 23.64 PASS AO=25;DP=132;FAO=24;FDP=132;FR=.;FRO=108;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=53;FSRR=55;FWDB=-0.0101475;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2951;QD=0.716454;RBI=0.0177379;REFB=0.00320651;REVB=-0.0145486;RO=107;SAF=12;SAR=13;SRF=52;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00762854;STB=0.507569;TYPE=snp;VARB=-0.00942781;OID=.;OPOS=30918597;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:132:132:107:108:25:24:13:12:52:55:12:12:53:55 chr10 30989188 . G C 2011.79 PASS AO=180;DP=180;FAO=211;FDP=211;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=127;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0916014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.039;QD=38.1382;RBI=0.0920677;REFB=0;REVB=0.0092545;RO=0;SAF=60;SAR=120;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.16765e-05;OID=.;OPOS=30989188;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:180:211:0:0:180:211:120:60:0:0:127:84:0:0 chr10 30993404 . G A 1277.92 PASS AO=134;DP=134;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0720384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.2387;QD=38.1468;RBI=0.0720387;REFB=0;REVB=-0.000216954;RO=0;SAF=74;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.74051e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000337797;OID=.;OPOS=30993404;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:134:134:0:0:134:134:60:74:0:0:60:74:0:0 chr10 30993448 . G A 1512.03 PASS AO=157;DP=159;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0268971;FXX=0.0125778;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.286;QD=38.5231;RBI=0.0528407;REFB=0;REVB=0.0454828;RO=0;SAF=95;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000195769;OID=.;OPOS=30993448;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:159:157:0:0:157:157:62:95:0:0:62:95:0:0 chr10 31001494 . A C 977.74 PASS AO=121;DP=135;FAO=121;FDP=135;FR=.;FRO=14;FSAF=84;FSAR=37;FSRF=2;FSRR=12;FWDB=0.0380162;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=66.3281;QD=28.9702;RBI=0.0387102;REFB=-0.0430729;REVB=0.00729677;RO=6;SAF=84;SAR=37;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0710388;STB=0.563979;TYPE=snp;VARB=0.000810963;OID=.;OPOS=31001494;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:135:135:6:14:121:121:37:84:0:6:37:84:2:12 chr10 31651824 . T C 69.2 PASS AO=19;DP=56;FAO=21;FDP=58;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=0.0137445;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.877;QD=4.77249;RBI=0.026964;REFB=0.00113347;REVB=-0.023198;RO=37;SAF=8;SAR=11;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0438589;STB=0.510698;TYPE=snp;VARB=-0.00230639;OID=.;OPOS=31651824;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:56:58:37:37:19:21:11:8:17:20:11:10:17:20 chr10 32045044 . CA C,CC 385.01 PASS AO=8,34;DP=43;FAO=39,0;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=11,0;FSAR=28,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0493771,-0.0910884;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=192.884,180.944;QD=39.4884;RBI=0.14796,0.196192;REFB=0,0;REVB=-0.139478,-0.173765;RO=0;SAF=4,7;SAR=4,27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.32246e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.000867163,0;OID=.,.;OPOS=32045045,32045045;OREF=A,A;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:8,34:42:39,0:39:0:11,0:28,0:0:0:18:0:4,7:4,27:0:0 chr10 32095666 . T C 255.71 PASS AO=54;DP=101;FAO=54;FDP=101;FR=.;FRO=47;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=17;FSRR=30;FWDB=-0.0208341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.733;QD=10.1271;RBI=0.0265378;REFB=-0.0180762;REVB=-0.0164376;RO=47;SAF=26;SAR=28;SRF=17;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102054;STB=0.556027;TYPE=snp;VARB=0.0139404;OID=.;OPOS=32095666;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:47:47:54:54:28:26:17:30:28:26:17:30 chr10 32098213 . G A 342.59 PASS AO=88;DP=189;FAO=87;FDP=188;FR=.;FRO=101;FSAF=46;FSAR=41;FSRF=51;FSRR=50;FWDB=-0.0291684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.652;QD=7.28908;RBI=0.0310468;REFB=-0.00978687;REVB=-0.0106351;RO=100;SAF=46;SAR=42;SRF=50;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218727;STB=0.512799;TYPE=snp;VARB=0.00976841;OID=.;OPOS=32098213;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:188:100:101:88:87:42:46:50:50:41:46:51:50 chr10 32120678 . C T 77.68 PASS AO=24;DP=85;FAO=31;FDP=91;FR=.;FRO=60;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=38;FSRR=22;FWDB=0.0123855;FXX=0.0108684;HRUN=3;LEN=1;MLLD=29.4657;QD=3.41464;RBI=0.156723;REFB=-0.019089;REVB=0.156233;RO=61;SAF=15;SAR=9;SRF=39;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0185013;STB=0.577697;TYPE=snp;VARB=0.0485711;OID=.;OPOS=32120678;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:85:91:61:60:24:31:9:15:39:22:15:16:38:22 chr10 32128611 . A G 113.41 PASS AO=30;DP=71;FAO=30;FDP=71;FR=.;FRO=41;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=-0.00471531;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=220.109;QD=6.38911;RBI=0.0137998;REFB=-0.00915087;REVB=-0.0129692;RO=41;SAF=11;SAR=19;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199846;STB=0.613409;TYPE=snp;VARB=0.013394;OID=.;OPOS=32128611;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:41:41:30:30:19:11:23:18:19:11:23:18 chr10 32141460 . T C 261.86 PASS AO=65;DP=139;FAO=65;FDP=139;FR=.;FRO=74;FSAF=37;FSAR=28;FSRF=47;FSRR=27;FWDB=0.00594706;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=254.874;QD=7.53567;RBI=0.034869;REFB=-0.0149186;REVB=0.0343581;RO=74;SAF=37;SAR=28;SRF=47;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0652099;STB=0.536119;TYPE=snp;VARB=0.0189682;OID=.;OPOS=32141460;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:74:74:65:65:28:37:47:27:28:37:47:27 chr10 32345710 . G A 3563.29 PASS AO=374;DP=379;FAO=374;FDP=374;FR=.;FRO=0;FSAF=186;FSAR=188;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103144;FXX=0.0131923;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.321;QD=38.11;RBI=0.048441;REFB=-0.0176659;REVB=0.0473302;RO=2;SAF=186;SAR=188;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.71557e-05;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.42319e-05;OID=.;OPOS=32345710;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:379:374:2:0:374:374:188:186:1:1:188:186:0:0 chr10 32580205 . C T 385.95 PASS AO=87;DP=169;FAO=87;FDP=170;FR=.;FRO=83;FSAF=43;FSAR=44;FSRF=28;FSRR=55;FWDB=-0.011212;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.216;QD=9.08128;RBI=0.0264069;REFB=-0.0393835;REVB=-0.0239085;RO=82;SAF=43;SAR=44;SRF=27;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146501;STB=0.576734;TYPE=snp;VARB=0.0384243;OID=.;OPOS=32580205;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:170:82:83:87:87:44:43:27:55:44:43:28:55 chr10 32974969 . A G 426.23 PASS AO=48;DP=51;FAO=48;FDP=50;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0263036;FXX=0.019604;HRUN=3;LEN=1;MLLD=71.3844;QD=34.0985;RBI=0.0313599;REFB=-0.0713163;REVB=-0.0170752;RO=0;SAF=24;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00151449;OID=.;OPOS=32974969;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:51:50:0:2:48:48:24:24:0:0:24:24:1:1 chr10 33018351 . G C 2988.13 PASS AO=309;DP=313;FAO=311;FDP=311;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=233;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0282974;FXX=0.0220119;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.411;QD=38.4326;RBI=0.0283135;REFB=0;REVB=0.000954669;RO=0;SAF=81;SAR=228;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00023219;OID=.;OPOS=33018351;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:313:311:0:0:309:311:228:81:0:0:233:78:0:0 chr10 33123824 . G C 1318.09 PASS AO=137;DP=139;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017395;FXX=0.0143875;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.613;QD=38.4845;RBI=0.024112;REFB=0;REVB=0.0166974;RO=0;SAF=46;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.02998e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.9825e-05;OID=.;OPOS=33123824;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:139:137:0:0:137:137:91:46:0:0:91:46:0:0 chr10 33143396 . G A 1373.99 PASS AO=143;DP=143;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0275161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.9966;QD=38.1664;RBI=0.0287026;REFB=0;REVB=0.00816712;RO=0;SAF=56;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.32469e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.7656e-05;OID=.;OPOS=33143396;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:143:144:0:0:143:144:87:56:0:0:88:56:0:0 chr10 33190285 . G A 109.44 PASS AO=38;DP=108;FAO=38;FDP=109;FR=.;FRO=71;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=46;FWDB=-0.0214132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.362;QD=4.0162;RBI=0.0238484;REFB=-0.0135699;REVB=-0.0104987;RO=70;SAF=16;SAR=22;SRF=25;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0750528;STB=0.54671;TYPE=snp;VARB=0.0225229;OID=.;OPOS=33190285;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:109:70:71:38:38:22:16:25:45:22:16:25:46 chr10 33190567 . C A 155.14 PASS AO=41;DP=101;FAO=43;FDP=103;FR=.;FRO=60;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=11;FSRR=49;FWDB=0.0227859;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=329.207;QD=6.025;RBI=0.0228544;REFB=-0.0081244;REVB=0.00176841;RO=56;SAF=17;SAR=24;SRF=9;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.287235;STB=0.63649;TYPE=snp;VARB=0.00871651;OID=.;OPOS=33190567;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:103:56:60:41:43:24:17:9:47:26:17:11:49 chr10 33209266 . G T 398.76 PASS AO=113;DP=265;FAO=113;FDP=264;FR=.;FRO=151;FSAF=59;FSAR=54;FSRF=82;FSRR=69;FWDB=0.000755891;FXX=0.00377344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.749;QD=6.04187;RBI=0.0214657;REFB=-0.0210656;REVB=0.0214524;RO=150;SAF=59;SAR=54;SRF=82;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0252379;STB=0.512001;TYPE=snp;VARB=0.0241072;OID=.;OPOS=33209266;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:265:264:150:151:113:113:54:59:82:68:54:59:82:69 chr10 33211227 . T G 385.9 PASS AO=102;DP=226;FAO=102;FDP=226;FR=.;FRO=124;FSAF=51;FSAR=51;FSRF=65;FSRR=59;FWDB=-0.0422581;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.9243;QD=6.83;RBI=0.0431615;REFB=-0.0153932;REVB=0.00878461;RO=123;SAF=51;SAR=51;SRF=64;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200516;STB=0.513272;TYPE=snp;VARB=0.0160104;OID=.;OPOS=33211227;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:226:226:123:124:102:102:51:51:64:59:51:51:65:59 chr10 33214802 . A G 345.68 PASS AO=77;DP=149;FAO=77;FDP=149;FR=.;FRO=72;FSAF=33;FSAR=44;FSRF=31;FSRR=41;FWDB=-0.0198142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.938;QD=9.27991;RBI=0.0218624;REFB=-0.00117673;REVB=0.0092393;RO=72;SAF=33;SAR=44;SRF=31;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00178134;STB=0.500978;TYPE=snp;VARB=0.00147604;OID=.;OPOS=33214802;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:72:72:77:77:44:33:31:41:44:33:31:41 chr10 33217110 . G A 435.8 PASS AO=100;DP=204;FAO=103;FDP=207;FR=.;FRO=104;FSAF=62;FSAR=41;FSRF=39;FSRR=65;FWDB=0.0155565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.631;QD=8.42121;RBI=0.0183672;REFB=-0.0220399;REVB=-0.00976473;RO=103;SAF=59;SAR=41;SRF=39;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19383;STB=0.613438;TYPE=snp;VARB=0.0197987;OID=.;OPOS=33217110;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:207:103:104:100:103:41:59:39:64:41:62:39:65 chr10 33468014 . T C 202.09 PASS AO=56;DP=132;FAO=56;FDP=132;FR=.;FRO=76;FSAF=13;FSAR=43;FSRF=35;FSRR=41;FWDB=-0.0125931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.452;QD=6.12382;RBI=0.0127352;REFB=-0.029815;REVB=0.00189727;RO=73;SAF=13;SAR=43;SRF=33;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260404;STB=0.653933;TYPE=snp;VARB=0.039453;OID=.;OPOS=33468014;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:73:76:56:56:43:13:33:40:43:13:35:41 chr10 33468456 . C T 406.06 PASS AO=95;DP=191;FAO=95;FDP=191;FR=.;FRO=96;FSAF=45;FSAR=50;FSRF=43;FSRR=53;FWDB=0.0267053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.809;QD=8.50392;RBI=0.0382109;REFB=-0.0117169;REVB=0.0273295;RO=95;SAF=45;SAR=50;SRF=43;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192243;STB=0.513002;TYPE=snp;VARB=0.00909015;OID=.;OPOS=33468456;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:191:191:95:96:95:95:50:45:43:52:50:45:43:53 chr10 33469181 . A G 499.9 PASS AO=94;DP=172;FAO=101;FDP=179;FR=.;FRO=78;FSAF=39;FSAR=62;FSRF=19;FSRR=59;FWDB=0.0202588;FXX=0.00555525;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.637;QD=11.1709;RBI=0.0209903;REFB=-0.0475632;REVB=-0.00549307;RO=77;SAF=34;SAR=60;SRF=19;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106389;STB=0.567516;TYPE=snp;VARB=0.0334903;OID=.;OPOS=33469181;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:179:77:78:94:101:60:34:19:58:62:39:19:59 chr10 33495267 . C T 280.44 PASS AO=84;DP=208;FAO=84;FDP=207;FR=.;FRO=123;FSAF=34;FSAR=50;FSRF=57;FSRR=66;FWDB=0.014196;FXX=0.00480746;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.692;QD=5.4191;RBI=0.0176143;REFB=-0.00641666;REVB=0.0104277;RO=123;SAF=34;SAR=50;SRF=57;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0635407;STB=0.535664;TYPE=snp;VARB=0.00850531;OID=.;OPOS=33495267;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:207:123:123:84:84:50:34:57:66:50:34:57:66 chr10 33502240 . C T 403.9 PASS AO=104;DP=234;FAO=108;FDP=240;FR=.;FRO=132;FSAF=46;FSAR=62;FSRF=43;FSRR=89;FWDB=0.0665784;FXX=0.00414921;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.7975;QD=6.7316;RBI=0.0671853;REFB=-0.00959359;REVB=0.00901032;RO=125;SAF=44;SAR=60;SRF=43;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0810754;STB=0.557275;TYPE=snp;VARB=0.0106738;OID=.;OPOS=33502240;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:234:240:125:132:104:108:60:44:43:82:62:46:43:89 chr10 33510663 . G A 508.27 PASS AO=128;DP=275;FAO=129;FDP=275;FR=.;FRO=146;FSAF=75;FSAR=54;FSRF=69;FSRR=77;FWDB=0.0139593;FXX=0.00362306;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.793;QD=7.39299;RBI=0.0152414;REFB=-0.0018181;REVB=0.00611883;RO=145;SAF=74;SAR=54;SRF=69;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0991443;STB=0.558198;TYPE=snp;VARB=0.00228141;OID=.;OPOS=33510663;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:275:275:145:146:128:129:54:74:69:76:54:75:69:77 chr10 33510768 . G A 238.13 PASS AO=69;DP=171;FAO=71;FDP=176;FR=.;FRO=105;FSAF=57;FSAR=14;FSRF=48;FSRR=57;FWDB=-0.00125533;FXX=0.115572;HRUN=4;LEN=1;MLLD=110.327;QD=5.41208;RBI=0.0351573;REFB=-0.0054076;REVB=-0.0351349;RO=101;SAF=56;SAR=13;SRF=46;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.425636;STB=0.733479;TYPE=snp;VARB=0.00359434;OID=.;OPOS=33510768;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:176:101:105:69:71:13:56:46:55:14:57:48:57 chr10 33552695 . C T 420.38 PASS AO=103;DP=214;FAO=103;FDP=214;FR=.;FRO=111;FSAF=41;FSAR=62;FSRF=49;FSRR=62;FWDB=-0.0137563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.842;QD=7.85762;RBI=0.014098;REFB=-0.00651925;REVB=0.00308476;RO=109;SAF=41;SAR=62;SRF=49;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0495497;STB=0.523251;TYPE=snp;VARB=0.00636068;OID=.;OPOS=33552695;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:214:109:111:103:103:62:41:49:60:62:41:49:62 chr10 33552696 . A G 1990.3 PASS AO=210;DP=213;FAO=210;FDP=210;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196162;FXX=0.0140838;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.901;QD=37.9105;RBI=0.0259491;REFB=0.0280013;REVB=0.016987;RO=1;SAF=95;SAR=115;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00412462;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.04251e-05;OID=.;OPOS=33552696;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:213:210:1:0:210:210:115:95:0:1:115:95:0:0 chr10 33577361 . G A 190.82 PASS AO=56;DP=136;FAO=56;FDP=138;FR=.;FRO=82;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=25;FSRR=57;FWDB=0.0279871;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5436;QD=5.53099;RBI=0.062869;REFB=0.0110002;REVB=0.0562959;RO=80;SAF=23;SAR=33;SRF=25;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108839;STB=0.56648;TYPE=snp;VARB=-0.0171031;OID=.;OPOS=33577361;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:138:80:82:56:56:33:23:25:55:33:23:25:57 chr10 34408636 . T C 612.61 PASS AO=46;DP=70;FAO=64;FDP=64;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=24;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0690152;FXX=0.0302984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.013;QD=38.2883;RBI=0.0782202;REFB=0;REVB=0.0368144;RO=0;SAF=21;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.85991e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000230423;OID=.;OPOS=34408636;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:67:64:0:0:46:64:25:21:0:0:40:24:0:0 chr10 34591402 . C T 961.31 PASS AO=101;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0116891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.0272;QD=38.0717;RBI=0.0137642;REFB=0;REVB=-0.00726761;RO=0;SAF=56;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.15371e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.41857e-05;OID=.;OPOS=34591402;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:101:101:0:0:101:101:45:56:0:0:45:56:0:0 chr10 34688287 . G A 1108.81 PASS AO=116;DP=116;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00764612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.3765;QD=38.2348;RBI=0.0260838;REFB=0;REVB=0.024938;RO=0;SAF=48;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.21597e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000102537;OID=.;OPOS=34688287;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:116:116:0:0:116:116:68:48:0:0:68:48:0:0 chr10 35215790 . C G 158.77 PASS AO=12;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0154831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.3776;QD=37.3575;RBI=0.018498;REFB=0;REVB=0.0101218;RO=0;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000151239;OID=.;OPOS=35215790;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:17:17:0:0:12:17:8:4:0:0:12:5:0:0 chr10 35299085 . C T 330.14 PASS AO=87;DP=194;FAO=87;FDP=193;FR=.;FRO=106;FSAF=47;FSAR=40;FSRF=55;FSRR=51;FWDB=-0.00658303;FXX=0.00515437;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.7724;QD=6.84234;RBI=0.0464228;REFB=-0.0246226;REVB=-0.0459537;RO=105;SAF=47;SAR=40;SRF=54;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0256745;STB=0.511784;TYPE=snp;VARB=0.0276296;OID=.;OPOS=35299085;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:193:105:106:87:87:40:47:54:51:40:47:55:51 chr10 35363104 . C T 335.63 PASS AO=72;DP=134;FAO=72;FDP=134;FR=.;FRO=62;FSAF=34;FSAR=38;FSRF=31;FSRR=31;FWDB=-0.0469123;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2107;QD=10.0187;RBI=0.0516293;REFB=-0.0197233;REVB=0.0215598;RO=62;SAF=34;SAR=38;SRF=31;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0234924;STB=0.51287;TYPE=snp;VARB=0.021723;OID=.;OPOS=35363104;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:62:62:72:72:38:34:31:31:38:34:31:31 chr10 35772402 . G A 182.6 PASS AO=40;DP=77;FAO=40;FDP=78;FR=.;FRO=38;FSAF=8;FSAR=32;FSRF=9;FSRR=29;FWDB=-0.0690306;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.049;QD=9.36424;RBI=0.0690933;REFB=-0.0142932;REVB=0.00294372;RO=37;SAF=8;SAR=32;SRF=8;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0216373;STB=0.527118;TYPE=snp;VARB=0.0157969;OID=.;OPOS=35772402;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:78:37:38:40:40:32:8:8:29:32:8:9:29 chr10 35897232 . CG C 14.28 PASS AO=2;DP=9;FAO=3;FDP=9;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.011256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.237;QD=6.34726;RBI=0.011256;REFB=0.00762726;REVB=0;RO=5;SAF=2;SAR=0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.0148277;OID=.;OPOS=35897233;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:2:9:3:9:6:3:0:6:0:14:5:2:0:5:0 chr10 36723415 . C A 250.89 PASS AO=73;DP=201;FAO=79;FDP=202;FR=.;FRO=123;FSAF=49;FSAR=30;FSRF=71;FSRR=52;FWDB=0.00304007;FXX=0.0146334;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.863;QD=4.96804;RBI=0.0157207;REFB=-0.011651;REVB=-0.0154239;RO=107;SAF=44;SAR=29;SRF=65;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0052416;STB=0.527428;TYPE=snp;VARB=0.0191473;OID=.;OPOS=36723415;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:202:107:123:73:79:29:44:65:42:30:49:71:52 chr10 36812362 . C T 3504.88 PASS AO=372;DP=378;FAO=372;FDP=372;FR=.;FRO=0;FSAF=156;FSAR=216;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00756401;FXX=0.0158726;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.6968;QD=37.6869;RBI=0.0128837;REFB=-0.112691;REVB=-0.0104295;RO=4;SAF=156;SAR=216;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00875345;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00170498;OID=.;OPOS=36812362;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:378:372:4:0:372:372:216:156:0:4:216:156:0:0 chr10 37431019 . C T 17.6 PASS AO=7;DP=36;FAO=8;FDP=36;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=22;FWDB=0.0308581;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=128.811;QD=1.955;RBI=0.048594;REFB=-0.021577;REVB=-0.0375387;RO=28;SAF=7;SAR=0;SRF=6;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.798588;STB=0.924475;TYPE=snp;VARB=0.0198544;OID=.;OPOS=37431019;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:36:36:28:28:7:8:0:7:6:22:1:7:6:22 chr10 37508450 . A C 868.74 PASS AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00608764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.474;QD=38.6106;RBI=0.00619272;REFB=0;REVB=-0.00113592;RO=0;SAF=41;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.12361e-05;OID=.;OPOS=37508450;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:90:90:0:0:90:90:49:41:0:0:49:41:0:0 chr10 37890955 . G A 943.56 PASS AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127596;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.611;QD=38.5127;RBI=0.0253575;REFB=0;REVB=-0.0219133;RO=0;SAF=44;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40252e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.16782e-05;OID=.;OPOS=37890955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:98:98:0:0:98:98:54:44:0:0:55:43:0:0 chr10 37891465 . G T 1163.3 PASS AO=128;DP=129;FAO=126;FDP=129;FR=.;FRO=3;FSAF=48;FSAR=78;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0397857;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2496;QD=36.0712;RBI=0.0399647;REFB=0.0679655;REVB=0.0037781;RO=1;SAF=48;SAR=80;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00979681;STB=0.501174;TYPE=snp;VARB=-0.00668995;OID=.;OPOS=37891465;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:129:129:1:3:128:126:80:48:1:0:78:48:1:2 chr10 37891576 . G A 1786.27 PASS AO=189;DP=190;FAO=187;FDP=187;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0428777;FXX=0.0157886;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.2538;QD=38.2089;RBI=0.0430522;REFB=-0.050576;REVB=-0.0038722;RO=1;SAF=93;SAR=96;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00493451;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.92639e-05;OID=.;OPOS=37891576;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:190:187:1:0:189:187:96:93:0:1:95:92:0:0 chr10 38344700 . C G 224.94 PASS AO=41;DP=131;FAO=50;FDP=115;FR=.,HEALED;FRO=56;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=16;FSRR=40;FWDB=-0.0349024;FXX=0.0254216;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.309;QD=7.82413;RBI=0.0352686;REFB=-0.0235058;REVB=-0.00506868;RO=45;SAF=23;SAR=18;SRF=19;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129898;STB=0.622708;TYPE=snp;VARB=0.01364;OID=.;OPOS=38344700;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:115:45:56:41:50:18:23:19:26:24:26:16:40 chr10 38407519 . A G 157.38 PASS AO=26;DP=46;FAO=29;FDP=49;FR=.;FRO=20;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=0.0137051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.206;QD=12.8473;RBI=0.0241328;REFB=-0.0263244;REVB=-0.0198635;RO=20;SAF=19;SAR=7;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.076893;STB=0.518625;TYPE=snp;VARB=0.0246467;OID=.;OPOS=38407519;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:46:49:20:20:26:29:7:19:13:7:9:20:13:7 chr10 38645403 . T C 222.88 PASS AO=49;DP=97;FAO=49;FDP=95;FR=.;FRO=46;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=-0.00643267;FXX=0.0206164;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.6341;QD=9.38426;RBI=0.0178494;REFB=-0.0326857;REVB=-0.01665;RO=46;SAF=20;SAR=29;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119704;STB=0.566133;TYPE=snp;VARB=0.0255934;OID=.;OPOS=38645403;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:95:46:46:49:49:29:20:25:21:29:20:25:21 chr10 38680963 . G T 119.41 PASS AO=34;DP=84;FAO=34;FDP=84;FR=.;FRO=50;FSAF=26;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=0.00020718;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.335;QD=5.68631;RBI=0.0717295;REFB=-0.0269882;REVB=-0.0717292;RO=48;SAF=26;SAR=8;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.345173;STB=0.708961;TYPE=snp;VARB=0.0334378;OID=.;OPOS=38680963;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:48:50:34:34:8:26:22:26:8:26:22:28 chr10 38740000 . T C 48.81 PASS AO=8;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0659713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.0039;QD=15.0171;RBI=0.0894435;REFB=-0.0752893;REVB=-0.0603982;RO=5;SAF=5;SAR=3;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0175135;STB=0.510178;TYPE=snp;VARB=0.0349585;OID=.;OPOS=38740000;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:13:13:5:5:8:8:3:5:3:2:3:5:3:2 chr10 38740029 . C T 22.75 PASS AO=4;DP=8;FAO=4;FDP=8;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0643001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.427;QD=11.3734;RBI=0.0728625;REFB=-0.00839929;REVB=-0.0342702;RO=3;SAF=3;SAR=1;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.305979;STB=0.748747;TYPE=snp;VARB=0.00552271;OID=.;OPOS=38740029;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:8:8:3:4:4:4:1:3:1:2:1:3:1:3 chr10 38740353 . T C 14.33 PASS AO=5;DP=22;FAO=5;FDP=22;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.149206;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.2363;QD=2.60595;RBI=0.150549;REFB=-0.00216832;REVB=-0.020064;RO=17;SAF=2;SAR=3;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0819252;STB=0.555331;TYPE=snp;VARB=-0.00498887;OID=.;OPOS=38740353;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:22:22:17:17:5:5:3:2:8:9:3:2:8:9 chr10 38740382 . T C 13.38 PASS AO=4;DP=17;FAO=4;FDP=17;FR=.;FRO=13;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.00851981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.008;QD=3.14879;RBI=0.0740769;REFB=-0.0199325;REVB=-0.0735853;RO=13;SAF=1;SAR=3;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171577;STB=0.620044;TYPE=snp;VARB=0.0655646;OID=.;OPOS=38740382;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:17:17:13:13:4:4:3:1:5:8:3:1:5:8 chr10 38740546 . G T 35.39 PASS AO=10;DP=29;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=0;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=19;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.87;QD=4.88079;RBI=0.00805273;REFB=-0.000561161;REVB=0.00805273;RO=19;SAF=0;SAR=10;SRF=0;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00414828;OID=.;OPOS=38740546;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:29:29:19:19:10:10:10:0:0:19:10:0:0:19 chr10 38740590 . A G 12.17 PASS AO=5;DP=25;FAO=5;FDP=25;FR=.;FRO=20;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=20;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.789;QD=1.94739;RBI=0.0219065;REFB=-0.00215053;REVB=-0.0219065;RO=20;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0188853;OID=.;OPOS=38740590;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:25:25:20:20:5:5:5:0:0:20:5:0:0:20 chr10 42965636 . C T 165.77 PASS AO=46;DP=111;FAO=46;FDP=110;FR=.;FRO=64;FSAF=13;FSAR=33;FSRF=13;FSRR=51;FWDB=-0.00462819;FXX=0.0090082;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.1464;QD=6.02784;RBI=0.0151736;REFB=0.00340696;REVB=-0.0144505;RO=61;SAF=13;SAR=33;SRF=13;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0913587;STB=0.559976;TYPE=snp;VARB=-0.00361431;OID=.;OPOS=42965636;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:110:61:64:46:46:33:13:13:48:33:13:13:51 chr10 43089265 . GA G 13.74 PASS AO=18;DP=110;FAO=17;FDP=108;FR=.;FRO=91;FSAF=16;FSAR=1;FSRF=48;FSRR=43;FWDB=-0.0304157;FXX=0.0270246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.946;QD=0.50885;RBI=0.0493033;REFB=-0.0307728;REVB=-0.0388034;RO=84;SAF=16;SAR=2;SRF=46;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.501487;STB=0.916101;TYPE=del;VARB=0.15369;OID=.;OPOS=43089266;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:18:109:17:108:91:16:1:48:43:13:84:16:2:46:38 chr10 43089965 . G A 1347.74 PASS AO=141;DP=143;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141593;FXX=0.0275843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.084;QD=38.2337;RBI=0.0142207;REFB=0;REVB=0.00132003;RO=0;SAF=70;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.23847e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000194195;OID=.;OPOS=43089965;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:143:141:0:0:141:141:71:70:0:0:71:70:0:0 chr10 43315692 . C T 107.33 PASS AO=28;DP=65;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=6;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=-0.000449709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.858;QD=6.6047;RBI=0.0317073;REFB=-0.0298382;REVB=-0.0317041;RO=36;SAF=6;SAR=22;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.327503;STB=0.69605;TYPE=snp;VARB=0.0322569;OID=.;OPOS=43315692;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:36:37:28:28:22:6:18:18:22:6:19:18 chr10 43595968 . A G 738.91 PASS AO=72;DP=72;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.105084;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.7234;QD=38.3852;RBI=0.107648;REFB=0;REVB=0.0233566;RO=0;SAF=16;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.77451e-05;OID=.;OPOS=43595968;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:72:77:0:0:72:77:56:16:0:0:55:22:0:0 chr10 43606687 . A G 378.78 PASS AO=111;DP=269;FAO=112;FDP=269;FR=.;FRO=157;FSAF=39;FSAR=73;FSRF=62;FSRR=95;FWDB=0.00814263;FXX=0.0146515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.124;QD=5.63246;RBI=0.00877515;REFB=-0.0150961;REVB=0.00327121;RO=156;SAF=38;SAR=73;SRF=61;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0553685;STB=0.529474;TYPE=snp;VARB=0.0191443;OID=.;OPOS=43606687;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:269:269:156:157:111:112:73:38:61:95:73:39:62:95 chr10 43613843 . G T 2181.1 PASS AO=224;DP=225;FAO=227;FDP=227;FR=.;FRO=0;FSAF=114;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0346489;FXX=0.00438577;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.763;QD=38.4335;RBI=0.0481507;REFB=0;REVB=0.0334357;RO=0;SAF=112;SAR=112;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.88775e-05;OID=.;OPOS=43613843;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:225:227:0:0:224:227:112:112:0:0:113:114:0:0 chr10 43623812 . C T 541.14 PASS AO=121;DP=232;FAO=121;FDP=232;FR=.;FRO=111;FSAF=90;FSAR=31;FSRF=81;FSRR=30;FWDB=0.0145101;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.3024;QD=9.32994;RBI=0.0709749;REFB=-0.0112959;REVB=-0.0694758;RO=111;SAF=90;SAR=31;SRF=81;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0159993;STB=0.508756;TYPE=snp;VARB=0.0138542;OID=.;OPOS=43623812;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:232:111:111:121:121:31:90:81:30:31:90:81:30 chr10 43624833 . T C 495.77 PASS AO=72;DP=295;FAO=76;FDP=275;FR=.,HEALED;FRO=144;FSAF=12;FSAR=64;FSRF=78;FSRR=66;FWDB=0.0064697;FXX=0.00721996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.675;QD=7.21124;RBI=0.0136699;REFB=-0.0140649;REVB=0.012042;RO=147;SAF=8;SAR=64;SRF=78;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.577115;STB=0.786802;TYPE=snp;VARB=0.0120166;OID=.;OPOS=43624833;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:282:275:147:144:72:76:64:8:78:69:64:12:78:66 chr10 43678796 . C T 382.38 PASS AO=82;DP=165;FAO=88;FDP=172;FR=.;FRO=84;FSAF=50;FSAR=38;FSRF=40;FSRR=44;FWDB=-0.00616683;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.4332;QD=8.89256;RBI=0.0199203;REFB=-0.030925;REVB=0.0189417;RO=80;SAF=44;SAR=38;SRF=36;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0776959;STB=0.545202;TYPE=snp;VARB=0.0301845;OID=.;OPOS=43678796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:172:80:84:82:88:38:44:36:44:38:50:40:44 chr10 43690189 . G A 1786.2 PASS AO=197;DP=203;FAO=197;FDP=203;FR=.;FRO=6;FSAF=90;FSAR=107;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0147867;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=210.471;QD=35.196;RBI=0.0159623;REFB=-0.0534667;REVB=0.00601246;RO=3;SAF=90;SAR=107;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0156074;STB=0.511188;TYPE=snp;VARB=0.000240334;OID=.;OPOS=43690189;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:203:203:3:6:197:197:107:90:3:0:107:90:5:1 chr10 43837352 . A G 670.3 PASS AO=67;DP=78;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00761627;FXX=0.109743;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.648;QD=36.729;RBI=0.0158664;REFB=-0.0141901;REVB=0.0139188;RO=1;SAF=24;SAR=43;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108646;STB=0.505616;TYPE=snp;VARB=-0.000430813;OID=.;OPOS=43837352;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:78:73:1:1:67:72:43:24:0:1:44:28:0:1 chr10 43883342 . T A 131.09 PASS AO=31;DP=69;FAO=31;FDP=66;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=-0.0229827;FXX=0.043472;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.683;QD=7.94479;RBI=0.0243102;REFB=-0.0017005;REVB=-0.0079236;RO=32;SAF=12;SAR=19;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160925;STB=0.598361;TYPE=snp;VARB=0.000458641;OID=.;OPOS=43883342;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:66:32:35:31:31:19:12:18:14:19:12:20:15 chr10 43912705 . G T 222.31 PASS AO=44;DP=81;FAO=45;FDP=80;FR=.;FRO=35;FSAF=29;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=0.0147967;FXX=0.0476134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.616;QD=11.1156;RBI=0.0259031;REFB=-0.0274443;REVB=-0.021261;RO=24;SAF=28;SAR=16;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0649838;STB=0.53415;TYPE=snp;VARB=0.0177402;OID=.;OPOS=43912705;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:80:24:35:44:45:16:28:13:11:16:29:20:15 chr10 43978087 . A G 148.71 PASS AO=44;DP=111;FAO=44;FDP=111;FR=.;FRO=67;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=44;FWDB=0.00930367;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2181;QD=5.35883;RBI=0.0309798;REFB=-0.00230723;REVB=-0.0295498;RO=67;SAF=21;SAR=23;SRF=23;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144678;STB=0.581609;TYPE=snp;VARB=0.00336033;OID=.;OPOS=43978087;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:67:67:44:44:23:21:23:44:23:21:23:44 chr10 44052903 . A C 615.67 PASS AO=134;DP=267;FAO=139;FDP=269;FR=.;FRO=130;FSAF=75;FSAR=64;FSRF=63;FSRR=67;FWDB=-0.00159589;FXX=0.0146515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.443;QD=9.15495;RBI=0.013283;REFB=-0.00463305;REVB=0.0131868;RO=126;SAF=70;SAR=64;SRF=61;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0338984;STB=0.526608;TYPE=snp;VARB=0.00416454;OID=.;OPOS=44052903;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:267:269:126:130:134:139:64:70:61:65:64:75:63:67 chr10 44053013 . G C 597.98 PASS AO=124;DP=221;FAO=124;FDP=222;FR=.;FRO=98;FSAF=71;FSAR=53;FSRF=41;FSRR=57;FWDB=0.00123826;FXX=0.00892817;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.413;QD=10.7744;RBI=0.021581;REFB=-0.0237203;REVB=-0.0215455;RO=95;SAF=73;SAR=51;SRF=40;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134541;STB=0.568154;TYPE=snp;VARB=0.0173405;OID=.;OPOS=44053013;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:222:95:98:124:124:51:73:40:55:53:71:41:57 chr10 44053585 . C T 248.31 PASS AO=60;DP=125;FAO=60;FDP=125;FR=.;FRO=65;FSAF=14;FSAR=46;FSRF=14;FSRR=51;FWDB=0.01324;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.194;QD=7.94576;RBI=0.0137796;REFB=-0.00524718;REVB=0.00381828;RO=65;SAF=14;SAR=46;SRF=14;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239046;STB=0.513223;TYPE=snp;VARB=0.0047538;OID=.;OPOS=44053585;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:65:65:60:60:46:14:14:51:46:14:14:51 chr10 44104101 . C T 418.89 PASS AO=111;DP=257;FAO=113;FDP=253;FR=.;FRO=140;FSAF=58;FSAR=55;FSRF=94;FSRR=46;FWDB=-0.00854951;FXX=0.0155636;HRUN=3;LEN=1;MLLD=118.938;QD=6.6227;RBI=0.00855648;REFB=-0.0203174;REVB=0.000345357;RO=137;SAF=58;SAR=53;SRF=92;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150389;STB=0.587972;TYPE=snp;VARB=0.0202214;OID=.;OPOS=44104101;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:257:253:137:140:111:113:53:58:92:45:55:58:94:46 chr10 44285777 . T C 138.55 PASS AO=29;DP=57;FAO=30;FDP=58;FR=.;FRO=28;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.0359298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.027;QD=9.55481;RBI=0.0374159;REFB=-0.00724879;REVB=0.0104403;RO=26;SAF=21;SAR=8;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211599;STB=0.622137;TYPE=snp;VARB=0.0131473;OID=.;OPOS=44285777;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:58:26:28:29:30:8:21:13:13:9:21:13:15 chr10 44793299 . C T 676.66 PASS AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.105107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.4497;QD=38.6663;RBI=0.105221;REFB=0;REVB=-0.00489218;RO=0;SAF=35;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000831156;OID=.;OPOS=44793299;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:70:70:0:0:70:70:35:35:0:0:35:35:0:0 chr10 45473317 . C T 152.96 PASS AO=30;DP=53;FAO=30;FDP=53;FR=.;FRO=23;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.0296317;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.656;QD=11.5439;RBI=0.0411023;REFB=-0.0184787;REVB=0.0284844;RO=22;SAF=21;SAR=9;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202709;STB=0.604865;TYPE=snp;VARB=0.0154703;OID=.;OPOS=45473317;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:53:53:22:23:30:30:9:21:10:12:9:21:11:12 chr10 45496120 . A T 308 PASS AO=86;DP=196;FAO=85;FDP=195;FR=.;FRO=110;FSAF=40;FSAR=45;FSRF=52;FSRR=58;FWDB=-0.0419309;FXX=0.00510178;HRUN=4;LEN=1;MLLD=35.6736;QD=6.31786;RBI=0.0580424;REFB=-0.0473272;REVB=0.0401337;RO=108;SAF=40;SAR=46;SRF=51;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00714502;STB=0.50121;TYPE=snp;VARB=0.0645487;OID=.;OPOS=45496120;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:195:108:110:86:85:46:40:51:57:45:40:52:58 chr10 45499799 . T C 74.13 PASS AO=20;DP=50;FAO=20;FDP=50;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.0603614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.9347;QD=5.93058;RBI=0.0709351;REFB=-0.00882567;REVB=-0.0372597;RO=30;SAF=7;SAR=13;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.091965;STB=0.553137;TYPE=snp;VARB=0.0182914;OID=.;OPOS=45499799;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:50:50:30:30:20:20:13:7:13:17:13:7:13:17 chr10 45499886 . TC T 55.73 PASS AO=17;DP=59;FAO=19;FDP=57;FR=.;FRO=38;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=-0.00357729;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.118;QD=3.91107;RBI=0.00469306;REFB=-0.00596177;REVB=0.00303773;RO=40;SAF=5;SAR=12;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167722;STB=0.620119;TYPE=del;VARB=0.0255645;OID=.;OPOS=45499887;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:17:57:19:57:38:5:14:16:22:55:40:5:12:17:23 chr10 45499897 . A AAAAATT 44.87 PASS AO=11;DP=55;FAO=16;FDP=51;FR=.;FRO=35;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=0.0142656;FXX=0.0192271;HRUN=6;LEN=6;MLLD=233.192;QD=3.51947;RBI=0.0144495;REFB=0.00301335;REVB=0.00229837;RO=42;SAF=1;SAR=10;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.516203;STB=0.761513;TYPE=ins;VARB=-0.00554622;OID=.;OPOS=45499898;OREF=-;OALT=AAAATT;OMAPALT=AAAAATT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:11:55:16:51:35:2:14:14:21:44:42:1:10:18:24 chr10 45953767 . A G 609.46 PASS AO=144;DP=289;FAO=144;FDP=289;FR=.;FRO=145;FSAF=66;FSAR=78;FSRF=68;FSRR=77;FWDB=0.00324525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.966;QD=8.43549;RBI=0.00725487;REFB=-0.00863639;REVB=-0.00648856;RO=145;SAF=66;SAR=78;SRF=68;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0097848;STB=0.505366;TYPE=snp;VARB=0.00754329;OID=.;OPOS=45953767;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:289:289:145:145:144:144:78:66:68:77:78:66:68:77 chr10 45958856 . G C 77.69 PASS AO=17;DP=36;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.0278085;FXX=0.0277701;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.216;QD=8.8788;RBI=0.0320092;REFB=-0.0208147;REVB=0.0158517;RO=17;SAF=2;SAR=15;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.339138;STB=0.721607;TYPE=snp;VARB=0.0175788;OID=.;OPOS=45958856;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:36:35:17:18:17:17:15:2:6:11:15:2:7:11 chr10 45958881 . A C 46.44 PASS AO=11;DP=26;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.0441684;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.5279;QD=7.14536;RBI=0.0448038;REFB=-0.0198634;REVB=-0.00751889;RO=15;SAF=3;SAR=8;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0716086;STB=0.542293;TYPE=snp;VARB=0.0211625;OID=.;OPOS=45958881;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:26:26:15:15:11:11:8:3:5:10:8:3:5:10 chr10 46143958 . T G 306.6 PASS AO=85;DP=198;FAO=85;FDP=197;FR=.;FRO=112;FSAF=27;FSAR=58;FSRF=27;FSRR=85;FWDB=-0.00405115;FXX=0.00505025;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.5239;QD=6.22547;RBI=0.00407604;REFB=-0.0100635;REVB=0.000449709;RO=112;SAF=27;SAR=58;SRF=27;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.093953;STB=0.552112;TYPE=snp;VARB=0.0163503;OID=.;OPOS=46143958;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:197:112:112:85:85:58:27:27:85:58:27:27:85 chr10 46923700 . T A 25.89 PASS AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=-0.0681479;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.479;QD=8.63103;RBI=0.0869862;REFB=0.00996423;REVB=-0.0540598;RO=7;SAF=4;SAR=1;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.090044;STB=0.555348;TYPE=snp;VARB=-0.0269498;OID=.;OPOS=46923700;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:12:12:7:7:5:5:1:4:6:1:1:4:6:1 chr10 46963951 . G A 36.24 PASS AO=29;DP=139;FAO=29;FDP=141;FR=.;FRO=112;FSAF=6;FSAR=23;FSRF=39;FSRR=73;FWDB=-0.013465;FXX=0.013985;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.073;QD=1.02807;RBI=0.0134916;REFB=-0.00651209;REVB=-0.000846394;RO=109;SAF=6;SAR=23;SRF=38;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.2239;STB=0.64235;TYPE=snp;VARB=0.019494;OID=.;OPOS=46963951;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:139:141:109:112:29:29:23:6:38:71:23:6:39:73 chr10 46965018 . C G 172.4 PASS AO=44;DP=98;FAO=44;FDP=98;FR=.;FRO=54;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=21;FSRR=33;FWDB=0.0106961;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.519;QD=7.0366;RBI=0.0234772;REFB=-0.00497247;REVB=-0.020899;RO=53;SAF=19;SAR=25;SRF=20;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0547303;STB=0.524252;TYPE=snp;VARB=0.00905634;OID=.;OPOS=46965018;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:53:54:44:44:25:19:20:33:25:19:21:33 chr10 46965727 . G A 105.5 PASS AO=26;DP=58;FAO=26;FDP=58;FR=.;FRO=32;FSAF=23;FSAR=3;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=-0.0037456;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.283;QD=7.27557;RBI=0.105574;REFB=-0.0220535;REVB=-0.105508;RO=31;SAF=23;SAR=3;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.401115;STB=0.727634;TYPE=snp;VARB=0.0223463;OID=.;OPOS=46965727;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:31:32:26:26:3:23:19:12:3:23:20:12 chr10 46967672 . C T 25.1 PASS AO=9;DP=33;FAO=9;FDP=33;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.0276494;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.918;QD=3.04207;RBI=0.0276907;REFB=-0.000131783;REVB=0.00151037;RO=24;SAF=4;SAR=5;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134173;STB=0.583157;TYPE=snp;VARB=5.37437e-05;OID=.;OPOS=46967672;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:33:33:24:24:9:9:5:4:8:16:5:4:8:16 chr10 46969312 . G A 15.73 PASS AO=13;DP=73;FAO=13;FDP=73;FR=.;FRO=60;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=27;FSRR=33;FWDB=0.0491273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.7948;QD=0.862106;RBI=0.0505252;REFB=-0.00573797;REVB=0.0118027;RO=59;SAF=6;SAR=7;SRF=26;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0262715;STB=0.509539;TYPE=snp;VARB=0.0343129;OID=.;OPOS=46969312;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:73:73:59:60:13:13:7:6:26:33:7:6:27:33 chr10 46998894 . G A 125.52 PASS AO=22;DP=35;FAO=22;FDP=35;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=0.0555924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.5097;QD=14.3449;RBI=0.0626368;REFB=-0.0010619;REVB=0.0288592;RO=12;SAF=9;SAR=13;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107642;STB=0.570187;TYPE=snp;VARB=0.00456844;OID=.;OPOS=46998894;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:35:35:12:13:22:22:13:9:3:9:13:9:3:10 chr10 46998995 . C G 21.72 PASS AO=8;DP=31;FAO=8;FDP=31;FR=.;FRO=23;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.00702248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.528;QD=2.80229;RBI=0.0213087;REFB=-0.00873666;REVB=0.0201183;RO=22;SAF=2;SAR=6;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155554;STB=0.622313;TYPE=snp;VARB=0.022553;OID=.;OPOS=46998995;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:31:31:22:23:8:8:6:2:8:14:6:2:9:14 chr10 46998999 . G A 158.83 PASS AO=23;DP=32;FAO=24;FDP=32;FR=.;FRO=8;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.00130654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.4903;QD=19.8532;RBI=0.0668981;REFB=-0.0590832;REVB=0.0668854;RO=8;SAF=8;SAR=15;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0517735;STB=0.533871;TYPE=snp;VARB=0.057249;OID=.;OPOS=46998999;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:32:32:8:8:23:24:15:8:2:6:15:9:2:6 chr10 46999019 . G A 181.75 PASS AO=22;DP=24;FAO=23;FDP=25;FR=.;FRO=2;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0236811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.3049;QD=29.0797;RBI=0.0807763;REFB=-0.126753;REVB=0.077227;RO=2;SAF=9;SAR=13;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0921477;STB=0.549956;TYPE=snp;VARB=0.0206754;OID=.;OPOS=46999019;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:24:25:2:2:22:23:13:9:2:0:14:9:2:0 chr10 46999151 . T C 30.24 PASS AO=7;DP=18;FAO=7;FDP=18;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=-0.0206974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.877;QD=6.71933;RBI=0.0393552;REFB=-0.013933;REVB=-0.0334731;RO=10;SAF=4;SAR=3;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.258458;STB=0.676457;TYPE=snp;VARB=0.00551593;OID=.;OPOS=46999151;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:18:18:10:11:7:7:3:4:3:7:3:4:3:8 chr10 46999178 . A C 43.05 PASS AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.00644732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.994;QD=14.3491;RBI=0.018101;REFB=-0.0223409;REVB=-0.0169138;RO=5;SAF=3;SAR=4;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0206743;STB=0.51216;TYPE=snp;VARB=0.00904618;OID=.;OPOS=46999178;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:12:12:5:5:7:7:4:3:2:3:4:3:2:3 chr10 46999189 . C T 19.9 PASS AO=4;DP=11;FAO=4;FDP=11;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0637997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.556;QD=7.23507;RBI=0.064198;REFB=-0.00970269;REVB=-0.00714055;RO=7;SAF=2;SAR=2;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.213092;STB=0.635732;TYPE=snp;VARB=0.0248366;OID=.;OPOS=46999189;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:11:11:7:7:4:4:2:2:2:5:2:2:2:5 chr10 46999190 . A G 96.35 PASS AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.123799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.797;QD=35.0365;RBI=0.126421;REFB=0;REVB=0.0256177;RO=0;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00968692;OID=.;OPOS=46999190;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:11:11:7:4:0:0:7:4:0:0 chr10 46999465 . A G 75.72 PASS AO=13;DP=24;FAO=14;FDP=24;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=9;FWDB=0.00334805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.249;QD=12.6204;RBI=0.00977368;REFB=-0.0604244;REVB=-0.00918234;RO=9;SAF=6;SAR=7;SRF=1;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.263102;STB=0.666455;TYPE=snp;VARB=0.0136801;OID=.;OPOS=46999465;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:24:24:9:10:13:14:7:6:1:8:7:7:1:9 chr10 46999484 . G T 29.01 PASS AO=8;DP=24;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.0421278;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=315.214;QD=4.83553;RBI=0.0443379;REFB=-0.0106062;REVB=-0.0138239;RO=16;SAF=2;SAR=6;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228754;STB=0.642474;TYPE=snp;VARB=0.0218199;OID=.;OPOS=46999484;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:24:24:16:16:8:8:6:2:7:9:6:2:7:9 chr10 46999601 . G A 13.56 PASS AO=5;DP=23;FAO=5;FDP=23;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=18;FSRR=0;FWDB=0.000988959;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.464;QD=2.35837;RBI=0.0214907;REFB=-0.00155728;REVB=0.0214679;RO=18;SAF=4;SAR=1;SRF=18;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.610872;STB=0.845633;TYPE=snp;VARB=0.0217783;OID=.;OPOS=46999601;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:23:23:18:18:5:5:1:4:18:0:1:4:18:0 chr10 46999732 . G A 213.7 PASS AO=47;DP=119;FAO=55;FDP=122;FR=.;FRO=67;FSAF=7;FSAR=48;FSRF=20;FSRR=47;FWDB=-0.00291597;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=153.062;QD=7.00672;RBI=0.0160858;REFB=-0.0148058;REVB=-0.0158193;RO=33;SAF=7;SAR=40;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.331984;STB=0.660818;TYPE=snp;VARB=0.018955;OID=.;OPOS=46999732;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:122:33:67:47:55:40:7:15:18:48:7:20:47 chr10 46999747 . T C 244.56 PASS AO=59;DP=123;FAO=59;FDP=123;FR=.;FRO=64;FSAF=14;FSAR=45;FSRF=9;FSRR=55;FWDB=0.00319916;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.9491;QD=7.95313;RBI=0.0208053;REFB=-0.0133274;REVB=-0.0205578;RO=64;SAF=14;SAR=45;SRF=9;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136472;STB=0.574926;TYPE=snp;VARB=0.0171512;OID=.;OPOS=46999747;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:64:64:59:59:45:14:9:55:45:14:9:55 chr10 46999863 . C G 44.08 PASS AO=20;DP=69;FAO=19;FDP=69;FR=.;FRO=50;FSAF=2;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=39;FWDB=-0.0848993;FXX=0.0142837;HRUN=4;LEN=1;MLLD=174.87;QD=2.55513;RBI=0.0861854;REFB=-0.00223836;REVB=-0.0148332;RO=49;SAF=3;SAR=17;SRF=10;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112247;STB=0.663456;TYPE=snp;VARB=0.00421961;OID=.;OPOS=46999863;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:69:69:49:50:20:19:17:3:10:39:17:2:11:39 chr10 46999922 . G T 48.48 PASS AO=13;DP=34;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=20;FWDB=0.0298291;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.571;QD=5.7034;RBI=0.0301753;REFB=-0.0185886;REVB=-0.00455777;RO=21;SAF=7;SAR=6;SRF=1;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.518358;STB=0.790994;TYPE=snp;VARB=0.0196808;OID=.;OPOS=46999922;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:34:34:21:21:13:13:6:7:1:20:6:7:1:20 chr10 47000004 . T C 243.17 PASS AO=25;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0278829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.8886;QD=37.411;RBI=0.0366337;REFB=0;REVB=-0.0237608;RO=0;SAF=13;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94263e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.77083e-05;OID=.;OPOS=47000004;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:26:26:0:0:25:26:12:13:0:0:12:14:0:0 chr10 47000071 . G A 31.79 PASS AO=9;DP=27;FAO=9;FDP=26;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.0252948;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.227;QD=4.89041;RBI=0.0387967;REFB=-0.0107662;REVB=-0.0294169;RO=18;SAF=5;SAR=4;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.239847;STB=0.629974;TYPE=snp;VARB=0.0415217;OID=.;OPOS=47000071;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:27:26:18:17:9:9:4:5:6:12:4:5:6:11 chr10 47000079 . T C 78.86 PASS AO=12;DP=20;FAO=13;FDP=21;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0323181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.671;QD=15.0209;RBI=0.0332067;REFB=-0.0308177;REVB=-0.00763033;RO=7;SAF=3;SAR=9;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14113;STB=0.580516;TYPE=snp;VARB=0.0158793;OID=.;OPOS=47000079;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:20:21:7:8:12:13:9:3:3:4:9:4:4:4 chr10 47000143 . GCCC GCC,GCCT 62.25 PASS AO=2,6;DP=10;FAO=2,6;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=1,1;FSAR=1,5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0185501,-0.0578388;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=16.2683,165.502;QD=27.6652;RBI=0.0894937,0.0675378;REFB=0.0339921,0.0723656;REVB=0.0875501,0.0348715;RO=1;SAF=1,1;SAR=1,5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.25849,-0.281147;STB=0.665164,0.666027;TYPE=del,snp;VARB=0.0158162,0.0130646;OID=.,.;OPOS=47000144,47000146;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=GCC,GCCT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:2,6:9:2,6:9:1:1,1:1,5:1:0:10:1:1,1:1,5:1:0 chr10 47000188 . A G 73.84 PASS AO=9;DP=9;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0415081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.4716;QD=36.9199;RBI=0.0454827;REFB=0;REVB=0.0185944;RO=0;SAF=2;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00310875;OID=.;OPOS=47000188;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:8:0:0:9:8:7:2:0:0:6:2:0:0 chr10 47000321 . G A 152.01 PASS AO=31;DP=57;FAO=31;FDP=57;FR=.;FRO=26;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=5;FWDB=-0.00461674;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.434;QD=10.6673;RBI=0.0210251;REFB=-0.00476912;REVB=-0.0205119;RO=26;SAF=22;SAR=9;SRF=21;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103046;STB=0.5568;TYPE=snp;VARB=0.0053118;OID=.;OPOS=47000321;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:26:26:31:31:9:22:21:5:9:22:21:5 chr10 47000366 . C G 243.08 PASS AO=50;DP=93;FAO=51;FDP=94;FR=.;FRO=43;FSAF=36;FSAR=15;FSRF=30;FSRR=13;FWDB=-0.00816273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7826;QD=10.3439;RBI=0.0289788;REFB=0.0131836;REVB=0.0278054;RO=42;SAF=36;SAR=14;SRF=29;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.029916;STB=0.504503;TYPE=snp;VARB=-0.00648777;OID=.;OPOS=47000366;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:94:42:43:50:51:14:36:29:13:15:36:30:13 chr10 47000374 . T C 251.36 PASS AO=51;DP=98;FAO=53;FDP=99;FR=.;FRO=46;FSAF=35;FSAR=18;FSRF=31;FSRR=15;FWDB=-0.0107779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.9266;QD=10.156;RBI=0.0108257;REFB=-0.0212029;REVB=0.00101629;RO=46;SAF=34;SAR=17;SRF=31;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00703386;STB=0.50704;TYPE=snp;VARB=0.0195995;OID=.;OPOS=47000374;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:99:46:46:51:53:17:34:31:15:18:35:31:15 chr10 47000381 . T C 874.44 PASS AO=93;DP=97;FAO=95;FDP=97;FR=.;FRO=2;FSAF=63;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0259026;FXX=0.010203;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.885;QD=36.0593;RBI=0.027936;REFB=-0.0558112;REVB=0.0104631;RO=2;SAF=62;SAR=31;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00746144;STB=0.503755;TYPE=snp;VARB=0.00082518;OID=.;OPOS=47000381;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:97:97:2:2:93:95:31:62:1:1:32:63:1:1 chr10 47000426 . T C 1406.52 PASS AO=137;DP=139;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0503935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.9812;QD=38.0141;RBI=0.05109;REFB=0;REVB=0.00840727;RO=0;SAF=82;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000700604;OID=.;OPOS=47000426;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:139:148:0:0:137:148:55:82:0:0:60:88:0:0 chr10 47000487 . G A 203.72 PASS AO=63;DP=155;FAO=63;FDP=161;FR=.;FRO=98;FSAF=20;FSAR=43;FSRF=55;FSRR=43;FWDB=-0.00749097;FXX=0.0122692;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.537;QD=5.06125;RBI=0.0148905;REFB=-0.00717116;REVB=0.012869;RO=92;SAF=20;SAR=43;SRF=52;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267797;STB=0.652125;TYPE=snp;VARB=0.0138382;OID=.;OPOS=47000487;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:161:92:98:63:63:43:20:52:40:43:20:55:43 chr10 47000508 . G A 37.66 PASS AO=32;DP=156;FAO=32;FDP=157;FR=.;FRO=125;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=58;FSRR=67;FWDB=0.00654664;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.399;QD=0.95944;RBI=0.0186941;REFB=-0.001425;REVB=0.0175103;RO=123;SAF=15;SAR=17;SRF=57;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00682867;STB=0.503796;TYPE=snp;VARB=0.00593093;OID=.;OPOS=47000508;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:156:157:123:125:32:32:17:15:57:66:17:15:58:67 chr10 47000547 . G T 141.23 PASS AO=37;DP=106;FAO=43;FDP=111;FR=.;FRO=68;FSAF=13;FSAR=30;FSRF=46;FSRR=22;FWDB=-0.0063589;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.695;QD=5.08944;RBI=0.0123908;REFB=0.00285732;REVB=-0.0106346;RO=68;SAF=9;SAR=28;SRF=46;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.477535;STB=0.723529;TYPE=snp;VARB=-0.00594803;OID=.;OPOS=47000547;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:111:68:68:37:43:28:9:46:22:30:13:46:22 chr10 47000728 . T C 228.1 PASS AO=55;DP=121;FAO=59;FDP=126;FR=.;FRO=67;FSAF=35;FSAR=24;FSRF=32;FSRR=35;FWDB=0.0015229;FXX=0.0156238;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.398;QD=7.24122;RBI=0.0131288;REFB=-0.0150603;REVB=-0.0130402;RO=66;SAF=33;SAR=22;SRF=31;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128892;STB=0.562189;TYPE=snp;VARB=0.0206642;OID=.;OPOS=47000728;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:126:66:67:55:59:22:33:31:35:24:35:32:35 chr10 47000765 . C T 17.02 PASS AO=23;DP=143;FAO=23;FDP=142;FR=.;FRO=119;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=63;FSRR=56;FWDB=-0.0254904;FXX=0.00699252;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.5407;QD=0.479333;RBI=0.0398351;REFB=-0.00246886;REVB=-0.0306117;RO=120;SAF=7;SAR=16;SRF=63;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.282747;STB=0.68949;TYPE=snp;VARB=0.0110452;OID=.;OPOS=47000765;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:143:142:120:119:23:23:16:7:63:57:16:7:63:56 chr10 47000863 . A G 723.03 PASS AO=76;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0265453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.065;QD=37.5597;RBI=0.0387121;REFB=0;REVB=0.0281776;RO=0;SAF=38;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000141322;OID=.;OPOS=47000863;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:77:77:0:0:76:77:38:38:0:0:39:38:0:0 chr10 47000873 . T A,G 734.23 PASS AO=43,37;DP=80;FAO=42,39;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=27,13;FSAR=15,26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156424,-0.0247985;FXX=0.0121936;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=52.1013,154.492;QD=36.2584;RBI=0.0265599,0.0383765;REFB=0,0;REVB=0.021465,0.0292881;RO=0;SAF=28,13;SAR=15,24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.02792e-08,0;STB=0.5,0.5;TYPE=snp,snp;VARB=0.0161759,0.0233531;OID=.,.;OPOS=47000873,47000873;OREF=T,T;OALT=A,G;OMAPALT=A,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:80:81:0:0:43,37:42,39:15,24:28,13:0:0:15,26:27,13:0:0 chr10 47000898 . C T 406.43 PASS AO=50;DP=108;FAO=54;FDP=101;FR=.,HEALED;FRO=30;FSAF=18;FSAR=36;FSRF=2;FSRR=28;FWDB=-0.0598866;FXX=0.00980296;HRUN=3;LEN=1;MLLD=131.954;QD=16.0962;RBI=0.0668941;REFB=-0.00276008;REVB=-0.0298063;RO=25;SAF=17;SAR=33;SRF=0;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.256356;STB=0.615347;TYPE=snp;VARB=0.0343304;OID=.;OPOS=47000898;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:101:101:25:30:50:54:33:17:0:25:36:18:2:28 chr10 47001032 . G A 193.37 PASS AO=35;DP=57;FAO=35;FDP=57;FR=.;FRO=22;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=5;FWDB=-0.00197486;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.048;QD=13.57;RBI=0.014559;REFB=-0.037098;REVB=0.0144244;RO=22;SAF=20;SAR=15;SRF=17;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1486;STB=0.581108;TYPE=snp;VARB=0.0148424;OID=.;OPOS=47001032;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:57:57:22:22:35:35:15:20:17:5:15:20:17:5 chr10 47001098 . C T 143.49 PASS AO=31;DP=59;FAO=32;FDP=64;FR=.;FRO=32;FSAF=23;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=-0.00606139;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.4752;QD=8.96807;RBI=0.0509165;REFB=-0.0211883;REVB=-0.0505544;RO=28;SAF=22;SAR=9;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00478289;STB=0.555137;TYPE=snp;VARB=0.0260965;OID=.;OPOS=47001098;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:64:28:32:31:32:9:22:20:8:9:23:20:12 chr10 47001293 . TG T 76.01 PASS AO=18;DP=38;FAO=22;FDP=37;FR=.;FRO=15;FSAF=18;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=1;FWDB=-0.0639574;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=14.7156;QD=8.21773;RBI=0.310113;REFB=0.11483;REVB=-0.303446;RO=12;SAF=16;SAR=2;SRF=11;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0528298;STB=0.587087;TYPE=del;VARB=-0.0962841;OID=.;OPOS=47001294;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:18:37:22:37:15:18:4:14:1:30:12:16:2:11:1 chr10 47001371 . C G 1204.97 PASS AO=120;DP=126;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00994045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.995;QD=38.2531;RBI=0.0145831;REFB=0;REVB=0.0106703;RO=1;SAF=77;SAR=43;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0109179;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.09444e-05;OID=.;OPOS=47001371;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:126:126:1:0:120:126:43:77:0:1:45:81:0:0 chr10 47001409 . G A 306.12 PASS AO=77;DP=167;FAO=77;FDP=166;FR=.;FRO=89;FSAF=42;FSAR=35;FSRF=51;FSRR=38;FWDB=0.00736252;FXX=0.0119041;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.832;QD=7.37631;RBI=0.0127698;REFB=-0.00295885;REVB=0.0104336;RO=89;SAF=42;SAR=35;SRF=51;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0269806;STB=0.514946;TYPE=snp;VARB=0.00361604;OID=.;OPOS=47001409;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:166:89:89:77:77:35:42:51:38:35:42:51:38 chr10 47001485 . A T 134.34 PASS AO=75;DP=280;FAO=75;FDP=280;FR=.;FRO=205;FSAF=28;FSAR=47;FSRF=93;FSRR=112;FWDB=-0.00909991;FXX=0.00709195;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.202;QD=1.91913;RBI=0.0375485;REFB=-0.00571566;REVB=-0.0364292;RO=204;SAF=28;SAR=47;SRF=93;SRR=111;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105588;STB=0.560887;TYPE=snp;VARB=0.026913;OID=.;OPOS=47001485;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:280:280:204:205:75:75:47:28:93:111:47:28:93:112 chr10 47001504 . G T 506.13 PASS AO=91;DP=290;FAO=139;FDP=271;FR=.;FRO=132;FSAF=48;FSAR=91;FSRF=35;FSRR=97;FWDB=0.110411;FXX=0.0355859;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.005;QD=7.4705;RBI=0.110942;REFB=-0.00353919;REVB=0.0108387;RO=103;SAF=1;SAR=90;SRF=14;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.652093;STB=0.544363;TYPE=snp;VARB=0.00901606;OID=.;OPOS=47001504;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:228:271:103:132:91:139:90:1:14:89:91:48:35:97 chr10 47001543 . C T 807.88 PASS AO=165;DP=291;FAO=165;FDP=290;FR=.;FRO=125;FSAF=53;FSAR=112;FSRF=31;FSRR=94;FWDB=-0.00958234;FXX=0.00684908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.612;QD=11.1431;RBI=0.0105605;REFB=-0.00752759;REVB=0.00443887;RO=124;SAF=53;SAR=112;SRF=30;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0741807;STB=0.53714;TYPE=snp;VARB=0.00543631;OID=.;OPOS=47001543;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:291:290:124:125:165:165:112:53:30:94:112:53:31:94 chr10 47001786 . A C 232.34 PASS AO=62;DP=139;FAO=62;FDP=140;FR=.;FRO=78;FSAF=39;FSAR=23;FSRF=49;FSRR=29;FWDB=0.00411877;FXX=0.0209776;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.565;QD=6.63836;RBI=0.0191765;REFB=-0.00978708;REVB=-0.018729;RO=77;SAF=40;SAR=22;SRF=48;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0234409;STB=0.500493;TYPE=snp;VARB=0.0155811;OID=.;OPOS=47001786;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:140:77:78:62:62:22:40:48:29:23:39:49:29 chr10 47001946 . T C 180.12 PASS AO=39;DP=109;FAO=52;FDP=122;FR=.;FRO=70;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=43;FSRR=27;FWDB=0.0128089;FXX=0.0161277;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.599;QD=5.90563;RBI=0.0133878;REFB=-0.02217;REVB=0.00389431;RO=70;SAF=16;SAR=23;SRF=43;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225581;STB=0.565549;TYPE=snp;VARB=0.0286466;OID=.;OPOS=47001946;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:122:70:70:39:52:23:16:43:27:26:26:43:27 chr10 47001954 . C T 124.04 PASS AO=41;DP=105;FAO=42;FDP=119;FR=.;FRO=77;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=51;FSRR=26;FWDB=-0.0126546;FXX=0.00833264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.573;QD=4.16946;RBI=0.0513175;REFB=-0.0152414;REVB=-0.0497328;RO=64;SAF=17;SAR=24;SRF=51;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.396653;STB=0.64782;TYPE=snp;VARB=0.0492711;OID=.;OPOS=47001954;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:119:64:77:41:42:24:17:51:13:24:18:51:26 chr10 47001984 . G A 1284.71 PASS AO=137;DP=139;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0241609;FXX=0.0143875;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.3177;QD=37.5098;RBI=0.0626296;REFB=-0.16163;REVB=0.0577816;RO=1;SAF=92;SAR=45;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00513998;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000719388;OID=.;OPOS=47001984;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:139:137:1:0:137:137:45:92:1:0:45:92:0:0 chr10 47002079 . T C 249.3 PASS AO=69;DP=182;FAO=76;FDP=186;FR=.;FRO=110;FSAF=53;FSAR=23;FSRF=80;FSRR=30;FWDB=0.000781976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.594;QD=5.36131;RBI=0.0473287;REFB=-0.0279669;REVB=0.0473222;RO=104;SAF=52;SAR=17;SRF=76;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0321941;STB=0.521297;TYPE=snp;VARB=0.0299381;OID=.;OPOS=47002079;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:186:104:110:69:76:17:52:76:28:23:53:80:30 chr10 47002118 . T A 127.37 PASS AO=58;DP=195;FAO=58;FDP=196;FR=.;FRO=138;FSAF=41;FSAR=17;FSRF=101;FSRR=37;FWDB=-0.00957979;FXX=0.00507588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.589;QD=2.59947;RBI=0.0108785;REFB=-0.00553626;REVB=0.00515464;RO=136;SAF=41;SAR=17;SRF=99;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0310565;STB=0.5216;TYPE=snp;VARB=0.0145194;OID=.;OPOS=47002118;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:196:136:138:58:58:17:41:99:37:17:41:101:37 chr10 47002127 . T C 1701.34 PASS AO=147;DP=164;FAO=183;FDP=183;FR=.;FRO=0;FSAF=136;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208961;FXX=0.0518108;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.813;QD=37.1877;RBI=0.0270512;REFB=0;REVB=0.0171791;RO=2;SAF=109;SAR=38;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00864647;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00441184;OID=.;OPOS=47002127;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:164:183:2:0:147:183:38:109:2:0:47:136:0:0 chr10 47002135 . A G 405.38 PASS AO=98;DP=202;FAO=98;FDP=202;FR=.;FRO=104;FSAF=67;FSAR=31;FSRF=77;FSRR=27;FWDB=-0.0356724;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.255;QD=8.02722;RBI=0.0605234;REFB=0.000694256;REVB=-0.0488934;RO=104;SAF=67;SAR=31;SRF=77;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0629835;STB=0.534604;TYPE=snp;VARB=-0.00117558;OID=.;OPOS=47002135;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:202:104:104:98:98:31:67:77:27:31:67:77:27 chr10 47002414 . CAT C 16.42 PASS AO=8;DP=43;FAO=8;FDP=38;FR=.;FRO=30;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=-0.0195447;FXX=0.0952154;HRUN=1;LEN=2;MLLD=223.236;QD=1.72836;RBI=0.0368617;REFB=-0.00676871;REVB=-0.0312537;RO=30;SAF=5;SAR=3;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0316313;STB=0.520781;TYPE=del;VARB=0.0209019;OID=.;OPOS=47002415;OREF=AT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:8:42:8:38:30:5:3:18:12:16:30:5:3:18:12 chr10 47002501 . T A 253.15 PASS AO=46;DP=84;FAO=50;FDP=88;FR=.;FRO=38;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=-0.0221713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.738;QD=11.5069;RBI=0.0828807;REFB=-0.0228363;REVB=0.0798601;RO=37;SAF=29;SAR=17;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0986874;STB=0.535041;TYPE=snp;VARB=0.0280381;OID=.;OPOS=47002501;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:88:37:38:46:50:17:29:19:18:21:29:19:19 chr10 47002542 . C A 1149.22 PASS AO=119;DP=120;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00408772;FXX=0.00833264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.538;QD=38.6293;RBI=0.0164982;REFB=0;REVB=0.0159837;RO=0;SAF=59;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000115723;OID=.;OPOS=47002542;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:120:119:0:0:119:119:60:59:0:0:60:59:0:0 chr10 47002606 . G A 523.32 PASS AO=100;DP=166;FAO=100;FDP=167;FR=.;FRO=67;FSAF=55;FSAR=45;FSRF=28;FSRR=39;FWDB=5.33659e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9501;QD=12.5346;RBI=0.0410024;REFB=-0.0237644;REVB=-0.0410023;RO=64;SAF=55;SAR=45;SRF=26;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103508;STB=0.552952;TYPE=snp;VARB=0.0204509;OID=.;OPOS=47002606;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:167:64:67:100:100:45:55:26:38:45:55:28:39 chr10 47002617 . T C 468.58 PASS AO=92;DP=158;FAO=92;FDP=158;FR=.;FRO=66;FSAF=54;FSAR=38;FSRF=30;FSRR=36;FWDB=-0.0639785;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.078;QD=11.8627;RBI=0.072642;REFB=-0.00503019;REVB=-0.0344036;RO=66;SAF=54;SAR=38;SRF=30;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102848;STB=0.555914;TYPE=snp;VARB=0.00316052;OID=.;OPOS=47002617;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:158:66:66:92:92:38:54:30:36:38:54:30:36 chr10 47002724 . G A 82.67 PASS AO=25;DP=69;FAO=26;FDP=71;FR=.;FRO=45;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=29;FSRR=16;FWDB=-0.0470069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.9737;QD=4.65727;RBI=0.0552457;REFB=-0.0261492;REVB=0.0290248;RO=44;SAF=15;SAR=10;SRF=28;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.042206;STB=0.519616;TYPE=snp;VARB=0.0314581;OID=.;OPOS=47002724;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:69:71:44:45:25:26:10:15:28:16:10:16:29:16 chr10 47002757 . A G 382.14 PASS AO=21;DP=54;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.066157;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.8661;QD=38.214;RBI=0.0665164;REFB=0;REVB=-0.00690481;RO=0;SAF=7;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000695599;OID=.;OPOS=47002757;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:22:40:0:0:21:40:14:7:0:0:16:24:0:0 chr10 47002792 . T C 48.8 PASS AO=19;DP=56;FAO=18;FDP=60;FR=.;FRO=42;FSAF=1;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=34;FWDB=-0.025769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.763;QD=3.25323;RBI=0.030467;REFB=-0.0216242;REVB=0.0162541;RO=37;SAF=1;SAR=18;SRF=6;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.356501;STB=0.749625;TYPE=snp;VARB=0.0687696;OID=.;OPOS=47002792;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:56:60:37:42:19:18:18:1:6:31:17:1:8:34 chr10 47002917 . T C 773.84 PASS AO=84;DP=101;FAO=102;FDP=116;FR=.;FRO=14;FSAF=43;FSAR=59;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=0.0829549;FXX=0.0169477;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.5448;QD=26.6841;RBI=0.0844101;REFB=0.0634867;REVB=-0.0156058;RO=17;SAF=26;SAR=58;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0372252;STB=0.525851;TYPE=snp;VARB=-0.00266633;OID=.;OPOS=47002917;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:101:116:17:14:84:102:58:26:7:10:59:43:3:11 chr10 47002937 . A G 236.36 PASS AO=59;DP=134;FAO=62;FDP=138;FR=.;FRO=76;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=26;FSRR=50;FWDB=0.0482252;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.8333;QD=6.85095;RBI=0.119237;REFB=-0.000359433;REVB=-0.109049;RO=75;SAF=25;SAR=34;SRF=25;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0944972;STB=0.561585;TYPE=snp;VARB=9.68034e-05;OID=.;OPOS=47002937;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:138:75:76:59:62:34:25:25:50:34:28:26:50 chr10 47002942 . C G 238.51 PASS AO=54;DP=124;FAO=63;FDP=135;FR=.;FRO=72;FSAF=28;FSAR=35;FSRF=27;FSRR=45;FWDB=0.0714248;FXX=0.0217376;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.6573;QD=7.067;RBI=0.100479;REFB=-0.00509107;REVB=-0.0706715;RO=70;SAF=28;SAR=26;SRF=26;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147979;STB=0.537803;TYPE=snp;VARB=0.00663461;OID=.;OPOS=47002942;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:135:70:72:54:63:26:28:26:44:35:28:27:45 chr10 47003115 . C T 239.24 PASS AO=70;DP=171;FAO=70;FDP=171;FR=.;FRO=101;FSAF=32;FSAR=38;FSRF=43;FSRR=58;FWDB=-0.0160089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.665;QD=5.59616;RBI=0.0231118;REFB=6.60215e-05;REVB=-0.0166694;RO=100;SAF=32;SAR=38;SRF=43;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0287605;STB=0.518738;TYPE=snp;VARB=-0.00030366;OID=.;OPOS=47003115;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:171:100:101:70:70:38:32:43:57:38:32:43:58 chr10 47003177 . A G 220.79 PASS AO=59;DP=133;FAO=60;FDP=136;FR=.;FRO=76;FSAF=19;FSAR=41;FSRF=35;FSRR=41;FWDB=0.00660233;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.387;QD=6.49376;RBI=0.00906948;REFB=-0.00886328;REVB=-0.00621809;RO=74;SAF=19;SAR=40;SRF=33;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133463;STB=0.586927;TYPE=snp;VARB=0.00979709;OID=.;OPOS=47003177;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:136:74:76:59:60:40:19:33:41:41:19:35:41 chr10 47003215 . T C 143.5 PASS AO=39;DP=95;FAO=40;FDP=96;FR=.;FRO=56;FSAF=9;FSAR=31;FSRF=26;FSRR=30;FWDB=0.0426295;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=241.756;QD=5.9791;RBI=0.0426418;REFB=-0.00710069;REVB=-0.00102499;RO=56;SAF=9;SAR=30;SRF=26;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280719;STB=0.663925;TYPE=snp;VARB=0.00871206;OID=.;OPOS=47003215;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:96:56:56:39:40:30:9:26:30:31:9:26:30 chr10 47003229 . C G 157.86 PASS AO=33;DP=92;FAO=38;FDP=85;FR=.,HEALED;FRO=42;FSAF=11;FSAR=27;FSRF=14;FSRR=28;FWDB=-0.116828;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=123.463;QD=7.42863;RBI=0.116955;REFB=-0.0204217;REVB=-0.0054493;RO=31;SAF=7;SAR=26;SRF=4;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117299;STB=0.527329;TYPE=snp;VARB=0.0135917;OID=.;OPOS=47003229;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:85:31:42:33:38:26:7:4:27:27:11:14:28 chr10 47003250 . C T 55.76 PASS AO=22;DP=73;FAO=22;FDP=73;FR=.;FRO=51;FSAF=2;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=31;FWDB=-0.018986;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.546;QD=3.05515;RBI=0.0203544;REFB=0.0108028;REVB=0.00733712;RO=51;SAF=2;SAR=20;SRF=20;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.505392;STB=0.811454;TYPE=snp;VARB=-0.0149604;OID=.;OPOS=47003250;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:73:73:51:51:22:22:20:2:20:31:20:2:20:31 chr10 47003615 . C T 318.41 PASS AO=67;DP=120;FAO=67;FDP=123;FR=.;FRO=56;FSAF=34;FSAR=33;FSRF=32;FSRR=24;FWDB=-0.00851567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.021;QD=10.3549;RBI=0.0279641;REFB=-0.0162178;REVB=-0.0266359;RO=53;SAF=34;SAR=33;SRF=32;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.077969;STB=0.529146;TYPE=snp;VARB=0.0153494;OID=.;OPOS=47003615;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:123:53:56:67:67:33:34:32:21:33:34:32:24 chr10 47003896 . C T 236.88 PASS AO=53;DP=100;FAO=54;FDP=107;FR=.;FRO=53;FSAF=10;FSAR=44;FSRF=16;FSRR=37;FWDB=-0.00175275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.293;QD=8.85531;RBI=0.00379422;REFB=-0.0076974;REVB=-0.00336511;RO=46;SAF=9;SAR=44;SRF=16;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22092;STB=0.585431;TYPE=snp;VARB=0.00633821;OID=.;OPOS=47003896;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:107:46:53:53:54:44:9:16:30:44:10:16:37 chr10 47004036 . G C 14.67 PASS AO=17;DP=104;FAO=17;FDP=104;FR=.;FRO=87;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=43;FSRR=44;FWDB=-0.0154615;FXX=0.0095229;HRUN=4;LEN=1;MLLD=72.1117;QD=0.564326;RBI=0.0215887;REFB=-0.000656694;REVB=-0.015067;RO=87;SAF=7;SAR=10;SRF=43;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104664;STB=0.569394;TYPE=snp;VARB=0.00306335;OID=.;OPOS=47004036;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:104:104:87:87:17:17:10:7:43:44:10:7:43:44 chr10 47004068 . T C 469.78 PASS AO=73;DP=101;FAO=73;FDP=101;FR=.;FRO=28;FSAF=45;FSAR=28;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=0.0324496;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.2598;QD=18.605;RBI=0.0332446;REFB=-0.00731316;REVB=-0.00722678;RO=28;SAF=45;SAR=28;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0998877;STB=0.553676;TYPE=snp;VARB=0.00366306;OID=.;OPOS=47004068;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:101:101:28:28:73:73:28:45:12:16:28:45:12:16 chr10 47004182 . G A 711.66 PASS AO=76;DP=82;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0942841;FXX=0.0238067;HRUN=4;LEN=1;MLLD=56.5576;QD=34.7153;RBI=0.144716;REFB=-0.130267;REVB=0.109787;RO=4;SAF=35;SAR=41;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200501;STB=0.505493;TYPE=snp;VARB=0.00437153;OID=.;OPOS=47004182;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:82:82:4:1:76:81:41:35:1:3:45:36:0:1 chr10 47004217 . T C 244.26 PASS AO=46;DP=80;FAO=47;FDP=81;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=35;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=-0.00630212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.492;QD=12.062;RBI=0.0412547;REFB=-0.00209752;REVB=0.0407705;RO=34;SAF=12;SAR=34;SRF=12;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0879479;STB=0.551158;TYPE=snp;VARB=0.00303255;OID=.;OPOS=47004217;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:81:34:34:46:47:34:12:12:22:35:12:12:22 chr10 47004289 . C T 251.13 PASS AO=56;DP=110;FAO=56;FDP=110;FR=.;FRO=54;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=0.0147989;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.1835;QD=9.13183;RBI=0.0171695;REFB=-0.0363505;REVB=-0.00870552;RO=54;SAF=30;SAR=26;SRF=25;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0647113;STB=0.535702;TYPE=snp;VARB=0.0624713;OID=.;OPOS=47004289;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:54:54:56:56:26:30:25:29:26:30:25:29 chr10 47004355 . C CA 232.62 PASS AO=52;DP=106;FAO=53;FDP=105;FR=.;FRO=52;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=29;FSRR=23;FWDB=-0.00610611;FXX=0.00943307;HRUN=0;LEN=1;MLLD=166.031;QD=8.86154;RBI=0.00620666;REFB=-0.0304711;REVB=0.00111268;RO=53;SAF=29;SAR=23;SRF=29;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00970873;STB=0.505261;TYPE=ins;VARB=0.0325907;OID=.;OPOS=47004356;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:52:106:53:105:52:29:24:29:23:99:53:29:23:29:24 chr10 47004362 . C T 264.33 PASS AO=57;DP=108;FAO=57;FDP=108;FR=.;FRO=51;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=27;FSRR=24;FWDB=0.0143359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.488;QD=9.78996;RBI=0.0240936;REFB=-0.00870944;REVB=0.0193645;RO=51;SAF=29;SAR=28;SRF=27;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177276;STB=0.50975;TYPE=snp;VARB=0.0049327;OID=.;OPOS=47004362;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:51:51:57:57:28:29:27:24:28:29:27:24 chr10 47004633 . C T 169.6 PASS AO=41;DP=87;FAO=41;FDP=87;FR=.;FRO=46;FSAF=10;FSAR=31;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=0.0147089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.678;QD=7.79753;RBI=0.0343166;REFB=-0.00128788;REVB=-0.0310044;RO=45;SAF=10;SAR=31;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.262544;STB=0.643245;TYPE=snp;VARB=0.00202104;OID=.;OPOS=47004633;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:45:46:41:41:31:10:22:23:31:10:22:24 chr10 47004634 . A G 169.7 PASS AO=41;DP=87;FAO=41;FDP=87;FR=.;FRO=46;FSAF=10;FSAR=31;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=0.0185626;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.204;QD=7.80213;RBI=0.0185631;REFB=0.00705627;REVB=-0.00013039;RO=46;SAF=10;SAR=31;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254791;STB=0.643245;TYPE=snp;VARB=-0.0188889;OID=.;OPOS=47004634;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:46:46:41:41:31:10:22:24:31:10:22:24 chr10 47004699 . A G 24.09 PASS AO=22;DP=117;FAO=22;FDP=117;FR=.;FRO=95;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=53;FSRR=42;FWDB=-0.0233093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.008;QD=0.823573;RBI=0.0234012;REFB=-0.0019318;REVB=-0.00207251;RO=95;SAF=10;SAR=12;SRF=53;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130703;STB=0.583259;TYPE=snp;VARB=0.00832596;OID=.;OPOS=47004699;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:117:117:95:95:22:22:12:10:53:42:12:10:53:42 chr10 47004702 . A G 219.31 PASS AO=56;DP=123;FAO=56;FDP=123;FR=.;FRO=67;FSAF=33;FSAR=23;FSRF=39;FSRR=28;FWDB=-0.0167984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.3132;QD=7.13206;RBI=0.0935798;REFB=-0.0120552;REVB=-0.0920597;RO=67;SAF=33;SAR=23;SRF=39;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00725525;STB=0.504042;TYPE=snp;VARB=0.0151444;OID=.;OPOS=47004702;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:67:67:56:56:23:33:39:28:23:33:39:28 chr10 47004971 . A G 148.42 PASS AO=41;DP=95;FAO=40;FDP=94;FR=.;FRO=54;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=27;FSRR=27;FWDB=0.0171203;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.611;QD=6.31565;RBI=0.0198652;REFB=-0.00672241;REVB=-0.0100759;RO=51;SAF=16;SAR=25;SRF=26;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120313;STB=0.558412;TYPE=snp;VARB=0.00731849;OID=.;OPOS=47004971;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:94:51:54:41:40:25:16:26:25:24:16:27:27 chr10 47004994 . A G 48.56 PASS AO=16;DP=57;FAO=18;FDP=59;FR=.;FRO=41;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=-0.0146659;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.662;QD=3.29237;RBI=0.0285885;REFB=-0.00801264;REVB=-0.02454;RO=41;SAF=5;SAR=11;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131724;STB=0.518643;TYPE=snp;VARB=0.0209746;OID=.;OPOS=47004994;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:57:59:41:41:16:18:11:5:17:24:11:7:17:24 chr10 47005267 . C T 177.63 PASS AO=32;DP=52;FAO=32;FDP=52;FR=.;FRO=20;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=0.00181289;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.637;QD=13.6639;RBI=0.00218742;REFB=-0.00141692;REVB=-0.00122403;RO=20;SAF=19;SAR=13;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0411975;STB=0.522599;TYPE=snp;VARB=0.00164812;OID=.;OPOS=47005267;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:52:52:20:20:32:32:13:19:13:7:13:19:13:7 chr10 47005466 . C T 61.35 PASS AO=52;DP=244;FAO=52;FDP=244;FR=.;FRO=192;FSAF=37;FSAR=15;FSRF=175;FSRR=17;FWDB=-0.039497;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.3587;QD=1.0057;RBI=0.0743501;REFB=-0.00900534;REVB=-0.0629914;RO=185;SAF=37;SAR=15;SRF=174;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.472372;STB=0.728631;TYPE=snp;VARB=0.0259453;OID=.;OPOS=47005466;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:244:244:185:192:52:52:15:37:174:11:15:37:175:17 chr10 47005504 . T C 590.12 PASS AO=135;DP=264;FAO=137;FDP=271;FR=.;FRO=134;FSAF=109;FSAR=28;FSRF=97;FSRR=37;FWDB=-0.0149467;FXX=0.00367634;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.084;QD=8.71019;RBI=0.0191713;REFB=-0.0276388;REVB=-0.0120057;RO=127;SAF=107;SAR=28;SRF=90;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104919;STB=0.551225;TYPE=snp;VARB=0.0237897;OID=.;OPOS=47005504;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:264:271:127:134:135:137:28:107:90:37:28:109:97:37 chr10 47005575 . C T 275.28 PASS AO=87;DP=223;FAO=87;FDP=223;FR=.;FRO=136;FSAF=46;FSAR=41;FSRF=86;FSRR=50;FWDB=0.00252262;FXX=0.00888849;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.559;QD=4.9377;RBI=0.0124577;REFB=-0.00616203;REVB=0.0121997;RO=133;SAF=46;SAR=41;SRF=83;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103766;STB=0.563853;TYPE=snp;VARB=0.0106941;OID=.;OPOS=47005575;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:223:133:136:87:87:41:46:83:50:41:46:86:50 chr10 47005611 . CAGA C 335.82 PASS AO=73;DP=170;FAO=78;FDP=155;FR=.;FRO=77;FSAF=46;FSAR=32;FSRF=36;FSRR=41;FWDB=0.0112443;FXX=0.071852;HRUN=1;LEN=3;MLLD=216.206;QD=8.6662;RBI=0.0140183;REFB=-0.00290765;REVB=-0.00837128;RO=71;SAF=42;SAR=31;SRF=34;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.087102;STB=0.561335;TYPE=del;VARB=0.00321983;OID=.;OPOS=47005612;OREF=AGA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:73:152:78:155:77:46:32:36:41:99:71:42:31:34:37 chr10 47087078 . G T 92.76 PASS AO=65;DP=278;FAO=65;FDP=275;FR=.;FRO=210;FSAF=37;FSAR=28;FSRF=92;FSRR=118;FWDB=-0.0461464;FXX=0.010791;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.0567;QD=1.3493;RBI=0.0464878;REFB=-0.0115562;REVB=-0.00562345;RO=182;SAF=37;SAR=28;SRF=66;SRR=116;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253031;STB=0.59926;TYPE=snp;VARB=0.0343062;OID=.;OPOS=47087078;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:278:275:182:210:65:65:28:37:66:116:28:37:92:118 chr10 47087371 . G A 460.16 PASS AO=104;DP=206;FAO=105;FDP=207;FR=.;FRO=102;FSAF=65;FSAR=40;FSRF=46;FSRR=56;FWDB=-0.0186623;FXX=0.00480746;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.369;QD=8.89204;RBI=0.0233653;REFB=-0.0200021;REVB=0.0140589;RO=100;SAF=64;SAR=40;SRF=46;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141271;STB=0.584253;TYPE=snp;VARB=0.0217265;OID=.;OPOS=47087371;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:206:207:100:102:104:105:40:64:46:54:40:65:46:56 chr10 47087474 . C T 276.87 PASS AO=72;DP=163;FAO=73;FDP=163;FR=.;FRO=90;FSAF=34;FSAR=39;FSRF=54;FSRR=36;FWDB=0.0417369;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2843;QD=6.79425;RBI=0.0631425;REFB=-0.0118165;REVB=0.0473815;RO=91;SAF=32;SAR=40;SRF=56;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170053;STB=0.573701;TYPE=snp;VARB=0.0156692;OID=.;OPOS=47087474;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:163:91:90:72:73:40:32:56:35:39:34:54:36 chr10 47087608 . T C 830.33 PASS AO=158;DP=163;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0361275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.633;QD=36.9036;RBI=0.0507168;REFB=-0.035795;REVB=0.0355948;RO=4;SAF=99;SAR=59;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0311616;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000485585;OID=.;OPOS=47087608;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:163:90:4:0:158:90:59:99:0:4:44:46:0:0 chr10 47087680 . C T 265.67 PASS AO=72;DP=169;FAO=72;FDP=166;FR=.;FRO=94;FSAF=19;FSAR=53;FSRF=51;FSRR=43;FWDB=-0.0204521;FXX=0.023528;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.2834;QD=6.40164;RBI=0.0286763;REFB=-0.0302077;REVB=0.0201007;RO=89;SAF=19;SAR=53;SRF=50;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.315718;STB=0.670351;TYPE=snp;VARB=0.0350019;OID=.;OPOS=47087680;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:166:89:94:72:72:53:19:50:39:53:19:51:43 chr10 47087731 . C T 272.31 PASS AO=65;DP=137;FAO=66;FDP=138;FR=.;FRO=72;FSAF=21;FSAR=45;FSRF=30;FSRR=42;FWDB=0.0869405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.0415;QD=7.89298;RBI=0.0892923;REFB=-0.0144384;REVB=-0.0203584;RO=69;SAF=21;SAR=44;SRF=28;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0848907;STB=0.556751;TYPE=snp;VARB=0.0172265;OID=.;OPOS=47087731;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:138:69:72:65:66:44:21:28:41:45:21:30:42 chr10 47087830 . G A 170.45 PASS AO=39;DP=76;FAO=38;FDP=75;FR=.;FRO=37;FSAF=9;FSAR=29;FSRF=14;FSRR=23;FWDB=0.0227959;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.343;QD=9.09069;RBI=0.0229168;REFB=-0.0137498;REVB=-0.00235095;RO=37;SAF=9;SAR=30;SRF=14;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16338;STB=0.587616;TYPE=snp;VARB=0.0097384;OID=.;OPOS=47087830;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:75:37:37:39:38:30:9:14:23:29:9:14:23 chr10 47416867 . G A 128.33 PASS AO=312;DP=1288;FAO=94;FDP=400;FR=.;FRO=306;FSAF=66;FSAR=28;FSRF=226;FSRR=80;FWDB=-0.0217067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.0466;QD=1.28332;RBI=0.0235312;REFB=-0.0118354;REVB=0.00908509;RO=961;SAF=217;SAR=95;SRF=694;SRR=267;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0408733;STB=0.534232;TYPE=snp;VARB=0.0332178;OID=.;OPOS=47416867;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:1288:400:961:306:312:94:95:217:694:267:28:66:226:80 chr10 47747159 . G C 27.79 PASS AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=11;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0140875;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.059;QD=10.1062;RBI=0.0239628;REFB=-0.0248469;REVB=-0.0193844;RO=6;SAF=3;SAR=2;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0621951;STB=0.538311;TYPE=snp;VARB=0.046521;OID=.;OPOS=47747159;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:11:11:6:6:5:5:2:3:4:2:2:3:4:2 chr10 48370595 . G A 117.78 PASS AO=31;DP=67;FAO=30;FDP=68;FR=.;FRO=38;FSAF=6;FSAR=24;FSRF=8;FSRR=30;FWDB=0.125201;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=40.4795;QD=6.92825;RBI=0.134676;REFB=-0.00446049;REVB=0.0496202;RO=36;SAF=6;SAR=25;SRF=7;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00137047;STB=0.509085;TYPE=snp;VARB=0.0101924;OID=.;OPOS=48370595;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:68:36:38:31:30:25:6:7:29:24:6:8:30 chr10 48370710 . G A 73.84 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0801702;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=286.246;QD=36.9199;RBI=0.0801702;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=8;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00118448;OID=.;OPOS=48370710;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:0:8:0:0:0:8:0:0 chr10 48373123 . G A 192.11 PASS AO=30;DP=42;FAO=30;FDP=42;FR=.;FRO=12;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.055454;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.344;QD=18.2957;RBI=0.060223;REFB=0.00213701;REVB=-0.0234875;RO=10;SAF=15;SAR=15;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0920735;STB=0.547588;TYPE=snp;VARB=-0.00057798;OID=.;OPOS=48373123;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:42:42:10:12:30:30:15:15:7:3:15:15:8:4 chr10 48373576 . T C 92.27 PASS AO=20;DP=41;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.0371664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.943;QD=9.00234;RBI=0.0473987;REFB=-0.0479726;REVB=0.029416;RO=21;SAF=9;SAR=11;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15199;STB=0.585871;TYPE=snp;VARB=0.0536543;OID=.;OPOS=48373576;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:41:41:21:21:20:20:11:9:13:8:11:9:13:8 chr10 48373663 . C T 36.93 PASS AO=18;DP=71;FAO=18;FDP=71;FR=.;FRO=53;FSAF=3;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=45;FWDB=0.0220913;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.156;QD=2.08029;RBI=0.0417438;REFB=-0.0334834;REVB=-0.0354191;RO=52;SAF=3;SAR=15;SRF=8;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0288505;STB=0.521716;TYPE=snp;VARB=0.103838;OID=.;OPOS=48373663;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:71:71:52:53:18:18:15:3:8:44:15:3:8:45 chr10 48389061 . C T 289.24 PASS AO=53;DP=86;FAO=53;FDP=86;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=40;FSRF=8;FSRR=25;FWDB=0.0346559;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.358;QD=13.4529;RBI=0.034656;REFB=-0.0191942;REVB=-8.29457e-05;RO=33;SAF=13;SAR=40;SRF=8;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00272511;STB=0.501483;TYPE=snp;VARB=0.0119895;OID=.;OPOS=48389061;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:33:33:53:53:40:13:8:25:40:13:8:25 chr10 49313245 . C T 43.05 PASS AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0378778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.668;QD=14.349;RBI=0.0673638;REFB=0.0724201;REVB=0.055706;RO=5;SAF=5;SAR=2;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237226;STB=0.640603;TYPE=snp;VARB=-0.0160645;OID=.;OPOS=49313245;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:12:12:5:5:7:7:2:5:2:3:2:5:2:3 chr10 49658943 . G T 76.35 PASS AO=12;DP=34;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.0135403;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.761;QD=7.63513;RBI=0.0244716;REFB=-0.00273074;REVB=0.0203843;RO=19;SAF=2;SAR=10;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223691;STB=0.583236;TYPE=snp;VARB=0.0039151;OID=.;OPOS=49658943;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:34:40:19:22:12:18:10:2:6:13:13:5:9:13 chr10 49659351 . C T 70.9 PASS AO=17;DP=31;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.0894676;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.894;QD=8.59414;RBI=0.0967781;REFB=-0.00844277;REVB=0.0368991;RO=14;SAF=6;SAR=11;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127426;STB=0.511097;TYPE=snp;VARB=0.0166584;OID=.;OPOS=49659351;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:31:33:14:17:17:16:11:6:3:11:11:5:5:12 chr10 49659559 . C T 39.78 PASS AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0334681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.435;QD=12.2394;RBI=0.033506;REFB=-0.00939197;REVB=-0.00159154;RO=6;SAF=4;SAR=3;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0767769;STB=0.545327;TYPE=snp;VARB=0.00491895;OID=.;OPOS=49659559;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:13:13:6:6:7:7:3:4:4:2:3:4:4:2 chr10 49659637 . T C 31.59 PASS AO=6;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.0196517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.1804;QD=9.71876;RBI=0.0204498;REFB=0.00953907;REVB=-0.00565719;RO=7;SAF=3;SAR=3;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191087;STB=0.61502;TYPE=snp;VARB=-0.00699186;OID=.;OPOS=49659637;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:13:13:7:7:6:6:3:3:2:5:3:3:2:5 chr10 49667795 . T C 457.32 PASS AO=50;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.928;QD=35.8686;RBI=0.0251924;REFB=-0.0689588;REVB=0.0224241;RO=1;SAF=20;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229535;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00177957;OID=.;OPOS=49667795;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:51:51:1:0:50:51:30:20:1:0:30:21:0:0 chr10 49687800 . G A 116.19 PASS AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.119244;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=280.675;QD=35.7501;RBI=0.119776;REFB=0;REVB=-0.0112772;RO=0;SAF=2;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000429939;OID=.;OPOS=49687800;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:13:0:0:13:13:11:2:0:0:11:2:0:0 chr10 49998780 . G A 305.99 PASS AO=65;DP=121;FAO=65;FDP=121;FR=.;FRO=56;FSAF=52;FSAR=13;FSRF=34;FSRR=22;FWDB=-0.0114826;FXX=0.00819605;HRUN=3;LEN=1;MLLD=110.089;QD=10.1153;RBI=0.0903297;REFB=0.00283426;REVB=0.0895969;RO=52;SAF=52;SAR=13;SRF=31;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219231;STB=0.619429;TYPE=snp;VARB=-0.00174198;OID=.;OPOS=49998780;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:52:56:65:65:13:52:31:21:13:52:34:22 chr10 50013402 . T C 130.87 PASS AO=36;DP=86;FAO=36;FDP=86;FR=.;FRO=50;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=20;FSRR=30;FWDB=0.0148566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.358;QD=6.08674;RBI=0.027241;REFB=-0.0176282;REVB=-0.0228331;RO=50;SAF=12;SAR=24;SRF=20;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0747377;STB=0.542349;TYPE=snp;VARB=0.0235702;OID=.;OPOS=50013402;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:50:50:36:36:24:12:20:30:24:12:20:30 chr10 50022040 . G A 243.85 PASS AO=65;DP=147;FAO=65;FDP=147;FR=.;FRO=82;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=48;FSRR=34;FWDB=-0.0566278;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.8224;QD=6.63529;RBI=0.0598741;REFB=-0.0184829;REVB=0.0194473;RO=82;SAF=33;SAR=32;SRF=48;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0778873;STB=0.543383;TYPE=snp;VARB=0.021323;OID=.;OPOS=50022040;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:147:82:82:65:65:32:33:48:34:32:33:48:34 chr10 50025446 . G T 100.39 PASS AO=19;DP=38;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=16;FWDB=0.00707855;FXX=0.0526177;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.885;QD=11.1543;RBI=0.00708488;REFB=0.000765508;REVB=0.000299619;RO=14;SAF=3;SAR=16;SRF=0;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.279153;STB=0.659882;TYPE=snp;VARB=-0.000387564;OID=.;OPOS=50025446;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:38:36:14:16:19:20:16:3:0:14:17:3:0:16 chr10 50034833 . G A 371.14 PASS AO=59;DP=83;FAO=59;FDP=83;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=50;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=0.00704748;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.578;QD=17.8864;RBI=0.0414573;REFB=-0.0347587;REVB=0.0408539;RO=24;SAF=9;SAR=50;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.376797;STB=0.705337;TYPE=snp;VARB=0.0153852;OID=.;OPOS=50034833;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:83:83:24:24:59:59:50:9:16:8:50:9:16:8 chr10 50038800 . A G 250.09 PASS AO=68;DP=156;FAO=68;FDP=156;FR=.;FRO=88;FSAF=23;FSAR=45;FSRF=53;FSRR=35;FWDB=0.00535411;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=171.573;QD=6.41254;RBI=0.00799089;REFB=0.00235819;REVB=0.00593193;RO=88;SAF=23;SAR=45;SRF=53;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.268872;STB=0.650146;TYPE=snp;VARB=-0.00364337;OID=.;OPOS=50038800;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:156:88:88:68:68:45:23:53:35:45:23:53:35 chr10 50105597 . G A 76.66 PASS AO=14;DP=24;FAO=14;FDP=24;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0764712;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.859;QD=12.7766;RBI=0.0858731;REFB=-0.00338282;REVB=0.0390684;RO=10;SAF=7;SAR=7;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147608;STB=0.583217;TYPE=snp;VARB=0.00263721;OID=.;OPOS=50105597;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:24:24:10:10:14:14:7:7:3:7:7:7:3:7 chr10 50109902 . G A 812.56 PASS AO=85;DP=86;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0551692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1185;QD=36.9346;RBI=0.0589704;REFB=-0.0741635;REVB=0.0208294;RO=1;SAF=37;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126311;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00167798;OID=.;OPOS=50109902;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:86:88:1:0:85:88:48:37:1:0:50:38:0:0 chr10 50121784 . T C 406.26 PASS AO=86;DP=159;FAO=86;FDP=159;FR=.;FRO=73;FSAF=31;FSAR=55;FSRF=25;FSRR=48;FWDB=0.0625571;FXX=0.00624961;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9872;QD=10.2203;RBI=0.0729071;REFB=-0.0285326;REVB=0.037444;RO=73;SAF=31;SAR=55;SRF=25;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0164804;STB=0.509005;TYPE=snp;VARB=0.0216217;OID=.;OPOS=50121784;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:159:73:73:86:86:55:31:25:48:55:31:25:48 chr10 50121785 . G A 392.47 PASS AO=84;DP=157;FAO=84;FDP=156;FR=.;FRO=72;FSAF=31;FSAR=53;FSRF=25;FSRR=47;FWDB=0.0575289;FXX=0.00636902;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.4391;QD=10.0633;RBI=0.0678525;REFB=-0.0242771;REVB=0.0359775;RO=72;SAF=31;SAR=53;SRF=25;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0198923;STB=0.510874;TYPE=snp;VARB=0.0194098;OID=.;OPOS=50121785;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:156:72:72:84:84:53:31:25:47:53:31:25:47 chr10 50121964 . G A 350.22 PASS AO=93;DP=211;FAO=94;FDP=210;FR=.;FRO=116;FSAF=40;FSAR=54;FSRF=88;FSRR=28;FWDB=-0.00139347;FXX=0.00473911;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.04;QD=6.6709;RBI=0.0227557;REFB=-0.0174387;REVB=0.022713;RO=111;SAF=40;SAR=53;SRF=83;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.305173;STB=0.678144;TYPE=snp;VARB=0.0214564;OID=.;OPOS=50121964;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:210:111:116:93:94:53:40:83:28:54:40:88:28 chr10 50227785 . T C 1100.07 PASS AO=114;DP=116;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0259594;FXX=0.00847386;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.913;QD=37.6092;RBI=0.0317607;REFB=-0.0618771;REVB=0.0182989;RO=1;SAF=46;SAR=68;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00693243;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00027621;OID=.;OPOS=50227785;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:116:117:1:0:114:117:68:46:0:1:70:47:0:0 chr10 50256548 . G A 312.08 PASS AO=82;DP=182;FAO=82;FDP=182;FR=.;FRO=100;FSAF=46;FSAR=36;FSRF=59;FSRR=41;FWDB=0.0466741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.249;QD=6.85887;RBI=0.046973;REFB=-0.00127651;REVB=0.0052906;RO=100;SAF=46;SAR=36;SRF=59;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0292754;STB=0.516248;TYPE=snp;VARB=0.00168795;OID=.;OPOS=50256548;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:182:100:100:82:82:36:46:59:41:36:46:59:41 chr10 50315893 . A G 272.05 PASS AO=64;DP=131;FAO=65;FDP=133;FR=.;FRO=68;FSAF=29;FSAR=36;FSRF=43;FSRR=25;FWDB=0.0110568;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.2233;QD=8.18198;RBI=0.016519;REFB=0.00897664;REVB=0.012273;RO=67;SAF=29;SAR=35;SRF=43;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173232;STB=0.594331;TYPE=snp;VARB=-0.00883154;OID=.;OPOS=50315893;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:133:67:68:64:65:35:29:43:24:36:29:43:25 chr10 50339754 . G T 183.2 PASS AO=31;DP=48;FAO=32;FDP=51;FR=.;FRO=19;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.0105667;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.1003;QD=14.3687;RBI=0.0409069;REFB=-0.0466085;REVB=0.0395186;RO=17;SAF=15;SAR=16;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00859578;STB=0.517868;TYPE=snp;VARB=0.0402827;OID=.;OPOS=50339754;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:48:51:17:19:31:32:16:15:8:9:17:15:8:11 chr10 50340190 . C T 120.32 PASS AO=35;DP=88;FAO=35;FDP=88;FR=.;FRO=53;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=35;FWDB=0.0126188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.9995;QD=5.46898;RBI=0.0153256;REFB=0.00378282;REVB=0.00869719;RO=53;SAF=18;SAR=17;SRF=18;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184865;STB=0.604594;TYPE=snp;VARB=-0.00636769;OID=.;OPOS=50340190;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:53:53:35:35:17:18:18:35:17:18:18:35 chr10 50374819 . T C 76.94 PASS AO=17;DP=41;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.015264;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.6024;QD=7.15744;RBI=0.0153266;REFB=-0.0233505;REVB=0.00138372;RO=24;SAF=4;SAR=13;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.337983;STB=0.631571;TYPE=snp;VARB=0.0286362;OID=.;OPOS=50374819;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:41:43:24:24:17:19:13:4:13:11:13:6:13:11 chr10 50396388 . G A 252.02 PASS AO=58;DP=116;FAO=58;FDP=116;FR=.;FRO=58;FSAF=11;FSAR=47;FSRF=21;FSRR=37;FWDB=-0.00937474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.6197;QD=8.69033;RBI=0.0118537;REFB=-0.0470454;REVB=-0.00725427;RO=57;SAF=11;SAR=47;SRF=20;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200786;STB=0.619394;TYPE=snp;VARB=0.0351143;OID=.;OPOS=50396388;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:57:58:58:58:47:11:20:37:47:11:21:37 chr10 50531549 . G T 108.79 PASS AO=26;DP=56;FAO=26;FDP=56;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=-0.00799282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.5403;QD=7.7709;RBI=0.0278815;REFB=-0.0513686;REVB=0.0267113;RO=30;SAF=9;SAR=17;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0552754;STB=0.531226;TYPE=snp;VARB=0.0507084;OID=.;OPOS=50531549;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:30:30:26:26:17:9:12:18:17:9:12:18 chr10 50531604 . T C 412.47 PASS AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0157629;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.636;QD=37.4974;RBI=0.0215628;REFB=0;REVB=0.0147135;RO=0;SAF=12;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.39153e-06;OID=.;OPOS=50531604;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:44:44:0:0:44:44:32:12:0:0:32:12:0:0 chr10 50531606 . C A 81.12 PASS AO=17;DP=40;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=0.0419001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.464;QD=7.72532;RBI=0.0419415;REFB=-0.0287388;REVB=0.00186381;RO=23;SAF=3;SAR=14;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185783;STB=0.528271;TYPE=snp;VARB=0.035971;OID=.;OPOS=50531606;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:40:42:23:23:17:19:14:3:7:16:14:5:7:16 chr10 50531972 . A C 154.8 PASS AO=37;DP=73;FAO=37;FDP=75;FR=.;FRO=38;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=5;FSRR=33;FWDB=-0.0263657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.5823;QD=8.25623;RBI=0.0454056;REFB=-0.0295519;REVB=-0.0369665;RO=34;SAF=13;SAR=24;SRF=5;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209048;STB=0.631652;TYPE=snp;VARB=0.0160301;OID=.;OPOS=50531972;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:75:34:38:37:37:24:13:5:29:24:13:5:33 chr10 50532681 . CT C 178.11 PASS AO=8;DP=30;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.165458;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=12.4514;QD=26.3873;RBI=0.166596;REFB=0;REVB=-0.0194332;RO=22;SAF=6;SAR=2;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.476273;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.00845656;OID=.;OPOS=50532682;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:8:30:27:27:0:12:15:0:0:17:22:6:2:7:15 chr10 50532683 . T C 139.54 PASS AO=19;DP=29;FAO=21;FDP=29;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.00656627;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.0729;QD=19.2467;RBI=0.0419981;REFB=-0.0129648;REVB=-0.0414816;RO=8;SAF=4;SAR=15;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.337163;STB=0.63816;TYPE=snp;VARB=0.0464017;OID=.;OPOS=50532683;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:29:29:8:8:19:21:15:4:6:2:15:6:6:2 chr10 50533237 . G A 108.5 PASS AO=15;DP=20;FAO=15;FDP=20;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.0435167;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1143;QD=21.6996;RBI=0.0441404;REFB=-0.0615581;REVB=-0.00739404;RO=5;SAF=1;SAR=14;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192304;STB=0.608524;TYPE=snp;VARB=0.016332;OID=.;OPOS=50533237;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:20:20:5:5:15:15:14:1:1:4:14:1:1:4 chr10 50533617 . T C 363.28 PASS AO=28;DP=39;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0125404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.8459;QD=38.2404;RBI=0.0982576;REFB=0;REVB=0.097454;RO=0;SAF=1;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00144197;OID=.;OPOS=50533617;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:28:38:0:0:28:38:27:1:0:0:33:5:0:0 chr10 50534599 . G A 117.69 PASS AO=15;DP=22;FAO=16;FDP=20;FR=.;FRO=4;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0552373;FXX=0.0908678;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.0287;QD=23.5375;RBI=0.0555662;REFB=-0.0259238;REVB=0.00603695;RO=4;SAF=8;SAR=7;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201273;STB=0.610975;TYPE=snp;VARB=0.00532044;OID=.;OPOS=50534599;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:22:20:4:4:15:16:7:8:0:4:7:9:0:4 chr10 50534862 . T C 142.87 PASS AO=28;DP=60;FAO=33;FDP=67;FR=.;FRO=34;FSAF=6;FSAR=27;FSRF=5;FSRR=29;FWDB=0.0126358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.053;QD=8.52965;RBI=0.0474918;REFB=-0.0264205;REVB=0.04578;RO=32;SAF=6;SAR=22;SRF=5;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0867516;STB=0.530788;TYPE=snp;VARB=0.029417;OID=.;OPOS=50534862;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:67:32:34:28:33:22:6:5:27:27:6:5:29 chr10 50535186 . C T 237.34 PASS AO=39;DP=60;FAO=41;FDP=63;FR=.;FRO=22;FSAF=2;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=21;FWDB=-0.0697302;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=235.746;QD=15.0691;RBI=0.0701952;REFB=0.0291637;REVB=-0.00806613;RO=20;SAF=1;SAR=38;SRF=1;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129726;STB=0.506326;TYPE=snp;VARB=-0.0108381;OID=.;OPOS=50535186;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:60:63:20:22:39:41:38:1:1:19:39:2:1:21 chr10 50681033 . G A 303.31 PASS AO=71;DP=143;FAO=71;FDP=143;FR=.;FRO=72;FSAF=50;FSAR=21;FSRF=53;FSRR=19;FWDB=-0.0199094;FXX=0.00694396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.704;QD=8.48417;RBI=0.0419103;REFB=-0.00309828;REVB=0.0368794;RO=71;SAF=50;SAR=21;SRF=53;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0470786;STB=0.519572;TYPE=snp;VARB=0.00421372;OID=.;OPOS=50681033;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:71:72:71:71:21:50:53:18:21:50:53:19 chr10 50723684 . G A 412.68 PASS AO=103;DP=234;FAO=107;FDP=233;FR=.;FRO=126;FSAF=42;FSAR=65;FSRF=57;FSRR=69;FWDB=-0.00426904;FXX=0.00427332;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.095;QD=7.08469;RBI=0.010637;REFB=-0.00887733;REVB=0.00974273;RO=124;SAF=38;SAR=65;SRF=55;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.077104;STB=0.533443;TYPE=snp;VARB=0.00901;OID=.;OPOS=50723684;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:234:233:124:126:103:107:65:38:55:69:65:42:57:69 chr10 50724016 . C T 1540.13 PASS AO=158;DP=158;FAO=160;FDP=160;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00908975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.989;QD=38.5033;RBI=0.0090986;REFB=0;REVB=0.00040134;RO=0;SAF=73;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.40066e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.37912e-06;OID=.;OPOS=50724016;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:158:160:0:0:158:160:85:73:0:0:87:73:0:0 chr10 50740876 . G C 131.21 PASS AO=30;DP=62;FAO=30;FDP=62;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.0730928;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.8712;QD=8.46482;RBI=0.0766657;REFB=-0.0060581;REVB=-0.0231316;RO=32;SAF=19;SAR=11;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0980653;STB=0.555019;TYPE=snp;VARB=0.00481455;OID=.;OPOS=50740876;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:32:32:30:30:11:19:17:15:11:19:17:15 chr10 50820345 . C A 415.89 PASS AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0712465;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.908;QD=37.8082;RBI=0.075387;REFB=0;REVB=0.0246402;RO=0;SAF=23;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2717e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000390767;OID=.;OPOS=50820345;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:44:44:0:0:44:44:21:23:0:0:21:23:0:0 chr10 50820370 . C T 65.23 PASS AO=17;DP=42;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=2;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=0.0446156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7227;QD=6.21267;RBI=0.0513637;REFB=0.00258549;REVB=0.0254494;RO=25;SAF=15;SAR=2;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.419129;STB=0.749643;TYPE=snp;VARB=-0.00271047;OID=.;OPOS=50820370;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:42:42:25:25:17:17:2:15:15:10:2:15:15:10 chr10 50824117 . G A 83.45 PASS AO=29;DP=85;FAO=29;FDP=85;FR=.;FRO=56;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=38;FWDB=0.0129439;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.069;QD=3.92699;RBI=0.0267019;REFB=-0.0188124;REVB=-0.0233548;RO=56;SAF=11;SAR=18;SRF=18;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0713984;STB=0.541273;TYPE=snp;VARB=0.0320913;OID=.;OPOS=50824117;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:85:85:56:56:29:29:18:11:18:38:18:11:18:38 chr10 50824619 . G A 279.87 PASS AO=46;DP=117;FAO=49;FDP=114;FR=.,HEALED;FRO=46;FSAF=18;FSAR=31;FSRF=9;FSRR=37;FWDB=0.021739;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.177;QD=9.82003;RBI=0.0387385;REFB=-0.0424466;REVB=0.0320637;RO=40;SAF=15;SAR=31;SRF=5;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210845;STB=0.593851;TYPE=snp;VARB=0.0213972;OID=.;OPOS=50824619;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:114:40:46:46:49:31:15:5:35:31:18:9:37 chr10 50856652 . G A 295.58 PASS AO=33;DP=35;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0205545;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.207;QD=34.7736;RBI=0.0288737;REFB=-0.0575436;REVB=0.0202781;RO=1;SAF=6;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0169959;STB=0.509085;TYPE=snp;VARB=-6.62078e-05;OID=.;OPOS=50856652;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:35:34:1:1:33:33:27:6:0:1:27:6:0:1 chr10 50863147 . T C 182.48 PASS AO=41;DP=82;FAO=41;FDP=82;FR=.;FRO=41;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=15;FWDB=-0.0297165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.2791;QD=8.90121;RBI=0.0409942;REFB=-0.045207;REVB=0.0282393;RO=41;SAF=23;SAR=18;SRF=26;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0675866;STB=0.537459;TYPE=snp;VARB=0.026273;OID=.;OPOS=50863147;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:41:41:41:41:18:23:26:15:18:23:26:15 chr10 50911075 . G A 98.99 PASS AO=25;DP=57;FAO=25;FDP=57;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=-0.00456552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.193;QD=6.94668;RBI=0.00777475;REFB=0.0028632;REVB=0.00629307;RO=32;SAF=9;SAR=16;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232114;STB=0.63177;TYPE=snp;VARB=-0.007669;OID=.;OPOS=50911075;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:57:57:32:32:25:25:16:9:19:13:16:9:19:13 chr10 50916484 . A G 1381.37 PASS AO=118;DP=145;FAO=143;FDP=145;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=58;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00681012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.324;QD=38.1068;RBI=0.0309934;REFB=0;REVB=0.030236;RO=0;SAF=57;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.03988e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000424737;OID=.;OPOS=50916484;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:145:145:0:0:118:143:61:57:0:0:85:58:0:0 chr10 50916542 . C T 540.25 PASS AO=107;DP=190;FAO=109;FDP=191;FR=.;FRO=82;FSAF=40;FSAR=69;FSRF=32;FSRR=50;FWDB=-0.00530719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.5778;QD=11.3141;RBI=0.03289;REFB=-0.0137783;REVB=0.032459;RO=80;SAF=39;SAR=68;SRF=31;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0194294;STB=0.510689;TYPE=snp;VARB=0.0119651;OID=.;OPOS=50916542;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:191:80:82:107:109:68:39:31:49:69:40:32:50 chr10 50942763 . C T 363.82 PASS AO=76;DP=139;FAO=76;FDP=139;FR=.;FRO=63;FSAF=31;FSAR=45;FSRF=28;FSRR=35;FWDB=0.0245391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5369;QD=10.4697;RBI=0.0819048;REFB=-0.0246262;REVB=-0.0781423;RO=62;SAF=31;SAR=45;SRF=27;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0233533;STB=0.517035;TYPE=snp;VARB=0.014289;OID=.;OPOS=50942763;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:62:63:76:76:45:31:27:35:45:31:28:35 chr10 50944529 . G A 283.65 PASS AO=47;DP=71;FAO=47;FDP=70;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=35;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=-0.000778983;FXX=0.0140825;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.331;QD=16.2085;RBI=0.0182265;REFB=-0.00343383;REVB=0.0182099;RO=22;SAF=12;SAR=35;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0473231;STB=0.538445;TYPE=snp;VARB=0.00116948;OID=.;OPOS=50944529;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:71:70:22:23:47:47:35:12:7:15:35:12:8:15 chr10 50950976 . G A 110.38 PASS AO=28;DP=70;FAO=30;FDP=72;FR=.;FRO=42;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=31;FSRR=11;FWDB=0.0287451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.8358;QD=6.13195;RBI=0.0578029;REFB=-0.0174333;REVB=0.0501487;RO=42;SAF=19;SAR=9;SRF=31;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0741584;STB=0.568139;TYPE=snp;VARB=0.0316682;OID=.;OPOS=50950976;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:72:42:42:28:30:9:19:31:11:11:19:31:11 chr10 50960209 . G A 83.2 PASS AO=16;DP=37;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.00700324;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.637;QD=8.53328;RBI=0.0272376;REFB=-0.0116619;REVB=0.0263219;RO=21;SAF=8;SAR=8;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117353;STB=0.61588;TYPE=snp;VARB=0.0221122;OID=.;OPOS=50960209;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:37:39:21:20:16:19:8:8:13:8:11:8:13:7 chr10 51465552 . A T 423.68 PASS AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0361065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.355;QD=37.6608;RBI=0.0361145;REFB=0;REVB=-0.000762925;RO=0;SAF=28;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.95594e-05;OID=.;OPOS=51465552;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:45:45:0:0:45:45:17:28:0:0:17:28:0:0 chr10 51549545 . G T 1675.72 PASS AO=159;DP=163;FAO=175;FDP=175;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118313;FXX=0.016853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.767;QD=38.3023;RBI=0.0695367;REFB=0;REVB=0.0685228;RO=0;SAF=73;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000286364;OID=.;OPOS=51549545;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:163:175:0:0:159:175:86:73:0:0:91:84:0:0 chr10 51568378 . T G 1989.31 PASS AO=228;DP=242;FAO=228;FDP=241;FR=.;FRO=13;FSAF=133;FSAR=95;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.0161062;FXX=0.00413206;HRUN=4;LEN=1;MLLD=238.277;QD=33.0175;RBI=0.0487902;REFB=-0.0833126;REVB=0.0460551;RO=12;SAF=133;SAR=95;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0081399;STB=0.502487;TYPE=snp;VARB=0.00101148;OID=.;OPOS=51568378;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:242:241:12:13:228:228:95:133:6:6:95:133:7:6 chr10 51623147 . C T 45.93 PASS AO=7;DP=13;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0312858;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.7603;QD=13.1219;RBI=0.0365546;REFB=-0.0344471;REVB=-0.018906;RO=6;SAF=6;SAR=1;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.477234;STB=0.79459;TYPE=snp;VARB=0.034993;OID=.;OPOS=51623147;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:13:14:6:6:7:8:1:6:2:4:1:7:2:4 chr10 51623174 . C A 23.29 PASS AO=4;DP=6;FAO=4;FDP=7;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00630567;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=216.063;QD=13.3071;RBI=0.00887617;REFB=-0.00407697;REVB=-0.006247;RO=2;SAF=3;SAR=1;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161039;STB=0.545217;TYPE=snp;VARB=0.00206335;OID=.;OPOS=51623174;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:6:7:2:3:4:4:1:3:1:1:1:3:2:1 chr10 51631812 . A G 116.19 PASS AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0273174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7906;QD=35.75;RBI=0.102289;REFB=0;REVB=0.0985736;RO=0;SAF=7;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0040808;OID=.;OPOS=51631812;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:13:0:0:13:13:6:7:0:0:6:7:0:0 chr10 51748684 . G A 140.57 PASS AO=30;DP=58;FAO=30;FDP=58;FR=.;FRO=28;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.0415145;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=89.0657;QD=9.69424;RBI=0.0432265;REFB=-0.0112038;REVB=0.0120446;RO=28;SAF=21;SAR=9;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156839;STB=0.587725;TYPE=snp;VARB=0.016801;OID=.;OPOS=51748684;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:28:28:30:30:9:21:15:13:9:21:15:13 chr10 51827934 . G A 36.92 PASS AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0504663;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.606;QD=13.4271;RBI=0.0608247;REFB=-0.0100653;REVB=0.0339529;RO=5;SAF=2;SAR=4;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120202;STB=0.571205;TYPE=snp;VARB=0.010586;OID=.;OPOS=51827934;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:11:11:5:5:6:6:4:2:1:4:4:2:1:4 chr10 51885927 . G A 24.51 PASS AO=4;DP=7;FAO=4;FDP=7;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00420046;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.6004;QD=14.0043;RBI=0.0301068;REFB=-0.0640059;REVB=-0.0298123;RO=3;SAF=3;SAR=1;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0725463;STB=0.545217;TYPE=snp;VARB=0.036868;OID=.;OPOS=51885927;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:7:7:3:3:4:4:1:3:2:1:1:3:2:1 chr10 52103707 . A G 954.21 PASS AO=100;DP=102;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0420165;FXX=0.0384578;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.952;QD=38.1683;RBI=0.0470168;REFB=0;REVB=0.0210996;RO=0;SAF=69;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.04716e-05;OID=.;OPOS=52103707;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:102:100:0:0:100:100:31:69:0:0:31:69:0:0 chr10 52603754 . A G 559.06 PASS AO=121;DP=225;FAO=121;FDP=225;FR=.;FRO=104;FSAF=51;FSAR=70;FSRF=39;FSRR=65;FWDB=0.0173297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.696;QD=9.93882;RBI=0.0183937;REFB=-0.00528817;REVB=0.00616534;RO=104;SAF=51;SAR=70;SRF=39;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0406869;STB=0.522181;TYPE=snp;VARB=0.0046605;OID=.;OPOS=52603754;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:225:225:104:104:121:121:70:51:39:65:70:51:39:65 chr10 54053817 . C T 124.35 PASS AO=40;DP=106;FAO=40;FDP=108;FR=.;FRO=68;FSAF=30;FSAR=10;FSRF=49;FSRR=19;FWDB=0.031522;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.362;QD=4.60557;RBI=0.0339056;REFB=-0.0185551;REVB=-0.0124881;RO=66;SAF=30;SAR=10;SRF=48;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0323969;STB=0.524084;TYPE=snp;VARB=0.0354655;OID=.;OPOS=54053817;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:108:66:68:40:40:10:30:48:18:10:30:49:19 chr10 54074757 . A G 120.18 PASS AO=31;DP=72;FAO=33;FDP=77;FR=.;FRO=44;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=12;FSRR=32;FWDB=0.0241389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.3988;QD=6.24287;RBI=0.0277145;REFB=-0.0350367;REVB=0.0136164;RO=37;SAF=11;SAR=20;SRF=11;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0621493;STB=0.539977;TYPE=snp;VARB=0.0453054;OID=.;OPOS=54074757;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:77:37:44:31:33:20:11:11:26:22:11:12:32 chr10 54405572 . A G 474.77 PASS AO=53;DP=54;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0342033;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.572;QD=35.8317;RBI=0.0352117;REFB=-0.0105467;REVB=0.00836612;RO=0;SAF=28;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5098;TYPE=snp;VARB=-1.87785e-05;OID=.;OPOS=54405572;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:54:53:0:1:53:52:25:28:0:0:25:27:0:1 chr10 54528266 . G C 928.8 PASS AO=96;DP=96;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00341717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.973;QD=38.3009;RBI=0.00897104;REFB=0;REVB=0.00829473;RO=0;SAF=37;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.78952e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.38644e-05;OID=.;OPOS=54528266;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:96:97:0:0:96:97:59:37:0:0:59:38:0:0 chr10 55566406 . T G 673.14 PASS AO=133;DP=230;FAO=134;FDP=231;FR=.;FRO=97;FSAF=54;FSAR=80;FSRF=36;FSRR=61;FWDB=0.00522298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.373;QD=11.656;RBI=0.00700861;REFB=-0.00243224;REVB=0.00467345;RO=96;SAF=54;SAR=79;SRF=36;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0249955;STB=0.513971;TYPE=snp;VARB=0.00189754;OID=.;OPOS=55566406;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:230:231:96:97:133:134:79:54:36:60:80:54:36:61 chr10 55590950 . C T 133.12 PASS AO=59;DP=205;FAO=62;FDP=209;FR=.;FRO=147;FSAF=6;FSAR=56;FSRF=30;FSRR=117;FWDB=0.0389163;FXX=0.00947822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1329;QD=2.5477;RBI=0.0425944;REFB=0.00361541;REVB=-0.0173149;RO=146;SAF=6;SAR=53;SRF=30;SRR=116;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253709;STB=0.660055;TYPE=snp;VARB=-0.00827806;OID=.;OPOS=55590950;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:209:146:147:59:62:53:6:30:116:56:6:30:117 chr10 55782957 . C T 95.97 PASS AO=25;DP=59;FAO=25;FDP=59;FR=.;FRO=34;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=-0.0151746;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.9274;QD=6.50651;RBI=0.0172304;REFB=0.00265861;REVB=0.00816199;RO=34;SAF=17;SAR=8;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.302727;STB=0.67244;TYPE=snp;VARB=-0.00458153;OID=.;OPOS=55782957;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:59:59:34:34:25:25:8:17:13:21:8:17:13:21 chr10 55892642 . T C 311.19 PASS AO=63;DP=111;FAO=63;FDP=112;FR=.;FRO=49;FSAF=32;FSAR=31;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=0.00943708;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=83.783;QD=11.114;RBI=0.0598921;REFB=-0.0175001;REVB=-0.0591439;RO=47;SAF=32;SAR=31;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00211442;STB=0.507934;TYPE=snp;VARB=0.0360772;OID=.;OPOS=55892642;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:112:47:49:63:63:31:32:24:23:31:32:24:25 chr10 56106173 . T C 266.98 PASS AO=75;DP=185;FAO=78;FDP=185;FR=.;FRO=107;FSAF=37;FSAR=41;FSRF=60;FSRR=47;FWDB=0.00969264;FXX=0.00537606;HRUN=1;LEN=1;MLLD=44.1559;QD=5.77246;RBI=0.0696453;REFB=-0.0309463;REVB=0.0689676;RO=104;SAF=36;SAR=39;SRF=58;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0805272;STB=0.549828;TYPE=snp;VARB=0.0464777;OID=.;OPOS=56106173;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:185:104:107:75:78:39:36:58:46:41:37:60:47 chr10 56335031 . A G 1298.26 PASS AO=134;DP=135;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0379775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.1608;QD=37.9055;RBI=0.0585544;REFB=0;REVB=0.0445682;RO=0;SAF=84;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000314831;OID=.;OPOS=56335031;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:135:137:0:0:134:137:50:84:0:0:53:84:0:0 chr10 56335067 . A G 1549.79 PASS AO=149;DP=221;FAO=190;FDP=201;FR=.,HEALED;FRO=11;FSAF=100;FSAR=90;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=-0.000288306;FXX=0.0518843;HRUN=11;LEN=1;MLLD=179.492;QD=30.8416;RBI=0.00938111;REFB=-0.140231;REVB=-0.00937668;RO=37;SAF=76;SAR=73;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0290715;STB=0.516043;TYPE=snp;VARB=0.00294892;OID=.;OPOS=56335067;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:221:201:37:11:149:190:73:76:16:21:90:100:9:2 chr10 56345303 . T C 953.28 PASS AO=94;DP=94;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.554;QD=38.5164;RBI=0.0253659;REFB=0;REVB=0.0118428;RO=0;SAF=50;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.08529e-05;OID=.;OPOS=56345303;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:94:99:0:0:94:99:44:50:0:0:48:51:0:0 chr10 57357632 . G A 149.4 PASS AO=33;DP=65;FAO=33;FDP=65;FR=.;FRO=32;FSAF=6;FSAR=27;FSRF=3;FSRR=29;FWDB=-0.114123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1286;QD=9.19358;RBI=0.126896;REFB=-0.0302058;REVB=-0.0554852;RO=32;SAF=6;SAR=27;SRF=3;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145931;STB=0.580268;TYPE=snp;VARB=0.0132386;OID=.;OPOS=57357632;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:32:32:33:33:27:6:3:29:27:6:3:29 chr10 57358664 . C A 249.71 PASS AO=65;DP=151;FAO=67;FDP=151;FR=.;FRO=84;FSAF=37;FSAR=30;FSRF=58;FSRR=26;FWDB=0.0242063;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.9523;QD=6.61486;RBI=0.0264686;REFB=0.0188544;REVB=-0.0107071;RO=86;SAF=35;SAR=30;SRF=60;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166318;STB=0.57901;TYPE=snp;VARB=-0.0260912;OID=.;OPOS=57358664;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:151:86:84:65:67:30:35:60:26:30:37:58:26 chr10 57358667 . G A 244.98 PASS AO=66;DP=151;FAO=66;FDP=151;FR=.;FRO=85;FSAF=36;FSAR=30;FSRF=59;FSRR=26;FWDB=-0.00455999;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.942;QD=6.48943;RBI=0.00473045;REFB=0.000260211;REVB=0.00125843;RO=85;SAF=36;SAR=30;SRF=59;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154239;STB=0.585672;TYPE=snp;VARB=-0.000420768;OID=.;OPOS=57358667;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:151:85:85:66:66:30:36:59:26:30:36:59:26 chr10 58118630 . T C 289.37 PASS AO=69;DP=147;FAO=71;FDP=149;FR=.;FRO=78;FSAF=21;FSAR=50;FSRF=25;FSRR=53;FWDB=0.0518263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.1294;QD=7.76833;RBI=0.051966;REFB=0.00294256;REVB=-0.00380841;RO=78;SAF=19;SAR=50;SRF=25;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.052605;STB=0.515344;TYPE=snp;VARB=-0.00209413;OID=.;OPOS=58118630;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:149:78:78:69:71:50:19:25:53:50:21:25:53 chr10 60027346 . A G 22.13 PASS AO=2;DP=11;FAO=2;FDP=9;FR=.,HEALED;FRO=5;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.00860126;FXX=0.0999001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.893;QD=9.83345;RBI=0.0203524;REFB=0.000549762;REVB=-0.0184455;RO=5;SAF=2;SAR=0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0394876;OID=.;OPOS=60027346;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:10:9:5:5:2:2:0:2:5:0:0:2:5:0 chr10 60573753 . G T 2898.24 PASS AO=312;DP=320;FAO=315;FDP=322;FR=.;FRO=7;FSAF=156;FSAR=159;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=-0.00216596;FXX=0.00923049;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.499;QD=36.003;RBI=0.0305059;REFB=-0.07731;REVB=0.0304289;RO=2;SAF=155;SAR=157;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00611442;STB=0.510971;TYPE=snp;VARB=0.000313243;OID=.;OPOS=60573753;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:320:322:2:7:312:315:157:155:2:0:159:156:7:0 chr10 60577393 . T C 1574.23 PASS AO=163;DP=165;FAO=166;FDP=166;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0746176;FXX=0.00598767;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.8458;QD=37.9332;RBI=0.0748547;REFB=-0.0468515;REVB=0.0059533;RO=1;SAF=81;SAR=82;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00576791;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000125426;OID=.;OPOS=60577393;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:165:166:1:0:163:166:82:81:0:1:82:84:0:0 chr10 60588553 . T C 1743.81 PASS AO=184;DP=185;FAO=184;FDP=184;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0065629;FXX=0.00540511;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.081;QD=37.9088;RBI=0.0355263;REFB=-0.0598381;REVB=0.0349149;RO=0;SAF=93;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.82301e-05;OID=.;OPOS=60588553;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:185:184:0:0:184:184:91:93:0:0:91:93:0:0 chr10 61005244 . G C 534.84 PASS AO=113;DP=206;FAO=113;FDP=206;FR=.;FRO=93;FSAF=54;FSAR=59;FSRF=37;FSRR=56;FWDB=-0.0101288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.853;QD=10.3853;RBI=0.0251678;REFB=-0.0162917;REVB=0.0230397;RO=93;SAF=54;SAR=59;SRF=37;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0666741;STB=0.536309;TYPE=snp;VARB=0.0183013;OID=.;OPOS=61005244;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:206:206:93:93:113:113:59:54:37:56:59:54:37:56 chr10 61122268 . T TTA 495.47 PASS AO=48;DP=56;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0369213;FXX=0.0535619;HRUN=1;LEN=2;MLLD=189.681;QD=37.3942;RBI=0.0369231;REFB=0;REVB=-0.000365443;RO=2;SAF=17;SAR=31;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0293889;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00010886;OID=.;OPOS=61122269;OREF=-;OALT=TA;OMAPALT=TTA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:48:56:53:53:0:19:34:0:0:24:2:17:31:0:2 chr10 61552774 . C T 444.17 PASS AO=47;DP=52;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149641;FXX=0.0769083;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.432;QD=37.0145;RBI=0.0978516;REFB=0;REVB=0.0967007;RO=1;SAF=44;SAR=3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133398;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00125359;OID=.;OPOS=61552774;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:52:48:1:0:47:48:3:44:0:1:4:44:0:0 chr10 61719159 . C T 3175.15 PASS AO=301;DP=304;FAO=338;FDP=338;FR=.;FRO=0;FSAF=177;FSAR=161;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.209;QD=37.5757;RBI=0.0419922;REFB=0;REVB=0.0369681;RO=1;SAF=169;SAR=132;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00281391;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00074794;OID=.;OPOS=61719159;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:304:338:1:0:301:338:132:169:1:0:161:177:0:0 chr10 61719232 . A AT 1867.61 PASS AO=239;DP=270;FAO=254;FDP=254;FR=.;FRO=0;FSAF=149;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0636084;FXX=0.023076;HRUN=2;LEN=1;MLLD=19.2946;QD=29.4112;RBI=0.0937929;REFB=0;REVB=0.0689281;RO=21;SAF=134;SAR=105;SRF=17;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0389567;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.000649033;OID=.;OPOS=61719233;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:239:270:254:254:0:149:105:0:0:99:21:134:105:17:4 chr10 61719385 . T G 897.05 PASS AO=71;DP=112;FAO=99;FDP=99;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=48;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0720701;FXX=0.0294089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=43.5391;QD=36.2444;RBI=0.0739248;REFB=-0.0520566;REVB=0.0164555;RO=1;SAF=46;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101703;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00242742;OID=.;OPOS=61719385;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:102:99:1:0:71:99:25:46:1:0:51:48:0:0 chr10 61788623 . T G 340.55 PASS AO=21;DP=49;FAO=44;FDP=49;FR=.,HEALED;FRO=5;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0115131;FXX=0.0576812;HRUN=9;LEN=1;MLLD=192.662;QD=27.7996;RBI=0.0116279;REFB=0.0243698;REVB=-0.00163011;RO=0;SAF=14;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.530598;TYPE=snp;VARB=-0.000728116;OID=.;OPOS=61788623;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:29:49:0:5:21:44:7:14:0:0:22:22:4:1 chr10 61831271 . T C 369.21 PASS AO=87;DP=181;FAO=89;FDP=182;FR=.;FRO=93;FSAF=43;FSAR=46;FSRF=35;FSRR=58;FWDB=0.005412;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0471;QD=8.11461;RBI=0.0324581;REFB=-0.0193014;REVB=0.0320038;RO=94;SAF=42;SAR=45;SRF=36;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0944553;STB=0.554827;TYPE=snp;VARB=0.0241647;OID=.;OPOS=61831271;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:182:94:93:87:89:45:42:36:58:46:43:35:58 chr10 61841573 . CT C 1001.62 PASS AO=113;DP=155;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=143;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0618371;FXX=0.00662208;HRUN=4;LEN=1;MLLD=13.6143;QD=26.71;RBI=0.255685;REFB=0;REVB=-0.248095;RO=0;SAF=5;SAR=108;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.422397;SSEP=0;SSSB=4.85723e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.00124625;OID=.;OPOS=61841574;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:113:151:150:150:0:7:143:0:0:93:0:5:108:0:0 chr10 61844308 . C T 457.65 PASS AO=146;DP=371;FAO=146;FDP=372;FR=.;FRO=226;FSAF=87;FSAR=59;FSRF=122;FSRR=104;FWDB=0.011848;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.786;QD=4.92096;RBI=0.0120078;REFB=-0.000761253;REVB=0.00195248;RO=225;SAF=87;SAR=59;SRF=122;SRR=103;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0594541;STB=0.534885;TYPE=snp;VARB=0.00136796;OID=.;OPOS=61844308;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:371:372:225:226:146:146:59:87:122:103:59:87:122:104 chr10 61965625 . A G 267.05 PASS AO=81;DP=202;FAO=81;FDP=202;FR=.;FRO=121;FSAF=17;FSAR=64;FSRF=38;FSRR=83;FWDB=0.00628597;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.375;QD=5.28809;RBI=0.0367262;REFB=-0.00900729;REVB=-0.0361842;RO=120;SAF=17;SAR=64;SRF=37;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14196;STB=0.584792;TYPE=snp;VARB=0.0191644;OID=.;OPOS=61965625;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:202:120:121:81:81:64:17:37:83:64:17:38:83 chr10 63170292 . A G 274.24 PASS AO=46;DP=70;FAO=46;FDP=70;FR=.;FRO=24;FSAF=30;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.00493687;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.034;QD=15.6706;RBI=0.00906394;REFB=-0.00664556;REVB=-0.00760146;RO=23;SAF=30;SAR=16;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0856314;STB=0.540703;TYPE=snp;VARB=0.00496243;OID=.;OPOS=63170292;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:70:70:23:24:46:46:16:30:12:11:16:30:13:11 chr10 63422754 . G GGGCCGACCCCGGCA,GGGGCCGACCCCGGCA 113.67 PASS AO=6,8;DP=26;FAO=7,9;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=7,6;FSAR=0,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100433,0.0129699;FXX=0.384468;HRUN=5,5;LEN=14,15;MLLD=184.444,188.173;QD=28.4163;RBI=0.0294437,0.0342222;REFB=0.00300508,0.0189278;REVB=-0.0276778,-0.0316692;RO=1;SAF=6,5;SAR=0,3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-0.080241;STB=0.5,0.5;TYPE=ins,ins;VARB=0.014778,-0.00222459;OID=.,.;OPOS=63422755,63422755;OREF=-,-;OALT=GGCCGACCCCGGCA,GGGCCGACCCCGGCA;OMAPALT=GGGCCGACCCCGGCA,GGGGCCGACCCCGGCA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:6,8:22:7,9:16:0:7,6:0,3:0:0:28:1:6,5:0,3:1:0 chr10 63520698 . T C 2741.32 PASS AO=290;DP=293;FAO=290;FDP=290;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=195;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0641673;FXX=0.0102386;HRUN=4;LEN=1;MLLD=188.251;QD=37.8113;RBI=0.0650942;REFB=-0.0854683;REVB=0.010946;RO=2;SAF=95;SAR=195;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00486598;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.23762e-05;OID=.;OPOS=63520698;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:293:290:2:0:290:290:195:95:0:2:195:95:0:0 chr10 63954188 . G A 1549.56 PASS AO=167;DP=169;FAO=167;FDP=167;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195759;FXX=0.0233904;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.09;QD=37.1151;RBI=0.0219729;REFB=-0.0732607;REVB=0.00997965;RO=2;SAF=66;SAR=101;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00246718;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000226261;OID=.;OPOS=63954188;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:169:167:2:0:167:167:101:66:1:1:101:66:0:0 chr10 63964653 . C T 696.21 PASS AO=109;DP=152;FAO=111;FDP=155;FR=.;FRO=44;FSAF=80;FSAR=31;FSRF=35;FSRR=9;FWDB=0.0225941;FXX=0.00640985;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.253;QD=17.9666;RBI=0.031685;REFB=-0.0459685;REVB=0.0222136;RO=43;SAF=76;SAR=33;SRF=35;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0755354;STB=0.526972;TYPE=snp;VARB=0.0171754;OID=.;OPOS=63964653;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:152:155:43:44:109:111:33:76:35:8:31:80:35:9 chr10 63976912 . TAGCTTC T 46.04 PASS AO=19;DP=68;FAO=19;FDP=66;FR=.;FRO=47;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=-0.00820609;FXX=0.043472;HRUN=1;LEN=6;MLLD=251.756;QD=2.79058;RBI=0.0133143;REFB=-0.00401028;REVB=0.0104848;RO=40;SAF=13;SAR=6;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1642;STB=0.61474;TYPE=del;VARB=0.00845567;OID=.;OPOS=63976913;OREF=AGCTTC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:19:67:19:66:47:13:6:25:22:46:40:13:6:22:18 chr10 63977980 . C T 557.9 PASS AO=121;DP=227;FAO=121;FDP=226;FR=.;FRO=105;FSAF=69;FSAR=52;FSRF=41;FSRR=64;FWDB=0.00853527;FXX=0.00440509;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.3848;QD=9.87438;RBI=0.0128332;REFB=-0.0341948;REVB=-0.00958333;RO=105;SAF=69;SAR=52;SRF=41;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152505;STB=0.583198;TYPE=snp;VARB=0.0266206;OID=.;OPOS=63977980;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:227:226:105:105:121:121:52:69:41:64:52:69:41:64 chr10 63995983 . C T 2893.49 PASS AO=302;DP=303;FAO=302;FDP=302;FR=.;FRO=0;FSAF=112;FSAR=190;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.026918;FXX=0.00330022;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.072;QD=38.3243;RBI=0.0274201;REFB=0;REVB=-0.00522316;RO=0;SAF=112;SAR=190;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.3436e-05;OID=.;OPOS=63995983;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:303:302:0:0:302:302:190:112:0:0:190:112:0:0 chr10 64000878 . T G 191.49 PASS AO=33;DP=53;FAO=34;FDP=54;FR=.;FRO=20;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.00510441;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.871;QD=14.1843;RBI=0.0211747;REFB=-0.00518686;REVB=0.0205502;RO=20;SAF=16;SAR=17;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104276;STB=0.510911;TYPE=snp;VARB=0.0043317;OID=.;OPOS=64000878;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:53:54:20:20:33:34:17:16:10:10:18:16:10:10 chr10 64110037 . C T 184 PASS AO=33;DP=53;FAO=33;FDP=53;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.0410622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.5309;QD=13.8868;RBI=0.0428896;REFB=0.00666105;REVB=0.012386;RO=20;SAF=14;SAR=19;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0180749;STB=0.509912;TYPE=snp;VARB=-0.00252816;OID=.;OPOS=64110037;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:53:53:20:20:33:33:19:14:9:11:19:14:9:11 chr10 64159333 . G T 37.72 PASS AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.0118386;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.867;QD=8.38119;RBI=0.0456387;REFB=-0.0130577;REVB=-0.0440765;RO=10;SAF=7;SAR=1;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.3708;STB=0.728476;TYPE=snp;VARB=0.00971568;OID=.;OPOS=64159333;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:18:18:10:10:8:8:1:7:6:4:1:7:6:4 chr10 64415184 . A G 2224.11 PASS AO=234;DP=236;FAO=234;FDP=234;FR=.;FRO=0;FSAF=115;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.127594;FXX=0.0370355;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.188;QD=38.019;RBI=0.127875;REFB=-0.0132518;REVB=0.00847225;RO=1;SAF=115;SAR=119;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00398808;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000280053;OID=.;OPOS=64415184;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:97:236:234:1:0:234:234:119:115:0:1:119:115:0:0 chr10 64566258 . C T 659.6 PASS AO=70;DP=72;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.000304495;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.7578;QD=36.1424;RBI=0.015334;REFB=0.00955193;REVB=-0.015331;RO=2;SAF=53;SAR=17;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0175084;STB=0.504503;TYPE=snp;VARB=-0.000593348;OID=.;OPOS=64566258;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:72:73:2:1:70:72:17:53:2:0:17:55:1:0 chr10 64572037 . AT A 701.66 PASS AO=119;DP=160;FAO=151;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0866587;FXX=0.0503113;HRUN=8;LEN=1;MLLD=9.17682;QD=18.5869;RBI=0.0889222;REFB=0;REVB=0.0199356;RO=9;SAF=52;SAR=67;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00101093;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00281097;OID=.;OPOS=64572038;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:119:153:151:151:0:72:79:0:0:60:9:52:67:4:5 chr10 64573771 . C T 288.27 PASS AO=19;DP=36;FAO=31;FDP=31;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=30;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0816042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.951;QD=37.1964;RBI=0.0870477;REFB=0;REVB=-0.0302996;RO=0;SAF=18;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00037641;OID=.;OPOS=64573771;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:31:31:0:0:19:31:1:18:0:0:1:30:0:0 chr10 64869942 . A G 1106.04 PASS AO=118;DP=122;FAO=121;FDP=123;FR=.;FRO=2;FSAF=59;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0125473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0999;QD=35.9687;RBI=0.039009;REFB=-0.131959;REVB=0.036936;RO=2;SAF=59;SAR=59;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507935;TYPE=snp;VARB=0.0015683;OID=.;OPOS=64869942;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:122:123:2:2:118:121:59:59:1:1:62:59:0:2 chr10 64869973 . T C 1157.83 PASS AO=121;DP=122;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0267692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.945;QD=37.9617;RBI=0.0736634;REFB=0;REVB=0.0686273;RO=0;SAF=51;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000238925;OID=.;OPOS=64869973;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:122:122:0:0:121:122:70:51:0:0:70:52:0:0 chr10 64914467 . A G 1888.32 PASS AO=199;DP=202;FAO=200;FDP=200;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210812;FXX=0.0099005;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.149;QD=37.7665;RBI=0.0253633;REFB=-0.00728438;REVB=-0.0141025;RO=1;SAF=89;SAR=110;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00431032;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.3703e-05;OID=.;OPOS=64914467;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:202:200:1:0:199:200:110:89:0:1:111:89:0:0 chr10 64945364 . G A 531.49 PASS AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0268394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.13;QD=37.9635;RBI=0.0298934;REFB=0;REVB=-0.0131629;RO=0;SAF=25;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.09075e-05;OID=.;OPOS=64945364;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:56:56:0:0:56:56:31:25:0:0:31:25:0:0 chr10 64952835 . G A 59.45 PASS AO=18;DP=50;FAO=18;FDP=51;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=0.01253;FXX=0.0192271;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.659;QD=4.66249;RBI=0.0237412;REFB=-0.00824476;REVB=0.0201654;RO=32;SAF=13;SAR=5;SRF=21;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0854301;STB=0.543032;TYPE=snp;VARB=0.0196564;OID=.;OPOS=64952835;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:50:51:32:33:18:18:5:13:21:11:5:13:22:11 chr10 64967445 . A T 2602.31 PASS AO=270;DP=270;FAO=270;FDP=270;FR=.;FRO=0;FSAF=111;FSAR=159;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.3968;QD=38.5528;RBI=0.0223991;REFB=0;REVB=-0.00525597;RO=0;SAF=111;SAR=159;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.81073e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.59817e-05;OID=.;OPOS=64967445;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:270:270:0:0:270:270:159:111:0:0:159:111:0:0 chr10 64974537 . A T 1786.83 PASS AO=193;DP=198;FAO=193;FDP=197;FR=.;FRO=4;FSAF=110;FSAR=83;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.00875178;FXX=0.00505025;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.026;QD=36.2808;RBI=0.0231172;REFB=-0.147675;REVB=-0.0213965;RO=4;SAF=110;SAR=83;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0169987;STB=0.508928;TYPE=snp;VARB=0.000947159;OID=.;OPOS=64974537;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:198:197:4:4:193:193:83:110:4:0:83:110:4:0 chr10 65225450 . C T 466.17 PASS AO=58;DP=64;FAO=57;FDP=63;FR=.;FRO=6;FSAF=33;FSAR=24;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.132511;FXX=0.0156226;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.3741;QD=29.5982;RBI=0.139492;REFB=-0.139236;REVB=0.0435746;RO=5;SAF=33;SAR=25;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0556776;STB=0.523801;TYPE=snp;VARB=0.0287645;OID=.;OPOS=65225450;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:64:63:5:6:58:57:25:33:1:4:24:33:2:4 chr10 68040325 . C T 80.54 PASS AO=28;DP=83;FAO=28;FDP=83;FR=.;FRO=55;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=31;FWDB=-0.0129485;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.067;QD=3.88164;RBI=0.0161029;REFB=-0.0132802;REVB=0.00957287;RO=50;SAF=15;SAR=13;SRF=22;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105902;STB=0.565506;TYPE=snp;VARB=0.0237885;OID=.;OPOS=68040325;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:83:83:50:55:28:28:13:15:22:28:13:15:24:31 chr10 68685929 . G C 78.31 PASS AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=6;FWDB=-0.019387;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=187.892;QD=7.28458;RBI=0.0279965;REFB=-0.00635916;REVB=-0.0201977;RO=24;SAF=15;SAR=4;SRF=18;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0555262;STB=0.53188;TYPE=snp;VARB=0.0123026;OID=.;OPOS=68685929;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:43:43:24:24:19:19:4:15:18:6:4:15:18:6 chr10 69571336 . G A 432.61 PASS AO=62;DP=121;FAO=65;FDP=118;FR=.,HEALED;FRO=32;FSAF=27;FSAR=38;FSRF=5;FSRR=27;FWDB=-0.00346701;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.269;QD=14.6646;RBI=0.0167456;REFB=-0.0771789;REVB=-0.0163828;RO=29;SAF=25;SAR=37;SRF=2;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215655;STB=0.590684;TYPE=snp;VARB=0.0150615;OID=.;OPOS=69571336;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:117:118:29:32:62:65:37:25:2:27:38:27:5:27 chr10 69666598 . T C 494.31 PASS AO=121;DP=259;FAO=122;FDP=256;FR=.;FRO=134;FSAF=58;FSAR=64;FSRF=48;FSRR=86;FWDB=-0.0232674;FXX=0.0115826;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3151;QD=7.72351;RBI=0.0363985;REFB=0.00274701;REVB=-0.0279907;RO=135;SAF=57;SAR=64;SRF=49;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104612;STB=0.56186;TYPE=snp;VARB=-0.00342905;OID=.;OPOS=69666598;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:259:256:135:134:121:122:64:57:49:86:64:58:48:86 chr10 69773841 . G A 2380.88 PASS AO=280;DP=301;FAO=280;FDP=300;FR=.;FRO=20;FSAF=133;FSAR=147;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.0256913;FXX=0.00332215;HRUN=4;LEN=1;MLLD=60.6632;QD=31.745;RBI=0.0327147;REFB=-0.0465128;REVB=0.0202536;RO=15;SAF=133;SAR=147;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000808615;STB=0.501671;TYPE=snp;VARB=0.00310172;OID=.;OPOS=69773841;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:301:300:15:20:280:280:147:133:7:8:147:133:9:11 chr10 69785435 . T TA 29.22 PASS AO=33;DP=90;FAO=34;FDP=88;FR=.;FRO=54;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=7;FSRR=47;FWDB=-0.0836976;FXX=0.0112347;HRUN=7;LEN=1;MLLD=6.73261;QD=1.32818;RBI=0.185726;REFB=-0.0716356;REVB=-0.165798;RO=44;SAF=9;SAR=24;SRF=5;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230613;STB=0.634996;TYPE=ins;VARB=-0.00940229;OID=.;OPOS=69785436;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:33:90:34:88:54:10:24:7:47:29:44:9:24:5:39 chr10 69917921 . C T 2038.86 PASS AO=216;DP=222;FAO=222;FDP=225;FR=.;FRO=3;FSAF=83;FSAR=139;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.061188;FXX=0.00442458;HRUN=3;LEN=1;MLLD=77.8373;QD=36.2465;RBI=0.0618773;REFB=-0.18661;REVB=-0.00921017;RO=5;SAF=77;SAR=139;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0299288;STB=0.508875;TYPE=snp;VARB=0.0017217;OID=.;OPOS=69917921;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:222:225:5:3:216:222:139:77:5:0:139:83:3:0 chr10 69917925 . T C 1833.69 PASS AO=206;DP=215;FAO=206;FDP=215;FR=.;FRO=9;FSAF=71;FSAR=135;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.021686;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=266.551;QD=34.1151;RBI=0.028305;REFB=-0.0236868;REVB=-0.0181903;RO=9;SAF=71;SAR=135;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0376819;STB=0.519818;TYPE=snp;VARB=0.000456291;OID=.;OPOS=69917925;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:215:215:9:9:206:206:135:71:7:2:135:71:7:2 chr10 69926097 . T C 907.97 PASS AO=95;DP=96;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155481;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.596;QD=38.2304;RBI=0.0198602;REFB=0;REVB=0.0123565;RO=0;SAF=50;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000131386;OID=.;OPOS=69926097;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:96:95:0:0:95:95:45:50:0:0:45:50:0:0 chr10 69926334 . C G 661.08 PASS AO=73;DP=75;FAO=73;FDP=75;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=51;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0251232;FXX=0.0131562;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.977;QD=35.2577;RBI=0.0262709;REFB=0.0354142;REVB=0.00768024;RO=1;SAF=22;SAR=51;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00918607;STB=0.506256;TYPE=snp;VARB=-3.89173e-06;OID=.;OPOS=69926334;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:75:75:1:2:73:73:51:22:0:1:51:22:1:1 chr10 69933921 . G A 1189.19 PASS AO=127;DP=129;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229479;FXX=0.0155027;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.082;QD=37.4549;RBI=0.0237451;REFB=0.00977649;REVB=0.00610113;RO=2;SAF=21;SAR=106;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00888163;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.81922e-05;OID=.;OPOS=69933921;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:129:127:2:0:127:127:106:21:0:2:106:21:0:0 chr10 69933969 . G A 1538.4 PASS AO=159;DP=159;FAO=161;FDP=161;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00818924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.853;QD=38.2212;RBI=0.00819038;REFB=0;REVB=0.000136443;RO=0;SAF=55;SAR=104;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.68934e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.55321e-06;OID=.;OPOS=69933969;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:159:161:0:0:159:161:104:55:0:0:106:55:0:0 chr10 69934258 . C G 112.75 PASS AO=21;DP=41;FAO=22;FDP=40;FR=.;FRO=18;FSAF=1;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=17;FWDB=0.0130171;FXX=0.0476077;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.405;QD=11.2754;RBI=0.0162689;REFB=-0.0182879;REVB=0.00975867;RO=20;SAF=1;SAR=20;SRF=1;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011223;STB=0.524976;TYPE=snp;VARB=0.010524;OID=.;OPOS=69934258;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:41:40:20:18:21:22:20:1:1:19:21:1:1:17 chr10 69948844 . T C 3631.15 PASS AO=386;DP=391;FAO=386;FDP=386;FR=.;FRO=0;FSAF=154;FSAR=232;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00975919;FXX=0.0127874;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.004;QD=37.6285;RBI=0.00989314;REFB=-0.016999;REVB=0.00162249;RO=3;SAF=154;SAR=232;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00410426;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.12203e-05;OID=.;OPOS=69948844;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:391:386:3:0:386:386:232:154:2:1:232:154:0:0 chr10 69959242 . C A 3015.09 PASS AO=321;DP=326;FAO=322;FDP=322;FR=.;FRO=0;FSAF=154;FSAR=168;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162973;FXX=0.0122696;HRUN=3;LEN=1;MLLD=214.863;QD=37.4545;RBI=0.0285114;REFB=-0.0902616;REVB=0.0233944;RO=3;SAF=153;SAR=168;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00253702;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000265437;OID=.;OPOS=69959242;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:326:322:3:0:321:322:168:153:1:2:168:154:0:0 chr10 69991853 . A G 93.33 PASS AO=11;DP=12;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0572149;FXX=0.166528;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.4227;QD=37.3338;RBI=0.0579079;REFB=0;REVB=0.00893242;RO=0;SAF=8;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0110413;OID=.;OPOS=69991853;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:10:0:0:11:10:3:8:0:0:2:8:0:0 chr10 70051810 . A G 1332.17 PASS AO=205;DP=279;FAO=204;FDP=278;FR=.;FRO=74;FSAF=106;FSAR=98;FSRF=29;FSRR=45;FWDB=0.00165974;FXX=0.0071426;HRUN=8;LEN=1;MLLD=188.775;QD=19.1679;RBI=0.00489129;REFB=-0.0184957;REVB=0.00460109;RO=74;SAF=108;SAR=97;SRF=29;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0670971;STB=0.533955;TYPE=snp;VARB=0.00233305;OID=.;OPOS=70051810;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:279:278:74:74:205:204:97:108:29:45:98:106:29:45 chr10 70051928 . A G 2930.14 PASS AO=137;DP=289;FAO=304;FDP=304;FR=.;FRO=0;FSAF=136;FSAR=168;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00449988;FXX=0.0193542;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.901;QD=38.5544;RBI=0.00479774;REFB=0;REVB=0.00166415;RO=0;SAF=119;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.91492e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.2234e-05;OID=.;OPOS=70051928;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:141:304:0:0:137:304:18:119:0:0:168:136:0:0 chr10 70101417 . G C 210.88 PASS AO=56;DP=127;FAO=56;FDP=127;FR=.;FRO=71;FSAF=16;FSAR=40;FSRF=21;FSRR=50;FWDB=-0.0383727;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.2716;QD=6.64193;RBI=0.095023;REFB=0.00494142;REVB=0.0869305;RO=71;SAF=16;SAR=40;SRF=21;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122495;STB=0.506847;TYPE=snp;VARB=-0.00579393;OID=.;OPOS=70101417;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:71:71:56:56:40:16:21:50:40:16:21:50 chr10 70102936 . T A 2047.45 PASS AO=219;DP=221;FAO=220;FDP=220;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0604807;FXX=0.0090086;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.1709;QD=37.2265;RBI=0.0604812;REFB=-0.0267104;REVB=-0.000258929;RO=2;SAF=104;SAR=115;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000434134;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00040403;OID=.;OPOS=70102936;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:221:220:2:0:219:220:115:104:1:1:115:105:0:0 chr10 70103272 . G C 1338.13 PASS AO=144;DP=148;FAO=146;FDP=150;FR=.;FRO=4;FSAF=69;FSAR=77;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0346085;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.908;QD=35.6834;RBI=0.068124;REFB=-0.00465256;REVB=0.0586783;RO=4;SAF=68;SAR=76;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0142994;STB=0.507412;TYPE=snp;VARB=0.000300408;OID=.;OPOS=70103272;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:148:150:4:4:144:146:76:68:3:1:77:69:3:1 chr10 70105560 . G A 1353.4 PASS AO=142;DP=142;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=128;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0229616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.694;QD=38.1239;RBI=0.0230927;REFB=0;REVB=-0.00245745;RO=0;SAF=14;SAR=128;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.87823e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.59408e-05;OID=.;OPOS=70105560;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:142:142:0:0:142:142:128:14:0:0:128:14:0:0 chr10 70221267 . T C 270.78 PASS AO=49;DP=81;FAO=50;FDP=82;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=40;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=0.00460412;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.7112;QD=13.2088;RBI=0.00601633;REFB=-0.00688256;REVB=-0.00387275;RO=32;SAF=10;SAR=39;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.245531;STB=0.636882;TYPE=snp;VARB=0.00683143;OID=.;OPOS=70221267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:82:32:32:49:50:39:10:15:17:40:10:15:17 chr10 70225504 . G T 431.02 PASS AO=134;DP=333;FAO=133;FDP=331;FR=.;FRO=198;FSAF=83;FSAR=50;FSRF=92;FSRR=106;FWDB=0.0332843;FXX=0.00600583;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.7671;QD=5.20875;RBI=0.0332877;REFB=0.0199809;REVB=0.000475575;RO=199;SAF=84;SAR=50;SRF=93;SRR=106;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172923;STB=0.596722;TYPE=snp;VARB=-0.0242103;OID=.;OPOS=70225504;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:333:331:199:198:134:133:50:84:93:106:50:83:92:106 chr10 70230336 . A C 212.91 PASS AO=37;DP=87;FAO=52;FDP=102;FR=.;FRO=50;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=14;FSRR=36;FWDB=0.025115;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.27;QD=8.34953;RBI=0.0410212;REFB=-0.0318539;REVB=0.0324343;RO=48;SAF=22;SAR=15;SRF=12;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.335775;STB=0.633654;TYPE=snp;VARB=0.0242028;OID=.;OPOS=70230336;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:102:48:50:37:52:15:22:12:36:23:29:14:36 chr10 70332477 . G T 142.18 PASS AO=36;DP=76;FAO=35;FDP=76;FR=.;FRO=41;FSAF=29;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=-0.000840768;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7379;QD=7.48304;RBI=0.00251286;REFB=-0.00293846;REVB=0.00236803;RO=39;SAF=30;SAR=6;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.458341;STB=0.748728;TYPE=snp;VARB=0.00685573;OID=.;OPOS=70332477;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:39:41:36:35:6:30:16:23:6:29:18:23 chr10 70332580 . A G 196.74 PASS AO=54;DP=126;FAO=54;FDP=126;FR=.;FRO=72;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=47;FSRR=25;FWDB=0.0408977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.426;QD=6.24566;RBI=0.0412625;REFB=0.00299525;REVB=-0.00547455;RO=71;SAF=27;SAR=27;SRF=46;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150415;STB=0.58727;TYPE=snp;VARB=-0.00379152;OID=.;OPOS=70332580;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:71:72:54:54:27:27:46:25:27:27:47:25 chr10 70405566 . C T 113.2 PASS AO=26;DP=54;FAO=26;FDP=54;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.00830197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.507;QD=8.38522;RBI=0.0188525;REFB=-0.00367094;REVB=-0.0169261;RO=28;SAF=5;SAR=21;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.34243;STB=0.694954;TYPE=snp;VARB=0.00286751;OID=.;OPOS=70405566;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:28:28:26:26:21:5:14:14:21:5:14:14 chr10 70405855 . A G 542.79 PASS AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0322905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.9965;QD=36.799;RBI=0.0326293;REFB=-0.00993336;REVB=0.00468953;RO=1;SAF=27;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171508;STB=0.509088;TYPE=snp;VARB=0.000410016;OID=.;OPOS=70405855;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:59:59:1:1:58:58:31:27:1:0:31:27:1:0 chr10 70495544 . T C 584.12 PASS AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00693945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.305;QD=37.6849;RBI=0.0449661;REFB=0;REVB=0.0444274;RO=0;SAF=12;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30297e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000351958;OID=.;OPOS=70495544;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:62:62:0:0:62:62:50:12:0:0:50:12:0:0 chr10 70502288 . G A 1822.01 PASS AO=189;DP=193;FAO=190;FDP=190;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=157;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0220212;FXX=0.0256397;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.5105;QD=38.3581;RBI=0.034674;REFB=0;REVB=0.0267835;RO=0;SAF=33;SAR=156;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000318162;OID=.;OPOS=70502288;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:193:190:0:0:189:190:156:33:0:0:157:33:0:0 chr10 70534744 . A C 487.23 PASS AO=50;DP=54;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00629657;FXX=0.0370302;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.208;QD=37.4791;RBI=0.0477744;REFB=0;REVB=0.0473576;RO=0;SAF=27;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00131337;OID=.;OPOS=70534744;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:54:52:0:0:50:52:23:27:0:0:25:27:0:0 chr10 70641860 . T C 1367.15 PASS AO=161;DP=175;FAO=162;FDP=175;FR=.;FRO=13;FSAF=51;FSAR=111;FSRF=13;FSRR=0;FWDB=0.0310161;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.3814;QD=31.2493;RBI=0.046032;REFB=-0.194124;REVB=0.0340139;RO=0;SAF=51;SAR=110;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.556515;TYPE=snp;VARB=0.00890339;OID=.;OPOS=70641860;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:175:175:0:13:161:162:110:51:0:0:111:51:13:0 chr10 70645790 . CG C 472.65 PASS AO=51;DP=63;FAO=60;FDP=63;FR=.;FRO=3;FSAF=60;FSAR=0;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.231072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=22.542;QD=30.0092;RBI=0.231072;REFB=-0.217759;REVB=0;RO=10;SAF=51;SAR=0;SRF=10;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0630577;OID=.;OPOS=70645791;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:51:63:60:63:3:60:0:3:0:10:10:51:0:10:0 chr10 70696713 . C T 1999.37 PASS AO=211;DP=212;FAO=211;FDP=211;FR=.;FRO=0;FSAF=100;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00828716;FXX=0.00471676;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.181;QD=37.9028;RBI=0.0277332;REFB=-0.054741;REVB=0.0264661;RO=1;SAF=100;SAR=111;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00474022;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.71876e-05;OID=.;OPOS=70696713;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:212:211:1:0:211:211:111:100:1:0:111:100:0:0 chr10 70700944 . A G 517.8 PASS AO=41;DP=57;FAO=56;FDP=56;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=1;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214019;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=39.066;QD=36.9857;RBI=0.155679;REFB=0;REVB=0.154201;RO=1;SAF=1;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0115908;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00391652;OID=.;OPOS=70700944;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:56:56:1:0:41:56:40:1:0:1:55:1:0:0 chr10 70748784 . G A 76.75 PASS AO=15;DP=30;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.0569623;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.149;QD=9.5932;RBI=0.0585899;REFB=-0.0077142;REVB=-0.0137139;RO=15;SAF=5;SAR=10;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0638684;STB=0.535353;TYPE=snp;VARB=0.0194417;OID=.;OPOS=70748784;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:30:32:15:16:15:16:10:5:6:9:11:5:6:10 chr10 70775959 . C T 492.69 PASS AO=111;DP=216;FAO=111;FDP=215;FR=.;FRO=104;FSAF=57;FSAR=54;FSRF=53;FSRR=51;FWDB=0.011131;FXX=0.00921617;HRUN=3;LEN=1;MLLD=195.014;QD=9.16636;RBI=0.016555;REFB=-0.0203259;REVB=0.0122543;RO=100;SAF=57;SAR=54;SRF=51;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00304673;STB=0.501886;TYPE=snp;VARB=0.0179216;OID=.;OPOS=70775959;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:216:215:100:104:111:111:54:57:51:49:54:57:53:51 chr10 70856852 . G A 2185.34 PASS AO=232;DP=234;FAO=232;FDP=232;FR=.;FRO=0;FSAF=118;FSAR=114;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0304345;FXX=0.00854664;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.714;QD=37.6782;RBI=0.0439715;REFB=-0.00657323;REVB=0.031737;RO=2;SAF=118;SAR=114;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00828645;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.49922e-05;OID=.;OPOS=70856852;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:87:234:232:2:0:232:232:114:118:0:2:114:118:0:0 chr10 70884013 . G A 41.33 PASS AO=3;DP=7;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.00273809;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=31.7765;QD=18.3695;RBI=0.040462;REFB=-0.0074998;REVB=0.0403692;RO=0;SAF=1;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.615062;TYPE=snp;VARB=0.00879615;OID=.;OPOS=70884013;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:3:9:0:3:3:6:2:1:0:0:5:1:0:3 chr10 70892791 . C T 333.29 PASS AO=70;DP=129;FAO=70;FDP=129;FR=.;FRO=59;FSAF=25;FSAR=45;FSRF=28;FSRR=31;FWDB=0.000562729;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.4139;QD=10.3344;RBI=0.0252045;REFB=-0.00036773;REVB=-0.0251982;RO=59;SAF=25;SAR=45;SRF=28;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103146;STB=0.556576;TYPE=snp;VARB=0.000386252;OID=.;OPOS=70892791;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:59:59:70:70:45:25:28:31:45:25:28:31 chr10 70922159 . T C 302.28 PASS AO=95;DP=248;FAO=96;FDP=247;FR=.;FRO=151;FSAF=59;FSAR=37;FSRF=73;FSRR=78;FWDB=0.0023211;FXX=0.00803181;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.212;QD=4.89518;RBI=0.00669669;REFB=-0.00381998;REVB=0.00628157;RO=151;SAF=58;SAR=37;SRF=73;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140371;STB=0.581438;TYPE=snp;VARB=0.00558267;OID=.;OPOS=70922159;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:248:247:151:151:95:96:37:58:73:78:37:59:73:78 chr10 70931199 . G A 137.89 PASS AO=40;DP=100;FAO=40;FDP=100;FR=.;FRO=60;FSAF=13;FSAR=27;FSRF=22;FSRR=38;FWDB=-0.0061378;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.13;QD=5.51575;RBI=0.0169904;REFB=-0.0204953;REVB=0.015843;RO=58;SAF=13;SAR=27;SRF=20;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0233916;STB=0.527919;TYPE=snp;VARB=0.0308197;OID=.;OPOS=70931199;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:58:60:40:40:27:13:20:38:27:13:22:38 chr10 70992664 . C T 398.84 PASS AO=81;DP=146;FAO=83;FDP=149;FR=.;FRO=66;FSAF=43;FSAR=40;FSRF=49;FSRR=17;FWDB=0.0086684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.506;QD=10.7071;RBI=0.0132938;REFB=-0.0174523;REVB=-0.0100789;RO=64;SAF=41;SAR=40;SRF=47;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18573;STB=0.600205;TYPE=snp;VARB=0.024479;OID=.;OPOS=70992664;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:149:64:66:81:83:40:41:47:17:40:43:49:17 chr10 71010375 . C T 128.34 PASS AO=28;DP=59;FAO=29;FDP=60;FR=.;FRO=31;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=0.0117361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.554;QD=8.55585;RBI=0.0381236;REFB=-0.0132661;REVB=0.0362722;RO=31;SAF=20;SAR=8;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.342669;STB=0.675081;TYPE=snp;VARB=0.0157912;OID=.;OPOS=71010375;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:60:31:31:28:29:8:20:11:20:9:20:11:20 chr10 71018660 . T C 1817.17 PASS AO=188;DP=191;FAO=192;FDP=192;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=124;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0158254;FXX=0.0103087;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.262;QD=37.8577;RBI=0.0391457;REFB=-0.0728998;REVB=0.0358042;RO=1;SAF=67;SAR=121;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00391928;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.80321e-05;OID=.;OPOS=71018660;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:191:192:1:0:188:192:121:67:0:1:124:68:0:0 chr10 71026510 . C A 261.11 PASS AO=74;DP=184;FAO=77;FDP=187;FR=.;FRO=110;FSAF=35;FSAR=42;FSRF=40;FSRR=70;FWDB=0.0576548;FXX=0.00531887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.929;QD=5.58516;RBI=0.0595848;REFB=-0.0207575;REVB=0.0150424;RO=109;SAF=33;SAR=41;SRF=40;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0857933;STB=0.554442;TYPE=snp;VARB=0.0316898;OID=.;OPOS=71026510;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:187:109:110:74:77:41:33:40:69:42:35:40:70 chr10 71055459 . T TC,C 341.09 PASS AO=21,12;DP=40;FAO=36,0;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=18,0;FSAR=18,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0645616,-0.064922;FXX=0.0769034;HRUN=0,11;LEN=1,1;MLLD=31.4049,28.348;QD=37.8993;RBI=0.0869187,0.0679037;REFB=0,0;REVB=0.0581951,0.0199008;RO=5;SAF=9,7;SAR=12,5;SRF=2;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0102808,0.096601;STB=0.5,0.5;TYPE=ins,snp;VARB=0.00351623,0.00227764;OID=.,.;OPOS=71055460,71055459;OREF=-,T;OALT=C,C;OMAPALT=TC,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:40:36:5:0:21,12:36,0:12,5:9,7:2:3:18,0:18,0:0:0 chr10 71060610 . A G 422.91 PASS AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.04585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.752;QD=35.9926;RBI=0.0486499;REFB=-0.147074;REVB=0.0162663;RO=0;SAF=21;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.85991e-08;STB=0.5098;TYPE=snp;VARB=0.00269429;OID=.;OPOS=71060610;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:47:47:0:1:46:46:25:21:0:0:25:21:0:1 chr10 71060634 . G A 435.33 PASS AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00117716;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.785;QD=37.8549;RBI=0.0163752;REFB=0;REVB=0.0163328;RO=0;SAF=17;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.71193e-05;OID=.;OPOS=71060634;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:46:46:0:0:46:46:29:17:0:0:29:17:0:0 chr10 71142420 . G A 710.04 PASS AO=52;DP=78;FAO=75;FDP=75;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=47;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.285239;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.0887;QD=37.8686;RBI=0.319837;REFB=0;REVB=0.144688;RO=0;SAF=28;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.005388;OID=.;OPOS=71142420;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:74:75:0:0:52:75:24:28:0:0:28:47:0:0 chr10 71160897 . C T 120.56 PASS AO=23;DP=41;FAO=23;FDP=41;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=19;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.0219811;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.905;QD=11.7616;RBI=0.0224736;REFB=-0.00150689;REVB=0.00467908;RO=18;SAF=4;SAR=19;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.332395;STB=0.687836;TYPE=snp;VARB=0.00130952;OID=.;OPOS=71160897;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:41:41:18:18:23:23:19:4:9:9:19:4:9:9 chr10 71168685 . A T 73.84 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0130914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.703;QD=36.9199;RBI=0.0319288;REFB=0;REVB=0.0291215;RO=0;SAF=7;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.78849e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000505745;OID=.;OPOS=71168685;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:7:0:0:1:7:0:0 chr10 71332204 . A G 23.02 PASS AO=7;DP=24;FAO=7;FDP=24;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.00449119;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=189.952;QD=3.83646;RBI=0.021986;REFB=-0.00572091;REVB=-0.0215224;RO=17;SAF=3;SAR=4;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192881;STB=0.51216;TYPE=snp;VARB=0.00997571;OID=.;OPOS=71332204;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:24:24:17:17:7:7:4:3:7:10:4:3:7:10 chr10 71392557 . C T 45.36 PASS AO=13;DP=36;FAO=13;FDP=36;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.0226353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.914;QD=5.0395;RBI=0.0335524;REFB=0.0021178;REVB=-0.0247671;RO=23;SAF=10;SAR=3;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.254963;STB=0.65301;TYPE=snp;VARB=-0.00256677;OID=.;OPOS=71392557;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:36:36:23:23:13:13:3:10:13:10:3:10:13:10 chr10 71392692 . T C 43.43 PASS AO=16;DP=53;FAO=16;FDP=53;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=23;FWDB=-0.039342;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.801;QD=3.27807;RBI=0.0412706;REFB=-0.000398907;REVB=0.0124687;RO=35;SAF=10;SAR=6;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.25548;STB=0.667999;TYPE=snp;VARB=0.000939521;OID=.;OPOS=71392692;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:53:53:35:37:16:16:6:10:14:21:6:10:14:23 chr10 71562437 . G A 70.37 PASS AO=10;DP=13;FAO=10;FDP=13;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0130272;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.118;QD=21.6513;RBI=0.034381;REFB=-0.127479;REVB=0.0318174;RO=2;SAF=2;SAR=8;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0994744;STB=0.578805;TYPE=snp;VARB=0.0320372;OID=.;OPOS=71562437;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:13:13:2:3:10:10:8:2:0:2:8:2:0:3 chr10 71620403 . G A 46.05 PASS AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.00138747;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=201.537;QD=10.2329;RBI=0.0216324;REFB=-0.00565832;REVB=-0.0215878;RO=9;SAF=7;SAR=2;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124428;STB=0.573595;TYPE=snp;VARB=0.0056135;OID=.;OPOS=71620403;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:18:18:9:9:9:9:2:7:6:3:2:7:6:3 chr10 71657272 . A G 375.71 PASS AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00736709;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=209.797;QD=38.5341;RBI=0.0198506;REFB=0;REVB=-0.018433;RO=0;SAF=8;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.77492e-05;OID=.;OPOS=71657272;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:39:39:0:0:39:39:31:8:0:0:31:8:0:0 chr10 71658512 . G A 934.34 PASS AO=99;DP=100;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00480169;FXX=0.0198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.446;QD=37.7513;RBI=0.030678;REFB=0;REVB=0.0302999;RO=0;SAF=31;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000403563;OID=.;OPOS=71658512;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:100:99:0:0:99:99:68:31:0:0:68:31:0:0 chr10 71876382 . C T 423.69 PASS AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0381057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.893;QD=37.661;RBI=0.0384843;REFB=0;REVB=-0.0053845;RO=0;SAF=40;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00018584;OID=.;OPOS=71876382;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:45:45:0:0:45:45:5:40:0:0:5:40:0:0 chr10 72043389 . T G 183.13 PASS AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0298339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.98;QD=38.5532;RBI=0.0441699;REFB=0;REVB=-0.0325718;RO=0;SAF=4;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.00629e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000454593;OID=.;OPOS=72043389;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:19:19:0:0:19:19:15:4:0:0:15:4:0:0 chr10 72043460 . T G 36.92 PASS AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0965895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.4964;QD=13.427;RBI=0.125679;REFB=-0.0145896;REVB=-0.0804102;RO=5;SAF=1;SAR=5;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.392076;STB=0.739831;TYPE=snp;VARB=-0.00758407;OID=.;OPOS=72043460;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:11:11:5:5:6:6:5:1:3:2:5:1:3:2 chr10 72179746 . C T 89.95 PASS AO=23;DP=54;FAO=23;FDP=53;FR=.;FRO=30;FSAF=3;FSAR=20;FSRF=3;FSRR=27;FWDB=0.0105893;FXX=0.0185151;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.179;QD=6.78843;RBI=0.0106351;REFB=0.00469097;REVB=0.000986369;RO=30;SAF=3;SAR=20;SRF=3;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0711527;STB=0.540197;TYPE=snp;VARB=-0.00581443;OID=.;OPOS=72179746;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:54:53:30:30:23:23:20:3:3:27:20:3:3:27 chr10 72181460 . G T 283.76 PASS AO=73;DP=165;FAO=75;FDP=168;FR=.;FRO=93;FSAF=46;FSAR=29;FSRF=38;FSRR=55;FWDB=-0.00389046;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.3108;QD=6.75626;RBI=0.0309228;REFB=-0.0144722;REVB=-0.030677;RO=92;SAF=44;SAR=29;SRF=39;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179223;STB=0.613303;TYPE=snp;VARB=0.0238433;OID=.;OPOS=72181460;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:168:92:93:73:75:29:44:39:53:29:46:38:55 chr10 72195439 . T C 165.97 PASS AO=13;DP=59;FAO=33;FDP=60;FR=.;FRO=27;FSAF=25;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=7;FWDB=0.00698855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.3223;QD=11.0646;RBI=0.0176397;REFB=-0.0123934;REVB=-0.0161963;RO=22;SAF=12;SAR=1;SRF=18;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.27181;STB=0.510198;TYPE=snp;VARB=0.0249019;OID=.;OPOS=72195439;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:39:60:22:27:13:33:1:12:18:4:8:25:20:7 chr10 72195844 . T G 220.52 PASS AO=51;DP=102;FAO=51;FDP=103;FR=.;FRO=52;FSAF=17;FSAR=34;FSRF=30;FSRR=22;FWDB=-0.00213039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.4544;QD=8.56401;RBI=0.00394154;REFB=-0.00960824;REVB=-0.0033162;RO=50;SAF=17;SAR=34;SRF=30;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243944;STB=0.626616;TYPE=snp;VARB=0.0133678;OID=.;OPOS=72195844;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:103:50:52:51:51:34:17:30:20:34:17:30:22 chr10 72292491 . A T 142.78 PASS AO=44;DP=113;FAO=44;FDP=114;FR=.;FRO=70;FSAF=7;FSAR=37;FSRF=31;FSRR=39;FWDB=-0.00520678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.858;QD=5.00966;RBI=0.00887663;REFB=-0.00498469;REVB=0.00718915;RO=69;SAF=7;SAR=37;SRF=31;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.394869;STB=0.725372;TYPE=snp;VARB=0.00904004;OID=.;OPOS=72292491;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:114:69:70:44:44:37:7:31:38:37:7:31:39 chr10 72293713 . C T 143.98 PASS AO=34;DP=74;FAO=35;FDP=75;FR=.;FRO=40;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=12;FSRR=28;FWDB=-0.0298893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.526;QD=7.67875;RBI=0.0315876;REFB=-0.0410734;REVB=0.0102178;RO=35;SAF=10;SAR=24;SRF=11;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218347;STB=0.508892;TYPE=snp;VARB=0.0402324;OID=.;OPOS=72293713;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:75:35:40:34:35:24:10:11:24:24:11:12:28 chr10 72324143 . A G 1021.25 PASS AO=108;DP=113;FAO=111;FDP=113;FR=.;FRO=2;FSAF=57;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0177804;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.7309;QD=36.1506;RBI=0.0604253;REFB=0.0188702;REVB=-0.0577501;RO=5;SAF=54;SAR=54;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00838753;STB=0.509089;TYPE=snp;VARB=-0.00126244;OID=.;OPOS=72324143;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:113:113:5:2:108:111:54:54:3:2:54:57:0:2 chr10 72358577 . G A 190.6 PASS AO=46;DP=101;FAO=47;FDP=101;FR=.;FRO=54;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=31;FSRR=23;FWDB=-0.00241475;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3316;QD=7.5485;RBI=0.0467735;REFB=0.000520316;REVB=0.0467111;RO=54;SAF=20;SAR=26;SRF=31;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134434;STB=0.579268;TYPE=snp;VARB=0.00122786;OID=.;OPOS=72358577;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:54:54:46:47:26:20:31:23:27:20:31:23 chr10 72358655 . G A 244.66 PASS AO=59;DP=123;FAO=59;FDP=123;FR=.;FRO=64;FSAF=19;FSAR=40;FSRF=31;FSRR=33;FWDB=0.000402693;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.089;QD=7.95648;RBI=0.0235686;REFB=-0.0251604;REVB=0.0235652;RO=64;SAF=19;SAR=40;SRF=31;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162722;STB=0.590461;TYPE=snp;VARB=0.0226354;OID=.;OPOS=72358655;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:64:64:59:59:40:19:31:33:40:19:31:33 chr10 72500763 . T C 127.06 PASS AO=27;DP=63;FAO=33;FDP=70;FR=.;FRO=37;FSAF=7;FSAR=26;FSRF=10;FSRR=27;FWDB=0.0187219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.815;QD=7.26041;RBI=0.0249418;REFB=-0.0352456;REVB=-0.0164798;RO=36;SAF=1;SAR=26;SRF=9;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.552445;STB=0.543638;TYPE=snp;VARB=0.0369955;OID=.;OPOS=72500763;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:70:36:37:27:33:26:1:9:27:26:7:10:27 chr10 72500863 . C G 158.87 PASS AO=39;DP=84;FAO=39;FDP=84;FR=.;FRO=45;FSAF=8;FSAR=31;FSRF=13;FSRR=32;FWDB=-0.083171;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.1404;QD=7.56521;RBI=0.0849219;REFB=-0.0113763;REVB=-0.0171555;RO=45;SAF=8;SAR=31;SRF=13;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113011;STB=0.563602;TYPE=snp;VARB=0.0105756;OID=.;OPOS=72500863;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:45:45:39:39:31:8:13:32:31:8:13:32 chr10 72503344 . G A 160.97 PASS AO=40;DP=86;FAO=40;FDP=88;FR=.;FRO=48;FSAF=28;FSAR=12;FSRF=29;FSRR=19;FWDB=0.00281416;FXX=0.0833246;HRUN=5;LEN=1;MLLD=212.181;QD=7.31678;RBI=0.0153539;REFB=-0.0177304;REVB=-0.0150938;RO=43;SAF=28;SAR=12;SRF=26;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100436;STB=0.559248;TYPE=snp;VARB=0.0171757;OID=.;OPOS=72503344;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:88:43:48:40:40:12:28:26:17:12:28:29:19 chr10 72517837 . C T 65.52 PASS AO=20;DP=55;FAO=20;FDP=55;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=28;FSRR=7;FWDB=0.0193479;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=116.08;QD=4.76473;RBI=0.0210049;REFB=-0.0160175;REVB=0.00817715;RO=35;SAF=13;SAR=7;SRF=28;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19521;STB=0.611841;TYPE=snp;VARB=0.0247071;OID=.;OPOS=72517837;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:55:55:35:35:20:20:7:13:28:7:7:13:28:7 chr10 72520330 . A G 617.13 PASS AO=66;DP=68;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0260344;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.667;QD=36.8433;RBI=0.0262345;REFB=0.0287634;REVB=-0.00323471;RO=1;SAF=26;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0178244;STB=0.509801;TYPE=snp;VARB=4.66299e-05;OID=.;OPOS=72520330;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:68:67:1:1:66:66:40:26:1:0:41:25:1:0 chr10 72520567 . A G 33.39 PASS AO=6;DP=17;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.00399375;FXX=0.0555247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.668;QD=7.85601;RBI=0.110398;REFB=-0.00632195;REVB=-0.110326;RO=10;SAF=4;SAR=2;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0726992;STB=0.517192;TYPE=snp;VARB=0.0151149;OID=.;OPOS=72520567;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:17:17:10:10:6:7:2:4:6:4:3:4:6:4 chr10 72535007 . C T 68.18 PASS AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=3;FWDB=0.0420951;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.401;QD=8.52305;RBI=0.0420955;REFB=-0.00776229;REVB=-0.00019186;RO=17;SAF=8;SAR=7;SRF=14;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.279505;STB=0.657934;TYPE=snp;VARB=0.00876154;OID=.;OPOS=72535007;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:32:32:17:17:15:15:7:8:14:3:7:8:14:3 chr10 72619205 . C T 2761.87 PASS AO=286;DP=287;FAO=289;FDP=289;FR=.;FRO=0;FSAF=116;FSAR=173;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0144565;FXX=0.00687262;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.483;QD=38.2266;RBI=0.0146751;REFB=0;REVB=0.00252332;RO=0;SAF=117;SAR=169;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.64432e-05;OID=.;OPOS=72619205;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:287:289:0:0:286:289:169:117:0:0:173:116:0:0 chr10 72629567 . C T 242.9 PASS AO=66;DP=152;FAO=66;FDP=152;FR=.;FRO=86;FSAF=27;FSAR=39;FSRF=33;FSRR=53;FWDB=-0.0199884;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=296.856;QD=6.39222;RBI=0.0298163;REFB=0.00539885;REVB=0.0221241;RO=85;SAF=27;SAR=39;SRF=32;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0342879;STB=0.514921;TYPE=snp;VARB=-0.00621303;OID=.;OPOS=72629567;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:152:85:86:66:66:39:27:32:53:39:27:33:53 chr10 72631626 . C T 615.45 PASS AO=161;DP=345;FAO=160;FDP=347;FR=.;FRO=187;FSAF=79;FSAR=81;FSRF=101;FSRR=86;FWDB=0.03524;FXX=0.00287348;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.8823;QD=7.09452;RBI=0.0358686;REFB=-0.00099615;REVB=-0.00668558;RO=183;SAF=78;SAR=83;SRF=100;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.059772;STB=0.524967;TYPE=snp;VARB=0.00152625;OID=.;OPOS=72631626;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:345:347:183:187:161:160:83:78:100:83:81:79:101:86 chr10 72637176 . T A 445.5 PASS AO=119;DP=271;FAO=120;FDP=269;FR=.;FRO=149;FSAF=53;FSAR=67;FSRF=53;FSRR=96;FWDB=0.0112918;FXX=0.011029;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.658;QD=6.62453;RBI=0.0116761;REFB=-0.00512773;REVB=-0.00297114;RO=152;SAF=52;SAR=67;SRF=56;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0711865;STB=0.548814;TYPE=snp;VARB=0.00669501;OID=.;OPOS=72637176;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:271:269:152:149:119:120:67:52:56:96:67:53:53:96 chr10 73044580 . G A 94.72 PASS AO=20;DP=37;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.000934831;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=134.767;QD=9.47155;RBI=0.062971;REFB=-0.0284372;REVB=-0.0629641;RO=17;SAF=12;SAR=8;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107478;STB=0.5999;TYPE=snp;VARB=0.0230492;OID=.;OPOS=73044580;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:37:40:17:20:20:20:8:12:8:9:8:12:8:12 chr10 73051388 . T C 158.46 PASS AO=35;DP=72;FAO=36;FDP=71;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=10;FSRR=25;FWDB=-0.00487029;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.004;QD=8.92722;RBI=0.0106367;REFB=-0.0200287;REVB=-0.00945617;RO=31;SAF=13;SAR=22;SRF=7;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138105;STB=0.541175;TYPE=snp;VARB=0.0157474;OID=.;OPOS=73051388;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:71:31:35:35:36:22:13:7:24:23:13:10:25 chr10 73104056 . A G 593.89 PASS AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0400708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.1469;QD=37.7071;RBI=0.0670724;REFB=0;REVB=-0.0537869;RO=0;SAF=6;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.77659e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000785783;OID=.;OPOS=73104056;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:63:63:0:0:63:63:57:6:0:0:57:6:0:0 chr10 73111408 . C T 1261.6 PASS AO=127;DP=129;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0332524;FXX=0.00740686;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.6137;QD=37.6597;RBI=0.0437171;REFB=0.0151463;REVB=-0.0283808;RO=2;SAF=75;SAR=52;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125021;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.20337e-05;OID=.;OPOS=73111408;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:129:134:2:0:127:134:52:75:2:0:53:81:0:0 chr10 73115941 . T C 638.85 PASS AO=74;DP=76;FAO=70;FDP=72;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0310435;FXX=0.0885964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.82;QD=35.4914;RBI=0.0311605;REFB=-0.0769548;REVB=-0.00269815;RO=1;SAF=33;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0141198;STB=0.500397;TYPE=snp;VARB=0.00352006;OID=.;OPOS=73115941;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:76:72:1:2:74:70:41:33:1:0:34:36:1:1 chr10 73115942 . G A 751.31 PASS AO=75;DP=76;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019694;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.25;QD=38.5284;RBI=0.0500306;REFB=0;REVB=0.0459914;RO=0;SAF=34;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000207808;OID=.;OPOS=73115942;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:76:78:0:0:75:78:41:34:0:0:41:37:0:0 chr10 73121913 . A G 543.35 PASS AO=66;DP=66;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0802254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.364;QD=38.1295;RBI=0.0830551;REFB=0;REVB=-0.021495;RO=0;SAF=32;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.75585e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000150167;OID=.;OPOS=73121913;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:66:57:0:0:66:57:34:32:0:0:25:32:0:0 chr10 73121945 . T C 519.78 PASS AO=30;DP=69;FAO=57;FDP=59;FR=.;FRO=2;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0168762;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.004;QD=35.239;RBI=0.0221134;REFB=-0.00274029;REVB=-0.0142897;RO=0;SAF=30;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.519224;TYPE=snp;VARB=8.85426e-05;OID=.;OPOS=73121945;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:32:59:0:2:30:57:0:30:0:0:25:32:0:2 chr10 73270906 . T C 1148.7 PASS AO=121;DP=136;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00752009;FXX=0.0948836;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.324;QD=37.055;RBI=0.00796189;REFB=-0.0372008;REVB=-0.00261532;RO=1;SAF=63;SAR=58;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00748096;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000250874;OID=.;OPOS=73270906;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:136:124:1:0:121:124:58:63:1:0:61:63:0:0 chr10 73270982 . G A 584.19 PASS AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122777;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=184.094;QD=37.6898;RBI=0.0217671;REFB=0;REVB=0.017974;RO=0;SAF=27;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.46408e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.38152e-05;OID=.;OPOS=73270982;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:62:62:0:0:62:62:35:27:0:0:35:27:0:0 chr10 73437218 . C T 123.23 PASS AO=38;DP=100;FAO=38;FDP=100;FR=.;FRO=62;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=25;FSRR=37;FWDB=-0.0100338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.628;QD=4.92938;RBI=0.0128535;REFB=-0.0156807;REVB=0.00803328;RO=60;SAF=17;SAR=21;SRF=25;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0335448;STB=0.527823;TYPE=snp;VARB=0.0261353;OID=.;OPOS=73437218;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:60:62:38:38:21:17:25:35:21:17:25:37 chr10 73455201 . T C 435.34 PASS AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0258159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.056;QD=37.8553;RBI=0.0625011;REFB=0;REVB=-0.0569203;RO=0;SAF=19;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000515445;OID=.;OPOS=73455201;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:46:46:0:0:46:46:27:19:0:0:27:19:0:0 chr10 73455273 . T C 700.76 PASS AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.021355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.579;QD=37.8787;RBI=0.0216164;REFB=0;REVB=-0.00335183;RO=0;SAF=35;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.80413e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000101152;OID=.;OPOS=73455273;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:74:74:0:0:74:74:39:35:0:0:39:35:0:0 chr10 73490310 . G A 20 PASS AO=8;DP=33;FAO=8;FDP=33;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.0348696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.892;QD=2.42389;RBI=0.0542132;REFB=-0.0145364;REVB=0.0415112;RO=25;SAF=4;SAR=4;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118476;STB=0.575573;TYPE=snp;VARB=0.056756;OID=.;OPOS=73490310;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:33:33:25:25:8:8:4:4:10:15:4:4:10:15 chr10 73492079 . A G 577.05 PASS AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0258894;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.8446;QD=37.8392;RBI=0.0309812;REFB=0;REVB=-0.017017;RO=0;SAF=39;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.01474e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.84515e-05;OID=.;OPOS=73492079;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:61:61:0:0:61:61:22:39:0:0:22:39:0:0 chr10 73501556 . G A 500.47 PASS AO=55;DP=58;FAO=56;FDP=58;FR=.;FRO=2;FSAF=12;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0874368;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.9553;QD=34.5154;RBI=0.108185;REFB=-0.0250314;REVB=0.0637087;RO=2;SAF=12;SAR=43;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0214235;STB=0.511107;TYPE=snp;VARB=0.00197199;OID=.;OPOS=73501556;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:58:58:2:2:55:56:43:12:0:2:44:12:0:2 chr10 73520511 . G A 134.62 PASS AO=35;DP=80;FAO=35;FDP=81;FR=.;FRO=46;FSAF=31;FSAR=4;FSRF=46;FSRR=0;FWDB=-0.0126966;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=120.052;QD=6.64777;RBI=0.0126981;REFB=-0.000845497;REVB=0.000195768;RO=44;SAF=31;SAR=4;SRF=44;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.384776;STB=0.712888;TYPE=snp;VARB=0.000393462;OID=.;OPOS=73520511;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:81:44:46:35:35:4:31:44:0:4:31:46:0 chr10 73520632 . A C 1160.85 PASS AO=121;DP=121;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0162949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.7075;QD=38.0608;RBI=0.113356;REFB=0;REVB=0.112178;RO=0;SAF=70;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000557457;OID=.;OPOS=73520632;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:121:122:0:0:121:122:51:70:0:0:52:70:0:0 chr10 73521371 . C T 131.16 PASS AO=30;DP=62;FAO=30;FDP=62;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=0.00738465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.14;QD=8.46166;RBI=0.00738488;REFB=-0.026208;REVB=5.71693e-05;RO=32;SAF=14;SAR=16;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0594865;STB=0.533311;TYPE=snp;VARB=0.0264517;OID=.;OPOS=73521371;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:32:32:30:30:16:14:17:15:16:14:17:15 chr10 73521578 . G A 46.44 PASS AO=14;DP=44;FAO=15;FDP=45;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=0.00425234;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.559;QD=4.12796;RBI=0.00519876;REFB=-0.0156032;REVB=0.00299076;RO=30;SAF=8;SAR=6;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119092;STB=0.54432;TYPE=snp;VARB=0.0253786;OID=.;OPOS=73521578;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:44:45:30:30:14:15:6:8:14:16:7:8:14:16 chr10 73537978 . C T 148.36 PASS AO=27;DP=46;FAO=27;FDP=45;FR=.;FRO=18;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=0.0418432;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.1296;QD=13.1874;RBI=0.0484294;REFB=-0.0201762;REVB=0.0243834;RO=16;SAF=18;SAR=9;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0650009;STB=0.525405;TYPE=snp;VARB=0.00716076;OID=.;OPOS=73537978;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:46:45:16:18:27:27:9:18:12:4:9:18:13:5 chr10 73538000 . AC A 34.04 PASS AO=17;DP=46;FAO=16;FDP=43;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.0381711;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=20.2264;QD=3.16682;RBI=0.184727;REFB=-0.00952737;REVB=-0.180741;RO=24;SAF=16;SAR=1;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.694099;STB=0.898276;TYPE=del;VARB=0.00495476;OID=.;OPOS=73538001;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:17:43:16:43:27:15:1:12:15:34:24:16:1:9:15 chr10 73550969 . G A 349.89 PASS AO=69;DP=123;FAO=71;FDP=126;FR=.;FRO=55;FSAF=42;FSAR=29;FSRF=33;FSRR=22;FWDB=0.0308952;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.408;QD=11.1077;RBI=0.0308963;REFB=-0.0356379;REVB=0.000260657;RO=53;SAF=41;SAR=28;SRF=32;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00790791;STB=0.503821;TYPE=snp;VARB=0.0308676;OID=.;OPOS=73550969;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:126:53:55:69:71:28:41:32:21:29:42:33:22 chr10 73558886 . G A 109.29 PASS AO=34;DP=91;FAO=34;FDP=91;FR=.;FRO=57;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=40;FWDB=0.00359947;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.077;QD=4.80399;RBI=0.0336109;REFB=-0.011096;REVB=0.0334176;RO=57;SAF=18;SAR=16;SRF=17;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.251532;STB=0.642779;TYPE=snp;VARB=0.0198394;OID=.;OPOS=73558886;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:57:57:34:34:16:18:17:40:16:18:17:40 chr10 73558952 . C T 138.56 PASS AO=37;DP=84;FAO=37;FDP=86;FR=.;FRO=49;FSAF=12;FSAR=25;FSRF=14;FSRR=35;FWDB=-0.00800262;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=127.672;QD=6.44444;RBI=0.0185223;REFB=-0.0191159;REVB=-0.0167043;RO=47;SAF=12;SAR=25;SRF=14;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0304205;STB=0.525534;TYPE=snp;VARB=0.0110983;OID=.;OPOS=73558952;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:86:47:49:37:37:25:12:14:33:25:12:14:35 chr10 73562744 . G A 57.83 PASS AO=21;DP=65;FAO=21;FDP=66;FR=.;FRO=45;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=-0.0165359;FXX=0.0149231;HRUN=3;LEN=1;MLLD=80.6429;QD=3.50488;RBI=0.0199025;REFB=-0.0065619;REVB=-0.0110759;RO=44;SAF=6;SAR=15;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.307129;STB=0.675503;TYPE=snp;VARB=0.0226657;OID=.;OPOS=73562744;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:65:66:44:45:21:21:15:6:24:20:15:6:24:21 chr10 73569749 . C T 345.71 PASS AO=81;DP=163;FAO=81;FDP=163;FR=.;FRO=82;FSAF=21;FSAR=60;FSRF=18;FSRR=64;FWDB=0.0218521;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=118.253;QD=8.4836;RBI=0.0225076;REFB=0.00144158;REVB=0.00539242;RO=81;SAF=21;SAR=60;SRF=18;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0449377;STB=0.526693;TYPE=snp;VARB=-0.00187151;OID=.;OPOS=73569749;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:163:81:82:81:81:60:21:18:63:60:21:18:64 chr10 73571521 . G A 11.18 PASS AO=2;DP=9;FAO=2;FDP=9;FR=.,HEALED;FRO=7;FSAF=1;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0.0729789;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.3905;QD=4.96707;RBI=0.093925;REFB=-0.0140854;REVB=-0.0591269;RO=4;SAF=1;SAR=1;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.532453;STB=0.887323;TYPE=snp;VARB=0.0194881;OID=.;OPOS=73571521;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:4:7:2:2:1:1:0:4:1:1:0:7 chr10 73576307 . C T 54.02 PASS AO=15;DP=40;FAO=15;FDP=40;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=18;FWDB=0.0418981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.991;QD=5.40166;RBI=0.0583728;REFB=-0.0153627;REVB=-0.040644;RO=25;SAF=6;SAR=9;SRF=7;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138554;STB=0.580544;TYPE=snp;VARB=0.0425163;OID=.;OPOS=73576307;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:40:40:25:25:15:15:9:6:7:18:9:6:7:18 chr10 73610982 . G A 358.3 PASS AO=67;DP=111;FAO=67;FDP=111;FR=.;FRO=44;FSAF=24;FSAR=43;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=-0.0188336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.923;QD=12.9117;RBI=0.0204297;REFB=-0.0269718;REVB=-0.00791637;RO=44;SAF=24;SAR=43;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125177;STB=0.568155;TYPE=snp;VARB=0.027211;OID=.;OPOS=73610982;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:44:44:67:67:43:24:23:21:43:24:23:21 chr10 73766991 . GC G 232.63 PASS AO=25;DP=30;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.222987;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=17.316;QD=29.079;RBI=0.393433;REFB=0;REVB=-0.324139;RO=2;SAF=13;SAR=12;SRF=2;SRR=0;SSEN=0.519481;SSEP=0;SSSB=-0.0661725;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.00518544;OID=.;OPOS=73766992;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:25:31:32:32:0:15:17:0:0:21:2:13:12:2:0 chr10 73767859 . G A 53.81 PASS AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00732934;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.534;QD=23.9157;RBI=0.0677726;REFB=-0.00991777;REVB=0.0673751;RO=2;SAF=4;SAR=3;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174483;STB=0.599732;TYPE=snp;VARB=0.00298844;OID=.;OPOS=73767859;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:2:2:7:7:3:4:2:0:3:4:2:0 chr10 73768992 . C A 406.03 PASS AO=99;DP=205;FAO=99;FDP=205;FR=.;FRO=106;FSAF=67;FSAR=32;FSRF=58;FSRR=48;FWDB=-0.0196857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.464;QD=7.92245;RBI=0.0229234;REFB=-0.00441452;REVB=0.0117455;RO=102;SAF=67;SAR=32;SRF=56;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127567;STB=0.572634;TYPE=snp;VARB=0.00411814;OID=.;OPOS=73768992;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:205:102:106:99:99:32:67:56:46:32:67:58:48 chr10 73772661 . T A 183.77 PASS AO=36;DP=63;FAO=36;FDP=63;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.0514531;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.533;QD=11.668;RBI=0.0538865;REFB=-0.00310685;REVB=0.0160104;RO=27;SAF=14;SAR=22;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0152161;STB=0.508375;TYPE=snp;VARB=0.00317096;OID=.;OPOS=73772661;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:27:27:36:36:22:14:10:17:22:14:10:17 chr10 73820396 . G A 233 PASS AO=73;DP=178;FAO=73;FDP=188;FR=.;FRO=115;FSAF=52;FSAR=21;FSRF=83;FSRR=32;FWDB=-0.0158301;FXX=0.00529073;HRUN=1;LEN=1;MLLD=39.7141;QD=4.95747;RBI=0.0192359;REFB=-0.0333107;REVB=0.0109283;RO=104;SAF=52;SAR=21;SRF=72;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0252567;STB=0.507063;TYPE=snp;VARB=0.0514973;OID=.;OPOS=73820396;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:188:104:115:73:73:21:52:72:32:21:52:83:32 chr10 73970502 . C G 158.6 PASS AO=54;DP=155;FAO=55;FDP=155;FR=.;FRO=100;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=70;FSRR=30;FWDB=0.0014688;FXX=0.00640985;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.8;QD=4.09294;RBI=0.0510078;REFB=0.00320605;REVB=0.0509867;RO=100;SAF=26;SAR=28;SRF=70;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247834;STB=0.634238;TYPE=snp;VARB=-0.00693476;OID=.;OPOS=73970502;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:100:100:54:55:28:26:70:30:28:27:70:30 chr10 74268031 . T C 1457.3 PASS AO=155;DP=157;FAO=156;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000780175;FXX=0.00636902;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.0358;QD=37.3667;RBI=0.00354562;REFB=-0.0401883;REVB=-0.00345872;RO=2;SAF=50;SAR=105;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00897499;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.01479e-05;OID=.;OPOS=74268031;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:157:156:2:0:155:156:105:50:0:2:106:50:0:0 chr10 74830335 . A G 251.26 PASS AO=53;DP=99;FAO=53;FDP=99;FR=.;FRO=46;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=0.0076029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.712;QD=10.1521;RBI=0.00786306;REFB=-0.00243645;REVB=-0.00200588;RO=46;SAF=25;SAR=28;SRF=24;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0422892;STB=0.523256;TYPE=snp;VARB=0.00199066;OID=.;OPOS=74830335;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:46:46:53:53:28:25:24:22:28:25:24:22 chr10 74834651 . T C 200.45 PASS AO=55;DP=119;FAO=56;FDP=131;FR=.;FRO=75;FSAF=21;FSAR=35;FSRF=30;FSRR=45;FWDB=0.00795317;FXX=0.0150365;HRUN=3;LEN=1;MLLD=112.526;QD=6.1206;RBI=0.0500631;REFB=-0.0319376;REVB=-0.0494273;RO=64;SAF=20;SAR=35;SRF=31;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121161;STB=0.515146;TYPE=snp;VARB=0.0413148;OID=.;OPOS=74834651;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:131:64:75:55:56:35:20:31:33:35:21:30:45 chr10 74894375 . T C 391.53 PASS AO=131;DP=347;FAO=131;FDP=347;FR=.;FRO=216;FSAF=75;FSAR=56;FSRF=105;FSRR=111;FWDB=-0.00222497;FXX=0.00287348;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.829;QD=4.51331;RBI=0.0181492;REFB=0.00167804;REVB=0.0180123;RO=214;SAF=75;SAR=56;SRF=103;SRR=111;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100919;STB=0.554073;TYPE=snp;VARB=-0.00269535;OID=.;OPOS=74894375;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:347:347:214:216:131:131:56:75:103:111:56:75:105:111 chr10 74896664 . T C 168.01 PASS AO=58;DP=162;FAO=58;FDP=162;FR=.;FRO=104;FSAF=24;FSAR=34;FSRF=45;FSRR=59;FWDB=-0.0284796;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.3759;QD=4.14843;RBI=0.0288644;REFB=-0.00870847;REVB=0.00469744;RO=104;SAF=24;SAR=34;SRF=45;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218136;STB=0.512447;TYPE=snp;VARB=0.0176649;OID=.;OPOS=74896664;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:162:104:104:58:58:34:24:45:59:34:24:45:59 chr10 74897816 . C T 290.72 PASS AO=42;DP=54;FAO=42;FDP=54;FR=.;FRO=12;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=12;FWDB=4.65974e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.5919;QD=21.5348;RBI=0.00413622;REFB=-0.00171819;REVB=-0.00413595;RO=12;SAF=22;SAR=20;SRF=0;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214835;STB=0.615332;TYPE=snp;VARB=0.000491556;OID=.;OPOS=74897816;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:54:54:12:12:42:42:20:22:0:12:20:22:0:12 chr10 74899134 . C G 249.39 PASS AO=63;DP=139;FAO=63;FDP=137;FR=.;FRO=74;FSAF=55;FSAR=8;FSRF=70;FSRR=4;FWDB=-0.00912899;FXX=0.0143875;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.6047;QD=7.28139;RBI=0.0471923;REFB=-0.00231028;REVB=-0.0463009;RO=73;SAF=55;SAR=8;SRF=69;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183921;STB=0.602383;TYPE=snp;VARB=0.00133536;OID=.;OPOS=74899134;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:137:73:74:63:63:8:55:69:4:8:55:70:4 chr10 74916173 . T A 383.3 PASS AO=73;DP=122;FAO=73;FDP=122;FR=.;FRO=49;FSAF=39;FSAR=34;FSRF=29;FSRR=20;FWDB=-0.0397073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.794;QD=12.5672;RBI=0.0398714;REFB=-0.0489002;REVB=-0.0036142;RO=49;SAF=39;SAR=34;SRF=29;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0429092;STB=0.523307;TYPE=snp;VARB=0.0454715;OID=.;OPOS=74916173;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:49:49:73:73:34:39:29:20:34:39:29:20 chr10 74923562 . C T 425.54 PASS AO=128;DP=310;FAO=129;FDP=317;FR=.;FRO=188;FSAF=79;FSAR=50;FSRF=99;FSRR=89;FWDB=0.00474655;FXX=0.00314456;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.454;QD=5.36956;RBI=0.0124993;REFB=-0.00729189;REVB=0.011563;RO=178;SAF=79;SAR=49;SRF=98;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0720718;STB=0.552328;TYPE=snp;VARB=0.00998646;OID=.;OPOS=74923562;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:310:317:178:188:128:129:49:79:98:80:50:79:99:89 chr10 74934442 . C T 282.2 PASS AO=59;DP=109;FAO=59;FDP=109;FR=.;FRO=50;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=23;FSRR=27;FWDB=-0.000430591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.0445;QD=10.3561;RBI=0.0256546;REFB=-0.0249194;REVB=-0.025651;RO=49;SAF=28;SAR=31;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0212565;STB=0.506706;TYPE=snp;VARB=0.0100143;OID=.;OPOS=74934442;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:49:50:59:59:31:28:22:27:31:28:23:27 chr10 74995086 . C T 478.6 PASS AO=99;DP=178;FAO=99;FDP=178;FR=.;FRO=79;FSAF=36;FSAR=63;FSRF=32;FSRR=47;FWDB=0.00392851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.992;QD=10.755;RBI=0.01123;REFB=-0.000185155;REVB=-0.0105205;RO=78;SAF=36;SAR=63;SRF=31;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.029263;STB=0.519647;TYPE=snp;VARB=0.000128909;OID=.;OPOS=74995086;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:178:78:79:99:99:63:36:31:47:63:36:32:47 chr10 75000698 . T C 79.56 PASS AO=25;DP=69;FAO=25;FDP=69;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=27;FSRR=17;FWDB=-0.0136665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.977;QD=4.61238;RBI=0.015965;REFB=-0.0136264;REVB=-0.0082528;RO=43;SAF=14;SAR=11;SRF=26;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0499826;STB=0.534966;TYPE=snp;VARB=0.0290241;OID=.;OPOS=75000698;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:69:69:43:44:25:25:11:14:26:17:11:14:27:17 chr10 75000739 . G A 87.02 PASS AO=26;DP=71;FAO=27;FDP=73;FR=.;FRO=46;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=28;FSRR=18;FWDB=0.0244133;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.074;QD=4.76801;RBI=0.0334867;REFB=-0.00999384;REVB=0.0229205;RO=45;SAF=14;SAR=12;SRF=27;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0684581;STB=0.534136;TYPE=snp;VARB=0.0270889;OID=.;OPOS=75000739;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:71:73:45:46:26:27:12:14:27:18:12:15:28:18 chr10 75006804 . A G 34.1 PASS AO=5;DP=10;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.00129024;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.4728;QD=12.4003;RBI=0.00247821;REFB=-0.0418987;REVB=0.00211584;RO=5;SAF=5;SAR=0;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.706441;STB=0.526224;TYPE=snp;VARB=0.0342681;OID=.;OPOS=75006804;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:10:11:5:5:5:6:0:5:4:1:1:5:4:1 chr10 75009107 . T A 134.92 PASS AO=38;DP=102;FAO=41;FDP=103;FR=.;FRO=62;FSAF=9;FSAR=32;FSRF=24;FSRR=38;FWDB=0.0435765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.822;QD=5.23957;RBI=0.0436045;REFB=-0.00700793;REVB=-0.00156492;RO=62;SAF=7;SAR=31;SRF=24;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.285684;STB=0.626267;TYPE=snp;VARB=0.0147127;OID=.;OPOS=75009107;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:103:62:62:38:41:31:7:24:38:32:9:24:38 chr10 75034215 . C G 44.02 PASS AO=6;DP=13;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=0;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=23.534;QD=12.5765;RBI=0.141358;REFB=-0.151788;REVB=0.141358;RO=6;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.10379;OID=.;OPOS=75034215;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:13:14:6:6:6:8:6:0:0:6:8:0:0:6 chr10 75035257 . T C 429.42 PASS AO=96;DP=189;FAO=97;FDP=189;FR=.;FRO=92;FSAF=39;FSAR=58;FSRF=43;FSRR=49;FWDB=-0.0357809;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3153;QD=9.08825;RBI=0.0631508;REFB=0.0195347;REVB=0.052036;RO=93;SAF=38;SAR=58;SRF=44;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.071166;STB=0.53264;TYPE=snp;VARB=-0.0203776;OID=.;OPOS=75035257;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:189:93:92:96:97:58:38:44:49:58:39:43:49 chr10 75056863 . A C 378.36 PASS AO=97;DP=210;FAO=97;FDP=211;FR=.;FRO=114;FSAF=34;FSAR=63;FSRF=64;FSRR=50;FWDB=0.00282723;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.093;QD=7.17272;RBI=0.00613625;REFB=-0.0133634;REVB=0.00544612;RO=113;SAF=34;SAR=63;SRF=64;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213818;STB=0.616389;TYPE=snp;VARB=0.0205447;OID=.;OPOS=75056863;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:210:211:113:114:97:97:63:34:64:49:63:34:64:50 chr10 75095253 . G A 187.69 PASS AO=57;DP=144;FAO=57;FDP=144;FR=.;FRO=87;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=46;FSRR=41;FWDB=-0.0605701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.302;QD=5.21364;RBI=0.0649668;REFB=0.00267707;REVB=0.0234936;RO=87;SAF=30;SAR=27;SRF=46;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00259715;STB=0.501466;TYPE=snp;VARB=-0.00361539;OID=.;OPOS=75095253;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:144:87:87:57:57:27:30:46:41:27:30:46:41 chr10 75148116 . A G 323.12 PASS AO=88;DP=204;FAO=91;FDP=213;FR=.;FRO=122;FSAF=46;FSAR=45;FSRF=47;FSRR=75;FWDB=0.00483185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.636;QD=6.06805;RBI=0.0181703;REFB=-0.0197198;REVB=-0.0175161;RO=116;SAF=45;SAR=43;SRF=43;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1434;STB=0.568764;TYPE=snp;VARB=0.0253162;OID=.;OPOS=75148116;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:213:116:122:88:91:43:45:43:73:45:46:47:75 chr10 75289359 . C A 435.81 PASS AO=77;DP=125;FAO=79;FDP=126;FR=.;FRO=47;FSAF=27;FSAR=52;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=0.0511962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.892;QD=13.8352;RBI=0.0516051;REFB=-0.0151838;REVB=0.00648401;RO=47;SAF=26;SAR=51;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0510714;STB=0.525477;TYPE=snp;VARB=0.00636014;OID=.;OPOS=75289359;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:126:47:47:77:79:51:26:19:28:52:27:19:28 chr10 75290485 . TG T 1361.51 PASS AO=167;DP=208;FAO=204;FDP=204;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.323574;FXX=0.0285701;HRUN=4;LEN=1;MLLD=16.7206;QD=26.6963;RBI=0.327591;REFB=0.0974264;REVB=-0.0511449;RO=24;SAF=80;SAR=87;SRF=19;SRR=5;SSEN=0.455479;SSEP=0;SSSB=-0.0742339;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00161162;OID=.;OPOS=75290486;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:167:201:204:204:0:105:99:0:0:99:24:80:87:19:5 chr10 75391823 . C A 401.66 PASS AO=87;DP=163;FAO=87;FDP=163;FR=.;FRO=76;FSAF=48;FSAR=39;FSRF=42;FSRR=34;FWDB=-0.0282954;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.5401;QD=9.8566;RBI=0.0290451;REFB=0.0190475;REVB=0.00655685;RO=74;SAF=48;SAR=39;SRF=41;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00198033;STB=0.500428;TYPE=snp;VARB=-0.0185964;OID=.;OPOS=75391823;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:163:74:76:87:87:39:48:41:33:39:48:42:34 chr10 75406912 . G T 115.84 PASS AO=26;DP=53;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=8;FWDB=0.0072223;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=216.293;QD=8.74289;RBI=0.0172634;REFB=-0.0106134;REVB=-0.01568;RO=26;SAF=18;SAR=8;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506844;TYPE=snp;VARB=0.0100279;OID=.;OPOS=75406912;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:26:27:26:26:8:18:18:8:8:18:19:8 chr10 75407290 . G A 75.08 PASS AO=17;DP=53;FAO=21;FDP=53;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=3;FSRF=23;FSRR=9;FWDB=0.021705;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=38.3995;QD=5.66609;RBI=0.0309635;REFB=-0.0436982;REVB=-0.0220824;RO=21;SAF=14;SAR=3;SRF=17;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0227546;STB=0.637018;TYPE=snp;VARB=0.077069;OID=.;OPOS=75407290;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:49:53:21:32:17:21:3:14:17:4:3:18:23:9 chr10 75407649 . A C 47.15 PASS AO=7;DP=11;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0123295;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=144.99;QD=17.1439;RBI=0.0343846;REFB=-0.00299215;REVB=0.032098;RO=4;SAF=1;SAR=6;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.563426;STB=0.832321;TYPE=snp;VARB=0.000493762;OID=.;OPOS=75407649;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:11:11:4:4:7:7:6:1:4:0:6:1:4:0 chr10 75415677 . C T 623.22 PASS AO=154;DP=326;FAO=158;FDP=335;FR=.;FRO=177;FSAF=29;FSAR=129;FSRF=24;FSRR=153;FWDB=0.00793802;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=151.749;QD=7.44138;RBI=0.0289807;REFB=-0.0170155;REVB=0.0278724;RO=170;SAF=25;SAR=129;SRF=19;SRR=151;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.095537;STB=0.54465;TYPE=snp;VARB=0.0205444;OID=.;OPOS=75415677;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:326:335:170:177:154:158:129:25:19:151:129:29:24:153 chr10 75442543 . C T 94.83 PASS AO=20;DP=40;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.0194715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.796;QD=9.48339;RBI=0.0547989;REFB=-0.0195895;REVB=-0.0512229;RO=20;SAF=10;SAR=10;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0442434;STB=0.524975;TYPE=snp;VARB=0.0186497;OID=.;OPOS=75442543;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:40:40:20:20:20:20:10:10:9:11:10:10:9:11 chr10 75457513 . TG T 92.91 PASS AO=16;DP=62;FAO=29;FDP=42;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=27;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.0897309;FXX=0.10636;HRUN=4;LEN=1;MLLD=11.0638;QD=8.84884;RBI=0.144901;REFB=0.0613542;REVB=0.113775;RO=21;SAF=1;SAR=15;SRF=4;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.334997;STB=0.692138;TYPE=del;VARB=0.0805619;OID=.;OPOS=75457514;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:16:46:29:42:13:2:27:4:9:16:21:1:15:4:17 chr10 75506674 . T C 237.01 PASS AO=63;DP=143;FAO=63;FDP=143;FR=.;FRO=80;FSAF=10;FSAR=53;FSRF=7;FSRR=73;FWDB=-0.0143741;FXX=0.00694396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.3186;QD=6.62955;RBI=0.0470185;REFB=-0.0167973;REVB=-0.0447675;RO=78;SAF=10;SAR=53;SRF=7;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143825;STB=0.58304;TYPE=snp;VARB=0.0101308;OID=.;OPOS=75506674;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:78:80:63:63:53:10:7:71:53:10:7:73 chr10 75527708 . A G 369.78 PASS AO=86;DP=172;FAO=86;FDP=172;FR=.;FRO=86;FSAF=27;FSAR=59;FSRF=34;FSRR=52;FWDB=-0.000444178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.635;QD=8.59957;RBI=0.0304879;REFB=-0.0115856;REVB=-0.0304846;RO=83;SAF=27;SAR=59;SRF=33;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0836038;STB=0.545623;TYPE=snp;VARB=0.0147547;OID=.;OPOS=75527708;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:172:83:86:86:86:59:27:33:50:59:27:34:52 chr10 75558867 . G A 223.83 PASS AO=53;DP=110;FAO=53;FDP=110;FR=.;FRO=57;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=26;FSRR=31;FWDB=0.0333388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.9867;QD=8.13915;RBI=0.045526;REFB=-0.0330059;REVB=0.0310022;RO=57;SAF=26;SAR=27;SRF=26;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0321905;STB=0.51785;TYPE=snp;VARB=0.02705;OID=.;OPOS=75558867;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:57:57:53:53:27:26:26:31:27:26:26:31 chr10 75562108 . G A 127.9 PASS AO=18;DP=48;FAO=25;FDP=46;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0389783;FXX=0.0212721;HRUN=5;LEN=1;MLLD=33.3734;QD=11.1214;RBI=0.0402403;REFB=-0.0538952;REVB=0.00999884;RO=12;SAF=8;SAR=10;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0992905;STB=0.505296;TYPE=snp;VARB=0.00789948;OID=.;OPOS=75562108;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:38:46:12:21:18:25:10:8:7:5:14:11:9:12 chr10 75576483 . T C 33.04 PASS AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0349415;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.468;QD=18.8792;RBI=0.0494204;REFB=-0.00574675;REVB=-0.0349494;RO=2;SAF=2;SAR=3;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.281149;STB=0.666029;TYPE=snp;VARB=0.00265995;OID=.;OPOS=75576483;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:2:2:5:5:3:2:2:0:3:2:2:0 chr10 75597289 . T A 237.07 PASS AO=59;DP=129;FAO=60;FDP=131;FR=.;FRO=71;FSAF=15;FSAR=45;FSRF=33;FSRR=38;FWDB=0.0200923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.304;QD=7.23872;RBI=0.0260466;REFB=-0.0234832;REVB=0.0165748;RO=70;SAF=14;SAR=45;SRF=33;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.264059;STB=0.634313;TYPE=snp;VARB=0.0193008;OID=.;OPOS=75597289;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:131:70:71:59:60:45:14:33:37:45:15:33:38 chr10 75673101 . T C 135.49 PASS AO=32;DP=69;FAO=32;FDP=69;FR=.;FRO=37;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.0112567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.9452;QD=7.85423;RBI=0.0152517;REFB=-0.0319103;REVB=-0.0102907;RO=36;SAF=16;SAR=16;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0262221;STB=0.521726;TYPE=snp;VARB=0.0283042;OID=.;OPOS=75673101;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:36:37:32:32:16:16:17:19:16:16:17:20 chr10 75673879 . C T 284.65 PASS AO=53;DP=96;FAO=57;FDP=101;FR=.;FRO=44;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=-0.0145172;FXX=0.0194156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.2764;QD=11.2732;RBI=0.0390764;REFB=-0.0340983;REVB=-0.0362797;RO=41;SAF=25;SAR=28;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0128512;STB=0.5007;TYPE=snp;VARB=0.0239635;OID=.;OPOS=75673879;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:101:41:44:53:57:28:25:20:21:31:26:20:24 chr10 75865065 . G A 237.44 PASS AO=31;DP=173;FAO=67;FDP=164;FR=.,HEALED;FRO=97;FSAF=36;FSAR=31;FSRF=47;FSRR=50;FWDB=-0.0371189;FXX=0.0120475;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.627;QD=5.79112;RBI=0.0408899;REFB=-0.00266488;REVB=-0.0171514;RO=54;SAF=3;SAR=28;SRF=7;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0936231;STB=0.531235;TYPE=snp;VARB=0.00412605;OID=.;OPOS=75865065;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:164:54:97:31:67:28:3:7:47:31:36:47:50 chr10 75871735 . C G 154.37 PASS AO=39;DP=117;FAO=49;FDP=127;FR=.;FRO=78;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=32;FSRR=46;FWDB=0.00490756;FXX=0.0155027;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.488;QD=4.86189;RBI=0.0248372;REFB=-0.00892048;REVB=0.0243475;RO=77;SAF=26;SAR=13;SRF=31;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.301761;STB=0.5735;TYPE=snp;VARB=0.0171873;OID=.;OPOS=75871735;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:127:77:78:39:49:13:26:31:46:23:26:32:46 chr10 75878915 . C CTA 148.86 PASS AO=32;DP=73;FAO=36;FDP=77;FR=.;FRO=41;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=-0.0189609;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=184.738;QD=7.73297;RBI=0.0293618;REFB=-0.0136849;REVB=0.0224188;RO=40;SAF=11;SAR=21;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160513;STB=0.617693;TYPE=ins;VARB=0.0149433;OID=.;OPOS=75878916;OREF=-;OALT=TA;OMAPALT=CTA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:32:73:36:77:41:11:25:21:20:99:40:11:21:20:20 chr10 75883134 . C CTT 189.47 PASS AO=47;DP=159;FAO=58;FDP=147;FR=.;FRO=89;FSAF=39;FSAR=19;FSRF=40;FSRR=49;FWDB=-0.0197151;FXX=0.0454516;HRUN=0;LEN=2;MLLD=173.993;QD=5.15571;RBI=0.0197328;REFB=0.0017313;REVB=-0.000836221;RO=93;SAF=32;SAR=15;SRF=46;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223014;STB=0.638526;TYPE=ins;VARB=-0.00318601;OID=.;OPOS=75883135;OREF=-;OALT=TT;OMAPALT=CTT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:47:159:58:147:89:39:19:40:49:99:93:32:15:46:47 chr10 76735391 . AG A 539.61 PASS AO=84;DP=112;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.135992;FXX=0.0178555;HRUN=3;LEN=1;MLLD=9.0031;QD=19.6222;RBI=0.136866;REFB=0;REVB=0.0154485;RO=9;SAF=16;SAR=68;SRF=1;SRR=8;SSEN=0.516854;SSEP=0;SSSB=0.0238855;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00341137;OID=.;OPOS=76735392;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:84:109:110:110:0:21:89:0:0:51:9:16:68:1:8 chr10 78629795 . C G 552.09 PASS AO=57;DP=60;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287544;FXX=0.0491723;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.19;QD=38.0751;RBI=0.0381099;REFB=0;REVB=0.025011;RO=0;SAF=33;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.25003e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000157639;OID=.;OPOS=78629795;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:60:58:0:0:57:58:24:33:0:0:23:35:0:0 chr10 78944590 . G A 151.37 PASS AO=43;DP=108;FAO=44;FDP=109;FR=.;FRO=65;FSAF=13;FSAR=31;FSRF=32;FSRR=33;FWDB=-0.00873508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.727;QD=5.55484;RBI=0.0564335;REFB=-0.0111997;REVB=0.0557534;RO=63;SAF=13;SAR=30;SRF=31;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212764;STB=0.626343;TYPE=snp;VARB=0.0259352;OID=.;OPOS=78944590;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:109:63:65:43:44:30:13:31:32:31:13:32:33 chr10 79566632 . G A 392.38 PASS AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0307176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.6648;QD=37.3699;RBI=0.0357233;REFB=0;REVB=0.0182369;RO=0;SAF=17;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.98888e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000499666;OID=.;OPOS=79566632;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:42:42:0:0:42:42:25:17:0:0:25:17:0:0 chr10 79584178 . G C 251.49 PASS AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00848273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.61;QD=37.2582;RBI=0.0181499;REFB=0;REVB=0.0160457;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00102529;OID=.;OPOS=79584178;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:26:27:0:0:26:27:15:11:0:0:16:11:0:0 chr10 79613260 . C T 46.83 PASS AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=-0.00981864;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.105;QD=6.04318;RBI=0.0401723;REFB=-0.0186051;REVB=0.038954;RO=18;SAF=2;SAR=10;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0933327;STB=0.593049;TYPE=snp;VARB=0.0345309;OID=.;OPOS=79613260;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:31:31:18:19:12:12:10:2:4:14:10:2:5:14 chr10 79616605 . T C 1391.74 PASS AO=143;DP=145;FAO=145;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243899;FXX=0.0136045;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.276;QD=38.3929;RBI=0.0297296;REFB=0;REVB=0.0169995;RO=0;SAF=51;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.49059e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000196687;OID=.;OPOS=79616605;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:145:145:0:0:143:145:92:51:0:0:93:52:0:0 chr10 79628875 . A G 604.58 PASS AO=63;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0223911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.709;QD=37.7864;RBI=0.0643884;REFB=0;REVB=0.0603697;RO=0;SAF=55;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000315481;OID=.;OPOS=79628875;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:64:64:0:0:63:64:8:55:0:0:9:55:0:0 chr10 79793688 . C T 182.19 PASS AO=28;DP=40;FAO=28;FDP=40;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=26;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0726299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.739;QD=18.2187;RBI=0.078915;REFB=-0.0137598;REVB=0.0308622;RO=11;SAF=2;SAR=26;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.428413;STB=0.764456;TYPE=snp;VARB=0.00562181;OID=.;OPOS=79793688;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:40:40:11:12:28:28:26:2:5:6:26:2:6:6 chr10 80310465 . T C 401.9 PASS AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0243189;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.346;QD=37.3857;RBI=0.0379895;REFB=0;REVB=-0.0291855;RO=0;SAF=30;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000183431;OID=.;OPOS=80310465;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:43:43:0:0:43:43:13:30:0:0:13:30:0:0 chr10 80310636 . G A 847.65 PASS AO=186;DP=362;FAO=192;FDP=366;FR=.;FRO=174;FSAF=94;FSAR=98;FSRF=75;FSRR=99;FWDB=0.00622586;FXX=0.00272472;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.867;QD=9.26396;RBI=0.013478;REFB=0.00524267;REVB=0.0119539;RO=174;SAF=89;SAR=97;SRF=75;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0421734;STB=0.527876;TYPE=snp;VARB=-0.00500907;OID=.;OPOS=80310636;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:362:366:174:174:186:192:97:89:75:99:98:94:75:99 chr10 81045207 . T C 304.88 PASS AO=91;DP=222;FAO=91;FDP=223;FR=.;FRO=132;FSAF=41;FSAR=50;FSRF=57;FSRR=75;FWDB=0.00990813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.026;QD=5.46864;RBI=0.00998123;REFB=-0.0228346;REVB=0.00120583;RO=131;SAF=41;SAR=50;SRF=57;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0164602;STB=0.51122;TYPE=snp;VARB=0.0293113;OID=.;OPOS=81045207;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:223:131:132:91:91:50:41:57:74:50:41:57:75 chr10 81266473 . A G 46.6 PASS AO=18;DP=58;FAO=18;FDP=58;FR=.;FRO=40;FSAF=17;FSAR=1;FSRF=34;FSRR=6;FWDB=0.0186255;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.0686;QD=3.21374;RBI=0.047658;REFB=-0.0377323;REVB=-0.0438677;RO=37;SAF=17;SAR=1;SRF=32;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.284517;STB=0.69971;TYPE=snp;VARB=0.210729;OID=.;OPOS=81266473;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:58:58:37:40:18:18:1:17:32:5:1:17:34:6 chr10 81270319 . T A 35.93 PASS AO=13;DP=44;FAO=13;FDP=44;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=0.00165485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.509;QD=3.26625;RBI=0.00948878;REFB=0.000455131;REVB=0.00934336;RO=31;SAF=6;SAR=7;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174626;STB=0.605379;TYPE=snp;VARB=-0.00102932;OID=.;OPOS=81270319;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:44:44:31:31:13:13:7:6:19:12:7:6:19:12 chr10 81272814 . G C 812.88 PASS AO=97;DP=107;FAO=97;FDP=106;FR=.;FRO=9;FSAF=44;FSAR=53;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.00789148;FXX=0.00934492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.176;QD=30.6747;RBI=0.0371188;REFB=-0.0131374;REVB=0.0362702;RO=9;SAF=44;SAR=53;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0195109;STB=0.510318;TYPE=snp;VARB=0.00100354;OID=.;OPOS=81272814;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:107:106:9:9:97:97:53:44:3:6:53:44:3:6 chr10 81272881 . A G 19.51 PASS AO=6;DP=22;FAO=6;FDP=22;FR=.;FRO=16;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=0.00595727;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.4017;QD=3.54776;RBI=0.0720417;REFB=0.0336161;REVB=0.0717949;RO=16;SAF=1;SAR=5;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143816;STB=0.594887;TYPE=snp;VARB=-0.0563717;OID=.;OPOS=81272881;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:22:22:16:16:6:6:5:1:4:12:5:1:4:12 chr10 81273085 . C T 481.11 PASS AO=50;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288068;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.3654;QD=37.7344;RBI=0.0427185;REFB=0;REVB=-0.0315442;RO=0;SAF=21;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.20481e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.84581e-05;OID=.;OPOS=81273085;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:50:51:0:0:50:51:29:21:0:0:30:21:0:0 chr10 81273490 . A C 157.2 PASS AO=19;DP=21;FAO=19;FDP=21;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00867628;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=225.219;QD=29.9437;RBI=0.0209379;REFB=-0.155442;REVB=-0.0190556;RO=1;SAF=13;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0340907;STB=0.535678;TYPE=snp;VARB=0.00245981;OID=.;OPOS=81273490;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:21:21:1:2:19:19:6:13:1:0:6:13:2:0 chr10 81273523 . G A 17.94 PASS AO=5;DP=26;FAO=6;FDP=24;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=14;FSRR=4;FWDB=0.00726148;FXX=0.11107;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.423;QD=2.99008;RBI=0.00729556;REFB=0.00214154;REVB=-0.000704407;RO=21;SAF=4;SAR=1;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1954;STB=0.5997;TYPE=snp;VARB=-0.00314454;OID=.;OPOS=81273523;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:26:24:21:18:5:6:1:4:14:7:2:4:14:4 chr10 81273879 . A G 393 PASS AO=34;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0239246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.514;QD=37.4287;RBI=0.04505;REFB=0;REVB=0.0381722;RO=0;SAF=16;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000436065;OID=.;OPOS=81273879;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:42:42:0:0:34:42:18:16:0:0:19:23:0:0 chr10 81274334 . A G 471.88 PASS AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00354699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.304;QD=38.521;RBI=0.0176762;REFB=0;REVB=0.0173167;RO=0;SAF=23;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.25175e-05;OID=.;OPOS=81274334;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:49:49:0:0:49:49:26:23:0:0:26:23:0:0 chr10 81275154 . G T 691.42 PASS AO=74;DP=74;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136788;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.1321;QD=37.8857;RBI=0.0254133;REFB=0;REVB=0.0214179;RO=0;SAF=21;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.66544e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.24792e-05;OID=.;OPOS=81275154;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:74:73:0:0:74:73:53:21:0:0:53:20:0:0 chr10 81275669 . A C 424.67 PASS AO=70;DP=92;FAO=69;FDP=94;FR=.;FRO=25;FSAF=38;FSAR=31;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=-0.0174131;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=28.9238;QD=18.0712;RBI=0.110045;REFB=-0.00502479;REVB=-0.108658;RO=22;SAF=40;SAR=30;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0297381;STB=0.534976;TYPE=snp;VARB=0.00821059;OID=.;OPOS=81275669;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:92:94:22:25:70:69:30:40:14:8:31:38:17:8 chr10 81275738 . C T 912.18 PASS AO=97;DP=100;FAO=98;FDP=100;FR=.;FRO=2;FSAF=44;FSAR=54;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.111021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.8405;QD=36.4872;RBI=0.111714;REFB=0.100704;REVB=0.0124216;RO=3;SAF=43;SAR=54;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0319392;STB=0.511109;TYPE=snp;VARB=-0.000893632;OID=.;OPOS=81275738;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:100:100:3:2:97:98:54:43:3:0:54:44:2:0 chr10 81275840 . A G 627.91 PASS AO=69;DP=71;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0482516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.687;QD=35.3749;RBI=0.0527204;REFB=-0.0727217;REVB=0.0212421;RO=0;SAF=22;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505153;TYPE=snp;VARB=0.00014973;OID=.;OPOS=81275840;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:71:71:0:1:69:70:47:22:0:0:48:22:0:1 chr10 81318663 . C G 441.67 PASS AO=48;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0567996;FXX=0.0384541;HRUN=2;LEN=1;MLLD=35.5785;QD=35.3335;RBI=0.104136;REFB=0;REVB=-0.0872813;RO=2;SAF=19;SAR=29;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0469715;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00319785;OID=.;OPOS=81318663;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:50:50:2:0:48:50:29:19:2:0:31:19:0:0 chr10 81319423 . C T 483.69 PASS AO=54;DP=56;FAO=54;FDP=56;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.105795;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.528;QD=34.5494;RBI=0.110148;REFB=-0.0951442;REVB=0.0306577;RO=2;SAF=25;SAR=29;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.031395;STB=0.516661;TYPE=snp;VARB=0.00291394;OID=.;OPOS=81319423;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:56:56:2:2:54:54:29:25:0:2:29:25:0:2 chr10 81319458 . C T 477.25 PASS AO=52;DP=56;FAO=53;FDP=55;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0133063;FXX=0.0350816;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.408;QD=34.7087;RBI=0.0145932;REFB=-0.0247635;REVB=0.00599206;RO=2;SAF=20;SAR=32;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0285316;STB=0.515146;TYPE=snp;VARB=1.56404e-05;OID=.;OPOS=81319458;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:56:55:2:2:52:53:32:20:0:2:32:21:0:2 chr10 81319483 . A G 451 PASS AO=50;DP=52;FAO=51;FDP=53;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0134436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.406;QD=34.0374;RBI=0.0265884;REFB=-0.0615651;REVB=0.0229393;RO=2;SAF=19;SAR=31;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0294058;STB=0.515619;TYPE=snp;VARB=0.00367679;OID=.;OPOS=81319483;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:52:53:2:2:50:51:31:19:0:2:31:20:0:2 chr10 81371341 . G T 226.64 PASS AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0491412;FXX=0.0384468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.1698;QD=36.2617;RBI=0.0544981;REFB=0;REVB=0.0235623;RO=1;SAF=17;SAR=8;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.026521;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0027099;OID=.;OPOS=81371341;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:26:25:1:0:25:25:8:17:1:0:8:17:0:0 chr10 81372081 . A G 986.52 PASS AO=103;DP=107;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0548513;FXX=0.0280348;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.636;QD=37.943;RBI=0.0980007;REFB=0;REVB=-0.0812125;RO=1;SAF=59;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.007975;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000172153;OID=.;OPOS=81372081;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:107:104:1:0:103:104:44:59:1:0:44:60:0:0 chr10 81373777 . C G,T 2807.82 PASS AO=44,243;DP=288;FAO=17,287;FDP=304;FR=.;FRO=0;FSAF=0,167;FSAR=17,120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0182408,0.00459475;FXX=0.00653573;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=19.2498,54.8353;QD=36.945;RBI=0.0308307,0.186274;REFB=-0.00465723,-0.0206807;REVB=0.0248557,0.186217;RO=1;SAF=25,143;SAR=19,100;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0240823,0.00474244;STB=0.5,0.5;TYPE=snp,snp;VARB=0.223528,-0.00011701;OID=.,.;OPOS=81373777,81373777;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 2/2:32:288:304:1:0:44,243:17,287:19,100:25,143:0:1:17,120:0,167:0:0 chr10 81701722 . T C 604.59 PASS AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0617724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.515;QD=37.7868;RBI=0.0618308;REFB=0;REVB=-0.00268675;RO=0;SAF=25;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30166e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000204685;OID=.;OPOS=81701722;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:64:64:0:0:64:64:39:25:0:0:39:25:0:0 chr10 81702538 . C T 79.13 PASS AO=27;DP=80;FAO=27;FDP=79;FR=.;FRO=52;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=38;FSRR=14;FWDB=0.117737;FXX=0.0124984;HRUN=3;LEN=1;MLLD=37.856;QD=4.00655;RBI=0.135753;REFB=-0.0190965;REVB=0.0675794;RO=52;SAF=14;SAR=13;SRF=37;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223224;STB=0.641271;TYPE=snp;VARB=0.038884;OID=.;OPOS=81702538;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:80:79:52:52:27:27:13:14:37:15:13:14:38:14 chr10 81706324 . A G 103.25 PASS AO=30;DP=75;FAO=30;FDP=76;FR=.;FRO=46;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=33;FWDB=0.0253752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.0508;QD=5.43443;RBI=0.0419808;REFB=0.00267098;REVB=0.0334438;RO=45;SAF=12;SAR=18;SRF=13;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125994;STB=0.576223;TYPE=snp;VARB=-0.00166511;OID=.;OPOS=81706324;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:76:45:46:30:30:18:12:13:32:18:12:13:33 chr10 81841692 . G T 1375.76 PASS AO=144;DP=144;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203404;FXX=0.0335548;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.317;QD=38.2156;RBI=0.0317374;REFB=-0.0147512;REVB=0.0243625;RO=0;SAF=56;SAR=88;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000332662;OID=.;OPOS=81841692;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:144:144:0:0:144:144:88:56:0:0:90:54:0:0 chr10 81904097 . G GAGA 24.44 PASS AO=11;DP=46;FAO=11;FDP=45;FR=.;FRO=34;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.00124762;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=3;MLLD=225.641;QD=2.17259;RBI=0.00176398;REFB=-0.000862819;REVB=-0.00124702;RO=34;SAF=6;SAR=5;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0162281;STB=0.510186;TYPE=ins;VARB=0.000438705;OID=.;OPOS=81904098;OREF=-;OALT=AGA;OMAPALT=GAGA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:11:46:11:45:34:6:5:19:15:24:34:6:5:19:15 chr10 81915136 . T C 387.99 PASS AO=87;DP=177;FAO=90;FDP=180;FR=.;FRO=90;FSAF=24;FSAR=66;FSRF=25;FSRR=65;FWDB=-0.0418558;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.831;QD=8.62191;RBI=0.0621212;REFB=0.00960646;REVB=0.0459036;RO=90;SAF=24;SAR=63;SRF=25;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00221004;STB=0.507054;TYPE=snp;VARB=-0.00406013;OID=.;OPOS=81915136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:180:90:90:87:90:63:24:25:65:66:24:25:65 chr10 81917423 . C T 89.99 PASS AO=21;DP=45;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=17;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=0.00657028;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.359;QD=7.99869;RBI=0.00969329;REFB=0.00667645;REVB=0.0071268;RO=23;SAF=17;SAR=4;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199599;STB=0.607031;TYPE=snp;VARB=-0.00733894;OID=.;OPOS=81917423;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:45:45:23:24:21:21:4:17:15:8:4:17:16:8 chr10 81926718 . A G 85.17 PASS AO=33;DP=108;FAO=35;FDP=111;FR=.;FRO=76;FSAF=25;FSAR=10;FSRF=55;FSRR=21;FWDB=-0.0147021;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.4434;QD=3.06922;RBI=0.0153713;REFB=-0.0386714;REVB=-0.00448621;RO=75;SAF=24;SAR=9;SRF=54;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0107787;STB=0.507932;TYPE=snp;VARB=0.0668575;OID=.;OPOS=81926718;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:108:111:75:76:33:35:9:24:54:21:10:25:55:21 chr10 81927059 . C T 12.88 PASS AO=5;DP=19;FAO=4;FDP=18;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=-0.0131935;FXX=0.0526039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.697;QD=2.86207;RBI=0.0137714;REFB=-0.00433186;REVB=-0.00394748;RO=13;SAF=3;SAR=2;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109988;STB=0.665926;TYPE=snp;VARB=0.0119535;OID=.;OPOS=81927059;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:19:18:13:14:5:4:2:3:9:4:2:2:10:4 chr10 82012748 . G A 30.44 PASS AO=9;DP=28;FAO=9;FDP=28;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.00056932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.911;QD=4.34848;RBI=0.0374927;REFB=-0.00545827;REVB=-0.0374884;RO=19;SAF=4;SAR=5;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0905072;STB=0.555432;TYPE=snp;VARB=0.0057768;OID=.;OPOS=82012748;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:28:28:19:19:9:9:5:4:10:9:5:4:10:9 chr10 82012791 . G T 72.81 PASS AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=14;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.0633233;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7129;QD=9.39545;RBI=0.0767958;REFB=-0.0338077;REVB=0.0434484;RO=15;SAF=14;SAR=2;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.358705;STB=0.708546;TYPE=snp;VARB=0.0692692;OID=.;OPOS=82012791;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:31:31:15:15:16:16:2:14:9:6:2:14:9:6 chr10 82012954 . A G 96.3 PASS AO=42;DP=140;FAO=42;FDP=140;FR=.;FRO=98;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=35;FSRR=63;FWDB=-0.0190997;FXX=0.0070917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.504;QD=2.75137;RBI=0.0216265;REFB=-0.00206168;REVB=-0.0101443;RO=96;SAF=16;SAR=26;SRF=35;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0207952;STB=0.51781;TYPE=snp;VARB=0.00432715;OID=.;OPOS=82012954;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:140:140:96:98:42:42:26:16:35:61:26:16:35:63 chr10 82012967 . G T 112.89 PASS AO=45;DP=140;FAO=45;FDP=141;FR=.;FRO=96;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=37;FSRR=59;FWDB=-0.00753356;FXX=0.00704176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.492;QD=3.20241;RBI=0.0201032;REFB=-0.0169205;REVB=0.0186382;RO=95;SAF=19;SAR=26;SRF=37;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.03961;STB=0.525876;TYPE=snp;VARB=0.0367146;OID=.;OPOS=82012967;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:141:95:96:45:45:26:19:37:58:26:19:37:59 chr10 82013022 . G A 123.63 PASS AO=49;DP=150;FAO=49;FDP=152;FR=.;FRO=103;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=51;FSRR=52;FWDB=-0.0225871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.6601;QD=3.2535;RBI=0.0282587;REFB=0.00164363;REVB=0.0169816;RO=101;SAF=26;SAR=23;SRF=50;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0414655;STB=0.524043;TYPE=snp;VARB=-0.00472531;OID=.;OPOS=82013022;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:152:101:103:49:49:23:26:50:51:23:26:51:52 chr10 82013119 . G A 204.15 PASS AO=73;DP=205;FAO=73;FDP=206;FR=.;FRO=133;FSAF=39;FSAR=34;FSRF=70;FSRR=63;FWDB=-0.0279459;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.751;QD=3.96416;RBI=0.0355784;REFB=-0.0182255;REVB=0.0220193;RO=132;SAF=39;SAR=34;SRF=70;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00447855;STB=0.505139;TYPE=snp;VARB=0.0354905;OID=.;OPOS=82013119;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:206:132:133:73:73:34:39:70:62:34:39:70:63 chr10 82033594 . G A 187.82 PASS AO=48;DP=106;FAO=48;FDP=106;FR=.;FRO=58;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=38;FSRR=20;FWDB=-0.0169803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.4404;QD=7.08744;RBI=0.0177686;REFB=-0.0321247;REVB=0.00523378;RO=58;SAF=25;SAR=23;SRF=38;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133011;STB=0.574059;TYPE=snp;VARB=0.0344689;OID=.;OPOS=82033594;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:58:58:48:48:23:25:38:20:23:25:38:20 chr10 82034842 . A G 145.95 PASS AO=33;DP=83;FAO=39;FDP=90;FR=.;FRO=51;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=34;FWDB=0.087525;FXX=0.0217368;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.9458;QD=6.48672;RBI=0.0875497;REFB=-0.0558235;REVB=0.00208058;RO=47;SAF=22;SAR=11;SRF=16;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.333041;STB=0.656538;TYPE=snp;VARB=0.0938475;OID=.;OPOS=82034842;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:90:47:51:33:39:11:22:16:31:15:24:17:34 chr10 82034854 . T C 178.69 PASS AO=42;DP=91;FAO=43;FDP=91;FR=.;FRO=48;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=31;FWDB=0.0291242;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.754;QD=7.85449;RBI=0.0305015;REFB=-0.00236044;REVB=-0.00906221;RO=49;SAF=24;SAR=18;SRF=18;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194829;STB=0.61832;TYPE=snp;VARB=0.00362219;OID=.;OPOS=82034854;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:49:48:42:43:18:24:18:31:18:25:17:31 chr10 82040052 . A G 102.59 PASS AO=26;DP=59;FAO=26;FDP=60;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=9;FWDB=0.0509263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.0747;QD=6.83949;RBI=0.0516388;REFB=-0.0103735;REVB=-0.0085483;RO=33;SAF=13;SAR=13;SRF=25;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.256609;STB=0.633238;TYPE=snp;VARB=0.013132;OID=.;OPOS=82040052;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:60:33:34:26:26:13:13:25:8:13:13:25:9 chr10 82045354 . G C 131.99 PASS AO=38;DP=95;FAO=38;FDP=94;FR=.;FRO=56;FSAF=9;FSAR=29;FSRF=26;FSRR=30;FWDB=-0.00430211;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.037;QD=5.61676;RBI=0.00534283;REFB=-0.0066336;REVB=-0.00316824;RO=56;SAF=9;SAR=29;SRF=26;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.273547;STB=0.656444;TYPE=snp;VARB=0.00956072;OID=.;OPOS=82045354;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:94:56:56:38:38:29:9:26:30:29:9:26:30 chr10 82095968 . T G 266.53 PASS AO=49;DP=81;FAO=49;FDP=81;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=35;FSRF=7;FSRR=25;FWDB=0.0024243;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=248.093;QD=13.1621;RBI=0.0118262;REFB=-0.00721537;REVB=-0.0115751;RO=31;SAF=14;SAR=35;SRF=7;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0535714;STB=0.53332;TYPE=snp;VARB=0.00456193;OID=.;OPOS=82095968;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:31:32:49:49:35:14:7:24:35:14:7:25 chr10 82192713 . T A 78.77 PASS AO=25;DP=72;FAO=26;FDP=73;FR=.;FRO=47;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=30;FSRR=17;FWDB=0.00687322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.385;QD=4.31605;RBI=0.0178204;REFB=-0.016175;REVB=0.0164415;RO=47;SAF=15;SAR=10;SRF=30;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0453327;STB=0.515683;TYPE=snp;VARB=0.0311714;OID=.;OPOS=82192713;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:72:73:47:47:25:26:10:15:30:17:10:16:30:17 chr10 82363340 . C A 210.4 PASS AO=45;DP=86;FAO=45;FDP=85;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=0.0132065;FXX=0.0116266;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.486;QD=9.90121;RBI=0.0160848;REFB=-0.0153598;REVB=0.00918204;RO=39;SAF=16;SAR=29;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116201;STB=0.571084;TYPE=snp;VARB=0.0108529;OID=.;OPOS=82363340;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:85:39:40:45:45:29:16:19:20:29:16:20:20 chr10 82363404 . A G 169.81 PASS AO=39;DP=80;FAO=39;FDP=80;FR=.;FRO=41;FSAF=8;FSAR=31;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=-0.0451356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.06;QD=8.49042;RBI=0.0745193;REFB=-0.0229753;REVB=-0.059295;RO=41;SAF=8;SAR=31;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.35412;STB=0.699136;TYPE=snp;VARB=0.0241668;OID=.;OPOS=82363404;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:41:41:39:39:31:8:22:19:31:8:22:19 chr10 85960395 . A G 143.23 PASS AO=28;DP=51;FAO=29;FDP=53;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.0167837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.2099;QD=10.8098;RBI=0.0324993;REFB=-0.00628803;REVB=0.0278301;RO=23;SAF=14;SAR=14;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0883058;STB=0.545423;TYPE=snp;VARB=0.0111148;OID=.;OPOS=85960395;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:53:23:24:28:29:14:14:9:14:14:15:10:14 chr10 85972043 . A G 37.32 PASS AO=22;DP=95;FAO=22;FDP=94;FR=.;FRO=72;FSAF=19;FSAR=3;FSRF=56;FSRR=16;FWDB=0.0144624;FXX=0.0105252;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.3173;QD=1.58799;RBI=0.0709992;REFB=-0.0054995;REVB=-0.0695106;RO=73;SAF=19;SAR=3;SRF=56;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202093;STB=0.615921;TYPE=snp;VARB=0.0382565;OID=.;OPOS=85972043;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:95:94:73:72:22:22:3:19:56:17:3:19:56:16 chr10 85974236 . T C 93.98 PASS AO=32;DP=92;FAO=32;FDP=92;FR=.;FRO=60;FSAF=7;FSAR=25;FSRF=22;FSRR=38;FWDB=0.0151244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.609;QD=4.08622;RBI=0.0246376;REFB=-0.00972085;REVB=-0.0194491;RO=60;SAF=7;SAR=25;SRF=22;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208168;STB=0.621701;TYPE=snp;VARB=0.0186526;OID=.;OPOS=85974236;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:92:92:60:60:32:32:25:7:22:38:25:7:22:38 chr10 85978939 . G A 314.5 PASS AO=73;DP=146;FAO=73;FDP=146;FR=.;FRO=73;FSAF=25;FSAR=48;FSRF=18;FSRR=55;FWDB=-0.0267506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.9915;QD=8.61633;RBI=0.0268689;REFB=-0.00599034;REVB=-0.00251788;RO=73;SAF=25;SAR=48;SRF=18;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10037;STB=0.555062;TYPE=snp;VARB=0.0116604;OID=.;OPOS=85978939;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:73:73:73:73:48:25:18:55:48:25:18:55 chr10 85978991 . C T 266.49 PASS AO=65;DP=133;FAO=64;FDP=133;FR=.;FRO=69;FSAF=17;FSAR=47;FSRF=19;FSRR=50;FWDB=-0.0142708;FXX=0.00746213;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.18;QD=8.01458;RBI=0.0144779;REFB=-0.0159689;REVB=0.00243971;RO=67;SAF=18;SAR=47;SRF=18;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00953168;STB=0.506433;TYPE=snp;VARB=0.0163387;OID=.;OPOS=85978991;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:67:69:65:64:47:18:18:49:47:17:19:50 chr10 85992478 . T C 106.01 PASS AO=26;DP=67;FAO=29;FDP=70;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=-0.0125767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.424;QD=6.05793;RBI=0.0461656;REFB=-0.0124264;REVB=0.0444194;RO=41;SAF=8;SAR=18;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.277133;STB=0.628796;TYPE=snp;VARB=0.023421;OID=.;OPOS=85992478;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:70:41:41:26:29:18:8:23:18:19:10:23:18 chr10 85992511 . T C 128.67 PASS AO=33;DP=74;FAO=33;FDP=75;FR=.;FRO=42;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=-0.0178267;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.5213;QD=6.86218;RBI=0.0327115;REFB=-0.00200771;REVB=0.0274272;RO=37;SAF=10;SAR=23;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.283771;STB=0.631135;TYPE=snp;VARB=0.00126238;OID=.;OPOS=85992511;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:75:37:42:33:33:23:10:22:15:23:10:22:20 chr10 85993836 . A G 423.69 PASS AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0531085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.916;QD=37.6611;RBI=0.053133;REFB=0;REVB=0.00161148;RO=0;SAF=10;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.64128e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000128906;OID=.;OPOS=85993836;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:45:45:0:0:45:45:35:10:0:0:35:10:0:0 chr10 85993910 . G A 95.35 PASS AO=20;DP=42;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=19;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.00358603;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.4861;QD=9.08055;RBI=0.0457608;REFB=-0.0448415;REVB=0.0456201;RO=22;SAF=2;SAR=18;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.447569;STB=0.747734;TYPE=snp;VARB=0.059209;OID=.;OPOS=85993910;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:42:42:22:21:20:21:18:2:9:13:19:2:8:13 chr10 86274871 . C T 3132.55 PASS AO=326;DP=326;FAO=326;FDP=326;FR=.;FRO=0;FSAF=137;FSAR=189;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0249378;FXX=0.00305801;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.928;QD=38.4363;RBI=0.0278878;REFB=0;REVB=0.0124834;RO=0;SAF=138;SAR=188;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.27733e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.152e-06;OID=.;OPOS=86274871;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:326:326:0:0:326:326:188:138:0:0:189:137:0:0 chr10 87359826 . A G 530.7 PASS AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0565983;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.288;QD=36.6002;RBI=0.0568617;REFB=0.143886;REVB=0.00546614;RO=1;SAF=15;SAR=42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0110991;STB=0.50588;TYPE=snp;VARB=-0.000747467;OID=.;OPOS=87359826;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:58:58:1:1:57:57:42:15:0:1:42:15:0:1 chr10 87898729 . G A 172.47 PASS AO=45;DP=102;FAO=45;FDP=102;FR=.;FRO=57;FSAF=13;FSAR=32;FSRF=13;FSRR=44;FWDB=0.0157636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.696;QD=6.76366;RBI=0.0430431;REFB=-0.0181157;REVB=0.0400527;RO=57;SAF=13;SAR=32;SRF=13;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0768058;STB=0.542839;TYPE=snp;VARB=0.0206526;OID=.;OPOS=87898729;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:57:57:45:45:32:13:13:44:32:13:13:44 chr10 88203068 . T C 1327.35 PASS AO=139;DP=143;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0051072;FXX=0.0138879;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.829;QD=37.3902;RBI=0.0618564;REFB=-0.0518817;REVB=0.0616452;RO=0;SAF=80;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46196e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.001892;OID=.;OPOS=88203068;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:143:142:0:0:139:142:59:80:0:0:62:80:0:0 chr10 88248288 . T C 26.49 PASS AO=8;DP=26;FAO=8;FDP=26;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.00543797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.3239;QD=4.07502;RBI=0.00973537;REFB=0.00318063;REVB=0.00807501;RO=18;SAF=6;SAR=2;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180179;STB=0.613332;TYPE=snp;VARB=-0.008711;OID=.;OPOS=88248288;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:26:26:18:18:8:8:2:6:11:7:2:6:11:7 chr10 88277457 . C T 476.15 PASS AO=96;DP=165;FAO=95;FDP=165;FR=.;FRO=70;FSAF=48;FSAR=47;FSRF=42;FSRR=28;FWDB=0.0115984;FXX=0.00602373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.628;QD=11.5429;RBI=0.0393625;REFB=-0.0196083;REVB=-0.0376149;RO=69;SAF=48;SAR=48;SRF=42;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0837159;STB=0.540221;TYPE=snp;VARB=0.0157019;OID=.;OPOS=88277457;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:165:69:70:96:95:48:48:42:27:47:48:42:28 chr10 88414570 . G A 37.01 PASS AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0.0666222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.8622;QD=10.5736;RBI=0.0204511;REFB=-0.00367808;REVB=0.0204511;RO=7;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0106922;OID=.;OPOS=88414570;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:14:14:7:7:7:7:7:0:0:7:7:0:0:7 chr10 88422116 . C T 940.34 PASS AO=110;DP=119;FAO=110;FDP=119;FR=.;FRO=9;FSAF=43;FSAR=67;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.0505285;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.504;QD=31.608;RBI=0.0667179;REFB=-0.159148;REVB=0.0435677;RO=5;SAF=43;SAR=67;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0351081;STB=0.530309;TYPE=snp;VARB=0.00268863;OID=.;OPOS=88422116;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:119:119:5:9:110:110:67:43:4:1:67:43:7:2 chr10 88422151 . C A 204.47 PASS AO=56;DP=131;FAO=56;FDP=131;FR=.;FRO=75;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=38;FSRR=37;FWDB=0.0350425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.863;QD=6.24329;RBI=0.0353073;REFB=0.00140126;REVB=-0.00431652;RO=72;SAF=30;SAR=26;SRF=37;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0220243;STB=0.51667;TYPE=snp;VARB=-0.00183951;OID=.;OPOS=88422151;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:72:75:56:56:26:30:37:35:26:30:38:37 chr10 88426614 . TC T 79.18 PASS AO=42;DP=103;FAO=43;FDP=93;FR=.;FRO=50;FSAF=29;FSAR=14;FSRF=31;FSRR=19;FWDB=0.0373197;FXX=0.0412329;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.5933;QD=3.4057;RBI=0.0637388;REFB=-0.0364373;REVB=0.0516709;RO=40;SAF=29;SAR=13;SRF=25;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0654266;STB=0.532539;TYPE=del;VARB=0.0758269;OID=.;OPOS=88426615;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:42:94:43:93:50:29:14:31:19:79:40:29:13:25:15 chr10 88683890 . T A 557.43 PASS AO=73;DP=86;FAO=73;FDP=86;FR=.;FRO=13;FSAF=33;FSAR=40;FSRF=11;FSRR=2;FWDB=-0.00413231;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=129.045;QD=25.9269;RBI=0.00414016;REFB=-0.0886897;REVB=0.000254856;RO=12;SAF=33;SAR=40;SRF=11;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122911;STB=0.559424;TYPE=snp;VARB=0.00233957;OID=.;OPOS=88683890;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:86:86:12:13:73:73:40:33:11:1:40:33:11:2 chr10 88702350 . G C 125.84 PASS AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0644647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.6957;QD=35.9532;RBI=0.0721883;REFB=0;REVB=0.0324877;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00513532;OID=.;OPOS=88702350;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:14:14:0:0:14:14:8:6:0:0:8:6:0:0 chr10 88717140 . T A 1061.24 PASS AO=112;DP=115;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00460649;FXX=0.0344798;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.3293;QD=37.9014;RBI=0.0111447;REFB=0;REVB=0.0101482;RO=0;SAF=88;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00240664;OID=.;OPOS=88717140;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:115:112:0:0:112:112:24:88:0:0:25:87:0:0 chr10 88717154 . C T 904.76 PASS AO=112;DP=128;FAO=113;FDP=128;FR=.;FRO=15;FSAF=76;FSAR=37;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0575119;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.962;QD=28.2738;RBI=0.0618402;REFB=-0.123853;REVB=0.0227285;RO=8;SAF=76;SAR=36;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0255823;STB=0.535369;TYPE=snp;VARB=0.00525991;OID=.;OPOS=88717154;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:128:128:8:15:112:113:36:76:4:4:37:76:6:9 chr10 88730106 . C T 116.19 PASS AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.0194;QD=35.75;RBI=0.0790393;REFB=0;REVB=0.0790393;RO=0;SAF=0;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00389236;OID=.;OPOS=88730106;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:13:0:0:13:13:13:0:0:0:13:0:0:0 chr10 88730176 . CA C,CG 107.9 PASS AO=6,6;DP=12;FAO=1,11;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=0,6;FSAR=1,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0534785,0.0699606;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=54.5627,67.0951;QD=35.9681;RBI=0.0623557,0.194613;REFB=0,0;REVB=0.0320669,0.181603;RO=0;SAF=0,6;SAR=6,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.0529542,0.00848637;OID=.,.;OPOS=88730177,88730177;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:6,6:12:1,11:12:0:0,6:1,5:0:0:4:0:0,6:6,0:0:0 chr10 88730312 . T C 291.72 PASS AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.030115;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.3368;QD=38.8961;RBI=0.0871676;REFB=0;REVB=-0.0818003;RO=0;SAF=19;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000968001;OID=.;OPOS=88730312;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:30:30:0:0:30:30:11:19:0:0:11:19:0:0 chr10 88768253 . A G 891.43 PASS AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0575367;FXX=0.0412329;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.9322;QD=38.3409;RBI=0.0821252;REFB=0;REVB=0.058601;RO=0;SAF=63;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.52795e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.9044e-06;OID=.;OPOS=88768253;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:93:93:0:0:93:93:30:63:0:0:30:63:0:0 chr10 88768423 . A G 231.74 PASS AO=24;DP=24;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0459866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.2904;QD=37.079;RBI=0.133376;REFB=0;REVB=0.125197;RO=0;SAF=15;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000824967;OID=.;OPOS=88768423;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:24:25:0:0:24:25:9:15:0:0:10:15:0:0 chr10 88768657 . C T 767.16 PASS AO=162;DP=163;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0482372;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.6529;QD=37.8842;RBI=0.0488228;REFB=0;REVB=0.00753898;RO=0;SAF=43;SAR=119;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.12517e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000231665;OID=.;OPOS=88768657;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:163:81:0:0:162:81:119:43:0:0:61:20:0:0 chr10 88782084 . A G 180.76 PASS AO=22;DP=24;FAO=22;FDP=24;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0938955;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.9098;QD=30.127;RBI=0.0984672;REFB=0.0175317;REVB=0.0296553;RO=2;SAF=13;SAR=9;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0921477;STB=0.549954;TYPE=snp;VARB=-0.0125999;OID=.;OPOS=88782084;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:24:24:2:2:22:22:9:13:0:2:9:13:0:2 chr10 88782151 . C T 94.72 PASS AO=10;DP=11;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0303229;FXX=0.0908265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6962;QD=37.8861;RBI=0.0759317;REFB=0;REVB=0.0696143;RO=0;SAF=8;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00143241;OID=.;OPOS=88782151;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:10:0:0:10:10:2:8:0:0:1:9:0:0 chr10 88939962 . T C 1574.84 PASS AO=164;DP=165;FAO=166;FDP=166;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=132;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00145962;FXX=0.00598767;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.045;QD=37.948;RBI=0.0122843;REFB=-0.0132105;REVB=0.0121972;RO=1;SAF=34;SAR=130;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0137876;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.19677e-05;OID=.;OPOS=88939962;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:165:166:1:0:164:166:130:34:1:0:132:34:0:0 chr10 89124905 . C T 70.76 PASS AO=9;DP=11;FAO=9;FDP=11;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0036639;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=145.723;QD=25.7294;RBI=0.0196602;REFB=-0.0140246;REVB=0.0193158;RO=2;SAF=4;SAR=5;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0179867;STB=0.510181;TYPE=snp;VARB=0.00505775;OID=.;OPOS=89124905;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:11:11:2:2:9:9:5:4:1:1:5:4:1:1 chr10 89124914 . T A 68.26 PASS AO=7;DP=8;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0561454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.5067;QD=30.3382;RBI=0.0608486;REFB=-0.00460858;REVB=-0.0234573;RO=1;SAF=3;SAR=4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124421;STB=0.555418;TYPE=snp;VARB=0.00181881;OID=.;OPOS=89124914;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:8:9:1:1:7:8:4:3:1:0:4:4:1:0 chr10 89267957 . C T 554.43 PASS AO=121;DP=227;FAO=121;FDP=227;FR=.;FRO=106;FSAF=63;FSAR=58;FSRF=58;FSRR=48;FWDB=0.0197441;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.15;QD=9.76961;RBI=0.0201137;REFB=-0.0133043;REVB=-0.0038382;RO=105;SAF=63;SAR=58;SRF=57;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0189432;STB=0.51241;TYPE=snp;VARB=0.010021;OID=.;OPOS=89267957;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:227:227:105:106:121:121:58:63:57:48:58:63:58:48 chr10 89420789 . A G 327.79 PASS AO=88;DP=202;FAO=89;FDP=202;FR=.;FRO=113;FSAF=28;FSAR=61;FSRF=40;FSRR=73;FWDB=0.0939303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.318;QD=6.49081;RBI=0.0942209;REFB=-0.0289047;REVB=0.00739383;RO=113;SAF=28;SAR=60;SRF=40;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.04092;STB=0.525058;TYPE=snp;VARB=0.0322647;OID=.;OPOS=89420789;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:202:113:113:88:89:60:28:40:73:61:28:40:73 chr10 89720633 . C T 83.49 PASS AO=17;DP=94;FAO=20;FDP=94;FR=.,HEALED;FRO=58;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=33;FSRR=25;FWDB=0.00890956;FXX=0.0873702;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.085;QD=3.55271;RBI=0.0207269;REFB=0.00225031;REVB=0.0187143;RO=23;SAF=13;SAR=4;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0898175;STB=0.606035;TYPE=snp;VARB=-0.0131295;OID=.;OPOS=89720633;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:86:94:23:58:17:20:4:13:16:7:6:14:33:25 chr10 90305177 . C T 223.01 PASS AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0443754;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.663;QD=37.168;RBI=0.066166;REFB=0;REVB=0.0490791;RO=0;SAF=8;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00111752;OID=.;OPOS=90305177;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:25:24:0:0:24:24:16:8:0:0:16:8:0:0 chr10 90342837 . C G 747.36 PASS AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=62;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0861294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.0397;QD=37.3681;RBI=0.0867607;REFB=-0.0290593;REVB=-0.0104469;RO=0;SAF=17;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.514282;TYPE=snp;VARB=0.000822741;OID=.;OPOS=90342837;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:80:80:0:1:79:79:62:17:0:0:62:17:1:0 chr10 90356598 . A G 2500.23 PASS AO=267;DP=281;FAO=270;FDP=270;FR=.;FRO=0;FSAF=135;FSAR=135;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00670253;FXX=0.0425517;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.237;QD=37.0404;RBI=0.0307754;REFB=-0.0795977;REVB=-0.0300366;RO=3;SAF=133;SAR=134;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106311;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000221651;OID=.;OPOS=90356598;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:91:281:270:3:0:267:270:134:133:3:0:135:135:0:0 chr10 90673024 . G A 215.17 PASS AO=73;DP=197;FAO=73;FDP=198;FR=.;FRO=125;FSAF=33;FSAR=40;FSRF=45;FSRR=80;FWDB=0.0122023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.2056;QD=4.34684;RBI=0.0122303;REFB=-0.0172822;REVB=-0.000827808;RO=123;SAF=33;SAR=40;SRF=44;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106991;STB=0.559306;TYPE=snp;VARB=0.0379569;OID=.;OPOS=90673024;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:198:123:125:73:73:40:33:44:79:40:33:45:80 chr10 90681048 . C T 256.11 PASS AO=52;DP=93;FAO=52;FDP=93;FR=.;FRO=41;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=27;FSRR=14;FWDB=-0.00540449;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=144.748;QD=11.0153;RBI=0.0283435;REFB=0.000978273;REVB=0.0278234;RO=41;SAF=23;SAR=29;SRF=27;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172534;STB=0.59447;TYPE=snp;VARB=-0.000457242;OID=.;OPOS=90681048;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:41:41:52:52:29:23:27:14:29:23:27:14 chr10 90771829 . T C 482.91 PASS AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.118197;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.1811;QD=37.1466;RBI=0.123158;REFB=0;REVB=0.0346026;RO=1;SAF=10;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0447794;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00225223;OID=.;OPOS=90771829;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:53:52:1:0:52:52:42:10:1:0:42:10:0:0 chr10 90823095 . CT C 31.19 PASS AO=14;DP=51;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=-0.055827;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=9.47535;QD=2.71174;RBI=0.16363;REFB=-0.0354934;REVB=0.153812;RO=22;SAF=11;SAR=3;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.487118;STB=0.701451;TYPE=del;VARB=0.0636902;OID=.;OPOS=90823096;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:14:46:19:46:27:14:5:11:16:31:22:11:3:7:15 chr10 91007360 . T G 294.23 PASS AO=48;DP=84;FAO=55;FDP=90;FR=.;FRO=35;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=0.0121868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.727;QD=13.077;RBI=0.0160553;REFB=-0.0129563;REVB=0.0104525;RO=35;SAF=21;SAR=27;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124937;STB=0.549357;TYPE=snp;VARB=0.00757106;OID=.;OPOS=91007360;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:90:35:35:48:55:27:21:21:14:29:26:21:14 chr10 91066769 . C A 186.79 PASS AO=59;DP=158;FAO=60;FDP=158;FR=.;FRO=98;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=42;FSRR=56;FWDB=-0.0135476;FXX=0.00628891;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.955;QD=4.72888;RBI=0.0430845;REFB=-0.0222311;REVB=-0.0408991;RO=98;SAF=26;SAR=33;SRF=43;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00212348;STB=0.513457;TYPE=snp;VARB=0.0331199;OID=.;OPOS=91066769;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:158:98:98:59:60:33:26:43:55:33:27:42:56 chr10 91162497 . A G 856.28 PASS AO=92;DP=93;FAO=92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=58;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00627195;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=234.533;QD=36.8291;RBI=0.00786942;REFB=0.0522363;REVB=-0.00475294;RO=1;SAF=34;SAR=58;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0137378;STB=0.507245;TYPE=snp;VARB=-5.4854e-05;OID=.;OPOS=91162497;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:93:93:1:1:92:92:58:34:1:0:58:34:1:0 chr10 91465171 . A G 429.36 PASS AO=110;DP=240;FAO=110;FDP=238;FR=.;FRO=128;FSAF=47;FSAR=63;FSRF=53;FSRR=75;FWDB=0.00733953;FXX=0.00833299;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.7912;QD=7.21615;RBI=0.0154268;REFB=-0.00849985;REVB=0.013569;RO=122;SAF=47;SAR=63;SRF=51;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00901252;STB=0.507272;TYPE=snp;VARB=0.0105612;OID=.;OPOS=91465171;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:240:238:122:128:110:110:63:47:51:71:63:47:53:75 chr10 91479211 . G T 123.56 PASS AO=25;DP=46;FAO=25;FDP=46;FR=.;FRO=21;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.0337598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9862;QD=10.7446;RBI=0.0555907;REFB=-0.0138505;REVB=0.0441655;RO=21;SAF=15;SAR=10;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0163068;STB=0.509084;TYPE=snp;VARB=0.0103003;OID=.;OPOS=91479211;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:46:46:21:21:25:25:10:15:13:8:10:15:13:8 chr10 91498127 . T C 287.27 PASS AO=67;DP=136;FAO=67;FDP=135;FR=.;FRO=68;FSAF=25;FSAR=42;FSRF=26;FSRR=42;FWDB=0.0131173;FXX=0.0073524;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.1501;QD=8.51158;RBI=0.0143688;REFB=-0.0160228;REVB=0.00586511;RO=68;SAF=25;SAR=42;SRF=26;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00896818;STB=0.504949;TYPE=snp;VARB=0.0173042;OID=.;OPOS=91498127;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:135:68:68:67:67:42:25:26:42:42:25:26:42 chr10 91522548 . A G 494.19 PASS AO=99;DP=174;FAO=99;FDP=172;FR=.;FRO=73;FSAF=48;FSAR=51;FSRF=40;FSRR=33;FWDB=-0.00838639;FXX=0.0114936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.418;QD=11.4927;RBI=0.0254973;REFB=-0.00898306;REVB=0.0240786;RO=73;SAF=48;SAR=51;SRF=40;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0492319;STB=0.526755;TYPE=snp;VARB=0.00672168;OID=.;OPOS=91522548;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:172:73:73:99:99:51:48:40:33:51:48:40:33 chr10 91738556 . C A 1892.54 PASS AO=204;DP=206;FAO=203;FDP=203;FR=.;FRO=0;FSAF=120;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0125359;FXX=0.0145624;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.9575;QD=37.2913;RBI=0.0587651;REFB=0.0405534;REVB=-0.0574125;RO=0;SAF=122;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.23207e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00247025;OID=.;OPOS=91738556;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:206:203:0:0:204:203:82:122:0:0:83:120:0:0 chr10 92503619 . T C 762.81 PASS AO=83;DP=87;FAO=83;FDP=85;FR=.;FRO=2;FSAF=55;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0169739;FXX=0.0229859;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.434;QD=35.8968;RBI=0.0598229;REFB=-0.0453403;REVB=0.0573643;RO=0;SAF=55;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504267;TYPE=snp;VARB=0.000638673;OID=.;OPOS=92503619;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:87:85:0:2:83:83:28:55:0:0:28:55:1:1 chr10 93390149 . C T 131.82 PASS AO=40;DP=103;FAO=40;FDP=103;FR=.;FRO=63;FSAF=32;FSAR=8;FSRF=30;FSRR=33;FWDB=-0.0246636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.671;QD=5.11922;RBI=0.0528757;REFB=-0.00974488;REVB=-0.0467712;RO=62;SAF=32;SAR=8;SRF=30;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.384137;STB=0.72554;TYPE=snp;VARB=0.0282281;OID=.;OPOS=93390149;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:62:63:40:40:8:32:30:32:8:32:30:33 chr10 93667635 . C T 975.09 PASS AO=105;DP=107;FAO=106;FDP=107;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=56;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0323699;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=210.105;QD=36.4518;RBI=0.032575;REFB=-0.0870148;REVB=-0.00364982;RO=1;SAF=49;SAR=56;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00958663;STB=0.50495;TYPE=snp;VARB=0.000330325;OID=.;OPOS=93667635;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:107:107:1:1:105:106:56:49:1:0:56:50:1:0 chr10 93668110 . T A 70.26 PASS AO=13;DP=23;FAO=13;FDP=23;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0664907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.0709;QD=12.2188;RBI=0.0666088;REFB=-0.0192419;REVB=0.0039657;RO=10;SAF=1;SAR=12;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.367221;STB=0.715989;TYPE=snp;VARB=0.00674473;OID=.;OPOS=93668110;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:23:23:10:10:13:13:12:1:3:7:12:1:3:7 chr10 93756883 . ACT A 138.93 PASS AO=40;DP=118;FAO=44;FDP=115;FR=.;FRO=71;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=45;FSRR=26;FWDB=0.003056;FXX=0.0416632;HRUN=1;LEN=2;MLLD=226.986;QD=4.83228;RBI=0.00440927;REFB=-0.004293;REVB=-0.00317845;RO=62;SAF=17;SAR=23;SRF=40;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232338;STB=0.609327;TYPE=del;VARB=0.0068076;OID=.;OPOS=93756884;OREF=CT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:40:110:44:115:71:20:24:45:26:99:62:17:23:40:22 chr10 93841227 . A G 1347.21 PASS AO=142;DP=143;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0536517;FXX=0.00694396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.364;QD=37.6841;RBI=0.0549034;REFB=-0.0494517;REVB=0.0116571;RO=0;SAF=67;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00030056;OID=.;OPOS=93841227;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:143:143:0:0:142:143:75:67:0:0:75:68:0:0 chr10 94031934 . G A 391.46 PASS AO=98;DP=208;FAO=98;FDP=209;FR=.;FRO=111;FSAF=46;FSAR=52;FSRF=60;FSRR=51;FWDB=-0.000837351;FXX=0.00947822;HRUN=5;LEN=1;MLLD=211.394;QD=7.49196;RBI=0.000847761;REFB=-0.00898798;REVB=-0.000132451;RO=109;SAF=46;SAR=52;SRF=60;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.077211;STB=0.537748;TYPE=snp;VARB=0.0102402;OID=.;OPOS=94031934;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:209:109:111:98:98:52:46:60:49:52:46:60:51 chr10 94112156 . G C 164.37 PASS AO=57;DP=163;FAO=58;FDP=164;FR=.;FRO=106;FSAF=24;FSAR=34;FSRF=54;FSRR=52;FWDB=-0.00184014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.0038;QD=4.00897;RBI=0.00789279;REFB=-0.0223761;REVB=-0.00767529;RO=104;SAF=23;SAR=34;SRF=52;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110428;STB=0.562319;TYPE=snp;VARB=0.0438994;OID=.;OPOS=94112156;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:164:104:106:57:58:34:23:52:52:34:24:54:52 chr10 94594565 . G A 631.34 PASS AO=127;DP=224;FAO=127;FDP=221;FR=.;FRO=94;FSAF=66;FSAR=61;FSRF=58;FSRR=36;FWDB=-0.0403891;FXX=0.0133923;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.9057;QD=11.427;RBI=0.042718;REFB=0.00786708;REVB=0.0139123;RO=92;SAF=66;SAR=61;SRF=56;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0692945;STB=0.541595;TYPE=snp;VARB=-0.00918436;OID=.;OPOS=94594565;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:224:221:92:94:127:127:61:66:56:36:61:66:58:36 chr10 94695617 . C T 195.85 PASS AO=50;DP=110;FAO=50;FDP=111;FR=.;FRO=61;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=37;FWDB=0.00622488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.955;QD=7.05753;RBI=0.0218724;REFB=-0.0015373;REVB=-0.0209678;RO=60;SAF=24;SAR=26;SRF=24;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0786747;STB=0.547807;TYPE=snp;VARB=0.00123752;OID=.;OPOS=94695617;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:111:60:61:50:50:26:24:24:36:26:24:24:37 chr10 94822686 . C T 22.01 PASS AO=6;DP=19;FAO=6;FDP=19;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.00866382;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.1237;QD=4.6345;RBI=0.0490643;REFB=-0.0310993;REVB=-0.0482933;RO=12;SAF=3;SAR=3;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0883056;STB=0.578691;TYPE=snp;VARB=0.0814627;OID=.;OPOS=94822686;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:19:19:12:13:6:6:3:3:7:5:3:3:8:5 chr10 94824136 . AG A 503.65 PASS AO=72;DP=86;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.14793;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.7358;QD=23.7013;RBI=0.182896;REFB=-0.0370387;REVB=-0.107553;RO=7;SAF=58;SAR=14;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0.487603;SSSB=0.0598566;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0104936;OID=.;OPOS=94824137;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:72:84:85:85:0:64:21:0:0:36:7:58:14:4:3 chr10 95072906 . T C 781.75 PASS AO=160;DP=288;FAO=162;FDP=290;FR=.;FRO=128;FSAF=90;FSAR=72;FSRF=51;FSRR=77;FWDB=0.0035354;FXX=0.00343631;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.908;QD=10.7827;RBI=0.00460004;REFB=-0.00985823;REVB=0.00294301;RO=128;SAF=89;SAR=71;SRF=51;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128694;STB=0.569128;TYPE=snp;VARB=0.00796412;OID=.;OPOS=95072906;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:288:290:128:128:160:162:71:89:51:77:72:90:51:77 chr10 95083039 . C T 374.31 PASS AO=117;DP=304;FAO=117;FDP=295;FR=.;FRO=178;FSAF=11;FSAR=106;FSRF=40;FSRR=138;FWDB=0.0127198;FXX=0.0296043;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.857;QD=5.07538;RBI=0.0137547;REFB=0.00433403;REVB=0.00523426;RO=153;SAF=11;SAR=106;SRF=39;SRR=114;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.327761;STB=0.668197;TYPE=snp;VARB=-0.007888;OID=.;OPOS=95083039;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:304:295:153:178:117:117:106:11:39:114:106:11:40:138 chr10 95168634 . A G 626.73 PASS AO=133;DP=242;FAO=133;FDP=243;FR=.;FRO=110;FSAF=73;FSAR=60;FSRF=48;FSRR=62;FWDB=0.0327902;FXX=0.0121946;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.783;QD=10.3165;RBI=0.0402757;REFB=-0.0374739;REVB=-0.0233867;RO=108;SAF=73;SAR=60;SRF=47;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0935718;STB=0.550902;TYPE=snp;VARB=0.0261889;OID=.;OPOS=95168634;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:242:243:108:110:133:133:60:73:47:61:60:73:48:62 chr10 95237963 . A G 1912.36 PASS AO=244;DP=277;FAO=242;FDP=275;FR=.;FRO=33;FSAF=23;FSAR=219;FSRF=0;FSRR=33;FWDB=-0.0212969;FXX=0.00721996;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.4403;QD=27.8161;RBI=0.0355124;REFB=-0.0108479;REVB=-0.0284178;RO=31;SAF=23;SAR=221;SRF=0;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0623224;STB=0.535029;TYPE=snp;VARB=0.00821767;OID=.;OPOS=95237963;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:277:275:31:33:244:242:221:23:0:31:219:23:0:33 chr10 95262981 . A G 1153.64 PASS AO=124;DP=126;FAO=124;FDP=126;FR=.;FRO=2;FSAF=59;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0020827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.4371;QD=36.6236;RBI=0.0359642;REFB=-0.130521;REVB=0.0359038;RO=2;SAF=59;SAR=65;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0143929;STB=0.507575;TYPE=snp;VARB=0.00191517;OID=.;OPOS=95262981;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:126:126:2:2:124:124:65:59:0:2:65:59:0:2 chr10 95279506 . A T 1665.28 PASS AO=173;DP=173;FAO=174;FDP=174;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017509;FXX=0.00571396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.518;QD=38.2823;RBI=0.0209575;REFB=0;REVB=0.0115174;RO=0;SAF=95;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000167987;OID=.;OPOS=95279506;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:173:174:0:0:173:174:78:95:0:0:78:96:0:0 chr10 95279653 . A G 1358.39 PASS AO=144;DP=145;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287394;FXX=0.00689608;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.0209;QD=37.733;RBI=0.0289246;REFB=-0.0224744;REVB=-0.00326755;RO=0;SAF=61;SAR=83;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.83325e-05;OID=.;OPOS=95279653;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:145:144:0:0:144:144:83:61:0:0:83:61:0:0 chr10 95433124 . A G 760.53 PASS AO=84;DP=88;FAO=85;FDP=89;FR=.;FRO=4;FSAF=17;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0693693;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.503;QD=34.181;RBI=0.0705288;REFB=-0.0579329;REVB=-0.0127359;RO=4;SAF=16;SAR=68;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0270507;STB=0.514282;TYPE=snp;VARB=0.001457;OID=.;OPOS=95433124;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:88:89:4:4:84:85:68:16:0:4:68:17:0:4 chr10 95441272 . G A 187.73 PASS AO=48;DP=109;FAO=49;FDP=110;FR=.;FRO=61;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=37;FWDB=0.00914865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.818;QD=6.82639;RBI=0.0131048;REFB=-0.0155772;REVB=0.00938289;RO=60;SAF=22;SAR=26;SRF=23;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0756197;STB=0.542476;TYPE=snp;VARB=0.0199104;OID=.;OPOS=95441272;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:110:60:61:48:49:26:22:23:37:26:23:24:37 chr10 95454681 . G C 355.22 PASS AO=86;DP=181;FAO=86;FDP=179;FR=.;FRO=93;FSAF=25;FSAR=61;FSRF=28;FSRR=65;FWDB=0.00589437;FXX=0.0110491;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.102;QD=7.93778;RBI=0.00589438;REFB=-0.0252116;REVB=8.26893e-06;RO=92;SAF=25;SAR=61;SRF=28;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0153821;STB=0.5065;TYPE=snp;VARB=0.0204119;OID=.;OPOS=95454681;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:179:92:93:86:86:61:25:28:64:61:25:28:65 chr10 95458141 . A G 392.08 PASS AO=83;DP=157;FAO=85;FDP=159;FR=.;FRO=74;FSAF=30;FSAR=55;FSRF=38;FSRR=36;FWDB=0.0208861;FXX=0.0185174;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.796;QD=9.86369;RBI=0.0248021;REFB=-0.00297036;REVB=-0.013376;RO=74;SAF=28;SAR=55;SRF=38;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159434;STB=0.578034;TYPE=snp;VARB=0.00254238;OID=.;OPOS=95458141;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:159:74:74:83:85:55:28:38:36:55:30:38:36 chr10 95459817 . C T 2528.76 PASS AO=265;DP=268;FAO=265;FDP=265;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=170;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0186839;FXX=0.0111936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.414;QD=38.17;RBI=0.041632;REFB=-0.0520718;REVB=0.037204;RO=1;SAF=95;SAR=170;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00279641;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000408429;OID=.;OPOS=95459817;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:268:265:1:0:265:265:170:95:0:1:170:95:0:0 chr10 95552653 . T C 1394.26 PASS AO=142;DP=145;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00662782;FXX=0.0129862;HRUN=4;LEN=1;MLLD=87.4956;QD=36.691;RBI=0.0224986;REFB=-0.09941;REVB=0.0215002;RO=0;SAF=59;SAR=83;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.47406e-05;OID=.;OPOS=95552653;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:145:152:0:0:142:152:83:59:0:0:93:59:0:0 chr10 95718600 . T C 83.3 PASS AO=31;DP=95;FAO=31;FDP=95;FR=.;FRO=64;FSAF=8;FSAR=23;FSRF=11;FSRR=53;FWDB=0.0110075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.432;QD=3.50725;RBI=0.0292003;REFB=-0.0205761;REVB=0.0270461;RO=64;SAF=8;SAR=23;SRF=11;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14239;STB=0.581771;TYPE=snp;VARB=0.0262778;OID=.;OPOS=95718600;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:95:95:64:64:31:31:23:8:11:53:23:8:11:53 chr10 95720490 . C T 706.73 PASS AO=163;DP=321;FAO=163;FDP=320;FR=.;FRO=157;FSAF=64;FSAR=99;FSRF=94;FSRR=63;FWDB=-0.0175425;FXX=0.00311517;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.51;QD=8.83416;RBI=0.0261791;REFB=0.017113;REVB=-0.0194321;RO=156;SAF=64;SAR=99;SRF=93;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182512;STB=0.601372;TYPE=snp;VARB=-0.0128849;OID=.;OPOS=95720490;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:321:320:156:157:163:163:99:64:93:63:99:64:94:63 chr10 95720501 . T C 560.07 PASS AO=135;DP=292;FAO=136;FDP=281;FR=.;FRO=145;FSAF=53;FSAR=83;FSRF=80;FSRR=65;FWDB=-0.0226512;FXX=0.0376699;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.412;QD=7.97255;RBI=0.0239325;REFB=0.00838256;REVB=0.00772569;RO=133;SAF=52;SAR=83;SRF=76;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17024;STB=0.584587;TYPE=snp;VARB=-0.00951784;OID=.;OPOS=95720501;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:292:281:133:145:135:136:83:52:76:57:83:53:80:65 chr10 96039597 . G C 161.74 PASS AO=47;DP=133;FAO=53;FDP=139;FR=.;FRO=86;FSAF=16;FSAR=37;FSRF=24;FSRR=62;FWDB=0.000273651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.203;QD=4.65436;RBI=0.00967476;REFB=-0.0127272;REVB=-0.00967089;RO=86;SAF=16;SAR=31;SRF=24;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0796969;STB=0.516965;TYPE=snp;VARB=0.0186169;OID=.;OPOS=96039597;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:139:86:86:47:53:31:16:24:62:37:16:24:62 chr10 96058298 . C T 342.94 PASS AO=79;DP=157;FAO=79;FDP=158;FR=.;FRO=79;FSAF=21;FSAR=58;FSRF=26;FSRR=53;FWDB=0.0450854;FXX=0.00628891;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.074;QD=8.68191;RBI=0.0450854;REFB=-0.00744526;REVB=-2.28176e-06;RO=78;SAF=21;SAR=58;SRF=26;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0748227;STB=0.539045;TYPE=snp;VARB=0.00493144;OID=.;OPOS=96058298;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:158:78:79:79:79:58:21:26:52:58:21:26:53 chr10 96066341 . A G 405 PASS AO=99;DP=207;FAO=99;FDP=206;FR=.;FRO=107;FSAF=34;FSAR=65;FSRF=51;FSRR=56;FWDB=0.00657338;FXX=0.00483068;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.167;QD=7.86406;RBI=0.0119957;REFB=-0.00806258;REVB=0.0100344;RO=106;SAF=34;SAR=65;SRF=51;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136144;STB=0.573177;TYPE=snp;VARB=0.0083354;OID=.;OPOS=96066341;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:206:106:107:99:99:65:34:51:55:65:34:51:56 chr10 96106240 . G C 124.77 PASS AO=37;DP=94;FAO=37;FDP=94;FR=.;FRO=57;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=34;FSRR=23;FWDB=0.000399053;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.777;QD=5.30913;RBI=0.00203142;REFB=-0.0197986;REVB=0.00199184;RO=57;SAF=17;SAR=20;SRF=34;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145358;STB=0.58248;TYPE=snp;VARB=0.0164504;OID=.;OPOS=96106240;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:57:57:37:37:20:17:34:23:20:17:34:23 chr10 96122543 . A G 239.19 PASS AO=54;DP=111;FAO=55;FDP=111;FR=.;FRO=56;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=32;FSRR=24;FWDB=-0.0390595;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.0259;QD=8.61958;RBI=0.0605271;REFB=0.00307349;REVB=0.0462372;RO=56;SAF=28;SAR=26;SRF=33;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0653653;STB=0.52239;TYPE=snp;VARB=-0.00450068;OID=.;OPOS=96122543;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:56:56:54:55:26:28:33:23:26:29:32:24 chr10 96313960 . A C 529.8 PASS AO=137;DP=295;FAO=137;FDP=297;FR=.;FRO=160;FSAF=42;FSAR=95;FSRF=57;FSRR=103;FWDB=0.0116676;FXX=0.00335559;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.521;QD=7.13533;RBI=0.0169871;REFB=-0.00685075;REVB=-0.0123462;RO=158;SAF=42;SAR=95;SRF=57;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0601259;STB=0.530722;TYPE=snp;VARB=0.00638189;OID=.;OPOS=96313960;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:295:297:158:160:137:137:95:42:57:101:95:42:57:103 chr10 96493058 . C T 415.44 PASS AO=91;DP=172;FAO=91;FDP=171;FR=.;FRO=80;FSAF=44;FSAR=47;FSRF=33;FSRR=47;FWDB=-0.0456186;FXX=0.00581362;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.1542;QD=9.71792;RBI=0.0846977;REFB=-0.039298;REVB=-0.0713628;RO=80;SAF=44;SAR=47;SRF=33;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.060951;STB=0.533326;TYPE=snp;VARB=0.0326608;OID=.;OPOS=96493058;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:171:80:80:91:91:47:44:33:47:47:44:33:47 chr10 96541616 . G A 846.57 PASS AO=103;DP=196;FAO=105;FDP=190;FR=.,HEALED;FRO=44;FSAF=54;FSAR=51;FSRF=40;FSRR=4;FWDB=-0.0052554;FXX=0.0206175;HRUN=3;LEN=1;MLLD=234.687;QD=17.8225;RBI=0.0325313;REFB=-8.5064e-05;REVB=-0.0321039;RO=44;SAF=53;SAR=50;SRF=40;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222823;STB=0.617444;TYPE=snp;VARB=0.0109814;OID=.;OPOS=96541616;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:191:190:44:44:103:105:50:53:40:4:51:54:40:4 chr10 96602622 . C T 347.3 PASS AO=93;DP=210;FAO=94;FDP=213;FR=.;FRO=119;FSAF=62;FSAR=32;FSRF=81;FSRR=38;FWDB=0.0300914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.757;QD=6.52199;RBI=0.0430516;REFB=0.00164108;REVB=0.0307887;RO=117;SAF=63;SAR=30;SRF=80;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0072964;STB=0.513232;TYPE=snp;VARB=-0.00169113;OID=.;OPOS=96602622;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:210:213:117:119:93:94:30:63:80:37:32:62:81:38 chr10 96818119 . G C 565.09 PASS AO=112;DP=195;FAO=113;FDP=196;FR=.;FRO=83;FSAF=44;FSAR=69;FSRF=42;FSRR=41;FWDB=-0.00402093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.224;QD=11.5324;RBI=0.0189287;REFB=-0.00169642;REVB=0.0184967;RO=80;SAF=43;SAR=69;SRF=40;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0919247;STB=0.550761;TYPE=snp;VARB=0.00130204;OID=.;OPOS=96818119;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:196:80:83:112:113:69:43:40:40:69:44:42:41 chr10 96827178 . T C 1630.71 PASS AO=176;DP=182;FAO=176;FDP=179;FR=.;FRO=3;FSAF=101;FSAR=75;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0163992;FXX=0.0164826;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.219;QD=36.4406;RBI=0.0335499;REFB=-0.0982148;REVB=0.0292689;RO=1;SAF=101;SAR=75;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0063047;STB=0.501591;TYPE=snp;VARB=0.000240725;OID=.;OPOS=96827178;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:182:179:1:3:176:176:75:101:0:1:75:101:2:1 chr10 96954298 . A G 340.79 PASS AO=68;DP=125;FAO=71;FDP=129;FR=.;FRO=58;FSAF=2;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=58;FWDB=-0.0173606;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.2213;QD=10.567;RBI=0.0625889;REFB=-0.0670289;REVB=0.060133;RO=57;SAF=2;SAR=66;SRF=0;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.282478;STB=0.647929;TYPE=snp;VARB=0.0548961;OID=.;OPOS=96954298;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:129:57:58:68:71:66:2:0:57:69:2:0:58 chr10 96954360 . T A 226.47 PASS AO=50;DP=97;FAO=50;FDP=97;FR=.;FRO=47;FSAF=0;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=47;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.265;QD=9.33915;RBI=0.000555315;REFB=-0.00403425;REVB=-0.000555315;RO=47;SAF=0;SAR=50;SRF=0;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00631952;OID=.;OPOS=96954360;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:47:47:50:50:50:0:0:47:50:0:0:47 chr10 97072008 . T C 1413.64 PASS AO=153;DP=159;FAO=155;FDP=160;FR=.;FRO=5;FSAF=90;FSAR=65;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.00514467;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.909;QD=35.341;RBI=0.0337305;REFB=-0.028247;REVB=0.0333358;RO=5;SAF=89;SAR=64;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0234885;STB=0.512163;TYPE=snp;VARB=0.000511303;OID=.;OPOS=97072008;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:159:160:5:5:153:155:64:89:1:4:65:90:1:4 chr10 97074887 . T C 134.28 PASS AO=34;DP=80;FAO=35;FDP=81;FR=.;FRO=46;FSAF=2;FSAR=33;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=-0.0388542;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.0638;QD=6.63095;RBI=0.0489379;REFB=-0.00669959;REVB=0.0297535;RO=46;SAF=2;SAR=32;SRF=18;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.582089;STB=0.843725;TYPE=snp;VARB=0.0164728;OID=.;OPOS=97074887;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:81:46:46:34:35:32:2:18:28:33:2:18:28 chr10 97078098 . AT A 23.23 PASS AO=27;DP=83;FAO=26;FDP=82;FR=.;FRO=56;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=35;FSRR=21;FWDB=-0.00634906;FXX=0.0120467;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.9868;QD=1.13335;RBI=0.0785368;REFB=-0.0718839;REVB=-0.0782797;RO=50;SAF=8;SAR=19;SRF=32;SRR=18;SSEN=0.38209;SSEP=0;SSSB=-0.379835;STB=0.686099;TYPE=del;VARB=0.0690656;OID=.;OPOS=97078099;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:27:83:26:82:56:9:17:35:21:23:50:8:19:32:18 chr10 97106165 . T C 335.57 PASS AO=79;DP=162;FAO=79;FDP=161;FR=.;FRO=82;FSAF=48;FSAR=31;FSRF=49;FSRR=33;FWDB=-0.0277759;FXX=0.00617246;HRUN=3;LEN=1;MLLD=110.254;QD=8.33711;RBI=0.035599;REFB=-0.0180849;REVB=-0.0222664;RO=80;SAF=48;SAR=31;SRF=48;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00725954;STB=0.505345;TYPE=snp;VARB=0.0172205;OID=.;OPOS=97106165;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:161:80:82:79:79:31:48:48:32:31:48:49:33 chr10 97116219 . C T 82.15 PASS AO=20;DP=49;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=0.0173492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.8983;QD=6.57175;RBI=0.104736;REFB=-0.014443;REVB=0.103289;RO=29;SAF=12;SAR=8;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0147169;STB=0.508764;TYPE=snp;VARB=0.0194968;OID=.;OPOS=97116219;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:49:50:29:29:20:21:8:12:17:12:9:12:17:12 chr10 97127462 . C A 205.53 PASS AO=45;DP=87;FAO=45;FDP=87;FR=.;FRO=42;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=-0.0163567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.739;QD=9.44978;RBI=0.0250212;REFB=-0.0156851;REVB=0.0189346;RO=41;SAF=27;SAR=18;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00878907;STB=0.502391;TYPE=snp;VARB=0.0125572;OID=.;OPOS=97127462;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:41:42:45:45:18:27:25:16:18:27:25:17 chr10 97174164 . A G 222.69 PASS AO=45;DP=107;FAO=57;FDP=118;FR=.;FRO=61;FSAF=44;FSAR=13;FSRF=36;FSRR=25;FWDB=-0.0104358;FXX=0.00840265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.249;QD=7.54871;RBI=0.0704042;REFB=-0.0597056;REVB=0.0696265;RO=60;SAF=43;SAR=2;SRF=36;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.64235;STB=0.616475;TYPE=snp;VARB=0.0578431;OID=.;OPOS=97174164;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:118:60:61:45:57:2:43:36:24:13:44:36:25 chr10 97174306 . G A 135.1 PASS AO=35;DP=97;FAO=37;FDP=91;FR=.;FRO=54;FSAF=28;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=35;FWDB=-0.00505135;FXX=0.0714213;HRUN=4;LEN=1;MLLD=126.885;QD=5.93863;RBI=0.0486964;REFB=-0.0124131;REVB=-0.0484337;RO=39;SAF=28;SAR=7;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.410248;STB=0.744277;TYPE=snp;VARB=0.00529336;OID=.;OPOS=97174306;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:91:39:54:35:37:7:28:16:23:9:28:19:35 chr10 97192324 . A G 2209.06 PASS AO=257;DP=268;FAO=253;FDP=268;FR=.;FRO=15;FSAF=84;FSAR=169;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.0050315;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3688;QD=32.971;RBI=0.0141987;REFB=-0.0347874;REVB=-0.0132774;RO=7;SAF=88;SAR=169;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00482384;STB=0.520817;TYPE=snp;VARB=0.00430221;OID=.;OPOS=97192324;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:268:268:7:15:257:253:169:88:3:4:169:84:10:5 chr10 97387248 . A G 219.21 PASS AO=56;DP=123;FAO=56;FDP=123;FR=.;FRO=67;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=27;FSRR=40;FWDB=0.00111983;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.135;QD=7.1289;RBI=0.0161739;REFB=-0.0391901;REVB=0.016135;RO=67;SAF=29;SAR=27;SRF=27;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112071;STB=0.562351;TYPE=snp;VARB=0.0404046;OID=.;OPOS=97387248;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:67:67:56:56:27:29:27:40:27:29:27:40 chr10 97388162 . G A 197.95 PASS AO=43;DP=81;FAO=42;FDP=80;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=12;FSRR=26;FWDB=-0.0566725;FXX=0.0123442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.394;QD=9.89741;RBI=0.0647818;REFB=0.0183207;REVB=0.0313834;RO=37;SAF=18;SAR=25;SRF=11;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106787;STB=0.544577;TYPE=snp;VARB=-0.0158766;OID=.;OPOS=97388162;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:80:37:38:43:42:25:18:11:26:25:17:12:26 chr10 97447110 . A G 49.33 PASS AO=17;DP=53;FAO=17;FDP=53;FR=.;FRO=36;FSAF=1;FSAR=16;FSRF=5;FSRR=31;FWDB=0.00864392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.966;QD=3.72285;RBI=0.00949905;REFB=0.00232467;REVB=-0.00393886;RO=34;SAF=1;SAR=16;SRF=5;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.293111;STB=0.671073;TYPE=snp;VARB=-0.00490284;OID=.;OPOS=97447110;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:53:53:34:36:17:17:16:1:5:29:16:1:5:31 chr10 97632082 . C T 440.52 PASS AO=107;DP=222;FAO=107;FDP=221;FR=.;FRO=114;FSAF=48;FSAR=59;FSRF=62;FSRR=52;FWDB=-0.0106218;FXX=0.0045043;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.898;QD=7.97315;RBI=0.0168376;REFB=-0.00927167;REVB=0.0130645;RO=114;SAF=48;SAR=59;SRF=62;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.089257;STB=0.549153;TYPE=snp;VARB=0.00994221;OID=.;OPOS=97632082;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:221:114:114:107:107:59:48:62:52:59:48:62:52 chr10 97697822 . G C 169.12 PASS AO=43;DP=95;FAO=43;FDP=95;FR=.;FRO=52;FSAF=33;FSAR=10;FSRF=47;FSRR=5;FWDB=0.0119686;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.023;QD=7.1207;RBI=0.0215245;REFB=0.0021387;REVB=-0.0178901;RO=52;SAF=33;SAR=10;SRF=47;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214098;STB=0.617715;TYPE=snp;VARB=-0.00299259;OID=.;OPOS=97697822;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:52:52:43:43:10:33:47:5:10:33:47:5 chr10 97698338 . G A 113.16 PASS AO=41;DP=121;FAO=41;FDP=121;FR=.;FRO=80;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=38;FSRR=42;FWDB=-0.0198512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.495;QD=3.74082;RBI=0.0216018;REFB=-0.0114646;REVB=-0.00851883;RO=78;SAF=17;SAR=24;SRF=38;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0835688;STB=0.540521;TYPE=snp;VARB=0.0333324;OID=.;OPOS=97698338;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:78:80:41:41:24:17:38:40:24:17:38:42 chr10 97698370 . C T 421.35 PASS AO=66;DP=112;FAO=79;FDP=125;FR=.;FRO=46;FSAF=36;FSAR=43;FSRF=19;FSRR=27;FWDB=0.0357006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.469;QD=13.4832;RBI=0.048865;REFB=-0.0399333;REVB=0.0333655;RO=46;SAF=31;SAR=35;SRF=19;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0430125;STB=0.515861;TYPE=snp;VARB=0.0279264;OID=.;OPOS=97698370;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:125:46:46:66:79:35:31:19:27:43:36:19:27 chr10 97772358 . A G 247.8 PASS AO=75;DP=188;FAO=75;FDP=187;FR=.;FRO=112;FSAF=35;FSAR=40;FSRF=67;FSRR=45;FWDB=0.0380567;FXX=0.00531887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.541;QD=5.30049;RBI=0.0381424;REFB=-0.0206664;REVB=-0.00255456;RO=112;SAF=35;SAR=40;SRF=67;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139536;STB=0.578293;TYPE=snp;VARB=0.02954;OID=.;OPOS=97772358;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:187:112:112:75:75:40:35:67:45:40:35:67:45 chr10 97917843 . C T 144.13 PASS AO=36;DP=80;FAO=36;FDP=80;FR=.;FRO=44;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=0.00832468;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=160.324;QD=7.20651;RBI=0.0108847;REFB=-0.0100315;REVB=-0.00701252;RO=44;SAF=15;SAR=21;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104651;STB=0.558791;TYPE=snp;VARB=0.0118653;OID=.;OPOS=97917843;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:44:44:36:36:21:15:23:21:21:15:23:21 chr10 97919550 . T G 64.58 PASS AO=21;DP=61;FAO=21;FDP=61;FR=.;FRO=40;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=28;FWDB=0.00112104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.9492;QD=4.23445;RBI=0.043429;REFB=-0.0247055;REVB=-0.0434145;RO=39;SAF=7;SAR=14;SRF=12;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.032576;STB=0.524977;TYPE=snp;VARB=0.0416608;OID=.;OPOS=97919550;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:61:61:39:40:21:21:14:7:12:27:14:7:12:28 chr10 97919839 . A T 15.44 PASS AO=8;DP=36;FAO=8;FDP=37;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=-0.00720884;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=82.4114;QD=1.66898;RBI=0.00830054;REFB=0.00405866;REVB=0.0041148;RO=23;SAF=5;SAR=3;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0342276;STB=0.618729;TYPE=snp;VARB=-0.00598248;OID=.;OPOS=97919839;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:36:37:23:29:8:8:3:5:15:8:2:6:18:11 chr10 97920099 . T TC 978.53 PASS AO=122;DP=137;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0662214;FXX=0.0218962;HRUN=1;LEN=1;MLLD=22.8482;QD=29.2099;RBI=0.201231;REFB=0;REVB=0.190023;RO=11;SAF=69;SAR=53;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0748357;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00182242;OID=.;OPOS=97920100;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:122:137:134:134:0:70:64:0:0:85:11:69:53:1:10 chr10 97990583 . A G 126.61 PASS AO=24;DP=67;FAO=34;FDP=77;FR=.;FRO=43;FSAF=2;FSAR=32;FSRF=10;FSRR=33;FWDB=-0.000580267;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.111;QD=6.5773;RBI=0.0152169;REFB=-0.0483594;REVB=0.0152058;RO=37;SAF=3;SAR=21;SRF=10;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263186;STB=0.746887;TYPE=snp;VARB=0.0600032;OID=.;OPOS=97990583;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:77:37:43:24:34:21:3:10:27:32:2:10:33 chr10 98078127 . C T 1596.06 PASS AO=169;DP=177;FAO=176;FDP=179;FR=.;FRO=3;FSAF=105;FSAR=71;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0217771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.1336;QD=35.6662;RBI=0.0367001;REFB=-0.0935785;REVB=0.0295407;RO=8;SAF=103;SAR=66;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0432533;STB=0.504575;TYPE=snp;VARB=0.00261392;OID=.;OPOS=98078127;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:177:179:8:3:169:176:66:103:1:7:71:105:1:2 chr10 98078239 . A G 2067.89 PASS AO=217;DP=218;FAO=217;FDP=217;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=116;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00684787;FXX=0.00458695;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0077;QD=38.1178;RBI=0.0205994;REFB=-0.00362764;REVB=-0.0194279;RO=1;SAF=101;SAR=116;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00408971;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.07647e-05;OID=.;OPOS=98078239;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:89:218:217:1:0:217:217:116:101:0:1:116:101:0:0 chr10 98287261 . G C 479.77 PASS AO=59;DP=63;FAO=59;FDP=66;FR=.;FRO=7;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=5.5244e-05;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=187.184;QD=29.0772;RBI=0.00999211;REFB=-0.0410204;REVB=0.00999195;RO=4;SAF=31;SAR=28;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0329535;STB=0.510285;TYPE=snp;VARB=0.000620862;OID=.;OPOS=98287261;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:63:66:4:7:59:59:28:31:1:3:28:31:3:4 chr10 98319503 . A T 81.7 PASS AO=20;DP=61;FAO=29;FDP=73;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=34;FWDB=0.0348551;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=43.99;QD=4.47685;RBI=0.0379756;REFB=-0.0137263;REVB=-0.0150755;RO=37;SAF=8;SAR=12;SRF=11;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122992;STB=0.655736;TYPE=snp;VARB=0.0168281;OID=.;OPOS=98319503;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:61:73:37:44:20:29:12:8:11:26:15:14:10:34 chr10 98380277 . C T 676.72 PASS AO=60;DP=61;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0704916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.4853;QD=38.6697;RBI=0.0735262;REFB=0;REVB=0.0209055;RO=0;SAF=27;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.7886e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000535587;OID=.;OPOS=98380277;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:61:70:0:0:60:70:33:27:0:0:42:28:0:0 chr10 98386558 . G A 1449.53 PASS AO=152;DP=152;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0225039;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.8866;QD=38.1454;RBI=0.0240562;REFB=0;REVB=-0.0085016;RO=0;SAF=81;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.66707e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000164376;OID=.;OPOS=98386558;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:152:152:0:0:152:152:71:81:0:0:71:81:0:0 chr10 98469693 . C T 256.88 PASS AO=80;DP=207;FAO=81;FDP=208;FR=.;FRO=127;FSAF=49;FSAR=32;FSRF=83;FSRR=44;FWDB=-0.00495461;FXX=0.00478446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.866;QD=4.93996;RBI=0.0244069;REFB=-0.00205303;REVB=-0.0238987;RO=126;SAF=48;SAR=32;SRF=82;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0582827;STB=0.531447;TYPE=snp;VARB=0.00312347;OID=.;OPOS=98469693;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:208:126:127:80:81:32:48:82:44:32:49:83:44 chr10 98742750 . A C 326.49 PASS AO=85;DP=189;FAO=86;FDP=189;FR=.;FRO=103;FSAF=56;FSAR=30;FSRF=58;FSRR=45;FWDB=0.00306907;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=74.1744;QD=6.90978;RBI=0.0101883;REFB=-0.0100717;REVB=0.00971501;RO=104;SAF=55;SAR=30;SRF=59;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0839652;STB=0.551169;TYPE=snp;VARB=0.0127683;OID=.;OPOS=98742750;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:189:104:103:85:86:30:55:59:45:30:56:58:45 chr10 98790576 . G A 98.12 PASS AO=31;DP=84;FAO=31;FDP=84;FR=.;FRO=53;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=30;FSRR=23;FWDB=0.0160674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.874;QD=4.67217;RBI=0.0273122;REFB=-0.0155361;REVB=-0.0220861;RO=53;SAF=21;SAR=10;SRF=30;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131805;STB=0.576009;TYPE=snp;VARB=0.027575;OID=.;OPOS=98790576;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:84:84:53:53:31:31:10:21:30:23:10:21:30:23 chr10 98803252 . G A 172.31 PASS AO=34;DP=61;FAO=34;FDP=61;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.0239983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.0852;QD=11.299;RBI=0.0298552;REFB=-0.026236;REVB=0.0177599;RO=27;SAF=15;SAR=19;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0026534;STB=0.501465;TYPE=snp;VARB=0.0184432;OID=.;OPOS=98803252;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:27:27:34:34:19:15:12:15:19:15:12:15 chr10 98808866 . C G 482.44 PASS AO=44;DP=44;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0775172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.822;QD=37.8385;RBI=0.0787339;REFB=0;REVB=-0.013788;RO=0;SAF=11;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000170796;OID=.;OPOS=98808866;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:44:51:0:0:44:51:33:11:0:0:35:16:0:0 chr10 98819317 . A G 101.65 PASS AO=31;DP=81;FAO=31;FDP=82;FR=.;FRO=51;FSAF=8;FSAR=23;FSRF=11;FSRR=40;FWDB=0.0214742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.606;QD=4.95859;RBI=0.0279791;REFB=-0.00362415;REVB=-0.0179358;RO=50;SAF=8;SAR=23;SRF=10;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0862297;STB=0.535578;TYPE=snp;VARB=0.00582309;OID=.;OPOS=98819317;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:82:50:51:31:31:23:8:10:40:23:8:11:40 chr10 98820528 . C G 58.43 PASS AO=11;DP=22;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=-0.0417387;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=50.5911;QD=9.73794;RBI=0.0418387;REFB=0.0205673;REVB=0.00289077;RO=11;SAF=1;SAR=10;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0218081;OID=.;OPOS=98820528;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:22:24:11:12:11:12:10:1:1:10:10:2:2:10 chr10 98901433 . C T 1556.4 PASS AO=209;DP=256;FAO=214;FDP=260;FR=.;FRO=46;FSAF=138;FSAR=76;FSRF=36;FSRR=10;FWDB=0.0130114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.5894;QD=23.9447;RBI=0.0226249;REFB=-0.0266319;REVB=0.0185091;RO=46;SAF=136;SAR=73;SRF=36;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0502503;STB=0.527018;TYPE=snp;VARB=0.00541567;OID=.;OPOS=98901433;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:256:260:46:46:209:214:73:136:36:10:76:138:36:10 chr10 98901438 . T C 302.23 PASS AO=101;DP=267;FAO=101;FDP=266;FR=.;FRO=165;FSAF=77;FSAR=24;FSRF=99;FSRR=66;FWDB=-0.0488076;FXX=0.00374518;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.121;QD=4.54473;RBI=0.0512873;REFB=-0.0135825;REVB=-0.0157546;RO=163;SAF=77;SAR=24;SRF=98;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211129;STB=0.621276;TYPE=snp;VARB=0.0405125;OID=.;OPOS=98901438;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:267:266:163:165:101:101:24:77:98:65:24:77:99:66 chr10 98901472 . C T 44.4 PASS AO=58;DP=320;FAO=58;FDP=321;FR=.;FRO=263;FSAF=16;FSAR=42;FSRF=156;FSRR=107;FWDB=-0.018848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.24;QD=0.55324;RBI=0.0473122;REFB=-0.00811084;REVB=-0.0433958;RO=257;SAF=16;SAR=42;SRF=155;SRR=102;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.411541;STB=0.75179;TYPE=snp;VARB=0.0445982;OID=.;OPOS=98901472;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:320:321:257:263:58:58:42:16:155:102:42:16:156:107 chr10 98901487 . C T 47.14 PASS AO=64;DP=343;FAO=62;FDP=342;FR=.;FRO=280;FSAF=24;FSAR=38;FSRF=149;FSRR=131;FWDB=-0.000544563;FXX=0.00581378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.7486;QD=0.551357;RBI=0.0585299;REFB=-0.0143862;REVB=-0.0585274;RO=268;SAF=24;SAR=40;SRF=147;SRR=121;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223036;STB=0.6184;TYPE=snp;VARB=0.0533285;OID=.;OPOS=98901487;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:343:342:268:280:64:62:40:24:147:121:38:24:149:131 chr10 98901493 . T C 28.7 PASS AO=58;DP=363;FAO=58;FDP=363;FR=.;FRO=305;FSAF=18;FSAR=40;FSRF=156;FSRR=149;FWDB=-0.0205893;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3833;QD=0.31629;RBI=0.0252036;REFB=-0.00375185;REVB=-0.0145363;RO=303;SAF=18;SAR=40;SRF=155;SRR=148;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263705;STB=0.671625;TYPE=snp;VARB=0.0218814;OID=.;OPOS=98901493;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:363:363:303:305:58:58:40:18:155:148:40:18:156:149 chr10 98901528 . C T 166.64 PASS AO=79;DP=273;FAO=80;FDP=273;FR=.;FRO=193;FSAF=34;FSAR=46;FSRF=52;FSRR=141;FWDB=0.0207462;FXX=0.00727246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.974;QD=2.44162;RBI=0.085967;REFB=-0.0150174;REVB=-0.0834261;RO=182;SAF=34;SAR=45;SRF=51;SRR=131;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191688;STB=0.616417;TYPE=snp;VARB=0.0744119;OID=.;OPOS=98901528;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:273:273:182:193:79:80:45:34:51:131:46:34:52:141 chr10 99006083 . G A 298.55 PASS AO=64;DP=118;FAO=64;FDP=118;FR=.;FRO=54;FSAF=27;FSAR=37;FSRF=20;FSRR=34;FWDB=-0.0048472;FXX=0.00840265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.963;QD=10.1203;RBI=0.0124058;REFB=0.0118859;REVB=0.0114196;RO=52;SAF=27;SAR=37;SRF=18;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0643304;STB=0.524336;TYPE=snp;VARB=-0.0102342;OID=.;OPOS=99006083;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:52:54:64:64:37:27:18:34:37:27:20:34 chr10 99019177 . A G 2575.29 PASS AO=269;DP=271;FAO=271;FDP=271;FR=.;FRO=0;FSAF=130;FSAR=141;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00388938;FXX=0.00367634;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.933;QD=38.0116;RBI=0.0235753;REFB=0;REVB=0.0232522;RO=1;SAF=129;SAR=140;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0036818;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.78973e-06;OID=.;OPOS=99019177;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:271:271:1:0:269:271:140:129:1:0:141:130:0:0 chr10 99080246 . CT C 1196.12 PASS AO=139;DP=171;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0251605;FXX=0.0289001;HRUN=3;LEN=1;MLLD=19.8291;QD=28.479;RBI=0.0909771;REFB=0;REVB=0.0874287;RO=2;SAF=78;SAR=61;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00167373;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.00054363;OID=.;OPOS=99080247;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:139:167:168:168:0:92:76:0:0:99:2:78:61:1:1 chr10 99080981 . G T 24.08 PASS AO=4;DP=6;FAO=4;FDP=6;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.105674;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.0694;QD=16.0537;RBI=0.114539;REFB=-0.00517694;REVB=0.0441837;RO=2;SAF=3;SAR=1;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210252;STB=0.624469;TYPE=snp;VARB=0.0284292;OID=.;OPOS=99080981;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:2:2:4:4:1:3:2:0:1:3:2:0 chr10 99116903 . C T 94.54 PASS AO=22;DP=47;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.00538031;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.251;QD=8.04598;RBI=0.0180665;REFB=-0.00228923;REVB=-0.0172468;RO=22;SAF=10;SAR=12;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0404908;STB=0.513606;TYPE=snp;VARB=0.00345809;OID=.;OPOS=99116903;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:47:47:22:25:22:22:12:10:11:11:12:10:12:13 chr10 99118382 . T C 203.99 PASS AO=50;DP=109;FAO=50;FDP=107;FR=.;FRO=57;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=31;FSRR=26;FWDB=-0.0252632;FXX=0.0183469;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.694;QD=7.62588;RBI=0.0306259;REFB=-0.00809405;REVB=-0.0173124;RO=56;SAF=23;SAR=27;SRF=31;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0887437;STB=0.544622;TYPE=snp;VARB=0.0111977;OID=.;OPOS=99118382;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:107:56:57:50:50:27:23:31:25:27:23:31:26 chr10 99125949 . C T 327.79 PASS AO=63;DP=108;FAO=63;FDP=107;FR=.;FRO=44;FSAF=22;FSAR=41;FSRF=12;FSRR=32;FWDB=0.0178007;FXX=0.0092584;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.662;QD=12.2539;RBI=0.0180056;REFB=-0.0307726;REVB=-0.00270852;RO=44;SAF=22;SAR=41;SRF=12;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0649642;STB=0.535322;TYPE=snp;VARB=0.0167596;OID=.;OPOS=99125949;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:107:44:44:63:63:41:22:12:32:41:22:12:32 chr10 99126249 . G A 117.67 PASS AO=34;DP=86;FAO=34;FDP=85;FR=.;FRO=51;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=-0.00595569;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.27;QD=5.53732;RBI=0.0189622;REFB=-0.0109179;REVB=0.0180027;RO=51;SAF=14;SAR=20;SRF=24;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0631826;STB=0.535945;TYPE=snp;VARB=0.0249874;OID=.;OPOS=99126249;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:85:51:51:34:34:20:14:24:27:20:14:24:27 chr10 99141205 . A G 94.69 PASS AO=25;DP=60;FAO=25;FDP=60;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=0.00821141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.797;QD=6.31258;RBI=0.0241681;REFB=-0.0258751;REVB=-0.0227304;RO=35;SAF=15;SAR=10;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0893044;STB=0.550979;TYPE=snp;VARB=0.031176;OID=.;OPOS=99141205;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:60:60:35:35:25:25:10:15:18:17:10:15:18:17 chr10 99141484 . C T 131.9 PASS AO=25;DP=43;FAO=25;FDP=43;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=18;FWDB=0.0428344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.0502;QD=12.2702;RBI=0.0429235;REFB=-0.0186156;REVB=-0.00276442;RO=18;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.375301;STB=0.704411;TYPE=snp;VARB=0.0221588;OID=.;OPOS=99141484;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:43:43:18:18:25:25:13:12:0:18:13:12:0:18 chr10 99155984 . G A 162.14 PASS AO=40;DP=93;FAO=42;FDP=94;FR=.;FRO=52;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=27;FSRR=25;FWDB=-0.0180422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.183;QD=6.89958;RBI=0.025147;REFB=-0.0155994;REVB=-0.0175172;RO=52;SAF=15;SAR=25;SRF=27;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147936;STB=0.564072;TYPE=snp;VARB=0.0258339;OID=.;OPOS=99155984;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:94:52:52:40:42:25:15:27:25:25:17:27:25 chr10 99160152 . A G 184.28 PASS AO=44;DP=94;FAO=44;FDP=92;FR=.;FRO=48;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=-0.00802367;FXX=0.0212743;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.511;QD=8.01225;RBI=0.0155886;REFB=0.00032014;REVB=-0.0133651;RO=48;SAF=22;SAR=22;SRF=21;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0585972;STB=0.532594;TYPE=snp;VARB=-0.000230607;OID=.;OPOS=99160152;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:92:48:48:44:44:22:22:21:27:22:22:21:27 chr10 99160965 . A G 529.52 PASS AO=43;DP=60;FAO=56;FDP=57;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=36;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0720909;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.9199;QD=37.159;RBI=0.147993;REFB=0;REVB=0.129247;RO=0;SAF=34;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000932964;OID=.;OPOS=99160965;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:55:57:0:0:43:56:9:34:0:0:20:36:0:0 chr10 99181008 . G A 209.71 PASS AO=41;DP=76;FAO=45;FDP=85;FR=.;FRO=40;FSAF=14;FSAR=31;FSRF=13;FSRR=27;FWDB=-0.0565487;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.0078;QD=9.86869;RBI=0.0678861;REFB=-0.0360645;REVB=-0.0375602;RO=34;SAF=14;SAR=27;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0368526;STB=0.507577;TYPE=snp;VARB=0.0300049;OID=.;OPOS=99181008;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:85:34:40:41:45:27:14:13:21:31:14:13:27 chr10 99219885 . G A 192.23 PASS AO=43;DP=86;FAO=43;FDP=85;FR=.;FRO=42;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=27;FSRR=15;FWDB=0.00567668;FXX=0.0229859;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.05;QD=9.04615;RBI=0.0217324;REFB=-0.0282663;REVB=-0.0209779;RO=40;SAF=22;SAR=21;SRF=25;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0991966;STB=0.565044;TYPE=snp;VARB=0.0329339;OID=.;OPOS=99219885;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:85:40:42:43:43:21:22:25:15:21:22:27:15 chr10 99220707 . C T 192.4 PASS AO=42;DP=80;FAO=43;FDP=86;FR=.;FRO=43;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=30;FWDB=-0.0376513;FXX=0.054939;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.6353;QD=8.94893;RBI=0.0402546;REFB=-0.0193095;REVB=0.0142411;RO=38;SAF=23;SAR=19;SRF=10;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.241446;STB=0.625808;TYPE=snp;VARB=0.0419659;OID=.;OPOS=99220707;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:86:38:43:42:43:19:23:10:28:19:24:13:30 chr10 99225846 . C T 116.02 PASS AO=25;DP=50;FAO=25;FDP=50;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=0.0279832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.007;QD=9.28132;RBI=0.0280764;REFB=-0.00461818;REVB=0.00228603;RO=25;SAF=15;SAR=10;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212274;STB=0.618953;TYPE=snp;VARB=0.00667276;OID=.;OPOS=99225846;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:25:25:25:25:10:15:9:16:10:15:9:16 chr10 99229394 . G A 125.74 PASS AO=48;DP=145;FAO=48;FDP=145;FR=.;FRO=97;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=56;FSRR=41;FWDB=-0.00103506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.344;QD=3.46881;RBI=0.0353634;REFB=-0.00733845;REVB=0.0353482;RO=96;SAF=29;SAR=19;SRF=56;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0250081;STB=0.518621;TYPE=snp;VARB=0.0130047;OID=.;OPOS=99229394;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:96:97:48:48:19:29:56:40:19:29:56:41 chr10 99240048 . C T 273.77 PASS AO=37;DP=153;FAO=67;FDP=141;FR=.;FRO=74;FSAF=30;FSAR=37;FSRF=25;FSRR=49;FWDB=0.0156279;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=131.847;QD=7.76664;RBI=0.0163093;REFB=-0.00710771;REVB=-0.00466478;RO=64;SAF=15;SAR=22;SRF=19;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128712;STB=0.559029;TYPE=snp;VARB=0.0119419;OID=.;OPOS=99240048;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:141:64:74:37:67:22:15:19:45:37:30:25:49 chr10 99240758 . G C 3410.23 PASS AO=356;DP=356;FAO=355;FDP=355;FR=.;FRO=0;FSAF=157;FSAR=198;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.002132;FXX=0.0138885;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.226;QD=38.4251;RBI=0.0255513;REFB=0;REVB=0.0254622;RO=0;SAF=159;SAR=197;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.43224e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000361596;OID=.;OPOS=99240758;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:356:355:0:0:356:355:197:159:0:0:198:157:0:0 chr10 99337572 . G A 483.95 PASS AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0279743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.7778;QD=35.8483;RBI=0.0995001;REFB=-0.03626;REVB=0.0954866;RO=0;SAF=40;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.518511;TYPE=snp;VARB=0.00202935;OID=.;OPOS=99337572;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:54:54:0:1:53:53:13:40:0:0:13:40:0:1 chr10 99371344 . C A 162.7 PASS AO=50;DP=129;FAO=51;FDP=133;FR=.;FRO=82;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=44;FSRR=38;FWDB=0.00857846;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=231.043;QD=4.89323;RBI=0.0134143;REFB=-0.0231331;REVB=0.0103128;RO=77;SAF=28;SAR=22;SRF=40;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0437685;STB=0.520016;TYPE=snp;VARB=0.0294007;OID=.;OPOS=99371344;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:133:77:82:50:51:22:28:40:37:22:29:44:38 chr10 99422648 . A G 117.82 PASS AO=29;DP=64;FAO=29;FDP=64;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.00262813;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.4343;QD=7.3639;RBI=0.0231541;REFB=-0.010081;REVB=-0.0230044;RO=35;SAF=16;SAR=13;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119083;STB=0.567086;TYPE=snp;VARB=0.019104;OID=.;OPOS=99422648;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:35:35:29:29:13:16:15:20:13:16:15:20 chr10 99434760 . C T 153.65 PASS AO=38;DP=83;FAO=38;FDP=82;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=12;FSRR=32;FWDB=-0.0116222;FXX=0.0120467;HRUN=4;LEN=1;MLLD=118.366;QD=7.49523;RBI=0.012388;REFB=-0.017227;REVB=-0.00428792;RO=39;SAF=14;SAR=24;SRF=9;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140986;STB=0.55679;TYPE=snp;VARB=0.021455;OID=.;OPOS=99434760;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:82:39:44:38:38:24:14:9:30:24:14:12:32 chr10 99435006 . G T 49.31 PASS AO=17;DP=52;FAO=17;FDP=53;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=24;FWDB=-0.00833265;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.2021;QD=3.72163;RBI=0.0167547;REFB=-0.00938151;REVB=-0.0145357;RO=35;SAF=8;SAR=9;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147906;STB=0.594488;TYPE=snp;VARB=0.0533923;OID=.;OPOS=99435006;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:52:53:35:36:17:17:9:8:12:23:9:8:12:24 chr10 99439541 . G C 108.56 PASS AO=24;DP=49;FAO=24;FDP=49;FR=.;FRO=25;FSAF=3;FSAR=21;FSRF=5;FSRR=20;FWDB=-0.0839422;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=40.6481;QD=8.86194;RBI=0.125106;REFB=0.027294;REVB=0.0927639;RO=24;SAF=3;SAR=21;SRF=5;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146471;STB=0.577248;TYPE=snp;VARB=-0.0246069;OID=.;OPOS=99439541;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:24:25:24:24:21:3:5:19:21:3:5:20 chr10 99627274 . C T 18.22 PASS AO=3;DP=8;FAO=4;FDP=9;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.9819;QD=8.09613;RBI=0.0797026;REFB=-0.194312;REVB=0.0797026;RO=5;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.174111;OID=.;OPOS=99627274;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:8:9:5:5:3:4:3:0:0:5:4:0:0:5 chr10 99969568 . A G 115.86 PASS AO=34;DP=86;FAO=34;FDP=86;FR=.;FRO=52;FSAF=25;FSAR=9;FSRF=36;FSRR=16;FWDB=0.0118402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.245;QD=5.38886;RBI=0.0127697;REFB=-0.00385565;REVB=0.00478263;RO=52;SAF=25;SAR=9;SRF=36;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0566598;STB=0.532348;TYPE=snp;VARB=0.00563392;OID=.;OPOS=99969568;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:52:52:34:34:9:25:36:16:9:25:36:16 chr10 99990809 . G GT,T 20.76 PASS AO=24,27;DP=128;FAO=25,0;FDP=120;FR=.;FRO=95;FSAF=9,0;FSAR=16,0;FSRF=32;FSRR=63;FWDB=-0.0573954,-0.0909588;FXX=0.0163921;HRUN=7,1;LEN=1,1;MLLD=6.96834,70.301;QD=0.69207;RBI=0.172561,0.0910257;REFB=-0.139646,-0.0123938;REVB=-0.162736,-0.00348972;RO=75;SAF=13,4;SAR=11,23;SRF=28;SRR=47;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.20751,-0.36326;STB=0.520101,0.5;TYPE=ins,snp;VARB=0.0556586,0;OID=.,.;OPOS=99990810,99990809;OREF=-,G;OALT=T,T;OMAPALT=GT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:128:120:75:95:24,27:25,0:11,23:13,4:28:47:16,0:9,0:32:63 chr10 99991408 . A G 2457.83 PASS AO=260;DP=281;FAO=266;FDP=266;FR=.;FRO=0;FSAF=106;FSAR=160;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0305322;FXX=0.0533789;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.71;QD=36.9598;RBI=0.0351228;REFB=-0.106433;REVB=0.0173608;RO=4;SAF=105;SAR=155;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0121417;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.001331;OID=.;OPOS=99991408;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:94:281:266:4:0:260:266:155:105:0:4:160:106:0:0 chr10 100017453 . T G 110.76 PASS AO=18;DP=27;FAO=18;FDP=27;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.0398685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.585;QD=16.4094;RBI=0.0528962;REFB=-0.0346797;REVB=-0.0347637;RO=9;SAF=8;SAR=10;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137822;STB=0.57619;TYPE=snp;VARB=0.0225785;OID=.;OPOS=100017453;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:27:27:9:9:18:18:10:8:2:7:10:8:2:7 chr10 100017489 . AG A 161.08 PASS AO=25;DP=30;FAO=28;FDP=30;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.139576;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.9166;QD=21.4772;RBI=0.149377;REFB=0.125065;REVB=0.053219;RO=4;SAF=12;SAR=13;SRF=1;SRR=3;SSEN=0.396318;SSEP=0;SSSB=0.0588136;STB=0.531228;TYPE=del;VARB=0.000425629;OID=.;OPOS=100017490;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:25:30:28:30:2:13:15:0:2:8:4:12:13:1:3 chr10 100018844 . G A 117.16 PASS AO=18;DP=25;FAO=18;FDP=25;FR=.;FRO=7;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0188623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.2315;QD=18.7449;RBI=0.0196076;REFB=-0.0380399;REVB=-0.00535444;RO=7;SAF=14;SAR=4;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219182;STB=0.622074;TYPE=snp;VARB=0.0213269;OID=.;OPOS=100018844;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:25:25:7:7:18:18:4:14:3:4:4:14:3:4 chr10 100144782 . C T 447.29 PASS AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00147891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.441;QD=38.0675;RBI=0.0276275;REFB=0;REVB=0.0275879;RO=0;SAF=20;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000141023;OID=.;OPOS=100144782;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:46:47:0:0:46:47:26:20:0:0:27:20:0:0 chr10 100147060 . A G 1272.35 PASS AO=132;DP=132;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00154677;FXX=0.0425502;HRUN=3;LEN=1;MLLD=107.62;QD=37.6992;RBI=0.0230514;REFB=0.0391794;REVB=-0.0229994;RO=0;SAF=53;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.02569e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0011083;OID=.;OPOS=100147060;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:132:135:0:0:132:135:79:53:0:0:82:53:0:0 chr10 100148176 . A G 388 PASS AO=42;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.060353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.1419;QD=35.2724;RBI=0.0877897;REFB=0;REVB=0.0637538;RO=1;SAF=20;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0208598;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00392457;OID=.;OPOS=100148176;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:43:44:1:0:42:44:22:20:0:1:23:21:0:0 chr10 100167396 . G A 555.78 PASS AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.009;QD=38.3295;RBI=0.0288525;REFB=0;REVB=-0.0236509;RO=0;SAF=23;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.41688e-05;OID=.;OPOS=100167396;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:58:58:0:0:58:58:35:23:0:0:35:23:0:0 chr10 100184062 . C A 479.83 PASS AO=55;DP=55;FAO=54;FDP=56;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0134242;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.8488;QD=34.2732;RBI=0.0187017;REFB=-0.110072;REVB=-0.0130208;RO=0;SAF=30;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.501329;TYPE=snp;VARB=0.00452989;OID=.;OPOS=100184062;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:55:56:0:2:55:54:25:30:0:0:25:29:1:1 chr10 100184063 . C G 506.6 PASS AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0268887;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.307;QD=36.1853;RBI=0.0288925;REFB=-0.0692781;REVB=-0.0105725;RO=0;SAF=30;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5098;TYPE=snp;VARB=0.000630888;OID=.;OPOS=100184063;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:55:56:0:1:55:55:25:30:0:0:25:30:0:1 chr10 100219314 . G A 1275.7 PASS AO=109;DP=137;FAO=136;FDP=138;FR=.;FRO=2;FSAF=57;FSAR=79;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0147858;FXX=0.00719373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.577;QD=36.9769;RBI=0.0478919;REFB=-0.160998;REVB=0.0455523;RO=0;SAF=55;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508619;TYPE=snp;VARB=0.000681818;OID=.;OPOS=100219314;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:111:138:0:2:109:136:54:55:0:0:79:57:2:0 chr10 100219374 . T A 902.62 PASS AO=88;DP=88;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00878121;FXX=0.0206164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.247;QD=38.0051;RBI=0.0352091;REFB=0;REVB=0.0340965;RO=0;SAF=18;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.14043e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000427465;OID=.;OPOS=100219374;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:88:95:0:0:88:95:70:18:0:0:73:22:0:0 chr10 101090426 . GT G 312.31 PASS AO=14;DP=66;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.133896;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=7.45346;QD=18.1048;RBI=0.18801;REFB=0;REVB=-0.131983;RO=49;SAF=0;SAR=14;SRF=36;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.816656;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.00400115;OID=.;OPOS=101090427;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:14:65:69:69:0:38:31:0:0:34:49:0:14:36:13 chr10 101090428 . T G 282.44 PASS AO=50;DP=71;FAO=49;FDP=75;FR=.;FRO=26;FSAF=37;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=26;FWDB=-0.0822577;FXX=0.0259707;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.191;QD=15.0637;RBI=0.0879929;REFB=-0.00356944;REVB=-0.0312477;RO=21;SAF=38;SAR=12;SRF=0;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.430777;STB=0.759895;TYPE=snp;VARB=0.0214869;OID=.;OPOS=101090428;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:71:75:21:26:50:49:12:38:0:21:12:37:0:26 chr10 101293035 . C A 263.97 PASS AO=56;DP=104;FAO=56;FDP=104;FR=.;FRO=48;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=-0.0113569;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.8989;QD=10.1527;RBI=0.0352241;REFB=-0.0427586;REVB=-0.033343;RO=48;SAF=25;SAR=31;SRF=20;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.025374;STB=0.513932;TYPE=snp;VARB=0.0366583;OID=.;OPOS=101293035;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:48:48:56:56:31:25:20:28:31:25:20:28 chr10 101295863 . A G 171.24 PASS AO=29;DP=44;FAO=29;FDP=44;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=3;FWDB=-0.00418332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.514;QD=15.5672;RBI=0.00720607;REFB=-0.0844487;REVB=0.00586748;RO=15;SAF=10;SAR=19;SRF=12;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.283075;STB=0.655065;TYPE=snp;VARB=0.00844126;OID=.;OPOS=101295863;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:44:44:15:15:29:29:19:10:12:3:19:10:12:3 chr10 101445591 . A C 577.16 PASS AO=110;DP=241;FAO=137;FDP=267;FR=.;FRO=130;FSAF=56;FSAR=81;FSRF=73;FSRR=57;FWDB=0.0244003;FXX=0.00743467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.025;QD=8.64661;RBI=0.0248266;REFB=-0.0169242;REVB=0.00458079;RO=130;SAF=32;SAR=78;SRF=72;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.271549;STB=0.574836;TYPE=snp;VARB=0.0137392;OID=.;OPOS=101445591;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:241:267:130:130:110:137:78:32:72:58:81:56:73:57 chr10 101451259 . T C 227.94 PASS AO=60;DP=158;FAO=67;FDP=167;FR=.;FRO=100;FSAF=35;FSAR=32;FSRF=52;FSRR=48;FWDB=-0.0155339;FXX=0.017646;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2703;QD=5.45956;RBI=0.0640911;REFB=-0.0295448;REVB=0.0621801;RO=93;SAF=32;SAR=28;SRF=47;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0301515;STB=0.501432;TYPE=snp;VARB=0.0484027;OID=.;OPOS=101451259;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:167:93:100:60:67:28:32:47:46:32:35:52:48 chr10 101473218 . A G 602.35 PASS AO=65;DP=66;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00349122;FXX=0.0302984;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.6458;QD=37.6466;RBI=0.0398591;REFB=0;REVB=-0.0397059;RO=0;SAF=34;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.90682e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000681368;OID=.;OPOS=101473218;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:66:64:0:0:65:64:31:34:0:0:30:34:0:0 chr10 101544447 . A T 2172.34 PASS AO=221;DP=222;FAO=226;FDP=226;FR=.;FRO=0;FSAF=106;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.051086;FXX=0.00877155;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.529;QD=38.4485;RBI=0.0526534;REFB=0;REVB=-0.0127513;RO=0;SAF=100;SAR=121;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.34832e-05;OID=.;OPOS=101544447;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:222:226:0:0:221:226:121:100:0:0:120:106:0:0 chr10 101595996 . T A 288.85 PASS AO=72;DP=153;FAO=72;FDP=153;FR=.;FRO=81;FSAF=43;FSAR=29;FSRF=38;FSRR=43;FWDB=0.0207623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.9909;QD=7.55158;RBI=0.0219092;REFB=-0.0204481;REVB=-0.00699577;RO=81;SAF=43;SAR=29;SRF=38;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123728;STB=0.568576;TYPE=snp;VARB=0.0221039;OID=.;OPOS=101595996;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:153:81:81:72:72:29:43:38:43:29:43:38:43 chr10 101606861 . G T 404.26 PASS AO=88;DP=168;FAO=89;FDP=170;FR=.;FRO=81;FSAF=28;FSAR=61;FSRF=27;FSRR=54;FWDB=0.0209202;FXX=0.0116272;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.765;QD=9.51205;RBI=0.0282304;REFB=-0.0145537;REVB=0.0189552;RO=80;SAF=28;SAR=60;SRF=27;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0191833;STB=0.510264;TYPE=snp;VARB=0.0187327;OID=.;OPOS=101606861;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:170:80:81:88:89:60:28:27:53:61:28:27:54 chr10 101610533 . C T 240.22 PASS AO=46;DP=79;FAO=46;FDP=79;FR=.;FRO=33;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=0.0303482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.081;QD=12.1632;RBI=0.0348492;REFB=0.00641907;REVB=0.0171306;RO=33;SAF=24;SAR=22;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0972404;STB=0.553215;TYPE=snp;VARB=-0.00323889;OID=.;OPOS=101610533;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:33:33:46:46:22:24:13:20:22:24:13:20 chr10 101611294 . G A 575.29 PASS AO=142;DP=295;FAO=142;FDP=295;FR=.;FRO=153;FSAF=77;FSAR=65;FSRF=72;FSRR=81;FWDB=-0.0460156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.6973;QD=7.80047;RBI=0.0543123;REFB=-0.0257438;REVB=-0.0288513;RO=153;SAF=77;SAR=65;SRF=72;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0676199;STB=0.537196;TYPE=snp;VARB=0.0275918;OID=.;OPOS=101611294;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:295:295:153:153:142:142:65:77:72:81:65:77:72:81 chr10 101639796 . G A 451.7 PASS AO=128;DP=308;FAO=131;FDP=311;FR=.;FRO=180;FSAF=85;FSAR=46;FSRF=117;FSRR=63;FWDB=0.0266658;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.783;QD=5.80964;RBI=0.0275281;REFB=-0.00914637;REVB=0.00683588;RO=178;SAF=82;SAR=46;SRF=116;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125857;STB=0.500727;TYPE=snp;VARB=0.0111996;OID=.;OPOS=101639796;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:308:311:178:180:128:131:46:82:116:62:46:85:117:63 chr10 101645498 . T C 116.37 PASS AO=37;DP=102;FAO=37;FDP=100;FR=.;FRO=63;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=42;FWDB=0.0142472;FXX=0.0196059;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.863;QD=4.65487;RBI=0.0162655;REFB=-0.0082755;REVB=0.00784754;RO=63;SAF=23;SAR=14;SRF=21;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.309963;STB=0.676379;TYPE=snp;VARB=0.023535;OID=.;OPOS=101645498;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:100:63:63:37:37:14:23:21:42:14:23:21:42 chr10 101689378 . G C 200.77 PASS AO=49;DP=100;FAO=47;FDP=98;FR=.;FRO=51;FSAF=33;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=26;FWDB=0.0110732;FXX=0.019998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.654;QD=8.19468;RBI=0.0176222;REFB=-0.0243993;REVB=-0.0137086;RO=49;SAF=35;SAR=14;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221057;STB=0.619084;TYPE=snp;VARB=0.0250099;OID=.;OPOS=101689378;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:98:49:51:49:47:14:35:24:25:14:33:25:26 chr10 101912064 . T C 329.78 PASS AO=105;DP=270;FAO=106;FDP=272;FR=.;FRO=166;FSAF=69;FSAR=37;FSRF=82;FSRR=84;FWDB=0.00936245;FXX=0.007299;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.759;QD=4.84977;RBI=0.0202273;REFB=-0.00578058;REVB=-0.0179301;RO=164;SAF=69;SAR=36;SRF=81;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183214;STB=0.599077;TYPE=snp;VARB=0.00694513;OID=.;OPOS=101912064;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:270:272:164:166:105:106:36:69:81:83:37:69:82:84 chr10 101977883 . C T 197.85 PASS AO=45;DP=94;FAO=46;FDP=94;FR=.;FRO=48;FSAF=30;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=0.0217964;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.63;QD=8.41913;RBI=0.0280808;REFB=0.00891912;REVB=0.0177044;RO=48;SAF=29;SAR=16;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120099;STB=0.559895;TYPE=snp;VARB=-0.00780625;OID=.;OPOS=101977883;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:48:48:45:46:16:29:25:23:16:30:26:22 chr10 102089663 . C T 286.88 PASS AO=67;DP=135;FAO=67;FDP=135;FR=.;FRO=68;FSAF=9;FSAR=58;FSRF=8;FSRR=60;FWDB=0.0240022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.1937;QD=8.50008;RBI=0.0246358;REFB=-0.00703803;REVB=0.00555106;RO=68;SAF=9;SAR=58;SRF=8;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0337089;STB=0.518549;TYPE=snp;VARB=0.0106677;OID=.;OPOS=102089663;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:68:68:67:67:58:9:8:60:58:9:8:60 chr10 102107251 . C G 88.99 PASS AO=26;DP=67;FAO=26;FDP=67;FR=.;FRO=41;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=27;FSRR=14;FWDB=0.0304632;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3892;QD=5.31258;RBI=0.0349838;REFB=0.00707519;REVB=0.0172006;RO=41;SAF=11;SAR=15;SRF=27;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247132;STB=0.641065;TYPE=snp;VARB=-0.010168;OID=.;OPOS=102107251;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:67:67:41:41:26:26:15:11:27:14:15:11:27:14 chr10 102116311 . A C 737.17 PASS AO=164;DP=314;FAO=165;FDP=315;FR=.;FRO=150;FSAF=79;FSAR=86;FSRF=85;FSRR=65;FWDB=-0.00319632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.831;QD=9.36091;RBI=0.0074684;REFB=-0.0254576;REVB=-0.00674986;RO=149;SAF=79;SAR=85;SRF=84;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0714639;STB=0.541769;TYPE=snp;VARB=0.0217558;OID=.;OPOS=102116311;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:314:315:149:150:164:165:85:79:84:65:86:79:85:65 chr10 102222957 . G C 392.46 PASS AO=93;DP=189;FAO=93;FDP=189;FR=.;FRO=96;FSAF=40;FSAR=53;FSRF=38;FSRR=58;FWDB=0.0210221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.2293;QD=8.30597;RBI=0.0337014;REFB=-0.0257508;REVB=-0.0263412;RO=95;SAF=40;SAR=53;SRF=37;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0383039;STB=0.517841;TYPE=snp;VARB=0.0382614;OID=.;OPOS=102222957;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:189:95:96:93:93:53:40:37:58:53:40:38:58 chr10 102247408 . C A 225.02 PASS AO=59;DP=163;FAO=60;FDP=155;FR=.,HEALED;FRO=90;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=49;FSRR=41;FWDB=0.00184003;FXX=0.031248;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.969;QD=5.807;RBI=0.0223351;REFB=-0.0164659;REVB=-0.0222591;RO=69;SAF=28;SAR=31;SRF=49;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227143;STB=0.546568;TYPE=snp;VARB=0.0254696;OID=.;OPOS=102247408;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:155:69:90:59:60:31:28:49:20:32:28:49:41 chr10 102247526 . G C 315.67 PASS AO=88;DP=208;FAO=89;FDP=209;FR=.;FRO=120;FSAF=33;FSAR=56;FSRF=61;FSRR=59;FWDB=0.000673831;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=247.102;QD=6.04143;RBI=0.00107428;REFB=-0.00931685;REVB=-0.000836676;RO=120;SAF=33;SAR=55;SRF=61;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140932;STB=0.581061;TYPE=snp;VARB=0.0137557;OID=.;OPOS=102247526;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:209:120:120:88:89:55:33:61:59:56:33:61:59 chr10 102250548 . ACC AC,A 615.33 PASS AO=71,19;DP=116;FAO=95,12;FDP=108;FR=.;FRO=1;FSAF=41,12;FSAR=54,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.197796,-0.0974884;FXX=0.00917347;HRUN=3,3;LEN=1,2;MLLD=14.7348,14.8757;QD=22.7898;RBI=0.266617,0.131887;REFB=0.0353176,0.0367854;REVB=0.178778,0.0888272;RO=10;SAF=31,18;SAR=40,1;SRF=1;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0.469521,0.469521;SSSB=0.0803944,0.71093;STB=0.506023,0.5;TYPE=del,del;VARB=-0.0258775,0.0821205;OID=.,.;OPOS=102250549,102250549;OREF=C,CC;OALT=-,-;OMAPALT=AC,A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:71,19:109:95,12:108:1:41,12:54,0:1:0:7:10:31,18:40,1:1:9 chr10 102265183 . G A 136.45 PASS AO=35;DP=81;FAO=35;FDP=80;FR=.;FRO=45;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=0.00617535;FXX=0.0123442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.551;QD=6.82254;RBI=0.0238894;REFB=0.000143886;REVB=0.0230775;RO=43;SAF=23;SAR=12;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126695;STB=0.586156;TYPE=snp;VARB=-0.000158023;OID=.;OPOS=102265183;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:80:43:45:35:35:12:23:23:20:12:23:23:22 chr10 102265815 . A G 277.64 PASS AO=55;DP=96;FAO=55;FDP=96;FR=.;FRO=41;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=0.013485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.9501;QD=11.5684;RBI=0.0848126;REFB=-0.0114739;REVB=0.0837337;RO=40;SAF=26;SAR=29;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0175789;STB=0.503989;TYPE=snp;VARB=0.0115059;OID=.;OPOS=102265815;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:40:41:55:55:29:26:18:22:29:26:19:22 chr10 102265847 . A C 272.37 PASS AO=59;DP=112;FAO=59;FDP=112;FR=.;FRO=53;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=27;FSRR=26;FWDB=-0.0746418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.039;QD=9.72745;RBI=0.0830181;REFB=-0.0189507;REVB=-0.0363402;RO=52;SAF=28;SAR=31;SRF=26;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0216973;STB=0.516505;TYPE=snp;VARB=0.014944;OID=.;OPOS=102265847;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:52:53:59:59:31:28:26:26:31:28:27:26 chr10 102269085 . C A 110.88 PASS AO=39;DP=120;FAO=42;FDP=123;FR=.;FRO=81;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=50;FSRR=31;FWDB=-0.0256021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.879;QD=3.60593;RBI=0.0256804;REFB=-0.0169973;REVB=0.00200304;RO=80;SAF=20;SAR=19;SRF=49;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116399;STB=0.5772;TYPE=snp;VARB=0.0292164;OID=.;OPOS=102269085;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:123:80:81:39:42:19:20:49:31:21:21:50:31 chr10 102269206 . A G 98.88 PASS AO=33;DP=93;FAO=33;FDP=93;FR=.;FRO=60;FSAF=9;FSAR=24;FSRF=18;FSRR=42;FWDB=0.00258293;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.463;QD=4.25304;RBI=0.00264592;REFB=-0.00491302;REVB=-0.000573915;RO=58;SAF=9;SAR=24;SRF=16;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0043688;STB=0.521726;TYPE=snp;VARB=0.00746512;OID=.;OPOS=102269206;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:93:93:58:60:33:33:24:9:16:42:24:9:18:42 chr10 102295836 . C G 100.29 PASS AO=25;DP=57;FAO=25;FDP=57;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=0.0423876;FXX=0.0172384;HRUN=3;LEN=1;MLLD=30.184;QD=7.03759;RBI=0.104657;REFB=-0.0377973;REVB=-0.0956889;RO=31;SAF=15;SAR=10;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0131686;STB=0.503647;TYPE=snp;VARB=0.0411054;OID=.;OPOS=102295836;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:31:32:25:25:10:15:19:12:10:15:19:13 chr10 102309220 . G C 285.48 PASS AO=62;DP=122;FAO=65;FDP=126;FR=.;FRO=61;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=40;FSRR=21;FWDB=-0.0131647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.382;QD=9.06275;RBI=0.0184253;REFB=-0.00484581;REVB=-0.0128912;RO=59;SAF=32;SAR=30;SRF=39;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129252;STB=0.571827;TYPE=snp;VARB=0.00331314;OID=.;OPOS=102309220;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:126:59:61:62:65:30:32:39:20:32:33:40:21 chr10 102313607 . A G 472.86 PASS AO=104;DP=197;FAO=104;FDP=197;FR=.;FRO=93;FSAF=87;FSAR=17;FSRF=66;FSRR=27;FWDB=0.00325734;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=135.357;QD=9.60123;RBI=0.00943368;REFB=-0.00912386;REVB=-0.00885348;RO=93;SAF=87;SAR=17;SRF=66;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172891;STB=0.595407;TYPE=snp;VARB=0.0141027;OID=.;OPOS=102313607;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:197:93:93:104:104:17:87:66:27:17:87:66:27 chr10 102506070 . G C 135.36 PASS AO=37;DP=86;FAO=42;FDP=97;FR=.;FRO=55;FSAF=9;FSAR=33;FSRF=27;FSRR=28;FWDB=0.0383386;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=37.3334;QD=5.58191;RBI=0.0503143;REFB=-0.033768;REVB=-0.0325834;RO=49;SAF=4;SAR=33;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.518661;STB=0.683842;TYPE=snp;VARB=0.0817782;OID=.;OPOS=102506070;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:97:49:55:37:42:33:4:24:25:33:9:27:28 chr10 102684380 . C A 92.79 PASS AO=28;DP=77;FAO=28;FDP=75;FR=.;FRO=47;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=0.0420518;FXX=0.0384566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.0771;QD=4.94904;RBI=0.0432582;REFB=-0.0185769;REVB=-0.0101449;RO=47;SAF=13;SAR=15;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0505355;STB=0.529055;TYPE=snp;VARB=0.0175791;OID=.;OPOS=102684380;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:77:75:47:47:28:28:15:13:24:23:15:13:24:23 chr10 102685853 . TTA T 81.95 PASS AO=41;DP=216;FAO=70;FDP=182;FR=.;FRO=112;FSAF=21;FSAR=49;FSRF=49;FSRR=63;FWDB=-0.0503469;FXX=0.0520806;HRUN=6;LEN=2;MLLD=15.3286;QD=1.80107;RBI=0.0702233;REFB=-0.0960764;REVB=-0.0489541;RO=85;SAF=8;SAR=33;SRF=50;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.47776;STB=0.593193;TYPE=del;VARB=0.10651;OID=.;OPOS=102685854;OREF=TA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:41:190:70:182:112:21:49:49:63:81:85:8:33:50:35 chr10 102722625 . T C 295.89 PASS AO=83;DP=194;FAO=84;FDP=194;FR=.;FRO=110;FSAF=37;FSAR=47;FSRF=46;FSRR=64;FWDB=-0.0697832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.8841;QD=6.10088;RBI=0.0832408;REFB=-0.0681175;REVB=0.04538;RO=105;SAF=37;SAR=46;SRF=44;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0272566;STB=0.512859;TYPE=snp;VARB=0.0772068;OID=.;OPOS=102722625;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:194:105:110:83:84:46:37:44:61:47:37:46:64 chr10 102722649 . C T 371.48 PASS AO=97;DP=215;FAO=98;FDP=216;FR=.;FRO=118;FSAF=36;FSAR=62;FSRF=53;FSRR=65;FWDB=0.00689254;FXX=0.00460808;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.393;QD=6.87927;RBI=0.0111932;REFB=-0.0118565;REVB=-0.00881931;RO=115;SAF=36;SAR=61;SRF=53;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0915258;STB=0.546868;TYPE=snp;VARB=0.013528;OID=.;OPOS=102722649;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:216:115:118:97:98:61:36:53:62:62:36:53:65 chr10 102734778 . C G 286.41 PASS AO=66;DP=132;FAO=66;FDP=132;FR=.;FRO=66;FSAF=34;FSAR=32;FSRF=36;FSRR=30;FWDB=-0.00135321;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.264;QD=8.67893;RBI=0.0447675;REFB=0.0100298;REVB=-0.0447471;RO=66;SAF=34;SAR=32;SRF=36;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.027522;STB=0.515175;TYPE=snp;VARB=-0.0104264;OID=.;OPOS=102734778;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:66:66:66:66:32:34:36:30:32:34:36:30 chr10 102738891 . G A 230.14 PASS AO=50;DP=101;FAO=51;FDP=99;FR=.;FRO=48;FSAF=33;FSAR=18;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=0.000684586;FXX=0.0388312;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.958;QD=9.29862;RBI=0.00234057;REFB=-0.01155;REVB=-0.00223822;RO=50;SAF=32;SAR=18;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11325;STB=0.574597;TYPE=snp;VARB=0.0103165;OID=.;OPOS=102738891;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:99:50:48:50:51:18:32:26:24:18:33:24:24 chr10 102744376 . T C 360.68 PASS AO=70;DP=197;FAO=96;FDP=219;FR=.,HEALED;FRO=123;FSAF=57;FSAR=39;FSRF=58;FSRR=65;FWDB=-0.0161614;FXX=0.00904936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.55;QD=6.58774;RBI=0.0244023;REFB=-0.0211907;REVB=0.0182834;RO=63;SAF=56;SAR=14;SRF=57;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157402;STB=0.569274;TYPE=snp;VARB=0.0235963;OID=.;OPOS=102744376;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:219:63:123:70:96:14:56:57:6:39:57:58:65 chr10 102745062 . G T 309.66 PASS AO=93;DP=229;FAO=93;FDP=229;FR=.;FRO=136;FSAF=70;FSAR=23;FSRF=90;FSRR=46;FWDB=0.0134037;FXX=0.00434764;HRUN=4;LEN=1;MLLD=43.3328;QD=5.40892;RBI=0.013806;REFB=-0.046752;REVB=0.00330848;RO=130;SAF=69;SAR=24;SRF=89;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0746273;STB=0.567552;TYPE=snp;VARB=0.0490341;OID=.;OPOS=102745062;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:229:229:130:136:93:93:24:69:89:41:23:70:90:46 chr10 102746503 . C T 246.11 PASS AO=45;DP=73;FAO=45;FDP=73;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=33;FSRF=19;FSRR=9;FWDB=-0.0171527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.582;QD=13.4855;RBI=0.02218;REFB=-0.0214029;REVB=0.0140619;RO=28;SAF=12;SAR=33;SRF=19;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.310012;STB=0.669862;TYPE=snp;VARB=0.0200232;OID=.;OPOS=102746503;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:73:73:28:28:45:45:33:12:19:9:33:12:19:9 chr10 102750623 . T C 372.4 PASS AO=85;DP=170;FAO=85;FDP=168;FR=.;FRO=83;FSAF=39;FSAR=46;FSRF=42;FSRR=41;FWDB=0.00283266;FXX=0.011764;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.788;QD=8.86658;RBI=0.028101;REFB=-0.0178282;REVB=0.0279579;RO=82;SAF=39;SAR=46;SRF=41;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0369185;STB=0.523383;TYPE=snp;VARB=0.0142992;OID=.;OPOS=102750623;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:168:82:83:85:85:46:39:41:41:46:39:42:41 chr10 102750783 . C A 280.76 PASS AO=49;DP=76;FAO=49;FDP=76;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=36;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=0.0246198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.457;QD=14.7767;RBI=0.0255115;REFB=-0.0371007;REVB=0.00668563;RO=27;SAF=13;SAR=36;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0553086;STB=0.530108;TYPE=snp;VARB=0.0147712;OID=.;OPOS=102750783;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:76:76:27:27:49:49:36:13:9:18:36:13:9:18 chr10 102766574 . A G 33.04 PASS AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00628957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.028;QD=18.8792;RBI=0.0362596;REFB=-0.0845077;REVB=-0.0357099;RO=2;SAF=2;SAR=3;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212944;STB=0.62455;TYPE=snp;VARB=0.0201057;OID=.;OPOS=102766574;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:2:2:5:5:3:2:0:2:3:2:0:2 chr10 102770082 . T G 1633.65 PASS AO=155;DP=165;FAO=181;FDP=181;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0328355;FXX=0.0054942;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.4793;QD=36.1028;RBI=0.0355702;REFB=-0.041289;REVB=0.0136775;RO=5;SAF=57;SAR=98;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0147701;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00224885;OID=.;OPOS=102770082;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:165:181:5:0:155:181:98:57:3:2:103:78:0:0 chr10 102770327 . A G 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00822769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.805;QD=33.0214;RBI=0.0186937;REFB=0;REVB=0.0167857;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00128471;OID=.;OPOS=102770327;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:3:3:0:0:3:3:0:0 chr10 102778967 . G A 97.74 PASS AO=23;DP=49;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.00951382;FXX=0.0740604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.1628;QD=7.81895;RBI=0.0102537;REFB=-0.0162419;REVB=0.00382434;RO=26;SAF=10;SAR=13;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0974748;STB=0.565161;TYPE=snp;VARB=0.0159013;OID=.;OPOS=102778967;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:49:50:26:27:23:23:13:10:14:12:13:10:15:12 chr10 102827757 . G GT 586.93 PASS AO=73;DP=83;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0287736;FXX=0.03571;HRUN=2;LEN=1;MLLD=16.9789;QD=28.9843;RBI=0.184536;REFB=0;REVB=0.182279;RO=6;SAF=30;SAR=43;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0364106;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00367847;OID=.;OPOS=102827758;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:73:83:81:81:0:33:48:0:0:54:6:30:43:1:5 chr10 102897311 . A G 379.98 PASS AO=103;DP=232;FAO=103;FDP=233;FR=.;FRO=130;FSAF=64;FSAR=39;FSRF=63;FSRR=67;FWDB=0.00400523;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.498;QD=6.52321;RBI=0.0180505;REFB=-0.0223645;REVB=0.0176006;RO=129;SAF=64;SAR=39;SRF=63;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136137;STB=0.577986;TYPE=snp;VARB=0.0345655;OID=.;OPOS=102897311;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:233:129:130:103:103:39:64:63:66:39:64:63:67 chr10 102992095 . G A 357.48 PASS AO=83;DP=169;FAO=84;FDP=170;FR=.;FRO=86;FSAF=28;FSAR=56;FSRF=34;FSRR=52;FWDB=-0.0163245;FXX=0.0116272;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.3654;QD=8.41129;RBI=0.0270341;REFB=-0.0338107;REVB=-0.0215489;RO=85;SAF=27;SAR=56;SRF=34;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0756978;STB=0.534474;TYPE=snp;VARB=0.0223775;OID=.;OPOS=102992095;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:170:85:86:83:84:56:27:34:51:56:28:34:52 chr10 103124606 . A G 2282.09 PASS AO=602;DP=734;FAO=320;FDP=396;FR=.;FRO=76;FSAF=87;FSAR=233;FSRF=41;FSRR=35;FWDB=0.00567932;FXX=0.00999975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.366;QD=23.0515;RBI=0.00640212;REFB=-0.0113314;REVB=-0.00295508;RO=130;SAF=177;SAR=425;SRF=73;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10324;STB=0.56123;TYPE=snp;VARB=0.000792322;OID=.;OPOS=103124606;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:734:396:130:76:602:320:425:177:73:57:233:87:41:35 chr10 103124647 . A G 2117.49 PASS AO=696;DP=875;FAO=309;FDP=400;FR=.;FRO=91;FSAF=97;FSAR=212;FSRF=45;FSRR=46;FWDB=0.0511973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.0558;QD=21.1749;RBI=0.061653;REFB=-0.028462;REVB=0.03435;RO=178;SAF=239;SAR=457;SRF=81;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0468795;STB=0.546052;TYPE=snp;VARB=0.00716896;OID=.;OPOS=103124647;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:875:400:178:91:696:309:457:239:81:97:212:97:45:46 chr10 103124696 . T C 2033.97 PASS AO=529;DP=688;FAO=303;FDP=399;FR=.;FRO=96;FSAF=104;FSAR=199;FSRF=40;FSRR=56;FWDB=0.0187779;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.286;QD=20.3907;RBI=0.0227431;REFB=0.00193231;REVB=-0.0128313;RO=157;SAF=192;SAR=337;SRF=68;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0324233;STB=0.519355;TYPE=snp;VARB=-0.000265586;OID=.;OPOS=103124696;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:688:399:157:96:529:303:337:192:68:89:199:104:40:56 chr10 103124715 . A G 1892 PASS AO=360;DP=501;FAO=293;FDP=400;FR=.;FRO=107;FSAF=120;FSAR=173;FSRF=45;FSRR=62;FWDB=0.0528915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.798;QD=18.92;RBI=0.0555291;REFB=-0.0391693;REVB=-0.0169106;RO=141;SAF=143;SAR=217;SRF=63;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0271781;STB=0.50304;TYPE=snp;VARB=0.00673137;OID=.;OPOS=103124715;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:501:400:141:107:360:293:217:143:63:78:173:120:45:62 chr10 103124726 . A G 1362.57 PASS AO=233;DP=372;FAO=245;FDP=383;FR=.;FRO=138;FSAF=117;FSAR=128;FSRF=62;FSRR=76;FWDB=0.0593006;FXX=0.0026041;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.269;QD=14.2304;RBI=0.0605917;REFB=-0.0283426;REVB=-0.0124416;RO=138;SAF=105;SAR=128;SRF=62;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00095561;STB=0.510217;TYPE=snp;VARB=0.0092886;OID=.;OPOS=103124726;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:372:383:138:138:233:245:128:105:62:76:128:117:62:76 chr10 103124736 . C T 838.29 PASS AO=159;DP=279;FAO=166;FDP=284;FR=.;FRO=118;FSAF=92;FSAR=74;FSRF=52;FSRR=66;FWDB=-0.00568706;FXX=0.00350865;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.636;QD=11.8069;RBI=0.00756004;REFB=-0.0110914;REVB=0.00498112;RO=113;SAF=89;SAR=70;SRF=49;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0969257;STB=0.547241;TYPE=snp;VARB=0.00492216;OID=.;OPOS=103124736;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:279:284:113:118:159:166:70:89:49:64:74:92:52:66 chr10 103124746 . G A 521.94 PASS AO=116;DP=227;FAO=118;FDP=228;FR=.;FRO=110;FSAF=79;FSAR=39;FSRF=48;FSRR=62;FWDB=-0.00111929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.3451;QD=9.15691;RBI=0.00417865;REFB=-0.0118196;REVB=0.00402596;RO=111;SAF=77;SAR=39;SRF=48;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.213087;STB=0.616976;TYPE=snp;VARB=0.0176689;OID=.;OPOS=103124746;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:227:228:111:110:116:118:39:77:48:63:39:79:48:62 chr10 103558701 . G A 2469.22 PASS AO=254;DP=259;FAO=264;FDP=264;FR=.;FRO=0;FSAF=107;FSAR=157;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142251;FXX=0.0149248;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.603;QD=37.4125;RBI=0.0197876;REFB=-0.12279;REVB=-0.0137548;RO=4;SAF=106;SAR=148;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0176445;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000428784;OID=.;OPOS=103558701;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:92:259:264:4:0:254:264:148:106:4:0:157:107:0:0 chr10 103577726 . G A 61.4 PASS AO=6;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.679;QD=35.0875;RBI=0.0306432;REFB=0;REVB=0.0306432;RO=0;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000358873;OID=.;OPOS=103577726;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:6:7:6:0:0:0:7:0:0:0 chr10 103826848 . AC A 46.16 PASS AO=16;DP=39;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=1;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0455822;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.9309;QD=5.27529;RBI=0.0587935;REFB=-0.130158;REVB=-0.0371341;RO=15;SAF=1;SAR=15;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.610899;STB=0.854218;TYPE=del;VARB=0.136827;OID=.;OPOS=103826849;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:16:35:18:35:17:1:17:8:9:37:15:1:15:8:7 chr10 103900729 . G A 719.02 PASS AO=76;DP=79;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0185392;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.2362;QD=36.8728;RBI=0.0190777;REFB=-0.0839667;REVB=0.00450068;RO=1;SAF=8;SAR=68;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00690989;STB=0.503649;TYPE=snp;VARB=0.00112455;OID=.;OPOS=103900729;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:79:78:1:1:76:77:68:8:0:1:68:9:0:1 chr10 103920475 . T C 305.39 PASS AO=32;DP=32;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.091;QD=37.017;RBI=0.0338151;REFB=0;REVB=-0.0282279;RO=0;SAF=15;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.11629e-05;OID=.;OPOS=103920475;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:32:33:0:0:32:33:17:15:0:0:17:16:0:0 chr10 103990563 . G C 10.2 PASS AO=2;DP=9;FAO=2;FDP=9;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=-0.0370467;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=40.4889;QD=4.53499;RBI=0.0370467;REFB=-0.0254378;REVB=0;RO=7;SAF=2;SAR=0;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0698002;OID=.;OPOS=103990563;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:7:7:2:2:0:2:7:0:0:2:7:0 chr10 103991381 . G A 363.29 PASS AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0456116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0915;QD=38.2405;RBI=0.0814178;REFB=0;REVB=0.0674421;RO=0;SAF=18;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.51048e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00207694;OID=.;OPOS=103991381;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:38:38:0:0:38:38:20:18:0:0:20:18:0:0 chr10 104136469 . T C 994.62 PASS AO=104;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0175314;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.21;QD=37.8904;RBI=0.0511326;REFB=0;REVB=0.0480333;RO=1;SAF=50;SAR=54;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00870688;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.0267e-05;OID=.;OPOS=104136469;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:105:105:1:0:104:105:54:50:0:1:55:50:0:0 chr10 104160434 . A G 402.72 PASS AO=40;DP=41;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171553;FXX=0.0444346;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.696;QD=37.462;RBI=0.0188721;REFB=0;REVB=0.00786462;RO=0;SAF=23;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.4817e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000502563;OID=.;OPOS=104160434;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:41:43:0:0:40:43:17:23:0:0:18:25:0:0 chr10 104214048 . A T 209.97 PASS AO=44;DP=84;FAO=45;FDP=85;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=30;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=0.0255433;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.347;QD=9.88104;RBI=0.0296255;REFB=-0.0329969;REVB=0.015007;RO=40;SAF=15;SAR=29;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144409;STB=0.583295;TYPE=snp;VARB=0.038797;OID=.;OPOS=104214048;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:85:40:40:44:45:29:15:20:20:30:15:20:20 chr10 104229785 . C T 312.57 PASS AO=57;DP=92;FAO=57;FDP=92;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=40;FSRF=8;FSRR=27;FWDB=-0.0132768;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=259.995;QD=13.59;RBI=0.0140416;REFB=-0.0137941;REVB=-0.00457089;RO=35;SAF=17;SAR=40;SRF=8;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0598936;STB=0.532481;TYPE=snp;VARB=0.00787829;OID=.;OPOS=104229785;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:35:35:57:57:40:17:8:27:40:17:8:27 chr10 104230437 . C G 15.78 PASS AO=3;DP=7;FAO=3;FDP=7;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0230707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.769;QD=9.018;RBI=0.0633888;REFB=-0.0175262;REVB=0.0590413;RO=3;SAF=2;SAR=1;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.555201;TYPE=snp;VARB=0.0121611;OID=.;OPOS=104230437;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:7:7:3:4:3:3:1:2:2:1:1:2:3:1 chr10 104231054 . A G 107.85 PASS AO=26;DP=60;FAO=27;FDP=61;FR=.;FRO=34;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=-0.015106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.67;QD=7.07197;RBI=0.0186748;REFB=-0.037677;REVB=-0.0109799;RO=34;SAF=7;SAR=19;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223585;STB=0.606301;TYPE=snp;VARB=0.0466709;OID=.;OPOS=104231054;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:61:34:34:26:27:19:7:16:18:19:8:16:18 chr10 104236457 . C T 590.75 PASS AO=65;DP=67;FAO=65;FDP=67;FR=.;FRO=2;FSAF=9;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0511254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7462;QD=35.2687;RBI=0.0623307;REFB=-0.132978;REVB=-0.0356555;RO=1;SAF=9;SAR=56;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00836328;STB=0.508769;TYPE=snp;VARB=0.0145097;OID=.;OPOS=104236457;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:67:67:1:2:65:65:56:9:0:1:56:9:0:2 chr10 104239100 . T C 102.43 PASS AO=38;DP=113;FAO=38;FDP=114;FR=.;FRO=76;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=38;FSRR=38;FWDB=-0.0149721;FXX=0.0086949;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.537;QD=3.59401;RBI=0.0161496;REFB=-0.00414645;REVB=-0.00605364;RO=75;SAF=21;SAR=17;SRF=38;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0529828;STB=0.535199;TYPE=snp;VARB=0.0102526;OID=.;OPOS=104239100;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:114:75:76:38:38:17:21:38:37:17:21:38:38 chr10 104386934 . T C 276.19 PASS AO=61;DP=121;FAO=62;FDP=122;FR=.;FRO=60;FSAF=24;FSAR=38;FSRF=33;FSRR=27;FWDB=0.00664446;FXX=0.00812942;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.7243;QD=9.05547;RBI=0.0340797;REFB=-0.0145653;REVB=0.0334257;RO=60;SAF=23;SAR=38;SRF=33;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158135;STB=0.581294;TYPE=snp;VARB=0.0116663;OID=.;OPOS=104386934;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:122:60:60:61:62:38:23:33:27:38:24:33:27 chr10 104389932 . T G 1392.02 PASS AO=116;DP=149;FAO=139;FDP=147;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=58;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0341114;FXX=0.0134219;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.348;QD=37.878;RBI=0.0389361;REFB=0;REVB=0.0187732;RO=0;SAF=47;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.11246e-05;OID=.;OPOS=104389932;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:148:147:0:0:116:139:69:47:0:0:81:58:0:0 chr10 104435746 . C T 1421.38 PASS AO=150;DP=153;FAO=151;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0049893;FXX=0.0194793;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.669;QD=37.6526;RBI=0.00557979;REFB=-0.0156321;REVB=0.00249819;RO=1;SAF=59;SAR=91;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00799337;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000128215;OID=.;OPOS=104435746;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:153:151:1:0:150:151:91:59:1:0:92:59:0:0 chr10 104436641 . C T 359.96 PASS AO=72;DP=141;FAO=79;FDP=150;FR=.;FRO=71;FSAF=7;FSAR=72;FSRF=25;FSRR=46;FWDB=0.0120715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.978;QD=9.599;RBI=0.0127858;REFB=0.000809952;REVB=-0.00421375;RO=69;SAF=7;SAR=65;SRF=25;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.411503;STB=0.736026;TYPE=snp;VARB=-0.000468966;OID=.;OPOS=104436641;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:150:69:71:72:79:65:7:25:44:72:7:25:46 chr10 104498846 . T C 348.65 PASS AO=75;DP=141;FAO=75;FDP=141;FR=.;FRO=66;FSAF=40;FSAR=35;FSRF=27;FSRR=39;FWDB=0.0552514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2239;QD=9.89089;RBI=0.0568017;REFB=-0.0123709;REVB=0.0131805;RO=65;SAF=40;SAR=35;SRF=26;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112634;STB=0.557949;TYPE=snp;VARB=0.00937058;OID=.;OPOS=104498846;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:65:66:75:75:35:40:26:39:35:40:27:39 chr10 104572963 . T C 11.72 PASS AO=4;DP=24;FAO=5;FDP=25;FR=.;FRO=20;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=4;FWDB=-0.00721418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.458;QD=1.87595;RBI=0.00831357;REFB=-0.00499404;REVB=0.00413171;RO=20;SAF=1;SAR=3;SRF=16;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.575634;STB=0.893606;TYPE=snp;VARB=0.0516616;OID=.;OPOS=104572963;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:24:25:20:20:4:5:3:1:16:4:4:1:16:4 chr10 104574329 . A T 253.39 PASS AO=55;DP=102;FAO=55;FDP=103;FR=.;FRO=48;FSAF=23;FSAR=32;FSRF=19;FSRR=29;FWDB=-0.0108036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.374;QD=9.84021;RBI=0.0118935;REFB=-0.0230262;REVB=-0.00497367;RO=47;SAF=23;SAR=32;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0120272;STB=0.510735;TYPE=snp;VARB=0.0102608;OID=.;OPOS=104574329;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:103:47:48:55:55:32:23:19:28:32:23:19:29 chr10 104596924 . C A 390 PASS AO=96;DP=202;FAO=96;FDP=201;FR=.;FRO=105;FSAF=47;FSAR=49;FSRF=49;FSRR=56;FWDB=0.000625226;FXX=0.00985173;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.523;QD=7.76121;RBI=0.00336921;REFB=-0.00371044;REVB=0.00331069;RO=103;SAF=47;SAR=49;SRF=49;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0130163;STB=0.51198;TYPE=snp;VARB=0.00394885;OID=.;OPOS=104596924;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:201:103:105:96:96:49:47:49:54:49:47:49:56 chr10 104596981 . G A 517.54 PASS AO=124;DP=253;FAO=124;FDP=252;FR=.;FRO=128;FSAF=48;FSAR=76;FSRF=61;FSRR=67;FWDB=-0.023157;FXX=0.00395241;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.1812;QD=8.21499;RBI=0.0405115;REFB=-0.0229977;REVB=-0.0332405;RO=128;SAF=48;SAR=76;SRF=61;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0852008;STB=0.546863;TYPE=snp;VARB=0.0239862;OID=.;OPOS=104596981;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:253:252:128:128:124:124:76:48:61:67:76:48:61:67 chr10 104628234 . T C 267.75 PASS AO=78;DP=185;FAO=77;FDP=185;FR=.;FRO=108;FSAF=42;FSAR=35;FSRF=66;FSRR=42;FWDB=-0.00447342;FXX=0.00537606;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.619;QD=5.78916;RBI=0.00487173;REFB=0.00174706;REVB=-0.00192933;RO=107;SAF=42;SAR=36;SRF=66;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0822478;STB=0.538912;TYPE=snp;VARB=-0.00229629;OID=.;OPOS=104628234;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:185:107:108:78:77:36:42:66:41:35:42:66:42 chr10 104661484 . T C 337.59 PASS AO=71;DP=131;FAO=71;FDP=131;FR=.;FRO=60;FSAF=26;FSAR=45;FSRF=34;FSRR=26;FWDB=-0.00422746;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=255.581;QD=10.3081;RBI=0.00952521;REFB=0.00106905;REVB=-0.0085357;RO=59;SAF=26;SAR=45;SRF=34;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177617;STB=0.593902;TYPE=snp;VARB=-0.00103654;OID=.;OPOS=104661484;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:59:60:71:71:45:26:34:25:45:26:34:26 chr10 104814162 . T C 551.68 PASS AO=134;DP=276;FAO=134;FDP=275;FR=.;FRO=141;FSAF=53;FSAR=81;FSRF=58;FSRR=83;FWDB=0.0259995;FXX=0.00362306;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.7861;QD=8.02446;RBI=0.0259999;REFB=-0.0221939;REVB=-0.000135361;RO=141;SAF=53;SAR=81;SRF=58;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0153755;STB=0.508453;TYPE=snp;VARB=0.0158022;OID=.;OPOS=104814162;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:276:275:141:141:134:134:81:53:58:83:81:53:58:83 chr10 104835919 . C T 301.75 PASS AO=89;DP=216;FAO=89;FDP=216;FR=.;FRO=127;FSAF=26;FSAR=63;FSRF=39;FSRR=88;FWDB=0.0367751;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.426;QD=5.58795;RBI=0.042651;REFB=-0.00416528;REVB=-0.0216033;RO=127;SAF=26;SAR=63;SRF=39;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0188034;STB=0.510532;TYPE=snp;VARB=0.00641729;OID=.;OPOS=104835919;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:216:216:127:127:89:89:63:26:39:88:63:26:39:88 chr10 104849468 . G A 452.05 PASS AO=117;DP=253;FAO=117;FDP=254;FR=.;FRO=137;FSAF=72;FSAR=45;FSRF=79;FSRR=58;FWDB=0.0164186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.254;QD=7.11891;RBI=0.0191926;REFB=-0.0189131;REVB=0.00993906;RO=133;SAF=72;SAR=45;SRF=76;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.044199;STB=0.521846;TYPE=snp;VARB=0.0236592;OID=.;OPOS=104849468;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:253:254:133:137:117:117:45:72:76:57:45:72:79:58 chr10 104851301 . G T 285.88 PASS AO=88;DP=223;FAO=88;FDP=220;FR=.;FRO=132;FSAF=38;FSAR=50;FSRF=49;FSRR=83;FWDB=-0.00596552;FXX=0.0134523;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.681;QD=5.1978;RBI=0.0236604;REFB=-0.000179083;REVB=0.022896;RO=124;SAF=38;SAR=50;SRF=47;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0568002;STB=0.537423;TYPE=snp;VARB=0.000320195;OID=.;OPOS=104851301;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:220:124:132:88:88:50:38:47:77:50:38:49:83 chr10 105049105 . C G 2399.09 PASS AO=261;DP=272;FAO=261;FDP=261;FR=.;FRO=0;FSAF=110;FSAR=151;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00216821;FXX=0.0439544;HRUN=3;LEN=1;MLLD=133.264;QD=36.7677;RBI=0.0119006;REFB=-0.025803;REVB=0.0117014;RO=5;SAF=110;SAR=151;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0211717;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000122177;OID=.;OPOS=105049105;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:272:261:5:0:261:261:151:110:5:0:151:110:0:0 chr10 105154089 . A G 1708.39 PASS AO=178;DP=179;FAO=179;FDP=179;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0408434;FXX=0.00555525;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.9101;QD=38.1762;RBI=0.0423241;REFB=-0.0215745;REVB=-0.0110971;RO=1;SAF=82;SAR=96;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00493328;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000134392;OID=.;OPOS=105154089;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:179:179:1:0:178:179:96:82:0:1:97:82:0:0 chr10 105194086 . C T 102.39 PASS AO=26;DP=60;FAO=26;FDP=60;FR=.;FRO=34;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=26;FWDB=0.00673155;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.995;QD=6.82597;RBI=0.0126644;REFB=-0.00427281;REVB=-0.0107272;RO=34;SAF=17;SAR=9;SRF=8;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.400892;STB=0.725449;TYPE=snp;VARB=0.00578979;OID=.;OPOS=105194086;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:34:34:26:26:9:17:8:26:9:17:8:26 chr10 105205302 . A C 56.42 PASS AO=21;DP=68;FAO=22;FDP=73;FR=.;FRO=51;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=33;FSRR=18;FWDB=-0.0489718;FXX=0.0394685;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0931;QD=3.09163;RBI=0.0500523;REFB=-0.0555055;REVB=-0.0103436;RO=46;SAF=11;SAR=10;SRF=31;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177767;STB=0.6914;TYPE=snp;VARB=0.111059;OID=.;OPOS=105205302;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:68:73:46:51:21:22:10:11:31:15:14:8:33:18 chr10 105215016 . A G 78.03 PASS AO=21;DP=52;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.0395258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.6729;QD=6.00219;RBI=0.0411709;REFB=-0.0167418;REVB=0.011522;RO=31;SAF=5;SAR=16;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254925;STB=0.648035;TYPE=snp;VARB=0.0304407;OID=.;OPOS=105215016;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:52:52:31:31:21:21:16:5:14:17:16:5:14:17 chr10 105218252 . A G 60.82 PASS AO=18;DP=71;FAO=18;FDP=58;FR=.;FRO=40;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=0.0367463;FXX=0.183073;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.292;QD=4.19482;RBI=0.0369443;REFB=-0.00433773;REVB=-0.00382;RO=31;SAF=6;SAR=12;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170531;STB=0.666481;TYPE=snp;VARB=0.0110898;OID=.;OPOS=105218252;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:57:58:31:40:18:18:12:6:15:16:12:6:23:17 chr10 105218359 . T C 153.07 PASS AO=45;DP=113;FAO=45;FDP=113;FR=.;FRO=68;FSAF=30;FSAR=15;FSRF=44;FSRR=24;FWDB=-0.0137364;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.818;QD=5.41843;RBI=0.013775;REFB=-0.0247581;REVB=-0.00103035;RO=68;SAF=30;SAR=15;SRF=44;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0232206;STB=0.513152;TYPE=snp;VARB=0.0487191;OID=.;OPOS=105218359;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:68:68:45:45:15:30:44:24:15:30:44:24 chr10 105233110 . C T 92.21 PASS AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.0266009;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5647;QD=8.3826;RBI=0.0993325;REFB=0.0137636;REVB=0.0957044;RO=23;SAF=13;SAR=8;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171704;STB=0.597281;TYPE=snp;VARB=-0.0104447;OID=.;OPOS=105233110;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:44:44:23:23:21:21:8:13:10:13:8:13:10:13 chr10 105362104 . G A 71.52 PASS AO=12;DP=22;FAO=13;FDP=23;FR=.;FRO=10;FSAF=12;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.00546671;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.099;QD=12.4381;RBI=0.127073;REFB=-0.0107999;REVB=0.126956;RO=10;SAF=12;SAR=0;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.806142;STB=0.768689;TYPE=snp;VARB=0.0213383;OID=.;OPOS=105362104;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:22:23:10:10:12:13:0:12:6:4:1:12:6:4 chr10 105362209 . T C 110.2 PASS AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.00462976;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=112.909;QD=9.18342;RBI=0.0471459;REFB=-0.00487545;REVB=-0.046918;RO=24;SAF=10;SAR=14;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148268;STB=0.583264;TYPE=snp;VARB=0.0104818;OID=.;OPOS=105362209;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:24:24:24:24:14:10:14:10:14:10:14:10 chr10 105657316 . G C 1010.61 PASS AO=106;DP=108;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0480383;FXX=0.0092584;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.024;QD=37.7799;RBI=0.0480533;REFB=0;REVB=-0.00119748;RO=1;SAF=54;SAR=52;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00870811;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.26962e-05;OID=.;OPOS=105657316;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:108:107:1:0:106:107:52:54:1:0:52:55:0:0 chr10 105659826 . T C 2792.24 PASS AO=293;DP=295;FAO=293;FDP=293;FR=.;FRO=0;FSAF=172;FSAR=121;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209664;FXX=0.0101348;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.043;QD=38.1193;RBI=0.0265428;REFB=-0.0393431;REVB=0.0162766;RO=1;SAF=172;SAR=121;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0027648;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000113533;OID=.;OPOS=105659826;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:295:293:1:0:293:293:121:172:1:0:121:172:0:0 chr10 105762697 . GC G 453.69 PASS AO=53;DP=90;FAO=79;FDP=81;FR=.;FRO=2;FSAF=51;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.175306;FXX=0.0121936;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.1058;QD=22.4042;RBI=0.177593;REFB=0.0576655;REVB=0.0284053;RO=4;SAF=32;SAR=21;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0.538824;SSSB=0.0482235;STB=0.517237;TYPE=del;VARB=0.00797351;OID=.;OPOS=105762698;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:53:71:79:81:2:51:28:0:2:28:4:32:21:1:3 chr10 105795282 . GGC G,GG 568.76 PASS AO=23,23;DP=98;FAO=85,0;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=67,0;FSAR=18,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.210936,-0.0283033;FXX=0.0116266;HRUN=5,4;LEN=2,1;MLLD=21.2851,12.0643;QD=26.765;RBI=0.216063,0.631485;REFB=0,0;REVB=-0.0467876,0.63085;RO=21;SAF=23,23;SAR=0,0;SRF=5;SRR=16;SSEN=0.30137,0;SSEP=0,0;SSSB=0.866107,0.866107;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.00374863,0;OID=.,.;OPOS=105795283,105795284;OREF=GC,C;OALT=-,-;OMAPALT=G,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:23,23:85:85,0:85:0:67,0:18,0:0:0:48:21:23,23:0,0:5:16 chr10 105796819 . A G 446.44 PASS AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0071886;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.8937;QD=36.4438;RBI=0.0769485;REFB=-0.091973;REVB=-0.076612;RO=1;SAF=14;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136387;STB=0.507243;TYPE=snp;VARB=0.00110453;OID=.;OPOS=105796819;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:49:49:1:1:48:48:34:14:0:1:34:14:0:1 chr10 105798872 . T C 501.32 PASS AO=127;DP=278;FAO=129;FDP=279;FR=.;FRO=150;FSAF=60;FSAR=69;FSRF=74;FSRR=76;FWDB=-0.0279677;FXX=0.0035713;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.442;QD=7.18745;RBI=0.034123;REFB=-0.0067872;REVB=-0.0195497;RO=148;SAF=60;SAR=67;SRF=74;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0268833;STB=0.51521;TYPE=snp;VARB=0.00811959;OID=.;OPOS=105798872;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:278:279:148:150:127:129:67:60:74:74:69:60:74:76 chr10 105799216 . G T 357.69 PASS AO=66;DP=146;FAO=69;FDP=140;FR=.,HEALED;FRO=62;FSAF=35;FSAR=34;FSRF=30;FSRR=32;FWDB=0.0123348;FXX=0.0070917;HRUN=3;LEN=1;MLLD=35.1802;QD=10.2198;RBI=0.0329739;REFB=-0.0612135;REVB=0.0305799;RO=48;SAF=33;SAR=33;SRF=28;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.064358;STB=0.511059;TYPE=snp;VARB=0.0352206;OID=.;OPOS=105799216;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:48:62:66:69:33:33:28:20:34:35:30:32 chr10 105805497 . C T 318.03 PASS AO=80;DP=171;FAO=80;FDP=171;FR=.;FRO=91;FSAF=41;FSAR=39;FSRF=53;FSRR=38;FWDB=0.046798;FXX=0.00581362;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.3005;QD=7.43934;RBI=0.056578;REFB=0.00105789;REVB=0.0317964;RO=91;SAF=41;SAR=39;SRF=53;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0674152;STB=0.537291;TYPE=snp;VARB=-6.42192e-07;OID=.;OPOS=105805497;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:171:91:91:80:80:39:41:53:38:39:41:53:38 chr10 105816916 . C T 993.94 PASS AO=108;DP=112;FAO=109;FDP=111;FR=.;FRO=2;FSAF=70;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0231005;FXX=0.00892777;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.9737;QD=35.8177;RBI=0.0651131;REFB=-0.081776;REVB=0.0608776;RO=2;SAF=70;SAR=38;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0243227;STB=0.502783;TYPE=snp;VARB=0.00125142;OID=.;OPOS=105816916;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:112:111:2:2:108:109:38:70:0:2:39:70:1:1 chr10 105817891 . G A 1041.89 PASS AO=112;DP=114;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0277935;FXX=0.0173898;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.541;QD=36.8812;RBI=0.0279803;REFB=-0.0948949;REVB=0.00322727;RO=2;SAF=59;SAR=53;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.017577;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000753092;OID=.;OPOS=105817891;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:114:113:2:0:112:113:53:59:0:2:54:59:0:0 chr10 105900601 . C T 260.31 PASS AO=66;DP=143;FAO=66;FDP=143;FR=.;FRO=77;FSAF=35;FSAR=31;FSRF=40;FSRR=37;FWDB=0.00544221;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=141.801;QD=7.28132;RBI=0.00707109;REFB=-0.0129385;REVB=-0.00451472;RO=76;SAF=35;SAR=31;SRF=39;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0165726;STB=0.505843;TYPE=snp;VARB=0.0122331;OID=.;OPOS=105900601;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:76:77:66:66:31:35:39:37:31:35:40:37 chr10 105927460 . C T 234.52 PASS AO=51;DP=103;FAO=52;FDP=101;FR=.;FRO=49;FSAF=20;FSAR=32;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=-0.0181186;FXX=0.0288434;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.4544;QD=9.28776;RBI=0.0182889;REFB=0.00771749;REVB=0.00249009;RO=43;SAF=20;SAR=31;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139895;STB=0.55257;TYPE=snp;VARB=-0.00389257;OID=.;OPOS=105927460;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:101:43:49:51:52:31:20:24:19:32:20:24:25 chr10 105957714 . A G 422.07 PASS AO=121;DP=289;FAO=121;FDP=286;FR=.;FRO=165;FSAF=53;FSAR=68;FSRF=64;FSRR=101;FWDB=-0.0167149;FXX=0.0103803;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.3332;QD=5.90309;RBI=0.0200884;REFB=0.00392266;REVB=0.0111424;RO=161;SAF=53;SAR=68;SRF=64;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0424914;STB=0.529588;TYPE=snp;VARB=-0.00455884;OID=.;OPOS=105957714;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:289:286:161:165:121:121:68:53:64:97:68:53:64:101 chr10 105963553 . A G 110.54 PASS AO=29;DP=68;FAO=29;FDP=68;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=0.0475444;FXX=0.0144907;HRUN=3;LEN=1;MLLD=90.2981;QD=6.50213;RBI=0.0481867;REFB=-0.0172102;REVB=-0.00784167;RO=39;SAF=14;SAR=15;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.047558;STB=0.52694;TYPE=snp;VARB=0.0161406;OID=.;OPOS=105963553;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:39:39:29:29:15:14:17:22:15:14:17:22 chr10 106022789 . C A 259.34 PASS AO=73;DP=174;FAO=73;FDP=173;FR=.;FRO=100;FSAF=22;FSAR=51;FSRF=50;FSRR=50;FWDB=-0.0149079;FXX=0.0114279;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.785;QD=5.99633;RBI=0.0166505;REFB=-0.0103442;REVB=-0.00741588;RO=100;SAF=22;SAR=51;SRF=50;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218906;STB=0.622971;TYPE=snp;VARB=0.0198134;OID=.;OPOS=106022789;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:173:100:100:73:73:51:22:50:50:51:22:50:50 chr10 106028154 . G A 184.78 PASS AO=45;DP=98;FAO=45;FDP=96;FR=.;FRO=51;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=29;FSRR=22;FWDB=0.0125211;FXX=0.0204061;HRUN=3;LEN=1;MLLD=244.591;QD=7.69907;RBI=0.0137902;REFB=-0.000650008;REVB=-0.0057786;RO=51;SAF=21;SAR=24;SRF=29;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0969363;STB=0.553993;TYPE=snp;VARB=0.000463417;OID=.;OPOS=106028154;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:96:51:51:45:45:24:21:29:22:24:21:29:22 chr10 106028157 . G T 202.75 PASS AO=46;DP=92;FAO=46;FDP=92;FR=.;FRO=46;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=-0.011741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.491;QD=8.81501;RBI=0.054621;REFB=-0.0370606;REVB=0.0533442;RO=46;SAF=21;SAR=25;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0784433;STB=0.543459;TYPE=snp;VARB=0.0272237;OID=.;OPOS=106028157;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:46:46:46:46:25:21:25:21:25:21:25:21 chr10 106039185 . A G 310.76 PASS AO=76;DP=158;FAO=76;FDP=160;FR=.;FRO=84;FSAF=40;FSAR=36;FSRF=36;FSRR=48;FWDB=-0.0296115;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.344;QD=7.76909;RBI=0.036883;REFB=-0.0198936;REVB=-0.0219889;RO=82;SAF=40;SAR=36;SRF=34;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104608;STB=0.551168;TYPE=snp;VARB=0.0248652;OID=.;OPOS=106039185;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:160:82:84:76:76:36:40:34:48:36:40:36:48 chr10 106075419 . AG A 22.02 PASS AO=10;DP=36;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.204988;FXX=0.166597;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.5625;QD=4.40323;RBI=0.206507;REFB=-0.125478;REVB=-0.024998;RO=10;SAF=8;SAR=2;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0.333333;SSSB=0.452485;STB=0.740614;TYPE=del;VARB=0.0892694;OID=.;OPOS=106075420;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:10:23:9:20:11:7:2:4:7:21:10:8:2:3:7 chr10 108729824 . C T 446.7 PASS AO=112;DP=236;FAO=112;FDP=237;FR=.;FRO=125;FSAF=46;FSAR=66;FSRF=53;FSRR=72;FWDB=0.0388439;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.7873;QD=7.53924;RBI=0.0547803;REFB=0.00246684;REVB=-0.0386268;RO=123;SAF=46;SAR=66;SRF=53;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0197052;STB=0.507218;TYPE=snp;VARB=-0.00257146;OID=.;OPOS=108729824;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:236:237:123:125:112:112:66:46:53:70:66:46:53:72 chr10 109221364 . G A 1131.62 PASS AO=119;DP=120;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00669335;FXX=0.00833264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=221.215;QD=38.0376;RBI=0.00755554;REFB=-0.028791;REVB=0.00350503;RO=1;SAF=10;SAR=109;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00433854;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.23803e-05;OID=.;OPOS=109221364;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:120:119:1:0:119:119:109:10:0:1:109:10:0:0 chr10 110701023 . C A 206.78 PASS AO=38;DP=68;FAO=40;FDP=70;FR=.;FRO=30;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=22;FWDB=0.03364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.683;QD=11.8157;RBI=0.0342837;REFB=-0.00284546;REVB=-0.00661202;RO=29;SAF=25;SAR=13;SRF=7;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.323303;STB=0.662809;TYPE=snp;VARB=0.00207818;OID=.;OPOS=110701023;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:70:29:30:38:40:13:25:7:22:14:26:8:22 chr10 112044842 . TAAAAC T 137.34 PASS AO=45;DP=105;FAO=45;FDP=92;FR=.;FRO=47;FSAF=11;FSAR=34;FSRF=12;FSRR=35;FWDB=-0.0246186;FXX=0.079992;HRUN=4;LEN=5;MLLD=227.657;QD=5.97128;RBI=0.0294984;REFB=-0.00300522;REVB=-0.0162506;RO=0;SAF=11;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.31058;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507459;TYPE=del;VARB=0.0034124;OID=.;OPOS=112044843;OREF=AAAAC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:45:53:45:92:47:11:34:12:35:99:0:11:34:0:0 chr10 112266771 . C T 292.14 PASS AO=82;DP=188;FAO=81;FDP=188;FR=.;FRO=107;FSAF=28;FSAR=53;FSRF=30;FSRR=77;FWDB=0.0424175;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4809;QD=6.21572;RBI=0.0836473;REFB=0.00708792;REVB=0.0720946;RO=105;SAF=29;SAR=53;SRF=28;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0994754;STB=0.542141;TYPE=snp;VARB=-0.00953522;OID=.;OPOS=112266771;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:188:105:107:82:81:53:29:28:77:53:28:30:77 chr10 112266822 . G A 1459.83 PASS AO=152;DP=152;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=125;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0166623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.981;QD=38.1656;RBI=0.0219227;REFB=0;REVB=-0.0142469;RO=0;SAF=28;SAR=124;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.03706e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.23857e-05;OID=.;OPOS=112266822;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:152:153:0:0:152:153:124:28:0:0:125:28:0:0 chr10 112266823 . C T 1458.58 PASS AO=153;DP=153;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=125;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00757178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.8825;QD=38.1328;RBI=0.0109489;REFB=0;REVB=-0.00790865;RO=0;SAF=28;SAR=125;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.01305e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.32339e-05;OID=.;OPOS=112266823;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:153:153:0:0:153:153:125:28:0:0:125:28:0:0 chr10 112361870 . A G 2192.14 PASS AO=230;DP=231;FAO=231;FDP=231;FR=.;FRO=0;FSAF=108;FSAR=123;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0453375;FXX=0.00431016;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.9592;QD=37.9591;RBI=0.049605;REFB=-0.065533;REVB=0.0201288;RO=1;SAF=107;SAR=123;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00443294;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000334844;OID=.;OPOS=112361870;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:231:231:1:0:230:231:123:107:1:0:123:108:0:0 chr10 112402492 . G T 2005.56 PASS AO=212;DP=212;FAO=214;FDP=214;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=135;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0027599;FXX=0.00465095;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.172;QD=37.4871;RBI=0.00435347;REFB=-0.0693573;REVB=-0.00336684;RO=0;SAF=77;SAR=135;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.4771e-05;OID=.;OPOS=112402492;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:212:214:0:0:212:214:135:77:0:0:135:79:0:0 chr10 112572458 . G C 866.64 PASS AO=93;DP=95;FAO=94;FDP=96;FR=.;FRO=2;FSAF=52;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00695376;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=88.7186;QD=36.1099;RBI=0.0453363;REFB=-0.163217;REVB=0.0447998;RO=2;SAF=52;SAR=41;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00239266;STB=0.50112;TYPE=snp;VARB=0.00223859;OID=.;OPOS=112572458;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:95:96:2:2:93:94:41:52:1:1:42:52:1:1 chr10 112595719 . G C 586.66 PASS AO=60;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0196932;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.654;QD=37.8491;RBI=0.0396325;REFB=0;REVB=0.0343935;RO=0;SAF=34;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.99308e-05;OID=.;OPOS=112595719;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:61:62:0:0:60:62:26:34:0:0:28:34:0:0 chr10 112641053 . A G 778.17 PASS AO=89;DP=95;FAO=89;FDP=94;FR=.;FRO=5;FSAF=78;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.00154253;FXX=0.0105252;HRUN=3;LEN=1;MLLD=117.505;QD=33.1137;RBI=0.0680142;REFB=-0.156174;REVB=0.0679967;RO=4;SAF=78;SAR=11;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0236849;STB=0.509247;TYPE=snp;VARB=0.00214666;OID=.;OPOS=112641053;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:95:94:4:5:89:89:11:78:4:0:11:78:4:1 chr10 112839579 . A G 984.44 PASS AO=110;DP=120;FAO=112;FDP=119;FR=.;FRO=7;FSAF=30;FSAR=82;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.00672549;FXX=0.0775134;HRUN=3;LEN=1;MLLD=132.021;QD=33.0905;RBI=0.0102431;REFB=0.0254052;REVB=-0.00772585;RO=7;SAF=30;SAR=80;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0417741;STB=0.522289;TYPE=snp;VARB=-0.000281022;OID=.;OPOS=112839579;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:120:119:7:7:110:112:80:30:4:3:82:30:4:3 chr10 113913222 . T C 308.18 PASS AO=60;DP=107;FAO=61;FDP=109;FR=.;FRO=48;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=17;FSRR=31;FWDB=-0.0328292;FXX=0.0762647;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.1747;QD=11.3094;RBI=0.0331622;REFB=-0.0370932;REVB=-0.00468752;RO=44;SAF=28;SAR=32;SRF=15;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0987088;STB=0.546827;TYPE=snp;VARB=0.0312735;OID=.;OPOS=113913222;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:109:44:48:60:61:32:28:15:29:33:28:17:31 chr10 113917085 . T A 299.85 PASS AO=81;DP=184;FAO=81;FDP=184;FR=.;FRO=103;FSAF=31;FSAR=50;FSRF=44;FSRR=59;FWDB=0.00838483;FXX=0.00540511;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.501;QD=6.5185;RBI=0.0138745;REFB=-0.00948641;REVB=0.0110543;RO=100;SAF=31;SAR=50;SRF=43;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0490497;STB=0.526014;TYPE=snp;VARB=0.0121481;OID=.;OPOS=113917085;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:184:100:103:81:81:50:31:43:57:50:31:44:59 chr10 113920465 . G A 670.17 PASS AO=201;DP=442;FAO=177;FDP=389;FR=.;FRO=212;FSAF=81;FSAR=96;FSRF=100;FSRR=112;FWDB=0.0121591;FXX=0.0274993;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.8337;QD=6.8912;RBI=0.0327792;REFB=-0.0225435;REVB=0.0304407;RO=236;SAF=92;SAR=109;SRF=109;SRR=127;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0040946;STB=0.507713;TYPE=snp;VARB=0.0276484;OID=.;OPOS=113920465;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:442:389:236:212:201:177:109:92:109:127:96:81:100:112 chr10 113935379 . T C 150.57 PASS AO=38;DP=81;FAO=36;FDP=78;FR=.;FRO=42;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=-0.0315425;FXX=0.0370325;HRUN=4;LEN=1;MLLD=55.7953;QD=7.7217;RBI=0.104425;REFB=-0.0030437;REVB=-0.0995476;RO=42;SAF=14;SAR=24;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0596026;STB=0.568768;TYPE=snp;VARB=0.00399023;OID=.;OPOS=113935379;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:78:42:42:38:36:24:14:18:24:24:12:19:23 chr10 113940329 . T C 260.22 PASS AO=76;DP=185;FAO=76;FDP=184;FR=.;FRO=108;FSAF=35;FSAR=41;FSRF=47;FSRR=61;FWDB=0.0437256;FXX=0.0107521;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.189;QD=5.65691;RBI=0.0454244;REFB=-0.015304;REVB=0.0123067;RO=107;SAF=35;SAR=41;SRF=47;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0223978;STB=0.514999;TYPE=snp;VARB=0.0252273;OID=.;OPOS=113940329;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:184:107:108:76:76:41:35:47:60:41:35:47:61 chr10 114053546 . C G 1947.36 PASS AO=232;DP=256;FAO=234;FDP=255;FR=.;FRO=21;FSAF=145;FSAR=89;FSRF=2;FSRR=19;FWDB=-0.0423427;FXX=0.0039061;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7116;QD=30.5469;RBI=0.0577761;REFB=-0.00829929;REVB=0.0393087;RO=18;SAF=144;SAR=88;SRF=2;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.072618;STB=0.544824;TYPE=snp;VARB=0.000215599;OID=.;OPOS=114053546;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:256:255:18:21:232:234:88:144:2:16:89:145:2:19 chr10 114059330 . TCTCTGTTTTC T 348.67 PASS AO=36;DP=45;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00488765;FXX=0.159055;HRUN=1;LEN=10;MLLD=268.061;QD=37.694;RBI=0.0102714;REFB=0;REVB=0.00903398;RO=0;SAF=13;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21415e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=2.21713e-05;OID=.;OPOS=114059331;OREF=CTCTGTTTTC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:36:42:37:37:0:13:24:0:0:17:0:13:23:0:0 chr10 114154815 . C T 1950.45 PASS AO=215;DP=223;FAO=217;FDP=222;FR=.;FRO=5;FSAF=107;FSAR=110;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.000578689;FXX=0.0044841;HRUN=3;LEN=1;MLLD=155.218;QD=35.1433;RBI=0.00914421;REFB=-0.0328827;REVB=-0.00912588;RO=7;SAF=107;SAR=108;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00442651;STB=0.506912;TYPE=snp;VARB=0.000338315;OID=.;OPOS=114154815;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:223:222:7:5:215:217:108:107:4:3:110:107:4:1 chr10 114169276 . A G 2059.95 PASS AO=152;DP=212;FAO=215;FDP=215;FR=.;FRO=0;FSAF=165;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301924;FXX=0.00921617;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.5777;QD=38.3247;RBI=0.0402056;REFB=0;REVB=0.0265501;RO=0;SAF=151;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.3645e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000192499;OID=.;OPOS=114169276;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:97:161:215:0:0:152:215:1:151:0:0:50:165:0:0 chr10 114186624 . G A 2179.91 PASS AO=228;DP=229;FAO=230;FDP=230;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=134;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0311754;FXX=0.00432882;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.8536;QD=37.9115;RBI=0.0314641;REFB=-0.0325056;REVB=-0.00425219;RO=1;SAF=96;SAR=132;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00359661;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.27369e-05;OID=.;OPOS=114186624;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:229:230:1:0:228:230:132:96:0:1:134:96:0:0 chr10 114190352 . G C 1697.23 PASS AO=179;DP=186;FAO=179;FDP=179;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0138574;FXX=0.0376324;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.742;QD=37.9269;RBI=0.0146801;REFB=-0.0464318;REVB=0.00484542;RO=1;SAF=88;SAR=91;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00537921;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.08322e-05;OID=.;OPOS=114190352;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:186:179:1:0:179:179:91:88:1:0:91:88:0:0 chr10 114427978 . G A 184.2 PASS AO=47;DP=111;FAO=50;FDP=116;FR=.;FRO=66;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=38;FSRR=28;FWDB=-0.0215015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.143;QD=6.35173;RBI=0.0216973;REFB=-0.0179334;REVB=0.00290833;RO=63;SAF=27;SAR=20;SRF=38;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0300976;STB=0.509113;TYPE=snp;VARB=0.0211645;OID=.;OPOS=114427978;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:116:63:66:47:50:20:27:38:25:22:28:38:28 chr10 114831434 . A T 151.94 PASS AO=40;DP=92;FAO=40;FDP=92;FR=.;FRO=52;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=26;FSRR=26;FWDB=-0.046435;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.428;QD=6.60614;RBI=0.049657;REFB=-0.0171318;REVB=0.0175955;RO=52;SAF=15;SAR=25;SRF=26;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128909;STB=0.572589;TYPE=snp;VARB=0.0210206;OID=.;OPOS=114831434;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:52:52:40:40:25:15:26:26:25:15:26:26 chr10 115334124 . C T 99.36 PASS AO=37;DP=112;FAO=37;FDP=112;FR=.;FRO=75;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=59;FSRR=16;FWDB=0.0181846;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.196;QD=3.54854;RBI=0.0213521;REFB=-0.021335;REVB=-0.0111908;RO=74;SAF=21;SAR=16;SRF=59;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.286849;STB=0.655665;TYPE=snp;VARB=0.0542595;OID=.;OPOS=115334124;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:74:75:37:37:16:21:59:15:16:21:59:16 chr10 115341753 . G A 153.99 PASS AO=37;DP=78;FAO=37;FDP=78;FR=.;FRO=41;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=0.0287144;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.722;QD=7.89691;RBI=0.0350839;REFB=-0.0273616;REVB=0.0201584;RO=41;SAF=18;SAR=19;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.024182;STB=0.513506;TYPE=snp;VARB=0.0313999;OID=.;OPOS=115341753;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:41:41:37:37:19:18:21:20:19:18:21:20 chr10 115341846 . G A 51.15 PASS AO=12;DP=30;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.01516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.5669;QD=6.82061;RBI=0.061196;REFB=-0.059824;REVB=0.0592884;RO=17;SAF=7;SAR=5;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113103;STB=0.583194;TYPE=snp;VARB=0.0700586;OID=.;OPOS=115341846;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:30:30:17:18:12:12:5:7:8:9:5:7:8:10 chr10 115350597 . G A 318.28 PASS AO=60;DP=97;FAO=60;FDP=100;FR=.;FRO=40;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=10;FSRR=30;FWDB=0.0148491;FXX=0.00990001;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.559;QD=12.7314;RBI=0.034845;REFB=-0.0384556;REVB=-0.0315227;RO=37;SAF=31;SAR=29;SRF=10;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172439;STB=0.605996;TYPE=snp;VARB=0.030955;OID=.;OPOS=115350597;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:100:37:40:60:60:29:31:10:27:29:31:10:30 chr10 115352005 . A G 207.66 PASS AO=57;DP=145;FAO=61;FDP=149;FR=.;FRO=88;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=58;FSRR=30;FWDB=0.0281798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.6008;QD=5.57468;RBI=0.0293246;REFB=-0.0223231;REVB=-0.00811375;RO=77;SAF=25;SAR=32;SRF=47;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174774;STB=0.625772;TYPE=snp;VARB=0.0252595;OID=.;OPOS=115352005;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:149:77:88:57:61:32:25:47:30:34:27:58:30 chr10 115370254 . A G 178.18 PASS AO=51;DP=126;FAO=52;FDP=128;FR=.;FRO=76;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=26;FSRR=50;FWDB=-0.00893032;FXX=0.00775134;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.6773;QD=5.56803;RBI=0.00898412;REFB=-0.0116909;REVB=-0.000981686;RO=75;SAF=22;SAR=29;SRF=25;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107556;STB=0.549981;TYPE=snp;VARB=0.0117007;OID=.;OPOS=115370254;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:128:75:76:51:52:29:22:25:50:30:22:26:50 chr10 115370274 . T C 149.91 PASS AO=47;DP=124;FAO=47;FDP=123;FR=.;FRO=76;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=24;FSRR=52;FWDB=-0.0632374;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.704;QD=4.8751;RBI=0.0714913;REFB=-0.0285127;REVB=0.0333473;RO=76;SAF=19;SAR=28;SRF=24;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102521;STB=0.557979;TYPE=snp;VARB=0.0497086;OID=.;OPOS=115370274;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:123:76:76:47:47:28:19:24:52:28:19:24:52 chr10 115381747 . G A 903.89 PASS AO=188;DP=338;FAO=189;FDP=340;FR=.;FRO=151;FSAF=102;FSAR=87;FSRF=74;FSRR=77;FWDB=0.0101031;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=120.149;QD=10.6341;RBI=0.0174037;REFB=-0.0165714;REVB=0.014171;RO=148;SAF=102;SAR=86;SRF=73;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0401508;STB=0.522095;TYPE=snp;VARB=0.012785;OID=.;OPOS=115381747;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:338:340:148:151:188:189:86:102:73:75:87:102:74:77 chr10 115389356 . G A 291.23 PASS AO=67;DP=136;FAO=68;FDP=136;FR=.;FRO=68;FSAF=47;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=40;FWDB=0.0331831;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7074;QD=8.5656;RBI=0.103912;REFB=0.00541003;REVB=0.0984713;RO=68;SAF=47;SAR=20;SRF=28;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275951;STB=0.645386;TYPE=snp;VARB=-0.00384258;OID=.;OPOS=115389356;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:68:68:67:68:20:47:28:40:21:47:28:40 chr10 115389366 . G A 291.23 PASS AO=68;DP=143;FAO=69;FDP=141;FR=.;FRO=72;FSAF=50;FSAR=19;FSRF=27;FSRR=45;FWDB=-0.0407946;FXX=0.013985;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.179;QD=8.26175;RBI=0.0415929;REFB=0.00617953;REVB=0.0081095;RO=70;SAF=50;SAR=18;SRF=27;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.338313;STB=0.686198;TYPE=snp;VARB=-0.0146499;OID=.;OPOS=115389366;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:141:70:72:68:69:18:50:27:43:19:50:27:45 chr10 115393929 . G A 342.58 PASS AO=95;DP=218;FAO=95;FDP=220;FR=.;FRO=125;FSAF=60;FSAR=35;FSRF=67;FSRR=58;FWDB=-0.00174348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.006;QD=6.22876;RBI=0.0161046;REFB=-0.023365;REVB=-0.01601;RO=122;SAF=60;SAR=35;SRF=67;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0870522;STB=0.556596;TYPE=snp;VARB=0.0266682;OID=.;OPOS=115393929;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:218:220:122:125:95:95:35:60:67:55:35:60:67:58 chr10 115405615 . T C 1382.75 PASS AO=114;DP=155;FAO=151;FDP=151;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=86;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.089559;FXX=0.00657851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.9145;QD=36.6292;RBI=0.0897597;REFB=0;REVB=-0.00599806;RO=0;SAF=50;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.2792e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0107147;OID=.;OPOS=115405615;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:152:151:0:0:114:151:64:50:0:0:65:86:0:0 chr10 115405664 . C T 1446.26 PASS AO=153;DP=154;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0414301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.067;QD=37.5651;RBI=0.0418699;REFB=-0.0284883;REVB=0.00605284;RO=0;SAF=87;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.67317e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000254486;OID=.;OPOS=115405664;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:154:154:0:0:153:154:66:87:0:0:66:88:0:0 chr10 115411614 . A G 687.22 PASS AO=72;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00228478;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.6977;QD=37.6559;RBI=0.026509;REFB=0;REVB=-0.0264104;RO=0;SAF=25;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00134413;OID=.;OPOS=115411614;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:73:73:0:0:72:73:47:25:0:0:47:26:0:0 chr10 115417289 . G A 2079.19 PASS AO=213;DP=217;FAO=218;FDP=218;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=128;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00155638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.651;QD=38.1503;RBI=0.00162207;REFB=0;REVB=0.000456936;RO=0;SAF=89;SAR=124;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.83811e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000256094;OID=.;OPOS=115417289;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:217:218:0:0:213:218:124:89:0:0:128:90:0:0 chr10 115422474 . A G 328.05 PASS AO=72;DP=154;FAO=77;FDP=156;FR=.;FRO=79;FSAF=28;FSAR=49;FSRF=30;FSRR=49;FWDB=0.0188775;FXX=0.00636902;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.165;QD=8.41154;RBI=0.0211476;REFB=-0.0157697;REVB=0.00953202;RO=76;SAF=26;SAR=46;SRF=29;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0204774;STB=0.50877;TYPE=snp;VARB=0.01389;OID=.;OPOS=115422474;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:156:76:79:72:77:46:26:29:47:49:28:30:49 chr10 115439530 . G C 86.7 PASS AO=16;DP=28;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0350742;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.4297;QD=12.3855;RBI=0.0705805;REFB=-0.000429727;REVB=-0.0612488;RO=12;SAF=8;SAR=8;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0633569;STB=0.53567;TYPE=snp;VARB=-0.00112652;OID=.;OPOS=115439530;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:28:28:12:12:16:16:8:8:5:7:8:8:5:7 chr10 115439569 . C T 42.12 PASS AO=12;DP=35;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.00753422;FXX=0.0277701;HRUN=4;LEN=1;MLLD=96.3434;QD=4.81364;RBI=0.00909756;REFB=-0.0222141;REVB=0.00509913;RO=21;SAF=5;SAR=7;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0130543;STB=0.504418;TYPE=snp;VARB=0.036148;OID=.;OPOS=115439569;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:35:35:21:22:12:13:7:5:9:12:7:6:10:12 chr10 115609831 . TA T 142.31 PASS AO=50;DP=228;FAO=142;FDP=223;FR=.;FRO=81;FSAF=58;FSAR=84;FSRF=28;FSRR=53;FWDB=0.0477818;FXX=0.0261997;HRUN=7;LEN=1;MLLD=5.13767;QD=2.55256;RBI=0.118038;REFB=-0.0629606;REVB=-0.107935;RO=74;SAF=12;SAR=38;SRF=28;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177926;STB=0.523794;TYPE=del;VARB=0.0986721;OID=.;OPOS=115609832;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:50:197:142:223:81:58:84:28:53:35:74:12:38:28:46 chr10 115609915 . C G 1883.07 PASS AO=204;DP=212;FAO=205;FDP=205;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=143;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00123806;FXX=0.0330173;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.805;QD=36.7429;RBI=0.022397;REFB=0.0246217;REVB=-0.0223628;RO=4;SAF=61;SAR=143;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00214294;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.86936e-05;OID=.;OPOS=115609915;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:212:205:4:0:204:205:143:61:1:3:143:62:0:0 chr10 115644040 . G A 305.66 PASS AO=77;DP=165;FAO=77;FDP=165;FR=.;FRO=88;FSAF=58;FSAR=19;FSRF=51;FSRR=37;FWDB=0.031557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.8033;QD=7.40998;RBI=0.0353181;REFB=-0.0164569;REVB=-0.0158597;RO=88;SAF=58;SAR=19;SRF=51;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198335;STB=0.61061;TYPE=snp;VARB=0.0209104;OID=.;OPOS=115644040;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:165:88:88:77:77:19:58:51:37:19:58:51:37 chr10 115675025 . G A 865.2 PASS AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00568915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.9144;QD=38.0307;RBI=0.0534644;REFB=0;REVB=0.0531609;RO=0;SAF=43;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000280452;OID=.;OPOS=115675025;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:91:91:0:0:91:91:48:43:0:0:48:43:0:0 chr10 115905407 . T C 460.01 PASS AO=106;DP=210;FAO=106;FDP=210;FR=.;FRO=104;FSAF=64;FSAR=42;FSRF=52;FSRR=52;FWDB=0.000346323;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=189.204;QD=8.76203;RBI=0.00106907;REFB=-0.00626324;REVB=0.00101142;RO=100;SAF=64;SAR=42;SRF=51;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0850401;STB=0.552525;TYPE=snp;VARB=0.00685802;OID=.;OPOS=115905407;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:210:210:100:104:106:106:42:64:51:49:42:64:52:52 chr10 115980422 . G C 396.85 PASS AO=67;DP=213;FAO=99;FDP=207;FR=.,HEALED;FRO=108;FSAF=64;FSAR=35;FSRF=60;FSRR=48;FWDB=0.0131511;FXX=0.00956892;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.1882;QD=7.66859;RBI=0.075858;REFB=-0.0273667;REVB=0.0747094;RO=69;SAF=56;SAR=11;SRF=54;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0830996;STB=0.550342;TYPE=snp;VARB=0.0275558;OID=.;OPOS=115980422;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:207:69:108:67:99:11:56:54:15:35:64:60:48 chr10 116032519 . A G 177.26 PASS AO=52;DP=126;FAO=52;FDP=128;FR=.;FRO=76;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=36;FSRR=40;FWDB=-0.0685455;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.1132;QD=5.53939;RBI=0.114636;REFB=0.0127388;REVB=-0.0918848;RO=74;SAF=25;SAR=27;SRF=36;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00597219;STB=0.504213;TYPE=snp;VARB=-0.0202585;OID=.;OPOS=116032519;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:128:74:76:52:52:27:25:36:38:27:25:36:40 chr10 116049152 . C CGGAGGCTTG 23.82 PASS AO=20;DP=109;FAO=20;FDP=104;FR=.;FRO=84;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=49;FSRR=35;FWDB=-0.0174821;FXX=0;HRUN=2;LEN=9;MLLD=255.16;QD=0.916289;RBI=0.0179254;REFB=-0.0138328;REVB=-0.00396179;RO=87;SAF=10;SAR=10;SRF=49;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0802643;STB=0.567242;TYPE=ins;VARB=0.0520297;OID=.;OPOS=116049153;OREF=-;OALT=GGAGGCTTG;OMAPALT=CGGAGGCTTG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:20:109:20:104:84:10:10:49:35:23:87:10:10:49:38 chr10 116060387 . T C 289.94 PASS AO=29;DP=29;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0474088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.481;QD=37.4116;RBI=0.0558727;REFB=0;REVB=0.0295663;RO=0;SAF=7;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.60551e-05;OID=.;OPOS=116060387;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:29:31:0:0:29:31:22:7:0:0:24:7:0:0 chr10 116073696 . C T 1437.29 PASS AO=149;DP=149;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276292;FXX=0.00666622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.3937;QD=38.5849;RBI=0.0315032;REFB=0;REVB=0.0151354;RO=0;SAF=55;SAR=94;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000103591;OID=.;OPOS=116073696;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:149:149:0:0:149:149:94:55:0:0:94:55:0:0 chr10 116085784 . C CCG,CCCG 659.94 PASS AO=13,52;DP=83;FAO=0,73;FDP=75;FR=.;FRO=2;FSAF=0,29;FSAR=0,44;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00368409,0.0202631;FXX=0.0506265;HRUN=3,3;LEN=2,3;MLLD=157.027,173.967;QD=35.1967;RBI=0.0127226,0.0227839;REFB=0.00721466,0.0129299;REVB=-0.0121775,-0.0104169;RO=9;SAF=12,13;SAR=1,39;SRF=4;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.541637,-0.0687997;STB=0.5,0.502856;TYPE=ins,ins;VARB=0,-1.13294e-05;OID=.,.;OPOS=116085785,116085785;OREF=-,-;OALT=CG,CCG;OMAPALT=CCG,CCCG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:13,52:83:0,73:75:2:0,29:0,44:1:1:19:9:12,13:1,39:4:5 chr10 116307504 . A G 138.8 PASS AO=28;DP=56;FAO=29;FDP=55;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=0.0388525;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.82;QD=10.0948;RBI=0.0463145;REFB=0.0108727;REVB=-0.0252094;RO=25;SAF=14;SAR=14;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0847192;STB=0.546568;TYPE=snp;VARB=-0.0066818;OID=.;OPOS=116307504;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:55:25:26:28:29:14:14:15:10:14:15:16:10 chr10 116593175 . C T 277.64 PASS AO=71;DP=165;FAO=77;FDP=178;FR=.;FRO=101;FSAF=31;FSAR=46;FSRF=48;FSRR=53;FWDB=-0.006231;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.742;QD=6.23914;RBI=0.0384518;REFB=-0.0217665;REVB=-0.0379436;RO=94;SAF=25;SAR=46;SRF=41;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0909277;STB=0.542134;TYPE=snp;VARB=0.0273041;OID=.;OPOS=116593175;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:178:94:101:71:77:46:25:41:53:46:31:48:53 chr10 116615045 . T C 603.72 PASS AO=137;DP=265;FAO=137;FDP=265;FR=.;FRO=128;FSAF=84;FSAR=53;FSRF=61;FSRR=67;FWDB=0.0227455;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=71.9311;QD=9.11269;RBI=0.0235771;REFB=-0.0128282;REVB=-0.00620695;RO=127;SAF=84;SAR=53;SRF=61;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119389;STB=0.567398;TYPE=snp;VARB=0.0110583;OID=.;OPOS=116615045;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:265:265:127:128:137:137:53:84:61:66:53:84:61:67 chr10 116659253 . A G 1578.15 PASS AO=154;DP=154;FAO=166;FDP=166;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0874365;FXX=0.00598767;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.4711;QD=38.0277;RBI=0.0946524;REFB=0;REVB=-0.0362483;RO=0;SAF=47;SAR=107;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000393826;OID=.;OPOS=116659253;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:154:166:0:0:154:166:107:47:0:0:107:59:0:0 chr10 116719543 . G A 1472.28 PASS AO=159;DP=161;FAO=160;FDP=160;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00793736;FXX=0.0123449;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.5921;QD=36.807;RBI=0.0400676;REFB=-0.0636133;REVB=-0.0392735;RO=2;SAF=79;SAR=80;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0117449;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00117962;OID=.;OPOS=116719543;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:161:160:2:0:159:160:80:79:0:2:81:79:0:0 chr10 116931101 . C CTT,T 535.34 PASS AO=38,17;DP=60;FAO=48,10;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=10,3;FSAR=38,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162895,-0.00800021;FXX=0.0169463;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=41.7842,157.168;QD=36.9199;RBI=0.0355469,0.0118621;REFB=0,0;REVB=0.0315948,0.00875826;RO=4;SAF=8,5;SAR=30,12;SRF=2;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0736817,-0.0823487;STB=0.5,0.5;TYPE=ins,snp;VARB=-0.000163009,0.0223754;OID=.,.;OPOS=116931102,116931101;OREF=-,C;OALT=TT,T;OMAPALT=CTT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:13:60:58:4:0:38,17:48,10:30,12:8,5:2:2:38,7:10,3:0:0 chr10 117075175 . G A 1984.8 PASS AO=202;DP=204;FAO=206;FDP=206;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=124;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00319827;FXX=0.00961492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.16;QD=38.5398;RBI=0.00953542;REFB=0;REVB=-0.00898306;RO=0;SAF=80;SAR=122;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.06798e-05;OID=.;OPOS=117075175;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:94:204:206:0:0:202:206:122:80:0:0:124:82:0:0 chr10 117228794 . A G 3797.75 PASS AO=442;DP=446;FAO=398;FDP=398;FR=.;FRO=0;FSAF=160;FSAR=238;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00471876;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.209;QD=38.1683;RBI=0.00477474;REFB=0;REVB=0.000728954;RO=0;SAF=173;SAR=269;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.25966e-05;OID=.;OPOS=117228794;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:446:398:0:0:442:398:269:173:0:0:238:160:0:0 chr10 117486763 . G T 370.12 PASS AO=109;DP=265;FAO=109;FDP=263;FR=.;FRO=154;FSAF=49;FSAR=60;FSRF=94;FSRR=60;FWDB=0.00796683;FXX=0.00754688;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.808;QD=5.62918;RBI=0.0198409;REFB=-0.0108348;REVB=0.0181711;RO=153;SAF=49;SAR=60;SRF=93;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164426;STB=0.593344;TYPE=snp;VARB=0.0163114;OID=.;OPOS=117486763;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:265:263:153:154:109:109:60:49:93:60:60:49:94:60 chr10 117823739 . A G 214.46 PASS AO=62;DP=149;FAO=62;FDP=151;FR=.;FRO=89;FSAF=23;FSAR=39;FSRF=39;FSRR=50;FWDB=-0.0121708;FXX=0.013071;HRUN=3;LEN=1;MLLD=111.08;QD=5.68109;RBI=0.0174911;REFB=-0.015153;REVB=0.0125622;RO=87;SAF=23;SAR=39;SRF=39;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0839291;STB=0.541532;TYPE=snp;VARB=0.0136341;OID=.;OPOS=117823739;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:151:87:89:62:62:39:23:39:48:39:23:39:50 chr10 117884950 . G A 1361.12 PASS AO=143;DP=147;FAO=145;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203141;FXX=0.0333311;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.3;QD=37.5482;RBI=0.0786838;REFB=-0.108159;REVB=0.0760163;RO=0;SAF=66;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.14598e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000509829;OID=.;OPOS=117884950;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:147:145:0:0:143:145:77:66:0:0:79:66:0:0 chr10 118231360 . G A 1869.83 PASS AO=195;DP=195;FAO=196;FDP=196;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00825593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.074;QD=38.1598;RBI=0.0487387;REFB=0;REVB=0.0480343;RO=0;SAF=75;SAR=120;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000274107;OID=.;OPOS=118231360;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:195:196:0:0:195:196:120:75:0:0:120:76:0:0 chr10 118231363 . A G 1875.29 PASS AO=164;DP=165;FAO=196;FDP=196;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00318467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.936;QD=38.2712;RBI=0.0036536;REFB=0;REVB=0.00179071;RO=0;SAF=56;SAR=108;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.38561e-05;OID=.;OPOS=118231363;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:89:165:196:0:0:164:196:108:56:0:0:120:76:0:0 chr10 118313265 . T C 1196.52 PASS AO=126;DP=129;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000671546;FXX=0.023254;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.6302;QD=37.9847;RBI=0.040256;REFB=-0.0131801;REVB=0.0402504;RO=1;SAF=64;SAR=62;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00760253;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000675702;OID=.;OPOS=118313265;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:129:126:1:0:126:126:62:64:0:1:62:64:0:0 chr10 118363642 . T C 3037.73 PASS AO=316;DP=318;FAO=318;FDP=318;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=221;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00524409;FXX=0.0031347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.753;QD=38.2105;RBI=0.0173803;REFB=0;REVB=0.0165703;RO=1;SAF=95;SAR=221;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00499438;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.3685e-05;OID=.;OPOS=118363642;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:318:318:1:0:316:318:221:95:1:0:221:97:0:0 chr10 118368606 . T C 207.88 PASS AO=42;DP=77;FAO=42;FDP=76;FR=.;FRO=34;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=26;FWDB=-0.0220573;FXX=0.0256377;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.305;QD=10.9409;RBI=0.0298785;REFB=-0.0173294;REVB=-0.0201544;RO=33;SAF=28;SAR=14;SRF=8;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.335263;STB=0.689567;TYPE=snp;VARB=0.0130581;OID=.;OPOS=118368606;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:76:33:34:42:42:14:28:8:25:14:28:8:26 chr10 118380511 . A G 187.64 PASS AO=12;DP=20;FAO=19;FDP=19;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.174025;FXX=0.049975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.876;QD=39.5028;RBI=0.193625;REFB=0;REVB=0.0848887;RO=0;SAF=5;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0049742;OID=.;OPOS=118380511;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:20:19:0:0:12:19:7:5:0:0:11:8:0:0 chr10 118383463 . A AG 1708.49 PASS AO=203;DP=240;FAO=224;FDP=224;FR=.;FRO=0;FSAF=102;FSAR=122;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.259067;FXX=0.0627589;HRUN=1;LEN=1;MLLD=22.06;QD=30.5088;RBI=0.281076;REFB=0;REVB=0.109033;RO=19;SAF=91;SAR=112;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.029996;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00290911;OID=.;OPOS=118383464;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:203:240:224:224:0:102:122:0:0:99:19:91:112:12:7 chr10 118397884 . A G 186.88 PASS AO=51;DP=120;FAO=52;FDP=123;FR=.;FRO=71;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=39;FSRR=32;FWDB=0.0265755;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3452;QD=6.07743;RBI=0.0358703;REFB=0.00492054;REVB=-0.0240919;RO=69;SAF=29;SAR=22;SRF=39;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00355722;STB=0.504905;TYPE=snp;VARB=-0.00738779;OID=.;OPOS=118397884;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:123:69:71:51:52:22:29:39:30:23:29:39:32 chr10 118397894 . A G 200.01 PASS AO=56;DP=129;FAO=55;FDP=128;FR=.;FRO=73;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=39;FSRR=34;FWDB=0.0139547;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.171;QD=6.25021;RBI=0.0257343;REFB=-0.00993749;REVB=-0.0216222;RO=73;SAF=31;SAR=25;SRF=39;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0197173;STB=0.506435;TYPE=snp;VARB=0.0139897;OID=.;OPOS=118397894;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:128:73:73:56:55:25:31:39:34:25:30:39:34 chr10 118397971 . A G 238.8 PASS AO=59;DP=122;FAO=59;FDP=126;FR=.;FRO=67;FSAF=26;FSAR=33;FSRF=34;FSRR=33;FWDB=-0.0261313;FXX=0.0078734;HRUN=4;LEN=1;MLLD=114.451;QD=7.58096;RBI=0.0261359;REFB=-0.0232045;REVB=-0.000490654;RO=63;SAF=26;SAR=33;SRF=33;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0777842;STB=0.535702;TYPE=snp;VARB=0.0215924;OID=.;OPOS=118397971;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:126:63:67:59:59:33:26:33:30:33:26:34:33 chr10 118404620 . A G 258.47 PASS AO=67;DP=136;FAO=64;FDP=136;FR=.;FRO=72;FSAF=29;FSAR=35;FSRF=20;FSRR=52;FWDB=0.0218312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.123;QD=7.60191;RBI=0.0233595;REFB=-0.0104521;REVB=-0.00831057;RO=68;SAF=29;SAR=38;SRF=20;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131941;STB=0.5953;TYPE=snp;VARB=0.0164041;OID=.;OPOS=118404620;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:68:72:67:64:38:29:20:48:35:29:20:52 chr10 118616110 . C T 12.85 PASS AO=5;DP=24;FAO=5;FDP=24;FR=.;FRO=19;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=0.0346192;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.692;QD=2.14129;RBI=0.0425639;REFB=-0.0137119;REVB=-0.0247628;RO=18;SAF=1;SAR=4;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122663;STB=0.571123;TYPE=snp;VARB=0.100588;OID=.;OPOS=118616110;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:24:24:18:19:5:5:4:1:5:13:4:1:5:14 chr10 118620459 . A C 568.38 PASS AO=131;DP=258;FAO=131;FDP=258;FR=.;FRO=127;FSAF=79;FSAR=52;FSRF=54;FSRR=73;FWDB=-0.00254861;FXX=0.00386085;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.3806;QD=8.81204;RBI=0.00263574;REFB=-0.00245113;REVB=-0.000672091;RO=127;SAF=79;SAR=52;SRF=54;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160744;STB=0.588099;TYPE=snp;VARB=0.00222393;OID=.;OPOS=118620459;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:258:258:127:127:131:131:52:79:54:73:52:79:54:73 chr10 118890573 . T C 1127.69 PASS AO=84;DP=129;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.171176;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.8604;QD=37.9055;RBI=0.171655;REFB=1.98239e-06;REVB=0.0128062;RO=0;SAF=5;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000604632;OID=.;OPOS=118890573;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:91:119:0:0:84:119:79:5:0:0:107:12:0:0 chr10 119026566 . T C 2048.8 PASS AO=227;DP=235;FAO=227;FDP=235;FR=.;FRO=8;FSAF=109;FSAR=118;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.00273972;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.875;QD=34.8732;RBI=0.0432609;REFB=-0.214155;REVB=0.0431741;RO=0;SAF=109;SAR=118;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512121;TYPE=snp;VARB=0.00130464;OID=.;OPOS=119026566;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:235:235:0:8:227:227:118:109:0:0:118:109:1:7 chr10 119768551 . C T 936.8 PASS AO=97;DP=97;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.032309;FXX=0.0288434;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.427;QD=37.1009;RBI=0.0335506;REFB=0;REVB=0.00904274;RO=0;SAF=80;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000470087;OID=.;OPOS=119768551;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:97:101:0:0:97:101:17:80:0:0:17:84:0:0 chr10 120069611 . T C 508.51 PASS AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.020116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.608;QD=37.6675;RBI=0.0253678;REFB=0;REVB=-0.0154555;RO=0;SAF=52;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0874e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.37515e-05;OID=.;OPOS=120069611;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:54:54:0:0:54:54:2:52:0:0:2:52:0:0 chr10 120070427 . G T 52.56 PASS AO=15;DP=42;FAO=15;FDP=41;FR=.;FRO=26;FSAF=1;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=21;FWDB=-0.0874135;FXX=0.0238039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.888;QD=5.12821;RBI=0.0894124;REFB=-0.00403124;REVB=-0.0188007;RO=26;SAF=1;SAR=14;SRF=5;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.335161;STB=0.705527;TYPE=snp;VARB=0.011581;OID=.;OPOS=120070427;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:42:41:26:26:15:15:14:1:5:21:14:1:5:21 chr10 120353910 . T C 262.27 PASS AO=26;DP=26;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.704;QD=37.4677;RBI=0.0554787;REFB=0;REVB=0.0526921;RO=0;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00338021;OID=.;OPOS=120353910;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:26:28:0:0:26:28:12:14:0:0:13:15:0:0 chr10 120791060 . A C 581.88 PASS AO=58;DP=63;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0348931;FXX=0.0461467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.38;QD=37.5405;RBI=0.0349439;REFB=0;REVB=0.00188505;RO=0;SAF=15;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.20304e-05;OID=.;OPOS=120791060;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:63:62:0:0:58:62:43:15:0:0:45:17:0:0 chr10 120792297 . G GCTA 812.18 PASS AO=119;DP=163;FAO=122;FDP=162;FR=.;FRO=40;FSAF=60;FSAR=62;FSRF=30;FSRR=10;FWDB=0.0167304;FXX=0.00613459;HRUN=1;LEN=3;MLLD=268.187;QD=20.0538;RBI=0.037422;REFB=-0.0086576;REVB=0.0334738;RO=41;SAF=60;SAR=59;SRF=31;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121156;STB=0.563626;TYPE=ins;VARB=0.00205754;OID=.;OPOS=120792298;OREF=-;OALT=CTA;OMAPALT=GCTA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:119:163:122:162:40:60:62:30:10:66:41:60:59:31:10 chr10 120792684 . A G 534.87 PASS AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0433508;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.755;QD=38.2048;RBI=0.0440457;REFB=0;REVB=0.00779343;RO=0;SAF=27;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00106824;OID=.;OPOS=120792684;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:56:56:0:0:56:56:29:27:0:0:30:26:0:0 chr10 120792703 . C A 786.11 PASS AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0231821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.152;QD=37.8848;RBI=0.0252043;REFB=0;REVB=-0.00989173;RO=0;SAF=49;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.54212e-05;OID=.;OPOS=120792703;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:83:83:0:0:83:83:34:49:0:0:34:49:0:0 chr10 120820528 . A G 483.6 PASS AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00518199;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=69.1749;QD=35.8218;RBI=0.0154377;REFB=0.0463389;REVB=0.014542;RO=1;SAF=20;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140652;STB=0.50746;TYPE=snp;VARB=0.00019263;OID=.;OPOS=120820528;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:54:54:1:1:53:53:33:20:0:1:33:20:0:1 chr10 120828969 . A G 1004.59 PASS AO=104;DP=106;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0364572;FXX=0.0186898;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.65;QD=38.27;RBI=0.0611183;REFB=0;REVB=0.0490542;RO=0;SAF=48;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.9768e-05;OID=.;OPOS=120828969;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:106:105:0:0:104:105:56:48:0:0:56:49:0:0 chr10 120896027 . G A 1719.78 PASS AO=170;DP=183;FAO=183;FDP=183;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0240266;FXX=0.0368402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.5158;QD=37.5908;RBI=0.0300503;REFB=0;REVB=-0.0180484;RO=0;SAF=90;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.86729e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00442321;OID=.;OPOS=120896027;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:82:183:183:0:0:170:183:80:90:0:0:91:92:0:0 chr10 120909313 . T A 182.6 PASS AO=34;DP=57;FAO=34;FDP=57;FR=.;FRO=23;FSAF=3;FSAR=31;FSRF=3;FSRR=20;FWDB=0.000265903;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.313;QD=12.8139;RBI=0.00535506;REFB=-0.0078246;REVB=0.00534845;RO=23;SAF=3;SAR=31;SRF=3;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.087902;STB=0.548642;TYPE=snp;VARB=0.0129667;OID=.;OPOS=120909313;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:57:57:23:23:34:34:31:3:3:20:31:3:3:20 chr10 120914692 . G A 255.52 PASS AO=60;DP=123;FAO=60;FDP=122;FR=.;FRO=62;FSAF=17;FSAR=43;FSRF=25;FSRR=37;FWDB=-0.0292083;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.662;QD=8.3777;RBI=0.0307468;REFB=-0.0358895;REVB=0.00960441;RO=62;SAF=17;SAR=43;SRF=25;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126838;STB=0.570411;TYPE=snp;VARB=0.0293316;OID=.;OPOS=120914692;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:122:62:62:60:60:43:17:25:37:43:17:25:37 chr10 120917616 . G A 376.71 PASS AO=80;DP=148;FAO=80;FDP=148;FR=.;FRO=68;FSAF=35;FSAR=45;FSRF=41;FSRR=27;FWDB=-0.0110916;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.611;QD=10.1813;RBI=0.0110931;REFB=-0.00973984;REVB=0.00017671;RO=68;SAF=35;SAR=45;SRF=41;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138508;STB=0.575739;TYPE=snp;VARB=0.00760812;OID=.;OPOS=120917616;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:68:68:80:80:45:35:41:27:45:35:41:27 chr10 120919246 . T C 548.32 PASS AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0466604;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.126;QD=38.4789;RBI=0.0478964;REFB=0;REVB=0.0108107;RO=0;SAF=26;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19358e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00115807;OID=.;OPOS=120919246;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:57:57:0:0:57:57:31:26:0:0:31:26:0:0 chr10 120933324 . G A 88.65 PASS AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=0;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=16;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.2809;QD=10.4291;RBI=0.025141;REFB=-0.0136456;REVB=-0.025141;RO=15;SAF=0;SAR=18;SRF=0;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0143025;OID=.;OPOS=120933324;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:34:34:15:16:18:18:18:0:0:15:18:0:0:16 chr10 120972555 . G C 90.03 PASS AO=25;DP=66;FAO=26;FDP=66;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=-0.0289278;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.221;QD=5.45661;RBI=0.0349749;REFB=-0.00685308;REVB=0.0196577;RO=36;SAF=15;SAR=10;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216208;STB=0.600861;TYPE=snp;VARB=0.0317785;OID=.;OPOS=120972555;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:66:66:36:40:25:26:10:15:14:22:10:16:18:22 chr10 121199310 . T C 117.78 PASS AO=35;DP=101;FAO=38;FDP=103;FR=.;FRO=65;FSAF=10;FSAR=28;FSRF=15;FSRR=50;FWDB=0.0284038;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.2064;QD=4.57379;RBI=0.0290509;REFB=-0.0353061;REVB=0.00609739;RO=63;SAF=10;SAR=25;SRF=15;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0676926;STB=0.527013;TYPE=snp;VARB=0.0519386;OID=.;OPOS=121199310;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:103:63:65:35:38:25:10:15:48:28:10:15:50 chr10 121201580 . TG T 91.24 PASS AO=10;DP=19;FAO=19;FDP=20;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.291118;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=10.879;QD=18.2488;RBI=0.358059;REFB=-0.0773377;REVB=0.208462;RO=9;SAF=3;SAR=7;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0.234848;SSSB=0.0787205;STB=0.555494;TYPE=del;VARB=0.0644807;OID=.;OPOS=121201581;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:10:19:19:20:1:4:15:1:0:6:9:3:7:2:7 chr10 121436362 . A G 963.71 PASS AO=103;DP=104;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00945296;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.393;QD=37.4256;RBI=0.0228139;REFB=-0.0928259;REVB=0.0207633;RO=1;SAF=43;SAR=60;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0109066;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000293433;OID=.;OPOS=121436362;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:104:103:1:0:103:103:60:43:1:0:60:43:0:0 chr10 121527997 . C T 192.82 PASS AO=48;DP=109;FAO=50;FDP=111;FR=.;FRO=61;FSAF=16;FSAR=34;FSRF=31;FSRR=30;FWDB=0.0731443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.055;QD=6.94861;RBI=0.0731463;REFB=-0.00744738;REVB=-0.000541187;RO=61;SAF=15;SAR=33;SRF=31;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206883;STB=0.609413;TYPE=snp;VARB=0.00697725;OID=.;OPOS=121527997;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:111:61:61:48:50:33:15:31:30:34:16:31:30 chr10 121551581 . A C 192.63 PASS AO=56;DP=138;FAO=56;FDP=137;FR=.;FRO=81;FSAF=36;FSAR=20;FSRF=51;FSRR=30;FWDB=-0.00500618;FXX=0.00724585;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.939;QD=5.62428;RBI=0.00580103;REFB=0.00760993;REVB=0.0029309;RO=82;SAF=36;SAR=20;SRF=52;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00997002;STB=0.508472;TYPE=snp;VARB=-0.0110371;OID=.;OPOS=121551581;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:137:82:81:56:56:20:36:52:30:20:36:51:30 chr10 121586882 . A G 113.41 PASS AO=25;DP=51;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=3;FSRR=23;FWDB=0.00109153;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=248.677;QD=8.89492;RBI=0.00190239;REFB=-0.0257645;REVB=-0.0015581;RO=26;SAF=8;SAR=17;SRF=3;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237174;STB=0.631074;TYPE=snp;VARB=0.0219664;OID=.;OPOS=121586882;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:26:26:25:25:17:8:3:23:17:8:3:23 chr10 121589402 . T G 354.44 PASS AO=101;DP=236;FAO=101;FDP=238;FR=.;FRO=137;FSAF=55;FSAR=46;FSRF=88;FSRR=49;FWDB=-0.0194586;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=96.4316;QD=5.95702;RBI=0.0205697;REFB=-0.00239421;REVB=-0.00666905;RO=135;SAF=55;SAR=46;SRF=87;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104703;STB=0.557305;TYPE=snp;VARB=0.00374891;OID=.;OPOS=121589402;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:236:238:135:137:101:101:46:55:87:48:46:55:88:49 chr10 121602914 . C T 361.67 PASS AO=74;DP=138;FAO=79;FDP=147;FR=.;FRO=68;FSAF=34;FSAR=45;FSRF=28;FSRR=40;FWDB=-0.0115709;FXX=0.0134219;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.3641;QD=9.84131;RBI=0.04174;REFB=-0.035942;REVB=0.0401041;RO=64;SAF=34;SAR=40;SRF=27;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0321269;STB=0.508801;TYPE=snp;VARB=0.0318009;OID=.;OPOS=121602914;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:147:64:68:74:79:40:34:27:37:45:34:28:40 chr10 121662335 . G T 594.96 PASS AO=125;DP=234;FAO=127;FDP=232;FR=.;FRO=105;FSAF=73;FSAR=54;FSRF=57;FSRR=48;FWDB=-0.0634724;FXX=0.00854664;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.4941;QD=10.2579;RBI=0.0638635;REFB=-0.00224198;REVB=0.00705717;RO=103;SAF=72;SAR=53;SRF=57;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0191223;STB=0.514722;TYPE=snp;VARB=0.00235157;OID=.;OPOS=121662335;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:234:232:103:105:125:127:53:72:57:46:54:73:57:48 chr10 121679013 . A G 531.09 PASS AO=146;DP=335;FAO=146;FDP=332;FR=.;FRO=186;FSAF=70;FSAR=76;FSRF=88;FSRR=98;FWDB=0.000384596;FXX=0.0206484;HRUN=3;LEN=1;MLLD=207.171;QD=6.39872;RBI=0.0142806;REFB=-0.0161651;REVB=-0.0142754;RO=181;SAF=70;SAR=76;SRF=88;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00674249;STB=0.503555;TYPE=snp;VARB=0.0187658;OID=.;OPOS=121679013;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:335:332:181:186:146:146:76:70:88:93:76:70:88:98 chr10 121701160 . G T 239.31 PASS AO=54;DP=132;FAO=62;FDP=137;FR=.;FRO=75;FSAF=35;FSAR=27;FSRF=37;FSRR=38;FWDB=-0.0148115;FXX=0.0143875;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.992;QD=6.98712;RBI=0.0169936;REFB=-0.00648363;REVB=0.00833073;RO=73;SAF=33;SAR=21;SRF=37;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109166;STB=0.539215;TYPE=snp;VARB=0.00737144;OID=.;OPOS=121701160;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:137:73:75:54:62:21:33:37:36:27:35:37:38 chr10 121718112 . C T 159.82 PASS AO=41;DP=92;FAO=41;FDP=92;FR=.;FRO=51;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=31;FWDB=0.0351145;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.5052;QD=6.9486;RBI=0.0351862;REFB=-0.0206399;REVB=-0.00224518;RO=50;SAF=21;SAR=20;SRF=19;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129493;STB=0.566335;TYPE=snp;VARB=0.0248009;OID=.;OPOS=121718112;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:50:51:41:41:20:21:19:31:20:21:20:31 chr10 122216862 . C T 186 PASS AO=33;DP=58;FAO=35;FDP=60;FR=.;FRO=25;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=0.0196161;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.382;QD=12.4002;RBI=0.0622324;REFB=-0.0352277;REVB=0.05906;RO=25;SAF=21;SAR=12;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217645;STB=0.626386;TYPE=snp;VARB=0.0235901;OID=.;OPOS=122216862;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:58:60:25:25:33:35:12:21:9:16:12:23:9:16 chr10 122358342 . G C 1251.73 PASS AO=133;DP=135;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0799027;FXX=0.0148137;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1926;QD=37.6461;RBI=0.08071;REFB=0.00136318;REVB=-0.0113875;RO=1;SAF=65;SAR=68;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00725672;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00022561;OID=.;OPOS=122358342;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:135:133:1:0:133:133:68:65:1:0:68:65:0:0 chr10 122358463 . G A 287.08 PASS AO=77;DP=174;FAO=77;FDP=174;FR=.;FRO=97;FSAF=34;FSAR=43;FSRF=49;FSRR=48;FWDB=0.0306627;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=152.752;QD=6.59953;RBI=0.0495277;REFB=-0.0100182;REVB=0.0388946;RO=96;SAF=34;SAR=43;SRF=49;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0689822;STB=0.535635;TYPE=snp;VARB=0.0136172;OID=.;OPOS=122358463;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:174:96:97:77:77:43:34:49:47:43:34:49:48 chr10 122358604 . C T 74.13 PASS AO=13;DP=22;FAO=13;FDP=22;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.0231882;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=170.617;QD=13.4779;RBI=0.0231949;REFB=-0.0183033;REVB=0.000559082;RO=9;SAF=3;SAR=10;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00872399;STB=0.504943;TYPE=snp;VARB=0.00874667;OID=.;OPOS=122358604;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:22:22:9:9:13:13:10:3:2:7:10:3:2:7 chr10 122358657 . A T 290.88 PASS AO=31;DP=34;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0813726;FXX=0.0882094;HRUN=3;LEN=1;MLLD=64.9404;QD=37.5323;RBI=0.0850933;REFB=0;REVB=0.0248872;RO=0;SAF=16;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00230669;OID=.;OPOS=122358657;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:34:31:0:0:31:31:15:16:0:0:15:16:0:0 chr10 122358876 . TGA T 309.03 PASS AO=59;DP=113;FAO=61;FDP=106;FR=.;FRO=45;FSAF=25;FSAR=36;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=-0.011645;FXX=0.0185168;HRUN=1;LEN=2;MLLD=196.514;QD=11.6615;RBI=0.045275;REFB=-0.00989755;REVB=0.0437518;RO=43;SAF=25;SAR=34;SRF=25;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122035;STB=0.571761;TYPE=del;VARB=0.00814337;OID=.;OPOS=122358877;OREF=GA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:59:105:61:106:45:25:36:26:19:99:43:25:34:25:18 chr10 122359040 . A G 231.84 PASS AO=43;DP=88;FAO=50;FDP=94;FR=.;FRO=44;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=28;FSRR=16;FWDB=-0.0297423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.0008;QD=9.86563;RBI=0.0344875;REFB=-0.0695451;REVB=0.017458;RO=45;SAF=27;SAR=16;SRF=27;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0272356;STB=0.545711;TYPE=snp;VARB=0.0528228;OID=.;OPOS=122359040;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:94:45:44:43:50:16:27:27:18:23:27:28:16 chr10 122359344 . C T 241.06 PASS AO=76;DP=195;FAO=76;FDP=195;FR=.;FRO=119;FSAF=29;FSAR=47;FSRF=41;FSRR=78;FWDB=-0.0563415;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.931;QD=4.94472;RBI=0.0563558;REFB=-0.00893094;REVB=0.00126746;RO=117;SAF=29;SAR=47;SRF=39;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0559625;STB=0.524216;TYPE=snp;VARB=0.0122353;OID=.;OPOS=122359344;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:195:117:119:76:76:47:29:39:78:47:29:41:78 chr10 122359580 . C A 331.01 PASS AO=78;DP=161;FAO=79;FDP=162;FR=.;FRO=83;FSAF=15;FSAR=64;FSRF=20;FSRR=63;FWDB=0.0221248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.802;QD=8.17306;RBI=0.0221698;REFB=-0.0139437;REVB=-0.00141235;RO=82;SAF=14;SAR=64;SRF=20;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0942099;STB=0.540399;TYPE=snp;VARB=0.0128809;OID=.;OPOS=122359580;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:162:82:83:78:79:64:14:20:62:64:15:20:63 chr10 122624679 . G A 494.36 PASS AO=113;DP=223;FAO=114;FDP=225;FR=.;FRO=111;FSAF=55;FSAR=59;FSRF=46;FSRR=65;FWDB=0.0270279;FXX=0.00881018;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.9396;QD=8.78867;RBI=0.0433805;REFB=-0.0243189;REVB=-0.0339317;RO=109;SAF=55;SAR=58;SRF=46;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0581147;STB=0.533682;TYPE=snp;VARB=0.0240442;OID=.;OPOS=122624679;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:225:109:111:113:114:58:55:46:63:59:55:46:65 chr10 122645376 . A T 137.95 PASS AO=31;DP=64;FAO=32;FDP=67;FR=.;FRO=35;FSAF=6;FSAR=26;FSRF=10;FSRR=25;FWDB=0.0722913;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.537;QD=8.23555;RBI=0.0725716;REFB=-0.0171888;REVB=-0.00637232;RO=33;SAF=5;SAR=26;SRF=9;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163978;STB=0.576126;TYPE=snp;VARB=0.0217098;OID=.;OPOS=122645376;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:67:33:35:31:32:26:5:9:24:26:6:10:25 chr10 122663585 . G A 242.2 PASS AO=74;DP=187;FAO=74;FDP=186;FR=.;FRO=112;FSAF=38;FSAR=36;FSRF=46;FSRR=66;FWDB=-0.0209946;FXX=0.00534731;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.735;QD=5.20853;RBI=0.0244212;REFB=-0.0094803;REVB=0.0124749;RO=106;SAF=38;SAR=36;SRF=45;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0933267;STB=0.561723;TYPE=snp;VARB=0.0115178;OID=.;OPOS=122663585;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:186:106:112:74:74:36:38:45:61:36:38:46:66 chr10 123239112 . G A 3334.8 PASS AO=354;DP=355;FAO=353;FDP=353;FR=.;FRO=0;FSAF=206;FSAR=147;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00419214;FXX=0.00842673;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.004;QD=37.7881;RBI=0.0264552;REFB=-0.0442175;REVB=0.0261209;RO=1;SAF=206;SAR=148;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00321297;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000180725;OID=.;OPOS=123239112;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:355:353:1:0:354:353:148:206:0:1:147:206:0:0 chr10 123298158 . T C 3852.62 PASS AO=526;DP=527;FAO=400;FDP=400;FR=.;FRO=0;FSAF=229;FSAR=171;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.259;QD=38.5262;RBI=0.0665586;REFB=0;REVB=0.0649719;RO=1;SAF=302;SAR=224;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00157854;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.56201e-05;OID=.;OPOS=123298158;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:527:400:1:0:526:400:224:302:1:0:171:229:0:0 chr10 123549691 . T G 63.18 PASS AO=18;DP=55;FAO=20;FDP=57;FR=.;FRO=37;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=0.00217168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.386;QD=4.43379;RBI=0.0137714;REFB=-0.00821982;REVB=0.0135991;RO=32;SAF=5;SAR=13;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.350923;STB=0.685518;TYPE=snp;VARB=0.0131686;OID=.;OPOS=123549691;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:55:57:32:37:18:20:13:5:19:13:15:5:19:18 chr10 123596254 . T C 363.59 PASS AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.766;QD=38.2721;RBI=0.0676518;REFB=0;REVB=0.0642241;RO=0;SAF=19;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.68991e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00155277;OID=.;OPOS=123596254;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:37:38:0:0:37:38:18:19:0:0:19:19:0:0 chr10 123673339 . T C 1236.38 PASS AO=130;DP=130;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00736467;FXX=0.0153834;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.5601;QD=38.6369;RBI=0.0216445;REFB=0;REVB=0.020353;RO=0;SAF=45;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.0955e-05;OID=.;OPOS=123673339;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:130:128:0:0:130:128:85:45:0:0:85:43:0:0 chr10 123845322 . T C 543.51 PASS AO=56;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0290393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.293;QD=38.1408;RBI=0.0465994;REFB=0;REVB=0.0364448;RO=0;SAF=46;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.47747e-05;OID=.;OPOS=123845322;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:57:57:0:0:56:57:10:46:0:0:10:47:0:0 chr10 123970530 . T C 229.97 PASS AO=43;DP=90;FAO=55;FDP=102;FR=.;FRO=47;FSAF=40;FSAR=15;FSRF=37;FSRR=10;FWDB=-0.0680969;FXX=0.0285687;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.6495;QD=9.01836;RBI=0.0821734;REFB=-0.0501041;REVB=0.0459921;RO=46;SAF=40;SAR=3;SRF=37;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.306719;STB=0.53595;TYPE=snp;VARB=0.0548284;OID=.;OPOS=123970530;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:102:46:47:43:55:3:40:37:9:15:40:37:10 chr10 123970569 . C T 375.88 PASS AO=75;DP=132;FAO=76;FDP=134;FR=.;FRO=58;FSAF=58;FSAR=18;FSRF=44;FSRR=14;FWDB=0.0138563;FXX=0.0147048;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.656;QD=11.2204;RBI=0.0629463;REFB=-0.00467115;REVB=-0.0614022;RO=54;SAF=57;SAR=18;SRF=44;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0598895;STB=0.502708;TYPE=snp;VARB=0.00139859;OID=.;OPOS=123970569;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:134:54:58:75:76:18:57:44:10:18:58:44:14 chr10 123970722 . T A 298.73 PASS AO=70;DP=143;FAO=70;FDP=142;FR=.;FRO=72;FSAF=45;FSAR=25;FSRF=38;FSRR=34;FWDB=-0.031853;FXX=0.00699252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2155;QD=8.41478;RBI=0.0318869;REFB=-0.0206799;REVB=0.00147019;RO=72;SAF=45;SAR=25;SRF=38;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110868;STB=0.561293;TYPE=snp;VARB=0.0263295;OID=.;OPOS=123970722;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:142:72:72:70:70:25:45:38:34:25:45:38:34 chr10 123976391 . C A 1107.76 PASS AO=126;DP=134;FAO=128;FDP=135;FR=.;FRO=7;FSAF=54;FSAR=74;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=0.00192727;FXX=0.0073524;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.063;QD=32.8225;RBI=0.0189756;REFB=-0.0816555;REVB=-0.0188774;RO=8;SAF=52;SAR=74;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0676906;STB=0.53043;TYPE=snp;VARB=0.00118391;OID=.;OPOS=123976391;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:134:135:8:7:126:128:74:52:8:0:74:54:7:0 chr10 123996976 . G A 213.3 PASS AO=41;DP=71;FAO=41;FDP=71;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=31;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=-0.0113224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.2539;QD=12.0168;RBI=0.0114123;REFB=-0.0227841;REVB=-0.00143033;RO=30;SAF=10;SAR=31;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148323;STB=0.581869;TYPE=snp;VARB=0.0233904;OID=.;OPOS=123996976;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:30:30:41:41:31:10:12:18:31:10:12:18 chr10 124089036 . G A 77.85 PASS AO=27;DP=80;FAO=27;FDP=80;FR=.;FRO=53;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=0.00931412;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.856;QD=3.89251;RBI=0.0337348;REFB=0.00844175;REVB=0.0324235;RO=53;SAF=18;SAR=9;SRF=26;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206557;STB=0.620598;TYPE=snp;VARB=-0.0144234;OID=.;OPOS=124089036;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:80:80:53:53:27:27:9:18:26:27:9:18:26:27 chr10 124096035 . T C 185.32 PASS AO=37;DP=72;FAO=39;FDP=72;FR=.;FRO=33;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=-0.00209648;FXX=0.0270234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.305;QD=10.2957;RBI=0.0141342;REFB=-0.0199236;REVB=-0.0139779;RO=33;SAF=22;SAR=15;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101451;STB=0.533949;TYPE=snp;VARB=0.0110552;OID=.;OPOS=124096035;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:33:33:37:39:15:22:20:13:17:22:21:12 chr10 124096041 . T C 186.68 PASS AO=40;DP=76;FAO=40;FDP=76;FR=.;FRO=36;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=-0.042926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.236;QD=9.82523;RBI=0.0504477;REFB=-0.0589099;REVB=-0.0265014;RO=36;SAF=23;SAR=17;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.031815;STB=0.517583;TYPE=snp;VARB=0.0118216;OID=.;OPOS=124096041;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:36:36:40:40:17:23:22:14:17:23:22:14 chr10 124096061 . A C 179.18 PASS AO=40;DP=88;FAO=43;FDP=91;FR=.;FRO=48;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=29;FSRR=19;FWDB=0.00693741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.85;QD=7.87617;RBI=0.00934295;REFB=-0.00607209;REVB=-0.00625803;RO=48;SAF=20;SAR=20;SRF=29;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10158;STB=0.536896;TYPE=snp;VARB=0.00663521;OID=.;OPOS=124096061;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:91:48:48:40:43:20:20:29:19:20:23:29:19 chr10 124183732 . T C 2913.77 PASS AO=313;DP=319;FAO=314;FDP=314;FR=.;FRO=0;FSAF=148;FSAR=166;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0144447;FXX=0.0218062;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1466;QD=37.1182;RBI=0.0159781;REFB=0.00490367;REVB=-0.00683018;RO=4;SAF=148;SAR=165;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000655418;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000866533;OID=.;OPOS=124183732;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:319:314:4:0:313:314:165:148:2:2:166:148:0:0 chr10 124189197 . A G 617.32 PASS AO=66;DP=69;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.047292;FXX=0.0289813;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.7574;QD=36.8548;RBI=0.112492;REFB=0;REVB=0.102068;RO=1;SAF=53;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0349541;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00211508;OID=.;OPOS=124189197;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:69:67:1:0:66:67:13:53:0:1:14:53:0:0 chr10 124214251 . G A 524.94 PASS AO=106;DP=188;FAO=106;FDP=188;FR=.;FRO=82;FSAF=92;FSAR=14;FSRF=57;FSRR=25;FWDB=0.0111062;FXX=0.0105258;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.911;QD=11.169;RBI=0.136516;REFB=-0.0635646;REVB=0.136064;RO=77;SAF=92;SAR=14;SRF=54;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.227143;STB=0.632329;TYPE=snp;VARB=0.0288131;OID=.;OPOS=124214251;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:188:77:82:106:106:14:92:54:23:14:92:57:25 chr10 124214448 . G T 346.89 PASS AO=71;DP=130;FAO=72;FDP=131;FR=.;FRO=59;FSAF=31;FSAR=41;FSRF=31;FSRR=28;FWDB=0.0157426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.358;QD=10.5921;RBI=0.0163491;REFB=-0.018976;REVB=0.00441193;RO=58;SAF=30;SAR=41;SRF=31;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0927472;STB=0.543034;TYPE=snp;VARB=0.0199582;OID=.;OPOS=124214448;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:131:58:59:71:72:41:30:31:27:41:31:31:28 chr10 124216397 . T C 213.52 PASS AO=45;DP=85;FAO=45;FDP=84;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=29;FSRR=10;FWDB=0.0276262;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.5608;QD=10.1677;RBI=0.0297681;REFB=-0.0109406;REVB=0.0110875;RO=39;SAF=18;SAR=27;SRF=29;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.283553;STB=0.655747;TYPE=snp;VARB=0.0190275;OID=.;OPOS=124216397;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:84:39:39:45:45:27:18:29:10:27:18:29:10 chr10 124216410 . A G 169.83 PASS AO=21;DP=81;FAO=40;FDP=80;FR=.,HEALED;FRO=40;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=29;FSRR=11;FWDB=0.0920215;FXX=0.0361402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.6149;QD=8.49138;RBI=0.0920775;REFB=-0.00569034;REVB=0.00321087;RO=29;SAF=15;SAR=6;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0300316;STB=0.635071;TYPE=snp;VARB=0.00869069;OID=.;OPOS=124216410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:80:29:40:21:40:6:15:20:9:22:18:29:11 chr10 124329710 . C A 285.26 PASS AO=76;DP=170;FAO=76;FDP=170;FR=.;FRO=94;FSAF=22;FSAR=54;FSRF=24;FSRR=70;FWDB=-0.0188024;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.516;QD=6.71199;RBI=0.0219493;REFB=-0.00390061;REVB=-0.0113243;RO=93;SAF=22;SAR=54;SRF=24;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0385476;STB=0.523401;TYPE=snp;VARB=0.0080163;OID=.;OPOS=124329710;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:170:93:94:76:76:54:22:24:69:54:22:24:70 chr10 124329746 . A T 213.65 PASS AO=61;DP=148;FAO=61;FDP=147;FR=.;FRO=86;FSAF=13;FSAR=48;FSRF=24;FSRR=62;FWDB=0.00511034;FXX=0.0134219;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.513;QD=5.81354;RBI=0.0149828;REFB=-0.0113011;REVB=-0.0140844;RO=77;SAF=13;SAR=48;SRF=16;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00797773;STB=0.553943;TYPE=snp;VARB=0.0123656;OID=.;OPOS=124329746;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:147:77:86:61:61:48:13:16:61:48:13:24:62 chr10 124330427 . C T 267.78 PASS AO=89;DP=249;FAO=93;FDP=253;FR=.;FRO=160;FSAF=49;FSAR=44;FSRF=84;FSRR=76;FWDB=0.000525804;FXX=0.00393685;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.5611;QD=4.23368;RBI=0.00552904;REFB=-0.00803541;REVB=-0.00550398;RO=160;SAF=45;SAR=44;SRF=85;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0290067;STB=0.501193;TYPE=snp;VARB=0.013992;OID=.;OPOS=124330427;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:249:253:160:160:89:93:44:45:85:75:44:49:84:76 chr10 124331867 . C T 3689.83 PASS AO=389;DP=392;FAO=389;FDP=389;FR=.;FRO=0;FSAF=175;FSAR=214;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00696117;FXX=0.00765287;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.412;QD=37.9417;RBI=0.0105156;REFB=-0.045799;REVB=0.0078816;RO=1;SAF=175;SAR=214;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00222499;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.32834e-05;OID=.;OPOS=124331867;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:392:389:1:0:389:389:214:175:0:1:214:175:0:0 chr10 124339332 . T C 1133.25 PASS AO=116;DP=116;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.033463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3642;QD=38.4153;RBI=0.0352361;REFB=0;REVB=-0.0110369;RO=0;SAF=52;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.15413e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000200601;OID=.;OPOS=124339332;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:116:118:0:0:116:118:64:52:0:0:66:52:0:0 chr10 124351954 . G A 263.48 PASS AO=65;DP=138;FAO=65;FDP=138;FR=.;FRO=73;FSAF=19;FSAR=46;FSRF=28;FSRR=45;FWDB=-0.0136322;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.541;QD=7.63695;RBI=0.0197276;REFB=-0.0193281;REVB=0.0142598;RO=73;SAF=19;SAR=46;SRF=28;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0999912;STB=0.555624;TYPE=snp;VARB=0.0255763;OID=.;OPOS=124351954;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:73:73:65:65:46:19:28:45:46:19:28:45 chr10 124380870 . A G 152.06 PASS AO=48;DP=126;FAO=48;FDP=126;FR=.;FRO=78;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=40;FSRR=38;FWDB=-0.0269413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.423;QD=4.82729;RBI=0.0277131;REFB=-0.00131325;REVB=-0.00649494;RO=77;SAF=19;SAR=29;SRF=39;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121765;STB=0.573361;TYPE=snp;VARB=0.00191637;OID=.;OPOS=124380870;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:77:78:48:48:29:19:39:38:29:19:40:38 chr10 124380871 . C T 155.28 PASS AO=48;DP=126;FAO=48;FDP=124;FR=.;FRO=76;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=40;FSRR=36;FWDB=0.0201359;FXX=0.0158718;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.519;QD=5.00909;RBI=0.0201566;REFB=-0.00641371;REVB=0.000913068;RO=76;SAF=19;SAR=29;SRF=40;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142301;STB=0.580754;TYPE=snp;VARB=0.0124424;OID=.;OPOS=124380871;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:124:76:76:48:48:29:19:40:36:29:19:40:36 chr10 124457452 . C T 711.45 PASS AO=148;DP=273;FAO=149;FDP=267;FR=.;FRO=118;FSAF=66;FSAR=83;FSRF=38;FSRR=80;FWDB=0.06312;FXX=0.0219772;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.812;QD=10.6585;RBI=0.0633618;REFB=-0.0235818;REVB=0.00553049;RO=111;SAF=65;SAR=83;SRF=36;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0933934;STB=0.554815;TYPE=snp;VARB=0.0234582;OID=.;OPOS=124457452;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:273:267:111:118:148:149:83:65:36:75:83:66:38:80 chr10 124457906 . C T 658.88 PASS AO=157;DP=318;FAO=157;FDP=317;FR=.;FRO=160;FSAF=60;FSAR=97;FSRF=92;FSRR=68;FWDB=0.0212692;FXX=0.0062694;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.507;QD=8.31399;RBI=0.0233296;REFB=0.000125623;REVB=-0.00958612;RO=159;SAF=60;SAR=97;SRF=91;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176196;STB=0.598267;TYPE=snp;VARB=-0.000223355;OID=.;OPOS=124457906;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:318:317:159:160:157:157:97:60:91:68:97:60:92:68 chr10 124459139 . T C 377.1 PASS AO=71;DP=118;FAO=71;FDP=118;FR=.;FRO=47;FSAF=16;FSAR=55;FSRF=17;FSRR=30;FWDB=0.00905897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.5142;QD=12.7829;RBI=0.0163666;REFB=-0.00841454;REVB=0.0136309;RO=47;SAF=16;SAR=55;SRF=17;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131173;STB=0.571632;TYPE=snp;VARB=0.00586569;OID=.;OPOS=124459139;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:47:47:71:71:55:16:17:30:55:16:17:30 chr10 124610027 . G A 1650.18 PASS AO=173;DP=174;FAO=175;FDP=175;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00972685;FXX=0.0056815;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7299;QD=37.7184;RBI=0.0280563;REFB=-0.0138735;REVB=-0.0263163;RO=1;SAF=71;SAR=102;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00665679;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000109563;OID=.;OPOS=124610027;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:174:175:1:0:173:175:102:71:1:0:102:73:0:0 chr10 124648150 . A G 510.23 PASS AO=55;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0160229;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.6316;QD=36.4447;RBI=0.0435514;REFB=-0.0382539;REVB=0.0404968;RO=0;SAF=22;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000405784;OID=.;OPOS=124648150;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:56:56:0:0:55:56:33:22:0:0:34:22:0:0 chr10 124742792 . G A 1227.89 PASS AO=128;DP=130;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=112;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00696772;FXX=0.0227256;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.239;QD=38.074;RBI=0.0171349;REFB=0;REVB=0.0156542;RO=0;SAF=111;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000294295;OID=.;OPOS=124742792;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:130:129:0:0:128:129:17:111:0:0:17:112:0:0 chr10 124742895 . G C 788.38 PASS AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013203;FXX=0.0119033;HRUN=3;LEN=1;MLLD=213.616;QD=37.9944;RBI=0.016015;REFB=0;REVB=-0.0090643;RO=0;SAF=69;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.28792e-05;OID=.;OPOS=124742895;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:84:83:0:0:83:83:14:69:0:0:14:69:0:0 chr10 124749740 . A C 1737.73 PASS AO=182;DP=182;FAO=182;FDP=182;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0474186;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6139;QD=38.1919;RBI=0.0499248;REFB=0;REVB=-0.0156191;RO=0;SAF=98;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.1362e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000269325;OID=.;OPOS=124749740;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:82:182:182:0:0:182:182:84:98:0:0:84:98:0:0 chr10 124768583 . G A 155.02 PASS AO=18;DP=21;FAO=20;FDP=23;FR=.;FRO=3;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.203763;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.1864;QD=26.9592;RBI=0.220681;REFB=-0.120054;REVB=0.0847403;RO=3;SAF=11;SAR=7;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161;STB=0.588145;TYPE=snp;VARB=0.0383831;OID=.;OPOS=124768583;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:21:23:3:3:18:20:7:11:0:3:7:13:0:3 chr10 124806770 . A G 511.89 PASS AO=104;DP=186;FAO=105;FDP=187;FR=.;FRO=82;FSAF=36;FSAR=69;FSRF=45;FSRR=37;FWDB=0.0212354;FXX=0.00531887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.2455;QD=10.9495;RBI=0.037429;REFB=-0.00891045;REVB=-0.0308219;RO=81;SAF=36;SAR=68;SRF=44;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165043;STB=0.59424;TYPE=snp;VARB=0.0123521;OID=.;OPOS=124806770;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:187:81:82:104:105:68:36:44:37:69:36:45:37 chr10 124816515 . C G 933.04 PASS AO=97;DP=98;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00828338;FXX=0.0202;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8802;QD=38.4761;RBI=0.0131376;REFB=0;REVB=0.0101971;RO=0;SAF=36;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.76228e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00022039;OID=.;OPOS=124816515;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:98:97:0:0:97:97:61:36:0:0:61:36:0:0 chr10 124907975 . CGGGGGC CGGGGC,CGGG,CGGGG 72.57 PASS AO=3,3,3;DP=22;FAO=0,2,13;FDP=21;FR=.;FRO=6;FSAF=0,0,8;FSAR=0,2,5;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.134069,-0.0191417,-0.122323;FXX=0;HRUN=5,5,5;LEN=1,3,2;MLLD=9.69284,22.373,18.9281;QD=13.8238;RBI=0.639143,0.186002,0.168772;REFB=-0.0396585,-0.0285471,-0.0430253;REVB=-0.624924,-0.185014,-0.11628;RO=2;SAF=0,0,3;SAR=3,3,0;SRF=2;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.74993,-0.74993,0;STB=0.5,0.993777,0.537756;TYPE=del,del,del;VARB=0.0541271,0.0464038,-0.00872597;OID=.,.,.;OPOS=124907976,124907979,124907980;OREF=G,GGC,GC;OALT=-,-,-;OMAPALT=CGGGGC,CGGG,CGGGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/3:3,3,3:16:0,2,13:21:6:0,0,8:0,2,5:3:3:11:2:0,0,3:3,3,0:2:0 chr10 125426412 . A G 66.03 PASS AO=14;DP=29;FAO=14;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=-0.0247166;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.677;QD=9.1074;RBI=0.0355467;REFB=0.00356581;REVB=-0.0255471;RO=15;SAF=9;SAR=5;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0917792;STB=0.552414;TYPE=snp;VARB=-0.00564539;OID=.;OPOS=125426412;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:29:29:15:15:14:14:5:9:11:4:5:9:11:4 chr10 125426565 . G C 459.17 PASS AO=46;DP=46;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00967981;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.3108;QD=38.264;RBI=0.050557;REFB=0;REVB=0.0496217;RO=0;SAF=17;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000461152;OID=.;OPOS=125426565;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:46:48:0:0:46:48:29:17:0:0:31:17:0:0 chr10 125449015 . G A 171.28 PASS AO=45;DP=101;FAO=45;FDP=102;FR=.;FRO=57;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=29;FSRR=28;FWDB=-0.0754555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.905;QD=6.71685;RBI=0.0755209;REFB=0.00909761;REVB=-0.00314338;RO=53;SAF=21;SAR=24;SRF=26;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0232028;STB=0.52355;TYPE=snp;VARB=-0.00542574;OID=.;OPOS=125449015;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:102:53:57:45:45:24:21:26:27:24:21:29:28 chr10 125450856 . GC G,GG 842.21 PASS AO=22,55;DP=94;FAO=89,0;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=50,0;FSAR=39,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00338686,-0.128334;FXX=0.0111099;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=89.3532,75.0607;QD=37.8519;RBI=0.0801572,0.189281;REFB=0,0;REVB=-0.0800856,-0.139131;RO=0;SAF=20,19;SAR=2,36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.80459e-08,-3.75811e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.000261176,0.0215444;OID=.,.;OPOS=125450857,125450857;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:22,55:89:89,0:89:0:50,0:39,0:0:0:40:0:20,19:2,36:0:0 chr10 125472862 . A G 260.45 PASS AO=66;DP=145;FAO=67;FDP=147;FR=.;FRO=80;FSAF=31;FSAR=36;FSRF=34;FSRR=46;FWDB=0.00351049;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=201.172;QD=7.08693;RBI=0.00746287;REFB=-0.0120312;REVB=-0.00658565;RO=79;SAF=31;SAR=35;SRF=34;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0387797;STB=0.520682;TYPE=snp;VARB=0.013381;OID=.;OPOS=125472862;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:147:79:80:66:67:35:31:34:45:36:31:34:46 chr10 125506302 . T C 316.55 PASS AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00275495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.665;QD=37.2412;RBI=0.0138802;REFB=0;REVB=0.013604;RO=0;SAF=14;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48532e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.10537e-05;OID=.;OPOS=125506302;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:34:0:0:34:34:20:14:0:0:20:14:0:0 chr10 125521533 . G A 183.93 PASS AO=31;DP=49;FAO=32;FDP=49;FR=.;FRO=17;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.0251438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.628;QD=15.0143;RBI=0.0597438;REFB=0.00409942;REVB=0.0541951;RO=17;SAF=16;SAR=15;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0673729;STB=0.541375;TYPE=snp;VARB=-0.00238218;OID=.;OPOS=125521533;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:49:49:17:17:31:32:15:16:7:10:15:17:7:10 chr10 125521590 . G A 86.04 PASS AO=22;DP=52;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=-0.022576;FXX=0.0192271;HRUN=4;LEN=1;MLLD=182.275;QD=6.74826;RBI=0.0229291;REFB=0.00777989;REVB=-0.00400836;RO=25;SAF=13;SAR=9;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17861;STB=0.637356;TYPE=snp;VARB=-0.00724873;OID=.;OPOS=125521590;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:52:51:25:29:22:22:9:13:10:15:9:13:10:19 chr10 125528048 . G A 466.66 PASS AO=108;DP=214;FAO=109;FDP=218;FR=.;FRO=109;FSAF=45;FSAR=64;FSRF=70;FSRR=39;FWDB=-0.0102599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.723;QD=8.56265;RBI=0.0185375;REFB=-0.00823481;REVB=0.0154393;RO=105;SAF=45;SAR=63;SRF=69;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213885;STB=0.613568;TYPE=snp;VARB=0.00923157;OID=.;OPOS=125528048;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:218:105:109:108:109:63:45:69:36:64:45:70:39 chr10 126089434 . G A 1332.54 PASS AO=139;DP=144;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00254773;FXX=0.0275843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.011;QD=37.8026;RBI=0.0210691;REFB=0;REVB=0.0209145;RO=0;SAF=49;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.77561e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00130907;OID=.;OPOS=126089434;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:144:141:0:0:139:141:90:49:0:0:92:49:0:0 chr10 126172863 . A G 57.61 PASS AO=19;DP=56;FAO=19;FDP=56;FR=.;FRO=37;FSAF=2;FSAR=17;FSRF=7;FSRR=30;FWDB=-0.00107916;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.001;QD=4.11486;RBI=0.0171704;REFB=-3.83313e-05;REVB=-0.0171365;RO=37;SAF=2;SAR=17;SRF=7;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198287;STB=0.619287;TYPE=snp;VARB=-0.0004045;OID=.;OPOS=126172863;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:56:56:37:37:19:19:17:2:7:30:17:2:7:30 chr10 126517989 . G A 526.08 PASS AO=120;DP=235;FAO=121;FDP=238;FR=.;FRO=117;FSAF=70;FSAR=51;FSRF=65;FSRR=52;FWDB=0.0156643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.2353;QD=8.84173;RBI=0.0158618;REFB=-0.0162485;REVB=-0.0024952;RO=115;SAF=70;SAR=50;SRF=63;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0324118;STB=0.511527;TYPE=snp;VARB=0.01426;OID=.;OPOS=126517989;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:235:238:115:117:120:121:50:70:63:52:51:70:65:52 chr10 126670356 . G A 677.1 PASS AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0211951;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.5718;QD=38.6914;RBI=0.0375711;REFB=0;REVB=0.0310218;RO=0;SAF=12;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000301183;OID=.;OPOS=126670356;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:70:70:0:0:70:70:58:12:0:0:58:12:0:0 chr10 126674227 . C CT 2343.7 PASS AO=325;DP=416;FAO=393;FDP=393;FR=.;FRO=0;FSAF=190;FSAR=203;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0483176;FXX=0.0174996;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.4368;QD=23.8545;RBI=0.0937137;REFB=0;REVB=0.0802973;RO=57;SAF=162;SAR=163;SRF=20;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0417201;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-0.00086694;OID=.;OPOS=126674228;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:325:416:393:393:0:190:203:0:0:99:57:162:163:20:37 chr10 126675759 . A AAGAT 943.16 PASS AO=141;DP=215;FAO=147;FDP=201;FR=.;FRO=54;FSAF=54;FSAR=93;FSRF=32;FSRR=22;FWDB=-0.000493306;FXX=0.0563354;HRUN=2;LEN=4;MLLD=217.48;QD=18.7693;RBI=0.0084903;REFB=-0.0425921;REVB=-0.00847595;RO=59;SAF=51;SAR=90;SRF=35;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132594;STB=0.562914;TYPE=ins;VARB=0.0132767;OID=.;OPOS=126675760;OREF=-;OALT=AGAT;OMAPALT=AAGAT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:141:215:147:201:54:54:93:32:22:99:59:51:90:35:24 chr10 126691979 . C G 11.68 PASS AO=4;DP=13;FAO=3;FDP=13;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.0264159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.9246;QD=3.59366;RBI=0.0741243;REFB=-0.0189124;REVB=-0.0692575;RO=9;SAF=1;SAR=3;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0398812;STB=0.52922;TYPE=snp;VARB=0.0367133;OID=.;OPOS=126691979;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:13:13:9:10:4:3:3:1:2:7:2:1:3:7 chr10 126692009 . C A 10.38 PASS AO=3;DP=8;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.00216927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.992;QD=5.93125;RBI=0.0186222;REFB=-0.0019797;REVB=-0.0184954;RO=5;SAF=1;SAR=2;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152533;STB=0.71253;TYPE=snp;VARB=0.00434034;OID=.;OPOS=126692009;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:7:5:5:3:2:2:1:1:4:1:1:1:4 chr10 126692017 . G C 10.47 PASS AO=3;DP=7;FAO=2;FDP=6;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0515102;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=60.7896;QD=6.97935;RBI=0.0771561;REFB=-0.0262942;REVB=-0.0574436;RO=4;SAF=1;SAR=2;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.413613;STB=0.831449;TYPE=snp;VARB=0.0556149;OID=.;OPOS=126692017;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:6:4:4:3:2:2:1:0:4:1:1:0:4 chr10 126692019 . G A 10.47 PASS AO=3;DP=7;FAO=2;FDP=6;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.0396517;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=272.058;QD=6.97934;RBI=0.055696;REFB=0.0021886;REVB=-0.0391126;RO=4;SAF=1;SAR=2;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.413613;STB=0.831449;TYPE=snp;VARB=-0.0142522;OID=.;OPOS=126692019;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:6:4:4:3:2:2:1:0:4:1:1:0:4 chr10 126694231 . TG T 409.23 PASS AO=86;DP=139;FAO=97;FDP=128;FR=.;FRO=31;FSAF=32;FSAR=65;FSRF=27;FSRR=4;FWDB=-0.0653727;FXX=0.00775134;HRUN=2;LEN=1;MLLD=16.4838;QD=12.7883;RBI=0.0741043;REFB=-0.113952;REVB=-0.0348978;RO=33;SAF=29;SAR=57;SRF=27;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253341;STB=0.63459;TYPE=del;VARB=0.0475721;OID=.;OPOS=126694232;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:86:124:97:128:31:32:65:27:4:17:33:29:57:27:6 chr10 126714714 . G C 24.49 PASS AO=6;DP=22;FAO=7;FDP=23;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.01498;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.415;QD=4.25851;RBI=0.0154123;REFB=-0.0087633;REVB=0.00362483;RO=16;SAF=1;SAR=5;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.467764;STB=0.695633;TYPE=snp;VARB=0.00932589;OID=.;OPOS=126714714;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:22:23:16:16:6:7:5:1:9:7:5:2:9:7 chr10 126714841 . G A 21.53 PASS AO=5;DP=15;FAO=5;FDP=15;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=9;FWDB=0.00942534;FXX=0.062461;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.106;QD=5.7405;RBI=0.0241649;REFB=0.00321664;REVB=0.0222509;RO=10;SAF=2;SAR=3;SRF=1;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.376774;STB=0.726608;TYPE=snp;VARB=-0.00247366;OID=.;OPOS=126714841;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:15:15:10:10:5:5:3:2:1:9:3:2:1:9 chr10 126715154 . A G 50.29 PASS AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.0712275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.153;QD=8.38221;RBI=0.0927418;REFB=-0.0116299;REVB=-0.0593942;RO=11;SAF=7;SAR=4;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0822389;STB=0.555453;TYPE=snp;VARB=0.0204306;OID=.;OPOS=126715154;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:24:24:11:13:11:11:4:7:6:5:4:7:7:6 chr10 126715629 . C T 148.39 PASS AO=38;DP=86;FAO=38;FDP=86;FR=.;FRO=48;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=0.0147172;FXX=0.0227247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.3321;QD=6.90192;RBI=0.017556;REFB=-0.0146642;REVB=0.00957182;RO=46;SAF=14;SAR=24;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132368;STB=0.575717;TYPE=snp;VARB=0.0544913;OID=.;OPOS=126715629;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:46:48:38:38:24:14:23:23:24:14:24:24 chr10 126721441 . C A 46.1 PASS AO=15;DP=50;FAO=16;FDP=50;FR=.;FRO=34;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=29;FWDB=0.0246268;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.876;QD=3.68788;RBI=0.0255206;REFB=-0.00488926;REVB=0.00669504;RO=35;SAF=4;SAR=11;SRF=5;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210822;STB=0.602829;TYPE=snp;VARB=0.0119564;OID=.;OPOS=126721441;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:50:50:35:34:15:16:11:4:5:30:12:4:5:29 chr10 126727602 . T A 18.32 PASS AO=25;DP=153;FAO=25;FDP=153;FR=.;FRO=128;FSAF=5;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=108;FWDB=0.0039819;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=149.887;QD=0.478877;RBI=0.00571573;REFB=-0.000420784;REVB=0.0041005;RO=127;SAF=5;SAR=20;SRF=19;SRR=108;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11171;STB=0.561359;TYPE=snp;VARB=0.0015094;OID=.;OPOS=126727602;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:153:153:127:128:25:25:20:5:19:108:20:5:20:108 chr10 126727604 . T C 22.55 PASS AO=26;DP=150;FAO=26;FDP=149;FR=.;FRO=123;FSAF=5;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=105;FWDB=-0.0645846;FXX=0.0132442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.8132;QD=0.605479;RBI=0.0684372;REFB=-0.0164588;REVB=-0.0226379;RO=123;SAF=5;SAR=21;SRF=18;SRR=105;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104387;STB=0.565992;TYPE=snp;VARB=0.0925491;OID=.;OPOS=126727604;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:150:149:123:123:26:26:21:5:18:105:21:5:18:105 chr10 126727630 . T G 19.78 PASS AO=21;DP=125;FAO=21;FDP=120;FR=.;FRO=99;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=90;FWDB=-0.000661035;FXX=0.0399968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.085;QD=0.65935;RBI=0.000725328;REFB=-0.000964103;REVB=-0.000298553;RO=99;SAF=5;SAR=16;SRF=9;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.336617;STB=0.702784;TYPE=snp;VARB=0.00219932;OID=.;OPOS=126727630;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:125:120:99:99:21:21:16:5:9:90:16:5:9:90 chr10 127445408 . G T 22.3 PASS AO=4;DP=9;FAO=4;FDP=9;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.145775;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8506;QD=9.91241;RBI=0.145776;REFB=0.00818801;REVB=0.000524546;RO=5;SAF=1;SAR=3;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15474;STB=0.599465;TYPE=snp;VARB=-0.0338892;OID=.;OPOS=127445408;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:9:9:5:5:4:4:3:1:2:3:3:1:2:3 chr10 127530325 . T C 321.44 PASS AO=58;DP=143;FAO=77;FDP=149;FR=.;FRO=72;FSAF=37;FSAR=40;FSRF=54;FSRR=18;FWDB=0.00219022;FXX=0.00666622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.448;QD=8.62936;RBI=0.00282674;REFB=-0.0324966;REVB=0.00178701;RO=48;SAF=22;SAR=36;SRF=33;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252353;STB=0.629073;TYPE=snp;VARB=0.0366774;OID=.;OPOS=127530325;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:149:48:72:58:77:36:22:33:15:40:37:54:18 chr10 127579186 . C A 154.62 PASS AO=128;DP=531;FAO=100;FDP=399;FR=.;FRO=299;FSAF=52;FSAR=48;FSRF=144;FSRR=155;FWDB=-0.00440477;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.752;QD=1.55003;RBI=0.0132869;REFB=-0.0147509;REVB=0.0125355;RO=398;SAF=63;SAR=65;SRF=198;SRR=200;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00672238;STB=0.528746;TYPE=snp;VARB=0.042696;OID=.;OPOS=127579186;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:531:399:398:299:128:100:65:63:198:200:48:52:144:155 chr10 127579210 . T C 157.63 PASS AO=142;DP=554;FAO=101;FDP=400;FR=.;FRO=299;FSAF=47;FSAR=54;FSRF=141;FSRR=158;FWDB=0.0136584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.6155;QD=1.57626;RBI=0.0246732;REFB=-0.00238033;REVB=0.0205479;RO=408;SAF=69;SAR=73;SRF=199;SRR=209;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00229839;STB=0.504672;TYPE=snp;VARB=0.00911614;OID=.;OPOS=127579210;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:554:400:408:299:142:101:73:69:199:209:54:47:141:158 chr10 127579238 . G T 112.09 PASS AO=112;DP=542;FAO=90;FDP=399;FR=.;FRO=309;FSAF=37;FSAR=53;FSRF=159;FSRR=150;FWDB=-0.00910432;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.931;QD=1.12368;RBI=0.0311782;REFB=-0.00201043;REVB=-0.0298193;RO=427;SAF=51;SAR=61;SRF=214;SRR=213;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0592773;STB=0.58035;TYPE=snp;VARB=0.00817951;OID=.;OPOS=127579238;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:542:399:427:309:112:90:61:51:214:213:53:37:159:150 chr10 127585169 . G C 15.36 PASS AO=3;DP=9;FAO=3;FDP=9;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.00834115;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.5192;QD=6.82559;RBI=0.0214036;REFB=0.0047525;REVB=0.0197114;RO=6;SAF=1;SAR=2;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208152;STB=0.635588;TYPE=snp;VARB=-0.0175119;OID=.;OPOS=127585169;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:9:9:6:6:3:3:2:1:1:5:2:1:1:5 chr10 127585173 . T C 41.47 PASS AO=6;DP=9;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0130312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.445;QD=18.4319;RBI=0.0228149;REFB=-0.0666723;REVB=0.0187272;RO=3;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.236104;STB=0.635975;TYPE=snp;VARB=0.0346551;OID=.;OPOS=127585173;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:9:9:3:3:6:6:4:2:0:3:4:2:0:3 chr10 127585179 . G C 53.81 PASS AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0288145;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=294.945;QD=23.916;RBI=0.0311304;REFB=0.000616337;REVB=-0.0117823;RO=2;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145918;STB=0.583115;TYPE=snp;VARB=-0.000523918;OID=.;OPOS=127585179;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:2:2:7:7:5:2:0:2:5:2:0:2 chr10 127668431 . A G 343.37 PASS AO=104;DP=259;FAO=104;FDP=257;FR=.;FRO=153;FSAF=45;FSAR=59;FSRF=66;FSRR=87;FWDB=-0.0600925;FXX=0.00772171;HRUN=3;LEN=1;MLLD=128.115;QD=5.34431;RBI=0.0605235;REFB=-0.00976607;REVB=-0.00720949;RO=148;SAF=45;SAR=59;SRF=62;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.014774;STB=0.5008;TYPE=snp;VARB=0.0141488;OID=.;OPOS=127668431;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:259:257:148:153:104:104:59:45:62:86:59:45:66:87 chr10 127677374 . A G 177.72 PASS AO=36;DP=65;FAO=36;FDP=65;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=26;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.0106845;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.6;QD=10.9368;RBI=0.010701;REFB=0.000973302;REVB=0.000594395;RO=29;SAF=10;SAR=26;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127767;STB=0.570817;TYPE=snp;VARB=-0.000834854;OID=.;OPOS=127677374;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:29:29:36:36:26:10:12:17:26:10:12:17 chr10 127753388 . C T 83.59 PASS AO=20;DP=46;FAO=21;FDP=46;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=23;FSRR=2;FWDB=0.0272148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.8252;QD=7.2688;RBI=0.0493842;REFB=-0.0142012;REVB=0.0412087;RO=25;SAF=15;SAR=5;SRF=23;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.258694;STB=0.655054;TYPE=snp;VARB=0.0190621;OID=.;OPOS=127753388;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:46:46:25:25:20:21:5:15:23:2:6:15:23:2 chr10 127967533 . G T 259.98 PASS AO=73;DP=172;FAO=73;FDP=172;FR=.;FRO=99;FSAF=41;FSAR=32;FSRF=46;FSRR=53;FWDB=-0.0369328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.681;QD=6.04594;RBI=0.0451003;REFB=-0.0151024;REVB=-0.0258844;RO=97;SAF=41;SAR=32;SRF=44;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110369;STB=0.555895;TYPE=snp;VARB=0.0239814;OID=.;OPOS=127967533;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:172:97:99:73:73:32:41:44:53:32:41:46:53 chr10 128019025 . C G 330.69 PASS AO=81;DP=177;FAO=81;FDP=170;FR=.;FRO=89;FSAF=36;FSAR=45;FSRF=22;FSRR=67;FWDB=0.0406109;FXX=0.0395458;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.9947;QD=7.78082;RBI=0.044574;REFB=-0.0150929;REVB=0.0183738;RO=88;SAF=36;SAR=45;SRF=21;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202648;STB=0.607021;TYPE=snp;VARB=0.0175954;OID=.;OPOS=128019025;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:170:88:89:81:81:45:36:21:67:45:36:22:67 chr10 128114325 . G A 132.55 PASS AO=43;DP=133;FAO=48;FDP=136;FR=.;FRO=88;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=42;FSRR=46;FWDB=0.0119941;FXX=0.0144917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.816;QD=3.89857;RBI=0.067917;REFB=-0.00646973;REVB=0.0668496;RO=89;SAF=21;SAR=22;SRF=43;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00608751;STB=0.5147;TYPE=snp;VARB=0.0134647;OID=.;OPOS=128114325;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:136:89:88:43:48:22:21:43:46:24:24:42:46 chr10 128191368 . T C 458.59 PASS AO=85;DP=139;FAO=85;FDP=139;FR=.;FRO=54;FSAF=46;FSAR=39;FSRF=19;FSRR=35;FWDB=0.0693805;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.119;QD=13.1967;RBI=0.0694354;REFB=-0.00877469;REVB=-0.00276022;RO=54;SAF=46;SAR=39;SRF=19;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13509;STB=0.573143;TYPE=snp;VARB=0.00879511;OID=.;OPOS=128191368;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:54:54:85:85:39:46:19:35:39:46:19:35 chr10 128192985 . C T 77.09 PASS AO=29;DP=91;FAO=30;FDP=92;FR=.;FRO=62;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=36;FSRR=26;FWDB=-0.00419134;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.661;QD=3.35171;RBI=0.00558098;REFB=-0.0154668;REVB=-0.0036851;RO=62;SAF=18;SAR=11;SRF=36;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0487403;STB=0.513505;TYPE=snp;VARB=0.026352;OID=.;OPOS=128192985;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:91:92:62:62:29:30:11:18:36:26:12:18:36:26 chr10 128202435 . T C 1674.93 PASS AO=192;DP=206;FAO=195;FDP=206;FR=.;FRO=11;FSAF=112;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=11;FWDB=0.0211416;FXX=0.00483068;HRUN=4;LEN=1;MLLD=97.6209;QD=32.5229;RBI=0.0559012;REFB=-0.206911;REVB=0.0517492;RO=2;SAF=111;SAR=81;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116113;STB=0.53107;TYPE=snp;VARB=0.00470022;OID=.;OPOS=128202435;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:206:206:2:11:192:195:81:111:0:2:83:112:0:11 chr10 128807078 . G A 349.69 PASS AO=77;DP=148;FAO=77;FDP=147;FR=.;FRO=70;FSAF=28;FSAR=49;FSRF=26;FSRR=44;FWDB=-0.00777478;FXX=0.0067563;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.3154;QD=9.51542;RBI=0.0236025;REFB=-0.0012487;REVB=-0.0222853;RO=70;SAF=29;SAR=48;SRF=26;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00480753;STB=0.503999;TYPE=snp;VARB=0.000457294;OID=.;OPOS=128807078;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:147:70:70:77:77:48:29:26:44:49:28:26:44 chr10 128830409 . A G 84.31 PASS AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.00823314;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=74.9362;QD=6.88237;RBI=0.0681444;REFB=-0.034695;REVB=0.0676452;RO=27;SAF=6;SAR=15;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0968653;STB=0.5704;TYPE=snp;VARB=0.0579563;OID=.;OPOS=128830409;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:48:49:27:28:21:21:15:6:10:17:15:6:11:17 chr10 128926013 . A G 2414.81 PASS AO=253;DP=255;FAO=255;FDP=255;FR=.;FRO=0;FSAF=136;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104944;FXX=0.0116275;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.053;QD=37.8794;RBI=0.0135865;REFB=-0.140834;REVB=0.00862912;RO=0;SAF=135;SAR=118;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000523347;OID=.;OPOS=128926013;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:255:255:0:0:253:255:118:135:0:0:119:136:0:0 chr10 128974621 . C T 10.16 PASS AO=3;DP=15;FAO=3;FDP=15;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=-0.0257854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.839;QD=2.70866;RBI=0.0259612;REFB=-0.0179926;REVB=-0.00301616;RO=12;SAF=2;SAR=1;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.524397;STB=0.84459;TYPE=snp;VARB=0.0585718;OID=.;OPOS=128974621;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:15:15:12:12:3:3:1:2:2:10:1:2:2:10 chr10 129216658 . T C 206.53 PASS AO=52;DP=113;FAO=52;FDP=113;FR=.;FRO=61;FSAF=33;FSAR=19;FSRF=28;FSRR=33;FWDB=-0.0393557;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.147;QD=7.31062;RBI=0.0429542;REFB=-0.00473243;REVB=0.0172101;RO=61;SAF=33;SAR=19;SRF=28;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173573;STB=0.596832;TYPE=snp;VARB=0.00594154;OID=.;OPOS=129216658;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:61:61:52:52:19:33:28:33:19:33:28:33 chr10 129242515 . G A 318.53 PASS AO=58;DP=98;FAO=58;FDP=94;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=49;FSRF=7;FSRR=29;FWDB=-0.0454499;FXX=0.0408122;HRUN=3;LEN=1;MLLD=220.547;QD=13.5543;RBI=0.0455663;REFB=0.0137826;REVB=0.00325473;RO=36;SAF=9;SAR=49;SRF=7;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0505866;STB=0.527581;TYPE=snp;VARB=-0.00650124;OID=.;OPOS=129242515;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:94:36:36:58:58:49:9:7:29:49:9:7:29 chr10 129245684 . G A 303.63 PASS AO=68;DP=133;FAO=68;FDP=132;FR=.;FRO=64;FSAF=56;FSAR=12;FSRF=43;FSRR=21;FWDB=-0.00153487;FXX=0.00751823;HRUN=5;LEN=1;MLLD=114.365;QD=9.20099;RBI=0.0203843;REFB=-0.0267839;REVB=-0.0203264;RO=58;SAF=56;SAR=12;SRF=40;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168633;STB=0.60866;TYPE=snp;VARB=0.0291808;OID=.;OPOS=129245684;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:132:58:64:68:68:12:56:40:18:12:56:43:21 chr10 129249662 . G A 624.32 PASS AO=69;DP=71;FAO=69;FDP=71;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00529706;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.282;QD=35.1728;RBI=0.0690862;REFB=-0.211274;REVB=0.0688828;RO=2;SAF=26;SAR=43;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0214794;STB=0.51136;TYPE=snp;VARB=0.00466036;OID=.;OPOS=129249662;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:71:71:2:2:69:69:43:26:0:2:43:26:0:2 chr10 129249676 . C T 44.08 PASS AO=20;DP=74;FAO=20;FDP=74;FR=.;FRO=54;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=37;FWDB=0.0259293;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.336;QD=2.38266;RBI=0.0264707;REFB=-0.0144921;REVB=0.00532632;RO=28;SAF=11;SAR=9;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0870393;STB=0.667392;TYPE=snp;VARB=0.0374754;OID=.;OPOS=129249676;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:55:74:28:54:20:20:9:11:13:15:9:11:17:37 chr10 129249693 . G A 227.74 PASS AO=50;DP=97;FAO=50;FDP=97;FR=.;FRO=47;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=20;FSRR=27;FWDB=0.00248885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.891;QD=9.39152;RBI=0.0406489;REFB=-0.0282775;REVB=0.0405726;RO=45;SAF=25;SAR=25;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0477471;STB=0.536068;TYPE=snp;VARB=0.023454;OID=.;OPOS=129249693;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:45:47:50:50:25:25:20:25:25:25:20:27 chr10 129249701 . C G 978.1 PASS AO=100;DP=100;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0405867;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1303;QD=37.9844;RBI=0.0802297;REFB=0;REVB=0.0692063;RO=0;SAF=54;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21299e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000807484;OID=.;OPOS=129249701;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:100:103:0:0:100:103:46:54:0:0:49:54:0:0 chr10 129249925 . T C 417.71 PASS AO=133;DP=333;FAO=132;FDP=331;FR=.;FRO=199;FSAF=113;FSAR=19;FSRF=141;FSRR=58;FWDB=-0.0127221;FXX=0.0119399;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.747;QD=5.04784;RBI=0.0224542;REFB=-0.0426585;REVB=0.0185023;RO=196;SAF=113;SAR=20;SRF=139;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23465;STB=0.643207;TYPE=snp;VARB=0.0118094;OID=.;OPOS=129249925;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:333:331:196:199:133:132:20:113:139:57:19:113:141:58 chr10 129347785 . C T 767.21 PASS AO=167;DP=312;FAO=167;FDP=311;FR=.;FRO=144;FSAF=31;FSAR=136;FSRF=41;FSRR=103;FWDB=-0.0127657;FXX=0.00320503;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.386;QD=9.86765;RBI=0.013012;REFB=-0.034418;REVB=-0.00252002;RO=143;SAF=31;SAR=136;SRF=41;SRR=102;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128277;STB=0.56926;TYPE=snp;VARB=0.0231526;OID=.;OPOS=129347785;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:312:311:143:144:167:167:136:31:41:102:136:31:41:103 chr10 129534679 . T C 446.94 PASS AO=43;DP=43;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00191214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.012;QD=38.0371;RBI=0.0744936;REFB=0;REVB=0.074469;RO=0;SAF=43;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000232354;OID=.;OPOS=129534679;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:43:47:0:0:43:47:0:43:0:0:2:45:0:0 chr10 129534739 . C G 509.87 PASS AO=56;DP=57;FAO=58;FDP=60;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=23;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0317529;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.1536;QD=33.9916;RBI=0.0435972;REFB=-0.166275;REVB=0.0298742;RO=0;SAF=33;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.513884;TYPE=snp;VARB=0.0134676;OID=.;OPOS=129534739;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:57:60:0:2:56:58:23:33:0:0:23:35:2:0 chr10 129534864 . A C 363.29 PASS AO=27;DP=39;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0577185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.769;QD=38.2408;RBI=0.0599267;REFB=0;REVB=0.016118;RO=0;SAF=4;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000151855;OID=.;OPOS=129534864;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:27:38:0:0:27:38:23:4:0:0:28:10:0:0 chr10 129763277 . C T 447.33 PASS AO=114;DP=255;FAO=118;FDP=258;FR=.;FRO=140;FSAF=41;FSAR=77;FSRF=50;FSRR=90;FWDB=0.0434892;FXX=0.00386085;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.102;QD=6.93541;RBI=0.0435199;REFB=-0.0138584;REVB=0.0016356;RO=140;SAF=39;SAR=75;SRF=50;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165063;STB=0.505774;TYPE=snp;VARB=0.0161728;OID=.;OPOS=129763277;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:255:258:140:140:114:118:75:39:50:90:77:41:50:90 chr10 129859992 . T C 412.31 PASS AO=97;DP=198;FAO=98;FDP=200;FR=.;FRO=102;FSAF=34;FSAR=64;FSRF=35;FSRR=67;FWDB=-0.0188938;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=248.884;QD=8.2461;RBI=0.0216221;REFB=-0.00504264;REVB=0.0105138;RO=100;SAF=34;SAR=63;SRF=35;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000522173;STB=0.502142;TYPE=snp;VARB=0.00520345;OID=.;OPOS=129859992;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:200:100:102:97:98:63:34:35:65:64:34:35:67 chr10 129882401 . C T 341.02 PASS AO=68;DP=120;FAO=68;FDP=120;FR=.;FRO=52;FSAF=65;FSAR=3;FSRF=45;FSRR=7;FWDB=-0.00573905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.5925;QD=11.3674;RBI=0.121613;REFB=-0.00510124;REVB=-0.121477;RO=52;SAF=65;SAR=3;SRF=45;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.292257;STB=0.663204;TYPE=snp;VARB=0.000966658;OID=.;OPOS=129882401;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:52:52:68:68:3:65:45:7:3:65:45:7 chr10 129883370 . A G 675.32 PASS AO=164;DP=331;FAO=162;FDP=329;FR=.;FRO=167;FSAF=73;FSAR=89;FSRF=67;FSRR=100;FWDB=0.0585175;FXX=0.00604211;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7943;QD=8.21061;RBI=0.0835138;REFB=0.00863496;REVB=-0.059584;RO=167;SAF=73;SAR=91;SRF=67;SRR=100;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0411328;STB=0.525457;TYPE=snp;VARB=-0.00780366;OID=.;OPOS=129883370;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:331:329:167:167:164:162:91:73:67:100:89:73:67:100 chr10 129883933 . C T 218.62 PASS AO=66;DP=164;FAO=66;FDP=164;FR=.;FRO=98;FSAF=22;FSAR=44;FSRF=42;FSRR=56;FWDB=-0.00940542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.234;QD=5.33226;RBI=0.0103463;REFB=-0.010055;REVB=-0.00431087;RO=96;SAF=22;SAR=44;SRF=42;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117742;STB=0.561384;TYPE=snp;VARB=0.0121025;OID=.;OPOS=129883933;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:164:96:98:66:66:44:22:42:54:44:22:42:56 chr10 129899578 . T C 2641.49 PASS AO=284;DP=291;FAO=285;FDP=285;FR=.;FRO=0;FSAF=136;FSAR=149;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0597236;FXX=0.0206178;HRUN=3;LEN=1;MLLD=165.188;QD=37.0735;RBI=0.0681515;REFB=-0.142082;REVB=0.0328286;RO=1;SAF=136;SAR=148;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00321124;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000462608;OID=.;OPOS=129899578;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:91:291:285:1:0:284:285:148:136:0:1:149:136:0:0 chr10 129899778 . G C 1674.27 PASS AO=175;DP=175;FAO=175;FDP=175;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00532905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.6272;QD=38.2691;RBI=0.0122648;REFB=0;REVB=-0.0110466;RO=0;SAF=94;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.40407e-05;OID=.;OPOS=129899778;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:175:175:0:0:175:175:81:94:0:0:81:94:0:0 chr10 129899922 . T C 285.56 PASS AO=57;DP=101;FAO=57;FDP=101;FR=.;FRO=44;FSAF=5;FSAR=52;FSRF=13;FSRR=31;FWDB=0.0599206;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2144;QD=11.3091;RBI=0.0699749;REFB=0.0400102;REVB=0.0361387;RO=44;SAF=5;SAR=52;SRF=13;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.344842;STB=0.692736;TYPE=snp;VARB=-0.0339152;OID=.;OPOS=129899922;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:44:44:57:57:52:5:13:31:52:5:13:31 chr10 129901066 . C A 459.26 PASS AO=113;DP=237;FAO=114;FDP=237;FR=.;FRO=123;FSAF=65;FSAR=49;FSRF=62;FSRR=61;FWDB=0.0689004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.1179;QD=7.75118;RBI=0.10067;REFB=-0.0164912;REVB=0.0733977;RO=124;SAF=64;SAR=49;SRF=63;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0558453;STB=0.534653;TYPE=snp;VARB=0.0209585;OID=.;OPOS=129901066;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:237:237:124:123:113:114:49:64:63:61:49:65:62:61 chr10 129901393 . T C 2269.05 PASS AO=234;DP=235;FAO=236;FDP=236;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=170;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00545178;FXX=0.016666;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.709;QD=38.4585;RBI=0.0227325;REFB=0;REVB=0.0220691;RO=0;SAF=68;SAR=166;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.87531e-05;OID=.;OPOS=129901393;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:235:236:0:0:234:236:166:68:0:0:170:66:0:0 chr10 129901570 . C T 490.41 PASS AO=111;DP=215;FAO=111;FDP=215;FR=.;FRO=104;FSAF=44;FSAR=67;FSRF=53;FSRR=51;FWDB=-0.0754546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.384;QD=9.12391;RBI=0.0764283;REFB=-0.0116238;REVB=-0.0121614;RO=103;SAF=44;SAR=67;SRF=52;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0973268;STB=0.555888;TYPE=snp;VARB=0.00918176;OID=.;OPOS=129901570;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:215:103:104:111:111:67:44:52:51:67:44:53:51 chr10 129901722 . G A 1215.14 PASS AO=128;DP=129;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0225586;FXX=0.00775134;HRUN=3;LEN=1;MLLD=276.637;QD=37.9732;RBI=0.037211;REFB=-0.0128165;REVB=0.0295934;RO=1;SAF=48;SAR=80;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00979681;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.53796e-05;OID=.;OPOS=129901722;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:129:128:1:0:128:128:80:48:1:0:80:48:0:0 chr10 129901726 . C T 1236.23 PASS AO=118;DP=121;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.377;QD=37.4614;RBI=0.116617;REFB=0;REVB=0.115496;RO=1;SAF=48;SAR=70;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00673742;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000314553;OID=.;OPOS=129901726;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:121:132:1:0:118:132:70:48:0:1:83:49:0:0 chr10 129901825 . T C 1389.08 PASS AO=150;DP=151;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00404863;FXX=0.0132442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.161;QD=37.2907;RBI=0.0167863;REFB=-0.0501839;REVB=0.0162907;RO=1;SAF=88;SAR=62;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00537481;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.17519e-05;OID=.;OPOS=129901825;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:151:149:1:0:150:149:62:88:1:0:62:87:0:0 chr10 129901946 . T G 1231.7 PASS AO=127;DP=129;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0482198;FXX=0.00746213;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.049;QD=37.0436;RBI=0.0669817;REFB=0;REVB=0.0464908;RO=0;SAF=86;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000940616;OID=.;OPOS=129901946;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:129:133:0:0:127:133:41:86:0:0:41:92:0:0 chr10 129902158 . C T 481.18 PASS AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00138203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.019;QD=37.74;RBI=0.0151511;REFB=0;REVB=0.015088;RO=0;SAF=12;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.37303e-05;OID=.;OPOS=129902158;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:51:51:0:0:51:51:39:12:0:0:39:12:0:0 chr10 129902281 . G A 375.71 PASS AO=38;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167582;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=198.133;QD=38.5341;RBI=0.0258087;REFB=0;REVB=0.0196279;RO=0;SAF=32;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.29107e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000128875;OID=.;OPOS=129902281;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:38:39:0:0:38:39:6:32:0:0:6:33:0:0 chr10 129902368 . T A 198.54 PASS AO=40;DP=72;FAO=40;FDP=72;FR=.;FRO=32;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.00626152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.733;QD=11.0301;RBI=0.013131;REFB=-0.00524643;REVB=-0.0115419;RO=32;SAF=22;SAR=18;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0657094;STB=0.536194;TYPE=snp;VARB=0.00415802;OID=.;OPOS=129902368;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:32:32:40:40:18:22:15:17:18:22:15:17 chr10 129903016 . T C 2320.35 PASS AO=254;DP=263;FAO=257;FDP=266;FR=.;FRO=9;FSAF=130;FSAR=127;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=-0.00336894;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=154.739;QD=34.8925;RBI=0.0477654;REFB=-0.0965268;REVB=0.0476464;RO=9;SAF=130;SAR=124;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0188723;STB=0.509594;TYPE=snp;VARB=0.000539455;OID=.;OPOS=129903016;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:263:266:9:9:254:257:124:130:2:7:127:130:2:7 chr10 129903094 . G T 618.48 PASS AO=142;DP=302;FAO=155;FDP=314;FR=.;FRO=159;FSAF=62;FSAR=93;FSRF=80;FSRR=79;FWDB=-0.0181815;FXX=0.00946342;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.5135;QD=7.87871;RBI=0.0207846;REFB=-0.0221973;REVB=0.0100713;RO=148;SAF=60;SAR=82;SRF=74;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0727866;STB=0.55324;TYPE=snp;VARB=0.019079;OID=.;OPOS=129903094;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:302:314:148:159:142:155:82:60:74:74:93:62:80:79 chr10 129904477 . C T 1208.09 PASS AO=128;DP=130;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0441049;FXX=0.00769172;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.005;QD=37.4602;RBI=0.044417;REFB=-0.0636223;REVB=-0.00525616;RO=1;SAF=60;SAR=68;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00785446;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000557409;OID=.;OPOS=129904477;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:130:129:1:0:128:129:68:60:1:0:68:61:0:0 chr10 129906468 . C T 3463.29 PASS AO=368;DP=371;FAO=368;FDP=368;FR=.;FRO=0;FSAF=211;FSAR=157;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00100754;FXX=0.0134045;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.28;QD=37.6445;RBI=0.0302299;REFB=-0.007936;REVB=0.0302131;RO=3;SAF=210;SAR=158;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00676734;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.00288e-05;OID=.;OPOS=129906468;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:371:368:3:0:368:368:158:210:3:0:157:211:0:0 chr10 129907544 . G C 627.69 PASS AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0884888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.697;QD=38.0421;RBI=0.0895956;REFB=0;REVB=0.0140395;RO=0;SAF=4;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000780967;OID=.;OPOS=129907544;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:66:66:0:0:66:66:62:4:0:0:62:4:0:0 chr10 129911856 . C G 1538.57 PASS AO=168;DP=173;FAO=168;FDP=172;FR=.;FRO=4;FSAF=67;FSAR=101;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0313796;FXX=0.00578001;HRUN=3;LEN=1;MLLD=111.158;QD=35.7808;RBI=0.0318335;REFB=-0.0695309;REVB=-0.00535646;RO=3;SAF=67;SAR=101;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00930384;STB=0.508486;TYPE=snp;VARB=0.000286187;OID=.;OPOS=129911856;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:173:172:3:4:168:168:101:67:2:1:101:67:3:1 chr10 129913960 . A T 404.47 PASS AO=102;DP=213;FAO=102;FDP=218;FR=.;FRO=116;FSAF=48;FSAR=54;FSRF=50;FSRR=66;FWDB=-0.0194868;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=147.779;QD=7.42151;RBI=0.0247104;REFB=-0.00529593;REVB=-0.0151943;RO=111;SAF=48;SAR=54;SRF=48;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0362796;STB=0.521169;TYPE=snp;VARB=0.004794;OID=.;OPOS=129913960;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:213:218:111:116:102:102:54:48:48:63:54:48:50:66 chr10 129917560 . T C 311.95 PASS AO=74;DP=151;FAO=75;FDP=153;FR=.;FRO=78;FSAF=34;FSAR=41;FSRF=41;FSRR=37;FWDB=-0.0202256;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.1443;QD=8.1555;RBI=0.0280043;REFB=-0.00822067;REVB=0.0193692;RO=77;SAF=34;SAR=40;SRF=40;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0555408;STB=0.53692;TYPE=snp;VARB=0.00604392;OID=.;OPOS=129917560;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:153:77:78:74:75:40:34:40:37:41:34:41:37 chr10 131565064 . A G 72.84 PASS AO=20;DP=53;FAO=20;FDP=50;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=10;FWDB=-0.00399718;FXX=0.0565931;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.225;QD=5.82738;RBI=0.0875671;REFB=-0.0162983;REVB=-0.0874758;RO=30;SAF=14;SAR=6;SRF=20;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0404197;STB=0.523341;TYPE=snp;VARB=0.0199884;OID=.;OPOS=131565064;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:53:50:30:30:20:20:6:14:20:10:6:14:20:10 chr10 131565170 . A G 34.91 PASS AO=18;DP=61;FAO=16;FDP=61;FR=.;FRO=45;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=29;FSRR=16;FWDB=-0.0020119;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.6399;QD=2.2889;RBI=0.0129158;REFB=0.000813086;REVB=-0.0127581;RO=43;SAF=5;SAR=13;SRF=27;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.404609;STB=0.826642;TYPE=snp;VARB=-0.00663111;OID=.;OPOS=131565170;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:61:61:43:45:18:16:13:5:27:16:13:3:29:16 chr10 131934747 . G C 15.35 PASS AO=3;DP=9;FAO=3;FDP=9;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.00238816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.0253;QD=6.82204;RBI=0.00238816;REFB=-0.0861372;REVB=0;RO=6;SAF=3;SAR=0;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0267183;OID=.;OPOS=131934747;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:9:9:6:6:3:3:0:3:6:0:0:3:6:0 chr10 131959150 . C T 242.05 PASS AO=66;DP=150;FAO=66;FDP=152;FR=.;FRO=86;FSAF=18;FSAR=48;FSRF=23;FSRR=63;FWDB=0.0158989;FXX=0.00653552;HRUN=3;LEN=1;MLLD=157.911;QD=6.36973;RBI=0.0169492;REFB=-0.00852365;REVB=0.00587348;RO=84;SAF=18;SAR=48;SRF=23;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00136829;STB=0.503781;TYPE=snp;VARB=0.00721628;OID=.;OPOS=131959150;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:152:84:86:66:66:48:18:23:61:48:18:23:63 chr10 131967693 . T A 1894.17 PASS AO=203;DP=206;FAO=203;FDP=203;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=108;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112332;FXX=0.0145624;HRUN=3;LEN=1;MLLD=229.444;QD=37.3235;RBI=0.0261509;REFB=-0.0379702;REVB=0.0236153;RO=2;SAF=95;SAR=108;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00992098;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000135026;OID=.;OPOS=131967693;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:206:203:2:0:203:203:108:95:2:0:108:95:0:0 chr10 133607904 . G A 97.08 PASS AO=17;DP=28;FAO=17;FDP=28;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.0326812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.344;QD=13.8692;RBI=0.0493599;REFB=-0.0574948;REVB=0.0369911;RO=9;SAF=5;SAR=12;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.245897;STB=0.642682;TYPE=snp;VARB=0.0178535;OID=.;OPOS=133607904;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:28:28:9:11:17:17:12:5:6:3:12:5:7:4 chr10 133607947 . T G 79.63 PASS AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.0276939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.757;QD=8.16699;RBI=0.0524027;REFB=-0.040033;REVB=-0.0444869;RO=21;SAF=7;SAR=11;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215916;STB=0.623093;TYPE=snp;VARB=0.0301347;OID=.;OPOS=133607947;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:39:39:21:21:18:18:11:7:13:8:11:7:13:8 chr10 133608171 . G A 149.42 PASS AO=33;DP=65;FAO=33;FDP=65;FR=.;FRO=32;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.0770473;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.4774;QD=9.19498;RBI=0.0798347;REFB=-0.00594044;REVB=0.0209117;RO=32;SAF=20;SAR=13;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0680559;STB=0.537921;TYPE=snp;VARB=0.0071655;OID=.;OPOS=133608171;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:32:32:33:33:13:20:17:15:13:20:17:15 chr10 133608210 . A G 68.12 PASS AO=21;DP=57;FAO=21;FDP=58;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=-0.0147183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.902;QD=4.698;RBI=0.0678315;REFB=-0.0167564;REVB=-0.0662154;RO=36;SAF=13;SAR=8;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0716143;STB=0.551733;TYPE=snp;VARB=0.0360559;OID=.;OPOS=133608210;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:57:58:36:37:21:21:8:13:20:16:8:13:20:17 chr10 133608355 . G A 12.32 PASS AO=8;DP=45;FAO=8;FDP=45;FR=.;FRO=37;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=25;FWDB=0.0140732;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.974;QD=1.09505;RBI=0.0350769;REFB=-0.00858363;REVB=0.0321299;RO=37;SAF=3;SAR=5;SRF=12;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0676294;STB=0.545344;TYPE=snp;VARB=0.0401897;OID=.;OPOS=133608355;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:45:45:37:37:8:8:5:3:12:25:5:3:12:25 chr10 133918420 . G A 116.04 PASS AO=35;DP=116;FAO=42;FDP=123;FR=.;FRO=81;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=42;FSRR=39;FWDB=0.0238744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.304;QD=3.77349;RBI=0.0293966;REFB=-0.0107545;REVB=0.0171515;RO=80;SAF=18;SAR=17;SRF=41;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00212038;STB=0.503489;TYPE=snp;VARB=0.026422;OID=.;OPOS=133918420;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:123:80:81:35:42:17:18:41:39:20:22:42:39 chr10 133961494 . C T 89.99 PASS AO=28;DP=80;FAO=29;FDP=81;FR=.;FRO=52;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=36;FWDB=0.0694319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.557;QD=4.4437;RBI=0.0701434;REFB=-0.00921577;REVB=0.00996564;RO=50;SAF=10;SAR=18;SRF=16;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0456578;STB=0.549967;TYPE=snp;VARB=0.022618;OID=.;OPOS=133961494;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:80:81:50:52:28:29:18:10:16:34:18:11:16:36 chr10 133963499 . C T 409.25 PASS AO=77;DP=129;FAO=77;FDP=128;FR=.;FRO=51;FSAF=25;FSAR=52;FSRF=22;FSRR=29;FWDB=0.0347243;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.2612;QD=12.7892;RBI=0.0938388;REFB=-0.00983744;REVB=0.0871777;RO=49;SAF=25;SAR=52;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0976156;STB=0.546866;TYPE=snp;VARB=0.00753159;OID=.;OPOS=133963499;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:128:49:51:77:77:52:25:22:27:52:25:22:29 chr10 133967253 . T G 100.76 PASS AO=22;DP=44;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=-0.0271612;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=153.386;QD=9.15983;RBI=0.0272619;REFB=-0.0184778;REVB=-0.00234101;RO=22;SAF=12;SAR=10;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199884;STB=0.612146;TYPE=snp;VARB=0.0175254;OID=.;OPOS=133967253;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:44:44:22:22:22:22:10:12:7:15:10:12:7:15 chr10 134010435 . AG A 187.14 PASS AO=48;DP=86;FAO=48;FDP=80;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.0249256;FXX=0.0243873;HRUN=2;LEN=1;MLLD=28.7821;QD=9.35675;RBI=0.0519421;REFB=0.00737042;REVB=0.0455708;RO=31;SAF=19;SAR=29;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.041499;STB=0.530095;TYPE=del;VARB=-0.002231;OID=.;OPOS=134010436;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:48:82:48:80:32:19:29:15:17:67:31:19:29:14:17 chr10 134013990 . G A 39.28 PASS AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=0.0193644;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.669;QD=7.14193;RBI=0.0194618;REFB=-0.0356871;REVB=-0.00194455;RO=13;SAF=3;SAR=6;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120736;STB=0.57128;TYPE=snp;VARB=0.0353047;OID=.;OPOS=134013990;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:22:22:13:13:9:9:6:3:3:10:6:3:3:10 chr10 134017295 . A G 37 PASS AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0084627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.044;QD=13.453;RBI=0.0878624;REFB=-0.0344601;REVB=-0.0874538;RO=4;SAF=5;SAR=1;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.297985;STB=0.739831;TYPE=snp;VARB=0.0117198;OID=.;OPOS=134017295;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:10:11:4:5:6:6:1:5:2:2:1:5:2:3 chr10 134017388 . C G 68.19 PASS AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.017226;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=184.956;QD=8.52312;RBI=0.0371167;REFB=-0.0230456;REVB=-0.0328773;RO=17;SAF=9;SAR=6;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226093;STB=0.62946;TYPE=snp;VARB=0.0257015;OID=.;OPOS=134017388;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:32:32:17:17:15:15:6:9:6:11:6:9:6:11 chr10 134036193 . A G 19.83 PASS AO=5;DP=16;FAO=5;FDP=16;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=1;FWDB=0.00425483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.0009;QD=4.95794;RBI=0.0299925;REFB=-0.00936329;REVB=-0.0296892;RO=11;SAF=3;SAR=2;SRF=10;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.403186;STB=0.742177;TYPE=snp;VARB=0.0214529;OID=.;OPOS=134036193;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:16:16:11:11:5:5:2:3:10:1:2:3:10:1 chr10 134039242 . C T 97.88 PASS AO=21;DP=42;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=17;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=-0.00836934;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=140.761;QD=9.32211;RBI=0.0146275;REFB=0.00566503;REVB=-0.0119965;RO=21;SAF=4;SAR=17;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123834;STB=0.570398;TYPE=snp;VARB=-0.00574732;OID=.;OPOS=134039242;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:42:42:21:21:21:21:17:4:6:15:17:4:6:15 chr10 134062574 . G A 204.59 PASS AO=41;DP=73;FAO=41;FDP=73;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=27;FSRF=10;FSRR=22;FWDB=0.00916818;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.109;QD=11.2105;RBI=0.020735;REFB=-0.0167031;REVB=0.018598;RO=32;SAF=14;SAR=27;SRF=10;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0259052;STB=0.514236;TYPE=snp;VARB=0.0153221;OID=.;OPOS=134062574;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:32:32:41:41:27:14:10:22:27:14:10:22 chr10 134143942 . C T 103.43 PASS AO=33;DP=90;FAO=33;FDP=90;FR=.;FRO=57;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=35;FWDB=-0.00562821;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.232;QD=4.597;RBI=0.0152181;REFB=-0.0129283;REVB=-0.0141391;RO=57;SAF=14;SAR=19;SRF=22;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0435909;STB=0.505297;TYPE=snp;VARB=0.0249775;OID=.;OPOS=134143942;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:57:57:33:33:19:14:22:35:20:13:22:35 chr10 134143985 . G T 77.11 PASS AO=30;DP=115;FAO=34;FDP=119;FR=.;FRO=85;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=31;FSRR=54;FWDB=0.00844708;FXX=0.0165276;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.276;QD=2.59202;RBI=0.0307462;REFB=-0.033489;REVB=0.0295631;RO=84;SAF=12;SAR=18;SRF=30;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0557256;STB=0.556088;TYPE=snp;VARB=0.0246724;OID=.;OPOS=134143985;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:115:119:84:85:30:34:18:12:30:54:19:15:31:54 chr10 134143986 . C T 72.51 PASS AO=36;DP=121;FAO=33;FDP=119;FR=.;FRO=86;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=31;FSRR=55;FWDB=0.0130468;FXX=0.0165276;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.475;QD=2.43725;RBI=0.0309448;REFB=-0.0380319;REVB=0.02806;RO=83;SAF=16;SAR=20;SRF=30;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101672;STB=0.569382;TYPE=snp;VARB=0.0411574;OID=.;OPOS=134143986;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:121:119:83:86:36:33:20:16:30:53:18:15:31:55 chr10 134144005 . T C 61.31 PASS AO=31;DP=116;FAO=31;FDP=116;FR=.;FRO=85;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=30;FSRR=55;FWDB=0.00822071;FXX=0.00854628;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.603;QD=2.11402;RBI=0.00963543;REFB=-0.0088879;REVB=-0.00502608;RO=83;SAF=13;SAR=18;SRF=30;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0738312;STB=0.550752;TYPE=snp;VARB=0.0180525;OID=.;OPOS=134144005;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:116:116:83:85:31:31:18:13:30:53:18:13:30:55 chr10 134145136 . A G 52.53 PASS AO=12;DP=27;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.0508077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.681;QD=7.78259;RBI=0.0556226;REFB=-0.0313564;REVB=-0.0226375;RO=15;SAF=8;SAR=4;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.314161;STB=0.682626;TYPE=snp;VARB=0.0117589;OID=.;OPOS=134145136;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:27:27:15:15:12:12:4:8:5:10:4:8:5:10 chr10 134145138 . C G 52.54 PASS AO=12;DP=27;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.0161548;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1006;QD=7.78336;RBI=0.0590441;REFB=-0.0127524;REVB=0.0567911;RO=15;SAF=8;SAR=4;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.314161;STB=0.682626;TYPE=snp;VARB=0.0181722;OID=.;OPOS=134145138;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:27:27:15:15:12:12:4:8:5:10:4:8:5:10 chr10 134145153 . G A 46.05 PASS AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=0.0149866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.953;QD=10.2329;RBI=0.0187264;REFB=-0.0135397;REVB=-0.0112285;RO=9;SAF=5;SAR=4;SRF=1;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.372859;STB=0.713877;TYPE=snp;VARB=0.0172016;OID=.;OPOS=134145153;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:18:18:9:9:9:9:4:5:1:8:4:5:1:8 chr10 134145166 . T C 49.9 PASS AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=-0.0277279;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.226;QD=12.474;RBI=0.0305872;REFB=-0.00184727;REVB=-0.0129129;RO=7;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.411267;STB=0.732904;TYPE=snp;VARB=0.000424592;OID=.;OPOS=134145166;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:16:16:7:7:9:9:4:5:0:7:4:5:0:7 chr10 134147172 . G A 650.91 PASS AO=157;DP=325;FAO=159;FDP=326;FR=.;FRO=167;FSAF=74;FSAR=85;FSRF=78;FSRR=89;FWDB=-0.00393075;FXX=0.00609737;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.517;QD=7.9866;RBI=0.0418053;REFB=-0.0165099;REVB=0.0416201;RO=166;SAF=72;SAR=85;SRF=77;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00494908;STB=0.500853;TYPE=snp;VARB=0.0139353;OID=.;OPOS=134147172;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:325:326:166:167:157:159:85:72:77:89:85:74:78:89 chr10 134161633 . A G 209.46 PASS AO=46;DP=90;FAO=46;FDP=90;FR=.;FRO=44;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=10;FSRR=34;FWDB=-0.00402945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.414;QD=9.30948;RBI=0.0266422;REFB=-0.0171038;REVB=-0.0263357;RO=44;SAF=20;SAR=26;SRF=10;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193011;STB=0.606018;TYPE=snp;VARB=0.0141662;OID=.;OPOS=134161633;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:44:44:46:46:26:20:10:34:26:20:10:34 chr10 134218175 . C T 138.1 PASS AO=34;DP=74;FAO=34;FDP=74;FR=.;FRO=40;FSAF=8;FSAR=26;FSRF=13;FSRR=27;FWDB=0.134363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.048;QD=7.46488;RBI=0.135019;REFB=-0.036738;REVB=-0.0132908;RO=39;SAF=8;SAR=26;SRF=12;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0902441;STB=0.562848;TYPE=snp;VARB=0.0276729;OID=.;OPOS=134218175;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:39:40:34:34:26:8:12:27:26:8:13:27 chr10 134218296 . C G 42.99 PASS AO=6;DP=8;FAO=6;FDP=8;FR=.;FRO=2;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.1525;QD=21.497;RBI=0.105138;REFB=-0.0392307;REVB=-0.105138;RO=1;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00484504;OID=.;OPOS=134218296;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:8:1:2:6:6:6:0:0:1:6:0:0:2 chr10 134219066 . G C 51.22 PASS AO=16;DP=47;FAO=16;FDP=47;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=9;FWDB=-0.00967961;FXX=0.020829;HRUN=5;LEN=1;MLLD=84.3897;QD=4.35916;RBI=0.0151923;REFB=-0.0224162;REVB=-0.0117094;RO=30;SAF=8;SAR=8;SRF=21;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223328;STB=0.638138;TYPE=snp;VARB=0.0373229;OID=.;OPOS=134219066;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:47:47:30:31:16:16:8:8:21:9:8:8:22:9 chr10 134521802 . G C 467.27 PASS AO=142;DP=348;FAO=142;FDP=349;FR=.;FRO=207;FSAF=68;FSAR=74;FSRF=108;FSRR=99;FWDB=-0.0101994;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.649;QD=5.35547;RBI=0.0213665;REFB=-0.0270523;REVB=-0.018775;RO=202;SAF=68;SAR=74;SRF=105;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0430656;STB=0.525412;TYPE=snp;VARB=0.0323894;OID=.;OPOS=134521802;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:348:349:202:207:142:142:74:68:105:97:74:68:108:99 chr10 134598628 . A G 89.99 PASS AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00214364;FXX=0.0999001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.048;QD=39.9959;RBI=0.0122265;REFB=0;REVB=0.0120371;RO=0;SAF=1;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000190625;OID=.;OPOS=134598628;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:9:0:0:9:9:8:1:0:0:8:1:0:0 chr10 134622408 . T C 254.84 PASS AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0315964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.6018;QD=37.7537;RBI=0.093348;REFB=0;REVB=0.0878381;RO=0;SAF=9;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00222943;OID=.;OPOS=134622408;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:27:27:0:0:27:27:18:9:0:0:18:9:0:0 chr10 134623959 . T C 497.85 PASS AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0388568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.61;QD=37.5733;RBI=0.0428824;REFB=0;REVB=-0.0181398;RO=0;SAF=39;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000186141;OID=.;OPOS=134623959;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:53:53:0:0:53:53:14:39:0:0:14:39:0:0 chr10 134624504 . C T 151.46 PASS AO=28;DP=47;FAO=28;FDP=47;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=25;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=0.122763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.859;QD=12.8899;RBI=0.123011;REFB=-0.0274351;REVB=0.00780735;RO=19;SAF=3;SAR=25;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.290826;STB=0.663576;TYPE=snp;VARB=0.0157344;OID=.;OPOS=134624504;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:47:47:19:19:28:28:25:3:6:13:25:3:6:13 chr10 134735672 . A G 385.26 PASS AO=94;DP=198;FAO=94;FDP=196;FR=.;FRO=102;FSAF=41;FSAR=53;FSRF=54;FSRR=48;FWDB=-0.00824537;FXX=0.0101005;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.59;QD=7.86247;RBI=0.00826136;REFB=-0.0179009;REVB=-0.000513829;RO=101;SAF=41;SAR=53;SRF=54;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0927725;STB=0.548704;TYPE=snp;VARB=0.0191675;OID=.;OPOS=134735672;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:196:101:102:94:94:53:41:54:47:53:41:54:48 chr10 134736026 . G A 19.84 PASS AO=5;DP=16;FAO=5;FDP=16;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.00919599;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=228.582;QD=4.95945;RBI=0.0229865;REFB=-0.00481089;REVB=0.0210668;RO=11;SAF=3;SAR=2;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154572;STB=0.5996;TYPE=snp;VARB=0.00734332;OID=.;OPOS=134736026;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:16:16:11:11:5:5:2:3:5:6:2:3:5:6 chr10 134736052 . G T 10.76 PASS AO=4;DP=19;FAO=4;FDP=18;FR=.;FRO=14;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.0750246;FXX=0.0526039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.129;QD=2.39135;RBI=0.0927693;REFB=-0.0362451;REVB=-0.0545659;RO=13;SAF=1;SAR=3;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171577;STB=0.655416;TYPE=snp;VARB=0.0927493;OID=.;OPOS=134736052;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:19:18:13:14:4:4:3:1:5:8:3:1:6:8 chr10 134736076 . T G 44.89 PASS AO=11;DP=27;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=0.00370456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.943;QD=6.65029;RBI=0.032278;REFB=-0.00929911;REVB=-0.0320647;RO=16;SAF=5;SAR=6;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21426;STB=0.624791;TYPE=snp;VARB=0.0045184;OID=.;OPOS=134736076;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:27:27:16:16:11:11:6:5:4:12:6:5:4:12 chr10 134738232 . A G 70.61 PASS AO=24;DP=71;FAO=24;FDP=71;FR=.;FRO=47;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=29;FSRR=18;FWDB=0.013654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.402;QD=3.97803;RBI=0.0259012;REFB=-0.00895875;REVB=-0.02201;RO=45;SAF=13;SAR=11;SRF=29;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117764;STB=0.550614;TYPE=snp;VARB=0.0390145;OID=.;OPOS=134738232;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:71:71:45:47:24:24:11:13:29:16:11:13:29:18 chr10 134748331 . C T 323.98 PASS AO=87;DP=195;FAO=87;FDP=196;FR=.;FRO=109;FSAF=41;FSAR=46;FSRF=53;FSRR=56;FWDB=-0.0171908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.18;QD=6.61175;RBI=0.0172049;REFB=-0.0111693;REVB=-0.000697532;RO=108;SAF=41;SAR=46;SRF=52;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0102105;STB=0.508345;TYPE=snp;VARB=0.0136862;OID=.;OPOS=134748331;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:196:108:109:87:87:46:41:52:56:46:41:53:56 chr10 134777790 . G A 414.31 PASS AO=54;DP=63;FAO=54;FDP=63;FR=.;FRO=9;FSAF=0;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=0;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=192.834;QD=26.3052;RBI=0.00394995;REFB=-0.0424516;REVB=0.00394995;RO=6;SAF=0;SAR=54;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00142082;OID=.;OPOS=134777790;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:63:63:6:9:54:54:54:0:0:6:54:0:0:9 chr10 134778106 . C T 244.45 PASS AO=47;DP=81;FAO=47;FDP=81;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=33;FWDB=0.0243526;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.021;QD=12.0717;RBI=0.0296789;REFB=0.0260023;REVB=0.0169643;RO=31;SAF=16;SAR=31;SRF=1;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.277375;STB=0.660164;TYPE=snp;VARB=-0.0170958;OID=.;OPOS=134778106;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:31:34:47:47:31:16:1:30:31:16:1:33 chr10 134884516 . G A 85.18 PASS AO=23;DP=56;FAO=23;FDP=56;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=26;FWDB=0.0278969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.202;QD=6.08441;RBI=0.0396632;REFB=-0.0250297;REVB=-0.0281946;RO=33;SAF=11;SAR=12;SRF=7;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.282227;STB=0.659183;TYPE=snp;VARB=0.0406712;OID=.;OPOS=134884516;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:56:56:33:33:23:23:12:11:7:26:12:11:7:26 chr10 134884546 . A G 44.25 PASS AO=13;DP=42;FAO=15;FDP=44;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=22;FWDB=0.0277148;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.132;QD=4.0229;RBI=0.0287741;REFB=-0.0274866;REVB=0.00773576;RO=29;SAF=8;SAR=5;SRF=7;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.410963;STB=0.760257;TYPE=snp;VARB=0.0647554;OID=.;OPOS=134884546;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:42:44:29:29:13:15:5:8:7:22:5:10:7:22 chr10 134884592 . CGGG CGG,CG,CGGA 319.07 PASS AO=9,8,26;DP=51;FAO=20,2,26;FDP=51;FR=.;FRO=3;FSAF=5,0,17;FSAR=15,2,9;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0891163,0.0489802,0.0463848;FXX=0;HRUN=4,4,4;LEN=1,2,1;MLLD=14.5934,25.048,128.602;QD=25.0247;RBI=0.118777,0.0640612,0.0520739;REFB=-0.00784476,-0.00445478,-0.00722783;REVB=-0.0785254,-0.041289,-0.0236673;RO=8;SAF=0,0,17;SAR=9,8,9;SRF=8;SRR=0;SSEN=0.427184,0.427184,0;SSEP=0.378151,0.378151,0;SSSB=-0.848352,-0.844818,-0.176109;STB=0.615261,0.995982,0.54051;TYPE=del,del,snp;VARB=-0.00462842,0.0299834,0.0125074;OID=.,.,.;OPOS=134884593,134884593,134884595;OREF=G,GG,G;OALT=-,-,A;OMAPALT=CGG,CG,CGGA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/3:9,8,26:51:20,2,26:51:3:5,0,17:15,2,9:3:0:62:8:0,0,17:9,8,9:8:0 chr10 134884610 . C G 112.61 PASS AO=14;DP=54;FAO=16;FDP=54;FR=.,HEALED;FRO=27;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=20;FWDB=-0.0130475;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.8549;QD=8.34151;RBI=0.0935234;REFB=0.04627;REVB=0.0926088;RO=27;SAF=7;SAR=7;SRF=7;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.270869;STB=0.650991;TYPE=snp;VARB=-0.0374102;OID=.;OPOS=134884610;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:53:54:27:27:14:16:7:7:7:20:8:8:7:20 chr10 134886618 . G C 46.32 PASS AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0222644;FXX=0.049975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.608;QD=9.75155;RBI=0.0258045;REFB=-0.0237614;REVB=0.013045;RO=8;SAF=3;SAR=6;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0371297;STB=0.592381;TYPE=snp;VARB=0.021637;OID=.;OPOS=134886618;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:19:19:8:10:9:9:6:3:3:5:6:3:5:5 chr10 134942166 . A G 84.69 PASS AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=4;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=19;FWDB=0.0299138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.1792;QD=7.05744;RBI=0.033882;REFB=-0.0581483;REVB=0.0159108;RO=27;SAF=4;SAR=17;SRF=8;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1494;STB=0.586118;TYPE=snp;VARB=0.0425168;OID=.;OPOS=134942166;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:48:48:27:27:21:21:17:4:8:19:17:4:8:19 chr10 134942832 . G A 42.78 PASS AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=2;FWDB=-0.0393257;FXX=0.039984;HRUN=3;LEN=1;MLLD=76.7484;QD=7.1307;RBI=0.051892;REFB=-0.00070808;REVB=0.0338566;RO=13;SAF=5;SAR=5;SRF=12;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.419633;STB=0.707988;TYPE=snp;VARB=0.00137807;OID=.;OPOS=134942832;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:23:24:13:14:10:10:5:5:12:1:5:5:12:2 chr10 134997480 . C T 167.47 PASS AO=40;DP=84;FAO=40;FDP=84;FR=.;FRO=44;FSAF=9;FSAR=31;FSRF=14;FSRR=30;FWDB=0.0349222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.1563;QD=7.97486;RBI=0.0349374;REFB=-0.000648063;REVB=0.00103054;RO=44;SAF=9;SAR=31;SRF=14;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115773;STB=0.564942;TYPE=snp;VARB=0.000334942;OID=.;OPOS=134997480;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:44:44:40:40:31:9:14:30:31:9:14:30 chr10 134999602 . G C 21.5 PASS AO=5;DP=17;FAO=6;FDP=20;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=-0.0418246;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2959;QD=4.29984;RBI=0.116986;REFB=0.00434369;REVB=0.109254;RO=12;SAF=2;SAR=3;SRF=10;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.458348;STB=0.787084;TYPE=snp;VARB=-0.00213356;OID=.;OPOS=134999602;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:17:20:12:14:5:6:3:2:10:2:4:2:11:3 chr10 135012162 . T C 33.2 PASS AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=-0.0994937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.139;QD=8.3001;RBI=0.102302;REFB=-0.0173539;REVB=-0.0238065;RO=9;SAF=1;SAR=6;SRF=1;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0642184;STB=0.538357;TYPE=snp;VARB=0.0233867;OID=.;OPOS=135012162;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:16:16:9:9:7:7:6:1:1:8:6:1:1:8 chr10 135012652 . T C 205.97 PASS AO=29;DP=37;FAO=29;FDP=37;FR=.;FRO=8;FSAF=26;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=0.0489964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.392;QD=22.2666;RBI=0.0489984;REFB=-0.116177;REVB=-0.000438746;RO=8;SAF=26;SAR=3;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0226633;STB=0.512307;TYPE=snp;VARB=0.0285329;OID=.;OPOS=135012652;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:37:37:8:8:29:29:3:26:7:1:3:26:7:1 chr10 135015185 . C T 47.82 PASS AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=-0.0178782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.948;QD=11.2518;RBI=0.0189551;REFB=-0.0350827;REVB=0.0062981;RO=7;SAF=1;SAR=8;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.271782;STB=0.666399;TYPE=snp;VARB=0.0675979;OID=.;OPOS=135015185;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:16:17:7:8:9:9:8:1:0:7:8:1:0:8 chr10 135015427 . C A 14.36 PASS AO=3;DP=10;FAO=3;FDP=10;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.048316;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.912;QD=5.74485;RBI=0.0857027;REFB=0.00079891;REVB=-0.070785;RO=7;SAF=2;SAR=1;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240731;STB=0.665556;TYPE=snp;VARB=-0.00255109;OID=.;OPOS=135015427;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:10:10:7:7:3:3:1:2:3:4:1:2:3:4 chr10 135015428 . G A 10.17 PASS AO=2;DP=9;FAO=2;FDP=9;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.0217971;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=100.722;QD=4.51898;RBI=0.0239113;REFB=0.0186683;REVB=-0.00983046;RO=7;SAF=1;SAR=1;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0720733;STB=0.555009;TYPE=snp;VARB=-0.0377374;OID=.;OPOS=135015428;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:7:7:2:2:1:1:4:3:1:1:4:3 chr10 135015667 . C T 89.55 PASS AO=17;DP=31;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0548546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8101;QD=11.5547;RBI=0.0581196;REFB=-0.0659374;REVB=0.0192057;RO=14;SAF=10;SAR=7;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0717644;STB=0.540492;TYPE=snp;VARB=0.0404083;OID=.;OPOS=135015667;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:31:31:14:14:17:17:7:10:7:7:7:10:7:7 chr10 135016089 . T C 211.31 PASS AO=40;DP=70;FAO=42;FDP=74;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=33;FSRF=7;FSRR=25;FWDB=0.0696253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.683;QD=11.4223;RBI=0.0715212;REFB=0.0159759;REVB=-0.0163588;RO=30;SAF=10;SAR=30;SRF=6;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0536465;STB=0.502856;TYPE=snp;VARB=-0.0110002;OID=.;OPOS=135016089;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:74:30:32:40:42:30:10:6:24:33:9:7:25 chr10 135016175 . T G 67.26 PASS AO=13;DP=24;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=-0.0573741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.97;QD=11.2106;RBI=0.0594577;REFB=-0.0857043;REVB=0.0156024;RO=11;SAF=2;SAR=11;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157818;STB=0.591242;TYPE=snp;VARB=0.0122253;OID=.;OPOS=135016175;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:24:24:11:11:13:13:11:2:3:8:11:2:3:8 chr10 135051543 . T C 61.27 PASS AO=6;DP=6;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0681907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.568;QD=35.0096;RBI=0.0684051;REFB=0;REVB=0.00541141;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000719541;OID=.;OPOS=135051543;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:7:0:0:6:7:5:1:0:0:5:2:0:0 chr10 135051562 . A G 73.84 PASS AO=7;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0408611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.653;QD=36.9199;RBI=0.0584255;REFB=0;REVB=0.0417601;RO=0;SAF=1;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.79986e-05;OID=.;OPOS=135051562;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:7:8:6:1:0:0:7:1:0:0 chr10 135061112 . C T 162.67 PASS AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0206777;FXX=0.0555247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.7437;QD=38.2747;RBI=0.0302366;REFB=0;REVB=-0.022061;RO=0;SAF=12;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.002788;OID=.;OPOS=135061112;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:17:17:0:0:17:17:5:12:0:0:5:12:0:0 chr10 135082346 . A G 33.94 PASS AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.0265134;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.9084;QD=5.4299;RBI=0.0674216;REFB=0.0192487;REVB=-0.0619896;RO=14;SAF=6;SAR=3;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.244315;STB=0.610858;TYPE=snp;VARB=-0.0425928;OID=.;OPOS=135082346;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:25:25:14:16:9:9:3:6:6:8:3:6:8:8 chr10 135084322 . A G 83.98 PASS AO=34;DP=110;FAO=34;FDP=110;FR=.;FRO=76;FSAF=6;FSAR=28;FSRF=14;FSRR=62;FWDB=-0.0508718;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.1984;QD=3.05378;RBI=0.0672443;REFB=0.00534048;REVB=-0.0439756;RO=76;SAF=6;SAR=28;SRF=14;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.015501;STB=0.509085;TYPE=snp;VARB=-0.0154083;OID=.;OPOS=135084322;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:110:110:76:76:34:34:28:6:14:62:28:6:14:62 chr10 135085321 . C T 36.64 PASS AO=10;DP=28;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=4;FWDB=-0.0209281;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=190.444;QD=5.2344;RBI=0.022075;REFB=-0.0104049;REVB=0.00702304;RO=17;SAF=3;SAR=7;SRF=14;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.51089;STB=0.782397;TYPE=snp;VARB=0.0239798;OID=.;OPOS=135085321;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:28:28:17:18:10:10:7:3:14:3:7:3:14:4 chr10 135085426 . A G 105.22 PASS AO=17;DP=24;FAO=17;FDP=25;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.0194842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.425;QD=16.8358;RBI=0.0218655;REFB=-0.014651;REVB=-0.00992291;RO=7;SAF=6;SAR=11;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0392481;STB=0.507683;TYPE=snp;VARB=0.00539931;OID=.;OPOS=135085426;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:24:25:7:8:17:17:11:6:2:5:11:6:3:5 chr10 135085754 . G A 104.68 PASS AO=27;DP=64;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=1;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=36;FWDB=-0.0161351;FXX=0.0156226;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.59;QD=6.64612;RBI=0.0195385;REFB=-0.00574555;REVB=0.0110186;RO=34;SAF=1;SAR=26;SRF=0;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.365457;STB=0.704452;TYPE=snp;VARB=0.00945212;OID=.;OPOS=135085754;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:63:34:36:27:27:26:1:0:34:26:1:0:36 chr10 135087521 . G A 192.44 PASS AO=29;DP=41;FAO=30;FDP=42;FR=.;FRO=12;FSAF=28;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=1;FWDB=-0.0111059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.184;QD=18.3279;RBI=0.0289177;REFB=-0.0112405;REVB=0.0267001;RO=11;SAF=27;SAR=2;SRF=10;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.041303;STB=0.518506;TYPE=snp;VARB=0.00445624;OID=.;OPOS=135087521;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:41:42:11:12:29:30:2:27:10:1:2:28:11:1 chr10 135089035 . A G 103.74 PASS AO=27;DP=63;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=25;FWDB=-0.0154668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.8158;QD=6.58685;RBI=0.0464881;REFB=-0.0113386;REVB=0.0438398;RO=35;SAF=11;SAR=16;SRF=10;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129567;STB=0.5616;TYPE=snp;VARB=0.0160175;OID=.;OPOS=135089035;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:35:36:27:27:16:11:10:25:16:11:11:25 chr10 135097434 . A G 122.13 PASS AO=30;DP=69;FAO=30;FDP=67;FR=.;FRO=37;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=-0.00737619;FXX=0.042851;HRUN=3;LEN=1;MLLD=115.603;QD=7.29102;RBI=0.0654491;REFB=-0.0150308;REVB=-0.0650321;RO=37;SAF=19;SAR=11;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198802;STB=0.61221;TYPE=snp;VARB=0.0177843;OID=.;OPOS=135097434;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:67:37:37:30:30:11:19:16:21:11:19:16:21 chr10 135098672 . G A 55.66 PASS AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=-0.00950313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.649;QD=6.54772;RBI=0.0726927;REFB=-0.000485682;REVB=0.0720688;RO=20;SAF=3;SAR=11;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.489896;STB=0.785306;TYPE=snp;VARB=0.00299716;OID=.;OPOS=135098672;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:34:34:20:20:14:14:11:3:14:6:11:3:14:6 chr10 135098830 . T C 30.5 PASS AO=12;DP=44;FAO=12;FDP=44;FR=.;FRO=32;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=23;FSRR=9;FWDB=-0.0227419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.605;QD=2.77251;RBI=0.0304834;REFB=-0.0033679;REVB=-0.0202988;RO=32;SAF=5;SAR=7;SRF=23;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.348464;STB=0.709835;TYPE=snp;VARB=0.00528706;OID=.;OPOS=135098830;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:44:44:32:32:12:12:7:5:23:9:7:5:23:9 chr10 135098845 . C T 34.81 PASS AO=13;DP=46;FAO=13;FDP=45;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=23;FSRR=9;FWDB=0.00596175;FXX=0.0217344;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.28;QD=3.09454;RBI=0.0257276;REFB=-0.000446892;REVB=-0.0250274;RO=30;SAF=7;SAR=6;SRF=21;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192854;STB=0.631394;TYPE=snp;VARB=0.00139292;OID=.;OPOS=135098845;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:46:45:30:32:13:13:6:7:21:9:6:7:23:9 chr10 135112940 . C T 126.33 PASS AO=31;DP=68;FAO=31;FDP=68;FR=.;FRO=37;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=27;FSRR=10;FWDB=0.023164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.3676;QD=7.43098;RBI=0.0267612;REFB=-0.0288593;REVB=0.0134011;RO=37;SAF=19;SAR=12;SRF=27;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123393;STB=0.56903;TYPE=snp;VARB=0.0303276;OID=.;OPOS=135112940;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:37:37:31:31:12:19:27:10:12:19:27:10 chr10 135165790 . A G 388.32 PASS AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.057773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.643;QD=38.832;RBI=0.0697486;REFB=0;REVB=-0.0390788;RO=0;SAF=30;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.68708e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.48505e-05;OID=.;OPOS=135165790;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:39:40:0:0:39:40:9:30:0:0:10:30:0:0 chr10 135180430 . A G 604.74 PASS AO=63;DP=63;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104221;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.926;QD=37.7961;RBI=0.0104966;REFB=0;REVB=-0.00124863;RO=0;SAF=25;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.16444e-05;OID=.;OPOS=135180430;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:63:64:0:0:63:64:38:25:0:0:40:24:0:0 chr10 135184126 . G A 1476.68 PASS AO=157;DP=159;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00496837;FXX=0.0125778;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.365;QD=37.6225;RBI=0.0216238;REFB=0.00238854;REVB=0.0210452;RO=1;SAF=81;SAR=76;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.006219;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.0127e-06;OID=.;OPOS=135184126;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:159:157:1:0:157:157:76:81:0:1:76:81:0:0 chr10 135195148 . G A 121.52 PASS AO=36;DP=92;FAO=36;FDP=92;FR=.;FRO=56;FSAF=7;FSAR=29;FSRF=22;FSRR=34;FWDB=0.0697608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.073;QD=5.28329;RBI=0.0698909;REFB=0.00520593;REVB=0.00426151;RO=56;SAF=7;SAR=29;SRF=22;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.270219;STB=0.65591;TYPE=snp;VARB=-0.00515519;OID=.;OPOS=135195148;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:56:56:36:36:29:7:22:34:29:7:22:34 chr10 135204950 . C G 660.78 PASS AO=71;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0271584;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=134.933;QD=36.7098;RBI=0.0302082;REFB=-0.0279009;REVB=0.0132271;RO=0;SAF=38;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000343563;OID=.;OPOS=135204950;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:72:72:0:0:71:72:33:38:0:0:33:39:0:0 chr10 135205009 . C G 1049.93 PASS AO=112;DP=115;FAO=115;FDP=116;FR=.;FRO=1;FSAF=81;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0348477;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=213.901;QD=36.2043;RBI=0.035163;REFB=-0.0870549;REVB=0.00469797;RO=2;SAF=78;SAR=34;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0120182;STB=0.503067;TYPE=snp;VARB=0.000397979;OID=.;OPOS=135205009;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:115:116:2:1:112:115:34:78:2:0:34:81:1:0 chr10 135233541 . A G 1142.6 PASS AO=111;DP=113;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0096941;FXX=0.0163921;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.736;QD=38.0867;RBI=0.064187;REFB=0;REVB=-0.0634507;RO=0;SAF=75;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.88442e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000138795;OID=.;OPOS=135233541;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:113:120:0:0:111:120:36:75:0:0:39:81:0:0 chr10 135270837 . TC T 32.66 PASS AO=19;DP=51;FAO=20;FDP=50;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=26;FSRR=4;FWDB=-0.0339734;FXX=0.019604;HRUN=4;LEN=1;MLLD=13.9576;QD=2.61264;RBI=0.0505592;REFB=-0.0124337;REVB=0.0374438;RO=25;SAF=16;SAR=3;SRF=22;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0753286;STB=0.567506;TYPE=del;VARB=0.0236901;OID=.;OPOS=135270838;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:19:50:20:50:30:16:4:26:4:32:25:16:3:22:3 chr10 135271789 . C T 1133.29 PASS AO=112;DP=112;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203844;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.891;QD=38.4167;RBI=0.0396027;REFB=0;REVB=0.0339536;RO=0;SAF=77;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.78464e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000104569;OID=.;OPOS=135271789;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:112:118:0:0:112:118:35:77:0:0:40:78:0:0 chr10 135272780 . TGGGGGC TGGGGC,TGGGG 463.36 PASS AO=33,18;DP=84;FAO=88,0;FDP=91;FR=.;FRO=3;FSAF=23,0;FSAR=65,0;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.107277,-0.370536;FXX=0.0421008;HRUN=5,5;LEN=1,2;MLLD=13.6267,9.17308;QD=20.3675;RBI=0.278098,0.416747;REFB=0.0699485,0.11291;REVB=-0.256574,-0.190738;RO=11;SAF=0,15;SAR=33,3;SRF=0;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0.323529,0.323529;SSSB=0,0.578227;STB=0.511276,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.00512295,0;OID=.,.;OPOS=135272781,135272785;OREF=G,GC;OALT=-,-;OMAPALT=TGGGGC,TGGGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:33,18:81:88,0:91:3:23,0:65,0:0:3:21:11:0,15:33,3:0:11 chr10 135278193 . A G 116.19 PASS AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0461273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.651;QD=35.75;RBI=0.0471795;REFB=0;REVB=0.00990863;RO=0;SAF=7;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000517089;OID=.;OPOS=135278193;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:13:0:0:13:13:6:7:0:0:6:7:0:0 chr10 135278244 . CTGGGGTG C 33.52 PASS AO=6;DP=17;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.0346546;FXX=0.0587889;HRUN=1;LEN=7;MLLD=178.701;QD=8.38021;RBI=0.0374867;REFB=-0.0217902;REVB=-0.0142938;RO=9;SAF=5;SAR=1;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228861;STB=0.66611;TYPE=del;VARB=0.0708254;OID=.;OPOS=135278245;OREF=TGGGGTG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:6:17:7:16:9:6:1:6:3:33:9:5:1:6:3 chr10 135278257 . T A 22.48 PASS AO=5;DP=14;FAO=5;FDP=14;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=-0.0226881;FXX=0.176367;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.585;QD=6.42217;RBI=0.0518822;REFB=0.00334734;REVB=-0.0466584;RO=9;SAF=3;SAR=2;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20092;STB=0.624553;TYPE=snp;VARB=-0.0123489;OID=.;OPOS=135278257;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:14:14:9:9:5:5:2:3:7:2:2:3:7:2 chr10 135279810 . T G 283.1 PASS AO=15;DP=34;FAO=33;FDP=33;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=24;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.126199;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.063;QD=34.3147;RBI=0.137667;REFB=0;REVB=-0.0550076;RO=0;SAF=6;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00523992;OID=.;OPOS=135279810;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:34:33:0:0:15:33:9:6:0:0:9:24:0:0 chr10 135280765 . C T 2077.06 PASS AO=228;DP=235;FAO=230;FDP=230;FR=.;FRO=0;FSAF=127;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190943;FXX=0.0254227;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.454;QD=36.1228;RBI=0.0288009;REFB=-0.0631362;REVB=0.0215615;RO=4;SAF=126;SAR=102;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0148844;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000437723;OID=.;OPOS=135280765;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:235:230:4:0:228:230:102:126:4:0:103:127:0:0 chr10 135347397 . T C 1466.04 PASS AO=153;DP=154;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=106;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00517362;FXX=0.0129024;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.0372;QD=38.3279;RBI=0.0250115;REFB=0;REVB=-0.0244706;RO=0;SAF=106;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000149177;OID=.;OPOS=135347397;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:154:153:0:0:153:153:47:106:0:0:47:106:0:0 chr10 135351362 . T C 1362.6 PASS AO=148;DP=152;FAO=148;FDP=151;FR=.;FRO=3;FSAF=80;FSAR=68;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0413477;FXX=0.00657851;HRUN=3;LEN=1;MLLD=187.407;QD=36.0955;RBI=0.0426181;REFB=-0.106525;REVB=0.0103284;RO=1;SAF=80;SAR=68;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00694304;STB=0.504141;TYPE=snp;VARB=0.000153845;OID=.;OPOS=135351362;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:152:151:1:3:148:148:68:80:0:1:68:80:1:2 chr10 135368163 . A G 963.3 PASS AO=101;DP=102;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00647801;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.763;QD=37.4097;RBI=0.0185895;REFB=-0.0202363;REVB=0.0174242;RO=1;SAF=39;SAR=62;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00759125;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.51873e-05;OID=.;OPOS=135368163;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:102:103:1:0:101:103:62:39:0:1:63:40:0:0 chr10 135368590 . T C 1202.53 PASS AO=127;DP=128;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00705517;FXX=0.00781189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.523;QD=37.875;RBI=0.00982899;REFB=-0.0864892;REVB=0.0068435;RO=0;SAF=57;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.30301e-05;OID=.;OPOS=135368590;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:128:127:0:0:127:127:70:57:0:0:70:57:0:0 chr10 135369532 . T C 877.8 PASS AO=87;DP=93;FAO=102;FDP=104;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=59;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0393346;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.9623;QD=33.7616;RBI=0.0816272;REFB=-0.0796105;REVB=-0.0715248;RO=6;SAF=31;SAR=56;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0833233;STB=0.511361;TYPE=snp;VARB=0.00455889;OID=.;OPOS=135369532;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:93:104:6:2:87:102:56:31:6:0:59:43:2:0 chr10 135370343 . G A 1721.06 PASS AO=177;DP=182;FAO=185;FDP=185;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=112;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.122143;FXX=0.0106946;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.0962;QD=37.212;RBI=0.122851;REFB=-0.0850919;REVB=0.0131735;RO=5;SAF=67;SAR=110;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0342014;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00323638;OID=.;OPOS=135370343;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:182:185:5:0:177:185:110:67:5:0:112:73:0:0 chr10 135370633 . C T 468.42 PASS AO=51;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00347128;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.4888;QD=36.0326;RBI=0.0345404;REFB=-0.0862654;REVB=0.0343655;RO=0;SAF=17;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00353095;OID=.;OPOS=135370633;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:52:52:0:0:51:52:34:17:0:0:34:18:0:0 chr10 135370639 . C A 405.63 PASS AO=36;DP=38;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0913228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.506;QD=36.8755;RBI=0.0949806;REFB=0;REVB=0.0261047;RO=0;SAF=11;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58193e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000647443;OID=.;OPOS=135370639;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:38:44:0:0:36:44:25:11:0:0:26:18:0:0 chr10 135372869 . AC A,AG 1079.08 PASS AO=46,65;DP=113;FAO=111,2;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=57,2;FSAR=54,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0867054,-0.111341;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=151.205,138.916;QD=38.1975;RBI=0.0913837,0.115001;REFB=0,0;REVB=0.0288645,-0.02878;RO=0;SAF=3,55;SAR=43,10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.94467e-08,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-5.95108e-05,0.081323;OID=.,.;OPOS=135372870,135372870;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=A,AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:46,65:111:111,2:113:0:57,2:54,0:0:0:26:0:3,55:43,10:0:0 chr10 135373591 . C T 856.93 PASS AO=92;DP=93;FAO=92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=60;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00587411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.73;QD=36.8572;RBI=0.0136511;REFB=-0.072284;REVB=-0.0123227;RO=1;SAF=60;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00783642;STB=0.504131;TYPE=snp;VARB=0.000359713;OID=.;OPOS=135373591;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:93:93:1:1:92:92:32:60:1:0:32:60:1:0 chr10 135381390 . G A 339.18 PASS AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026654;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.3601;QD=37.6863;RBI=0.150655;REFB=0;REVB=0.148278;RO=0;SAF=30;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.50008e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00441415;OID=.;OPOS=135381390;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:36:36:0:0:36:36:6:30:0:0:6:30:0:0 chr10 135381425 . G A 136.31 PASS AO=14;DP=14;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0388497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.582;QD=36.3484;RBI=0.0715248;REFB=0;REVB=-0.0600541;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000497631;OID=.;OPOS=135381425;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:14:15:0:0:14:15:8:6:0:0:9:6:0:0 chr10 135381443 . C T 139.2 PASS AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0223546;FXX=0.062461;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.111;QD=37.1211;RBI=0.0319015;REFB=0;REVB=0.022759;RO=0;SAF=7;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00177081;OID=.;OPOS=135381443;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:15:0:0:15:15:8:7:0:0:8:7:0:0 chr10 135381623 . T C 195.15 PASS AO=20;DP=20;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208126;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.137;QD=37.1722;RBI=0.0422708;REFB=0;REVB=0.0367921;RO=0;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0487e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000385683;OID=.;OPOS=135381623;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:20:21:0:0:20:21:11:9:0:0:11:10:0:0 chr10 135381766 . C T 77.02 PASS AO=10;DP=12;FAO=10;FDP=12;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0213526;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=95.5855;QD=25.6743;RBI=0.0289508;REFB=-0.168947;REVB=0.0195504;RO=2;SAF=2;SAR=8;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0994744;STB=0.555452;TYPE=snp;VARB=0.00820575;OID=.;OPOS=135381766;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:12:12:2:2:10:10:8:2:0:2:8:2:0:2 chr10 135381927 . T G 254.96 PASS AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.015268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.625;QD=37.7721;RBI=0.0156671;REFB=0;REVB=-0.00351378;RO=0;SAF=23;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.17865e-05;OID=.;OPOS=135381927;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:27:27:0:0:27:27:4:23:0:0:4:23:0:0 chr10 135438888 . C T 423.6 PASS AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.057002;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1382;QD=37.6536;RBI=0.0622995;REFB=0;REVB=-0.0251397;RO=0;SAF=20;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.09779e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000500367;OID=.;OPOS=135438888;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:45:45:0:0:45:45:25:20:0:0:25:20:0:0 chr10 135438929 . T G 497.85 PASS AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164915;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.462;QD=37.5733;RBI=0.0371752;REFB=0;REVB=0.033317;RO=0;SAF=23;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.72004e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00017234;OID=.;OPOS=135438929;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:53:53:0:0:53:53:30:23:0:0:30:23:0:0 chr10 135438951 . G A 497.85 PASS AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0179724;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=249.195;QD=37.5735;RBI=0.0189266;REFB=0;REVB=0.0059335;RO=0;SAF=23;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.72004e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.89659e-05;OID=.;OPOS=135438951;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:53:53:0:0:53:53:30:23:0:0:30:23:0:0 chr10 135438955 . C T 488.27 PASS AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144278;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=251.949;QD=37.5591;RBI=0.0212704;REFB=0;REVB=0.0156291;RO=0;SAF=22;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.18974e-05;OID=.;OPOS=135438955;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:52:52:0:0:52:52:30:22:0:0:30:22:0:0 chr10 135438967 . C T 481.19 PASS AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00844072;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.059;QD=37.7402;RBI=0.0186821;REFB=0;REVB=0.0166666;RO=0;SAF=19;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.2152e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.48598e-05;OID=.;OPOS=135438967;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:51:51:0:0:51:51:32:19:0:0:32:19:0:0 chr10 135438977 . G A 447.76 PASS AO=44;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0261669;FXX=0.039992;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.466;QD=37.3131;RBI=0.0536858;REFB=0;REVB=0.0468771;RO=1;SAF=14;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0323695;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000693184;OID=.;OPOS=135438977;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:48:48:1:0:44:48:30:14:1:0:30:18:0:0 chr10 135439015 . T C 19.97 PASS AO=7;DP=27;FAO=7;FDP=27;FR=.;FRO=20;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.00945486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.968;QD=2.95817;RBI=0.0289684;REFB=-0.00614515;REVB=-0.027382;RO=20;SAF=1;SAR=6;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.537883;STB=0.846807;TYPE=snp;VARB=0.0889021;OID=.;OPOS=135439015;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:27:27:20:20:7:7:6:1:12:8:6:1:12:8 chr10 135440203 . A T 520.73 PASS AO=67;DP=79;FAO=67;FDP=79;FR=.;FRO=12;FSAF=30;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=11;FWDB=-0.0284642;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.793;QD=26.3662;RBI=0.0285642;REFB=0.0155097;REVB=-0.00238826;RO=12;SAF=30;SAR=37;SRF=1;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106441;STB=0.556613;TYPE=snp;VARB=-0.00214216;OID=.;OPOS=135440203;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:79:79:12:12:67:67:37:30:1:11:37:30:1:11 chr11 193722 . A G 28.58 PASS AO=13;DP=52;FAO=13;FDP=52;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=1;FSRF=33;FSRR=6;FWDB=-0.0269913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.2138;QD=2.19847;RBI=0.0375377;REFB=-0.00657548;REVB=-0.0260873;RO=35;SAF=12;SAR=1;SRF=31;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131092;STB=0.650878;TYPE=snp;VARB=0.00941692;OID=.;OPOS=193722;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:52:52:35:39:13:13:1:12:31:4:1:12:33:6 chr11 193863 . T C 553.16 PASS AO=96;DP=147;FAO=96;FDP=147;FR=.;FRO=51;FSAF=57;FSAR=39;FSRF=27;FSRR=24;FWDB=-0.0370413;FXX=0.0067563;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.623;QD=15.052;RBI=0.0370559;REFB=-0.0236127;REVB=-0.00103812;RO=50;SAF=57;SAR=39;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0351418;STB=0.522931;TYPE=snp;VARB=0.0154291;OID=.;OPOS=193863;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:147:50:51:96:96:39:57:27:23:39:57:27:24 chr11 193865 . T G 191.52 PASS AO=58;DP=146;FAO=58;FDP=146;FR=.;FRO=88;FSAF=35;FSAR=23;FSRF=50;FSRR=38;FWDB=-0.017591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.859;QD=5.24707;RBI=0.0414811;REFB=-0.0139294;REVB=-0.0375665;RO=88;SAF=35;SAR=23;SRF=50;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0389665;STB=0.521997;TYPE=snp;VARB=0.0261506;OID=.;OPOS=193865;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:88:88:58:58:23:35:50:38:23:35:50:38 chr11 197337 . G A 92.67 PASS AO=24;DP=56;FAO=24;FDP=56;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=-0.00469286;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.055;QD=6.61922;RBI=0.00491532;REFB=-0.0150354;REVB=-0.00146201;RO=26;SAF=12;SAR=12;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106564;STB=0.553527;TYPE=snp;VARB=0.0168774;OID=.;OPOS=197337;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:56:56:26:32:24:24:12:12:10:16:12:12:13:19 chr11 197338 . C A 13.97 PASS AO=10;DP=50;FAO=10;FDP=56;FR=.;FRO=46;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=-0.0575397;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=103.305;QD=0.997952;RBI=0.0576206;REFB=-0.0178004;REVB=0.00305266;RO=40;SAF=2;SAR=8;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.390054;STB=0.762803;TYPE=snp;VARB=0.04721;OID=.;OPOS=197338;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:50:56:40:46:10:10:8:2:20:20:8:2:23:23 chr11 223796 . A G 23.42 PASS AO=10;DP=46;FAO=10;FDP=45;FR=.;FRO=35;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=-0.0529933;FXX=0.0425441;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.395;QD=2.08206;RBI=0.0530141;REFB=-0.00103965;REVB=-0.00148631;RO=34;SAF=2;SAR=8;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265822;STB=0.687755;TYPE=snp;VARB=0.00230106;OID=.;OPOS=223796;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:46:45:34:35:10:10:8:2:13:21:8:2:14:21 chr11 223823 . G A 30.39 PASS AO=10;DP=33;FAO=10;FDP=33;FR=.;FRO=23;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=17;FWDB=0.0450089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.656;QD=3.68314;RBI=0.0503353;REFB=-0.00163572;REVB=0.0225354;RO=23;SAF=1;SAR=9;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.324032;STB=0.707349;TYPE=snp;VARB=0.011503;OID=.;OPOS=223823;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:33:33:23:23:10:10:9:1:6:17:9:1:6:17 chr11 237087 . A G 118.1 PASS AO=30;DP=68;FAO=30;FDP=68;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=12;FWDB=-0.0118467;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.159;QD=6.94726;RBI=0.0349709;REFB=-0.0111359;REVB=-0.0329032;RO=38;SAF=14;SAR=16;SRF=26;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213732;STB=0.620078;TYPE=snp;VARB=0.0135555;OID=.;OPOS=237087;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:38:38:30:30:16:14:26:12:16:14:26:12 chr11 244106 . A G 206.81 PASS AO=73;DP=183;FAO=69;FDP=188;FR=.;FRO=119;FSAF=38;FSAR=31;FSRF=62;FSRR=57;FWDB=-0.0964012;FXX=0.0105258;HRUN=4;LEN=1;MLLD=51.8221;QD=4.40012;RBI=0.097129;REFB=-0.0211063;REVB=-0.0118688;RO=109;SAF=39;SAR=34;SRF=58;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00228596;STB=0.518927;TYPE=snp;VARB=0.0607971;OID=.;OPOS=244106;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:188:109:119:73:69:34:39:58:51:31:38:62:57 chr11 244108 . A G 236.3 PASS AO=74;DP=190;FAO=74;FDP=190;FR=.;FRO=116;FSAF=39;FSAR=35;FSRF=62;FSRR=54;FWDB=-0.0286206;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=262.869;QD=4.97479;RBI=0.0295669;REFB=-0.0154589;REVB=-0.00742048;RO=116;SAF=39;SAR=35;SRF=62;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0081006;STB=0.504566;TYPE=snp;VARB=0.0289011;OID=.;OPOS=244108;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:190:116:116:74:74:35:39:62:54:35:39:62:54 chr11 244115 . G A 228.85 PASS AO=74;DP=194;FAO=74;FDP=194;FR=.;FRO=120;FSAF=39;FSAR=35;FSRF=65;FSRR=55;FWDB=0.0144963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.492;QD=4.71854;RBI=0.0151408;REFB=-0.0120073;REVB=-0.0043704;RO=120;SAF=39;SAR=35;SRF=65;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0160893;STB=0.509088;TYPE=snp;VARB=0.0347864;OID=.;OPOS=244115;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:194:120:120:74:74:35:39:65:55:35:39:65:55 chr11 244129 . C T 252.3 PASS AO=76;DP=189;FAO=76;FDP=189;FR=.;FRO=113;FSAF=42;FSAR=34;FSRF=60;FSRR=53;FWDB=-0.0618906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.3722;QD=5.3397;RBI=0.0705877;REFB=-0.0103886;REVB=-0.0339438;RO=111;SAF=42;SAR=34;SRF=59;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0224984;STB=0.513055;TYPE=snp;VARB=0.0194018;OID=.;OPOS=244129;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:189:111:113:76:76:34:42:59:52:34:42:60:53 chr11 244141 . G A 235.74 PASS AO=71;DP=176;FAO=71;FDP=176;FR=.;FRO=105;FSAF=39;FSAR=32;FSRF=53;FSRR=52;FWDB=-0.00918185;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.855;QD=5.35772;RBI=0.00920684;REFB=-0.012398;REVB=-0.000677851;RO=104;SAF=39;SAR=32;SRF=53;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0421791;STB=0.526681;TYPE=snp;VARB=0.0254117;OID=.;OPOS=244141;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:176:104:105:71:71:32:39:53:51:32:39:53:52 chr11 244167 . C T 191.97 PASS AO=56;DP=163;FAO=57;FDP=156;FR=.,HEALED;FRO=95;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=44;FSRR=51;FWDB=-0.00733377;FXX=0.00636902;HRUN=3;LEN=1;MLLD=156.795;QD=4.92243;RBI=0.0129993;REFB=-0.00699212;REVB=-0.010733;RO=68;SAF=31;SAR=25;SRF=28;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138853;STB=0.550363;TYPE=snp;VARB=0.00964358;OID=.;OPOS=244167;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:156:68:95:56:57:25:31:28:40:26:31:44:51 chr11 244171 . T C 159.59 PASS AO=56;DP=157;FAO=56;FDP=158;FR=.;FRO=102;FSAF=31;FSAR=25;FSRF=46;FSRR=56;FWDB=-0.00518701;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=249.792;QD=4.0403;RBI=0.00635281;REFB=0.0044142;REVB=-0.00366785;RO=100;SAF=31;SAR=25;SRF=45;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116083;STB=0.566027;TYPE=snp;VARB=-0.00812041;OID=.;OPOS=244171;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:158:100:102:56:56:25:31:45:55:25:31:46:56 chr11 244197 . T C 153.13 PASS AO=50;DP=137;FAO=51;FDP=139;FR=.;FRO=88;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=39;FSRR=49;FWDB=0.00631118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.459;QD=4.40654;RBI=0.00843473;REFB=-0.00959642;REVB=-0.00559586;RO=87;SAF=27;SAR=23;SRF=39;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101869;STB=0.566744;TYPE=snp;VARB=0.0181183;OID=.;OPOS=244197;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:139:87:88:50:51:23:27:39:48:23:28:39:49 chr11 244414 . C T 284.2 PASS AO=78;DP=180;FAO=78;FDP=180;FR=.;FRO=102;FSAF=43;FSAR=35;FSRF=46;FSRR=56;FWDB=0.0175951;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6499;QD=6.31558;RBI=0.0278548;REFB=0.00625004;REVB=-0.021594;RO=99;SAF=43;SAR=35;SRF=44;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107154;STB=0.556758;TYPE=snp;VARB=-0.00965409;OID=.;OPOS=244414;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:180:99:102:78:78:35:43:44:55:35:43:46:56 chr11 244490 . ATACCTTTTAG A 96.02 PASS AO=46;DP=209;FAO=48;FDP=173;FR=.;FRO=125;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=29;FSRR=96;FWDB=-0.026462;FXX=0.079783;HRUN=1;LEN=10;MLLD=283.788;QD=2.22017;RBI=0.0264668;REFB=-0.00537922;REVB=-0.000507039;RO=89;SAF=19;SAR=27;SRF=19;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.251491;STB=0.630427;TYPE=del;VARB=0.017685;OID=.;OPOS=244491;OREF=TACCTTTTAG;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:46:167:48:173:125:19:29:29:96:96:89:19:27:19:70 chr11 280816 . A T 224.16 PASS AO=29;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0733206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.303;QD=29.8878;RBI=0.294338;REFB=0;REVB=0.285059;RO=0;SAF=17;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.0947e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0116327;OID=.;OPOS=280816;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:29:30:0:0:29:30:12:17:0:0:13:17:0:0 chr11 280817 . T C 268.72 PASS AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0201419;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=301.323;QD=35.8293;RBI=0.0293334;REFB=-0.0125;REVB=-0.0213249;RO=1;SAF=17;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.037234;STB=0.519986;TYPE=snp;VARB=-2.63002e-05;OID=.;OPOS=280817;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:30:30:1:1:29:29:12:17:0:1:12:17:0:1 chr11 284538 . T C 182.09 PASS AO=18;DP=18;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0.049975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=43.8914;QD=38.3354;RBI=0.00345616;REFB=0;REVB=0.00345616;RO=0;SAF=0;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00051287;OID=.;OPOS=284538;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:19:0:0:18:19:18:0:0:0:19:0:0:0 chr11 290816 . A G 401.9 PASS AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0313574;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.033;QD=37.3858;RBI=0.0576081;REFB=0;REVB=0.048326;RO=0;SAF=30;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.8348e-05;OID=.;OPOS=290816;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:43:43:0:0:43:43:13:30:0:0:13:30:0:0 chr11 290891 . T C 73.91 PASS AO=14;DP=25;FAO=14;FDP=25;FR=.;FRO=11;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=-0.0191652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.435;QD=11.8257;RBI=0.0650802;REFB=-0.0342402;REVB=-0.0621942;RO=11;SAF=10;SAR=4;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104309;STB=0.558744;TYPE=snp;VARB=0.0239114;OID=.;OPOS=290891;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:25:25:11:11:14:14:4:10:9:2:4:10:9:2 chr11 290918 . G A 44.84 PASS AO=11;DP=27;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=14;FSRR=2;FWDB=0.0156616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.9902;QD=6.64232;RBI=0.0160831;REFB=0.00306386;REVB=-0.00365779;RO=16;SAF=10;SAR=1;SRF=14;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0927701;STB=0.555445;TYPE=snp;VARB=-0.0123768;OID=.;OPOS=290918;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:27:27:16:16:11:11:1:10:14:2:1:10:14:2 chr11 293188 . T C 133.86 PASS AO=22;DP=33;FAO=23;FDP=36;FR=.;FRO=13;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.0137633;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.6427;QD=14.8736;RBI=0.0219284;REFB=0.002257;REVB=0.0170713;RO=11;SAF=12;SAR=10;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112251;STB=0.561991;TYPE=snp;VARB=-0.00314536;OID=.;OPOS=293188;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:33:36:11:13:22:23:10:12:8:3:11:12:9:4 chr11 299411 . C G 24.2 PASS AO=7;DP=23;FAO=7;FDP=23;FR=.;FRO=16;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.013379;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=166.937;QD=4.20923;RBI=0.0139089;REFB=-0.00430882;REVB=0.00380282;RO=13;SAF=1;SAR=6;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.343745;STB=0.79317;TYPE=snp;VARB=0.00574355;OID=.;OPOS=299411;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:23:23:13:16:7:7:6:1:5:8:6:1:8:8 chr11 308290 . T C 358.33 PASS AO=32;DP=34;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.178682;FXX=0.0499875;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.7594;QD=37.7186;RBI=0.183153;REFB=0;REVB=0.040219;RO=0;SAF=5;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00576491;OID=.;OPOS=308290;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:34:38:0:0:32:38:27:5:0:0:27:11:0:0 chr11 308314 . T C 296.64 PASS AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.114195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.8401;QD=37.0797;RBI=0.114271;REFB=0;REVB=0.00417058;RO=0;SAF=9;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02243e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00216717;OID=.;OPOS=308314;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:32:32:0:0:32:32:23:9:0:0:23:9:0:0 chr11 308363 . G C 210.68 PASS AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0983165;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=266.355;QD=36.6391;RBI=0.0985128;REFB=0;REVB=-0.00621489;RO=0;SAF=3;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000654468;OID=.;OPOS=308363;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:0:0:23:23:20:3:0:0:20:3:0:0 chr11 308426 . G C 183.13 PASS AO=18;DP=18;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0344129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3552;QD=38.554;RBI=0.0542866;REFB=0;REVB=0.0419855;RO=0;SAF=5;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000261511;OID=.;OPOS=308426;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:18:19:0:0:18:19:13:5:0:0:13:6:0:0 chr11 309127 . A G 157.56 PASS AO=29;DP=49;FAO=29;FDP=49;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.0234933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.497;QD=12.8622;RBI=0.0364906;REFB=-4.91599e-05;REVB=-0.0279217;RO=20;SAF=8;SAR=21;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187083;STB=0.603758;TYPE=snp;VARB=-3.05871e-06;OID=.;OPOS=309127;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:49:49:20:20:29:29:21:8:10:10:21:8:10:10 chr11 314207 . C G 811.41 PASS AO=76;DP=81;FAO=89;FDP=90;FR=.;FRO=1;FSAF=58;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0408724;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.3638;QD=36.0628;RBI=0.0857407;REFB=-0.0026417;REVB=0.0753719;RO=1;SAF=49;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00956081;STB=0.504273;TYPE=snp;VARB=0.000128013;OID=.;OPOS=314207;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:81:90:1:1:76:89:27:49:1:0:31:58:1:0 chr11 320606 . G T 24.21 PASS AO=6;DP=37;FAO=6;FDP=35;FR=.,HEALED;FRO=25;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=24;FSRR=1;FWDB=-0.0454746;FXX=0.0277701;HRUN=4;LEN=1;MLLD=231.004;QD=2.76691;RBI=0.0486396;REFB=-0.0149219;REVB=-0.0172589;RO=22;SAF=2;SAR=4;SRF=22;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.745449;STB=0.911672;TYPE=snp;VARB=0.0241393;OID=.;OPOS=320606;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:36:35:22:25:6:6:4:2:22:0:4:2:24:1 chr11 320713 . GC G 32.8 PASS AO=12;DP=43;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=6;FWDB=0.0590368;FXX=0.0714116;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.0261;QD=3.36417;RBI=0.1007;REFB=-0.0674244;REVB=-0.081579;RO=21;SAF=5;SAR=7;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.311229;STB=0.672324;TYPE=del;VARB=0.104628;OID=.;OPOS=320714;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:12:41:17:39:22:7:10:16:6:32:21:5:7:15:6 chr11 379598 . A G 12.53 PASS AO=3;DP=12;FAO=3;FDP=12;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=0.0602046;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.379;QD=4.17579;RBI=0.062751;REFB=-0.00170105;REVB=-0.0176947;RO=9;SAF=1;SAR=2;SRF=0;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.587597;STB=0.845157;TYPE=snp;VARB=0.0278935;OID=.;OPOS=379598;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:12:12:9:9:3:3:2:1:0:9:2:1:0:9 chr11 400040 . A G 112.24 PASS AO=27;DP=59;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=25;FWDB=-0.0272223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.489;QD=7.60931;RBI=0.0452671;REFB=-0.00532373;REVB=-0.036167;RO=32;SAF=13;SAR=14;SRF=7;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.258216;STB=0.644122;TYPE=snp;VARB=0.0080551;OID=.;OPOS=400040;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:32:32:27:27:14:13:7:25:14:13:7:25 chr11 400109 . A G 43.48 PASS AO=11;DP=28;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=0;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=17;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.357;QD=6.21078;RBI=0.0056481;REFB=-0.0352448;REVB=-0.0056481;RO=17;SAF=0;SAR=11;SRF=0;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0504725;OID=.;OPOS=400109;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:28:28:17:17:11:11:11:0:0:17:11:0:0:17 chr11 403980 . G A 225.26 PASS AO=35;DP=49;FAO=35;FDP=50;FR=.;FRO=15;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0013391;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=254.987;QD=18.0208;RBI=0.0237159;REFB=-0.0238789;REVB=-0.023678;RO=14;SAF=19;SAR=16;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0226582;STB=0.522923;TYPE=snp;VARB=0.00892243;OID=.;OPOS=403980;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:49:50:14:15:35:35:16:19:7:7:16:19:7:8 chr11 404317 . C T 63.44 PASS AO=13;DP=32;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.103486;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.036;QD=7.46361;RBI=0.142615;REFB=-0.0548957;REVB=0.0981309;RO=19;SAF=8;SAR=5;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0927383;STB=0.542112;TYPE=snp;VARB=0.077587;OID=.;OPOS=404317;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:32:34:19:19:13:15:5:8:10:9:6:9:10:9 chr11 404497 . G A 123.42 PASS AO=30;DP=65;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=11;FWDB=0.0277319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.988;QD=7.59507;RBI=0.0336639;REFB=-0.00572978;REVB=0.019084;RO=35;SAF=14;SAR=16;SRF=24;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20821;STB=0.616558;TYPE=snp;VARB=0.00567419;OID=.;OPOS=404497;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:35:35:30:30:16:14:24:11:16:14:24:11 chr11 406043 . G A 144.26 PASS AO=33;DP=85;FAO=41;FDP=92;FR=.;FRO=51;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=27;FSRR=24;FWDB=0.0103273;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.769;QD=6.27211;RBI=0.0147639;REFB=-0.00585958;REVB=0.0105507;RO=52;SAF=21;SAR=12;SRF=28;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109236;STB=0.560501;TYPE=snp;VARB=0.0123147;OID=.;OPOS=406043;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:92:52:51:33:41:12:21:28:24:15:26:27:24 chr11 406473 . A C 14.36 PASS AO=3;DP=10;FAO=3;FDP=10;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.6321;QD=5.74515;RBI=0.0813507;REFB=-0.0117703;REVB=-0.0813507;RO=7;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0127306;OID=.;OPOS=406473;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:10:10:7:7:3:3:3:0:0:7:3:0:0:7 chr11 428385 . A G 219.91 PASS AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.4766;QD=36.651;RBI=0.0551781;REFB=0;REVB=-0.0517948;RO=0;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000544641;OID=.;OPOS=428385;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:24:24:0:0:24:24:12:12:0:0:12:12:0:0 chr11 428489 . T C 147.38 PASS AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0447989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.933;QD=36.844;RBI=0.0492138;REFB=0;REVB=0.0203728;RO=0;SAF=5;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.36667e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000880097;OID=.;OPOS=428489;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:16:0:0:16:16:11:5:0:0:11:5:0:0 chr11 429659 . C T 482.16 PASS AO=50;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00271053;FXX=0.0892698;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.707;QD=37.8167;RBI=0.0499078;REFB=0;REVB=0.0498342;RO=0;SAF=28;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.15703e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00119876;OID=.;OPOS=429659;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:52:51:0:0:50:51:22:28:0:0:23:28:0:0 chr11 431793 . GC G 73.78 PASS AO=17;DP=40;FAO=24;FDP=33;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=6.89607e-05;FXX=0.0294031;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.0728;QD=8.94312;RBI=0.00265462;REFB=-0.143756;REVB=-0.00265372;RO=9;SAF=2;SAR=15;SRF=2;SRR=7;SSEN=0.5625;SSEP=0;SSSB=-0.136484;STB=0.523345;TYPE=del;VARB=0.123815;OID=.;OPOS=431794;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:17:32:24:33:9:7:17:2:7:11:9:2:15:2:7 chr11 431834 . A G 221.01 PASS AO=21;DP=21;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.109084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.791;QD=36.8354;RBI=0.109275;REFB=0;REVB=0.00647048;RO=0;SAF=1;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.78928e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000743719;OID=.;OPOS=431834;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:21:24:0:0:21:24:20:1:0:0:22:2:0:0 chr11 433387 . A G 388.57 PASS AO=42;DP=43;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.024333;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=187.304;QD=35.3247;RBI=0.0243409;REFB=0.00951108;REVB=0.000620499;RO=1;SAF=15;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0302621;STB=0.516121;TYPE=snp;VARB=-0.000148746;OID=.;OPOS=433387;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:43:44:1:1:42:43:27:15:1:0:28:15:1:0 chr11 499120 . G A 139.35 PASS AO=36;DP=82;FAO=36;FDP=82;FR=.;FRO=46;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=0.00953464;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.799;QD=6.79751;RBI=0.046922;REFB=-0.023011;REVB=0.0459431;RO=46;SAF=16;SAR=20;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0986782;STB=0.555525;TYPE=snp;VARB=0.036643;OID=.;OPOS=499120;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:46:46:36:36:20:16:25:21:20:16:25:21 chr11 499547 . A C 148.19 PASS AO=30;DP=59;FAO=31;FDP=59;FR=.;FRO=28;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=8;FWDB=0.0072173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.033;QD=10.0464;RBI=0.0150373;REFB=0.00759936;REVB=-0.0131921;RO=28;SAF=17;SAR=13;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133318;STB=0.566472;TYPE=snp;VARB=-0.00347345;OID=.;OPOS=499547;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:28:28:30:31:13:17:20:8:13:18:20:8 chr11 499583 . G A 168.26 PASS AO=35;DP=64;FAO=35;FDP=65;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=0.0237014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.955;QD=10.3543;RBI=0.0365228;REFB=-0.028074;REVB=-0.0277877;RO=29;SAF=17;SAR=18;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0822353;STB=0.537292;TYPE=snp;VARB=0.0190088;OID=.;OPOS=499583;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:65:29:30:35:35:18:17:17:12:18:17:17:13 chr11 549959 . C T 62.5 PASS AO=14;DP=31;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.0106209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.406;QD=8.0645;RBI=0.0321175;REFB=-0.0160459;REVB=-0.0303106;RO=17;SAF=12;SAR=2;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.494838;STB=0.790738;TYPE=snp;VARB=0.0285128;OID=.;OPOS=549959;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:31:31:17:17:14:14:2:12:7:10:2:12:7:10 chr11 551753 . G A 165.98 PASS AO=36;DP=70;FAO=36;FDP=70;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=5;FSRR=29;FWDB=0.0118717;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.906;QD=9.4846;RBI=0.0214064;REFB=-0.0319653;REVB=-0.0178129;RO=33;SAF=13;SAR=23;SRF=5;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210681;STB=0.620124;TYPE=snp;VARB=0.0413217;OID=.;OPOS=551753;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:33:34:36:36:23:13:5:28:23:13:5:29 chr11 554166 . C G 52.89 PASS AO=16;DP=45;FAO=16;FDP=45;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=0.0361134;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.308;QD=4.70097;RBI=0.0486178;REFB=-0.0239132;REVB=-0.0325502;RO=29;SAF=6;SAR=10;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0446273;STB=0.526283;TYPE=snp;VARB=0.0132137;OID=.;OPOS=554166;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:45:45:29:29:16:16:10:6:12:17:10:6:12:17 chr11 554214 . G C 57.9 PASS AO=16;DP=42;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.0547356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.5381;QD=5.5141;RBI=0.0726563;REFB=-0.0205856;REVB=-0.0477802;RO=26;SAF=6;SAR=10;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0948443;STB=0.555485;TYPE=snp;VARB=0.0241437;OID=.;OPOS=554214;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:42:42:26:26:16:16:10:6:12:14:10:6:12:14 chr11 556521 . C G 148.36 PASS AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0578164;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.5951;QD=32.9684;RBI=0.11545;REFB=-0.134598;REVB=0.0999296;RO=1;SAF=10;SAR=7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0436347;STB=0.523782;TYPE=snp;VARB=0.0166256;OID=.;OPOS=556521;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:18:18:1:1:17:17:7:10:1:0:7:10:1:0 chr11 556857 . G C 296.79 PASS AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.5;QD=37.0982;RBI=0.0138828;REFB=0;REVB=0.00153396;RO=0;SAF=9;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02243e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000138291;OID=.;OPOS=556857;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:32:32:0:0:32:32:23:9:0:0:23:9:0:0 chr11 557989 . C T 536.14 PASS AO=58;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.13002;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.3519;QD=36.3486;RBI=0.139045;REFB=-0.0481861;REVB=-0.0492782;RO=0;SAF=31;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07727e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00254778;OID=.;OPOS=557989;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:59:59:0:0:58:59:27:31:0:0:27:32:0:0 chr11 558884 . C T 143.73 PASS AO=15;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0485306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.815;QD=35.9319;RBI=0.0533149;REFB=0;REVB=0.0220739;RO=0;SAF=3;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00080418;OID=.;OPOS=558884;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:16:0:0:15:16:12:3:0:0:12:4:0:0 chr11 559016 . C T 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.131;QD=33.022;RBI=0.000359491;REFB=0;REVB=0.000359491;RO=0;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.01317e-06;OID=.;OPOS=559016;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:6:0:0:0:6:0:0:0 chr11 610277 . T C 171.32 PASS AO=18;DP=21;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0340847;FXX=0.142789;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.8556;QD=38.0708;RBI=0.0349331;REFB=0;REVB=-0.00765231;RO=0;SAF=10;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00234641;OID=.;OPOS=610277;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:21:18:0:0:18:18:8:10:0:0:8:10:0:0 chr11 614864 . C T 158.92 PASS AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0128917;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=234.962;QD=37.3931;RBI=0.0250724;REFB=0;REVB=0.0215041;RO=0;SAF=2;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.95117e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000145689;OID=.;OPOS=614864;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:17:17:0:0:17:17:15:2:0:0:15:2:0:0 chr11 616970 . A T 158.92 PASS AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.631;QD=37.3925;RBI=0.0192739;REFB=0;REVB=0.013922;RO=0;SAF=3;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53656e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000294228;OID=.;OPOS=616970;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:17:17:0:0:17:17:14:3:0:0:14:3:0:0 chr11 617537 . C T 37.45 PASS AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0269795;FXX=0.0666222;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.2273;QD=10.7013;RBI=0.0275856;REFB=0.00469541;REVB=0.00575116;RO=7;SAF=2;SAR=5;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00691093;OID=.;OPOS=617537;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:15:14:7:7:7:7:5:2:2:5:5:2:2:5 chr11 617967 . C G 365.27 PASS AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.128712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.669;QD=36.5266;RBI=0.130788;REFB=-0.112022;REVB=0.0232135;RO=1;SAF=13;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0176923;STB=0.509429;TYPE=snp;VARB=0.000909598;OID=.;OPOS=617967;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:40:40:1:1:39:39:26:13:0:1:26:13:0:1 chr11 624400 . C T 151.59 PASS AO=22;DP=31;FAO=22;FDP=29;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=18;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.00123795;FXX=0.0937207;HRUN=3;LEN=1;MLLD=184.08;QD=20.9096;RBI=0.0376277;REFB=0.0127844;REVB=0.0376073;RO=7;SAF=4;SAR=18;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160839;STB=0.588697;TYPE=snp;VARB=-0.00403375;OID=.;OPOS=624400;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:31:29:7:7:22:22:18:4:3:4:18:4:3:4 chr11 720197 . C T 381.88 PASS AO=40;DP=42;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0954953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.2915;QD=33.9445;RBI=0.0956139;REFB=-0.177862;REVB=-0.00476088;RO=0;SAF=21;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17587e-08;STB=0.509799;TYPE=snp;VARB=0.00549626;OID=.;OPOS=720197;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:42:45:0:1:40:44:19:21:0:0:19:25:1:0 chr11 721570 . C T 242.42 PASS AO=37;DP=51;FAO=37;FDP=51;FR=.;FRO=14;FSAF=27;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=0.029322;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.2508;QD=19.0133;RBI=0.049834;REFB=0.0677842;REVB=0.0402945;RO=14;SAF=27;SAR=10;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00986066;STB=0.505345;TYPE=snp;VARB=-0.0256748;OID=.;OPOS=721570;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:51:51:14:14:37:37:10:27:10:4:10:27:10:4 chr11 771034 . A G 33.26 PASS AO=11;DP=31;FAO=10;FDP=31;FR=.;FRO=21;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.0521818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.791;QD=4.29161;RBI=0.0521818;REFB=0.00962184;REVB=-3.82888e-06;RO=19;SAF=2;SAR=9;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.259998;STB=0.810052;TYPE=snp;VARB=-0.0223455;OID=.;OPOS=771034;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:31:31:19:21:11:10:9:2:7:12:9:1:9:12 chr11 772490 . G A 118.02 PASS AO=21;DP=34;FAO=21;FDP=34;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=12;FWDB=0.0515584;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.931;QD=13.8844;RBI=0.063911;REFB=-0.00922074;REVB=0.037767;RO=12;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.322729;STB=0.655139;TYPE=snp;VARB=0.00533015;OID=.;OPOS=772490;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:34:34:12:13:21:21:11:10:0:12:11:10:1:12 chr11 803582 . GC G 224.82 PASS AO=27;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.256121;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.4702;QD=23.6654;RBI=0.279006;REFB=-0.0212877;REVB=0.110662;RO=7;SAF=4;SAR=23;SRF=2;SRR=5;SSEN=0.285882;SSEP=0;SSSB=-0.0952289;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0218947;OID=.;OPOS=803583;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:27:35:38:38:0:8:30:0:0:18:7:4:23:2:5 chr11 804212 . C A 56.35 PASS AO=11;DP=24;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.0470636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.266;QD=9.01653;RBI=0.0658767;REFB=-0.00593357;REVB=0.046095;RO=13;SAF=9;SAR=2;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168645;STB=0.538395;TYPE=snp;VARB=0.00459256;OID=.;OPOS=804212;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:24:25:13:13:11:12:2:9:9:4:3:9:9:4 chr11 804251 . GC G 21.53 PASS AO=4;DP=31;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.0620738;FXX=0.0370233;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.6876;QD=3.31264;RBI=0.0726329;REFB=-0.0500708;REVB=0.0377144;RO=16;SAF=2;SAR=2;SRF=6;SRR=10;SSEN=0.309524;SSEP=0;SSSB=0.142855;STB=0.726859;TYPE=del;VARB=0.11361;OID=.;OPOS=804252;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:4:25:11:26:15:8:3:5:10:21:16:2:2:6:10 chr11 823809 . C G 44.72 PASS AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=-0.00598439;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=36.3073;QD=9.93859;RBI=0.0889766;REFB=-0.033468;REVB=-0.0887752;RO=9;SAF=7;SAR=2;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152945;STB=0.588061;TYPE=snp;VARB=0.0287188;OID=.;OPOS=823809;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:18:18:9:9:9:9:2:7:8:1:2:7:8:1 chr11 828916 . G A 73.83 PASS AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=0.0148372;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=115.356;QD=7.03131;RBI=0.0193296;REFB=-0.0248574;REVB=-0.012389;RO=22;SAF=5;SAR=13;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0470828;STB=0.509793;TYPE=snp;VARB=0.0209038;OID=.;OPOS=828916;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:40:42:22:24:18:18:13:5:7:15:13:5:7:17 chr11 829539 . A G 584.08 PASS AO=64;DP=68;FAO=64;FDP=66;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.018409;FXX=0.0294074;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.093;QD=35.3987;RBI=0.0205596;REFB=-0.0361878;REVB=0.00915453;RO=2;SAF=20;SAR=44;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0124163;STB=0.506577;TYPE=snp;VARB=0.00128314;OID=.;OPOS=829539;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:68:66:2:2:64:64:44:20:1:1:44:20:1:1 chr11 830670 . G T 95.34 PASS AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0223072;FXX=0.0908265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.378;QD=38.1345;RBI=0.0315696;REFB=0;REVB=0.022339;RO=0;SAF=3;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000406349;OID=.;OPOS=830670;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:7:3:0:0:7:3:0:0 chr11 831122 . C T 568.24 PASS AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00191823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.867;QD=38.5248;RBI=0.0212056;REFB=0;REVB=0.0211187;RO=0;SAF=54;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.50028e-05;OID=.;OPOS=831122;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:59:59:0:0:59:59:5:54:0:0:5:54:0:0 chr11 837582 . G A 593.7 PASS AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0022591;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=72.1818;QD=37.6951;RBI=0.0353446;REFB=0;REVB=0.0352724;RO=0;SAF=27;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.31521e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000252607;OID=.;OPOS=837582;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:63:63:0:0:63:63:36:27:0:0:36:27:0:0 chr11 840477 . A G 147.84 PASS AO=14;DP=14;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0406558;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.25;QD=36.961;RBI=0.0524627;REFB=0;REVB=0.0331579;RO=0;SAF=3;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00013197;OID=.;OPOS=840477;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:14:16:0:0:14:16:11:3:0:0:13:3:0:0 chr11 862652 . T C 201.63 PASS AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183498;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1553;QD=36.6605;RBI=0.0211742;REFB=0;REVB=0.0105656;RO=0;SAF=13;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2029e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000885043;OID=.;OPOS=862652;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:22:22:0:0:22:22:9:13:0:0:9:13:0:0 chr11 900929 . C G 29.48 PASS AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.0503273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.907;QD=8.42289;RBI=0.0504198;REFB=-0.0215668;REVB=0.00305214;RO=8;SAF=3;SAR=3;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116777;STB=0.571195;TYPE=snp;VARB=0.0235938;OID=.;OPOS=900929;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:14:14:8:8:6:6:3:3:3:5:3:3:3:5 chr11 903070 . G C 555.75 PASS AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0190623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.909;QD=38.3273;RBI=0.0312906;REFB=0;REVB=0.0248139;RO=0;SAF=18;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.98327e-05;OID=.;OPOS=903070;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:58:58:0:0:58:58:40:18:0:0:40:18:0:0 chr11 985547 . C T 168.21 PASS AO=42;DP=92;FAO=42;FDP=92;FR=.;FRO=50;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=-0.00140123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.487;QD=7.31348;RBI=0.00516369;REFB=-0.00887769;REVB=0.00496993;RO=50;SAF=24;SAR=18;SRF=25;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0700062;STB=0.539166;TYPE=snp;VARB=0.0109317;OID=.;OPOS=985547;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:50:50:42:42:18:24:25:25:18:24:25:25 chr11 993907 . C G 107.4 PASS AO=29;DP=70;FAO=29;FDP=70;FR=.;FRO=41;FSAF=6;FSAR=23;FSRF=12;FSRR=29;FWDB=-0.0572255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.494;QD=6.13701;RBI=0.06473;REFB=-0.0575812;REVB=-0.0302526;RO=41;SAF=6;SAR=23;SRF=12;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122503;STB=0.570196;TYPE=snp;VARB=0.0861257;OID=.;OPOS=993907;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:41:41:29:29:23:6:12:29:23:6:12:29 chr11 1010694 . C T 145.61 PASS AO=43;DP=108;FAO=43;FDP=108;FR=.;FRO=65;FSAF=3;FSAR=40;FSRF=11;FSRR=54;FWDB=0.0707166;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.8624;QD=5.39286;RBI=0.0792096;REFB=-0.0284463;REVB=-0.0356838;RO=65;SAF=3;SAR=40;SRF=11;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.283256;STB=0.664987;TYPE=snp;VARB=0.0441335;OID=.;OPOS=1010694;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:65:65:43:43:40:3:11:54:40:3:11:54 chr11 1011490 . G A 36.95 PASS AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=40.9302;QD=13.435;RBI=0.0211689;REFB=-0.0641228;REVB=0.0211689;RO=5;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0597237;OID=.;OPOS=1011490;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:11:11:5:5:6:6:6:0:0:5:6:0:0:5 chr11 1016604 . A G 10.1 PASS AO=10;DP=66;FAO=10;FDP=65;FR=.;FRO=55;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=48;FSRR=7;FWDB=-0.0461072;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7699;QD=0.621527;RBI=0.0479477;REFB=-0.0260682;REVB=0.0131568;RO=55;SAF=6;SAR=4;SRF=48;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.427722;STB=0.765612;TYPE=snp;VARB=0.043422;OID=.;OPOS=1016604;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:66:65:55:55:10:10:4:6:48:7:4:6:48:7 chr11 1016614 . G T 23.07 PASS AO=18;DP=93;FAO=18;FDP=92;FR=.;FRO=74;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=47;FSRR=27;FWDB=0.0169325;FXX=0.0107515;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.4187;QD=1.00316;RBI=0.0342356;REFB=0.0177124;REVB=0.0297551;RO=74;SAF=12;SAR=6;SRF=47;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0436907;STB=0.527968;TYPE=snp;VARB=-0.0680229;OID=.;OPOS=1016614;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:93:92:74:74:18:18:6:12:47:27:6:12:47:27 chr11 1016618 . G C 27.55 PASS AO=20;DP=100;FAO=20;FDP=97;FR=.;FRO=77;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=45;FSRR=32;FWDB=-0.00220172;FXX=0.029997;HRUN=4;LEN=1;MLLD=158.137;QD=1.13589;RBI=0.00799425;REFB=-0.00182704;REVB=-0.00768509;RO=76;SAF=12;SAR=8;SRF=45;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0103124;STB=0.512808;TYPE=snp;VARB=0.00628951;OID=.;OPOS=1016618;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:100:97:76:77:20:20:8:12:45:31:8:12:45:32 chr11 1016655 . G A 14.9 PASS AO=20;DP=126;FAO=20;FDP=126;FR=.;FRO=106;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=50;FSRR=56;FWDB=-0.00408443;FXX=0.0078734;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.414;QD=0.473032;RBI=0.00800843;REFB=-0.0142583;REVB=-0.00688857;RO=105;SAF=6;SAR=14;SRF=50;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231303;STB=0.651007;TYPE=snp;VARB=0.0673878;OID=.;OPOS=1016655;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:126:126:105:106:20:20:14:6:50:55:14:6:50:56 chr11 1016665 . C T 148.76 PASS AO=49;DP=132;FAO=49;FDP=133;FR=.;FRO=84;FSAF=8;FSAR=41;FSRF=55;FSRR=29;FWDB=0.0186689;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.719;QD=4.47392;RBI=0.0196216;REFB=-0.0131439;REVB=-0.00604002;RO=82;SAF=8;SAR=41;SRF=54;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.562759;STB=0.821691;TYPE=snp;VARB=0.0301437;OID=.;OPOS=1016665;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:133:82:84:49:49:41:8:54:28:41:8:55:29 chr11 1016704 . C A 19.17 PASS AO=23;DP=139;FAO=24;FDP=141;FR=.;FRO=117;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=67;FSRR=50;FWDB=0.014674;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6282;QD=0.543782;RBI=0.0199262;REFB=-0.0109612;REVB=-0.0134805;RO=116;SAF=7;SAR=16;SRF=67;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.341815;STB=0.762851;TYPE=snp;VARB=0.0455253;OID=.;OPOS=1016704;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:139:141:116:117:23:24:16:7:67:49:18:6:67:50 chr11 1016713 . T C 13.66 PASS AO=21;DP=134;FAO=20;FDP=130;FR=.;FRO=110;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=66;FSRR=44;FWDB=-0.0176742;FXX=0.0151504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.4703;QD=0.420237;RBI=0.0396386;REFB=-0.016017;REVB=-0.0354801;RO=107;SAF=7;SAR=14;SRF=63;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.317691;STB=0.743132;TYPE=snp;VARB=0.048733;OID=.;OPOS=1016713;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:134:130:107:110:21:20:14:7:63:44:14:6:66:44 chr11 1016724 . A G 26.26 PASS AO=29;DP=134;FAO=24;FDP=129;FR=.;FRO=105;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=69;FSRR=36;FWDB=-0.0410794;FXX=0.0227256;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.229;QD=0.814253;RBI=0.0411156;REFB=-0.0177145;REVB=0.00172388;RO=101;SAF=13;SAR=16;SRF=65;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24407;STB=0.658523;TYPE=snp;VARB=0.041636;OID=.;OPOS=1016724;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:134:129:101:105:29:24:16:13:65:36:13:11:69:36 chr11 1016776 . C T 75.45 PASS AO=29;DP=114;FAO=28;FDP=88;FR=.;FRO=60;FSAF=22;FSAR=6;FSRF=49;FSRR=11;FWDB=-0.0161085;FXX=0.214267;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.137;QD=3.42963;RBI=0.0423353;REFB=-0.00298262;REVB=-0.0391509;RO=61;SAF=23;SAR=6;SRF=50;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0487471;STB=0.532478;TYPE=snp;VARB=0.00771884;OID=.;OPOS=1016776;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:114:88:61:60:29:28:6:23:50:11:6:22:49:11 chr11 1016834 . G A 45.55 PASS AO=41;DP=201;FAO=41;FDP=199;FR=.;FRO=158;FSAF=40;FSAR=1;FSRF=117;FSRR=41;FWDB=0.0130045;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.434;QD=0.915636;RBI=0.0441627;REFB=-0.0111536;REVB=0.0422046;RO=149;SAF=40;SAR=1;SRF=115;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.594292;STB=0.914236;TYPE=snp;VARB=0.0578486;OID=.;OPOS=1016834;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:201:199:149:158:41:41:1:40:115:34:1:40:117:41 chr11 1016869 . A T 321.14 PASS AO=88;DP=220;FAO=87;FDP=199;FR=.;FRO=112;FSAF=78;FSAR=9;FSRF=86;FSRR=26;FWDB=-0.00737142;FXX=0.087152;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.75;QD=6.4551;RBI=0.0131596;REFB=-0.00266519;REVB=-0.0109012;RO=105;SAF=79;SAR=9;SRF=82;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240361;STB=0.649032;TYPE=snp;VARB=0.00299686;OID=.;OPOS=1016869;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:220:199:105:112:88:87:9:79:82:23:9:78:86:26 chr11 1016890 . G A 77.73 PASS AO=45;DP=178;FAO=45;FDP=176;FR=.;FRO=131;FSAF=34;FSAR=11;FSRF=120;FSRR=11;FWDB=-0.0044442;FXX=0.0056494;HRUN=4;LEN=1;MLLD=188.579;QD=1.7666;RBI=0.00607621;REFB=-0.00169499;REVB=-0.0041436;RO=131;SAF=34;SAR=11;SRF=121;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.360998;STB=0.693633;TYPE=snp;VARB=0.00784917;OID=.;OPOS=1016890;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:178:176:131:131:45:45:11:34:121:10:11:34:120:11 chr11 1016894 . G A 77.9 PASS AO=40;DP=162;FAO=43;FDP=164;FR=.;FRO=121;FSAF=41;FSAR=2;FSRF=103;FSRR=18;FWDB=0.0106922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.668;QD=1.89989;RBI=0.0122798;REFB=-0.00676412;REVB=-0.00603916;RO=119;SAF=38;SAR=2;SRF=102;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.347714;STB=0.73992;TYPE=snp;VARB=0.0508121;OID=.;OPOS=1016894;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:162:164:119:121:40:43:2:38:102:17:2:41:103:18 chr11 1016914 . G T 80.51 PASS AO=38;DP=129;FAO=37;FDP=128;FR=.;FRO=91;FSAF=36;FSAR=1;FSRF=91;FSRR=0;FWDB=0.0228717;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=37.539;QD=2.51586;RBI=0.0249813;REFB=0.00757289;REVB=-0.0100475;RO=88;SAF=37;SAR=1;SRF=88;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.502912;STB=0.779071;TYPE=snp;VARB=-0.0205665;OID=.;OPOS=1016914;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:129:128:88:91:38:37:1:37:88:0:1:36:91:0 chr11 1016928 . C G 525.76 PASS AO=82;DP=112;FAO=81;FDP=111;FR=.;FRO=30;FSAF=79;FSAR=2;FSRF=29;FSRR=1;FWDB=-0.00373219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.814;QD=18.9463;RBI=0.0386451;REFB=-0.0231759;REVB=0.0384645;RO=30;SAF=80;SAR=2;SRF=29;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0446722;STB=0.523173;TYPE=snp;VARB=0.00986977;OID=.;OPOS=1016928;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:112:111:30:30:82:81:2:80:29:1:2:79:29:1 chr11 1016933 . C T 73.65 PASS AO=33;DP=110;FAO=32;FDP=109;FR=.;FRO=77;FSAF=31;FSAR=1;FSRF=70;FSRR=7;FWDB=0.00978255;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.717;QD=2.70284;RBI=0.0559762;REFB=-0.0230956;REVB=-0.0551148;RO=75;SAF=32;SAR=1;SRF=68;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.353927;STB=0.710422;TYPE=snp;VARB=0.0523748;OID=.;OPOS=1016933;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:110:109:75:77:33:32:1:32:68:7:1:31:70:7 chr11 1016978 . T G 12.91 PASS AO=10;DP=59;FAO=10;FDP=58;FR=.;FRO=48;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=39;FSRR=9;FWDB=0.0245115;FXX=0.0333278;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.3685;QD=0.890499;RBI=0.0992323;REFB=-0.0209552;REVB=-0.0961574;RO=45;SAF=9;SAR=1;SRF=39;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.099127;STB=0.651809;TYPE=snp;VARB=0.0777746;OID=.;OPOS=1016978;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:59:58:45:48:10:10:1:9:39:6:1:9:39:9 chr11 1017029 . T G 294.48 PASS AO=57;DP=99;FAO=57;FDP=97;FR=.;FRO=40;FSAF=34;FSAR=23;FSRF=32;FSRR=8;FWDB=-0.0451442;FXX=0.0202;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.4385;QD=12.1435;RBI=0.0759103;REFB=-0.0122284;REVB=-0.0610277;RO=40;SAF=34;SAR=23;SRF=32;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166176;STB=0.590173;TYPE=snp;VARB=0.0085049;OID=.;OPOS=1017029;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:97:40:40:57:57:23:34:32:8:23:34:32:8 chr11 1017069 . G A 81.29 PASS AO=41;DP=151;FAO=41;FDP=150;FR=.;FRO=109;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=70;FSRR=39;FWDB=-0.0284224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.4142;QD=2.16783;RBI=0.028944;REFB=-0.00816615;REVB=0.00547006;RO=107;SAF=18;SAR=23;SRF=70;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.25918;STB=0.644519;TYPE=snp;VARB=0.0355991;OID=.;OPOS=1017069;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:151:150:107:109:41:41:23:18:70:37:23:18:70:39 chr11 1017084 . G A 108.38 PASS AO=46;DP=148;FAO=46;FDP=150;FR=.;FRO=104;FSAF=34;FSAR=12;FSRF=66;FSRR=38;FWDB=0.000585464;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=109.912;QD=2.8901;RBI=0.0290796;REFB=-0.0103008;REVB=-0.0290737;RO=102;SAF=34;SAR=12;SRF=67;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117186;STB=0.586167;TYPE=snp;VARB=0.0256333;OID=.;OPOS=1017084;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:150:102:104:46:46:12:34:67:35:12:34:66:38 chr11 1017112 . G C 44.02 PASS AO=33;DP=159;FAO=32;FDP=146;FR=.;FRO=114;FSAF=31;FSAR=1;FSRF=68;FSRR=46;FWDB=-0.0356562;FXX=0.0759446;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.7643;QD=1.20604;RBI=0.0458504;REFB=0.00114484;REVB=-0.0288251;RO=112;SAF=32;SAR=1;SRF=66;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.678381;STB=0.936018;TYPE=snp;VARB=-0.0102847;OID=.;OPOS=1017112;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:159:146:112:114:33:32:1:32:66:46:1:31:68:46 chr11 1017113 . T C 197.88 PASS AO=62;DP=161;FAO=61;FDP=156;FR=.;FRO=95;FSAF=40;FSAR=21;FSRF=68;FSRR=27;FWDB=0.0124746;FXX=0.0249984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.6708;QD=5.07392;RBI=0.0150853;REFB=-0.0151217;REVB=-0.00848227;RO=92;SAF=41;SAR=21;SRF=67;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0820035;STB=0.541534;TYPE=snp;VARB=0.0219815;OID=.;OPOS=1017113;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:156:92:95:62:61:21:41:67:25:21:40:68:27 chr11 1017173 . G A 179.53 PASS AO=70;DP=212;FAO=70;FDP=211;FR=.;FRO=141;FSAF=39;FSAR=31;FSRF=63;FSRR=78;FWDB=0.0216914;FXX=0.00471676;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.542;QD=3.40338;RBI=0.0217106;REFB=-0.0261975;REVB=-0.000913916;RO=141;SAF=39;SAR=31;SRF=63;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127966;STB=0.573431;TYPE=snp;VARB=0.0575567;OID=.;OPOS=1017173;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:211:141:141:70:70:31:39:63:78:31:39:63:78 chr11 1017183 . G T 47.55 PASS AO=40;DP=199;FAO=42;FDP=200;FR=.;FRO=158;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=74;FSRR=84;FWDB=0.0470296;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.2238;QD=0.951095;RBI=0.0486426;REFB=-0.0112693;REVB=0.0124223;RO=159;SAF=21;SAR=19;SRF=75;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0682464;STB=0.543706;TYPE=snp;VARB=0.0509596;OID=.;OPOS=1017183;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:199:200:159:158:40:42:19:21:75:84:20:22:74:84 chr11 1017220 . T C 407.72 PASS AO=87;DP=158;FAO=86;FDP=156;FR=.;FRO=70;FSAF=52;FSAR=34;FSRF=31;FSRR=39;FWDB=0.0356143;FXX=0.00636902;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6865;QD=10.4544;RBI=0.045654;REFB=-0.0596507;REVB=-0.0285641;RO=70;SAF=53;SAR=34;SRF=31;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137893;STB=0.57357;TYPE=snp;VARB=0.0847963;OID=.;OPOS=1017220;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:156:70:70:87:86:34:53:31:39:34:52:31:39 chr11 1017227 . AGGGA AGGA,AGGG,AGGGG 1003.04 PASS AO=23,30,43;DP=148;FAO=63,76,0;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=30,50,0;FSAR=33,26,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.96585,0.0260839,-0.0849726;FXX=0;HRUN=3,1,1;LEN=1,1,1;MLLD=10.0886,169.96,168.833;QD=28.8645;RBI=0.983078,0.026342,0.0854502;REFB=0.0623008,0.0575154,-0.00818506;REVB=0.183238,-0.00367823,-0.00902168;RO=35;SAF=0,5,39;SAR=23,25,4;SRF=29;SRR=6;SSEN=0.703911,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.869969,-0.616741,0.159913;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=del,del,snp;VARB=0.0781969,0.0270871,-0.0271479;OID=.,.,.;OPOS=1017228,1017231,1017231;OREF=G,A,A;OALT=-,-,G;OMAPALT=AGGA,AGGG,AGGGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:23,30,43:136:63,76,0:139:0:30,50,0:33,26,0:0:0:99:35:0,5,39:23,25,4:29:6 chr11 1017239 . C T 137.44 PASS AO=49;DP=138;FAO=48;FDP=136;FR=.;FRO=88;FSAF=35;FSAR=13;FSRF=39;FSRR=49;FWDB=-0.0151087;FXX=0.0215812;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.683;QD=4.0423;RBI=0.016096;REFB=-0.0106608;REVB=-0.00555049;RO=85;SAF=36;SAR=13;SRF=39;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.323195;STB=0.692765;TYPE=snp;VARB=0.0155426;OID=.;OPOS=1017239;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:136:85:88:49:48:13:36:39:46:13:35:39:49 chr11 1017240 . G A 180.23 PASS AO=54;DP=138;FAO=54;FDP=135;FR=.;FRO=81;FSAF=33;FSAR=21;FSRF=41;FSRR=40;FWDB=0.0265439;FXX=0.0287749;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.209;QD=5.34026;RBI=0.026551;REFB=-0.0210688;REVB=0.000614691;RO=73;SAF=33;SAR=21;SRF=35;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136896;STB=0.564316;TYPE=snp;VARB=0.0368676;OID=.;OPOS=1017240;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:135:73:81:54:54:21:33:35:38:21:33:41:40 chr11 1017325 . A C 18.34 PASS AO=17;DP=94;FAO=17;FDP=95;FR=.;FRO=78;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=41;FSRR=37;FWDB=-0.0123086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.755;QD=0.772036;RBI=0.04624;REFB=-0.0134416;REVB=-0.0445717;RO=75;SAF=11;SAR=6;SRF=38;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179779;STB=0.602425;TYPE=snp;VARB=0.102029;OID=.;OPOS=1017325;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:94:95:75:78:17:17:6:11:38:37:6:11:41:37 chr11 1017381 . G C 20.68 PASS AO=17;DP=90;FAO=17;FDP=90;FR=.;FRO=73;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=45;FSRR=28;FWDB=0.0225374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.446;QD=0.919023;RBI=0.0233083;REFB=-0.00288802;REVB=-0.00594492;RO=73;SAF=9;SAR=8;SRF=45;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111602;STB=0.571347;TYPE=snp;VARB=0.031876;OID=.;OPOS=1017381;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:90:90:73:73:17:17:8:9:45:28:8:9:45:28 chr11 1017384 . G C 46.64 PASS AO=24;DP=88;FAO=23;FDP=88;FR=.;FRO=65;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=38;FSRR=27;FWDB=0.0326818;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.431;QD=2.11989;RBI=0.0380993;REFB=0.00323581;REVB=-0.0195821;RO=64;SAF=17;SAR=7;SRF=38;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153792;STB=0.58994;TYPE=snp;VARB=-0.00893015;OID=.;OPOS=1017384;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:88:88:64:65:24:23:7:17:38:26:7:16:38:27 chr11 1017421 . G T 49.6 PASS AO=22;DP=75;FAO=21;FDP=73;FR=.;FRO=52;FSAF=18;FSAR=3;FSRF=39;FSRR=13;FWDB=0.0142003;FXX=0.0135117;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.0707;QD=2.71758;RBI=0.0907563;REFB=0.0161892;REVB=0.0896385;RO=53;SAF=19;SAR=3;SRF=39;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.245125;STB=0.627312;TYPE=snp;VARB=-0.0452915;OID=.;OPOS=1017421;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:75:73:53:52:22:21:3:19:39:14:3:18:39:13 chr11 1017440 . C T 30.76 PASS AO=18;DP=74;FAO=17;FDP=73;FR=.;FRO=56;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=41;FSRR=15;FWDB=-0.0040545;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.067;QD=1.68568;RBI=0.0364146;REFB=-0.0215135;REVB=-0.0361882;RO=55;SAF=9;SAR=9;SRF=40;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.28485;STB=0.696482;TYPE=snp;VARB=0.0613927;OID=.;OPOS=1017440;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:74:73:55:56:18:17:9:9:40:15:9:8:41:15 chr11 1017443 . C G 27.31 PASS AO=18;DP=79;FAO=17;FDP=78;FR=.;FRO=61;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=40;FSRR=21;FWDB=-0.0251166;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.73;QD=1.40061;RBI=0.0532008;REFB=-0.00593059;REVB=-0.0468986;RO=54;SAF=15;SAR=3;SRF=33;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.340413;STB=0.674466;TYPE=snp;VARB=0.0218281;OID=.;OPOS=1017443;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:79:78:54:61:18:17:3:15:33:21:3:14:40:21 chr11 1017498 . C G 16.88 PASS AO=13;DP=81;FAO=14;FDP=75;FR=.;FRO=61;FSAF=13;FSAR=1;FSRF=43;FSRR=18;FWDB=-0.0273288;FXX=0.0853554;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.536;QD=0.900051;RBI=0.090444;REFB=-0.00962082;REVB=-0.0862163;RO=60;SAF=13;SAR=0;SRF=43;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.672595;STB=0.814592;TYPE=snp;VARB=0.037531;OID=.;OPOS=1017498;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:81:75:60:61:13:14:0:13:43:17:1:13:43:18 chr11 1017514 . A G 17.61 PASS AO=20;DP=123;FAO=20;FDP=118;FR=.;FRO=98;FSAF=18;FSAR=2;FSRF=55;FSRR=43;FWDB=-0.0116517;FXX=0.0406471;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.53;QD=0.596956;RBI=0.0245651;REFB=-0.00571049;REVB=-0.021626;RO=100;SAF=17;SAR=3;SRF=55;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.430702;STB=0.846876;TYPE=snp;VARB=0.0260422;OID=.;OPOS=1017514;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:123:118:100:98:20:20:3:17:55:45:2:18:55:43 chr11 1017556 . G A 21.5 PASS AO=30;DP=199;FAO=33;FDP=200;FR=.;FRO=167;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=69;FSRR=98;FWDB=0.0446345;FXX=0.00497488;HRUN=3;LEN=1;MLLD=40.5346;QD=0.430009;RBI=0.0556792;REFB=-0.00200196;REVB=0.0332856;RO=169;SAF=16;SAR=14;SRF=71;SRR=98;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144366;STB=0.560086;TYPE=snp;VARB=0.010339;OID=.;OPOS=1017556;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:199:200:169:167:30:33:14:16:71:98:17:16:69:98 chr11 1017575 . C T 47.04 PASS AO=31;DP=135;FAO=31;FDP=135;FR=.;FRO=104;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=43;FSRR=61;FWDB=-0.0133355;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.123;QD=1.39367;RBI=0.0171683;REFB=-0.0190731;REVB=-0.0108127;RO=102;SAF=13;SAR=18;SRF=41;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0225491;STB=0.504665;TYPE=snp;VARB=0.0558268;OID=.;OPOS=1017575;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:135:135:102:104:31:31:18:13:41:61:18:13:43:61 chr11 1017597 . T G 13.46 PASS AO=17;DP=95;FAO=15;FDP=94;FR=.;FRO=79;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=39;FSRR=40;FWDB=-0.0143713;FXX=0.0105252;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.1142;QD=0.572642;RBI=0.0419251;REFB=0.00196588;REVB=-0.039385;RO=77;SAF=9;SAR=8;SRF=39;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0289347;STB=0.533289;TYPE=snp;VARB=-0.0174308;OID=.;OPOS=1017597;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:95:94:77:79:17:15:8:9:39:38:7:8:39:40 chr11 1017691 . C G 12.5 PASS AO=10;DP=58;FAO=10;FDP=59;FR=.;FRO=49;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=-0.0270982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.866;QD=0.847387;RBI=0.0731058;REFB=-0.0131098;REVB=-0.0678981;RO=46;SAF=1;SAR=9;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.510292;STB=0.85104;TYPE=snp;VARB=0.0837088;OID=.;OPOS=1017691;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:58:59:46:49:10:10:9:1:21:25:9:1:22:27 chr11 1017746 . T G 82.43 PASS AO=45;DP=175;FAO=45;FDP=171;FR=.;FRO=126;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=53;FSRR=73;FWDB=-0.000210278;FXX=0.0228558;HRUN=3;LEN=1;MLLD=67.5353;QD=1.92811;RBI=0.03542;REFB=-0.018566;REVB=-0.0354194;RO=119;SAF=17;SAR=28;SRF=51;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0648464;STB=0.533028;TYPE=snp;VARB=0.0422379;OID=.;OPOS=1017746;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:175:171:119:126:45:45:28:17:51:68:28:17:53:73 chr11 1017767 . G C 25.33 PASS AO=29;DP=163;FAO=29;FDP=163;FR=.;FRO=134;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=56;FSRR=78;FWDB=0.0637634;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.439;QD=0.621541;RBI=0.063884;REFB=-0.00552077;REVB=0.00392423;RO=134;SAF=17;SAR=12;SRF=56;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.213087;STB=0.635819;TYPE=snp;VARB=0.0387625;OID=.;OPOS=1017767;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:163:163:134:134:29:29:12:17:56:78:12:17:56:78 chr11 1017783 . A G 121.64 PASS AO=51;DP=158;FAO=50;FDP=158;FR=.;FRO=108;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=51;FSRR=57;FWDB=-0.0103389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.559;QD=3.07955;RBI=0.0433939;REFB=-0.0156088;REVB=-0.0421442;RO=104;SAF=25;SAR=26;SRF=50;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.010968;STB=0.51898;TYPE=snp;VARB=0.0327101;OID=.;OPOS=1017783;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:158:104:108:51:50:26:25:50:54:25:25:51:57 chr11 1017789 . A C 15.58 PASS AO=26;DP=170;FAO=26;FDP=169;FR=.;FRO=143;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=71;FSRR=72;FWDB=-0.0144818;FXX=0.0116952;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.8;QD=0.36883;RBI=0.0342089;REFB=-0.00556987;REVB=-0.0309924;RO=140;SAF=8;SAR=18;SRF=69;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.241707;STB=0.663737;TYPE=snp;VARB=0.0324528;OID=.;OPOS=1017789;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:170:169:140:143:26:26:18:8:69:71:18:8:71:72 chr11 1017845 . C G 82.39 PASS AO=52;DP=159;FAO=43;FDP=160;FR=.;FRO=117;FSAF=12;FSAR=31;FSRF=65;FSRR=52;FWDB=-0.0536182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.759;QD=2.05981;RBI=0.0583017;REFB=-0.0292084;REVB=-0.022895;RO=106;SAF=17;SAR=35;SRF=59;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.270224;STB=0.70549;TYPE=snp;VARB=0.0520318;OID=.;OPOS=1017845;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:159:160:106:117:52:43:35:17:59:47:31:12:65:52 chr11 1017858 . A G 135.26 PASS AO=54;DP=165;FAO=54;FDP=167;FR=.;FRO=113;FSAF=18;FSAR=36;FSRF=67;FSRR=46;FWDB=0.00378665;FXX=0.00595203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.1004;QD=3.23978;RBI=0.0323853;REFB=-0.0342592;REVB=-0.0321631;RO=110;SAF=18;SAR=36;SRF=66;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.308058;STB=0.674539;TYPE=snp;VARB=0.0846005;OID=.;OPOS=1017858;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:167:110:113:54:54:36:18:66:44:36:18:67:46 chr11 1017883 . C A 69.17 PASS AO=44;DP=193;FAO=49;FDP=207;FR=.;FRO=158;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=83;FSRR=75;FWDB=-0.00699755;FXX=0.00956892;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.5619;QD=1.3366;RBI=0.0161508;REFB=-0.013561;REVB=-0.0145562;RO=145;SAF=22;SAR=22;SRF=82;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.082966;STB=0.573763;TYPE=snp;VARB=0.0403487;OID=.;OPOS=1017883;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:193:207:145:158:44:49:22:22:82:63:28:21:83:75 chr11 1017935 . A G 27.25 PASS AO=29;DP=165;FAO=28;FDP=150;FR=.;FRO=122;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=70;FSRR=52;FWDB=-0.127021;FXX=0.0909036;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.3053;QD=0.72671;RBI=0.136473;REFB=-0.0227121;REVB=-0.0499034;RO=122;SAF=18;SAR=11;SRF=70;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0622664;STB=0.501944;TYPE=snp;VARB=0.0950547;OID=.;OPOS=1017935;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:165:150:122:122:29:28:11:18:70:52:12:16:70:52 chr11 1018025 . C A 117.4 PASS AO=27;DP=57;FAO=27;FDP=56;FR=.;FRO=29;FSAF=26;FSAR=1;FSRF=21;FSRR=8;FWDB=0.00792792;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.713;QD=8.38562;RBI=0.0837784;REFB=0.00282122;REVB=-0.0834025;RO=30;SAF=26;SAR=1;SRF=22;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.557866;STB=0.832382;TYPE=snp;VARB=-0.0075819;OID=.;OPOS=1018025;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:56:30:29:27:27:1:26:22:8:1:26:21:8 chr11 1018031 . G A 62.92 PASS AO=20;DP=58;FAO=20;FDP=57;FR=.;FRO=37;FSAF=19;FSAR=1;FSRF=30;FSRR=7;FWDB=0.0169793;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=187.507;QD=4.41525;RBI=0.0798293;REFB=-0.00491947;REVB=-0.0780027;RO=33;SAF=19;SAR=1;SRF=26;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.444753;STB=0.755868;TYPE=snp;VARB=0.0217231;OID=.;OPOS=1018031;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:58:57:33:37:20:20:1:19:26:7:1:19:30:7 chr11 1018262 . G C 12.7 PASS AO=3;DP=13;FAO=3;FDP=12;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.0723687;FXX=0.076864;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0043;QD=4.23298;RBI=0.0724379;REFB=0.00141504;REVB=-0.00316649;RO=9;SAF=2;SAR=1;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145032;STB=0.599399;TYPE=snp;VARB=0.00588872;OID=.;OPOS=1018262;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:13:12:9:9:3:3:1:2:7:2:1:2:7:2 chr11 1018295 . T C 79.2 PASS AO=12;DP=17;FAO=12;FDP=17;FR=.;FRO=5;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0150163;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.815;QD=18.6354;RBI=0.0447667;REFB=0.00152856;REVB=0.0421731;RO=5;SAF=8;SAR=4;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214373;STB=0.618873;TYPE=snp;VARB=0.000703137;OID=.;OPOS=1018295;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:17:17:5:5:12:12:4:8:5:0:4:8:5:0 chr11 1018314 . G A 10.89 PASS AO=3;DP=14;FAO=3;FDP=14;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.040652;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=116.21;QD=3.11133;RBI=0.0470425;REFB=-0.00797774;REVB=-0.023673;RO=11;SAF=2;SAR=1;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0774686;STB=0.555203;TYPE=snp;VARB=0.0190699;OID=.;OPOS=1018314;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:14:14:11:11:3:3:1:2:8:3:1:2:8:3 chr11 1018316 . G A 10.89 PASS AO=3;DP=14;FAO=3;FDP=14;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.00873899;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.83;QD=3.11201;RBI=0.053385;REFB=-0.0176391;REVB=-0.0526649;RO=11;SAF=2;SAR=1;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0774686;STB=0.555203;TYPE=snp;VARB=0.0481809;OID=.;OPOS=1018316;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:14:14:11:11:3:3:1:2:8:3:1:2:8:3 chr11 1018355 . A G 14.48 PASS AO=4;DP=16;FAO=4;FDP=16;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=-0.00797942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.3573;QD=3.61947;RBI=0.0284152;REFB=-0.00933875;REVB=-0.0272719;RO=11;SAF=2;SAR=2;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14919;STB=0.624414;TYPE=snp;VARB=0.0975305;OID=.;OPOS=1018355;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:16:16:11:12:4:4:2:2:4:7:2:2:4:8 chr11 1018374 . T A 37.14 PASS AO=6;DP=13;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0538209;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.4378;QD=10.6117;RBI=0.098874;REFB=-0.0422364;REVB=0.082942;RO=7;SAF=3;SAR=3;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0631528;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0276581;OID=.;OPOS=1018374;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:13:14:7:7:6:7:3:3:3:4:4:3:3:4 chr11 1018385 . T A 32.14 PASS AO=7;DP=21;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0279455;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.155;QD=5.84291;RBI=0.0445881;REFB=-0.023227;REVB=0.0347441;RO=12;SAF=3;SAR=4;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196632;STB=0.590689;TYPE=snp;VARB=0.0458177;OID=.;OPOS=1018385;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:21:22:12:14:7:8:4:3:3:9:4:4:5:9 chr11 1018419 . G A 40.69 PASS AO=20;DP=80;FAO=20;FDP=78;FR=.;FRO=58;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=47;FWDB=0.0393889;FXX=0.0249969;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.842;QD=2.08679;RBI=0.0396106;REFB=-0.0104005;REVB=-0.0041845;RO=58;SAF=7;SAR=13;SRF=11;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.24014;STB=0.642081;TYPE=snp;VARB=0.0287794;OID=.;OPOS=1018419;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:80:78:58:58:20:20:13:7:11:47:13:7:11:47 chr11 1018456 . G A 59.37 PASS AO=20;DP=60;FAO=20;FDP=60;FR=.;FRO=40;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=33;FWDB=0.0128038;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.785;QD=3.95792;RBI=0.0141996;REFB=-0.0274187;REVB=0.00613931;RO=40;SAF=5;SAR=15;SRF=7;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12301;STB=0.571363;TYPE=snp;VARB=0.0379702;OID=.;OPOS=1018456;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:60:60:40:40:20:20:15:5:7:33:15:5:7:33 chr11 1019375 . C T 655.15 PASS AO=67;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107477;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.808;QD=38.5382;RBI=0.0339898;REFB=0;REVB=0.0322458;RO=0;SAF=5;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000238999;OID=.;OPOS=1019375;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:68:68:0:0:67:68:62:5:0:0:63:5:0:0 chr11 1026048 . G A 150.98 PASS AO=25;DP=38;FAO=25;FDP=38;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.0274026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.338;QD=15.8925;RBI=0.04568;REFB=-0.0260577;REVB=0.0365481;RO=13;SAF=8;SAR=17;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194091;STB=0.607054;TYPE=snp;VARB=0.0140074;OID=.;OPOS=1026048;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:38:38:13:13:25:25:17:8:8:5:17:8:8:5 chr11 1027811 . C T 165.72 PASS AO=23;DP=30;FAO=23;FDP=30;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.00196966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.107;QD=22.0959;RBI=0.00976455;REFB=-0.0499773;REVB=0.00956383;RO=7;SAF=7;SAR=16;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126897;STB=0.569516;TYPE=snp;VARB=0.00975341;OID=.;OPOS=1027811;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:30:30:7:7:23:23:16:7:4:3:16:7:4:3 chr11 1029320 . C T 37.17 PASS AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.00215083;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.628;QD=10.6195;RBI=0.0139003;REFB=-0.02571;REVB=0.0137329;RO=6;SAF=2;SAR=5;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0441607;STB=0.581152;TYPE=snp;VARB=0.0504596;OID=.;OPOS=1029320;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:14:14:6:7:7:7:5:2:2:4:5:2:3:4 chr11 1092171 . CGGGGCC CGGGCC,CGGGC,CGGGG 1152.39 PASS AO=37,23,48;DP=183;FAO=0,155,0;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=0,76,0;FSAR=0,79,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.952104,-0.0861645,-0.632865;FXX=0;HRUN=4,4,4;LEN=1,2,2;MLLD=10.6543,22.4051,8.48335;QD=29.7391;RBI=0.954047,0.309271,0.71295;REFB=0,0,0;REVB=-0.0608474,0.297025,0.328296;RO=3;SAF=0,0,48;SAR=37,23,0;SRF=0;SRR=3;SSEN=0.509542,0.509542,0.452055;SSEP=0,0,0.534653;SSSB=0,0,0.891099;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=del,del,del;VARB=0,0.00210107,0;OID=.,.,.;OPOS=1092172,1092175,1092176;OREF=G,GC,CC;OALT=-,-,-;OMAPALT=CGGGCC,CGGGC,CGGGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:37,23,48:152:0,155,0:155:0:0,76,0:0,79,0:0:0:99:3:0,0,48:37,23,0:0:3 chr11 1092715 . G A 51.87 PASS AO=6;DP=8;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.167224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.181;QD=23.0516;RBI=0.170815;REFB=-0.0319199;REVB=0.0348409;RO=2;SAF=2;SAR=4;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0772509;STB=0.516083;TYPE=snp;VARB=0.0208228;OID=.;OPOS=1092715;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:8:9:2:2:6:7:4:2:1:1:4:3:1:1 chr11 1092726 . C T 31.03 PASS AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0721953;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.39;QD=13.7893;RBI=0.0823674;REFB=0.00144489;REVB=0.0396515;RO=4;SAF=2;SAR=3;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118169;STB=0.571155;TYPE=snp;VARB=0.0025924;OID=.;OPOS=1092726;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:9:9:4:4:5:5:3:2:1:3:3:2:1:3 chr11 1092872 . C G 42.08 PASS AO=4;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.1489;QD=24.0431;RBI=0.140525;REFB=0.00499129;REVB=0.140525;RO=1;SAF=0;SAR=4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0247482;OID=.;OPOS=1092872;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:7:7:1:1:4:5:4:0:0:1:5:0:0:1 chr11 1092885 . G C 33.01 PASS AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.0004;QD=18.8622;RBI=0.0332777;REFB=0.0530675;REVB=0.0332777;RO=2;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0185038;OID=.;OPOS=1092885;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:2:2:5:5:5:0:0:2:5:0:0:2 chr11 1093334 . C G 33.04 PASS AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=138.871;QD=18.8784;RBI=0.0425067;REFB=-0.00891607;REVB=-0.0425067;RO=2;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00833306;OID=.;OPOS=1093334;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:2:2:5:5:5:0:0:2:5:0:0:2 chr11 1093335 . C T 33 PASS AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=66.8736;QD=18.8555;RBI=0.0375614;REFB=-0.0603704;REVB=-0.0375614;RO=2;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.070387;OID=.;OPOS=1093335;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:2:2:5:5:5:0:0:2:5:0:0:2 chr11 1093336 . C A 33.04 PASS AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=204.198;QD=18.8791;RBI=0.0300807;REFB=-0.0311242;REVB=-0.0300807;RO=2;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0164742;OID=.;OPOS=1093336;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:2:2:5:5:5:0:0:2:5:0:0:2 chr11 1093569 . A C 16.56 PASS AO=3;DP=9;FAO=4;FDP=10;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.145489;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=35.8374;QD=6.62566;RBI=0.193149;REFB=-0.0820666;REVB=-0.12704;RO=6;SAF=1;SAR=2;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.317885;STB=0.748749;TYPE=snp;VARB=0.135325;OID=.;OPOS=1093569;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:9:10:6:6:3:4:2:1:4:2:3:1:4:2 chr11 1093710 . C G 10.89 PASS AO=3;DP=14;FAO=3;FDP=14;FR=.;FRO=11;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=11;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.0753;QD=3.11191;RBI=0.125923;REFB=0.0160277;REVB=0.125923;RO=10;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0347797;OID=.;OPOS=1093710;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:14:14:10:11:3:3:3:0:0:10:3:0:0:11 chr11 1094690 . C T 38.93 PASS AO=12;DP=36;FAO=12;FDP=36;FR=.;FRO=24;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=-0.00109578;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.341;QD=4.32548;RBI=0.00456032;REFB=-0.00772519;REVB=0.00442671;RO=23;SAF=2;SAR=10;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218669;STB=0.624765;TYPE=snp;VARB=0.027066;OID=.;OPOS=1094690;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:36:36:23:24:12:12:10:2:7:16:10:2:7:17 chr11 1094753 . A C 44.91 PASS AO=11;DP=32;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=19;FWDB=-0.0265072;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.739;QD=5.13264;RBI=0.0438336;REFB=0.00110567;REVB=0.0349107;RO=21;SAF=5;SAR=6;SRF=3;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.369535;STB=0.744383;TYPE=snp;VARB=0.00858611;OID=.;OPOS=1094753;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:32:35:21:22:11:13:6:5:3:18:6:7:3:19 chr11 1096494 . T C 303.02 PASS AO=67;DP=139;FAO=72;FDP=144;FR=.;FRO=72;FSAF=33;FSAR=39;FSRF=31;FSRR=41;FWDB=0.0056118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.0285;QD=8.41711;RBI=0.031999;REFB=-0.0171726;REVB=-0.0315031;RO=63;SAF=30;SAR=37;SRF=24;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0599674;STB=0.514015;TYPE=snp;VARB=0.0174412;OID=.;OPOS=1096494;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:144:63:72:67:72:37:30:24:39:39:33:31:41 chr11 1158073 . T C 412.47 PASS AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0302245;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.105;QD=37.4973;RBI=0.0310389;REFB=0;REVB=0.00706348;RO=0;SAF=21;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2717e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.63315e-05;OID=.;OPOS=1158073;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:44:44:0:0:44:44:23:21:0:0:23:21:0:0 chr11 1161315 . T C 103.02 PASS AO=9;DP=16;FAO=13;FDP=14;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0402857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.5967;QD=29.4344;RBI=0.0407095;REFB=-0.0799978;REVB=-0.00585878;RO=1;SAF=5;SAR=4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.080744;STB=0.526276;TYPE=snp;VARB=0.011432;OID=.;OPOS=1161315;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:10:14:1:1:9:13:4:5:1:0:4:9:1:0 chr11 1212877 . A G 39.6 PASS AO=56;DP=320;FAO=56;FDP=318;FR=.;FRO=262;FSAF=21;FSAR=35;FSRF=125;FSRR=137;FWDB=-0.00710656;FXX=0.0062498;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.667;QD=0.498109;RBI=0.0229899;REFB=-0.00798555;REVB=-0.021864;RO=258;SAF=21;SAR=35;SRF=124;SRR=134;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13898;STB=0.585844;TYPE=snp;VARB=0.049541;OID=.;OPOS=1212877;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:320:318:258:262:56:56:35:21:124:134:35:21:125:137 chr11 1212921 . C T 84.62 PASS AO=40;DP=141;FAO=40;FDP=141;FR=.;FRO=101;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=74;FWDB=0.0209611;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.708;QD=2.40043;RBI=0.0241625;REFB=0.00163021;REVB=0.0120191;RO=100;SAF=24;SAR=16;SRF=27;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.386243;STB=0.725708;TYPE=snp;VARB=-0.0054484;OID=.;OPOS=1212921;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:141:141:100:101:40:40:16:24:27:73:16:24:27:74 chr11 1212943 . C T 30.11 PASS AO=21;DP=100;FAO=21;FDP=99;FR=.;FRO=78;FSAF=1;FSAR=20;FSRF=45;FSRR=33;FWDB=0.00715485;FXX=0.009999;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.8772;QD=1.2167;RBI=0.010198;REFB=-0.0100608;REVB=-0.00726683;RO=77;SAF=1;SAR=20;SRF=45;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.706228;STB=0.945078;TYPE=snp;VARB=0.0448994;OID=.;OPOS=1212943;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:100:99:77:78:21:21:20:1:45:32:20:1:45:33 chr11 1212954 . C A 62.02 PASS AO=27;DP=101;FAO=29;FDP=103;FR=.;FRO=74;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=39;FSRR=35;FWDB=-0.00852053;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.387;QD=2.40846;RBI=0.00983982;REFB=-0.0220174;REVB=-0.00492165;RO=74;SAF=12;SAR=15;SRF=39;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100744;STB=0.531751;TYPE=snp;VARB=0.0662733;OID=.;OPOS=1212954;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:101:103:74:74:27:29:15:12:39:35:15:14:39:35 chr11 1213047 . T C 35.69 PASS AO=19;DP=69;FAO=18;FDP=71;FR=.;FRO=53;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=29;FWDB=-0.0860928;FXX=0.0405351;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9296;QD=2.01094;RBI=0.112964;REFB=-0.0635951;REVB=-0.0731363;RO=45;SAF=12;SAR=7;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220141;STB=0.506322;TYPE=snp;VARB=0.168863;OID=.;OPOS=1213047;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:69:71:45:53:19:18:7:12:20:25:10:8:24:29 chr11 1213118 . C G 29.03 PASS AO=16;DP=64;FAO=15;FDP=63;FR=.;FRO=48;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=39;FWDB=0.019973;FXX=0.0307645;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.444;QD=1.84323;RBI=0.0539758;REFB=-0.00854256;REVB=-0.0501445;RO=40;SAF=10;SAR=6;SRF=9;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.450699;STB=0.82211;TYPE=snp;VARB=0.0287031;OID=.;OPOS=1213118;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:64:63:40:48:16:15:6:10:9:31:5:10:9:39 chr11 1213125 . G A 75.31 PASS AO=26;DP=73;FAO=29;FDP=75;FR=.;FRO=46;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=36;FWDB=-0.017374;FXX=0.0384566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.705;QD=4.01632;RBI=0.0248264;REFB=-0.0414847;REVB=-0.017734;RO=42;SAF=9;SAR=17;SRF=9;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167612;STB=0.570091;TYPE=snp;VARB=0.0472918;OID=.;OPOS=1213125;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:73:75:42:46:26:29:17:9:9:33:20:9:10:36 chr11 1213174 . A G 71.89 PASS AO=33;DP=111;FAO=32;FDP=111;FR=.;FRO=79;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=6;FSRR=73;FWDB=0.0101261;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.109;QD=2.59064;RBI=0.013796;REFB=-0.017314;REVB=-0.00936973;RO=71;SAF=13;SAR=20;SRF=6;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.437526;STB=0.768035;TYPE=snp;VARB=0.0215806;OID=.;OPOS=1213174;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:111:111:71:79:33:32:20:13:6:65:19:13:6:73 chr11 1213177 . C T 79.37 PASS AO=35;DP=115;FAO=34;FDP=114;FR=.;FRO=80;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=7;FSRR=73;FWDB=-0.00218879;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=210.513;QD=2.78484;RBI=0.0171749;REFB=-0.00832307;REVB=-0.0170348;RO=80;SAF=15;SAR=20;SRF=7;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.465865;STB=0.767414;TYPE=snp;VARB=0.0162268;OID=.;OPOS=1213177;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:115:114:80:80:35:34:20:15:7:73:19:15:7:73 chr11 1213204 . C G 105.58 PASS AO=40;DP=120;FAO=39;FDP=118;FR=.;FRO=79;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=11;FSRR=68;FWDB=0.00955692;FXX=0.0327842;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.757;QD=3.57887;RBI=0.0111228;REFB=-0.00939746;REVB=-0.0056906;RO=79;SAF=16;SAR=24;SRF=11;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.346247;STB=0.70093;TYPE=snp;VARB=0.0197086;OID=.;OPOS=1213204;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:118:79:79:40:39:24:16:11:68:23:16:11:68 chr11 1220759 . CT C,CC 106.03 PASS AO=14,10;DP=57;FAO=18,10;FDP=55;FR=.;FRO=27;FSAF=13,0;FSAR=5,10;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=-0.0739773,-0.028569;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=19.6412,25.9397;QD=7.71119;RBI=0.0966611,0.0363236;REFB=-0.0599498,-0.0626093;REVB=-0.0622153,-0.0224324;RO=24;SAF=9,0;SAR=5,10;SRF=10;SRR=14;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.242189,-0.752478;STB=0.694435,0.998596;TYPE=del,snp;VARB=0.0318111,0.145473;OID=.,.;OPOS=1220760,1220760;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:14,10:52:18,10:55:27:13,0:5,10:11:16:50:24:9,0:5,10:10:14 chr11 1220796 . T C 137.88 PASS AO=32;DP=69;FAO=32;FDP=67;FR=.;FRO=35;FSAF=4;FSAR=28;FSRF=7;FSRR=28;FWDB=0.0311225;FXX=0.0289813;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.683;QD=8.23151;RBI=0.0323953;REFB=-0.0285036;REVB=-0.00899134;RO=33;SAF=4;SAR=28;SRF=7;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155223;STB=0.578893;TYPE=snp;VARB=0.0294276;OID=.;OPOS=1220796;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:67:33:35:32:32:28:4:7:26:28:4:7:28 chr11 1250488 . C T 63.99 PASS AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=19;FWDB=0.0778548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.9749;QD=6.73605;RBI=0.0836712;REFB=-0.012042;REVB=0.0306512;RO=22;SAF=5;SAR=11;SRF=3;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229815;STB=0.630114;TYPE=snp;VARB=0.0130032;OID=.;OPOS=1250488;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:38:38:22:22:16:16:11:5:3:19:11:5:3:19 chr11 1252708 . G C 67.43 PASS AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=13;FWDB=-0.00424248;FXX=0.0644953;HRUN=4;LEN=1;MLLD=233.928;QD=9.3009;RBI=0.0139558;REFB=-0.0213077;REVB=-0.0132953;RO=13;SAF=7;SAR=7;SRF=2;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.295747;STB=0.689423;TYPE=snp;VARB=0.0331387;OID=.;OPOS=1252708;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:28:29:13:15:14:14:7:7:2:11:7:7:2:13 chr11 1253942 . T C 43.07 PASS AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0471281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.3109;QD=14.3562;RBI=0.0518455;REFB=-0.0673462;REVB=0.021608;RO=5;SAF=3;SAR=4;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0206743;STB=0.51216;TYPE=snp;VARB=0.0208083;OID=.;OPOS=1253942;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:12:12:5:5:7:7:4:3:2:3:4:3:2:3 chr11 1255773 . C T 225.72 PASS AO=41;DP=68;FAO=41;FDP=67;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=0.0597552;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.851;QD=13.4758;RBI=0.076792;REFB=-0.0479891;REVB=0.048232;RO=25;SAF=15;SAR=26;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0346349;STB=0.50827;TYPE=snp;VARB=0.0305725;OID=.;OPOS=1255773;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:68:67:25:26:41:41:26:15:8:17:26:15:9:17 chr11 1258217 . T G 22.89 PASS AO=14;DP=66;FAO=14;FDP=66;FR=.;FRO=52;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=29;FSRR=23;FWDB=-0.0322614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.258;QD=1.38701;RBI=0.032485;REFB=-0.00392739;REVB=-0.00380536;RO=52;SAF=6;SAR=8;SRF=29;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159031;STB=0.600716;TYPE=snp;VARB=0.0442323;OID=.;OPOS=1258217;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:66:66:52:52:14:14:8:6:29:23:8:6:29:23 chr11 1258226 . C T 23.53 PASS AO=14;DP=66;FAO=14;FDP=65;FR=.;FRO=51;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=28;FSRR=23;FWDB=-0.00316614;FXX=0.0151492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.84;QD=1.44771;RBI=0.00815073;REFB=-0.000550742;REVB=-0.00751066;RO=51;SAF=6;SAR=8;SRF=28;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148303;STB=0.593754;TYPE=snp;VARB=0.00193406;OID=.;OPOS=1258226;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:66:65:51:51:14:14:8:6:28:23:8:6:28:23 chr11 1258240 . C T 15.65 PASS AO=12;DP=66;FAO=12;FDP=66;FR=.;FRO=54;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=30;FSRR=24;FWDB=0.00728492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.198;QD=0.948204;RBI=0.0345213;REFB=-0.00392321;REVB=0.0337439;RO=54;SAF=5;SAR=7;SRF=30;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171402;STB=0.612315;TYPE=snp;VARB=0.0494333;OID=.;OPOS=1258240;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:66:66:54:54:12:12:7:5:30:24:7:5:30:24 chr11 1258241 . A G 15.62 PASS AO=12;DP=66;FAO=12;FDP=66;FR=.;FRO=54;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=30;FSRR=24;FWDB=-0.0269709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.993;QD=0.946633;RBI=0.0290032;REFB=-0.00513832;REVB=-0.0106657;RO=54;SAF=5;SAR=7;SRF=30;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171402;STB=0.612315;TYPE=snp;VARB=0.0233828;OID=.;OPOS=1258241;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:66:66:54:54:12:12:7:5:30:24:7:5:30:24 chr11 1258283 . G A 30.77 PASS AO=10;DP=60;FAO=14;FDP=56;FR=.,HEALED;FRO=42;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=0.0274662;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.393;QD=2.19811;RBI=0.0284019;REFB=-0.0206432;REVB=-0.00722993;RO=19;SAF=0;SAR=10;SRF=0;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.732978;TYPE=snp;VARB=0.0312138;OID=.;OPOS=1258283;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:51:56:19:42:10:14:10:0:0:19:11:3:21:21 chr11 1258286 . C T 29.94 PASS AO=14;DP=55;FAO=14;FDP=56;FR=.;FRO=42;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=-0.00196526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.608;QD=2.13866;RBI=0.00961027;REFB=-0.0104935;REVB=-0.00940718;RO=41;SAF=3;SAR=11;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.359004;STB=0.732978;TYPE=snp;VARB=0.0202628;OID=.;OPOS=1258286;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:55:56:41:42:14:14:11:3:20:21:11:3:21:21 chr11 1258295 . A G 25.11 PASS AO=13;DP=58;FAO=13;FDP=58;FR=.;FRO=45;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=-0.0148144;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.618;QD=1.73147;RBI=0.0355735;REFB=-0.00769266;REVB=-0.0323421;RO=37;SAF=3;SAR=10;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.358225;STB=0.701423;TYPE=snp;VARB=0.0397878;OID=.;OPOS=1258295;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:58:58:37:45:13:13:10:3:19:18:10:3:21:24 chr11 1263999 . C T 10.47 PASS AO=2;DP=6;FAO=2;FDP=6;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0151678;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.592;QD=6.97934;RBI=0.0526846;REFB=-0.00542094;REVB=0.050454;RO=4;SAF=1;SAR=1;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0111614;OID=.;OPOS=1263999;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:4:4:2:2:1:1:2:2:1:1:2:2 chr11 1264823 . T C 125.84 PASS AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.46;QD=35.9535;RBI=0.00127071;REFB=0;REVB=0.00127071;RO=0;SAF=0;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.10096e-06;OID=.;OPOS=1264823;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:14:14:0:0:14:14:14:0:0:0:14:0:0:0 chr11 1264965 . G A 126.52 PASS AO=18;DP=22;FAO=18;FDP=23;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=17;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0125257;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.0652;QD=22.0029;RBI=0.0188808;REFB=-0.0707567;REVB=0.0141277;RO=4;SAF=1;SAR=17;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.512595;STB=0.78118;TYPE=snp;VARB=0.00903475;OID=.;OPOS=1264965;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:22:23:4:5:18:18:17:1:3:1:17:1:3:2 chr11 1266599 . C T 64.64 PASS AO=11;DP=20;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.0542203;FXX=0.049975;HRUN=4;LEN=1;MLLD=211.799;QD=13.609;RBI=0.054222;REFB=0.00541794;REVB=0.000428885;RO=8;SAF=1;SAR=10;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.258419;STB=0.651838;TYPE=snp;VARB=-0.00149748;OID=.;OPOS=1266599;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:20:19:8:8:11:11:10:1:2:6:10:1:2:6 chr11 1267115 . C A 90.87 PASS AO=19;DP=37;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=15;FWDB=0.0673645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.1516;QD=9.82365;RBI=0.0692435;REFB=0.0179287;REVB=-0.0160215;RO=18;SAF=7;SAR=12;SRF=3;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199975;STB=0.611545;TYPE=snp;VARB=-0.0151525;OID=.;OPOS=1267115;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:37:37:18:18:19:19:12:7:3:15:12:7:3:15 chr11 1267562 . C T 10.47 PASS AO=2;DP=6;FAO=2;FDP=6;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202;QD=6.97954;RBI=0.012702;REFB=-0.00860736;REVB=0.012702;RO=4;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0205801;OID=.;OPOS=1267562;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:4:4:2:2:2:0:0:4:2:0:0:4 chr11 1268608 . A G 86.76 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.918;QD=38.5593;RBI=0.00190138;REFB=0;REVB=-0.00190138;RO=0;SAF=0;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.02762e-05;OID=.;OPOS=1268608;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:9:0:0:0:9:0:0:0 chr11 1268682 . T C 31.59 PASS AO=6;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=-0.00461549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.957;QD=9.71868;RBI=0.0201426;REFB=0.00506538;REVB=0.0196067;RO=6;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.327571;STB=0.523732;TYPE=snp;VARB=-0.00745823;OID=.;OPOS=1268682;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:13:13:6:7:6:6:5:1:0:6:5:1:1:6 chr11 1269627 . C T 34.24 PASS AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.00449379;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.328;QD=9.12986;RBI=0.0542316;REFB=-0.0112067;REVB=0.0540451;RO=8;SAF=1;SAR=6;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.404365;STB=0.749165;TYPE=snp;VARB=0.0236628;OID=.;OPOS=1269627;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:15:15:8:8:7:7:6:1:4:4:6:1:4:4 chr11 1272226 . A C 26.92 PASS AO=6;DP=20;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=14;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.261;QD=5.12838;RBI=0.00497102;REFB=-0.0111749;REVB=-0.00497102;RO=13;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0223509;OID=.;OPOS=1272226;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:20:21:13:14:6:7:6:0:0:13:7:0:0:14 chr11 1309956 . C T 161.06 PASS AO=12;DP=40;FAO=26;FDP=40;FR=.,HEALED;FRO=14;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.00103688;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.692;QD=16.1055;RBI=0.0111177;REFB=-0.0292906;REVB=-0.0110693;RO=4;SAF=12;SAR=0;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.813231;STB=0.58772;TYPE=snp;VARB=0.0212193;OID=.;OPOS=1309956;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:25:40:4:14:12:26:0:12:3:1:12:14:4:10 chr11 1432691 . T C 85.46 PASS AO=17;DP=37;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.0477351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.575;QD=8.33731;RBI=0.0478117;REFB=-0.0224163;REVB=-0.00270419;RO=18;SAF=0;SAR=17;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.822576;STB=0.745797;TYPE=snp;VARB=0.0190531;OID=.;OPOS=1432691;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:37:41:18:21:17:20:17:0:8:10:17:3:11:10 chr11 1491341 . C G 14.38 PASS AO=5;DP=22;FAO=5;FDP=22;FR=.;FRO=17;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=17;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.273;QD=2.61503;RBI=0.00360536;REFB=0.00892389;REVB=-0.00360536;RO=17;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0237698;OID=.;OPOS=1491341;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:22:22:17:17:5:5:5:0:0:17:5:0:0:17 chr11 1501670 . G C 392.41 PASS AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0540596;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.3929;QD=37.3726;RBI=0.0639384;REFB=0;REVB=0.034142;RO=0;SAF=19;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000396585;OID=.;OPOS=1501670;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:42:42:0:0:42:42:23:19:0:0:23:19:0:0 chr11 1502097 . A G 519.8 PASS AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00859893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.907;QD=37.8034;RBI=0.00876802;REFB=0;REVB=0.00171365;RO=0;SAF=27;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4002e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.05329e-05;OID=.;OPOS=1502097;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:55:55:0:0:55:55:28:27:0:0:28:27:0:0 chr11 1507731 . A G 255.44 PASS AO=23;DP=23;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0549963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.806;QD=37.8423;RBI=0.0556103;REFB=0;REVB=-0.0082407;RO=0;SAF=14;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84921e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000126437;OID=.;OPOS=1507731;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:23:27:0:0:23:27:9:14:0:0:9:18:0:0 chr11 1579032 . G A 30.17 PASS AO=9;DP=28;FAO=9;FDP=28;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.0022086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.395;QD=4.31004;RBI=0.00312893;REFB=-0.0182268;REVB=-0.00221637;RO=19;SAF=3;SAR=6;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.271522;STB=0.666296;TYPE=snp;VARB=0.0376821;OID=.;OPOS=1579032;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:28:28:19:19:9:9:6:3:11:8:6:3:11:8 chr11 1629676 . G T 47.68 PASS AO=6;DP=13;FAO=5;FDP=13;FR=.,HEALED;FRO=5;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0442699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.378;QD=14.6702;RBI=0.0509194;REFB=-0.0280865;REVB=-0.0251588;RO=5;SAF=4;SAR=2;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207272;STB=0.726279;TYPE=snp;VARB=0.00715613;OID=.;OPOS=1629676;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:13:13:5:5:6:5:2:4:2:3:1:4:2:3 chr11 1651830 . G T 182.12 PASS AO=31;DP=48;FAO=31;FDP=48;FR=.;FRO=17;FSAF=25;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.00899066;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.2;QD=15.1763;RBI=0.0267923;REFB=-0.0391712;REVB=0.0252388;RO=16;SAF=25;SAR=6;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207139;STB=0.6074;TYPE=snp;VARB=0.0126498;OID=.;OPOS=1651830;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:48:48:16:17:31:31:6:25:9:7:6:25:10:7 chr11 1651917 . C T 97.71 PASS AO=19;DP=33;FAO=19;FDP=34;FR=.;FRO=15;FSAF=17;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0169087;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.8961;QD=11.4958;RBI=0.036894;REFB=-0.0272774;REVB=0.0327913;RO=14;SAF=17;SAR=2;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.500346;STB=0.779454;TYPE=snp;VARB=0.0289557;OID=.;OPOS=1651917;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:33:34:14:15:19:19:2:17:6:8:2:17:7:8 chr11 1652103 . G C 190.4 PASS AO=41;DP=79;FAO=41;FDP=79;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=13;FSRR=25;FWDB=-0.0368278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.71;QD=9.64024;RBI=0.0448355;REFB=-0.0124459;REVB=0.0255722;RO=37;SAF=15;SAR=26;SRF=12;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0388722;STB=0.512385;TYPE=snp;VARB=0.0110025;OID=.;OPOS=1652103;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:37:38:41:41:26:15:12:25:26:15:13:25 chr11 1853107 . C T 101.96 PASS AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.030198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.725;QD=37.075;RBI=0.0667077;REFB=0;REVB=0.0594811;RO=0;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00215521;OID=.;OPOS=1853107;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:11:11:7:4:0:0:7:4:0:0 chr11 1855854 . G C 218.61 PASS AO=39;DP=66;FAO=40;FDP=66;FR=.;FRO=26;FSAF=3;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=25;FWDB=0.0416909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.482;QD=13.2489;RBI=0.0706309;REFB=-0.0316668;REVB=0.0570139;RO=24;SAF=2;SAR=37;SRF=2;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102224;STB=0.556861;TYPE=snp;VARB=0.0189491;OID=.;OPOS=1855854;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:66:66:24:26:39:40:37:2:2:22:37:3:1:25 chr11 1856344 . C A 55.53 PASS AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.0572973;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.5815;QD=6.53294;RBI=0.0577099;REFB=0.00344693;REVB=0.00688897;RO=20;SAF=5;SAR=9;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00786832;STB=0.504581;TYPE=snp;VARB=-0.0034655;OID=.;OPOS=1856344;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:34:34:20:20:14:14:9:5:7:13:9:5:7:13 chr11 1857173 . T C 227.54 PASS AO=13;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0405188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.091;QD=36.4058;RBI=0.0424375;REFB=0;REVB=0.0126162;RO=0;SAF=3;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.18519e-05;OID=.;OPOS=1857173;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:14:25:0:0:13:25:10:3:0:0:15:10:0:0 chr11 1858262 . C T 56.21 PASS AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.000591313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.181;QD=8.99307;RBI=0.0091995;REFB=-0.0056779;REVB=0.00918047;RO=13;SAF=3;SAR=9;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.066069;STB=0.538395;TYPE=snp;VARB=0.0052161;OID=.;OPOS=1858262;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:25:25:13:13:12:12:9:3:4:9:9:3:4:9 chr11 1861760 . T C 138.82 PASS AO=26;DP=44;FAO=26;FDP=44;FR=.;FRO=18;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=0.0143964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.1462;QD=12.6201;RBI=0.0267197;REFB=-0.0586389;REVB=0.0225097;RO=18;SAF=15;SAR=11;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112417;STB=0.561998;TYPE=snp;VARB=0.0274627;OID=.;OPOS=1861760;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:44:44:18:18:26:26:11:15:13:5:11:15:13:5 chr11 1874404 . C T 267.06 PASS AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0325445;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.192;QD=38.1517;RBI=0.0457446;REFB=0;REVB=0.032147;RO=0;SAF=16;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00024491;OID=.;OPOS=1874404;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:28:28:0:0:28:28:12:16:0:0:12:16:0:0 chr11 1887806 . T A 217.68 PASS AO=22;DP=24;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0340006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.038;QD=34.8282;RBI=0.0765669;REFB=0;REVB=0.0686035;RO=0;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00634678;OID=.;OPOS=1887806;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:24:25:0:0:22:25:12:10:0:0:15:10:0:0 chr11 1890990 . G A 231.68 PASS AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216888;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=101.529;QD=37.069;RBI=0.0583368;REFB=0;REVB=0.0541552;RO=0;SAF=8;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000536926;OID=.;OPOS=1890990;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:25:25:0:0:25:25:17:8:0:0:17:8:0:0 chr11 1891722 . C T 432.52 PASS AO=46;DP=50;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0188976;FXX=0.059988;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.2759;QD=36.8099;RBI=0.0226931;REFB=-0.148586;REVB=-0.0125642;RO=1;SAF=41;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0113327;STB=0.506021;TYPE=snp;VARB=0.000806555;OID=.;OPOS=1891722;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:50:47:1:1:46:46:5:41:1:0:5:41:1:0 chr11 1902768 . G A 587.02 PASS AO=65;DP=69;FAO=65;FDP=68;FR=.;FRO=3;FSAF=14;FSAR=51;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0532947;FXX=0.0285673;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.219;QD=34.5308;RBI=0.0552289;REFB=-0.105268;REVB=0.014488;RO=3;SAF=14;SAR=51;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0910528;STB=0.548371;TYPE=snp;VARB=0.00121249;OID=.;OPOS=1902768;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:69:68:3:3:65:65:51:14:3:0:51:14:3:0 chr11 1911115 . T C,G 60.18 PASS AO=5,2;DP=7;FAO=6,1;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3,1;FSAR=3,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0195621,-0.0166218;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=140.478,152.722;QD=34.3901;RBI=0.0560611,0.0176133;REFB=0,0;REVB=0.0525374,0.00582605;RO=0;SAF=2,2;SAR=3,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00362547,0.117311;OID=.,.;OPOS=1911115,1911115;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:6:7:7:0:0:5,2:6,1:3,0:2,2:0:0:3,0:3,1:0:0 chr11 1959707 . C T 387.81 PASS AO=41;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.043468;FXX=0.0850883;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.797;QD=36.0751;RBI=0.0622823;REFB=-0.0748727;REVB=0.044605;RO=0;SAF=24;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.2194e-08;STB=0.513507;TYPE=snp;VARB=0.00153994;OID=.;OPOS=1959707;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:43:43:0:1:41:42:17:24:0:0:18:24:0:1 chr11 1993975 . C A 447.41 PASS AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0940534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.618;QD=38.0773;RBI=0.0953373;REFB=0;REVB=0.0155934;RO=0;SAF=13;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.94744e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000879226;OID=.;OPOS=1993975;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:46:47:0:0:46:47:33:13:0:0:33:14:0:0 chr11 2016908 . G A 56.3 PASS AO=7;DP=8;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0674123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.2576;QD=28.1501;RBI=0.0674123;REFB=-0.0987333;REVB=0;RO=0;SAF=7;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0102098;OID=.;OPOS=2016908;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:8:8:0:1:7:7:0:7:0:0:0:7:1:0 chr11 2167543 . T G 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0325308;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=242.633;QD=33.022;RBI=0.035764;REFB=0;REVB=0.0148598;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000723384;OID=.;OPOS=2167543;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:5:1:0:0:5:1:0:0 chr11 2167618 . A G 195.16 PASS AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103958;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.47;QD=37.1733;RBI=0.0492692;REFB=0;REVB=-0.0481599;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000385536;OID=.;OPOS=2167618;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:21:21:0:0:21:21:10:11:0:0:10:11:0:0 chr11 2168375 . G C,T 244.8 PASS AO=12,11;DP=35;FAO=17,15;FDP=36;FR=.;FRO=4;FSAF=4,3;FSAR=13,12;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.00592026,-0.00674256;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=41.8918,71.798;QD=27.1999;RBI=0.0143988,0.00783343;REFB=-0.0112951,0.0102194;REVB=0.0131254,0.00398755;RO=1;SAF=2,1;SAR=10,10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0430526,0.0428878;STB=0.566594,0.571342;TYPE=snp,snp;VARB=0.0185847,0.00781022;OID=.,.;OPOS=2168375,2168375;OREF=G,G;OALT=C,T;OMAPALT=C,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:65:29:36:1:4:12,11:17,15:10,10:2,1:0:1:13,12:4,3:0:4 chr11 2190951 . C T 156.72 PASS AO=27;DP=42;FAO=27;FDP=42;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=22;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.0019619;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.1863;QD=14.9257;RBI=0.00430605;REFB=-0.0312123;REVB=-0.00383315;RO=13;SAF=5;SAR=22;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226313;STB=0.609482;TYPE=snp;VARB=0.016644;OID=.;OPOS=2190951;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:42:42:13:15:27:27:22:5:6:7:22:5:6:9 chr11 2292080 . G A 84.76 PASS AO=15;DP=26;FAO=15;FDP=25;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=10;FWDB=0.193562;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.479;QD=13.5617;RBI=0.194724;REFB=-0.0420838;REVB=-0.0212492;RO=10;SAF=1;SAR=14;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240028;STB=0.631443;TYPE=snp;VARB=0.0393235;OID=.;OPOS=2292080;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:26:25:10:10:15:15:14:1:0:10:14:1:0:10 chr11 2323022 . C T 51.83 PASS AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=10;FWDB=0.139916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.4185;QD=10.3665;RBI=0.144394;REFB=0.0113923;REVB=0.0356828;RO=10;SAF=1;SAR=9;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.320847;STB=0.678324;TYPE=snp;VARB=0.00107458;OID=.;OPOS=2323022;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:20:20:10:10:10:10:9:1:0:10:9:1:0:10 chr11 2323029 . T C 195.71 PASS AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00918479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.177;QD=39.1419;RBI=0.0208677;REFB=0;REVB=-0.0187377;RO=0;SAF=1;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97126e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.27518e-05;OID=.;OPOS=2323029;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:20:20:0:0:20:20:19:1:0:0:19:1:0:0 chr11 2324041 . A G 147.32 PASS AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.12;QD=36.8303;RBI=0.0614428;REFB=0;REVB=-0.0603705;RO=0;SAF=12;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07465e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000535752;OID=.;OPOS=2324041;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:16:0:0:16:16:4:12:0:0:4:12:0:0 chr11 2324692 . C T 146.99 PASS AO=33;DP=73;FAO=35;FDP=74;FR=.;FRO=39;FSAF=33;FSAR=2;FSRF=35;FSRR=4;FWDB=0.0580073;FXX=0.0133316;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.1143;QD=7.94532;RBI=0.0610615;REFB=-0.0198218;REVB=-0.0190698;RO=39;SAF=31;SAR=2;SRF=35;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148814;STB=0.592753;TYPE=snp;VARB=0.0165416;OID=.;OPOS=2324692;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:74:39:39:33:35:2:31:35:4:2:33:35:4 chr11 2329995 . C T 180.78 PASS AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.106052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.7486;QD=32.8686;RBI=0.113479;REFB=-0.0887991;REVB=0.0403775;RO=0;SAF=15;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.516114;TYPE=snp;VARB=0.0091245;OID=.;OPOS=2329995;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:22:22:0:1:21:21:6:15:0:0:6:15:1:0 chr11 2330563 . C T 568.82 PASS AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0684807;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.4366;QD=36.1153;RBI=0.0701368;REFB=-0.0531372;REVB=-0.0151512;RO=1;SAF=16;SAR=46;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0285886;STB=0.515147;TYPE=snp;VARB=0.00107213;OID=.;OPOS=2330563;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:63:63:1:1:62:62:46:16:1:0:46:16:1:0 chr11 2343016 . C T 844.53 PASS AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0203854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.998;QD=38.3875;RBI=0.0203863;REFB=0;REVB=0.000192866;RO=0;SAF=22;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.59293e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.52957e-05;OID=.;OPOS=2343016;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:88:88:0:0:88:88:66:22:0:0:66:22:0:0 chr11 2424683 . CA C,CC 108.94 PASS AO=6,5;DP=13;FAO=1,11;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=0,4;FSAR=1,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142564,0.00726102;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=211.967,223.54;QD=36.313;RBI=0.131526,0.144735;REFB=0,0;REVB=0.130751,0.144553;RO=0;SAF=0,4;SAR=6,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0121521,0.00345828;OID=.,.;OPOS=2424684,2424684;OREF=A,A;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:6,5:11:1,11:12:0:0,4:1,7:0:0:4:0:0,4:6,1:0:0 chr11 2427291 . A C 300.24 PASS AO=29;DP=30;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.155289;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.0118;QD=36.3924;RBI=0.156051;REFB=0;REVB=0.0154028;RO=0;SAF=0;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00394044;OID=.;OPOS=2427291;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:30:33:0:0:29:33:29:0:0:0:32:1:0:0 chr11 2432666 . C T 47.61 PASS AO=8;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0697135;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.7729;QD=11.2033;RBI=0.101555;REFB=-0.022697;REVB=-0.0738476;RO=7;SAF=3;SAR=5;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211985;STB=0.594396;TYPE=snp;VARB=0.0416378;OID=.;OPOS=2432666;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:17:17:7:8:8:9:5:3:1:6:5:4:2:6 chr11 2432964 . T C 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00777368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.7542;QD=33.022;RBI=0.0599734;REFB=0;REVB=-0.0594674;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0044901;OID=.;OPOS=2432964;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:4:2:0:0:4:2:0:0 chr11 2436056 . C T 10.47 PASS AO=2;DP=6;FAO=2;FDP=6;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.137;QD=6.97936;RBI=0.0316802;REFB=-0.0211314;REVB=0.0316802;RO=4;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0318404;OID=.;OPOS=2436056;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:4:4:2:2:2:0:0:4:2:0:0:4 chr11 2438963 . C A 189.4 PASS AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0331407;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.0337;QD=32.9398;RBI=0.0585139;REFB=-0.0410481;REVB=0.0482242;RO=1;SAF=2;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182729;STB=0.599895;TYPE=snp;VARB=0.00549585;OID=.;OPOS=2438963;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:23:23:1:1:22:22:20:2:1:0:20:2:1:0 chr11 2439542 . A G 144.63 PASS AO=9;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0683645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.642;QD=36.1582;RBI=0.0708979;REFB=0;REVB=0.0187829;RO=0;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00147587;OID=.;OPOS=2439542;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:13:16:0:0:9:16:4:5:0:0:8:8:0:0 chr11 2869188 . C T 180.88 PASS AO=27;DP=40;FAO=28;FDP=40;FR=.;FRO=12;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.0778952;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.293;QD=18.0884;RBI=0.0872146;REFB=-0.0536634;REVB=0.0392266;RO=12;SAF=10;SAR=17;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0224722;STB=0.518855;TYPE=snp;VARB=0.0277734;OID=.;OPOS=2869188;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:40:40:12:12:27:28:17:10:4:8:17:11:4:8 chr11 2920666 . C T 604.44 PASS AO=78;DP=91;FAO=79;FDP=91;FR=.;FRO=12;FSAF=47;FSAR=32;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.0429684;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.2295;QD=26.5688;RBI=0.0457506;REFB=-0.172831;REVB=-0.0157107;RO=13;SAF=46;SAR=32;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0286402;STB=0.509847;TYPE=snp;VARB=0.00894363;OID=.;OPOS=2920666;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:91:91:13:12:78:79:32:46:9:4:32:47:8:4 chr11 2924610 . G A 90.87 PASS AO=19;DP=37;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.00535054;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.3652;QD=9.82363;RBI=0.0323471;REFB=0.00173022;REVB=0.0319015;RO=18;SAF=13;SAR=6;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169787;STB=0.596225;TYPE=snp;VARB=-0.0014818;OID=.;OPOS=2924610;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:37:37:18:18:19:19:6:13:9:9:6:13:9:9 chr11 2929552 . A G 96.93 PASS AO=19;DP=37;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.0331351;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.916;QD=10.4787;RBI=0.0334061;REFB=-0.0271417;REVB=-0.00424583;RO=17;SAF=9;SAR=10;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0466785;STB=0.536549;TYPE=snp;VARB=0.0196598;OID=.;OPOS=2929552;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:37:37:17:17:19:20:10:9:9:8:11:9:9:8 chr11 2943671 . G C 103.88 PASS AO=28;DP=66;FAO=28;FDP=67;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=-0.0321537;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.699;QD=6.20162;RBI=0.0328147;REFB=-0.0330019;REVB=-0.00655355;RO=38;SAF=12;SAR=16;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177848;STB=0.607519;TYPE=snp;VARB=0.0482419;OID=.;OPOS=2943671;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:67:38:39:28:28:16:12:23:15:16:12:24:15 chr11 2975987 . A G 48.24 PASS AO=21;DP=75;FAO=21;FDP=75;FR=.;FRO=54;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=36;FWDB=0.0107625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.456;QD=2.57278;RBI=0.0214752;REFB=-0.0138858;REVB=-0.0185837;RO=52;SAF=6;SAR=15;SRF=17;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0580681;STB=0.540501;TYPE=snp;VARB=0.0269297;OID=.;OPOS=2975987;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:75:75:52:54:21:21:15:6:17:35:15:6:18:36 chr11 2999507 . G T 290.01 PASS AO=71;DP=154;FAO=72;FDP=152;FR=.;FRO=80;FSAF=37;FSAR=35;FSRF=21;FSRR=59;FWDB=-0.00337581;FXX=0.0129862;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.884;QD=7.63189;RBI=0.00573773;REFB=-0.00336666;REVB=0.00463955;RO=78;SAF=37;SAR=34;SRF=20;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249481;STB=0.631411;TYPE=snp;VARB=0.00531546;OID=.;OPOS=2999507;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:152:78:80:71:72:34:37:20:58:35:37:21:59 chr11 3000395 . C T 101.96 PASS AO=38;DP=111;FAO=38;FDP=114;FR=.;FRO=76;FSAF=28;FSAR=10;FSRF=45;FSRR=31;FWDB=-0.00664143;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.8423;QD=3.5775;RBI=0.00688304;REFB=-0.0108999;REVB=0.00180768;RO=71;SAF=28;SAR=10;SRF=40;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220439;STB=0.611226;TYPE=snp;VARB=0.0193387;OID=.;OPOS=3000395;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:114:71:76:38:38:10:28:40:31:10:28:45:31 chr11 3028140 . G A 103.12 PASS AO=20;DP=35;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.00545041;FXX=0.0270197;HRUN=3;LEN=1;MLLD=135.189;QD=11.4582;RBI=0.00591904;REFB=-0.0638331;REVB=0.00230826;RO=14;SAF=13;SAR=7;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0622494;STB=0.570104;TYPE=snp;VARB=0.0315587;OID=.;OPOS=3028140;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:35:36:14:16:20:20:7:13:8:6:7:13:8:8 chr11 3061780 . C T 272.47 PASS AO=59;DP=123;FAO=61;FDP=120;FR=.;FRO=59;FSAF=21;FSAR=40;FSRF=27;FSRR=32;FWDB=0.0143718;FXX=0.069762;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.3488;QD=9.08218;RBI=0.032833;REFB=-0.00323307;REVB=0.0295204;RO=43;SAF=19;SAR=40;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174802;STB=0.559421;TYPE=snp;VARB=0.00438619;OID=.;OPOS=3061780;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:120:43:59:59:61:40:19:23:20:40:21:27:32 chr11 3109403 . A G 16.21 PASS AO=3;DP=12;FAO=4;FDP=13;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=0;FSRF=9;FSRR=0;FWDB=-0.011218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.145;QD=4.9887;RBI=0.011218;REFB=0.00150641;REVB=0;RO=9;SAF=3;SAR=0;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00338977;OID=.;OPOS=3109403;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:12:13:9:9:3:4:0:3:9:0:0:4:9:0 chr11 3109408 . C T 17.4 PASS AO=4;DP=13;FAO=4;FDP=13;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=0;FSRF=9;FSRR=0;FWDB=0.028107;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.21;QD=5.35314;RBI=0.028107;REFB=-0.00798745;REVB=0;RO=9;SAF=4;SAR=0;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0424226;OID=.;OPOS=3109408;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:13:13:9:9:4:4:0:4:9:0:0:4:9:0 chr11 3244005 . TC T 489.51 PASS AO=59;DP=69;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.116838;FXX=0.0140825;HRUN=4;LEN=1;MLLD=19.3143;QD=27.9717;RBI=0.131658;REFB=0;REVB=-0.0606849;RO=2;SAF=23;SAR=36;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00714644;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00143035;OID=.;OPOS=3244006;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:59:68:70:70:0:26:44:0:0:44:2:23:36:1:1 chr11 3249552 . C T 101.96 PASS AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.043912;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.617;QD=37.0753;RBI=0.0823328;REFB=0;REVB=0.069645;RO=0;SAF=7;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00347744;OID=.;OPOS=3249552;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:11:11:4:7:0:0:4:7:0:0 chr11 3249984 . C T 424.62 PASS AO=45;DP=47;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00884526;FXX=0.0212721;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.718;QD=36.9237;RBI=0.0490093;REFB=0;REVB=0.0482045;RO=0;SAF=28;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000230607;OID=.;OPOS=3249984;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:47:46:0:0:45:46:17:28:0:0:18:28:0:0 chr11 3361087 . T C 41.93 PASS AO=14;DP=48;FAO=15;FDP=49;FR=.;FRO=34;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=-0.0449125;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.58;QD=3.42298;RBI=0.0471133;REFB=0.00256038;REVB=-0.0142312;RO=34;SAF=5;SAR=9;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.329861;STB=0.710258;TYPE=snp;VARB=-0.0139105;OID=.;OPOS=3361087;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:48:49:34:34:14:15:9:5:22:12:10:5:22:12 chr11 3380914 . C T 638.89 PASS AO=144;DP=276;FAO=144;FDP=277;FR=.;FRO=133;FSAF=84;FSAR=60;FSRF=64;FSRR=69;FWDB=-0.0217595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.963;QD=9.22584;RBI=0.0322421;REFB=-0.024011;REVB=-0.0237923;RO=131;SAF=85;SAR=59;SRF=62;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103247;STB=0.549597;TYPE=snp;VARB=0.0239052;OID=.;OPOS=3380914;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:276:277:131:133:144:144:59:85:62:69:60:84:64:69 chr11 3400294 . C T 128.82 PASS AO=22;DP=34;FAO=22;FDP=34;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.0524636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.0871;QD=15.1551;RBI=0.0533309;REFB=-0.0336815;REVB=0.00957899;RO=12;SAF=10;SAR=12;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133856;STB=0.573706;TYPE=snp;VARB=0.0285999;OID=.;OPOS=3400294;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:34:34:12:12:22:22:12:10:3:9:12:10:3:9 chr11 3661140 . T C 589.67 PASS AO=58;DP=58;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00330115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.413;QD=37.439;RBI=0.0121127;REFB=0;REVB=0.0116542;RO=0;SAF=32;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.09576e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000306233;OID=.;OPOS=3661140;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:58:63:0:0:58:63:26:32:0:0:30:33:0:0 chr11 3661585 . A ATGG,G 257.41 PASS AO=20,10;DP=33;FAO=22,10;FDP=35;FR=.;FRO=3;FSAF=17,0;FSAR=5,10;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.00138083,0.0361749;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=3,1;MLLD=118.405,131.574;QD=29.4186;RBI=0.0414657,0.0414256;REFB=-0.0240183,0.0472215;REVB=-0.0414427,-0.0201857;RO=3;SAF=17,0;SAR=3,10;SRF=2;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0803087,-0.817835;STB=0.51775,0.998294;TYPE=ins,snp;VARB=0.00470446,0.0358405;OID=.,.;OPOS=3661586,3661585;OREF=-,A;OALT=TGG,G;OMAPALT=ATGG,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:30:33:35:3:3:20,10:22,10:3,10:17,0:2:1:5,10:17,0:2:1 chr11 3663021 . G A 167.51 PASS AO=36;DP=70;FAO=36;FDP=70;FR=.;FRO=34;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.0318003;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.123;QD=9.572;RBI=0.0322574;REFB=-0.00625878;REVB=-0.00541098;RO=34;SAF=20;SAR=16;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100032;STB=0.555525;TYPE=snp;VARB=0.00518294;OID=.;OPOS=3663021;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:34:34:36:36:16:20:15:19:16:20:15:19 chr11 3681115 . A G 39.55 PASS AO=7;DP=18;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.00544545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.395;QD=7.53251;RBI=0.0235751;REFB=-0.000671953;REVB=-0.0229376;RO=11;SAF=2;SAR=5;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0160434;STB=0.522337;TYPE=snp;VARB=0.00168426;OID=.;OPOS=3681115;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:18:21:11:12:7:9:5:2:3:8:7:2:3:9 chr11 3681519 . T C 80.12 PASS AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=13;FWDB=-0.0131974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.269;QD=10.3386;RBI=0.0372785;REFB=-0.0129997;REVB=-0.0348642;RO=15;SAF=6;SAR=10;SRF=2;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237709;STB=0.632882;TYPE=snp;VARB=0.00856902;OID=.;OPOS=3681519;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:31:31:15:15:16:16:10:6:2:13:10:6:2:13 chr11 3688659 . C T 37.17 PASS AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.6349;QD=10.6212;RBI=0.00645185;REFB=-0.0463603;REVB=-0.00645185;RO=6;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0547865;OID=.;OPOS=3688659;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:13:14:6:7:7:7:7:0:0:6:7:0:0:7 chr11 3714489 . C T 343.41 PASS AO=86;DP=183;FAO=86;FDP=183;FR=.;FRO=97;FSAF=67;FSAR=19;FSRF=67;FSRR=30;FWDB=0.00274403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.849;QD=7.50624;RBI=0.0381412;REFB=-0.0191026;REVB=-0.0380423;RO=95;SAF=67;SAR=19;SRF=66;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107975;STB=0.563203;TYPE=snp;VARB=0.0261635;OID=.;OPOS=3714489;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:183:95:97:86:86:19:67:66:29:19:67:67:30 chr11 3723781 . G C 275.81 PASS AO=48;DP=74;FAO=48;FDP=74;FR=.;FRO=26;FSAF=41;FSAR=7;FSRF=24;FSRR=2;FWDB=0.025557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.7736;QD=14.9084;RBI=0.0367488;REFB=-0.00468367;REVB=0.0264066;RO=26;SAF=41;SAR=7;SRF=24;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0966361;STB=0.552164;TYPE=snp;VARB=0.00267859;OID=.;OPOS=3723781;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:74:74:26:26:48:48:7:41:24:2:7:41:24:2 chr11 3733899 . C T 292.39 PASS AO=70;DP=147;FAO=71;FDP=148;FR=.;FRO=77;FSAF=38;FSAR=33;FSRF=38;FSRR=39;FWDB=-0.0166096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.378;QD=7.90241;RBI=0.0316469;REFB=-0.00582962;REVB=0.0269378;RO=77;SAF=38;SAR=32;SRF=38;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0468271;STB=0.521733;TYPE=snp;VARB=0.00628761;OID=.;OPOS=3733899;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:148:77:77:70:71:32:38:38:39:33:38:38:39 chr11 3752727 . T G 741.95 PASS AO=212;DP=451;FAO=189;FDP=400;FR=.;FRO=211;FSAF=83;FSAR=106;FSRF=89;FSRR=122;FWDB=0.00956947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.659;QD=7.41953;RBI=0.0117842;REFB=-0.0108293;REVB=-0.00687689;RO=238;SAF=93;SAR=119;SRF=101;SRR=137;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0139948;STB=0.509311;TYPE=snp;VARB=0.0113896;OID=.;OPOS=3752727;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:451:400:238:211:212:189:119:93:101:137:106:83:89:122 chr11 3829560 . TG T 102.58 PASS AO=30;DP=58;FAO=30;FDP=56;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=1;FWDB=-0.0363142;FXX=0.0344768;HRUN=2;LEN=1;MLLD=18.3427;QD=7.32695;RBI=0.131329;REFB=-0.0500057;REVB=0.126208;RO=26;SAF=14;SAR=16;SRF=25;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0.238749;SSSB=-0.410103;STB=0.723775;TYPE=del;VARB=0.0428886;OID=.;OPOS=3829561;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:30:58:30:56:26:14:16:25:1:57:26:14:16:25:1 chr11 3838899 . A T 69.02 PASS AO=14;DP=27;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.00031179;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.6589;QD=7.8877;RBI=0.0133994;REFB=-0.0117883;REVB=0.0133958;RO=12;SAF=2;SAR=12;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.390503;STB=0.707552;TYPE=snp;VARB=0.0223998;OID=.;OPOS=3838899;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:27:35:12:19:14:16:12:2:6:6:14:2:7:12 chr11 3838953 . T C 84.87 PASS AO=13;DP=20;FAO=15;FDP=23;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.0289465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.11;QD=14.7608;RBI=0.0368645;REFB=-0.0130415;REVB=0.0228274;RO=6;SAF=4;SAR=9;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0167666;STB=0.546035;TYPE=snp;VARB=0.00385481;OID=.;OPOS=3838953;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:20:23:6:8:13:15:9:4:2:4:11:4:3:5 chr11 3839127 . T A 16.08 PASS AO=3;DP=6;FAO=3;FDP=6;FR=.;FRO=3;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.964;QD=10.7228;RBI=0.00164829;REFB=0.0353932;REVB=-0.00164829;RO=3;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000708858;OID=.;OPOS=3839127;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:6:6:3:3:3:3:3:0:0:3:3:0:0:3 chr11 4103524 . A G 1224.91 PASS AO=134;DP=139;FAO=135;FDP=140;FR=.;FRO=5;FSAF=64;FSAR=71;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.00221393;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.8848;QD=34.9973;RBI=0.00673725;REFB=-0.0931675;REVB=0.0063631;RO=3;SAF=63;SAR=71;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0220936;STB=0.511656;TYPE=snp;VARB=0.00468994;OID=.;OPOS=4103524;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:139:140:3:5:134:135:71:63:3:0:71:64:4:1 chr11 4141132 . C A 1048.38 PASS AO=108;DP=108;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00726876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.679;QD=38.4727;RBI=0.0442893;REFB=0;REVB=0.0436888;RO=0;SAF=81;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000278755;OID=.;OPOS=4141132;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:108:109:0:0:108:109:27:81:0:0:28:81:0:0 chr11 4159457 . A G 839.52 PASS AO=90;DP=91;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00913808;FXX=0.0109878;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.3122;QD=37.312;RBI=0.0226486;REFB=-0.0551057;REVB=0.0207233;RO=1;SAF=64;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00734938;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000206055;OID=.;OPOS=4159457;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:91:90:1:0:90:90:26:64:1:0:26:64:0:0 chr11 4159466 . G A 819.95 PASS AO=88;DP=89;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000350155;FXX=0.0434735;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.279;QD=37.2703;RBI=0.0248977;REFB=0.0102067;REVB=0.0248952;RO=1;SAF=62;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00758305;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.41178e-05;OID=.;OPOS=4159466;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:89:88:1:0:88:88:26:62:1:0:26:62:0:0 chr11 4388905 . C T 146.18 PASS AO=27;DP=45;FAO=27;FDP=45;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.0136554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.892;QD=12.9939;RBI=0.0210131;REFB=-0.0169465;REVB=-0.0159713;RO=18;SAF=10;SAR=17;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137803;STB=0.576214;TYPE=snp;VARB=0.00708477;OID=.;OPOS=4388905;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:45:45:18:18:27:27:17:10:10:8:17:10:10:8 chr11 4389404 . AG A 131.41 PASS AO=63;DP=168;FAO=68;FDP=160;FR=.;FRO=92;FSAF=4;FSAR=64;FSRF=24;FSRR=68;FWDB=-0.0523226;FXX=0.0123449;HRUN=3;LEN=1;MLLD=18.4528;QD=3.28529;RBI=0.0957579;REFB=0.0241638;REVB=0.0801992;RO=88;SAF=4;SAR=59;SRF=24;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.465052;STB=0.772305;TYPE=del;VARB=-0.0230921;OID=.;OPOS=4389405;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:63:160:68:160:92:4:64:24:68:99:88:4:59:24:64 chr11 4389587 . G C 83.75 PASS AO=23;DP=56;FAO=23;FDP=57;FR=.;FRO=34;FSAF=2;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=0.0111415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.835;QD=5.87744;RBI=0.0225792;REFB=0.000667684;REVB=-0.0196389;RO=33;SAF=2;SAR=21;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.495227;STB=0.803493;TYPE=snp;VARB=-0.00102773;OID=.;OPOS=4389587;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:56:57:33:34:23:23:21:2:13:20:21:2:14:20 chr11 4510284 . CAG CG,CA 1563.28 PASS AO=75,60;DP=215;FAO=105,101;FDP=206;FR=.;FRO=0;FSAF=75,77;FSAR=30,24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0251585,0.279684;FXX=0.0190467;HRUN=1,2;LEN=1,1;MLLD=107.553,16.6958;QD=30.3549;RBI=0.0274208,0.602039;REFB=0,0;REVB=0.0109065,0.53313;RO=34;SAF=52,60;SAR=23,0;SRF=12;SRR=22;SSEN=0,0;SSEP=0,0.547945;SSSB=0.210845,0.885119;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=-0.0136769,0.123477;OID=.,.;OPOS=4510285,4510286;OREF=A,G;OALT=-,-;OMAPALT=CG,CA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:75,60:208:105,101:206:0:75,77:30,24:0:0:99:34:52,60:23,0:12:22 chr11 4510587 . C T 79.84 PASS AO=23;DP=59;FAO=23;FDP=60;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.00754447;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=140.802;QD=5.32271;RBI=0.0165282;REFB=-0.0351198;REVB=-0.0147058;RO=34;SAF=11;SAR=12;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00799572;STB=0.511618;TYPE=snp;VARB=0.0482682;OID=.;OPOS=4510587;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:59:60:34:37:23:23:12:11:16:18:12:11:17:20 chr11 4566711 . C T 2236.96 PASS AO=232;DP=233;FAO=234;FDP=234;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=143;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0236702;FXX=0.0126577;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.259;QD=38.2387;RBI=0.025952;REFB=0;REVB=0.0106409;RO=0;SAF=91;SAR=141;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.30404e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.58832e-05;OID=.;OPOS=4566711;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:233:234:0:0:232:234:141:91:0:0:143:91:0:0 chr11 4567335 . C G 542.49 PASS AO=54;DP=55;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.054224;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.3776;QD=38.0695;RBI=0.0795657;REFB=0;REVB=0.0582276;RO=1;SAF=32;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145012;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00163564;OID=.;OPOS=4567335;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:55:57:1:0:54:57:22:32:1:0:23:34:0:0 chr11 4592708 . C CAG 410.82 PASS AO=121;DP=305;FAO=123;FDP=299;FR=.;FRO=176;FSAF=78;FSAR=45;FSRF=73;FSRR=103;FWDB=-0.00406889;FXX=0.0196715;HRUN=1;LEN=2;MLLD=257.288;QD=5.49586;RBI=0.00491299;REFB=0.011983;REVB=-0.00275346;RO=176;SAF=78;SAR=43;SRF=73;SRR=103;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.244663;STB=0.629457;TYPE=ins;VARB=-0.0130836;OID=.;OPOS=4592709;OREF=-;OALT=AG;OMAPALT=CAG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:121:305:123:299:176:78:45:73:103:99:176:78:43:73:103 chr11 4608262 . A C 173.65 PASS AO=83;DP=312;FAO=91;FDP=320;FR=.;FRO=229;FSAF=37;FSAR=54;FSRF=91;FSRR=138;FWDB=-0.0341575;FXX=0.00621099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.919;QD=2.17063;RBI=0.0342731;REFB=-0.000252803;REVB=-0.00281294;RO=229;SAF=34;SAR=49;SRF=91;SRR=138;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0158169;STB=0.506848;TYPE=snp;VARB=0.000655654;OID=.;OPOS=4608262;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:312:320:229:229:83:91:49:34:91:138:54:37:91:138 chr11 4615234 . A G 156.81 PASS AO=39;DP=86;FAO=39;FDP=85;FR=.;FRO=46;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=30;FSRR=16;FWDB=-0.0208879;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.508;QD=7.37939;RBI=0.0610546;REFB=-0.0372965;REVB=-0.0573704;RO=46;SAF=24;SAR=15;SRF=30;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0379735;STB=0.521225;TYPE=snp;VARB=0.0341682;OID=.;OPOS=4615234;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:85:46:46:39:39:15:24:30:16:15:24:30:16 chr11 4615390 . C T 1051.94 PASS AO=114;DP=116;FAO=114;FDP=116;FR=.;FRO=2;FSAF=55;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0495945;FXX=0.0169477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.8229;QD=36.2739;RBI=0.051642;REFB=-0.123821;REVB=0.0143972;RO=0;SAF=55;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508332;TYPE=snp;VARB=0.0015879;OID=.;OPOS=4615390;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:116:116:0:2:114:114:59:55:0:0:59:55:0:2 chr11 4615508 . C G 62.8 PASS AO=40;DP=162;FAO=39;FDP=161;FR=.;FRO=122;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=52;FSRR=70;FWDB=0.0118861;FXX=0.00617246;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0635;QD=1.56029;RBI=0.0512395;REFB=-0.0174013;REVB=-0.0498419;RO=121;SAF=21;SAR=19;SRF=51;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128971;STB=0.584398;TYPE=snp;VARB=0.0524794;OID=.;OPOS=4615508;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:162:161:121:122:40:39:19:21:51:70:18:21:52:70 chr11 4661285 . A G 162.17 PASS AO=45;DP=107;FAO=45;FDP=107;FR=.;FRO=62;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=15;FSRR=47;FWDB=0.00515832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.615;QD=6.06234;RBI=0.0238552;REFB=-0.0232874;REVB=-0.0232908;RO=61;SAF=16;SAR=29;SRF=14;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148611;STB=0.57491;TYPE=snp;VARB=0.0268774;OID=.;OPOS=4661285;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:61:62:45:45:29:16:14:47:29:16:15:47 chr11 4674575 . G A 384.09 PASS AO=80;DP=145;FAO=80;FDP=145;FR=.;FRO=65;FSAF=29;FSAR=51;FSRF=29;FSRR=36;FWDB=0.0142296;FXX=0.00684885;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.0581;QD=10.5955;RBI=0.0311319;REFB=-0.0175325;REVB=0.0276896;RO=65;SAF=29;SAR=51;SRF=29;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0725419;STB=0.539672;TYPE=snp;VARB=0.0148855;OID=.;OPOS=4674575;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:65:65:80:80:51:29:29:36:51:29:29:36 chr11 4675056 . G A 69.39 PASS AO=19;DP=48;FAO=19;FDP=48;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.0782558;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.8261;QD=5.78227;RBI=0.0796945;REFB=-0.0143889;REVB=0.0150746;RO=29;SAF=13;SAR=6;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253422;STB=0.6469;TYPE=snp;VARB=0.0265497;OID=.;OPOS=4675056;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:48:48:29:29:19:19:6:13:13:16:6:13:13:16 chr11 4675158 . G A 106.8 PASS AO=13;DP=14;FAO=13;FDP=14;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00133201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.537;QD=30.5131;RBI=0.0494565;REFB=0.0132648;REVB=-0.0494385;RO=1;SAF=10;SAR=3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128507;STB=0.571311;TYPE=snp;VARB=-0.00317975;OID=.;OPOS=4675158;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:14:14:1:1:13:13:3:10:0:1:3:10:0:1 chr11 4675784 . A T 257.3 PASS AO=62;DP=132;FAO=63;FDP=131;FR=.;FRO=68;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=33;FSRR=35;FWDB=-0.0125112;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.025;QD=7.85652;RBI=0.0166423;REFB=-0.0133246;REVB=0.0109743;RO=66;SAF=33;SAR=29;SRF=30;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0723317;STB=0.519994;TYPE=snp;VARB=0.0155967;OID=.;OPOS=4675784;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:131:66:68:62:63:29:33:30:36:30:33:33:35 chr11 4675846 . C G 130.17 PASS AO=44;DP=124;FAO=44;FDP=123;FR=.;FRO=79;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=40;FSRR=39;FWDB=-0.0318483;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2655;QD=4.23303;RBI=0.0343436;REFB=-0.0196016;REVB=-0.0128518;RO=77;SAF=21;SAR=23;SRF=38;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0180875;STB=0.518661;TYPE=snp;VARB=0.032308;OID=.;OPOS=4675846;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:123:77:79:44:44:23:21:38:39:23:21:40:39 chr11 4675959 . A G 121.51 PASS AO=37;DP=102;FAO=39;FDP=105;FR=.;FRO=66;FSAF=29;FSAR=10;FSRF=41;FSRR=25;FWDB=-0.0231572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.04;QD=4.6288;RBI=0.0259766;REFB=-0.0128574;REVB=-0.0117698;RO=65;SAF=27;SAR=10;SRF=41;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128998;STB=0.591787;TYPE=snp;VARB=0.0359755;OID=.;OPOS=4675959;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:105:65:66:37:39:10:27:41:24:10:29:41:25 chr11 4676062 . G C 220.7 PASS AO=45;DP=87;FAO=47;FDP=89;FR=.;FRO=42;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=0.00913911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.655;QD=9.91889;RBI=0.0108546;REFB=0.00462238;REVB=0.00585646;RO=42;SAF=23;SAR=22;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0527803;STB=0.538666;TYPE=snp;VARB=-0.00358734;OID=.;OPOS=4676062;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:89:42:42:45:47:22:23:24:18:24:23:24:18 chr11 4676398 . C G 326 PASS AO=82;DP=181;FAO=84;FDP=183;FR=.;FRO=99;FSAF=24;FSAR=60;FSRF=44;FSRR=55;FWDB=0.0156244;FXX=0.00543449;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.6187;QD=7.12558;RBI=0.0243205;REFB=-0.0226413;REVB=-0.0186378;RO=99;SAF=24;SAR=58;SRF=44;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165948;STB=0.596467;TYPE=snp;VARB=0.0386946;OID=.;OPOS=4676398;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:183:99:99:82:84:58:24:44:55:60:24:44:55 chr11 4676457 . G A 270.79 PASS AO=62;DP=117;FAO=66;FDP=133;FR=.;FRO=67;FSAF=17;FSAR=49;FSRF=22;FSRR=45;FWDB=-0.0874642;FXX=0.00746213;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.824;QD=8.14415;RBI=0.0878433;REFB=-0.0140752;REVB=-0.00815189;RO=54;SAF=13;SAR=49;SRF=9;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0572107;STB=0.544586;TYPE=snp;VARB=0.0120967;OID=.;OPOS=4676457;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:133:54:67:62:66:49:13:9:45:49:17:22:45 chr11 4703165 . C A 934.51 PASS AO=100;DP=101;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00526668;FXX=0.00990001;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.8197;QD=37.3804;RBI=0.0108069;REFB=-0.0622716;REVB=0.00943666;RO=1;SAF=94;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00502099;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00120945;OID=.;OPOS=4703165;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:101:100:1:0:100:100:6:94:1:0:6:94:0:0 chr11 4712079 . A G 398.84 PASS AO=97;DP=210;FAO=104;FDP=224;FR=.;FRO=120;FSAF=55;FSAR=49;FSRF=44;FSRR=76;FWDB=0.0403172;FXX=0.00444425;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.742;QD=7.12206;RBI=0.0404305;REFB=-0.00353816;REVB=0.00302367;RO=111;SAF=51;SAR=46;SRF=42;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141702;STB=0.586288;TYPE=snp;VARB=0.0043059;OID=.;OPOS=4712079;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:210:224:111:120:97:104:46:51:42:69:49:55:44:76 chr11 4730985 . C T 1999.21 PASS AO=202;DP=203;FAO=208;FDP=208;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0385896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.613;QD=38.4464;RBI=0.0693243;REFB=0;REVB=0.0575908;RO=1;SAF=85;SAR=117;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00557067;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000137884;OID=.;OPOS=4730985;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:94:203:208:1:0:202:208:117:85:1:0:118:90:0:0 chr11 4731180 . G A 1760.96 PASS AO=184;DP=185;FAO=184;FDP=184;FR=.;FRO=0;FSAF=134;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00706354;FXX=0.00540511;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.5467;QD=38.2817;RBI=0.0254992;REFB=0;REVB=-0.0245014;RO=0;SAF=134;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.97993e-05;OID=.;OPOS=4731180;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:185:184:0:0:184:184:50:134:0:0:50:134:0:0 chr11 4731468 . G A 1496.77 PASS AO=156;DP=156;FAO=156;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0281634;FXX=0.00636902;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.4516;QD=38.3786;RBI=0.0282373;REFB=0;REVB=0.00204103;RO=0;SAF=85;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.99165e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000207607;OID=.;OPOS=4731468;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:156:156:0:0:156:156:71:85:0:0:71:85:0:0 chr11 4731583 . C T 2226.35 PASS AO=237;DP=241;FAO=238;FDP=238;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=154;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.023828;FXX=0.0124476;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.1529;QD=37.4177;RBI=0.0597772;REFB=-0.082072;REVB=0.0548228;RO=2;SAF=84;SAR=153;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00618898;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000296502;OID=.;OPOS=4731583;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:241:238:2:0:237:238:153:84:0:2:154:84:0:0 chr11 4790268 . C A 546.86 PASS AO=110;DP=194;FAO=110;FDP=192;FR=.;FRO=82;FSAF=30;FSAR=80;FSRF=34;FSRR=48;FWDB=-0.000157744;FXX=0.0103087;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.3315;QD=11.3929;RBI=0.0142635;REFB=-0.0337796;REVB=0.0142627;RO=81;SAF=30;SAR=80;SRF=33;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123939;STB=0.571415;TYPE=snp;VARB=0.0169085;OID=.;OPOS=4790268;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:192:81:82:110:110:80:30:33:48:80:30:34:48 chr11 4790308 . A G 437.91 PASS AO=87;DP=151;FAO=87;FDP=151;FR=.;FRO=64;FSAF=34;FSAR=53;FSRF=25;FSRR=39;FWDB=-0.00682963;FXX=0.00657851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.574;QD=11.6003;RBI=0.00892856;REFB=0.0192508;REVB=0.00575113;RO=63;SAF=34;SAR=53;SRF=25;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00487619;STB=0.50008;TYPE=snp;VARB=-0.00710447;OID=.;OPOS=4790308;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:151:63:64:87:87:53:34:25:38:53:34:25:39 chr11 4790396 . G A 127.77 PASS AO=35;DP=88;FAO=36;FDP=88;FR=.;FRO=52;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=35;FWDB=0.0227434;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.821;QD=5.80757;RBI=0.0285941;REFB=-0.0153723;REVB=0.0173309;RO=52;SAF=14;SAR=21;SRF=17;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0818398;STB=0.539168;TYPE=snp;VARB=0.0293146;OID=.;OPOS=4790396;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:52:52:35:36:21:14:17:35:22:14:17:35 chr11 4790410 . A G 78.4 PASS AO=25;DP=70;FAO=25;FDP=70;FR=.;FRO=45;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=31;FWDB=0.044363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.491;QD=4.48027;RBI=0.0481227;REFB=-0.00274575;REVB=0.0186472;RO=45;SAF=8;SAR=17;SRF=14;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0113856;STB=0.506591;TYPE=snp;VARB=0.00442691;OID=.;OPOS=4790410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:70:70:45:45:25:25:17:8:14:31:17:8:14:31 chr11 4790482 . T C 73.52 PASS AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.014747;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.24;QD=7.94826;RBI=0.0416985;REFB=-0.0141466;REVB=-0.0390037;RO=20;SAF=7;SAR=10;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114925;STB=0.506571;TYPE=snp;VARB=0.0222697;OID=.;OPOS=4790482;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:37:37:20:20:17:17:10:7:8:12:10:7:8:12 chr11 4790575 . A G 31.85 PASS AO=11;DP=37;FAO=11;FDP=37;FR=.;FRO=26;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=0.028921;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.218;QD=3.44302;RBI=0.0294709;REFB=-0.0121129;REVB=-0.00566672;RO=26;SAF=4;SAR=7;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123187;STB=0.574458;TYPE=snp;VARB=0.0386688;OID=.;OPOS=4790575;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:37:37:26:26:11:11:7:4:7:19:7:4:7:19 chr11 4790671 . C T 79.66 PASS AO=28;DP=86;FAO=29;FDP=88;FR=.;FRO=59;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=36;FWDB=0.00963204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.8224;QD=3.62082;RBI=0.0879877;REFB=-0.0103093;REVB=-0.0874589;RO=56;SAF=9;SAR=19;SRF=23;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111171;STB=0.559398;TYPE=snp;VARB=0.0288809;OID=.;OPOS=4790671;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:86:88:56:59:28:29:19:9:23:33:20:9:23:36 chr11 4790758 . G A 210.48 PASS AO=53;DP=118;FAO=54;FDP=120;FR=.;FRO=66;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=30;FSRR=36;FWDB=-0.0395223;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=107.888;QD=7.01594;RBI=0.0487002;REFB=-0.00153315;REVB=0.0284552;RO=64;SAF=28;SAR=25;SRF=29;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0736252;STB=0.535129;TYPE=snp;VARB=0.00123792;OID=.;OPOS=4790758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:120:64:66:53:54:25:28:29:35:26:28:30:36 chr11 4790857 . A G 174.29 PASS AO=58;DP=157;FAO=58;FDP=157;FR=.;FRO=99;FSAF=31;FSAR=27;FSRF=59;FSRR=40;FWDB=0.00452681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.397;QD=4.44062;RBI=0.00797772;REFB=-0.0271972;REVB=0.00656902;RO=99;SAF=31;SAR=27;SRF=59;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0689731;STB=0.539148;TYPE=snp;VARB=0.0409222;OID=.;OPOS=4790857;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:157:99:99:58:58:27:31:59:40:27:31:59:40 chr11 4790873 . CG C 134.6 PASS AO=50;DP=151;FAO=50;FDP=148;FR=.;FRO=98;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=59;FSRR=39;FWDB=-0.00184038;FXX=0.00671096;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.952;QD=3.63792;RBI=0.0052303;REFB=-0.00150781;REVB=-0.00489582;RO=97;SAF=27;SAR=23;SRF=59;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.079564;STB=0.541605;TYPE=del;VARB=0.0031058;OID=.;OPOS=4790874;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:50:149:50:148:98:27:23:59:39:99:97:27:23:59:38 chr11 4790948 . C A 183.85 PASS AO=50;DP=121;FAO=51;FDP=120;FR=.;FRO=69;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=44;FSRR=25;FWDB=-0.0250066;FXX=0.00826378;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.442;QD=6.12827;RBI=0.0274899;REFB=-0.0199207;REVB=-0.0114176;RO=67;SAF=29;SAR=21;SRF=43;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0655765;STB=0.540907;TYPE=snp;VARB=0.0265722;OID=.;OPOS=4790948;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:120:67:69:50:51:21:29:43:24:22:29:44:25 chr11 4790951 . A G 170.09 PASS AO=50;DP=120;FAO=49;FDP=121;FR=.;FRO=72;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=45;FSRR=27;FWDB=-0.0384626;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7397;QD=5.6228;RBI=0.0582249;REFB=0.0262705;REVB=-0.0437123;RO=70;SAF=30;SAR=20;SRF=44;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.031098;STB=0.520568;TYPE=snp;VARB=-0.0345534;OID=.;OPOS=4790951;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:121:70:72:50:49:20:30:44:26:20:29:45:27 chr11 4824878 . A C 223.72 PASS AO=64;DP=157;FAO=65;FDP=158;FR=.;FRO=93;FSAF=30;FSAR=35;FSRF=56;FSRR=37;FWDB=0.0594122;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.123;QD=5.6637;RBI=0.0616226;REFB=-0.0122679;REVB=0.0163566;RO=93;SAF=29;SAR=35;SRF=56;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156078;STB=0.58218;TYPE=snp;VARB=0.0122807;OID=.;OPOS=4824878;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:158:93:93:64:65:35:29:56:37:35:30:56:37 chr11 4825010 . T A 66.15 PASS AO=21;DP=61;FAO=21;FDP=60;FR=.;FRO=39;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=-0.00313262;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.389;QD=4.41015;RBI=0.00363694;REFB=-0.0040589;REVB=0.0018477;RO=37;SAF=11;SAR=10;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0704646;STB=0.540374;TYPE=snp;VARB=0.00657705;OID=.;OPOS=4825010;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:61:60:37:39:21:21:10:11:17:20:10:11:18:21 chr11 4825225 . A G 65.31 PASS AO=22;DP=66;FAO=23;FDP=66;FR=.;FRO=43;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=28;FSRR=15;FWDB=0.00717503;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.174;QD=3.95806;RBI=0.00765642;REFB=-0.0322962;REVB=-0.00267204;RO=41;SAF=13;SAR=9;SRF=28;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10921;STB=0.529387;TYPE=snp;VARB=0.0391117;OID=.;OPOS=4825225;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:66:66:41:43:22:23:9:13:28:13:9:14:28:15 chr11 4825349 . A G 130.92 PASS AO=36;DP=86;FAO=36;FDP=86;FR=.;FRO=50;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=33;FSRR=17;FWDB=-0.0139269;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.69;QD=6.08938;RBI=0.0140224;REFB=-0.00811089;REVB=0.0016342;RO=50;SAF=18;SAR=18;SRF=33;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16515;STB=0.592973;TYPE=snp;VARB=0.00916187;OID=.;OPOS=4825349;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:50:50:36:36:18:18:33:17:18:18:33:17 chr11 4842866 . A G 223.11 PASS AO=60;DP=189;FAO=76;FDP=206;FR=.;FRO=130;FSAF=29;FSAR=47;FSRF=33;FSRR=97;FWDB=0.057948;FXX=0.00483068;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.3461;QD=4.33222;RBI=0.0590341;REFB=-0.0340624;REVB=0.0112713;RO=123;SAF=28;SAR=32;SRF=32;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249799;STB=0.588977;TYPE=snp;VARB=0.0468465;OID=.;OPOS=4842866;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:206:123:130:60:76:32:28:32:91:47:29:33:97 chr11 4869649 . G A 1260.76 PASS AO=130;DP=131;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0569433;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.1128;QD=37.9176;RBI=0.0655409;REFB=0;REVB=0.032451;RO=0;SAF=26;SAR=104;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000661488;OID=.;OPOS=4869649;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:131:133:0:0:130:133:104:26:0:0:106:27:0:0 chr11 4869658 . G T 292.03 PASS AO=67;DP=134;FAO=67;FDP=133;FR=.;FRO=66;FSAF=13;FSAR=54;FSRF=13;FSRR=53;FWDB=0.00361906;FXX=0.00746213;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.472;QD=8.78287;RBI=0.0208519;REFB=-0.0204136;REVB=-0.0205354;RO=66;SAF=13;SAR=54;SRF=13;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00421801;STB=0.502325;TYPE=snp;VARB=0.0204149;OID=.;OPOS=4869658;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:133:66:66:67:67:54:13:13:53:54:13:13:53 chr11 4869906 . A C 1217.19 PASS AO=127;DP=127;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0256192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.134;QD=38.3366;RBI=0.0256852;REFB=0;REVB=-0.00184117;RO=0;SAF=80;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.69226e-05;OID=.;OPOS=4869906;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:127:127:0:0:127:127:47:80:0:0:47:80:0:0 chr11 4870139 . G A 375.23 PASS AO=47;DP=53;FAO=47;FDP=53;FR=.;FRO=6;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=-0.00593687;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=36.4422;QD=28.3188;RBI=0.113229;REFB=-0.141851;REVB=0.113073;RO=3;SAF=20;SAR=27;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0494362;STB=0.549979;TYPE=snp;VARB=0.0174731;OID=.;OPOS=4870139;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:53:53:3:6:47:47:27:20:0:3:27:20:0:6 chr11 4870261 . G C 577.08 PASS AO=59;DP=59;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.227;QD=37.8415;RBI=0.0391612;REFB=0;REVB=0.0375139;RO=0;SAF=26;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.00382e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.00531e-05;OID=.;OPOS=4870261;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:59:61:0:0:59:61:33:26:0:0:35:26:0:0 chr11 4870284 . G C 161.6 PASS AO=35;DP=68;FAO=35;FDP=68;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=-0.00529023;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.4841;QD=9.50591;RBI=0.0252547;REFB=-0.00839217;REVB=0.0246944;RO=33;SAF=15;SAR=20;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00386223;STB=0.502145;TYPE=snp;VARB=0.00912339;OID=.;OPOS=4870284;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:33:33:35:35:20:15:14:19:20:15:14:19 chr11 4870298 . T G 132.22 PASS AO=20;DP=72;FAO=30;FDP=71;FR=.,HEALED;FRO=38;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=-0.024947;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.458;QD=7.44897;RBI=0.026389;REFB=-0.0240266;REVB=0.00860377;RO=39;SAF=13;SAR=7;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.26878;STB=0.522074;TYPE=snp;VARB=0.033109;OID=.;OPOS=4870298;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:72:71:39:38:20:30:7:13:16:23:17:13:15:23 chr11 4880892 . T C 1069.27 PASS AO=116;DP=119;FAO=116;FDP=119;FR=.;FRO=3;FSAF=54;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.00765632;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=276.802;QD=35.9419;RBI=0.0209101;REFB=-0.113597;REVB=0.0194579;RO=2;SAF=54;SAR=62;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0150715;STB=0.511809;TYPE=snp;VARB=0.000165426;OID=.;OPOS=4880892;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:119:119:2:3:116:116:62:54:0:2:62:54:0:3 chr11 4928866 . C T 1049.54 PASS AO=109;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00986824;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.32;QD=38.5154;RBI=0.0197873;REFB=0;REVB=0.0171509;RO=0;SAF=31;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.31043e-05;OID=.;OPOS=4928866;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:109:109:0:0:109:109:78:31:0:0:78:31:0:0 chr11 4944892 . G C 78.51 PASS AO=16;DP=37;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=0.00831545;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.8829;QD=8.05255;RBI=0.0811366;REFB=-0.0059581;REVB=0.0807093;RO=21;SAF=6;SAR=10;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.282106;STB=0.67777;TYPE=snp;VARB=0.0135998;OID=.;OPOS=4944892;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:37:39:21:21:16:18:10:6:14:7:12:6:14:7 chr11 4944986 . A G 242.06 PASS AO=59;DP=124;FAO=59;FDP=124;FR=.;FRO=65;FSAF=35;FSAR=24;FSRF=29;FSRR=36;FWDB=-0.0112956;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.323;QD=7.80844;RBI=0.0517933;REFB=-0.012362;REVB=-0.0505465;RO=63;SAF=35;SAR=24;SRF=28;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139487;STB=0.577531;TYPE=snp;VARB=0.0182947;OID=.;OPOS=4944986;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:63:65:59:59:24:35:28:35:24:35:29:36 chr11 4945196 . T G 161.22 PASS AO=40;DP=85;FAO=40;FDP=87;FR=.;FRO=47;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=0.00870488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.171;QD=7.41244;RBI=0.0139093;REFB=-0.00800402;REVB=-0.0108487;RO=45;SAF=22;SAR=18;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0790903;STB=0.555655;TYPE=snp;VARB=0.026971;OID=.;OPOS=4945196;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:87:45:47:40:40:18:22:21:24:18:22:21:26 chr11 4945199 . C T 183.75 PASS AO=40;DP=83;FAO=42;FDP=85;FR=.;FRO=43;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=18;FWDB=0.00467135;FXX=0.0229859;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.939;QD=8.64698;RBI=0.0244501;REFB=-0.0258724;REVB=-0.0239998;RO=43;SAF=19;SAR=21;SRF=25;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.098682;STB=0.565017;TYPE=snp;VARB=0.0309786;OID=.;OPOS=4945199;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:85:43:43:40:42:21:19:25:18:23:19:25:18 chr11 4964753 . A G 331.69 PASS AO=100;DP=246;FAO=100;FDP=246;FR=.;FRO=146;FSAF=52;FSAR=48;FSRF=51;FSRR=95;FWDB=-0.00131118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.127;QD=5.3934;RBI=0.0186093;REFB=-0.0164841;REVB=-0.0185631;RO=142;SAF=52;SAR=48;SRF=51;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168305;STB=0.600627;TYPE=snp;VARB=0.0338415;OID=.;OPOS=4964753;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:246:246:142:146:100:100:48:52:51:91:48:52:51:95 chr11 4965301 . G T 1164.14 PASS AO=122;DP=128;FAO=126;FDP=129;FR=.;FRO=3;FSAF=78;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0192521;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.8463;QD=36.0973;RBI=0.0249576;REFB=0.0757825;REVB=0.0158819;RO=5;SAF=75;SAR=47;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0168631;STB=0.515149;TYPE=snp;VARB=0.000198205;OID=.;OPOS=4965301;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:128:129:5:3:122:126:47:75:2:3:48:78:0:3 chr11 4967468 . G A 131.55 PASS AO=58;DP=191;FAO=58;FDP=191;FR=.;FRO=133;FSAF=43;FSAR=15;FSRF=52;FSRR=81;FWDB=-0.000621902;FXX=0.00520806;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.693;QD=2.75486;RBI=0.0101087;REFB=-0.00228574;REVB=-0.0100895;RO=133;SAF=43;SAR=15;SRF=52;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.418404;STB=0.743298;TYPE=snp;VARB=0.00861886;OID=.;OPOS=4967468;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:191:191:133:133:58:58:15:43:52:81:15:43:52:81 chr11 4967532 . G C 655.93 PASS AO=105;DP=164;FAO=115;FDP=174;FR=.;FRO=59;FSAF=46;FSAR=69;FSRF=41;FSRR=18;FWDB=-0.0314633;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=38.9403;QD=15.0788;RBI=0.106337;REFB=-0.012903;REVB=0.101575;RO=59;SAF=45;SAR=60;SRF=42;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187484;STB=0.599983;TYPE=snp;VARB=0.00570303;OID=.;OPOS=4967532;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:174:59:59:105:115:60:45:42:17:69:46:41:18 chr11 4968198 . C A 54.27 PASS AO=22;DP=70;FAO=21;FDP=69;FR=.;FRO=48;FSAF=17;FSAR=4;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=-0.0372151;FXX=0.0142837;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8505;QD=3.14601;RBI=0.0421571;REFB=0.00319225;REVB=-0.0198056;RO=46;SAF=18;SAR=4;SRF=26;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.351166;STB=0.706935;TYPE=snp;VARB=-0.0161133;OID=.;OPOS=4968198;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:70:69:46:48:22:21:4:18:26:20:4:17:27:21 chr11 4976086 . C T 392.16 PASS AO=108;DP=248;FAO=108;FDP=248;FR=.;FRO=140;FSAF=75;FSAR=33;FSRF=94;FSRR=46;FWDB=-0.00927578;FXX=0.00799968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.65;QD=6.32516;RBI=0.0106261;REFB=-0.0171341;REVB=0.00518396;RO=137;SAF=75;SAR=33;SRF=94;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00981592;STB=0.515125;TYPE=snp;VARB=0.0321292;OID=.;OPOS=4976086;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:248:248:137:140:108:108:33:75:94:43:33:75:94:46 chr11 4976241 . C G 52.3 PASS AO=40;DP=182;FAO=40;FDP=183;FR=.;FRO=143;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=79;FSRR=64;FWDB=0.024077;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.164;QD=1.14317;RBI=0.0528543;REFB=0.00460007;REVB=-0.0470518;RO=142;SAF=25;SAR=15;SRF=79;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0902695;STB=0.558669;TYPE=snp;VARB=-0.0274752;OID=.;OPOS=4976241;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:182:183:142:143:40:40:15:25:79:63:15:25:79:64 chr11 4976811 . C A 137.2 PASS AO=28;DP=51;FAO=28;FDP=52;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=-0.0769776;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.121;QD=10.554;RBI=0.109037;REFB=-0.0184682;REVB=-0.0772243;RO=23;SAF=15;SAR=13;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0598752;STB=0.541637;TYPE=snp;VARB=0.0173974;OID=.;OPOS=4976811;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:52:23:24:28:28:13:15:14:9:13:15:15:9 chr11 5020416 . A G 1514.78 PASS AO=134;DP=158;FAO=167;FDP=167;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=117;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.148646;FXX=0.00595203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.731;QD=36.282;RBI=0.149673;REFB=0;REVB=0.0175013;RO=0;SAF=17;SAR=117;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00306346;OID=.;OPOS=5020416;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:158:167:0:0:134:167:117:17:0:0:117:50:0:0 chr11 5079946 . C T 1222.75 PASS AO=127;DP=128;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0179147;FXX=0.00763301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.304;QD=37.6231;RBI=0.0204045;REFB=-0.0177058;REVB=0.00976766;RO=1;SAF=48;SAR=79;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00597757;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.77219e-05;OID=.;OPOS=5079946;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:128:130:1:0:127:130:79:48:0:1:80:50:0:0 chr11 5080844 . T C 296.8 PASS AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0540155;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.479;QD=37.0998;RBI=0.0553333;REFB=0;REVB=-0.0120045;RO=0;SAF=7;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000289301;OID=.;OPOS=5080844;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:32:32:0:0:32:32:25:7:0:0:25:7:0:0 chr11 5141902 . T C 679.01 PASS AO=73;DP=75;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=53;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00205097;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=216.38;QD=36.2141;RBI=0.0716201;REFB=0.132215;REVB=0.0715908;RO=1;SAF=52;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00901111;STB=0.504672;TYPE=snp;VARB=-0.000181222;OID=.;OPOS=5141902;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:75:75:1:1:73:74:21:52:1:0:21:53:1:0 chr11 5141980 . A G 927.09 PASS AO=101;DP=103;FAO=101;FDP=103;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=62;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.063553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.532;QD=36.0034;RBI=0.0656279;REFB=-0.0985825;REVB=0.0163719;RO=2;SAF=39;SAR=62;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.023704;STB=0.512497;TYPE=snp;VARB=0.000301151;OID=.;OPOS=5141980;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:103:103:2:2:101:101:62:39:2:0:62:39:2:0 chr11 5142270 . T G 1416.22 PASS AO=143;DP=143;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0150748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.155;QD=38.2763;RBI=0.0203903;REFB=0;REVB=-0.0137301;RO=0;SAF=62;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.19551e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.84893e-05;OID=.;OPOS=5142270;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:143:148:0:0:143:148:81:62:0:0:85:63:0:0 chr11 5172785 . GA G,GG 1149.19 PASS AO=55,62;DP=121;FAO=111,11;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=48,0;FSAR=63,11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.126395,-0.168779;FXX=0.00812942;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=162.977,155.664;QD=37.6783;RBI=0.127235,0.169072;REFB=0,0;REVB=0.0145983,0.00994462;RO=2;SAF=2,46;SAR=53,16;SRF=0;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0174603,0.0554194;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.00978707,0.00023629;OID=.,.;OPOS=5172786,5172786;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:55,62:119:111,11:122:0:48,0:63,11:0:0:3:2:2,46:53,16:0:2 chr11 5172795 . A AC 172.76 PASS AO=60;DP=131;FAO=73;FDP=134;FR=.;FRO=61;FSAF=21;FSAR=52;FSRF=24;FSRR=37;FWDB=-0.00808178;FXX=0.00740686;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.3423;QD=5.15715;RBI=0.0113619;REFB=-0.00115313;REVB=0.00798615;RO=64;SAF=16;SAR=44;SRF=30;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212876;STB=0.555936;TYPE=ins;VARB=0.00177914;OID=.;OPOS=5172796;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:60:131:73:134:61:21:52:24:37:99:64:16:44:30:34 chr11 5221645 . C A 110.88 PASS AO=27;DP=60;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=-0.0170971;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=198.531;QD=7.3919;RBI=0.0172266;REFB=-0.00401973;REVB=0.00210819;RO=33;SAF=12;SAR=15;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0501146;STB=0.528281;TYPE=snp;VARB=0.00485151;OID=.;OPOS=5221645;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:33:33:27:27:15:12:13:20:15:12:13:20 chr11 5221825 . G A 50.2 PASS AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.036271;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.075;QD=6.92387;RBI=0.0423612;REFB=0.00980233;REVB=0.0218835;RO=16;SAF=4;SAR=8;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0448575;STB=0.549915;TYPE=snp;VARB=-0.00829116;OID=.;OPOS=5221825;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:28:29:16:17:12:12:8:4:6:10:8:4:7:10 chr11 5248243 . A G 353.67 PASS AO=78;DP=150;FAO=78;FDP=150;FR=.;FRO=72;FSAF=12;FSAR=66;FSRF=19;FSRR=53;FWDB=0.0167097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.873;QD=9.43106;RBI=0.0256064;REFB=-0.00716821;REVB=-0.019403;RO=70;SAF=12;SAR=66;SRF=19;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168074;STB=0.588921;TYPE=snp;VARB=0.005595;OID=.;OPOS=5248243;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:150:70:72:78:78:66:12:19:51:66:12:19:53 chr11 5269555 . T G 321.55 PASS AO=61;DP=102;FAO=61;FDP=102;FR=.;FRO=41;FSAF=32;FSAR=29;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=0.019012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.1843;QD=12.6099;RBI=0.0198436;REFB=-0.0247911;REVB=0.00568445;RO=41;SAF=32;SAR=29;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0271726;STB=0.514796;TYPE=snp;VARB=0.0108245;OID=.;OPOS=5269555;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:41:41:61:61:29:32:20:21:29:32:20:21 chr11 5322737 . A G 139.07 PASS AO=36;DP=82;FAO=36;FDP=82;FR=.;FRO=46;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=0.000289878;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.783;QD=6.7837;RBI=0.0324148;REFB=0.00910828;REVB=-0.0324135;RO=46;SAF=12;SAR=24;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152619;STB=0.586158;TYPE=snp;VARB=-0.0105002;OID=.;OPOS=5322737;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:46:46:36:36:24:12:22:24:24:12:22:24 chr11 5323071 . C T 164.76 PASS AO=47;DP=113;FAO=47;FDP=114;FR=.;FRO=67;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=24;FSRR=43;FWDB=-0.030558;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.427;QD=5.78115;RBI=0.0320329;REFB=-0.0166299;REVB=-0.00960801;RO=66;SAF=19;SAR=28;SRF=24;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0441955;STB=0.528386;TYPE=snp;VARB=0.027596;OID=.;OPOS=5323071;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:114:66:67:47:47:28:19:24:42:28:19:24:43 chr11 5344592 . A C 247.33 PASS AO=54;DP=97;FAO=52;FDP=96;FR=.;FRO=44;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=-0.00928037;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.684;QD=10.3052;RBI=0.00956532;REFB=-0.0143338;REVB=-0.00231732;RO=42;SAF=25;SAR=29;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0276822;STB=0.513727;TYPE=snp;VARB=0.0140213;OID=.;OPOS=5344592;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:96:42:44:54:52:29:25:18:24:28:24:19:25 chr11 5344681 . G A 173.02 PASS AO=54;DP=142;FAO=54;FDP=141;FR=.;FRO=87;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=42;FSRR=45;FWDB=0.000261563;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.9569;QD=4.90837;RBI=0.000796782;REFB=0.00629087;REVB=0.000752626;RO=88;SAF=28;SAR=26;SRF=42;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0450357;STB=0.522051;TYPE=snp;VARB=-0.0156908;OID=.;OPOS=5344681;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:141:88:87:54:54:26:28:42:46:26:28:42:45 chr11 5344772 . T C 1301.05 PASS AO=134;DP=134;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00803048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.977;QD=38.2661;RBI=0.0158139;REFB=0;REVB=0.0136231;RO=0;SAF=53;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.90283e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.57464e-05;OID=.;OPOS=5344772;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:134:136:0:0:134:136:81:53:0:0:83:53:0:0 chr11 5344847 . A G 948.69 PASS AO=104;DP=105;FAO=103;FDP=105;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=64;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0387467;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.4196;QD=36.1406;RBI=0.0569237;REFB=0.0165144;REVB=-0.0417013;RO=1;SAF=40;SAR=64;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00735759;STB=0.502453;TYPE=snp;VARB=-0.000583851;OID=.;OPOS=5344847;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:105:105:1:2:104:103:64:40:0:1:64:39:1:1 chr11 5344902 . C G 568.89 PASS AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0045512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.0529;QD=36.1197;RBI=0.0132172;REFB=-0.0538088;REVB=0.0124089;RO=0;SAF=21;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.99858e-08;STB=0.506022;TYPE=snp;VARB=0.00074087;OID=.;OPOS=5344902;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:63:63:0:1:62:62:41:21:0:0:41:21:0:1 chr11 5345128 . G A 202.79 PASS AO=45;DP=94;FAO=48;FDP=97;FR=.;FRO=49;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=28;FSRR=21;FWDB=0.0241757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.888;QD=8.36247;RBI=0.0246206;REFB=-0.0140596;REVB=-0.00465911;RO=48;SAF=28;SAR=17;SRF=28;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0379664;STB=0.517157;TYPE=snp;VARB=0.0145833;OID=.;OPOS=5345128;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:97:48:49:45:48:17:28:28:20:19:29:28:21 chr11 5345170 . A G 731.81 PASS AO=81;DP=86;FAO=83;FDP=86;FR=.;FRO=3;FSAF=49;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0323293;FXX=0.0114929;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.775;QD=34.0376;RBI=0.0348431;REFB=-0.0883548;REVB=0.0129943;RO=4;SAF=47;SAR=34;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0073199;STB=0.509236;TYPE=snp;VARB=0.0021444;OID=.;OPOS=5345170;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:86:86:4:3:81:83:34:47:2:2:34:49:1:2 chr11 5345486 . G A 1403.75 PASS AO=132;DP=133;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.368;QD=37.9392;RBI=0.0269217;REFB=0;REVB=0.0227542;RO=0;SAF=68;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000861763;OID=.;OPOS=5345486;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:133:148:0:0:132:148:64:68:0:0:73:75:0:0 chr11 5364276 . G A 75.98 PASS AO=21;DP=53;FAO=21;FDP=53;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=0.0102126;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=224.792;QD=5.73399;RBI=0.010225;REFB=0.0126006;REVB=-0.000504089;RO=31;SAF=9;SAR=12;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189355;STB=0.616912;TYPE=snp;VARB=-0.0121552;OID=.;OPOS=5364276;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:53:53:31:32:21:21:12:9:19:12:12:9:20:12 chr11 5364450 . A G 57.53 PASS AO=15;DP=35;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=-0.0130679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.742;QD=6.57458;RBI=0.0204593;REFB=-0.0290274;REVB=0.015742;RO=20;SAF=6;SAR=9;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105827;STB=0.560897;TYPE=snp;VARB=0.0258879;OID=.;OPOS=5364450;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:35:35:20:20:15:15:9:6:6:14:9:6:6:14 chr11 5364503 . C A 23.57 PASS AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=12;FWDB=0.0671656;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.339;QD=5.23859;RBI=0.0695617;REFB=-0.00561553;REVB=0.0181001;RO=12;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.52656;STB=0.799461;TYPE=snp;VARB=0.0164289;OID=.;OPOS=5364503;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:18:18:12:12:6:6:4:2:0:12:4:2:0:12 chr11 5364742 . C T 37.72 PASS AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=-0.00461802;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.497;QD=8.38186;RBI=0.055457;REFB=-0.0114702;REVB=0.0552644;RO=10;SAF=5;SAR=3;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.380216;STB=0.72318;TYPE=snp;VARB=0.0159506;OID=.;OPOS=5364742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:18:18:10:10:8:8:3:5:2:8:3:5:2:8 chr11 5364776 . T TGTC 16.35 PASS AO=4;DP=15;FAO=4;FDP=14;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.0317542;FXX=0.0666222;HRUN=1;LEN=3;MLLD=203.441;QD=4.67261;RBI=0.0323677;REFB=-0.000807218;REVB=0.00627184;RO=10;SAF=2;SAR=2;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217427;STB=0.642201;TYPE=ins;VARB=0.00226162;OID=.;OPOS=5364777;OREF=-;OALT=GTC;OMAPALT=TGTC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:4:15:4:14:10:2:2:3:7:16:10:2:2:3:7 chr11 5372751 . A C 323.85 PASS AO=71;DP=135;FAO=71;FDP=135;FR=.;FRO=64;FSAF=43;FSAR=28;FSRF=34;FSRR=30;FWDB=-0.0135333;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.4551;QD=9.59542;RBI=0.0504627;REFB=-0.00133588;REVB=-0.0486141;RO=64;SAF=43;SAR=28;SRF=34;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0661454;STB=0.536334;TYPE=snp;VARB=0.000615731;OID=.;OPOS=5372751;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:64:64:71:71:28:43:34:30:28:43:34:30 chr11 5372856 . A G 529 PASS AO=104;DP=189;FAO=110;FDP=199;FR=.;FRO=89;FSAF=50;FSAR=60;FSRF=41;FSRR=48;FWDB=0.0185426;FXX=0.00499975;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.444;QD=10.6331;RBI=0.0398881;REFB=-0.0288344;REVB=0.0353162;RO=84;SAF=44;SAR=60;SRF=36;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00460973;STB=0.502762;TYPE=snp;VARB=0.0170661;OID=.;OPOS=5372856;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:199:84:89:104:110:60:44:36:48:60:50:41:48 chr11 5372863 . T A 307.83 PASS AO=84;DP=200;FAO=88;FDP=209;FR=.;FRO=121;FSAF=40;FSAR=48;FSRF=51;FSRR=70;FWDB=-0.00521267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.357;QD=5.89154;RBI=0.00611661;REFB=0.00610049;REVB=0.00320015;RO=116;SAF=36;SAR=48;SRF=46;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0341249;STB=0.519362;TYPE=snp;VARB=-0.00833837;OID=.;OPOS=5372863;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:200:209:116:121:84:88:48:36:46:70:48:40:51:70 chr11 5373006 . T C 292.53 PASS AO=88;DP=217;FAO=88;FDP=217;FR=.;FRO=129;FSAF=39;FSAR=49;FSRF=49;FSRR=80;FWDB=0.00570042;FXX=0.00458695;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.989;QD=5.39219;RBI=0.0101615;REFB=-0.00442132;REVB=-0.00841194;RO=129;SAF=39;SAR=49;SRF=49;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0687331;STB=0.538469;TYPE=snp;VARB=0.00640236;OID=.;OPOS=5373006;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:217:217:129:129:88:88:49:39:49:80:49:39:49:80 chr11 5373104 . A G 362.44 PASS AO=120;DP=319;FAO=121;FDP=320;FR=.;FRO=199;FSAF=61;FSAR=60;FSRF=109;FSRR=90;FWDB=-0.0444686;FXX=0.00621099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.826;QD=4.53047;RBI=0.0471112;REFB=-0.0123668;REVB=-0.0155569;RO=198;SAF=60;SAR=60;SRF=108;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0502299;STB=0.527127;TYPE=snp;VARB=0.0191104;OID=.;OPOS=5373104;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:319:320:198:199:120:121:60:60:108:90:60:61:109:90 chr11 5373111 . G A 349.83 PASS AO=119;DP=325;FAO=120;FDP=323;FR=.;FRO=203;FSAF=60;FSAR=60;FSRF=110;FSRR=93;FWDB=0.013804;FXX=0.00920217;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.2313;QD=4.33229;RBI=0.0452737;REFB=-0.0198724;REVB=0.043118;RO=202;SAF=59;SAR=60;SRF=110;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0543226;STB=0.526311;TYPE=snp;VARB=0.033814;OID=.;OPOS=5373111;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:325:323:202:203:119:120:60:59:110:92:60:60:110:93 chr11 5373114 . G A 3034.07 PASS AO=297;DP=307;FAO=319;FDP=319;FR=.;FRO=0;FSAF=169;FSAR=150;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199679;FXX=0.0123835;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.696;QD=38.0448;RBI=0.0277205;REFB=-0.00978975;REVB=0.0192278;RO=1;SAF=153;SAR=144;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00330052;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.73052e-07;OID=.;OPOS=5373114;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:307:319:1:0:297:319:144:153:0:1:150:169:0:0 chr11 5373129 . C T 416 PASS AO=140;DP=372;FAO=141;FDP=376;FR=.;FRO=235;FSAF=64;FSAR=77;FSRF=127;FSRR=108;FWDB=0.00930034;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.916;QD=4.42552;RBI=0.019912;REFB=-0.00350731;REVB=-0.0176065;RO=232;SAF=63;SAR=77;SRF=126;SRR=106;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10293;STB=0.553991;TYPE=snp;VARB=0.00597852;OID=.;OPOS=5373129;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:372:376:232:235:140:141:77:63:126:106:77:64:127:108 chr11 5373170 . C G 512.06 PASS AO=150;DP=391;FAO=160;FDP=396;FR=.;FRO=236;FSAF=76;FSAR=84;FSRF=128;FSRR=108;FWDB=0.00769644;FXX=0.00999975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.677;QD=5.17236;RBI=0.0077868;REFB=0.00186855;REVB=0.00118284;RO=225;SAF=68;SAR=82;SRF=128;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123467;STB=0.540086;TYPE=snp;VARB=-0.00275502;OID=.;OPOS=5373170;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:391:396:225:236:150:160:82:68:128:97:84:76:128:108 chr11 5373242 . T G 337.7 PASS AO=116;DP=322;FAO=117;FDP=318;FR=.;FRO=201;FSAF=57;FSAR=60;FSRF=101;FSRR=100;FWDB=0.0142195;FXX=0.0334336;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.7109;QD=4.24785;RBI=0.0155192;REFB=-0.0262036;REVB=-0.00621682;RO=190;SAF=56;SAR=60;SRF=99;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0421802;STB=0.509676;TYPE=snp;VARB=0.0269496;OID=.;OPOS=5373242;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:322:318:190:201:116:117:60:56:99:91:60:57:101:100 chr11 5373251 . C T 418.55 PASS AO=121;DP=285;FAO=128;FDP=319;FR=.;FRO=191;FSAF=63;FSAR=65;FSRF=92;FSRR=99;FWDB=0.0139546;FXX=0.0031249;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.2949;QD=5.24827;RBI=0.0235334;REFB=-0.0583855;REVB=-0.0189496;RO=163;SAF=56;SAR=65;SRF=66;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0603817;STB=0.506296;TYPE=snp;VARB=0.0405798;OID=.;OPOS=5373251;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:285:319:163:191:121:128:65:56:66:97:65:63:92:99 chr11 5373311 . T C 328.78 PASS AO=91;DP=225;FAO=96;FDP=229;FR=.;FRO=133;FSAF=39;FSAR=57;FSRF=66;FSRR=67;FWDB=0.0397111;FXX=0.00434764;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.8699;QD=5.74285;RBI=0.044104;REFB=0.00331342;REVB=-0.0191884;RO=134;SAF=35;SAR=56;SRF=68;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132896;STB=0.55308;TYPE=snp;VARB=-0.00487366;OID=.;OPOS=5373311;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:225:229:134:133:91:96:56:35:68:66:57:39:66:67 chr11 5373334 . A G 284.13 PASS AO=79;DP=198;FAO=84;FDP=204;FR=.;FRO=120;FSAF=35;FSAR=49;FSRF=54;FSRR=66;FWDB=-0.0143082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.344;QD=5.57108;RBI=0.0147844;REFB=-0.0141666;REVB=0.00372181;RO=115;SAF=34;SAR=45;SRF=49;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00462944;STB=0.520029;TYPE=snp;VARB=0.016508;OID=.;OPOS=5373334;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:204:115:120:79:84:45:34:49:66:49:35:54:66 chr11 5373562 . C A 171.35 PASS AO=42;DP=96;FAO=44;FDP=99;FR=.;FRO=55;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=22;FSRR=33;FWDB=0.0184998;FXX=0.0198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.351;QD=6.92308;RBI=0.0234442;REFB=-0.0169323;REVB=0.014401;RO=52;SAF=17;SAR=25;SRF=22;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0186741;STB=0.507956;TYPE=snp;VARB=0.0225853;OID=.;OPOS=5373562;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:99:52:55:42:44:25:17:22:30:27:17:22:33 chr11 5373646 . T C 234.56 PASS AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0420077;FXX=0.0384468;HRUN=3;LEN=1;MLLD=207.672;QD=37.5298;RBI=0.0445398;REFB=0;REVB=-0.0148038;RO=0;SAF=6;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000132619;OID=.;OPOS=5373646;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:26:25:0:0:25:25:19:6:0:0:19:6:0:0 chr11 5410934 . T G 999.85 PASS AO=112;DP=122;FAO=120;FDP=122;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=100;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.132818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.1015;QD=32.782;RBI=0.133667;REFB=-0.105712;REVB=0.0150374;RO=4;SAF=17;SAR=95;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0994933;STB=0.509707;TYPE=snp;VARB=0.00378495;OID=.;OPOS=5410934;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:122:122:4:2:112:120:95:17:4:0:100:20:1:1 chr11 5411031 . C T 506.66 PASS AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0631548;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.6366;QD=36.1899;RBI=0.0634108;REFB=0.018979;REVB=-0.00569206;RO=1;SAF=18;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125721;STB=0.506664;TYPE=snp;VARB=-0.00132796;OID=.;OPOS=5411031;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:56:56:1:1:55:55:37:18:0:1:37:18:0:1 chr11 5411239 . T C 862.63 PASS AO=91;DP=91;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0241607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.179;QD=37.5057;RBI=0.0241808;REFB=0;REVB=-0.000986559;RO=0;SAF=38;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000148496;OID=.;OPOS=5411239;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:91:92:0:0:91:92:53:38:0:0:54:38:0:0 chr11 5411395 . C A 1444.26 PASS AO=149;DP=151;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199667;FXX=0.00653552;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.661;QD=38.007;RBI=0.0670723;REFB=0;REVB=0.0640315;RO=1;SAF=98;SAR=51;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00923417;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000157658;OID=.;OPOS=5411395;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:151:152:1:0:149:152:51:98:0:1:54:98:0:0 chr11 5411398 . T G 1466.79 PASS AO=153;DP=154;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00453601;FXX=0.00640985;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.4728;QD=37.8526;RBI=0.0354037;REFB=-0.049286;REVB=0.035112;RO=1;SAF=101;SAR=52;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0090596;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00012087;OID=.;OPOS=5411398;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:154:155:1:0:153:155:52:101:0:1:54:101:0:0 chr11 5411579 . G A 1644.48 PASS AO=172;DP=174;FAO=173;FDP=173;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.110823;FXX=0.0170445;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.698;QD=38.0226;RBI=0.112463;REFB=0;REVB=0.0191379;RO=1;SAF=80;SAR=92;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00591262;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000146446;OID=.;OPOS=5411579;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:174:173:1:0:172:173:92:80:1:0:92:81:0:0 chr11 5411580 . T C 1653.37 PASS AO=173;DP=174;FAO=173;FDP=173;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00863758;FXX=0.0057468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=269.839;QD=38.2281;RBI=0.0168039;REFB=0;REVB=0.014414;RO=0;SAF=82;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.14132e-05;OID=.;OPOS=5411580;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:174:173:0:0:173:173:91:82:0:0:91:82:0:0 chr11 5424050 . G A 1073.61 PASS AO=115;DP=117;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121669;FXX=0.00854628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6927;QD=37.021;RBI=0.0147509;REFB=-0.0813314;REVB=-0.00834003;RO=2;SAF=28;SAR=87;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0107916;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000922014;OID=.;OPOS=5424050;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:117:116:2:0:115:116:87:28:0:2:88:28:0:0 chr11 5424430 . A G 486.71 PASS AO=145;DP=413;FAO=159;FDP=399;FR=.;FRO=240;FSAF=79;FSAR=80;FSRF=134;FSRR=106;FWDB=-0.0168044;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.632;QD=4.87926;RBI=0.0185398;REFB=-0.0108947;REVB=-0.00783155;RO=232;SAF=66;SAR=79;SRF=121;SRR=111;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0727408;STB=0.536959;TYPE=snp;VARB=0.019709;OID=.;OPOS=5424430;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:413:399:232:240:145:159:79:66:121:111:80:79:134:106 chr11 5424701 . T C 79.95 PASS AO=14;DP=22;FAO=14;FDP=23;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.102606;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.9059;QD=13.9046;RBI=0.102948;REFB=-0.0544105;REVB=-0.00837379;RO=8;SAF=3;SAR=11;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139114;STB=0.615819;TYPE=snp;VARB=0.0426993;OID=.;OPOS=5424701;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:22:23:8:9:14:14:11:3:3:5:11:3:4:5 chr11 5443442 . G C 981.91 PASS AO=103;DP=105;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0221844;FXX=0.0190458;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.552;QD=38.1325;RBI=0.0236649;REFB=0;REVB=0.00823903;RO=0;SAF=66;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.25293e-05;OID=.;OPOS=5443442;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:105:103:0:0:103:103:37:66:0:0:37:66:0:0 chr11 5443700 . C T 1178.43 PASS AO=95;DP=131;FAO=129;FDP=132;FR=.;FRO=3;FSAF=33;FSAR=96;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0121565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.567;QD=35.7101;RBI=0.0195503;REFB=-0.0993991;REVB=0.0153113;RO=1;SAF=29;SAR=66;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0160683;STB=0.502308;TYPE=snp;VARB=0.000434875;OID=.;OPOS=5443700;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:98:132:1:3:95:129:66:29:1:0:96:33:1:2 chr11 5443739 . T C 1002.64 PASS AO=120;DP=131;FAO=120;FDP=131;FR=.;FRO=11;FSAF=40;FSAR=80;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.00762932;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=224.355;QD=30.615;RBI=0.00994036;REFB=-0.0942243;REVB=0.00637216;RO=8;SAF=40;SAR=80;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0383188;STB=0.519771;TYPE=snp;VARB=0.000783142;OID=.;OPOS=5443739;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:131:131:8:11:120:120:80:40:5:3:80:40:6:5 chr11 5443867 . C T 625.46 PASS AO=68;DP=69;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00922822;FXX=0.043472;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7349;QD=37.9068;RBI=0.022559;REFB=0;REVB=-0.0205852;RO=0;SAF=29;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00302876;OID=.;OPOS=5443867;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:69:66:0:0:68:66:39:29:0:0:39:27:0:0 chr11 5443887 . T C 555.77 PASS AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0495306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.852;QD=38.3289;RBI=0.0691043;REFB=0;REVB=0.0481885;RO=0;SAF=27;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07727e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000539434;OID=.;OPOS=5443887;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:58:58:0:0:58:58:31:27:0:0:31:27:0:0 chr11 5443893 . G A 558.74 PASS AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000575624;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.8297;QD=38.534;RBI=0.021019;REFB=0;REVB=0.0210111;RO=0;SAF=27;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07727e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000189963;OID=.;OPOS=5443893;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:59:58:0:0:58:58:31:27:0:0:31:27:0:0 chr11 5443963 . G A 254.47 PASS AO=30;DP=32;FAO=30;FDP=32;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0333428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7872;QD=31.8089;RBI=0.044987;REFB=-0.0772947;REVB=0.0302008;RO=2;SAF=4;SAR=26;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0345339;STB=0.518506;TYPE=snp;VARB=0.00485753;OID=.;OPOS=5443963;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:32:32:2:2:30:30:26:4:0:2:26:4:0:2 chr11 5444061 . G A 675.29 PASS AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00914569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.717;QD=36.5021;RBI=0.0194722;REFB=-0.020539;REVB=0.0171907;RO=0;SAF=38;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.90268e-08;STB=0.50704;TYPE=snp;VARB=0.000102628;OID=.;OPOS=5444061;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:74:74:0:1:73:73:35:38:0:0:35:38:0:1 chr11 5444136 . C T 2428.51 PASS AO=254;DP=255;FAO=255;FDP=255;FR=.;FRO=0;FSAF=122;FSAR=133;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0169568;FXX=0.0039061;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.6494;QD=38.0942;RBI=0.0395291;REFB=-0.0477659;REVB=0.0357073;RO=1;SAF=121;SAR=133;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00392349;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.03425e-05;OID=.;OPOS=5444136;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:255:255:1:0:254:255:133:121:1:0:133:122:0:0 chr11 5444353 . T C 659.67 PASS AO=75;DP=82;FAO=77;FDP=82;FR=.;FRO=5;FSAF=19;FSAR=58;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.00175807;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.5902;QD=32.1792;RBI=0.0688081;REFB=-0.0599535;REVB=-0.0687856;RO=7;SAF=18;SAR=57;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0701605;STB=0.528138;TYPE=snp;VARB=0.0028447;OID=.;OPOS=5444353;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:82:82:7:5:75:77:57:18:4:3:58:19:3:2 chr11 5451940 . G T 516.56 PASS AO=136;DP=299;FAO=136;FDP=299;FR=.;FRO=163;FSAF=72;FSAR=64;FSRF=67;FSRR=96;FWDB=0.0170114;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=203.56;QD=6.91049;RBI=0.0211133;REFB=0.00329877;REVB=-0.0125053;RO=163;SAF=72;SAR=64;SRF=67;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116312;STB=0.564254;TYPE=snp;VARB=-0.0038797;OID=.;OPOS=5451940;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:299:299:163:163:136:136:64:72:67:96:64:72:67:96 chr11 5461834 . C G 39.28 PASS AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=2;FWDB=0.0048148;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=252.353;QD=7.14217;RBI=0.00485476;REFB=0.00461953;REVB=0.000621618;RO=13;SAF=5;SAR=4;SRF=11;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.310814;STB=0.680515;TYPE=snp;VARB=-0.00787008;OID=.;OPOS=5461834;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:22:22:13:13:9:9:4:5:11:2:4:5:11:2 chr11 5462085 . G A 168.05 PASS AO=35;DP=64;FAO=35;FDP=65;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=-0.00790182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.124;QD=10.3413;RBI=0.0105238;REFB=-0.0192186;REVB=0.0069507;RO=28;SAF=11;SAR=24;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.039301;STB=0.527457;TYPE=snp;VARB=0.0169362;OID=.;OPOS=5462085;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:65:28:30:35:35:24:11:10:18:24:11:11:19 chr11 5462255 . C G 407.89 PASS AO=79;DP=141;FAO=81;FDP=140;FR=.;FRO=59;FSAF=47;FSAR=34;FSRF=30;FSRR=29;FWDB=-0.0260129;FXX=0.0209776;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.7058;QD=11.6539;RBI=0.026405;REFB=-0.00946567;REVB=0.00453371;RO=56;SAF=45;SAR=34;SRF=28;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.053676;STB=0.530733;TYPE=snp;VARB=0.0057818;OID=.;OPOS=5462255;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:140:56:59:79:81:34:45:28:28:34:47:30:29 chr11 5462653 . AG A 316.11 PASS AO=43;DP=62;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0400388;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.5206;QD=21.4314;RBI=0.226675;REFB=-0.0596602;REVB=0.223111;RO=10;SAF=21;SAR=22;SRF=1;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0.435071;SSSB=0.137159;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0357924;OID=.;OPOS=5462654;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:43:59:59:59:0:27:32:0:0:20:10:21:22:1:9 chr11 5475615 . C T 129.87 PASS AO=33;DP=74;FAO=33;FDP=74;FR=.;FRO=41;FSAF=7;FSAR=26;FSRF=11;FSRR=30;FWDB=-0.0716991;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.0701;QD=7.01985;RBI=0.0754051;REFB=0.0366342;REVB=0.0233487;RO=41;SAF=7;SAR=26;SRF=11;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0780598;STB=0.544158;TYPE=snp;VARB=-0.042211;OID=.;OPOS=5475615;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:41:41:33:33:26:7:11:30:26:7:11:30 chr11 5510284 . A G 1803.51 PASS AO=194;DP=198;FAO=195;FDP=199;FR=.;FRO=4;FSAF=73;FSAR=122;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.041153;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.164;QD=36.2516;RBI=0.0414023;REFB=-0.0610091;REVB=0.00453697;RO=4;SAF=73;SAR=121;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.01548;STB=0.508064;TYPE=snp;VARB=0.000872204;OID=.;OPOS=5510284;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:198:199:4:4:194:195:121:73:0:4:122:73:0:4 chr11 5510497 . T C 2227.63 PASS AO=242;DP=252;FAO=244;FDP=249;FR=.;FRO=5;FSAF=121;FSAR=123;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0294342;FXX=0.0158097;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6693;QD=35.7853;RBI=0.068032;REFB=-0.167816;REVB=0.061335;RO=5;SAF=120;SAR=122;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0191286;STB=0.505942;TYPE=snp;VARB=0.00242974;OID=.;OPOS=5510497;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:252:249:5:5:242:244:122:120:0:5:123:121:1:4 chr11 5510626 . T C 1193.22 PASS AO=124;DP=124;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00747196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.829;QD=38.183;RBI=0.0229154;REFB=0;REVB=0.0216629;RO=0;SAF=68;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51989e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.53766e-05;OID=.;OPOS=5510626;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:124:125:0:0:124:125:56:68:0:0:57:68:0:0 chr11 5510928 . G A 614.61 PASS AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.061723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.777;QD=36.6931;RBI=0.0668651;REFB=-0.0468322;REVB=0.0257141;RO=0;SAF=15;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504853;TYPE=snp;VARB=0.000188718;OID=.;OPOS=5510928;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:67:67:0:1:66:66:51:15:0:0:51:15:0:1 chr11 5529152 . A G 80.87 PASS AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.00497822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.5124;QD=7.70217;RBI=0.00727817;REFB=-0.0191642;REVB=0.00530935;RO=23;SAF=6;SAR=13;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0806656;STB=0.546169;TYPE=snp;VARB=0.0120682;OID=.;OPOS=5529152;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:42:42:23:23:19:19:13:6:9:14:13:6:9:14 chr11 5529865 . G A 676.07 PASS AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00414708;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.942;QD=36.5445;RBI=0.0204963;REFB=-0.10227;REVB=0.0200723;RO=1;SAF=37;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129584;STB=0.506847;TYPE=snp;VARB=0.00038698;OID=.;OPOS=5529865;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:74:74:1:1:73:73:36:37:0:1:36:37:0:1 chr11 5536415 . C T 1057.48 PASS AO=110;DP=110;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00716676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.631;QD=38.1073;RBI=0.0360868;REFB=0;REVB=0.035368;RO=0;SAF=51;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.64164e-05;OID=.;OPOS=5536415;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:110:111:0:0:110:111:59:51:0:0:60:51:0:0 chr11 5536537 . A C 2137.92 PASS AO=225;DP=230;FAO=230;FDP=230;FR=.;FRO=0;FSAF=140;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0177202;FXX=0.0170933;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.7901;QD=37.1813;RBI=0.0673629;REFB=0.0881782;REVB=-0.0649904;RO=5;SAF=139;SAR=86;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0182274;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000549087;OID=.;OPOS=5536537;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:230:230:5:0:225:230:86:139:1:4:90:140:0:0 chr11 5536852 . A G 2725.8 PASS AO=284;DP=284;FAO=285;FDP=285;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=189;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=1.87364e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.694;QD=38.2569;RBI=0.00835311;REFB=0;REVB=0.00835309;RO=0;SAF=96;SAR=188;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.70632e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.42212e-05;OID=.;OPOS=5536852;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:284:285:0:0:284:285:188:96:0:0:189:96:0:0 chr11 5537045 . T G 1030.27 PASS AO=98;DP=98;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.434;QD=38.158;RBI=0.0302202;REFB=0;REVB=-0.00344324;RO=0;SAF=31;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000139026;OID=.;OPOS=5537045;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:98:108:0:0:98:108:67:31:0:0:69:39:0:0 chr11 5537161 . A G 1313.46 PASS AO=137;DP=137;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00288468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.468;QD=38.3492;RBI=0.00296364;REFB=0;REVB=-0.000679531;RO=0;SAF=59;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.5753e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.81049e-06;OID=.;OPOS=5537161;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:137:137:0:0:137:137:78:59:0:0:78:59:0:0 chr11 5537780 . C A 183.12 PASS AO=98;DP=99;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0609085;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.392;QD=38.5512;RBI=0.0638533;REFB=0;REVB=-0.0191677;RO=1;SAF=28;SAR=70;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00672866;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00186026;OID=.;OPOS=5537780;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:99:19:1:0:98:19:70:28:0:1:17:2:0:0 chr11 5566030 . A G 643.12 PASS AO=65;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0186027;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.958;QD=38.3954;RBI=0.0410854;REFB=0;REVB=0.0366327;RO=0;SAF=35;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.75292e-05;OID=.;OPOS=5566030;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:66:67:0:0:65:67:30:35:0:0:30:37:0:0 chr11 5566051 . C A 505.93 PASS AO=57;DP=60;FAO=57;FDP=60;FR=.;FRO=3;FSAF=35;FSAR=22;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.022206;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3021;QD=33.7285;RBI=0.0222368;REFB=-0.0255046;REVB=0.00117042;RO=3;SAF=35;SAR=22;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0387244;STB=0.520541;TYPE=snp;VARB=0.0137009;OID=.;OPOS=5566051;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:60:60:3:3:57:57:22:35:3:0:22:35:3:0 chr11 5566112 . C T 552.33 PASS AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0551737;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.661;QD=36.2184;RBI=0.0606999;REFB=-0.155106;REVB=0.025305;RO=1;SAF=36;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192565;STB=0.510201;TYPE=snp;VARB=0.0047583;OID=.;OPOS=5566112;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:61:61:1:1:60:60:24:36:0:1:24:36:0:1 chr11 5566365 . T C 1399.02 PASS AO=157;DP=164;FAO=157;FDP=164;FR=.;FRO=7;FSAF=78;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0.0306834;FXX=0.00606024;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.744;QD=34.1225;RBI=0.119869;REFB=-0.184585;REVB=0.115875;RO=0;SAF=79;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.521209;TYPE=snp;VARB=0.00191711;OID=.;OPOS=5566365;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:164:164:0:7:157:157:78:79:0:0:79:78:0:7 chr11 5566489 . C T 1328.22 PASS AO=132;DP=133;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000135964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.963;QD=38.2221;RBI=0.0718636;REFB=0;REVB=0.0718635;RO=0;SAF=80;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000297612;OID=.;OPOS=5566489;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:133:139:0:0:132:139:52:80:0:0:56:83:0:0 chr11 5602275 . A G 134.87 PASS AO=50;DP=158;FAO=54;FDP=167;FR=.;FRO=113;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=51;FSRR=62;FWDB=-0.0270225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.961;QD=3.23035;RBI=0.0416416;REFB=-0.0219819;REVB=-0.0316829;RO=108;SAF=24;SAR=26;SRF=51;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00918574;STB=0.504709;TYPE=snp;VARB=0.0494914;OID=.;OPOS=5602275;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:167:108:113:50:54:26:24:51:57:30:24:51:62 chr11 5602438 . T A 216.65 PASS AO=51;DP=104;FAO=51;FDP=104;FR=.;FRO=53;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=0.000122062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.7503;QD=8.33267;RBI=0.00947978;REFB=-0.0160577;REVB=0.00947899;RO=53;SAF=23;SAR=28;SRF=26;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0365925;STB=0.52028;TYPE=snp;VARB=0.0128588;OID=.;OPOS=5602438;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:53:53:51:51:28:23:26:27:28:23:26:27 chr11 5602605 . G A 276.27 PASS AO=65;DP=136;FAO=66;FDP=136;FR=.;FRO=70;FSAF=29;FSAR=37;FSRF=28;FSRR=42;FWDB=-0.0160124;FXX=0.00729874;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.294;QD=8.12551;RBI=0.0342573;REFB=-0.0341393;REVB=-0.0302847;RO=61;SAF=29;SAR=36;SRF=23;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0620249;STB=0.520676;TYPE=snp;VARB=0.0323184;OID=.;OPOS=5602605;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:61:70:65:66:36:29:23:38:37:29:28:42 chr11 5602615 . A G 301.61 PASS AO=68;DP=137;FAO=69;FDP=137;FR=.;FRO=68;FSAF=33;FSAR=36;FSRF=27;FSRR=41;FWDB=0.00923121;FXX=0.00724585;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.382;QD=8.80622;RBI=0.0230254;REFB=-0.0228117;REVB=-0.021094;RO=68;SAF=33;SAR=35;SRF=27;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0803587;STB=0.540512;TYPE=snp;VARB=0.0335458;OID=.;OPOS=5602615;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:68:68:68:69:35:33:27:41:36:33:27:41 chr11 5602679 . T C 352.21 PASS AO=87;DP=182;FAO=87;FDP=181;FR=.;FRO=94;FSAF=39;FSAR=48;FSRF=51;FSRR=43;FWDB=0.00388091;FXX=0.0054942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.8;QD=7.78365;RBI=0.00549911;REFB=-0.0174834;REVB=-0.00389599;RO=93;SAF=39;SAR=48;SRF=50;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0837688;STB=0.548978;TYPE=snp;VARB=0.023875;OID=.;OPOS=5602679;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:181:93:94:87:87:48:39:50:43:48:39:51:43 chr11 5602790 . A G 658.06 PASS AO=149;DP=309;FAO=157;FDP=316;FR=.;FRO=159;FSAF=90;FSAR=67;FSRF=85;FSRR=74;FWDB=-0.00458772;FXX=0.00628911;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.67;QD=8.32982;RBI=0.00746209;REFB=-0.0216796;REVB=0.0058852;RO=158;SAF=86;SAR=63;SRF=84;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0433412;STB=0.51976;TYPE=snp;VARB=0.0172607;OID=.;OPOS=5602790;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:309:316:158:159:149:157:63:86:84:74:67:90:85:74 chr11 5602928 . G C 397.17 PASS AO=98;DP=355;FAO=149;FDP=387;FR=.;FRO=238;FSAF=62;FSAR=87;FSRF=81;FSRR=157;FWDB=0.00542692;FXX=0.00514126;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.762;QD=4.10516;RBI=0.0120079;REFB=-0.00679227;REVB=0.0107116;RO=253;SAF=18;SAR=80;SRF=95;SRR=158;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.299215;STB=0.548726;TYPE=snp;VARB=0.0132472;OID=.;OPOS=5602928;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:355:387:253:238:98:149:80:18:95:158:87:62:81:157 chr11 5602968 . G A 476.09 PASS AO=152;DP=396;FAO=154;FDP=396;FR=.;FRO=242;FSAF=57;FSAR=97;FSRF=68;FSRR=174;FWDB=0.00402331;FXX=0.005025;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.411;QD=4.80903;RBI=0.00416346;REFB=-0.00498872;REVB=-0.00107117;RO=241;SAF=55;SAR=97;SRF=68;SRR=173;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0974979;STB=0.560235;TYPE=snp;VARB=0.0073959;OID=.;OPOS=5602968;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:396:396:241:242:152:154:97:55:68:173:97:57:68:174 chr11 5625847 . A G 239.73 PASS AO=59;DP=127;FAO=59;FDP=125;FR=.;FRO=66;FSAF=43;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=45;FWDB=0.0158046;FXX=0.0157468;HRUN=4;LEN=1;MLLD=211.412;QD=7.6714;RBI=0.0473944;REFB=-0.0107002;REVB=-0.0446816;RO=65;SAF=43;SAR=16;SRF=20;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.40066;STB=0.719146;TYPE=snp;VARB=0.014135;OID=.;OPOS=5625847;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:125:65:66:59:59:16:43:20:45:16:43:21:45 chr11 5629607 . G A 901.78 PASS AO=200;DP=376;FAO=201;FDP=378;FR=.;FRO=177;FSAF=82;FSAR=119;FSRF=63;FSRR=114;FWDB=0.0162142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.794;QD=9.54264;RBI=0.0250094;REFB=-0.004272;REVB=0.0190413;RO=175;SAF=80;SAR=120;SRF=63;SRR=112;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0360068;STB=0.525451;TYPE=snp;VARB=0.00415646;OID=.;OPOS=5629607;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:376:378:175:177:200:201:120:80:63:112:119:82:63:114 chr11 5632212 . G A 1181.39 PASS AO=222;DP=641;FAO=184;FDP=396;FR=.,HEALED;FRO=130;FSAF=92;FSAR=92;FSRF=62;FSRR=68;FWDB=0.00464475;FXX=0.00999975;HRUN=5;LEN=1;MLLD=146.606;QD=11.9332;RBI=0.0107312;REFB=0.011107;REVB=-0.00967393;RO=186;SAF=111;SAR=111;SRF=104;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0496063;STB=0.509553;TYPE=snp;VARB=-0.0305032;OID=.;OPOS=5632212;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:558:396:186:130:222:184:111:111:104:82:92:92:62:68 chr11 5691191 . C T 316.55 PASS AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00347835;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.963;QD=37.241;RBI=0.00579503;REFB=0;REVB=-0.00463502;RO=0;SAF=13;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.82173e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.18939e-06;OID=.;OPOS=5691191;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:33:34:0:0:33:34:20:13:0:0:20:14:0:0 chr11 5700340 . T C 555.77 PASS AO=56;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0343938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.7338;QD=38.329;RBI=0.034408;REFB=0;REVB=-0.000987745;RO=0;SAF=37;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.65905e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000204426;OID=.;OPOS=5700340;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:57:58:0:0:56:58:19:37:0:0:20:38:0:0 chr11 5701001 . C T 122.47 PASS AO=26;DP=51;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=22;FSAR=4;FSRF=20;FSRR=5;FWDB=0.00210181;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=231.183;QD=9.60509;RBI=0.0319608;REFB=-0.0113434;REVB=0.0318916;RO=23;SAF=22;SAR=4;SRF=20;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0390744;STB=0.54095;TYPE=snp;VARB=0.0115593;OID=.;OPOS=5701001;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:23:25:26:26:4:22:20:3:4:22:20:5 chr11 5701409 . G C 43.19 PASS AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=-0.0773472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.133;QD=11.5177;RBI=0.0800166;REFB=0.00300053;REVB=-0.0204957;RO=7;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.363249;STB=0.705493;TYPE=snp;VARB=-0.0112439;OID=.;OPOS=5701409;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:15:15:7:7:8:8:5:3:0:7:5:3:0:7 chr11 5717762 . T C 320.54 PASS AO=67;DP=125;FAO=68;FDP=126;FR=.;FRO=58;FSAF=30;FSAR=38;FSRF=34;FSRR=24;FWDB=0.00271998;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.3363;QD=10.1759;RBI=0.0621408;REFB=0.00207402;REVB=0.0620812;RO=55;SAF=30;SAR=37;SRF=32;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110223;STB=0.566616;TYPE=snp;VARB=-0.00204105;OID=.;OPOS=5717762;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:126:55:58:67:68:37:30:32:23:38:30:34:24 chr11 5718517 . G A 529.6 PASS AO=134;DP=290;FAO=135;FDP=289;FR=.;FRO=154;FSAF=73;FSAR=62;FSRF=104;FSRR=50;FWDB=0.0252952;FXX=0.00344816;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0877;QD=7.33005;RBI=0.0694775;REFB=-0.00573938;REVB=-0.0647091;RO=151;SAF=72;SAR=62;SRF=101;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128829;STB=0.573044;TYPE=snp;VARB=0.00659251;OID=.;OPOS=5718517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:290:289:151:154:134:135:62:72:101:50:62:73:104:50 chr11 5719667 . T C 173.38 PASS AO=43;DP=98;FAO=44;FDP=96;FR=.;FRO=52;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=29;FSRR=23;FWDB=0.0105628;FXX=0.0204061;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.86;QD=7.22415;RBI=0.0351325;REFB=-0.0176536;REVB=0.0335071;RO=49;SAF=20;SAR=23;SRF=29;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120505;STB=0.55574;TYPE=snp;VARB=0.0190377;OID=.;OPOS=5719667;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:96:49:52:43:44:23:20:29:20:24:20:29:23 chr11 5719750 . G C 191.1 PASS AO=44;DP=88;FAO=44;FDP=90;FR=.;FRO=46;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=-0.00147345;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=135.346;QD=8.49329;RBI=0.0263509;REFB=-0.00853407;REVB=-0.0263096;RO=44;SAF=25;SAR=19;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0414726;STB=0.535152;TYPE=snp;VARB=0.0104088;OID=.;OPOS=5719750;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:90:44:46:44:44:19:25:23:21:19:25:23:23 chr11 5757785 . C T 143.34 PASS AO=29;DP=51;FAO=28;FDP=50;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.00529753;FXX=0.0384541;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.201;QD=11.4673;RBI=0.00724192;REFB=-0.0313479;REVB=0.00493777;RO=22;SAF=13;SAR=16;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.004934;STB=0.531769;TYPE=snp;VARB=0.0173873;OID=.;OPOS=5757785;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:51:50:22:22:29:28:16:13:10:12:16:12:11:11 chr11 5758062 . T C 481.69 PASS AO=124;DP=268;FAO=124;FDP=268;FR=.;FRO=144;FSAF=60;FSAR=64;FSRF=51;FSRR=93;FWDB=0.0635254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.263;QD=7.18944;RBI=0.0645787;REFB=-0.0141773;REVB=-0.0116159;RO=142;SAF=60;SAR=64;SRF=51;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121499;STB=0.570069;TYPE=snp;VARB=0.0151926;OID=.;OPOS=5758062;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:268:268:142:144:124:124:64:60:51:91:64:60:51:93 chr11 5758118 . A C 1932.1 PASS AO=198;DP=198;FAO=202;FDP=202;FR=.;FRO=0;FSAF=113;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0577342;FXX=0.00492587;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.984;QD=38.2593;RBI=0.0577396;REFB=0;REVB=-0.000786417;RO=0;SAF=108;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.35426e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.19697e-05;OID=.;OPOS=5758118;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:91:198:202:0:0:198:202:90:108:0:0:89:113:0:0 chr11 5758386 . C T 72.8 PASS AO=31;DP=110;FAO=33;FDP=113;FR=.;FRO=80;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=40;FSRR=40;FWDB=0.00793207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.212;QD=2.57695;RBI=0.0124631;REFB=0.000676297;REVB=-0.00961301;RO=71;SAF=17;SAR=14;SRF=40;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0179638;STB=0.510723;TYPE=snp;VARB=-0.00166008;OID=.;OPOS=5758386;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:110:113:71:80:31:33:14:17:40:31:16:17:40:40 chr11 5758641 . GT G 779.2 PASS AO=107;DP=137;FAO=141;FDP=142;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.320573;FXX=0.0138879;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.0947;QD=21.9493;RBI=0.322554;REFB=-0.0671084;REVB=0.0356878;RO=21;SAF=20;SAR=87;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152971;STB=0.502463;TYPE=del;VARB=0.0130909;OID=.;OPOS=5758642;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:107:137:141:142:1:40:101:0:1:47:21:20:87:11:10 chr11 5776287 . C T 3113.44 PASS AO=324;DP=327;FAO=337;FDP=337;FR=.;FRO=0;FSAF=127;FSAR=210;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0256941;FXX=0.0989278;HRUN=3;LEN=1;MLLD=137.995;QD=36.9547;RBI=0.0297783;REFB=-0.0564929;REVB=0.0150519;RO=2;SAF=114;SAR=210;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00829426;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00559478;OID=.;OPOS=5776287;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:327:337:2:0:324:337:210:114:2:0:210:127:0:0 chr11 5776470 . T G 1108.38 PASS AO=116;DP=121;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0427452;FXX=0.0330551;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.3275;QD=37.8933;RBI=0.0486773;REFB=0;REVB=0.023288;RO=0;SAF=41;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000919759;OID=.;OPOS=5776470;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:121:117:0:0:116:117:75:41:0:0:75:42:0:0 chr11 5776623 . A T 1027.3 PASS AO=107;DP=108;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00503291;FXX=0.0092584;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.621;QD=38.4038;RBI=0.0230878;REFB=0;REVB=0.0225326;RO=0;SAF=65;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.82963e-05;OID=.;OPOS=5776623;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:108:107:0:0:107:107:42:65:0:0:42:65:0:0 chr11 5809308 . A T 2217.78 PASS AO=238;DP=242;FAO=240;FDP=240;FR=.;FRO=0;FSAF=112;FSAR=128;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0325374;FXX=0.00826412;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.909;QD=36.9631;RBI=0.0372743;REFB=-0.112991;REVB=0.0181849;RO=4;SAF=111;SAR=127;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00106336;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00110311;OID=.;OPOS=5809308;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:82:242:240:4:0:238:240:127:111:2:2:128:112:0:0 chr11 5809548 . G A 1498.99 PASS AO=154;DP=155;FAO=160;FDP=160;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00319007;FXX=0.0184038;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.705;QD=37.4747;RBI=0.0197223;REFB=0;REVB=-0.0194626;RO=0;SAF=73;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.21282e-05;OID=.;OPOS=5809548;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:155:160:0:0:154:160:81:73:0:0:86:74:0:0 chr11 5841856 . C T 212.73 PASS AO=62;DP=156;FAO=64;FDP=158;FR=.;FRO=94;FSAF=38;FSAR=26;FSRF=54;FSRR=40;FWDB=0.0391538;FXX=0.0124992;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.643;QD=5.38552;RBI=0.0393845;REFB=-0.0168916;REVB=-0.00425652;RO=92;SAF=36;SAR=26;SRF=54;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00688502;STB=0.511833;TYPE=snp;VARB=0.0160357;OID=.;OPOS=5841856;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:158:92:94:62:64:26:36:54:38:26:38:54:40 chr11 5842310 . T G 1170.66 PASS AO=125;DP=126;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00776331;FXX=0.0157468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.429;QD=37.4612;RBI=0.0218811;REFB=0.013782;REVB=0.0204576;RO=0;SAF=82;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.96221e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000110641;OID=.;OPOS=5842310;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:126:125:0:0:125:125:43:82:0:0:43:82:0:0 chr11 5842356 . A G 1040.86 PASS AO=108;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00707068;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.575;QD=38.5503;RBI=0.00877557;REFB=0;REVB=-0.0051977;RO=0;SAF=51;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60583e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000247487;OID=.;OPOS=5842356;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:108:108:0:0:108:108:57:51:0:0:57:51:0:0 chr11 5862731 . A G 350.71 PASS AO=91;DP=200;FAO=91;FDP=200;FR=.;FRO=109;FSAF=41;FSAR=50;FSRF=59;FSRR=50;FWDB=0.00119475;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=194.076;QD=7.01416;RBI=0.0581353;REFB=-0.00239473;REVB=-0.0581231;RO=109;SAF=41;SAR=50;SRF=59;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0891885;STB=0.54944;TYPE=snp;VARB=0.00324849;OID=.;OPOS=5862731;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:200:200:109:109:91:91:50:41:59:50:50:41:59:50 chr11 5877979 . T A 228.92 PASS AO=59;DP=131;FAO=59;FDP=131;FR=.;FRO=72;FSAF=23;FSAR=36;FSRF=41;FSRR=31;FWDB=0.00175696;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.776;QD=6.98983;RBI=0.00336108;REFB=0.00179734;REVB=0.0028653;RO=72;SAF=23;SAR=36;SRF=41;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177931;STB=0.599186;TYPE=snp;VARB=-0.00173989;OID=.;OPOS=5877979;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:72:72:59:59:36:23:41:31:36:23:41:31 chr11 5906048 . G A 98.25 PASS AO=26;DP=62;FAO=26;FDP=62;FR=.;FRO=36;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=29;FSRR=7;FWDB=0.0107577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.735;QD=6.33875;RBI=0.0288147;REFB=-0.0455702;REVB=0.0267312;RO=36;SAF=19;SAR=7;SRF=29;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102866;STB=0.558098;TYPE=snp;VARB=0.0726543;OID=.;OPOS=5906048;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:62:62:36:36:26:26:7:19:29:7:7:19:29:7 chr11 5906073 . G T 106.85 PASS AO=27;DP=58;FAO=27;FDP=62;FR=.;FRO=35;FSAF=21;FSAR=6;FSRF=30;FSRR=5;FWDB=-0.00512989;FXX=0.0158705;HRUN=4;LEN=1;MLLD=107.966;QD=6.89365;RBI=0.0851789;REFB=0.0205191;REVB=-0.0850243;RO=29;SAF=21;SAR=6;SRF=26;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178315;STB=0.569785;TYPE=snp;VARB=-0.0260235;OID=.;OPOS=5906073;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:62:29:35:27:27:6:21:26:3:6:21:30:5 chr11 5906143 . T C 173.87 PASS AO=37;DP=70;FAO=37;FDP=71;FR=.;FRO=34;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.00575927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.9397;QD=9.79569;RBI=0.0228157;REFB=-0.0168437;REVB=-0.0220768;RO=33;SAF=23;SAR=14;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0675648;STB=0.545861;TYPE=snp;VARB=0.00915172;OID=.;OPOS=5906143;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:71:33:34:37:37:14:23:18:15:14:23:18:16 chr11 5906192 . A C 206.35 PASS AO=48;DP=97;FAO=48;FDP=98;FR=.;FRO=50;FSAF=30;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=-0.000482032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.022;QD=8.4224;RBI=0.0368064;REFB=-0.0159276;REVB=-0.0368032;RO=49;SAF=30;SAR=18;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163129;STB=0.595815;TYPE=snp;VARB=0.027412;OID=.;OPOS=5906192;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:98:49:50:48:48:18:30:22:27:18:30:22:28 chr11 5906203 . T G 185.51 PASS AO=46;DP=99;FAO=46;FDP=100;FR=.;FRO=54;FSAF=29;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=30;FWDB=0.0119122;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=192.779;QD=7.42034;RBI=0.013817;REFB=-0.00661823;REVB=0.00700057;RO=50;SAF=29;SAR=17;SRF=23;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162881;STB=0.601987;TYPE=snp;VARB=0.0107382;OID=.;OPOS=5906203;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:100:50:54:46:46:17:29:23:27:17:29:24:30 chr11 5906291 . T C 221.27 PASS AO=74;DP=197;FAO=75;FDP=204;FR=.;FRO=129;FSAF=44;FSAR=31;FSRF=64;FSRR=65;FWDB=-0.0105455;FXX=0.00970827;HRUN=7;LEN=1;MLLD=54.976;QD=4.33865;RBI=0.0105709;REFB=-0.022086;REVB=0.000731741;RO=122;SAF=44;SAR=30;SRF=60;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114317;STB=0.557829;TYPE=snp;VARB=0.0278947;OID=.;OPOS=5906291;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:204:122:129:74:75:30:44:60:62:31:44:64:65 chr11 5968728 . T C 555.77 PASS AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.275;QD=38.3289;RBI=0.105781;REFB=0;REVB=0.102841;RO=0;SAF=41;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000726398;OID=.;OPOS=5968728;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:58:58:0:0:58:58:17:41:0:0:17:41:0:0 chr11 5969185 . A G 1992.58 PASS AO=213;DP=217;FAO=213;FDP=213;FR=.;FRO=0;FSAF=173;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0250061;FXX=0.0184323;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.0623;QD=37.4193;RBI=0.0343714;REFB=0.0269166;REVB=0.0235815;RO=3;SAF=173;SAR=40;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00818919;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.24513e-05;OID=.;OPOS=5969185;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:217:213:3:0:213:213:40:173:3:0:40:173:0:0 chr11 5969444 . GC G 20.72 PASS AO=57;DP=185;FAO=44;FDP=183;FR=.;FRO=139;FSAF=3;FSAR=41;FSRF=69;FSRR=70;FWDB=-0.136588;FXX=0.00543449;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.0308;QD=0.45289;RBI=0.164201;REFB=-0.0500032;REVB=-0.0911341;RO=122;SAF=8;SAR=49;SRF=64;SRR=58;SSEN=0.246575;SSEP=0;SSSB=-0.518353;STB=0.898418;TYPE=del;VARB=0.0285452;OID=.;OPOS=5969445;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:57:184:44:183:139:3:41:69:70:20:122:8:49:64:58 chr11 5989415 . C A 341.03 PASS AO=78;DP=151;FAO=77;FDP=151;FR=.;FRO=74;FSAF=52;FSAR=25;FSRF=44;FSRR=30;FWDB=0.00379155;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2561;QD=9.03391;RBI=0.0143208;REFB=-0.0144101;REVB=0.0138097;RO=73;SAF=52;SAR=26;SRF=44;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0617671;STB=0.543715;TYPE=snp;VARB=0.0130961;OID=.;OPOS=5989415;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:151:73:74:78:77:26:52:44:29:25:52:44:30 chr11 6007272 . A G 187.4 PASS AO=51;DP=119;FAO=51;FDP=119;FR=.;FRO=68;FSAF=31;FSAR=20;FSRF=32;FSRR=36;FWDB=-0.0160627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.959;QD=6.29927;RBI=0.0232805;REFB=-0.00127415;REVB=0.0168514;RO=67;SAF=31;SAR=20;SRF=31;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148524;STB=0.579408;TYPE=snp;VARB=0.00185168;OID=.;OPOS=6007272;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:67:68:51:51:20:31:31:36:20:31:32:36 chr11 6007396 . C T 358.27 PASS AO=76;DP=141;FAO=76;FDP=141;FR=.;FRO=65;FSAF=28;FSAR=48;FSRF=33;FSRR=32;FWDB=-0.00666643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.294;QD=10.1637;RBI=0.0205724;REFB=-0.0193158;REVB=-0.0194624;RO=61;SAF=28;SAR=48;SRF=33;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144596;STB=0.566546;TYPE=snp;VARB=0.0151493;OID=.;OPOS=6007396;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:61:65:76:76:48:28:33:28:48:28:33:32 chr11 6007613 . T G 160.79 PASS AO=49;DP=125;FAO=49;FDP=125;FR=.;FRO=76;FSAF=35;FSAR=14;FSRF=39;FSRR=37;FWDB=-0.0213794;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=179.759;QD=5.14516;RBI=0.0605012;REFB=-0.00268355;REVB=-0.0565978;RO=75;SAF=35;SAR=14;SRF=38;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.238858;STB=0.632697;TYPE=snp;VARB=0.00297321;OID=.;OPOS=6007613;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:75:76:49:49:14:35:38:37:14:35:39:37 chr11 6007680 . A G 180.63 PASS AO=46;DP=105;FAO=47;FDP=106;FR=.;FRO=59;FSAF=34;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=37;FWDB=-0.00773984;FXX=0.0185168;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.084;QD=6.81612;RBI=0.00840719;REFB=-0.0264422;REVB=0.00328264;RO=58;SAF=34;SAR=12;SRF=22;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.370606;STB=0.700078;TYPE=snp;VARB=0.0371812;OID=.;OPOS=6007680;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:106:58:59:46:47:12:34:22:36:13:34:22:37 chr11 6007743 . A G 125.02 PASS AO=35;DP=85;FAO=35;FDP=85;FR=.;FRO=50;FSAF=26;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=31;FWDB=0.0149943;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.8494;QD=5.88322;RBI=0.0398245;REFB=-0.0331708;REVB=-0.0368939;RO=50;SAF=26;SAR=9;SRF=19;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.38651;STB=0.719594;TYPE=snp;VARB=0.0452412;OID=.;OPOS=6007743;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:50:50:35:35:9:26:19:31:9:26:19:31 chr11 6007772 . G A 142.87 PASS AO=35;DP=73;FAO=34;FDP=72;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=13;FWDB=-0.00417945;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.478;QD=7.93693;RBI=0.0318259;REFB=-0.0240002;REVB=0.0315503;RO=38;SAF=20;SAR=15;SRF=25;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0834917;STB=0.55366;TYPE=snp;VARB=0.0331657;OID=.;OPOS=6007772;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:72:38:38:35:34:15:20:25:13:15:19:25:13 chr11 6007899 . C T 83.37 PASS AO=21;DP=48;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.00973933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.7888;QD=6.29236;RBI=0.0100985;REFB=-0.00869732;REVB=-0.00266945;RO=27;SAF=10;SAR=11;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0417047;STB=0.501729;TYPE=snp;VARB=0.00794677;OID=.;OPOS=6007899;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:48:53:27:31:21:22:11:10:14:13:12:10:14:17 chr11 6008050 . A G 74.02 PASS AO=28;DP=94;FAO=29;FDP=93;FR=.;FRO=64;FSAF=22;FSAR=7;FSRF=22;FSRR=42;FWDB=-0.023557;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=157.972;QD=3.18365;RBI=0.0237989;REFB=-0.0192017;REVB=0.00338498;RO=38;SAF=21;SAR=7;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.35293;STB=0.777592;TYPE=snp;VARB=0.0152614;OID=.;OPOS=6008050;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:74:93:38:64:28:29:7:21:16:22:7:22:22:42 chr11 6023581 . A G 111.44 PASS AO=40;DP=117;FAO=40;FDP=117;FR=.;FRO=77;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=30;FSRR=47;FWDB=0.0183165;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.573;QD=3.80997;RBI=0.0263473;REFB=-0.00581182;REVB=-0.0189389;RO=77;SAF=14;SAR=26;SRF=30;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0487477;STB=0.528148;TYPE=snp;VARB=0.00947599;OID=.;OPOS=6023581;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:77:77:40:40:26:14:30:47:26:14:30:47 chr11 6023640 . T C 92.8 PASS AO=24;DP=56;FAO=24;FDP=56;FR=.;FRO=32;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.0494533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.545;QD=6.62854;RBI=0.0494753;REFB=-0.0157309;REVB=0.00147714;RO=32;SAF=6;SAR=18;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.248583;STB=0.64273;TYPE=snp;VARB=0.00977997;OID=.;OPOS=6023640;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:56:56:32:32:24:24:18:6:15:17:18:6:15:17 chr11 6023818 . G A 156.42 PASS AO=45;DP=111;FAO=45;FDP=111;FR=.;FRO=66;FSAF=32;FSAR=13;FSRF=45;FSRR=21;FWDB=0.0121316;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.582;QD=5.63664;RBI=0.0167064;REFB=-0.0104961;REVB=-0.011486;RO=66;SAF=32;SAR=13;SRF=45;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0367809;STB=0.520814;TYPE=snp;VARB=0.0224665;OID=.;OPOS=6023818;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:66:66:45:45:13:32:45:21:13:32:45:21 chr11 6048056 . T C 345.93 PASS AO=77;DP=149;FAO=77;FDP=149;FR=.;FRO=72;FSAF=38;FSAR=39;FSRF=30;FSRR=42;FWDB=-0.0321011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.038;QD=9.28682;RBI=0.032111;REFB=-0.0112015;REVB=-0.000798019;RO=72;SAF=38;SAR=39;SRF=30;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0677148;STB=0.537163;TYPE=snp;VARB=0.0188818;OID=.;OPOS=6048056;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:72:72:77:77:39:38:30:42:39:38:30:42 chr11 6129837 . C T 208.6 PASS AO=59;DP=137;FAO=59;FDP=138;FR=.;FRO=79;FSAF=26;FSAR=33;FSRF=34;FSRR=45;FWDB=0.0341599;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.3058;QD=6.04627;RBI=0.0710279;REFB=-0.0260179;REVB=0.0622741;RO=78;SAF=26;SAR=33;SRF=33;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0182098;STB=0.505986;TYPE=snp;VARB=0.0453477;OID=.;OPOS=6129837;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:138:78:79:59:59:33:26:33:45:33:26:34:45 chr11 6173346 . G T 783.47 PASS AO=70;DP=86;FAO=84;FDP=85;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=35;FSAR=49;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0921554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.72;QD=36.8693;RBI=0.107624;REFB=-0.023563;REVB=0.0555905;RO=1;SAF=27;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171877;STB=0.507041;TYPE=snp;VARB=0.000479655;OID=.;OPOS=6173346;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:84:85:1:1:70:84:43:27:1:0:49:35:1:0 chr11 6173364 . T A 734.31 PASS AO=74;DP=75;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0283211;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.9895;QD=38.1458;RBI=0.111961;REFB=0;REVB=-0.10832;RO=0;SAF=30;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.93382e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00128461;OID=.;OPOS=6173364;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:75:77:0:0:74:77:44:30:0:0:47:30:0:0 chr11 6221169 . A G 1239.31 PASS AO=128;DP=128;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0454396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.303;QD=38.4281;RBI=0.0481241;REFB=0;REVB=0.0158484;RO=0;SAF=42;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.9926e-05;OID=.;OPOS=6221169;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:128:129:0:0:128:129:86:42:0:0:86:43:0:0 chr11 6221214 . T A 1337.7 PASS AO=135;DP=136;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0339049;FXX=0.0273954;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.9737;QD=37.6817;RBI=0.0352192;REFB=0;REVB=0.00953139;RO=1;SAF=37;SAR=98;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00482658;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000842347;OID=.;OPOS=6221214;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:136:142:1:0:135:142:98:37:0:1:102:40:0:0 chr11 6231731 . C T 664.35 PASS AO=68;DP=68;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0485035;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.12;QD=38.5128;RBI=0.0519738;REFB=0;REVB=0.0186732;RO=0;SAF=45;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000171387;OID=.;OPOS=6231731;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:68:69:0:0:68:69:23:45:0:0:23:46:0:0 chr11 6232653 . C T 219.22 PASS AO=50;DP=102;FAO=51;FDP=102;FR=.;FRO=51;FSAF=11;FSAR=40;FSRF=22;FSRR=29;FWDB=-0.0153689;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.8708;QD=8.59681;RBI=0.0194667;REFB=-0.0249567;REVB=0.0119478;RO=51;SAF=11;SAR=39;SRF=22;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236915;STB=0.634863;TYPE=snp;VARB=0.031668;OID=.;OPOS=6232653;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:51:51:50:51:39:11:22:29:40:11:22:29 chr11 6243804 . A G 1133.25 PASS AO=118;DP=118;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00762786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.9426;QD=38.4153;RBI=0.00990313;REFB=0;REVB=-0.00631568;RO=0;SAF=103;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.72458e-06;OID=.;OPOS=6243804;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:118:118:0:0:118:118:15:103:0:0:15:103:0:0 chr11 6262706 . C T 113.34 PASS AO=29;DP=66;FAO=29;FDP=66;FR=.;FRO=37;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=-0.0181607;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.2734;QD=6.86877;RBI=0.0196913;REFB=-0.0229692;REVB=0.00761162;RO=37;SAF=8;SAR=21;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229234;STB=0.63039;TYPE=snp;VARB=0.0310324;OID=.;OPOS=6262706;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:37:37:29:29:21:8:18:19:21:8:18:19 chr11 6281216 . T G 10.88 PASS AO=2;DP=9;FAO=2;FDP=8;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0549984;FXX=0.110988;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.3936;QD=5.43806;RBI=0.0790057;REFB=-0.0138704;REVB=-0.0567193;RO=5;SAF=1;SAR=1;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.306614;STB=0.748118;TYPE=snp;VARB=0.149184;OID=.;OPOS=6281216;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:8:5:6:2:2:1:1:1:4:1:1:1:5 chr11 6291120 . G A 166.9 PASS AO=32;DP=55;FAO=32;FDP=55;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=24;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=0.0363403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.814;QD=12.1382;RBI=0.037077;REFB=0.00295918;REVB=0.00735424;RO=23;SAF=8;SAR=24;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0531914;STB=0.529393;TYPE=snp;VARB=-0.00220807;OID=.;OPOS=6291120;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:55:55:23:23:32:32:24:8:7:16:24:8:7:16 chr11 6293210 . A G 271.07 PASS AO=73;DP=166;FAO=73;FDP=166;FR=.;FRO=93;FSAF=34;FSAR=39;FSRF=51;FSRR=42;FWDB=0.0273484;FXX=0.00598767;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.78;QD=6.53182;RBI=0.0553736;REFB=-0.0132146;REVB=-0.0481488;RO=92;SAF=34;SAR=39;SRF=50;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0777253;STB=0.546206;TYPE=snp;VARB=0.00889359;OID=.;OPOS=6293210;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:166:92:93:73:73:39:34:50:42:39:34:51:42 chr11 6340525 . A T 21.98 PASS AO=5;DP=16;FAO=5;FDP=15;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.0616461;FXX=0.062461;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.0641;QD=5.86153;RBI=0.106641;REFB=-0.0193061;REVB=0.0870182;RO=10;SAF=1;SAR=4;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.347085;STB=0.726281;TYPE=snp;VARB=0.0539441;OID=.;OPOS=6340525;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:16:15:10:10:5:5:4:1:5:5:4:1:5:5 chr11 6340706 . A G 40.84 PASS AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=14;FSRR=1;FWDB=0.0304289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.945;QD=6.53473;RBI=0.0322869;REFB=-0.014736;REVB=0.0107946;RO=15;SAF=8;SAR=2;SRF=14;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.256185;STB=0.646829;TYPE=snp;VARB=0.0141455;OID=.;OPOS=6340706;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:25:25:15:15:10:10:2:8:14:1:2:8:14:1 chr11 6411935 . T C 170.72 PASS AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0284956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.554;QD=37.9374;RBI=0.0873644;REFB=0;REVB=0.0825865;RO=0;SAF=13;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0041124;OID=.;OPOS=6411935;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:18:0:0:18:18:5:13:0:0:5:13:0:0 chr11 6458286 . A G 274.26 PASS AO=72;DP=161;FAO=72;FDP=161;FR=.;FRO=89;FSAF=45;FSAR=27;FSRF=41;FSRR=48;FWDB=-0.00169784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.765;QD=6.81396;RBI=0.0269224;REFB=-0.0134621;REVB=-0.0268688;RO=89;SAF=45;SAR=27;SRF=41;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165857;STB=0.592391;TYPE=snp;VARB=0.0210331;OID=.;OPOS=6458286;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:161:89:89:72:72:27:45:41:48:27:45:41:48 chr11 6471722 . T G 253.28 PASS AO=69;DP=167;FAO=71;FDP=166;FR=.;FRO=95;FSAF=22;FSAR=49;FSRF=31;FSRR=64;FWDB=0.0081202;FXX=0.0119041;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.008;QD=6.10323;RBI=0.0104191;REFB=-0.00966417;REVB=0.00652847;RO=97;SAF=21;SAR=48;SRF=31;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0185884;STB=0.510916;TYPE=snp;VARB=0.0147797;OID=.;OPOS=6471722;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:166:97:95:69:71:48:21:31:66:49:22:31:64 chr11 6478619 . G A 153.01 PASS AO=31;DP=61;FAO=33;FDP=63;FR=.;FRO=30;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.0521847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.3111;QD=9.71485;RBI=0.0820099;REFB=-0.0257802;REVB=0.0632644;RO=30;SAF=16;SAR=15;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0142313;STB=0.521726;TYPE=snp;VARB=0.0167026;OID=.;OPOS=6478619;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:63:30:30:31:33:15:16:15:15:15:18:15:15 chr11 6502727 . C G 321.28 PASS AO=55;DP=92;FAO=59;FDP=95;FR=.;FRO=36;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=12;FSRR=24;FWDB=0.035486;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.9285;QD=13.5275;RBI=0.058748;REFB=-0.0390973;REVB=0.0468195;RO=36;SAF=26;SAR=29;SRF=12;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102262;STB=0.560066;TYPE=snp;VARB=0.0307023;OID=.;OPOS=6502727;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:95:36:36:55:59:29:26:12:24:30:29:12:24 chr11 6502780 . C A 248.46 PASS AO=47;DP=80;FAO=47;FDP=80;FR=.;FRO=33;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=0.00762476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.185;QD=12.423;RBI=0.008398;REFB=-0.0245063;REVB=0.00351985;RO=33;SAF=21;SAR=26;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0639457;STB=0.534945;TYPE=snp;VARB=0.0199735;OID=.;OPOS=6502780;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:33:33:47:47:26:21:12:21:26:21:12:21 chr11 6519642 . G A 174.49 PASS AO=44;DP=114;FAO=50;FDP=120;FR=.;FRO=70;FSAF=15;FSAR=35;FSRF=32;FSRR=38;FWDB=0.0481292;FXX=0.00826378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.114;QD=5.81615;RBI=0.0481809;REFB=-0.0196081;REVB=-0.00223081;RO=68;SAF=9;SAR=35;SRF=31;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.319776;STB=0.600323;TYPE=snp;VARB=0.0260071;OID=.;OPOS=6519642;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:120:68:70:44:50:35:9:31:37:35:15:32:38 chr11 6520015 . G T 272.36 PASS AO=54;DP=107;FAO=59;FDP=112;FR=.;FRO=53;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=34;FSRR=19;FWDB=0.0185086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.407;QD=9.72699;RBI=0.0207785;REFB=-0.0243137;REVB=0.00944351;RO=51;SAF=27;SAR=27;SRF=32;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112366;STB=0.555368;TYPE=snp;VARB=0.0197114;OID=.;OPOS=6520015;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:112:51:53:54:59:27:27:32:19:28:31:34:19 chr11 6520164 . T A 231.32 PASS AO=55;DP=117;FAO=56;FDP=118;FR=.;FRO=62;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=31;FSRR=31;FWDB=-0.0322616;FXX=0.00840265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.0547;QD=7.84129;RBI=0.0325903;REFB=-0.0358626;REVB=0.00461748;RO=60;SAF=25;SAR=30;SRF=29;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0272124;STB=0.518804;TYPE=snp;VARB=0.0210971;OID=.;OPOS=6520164;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:118:60:62:55:56:30:25:29:31:30:26:31:31 chr11 6524072 . A C 71 PASS AO=32;DP=108;FAO=32;FDP=111;FR=.;FRO=79;FSAF=23;FSAR=9;FSRF=31;FSRR=48;FWDB=-0.0408225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.9;QD=2.55857;RBI=0.0545941;REFB=-0.00355069;REVB=-0.0362497;RO=73;SAF=22;SAR=10;SRF=31;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.31212;STB=0.729408;TYPE=snp;VARB=0.0138813;OID=.;OPOS=6524072;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:108:111:73:79:32:32:10:22:31:42:9:23:31:48 chr11 6541225 . C G 273.67 PASS AO=73;DP=167;FAO=74;FDP=169;FR=.;FRO=95;FSAF=26;FSAR=48;FSRF=37;FSRR=58;FWDB=0.0384633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.4547;QD=6.47734;RBI=0.0441789;REFB=-0.0265369;REVB=0.0217336;RO=92;SAF=25;SAR=48;SRF=36;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0531813;STB=0.523177;TYPE=snp;VARB=0.0321018;OID=.;OPOS=6541225;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:169:92:95:73:74:48:25:36:56:48:26:37:58 chr11 6549779 . A C 820.11 PASS AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0225975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.715;QD=38.1448;RBI=0.0226147;REFB=0;REVB=-0.000883662;RO=0;SAF=48;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.40972e-05;OID=.;OPOS=6549779;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:86:86:0:0:86:86:38:48:0:0:38:48:0:0 chr11 6549995 . A G 846.54 PASS AO=91;DP=92;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173354;FXX=0.0108684;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.073;QD=37.2107;RBI=0.0187824;REFB=0.0189195;REVB=-0.00722922;RO=1;SAF=44;SAR=47;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106514;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.46354e-05;OID=.;OPOS=6549995;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:92:91:1:0:91:91:47:44:1:0:47:44:0:0 chr11 6550004 . A G 857.78 PASS AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00391182;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.484;QD=38.552;RBI=0.0133805;REFB=0;REVB=-0.0127959;RO=0;SAF=42;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.28712e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000470636;OID=.;OPOS=6550004;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:89:89:0:0:89:89:47:42:0:0:46:43:0:0 chr11 6550309 . G A 1048.2 PASS AO=112;DP=113;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00619777;FXX=0.00884877;HRUN=3;LEN=1;MLLD=262.059;QD=37.4357;RBI=0.0109858;REFB=0.0224919;REVB=-0.00907058;RO=1;SAF=49;SAR=63;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00959093;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.98787e-06;OID=.;OPOS=6550309;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:113:112:1:0:112:112:63:49:1:0:63:49:0:0 chr11 6555365 . A G 568.52 PASS AO=55;DP=55;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0355798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.899;QD=38.5438;RBI=0.0999179;REFB=0;REVB=0.0933684;RO=0;SAF=37;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.85968e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000677755;OID=.;OPOS=6555365;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:55:59:0:0:55:59:18:37:0:0:22:37:0:0 chr11 6561222 . GC G 380.25 PASS AO=67;DP=119;FAO=96;FDP=108;FR=.;FRO=12;FSAF=46;FSAR=50;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.00167927;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.5096;QD=14.0832;RBI=0.082753;REFB=-0.00948363;REVB=0.082736;RO=25;SAF=29;SAR=38;SRF=10;SRR=15;SSEN=0.37037;SSEP=0;SSSB=0.0169579;STB=0.51625;TYPE=del;VARB=0.0632665;OID=.;OPOS=6561223;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:67:107:96:108:12:46:50:4:8:8:25:29:38:10:15 chr11 6567895 . C CTGCCCTACTGCA 262.05 PASS AO=40;DP=75;FAO=44;FDP=66;FR=.;FRO=22;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=-0.00639133;FXX=0.131562;HRUN=1;LEN=12;MLLD=346.014;QD=15.8818;RBI=0.0197457;REFB=-0.00147337;REVB=-0.0186827;RO=21;SAF=17;SAR=23;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0599179;STB=0.508014;TYPE=ins;VARB=0.000667108;OID=.;OPOS=6567896;OREF=-;OALT=TGCCCTACTGCA;OMAPALT=CTGCCCTACTGCA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:40:75:44:66:22:17:27:8:14:63:21:17:23:7:14 chr11 6578792 . T C 74.37 PASS AO=22;DP=58;FAO=22;FDP=59;FR=.;FRO=37;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=-0.0199723;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.545;QD=5.04169;RBI=0.0221477;REFB=-0.0107438;REVB=0.00957235;RO=36;SAF=14;SAR=8;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23587;STB=0.628366;TYPE=snp;VARB=0.0123986;OID=.;OPOS=6578792;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:58:59:36:37:22:22:8:14:15:21:8:14:16:21 chr11 6584806 . G A 443.44 PASS AO=98;DP=186;FAO=98;FDP=186;FR=.;FRO=88;FSAF=52;FSAR=46;FSRF=53;FSRR=35;FWDB=-0.00409259;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.053;QD=9.53644;RBI=0.0064023;REFB=-0.0158802;REVB=-0.00492343;RO=88;SAF=52;SAR=46;SRF=53;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0624872;STB=0.534167;TYPE=snp;VARB=0.017305;OID=.;OPOS=6584806;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:186:88:88:98:98:46:52:53:35:46:52:53:35 chr11 6585007 . G A 56.61 PASS AO=17;DP=47;FAO=17;FDP=47;FR=.;FRO=30;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=24;FWDB=-0.011278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.9504;QD=4.81823;RBI=0.0118124;REFB=-0.00235834;REVB=0.00351277;RO=28;SAF=4;SAR=13;SRF=4;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15206;STB=0.532337;TYPE=snp;VARB=0.0028586;OID=.;OPOS=6585007;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:47:47:28:30:17:17:13:4:4:24:13:4:6:24 chr11 6588256 . G A 304.29 PASS AO=74;DP=175;FAO=84;FDP=189;FR=.;FRO=105;FSAF=43;FSAR=41;FSRF=43;FSRR=62;FWDB=0.00492513;FXX=0.0156242;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.597;QD=6.43994;RBI=0.00654749;REFB=-0.0162611;REVB=0.00431425;RO=97;SAF=35;SAR=39;SRF=42;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0408818;STB=0.556743;TYPE=snp;VARB=0.0175535;OID=.;OPOS=6588256;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:189:97:105:74:84:39:35:42:55:41:43:43:62 chr11 6591380 . G C 114.27 PASS AO=28;DP=62;FAO=28;FDP=62;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=0.0445328;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.899;QD=7.37245;RBI=0.0535414;REFB=-0.0078214;REVB=0.0297239;RO=34;SAF=10;SAR=18;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0566122;STB=0.531996;TYPE=snp;VARB=0.00291089;OID=.;OPOS=6591380;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:34:34:28:28:18:10:14:20:18:10:14:20 chr11 6622714 . G A 188.81 PASS AO=49;DP=110;FAO=49;FDP=110;FR=.;FRO=61;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=45;FSRR=16;FWDB=0.0259361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.9;QD=6.86582;RBI=0.0515108;REFB=-0.002629;REVB=0.0445049;RO=60;SAF=29;SAR=20;SRF=44;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149527;STB=0.586338;TYPE=snp;VARB=0.00557121;OID=.;OPOS=6622714;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:60:61:49:49:20:29:44:16:20:29:45:16 chr11 6626049 . G A 185.4 PASS AO=62;DP=168;FAO=62;FDP=168;FR=.;FRO=106;FSAF=27;FSAR=35;FSRF=49;FSRR=57;FWDB=-0.0026789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.8351;QD=4.41436;RBI=0.0138222;REFB=-0.0185871;REVB=0.0135601;RO=106;SAF=27;SAR=35;SRF=49;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0300973;STB=0.517102;TYPE=snp;VARB=0.0337736;OID=.;OPOS=6626049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:106:106:62:62:35:27:49:57:35:27:49:57 chr11 6626072 . C A 212.83 PASS AO=67;DP=173;FAO=67;FDP=173;FR=.;FRO=106;FSAF=27;FSAR=40;FSRF=48;FSRR=58;FWDB=-0.00655434;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.595;QD=4.92083;RBI=0.00942672;REFB=-0.0147414;REVB=-0.00677523;RO=103;SAF=27;SAR=40;SRF=47;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0587281;STB=0.53134;TYPE=snp;VARB=0.0302119;OID=.;OPOS=6626072;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:173:103:106:67:67:40:27:47:56:40:27:48:58 chr11 6629665 . C T 310.08 PASS AO=78;DP=169;FAO=78;FDP=168;FR=.;FRO=90;FSAF=41;FSAR=37;FSRF=43;FSRR=47;FWDB=-0.00870667;FXX=0.0289001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.3704;QD=7.38286;RBI=0.0225824;REFB=-0.0188778;REVB=-0.0208365;RO=82;SAF=41;SAR=37;SRF=40;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0351586;STB=0.525634;TYPE=snp;VARB=0.00843626;OID=.;OPOS=6629665;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:168:82:90:78:78:37:41:40:42:37:41:43:47 chr11 6630833 . G A 405.14 PASS AO=109;DP=247;FAO=111;FDP=252;FR=.;FRO=141;FSAF=36;FSAR=75;FSRF=47;FSRR=94;FWDB=-0.03052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.146;QD=6.43078;RBI=0.0321825;REFB=-0.014949;REVB=-0.0102099;RO=135;SAF=36;SAR=73;SRF=42;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218028;STB=0.505726;TYPE=snp;VARB=0.0167242;OID=.;OPOS=6630833;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:247:252:135:141:109:111:73:36:42:93:75:36:47:94 chr11 6634149 . C T 2224.18 PASS AO=234;DP=235;FAO=234;FDP=234;FR=.;FRO=0;FSAF=119;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0225667;FXX=0.00425514;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.727;QD=38.0201;RBI=0.0321936;REFB=-0.0178042;REVB=0.0229602;RO=1;SAF=119;SAR=115;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00412617;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.76913e-05;OID=.;OPOS=6634149;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:97:235:234:1:0:234:234:115:119:0:1:115:119:0:0 chr11 6634189 . G A 534.24 PASS AO=118;DP=226;FAO=118;FDP=224;FR=.;FRO=106;FSAF=53;FSAR=65;FSRF=59;FSRR=47;FWDB=-0.0228209;FXX=0.00884917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.23;QD=9.53999;RBI=0.0344134;REFB=-0.0136368;REVB=-0.0257583;RO=105;SAF=53;SAR=65;SRF=59;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0971178;STB=0.550839;TYPE=snp;VARB=0.00797162;OID=.;OPOS=6634189;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:226:224:105:106:118:118:65:53:59:46:65:53:59:47 chr11 6636106 . T A 354.22 PASS AO=77;DP=145;FAO=77;FDP=145;FR=.;FRO=68;FSAF=24;FSAR=53;FSRF=23;FSRR=45;FWDB=-0.00884373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.3579;QD=9.77151;RBI=0.0288295;REFB=-0.0200098;REVB=-0.0274396;RO=68;SAF=24;SAR=53;SRF=23;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0261594;STB=0.514347;TYPE=snp;VARB=0.0158308;OID=.;OPOS=6636106;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:68:68:77:77:53:24:23:45:53:24:23:45 chr11 6638506 . A T 197.52 PASS AO=49;DP=108;FAO=49;FDP=106;FR=.;FRO=57;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=32;FSRR=25;FWDB=0.00252848;FXX=0.0185168;HRUN=2;LEN=1;MLLD=255.95;QD=7.45354;RBI=0.00745297;REFB=-0.00370937;REVB=-0.00701096;RO=49;SAF=25;SAR=24;SRF=26;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184446;STB=0.527563;TYPE=snp;VARB=0.0055258;OID=.;OPOS=6638506;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:106:49:57:49:49:24:25:26:23:24:25:32:25 chr11 6643188 . C CG 29.94 PASS AO=2;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0427741;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=67.1024;QD=17.1101;RBI=0.355162;REFB=-0.0244406;REVB=0.352576;RO=5;SAF=1;SAR=1;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0967026;STB=0.666029;TYPE=ins;VARB=0.218489;OID=.;OPOS=6643189;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:2:7:5:7:2:2:3:2:0:10:5:1:1:3:2 chr11 6648424 . G A 49.32 PASS AO=17;DP=53;FAO=17;FDP=53;FR=.;FRO=36;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=10;FWDB=-0.00648535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.821;QD=3.72236;RBI=0.0491117;REFB=-0.000248489;REVB=0.0486816;RO=36;SAF=5;SAR=12;SRF=26;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.464074;STB=0.771494;TYPE=snp;VARB=0.00188607;OID=.;OPOS=6648424;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:53:53:36:36:17:17:12:5:26:10:12:5:26:10 chr11 6648585 . GC G 96.55 PASS AO=13;DP=26;FAO=19;FDP=23;FR=.;FRO=4;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0503037;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.8135;QD=16.792;RBI=0.340698;REFB=-0.0296472;REVB=0.336964;RO=11;SAF=7;SAR=6;SRF=8;SRR=3;SSEN=0.457143;SSEP=0;SSSB=-0.155247;STB=0.583249;TYPE=del;VARB=0.0516185;OID=.;OPOS=6648586;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:13:24:19:23:4:10:9:4:0:5:11:7:6:8:3 chr11 6652618 . C T 237.31 PASS AO=60;DP=131;FAO=60;FDP=131;FR=.;FRO=71;FSAF=15;FSAR=45;FSRF=27;FSRR=44;FWDB=0.0406971;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=210.854;QD=7.24605;RBI=0.0435853;REFB=0.000216369;REVB=0.0156021;RO=71;SAF=15;SAR=45;SRF=27;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153683;STB=0.586016;TYPE=snp;VARB=-0.000122458;OID=.;OPOS=6652618;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:71:71:60:60:45:15:27:44:45:15:27:44 chr11 6655433 . G A 312.9 PASS AO=58;DP=98;FAO=59;FDP=99;FR=.;FRO=40;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=0.00116463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.241;QD=12.6424;RBI=0.0111469;REFB=-0.0195735;REVB=0.0110859;RO=40;SAF=31;SAR=27;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0632252;STB=0.530448;TYPE=snp;VARB=0.0090489;OID=.;OPOS=6655433;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:99:40:40:58:59:27:31:18:22:28:31:18:22 chr11 6703148 . A C 636.12 PASS AO=167;DP=377;FAO=171;FDP=379;FR=.;FRO=208;FSAF=119;FSAR=52;FSRF=89;FSRR=119;FWDB=-0.0262985;FXX=0.00263151;HRUN=6;LEN=1;MLLD=98.0487;QD=6.71362;RBI=0.0271528;REFB=-0.00204759;REVB=-0.0067576;RO=202;SAF=119;SAR=48;SRF=83;SRR=119;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.310406;STB=0.652926;TYPE=snp;VARB=0.0017991;OID=.;OPOS=6703148;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:377:379:202:208:167:171:48:119:83:119:52:119:89:119 chr11 6703158 . T A 944.24 PASS AO=226;DP=423;FAO=211;FDP=399;FR=.;FRO=188;FSAF=119;FSAR=92;FSRF=92;FSRR=96;FWDB=-0.0034412;FXX=0.00249994;HRUN=3;LEN=1;MLLD=107.43;QD=9.46602;RBI=0.0186804;REFB=-0.0111984;REVB=-0.0183607;RO=195;SAF=130;SAR=96;SRF=96;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0713329;STB=0.535417;TYPE=snp;VARB=0.0568121;OID=.;OPOS=6703158;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:423:399:195:188:226:211:96:130:96:99:92:119:92:96 chr11 6703159 . T A 925.09 PASS AO=233;DP=424;FAO=207;FDP=397;FR=.;FRO=190;FSAF=112;FSAR=95;FSRF=99;FSRR=91;FWDB=-0.00034835;FXX=0.00749981;HRUN=3;LEN=1;MLLD=127.759;QD=9.32082;RBI=0.000613418;REFB=-0.0248084;REVB=0.000504909;RO=182;SAF=131;SAR=102;SRF=87;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0685183;STB=0.509625;TYPE=snp;VARB=0.00428837;OID=.;OPOS=6703159;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:424:397:182:190:233:207:102:131:87:95:95:112:99:91 chr11 6704051 . G A 256.85 PASS AO=78;DP=205;FAO=81;FDP=208;FR=.;FRO=127;FSAF=35;FSAR=46;FSRF=46;FSRR=81;FWDB=-0.0253201;FXX=0.00478446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.577;QD=4.93941;RBI=0.0254643;REFB=-0.0175773;REVB=-0.00270652;RO=127;SAF=33;SAR=45;SRF=46;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0693305;STB=0.543986;TYPE=snp;VARB=0.0292711;OID=.;OPOS=6704051;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:208:127:127:78:81:45:33:46:81:46:35:46:81 chr11 6736784 . C T 272.95 PASS AO=63;DP=126;FAO=63;FDP=126;FR=.;FRO=63;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=44;FSRR=19;FWDB=-0.00488119;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=185.835;QD=8.66505;RBI=0.00599351;REFB=-0.00703962;REVB=0.00347795;RO=59;SAF=31;SAR=32;SRF=40;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163337;STB=0.602832;TYPE=snp;VARB=0.00533224;OID=.;OPOS=6736784;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:59:63:63:63:32:31:40:19:32:31:44:19 chr11 6738952 . G T 483.2 PASS AO=125;DP=267;FAO=124;FDP=267;FR=.;FRO=143;FSAF=64;FSAR=60;FSRF=59;FSRR=84;FWDB=-0.0326244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.793;QD=7.23893;RBI=0.0327264;REFB=0.00371685;REVB=0.00258252;RO=140;SAF=64;SAR=61;SRF=58;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0935036;STB=0.555306;TYPE=snp;VARB=-0.0051123;OID=.;OPOS=6738952;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:267:267:140:143:125:124:61:64:58:82:60:64:59:84 chr11 6739109 . G A 336.33 PASS AO=73;DP=135;FAO=72;FDP=134;FR=.;FRO=62;FSAF=40;FSAR=32;FSRF=32;FSRR=30;FWDB=0.00802881;FXX=0.00740686;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.302;QD=10.0396;RBI=0.0325802;REFB=-0.00484834;REVB=0.0315755;RO=61;SAF=40;SAR=33;SRF=31;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0332452;STB=0.51839;TYPE=snp;VARB=0.00571398;OID=.;OPOS=6739109;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:134:61:62:73:72:33:40:31:30:32:40:32:30 chr11 6739149 . AG A 502.01 PASS AO=67;DP=89;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.221654;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.3946;QD=22.0665;RBI=0.234734;REFB=-0.0529153;REVB=0.0772651;RO=16;SAF=33;SAR=34;SRF=8;SRR=8;SSEN=0.365741;SSEP=0;SSSB=-0.00269351;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0250254;OID=.;OPOS=6739150;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:67:87:91:91:0:44:47:0:0:38:16:33:34:8:8 chr11 6739407 . A G 228.22 PASS AO=49;DP=138;FAO=61;FDP=138;FR=.;FRO=77;FSAF=48;FSAR=13;FSRF=64;FSRR=13;FWDB=-0.0127486;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9822;QD=6.61511;RBI=0.0164963;REFB=-0.002847;REVB=-0.0104691;RO=89;SAF=36;SAR=13;SRF=76;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193226;STB=0.53845;TYPE=snp;VARB=0.00447059;OID=.;OPOS=6739407;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:89:77:49:61:13:36:76:13:13:48:64:13 chr11 6739814 . C T 1056.43 PASS AO=100;DP=100;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0187923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.772;QD=37.7297;RBI=0.0863562;REFB=0;REVB=0.0842867;RO=0;SAF=62;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000402943;OID=.;OPOS=6739814;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:100:112:0:0:100:112:38:62:0:0:48:64:0:0 chr11 6739822 . T C 1016.51 PASS AO=105;DP=107;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0672715;FXX=0.0185168;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.9547;QD=38.3588;RBI=0.0683832;REFB=0;REVB=0.0122802;RO=0;SAF=61;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000348544;OID=.;OPOS=6739822;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:107:106:0:0:105:106:44:61:0:0:44:62:0:0 chr11 6739850 . G A 177.06 PASS AO=47;DP=111;FAO=48;FDP=112;FR=.;FRO=64;FSAF=39;FSAR=9;FSRF=33;FSRR=31;FWDB=-0.053024;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.111;QD=6.32372;RBI=0.0553994;REFB=-0.0116417;REVB=-0.0160484;RO=60;SAF=38;SAR=9;SRF=33;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.319991;STB=0.706425;TYPE=snp;VARB=0.0225785;OID=.;OPOS=6739850;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:112:60:64:47:48:9:38:33:27:9:39:33:31 chr11 6740308 . C T 329.3 PASS AO=64;DP=130;FAO=72;FDP=138;FR=.;FRO=66;FSAF=12;FSAR=60;FSRF=21;FSRR=45;FWDB=-0.0100696;FXX=0.00719373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.847;QD=9.5448;RBI=0.0371353;REFB=-0.0259409;REVB=0.0357439;RO=66;SAF=12;SAR=52;SRF=21;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171902;STB=0.611077;TYPE=snp;VARB=0.0231948;OID=.;OPOS=6740308;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:138:66:66:64:72:52:12:21:45:60:12:21:45 chr11 6789929 . C A 428.74 PASS AO=94;DP=185;FAO=100;FDP=200;FR=.;FRO=100;FSAF=48;FSAR=52;FSRF=43;FSRR=57;FWDB=-0.00538744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.758;QD=8.57481;RBI=0.0229924;REFB=-0.0279522;REVB=0.0223524;RO=91;SAF=48;SAR=46;SRF=43;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0341314;STB=0.525085;TYPE=snp;VARB=0.0264848;OID=.;OPOS=6789929;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:200:91:100:94:100:46:48:43:48:52:48:43:57 chr11 6790028 . C G 545.56 PASS AO=128;DP=254;FAO=128;FDP=254;FR=.;FRO=126;FSAF=62;FSAR=66;FSRF=74;FSRR=52;FWDB=0.0354635;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.8702;QD=8.59144;RBI=0.0604221;REFB=-0.0257582;REVB=-0.0489201;RO=115;SAF=62;SAR=66;SRF=74;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137513;STB=0.550937;TYPE=snp;VARB=0.032333;OID=.;OPOS=6790028;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:254:254:115:126:128:128:66:62:74:41:66:62:74:52 chr11 6790106 . T C 3036.53 PASS AO=316;DP=318;FAO=318;FDP=318;FR=.;FRO=0;FSAF=165;FSAR=153;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0610223;FXX=0.0062498;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.4173;QD=38.1953;RBI=0.0610617;REFB=0;REVB=-0.00219463;RO=1;SAF=164;SAR=152;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00289979;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000238812;OID=.;OPOS=6790106;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:318:318:1:0:316:318:152:164:1:0:153:165:0:0 chr11 6806496 . T C 262.56 PASS AO=75;DP=178;FAO=75;FDP=179;FR=.;FRO=104;FSAF=27;FSAR=48;FSRF=53;FSRR=51;FWDB=-0.00586428;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.54;QD=5.86715;RBI=0.0109234;REFB=-0.00777771;REVB=-0.00921579;RO=103;SAF=27;SAR=48;SRF=53;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164219;STB=0.589566;TYPE=snp;VARB=0.0125905;OID=.;OPOS=6806496;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:179:103:104:75:75:48:27:53:50:48:27:53:51 chr11 6806827 . G T 244.05 PASS AO=71;DP=164;FAO=69;FDP=164;FR=.;FRO=95;FSAF=41;FSAR=28;FSRF=58;FSRR=37;FWDB=-0.0861506;FXX=0.00606024;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8941;QD=5.95241;RBI=0.0959;REFB=0.0281933;REVB=0.0421293;RO=93;SAF=42;SAR=29;SRF=57;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0225595;STB=0.509837;TYPE=snp;VARB=-0.0288784;OID=.;OPOS=6806827;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:164:93:95:71:69:29:42:57:36:28:41:58:37 chr11 6807163 . C G 381.23 PASS AO=87;DP=181;FAO=91;FDP=184;FR=.;FRO=93;FSAF=41;FSAR=50;FSRF=38;FSRR=55;FWDB=0.0196598;FXX=0.00540511;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.032;QD=8.28759;RBI=0.0220798;REFB=-0.0103771;REVB=-0.0100502;RO=92;SAF=40;SAR=47;SRF=39;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0337512;STB=0.521497;TYPE=snp;VARB=0.00993667;OID=.;OPOS=6807163;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:184:92:93:87:91:47:40:39:53:50:41:38:55 chr11 6807243 . G A 209.96 PASS AO=44;DP=84;FAO=45;FDP=85;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=7;FSRR=33;FWDB=0.0231359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.189;QD=9.8805;RBI=0.026823;REFB=-0.00829642;REVB=0.0135723;RO=39;SAF=15;SAR=29;SRF=7;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162831;STB=0.597911;TYPE=snp;VARB=0.00774835;OID=.;OPOS=6807243;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:85:39:40:44:45:29:15:7:32:29:16:7:33 chr11 6816778 . A G 760.76 PASS AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0075698;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.738;QD=38.5196;RBI=0.0105049;REFB=0;REVB=0.00728365;RO=0;SAF=27;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.38383e-05;OID=.;OPOS=6816778;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:79:79:0:0:79:79:52:27:0:0:52:27:0:0 chr11 6816875 . G A 118.36 PASS AO=33;DP=81;FAO=33;FDP=81;FR=.;FRO=48;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=-0.0152282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.131;QD=5.8449;RBI=0.0329279;REFB=-0.00257691;REVB=-0.029195;RO=47;SAF=16;SAR=17;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0267062;STB=0.508977;TYPE=snp;VARB=0.00267026;OID=.;OPOS=6816875;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:47:48:33:33:17:16:24:23:17:16:24:24 chr11 6867894 . T C 148.46 PASS AO=38;DP=85;FAO=38;FDP=85;FR=.;FRO=47;FSAF=12;FSAR=26;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=0.0114707;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.702;QD=6.98642;RBI=0.0115595;REFB=-0.00975106;REVB=0.00142999;RO=47;SAF=12;SAR=26;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182095;STB=0.602593;TYPE=snp;VARB=0.0095644;OID=.;OPOS=6867894;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:47:47:38:38:26:12:23:24:26:12:23:24 chr11 6891385 . G A 1012.45 PASS AO=106;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00162032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.109;QD=38.2056;RBI=0.0392349;REFB=0;REVB=0.0392015;RO=0;SAF=58;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000100909;OID=.;OPOS=6891385;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:106:106:0:0:106:106:48:58:0:0:48:58:0:0 chr11 6913127 . A G 194.69 PASS AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182019;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.211;QD=37.0846;RBI=0.0336874;REFB=0;REVB=0.0283467;RO=0;SAF=14;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000179443;OID=.;OPOS=6913127;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:21:21:0:0:21:21:7:14:0:0:7:14:0:0 chr11 6913244 . A G 446.78 PASS AO=46;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0407889;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.63;QD=38.024;RBI=0.0483709;REFB=0;REVB=0.0260001;RO=0;SAF=30;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.31553e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000337392;OID=.;OPOS=6913244;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:47:47:0:0:46:47:16:30:0:0:17:30:0:0 chr11 6942476 . C A 85.15 PASS AO=27;DP=76;FAO=27;FDP=75;FR=.;FRO=48;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=37;FWDB=-0.0226562;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.6326;QD=4.54151;RBI=0.026078;REFB=-0.00209714;REVB=-0.0129136;RO=48;SAF=9;SAR=18;SRF=11;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137942;STB=0.578893;TYPE=snp;VARB=0.0046574;OID=.;OPOS=6942476;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:76:75:48:48:27:27:18:9:11:37:18:9:11:37 chr11 6942695 . C T 502.73 PASS AO=100;DP=176;FAO=100;FDP=174;FR=.;FRO=74;FSAF=49;FSAR=51;FSRF=42;FSRR=32;FWDB=0.00795121;FXX=0.0224706;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.621;QD=11.5571;RBI=0.0160147;REFB=0.0163489;REVB=-0.0139014;RO=69;SAF=49;SAR=51;SRF=41;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0783552;STB=0.532952;TYPE=snp;VARB=-0.0156196;OID=.;OPOS=6942695;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:174:69:74:100:100:51:49:41:28:51:49:42:32 chr11 6942726 . G C 157.59 PASS AO=53;DP=140;FAO=53;FDP=145;FR=.;FRO=92;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=47;FSRR=45;FWDB=-0.0910688;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.2971;QD=4.34727;RBI=0.0985184;REFB=-0.00692693;REVB=0.0375814;RO=87;SAF=22;SAR=31;SRF=44;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100122;STB=0.561247;TYPE=snp;VARB=0.00886947;OID=.;OPOS=6942726;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:145:87:92:53:53:31:22:44:43:31:22:47:45 chr11 6942934 . T C 385.71 PASS AO=99;DP=218;FAO=100;FDP=219;FR=.;FRO=119;FSAF=41;FSAR=59;FSRF=61;FSRR=58;FWDB=-0.00215601;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.163;QD=7.04493;RBI=0.0123342;REFB=-0.00187015;REVB=-0.0121443;RO=119;SAF=41;SAR=58;SRF=61;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0980011;STB=0.556438;TYPE=snp;VARB=0.00341533;OID=.;OPOS=6942934;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:218:219:119:119:99:100:58:41:61:58:59:41:61:58 chr11 6977175 . G C 662.66 PASS AO=66;DP=68;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0377323;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.1416;QD=38.4149;RBI=0.0379415;REFB=0;REVB=0.00397837;RO=0;SAF=37;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00182643;OID=.;OPOS=6977175;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:68:69:0:0:66:69:29:37:0:0:29:40:0:0 chr11 7020920 . T A 366.8 PASS AO=141;DP=397;FAO=136;FDP=388;FR=.;FRO=252;FSAF=78;FSAR=58;FSRF=135;FSRR=117;FWDB=-0.00790274;FXX=0.0299992;HRUN=6;LEN=1;MLLD=176.592;QD=3.78139;RBI=0.024116;REFB=-0.00101023;REVB=-0.0227844;RO=254;SAF=80;SAR=61;SRF=142;SRR=112;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00960254;STB=0.524916;TYPE=snp;VARB=0.00246294;OID=.;OPOS=7020920;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:397:388:254:252:141:136:61:80:142:112:58:78:135:117 chr11 7022038 . A G 298.43 PASS AO=99;DP=266;FAO=102;FDP=273;FR=.;FRO=171;FSAF=45;FSAR=57;FSRF=100;FSRR=71;FWDB=-0.0947802;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.1679;QD=4.37255;RBI=0.0948238;REFB=-0.0169619;REVB=-0.00287337;RO=167;SAF=43;SAR=56;SRF=96;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155294;STB=0.589287;TYPE=snp;VARB=0.028745;OID=.;OPOS=7022038;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:266:273:167:171:99:102:56:43:96:71:57:45:100:71 chr11 7022160 . A G 2070.55 PASS AO=208;DP=209;FAO=216;FDP=216;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=127;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000228683;FXX=0.00917389;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.941;QD=38.3436;RBI=0.0249816;REFB=0;REVB=0.0249806;RO=0;SAF=89;SAR=119;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000349682;OID=.;OPOS=7022160;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:209:216:0:0:208:216:119:89:0:0:127:89:0:0 chr11 7022360 . A C 232.97 PASS AO=75;DP=196;FAO=75;FDP=196;FR=.;FRO=121;FSAF=50;FSAR=25;FSRF=69;FSRR=52;FWDB=-0.00561177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.51;QD=4.75452;RBI=0.022964;REFB=-0.00539827;REVB=-0.0222678;RO=118;SAF=50;SAR=25;SRF=67;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114998;STB=0.564085;TYPE=snp;VARB=0.00843041;OID=.;OPOS=7022360;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:196:118:121:75:75:25:50:67:51:25:50:69:52 chr11 7022531 . A T 345.2 PASS AO=83;DP=167;FAO=82;FDP=168;FR=.;FRO=86;FSAF=38;FSAR=44;FSRF=44;FSRR=42;FWDB=0.0124456;FXX=0.011764;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.651;QD=8.21912;RBI=0.0233762;REFB=-0.00901907;REVB=0.0197877;RO=82;SAF=39;SAR=44;SRF=44;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0602429;STB=0.524718;TYPE=snp;VARB=0.00916218;OID=.;OPOS=7022531;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:168:82:86:83:82:44:39:44:38:44:38:44:42 chr11 7022717 . T C 277.15 PASS AO=57;DP=108;FAO=58;FDP=107;FR=.;FRO=49;FSAF=20;FSAR=38;FSRF=21;FSRR=28;FWDB=0.0107236;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.117;QD=10.3608;RBI=0.0142518;REFB=-0.0186657;REVB=0.00938706;RO=49;SAF=19;SAR=38;SRF=21;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0870854;STB=0.541334;TYPE=snp;VARB=0.0101768;OID=.;OPOS=7022717;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:107:49:49:57:58:38:19:21:28:38:20:21:28 chr11 7059960 . A C 1394.33 PASS AO=146;DP=146;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165946;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.539;QD=38.2009;RBI=0.0167462;REFB=0;REVB=0.00224801;RO=0;SAF=64;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.01612e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.24078e-05;OID=.;OPOS=7059960;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:146:146:0:0:146:146:82:64:0:0:82:64:0:0 chr11 7063755 . C T 1887.32 PASS AO=193;DP=193;FAO=197;FDP=197;FR=.;FRO=0;FSAF=111;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0343974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.639;QD=38.3213;RBI=0.035192;REFB=0;REVB=0.00743623;RO=0;SAF=111;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.33622e-05;OID=.;OPOS=7063755;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:89:193:197:0:0:193:197:82:111:0:0:86:111:0:0 chr11 7071031 . G A 1337.44 PASS AO=137;DP=141;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177079;FXX=0.00694396;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.5766;QD=37.4109;RBI=0.032301;REFB=-0.0958303;REVB=-0.0270145;RO=4;SAF=56;SAR=81;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0327469;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00126893;OID=.;OPOS=7071031;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:141:143:4:0:137:143:81:56:4:0:81:62:0:0 chr11 7079038 . G A 670.96 PASS AO=164;DP=345;FAO=166;FDP=347;FR=.;FRO=181;FSAF=65;FSAR=101;FSRF=62;FSRR=119;FWDB=-0.0222632;FXX=0.0169967;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.913;QD=7.73446;RBI=0.0256137;REFB=-0.0123868;REVB=-0.0126654;RO=180;SAF=63;SAR=101;SRF=62;SRR=118;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.040356;STB=0.527147;TYPE=snp;VARB=0.0113878;OID=.;OPOS=7079038;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:345:347:180:181:164:166:101:63:62:118:101:65:62:119 chr11 7112035 . GCAA G 146.01 PASS AO=24;DP=82;FAO=38;FDP=81;FR=.;FRO=43;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=-0.00136372;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=222.35;QD=7.21014;RBI=0.0160369;REFB=0.00540619;REVB=-0.0159788;RO=33;SAF=11;SAR=13;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0270131;STB=0.520145;TYPE=del;VARB=-0.00881127;OID=.;OPOS=7112036;OREF=CAA;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:24:76:38:81:43:18:20:22:21:99:33:11:13:16:17 chr11 7324475 . T C 955.26 PASS AO=96;DP=96;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.123308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.919;QD=37.8321;RBI=0.123349;REFB=0;REVB=0.00318547;RO=0;SAF=30;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000210811;OID=.;OPOS=7324475;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:96:101:0:0:96:101:66:30:0:0:68:33:0:0 chr11 7335424 . C G 1038.76 PASS AO=107;DP=107;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0125628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.748;QD=38.1197;RBI=0.012602;REFB=0;REVB=0.000993035;RO=0;SAF=62;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.75633e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.04778e-05;OID=.;OPOS=7335424;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:107:109:0:0:107:109:45:62:0:0:46:63:0:0 chr11 7439264 . C T 523.83 PASS AO=103;DP=172;FAO=102;FDP=171;FR=.;FRO=69;FSAF=32;FSAR=70;FSRF=34;FSRR=35;FWDB=0.0156973;FXX=0.00581362;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2624;QD=12.2534;RBI=0.0171593;REFB=-0.0169992;REVB=-0.00693083;RO=68;SAF=33;SAR=70;SRF=33;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13153;STB=0.578931;TYPE=snp;VARB=0.0135766;OID=.;OPOS=7439264;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:171:68:69:103:102:70:33:33:35:70:32:34:35 chr11 7441737 . T C 477.14 PASS AO=125;DP=273;FAO=125;FDP=274;FR=.;FRO=149;FSAF=71;FSAR=54;FSRF=70;FSRR=79;FWDB=-0.0328043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.639;QD=6.96551;RBI=0.0328097;REFB=-0.0253724;REVB=0.000596214;RO=148;SAF=71;SAR=54;SRF=70;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0935607;STB=0.553606;TYPE=snp;VARB=0.0258102;OID=.;OPOS=7441737;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:273:274:148:149:125:125:54:71:70:78:54:71:70:79 chr11 7488872 . C T 2341.61 PASS AO=244;DP=248;FAO=248;FDP=248;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=155;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.050335;FXX=0.0119517;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.609;QD=37.7679;RBI=0.0665989;REFB=-0.035098;REVB=0.0436096;RO=3;SAF=91;SAR=153;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00925306;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000500435;OID=.;OPOS=7488872;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:248:248:3:0:244:248:153:91:0:3:155:93:0:0 chr11 7488927 . A C 2480.55 PASS AO=258;DP=260;FAO=261;FDP=261;FR=.;FRO=0;FSAF=120;FSAR=141;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0601731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.0524;QD=38.0161;RBI=0.0712858;REFB=0;REVB=0.0382213;RO=1;SAF=118;SAR=140;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00402294;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000131113;OID=.;OPOS=7488927;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:260:261:1:0:258:261:140:118:1:0:141:120:0:0 chr11 7489819 . A C 1170.15 PASS AO=124;DP=126;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0483935;FXX=0.0078734;HRUN=3;LEN=1;MLLD=115.623;QD=37.1477;RBI=0.0510307;REFB=-0.074633;REVB=0.0161925;RO=0;SAF=61;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000538154;OID=.;OPOS=7489819;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:126:126:0:0:124:126:63:61:0:0:63:63:0:0 chr11 7619518 . T C 2566.43 PASS AO=269;DP=272;FAO=270;FDP=270;FR=.;FRO=0;FSAF=119;FSAR=151;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00920153;FXX=0.00735267;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.942;QD=38.0212;RBI=0.00958043;REFB=-0.0155565;REVB=-0.00266768;RO=1;SAF=119;SAR=150;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00316814;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.81247e-05;OID=.;OPOS=7619518;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:272:270:1:0:269:270:150:119:0:1:151:119:0:0 chr11 7670440 . A G 2091.76 PASS AO=216;DP=217;FAO=217;FDP=217;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=129;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0299457;FXX=0.009132;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.816;QD=38.5577;RBI=0.0329738;REFB=0;REVB=-0.0138032;RO=0;SAF=87;SAR=129;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.98425e-06;OID=.;OPOS=7670440;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:217:217:0:0:216:217:129:87:0:0:129:88:0:0 chr11 7674503 . G A 304.01 PASS AO=71;DP=143;FAO=71;FDP=143;FR=.;FRO=72;FSAF=34;FSAR=37;FSRF=24;FSRR=48;FWDB=-0.0510045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.624;QD=8.50367;RBI=0.0549711;REFB=-0.00239529;REVB=-0.0205028;RO=69;SAF=34;SAR=37;SRF=22;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144904;STB=0.573848;TYPE=snp;VARB=0.002245;OID=.;OPOS=7674503;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:69:72:71:71:37:34:22:47:37:34:24:48 chr11 7686674 . T C 214.01 PASS AO=62;DP=151;FAO=62;FDP=151;FR=.;FRO=89;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=58;FSRR=31;FWDB=0.00111023;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.819;QD=5.66902;RBI=0.0301318;REFB=0.00593647;REVB=0.0301113;RO=89;SAF=34;SAR=28;SRF=58;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111021;STB=0.56218;TYPE=snp;VARB=-0.0120566;OID=.;OPOS=7686674;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:151:89:89:62:62:28:34:58:31:28:34:58:31 chr11 7687160 . C T 83.99 PASS AO=20;DP=44;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=0.0690025;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.639;QD=7.63509;RBI=0.0700972;REFB=-0.029944;REVB=-0.0123395;RO=23;SAF=5;SAR=15;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0135142;STB=0.529382;TYPE=snp;VARB=0.043472;OID=.;OPOS=7687160;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:44:44:23:24:20:20:15:5:6:17:15:5:7:17 chr11 7687715 . T C 333.53 PASS AO=92;DP=212;FAO=92;FDP=212;FR=.;FRO=120;FSAF=40;FSAR=52;FSRF=58;FSRR=62;FWDB=0.00464565;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.647;QD=6.2931;RBI=0.00794976;REFB=-0.0299613;REVB=0.0064511;RO=120;SAF=40;SAR=52;SRF=58;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0498234;STB=0.527749;TYPE=snp;VARB=0.0343233;OID=.;OPOS=7687715;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:212:120:120:92:92:52:40:58:62:52:40:58:62 chr11 7689029 . A C 283.69 PASS AO=65;DP=130;FAO=65;FDP=130;FR=.;FRO=65;FSAF=25;FSAR=40;FSRF=30;FSRR=35;FWDB=0.0162729;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2897;QD=8.72879;RBI=0.0238477;REFB=0.00194241;REVB=0.0174328;RO=65;SAF=25;SAR=40;SRF=30;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0721945;STB=0.539865;TYPE=snp;VARB=-0.00198076;OID=.;OPOS=7689029;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:65:65:65:65:40:25:30:35:40:25:30:35 chr11 7710877 . C T 231.18 PASS AO=59;DP=130;FAO=59;FDP=130;FR=.;FRO=71;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=40;FSRR=31;FWDB=-0.0183644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.215;QD=7.11333;RBI=0.0188544;REFB=-0.0153057;REVB=-0.00427073;RO=71;SAF=30;SAR=29;SRF=40;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0539339;STB=0.530016;TYPE=snp;VARB=0.0127258;OID=.;OPOS=7710877;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:71:71:59:59:29:30:40:31:29:30:40:31 chr11 7712471 . C T 138.28 PASS AO=53;DP=159;FAO=53;FDP=159;FR=.;FRO=106;FSAF=23;FSAR=30;FSRF=66;FSRR=40;FWDB=0.00652266;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.95;QD=3.47874;RBI=0.00887617;REFB=0.00195318;REVB=0.00602007;RO=106;SAF=23;SAR=30;SRF=66;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215869;STB=0.623786;TYPE=snp;VARB=-0.00404181;OID=.;OPOS=7712471;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:159:106:106:53:53:30:23:66:40:30:23:66:40 chr11 7716855 . T A 798.81 PASS AO=261;DP=267;FAO=89;FDP=92;FR=.;FRO=3;FSAF=78;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0477658;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.9052;QD=34.7307;RBI=0.0561821;REFB=-0.0240126;REVB=-0.029578;RO=5;SAF=211;SAR=50;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119548;STB=0.515415;TYPE=snp;VARB=0.00383946;OID=.;OPOS=7716855;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:267:92:5:3:261:89:50:211:3:2:11:78:2:1 chr11 7717205 . A G 10.38 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.0036746;FXX=0;HRUN=25;LEN=1;MLLD=152.727;QD=5.93125;RBI=0.0036746;REFB=0.00674846;REVB=0;RO=5;SAF=2;SAR=0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00976304;OID=.;OPOS=7717205;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:5:5:2:2:0:2:5:0:0:2:5:0 chr11 7717206 . A G 33.04 PASS AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=0;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0089617;FXX=0;HRUN=25;LEN=1;MLLD=112.733;QD=18.8802;RBI=0.0089617;REFB=0.0109575;REVB=0;RO=2;SAF=5;SAR=0;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000540809;OID=.;OPOS=7717206;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:2:2:5:5:0:5:2:0:0:5:2:0 chr11 7717209 . A T 101.95 PASS AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0147249;FXX=0;HRUN=25;LEN=1;MLLD=64.8507;QD=37.0728;RBI=0.0147249;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=11;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000405067;OID=.;OPOS=7717209;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:11:11:0:11:0:0:0:11:0:0 chr11 7717210 . A T 90.03 PASS AO=11;DP=12;FAO=11;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00188884;FXX=0;HRUN=25;LEN=1;MLLD=62.1757;QD=30.0091;RBI=0.00188884;REFB=-0.0993115;REVB=0;RO=1;SAF=11;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0128371;OID=.;OPOS=7717210;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:12:12:1:1:11:11:0:11:1:0:0:11:1:0 chr11 7717212 . A G 91.39 PASS AO=12;DP=14;FAO=12;FDP=14;FR=.;FRO=2;FSAF=12;FSAR=0;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00456528;FXX=0;HRUN=25;LEN=1;MLLD=156.395;QD=26.1115;RBI=0.00456528;REFB=0.0336378;REVB=0;RO=2;SAF=12;SAR=0;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0071173;OID=.;OPOS=7717212;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:14:14:2:2:12:12:0:12:2:0:0:12:2:0 chr11 7717214 . A G 108.77 PASS AO=13;DP=15;FAO=13;FDP=14;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0422424;FXX=0.0666222;HRUN=25;LEN=1;MLLD=108.808;QD=31.078;RBI=0.0422424;REFB=0.00359531;REVB=0;RO=1;SAF=13;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000245114;OID=.;OPOS=7717214;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:15:14:1:1:13:13:0:13:1:0:0:13:1:0 chr11 7717215 . A C 173.85 PASS AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00775078;FXX=0.0526039;HRUN=25;LEN=1;MLLD=70.6704;QD=38.6334;RBI=0.00775078;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=18;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000105998;OID=.;OPOS=7717215;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:19:18:0:0:18:18:0:18:0:0:0:18:0:0 chr11 7717216 . A C 161.58 PASS AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0325192;FXX=0;HRUN=25;LEN=1;MLLD=48.5232;QD=34.0158;RBI=0.0325192;REFB=-0.0894153;REVB=0;RO=1;SAF=18;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00731609;OID=.;OPOS=7717216;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:1:1:18:18:0:18:1:0:0:18:1:0 chr11 7717219 . A T 173.75 PASS AO=19;DP=20;FAO=19;FDP=20;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00595514;FXX=0;HRUN=25;LEN=1;MLLD=297.255;QD=34.7495;RBI=0.00595514;REFB=0.0156048;REVB=0;RO=1;SAF=19;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.58803e-05;OID=.;OPOS=7717219;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:1:1:19:19:0:19:1:0:0:19:1:0 chr11 7721870 . G A 2910.06 PASS AO=321;DP=332;FAO=324;FDP=331;FR=.;FRO=7;FSAF=208;FSAR=116;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0796577;FXX=0.00301196;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.3531;QD=35.1669;RBI=0.102047;REFB=-0.176355;REVB=0.0637823;RO=10;SAF=205;SAR=116;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00383224;STB=0.501621;TYPE=snp;VARB=0.00534218;OID=.;OPOS=7721870;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:332:331:10:7:321:324:116:205:7:3:116:208:4:3 chr11 7723002 . A G 366.87 PASS AO=82;DP=159;FAO=82;FDP=159;FR=.;FRO=77;FSAF=32;FSAR=50;FSRF=30;FSRR=47;FWDB=0.0316126;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.336;QD=9.22954;RBI=0.0350349;REFB=-0.0156966;REVB=0.0151026;RO=77;SAF=32;SAR=50;SRF=30;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000587157;STB=0.500322;TYPE=snp;VARB=0.0144088;OID=.;OPOS=7723002;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:159:77:77:82:82:50:32:30:47:50:32:30:47 chr11 7727886 . C T 337.08 PASS AO=90;DP=202;FAO=90;FDP=202;FR=.;FRO=112;FSAF=47;FSAR=43;FSRF=39;FSRR=73;FWDB=-0.0144464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.32;QD=6.67476;RBI=0.0226539;REFB=-0.00602666;REVB=-0.01745;RO=112;SAF=47;SAR=43;SRF=39;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173016;STB=0.595826;TYPE=snp;VARB=0.00851655;OID=.;OPOS=7727886;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:202:112:112:90:90:43:47:39:73:43:47:39:73 chr11 7750622 . T C 624.59 PASS AO=148;DP=297;FAO=148;FDP=297;FR=.;FRO=149;FSAF=80;FSAR=68;FSRF=93;FSRR=56;FWDB=0.00629349;FXX=0.00335559;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.249;QD=8.41203;RBI=0.0110659;REFB=-0.0112129;REVB=-0.00910203;RO=147;SAF=80;SAR=68;SRF=91;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0723922;STB=0.542514;TYPE=snp;VARB=0.011457;OID=.;OPOS=7750622;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:297:297:147:149:148:148:68:80:91:56:68:80:93:56 chr11 7847208 . T C 832.22 PASS AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00893122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.64;QD=38.2631;RBI=0.0284191;REFB=0;REVB=0.0269792;RO=0;SAF=61;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.19766e-05;OID=.;OPOS=7847208;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:87:87:0:0:87:87:26:61:0:0:26:61:0:0 chr11 7847466 . A G 695.1 PASS AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0724677;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.368;QD=37.0717;RBI=0.074257;REFB=-0.0544606;REVB=-0.0162029;RO=0;SAF=24;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000778661;OID=.;OPOS=7847466;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:75:75:0:0:75:75:51:24:0:0:50:25:0:0 chr11 7847472 . C T 525.35 PASS AO=63;DP=69;FAO=63;FDP=69;FR=.;FRO=6;FSAF=19;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.011941;FXX=0.028165;HRUN=4;LEN=1;MLLD=146.796;QD=30.4548;RBI=0.0155181;REFB=-0.109367;REVB=0.00991078;RO=6;SAF=19;SAR=44;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0265215;STB=0.514076;TYPE=snp;VARB=0.00167667;OID=.;OPOS=7847472;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:69:69:6:6:63:63:44:19:1:5:44:19:1:5 chr11 7871011 . A G 1974.97 PASS AO=208;DP=215;FAO=210;FDP=210;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=116;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0237592;FXX=0.135797;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.099;QD=37.6185;RBI=0.0305025;REFB=0.000822573;REVB=0.0191285;RO=0;SAF=92;SAR=116;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00209096;OID=.;OPOS=7871011;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:215:210:0:0:208:210:116:92:0:0:116:94:0:0 chr11 7949350 . A G 699.93 PASS AO=183;DP=403;FAO=183;FDP=397;FR=.;FRO=214;FSAF=101;FSAR=82;FSRF=106;FSRR=108;FWDB=-0.0344132;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.927;QD=7.0522;RBI=0.0346561;REFB=-0.0103057;REVB=0.00409609;RO=220;SAF=106;SAR=77;SRF=110;SRR=110;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0791741;STB=0.530635;TYPE=snp;VARB=0.012515;OID=.;OPOS=7949350;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:403:397:220:214:183:183:77:106:110:110:82:101:106:108 chr11 7949791 . A C 139.2 PASS AO=41;DP=90;FAO=40;FDP=90;FR=.;FRO=50;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=-0.0310244;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=39.6436;QD=6.18675;RBI=0.0311745;REFB=0.00386172;REVB=-0.00305631;RO=47;SAF=21;SAR=20;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0392713;STB=0.508357;TYPE=snp;VARB=-0.00702921;OID=.;OPOS=7949791;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:47:50:41:40:20:21:26:21:19:21:27:23 chr11 7949860 . G A 272.49 PASS AO=60;DP=115;FAO=60;FDP=115;FR=.;FRO=55;FSAF=39;FSAR=21;FSRF=30;FSRR=25;FWDB=-0.00757082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.704;QD=9.47806;RBI=0.00772525;REFB=-0.00163415;REVB=0.00153694;RO=55;SAF=39;SAR=21;SRF=30;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0964642;STB=0.553173;TYPE=snp;VARB=0.00176255;OID=.;OPOS=7949860;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:55:55:60:60:21:39:30:25:21:39:30:25 chr11 7982094 . G A 291.43 PASS AO=77;DP=173;FAO=77;FDP=172;FR=.;FRO=95;FSAF=28;FSAR=49;FSRF=51;FSRR=44;FWDB=0.00275549;FXX=0.00578001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.718;QD=6.77752;RBI=0.00947485;REFB=-0.0071224;REVB=0.00906532;RO=91;SAF=28;SAR=49;SRF=47;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153417;STB=0.597812;TYPE=snp;VARB=0.00451782;OID=.;OPOS=7982094;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:172:91:95:77:77:49:28:47:44:49:28:51:44 chr11 8014479 . C T 423.69 PASS AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0396795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.075;QD=37.661;RBI=0.052267;REFB=0;REVB=0.0340203;RO=0;SAF=14;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000282958;OID=.;OPOS=8014479;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:45:45:0:0:45:45:31:14:0:0:31:14:0:0 chr11 8115699 . T C 17.4 PASS AO=10;DP=49;FAO=10;FDP=49;FR=.;FRO=39;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=-0.0581112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.699;QD=1.42075;RBI=0.0583183;REFB=-0.0170233;REVB=-0.00491019;RO=36;SAF=2;SAR=8;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.334295;STB=0.698589;TYPE=snp;VARB=0.0337067;OID=.;OPOS=8115699;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:49:49:36:39:10:10:8:2:16:20:8:2:16:23 chr11 8127495 . T C 398.12 PASS AO=96;DP=197;FAO=96;FDP=197;FR=.;FRO=101;FSAF=32;FSAR=64;FSRF=53;FSRR=48;FWDB=0.00968555;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.1824;QD=8.08363;RBI=0.0921132;REFB=0.00133232;REVB=-0.0916025;RO=99;SAF=32;SAR=64;SRF=52;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185104;STB=0.602815;TYPE=snp;VARB=-0.00181146;OID=.;OPOS=8127495;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:197:99:101:96:96:64:32:52:47:64:32:53:48 chr11 8149753 . T G 449.67 PASS AO=91;DP=161;FAO=91;FDP=161;FR=.;FRO=70;FSAF=40;FSAR=51;FSRF=31;FSRR=39;FWDB=-0.00815169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.234;QD=11.172;RBI=0.0100179;REFB=0.00177785;REVB=0.00582315;RO=69;SAF=40;SAR=51;SRF=31;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00780056;STB=0.501454;TYPE=snp;VARB=-0.00106775;OID=.;OPOS=8149753;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:161:69:70:91:91:51:40:31:38:51:40:31:39 chr11 8159892 . G T 376.25 PASS AO=88;DP=184;FAO=91;FDP=188;FR=.;FRO=97;FSAF=37;FSAR=54;FSRF=48;FSRR=49;FWDB=-0.0235235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.518;QD=8.0053;RBI=0.0531072;REFB=-0.0243573;REVB=-0.0476132;RO=96;SAF=37;SAR=51;SRF=48;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0760365;STB=0.546353;TYPE=snp;VARB=0.0343714;OID=.;OPOS=8159892;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:188:96:97:88:91:51:37:48:48:54:37:48:49 chr11 8174966 . G A 1721.77 PASS AO=166;DP=171;FAO=179;FDP=179;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00867833;FXX=0.00555525;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.732;QD=38.4753;RBI=0.0111719;REFB=0;REVB=-0.00703547;RO=0;SAF=85;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.06689e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.86169e-05;OID=.;OPOS=8174966;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:171:179:0:0:166:179:81:85:0:0:87:92:0:0 chr11 8246181 . A G 121.28 PASS AO=18;DP=24;FAO=18;FDP=24;FR=.;FRO=6;FSAF=16;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.00767473;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.5631;QD=20.2136;RBI=0.0699888;REFB=-0.0813931;REVB=-0.0695668;RO=6;SAF=16;SAR=2;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206194;STB=0.615236;TYPE=snp;VARB=0.0223168;OID=.;OPOS=8246181;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:24:24:6:6:18:18:2:16:4:2:2:16:4:2 chr11 8251921 . G C 46.32 PASS AO=21;DP=76;FAO=21;FDP=77;FR=.;FRO=56;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=39;FWDB=-0.014927;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.418;QD=2.40637;RBI=0.0241295;REFB=-0.0197376;REVB=-0.0189583;RO=55;SAF=7;SAR=14;SRF=17;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0333348;STB=0.524729;TYPE=snp;VARB=0.0553032;OID=.;OPOS=8251921;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:76:77:55:56:21:21:14:7:17:38:14:7:17:39 chr11 8435077 . C T 268.71 PASS AO=92;DP=249;FAO=92;FDP=250;FR=.;FRO=158;FSAF=8;FSAR=84;FSRF=98;FSRR=60;FWDB=-0.0238768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.693;QD=4.29931;RBI=0.0284377;REFB=-0.00304823;REVB=0.0154469;RO=153;SAF=8;SAR=84;SRF=94;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.666686;STB=0.885348;TYPE=snp;VARB=0.00330061;OID=.;OPOS=8435077;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:249:250:153:158:92:92:84:8:94:59:84:8:98:60 chr11 8486310 . C A 295.68 PASS AO=80;DP=183;FAO=80;FDP=182;FR=.;FRO=102;FSAF=37;FSAR=43;FSRF=61;FSRR=41;FWDB=-0.00171347;FXX=0.00546418;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.2;QD=6.49854;RBI=0.0126513;REFB=-0.0300168;REVB=-0.0125347;RO=102;SAF=37;SAR=43;SRF=61;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135799;STB=0.575507;TYPE=snp;VARB=0.0539652;OID=.;OPOS=8486310;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:182:102:102:80:80:43:37:61:41:43:37:61:41 chr11 8646670 . T G 123.22 PASS AO=38;DP=96;FAO=38;FDP=100;FR=.;FRO=62;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=27;FSRR=35;FWDB=-0.000233179;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.3565;QD=4.92876;RBI=0.0557168;REFB=-0.0153651;REVB=-0.0557163;RO=58;SAF=24;SAR=14;SRF=27;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179287;STB=0.622158;TYPE=snp;VARB=0.0293336;OID=.;OPOS=8646670;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:100:58:62:38:38:14:24:27:31:14:24:27:35 chr11 8646763 . G C 116.47 PASS AO=21;DP=38;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.001386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.053;QD=11.0925;RBI=0.0201243;REFB=-0.0339438;REVB=0.0200765;RO=17;SAF=9;SAR=12;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.062401;STB=0.530759;TYPE=snp;VARB=0.0373054;OID=.;OPOS=8646763;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:38:42:17:19:21:23:12:9:6:11:13:10:7:12 chr11 8671369 . C T 204.21 PASS AO=62;DP=156;FAO=62;FDP=156;FR=.;FRO=94;FSAF=24;FSAR=38;FSRF=46;FSRR=48;FWDB=-0.00466152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.1261;QD=5.23623;RBI=0.0306014;REFB=-0.0156938;REVB=-0.0302443;RO=94;SAF=24;SAR=38;SRF=46;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111729;STB=0.563062;TYPE=snp;VARB=0.0277665;OID=.;OPOS=8671369;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:156:94:94:62:62:38:24:46:48:38:24:46:48 chr11 8693405 . G A,T 1570.63 PASS AO=93,86;DP=184;FAO=93,86;FDP=179;FR=.;FRO=0;FSAF=42,47;FSAR=51,39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0514146,-0.0276488;FXX=0.0271724;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=107.32,110.048;QD=35.0979;RBI=0.0520804,0.0506229;REFB=0.0499077,0.0100695;REVB=0.00830126,0.0424054;RO=5;SAF=42,47;SAR=51,39;SRF=0;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0442407,0.0569583;STB=0.5,0.5;TYPE=snp,snp;VARB=0.0192268,0.0395837;OID=.,.;OPOS=8693405,8693405;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:184:179:5:0:93,86:93,86:51,39:42,47:0:5:51,39:42,47:0:0 chr11 8707083 . G A 695.21 PASS AO=121;DP=183;FAO=121;FDP=186;FR=.;FRO=65;FSAF=40;FSAR=81;FSRF=17;FSRR=48;FWDB=-0.0169825;FXX=0.0158722;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.746;QD=14.9507;RBI=0.0184171;REFB=-0.0342696;REVB=0.00712631;RO=59;SAF=40;SAR=81;SRF=11;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103428;STB=0.527765;TYPE=snp;VARB=0.0101406;OID=.;OPOS=8707083;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:186:59:65:121:121:81:40:11:48:81:40:17:48 chr11 8707233 . C T 393.13 PASS AO=87;DP=170;FAO=87;FDP=168;FR=.;FRO=81;FSAF=34;FSAR=53;FSRF=27;FSRR=54;FWDB=-0.000219955;FXX=0.011764;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.5109;QD=9.36019;RBI=0.0280203;REFB=-0.0162107;REVB=0.0280194;RO=78;SAF=34;SAR=53;SRF=26;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0528086;STB=0.529465;TYPE=snp;VARB=0.0140904;OID=.;OPOS=8707233;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:168:78:81:87:87:53:34:26:52:53:34:27:54 chr11 8717003 . C T 1340.79 PASS AO=144;DP=148;FAO=145;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00346847;FXX=0.0202689;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.66;QD=36.9873;RBI=0.00683138;REFB=-0.040915;REVB=0.00588536;RO=3;SAF=80;SAR=64;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0217652;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00017864;OID=.;OPOS=8717003;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:148:145:3:0:144:145:64:80:0:3:65:80:0:0 chr11 8751640 . G C 81.8 PASS AO=23;DP=60;FAO=23;FDP=59;FR=.;FRO=36;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=25;FSRR=11;FWDB=0.0274638;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.1898;QD=5.54562;RBI=0.0535492;REFB=-0.0251376;REVB=0.0459701;RO=36;SAF=18;SAR=5;SRF=25;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124948;STB=0.572497;TYPE=snp;VARB=0.0461436;OID=.;OPOS=8751640;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:60:59:36:36:23:23:5:18:25:11:5:18:25:11 chr11 8751889 . C G 43.19 PASS AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.00711693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.875;QD=11.5177;RBI=0.0402595;REFB=-0.00108478;REVB=0.0396255;RO=6;SAF=1;SAR=7;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.392868;STB=0.776953;TYPE=snp;VARB=0.00193579;OID=.;OPOS=8751889;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:15:15:6:7:8:8:7:1:3:3:7:1:4:3 chr11 8788168 . A T 204.12 PASS AO=62;DP=156;FAO=62;FDP=156;FR=.;FRO=94;FSAF=21;FSAR=41;FSRF=40;FSRR=54;FWDB=0.00897597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.6;QD=5.23389;RBI=0.0122994;REFB=0.0189711;REVB=-0.00840874;RO=93;SAF=21;SAR=41;SRF=40;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104218;STB=0.556254;TYPE=snp;VARB=-0.0233521;OID=.;OPOS=8788168;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:156:93:94:62:62:41:21:40:53:41:21:40:54 chr11 8788225 . A C 237.23 PASS AO=57;DP=150;FAO=69;FDP=161;FR=.;FRO=92;FSAF=24;FSAR=45;FSRF=35;FSRR=57;FWDB=0.0061653;FXX=0.0122692;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.115;QD=5.89397;RBI=0.0121754;REFB=-0.000311517;REVB=0.010499;RO=93;SAF=20;SAR=37;SRF=36;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0427821;STB=0.520276;TYPE=snp;VARB=0.000616402;OID=.;OPOS=8788225;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:161:93:92:57:69:37:20:36:57:45:24:35:57 chr11 8797707 . G A 15.78 PASS AO=3;DP=7;FAO=3;FDP=7;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0683617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.157;QD=9.01938;RBI=0.0683617;REFB=-0.0757542;REVB=0;RO=4;SAF=3;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0637584;OID=.;OPOS=8797707;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:7:7:4:4:3:3:0:3:4:0:0:3:4:0 chr11 8866808 . C G 159.07 PASS AO=42;DP=96;FAO=42;FDP=96;FR=.;FRO=54;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=26;FSRR=28;FWDB=0.0204251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.3551;QD=6.62809;RBI=0.0415921;REFB=-0.016119;REVB=0.0362314;RO=53;SAF=23;SAR=19;SRF=25;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0755609;STB=0.537259;TYPE=snp;VARB=0.0209016;OID=.;OPOS=8866808;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:53:54:42:42:19:23:25:28:19:23:26:28 chr11 8933064 . G A 90.34 PASS AO=16;DP=35;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=0.143708;FXX=0.0256345;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.659;QD=9.50977;RBI=0.167055;REFB=-0.0456886;REVB=0.0851775;RO=19;SAF=7;SAR=9;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119416;STB=0.579751;TYPE=snp;VARB=0.0513394;OID=.;OPOS=8933064;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:35:38:19:19:16:19:9:7:6:13:10:9:6:13 chr11 8938934 . C T 346.98 PASS AO=80;DP=162;FAO=81;FDP=162;FR=.;FRO=81;FSAF=40;FSAR=41;FSRF=33;FSRR=48;FWDB=0.0448479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6251;QD=8.5675;RBI=0.0457591;REFB=-0.0549007;REVB=-0.00908623;RO=82;SAF=39;SAR=41;SRF=34;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.067133;STB=0.543252;TYPE=snp;VARB=0.0550251;OID=.;OPOS=8938934;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:162:82:81:80:81:41:39:34:48:41:40:33:48 chr11 8942942 . C T 888.98 PASS AO=197;DP=373;FAO=197;FDP=372;FR=.;FRO=175;FSAF=104;FSAR=93;FSRF=103;FSRR=72;FWDB=0.00735338;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.288;QD=9.55891;RBI=0.0084117;REFB=-0.00144229;REVB=-0.00408467;RO=174;SAF=104;SAR=93;SRF=103;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0555082;STB=0.528711;TYPE=snp;VARB=0.00128767;OID=.;OPOS=8942942;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:373:372:174:175:197:197:93:104:103:71:93:104:103:72 chr11 8942999 . G A 3841.82 PASS AO=396;DP=397;FAO=399;FDP=399;FR=.;FRO=0;FSAF=214;FSAR=185;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0274522;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.889;QD=38.5145;RBI=0.0310791;REFB=0;REVB=0.0145701;RO=0;SAF=209;SAR=187;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000103822;OID=.;OPOS=8942999;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:397:399:0:0:396:399:187:209:0:0:185:214:0:0 chr11 8947179 . G A 246.14 PASS AO=51;DP=93;FAO=51;FDP=93;FR=.;FRO=42;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=15;FSRR=27;FWDB=0.00865886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.935;QD=10.5866;RBI=0.0182396;REFB=-0.0248368;REVB=-0.0160532;RO=42;SAF=23;SAR=28;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0786559;STB=0.543135;TYPE=snp;VARB=0.0204718;OID=.;OPOS=8947179;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:42:42:51:51:28:23:15:27:28:23:15:27 chr11 8948680 . A T 161.01 PASS AO=50;DP=130;FAO=50;FDP=130;FR=.;FRO=80;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=12;FSRR=68;FWDB=0.0328213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.8351;QD=4.95413;RBI=0.0355578;REFB=0.00285743;REVB=-0.0136793;RO=80;SAF=21;SAR=29;SRF=12;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.324798;STB=0.680301;TYPE=snp;VARB=-0.00475676;OID=.;OPOS=8948680;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:80:80:50:50:29:21:12:68:29:21:12:68 chr11 8959370 . G A 488.87 PASS AO=96;DP=164;FAO=96;FDP=164;FR=.;FRO=68;FSAF=35;FSAR=61;FSRF=28;FSRR=40;FWDB=-0.00600684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.781;QD=11.9236;RBI=0.0208026;REFB=-0.00921005;REVB=0.0199165;RO=67;SAF=35;SAR=61;SRF=27;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0310728;STB=0.520868;TYPE=snp;VARB=0.00793219;OID=.;OPOS=8959370;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:164:67:68:96:96:61:35:27:40:61:35:28:40 chr11 8959511 . T G 129.95 PASS AO=37;DP=89;FAO=37;FDP=91;FR=.;FRO=54;FSAF=27;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=34;FWDB=0.0103621;FXX=0.0108684;HRUN=3;LEN=1;MLLD=152.999;QD=5.71207;RBI=0.030935;REFB=-0.0239185;REVB=-0.0291479;RO=46;SAF=27;SAR=10;SRF=20;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.308204;STB=0.716407;TYPE=snp;VARB=0.0270497;OID=.;OPOS=8959511;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:91:46:54:37:37:10:27:20:26:10:27:20:34 chr11 8959545 . C A 140.92 PASS AO=40;DP=99;FAO=40;FDP=98;FR=.;FRO=58;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=38;FWDB=0.00915827;FXX=0.0101;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.2022;QD=5.75183;RBI=0.0632221;REFB=-0.0124872;REVB=-0.0625552;RO=57;SAF=24;SAR=16;SRF=19;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.272166;STB=0.647928;TYPE=snp;VARB=0.0113012;OID=.;OPOS=8959545;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:98:57:58:40:40:16:24:19:38:16:24:20:38 chr11 8968878 . GAGGACAT G,GAGGACAG 415.26 PASS AO=10,34;DP=50;FAO=11,34;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=4,17;FSAR=7,17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0294307,0.0278726;FXX=0.0425441;HRUN=1,1;LEN=7,1;MLLD=142.029,173.396;QD=36.912;RBI=0.0352798,0.0467483;REFB=0,0;REVB=0.0194551,0.0375303;RO=0;SAF=3,17;SAR=7,17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0269338,0.00313298;OID=.,.;OPOS=8968879,8968885;OREF=AGGACAT,T;OALT=-,G;OMAPALT=G,GAGGACAG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:10,34:46:11,34:45:0:4,17:7,17:0:0:24:0:3,17:7,17:0:0 chr11 9005036 . T A 1991.25 PASS AO=207;DP=207;FAO=207;FDP=207;FR=.;FRO=0;FSAF=99;FSAR=108;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0117722;FXX=0.00480746;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.868;QD=38.4782;RBI=0.0169271;REFB=0;REVB=-0.0121631;RO=0;SAF=99;SAR=108;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.23836e-06;OID=.;OPOS=9005036;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:94:207:207:0:0:207:207:108:99:0:0:108:99:0:0 chr11 9052423 . A C 1085.83 PASS AO=115;DP=118;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0533443;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.977;QD=37.1225;RBI=0.0609839;REFB=-0.0901699;REVB=0.0295537;RO=2;SAF=43;SAR=72;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.021571;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000455469;OID=.;OPOS=9052423;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:118:117:2:0:115:117:72:43:2:0:73:44:0:0 chr11 9316937 . G A 1805.22 PASS AO=185;DP=186;FAO=189;FDP=189;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=160;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0560793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.05;QD=38.2058;RBI=0.0586905;REFB=0;REVB=0.0173113;RO=0;SAF=27;SAR=158;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000437213;OID=.;OPOS=9316937;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:186:189:0:0:185:189:158:27:0:0:160:29:0:0 chr11 9406349 . T C 290.01 PASS AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0626887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.429;QD=37.4205;RBI=0.0641736;REFB=0;REVB=0.013725;RO=0;SAF=12;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.47712e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00017629;OID=.;OPOS=9406349;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:31:31:0:0:31:31:19:12:0:0:19:12:0:0 chr11 9430091 . AG A 804.72 PASS AO=110;DP=141;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.183005;FXX=0.00714235;HRUN=4;LEN=1;MLLD=12.8497;QD=23.1575;RBI=0.36668;REFB=-0.0059252;REVB=-0.317748;RO=11;SAF=83;SAR=27;SRF=10;SRR=1;SSEN=0.333333;SSEP=0;SSSB=-0.0366181;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.000660367;OID=.;OPOS=9430092;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:110:137:139:139:0:94:45:0:0:65:11:83:27:10:1 chr11 9450377 . T G 500.29 PASS AO=131;DP=288;FAO=131;FDP=286;FR=.;FRO=155;FSAF=69;FSAR=62;FSRF=82;FSRR=73;FWDB=-0.00425094;FXX=0.0069442;HRUN=5;LEN=1;MLLD=215.261;QD=6.997;RBI=0.0117178;REFB=-0.00886385;REVB=0.0109196;RO=153;SAF=69;SAR=62;SRF=80;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00375647;STB=0.501258;TYPE=snp;VARB=0.0107407;OID=.;OPOS=9450377;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:288:286:153:155:131:131:62:69:80:73:62:69:82:73 chr11 9537904 . G C 805.82 PASS AO=86;DP=87;FAO=86;FDP=87;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=51;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0176988;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=169.623;QD=37.049;RBI=0.0183677;REFB=0.0679261;REVB=0.00491161;RO=1;SAF=35;SAR=51;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133435;STB=0.507041;TYPE=snp;VARB=-8.8884e-05;OID=.;OPOS=9537904;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:87:87:1:1:86:86:51:35:1:0:51:35:1:0 chr11 9599472 . C T 327.85 PASS AO=102;DP=257;FAO=102;FDP=257;FR=.;FRO=155;FSAF=36;FSAR=66;FSRF=61;FSRR=94;FWDB=0.00526804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.405;QD=5.10272;RBI=0.0162786;REFB=-0.00542823;REVB=0.0154026;RO=154;SAF=36;SAR=66;SRF=61;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0497543;STB=0.526388;TYPE=snp;VARB=0.00912499;OID=.;OPOS=9599472;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:257:257:154:155:102:102:66:36:61:93:66:36:61:94 chr11 9702584 . C T 93.42 PASS AO=29;DP=78;FAO=29;FDP=78;FR=.;FRO=49;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=29;FWDB=-0.0270785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7632;QD=4.7909;RBI=0.0436936;REFB=-0.0281966;REVB=-0.0342912;RO=49;SAF=16;SAR=13;SRF=20;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155872;STB=0.589413;TYPE=snp;VARB=0.0519469;OID=.;OPOS=9702584;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:78:78:49:49:29:29:13:16:20:29:13:16:20:29 chr11 9748483 . T C 127.23 PASS AO=33;DP=118;FAO=61;FDP=211;FR=.;FRO=150;FSAF=48;FSAR=13;FSRF=56;FSRR=94;FWDB=0.011688;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.84;QD=2.41188;RBI=0.0227949;REFB=-0.000453623;REVB=-0.0195704;RO=85;SAF=27;SAR=6;SRF=32;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.536021;STB=0.791521;TYPE=snp;VARB=0.000597439;OID=.;OPOS=9748483;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:211:85:150:33:61:6:27:32:53:13:48:56:94 chr11 9749645 . A C 374.62 PASS AO=93;DP=197;FAO=93;FDP=197;FR=.;FRO=104;FSAF=73;FSAR=20;FSRF=70;FSRR=34;FWDB=-0.0120762;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.0696;QD=7.6065;RBI=0.0125114;REFB=-0.0143761;REVB=0.00327116;RO=103;SAF=73;SAR=20;SRF=69;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146093;STB=0.579517;TYPE=snp;VARB=0.0163693;OID=.;OPOS=9749645;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:197:103:104:93:93:20:73:69:34:20:73:70:34 chr11 9754221 . C T 119.3 PASS AO=28;DP=59;FAO=28;FDP=60;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=0.010111;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.9731;QD=7.95362;RBI=0.0101361;REFB=-0.0184071;REVB=0.000713018;RO=31;SAF=15;SAR=13;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0485052;STB=0.535689;TYPE=snp;VARB=0.0291528;OID=.;OPOS=9754221;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:60:31:32:28:28:13:15:15:16:13:15:15:17 chr11 9769562 . C G 173.86 PASS AO=35;DP=63;FAO=35;FDP=63;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=6;FSRR=22;FWDB=-0.000349071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.682;QD=11.0387;RBI=0.0151489;REFB=-0.0342132;REVB=-0.0151448;RO=26;SAF=11;SAR=24;SRF=5;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115217;STB=0.553581;TYPE=snp;VARB=0.0230343;OID=.;OPOS=9769562;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:26:28:35:35:24:11:5:21:24:11:6:22 chr11 9800601 . G A 308.69 PASS AO=71;DP=152;FAO=76;FDP=158;FR=.;FRO=82;FSAF=37;FSAR=39;FSRF=34;FSRR=48;FWDB=0.0151228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.978;QD=7.81493;RBI=0.0252187;REFB=-0.00415544;REVB=-0.0201813;RO=80;SAF=33;SAR=38;SRF=33;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0504786;STB=0.537565;TYPE=snp;VARB=0.00443472;OID=.;OPOS=9800601;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:158:80:82:71:76:38:33:33:47:39:37:34:48 chr11 9983446 . T C 282.02 PASS AO=77;DP=186;FAO=79;FDP=185;FR=.;FRO=106;FSAF=41;FSAR=38;FSRF=51;FSRR=55;FWDB=0.00795699;FXX=0.00537606;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.409;QD=6.09775;RBI=0.0135431;REFB=-0.00772518;REVB=0.0109591;RO=105;SAF=39;SAR=38;SRF=51;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0214417;STB=0.52168;TYPE=snp;VARB=0.00953386;OID=.;OPOS=9983446;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:185:105:106:77:79:38:39:51:54:38:41:51:55 chr11 10327547 . C G 264.36 PASS AO=67;DP=146;FAO=67;FDP=145;FR=.;FRO=78;FSAF=37;FSAR=30;FSRF=37;FSRR=41;FWDB=-0.0287644;FXX=0.00684885;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.571;QD=7.2928;RBI=0.0326852;REFB=-0.0108109;REVB=-0.0155219;RO=77;SAF=37;SAR=30;SRF=37;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0692932;STB=0.541972;TYPE=snp;VARB=0.0176265;OID=.;OPOS=10327547;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:145:77:78:67:67:30:37:37:40:30:37:37:41 chr11 10328552 . AG A 818.07 PASS AO=104;DP=149;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0620948;FXX=0.0143875;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.5909;QD=23.8853;RBI=0.367171;REFB=0;REVB=0.361882;RO=20;SAF=69;SAR=35;SRF=2;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0.348568;SSSB=0.179382;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00931203;OID=.;OPOS=10328553;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:104:135:137:137:0:79:58:0:0:69:20:69:35:2:18 chr11 10328747 . T TC 780.53 PASS AO=110;DP=171;FAO=170;FDP=171;FR=.;FRO=1;FSAF=80;FSAR=90;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.138956;FXX=0.00581362;HRUN=4;LEN=1;MLLD=10.5071;QD=18.2581;RBI=0.162562;REFB=0.0988093;REVB=-0.0843663;RO=36;SAF=60;SAR=50;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0468213;STB=0.503105;TYPE=ins;VARB=0.00347425;OID=.;OPOS=10328748;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:110:171:170:171:1:80:90:1:0:51:36:60:50:16:20 chr11 10521749 . C T 220.45 PASS AO=60;DP=139;FAO=60;FDP=139;FR=.;FRO=79;FSAF=19;FSAR=41;FSRF=37;FSRR=42;FWDB=0.013804;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.478;QD=6.34376;RBI=0.0154908;REFB=-0.00348914;REVB=0.00702946;RO=77;SAF=19;SAR=41;SRF=35;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149818;STB=0.59279;TYPE=snp;VARB=0.00404923;OID=.;OPOS=10521749;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:77:79:60:60:41:19:35:42:41:19:37:42 chr11 10533952 . T C 1201.17 PASS AO=126;DP=130;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0254468;FXX=0.0307669;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.537;QD=38.1325;RBI=0.0512428;REFB=-0.0890715;REVB=0.0444779;RO=1;SAF=68;SAR=58;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0081221;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000263601;OID=.;OPOS=10533952;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:130:126:1:0:126:126:58:68:0:1:58:68:0:0 chr11 10655609 . C T 1645.37 PASS AO=172;DP=175;FAO=172;FDP=172;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0336183;FXX=0.0171419;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.1219;QD=38.2645;RBI=0.0350306;REFB=0;REVB=0.00984628;RO=0;SAF=76;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000108228;OID=.;OPOS=10655609;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:175:172:0:0:172:172:96:76:0:0:96:76:0:0 chr11 10673739 . T C 1867.17 PASS AO=197;DP=202;FAO=197;FDP=197;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00304732;FXX=0.0247512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.566;QD=37.9121;RBI=0.0284117;REFB=-0.00814018;REVB=0.0282478;RO=1;SAF=105;SAR=92;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00514866;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.44226e-05;OID=.;OPOS=10673739;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:202:197:1:0:197:197:92:105:0:1:92:105:0:0 chr11 10715124 . T C 84.49 PASS AO=39;DP=136;FAO=36;FDP=120;FR=.;FRO=84;FSAF=25;FSAR=11;FSRF=27;FSRR=57;FWDB=0.000966758;FXX=0.00826378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.494;QD=2.81632;RBI=0.0019791;REFB=-0.00673349;REVB=0.00172691;RO=96;SAF=26;SAR=13;SRF=34;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.366374;STB=0.748111;TYPE=snp;VARB=0.0113269;OID=.;OPOS=10715124;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:136:120:96:84:39:36:13:26:34:62:11:25:27:57 chr11 10786142 . C T 2423.72 PASS AO=252;DP=253;FAO=253;FDP=253;FR=.;FRO=0;FSAF=114;FSAR=139;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.027299;FXX=0.00393685;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.468;QD=38.3197;RBI=0.0274106;REFB=0;REVB=0.0024714;RO=0;SAF=114;SAR=138;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000171193;OID=.;OPOS=10786142;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:253:253:0:0:252:253:138:114:0:0:139:114:0:0 chr11 10822350 . C T 3782.19 PASS AO=393;DP=394;FAO=395;FDP=395;FR=.;FRO=0;FSAF=209;FSAR=186;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.901;QD=38.3007;RBI=0.0314069;REFB=0;REVB=0.0249561;RO=0;SAF=208;SAR=185;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.23963e-05;OID=.;OPOS=10822350;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:394:395:0:0:393:395:185:208:0:0:186:209:0:0 chr11 10823079 . T C 1239.05 PASS AO=127;DP=130;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235501;FXX=0.0370343;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.339;QD=38.1247;RBI=0.0305074;REFB=0;REVB=0.0193932;RO=0;SAF=58;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.35241e-05;OID=.;OPOS=10823079;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:130:130:0:0:127:130:69:58:0:0:72:58:0:0 chr11 10828361 . C A 1233.52 PASS AO=127;DP=128;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0519303;FXX=0.00769172;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.6017;QD=38.2487;RBI=0.0559728;REFB=0;REVB=0.0208853;RO=0;SAF=62;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.21802e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00226966;OID=.;OPOS=10828361;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:128:129:0:0:127:129:65:62:0:0:67:62:0:0 chr11 11292700 . G C 141.27 PASS AO=40;DP=100;FAO=41;FDP=101;FR=.;FRO=60;FSAF=12;FSAR=29;FSRF=18;FSRR=42;FWDB=-0.0116148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.525;QD=5.59478;RBI=0.0202118;REFB=-0.0160891;REVB=-0.0165413;RO=60;SAF=11;SAR=29;SRF=18;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0325625;STB=0.505224;TYPE=snp;VARB=0.0250156;OID=.;OPOS=11292700;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:101:60:60:40:41:29:11:18:42:29:12:18:42 chr11 11354346 . T C 274.44 PASS AO=62;DP=122;FAO=62;FDP=122;FR=.;FRO=60;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=39;FSRR=21;FWDB=-0.00548837;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.668;QD=8.99805;RBI=0.00586919;REFB=-0.0260692;REVB=0.00207973;RO=60;SAF=34;SAR=28;SRF=39;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0925805;STB=0.550927;TYPE=snp;VARB=0.0398087;OID=.;OPOS=11354346;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:60:60:62:62:28:34:39:21:28:34:39:21 chr11 11373508 . T C 306.11 PASS AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00337839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7884;QD=37.104;RBI=0.0106718;REFB=0;REVB=0.0101229;RO=0;SAF=30;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00026221;OID=.;OPOS=11373508;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:33:33:0:0:33:33:3:30:0:0:3:30:0:0 chr11 11373587 . A G 1171.86 PASS AO=114;DP=114;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00363741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.876;QD=37.8018;RBI=0.0217479;REFB=0;REVB=0.0214415;RO=0;SAF=82;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.80169e-05;OID=.;OPOS=11373587;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:114:124:0:0:114:124:32:82:0:0:40:84:0:0 chr11 11373635 . C T 1749.63 PASS AO=177;DP=177;FAO=183;FDP=183;FR=.;FRO=0;FSAF=126;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188735;FXX=0.00543449;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.4925;QD=38.2434;RBI=0.0454702;REFB=0;REVB=0.0413683;RO=0;SAF=126;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000129952;OID=.;OPOS=11373635;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:177:183:0:0:177:183:51:126:0:0:57:126:0:0 chr11 11373808 . T G 2294.18 PASS AO=241;DP=242;FAO=242;FDP=242;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=138;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189654;FXX=0.00819639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.421;QD=37.9204;RBI=0.0383804;REFB=-0.0279993;REVB=-0.0333672;RO=1;SAF=103;SAR=138;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0034414;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.55431e-05;OID=.;OPOS=11373808;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:242:242:1:0:241:242:138:103:0:1:138:104:0:0 chr11 11373925 . A C 1542.79 PASS AO=200;DP=229;FAO=197;FDP=228;FR=.;FRO=31;FSAF=82;FSAR=115;FSRF=26;FSRR=5;FWDB=0.00262106;FXX=0.00436662;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.0744;QD=27.0664;RBI=0.0128512;REFB=-0.204385;REVB=0.0125811;RO=27;SAF=84;SAR=116;SRF=25;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114702;STB=0.557946;TYPE=snp;VARB=0.0280167;OID=.;OPOS=11373925;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:229:228:27:31:200:197:116:84:25:2:115:82:26:5 chr11 11373960 . C T 723.07 PASS AO=140;DP=235;FAO=140;FDP=235;FR=.;FRO=95;FSAF=69;FSAR=71;FSRF=52;FSRR=43;FWDB=-0.0242715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.4142;QD=12.3076;RBI=0.0278249;REFB=-0.0431356;REVB=-0.0136058;RO=94;SAF=69;SAR=71;SRF=51;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.036896;STB=0.522024;TYPE=snp;VARB=0.027247;OID=.;OPOS=11373960;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:235:235:94:95:140:140:71:69:51:43:71:69:52:43 chr11 11374016 . T A 3060.37 PASS AO=313;DP=314;FAO=319;FDP=319;FR=.;FRO=0;FSAF=147;FSAR=172;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0341617;FXX=0.00931648;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.655;QD=38.3745;RBI=0.0526082;REFB=0;REVB=-0.0400075;RO=0;SAF=142;SAR=171;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.24111e-06;OID=.;OPOS=11374016;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:314:319:0:0:313:319:171:142:0:0:172:147:0:0 chr11 11374283 . T G 3263.17 PASS AO=351;DP=370;FAO=355;FDP=355;FR=.;FRO=0;FSAF=208;FSAR=147;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222194;FXX=0.0456977;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.345;QD=36.7681;RBI=0.0284039;REFB=-0.0017887;REVB=0.017694;RO=6;SAF=205;SAR=146;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00823611;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.95077e-05;OID=.;OPOS=11374283;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:370:355:6:0:351:355:146:205:5:1:147:208:0:0 chr11 11913585 . G T 156.84 PASS AO=74;DP=251;FAO=74;FDP=251;FR=.;FRO=177;FSAF=31;FSAR=43;FSRF=60;FSRR=117;FWDB=0.0209469;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=251.882;QD=2.49939;RBI=0.0275791;REFB=0.00887329;REVB=-0.0179397;RO=175;SAF=31;SAR=43;SRF=58;SRR=117;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111347;STB=0.558984;TYPE=snp;VARB=-0.0197135;OID=.;OPOS=11913585;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:251:251:175:177:74:74:43:31:58:117:43:31:60:117 chr11 11976628 . G A 2278.42 PASS AO=238;DP=239;FAO=238;FDP=238;FR=.;FRO=0;FSAF=137;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00553017;FXX=0.00833299;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.9006;QD=38.2928;RBI=0.062097;REFB=0;REVB=-0.0618502;RO=0;SAF=137;SAR=101;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000487149;OID=.;OPOS=11976628;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:239:238:0:0:238:238:101:137:0:0:101:137:0:0 chr11 11977573 . T C 193.93 PASS AO=52;DP=124;FAO=54;FDP=125;FR=.;FRO=71;FSAF=31;FSAR=23;FSRF=39;FSRR=32;FWDB=0.0182168;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.9604;QD=6.20573;RBI=0.020825;REFB=-0.0112711;REVB=-0.0100911;RO=71;SAF=30;SAR=22;SRF=39;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0289274;STB=0.514323;TYPE=snp;VARB=0.0158268;OID=.;OPOS=11977573;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:125:71:71:52:54:22:30:39:32:23:31:39:32 chr11 11978815 . T TGA 377.39 PASS AO=110;DP=266;FAO=110;FDP=263;FR=.;FRO=153;FSAF=55;FSAR=55;FSRF=73;FSRR=80;FWDB=0.00918823;FXX=0.0112778;HRUN=1;LEN=2;MLLD=245.642;QD=5.73975;RBI=0.0105141;REFB=-0.0150843;REVB=-0.005111;RO=151;SAF=55;SAR=55;SRF=72;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240488;STB=0.513306;TYPE=ins;VARB=0.0202761;OID=.;OPOS=11978816;OREF=-;OALT=GA;OMAPALT=TGA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:110:266:110:263:153:55:55:73:80:99:151:55:55:72:79 chr11 11986061 . T C 579.74 PASS AO=56;DP=56;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0593795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.867;QD=37.4027;RBI=0.0632236;REFB=0;REVB=-0.0217093;RO=0;SAF=27;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.36532e-05;OID=.;OPOS=11986061;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:56:62:0:0:56:62:29:27:0:0:30:32:0:0 chr11 12115719 . TG T 349.05 PASS AO=57;DP=70;FAO=62;FDP=67;FR=.;FRO=5;FSAF=56;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.014236;FXX=0.042851;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.7741;QD=20.8389;RBI=0.341473;REFB=-0.0227255;REVB=0.341176;RO=9;SAF=55;SAR=2;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0.306818;SSSB=0.427262;STB=0.52127;TYPE=del;VARB=0.0476672;OID=.;OPOS=12115720;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:57:70:62:67:5:56:6:4:1:12:9:55:2:5:4 chr11 12183846 . C T 2003.78 PASS AO=203;DP=206;FAO=212;FDP=212;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=131;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00220382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.001;QD=37.8072;RBI=0.00454642;REFB=0;REVB=0.00397657;RO=0;SAF=76;SAR=127;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.38617e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.44483e-06;OID=.;OPOS=12183846;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:206:212:0:0:203:212:127:76:0:0:131:81:0:0 chr11 12225945 . GT G 235.12 PASS AO=59;DP=168;FAO=65;FDP=153;FR=.;FRO=88;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=21;FSRR=67;FWDB=-0.0131474;FXX=0.0838273;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.969;QD=6.14699;RBI=0.0142755;REFB=-0.0012618;REVB=0.00556192;RO=86;SAF=30;SAR=29;SRF=21;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280029;STB=0.654011;TYPE=del;VARB=0.000197047;OID=.;OPOS=12225946;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:59:164:65:153:88:33:32:21:67:99:86:30:29:21:65 chr11 12315186 . G A 347.41 PASS AO=49;DP=63;FAO=50;FDP=64;FR=.;FRO=14;FSAF=13;FSAR=37;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.0272892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.457;QD=21.7132;RBI=0.0561883;REFB=-0.0504143;REVB=-0.0491165;RO=14;SAF=13;SAR=36;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0107607;STB=0.507255;TYPE=snp;VARB=0.0106936;OID=.;OPOS=12315186;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:63:64:14:14:49:50:36:13:4:10:37:13:4:10 chr11 12315407 . G C 363.27 PASS AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0500041;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.8982;QD=38.2384;RBI=0.111555;REFB=0;REVB=0.0997202;RO=0;SAF=28;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000903128;OID=.;OPOS=12315407;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:38:38:0:0:38:38:10:28:0:0:10:28:0:0 chr11 12315716 . C T 201.73 PASS AO=24;DP=26;FAO=24;FDP=26;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0584063;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=226.638;QD=31.0351;RBI=0.0683936;REFB=-0.0747534;REVB=0.0355865;RO=2;SAF=21;SAR=3;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0421427;STB=0.522709;TYPE=snp;VARB=0.00338864;OID=.;OPOS=12315716;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:26:26:2:2:24:24:3:21:2:0:3:21:2:0 chr11 12315891 . G A 296.8 PASS AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0352253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.383;QD=37.0997;RBI=0.050928;REFB=0;REVB=0.036781;RO=0;SAF=24;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00034636;OID=.;OPOS=12315891;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:32:32:0:0:32:32:8:24:0:0:8:24:0:0 chr11 12315915 . A G 69.1 PASS AO=17;DP=40;FAO=17;FDP=40;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.00111208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.104;QD=6.90978;RBI=0.0129913;REFB=-0.00613697;REVB=-0.0129436;RO=22;SAF=13;SAR=4;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.250006;STB=0.63619;TYPE=snp;VARB=0.00932455;OID=.;OPOS=12315915;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:40:40:22:23:17:17:4:13:12:10:4:13:13:10 chr11 12534707 . G A 163.81 PASS AO=34;DP=65;FAO=35;FDP=67;FR=.;FRO=32;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=0.00401654;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.799;QD=9.77982;RBI=0.00503326;REFB=-0.0228097;REVB=0.00303332;RO=31;SAF=24;SAR=10;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.259939;STB=0.624702;TYPE=snp;VARB=0.0366266;OID=.;OPOS=12534707;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:67:31:32:34:35:10:24:13:18:11:24:14:18 chr11 13398129 . T A 1233.91 PASS AO=126;DP=126;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00895464;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.9;QD=38.5598;RBI=0.0218205;REFB=0;REVB=0.0198985;RO=0;SAF=82;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.77273e-05;OID=.;OPOS=13398129;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:126:128:0:0:126:128:44:82:0:0:46:82:0:0 chr11 13441126 . A G 445.99 PASS AO=112;DP=247;FAO=114;FDP=245;FR=.;FRO=131;FSAF=56;FSAR=58;FSRF=86;FSRR=45;FWDB=0.0129737;FXX=0.0277767;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.987;QD=7.28143;RBI=0.0247566;REFB=-0.0169267;REVB=0.0210849;RO=128;SAF=55;SAR=57;SRF=83;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1519;STB=0.588103;TYPE=snp;VARB=0.0195129;OID=.;OPOS=13441126;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:247:245:128:131:112:114:57:55:83:45:58:56:86:45 chr11 13443250 . C T 255.08 PASS AO=65;DP=142;FAO=65;FDP=142;FR=.;FRO=77;FSAF=30;FSAR=35;FSRF=27;FSRR=50;FWDB=0.0048917;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.8483;QD=7.18527;RBI=0.026781;REFB=-0.0215018;REVB=-0.0263304;RO=76;SAF=30;SAR=35;SRF=27;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104881;STB=0.561038;TYPE=snp;VARB=0.0192384;OID=.;OPOS=13443250;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:76:77:65:65:35:30:27:49:35:30:27:50 chr11 13929046 . T A 230.45 PASS AO=28;DP=31;FAO=28;FDP=31;FR=.;FRO=3;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.00681266;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=213.436;QD=29.7354;RBI=0.00899272;REFB=-0.0366062;REVB=-0.00586998;RO=3;SAF=10;SAR=18;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0593321;STB=0.531996;TYPE=snp;VARB=0.000931582;OID=.;OPOS=13929046;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:31:31:3:3:28:28:18:10:2:1:18:10:2:1 chr11 14101493 . G GC 1180.95 PASS AO=137;DP=166;FAO=163;FDP=163;FR=.;FRO=0;FSAF=111;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0612082;FXX=0.0180712;HRUN=1;LEN=1;MLLD=20.2625;QD=28.9804;RBI=0.334918;REFB=0;REVB=0.329277;RO=26;SAF=105;SAR=32;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132974;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00572383;OID=.;OPOS=14101494;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:137:166:163:163:0:111:52:0:0:94:26:105:32:11:15 chr11 14264916 . A G 1110.17 PASS AO=124;DP=137;FAO=127;FDP=134;FR=.;FRO=7;FSAF=32;FSAR=95;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0572627;FXX=0.0289834;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.4924;QD=33.1393;RBI=0.062708;REFB=-0.115691;REVB=0.0255592;RO=7;SAF=30;SAR=94;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00602653;STB=0.502332;TYPE=snp;VARB=0.00643562;OID=.;OPOS=14264916;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:137:134:7:7:124:127:94:30:2:5:95:32:2:5 chr11 14300488 . T C 39.75 PASS AO=10;DP=30;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.00458576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.218;QD=5.12911;RBI=0.00460523;REFB=0.00597213;REVB=-0.000423037;RO=20;SAF=4;SAR=6;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164705;STB=0.621079;TYPE=snp;VARB=-0.00570886;OID=.;OPOS=14300488;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:30:31:20:20:10:11:6:4:11:9:7:4:11:9 chr11 14991511 . A G 177.32 PASS AO=31;DP=50;FAO=31;FDP=50;FR=.;FRO=19;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.0210256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.216;QD=14.1852;RBI=0.0364924;REFB=-0.0126914;REVB=-0.0298265;RO=19;SAF=15;SAR=16;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0802217;STB=0.544013;TYPE=snp;VARB=0.00627574;OID=.;OPOS=14991511;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:50:50:19:19:31:31:16:15:7:12:16:15:7:12 chr11 14991539 . T C 544.93 PASS AO=57;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104997;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.981;QD=37.5813;RBI=0.0827754;REFB=0;REVB=-0.0821068;RO=0;SAF=27;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0010271;OID=.;OPOS=14991539;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:57:58:0:0:57:58:30:27:0:0:30:28:0:0 chr11 15199957 . T C 98.7 PASS AO=24;DP=73;FAO=31;FDP=81;FR=.;FRO=50;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=28;FSRR=22;FWDB=0.017453;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.574;QD=4.87431;RBI=0.0174711;REFB=-0.0241961;REVB=-0.000794207;RO=49;SAF=12;SAR=12;SRF=27;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0584886;STB=0.513021;TYPE=snp;VARB=0.0499781;OID=.;OPOS=15199957;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:73:81:49:50:24:31:12:12:27:22:13:18:28:22 chr11 16812397 . G A 73.8 PASS AO=10;DP=15;FAO=11;FDP=15;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0111943;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.0805;QD=19.6809;RBI=0.0213813;REFB=-0.0387157;REVB=0.0182167;RO=5;SAF=1;SAR=9;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.451874;STB=0.620445;TYPE=snp;VARB=0.0632602;OID=.;OPOS=16812397;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:15:15:5:4:10:11:9:1:3:2:9:2:2:2 chr11 16837788 . G A 268.85 PASS AO=76;DP=178;FAO=76;FDP=180;FR=.;FRO=104;FSAF=41;FSAR=35;FSRF=19;FSRR=85;FWDB=0.043892;FXX=0.00552456;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.656;QD=5.97452;RBI=0.0452515;REFB=-0.0101586;REVB=-0.0110088;RO=102;SAF=41;SAR=35;SRF=18;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.367996;STB=0.700809;TYPE=snp;VARB=0.0142444;OID=.;OPOS=16837788;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:180:102:104:76:76:35:41:18:84:35:41:19:85 chr11 16848077 . G A 273.63 PASS AO=45;DP=66;FAO=45;FDP=66;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=33;FSRF=5;FSRR=16;FWDB=0.015987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.938;QD=16.5837;RBI=0.0312702;REFB=-0.0199767;REVB=0.0268745;RO=21;SAF=12;SAR=33;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0216862;STB=0.511744;TYPE=snp;VARB=0.00906136;OID=.;OPOS=16848077;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:66:66:21:21:45:45:33:12:5:16:33:12:5:16 chr11 16863881 . G T 215.41 PASS AO=45;DP=88;FAO=46;FDP=88;FR=.;FRO=42;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=27;FSRR=15;FWDB=0.0246171;FXX=0.0112347;HRUN=3;LEN=1;MLLD=154.727;QD=9.79136;RBI=0.0255472;REFB=-0.0106281;REVB=0.00683072;RO=41;SAF=26;SAR=19;SRF=26;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0503387;STB=0.538055;TYPE=snp;VARB=0.0118409;OID=.;OPOS=16863881;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:41:42:45:46:19:26:26:15:20:26:27:15 chr11 17108868 . ACT A 243.13 PASS AO=62;DP=160;FAO=66;FDP=150;FR=.;FRO=84;FSAF=23;FSAR=43;FSRF=38;FSRR=46;FWDB=-0.00044472;FXX=0.112419;HRUN=1;LEN=2;MLLD=200.404;QD=6.48344;RBI=0.0224313;REFB=0.000213397;REVB=-0.0224269;RO=80;SAF=19;SAR=43;SRF=38;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183247;STB=0.561651;TYPE=del;VARB=-0.000198645;OID=.;OPOS=17108869;OREF=CT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:62:147:66:150:84:23:43:38:46:99:80:19:43:38:42 chr11 17172133 . T C 1740.5 PASS AO=185;DP=187;FAO=185;FDP=185;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.022764;FXX=0.0106946;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.916;QD=37.6324;RBI=0.0231589;REFB=-0.0330899;REVB=-0.00425856;RO=2;SAF=82;SAR=103;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114697;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.9826e-06;OID=.;OPOS=17172133;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:187:185:2:0:185:185:103:82:2:0:103:82:0:0 chr11 17190500 . C T 246.74 PASS AO=68;DP=158;FAO=68;FDP=158;FR=.;FRO=90;FSAF=40;FSAR=28;FSRF=56;FSRR=34;FWDB=-0.00997319;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1908;QD=6.24663;RBI=0.0169696;REFB=-0.00998168;REVB=0.0137297;RO=90;SAF=40;SAR=28;SRF=56;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0360445;STB=0.520118;TYPE=snp;VARB=0.0160243;OID=.;OPOS=17190500;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:158:90:90:68:68:28:40:56:34:28:40:56:34 chr11 17191019 . A G 486.15 PASS AO=95;DP=164;FAO=96;FDP=165;FR=.;FRO=69;FSAF=43;FSAR=53;FSRF=51;FSRR=18;FWDB=-0.0380918;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.0411;QD=11.7855;RBI=0.0569284;REFB=-0.0118622;REVB=-0.0423067;RO=69;SAF=42;SAR=53;SRF=51;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227;STB=0.620013;TYPE=snp;VARB=0.00915901;OID=.;OPOS=17191019;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:165:69:69:95:96:53:42:51:18:53:43:51:18 chr11 17333663 . G A 639.57 PASS AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0213921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.9556;QD=38.1831;RBI=0.0264913;REFB=0;REVB=0.015626;RO=0;SAF=14;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000210285;OID=.;OPOS=17333663;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:67:67:0:0:67:67:53:14:0:0:53:14:0:0 chr11 17339127 . T C 204.13 PASS AO=62;DP=156;FAO=62;FDP=156;FR=.;FRO=94;FSAF=32;FSAR=30;FSRF=46;FSRR=48;FWDB=0.0109063;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=187.675;QD=5.23398;RBI=0.0146675;REFB=-0.0126804;REVB=0.00980749;RO=94;SAF=32;SAR=30;SRF=46;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0286091;STB=0.516124;TYPE=snp;VARB=0.0196301;OID=.;OPOS=17339127;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:156:94:94:62:62:30:32:46:48:30:32:46:48 chr11 17351683 . C G 101.38 PASS AO=23;DP=48;FAO=23;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.00460499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6162;QD=8.44857;RBI=0.0207585;REFB=-0.00097069;REVB=0.0202413;RO=25;SAF=12;SAR=11;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.035428;STB=0.519983;TYPE=snp;VARB=0.00148457;OID=.;OPOS=17351683;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:25:25:23:23:11:12:14:11:11:12:14:11 chr11 17417263 . GC G 217.48 PASS AO=31;DP=39;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0863041;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.5184;QD=22.8926;RBI=0.256485;REFB=-0.0268735;REVB=0.241528;RO=3;SAF=26;SAR=5;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0.578947;SSSB=0.137064;STB=0.508192;TYPE=del;VARB=0.017295;OID=.;OPOS=17417264;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:31:38:37:38:1:30:7:1:0:15:3:26:5:1:2 chr11 17449929 . C T 72.15 PASS AO=15;DP=35;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=15;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.00665967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.154;QD=7.79956;RBI=0.0121953;REFB=-0.0179831;REVB=0.0102164;RO=20;SAF=13;SAR=2;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.459324;STB=0.78221;TYPE=snp;VARB=0.0168212;OID=.;OPOS=17449929;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:35:37:20:20:15:17:2:13:10:10:2:15:10:10 chr11 17452492 . G A 167.63 PASS AO=45;DP=104;FAO=45;FDP=104;FR=.;FRO=59;FSAF=33;FSAR=12;FSRF=30;FSRR=29;FWDB=0.00118136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.529;QD=6.44716;RBI=0.0133419;REFB=0.00557769;REVB=0.0132895;RO=59;SAF=33;SAR=12;SRF=30;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.250402;STB=0.64147;TYPE=snp;VARB=-0.0053575;OID=.;OPOS=17452492;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:59:59:45:45:12:33:30:29:12:33:30:29 chr11 17496516 . A G 75.64 PASS AO=16;DP=68;FAO=25;FDP=64;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=0.0113113;FXX=0.0302984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.28;QD=4.72719;RBI=0.0116067;REFB=-0.0199317;REVB=-0.00260216;RO=24;SAF=5;SAR=11;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0724028;STB=0.511269;TYPE=snp;VARB=0.0514514;OID=.;OPOS=17496516;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:55:64:24:39:16:25:11:5:9:15:13:12:18:21 chr11 17522638 . G A 177.27 PASS AO=38;DP=76;FAO=39;FDP=76;FR=.;FRO=37;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=0.00734161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.3736;QD=9.32998;RBI=0.0347875;REFB=0.0274041;REVB=0.034004;RO=36;SAF=21;SAR=17;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.021974;STB=0.512189;TYPE=snp;VARB=-0.0242767;OID=.;OPOS=17522638;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:36:37:38:39:17:21:19:17:18:21:19:18 chr11 17542439 . T C 149.68 PASS AO=49;DP=158;FAO=53;FDP=151;FR=.;FRO=98;FSAF=34;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=77;FWDB=-0.00245245;FXX=0.0503113;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.178;QD=3.96509;RBI=0.00347173;REFB=-0.00255923;REVB=-0.00245732;RO=91;SAF=33;SAR=16;SRF=21;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.47244;STB=0.757401;TYPE=snp;VARB=0.00286771;OID=.;OPOS=17542439;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:151:91:98:49:53:16:33:21:70:19:34:21:77 chr11 17593709 . T C 236.88 PASS AO=67;DP=149;FAO=64;FDP=147;FR=.;FRO=83;FSAF=37;FSAR=27;FSRF=43;FSRR=40;FWDB=-0.000618926;FXX=0.0134219;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.644;QD=6.44577;RBI=0.00184893;REFB=-0.0132666;REVB=-0.00174226;RO=82;SAF=40;SAR=27;SRF=42;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0854471;STB=0.534372;TYPE=snp;VARB=0.0161473;OID=.;OPOS=17593709;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:147:82:83:67:64:27:40:42:40:27:37:43:40 chr11 17596313 . G A 260.7 PASS AO=55;DP=109;FAO=57;FDP=110;FR=.;FRO=53;FSAF=39;FSAR=18;FSRF=34;FSRR=19;FWDB=-0.0136085;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.776;QD=9.48011;RBI=0.0254199;REFB=-0.0111277;REVB=0.0214704;RO=53;SAF=38;SAR=17;SRF=34;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0502329;STB=0.523387;TYPE=snp;VARB=0.0131344;OID=.;OPOS=17596313;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:110:53:53:55:57:17:38:34:19:18:39:34:19 chr11 17598187 . G A 124.31 PASS AO=28;DP=56;FAO=28;FDP=57;FR=.;FRO=29;FSAF=2;FSAR=26;FSRF=9;FSRR=20;FWDB=0.0199358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.917;QD=8.72322;RBI=0.0254457;REFB=-0.0124453;REVB=-0.0158129;RO=28;SAF=2;SAR=26;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.450417;STB=0.756372;TYPE=snp;VARB=0.00759772;OID=.;OPOS=17598187;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:57:28:29:28:28:26:2:9:19:26:2:9:20 chr11 17600033 . G A 236.62 PASS AO=38;DP=78;FAO=43;FDP=77;FR=.,HEALED;FRO=30;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=22;FWDB=0.0470258;FXX=0.0493766;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.4006;QD=12.2917;RBI=0.0494517;REFB=-0.0218014;REVB=0.0152987;RO=23;SAF=19;SAR=19;SRF=1;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.317897;STB=0.636872;TYPE=snp;VARB=0.0218152;OID=.;OPOS=17600033;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:23:30:38:43:19:19:1:22:17:26:8:22 chr11 17627613 . G C 424.24 PASS AO=40;DP=40;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00893553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.205;QD=37.71;RBI=0.0258223;REFB=0;REVB=0.024227;RO=0;SAF=7;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.48559e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.22354e-05;OID=.;OPOS=17627613;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:40:45:0:0:40:45:33:7:0:0:37:8:0:0 chr11 17948311 . T C 252.88 PASS AO=52;DP=94;FAO=52;FDP=94;FR=.;FRO=42;FSAF=15;FSAR=37;FSRF=28;FSRR=14;FWDB=-0.00922485;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.107;QD=10.7607;RBI=0.0435248;REFB=-0.011951;REVB=-0.042536;RO=42;SAF=15;SAR=37;SRF=28;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.318526;STB=0.675228;TYPE=snp;VARB=0.0193634;OID=.;OPOS=17948311;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:42:42:52:52:37:15:28:14:37:15:28:14 chr11 17981047 . C T 378.7 PASS AO=73;DP=124;FAO=74;FDP=124;FR=.;FRO=50;FSAF=32;FSAR=42;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=-0.00837153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.254;QD=12.2161;RBI=0.010262;REFB=-0.00482405;REVB=-0.00593514;RO=51;SAF=31;SAR=42;SRF=26;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0651144;STB=0.527538;TYPE=snp;VARB=0.00290722;OID=.;OPOS=17981047;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:51:50:73:74:42:31:26:25:42:32:25:25 chr11 18022305 . TCAC T 346.9 PASS AO=67;DP=123;FAO=70;FDP=121;FR=.;FRO=51;FSAF=29;FSAR=41;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=-0.00369784;FXX=0.0241916;HRUN=1;LEN=3;MLLD=254.576;QD=11.4677;RBI=0.00936649;REFB=-0.0252554;REVB=0.00860565;RO=50;SAF=26;SAR=41;SRF=23;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0584064;STB=0.524239;TYPE=del;VARB=0.0143661;OID=.;OPOS=18022306;OREF=CAC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:67:119:70:121:51:29:41:24:27:99:50:26:41:23:27 chr11 18108492 . T C 269.81 PASS AO=77;DP=183;FAO=77;FDP=183;FR=.;FRO=106;FSAF=41;FSAR=36;FSRF=54;FSRR=52;FWDB=0.0181756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.7457;QD=5.89747;RBI=0.0530077;REFB=-0.0125196;REVB=0.0497942;RO=106;SAF=41;SAR=36;SRF=54;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239102;STB=0.513372;TYPE=snp;VARB=0.018696;OID=.;OPOS=18108492;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:183:106:106:77:77:36:41:54:52:36:41:54:52 chr11 18159169 . A G 1385.69 PASS AO=145;DP=145;FAO=145;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.164;QD=38.226;RBI=0.0319962;REFB=0;REVB=-0.0269271;RO=0;SAF=97;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.52629e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.1208e-05;OID=.;OPOS=18159169;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:145:145:0:0:145:145:48:97:0:0:48:97:0:0 chr11 18159254 . A G 300.56 PASS AO=74;DP=154;FAO=75;FDP=159;FR=.;FRO=84;FSAF=46;FSAR=29;FSRF=42;FSRR=42;FWDB=-0.00808525;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.708;QD=7.56125;RBI=0.0339923;REFB=-0.0322629;REVB=-0.0330168;RO=79;SAF=46;SAR=28;SRF=40;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11094;STB=0.561345;TYPE=snp;VARB=0.0298373;OID=.;OPOS=18159254;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:159:79:84:74:75:28:46:40:39:29:46:42:42 chr11 18194827 . C G 268.64 PASS AO=39;DP=105;FAO=50;FDP=106;FR=.,HEALED;FRO=48;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=28;FSRR=20;FWDB=0.00416058;FXX=0.0185168;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.381;QD=10.1373;RBI=0.00988998;REFB=-0.0143976;REVB=0.00897225;RO=47;SAF=26;SAR=13;SRF=28;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0754228;STB=0.531135;TYPE=snp;VARB=0.0108567;OID=.;OPOS=18194827;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:106:47:48:39:50:13:26:28:19:24:26:28:20 chr11 18194878 . T G 302.75 PASS AO=65;DP=122;FAO=65;FDP=122;FR=.;FRO=57;FSAF=32;FSAR=33;FSRF=33;FSRR=24;FWDB=-0.0645764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1267;QD=9.9263;RBI=0.0647426;REFB=-0.0121006;REVB=-0.0046364;RO=56;SAF=32;SAR=33;SRF=32;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0667171;STB=0.540426;TYPE=snp;VARB=0.00806029;OID=.;OPOS=18194878;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:56:57:65:65:33:32:32:24:33:32:33:24 chr11 18194944 . T A 217.59 PASS AO=52;DP=110;FAO=52;FDP=109;FR=.;FRO=57;FSAF=41;FSAR=11;FSRF=31;FSRR=26;FWDB=0.0125594;FXX=0.00909008;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.268;QD=7.98493;RBI=0.019787;REFB=-0.00899002;REVB=0.0152901;RO=56;SAF=41;SAR=11;SRF=30;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.285675;STB=0.656928;TYPE=snp;VARB=0.0172825;OID=.;OPOS=18194944;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:109:56:57:52:52:11:41:30:26:11:41:31:26 chr11 18194964 . A G 174.12 PASS AO=46;DP=102;FAO=46;FDP=104;FR=.;FRO=58;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=43;FSRR=15;FWDB=0.0116323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.858;QD=6.69708;RBI=0.0120169;REFB=-0.0249389;REVB=0.00301571;RO=54;SAF=24;SAR=22;SRF=39;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197325;STB=0.623997;TYPE=snp;VARB=0.0188384;OID=.;OPOS=18194964;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:104:54:58:46:46:22:24:39:15:22:24:43:15 chr11 18195051 . T C 733.78 PASS AO=79;DP=81;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=57;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0074351;FXX=0.0123442;HRUN=3;LEN=1;MLLD=87.6942;QD=36.6889;RBI=0.0564915;REFB=-0.0558581;REVB=0.0560001;RO=0;SAF=57;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.14853e-08;STB=0.504347;TYPE=snp;VARB=0.000617133;OID=.;OPOS=18195051;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:81:80:0:1:79:79:22:57:0:0:22:57:1:0 chr11 18195448 . C T 445.37 PASS AO=100;DP=199;FAO=102;FDP=201;FR=.;FRO=99;FSAF=40;FSAR=62;FSRF=45;FSRR=54;FWDB=0.0329585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.007;QD=8.86309;RBI=0.0351581;REFB=-0.0182546;REVB=0.0122404;RO=99;SAF=39;SAR=61;SRF=45;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.060473;STB=0.53178;TYPE=snp;VARB=0.0251208;OID=.;OPOS=18195448;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:199:201:99:99:100:102:61:39:45:54:62:40:45:54 chr11 18210580 . C T 174.08 PASS AO=30;DP=63;FAO=37;FDP=70;FR=.;FRO=33;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=0.0631857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.97;QD=9.94767;RBI=0.0637916;REFB=-0.0545866;REVB=0.00877135;RO=33;SAF=19;SAR=11;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0338808;STB=0.504826;TYPE=snp;VARB=0.0505228;OID=.;OPOS=18210580;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:70:33:33:30:37:11:19:22:11:12:25:22:11 chr11 18231289 . C A 458.65 PASS AO=107;DP=215;FAO=108;FDP=215;FR=.;FRO=107;FSAF=47;FSAR=61;FSRF=38;FSRR=69;FWDB=0.00432212;FXX=0.00462942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.409;QD=8.53295;RBI=0.0320064;REFB=-0.0107955;REVB=-0.0317132;RO=107;SAF=47;SAR=60;SRF=38;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0786521;STB=0.54094;TYPE=snp;VARB=0.00830233;OID=.;OPOS=18231289;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:215:107:107:107:108:60:47:38:69:61:47:38:69 chr11 18231749 . T G 1181.1 PASS AO=74;DP=140;FAO=128;FDP=128;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=39;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0471301;FXX=0.00775134;HRUN=3;LEN=1;MLLD=36.1029;QD=36.9095;RBI=0.251568;REFB=0;REVB=0.247114;RO=1;SAF=36;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122874;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00524652;OID=.;OPOS=18231749;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:128:128:1:0:74:128:38:36:0:1:89:39:0:0 chr11 18231915 . T C 85.77 PASS AO=19;DP=40;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=17;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=0.0117389;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=193.574;QD=8.57683;RBI=0.0117417;REFB=-0.018565;REVB=-0.00025882;RO=21;SAF=2;SAR=17;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.308494;STB=0.679769;TYPE=snp;VARB=0.0139079;OID=.;OPOS=18231915;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:40:40:21:21:19:19:17:2:6:15:17:2:6:15 chr11 18253176 . C T 543.19 PASS AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0350142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.16;QD=38.1183;RBI=0.0442182;REFB=0;REVB=0.0270046;RO=0;SAF=29;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.45746e-05;OID=.;OPOS=18253176;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:57:57:0:0:57:57:28:29:0:0:28:29:0:0 chr11 18267027 . C T 1389.8 PASS AO=151;DP=154;FAO=151;FDP=154;FR=.;FRO=3;FSAF=58;FSAR=93;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0706712;FXX=0.0064512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.516;QD=36.0987;RBI=0.0713574;REFB=0.11821;REVB=-0.00987226;RO=3;SAF=58;SAR=93;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0239631;STB=0.512603;TYPE=snp;VARB=-0.00119743;OID=.;OPOS=18267027;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:154:154:3:3:151:151:93:58:3:0:93:58:3:0 chr11 18267471 . A G 183.46 PASS AO=36;DP=68;FAO=38;FDP=70;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=28;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=0.0368856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.167;QD=10.4835;RBI=0.0369217;REFB=-0.0260069;REVB=0.0016319;RO=32;SAF=9;SAR=27;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.293915;STB=0.651078;TYPE=snp;VARB=0.0137002;OID=.;OPOS=18267471;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:70:32:32:36:38:27:9:18:14:28:10:18:14 chr11 18290859 . C T 43.47 PASS AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=1;FWDB=0.0577063;FXX=0.039984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.944;QD=7.24483;RBI=0.0578376;REFB=-0.0044018;REVB=0.00389508;RO=14;SAF=7;SAR=3;SRF=13;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.31874;STB=0.681542;TYPE=snp;VARB=0.0015651;OID=.;OPOS=18290859;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:25:24:14:14:10:10:3:7:13:1:3:7:13:1 chr11 18290874 . T C 29.48 PASS AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=-0.00246893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.768;QD=8.42147;RBI=0.00818956;REFB=-0.0458892;REVB=0.00780854;RO=8;SAF=4;SAR=2;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247224;STB=0.646649;TYPE=snp;VARB=0.0884764;OID=.;OPOS=18290874;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:14:14:8:8:6:6:2:4:7:1:2:4:7:1 chr11 18290880 . C G 125.83 PASS AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0237424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.002;QD=35.9522;RBI=0.0238324;REFB=0;REVB=0.00206889;RO=0;SAF=11;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000358815;OID=.;OPOS=18290880;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:14:14:0:0:14:14:3:11:0:0:3:11:0:0 chr11 18291321 . T C 269.82 PASS AO=73;DP=163;FAO=72;FDP=162;FR=.;FRO=90;FSAF=43;FSAR=29;FSRF=50;FSRR=40;FWDB=-0.0155432;FXX=0.00613459;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.074;QD=6.6622;RBI=0.017072;REFB=-0.0171461;REVB=0.00706144;RO=89;SAF=44;SAR=29;SRF=49;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0531255;STB=0.523828;TYPE=snp;VARB=0.0186911;OID=.;OPOS=18291321;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:162:89:90:73:72:29:44:49:40:29:43:50:40 chr11 18291356 . A G 241.02 PASS AO=70;DP=170;FAO=70;FDP=170;FR=.;FRO=100;FSAF=42;FSAR=28;FSRF=54;FSRR=46;FWDB=0.0136419;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=232.14;QD=5.67104;RBI=0.0289725;REFB=0.00348637;REVB=0.0255599;RO=100;SAF=42;SAR=28;SRF=54;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0645145;STB=0.536221;TYPE=snp;VARB=-0.004704;OID=.;OPOS=18291356;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:170:100:100:70:70:28:42:54:46:28:42:54:46 chr11 18327684 . G T 214.12 PASS AO=49;DP=101;FAO=50;FDP=102;FR=.;FRO=52;FSAF=33;FSAR=17;FSRF=36;FSRR=16;FWDB=-0.00968682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.313;QD=8.39703;RBI=0.0145637;REFB=-0.022215;REVB=-0.0108751;RO=52;SAF=33;SAR=16;SRF=36;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200315;STB=0.51856;TYPE=snp;VARB=0.0119231;OID=.;OPOS=18327684;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:102:52:52:49:50:16:33:36:16:17:33:36:16 chr11 18388128 . G C 421 PASS AO=89;DP=163;FAO=89;FDP=163;FR=.;FRO=74;FSAF=39;FSAR=50;FSRF=32;FSRR=42;FWDB=-0.0145779;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=87.0348;QD=10.3312;RBI=0.0188146;REFB=-0.00257625;REVB=0.0118943;RO=74;SAF=39;SAR=50;SRF=32;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00487344;STB=0.502661;TYPE=snp;VARB=0.00286611;OID=.;OPOS=18388128;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:163:74:74:89:89:50:39:32:42:50:39:32:42 chr11 18422487 . C A 456.7 PASS AO=108;DP=230;FAO=115;FDP=241;FR=.;FRO=126;FSAF=49;FSAR=66;FSRF=65;FSRR=61;FWDB=-0.0389115;FXX=0.0163259;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.8209;QD=7.58012;RBI=0.0495769;REFB=0.0106001;REVB=0.0307207;RO=120;SAF=48;SAR=60;SRF=65;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0928188;STB=0.547311;TYPE=snp;VARB=-0.00935271;OID=.;OPOS=18422487;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:230:241:120:126:108:115:60:48:65:55:66:49:65:61 chr11 18424451 . C T 2242.18 PASS AO=234;DP=235;FAO=234;FDP=234;FR=.;FRO=0;FSAF=145;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000607531;FXX=0.00425514;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.44;QD=38.3278;RBI=0.0359276;REFB=0;REVB=0.0359225;RO=0;SAF=145;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.28536e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.2003e-05;OID=.;OPOS=18424451;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:235:234:0:0:234:234:89:145:0:0:89:145:0:0 chr11 18424487 . A G 1669.05 PASS AO=177;DP=179;FAO=177;FDP=177;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00788999;FXX=0.0166657;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.9965;QD=37.7186;RBI=0.0472822;REFB=0.00184241;REVB=-0.0466193;RO=2;SAF=93;SAR=84;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000542152;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000146728;OID=.;OPOS=18424487;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:179:177:2:0:177:177:84:93:1:1:84:93:0:0 chr11 18467821 . T C 2253.24 PASS AO=235;DP=235;FAO=235;FDP=235;FR=.;FRO=0;FSAF=114;FSAR=121;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00896904;FXX=0.00423711;HRUN=3;LEN=1;MLLD=251.955;QD=38.353;RBI=0.018585;REFB=0;REVB=0.0162776;RO=0;SAF=114;SAR=121;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07375e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.11128e-05;OID=.;OPOS=18467821;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:235:235:0:0:235:235:121:114:0:0:121:114:0:0 chr11 18724558 . C T 147.75 PASS AO=43;DP=109;FAO=43;FDP=107;FR=.;FRO=64;FSAF=15;FSAR=28;FSRF=29;FSRR=35;FWDB=0.00945404;FXX=0.0183469;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.71;QD=5.52317;RBI=0.0141818;REFB=-0.00423014;REVB=0.0105709;RO=59;SAF=15;SAR=28;SRF=29;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152445;STB=0.565885;TYPE=snp;VARB=0.00672775;OID=.;OPOS=18724558;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:107:59:64:43:43:28:15:29:30:28:15:29:35 chr11 18724559 . G T 11.02 PASS AO=16;DP=105;FAO=16;FDP=108;FR=.;FRO=92;FSAF=14;FSAR=2;FSRF=31;FSRR=61;FWDB=0.00111905;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=97.3531;QD=0.408157;RBI=0.0110436;REFB=-0.00229783;REVB=0.0109868;RO=89;SAF=14;SAR=2;SRF=31;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.616151;STB=0.906968;TYPE=snp;VARB=0.00301251;OID=.;OPOS=18724559;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:105:108:89:92:16:16:2:14:31:58:2:14:31:61 chr11 18735396 . G T 321.95 PASS AO=34;DP=34;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0487472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.249;QD=36.794;RBI=0.0487612;REFB=0;REVB=0.0011662;RO=0;SAF=11;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000241642;OID=.;OPOS=18735396;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:35:0:0:34:35:23:11:0:0:24:11:0:0 chr11 18735947 . T C 968.61 PASS AO=100;DP=100;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.104107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.215;QD=37.9846;RBI=0.111713;REFB=0;REVB=0.0405149;RO=0;SAF=15;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.10395e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000409695;OID=.;OPOS=18735947;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:100:102:0:0:100:102:85:15:0:0:87:15:0:0 chr11 18737095 . C T 1856.97 PASS AO=183;DP=185;FAO=199;FDP=199;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0296221;FXX=0.00994975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.12;QD=37.326;RBI=0.0309199;REFB=-0.0285209;REVB=-0.00886387;RO=1;SAF=81;SAR=102;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00464511;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.543e-05;OID=.;OPOS=18737095;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:185:199:1:0:183:199:102:81:0:1:104:95:0:0 chr11 18738281 . C T 715.17 PASS AO=76;DP=78;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0557703;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.737;QD=37.1519;RBI=0.0692721;REFB=-0.0599877;REVB=0.0410889;RO=0;SAF=51;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504853;TYPE=snp;VARB=0.000546097;OID=.;OPOS=18738281;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:78:77:0:1:76:76:25:51:0:0:25:51:1:0 chr11 18751041 . C T 195.01 PASS AO=31;DP=44;FAO=31;FDP=44;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=12;FWDB=-0.00206542;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=265.601;QD=17.7282;RBI=0.00918912;REFB=-0.0150044;REVB=0.00895399;RO=13;SAF=6;SAR=25;SRF=1;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10933;STB=0.559159;TYPE=snp;VARB=0.00601115;OID=.;OPOS=18751041;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:44:44:13:13:31:31:25:6:1:12:25:6:1:12 chr11 18764026 . G C 142.14 PASS AO=24;DP=37;FAO=24;FDP=37;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.0221786;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=190.902;QD=15.3662;RBI=0.0398926;REFB=-0.0180314;REVB=-0.0331592;RO=12;SAF=8;SAR=16;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0581086;STB=0.510196;TYPE=snp;VARB=0.00474202;OID=.;OPOS=18764026;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:37:37:12:13:24:24:16:8:3:9:16:8:4:9 chr11 18765699 . GC G 303.96 PASS AO=39;DP=58;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.12175;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.1472;QD=25.3303;RBI=0.259078;REFB=0;REVB=0.228689;RO=6;SAF=21;SAR=18;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0.365741;SSSB=0.0510711;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0156879;OID=.;OPOS=18765700;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:39:46:48:48:0:26:22:0:0:25:6:21:18:2:4 chr11 18955861 . C T 86.28 PASS AO=21;DP=47;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=0.00643733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.951;QD=7.34339;RBI=0.00705457;REFB=-0.00249334;REVB=0.00288578;RO=26;SAF=11;SAR=10;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171871;STB=0.597495;TYPE=snp;VARB=0.00256604;OID=.;OPOS=18955861;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:47:47:26:26:21:21:10:11:9:17:10:11:9:17 chr11 18956194 . T C 146.62 PASS AO=55;DP=163;FAO=55;FDP=163;FR=.;FRO=108;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=58;FSRR=50;FWDB=-0.015714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.3;QD=3.59801;RBI=0.0230467;REFB=0.00455566;REVB=-0.0168589;RO=107;SAF=30;SAR=25;SRF=58;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0039388;STB=0.505616;TYPE=snp;VARB=-0.00892414;OID=.;OPOS=18956194;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:163:107:108:55:55:25:30:58:49:25:30:58:50 chr11 19167850 . A G 1521.02 PASS AO=162;DP=163;FAO=161;FDP=161;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0378939;FXX=0.0122692;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.4191;QD=37.7893;RBI=0.041045;REFB=0.0277909;REVB=0.0157716;RO=1;SAF=65;SAR=97;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00488069;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000281156;OID=.;OPOS=19167850;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:163:161:1:0:162:161:97:65:0:1:97:64:0:0 chr11 19245854 . T C 635.96 PASS AO=132;DP=235;FAO=134;FDP=241;FR=.;FRO=107;FSAF=54;FSAR=80;FSRF=37;FSRR=70;FWDB=-0.00653135;FXX=0.00413206;HRUN=3;LEN=1;MLLD=109.876;QD=10.5553;RBI=0.00653227;REFB=-0.0282672;REVB=-0.000109683;RO=103;SAF=54;SAR=78;SRF=33;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0751944;STB=0.526654;TYPE=snp;VARB=0.0196264;OID=.;OPOS=19245854;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:235:241:103:107:132:134:78:54:33:70:80:54:37:70 chr11 19612775 . C T 1229.34 PASS AO=128;DP=128;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0765281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.1335;QD=38.417;RBI=0.0775785;REFB=0;REVB=0.0127231;RO=0;SAF=34;SAR=94;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.29028e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000235237;OID=.;OPOS=19612775;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:128:128:0:0:128:128:94:34:0:0:94:34:0:0 chr11 19854088 . G A 288.3 PASS AO=79;DP=182;FAO=83;FDP=199;FR=.;FRO=116;FSAF=39;FSAR=44;FSRF=51;FSRR=65;FWDB=-0.0480858;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=39.4648;QD=5.79504;RBI=0.0554308;REFB=-0.0122904;REVB=0.0275741;RO=103;SAF=37;SAR=42;SRF=42;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0620759;STB=0.517716;TYPE=snp;VARB=0.0152294;OID=.;OPOS=19854088;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:199:103:116:79:83:42:37:42:61:44:39:51:65 chr11 19901632 . G A 627.69 PASS AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121324;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.938;QD=38.042;RBI=0.070315;REFB=0;REVB=0.0692604;RO=0;SAF=36;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000424599;OID=.;OPOS=19901632;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:66:66:0:0:66:66:30:36:0:0:30:36:0:0 chr11 19955500 . A G 726.84 PASS AO=80;DP=82;FAO=80;FDP=82;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0019595;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=214.739;QD=35.4557;RBI=0.00375364;REFB=-0.070225;REVB=-0.00320159;RO=1;SAF=21;SAR=59;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0079585;STB=0.508331;TYPE=snp;VARB=0.000594894;OID=.;OPOS=19955500;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:82:82:1:2:80:80:59:21:0:1:59:21:0:2 chr11 19970558 . T C 1245.39 PASS AO=128;DP=129;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00651169;FXX=0.00769172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.928;QD=38.6167;RBI=0.0164155;REFB=0;REVB=-0.0150687;RO=0;SAF=29;SAR=99;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.66275e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.08573e-05;OID=.;OPOS=19970558;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:129:129:0:0:128:129:99:29:0:0:99:30:0:0 chr11 19970579 . C T 1853.06 PASS AO=192;DP=202;FAO=193;FDP=193;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=126;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108134;FXX=0.0809485;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.623;QD=38.4053;RBI=0.034831;REFB=0;REVB=0.03311;RO=0;SAF=67;SAR=125;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.05175e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.61516e-06;OID=.;OPOS=19970579;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:202:193:0:0:192:193:125:67:0:0:126:67:0:0 chr11 20065673 . G T 131.6 PASS AO=38;DP=92;FAO=37;FDP=91;FR=.;FRO=54;FSAF=12;FSAR=25;FSRF=13;FSRR=41;FWDB=-0.0111514;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.442;QD=5.78465;RBI=0.0265897;REFB=-0.0239089;REVB=-0.0241383;RO=54;SAF=13;SAR=25;SRF=13;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122769;STB=0.558897;TYPE=snp;VARB=0.0385158;OID=.;OPOS=20065673;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:91:54:54:38:37:25:13:13:41:25:12:13:41 chr11 20065779 . C G 203.01 PASS AO=15;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.190428;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.7898;QD=35.3062;RBI=0.224179;REFB=0;REVB=0.118294;RO=1;SAF=2;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0338159;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0117784;OID=.;OPOS=20065779;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:21:23:1:0:15:23:13:2:0:1:16:7:0:0 chr11 20067064 . C T 222.14 PASS AO=48;DP=92;FAO=48;FDP=92;FR=.;FRO=44;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=0.025987;FXX=0.0212743;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.693;QD=9.65831;RBI=0.034255;REFB=0.0222142;REVB=0.0223177;RO=44;SAF=21;SAR=27;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149692;STB=0.508261;TYPE=snp;VARB=-0.0104393;OID=.;OPOS=20067064;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:44:44:48:48:27:21:20:24:27:21:20:24 chr11 20089792 . G C 756.6 PASS AO=195;DP=412;FAO=190;FDP=400;FR=.;FRO=210;FSAF=78;FSAR=112;FSRF=76;FSRR=134;FWDB=-0.0398301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3249;QD=7.56604;RBI=0.0427115;REFB=-0.0127802;REVB=-0.0154218;RO=215;SAF=80;SAR=115;SRF=77;SRR=138;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0519429;STB=0.526619;TYPE=snp;VARB=0.013532;OID=.;OPOS=20089792;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:412:400:215:210:195:190:115:80:77:138:112:78:76:134 chr11 20089944 . T C 234.8 PASS AO=78;DP=212;FAO=79;FDP=213;FR=.;FRO=134;FSAF=19;FSAR=60;FSRF=45;FSRR=89;FWDB=-0.0132935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.538;QD=4.40936;RBI=0.0132971;REFB=-0.00550749;REVB=0.000306513;RO=134;SAF=18;SAR=60;SRF=45;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148621;STB=0.575606;TYPE=snp;VARB=0.0101141;OID=.;OPOS=20089944;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:213:134:134:78:79:60:18:45:89:60:19:45:89 chr11 20099112 . A T 1269.89 PASS AO=130;DP=130;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0373922;FXX=0.0148137;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.88;QD=38.1922;RBI=0.0468089;REFB=0;REVB=0.0281585;RO=0;SAF=60;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.53252e-05;OID=.;OPOS=20099112;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:130:133:0:0:130:133:70:60:0:0:73:60:0:0 chr11 20099541 . C T 580.23 PASS AO=55;DP=55;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.153178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.9709;QD=38.6822;RBI=0.162055;REFB=0;REVB=0.0528966;RO=0;SAF=24;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00217558;OID=.;OPOS=20099541;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:55:60:0:0:55:60:31:24:0:0:31:29:0:0 chr11 20101704 . C T 1240.61 PASS AO=130;DP=131;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0298449;FXX=0.00763301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.333;QD=38.1726;RBI=0.0372367;REFB=0;REVB=0.0222677;RO=0;SAF=46;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.44439e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.19165e-06;OID=.;OPOS=20101704;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:131:130:0:0:130:130:84:46:0:0:84:46:0:0 chr11 20101744 . C A 1245.1 PASS AO=129;DP=130;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0240781;FXX=0.00769172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7987;QD=38.6078;RBI=0.0373872;REFB=0;REVB=0.0286015;RO=0;SAF=33;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000324649;OID=.;OPOS=20101744;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:130:129:0:0:129:129:96:33:0:0:96:33:0:0 chr11 20112417 . A C 760.77 PASS AO=78;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0100251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.072;QD=38.5197;RBI=0.0586875;REFB=0;REVB=0.0578249;RO=0;SAF=51;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.22793e-05;OID=.;OPOS=20112417;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:79:79:0:0:78:79:27:51:0:0:27:52:0:0 chr11 20117232 . T C 790.17 PASS AO=177;DP=338;FAO=177;FDP=338;FR=.;FRO=161;FSAF=84;FSAR=93;FSRF=78;FSRR=83;FWDB=-0.00478092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.85;QD=9.35116;RBI=0.013085;REFB=0.00122776;REVB=0.0121803;RO=159;SAF=84;SAR=93;SRF=76;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00296641;STB=0.504723;TYPE=snp;VARB=-0.00139437;OID=.;OPOS=20117232;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:338:338:159:161:177:177:93:84:76:83:93:84:78:83 chr11 20124914 . A C 1415.38 PASS AO=150;DP=151;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0049877;FXX=0.00662208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.411;QD=37.7435;RBI=0.024907;REFB=-0.0328272;REVB=0.0244025;RO=1;SAF=84;SAR=66;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00562915;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000100036;OID=.;OPOS=20124914;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:151:150:1:0:150:150:66:84:1:0:66:84:0:0 chr11 20140387 . A G 237.97 PASS AO=65;DP=177;FAO=75;FDP=189;FR=.;FRO=114;FSAF=41;FSAR=34;FSRF=61;FSRR=53;FWDB=-0.0726689;FXX=0.0156242;HRUN=3;LEN=1;MLLD=39.2697;QD=5.03634;RBI=0.0732018;REFB=-0.0518923;REVB=-0.00881619;RO=112;SAF=39;SAR=26;SRF=64;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0328731;STB=0.507034;TYPE=snp;VARB=0.0655892;OID=.;OPOS=20140387;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:189:112:114:65:75:26:39:64:48:34:41:61:53 chr11 20140471 . A G 407.47 PASS AO=105;DP=221;FAO=105;FDP=229;FR=.;FRO=124;FSAF=47;FSAR=58;FSRF=57;FSRR=67;FWDB=-0.0805897;FXX=0.00434764;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.9776;QD=7.11746;RBI=0.0815927;REFB=-0.0361901;REVB=-0.0127538;RO=116;SAF=47;SAR=58;SRF=51;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00766783;STB=0.506591;TYPE=snp;VARB=0.043348;OID=.;OPOS=20140471;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:229:116:124:105:105:58:47:51:65:58:47:57:67 chr11 20404613 . T G 1598.8 PASS AO=141;DP=171;FAO=170;FDP=170;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=85;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208118;FXX=0.00584761;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.166;QD=37.6189;RBI=0.0590986;REFB=-0.0501831;REVB=0.0553128;RO=1;SAF=69;SAR=72;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00655845;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00179494;OID=.;OPOS=20404613;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:170:170:1:0:141:170:72:69:0:1:85:85:0:0 chr11 20429454 . T C 1348.57 PASS AO=117;DP=122;FAO=145;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00143599;FXX=0.0136045;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.054;QD=37.202;RBI=0.0474462;REFB=-0.0235771;REVB=0.0474244;RO=1;SAF=96;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00492236;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00264027;OID=.;OPOS=20429454;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:122:145:1:0:117:145:21:96:1:0:48:97:0:0 chr11 20515454 . TTA T,TT 38.69 PASS AO=45,34;DP=206;FAO=48,0;FDP=176;FR=.;FRO=128;FSAF=12,0;FSAR=36,0;FSRF=68;FSRR=60;FWDB=-0.166868,-0.386985;FXX=0.0537606;HRUN=7,6;LEN=2,1;MLLD=19.4415,10.7069;QD=0.879406;RBI=0.279925,0.469482;REFB=-0.0541159,-0.0504819;REVB=-0.224751,-0.265811;RO=83;SAF=14,26;SAR=31,8;SRF=41;SRR=42;SSEN=0,0.491525;SSEP=0,0;SSSB=-0.2173,0.349313;STB=0.714193,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.115328,0;OID=.,.;OPOS=20515455,20515456;OREF=TA,A;OALT=-,-;OMAPALT=T,TT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:45,34:201:48,0:176:128:12,0:36,0:68:60:37:83:14,26:31,8:41:42 chr11 20529886 . G A 2564.33 PASS AO=264;DP=265;FAO=268;FDP=268;FR=.;FRO=0;FSAF=142;FSAR=126;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000472379;FXX=0.00740713;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.025;QD=38.2736;RBI=0.0424276;REFB=-0.0258313;REVB=0.0424249;RO=0;SAF=142;SAR=122;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.90005e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.31365e-05;OID=.;OPOS=20529886;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:265:268:0:0:264:268:122:142:0:0:126:142:0:0 chr11 20622937 . C A 16.08 PASS AO=3;DP=6;FAO=3;FDP=6;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0145346;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.92;QD=10.7182;RBI=0.0187942;REFB=0.00527629;REVB=-0.011915;RO=2;SAF=2;SAR=1;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.39997;STB=0.665552;TYPE=snp;VARB=-0.0132428;OID=.;OPOS=20622937;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:6:6:2:3:3:3:1:2:0:2:1:2:1:2 chr11 20623007 . C T 19.84 PASS AO=5;DP=16;FAO=5;FDP=16;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=0.00353443;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.876;QD=4.95946;RBI=0.0994167;REFB=0.0158044;REVB=0.0993539;RO=11;SAF=4;SAR=1;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0310906;STB=0.519922;TYPE=snp;VARB=-0.0437759;OID=.;OPOS=20623007;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:16:16:11:11:5:5:1:4:9:2:1:4:9:2 chr11 20623023 . C T 24.78 PASS AO=6;DP=17;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=-0.00690906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.089;QD=5.83124;RBI=0.0222388;REFB=0.0123004;REVB=0.0211383;RO=11;SAF=4;SAR=2;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194949;STB=0.6187;TYPE=snp;VARB=-0.0163929;OID=.;OPOS=20623023;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:17:17:11:11:6:6:2:4:9:2:2:4:9:2 chr11 20623042 . T C 39.25 PASS AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=1;FWDB=-0.0280307;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=226.765;QD=6.03775;RBI=0.0420121;REFB=-0.0319031;REVB=-0.0312937;RO=16;SAF=7;SAR=3;SRF=15;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.35438;STB=0.701835;TYPE=snp;VARB=0.0258909;OID=.;OPOS=20623042;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:26:26:16:16:10:10:3:7:15:1:3:7:15:1 chr11 20623156 . C G 555.69 PASS AO=56;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0680459;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.0302;QD=38.3237;RBI=0.101536;REFB=0;REVB=0.0753612;RO=1;SAF=23;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200576;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000102207;OID=.;OPOS=20623156;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:57:58:1:0:56:58:33:23:1:0:34:24:0:0 chr11 20639400 . A G 1012.58 PASS AO=106;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00333284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.5714;QD=38.2105;RBI=0.0132818;REFB=0;REVB=-0.0128569;RO=0;SAF=57;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.21959e-05;OID=.;OPOS=20639400;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:106:106:0:0:106:106:49:57:0:0:49:57:0:0 chr11 20648364 . G C 291.06 PASS AO=67;DP=135;FAO=68;FDP=135;FR=.;FRO=67;FSAF=31;FSAR=37;FSRF=33;FSRR=34;FWDB=0.00604408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.4137;QD=8.62384;RBI=0.0245774;REFB=0.00425441;REVB=-0.0238226;RO=67;SAF=30;SAR=37;SRF=33;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0408364;STB=0.51827;TYPE=snp;VARB=-0.00333139;OID=.;OPOS=20648364;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:67:67:67:68:37:30:33:34:37:31:33:34 chr11 20648380 . G A 295.95 PASS AO=60;DP=107;FAO=60;FDP=107;FR=.;FRO=47;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=-0.00915625;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2076;QD=11.0636;RBI=0.00924586;REFB=0.028071;REVB=0.00128414;RO=47;SAF=26;SAR=34;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0109916;STB=0.506014;TYPE=snp;VARB=-0.023333;OID=.;OPOS=20648380;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:47:47:60:60:34:26:21:26:34:26:21:26 chr11 20673832 . C A 642.09 PASS AO=166;DP=346;FAO=163;FDP=346;FR=.;FRO=183;FSAF=86;FSAR=77;FSRF=94;FSRR=89;FWDB=-0.0156488;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.1935;QD=7.42302;RBI=0.0302742;REFB=0.00794985;REVB=0.0259161;RO=179;SAF=89;SAR=77;SRF=91;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0262851;STB=0.507392;TYPE=snp;VARB=-0.0101623;OID=.;OPOS=20673832;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:346:346:179:183:166:163:77:89:91:88:77:86:94:89 chr11 20676417 . C T 515.05 PASS AO=110;DP=202;FAO=111;FDP=206;FR=.;FRO=95;FSAF=39;FSAR=72;FSRF=37;FSRR=58;FWDB=0.0210545;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.294;QD=10.001;RBI=0.0215343;REFB=-0.0240584;REVB=-0.00452039;RO=92;SAF=39;SAR=71;SRF=37;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0428132;STB=0.519063;TYPE=snp;VARB=0.0230815;OID=.;OPOS=20676417;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:206:92:95:110:111:71:39:37:55:72:39:37:58 chr11 20805286 . G A 567.4 PASS AO=63;DP=65;FAO=63;FDP=65;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0116139;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.474;QD=34.9168;RBI=0.0423778;REFB=-0.120117;REVB=0.0407553;RO=2;SAF=31;SAR=32;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0285993;STB=0.515147;TYPE=snp;VARB=0.000849794;OID=.;OPOS=20805286;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:65:65:2:2:63:63:32:31:0:2:32:31:0:2 chr11 21305927 . T C 3055.69 PASS AO=318;DP=319;FAO=319;FDP=319;FR=.;FRO=0;FSAF=163;FSAR=156;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0324914;FXX=0.0031249;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.815;QD=38.3159;RBI=0.0442357;REFB=-0.0739475;REVB=0.0300183;RO=1;SAF=162;SAR=156;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00293548;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.03842e-05;OID=.;OPOS=21305927;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:319:319:1:0:318:319:156:162:1:0:156:163:0:0 chr11 21581805 . C T 1308.13 PASS AO=130;DP=134;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0975757;FXX=0.0408136;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.7063;QD=37.11;RBI=0.171784;REFB=-0.0180842;REVB=0.141382;RO=1;SAF=65;SAR=65;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0072558;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00327894;OID=.;OPOS=21581805;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:134:141:1:0:130:141:65:65:0:1:72:69:0:0 chr11 22242729 . T C 1823.15 PASS AO=192;DP=195;FAO=192;FDP=192;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=125;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181452;FXX=0.0204071;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.494;QD=37.9824;RBI=0.0582081;REFB=-0.0488235;REVB=0.0553076;RO=0;SAF=67;SAR=125;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.05175e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00013554;OID=.;OPOS=22242729;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:195:192:0:0:192:192:125:67:0:0:125:67:0:0 chr11 22401037 . CT C 96.17 PASS AO=55;DP=179;FAO=83;FDP=172;FR=.;FRO=89;FSAF=22;FSAR=61;FSRF=22;FSRR=67;FWDB=-0.192503;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.00461;QD=2.23655;RBI=0.200306;REFB=-0.0679453;REVB=0.0553646;RO=64;SAF=11;SAR=44;SRF=11;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0438403;STB=0.511997;TYPE=del;VARB=0.0802148;OID=.;OPOS=22401038;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:55:162:83:172:89:22:61:22:67:95:64:11:44:11:53 chr11 22647366 . G A 134.17 PASS AO=30;DP=62;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=-0.0323674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.675;QD=8.38558;RBI=0.0367629;REFB=-0.0127309;REVB=0.0174316;RO=31;SAF=19;SAR=11;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196683;STB=0.61283;TYPE=snp;VARB=0.00703062;OID=.;OPOS=22647366;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:64:31:33:30:31:11:19:13:18:12:19:13:20 chr11 22696451 . A G 894.7 PASS AO=77;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=71;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0133471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.851;QD=37.6716;RBI=0.149589;REFB=0;REVB=0.148992;RO=0;SAF=71;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.05079e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00195209;OID=.;OPOS=22696451;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:95:95:0:0:77:95:6:71:0:0:24:71:0:0 chr11 22709973 . C A 2506.81 PASS AO=265;DP=269;FAO=269;FDP=269;FR=.;FRO=0;FSAF=130;FSAR=139;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019736;FXX=0.0218174;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.9299;QD=37.276;RBI=0.0409321;REFB=0.029412;REVB=-0.0358598;RO=3;SAF=129;SAR=136;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00384096;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000179406;OID=.;OPOS=22709973;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:87:269:269:3:0:265:269:136:129:2:1:139:130:0:0 chr11 22834189 . C T 515.77 PASS AO=123;DP=250;FAO=123;FDP=250;FR=.;FRO=127;FSAF=50;FSAR=73;FSRF=46;FSRR=81;FWDB=0.0520535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.201;QD=8.25228;RBI=0.0521137;REFB=-0.0114478;REVB=-0.00250444;RO=127;SAF=50;SAR=73;SRF=46;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0428508;STB=0.523521;TYPE=snp;VARB=0.0142816;OID=.;OPOS=22834189;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:250:250:127:127:123:123:73:50:46:81:73:50:46:81 chr11 22881002 . C T 536.87 PASS AO=124;DP=244;FAO=124;FDP=244;FR=.;FRO=120;FSAF=79;FSAR=45;FSRF=65;FSRR=55;FWDB=0.0015422;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.681;QD=8.80114;RBI=0.0245342;REFB=-0.0445828;REVB=-0.0244857;RO=120;SAF=79;SAR=45;SRF=65;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0899536;STB=0.549366;TYPE=snp;VARB=0.0286539;OID=.;OPOS=22881002;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:244:120:120:124:124:45:79:65:55:45:79:65:55 chr11 24784862 . A T 866.93 PASS AO=245;DP=484;FAO=202;FDP=399;FR=.;FRO=197;FSAF=91;FSAR=111;FSRF=83;FSRR=114;FWDB=0.0251152;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.8;QD=8.69098;RBI=0.02758;REFB=-0.00251045;REVB=0.0113967;RO=236;SAF=110;SAR=135;SRF=97;SRR=139;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0346021;STB=0.514588;TYPE=snp;VARB=0.0027056;OID=.;OPOS=24784862;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:484:399:236:197:245:202:135:110:97:139:111:91:83:114 chr11 25098938 . G C 2774.65 PASS AO=268;DP=268;FAO=292;FDP=292;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=255;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.162488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.1381;QD=38.0088;RBI=0.164357;REFB=0;REVB=-0.0247158;RO=0;SAF=15;SAR=253;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000250203;OID=.;OPOS=25098938;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:268:292:0:0:268:292:253:15:0:0:255:37:0:0 chr11 26481611 . G A 677.43 PASS AO=59;DP=72;FAO=71;FDP=72;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=34;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0452785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.434;QD=37.635;RBI=0.0641196;REFB=0;REVB=0.0454002;RO=0;SAF=24;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.72003e-05;OID=.;OPOS=26481611;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:72:72:0:0:59:71:35:24:0:0:37:34:0:0 chr11 26568966 . A G 2391.81 PASS AO=255;DP=261;FAO=255;FDP=255;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=164;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0100218;FXX=0.0229876;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.6316;QD=37.5185;RBI=0.0101934;REFB=-0.0842042;REVB=-0.00186209;RO=3;SAF=91;SAR=164;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0086395;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.29783e-05;OID=.;OPOS=26568966;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:261:255:3:0:255:255:164:91:0:3:164:91:0:0 chr11 26586801 . G A 1706.57 PASS AO=192;DP=204;FAO=193;FDP=202;FR=.;FRO=9;FSAF=75;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=0.00427063;FXX=0.00980344;HRUN=4;LEN=1;MLLD=137.321;QD=33.7935;RBI=0.0316145;REFB=-0.0900762;REVB=0.0313248;RO=4;SAF=75;SAR=117;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0159993;STB=0.518366;TYPE=snp;VARB=0.000577244;OID=.;OPOS=26586801;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:204:202:4:9:192:193:117:75:0:4:118:75:0:9 chr11 26587133 . T C 2902.02 PASS AO=304;DP=310;FAO=311;FDP=311;FR=.;FRO=0;FSAF=159;FSAR=152;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0456952;FXX=0.00955384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.876;QD=37.325;RBI=0.0722374;REFB=-0.0523062;REVB=0.0559481;RO=4;SAF=156;SAR=148;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0120701;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000193634;OID=.;OPOS=26587133;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:310:311:4:0:304:311:148:156:4:0:152:159:0:0 chr11 26677947 . C T 1700.66 PASS AO=204;DP=211;FAO=196;FDP=207;FR=.;FRO=11;FSAF=110;FSAR=86;FSRF=10;FSRR=1;FWDB=-0.0110928;FXX=0.0189564;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.7398;QD=32.8631;RBI=0.0665678;REFB=-0.0202551;REVB=-0.0656371;RO=7;SAF=117;SAR=87;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0276422;STB=0.518852;TYPE=snp;VARB=0.00455993;OID=.;OPOS=26677947;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:211:207:7:11:204:196:87:117:7:0:86:110:10:1 chr11 26688627 . A AC 65.08 PASS AO=28;DP=82;FAO=31;FDP=78;FR=.;FRO=47;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=-0.0443511;FXX=0.0249969;HRUN=2;LEN=1;MLLD=22.8172;QD=3.33743;RBI=0.0552681;REFB=0.0510895;REVB=0.0329778;RO=50;SAF=11;SAR=17;SRF=29;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20668;STB=0.580593;TYPE=ins;VARB=-0.0730351;OID=.;OPOS=26688628;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:28:82:31:78:47:13:18:26:21:65:50:11:17:29:21 chr11 26690268 . T C 149.78 PASS AO=46;DP=118;FAO=46;FDP=118;FR=.;FRO=72;FSAF=31;FSAR=15;FSRF=46;FSRR=26;FWDB=0.00606726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.489;QD=5.07733;RBI=0.0263404;REFB=0.00285908;REVB=-0.0256321;RO=72;SAF=31;SAR=15;SRF=46;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0420815;STB=0.523897;TYPE=snp;VARB=-0.00420945;OID=.;OPOS=26690268;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:72:72:46:46:15:31:46:26:15:31:46:26 chr11 26692733 . T C 384.64 PASS AO=92;DP=205;FAO=96;FDP=203;FR=.;FRO=107;FSAF=42;FSAR=54;FSRF=50;FSRR=57;FWDB=0.017554;FXX=0.00975562;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.5661;QD=7.57901;RBI=0.017572;REFB=0.0268795;REVB=0.000796472;RO=113;SAF=38;SAR=54;SRF=54;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0654993;STB=0.515885;TYPE=snp;VARB=-0.0309423;OID=.;OPOS=26692733;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:203:113:107:92:96:54:38:54:59:54:42:50:57 chr11 26692742 . G A 404.66 PASS AO=97;DP=201;FAO=98;FDP=202;FR=.;FRO=104;FSAF=43;FSAR=55;FSRF=45;FSRR=59;FWDB=-0.0283388;FXX=0.00980344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.244;QD=8.01304;RBI=0.0329288;REFB=-5.8605e-05;REVB=-0.0167695;RO=102;SAF=42;SAR=55;SRF=44;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00153267;STB=0.503181;TYPE=snp;VARB=-0.000132496;OID=.;OPOS=26692742;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:202:102:104:97:98:55:42:44:58:55:43:45:59 chr11 26702664 . C T 1808.68 PASS AO=188;DP=188;FAO=188;FDP=188;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0468025;FXX=0.00529073;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1133;QD=38.4826;RBI=0.0739715;REFB=0;REVB=-0.0572827;RO=0;SAF=96;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.25369e-06;OID=.;OPOS=26702664;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:188:188:0:0:188:188:92:96:0:0:92:96:0:0 chr11 26734209 . C T 2133.09 PASS AO=223;DP=223;FAO=223;FDP=223;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=126;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0272515;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.576;QD=38.2618;RBI=0.027375;REFB=0;REVB=0.00259659;RO=0;SAF=97;SAR=126;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.52805e-05;OID=.;OPOS=26734209;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:223:223:0:0:223:223:126:97:0:0:126:97:0:0 chr11 26743240 . C T 211.96 PASS AO=52;DP=108;FAO=51;FDP=106;FR=.;FRO=55;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=18;FSRR=37;FWDB=0.00974924;FXX=0.0185168;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.521;QD=7.99865;RBI=0.0184955;REFB=-0.00279504;REVB=-0.0157174;RO=55;SAF=27;SAR=25;SRF=18;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177382;STB=0.594359;TYPE=snp;VARB=0.00398489;OID=.;OPOS=26743240;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:106:55:55:52:51:25:27:18:37:25:26:18:37 chr11 27017607 . C G 340.96 PASS AO=102;DP=252;FAO=102;FDP=250;FR=.;FRO=148;FSAF=44;FSAR=58;FSRF=71;FSRR=77;FWDB=-0.00369051;FXX=0.00793619;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.426;QD=5.45535;RBI=0.0152859;REFB=-0.00550949;REVB=0.0148337;RO=147;SAF=44;SAR=58;SRF=70;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0478207;STB=0.52894;TYPE=snp;VARB=0.0119355;OID=.;OPOS=27017607;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:252:250:147:148:102:102:58:44:70:77:58:44:71:77 chr11 27018019 . G A 362.36 PASS AO=74;DP=134;FAO=75;FDP=135;FR=.;FRO=60;FSAF=35;FSAR=40;FSRF=28;FSRR=32;FWDB=-0.00869703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.205;QD=10.7365;RBI=0.0169542;REFB=-0.0137643;REVB=-0.0145536;RO=60;SAF=35;SAR=39;SRF=28;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00518224;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00952873;OID=.;OPOS=27018019;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:135:60:60:74:75:39:35:28:32:40:35:28:32 chr11 27018626 . G A 605.06 PASS AO=119;DP=204;FAO=119;FDP=203;FR=.;FRO=84;FSAF=31;FSAR=88;FSRF=30;FSRR=54;FWDB=0.0032848;FXX=0.00490172;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.662;QD=11.9224;RBI=0.00339738;REFB=-0.0218436;REVB=-0.000867312;RO=84;SAF=31;SAR=88;SRF=30;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0908974;STB=0.549428;TYPE=snp;VARB=0.015135;OID=.;OPOS=27018626;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:203:84:84:119:119:88:31:30:54:88:31:30:54 chr11 27077118 . C T 2176.16 PASS AO=228;DP=231;FAO=230;FDP=230;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=137;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0361087;FXX=0.00432882;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.8;QD=37.8462;RBI=0.0370517;REFB=0;REVB=-0.00830609;RO=0;SAF=91;SAR=137;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.79985e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000137788;OID=.;OPOS=27077118;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:231:230:0:0:228:230:137:91:0:0:137:93:0:0 chr11 27362359 . T G 280.28 PASS AO=66;DP=139;FAO=67;FDP=139;FR=.;FRO=72;FSAF=27;FSAR=40;FSRF=17;FSRR=55;FWDB=-0.013946;FXX=0.00714235;HRUN=3;LEN=1;MLLD=160.093;QD=8.06546;RBI=0.0150327;REFB=-0.00813749;REVB=-0.00561168;RO=70;SAF=27;SAR=39;SRF=16;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181324;STB=0.593038;TYPE=snp;VARB=0.0119758;OID=.;OPOS=27362359;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:70:72:66:67:39:27:16:54:40:27:17:55 chr11 27388910 . T C 367.93 PASS AO=109;DP=266;FAO=109;FDP=265;FR=.;FRO=156;FSAF=64;FSAR=45;FSRF=72;FSRR=84;FWDB=0.00449086;FXX=0.0111936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.813;QD=5.55362;RBI=0.0145004;REFB=-0.0178722;REVB=-0.0137874;RO=156;SAF=64;SAR=45;SRF=72;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132839;STB=0.574277;TYPE=snp;VARB=0.0328928;OID=.;OPOS=27388910;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:266:265:156:156:109:109:45:64:72:84:45:64:72:84 chr11 27390089 . T C 1344.95 PASS AO=148;DP=154;FAO=149;FDP=154;FR=.;FRO=5;FSAF=102;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.00541177;FXX=0.0128197;HRUN=3;LEN=1;MLLD=166.857;QD=34.9338;RBI=0.0305705;REFB=0.00164591;REVB=-0.0300876;RO=5;SAF=101;SAR=47;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0479467;STB=0.525249;TYPE=snp;VARB=9.07637e-05;OID=.;OPOS=27390089;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:154:154:5:5:148:149:47:101:0:5:47:102:0:5 chr11 27406844 . G A 218.93 PASS AO=47;DP=90;FAO=47;FDP=90;FR=.;FRO=43;FSAF=33;FSAR=14;FSRF=36;FSRR=7;FWDB=-0.000796602;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.001;QD=9.73016;RBI=0.012376;REFB=-0.0152329;REVB=0.0123503;RO=42;SAF=33;SAR=14;SRF=35;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143824;STB=0.582247;TYPE=snp;VARB=0.0121833;OID=.;OPOS=27406844;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:42:43:47:47:14:33:35:7:14:33:36:7 chr11 27517670 . T C 586.04 PASS AO=43;DP=65;FAO=62;FDP=62;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=29;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.055918;FXX=0.0312451;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.724;QD=37.8089;RBI=0.06417;REFB=0;REVB=0.0314796;RO=0;SAF=16;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00472698;OID=.;OPOS=27517670;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:64:62:0:0:43:62:27:16:0:0:33:29:0:0 chr11 27679010 . GT G 176.66 PASS AO=63;DP=171;FAO=105;FDP=160;FR=.;FRO=55;FSAF=49;FSAR=56;FSRF=25;FSRR=30;FWDB=0.00884057;FXX=0.0588201;HRUN=8;LEN=1;MLLD=6.39773;QD=4.41655;RBI=0.273424;REFB=-0.0214573;REVB=0.273281;RO=55;SAF=25;SAR=38;SRF=20;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0296471;STB=0.504187;TYPE=del;VARB=0.118457;OID=.;OPOS=27679011;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:63:162:105:160:55:49:56:25:30:23:55:25:38:20:35 chr11 27679662 . T C 1204.2 PASS AO=126;DP=128;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249215;FXX=0.00763301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.933;QD=37.0524;RBI=0.0316356;REFB=-0.0883099;REVB=0.0194866;RO=2;SAF=55;SAR=71;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00191527;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000310034;OID=.;OPOS=27679662;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:128:130:2:0:126:130:71:55:1:1:73:57:0:0 chr11 27679916 . C T 630.92 PASS AO=116;DP=188;FAO=116;FDP=187;FR=.;FRO=71;FSAF=64;FSAR=52;FSRF=31;FSRR=40;FWDB=0.0383243;FXX=0.00531887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.074;QD=13.4955;RBI=0.03963;REFB=-0.0166;REVB=0.0100888;RO=70;SAF=64;SAR=52;SRF=31;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0760366;STB=0.543768;TYPE=snp;VARB=0.00965608;OID=.;OPOS=27679916;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:187:70:71:116:116:52:64:31:39:52:64:31:40 chr11 28057957 . T C 612.88 PASS AO=150;DP=307;FAO=149;FDP=307;FR=.;FRO=158;FSAF=96;FSAR=53;FSRF=79;FSRR=79;FWDB=-0.00888101;FXX=0.00324665;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.1187;QD=7.98541;RBI=0.0422262;REFB=-0.0249068;REVB=0.0412817;RO=154;SAF=96;SAR=54;SRF=77;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134187;STB=0.57738;TYPE=snp;VARB=0.0199126;OID=.;OPOS=28057957;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:307:307:154:158:150:149:54:96:77:77:53:96:79:79 chr11 28134974 . C A 117.17 PASS AO=61;DP=236;FAO=65;FDP=239;FR=.;FRO=174;FSAF=35;FSAR=30;FSRF=88;FSRR=86;FWDB=0.00339329;FXX=0.00829841;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.91;QD=1.96103;RBI=0.00776284;REFB=0.00259664;REVB=0.00698193;RO=175;SAF=31;SAR=30;SRF=88;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00665928;STB=0.523864;TYPE=snp;VARB=-0.00606355;OID=.;OPOS=28134974;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:236:239:175:174:61:65:30:31:88:87:30:35:88:86 chr11 29743167 . TGGG TGG,TGGC 256.51 PASS AO=11,7;DP=40;FAO=25,12;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=15,0;FSAR=10,12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.533864,0.274872;FXX=0.0975372;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=14.6278,16.3755;QD=27.7303;RBI=0.639522,0.308655;REFB=0,0;REVB=-0.352104,-0.140404;RO=10;SAF=4,0;SAR=7,7;SRF=10;SRR=0;SSEN=0.65,0;SSEP=0.239105,0;SSSB=-0.492927,-0.848352;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0812478,-0.0650265;OID=.,.;OPOS=29743168,29743170;OREF=G,G;OALT=-,C;OMAPALT=TGG,TGGC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:11,7:33:25,12:37:0:15,0:10,12:0:0:21:10:4,0:7,7:10:0 chr11 30255185 . C T 431.44 PASS AO=75;DP=115;FAO=75;FDP=115;FR=.;FRO=40;FSAF=45;FSAR=30;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=-0.00150721;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.838;QD=15.0065;RBI=0.0166955;REFB=-0.0182232;REVB=0.0166273;RO=39;SAF=45;SAR=30;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00675829;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0116065;OID=.;OPOS=30255185;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:39:40:75:75:30:45:23:16:30:45:24:16 chr11 30431997 . GA G 64.68 PASS AO=30;DP=78;FAO=30;FDP=74;FR=.;FRO=44;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=-0.0780674;FXX=0.0133316;HRUN=2;LEN=1;MLLD=25.8049;QD=3.49624;RBI=0.104359;REFB=0.00971252;REVB=0.0692557;RO=44;SAF=11;SAR=19;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119527;STB=0.568178;TYPE=del;VARB=-0.0118802;OID=.;OPOS=30431998;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:30:75:30:74:44:11:19:21:23:64:44:11:19:21:23 chr11 30915879 . AG A 510.56 PASS AO=106;DP=144;FAO=116;FDP=139;FR=.;FRO=23;FSAF=75;FSAR=41;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.0486791;FXX=0.0279701;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.402;QD=14.6925;RBI=0.0497527;REFB=-0.130328;REVB=-0.0102799;RO=34;SAF=72;SAR=34;SRF=18;SRR=16;SSEN=0.410853;SSEP=0;SSSB=0.0758263;STB=0.506824;TYPE=del;VARB=0.0755268;OID=.;OPOS=30915880;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:106:144:116:139:23:75:41:14:9:3:34:72:34:18:16 chr11 30965855 . A T 1022.9 PASS AO=108;DP=109;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0109719;FXX=0.00917347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.13;QD=37.885;RBI=0.0367688;REFB=-0.0146827;REVB=-0.0350936;RO=0;SAF=57;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60583e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000137704;OID=.;OPOS=30965855;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:109:108:0:0:108:108:51:57:0:0:51:57:0:0 chr11 31327316 . C T 1893.79 PASS AO=208;DP=219;FAO=210;FDP=218;FR=.;FRO=8;FSAF=60;FSAR=150;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0108117;FXX=0.004566;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.305;QD=34.7484;RBI=0.0385311;REFB=-0.101321;REVB=0.0369831;RO=10;SAF=58;SAR=150;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.013057;STB=0.501608;TYPE=snp;VARB=0.0170318;OID=.;OPOS=31327316;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:219:218:10:8:208:210:150:58:4:6:150:60:2:6 chr11 31458730 . T G 549.17 PASS AO=60;DP=65;FAO=63;FDP=65;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0308486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.6454;QD=33.7952;RBI=0.0316862;REFB=-0.100455;REVB=-0.00723738;RO=1;SAF=22;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0209661;STB=0.512816;TYPE=snp;VARB=0.00419093;OID=.;OPOS=31458730;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:65:65:1:2:60:63:38:22:1:0:38:25:0:2 chr11 32124978 . T C 377.66 PASS AO=82;DP=154;FAO=82;FDP=154;FR=.;FRO=72;FSAF=43;FSAR=39;FSRF=20;FSRR=52;FWDB=-0.0448169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3083;QD=9.80944;RBI=0.0713822;REFB=-0.0327812;REVB=0.0555596;RO=72;SAF=43;SAR=39;SRF=20;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209436;STB=0.614259;TYPE=snp;VARB=0.0307068;OID=.;OPOS=32124978;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:154:72:72:82:82:39:43:20:52:39:43:20:52 chr11 32125961 . C T 205.11 PASS AO=53;DP=118;FAO=53;FDP=118;FR=.;FRO=65;FSAF=34;FSAR=19;FSRF=35;FSRR=30;FWDB=0.00453497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.329;QD=6.95275;RBI=0.0247664;REFB=-0.00875759;REVB=-0.0243477;RO=65;SAF=34;SAR=19;SRF=35;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106574;STB=0.559601;TYPE=snp;VARB=0.00789777;OID=.;OPOS=32125961;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:65:65:53:53:19:34:35:30:19:34:35:30 chr11 32624405 . C T 245.32 PASS AO=58;DP=133;FAO=64;FDP=138;FR=.;FRO=74;FSAF=37;FSAR=27;FSRF=37;FSRR=37;FWDB=0.00736359;FXX=0.0349626;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.773;QD=7.11078;RBI=0.00917148;REFB=-0.0082699;REVB=0.00546751;RO=73;SAF=35;SAR=23;SRF=35;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125408;STB=0.54236;TYPE=snp;VARB=0.0104802;OID=.;OPOS=32624405;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:138:73:74:58:64:23:35:35:38:27:37:37:37 chr11 32657266 . T C 1068.58 PASS AO=129;DP=144;FAO=130;FDP=142;FR=.;FRO=12;FSAF=58;FSAR=72;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=0.0028842;FXX=0.0138879;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.768;QD=30.1009;RBI=0.0104596;REFB=-0.129946;REVB=0.010054;RO=12;SAF=58;SAR=71;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0486549;STB=0.52583;TYPE=snp;VARB=0.00231152;OID=.;OPOS=32657266;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:144:142:12:12:129:130:71:58:9:3:72:58:9:3 chr11 32852167 . C T 160.23 PASS AO=51;DP=139;FAO=51;FDP=138;FR=.;FRO=87;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=34;FSRR=53;FWDB=0.0247673;FXX=0.137491;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.751;QD=4.64422;RBI=0.0297208;REFB=-0.0224898;REVB=-0.0164289;RO=83;SAF=21;SAR=30;SRF=34;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00239561;STB=0.513699;TYPE=snp;VARB=0.0327979;OID=.;OPOS=32852167;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:138:83:87:51:51:30:21:34:49:30:21:34:53 chr11 32874926 . G A 328.74 PASS AO=81;DP=172;FAO=82;FDP=174;FR=.;FRO=92;FSAF=22;FSAR=60;FSRF=36;FSRR=56;FWDB=-0.0175224;FXX=0.00571396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.827;QD=7.5572;RBI=0.0175299;REFB=-0.00967686;REVB=0.000514307;RO=90;SAF=22;SAR=59;SRF=36;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142542;STB=0.576903;TYPE=snp;VARB=0.0120933;OID=.;OPOS=32874926;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:174:90:92:81:82:59:22:36:54:60:22:36:56 chr11 32954344 . G A 1533.64 PASS AO=159;DP=160;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=126;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229515;FXX=0.00624961;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.009;QD=38.5823;RBI=0.0332244;REFB=0;REVB=0.0240227;RO=0;SAF=33;SAR=126;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.07528e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.97557e-05;OID=.;OPOS=32954344;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:160:159:0:0:159:159:126:33:0:0:126:33:0:0 chr11 32956244 . A G 869.38 PASS AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026023;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.3119;QD=38.6389;RBI=0.0486014;REFB=0;REVB=0.0410475;RO=0;SAF=45;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000375774;OID=.;OPOS=32956244;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:90:90:0:0:90:90:45:45:0:0:45:45:0:0 chr11 32956620 . A G 1449.73 PASS AO=152;DP=152;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00531195;FXX=0.00653552;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.256;QD=38.1508;RBI=0.0232099;REFB=0;REVB=-0.0225939;RO=0;SAF=94;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.86819e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.41845e-05;OID=.;OPOS=32956620;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:152:152:0:0:152:152:58:94:0:0:59:93:0:0 chr11 33053107 . C T 203.79 PASS AO=66;DP=178;FAO=67;FDP=179;FR=.;FRO=112;FSAF=37;FSAR=30;FSRF=51;FSRR=61;FWDB=-0.0126491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.876;QD=4.55388;RBI=0.012655;REFB=-0.00555752;REVB=-0.000384825;RO=111;SAF=37;SAR=29;SRF=51;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111775;STB=0.560495;TYPE=snp;VARB=0.00961873;OID=.;OPOS=33053107;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:179:111:112:66:67:29:37:51:60:30:37:51:61 chr11 33065394 . C T 278.62 PASS AO=83;DP=206;FAO=84;FDP=208;FR=.;FRO=124;FSAF=37;FSAR=47;FSRF=57;FSRR=67;FWDB=-0.0169789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.695;QD=5.35802;RBI=0.0355368;REFB=0.00821332;REVB=-0.0312183;RO=123;SAF=36;SAR=47;SRF=57;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0319689;STB=0.511577;TYPE=snp;VARB=-0.0132891;OID=.;OPOS=33065394;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:206:208:123:124:83:84:47:36:57:66:47:37:57:67 chr11 33076191 . T C 318.83 PASS AO=78;DP=164;FAO=78;FDP=163;FR=.;FRO=85;FSAF=35;FSAR=43;FSRF=47;FSRR=38;FWDB=-0.00276902;FXX=0.00609719;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.789;QD=7.82393;RBI=0.00984577;REFB=-0.0187541;REVB=0.00944837;RO=84;SAF=35;SAR=43;SRF=46;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.092828;STB=0.554301;TYPE=snp;VARB=0.017028;OID=.;OPOS=33076191;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:163:84:85:78:78:43:35:46:38:43:35:47:38 chr11 33078251 . A T 438.62 PASS AO=94;DP=174;FAO=94;FDP=174;FR=.;FRO=80;FSAF=64;FSAR=30;FSRF=51;FSRR=29;FWDB=-0.00247368;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=224.873;QD=10.0833;RBI=0.0118296;REFB=-0.0215804;REVB=0.0115681;RO=80;SAF=64;SAR=30;SRF=51;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0412313;STB=0.522553;TYPE=snp;VARB=0.0171119;OID=.;OPOS=33078251;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:174:80:80:94:94:30:64:51:29:30:64:51:29 chr11 33106616 . C T 631.78 PASS AO=157;DP=328;FAO=157;FDP=328;FR=.;FRO=171;FSAF=79;FSAR=78;FSRF=78;FSRR=93;FWDB=0.0256847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.369;QD=7.70462;RBI=0.027363;REFB=-0.016432;REVB=-0.00943538;RO=171;SAF=79;SAR=78;SRF=78;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0445814;STB=0.524516;TYPE=snp;VARB=0.015281;OID=.;OPOS=33106616;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:328:328:171:171:157:157:78:79:78:93:78:79:78:93 chr11 33129997 . C T 481.46 PASS AO=130;DP=304;FAO=135;FDP=311;FR=.;FRO=176;FSAF=46;FSAR=89;FSRF=62;FSRR=114;FWDB=0.00532921;FXX=0.00320503;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.484;QD=6.19241;RBI=0.0147508;REFB=-0.010595;REVB=0.0137545;RO=171;SAF=42;SAR=88;SRF=59;SRR=112;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0253709;STB=0.507228;TYPE=snp;VARB=0.0129926;OID=.;OPOS=33129997;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:304:311:171:176:130:135:88:42:59:112:89:46:62:114 chr11 33564123 . T C 83.67 PASS AO=23;DP=57;FAO=23;FDP=57;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=-0.0216848;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.122;QD=5.87172;RBI=0.0404892;REFB=-0.0151858;REVB=-0.0341928;RO=34;SAF=11;SAR=12;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11407;STB=0.565293;TYPE=snp;VARB=0.0378586;OID=.;OPOS=33564123;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:57:57:34:34:23:23:12:11:20:14:12:11:20:14 chr11 33581306 . G A 137.87 PASS AO=42;DP=111;FAO=43;FDP=113;FR=.;FRO=70;FSAF=13;FSAR=30;FSRF=16;FSRR=54;FWDB=0.00117099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.5816;QD=4.88024;RBI=0.0110765;REFB=-0.0153712;REVB=0.0110144;RO=69;SAF=13;SAR=29;SRF=16;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104262;STB=0.55655;TYPE=snp;VARB=0.0307147;OID=.;OPOS=33581306;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:113:69:70:42:43:29:13:16:53:30:13:16:54 chr11 33631423 . G A 142 PASS AO=39;DP=113;FAO=47;FDP=122;FR=.;FRO=75;FSAF=17;FSAR=30;FSRF=45;FSRR=30;FWDB=-0.0109296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.923;QD=4.65582;RBI=0.0112967;REFB=-0.00715304;REVB=0.00285646;RO=73;SAF=16;SAR=23;SRF=45;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230467;STB=0.645772;TYPE=snp;VARB=0.00932971;OID=.;OPOS=33631423;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:122:73:75:39:47:23:16:45:28:30:17:45:30 chr11 33640104 . A C 85.54 PASS AO=26;DP=74;FAO=27;FDP=74;FR=.;FRO=47;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=33;FSRR=14;FWDB=0.000542782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.392;QD=4.62375;RBI=0.0191354;REFB=-0.0108302;REVB=-0.0191277;RO=47;SAF=19;SAR=7;SRF=33;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0394856;STB=0.53095;TYPE=snp;VARB=0.0247291;OID=.;OPOS=33640104;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:74:74:47:47:26:27:7:19:33:14:7:20:33:14 chr11 33691318 . C T 419.98 PASS AO=106;DP=225;FAO=106;FDP=224;FR=.;FRO=118;FSAF=65;FSAR=41;FSRF=84;FSRR=34;FWDB=0.00664217;FXX=0.00444425;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.379;QD=7.49969;RBI=0.00815355;REFB=-0.00524107;REVB=-0.00472885;RO=119;SAF=65;SAR=41;SRF=84;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0961271;STB=0.556162;TYPE=snp;VARB=0.00703503;OID=.;OPOS=33691318;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:225:224:119:118:106:106:41:65:84:35:41:65:84:34 chr11 33775982 . A G 670.22 PASS AO=100;DP=107;FAO=89;FDP=106;FR=.;FRO=17;FSAF=45;FSAR=44;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.00075433;FXX=0.00934492;HRUN=6;LEN=1;MLLD=37.4411;QD=25.2913;RBI=0.0364823;REFB=-0.152373;REVB=0.0364745;RO=2;SAF=52;SAR=48;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0178941;STB=0.503816;TYPE=snp;VARB=0.0243437;OID=.;OPOS=33775982;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:107:106:2:17:100:89:48:52:2:0:44:45:9:8 chr11 33881016 . T C 434.34 PASS AO=88;DP=155;FAO=88;FDP=155;FR=.;FRO=67;FSAF=31;FSAR=57;FSRF=16;FSRR=51;FWDB=-0.0389433;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=145.754;QD=11.2087;RBI=0.0402026;REFB=-0.0290868;REVB=0.00998322;RO=67;SAF=31;SAR=57;SRF=16;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102263;STB=0.555488;TYPE=snp;VARB=0.0224564;OID=.;OPOS=33881016;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:67:67:88:88:57:31:16:51:57:31:16:51 chr11 33886294 . A G 114.24 PASS AO=28;DP=62;FAO=28;FDP=62;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=-0.00992151;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.068;QD=7.37043;RBI=0.0101552;REFB=-0.00708643;REVB=0.00216592;RO=34;SAF=12;SAR=16;SRF=12;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0760672;STB=0.542827;TYPE=snp;VARB=0.00990765;OID=.;OPOS=33886294;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:34:34:28:28:16:12:12:22:16:12:12:22 chr11 33903328 . A G 108.51 PASS AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=49;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=19;FSRF=6;FSRR=19;FWDB=-0.0286908;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.2085;QD=8.85784;RBI=0.0319428;REFB=-0.0162884;REVB=-0.014042;RO=24;SAF=5;SAR=19;SRF=5;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.523789;TYPE=snp;VARB=0.0159541;OID=.;OPOS=33903328;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:49:24:25:24:24:19:5:5:19:19:5:6:19 chr11 34093349 . AT A 1770.02 PASS AO=261;DP=331;FAO=317;FDP=317;FR=.;FRO=0;FSAF=159;FSAR=158;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0482325;FXX=0.0185753;HRUN=6;LEN=1;MLLD=12.7084;QD=22.3347;RBI=0.106683;REFB=0.0130639;REVB=0.0951574;RO=24;SAF=140;SAR=121;SRF=6;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0.368421;SSSB=0.0458966;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00524691;OID=.;OPOS=34093350;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:261:319:317:317:0:159:158:0:0:99:24:140:121:6:18 chr11 34122369 . G T 2695.58 PASS AO=283;DP=285;FAO=283;FDP=283;FR=.;FRO=0;FSAF=133;FSAR=150;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177155;FXX=0.0070173;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.781;QD=38.1001;RBI=0.0217731;REFB=0.00185877;REVB=0.0126583;RO=1;SAF=133;SAR=150;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00357194;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.63891e-06;OID=.;OPOS=34122369;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:285:283:1:0:283:283:150:133:1:0:150:133:0:0 chr11 34152939 . T C 1366.37 PASS AO=144;DP=149;FAO=145;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00510895;FXX=0.0333311;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.431;QD=37.6931;RBI=0.0536628;REFB=-0.0262857;REVB=0.0534191;RO=1;SAF=48;SAR=96;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00980329;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000238516;OID=.;OPOS=34152939;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:149:145:1:0:144:145:96:48:1:0:96:49:0:0 chr11 34154641 . C T 399.93 PASS AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00562755;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=74.3124;QD=35.5491;RBI=0.0535055;REFB=-0.111469;REVB=0.0532087;RO=0;SAF=11;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507459;TYPE=snp;VARB=0.00244072;OID=.;OPOS=34154641;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:45:45:0:1:44:44:33:11:0:0:33:11:0:1 chr11 34501596 . A G 1292.11 PASS AO=135;DP=135;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0336746;FXX=0.0073524;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.578;QD=38.2847;RBI=0.0463591;REFB=0;REVB=0.031862;RO=0;SAF=82;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84364e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.94691e-06;OID=.;OPOS=34501596;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:135:135:0:0:135:135:53:82:0:0:53:82:0:0 chr11 34502345 . T C 701.08 PASS AO=139;DP=240;FAO=139;FDP=240;FR=.;FRO=101;FSAF=60;FSAR=79;FSRF=56;FSRR=45;FWDB=-0.0168239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.74;QD=11.6847;RBI=0.0204575;REFB=-0.0179809;REVB=0.0116389;RO=100;SAF=60;SAR=79;SRF=55;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0918008;STB=0.551908;TYPE=snp;VARB=0.0184511;OID=.;OPOS=34502345;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:240:240:100:101:139:139:79:60:55:45:79:60:56:45 chr11 34511541 . C A 458.88 PASS AO=115;DP=245;FAO=115;FDP=243;FR=.;FRO=128;FSAF=47;FSAR=68;FSRF=55;FSRR=73;FWDB=-0.0273423;FXX=0.00816293;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.117;QD=7.55361;RBI=0.028723;REFB=-0.00534329;REVB=-0.00879817;RO=127;SAF=47;SAR=68;SRF=54;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0161895;STB=0.511389;TYPE=snp;VARB=0.00635217;OID=.;OPOS=34511541;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:245:243:127:128:115:115:68:47:54:73:68:47:55:73 chr11 34680598 . C A 743.05 PASS AO=69;DP=69;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.048467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.896;QD=37.6226;RBI=0.0492972;REFB=0;REVB=0.00900922;RO=0;SAF=47;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00202612;OID=.;OPOS=34680598;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:69:79:0:0:69:79:22:47:0:0:23:56:0:0 chr11 34680634 . G A 830.66 PASS AO=92;DP=95;FAO=92;FDP=95;FR=.;FRO=3;FSAF=64;FSAR=28;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0127343;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.959;QD=34.975;RBI=0.0140701;REFB=-0.105828;REVB=0.00598362;RO=3;SAF=64;SAR=28;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00204566;STB=0.50108;TYPE=snp;VARB=0.00088005;OID=.;OPOS=34680634;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:95:95:3:3:92:92:28:64:2:1:28:64:2:1 chr11 34909926 . T G 175.13 PASS AO=62;DP=174;FAO=62;FDP=175;FR=.;FRO=113;FSAF=22;FSAR=40;FSRF=42;FSRR=71;FWDB=-0.0174536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=321.378;QD=4.00289;RBI=0.0179644;REFB=0.00738092;REVB=-0.00425312;RO=111;SAF=22;SAR=40;SRF=41;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177446;STB=0.511791;TYPE=snp;VARB=-0.0129351;OID=.;OPOS=34909926;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:175:111:113:62:62:40:22:41:70:40:22:42:71 chr11 34910397 . C T 352.26 PASS AO=88;DP=189;FAO=88;FDP=188;FR=.;FRO=100;FSAF=42;FSAR=46;FSRF=37;FSRR=63;FWDB=-0.00139444;FXX=0.015706;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.927;QD=7.49495;RBI=0.0212654;REFB=-0.00810603;REVB=-0.0212196;RO=93;SAF=42;SAR=46;SRF=33;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115217;STB=0.557464;TYPE=snp;VARB=0.0125475;OID=.;OPOS=34910397;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:188:93:100:88:88:46:42:33:60:46:42:37:63 chr11 34918375 . A G 271.56 PASS AO=65;DP=134;FAO=65;FDP=134;FR=.;FRO=69;FSAF=24;FSAR=41;FSRF=31;FSRR=38;FWDB=0.0101897;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.033;QD=8.10616;RBI=0.0122792;REFB=-0.00729801;REVB=0.00685189;RO=69;SAF=24;SAR=41;SRF=31;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0780625;STB=0.543229;TYPE=snp;VARB=0.00878085;OID=.;OPOS=34918375;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:69:69:65:65:41:24:31:38:41:24:31:38 chr11 34937931 . G A 15.78 PASS AO=3;DP=7;FAO=3;FDP=7;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.087;QD=9.01775;RBI=0.0249346;REFB=-0.0193762;REVB=0.0249346;RO=4;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.024436;OID=.;OPOS=34937931;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:7:7:4:4:3:3:3:0:0:4:3:0:0:4 chr11 34938265 . C T 71.71 PASS AO=8;DP=32;FAO=13;FDP=26;FR=.,HEALED;FRO=11;FSAF=12;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.00658773;FXX=0.0714031;HRUN=4;LEN=1;MLLD=151.748;QD=11.0325;RBI=0.0187502;REFB=-0.0189028;REVB=-0.0175548;RO=5;SAF=7;SAR=1;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.2967;STB=0.758972;TYPE=snp;VARB=0.0430323;OID=.;OPOS=34938265;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:22:26:5:11:8:13:1:7:3:2:1:12:7:4 chr11 34963416 . T C 52.21 PASS AO=17;DP=53;FAO=17;FDP=51;FR=.;FRO=34;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=28;FWDB=0.00721061;FXX=0.0377287;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.349;QD=4.09471;RBI=0.0101203;REFB=-0.000663385;REVB=0.00710123;RO=30;SAF=6;SAR=11;SRF=5;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.245854;STB=0.639204;TYPE=snp;VARB=0.00133752;OID=.;OPOS=34963416;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:53:51:30:34:17:17:11:6:5:25:11:6:6:28 chr11 34991727 . T C 159.6 PASS AO=50;DP=132;FAO=50;FDP=131;FR=.;FRO=81;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=29;FSRR=52;FWDB=-0.023583;FXX=0.00757518;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.9056;QD=4.87314;RBI=0.0237476;REFB=0.00335288;REVB=0.00279085;RO=81;SAF=25;SAR=25;SRF=29;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155206;STB=0.587752;TYPE=snp;VARB=-0.0041318;OID=.;OPOS=34991727;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:131:81:81:50:50:25:25:29:52:25:25:29:52 chr11 34999745 . C G 310.17 PASS AO=68;DP=133;FAO=69;FDP=133;FR=.;FRO=64;FSAF=23;FSAR=46;FSRF=22;FSRR=42;FWDB=-0.0217214;FXX=0.0148137;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.467;QD=9.32847;RBI=0.02174;REFB=-0.0120927;REVB=-0.000899659;RO=62;SAF=22;SAR=46;SRF=21;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149567;STB=0.505616;TYPE=snp;VARB=0.0122605;OID=.;OPOS=34999745;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:62:64:68:69:46:22:21:41:46:23:22:42 chr11 35017205 . G T 255.37 PASS AO=73;DP=174;FAO=73;FDP=174;FR=.;FRO=101;FSAF=35;FSAR=38;FSRF=43;FSRR=58;FWDB=0.007956;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.07;QD=5.87067;RBI=0.0146077;REFB=-0.010458;REVB=-0.012251;RO=101;SAF=35;SAR=38;SRF=43;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0559708;STB=0.531301;TYPE=snp;VARB=0.0146654;OID=.;OPOS=35017205;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:174:101:101:73:73:38:35:43:58:38:35:43:58 chr11 35017363 . C A 103.26 PASS AO=27;DP=72;FAO=30;FDP=75;FR=.;FRO=45;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=-0.0200902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.944;QD=5.50697;RBI=0.0255629;REFB=-0.0215446;REVB=-0.0158065;RO=44;SAF=14;SAR=13;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199792;STB=0.51336;TYPE=snp;VARB=0.0357533;OID=.;OPOS=35017363;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:75:44:45:27:30:13:14:22:22:16:14:22:23 chr11 35201842 . C T 286.04 PASS AO=56;DP=101;FAO=58;FDP=103;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=40;FSRF=31;FSRR=14;FWDB=-0.0256973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.6422;QD=11.1082;RBI=0.0261029;REFB=0.00628962;REVB=0.004584;RO=44;SAF=18;SAR=38;SRF=30;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.293318;STB=0.668427;TYPE=snp;VARB=-0.00435394;OID=.;OPOS=35201842;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:103:44:45:56:58:38:18:30:14:40:18:31:14 chr11 35226155 . A G 279.03 PASS AO=67;DP=139;FAO=67;FDP=139;FR=.;FRO=72;FSAF=35;FSAR=32;FSRF=29;FSRR=43;FWDB=-0.0118442;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=187.112;QD=8.02967;RBI=0.0120952;REFB=-0.00102928;REVB=0.00245143;RO=72;SAF=35;SAR=32;SRF=29;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111698;STB=0.561719;TYPE=snp;VARB=0.000815801;OID=.;OPOS=35226155;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:72:72:67:67:32:35:29:43:32:35:29:43 chr11 35229673 . T C 343.66 PASS AO=86;DP=187;FAO=86;FDP=184;FR=.;FRO=98;FSAF=57;FSAR=29;FSRF=53;FSRR=45;FWDB=-0.000430752;FXX=0.0212755;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.211;QD=7.47089;RBI=0.0547719;REFB=-0.0155398;REVB=0.0547702;RO=94;SAF=57;SAR=29;SRF=51;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121294;STB=0.569368;TYPE=snp;VARB=0.0155554;OID=.;OPOS=35229673;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:184:94:98:86:86:29:57:51:43:29:57:53:45 chr11 35274829 . A G 2906.73 PASS AO=326;DP=358;FAO=346;FDP=357;FR=.;FRO=11;FSAF=102;FSAR=244;FSRF=1;FSRR=10;FWDB=0.0251955;FXX=0.00279322;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2992;QD=32.5684;RBI=0.0504186;REFB=-0.196467;REVB=0.0436718;RO=25;SAF=102;SAR=224;SRF=1;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0437711;STB=0.507601;TYPE=snp;VARB=0.0110722;OID=.;OPOS=35274829;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:358:357:25:11:326:346:224:102:1:24:244:102:1:10 chr11 36103228 . A G 104.79 PASS AO=33;DP=89;FAO=33;FDP=89;FR=.;FRO=56;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=27;FSRR=29;FWDB=0.00647489;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.922;QD=4.70978;RBI=0.0210338;REFB=0.00561564;REVB=0.0200124;RO=56;SAF=20;SAR=13;SRF=27;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137423;STB=0.578863;TYPE=snp;VARB=-0.00989068;OID=.;OPOS=36103228;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:56:56:33:33:13:20:27:29:13:20:27:29 chr11 36293048 . G A 853.09 PASS AO=88;DP=89;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.022105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.212;QD=37.4986;RBI=0.0709712;REFB=0;REVB=0.0674409;RO=0;SAF=58;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.91893e-05;OID=.;OPOS=36293048;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:89:91:0:0:88:91:30:58:0:0:33:58:0:0 chr11 36422792 . G A 86.76 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0542103;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.079;QD=38.5593;RBI=0.0543617;REFB=0;REVB=-0.00405449;RO=0;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000694285;OID=.;OPOS=36422792;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:4:5:0:0:4:5:0:0 chr11 36467848 . AG A 451.61 PASS AO=61;DP=85;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.176232;FXX=0.0119033;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.079;QD=21.7643;RBI=0.176256;REFB=-0.0116393;REVB=0.00290121;RO=18;SAF=35;SAR=26;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0406458;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00838991;OID=.;OPOS=36467849;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:61:85:83:83:0:50:33:0:0:35:18:35:26:12:6 chr11 36484208 . T C 292.03 PASS AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000139884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.537;QD=38.9373;RBI=0.0114579;REFB=0;REVB=-0.011457;RO=0;SAF=11;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.12325e-05;OID=.;OPOS=36484208;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:30:30:0:0:30:30:19:11:0:0:19:11:0:0 chr11 36615034 . G A 173.99 PASS AO=55;DP=146;FAO=56;FDP=145;FR=.;FRO=89;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=32;FSRR=57;FWDB=-0.0241633;FXX=0.00684885;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.57;QD=4.79976;RBI=0.0278793;REFB=-0.00512178;REVB=0.0139065;RO=89;SAF=22;SAR=33;SRF=32;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0464908;STB=0.532807;TYPE=snp;VARB=0.00648536;OID=.;OPOS=36615034;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:145:89:89:55:56:33:22:32:57:33:23:32:57 chr11 40137543 . T C 2668.02 PASS AO=269;DP=269;FAO=282;FDP=282;FR=.;FRO=0;FSAF=160;FSAR=122;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0237257;FXX=0.00353344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.758;QD=37.8442;RBI=0.0370333;REFB=0.0131181;REVB=0.0284351;RO=0;SAF=158;SAR=111;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000331182;OID=.;OPOS=40137543;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:269:282:0:0:269:282:111:158:0:0:122:160:0:0 chr11 43391648 . C T 405.5 PASS AO=88;DP=165;FAO=88;FDP=165;FR=.;FRO=77;FSAF=35;FSAR=53;FSRF=42;FSRR=35;FWDB=-0.0812964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.343;QD=9.8302;RBI=0.0827394;REFB=0.00736019;REVB=-0.0153849;RO=75;SAF=35;SAR=53;SRF=41;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126996;STB=0.569876;TYPE=snp;VARB=-0.00457473;OID=.;OPOS=43391648;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:165:75:77:88:88:53:35:41:34:53:35:42:35 chr11 43427350 . G A 175.9 PASS AO=44;DP=96;FAO=44;FDP=96;FR=.;FRO=52;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=-0.0196003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.841;QD=7.32933;RBI=0.0204672;REFB=-0.0117805;REVB=-0.00589374;RO=52;SAF=22;SAR=22;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0186419;STB=0.510412;TYPE=snp;VARB=0.0133001;OID=.;OPOS=43427350;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:52:52:44:44:22:22:25:27:22:22:25:27 chr11 43819872 . GA G 20.12 PASS AO=26;DP=123;FAO=33;FDP=122;FR=.;FRO=89;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=59;FSRR=30;FWDB=0.0108754;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=14.1779;QD=0.659588;RBI=0.0967179;REFB=-0.0315593;REVB=0.0961046;RO=78;SAF=14;SAR=12;SRF=52;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163401;STB=0.649038;TYPE=del;VARB=0.0450345;OID=.;OPOS=43819873;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:26:117:33:122:89:15:18:59:30:20:78:14:12:52:26 chr11 43876698 . C T 357.22 PASS AO=82;DP=163;FAO=82;FDP=162;FR=.;FRO=80;FSAF=55;FSAR=27;FSRF=33;FSRR=47;FWDB=0.0107144;FXX=0.00613459;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.3506;QD=8.82028;RBI=0.0107994;REFB=-0.00368153;REVB=-0.00135202;RO=81;SAF=55;SAR=27;SRF=34;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233546;STB=0.631367;TYPE=snp;VARB=0.00344967;OID=.;OPOS=43876698;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:162:81:80:82:82:27:55:34:47:27:55:33:47 chr11 43911365 . T C 1420.11 PASS AO=146;DP=150;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0147763;FXX=0.0132442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.915;QD=38.1237;RBI=0.0152135;REFB=0;REVB=0.00362119;RO=0;SAF=74;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.95582e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.48072e-05;OID=.;OPOS=43911365;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:150:149:0:0:146:149:72:74:0:0:73:76:0:0 chr11 43913604 . G A 131.02 PASS AO=37;DP=91;FAO=37;FDP=91;FR=.;FRO=54;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=37;FWDB=0.0194369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.15;QD=5.75919;RBI=0.0270355;REFB=0.0212471;REVB=0.0187916;RO=54;SAF=13;SAR=24;SRF=17;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0426414;STB=0.524111;TYPE=snp;VARB=-0.0334292;OID=.;OPOS=43913604;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:54:54:37:37:24:13:17:37:24:13:17:37 chr11 43940644 . G T 1417.44 PASS AO=153;DP=157;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00070881;FXX=0.0254761;HRUN=3;LEN=1;MLLD=153.825;QD=37.0572;RBI=0.00765127;REFB=0.0177238;REVB=0.00761836;RO=2;SAF=67;SAR=86;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0109333;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.69193e-05;OID=.;OPOS=43940644;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:157:153:2:0:153:153:86:67:0:2:86:67:0:0 chr11 43946967 . A G 1577.64 PASS AO=166;DP=168;FAO=166;FDP=166;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=122;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0213555;FXX=0.0119041;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3405;QD=38.0154;RBI=0.0269601;REFB=-0.045914;REVB=0.0164558;RO=1;SAF=44;SAR=122;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106916;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000145508;OID=.;OPOS=43946967;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:168:166:1:0:166:166:122:44:1:0:122:44:0:0 chr11 43947990 . T C 629.3 PASS AO=72;DP=74;FAO=71;FDP=74;FR=.;FRO=3;FSAF=50;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0127015;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.6911;QD=34.0163;RBI=0.074926;REFB=-0.0804341;REVB=-0.0738416;RO=1;SAF=50;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0210088;STB=0.533324;TYPE=snp;VARB=0.00108716;OID=.;OPOS=43947990;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:74:74:1:3:72:71:22:50:0:1:21:50:0:3 chr11 43965880 . AC A 211.6 PASS AO=25;DP=46;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.259651;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.4484;QD=21.1599;RBI=0.347089;REFB=0;REVB=0.230331;RO=12;SAF=3;SAR=22;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0.314879;SSSB=-0.302751;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0249041;OID=.;OPOS=43965881;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:25:39:40:40:0:10:30:0:0:19:12:3:22:5:7 chr11 44069748 . G A 217.81 PASS AO=61;DP=144;FAO=61;FDP=144;FR=.;FRO=83;FSAF=32;FSAR=29;FSRF=31;FSRR=52;FWDB=0.00654993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.942;QD=6.05026;RBI=0.00984648;REFB=-0.00996281;REVB=0.00735198;RO=82;SAF=32;SAR=29;SRF=31;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149509;STB=0.58653;TYPE=snp;VARB=0.0125258;OID=.;OPOS=44069748;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:144:82:83:61:61:29:32:31:51:29:32:31:52 chr11 44080210 . T C 1758.95 PASS AO=183;DP=183;FAO=184;FDP=184;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=128;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0381506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.715;QD=38.2381;RBI=0.0396603;REFB=0;REVB=0.0108384;RO=0;SAF=56;SAR=127;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.65112e-05;OID=.;OPOS=44080210;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:183:184:0:0:183:184:127:56:0:0:128:56:0:0 chr11 44089352 . G A 523.4 PASS AO=124;DP=256;FAO=126;FDP=256;FR=.;FRO=130;FSAF=75;FSAR=51;FSRF=51;FSRR=79;FWDB=0.00348913;FXX=0.00775164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.928;QD=8.17807;RBI=0.0351323;REFB=-0.018786;REVB=0.0349586;RO=131;SAF=74;SAR=50;SRF=50;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19994;STB=0.602729;TYPE=snp;VARB=0.0141981;OID=.;OPOS=44089352;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:256:256:131:130:124:126:50:74:50:81:51:75:51:79 chr11 44092880 . C T 178.85 PASS AO=37;DP=69;FAO=37;FDP=69;FR=.;FRO=32;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=0.00675309;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=267.424;QD=10.3679;RBI=0.00943277;REFB=-0.00158957;REVB=0.0065858;RO=32;SAF=22;SAR=15;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106866;STB=0.559142;TYPE=snp;VARB=0.000988987;OID=.;OPOS=44092880;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:32:32:37:37:15:22:15:17:15:22:15:17 chr11 44096238 . G A 302.53 PASS AO=35;DP=38;FAO=36;FDP=38;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0457138;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.281;QD=31.8447;RBI=0.053197;REFB=-0.021462;REVB=0.027206;RO=2;SAF=12;SAR=23;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.038958;STB=0.520822;TYPE=snp;VARB=0.0032065;OID=.;OPOS=44096238;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:38:38:2:2:35:36:23:12:0:2:23:13:0:2 chr11 44101118 . C T 268 PASS AO=66;DP=151;FAO=70;FDP=154;FR=.;FRO=84;FSAF=19;FSAR=51;FSRF=16;FSRR=68;FWDB=0.00312399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.395;QD=6.96096;RBI=0.0615815;REFB=-0.0184153;REVB=0.0615023;RO=84;SAF=19;SAR=47;SRF=16;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127367;STB=0.558808;TYPE=snp;VARB=0.0169659;OID=.;OPOS=44101118;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:154:84:84:66:70:47:19:16:68:51:19:16:68 chr11 44104981 . C T 1134.87 PASS AO=121;DP=123;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000340404;FXX=0.0162588;HRUN=3;LEN=1;MLLD=211.411;QD=37.5163;RBI=0.0318533;REFB=-0.0405316;REVB=0.0318515;RO=1;SAF=23;SAR=98;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0202011;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00062112;OID=.;OPOS=44104981;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:123:121:1:0:121:121:98:23:1:0:98:23:0:0 chr11 44297054 . T C 1193.16 PASS AO=124;DP=125;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0010778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.069;QD=38.1811;RBI=0.0122411;REFB=0;REVB=0.0121936;RO=0;SAF=65;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.48103e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.97331e-05;OID=.;OPOS=44297054;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:125:125:0:0:124:125:59:65:0:0:59:66:0:0 chr11 44636839 . C T 299.29 PASS AO=71;DP=145;FAO=71;FDP=145;FR=.;FRO=74;FSAF=32;FSAR=39;FSRF=29;FSRR=45;FWDB=0.00258322;FXX=0.00684885;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.98;QD=8.2563;RBI=0.0145855;REFB=-0.0168674;REVB=0.0143549;RO=71;SAF=32;SAR=39;SRF=28;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0519403;STB=0.530483;TYPE=snp;VARB=0.0150123;OID=.;OPOS=44636839;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:71:74:71:71:39:32:28:43:39:32:29:45 chr11 44640268 . A G 279.43 PASS AO=28;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0185193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.17;QD=38.5419;RBI=0.0486012;REFB=0;REVB=-0.0449345;RO=0;SAF=10;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000744143;OID=.;OPOS=44640268;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:28:29:0:0:28:29:18:10:0:0:19:10:0:0 chr11 44640640 . C G 224.56 PASS AO=50;DP=98;FAO=50;FDP=98;FR=.;FRO=48;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=0.0253462;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.458;QD=9.16575;RBI=0.02707;REFB=-0.0171177;REVB=0.00950566;RO=48;SAF=27;SAR=23;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0723773;STB=0.539984;TYPE=snp;VARB=0.0166658;OID=.;OPOS=44640640;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:48:48:50:50:23:27:22:26:23:27:22:26 chr11 44925359 . C CT 971.67 PASS AO=109;DP=129;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0845285;FXX=0.0236202;HRUN=1;LEN=1;MLLD=27.6215;QD=31.344;RBI=0.0855547;REFB=0;REVB=-0.0132113;RO=12;SAF=24;SAR=85;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0080982;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-0.00106931;OID=.;OPOS=44925360;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:109:129:124:124:0:26:98:0:0:86:12:24:85:3:9 chr11 44925416 . G A 145.28 PASS AO=55;DP=158;FAO=54;FDP=159;FR=.;FRO=105;FSAF=9;FSAR=45;FSRF=15;FSRR=90;FWDB=-0.210687;FXX=0.00624961;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.7666;QD=3.65493;RBI=0.210935;REFB=-0.0188518;REVB=-0.0102402;RO=98;SAF=10;SAR=45;SRF=13;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100427;STB=0.529401;TYPE=snp;VARB=0.0293114;OID=.;OPOS=44925416;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:159:98:105:55:54:45:10:13:85:45:9:15:90 chr11 45670395 . C T 132.1 PASS AO=30;DP=64;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=0.0398681;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=86.7015;QD=8.25641;RBI=0.057624;REFB=-0.0443416;REVB=0.041606;RO=31;SAF=14;SAR=16;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132255;STB=0.578264;TYPE=snp;VARB=0.0514571;OID=.;OPOS=45670395;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:31:33:30:31:16:14:19:12:16:15:21:12 chr11 45671818 . AG A 129.01 PASS AO=15;DP=20;FAO=19;FDP=20;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.205042;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.753;QD=25.8021;RBI=0.317053;REFB=-0.011824;REVB=0.241827;RO=3;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0.426471;SSSB=0.118736;STB=0.518499;TYPE=del;VARB=0.0485252;OID=.;OPOS=45671819;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:15:18:19:20:1:6:13:0:1:8:3:5:10:0:3 chr11 45672261 . A G 73.18 PASS AO=14;DP=25;FAO=14;FDP=25;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.00466856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.366;QD=11.7088;RBI=0.00979924;REFB=-0.0119205;REVB=-0.00861567;RO=11;SAF=6;SAR=8;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0204611;STB=0.511611;TYPE=snp;VARB=0.013078;OID=.;OPOS=45672261;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:25:25:11:11:14:14:8:6:5:6:8:6:5:6 chr11 45834198 . T C 941 PASS AO=59;DP=134;FAO=105;FDP=106;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00899586;FXX=0.00934492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.934;QD=35.5094;RBI=0.00940117;REFB=0.0120164;REVB=0.00273068;RO=0;SAF=0;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503936;TYPE=snp;VARB=0.000410652;OID=.;OPOS=45834198;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:67:106:0:1:59:105:59:0:0:0:63:42:0:1 chr11 45848271 . A G 12.13 PASS AO=30;DP=200;FAO=28;FDP=197;FR=.;FRO=169;FSAF=25;FSAR=3;FSRF=62;FSRR=107;FWDB=-0.0123981;FXX=0.0198995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.888;QD=0.246305;RBI=0.0294742;REFB=-0.00166302;REVB=-0.0267398;RO=169;SAF=27;SAR=3;SRF=62;SRR=107;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.642412;STB=0.913051;TYPE=snp;VARB=0.00846055;OID=.;OPOS=45848271;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:200:197:169:169:30:28:3:27:62:107:3:25:62:107 chr11 45848275 . T C 20.21 PASS AO=33;DP=199;FAO=32;FDP=199;FR=.;FRO=167;FSAF=25;FSAR=7;FSRF=64;FSRR=103;FWDB=-2.79159e-05;FXX=0.00499975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.748;QD=0.406139;RBI=0.0899546;REFB=0.000983748;REVB=0.0899546;RO=160;SAF=27;SAR=6;SRF=62;SRR=98;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.533554;STB=0.815114;TYPE=snp;VARB=-0.00299765;OID=.;OPOS=45848275;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:199:199:160:167:33:32:6:27:62:98:7:25:64:103 chr11 45903613 . A C 626.09 PASS AO=67;DP=68;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0177899;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.7361;QD=36.829;RBI=0.0564401;REFB=0.15147;REVB=-0.0535631;RO=1;SAF=25;SAR=42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111201;STB=0.505881;TYPE=snp;VARB=-0.00235124;OID=.;OPOS=45903613;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:68:68:1:1:67:67:42:25:0:1:42:25:0:1 chr11 45935384 . A G 543.51 PASS AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00607736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.115;QD=38.1413;RBI=0.00611823;REFB=0;REVB=0.000706026;RO=0;SAF=26;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19358e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.55594e-05;OID=.;OPOS=45935384;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:57:57:0:0:57:57:31:26:0:0:31:26:0:0 chr11 45937267 . C T 155.68 PASS AO=18;DP=20;FAO=18;FDP=20;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0342178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.026;QD=31.1369;RBI=0.0367841;REFB=-0.213828;REVB=0.0134984;RO=2;SAF=6;SAR=12;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130434;STB=0.571347;TYPE=snp;VARB=0.00482397;OID=.;OPOS=45937267;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:20:20:2:2:18:18:12:6:2:0:12:6:2:0 chr11 45937269 . AG A 26.53 PASS AO=6;DP=20;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=-0.114263;FXX=0.0555247;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.0935;QD=6.24339;RBI=0.248128;REFB=-0.0429546;REVB=0.220254;RO=8;SAF=5;SAR=1;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0.269311;SSSB=0.613938;STB=0.810118;TYPE=del;VARB=0.074308;OID=.;OPOS=45937270;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:6:18:8:17:9:6:2:1:8:22:8:5:1:1:7 chr11 45949534 . C T 471.41 PASS AO=48;DP=49;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0915278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.2525;QD=36.9731;RBI=0.126761;REFB=0;REVB=0.0876985;RO=1;SAF=24;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.019199;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00190661;OID=.;OPOS=45949534;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:49:51:1:0:48:51:24:24:1:0:25:26:0:0 chr11 45949746 . A C 73.16 PASS AO=15;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.00607887;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.277;QD=9.1452;RBI=0.0102559;REFB=-0.037495;REVB=-0.00826014;RO=15;SAF=8;SAR=7;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174033;STB=0.562423;TYPE=snp;VARB=0.0159579;OID=.;OPOS=45949746;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:32:32:15:16:15:16:7:8:5:10:8:8:6:10 chr11 46342081 . TG T 355.06 PASS AO=42;DP=55;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0608286;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=16.1433;QD=27.3122;RBI=0.0852881;REFB=-0.0162308;REVB=0.0597825;RO=2;SAF=14;SAR=28;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0323575;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00220566;OID=.;OPOS=46342082;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:42:51:52:52:0:18:34:0:0:30:2:14:28:0:2 chr11 46624898 . A G 224.85 PASS AO=60;DP=136;FAO=60;FDP=136;FR=.;FRO=76;FSAF=19;FSAR=41;FSRF=29;FSRR=47;FWDB=0.0426712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.9936;QD=6.61327;RBI=0.0476475;REFB=0.00109145;REVB=-0.0212002;RO=76;SAF=19;SAR=41;SRF=29;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0726441;STB=0.540645;TYPE=snp;VARB=-0.00157779;OID=.;OPOS=46624898;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:76:76:60:60:41:19:29:47:41:19:29:47 chr11 46702920 . T C 1539.25 PASS AO=164;DP=167;FAO=164;FDP=164;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00783837;FXX=0.017963;HRUN=5;LEN=1;MLLD=222.07;QD=37.5427;RBI=0.00923177;REFB=0.0146662;REVB=-0.00487705;RO=1;SAF=79;SAR=85;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0059857;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.30399e-05;OID=.;OPOS=46702920;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:167:164:1:0:164:164:85:79:1:0:85:79:0:0 chr11 46801502 . T C 357.18 PASS AO=42;DP=45;FAO=42;FDP=45;FR=.;FRO=3;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0235577;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=152.964;QD=31.7491;RBI=0.0970214;REFB=-0.118759;REVB=0.0941179;RO=2;SAF=26;SAR=16;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0551181;STB=0.542836;TYPE=snp;VARB=0.00159372;OID=.;OPOS=46801502;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:45:45:2:3:42:42:16:26:0:2:16:26:0:3 chr11 46879973 . A G 505.11 PASS AO=60;DP=65;FAO=60;FDP=65;FR=.;FRO=5;FSAF=39;FSAR=21;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0301212;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=166.941;QD=31.0839;RBI=0.0301877;REFB=-0.0608663;REVB=-0.0020034;RO=4;SAF=39;SAR=21;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129926;STB=0.504214;TYPE=snp;VARB=0.000357736;OID=.;OPOS=46879973;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:65:65:4:5:60:60:21:39:3:1:21:39:3:2 chr11 46879990 . T C 636.79 PASS AO=65;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00395426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.918;QD=38.017;RBI=0.0279455;REFB=0;REVB=0.0276644;RO=0;SAF=36;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.23206e-05;OID=.;OPOS=46879990;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:66:67:0:0:65:67:29:36:0:0:29:38:0:0 chr11 46890165 . C T 351.11 PASS AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212099;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.309;QD=37.9581;RBI=0.0221015;REFB=0;REVB=0.00621449;RO=0;SAF=25;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.13976e-05;OID=.;OPOS=46890165;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:37:37:0:0:37:37:12:25:0:0:12:25:0:0 chr11 46893108 . T C 1053.85 PASS AO=110;DP=110;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00825244;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.685;QD=38.6734;RBI=0.0221207;REFB=0;REVB=0.0205237;RO=0;SAF=33;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.12674e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.99938e-05;OID=.;OPOS=46893108;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:110:109:0:0:110:109:77:33:0:0:77:32:0:0 chr11 46898771 . T C 2351.16 PASS AO=245;DP=251;FAO=245;FDP=245;FR=.;FRO=0;FSAF=130;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.004645;FXX=0.0239034;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.6081;QD=38.3863;RBI=0.0458602;REFB=0;REVB=0.0456243;RO=0;SAF=130;SAR=115;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000195266;OID=.;OPOS=46898771;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:251:245:0:0:245:245:115:130:0:0:115:130:0:0 chr11 46914583 . T C 555.95 PASS AO=57;DP=58;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0149733;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.512;QD=37.063;RBI=0.0334731;REFB=-0.136471;REVB=-0.0299374;RO=1;SAF=35;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0132859;STB=0.50704;TYPE=snp;VARB=0.00252456;OID=.;OPOS=46914583;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:58:60:1:1:57:59:22:35:1:0:24:35:1:0 chr11 46914598 . A G 577.08 PASS AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0546645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.4715;QD=37.8413;RBI=0.0572051;REFB=0;REVB=0.0168589;RO=0;SAF=36;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000291214;OID=.;OPOS=46914598;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:61:61:0:0:61:61:25:36:0:0:25:36:0:0 chr11 46916179 . T G 211.86 PASS AO=51;DP=106;FAO=51;FDP=106;FR=.;FRO=55;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=30;FSRR=25;FWDB=-0.0335638;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.8679;QD=7.99487;RBI=0.0523439;REFB=-0.00851956;REVB=-0.0401665;RO=54;SAF=25;SAR=26;SRF=29;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0434054;STB=0.528639;TYPE=snp;VARB=0.0126388;OID=.;OPOS=46916179;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:54:55:51:51:26:25:29:25:26:25:30:25 chr11 46917518 . TG T 815 PASS AO=110;DP=134;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.250531;FXX=0.00781189;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.4861;QD=25.6693;RBI=0.264357;REFB=0;REVB=0.0843749;RO=13;SAF=19;SAR=91;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0.260775;SSSB=-0.094031;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0050624;OID=.;OPOS=46917519;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:110:128:127:127:0:25:102:0:0:73:13:19:91:6:7 chr11 46969616 . T C 2115.72 PASS AO=221;DP=221;FAO=221;FDP=221;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00540962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.855;QD=38.2936;RBI=0.026026;REFB=0;REVB=0.0254576;RO=0;SAF=103;SAR=118;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.43489e-05;OID=.;OPOS=46969616;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:221:221:0:0:221:221:118:103:0:0:118:103:0:0 chr11 47188314 . T C 1060.33 PASS AO=97;DP=97;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0895599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.331;QD=38.5576;RBI=0.0897677;REFB=0;REVB=0.00610456;RO=0;SAF=29;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30323e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.87929e-05;OID=.;OPOS=47188314;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:97:110:0:0:97:110:68:29:0:0:68:42:0:0 chr11 47238522 . T C 1204.52 PASS AO=123;DP=123;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0294438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.5766;QD=38.2387;RBI=0.0394701;REFB=0;REVB=0.0262859;RO=0;SAF=46;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000163671;OID=.;OPOS=47238522;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:123:126:0:0:123:126:77:46:0:0:79:47:0:0 chr11 47259668 . T C 719.35 PASS AO=79;DP=81;FAO=79;FDP=81;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.010239;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.292;QD=35.5233;RBI=0.0122129;REFB=0.118122;REVB=0.00665719;RO=2;SAF=37;SAR=42;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0220075;STB=0.511625;TYPE=snp;VARB=-0.0017256;OID=.;OPOS=47259668;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:81:81:2:2:79:79:42:37:0:2:42:37:0:2 chr11 47298360 . G A 1279.68 PASS AO=128;DP=131;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.138959;FXX=0.0218962;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.192;QD=38.1993;RBI=0.139398;REFB=0;REVB=0.0110565;RO=0;SAF=31;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.53579e-05;OID=.;OPOS=47298360;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:131:134:0:0:128:134:97:31:0:0:99:35:0:0 chr11 47303275 . T C 162.75 PASS AO=41;DP=91;FAO=41;FDP=91;FR=.;FRO=50;FSAF=10;FSAR=31;FSRF=12;FSRR=38;FWDB=0.0147185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.631;QD=7.15402;RBI=0.0266871;REFB=-0.00628144;REVB=-0.0222613;RO=50;SAF=10;SAR=31;SRF=12;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00520484;STB=0.502914;TYPE=snp;VARB=0.00655879;OID=.;OPOS=47303275;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:50:50:41:41:31:10:12:38:31:10:12:38 chr11 47307076 . G T 218.28 PASS AO=51;DP=103;FAO=51;FDP=104;FR=.;FRO=53;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=19;FSRR=34;FWDB=0.00336398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.837;QD=8.39546;RBI=0.0035036;REFB=-0.00880704;REVB=-0.000979198;RO=52;SAF=22;SAR=29;SRF=18;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.080289;STB=0.538238;TYPE=snp;VARB=0.00785825;OID=.;OPOS=47307076;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:104:52:53:51:51:29:22:18:34:29:22:19:34 chr11 47314086 . TG T 291.22 PASS AO=40;DP=55;FAO=52;FDP=55;FR=.;FRO=3;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.313573;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=16.8078;QD=21.1797;RBI=0.313858;REFB=-0.0366939;REVB=-0.0133825;RO=11;SAF=17;SAR=23;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121302;STB=0.526306;TYPE=del;VARB=0.0190287;OID=.;OPOS=47314087;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:40:55:52:55:3:25:27:0:3:13:11:17:23:8:3 chr11 47331116 . T C 1724.55 PASS AO=191;DP=198;FAO=191;FDP=198;FR=.;FRO=7;FSAF=75;FSAR=116;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=-0.0151615;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.893;QD=34.8395;RBI=0.01694;REFB=0.0438867;REVB=0.00755594;RO=7;SAF=75;SAR=116;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0278663;STB=0.514643;TYPE=snp;VARB=-0.000505584;OID=.;OPOS=47331116;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:198:198:7:7:191:191:116:75:0:7:116:75:0:7 chr11 47364762 . A G 447.29 PASS AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0284237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.865;QD=38.0668;RBI=0.0451363;REFB=0;REVB=0.0350625;RO=0;SAF=22;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000250054;OID=.;OPOS=47364762;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:47:47:0:0:47:47:25:22:0:0:25:22:0:0 chr11 47380252 . CA C 28.68 PASS AO=8;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=10;FWDB=-0.0303968;FXX=0.0475964;HRUN=4;LEN=1;MLLD=17.048;QD=5.73531;RBI=0.0510177;REFB=-0.046936;REVB=0.0409737;RO=13;SAF=5;SAR=3;SRF=2;SRR=11;SSEN=0.372549;SSEP=0;SSSB=0.457906;STB=0.787349;TYPE=del;VARB=0.0806647;OID=.;OPOS=47380253;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:8:21:9:20:11:6:3:1:10:27:13:5:3:2:11 chr11 47431728 . A G 73.83 PASS AO=15;DP=19;FAO=12;FDP=19;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=-0.103095;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=35.099;QD=15.5426;RBI=0.106747;REFB=-0.0654864;REVB=0.027682;RO=4;SAF=4;SAR=11;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140082;STB=0.651964;TYPE=snp;VARB=0.0341365;OID=.;OPOS=47431728;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:19:19:4:7:15:12:11:4:0:4:8:4:0:7 chr11 47431763 . C CG 32.79 PASS AO=10;DP=24;FAO=11;FDP=15;FR=.;FRO=4;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.192845;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=7.97404;QD=8.74479;RBI=0.368931;REFB=-0.0146928;REVB=0.314517;RO=14;SAF=5;SAR=5;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.533274;TYPE=ins;VARB=0.105702;OID=.;OPOS=47431764;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:10:24:11:15:4:7:4:3:1:7:14:5:5:7:7 chr11 47434986 . G A 337.58 PASS AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0566634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.2636;QD=37.5092;RBI=0.0969398;REFB=0;REVB=0.0786548;RO=0;SAF=10;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.03206e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00124426;OID=.;OPOS=47434986;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:35:36:0:0:35:36:25:10:0:0:26:10:0:0 chr11 47460306 . A G 197.87 PASS AO=25;DP=31;FAO=26;FDP=31;FR=.;FRO=5;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.0981022;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.3071;QD=25.5313;RBI=0.113255;REFB=-0.0370169;REVB=-0.0565923;RO=6;SAF=11;SAR=14;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100193;STB=0.575701;TYPE=snp;VARB=0.00708921;OID=.;OPOS=47460306;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:31:31:6:5:25:26:14:11:1:5:14:12:0:5 chr11 47469439 . A G 929.29 PASS AO=96;DP=96;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218084;FXX=0.0202;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.717;QD=38.3212;RBI=0.0218541;REFB=0;REVB=0.00141286;RO=0;SAF=47;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.53995e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000445452;OID=.;OPOS=47469439;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:96:97:0:0:96:97:49:47:0:0:49:48:0:0 chr11 47579092 . G A 99.27 PASS AO=12;DP=12;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0177675;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=298.303;QD=39.7067;RBI=0.0177675;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=12;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.85077e-05;OID=.;OPOS=47579092;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:10:0:0:12:10:0:12:0:0:0:10:0:0 chr11 47579094 . A G 95.37 PASS AO=12;DP=12;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.173288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.278;QD=38.1487;RBI=0.173288;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=12;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00785578;OID=.;OPOS=47579094;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:12:10:0:0:12:10:0:12:0:0:0:10:0:0 chr11 47579103 . C A 107.82 PASS AO=14;DP=14;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00128232;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=315.677;QD=35.9384;RBI=0.00128232;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=14;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.64309e-06;OID=.;OPOS=47579103;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:14:12:0:0:14:12:0:14:0:0:0:12:0:0 chr11 47579104 . C T 107.82 PASS AO=13;DP=14;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00547771;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=388.61;QD=35.9384;RBI=0.00547771;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=13;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.59374e-05;OID=.;OPOS=47579104;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:14:12:0:0:13:12:0:13:0:0:0:12:0:0 chr11 47579105 . G A 107.82 PASS AO=13;DP=14;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.5877;QD=35.9384;RBI=0.0101034;REFB=0;REVB=0;RO=1;SAF=13;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000460082;OID=.;OPOS=47579105;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:14:12:1:0:13:12:0:13:1:0:0:12:0:0 chr11 47579119 . A T 712.14 PASS AO=77;DP=77;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.249;QD=37.9806;RBI=0.0166726;REFB=0;REVB=0.00144337;RO=0;SAF=16;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.3178e-05;OID=.;OPOS=47579119;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:77:75:0:0:77:75:61:16:0:0:61:14:0:0 chr11 47579326 . TC T 92.69 PASS AO=14;DP=34;FAO=23;FDP=25;FR=.;FRO=2;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.158108;FXX=0.0740466;HRUN=5;LEN=1;MLLD=9.52182;QD=14.83;RBI=0.295637;REFB=-0.111083;REVB=0.249806;RO=9;SAF=8;SAR=6;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0884995;STB=0.533305;TYPE=del;VARB=0.0450827;OID=.;OPOS=47579327;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:14:28:23:25:2:14:9:2:0:4:9:8:6:4:5 chr11 47593945 . A C 1726.35 PASS AO=179;DP=180;FAO=179;FDP=179;FR=.;FRO=0;FSAF=112;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0231983;FXX=0.00555525;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.167;QD=38.5778;RBI=0.0272316;REFB=0;REVB=0.0142617;RO=0;SAF=112;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.63333e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.27363e-05;OID=.;OPOS=47593945;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:180:179:0:0:179:179:67:112:0:0:67:112:0:0 chr11 47599714 . A G 61.4 PASS AO=6;DP=6;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00487272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.214;QD=35.0875;RBI=0.00960835;REFB=0;REVB=0.00828112;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000694922;OID=.;OPOS=47599714;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:7:0:0:6:7:3:3:0:0:4:3:0:0 chr11 47609604 . G GA 20.17 PASS AO=4;DP=10;FAO=4;FDP=8;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0183404;FXX=0.1998;HRUN=0;LEN=1;MLLD=108.97;QD=10.0825;RBI=0.0232378;REFB=-0.0145141;REVB=-0.0142698;RO=6;SAF=4;SAR=0;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.684163;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.0283967;OID=.;OPOS=47609605;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:4:10:4:8:4:4:0:4:0:19:6:4:0:4:2 chr11 47609867 . G A 341.03 PASS AO=39;DP=41;FAO=39;FDP=41;FR=.;FRO=2;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0319313;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=157.494;QD=33.2711;RBI=0.0385217;REFB=0.130914;REVB=0.021548;RO=1;SAF=14;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0323034;STB=0.507439;TYPE=snp;VARB=-0.00107673;OID=.;OPOS=47609867;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:41:41:1:2:39:39:25:14:1:0:25:14:1:1 chr11 47681370 . T G 368.2 PASS AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00343713;FXX=0.0499875;HRUN=4;LEN=1;MLLD=242.783;QD=38.7582;RBI=0.0291657;REFB=0;REVB=-0.0289624;RO=0;SAF=25;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.45856e-05;OID=.;OPOS=47681370;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:38:38:0:0:38:38:13:25:0:0:13:25:0:0 chr11 47712213 . C T 2469.83 PASS AO=258;DP=262;FAO=262;FDP=263;FR=.;FRO=1;FSAF=85;FSAR=177;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0114421;FXX=0.018656;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.017;QD=37.564;RBI=0.0145992;REFB=-0.13183;REVB=0.00906722;RO=1;SAF=84;SAR=174;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00273208;STB=0.501408;TYPE=snp;VARB=0.00017028;OID=.;OPOS=47712213;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:262:263:1:1:258:262:174:84:0:1:177:85:0:1 chr11 47748509 . T C 2107 PASS AO=222;DP=224;FAO=222;FDP=222;FR=.;FRO=0;FSAF=109;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0109295;FXX=0.00892817;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.723;QD=37.9639;RBI=0.0393905;REFB=0.0705232;REVB=-0.0378439;RO=1;SAF=109;SAR=113;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00435144;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000628207;OID=.;OPOS=47748509;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:91:224:222:1:0:222:222:113:109:1:0:113:109:0:0 chr11 47826090 . A C 1187.97 PASS AO=132;DP=137;FAO=132;FDP=137;FR=.;FRO=5;FSAF=50;FSAR=82;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.00294181;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=251.977;QD=34.6851;RBI=0.0372621;REFB=0.0456916;REVB=0.0371458;RO=4;SAF=50;SAR=82;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0365108;STB=0.523806;TYPE=snp;VARB=-0.000439638;OID=.;OPOS=47826090;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:137:137:4:5:132:132:82:50:4:0:82:50:5:0 chr11 47834592 . G A 741.75 PASS AO=80;DP=81;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0670687;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.465;QD=36.6296;RBI=0.0704756;REFB=-0.105223;REVB=0.0216472;RO=1;SAF=31;SAR=49;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00956538;STB=0.505049;TYPE=snp;VARB=0.000555986;OID=.;OPOS=47834592;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:81:81:1:1:80:80:49:31:0:1:49:31:0:1 chr11 47857232 . TC T 890.88 PASS AO=117;DP=169;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=116;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.311876;FXX=0.00624961;HRUN=4;LEN=1;MLLD=12.0137;QD=22.412;RBI=0.392472;REFB=0.00206003;REVB=0.23826;RO=31;SAF=27;SAR=90;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0493649;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00584594;OID=.;OPOS=47857233;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:117:156:159:159:0:43:116:0:0:75:31:27:90:10:21 chr11 47857253 . T C 1481.81 PASS AO=116;DP=160;FAO=158;FDP=158;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=43;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00570911;FXX=0.0186324;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.061;QD=37.5142;RBI=0.0404084;REFB=0;REVB=0.0400031;RO=0;SAF=39;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.49548e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.99404e-05;OID=.;OPOS=47857253;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:159:158:0:0:116:158:77:39:0:0:115:43:0:0 chr11 47857254 . G C 78.93 PASS AO=43;DP=163;FAO=43;FDP=164;FR=.;FRO=121;FSAF=3;FSAR=40;FSRF=43;FSRR=78;FWDB=-0.0438831;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=92.4147;QD=1.92507;RBI=0.0515282;REFB=-0.0506033;REVB=0.0270079;RO=120;SAF=3;SAR=40;SRF=42;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.53755;STB=0.838447;TYPE=snp;VARB=0.0139619;OID=.;OPOS=47857254;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:163:164:120:121:43:43:40:3:42:78:40:3:43:78 chr11 48118347 . T TA 678.79 PASS AO=85;DP=95;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0368018;FXX=0.0212743;HRUN=2;LEN=1;MLLD=19.6357;QD=29.5128;RBI=0.0392821;REFB=0;REVB=-0.0137373;RO=6;SAF=22;SAR=63;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.038361;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.000699964;OID=.;OPOS=48118348;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:85:95:92:92:0:25:67:0:0:58:6:22:63:3:3 chr11 48145247 . T C 1993.08 PASS AO=199;DP=200;FAO=208;FDP=208;FR=.;FRO=0;FSAF=102;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.76;QD=38.3285;RBI=0.0619824;REFB=0;REVB=0.05756;RO=0;SAF=102;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.95144e-05;OID=.;OPOS=48145247;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:94:200:208:0:0:199:208:97:102:0:0:106:102:0:0 chr11 48145375 . A C 274.09 PASS AO=64;DP=142;FAO=69;FDP=149;FR=.;FRO=80;FSAF=23;FSAR=46;FSRF=37;FSRR=43;FWDB=-0.0475565;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.3804;QD=7.358;RBI=0.0585776;REFB=0.020533;REVB=0.0342012;RO=78;SAF=23;SAR=41;SRF=36;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105602;STB=0.574141;TYPE=snp;VARB=-0.0218953;OID=.;OPOS=48145375;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:149:78:80:64:69:41:23:36:42:46:23:37:43 chr11 48166267 . G C 360.13 PASS AO=92;DP=204;FAO=94;FDP=206;FR=.;FRO=112;FSAF=29;FSAR=65;FSRF=49;FSRR=63;FWDB=0.00645537;FXX=0.00483068;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.353;QD=6.99271;RBI=0.00651146;REFB=-0.00972565;REVB=0.000852809;RO=111;SAF=29;SAR=63;SRF=49;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135626;STB=0.5773;TYPE=snp;VARB=0.020213;OID=.;OPOS=48166267;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:206:111:112:92:94:63:29:49:62:65:29:49:63 chr11 48190383 . A T 1658.6 PASS AO=185;DP=191;FAO=192;FDP=203;FR=.;FRO=11;FSAF=75;FSAR=117;FSRF=0;FSRR=11;FWDB=0.0274113;FXX=0.00490172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.126;QD=32.6817;RBI=0.0274357;REFB=-0.0139507;REVB=0.00115751;RO=1;SAF=68;SAR=117;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00405237;STB=0.522447;TYPE=snp;VARB=0.000492926;OID=.;OPOS=48190383;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:191:203:1:11:185:192:117:68:0:1:117:75:0:11 chr11 48190527 . T C 1158.38 PASS AO=120;DP=120;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0348115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.0497;QD=38.6127;RBI=0.0407616;REFB=0;REVB=0.0212054;RO=0;SAF=50;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.00207e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.09217e-05;OID=.;OPOS=48190527;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:120:120:0:0:120:120:70:50:0:0:70:50:0:0 chr11 48238421 . T G 1993.33 PASS AO=210;DP=214;FAO=214;FDP=214;FR=.;FRO=0;FSAF=110;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0606458;FXX=0.0138242;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.828;QD=37.2586;RBI=0.0616103;REFB=-0.067114;REVB=0.0108591;RO=1;SAF=106;SAR=104;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00447308;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000438845;OID=.;OPOS=48238421;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:214:214:1:0:210:214:104:106:1:0:104:110:0:0 chr11 48238549 . G A 549.06 PASS AO=134;DP=280;FAO=134;FDP=278;FR=.;FRO=144;FSAF=51;FSAR=83;FSRF=57;FSRR=87;FWDB=-0.0256109;FXX=0.0106758;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.315;QD=7.90015;RBI=0.0313573;REFB=-0.0183211;REVB=0.018093;RO=137;SAF=51;SAR=83;SRF=54;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0131948;STB=0.508335;TYPE=snp;VARB=0.0179599;OID=.;OPOS=48238549;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:280:278:137:144:134:134:83:51:54:83:83:51:57:87 chr11 48239182 . C A 122.59 PASS AO=29;DP=62;FAO=29;FDP=62;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=6;FSRR=27;FWDB=-0.00408985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.879;QD=7.90877;RBI=0.0310383;REFB=-0.0104165;REVB=-0.0307676;RO=33;SAF=12;SAR=17;SRF=6;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.239608;STB=0.633012;TYPE=snp;VARB=0.00876583;OID=.;OPOS=48239182;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:33:33:29:29:17:12:6:27:17:12:6:27 chr11 48267589 . A G 243.17 PASS AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.136182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.35;QD=37.4105;RBI=0.150078;REFB=0;REVB=0.0630705;RO=0;SAF=10;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.71087e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00326937;OID=.;OPOS=48267589;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:26:26:0:0:26:26:16:10:0:0:16:10:0:0 chr11 48285842 . A G 1738.21 PASS AO=157;DP=157;FAO=182;FDP=182;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0231663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.444;QD=38.2024;RBI=0.0655297;REFB=0;REVB=0.0612982;RO=0;SAF=87;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.05864e-05;OID=.;OPOS=48285842;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:82:157:182:0:0:157:182:70:87:0:0:91:91:0:0 chr11 48285856 . C T 109.64 PASS AO=44;DP=153;FAO=44;FDP=146;FR=.;FRO=102;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=42;FSRR=60;FWDB=0.0284076;FXX=0.109749;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.906;QD=3.00392;RBI=0.0287503;REFB=-0.00493499;REVB=-0.00442585;RO=79;SAF=24;SAR=20;SRF=35;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114496;STB=0.592551;TYPE=snp;VARB=0.0167076;OID=.;OPOS=48285856;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:146:79:102:44:44:20:24:35:44:20:24:42:60 chr11 48286231 . T A 102.4 PASS AO=27;DP=55;FAO=25;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=19;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=0.0660831;FXX=0.036357;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.626;QD=7.72837;RBI=0.0662232;REFB=-0.0153887;REVB=0.00430572;RO=28;SAF=20;SAR=7;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.3625;STB=0.723623;TYPE=snp;VARB=0.0306558;OID=.;OPOS=48286231;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:53:28:28:27:25:7:20:10:18:6:19:10:18 chr11 48286256 . C T 149.02 PASS AO=25;DP=62;FAO=32;FDP=62;FR=.;FRO=30;FSAF=24;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.0110943;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=239.9;QD=9.61446;RBI=0.0110957;REFB=-0.00566528;REVB=0.000174385;RO=21;SAF=17;SAR=8;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.322743;STB=0.654442;TYPE=snp;VARB=0.00490866;OID=.;OPOS=48286256;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:62:21:30:25:32:8:17:6:15:8:24:14:16 chr11 48328644 . C T 176.76 PASS AO=47;DP=108;FAO=47;FDP=108;FR=.;FRO=61;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=24;FSRR=37;FWDB=0.0177565;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.8617;QD=6.54653;RBI=0.0187576;REFB=-0.00183915;REVB=-0.00604597;RO=61;SAF=18;SAR=29;SRF=24;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111123;STB=0.506232;TYPE=snp;VARB=0.00327656;OID=.;OPOS=48328644;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:61:61:47:47:29:18:24:37:29:18:24:37 chr11 48346513 . T C 75.86 PASS AO=45;DP=167;FAO=42;FDP=163;FR=.;FRO=121;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=36;FSRR=85;FWDB=-0.00898256;FXX=0.00609719;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.7361;QD=1.86166;RBI=0.00928563;REFB=-0.00172513;REVB=-0.00235297;RO=115;SAF=27;SAR=18;SRF=32;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.379133;STB=0.710811;TYPE=snp;VARB=0.00427765;OID=.;OPOS=48346513;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:167:163:115:121:45:42:18:27:32:83:17:25:36:85 chr11 48346523 . C T 76.86 PASS AO=46;DP=169;FAO=43;FDP=166;FR=.;FRO=123;FSAF=31;FSAR=12;FSRF=34;FSRR=89;FWDB=0.0290563;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.8329;QD=1.85209;RBI=0.0290682;REFB=-0.00278579;REVB=0.000830127;RO=118;SAF=33;SAR=13;SRF=29;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.53223;STB=0.800441;TYPE=snp;VARB=0.00864455;OID=.;OPOS=48346523;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:169:166:118:123:46:43:13:33:29:89:12:31:34:89 chr11 48346535 . G C 83.04 PASS AO=49;DP=175;FAO=46;FDP=175;FR=.;FRO=129;FSAF=35;FSAR=11;FSRF=32;FSRR=97;FWDB=-0.0896192;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.4062;QD=1.89798;RBI=0.0896622;REFB=-0.0191529;REVB=-0.00277823;RO=126;SAF=37;SAR=12;SRF=30;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.577689;STB=0.836715;TYPE=snp;VARB=0.0555347;OID=.;OPOS=48346535;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:175:175:126:129:49:46:12:37:30:96:11:35:32:97 chr11 48346541 . A T 103.61 PASS AO=55;DP=184;FAO=51;FDP=183;FR=.;FRO=132;FSAF=38;FSAR=13;FSRF=30;FSRR=102;FWDB=0.00367684;FXX=0.0161282;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.2373;QD=2.26463;RBI=0.0709626;REFB=-0.0163752;REVB=-0.0708673;RO=123;SAF=41;SAR=14;SRF=29;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.559308;STB=0.831639;TYPE=snp;VARB=0.0224705;OID=.;OPOS=48346541;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:183:123:132:55:51:14:41:29:94:13:38:30:102 chr11 48346547 . C T 127.01 PASS AO=63;DP=205;FAO=60;FDP=206;FR=.;FRO=146;FSAF=44;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=115;FWDB=0.00569784;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.423;QD=2.46619;RBI=0.0384475;REFB=-0.00655091;REVB=-0.038023;RO=142;SAF=46;SAR=17;SRF=31;SRR=111;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.560344;STB=0.827595;TYPE=snp;VARB=0.00581974;OID=.;OPOS=48346547;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:206:142:146:63:60:17:46:31:111:16:44:31:115 chr11 48346551 . C A 142.33 PASS AO=67;DP=217;FAO=64;FDP=212;FR=.;FRO=148;FSAF=45;FSAR=19;FSRF=28;FSRR=120;FWDB=0.00514189;FXX=0.00934536;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.544;QD=2.68542;RBI=0.0102001;REFB=-0.0237754;REVB=-0.00880921;RO=147;SAF=47;SAR=20;SRF=28;SRR=119;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.555484;STB=0.818423;TYPE=snp;VARB=0.0270888;OID=.;OPOS=48346551;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:217:212:147:148:67:64:20:47:28:119:19:45:28:120 chr11 48346579 . C A 159.15 PASS AO=80;DP=311;FAO=88;FDP=320;FR=.;FRO=232;FSAF=59;FSAR=29;FSRF=56;FSRR=176;FWDB=0.043245;FXX=0.00311517;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.187;QD=1.98941;RBI=0.0454593;REFB=-0.0127154;REVB=0.014015;RO=228;SAF=53;SAR=27;SRF=55;SRR=173;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.492726;STB=0.783808;TYPE=snp;VARB=0.0285406;OID=.;OPOS=48346579;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:311:320:228:232:80:88:27:53:55:173:29:59:56:176 chr11 48346588 . A C 176.59 PASS AO=96;DP=346;FAO=94;FDP=339;FR=.;FRO=245;FSAF=59;FSAR=35;FSRF=67;FSRR=178;FWDB=-0.00471385;FXX=0.0116615;HRUN=4;LEN=1;MLLD=165.958;QD=2.08363;RBI=0.0146952;REFB=-0.00775557;REVB=-0.0139187;RO=245;SAF=61;SAR=35;SRF=67;SRR=178;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.423891;STB=0.740192;TYPE=snp;VARB=0.0121601;OID=.;OPOS=48346588;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:346:339:245:245:96:94:35:61:67:178:35:59:67:178 chr11 48346604 . T G 244.19 PASS AO=120;DP=396;FAO=117;FDP=393;FR=.;FRO=276;FSAF=72;FSAR=45;FSRF=76;FSRR=200;FWDB=0.002115;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=211.161;QD=2.48537;RBI=0.01394;REFB=-0.00419175;REVB=-0.0137786;RO=276;SAF=74;SAR=46;SRF=76;SRR=200;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.395081;STB=0.725892;TYPE=snp;VARB=0.0115677;OID=.;OPOS=48346604;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:396:393:276:276:120:117:46:74:76:200:45:72:76:200 chr11 48346615 . G A 231.29 PASS AO=127;DP=441;FAO=117;FDP=398;FR=.;FRO=281;FSAF=68;FSAR=49;FSRF=80;FSRR=201;FWDB=-0.00472626;FXX=0.00499988;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.9374;QD=2.32449;RBI=0.0391787;REFB=-0.00588873;REVB=0.0388926;RO=299;SAF=78;SAR=49;SRF=89;SRR=210;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.369995;STB=0.700942;TYPE=snp;VARB=0.0168974;OID=.;OPOS=48346615;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:441:398:299:281:127:117:49:78:89:210:49:68:80:201 chr11 48346660 . TTTGCTGATC T 76.54 PASS AO=103;DP=476;FAO=104;FDP=392;FR=.;FRO=288;FSAF=58;FSAR=46;FSRF=94;FSRR=194;FWDB=0.0159146;FXX=0.0199995;HRUN=5;LEN=9;MLLD=329.258;QD=0.78099;RBI=0.0174958;REFB=-0.00249731;REVB=-0.0072682;RO=295;SAF=60;SAR=43;SRF=108;SRR=187;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.266273;STB=0.665617;TYPE=del;VARB=0.00919309;OID=.;OPOS=48346661;OREF=TTGCTGATC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:103:429:104:392:288:58:46:94:194:76:295:60:43:108:187 chr11 48346681 . G A 183.55 PASS AO=125;DP=494;FAO=106;FDP=397;FR=.;FRO=291;FSAF=57;FSAR=49;FSRF=109;FSRR=182;FWDB=0.00208538;FXX=0.00749981;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.686;QD=1.84936;RBI=0.0120205;REFB=-0.00208194;REVB=0.0118382;RO=366;SAF=68;SAR=57;SRF=137;SRR=229;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211759;STB=0.618119;TYPE=snp;VARB=0.0034609;OID=.;OPOS=48346681;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:494:397:366:291:125:106:57:68:137:229:49:57:109:182 chr11 48346729 . G C 74.5 PASS AO=76;DP=383;FAO=77;FDP=384;FR=.;FRO=307;FSAF=8;FSAR=69;FSRF=123;FSRR=184;FWDB=-0.00625708;FXX=0.00259734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.511;QD=0.776082;RBI=0.00987272;REFB=0.0011612;REVB=-0.00763673;RO=307;SAF=8;SAR=68;SRF=123;SRR=184;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.489945;STB=0.816949;TYPE=snp;VARB=-0.00526475;OID=.;OPOS=48346729;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:383:384:307:307:76:77:68:8:123:184:69:8:123:184 chr11 48346791 . C T 142.72 PASS AO=79;DP=307;FAO=81;FDP=306;FR=.;FRO=225;FSAF=15;FSAR=66;FSRF=88;FSRR=137;FWDB=-0.00164296;FXX=0.0160767;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.404;QD=1.86557;RBI=0.0030869;REFB=-0.00799125;REVB=-0.00261336;RO=218;SAF=15;SAR=64;SRF=83;SRR=135;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.295122;STB=0.69059;TYPE=snp;VARB=0.0239627;OID=.;OPOS=48346791;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:307:306:218:225:79:81:64:15:83:135:66:15:88:137 chr11 48346822 . A C 136.37 PASS AO=74;DP=269;FAO=73;FDP=266;FR=.;FRO=193;FSAF=20;FSAR=53;FSRF=73;FSRR=120;FWDB=0.00685955;FXX=0.011152;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.26;QD=2.05064;RBI=0.0192951;REFB=-0.00776766;REVB=-0.0180346;RO=189;SAF=20;SAR=54;SRF=70;SRR=119;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142383;STB=0.58753;TYPE=snp;VARB=0.012904;OID=.;OPOS=48346822;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:269:266:189:193:74:73:54:20:70:119:53:20:73:120 chr11 48346843 . C T 213.25 PASS AO=86;DP=264;FAO=86;FDP=262;FR=.;FRO=176;FSAF=25;FSAR=61;FSRF=57;FSRR=119;FWDB=0.00347312;FXX=0.00757547;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.999;QD=3.25576;RBI=0.00364507;REFB=-0.00102153;REVB=-0.00110633;RO=177;SAF=25;SAR=61;SRF=57;SRR=120;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0434866;STB=0.526409;TYPE=snp;VARB=0.00201281;OID=.;OPOS=48346843;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:264:262:177:176:86:86:61:25:57:120:61:25:57:119 chr11 48346916 . G C 327.58 PASS AO=127;DP=361;FAO=124;FDP=358;FR=.;FRO=234;FSAF=39;FSAR=85;FSRF=105;FSRR=129;FWDB=-0.0161925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4214;QD=3.66013;RBI=0.0258263;REFB=-0.00389215;REVB=0.0201197;RO=232;SAF=40;SAR=87;SRF=103;SRR=129;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158174;STB=0.594563;TYPE=snp;VARB=0.00940792;OID=.;OPOS=48346916;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:361:358:232:234:127:124:87:40:103:129:85:39:105:129 chr11 48346924 . T C 346.82 PASS AO=133;DP=381;FAO=130;FDP=373;FR=.;FRO=243;FSAF=47;FSAR=83;FSRF=102;FSRR=141;FWDB=0.0011203;FXX=0.0209968;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0981;QD=3.7192;RBI=0.0262406;REFB=-0.00974546;REVB=0.0262166;RO=240;SAF=48;SAR=85;SRF=99;SRR=141;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0621283;STB=0.540155;TYPE=snp;VARB=0.0168305;OID=.;OPOS=48346924;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:381:373:240:243:133:130:85:48:99:141:83:47:102:141 chr11 48346932 . G A 327.1 PASS AO=129;DP=367;FAO=125;FDP=363;FR=.;FRO=238;FSAF=48;FSAR=77;FSRF=108;FSRR=130;FWDB=0.0110887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.312;QD=3.60436;RBI=0.0149618;REFB=-0.0141615;REVB=-0.0100446;RO=237;SAF=49;SAR=80;SRF=108;SRR=129;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0894281;STB=0.547286;TYPE=snp;VARB=0.0196682;OID=.;OPOS=48346932;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:367:363:237:238:129:125:80:49:108:129:77:48:108:130 chr11 48346961 . A T 297.17 PASS AO=119;DP=338;FAO=115;FDP=338;FR=.;FRO=223;FSAF=49;FSAR=66;FSRF=103;FSRR=120;FWDB=-0.0159739;FXX=0.00294977;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.132;QD=3.51674;RBI=0.0392086;REFB=0.0016229;REVB=-0.0358071;RO=217;SAF=50;SAR=69;SRF=99;SRR=118;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0417483;STB=0.523969;TYPE=snp;VARB=-0.00961797;OID=.;OPOS=48346961;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:338:338:217:223:119:115:69:50:99:118:66:49:103:120 chr11 48346962 . A G 285.27 PASS AO=117;DP=338;FAO=113;FDP=337;FR=.;FRO=224;FSAF=49;FSAR=64;FSRF=103;FSRR=121;FWDB=-0.00688371;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.774;QD=3.38594;RBI=0.0152049;REFB=-7.86933e-05;REVB=-0.0135574;RO=217;SAF=50;SAR=67;SRF=101;SRR=116;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0441248;STB=0.517636;TYPE=snp;VARB=0.000146689;OID=.;OPOS=48346962;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:338:337:217:224:117:113:67:50:101:116:64:49:103:121 chr11 48346999 . T G 252.3 PASS AO=106;DP=312;FAO=102;FDP=310;FR=.;FRO=208;FSAF=37;FSAR=65;FSRF=101;FSRR=107;FWDB=0.0149791;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3641;QD=3.2555;RBI=0.01522;REFB=-0.000544558;REVB=-0.00269701;RO=204;SAF=38;SAR=68;SRF=99;SRR=105;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150906;STB=0.584958;TYPE=snp;VARB=0.000240617;OID=.;OPOS=48346999;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:312:310:204:208:106:102:68:38:99:105:65:37:101:107 chr11 48347014 . G A 259.64 PASS AO=104;DP=304;FAO=101;FDP=299;FR=.;FRO=198;FSAF=36;FSAR=65;FSRF=94;FSRR=104;FWDB=-0.00809999;FXX=0.00333322;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.59;QD=3.47338;RBI=0.0135468;REFB=-0.00253722;REVB=0.0108585;RO=189;SAF=36;SAR=68;SRF=95;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183223;STB=0.581379;TYPE=snp;VARB=0.0257091;OID=.;OPOS=48347014;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:304:299:189:198:104:101:68:36:95:94:65:36:94:104 chr11 48347023 . C T 289.96 PASS AO=102;DP=288;FAO=104;FDP=287;FR=.;FRO=183;FSAF=35;FSAR=69;FSRF=91;FSRR=92;FWDB=0.0151435;FXX=0.00692018;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.199;QD=4.04124;RBI=0.0152828;REFB=-0.00836993;REVB=-0.00205889;RO=182;SAF=36;SAR=66;SRF=91;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171032;STB=0.606721;TYPE=snp;VARB=0.0124263;OID=.;OPOS=48347023;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:288:287:182:183:102:104:66:36:91:91:69:35:91:92 chr11 48347067 . C T 348.46 PASS AO=115;DP=288;FAO=111;FDP=284;FR=.;FRO=173;FSAF=47;FSAR=64;FSRF=84;FSRR=89;FWDB=-0.0177957;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=199.856;QD=4.90783;RBI=0.0181504;REFB=-0.00484634;REVB=0.00357099;RO=172;SAF=47;SAR=68;SRF=84;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0865232;STB=0.538292;TYPE=snp;VARB=0.00544055;OID=.;OPOS=48347067;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:288:284:172:173:115:111:68:47:84:88:64:47:84:89 chr11 48347100 . C T 300.02 PASS AO=106;DP=273;FAO=102;FDP=274;FR=.;FRO=172;FSAF=42;FSAR=60;FSRF=66;FSRR=106;FWDB=-0.0344;FXX=0.00363623;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.905;QD=4.37988;RBI=0.0353324;REFB=-0.021609;REVB=0.00806351;RO=166;SAF=42;SAR=64;SRF=62;SRR=104;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0259642;STB=0.518284;TYPE=snp;VARB=0.0346776;OID=.;OPOS=48347100;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:273:274:166:172:106:102:64:42:62:104:60:42:66:106 chr11 48347124 . A G 249.28 PASS AO=89;DP=245;FAO=88;FDP=245;FR=.;FRO=157;FSAF=37;FSAR=51;FSRF=61;FSRR=96;FWDB=-0.0586216;FXX=0.00406488;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.4253;QD=4.06986;RBI=0.102;REFB=0.0142887;REVB=-0.0834714;RO=156;SAF=37;SAR=52;SRF=61;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0287243;STB=0.521122;TYPE=snp;VARB=-0.0277359;OID=.;OPOS=48347124;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:245:245:156:157:89:88:52:37:61:95:51:37:61:96 chr11 48347130 . C G 265.99 PASS AO=93;DP=251;FAO=92;FDP=252;FR=.;FRO=160;FSAF=38;FSAR=54;FSRF=62;FSRR=98;FWDB=0.043294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.1214;QD=4.22213;RBI=0.0495379;REFB=-0.00352687;REVB=-0.0240754;RO=158;SAF=38;SAR=55;SRF=62;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0187263;STB=0.516818;TYPE=snp;VARB=0.00615695;OID=.;OPOS=48347130;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:251:252:158:160:93:92:55:38:62:96:54:38:62:98 chr11 48347140 . T C 1220.89 PASS AO=189;DP=256;FAO=188;FDP=255;FR=.;FRO=67;FSAF=73;FSAR=115;FSRF=34;FSRR=33;FWDB=0.0273342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.975;QD=19.1512;RBI=0.0302078;REFB=-0.0124074;REVB=0.0128589;RO=65;SAF=73;SAR=116;SRF=33;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0605826;STB=0.532473;TYPE=snp;VARB=0.00366014;OID=.;OPOS=48347140;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:256:255:65:67:189:188:116:73:33:32:115:73:34:33 chr11 48347142 . C T 254.51 PASS AO=93;DP=262;FAO=92;FDP=260;FR=.;FRO=168;FSAF=40;FSAR=52;FSRF=71;FSRR=97;FWDB=0.0115637;FXX=0.00383127;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.668;QD=3.91558;RBI=0.0208511;REFB=0.000734476;REVB=-0.0173507;RO=166;SAF=40;SAR=53;SRF=69;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0166829;STB=0.508011;TYPE=snp;VARB=-0.00131287;OID=.;OPOS=48347142;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:262:260:166:168:93:92:53:40:69:97:52:40:71:97 chr11 48347144 . T C 269.07 PASS AO=94;DP=255;FAO=93;FDP=254;FR=.;FRO=161;FSAF=40;FSAR=53;FSRF=71;FSRR=90;FWDB=-0.0170388;FXX=0.00392141;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.417;QD=4.23726;RBI=0.0173191;REFB=-0.013803;REVB=-0.0031032;RO=161;SAF=40;SAR=54;SRF=71;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0175808;STB=0.507023;TYPE=snp;VARB=0.0160283;OID=.;OPOS=48347144;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:255:254:161:161:94:93:54:40:71:90:53:40:71:90 chr11 48347267 . T C 178.25 PASS AO=83;DP=272;FAO=82;FDP=271;FR=.;FRO=189;FSAF=43;FSAR=39;FSRF=86;FSRR=103;FWDB=-0.00415092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.001;QD=2.63093;RBI=0.00734173;REFB=-0.004911;REVB=0.00605565;RO=188;SAF=43;SAR=40;SRF=85;SRR=103;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0788874;STB=0.548251;TYPE=snp;VARB=0.0149256;OID=.;OPOS=48347267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:272:271:188:189:83:82:40:43:85:103:39:43:86:103 chr11 48347306 . G T 94.84 PASS AO=63;DP=273;FAO=67;FDP=276;FR=.;FRO=209;FSAF=30;FSAR=37;FSRF=80;FSRR=129;FWDB=-0.00215034;FXX=0.00719399;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.96;QD=1.37453;RBI=0.0125486;REFB=0.0012821;REVB=0.012363;RO=209;SAF=26;SAR=37;SRF=79;SRR=130;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0460363;STB=0.550261;TYPE=snp;VARB=-0.00478925;OID=.;OPOS=48347306;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:273:276:209:209:63:67:37:26:79:130:37:30:80:129 chr11 48347342 . G A 70.64 PASS AO=57;DP=260;FAO=57;FDP=260;FR=.;FRO=203;FSAF=22;FSAR=35;FSRF=75;FSRR=128;FWDB=-0.0158573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.759;QD=1.08671;RBI=0.0208751;REFB=-0.00706477;REVB=-0.0135763;RO=203;SAF=22;SAR=35;SRF=75;SRR=128;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0224226;STB=0.513675;TYPE=snp;VARB=0.0374184;OID=.;OPOS=48347342;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:260:260:203:203:57:57:35:22:75:128:35:22:75:128 chr11 48347346 . A T 77.83 PASS AO=57;DP=260;FAO=59;FDP=261;FR=.;FRO=202;FSAF=24;FSAR=35;FSRF=74;FSRR=128;FWDB=-0.00253247;FXX=0.00381665;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.005;QD=1.19279;RBI=0.0273803;REFB=-0.0101506;REVB=-0.027263;RO=200;SAF=24;SAR=33;SRF=74;SRR=126;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0679426;STB=0.532814;TYPE=snp;VARB=0.0354174;OID=.;OPOS=48347346;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:260:261:200:202:57:59:33:24:74:126:35:24:74:128 chr11 48347358 . C T 83.16 PASS AO=57;DP=251;FAO=59;FDP=253;FR=.;FRO=194;FSAF=22;FSAR=37;FSRF=65;FSRR=129;FWDB=0.0146115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.3077;QD=1.31475;RBI=0.0275912;REFB=-0.00282152;REVB=0.0234047;RO=186;SAF=20;SAR=37;SRF=60;SRR=126;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0400347;STB=0.531499;TYPE=snp;VARB=0.00151969;OID=.;OPOS=48347358;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:251:253:186:194:57:59:37:20:60:126:37:22:65:129 chr11 48347363 . C T 84.32 PASS AO=60;DP=256;FAO=60;FDP=257;FR=.;FRO=197;FSAF=22;FSAR=38;FSRF=65;FSRR=132;FWDB=-0.0286523;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.148;QD=1.31235;RBI=0.0311164;REFB=-0.00389156;REVB=-0.0121357;RO=196;SAF=22;SAR=38;SRF=65;SRR=131;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.048729;STB=0.530788;TYPE=snp;VARB=0.0200445;OID=.;OPOS=48347363;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:256:257:196:197:60:60:38:22:65:131:38:22:65:132 chr11 48347392 . T C 89.19 PASS AO=54;DP=218;FAO=54;FDP=216;FR=.;FRO=162;FSAF=22;FSAR=32;FSRF=53;FSRR=109;FWDB=-0.00526894;FXX=0.013698;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.85;QD=1.65172;RBI=0.0121734;REFB=-0.0036109;REVB=0.010974;RO=161;SAF=22;SAR=32;SRF=52;SRR=109;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112956;STB=0.563772;TYPE=snp;VARB=0.00666963;OID=.;OPOS=48347392;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:218:216:161:162:54:54:32:22:52:109:32:22:53:109 chr11 48347419 . A G 79.96 PASS AO=46;DP=181;FAO=46;FDP=180;FR=.;FRO=134;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=45;FSRR=89;FWDB=-0.000352635;FXX=0.00552456;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.3502;QD=1.77678;RBI=0.00193716;REFB=-0.00456164;REVB=0.00190479;RO=134;SAF=19;SAR=27;SRF=45;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101831;STB=0.560504;TYPE=snp;VARB=0.0104136;OID=.;OPOS=48347419;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:181:180:134:134:46:46:27:19:45:89:27:19:45:89 chr11 48347492 . G A 93.53 PASS AO=36;DP=112;FAO=36;FDP=112;FR=.;FRO=76;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=53;FWDB=-0.0225843;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0907;QD=3.34021;RBI=0.0238119;REFB=0.012462;REVB=0.00754681;RO=76;SAF=16;SAR=20;SRF=23;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172585;STB=0.599537;TYPE=snp;VARB=-0.0268701;OID=.;OPOS=48347492;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:112:112:76:76:36:36:20:16:23:53:20:16:23:53 chr11 48347498 . A T 85.92 PASS AO=34;DP=108;FAO=34;FDP=108;FR=.;FRO=74;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=51;FWDB=-0.0245398;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=282.736;QD=3.18231;RBI=0.0301587;REFB=-0.00541233;REVB=-0.0175313;RO=74;SAF=16;SAR=18;SRF=23;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19224;STB=0.611234;TYPE=snp;VARB=0.011355;OID=.;OPOS=48347498;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:108:108:74:74:34:34:18:16:23:51:18:16:23:51 chr11 48366958 . T G 241 PASS AO=65;DP=149;FAO=65;FDP=149;FR=.;FRO=84;FSAF=15;FSAR=50;FSRF=40;FSRR=44;FWDB=-0.00161668;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.873;QD=6.46967;RBI=0.00883148;REFB=-0.0119321;REVB=0.00868225;RO=81;SAF=15;SAR=50;SRF=37;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263915;STB=0.661004;TYPE=snp;VARB=0.00408898;OID=.;OPOS=48366958;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:81:84:65:65:50:15:37:44:50:15:40:44 chr11 48366971 . G C 278.77 PASS AO=70;DP=149;FAO=70;FDP=151;FR=.;FRO=81;FSAF=16;FSAR=54;FSRF=36;FSRR=45;FWDB=0.00895066;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=100.372;QD=7.38462;RBI=0.00910286;REFB=-0.0118736;REVB=-0.00165764;RO=79;SAF=16;SAR=54;SRF=35;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.245491;STB=0.639301;TYPE=snp;VARB=0.0576151;OID=.;OPOS=48366971;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:151:79:81:70:70:54:16:35:44:54:16:36:45 chr11 48366972 . G A 287.29 PASS AO=71;DP=151;FAO=71;FDP=151;FR=.;FRO=80;FSAF=17;FSAR=54;FSRF=35;FSRR=45;FWDB=0.000649152;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.176;QD=7.61029;RBI=0.0108006;REFB=-0.0108209;REVB=-0.0107811;RO=80;SAF=17;SAR=54;SRF=35;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224341;STB=0.625212;TYPE=snp;VARB=0.0160363;OID=.;OPOS=48366972;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:151:80:80:71:71:54:17:35:45:54:17:35:45 chr11 48367050 . T TAG 119.34 PASS AO=44;DP=141;FAO=46;FDP=138;FR=.;FRO=92;FSAF=5;FSAR=41;FSRF=35;FSRR=57;FWDB=0.00261087;FXX=0.0142847;HRUN=1;LEN=2;MLLD=175.572;QD=3.45921;RBI=0.00317834;REFB=-0.0112363;REVB=-0.00181251;RO=93;SAF=5;SAR=39;SRF=36;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.45054;STB=0.769809;TYPE=ins;VARB=0.0199939;OID=.;OPOS=48367051;OREF=-;OALT=AG;OMAPALT=TAG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:44:141:46:138:92:5:41:35:57:99:93:5:39:36:57 chr11 48367073 . A C 1016.52 PASS AO=108;DP=111;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00358361;FXX=0.0272702;HRUN=5;LEN=1;MLLD=235.847;QD=38.0006;RBI=0.0115725;REFB=-0.10052;REVB=0.0110037;RO=0;SAF=33;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.15678e-05;OID=.;OPOS=48367073;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:111:107:0:0:108:107:75:33:0:0:75:32:0:0 chr11 48367097 . A G 73.58 PASS AO=33;DP=106;FAO=31;FDP=104;FR=.;FRO=73;FSAF=7;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=50;FWDB=-0.0189454;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.222;QD=2.8301;RBI=0.0189464;REFB=-0.0127569;REVB=-0.000190269;RO=73;SAF=8;SAR=25;SRF=23;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107891;STB=0.581527;TYPE=snp;VARB=0.0582242;OID=.;OPOS=48367097;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:106:104:73:73:33:31:25:8:23:50:24:7:23:50 chr11 48367133 . C A 53.54 PASS AO=33;DP=130;FAO=31;FDP=126;FR=.;FRO=95;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=36;FSRR=59;FWDB=-0.00891733;FXX=0.0156238;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.6669;QD=1.69956;RBI=0.0486992;REFB=-0.00761177;REVB=-0.0478758;RO=94;SAF=12;SAR=21;SRF=36;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0255386;STB=0.519611;TYPE=snp;VARB=0.0118219;OID=.;OPOS=48367133;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:130:126:94:95:33:31:21:12:36:58:20:11:36:59 chr11 48367136 . C T 67.78 PASS AO=36;DP=128;FAO=34;FDP=126;FR=.;FRO=92;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=32;FSRR=60;FWDB=0.0208956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.276;QD=2.1516;RBI=0.0382798;REFB=-0.0188759;REVB=-0.0320736;RO=92;SAF=13;SAR=23;SRF=32;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0175923;STB=0.504096;TYPE=snp;VARB=0.0412844;OID=.;OPOS=48367136;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:128:126:92:92:36:34:23:13:32:60:22:12:32:60 chr11 48367155 . T A 65.49 PASS AO=34;DP=115;FAO=33;FDP=122;FR=.;FRO=89;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=64;FWDB=-0.0339079;FXX=0.0161277;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.6561;QD=2.14711;RBI=0.0416593;REFB=-0.0543668;REVB=-0.0242023;RO=73;SAF=15;SAR=19;SRF=14;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.315656;STB=0.630697;TYPE=snp;VARB=0.114061;OID=.;OPOS=48367155;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:115:122:73:89:34:33:19:15:14:59:18:15:25:64 chr11 48367159 . C T 78.5 PASS AO=38;DP=130;FAO=37;FDP=130;FR=.;FRO=93;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=30;FSRR=63;FWDB=-0.0188389;FXX=0.00763301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.179;QD=2.41552;RBI=0.0207179;REFB=-0.0066375;REVB=0.00862133;RO=91;SAF=14;SAR=24;SRF=30;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0508876;STB=0.522873;TYPE=snp;VARB=0.0123164;OID=.;OPOS=48367159;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:130:130:91:93:38:37:24:14:30:61:24:13:30:63 chr11 48367163 . A G 82.14 PASS AO=41;DP=126;FAO=39;FDP=136;FR=.;FRO=97;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=30;FSRR=67;FWDB=-0.0377947;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=37.1871;QD=2.416;RBI=0.0772991;REFB=-0.0326156;REVB=-0.0674293;RO=85;SAF=14;SAR=27;SRF=30;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0147565;STB=0.519543;TYPE=snp;VARB=0.0648462;OID=.;OPOS=48367163;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:126:136:85:97:41:39:27:14:30:55:26:13:30:67 chr11 48367170 . G A 119.59 PASS AO=46;DP=135;FAO=45;FDP=130;FR=.,HEALED;FRO=85;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=27;FSRR=58;FWDB=0.0300785;FXX=0.00763301;HRUN=2;LEN=1;MLLD=37.5882;QD=3.67981;RBI=0.192762;REFB=-0.0558225;REVB=-0.190401;RO=51;SAF=18;SAR=28;SRF=27;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13236;STB=0.542669;TYPE=snp;VARB=0.0848128;OID=.;OPOS=48367170;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:51:85:46:45:28:18:27:24:28:17:27:58 chr11 48367190 . A T 86.58 PASS AO=42;DP=146;FAO=40;FDP=139;FR=.;FRO=99;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=30;FSRR=69;FWDB=0.0200754;FXX=0.0347198;HRUN=2;LEN=1;MLLD=261.676;QD=2.49152;RBI=0.0240972;REFB=-0.00819226;REVB=-0.0133287;RO=98;SAF=23;SAR=19;SRF=29;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.297587;STB=0.671501;TYPE=snp;VARB=0.0174208;OID=.;OPOS=48367190;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:146:139:98:99:42:40:19:23:29:69:18:22:30:69 chr11 48367195 . C T 118.97 PASS AO=48;DP=143;FAO=46;FDP=141;FR=.;FRO=95;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=28;FSRR=67;FWDB=0.00289876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.31;QD=3.37513;RBI=0.00486548;REFB=-0.00453309;REVB=-0.0039077;RO=93;SAF=25;SAR=23;SRF=27;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.264165;STB=0.651159;TYPE=snp;VARB=0.0140225;OID=.;OPOS=48367195;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:141:93:95:48:46:23:25:27:66:22:24:28:67 chr11 48367249 . C T 98.76 PASS AO=50;DP=174;FAO=47;FDP=165;FR=.;FRO=118;FSAF=15;FSAR=32;FSRF=44;FSRR=74;FWDB=0.0119066;FXX=0.0350857;HRUN=4;LEN=1;MLLD=193.433;QD=2.39413;RBI=0.0181706;REFB=-0.0127474;REVB=-0.013726;RO=115;SAF=17;SAR=33;SRF=44;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0554225;STB=0.542822;TYPE=snp;VARB=0.0202739;OID=.;OPOS=48367249;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:174:165:115:118:50:47:33:17:44:71:32:15:44:74 chr11 48367252 . G A 118.04 PASS AO=52;DP=169;FAO=51;FDP=166;FR=.;FRO=115;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=44;FSRR=71;FWDB=-0.0318749;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.3743;QD=2.84435;RBI=0.0440024;REFB=-0.0278377;REVB=0.0303348;RO=116;SAF=18;SAR=34;SRF=45;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0536428;STB=0.522196;TYPE=snp;VARB=0.0581009;OID=.;OPOS=48367252;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:166:116:115:52:51:34:18:45:71:33:18:44:71 chr11 48367311 . T C 160.29 PASS AO=51;DP=245;FAO=71;FDP=241;FR=.,HEALED;FRO=167;FSAF=17;FSAR=54;FSRF=78;FSRR=89;FWDB=0.0406804;FXX=0.0163259;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.0401;QD=2.66041;RBI=0.0440346;REFB=-0.0137615;REVB=-0.0168566;RO=112;SAF=17;SAR=34;SRF=74;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.375551;STB=0.678428;TYPE=snp;VARB=0.0394074;OID=.;OPOS=48367311;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:241:112:167:51:71:34:17:74:38:54:17:78:89 chr11 48367363 . C T 250.47 PASS AO=84;DP=221;FAO=88;FDP=242;FR=.;FRO=154;FSAF=24;FSAR=64;FSRF=60;FSRR=94;FWDB=0.0497341;FXX=0.00411506;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.0615;QD=4.14003;RBI=0.0739185;REFB=-0.0353377;REVB=-0.0546851;RO=137;SAF=20;SAR=64;SRF=54;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20536;STB=0.586367;TYPE=snp;VARB=0.0488343;OID=.;OPOS=48367363;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:242:137:154:84:88:64:20:54:83:64:24:60:94 chr11 48367387 . C T 205.46 PASS AO=80;DP=232;FAO=80;FDP=236;FR=.;FRO=156;FSAF=23;FSAR=57;FSRF=60;FSRR=96;FWDB=0.0044479;FXX=0.00421923;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.801;QD=3.48233;RBI=0.0433736;REFB=-0.00982957;REVB=0.0431449;RO=151;SAF=23;SAR=57;SRF=56;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109744;STB=0.573435;TYPE=snp;VARB=0.016585;OID=.;OPOS=48367387;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:236:151:156:80:80:57:23:56:95:57:23:60:96 chr11 48367419 . G A 157.65 PASS AO=67;DP=212;FAO=67;FDP=212;FR=.;FRO=145;FSAF=19;FSAR=48;FSRF=53;FSRR=92;FWDB=0.00296401;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.577;QD=2.97454;RBI=0.00432266;REFB=-0.000621409;REVB=-0.00314644;RO=139;SAF=19;SAR=48;SRF=49;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0942215;STB=0.565055;TYPE=snp;VARB=0.00108856;OID=.;OPOS=48367419;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:212:139:145:67:67:48:19:49:90:48:19:53:92 chr11 48367424 . C G 134.88 PASS AO=61;DP=198;FAO=60;FDP=198;FR=.;FRO=138;FSAF=17;FSAR=43;FSRF=53;FSRR=85;FWDB=0.0133121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.582;QD=2.72487;RBI=0.0164717;REFB=-0.00310502;REVB=-0.00970077;RO=137;SAF=18;SAR=43;SRF=53;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123048;STB=0.580381;TYPE=snp;VARB=0.0069343;OID=.;OPOS=48367424;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:198:137:138:61:60:43:18:53:84:43:17:53:85 chr11 48367455 . G A 181.62 PASS AO=62;DP=171;FAO=62;FDP=171;FR=.;FRO=109;FSAF=25;FSAR=37;FSRF=41;FSRR=68;FWDB=0.0153144;FXX=0.00581362;HRUN=2;LEN=1;MLLD=266.975;QD=4.24834;RBI=0.0174186;REFB=9.5585e-05;REVB=0.0082993;RO=108;SAF=25;SAR=37;SRF=41;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0275644;STB=0.518052;TYPE=snp;VARB=-7.39882e-05;OID=.;OPOS=48367455;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:171:108:109:62:62:37:25:41:67:37:25:41:68 chr11 48367469 . T C 165.35 PASS AO=57;DP=159;FAO=57;FDP=159;FR=.;FRO=102;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=40;FSRR=62;FWDB=0.00466101;FXX=0.00624961;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.695;QD=4.15972;RBI=0.0181207;REFB=-0.00541019;REVB=-0.0175109;RO=84;SAF=26;SAR=31;SRF=23;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199634;STB=0.541652;TYPE=snp;VARB=0.0124402;OID=.;OPOS=48367469;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:159:84:102:57:57:31:26:23:61:31:26:40:62 chr11 48367470 . G A 165.84 PASS AO=57;DP=142;FAO=57;FDP=159;FR=.;FRO=102;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=40;FSRR=62;FWDB=-0.103176;FXX=0.00624961;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.52;QD=4.17197;RBI=0.104434;REFB=-0.0579696;REVB=-0.0161603;RO=84;SAF=26;SAR=31;SRF=23;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199634;STB=0.541652;TYPE=snp;VARB=0.0758517;OID=.;OPOS=48367470;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:159:84:102:57:57:31:26:23:61:31:26:40:62 chr11 48367474 . A G 173 PASS AO=58;DP=158;FAO=58;FDP=158;FR=.;FRO=100;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=38;FSRR=62;FWDB=0.00463292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.755;QD=4.37963;RBI=0.00700854;REFB=-0.010228;REVB=-0.00525886;RO=100;SAF=27;SAR=31;SRF=38;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0965344;STB=0.554776;TYPE=snp;VARB=0.0144645;OID=.;OPOS=48367474;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:158:100:100:58:58:31:27:38:62:31:27:38:62 chr11 48367499 . A G 131.75 PASS AO=36;DP=92;FAO=38;FDP=94;FR=.;FRO=56;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=37;FWDB=0.0352838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.795;QD=5.6063;RBI=0.0400429;REFB=-0.00738261;REVB=-0.0189336;RO=56;SAF=22;SAR=14;SRF=19;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.284982;STB=0.670231;TYPE=snp;VARB=0.0258347;OID=.;OPOS=48367499;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:94:56:56:36:38:14:22:19:37:14:24:19:37 chr11 48367511 . T G 57.66 PASS AO=21;DP=66;FAO=21;FDP=66;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=3;FSRF=17;FSRR=28;FWDB=-0.0156923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.155;QD=3.49484;RBI=0.017509;REFB=0.000254335;REVB=-0.00776619;RO=45;SAF=18;SAR=3;SRF=17;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.574814;STB=0.84129;TYPE=snp;VARB=-0.00321365;OID=.;OPOS=48367511;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:66:66:45:45:21:21:3:18:17:28:3:18:17:28 chr11 48373748 . C G 27.76 PASS AO=23;DP=117;FAO=23;FDP=117;FR=.;FRO=94;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=69;FSRR=25;FWDB=0.0110518;FXX=0.0168053;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.4368;QD=0.949154;RBI=0.0191279;REFB=-0.00518259;REVB=-0.0156121;RO=90;SAF=6;SAR=17;SRF=68;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.570184;STB=0.834734;TYPE=snp;VARB=0.0190647;OID=.;OPOS=48373748;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:117:117:90:94:23:23:17:6:68:22:17:6:69:25 chr11 48373770 . T A 17.27 PASS AO=22;DP=133;FAO=22;FDP=134;FR=.;FRO=112;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=88;FSRR=24;FWDB=-0.00773431;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=267.597;QD=0.515585;RBI=0.00793943;REFB=-0.00205205;REVB=0.00179306;RO=111;SAF=7;SAR=15;SRF=87;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.551615;STB=0.839002;TYPE=snp;VARB=0.0226942;OID=.;OPOS=48373770;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:133:134:111:112:22:22:15:7:87:24:15:7:88:24 chr11 48373885 . A G 114.75 PASS AO=66;DP=230;FAO=61;FDP=225;FR=.;FRO=164;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=134;FSRR=30;FWDB=-0.00492234;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=263.925;QD=2.04003;RBI=0.00806821;REFB=-0.00544294;REVB=-0.00639269;RO=162;SAF=33;SAR=33;SRF=134;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.410402;STB=0.743593;TYPE=snp;VARB=0.019645;OID=.;OPOS=48373885;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:230:225:162:164:66:61:33:33:134:28:32:29:134:30 chr11 48373900 . A G 143.66 PASS AO=74;DP=243;FAO=69;FDP=237;FR=.;FRO=168;FSAF=29;FSAR=40;FSRF=132;FSRR=36;FWDB=0.0187607;FXX=0.0042015;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.0291;QD=2.42456;RBI=0.0336169;REFB=-0.0103425;REVB=0.027895;RO=163;SAF=33;SAR=41;SRF=132;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.425983;STB=0.744967;TYPE=snp;VARB=0.0191589;OID=.;OPOS=48373900;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:243:237:163:168:74:69:41:33:132:31:40:29:132:36 chr11 48373936 . A G 337.79 PASS AO=107;DP=257;FAO=102;FDP=252;FR=.;FRO=150;FSAF=33;FSAR=69;FSRF=111;FSRR=39;FWDB=-0.0322218;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.4907;QD=5.36166;RBI=0.0506703;REFB=0.00431032;REVB=-0.0391054;RO=148;SAF=37;SAR=70;SRF=110;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.397563;STB=0.735957;TYPE=snp;VARB=-0.00799428;OID=.;OPOS=48373936;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:257:252:148:150:107:102:70:37:110:38:69:33:111:39 chr11 48373946 . C A 74.22 PASS AO=58;DP=260;FAO=57;FDP=254;FR=.;FRO=197;FSAF=39;FSAR=18;FSRF=103;FSRR=94;FWDB=-0.017334;FXX=0.00392141;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.835;QD=1.16879;RBI=0.0269432;REFB=-0.00152458;REVB=-0.0206269;RO=200;SAF=39;SAR=19;SRF=107;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182535;STB=0.630802;TYPE=snp;VARB=0.00422446;OID=.;OPOS=48373946;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:260:254:200:197:58:57:19:39:107:93:18:39:103:94 chr11 48373976 . T G 295.26 PASS AO=101;DP=265;FAO=98;FDP=260;FR=.;FRO=162;FSAF=30;FSAR=68;FSRF=99;FSRR=63;FWDB=0.026132;FXX=0.0076333;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.643;QD=4.5425;RBI=0.0266852;REFB=-0.0189586;REVB=-0.00540563;RO=156;SAF=32;SAR=69;SRF=98;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.335101;STB=0.690561;TYPE=snp;VARB=0.0160787;OID=.;OPOS=48373976;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:265:260:156:162:101:98:69:32:98:58:68:30:99:63 chr11 48373986 . A G 293.5 PASS AO=97;DP=247;FAO=94;FDP=243;FR=.;FRO=149;FSAF=27;FSAR=67;FSRF=85;FSRR=64;FWDB=0.0174617;FXX=0.00816293;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.063;QD=4.83134;RBI=0.0230418;REFB=-0.0329389;REVB=-0.0150337;RO=147;SAF=29;SAR=68;SRF=84;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.300504;STB=0.679609;TYPE=snp;VARB=0.0205538;OID=.;OPOS=48373986;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:247:243:147:149:97:94:68:29:84:63:67:27:85:64 chr11 48387186 . A G 269.11 PASS AO=56;DP=100;FAO=55;FDP=100;FR=.;FRO=45;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=31;FSRR=14;FWDB=0.0486401;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.498;QD=10.7644;RBI=0.0553611;REFB=0.0109342;REVB=0.0264384;RO=44;SAF=31;SAR=25;SRF=30;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105725;STB=0.565839;TYPE=snp;VARB=-0.0103584;OID=.;OPOS=48387186;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:44:45:56:55:25:31:30:14:25:30:31:14 chr11 48387301 . G A 11.77 PASS AO=14;DP=90;FAO=14;FDP=90;FR=.;FRO=76;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=44;FSRR=32;FWDB=-0.0163953;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.3403;QD=0.523282;RBI=0.0166515;REFB=-0.017281;REVB=0.00290936;RO=75;SAF=7;SAR=7;SRF=43;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0921313;STB=0.566573;TYPE=snp;VARB=0.0499428;OID=.;OPOS=48387301;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:90:90:75:76:14:14:7:7:43:32:7:7:44:32 chr11 48387335 . C A 62.42 PASS AO=28;DP=114;FAO=31;FDP=115;FR=.;FRO=84;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=50;FSRR=34;FWDB=-0.00224154;FXX=0.0170926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.742;QD=2.17126;RBI=0.0024218;REFB=-0.003872;REVB=0.000916849;RO=86;SAF=15;SAR=13;SRF=50;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0574412;STB=0.580954;TYPE=snp;VARB=0.00912797;OID=.;OPOS=48387335;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:114:115:86:84:28:31:13:15:50:36:16:15:50:34 chr11 48387370 . A G 56.91 PASS AO=34;DP=138;FAO=34;FDP=142;FR=.;FRO=108;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=61;FSRR=47;FWDB=-0.00410259;FXX=0.0405378;HRUN=3;LEN=1;MLLD=117.223;QD=1.60298;RBI=0.0262849;REFB=-0.0028064;REVB=-0.0259627;RO=104;SAF=17;SAR=17;SRF=61;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10825;STB=0.549267;TYPE=snp;VARB=0.0134972;OID=.;OPOS=48387370;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:138:142:104:108:34:34:17:17:61:43:17:17:61:47 chr11 48387424 . G T 119.89 PASS AO=58;DP=201;FAO=58;FDP=200;FR=.;FRO=142;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=67;FSRR=75;FWDB=-0.00656473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.325;QD=2.39771;RBI=0.00668631;REFB=-0.0144404;REVB=-0.00126925;RO=139;SAF=28;SAR=30;SRF=66;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00960288;STB=0.5045;TYPE=snp;VARB=0.0218649;OID=.;OPOS=48387424;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:200:139:142:58:58:30:28:66:73:31:27:67:75 chr11 48387490 . G A 111.63 PASS AO=61;DP=223;FAO=60;FDP=222;FR=.;FRO=162;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=78;FSRR=84;FWDB=-0.0334927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.5724;QD=2.01137;RBI=0.0350353;REFB=-0.0121733;REVB=-0.0102816;RO=162;SAF=30;SAR=31;SRF=78;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0127207;STB=0.51084;TYPE=snp;VARB=0.0281821;OID=.;OPOS=48387490;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:222:162:162:61:60:31:30:78:84:32:28:78:84 chr11 48387506 . A G 38.68 PASS AO=37;DP=185;FAO=36;FDP=183;FR=.,HEALED;FRO=147;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=68;FSRR=79;FWDB=-0.0890603;FXX=0.0108102;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.8976;QD=0.845424;RBI=0.139928;REFB=-0.0123435;REVB=-0.107926;RO=82;SAF=16;SAR=21;SRF=6;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.487217;STB=0.537444;TYPE=snp;VARB=0.0812096;OID=.;OPOS=48387506;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:180:183:82:147:37:36:21:16:6:76:21:15:68:79 chr11 48387526 . G T 34.29 PASS AO=36;DP=181;FAO=35;FDP=184;FR=.;FRO=149;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=68;FSRR=81;FWDB=-0.0378848;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.554;QD=0.745395;RBI=0.0428442;REFB=-0.00968535;REVB=0.0200093;RO=144;SAF=15;SAR=21;SRF=66;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0541639;STB=0.54664;TYPE=snp;VARB=0.0259803;OID=.;OPOS=48387526;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:181:184:144:149:36:35:21:15:66:78:21:14:68:81 chr11 48387535 . T C 30.76 PASS AO=35;DP=182;FAO=34;FDP=185;FR=.;FRO=151;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=64;FSRR=87;FWDB=0.0186535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.949;QD=0.665145;RBI=0.0239569;REFB=-0.00233254;REVB=-0.0150326;RO=146;SAF=15;SAR=20;SRF=61;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141294;STB=0.510131;TYPE=snp;VARB=0.00782852;OID=.;OPOS=48387535;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:182:185:146:151:35:34:20:15:61:85:20:14:64:87 chr11 48387540 . G T 28.62 PASS AO=31;DP=171;FAO=32;FDP=176;FR=.;FRO=144;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=61;FSRR=83;FWDB=0.0491454;FXX=0.0056494;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.014;QD=0.650493;RBI=0.0537243;REFB=0.00194068;REVB=0.0217032;RO=138;SAF=13;SAR=18;SRF=58;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00123006;STB=0.514632;TYPE=snp;VARB=-0.00504344;OID=.;OPOS=48387540;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:171:176:138:144:31:32:18:13:58:80:19:13:61:83 chr11 48510654 . A C 353.89 PASS AO=92;DP=213;FAO=95;FDP=214;FR=.;FRO=119;FSAF=30;FSAR=65;FSRF=45;FSRR=74;FWDB=-0.00395541;FXX=0.00465095;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.785;QD=6.61469;RBI=0.00427079;REFB=-0.0143332;REVB=-0.00161072;RO=115;SAF=29;SAR=63;SRF=44;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0754362;STB=0.538963;TYPE=snp;VARB=0.0160825;OID=.;OPOS=48510654;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:213:214:115:119:92:95:63:29:44:71:65:30:45:74 chr11 48510777 . G A 416.11 PASS AO=104;DP=228;FAO=106;FDP=228;FR=.;FRO=122;FSAF=51;FSAR=55;FSRF=52;FSRR=70;FWDB=0.0171413;FXX=0.0129865;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.171;QD=7.3001;RBI=0.0319261;REFB=-0.0187686;REVB=0.0269342;RO=123;SAF=49;SAR=55;SRF=54;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0316291;STB=0.52948;TYPE=snp;VARB=0.0305164;OID=.;OPOS=48510777;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:228:228:123:122:104:106:55:49:54:69:55:51:52:70 chr11 48997107 . G A 615.94 PASS AO=70;DP=139;FAO=72;FDP=137;FR=.,HEALED;FRO=36;FSAF=33;FSAR=39;FSRF=36;FSRR=0;FWDB=0.0506034;FXX=0.021427;HRUN=3;LEN=1;MLLD=37.0917;QD=17.9838;RBI=0.0509077;REFB=0.038625;REVB=0.005558;RO=32;SAF=32;SAR=38;SRF=32;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.311172;STB=0.676426;TYPE=snp;VARB=0.0157708;OID=.;OPOS=48997107;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:136:137:32:36:70:72:38:32:32:0:39:33:36:0 chr11 48997334 . T G 235.93 PASS AO=58;DP=124;FAO=58;FDP=123;FR=.;FRO=65;FSAF=33;FSAR=25;FSRF=19;FSRR=46;FWDB=0.0323126;FXX=0.00806387;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.43;QD=7.67255;RBI=0.0381;REFB=-0.00504476;REVB=-0.0201868;RO=64;SAF=33;SAR=25;SRF=19;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253164;STB=0.643104;TYPE=snp;VARB=0.00518981;OID=.;OPOS=48997334;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:123:64:65:58:58:25:33:19:45:25:33:19:46 chr11 49000423 . C G 397.46 PASS AO=85;DP=158;FAO=85;FDP=158;FR=.;FRO=73;FSAF=36;FSAR=49;FSRF=22;FSRR=51;FWDB=0.0526787;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.983;QD=10.0624;RBI=0.0544697;REFB=-0.0125523;REVB=-0.0138532;RO=73;SAF=36;SAR=49;SRF=22;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107835;STB=0.558819;TYPE=snp;VARB=0.00666031;OID=.;OPOS=49000423;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:158:73:73:85:85:49:36:22:51:49:36:22:51 chr11 49000522 . C T 148.23 PASS AO=36;DP=79;FAO=37;FDP=80;FR=.;FRO=43;FSAF=11;FSAR=26;FSRF=11;FSRR=32;FWDB=-0.00795814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.8296;QD=7.41158;RBI=0.106859;REFB=-0.0193009;REVB=0.106563;RO=42;SAF=11;SAR=25;SRF=10;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.07934;STB=0.527258;TYPE=snp;VARB=0.0300774;OID=.;OPOS=49000522;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:80:42:43:36:37:25:11:10:32:26:11:11:32 chr11 49000558 . G A 252.67 PASS AO=33;DP=84;FAO=50;FDP=88;FR=.;FRO=38;FSAF=8;FSAR=42;FSRF=12;FSRR=26;FWDB=-0.069369;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.529;QD=11.4848;RBI=0.071206;REFB=-0.030862;REVB=0.0160701;RO=28;SAF=8;SAR=25;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119811;STB=0.606889;TYPE=snp;VARB=0.0202999;OID=.;OPOS=49000558;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:88:28:38:33:50:25:8:10:18:42:8:12:26 chr11 49055751 . T C 61.04 PASS AO=17;DP=66;FAO=23;FDP=71;FR=.;FRO=48;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=41;FSRR=7;FWDB=-0.018084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.2835;QD=3.43881;RBI=0.104064;REFB=-0.0217176;REVB=0.102481;RO=48;SAF=11;SAR=6;SRF=41;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.316967;STB=0.665559;TYPE=snp;VARB=0.063879;OID=.;OPOS=49055751;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:66:71:48:48:17:23:6:11:41:7:8:15:41:7 chr11 49059362 . C A 393.04 PASS AO=118;DP=296;FAO=120;FDP=297;FR=.;FRO=177;FSAF=41;FSAR=79;FSRF=84;FSRR=93;FWDB=-0.0142775;FXX=0.00335559;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.6553;QD=5.2935;RBI=0.0159215;REFB=-0.0036213;REVB=-0.00704596;RO=175;SAF=39;SAR=79;SRF=82;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156;STB=0.583373;TYPE=snp;VARB=0.00566119;OID=.;OPOS=49059362;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:296:297:175:177:118:120:79:39:82:93:79:41:84:93 chr11 49075605 . G A 361.07 PASS AO=100;DP=230;FAO=100;FDP=231;FR=.;FRO=131;FSAF=41;FSAR=59;FSRF=59;FSRR=72;FWDB=-0.0227461;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.426;QD=6.25228;RBI=0.0258012;REFB=-0.00929095;REVB=0.0121786;RO=130;SAF=41;SAR=59;SRF=58;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0376498;STB=0.523463;TYPE=snp;VARB=0.0099245;OID=.;OPOS=49075605;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:230:231:130:131:100:100:59:41:58:72:59:41:59:72 chr11 49080616 . T C 200.66 PASS AO=45;DP=92;FAO=47;FDP=92;FR=.;FRO=45;FSAF=31;FSAR=16;FSRF=30;FSRR=15;FWDB=0.0685628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.1006;QD=8.72422;RBI=0.069722;REFB=-0.00267362;REVB=0.0126612;RO=44;SAF=29;SAR=16;SRF=30;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0368687;STB=0.50387;TYPE=snp;VARB=0.00286762;OID=.;OPOS=49080616;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:44:45:45:47:16:29:30:14:16:31:30:15 chr11 49598178 . G A 2625.48 PASS AO=272;DP=272;FAO=274;FDP=274;FR=.;FRO=0;FSAF=146;FSAR=128;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0218797;FXX=0.00363623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.0894;QD=38.3282;RBI=0.0219328;REFB=0;REVB=-0.00152546;RO=0;SAF=146;SAR=126;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.61567e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.42845e-05;OID=.;OPOS=49598178;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:272:274:0:0:272:274:126:146:0:0:128:146:0:0 chr11 49598207 . T C 2342.53 PASS AO=169;DP=258;FAO=247;FDP=247;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=124;FSAR=123;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.164545;FXX=0.0040321;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.1754;QD=37.9357;RBI=0.188227;REFB=0;REVB=-0.0914017;RO=0;SAF=50;SAR=119;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00032954;OID=.;OPOS=49598207;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:247:247:0:0:169:247:119:50:0:0:123:124:0:0 chr11 49598209 . T C 2322.7 PASS AO=248;DP=249;FAO=249;FDP=249;FR=.;FRO=0;FSAF=126;FSAR=123;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.100002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.382;QD=37.3124;RBI=0.102942;REFB=0;REVB=-0.024425;RO=0;SAF=125;SAR=123;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000281788;OID=.;OPOS=49598209;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:249:249:0:0:248:249:123:125:0:0:123:126:0:0 chr11 49830142 . G T 2856.07 PASS AO=295;DP=295;FAO=297;FDP=297;FR=.;FRO=0;FSAF=159;FSAR=138;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00436487;FXX=0.00335559;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.916;QD=38.4656;RBI=0.0129725;REFB=0;REVB=-0.0122161;RO=0;SAF=156;SAR=139;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.43921e-05;OID=.;OPOS=49830142;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:295:297:0:0:295:297:139:156:0:0:138:159:0:0 chr11 49973979 . C T 270.58 PASS AO=73;DP=166;FAO=73;FDP=166;FR=.;FRO=93;FSAF=40;FSAR=33;FSRF=33;FSRR=60;FWDB=0.0320599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.0002;QD=6.52002;RBI=0.0614996;REFB=-0.0159628;REVB=-0.052482;RO=92;SAF=40;SAR=33;SRF=33;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187849;STB=0.606922;TYPE=snp;VARB=0.0182683;OID=.;OPOS=49973979;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:166:92:93:73:73:33:40:33:59:33:40:33:60 chr11 49974371 . G A 1388.69 PASS AO=141;DP=142;FAO=145;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00853497;FXX=0.0202689;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.73;QD=38.3086;RBI=0.0113171;REFB=0;REVB=-0.00743182;RO=0;SAF=65;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-8.52843e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.91347e-05;OID=.;OPOS=49974371;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:142:145:0:0:141:145:76:65:0:0:80:65:0:0 chr11 49974770 . G T 210.43 PASS AO=57;DP=140;FAO=59;FDP=141;FR=.;FRO=82;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=48;FSRR=34;FWDB=-0.00828793;FXX=0.00704176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.415;QD=5.96972;RBI=0.00842795;REFB=-0.00555012;REVB=0.00152986;RO=81;SAF=27;SAR=30;SRF=48;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123749;STB=0.55447;TYPE=snp;VARB=0.00501412;OID=.;OPOS=49974770;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:141:81:82:57:59:30:27:48:33:30:29:48:34 chr11 49974931 . G A 481.04 PASS AO=50;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0377101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.711;QD=37.7285;RBI=0.0710184;REFB=0;REVB=0.0601794;RO=0;SAF=23;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000363676;OID=.;OPOS=49974931;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:50:51:0:0:50:51:27:23:0:0:28:23:0:0 chr11 50003191 . C A 2073.97 PASS AO=209;DP=210;FAO=216;FDP=216;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=123;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.012899;FXX=0.00460808;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.4797;QD=38.4069;RBI=0.0438811;REFB=0;REVB=0.0419424;RO=0;SAF=92;SAR=117;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.32372e-05;OID=.;OPOS=50003191;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:210:216:0:0:209:216:117:92:0:0:123:93:0:0 chr11 51516000 . C T 1461.52 PASS AO=158;DP=165;FAO=163;FDP=169;FR=.;FRO=6;FSAF=73;FSAR=90;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0263045;FXX=0.00588201;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.8518;QD=34.5922;RBI=0.0298101;REFB=-0.103775;REVB=-0.0140254;RO=6;SAF=70;SAR=88;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00401068;STB=0.501871;TYPE=snp;VARB=0.00300246;OID=.;OPOS=51516000;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:165:169:6:6:158:163:88:70:3:3:90:73:3:3 chr11 51516036 . G A 1226.04 PASS AO=126;DP=130;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0633179;FXX=0.0227256;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.725;QD=38.0167;RBI=0.0652621;REFB=0;REVB=0.0158109;RO=0;SAF=58;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.33106e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000251986;OID=.;OPOS=51516036;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:130:129:0:0:126:129:68:58:0:0:71:58:0:0 chr11 51516142 . GAA GA,GAG 143.9 PASS AO=3,12;DP=16;FAO=2,14;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=1,4;FSAR=1,10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0275889,0.042617;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=31.9989,55.086;QD=35.976;RBI=0.0669185,0.0488414;REFB=0,0;REVB=-0.0609667,-0.0238594;RO=0;SAF=1,4;SAR=2,8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.0564262,0.00714762;OID=.,.;OPOS=51516143,51516144;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=GA,GAG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:3,12:15:2,14:16:0:1,4:1,10:0:0:5:0:1,4:2,8:0:0 chr11 55033084 . T G 209.99 PASS AO=45;DP=86;FAO=45;FDP=85;FR=.;FRO=40;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=-0.00274909;FXX=0.0116266;HRUN=4;LEN=1;MLLD=225.467;QD=9.88167;RBI=0.003918;REFB=-0.018454;REVB=-0.00279163;RO=40;SAF=26;SAR=19;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.045731;STB=0.525241;TYPE=snp;VARB=0.0137963;OID=.;OPOS=55033084;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:85:40:40:45:45:19:26:21:19:19:26:21:19 chr11 55111238 . C A 2010.39 PASS AO=217;DP=225;FAO=217;FDP=217;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=125;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0019093;FXX=0.035554;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.022;QD=37.0579;RBI=0.00570278;REFB=-0.0634109;REVB=-0.00537367;RO=0;SAF=92;SAR=125;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.68397e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.87575e-05;OID=.;OPOS=55111238;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:225:217:0:0:217:217:125:92:0:0:125:92:0:0 chr11 55111584 . A T 1824.71 PASS AO=195;DP=198;FAO=195;FDP=195;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=134;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00847456;FXX=0.0151508;HRUN=4;LEN=1;MLLD=138.432;QD=37.4299;RBI=0.0128769;REFB=-0.0804732;REVB=0.00969521;RO=0;SAF=61;SAR=134;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.76991e-05;OID=.;OPOS=55111584;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:198:195:0:0:195:195:134:61:0:0:134:61:0:0 chr11 55322539 . G A 1041.2 PASS AO=109;DP=110;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143882;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.318;QD=37.862;RBI=0.025524;REFB=0;REVB=0.0210822;RO=0;SAF=60;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.56602e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000186416;OID=.;OPOS=55322539;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:110:110:0:0:109:110:49:60:0:0:50:60:0:0 chr11 55339676 . G T 1509.43 PASS AO=162;DP=162;FAO=160;FDP=160;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0215674;FXX=0.0123449;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.663;QD=37.7358;RBI=0.0219376;REFB=0.0725639;REVB=-0.00401348;RO=0;SAF=64;SAR=98;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.73103e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000193028;OID=.;OPOS=55339676;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:162:160:0:0:162:160:98:64:0:0:98:62:0:0 chr11 55339702 . C T 1901.05 PASS AO=200;DP=201;FAO=201;FDP=201;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000871586;FXX=0.00985173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.366;QD=37.8319;RBI=0.0336335;REFB=-0.0634213;REVB=0.0336222;RO=0;SAF=94;SAR=106;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.31828e-05;OID=.;OPOS=55339702;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:82:201:201:0:0:200:201:106:94:0:0:106:95:0:0 chr11 55339829 . A G 1004.11 PASS AO=120;DP=145;FAO=121;FDP=133;FR=.;FRO=12;FSAF=104;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=2;FWDB=0.00434122;FXX=0.089035;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.171;QD=30.1987;RBI=0.052046;REFB=-0.0386948;REVB=0.0518646;RO=9;SAF=104;SAR=16;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0393528;STB=0.504854;TYPE=snp;VARB=0.00103296;OID=.;OPOS=55339829;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:145:133:9:12:120:121:16:104:9:0:17:104:10:2 chr11 55340379 . T C 1608.74 PASS AO=166;DP=171;FAO=176;FDP=176;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0634014;FXX=0.0112353;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.9344;QD=36.5623;RBI=0.0656875;REFB=-0.0409922;REVB=0.0171788;RO=5;SAF=89;SAR=77;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0259815;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000717451;OID=.;OPOS=55340379;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:171:176:5:0:166:176:77:89:5:0:78:98:0:0 chr11 55371807 . A T 483.94 PASS AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0457529;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.2706;QD=35.8473;RBI=0.0525412;REFB=-0.0927907;REVB=0.0258313;RO=1;SAF=15;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122398;STB=0.506491;TYPE=snp;VARB=0.00743512;OID=.;OPOS=55371807;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:54:54:1:1:53:53:38:15:0:1:38:15:0:1 chr11 55541098 . G A 1610.71 PASS AO=167;DP=170;FAO=167;FDP=167;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00784777;FXX=0.017646;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.349;QD=38.5799;RBI=0.0273637;REFB=0;REVB=-0.0262142;RO=0;SAF=76;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.29889e-05;OID=.;OPOS=55541098;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:170:167:0:0:167:167:91:76:0:0:91:76:0:0 chr11 55563776 . T G 1455.79 PASS AO=150;DP=153;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0385516;FXX=0.0189861;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.05;QD=37.5687;RBI=0.041181;REFB=-0.131426;REVB=0.0144792;RO=0;SAF=55;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00051039;OID=.;OPOS=55563776;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:153:155:0:0:150:155:95:55:0:0:100:55:0:0 chr11 55587117 . T A 267.06 PASS AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.024307;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.83;QD=38.152;RBI=0.034774;REFB=0;REVB=0.0248676;RO=0;SAF=5;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.39272e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000815666;OID=.;OPOS=55587117;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:28:28:0:0:28:28:23:5:0:0:23:5:0:0 chr11 55587511 . A G 1868.25 PASS AO=205;DP=211;FAO=206;FDP=206;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=159;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0193218;FXX=0.0418585;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.74;QD=36.2767;RBI=0.027357;REFB=0.00686415;REVB=-0.0193668;RO=6;SAF=47;SAR=158;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.020478;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.30938e-05;OID=.;OPOS=55587511;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:211:206:6:0:205:206:158:47:3:3:159:47:0:0 chr11 55606472 . T C 500.86 PASS AO=121;DP=247;FAO=121;FDP=247;FR=.;FRO=126;FSAF=29;FSAR=92;FSRF=25;FSRR=101;FWDB=0.00679405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.3703;QD=8.11105;RBI=0.00810634;REFB=-0.00537229;REVB=0.00442195;RO=124;SAF=29;SAR=92;SRF=23;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0715633;STB=0.529763;TYPE=snp;VARB=0.00740683;OID=.;OPOS=55606472;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:247:247:124:126:121:121:92:29:23:101:92:29:25:101 chr11 55652971 . C A 543.05 PASS AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0168514;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=242.793;QD=36.8169;RBI=0.0243107;REFB=-0.0895243;REVB=0.0175225;RO=1;SAF=26;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145145;STB=0.50769;TYPE=snp;VARB=0.000414979;OID=.;OPOS=55652971;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:59:59:1:1:58:58:32:26:0:1:32:26:0:1 chr11 55656483 . T A 435.34 PASS AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0621217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.544;QD=37.8553;RBI=0.0649262;REFB=0;REVB=0.0188764;RO=0;SAF=12;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.12678e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000268912;OID=.;OPOS=55656483;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:46:46:0:0:46:46:34:12:0:0:34:12:0:0 chr11 55681336 . G A 1189.18 PASS AO=127;DP=129;FAO=127;FDP=129;FR=.;FRO=2;FSAF=45;FSAR=82;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0200261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.7497;QD=36.8738;RBI=0.0279944;REFB=-0.0462891;REVB=0.0195612;RO=2;SAF=45;SAR=82;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0206469;STB=0.510868;TYPE=snp;VARB=0.000538224;OID=.;OPOS=55681336;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:129:129:2:2:127:127:82:45:2:0:82:45:2:0 chr11 55681494 . G A 549.16 PASS AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0290301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.198;QD=37.8728;RBI=0.0411981;REFB=0;REVB=0.0292325;RO=0;SAF=14;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00236899;OID=.;OPOS=55681494;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:58:58:0:0:58:58:44:14:0:0:44:14:0:0 chr11 55746891 . G A 2980.92 PASS AO=321;DP=328;FAO=321;FDP=321;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=257;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00729906;FXX=0.0213408;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.265;QD=37.1455;RBI=0.00970916;REFB=-0.0499415;REVB=0.00640246;RO=5;SAF=64;SAR=257;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.84841e-05;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.80033e-06;OID=.;OPOS=55746891;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:94:328:321:5:0:321:321:257:64:1:4:257:64:0:0 chr11 55761221 . C T 1036.53 PASS AO=107;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00350888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.9611;QD=38.3899;RBI=0.0326581;REFB=0;REVB=-0.032469;RO=0;SAF=61;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.73491e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000214477;OID=.;OPOS=55761221;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:108:108:0:0:107:108:46:61:0:0:47:61:0:0 chr11 55761738 . T G 1290.78 PASS AO=135;DP=136;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000850529;FXX=0.0073524;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.517;QD=38.2453;RBI=0.00679429;REFB=0;REVB=-0.00674084;RO=0;SAF=61;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000114765;OID=.;OPOS=55761738;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:136:135:0:0:135:135:74:61:0:0:75:60:0:0 chr11 55762060 . T C 1096.69 PASS AO=115;DP=115;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0280387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.614;QD=38.1458;RBI=0.0336834;REFB=0;REVB=0.0186656;RO=0;SAF=29;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.20818e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000161024;OID=.;OPOS=55762060;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:115:115:0:0:115:115:86:29:0:0:86:29:0:0 chr11 55798152 . G A 1052.87 PASS AO=109;DP=109;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0357463;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.775;QD=38.2862;RBI=0.0361013;REFB=0;REVB=0.00505054;RO=0;SAF=38;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.27115e-05;OID=.;OPOS=55798152;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:109:110:0:0:109:110:71:38:0:0:71:39:0:0 chr11 55872876 . C T 3564.9 PASS AO=367;DP=367;FAO=370;FDP=370;FR=.;FRO=0;FSAF=154;FSAR=216;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0484598;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=244.135;QD=38.5395;RBI=0.0494595;REFB=0;REVB=0.00989385;RO=0;SAF=154;SAR=213;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.62072e-05;OID=.;OPOS=55872876;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:367:370:0:0:367:370:213:154:0:0:216:154:0:0 chr11 55873024 . A G 2659.16 PASS AO=270;DP=278;FAO=277;FDP=277;FR=.;FRO=0;FSAF=138;FSAR=139;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0333662;FXX=0.0280692;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.169;QD=38.3994;RBI=0.0335357;REFB=0;REVB=-0.0033675;RO=0;SAF=138;SAR=132;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.52278e-05;OID=.;OPOS=55873024;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:278:277:0:0:270:277:132:138:0:0:139:138:0:0 chr11 55873368 . G A 1434.54 PASS AO=149;DP=149;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00984977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.5529;QD=38.5112;RBI=0.0313152;REFB=0;REVB=0.0297258;RO=0;SAF=64;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000148279;OID=.;OPOS=55873368;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:149:149:0:0:149:149:85:64:0:0:85:64:0:0 chr11 55890257 . C T 3246.25 PASS AO=395;DP=423;FAO=375;FDP=400;FR=.;FRO=25;FSAF=163;FSAR=212;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.0539683;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.9473;QD=32.4625;RBI=0.0541362;REFB=0.000657849;REVB=-0.00426081;RO=28;SAF=167;SAR=228;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.01454;STB=0.507952;TYPE=snp;VARB=-5.5124e-05;OID=.;OPOS=55890257;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:423:400:28:25:395:375:228:167:15:13:212:163:14:11 chr11 56000403 . C G 531.19 PASS AO=140;DP=140;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00403885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.7057;QD=37.9419;RBI=0.00701437;REFB=0;REVB=-0.00573489;RO=0;SAF=72;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.30205e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.03559e-05;OID=.;OPOS=56000403;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:140:56:0:0:140:56:68:72:0:0:32:24:0:0 chr11 56127746 . A G 1339.52 PASS AO=122;DP=122;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00402725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.742;QD=38.0006;RBI=0.0556832;REFB=0;REVB=0.0555374;RO=0;SAF=80;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000804627;OID=.;OPOS=56127746;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:122:141:0:0:122:141:42:80:0:0:59:82:0:0 chr11 56128081 . A G 1974.48 PASS AO=206;DP=209;FAO=207;FDP=207;FR=.;FRO=0;FSAF=111;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019581;FXX=0.00956892;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.9216;QD=38.1541;RBI=0.0200038;REFB=0;REVB=-0.00409105;RO=1;SAF=110;SAR=96;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00431092;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00038351;OID=.;OPOS=56128081;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:92:209:207:1:0:206:207:96:110:1:0:96:111:0:0 chr11 56128524 . C T 1481.87 PASS AO=153;DP=153;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00540578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.636;QD=38.2418;RBI=0.0245689;REFB=0;REVB=0.0239668;RO=0;SAF=80;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.61154e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.48767e-05;OID=.;OPOS=56128524;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:153:155:0:0:153:155:73:80:0:0:75:80:0:0 chr11 56143434 . C G 2452.09 PASS AO=257;DP=261;FAO=258;FDP=258;FR=.;FRO=0;FSAF=122;FSAR=136;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214076;FXX=0.0152666;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.049;QD=38.0169;RBI=0.0223816;REFB=-0.0655181;REVB=-0.00653058;RO=1;SAF=122;SAR=135;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00389162;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000154569;OID=.;OPOS=56143434;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:261:258:1:0:257:258:135:122:1:0:136:122:0:0 chr11 56143690 . C A 136.89 PASS AO=53;DP=163;FAO=53;FDP=162;FR=.;FRO=109;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=61;FSRR=48;FWDB=0.00447403;FXX=0.00613459;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.222;QD=3.37991;RBI=0.0123947;REFB=-0.0130398;REVB=0.011559;RO=109;SAF=26;SAR=27;SRF=61;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0804757;STB=0.546389;TYPE=snp;VARB=0.0456582;OID=.;OPOS=56143690;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:162:109:109:53:53:27:26:61:48:27:26:61:48 chr11 56143696 . C T 39.55 PASS AO=31;DP=143;FAO=35;FDP=146;FR=.;FRO=111;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=63;FSRR=48;FWDB=0.00404701;FXX=0.0874945;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.617;QD=1.08354;RBI=0.033161;REFB=-0.0138285;REVB=0.0329132;RO=110;SAF=9;SAR=22;SRF=62;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.345014;STB=0.647477;TYPE=snp;VARB=0.145881;OID=.;OPOS=56143696;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:143:146:110:111:31:35:22:9:62:48:22:13:63:48 chr11 56143716 . T C 43.01 PASS AO=33;DP=154;FAO=33;FDP=154;FR=.;FRO=121;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=72;FSRR=49;FWDB=-0.014804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.776;QD=1.11706;RBI=0.0174816;REFB=-0.00908426;REVB=-0.00929767;RO=119;SAF=18;SAR=15;SRF=71;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0661406;STB=0.539545;TYPE=snp;VARB=0.0443958;OID=.;OPOS=56143716;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:154:154:119:121:33:33:15:18:71:48:15:18:72:49 chr11 56143717 . G A 42.4 PASS AO=33;DP=155;FAO=33;FDP=155;FR=.;FRO=122;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=73;FSRR=49;FWDB=-0.0156172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.827;QD=1.09427;RBI=0.0229394;REFB=-0.00679903;REVB=0.0168023;RO=118;SAF=18;SAR=15;SRF=71;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0727015;STB=0.542287;TYPE=snp;VARB=0.0242423;OID=.;OPOS=56143717;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:155:155:118:122:33:33:15:18:71:47:15:18:73:49 chr11 56143723 . T C 30.9 PASS AO=31;DP=164;FAO=31;FDP=164;FR=.;FRO=133;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=79;FSRR=54;FWDB=-0.0233922;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=211.121;QD=0.753685;RBI=0.0308649;REFB=-0.00388977;REVB=-0.0201358;RO=133;SAF=18;SAR=13;SRF=79;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0176135;STB=0.51114;TYPE=snp;VARB=0.0214537;OID=.;OPOS=56143723;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:164:164:133:133:31:31:13:18:79:54:13:18:79:54 chr11 56143725 . C G 33.62 PASS AO=32;DP=164;FAO=32;FDP=165;FR=.;FRO=133;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=81;FSRR=52;FWDB=-0.0201605;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.838;QD=0.814958;RBI=0.0326982;REFB=0.000210375;REVB=-0.0257434;RO=132;SAF=18;SAR=14;SRF=81;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0673916;STB=0.538438;TYPE=snp;VARB=-0.00259739;OID=.;OPOS=56143725;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:164:165:132:133:32:32:14:18:81:51:14:18:81:52 chr11 56143729 . C T 26.17 PASS AO=29;DP=161;FAO=29;FDP=161;FR=.;FRO=132;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=81;FSRR=51;FWDB=-0.0131775;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.626;QD=0.650115;RBI=0.0255967;REFB=-0.00417217;REVB=-0.0219442;RO=132;SAF=18;SAR=11;SRF=81;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0095565;STB=0.506118;TYPE=snp;VARB=0.0352208;OID=.;OPOS=56143729;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:161:161:132:132:29:29:11:18:81:51:11:18:81:51 chr11 56143730 . C G 24.09 PASS AO=28;DP=160;FAO=28;FDP=159;FR=.;FRO=131;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=80;FSRR=51;FWDB=-0.0127893;FXX=0.00624961;HRUN=3;LEN=1;MLLD=106.259;QD=0.606025;RBI=0.0172686;REFB=-0.00234532;REVB=-0.0116034;RO=127;SAF=18;SAR=10;SRF=78;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.039282;STB=0.528372;TYPE=snp;VARB=0.0365069;OID=.;OPOS=56143730;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:160:159:127:131:28:28:10:18:78:49:10:18:80:51 chr11 56143966 . C T 1871.1 PASS AO=189;DP=189;FAO=196;FDP=196;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0347884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.39;QD=38.1858;RBI=0.0353982;REFB=0;REVB=-0.00654225;RO=0;SAF=90;SAR=99;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.74754e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000161185;OID=.;OPOS=56143966;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:189:196:0:0:189:196:99:90:0:0:99:97:0:0 chr11 56143977 . A G 1811.63 PASS AO=188;DP=188;FAO=190;FDP=190;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144086;FXX=0.0155432;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.007;QD=38.1395;RBI=0.0197252;REFB=0;REVB=-0.0134713;RO=0;SAF=88;SAR=100;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.80658e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.33398e-05;OID=.;OPOS=56143977;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:188:190:0:0:188:190:100:88:0:0:103:87:0:0 chr11 56185159 . A G 269.24 PASS AO=37;DP=41;FAO=35;FDP=41;FR=.;FRO=6;FSAF=33;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.00655926;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.5742;QD=26.2672;RBI=0.0228337;REFB=-0.0127273;REVB=-0.0218714;RO=4;SAF=33;SAR=4;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0631934;STB=0.696057;TYPE=snp;VARB=0.0271334;OID=.;OPOS=56185159;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:41:41:4:6:37:35:4:33:3:1:2:33:3:3 chr11 56185327 . T C 565.94 PASS AO=58;DP=58;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.732;QD=38.3685;RBI=0.0350639;REFB=0;REVB=0.0246629;RO=0;SAF=32;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.09576e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000126849;OID=.;OPOS=56185327;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:58:59:0:0:58:59:26:32:0:0:27:32:0:0 chr11 56185345 . A G 677.66 PASS AO=67;DP=67;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0116162;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.621;QD=38.7235;RBI=0.146332;REFB=0;REVB=0.145871;RO=0;SAF=39;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.74073e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000737217;OID=.;OPOS=56185345;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:67:70:0:0:67:70:28:39:0:0:31:39:0:0 chr11 56185689 . A G 1015.25 PASS AO=106;DP=107;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204258;FXX=0.00934492;HRUN=3;LEN=1;MLLD=204.664;QD=38.3112;RBI=0.0244707;REFB=0;REVB=0.0134759;RO=0;SAF=39;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.00999e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.97258e-05;OID=.;OPOS=56185689;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:107:106:0:0:106:106:67:39:0:0:67:39:0:0 chr11 56237410 . A G 642.06 PASS AO=70;DP=74;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00444934;FXX=0.0666578;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.016;QD=36.689;RBI=0.00642762;REFB=-0.0932935;REVB=0.00463871;RO=0;SAF=33;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506665;TYPE=snp;VARB=-0.000134987;OID=.;OPOS=56237410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:74:70:0:1:70:69:37:33:0:0:37:32:0:1 chr11 56237722 . T A 763.5 PASS AO=73;DP=73;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0354976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.001;QD=37.2439;RBI=0.0467707;REFB=0;REVB=0.0304535;RO=0;SAF=25;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.56753e-05;OID=.;OPOS=56237722;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:73:82:0:0:73:82:48:25:0:0:56:26:0:0 chr11 56294275 . T C 1422.04 PASS AO=148;DP=148;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0146823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.5275;QD=38.4334;RBI=0.0147003;REFB=0;REVB=-0.000727278;RO=0;SAF=79;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.86736e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.64597e-05;OID=.;OPOS=56294275;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:148:148:0:0:148:148:69:79:0:0:69:79:0:0 chr11 56294338 . G A 1583.74 PASS AO=173;DP=179;FAO=173;FDP=178;FR=.;FRO=5;FSAF=110;FSAR=63;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0332273;FXX=0.00558628;HRUN=3;LEN=1;MLLD=126.929;QD=35.5896;RBI=0.0415414;REFB=0.0315759;REVB=0.0249326;RO=4;SAF=110;SAR=63;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0178157;STB=0.507124;TYPE=snp;VARB=-0.000229573;OID=.;OPOS=56294338;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:179:178:4:5:173:173:63:110:1:3:63:110:2:3 chr11 56310222 . C T 537.05 PASS AO=58;DP=58;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-9.77347e-05;FXX=0.0344768;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.004;QD=38.3604;RBI=0.00134102;REFB=0;REVB=0.00133746;RO=0;SAF=40;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.20894e-05;OID=.;OPOS=56310222;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:58:56:0:0:58:56:18:40:0:0:18:38:0:0 chr11 56344260 . A G 883.93 PASS AO=107;DP=122;FAO=108;FDP=119;FR=.;FRO=11;FSAF=59;FSAR=49;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0282536;FXX=0.0245881;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.2688;QD=29.7119;RBI=0.0291484;REFB=-0.019085;REVB=-0.0071668;RO=11;SAF=58;SAR=49;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000603315;STB=0.500078;TYPE=snp;VARB=0.00483307;OID=.;OPOS=56344260;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:122:119:11:11:107:108:49:58:6:5:49:59:6:5 chr11 56344993 . C A 1897.9 PASS AO=181;DP=181;FAO=204;FDP=204;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0043374;FXX=0.00970827;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.047;QD=37.2137;RBI=0.0297156;REFB=0;REVB=0.0293973;RO=0;SAF=103;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00078927;OID=.;OPOS=56344993;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:91:181:204:0:0:181:204:78:103:0:0:99:105:0:0 chr11 56380546 . CCAGA C 750.22 PASS AO=106;DP=122;FAO=108;FDP=116;FR=.;FRO=8;FSAF=71;FSAR=37;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=-0.00390275;FXX=0.025208;HRUN=2;LEN=4;MLLD=236.493;QD=25.8698;RBI=0.0649808;REFB=-0.0265387;REVB=0.0648634;RO=0;SAF=70;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507119;TYPE=del;VARB=0.00103256;OID=.;OPOS=56380547;OREF=CAGA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:106:111:108:116:8:71:37:6:2:24:0:70:36:0:0 chr11 56431216 . C T 1833.33 PASS AO=197;DP=201;FAO=197;FDP=197;FR=.;FRO=0;FSAF=99;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00461211;FXX=0.0198995;HRUN=3;LEN=1;MLLD=151.223;QD=37.2249;RBI=0.0270177;REFB=-0.101928;REVB=0.0266211;RO=1;SAF=99;SAR=98;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00478661;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00024795;OID=.;OPOS=56431216;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:201:197:1:0:197:197:98:99:1:0:98:99:0:0 chr11 56467881 . T C 326.28 PASS AO=115;DP=316;FAO=115;FDP=316;FR=.;FRO=201;FSAF=60;FSAR=55;FSRF=115;FSRR=86;FWDB=-0.0134645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.4827;QD=4.13017;RBI=0.0144256;REFB=-0.00928556;REVB=-0.00517749;RO=196;SAF=60;SAR=55;SRF=112;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.055722;STB=0.532203;TYPE=snp;VARB=0.0179658;OID=.;OPOS=56467881;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:316:316:196:201:115:115:55:60:112:84:55:60:115:86 chr11 56467926 . A G 483.97 PASS AO=159;DP=416;FAO=156;FDP=400;FR=.;FRO=244;FSAF=73;FSAR=83;FSRF=126;FSRR=118;FWDB=-0.0323522;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.7894;QD=4.83969;RBI=0.0649203;REFB=0.0130547;REVB=-0.0562848;RO=257;SAF=72;SAR=87;SRF=136;SRR=121;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0839246;STB=0.529557;TYPE=snp;VARB=-0.02086;OID=.;OPOS=56467926;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:416:400:257:244:159:156:87:72:136:121:83:73:126:118 chr11 56467945 . G T 586.3 PASS AO=185;DP=466;FAO=169;FDP=398;FR=.;FRO=229;FSAF=77;FSAR=92;FSRF=119;FSRR=110;FWDB=-0.0342082;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.127;QD=5.89246;RBI=0.0342083;REFB=0.000596177;REVB=-9.28265e-05;RO=280;SAF=84;SAR=101;SRF=141;SRR=139;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0534539;STB=0.536886;TYPE=snp;VARB=-0.00110293;OID=.;OPOS=56467945;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:466:398:280:229:185:169:101:84:141:139:92:77:119:110 chr11 56468020 . T C 370.43 PASS AO=139;DP=401;FAO=139;FDP=397;FR=.;FRO=258;FSAF=53;FSAR=86;FSRF=118;FSRR=140;FWDB=-0.0492218;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.323;QD=3.73228;RBI=0.0495096;REFB=-0.00411517;REVB=-0.00532998;RO=258;SAF=53;SAR=86;SRF=119;SRR=139;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.094323;STB=0.551109;TYPE=snp;VARB=0.00822223;OID=.;OPOS=56468020;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:401:397:258:258:139:139:86:53:119:139:86:53:118:140 chr11 56468021 . G A 363.85 PASS AO=139;DP=402;FAO=138;FDP=398;FR=.;FRO=260;FSAF=54;FSAR=84;FSRF=118;FSRR=142;FWDB=-0.0702738;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.81;QD=3.65679;RBI=0.0708963;REFB=-0.0036928;REVB=0.00937434;RO=257;SAF=54;SAR=85;SRF=117;SRR=140;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0786024;STB=0.542092;TYPE=snp;VARB=0.0128081;OID=.;OPOS=56468021;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:402:398:257:260:139:138:85:54:117:140:84:54:118:142 chr11 56468044 . T G 2411.03 PASS AO=288;DP=318;FAO=291;FDP=316;FR=.;FRO=25;FSAF=107;FSAR=184;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=-0.0122906;FXX=0.00628911;HRUN=6;LEN=1;MLLD=215.501;QD=30.5194;RBI=0.0124248;REFB=-0.143713;REVB=0.0018212;RO=3;SAF=104;SAR=184;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0135543;STB=0.504066;TYPE=snp;VARB=0.000686039;OID=.;OPOS=56468044;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:318:316:3:25:288:291:184:104:3:0:184:107:8:17 chr11 56468047 . A G 3039.3 PASS AO=315;DP=320;FAO=317;FDP=317;FR=.;FRO=0;FSAF=119;FSAR=198;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132427;FXX=0.0185753;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.695;QD=38.3507;RBI=0.0133285;REFB=0;REVB=-0.00150984;RO=0;SAF=118;SAR=197;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000131924;OID=.;OPOS=56468047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:320:317:0:0:315:317:197:118:0:0:198:119:0:0 chr11 56468048 . C T 2635.15 PASS AO=319;DP=321;FAO=301;FDP=301;FR=.;FRO=0;FSAF=106;FSAR=195;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00535873;FXX=0.0652154;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.609;QD=35.0186;RBI=0.015982;REFB=0.00154317;REVB=0.0150569;RO=0;SAF=122;SAR=197;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000149665;OID=.;OPOS=56468048;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:321:301:0:0:319:301:197:122:0:0:195:106:0:0 chr11 56468111 . C T 270.28 PASS AO=99;DP=279;FAO=99;FDP=281;FR=.;FRO=182;FSAF=35;FSAR=64;FSRF=72;FSRR=110;FWDB=0.00868345;FXX=0.00354597;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.114;QD=3.8474;RBI=0.0218802;REFB=-0.0104432;REVB=-0.0200833;RO=180;SAF=35;SAR=64;SRF=72;SRR=108;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.056521;STB=0.529288;TYPE=snp;VARB=0.0146566;OID=.;OPOS=56468111;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:279:281:180:182:99:99:64:35:72:108:64:35:72:110 chr11 56468198 . A G 397.99 PASS AO=105;DP=229;FAO=105;FDP=232;FR=.;FRO=127;FSAF=43;FSAR=62;FSRF=69;FSRR=58;FWDB=-0.0289948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.5296;QD=6.86185;RBI=0.0708962;REFB=-0.0278603;REVB=-0.0646961;RO=122;SAF=43;SAR=62;SRF=67;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136419;STB=0.573681;TYPE=snp;VARB=0.0332454;OID=.;OPOS=56468198;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:229:232:122:127:105:105:62:43:67:55:62:43:69:58 chr11 56468200 . C T 372.99 PASS AO=105;DP=232;FAO=101;FDP=229;FR=.;FRO=128;FSAF=42;FSAR=59;FSRF=69;FSRR=59;FWDB=0.0176695;FXX=0.0129305;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.8125;QD=6.51508;RBI=0.0327157;REFB=-0.00713736;REVB=0.0275337;RO=126;SAF=43;SAR=62;SRF=67;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121328;STB=0.569217;TYPE=snp;VARB=0.00981232;OID=.;OPOS=56468200;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:229:126:128:105:101:62:43:67:59:59:42:69:59 chr11 56468202 . G A 385.15 PASS AO=103;DP=231;FAO=103;FDP=231;FR=.;FRO=128;FSAF=41;FSAR=62;FSRF=70;FSRR=58;FWDB=-0.00854364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.105;QD=6.66933;RBI=0.0552265;REFB=-0.0226578;REVB=0.0545616;RO=125;SAF=41;SAR=62;SRF=68;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145552;STB=0.583105;TYPE=snp;VARB=0.033183;OID=.;OPOS=56468202;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:231:231:125:128:103:103:62:41:68:57:62:41:70:58 chr11 56468212 . G A 392.16 PASS AO=103;DP=226;FAO=103;FDP=227;FR=.;FRO=124;FSAF=43;FSAR=60;FSRF=70;FSRR=54;FWDB=-0.00166712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.707;QD=6.91037;RBI=0.0016916;REFB=-0.0379443;REVB=0.00028675;RO=123;SAF=43;SAR=60;SRF=69;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1412;STB=0.580364;TYPE=snp;VARB=0.033324;OID=.;OPOS=56468212;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:226:227:123:124:103:103:60:43:69:54:60:43:70:54 chr11 56468259 . C T 558.21 PASS AO=117;DP=212;FAO=117;FDP=212;FR=.;FRO=95;FSAF=70;FSAR=47;FSRF=42;FSRR=53;FWDB=0.00436548;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.21;QD=10.5322;RBI=0.0146834;REFB=-0.0437635;REVB=0.0140194;RO=75;SAF=70;SAR=47;SRF=22;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218648;STB=0.570764;TYPE=snp;VARB=0.0188095;OID=.;OPOS=56468259;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:212:75:95:117:117:47:70:22:53:47:70:42:53 chr11 56468368 . C T 282.68 PASS AO=87;DP=239;FAO=93;FDP=245;FR=.;FRO=152;FSAF=35;FSAR=58;FSRF=87;FSRR=65;FWDB=-0.0174682;FXX=0.00406488;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.345;QD=4.61511;RBI=0.0436315;REFB=-0.0205043;REVB=-0.0399822;RO=150;SAF=29;SAR=58;SRF=85;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263619;STB=0.621712;TYPE=snp;VARB=0.0570784;OID=.;OPOS=56468368;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:239:245:150:152:87:93:58:29:85:65:58:35:87:65 chr11 56468403 . G A 217.92 PASS AO=80;DP=237;FAO=82;FDP=239;FR=.;FRO=157;FSAF=34;FSAR=48;FSRF=83;FSRR=74;FWDB=-0.0332152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.8232;QD=3.6472;RBI=0.0352425;REFB=-0.00674411;REVB=0.0117808;RO=157;SAF=31;SAR=49;SRF=83;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164612;STB=0.575156;TYPE=snp;VARB=0.0254854;OID=.;OPOS=56468403;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:237:239:157:157:80:82:49:31:83:74:48:34:83:74 chr11 56468416 . G A 147.96 PASS AO=68;DP=232;FAO=69;FDP=233;FR=.;FRO=164;FSAF=28;FSAR=41;FSRF=83;FSRR=81;FWDB=0.0364895;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.7551;QD=2.54004;RBI=0.0370412;REFB=-0.0126885;REVB=-0.00636976;RO=163;SAF=26;SAR=42;SRF=82;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148075;STB=0.571211;TYPE=snp;VARB=0.038109;OID=.;OPOS=56468416;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:233:163:164:68:69:42:26:82:81:41:28:83:81 chr11 56468440 . G T 183.17 PASS AO=75;DP=220;FAO=74;FDP=226;FR=.;FRO=152;FSAF=29;FSAR=45;FSRF=65;FSRR=87;FWDB=-0.0819856;FXX=0.00440509;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.4506;QD=3.24189;RBI=0.0832756;REFB=-0.00171563;REVB=0.014601;RO=145;SAF=29;SAR=46;SRF=59;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0243941;STB=0.524937;TYPE=snp;VARB=0.00537984;OID=.;OPOS=56468440;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:220:226:145:152:75:74:46:29:59:86:45:29:65:87 chr11 56468448 . A G 126.69 PASS AO=68;DP=246;FAO=67;FDP=244;FR=.;FRO=177;FSAF=24;FSAR=43;FSRF=80;FSRR=97;FWDB=-0.0377062;FXX=0.00408147;HRUN=4;LEN=1;MLLD=178.235;QD=2.07685;RBI=0.0388098;REFB=-0.000125183;REVB=-0.00918947;RO=176;SAF=24;SAR=44;SRF=80;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129949;STB=0.570969;TYPE=snp;VARB=0.000383374;OID=.;OPOS=56468448;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:246:244:176:177:68:67:44:24:80:96:43:24:80:97 chr11 56468449 . A T 127.29 PASS AO=69;DP=244;FAO=67;FDP=242;FR=.;FRO=175;FSAF=25;FSAR=42;FSRF=76;FSRR=99;FWDB=-0.00747124;FXX=0.00819639;HRUN=4;LEN=1;MLLD=77.7718;QD=2.10389;RBI=0.0269985;REFB=-0.0382158;REVB=-0.0259441;RO=172;SAF=24;SAR=45;SRF=75;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113352;STB=0.546143;TYPE=snp;VARB=0.0223438;OID=.;OPOS=56468449;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:242:172:175:69:67:45:24:75:97:42:25:76:99 chr11 56468452 . A C 154.74 PASS AO=74;DP=249;FAO=73;FDP=248;FR=.;FRO=175;FSAF=29;FSAR=44;FSRF=76;FSRR=99;FWDB=-0.0492062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.6158;QD=2.49584;RBI=0.0803899;REFB=-0.0187631;REVB=-0.0635712;RO=172;SAF=29;SAR=45;SRF=73;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0405912;STB=0.526969;TYPE=snp;VARB=0.0313594;OID=.;OPOS=56468452;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:249:248:172:175:74:73:45:29:73:99:44:29:76:99 chr11 56468493 . A G 110.65 PASS AO=33;DP=278;FAO=62;FDP=239;FR=.,HEALED;FRO=177;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=70;FSRR=107;FWDB=-0.000922886;FXX=0.020491;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.828;QD=1.85186;RBI=0.0231937;REFB=-0.0139668;REVB=0.0231754;RO=98;SAF=0;SAR=33;SRF=1;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.710642;STB=0.518255;TYPE=snp;VARB=0.0669889;OID=.;OPOS=56468493;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:239:98:177:33:62:33:0:1:97:36:26:70:107 chr11 56468554 . A C 32.14 PASS AO=55;DP=315;FAO=53;FDP=314;FR=.;FRO=261;FSAF=15;FSAR=38;FSRF=114;FSRR=147;FWDB=-0.0339772;FXX=0.00632891;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5314;QD=0.409398;RBI=0.0378438;REFB=-0.0040991;REVB=-0.0166645;RO=246;SAF=16;SAR=39;SRF=103;SRR=143;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179354;STB=0.638476;TYPE=snp;VARB=0.0333945;OID=.;OPOS=56468554;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:315:314:246:261:55:53:39:16:103:143:38:15:114:147 chr11 56468560 . T C 61.37 PASS AO=70;DP=311;FAO=60;FDP=305;FR=.;FRO=245;FSAF=22;FSAR=38;FSRF=100;FSRR=145;FWDB=0.00398182;FXX=0.031745;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.485;QD=0.804826;RBI=0.0141941;REFB=-0.0102032;REVB=0.0136241;RO=241;SAF=31;SAR=39;SRF=99;SRR=142;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.041794;STB=0.535199;TYPE=snp;VARB=0.0558517;OID=.;OPOS=56468560;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:311:305:241:245:70:60:39:31:99:142:38:22:100:145 chr11 56468561 . A G 83.34 PASS AO=71;DP=313;FAO=69;FDP=314;FR=.;FRO=245;FSAF=29;FSAR=40;FSRF=100;FSRR=145;FWDB=0.0283169;FXX=0.0031745;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.0773;QD=1.06165;RBI=0.0359088;REFB=-0.000541247;REVB=-0.0220816;RO=237;SAF=31;SAR=40;SRF=99;SRR=138;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0245653;STB=0.509736;TYPE=snp;VARB=0.0040953;OID=.;OPOS=56468561;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:313:314:237:245:71:69:40:31:99:138:40:29:100:145 chr11 56468637 . C T 203.72 PASS AO=104;DP=359;FAO=103;FDP=359;FR=.;FRO=256;FSAF=41;FSAR=62;FSRF=100;FSRR=156;FWDB=-0.0262804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.566;QD=2.2698;RBI=0.0263588;REFB=-0.0248752;REVB=0.00203196;RO=254;SAF=42;SAR=62;SRF=99;SRR=155;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0179035;STB=0.505542;TYPE=snp;VARB=0.044856;OID=.;OPOS=56468637;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:359:359:254:256:104:103:62:42:99:155:62:41:100:156 chr11 56468646 . C T 194.55 PASS AO=101;DP=346;FAO=98;FDP=343;FR=.;FRO=245;FSAF=38;FSAR=60;FSRF=88;FSRR=157;FWDB=-0.00783992;FXX=0.00290689;HRUN=4;LEN=1;MLLD=197.568;QD=2.26879;RBI=0.0119003;REFB=0.00259443;REVB=0.00895277;RO=239;SAF=41;SAR=60;SRF=86;SRR=153;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0587552;STB=0.521696;TYPE=snp;VARB=-0.00712044;OID=.;OPOS=56468646;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:346:343:239:245:101:98:60:41:86:153:60:38:88:157 chr11 56468694 . C T 166.95 PASS AO=80;DP=264;FAO=78;FDP=262;FR=.;FRO=184;FSAF=26;FSAR=52;FSRF=56;FSRR=128;FWDB=-0.024518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.7309;QD=2.54884;RBI=0.0250203;REFB=-0.0138345;REVB=-0.00498822;RO=183;SAF=28;SAR=52;SRF=55;SRR=128;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.066991;STB=0.52325;TYPE=snp;VARB=0.0257441;OID=.;OPOS=56468694;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:264:262:183:184:80:78:52:28:55:128:52:26:56:128 chr11 56468699 . T A 161.78 PASS AO=76;DP=249;FAO=74;FDP=246;FR=.;FRO=172;FSAF=26;FSAR=48;FSRF=53;FSRR=119;FWDB=-0.0212495;FXX=0.00404842;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.525;QD=2.63053;RBI=0.022772;REFB=-0.0078347;REVB=-0.00818665;RO=170;SAF=28;SAR=48;SRF=51;SRR=119;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0906168;STB=0.5338;TYPE=snp;VARB=0.017844;OID=.;OPOS=56468699;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:249:246:170:172:76:74:48:28:51:119:48:26:53:119 chr11 56468704 . T C 135.04 PASS AO=68;DP=236;FAO=67;FDP=235;FR=.;FRO=168;FSAF=25;FSAR=42;FSRF=52;FSRR=116;FWDB=-0.00110949;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.3629;QD=2.29861;RBI=0.0128815;REFB=-0.0192375;REVB=-0.0128336;RO=167;SAF=27;SAR=41;SRF=52;SRR=115;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11239;STB=0.549819;TYPE=snp;VARB=0.0397791;OID=.;OPOS=56468704;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:236:235:167:168:68:67:41:27:52:115:42:25:52:116 chr11 56468720 . T C 136.51 PASS AO=62;DP=203;FAO=62;FDP=204;FR=.;FRO=142;FSAF=22;FSAR=40;FSRF=43;FSRR=99;FWDB=-0.0280277;FXX=0.00487781;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.689;QD=2.6767;RBI=0.0283758;REFB=-0.0100432;REVB=-0.0044311;RO=138;SAF=21;SAR=41;SRF=42;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0465534;STB=0.540461;TYPE=snp;VARB=0.0262158;OID=.;OPOS=56468720;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:204:138:142:62:62:41:21:42:96:40:22:43:99 chr11 56508525 . A G 244.37 PASS AO=60;DP=127;FAO=60;FDP=127;FR=.;FRO=67;FSAF=23;FSAR=37;FSRF=33;FSRR=34;FWDB=0.00308681;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.9214;QD=7.69669;RBI=0.0363636;REFB=-0.0118852;REVB=-0.0362324;RO=67;SAF=23;SAR=37;SRF=33;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106619;STB=0.559224;TYPE=snp;VARB=0.0191573;OID=.;OPOS=56508525;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:67:67:60:60:37:23:33:34:37:23:33:34 chr11 56510623 . A G 140.2 PASS AO=29;DP=53;FAO=29;FDP=54;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.0303092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.343;QD=10.3852;RBI=0.0449401;REFB=-0.00823429;REVB=0.0331808;RO=24;SAF=11;SAR=18;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0671088;STB=0.529391;TYPE=snp;VARB=0.00729158;OID=.;OPOS=56510623;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:54:24:25:29:29:18:11:11:13:18:11:11:14 chr11 56510672 . T C 304.3 PASS AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0136016;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=155.564;QD=34.777;RBI=0.0180707;REFB=0.0289021;REVB=-0.0118973;RO=1;SAF=14;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0322195;STB=0.517231;TYPE=snp;VARB=-0.000201616;OID=.;OPOS=56510672;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:35:35:1:1:34:34:20:14:1:0:20:14:1:0 chr11 56570012 . C T 186.82 PASS AO=42;DP=90;FAO=44;FDP=91;FR=.;FRO=47;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=14;FSRR=33;FWDB=0.052655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.23;QD=8.21201;RBI=0.0562072;REFB=-0.00390716;REVB=0.0196646;RO=46;SAF=18;SAR=24;SRF=14;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121711;STB=0.582786;TYPE=snp;VARB=0.00731753;OID=.;OPOS=56570012;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:91:46:47:42:44:24:18:14:32:24:20:14:33 chr11 56570095 . A T 148.85 PASS AO=50;DP=148;FAO=53;FDP=152;FR=.;FRO=99;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=26;FSRR=73;FWDB=0.00750849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.5706;QD=3.91719;RBI=0.0362023;REFB=0.00564526;REVB=0.0354151;RO=98;SAF=25;SAR=25;SRF=26;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.273529;STB=0.638708;TYPE=snp;VARB=-0.0126275;OID=.;OPOS=56570095;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:152:98:99:50:53:25:25:26:72:28:25:26:73 chr11 56570229 . G A 87.78 PASS AO=38;DP=126;FAO=38;FDP=127;FR=.;FRO=89;FSAF=12;FSAR=26;FSRF=20;FSRR=69;FWDB=-0.0242858;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.4845;QD=2.76486;RBI=0.0250239;REFB=0.00285707;REVB=0.0060328;RO=87;SAF=12;SAR=26;SRF=19;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14395;STB=0.578055;TYPE=snp;VARB=-0.00782668;OID=.;OPOS=56570229;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:126:127:87:89:38:38:26:12:19:68:26:12:20:69 chr11 56756664 . G A 435.46 PASS AO=107;DP=227;FAO=108;FDP=225;FR=.;FRO=117;FSAF=51;FSAR=57;FSRF=56;FSRR=61;FWDB=-0.0223167;FXX=0.0131573;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2624;QD=7.7416;RBI=0.0248576;REFB=-0.010043;REVB=-0.0109484;RO=116;SAF=50;SAR=57;SRF=55;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00648736;STB=0.503342;TYPE=snp;VARB=0.00938089;OID=.;OPOS=56756664;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:227:225:116:117:107:108:57:50:55:61:57:51:56:61 chr11 56956516 . G A 1819.42 PASS AO=189;DP=189;FAO=189;FDP=189;FR=.;FRO=0;FSAF=102;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.073039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.0158;QD=38.5061;RBI=0.0780601;REFB=0;REVB=-0.0275441;RO=0;SAF=102;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000350853;OID=.;OPOS=56956516;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:189:189:0:0:189:189:87:102:0:0:87:102:0:0 chr11 57004344 . G T 141.63 PASS AO=35;DP=80;FAO=36;FDP=81;FR=.;FRO=45;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=0.00407974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.268;QD=6.99426;RBI=0.0288053;REFB=-0.0172273;REVB=0.028515;RO=44;SAF=14;SAR=21;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122882;STB=0.569192;TYPE=snp;VARB=0.0231819;OID=.;OPOS=57004344;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:81:44:45:35:36:21:14:23:21:22:14:23:22 chr11 57004577 . C T 341.22 PASS AO=74;DP=140;FAO=74;FDP=140;FR=.;FRO=66;FSAF=25;FSAR=49;FSRF=11;FSRR=55;FWDB=-0.00430215;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.913;QD=9.749;RBI=0.0090213;REFB=-0.0373844;REVB=-0.00792941;RO=66;SAF=25;SAR=49;SRF=11;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176074;STB=0.59576;TYPE=snp;VARB=0.0572984;OID=.;OPOS=57004577;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:66:66:74:74:49:25:11:55:49:25:11:55 chr11 57077464 . T C 188.21 PASS AO=55;DP=140;FAO=56;FDP=140;FR=.;FRO=84;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=34;FSRR=50;FWDB=-0.0158058;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1724;QD=5.37755;RBI=0.0169594;REFB=0.0166547;REVB=-0.00614813;RO=85;SAF=24;SAR=31;SRF=35;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0269753;STB=0.525419;TYPE=snp;VARB=-0.0226584;OID=.;OPOS=57077464;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:85:84:55:56:31:24:35:50:31:25:34:50 chr11 57114092 . AG A 1146 PASS AO=161;DP=198;FAO=186;FDP=186;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.119161;FXX=0.0558347;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.3666;QD=24.6452;RBI=0.120284;REFB=-0.00217225;REVB=0.016398;RO=13;SAF=64;SAR=97;SRF=3;SRR=10;SSEN=0.365741;SSEP=0;SSSB=0.0248114;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00453534;OID=.;OPOS=57114093;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:161:194:186:186:0:71:115:0:0:88:13:64:97:3:10 chr11 57137371 . G A 101.73 PASS AO=31;DP=82;FAO=31;FDP=82;FR=.;FRO=51;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=32;FWDB=-0.00703223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.214;QD=4.96253;RBI=0.0177979;REFB=-0.0179618;REVB=0.0163497;RO=50;SAF=13;SAR=18;SRF=19;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0439849;STB=0.53016;TYPE=snp;VARB=0.0350028;OID=.;OPOS=57137371;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:50:51:31:31:18:13:19:31:18:13:19:32 chr11 57137424 . C T 69.99 PASS AO=26;DP=82;FAO=26;FDP=82;FR=.;FRO=56;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=38;FWDB=0.0774936;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.4633;QD=3.41402;RBI=0.0784661;REFB=-0.0171688;REVB=0.0123156;RO=52;SAF=8;SAR=18;SRF=18;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0502461;STB=0.510909;TYPE=snp;VARB=0.021309;OID=.;OPOS=57137424;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:82:82:52:56:26:26:18:8:18:34:18:8:18:38 chr11 57147016 . A G 2099.97 PASS AO=222;DP=224;FAO=221;FDP=221;FR=.;FRO=0;FSAF=130;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00428921;FXX=0.0133923;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.383;QD=38.0085;RBI=0.0189907;REFB=-0.0129491;REVB=-0.0185;RO=1;SAF=130;SAR=92;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00365137;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.86877e-06;OID=.;OPOS=57147016;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:91:224:221:1:0:222:221:92:130:1:0:91:130:0:0 chr11 57148175 . A G 1816.77 PASS AO=189;DP=191;FAO=190;FDP=190;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207857;FXX=0.0104161;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.997;QD=38.2478;RBI=0.0238112;REFB=0;REVB=0.0116158;RO=0;SAF=104;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.14424e-05;OID=.;OPOS=57148175;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:191:190:0:0:189:190:85:104:0:0:85:105:0:0 chr11 57155001 . G A 2741.1 PASS AO=295;DP=304;FAO=295;FDP=295;FR=.;FRO=0;FSAF=125;FSAR=170;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180131;FXX=0.0296043;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.858;QD=37.1675;RBI=0.040294;REFB=-0.0387611;REVB=0.0360435;RO=2;SAF=125;SAR=170;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00756867;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00048938;OID=.;OPOS=57155001;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:91:304:295:2:0:295:295:170:125:2:0:170:125:0:0 chr11 57155288 . T C 1959.39 PASS AO=205;DP=207;FAO=206;FDP=206;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=121;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0228614;FXX=0.00483068;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.012;QD=38.0465;RBI=0.0528662;REFB=-0.0124914;REVB=0.0476676;RO=1;SAF=85;SAR=120;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00395316;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.55009e-05;OID=.;OPOS=57155288;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:207:206:1:0:205:206:120:85:0:1:121:85:0:0 chr11 57157405 . A G 175.51 PASS AO=42;DP=90;FAO=43;FDP=90;FR=.;FRO=47;FSAF=12;FSAR=31;FSRF=28;FSRR=19;FWDB=0.0336149;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.3231;QD=7.80055;RBI=0.0349255;REFB=0.00797238;REVB=0.00947767;RO=39;SAF=12;SAR=30;SRF=24;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.300066;STB=0.673829;TYPE=snp;VARB=-0.00729792;OID=.;OPOS=57157405;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:39:47:42:43:30:12:24:15:31:12:28:19 chr11 57311197 . GC G 190.37 PASS AO=24;DP=44;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.293662;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=10.8619;QD=18.5728;RBI=0.348819;REFB=-0.0810328;REVB=0.188248;RO=9;SAF=7;SAR=17;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0.28169;SSSB=-0.0248051;STB=0.508768;TYPE=del;VARB=0.0459059;OID=.;OPOS=57311198;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:24:40:40:41:1:12:28:0:1:11:9:7:17:3:6 chr11 57313469 . C G 1294.45 PASS AO=173;DP=196;FAO=169;FDP=195;FR=.;FRO=26;FSAF=58;FSAR=111;FSRF=3;FSRR=23;FWDB=0.101019;FXX=0.00510178;HRUN=4;LEN=1;MLLD=42.7316;QD=26.5528;RBI=0.101596;REFB=-0.101136;REVB=0.0108129;RO=22;SAF=58;SAR=115;SRF=3;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0485296;STB=0.534411;TYPE=snp;VARB=0.029011;OID=.;OPOS=57313469;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:196:195:22:26:173:169:115:58:3:19:111:58:3:23 chr11 57353983 . T G 543.47 PASS AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0280942;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=210.074;QD=38.138;RBI=0.0294024;REFB=0;REVB=0.00867298;RO=0;SAF=27;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.23279e-05;OID=.;OPOS=57353983;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:57:57:0:0:57:57:30:27:0:0:30:27:0:0 chr11 57382033 . AG A 11.84 PASS AO=3;DP=9;FAO=3;FDP=9;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.0376043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.1883;QD=5.26259;RBI=0.0450035;REFB=-0.00656236;REVB=0.0247231;RO=5;SAF=1;SAR=2;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.462295;STB=0.798912;TYPE=del;VARB=0.145553;OID=.;OPOS=57382034;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:3:9:3:9:6:1:2:0:6:11:5:1:2:0:5 chr11 57463500 . T C 288.94 PASS AO=74;DP=168;FAO=76;FDP=170;FR=.;FRO=94;FSAF=12;FSAR=64;FSRF=28;FSRR=66;FWDB=-0.0156449;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.3633;QD=6.79861;RBI=0.0423278;REFB=0.0109507;REVB=0.0393304;RO=94;SAF=12;SAR=62;SRF=28;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208329;STB=0.621323;TYPE=snp;VARB=-0.0137422;OID=.;OPOS=57463500;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:170:94:94:74:76:62:12:28:66:64:12:28:66 chr11 57467817 . A AT 22.45 PASS AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.0711474;FXX=0.039984;HRUN=8;LEN=1;MLLD=8.48715;QD=3.74175;RBI=0.0926481;REFB=-0.0915884;REVB=0.059344;RO=16;SAF=2;SAR=10;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0354515;STB=0.568059;TYPE=ins;VARB=0.142865;OID=.;OPOS=57467818;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:12:29:12:24:12:2:10:3:9:21:16:2:10:3:13 chr11 57468129 . T C 635.67 PASS AO=168;DP=369;FAO=168;FDP=369;FR=.;FRO=201;FSAF=63;FSAR=105;FSRF=90;FSRR=111;FWDB=0.0299482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.9708;QD=6.89077;RBI=0.0299486;REFB=-0.0280607;REVB=-0.000155129;RO=199;SAF=63;SAR=105;SRF=89;SRR=110;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.074029;STB=0.541396;TYPE=snp;VARB=0.00946305;OID=.;OPOS=57468129;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:369:369:199:201:168:168:105:63:89:110:105:63:90:111 chr11 57509429 . A G 116.19 PASS AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0228992;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.071;QD=35.7501;RBI=0.0269338;REFB=0;REVB=0.0141794;RO=0;SAF=11;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000322618;OID=.;OPOS=57509429;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:13:0:0:13:13:2:11:0:0:2:11:0:0 chr11 57509618 . GGGC G,GG 493.65 PASS AO=65,60;DP=247;FAO=0,147;FDP=245;FR=.;FRO=98;FSAF=0,58;FSAR=0,89;FSRF=92;FSRR=6;FWDB=0.0177254,-0.0170648;FXX=0.0466908;HRUN=4,4;LEN=3,2;MLLD=25.3341,22.8723;QD=8.05952;RBI=0.321342,0.372279;REFB=-0.035942,-0.0404374;REVB=-0.320853,-0.371888;RO=84;SAF=4,47;SAR=61,13;SRF=79;SRR=5;SSEN=0.514563,0.514563;SSEP=0,0;SSSB=-0.815458,-0.291617;STB=0.5,0.707822;TYPE=del,del;VARB=-0.0235501,0.0327397;OID=.,.;OPOS=57509619,57509620;OREF=GGC,GC;OALT=-,-;OMAPALT=G,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:65,60:241:0,147:245:98:0,58:0,89:92:6:99:84:4,47:61,13:79:5 chr11 57563991 . C T 503.78 PASS AO=103;DP=184;FAO=104;FDP=184;FR=.;FRO=80;FSAF=58;FSAR=46;FSRF=33;FSRR=47;FWDB=0.0116142;FXX=0.0107521;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.818;QD=10.9516;RBI=0.0216215;REFB=0.00850293;REVB=-0.0182373;RO=79;SAF=58;SAR=45;SRF=32;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125916;STB=0.563036;TYPE=snp;VARB=-0.00517567;OID=.;OPOS=57563991;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:184:79:80:103:104:45:58:32:47:46:58:33:47 chr11 57571232 . C T 1538.36 PASS AO=161;DP=161;FAO=161;FDP=161;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00324213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.787;QD=38.2201;RBI=0.025912;REFB=0;REVB=-0.0257083;RO=0;SAF=51;SAR=110;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.82775e-05;OID=.;OPOS=57571232;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:161:161:0:0:161:161:110:51:0:0:110:51:0:0 chr11 57798723 . A G 436.06 PASS AO=95;DP=181;FAO=96;FDP=182;FR=.;FRO=86;FSAF=39;FSAR=57;FSRF=32;FSRR=54;FWDB=0.0128693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.818;QD=9.5837;RBI=0.0254051;REFB=-0.0135138;REVB=-0.0219043;RO=85;SAF=39;SAR=56;SRF=31;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0412027;STB=0.51683;TYPE=snp;VARB=0.017561;OID=.;OPOS=57798723;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:182:85:86:95:96:56:39:31:54:57:39:32:54 chr11 57798942 . A G 160.5 PASS AO=47;DP=119;FAO=47;FDP=116;FR=.;FRO=69;FSAF=1;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=69;FWDB=0.088481;FXX=0.025208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.58;QD=5.53457;RBI=0.0907247;REFB=-0.0221118;REVB=-0.0200521;RO=69;SAF=1;SAR=46;SRF=0;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.398685;STB=0.714232;TYPE=snp;VARB=0.0306184;OID=.;OPOS=57798942;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:116:69:69:47:47:46:1:0:69:46:1:0:69 chr11 57799108 . AC A 250.8 PASS AO=66;DP=156;FAO=67;FDP=151;FR=.;FRO=84;FSAF=12;FSAR=55;FSRF=28;FSRR=56;FWDB=-0.032478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.547;QD=6.64362;RBI=0.0487977;REFB=-0.0221765;REVB=-0.0364197;RO=83;SAF=12;SAR=54;SRF=28;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217783;STB=0.622836;TYPE=del;VARB=0.0282835;OID=.;OPOS=57799109;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:66:151:67:151:84:12:55:28:56:99:83:12:54:28:55 chr11 57799371 . G C 144.77 PASS AO=36;DP=82;FAO=37;FDP=83;FR=.;FRO=46;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=0.0206943;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=181.929;QD=6.97693;RBI=0.0299627;REFB=-0.0118242;REVB=-0.0216681;RO=45;SAF=21;SAR=15;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0723342;STB=0.553247;TYPE=snp;VARB=0.0240359;OID=.;OPOS=57799371;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:83:45:46:36:37:15:21:23:22:15:22:23:23 chr11 57947264 . C G 134.86 PASS AO=34;DP=95;FAO=36;FDP=86;FR=.,HEALED;FRO=50;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=-0.0550068;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.008;QD=6.27236;RBI=0.0594683;REFB=-0.03816;REVB=-0.0225994;RO=30;SAF=15;SAR=19;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0644816;STB=0.518821;TYPE=snp;VARB=0.0528268;OID=.;OPOS=57947264;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:86:30:50:34:36:19:15:11:19:19:17:22:28 chr11 57948952 . G A 618.58 PASS AO=62;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134008;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.886;QD=38.0665;RBI=0.0153271;REFB=0;REVB=0.00743904;RO=0;SAF=24;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.45961e-05;OID=.;OPOS=57948952;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:65:65:0:0:62:65:38:24:0:0:38:27:0:0 chr11 57949021 . T C 42.81 PASS AO=13;DP=38;FAO=13;FDP=38;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=18;FWDB=0.01094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.231;QD=4.50605;RBI=0.011046;REFB=-0.00133065;REVB=0.00152666;RO=25;SAF=7;SAR=6;SRF=7;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.283311;STB=0.666433;TYPE=snp;VARB=0.00276724;OID=.;OPOS=57949021;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:38:38:25:25:13:13:6:7:7:18:6:7:7:18 chr11 57958775 . C T 1336 PASS AO=141;DP=142;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189779;FXX=0.00699252;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.223;QD=37.6339;RBI=0.0281645;REFB=-0.0772327;REVB=0.0208105;RO=1;SAF=79;SAR=62;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00760739;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.77969e-05;OID=.;OPOS=57958775;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:142:142:1:0:141:142:62:79:0:1:63:79:0:0 chr11 57958972 . C A 829.83 PASS AO=86;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00378392;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.7902;QD=38.1531;RBI=0.0352644;REFB=0;REVB=-0.0350608;RO=1;SAF=35;SAR=51;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133435;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00028426;OID=.;OPOS=57958972;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:87:87:1:0:86:87:51:35:1:0:51:36:0:0 chr11 57971195 . G A 1471.88 PASS AO=145;DP=147;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.045956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.877;QD=37.9839;RBI=0.073381;REFB=0;REVB=0.0572085;RO=0;SAF=68;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.02491e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000128773;OID=.;OPOS=57971195;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:147:155:0:0:145:155:77:68:0:0:78:77:0:0 chr11 57971201 . G A 1400.67 PASS AO=154;DP=160;FAO=154;FDP=159;FR=.;FRO=5;FSAF=78;FSAR=76;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.0340765;FXX=0.00624961;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.256;QD=35.2371;RBI=0.0419345;REFB=-0.0195864;REVB=-0.0244395;RO=4;SAF=78;SAR=76;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0237667;STB=0.515526;TYPE=snp;VARB=-0.000108283;OID=.;OPOS=57971201;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:160:159:4:5:154:154:76:78:4:0:76:78:5:0 chr11 57982229 . A G 1456.81 PASS AO=167;DP=168;FAO=160;FDP=160;FR=.;FRO=0;FSAF=117;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0228768;FXX=0.0697634;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.387;QD=36.4202;RBI=0.0329739;REFB=0;REVB=0.0237472;RO=0;SAF=128;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00550985;OID=.;OPOS=57982229;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:168:160:0:0:167:160:39:128:0:0:43:117:0:0 chr11 57982584 . T C 2219.51 PASS AO=233;DP=236;FAO=234;FDP=234;FR=.;FRO=0;FSAF=107;FSAR=127;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288439;FXX=0.00847422;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.7261;QD=37.9403;RBI=0.0290091;REFB=0;REVB=-0.00309172;RO=0;SAF=107;SAR=126;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.14463e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.69105e-05;OID=.;OPOS=57982584;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:236:234:0:0:233:234:126:107:0:0:127:107:0:0 chr11 57982620 . A G 1773.31 PASS AO=184;DP=184;FAO=185;FDP=185;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0449451;FXX=0.031412;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.557;QD=38.3418;RBI=0.0465819;REFB=0;REVB=-0.0122398;RO=0;SAF=84;SAR=100;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.03415e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.43981e-05;OID=.;OPOS=57982620;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:184:185:0:0:184:185:100:84:0:0:100:85:0:0 chr11 57982726 . G T 893.11 PASS AO=93;DP=93;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0286271;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.907;QD=38.0048;RBI=0.0297214;REFB=0;REVB=0.00799061;RO=0;SAF=61;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.35236e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.88822e-05;OID=.;OPOS=57982726;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:93:94:0:0:93:94:32:61:0:0:32:62:0:0 chr11 57982763 . A G 462.99 PASS AO=50;DP=53;FAO=53;FDP=56;FR=.;FRO=3;FSAF=42;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0475353;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.3945;QD=33.0704;RBI=0.0494736;REFB=-0.149547;REVB=0.0137125;RO=2;SAF=40;SAR=10;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.02296;STB=0.510118;TYPE=snp;VARB=0.00866912;OID=.;OPOS=57982763;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:53:56:2:3:50:53:10:40:2:0:11:42:2:1 chr11 57982832 . T A 752.78 PASS AO=79;DP=81;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0729933;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.3916;QD=36.7209;RBI=0.153151;REFB=-0.0426416;REVB=0.134637;RO=1;SAF=61;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0255682;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00235739;OID=.;OPOS=57982832;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:81:82:1:0:79:82:18:61:0:1:20:62:0:0 chr11 57982896 . G T 1188.25 PASS AO=127;DP=130;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189065;FXX=0.022899;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.466;QD=37.133;RBI=0.0279727;REFB=-0.052021;REVB=0.0206159;RO=2;SAF=100;SAR=27;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125433;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.00529e-05;OID=.;OPOS=57982896;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:130:128:2:0:127:128:27:100:1:1:27:101:0:0 chr11 57983194 . A G 916.49 PASS AO=94;DP=94;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0817305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.763;QD=38.187;RBI=0.0830189;REFB=0;REVB=-0.0145696;RO=0;SAF=15;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.10018e-05;OID=.;OPOS=57983194;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:94:96:0:0:94:96:79:15:0:0:79:17:0:0 chr11 57996312 . C G 1351.06 PASS AO=141;DP=141;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0505579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.876;QD=37.5295;RBI=0.0536026;REFB=0;REVB=-0.0178085;RO=0;SAF=54;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.48387e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.69271e-05;OID=.;OPOS=57996312;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:141:144:0:0:141:144:87:54:0:0:87:57:0:0 chr11 58034543 . C T 1245.24 PASS AO=133;DP=138;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00196968;FXX=0.0289834;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.711;QD=37.1715;RBI=0.00277649;REFB=0.00728908;REVB=0.00195685;RO=2;SAF=73;SAR=60;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0155781;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.73071e-05;OID=.;OPOS=58034543;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:138:134:2:0:133:134:60:73:0:2:60:74:0:0 chr11 58123152 . T C 1751.38 PASS AO=187;DP=190;FAO=187;FDP=190;FR=.;FRO=3;FSAF=72;FSAR=115;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0057066;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.033;QD=36.8711;RBI=0.0271265;REFB=-0.0603964;REVB=0.0265194;RO=3;SAF=72;SAR=115;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00164126;STB=0.500862;TYPE=snp;VARB=0.00107741;OID=.;OPOS=58123152;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:190:190:3:3:187:187:115:72:1:2:115:72:1:2 chr11 58125620 . T C 1367.46 PASS AO=141;DP=149;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00618628;FXX=0.0533298;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.21;QD=38.5201;RBI=0.0174487;REFB=0;REVB=-0.0163152;RO=0;SAF=93;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.71891e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.49852e-05;OID=.;OPOS=58125620;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:149:142:0:0:141:142:48:93:0:0:49:93:0:0 chr11 58126305 . A T 626.19 PASS AO=77;DP=86;FAO=77;FDP=86;FR=.;FRO=9;FSAF=57;FSAR=20;FSRF=9;FSRR=0;FWDB=0.000780093;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=282.067;QD=29.125;RBI=0.00508246;REFB=0.012785;REVB=-0.00502224;RO=9;SAF=57;SAR=20;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.069102;STB=0.536576;TYPE=snp;VARB=-0.00101806;OID=.;OPOS=58126305;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:86:86:9:9:77:77:20:57:9:0:20:57:9:0 chr11 58170792 . AG A 103.47 PASS AO=35;DP=82;FAO=42;FDP=80;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=-0.0227734;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=13.8171;QD=5.17331;RBI=0.104263;REFB=-0.0483581;REVB=0.101745;RO=34;SAF=11;SAR=24;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0.769231;SSSB=-0.201808;STB=0.570879;TYPE=del;VARB=0.0904821;OID=.;OPOS=58170793;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:35:79:42:80:38:17:25:21:17:74:34:11:24:18:16 chr11 58207204 . A G 1933.32 PASS AO=205;DP=208;FAO=207;FDP=207;FR=.;FRO=0;FSAF=114;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0285259;FXX=0.00480746;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.434;QD=37.3588;RBI=0.0298323;REFB=-0.00774019;REVB=0.0087317;RO=1;SAF=114;SAR=91;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00416029;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.34336e-05;OID=.;OPOS=58207204;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:208:207:1:0:205:207:91:114:1:0:93:114:0:0 chr11 58318619 . C G 1133.27 PASS AO=117;DP=117;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00982275;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.832;QD=38.4159;RBI=0.0310018;REFB=0;REVB=-0.0294045;RO=0;SAF=71;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.21453e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.55063e-05;OID=.;OPOS=58318619;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:117:118:0:0:117:118:46:71:0:0:47:71:0:0 chr11 58478084 . T C 2895.04 PASS AO=319;DP=337;FAO=325;FDP=337;FR=.;FRO=12;FSAF=195;FSAR=130;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.00954145;FXX=0.00589953;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.8555;QD=34.3625;RBI=0.0666819;REFB=-0.0590858;REVB=0.0659957;RO=11;SAF=190;SAR=129;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00330439;STB=0.500618;TYPE=snp;VARB=0.00264791;OID=.;OPOS=58478084;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:337:337:11:12:319:325:129:190:6:5:130:195:7:5 chr11 58491921 . A T 142.92 PASS AO=35;DP=82;FAO=37;FDP=84;FR=.;FRO=47;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=6;FSRR=41;FWDB=0.0500951;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.621;QD=6.80591;RBI=0.0558659;REFB=-0.0189037;REVB=0.0247281;RO=47;SAF=17;SAR=18;SRF=6;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.375848;STB=0.713463;TYPE=snp;VARB=0.0168824;OID=.;OPOS=58491921;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:84:47:47:35:37:18:17:6:41:18:19:6:41 chr11 58602309 . C T 129.43 PASS AO=46;DP=135;FAO=47;FDP=138;FR=.;FRO=91;FSAF=14;FSAR=33;FSRF=43;FSRR=48;FWDB=0.0252349;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.9922;QD=3.75166;RBI=0.0958293;REFB=-0.00216168;REVB=0.092447;RO=89;SAF=14;SAR=32;SRF=41;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19201;STB=0.623826;TYPE=snp;VARB=0.00679144;OID=.;OPOS=58602309;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:138:89:91:46:47:32:14:41:48:33:14:43:48 chr11 58894067 . A G 125.99 PASS AO=25;DP=45;FAO=25;FDP=45;FR=.;FRO=20;FSAF=20;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=1;FWDB=-0.00202622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.4143;QD=11.199;RBI=0.0437254;REFB=-0.0233414;REVB=0.0436784;RO=20;SAF=20;SAR=5;SRF=19;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217685;STB=0.618969;TYPE=snp;VARB=0.0163464;OID=.;OPOS=58894067;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:45:45:20:20:25:25:5:20:19:1:5:20:19:1 chr11 58894253 . T C 400.92 PASS AO=88;DP=167;FAO=88;FDP=167;FR=.;FRO=79;FSAF=37;FSAR=51;FSRF=33;FSRR=46;FWDB=0.0109747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.5459;QD=9.60297;RBI=0.0288135;REFB=-0.0284448;REVB=0.0266416;RO=77;SAF=37;SAR=51;SRF=31;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0156696;STB=0.501327;TYPE=snp;VARB=0.0256936;OID=.;OPOS=58894253;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:167:77:79:88:88:51:37:31:46:51:37:33:46 chr11 58919813 . A G 108.86 PASS AO=32;DP=82;FAO=32;FDP=82;FR=.;FRO=50;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=38;FWDB=-0.00271595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.759;QD=5.31033;RBI=0.0133842;REFB=-0.00914152;REVB=0.0131058;RO=49;SAF=14;SAR=18;SRF=12;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216249;STB=0.626126;TYPE=snp;VARB=0.0133939;OID=.;OPOS=58919813;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:49:50:32:32:18:14:12:37:18:14:12:38 chr11 58973982 . GTA G 930.46 PASS AO=76;DP=305;FAO=105;FDP=107;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0822609;FXX=0.157468;HRUN=1;LEN=2;MLLD=163.157;QD=34.7837;RBI=0.0922542;REFB=-0.0429049;REVB=0.041761;RO=3;SAF=18;SAR=58;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00952818;STB=0.506096;TYPE=del;VARB=0.000912255;OID=.;OPOS=58973983;OREF=TA;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:76:114:105:107:2:24:81:0:2:32:3:18:58:1:2 chr11 58978684 . G A 45.67 PASS AO=17;DP=55;FAO=17;FDP=56;FR=.;FRO=39;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=27;FWDB=0.00273163;FXX=0.0175408;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.888;QD=3.26201;RBI=0.00773304;REFB=-0.00875115;REVB=-0.00723451;RO=36;SAF=11;SAR=6;SRF=12;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.34812;STB=0.724308;TYPE=snp;VARB=0.0168963;OID=.;OPOS=58978684;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:55:56:36:39:17:17:6:11:12:24:6:11:12:27 chr11 58982071 . C T 1001.09 PASS AO=103;DP=103;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00220569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.075;QD=38.1368;RBI=0.0271401;REFB=0;REVB=-0.0270504;RO=0;SAF=62;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.43649e-05;OID=.;OPOS=58982071;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:103:105:0:0:103:105:41:62:0:0:42:63:0:0 chr11 59058590 . C G 327.07 PASS AO=81;DP=175;FAO=82;FDP=175;FR=.;FRO=93;FSAF=41;FSAR=41;FSRF=45;FSRR=48;FWDB=-0.00948642;FXX=0.0056815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.179;QD=7.4758;RBI=0.0218102;REFB=-0.00838621;REVB=0.019639;RO=94;SAF=41;SAR=40;SRF=46;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0162941;STB=0.508569;TYPE=snp;VARB=0.008266;OID=.;OPOS=59058590;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:175:94:93:81:82:40:41:46:48:41:41:45:48 chr11 59058748 . TC T 54.3 PASS AO=9;DP=22;FAO=12;FDP=16;FR=.;FRO=4;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0149078;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=13.8198;QD=13.5746;RBI=0.282033;REFB=-0.051702;REVB=0.281638;RO=4;SAF=7;SAR=2;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.321495;STB=0.642601;TYPE=del;VARB=0.103513;OID=.;OPOS=59058749;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:9:16:12:16:4:9:3:1:3:6:4:7:2:1:3 chr11 59132798 . G C 1332.56 PASS AO=137;DP=138;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0414783;FXX=0.0142847;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.0587;QD=38.625;RBI=0.0749728;REFB=0;REVB=0.0624537;RO=0;SAF=40;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000328239;OID=.;OPOS=59132798;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:138:138:0:0:137:138:97:40:0:0:98:40:0:0 chr11 59132882 . A G 760.76 PASS AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0561964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.993;QD=38.5195;RBI=0.0569449;REFB=0;REVB=0.00920234;RO=0;SAF=14;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.71677e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.43529e-05;OID=.;OPOS=59132882;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:79:79:0:0:79:79:65:14:0:0:65:14:0:0 chr11 59211188 . G A 1236.94 PASS AO=130;DP=131;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0559673;FXX=0.00751823;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.9443;QD=37.4832;RBI=0.0566981;REFB=0;REVB=-0.00907393;RO=0;SAF=41;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000275314;OID=.;OPOS=59211188;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:131:132:0:0:130:132:89:41:0:0:90:42:0:0 chr11 59211265 . T C 985.61 PASS AO=106;DP=107;FAO=107;FDP=110;FR=.;FRO=3;FSAF=39;FSAR=68;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0773447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.696;QD=35.8402;RBI=0.0784041;REFB=-0.0809448;REVB=0.0128454;RO=1;SAF=41;SAR=65;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114343;STB=0.518515;TYPE=snp;VARB=0.00137097;OID=.;OPOS=59211265;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:107:110:1:3:106:107:65:41:1:0:68:39:3:0 chr11 59224720 . A G 3634.71 PASS AO=375;DP=377;FAO=381;FDP=381;FR=.;FRO=0;FSAF=206;FSAR=175;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0744353;FXX=0.00261773;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.778;QD=38.1597;RBI=0.0771184;REFB=0;REVB=-0.0201651;RO=0;SAF=202;SAR=173;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.11806e-05;OID=.;OPOS=59224720;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:377:381:0:0:375:381:173:202:0:0:175:206:0:0 chr11 59323951 . G A 2392.62 PASS AO=252;DP=256;FAO=262;FDP=262;FR=.;FRO=0;FSAF=177;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0166658;FXX=0.0296285;HRUN=4;LEN=1;MLLD=167.391;QD=36.5285;RBI=0.0321622;REFB=0.00806853;REVB=-0.0275074;RO=4;SAF=176;SAR=76;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00699127;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.65034e-05;OID=.;OPOS=59323951;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:256:262:4:0:252:262:76:176:2:2:85:177:0:0 chr11 59480951 . T C 844.53 PASS AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000938964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.803;QD=38.3878;RBI=0.00164456;REFB=0;REVB=-0.00135015;RO=0;SAF=63;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.20775e-07;OID=.;OPOS=59480951;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:88:88:0:0:88:88:25:63:0:0:25:63:0:0 chr11 59481280 . GA G 21.55 PASS AO=12;DP=40;FAO=13;FDP=36;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=17;FWDB=0.138549;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=9.64092;QD=2.39393;RBI=0.144235;REFB=-0.0565716;REVB=0.040099;RO=20;SAF=5;SAR=7;SRF=4;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.251285;STB=0.58673;TYPE=del;VARB=0.117383;OID=.;OPOS=59481281;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:12:35:13:36:23:5:8:6:17:21:20:5:7:4:16 chr11 59623433 . G A 209.31 PASS AO=50;DP=116;FAO=55;FDP=124;FR=.;FRO=69;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=19;FSRR=50;FWDB=-0.00517607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.398;QD=6.75193;RBI=0.00904111;REFB=-0.0154632;REVB=0.00741283;RO=64;SAF=23;SAR=27;SRF=18;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184468;STB=0.602375;TYPE=snp;VARB=0.0235952;OID=.;OPOS=59623433;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:124:64:69:50:55:27:23:18:46:30:25:19:50 chr11 59631535 . C T 627.68 PASS AO=169;DP=376;FAO=169;FDP=376;FR=.;FRO=207;FSAF=48;FSAR=121;FSRF=81;FSRR=126;FWDB=-0.0183495;FXX=0.00265245;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.0818;QD=6.67748;RBI=0.0325398;REFB=-0.00504304;REVB=0.0268726;RO=206;SAF=48;SAR=121;SRF=81;SRR=125;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124864;STB=0.568315;TYPE=snp;VARB=0.00636527;OID=.;OPOS=59631535;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:376:376:206:207:169:169:121:48:81:125:121:48:81:126 chr11 59831716 . C A 1214.48 PASS AO=133;DP=138;FAO=133;FDP=137;FR=.;FRO=4;FSAF=66;FSAR=67;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.00635203;FXX=0.00724585;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.733;QD=35.4592;RBI=0.0270865;REFB=0.00127681;REVB=0.0263312;RO=2;SAF=66;SAR=67;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000105913;STB=0.507408;TYPE=snp;VARB=3.4853e-05;OID=.;OPOS=59831716;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:138:137:2:4:133:133:67:66:1:1:67:66:3:1 chr11 59837097 . C T 1836.3 PASS AO=192;DP=194;FAO=192;FDP=192;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=121;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0362764;FXX=0.0103087;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.211;QD=38.2562;RBI=0.0364965;REFB=0;REVB=0.00400253;RO=0;SAF=71;SAR=121;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000124755;OID=.;OPOS=59837097;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:87:194:192:0:0:192:192:121:71:0:0:121:71:0:0 chr11 59837721 . T TTATGAAAA 948.82 PASS AO=87;DP=144;FAO=107;FDP=111;FR=.;FRO=4;FSAF=43;FSAR=64;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0475408;FXX=0.0430997;HRUN=2;LEN=8;MLLD=305.453;QD=34.1915;RBI=0.0487873;REFB=-0.0575047;REVB=0.0109576;RO=41;SAF=31;SAR=56;SRF=30;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226313;STB=0.522218;TYPE=ins;VARB=0.00127783;OID=.;OPOS=59837722;OREF=-;OALT=TATGAAAA;OMAPALT=TTATGAAAA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:87:144:107:111:4:43:64:4:0:22:41:31:56:30:11 chr11 59945745 . T C 890.54 PASS AO=101;DP=110;FAO=101;FDP=107;FR=.;FRO=6;FSAF=45;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.00273971;FXX=0.0272702;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.804;QD=33.2912;RBI=0.00865622;REFB=-0.123128;REVB=0.00821122;RO=0;SAF=45;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.15371e-08;STB=0.525419;TYPE=snp;VARB=0.00131921;OID=.;OPOS=59945745;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:110:107:0:6:101:101:56:45:0:0:56:45:0:6 chr11 59946302 . C T 549.95 PASS AO=57;DP=60;FAO=63;FDP=66;FR=.;FRO=3;FSAF=24;FSAR=39;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.00665486;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.308;QD=33.3301;RBI=0.0132792;REFB=0.0457394;REVB=0.0114913;RO=3;SAF=22;SAR=35;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0600707;STB=0.529402;TYPE=snp;VARB=-0.0018551;OID=.;OPOS=59946302;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:60:66:3:3:57:63:35:22:3:0:39:24:3:0 chr11 60070176 . A G 297.68 PASS AO=72;DP=160;FAO=76;FDP=164;FR=.;FRO=88;FSAF=40;FSAR=36;FSRF=37;FSRR=51;FWDB=0.0206955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.814;QD=7.26048;RBI=0.0211407;REFB=-0.0173355;REVB=0.00431569;RO=87;SAF=40;SAR=32;SRF=37;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127842;STB=0.556607;TYPE=snp;VARB=0.0271912;OID=.;OPOS=60070176;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:164:87:88:72:76:32:40:37:50:36:40:37:51 chr11 60073597 . C T 2246.83 PASS AO=249;DP=258;FAO=249;FDP=258;FR=.;FRO=9;FSAF=132;FSAR=117;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=-0.064485;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.9909;QD=34.8345;RBI=0.0645083;REFB=-0.025014;REVB=0.00173377;RO=9;SAF=132;SAR=117;SRF=1;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0278816;STB=0.514643;TYPE=snp;VARB=0.00389181;OID=.;OPOS=60073597;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:258:258:9:9:249:249:117:132:1:8:117:132:1:8 chr11 60105366 . T C 263.08 PASS AO=86;DP=224;FAO=86;FDP=226;FR=.;FRO=140;FSAF=38;FSAR=48;FSRF=67;FSRR=73;FWDB=-0.00471886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.427;QD=4.65632;RBI=0.0136131;REFB=-0.00370248;REVB=-0.012769;RO=138;SAF=38;SAR=48;SRF=65;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0321376;STB=0.522925;TYPE=snp;VARB=0.00515083;OID=.;OPOS=60105366;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:224:226:138:140:86:86:48:38:65:73:48:38:67:73 chr11 60152563 . T A 2752.63 PASS AO=301;DP=314;FAO=309;FDP=314;FR=.;FRO=5;FSAF=142;FSAR=167;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0399696;FXX=0.0125782;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.589;QD=35.0653;RBI=0.0667891;REFB=-0.193512;REVB=0.053509;RO=12;SAF=142;SAR=159;SRF=0;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0346377;STB=0.507374;TYPE=snp;VARB=0.00117986;OID=.;OPOS=60152563;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:314:314:12:5:301:309:159:142:0:12:167:142:0:5 chr11 60157107 . T G 857.9 PASS AO=88;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0246185;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.359;QD=38.5571;RBI=0.0312502;REFB=0;REVB=0.0192485;RO=0;SAF=67;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.99663e-05;OID=.;OPOS=60157107;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:89:89:0:0:88:89:21:67:0:0:21:68:0:0 chr11 60157166 . C T 1127.12 PASS AO=120;DP=121;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190662;FXX=0.00826378;HRUN=2;LEN=1;MLLD=305.803;QD=37.5705;RBI=0.019071;REFB=-0.004458;REVB=-0.000425566;RO=0;SAF=43;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.23245e-05;OID=.;OPOS=60157166;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:121:120:0:0:120:120:77:43:0:0:77:43:0:0 chr11 60165352 . ATT A 1929.32 PASS AO=231;DP=258;FAO=242;FDP=242;FR=.;FRO=0;FSAF=112;FSAR=130;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161156;FXX=0.0583635;HRUN=2;LEN=2;MLLD=159.023;QD=31.8896;RBI=0.0245425;REFB=0;REVB=-0.0185101;RO=0;SAF=103;SAR=128;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.21544e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=2.68443e-07;OID=.;OPOS=60165353;OREF=TT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:231:235:242:242:0:112:130:0:0:99:0:103:128:0:0 chr11 60172087 . C T 495.09 PASS AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0310238;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.225;QD=37.3655;RBI=0.0311615;REFB=0;REVB=0.00292678;RO=0;SAF=3;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000647954;OID=.;OPOS=60172087;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:52:53:0:0:52:53:49:3:0:0:49:4:0:0 chr11 60173360 . A G 391.73 PASS AO=41;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0364753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.35;QD=37.308;RBI=0.0379547;REFB=0;REVB=0.0104932;RO=0;SAF=12;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00018094;OID=.;OPOS=60173360;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:41:42:0:0:41:42:29:12:0:0:29:13:0:0 chr11 60182970 . A T 978.4 PASS AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0112146;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=251.722;QD=37.9962;RBI=0.0177135;REFB=0;REVB=-0.0137113;RO=0;SAF=45;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.66954e-05;OID=.;OPOS=60182970;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:103:103:0:0:103:103:58:45:0:0:58:45:0:0 chr11 60184191 . G A 599.33 PASS AO=63;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00317071;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=270.569;QD=37.4582;RBI=0.0405863;REFB=0;REVB=0.0404622;RO=0;SAF=49;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76558e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.0142e-05;OID=.;OPOS=60184191;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:64:64:0:0:63:64:14:49:0:0:14:50:0:0 chr11 60202892 . G T 191.68 PASS AO=40;DP=74;FAO=40;FDP=74;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=27;FSRF=11;FSRR=23;FWDB=0.0112376;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=206.206;QD=10.3609;RBI=0.0114867;REFB=-0.020087;REVB=-0.00237898;RO=33;SAF=13;SAR=27;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00775799;STB=0.50077;TYPE=snp;VARB=0.0141993;OID=.;OPOS=60202892;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:33:34:40:40:27:13:11:22:27:13:11:23 chr11 60264947 . C T 343.29 PASS AO=80;DP=164;FAO=81;FDP=164;FR=.;FRO=83;FSAF=35;FSAR=46;FSRF=37;FSRR=46;FWDB=-0.00417108;FXX=0.017963;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.7404;QD=8.37298;RBI=0.00600725;REFB=-0.0402341;REVB=0.00432309;RO=80;SAF=35;SAR=45;SRF=34;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0115524;STB=0.507041;TYPE=snp;VARB=0.0406445;OID=.;OPOS=60264947;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:164:80:83:80:81:45:35:34:46:46:35:37:46 chr11 60265002 . C T 358.86 PASS AO=76;DP=141;FAO=76;FDP=141;FR=.;FRO=65;FSAF=34;FSAR=42;FSRF=29;FSRR=36;FWDB=0.0151626;FXX=0.0472941;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.812;QD=10.1804;RBI=0.0418666;REFB=-0.0118907;REVB=-0.0390245;RO=58;SAF=34;SAR=42;SRF=29;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0420208;STB=0.500566;TYPE=snp;VARB=0.0113269;OID=.;OPOS=60265002;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:58:65:76:76:42:34:29:29:42:34:29:36 chr11 60285575 . A G 3194.2 PASS AO=331;DP=344;FAO=334;FDP=334;FR=.;FRO=0;FSAF=194;FSAR=140;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0262486;FXX=0.106949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.136;QD=38.2539;RBI=0.0266742;REFB=0;REVB=0.004746;RO=0;SAF=192;SAR=139;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.1863e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.61656e-06;OID=.;OPOS=60285575;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:344:334:0:0:331:334:139:192:0:0:140:194:0:0 chr11 60291413 . C T 1405.33 PASS AO=147;DP=148;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.048536;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.8531;QD=37.9818;RBI=0.0504458;REFB=0;REVB=-0.0137491;RO=1;SAF=71;SAR=76;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00621698;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000130604;OID=.;OPOS=60291413;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:148:148:1:0:147:148:76:71:0:1:77:71:0:0 chr11 60531346 . T G 114.9 PASS AO=30;DP=85;FAO=36;FDP=91;FR=.;FRO=55;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=0.0133516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.233;QD=5.05034;RBI=0.0165681;REFB=-0.00709108;REVB=0.00981001;RO=42;SAF=17;SAR=13;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0932343;STB=0.517232;TYPE=snp;VARB=0.010572;OID=.;OPOS=60531346;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:91:42:55:30:36:13:17:20:22:16:20:29:26 chr11 60559805 . A G 564.11 PASS AO=60;DP=62;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0352492;FXX=0.0322529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.172;QD=37.6074;RBI=0.0452593;REFB=0;REVB=0.0283883;RO=0;SAF=39;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.40158e-05;OID=.;OPOS=60559805;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:62:60:0:0:60:60:21:39:0:0:21:39:0:0 chr11 60620585 . A G 150.33 PASS AO=7;DP=19;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0623006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.601;QD=35.3721;RBI=0.0706543;REFB=0;REVB=0.0333268;RO=0;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00283419;OID=.;OPOS=60620585;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:9:17:0:0:7:17:7:0:0:0:9:8:0:0 chr11 60620590 . C G 183.11 PASS AO=18;DP=18;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0670687;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.3597;QD=38.5502;RBI=0.0671179;REFB=0;REVB=-0.00256917;RO=0;SAF=8;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00268465;OID=.;OPOS=60620590;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:18:19:0:0:18:19:10:8:0:0:11:8:0:0 chr11 60635091 . T C 147.38 PASS AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0899674;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.8965;QD=36.8438;RBI=0.0955446;REFB=0;REVB=-0.0321657;RO=0;SAF=3;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.78418e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00499923;OID=.;OPOS=60635091;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:16:0:0:16:16:13:3:0:0:13:3:0:0 chr11 60637164 . C T 182.59 PASS AO=22;DP=25;FAO=22;FDP=24;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00341281;FXX=0.039984;HRUN=4;LEN=1;MLLD=128.261;QD=30.4322;RBI=0.00457018;REFB=-0.0403545;REVB=-0.00303961;RO=2;SAF=3;SAR=19;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10782;STB=0.558766;TYPE=snp;VARB=0.000916201;OID=.;OPOS=60637164;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:25:24:2:2:22:22:19:3:1:1:19:3:1:1 chr11 60638470 . A G 1338.9 PASS AO=137;DP=137;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0289738;FXX=0.00714235;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.646;QD=38.5294;RBI=0.030058;REFB=0;REVB=0.00800013;RO=0;SAF=27;SAR=110;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5447e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000110763;OID=.;OPOS=60638470;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:137:139:0:0:137:139:110:27:0:0:111:28:0:0 chr11 60705454 . A G 507.91 PASS AO=51;DP=51;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0871782;FXX=0.116647;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.2298;QD=38.3325;RBI=0.0941584;REFB=0;REVB=0.0355777;RO=0;SAF=12;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0194462;OID=.;OPOS=60705454;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:51:53:0:0:51:53:39:12:0:0:39:14:0:0 chr11 60776103 . T C 62.44 PASS AO=10;DP=15;FAO=10;FDP=15;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0755393;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.7941;QD=16.6499;RBI=0.0838032;REFB=-0.0150401;REVB=0.0362876;RO=5;SAF=5;SAR=5;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0584143;STB=0.533267;TYPE=snp;VARB=0.00534706;OID=.;OPOS=60776103;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:15:15:5:5:10:10:5:5:2:3:5:5:2:3 chr11 60776209 . C T 43.19 PASS AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0592843;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=263.026;QD=11.5178;RBI=0.0599828;REFB=-0.0278306;REVB=-0.00912737;RO=6;SAF=2;SAR=6;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0771948;STB=0.521684;TYPE=snp;VARB=0.0174381;OID=.;OPOS=60776209;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:15:15:6:7:8:8:6:2:2:4:6:2:2:5 chr11 60776306 . C T 43.93 PASS AO=5;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0922849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.2852;QD=29.2871;RBI=0.101766;REFB=0;REVB=0.042892;RO=1;SAF=3;SAR=2;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169284;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0166442;OID=.;OPOS=60776306;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:1:0:5:6:2:3:0:1:3:3:0:0 chr11 60785352 . A G 976.02 PASS AO=76;DP=107;FAO=102;FDP=102;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=27;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00616206;FXX=0.0377323;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.813;QD=38.2753;RBI=0.0463438;REFB=0;REVB=0.0459323;RO=0;SAF=27;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000148947;OID=.;OPOS=60785352;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:106:102:0:0:76:102:49:27:0:0:75:27:0:0 chr11 60785464 . G A 268.93 PASS AO=44;DP=63;FAO=44;FDP=64;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=32;FSRF=2;FSRR=18;FWDB=0.0478194;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.321;QD=16.8084;RBI=0.0497812;REFB=-0.00508622;REVB=-0.0138372;RO=19;SAF=12;SAR=32;SRF=2;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125464;STB=0.572489;TYPE=snp;VARB=0.002128;OID=.;OPOS=60785464;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:63:64:19:20:44:44:32:12:2:17:32:12:2:18 chr11 60892606 . A G 281.4 PASS AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0887393;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.542;QD=37.52;RBI=0.0887466;REFB=0;REVB=0.00114002;RO=0;SAF=13;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.63861e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00235946;OID=.;OPOS=60892606;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:31:30:0:0:30:30:17:13:0:0:17:13:0:0 chr11 60893235 . C T 142.66 PASS AO=22;DP=82;FAO=36;FDP=82;FR=.,HEALED;FRO=44;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=29;FSRR=15;FWDB=0.00588475;FXX=0.03529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.317;QD=6.95904;RBI=0.0110339;REFB=-0.0493282;REVB=0.00933365;RO=27;SAF=17;SAR=5;SRF=22;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0605121;STB=0.512115;TYPE=snp;VARB=0.0568614;OID=.;OPOS=60893235;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:82:27:44:22:36:5:17:22:5:13:23:29:15 chr11 60899767 . A G 126.81 PASS AO=30;DP=70;FAO=32;FDP=72;FR=.;FRO=40;FSAF=31;FSAR=1;FSRF=40;FSRR=0;FWDB=0.0132995;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.8759;QD=7.04484;RBI=0.0145733;REFB=0.00488692;REVB=-0.00595856;RO=40;SAF=29;SAR=1;SRF=40;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.377852;STB=0.696001;TYPE=snp;VARB=-0.00608227;OID=.;OPOS=60899767;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:72:40:40:30:32:1:29:40:0:1:31:40:0 chr11 60899920 . C T 43.48 PASS AO=11;DP=28;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.0402489;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=103.383;QD=6.21108;RBI=0.0769019;REFB=0.00518684;REVB=-0.0655281;RO=17;SAF=7;SAR=4;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113573;STB=0.567442;TYPE=snp;VARB=-0.0353063;OID=.;OPOS=60899920;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:28:28:17:17:11:11:4:7:9:8:4:7:9:8 chr11 61058867 . T C 19.67 PASS AO=5;DP=18;FAO=6;FDP=19;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.00388824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.047;QD=4.14197;RBI=0.0122954;REFB=-0.0104787;REVB=0.0116644;RO=10;SAF=1;SAR=4;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.347085;STB=0.689036;TYPE=snp;VARB=0.0254392;OID=.;OPOS=61058867;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:18:19:10:13:5:6:4:1:5:5:4:2:8:5 chr11 61058875 . GC G 27.77 PASS AO=8;DP=18;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.0335605;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=14.6914;QD=6.53351;RBI=0.0412523;REFB=-0.113809;REVB=-0.0239885;RO=6;SAF=4;SAR=4;SRF=4;SRR=2;SSEN=0.44;SSEP=0;SSSB=-0.122361;STB=0.526257;TYPE=del;VARB=0.104103;OID=.;OPOS=61058876;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:8:17:9:17:8:5:4:4:4:23:6:4:4:4:2 chr11 61106892 . G C 508.72 PASS AO=53;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0763085;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.4255;QD=37.6829;RBI=0.0764198;REFB=0;REVB=0.00412227;RO=0;SAF=20;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.88914e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000560947;OID=.;OPOS=61106892;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:53:54:0:0:53:54:33:20:0:0:33:21:0:0 chr11 61108974 . G A 231.74 PASS AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00111002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.8078;QD=37.0781;RBI=0.0868737;REFB=0;REVB=0.0868666;RO=0;SAF=2;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.34264e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00227861;OID=.;OPOS=61108974;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:25:25:0:0:25:25:23:2:0:0:23:2:0:0 chr11 61111346 . C G 258.72 PASS AO=51;DP=90;FAO=51;FDP=90;FR=.;FRO=39;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=0.0257343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.28;QD=11.4988;RBI=0.029439;REFB=-0.0427101;REVB=0.0142968;RO=39;SAF=24;SAR=27;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0536663;STB=0.5294;TYPE=snp;VARB=0.0349792;OID=.;OPOS=61111346;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:39:39:51:51:27:24:21:18:27:24:21:18 chr11 61112802 . C T 497.81 PASS AO=51;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0667459;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.5017;QD=37.5707;RBI=0.0671011;REFB=0;REVB=0.00689532;RO=0;SAF=15;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.746e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00104357;OID=.;OPOS=61112802;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:52:53:0:0:51:53:36:15:0:0:37:16:0:0 chr11 61165280 . G A 495.86 PASS AO=109;DP=206;FAO=109;FDP=206;FR=.;FRO=97;FSAF=63;FSAR=46;FSRF=45;FSRR=52;FWDB=-0.0159073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.5497;QD=9.62836;RBI=0.0159716;REFB=-0.0226426;REVB=-0.00143129;RO=93;SAF=63;SAR=46;SRF=42;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107201;STB=0.55411;TYPE=snp;VARB=0.0177232;OID=.;OPOS=61165280;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:206:206:93:97:109:109:46:63:42:51:46:63:45:52 chr11 61165731 . C CA 60.42 PASS AO=22;DP=69;FAO=22;FDP=69;FR=.;FRO=47;FSAF=3;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=36;FWDB=-0.0140187;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=278.913;QD=3.50288;RBI=0.0150953;REFB=-0.00501306;REVB=-0.00559869;RO=46;SAF=3;SAR=19;SRF=11;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202089;STB=0.617048;TYPE=ins;VARB=0.0138826;OID=.;OPOS=61165732;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:22:69:22:69:47:3:19:11:36:60:46:3:19:11:35 chr11 61165741 . G C 62.99 PASS AO=23;DP=72;FAO=23;FDP=72;FR=.;FRO=49;FSAF=3;FSAR=20;FSRF=11;FSRR=38;FWDB=0.0138205;FXX=0.0136968;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.55;QD=3.49951;RBI=0.031753;REFB=-0.00442218;REVB=-0.0285876;RO=49;SAF=3;SAR=20;SRF=11;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194139;STB=0.616624;TYPE=snp;VARB=0.0158011;OID=.;OPOS=61165741;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:72:72:49:49:23:23:20:3:11:38:20:3:11:38 chr11 61166306 . G A 169.57 PASS AO=53;DP=140;FAO=53;FDP=138;FR=.;FRO=85;FSAF=11;FSAR=42;FSRF=39;FSRR=46;FWDB=-0.00294665;FXX=0.0142847;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.628;QD=4.91499;RBI=0.017747;REFB=-0.00828118;REVB=-0.0175007;RO=82;SAF=11;SAR=42;SRF=37;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.311188;STB=0.684408;TYPE=snp;VARB=0.0201414;OID=.;OPOS=61166306;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:138:82:85:53:53:42:11:37:45:42:11:39:46 chr11 61179285 . G A 238.59 PASS AO=82;DP=224;FAO=82;FDP=224;FR=.;FRO=142;FSAF=41;FSAR=41;FSRF=84;FSRR=58;FWDB=-0.0246099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.155;QD=4.26057;RBI=0.0500384;REFB=-0.00922643;REVB=0.0435683;RO=142;SAF=41;SAR=41;SRF=84;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102504;STB=0.558022;TYPE=snp;VARB=0.0200409;OID=.;OPOS=61179285;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:224:224:142:142:82:82:41:41:84:58:41:41:84:58 chr11 61204361 . A C 553.21 PASS AO=133;DP=262;FAO=133;FDP=272;FR=.;FRO=139;FSAF=51;FSAR=82;FSRF=64;FSRR=75;FWDB=-0.0444685;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.3165;QD=8.13544;RBI=0.0551233;REFB=-0.0235472;REVB=0.032575;RO=126;SAF=51;SAR=82;SRF=53;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0346099;STB=0.540798;TYPE=snp;VARB=0.0299853;OID=.;OPOS=61204361;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:262:272:126:139:133:133:82:51:53:73:82:51:64:75 chr11 61249383 . C A 99.59 PASS AO=34;DP=97;FAO=34;FDP=97;FR=.;FRO=63;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=48;FWDB=0.00988385;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.672;QD=4.1068;RBI=0.0142058;REFB=-0.00342944;REVB=-0.0102037;RO=61;SAF=14;SAR=20;SRF=15;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20109;STB=0.621345;TYPE=snp;VARB=0.00845333;OID=.;OPOS=61249383;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:61:63:34:34:20:14:15:46:20:14:15:48 chr11 61282980 . A AT,T 30.11 PASS AO=3,3;DP=17;FAO=8,3;FDP=14;FR=.;FRO=3;FSAF=5,2;FSAR=3,1;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.04387,-0.00721236;FXX=0;HRUN=11,4;LEN=1,1;MLLD=5.05319,43.4677;QD=8.60241;RBI=0.0533899,0.0403557;REFB=-0.125453,-0.134298;REVB=-0.0304287,-0.039706;RO=9;SAF=1,2;SAR=2,1;SRF=8;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.562113,-0.329465;STB=0.615125,0.713247;TYPE=ins,snp;VARB=-0.145637,0.00387008;OID=.,.;OPOS=61282981,61282980;OREF=-,A;OALT=T,T;OMAPALT=AT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:15:17:14:9:3:3,3:8,3:2,1:1,2:8:1:3,1:5,2:3:0 chr11 61291306 . GC G 37.59 PASS AO=44;DP=127;FAO=47;FDP=120;FR=.;FRO=73;FSAF=35;FSAR=12;FSRF=35;FSRR=38;FWDB=-0.23023;FXX=0.0243883;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.7718;QD=1.25286;RBI=0.231329;REFB=-0.0967141;REVB=-0.0225156;RO=58;SAF=32;SAR=12;SRF=22;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.360843;STB=0.675596;TYPE=del;VARB=0.0857842;OID=.;OPOS=61291307;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:44:121:47:120:73:35:12:35:38:37:58:32:12:22:36 chr11 61404161 . G A 128.09 PASS AO=29;DP=60;FAO=29;FDP=60;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=0.0793813;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.7765;QD=8.53931;RBI=0.0883191;REFB=-0.0381243;REVB=0.0387152;RO=31;SAF=17;SAR=12;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0356394;STB=0.519986;TYPE=snp;VARB=0.0406169;OID=.;OPOS=61404161;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:31:31:29:29:12:17:17:14:12:17:17:14 chr11 61404336 . G A 261.69 PASS AO=65;DP=139;FAO=65;FDP=139;FR=.;FRO=74;FSAF=42;FSAR=23;FSRF=46;FSRR=28;FWDB=-0.0109829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.5564;QD=7.53058;RBI=0.0127078;REFB=-0.0158758;REVB=0.00639252;RO=74;SAF=42;SAR=23;SRF=46;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0255042;STB=0.514158;TYPE=snp;VARB=0.0129812;OID=.;OPOS=61404336;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:74:74:65:65:23:42:46:28:23:42:46:28 chr11 61405104 . T G 59.36 PASS AO=20;DP=60;FAO=20;FDP=60;FR=.;FRO=40;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=-0.0858459;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=158.724;QD=3.95718;RBI=0.0860673;REFB=-0.00441531;REVB=0.00616848;RO=40;SAF=12;SAR=8;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0292851;STB=0.517224;TYPE=snp;VARB=0.00928763;OID=.;OPOS=61405104;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:60:60:40:40:20:20:8:12:23:17:8:12:23:17 chr11 61505168 . G A 65.51 PASS AO=20;DP=55;FAO=20;FDP=55;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.00992196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.691;QD=4.76411;RBI=0.0209972;REFB=-0.00383305;REVB=0.018505;RO=34;SAF=12;SAR=8;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172013;STB=0.608587;TYPE=snp;VARB=0.00426749;OID=.;OPOS=61505168;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:55:55:34:35:20:20:8:12:15:19:8:12:15:20 chr11 61513725 . A G 213.25 PASS AO=58;DP=132;FAO=58;FDP=134;FR=.;FRO=76;FSAF=22;FSAR=36;FSRF=35;FSRR=41;FWDB=-0.00455629;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.213;QD=6.36562;RBI=0.0235156;REFB=-0.0109404;REVB=-0.02307;RO=74;SAF=22;SAR=36;SRF=34;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0833439;STB=0.547768;TYPE=snp;VARB=0.0136541;OID=.;OPOS=61513725;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:134:74:76:58:58:36:22:34:40:36:22:35:41 chr11 61524974 . G A 1032.36 PASS AO=110;DP=111;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139827;FXX=0.0090082;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.908;QD=37.5405;RBI=0.0356539;REFB=-0.0530598;REVB=0.0327977;RO=0;SAF=55;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.80916e-05;OID=.;OPOS=61524974;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:111:110:0:0:110:110:55:55:0:0:55:55:0:0 chr11 61534872 . A C 175.22 PASS AO=43;DP=96;FAO=44;FDP=96;FR=.;FRO=52;FSAF=40;FSAR=4;FSRF=43;FSRR=9;FWDB=-0.0198594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.7306;QD=7.30064;RBI=0.0200554;REFB=-0.00687375;REVB=0.00279725;RO=48;SAF=39;SAR=4;SRF=39;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209849;STB=0.61027;TYPE=snp;VARB=0.0038347;OID=.;OPOS=61534872;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:48:52:43:44:4:39:39:9:4:40:43:9 chr11 61669946 . G A 121.48 PASS AO=28;DP=72;FAO=34;FDP=83;FR=.;FRO=49;FSAF=7;FSAR=27;FSRF=16;FSRR=33;FWDB=0.0333207;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.274;QD=5.85442;RBI=0.033625;REFB=0.0026798;REVB=0.00451345;RO=44;SAF=7;SAR=21;SRF=16;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146798;STB=0.59648;TYPE=snp;VARB=-0.00416659;OID=.;OPOS=61669946;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:83:44:49:28:34:21:7:16:28:27:7:16:33 chr11 61672235 . T C 136.31 PASS AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0284306;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.847;QD=36.3483;RBI=0.0408891;REFB=0;REVB=0.0293874;RO=0;SAF=10;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.01689e-05;OID=.;OPOS=61672235;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:15:0:0:15:15:5:10:0:0:5:10:0:0 chr11 61672265 . T C 147.38 PASS AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00256975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.67;QD=36.8441;RBI=0.0401927;REFB=0;REVB=0.0401104;RO=0;SAF=10;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000145456;OID=.;OPOS=61672265;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:16:0:0:16:16:6:10:0:0:6:10:0:0 chr11 61675644 . T C 107.24 PASS AO=25;DP=52;FAO=25;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.00870153;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.171;QD=8.09335;RBI=0.00895896;REFB=-0.0108805;REVB=-0.00213223;RO=27;SAF=6;SAR=19;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149139;STB=0.599173;TYPE=snp;VARB=0.0110704;OID=.;OPOS=61675644;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:53:27:28:25:25:19:6:10:17:19:6:11:17 chr11 61719387 . T C 71.05 PASS AO=20;DP=51;FAO=20;FDP=51;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=8;FWDB=0.00649587;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.7216;QD=5.57216;RBI=0.0584242;REFB=-0.0125318;REVB=-0.058062;RO=31;SAF=11;SAR=9;SRF=23;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21113;STB=0.620579;TYPE=snp;VARB=0.0146026;OID=.;OPOS=61719387;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:51:51:31:31:20:20:9:11:23:8:9:11:23:8 chr11 61722645 . C A 109.77 PASS AO=23;DP=44;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=4;FSRR=17;FWDB=0.0124976;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.205;QD=9.97942;RBI=0.0863202;REFB=0.0145594;REVB=0.0854107;RO=21;SAF=7;SAR=16;SRF=4;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121387;STB=0.567513;TYPE=snp;VARB=-0.0042865;OID=.;OPOS=61722645;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:44:44:21:21:23:23:16:7:4:17:16:7:4:17 chr11 61730036 . G A 111.18 PASS AO=26;DP=55;FAO=26;FDP=55;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.0088932;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2082;QD=8.08588;RBI=0.021368;REFB=-0.0133073;REVB=-0.0194294;RO=19;SAF=10;SAR=16;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0130702;STB=0.502956;TYPE=snp;VARB=0.0101797;OID=.;OPOS=61730036;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:19:29:26:26:16:10:7:12:16:10:11:18 chr11 61730183 . C T 94.95 PASS AO=27;DP=68;FAO=27;FDP=68;FR=.;FRO=41;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=-0.0202514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.8185;QD=5.5853;RBI=0.0212977;REFB=-0.0184424;REVB=-0.00659331;RO=39;SAF=12;SAR=15;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.044551;STB=0.511543;TYPE=snp;VARB=0.0294334;OID=.;OPOS=61730183;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:68:68:39:41:27:27:15:12:19:20:15:12:19:22 chr11 61730234 . T C 122.87 PASS AO=33;DP=75;FAO=32;FDP=74;FR=.;FRO=42;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=-0.0049529;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.659;QD=6.64181;RBI=0.0222862;REFB=0.00868115;REVB=0.0217288;RO=42;SAF=15;SAR=18;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00216807;STB=0.508556;TYPE=snp;VARB=-0.006255;OID=.;OPOS=61730234;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:74:42:42:33:32:18:15:19:23:18:14:19:23 chr11 61730553 . T C 114.26 PASS AO=37;DP=99;FAO=36;FDP=98;FR=.;FRO=62;FSAF=29;FSAR=7;FSRF=51;FSRR=11;FWDB=-0.05539;FXX=0.0101;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.844;QD=4.66352;RBI=0.0650063;REFB=0.0306355;REVB=0.0340259;RO=61;SAF=30;SAR=7;SRF=50;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159394;STB=0.517551;TYPE=snp;VARB=-0.0599061;OID=.;OPOS=61730553;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:98:61:62:37:36:7:30:50:11:7:29:51:11 chr11 61895741 . A G 481.19 PASS AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0170824;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=253.726;QD=37.7406;RBI=0.017338;REFB=0;REVB=0.002966;RO=0;SAF=18;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=8.62909e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.89957e-05;OID=.;OPOS=61895741;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:51:51:0:0:51:51:33:18:0:0:33:18:0:0 chr11 61897359 . C T 383.55 PASS AO=40;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102993;FXX=0.0238039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.537;QD=37.4195;RBI=0.0182569;REFB=0;REVB=-0.0150744;RO=1;SAF=13;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0347063;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.5776e-05;OID=.;OPOS=61897359;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:42:41:1:0:40:41:27:13:1:0:27:14:0:0 chr11 61906374 . T C 279.43 PASS AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0954599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.5325;QD=38.542;RBI=0.106368;REFB=0;REVB=-0.0469205;RO=0;SAF=14;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.92057e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00184115;OID=.;OPOS=61906374;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:29:29:0:0:29:29:15:14:0:0:15:14:0:0 chr11 61913196 . G T 183.14 PASS AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.015005;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.534;QD=38.5547;RBI=0.0584194;REFB=0;REVB=0.0564595;RO=0;SAF=3;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00101729;OID=.;OPOS=61913196;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:19:19:0:0:19:19:16:3:0:0:16:3:0:0 chr11 62063899 . C CA 34.94 PASS AO=26;DP=92;FAO=38;FDP=87;FR=.;FRO=49;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=-0.199418;FXX=0.0224694;HRUN=8;LEN=1;MLLD=6.11963;QD=1.60657;RBI=0.201544;REFB=-0.0425393;REVB=-0.0291991;RO=52;SAF=10;SAR=16;SRF=23;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0681966;STB=0.500917;TYPE=ins;VARB=0.022319;OID=.;OPOS=62063900;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:26:92:38:87:49:17:21:22:27:34:52:10:16:23:29 chr11 62160723 . C T 285.36 PASS AO=71;DP=154;FAO=72;FDP=155;FR=.;FRO=83;FSAF=33;FSAR=39;FSRF=41;FSRR=42;FWDB=0.0064345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.397;QD=7.36403;RBI=0.0263505;REFB=-0.00187971;REVB=-0.0255528;RO=80;SAF=32;SAR=39;SRF=40;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0473404;STB=0.519153;TYPE=snp;VARB=0.00228175;OID=.;OPOS=62160723;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:155:80:83:71:72:39:32:40:40:39:33:41:42 chr11 62160729 . G A 236.96 PASS AO=64;DP=156;FAO=66;FDP=153;FR=.;FRO=87;FSAF=30;FSAR=36;FSRF=41;FSRR=46;FWDB=-0.00405383;FXX=0.0192295;HRUN=3;LEN=1;MLLD=89.6472;QD=6.195;RBI=0.0648801;REFB=-0.0446699;REVB=0.0647533;RO=84;SAF=30;SAR=34;SRF=40;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00758063;STB=0.509566;TYPE=snp;VARB=0.0701233;OID=.;OPOS=62160729;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:153:84:87:64:66:34:30:40:44:36:30:41:46 chr11 62236219 . T C 351.11 PASS AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0198845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.368;QD=37.9577;RBI=0.0277779;REFB=0;REVB=0.0193963;RO=0;SAF=18;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.68991e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000351477;OID=.;OPOS=62236219;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:37:37:0:0:37:37:19:18:0:0:19:18:0:0 chr11 62284888 . G A 96.83 PASS AO=32;DP=90;FAO=32;FDP=90;FR=.;FRO=58;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=37;FWDB=0.00502534;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.9194;QD=4.3035;RBI=0.0115021;REFB=-0.00498558;REVB=-0.0103462;RO=58;SAF=11;SAR=21;SRF=21;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0224847;STB=0.512969;TYPE=snp;VARB=0.0163219;OID=.;OPOS=62284888;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:90:90:58:58:32:32:21:11:21:37:21:11:21:37 chr11 62292882 . G T 1555.29 PASS AO=179;DP=187;FAO=178;FDP=186;FR=.;FRO=8;FSAF=105;FSAR=73;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.040692;FXX=0.00534731;HRUN=4;LEN=1;MLLD=50.1416;QD=33.447;RBI=0.0778606;REFB=0.0675862;REVB=0.066381;RO=8;SAF=107;SAR=72;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0187612;STB=0.501561;TYPE=snp;VARB=-0.0017998;OID=.;OPOS=62292882;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:187:186:8:8:179:178:72:107:3:5:73:105:5:3 chr11 62293948 . G A 182.33 PASS AO=42;DP=89;FAO=43;FDP=90;FR=.;FRO=47;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=29;FWDB=-0.000148438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.519;QD=8.10379;RBI=0.0313236;REFB=-0.0231102;REVB=0.0313233;RO=47;SAF=24;SAR=18;SRF=18;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177195;STB=0.590728;TYPE=snp;VARB=0.0248565;OID=.;OPOS=62293948;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:90:47:47:42:43:18:24:18:29:19:24:18:29 chr11 62296152 . G A 122.92 PASS AO=30;DP=68;FAO=31;FDP=70;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=26;FWDB=-0.00337285;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.9607;QD=7.02404;RBI=0.0429729;REFB=-0.0448756;REVB=0.0428404;RO=35;SAF=12;SAR=18;SRF=11;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0874028;STB=0.549969;TYPE=snp;VARB=0.0592877;OID=.;OPOS=62296152;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:70:35:39:30:31:18:12:11:24:18:13:13:26 chr11 62334908 . G C 265.78 PASS AO=65;DP=140;FAO=65;FDP=138;FR=.;FRO=73;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=35;FSRR=38;FWDB=0.000637143;FXX=0.0212751;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.207;QD=7.70382;RBI=0.014775;REFB=-0.00448404;REVB=0.0147613;RO=72;SAF=34;SAR=31;SRF=34;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0482132;STB=0.514931;TYPE=snp;VARB=0.00394879;OID=.;OPOS=62334908;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:138:72:73:65:65:31:34:34:38:32:33:35:38 chr11 62378660 . G A 69.07 PASS AO=6;DP=40;FAO=16;FDP=36;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=5;FWDB=0.0153401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.994;QD=7.67434;RBI=0.0206711;REFB=0.00298994;REVB=0.0138555;RO=9;SAF=0;SAR=6;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.742456;STB=0.576833;TYPE=snp;VARB=-0.00306805;OID=.;OPOS=62378660;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:26:36:9:20:6:16:6:0:4:5:6:10:15:5 chr11 62378801 . T C 107.08 PASS AO=20;DP=52;FAO=25;FDP=54;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.0121868;FXX=0.0689536;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.427;QD=7.93159;RBI=0.0258766;REFB=-0.00240903;REVB=-0.0228272;RO=21;SAF=11;SAR=9;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109584;STB=0.59992;TYPE=snp;VARB=0.00203561;OID=.;OPOS=62378801;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:54:21:29:20:25:9:11:9:12:10:15:12:17 chr11 62381106 . G C 124.68 PASS AO=10;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=13;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0531428;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.7626;QD=35.6229;RBI=0.202775;REFB=0;REVB=0.195688;RO=0;SAF=10;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0132977;OID=.;OPOS=62381106;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:14:0:0:10:14:0:10:0:0:1:13:0:0 chr11 62397114 . T C 91.4 PASS AO=12;DP=14;FAO=12;FDP=14;FR=.;FRO=2;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00435124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.174;QD=26.114;RBI=0.00438132;REFB=0.00595825;REVB=0.000512572;RO=2;SAF=11;SAR=1;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0753549;STB=0.541601;TYPE=snp;VARB=-0.000933152;OID=.;OPOS=62397114;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:14:14:2:2:12:12:1:11:2:0:1:11:2:0 chr11 62414601 . TG T 30.04 PASS AO=24;DP=72;FAO=26;FDP=71;FR=.;FRO=45;FSAF=2;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=28;FWDB=-0.0247041;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=13.1233;QD=1.69254;RBI=0.124273;REFB=-0.0512005;REVB=0.121793;RO=42;SAF=1;SAR=23;SRF=17;SRR=25;SSEN=0.296875;SSEP=0;SSSB=-0.651705;STB=0.813973;TYPE=del;VARB=0.166508;OID=.;OPOS=62414602;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:24:71:26:71:45:2:24:17:28:30:42:1:23:17:25 chr11 62430659 . T A 286.8 PASS AO=75;DP=170;FAO=76;FDP=169;FR=.;FRO=93;FSAF=39;FSAR=37;FSRF=52;FSRR=41;FWDB=0.00670869;FXX=0.0231201;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.015;QD=6.7881;RBI=0.0267116;REFB=0.00557213;REVB=0.0258554;RO=85;SAF=39;SAR=36;SRF=52;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0886101;STB=0.525348;TYPE=snp;VARB=-0.00708774;OID=.;OPOS=62430659;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:169:85:93:75:76:36:39:52:33:37:39:52:41 chr11 62434173 . G A 204.95 PASS AO=36;DP=65;FAO=39;FDP=66;FR=.;FRO=27;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=9;FWDB=0.00545756;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.3447;QD=12.4214;RBI=0.0715286;REFB=0.015586;REVB=0.0713201;RO=29;SAF=17;SAR=19;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174775;STB=0.573162;TYPE=snp;VARB=-0.0105731;OID=.;OPOS=62434173;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:65:66:29:27:36:39:19:17:20:9:20:19:18:9 chr11 62438750 . T C 632.05 PASS AO=194;DP=426;FAO=175;FDP=399;FR=.;FRO=224;FSAF=86;FSAR=89;FSRF=90;FSRR=134;FWDB=-0.0183125;FXX=0.00249994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.031;QD=6.33638;RBI=0.0184437;REFB=-0.010441;REVB=-0.00219577;RO=230;SAF=96;SAR=98;SRF=91;SRR=139;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0977494;STB=0.550422;TYPE=snp;VARB=0.00869862;OID=.;OPOS=62438750;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:426:399:230:224:194:175:98:96:91:139:89:86:90:134 chr11 62439569 . G A 147.07 PASS AO=31;DP=56;FAO=28;FDP=49;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.00807451;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.004;QD=12.0053;RBI=0.00808108;REFB=-0.0499218;REVB=-0.000325777;RO=25;SAF=15;SAR=16;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0354459;STB=0.511174;TYPE=snp;VARB=0.0306351;OID=.;OPOS=62439569;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:56:49:25:21:31:28:16:15:11:14:18:10:7:14 chr11 62458275 . T C 129.25 PASS AO=34;DP=79;FAO=34;FDP=79;FR=.;FRO=45;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=30;FWDB=0.00454646;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.9607;QD=6.5445;RBI=0.0151048;REFB=-0.0079214;REVB=-0.0144044;RO=45;SAF=14;SAR=20;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0832481;STB=0.546848;TYPE=snp;VARB=0.0128767;OID=.;OPOS=62458275;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:45:45:34:34:20:14:15:30:20:14:15:30 chr11 62494290 . G A 22.75 PASS AO=4;DP=8;FAO=4;FDP=8;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.00495103;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=112.575;QD=11.3735;RBI=0.0356695;REFB=0.0287478;REVB=-0.0353242;RO=1;SAF=1;SAR=3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119989;STB=0.64209;TYPE=snp;VARB=-0.00914826;OID=.;OPOS=62494290;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:5:8:1:4:4:4:3:1:0:1:3:1:2:2 chr11 62496519 . T C 395.91 PASS AO=81;DP=144;FAO=81;FDP=144;FR=.;FRO=63;FSAF=26;FSAR=55;FSRF=30;FSRR=33;FWDB=-0.0557135;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.995;QD=10.9975;RBI=0.0561578;REFB=-0.00830006;REVB=-0.00704985;RO=63;SAF=26;SAR=55;SRF=30;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134881;STB=0.573752;TYPE=snp;VARB=0.00511703;OID=.;OPOS=62496519;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:144:63:63:81:81:55:26:30:33:55:26:30:33 chr11 62505764 . C T 230.33 PASS AO=57;DP=122;FAO=57;FDP=122;FR=.;FRO=65;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=32;FSRR=33;FWDB=0.0115281;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.4822;QD=7.55184;RBI=0.0124582;REFB=-0.0108336;REVB=-0.00472334;RO=62;SAF=30;SAR=27;SRF=32;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00959077;STB=0.518128;TYPE=snp;VARB=0.0150403;OID=.;OPOS=62505764;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:62:65:57:57:27:30:32:30:27:30:32:33 chr11 62521475 . T C 105.67 PASS AO=23;DP=42;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.0106939;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=43.9679;QD=10.0636;RBI=0.0109931;REFB=0.030192;REVB=0.00254694;RO=19;SAF=6;SAR=17;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198254;STB=0.596922;TYPE=snp;VARB=-0.0232141;OID=.;OPOS=62521475;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:42:42:19:20:23:22:17:6:9:10:16:6:9:11 chr11 62563353 . G A 806.05 PASS AO=87;DP=89;FAO=87;FDP=89;FR=.;FRO=2;FSAF=53;FSAR=34;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0185076;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=235.166;QD=36.2271;RBI=0.0202149;REFB=0.00689884;REVB=-0.00813076;RO=2;SAF=53;SAR=34;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0175436;STB=0.509257;TYPE=snp;VARB=1.00176e-05;OID=.;OPOS=62563353;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:89:89:2:2:87:87:34:53:2:0:34:53:2:0 chr11 62564009 . T C 200.07 PASS AO=47;DP=93;FAO=46;FDP=93;FR=.;FRO=47;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=22;FSRR=25;FWDB=-0.0524928;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.8783;QD=8.60502;RBI=0.0526437;REFB=-0.00877904;REVB=0.00398344;RO=46;SAF=22;SAR=25;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0103824;STB=0.50588;TYPE=snp;VARB=0.00934224;OID=.;OPOS=62564009;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:46:47:47:46:25:22:21:25:25:21:22:25 chr11 62601329 . AG A 365.88 PASS AO=57;DP=80;FAO=77;FDP=79;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=38;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0422929;FXX=0.0124984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=13.2416;QD=18.5254;RBI=0.261731;REFB=-0.0271907;REVB=0.258292;RO=20;SAF=26;SAR=31;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0.394036;SSSB=-0.0935328;STB=0.512497;TYPE=del;VARB=0.0128506;OID=.;OPOS=62601330;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:57:79:77:79:2:39:38:2:0:16:20:26:31:13:7 chr11 62609112 . A G 921.46 PASS AO=186;DP=331;FAO=188;FDP=330;FR=.;FRO=142;FSAF=92;FSAR=96;FSRF=80;FSRR=62;FWDB=0.0295886;FXX=0.00302106;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.5291;QD=11.1692;RBI=0.0298227;REFB=0.0049895;REVB=-0.00372968;RO=144;SAF=91;SAR=95;SRF=80;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0532995;STB=0.531818;TYPE=snp;VARB=-0.0037282;OID=.;OPOS=62609112;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:331:330:144:142:186:188:95:91:80:64:96:92:80:62 chr11 62609171 . T C 1503.86 PASS AO=522;DP=784;FAO=262;FDP=398;FR=.;FRO=136;FSAF=96;FSAR=166;FSRF=56;FSRR=80;FWDB=-0.0110809;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.8611;QD=15.1141;RBI=0.0150761;REFB=0.00125739;REVB=-0.0102227;RO=253;SAF=182;SAR=340;SRF=103;SRR=150;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0387798;STB=0.51654;TYPE=snp;VARB=-0.00456962;OID=.;OPOS=62609171;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:784:398:253:136:522:262:340:182:103:150:166:96:56:80 chr11 62609173 . T G 1480.21 PASS AO=523;DP=782;FAO=256;FDP=383;FR=.;FRO=127;FSAF=83;FSAR=173;FSRF=57;FSRR=70;FWDB=0.00847054;FXX=0.0424989;HRUN=3;LEN=1;MLLD=211.41;QD=15.4591;RBI=0.0152256;REFB=-0.0341593;REVB=0.0126519;RO=217;SAF=183;SAR=340;SRF=89;SRR=128;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0359827;STB=0.545627;TYPE=snp;VARB=0.00620783;OID=.;OPOS=62609173;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:782:383:217:127:523:256:340:183:89:128:173:83:57:70 chr11 62609174 . T C 1533.76 PASS AO=540;DP=790;FAO=262;FDP=392;FR=.;FRO=130;FSAF=85;FSAR=177;FSRF=56;FSRR=74;FWDB=-0.0081601;FXX=0.0199995;HRUN=3;LEN=1;MLLD=240.756;QD=15.6506;RBI=0.0193152;REFB=-0.0247377;REVB=0.0175069;RO=227;SAF=188;SAR=352;SRF=92;SRR=135;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0345356;STB=0.539118;TYPE=snp;VARB=0.0123263;OID=.;OPOS=62609174;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:790:392:227:130:540:262:352:188:92:135:177:85:56:74 chr11 62677220 . G A 98.26 PASS AO=14;DP=19;FAO=14;FDP=19;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.00167432;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.5501;QD=20.6869;RBI=0.0133148;REFB=-0.0158607;REVB=0.0132091;RO=5;SAF=5;SAR=9;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218489;STB=0.512178;TYPE=snp;VARB=0.00661166;OID=.;OPOS=62677220;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:19:19:5:5:14:14:9:5:2:3:9:5:2:3 chr11 62678306 . G T 168.23 PASS AO=24;DP=63;FAO=29;FDP=63;FR=.,HEALED;FRO=25;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=6;FWDB=0.00971398;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1346;QD=10.6813;RBI=0.0148885;REFB=-0.0797388;REVB=-0.011283;RO=19;SAF=11;SAR=13;SRF=19;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.423788;STB=0.656186;TYPE=snp;VARB=0.0166069;OID=.;OPOS=62678306;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:60:63:19:25:24:29:13:11:19:0:17:12:19:6 chr11 62751812 . T C 116.72 PASS AO=11;DP=40;FAO=22;FDP=40;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=16;FWDB=-0.0099115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.74;QD=11.6723;RBI=0.0124065;REFB=-0.0101021;REVB=0.00746208;RO=2;SAF=10;SAR=1;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0818657;STB=0.66025;TYPE=snp;VARB=0.00372117;OID=.;OPOS=62751812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:29:40:2:18:11:22:1:10:2:0:12:10:2:16 chr11 62847453 . T C 1587.92 PASS AO=166;DP=166;FAO=166;FDP=166;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0944409;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.515;QD=38.2632;RBI=0.100928;REFB=0;REVB=0.035599;RO=0;SAF=86;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.06912e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000185998;OID=.;OPOS=62847453;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:166:166:0:0:166:166:80:86:0:0:80:86:0:0 chr11 62848487 . A C 1798.07 PASS AO=185;DP=186;FAO=189;FDP=189;FR=.;FRO=0;FSAF=114;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0257217;FXX=0.00526288;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.48;QD=38.0544;RBI=0.0412083;REFB=-0.0769513;REVB=0.032195;RO=1;SAF=112;SAR=73;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00647756;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.19184e-05;OID=.;OPOS=62848487;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:186:189:1:0:185:189:73:112:0:1:75:114:0:0 chr11 62886319 . G C 767.71 PASS AO=81;DP=84;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00339818;FXX=0.03571;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1694;QD=37.9115;RBI=0.0219374;REFB=0;REVB=0.0216726;RO=0;SAF=25;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000139949;OID=.;OPOS=62886319;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:84:81:0:0:81:81:56:25:0:0:56:25:0:0 chr11 62902172 . A C 1023.29 PASS AO=112;DP=116;FAO=112;FDP=115;FR=.;FRO=3;FSAF=82;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0168919;FXX=0.00861995;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.549;QD=35.5926;RBI=0.0243344;REFB=0.00199339;REVB=0.0175164;RO=2;SAF=82;SAR=30;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00980643;STB=0.513099;TYPE=snp;VARB=-9.8765e-05;OID=.;OPOS=62902172;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:116:115:2:3:112:112:30:82:1:1:30:82:1:2 chr11 62910849 . T C 2046.89 PASS AO=213;DP=213;FAO=214;FDP=214;FR=.;FRO=0;FSAF=123;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0016472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.125;QD=38.2597;RBI=0.0141272;REFB=0;REVB=0.0140309;RO=0;SAF=122;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.14356e-06;OID=.;OPOS=62910849;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:97:213:214:0:0:213:214:91:122:0:0:91:123:0:0 chr11 62911079 . G C 1596.16 PASS AO=167;DP=170;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0681921;FXX=0.011764;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.13;QD=38.0037;RBI=0.0701774;REFB=-0.0401062;REVB=0.0165743;RO=2;SAF=94;SAR=73;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0100172;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000414305;OID=.;OPOS=62911079;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:170:168:2:0:167:168:73:94:2:0:73:95:0:0 chr11 63057925 . G A 1227.54 PASS AO=132;DP=138;FAO=133;FDP=136;FR=.;FRO=3;FSAF=25;FSAR=108;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0394548;FXX=0.0144917;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.253;QD=36.1041;RBI=0.0426414;REFB=-0.209619;REVB=0.0161742;RO=2;SAF=25;SAR=107;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00880145;STB=0.506848;TYPE=snp;VARB=0.00128853;OID=.;OPOS=63057925;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:138:136:2:3:132:133:107:25:0:2:108:25:0:3 chr11 63064823 . T C 1721.3 PASS AO=186;DP=192;FAO=189;FDP=191;FR=.;FRO=2;FSAF=86;FSAR=103;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0791533;FXX=0.00520806;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.5197;QD=36.0482;RBI=0.111013;REFB=-0.160033;REVB=0.0778367;RO=1;SAF=86;SAR=100;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00473792;STB=0.500475;TYPE=snp;VARB=0.00226951;OID=.;OPOS=63064823;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:192:191:1:2:186:189:100:86:0:1:103:86:1:1 chr11 63072310 . C T 1748 PASS AO=183;DP=183;FAO=183;FDP=183;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=121;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.035241;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.003;QD=38.2076;RBI=0.0498326;REFB=0;REVB=-0.0352329;RO=0;SAF=62;SAR=121;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.25579e-05;OID=.;OPOS=63072310;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:183:183:0:0:183:183:121:62:0:0:121:62:0:0 chr11 63129876 . T G 1074.64 PASS AO=113;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.185;QD=38.0405;RBI=0.0174251;REFB=0;REVB=-0.00317502;RO=0;SAF=39;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.91924e-05;OID=.;OPOS=63129876;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:113:113:0:0:113:113:74:39:0:0:74:39:0:0 chr11 63258416 . T C 201.65 PASS AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00886509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.507;QD=36.6635;RBI=0.0254309;REFB=0;REVB=0.0238357;RO=0;SAF=6;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17051e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000203022;OID=.;OPOS=63258416;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:22:22:0:0:22:22:16:6:0:0:16:6:0:0 chr11 63313644 . T C 1469.24 PASS AO=155;DP=157;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0143415;FXX=0.012738;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.7805;QD=37.9159;RBI=0.0160437;REFB=-0.0685554;REVB=0.00719194;RO=1;SAF=81;SAR=74;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00583723;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.98259e-05;OID=.;OPOS=63313644;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:157:155:1:0:155:155:74:81:1:0:74:81:0:0 chr11 63413962 . AAAAT A 50 PASS AO=214;DP=410;LEN=4;RO=196;SAF=146;SAR=131;SRF=43;SRR=90;TYPE=del;FR=.;OID=.;OPOS=63413963;OREF=AAAT;OALT=-;OMAPALT=A GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR 0/1:99:410:196:214:131:146:43:90 chr11 63487386 . T C 1524.24 PASS AO=153;DP=155;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00844902;FXX=0.0181807;HRUN=4;LEN=1;MLLD=189.731;QD=37.6356;RBI=0.0231622;REFB=-0.0884514;REVB=0.0215662;RO=1;SAF=52;SAR=101;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0090596;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.09661e-05;OID=.;OPOS=63487386;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:155:162:1:0:153:162:101:52:1:0:110:52:0:0 chr11 63585804 . C A 105.04 PASS AO=19;DP=32;FAO=19;FDP=32;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=-0.0286676;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.663;QD=13.1293;RBI=0.0306184;REFB=0.00202683;REVB=-0.0107542;RO=13;SAF=10;SAR=9;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.213745;STB=0.618773;TYPE=snp;VARB=-0.0029867;OID=.;OPOS=63585804;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:32:32:13:13:19:19:9:10:3:10:9:10:3:10 chr11 63661820 . C T 981.06 PASS AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0197165;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.773;QD=38.0992;RBI=0.0252036;REFB=0;REVB=-0.0156996;RO=0;SAF=47;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.97864e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.79972e-05;OID=.;OPOS=63661820;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:103:103:0:0:103:103:56:47:0:0:56:47:0:0 chr11 63673603 . CTG C 93.69 PASS AO=9;DP=17;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0211859;FXX=0.28551;HRUN=1;LEN=2;MLLD=117.501;QD=37.4745;RBI=0.0254434;REFB=0;REVB=-0.0140899;RO=0;SAF=1;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.000226035;OID=.;OPOS=63673604;OREF=TG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:9:10:10:10:0:2:8:0:0:4:0:1:8:0:0 chr11 63681513 . T C 401.45 PASS AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0483492;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.3085;QD=37.3442;RBI=0.0483492;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=43;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00105387;OID=.;OPOS=63681513;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:43:43:0:0:43:43:0:43:0:0:0:43:0:0 chr11 63883985 . T C 843.94 PASS AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00429139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.741;QD=38.3611;RBI=0.0059055;REFB=0;REVB=-0.00405696;RO=0;SAF=44;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.42346e-05;OID=.;OPOS=63883985;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:88:88:0:0:88:88:44:44:0:0:44:44:0:0 chr11 63884027 . C T 698.16 PASS AO=76;DP=78;FAO=76;FDP=78;FR=.;FRO=2;FSAF=40;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0372083;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.805;QD=35.8031;RBI=0.0477065;REFB=-0.0188035;REVB=0.0298572;RO=2;SAF=40;SAR=36;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0255619;STB=0.51351;TYPE=snp;VARB=0.000488202;OID=.;OPOS=63884027;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:78:78:2:2:76:76:36:40:0:2:36:40:0:2 chr11 63885305 . C T 86.23 PASS AO=18;DP=35;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=0.0682814;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=110.18;QD=9.85502;RBI=0.0684882;REFB=-0.0171645;REVB=0.0053187;RO=17;SAF=8;SAR=10;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187418;STB=0.605154;TYPE=snp;VARB=0.0152198;OID=.;OPOS=63885305;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:35:35:17:17:18:18:10:8:4:13:10:8:4:13 chr11 63885632 . A G 533.45 PASS AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0939982;FXX=0.0169463;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.5564;QD=36.7898;RBI=0.0951034;REFB=-0.0911693;REVB=0.0144565;RO=0;SAF=13;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505616;TYPE=snp;VARB=0.00250235;OID=.;OPOS=63885632;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:57:58:0:1:57:57:44:13:0:0:44:13:0:1 chr11 63885704 . C T 267.06 PASS AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.140547;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.039;QD=38.1519;RBI=0.140623;REFB=0;REVB=0.00461765;RO=0;SAF=8;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.75204e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00200726;OID=.;OPOS=63885704;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:28:28:0:0:28:28:20:8:0:0:20:8:0:0 chr11 63886539 . C T 1958.72 PASS AO=204;DP=206;FAO=211;FDP=211;FR=.;FRO=0;FSAF=100;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260887;FXX=0.00471676;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.054;QD=37.1322;RBI=0.0358986;REFB=0;REVB=0.0246595;RO=1;SAF=96;SAR=108;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00493601;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000778133;OID=.;OPOS=63886539;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:206:211:1:0:204:211:108:96:1:0:111:100:0:0 chr11 63988062 . GC G 348.34 PASS AO=46;DP=64;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.320428;FXX=0.0158705;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.4163;QD=22.4733;RBI=0.340624;REFB=0.0330346;REVB=-0.115544;RO=9;SAF=18;SAR=28;SRF=9;SRR=0;SSEN=0.487603;SSEP=0;SSSB=-0.186567;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0230322;OID=.;OPOS=63988063;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:46:63:62:62:0:31:31:0:0:26:9:18:28:9:0 chr11 63988102 . C T 142.51 PASS AO=37;DP=84;FAO=37;FDP=84;FR=.;FRO=47;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=0.00665533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.124;QD=6.78602;RBI=0.0109833;REFB=-0.00119366;REVB=-0.00873728;RO=47;SAF=17;SAR=20;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0556079;STB=0.531233;TYPE=snp;VARB=0.00132507;OID=.;OPOS=63988102;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:47:47:37:37:20:17:19:28:20:17:19:28 chr11 63991801 . T C 28.61 PASS AO=17;DP=76;FAO=17;FDP=76;FR=.;FRO=59;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=39;FWDB=-0.0323082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.086;QD=1.50597;RBI=0.0331961;REFB=-0.00331106;REVB=-0.00762618;RO=59;SAF=6;SAR=11;SRF=20;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.019131;STB=0.511931;TYPE=snp;VARB=0.0153807;OID=.;OPOS=63991801;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:76:76:59:59:17:17:11:6:20:39:11:6:20:39 chr11 63994692 . T C 204.23 PASS AO=52;DP=120;FAO=54;FDP=122;FR=.;FRO=68;FSAF=12;FSAR=42;FSRF=15;FSRR=53;FWDB=-0.0254685;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.186;QD=6.69589;RBI=0.0254806;REFB=-0.00588932;REVB=0.000783777;RO=67;SAF=12;SAR=40;SRF=16;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0112972;STB=0.501319;TYPE=snp;VARB=0.00781405;OID=.;OPOS=63994692;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:122:67:68:52:54:40:12:16:51:42:12:15:53 chr11 63994696 . T C 760.25 PASS AO=85;DP=92;FAO=103;FDP=110;FR=.;FRO=7;FSAF=16;FSAR=87;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0698234;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.5365;QD=27.6455;RBI=0.0778896;REFB=-0.0596914;REVB=-0.0345178;RO=6;SAF=0;SAR=85;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.89883;STB=0.54716;TYPE=snp;VARB=0.0728726;OID=.;OPOS=63994696;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:92:110:6:7:85:103:85:0:3:3:87:16:4:3 chr11 63997329 . A G 1298.46 PASS AO=134;DP=135;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0286201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.728;QD=38.1901;RBI=0.0319363;REFB=0;REVB=-0.0141711;RO=0;SAF=85;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.12601e-05;OID=.;OPOS=63997329;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:135:136:0:0:134:136:49:85:0:0:51:85:0:0 chr11 63997338 . T C 1236.23 PASS AO=128;DP=128;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00326191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.34;QD=38.3327;RBI=0.0810515;REFB=0;REVB=0.0809858;RO=0;SAF=76;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.32173e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000112408;OID=.;OPOS=63997338;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:128:129:0:0:128:129:52:76:0:0:52:77:0:0 chr11 64011441 . T C 655.1 PASS AO=68;DP=68;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0804736;FXX=0.0799893;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.728;QD=37.9768;RBI=0.0808257;REFB=0;REVB=0.00753657;RO=0;SAF=16;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.11257e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00165984;OID=.;OPOS=64011441;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:68:69:0:0:68:69:52:16:0:0:53:16:0:0 chr11 64012225 . G C 222.27 PASS AO=25;DP=28;FAO=28;FDP=31;FR=.;FRO=3;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.095586;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.9931;QD=28.6806;RBI=0.162706;REFB=-0.167343;REVB=0.131668;RO=3;SAF=7;SAR=18;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0713041;STB=0.538435;TYPE=snp;VARB=0.0165904;OID=.;OPOS=64012225;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:28:31:3:3:25:28:18:7:0:3:18:10:0:3 chr11 64022459 . A G 1026.83 PASS AO=111;DP=112;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0293115;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.475;QD=37.003;RBI=0.0366974;REFB=0;REVB=0.0220801;RO=0;SAF=67;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0016151;OID=.;OPOS=64022459;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:112:111:0:0:111:111:44:67:0:0:45:66:0:0 chr11 64031241 . C T 64.53 PASS AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=14;FWDB=0.0508843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.228;QD=8.60415;RBI=0.052023;REFB=-0.0273892;REVB=0.0108248;RO=15;SAF=6;SAR=8;SRF=2;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.289336;STB=0.673261;TYPE=snp;VARB=0.0174601;OID=.;OPOS=64031241;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:30:30:15:16:14:14:8:6:2:13:8:6:2:14 chr11 64083273 . C T 82.02 PASS AO=9;DP=28;FAO=15;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=-0.0206922;FXX=0.0370233;HRUN=4;LEN=1;MLLD=165.459;QD=12.6184;RBI=0.0250712;REFB=-0.0142018;REVB=0.0141561;RO=8;SAF=3;SAR=6;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0782009;STB=0.575663;TYPE=snp;VARB=0.0113157;OID=.;OPOS=64083273;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:19:26:8:11:9:15:6:3:2:6:10:5:2:9 chr11 64084113 . A G 1525.17 PASS AO=158;DP=158;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00934375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.1756;QD=38.369;RBI=0.010054;REFB=0;REVB=-0.00371183;RO=0;SAF=100;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.63812e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.18753e-05;OID=.;OPOS=64084113;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:158:159:0:0:158:159:58:100:0:0:58:101:0:0 chr11 64085785 . A G 97.52 PASS AO=10;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0240903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.955;QD=35.4621;RBI=0.0273315;REFB=0;REVB=-0.01291;RO=0;SAF=2;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000587546;OID=.;OPOS=64085785;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:10:11:8:2:0:0:9:2:0:0 chr11 64107735 . G A 64.71 PASS AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.00278509;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.554;QD=10.3535;RBI=0.0162401;REFB=-0.040688;REVB=0.0159995;RO=12;SAF=9;SAR=4;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0248839;STB=0.514264;TYPE=snp;VARB=0.0334691;OID=.;OPOS=64107735;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:25:25:12:12:13:13:4:9:8:4:4:9:8:4 chr11 64110668 . G A 55.68 PASS AO=16;DP=42;FAO=17;FDP=47;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=21;FSRR=9;FWDB=0.00104333;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=159.032;QD=4.7389;RBI=0.0321169;REFB=-0.0148152;REVB=-0.0321;RO=22;SAF=12;SAR=4;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.08592;STB=0.554032;TYPE=snp;VARB=0.0193792;OID=.;OPOS=64110668;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:42:47:22:30:16:17:4:12:15:7:4:13:21:9 chr11 64110683 . G C 39.2 PASS AO=12;DP=46;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=-0.0359796;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.494;QD=7.12693;RBI=0.0393202;REFB=-0.0263954;REVB=0.0158604;RO=14;SAF=8;SAR=4;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225663;STB=0.685902;TYPE=snp;VARB=0.0399269;OID=.;OPOS=64110683;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:33:22:14:13:12:9:4:8:6:8:4:5:3:10 chr11 64111928 . T C 53.11 PASS AO=12;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.0244402;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.889;QD=6.24864;RBI=0.0244834;REFB=-0.00458771;REVB=-0.00145337;RO=18;SAF=1;SAR=11;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.530609;STB=0.843524;TYPE=snp;VARB=0.0118965;OID=.;OPOS=64111928;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:34:34:18:20:12:14:11:1:8:10:13:1:9:11 chr11 64116843 . A C 200.15 PASS AO=20;DP=20;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.283481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.7011;QD=36.3913;RBI=0.283488;REFB=0;REVB=-0.00201809;RO=0;SAF=1;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97126e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00891898;OID=.;OPOS=64116843;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:20:22:0:0:20:22:19:1:0:0:19:3:0:0 chr11 64122846 . TG T 55.75 PASS AO=13;DP=77;FAO=27;FDP=54;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.105199;FXX=0.0357079;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.0654;QD=4.13;RBI=0.204248;REFB=-0.0660907;REVB=0.175072;RO=35;SAF=9;SAR=4;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252025;STB=0.555821;TYPE=del;VARB=0.103553;OID=.;OPOS=64122847;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:13:55:27:54:27:13:14:10:17:50:35:9:4:17:18 chr11 64123140 . TG T 13.53 PASS AO=7;DP=16;FAO=4;FDP=15;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=0;FSRF=11;FSRR=0;FWDB=0.00304741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=36.8193;QD=3.60906;RBI=0.00304741;REFB=-0.0443518;REVB=0;RO=8;SAF=7;SAR=0;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.22432;OID=.;OPOS=64123141;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:7:15:4:15:11:4:0:11:0:13:8:7:0:8:0 chr11 64124515 . T C 36.27 PASS AO=6;DP=17;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=-0.0465861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.542;QD=7.63544;RBI=0.049696;REFB=-0.0238962;REVB=0.017304;RO=11;SAF=2;SAR=4;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0730921;STB=0.517197;TYPE=snp;VARB=0.0555333;OID=.;OPOS=64124515;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:17:19:11:11:6:8:4:2:3:8:6:2:3:8 chr11 64124622 . G A 53.25 PASS AO=17;DP=50;FAO=17;FDP=50;FR=.;FRO=33;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=0.118036;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.713;QD=4.26;RBI=0.11869;REFB=-0.0133938;REVB=-0.0124365;RO=33;SAF=2;SAR=15;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.368823;STB=0.724585;TYPE=snp;VARB=0.0226844;OID=.;OPOS=64124622;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:50:50:33:33:17:17:15:2:11:22:15:2:11:22 chr11 64124823 . C T 173.34 PASS AO=31;DP=52;FAO=32;FDP=53;FR=.;FRO=21;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.00743287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.768;QD=13.0819;RBI=0.0172108;REFB=-0.0143087;REVB=-0.0155231;RO=20;SAF=20;SAR=11;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0433323;STB=0.517756;TYPE=snp;VARB=0.011754;OID=.;OPOS=64124823;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:52:53:20:21:31:32:11:20:14:6:12:20:14:7 chr11 64124939 . CTG CG,CT 270.77 PASS AO=8,8;DP=41;FAO=17,25;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=7,11;FSAR=10,14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0688348,0.703005;FXX=0.0232504;HRUN=1,3;LEN=1,1;MLLD=40.0499,9.95374;QD=25.788;RBI=0.0818339,0.773587;REFB=0,0;REVB=-0.0442555,-0.322832;RO=10;SAF=2,0;SAR=6,8;SRF=10;SRR=0;SSEN=0,0.516949;SSEP=0,0.239875;SSSB=-0.621431,-0.851555;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=-0.0696429,0.0444628;OID=.,.;OPOS=64124940,64124941;OREF=T,G;OALT=-,-;OMAPALT=CG,CT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:8,8:35:17,25:42:0:7,11:10,14:0:0:63:10:2,0:6,8:10:0 chr11 64127744 . A G 67.17 PASS AO=13;DP=24;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.0766941;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.5102;QD=11.1955;RBI=0.0787899;REFB=0.0257545;REVB=0.0180516;RO=11;SAF=9;SAR=4;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.271432;STB=0.655383;TYPE=snp;VARB=-0.0110315;OID=.;OPOS=64127744;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:24:24:11:11:13:13:4:9:4:7:4:9:4:7 chr11 64138940 . G C 16.08 PASS AO=4;DP=6;FAO=3;FDP=6;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0530421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=36.6281;QD=10.723;RBI=0.0530421;REFB=0.0488071;REVB=0;RO=2;SAF=4;SAR=0;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0323032;OID=.;OPOS=64138940;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:6:6:2:3:4:3:0:4:2:0:0:3:3:0 chr11 64332862 . A C 135.67 PASS AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.26695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.931;QD=33.9177;RBI=0.268576;REFB=0;REVB=0.0295057;RO=0;SAF=12;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07465e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00785136;OID=.;OPOS=64332862;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:16:0:0:16:16:4:12:0:0:4:12:0:0 chr11 64359286 . C T 232.64 PASS AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0471269;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.904;QD=34.4651;RBI=0.0540426;REFB=-0.143744;REVB=0.0264512;RO=1;SAF=8;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0545422;STB=0.529389;TYPE=snp;VARB=0.0012696;OID=.;OPOS=64359286;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:27:27:1:1:26:26:18:8:1:0:18:8:1:0 chr11 64360274 . T C 508.43 PASS AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0549261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.608;QD=37.6616;RBI=0.0667416;REFB=0;REVB=0.0379153;RO=0;SAF=21;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.70667e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000386464;OID=.;OPOS=64360274;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:54:54:0:0:54:54:33:21:0:0:33:21:0:0 chr11 64367325 . A G 601.28 PASS AO=44;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=13;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.181221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.74;QD=37.5797;RBI=0.196152;REFB=0;REVB=0.0750645;RO=0;SAF=6;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0038158;OID=.;OPOS=64367325;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:64:64:0:0:44:63:38:6:0:0:50:13:0:0 chr11 64418900 . G A 1409.57 PASS AO=145;DP=146;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0466028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.041;QD=38.3557;RBI=0.0662937;REFB=0;REVB=0.0471491;RO=0;SAF=55;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000174799;OID=.;OPOS=64418900;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:146:147:0:0:145:147:90:55:0:0:91:56:0:0 chr11 64465282 . C T 305.54 PASS AO=66;DP=148;FAO=76;FDP=162;FR=.;FRO=86;FSAF=32;FSAR=44;FSRF=34;FSRR=52;FWDB=0.0162761;FXX=0.0181807;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.378;QD=7.5443;RBI=0.0167351;REFB=-0.0418286;REVB=0.00389221;RO=80;SAF=31;SAR=35;SRF=32;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0692793;STB=0.514053;TYPE=snp;VARB=0.0440684;OID=.;OPOS=64465282;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:162:80:86:66:76:35:31:32:48:44:32:34:52 chr11 64497599 . GC G 65.68 PASS AO=40;DP=112;FAO=48;FDP=110;FR=.;FRO=62;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=35;FSRR=27;FWDB=-0.0408478;FXX=0.0090082;HRUN=7;LEN=1;MLLD=8.15576;QD=2.38846;RBI=0.172248;REFB=-0.107784;REVB=0.167335;RO=55;SAF=25;SAR=15;SRF=32;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.046594;STB=0.523128;TYPE=del;VARB=0.105117;OID=.;OPOS=64497600;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:40:111:48:110:62:29:19:35:27:65:55:25:15:32:23 chr11 64507680 . A C 147.37 PASS AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0401851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.7033;QD=36.8427;RBI=0.0401851;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=16;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00107883;OID=.;OPOS=64507680;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:16:0:0:16:16:0:16:0:0:0:16:0:0 chr11 64511050 . G C 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0294511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.638;QD=35.0875;RBI=0.0648446;REFB=0;REVB=0.0577707;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0030664;OID=.;OPOS=64511050;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:4:3:0:0:4:3:0:0 chr11 64533477 . G A 10.47 PASS AO=2;DP=6;FAO=2;FDP=6;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0296689;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.651;QD=6.97935;RBI=0.0296689;REFB=-0.0135362;REVB=0;RO=4;SAF=2;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0214098;OID=.;OPOS=64533477;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:4:4:2:2:0:2:4:0:0:2:4:0 chr11 64559740 . G T 13.45 PASS AO=3;DP=11;FAO=3;FDP=11;FR=.;FRO=8;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=87.4532;QD=4.89021;RBI=0.0354545;REFB=0.0113975;REVB=0.0354545;RO=8;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00244426;OID=.;OPOS=64559740;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:11:11:8:8:3:3:3:0:0:8:3:0:0:8 chr11 64572018 . T C 301.78 PASS AO=32;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.034313;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.244;QD=36.5788;RBI=0.034314;REFB=0;REVB=0.000269179;RO=0;SAF=6;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00193165;OID=.;OPOS=64572018;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:33:33:0:0:32:33:26:6:0:0:26:7:0:0 chr11 64572557 . A G 385.37 PASS AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00704884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.156;QD=37.5972;RBI=0.00832187;REFB=0;REVB=-0.0044235;RO=0;SAF=27;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00010162;OID=.;OPOS=64572557;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:41:41:0:0:41:41:14:27:0:0:14:27:0:0 chr11 64572602 . G A 157.56 PASS AO=29;DP=49;FAO=29;FDP=49;FR=.;FRO=20;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.041367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.087;QD=12.862;RBI=0.0437024;REFB=-0.00198107;REVB=0.0140951;RO=20;SAF=21;SAR=8;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0661587;STB=0.536601;TYPE=snp;VARB=0.00117426;OID=.;OPOS=64572602;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:49:49:20:20:29:29:8:21:13:7:8:21:13:7 chr11 64591972 . T C 97.42 PASS AO=20;DP=41;FAO=20;FDP=39;FR=.;FRO=19;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=19;FSRR=0;FWDB=-0.0265125;FXX=0.0487686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.818;QD=9.99192;RBI=0.0681096;REFB=-0.00503984;REVB=0.0627376;RO=19;SAF=14;SAR=6;SRF=19;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.370107;STB=0.701982;TYPE=snp;VARB=0.0105111;OID=.;OPOS=64591972;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:41:39:19:19:20:20:6:14:19:0:6:14:19:0 chr11 64597506 . T C 29.49 PASS AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=-0.0256407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.8529;QD=8.42519;RBI=0.025775;REFB=-0.0684059;REVB=-0.00262756;RO=8;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.43608;STB=0.749459;TYPE=snp;VARB=0.026317;OID=.;OPOS=64597506;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:14:14:8:8:6:6:4:2:0:8:4:2:0:8 chr11 64621856 . A G 159.89 PASS AO=12;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0630855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.594;QD=37.6203;RBI=0.0953997;REFB=0;REVB=0.0715635;RO=0;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00142738;OID=.;OPOS=64621856;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:17:17:0:0:12:17:5:7:0:0:7:10:0:0 chr11 64622869 . G C 841.41 PASS AO=88;DP=89;FAO=89;FDP=90;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0356606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.8161;QD=37.3961;RBI=0.0451216;REFB=0.01968;REVB=-0.0276456;RO=0;SAF=44;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505493;TYPE=snp;VARB=-0.000778931;OID=.;OPOS=64622869;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:89:90:0:1:88:89:44:44:0:0:45:44:0:1 chr11 64645871 . A G 435.34 PASS AO=45;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0581751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.815;QD=37.8553;RBI=0.0592819;REFB=0;REVB=-0.0114019;RO=0;SAF=13;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.19395e-05;OID=.;OPOS=64645871;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:45:46:0:0:45:46:32:13:0:0:33:13:0:0 chr11 64670022 . C G 10.42 PASS AO=2;DP=6;FAO=2;FDP=6;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.00136137;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=242.371;QD=6.9443;RBI=0.00136137;REFB=0.0127186;REVB=0;RO=4;SAF=2;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0156377;OID=.;OPOS=64670022;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:4:4:2:2:0:2:4:0:0:2:4:0 chr11 64677293 . G C 49.14 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0935604;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=37.3519;QD=32.7605;RBI=0.0948767;REFB=0;REVB=-0.0157492;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0106248;OID=.;OPOS=64677293;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:4:2:0:0:4:2:0:0 chr11 64680819 . G A 117.27 PASS AO=14;DP=15;FAO=14;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0541918;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.205;QD=31.2713;RBI=0.0718683;REFB=-0.183609;REVB=0.0472049;RO=1;SAF=7;SAR=7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.060556;STB=0.533286;TYPE=snp;VARB=0.00783284;OID=.;OPOS=64680819;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:15:15:1:1:14:14:7:7:0:1:7:7:0:1 chr11 64789194 . T C 81.1 PASS AO=20;DP=55;FAO=22;FDP=57;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=-0.00427653;FXX=0.0806322;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.155;QD=5.6909;RBI=0.00440722;REFB=-0.00899732;REVB=-0.00106528;RO=34;SAF=15;SAR=5;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.404701;STB=0.720055;TYPE=snp;VARB=0.0192941;OID=.;OPOS=64789194;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:55:57:34:35:20:22:5:15:13:21:6:16:13:22 chr11 64799998 . T C 96.55 PASS AO=30;DP=81;FAO=30;FDP=81;FR=.;FRO=51;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=25;FSRR=26;FWDB=0.00121871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.625;QD=4.76798;RBI=0.0105815;REFB=0.00225524;REVB=0.010511;RO=48;SAF=10;SAR=20;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208015;STB=0.603377;TYPE=snp;VARB=-0.00202093;OID=.;OPOS=64799998;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:81:81:48:51:30:30:20:10:25:23:20:10:25:26 chr11 64807294 . G A 232.19 PASS AO=55;DP=114;FAO=55;FDP=113;FR=.;FRO=58;FSAF=22;FSAR=33;FSRF=15;FSRR=43;FWDB=0.0288418;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.1126;QD=8.21922;RBI=0.0292702;REFB=-0.0400312;REVB=0.00498942;RO=58;SAF=22;SAR=33;SRF=15;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141418;STB=0.57792;TYPE=snp;VARB=0.0269224;OID=.;OPOS=64807294;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:113:58:58:55:55:33:22:15:43:33:22:15:43 chr11 64833935 . G A 165.7 PASS AO=46;DP=109;FAO=46;FDP=110;FR=.;FRO=64;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=20;FSRR=44;FWDB=0.00489454;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=221.783;QD=6.02551;RBI=0.0129118;REFB=-0.00273916;REVB=-0.0119482;RO=61;SAF=19;SAR=27;SRF=20;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.091;STB=0.56159;TYPE=snp;VARB=0.00390039;OID=.;OPOS=64833935;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:110:61:64:46:46:27:19:20:41:27:19:20:44 chr11 64852421 . T C 633.36 PASS AO=54;DP=95;FAO=81;FDP=93;FR=.;FRO=12;FSAF=32;FSAR=49;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.0540237;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.4389;QD=27.2412;RBI=0.0658885;REFB=-0.0713748;REVB=0.0377191;RO=0;SAF=18;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.525138;TYPE=snp;VARB=0.0201396;OID=.;OPOS=64852421;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:57:93:0:12:54:81:36:18:0:0:49:32:7:5 chr11 64856500 . A G 392.42 PASS AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.6645;QD=37.3735;RBI=0.0416442;REFB=0;REVB=0.0391557;RO=0;SAF=2;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.96959e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000789793;OID=.;OPOS=64856500;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:42:42:0:0:42:42:40:2:0:0:40:2:0:0 chr11 64878661 . T C 784.03 PASS AO=81;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0656122;FXX=0.0119033;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.7612;QD=37.7847;RBI=0.0694012;REFB=0;REVB=-0.0226177;RO=1;SAF=8;SAR=73;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0555689;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000474142;OID=.;OPOS=64878661;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:83:83:1:0:81:83:73:8:1:0:73:10:0:0 chr11 64884052 . G A 447.31 PASS AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0345704;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=243.285;QD=36.5151;RBI=0.0368479;REFB=-0.04765;REVB=0.0127536;RO=0;SAF=35;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.61818e-08;STB=0.518511;TYPE=snp;VARB=0.000221428;OID=.;OPOS=64884052;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:49:49:0:1:48:48:13:35:0:0:13:35:0:1 chr11 64895202 . A G 570.59 PASS AO=63;DP=64;FAO=64;FDP=67;FR=.;FRO=3;FSAF=25;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0272391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.498;QD=34.0651;RBI=0.049351;REFB=-0.143055;REVB=0.0411528;RO=1;SAF=23;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116608;STB=0.518513;TYPE=snp;VARB=0.00205168;OID=.;OPOS=64895202;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:64:67:1:3:63:64:40:23:0:1:39:25:0:3 chr11 64948277 . A C 239.65 PASS AO=60;DP=129;FAO=60;FDP=130;FR=.;FRO=70;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=42;FSRR=28;FWDB=-0.0239907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.398;QD=7.37379;RBI=0.0412595;REFB=-0.0127946;REVB=-0.0335677;RO=69;SAF=32;SAR=28;SRF=41;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0591648;STB=0.53622;TYPE=snp;VARB=0.0124658;OID=.;OPOS=64948277;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:130:69:70:60:60:28:32:41:28:28:32:42:28 chr11 64950970 . C T 89.09 PASS AO=18;DP=37;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0481842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.444;QD=9.37743;RBI=0.0482689;REFB=-0.0125855;REVB=0.00285857;RO=19;SAF=11;SAR=7;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0195539;STB=0.527192;TYPE=snp;VARB=0.0107828;OID=.;OPOS=64950970;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:37:38:19:19:18:19:7:11:12:7:8:11:12:7 chr11 64981472 . G C 50.19 PASS AO=16;DP=46;FAO=16;FDP=47;FR=.;FRO=31;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=-0.145314;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0425;QD=4.27151;RBI=0.154922;REFB=-0.00528023;REVB=0.0537066;RO=30;SAF=4;SAR=12;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.299723;STB=0.689405;TYPE=snp;VARB=0.0094887;OID=.;OPOS=64981472;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:46:47:30:31:16:16:12:4:15:15:12:4:16:15 chr11 64981522 . C A 28.55 PASS AO=6;DP=24;FAO=7;FDP=22;FR=.,HEALED;FRO=14;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.010837;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.752;QD=5.19027;RBI=0.0176666;REFB=-0.0197674;REVB=-0.0139524;RO=9;SAF=2;SAR=4;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.693879;TYPE=snp;VARB=0.0412463;OID=.;OPOS=64981522;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:21:22:9:14:6:7:4:2:3:6:5:2:8:6 chr11 64981837 . C T 33.99 PASS AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.0285123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.187;QD=5.43838;RBI=0.0337169;REFB=-0.0357135;REVB=0.0179967;RO=16;SAF=2;SAR=7;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.381346;STB=0.732786;TYPE=snp;VARB=0.0439813;OID=.;OPOS=64981837;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:25:25:16:16:9:9:7:2:9:7:7:2:9:7 chr11 64981853 . G T 71.67 PASS AO=12;DP=20;FAO=12;FDP=20;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.024789;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.3683;QD=14.3344;RBI=0.080711;REFB=-0.0151914;REVB=0.07681;RO=8;SAF=4;SAR=8;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0677961;STB=0.538399;TYPE=snp;VARB=0.014005;OID=.;OPOS=64981853;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:20:20:8:8:12:12:8:4:2:6:8:4:2:6 chr11 64990041 . G C 680.28 PASS AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0363325;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.026;QD=37.7931;RBI=0.0402171;REFB=0;REVB=0.0172442;RO=0;SAF=18;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.33789e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.04833e-05;OID=.;OPOS=64990041;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:72:72:0:0:72:72:54:18:0:0:54:18:0:0 chr11 65000719 . C T 552.4 PASS AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0209281;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=158.799;QD=36.2226;RBI=0.0351952;REFB=-0.0142125;REVB=0.0282969;RO=1;SAF=12;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0377019;STB=0.519993;TYPE=snp;VARB=0.000114262;OID=.;OPOS=65000719;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:61:61:1:1:60:60:48:12:1:0:48:12:1:0 chr11 65004301 . G T 725.29 PASS AO=70;DP=70;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0474444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9029;QD=38.1731;RBI=0.122112;REFB=0;REVB=0.112518;RO=0;SAF=28;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40816e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00119304;OID=.;OPOS=65004301;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:70:76:0:0:70:76:42:28:0:0:47:29:0:0 chr11 65089459 . G A 65.8 PASS AO=23;DP=68;FAO=23;FDP=68;FR=.;FRO=45;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=0.00220861;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=39.5468;QD=3.87075;RBI=0.0713954;REFB=-0.0302357;REVB=0.0713613;RO=36;SAF=7;SAR=16;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219401;STB=0.585838;TYPE=snp;VARB=0.0535629;OID=.;OPOS=65089459;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:68:68:36:45:23:23:16:7:18:18:16:7:19:26 chr11 65089792 . G C 303.38 PASS AO=21;DP=37;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170019;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=88.3211;QD=34.6716;RBI=0.156641;REFB=0;REVB=0.155715;RO=0;SAF=14;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00403978;OID=.;OPOS=65089792;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:21:35:0:0:21:35:7:14:0:0:18:17:0:0 chr11 65120390 . T TC 1040.67 PASS AO=24;DP=144;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0486565;FXX=0.0141834;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.519;QD=29.9473;RBI=0.129278;REFB=-0.0803046;REVB=-0.119772;RO=108;SAF=12;SAR=12;SRF=59;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0590777;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-0.000623972;OID=.;OPOS=65120391;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:24:144:139:139:0:74:65:0:0:85:108:12:12:59:49 chr11 65120391 . T C 530.25 PASS AO=94;DP=143;FAO=93;FDP=142;FR=.;FRO=49;FSAF=46;FSAR=47;FSRF=31;FSRR=18;FWDB=-0.0105133;FXX=0.00699252;HRUN=10;LEN=1;MLLD=147.681;QD=14.9367;RBI=0.0131709;REFB=-0.149261;REVB=0.00793371;RO=38;SAF=47;SAR=47;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0423877;STB=0.547576;TYPE=snp;VARB=0.00633758;OID=.;OPOS=65120391;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:142:38:49:94:93:47:47:22:16:47:46:31:18 chr11 65144075 . T C 555.55 PASS AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0195021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.558;QD=37.037;RBI=0.02356;REFB=0.0380057;REVB=-0.0132189;RO=1;SAF=1;SAR=58;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00806833;STB=0.504272;TYPE=snp;VARB=3.10385e-05;OID=.;OPOS=65144075;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:60:60:1:1:59:59:58:1:0:1:58:1:0:1 chr11 65144138 . TG T 181.45 PASS AO=26;DP=34;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0621842;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=14.648;QD=23.4124;RBI=0.208383;REFB=0.00643454;REVB=-0.198888;RO=3;SAF=10;SAR=16;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0.508475;SSSB=-0.0561959;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00156833;OID=.;OPOS=65144139;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:26:31:31:31:0:12:19:0:0:14:3:10:16:2:1 chr11 65161129 . C T 248.67 PASS AO=26;DP=28;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0678347;FXX=0.0714031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.181;QD=38.2566;RBI=0.0901854;REFB=0;REVB=0.0594294;RO=0;SAF=17;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00106062;OID=.;OPOS=65161129;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:28:26:0:0:26:26:9:17:0:0:9:17:0:0 chr11 65161559 . CG C 53.96 PASS AO=23;DP=45;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=1;FSAR=20;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.0966391;FXX=0.0444346;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.1376;QD=5.0194;RBI=0.145479;REFB=-0.0368523;REVB=-0.108743;RO=20;SAF=1;SAR=22;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.633531;STB=0.857896;TYPE=del;VARB=0.0387762;OID=.;OPOS=65161560;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:23:45:21:43:22:1:20:9:13:53:20:1:22:9:11 chr11 65180883 . A G 1318.26 PASS AO=138;DP=141;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0230805;FXX=0.028167;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.072;QD=38.2105;RBI=0.0235282;REFB=0;REVB=0.00456783;RO=0;SAF=45;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.37344e-05;OID=.;OPOS=65180883;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:141:138:0:0:138:138:93:45:0:0:93:45:0:0 chr11 65293819 . G A 35.44 PASS AO=4;DP=16;FAO=7;FDP=15;FR=.,HEALED;FRO=8;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.110672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.5543;QD=9.45148;RBI=0.125687;REFB=-0.0241186;REVB=0.0595727;RO=8;SAF=4;SAR=0;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.703678;STB=0.538351;TYPE=snp;VARB=0.0668001;OID=.;OPOS=65293819;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:15:15:8:8:4:7:0:4:4:4:3:4:4:4 chr11 65347636 . G C 306.11 PASS AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00117006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7818;QD=37.1044;RBI=0.0635181;REFB=0;REVB=-0.0635073;RO=0;SAF=32;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00134985;OID=.;OPOS=65347636;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:33:33:0:0:33:33:1:32:0:0:1:32:0:0 chr11 65349756 . T G 292.03 PASS AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0257779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.414;QD=38.9374;RBI=0.0260579;REFB=0;REVB=-0.00380955;RO=0;SAF=25;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.91625e-05;OID=.;OPOS=65349756;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:30:30:0:0:30:30:5:25:0:0:5:25:0:0 chr11 65349849 . A T 183.08 PASS AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3328;QD=38.5435;RBI=0.166159;REFB=0;REVB=0.165233;RO=0;SAF=18;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00417489;OID=.;OPOS=65349849;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:19:19:0:0:19:19:1:18:0:0:1:18:0:0 chr11 65351179 . GC G,CG 76.42 PASS AO=6,4;DP=18;FAO=8,4;FDP=14;FR=.;FRO=2;FSAF=7,4;FSAR=1,0;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0360635,-0.0133752;FXX=0.0666222;HRUN=3,1;LEN=1,2;MLLD=15.6405,24.8202;QD=21.833;RBI=0.0362735,0.102775;REFB=-0.00486127,0.0504863;REVB=0.00389835,0.101901;RO=3;SAF=6,4;SAR=0,0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.562356,0.5;TYPE=del,mnp;VARB=0.0512656,-0.0338756;OID=.,.;OPOS=65351180,65351179;OREF=C,GC;OALT=-,CG;OMAPALT=G,CG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:14:15:14:3:2:6,4:8,4:0,0:6,4:3:0:1,0:7,4:2:0 chr11 65380916 . G A 90.39 PASS AO=25;DP=61;FAO=25;FDP=62;FR=.;FRO=37;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.000945142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.8239;QD=5.8317;RBI=0.0177237;REFB=-0.011533;REVB=0.0176985;RO=35;SAF=16;SAR=9;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161905;STB=0.609635;TYPE=snp;VARB=0.0289051;OID=.;OPOS=65380916;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:61:62:35:37:25:25:9:16:17:18:9:16:17:20 chr11 65381458 . C G 45.44 PASS AO=2;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.217761;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=18.1524;QD=20.1947;RBI=0.217761;REFB=-0.119374;REVB=0;RO=2;SAF=2;SAR=0;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0862194;OID=.;OPOS=65381458;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:5:9:2:2:2:7:0:2:2:0:0:7:2:0 chr11 65383896 . G C 531.47 PASS AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0055109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.1708;QD=37.9622;RBI=0.00750479;REFB=0;REVB=0.0050943;RO=0;SAF=41;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.11632e-06;OID=.;OPOS=65383896;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:56:56:0:0:56:56:15:41:0:0:15:41:0:0 chr11 65385606 . A G 668.46 PASS AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.160431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.5582;QD=38.1976;RBI=0.162188;REFB=0;REVB=-0.023809;RO=0;SAF=19;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.34984e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00107269;OID=.;OPOS=65385606;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:70:70:0:0:70:70:51:19:0:0:51:19:0:0 chr11 65387378 . T A 460.47 PASS AO=47;DP=53;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0660332;FXX=0.0357079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.7673;QD=34.1089;RBI=0.0799881;REFB=-0.0225946;REVB=0.0451411;RO=1;SAF=32;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0144729;STB=0.506664;TYPE=snp;VARB=0.00341546;OID=.;OPOS=65387378;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:53:54:1:1:47:53:15:32:1:0:16:37:1:0 chr11 65412467 . G A 154.02 PASS AO=25;DP=35;FAO=25;FDP=37;FR=.;FRO=12;FSAF=25;FSAR=0;FSRF=12;FSRR=0;FWDB=-0.0140828;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=96.2111;QD=16.6511;RBI=0.0140828;REFB=-0.0304538;REVB=0;RO=10;SAF=25;SAR=0;SRF=10;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0237961;OID=.;OPOS=65412467;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:35:37:10:12:25:25:0:25:10:0:0:25:12:0 chr11 65417434 . G A 27.63 PASS AO=8;DP=23;FAO=8;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=14;FWDB=-0.0684741;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=107.182;QD=4.42117;RBI=0.0707133;REFB=-0.0270518;REVB=0.0176544;RO=15;SAF=4;SAR=4;SRF=1;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.48975;STB=0.719556;TYPE=snp;VARB=0.051582;OID=.;OPOS=65417434;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:23:25:15:17:8:8:4:4:1:14:4:4:3:14 chr11 65423082 . G A 1509.14 PASS AO=159;DP=162;FAO=160;FDP=160;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00504552;FXX=0.0184038;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.706;QD=37.7284;RBI=0.0279492;REFB=0.030716;REVB=-0.02749;RO=2;SAF=84;SAR=75;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000671056;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00195688;OID=.;OPOS=65423082;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:162:160:2:0:159:160:75:84:1:1:76:84:0:0 chr11 65546593 . GC G,GG 143.33 PASS AO=7,8;DP=34;FAO=25,9;FDP=41;FR=.;FRO=7;FSAF=12,1;FSAR=13,8;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.889937,-0.325506;FXX=0.0238039;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=8.9332,10.0923;QD=13.9836;RBI=0.890006,0.328846;REFB=0.230316,0.0453456;REVB=-0.0111204,0.0467509;RO=10;SAF=0,0;SAR=7,8;SRF=3;SRR=7;SSEN=0.388489,0;SSEP=0.416667,0;SSSB=-0.736633,-0.753653;STB=0.511269,0.726651;TYPE=del,snp;VARB=-0.0785915,-0.0508722;OID=.,.;OPOS=65546594,65546594;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:7,8:31:25,9:41:7:12,1:13,8:3:4:23:10:0,0:7,8:3:7 chr11 65563502 . TA T 124.76 PASS AO=19;DP=91;FAO=38;FDP=95;FR=.;FRO=57;FSAF=12;FSAR=26;FSRF=31;FSRR=26;FWDB=-0.00996092;FXX=0.0306091;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.696;QD=5.25319;RBI=0.0170219;REFB=0.0088773;REVB=-0.0138031;RO=53;SAF=5;SAR=14;SRF=30;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.37117;STB=0.641714;TYPE=del;VARB=-0.0166083;OID=.;OPOS=65563503;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:19:90:38:95:57:12:26:31:26:99:53:5:14:30:23 chr11 65623519 . G A 994.68 PASS AO=113;DP=123;FAO=115;FDP=121;FR=.;FRO=6;FSAF=58;FSAR=57;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0304688;FXX=0.0162588;HRUN=4;LEN=1;MLLD=112.69;QD=32.882;RBI=0.0486637;REFB=-0.111052;REVB=0.0379448;RO=6;SAF=57;SAR=56;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0163513;STB=0.508478;TYPE=snp;VARB=0.00229179;OID=.;OPOS=65623519;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:123:121:6:6:113:115:56:57:2:4:57:58:2:4 chr11 65624934 . A C 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00316925;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.413;QD=33.022;RBI=0.00676035;REFB=0;REVB=0.00597144;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000152174;OID=.;OPOS=65624934;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:5:1:0:0:5:1:0:0 chr11 65628334 . G A 231.77 PASS AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00544389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.935;QD=37.0833;RBI=0.0900069;REFB=0;REVB=0.0898421;RO=0;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99383e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00109829;OID=.;OPOS=65628334;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:25:25:0:0:25:25:11:14:0:0:11:14:0:0 chr11 65629932 . T C 296.8 PASS AO=29;DP=29;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.129;QD=37.0999;RBI=0.0143521;REFB=0;REVB=-0.000385995;RO=0;SAF=7;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.76698e-05;OID=.;OPOS=65629932;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:29:32:0:0:29:32:22:7:0:0:24:8:0:0 chr11 65629934 . G C 296.51 PASS AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0344685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.068;QD=37.0639;RBI=0.0515481;REFB=0;REVB=0.0383292;RO=0;SAF=8;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000330277;OID=.;OPOS=65629934;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:32:32:0:0:32:32:24:8:0:0:24:8:0:0 chr11 65631167 . C T 771.66 PASS AO=84;DP=86;FAO=84;FDP=86;FR=.;FRO=2;FSAF=63;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0230338;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=213.607;QD=35.8913;RBI=0.0546581;REFB=-0.0761209;REVB=0.0495677;RO=2;SAF=63;SAR=21;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0429888;STB=0.522722;TYPE=snp;VARB=0.000321443;OID=.;OPOS=65631167;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:86:86:2:2:84:84:21:63:0:2:21:63:0:2 chr11 65631973 . G A 807.42 PASS AO=84;DP=86;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287723;FXX=0.0116266;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.811;QD=37.9962;RBI=0.0531208;REFB=0;REVB=0.0446539;RO=0;SAF=43;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000243081;OID=.;OPOS=65631973;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:86:85:0:0:84:85:41:43:0:0:41:44:0:0 chr11 65632262 . G T 459.17 PASS AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00827553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.867;QD=38.2641;RBI=0.0236104;REFB=0;REVB=0.0221126;RO=0;SAF=21;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.88823e-05;OID=.;OPOS=65632262;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:48:48:0:0:48:48:27:21:0:0:27:21:0:0 chr11 65636053 . T C 170.86 PASS AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00543144;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.082;QD=37.9686;RBI=0.018697;REFB=0;REVB=-0.0178908;RO=0;SAF=7;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000242918;OID=.;OPOS=65636053;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:18:0:0:18:18:11:7:0:0:11:7:0:0 chr11 65638719 . G A 375.67 PASS AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.014494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.2504;QD=38.5304;RBI=0.0442065;REFB=0;REVB=0.0417629;RO=0;SAF=24;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000190335;OID=.;OPOS=65638719;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:39:39:0:0:39:39:15:24:0:0:15:24:0:0 chr11 65649774 . A G 362.03 PASS AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0753593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.6994;QD=35.32;RBI=0.0814378;REFB=-0.034101;REVB=0.0308723;RO=0;SAF=19;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17587e-08;STB=0.511622;TYPE=snp;VARB=0.00193499;OID=.;OPOS=65649774;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:41:41:0:1:40:40:21:19:0:0:21:19:0:1 chr11 65649984 . T C 210.67 PASS AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.917;QD=36.6385;RBI=0.0266205;REFB=0;REVB=0.0205509;RO=0;SAF=6;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.9951e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000492664;OID=.;OPOS=65649984;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:0:0:23:23:17:6:0:0:17:6:0:0 chr11 65684929 . C T 826.59 PASS AO=101;DP=109;FAO=97;FDP=104;FR=.;FRO=7;FSAF=50;FSAR=47;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=0.0291619;FXX=0.0458673;HRUN=6;LEN=1;MLLD=284.878;QD=31.7919;RBI=0.0300002;REFB=-0.0680698;REVB=-0.00704256;RO=2;SAF=49;SAR=52;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0189681;STB=0.532704;TYPE=snp;VARB=0.000696298;OID=.;OPOS=65684929;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:109:104:2:7:101:97:52:49:2:0:47:50:7:0 chr11 65685225 . T C 279.36 PASS AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000986744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.385;QD=38.5324;RBI=0.0152996;REFB=0;REVB=0.0152678;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000101168;OID=.;OPOS=65685225;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:29:29:0:0:29:29:14:15:0:0:14:15:0:0 chr11 65713207 . T C 484.54 PASS AO=49;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0659717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.9737;QD=38.7632;RBI=0.0665331;REFB=0;REVB=0.00862527;RO=0;SAF=19;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.48867e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000559576;OID=.;OPOS=65713207;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:49:50:0:0:49:50:30:19:0:0:31:19:0:0 chr11 65733393 . C T 925.82 PASS AO=99;DP=102;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0342417;FXX=0.0294089;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.366;QD=37.407;RBI=0.0382249;REFB=-0.0859883;REVB=0.0169897;RO=0;SAF=42;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.37041e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000378889;OID=.;OPOS=65733393;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:102:99:0:0:99:99:57:42:0:0:57:42:0:0 chr11 65787666 . G A 174.93 PASS AO=41;DP=88;FAO=41;FDP=85;FR=.;FRO=44;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=-0.00811934;FXX=0.034087;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.057;QD=8.23211;RBI=0.00894631;REFB=-0.0186938;REVB=-0.0037567;RO=41;SAF=21;SAR=20;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0877487;STB=0.541527;TYPE=snp;VARB=0.0106105;OID=.;OPOS=65787666;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:85:41:44:41:41:20:21:17:24:20:21:19:25 chr11 65787667 . GC G 416.76 PASS AO=47;DP=84;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.275373;FXX=0.0114929;HRUN=3;LEN=1;MLLD=10.2028;QD=19.384;RBI=0.392022;REFB=0;REVB=0.279017;RO=28;SAF=17;SAR=30;SRF=17;SRR=11;SSEN=0.30303;SSEP=0;SSSB=-0.172384;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0151381;OID=.;OPOS=65787668;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:47:84:86:86:0:40:46:0:0:39:28:17:30:17:11 chr11 65788071 . A AT 40.65 PASS AO=2;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.112056;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=57.0048;QD=27.0997;RBI=0.117745;REFB=0;REVB=0.0361576;RO=3;SAF=2;SAR=0;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.666583;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00731108;OID=.;OPOS=65788072;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:2:6:6:6:0:4:2:0:0:4:3:2:0:1:2 chr11 65790527 . G T 276.07 PASS AO=52;DP=86;FAO=52;FDP=85;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=37;FSRF=7;FSRR=26;FWDB=-0.0246819;FXX=0.0116266;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.166;QD=12.9915;RBI=0.0255632;REFB=-0.0181363;REVB=-0.00665432;RO=33;SAF=14;SAR=38;SRF=7;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0532097;STB=0.537223;TYPE=snp;VARB=0.0135411;OID=.;OPOS=65790527;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:85:33:33:52:52:38:14:7:26:37:15:7:26 chr11 65803383 . T C 55.7 PASS AO=17;DP=47;FAO=17;FDP=48;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.0481755;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=66.6314;QD=4.64204;RBI=0.0543473;REFB=-0.012941;REVB=0.0251545;RO=30;SAF=7;SAR=10;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203122;STB=0.627872;TYPE=snp;VARB=0.0104206;OID=.;OPOS=65803383;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:47:48:30:31:17:17:10:7:18:12:10:7:19:12 chr11 65809875 . C A 58.61 PASS AO=18;DP=51;FAO=18;FDP=51;FR=.;FRO=33;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=27;FWDB=0.0502181;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=151.312;QD=4.59648;RBI=0.0524797;REFB=-0.0201432;REVB=-0.0152402;RO=33;SAF=6;SAR=12;SRF=6;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206805;STB=0.618932;TYPE=snp;VARB=0.0213653;OID=.;OPOS=65809875;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:51:51:33:33:18:18:12:6:6:27:12:6:6:27 chr11 65810239 . G A 10.47 PASS AO=2;DP=6;FAO=2;FDP=6;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.688;QD=6.97935;RBI=0.00444768;REFB=-0.00300993;REVB=-0.00444768;RO=4;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00597411;OID=.;OPOS=65810239;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:4:4:2:2:2:0:0:4:2:0:0:4 chr11 65820673 . A G 744.77 PASS AO=170;DP=361;FAO=183;FDP=373;FR=.;FRO=190;FSAF=89;FSAR=94;FSRF=92;FSRR=98;FWDB=0.0709636;FXX=0.00267373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.3273;QD=7.98679;RBI=0.07097;REFB=-0.0102466;REVB=0.000952789;RO=190;SAF=75;SAR=95;SRF=93;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0466511;STB=0.501085;TYPE=snp;VARB=0.0156844;OID=.;OPOS=65820673;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:361:373:190:190:170:183:95:75:93:97:94:89:92:98 chr11 65826704 . G A 44.5 PASS AO=18;DP=63;FAO=18;FDP=63;FR=.;FRO=45;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=32;FWDB=-0.0106313;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.8618;QD=2.8252;RBI=0.0169014;REFB=-0.00744463;REVB=-0.013139;RO=45;SAF=10;SAR=8;SRF=13;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.312546;STB=0.684747;TYPE=snp;VARB=0.0238849;OID=.;OPOS=65826704;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:63:63:45:45:18:18:8:10:13:32:8:10:13:32 chr11 65868310 . T A 723.66 PASS AO=83;DP=84;FAO=81;FDP=84;FR=.;FRO=3;FSAF=33;FSAR=48;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.026411;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.211;QD=34.4598;RBI=0.0293357;REFB=-0.00633856;REVB=-0.0127687;RO=1;SAF=35;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133394;STB=0.521734;TYPE=snp;VARB=0.00209196;OID=.;OPOS=65868310;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:84:84:1:3:83:81:48:35:1:0:48:33:3:0 chr11 65985000 . A C 596.05 PASS AO=24;DP=71;FAO=64;FDP=64;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=48;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0356701;FXX=0.0302984;HRUN=3;LEN=1;MLLD=33.7994;QD=37.2529;RBI=0.093782;REFB=0;REVB=0.0867335;RO=0;SAF=16;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00127884;OID=.;OPOS=65985000;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:31:64:0:0:24:64:8:16:0:0:16:48:0:0 chr11 66010633 . T C 327.51 PASS AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00819173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.5564;QD=37.4298;RBI=0.0356672;REFB=0;REVB=-0.0347138;RO=0;SAF=9;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000370299;OID=.;OPOS=66010633;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:35:35:0:0:35:35:26:9:0:0:26:9:0:0 chr11 66031660 . C T 56.51 PASS AO=12;DP=33;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=-0.00484945;FXX=0.212057;HRUN=4;LEN=1;MLLD=81.517;QD=8.69415;RBI=0.015583;REFB=-0.040632;REVB=-0.0148092;RO=12;SAF=2;SAR=10;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.599815;TYPE=snp;VARB=0.0280313;OID=.;OPOS=66031660;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:27:26:12:14:12:12:10:2:2:10:10:2:4:10 chr11 66035286 . CA C 198.1 PASS AO=23;DP=25;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0596142;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=43.8735;QD=33.0174;RBI=0.161287;REFB=-0.0853996;REVB=-0.149866;RO=1;SAF=15;SAR=8;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0298695;STB=0.516115;TYPE=del;VARB=0.0392539;OID=.;OPOS=66035287;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:23:24:23:24:1:15:8:1:0:5:1:15:8:1:0 chr11 66083129 . T C 11.82 PASS AO=4;DP=19;FAO=4;FDP=19;FR=.;FRO=15;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.00649466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.408;QD=2.48857;RBI=0.00824097;REFB=-0.000347391;REVB=-0.00507276;RO=15;SAF=1;SAR=3;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112906;STB=0.580219;TYPE=snp;VARB=0.0030734;OID=.;OPOS=66083129;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:19:19:15:15:4:4:3:1:5:10:3:1:5:10 chr11 66083782 . G A 74.01 PASS AO=8;DP=27;FAO=13;FDP=22;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.00953784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.284;QD=13.4562;RBI=0.0505177;REFB=-0.0535523;REVB=-0.0496091;RO=7;SAF=5;SAR=3;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0775671;STB=0.525508;TYPE=snp;VARB=0.041125;OID=.;OPOS=66083782;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:17:22:7:9:8:13:3:5:5:2:5:8:5:4 chr11 66099987 . C T 83.08 PASS AO=16;DP=30;FAO=16;FDP=30;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0202237;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.61;QD=11.0775;RBI=0.0359857;REFB=-0.0315679;REVB=0.0297653;RO=13;SAF=8;SAR=8;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.09158;STB=0.566585;TYPE=snp;VARB=0.0138805;OID=.;OPOS=66099987;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:30:30:13:14:16:16:8:8:5:8:8:8:5:9 chr11 66100152 . T C 463.22 PASS AO=53;DP=54;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191682;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=36.2485;QD=33.6885;RBI=0.153087;REFB=-0.0369682;REVB=0.151882;RO=0;SAF=26;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0162416;OID=.;OPOS=66100152;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:54:55:0:0:53:55:27:26:0:0:29:26:0:0 chr11 66102088 . G A 51.07 PASS AO=7;DP=10;FAO=7;FDP=10;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0288901;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=80.6882;QD=20.4268;RBI=0.0406119;REFB=0.0733299;REVB=0.0285427;RO=3;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202067;STB=0.615098;TYPE=snp;VARB=-0.0101191;OID=.;OPOS=66102088;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:10:10:3:3:7:7:5:2:0:3:5:2:0:3 chr11 66107674 . A G 677.13 PASS AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.003647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.614;QD=38.693;RBI=0.0112962;REFB=0;REVB=0.0106912;RO=0;SAF=29;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.70529e-05;OID=.;OPOS=66107674;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:70:70:0:0:70:70:41:29:0:0:41:29:0:0 chr11 66114900 . C T 151.31 PASS AO=39;DP=88;FAO=39;FDP=88;FR=.;FRO=49;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=12;FSRR=37;FWDB=0.0421635;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9264;QD=6.87781;RBI=0.0423041;REFB=-0.00261639;REVB=-0.00344647;RO=49;SAF=13;SAR=26;SRF=12;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102976;STB=0.557494;TYPE=snp;VARB=0.00573;OID=.;OPOS=66114900;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:49:49:39:39:26:13:12:37:26:13:12:37 chr11 66131149 . C T 89.64 PASS AO=17;DP=31;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=1;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=12;FWDB=-0.0518565;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.826;QD=11.5663;RBI=0.051879;REFB=0.00205235;REVB=0.00152979;RO=14;SAF=1;SAR=16;SRF=2;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227614;STB=0.63139;TYPE=snp;VARB=-0.00479753;OID=.;OPOS=66131149;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:31:31:14:14:17:17:16:1:2:12:16:1:2:12 chr11 66161072 . C T 330.36 PASS AO=72;DP=135;FAO=72;FDP=134;FR=.;FRO=62;FSAF=29;FSAR=43;FSRF=31;FSRR=31;FWDB=0.0549096;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.919;QD=9.86142;RBI=0.0556616;REFB=-0.00240929;REVB=-0.00911845;RO=62;SAF=29;SAR=43;SRF=31;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0837245;STB=0.545903;TYPE=snp;VARB=0.00173318;OID=.;OPOS=66161072;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:134:62:62:72:72:43:29:31:31:43:29:31:31 chr11 66188761 . G T 37.33 PASS AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=0.0108872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.472;QD=6.49217;RBI=0.0122255;REFB=-0.00953861;REVB=0.00556163;RO=14;SAF=6;SAR=3;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0557404;STB=0.533261;TYPE=snp;VARB=0.0158679;OID=.;OPOS=66188761;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:23:23:14:14:9:9:3:6:10:4:3:6:10:4 chr11 66240882 . T C 144.2 PASS AO=34;DP=72;FAO=34;FDP=72;FR=.;FRO=38;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=0.0106227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.9952;QD=8.01084;RBI=0.011434;REFB=-0.0373543;REVB=0.00423026;RO=37;SAF=18;SAR=16;SRF=14;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14014;STB=0.570691;TYPE=snp;VARB=0.0195126;OID=.;OPOS=66240882;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:37:38:34:34:16:18:14:23:16:18:15:23 chr11 66254085 . G T 284.04 PASS AO=50;DP=79;FAO=50;FDP=79;FR=.;FRO=29;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=0.0213543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.087;QD=14.3819;RBI=0.0418655;REFB=0.000307025;REVB=0.0360099;RO=29;SAF=28;SAR=22;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0899648;STB=0.548837;TYPE=snp;VARB=0.000146909;OID=.;OPOS=66254085;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:79:79:29:29:50:50:22:28:20:9:22:28:20:9 chr11 66272142 . A G 872.5 PASS AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0200227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.364;QD=37.9346;RBI=0.0387504;REFB=0;REVB=-0.0331766;RO=0;SAF=43;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000101784;OID=.;OPOS=66272142;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:92:92:0:0:92:92:49:43:0:0:49:43:0:0 chr11 66272237 . G A 85.28 PASS AO=23;DP=56;FAO=23;FDP=56;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=-0.0684636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.483;QD=6.09144;RBI=0.0689973;REFB=-0.0418751;REVB=-0.00856532;RO=29;SAF=10;SAR=13;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0474967;STB=0.511801;TYPE=snp;VARB=0.0223353;OID=.;OPOS=66272237;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:56:56:29:33:23:23:13:10:14:15:13:10:15:18 chr11 66282095 . G A 91.5 PASS AO=33;DP=102;FAO=33;FDP=99;FR=.;FRO=66;FSAF=3;FSAR=30;FSRF=23;FSRR=43;FWDB=0.0257461;FXX=0.0388312;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.373;QD=3.69702;RBI=0.0375474;REFB=-0.00353376;REVB=0.0273302;RO=58;SAF=3;SAR=30;SRF=20;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.456752;STB=0.780565;TYPE=snp;VARB=0.00588951;OID=.;OPOS=66282095;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:102:99:58:66:33:33:30:3:20:38:30:3:23:43 chr11 66297363 . C T 15.91 PASS AO=5;DP=20;FAO=5;FDP=20;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.0359058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.3952;QD=3.18286;RBI=0.0362275;REFB=-0.00621509;REVB=0.00481713;RO=14;SAF=2;SAR=3;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0327935;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0125535;OID=.;OPOS=66297363;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:20:20:14:15:5:5:3:2:6:8:3:2:6:9 chr11 66327673 . G A 905.5 PASS AO=96;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118353;FXX=0.0101;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.1152;QD=36.9593;RBI=0.0971965;REFB=-0.112536;REVB=0.0964732;RO=2;SAF=81;SAR=15;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.024747;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00169685;OID=.;OPOS=66327673;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:98:98:2:0:96:98:15:81:1:1:17:81:0:0 chr11 66328095 . T C 239.97 PASS AO=24;DP=24;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0232154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.626;QD=36.918;RBI=0.023354;REFB=0;REVB=0.00254018;RO=0;SAF=11;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000376572;OID=.;OPOS=66328095;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:24:26:0:0:24:26:13:11:0:0:15:11:0:0 chr11 66328719 . T C 392.78 PASS AO=42;DP=43;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0779363;FXX=0.0888691;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.728;QD=38.3197;RBI=0.110842;REFB=0;REVB=0.0788151;RO=0;SAF=19;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00273166;OID=.;OPOS=66328719;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:43:41:0:0:42:41:23:19:0:0:25:16:0:0 chr11 66329732 . A G 577.11 PASS AO=60;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0294056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.751;QD=37.8433;RBI=0.0717979;REFB=0;REVB=0.0655;RO=0;SAF=24;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.9695e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000538497;OID=.;OPOS=66329732;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:60:61:0:0:60:61:36:24:0:0:37:24:0:0 chr11 66331000 . A G 404.75 PASS AO=82;DP=152;FAO=85;FDP=154;FR=.;FRO=69;FSAF=24;FSAR=61;FSRF=25;FSRR=44;FWDB=-0.0107484;FXX=0.0064512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.254;QD=10.513;RBI=0.0112803;REFB=-0.0136511;REVB=-0.00342309;RO=66;SAF=23;SAR=59;SRF=25;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0946397;STB=0.542556;TYPE=snp;VARB=0.0115741;OID=.;OPOS=66331000;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:154:66:69:82:85:59:23:25:41:61:24:25:44 chr11 66331458 . A G 423.66 PASS AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00987385;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.423;QD=37.659;RBI=0.1043;REFB=0;REVB=-0.103832;RO=0;SAF=36;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000760759;OID=.;OPOS=66331458;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:45:45:0:0:45:45:9:36:0:0:9:36:0:0 chr11 66333598 . C T 903.7 PASS AO=91;DP=91;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0504418;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.7935;QD=38.0503;RBI=0.050656;REFB=0;REVB=-0.00465399;RO=0;SAF=43;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000286877;OID=.;OPOS=66333598;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:91:95:0:0:91:95:48:43:0:0:49:46:0:0 chr11 66335548 . A G 339.21 PASS AO=29;DP=29;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.022925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.77;QD=37.6899;RBI=0.0231122;REFB=0;REVB=0.00293604;RO=0;SAF=10;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.64292e-05;OID=.;OPOS=66335548;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:29:36:0:0:29:36:19:10:0:0:24:12:0:0 chr11 66408033 . C G 133.02 PASS AO=45;DP=125;FAO=45;FDP=125;FR=.;FRO=80;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=29;FSRR=51;FWDB=-0.00143382;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.049;QD=4.25671;RBI=0.016458;REFB=0.00843401;REVB=0.0163954;RO=80;SAF=24;SAR=21;SRF=29;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189953;STB=0.60819;TYPE=snp;VARB=-0.014382;OID=.;OPOS=66408033;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:80:80:45:45:21:24:29:51:21:24:29:51 chr11 66408071 . G C 119.98 PASS AO=43;DP=125;FAO=43;FDP=125;FR=.;FRO=82;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=34;FSRR=48;FWDB=-0.00156611;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=240.985;QD=3.83929;RBI=0.00267561;REFB=5.2619e-05;REVB=-0.00216937;RO=82;SAF=26;SAR=17;SRF=34;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215062;STB=0.623559;TYPE=snp;VARB=-0.000116279;OID=.;OPOS=66408071;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:82:82:43:43:17:26:34:48:17:26:34:48 chr11 66458980 . G A 56.72 PASS AO=17;DP=47;FAO=17;FDP=47;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=22;FSRR=8;FWDB=0.0167069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.812;QD=4.82755;RBI=0.0874619;REFB=-0.0148621;REVB=0.0858514;RO=30;SAF=11;SAR=6;SRF=22;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10741;STB=0.56243;TYPE=snp;VARB=0.028867;OID=.;OPOS=66458980;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:47:47:30:30:17:17:6:11:22:8:6:11:22:8 chr11 66460527 . C T 143.28 PASS AO=38;DP=88;FAO=38;FDP=88;FR=.;FRO=50;FSAF=29;FSAR=9;FSRF=33;FSRR=17;FWDB=0.0021209;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.621;QD=6.51281;RBI=0.00456095;REFB=-0.0195426;REVB=-0.00403782;RO=49;SAF=29;SAR=9;SRF=32;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138823;STB=0.574653;TYPE=snp;VARB=0.0306087;OID=.;OPOS=66460527;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:49:50:38:38:9:29:32:17:9:29:33:17 chr11 66468469 . A G 50.78 PASS AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=0.0496837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.0295;QD=6.15573;RBI=0.0743465;REFB=-0.0462787;REVB=-0.0553076;RO=20;SAF=3;SAR=10;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0938032;STB=0.555466;TYPE=snp;VARB=0.0466146;OID=.;OPOS=66468469;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:33:33:20:20:13:13:10:3:6:14:10:3:6:14 chr11 66743098 . C T 145.62 PASS AO=25;DP=40;FAO=25;FDP=40;FR=.;FRO=15;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=3;FWDB=-0.00862496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.4202;QD=14.562;RBI=0.0568842;REFB=-0.0208859;REVB=0.0562266;RO=15;SAF=12;SAR=13;SRF=12;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216572;STB=0.618957;TYPE=snp;VARB=0.0124912;OID=.;OPOS=66743098;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:40:40:15:15:25:25:13:12:12:3:13:12:12:3 chr11 66837965 . T C 677.11 PASS AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0292105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.231;QD=38.6918;RBI=0.067985;REFB=0;REVB=0.0613898;RO=0;SAF=29;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000109781;OID=.;OPOS=66837965;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:70:70:0:0:70:70:41:29:0:0:41:29:0:0 chr11 66995603 . T C 1867.72 PASS AO=203;DP=204;FAO=200;FDP=200;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000285174;FXX=0.0338148;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.58;QD=37.3544;RBI=0.00154716;REFB=-0.019047;REVB=-0.00152065;RO=1;SAF=99;SAR=104;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00455807;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000554786;OID=.;OPOS=66995603;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:204:200:1:0:203:200:104:99:0:1:106:94:0:0 chr11 67050292 . G A 126.95 PASS AO=16;DP=19;FAO=16;FDP=19;FR=.;FRO=3;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0468151;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=187.446;QD=26.7255;RBI=0.0566718;REFB=-0.0207812;REVB=0.0319381;RO=3;SAF=7;SAR=9;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130187;STB=0.571342;TYPE=snp;VARB=0.00281221;OID=.;OPOS=67050292;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:19:19:3:3:16:16:9:7:0:3:9:7:0:3 chr11 67068859 . T C 182.07 PASS AO=20;DP=21;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0839179;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.694;QD=33.1032;RBI=0.0839187;REFB=-0.153429;REVB=-0.000376832;RO=1;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0400637;STB=0.519981;TYPE=snp;VARB=0.00258134;OID=.;OPOS=67068859;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:21:22:1:1:20:21:11:9:0:1:12:9:0:1 chr11 67071584 . C G 339.17 PASS AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0639722;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.4841;QD=37.6858;RBI=0.0661514;REFB=0;REVB=-0.0168397;RO=0;SAF=1;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=9.00013e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000777528;OID=.;OPOS=67071584;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:36:36:0:0:36:36:35:1:0:0:35:1:0:0 chr11 67164842 . T G 10.23 PASS AO=2;DP=6;FAO=2;FDP=6;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.024441;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.9311;QD=6.82175;RBI=0.024441;REFB=-0.00816293;REVB=0;RO=4;SAF=2;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0919784;OID=.;OPOS=67164842;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:4:4:2:2:0:2:4:0:0:2:4:0 chr11 67177278 . G A 296.8 PASS AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00205156;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.397;QD=37.0998;RBI=0.0192631;REFB=0;REVB=0.0191536;RO=0;SAF=25;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000142377;OID=.;OPOS=67177278;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:32:32:0:0:32:32:7:25:0:0:7:25:0:0 chr11 67232265 . C A 19.89 PASS AO=4;DP=11;FAO=4;FDP=11;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=0;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=-0.00153928;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=68.6257;QD=7.2343;RBI=0.00153928;REFB=-0.0425545;REVB=0;RO=7;SAF=4;SAR=0;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.100473;OID=.;OPOS=67232265;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:11:11:7:7:4:4:0:4:7:0:0:4:7:0 chr11 67235051 . G A 64.76 PASS AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=12;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=0;FWDB=0.0229095;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.7674;QD=10.3613;RBI=0.0371042;REFB=-0.0279004;REVB=0.0291869;RO=12;SAF=12;SAR=1;SRF=12;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.302557;STB=0.666485;TYPE=snp;VARB=0.0177736;OID=.;OPOS=67235051;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:25:25:12:12:13:13:1:12:12:0:1:12:12:0 chr11 67257823 . C A 363.99 PASS AO=37;DP=38;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.011687;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7794;QD=36.399;RBI=0.0121138;REFB=-0.0924072;REVB=0.00318707;RO=1;SAF=12;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0183679;STB=0.509086;TYPE=snp;VARB=0.0118486;OID=.;OPOS=67257823;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:38:40:1:1:37:39:25:12:0:1:27:12:0:1 chr11 67258391 . A G 193.99 PASS AO=17;DP=17;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.267;QD=38.7982;RBI=0.0488308;REFB=0;REVB=0.044498;RO=0;SAF=7;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000477925;OID=.;OPOS=67258391;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:17:20:0:0:17:20:10:7:0:0:13:7:0:0 chr11 67259577 . G A 18.73 PASS AO=5;DP=15;FAO=5;FDP=17;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=-0.000662707;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=156.98;QD=4.4079;RBI=0.00253963;REFB=-0.0149495;REVB=0.00245164;RO=10;SAF=1;SAR=4;SRF=9;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.64267;STB=0.849833;TYPE=snp;VARB=0.0242385;OID=.;OPOS=67259577;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:15:17:10:12:5:5:4:1:9:1:4:1:9:3 chr11 67263767 . A G 147.38 PASS AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0254443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.542;QD=36.844;RBI=0.0311634;REFB=0;REVB=0.0179928;RO=0;SAF=6;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000205708;OID=.;OPOS=67263767;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:16:0:0:16:16:10:6:0:0:10:6:0:0 chr11 67266164 . C T 76.78 PASS AO=13;DP=23;FAO=14;FDP=24;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0668721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.369;QD=12.7973;RBI=0.0671996;REFB=-0.041443;REVB=0.00662612;RO=10;SAF=6;SAR=7;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0294478;STB=0.530077;TYPE=snp;VARB=0.0198476;OID=.;OPOS=67266164;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:23:24:10:10:13:14:7:6:5:5:8:6:5:5 chr11 67288594 . C T 94.83 PASS AO=18;DP=39;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=0.031152;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=147.695;QD=8.82116;RBI=0.031467;REFB=-0.0185147;REVB=-0.00444094;RO=21;SAF=5;SAR=13;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0629543;STB=0.519981;TYPE=snp;VARB=0.0172058;OID=.;OPOS=67288594;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:39:43:21:22:18:21:13:5:7:14:15:6:7:15 chr11 67290152 . GC G 51.23 PASS AO=10;DP=17;FAO=12;FDP=17;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.0775443;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=18.5454;QD=12.0549;RBI=0.257026;REFB=-0.0373939;REVB=-0.24505;RO=4;SAF=3;SAR=7;SRF=4;SRR=0;SSEN=0.311321;SSEP=0;SSSB=-0.351867;STB=0.726883;TYPE=del;VARB=-0.00775625;OID=.;OPOS=67290153;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:10:17:12:17:5:3:9:5:0:13:4:3:7:4:0 chr11 67351585 . C G 105.72 PASS AO=21;DP=40;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=19;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.0419226;FXX=0.0697512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9066;QD=10.5722;RBI=0.123261;REFB=-0.0484684;REVB=-0.115913;RO=16;SAF=19;SAR=2;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.441221;STB=0.782433;TYPE=snp;VARB=0.0216472;OID=.;OPOS=67351585;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:40:40:16:19:21:21:2:19:9:7:2:19:10:9 chr11 67371794 . T G 10.38 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0306121;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=189.446;QD=5.93039;RBI=0.0306121;REFB=-0.00620715;REVB=0;RO=5;SAF=2;SAR=0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.112005;OID=.;OPOS=67371794;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:5:5:2:2:0:2:5:0:0:2:5:0 chr11 67372477 . G T 138.11 PASS AO=34;DP=74;FAO=34;FDP=74;FR=.;FRO=40;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=14;FWDB=0.0313105;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=213.455;QD=7.46543;RBI=0.0344361;REFB=0.000892023;REVB=-0.0143351;RO=40;SAF=17;SAR=17;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144861;STB=0.581035;TYPE=snp;VARB=-0.00123635;OID=.;OPOS=67372477;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:40:40:34:34:17:17:26:14:17:17:26:14 chr11 67395714 . C T 144.01 PASS AO=39;DP=92;FAO=39;FDP=92;FR=.;FRO=53;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=29;FSRR=24;FWDB=0.0096324;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.6952;QD=6.26145;RBI=0.0175912;REFB=0.0131014;REVB=0.0147197;RO=53;SAF=22;SAR=17;SRF=29;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0175357;STB=0.509888;TYPE=snp;VARB=-0.0166895;OID=.;OPOS=67395714;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:53:53:39:39:17:22:29:24:17:22:29:24 chr11 67399216 . TC T 68.2 PASS AO=10;DP=19;FAO=15;FDP=17;FR=.;FRO=2;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.2746;FXX=0.0555247;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.2296;QD=16.046;RBI=0.284852;REFB=-0.0366022;REVB=-0.0757329;RO=7;SAF=3;SAR=7;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0.545455;SSSB=-0.473371;STB=0.555483;TYPE=del;VARB=0.0890589;OID=.;OPOS=67399217;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:10:18:15:17:2:8:7:2:0:3:7:3:7:7:0 chr11 67399832 . G A 34.2 PASS AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.00781722;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.8482;QD=11.4002;RBI=0.00781722;REFB=-0.196298;REVB=0;RO=6;SAF=6;SAR=0;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.165148;OID=.;OPOS=67399832;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:12:12:6:6:6:6:0:6:6:0:0:6:6:0 chr11 67430762 . T C 813.21 PASS AO=89;DP=92;FAO=89;FDP=91;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.000517858;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.3256;QD=35.7453;RBI=0.0499296;REFB=-0.0884404;REVB=-0.0499269;RO=0;SAF=31;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508473;TYPE=snp;VARB=0.000469774;OID=.;OPOS=67430762;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:92:91:0:2:89:89:58:31:0:0:58:31:0:2 chr11 67432804 . T C 435.33 PASS AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.192;QD=37.855;RBI=0.0185696;REFB=0;REVB=0.00984077;RO=0;SAF=22;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.77804e-05;OID=.;OPOS=67432804;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:46:46:0:0:46:46:24:22:0:0:24:22:0:0 chr11 67432854 . T C 463.96 PASS AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0220852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.375;QD=35.6891;RBI=0.0335187;REFB=-0.0252922;REVB=0.025214;RO=1;SAF=28;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200325;STB=0.510634;TYPE=snp;VARB=0.000607983;OID=.;OPOS=67432854;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:52:52:1:1:51:51:23:28:0:1:23:28:0:1 chr11 67433869 . C T 102.66 PASS AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00207204;FXX=0.0832639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.898;QD=37.3309;RBI=0.0429305;REFB=0;REVB=0.0428805;RO=0;SAF=9;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00112886;OID=.;OPOS=67433869;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:11:11:2:9:0:0:2:9:0:0 chr11 67434415 . GC G,GA 205.98 PASS AO=6,17;DP=23;FAO=6,17;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=0,10;FSAR=6,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00651801,0.00872904;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=247.811,265.51;QD=35.8229;RBI=0.023711,0.0381435;REFB=0,0;REVB=0.0227975,0.0371313;RO=0;SAF=0,10;SAR=6,7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.00626679,-0.00138118;OID=.,.;OPOS=67434416,67434416;OREF=C,C;OALT=-,A;OMAPALT=G,GA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:6,17:23:6,17:23:0:0,10:6,7:0:0:17:0:0,10:6,7:0:0 chr11 67564162 . A G 99.01 PASS AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0526925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9493;QD=39.6035;RBI=0.0641357;REFB=0;REVB=-0.0365634;RO=0;SAF=1;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.8593e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00343486;OID=.;OPOS=67564162;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:9:1:0:0:9:1:0:0 chr11 67564197 . T C 170.26 PASS AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0183593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.8683;QD=37.8352;RBI=0.0447039;REFB=0;REVB=0.04076;RO=0;SAF=4;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000611752;OID=.;OPOS=67564197;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:18:0:0:18:18:14:4:0:0:14:4:0:0 chr11 67564293 . T A 73.84 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.16;QD=36.9199;RBI=0.0513356;REFB=0;REVB=0.0513356;RO=0;SAF=0;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0020856;OID=.;OPOS=67564293;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:8:0:0:0:8:0:0:0 chr11 67663113 . G A 132.11 PASS AO=20;DP=28;FAO=20;FDP=28;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0197404;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.948;QD=18.8723;RBI=0.0197715;REFB=-0.032155;REVB=0.00110812;RO=8;SAF=6;SAR=14;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116643;STB=0.564449;TYPE=snp;VARB=0.0196744;OID=.;OPOS=67663113;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:28:28:8:8:20:20:14:6:4:4:14:6:4:4 chr11 67663116 . T A 279.53 PASS AO=28;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0307513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.711;QD=38.5557;RBI=0.0321094;REFB=0;REVB=0.0092394;RO=0;SAF=11;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31638e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000527685;OID=.;OPOS=67663116;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:28:29:0:0:28:29:17:11:0:0:18:11:0:0 chr11 67663195 . C A 46.8 PASS AO=13;DP=35;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=17;FWDB=0.0155518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.959;QD=5.34833;RBI=0.0156599;REFB=-0.00346324;REVB=0.00183722;RO=22;SAF=5;SAR=8;SRF=5;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188323;STB=0.609603;TYPE=snp;VARB=0.0134775;OID=.;OPOS=67663195;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:35:35:22:22:13:13:8:5:5:17:8:5:5:17 chr11 67763102 . AG A 131.1 PASS AO=16;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.21934;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.8406;QD=27.6009;RBI=0.268861;REFB=0;REVB=0.155487;RO=3;SAF=8;SAR=8;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0.299652;SSSB=-0.0478102;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0296944;OID=.;OPOS=67763103;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:16:19:19:19:0:10:9:0:0:12:3:8:8:2:1 chr11 67763224 . G A 27.69 PASS AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=-0.0197299;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.4723;QD=7.38317;RBI=0.0199445;REFB=-0.00327829;REVB=-0.00291802;RO=9;SAF=5;SAR=1;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.572962;STB=0.849948;TYPE=snp;VARB=0.00376318;OID=.;OPOS=67763224;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:15:15:9:9:6:6:1:5:2:7:1:5:2:7 chr11 67765163 . A AG,G 345.85 PASS AO=27,9;DP=45;FAO=37,2;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=18,2;FSAR=19,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.259289,0.0618362;FXX=0.133304;HRUN=1,2;LEN=1,1;MLLD=24.0245,13.318;QD=35.4719;RBI=0.274143,0.0633847;REFB=0,0;REVB=0.0890142,-0.0139253;RO=8;SAF=14,7;SAR=13,2;SRF=4;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.00778883,0.263859;STB=0.5,0.5;TYPE=ins,snp;VARB=0.016892,0.0498989;OID=.,.;OPOS=67765164,67765163;OREF=-,A;OALT=G,G;OMAPALT=AG,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:45:39:8:0:27,9:37,2:13,2:14,7:4:4:19,0:18,2:0:0 chr11 67786064 . A AC,C 285.63 PASS AO=25,5;DP=31;FAO=30,0;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=11,0;FSAR=19,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162086,-0.143734;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=1,1;MLLD=24.9207,5.5236;QD=38.0846;RBI=0.031392,0.174567;REFB=0,0;REVB=0.0268838,-0.0990662;RO=1;SAF=8,3;SAR=17,2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.054487,-0.121807;STB=0.5,0.5;TYPE=ins,snp;VARB=0.002037,0;OID=.,.;OPOS=67786065,67786064;OREF=-,A;OALT=C,C;OMAPALT=AC,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:31:30:1:0:25,5:30,0:17,2:8,3:1:0:19,0:11,0:0:0 chr11 67789293 . G GC 373.63 PASS AO=43;DP=52;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0735164;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=29.7896;QD=31.1359;RBI=0.0760831;REFB=0;REVB=0.0195952;RO=5;SAF=20;SAR=23;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0263553;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-0.00158985;OID=.;OPOS=67789294;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:43:52:48:48:0:25:23:0:0:33:5:20:23:3:2 chr11 67795299 . G A 71.59 PASS AO=11;DP=16;FAO=11;FDP=16;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0446724;FXX=0.0587889;HRUN=4;LEN=1;MLLD=167.253;QD=17.8986;RBI=0.0604165;REFB=0.00239869;REVB=0.040676;RO=5;SAF=5;SAR=6;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.262873;STB=0.64682;TYPE=snp;VARB=-0.000429992;OID=.;OPOS=67795299;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:16:16:5:5:11:11:6:5:0:5:6:5:0:5 chr11 67798381 . G A 52.85 PASS AO=8;DP=12;FAO=8;FDP=12;FR=.;FRO=4;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.00441365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.89;QD=17.6151;RBI=0.0682857;REFB=-0.00159291;REVB=-0.0681429;RO=4;SAF=7;SAR=1;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196883;STB=0.61088;TYPE=snp;VARB=-9.52591e-05;OID=.;OPOS=67798381;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:12:12:4:4:8:8:1:7:4:0:1:7:4:0 chr11 67803215 . G A 177.44 PASS AO=53;DP=145;FAO=57;FDP=151;FR=.;FRO=94;FSAF=15;FSAR=42;FSRF=33;FSRR=61;FWDB=0.00385689;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.92;QD=4.70041;RBI=0.0120037;REFB=-0.0133326;REVB=-0.0113672;RO=91;SAF=15;SAR=38;SRF=33;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102807;STB=0.566109;TYPE=snp;VARB=0.0253791;OID=.;OPOS=67803215;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:151:91:94:53:57:38:15:33:58:42:15:33:61 chr11 67814979 . G C 604.68 PASS AO=65;DP=68;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.114851;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.0204;QD=35.5693;RBI=0.116868;REFB=-0.16267;REVB=0.0216142;RO=2;SAF=34;SAR=31;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0269769;STB=0.506847;TYPE=snp;VARB=0.00999416;OID=.;OPOS=67814979;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:68:68:2:1:65:67:31:34:2:0:31:36:1:0 chr11 67957518 . A T 1730.22 PASS AO=179;DP=179;FAO=181;FDP=181;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=145;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0541174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.925;QD=38.2369;RBI=0.0584178;REFB=0;REVB=-0.0219989;RO=0;SAF=34;SAR=145;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.65433e-05;OID=.;OPOS=67957518;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:82:179:181:0:0:179:181:145:34:0:0:145:36:0:0 chr11 68030173 . C A 965.33 PASS AO=99;DP=99;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183499;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.0734;QD=37.856;RBI=0.038217;REFB=0;REVB=-0.0335234;RO=0;SAF=29;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000130106;OID=.;OPOS=68030173;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:99:102:0:0:99:102:70:29:0:0:72:30:0:0 chr11 68171013 . T C 867.09 PASS AO=116;DP=146;FAO=118;FDP=143;FR=.;FRO=25;FSAF=66;FSAR=52;FSRF=4;FSRR=21;FWDB=-0.0569774;FXX=0.0205465;HRUN=5;LEN=1;MLLD=103.157;QD=24.2544;RBI=0.0596082;REFB=-0.0291346;REVB=0.0175134;RO=19;SAF=64;SAR=52;SRF=1;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132075;STB=0.569626;TYPE=snp;VARB=0.000453888;OID=.;OPOS=68171013;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:146:143:19:25:116:118:52:64:1:18:52:66:4:21 chr11 68174189 . G A 168.74 PASS AO=35;DP=66;FAO=35;FDP=66;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=-0.0117335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.716;QD=10.2268;RBI=0.0423612;REFB=-0.0234033;REVB=0.0407038;RO=31;SAF=16;SAR=19;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0323676;STB=0.517925;TYPE=snp;VARB=0.0179262;OID=.;OPOS=68174189;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:31:31:35:35:19:16:13:18:19:16:13:18 chr11 68177510 . C T 1262.79 PASS AO=134;DP=135;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00557724;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.458;QD=37.6952;RBI=0.0103162;REFB=-0.0822958;REVB=0.00867863;RO=1;SAF=55;SAR=79;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00597952;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.32849e-05;OID=.;OPOS=68177510;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:135:134:1:0:134:134:79:55:0:1:79:55:0:0 chr11 68201295 . C T 261.58 PASS AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0269161;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.584;QD=34.8772;RBI=0.0777449;REFB=-0.132971;REVB=0.0729369;RO=1;SAF=22;SAR=7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0619467;STB=0.53331;TYPE=snp;VARB=0.00192507;OID=.;OPOS=68201295;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:30:30:1:1:29:29:7:22:0:1:7:22:0:1 chr11 68358106 . CTTTTA C 318.38 PASS AO=38;DP=48;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00836835;FXX=0.166632;HRUN=4;LEN=5;MLLD=226.8;QD=31.8382;RBI=0.00890998;REFB=0;REVB=-0.00305916;RO=0;SAF=20;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0.310231;SSSB=-3.51048e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-2.888e-05;OID=.;OPOS=68358107;OREF=TTTTA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:38:48:40:40:0:22:18:0:0:28:0:20:18:0:0 chr11 68380511 . G A 214.1 PASS AO=51;DP=103;FAO=50;FDP=102;FR=.;FRO=52;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=26;FSRR=26;FWDB=-0.00463127;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.8735;QD=8.39625;RBI=0.00650504;REFB=0.0187694;REVB=-0.00456803;RO=52;SAF=29;SAR=22;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0805874;STB=0.530793;TYPE=snp;VARB=-0.0192429;OID=.;OPOS=68380511;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:102:52:52:51:50:22:29:25:27:22:28:26:26 chr11 68548139 . GC G 674 PASS AO=105;DP=150;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00714931;FXX=0.00704176;HRUN=3;LEN=1;MLLD=10.2726;QD=19.1206;RBI=0.240721;REFB=0.00505363;REVB=0.240615;RO=20;SAF=63;SAR=42;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0.76;SSSB=0.0311732;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00648413;OID=.;OPOS=68548140;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:105:141:141:141:0:87:54:0:0:52:20:63:42:10:10 chr11 68549340 . A G 2007.1 PASS AO=215;DP=219;FAO=216;FDP=216;FR=.;FRO=0;FSAF=108;FSAR=108;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.015249;FXX=0.018181;HRUN=3;LEN=1;MLLD=136.36;QD=37.1684;RBI=0.017209;REFB=-0.141661;REVB=-0.007976;RO=4;SAF=107;SAR=108;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00861628;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000171741;OID=.;OPOS=68549340;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:219:216:4:0:215:216:108:107:1:3:108:108:0:0 chr11 68671477 . T C 33.2 PASS AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=-0.0329498;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.2086;QD=8.3;RBI=0.0366395;REFB=0.0053243;REVB=-0.016024;RO=9;SAF=1;SAR=6;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.590354;STB=0.856122;TYPE=snp;VARB=-0.0129342;OID=.;OPOS=68671477;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:16:16:9:9:7:7:6:1:7:2:6:1:7:2 chr11 68678962 . T C 246.68 PASS AO=52;DP=99;FAO=52;FDP=97;FR=.;FRO=45;FSAF=20;FSAR=32;FSRF=18;FSRR=27;FWDB=-0.026272;FXX=0.0202;HRUN=4;LEN=1;MLLD=179.874;QD=10.1725;RBI=0.0266487;REFB=-0.0118307;REVB=-0.00446501;RO=43;SAF=20;SAR=32;SRF=16;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0109317;STB=0.50751;TYPE=snp;VARB=0.00939411;OID=.;OPOS=68678962;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:97:43:45:52:52:32:20:16:27:32:20:18:27 chr11 68703959 . A G 88.58 PASS AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=0.0680892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.6529;QD=10.4215;RBI=0.0697897;REFB=-0.0475096;REVB=-0.0153121;RO=16;SAF=4;SAR=14;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0431212;STB=0.524246;TYPE=snp;VARB=0.0311963;OID=.;OPOS=68703959;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:34:34:16:16:18:18:14:4:3:13:14:4:3:13 chr11 68704264 . C T 220.29 PASS AO=40;DP=66;FAO=40;FDP=65;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=4;FSRR=21;FWDB=0.0213967;FXX=0.0151492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.113;QD=13.5563;RBI=0.0258853;REFB=-0.0113374;REVB=0.0145682;RO=23;SAF=14;SAR=26;SRF=4;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135873;STB=0.58433;TYPE=snp;VARB=0.00509185;OID=.;OPOS=68704264;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:66:65:23:25:40:40:26:14:4:19:26:14:4:21 chr11 68747807 . TG T 48.68 PASS AO=13;DP=28;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.148758;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.4477;QD=6.95397;RBI=0.198549;REFB=-0.0814164;REVB=0.131502;RO=14;SAF=12;SAR=1;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0.29022;SSSB=0.634995;STB=0.720988;TYPE=del;VARB=0.0738571;OID=.;OPOS=68747808;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:13:28:15:28:13:12:3:5:8:32:14:12:1:5:9 chr11 68748003 . T C 216.73 PASS AO=54;DP=116;FAO=54;FDP=116;FR=.;FRO=62;FSAF=19;FSAR=35;FSRF=27;FSRR=35;FWDB=-0.0610435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.847;QD=7.4733;RBI=0.0703116;REFB=-0.0294885;REVB=-0.0348913;RO=60;SAF=19;SAR=35;SRF=25;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0657491;STB=0.547601;TYPE=snp;VARB=0.0449467;OID=.;OPOS=68748003;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:60:62:54:54:35:19:25:35:35:19:27:35 chr11 68777183 . G T 37.72 PASS AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.032312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.127;QD=8.38164;RBI=0.0426233;REFB=-0.00810426;REVB=0.0277971;RO=9;SAF=3;SAR=5;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153362;STB=0.545344;TYPE=snp;VARB=0.00205727;OID=.;OPOS=68777183;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:18:18:9:10:8:8:5:3:2:7:5:3:3:7 chr11 68822739 . T C 464.85 PASS AO=44;DP=44;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0329368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.461;QD=37.9468;RBI=0.0497664;REFB=0;REVB=0.0373077;RO=0;SAF=11;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000604895;OID=.;OPOS=68822739;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:44:49:0:0:44:49:33:11:0:0:35:14:0:0 chr11 68834968 . T C 173.91 PASS AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204618;FXX=0.0526039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.633;QD=38.6455;RBI=0.0366093;REFB=0;REVB=0.0303571;RO=0;SAF=7;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000600616;OID=.;OPOS=68834968;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:19:18:0:0:18:18:11:7:0:0:11:7:0:0 chr11 68840160 . A G 62.74 PASS AO=20;DP=57;FAO=20;FDP=57;FR=.;FRO=37;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=-0.0221588;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=262.448;QD=4.40289;RBI=0.0275834;REFB=-0.00928324;REVB=-0.0164266;RO=37;SAF=8;SAR=12;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127196;STB=0.574393;TYPE=snp;VARB=0.0187104;OID=.;OPOS=68840160;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:57:57:37:37:20:20:12:8:19:18:12:8:19:18 chr11 68840397 . T C 11.82 PASS AO=4;DP=19;FAO=4;FDP=19;FR=.;FRO=15;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.049837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.999;QD=2.48815;RBI=0.0709051;REFB=-0.0276859;REVB=-0.0504362;RO=14;SAF=1;SAR=3;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0508503;STB=0.580219;TYPE=snp;VARB=0.0506242;OID=.;OPOS=68840397;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:19:19:14:15:4:4:3:1:4:10:3:1:5:10 chr11 68840399 . G A 12.63 PASS AO=4;DP=19;FAO=4;FDP=18;FR=.;FRO=14;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.07214;FXX=0.0526039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.8483;QD=2.80583;RBI=0.0800075;REFB=0.0132038;REVB=0.034598;RO=14;SAF=1;SAR=3;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141006;STB=0.599467;TYPE=snp;VARB=-0.0175696;OID=.;OPOS=68840399;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:19:18:14:14:4:4:3:1:5:9:3:1:5:9 chr11 68840412 . C G 20.91 PASS AO=7;DP=26;FAO=7;FDP=26;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.0264237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.085;QD=3.21712;RBI=0.0433935;REFB=-0.00420546;REVB=-0.0344207;RO=19;SAF=3;SAR=4;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0713947;STB=0.545327;TYPE=snp;VARB=0.0126958;OID=.;OPOS=68840412;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:26:26:19:19:7:7:4:3:7:12:4:3:7:12 chr11 68851414 . T C 483.94 PASS AO=54;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00303459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.744;QD=35.8474;RBI=0.0146585;REFB=0.0279582;REVB=0.0143409;RO=0;SAF=18;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50704;TYPE=snp;VARB=-0.00024207;OID=.;OPOS=68851414;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:54:54:0:1:54:53:36:18:0:0:35:18:0:1 chr11 68851466 . G T 102.95 PASS AO=25;DP=55;FAO=25;FDP=55;FR=.;FRO=30;FSAF=5;FSAR=20;FSRF=7;FSRR=23;FWDB=0.0122458;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.663;QD=7.48743;RBI=0.0350962;REFB=-0.00840426;REVB=0.0328905;RO=30;SAF=5;SAR=20;SRF=7;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0483633;STB=0.52745;TYPE=snp;VARB=0.0107193;OID=.;OPOS=68851466;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:30:30:25:25:20:5:7:23:20:5:7:23 chr11 69063136 . C T 117.07 PASS AO=28;DP=61;FAO=28;FDP=61;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=0.0124407;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.99;QD=7.67655;RBI=0.0181892;REFB=-0.0303861;REVB=-0.0132693;RO=32;SAF=17;SAR=11;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10358;STB=0.550984;TYPE=snp;VARB=0.0246178;OID=.;OPOS=69063136;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:32:33:28:28:11:17:16:16:11:17:17:16 chr11 69063393 . T C 106.63 PASS AO=26;DP=59;FAO=26;FDP=58;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=0.0244005;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.318;QD=7.35401;RBI=0.0257486;REFB=-0.024397;REVB=-0.00822239;RO=30;SAF=14;SAR=12;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0681525;STB=0.555513;TYPE=snp;VARB=0.0396873;OID=.;OPOS=69063393;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:58:30:32:26:26:12:14:14:16:12:14:14:18 chr11 69063572 . A G 55.47 PASS AO=17;DP=48;FAO=17;FDP=48;FR=.;FRO=31;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.00877521;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.781;QD=4.62244;RBI=0.0401772;REFB=-0.0183177;REVB=-0.0392072;RO=31;SAF=5;SAR=12;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188049;STB=0.611123;TYPE=snp;VARB=0.0276254;OID=.;OPOS=69063572;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:48:48:31:31:17:17:12:5:14:17:12:5:14:17 chr11 69063723 . TG T 91.13 PASS AO=10;DP=18;FAO=19;FDP=21;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.227316;FXX=0.0454339;HRUN=7;LEN=1;MLLD=10.1929;QD=17.3574;RBI=0.278182;REFB=0.0517325;REVB=0.160352;RO=4;SAF=2;SAR=8;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0381322;STB=0.528271;TYPE=del;VARB=0.0434722;OID=.;OPOS=69063724;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:10:16:19:21:2:5:14:1:1:5:4:2:8:1:3 chr11 69063984 . C T 136.2 PASS AO=39;DP=97;FAO=39;FDP=96;FR=.;FRO=57;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=14;FSRR=43;FWDB=0.0671978;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.3361;QD=5.67479;RBI=0.0682994;REFB=-0.0162675;REVB=-0.0122173;RO=57;SAF=14;SAR=25;SRF=14;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135683;STB=0.576235;TYPE=snp;VARB=0.0237234;OID=.;OPOS=69063984;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:96:57:57:39:39:25:14:14:43:25:14:14:43 chr11 69462910 . G A 156.12 PASS AO=30;DP=52;FAO=30;FDP=52;FR=.;FRO=22;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=0.0460991;FXX=0.0188644;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.318;QD=12.009;RBI=0.0461134;REFB=-0.0062462;REVB=0.00115009;RO=21;SAF=15;SAR=15;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12456;STB=0.576873;TYPE=snp;VARB=0.0073769;OID=.;OPOS=69462910;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:52:52:21:22:30:30:15:15:7:14:15:15:7:15 chr11 69513143 . CA C 218.02 PASS AO=94;DP=254;FAO=98;FDP=227;FR=.;FRO=129;FSAF=45;FSAR=53;FSRF=54;FSRR=75;FWDB=0.0357835;FXX=0.0502071;HRUN=2;LEN=1;MLLD=24.3287;QD=3.84182;RBI=0.08803;REFB=0.0199607;REVB=0.080429;RO=144;SAF=43;SAR=51;SRF=70;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0309918;STB=0.523299;TYPE=del;VARB=-0.0186722;OID=.;OPOS=69513144;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:94:253:98:227:129:45:53:54:75:99:144:43:51:70:74 chr11 70007311 . A G 574.59 PASS AO=57;DP=58;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272184;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.2009;QD=38.3057;RBI=0.176938;REFB=0;REVB=-0.174832;RO=1;SAF=25;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184904;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00166766;OID=.;OPOS=70007311;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:58:60:1:0:57:60:32:25:1:0:32:28:0:0 chr11 70007392 . A G 775.86 PASS AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0239351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.403;QD=37.8468;RBI=0.023949;REFB=0;REVB=-0.000815962;RO=0;SAF=36;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.14462e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.62017e-05;OID=.;OPOS=70007392;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:82:82:0:0:82:82:46:36:0:0:46:36:0:0 chr11 70185325 . C T 197.2 PASS AO=42;DP=82;FAO=43;FDP=83;FR=.;FRO=40;FSAF=8;FSAR=35;FSRF=7;FSRR=33;FWDB=0.017493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.7217;QD=9.5035;RBI=0.0184723;REFB=-0.0395928;REVB=-0.00593463;RO=38;SAF=8;SAR=34;SRF=7;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00878479;STB=0.508883;TYPE=snp;VARB=0.0200283;OID=.;OPOS=70185325;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:83:38:40:42:43:34:8:7:31:35:8:7:33 chr11 70200529 . C T 496.81 PASS AO=108;DP=212;FAO=114;FDP=223;FR=.;FRO=109;FSAF=42;FSAR=72;FSRF=42;FSRR=67;FWDB=0.0831656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.4076;QD=8.91141;RBI=0.0900399;REFB=-0.0188109;REVB=0.0345061;RO=101;SAF=42;SAR=66;SRF=38;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0117777;STB=0.508832;TYPE=snp;VARB=0.0134462;OID=.;OPOS=70200529;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:223:101:109:108:114:66:42:38:63:72:42:42:67 chr11 70218426 . GC G 697.27 PASS AO=96;DP=137;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.026037;FXX=0.0310053;HRUN=2;LEN=1;MLLD=14.0641;QD=22.3126;RBI=0.257594;REFB=-0.00131315;REVB=0.256275;RO=23;SAF=62;SAR=34;SRF=7;SRR=16;SSEN=0.403226;SSEP=0;SSSB=0.129847;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0115482;OID=.;OPOS=70218427;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:96:128:125:125:0:70:55:0:0:48:23:62:34:7:16 chr11 70229171 . G A 248.18 PASS AO=72;DP=178;FAO=73;FDP=178;FR=.;FRO=105;FSAF=25;FSAR=48;FSRF=47;FSRR=58;FWDB=-0.00748543;FXX=0.00558628;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.804;QD=5.577;RBI=0.0143637;REFB=-0.0136151;REVB=0.012259;RO=105;SAF=25;SAR=47;SRF=47;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112176;STB=0.565982;TYPE=snp;VARB=0.0194424;OID=.;OPOS=70229171;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:178:105:105:72:73:47:25:47:58:48:25:47:58 chr11 70253475 . C T 342.12 PASS AO=73;DP=139;FAO=74;FDP=140;FR=.;FRO=66;FSAF=45;FSAR=29;FSRF=31;FSRR=35;FWDB=0.000874656;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.412;QD=9.77483;RBI=0.00718032;REFB=-0.0148518;REVB=-0.00712685;RO=65;SAF=44;SAR=29;SRF=31;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109896;STB=0.566465;TYPE=snp;VARB=0.0124722;OID=.;OPOS=70253475;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:140:65:66:73:74:29:44:31:34:29:45:31:35 chr11 70282629 . A C 818.92 PASS AO=139;DP=223;FAO=145;FDP=224;FR=.;FRO=79;FSAF=63;FSAR=82;FSRF=24;FSRR=55;FWDB=0.0175258;FXX=0.00444425;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.474;QD=14.6236;RBI=0.0204844;REFB=-0.0381534;REVB=0.0106046;RO=79;SAF=59;SAR=80;SRF=24;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0843525;STB=0.547472;TYPE=snp;VARB=0.0195785;OID=.;OPOS=70282629;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:224:79:79:139:145:80:59:24:55:82:63:24:55 chr11 70333498 . T C 227.07 PASS AO=60;DP=135;FAO=60;FDP=135;FR=.;FRO=75;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=30;FSRR=45;FWDB=-0.0415757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.1;QD=6.72788;RBI=0.0437323;REFB=-0.0114867;REVB=-0.0135637;RO=73;SAF=30;SAR=30;SRF=29;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101341;STB=0.555537;TYPE=snp;VARB=0.0146086;OID=.;OPOS=70333498;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:73:75:60:60:30:30:29:44:30:30:30:45 chr11 70544864 . G C 288.86 PASS AO=75;DP=165;FAO=75;FDP=165;FR=.;FRO=90;FSAF=32;FSAR=43;FSRF=36;FSRR=54;FWDB=0.0216395;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=187.466;QD=7.0026;RBI=0.0219062;REFB=-0.00795819;REVB=-0.00340749;RO=88;SAF=32;SAR=43;SRF=34;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0403752;STB=0.514926;TYPE=snp;VARB=0.0097559;OID=.;OPOS=70544864;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:165:88:90:75:75:43:32:34:54:43:32:36:54 chr11 70666512 . C T 12.63 PASS AO=3;DP=12;FAO=3;FDP=12;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.0751643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.5064;QD=4.21104;RBI=0.0943921;REFB=-0.0375198;REVB=0.0570982;RO=9;SAF=2;SAR=1;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145032;STB=0.599399;TYPE=snp;VARB=0.0875089;OID=.;OPOS=70666512;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:12:12:9:9:3:3:1:2:7:2:1:2:7:2 chr11 71146577 . G A 39.86 PASS AO=10;DP=27;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.0102777;FXX=0.0714031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7651;QD=6.13216;RBI=0.0395174;REFB=0.0117435;REVB=0.0381575;RO=15;SAF=5;SAR=5;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169053;STB=0.615166;TYPE=snp;VARB=-0.00749859;OID=.;OPOS=71146577;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:27:26:15:16:10:10:5:5:5:10:5:5:5:11 chr11 71146691 . A G 173.35 PASS AO=32;DP=53;FAO=32;FDP=53;FR=.;FRO=21;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.00059146;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.284;QD=13.0831;RBI=0.0103817;REFB=0.00653889;REVB=0.0103648;RO=21;SAF=18;SAR=14;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130483;STB=0.57172;TYPE=snp;VARB=-0.00337175;OID=.;OPOS=71146691;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:53:53:21:21:32:32:14:18:8:13:14:18:8:13 chr11 71146952 . G A 90 PASS AO=21;DP=45;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.000466006;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=257.375;QD=7.99969;RBI=0.0192483;REFB=-0.00850865;REVB=-0.0192426;RO=23;SAF=14;SAR=7;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149496;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00792248;OID=.;OPOS=71146952;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:45:45:23:24:21:21:7:14:15:8:7:14:16:8 chr11 71152461 . A G 148.79 PASS AO=47;DP=129;FAO=48;FDP=129;FR=.;FRO=81;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=31;FSRR=50;FWDB=-0.00997049;FXX=0.00769172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.0786;QD=4.61368;RBI=0.0230808;REFB=-0.0200166;REVB=-0.0208162;RO=79;SAF=17;SAR=30;SRF=31;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0361357;STB=0.505152;TYPE=snp;VARB=0.0339318;OID=.;OPOS=71152461;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:79:81:47:48:30:17:31:48:30:18:31:50 chr11 71155153 . A G 218.19 PASS AO=71;DP=183;FAO=70;FDP=183;FR=.;FRO=113;FSAF=37;FSAR=33;FSRF=44;FSRR=69;FWDB=0.00249659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2409;QD=4.76907;RBI=0.00996382;REFB=-0.0115966;REVB=-0.00964597;RO=111;SAF=37;SAR=34;SRF=44;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134505;STB=0.585365;TYPE=snp;VARB=0.0162852;OID=.;OPOS=71155153;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:183:111:113:71:70:34:37:44:67:33:37:44:69 chr11 71155171 . C T 181.66 PASS AO=56;DP=158;FAO=60;FDP=161;FR=.;FRO=101;FSAF=34;FSAR=26;FSRF=40;FSRR=61;FWDB=0.0109158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.257;QD=4.51323;RBI=0.0184224;REFB=-0.0317812;REVB=-0.0148401;RO=98;SAF=33;SAR=23;SRF=40;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200716;STB=0.605865;TYPE=snp;VARB=0.0685245;OID=.;OPOS=71155171;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:161:98:101:56:60:23:33:40:58:26:34:40:61 chr11 71169547 . G C 436.16 PASS AO=77;DP=209;FAO=104;FDP=211;FR=.;FRO=107;FSAF=53;FSAR=51;FSRF=45;FSRR=62;FWDB=-0.0444547;FXX=0.0186038;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.2207;QD=8.26836;RBI=0.0672161;REFB=-0.0121356;REVB=-0.0504161;RO=76;SAF=35;SAR=42;SRF=21;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165587;STB=0.54509;TYPE=snp;VARB=0.0137959;OID=.;OPOS=71169547;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:211:76:107:77:104:42:35:21:55:51:53:45:62 chr11 71183474 . C T 337.97 PASS AO=70;DP=139;FAO=72;FDP=135;FR=.;FRO=63;FSAF=48;FSAR=24;FSRF=25;FSRR=38;FWDB=-0.0143392;FXX=0.0287749;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.8472;QD=10.0139;RBI=0.0437113;REFB=-0.0125627;REVB=0.0412925;RO=69;SAF=47;SAR=23;SRF=27;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.257678;STB=0.629405;TYPE=snp;VARB=0.0109936;OID=.;OPOS=71183474;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:135:69:63:70:72:23:47:27:42:24:48:25:38 chr11 71183477 . C T 304.53 PASS AO=74;DP=140;FAO=70;FDP=140;FR=.;FRO=70;FSAF=47;FSAR=23;FSRF=28;FSRR=42;FWDB=0.0120085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3468;QD=8.70079;RBI=0.0285347;REFB=-0.00225729;REVB=0.0258848;RO=64;SAF=48;SAR=26;SRF=26;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209392;STB=0.639081;TYPE=snp;VARB=0.00416724;OID=.;OPOS=71183477;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:64:70:74:70:26:48:26:38:23:47:28:42 chr11 71184678 . A C 1015.45 PASS AO=107;DP=109;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0630704;FXX=0.00917347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.552;QD=37.6091;RBI=0.0759857;REFB=0.0188491;REVB=0.0423786;RO=1;SAF=59;SAR=48;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00978547;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.34996e-05;OID=.;OPOS=71184678;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:109:108:1:0:107:108:48:59:0:1:49:59:0:0 chr11 71185479 . T C 250.01 PASS AO=67;DP=162;FAO=69;FDP=159;FR=.;FRO=90;FSAF=32;FSAR=37;FSRF=46;FSRR=44;FWDB=0.0159224;FXX=0.0245384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.9235;QD=6.28954;RBI=0.0185321;REFB=-0.00956459;REVB=-0.00948237;RO=89;SAF=30;SAR=37;SRF=46;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0706883;STB=0.526827;TYPE=snp;VARB=0.00628712;OID=.;OPOS=71185479;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:159:89:90:67:69:37:30:46:43:37:32:46:44 chr11 71185518 . T C 304.34 PASS AO=81;DP=182;FAO=81;FDP=182;FR=.;FRO=101;FSAF=33;FSAR=48;FSRF=43;FSRR=58;FWDB=-0.0287074;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.548;QD=6.68886;RBI=0.0291218;REFB=-0.02381;REVB=-0.00489573;RO=101;SAF=33;SAR=48;SRF=43;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.018866;STB=0.510493;TYPE=snp;VARB=0.0280157;OID=.;OPOS=71185518;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:182:101:101:81:81:48:33:43:58:48:33:43:58 chr11 71189436 . T C 282.02 PASS AO=64;DP=126;FAO=64;FDP=126;FR=.;FRO=62;FSAF=14;FSAR=50;FSRF=22;FSRR=40;FWDB=0.000696999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.316;QD=8.9529;RBI=0.00350549;REFB=0.00310538;REVB=-0.0034355;RO=62;SAF=14;SAR=50;SRF=22;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15899;STB=0.588206;TYPE=snp;VARB=-0.00255468;OID=.;OPOS=71189436;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:62:62:64:64:50:14:22:40:50:14:22:40 chr11 71249239 . C CG 22.78 PASS AO=5;DP=8;FAO=4;FDP=8;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0088658;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=17.0723;QD=11.3893;RBI=0.0088658;REFB=-0.104064;REVB=0;RO=3;SAF=5;SAR=0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.122664;OID=.;OPOS=71249240;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:5:8:4:8:4:4:0:4:0:16:3:5:0:3:0 chr11 71249386 . T C 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0304717;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.46;QD=33.022;RBI=0.0348235;REFB=0;REVB=0.0168569;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000915521;OID=.;OPOS=71249386;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:5:1:0:0:5:1:0:0 chr11 71259822 . A G 139.97 PASS AO=19;DP=23;FAO=19;FDP=23;FR=.;FRO=4;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0230123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.296;QD=24.342;RBI=0.0783877;REFB=-0.0130098;REVB=-0.0749338;RO=4;SAF=11;SAR=8;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0255889;STB=0.514004;TYPE=snp;VARB=0.00253452;OID=.;OPOS=71259822;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:23:23:4:4:19:19:8:11:2:2:8:11:2:2 chr11 71260243 . T C 163.04 PASS AO=31;DP=53;FAO=31;FDP=53;FR=.;FRO=22;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.0372055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.566;QD=12.3048;RBI=0.0412572;REFB=-0.0160944;REVB=-0.0178299;RO=22;SAF=17;SAR=14;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0707193;STB=0.538999;TYPE=snp;VARB=0.00748751;OID=.;OPOS=71260243;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:53:53:22:22:31:31:14:17:10:12:14:17:10:12 chr11 71260348 . T A 249.42 PASS AO=49;DP=85;FAO=49;FDP=85;FR=.;FRO=36;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=0.0183626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.145;QD=11.7373;RBI=0.0199487;REFB=-0.0067917;REVB=0.00779524;RO=35;SAF=22;SAR=27;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0378656;STB=0.513863;TYPE=snp;VARB=0.00466442;OID=.;OPOS=71260348;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:35:36:49:49:27:22:14:21:27:22:15:21 chr11 71276632 . T C 37.72 PASS AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=9;FWDB=0.027405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.222;QD=8.38183;RBI=0.0370948;REFB=-0.022214;REVB=-0.0249997;RO=10;SAF=4;SAR=4;SRF=1;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.38401;STB=0.721775;TYPE=snp;VARB=0.0133409;OID=.;OPOS=71276632;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:18:18:10:10:8:8:4:4:1:9:4:4:1:9 chr11 71276681 . T C 48.64 PASS AO=6;DP=8;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.014909;FXX=0.124844;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.128;QD=27.7947;RBI=0.016921;REFB=-0.00944661;REVB=-0.00800265;RO=1;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123249;STB=0.571194;TYPE=snp;VARB=0.0020773;OID=.;OPOS=71276681;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:8:7:1:1:6:6:3:3:0:1:3:3:0:1 chr11 71277273 . T G 105.49 PASS AO=24;DP=56;FAO=26;FDP=58;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=-0.00591813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.168;QD=7.27518;RBI=0.0312733;REFB=-0.00108165;REVB=-0.0307082;RO=32;SAF=12;SAR=12;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0941656;STB=0.530808;TYPE=snp;VARB=0.00131863;OID=.;OPOS=71277273;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:58:32:32:24:26:12:12:13:19:14:12:13:19 chr11 71277598 . A C 162.47 PASS AO=49;DP=124;FAO=49;FDP=124;FR=.;FRO=75;FSAF=38;FSAR=11;FSRF=59;FSRR=16;FWDB=-0.021217;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.476;QD=5.24108;RBI=0.0277074;REFB=-0.0128527;REVB=-0.0178196;RO=73;SAF=38;SAR=11;SRF=57;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0081251;STB=0.509791;TYPE=snp;VARB=0.0163522;OID=.;OPOS=71277598;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:73:75:49:49:11:38:57:16:11:38:59:16 chr11 71277643 . AG A 259.91 PASS AO=19;DP=68;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.031639;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=7.94779;QD=17.9246;RBI=0.132293;REFB=0;REVB=0.128454;RO=3;SAF=9;SAR=10;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119598;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0233555;OID=.;OPOS=71277644;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:19:30:58:58:0:31:27:0:0:28:3:9:10:0:3 chr11 71316780 . G A 235.89 PASS AO=51;DP=97;FAO=51;FDP=97;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=34;FSRF=10;FSRR=36;FWDB=-0.0166945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.3867;QD=9.72724;RBI=0.0217957;REFB=-0.00929555;REVB=0.0140123;RO=45;SAF=17;SAR=34;SRF=10;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111264;STB=0.564492;TYPE=snp;VARB=0.0148149;OID=.;OPOS=71316780;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:45:46:51:51:34:17:10:35:34:17:10:36 chr11 71316920 . C T 155.08 PASS AO=37;DP=79;FAO=37;FDP=79;FR=.;FRO=42;FSAF=12;FSAR=25;FSRF=7;FSRR=35;FWDB=-0.00832287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.192;QD=7.85236;RBI=0.0327689;REFB=-0.0136126;REVB=-0.0316944;RO=42;SAF=12;SAR=25;SRF=7;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185332;STB=0.602461;TYPE=snp;VARB=0.00903139;OID=.;OPOS=71316920;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:42:42:37:37:25:12:7:35:25:12:7:35 chr11 71318195 . G A 34.08 PASS AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.107658;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=80.3761;QD=11.3598;RBI=0.109743;REFB=-0.0132105;REVB=-0.0212922;RO=6;SAF=5;SAR=1;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.45721;STB=0.780223;TYPE=snp;VARB=0.0443799;OID=.;OPOS=71318195;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:12:12:6:6:6:6:1:5:2:4:1:5:2:4 chr11 71507186 . T C 187.65 PASS AO=33;DP=53;FAO=33;FDP=52;FR=.;FRO=19;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.025683;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.534;QD=14.4343;RBI=0.0279867;REFB=-0.04343;REVB=-0.0111195;RO=19;SAF=13;SAR=20;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125306;STB=0.568678;TYPE=snp;VARB=0.0124635;OID=.;OPOS=71507186;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:53:52:19:19:33:33:20:13:11:8:20:13:11:8 chr11 71544269 . C T 302.49 PASS AO=75;DP=163;FAO=78;FDP=167;FR=.;FRO=89;FSAF=26;FSAR=52;FSRF=24;FSRR=65;FWDB=-0.00847591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.1047;QD=7.24535;RBI=0.0102802;REFB=-0.0259512;REVB=-0.00581736;RO=88;SAF=23;SAR=52;SRF=23;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0531437;STB=0.539161;TYPE=snp;VARB=0.0178504;OID=.;OPOS=71544269;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:167:88:89:75:78:52:23:23:65:52:26:24:65 chr11 71548465 . A G 175.33 PASS AO=55;DP=141;FAO=55;FDP=143;FR=.;FRO=88;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=23;FSRR=65;FWDB=0.157971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.0346;QD=4.90443;RBI=0.158141;REFB=0.00401008;REVB=0.00732081;RO=86;SAF=29;SAR=26;SRF=23;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.278856;STB=0.661184;TYPE=snp;VARB=-0.00647145;OID=.;OPOS=71548465;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:143:86:88:55:55:26:29:23:63:26:29:23:65 chr11 71548492 . C T 128.54 PASS AO=44;DP=126;FAO=45;FDP=128;FR=.;FRO=83;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=65;FWDB=-0.0331878;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.8703;QD=4.0169;RBI=0.0406292;REFB=-0.00341178;REVB=0.0234371;RO=81;SAF=23;SAR=21;SRF=18;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.339894;STB=0.700534;TYPE=snp;VARB=0.00655175;OID=.;OPOS=71548492;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:128:81:83:44:45:21:23:18:63:21:24:18:65 chr11 71548520 . A T 95.64 PASS AO=39;DP=124;FAO=39;FDP=125;FR=.;FRO=86;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=67;FWDB=-0.00482989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.786;QD=3.06062;RBI=0.00825619;REFB=0.00516695;REVB=-0.00669603;RO=83;SAF=20;SAR=19;SRF=19;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.335587;STB=0.698816;TYPE=snp;VARB=-0.0118885;OID=.;OPOS=71548520;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:124:125:83:86:39:39:19:20:19:64:19:20:19:67 chr11 71548544 . A G 59.56 PASS AO=27;DP=94;FAO=27;FDP=96;FR=.;FRO=69;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=53;FWDB=0.0038956;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.7903;QD=2.48152;RBI=0.0642278;REFB=-0.00218729;REVB=-0.0641096;RO=67;SAF=13;SAR=14;SRF=16;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.301743;STB=0.681952;TYPE=snp;VARB=0.00963963;OID=.;OPOS=71548544;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:94:96:67:69:27:27:14:13:16:51:14:13:16:53 chr11 71707489 . T C 652.02 PASS AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0325362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.521;QD=38.3539;RBI=0.0445541;REFB=0;REVB=-0.0304379;RO=0;SAF=20;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.58366e-06;OID=.;OPOS=71707489;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:68:68:0:0:68:68:48:20:0:0:48:20:0:0 chr11 71708013 . G A 710.1 PASS AO=70;DP=70;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0462714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.816;QD=37.8718;RBI=0.0525908;REFB=0;REVB=0.0249949;RO=0;SAF=7;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.6383e-05;OID=.;OPOS=71708013;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:70:75:0:0:70:75:63:7:0:0:66:9:0:0 chr11 71714526 . G C 894.76 PASS AO=99;DP=102;FAO=99;FDP=102;FR=.;FRO=3;FSAF=79;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0245837;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.273;QD=35.0885;RBI=0.0759239;REFB=-0.144158;REVB=0.0718337;RO=3;SAF=79;SAR=20;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0659963;STB=0.534876;TYPE=snp;VARB=0.000469947;OID=.;OPOS=71714526;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:102:102:3:3:99:99:20:79:0:3:20:79:0:3 chr11 71714528 . T G 920.08 PASS AO=99;DP=100;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.109434;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.802;QD=35.3878;RBI=0.369999;REFB=0;REVB=0.353445;RO=1;SAF=77;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0210685;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00327374;OID=.;OPOS=71714528;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:100:104:1:0:99:104:22:77:0:1:23:81:0:0 chr11 71724869 . A AC 37.14 PASS AO=43;DP=151;FAO=32;FDP=150;FR=.;FRO=118;FSAF=1;FSAR=31;FSRF=55;FSRR=63;FWDB=-0.126347;FXX=0.00662208;HRUN=0;LEN=1;MLLD=33.0209;QD=0.990411;RBI=0.129282;REFB=-0.0278488;REVB=-0.0273951;RO=102;SAF=2;SAR=41;SRF=54;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.709975;STB=0.94829;TYPE=ins;VARB=0.0903121;OID=.;OPOS=71724870;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:43:151:32:150:118:1:31:55:63:37:102:2:41:54:48 chr11 71941212 . A G 30.32 PASS AO=11;DP=37;FAO=11;FDP=37;FR=.;FRO=26;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=21;FWDB=-0.0191725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.6833;QD=3.27811;RBI=0.0800402;REFB=-0.0306329;REVB=-0.07771;RO=26;SAF=1;SAR=10;SRF=5;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.250367;STB=0.658988;TYPE=snp;VARB=0.0699789;OID=.;OPOS=71941212;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:37:37:26:26:11:11:10:1:5:21:10:1:5:21 chr11 72281818 . A G 1499.34 PASS AO=157;DP=160;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0383163;FXX=0.00624961;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.364;QD=37.7193;RBI=0.041943;REFB=0;REVB=-0.017061;RO=2;SAF=79;SAR=78;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0120413;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.3545e-05;OID=.;OPOS=72281818;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:160:159:2:0:157:159:78:79:0:2:80:79:0:0 chr11 72281884 . C T 2000.74 PASS AO=201;DP=202;FAO=208;FDP=208;FR=.;FRO=0;FSAF=99;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0913561;FXX=0.00952336;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.844;QD=38.4757;RBI=0.0933121;REFB=0;REVB=0.019006;RO=0;SAF=93;SAR=108;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000662704;OID=.;OPOS=72281884;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:94:202:208:0:0:201:208:108:93:0:0:109:99:0:0 chr11 72287350 . A G 350.97 PASS AO=36;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.809;QD=36.9444;RBI=0.0116906;REFB=0;REVB=0.0116906;RO=0;SAF=0;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.04982e-05;OID=.;OPOS=72287350;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:37:38:0:0:36:38:36:0:0:0:38:0:0:0 chr11 72288599 . G A 130.23 PASS AO=40;DP=104;FAO=40;FDP=104;FR=.;FRO=64;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=31;FSRR=33;FWDB=-0.0209643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.395;QD=5.00867;RBI=0.0650726;REFB=-0.0215583;REVB=0.0616031;RO=64;SAF=15;SAR=25;SRF=31;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121516;STB=0.569272;TYPE=snp;VARB=0.0379063;OID=.;OPOS=72288599;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:64:64:40:40:25:15:31:33:25:15:31:33 chr11 72289291 . T C 126.95 PASS AO=40;DP=106;FAO=40;FDP=106;FR=.;FRO=66;FSAF=10;FSAR=30;FSRF=42;FSRR=24;FWDB=0.010278;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.724;QD=4.79051;RBI=0.02053;REFB=-0.00956624;REVB=0.017772;RO=66;SAF=10;SAR=30;SRF=42;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.425297;STB=0.742735;TYPE=snp;VARB=0.0111684;OID=.;OPOS=72289291;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:66:66:40:40:30:10:42:24:30:10:42:24 chr11 72290629 . G A 10.16 PASS AO=3;DP=15;FAO=3;FDP=15;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.00759431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.506;QD=2.70899;RBI=0.0102741;REFB=-0.00925635;REVB=-0.00691975;RO=12;SAF=2;SAR=1;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0961013;STB=0.57094;TYPE=snp;VARB=0.0475828;OID=.;OPOS=72290629;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:15:15:12:12:3:3:1:2:7:5:1:2:7:5 chr11 72291927 . T C 375.71 PASS AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0037917;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.228;QD=38.5341;RBI=0.0159426;REFB=0;REVB=0.0154852;RO=0;SAF=8;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.69248e-05;OID=.;OPOS=72291927;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:39:39:0:0:39:39:31:8:0:0:31:8:0:0 chr11 72293602 . A G 1607.35 PASS AO=168;DP=169;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00514217;FXX=0.0175428;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.7855;QD=38.2703;RBI=0.0277621;REFB=0;REVB=0.0272817;RO=0;SAF=83;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.99347e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000131539;OID=.;OPOS=72293602;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:169:168:0:0:168:168:85:83:0:0:85:83:0:0 chr11 72295502 . T C 380.87 PASS AO=40;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0622534;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.295;QD=35.4296;RBI=0.0657017;REFB=0;REVB=0.0210053;RO=0;SAF=9;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.54184e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000397207;OID=.;OPOS=72295502;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:43:43:0:0:40:43:31:9:0:0:34:9:0:0 chr11 72295906 . A G 273.76 PASS AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0548001;FXX=0.0666445;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.613;QD=39.1083;RBI=0.0716408;REFB=0;REVB=-0.0461449;RO=0;SAF=20;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.75204e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.58964e-05;OID=.;OPOS=72295906;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:28:28:0:0:28:28:8:20:0:0:8:20:0:0 chr11 72301320 . GC G 28.99 PASS AO=8;DP=27;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.102944;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=12.5958;QD=5.04162;RBI=0.106653;REFB=-0.10752;REVB=0.027884;RO=16;SAF=3;SAR=5;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.328701;STB=0.518487;TYPE=del;VARB=0.139653;OID=.;OPOS=72301321;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:8:25:12:23:11:7:5:6:5:24:16:3:5:11:5 chr11 72301622 . G T 16.08 PASS AO=3;DP=6;FAO=3;FDP=6;FR=.;FRO=3;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=199.025;QD=10.7182;RBI=0.00928216;REFB=-0.0400297;REVB=0.00928216;RO=3;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0211292;OID=.;OPOS=72301622;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:6:6:3:3:3:3:3:0:0:3:3:0:0:3 chr11 72301623 . G C 16.08 PASS AO=3;DP=6;FAO=3;FDP=6;FR=.;FRO=3;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=123.011;QD=10.7181;RBI=0.0322397;REFB=-0.00482238;REVB=-0.0322397;RO=3;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.021956;OID=.;OPOS=72301623;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:6:6:3:3:3:3:3:0:0:3:3:0:0:3 chr11 72363759 . G A 64.53 PASS AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=-0.0374425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.517;QD=8.60415;RBI=0.0382718;REFB=-0.0160586;REVB=-0.00792411;RO=14;SAF=6;SAR=8;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130632;STB=0.599867;TYPE=snp;VARB=0.0354067;OID=.;OPOS=72363759;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:28:30:14:16:14:14:8:6:4:10:8:6:4:12 chr11 72363766 . G A 82.13 PASS AO=12;DP=25;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0979665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.888;QD=11.3285;RBI=0.0999268;REFB=-7.85597e-06;REVB=0.0196963;RO=13;SAF=4;SAR=8;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122788;STB=0.612095;TYPE=snp;VARB=0.00566109;OID=.;OPOS=72363766;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:25:29:13:13:12:16:8:4:6:7:12:4:6:7 chr11 72368986 . T G 82.41 PASS AO=17;DP=33;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=-0.0391136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.602;QD=9.98884;RBI=0.0439708;REFB=0.0147255;REVB=-0.0200886;RO=16;SAF=8;SAR=9;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193005;STB=0.608575;TYPE=snp;VARB=-0.0116667;OID=.;OPOS=72368986;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:33:33:16:16:17:17:9:8:4:12:9:8:4:12 chr11 72396990 . G A 119.43 PASS AO=10;DP=19;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0285765;FXX=0.0555247;HRUN=4;LEN=1;MLLD=166.184;QD=28.1021;RBI=0.125882;REFB=-0.0916198;REVB=0.122596;RO=0;SAF=9;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.8593e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00740925;OID=.;OPOS=72396990;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:17:0:0:10:17:1:9:0:0:8:9:0:0 chr11 72408657 . C T 171.73 PASS AO=39;DP=79;FAO=39;FDP=79;FR=.;FRO=40;FSAF=12;FSAR=27;FSRF=15;FSRR=25;FWDB=0.021476;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.59;QD=8.69508;RBI=0.0406514;REFB=-0.0269638;REVB=-0.0345155;RO=40;SAF=12;SAR=27;SRF=15;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0695663;STB=0.538782;TYPE=snp;VARB=0.0222904;OID=.;OPOS=72408657;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:40:40:39:39:27:12:15:25:27:12:15:25 chr11 72409090 . AG A 35.95 PASS AO=18;DP=43;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=3;FSAR=16;FSRF=5;FSRR=17;FWDB=-0.133175;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=12.5294;QD=3.50705;RBI=0.134733;REFB=-0.123607;REVB=0.0204303;RO=25;SAF=3;SAR=15;SRF=6;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0.294462;SSSB=-0.11952;STB=0.563804;TYPE=del;VARB=0.159648;OID=.;OPOS=72409091;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:18:43:19:41:22:3:16:5:17:35:25:3:15:6:19 chr11 72415319 . TG T,CT 87.59 PASS AO=9,4;DP=20;FAO=15,4;FDP=21;FR=.;FRO=2;FSAF=12,0;FSAR=3,4;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.445287,0.239204;FXX=0;HRUN=6,1;LEN=1,2;MLLD=10.2791,27.3969;QD=16.6837;RBI=0.446575,0.243442;REFB=-0.145942,-0.0431166;REVB=-0.0338948,-0.0452288;RO=8;SAF=6,0;SAR=3,4;SRF=6;SRR=2;SSEN=0.564356,0;SSEP=0.659091,0;SSSB=-0.0782009,-0.75998;STB=0.624816,0.5;TYPE=del,mnp;VARB=0.146281,0.0059884;OID=.,.;OPOS=72415320,72415319;OREF=G,TG;OALT=-,CT;OMAPALT=T,CT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:11:21:21:8:2:9,4:15,4:3,4:6,0:6:2:3,4:12,0:0:2 chr11 72532569 . G T 267.53 PASS AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00408282;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.783;QD=34.5201;RBI=0.0330335;REFB=-0.0946081;REVB=0.0327802;RO=1;SAF=18;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0372625;STB=0.519987;TYPE=snp;VARB=0.0234536;OID=.;OPOS=72532569;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:31:31:1:1:30:30:12:18:0:1:12:18:0:1 chr11 72532621 . T G 292.36 PASS AO=29;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0286523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.032;QD=38.9809;RBI=0.0433393;REFB=0;REVB=0.0325168;RO=0;SAF=13;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0001852;OID=.;OPOS=72532621;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:29:30:0:0:29:30:16:13:0:0:16:14:0:0 chr11 72532708 . C T 79.97 PASS AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0493988;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=169.783;QD=31.9885;RBI=0.0571603;REFB=-0.16938;REVB=0.0287586;RO=1;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0984833;STB=0.555432;TYPE=snp;VARB=0.00486294;OID=.;OPOS=72532708;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:10:10:1:1:9:9:4:5:0:1:4:5:0:1 chr11 72537561 . AG A 861.56 PASS AO=113;DP=148;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0618242;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.6078;QD=23.6044;RBI=0.398051;REFB=0.0503307;REVB=0.393221;RO=28;SAF=55;SAR=58;SRF=5;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0.350515;SSSB=0.115616;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0154442;OID=.;OPOS=72537562;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:113:146:146:146:0:61:85:0:0:65:28:55:58:5:23 chr11 72945341 . C T 1332.38 PASS AO=149;DP=157;FAO=150;FDP=157;FR=.;FRO=7;FSAF=64;FSAR=86;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.00256952;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8256;QD=33.946;RBI=0.0290211;REFB=-0.0283574;REVB=-0.0289072;RO=8;SAF=62;SAR=87;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0207155;STB=0.500087;TYPE=snp;VARB=0.00524702;OID=.;OPOS=72945341;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:157:157:8:7:149:150:87:62:5:3:86:64:3:4 chr11 72946020 . C T 76.66 PASS AO=14;DP=24;FAO=14;FDP=24;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0111061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.383;QD=12.7767;RBI=0.011118;REFB=-0.0292727;REVB=0.000512408;RO=10;SAF=5;SAR=9;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0339143;STB=0.519203;TYPE=snp;VARB=0.0218887;OID=.;OPOS=72946020;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:24:24:10:10:14:14:9:5:4:6:9:5:4:6 chr11 72946140 . G C 83.12 PASS AO=7;DP=16;FAO=12;FDP=16;FR=.,HEALED;FRO=4;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0123427;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.1137;QD=20.7804;RBI=0.0989091;REFB=-0.159486;REVB=0.0981359;RO=4;SAF=0;SAR=7;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.760919;STB=0.610893;TYPE=snp;VARB=0.0851808;OID=.;OPOS=72946140;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:16:16:4:4:7:12:7:0:1:3:11:1:1:3 chr11 73357708 . AGG AG,AGA 178.69 PASS AO=10,17;DP=36;FAO=12,17;FDP=37;FR=.;FRO=8;FSAF=10,3;FSAR=2,14;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=-0.171776,-0.0202276;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=15.9442,175.308;QD=19.3174;RBI=0.206546,0.0231763;REFB=-0.131449,-0.0101872;REVB=-0.114693,-0.011313;RO=7;SAF=7,3;SAR=3,14;SRF=0;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0.221264,0;SSSB=0.473371,0.182988;STB=0.832777,0.611002;TYPE=del,snp;VARB=0.00822171,0.00527268;OID=.,.;OPOS=73357709,73357710;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=AG,AGA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:10,17:35:12,17:37:8:10,3:2,14:0:8:48:7:7,3:3,14:0:7 chr11 73387057 . TTAAGTA T 905.35 PASS AO=104;DP=145;FAO=124;FDP=128;FR=.;FRO=4;FSAF=65;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0397888;FXX=0.104888;HRUN=3;LEN=6;MLLD=197.825;QD=28.2922;RBI=0.040068;REFB=0.00302765;REVB=0.00472169;RO=6;SAF=51;SAR=53;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0162378;STB=0.516391;TYPE=del;VARB=0.000517486;OID=.;OPOS=73387058;OREF=TAAGTA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:104:134:124:128:4:65:59:0:4:52:6:51:53:2:4 chr11 73390771 . GGAA G,GG 577.28 PASS AO=19,50;DP=90;FAO=0,74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=0,38;FSAR=0,36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0192737,-0.00173826;FXX=0.0740649;HRUN=3,3;LEN=3,2;MLLD=23.0935,38.0907;QD=30.7883;RBI=0.101535,0.0255114;REFB=0.00842286,-0.0383939;REVB=-0.0996884,-0.0254521;RO=1;SAF=0,33;SAR=19,17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0.0268819;STB=0.5,0.506848;TYPE=del,del;VARB=0,0.000446121;OID=.,.;OPOS=73390772,73390773;OREF=GAA,AA;OALT=-,-;OMAPALT=G,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:19,50:76:0,74:75:1:0,38:0,36:0:1:43:1:0,33:19,17:0:1 chr11 73441772 . A C 863.1 PASS AO=104;DP=114;FAO=104;FDP=114;FR=.;FRO=10;FSAF=51;FSAR=53;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0121323;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=202.489;QD=30.2842;RBI=0.0151315;REFB=-0.0241351;REVB=-0.00904271;RO=10;SAF=51;SAR=53;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0347597;STB=0.518378;TYPE=snp;VARB=0.000532433;OID=.;OPOS=73441772;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:114:114:10:10:104:104:53:51:7:3:53:51:7:3 chr11 73715542 . G A 473.08 PASS AO=53;DP=55;FAO=53;FDP=55;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0263604;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.392;QD=34.4055;RBI=0.0459759;REFB=-0.14193;REVB=0.0376685;RO=2;SAF=22;SAR=31;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.029429;STB=0.515619;TYPE=snp;VARB=0.00103863;OID=.;OPOS=73715542;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:55:55:2:2:53:53:31:22:0:2:31:22:0:2 chr11 73717254 . A G 435.34 PASS AO=45;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0159479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.687;QD=37.8553;RBI=0.027212;REFB=0;REVB=0.022049;RO=0;SAF=26;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.15971e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.39558e-05;OID=.;OPOS=73717254;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:45:46:0:0:45:46:19:26:0:0:20:26:0:0 chr11 73785326 . T C 1898.81 PASS AO=199;DP=199;FAO=197;FDP=197;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00952496;FXX=0.0149993;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.744;QD=38.5545;RBI=0.0142274;REFB=0;REVB=0.0105685;RO=0;SAF=108;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.30666e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.68462e-05;OID=.;OPOS=73785326;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:89:199:197:0:0:199:197:91:108:0:0:92:105:0:0 chr11 73806443 . C T 1635.91 PASS AO=175;DP=179;FAO=177;FDP=177;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0321023;FXX=0.027471;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.537;QD=36.9696;RBI=0.032258;REFB=-0.0413517;REVB=-0.00316605;RO=3;SAF=57;SAR=118;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119468;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.0969e-06;OID=.;OPOS=73806443;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:179:177:3:0:175:177:118:57:0:3:118:59:0:0 chr11 73825503 . T C 3000.99 PASS AO=310;DP=312;FAO=314;FDP=314;FR=.;FRO=0;FSAF=167;FSAR=147;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0288122;FXX=0.0031745;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.331;QD=38.2291;RBI=0.0288123;REFB=0;REVB=-8.42571e-05;RO=0;SAF=166;SAR=144;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.62042e-05;OID=.;OPOS=73825503;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:312:314:0:0:310:314:144:166:0:0:147:167:0:0 chr11 73978243 . G A 1080.24 PASS AO=119;DP=125;FAO=121;FDP=124;FR=.;FRO=3;FSAF=52;FSAR=69;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.00815631;FXX=0.00799936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.042;QD=34.8465;RBI=0.0395963;REFB=0.00410442;REVB=0.0387471;RO=3;SAF=52;SAR=67;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00492008;STB=0.502381;TYPE=snp;VARB=1.45229e-05;OID=.;OPOS=73978243;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:125:124:3:3:119:121:67:52:1:2:69:52:1:2 chr11 73988167 . C T 1760.59 PASS AO=181;DP=183;FAO=187;FDP=187;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0685461;FXX=0.00531887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.591;QD=37.6598;RBI=0.0686135;REFB=-0.0520281;REVB=0.00303933;RO=2;SAF=85;SAR=96;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00981427;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000266507;OID=.;OPOS=73988167;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:183:187:2:0:181:187:96:85:0:2:99:88:0:0 chr11 74043708 . G A 1040.34 PASS AO=90;DP=113;FAO=109;FDP=111;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=43;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.06734;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.348;QD=37.4896;RBI=0.0739579;REFB=0;REVB=0.0305793;RO=0;SAF=40;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.21981e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00324826;OID=.;OPOS=74043708;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:110:111:0:0:90:109:50:40:0:0:66:43:0:0 chr11 74046975 . C T 1335.26 PASS AO=142;DP=143;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00702405;FXX=0.00699252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.118;QD=37.613;RBI=0.0179547;REFB=0.054569;REVB=-0.0165237;RO=1;SAF=90;SAR=52;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00905602;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000107611;OID=.;OPOS=74046975;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:143:142:1:0:142:142:52:90:0:1:52:90:0:0 chr11 74049569 . A G 2493.92 PASS AO=262;DP=265;FAO=262;FDP=262;FR=.;FRO=0;FSAF=115;FSAR=147;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0593701;FXX=0.0113203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.8984;QD=38.0751;RBI=0.0630276;REFB=-0.0236655;REVB=-0.0211583;RO=1;SAF=115;SAR=147;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00412759;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000107857;OID=.;OPOS=74049569;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:265:262:1:0:262:262:147:115:1:0:147:115:0:0 chr11 74053547 . C T 2222.19 PASS AO=232;DP=233;FAO=232;FDP=232;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=141;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0178615;FXX=0.00854664;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.064;QD=38.3136;RBI=0.0178623;REFB=0;REVB=-0.000172093;RO=0;SAF=91;SAR=141;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.30404e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.56598e-06;OID=.;OPOS=74053547;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:233:232:0:0:232:232:141:91:0:0:141:91:0:0 chr11 74109166 . A G 184.28 PASS AO=15;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0190227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.069;QD=38.7954;RBI=0.0330263;REFB=0;REVB=0.0269977;RO=0;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000205243;OID=.;OPOS=74109166;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:19:19:0:0:15:19:10:5:0:0:14:5:0:0 chr11 74110353 . A G 366.3 PASS AO=41;DP=43;FAO=42;FDP=44;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00152278;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.671;QD=33.3001;RBI=0.0275139;REFB=0.0563839;REVB=0.0274717;RO=0;SAF=23;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.502182;TYPE=snp;VARB=-0.000507446;OID=.;OPOS=74110353;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:43:44:0:2:41:42:18:23:0:0:19:23:1:1 chr11 74203256 . T A 120.56 PASS AO=50;DP=161;FAO=50;FDP=160;FR=.;FRO=110;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=42;FSRR=68;FWDB=-0.0184706;FXX=0.00621079;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.947;QD=3.0139;RBI=0.0225339;REFB=-0.00360348;REVB=0.0129078;RO=108;SAF=23;SAR=27;SRF=41;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0964631;STB=0.554547;TYPE=snp;VARB=0.0103227;OID=.;OPOS=74203256;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:160:108:110:50:50:27:23:41:67:27:23:42:68 chr11 74203308 . T A 1112.05 PASS AO=137;DP=141;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.01976;FXX=0.0245881;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9763;QD=37.3798;RBI=0.0345179;REFB=-0.0247696;REVB=0.0283025;RO=2;SAF=52;SAR=85;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.011054;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00145667;OID=.;OPOS=74203308;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:141:119:2:0:137:119:85:52:0:2:81:38:0:0 chr11 74204269 . T G 274.76 PASS AO=31;DP=33;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0357543;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.444;QD=34.3454;RBI=0.0516583;REFB=-0.114654;REVB=0.0372855;RO=0;SAF=2;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508469;TYPE=snp;VARB=0.00671821;OID=.;OPOS=74204269;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:33:32:0:1:31:31:29:2:0:0:29:2:0:1 chr11 74208029 . C T 1373.02 PASS AO=143;DP=144;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117481;FXX=0.0136977;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.117;QD=38.1395;RBI=0.0118237;REFB=0;REVB=0.00133502;RO=0;SAF=60;SAR=83;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.2309e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000285276;OID=.;OPOS=74208029;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:144:144:0:0:143:144:83:60:0:0:83:61:0:0 chr11 74208214 . G A 732.47 PASS AO=79;DP=82;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143124;FXX=0.0121936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.268;QD=36.1715;RBI=0.0280199;REFB=-0.0283355;REVB=0.0240888;RO=2;SAF=34;SAR=45;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0270302;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000222987;OID=.;OPOS=74208214;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:82:81:2:0:79:81:45:34:2:0:45:36:0:0 chr11 74208592 . G T 716.31 PASS AO=70;DP=71;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0465146;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.5355;QD=37.7006;RBI=0.145554;REFB=0;REVB=0.137922;RO=0;SAF=21;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.0379e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.001532;OID=.;OPOS=74208592;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:71:76:0:0:70:76:49:21:0:0:55:21:0:0 chr11 74278090 . C T 3199.28 PASS AO=337;DP=339;FAO=337;FDP=337;FR=.;FRO=0;FSAF=217;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126943;FXX=0.0117299;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.458;QD=37.9736;RBI=0.0268263;REFB=-0.00340308;REVB=-0.0236327;RO=1;SAF=217;SAR=120;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00219359;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.55709e-05;OID=.;OPOS=74278090;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:339:337:1:0:337:337:120:217:1:0:120:217:0:0 chr11 74329615 . T C 317.61 PASS AO=65;DP=118;FAO=65;FDP=117;FR=.;FRO=52;FSAF=46;FSAR=19;FSRF=33;FSRR=19;FWDB=-0.00112238;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.569;QD=10.8585;RBI=0.0118977;REFB=-0.0171824;REVB=0.0118447;RO=53;SAF=46;SAR=19;SRF=34;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0635753;STB=0.538;TYPE=snp;VARB=0.0166119;OID=.;OPOS=74329615;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:117:53:52:65:65:19:46:34:19:19:46:33:19 chr11 74396330 . C T 943.38 PASS AO=97;DP=102;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00355993;FXX=0.0291234;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.843;QD=37.7351;RBI=0.0720504;REFB=0;REVB=0.0719624;RO=0;SAF=60;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.7108e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000605686;OID=.;OPOS=74396330;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:102:100:0:0:97:100:37:60:0:0:40:60:0:0 chr11 74419357 . C T 89.59 PASS AO=24;DP=58;FAO=24;FDP=58;FR=.;FRO=34;FSAF=20;FSAR=4;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=0.0226658;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5642;QD=6.17868;RBI=0.064368;REFB=-0.00959455;REVB=-0.0602454;RO=34;SAF=20;SAR=4;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.267766;STB=0.65559;TYPE=snp;VARB=0.017375;OID=.;OPOS=74419357;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:58:58:34:34:24:24:4:20:22:12:4:20:22:12 chr11 74546905 . G A 521.78 PASS AO=100;DP=177;FAO=106;FDP=183;FR=.;FRO=77;FSAF=54;FSAR=52;FSRF=36;FSRR=41;FWDB=0.0125479;FXX=0.00543449;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.78;QD=11.4049;RBI=0.0226608;REFB=-0.0329921;REVB=0.0188696;RO=75;SAF=51;SAR=49;SRF=34;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0446336;STB=0.517622;TYPE=snp;VARB=0.0256841;OID=.;OPOS=74546905;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:183:75:77:100:106:49:51:34:41:52:54:36:41 chr11 74553074 . C T 321.74 PASS AO=79;DP=164;FAO=79;FDP=165;FR=.;FRO=86;FSAF=33;FSAR=46;FSRF=50;FSRR=36;FWDB=-0.00549979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.5522;QD=7.79969;RBI=0.0132151;REFB=-0.014431;REVB=-0.0120163;RO=84;SAF=33;SAR=46;SRF=49;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154453;STB=0.585202;TYPE=snp;VARB=0.0168209;OID=.;OPOS=74553074;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:165:84:86:79:79:46:33:49:35:46:33:50:36 chr11 74660631 . G A 255.21 PASS AO=52;DP=94;FAO=52;FDP=94;FR=.;FRO=42;FSAF=20;FSAR=32;FSRF=11;FSRR=31;FWDB=0.0187068;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.559;QD=10.8602;RBI=0.026;REFB=-0.0174304;REVB=0.018057;RO=41;SAF=20;SAR=32;SRF=11;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10163;STB=0.559481;TYPE=snp;VARB=0.0171018;OID=.;OPOS=74660631;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:41:42:52:52:32:20:11:30:32:20:11:31 chr11 74674727 . TG T 842.41 PASS AO=98;DP=121;FAO=119;FDP=121;FR=.;FRO=2;FSAF=56;FSAR=63;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.293795;FXX=0.00819605;HRUN=2;LEN=1;MLLD=19.3594;QD=27.8484;RBI=0.308649;REFB=0.0154966;REVB=-0.0945963;RO=15;SAF=42;SAR=56;SRF=14;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0.307323;SSSB=-0.126489;STB=0.500488;TYPE=del;VARB=0.00336279;OID=.;OPOS=74674728;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:98:121:119:121:2:56:63:1:1:62:15:42:56:14:1 chr11 74679321 . G A 52.32 PASS AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.132529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.388;QD=6.53981;RBI=0.132692;REFB=0.00841192;REVB=0.0065649;RO=17;SAF=4;SAR=9;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0503595;STB=0.540919;TYPE=snp;VARB=-0.0112064;OID=.;OPOS=74679321;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:32:32:17:19:13:13:9:4:6:11:9:4:7:12 chr11 74705696 . T C 190.69 PASS AO=39;DP=68;FAO=38;FDP=68;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=-0.0609479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.05;QD=11.2169;RBI=0.0629511;REFB=-0.0334159;REVB=-0.015754;RO=29;SAF=14;SAR=25;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0415535;STB=0.504308;TYPE=snp;VARB=0.0211054;OID=.;OPOS=74705696;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:29:30:39:38:25:14:9:20:25:13:10:20 chr11 74800284 . G A 267.01 PASS AO=67;DP=147;FAO=68;FDP=148;FR=.;FRO=80;FSAF=44;FSAR=24;FSRF=57;FSRR=23;FWDB=-0.00440983;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.892;QD=7.21655;RBI=0.0536873;REFB=-0.0105896;REVB=0.0535059;RO=79;SAF=43;SAR=24;SRF=56;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0728649;STB=0.539615;TYPE=snp;VARB=0.0117782;OID=.;OPOS=74800284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:148:79:80:67:68:24:43:56:23:24:44:57:23 chr11 74862391 . A G 401.9 PASS AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00745808;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=145.829;QD=37.3859;RBI=0.0278263;REFB=0;REVB=-0.0268082;RO=0;SAF=29;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.13233e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000168182;OID=.;OPOS=74862391;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:43:43:0:0:43:43:14:29:0:0:14:29:0:0 chr11 74883577 . G A 295.29 PASS AO=43;DP=61;FAO=47;FDP=65;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=36;FSRF=4;FSRR=14;FWDB=0.0219204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.6716;QD=18.1716;RBI=0.0543929;REFB=-0.0559632;REVB=0.0497803;RO=13;SAF=10;SAR=33;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0010801;STB=0.504585;TYPE=snp;VARB=0.0112241;OID=.;OPOS=74883577;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:61:65:13:18:43:47:33:10:3:10:36:11:4:14 chr11 74904362 . T C 989.29 PASS AO=99;DP=99;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.034217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.826;QD=38.0495;RBI=0.0390625;REFB=0;REVB=0.0188434;RO=0;SAF=47;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.28099e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.67774e-05;OID=.;OPOS=74904362;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:99:104:0:0:99:104:52:47:0:0:54:50:0:0 chr11 74995350 . C T 212.24 PASS AO=28;DP=91;FAO=29;FDP=87;FR=.,HEALED;FRO=37;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=4;FSRR=33;FWDB=0.0931003;FXX=0.0113623;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.2705;QD=9.75827;RBI=0.0961461;REFB=-0.0118031;REVB=-0.0240084;RO=37;SAF=11;SAR=17;SRF=5;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.296118;STB=0.674992;TYPE=snp;VARB=0.00279228;OID=.;OPOS=74995350;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:87:37:37:28:29:17:11:5:32:18:11:4:33 chr11 75145952 . A G 392.72 PASS AO=41;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.045403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.777;QD=37.4018;RBI=0.060437;REFB=0;REVB=0.0398898;RO=1;SAF=31;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0446131;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00017019;OID=.;OPOS=75145952;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:42:42:1:0:41:42:10:31:0:1:11:31:0:0 chr11 75152243 . C T 183.13 PASS AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.167236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.148;QD=38.5535;RBI=0.167558;REFB=0;REVB=-0.0103829;RO=0;SAF=11;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41338e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00143115;OID=.;OPOS=75152243;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:19:19:0:0:19:19:8:11:0:0:8:11:0:0 chr11 75160575 . G A 672.98 PASS AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00665607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.76;QD=37.9141;RBI=0.0532172;REFB=0;REVB=0.0527993;RO=0;SAF=42;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000136633;OID=.;OPOS=75160575;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:71:71:0:0:71:71:29:42:0:0:29:42:0:0 chr11 75277628 . A G 146.35 PASS AO=14;DP=15;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0506206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.853;QD=36.5881;RBI=0.0522504;REFB=0;REVB=0.0129483;RO=0;SAF=4;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.63386e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000900972;OID=.;OPOS=75277628;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:16:0:0:14:16:10:4:0:0:10:6:0:0 chr11 75277992 . C T 209.6 PASS AO=22;DP=22;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0334607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.166;QD=36.4525;RBI=0.0337635;REFB=0;REVB=0.00451149;RO=0;SAF=9;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2029e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000301233;OID=.;OPOS=75277992;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:22:23:0:0:22:23:13:9:0:0:13:10:0:0 chr11 75428958 . A G 604.61 PASS AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.034951;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.204;QD=37.7883;RBI=0.0349592;REFB=0;REVB=-0.000758445;RO=0;SAF=24;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.3845e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.77845e-05;OID=.;OPOS=75428958;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:64:64:0:0:64:64:40:24:0:0:40:24:0:0 chr11 75509435 . TG T 188.31 PASS AO=81;DP=179;FAO=98;FDP=172;FR=.;FRO=74;FSAF=20;FSAR=78;FSRF=26;FSRR=48;FWDB=0.13841;FXX=0.0114936;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.0637;QD=4.37932;RBI=0.138463;REFB=-0.104284;REVB=-0.00386222;RO=81;SAF=12;SAR=69;SRF=33;SRR=48;SSEN=0.348958;SSEP=0;SSSB=-0.337449;STB=0.587407;TYPE=del;VARB=0.132785;OID=.;OPOS=75509436;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:81:173:98:172:74:20:78:26:48:99:81:12:69:33:48 chr11 75852448 . C T 578.22 PASS AO=112;DP=192;FAO=113;FDP=192;FR=.;FRO=79;FSAF=64;FSAR=49;FSRF=32;FSRR=47;FWDB=0.0214929;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.221;QD=12.0462;RBI=0.0217993;REFB=-0.00996905;REVB=0.00364212;RO=78;SAF=64;SAR=48;SRF=30;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141248;STB=0.56636;TYPE=snp;VARB=0.00783946;OID=.;OPOS=75852448;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:192:78:79:112:113:48:64:30:48:49:64:32:47 chr11 76207633 . G A 1063.72 PASS AO=114;DP=116;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.031362;FXX=0.0258598;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.202;QD=37.6539;RBI=0.0331431;REFB=-0.00949848;REVB=0.0107185;RO=0;SAF=43;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43709e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.37743e-05;OID=.;OPOS=76207633;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:116:113:0:0:114:113:71:43:0:0:69:44:0:0 chr11 76368553 . A G 643.79 PASS AO=78;DP=86;FAO=78;FDP=86;FR=.;FRO=8;FSAF=30;FSAR=48;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.0331822;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1686;QD=29.9438;RBI=0.0398309;REFB=-0.0504585;REVB=-0.0220327;RO=8;SAF=30;SAR=48;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0665593;STB=0.535307;TYPE=snp;VARB=0.0352011;OID=.;OPOS=76368553;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:86:86:8:8:78:78:48:30:6:2:48:30:6:2 chr11 76368639 . A C 769.12 PASS AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00423762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.345;QD=37.9811;RBI=0.00488503;REFB=0;REVB=0.00243025;RO=0;SAF=34;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.25769e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.15512e-05;OID=.;OPOS=76368639;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:81:81:0:0:81:81:47:34:0:0:47:34:0:0 chr11 76370792 . A G 447.31 PASS AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.97;QD=38.0688;RBI=0.0140609;REFB=0;REVB=0.00736033;RO=0;SAF=14;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.0395e-05;OID=.;OPOS=76370792;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:47:47:0:0:47:47:33:14:0:0:33:14:0:0 chr11 76372418 . T C 158.68 PASS AO=16;DP=16;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0760356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.9071;QD=37.3361;RBI=0.0955076;REFB=0;REVB=0.0577952;RO=0;SAF=8;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00573353;OID=.;OPOS=76372418;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:16:17:0:0:16:17:8:8:0:0:9:8:0:0 chr11 76405613 . C T 311.82 PASS AO=78;DP=167;FAO=78;FDP=166;FR=.;FRO=88;FSAF=34;FSAR=44;FSRF=46;FSRR=42;FWDB=0.036267;FXX=0.00598767;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.366;QD=7.51367;RBI=0.0401195;REFB=-0.0116378;REVB=-0.0171547;RO=88;SAF=34;SAR=44;SRF=46;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0835059;STB=0.546233;TYPE=snp;VARB=0.0115365;OID=.;OPOS=76405613;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:166:88:88:78:78:44:34:46:42:44:34:46:42 chr11 76415209 . G A 225.64 PASS AO=64;DP=151;FAO=65;FDP=151;FR=.;FRO=86;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=26;FSRR=60;FWDB=0.0667527;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=33.3804;QD=5.97716;RBI=0.0891665;REFB=-0.0272431;REVB=0.0591164;RO=83;SAF=32;SAR=32;SRF=25;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202015;STB=0.616538;TYPE=snp;VARB=0.0347365;OID=.;OPOS=76415209;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:151:83:86:64:65:32:32:25:58:32:33:26:60 chr11 76418737 . A G 287.92 PASS AO=20;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.125551;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=31.7528;QD=35.9903;RBI=0.215065;REFB=0;REVB=0.174613;RO=0;SAF=13;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00193515;OID=.;OPOS=76418737;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:31:32:0:0:20:32:7:13:0:0:18:14:0:0 chr11 76430684 . A C 88.3 PASS AO=22;DP=59;FAO=25;FDP=61;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=26;FWDB=0.0422648;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.021;QD=5.78999;RBI=0.0452358;REFB=-0.00718774;REVB=-0.0161236;RO=36;SAF=12;SAR=10;SRF=10;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.284226;STB=0.6206;TYPE=snp;VARB=0.0155706;OID=.;OPOS=76430684;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:59:61:36:36:22:25:10:12:10:26:13:12:10:26 chr11 76507692 . T A 330.89 PASS AO=35;DP=37;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0339065;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.0408;QD=33.937;RBI=0.0472032;REFB=-0.187312;REVB=0.0328403;RO=2;SAF=22;SAR=13;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0406472;STB=0.509799;TYPE=snp;VARB=0.0238643;OID=.;OPOS=76507692;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:37:39:2:1:35:38:13:22:2:0:13:25:1:0 chr11 76508843 . T C 338.58 PASS AO=84;DP=179;FAO=84;FDP=178;FR=.;FRO=94;FSAF=29;FSAR=55;FSRF=24;FSRR=70;FWDB=-0.0119047;FXX=0.00558628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.649;QD=7.60848;RBI=0.0151096;REFB=-0.00109837;REVB=0.00930483;RO=92;SAF=29;SAR=55;SRF=23;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103631;STB=0.554269;TYPE=snp;VARB=0.00162065;OID=.;OPOS=76508843;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:178:92:94:84:84:55:29:23:69:55:29:24:70 chr11 76637651 . G A 360.69 PASS AO=110;DP=283;FAO=113;FDP=285;FR=.;FRO=172;FSAF=52;FSAR=61;FSRF=88;FSRR=84;FWDB=0.00962868;FXX=0.00349638;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.929;QD=5.06225;RBI=0.0103123;REFB=-0.00272825;REVB=0.00369231;RO=170;SAF=51;SAR=59;SRF=86;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.045739;STB=0.531089;TYPE=snp;VARB=0.00696808;OID=.;OPOS=76637651;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:283:285:170:172:110:113:59:51:86:84:61:52:88:84 chr11 76637680 . G A 359.15 PASS AO=106;DP=273;FAO=113;FDP=280;FR=.;FRO=167;FSAF=51;FSAR=62;FSRF=86;FSRR=81;FWDB=0.072567;FXX=0.00709195;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.954;QD=5.13071;RBI=0.0726122;REFB=-0.00162396;REVB=0.00255981;RO=167;SAF=47;SAR=59;SRF=86;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.078057;STB=0.538031;TYPE=snp;VARB=0.00335268;OID=.;OPOS=76637680;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:273:280:167:167:106:113:59:47:86:81:62:51:86:81 chr11 76687399 . A C 266.58 PASS AO=79;DP=193;FAO=79;FDP=193;FR=.;FRO=114;FSAF=34;FSAR=45;FSRF=46;FSRR=68;FWDB=-0.0084006;FXX=0.00515437;HRUN=4;LEN=1;MLLD=263.691;QD=5.52487;RBI=0.0143443;REFB=-0.0072908;REVB=-0.0116271;RO=113;SAF=34;SAR=45;SRF=46;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0250634;STB=0.516255;TYPE=snp;VARB=0.0101549;OID=.;OPOS=76687399;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:193:113:114:79:79:45:34:46:67:45:34:46:68 chr11 76701606 . G A 150.07 PASS AO=46;DP=120;FAO=46;FDP=119;FR=.;FRO=73;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=32;FSRR=41;FWDB=-0.0246276;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.882;QD=5.0443;RBI=0.0247231;REFB=-0.0072894;REVB=-0.00217061;RO=74;SAF=23;SAR=23;SRF=32;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0734001;STB=0.537799;TYPE=snp;VARB=0.013312;OID=.;OPOS=76701606;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:119:74:73:46:46:23:23:32:42:23:23:32:41 chr11 76732308 . G A 261.54 PASS AO=53;DP=179;FAO=76;FDP=184;FR=.,HEALED;FRO=107;FSAF=25;FSAR=51;FSRF=11;FSRR=96;FWDB=0.0228188;FXX=0.0315773;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.2842;QD=5.68571;RBI=0.0240821;REFB=-0.00910078;REVB=-0.00769735;RO=64;SAF=11;SAR=42;SRF=6;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193756;STB=0.666813;TYPE=snp;VARB=0.0123874;OID=.;OPOS=76732308;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:184:64:107:53:76:42:11:6:58:51:25:11:96 chr11 76732949 . T C 157.12 PASS AO=38;DP=79;FAO=38;FDP=82;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=-0.037822;FXX=0.0120467;HRUN=5;LEN=1;MLLD=89.162;QD=7.66418;RBI=0.0405003;REFB=-0.0232675;REVB=-0.0144835;RO=41;SAF=14;SAR=24;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0690309;STB=0.560715;TYPE=snp;VARB=0.0373114;OID=.;OPOS=76732949;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:82:41:44:38:38:24:14:18:23:24:14:21:23 chr11 76733024 . A G 131.84 PASS AO=31;DP=65;FAO=31;FDP=65;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.0224507;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=228.51;QD=8.11324;RBI=0.0275217;REFB=-0.000189386;REVB=-0.0159188;RO=34;SAF=11;SAR=20;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167771;STB=0.5942;TYPE=snp;VARB=0.000143655;OID=.;OPOS=76733024;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:34:34:31:31:20:11:18:16:20:11:18:16 chr11 76751584 . CT C 303.91 PASS AO=32;DP=35;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159409;FXX=0.0833102;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.118;QD=36.8378;RBI=0.0235117;REFB=0;REVB=0.0172825;RO=0;SAF=24;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.000307026;OID=.;OPOS=76751585;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:32:34:33:33:0:25:8:0:0:15:0:24:8:0:0 chr11 76751587 . G A 55.06 PASS AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=39;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=0.00353439;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.497;QD=5.64766;RBI=0.0414374;REFB=-0.0893366;REVB=0.0412864;RO=23;SAF=11;SAR=4;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0484479;STB=0.519287;TYPE=snp;VARB=0.14158;OID=.;OPOS=76751587;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:38:39:23:24:15:15:4:11:16:7:4:11:17:7 chr11 76751603 . CT C 337.75 PASS AO=42;DP=45;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0265698;FXX=0.0227221;HRUN=2;LEN=1;MLLD=27.7058;QD=31.4186;RBI=0.0792875;REFB=0;REVB=-0.0747031;RO=0;SAF=31;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.72514e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.00392678;OID=.;OPOS=76751604;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:42:43:43:43:0:32:11:0:0:30:0:31:11:0:0 chr11 76799004 . T C 488.77 PASS AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00885968;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.979;QD=37.5976;RBI=0.0217315;REFB=0;REVB=0.0198435;RO=0;SAF=24;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.44887e-05;OID=.;OPOS=76799004;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:53:52:0:0:52:52:28:24:0:0:28:24:0:0 chr11 76814110 . G A 251.34 PASS AO=48;DP=84;FAO=49;FDP=85;FR=.;FRO=36;FSAF=34;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.00686258;FXX=0.0116266;HRUN=3;LEN=1;MLLD=96.6851;QD=11.8278;RBI=0.0236324;REFB=-0.0362336;REVB=-0.022614;RO=35;SAF=34;SAR=14;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143482;STB=0.565423;TYPE=snp;VARB=0.0387067;OID=.;OPOS=76814110;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:85:35:36:48:49:14:34:19:16:15:34:20:16 chr11 76827360 . A G 138.1 PASS AO=34;DP=74;FAO=34;FDP=74;FR=.;FRO=40;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=0.00887368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.724;QD=7.46484;RBI=0.059434;REFB=-0.0211925;REVB=-0.0587679;RO=39;SAF=19;SAR=15;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0685776;STB=0.545428;TYPE=snp;VARB=0.0194547;OID=.;OPOS=76827360;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:39:40:34:34:15:19:19:20:15:19:19:21 chr11 76836864 . G A 244.61 PASS AO=66;DP=154;FAO=66;FDP=149;FR=.;FRO=83;FSAF=9;FSAR=57;FSRF=20;FSRR=63;FWDB=-0.0100348;FXX=0.0387072;HRUN=4;LEN=1;MLLD=158.888;QD=6.56675;RBI=0.0141525;REFB=-0.0178422;REVB=-0.0099798;RO=82;SAF=9;SAR=57;SRF=20;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189219;STB=0.604794;TYPE=snp;VARB=0.0231155;OID=.;OPOS=76836864;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:149:82:83:66:66:57:9:20:62:57:9:20:63 chr11 76868372 . T C 193.9 PASS AO=42;DP=83;FAO=43;FDP=84;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=30;FSRF=29;FSRR=12;FWDB=-0.0203252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.6467;QD=9.23327;RBI=0.0572423;REFB=-0.0391763;REVB=0.0535124;RO=40;SAF=13;SAR=29;SRF=28;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.343821;STB=0.697582;TYPE=snp;VARB=0.0351457;OID=.;OPOS=76868372;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:84:40:41:42:43:29:13:28:12:30:13:29:12 chr11 76928149 . A G 2853.59 PASS AO=312;DP=321;FAO=313;FDP=320;FR=.;FRO=7;FSAF=99;FSAR=214;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0050624;FXX=0.00311517;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.477;QD=35.6699;RBI=0.00650442;REFB=-0.113081;REVB=0.00408407;RO=8;SAF=98;SAR=214;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170719;STB=0.506421;TYPE=snp;VARB=0.000385973;OID=.;OPOS=76928149;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:321:320:8:7:312:313:214:98:5:3:214:99:4:3 chr11 76954788 . T TA 260.81 PASS AO=72;DP=175;FAO=90;FDP=169;FR=.;FRO=79;FSAF=45;FSAR=45;FSRF=42;FSRR=37;FWDB=-0.00686134;FXX=0.050559;HRUN=1;LEN=1;MLLD=22.1341;QD=6.17303;RBI=0.0376756;REFB=0.000255972;REVB=-0.0370455;RO=98;SAF=36;SAR=36;SRF=51;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0210344;STB=0.51479;TYPE=ins;VARB=0.000201344;OID=.;OPOS=76954789;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:72:175:90:169:79:45:45:42:37:99:98:36:36:51:47 chr11 76954812 . T C 406.2 PASS AO=91;DP=181;FAO=93;FDP=183;FR=.;FRO=90;FSAF=40;FSAR=53;FSRF=45;FSRR=45;FWDB=0.000564857;FXX=0.0161282;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.7708;QD=8.87865;RBI=0.0229397;REFB=-0.00764213;REVB=0.0229328;RO=87;SAF=40;SAR=51;SRF=45;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0695206;STB=0.534711;TYPE=snp;VARB=0.00865692;OID=.;OPOS=76954812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:183:87:90:91:93:51:40:45:42:53:40:45:45 chr11 76954833 . G A 361.23 PASS AO=84;DP=172;FAO=86;FDP=175;FR=.;FRO=89;FSAF=40;FSAR=46;FSRF=46;FSRR=43;FWDB=0.01048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.829;QD=8.25672;RBI=0.0114017;REFB=-0.0180284;REVB=0.00449093;RO=85;SAF=40;SAR=44;SRF=44;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0378798;STB=0.526338;TYPE=snp;VARB=0.0151063;OID=.;OPOS=76954833;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:175:85:89:84:86:44:40:44:41:46:40:46:43 chr11 77033699 . A G 236.08 PASS AO=64;DP=147;FAO=64;FDP=148;FR=.;FRO=84;FSAF=24;FSAR=40;FSRF=44;FSRR=40;FWDB=0.0685348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.561;QD=6.38052;RBI=0.0689104;REFB=-0.0126619;REVB=-0.00718471;RO=81;SAF=24;SAR=40;SRF=42;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146783;STB=0.58618;TYPE=snp;VARB=0.0151164;OID=.;OPOS=77033699;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:148:81:84:64:64:40:24:42:39:40:24:44:40 chr11 77412851 . A G 441.5 PASS AO=83;DP=195;FAO=111;FDP=222;FR=.;FRO=111;FSAF=56;FSAR=55;FSRF=75;FSRR=36;FWDB=0.0160493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.287;QD=7.95494;RBI=0.021121;REFB=-0.0247376;REVB=-0.0137302;RO=93;SAF=31;SAR=52;SRF=63;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.286015;STB=0.58571;TYPE=snp;VARB=0.0297086;OID=.;OPOS=77412851;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:222:93:111:83:111:52:31:63:30:55:56:75:36 chr11 77553638 . T C 1101.38 PASS AO=46;DP=73;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0582661;FXX=0.0170926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.821;QD=38.309;RBI=0.0637314;REFB=0;REVB=0.0258215;RO=0;SAF=27;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.94507e-05;OID=.;OPOS=77553638;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:54:115:0:0:46:115:19:27:0:0:72:43:0:0 chr11 77597486 . C T 187.57 PASS AO=24;DP=162;FAO=60;FDP=149;FR=.,HEALED;FRO=89;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=40;FSRR=49;FWDB=-0.0288024;FXX=0.0387072;HRUN=3;LEN=1;MLLD=80.3529;QD=5.03532;RBI=0.0632651;REFB=-0.00730005;REVB=-0.0563284;RO=50;SAF=9;SAR=15;SRF=32;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.298733;STB=0.519993;TYPE=snp;VARB=0.0160945;OID=.;OPOS=77597486;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:149:50:89:24:60:15:9:32:18:35:25:40:49 chr11 77597567 . C T 103.41 PASS AO=33;DP=92;FAO=33;FDP=90;FR=.;FRO=57;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=26;FSRR=31;FWDB=-0.00630902;FXX=0.0217368;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.174;QD=4.59624;RBI=0.00658884;REFB=-0.00608306;REVB=0.00189975;RO=56;SAF=11;SAR=22;SRF=26;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151636;STB=0.582626;TYPE=snp;VARB=0.00608299;OID=.;OPOS=77597567;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:90:56:57:33:33:22:11:26:30:22:11:26:31 chr11 77597794 . G C 105.79 PASS AO=24;DP=51;FAO=26;FDP=54;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=-0.00385266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.705;QD=7.83596;RBI=0.0105935;REFB=-0.0202226;REVB=0.00986813;RO=26;SAF=7;SAR=17;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0984894;STB=0.5498;TYPE=snp;VARB=0.0228323;OID=.;OPOS=77597794;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:54:26:28:24:26:17:7:10:16:18:8:11:17 chr11 77629132 . A AT 151.97 PASS AO=40;DP=70;FAO=41;FDP=68;FR=.;FRO=27;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.0212378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=25.0748;QD=8.93938;RBI=0.105584;REFB=0.0126619;REVB=0.103426;RO=29;SAF=20;SAR=20;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0395849;STB=0.512189;TYPE=ins;VARB=3.469e-05;OID=.;OPOS=77629133;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:40:70:41:68:27:20:21:14:13:57:29:20:20:16:13 chr11 77635882 . A C 404.59 PASS AO=103;DP=223;FAO=103;FDP=222;FR=.;FRO=119;FSAF=65;FSAR=38;FSRF=64;FSRR=55;FWDB=0.00797541;FXX=0.0044841;HRUN=3;LEN=1;MLLD=214.563;QD=7.28993;RBI=0.0175353;REFB=-0.00987217;REVB=-0.0156166;RO=119;SAF=65;SAR=38;SRF=64;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0942584;STB=0.552196;TYPE=snp;VARB=0.0121381;OID=.;OPOS=77635882;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:222:119:119:103:103:38:65:64:55:38:65:64:55 chr11 77639466 . A G 55.16 PASS AO=40;DP=178;FAO=40;FDP=178;FR=.;FRO=138;FSAF=34;FSAR=6;FSRF=59;FSRR=79;FWDB=0.00827229;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.8706;QD=1.23954;RBI=0.016039;REFB=-0.00206779;REVB=-0.0137412;RO=138;SAF=34;SAR=6;SRF=59;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.550091;STB=0.837993;TYPE=snp;VARB=0.0187265;OID=.;OPOS=77639466;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:178:178:138:138:40:40:6:34:59:79:6:34:59:79 chr11 77639511 . T A 24.66 PASS AO=18;DP=89;FAO=18;FDP=89;FR=.;FRO=71;FSAF=17;FSAR=1;FSRF=33;FSRR=38;FWDB=0.00877851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.037;QD=1.10819;RBI=0.0182097;REFB=-0.00368281;REVB=0.015954;RO=69;SAF=17;SAR=1;SRF=33;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.656752;STB=0.929346;TYPE=snp;VARB=0.00895459;OID=.;OPOS=77639511;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:89:89:69:71:18:18:1:17:33:36:1:17:33:38 chr11 77734209 . T C 61.59 PASS AO=11;DP=21;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=0;FWDB=0.0128986;FXX=0.0475964;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.0341;QD=12.3171;RBI=0.154921;REFB=0.0164743;REVB=0.154383;RO=9;SAF=8;SAR=3;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.32335;STB=0.679754;TYPE=snp;VARB=-0.00687571;OID=.;OPOS=77734209;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:21:20:9:9:11:11:3:8:9:0:3:8:9:0 chr11 77790653 . T C 275.31 PASS AO=60;DP=114;FAO=60;FDP=114;FR=.;FRO=54;FSAF=29;FSAR=31;FSRF=21;FSRR=33;FWDB=-0.0444219;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.5617;QD=9.65997;RBI=0.0508038;REFB=-0.00156172;REVB=-0.0246519;RO=54;SAF=29;SAR=31;SRF=21;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0817618;STB=0.544906;TYPE=snp;VARB=0.000752693;OID=.;OPOS=77790653;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:54:54:60:60:31:29:21:33:31:29:21:33 chr11 77790655 . G C 287.21 PASS AO=62;DP=117;FAO=62;FDP=117;FR=.;FRO=55;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=22;FSRR=33;FWDB=-0.0043546;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.648;QD=9.81896;RBI=0.0316442;REFB=-0.0208029;REVB=0.0313431;RO=55;SAF=30;SAR=32;SRF=22;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0720713;STB=0.539556;TYPE=snp;VARB=0.0116197;OID=.;OPOS=77790655;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:55:55:62:62:32:30:22:33:32:30:22:33 chr11 77825320 . T C 391.16 PASS AO=89;DP=173;FAO=89;FDP=174;FR=.;FRO=85;FSAF=38;FSAR=51;FSRF=31;FSRR=54;FWDB=0.00115357;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=95.7173;QD=8.9922;RBI=0.00273466;REFB=-0.0144234;REVB=-0.00247944;RO=84;SAF=38;SAR=51;SRF=30;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0638563;STB=0.531355;TYPE=snp;VARB=0.0200585;OID=.;OPOS=77825320;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:174:84:85:89:89:51:38:30:54:51:38:31:54 chr11 77882393 . T C 685.81 PASS AO=139;DP=269;FAO=149;FDP=274;FR=.;FRO=125;FSAF=57;FSAR=92;FSRF=50;FSRR=75;FWDB=0.0148771;FXX=0.00363623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.305;QD=10.0118;RBI=0.0149329;REFB=-0.00741736;REVB=-0.00128876;RO=125;SAF=50;SAR=89;SRF=50;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0374474;STB=0.508391;TYPE=snp;VARB=0.00671348;OID=.;OPOS=77882393;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:269:274:125:125:139:149:89:50:50:75:92:57:50:75 chr11 77920563 . G T 80.37 PASS AO=21;DP=54;FAO=22;FDP=58;FR=.;FRO=36;FSAF=1;FSAR=21;FSRF=10;FSRR=26;FWDB=-0.0156318;FXX=0.134308;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.321;QD=5.54295;RBI=0.0211318;REFB=-0.00964843;REVB=0.0142196;RO=28;SAF=1;SAR=20;SRF=8;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.529426;STB=0.83051;TYPE=snp;VARB=0.018422;OID=.;OPOS=77920563;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:54:58:28:36:21:22:20:1:8:20:21:1:10:26 chr11 77920863 . C A 47.67 PASS AO=14;DP=28;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.106367;FXX=0.0357015;HRUN=8;LEN=1;MLLD=60.7043;QD=7.06175;RBI=0.149907;REFB=-0.0145669;REVB=0.105632;RO=13;SAF=11;SAR=3;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0203139;STB=0.636106;TYPE=snp;VARB=0.0364969;OID=.;OPOS=77920863;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:28:27:13:15:14:12:3:11:10:3:2:10:10:5 chr11 77920930 . A G 280.28 PASS AO=25;DP=27;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00722157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.004;QD=38.6593;RBI=0.203871;REFB=0;REVB=0.203743;RO=0;SAF=24;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.20334e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00113746;OID=.;OPOS=77920930;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:27:29:0:0:25:29:1:24:0:0:3:26:0:0 chr11 77921527 . G C 423.79 PASS AO=43;DP=43;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0527891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.999;QD=37.6701;RBI=0.0528218;REFB=0;REVB=0.0018572;RO=0;SAF=17;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75441e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.39455e-05;OID=.;OPOS=77921527;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:43:45:0:0:43:45:26:17:0:0:26:19:0:0 chr11 77928184 . TC T,TCATTA 252.41 PASS AO=28,41;DP=172;FAO=4,66;FDP=163;FR=.;FRO=93;FSAF=1,16;FSAR=3,50;FSRF=25;FSRR=68;FWDB=-0.195514,-0.00880106;FXX=0.0180712;HRUN=5,1;LEN=1,4;MLLD=10.383,254.702;QD=6.19416;RBI=0.202127,0.00980333;REFB=-0.183205,-0.0542035;REVB=0.0512786,0.00431818;RO=62;SAF=21,0;SAR=7,41;SRF=6;SRR=56;SSEN=0,0;SSEP=0.378378,0;SSSB=0.668136,-0.798474;STB=0.52337,0.520562;TYPE=del,ins;VARB=0.183628,0.0533306;OID=.,.;OPOS=77928185,77928186;OREF=C,-;OALT=-,ATTA;OMAPALT=T,TCATTA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:28,41:150:4,66:163:93:1,16:3,50:25:68:99:62:21,0:7,41:6:56 chr11 77928185 . C CATTA 50 PASS AO=32;DP=191;LEN=4;RO=159;SAF=21;SAR=48;SRF=25;SRR=97;TYPE=ins;FR=.;OID=.;OPOS=77928186;OREF=-;OALT=ATTA;OMAPALT=CATTA GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR 0/1:99:191:159:32:48:21:25:97 chr11 77930138 . T C 102.52 PASS AO=37;DP=109;FAO=37;FDP=109;FR=.;FRO=72;FSAF=28;FSAR=9;FSRF=51;FSRR=21;FWDB=-0.00180473;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.884;QD=3.76219;RBI=0.0367138;REFB=-0.00800235;REVB=0.0366694;RO=72;SAF=28;SAR=9;SRF=51;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0715949;STB=0.541563;TYPE=snp;VARB=0.0160391;OID=.;OPOS=77930138;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:72:72:37:37:9:28:51:21:9:28:51:21 chr11 77930345 . T C 181.61 PASS AO=43;DP=91;FAO=43;FDP=90;FR=.;FRO=47;FSAF=32;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=-0.0234033;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.67;QD=8.07139;RBI=0.0234034;REFB=-0.017254;REVB=6.95383e-05;RO=47;SAF=32;SAR=11;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246944;STB=0.638429;TYPE=snp;VARB=0.0146079;OID=.;OPOS=77930345;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:90:47:47:43:43:11:32:24:23:11:32:24:23 chr11 77936166 . A G 66.9 PASS AO=19;DP=50;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=0.00933486;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.024;QD=5.35185;RBI=0.0166532;REFB=0.0175699;REVB=-0.0137909;RO=31;SAF=8;SAR=11;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13593;STB=0.578864;TYPE=snp;VARB=-0.0297481;OID=.;OPOS=77936166;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:50:50:31:31:19:19:11:8:17:14:11:8:17:14 chr11 77937773 . A AG 31.98 PASS AO=21;DP=82;FAO=18;FDP=77;FR=.;FRO=59;FSAF=17;FSAR=1;FSRF=25;FSRR=34;FWDB=-0.0503924;FXX=0.0493766;HRUN=0;LEN=1;MLLD=51.8;QD=1.66151;RBI=0.119519;REFB=-0.00375826;REVB=-0.108377;RO=61;SAF=19;SAR=2;SRF=28;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.606811;STB=0.933546;TYPE=ins;VARB=0.0167255;OID=.;OPOS=77937774;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:21:82:18:77:59:17:1:25:34:31:61:19:2:28:33 chr11 77937800 . G A 226.9 PASS AO=30;DP=96;FAO=36;FDP=96;FR=.,HEALED;FRO=45;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=0.0156276;FXX=0.0204061;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.76;QD=9.45431;RBI=0.0227483;REFB=-0.00824052;REVB=-0.0165306;RO=42;SAF=9;SAR=21;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195201;STB=0.531988;TYPE=snp;VARB=0.0184933;OID=.;OPOS=77937800;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:96:42:45:30:36:21:9:20:22:22:14:20:25 chr11 78277277 . A G 199.54 PASS AO=50;DP=109;FAO=50;FDP=109;FR=.;FRO=59;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=27;FSRR=32;FWDB=0.00608076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.632;QD=7.32256;RBI=0.0378537;REFB=-0.00961594;REVB=-0.0373621;RO=58;SAF=20;SAR=30;SRF=26;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0479091;STB=0.532063;TYPE=snp;VARB=0.0123702;OID=.;OPOS=78277277;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:58:59:50:50:30:20:26:32:30:20:27:32 chr11 78279790 . T G 253 PASS AO=69;DP=157;FAO=69;FDP=160;FR=.;FRO=91;FSAF=39;FSAR=30;FSRF=49;FSRR=42;FWDB=-0.0103946;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=200.334;QD=6.32508;RBI=0.0117102;REFB=0.000691693;REVB=-0.0053927;RO=88;SAF=39;SAR=30;SRF=49;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00857693;STB=0.515414;TYPE=snp;VARB=-0.00127278;OID=.;OPOS=78279790;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:160:88:91:69:69:30:39:49:39:30:39:49:42 chr11 78364513 . A G 305.52 PASS AO=102;DP=273;FAO=102;FDP=271;FR=.;FRO=169;FSAF=52;FSAR=50;FSRF=88;FSRR=81;FWDB=-0.00728847;FXX=0.00732574;HRUN=1;LEN=1;MLLD=310.695;QD=4.50945;RBI=0.0103845;REFB=0.00351117;REVB=0.00739705;RO=168;SAF=53;SAR=49;SRF=87;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00193361;STB=0.506804;TYPE=snp;VARB=-0.00612936;OID=.;OPOS=78364513;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:273:271:168:169:102:102:49:53:87:81:50:52:88:81 chr11 78372536 . G A 780.11 PASS AO=177;DP=374;FAO=191;FDP=388;FR=.;FRO=197;FSAF=101;FSAR=90;FSRF=95;FSRR=102;FWDB=0.0315398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.283;QD=8.04238;RBI=0.040671;REFB=-0.0232253;REVB=0.0256783;RO=196;SAF=89;SAR=88;SRF=95;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0173145;STB=0.523653;TYPE=snp;VARB=0.0230653;OID=.;OPOS=78372536;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:374:388:196:197:177:191:88:89:95:101:90:101:95:102 chr11 81264998 . G T 118.4 PASS AO=36;DP=94;FAO=36;FDP=93;FR=.;FRO=57;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=39;FWDB=-0.00507241;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.235;QD=5.0923;RBI=0.00553816;REFB=-0.0168403;REVB=0.00222303;RO=55;SAF=18;SAR=18;SRF=16;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223942;STB=0.612844;TYPE=snp;VARB=0.0227003;OID=.;OPOS=81264998;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:93:55:57:36:36:18:18:16:39:18:18:18:39 chr11 82443672 . C G 36.91 PASS AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.048194;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=43.6697;QD=13.42;RBI=0.139499;REFB=0.0200427;REVB=0.130909;RO=5;SAF=1;SAR=5;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.392076;STB=0.739831;TYPE=snp;VARB=0.00365791;OID=.;OPOS=82443672;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:11:11:5:5:6:6:5:1:3:2:5:1:3:2 chr11 82564294 . T G 383.3 PASS AO=82;DP=170;FAO=89;FDP=178;FR=.;FRO=89;FSAF=42;FSAR=47;FSRF=46;FSRR=43;FWDB=0.0774553;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.1725;QD=8.61337;RBI=0.0793858;REFB=-0.0391358;REVB=0.0174007;RO=87;SAF=42;SAR=40;SRF=44;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00601781;STB=0.522481;TYPE=snp;VARB=0.0371877;OID=.;OPOS=82564294;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:178:87:89:82:89:40:42:44:43:47:42:46:43 chr11 82644904 . G A 117.48 PASS AO=23;DP=44;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.0158267;FXX=0.0869376;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.123;QD=11.1884;RBI=0.0158938;REFB=0.00796933;REVB=0.00145984;RO=18;SAF=11;SAR=12;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0707973;STB=0.525965;TYPE=snp;VARB=-0.00548455;OID=.;OPOS=82644904;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:44:42:18:19:23:23:12:11:7:11:12:11:8:11 chr11 82645477 . G A 422.28 PASS AO=89;DP=171;FAO=92;FDP=170;FR=.;FRO=78;FSAF=40;FSAR=52;FSRF=40;FSRR=38;FWDB=0.00280081;FXX=0.01734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.606;QD=9.93595;RBI=0.00860127;REFB=-0.0119302;REVB=-0.00813248;RO=82;SAF=37;SAR=52;SRF=44;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106593;STB=0.536075;TYPE=snp;VARB=0.00907129;OID=.;OPOS=82645477;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:170:82:78:89:92:52:37:44:38:52:40:40:38 chr11 82645650 . T C 82.11 PASS AO=28;DP=85;FAO=29;FDP=86;FR=.;FRO=57;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=36;FWDB=-0.000660238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.953;QD=3.81917;RBI=0.0064935;REFB=-0.00761489;REVB=-0.00645984;RO=57;SAF=10;SAR=18;SRF=21;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.01404;STB=0.517108;TYPE=snp;VARB=0.014389;OID=.;OPOS=82645650;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:85:86:57:57:28:29:18:10:21:36:19:10:21:36 chr11 82973004 . C T 112.51 PASS AO=32;DP=80;FAO=32;FDP=80;FR=.;FRO=48;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=-0.0119394;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.535;QD=5.62533;RBI=0.019605;REFB=0.00177741;REVB=0.0155501;RO=48;SAF=12;SAR=20;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0910528;STB=0.551915;TYPE=snp;VARB=-0.00207573;OID=.;OPOS=82973004;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:48:48:32:32:20:12:22:26:20:12:22:26 chr11 82984985 . T A 110.96 PASS AO=35;DP=121;FAO=47;FDP=133;FR=.;FRO=86;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=34;FSRR=52;FWDB=-0.000410565;FXX=0.0220572;HRUN=2;LEN=1;MLLD=37.4066;QD=3.33726;RBI=0.0454169;REFB=-0.00172175;REVB=0.045415;RO=85;SAF=13;SAR=22;SRF=32;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00647217;STB=0.508425;TYPE=snp;VARB=0.00190197;OID=.;OPOS=82984985;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:133:85:86:35:47:22:13:32:53:29:18:34:52 chr11 82996986 . A C 793.8 PASS AO=86;DP=88;FAO=86;FDP=88;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=48;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.022207;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.832;QD=36.0817;RBI=0.0243381;REFB=-0.0617014;REVB=-0.00995966;RO=2;SAF=38;SAR=48;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0242799;STB=0.512818;TYPE=snp;VARB=0.000183626;OID=.;OPOS=82996986;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:88:88:2:2:86:86:48:38:2:0:48:38:2:0 chr11 83197307 . GA G,AG 104.55 PASS AO=10,3;DP=21;FAO=20,0;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=15,0;FSAR=5,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0649248,0.116927;FXX=0;HRUN=8,1;LEN=1,2;MLLD=7.50678,8.17251;QD=20.9092;RBI=0.182817,0.162726;REFB=0,0;REVB=-0.1709,-0.113172;RO=3;SAF=6,3;SAR=4,0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.178335,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,mnp;VARB=0.00155007,-0.0143882;OID=.,.;OPOS=83197308,83197307;OREF=A,GA;OALT=-,AG;OMAPALT=G,AG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:18:20:3:0:10,3:20,0:4,0:6,3:3:0:5,0:15,0:0:0 chr11 85195025 . A C 610.64 PASS AO=81;DP=98;FAO=82;FDP=99;FR=.;FRO=17;FSAF=29;FSAR=53;FSRF=3;FSRR=14;FWDB=-0.0272052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.977;QD=24.6725;RBI=0.055886;REFB=0.0084834;REVB=-0.0488172;RO=17;SAF=30;SAR=51;SRF=3;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.069108;STB=0.53393;TYPE=snp;VARB=-0.00127627;OID=.;OPOS=85195025;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:98:99:17:17:81:82:51:30:3:14:53:29:3:14 chr11 85195075 . T C 901.32 PASS AO=116;DP=135;FAO=115;FDP=132;FR=.;FRO=17;FSAF=39;FSAR=76;FSRF=3;FSRR=14;FWDB=-0.0116687;FXX=0.0149243;HRUN=3;LEN=1;MLLD=207.219;QD=27.3129;RBI=0.0131707;REFB=-0.0296174;REVB=0.00610799;RO=17;SAF=40;SAR=76;SRF=3;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0456843;STB=0.52372;TYPE=snp;VARB=0.0037506;OID=.;OPOS=85195075;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:135:132:17:17:116:115:76:40:3:14:76:39:3:14 chr11 85195154 . A T 956.71 PASS AO=120;DP=138;FAO=121;FDP=139;FR=.;FRO=18;FSAF=37;FSAR=84;FSRF=2;FSRR=16;FWDB=-0.000775277;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.437;QD=27.5311;RBI=0.0321136;REFB=-0.0363382;REVB=0.0321043;RO=18;SAF=37;SAR=83;SRF=2;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.058383;STB=0.530385;TYPE=snp;VARB=0.0037567;OID=.;OPOS=85195154;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:138:139:18:18:120:121:83:37:2:16:84:37:2:16 chr11 85195185 . T C 763.86 PASS AO=98;DP=115;FAO=99;FDP=115;FR=.;FRO=16;FSAF=28;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=16;FWDB=-0.0431005;FXX=0.0170926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.481;QD=26.5691;RBI=0.0455475;REFB=-0.0264626;REVB=0.0147285;RO=13;SAF=29;SAR=69;SRF=0;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0814251;STB=0.550623;TYPE=snp;VARB=0.00819994;OID=.;OPOS=85195185;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:115:115:13:16:98:99:69:29:0:13:71:28:0:16 chr11 85195190 . C G 723.45 PASS AO=91;DP=108;FAO=93;FDP=108;FR=.;FRO=15;FSAF=27;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=15;FWDB=-0.0334495;FXX=0.0181802;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.319;QD=26.7944;RBI=0.0381322;REFB=-0.0499463;REVB=0.0183084;RO=15;SAF=28;SAR=63;SRF=0;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100478;STB=0.55101;TYPE=snp;VARB=0.00254167;OID=.;OPOS=85195190;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:108:108:15:15:91:93:63:28:0:15:66:27:0:15 chr11 85195191 . A G 690.87 PASS AO=90;DP=101;FAO=87;FDP=98;FR=.;FRO=11;FSAF=27;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=11;FWDB=-0.0335472;FXX=0.019998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.438;QD=28.1986;RBI=0.0452809;REFB=-0.0427795;REVB=0.0304129;RO=10;SAF=28;SAR=62;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0705645;STB=0.541975;TYPE=snp;VARB=0.00477258;OID=.;OPOS=85195191;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:101:98:10:11:90:87:62:28:0:10:60:27:0:11 chr11 85195226 . T C 190.81 PASS AO=22;DP=24;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.263;QD=33.1841;RBI=0.00623107;REFB=-0.0261476;REVB=0.00623107;RO=1;SAF=0;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00172004;OID=.;OPOS=85195226;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:24:23:1:1:22:22:22:0:0:1:22:0:0:1 chr11 85195232 . A G 43.78 PASS AO=6;DP=13;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=0;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.075;QD=12.5082;RBI=0.000727942;REFB=-0.0331219;REVB=-0.000727942;RO=6;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.12086;OID=.;OPOS=85195232;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:13:14:6:6:6:8:6:0:0:6:8:0:0:6 chr11 85195234 . C CCGGCCG 34.01 PASS AO=6;DP=13;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0;FXX=0.142755;HRUN=1;LEN=6;MLLD=235.433;QD=11.3361;RBI=0.0321258;REFB=-0.0142287;REVB=-0.0321258;RO=7;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.0181277;OID=.;OPOS=85195235;OREF=-;OALT=CGGCCG;OMAPALT=CCGGCCG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:6:13:6:12:6:0:6:0:6:30:7:0:6:0:7 chr11 85195236 . T G 39.63 PASS AO=6;DP=12;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=177.402;QD=12.1952;RBI=0.0329758;REFB=-0.023811;REVB=-0.0329758;RO=6;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0445132;OID=.;OPOS=85195236;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:12:13:6:6:6:7:6:0:0:6:7:0:0:6 chr11 85435730 . C T 1353.38 PASS AO=141;DP=141;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.5858;QD=38.1233;RBI=0.0652331;REFB=0;REVB=-0.0640798;RO=0;SAF=23;SAR=118;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.88084e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000150382;OID=.;OPOS=85435730;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:141:142:0:0:141:142:118:23:0:0:119:23:0:0 chr11 85436352 . G A 2613.18 PASS AO=274;DP=277;FAO=274;FDP=274;FR=.;FRO=0;FSAF=148;FSAR=126;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0136449;FXX=0.014388;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.961;QD=38.1485;RBI=0.0210825;REFB=-0.00150005;REVB=0.0160714;RO=1;SAF=148;SAR=126;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00376926;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.48955e-05;OID=.;OPOS=85436352;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:277:274:1:0:274:274:126:148:0:1:126:148:0:0 chr11 85436394 . T C 2257.77 PASS AO=228;DP=229;FAO=237;FDP=237;FR=.;FRO=0;FSAF=114;FSAR=123;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0219552;FXX=0.0042015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.761;QD=38.1058;RBI=0.0578437;REFB=-0.00682425;REVB=0.053515;RO=1;SAF=107;SAR=121;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00392214;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.41209e-06;OID=.;OPOS=85436394;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:229:237:1:0:228:237:121:107:0:1:123:114:0:0 chr11 85436500 . T C 1383.3 PASS AO=143;DP=146;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288172;FXX=0.0132442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.68;QD=37.1355;RBI=0.0587408;REFB=0.0325683;REVB=0.0511865;RO=2;SAF=56;SAR=87;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.016677;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.79426e-07;OID=.;OPOS=85436500;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:146:149:2:0:143:149:87:56:2:0:90:59:0:0 chr11 85436699 . A G 1996.65 PASS AO=211;DP=211;FAO=209;FDP=209;FR=.;FRO=0;FSAF=122;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0313757;FXX=0.0141503;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.609;QD=38.2133;RBI=0.0576372;REFB=0;REVB=-0.0483488;RO=0;SAF=125;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.87964e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.52967e-05;OID=.;OPOS=85436699;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:94:211:209:0:0:211:209:86:125:0:0:87:122:0:0 chr11 85436868 . G C 1545.71 PASS AO=145;DP=145;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.307;QD=38.1657;RBI=0.0324597;REFB=0;REVB=0.0149779;RO=0;SAF=76;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.01877e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.90057e-05;OID=.;OPOS=85436868;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:145:162:0:0:145:162:69:76:0:0:73:89:0:0 chr11 85437896 . A G 1385.86 PASS AO=116;DP=157;FAO=148;FDP=148;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=74;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0219544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.6973;QD=37.4558;RBI=0.0617794;REFB=0;REVB=0.0577468;RO=1;SAF=64;SAR=52;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00904526;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000362388;OID=.;OPOS=85437896;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:145:148:1:0:116:148:52:64:0:1:74:74:0:0 chr11 85437897 . C G 31.61 PASS AO=29;DP=149;FAO=29;FDP=149;FR=.;FRO=120;FSAF=4;FSAR=25;FSRF=71;FSRR=49;FWDB=0.0139102;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=73.9977;QD=0.848541;RBI=0.0498022;REFB=-0.0448707;REVB=0.0478202;RO=120;SAF=4;SAR=25;SRF=71;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.577042;STB=0.863408;TYPE=snp;VARB=0.0353;OID=.;OPOS=85437897;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:149:149:120:120:29:29:25:4:71:49:25:4:71:49 chr11 85447611 . T C 1863.23 PASS AO=197;DP=200;FAO=197;FDP=197;FR=.;FRO=0;FSAF=122;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0124152;FXX=0.0149993;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.837;QD=37.8321;RBI=0.03744;REFB=-0.0130834;REVB=0.0353217;RO=2;SAF=122;SAR=75;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00774314;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000253853;OID=.;OPOS=85447611;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:200:197:2:0:197:197:75:122:2:0:75:122:0:0 chr11 85456703 . T C 1825.58 PASS AO=190;DP=190;FAO=191;FDP=191;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0361162;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.7752;QD=38.232;RBI=0.0957721;REFB=0;REVB=-0.0887012;RO=0;SAF=75;SAR=115;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.90472e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000197136;OID=.;OPOS=85456703;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:190:191:0:0:190:191:115:75:0:0:115:76:0:0 chr11 85564826 . A C 255.52 PASS AO=70;DP=162;FAO=70;FDP=162;FR=.;FRO=92;FSAF=15;FSAR=55;FSRF=25;FSRR=67;FWDB=-0.00375537;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=265.106;QD=6.30923;RBI=0.00691262;REFB=-0.00398372;REVB=0.00580358;RO=91;SAF=15;SAR=55;SRF=25;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.085477;STB=0.545892;TYPE=snp;VARB=0.00639836;OID=.;OPOS=85564826;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:162:91:92:70:70:55:15:25:66:55:15:25:67 chr11 85565311 . T TA 57.41 PASS AO=36;DP=132;FAO=43;FDP=124;FR=.;FRO=81;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=44;FSRR=37;FWDB=0.00511663;FXX=0.0236202;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.3179;QD=1.85204;RBI=0.0890154;REFB=-0.00732659;REVB=0.0888682;RO=85;SAF=21;SAR=15;SRF=50;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00603501;STB=0.54123;TYPE=ins;VARB=0.00165232;OID=.;OPOS=85565312;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:36:132:43:124:81:26:17:44:37:57:85:21:15:50:35 chr11 85565450 . C T 435.71 PASS AO=117;DP=259;FAO=116;FDP=258;FR=.;FRO=142;FSAF=56;FSAR=60;FSRF=89;FSRR=53;FWDB=-0.000756165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.277;QD=6.75519;RBI=0.0173569;REFB=-0.00168073;REVB=-0.0173404;RO=140;SAF=57;SAR=60;SRF=89;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146005;STB=0.578906;TYPE=snp;VARB=0.00215393;OID=.;OPOS=85565450;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:259:258:140:142:117:116:60:57:89:51:60:56:89:53 chr11 85565669 . G A 236.11 PASS AO=62;DP=144;FAO=64;FDP=146;FR=.;FRO=82;FSAF=30;FSAR=34;FSRF=60;FSRR=22;FWDB=0.00318093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.858;QD=6.46871;RBI=0.0189286;REFB=-0.00992602;REVB=0.0186594;RO=81;SAF=28;SAR=34;SRF=59;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.276643;STB=0.645527;TYPE=snp;VARB=0.016657;OID=.;OPOS=85565669;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:146:81:82:62:64:34:28:59:22:34:30:60:22 chr11 85565864 . G A 218.31 PASS AO=40;DP=65;FAO=40;FDP=65;FR=.;FRO=25;FSAF=36;FSAR=4;FSRF=22;FSRR=3;FWDB=0.00525273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.71;QD=13.4347;RBI=0.0405693;REFB=0.00367806;REVB=0.0402279;RO=25;SAF=36;SAR=4;SRF=22;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0376681;STB=0.52065;TYPE=snp;VARB=-0.00342765;OID=.;OPOS=85565864;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:65:65:25:25:40:40:4:36:22:3:4:36:22:3 chr11 85627108 . T C 133.69 PASS AO=47;DP=135;FAO=47;FDP=134;FR=.;FRO=87;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=39;FSRR=48;FWDB=-0.0121827;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.535;QD=3.99063;RBI=0.0131426;REFB=-0.00470162;REVB=-0.00493047;RO=87;SAF=26;SAR=21;SRF=39;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118465;STB=0.567872;TYPE=snp;VARB=0.0128294;OID=.;OPOS=85627108;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:134:87:87:47:47:21:26:39:48:21:26:39:48 chr11 85692181 . A C 369.65 PASS AO=88;DP=184;FAO=90;FDP=186;FR=.;FRO=96;FSAF=52;FSAR=38;FSRF=59;FSRR=37;FWDB=0.00548272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.3723;QD=7.94946;RBI=0.00667504;REFB=-0.00362041;REVB=0.00380735;RO=95;SAF=50;SAR=38;SRF=59;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0511136;STB=0.519582;TYPE=snp;VARB=0.00445787;OID=.;OPOS=85692181;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:186:95:96:88:90:38:50:59:36:38:52:59:37 chr11 85725937 . C T 1441.94 PASS AO=149;DP=149;FAO=151;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.385;QD=38.1972;RBI=0.0365987;REFB=0;REVB=0.0293484;RO=0;SAF=94;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.32872e-05;OID=.;OPOS=85725937;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:149:151:0:0:149:151:55:94:0:0:55:96:0:0 chr11 85968623 . C T 241.03 PASS AO=60;DP=129;FAO=60;FDP=129;FR=.;FRO=69;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=26;FSRR=43;FWDB=0.0389446;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4097;QD=7.47373;RBI=0.0485539;REFB=0.00429132;REVB=-0.0289965;RO=68;SAF=27;SAR=33;SRF=26;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0659345;STB=0.539845;TYPE=snp;VARB=-0.0065349;OID=.;OPOS=85968623;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:68:69:60:60:33:27:26:42:33:27:26:43 chr11 86098680 . T C 294.89 PASS AO=97;DP=246;FAO=95;FDP=246;FR=.;FRO=151;FSAF=45;FSAR=50;FSRF=84;FSRR=67;FWDB=0.0284765;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.7643;QD=4.79501;RBI=0.036768;REFB=-0.00933082;REVB=0.0232589;RO=148;SAF=47;SAR=50;SRF=82;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0746862;STB=0.550566;TYPE=snp;VARB=0.0154809;OID=.;OPOS=86098680;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:246:246:148:151:97:95:50:47:82:66:50:45:84:67 chr11 86123556 . A G 242.89 PASS AO=72;DP=175;FAO=72;FDP=177;FR=.;FRO=105;FSAF=28;FSAR=44;FSRF=35;FSRR=70;FWDB=0.0899506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.851;QD=5.48914;RBI=0.0940341;REFB=-0.0214246;REVB=-0.02741;RO=103;SAF=28;SAR=44;SRF=35;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.055023;STB=0.535202;TYPE=snp;VARB=0.0304345;OID=.;OPOS=86123556;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:177:103:105:72:72:44:28:35:68:44:28:35:70 chr11 86267633 . C T 1012.6 PASS AO=106;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176814;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.079;QD=38.2113;RBI=0.0340393;REFB=0;REVB=0.0290868;RO=0;SAF=51;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.82082e-05;OID=.;OPOS=86267633;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:106:106:0:0:106:106:55:51:0:0:55:51:0:0 chr11 86267714 . C A 1214.44 PASS AO=131;DP=133;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00222653;FXX=0.0150365;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.885;QD=37.082;RBI=0.00693239;REFB=0.00201849;REVB=0.00656511;RO=2;SAF=62;SAR=69;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0135754;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.20992e-06;OID=.;OPOS=86267714;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:133:131:2:0:131:131:69:62:0:2:69:62:0:0 chr11 86660886 . G A 2981.9 PASS AO=310;DP=310;FAO=311;FDP=311;FR=.;FRO=0;FSAF=161;FSAR=150;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0197955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.235;QD=38.3523;RBI=0.022472;REFB=0;REVB=-0.0106363;RO=0;SAF=160;SAR=150;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.25771e-06;OID=.;OPOS=86660886;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:310:311:0:0:310:311:150:160:0:0:150:161:0:0 chr11 87013438 . G A 2202.75 PASS AO=237;DP=243;FAO=239;FDP=239;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=134;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0363851;FXX=0.0164602;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.315;QD=36.8661;RBI=0.0369831;REFB=0.0364265;REVB=0.00662402;RO=4;SAF=105;SAR=132;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00182462;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000129005;OID=.;OPOS=87013438;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:243:239:4:0:237:239:132:105:2:2:134:105:0:0 chr11 87034002 . C T 989.26 PASS AO=104;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.727;QD=38.0484;RBI=0.0117966;REFB=0;REVB=-0.00403077;RO=0;SAF=56;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.62947e-06;OID=.;OPOS=87034002;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:104:104:0:0:104:104:48:56:0:0:48:56:0:0 chr11 87908448 . A G 722.74 PASS AO=79;DP=80;FAO=78;FDP=80;FR=.;FRO=2;FSAF=50;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0176634;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0124;QD=36.137;RBI=0.0191237;REFB=-0.0627999;REVB=-0.00732924;RO=1;SAF=50;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0160428;STB=0.517237;TYPE=snp;VARB=0.00334975;OID=.;OPOS=87908448;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:80:80:1:2:79:78:29:50:0:1:28:50:0:2 chr11 87908563 . G A 555.54 PASS AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0134225;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.317;QD=37.0357;RBI=0.0294204;REFB=-0.0531605;REVB=0.0261801;RO=1;SAF=34;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136765;STB=0.507244;TYPE=snp;VARB=0.00140659;OID=.;OPOS=87908563;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:60:60:1:1:59:59:25:34:1:0:25:34:1:0 chr11 88045583 . A G 1444.82 PASS AO=153;DP=154;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0517461;FXX=0.00649309;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.8138;QD=37.7732;RBI=0.0728811;REFB=-0.0978993;REVB=0.0513226;RO=1;SAF=58;SAR=95;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00498144;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000959583;OID=.;OPOS=88045583;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:154:153:1:0:153:153:95:58:0:1:95:58:0:0 chr11 88645129 . T A 998.99 PASS AO=111;DP=116;FAO=111;FDP=114;FR=.;FRO=3;FSAF=37;FSAR=74;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00137242;FXX=0.0172399;HRUN=6;LEN=1;MLLD=257.529;QD=35.0522;RBI=0.0013757;REFB=-0.167266;REVB=9.49312e-05;RO=4;SAF=37;SAR=74;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0123141;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000313184;OID=.;OPOS=88645129;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:116:114:4:3:111:111:74:37:2:2:74:37:1:2 chr11 88911696 . C A 2321.25 PASS AO=241;DP=247;FAO=245;FDP=245;FR=.;FRO=0;FSAF=140;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00338978;FXX=0.0199992;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.8662;QD=37.898;RBI=0.0231776;REFB=-0.0562181;REVB=0.0229284;RO=2;SAF=139;SAR=102;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00680805;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000981417;OID=.;OPOS=88911696;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:247:245:2:0:241:245:102:139:2:0:105:140:0:0 chr11 89133449 . C T 2243.67 PASS AO=233;DP=234;FAO=234;FDP=234;FR=.;FRO=0;FSAF=147;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0394976;FXX=0.00847422;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.646;QD=38.3533;RBI=0.0397799;REFB=0;REVB=0.0047311;RO=0;SAF=145;SAR=88;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.32256e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.65547e-05;OID=.;OPOS=89133449;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:234:234:0:0:233:234:88:145:0:0:87:147:0:0 chr11 89224101 . G T 613.2 PASS AO=72;DP=78;FAO=72;FDP=78;FR=.;FRO=6;FSAF=29;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0240202;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.304;QD=31.4461;RBI=0.0410173;REFB=-0.0372312;REVB=0.0332484;RO=6;SAF=29;SAR=43;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.035881;STB=0.51901;TYPE=snp;VARB=0.000438267;OID=.;OPOS=89224101;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:78:78:6:6:72:72:43:29:1:5:43:29:1:5 chr11 89224131 . T TCTC 532.87 PASS AO=59;DP=75;FAO=62;FDP=66;FR=.;FRO=4;FSAF=12;FSAR=50;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.000443274;FXX=0.043472;HRUN=1;LEN=3;MLLD=221.572;QD=32.2953;RBI=0.0389466;REFB=-0.140028;REVB=0.0389441;RO=11;SAF=12;SAR=47;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173951;STB=0.528691;TYPE=ins;VARB=0.00577549;OID=.;OPOS=89224132;OREF=-;OALT=CTC;OMAPALT=TCTC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:59:75:62:66:4:12:50:2:2:8:11:12:47:7:4 chr11 89443808 . A C 113.18 PASS AO=26;DP=54;FAO=26;FDP=54;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=9;FWDB=-0.0250148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.216;QD=8.38391;RBI=0.0309033;REFB=-0.00836294;REVB=-0.018146;RO=27;SAF=13;SAR=13;SRF=18;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15164;STB=0.592524;TYPE=snp;VARB=0.0290597;OID=.;OPOS=89443808;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:27:28:26:26:13:13:18:9:13:13:19:9 chr11 89531540 . C T 417.42 PASS AO=144;DP=389;FAO=144;FDP=388;FR=.;FRO=244;FSAF=73;FSAR=71;FSRF=130;FSRR=114;FWDB=0.015775;FXX=0.00257063;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.451;QD=4.30328;RBI=0.0159832;REFB=0.00751102;REVB=-0.00257168;RO=243;SAF=73;SAR=71;SRF=129;SRR=114;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0266534;STB=0.51626;TYPE=snp;VARB=-0.0113299;OID=.;OPOS=89531540;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:389:388:243:244:144:144:71:73:129:114:71:73:130:114 chr11 89935586 . G T 316.22 PASS AO=88;DP=204;FAO=88;FDP=204;FR=.;FRO=116;FSAF=38;FSAR=50;FSRF=54;FSRR=62;FWDB=-0.080045;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.3175;QD=6.20046;RBI=0.0815322;REFB=-0.0113736;REVB=0.0155016;RO=113;SAF=38;SAR=50;SRF=53;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0380596;STB=0.519417;TYPE=snp;VARB=0.0184912;OID=.;OPOS=89935586;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:204:113:116:88:88:50:38:53:60:50:38:54:62 chr11 89939442 . T TA 81.11 PASS AO=12;DP=76;FAO=40;FDP=63;FR=.;FRO=23;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=-0.114254;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=8.9801;QD=5.14983;RBI=0.139628;REFB=-0.0179379;REVB=-0.0802624;RO=59;SAF=8;SAR=4;SRF=23;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.335115;STB=0.56282;TYPE=ins;VARB=0.0513123;OID=.;OPOS=89939443;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:12:76:40:63:23:19:21:7:16:29:59:8:4:23:36 chr11 89939448 . G A 156.18 PASS AO=34;DP=63;FAO=34;FDP=64;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=21;FWDB=0.0483294;FXX=0.0153822;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.4871;QD=9.76111;RBI=0.0748112;REFB=0.0239765;REVB=-0.0571049;RO=29;SAF=16;SAR=18;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105803;STB=0.58096;TYPE=snp;VARB=-0.0128663;OID=.;OPOS=89939448;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:64:29:30:34:34:18:16:10:19:18:16:9:21 chr11 89956206 . G A 66.93 PASS AO=19;DP=49;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=25;FWDB=0.0391341;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.248;QD=5.35432;RBI=0.0396795;REFB=-0.0254008;REVB=-0.00655595;RO=30;SAF=7;SAR=12;SRF=6;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206111;STB=0.623981;TYPE=snp;VARB=0.0656973;OID=.;OPOS=89956206;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:49:50:30:31:19:19:12:7:6:24:12:7:6:25 chr11 91545212 . C G 471.56 PASS AO=43;DP=45;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0179149;FXX=0.0565931;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.7759;QD=37.7247;RBI=0.066139;REFB=0;REVB=0.0636665;RO=0;SAF=17;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75441e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00113991;OID=.;OPOS=91545212;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:45:50:0:0:43:50:26:17:0:0:31:19:0:0 chr11 92531356 . A G 1277.96 PASS AO=134;DP=134;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.35;QD=38.1481;RBI=0.0253033;REFB=0;REVB=0.0214803;RO=0;SAF=57;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.79559e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.18032e-05;OID=.;OPOS=92531356;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:134:134:0:0:134:134:77:57:0:0:77:57:0:0 chr11 92532677 . T C 426.09 PASS AO=42;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300276;FXX=0.0217344;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.3491;QD=37.8743;RBI=0.0314974;REFB=0;REVB=-0.00950913;RO=1;SAF=20;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0228919;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000174016;OID=.;OPOS=92532677;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:44:45:1:0:42:45:22:20:1:0:22:23:0:0 chr11 92534442 . A G 917.97 PASS AO=100;DP=103;FAO=100;FDP=102;FR=.;FRO=2;FSAF=42;FSAR=58;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0431264;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.686;QD=35.9988;RBI=0.0441377;REFB=-0.127586;REVB=0.0093941;RO=2;SAF=42;SAR=58;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0220506;STB=0.511626;TYPE=snp;VARB=0.000242391;OID=.;OPOS=92534442;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:103:102:2:2:100:100:58:42:2:0:58:42:2:0 chr11 92573911 . G T 1418.73 PASS AO=149;DP=149;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0263674;FXX=0.00666622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.684;QD=38.0866;RBI=0.0316967;REFB=-0.0219475;REVB=-0.017591;RO=0;SAF=76;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.08966e-05;OID=.;OPOS=92573911;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:149:149:0:0:149:149:73:76:0:0:74:75:0:0 chr11 92590448 . A G 1579.33 PASS AO=164;DP=164;FAO=165;FDP=165;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0223562;FXX=0.00602373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.663;QD=38.2868;RBI=0.0307429;REFB=0;REVB=0.0211027;RO=0;SAF=103;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.36019e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.15396e-05;OID=.;OPOS=92590448;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:164:165:0:0:164:165:61:103:0:0:62:103:0:0 chr11 92600126 . GC G 339.79 PASS AO=48;DP=64;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.1032;FXX=0.0158705;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.2768;QD=21.922;RBI=0.162152;REFB=0.0329087;REVB=0.125072;RO=8;SAF=19;SAR=29;SRF=6;SRR=2;SSEN=0.348568;SSEP=0;SSSB=-0.0966863;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0144602;OID=.;OPOS=92600127;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:48:60:62:62:0:29:33:0:0:26:8:19:29:6:2 chr11 92625459 . C T 73.85 PASS AO=27;DP=83;FAO=27;FDP=83;FR=.;FRO=56;FSAF=3;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=39;FWDB=-0.0864746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.5003;QD=3.5591;RBI=0.090549;REFB=-0.0327539;REVB=-0.0268563;RO=56;SAF=3;SAR=24;SRF=17;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.360104;STB=0.717291;TYPE=snp;VARB=0.0665889;OID=.;OPOS=92625459;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:83:83:56:56:27:27:24:3:17:39:24:3:17:39 chr11 92627848 . A G 3452.13 PASS AO=360;DP=362;FAO=360;FDP=360;FR=.;FRO=0;FSAF=181;FSAR=179;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0440961;FXX=0.00826424;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.02;QD=38.357;RBI=0.0518743;REFB=0;REVB=0.0273218;RO=0;SAF=181;SAR=179;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.25221e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.15701e-05;OID=.;OPOS=92627848;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:362:360:0:0:360:360:179:181:0:0:179:181:0:0 chr11 92629097 . C T 61.42 PASS AO=42;DP=186;FAO=43;FDP=186;FR=.;FRO=143;FSAF=38;FSAR=5;FSRF=59;FSRR=84;FWDB=-0.0344752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.0219;QD=1.32087;RBI=0.0364867;REFB=-0.0150461;REVB=-0.0119474;RO=144;SAF=37;SAR=5;SRF=60;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.60533;STB=0.8744;TYPE=snp;VARB=0.0649568;OID=.;OPOS=92629097;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:186:186:144:143:42:43:5:37:60:84:5:38:59:84 chr11 92629305 . C T 1962.55 PASS AO=209;DP=214;FAO=211;FDP=211;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=121;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164863;FXX=0.0186038;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7574;QD=37.2047;RBI=0.0665555;REFB=-0.0749101;REVB=0.0644813;RO=4;SAF=90;SAR=119;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116252;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0013368;OID=.;OPOS=92629305;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:214:211:4:0:209:211:119:90:3:1:121:90:0:0 chr11 92629310 . T G 385.08 PASS AO=100;DP=219;FAO=100;FDP=219;FR=.;FRO=119;FSAF=42;FSAR=58;FSRF=55;FSRR=64;FWDB=-0.00511137;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=217.724;QD=7.03341;RBI=0.0101816;REFB=-0.0128754;REVB=-0.00880563;RO=119;SAF=42;SAR=58;SRF=55;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0421339;STB=0.523344;TYPE=snp;VARB=0.0172527;OID=.;OPOS=92629310;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:219:219:119:119:100:100:58:42:55:64:58:42:55:64 chr11 92629599 . G A 41.83 PASS AO=11;DP=32;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.0174297;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.4506;QD=4.92139;RBI=0.0229004;REFB=-0.0347281;REVB=0.0148537;RO=20;SAF=4;SAR=7;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0969096;STB=0.553101;TYPE=snp;VARB=0.0306642;OID=.;OPOS=92629599;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:32:34:20:22:11:12:7:4:9:11:8:4:9:13 chr11 93141580 . C A 187.88 PASS AO=43;DP=108;FAO=52;FDP=117;FR=.;FRO=65;FSAF=14;FSAR=38;FSRF=33;FSRR=32;FWDB=-0.00776583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.744;QD=6.42317;RBI=0.0312672;REFB=-0.0169114;REVB=0.0302874;RO=61;SAF=13;SAR=30;SRF=31;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226773;STB=0.645638;TYPE=snp;VARB=0.0223185;OID=.;OPOS=93141580;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:117:61:65:43:52:30:13:31:30:38:14:33:32 chr11 93211764 . A G 1297.33 PASS AO=138;DP=140;FAO=138;FDP=140;FR=.;FRO=2;FSAF=71;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0314961;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9696;QD=37.0665;RBI=0.0622381;REFB=-0.115258;REVB=0.0536803;RO=2;SAF=71;SAR=67;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0139784;STB=0.507352;TYPE=snp;VARB=0.00601556;OID=.;OPOS=93211764;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:140:140:2:2:138:138:67:71:0:2:67:71:0:2 chr11 93212254 . C T 968.65 PASS AO=102;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00895263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.869;QD=37.9861;RBI=0.0114751;REFB=0;REVB=-0.00717834;RO=0;SAF=59;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.12343e-06;OID=.;OPOS=93212254;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:102:102:0:0:102:102:43:59:0:0:43:59:0:0 chr11 93402096 . C A 530.59 PASS AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0669516;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.198;QD=36.5925;RBI=0.0670883;REFB=-0.0216161;REVB=-0.00427932;RO=1;SAF=11;SAR=46;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101449;STB=0.505374;TYPE=snp;VARB=0.000978083;OID=.;OPOS=93402096;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:58:58:1:1:57:57:46:11:0:1:46:11:0:1 chr11 93408831 . G A 1213.89 PASS AO=127;DP=130;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021841;FXX=0.0153834;HRUN=3;LEN=1;MLLD=235.492;QD=37.9341;RBI=0.0218934;REFB=0;REVB=0.00151475;RO=0;SAF=79;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.54552e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.36078e-05;OID=.;OPOS=93408831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:130:128:0:0:127:128:48:79:0:0:49:79:0:0 chr11 93425159 . C A 3171.25 PASS AO=330;DP=330;FAO=331;FDP=331;FR=.;FRO=0;FSAF=148;FSAR=183;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0213273;FXX=0.00301196;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.902;QD=38.3233;RBI=0.0366151;REFB=0;REVB=0.0297627;RO=0;SAF=149;SAR=181;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.15304e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.86351e-05;OID=.;OPOS=93425159;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:330:331:0:0:330:331:181:149:0:0:183:148:0:0 chr11 93428778 . GA G,AA 42.52 PASS AO=6,4;DP=24;FAO=8,4;FDP=20;FR=.;FRO=8;FSAF=3,3;FSAR=5,1;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.108021,0.0123668;FXX=0.0908678;HRUN=8,1;LEN=1,1;MLLD=9.85962,167.816;QD=8.50413;RBI=0.110315,0.0123703;REFB=-0.00432752,0.00622151;REVB=0.0223795,0.000295405;RO=7;SAF=2,3;SAR=4,1;SRF=3;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.090705,0.326128;STB=0.5,0.74875;TYPE=del,snp;VARB=0.0847716,-0.0280829;OID=.,.;OPOS=93428779,93428778;OREF=A,G;OALT=-,A;OMAPALT=G,AA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:20:20:7:8:6,4:8,4:4,1:2,3:3:4:5,1:3,3:3:5 chr11 93462607 . A T 1678.7 PASS AO=182;DP=187;FAO=182;FDP=186;FR=.;FRO=4;FSAF=48;FSAR=134;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0160495;FXX=0.00534731;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.1905;QD=36.1011;RBI=0.0611812;REFB=-0.102031;REVB=0.0590385;RO=3;SAF=48;SAR=134;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0158806;STB=0.506501;TYPE=snp;VARB=0.00202789;OID=.;OPOS=93462607;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:187:186:3:4:182:182:134:48:2:1:134:48:2:2 chr11 93463726 . T TAG 1418.28 PASS AO=130;DP=164;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0352174;FXX=0.0683187;HRUN=0;LEN=2;MLLD=154.048;QD=37.8208;RBI=0.0415536;REFB=0;REVB=0.0220553;RO=3;SAF=68;SAR=62;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0205022;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00240688;OID=.;OPOS=93463727;OREF=-;OALT=AG;OMAPALT=TAG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:130:164:150:150:0:82:68:0:0:68:3:68:62:3:0 chr11 93466866 . G T 290.01 PASS AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0853409;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.986;QD=37.4204;RBI=0.0872737;REFB=0;REVB=-0.0182656;RO=0;SAF=8;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000485262;OID=.;OPOS=93466866;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:30:31:0:0:30:31:22:8:0:0:23:8:0:0 chr11 93474570 . T TGCGTGA 777.27 PASS AO=100;DP=143;FAO=109;FDP=135;FR=.;FRO=26;FSAF=51;FSAR=58;FSRF=24;FSRR=2;FWDB=0.00453807;FXX=0.0425502;HRUN=1;LEN=6;MLLD=212.616;QD=23.0301;RBI=0.0206989;REFB=-0.0755625;REVB=0.0201953;RO=28;SAF=47;SAR=53;SRF=26;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186896;STB=0.587029;TYPE=ins;VARB=0.0133959;OID=.;OPOS=93474571;OREF=-;OALT=GCGTGA;OMAPALT=TGCGTGA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:100:143:109:135:26:51:58:24:2:28:28:47:53:26:2 chr11 93517874 . C G 378.43 PASS AO=38;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0800867;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.862;QD=38.8128;RBI=0.0817631;REFB=0;REVB=0.0164722;RO=0;SAF=8;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.26572e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000118701;OID=.;OPOS=93517874;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:38:39:0:0:38:39:30:8:0:0:30:9:0:0 chr11 93517886 . G C 292 PASS AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.108357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.702;QD=38.9331;RBI=0.109551;REFB=0;REVB=0.0161308;RO=0;SAF=7;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000704076;OID=.;OPOS=93517886;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:30:30:0:0:30:30:23:7:0:0:23:7:0:0 chr11 93554242 . C G 275.12 PASS AO=81;DP=197;FAO=81;FDP=197;FR=.;FRO=116;FSAF=44;FSAR=37;FSRF=54;FSRR=62;FWDB=0.00334122;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=247.871;QD=5.58626;RBI=0.0139898;REFB=0.00424004;REVB=0.013585;RO=116;SAF=44;SAR=37;SRF=54;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0816129;STB=0.545717;TYPE=snp;VARB=-0.00642381;OID=.;OPOS=93554242;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:197:116:116:81:81:37:44:54:62:37:44:54:62 chr11 93797619 . A G 1262.75 PASS AO=133;DP=134;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132234;FXX=0.00740686;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.3553;QD=37.694;RBI=0.0227081;REFB=-0.00579758;REVB=0.0184608;RO=1;SAF=49;SAR=84;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00562555;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000104464;OID=.;OPOS=93797619;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:134:134:1:0:133:134:84:49:0:1:85:49:0:0 chr11 93845511 . A G 1834.28 PASS AO=191;DP=191;FAO=192;FDP=192;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.037047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.793;QD=38.2142;RBI=0.0420737;REFB=0;REVB=0.0199428;RO=0;SAF=81;SAR=110;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.97813e-05;OID=.;OPOS=93845511;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:87:191:192:0:0:191:192:110:81:0:0:110:82:0:0 chr11 93862493 . A C 385.45 PASS AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.109068;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.5648;QD=37.6044;RBI=0.120819;REFB=0;REVB=-0.0519753;RO=0;SAF=25;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.1719e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00295618;OID=.;OPOS=93862493;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:41:41:0:0:41:41:16:25:0:0:16:25:0:0 chr11 94225807 . C T 421.62 PASS AO=87;DP=150;FAO=87;FDP=155;FR=.;FRO=68;FSAF=52;FSAR=35;FSRF=36;FSRR=32;FWDB=0.0231714;FXX=0.012738;HRUN=3;LEN=1;MLLD=127.644;QD=10.8806;RBI=0.0253855;REFB=-0.00845947;REVB=-0.0103686;RO=61;SAF=52;SAR=35;SRF=29;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0944379;STB=0.530767;TYPE=snp;VARB=0.00860509;OID=.;OPOS=94225807;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:155:61:68:87:87:35:52:29:32:35:52:36:32 chr11 94225920 . C T 712.63 PASS AO=159;DP=304;FAO=159;FDP=303;FR=.;FRO=144;FSAF=62;FSAR=97;FSRF=59;FSRR=85;FWDB=0.00611679;FXX=0.00655716;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.988;QD=9.40762;RBI=0.011591;REFB=0.0032279;REVB=-0.00984566;RO=144;SAF=62;SAR=97;SRF=59;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0180174;STB=0.509838;TYPE=snp;VARB=-0.00304842;OID=.;OPOS=94225920;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:304:303:144:144:159:159:97:62:59:85:97:62:59:85 chr11 94231257 . C G 283.98 PASS AO=66;DP=132;FAO=66;FDP=133;FR=.;FRO=67;FSAF=27;FSAR=39;FSRF=21;FSRR=46;FWDB=-0.00634085;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.613;QD=8.54074;RBI=0.0390638;REFB=-0.0284115;REVB=-0.0385458;RO=65;SAF=27;SAR=39;SRF=21;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0815513;STB=0.550741;TYPE=snp;VARB=0.0242645;OID=.;OPOS=94231257;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:133:65:67:66:66:39:27:21:44:39:27:21:46 chr11 94261255 . C G 476.63 PASS AO=119;DP=252;FAO=119;FDP=251;FR=.;FRO=132;FSAF=51;FSAR=68;FSRF=70;FSRR=62;FWDB=0.0746278;FXX=0.0039681;HRUN=3;LEN=1;MLLD=152.414;QD=7.59567;RBI=0.0746956;REFB=-0.0205368;REVB=0.00318227;RO=132;SAF=51;SAR=68;SRF=70;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0974935;STB=0.553767;TYPE=snp;VARB=0.0208774;OID=.;OPOS=94261255;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:252:251:132:132:119:119:68:51:70:62:68:51:70:62 chr11 94277805 . AC A 14.88 PASS AO=4;DP=8;FAO=4;FDP=7;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=0;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.00801027;FXX=0.124844;HRUN=1;LEN=1;MLLD=42.9757;QD=8.50052;RBI=0.00801027;REFB=-0.0364482;REVB=0;RO=3;SAF=4;SAR=0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.25989;OID=.;OPOS=94277806;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:4:8:4:7:3:4:0:3:0:12:3:4:0:3:0 chr11 94602414 . C T 48.81 PASS AO=8;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0135231;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.52;QD=15.0198;RBI=0.0179978;REFB=-0.0167532;REVB=-0.0118763;RO=5;SAF=3;SAR=5;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128939;STB=0.574292;TYPE=snp;VARB=0.0148238;OID=.;OPOS=94602414;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:13:13:5:5:8:8:5:3:1:4:5:3:1:4 chr11 94699507 . A AT 1173.72 PASS AO=142;DP=169;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.117304;FXX=0.0670691;HRUN=1;LEN=1;MLLD=21.6332;QD=30.6856;RBI=0.118977;REFB=0;REVB=0.0198821;RO=15;SAF=68;SAR=74;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00221298;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.000127575;OID=.;OPOS=94699508;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:142:169:153:153:0:72:81:0:0:99:15:68:74:7:8 chr11 94732407 . G A 472.83 PASS AO=125;DP=277;FAO=125;FDP=276;FR=.;FRO=151;FSAF=73;FSAR=52;FSRF=81;FSRR=70;FWDB=0.00537379;FXX=0.00360998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.813;QD=6.85258;RBI=0.0138844;REFB=-0.0113669;REVB=0.0128024;RO=148;SAF=73;SAR=52;SRF=80;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.04347;STB=0.526542;TYPE=snp;VARB=0.0167617;OID=.;OPOS=94732407;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:277:276:148:151:125:125:52:73:80:68:52:73:81:70 chr11 94759059 . A G 21.5 PASS AO=6;DP=20;FAO=6;FDP=20;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=0.00870028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.833;QD=4.29961;RBI=0.0158537;REFB=0.00523015;REVB=-0.0132531;RO=14;SAF=2;SAR=4;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.468168;STB=0.787084;TYPE=snp;VARB=-0.01147;OID=.;OPOS=94759059;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:20:20:14:14:6:6:4:2:11:3:4:2:11:3 chr11 94800902 . G GC 737.94 PASS AO=97;DP=108;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0768879;FXX=0.0185168;HRUN=1;LEN=1;MLLD=21.1241;QD=27.8467;RBI=0.0908447;REFB=0;REVB=0.0483839;RO=7;SAF=75;SAR=22;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.084;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-3.96943e-05;OID=.;OPOS=94800903;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:97:108:106:106:0:78:28:0:0:62:7:75:22:2:5 chr11 94802776 . G C 314.46 PASS AO=78;DP=166;FAO=78;FDP=165;FR=.;FRO=87;FSAF=30;FSAR=48;FSRF=50;FSRR=37;FWDB=-0.0118228;FXX=0.00602373;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.348;QD=7.6233;RBI=0.0131018;REFB=-0.012865;REVB=-0.00564601;RO=86;SAF=30;SAR=48;SRF=49;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176938;STB=0.600913;TYPE=snp;VARB=0.0107341;OID=.;OPOS=94802776;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:165:86:87:78:78:48:30:49:37:48:30:50:37 chr11 95502128 . G C 81.1 PASS AO=34;DP=125;FAO=34;FDP=116;FR=.;FRO=82;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=41;FSRR=41;FWDB=0.00198368;FXX=0.0719942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.7659;QD=2.79652;RBI=0.0197637;REFB=-0.00114823;REVB=-0.0196639;RO=69;SAF=16;SAR=18;SRF=33;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00887459;STB=0.5208;TYPE=snp;VARB=0.00118179;OID=.;OPOS=95502128;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:125:116:69:82:34:34:18:16:33:36:18:16:41:41 chr11 95512060 . A G 417.73 PASS AO=101;DP=208;FAO=101;FDP=208;FR=.;FRO=107;FSAF=58;FSAR=43;FSRF=49;FSRR=58;FWDB=-0.047188;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.8149;QD=8.0333;RBI=0.0600226;REFB=5.60511e-05;REVB=0.0370946;RO=106;SAF=58;SAR=43;SRF=49;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104639;STB=0.56008;TYPE=snp;VARB=-0.000158177;OID=.;OPOS=95512060;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:208:106:107:101:101:43:58:49:57:43:58:49:58 chr11 95521648 . A G 287.91 PASS AO=70;DP=146;FAO=70;FDP=146;FR=.;FRO=76;FSAF=31;FSAR=39;FSRF=41;FSRR=35;FWDB=0.0132319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6321;QD=7.88804;RBI=0.036438;REFB=-0.0518966;REVB=0.0339507;RO=73;SAF=31;SAR=39;SRF=38;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0720841;STB=0.550358;TYPE=snp;VARB=0.0904175;OID=.;OPOS=95521648;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:73:76:70:70:39:31:38:35:39:31:41:35 chr11 95528714 . C T 196.92 PASS AO=65;DP=174;FAO=65;FDP=174;FR=.;FRO=109;FSAF=32;FSAR=33;FSRF=46;FSRR=63;FWDB=-0.0162099;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.199;QD=4.52692;RBI=0.0229289;REFB=-0.00736771;REVB=-0.0162165;RO=109;SAF=32;SAR=33;SRF=46;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0778475;STB=0.544089;TYPE=snp;VARB=0.0134619;OID=.;OPOS=95528714;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:174:109:109:65:65:33:32:46:63:33:32:46:63 chr11 95564259 . A G 75.01 PASS AO=22;DP=58;FAO=22;FDP=58;FR=.;FRO=36;FSAF=19;FSAR=3;FSRF=29;FSRR=7;FWDB=-0.0134759;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.5468;QD=5.17293;RBI=0.024094;REFB=-0.0326136;REVB=-0.019973;RO=35;SAF=19;SAR=3;SRF=28;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126636;STB=0.568794;TYPE=snp;VARB=0.0573396;OID=.;OPOS=95564259;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:58:58:35:36:22:22:3:19:28:7:3:19:29:7 chr11 95580926 . G A 327.36 PASS AO=110;DP=293;FAO=110;FDP=293;FR=.;FRO=183;FSAF=47;FSAR=63;FSRF=68;FSRR=115;FWDB=-0.00304884;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=257.54;QD=4.46913;RBI=0.0272219;REFB=0.0019443;REVB=-0.0270506;RO=180;SAF=47;SAR=63;SRF=67;SRR=113;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0626738;STB=0.535898;TYPE=snp;VARB=-0.00307497;OID=.;OPOS=95580926;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:293:293:180:183:110:110:63:47:67:113:63:47:68:115 chr11 95657111 . T G 10.71 PASS AO=5;DP=27;FAO=5;FDP=28;FR=.;FRO=23;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.101028;FXX=0.0344709;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.2005;QD=1.53057;RBI=0.118113;REFB=-0.0033512;REVB=-0.0611885;RO=21;SAF=2;SAR=3;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0833325;STB=0.507433;TYPE=snp;VARB=0.00462553;OID=.;OPOS=95657111;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:27:28:21:23:5:5:3:2:7:14:3:2:9:14 chr11 95825797 . A G 69.1 PASS AO=19;DP=40;FAO=17;FDP=40;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.0153022;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.3466;QD=6.90968;RBI=0.0631966;REFB=0.0116999;REVB=-0.061316;RO=21;SAF=16;SAR=3;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.547266;STB=0.792089;TYPE=snp;VARB=-0.0333983;OID=.;OPOS=95825797;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:40:40:21:23:19:17:3:16:6:15:3:14:8:15 chr11 96116444 . T C 136.11 PASS AO=46;DP=124;FAO=45;FDP=123;FR=.;FRO=78;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=36;FSRR=42;FWDB=-0.00428559;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.818;QD=4.42639;RBI=0.0202512;REFB=-0.00967751;REVB=0.0197925;RO=77;SAF=24;SAR=22;SRF=36;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0595221;STB=0.545434;TYPE=snp;VARB=0.0157063;OID=.;OPOS=96116444;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:123:77:78:46:45:22:24:36:41:21:24:36:42 chr11 97716872 . A G 568.24 PASS AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203527;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=203.396;QD=38.5247;RBI=0.0213352;REFB=0;REVB=0.00639987;RO=0;SAF=22;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.13651e-05;OID=.;OPOS=97716872;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:59:59:0:0:59:59:37:22:0:0:37:22:0:0 chr11 98991049 . G A 650.13 PASS AO=122;DP=208;FAO=125;FDP=209;FR=.;FRO=84;FSAF=62;FSAR=63;FSRF=40;FSRR=44;FWDB=-0.0102673;FXX=0.00476168;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.312;QD=12.4426;RBI=0.0105124;REFB=-0.0145536;REVB=-0.00225654;RO=84;SAF=61;SAR=61;SRF=40;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0179221;STB=0.507962;TYPE=snp;VARB=0.0106951;OID=.;OPOS=98991049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:209:84:84:122:125:61:61:40:44:63:62:40:44 chr11 99690286 . T G 756.11 PASS AO=116;DP=162;FAO=117;FDP=159;FR=.;FRO=42;FSAF=41;FSAR=76;FSRF=13;FSRR=29;FWDB=0.00476153;FXX=0.0185174;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.965;QD=19.0216;RBI=0.00525501;REFB=-0.0161067;REVB=-0.00222328;RO=42;SAF=41;SAR=75;SRF=13;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.024092;STB=0.511949;TYPE=snp;VARB=0.005964;OID=.;OPOS=99690286;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:162:159:42:42:116:117:75:41:13:29:76:41:13:29 chr11 99690428 . T G 22.78 PASS AO=20;DP=106;FAO=20;FDP=106;FR=.;FRO=86;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=63;FWDB=0.00869547;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.345;QD=0.8597;RBI=0.0510743;REFB=-0.00528499;REVB=-0.0503286;RO=85;SAF=10;SAR=10;SRF=22;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.315746;STB=0.688517;TYPE=snp;VARB=0.0353325;OID=.;OPOS=99690428;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:106:106:85:86:20:20:10:10:22:63:10:10:23:63 chr11 99690461 . A G 23.58 PASS AO=25;DP=139;FAO=25;FDP=139;FR=.;FRO=114;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=100;FWDB=0.0240159;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.374;QD=0.678696;RBI=0.0240221;REFB=0.00672389;REVB=-0.000545771;RO=114;SAF=15;SAR=10;SRF=14;SRR=100;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.599794;STB=0.85035;TYPE=snp;VARB=-0.0149405;OID=.;OPOS=99690461;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:139:139:114:114:25:25:10:15:14:100:10:15:14:100 chr11 100512794 . G A 254.32 PASS AO=71;DP=172;FAO=73;FDP=174;FR=.;FRO=101;FSAF=46;FSAR=27;FSRF=46;FSRR=55;FWDB=-0.0361906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.6922;QD=5.84647;RBI=0.0417974;REFB=0.000772428;REVB=0.0209108;RO=99;SAF=46;SAR=25;SRF=44;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214914;STB=0.602913;TYPE=snp;VARB=-0.0010156;OID=.;OPOS=100512794;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:174:99:101:71:73:25:46:44:55:27:46:46:55 chr11 100803982 . C T 304.25 PASS AO=81;DP=180;FAO=81;FDP=181;FR=.;FRO=100;FSAF=15;FSAR=66;FSRF=44;FSRR=56;FWDB=0.00674829;FXX=0.0163035;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.264;QD=6.72375;RBI=0.00814495;REFB=-0.0061598;REVB=0.00456078;RO=96;SAF=17;SAR=64;SRF=42;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.273179;STB=0.680243;TYPE=snp;VARB=0.0116435;OID=.;OPOS=100803982;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:181:96:100:81:81:64:17:42:54:66:15:44:56 chr11 100814570 . A G 2262.27 PASS AO=233;DP=237;FAO=235;FDP=235;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=156;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00865903;FXX=0.0126045;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.29;QD=38.5067;RBI=0.0154333;REFB=0;REVB=-0.0127753;RO=0;SAF=77;SAR=156;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52946e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.52381e-06;OID=.;OPOS=100814570;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:237:235:0:0:233:235:156:77:0:0:156:79:0:0 chr11 100846936 . A G 916.35 PASS AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.015331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.58;QD=38.1813;RBI=0.0193153;REFB=0;REVB=-0.0117491;RO=0;SAF=53;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.52018e-06;OID=.;OPOS=100846936;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:96:96:0:0:96:96:43:53:0:0:43:53:0:0 chr11 100847050 . A G 614.48 PASS AO=63;DP=63;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0452839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.258;QD=37.2413;RBI=0.0455553;REFB=0;REVB=0.00496535;RO=0;SAF=27;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.31521e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000127536;OID=.;OPOS=100847050;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:63:66:0:0:63:66:36:27:0:0:36:30:0:0 chr11 100847069 . G A 480.68 PASS AO=51;DP=53;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000723269;FXX=0.0377287;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.933;QD=37.7004;RBI=0.00810504;REFB=0;REVB=0.00807271;RO=0;SAF=16;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.5765e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0001857;OID=.;OPOS=100847069;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:53:51:0:0:51:51:35:16:0:0:35:16:0:0 chr11 100859439 . G A 198.08 PASS AO=41;DP=83;FAO=43;FDP=83;FR=.;FRO=40;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=-0.0231853;FXX=0.0235266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.6819;QD=9.54592;RBI=0.0562797;REFB=-0.0399013;REVB=0.051282;RO=35;SAF=24;SAR=17;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.08422;STB=0.552164;TYPE=snp;VARB=0.0454572;OID=.;OPOS=100859439;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:35:40:41:43:17:24:17:18:19:24:18:22 chr11 100863096 . A G 1573.75 PASS AO=172;DP=176;FAO=171;FDP=175;FR=.;FRO=4;FSAF=88;FSAR=83;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.00388164;FXX=0.0056815;HRUN=5;LEN=1;MLLD=154.285;QD=35.9715;RBI=0.0136629;REFB=-0.0153454;REVB=-0.0131;RO=4;SAF=89;SAR=83;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0115726;STB=0.506051;TYPE=snp;VARB=4.97427e-05;OID=.;OPOS=100863096;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:176:175:4:4:172:171:83:89:1:3:83:88:1:3 chr11 100863354 . C A 1749.61 PASS AO=184;DP=185;FAO=186;FDP=186;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0277091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.1677;QD=37.626;RBI=0.028327;REFB=-0.022087;REVB=-0.00588405;RO=1;SAF=80;SAR=104;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00591431;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00131685;OID=.;OPOS=100863354;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:185:186:1:0:184:186:104:80:1:0:105:81:0:0 chr11 100864367 . G A 2545.93 PASS AO=264;DP=269;FAO=270;FDP=270;FR=.;FRO=0;FSAF=107;FSAR=163;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010228;FXX=0.0109886;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.315;QD=37.7175;RBI=0.0133273;REFB=-0.0438065;REVB=0.00854441;RO=0;SAF=106;SAR=158;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.06857e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.49209e-05;OID=.;OPOS=100864367;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:269:270:0:0:264:270:158:106:0:0:163:107:0:0 chr11 100909991 . T C 190.84 PASS AO=56;DP=138;FAO=56;FDP=138;FR=.;FRO=82;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=29;FSRR=53;FWDB=0.00930406;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.336;QD=5.53146;RBI=0.00975747;REFB=-0.0112156;REVB=0.00293985;RO=80;SAF=23;SAR=33;SRF=29;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0527153;STB=0.53545;TYPE=snp;VARB=0.0172512;OID=.;OPOS=100909991;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:80:82:56:56:33:23:29:51:33:23:29:53 chr11 100921665 . C A 646.13 PASS AO=289;DP=669;FAO=177;FDP=394;FR=.;FRO=217;FSAF=97;FSAR=80;FSRF=99;FSRR=118;FWDB=0.00116768;FXX=0.0149996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.37;QD=6.55968;RBI=0.0284554;REFB=-0.0120315;REVB=0.0284314;RO=370;SAF=166;SAR=123;SRF=178;SRR=192;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0952791;STB=0.55053;TYPE=snp;VARB=0.0150895;OID=.;OPOS=100921665;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:669:394:370:217:289:177:123:166:178:192:80:97:99:118 chr11 100922202 . G A 407.87 PASS AO=104;DP=220;FAO=105;FDP=228;FR=.;FRO=123;FSAF=48;FSAR=57;FSRF=47;FSRR=76;FWDB=-0.0202154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.984;QD=7.1556;RBI=0.0310043;REFB=-0.00661889;REVB=-0.0235075;RO=116;SAF=47;SAR=57;SRF=41;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0960966;STB=0.541055;TYPE=snp;VARB=0.00658504;OID=.;OPOS=100922202;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:220:228:116:123:104:105:57:47:41:75:57:48:47:76 chr11 100933412 . C A 338.83 PASS AO=97;DP=209;FAO=92;FDP=204;FR=.;FRO=112;FSAF=36;FSAR=56;FSRF=55;FSRR=57;FWDB=0.00710446;FXX=0.0239223;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.437;QD=6.64368;RBI=0.00926114;REFB=-0.00696782;REVB=-0.00594099;RO=111;SAF=41;SAR=56;SRF=54;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0623781;STB=0.556077;TYPE=snp;VARB=0.00806921;OID=.;OPOS=100933412;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:204:111:112:97:92:56:41:54:57:56:36:55:57 chr11 100998771 . C G 69.48 PASS AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=13;FSRR=0;FWDB=-0.0265493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.838;QD=10.2935;RBI=0.0406543;REFB=-0.00099447;REVB=0.030788;RO=13;SAF=12;SAR=2;SRF=13;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.319355;STB=0.675498;TYPE=snp;VARB=0.00235872;OID=.;OPOS=100998771;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:27:27:13:13:14:14:2:12:13:0:2:12:13:0 chr11 101771248 . G A 1324.55 PASS AO=138;DP=138;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.03647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.846;QD=38.3927;RBI=0.0482229;REFB=0;REVB=-0.0315498;RO=0;SAF=47;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.92354e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000111322;OID=.;OPOS=101771248;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:138:138:0:0:138:138:91:47:0:0:91:47:0:0 chr11 101826949 . T C 88.31 PASS AO=24;DP=59;FAO=24;FDP=59;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=-0.00616025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.861;QD=5.9871;RBI=0.00896657;REFB=-0.0172074;REVB=-0.00651542;RO=35;SAF=13;SAR=11;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204313;STB=0.616364;TYPE=snp;VARB=0.0275475;OID=.;OPOS=101826949;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:59:59:35:35:24:24:11:13:12:23:11:13:12:23 chr11 101832478 . G T 374.34 PASS AO=38;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0116452;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9806;QD=38.3938;RBI=0.0859306;REFB=0;REVB=0.0851379;RO=1;SAF=20;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0228522;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000885492;OID=.;OPOS=101832478;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:39:39:1:0:38:39:18:20:1:0:18:21:0:0 chr11 101833644 . C T 865.21 PASS AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00698666;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=258.13;QD=38.0311;RBI=0.0163238;REFB=0;REVB=0.014753;RO=0;SAF=47;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.04952e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.90466e-06;OID=.;OPOS=101833644;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:91:91:0:0:91:91:44:47:0:0:44:47:0:0 chr11 101857758 . G A 910.31 PASS AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=101;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0117762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.817;QD=36.0518;RBI=0.0385032;REFB=-0.0297046;REVB=-0.0366582;RO=0;SAF=37;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507935;TYPE=snp;VARB=0.000927245;OID=.;OPOS=101857758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:99:101:0:2:99:99:62:37:0:0:62:37:0:2 chr11 102248377 . C T 172.19 PASS AO=46;DP=106;FAO=46;FDP=106;FR=.;FRO=60;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=36;FSRR=24;FWDB=-0.0252904;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.262;QD=6.49785;RBI=0.0257655;REFB=-0.0119327;REVB=-0.00492534;RO=59;SAF=21;SAR=25;SRF=35;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136351;STB=0.58065;TYPE=snp;VARB=0.0217541;OID=.;OPOS=102248377;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:59:60:46:46:25:21:35:24:25:21:36:24 chr11 102272884 . C T 459.08 PASS AO=141;DP=355;FAO=142;FDP=354;FR=.;FRO=212;FSAF=68;FSAR=74;FSRF=90;FSRR=122;FWDB=-0.0432927;FXX=0.00281682;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.003;QD=5.18731;RBI=0.0444973;REFB=-0.0312122;REVB=-0.0102836;RO=211;SAF=67;SAR=74;SRF=89;SRR=122;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0575394;STB=0.532689;TYPE=snp;VARB=0.0407015;OID=.;OPOS=102272884;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:355:354:211:212:141:142:74:67:89:122:74:68:90:122 chr11 102562700 . C T 527.09 PASS AO=147;DP=341;FAO=148;FDP=342;FR=.;FRO=194;FSAF=53;FSAR=95;FSRF=94;FSRR=100;FWDB=0.0465879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.711;QD=6.16482;RBI=0.0481009;REFB=-0.0131046;REVB=-0.0119694;RO=190;SAF=52;SAR=95;SRF=92;SRR=98;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138145;STB=0.574681;TYPE=snp;VARB=0.0135006;OID=.;OPOS=102562700;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:341:342:190:194:147:148:95:52:92:98:95:53:94:100 chr11 102563739 . C T 540.95 PASS AO=140;DP=265;FAO=140;FDP=303;FR=.;FRO=163;FSAF=68;FSAR=72;FSRF=89;FSRR=74;FWDB=-0.0390394;FXX=0.0319479;HRUN=3;LEN=1;MLLD=82.5538;QD=7.14122;RBI=0.0451739;REFB=-0.022042;REVB=-0.0227289;RO=125;SAF=68;SAR=72;SRF=52;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0604271;STB=0.532399;TYPE=snp;VARB=0.012697;OID=.;OPOS=102563739;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:265:303:125:163:140:140:72:68:52:73:72:68:89:74 chr11 102567207 . T A 270.7 PASS AO=68;DP=143;FAO=68;FDP=146;FR=.;FRO=78;FSAF=31;FSAR=37;FSRF=37;FSRR=41;FWDB=-0.00678321;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.812;QD=7.41632;RBI=0.0295752;REFB=-0.0124882;REVB=-0.0287868;RO=75;SAF=31;SAR=37;SRF=37;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0356154;STB=0.509928;TYPE=snp;VARB=0.0147836;OID=.;OPOS=102567207;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:146:75:78:68:68:37:31:37:38:37:31:37:41 chr11 102576358 . T C 371.61 PASS AO=103;DP=238;FAO=103;FDP=238;FR=.;FRO=135;FSAF=69;FSAR=34;FSRF=64;FSRR=71;FWDB=0.0126263;FXX=0.00418393;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.934;QD=6.2455;RBI=0.0394097;REFB=-0.0202192;REVB=-0.0373323;RO=134;SAF=69;SAR=34;SRF=63;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210636;STB=0.615682;TYPE=snp;VARB=0.0122094;OID=.;OPOS=102576358;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:238:238:134:135:103:103:34:69:63:71:34:69:64:71 chr11 102576375 . G A 385.51 PASS AO=105;DP=240;FAO=105;FDP=239;FR=.;FRO=134;FSAF=69;FSAR=36;FSRF=63;FSRR=71;FWDB=-0.0245982;FXX=0.00416649;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.7806;QD=6.45198;RBI=0.0394276;REFB=-0.00737276;REVB=-0.0308133;RO=134;SAF=69;SAR=36;SRF=63;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194659;STB=0.608384;TYPE=snp;VARB=0.0131882;OID=.;OPOS=102576375;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:240:239:134:134:105:105:36:69:63:71:36:69:63:71 chr11 102593248 . T C 612.01 PASS AO=145;DP=275;FAO=142;FDP=273;FR=.;FRO=131;FSAF=70;FSAR=72;FSRF=63;FSRR=68;FWDB=-0.0170198;FXX=0.0108692;HRUN=5;LEN=1;MLLD=46.4512;QD=8.96723;RBI=0.0378073;REFB=0.0378187;REVB=-0.0337597;RO=126;SAF=73;SAR=72;SRF=61;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0164729;STB=0.50578;TYPE=snp;VARB=-0.0258983;OID=.;OPOS=102593248;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:275:273:126:131:145:142:72:73:61:65:72:70:63:68 chr11 102595492 . G A 220.53 PASS AO=44;DP=101;FAO=51;FDP=103;FR=.;FRO=52;FSAF=32;FSAR=19;FSRF=28;FSRR=24;FWDB=-0.0167119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.493;QD=8.56431;RBI=0.0182761;REFB=-0.0115153;REVB=0.007398;RO=49;SAF=27;SAR=17;SRF=27;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0613869;STB=0.546881;TYPE=snp;VARB=0.00809871;OID=.;OPOS=102595492;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:103:49:52:44:51:17:27:27:22:19:32:28:24 chr11 102650246 . G A 403.14 PASS AO=112;DP=258;FAO=112;FDP=258;FR=.;FRO=146;FSAF=54;FSAR=58;FSRF=84;FSRR=62;FWDB=0.0108889;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=277.085;QD=6.25026;RBI=0.0177086;REFB=0.00273449;REVB=0.0139652;RO=145;SAF=54;SAR=58;SRF=83;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.091479;STB=0.5526;TYPE=snp;VARB=-0.00372029;OID=.;OPOS=102650246;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:258:258:145:146:112:112:58:54:83:62:58:54:84:62 chr11 102666316 . T C 1000.75 PASS AO=102;DP=103;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.05;QD=38.1236;RBI=0.0581701;REFB=0;REVB=0.0526287;RO=0;SAF=23;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000242652;OID=.;OPOS=102666316;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:103:105:0:0:102:105:79:23:0:0:81:24:0:0 chr11 102667446 . CA C 564.19 PASS AO=148;DP=284;FAO=166;FDP=281;FR=.;FRO=115;FSAF=84;FSAR=82;FSRF=51;FSRR=64;FWDB=-0.027971;FXX=0.0310334;HRUN=2;LEN=1;MLLD=21.1139;QD=8.03122;RBI=0.0283238;REFB=-0.0088599;REVB=-0.00445649;RO=114;SAF=69;SAR=79;SRF=50;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0222736;STB=0.525582;TYPE=del;VARB=0.00728581;OID=.;OPOS=102667447;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:148:282:166:281:115:84:82:51:64:99:114:69:79:50:64 chr11 102738795 . G T 990.08 PASS AO=100;DP=103;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170873;FXX=0.0095229;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.2971;QD=38.0801;RBI=0.0170874;REFB=0;REVB=2.29422e-05;RO=3;SAF=41;SAR=59;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0334472;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.4541e-05;OID=.;OPOS=102738795;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:103:104:3:0:100:104:59:41:3:0:61:43:0:0 chr11 102988504 . A T 2364.61 PASS AO=245;DP=248;FAO=246;FDP=246;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=149;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00187577;FXX=0.0120477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.8518;QD=38.4489;RBI=0.0374626;REFB=0;REVB=0.0374156;RO=0;SAF=97;SAR=148;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000354624;OID=.;OPOS=102988504;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:248:246:0:0:245:246:148:97:0:0:149:97:0:0 chr11 103029516 . A G 373.26 PASS AO=90;DP=185;FAO=90;FDP=185;FR=.;FRO=95;FSAF=28;FSAR=62;FSRF=35;FSRR=60;FWDB=0.002372;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=180.753;QD=8.07053;RBI=0.00237812;REFB=-0.0218796;REVB=0.000170466;RO=95;SAF=28;SAR=62;SRF=35;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0605782;STB=0.533453;TYPE=snp;VARB=0.0220381;OID=.;OPOS=103029516;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:185:95:95:90:90:62:28:35:60:62:28:35:60 chr11 103047007 . C A 2812.91 PASS AO=295;DP=296;FAO=295;FDP=295;FR=.;FRO=0;FSAF=150;FSAR=145;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0296615;FXX=0.00337826;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.7764;QD=38.1411;RBI=0.120253;REFB=-0.000118011;REVB=-0.116538;RO=1;SAF=149;SAR=146;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00319013;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000336473;OID=.;OPOS=103047007;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:296:295:1:0:295:295:146:149:1:0:145:150:0:0 chr11 103057048 . A G 509 PASS AO=114;DP=223;FAO=116;FDP=226;FR=.;FRO=110;FSAF=60;FSAR=56;FSRF=56;FSRR=54;FWDB=0.00621857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.305;QD=9.00879;RBI=0.00644616;REFB=-0.0105828;REVB=-0.00169776;RO=107;SAF=59;SAR=55;SRF=54;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0113875;STB=0.50397;TYPE=snp;VARB=0.00899895;OID=.;OPOS=103057048;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:226:107:110:114:116:55:59:54:53:56:60:56:54 chr11 103058126 . C T 404.07 PASS AO=105;DP=232;FAO=106;FDP=233;FR=.;FRO=127;FSAF=50;FSAR=56;FSRF=82;FSRR=45;FWDB=-0.00573455;FXX=0.00427332;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.023;QD=6.93684;RBI=0.0101906;REFB=-0.00939089;REVB=0.00842391;RO=126;SAF=50;SAR=55;SRF=81;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163468;STB=0.594099;TYPE=snp;VARB=0.00890597;OID=.;OPOS=103058126;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:233:126:127:105:106:55:50:81:45:56:50:82:45 chr11 103082590 . G A 3632.42 PASS AO=375;DP=376;FAO=383;FDP=383;FR=.;FRO=0;FSAF=206;FSAR=177;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112287;FXX=0.00519467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.033;QD=37.9365;RBI=0.021175;REFB=0;REVB=0.0179526;RO=0;SAF=205;SAR=170;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000244623;OID=.;OPOS=103082590;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:376:383:0:0:375:383:170:205:0:0:177:206:0:0 chr11 103229027 . T C 1108.8 PASS AO=113;DP=113;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0309018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.896;QD=38.2346;RBI=0.0357381;REFB=0;REVB=0.0179525;RO=0;SAF=61;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.30758e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.71979e-05;OID=.;OPOS=103229027;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:113:116:0:0:113:116:52:61:0:0:55:61:0:0 chr11 103275034 . G T 272.14 PASS AO=75;DP=192;FAO=82;FDP=200;FR=.;FRO=118;FSAF=41;FSAR=41;FSRF=46;FSRR=72;FWDB=0.0322303;FXX=0.0196069;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.1658;QD=5.44286;RBI=0.0398521;REFB=-0.0252426;REVB=0.0234393;RO=115;SAF=37;SAR=38;SRF=44;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119529;STB=0.564984;TYPE=snp;VARB=0.0185984;OID=.;OPOS=103275034;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:200:115:118:75:82:38:37:44:71:41:41:46:72 chr11 103278054 . T C 374.66 PASS AO=86;DP=167;FAO=85;FDP=166;FR=.;FRO=81;FSAF=33;FSAR=52;FSRF=27;FSRR=54;FWDB=0.00484674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.461;QD=9.02788;RBI=0.00654893;REFB=0.0148546;REVB=-0.00440426;RO=81;SAF=33;SAR=53;SRF=27;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0477064;STB=0.528552;TYPE=snp;VARB=-0.0146237;OID=.;OPOS=103278054;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:166:81:81:86:85:53:33:27:54:52:33:27:54 chr11 103778154 . C T 552.94 PASS AO=159;DP=374;FAO=159;FDP=373;FR=.;FRO=214;FSAF=84;FSAR=75;FSRF=109;FSRR=105;FWDB=0.0115298;FXX=0.00267373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.234;QD=5.92964;RBI=0.0139914;REFB=-0.00474811;REVB=-0.00792604;RO=210;SAF=84;SAR=75;SRF=108;SRR=102;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.014396;STB=0.510896;TYPE=snp;VARB=0.00617195;OID=.;OPOS=103778154;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:374:373:210:214:159:159:75:84:108:102:75:84:109:105 chr11 103780455 . A G 2167.47 PASS AO=226;DP=226;FAO=226;FDP=226;FR=.;FRO=0;FSAF=102;FSAR=124;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0522517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.0684;QD=38.3623;RBI=0.0533565;REFB=0;REVB=-0.0108019;RO=0;SAF=102;SAR=124;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000149856;OID=.;OPOS=103780455;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:226:226:0:0:226:226:124:102:0:0:124:102:0:0 chr11 103818395 . T C 350.99 PASS AO=93;DP=207;FAO=93;FDP=207;FR=.;FRO=114;FSAF=53;FSAR=40;FSRF=60;FSRR=54;FWDB=-0.0228141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1478;QD=6.78232;RBI=0.0415844;REFB=-0.00622502;REVB=0.0347675;RO=114;SAF=53;SAR=40;SRF=60;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0437843;STB=0.524305;TYPE=snp;VARB=0.00614968;OID=.;OPOS=103818395;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:207:114:114:93:93:40:53:60:54:40:53:60:54 chr11 103908735 . G A 218.76 PASS AO=54;DP=114;FAO=54;FDP=115;FR=.;FRO=61;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=19;FSRR=42;FWDB=0.0329673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.714;QD=7.60907;RBI=0.0332536;REFB=-0.00391497;REVB=0.00435434;RO=58;SAF=26;SAR=28;SRF=18;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161667;STB=0.590877;TYPE=snp;VARB=0.00537483;OID=.;OPOS=103908735;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:115:58:61:54:54:28:26:18:40:28:26:19:42 chr11 103908968 . C T 170.12 PASS AO=34;DP=73;FAO=39;FDP=80;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=29;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=0.0040436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.602;QD=8.50612;RBI=0.0131224;REFB=-0.000516478;REVB=0.0124839;RO=38;SAF=10;SAR=24;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160238;STB=0.596292;TYPE=snp;VARB=0.000391808;OID=.;OPOS=103908968;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:80:38:41:34:39:24:10:17:21:29:10:17:24 chr11 103909897 . A G 130.99 PASS AO=30;DP=68;FAO=31;FDP=66;FR=.;FRO=35;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=0.0276628;FXX=0.0294074;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.881;QD=7.93878;RBI=0.0277204;REFB=-0.0191725;REVB=-0.00178636;RO=36;SAF=21;SAR=9;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181305;STB=0.613657;TYPE=snp;VARB=0.0238425;OID=.;OPOS=103909897;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:66:36:35:30:31:9:21:19:17:9:22:18:17 chr11 104758035 . G A 584.12 PASS AO=61;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.6956;QD=37.6853;RBI=0.0279794;REFB=0;REVB=0.0237951;RO=0;SAF=28;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000361611;OID=.;OPOS=104758035;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:61:62:0:0:61:62:33:28:0:0:33:29:0:0 chr11 104761100 . T C 735.82 PASS AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00192218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.924;QD=38.2243;RBI=0.00630959;REFB=0;REVB=-0.00600968;RO=0;SAF=49;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.00876e-06;OID=.;OPOS=104761100;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:77:77:0:0:77:77:28:49:0:0:28:49:0:0 chr11 104761206 . C T 1069.66 PASS AO=113;DP=115;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0234374;FXX=0.0086949;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.3924;QD=37.5319;RBI=0.0309225;REFB=0;REVB=-0.0201715;RO=1;SAF=54;SAR=59;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00871196;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.43581e-05;OID=.;OPOS=104761206;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:115:114:1:0:113:114:59:54:1:0:59:55:0:0 chr11 104763117 . G A 1360.13 PASS AO=142;DP=145;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0090922;FXX=0.0206882;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.495;QD=38.3136;RBI=0.045113;REFB=0;REVB=0.0441872;RO=0;SAF=62;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.24749e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.86885e-05;OID=.;OPOS=104763117;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:145:142:0:0:142:142:80:62:0:0:80:62:0:0 chr11 104763716 . A G 1848 PASS AO=198;DP=201;FAO=197;FDP=197;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=108;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000298674;FXX=0.0149993;HRUN=4;LEN=1;MLLD=263.506;QD=37.5228;RBI=0.00240791;REFB=-0.0805466;REVB=-0.00238932;RO=2;SAF=89;SAR=109;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000971786;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.89204e-05;OID=.;OPOS=104763716;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:201:197:2:0:198:197:109:89:1:1:108:89:0:0 chr11 104768000 . G A 1098.44 PASS AO=110;DP=114;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0319997;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.6826;QD=38.2068;RBI=0.0320011;REFB=0;REVB=0.000295018;RO=0;SAF=7;SAR=103;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000482375;OID=.;OPOS=104768000;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:114:115:0:0:110:115:103:7:0:0:105:10:0:0 chr11 104768098 . T C 1374.86 PASS AO=151;DP=158;FAO=154;FDP=158;FR=.;FRO=4;FSAF=37;FSAR=117;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0179421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9569;QD=34.8067;RBI=0.0269849;REFB=-0.136094;REVB=0.0201561;RO=7;SAF=36;SAR=115;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111426;STB=0.508402;TYPE=snp;VARB=0.00187588;OID=.;OPOS=104768098;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:158:158:7:4:151:154:115:36:1:6:117:37:0:4 chr11 104819327 . T C 1461.07 PASS AO=152;DP=153;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016366;FXX=0.00649309;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.281;QD=38.198;RBI=0.0252505;REFB=0;REVB=-0.0192287;RO=0;SAF=50;SAR=102;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.13517e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.49262e-05;OID=.;OPOS=104819327;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:153:153:0:0:152:153:102:50:0:0:102:51:0:0 chr11 104839222 . A G 202.81 PASS AO=46;DP=92;FAO=46;FDP=92;FR=.;FRO=46;FSAF=13;FSAR=33;FSRF=13;FSRR=33;FWDB=0.015397;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=252.7;QD=8.81791;RBI=0.0155932;REFB=0.00797065;REVB=0.00246609;RO=45;SAF=13;SAR=33;SRF=13;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00689022;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00813875;OID=.;OPOS=104839222;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:45:46:46:46:33:13:13:32:33:13:13:33 chr11 104869708 . G C 329.53 PASS AO=88;DP=198;FAO=89;FDP=201;FR=.;FRO=112;FSAF=22;FSAR=67;FSRF=25;FSRR=87;FWDB=-0.0241044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.2313;QD=6.55782;RBI=0.0313684;REFB=-0.0325396;REVB=-0.0200737;RO=108;SAF=22;SAR=66;SRF=23;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0505275;STB=0.518277;TYPE=snp;VARB=0.0298958;OID=.;OPOS=104869708;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:201:108:112:88:89:66:22:23:85:67:22:25:87 chr11 104877927 . T C 2922.3 PASS AO=304;DP=307;FAO=307;FDP=307;FR=.;FRO=0;FSAF=137;FSAR=170;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0157414;FXX=0.00967711;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.7172;QD=38.0755;RBI=0.0190201;REFB=0.00241946;REVB=0.0106757;RO=2;SAF=134;SAR=170;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00706478;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.74266e-05;OID=.;OPOS=104877927;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:307:307:2:0:304:307:170:134:2:0:170:137:0:0 chr11 104900488 . G A 513.1 PASS AO=152;DP=356;FAO=152;FDP=361;FR=.;FRO=209;FSAF=85;FSAR=67;FSRF=135;FSRR=74;FWDB=-0.0358719;FXX=0.00550949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7735;QD=5.68528;RBI=0.0360287;REFB=-0.0155981;REVB=0.00335755;RO=202;SAF=89;SAR=63;SRF=131;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0676154;STB=0.551537;TYPE=snp;VARB=0.0196796;OID=.;OPOS=104900488;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:356:361:202:209:152:152:63:89:131:71:67:85:135:74 chr11 104905047 . G A 454.12 PASS AO=116;DP=250;FAO=116;FDP=250;FR=.;FRO=134;FSAF=45;FSAR=71;FSRF=32;FSRR=102;FWDB=0.0156366;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=231.507;QD=7.26598;RBI=0.015794;REFB=-0.00327176;REVB=0.00222383;RO=133;SAF=45;SAR=71;SRF=32;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156777;STB=0.587444;TYPE=snp;VARB=0.00348041;OID=.;OPOS=104905047;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:250:250:133:134:116:116:71:45:32:101:71:45:32:102 chr11 104912221 . T A 354.33 PASS AO=83;DP=167;FAO=83;FDP=167;FR=.;FRO=84;FSAF=30;FSAR=53;FSRF=33;FSRR=51;FWDB=0.00579882;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.692;QD=8.48699;RBI=0.00891943;REFB=-0.0108475;REVB=-0.00677716;RO=84;SAF=30;SAR=53;SRF=33;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0307637;STB=0.516949;TYPE=snp;VARB=0.00802727;OID=.;OPOS=104912221;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:167:84:84:83:83:53:30:33:51:53:30:33:51 chr11 104971257 . G A 394.88 PASS AO=82;DP=148;FAO=82;FDP=149;FR=.;FRO=67;FSAF=55;FSAR=27;FSRF=50;FSRR=17;FWDB=-0.0123073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.609;QD=10.6007;RBI=0.0293862;REFB=-0.0254478;REVB=-0.0266848;RO=65;SAF=55;SAR=27;SRF=49;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0786966;STB=0.539477;TYPE=snp;VARB=0.0267498;OID=.;OPOS=104971257;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:149:65:67:82:82:27:55:49:16:27:55:50:17 chr11 105223502 . T C 1275.27 PASS AO=139;DP=142;FAO=139;FDP=142;FR=.;FRO=3;FSAF=62;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0525284;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.6834;QD=35.9232;RBI=0.0527326;REFB=0.108886;REVB=0.00463517;RO=3;SAF=62;SAR=77;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0181606;STB=0.509553;TYPE=snp;VARB=-0.0106486;OID=.;OPOS=105223502;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:142:142:3:3:139:139:77:62:0:3:77:62:0:3 chr11 107197640 . T C 1538.34 PASS AO=161;DP=161;FAO=161;FDP=161;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00765558;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.776;QD=38.2195;RBI=0.03311;REFB=0;REVB=0.0322128;RO=0;SAF=94;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.07808e-05;OID=.;OPOS=107197640;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:161:161:0:0:161:161:67:94:0:0:67:94:0:0 chr11 107381765 . G A 283.03 PASS AO=59;DP=103;FAO=58;FDP=105;FR=.;FRO=47;FSAF=8;FSAR=50;FSRF=13;FSRR=34;FWDB=-0.0319939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.207;QD=10.7822;RBI=0.0323031;REFB=-0.0239677;REVB=-0.00445837;RO=44;SAF=9;SAR=50;SRF=12;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158239;STB=0.609713;TYPE=snp;VARB=0.0118374;OID=.;OPOS=107381765;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:105:44:47:59:58:50:9:12:32:50:8:13:34 chr11 107420530 . A G 1680.74 PASS AO=175;DP=176;FAO=175;FDP=175;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0262316;FXX=0.0112988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.429;QD=38.4168;RBI=0.0406847;REFB=0;REVB=0.031099;RO=0;SAF=92;SAR=83;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.24029e-05;OID=.;OPOS=107420530;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:176:175:0:0:175:175:83:92:0:0:83:92:0:0 chr11 107578721 . C G 199 PASS AO=46;DP=96;FAO=47;FDP=96;FR=.;FRO=49;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=0.0304209;FXX=0.0204061;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.515;QD=8.29151;RBI=0.0309025;REFB=-0.00114762;REVB=-0.00543437;RO=48;SAF=25;SAR=21;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0783032;STB=0.542257;TYPE=snp;VARB=0.00138888;OID=.;OPOS=107578721;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:48:49:46:47:21:25:22:26:22:25:22:27 chr11 107650473 . G A 66.13 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0893374;FXX=0.124844;HRUN=3;LEN=1;MLLD=126.892;QD=37.7911;RBI=0.0896431;REFB=0;REVB=0.00739775;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00359181;OID=.;OPOS=107650473;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:4:3:0:0:4:3:0:0 chr11 107677399 . C CA 38.03 PASS AO=25;DP=67;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.0541777;FXX=0.0298463;HRUN=3;LEN=1;MLLD=8.65928;QD=2.34037;RBI=0.0545204;REFB=-0.138746;REVB=-0.00610379;RO=33;SAF=12;SAR=13;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0351646;STB=0.547138;TYPE=ins;VARB=0.117096;OID=.;OPOS=107677400;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:25:67:30:65:35:18:12:18:17:38:33:12:13:17:16 chr11 107917087 . A G 280.51 PASS AO=73;DP=163;FAO=74;FDP=165;FR=.;FRO=91;FSAF=19;FSAR=55;FSRF=39;FSRR=52;FWDB=0.0672451;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1447;QD=6.80022;RBI=0.0673335;REFB=-0.00472683;REVB=-0.00344908;RO=89;SAF=19;SAR=54;SRF=39;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202196;STB=0.610728;TYPE=snp;VARB=0.00731268;OID=.;OPOS=107917087;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:165:89:91:73:74:54:19:39:50:55:19:39:52 chr11 108009660 . C A 319.37 PASS AO=98;DP=240;FAO=97;FDP=241;FR=.;FRO=144;FSAF=62;FSAR=35;FSRF=68;FSRR=76;FWDB=0.0090379;FXX=0.00413206;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.6762;QD=5.30082;RBI=0.077762;REFB=-0.00983296;REVB=-0.077235;RO=138;SAF=62;SAR=36;SRF=66;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16497;STB=0.601973;TYPE=snp;VARB=0.0155744;OID=.;OPOS=108009660;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:240:241:138:144:98:97:36:62:66:72:35:62:68:76 chr11 108040484 . G T 341.91 PASS AO=65;DP=114;FAO=68;FDP=117;FR=.;FRO=49;FSAF=61;FSAR=7;FSRF=40;FSRR=9;FWDB=0.0114854;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.881;QD=11.6893;RBI=0.0117302;REFB=-0.0144285;REVB=0.00238391;RO=49;SAF=59;SAR=6;SRF=40;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177961;STB=0.579891;TYPE=snp;VARB=0.0129036;OID=.;OPOS=108040484;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:117:49:49:65:68:6:59:40:9:7:61:40:9 chr11 108043988 . C T 221.56 PASS AO=63;DP=154;FAO=64;FDP=154;FR=.;FRO=90;FSAF=41;FSAR=23;FSRF=58;FSRR=32;FWDB=0.00107299;FXX=0.0064512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.029;QD=5.75469;RBI=0.0187022;REFB=-0.00476623;REVB=-0.0186714;RO=90;SAF=40;SAR=23;SRF=58;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0107967;STB=0.502426;TYPE=snp;VARB=0.00676956;OID=.;OPOS=108043988;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:154:90:90:63:64:23:40:58:32:23:41:58:32 chr11 108093208 . A T 279.47 PASS AO=70;DP=162;FAO=74;FDP=166;FR=.;FRO=92;FSAF=20;FSAR=54;FSRF=38;FSRR=54;FWDB=0.0227551;FXX=0.00598767;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.433;QD=6.73413;RBI=0.0229547;REFB=0.0130475;REVB=-0.00302081;RO=89;SAF=16;SAR=54;SRF=37;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227447;STB=0.591811;TYPE=snp;VARB=-0.010954;OID=.;OPOS=108093208;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:166:89:92:70:74:54:16:37:52:54:20:38:54 chr11 108183167 . A G 1178.3 PASS AO=125;DP=126;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0331697;FXX=0.00793588;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.651;QD=37.7056;RBI=0.0469721;REFB=-0.0345904;REVB=0.0332588;RO=1;SAF=58;SAR=67;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00703919;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00017232;OID=.;OPOS=108183167;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:126:125:1:0:125:125:67:58:0:1:67:58:0:0 chr11 108345515 . G GA 264.02 PASS AO=98;DP=231;FAO=100;FDP=213;FR=.;FRO=113;FSAF=58;FSAR=42;FSRF=65;FSRR=48;FWDB=0.0027904;FXX=0.044841;HRUN=0;LEN=1;MLLD=190.695;QD=4.95813;RBI=0.0105708;REFB=-0.00206837;REVB=0.0101958;RO=121;SAF=58;SAR=40;SRF=72;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00330425;STB=0.502599;TYPE=ins;VARB=0.00195057;OID=.;OPOS=108345516;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:98:231:100:213:113:58:42:65:48:99:121:58:40:72:49 chr11 108380335 . T C 1228.08 PASS AO=137;DP=142;FAO=137;FDP=142;FR=.;FRO=5;FSAF=56;FSAR=81;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0324804;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=176.873;QD=34.5938;RBI=0.0324975;REFB=-0.114687;REVB=0.00105388;RO=4;SAF=56;SAR=81;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0327469;STB=0.514175;TYPE=snp;VARB=0.00256227;OID=.;OPOS=108380335;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:142:142:4:5:137:137:81:56:4:0:81:56:4:1 chr11 108381247 . C T 476.34 PASS AO=121;DP=259;FAO=121;FDP=259;FR=.;FRO=138;FSAF=55;FSAR=66;FSRF=83;FSRR=55;FWDB=0.0103249;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.536;QD=7.3566;RBI=0.013851;REFB=-0.0100599;REVB=-0.00923288;RO=136;SAF=55;SAR=66;SRF=82;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141635;STB=0.577796;TYPE=snp;VARB=0.0103132;OID=.;OPOS=108381247;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:259:259:136:138:121:121:66:55:82:54:66:55:83:55 chr11 108384207 . C T 339.29 PASS AO=71;DP=136;FAO=73;FDP=137;FR=.;FRO=64;FSAF=25;FSAR=48;FSRF=27;FSRR=37;FWDB=-0.0146703;FXX=0.00724585;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.932;QD=9.90632;RBI=0.0168988;REFB=-0.0402632;REVB=-0.00838757;RO=65;SAF=23;SAR=48;SRF=27;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0875431;STB=0.540132;TYPE=snp;VARB=0.0407374;OID=.;OPOS=108384207;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:137:65:64:71:73:48:23:27:38:48:25:27:37 chr11 108464209 . T C 1248.8 PASS AO=123;DP=124;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0627416;FXX=0.00746213;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.386;QD=37.5578;RBI=0.124182;REFB=0;REVB=-0.107167;RO=0;SAF=54;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00017526;OID=.;OPOS=108464209;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:124:133:0:0:123:133:69:54:0:0:70:63:0:0 chr11 109296550 . A G 1051.99 PASS AO=119;DP=123;FAO=117;FDP=121;FR=.;FRO=4;FSAF=66;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.0461866;FXX=0.0162588;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.7742;QD=34.7766;RBI=0.0757805;REFB=0.0398923;REVB=-0.060079;RO=4;SAF=67;SAR=52;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0351394;STB=0.518865;TYPE=snp;VARB=-0.00326782;OID=.;OPOS=109296550;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:123:121:4:4:119:117:52:67:0:4:51:66:0:4 chr11 109298127 . T G 531.51 PASS AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00740452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.137;QD=37.9647;RBI=0.00744933;REFB=0;REVB=-0.000815871;RO=0;SAF=30;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.29784e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.16831e-05;OID=.;OPOS=109298127;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:56:56:0:0:56:56:26:30:0:0:26:30:0:0 chr11 110035262 . A G 297.59 PASS AO=69;DP=148;FAO=72;FDP=151;FR=.;FRO=79;FSAF=37;FSAR=35;FSRF=39;FSRR=40;FWDB=0.0027012;FXX=0.00657851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.854;QD=7.88316;RBI=0.0295001;REFB=-0.000722644;REVB=0.0293762;RO=78;SAF=36;SAR=33;SRF=39;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0208263;STB=0.510577;TYPE=snp;VARB=0.00109375;OID=.;OPOS=110035262;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:151:78:79:69:72:33:36:39:39:35:37:39:40 chr11 110035301 . A G 212.8 PASS AO=58;DP=134;FAO=58;FDP=134;FR=.;FRO=76;FSAF=20;FSAR=38;FSRF=36;FSRR=40;FWDB=-0.00265042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.774;QD=6.35231;RBI=0.00408933;REFB=-0.00592904;REVB=0.00311414;RO=76;SAF=20;SAR=38;SRF=36;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137256;STB=0.576979;TYPE=snp;VARB=0.00855204;OID=.;OPOS=110035301;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:76:76:58:58:38:20:36:40:38:20:36:40 chr11 111164651 . T C 303.35 PASS AO=89;DP=232;FAO=91;FDP=225;FR=.;FRO=134;FSAF=29;FSAR=62;FSRF=49;FSRR=85;FWDB=-0.00801144;FXX=0.0384599;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.119;QD=5.39293;RBI=0.01266;REFB=-0.0111454;REVB=0.00980268;RO=126;SAF=27;SAR=62;SRF=47;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0828815;STB=0.53148;TYPE=snp;VARB=0.0187849;OID=.;OPOS=111164651;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:225:126:134:89:91:62:27:47:79:62:29:49:85 chr11 111167557 . A C 441.74 PASS AO=54;DP=61;FAO=54;FDP=60;FR=.;FRO=6;FSAF=38;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.0184024;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.403;QD=29.4494;RBI=0.0386751;REFB=-0.0371097;REVB=0.0340163;RO=6;SAF=38;SAR=16;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147826;STB=0.578917;TYPE=snp;VARB=0.000581467;OID=.;OPOS=111167557;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:61:60:6:6:54:54:16:38:0:6:16:38:0:6 chr11 111167776 . C G 361.71 PASS AO=37;DP=37;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0717059;FXX=0.0714116;HRUN=5;LEN=1;MLLD=138.419;QD=37.0982;RBI=0.0725315;REFB=0;REVB=-0.0109125;RO=0;SAF=2;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.50694e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000520579;OID=.;OPOS=111167776;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:37:39:0:0:37:39:35:2:0:0:35:4:0:0 chr11 111167792 . T G 71.07 PASS AO=18;DP=46;FAO=19;FDP=47;FR=.;FRO=28;FSAF=1;FSAR=18;FSRF=2;FSRR=26;FWDB=0.0405678;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.9835;QD=6.0485;RBI=0.0408415;REFB=-0.000534519;REVB=-0.00472081;RO=28;SAF=1;SAR=17;SRF=2;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0726037;STB=0.550961;TYPE=snp;VARB=0.00201794;OID=.;OPOS=111167792;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:46:47:28:28:18:19:17:1:2:26:18:1:2:26 chr11 111168767 . C T 160.99 PASS AO=43;DP=100;FAO=43;FDP=100;FR=.;FRO=57;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=28;FSRR=29;FWDB=-0.0021039;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.7497;QD=6.43965;RBI=0.00244959;REFB=-0.0154516;REVB=-0.00125463;RO=57;SAF=18;SAR=25;SRF=28;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0745349;STB=0.541922;TYPE=snp;VARB=0.0301089;OID=.;OPOS=111168767;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:57:57:43:43:25:18:28:29:25:18:28:29 chr11 111169110 . A T 76.53 PASS AO=26;DP=76;FAO=26;FDP=76;FR=.;FRO=50;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=-0.0152623;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=191.838;QD=4.02775;RBI=0.0154945;REFB=0.000363782;REVB=0.00267233;RO=46;SAF=14;SAR=12;SRF=20;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11414;STB=0.564467;TYPE=snp;VARB=-0.000821209;OID=.;OPOS=111169110;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:76:76:46:50:26:26:12:14:20:26:12:14:22:28 chr11 111179054 . A G 206.75 PASS AO=31;DP=54;FAO=39;FDP=63;FR=.;FRO=24;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=0.0615264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.652;QD=13.127;RBI=0.0655614;REFB=-0.052208;REVB=0.0226452;RO=23;SAF=15;SAR=16;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173861;STB=0.556647;TYPE=snp;VARB=0.0507037;OID=.;OPOS=111179054;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:54:63:23:24:31:39:16:15:6:17:22:17:7:17 chr11 111324146 . A C 98.3 PASS AO=23;DP=50;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=19;FWDB=-0.00890583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.17;QD=7.86388;RBI=0.00892834;REFB=-0.0191849;REVB=0.000633704;RO=27;SAF=13;SAR=10;SRF=8;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252346;STB=0.642131;TYPE=snp;VARB=0.0275276;OID=.;OPOS=111324146;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:50:50:27:27:23:23:10:13:8:19:10:13:8:19 chr11 111327213 . G A 147.38 PASS AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0884345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.671;QD=36.8437;RBI=0.0952573;REFB=0;REVB=0.0354019;RO=0;SAF=6;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00153887;OID=.;OPOS=111327213;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:16:0:0:16:16:10:6:0:0:10:6:0:0 chr11 111368047 . G T 1497.7 PASS AO=163;DP=167;FAO=163;FDP=167;FR=.;FRO=4;FSAF=72;FSAR=91;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.00384817;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.947;QD=35.873;RBI=0.00855784;REFB=0.0158208;REVB=0.00764383;RO=4;SAF=72;SAR=91;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00269062;STB=0.501415;TYPE=snp;VARB=-0.000224739;OID=.;OPOS=111368047;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:167:167:4:4:163:163:91:72:2:2:91:72:2:2 chr11 111420364 . A G 1065.29 PASS AO=111;DP=112;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0125867;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.356;QD=38.0462;RBI=0.0411561;REFB=0;REVB=0.0391841;RO=0;SAF=45;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.53129e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.22963e-05;OID=.;OPOS=111420364;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:112:112:0:0:111:112:66:45:0:0:67:45:0:0 chr11 111431656 . GAAT G 737.38 PASS AO=120;DP=157;FAO=124;FDP=145;FR=.;FRO=21;FSAF=66;FSAR=58;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0169081;FXX=0.0822733;HRUN=2;LEN=3;MLLD=242.276;QD=20.3416;RBI=0.0195632;REFB=-0.0186279;REVB=0.00984045;RO=0;SAF=64;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.501228;TYPE=del;VARB=0.00373272;OID=.;OPOS=111431657;OREF=AAT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:120:143:124:145:21:66:58:11:10:3:0:64:56:0:0 chr11 111553893 . T C 603.33 PASS AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0210311;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=119.812;QD=36.5654;RBI=0.0381728;REFB=0.05872;REVB=0.0318568;RO=1;SAF=46;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0242098;STB=0.512817;TYPE=snp;VARB=-4.39268e-05;OID=.;OPOS=111553893;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:66:66:1:1:65:65:19:46:0:1:19:46:0:1 chr11 111594767 . GC G 31.39 PASS AO=7;DP=29;FAO=14;FDP=25;FR=.;FRO=11;FSAF=13;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.246495;FXX=0.0740466;HRUN=3;LEN=1;MLLD=10.6606;QD=5.02176;RBI=0.247909;REFB=-0.0236098;REVB=-0.0264351;RO=9;SAF=6;SAR=1;SRF=6;SRR=3;SSEN=0.356912;SSEP=0;SSSB=0.267754;STB=0.764206;TYPE=del;VARB=-0.0377354;OID=.;OPOS=111594768;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:7:26:14:25:11:13:1:7:4:26:9:6:1:6:3 chr11 111596025 . G C 232.13 PASS AO=77;DP=210;FAO=78;FDP=211;FR=.;FRO=133;FSAF=31;FSAR=47;FSRF=41;FSRR=92;FWDB=-0.0208199;FXX=0.00471676;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.235;QD=4.40049;RBI=0.0209175;REFB=-0.006062;REVB=-0.00201859;RO=130;SAF=31;SAR=46;SRF=38;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131538;STB=0.560105;TYPE=snp;VARB=0.0107022;OID=.;OPOS=111596025;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:210:211:130:133:77:78:46:31:38:92:47:31:41:92 chr11 111596073 . CAAAG C 74.22 PASS AO=43;DP=138;FAO=44;FDP=125;FR=.;FRO=81;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=30;FSRR=51;FWDB=-0.0117732;FXX=0.0157468;HRUN=3;LEN=4;MLLD=227.243;QD=2.37511;RBI=0.0151888;REFB=-0.0023197;REVB=-0.0095964;RO=72;SAF=18;SAR=25;SRF=27;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0497066;STB=0.526184;TYPE=del;VARB=0.00467211;OID=.;OPOS=111596074;OREF=AAAG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:43:118:44:125:81:18:26:30:51:74:72:18:25:27:45 chr11 111611712 . G C 84.2 PASS AO=19;DP=44;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.00872843;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.3219;QD=7.65453;RBI=0.0660288;REFB=-0.0403272;REVB=0.0654493;RO=23;SAF=8;SAR=11;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0972164;STB=0.577903;TYPE=snp;VARB=0.0515722;OID=.;OPOS=111611712;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:44:44:23:24:19:20:11:8:12:11:12:8:13:11 chr11 111635619 . A G 410.82 PASS AO=77;DP=131;FAO=79;FDP=133;FR=.;FRO=54;FSAF=28;FSAR=51;FSRF=22;FSRR=32;FWDB=0.026351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.136;QD=12.3554;RBI=0.0263687;REFB=-0.00189763;REVB=0.000965587;RO=54;SAF=26;SAR=51;SRF=22;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0577947;STB=0.523178;TYPE=snp;VARB=0.00153732;OID=.;OPOS=111635619;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:133:54:54:77:79:51:26:22:32:51:28:22:32 chr11 111655497 . T G 127.84 PASS AO=37;DP=88;FAO=36;FDP=88;FR=.;FRO=52;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=28;FSRR=24;FWDB=-0.000856613;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.797;QD=5.81098;RBI=0.0540722;REFB=-0.0160748;REVB=-0.0540654;RO=51;SAF=17;SAR=20;SRF=28;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0917222;STB=0.53907;TYPE=snp;VARB=0.0203109;OID=.;OPOS=111655497;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:51:52:37:36:20:17:28:23:19:17:28:24 chr11 111655514 . G A 153.04 PASS AO=41;DP=95;FAO=41;FDP=95;FR=.;FRO=54;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=31;FSRR=23;FWDB=-0.000494685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.149;QD=6.4438;RBI=0.00558554;REFB=0.0137547;REVB=-0.00556359;RO=51;SAF=17;SAR=24;SRF=28;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133268;STB=0.590422;TYPE=snp;VARB=-0.0128056;OID=.;OPOS=111655514;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:51:54:41:41:24:17:28:23:24:17:31:23 chr11 111692182 . G A 69.14 PASS AO=23;DP=69;FAO=23;FDP=68;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=28;FWDB=-0.00611762;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.5167;QD=4.0669;RBI=0.0347095;REFB=-0.00745097;REVB=0.0341662;RO=45;SAF=18;SAR=5;SRF=17;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.464861;STB=0.772191;TYPE=snp;VARB=0.0250679;OID=.;OPOS=111692182;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:69:68:45:45:23:23:5:18:17:28:5:18:17:28 chr11 111746041 . A G 249.98 PASS AO=49;DP=91;FAO=52;FDP=95;FR=.;FRO=43;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=13;FSRR=30;FWDB=0.00110833;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.1878;QD=10.5253;RBI=0.0440253;REFB=0.00347528;REVB=0.0440114;RO=41;SAF=29;SAR=20;SRF=13;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225162;STB=0.61402;TYPE=snp;VARB=-0.00310773;OID=.;OPOS=111746041;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:95:41:43:49:52:20:29:13:28:23:29:13:30 chr11 111746231 . G A 220.49 PASS AO=49;DP=101;FAO=51;FDP=103;FR=.;FRO=52;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=28;FSRR=24;FWDB=-0.00143023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.497;QD=8.56271;RBI=0.0159727;REFB=-0.0284771;REVB=-0.0159085;RO=52;SAF=24;SAR=25;SRF=28;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0451139;STB=0.534233;TYPE=snp;VARB=0.0254504;OID=.;OPOS=111746231;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:103:52:52:49:51:25:24:28:24:27:24:28:24 chr11 111747297 . A G 2513.53 PASS AO=272;DP=279;FAO=274;FDP=274;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=192;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00735939;FXX=0.0283678;HRUN=4;LEN=1;MLLD=64.5578;QD=36.6938;RBI=0.0312306;REFB=-0.0184338;REVB=-0.0303511;RO=6;SAF=81;SAR=191;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.02603;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000816233;OID=.;OPOS=111747297;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:279:274:6:0:272:274:191:81:5:1:192:82:0:0 chr11 111747587 . C T 257.08 PASS AO=61;DP=125;FAO=61;FDP=125;FR=.;FRO=64;FSAF=43;FSAR=18;FSRF=30;FSRR=34;FWDB=0.0336275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.702;QD=8.22669;RBI=0.0345851;REFB=0.00607113;REVB=-0.00808189;RO=64;SAF=43;SAR=18;SRF=30;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233739;STB=0.629815;TYPE=snp;VARB=-0.00590245;OID=.;OPOS=111747587;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:64:64:61:61:18:43:30:34:18:43:30:34 chr11 111749349 . A T 1902.93 PASS AO=198;DP=198;FAO=198;FDP=198;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00591236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.982;QD=38.4431;RBI=0.0185871;REFB=0;REVB=-0.0176217;RO=0;SAF=103;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.32534e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.44852e-06;OID=.;OPOS=111749349;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:198:198:0:0:198:198:95:103:0:0:95:103:0:0 chr11 111753246 . G A 360.27 PASS AO=86;DP=187;FAO=94;FDP=207;FR=.;FRO=113;FSAF=39;FSAR=55;FSRF=42;FSRR=71;FWDB=-0.0238283;FXX=0.00480746;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.099;QD=6.96176;RBI=0.0240066;REFB=-0.00398961;REVB=-0.00292064;RO=100;SAF=39;SAR=47;SRF=41;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.042794;STB=0.524491;TYPE=snp;VARB=0.00465291;OID=.;OPOS=111753246;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:207:100:113:86:94:47:39:41:59:55:39:42:71 chr11 111754574 . A C 133.43 PASS AO=25;DP=43;FAO=26;FDP=44;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.00358236;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.4595;QD=12.1297;RBI=0.0980547;REFB=0.0268787;REVB=0.0979893;RO=18;SAF=13;SAR=12;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140404;STB=0.56813;TYPE=snp;VARB=-0.0176532;OID=.;OPOS=111754574;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:43:44:18:18:25:26:12:13:6:12:13:13:6:12 chr11 111781047 . A C 338.04 PASS AO=89;DP=196;FAO=89;FDP=197;FR=.;FRO=108;FSAF=46;FSAR=43;FSRF=50;FSRR=58;FWDB=0.0291639;FXX=0.00505025;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.819;QD=6.86369;RBI=0.0301729;REFB=0.0118405;REVB=-0.00773767;RO=106;SAF=46;SAR=43;SRF=50;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.044256;STB=0.529512;TYPE=snp;VARB=-0.00906658;OID=.;OPOS=111781047;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:197:106:108:89:89:43:46:50:56:43:46:50:58 chr11 111796689 . T C 397.35 PASS AO=76;DP=128;FAO=76;FDP=128;FR=.;FRO=52;FSAF=28;FSAR=48;FSRF=20;FSRR=32;FWDB=-0.0248719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.7088;QD=12.4172;RBI=0.0261622;REFB=-0.0226765;REVB=-0.00811469;RO=51;SAF=28;SAR=48;SRF=19;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00327463;STB=0.50704;TYPE=snp;VARB=0.0160477;OID=.;OPOS=111796689;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:51:52:76:76:48:28:19:32:48:28:20:32 chr11 111853106 . G GC 290.26 PASS AO=43;DP=58;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.217534;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=11.11;QD=20.3688;RBI=0.221903;REFB=-0.0349714;REVB=0.0438173;RO=13;SAF=18;SAR=25;SRF=11;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183203;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.017477;OID=.;OPOS=111853107;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:43:58:57:57:0:29:28:0:0:21:13:18:25:11:2 chr11 111890045 . G A 234.39 PASS AO=63;DP=143;FAO=63;FDP=143;FR=.;FRO=80;FSAF=44;FSAR=19;FSRF=52;FSRR=28;FWDB=-0.00523682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.213;QD=6.55646;RBI=0.0113719;REFB=-0.003903;REVB=0.0100943;RO=79;SAF=44;SAR=19;SRF=52;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0465094;STB=0.531336;TYPE=snp;VARB=0.00632043;OID=.;OPOS=111890045;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:79:80:63:63:19:44:52:27:19:44:52:28 chr11 111896251 . G C 39.28 PASS AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.130028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2036;QD=7.14166;RBI=0.135057;REFB=0.0380111;REVB=0.036512;RO=12;SAF=4;SAR=5;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.289502;STB=0.643262;TYPE=snp;VARB=-0.014995;OID=.;OPOS=111896251;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:21:22:12:13:9:9:5:4:9:3:5:4:9:4 chr11 111899635 . A G 67.72 PASS AO=16;DP=49;FAO=20;FDP=52;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=31;FWDB=0.0259052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.4862;QD=5.2092;RBI=0.0568887;REFB=-0.0305229;REVB=0.0506483;RO=30;SAF=7;SAR=9;SRF=1;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.515758;STB=0.74741;TYPE=snp;VARB=0.0641267;OID=.;OPOS=111899635;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:49:52:30:32:16:20:9:7:1:29:13:7:1:31 chr11 111908162 . T C 373.52 PASS AO=111;DP=270;FAO=111;FDP=270;FR=.;FRO=159;FSAF=29;FSAR=82;FSRF=77;FSRR=82;FWDB=0.0003098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.5464;QD=5.53368;RBI=0.0197092;REFB=-0.0178168;REVB=0.0197068;RO=159;SAF=29;SAR=82;SRF=77;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260075;STB=0.646313;TYPE=snp;VARB=0.0203781;OID=.;OPOS=111908162;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:270:270:159:159:111:111:82:29:77:82:82:29:77:82 chr11 111942362 . A G 245.59 PASS AO=78;DP=200;FAO=77;FDP=197;FR=.;FRO=120;FSAF=28;FSAR=49;FSRF=65;FSRR=55;FWDB=0.0232598;FXX=0.0149993;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.908;QD=4.98649;RBI=0.0235756;REFB=-0.0431374;REVB=-0.00384615;RO=118;SAF=28;SAR=50;SRF=64;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199486;STB=0.610093;TYPE=snp;VARB=0.0607885;OID=.;OPOS=111942362;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:200:197:118:120:78:77:50:28:64:54:49:28:65:55 chr11 111953922 . TA T,TT 175.66 PASS AO=19,22;DP=125;FAO=54,0;FDP=133;FR=.;FRO=79;FSAF=10,0;FSAR=44,0;FSRF=31;FSRR=48;FWDB=-0.00467178,-0.00365345;FXX=0.0362293;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=167.085,169.187;QD=5.28315;RBI=0.0048439,0.00584057;REFB=0.00974395,0.0102081;REVB=-0.00127977,-0.00455682;RO=48;SAF=3,5;SAR=16,17;SRF=15;SRR=33;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.26288,-0.127855;STB=0.662194,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.0297345,0.00793526;OID=.,.;OPOS=111953923,111953923;OREF=A,A;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:19,22:121:54,0:133:79:10,0:44,0:31:48:99:48:3,5:16,17:15:33 chr11 111956989 . C A 1831.26 PASS AO=189;DP=190;FAO=193;FDP=193;FR=.;FRO=0;FSAF=130;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00875644;FXX=0.0102559;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.713;QD=37.9536;RBI=0.064199;REFB=-0.154516;REVB=0.063599;RO=1;SAF=130;SAR=59;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00800182;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000385414;OID=.;OPOS=111956989;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:190:193:1:0:189:193:59:130:0:1:63:130:0:0 chr11 111957665 . G A 176.47 PASS AO=36;DP=65;FAO=36;FDP=66;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=26;FSRF=9;FSRR=21;FWDB=-0.0414171;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.45;QD=10.6951;RBI=0.0483917;REFB=-0.00061267;REVB=-0.0250277;RO=29;SAF=10;SAR=26;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0322252;STB=0.512441;TYPE=snp;VARB=0.000344547;OID=.;OPOS=111957665;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:66:29:30:36:36:26:10:9:20:26:10:9:21 chr11 111959625 . C T 596.13 PASS AO=132;DP=251;FAO=132;FDP=251;FR=.;FRO=119;FSAF=52;FSAR=80;FSRF=66;FSRR=53;FWDB=-0.0849574;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.1098;QD=9.50009;RBI=0.0881264;REFB=-0.00183868;REVB=-0.0234201;RO=119;SAF=52;SAR=80;SRF=66;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141121;STB=0.577146;TYPE=snp;VARB=0.00117334;OID=.;OPOS=111959625;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:251:251:119:119:132:132:80:52:66:53:80:52:66:53 chr11 112020916 . T G 225.07 PASS AO=56;DP=124;FAO=57;FDP=124;FR=.;FRO=67;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=23;FSRR=44;FWDB=0.00342522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.856;QD=7.26031;RBI=0.00839988;REFB=-0.0105605;REVB=0.0076698;RO=67;SAF=29;SAR=27;SRF=23;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170239;STB=0.589134;TYPE=snp;VARB=0.00911621;OID=.;OPOS=112020916;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:67:67:56:57:27:29:23:44:28:29:23:44 chr11 112040027 . A G 317 PASS AO=89;DP=208;FAO=89;FDP=208;FR=.;FRO=119;FSAF=34;FSAR=55;FSRF=54;FSRR=65;FWDB=0.00260028;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.3778;QD=6.09622;RBI=0.0296729;REFB=-0.00480797;REVB=-0.0295588;RO=119;SAF=34;SAR=55;SRF=54;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0762808;STB=0.542591;TYPE=snp;VARB=0.00603676;OID=.;OPOS=112040027;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:208:119:119:89:89:55:34:54:65:55:34:54:65 chr11 112065434 . T C 1570.07 PASS AO=162;DP=162;FAO=164;FDP=164;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0192176;FXX=0.00606024;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.305;QD=38.2945;RBI=0.0198228;REFB=0;REVB=0.00486093;RO=0;SAF=83;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.21923e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.25161e-05;OID=.;OPOS=112065434;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:162:164:0:0:162:164:79:83:0:0:81:83:0:0 chr11 112088499 . A C 2376.87 PASS AO=255;DP=280;FAO=274;FDP=278;FR=.;FRO=4;FSAF=153;FSAR=121;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0112984;FXX=0.0071426;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5774;QD=34.1995;RBI=0.138872;REFB=-0.138402;REVB=0.138411;RO=22;SAF=153;SAR=102;SRF=1;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.085558;STB=0.504494;TYPE=snp;VARB=0.00961336;OID=.;OPOS=112088499;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:280:278:22:4:255:274:102:153:1:21:121:153:1:3 chr11 112123095 . A G 1456.31 PASS AO=152;DP=154;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103925;FXX=0.0128197;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.8136;QD=37.8262;RBI=0.122032;REFB=0.00776039;REVB=-0.121588;RO=1;SAF=86;SAR=66;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00715279;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000612278;OID=.;OPOS=112123095;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:154:154:1:0:152:154:66:86:0:1:68:86:0:0 chr11 112832325 . C A 55.64 PASS AO=17;DP=52;FAO=18;FDP=53;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=0.0422075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.425;QD=4.19945;RBI=0.062815;REFB=-0.017331;REVB=0.0465215;RO=34;SAF=10;SAR=7;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.47182e-08;STB=0.510626;TYPE=snp;VARB=0.0267016;OID=.;OPOS=112832325;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:52:53:34:35:17:18:7:10:20:14:8:10:20:15 chr11 112832339 . GC G 377.31 PASS AO=47;DP=53;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0362139;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=23.1715;QD=30.1848;RBI=0.0505193;REFB=0;REVB=0.0352244;RO=4;SAF=24;SAR=23;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0721739;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00205762;OID=.;OPOS=112832340;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:47:52:50:50:0:26:24:0:0:34:4:24:23:4:0 chr11 112832353 . T C 403.9 PASS AO=45;DP=48;FAO=46;FDP=49;FR=.;FRO=3;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0206666;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=223.364;QD=32.9717;RBI=0.0272952;REFB=-0.105689;REVB=-0.0178303;RO=2;SAF=22;SAR=23;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0408209;STB=0.531901;TYPE=snp;VARB=0.00083684;OID=.;OPOS=112832353;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:48:49:2:3:45:46:23:22:2:0:24:22:3:0 chr11 112832358 . T C 435 PASS AO=46;DP=47;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00979769;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=240.625;QD=36.25;RBI=0.0138298;REFB=0.0191424;REVB=-0.00976058;RO=1;SAF=22;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.02089;STB=0.511106;TYPE=snp;VARB=7.92824e-08;OID=.;OPOS=112832358;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:47:48:1:1:46:47:24:22:1:0:25:22:1:0 chr11 113111501 . T C 155.57 PASS AO=37;DP=78;FAO=37;FDP=78;FR=.;FRO=41;FSAF=6;FSAR=31;FSRF=6;FSRR=35;FWDB=0.00932813;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.341;QD=7.97788;RBI=0.010492;REFB=0.0219488;REVB=-0.00480281;RO=41;SAF=6;SAR=31;SRF=6;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0280242;STB=0.515617;TYPE=snp;VARB=-0.0232859;OID=.;OPOS=113111501;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:41:41:37:37:31:6:6:35:31:6:6:35 chr11 113113515 . G A 1346.01 PASS AO=141;DP=141;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0557547;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.835;QD=38.1846;RBI=0.0711895;REFB=0;REVB=0.0442646;RO=0;SAF=80;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.78794e-05;OID=.;OPOS=113113515;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:141:141:0:0:141:141:61:80:0:0:61:80:0:0 chr11 113146785 . T C 1954.23 PASS AO=221;DP=236;FAO=224;FDP=234;FR=.;FRO=10;FSAF=145;FSAR=79;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.0100645;FXX=0.00847422;HRUN=4;LEN=1;MLLD=132.313;QD=33.4056;RBI=0.0236546;REFB=-0.145154;REVB=-0.0214067;RO=8;SAF=143;SAR=78;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.007511;STB=0.502469;TYPE=snp;VARB=0.000697542;OID=.;OPOS=113146785;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:236:234:8:10:221:224:78:143:6:2:79:145:7:3 chr11 113194168 . A C 211.37 PASS AO=40;DP=68;FAO=40;FDP=68;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=27;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=-0.0350989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.181;QD=12.4333;RBI=0.0453126;REFB=0.0138092;REVB=0.0286583;RO=28;SAF=13;SAR=27;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0271781;STB=0.514918;TYPE=snp;VARB=-0.00673134;OID=.;OPOS=113194168;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:28:28:40:40:27:13:10:18:27:13:10:18 chr11 113266821 . G A 116.45 PASS AO=24;DP=45;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.0149715;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.903;QD=10.3507;RBI=0.041798;REFB=-0.0055061;REVB=0.0390248;RO=21;SAF=8;SAR=16;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243403;STB=0.636248;TYPE=snp;VARB=0.00444924;OID=.;OPOS=113266821;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:45:45:21:21:24:24:16:8:13:8:16:8:13:8 chr11 113270015 . G C 74.02 PASS AO=12;DP=18;FAO=12;FDP=19;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.0363613;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.889;QD=15.5837;RBI=0.0654045;REFB=-0.0727213;REVB=-0.0543655;RO=6;SAF=7;SAR=5;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0510973;STB=0.504497;TYPE=snp;VARB=0.0389644;OID=.;OPOS=113270015;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:18:19:6:7:12:12:5:7:4:2:5:7:4:3 chr11 113270374 . C T 151.44 PASS AO=47;DP=123;FAO=47;FDP=122;FR=.;FRO=75;FSAF=34;FSAR=13;FSRF=31;FSRR=44;FWDB=0.00771404;FXX=0.0161277;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.7246;QD=4.96509;RBI=0.0298028;REFB=-0.0179205;REVB=0.0287871;RO=75;SAF=34;SAR=13;SRF=31;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.344874;STB=0.696285;TYPE=snp;VARB=0.0342298;OID=.;OPOS=113270374;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:122:75:75:47:47:13:34:31:44:13:34:31:44 chr11 113270828 . G A 236.39 PASS AO=50;DP=93;FAO=50;FDP=93;FR=.;FRO=43;FSAF=34;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=0.00104864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.4646;QD=10.1672;RBI=0.017936;REFB=0.00240934;REVB=-0.0179053;RO=43;SAF=34;SAR=16;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171779;STB=0.594804;TYPE=snp;VARB=-0.00293217;OID=.;OPOS=113270828;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:43:43:50:50:16:34:21:22:16:34:21:22 chr11 113283477 . A G 149.03 PASS AO=35;DP=72;FAO=35;FDP=73;FR=.;FRO=38;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=12;FWDB=-0.0445298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.4145;QD=8.16584;RBI=0.0610379;REFB=-0.0191531;REVB=-0.0417459;RO=37;SAF=22;SAR=13;SRF=25;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.047136;STB=0.531498;TYPE=snp;VARB=0.0193891;OID=.;OPOS=113283477;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:73:37:38:35:35:13:22:25:12:13:22:26:12 chr11 113561025 . G A 168.62 PASS AO=43;DP=96;FAO=43;FDP=95;FR=.;FRO=52;FSAF=33;FSAR=10;FSRF=32;FSRR=20;FWDB=0.0405157;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.9581;QD=7.09989;RBI=0.0779057;REFB=-0.00422129;REVB=0.0665416;RO=52;SAF=33;SAR=10;SRF=32;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183728;STB=0.603607;TYPE=snp;VARB=0.00300863;OID=.;OPOS=113561025;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:95:52:52:43:43:10:33:32:20:10:33:32:20 chr11 113561054 . A G 930.65 PASS AO=99;DP=104;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144299;FXX=0.0384578;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.389;QD=37.226;RBI=0.0146458;REFB=-0.0642519;REVB=-0.00250537;RO=0;SAF=62;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000202479;OID=.;OPOS=113561054;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:104:100:0:0:99:100:37:62:0:0:38:62:0:0 chr11 113561057 . A G 763.95 PASS AO=94;DP=104;FAO=94;FDP=104;FR=.;FRO=10;FSAF=57;FSAR=37;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.0239484;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.4881;QD=29.3827;RBI=0.0239864;REFB=-0.155712;REVB=0.00134969;RO=10;SAF=57;SAR=37;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0201394;STB=0.510663;TYPE=snp;VARB=0.0443848;OID=.;OPOS=113561057;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:104:104:10:10:94:94:37:57:5:5:37:57:5:5 chr11 113570405 . T C 231.76 PASS AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0238691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5205;QD=34.3347;RBI=0.0881333;REFB=-0.11761;REVB=0.0848396;RO=0;SAF=1;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.20334e-08;STB=0.509796;TYPE=snp;VARB=0.0158333;OID=.;OPOS=113570405;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:25:27:0:1:25:26:24:1:0:0:25:1:0:1 chr11 113570852 . C T 252.9 PASS AO=60;DP=124;FAO=61;FDP=127;FR=.;FRO=66;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=29;FSRR=37;FWDB=0.023919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.822;QD=7.96534;RBI=0.0241018;REFB=-0.0145934;REVB=-0.00296306;RO=63;SAF=28;SAR=32;SRF=27;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0355246;STB=0.518791;TYPE=snp;VARB=0.0249663;OID=.;OPOS=113570852;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:127:63:66:60:61:32:28:27:36:32:29:29:37 chr11 113576932 . A G 767.57 PASS AO=74;DP=74;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0179462;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.738;QD=38.3785;RBI=0.099561;REFB=0;REVB=0.0979302;RO=0;SAF=34;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000430341;OID=.;OPOS=113576932;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:74:80:0:0:74:80:40:34:0:0:46:34:0:0 chr11 113670052 . T A 976.16 PASS AO=102;DP=105;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00910442;FXX=0.0190458;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.503;QD=37.9091;RBI=0.0178357;REFB=0;REVB=-0.0153369;RO=0;SAF=65;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.36992e-05;OID=.;OPOS=113670052;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:105:103:0:0:102:103:37:65:0:0:37:66:0:0 chr11 113679119 . C T 773.13 PASS AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0256216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5578;QD=38.6566;RBI=0.0909084;REFB=0;REVB=0.0872231;RO=0;SAF=31;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.85194e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000534441;OID=.;OPOS=113679119;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:80:80:0:0:80:80:49:31:0:0:49:31:0:0 chr11 113803104 . G A 419.34 PASS AO=101;DP=207;FAO=101;FDP=207;FR=.;FRO=106;FSAF=38;FSAR=63;FSRF=50;FSRR=56;FWDB=-0.00684728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.8784;QD=8.10327;RBI=0.0366555;REFB=-0.00514675;REVB=-0.0360103;RO=106;SAF=38;SAR=63;SRF=50;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0920647;STB=0.550755;TYPE=snp;VARB=0.0058354;OID=.;OPOS=113803104;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:207:106:106:101:101:63:38:50:56:63:38:50:56 chr11 113848273 . A T 347.68 PASS AO=41;DP=42;FAO=40;FDP=42;FR=.;FRO=2;FSAF=7;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.124966;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5976;QD=33.1121;RBI=0.132964;REFB=-0.0964669;REVB=-0.045418;RO=1;SAF=7;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.013605;STB=0.514699;TYPE=snp;VARB=0.00271927;OID=.;OPOS=113848273;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:42:42:1:2:41:40:34:7:0:1:33:7:0:2 chr11 113935014 . TG T 156.08 PASS AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.122558;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=19.9226;QD=28.3788;RBI=0.122989;REFB=0;REVB=-0.0102951;RO=0;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0.487603;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.00811946;OID=.;OPOS=113935015;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:22:22:22:22:0:10:12:0:0:14:0:10:12:0:0 chr11 114027135 . A C 34.98 PASS AO=32;DP=128;FAO=29;FDP=128;FR=.;FRO=99;FSAF=28;FSAR=1;FSRF=59;FSRR=40;FWDB=-0.0700754;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.787;QD=1.09312;RBI=0.0808516;REFB=-0.057874;REVB=-0.0403289;RO=93;SAF=31;SAR=1;SRF=56;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.678215;STB=0.929167;TYPE=snp;VARB=0.290431;OID=.;OPOS=114027135;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:128:128:93:99:32:29:1:31:56:37:1:28:59:40 chr11 114284744 . C T 284.28 PASS AO=70;DP=147;FAO=70;FDP=148;FR=.;FRO=78;FSAF=14;FSAR=56;FSRF=13;FSRR=65;FWDB=-0.00338963;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.661;QD=7.68319;RBI=0.0138025;REFB=-0.030902;REVB=-0.0133798;RO=76;SAF=14;SAR=56;SRF=12;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0648425;STB=0.528376;TYPE=snp;VARB=0.0311465;OID=.;OPOS=114284744;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:148:76:78:70:70:56:14:12:64:56:14:13:65 chr11 114393652 . C T 1850.54 PASS AO=197;DP=201;FAO=197;FDP=197;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144682;FXX=0.0198995;HRUN=3;LEN=1;MLLD=197.102;QD=37.5745;RBI=0.0515611;REFB=-0.0711126;REVB=0.0494896;RO=1;SAF=92;SAR=105;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00451446;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000145759;OID=.;OPOS=114393652;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:201:197:1:0:197:197:105:92:0:1:105:92:0:0 chr11 114401577 . T C 1857.39 PASS AO=211;DP=230;FAO=215;FDP=227;FR=.;FRO=12;FSAF=70;FSAR=145;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.0451953;FXX=0.0130429;HRUN=3;LEN=1;MLLD=87.6038;QD=32.7293;RBI=0.0537838;REFB=-0.232234;REVB=0.0291561;RO=5;SAF=67;SAR=144;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0242924;STB=0.504563;TYPE=snp;VARB=0.00342766;OID=.;OPOS=114401577;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:230:227:5:12:211:215:144:67:4:1:145:70:3:9 chr11 114421857 . T C 31.27 PASS AO=23;DP=109;FAO=23;FDP=109;FR=.;FRO=86;FSAF=3;FSAR=20;FSRF=50;FSRR=36;FWDB=0.0128626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.985;QD=1.14764;RBI=0.0296878;REFB=-0.0070911;REVB=0.0267566;RO=85;SAF=2;SAR=21;SRF=49;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.64098;STB=0.86287;TYPE=snp;VARB=0.0668485;OID=.;OPOS=114421857;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:109:109:85:86:23:23:21:2:49:36:20:3:50:36 chr11 114421861 . G A 25.92 PASS AO=22;DP=109;FAO=21;FDP=107;FR=.;FRO=86;FSAF=3;FSAR=18;FSRF=50;FSRR=36;FWDB=0.0623909;FXX=0.0092584;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.6774;QD=0.969083;RBI=0.0795639;REFB=0.00682777;REVB=0.049374;RO=87;SAF=3;SAR=19;SRF=51;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.571979;STB=0.854499;TYPE=snp;VARB=-0.0236972;OID=.;OPOS=114421861;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:109:107:87:86:22:21:19:3:51:36:18:3:50:36 chr11 114421895 . G A 20.64 PASS AO=18;DP=96;FAO=17;FDP=92;FR=.;FRO=75;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=40;FSRR=35;FWDB=-0.0192245;FXX=0.0416623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.668;QD=0.897483;RBI=0.0270615;REFB=-0.00588556;REVB=-0.0190458;RO=64;SAF=3;SAR=15;SRF=36;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.506934;STB=0.803367;TYPE=snp;VARB=0.0256566;OID=.;OPOS=114421895;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:96:92:64:75:18:17:15:3:36:28:14:3:40:35 chr11 114421909 . T C 48.9 PASS AO=24;DP=82;FAO=22;FDP=80;FR=.;FRO=58;FSAF=1;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=32;FWDB=0.0562473;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.278;QD=2.44512;RBI=0.0565678;REFB=-0.00502561;REVB=-0.0060127;RO=58;SAF=1;SAR=23;SRF=26;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.673581;STB=0.914038;TYPE=snp;VARB=0.020457;OID=.;OPOS=114421909;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:82:80:58:58:24:22:23:1:26:32:21:1:26:32 chr11 114421912 . A G 46.91 PASS AO=23;DP=80;FAO=21;FDP=77;FR=.;FRO=56;FSAF=2;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=31;FWDB=0.0373652;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.337;QD=2.43666;RBI=0.037388;REFB=-0.0142626;REVB=0.00130643;RO=54;SAF=2;SAR=21;SRF=25;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.570877;STB=0.836483;TYPE=snp;VARB=0.0205555;OID=.;OPOS=114421912;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:80:77:54:56:23:21:21:2:25:29:19:2:25:31 chr11 114441943 . G A 787.62 PASS AO=100;DP=116;FAO=101;FDP=117;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=95;FSRF=14;FSRR=2;FWDB=-0.0149232;FXX=0.00847386;HRUN=3;LEN=1;MLLD=77.2301;QD=26.9271;RBI=0.0151178;REFB=0.00224056;REVB=-0.00241796;RO=16;SAF=6;SAR=94;SRF=14;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.49069;STB=0.765441;TYPE=snp;VARB=-0.000206155;OID=.;OPOS=114441943;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:116:117:16:16:100:101:94:6:14:2:95:6:14:2 chr11 114442103 . A G 456.7 PASS AO=47;DP=49;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0109592;FXX=0.059988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.951;QD=38.8683;RBI=0.026461;REFB=0;REVB=-0.0240849;RO=0;SAF=18;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0009586;OID=.;OPOS=114442103;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:49:47:0:0:47:47:29:18:0:0:29:18:0:0 chr11 114569054 . A G 2479.22 PASS AO=240;DP=245;FAO=266;FDP=266;FR=.;FRO=0;FSAF=148;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0868625;FXX=0.00746241;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.3278;QD=37.2814;RBI=0.102107;REFB=-0.0229522;REVB=0.0536724;RO=2;SAF=137;SAR=103;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0091635;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00310662;OID=.;OPOS=114569054;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:245:266:2:0:240:266:103:137:0:2:118:148:0:0 chr11 114576626 . A T 224.22 PASS AO=64;DP=148;FAO=63;FDP=148;FR=.;FRO=85;FSAF=28;FSAR=35;FSRF=38;FSRR=47;FWDB=0.0202623;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=36.6284;QD=6.06012;RBI=0.0203453;REFB=-0.0576819;REVB=-0.00183599;RO=74;SAF=28;SAR=36;SRF=29;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0450534;STB=0.501519;TYPE=snp;VARB=0.0720144;OID=.;OPOS=114576626;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:74:85:64:63:36:28:29:45:35:28:38:47 chr11 115044850 . C A 94.56 PASS AO=22;DP=46;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=21;FSAR=1;FSRF=24;FSRR=1;FWDB=-0.00724561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.824;QD=8.04736;RBI=0.0104749;REFB=-0.0290259;REVB=-0.00756468;RO=19;SAF=21;SAR=1;SRF=18;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0329298;STB=0.517226;TYPE=snp;VARB=0.0271122;OID=.;OPOS=115044850;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:46:47:19:25:22:22:1:21:18:1:1:21:24:1 chr11 115085467 . A C 559.12 PASS AO=162;DP=397;FAO=166;FDP=400;FR=.;FRO=234;FSAF=85;FSAR=81;FSRF=121;FSRR=113;FWDB=0.00674034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.7;QD=5.59124;RBI=0.00839452;REFB=-0.0187612;REVB=0.00500358;RO=232;SAF=84;SAR=78;SRF=121;SRR=111;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00320675;STB=0.502954;TYPE=snp;VARB=0.0272017;OID=.;OPOS=115085467;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:397:400:232:234:162:166:78:84:121:111:81:85:121:113 chr11 116661826 . T C 375.18 PASS AO=45;DP=125;FAO=61;FDP=124;FR=.,HEALED;FRO=40;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=30;FSRR=10;FWDB=-0.00258605;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.034;QD=12.1025;RBI=0.00796263;REFB=-0.0144123;REVB=0.007531;RO=34;SAF=29;SAR=16;SRF=30;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219885;STB=0.584466;TYPE=snp;VARB=0.0186985;OID=.;OPOS=116661826;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:124:34:40:45:61:16:29:30:4:28:33:30:10 chr11 116662579 . C T 62.19 PASS AO=18;DP=48;FAO=18;FDP=48;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=21;FWDB=-0.0109366;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.172;QD=5.18288;RBI=0.0366691;REFB=0.0025264;REVB=0.0350002;RO=30;SAF=9;SAR=9;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216429;STB=0.62487;TYPE=snp;VARB=-0.00425876;OID=.;OPOS=116662579;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:48:48:30:30:18:18:9:9:9:21:9:9:9:21 chr11 116692334 . C T 85.64 PASS AO=13;DP=19;FAO=13;FDP=19;FR=.;FRO=6;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0389414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.64;QD=18.0285;RBI=0.0394417;REFB=0.00627587;REVB=-0.00626225;RO=6;SAF=11;SAR=2;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166233;STB=0.594432;TYPE=snp;VARB=-0.00457902;OID=.;OPOS=116692334;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:19:19:6:6:13:13:2:11:4:2:2:11:4:2 chr11 116693464 . C T 276.94 PASS AO=58;DP=107;FAO=58;FDP=107;FR=.;FRO=49;FSAF=21;FSAR=37;FSRF=23;FSRR=26;FWDB=0.0255028;FXX=0.0092584;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.704;QD=10.3529;RBI=0.0357962;REFB=-0.0295671;REVB=-0.0251192;RO=48;SAF=21;SAR=37;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0837028;STB=0.551659;TYPE=snp;VARB=0.0380811;OID=.;OPOS=116693464;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:48:49:58:58:37:21:22:26:37:21:23:26 chr11 117042377 . G A 2816.9 PASS AO=293;DP=293;FAO=294;FDP=294;FR=.;FRO=0;FSAF=146;FSAR=148;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.501;QD=38.3251;RBI=0.0353534;REFB=0;REVB=0.0289381;RO=0;SAF=145;SAR=148;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.8953e-05;OID=.;OPOS=117042377;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:293:294:0:0:293:294:148:145:0:0:148:146:0:0 chr11 117052799 . A G 40.13 PASS AO=18;DP=66;FAO=18;FDP=67;FR=.;FRO=49;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=36;FWDB=0.0109439;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.881;QD=2.39556;RBI=0.0330135;REFB=-0.00965916;REVB=-0.0311468;RO=48;SAF=6;SAR=12;SRF=12;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119284;STB=0.558078;TYPE=snp;VARB=0.0316675;OID=.;OPOS=117052799;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:66:67:48:49:18:18:12:6:12:36:12:6:13:36 chr11 117160347 . A G 642.08 PASS AO=71;DP=74;FAO=71;FDP=73;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=36;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.054152;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.775;QD=35.1825;RBI=0.0674049;REFB=-0.185788;REVB=-0.040137;RO=2;SAF=35;SAR=36;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0262533;STB=0.513885;TYPE=snp;VARB=0.00251092;OID=.;OPOS=117160347;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:74:73:2:2:71:71:36:35:2:0:36:35:2:0 chr11 117222592 . G A 149.23 PASS AO=32;DP=62;FAO=32;FDP=62;FR=.;FRO=30;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=0.00612963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.541;QD=9.62799;RBI=0.00725197;REFB=-0.0348534;REVB=0.0038754;RO=25;SAF=18;SAR=14;SRF=18;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129633;STB=0.518507;TYPE=snp;VARB=0.0253392;OID=.;OPOS=117222592;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:25:30:32:32:14:18:18:7:14:18:18:12 chr11 117252488 . CT C,CC 1154.87 PASS AO=48,72;DP=121;FAO=54,70;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=46,43;FSAR=8,27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.022338,0.0188331;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=210.168,211.141;QD=37.254;RBI=0.0252515,0.0240494;REFB=0,0;REVB=-0.011775,-0.0149562;RO=0;SAF=41,44;SAR=7,28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,4.21139e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.0125921,0.0163177;OID=.,.;OPOS=117252489,117252489;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:48,72:120:54,70:124:0:46,43:8,27:0:0:90:0:41,44:7,28:0:0 chr11 117266312 . C G 68.08 PASS AO=29;DP=95;FAO=29;FDP=97;FR=.;FRO=68;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=36;FSRR=32;FWDB=-0.0113651;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=154.754;QD=2.80729;RBI=0.0132258;REFB=-0.00882372;REVB=0.00676434;RO=66;SAF=14;SAR=15;SRF=34;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0382337;STB=0.532648;TYPE=snp;VARB=0.0194576;OID=.;OPOS=117266312;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:95:97:66:68:29:29:15:14:34:32:15:14:36:32 chr11 117267884 . A G 225.16 PASS AO=60;DP=133;FAO=60;FDP=136;FR=.;FRO=76;FSAF=23;FSAR=37;FSRF=37;FSRR=39;FWDB=0.02471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.9452;QD=6.62237;RBI=0.0408052;REFB=-0.0292071;REVB=-0.0324728;RO=72;SAF=23;SAR=37;SRF=37;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130493;STB=0.559456;TYPE=snp;VARB=0.0350332;OID=.;OPOS=117267884;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:136:72:76:60:60:37:23:37:35:37:23:37:39 chr11 117282800 . G T 961.1 PASS AO=100;DP=100;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0714471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.831;QD=38.0632;RBI=0.0799624;REFB=0;REVB=0.0359068;RO=0;SAF=43;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000307898;OID=.;OPOS=117282800;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:100:101:0:0:100:101:57:43:0:0:58:43:0:0 chr11 117335722 . T C 211.38 PASS AO=36;DP=70;FAO=43;FDP=77;FR=.;FRO=34;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=0.10399;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.7552;QD=10.9806;RBI=0.117932;REFB=-0.0341251;REVB=0.0556241;RO=34;SAF=16;SAR=20;SRF=12;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0819927;STB=0.569848;TYPE=snp;VARB=0.0396953;OID=.;OPOS=117335722;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:77:34:34:36:43:20:16:12:22:21:22:12:22 chr11 117691386 . G A 130.74 PASS AO=28;DP=54;FAO=28;FDP=54;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=-0.039696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.9312;QD=9.68434;RBI=0.0404624;REFB=-0.0253743;REVB=0.00783763;RO=26;SAF=9;SAR=19;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0608347;STB=0.533999;TYPE=snp;VARB=0.030076;OID=.;OPOS=117691386;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:26:26:28:28:19:9:10:16:19:9:10:16 chr11 117698762 . G A 137.13 PASS AO=30;DP=60;FAO=30;FDP=60;FR=.;FRO=30;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.0250265;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.4505;QD=9.14187;RBI=0.0250405;REFB=0.0291913;REVB=-0.000837203;RO=30;SAF=18;SAR=12;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178947;STB=0.599933;TYPE=snp;VARB=-0.0268653;OID=.;OPOS=117698762;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:30:30:30:30:12:18:12:18:12:18:12:18 chr11 117774146 . C G 99 PASS AO=25;DP=56;FAO=25;FDP=57;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.000996996;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=260.252;QD=6.94708;RBI=0.00763268;REFB=0.010811;REVB=0.00756729;RO=31;SAF=15;SAR=10;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114912;STB=0.574408;TYPE=snp;VARB=-0.0104077;OID=.;OPOS=117774146;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:56:57:31:32:25:25:10:15:15:16:10:15:15:17 chr11 117774291 . A C 440.19 PASS AO=53;DP=54;FAO=51;FDP=54;FR=.;FRO=3;FSAF=38;FSAR=13;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0148014;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.5405;QD=32.6066;RBI=0.0148521;REFB=0.0139551;REVB=-0.00122614;RO=1;SAF=40;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116359;STB=0.51898;TYPE=snp;VARB=-0.00913395;OID=.;OPOS=117774291;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:54:54:1:3:53:51:13:40:1:0:13:38:3:0 chr11 117781435 . A G 1068.84 PASS AO=103;DP=103;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00640203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.495;QD=37.8351;RBI=0.0304781;REFB=0;REVB=0.0297982;RO=0;SAF=77;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.23066e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000270135;OID=.;OPOS=117781435;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:103:113:0:0:103:113:26:77:0:0:34:79:0:0 chr11 117789462 . TGGG TGG,TGGC 81.76 PASS AO=9,4;DP=22;FAO=14,0;FDP=17;FR=.;FRO=3;FSAF=11,0;FSAR=3,0;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.161658,-0.260994;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=14.6948,10.8535;QD=19.2369;RBI=0.310676,0.324796;REFB=-0.0435576,0.0149904;REVB=0.265304,0.193325;RO=3;SAF=6,4;SAR=3,0;SRF=1;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0.29899,0;SSSB=0.154191,0.74182;STB=0.604233,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0262836,0;OID=.,.;OPOS=117789463,117789465;OREF=G,G;OALT=-,C;OMAPALT=TGG,TGGC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:9,4:16:14,0:17:3:11,0:3,0:1:2:7:3:6,4:3,0:1:2 chr11 117864047 . A G 1058.97 PASS AO=113;DP=114;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010484;FXX=0.00877116;HRUN=3;LEN=1;MLLD=91.245;QD=37.4855;RBI=0.0237111;REFB=-0.0360877;REVB=0.0212675;RO=1;SAF=21;SAR=92;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0220683;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000210637;OID=.;OPOS=117864047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:114:113:1:0:113:113:92:21:1:0:92:21:0:0 chr11 117869670 . A G 265.35 PASS AO=26;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0700924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.219;QD=37.9073;RBI=0.0703878;REFB=0;REVB=-0.0064417;RO=0;SAF=4;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.50493e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000202721;OID=.;OPOS=117869670;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:27:28:0:0:26:28:22:4:0:0:24:4:0:0 chr11 117965595 . C T 109.55 PASS AO=31;DP=76;FAO=31;FDP=77;FR=.;FRO=46;FSAF=2;FSAR=29;FSRF=10;FSRR=36;FWDB=0.0276954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2126;QD=5.69098;RBI=0.0315095;REFB=-0.0151989;REVB=-0.0150271;RO=45;SAF=1;SAR=30;SRF=10;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.557674;STB=0.72784;TYPE=snp;VARB=0.0145818;OID=.;OPOS=117965595;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:77:45:46:31:31:30:1:10:35:29:2:10:36 chr11 117965602 . C T 201.57 PASS AO=41;DP=74;FAO=41;FDP=74;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=32;FSRF=2;FSRR=31;FWDB=0.0511417;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.249;QD=10.8956;RBI=0.0568026;REFB=-0.0274336;REVB=0.0247197;RO=33;SAF=9;SAR=32;SRF=2;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215623;STB=0.616927;TYPE=snp;VARB=0.0220419;OID=.;OPOS=117965602;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:33:33:41:41:32:9:2:31:32:9:2:31 chr11 117982495 . T G 242.5 PASS AO=23;DP=23;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00487209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.384;QD=37.3075;RBI=0.057908;REFB=0;REVB=0.0577026;RO=0;SAF=19;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000113046;OID=.;OPOS=117982495;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:23:26:0:0:23:26:4:19:0:0:7:19:0:0 chr11 117988082 . T C 571.21 PASS AO=64;DP=68;FAO=65;FDP=69;FR=.;FRO=4;FSAF=38;FSAR=27;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.00568831;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.978;QD=33.1136;RBI=0.020059;REFB=-0.0278311;REVB=0.0192355;RO=4;SAF=37;SAR=27;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00886683;STB=0.50504;TYPE=snp;VARB=0.00121288;OID=.;OPOS=117988082;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:68:69:4:4:64:65:27:37:2:2:27:38:2:2 chr11 117988654 . G C 32.58 PASS AO=9;DP=26;FAO=9;FDP=26;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=15;FWDB=0.0578934;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=182.029;QD=5.01284;RBI=0.0581815;REFB=-0.00591703;REVB=-0.00578307;RO=17;SAF=2;SAR=7;SRF=2;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187728;STB=0.610901;TYPE=snp;VARB=0.0123976;OID=.;OPOS=117988654;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:26:26:17:17:9:9:7:2:2:15:7:2:2:15 chr11 118034223 . G A 478.56 PASS AO=64;DP=188;FAO=83;FDP=184;FR=.,HEALED;FRO=71;FSAF=39;FSAR=44;FSRF=53;FSRR=18;FWDB=0.0233572;FXX=0.0107521;HRUN=5;LEN=1;MLLD=126.06;QD=10.4034;RBI=0.0247723;REFB=-0.0606544;REVB=0.00825292;RO=58;SAF=34;SAR=30;SRF=48;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.264298;STB=0.626015;TYPE=snp;VARB=0.0286024;OID=.;OPOS=118034223;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:184:58:71:64:83:30:34:48:10:44:39:53:18 chr11 118034228 . T G 298.25 PASS AO=83;DP=193;FAO=83;FDP=193;FR=.;FRO=110;FSAF=38;FSAR=45;FSRF=64;FSRR=46;FWDB=-0.0189202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.0125;QD=6.1814;RBI=0.0190942;REFB=-0.0119503;REVB=-0.00257142;RO=109;SAF=38;SAR=45;SRF=63;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121903;STB=0.570311;TYPE=snp;VARB=0.0138897;OID=.;OPOS=118034228;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:193:109:110:83:83:45:38:63:46:45:38:64:46 chr11 118068752 . T C 393.84 PASS AO=100;DP=221;FAO=102;FDP=222;FR=.;FRO=120;FSAF=36;FSAR=66;FSRF=52;FSRR=68;FWDB=-0.038293;FXX=0.0044841;HRUN=4;LEN=1;MLLD=111.292;QD=7.09622;RBI=0.0560773;REFB=-0.0310976;REVB=-0.0409671;RO=117;SAF=36;SAR=64;SRF=51;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0781579;STB=0.546266;TYPE=snp;VARB=0.0272824;OID=.;OPOS=118068752;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:222:117:120:100:102:64:36:51:66:66:36:52:68 chr11 118071306 . AG A 253 PASS AO=41;DP=60;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.175281;FXX=0.0175408;HRUN=3;LEN=1;MLLD=10.3423;QD=18.0714;RBI=0.226314;REFB=0.00330376;REVB=-0.143159;RO=6;SAF=27;SAR=14;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0.444606;SSSB=0.124565;STB=0.508471;TYPE=del;VARB=0.0146681;OID=.;OPOS=118071307;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:41:57:55:56:1:29:26:1:0:16:6:27:14:1:5 chr11 118074337 . A G 812.17 PASS AO=84;DP=87;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00129024;FXX=0.0229859;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.2057;QD=38.2198;RBI=0.0174761;REFB=0;REVB=0.0174285;RO=0;SAF=43;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000143679;OID=.;OPOS=118074337;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:87:85:0:0:84:85:41:43:0:0:42:43:0:0 chr11 118081345 . A T 477.46 PASS AO=114;DP=235;FAO=115;FDP=235;FR=.;FRO=120;FSAF=40;FSAR=75;FSRF=47;FSRR=73;FWDB=0.00247381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.546;QD=8.12693;RBI=0.0142366;REFB=-0.00251551;REVB=-0.01402;RO=120;SAF=39;SAR=75;SRF=47;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0503404;STB=0.524303;TYPE=snp;VARB=0.00338035;OID=.;OPOS=118081345;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:235:235:120:120:114:115:75:39:47:73:75:40:47:73 chr11 118083664 . A G 1371.32 PASS AO=149;DP=153;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0103543;FXX=0.0261421;HRUN=3;LEN=1;MLLD=86.3938;QD=36.8139;RBI=0.0254505;REFB=-0.0897503;REVB=0.0232489;RO=0;SAF=54;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000136433;OID=.;OPOS=118083664;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:153:149:0:0:149:149:95:54:0:0:95:54:0:0 chr11 118107805 . A G 1834.01 PASS AO=201;DP=202;FAO=199;FDP=203;FR=.;FRO=4;FSAF=104;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.000203415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.597;QD=36.1381;RBI=0.00237752;REFB=0.0114853;REVB=0.0023688;RO=0;SAF=103;SAR=98;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510308;TYPE=snp;VARB=-0.000272069;OID=.;OPOS=118107805;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:202:203:0:4:201:199:98:103:0:0:95:104:0:4 chr11 118110977 . T C 2696.98 PASS AO=290;DP=295;FAO=290;FDP=290;FR=.;FRO=0;FSAF=158;FSAR=132;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153196;FXX=0.0202696;HRUN=3;LEN=1;MLLD=91.8246;QD=37.1998;RBI=0.0643518;REFB=-0.118858;REVB=0.0625017;RO=5;SAF=158;SAR=132;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00471546;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00076879;OID=.;OPOS=118110977;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:295:290:5:0:290:290:132:158:2:3:132:158:0:0 chr11 118178007 . C T 118.61 PASS AO=26;DP=49;FAO=25;FDP=48;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=6;FSRR=17;FWDB=-0.0640709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.864;QD=9.88397;RBI=0.0641;REFB=-0.00304652;REVB=-0.00193334;RO=23;SAF=6;SAR=20;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0348293;STB=0.513503;TYPE=snp;VARB=0.00293227;OID=.;OPOS=118178007;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:48:23:23:26:25:20:6:6:17:19:6:6:17 chr11 118179197 . A G 1005.3 PASS AO=112;DP=121;FAO=117;FDP=120;FR=.;FRO=3;FSAF=52;FSAR=65;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0498439;FXX=0.00826378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.131;QD=33.51;RBI=0.0530778;REFB=-0.145156;REVB=0.0182441;RO=8;SAF=47;SAR=65;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0584163;STB=0.505617;TYPE=snp;VARB=0.00212303;OID=.;OPOS=118179197;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:121:120:8:3:112:117:65:47:7:1:65:52:2:1 chr11 118182829 . T A 88.9 PASS AO=26;DP=70;FAO=27;FDP=72;FR=.;FRO=45;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=0.0131274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.475;QD=4.93866;RBI=0.0184029;REFB=-0.0190494;REVB=0.0128972;RO=43;SAF=11;SAR=15;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121246;STB=0.555514;TYPE=snp;VARB=0.0273064;OID=.;OPOS=118182829;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:70:72:43:45:26:27:15:11:23:20:15:12:24:21 chr11 118185140 . T C 170.68 PASS AO=43;DP=96;FAO=43;FDP=95;FR=.;FRO=52;FSAF=27;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=33;FWDB=-0.00336586;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.8615;QD=7.18653;RBI=0.0526331;REFB=-0.0152829;REVB=-0.0525254;RO=47;SAF=27;SAR=16;SRF=14;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.303485;STB=0.642479;TYPE=snp;VARB=0.00912992;OID=.;OPOS=118185140;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:95:47:52:43:43:16:27:14:33:16:27:19:33 chr11 118393396 . A G 1634.13 PASS AO=169;DP=169;FAO=172;FDP=172;FR=.;FRO=0;FSAF=99;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00815842;FXX=0.028247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.3295;QD=38.0031;RBI=0.00963616;REFB=0;REVB=-0.00512793;RO=0;SAF=96;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00268538;OID=.;OPOS=118393396;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:169:172:0:0:169:172:73:96:0:0:73:99:0:0 chr11 118505676 . GT G 256.61 PASS AO=25;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0894435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=39.6717;QD=36.6591;RBI=0.0912255;REFB=0;REVB=-0.0179426;RO=0;SAF=4;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.661e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00183849;OID=.;OPOS=118505677;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:25:27:28:28:0:5:23:0:0:12:0:4:21:0:0 chr11 118509668 . A G 928.15 PASS AO=97;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00855679;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.663;QD=38.2742;RBI=0.0535636;REFB=0;REVB=-0.0528757;RO=0;SAF=62;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.81934e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00017784;OID=.;OPOS=118509668;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:97:97:0:0:97:97:35:62:0:0:35:62:0:0 chr11 118514625 . C T 195.15 PASS AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0618659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.539;QD=37.1719;RBI=0.0664782;REFB=0;REVB=-0.0243302;RO=0;SAF=7;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000623014;OID=.;OPOS=118514625;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:21:21:0:0:21:21:14:7:0:0:14:7:0:0 chr11 118516333 . G A 248.81 PASS AO=47;DP=80;FAO=47;FDP=80;FR=.;FRO=33;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=0.0182177;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=202.147;QD=12.4403;RBI=0.0195508;REFB=-0.0214048;REVB=-0.0070957;RO=31;SAF=26;SAR=21;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0271799;STB=0.515811;TYPE=snp;VARB=0.011444;OID=.;OPOS=118516333;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:31:33:47:47:21:26:16:15:21:26:17:16 chr11 118529069 . G C 116.18 PASS AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00893677;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.3726;QD=35.7485;RBI=0.217206;REFB=0;REVB=0.217022;RO=0;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60098e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0121983;OID=.;OPOS=118529069;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:13:0:0:13:13:8:5:0:0:8:5:0:0 chr11 118529078 . G C 113.19 PASS AO=12;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0303433;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=35.2067;QD=32.3388;RBI=0.332725;REFB=0;REVB=0.331339;RO=2;SAF=5;SAR=7;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11262;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0208036;OID=.;OPOS=118529078;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:14:14:2:0:12:14:7:5:0:2:9:5:0:0 chr11 118529127 . G A 183.11 PASS AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0401338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.996;QD=38.5489;RBI=0.0592945;REFB=0;REVB=0.0436476;RO=0;SAF=9;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33753e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000673354;OID=.;OPOS=118529127;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:19:19:0:0:19:19:10:9:0:0:10:9:0:0 chr11 118530611 . T C 765.48 PASS AO=81;DP=82;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00586993;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.683;QD=37.8015;RBI=0.00626855;REFB=0;REVB=-0.00219969;RO=0;SAF=37;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.65992e-05;OID=.;OPOS=118530611;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:82:81:0:0:81:81:44:37:0:0:44:37:0:0 chr11 118531367 . A G 55.65 PASS AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.0300959;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.259;QD=6.54717;RBI=0.0535878;REFB=-0.016236;REVB=0.0443383;RO=19;SAF=6;SAR=8;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.045221;STB=0.512802;TYPE=snp;VARB=0.0092604;OID=.;OPOS=118531367;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:34:34:19:20:14:14:8:6:9:10:8:6:9:11 chr11 118534082 . C T 1667.32 PASS AO=175;DP=175;FAO=174;FDP=174;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00671544;FXX=0.011363;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.231;QD=38.3291;RBI=0.0528835;REFB=0;REVB=0.0524554;RO=0;SAF=83;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.09587e-05;OID=.;OPOS=118534082;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:175:174:0:0:175:174:92:83:0:0:93:81:0:0 chr11 118621775 . A G 10.02 PASS AO=13;DP=77;FAO=12;FDP=78;FR=.;FRO=66;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=58;FWDB=-0.0507672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.6036;QD=0.513807;RBI=0.0513518;REFB=0.000330697;REVB=0.00772611;RO=64;SAF=1;SAR=12;SRF=8;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163618;STB=0.589116;TYPE=snp;VARB=-0.00368414;OID=.;OPOS=118621775;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:77:78:64:66:13:12:12:1:8:56:11:1:8:58 chr11 118621777 . G A 33.9 PASS AO=16;DP=62;FAO=16;FDP=63;FR=.;FRO=47;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=42;FWDB=-0.0109709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.75;QD=2.15213;RBI=0.0126376;REFB=-0.0024795;REVB=-0.0062728;RO=42;SAF=4;SAR=12;SRF=3;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.363284;STB=0.666508;TYPE=snp;VARB=0.0367557;OID=.;OPOS=118621777;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:62:63:42:47:16:16:12:4:3:39:12:4:5:42 chr11 118621825 . G GT 1754.29 PASS AO=227;DP=260;FAO=253;FDP=253;FR=.;FRO=0;FSAF=122;FSAR=131;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00686858;FXX=0.026922;HRUN=2;LEN=1;MLLD=16.7977;QD=27.7358;RBI=0.0930825;REFB=0;REVB=0.0928288;RO=13;SAF=107;SAR=120;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0249055;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=1.51471e-05;OID=.;OPOS=118621826;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:227:260:253:253:0:122:131:0:0:99:13:107:120:3:10 chr11 118622744 . G A 815.07 PASS AO=84;DP=84;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0371701;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.2459;QD=37.91;RBI=0.0371945;REFB=0;REVB=-0.00134639;RO=0;SAF=22;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.82022e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000117335;OID=.;OPOS=118622744;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:84:86:0:0:84:86:62:22:0:0:64:22:0:0 chr11 118744701 . A AAAAG 134.01 PASS AO=6;DP=18;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0.111049;HRUN=4;LEN=4;MLLD=125.751;QD=33.5017;RBI=0.000562486;REFB=0;REVB=-0.000562486;RO=11;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.000553298;OID=.;OPOS=118744702;OREF=-;OALT=AAAG;OMAPALT=AAAAG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:6:18:16:16:0:0:16:0:0:7:11:0:6:0:11 chr11 118744706 . A AAAG 138 PASS AO=5;DP=24;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0.166574;HRUN=3;LEN=3;MLLD=133.865;QD=36.8007;RBI=0.0631558;REFB=0;REVB=0.0631558;RO=17;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00121713;OID=.;OPOS=118744707;OREF=-;OALT=AAG;OMAPALT=AAAG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:5:24:15:15:0:0:15:0:0:7:17:0:5:0:17 chr11 118757191 . G A 368.08 PASS AO=42;DP=44;FAO=42;FDP=44;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00142306;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=219.33;QD=33.4617;RBI=0.0225842;REFB=-0.0665436;REVB=0.0225393;RO=2;SAF=31;SAR=11;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0258812;STB=0.513806;TYPE=snp;VARB=0.000276612;OID=.;OPOS=118757191;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:44:44:2:2:42:42:11:31:1:1:11:31:1:1 chr11 118757201 . C G 288.41 PASS AO=25;DP=27;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00865276;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.148;QD=37.2145;RBI=0.0765932;REFB=0;REVB=0.0761028;RO=0;SAF=23;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34264e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000330054;OID=.;OPOS=118757201;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:27:31:0:0:25:31:2:23:0:0:3:28:0:0 chr11 118773097 . T C 12.71 PASS AO=3;DP=8;FAO=3;FDP=8;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-3.41418e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.077;QD=6.35555;RBI=3.41418e-05;REFB=-0.0150713;REVB=0;RO=4;SAF=3;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0431229;OID=.;OPOS=118773097;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:8:8:4:5:3:3:0:3:4:0:0:3:5:0 chr11 118773099 . G T 10.3 PASS AO=2;DP=8;FAO=2;FDP=8;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.0121862;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=229.447;QD=5.14842;RBI=0.0121862;REFB=0.0132471;REVB=0;RO=6;SAF=2;SAR=0;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.054564;OID=.;OPOS=118773099;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:8:6:6:2:2:0:2:6:0:0:2:6:0 chr11 118828942 . A G 88.86 PASS AO=23;DP=54;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.00392578;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.944;QD=6.58201;RBI=0.00750214;REFB=-0.00148002;REVB=0.00639299;RO=31;SAF=9;SAR=14;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0625972;STB=0.535742;TYPE=snp;VARB=0.00186938;OID=.;OPOS=118828942;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:54:54:31:31:23:23:14:9:14:17:14:9:14:17 chr11 118842065 . T A 29.98 PASS AO=5;DP=15;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.0199137;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=69.418;QD=6.3119;RBI=0.048844;REFB=-0.00487819;REVB=0.0446002;RO=10;SAF=0;SAR=5;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.767621;STB=0.834892;TYPE=snp;VARB=0.0095879;OID=.;OPOS=118842065;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:15:19:10:11:5:8:5:0:7:3:7:1:7:4 chr11 118842845 . C T 10.39 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.0134811;FXX=0;HRUN=12;LEN=1;MLLD=173.637;QD=5.93533;RBI=0.0134811;REFB=-0.012149;REVB=0;RO=5;SAF=2;SAR=0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00604846;OID=.;OPOS=118842845;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:5:5:2:2:0:2:5:0:0:2:5:0 chr11 118842846 . C T 23.33 PASS AO=4;DP=7;FAO=4;FDP=7;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=0;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0108913;FXX=0;HRUN=12;LEN=1;MLLD=184.569;QD=13.3307;RBI=0.0108913;REFB=0.104786;REVB=0;RO=3;SAF=4;SAR=0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00299175;OID=.;OPOS=118842846;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:7:7:3:3:4:4:0:4:3:0:0:4:3:0 chr11 118850224 . GC G,GG 29.7 PASS AO=5,4;DP=24;FAO=7,4;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=5,3;FSAR=2,1;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.0378403,0.0821192;FXX=0;HRUN=6,6;LEN=1,1;MLLD=12.0044,22.8606;QD=4.75146;RBI=0.0624638,0.106435;REFB=0.00728701,-0.00218998;REVB=0.0496975,-0.0677114;RO=14;SAF=3,3;SAR=2,1;SRF=8;SRR=6;SSEN=0.627119,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0327935,0.220153;STB=0.605742,0.655416;TYPE=del,snp;VARB=-0.0765558,-8.31216e-05;OID=.,.;OPOS=118850225,118850225;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:5,4:23:7,4:25:14:5,3:2,1:8:6:16:14:3,3:2,1:8:6 chr11 118865319 . C G 238.68 PASS AO=83;DP=228;FAO=83;FDP=229;FR=.;FRO=146;FSAF=22;FSAR=61;FSRF=56;FSRR=90;FWDB=0.00829733;FXX=0.00434764;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.3984;QD=4.16906;RBI=0.0233099;REFB=-0.0310428;REVB=0.0217831;RO=144;SAF=22;SAR=61;SRF=55;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153005;STB=0.588839;TYPE=snp;VARB=0.0461275;OID=.;OPOS=118865319;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:228:229:144:146:83:83:61:22:55:89:61:22:56:90 chr11 118865465 . C T 173.72 PASS AO=46;DP=105;FAO=46;FDP=105;FR=.;FRO=59;FSAF=11;FSAR=35;FSRF=19;FSRR=40;FWDB=0.00157979;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=104.507;QD=6.6179;RBI=0.00747225;REFB=-0.0131241;REVB=0.00730334;RO=57;SAF=11;SAR=35;SRF=19;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118373;STB=0.559973;TYPE=snp;VARB=0.0153623;OID=.;OPOS=118865465;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:57:59:46:46:35:11:19:38:35:11:19:40 chr11 118898435 . AC A 425.61 PASS AO=54;DP=79;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0422052;FXX=0.0357079;HRUN=2;LEN=1;MLLD=28.6461;QD=31.5263;RBI=0.0942409;REFB=0;REVB=0.0842619;RO=0;SAF=22;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.64875e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00104355;OID=.;OPOS=118898436;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:54:56:54:54:0:22:32:0:0:38:0:22:32:0:0 chr11 118919206 . T C 700.9 PASS AO=73;DP=73;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0236422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.687;QD=37.8863;RBI=0.0628766;REFB=0;REVB=0.0582625;RO=0;SAF=39;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000521699;OID=.;OPOS=118919206;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:73:74:0:0:73:74:34:39:0:0:34:40:0:0 chr11 118940957 . C G 1206.04 PASS AO=124;DP=124;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0281586;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.901;QD=38.2871;RBI=0.0282629;REFB=0;REVB=0.0024251;RO=0;SAF=72;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.61425e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.72911e-05;OID=.;OPOS=118940957;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:124:126:0:0:124:126:52:72:0:0:54:72:0:0 chr11 118949331 . C T 1314.26 PASS AO=138;DP=140;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00419544;FXX=0.0142847;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.7525;QD=38.0945;RBI=0.0180806;REFB=-0.142055;REVB=0.0175871;RO=0;SAF=71;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0020024;OID=.;OPOS=118949331;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:140:138:0:0:138:138:67:71:0:0:67:71:0:0 chr11 118952173 . A G 291.67 PASS AO=35;DP=39;FAO=35;FDP=39;FR=.;FRO=4;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0196125;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.2074;QD=29.9147;RBI=0.0256824;REFB=-0.11741;REVB=-0.0165812;RO=4;SAF=22;SAR=13;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124093;STB=0.566628;TYPE=snp;VARB=0.0147274;OID=.;OPOS=118952173;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:39:39:4:4:35:35:13:22:0:4:13:22:0:4 chr11 118967758 . T C 278.26 PASS AO=63;DP=126;FAO=63;FDP=124;FR=.;FRO=61;FSAF=48;FSAR=15;FSRF=41;FSRR=20;FWDB=-0.0188617;FXX=0.0158718;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.499;QD=8.97608;RBI=0.0253753;REFB=-0.00618253;REVB=-0.0169748;RO=59;SAF=48;SAR=15;SRF=40;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0955899;STB=0.557195;TYPE=snp;VARB=0.0071538;OID=.;OPOS=118967758;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:124:59:61:63:63:15:48:40:19:15:48:41:20 chr11 119005088 . C T 1042.28 PASS AO=108;DP=108;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0680571;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.577;QD=37.9011;RBI=0.0732634;REFB=0;REVB=0.027125;RO=0;SAF=43;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.75032e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000370837;OID=.;OPOS=119005088;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:108:110:0:0:108:110:65:43:0:0:67:43:0:0 chr11 119005132 . C T 176.35 PASS AO=29;DP=50;FAO=34;FDP=60;FR=.;FRO=26;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=0.00348378;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=142.185;QD=11.7565;RBI=0.00684473;REFB=-0.00999834;REVB=0.00589182;RO=21;SAF=11;SAR=18;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118001;STB=0.537528;TYPE=snp;VARB=0.00682673;OID=.;OPOS=119005132;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:60:21:26:29:34:18:11:5:16:18:16:10:16 chr11 119031841 . G GC 160.82 PASS AO=20;DP=35;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.33052;FXX=0.0571265;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.2572;QD=19.4928;RBI=0.333268;REFB=0.0430462;REVB=0.0427109;RO=12;SAF=4;SAR=16;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.314755;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.0230866;OID=.;OPOS=119031842;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:20:35:33:33:0:12:21:0:0:12:12:4:16:7:5 chr11 119043656 . C T 177 PASS AO=43;DP=93;FAO=44;FDP=97;FR=.;FRO=53;FSAF=30;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=35;FWDB=0.0197156;FXX=0.0202;HRUN=3;LEN=1;MLLD=99.2982;QD=7.2991;RBI=0.0214046;REFB=0.00463199;REVB=0.00833373;RO=47;SAF=30;SAR=13;SRF=13;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.388742;STB=0.68619;TYPE=snp;VARB=-0.00445749;OID=.;OPOS=119043656;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:97:47:53:43:44:13:30:13:34:14:30:18:35 chr11 119052826 . C A 485.31 PASS AO=126;DP=278;FAO=128;FDP=279;FR=.;FRO=151;FSAF=47;FSAR=81;FSRF=59;FSRR=92;FWDB=0.0627908;FXX=0.0035713;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.8699;QD=6.95785;RBI=0.0732899;REFB=-0.0292176;REVB=0.0377986;RO=152;SAF=46;SAR=80;SRF=59;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0243974;STB=0.513607;TYPE=snp;VARB=0.0313196;OID=.;OPOS=119052826;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:278:279:152:151:126:128:80:46:59:93:81:47:59:92 chr11 119054488 . C T 119.2 PASS AO=44;DP=131;FAO=44;FDP=131;FR=.;FRO=87;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=38;FSRR=49;FWDB=0.0196681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.729;QD=3.63967;RBI=0.0212201;REFB=-0.00996027;REVB=0.00796605;RO=87;SAF=25;SAR=19;SRF=38;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150609;STB=0.586775;TYPE=snp;VARB=0.0204971;OID=.;OPOS=119054488;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:87:87:44:44:19:25:38:49:19:25:38:49 chr11 119059402 . CCG C,CCA 78.49 PASS AO=3,3;DP=17;FAO=3,7;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=3,7;FSAR=0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0310901,0.0180134;FXX=0.166528;HRUN=4,4;LEN=2,1;MLLD=11.4883,58.9932;QD=31.3969;RBI=0.0310901,0.0180134;REFB=0.0523426,0.0149636;REVB=0,0;RO=1;SAF=3,3;SAR=0,0;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.727144,0.727144;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.214081,-0.0509324;OID=.,.;OPOS=119059403,119059404;OREF=CG,G;OALT=-,A;OMAPALT=C,CCA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:3,3:9:3,7:10:0:3,7:0,0:0:0:15:1:3,3:0,0:0:1 chr11 119065709 . G C 99.48 PASS AO=17;DP=27;FAO=17;FDP=27;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=9;FWDB=-0.124201;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.8;QD=14.7384;RBI=0.12438;REFB=-0.0600752;REVB=0.00666601;RO=10;SAF=1;SAR=16;SRF=1;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108672;STB=0.561323;TYPE=snp;VARB=0.0324425;OID=.;OPOS=119065709;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:27:27:10:10:17:17:16:1:1:9:16:1:1:9 chr11 119148905 . C T 305.54 PASS AO=77;DP=161;FAO=75;FDP=159;FR=.;FRO=84;FSAF=49;FSAR=26;FSRF=38;FSRR=46;FWDB=-0.00737209;FXX=0.0124216;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.659;QD=7.68654;RBI=0.0742045;REFB=0.00337787;REVB=-0.0738374;RO=84;SAF=51;SAR=26;SRF=38;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204715;STB=0.609297;TYPE=snp;VARB=-0.00255433;OID=.;OPOS=119148905;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:159:84:84:77:75:26:51:38:46:26:49:38:46 chr11 119181170 . T C 137.26 PASS AO=28;DP=52;FAO=28;FDP=52;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.0408996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.261;QD=10.5584;RBI=0.0411458;REFB=-0.0167171;REVB=0.00449454;RO=24;SAF=8;SAR=20;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0866594;STB=0.548351;TYPE=snp;VARB=0.00565398;OID=.;OPOS=119181170;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:24:24:28:28:20:8:9:15:20:8:9:15 chr11 119183673 . AAG A,AA 40.75 PASS AO=8,6;DP=27;FAO=0,15;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=0,1;FSAR=0,14;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.0188458,0.0870562;FXX=0.0370233;HRUN=2,4;LEN=2,1;MLLD=20.3555,14.1768;QD=6.26939;RBI=0.166202,0.0889757;REFB=0.0436137,0.0125281;REVB=-0.16513,0.0183816;RO=11;SAF=0,0;SAR=8,6;SRF=8;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.810252,-0.78856;STB=0.5,0.860922;TYPE=del,del;VARB=0,0.00482238;OID=.,.;OPOS=119183674,119183675;OREF=AG,G;OALT=-,-;OMAPALT=A,AA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:8,6:26:0,15:26:11:0,1:0,14:7:4:32:11:0,0:8,6:8:3 chr11 119205830 . A G 383.97 PASS AO=115;DP=282;FAO=115;FDP=281;FR=.;FRO=166;FSAF=30;FSAR=85;FSRF=57;FSRR=109;FWDB=-0.0134307;FXX=0.00354597;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.407;QD=5.4657;RBI=0.0398671;REFB=-0.0140854;REVB=-0.0375367;RO=166;SAF=30;SAR=85;SRF=57;SRR=109;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106075;STB=0.559581;TYPE=snp;VARB=0.0143285;OID=.;OPOS=119205830;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:282:281:166:166:115:115:85:30:57:109:85:30:57:109 chr11 119206375 . G A 82.08 PASS AO=20;DP=46;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=2;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.0288569;FXX=0.0217344;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.113;QD=7.29601;RBI=0.034852;REFB=-0.000253627;REVB=0.0195434;RO=25;SAF=2;SAR=18;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.451832;STB=0.765625;TYPE=snp;VARB=0.00111941;OID=.;OPOS=119206375;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:46:45:25:25:20:20:18:2:10:15:18:2:10:15 chr11 119216231 . A G 857.01 PASS AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0158682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.688;QD=38.5173;RBI=0.0159818;REFB=0;REVB=0.00190253;RO=0;SAF=38;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.53019e-05;OID=.;OPOS=119216231;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:89:89:0:0:89:89:51:38:0:0:51:38:0:0 chr11 119216504 . C T 20.52 PASS AO=6;DP=21;FAO=6;FDP=21;FR=.;FRO=15;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=13;FWDB=-0.000208879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.986;QD=3.90776;RBI=0.00974059;REFB=-0.00346423;REVB=-0.00973835;RO=14;SAF=1;SAR=5;SRF=2;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0493816;STB=0.545312;TYPE=snp;VARB=0.0284926;OID=.;OPOS=119216504;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:21:21:14:15:6:6:5:1:2:12:5:1:2:13 chr11 119229964 . G A 1888.82 PASS AO=198;DP=199;FAO=198;FDP=198;FR=.;FRO=0;FSAF=99;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00864238;FXX=0.00502487;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.089;QD=38.158;RBI=0.0422804;REFB=-0.0517678;REVB=0.0413877;RO=0;SAF=99;SAR=99;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000170311;OID=.;OPOS=119229964;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:199:198:0:0:198:198:99:99:0:0:99:99:0:0 chr11 119244095 . C T 135.48 PASS AO=35;DP=83;FAO=35;FDP=80;FR=.;FRO=45;FSAF=25;FSAR=10;FSRF=34;FSRR=11;FWDB=0.0140111;FXX=0.0361402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.297;QD=6.77386;RBI=0.029141;REFB=0.00381179;REVB=0.0255516;RO=44;SAF=25;SAR=10;SRF=33;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.044332;STB=0.529132;TYPE=snp;VARB=-0.00718743;OID=.;OPOS=119244095;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:80:44:45:35:35:10:25:33:11:10:25:34:11 chr11 119252199 . T G 959.24 PASS AO=100;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0521085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.04;QD=37.9897;RBI=0.0556041;REFB=0;REVB=0.0194043;RO=0;SAF=54;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21299e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000120643;OID=.;OPOS=119252199;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:101:101:0:0:100:101:46:54:0:0:46:55:0:0 chr11 119290034 . G C 40.87 PASS AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=0;FSRF=15;FSRR=0;FWDB=0.00297255;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=210.456;QD=6.5394;RBI=0.00297255;REFB=0.0018231;REVB=0;RO=15;SAF=10;SAR=0;SRF=15;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00265209;OID=.;OPOS=119290034;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:25:25:15:15:10:10:0:10:15:0:0:10:15:0 chr11 119510644 . A C 2301.87 PASS AO=262;DP=266;FAO=256;FDP=265;FR=.;FRO=9;FSAF=116;FSAR=140;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.00680843;FXX=0.00375926;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7746;QD=34.7452;RBI=0.0456312;REFB=-0.0583529;REVB=-0.0451205;RO=3;SAF=118;SAR=144;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00255193;STB=0.504107;TYPE=snp;VARB=0.00356646;OID=.;OPOS=119510644;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:266:265:3:9:262:256:144:118:1:2:140:116:3:6 chr11 119879327 . C T 167.97 PASS AO=44;DP=104;FAO=45;FDP=103;FR=.;FRO=58;FSAF=29;FSAR=16;FSRF=37;FSRR=21;FWDB=-0.0157856;FXX=0.0190458;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.101;QD=6.52318;RBI=0.0405205;REFB=-0.0191781;REVB=-0.0373192;RO=55;SAF=29;SAR=15;SRF=34;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0443476;STB=0.503991;TYPE=snp;VARB=0.0167446;OID=.;OPOS=119879327;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:103:55:58:44:45:15:29:34:21:16:29:37:21 chr11 119879425 . T C 235.86 PASS AO=54;DP=113;FAO=56;FDP=115;FR=.;FRO=59;FSAF=20;FSAR=36;FSRF=24;FSRR=35;FWDB=-0.00775714;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.666;QD=8.20381;RBI=0.0468582;REFB=-0.0322698;REVB=0.0462117;RO=59;SAF=20;SAR=34;SRF=24;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0362987;STB=0.527287;TYPE=snp;VARB=0.0329738;OID=.;OPOS=119879425;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:115:59:59:54:56:34:20:24:35:36:20:24:35 chr11 119994148 . C T 57.72 PASS AO=19;DP=57;FAO=19;FDP=56;FR=.;FRO=37;FSAF=16;FSAR=3;FSRF=32;FSRR=5;FWDB=-0.00914128;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.603;QD=4.12302;RBI=0.0263239;REFB=-0.021733;REVB=0.0246858;RO=37;SAF=16;SAR=3;SRF=32;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0503322;STB=0.529382;TYPE=snp;VARB=0.0384402;OID=.;OPOS=119994148;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:57:56:37:37:19:19:3:16:32:5:3:16:32:5 chr11 119999191 . A G 199.89 PASS AO=57;DP=137;FAO=57;FDP=137;FR=.;FRO=80;FSAF=14;FSAR=43;FSRF=39;FSRR=41;FWDB=0.0110221;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.861;QD=5.83619;RBI=0.0118323;REFB=-0.01123;REVB=-0.00430305;RO=79;SAF=14;SAR=43;SRF=38;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.274506;STB=0.659564;TYPE=snp;VARB=0.0153943;OID=.;OPOS=119999191;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:79:80:57:57:43:14:38:41:43:14:39:41 chr11 120041110 . T A 170.57 PASS AO=44;DP=98;FAO=44;FDP=99;FR=.;FRO=55;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=27;FSRR=28;FWDB=-0.00389851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.995;QD=6.89157;RBI=0.00880687;REFB=-0.0153944;REVB=-0.00789699;RO=53;SAF=27;SAR=17;SRF=25;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140799;STB=0.569588;TYPE=snp;VARB=0.0168875;OID=.;OPOS=120041110;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:99:53:55:44:44:17:27:25:28:17:27:27:28 chr11 120041444 . C T 1518.21 PASS AO=157;DP=157;FAO=158;FDP=158;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.025188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.7956;QD=38.4356;RBI=0.0287205;REFB=0;REVB=0.0137996;RO=0;SAF=66;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.51302e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000133131;OID=.;OPOS=120041444;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:157:158:0:0:157:158:91:66:0:0:92:66:0:0 chr11 120041917 . C T 18.3 PASS AO=7;DP=29;FAO=7;FDP=29;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.0236686;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.69;QD=2.5247;RBI=0.0242449;REFB=-0.0125631;REVB=0.00525432;RO=22;SAF=6;SAR=1;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.385107;STB=0.758634;TYPE=snp;VARB=0.0347945;OID=.;OPOS=120041917;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:29:29:22:22:7:7:1:6:13:9:1:6:13:9 chr11 120099658 . A G 481.19 PASS AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00464816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.386;QD=37.7405;RBI=0.0694234;REFB=0;REVB=-0.0692676;RO=0;SAF=37;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00012367;OID=.;OPOS=120099658;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:51:51:0:0:51:51:14:37:0:0:14:37:0:0 chr11 120099679 . G A 543.52 PASS AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.472;QD=38.142;RBI=0.0504339;REFB=0;REVB=0.0477502;RO=0;SAF=39;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000152947;OID=.;OPOS=120099679;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:57:57:0:0:57:57:18:39:0:0:18:39:0:0 chr11 120100597 . G A 912.26 PASS AO=97;DP=97;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00912942;FXX=0.0206164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.306;QD=38.411;RBI=0.00932589;REFB=0;REVB=0.00190421;RO=0;SAF=46;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000329468;OID=.;OPOS=120100597;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:97:95:0:0:97:95:51:46:0:0:51:44:0:0 chr11 120107409 . AG A 499.21 PASS AO=24;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0601352;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=6.46147;QD=17.671;RBI=0.0895155;REFB=0;REVB=-0.0663083;RO=85;SAF=0;SAR=24;SRF=42;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.771946;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00129535;OID=.;OPOS=120107410;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:24:113:113:113:0:46:67:0:0:57:85:0:24:42:43 chr11 120107411 . G A 541.86 PASS AO=79;DP=118;FAO=87;FDP=120;FR=.;FRO=33;FSAF=43;FSAR=44;FSRF=3;FSRR=30;FWDB=0.0582764;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.9663;QD=18.0619;RBI=0.0582851;REFB=0.00101937;REVB=-0.00100993;RO=33;SAF=36;SAR=43;SRF=2;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.224182;STB=0.611194;TYPE=snp;VARB=0.000123005;OID=.;OPOS=120107411;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:118:120:33:33:79:87:43:36:2:31:44:43:3:30 chr11 120175749 . A G 1048.61 PASS AO=81;DP=109;FAO=114;FDP=114;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=45;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0472022;FXX=0.0655684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.5823;QD=36.7933;RBI=0.0473258;REFB=0;REVB=-0.00341884;RO=0;SAF=42;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000128259;OID=.;OPOS=120175749;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:106:114:0:0:81:114:39:42:0:0:69:45:0:0 chr11 120175750 . C G 61.64 PASS AO=24;DP=108;FAO=32;FDP=122;FR=.;FRO=90;FSAF=2;FSAR=30;FSRF=45;FSRR=45;FWDB=-0.00435848;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=99.63;QD=2.02082;RBI=0.0393613;REFB=-0.00938785;REVB=0.0391193;RO=84;SAF=1;SAR=23;SRF=44;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.695081;STB=0.903547;TYPE=snp;VARB=0.00394956;OID=.;OPOS=120175750;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:108:122:84:90:24:32:23:1:44:40:30:2:45:45 chr11 120292570 . T A 1326.52 PASS AO=130;DP=130;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0278252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.422;QD=38.1732;RBI=0.0382281;REFB=0;REVB=0.0262135;RO=0;SAF=39;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92762e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00047869;OID=.;OPOS=120292570;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:130:139:0:0:130:139:91:39:0:0:91:48:0:0 chr11 120336038 . GA G 35.11 PASS AO=45;DP=151;FAO=47;FDP=140;FR=.;FRO=93;FSAF=2;FSAR=45;FSRF=25;FSRR=68;FWDB=0.0413184;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.5541;QD=1.00328;RBI=0.103605;REFB=-0.0790926;REVB=-0.0950093;RO=85;SAF=1;SAR=44;SRF=25;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.680751;STB=0.842957;TYPE=del;VARB=0.0794314;OID=.;OPOS=120336039;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:45:140:47:140:93:2:45:25:68:35:85:1:44:25:60 chr11 120355230 . A G 1576.77 PASS AO=166;DP=168;FAO=166;FDP=166;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0178536;FXX=0.0119041;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.8451;QD=37.9945;RBI=0.0203465;REFB=-0.0414404;REVB=0.00975855;RO=0;SAF=81;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.06689e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.23644e-05;OID=.;OPOS=120355230;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:168:166:0:0:166:166:85:81:0:0:85:81:0:0 chr11 120356581 . G A 197.55 PASS AO=42;DP=81;FAO=42;FDP=80;FR=.;FRO=38;FSAF=32;FSAR=10;FSRF=29;FSRR=9;FWDB=-0.0116794;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.92;QD=9.87743;RBI=0.0250682;REFB=-0.0245944;REVB=0.0221812;RO=38;SAF=32;SAR=10;SRF=29;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00148503;STB=0.500821;TYPE=snp;VARB=0.0105207;OID=.;OPOS=120356581;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:80:38:38:42:42:10:32:29:9:10:32:29:9 chr11 120776000 . AG A,AA 713.07 PASS AO=26,47;DP=77;FAO=76,0;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=50,0;FSAR=26,0;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0438216,-0.0601473;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=205.808,194.34;QD=37.0426;RBI=0.0636589,0.0630698;REFB=-0.154482,-0.128307;REVB=0.046175,0.0189762;RO=1;SAF=6,43;SAR=20,4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0226687,0.103945;STB=0.509431,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.000583771,0.0711369;OID=.,.;OPOS=120776001,120776001;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:26,47:76:76,0:77:1:50,0:26,0:0:1:27:1:6,43:20,4:0:1 chr11 120827609 . A G 456.12 PASS AO=33;DP=51;FAO=48;FDP=48;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0225996;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=37.5374;QD=38.0095;RBI=0.16014;REFB=0;REVB=0.158537;RO=0;SAF=16;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.60901e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00345085;OID=.;OPOS=120827609;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:46:48:0:0:33:48:17:16:0:0:29:19:0:0 chr11 120989335 . A G 258.91 PASS AO=55;DP=106;FAO=56;FDP=106;FR=.;FRO=50;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=33;FSRR=17;FWDB=-0.0099952;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.873;QD=9.77001;RBI=0.0119717;REFB=-0.0201075;REVB=-0.00658925;RO=50;SAF=31;SAR=24;SRF=33;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0858675;STB=0.54316;TYPE=snp;VARB=0.0165177;OID=.;OPOS=120989335;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:50:50:55:56:24:31:33:17:24:32:33:17 chr11 120996292 . A G 167.33 PASS AO=40;DP=84;FAO=40;FDP=84;FR=.;FRO=44;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=27;FWDB=-0.0171812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.655;QD=7.9681;RBI=0.0178709;REFB=-0.0316948;REVB=-0.00491693;RO=44;SAF=19;SAR=21;SRF=17;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0839443;STB=0.54674;TYPE=snp;VARB=0.040131;OID=.;OPOS=120996292;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:44:44:40:40:21:19:17:27:21:19:17:27 chr11 121000784 . T C 173.77 PASS AO=43;DP=95;FAO=44;FDP=96;FR=.;FRO=52;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=18;FSRR=34;FWDB=-0.0499391;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0637;QD=7.24022;RBI=0.0510514;REFB=-0.0296368;REVB=-0.0105986;RO=52;SAF=16;SAR=27;SRF=18;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0273849;STB=0.510283;TYPE=snp;VARB=0.0388063;OID=.;OPOS=121000784;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:96:52:52:43:44:27:16:18:34:28:16:18:34 chr11 121016818 . G A 43.22 PASS AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=-0.0102535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.207;QD=11.5258;RBI=0.0345446;REFB=-0.0305541;REVB=0.0329878;RO=7;SAF=3;SAR=5;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211985;STB=0.622369;TYPE=snp;VARB=0.0366648;OID=.;OPOS=121016818;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:15:15:7:7:8:8:5:3:1:6:5:3:1:6 chr11 121032978 . G A 435.34 PASS AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0507464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.491;QD=37.8553;RBI=0.0507961;REFB=0;REVB=-0.00224643;RO=0;SAF=14;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000193752;OID=.;OPOS=121032978;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:46:46:0:0:46:46:32:14:0:0:32:14:0:0 chr11 121367626 . T C 2664.31 PASS AO=276;DP=276;FAO=277;FDP=277;FR=.;FRO=0;FSAF=115;FSAR=162;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00833624;FXX=0.00359699;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.901;QD=38.4738;RBI=0.0371379;REFB=0;REVB=0.0361902;RO=0;SAF=115;SAR=161;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.58655e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.06546e-06;OID=.;OPOS=121367626;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:276:277:0:0:276:277:161:115:0:0:162:115:0:0 chr11 121403229 . T C 2463.59 PASS AO=255;DP=255;FAO=257;FDP=257;FR=.;FRO=0;FSAF=129;FSAR=128;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144642;FXX=0.00772171;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.704;QD=38.3438;RBI=0.0144658;REFB=0;REVB=-0.000215158;RO=0;SAF=128;SAR=127;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.30289e-05;OID=.;OPOS=121403229;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:255:257:0:0:255:257:127:128:0:0:128:129:0:0 chr11 121437819 . C G 685.55 PASS AO=73;DP=78;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0361498;FXX=0.0632831;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.838;QD=37.0566;RBI=0.0368233;REFB=-0.0695287;REVB=0.00701062;RO=0;SAF=26;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.2476e-08;STB=0.505262;TYPE=snp;VARB=0.0001429;OID=.;OPOS=121437819;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:78:74:0:1:73:73:47:26:0:0:47:26:0:1 chr11 121456962 . C T 215.69 PASS AO=45;DP=83;FAO=45;FDP=83;FR=.;FRO=38;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=-0.0239167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.716;QD=10.3945;RBI=0.0284043;REFB=-0.0154919;REVB=-0.015323;RO=37;SAF=20;SAR=25;SRF=13;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0781294;STB=0.535504;TYPE=snp;VARB=0.016358;OID=.;OPOS=121456962;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:37:38:45:45:25:20:13:24:25:20:14:24 chr11 121475922 . T A 375.69 PASS AO=76;DP=134;FAO=76;FDP=134;FR=.;FRO=58;FSAF=37;FSAR=39;FSRF=30;FSRR=28;FWDB=0.00905279;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.734;QD=11.2146;RBI=0.0140459;REFB=-0.0188684;REVB=-0.0107394;RO=58;SAF=37;SAR=39;SRF=30;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0241236;STB=0.513154;TYPE=snp;VARB=0.0208584;OID=.;OPOS=121475922;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:58:58:76:76:39:37:30:28:39:37:30:28 chr11 121491782 . G A 1863.45 PASS AO=196;DP=198;FAO=197;FDP=197;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00869096;FXX=0.0198995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2516;QD=37.8365;RBI=0.0372376;REFB=0.0791929;REVB=-0.0362092;RO=1;SAF=94;SAR=102;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00464642;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000212215;OID=.;OPOS=121491782;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:198:197:1:0:196:197:102:94:0:1:105:92:0:0 chr11 122022927 . C T 149.48 PASS AO=51;DP=142;FAO=51;FDP=142;FR=.;FRO=91;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=53;FSRR=38;FWDB=0.00347442;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.331;QD=4.21082;RBI=0.00966862;REFB=-0.00981037;REVB=-0.00902279;RO=90;SAF=26;SAR=25;SRF=52;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0762537;STB=0.546619;TYPE=snp;VARB=0.0196402;OID=.;OPOS=122022927;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:90:91:51:51:25:26:52:38:25:26:53:38 chr11 122322268 . A C 580.08 PASS AO=130;DP=247;FAO=129;FDP=246;FR=.;FRO=117;FSAF=47;FSAR=82;FSRF=51;FSRR=66;FWDB=0.00971981;FXX=0.00806419;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3765;QD=9.43221;RBI=0.0224426;REFB=0.00108643;REVB=0.0202285;RO=116;SAF=49;SAR=81;SRF=51;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0567192;STB=0.536014;TYPE=snp;VARB=-0.000806134;OID=.;OPOS=122322268;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:247:246:116:117:130:129:81:49:51:65:82:47:51:66 chr11 122646967 . G A 197.44 PASS AO=36;DP=60;FAO=36;FDP=60;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=28;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.0476501;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.014;QD=13.1629;RBI=0.0587998;REFB=-0.00653702;REVB=0.0344511;RO=24;SAF=8;SAR=28;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108742;STB=0.559965;TYPE=snp;VARB=0.00563631;OID=.;OPOS=122646967;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:60:60:24:24:36:36:28:8:8:16:28:8:8:16 chr11 122680764 . CTT C 61.68 PASS AO=45;DP=161;FAO=48;FDP=154;FR=.;FRO=106;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=39;FSRR=67;FWDB=0.0109059;FXX=0.0128197;HRUN=2;LEN=2;MLLD=224.738;QD=1.60219;RBI=0.0149408;REFB=-0.000531408;REVB=-0.0102122;RO=92;SAF=16;SAR=29;SRF=39;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0839588;STB=0.510284;TYPE=del;VARB=0.000906598;OID=.;OPOS=122680765;OREF=TT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:45:147:48:154:106:17:31:39:67:61:92:16:29:39:53 chr11 122681254 . T C 56.33 PASS AO=8;DP=52;FAO=25;FDP=75;FR=.;FRO=50;FSAF=5;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=35;FWDB=0.0139505;FXX=0.0259707;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.517;QD=3.00403;RBI=0.0216189;REFB=-0.015871;REVB=0.0165154;RO=44;SAF=0;SAR=8;SRF=10;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.610305;STB=0.592512;TYPE=snp;VARB=0.0440605;OID=.;OPOS=122681254;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:52:75:44:50:8:25:8:0:10:34:20:5:15:35 chr11 122738261 . A G 342.65 PASS AO=61;DP=96;FAO=61;FDP=96;FR=.;FRO=35;FSAF=26;FSAR=35;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=0.0194995;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=240.933;QD=14.277;RBI=0.0195232;REFB=-0.00959948;REVB=-0.000961128;RO=35;SAF=26;SAR=35;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0180792;STB=0.509801;TYPE=snp;VARB=0.00540342;OID=.;OPOS=122738261;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:35:35:61:61:35:26:14:21:35:26:14:21 chr11 122742428 . T G 97.16 PASS AO=28;DP=71;FAO=29;FDP=78;FR=.;FRO=49;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=0.0643085;FXX=0.0370325;HRUN=6;LEN=1;MLLD=111.295;QD=4.98257;RBI=0.0656283;REFB=-0.0219565;REVB=-0.0130954;RO=43;SAF=7;SAR=21;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.279786;STB=0.621213;TYPE=snp;VARB=0.0276162;OID=.;OPOS=122742428;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:71:78:43:49:28:29:21:7:21:22:21:8:22:27 chr11 122929624 . A G 1689.49 PASS AO=183;DP=187;FAO=183;FDP=187;FR=.;FRO=4;FSAF=101;FSAR=82;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0161935;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=217.838;QD=36.1388;RBI=0.021515;REFB=-0.0538595;REVB=0.0141656;RO=3;SAF=101;SAR=82;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0139296;STB=0.509708;TYPE=snp;VARB=9.77979e-05;OID=.;OPOS=122929624;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:187:187:3:4:183:183:82:101:3:0:82:101:4:0 chr11 123065683 . C T 289.85 PASS AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0540277;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.1573;QD=37.4001;RBI=0.0652811;REFB=0;REVB=0.0366419;RO=0;SAF=10;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0017205;OID=.;OPOS=123065683;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:31:31:0:0:31:31:21:10:0:0:21:10:0:0 chr11 123596703 . A C 205.83 PASS AO=47;DP=94;FAO=47;FDP=94;FR=.;FRO=47;FSAF=33;FSAR=14;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=-0.0296438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.85;QD=8.75857;RBI=0.0300715;REFB=-0.00490524;REVB=-0.00505377;RO=47;SAF=33;SAR=14;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14925;STB=0.583002;TYPE=snp;VARB=0.00965504;OID=.;OPOS=123596703;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:47:47:47:47:14:33:26:21:14:33:26:21 chr11 123600475 . A G 1610.6 PASS AO=170;DP=171;FAO=171;FDP=171;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196527;FXX=0.00581362;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.664;QD=37.6749;RBI=0.0486157;REFB=-0.0753575;REVB=0.0444663;RO=1;SAF=88;SAR=82;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00537804;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000372231;OID=.;OPOS=123600475;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:171:171:1:0:170:171:82:88:1:0:83:88:0:0 chr11 123676368 . GCCCT GCCT,GCC 21.02 PASS AO=29,27;DP=124;FAO=34,0;FDP=123;FR=.;FRO=89;FSAF=7,0;FSAR=27,0;FSRF=37;FSRR=52;FWDB=0.127745,-0.000497459;FXX=0.0238076;HRUN=3,3;LEN=1,2;MLLD=10.919,70.0777;QD=0.683499;RBI=0.195196,0.0290188;REFB=-0.189231,-0.0201092;REVB=-0.147589,-0.0290146;RO=60;SAF=6,1;SAR=23,26;SRF=33;SRR=27;SSEN=0.252336,0.252336;SSEP=0,0;SSSB=-0.423475,-0.732576;STB=0.682248,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.184791,0.146924;OID=.,.;OPOS=123676369,123676371;OREF=C,CT;OALT=-,-;OMAPALT=GCCT,GCC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:29,27:125:34,0:123:89:7,0:27,0:37:52:20:60:6,1:23,26:33:27 chr11 123676388 . G A 175.48 PASS AO=51;DP=122;FAO=51;FDP=125;FR=.;FRO=74;FSAF=14;FSAR=37;FSRF=23;FSRR=51;FWDB=0.00704588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.592;QD=5.6154;RBI=0.00710453;REFB=-0.0192844;REVB=0.000910999;RO=71;SAF=14;SAR=37;SRF=23;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0620043;STB=0.526325;TYPE=snp;VARB=0.0245079;OID=.;OPOS=123676388;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:125:71:74:51:51:37:14:23:48:37:14:23:51 chr11 123753937 . A G 2077.9 PASS AO=216;DP=219;FAO=216;FDP=216;FR=.;FRO=0;FSAF=106;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0429557;FXX=0.013698;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.561;QD=38.4796;RBI=0.0561807;REFB=0;REVB=0.0362088;RO=0;SAF=106;SAR=110;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.63324e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000115078;OID=.;OPOS=123753937;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:219:216:0:0:216:216:110:106:0:0:110:106:0:0 chr11 123754844 . T C 1158.05 PASS AO=121;DP=125;FAO=125;FDP=128;FR=.;FRO=3;FSAF=61;FSAR=64;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0189223;FXX=0.00775134;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.942;QD=36.1891;RBI=0.0416206;REFB=-0.0495677;REVB=0.0370705;RO=3;SAF=61;SAR=60;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0227861;STB=0.511998;TYPE=snp;VARB=0.000138651;OID=.;OPOS=123754844;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:125:128:3:3:121:125:60:61:3:0:64:61:3:0 chr11 123777302 . T G 183.16 PASS AO=52;DP=129;FAO=53;FDP=130;FR=.;FRO=77;FSAF=13;FSAR=40;FSRF=24;FSRR=53;FWDB=0.017452;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.366;QD=5.63571;RBI=0.0214179;REFB=-0.00577932;REVB=0.0124159;RO=77;SAF=13;SAR=39;SRF=24;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0825682;STB=0.550371;TYPE=snp;VARB=0.00715878;OID=.;OPOS=123777302;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:130:77:77:52:53:39:13:24:53:40:13:24:53 chr11 123777412 . A G 167.33 PASS AO=40;DP=84;FAO=40;FDP=84;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=15;FSRR=29;FWDB=-0.0230854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.99;QD=7.96826;RBI=0.0265136;REFB=-0.00071335;REVB=-0.0130398;RO=43;SAF=16;SAR=24;SRF=15;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0501722;STB=0.532647;TYPE=snp;VARB=0.000491014;OID=.;OPOS=123777412;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:43:44:40:40:24:16:15:28:24:16:15:29 chr11 123777497 . G A 639.1 PASS AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0738193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.243;QD=38.155;RBI=0.112882;REFB=0;REVB=0.0854;RO=0;SAF=27;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000863837;OID=.;OPOS=123777497;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:67:67:0:0:67:67:40:27:0:0:40:27:0:0 chr11 123777536 . G A 158.1 PASS AO=40;DP=93;FAO=43;FDP=102;FR=.;FRO=59;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=25;FSRR=34;FWDB=-0.0215905;FXX=0.0097078;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.3506;QD=6.20003;RBI=0.0361272;REFB=0.000636475;REVB=0.0289659;RO=50;SAF=17;SAR=23;SRF=24;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0551433;STB=0.517037;TYPE=snp;VARB=-0.00308098;OID=.;OPOS=123777536;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:102:50:59:40:43:23:17:24:26:26:17:25:34 chr11 123777861 . T C 301.9 PASS AO=64;DP=139;FAO=75;FDP=160;FR=.;FRO=85;FSAF=44;FSAR=31;FSRF=40;FSRR=45;FWDB=-0.0136415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.118;QD=7.5476;RBI=0.0163169;REFB=-0.0229842;REVB=-0.00895278;RO=75;SAF=44;SAR=20;SRF=38;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187563;STB=0.562189;TYPE=snp;VARB=0.0250474;OID=.;OPOS=123777861;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:160:75:85:64:75:20:44:38:37:31:44:40:45 chr11 123777986 . T C 1351.09 PASS AO=131;DP=131;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.819;QD=38.6026;RBI=0.018041;REFB=0;REVB=-0.0110748;RO=0;SAF=53;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.78048e-06;OID=.;OPOS=123777986;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:131:140:0:0:131:140:78:53:0:0:85:55:0:0 chr11 123778031 . G A 145.12 PASS AO=42;DP=111;FAO=45;FDP=114;FR=.;FRO=69;FSAF=12;FSAR=33;FSRF=22;FSRR=47;FWDB=-0.0139561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.174;QD=5.09204;RBI=0.0141949;REFB=-0.00930957;REVB=0.00259282;RO=68;SAF=10;SAR=32;SRF=22;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117999;STB=0.538887;TYPE=snp;VARB=0.0127491;OID=.;OPOS=123778031;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:114:68:69:42:45:32:10:22:46:33:12:22:47 chr11 123778173 . T G 318.46 PASS AO=23;DP=39;FAO=36;FDP=37;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=9;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.256922;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=45.3092;QD=34.4285;RBI=0.260023;REFB=-0.0594323;REVB=-0.040041;RO=1;SAF=3;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0225969;STB=0.509086;TYPE=snp;VARB=0.00699604;OID=.;OPOS=123778173;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:37:37:1:1:23:36:20:3:0:1:27:9:0:1 chr11 123886307 . C T 303.35 PASS AO=79;DP=174;FAO=79;FDP=174;FR=.;FRO=95;FSAF=23;FSAR=56;FSRF=55;FSRR=40;FWDB=0.0342088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.2046;QD=6.97351;RBI=0.0450337;REFB=0.0108132;REVB=0.029288;RO=93;SAF=23;SAR=56;SRF=55;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.303595;STB=0.664191;TYPE=snp;VARB=-0.0127004;OID=.;OPOS=123886307;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:174:93:95:79:79:56:23:55:38:56:23:55:40 chr11 123886308 . A G 295.17 PASS AO=78;DP=173;FAO=78;FDP=174;FR=.;FRO=96;FSAF=23;FSAR=55;FSRF=55;FSRR=41;FWDB=0.0152852;FXX=0.00571396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.1289;QD=6.78539;RBI=0.0376884;REFB=-0.0434467;REVB=-0.0344496;RO=94;SAF=23;SAR=55;SRF=55;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.296038;STB=0.660161;TYPE=snp;VARB=0.0447407;OID=.;OPOS=123886308;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:174:94:96:78:78:55:23:55:39:55:23:55:41 chr11 123886681 . A G 319.22 PASS AO=77;DP=159;FAO=77;FDP=160;FR=.;FRO=83;FSAF=40;FSAR=37;FSRF=37;FSRR=46;FWDB=0.00496322;FXX=0.00621079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.806;QD=7.98044;RBI=0.021732;REFB=-0.0176047;REVB=-0.0211577;RO=82;SAF=40;SAR=37;SRF=37;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.063683;STB=0.538165;TYPE=snp;VARB=0.0151693;OID=.;OPOS=123886681;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:160:82:83:77:77:37:40:37:45:37:40:37:46 chr11 123886865 . T A 313.71 PASS AO=89;DP=215;FAO=90;FDP=214;FR=.;FRO=124;FSAF=42;FSAR=48;FSRF=43;FSRR=81;FWDB=0.035158;FXX=0.0183478;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.2206;QD=5.86379;RBI=0.0577494;REFB=-0.0272195;REVB=0.0458139;RO=121;SAF=41;SAR=48;SRF=41;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128375;STB=0.570421;TYPE=snp;VARB=0.0332592;OID=.;OPOS=123886865;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:214:121:124:89:90:48:41:41:80:48:42:43:81 chr11 123886984 . A G 214.91 PASS AO=58;DP=137;FAO=59;FDP=137;FR=.;FRO=78;FSAF=19;FSAR=40;FSRF=26;FSRR=52;FWDB=-0.00726294;FXX=0.00724585;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.643;QD=6.27469;RBI=0.027446;REFB=0.00219032;REVB=-0.0264675;RO=79;SAF=18;SAR=40;SRF=26;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0223103;STB=0.507326;TYPE=snp;VARB=-0.00279824;OID=.;OPOS=123886984;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:79:78:58:59:40:18:26:53:40:19:26:52 chr11 123887164 . A C 231.36 PASS AO=52;DP=104;FAO=53;FDP=106;FR=.;FRO=53;FSAF=13;FSAR=40;FSRF=11;FSRR=42;FWDB=0.0510719;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.583;QD=8.73055;RBI=0.0595329;REFB=-0.00235166;REVB=-0.0305912;RO=52;SAF=13;SAR=39;SRF=11;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0476946;STB=0.52615;TYPE=snp;VARB=0.00233362;OID=.;OPOS=123887164;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:106:52:53:52:53:39:13:11:41:40:13:11:42 chr11 123887184 . T G 203.61 PASS AO=45;DP=88;FAO=45;FDP=88;FR=.;FRO=43;FSAF=11;FSAR=34;FSRF=7;FSRR=36;FWDB=0.0227958;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.299;QD=9.25493;RBI=0.0242509;REFB=-0.00921187;REVB=-0.0082738;RO=42;SAF=11;SAR=34;SRF=6;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129876;STB=0.55714;TYPE=snp;VARB=0.00982919;OID=.;OPOS=123887184;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:42:43:45:45:34:11:6:36:34:11:7:36 chr11 123894136 . A G 404.43 PASS AO=44;DP=44;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0245373;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.921;QD=37.6212;RBI=0.0259293;REFB=0;REVB=0.00838126;RO=0;SAF=15;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000545009;OID=.;OPOS=123894136;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:44:43:0:0:44:43:29:15:0:0:29:14:0:0 chr11 123901175 . C A 231.2 PASS AO=72;DP=214;FAO=81;FDP=222;FR=.;FRO=141;FSAF=18;FSAR=63;FSRF=60;FSRR=81;FWDB=0.0245348;FXX=0.0133327;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.42;QD=4.16571;RBI=0.0259459;REFB=-0.00291242;REVB=0.00844;RO=141;SAF=10;SAR=62;SRF=60;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.430663;STB=0.654635;TYPE=snp;VARB=0.00610799;OID=.;OPOS=123901175;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:222:141:141:72:81:62:10:60:81:63:18:60:81 chr11 123909637 . G T 185.85 PASS AO=53;DP=128;FAO=53;FDP=128;FR=.;FRO=75;FSAF=45;FSAR=8;FSRF=48;FSRR=27;FWDB=0.00151885;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=234.883;QD=5.8078;RBI=0.051644;REFB=0.00030746;REVB=-0.0516216;RO=75;SAF=45;SAR=8;SRF=48;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.312835;STB=0.679093;TYPE=snp;VARB=-0.000351907;OID=.;OPOS=123909637;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:75:75:53:53:8:45:48:27:8:45:48:27 chr11 123909671 . G A 341.28 PASS AO=84;DP=176;FAO=84;FDP=176;FR=.;FRO=92;FSAF=50;FSAR=34;FSRF=41;FSRR=51;FWDB=0.0438258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.6866;QD=7.75645;RBI=0.0440551;REFB=-0.0349339;REVB=-0.00448891;RO=91;SAF=50;SAR=34;SRF=41;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137215;STB=0.578685;TYPE=snp;VARB=0.0445782;OID=.;OPOS=123909671;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:176:91:92:84:84:34:50:41:50:34:50:41:51 chr11 124006972 . G T 406.21 PASS AO=92;DP=182;FAO=93;FDP=183;FR=.;FRO=90;FSAF=41;FSAR=52;FSRF=40;FSRR=50;FWDB=-0.00913835;FXX=0.00543449;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.437;QD=8.87894;RBI=0.0168999;REFB=-0.0140054;REVB=0.0142161;RO=88;SAF=41;SAR=51;SRF=39;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00222717;STB=0.501787;TYPE=snp;VARB=0.012649;OID=.;OPOS=124006972;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:183:88:90:92:93:51:41:39:49:52:41:40:50 chr11 124006993 . G A 376.47 PASS AO=84;DP=164;FAO=87;FDP=172;FR=.;FRO=85;FSAF=37;FSAR=50;FSRF=37;FSRR=48;FWDB=0.0666088;FXX=0.0114936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.483;QD=8.75511;RBI=0.06922;REFB=-0.00737694;REVB=0.0188329;RO=79;SAF=37;SAR=47;SRF=37;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0248797;STB=0.505049;TYPE=snp;VARB=0.0078725;OID=.;OPOS=124006993;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:172:79:85:84:87:47:37:37:42:50:37:37:48 chr11 124007930 . A G 403.23 PASS AO=90;DP=175;FAO=90;FDP=173;FR=.;FRO=83;FSAF=34;FSAR=56;FSRF=20;FSRR=63;FWDB=0.0411574;FXX=0.0114279;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.824;QD=9.32316;RBI=0.0411669;REFB=-0.00674522;REVB=0.000885943;RO=82;SAF=34;SAR=56;SRF=20;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128715;STB=0.572262;TYPE=snp;VARB=0.00986508;OID=.;OPOS=124007930;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:173:82:83:90:90:56:34:20:62:56:34:20:63 chr11 124015994 . C T 1323.86 PASS AO=139;DP=140;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0467026;FXX=0.00714235;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.239;QD=38.0968;RBI=0.0480797;REFB=0.0304724;REVB=-0.0114246;RO=1;SAF=67;SAR=72;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00655795;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.48263e-05;OID=.;OPOS=124015994;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:140:139:1:0:139:139:72:67:0:1:72:67:0:0 chr11 124056377 . T C 462.25 PASS AO=106;DP=210;FAO=107;FDP=212;FR=.;FRO=105;FSAF=56;FSAR=51;FSRF=44;FSRR=61;FWDB=-0.024751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.9703;QD=8.72175;RBI=0.0332103;REFB=-0.00238573;REVB=-0.0221429;RO=103;SAF=56;SAR=50;SRF=44;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0906377;STB=0.55152;TYPE=snp;VARB=0.00271343;OID=.;OPOS=124056377;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:210:212:103:105:106:107:50:56:44:59:51:56:44:61 chr11 124056581 . A G 175.43 PASS AO=44;DP=95;FAO=44;FDP=96;FR=.;FRO=52;FSAF=13;FSAR=31;FSRF=20;FSRR=32;FWDB=-0.0435675;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.327;QD=7.30936;RBI=0.0436221;REFB=0.00255497;REVB=0.00218245;RO=51;SAF=13;SAR=31;SRF=20;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105857;STB=0.555349;TYPE=snp;VARB=-0.00217981;OID=.;OPOS=124056581;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:96:51:52:44:44:31:13:20:31:31:13:20:32 chr11 124056732 . T G 157.64 PASS AO=25;DP=86;FAO=25;FDP=79;FR=.,HEALED;FRO=40;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=0.0155916;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.7407;QD=7.98196;RBI=0.0611082;REFB=-0.00805029;REVB=0.0590857;RO=41;SAF=8;SAR=17;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215844;STB=0.603689;TYPE=snp;VARB=0.0503436;OID=.;OPOS=124056732;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:83:79:41:40:25:25:17:8:21:20:16:9:21:19 chr11 124056787 . G A 231.83 PASS AO=45;DP=77;FAO=45;FDP=78;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=31;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=0.00193413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.6655;QD=11.8886;RBI=0.0175696;REFB=-0.00883393;REVB=-0.0174629;RO=32;SAF=14;SAR=31;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0811593;STB=0.539634;TYPE=snp;VARB=0.00667504;OID=.;OPOS=124056787;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:78:32:33:45:45:31:14:13:19:31:14:13:20 chr11 124095414 . C G 823.89 PASS AO=191;DP=375;FAO=191;FDP=375;FR=.;FRO=184;FSAF=101;FSAR=90;FSRF=80;FSRR=104;FWDB=0.00675982;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.504;QD=8.7881;RBI=0.0206228;REFB=-0.00464847;REVB=0.0194835;RO=184;SAF=101;SAR=90;SRF=80;SRR=104;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0842208;STB=0.546032;TYPE=snp;VARB=0.00257424;OID=.;OPOS=124095414;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:375:375:184:184:191:191:90:101:80:104:90:101:80:104 chr11 124095525 . T C 566.47 PASS AO=108;DP=275;FAO=153;FDP=320;FR=.;FRO=167;FSAF=97;FSAR=56;FSRF=95;FSRR=72;FWDB=0.0210492;FXX=0.00311517;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.2329;QD=7.08092;RBI=0.0211082;REFB=-0.0185073;REVB=0.00157772;RO=164;SAF=52;SAR=56;SRF=94;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0983562;STB=0.535907;TYPE=snp;VARB=0.0258025;OID=.;OPOS=124095525;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:275:320:164:167:108:153:56:52:94:70:56:97:95:72 chr11 124095647 . A C 400.89 PASS AO=126;DP=323;FAO=128;FDP=326;FR=.;FRO=198;FSAF=48;FSAR=80;FSRF=94;FSRR=104;FWDB=0.0491482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.6493;QD=4.91891;RBI=0.0533746;REFB=-0.0463875;REVB=0.0208159;RO=196;SAF=48;SAR=78;SRF=93;SRR=103;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104353;STB=0.562589;TYPE=snp;VARB=0.0688677;OID=.;OPOS=124095647;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:323:326:196:198:126:128:78:48:93:103:80:48:94:104 chr11 124096122 . G A 134.29 PASS AO=58;DP=187;FAO=58;FDP=187;FR=.;FRO=129;FSAF=19;FSAR=39;FSRF=52;FSRR=77;FWDB=-0.00176114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.6354;QD=2.87257;RBI=0.0287785;REFB=-0.0115295;REVB=-0.0287246;RO=129;SAF=19;SAR=39;SRF=52;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0975176;STB=0.556787;TYPE=snp;VARB=0.0260287;OID=.;OPOS=124096122;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:187:129:129:58:58:39:19:52:77:39:19:52:77 chr11 124096195 . G A 146.93 PASS AO=43;DP=120;FAO=46;FDP=120;FR=.;FRO=74;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=24;FSRR=50;FWDB=0.0103654;FXX=0.00826378;HRUN=3;LEN=1;MLLD=81.9396;QD=4.89768;RBI=0.0106929;REFB=-0.00793634;REVB=-0.00262624;RO=74;SAF=19;SAR=24;SRF=24;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134943;STB=0.583299;TYPE=snp;VARB=0.026879;OID=.;OPOS=124096195;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:74:74:43:46:24:19:24:50:25:21:24:50 chr11 124096247 . G A 209.98 PASS AO=57;DP=131;FAO=57;FDP=132;FR=.;FRO=75;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=23;FSRR=52;FWDB=0.00361926;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=259.624;QD=6.36303;RBI=0.00370567;REFB=-0.00978225;REVB=0.00079561;RO=74;SAF=30;SAR=27;SRF=23;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216518;STB=0.623479;TYPE=snp;VARB=0.0105099;OID=.;OPOS=124096247;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:132:74:75:57:57:27:30:23:51:27:30:23:52 chr11 124179902 . G A 558.84 PASS AO=101;DP=217;FAO=118;FDP=215;FR=.;FRO=97;FSAF=63;FSAR=55;FSRF=45;FSRR=52;FWDB=0.0365461;FXX=0.00921617;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.5221;QD=10.397;RBI=0.0677627;REFB=0.006567;REVB=0.0570628;RO=116;SAF=46;SAR=55;SRF=64;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0929856;STB=0.531577;TYPE=snp;VARB=-0.00514273;OID=.;OPOS=124179902;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:217:215:116:97:101:118:55:46:64:52:55:63:45:52 chr11 124189306 . G A 1630.65 PASS AO=155;DP=165;FAO=190;FDP=195;FR=.;FRO=5;FSAF=82;FSAR=108;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.0109809;FXX=0.00510178;HRUN=5;LEN=1;MLLD=35.6159;QD=33.4491;RBI=0.0657452;REFB=-0.0953406;REVB=0.0648216;RO=10;SAF=75;SAR=80;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0211909;STB=0.511311;TYPE=snp;VARB=0.0233111;OID=.;OPOS=124189306;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:165:195:10:5:155:190:80:75:3:7:108:82:0:5 chr11 124189729 . C T 330.74 PASS AO=35;DP=37;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0293634;FXX=0.0540395;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.394;QD=37.7992;RBI=0.0318128;REFB=0;REVB=0.0122411;RO=0;SAF=26;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.79473e-05;OID=.;OPOS=124189729;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:37:35:0:0:35:35:9:26:0:0:9:26:0:0 chr11 124190137 . A G 1170.81 PASS AO=122;DP=122;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000868645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.409;QD=38.0751;RBI=0.0200961;REFB=0;REVB=0.0200773;RO=0;SAF=52;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.63761e-05;OID=.;OPOS=124190137;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:122:123:0:0:122:123:70:52:0:0:70:53:0:0 chr11 124252422 . G A 240.42 PASS AO=55;DP=114;FAO=57;FDP=116;FR=.;FRO=59;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=42;FSRR=17;FWDB=-0.000187897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.87;QD=8.2902;RBI=0.00142322;REFB=-0.00392288;REVB=-0.00141076;RO=58;SAF=30;SAR=25;SRF=41;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153776;STB=0.579184;TYPE=snp;VARB=0.0026478;OID=.;OPOS=124252422;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:116:58:59:55:57:25:30:41:17:25:32:42:17 chr11 124252718 . G A 190.72 PASS AO=39;DP=71;FAO=38;FDP=69;FR=.;FRO=31;FSAF=26;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=-0.0373927;FXX=0.028165;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.5877;QD=11.0565;RBI=0.0480098;REFB=-0.00348892;REVB=-0.0301118;RO=30;SAF=27;SAR=12;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0533281;STB=0.519989;TYPE=snp;VARB=0.0038873;OID=.;OPOS=124252718;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:69:30:31:39:38:12:27:19:11:12:26:20:11 chr11 124252750 . G A 174.53 PASS AO=33;DP=56;FAO=33;FDP=56;FR=.;FRO=23;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=-0.00957138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.106;QD=12.4665;RBI=0.0106001;REFB=-0.0293379;REVB=-0.00455532;RO=23;SAF=22;SAR=11;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0245608;STB=0.513505;TYPE=snp;VARB=0.0154412;OID=.;OPOS=124252750;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:56:56:23:23:33:33:11:22:16:7:11:22:16:7 chr11 124252892 . A G 126.42 PASS AO=48;DP=141;FAO=47;FDP=140;FR=.;FRO=93;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=40;FSRR=53;FWDB=0.027118;FXX=0.0070917;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2332;QD=3.61191;RBI=0.0556616;REFB=-0.0149274;REVB=0.048609;RO=93;SAF=22;SAR=26;SRF=39;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0452405;STB=0.511243;TYPE=snp;VARB=0.0312941;OID=.;OPOS=124252892;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:140:93:93:48:47:26:22:39:54:26:21:40:53 chr11 124253147 . A G 336.54 PASS AO=89;DP=197;FAO=90;FDP=202;FR=.;FRO=112;FSAF=20;FSAR=70;FSRF=47;FSRR=65;FWDB=0.0231409;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.5538;QD=6.66418;RBI=0.0481664;REFB=-0.0205349;REVB=-0.0422434;RO=108;SAF=20;SAR=69;SRF=47;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.250147;STB=0.634609;TYPE=snp;VARB=0.0229596;OID=.;OPOS=124253147;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:202:108:112:89:90:69:20:47:61:70:20:47:65 chr11 124253161 . G A 271.8 PASS AO=68;DP=160;FAO=78;FDP=183;FR=.;FRO=105;FSAF=17;FSAR=61;FSRF=39;FSRR=66;FWDB=-0.045464;FXX=0.00543449;HRUN=4;LEN=1;MLLD=38.7677;QD=5.94101;RBI=0.0660779;REFB=-0.0272953;REVB=-0.0479511;RO=92;SAF=17;SAR=51;SRF=38;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19714;STB=0.612704;TYPE=snp;VARB=0.0236208;OID=.;OPOS=124253161;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:183:92:105:68:78:51:17:38:54:61:17:39:66 chr11 124253170 . G A 287 PASS AO=77;DP=174;FAO=77;FDP=174;FR=.;FRO=97;FSAF=19;FSAR=58;FSRF=35;FSRR=62;FWDB=0.0139144;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.888;QD=6.5976;RBI=0.0163764;REFB=0.0032654;REVB=0.00863565;RO=97;SAF=19;SAR=58;SRF=35;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140547;STB=0.578692;TYPE=snp;VARB=-0.00501101;OID=.;OPOS=124253170;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:174:97:97:77:77:58:19:35:62:58:19:35:62 chr11 124253181 . T C 522.69 PASS AO=95;DP=154;FAO=96;FDP=154;FR=.;FRO=58;FSAF=25;FSAR=71;FSRF=20;FSRR=38;FWDB=0.0241963;FXX=0.0064512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.195;QD=13.5765;RBI=0.0244922;REFB=-0.0175328;REVB=-0.00379527;RO=57;SAF=25;SAR=70;SRF=20;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0752241;STB=0.539687;TYPE=snp;VARB=0.00911792;OID=.;OPOS=124253181;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:154:57:58:95:96:70:25:20:37:71:25:20:38 chr11 124266906 . C T 106.41 PASS AO=35;DP=97;FAO=35;FDP=97;FR=.;FRO=62;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=30;FSRR=32;FWDB=0.0031639;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.07;QD=4.38788;RBI=0.0210661;REFB=0.000385211;REVB=-0.0208272;RO=61;SAF=19;SAR=16;SRF=30;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0566152;STB=0.537714;TYPE=snp;VARB=-0.000987015;OID=.;OPOS=124266906;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:61:62:35:35:16:19:30:31:16:19:30:32 chr11 124266912 . A G 726.81 PASS AO=85;DP=94;FAO=86;FDP=93;FR=.;FRO=7;FSAF=46;FSAR=40;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.042617;FXX=0.0210504;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.218;QD=31.2606;RBI=0.0461066;REFB=-0.0791753;REVB=0.0175959;RO=6;SAF=46;SAR=39;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.015768;STB=0.502765;TYPE=snp;VARB=0.00355519;OID=.;OPOS=124266912;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:94:93:6:7:85:86:39:46:4:2:40:46:4:3 chr11 124267177 . T C 210.68 PASS AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0197608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.862;QD=36.6392;RBI=0.0347651;REFB=0;REVB=0.0286029;RO=0;SAF=6;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.9951e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.54188e-05;OID=.;OPOS=124267177;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:0:0:23:23:17:6:0:0:17:6:0:0 chr11 124267189 . T C 147.32 PASS AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0476262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.822;QD=36.8295;RBI=0.0477634;REFB=0;REVB=0.00361749;RO=0;SAF=4;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07465e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000569585;OID=.;OPOS=124267189;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:16:0:0:16:16:12:4:0:0:12:4:0:0 chr11 124294236 . A G 1004.88 PASS AO=107;DP=108;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0296175;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.722;QD=37.5657;RBI=0.0299625;REFB=-0.0660792;REVB=0.00453335;RO=1;SAF=51;SAR=56;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00840057;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.48543e-05;OID=.;OPOS=124294236;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:108:107:1:0:107:107:56:51:0:1:56:51:0:0 chr11 124294349 . C A 126 PASS AO=33;DP=74;FAO=33;FDP=76;FR=.;FRO=43;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=27;FWDB=0.00252108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.046;QD=6.63161;RBI=0.00733693;REFB=-0.0116061;REVB=-0.00689018;RO=41;SAF=12;SAR=21;SRF=16;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0280119;STB=0.505152;TYPE=snp;VARB=0.0150612;OID=.;OPOS=124294349;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:76:41:43:33:33:21:12:16:25:21:12:16:27 chr11 124294377 . A G 707.24 PASS AO=71;DP=71;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00938251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.297;QD=37.7194;RBI=0.0182865;REFB=0;REVB=0.015696;RO=0;SAF=36;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11607e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000714467;OID=.;OPOS=124294377;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:71:75:0:0:71:75:35:36:0:0:38:37:0:0 chr11 124310622 . A G 127.82 PASS AO=30;DP=66;FAO=31;FDP=67;FR=.;FRO=36;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=-0.0153535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.535;QD=7.63123;RBI=0.0205165;REFB=-0.00875266;REVB=-0.0136087;RO=35;SAF=20;SAR=10;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0403342;STB=0.519738;TYPE=snp;VARB=0.00795561;OID=.;OPOS=124310622;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:67:35:36:30:31:10:20:22:13:11:20:22:14 chr11 124440362 . C G 989.28 PASS AO=104;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0408073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.303;QD=38.0491;RBI=0.0453406;REFB=0;REVB=0.0197618;RO=0;SAF=52;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000155213;OID=.;OPOS=124440362;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:104:104:0:0:104:104:52:52:0:0:52:52:0:0 chr11 124440617 . C T 1716.87 PASS AO=167;DP=170;FAO=183;FDP=183;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=121;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300324;FXX=0.00543449;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.204;QD=37.5272;RBI=0.0330768;REFB=0;REVB=0.013861;RO=0;SAF=51;SAR=116;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.11556e-05;OID=.;OPOS=124440617;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:82:170:183:0:0:167:183:116:51:0:0:121:62:0:0 chr11 124615547 . G C 21.39 PASS AO=5;DP=13;FAO=5;FDP=13;FR=.;FRO=8;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=23.0682;QD=6.58175;RBI=0.000568892;REFB=-0.115675;REVB=0.000568892;RO=8;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.187837;OID=.;OPOS=124615547;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:13:13:8:8:5:5:5:0:0:8:5:0:0:8 chr11 124747837 . G A 75.69 PASS AO=20;DP=52;FAO=21;FDP=53;FR=.;FRO=32;FSAF=2;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=0.0143786;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=96.3552;QD=5.71279;RBI=0.0322785;REFB=-0.0162951;REVB=0.0288991;RO=31;SAF=2;SAR=18;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.535271;STB=0.81735;TYPE=snp;VARB=0.0244786;OID=.;OPOS=124747837;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:52:53:31:32:20:21:18:2:15:16:19:2:15:17 chr11 124789755 . T C 254.48 PASS AO=61;DP=129;FAO=61;FDP=127;FR=.;FRO=66;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=34;FSRR=32;FWDB=0.0167387;FXX=0.0155027;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.576;QD=8.015;RBI=0.0168013;REFB=0.0102236;REVB=-0.00144912;RO=62;SAF=27;SAR=34;SRF=33;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0819892;STB=0.537851;TYPE=snp;VARB=-0.00942231;OID=.;OPOS=124789755;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:127:62:66:61:61:34:27:33:29:34:27:34:32 chr11 124792627 . G A 693.94 PASS AO=132;DP=225;FAO=138;FDP=239;FR=.;FRO=101;FSAF=27;FSAR=111;FSRF=38;FSRR=63;FWDB=-0.0445461;FXX=0.00416649;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.8272;QD=11.6141;RBI=0.0445475;REFB=-0.0366401;REVB=-0.000358641;RO=93;SAF=27;SAR=105;SRF=38;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205898;STB=0.605624;TYPE=snp;VARB=0.0269286;OID=.;OPOS=124792627;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:225:239:93:101:132:138:105:27:38:55:111:27:38:63 chr11 124793682 . T C 90.61 PASS AO=26;DP=66;FAO=26;FDP=66;FR=.;FRO=40;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=0.00927212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.344;QD=5.49143;RBI=0.0118911;REFB=-0.0133816;REVB=-0.0074449;RO=40;SAF=12;SAR=14;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119544;STB=0.568393;TYPE=snp;VARB=0.0344415;OID=.;OPOS=124793682;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:66:66:40:40:26:26:14:12:23:17:14:12:23:17 chr11 124857708 . G A 763.13 PASS AO=77;DP=81;FAO=85;FDP=89;FR=.;FRO=4;FSAF=62;FSAR=23;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.000386344;FXX=0.0111099;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.786;QD=34.2981;RBI=0.004947;REFB=-0.0625605;REVB=0.00493189;RO=1;SAF=54;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0201293;STB=0.501173;TYPE=snp;VARB=0.00198412;OID=.;OPOS=124857708;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:81:89:1:4:77:85:23:54:0:1:23:62:3:1 chr11 124862514 . A G 507.47 PASS AO=56;DP=58;FAO=56;FDP=58;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.066545;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.5202;QD=34.9977;RBI=0.0693627;REFB=-0.0518519;REVB=-0.019569;RO=2;SAF=15;SAR=41;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0190384;STB=0.510105;TYPE=snp;VARB=0.00707608;OID=.;OPOS=124862514;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:58:58:2:2:56:56:41:15:1:1:41:15:1:1 chr11 124863136 . C A 1333.14 PASS AO=146;DP=154;FAO=146;FDP=150;FR=.;FRO=4;FSAF=67;FSAR=79;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.002443;FXX=0.0259723;HRUN=3;LEN=1;MLLD=134.744;QD=35.5503;RBI=0.0210648;REFB=-0.126779;REVB=0.0209227;RO=4;SAF=67;SAR=79;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0148341;STB=0.507804;TYPE=snp;VARB=0.0008628;OID=.;OPOS=124863136;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:154:150:4:4:146:146:79:67:3:1:79:67:3:1 chr11 124908352 . T C 922.54 PASS AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00349522;FXX=0.0204061;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.838;QD=38.4392;RBI=0.00504149;REFB=0;REVB=0.00363319;RO=0;SAF=43;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000187928;OID=.;OPOS=124908352;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:96:96:0:0:96:96:53:43:0:0:53:43:0:0 chr11 124947149 . G A 215.51 PASS AO=51;DP=106;FAO=51;FDP=105;FR=.;FRO=54;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=28;FSRR=26;FWDB=0.0166161;FXX=0.00943307;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.42;QD=8.20987;RBI=0.0180436;REFB=-0.0261711;REVB=0.00703399;RO=54;SAF=29;SAR=22;SRF=28;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0469857;STB=0.526067;TYPE=snp;VARB=0.0272337;OID=.;OPOS=124947149;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:105:54:54:51:51:22:29:28:26:22:29:28:26 chr11 124947396 . A G 844.54 PASS AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00810922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.142;QD=38.3881;RBI=0.0162747;REFB=0;REVB=-0.0141105;RO=0;SAF=35;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.51546e-05;OID=.;OPOS=124947396;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:88:88:0:0:88:88:53:35:0:0:53:35:0:0 chr11 124955032 . T C 135.41 PASS AO=12;DP=13;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0555438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.2999;QD=36.1084;RBI=0.21014;REFB=0;REVB=0.202667;RO=0;SAF=8;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00562557;OID=.;OPOS=124955032;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:13:15:0:0:12:15:4:8:0:0:6:9:0:0 chr11 124972208 . A G 330.9 PASS AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0230971;FXX=0.0263089;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.555;QD=35.7732;RBI=0.0235769;REFB=-0.0670249;REVB=0.00473246;RO=1;SAF=8;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0164281;STB=0.508767;TYPE=snp;VARB=0.000507822;OID=.;OPOS=124972208;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:37:37:1:1:36:36:28:8:0:1:28:8:0:1 chr11 124972518 . A G 1270.51 PASS AO=139;DP=144;FAO=141;FDP=145;FR=.;FRO=4;FSAF=88;FSAR=53;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0170687;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.183;QD=35.0486;RBI=0.0210452;REFB=-0.0262153;REVB=0.012311;RO=4;SAF=86;SAR=53;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00740901;STB=0.503642;TYPE=snp;VARB=0.00330634;OID=.;OPOS=124972518;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:144:145:4:4:139:141:53:86:3:1:53:88:2:2 chr11 124972522 . T C 1256.48 PASS AO=134;DP=142;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00524132;FXX=0.0753373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.312;QD=37.229;RBI=0.0227085;REFB=-0.004429;REVB=0.0220954;RO=2;SAF=82;SAR=52;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114519;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000120745;OID=.;OPOS=124972522;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:142:135:2:0:134:135:52:82:2:0:53:82:0:0 chr11 125009370 . C A 212.67 PASS AO=66;DP=157;FAO=65;FDP=159;FR=.;FRO=94;FSAF=30;FSAR=35;FSRF=42;FSRR=52;FWDB=0.0229559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.49;QD=5.35019;RBI=0.0239147;REFB=0.00282594;REVB=0.00670341;RO=91;SAF=31;SAR=35;SRF=40;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0313711;STB=0.508769;TYPE=snp;VARB=-0.00296855;OID=.;OPOS=125009370;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:159:91:94:66:65:35:31:40:51:35:30:42:52 chr11 125301587 . T C 203.1 PASS AO=48;DP=100;FAO=48;FDP=100;FR=.;FRO=52;FSAF=31;FSAR=17;FSRF=31;FSRR=21;FWDB=0.0128836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.387;QD=8.12405;RBI=0.0359568;REFB=-0.024807;REVB=-0.0335694;RO=52;SAF=31;SAR=17;SRF=31;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0499109;STB=0.527766;TYPE=snp;VARB=0.0258241;OID=.;OPOS=125301587;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:52:52:48:48:17:31:31:21:17:31:31:21 chr11 125443429 . T C 269.09 PASS AO=88;DP=245;FAO=93;FDP=253;FR=.;FRO=160;FSAF=31;FSAR=62;FSRF=58;FSRR=102;FWDB=-0.0085615;FXX=0.026922;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.417;QD=4.25439;RBI=0.0155661;REFB=-0.00163869;REVB=0.0130002;RO=144;SAF=29;SAR=59;SRF=56;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0716038;STB=0.520463;TYPE=snp;VARB=0.0027421;OID=.;OPOS=125443429;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:245:253:144:160:88:93:59:29:56:88:62:31:58:102 chr11 125443473 . A C 173.15 PASS AO=64;DP=177;FAO=64;FDP=186;FR=.;FRO=122;FSAF=16;FSAR=48;FSRF=41;FSRR=81;FWDB=0.0612826;FXX=0.00534731;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.017;QD=3.72358;RBI=0.062301;REFB=-0.0129256;REVB=0.0112187;RO=112;SAF=16;SAR=48;SRF=41;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1564;STB=0.569977;TYPE=snp;VARB=0.0365701;OID=.;OPOS=125443473;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:186:112:122:64:64:48:16:41:71:48:16:41:81 chr11 125452300 . A AC 762.54 PASS AO=104;DP=126;FAO=123;FDP=124;FR=.;FRO=1;FSAF=58;FSAR=65;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0727478;FXX=0.00799936;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.918;QD=24.5982;RBI=0.144956;REFB=-0.0100194;REVB=0.125379;RO=15;SAF=54;SAR=50;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0442056;STB=0.504273;TYPE=ins;VARB=0.00101559;OID=.;OPOS=125452301;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:104:126:123:124:1:58:65:1:0:55:15:54:50:5:10 chr11 125452313 . A G 253.27 PASS AO=64;DP=138;FAO=64;FDP=139;FR=.;FRO=75;FSAF=28;FSAR=36;FSRF=34;FSRR=41;FWDB=0.00102102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.971;QD=7.28844;RBI=0.0302968;REFB=-0.0139148;REVB=-0.0302796;RO=74;SAF=28;SAR=36;SRF=33;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0082738;STB=0.508657;TYPE=snp;VARB=0.012554;OID=.;OPOS=125452313;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:139:74:75:64:64:36:28:33:41:36:28:34:41 chr11 125454154 . A T 24.92 PASS AO=16;DP=42;FAO=13;FDP=39;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=25;FWDB=-0.0150783;FXX=0.0714116;HRUN=33;LEN=1;MLLD=82.4849;QD=2.55608;RBI=0.0917827;REFB=0.0216799;REVB=0.0905357;RO=25;SAF=5;SAR=11;SRF=1;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.406416;STB=0.774385;TYPE=snp;VARB=-0.0882056;OID=.;OPOS=125454154;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:42:39:25:26:16:13:11:5:1:24:8:5:1:25 chr11 125465862 . T C 164.95 PASS AO=53;DP=141;FAO=53;FDP=141;FR=.;FRO=88;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=40;FSRR=48;FWDB=0.0140091;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=192.75;QD=4.67957;RBI=0.0300099;REFB=-0.00333529;REVB=-0.0265394;RO=86;SAF=33;SAR=20;SRF=38;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198097;STB=0.605791;TYPE=snp;VARB=0.0056481;OID=.;OPOS=125465862;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:86:88:53:53:20:33:38:48:20:33:40:48 chr11 125476252 . C G 719.53 PASS AO=149;DP=267;FAO=149;FDP=266;FR=.;FRO=117;FSAF=55;FSAR=94;FSRF=59;FSRR=58;FWDB=0.026786;FXX=0.00374518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.486;QD=10.8201;RBI=0.0340224;REFB=-0.0218487;REVB=0.020977;RO=118;SAF=55;SAR=94;SRF=59;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110498;STB=0.561745;TYPE=snp;VARB=0.0173189;OID=.;OPOS=125476252;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:267:266:118:117:149:149:94:55:59:59:94:55:59:58 chr11 125479363 . G A 2504.98 PASS AO=261;DP=262;FAO=262;FDP=262;FR=.;FRO=0;FSAF=119;FSAR=143;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00841213;FXX=0.00757547;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.662;QD=38.244;RBI=0.0362063;REFB=0;REVB=-0.0352155;RO=0;SAF=119;SAR=142;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.02308e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.31547e-06;OID=.;OPOS=125479363;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:262:262:0:0:261:262:142:119:0:0:143:119:0:0 chr11 125479496 . C T 552.93 PASS AO=133;DP=276;FAO=134;FDP=275;FR=.;FRO=141;FSAF=62;FSAR=72;FSRF=63;FSRR=78;FWDB=0.00746234;FXX=0.010791;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.788;QD=8.04258;RBI=0.0152186;REFB=-0.0195098;REVB=-0.0132634;RO=137;SAF=62;SAR=71;SRF=61;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0194381;STB=0.508196;TYPE=snp;VARB=0.0163886;OID=.;OPOS=125479496;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:276:275:137:141:133:134:71:62:61:76:72:62:63:78 chr11 125488404 . C T 501.28 PASS AO=141;DP=319;FAO=141;FDP=326;FR=.;FRO=185;FSAF=68;FSAR=73;FSRF=84;FSRR=101;FWDB=0.0101694;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.059;QD=6.15073;RBI=0.0165694;REFB=-0.00930542;REVB=-0.0130816;RO=177;SAF=68;SAR=73;SRF=84;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00773938;STB=0.516048;TYPE=snp;VARB=0.0144994;OID=.;OPOS=125488404;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:319:326:177:185:141:141:73:68:84:93:73:68:84:101 chr11 125495740 . A G 94.7 PASS AO=29;DP=77;FAO=29;FDP=77;FR=.;FRO=48;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=-0.00571308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.796;QD=4.91967;RBI=0.0163399;REFB=-0.00589121;REVB=-0.0153086;RO=46;SAF=14;SAR=15;SRF=26;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0881836;STB=0.549564;TYPE=snp;VARB=0.0186245;OID=.;OPOS=125495740;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:77:77:46:48:29:29:15:14:26:20:15:14:27:21 chr11 125495746 . C G 92.95 PASS AO=28;DP=77;FAO=29;FDP=78;FR=.;FRO=49;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=28;FSRR=21;FWDB=-0.0196299;FXX=0.0249969;HRUN=3;LEN=1;MLLD=112.068;QD=4.76664;RBI=0.0240787;REFB=-0.00871507;REVB=0.0139446;RO=49;SAF=15;SAR=13;SRF=28;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0397543;STB=0.534138;TYPE=snp;VARB=0.0151175;OID=.;OPOS=125495746;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:77:78:49:49:28:29:13:15:28:21:14:15:28:21 chr11 125525195 . A G 3506.23 PASS AO=371;DP=376;FAO=372;FDP=372;FR=.;FRO=0;FSAF=166;FSAR=206;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00580769;FXX=0.010638;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.191;QD=37.7014;RBI=0.00969737;REFB=0.029831;REVB=-0.00776593;RO=0;SAF=166;SAR=205;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.7114e-05;OID=.;OPOS=125525195;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:376:372:0:0:371:372:205:166:0:0:206:166:0:0 chr11 125547869 . C T 371.54 PASS AO=86;DP=170;FAO=86;FDP=171;FR=.;FRO=85;FSAF=30;FSAR=56;FSRF=16;FSRR=69;FWDB=-0.00448326;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.427;QD=8.691;RBI=0.00694988;REFB=-0.029081;REVB=0.00531048;RO=76;SAF=30;SAR=56;SRF=16;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137075;STB=0.592772;TYPE=snp;VARB=0.0356756;OID=.;OPOS=125547869;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:171:76:85:86:86:56:30:16:60:56:30:16:69 chr11 125617610 . A G 188.79 PASS AO=48;DP=107;FAO=48;FDP=106;FR=.;FRO=58;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=34;FSRR=24;FWDB=0.00517757;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.276;QD=7.12411;RBI=0.0101546;REFB=-0.0146616;REVB=-0.00873548;RO=58;SAF=19;SAR=29;SRF=34;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18646;STB=0.604123;TYPE=snp;VARB=0.016719;OID=.;OPOS=125617610;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:106:58:58:48:48:29:19:34:24:29:19:34:24 chr11 125648503 . G A 321.71 PASS AO=74;DP=147;FAO=74;FDP=147;FR=.;FRO=73;FSAF=36;FSAR=38;FSRF=46;FSRR=27;FWDB=-0.023939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.533;QD=8.75392;RBI=0.0239952;REFB=-0.015427;REVB=-0.00164193;RO=72;SAF=36;SAR=38;SRF=46;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136338;STB=0.571095;TYPE=snp;VARB=0.0113927;OID=.;OPOS=125648503;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:147:72:73:74:74:38:36:46:26:38:36:46:27 chr11 125659371 . G A 291.53 PASS AO=98;DP=263;FAO=98;FDP=262;FR=.;FRO=164;FSAF=36;FSAR=62;FSRF=75;FSRR=89;FWDB=0.0373533;FXX=0.00380214;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.4938;QD=4.45078;RBI=0.0694236;REFB=0.00305023;REVB=0.0585181;RO=157;SAF=36;SAR=62;SRF=73;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110741;STB=0.558682;TYPE=snp;VARB=-0.00346798;OID=.;OPOS=125659371;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:263:262:157:164:98:98:62:36:73:84:62:36:75:89 chr11 125708198 . C T 217.73 PASS AO=49;DP=112;FAO=58;FDP=120;FR=.;FRO=62;FSAF=32;FSAR=26;FSRF=40;FSRR=22;FWDB=0.0547143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.078;QD=7.25778;RBI=0.0557645;REFB=-0.0174323;REVB=0.0107715;RO=60;SAF=26;SAR=23;SRF=40;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136224;STB=0.549279;TYPE=snp;VARB=0.0147108;OID=.;OPOS=125708198;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:120:60:62:49:58:23:26:40:20:26:32:40:22 chr11 125766044 . C A 236.03 PASS AO=75;DP=194;FAO=75;FDP=194;FR=.;FRO=119;FSAF=37;FSAR=38;FSRF=63;FSRR=56;FWDB=-0.00540617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.47;QD=4.8666;RBI=0.0065064;REFB=-0.0142331;REVB=0.00362029;RO=118;SAF=37;SAR=38;SRF=62;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0347828;STB=0.522116;TYPE=snp;VARB=0.0254469;OID=.;OPOS=125766044;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:194:118:119:75:75:38:37:62:56:38:37:63:56 chr11 125766173 . A C 142.36 PASS AO=47;DP=128;FAO=47;FDP=128;FR=.;FRO=81;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=43;FSRR=38;FWDB=-0.0152407;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.805;QD=4.44859;RBI=0.0160267;REFB=-0.0166065;REVB=0.00495742;RO=81;SAF=19;SAR=28;SRF=43;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141179;STB=0.580568;TYPE=snp;VARB=0.0319185;OID=.;OPOS=125766173;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:81:81:47:47:28:19:43:38:28:19:43:38 chr11 125770270 . G A 222.15 PASS AO=49;DP=95;FAO=49;FDP=95;FR=.;FRO=46;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=20;FSRR=26;FWDB=0.00164798;FXX=0.0104156;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.049;QD=9.35384;RBI=0.00343942;REFB=-0.00999702;REVB=0.0030189;RO=46;SAF=20;SAR=29;SRF=20;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0240235;STB=0.513269;TYPE=snp;VARB=0.0108406;OID=.;OPOS=125770270;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:46:46:49:49:29:20:20:26:29:20:20:26 chr11 125830697 . T C 1476.37 PASS AO=161;DP=163;FAO=160;FDP=163;FR=.;FRO=3;FSAF=87;FSAR=73;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0413664;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2463;QD=36.23;RBI=0.0435115;REFB=0.0994463;REVB=-0.0134933;RO=2;SAF=88;SAR=73;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106904;STB=0.508474;TYPE=snp;VARB=-0.00477516;OID=.;OPOS=125830697;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:163:163:2:3:161:160:73:88:2:0:73:87:3:0 chr11 125830970 . A T 1397.13 PASS AO=145;DP=145;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0259281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.38;QD=38.2776;RBI=0.0264874;REFB=0;REVB=0.00541446;RO=0;SAF=62;SAR=83;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.4102e-05;OID=.;OPOS=125830970;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:145:146:0:0:145:146:83:62:0:0:83:63:0:0 chr11 125831701 . G A 1451.29 PASS AO=155;DP=156;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0105868;FXX=0.0128197;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.6716;QD=37.6959;RBI=0.0314826;REFB=-0.0602825;REVB=-0.0296492;RO=1;SAF=88;SAR=67;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00704753;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000587102;OID=.;OPOS=125831701;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:156:154:1:0:155:154:67:88:0:1:68:86:0:0 chr11 125848261 . C T 769.12 PASS AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00401837;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.835;QD=37.9811;RBI=0.0262013;REFB=0;REVB=-0.0258913;RO=0;SAF=37;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.84101e-05;OID=.;OPOS=125848261;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:81:81:0:0:81:81:44:37:0:0:44:37:0:0 chr11 125891269 . C T 2060.64 PASS AO=217;DP=220;FAO=218;FDP=218;FR=.;FRO=0;FSAF=128;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0050321;FXX=0.0090905;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.713;QD=37.8099;RBI=0.00764417;REFB=-0.0889546;REVB=-0.00575424;RO=0;SAF=127;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.70653e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.05681e-05;OID=.;OPOS=125891269;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:220:218:0:0:217:218:90:127:0:0:90:128:0:0 chr11 126133805 . GC G 1041.95 PASS AO=140;DP=160;FAO=156;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=118;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0605411;FXX=0.00636902;HRUN=2;LEN=1;MLLD=16.8738;QD=26.7168;RBI=0.239981;REFB=-0.0145116;REVB=0.232219;RO=13;SAF=108;SAR=32;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0515317;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00522433;OID=.;OPOS=126133806;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:140:156:156:156:0:118:38:0:0:83:13:108:32:7:6 chr11 126294817 . G A 79.97 PASS AO=14;DP=23;FAO=14;FDP=23;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.0109355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.827;QD=13.9087;RBI=0.0483838;REFB=-0.0221761;REVB=0.0471318;RO=8;SAF=3;SAR=11;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230493;STB=0.6614;TYPE=snp;VARB=0.0296317;OID=.;OPOS=126294817;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:23:23:8:9:14:14:11:3:4:4:11:3:5:4 chr11 126310082 . A T 656.69 PASS AO=72;DP=72;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0267811;FXX=0.0273935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.297;QD=36.9965;RBI=0.0373899;REFB=0;REVB=-0.0260917;RO=0;SAF=34;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000682146;OID=.;OPOS=126310082;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:72:71:0:0:72:71:38:34:0:0:39:32:0:0 chr11 126858392 . A G 89.09 PASS AO=25;DP=67;FAO=26;FDP=67;FR=.;FRO=41;FSAF=22;FSAR=4;FSRF=26;FSRR=15;FWDB=-0.00881747;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0457;QD=5.31876;RBI=0.0582567;REFB=0.000203965;REVB=0.0575856;RO=42;SAF=21;SAR=4;SRF=27;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.297493;STB=0.685081;TYPE=snp;VARB=0.000874847;OID=.;OPOS=126858392;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:67:67:42:41:25:26:4:21:27:15:4:22:26:15 chr11 126858406 . A T 79.51 PASS AO=22;DP=55;FAO=22;FDP=55;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=4;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=-0.00557804;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=200.655;QD=5.78287;RBI=0.00855383;REFB=-0.0009739;REVB=-0.00648487;RO=33;SAF=18;SAR=4;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.287571;STB=0.66795;TYPE=snp;VARB=0.0010974;OID=.;OPOS=126858406;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:55:55:33:33:22:22:4:18:20:13:4:18:20:13 chr11 126968472 . C T 951.94 PASS AO=209;DP=402;FAO=211;FDP=400;FR=.;FRO=189;FSAF=120;FSAR=91;FSRF=97;FSRR=92;FWDB=0.0674978;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.2927;QD=9.51937;RBI=0.0689721;REFB=0.0241935;REVB=-0.0141842;RO=193;SAF=118;SAR=91;SRF=98;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0504615;STB=0.526528;TYPE=snp;VARB=-0.0198218;OID=.;OPOS=126968472;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:402:400:193:189:209:211:91:118:98:95:91:120:97:92 chr11 128328913 . G A 189.74 PASS AO=60;DP=153;FAO=59;FDP=152;FR=.;FRO=93;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=33;FSRR=60;FWDB=-0.0665523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.0303;QD=4.99309;RBI=0.067205;REFB=-0.000244848;REVB=-0.00934297;RO=93;SAF=25;SAR=35;SRF=33;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0694901;STB=0.543715;TYPE=snp;VARB=4.06831e-05;OID=.;OPOS=128328913;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:152:93:93:60:59:35:25:33:60:34:25:33:60 chr11 128333503 . T C 558.63 PASS AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0806424;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.2668;QD=38.5264;RBI=0.0872763;REFB=0;REVB=-0.0333759;RO=0;SAF=18;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000615549;OID=.;OPOS=128333503;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:59:58:0:0:58:58:40:18:0:0:40:18:0:0 chr11 128638216 . TGG TG,T 707.11 PASS AO=86,23;DP=145;FAO=118,14;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=56,4;FSAR=62,10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.033151,-0.0151187;FXX=0.0294096;HRUN=7,7;LEN=1,2;MLLD=11.6331,11.7807;QD=21.4275;RBI=0.234327,0.127774;REFB=0.00376526,0.00614431;REVB=0.23197,0.126877;RO=18;SAF=41,9;SAR=45,14;SRF=6;SRR=12;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0468612,0.0485328;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=-0.0200018,0.014358;OID=.,.;OPOS=128638217,128638217;OREF=G,GG;OALT=-,-;OMAPALT=TG,T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:86,23:133:118,14:132:0:56,4:62,10:0:0:4:18:41,9:45,14:6:12 chr11 128651893 . A G 395.97 PASS AO=95;DP=200;FAO=96;FDP=198;FR=.;FRO=102;FSAF=28;FSAR=68;FSRF=23;FSRR=79;FWDB=-0.014638;FXX=0.0099995;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.287;QD=7.99933;RBI=0.0150275;REFB=-0.000291041;REVB=0.00339908;RO=101;SAF=28;SAR=67;SRF=23;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.078309;STB=0.542713;TYPE=snp;VARB=0.000565237;OID=.;OPOS=128651893;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:200:198:101:102:95:96:67:28:23:78:68:28:23:79 chr11 128675292 . T A 359.45 PASS AO=101;DP=235;FAO=101;FDP=235;FR=.;FRO=134;FSAF=55;FSAR=46;FSRF=73;FSRR=61;FWDB=-0.00506618;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.297;QD=6.11831;RBI=0.00823829;REFB=-0.0125271;REVB=-0.0064964;RO=134;SAF=55;SAR=46;SRF=73;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000228788;STB=0.500127;TYPE=snp;VARB=0.0176759;OID=.;OPOS=128675292;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:235:235:134:134:101:101:46:55:73:61:46:55:73:61 chr11 128708009 . G A 208.76 PASS AO=59;DP=139;FAO=59;FDP=140;FR=.;FRO=81;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=27;FSRR=54;FWDB=0.0106817;FXX=0.0070917;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.246;QD=5.96457;RBI=0.0297216;REFB=-0.01047;REVB=-0.0277358;RO=78;SAF=25;SAR=34;SRF=27;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0821172;STB=0.554418;TYPE=snp;VARB=0.0123887;OID=.;OPOS=128708009;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:140:78:81:59:59:34:25:27:51:34:25:27:54 chr11 128782012 . C G 1485.61 PASS AO=155;DP=156;FAO=156;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00563269;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.8863;QD=38.0925;RBI=0.0192584;REFB=0;REVB=-0.0184162;RO=0;SAF=94;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.67899e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.40628e-05;OID=.;OPOS=128782012;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:156:156:0:0:155:156:61:94:0:0:61:95:0:0 chr11 128805548 . G A 141.06 PASS AO=41;DP=102;FAO=41;FDP=102;FR=.;FRO=61;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=39;FWDB=-0.00448264;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.4343;QD=5.5318;RBI=0.0114617;REFB=-0.0138076;REVB=0.0105488;RO=56;SAF=22;SAR=19;SRF=20;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182572;STB=0.604117;TYPE=snp;VARB=0.0539687;OID=.;OPOS=128805548;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:56:61:41:41:19:22:20:36:19:22:22:39 chr11 128805557 . T C 194.36 PASS AO=48;DP=106;FAO=49;FDP=107;FR=.;FRO=58;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=18;FSRR=40;FWDB=-0.0299657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.989;QD=7.26564;RBI=0.0300654;REFB=-0.0196405;REVB=-0.00244719;RO=57;SAF=24;SAR=24;SRF=18;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179904;STB=0.607861;TYPE=snp;VARB=0.0202314;OID=.;OPOS=128805557;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:107:57:58:48:49:24:24:18:39:24:25:18:40 chr11 128842873 . T C 348.47 PASS AO=88;DP=189;FAO=88;FDP=189;FR=.;FRO=101;FSAF=62;FSAR=26;FSRF=62;FSRR=39;FWDB=-0.00361904;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=291.603;QD=7.37509;RBI=0.0141049;REFB=0.00546335;REVB=-0.0136327;RO=101;SAF=62;SAR=26;SRF=62;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100043;STB=0.555543;TYPE=snp;VARB=-0.00546494;OID=.;OPOS=128842873;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:189:101:101:88:88:26:62:62:39:26:62:62:39 chr11 128868239 . T C 354.64 PASS AO=103;DP=246;FAO=103;FDP=246;FR=.;FRO=143;FSAF=59;FSAR=44;FSRF=74;FSRR=69;FWDB=0.00152888;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.807;QD=5.76645;RBI=0.00791167;REFB=-0.00752057;REVB=0.00776255;RO=143;SAF=59;SAR=44;SRF=74;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0582746;STB=0.532544;TYPE=snp;VARB=0.020961;OID=.;OPOS=128868239;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:246:246:143:143:103:103:44:59:74:69:44:59:74:69 chr11 129072915 . C G 158.87 PASS AO=40;DP=84;FAO=39;FDP=84;FR=.;FRO=45;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=28;FSRR=17;FWDB=0.0237667;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.5899;QD=7.56511;RBI=0.0237786;REFB=0.0200329;REVB=0.000753011;RO=43;SAF=20;SAR=20;SRF=26;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0974081;STB=0.572088;TYPE=snp;VARB=-0.0305144;OID=.;OPOS=129072915;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:43:45:40:39:20:20:26:17:20:19:28:17 chr11 129312660 . C T 1108.71 PASS AO=116;DP=116;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0911168;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.6756;QD=38.2312;RBI=0.0913736;REFB=0;REVB=0.0068463;RO=0;SAF=55;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.12874e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000572542;OID=.;OPOS=129312660;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:116:116:0:0:116:116:61:55:0:0:61:55:0:0 chr11 129321066 . C T 420.61 PASS AO=46;DP=50;FAO=47;FDP=49;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0242817;FXX=0.019996;HRUN=3;LEN=1;MLLD=128.555;QD=34.3356;RBI=0.0245595;REFB=-0.108412;REVB=0.00368347;RO=2;SAF=36;SAR=10;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.025408;STB=0.513508;TYPE=snp;VARB=0.000866168;OID=.;OPOS=129321066;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:50:49:2:2:46:47:10:36:2:0:11:36:2:0 chr11 129321818 . T G 113.66 PASS AO=10;DP=10;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0284951;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.573;QD=34.9725;RBI=0.0647238;REFB=0;REVB=0.0581137;RO=0;SAF=8;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00108668;OID=.;OPOS=129321818;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:10:13:0:0:10:13:2:8:0:0:4:9:0:0 chr11 129744042 . A AC,AAC 55.38 PASS AO=3,4;DP=15;FAO=5,3;FDP=10;FR=.;FRO=2;FSAF=5,3;FSAR=0,0;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0290997,0.0261383;FXX=0;HRUN=0,2;LEN=1,2;MLLD=56.7122,50.5601;QD=22.151;RBI=0.0290997,0.0261383;REFB=-0.0579112,-0.0620908;REVB=0,0;RO=8;SAF=3,4;SAR=0,0;SRF=8;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=ins,ins;VARB=0.258646,0.259147;OID=.,.;OPOS=129744043,129744043;OREF=-,-;OALT=C,AC;OMAPALT=AC,AAC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:3,4:15:5,3:10:2:5,3:0,0:2:0:11:8:3,4:0,0:8:0 chr11 130068491 . G C 19.11 PASS AO=7;DP=28;FAO=7;FDP=28;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=18;FWDB=0.0166557;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=97.7572;QD=2.7297;RBI=0.0323401;REFB=0.000709275;REVB=-0.0277213;RO=20;SAF=4;SAR=3;SRF=3;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.484568;STB=0.799399;TYPE=snp;VARB=-0.00177093;OID=.;OPOS=130068491;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:28:28:20:21:7:7:3:4:3:17:3:4:3:18 chr11 130180238 . G C 588.89 PASS AO=97;DP=140;FAO=97;FDP=141;FR=.;FRO=44;FSAF=17;FSAR=80;FSRF=12;FSRR=32;FWDB=-0.0942917;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.767;QD=16.7061;RBI=0.0943014;REFB=0.0347462;REVB=-0.00134809;RO=42;SAF=17;SAR=80;SRF=10;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0585223;STB=0.549232;TYPE=snp;VARB=-0.0157807;OID=.;OPOS=130180238;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:141:42:44:97:97:80:17:10:32:80:17:12:32 chr11 130281488 . G A 160.23 PASS AO=33;DP=62;FAO=34;FDP=63;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=25;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.0411696;FXX=0.0454477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.112;QD=10.1734;RBI=0.0423526;REFB=-0.0214457;REVB=0.00993998;RO=29;SAF=8;SAR=25;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236433;STB=0.614901;TYPE=snp;VARB=0.0134081;OID=.;OPOS=130281488;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:63:29:29:33:34:25:8:14:15:25:9:14:15 chr11 130332615 . C T 16.44 PASS AO=6;DP=25;FAO=6;FDP=25;FR=.;FRO=19;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=15;FWDB=-0.0284317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3081;QD=2.6305;RBI=0.0284318;REFB=-0.0280625;REVB=9.52942e-05;RO=19;SAF=1;SAR=5;SRF=4;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0829805;STB=0.555358;TYPE=snp;VARB=0.118205;OID=.;OPOS=130332615;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:25:25:19:19:6:6:5:1:4:15:5:1:4:15 chr11 130339312 . T C 111.98 PASS AO=15;DP=18;FAO=15;FDP=19;FR=.;FRO=4;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0227708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.778;QD=23.5751;RBI=0.0324701;REFB=-0.045098;REVB=0.0231473;RO=3;SAF=6;SAR=9;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.021064;STB=0.53329;TYPE=snp;VARB=0.0109972;OID=.;OPOS=130339312;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:18:19:3:4:15:15:9:6:1:2:9:6:1:3 chr11 130340906 . GCCCAAG GCCAAG,GCCCAAA 717.94 PASS AO=53,73;DP=194;FAO=47,89;FDP=183;FR=.;FRO=47;FSAF=46,50;FSAR=1,39;FSRF=12;FSRR=35;FWDB=-0.186056,0.0388728;FXX=0.0265943;HRUN=3,1;LEN=1,1;MLLD=14.4787,57.3583;QD=15.6927;RBI=0.187304,0.0392342;REFB=-0.157825,-0.0192608;REVB=-0.0215806,-0.00531321;RO=36;SAF=50,38;SAR=3,35;SRF=5;SRR=31;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.741892,0.232535;STB=0.965919,0.60475;TYPE=del,snp;VARB=0.0683933,0.023255;OID=.,.;OPOS=130340907,130340912;OREF=C,G;OALT=-,A;OMAPALT=GCCAAG,GCCCAAA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:53,73:177:47,89:183:47:46,50:1,39:12:35:99:36:50,38:3,35:5:31 chr11 130750642 . A C 1085.58 PASS AO=110;DP=110;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000861871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.432;QD=38.0906;RBI=0.0157286;REFB=0;REVB=-0.0157049;RO=0;SAF=36;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.10006e-05;OID=.;OPOS=130750642;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:110:114:0:0:110:114:74:36:0:0:77:37:0:0 chr11 130775688 . C T 224.33 PASS AO=54;DP=120;FAO=57;FDP=123;FR=.;FRO=66;FSAF=24;FSAR=33;FSRF=26;FSRR=40;FWDB=0.00540319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.937;QD=7.29541;RBI=0.0106693;REFB=-0.0210136;REVB=0.00919994;RO=66;SAF=21;SAR=33;SRF=26;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00522882;STB=0.514986;TYPE=snp;VARB=0.024546;OID=.;OPOS=130775688;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:123:66:66:54:57:33:21:26:40:33:24:26:40 chr11 130775782 . C T 208.35 PASS AO=62;DP=153;FAO=62;FDP=155;FR=.;FRO=93;FSAF=20;FSAR=42;FSRF=32;FSRR=61;FWDB=0.00164415;FXX=0.0490767;HRUN=4;LEN=1;MLLD=238.747;QD=5.37675;RBI=0.00782855;REFB=-0.0164848;REVB=0.00765395;RO=89;SAF=20;SAR=42;SRF=29;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00390759;STB=0.514604;TYPE=snp;VARB=0.0253045;OID=.;OPOS=130775782;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:155:89:93:62:62:42:20:29:60:42:20:32:61 chr11 130776524 . T C 150.34 PASS AO=30;DP=57;FAO=31;FDP=58;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=24;FSRF=8;FSRR=19;FWDB=0.0150412;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.269;QD=10.368;RBI=0.0223623;REFB=-0.00951707;REVB=0.016548;RO=27;SAF=7;SAR=23;SRF=8;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0714308;STB=0.544599;TYPE=snp;VARB=0.0188545;OID=.;OPOS=130776524;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:58:27:27:30:31:23:7:8:19:24:7:8:19 chr11 130776613 . A G 186.66 PASS AO=40;DP=76;FAO=40;FDP=76;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=30;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=0.0218401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.62;QD=9.82442;RBI=0.0241684;REFB=-0.00162913;REVB=-0.01035;RO=36;SAF=10;SAR=30;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196382;STB=0.609316;TYPE=snp;VARB=0.00163601;OID=.;OPOS=130776613;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:36:36:40:40:30:10:16:20:30:10:16:20 chr11 130780015 . C T 461.93 PASS AO=100;DP=186;FAO=100;FDP=187;FR=.;FRO=87;FSAF=51;FSAR=49;FSRF=41;FSRR=46;FWDB=-0.0018803;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.881;QD=9.88084;RBI=0.0134974;REFB=-0.00232614;REVB=0.0133658;RO=86;SAF=51;SAR=49;SRF=40;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0379698;STB=0.518012;TYPE=snp;VARB=0.00209746;OID=.;OPOS=130780015;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:187:86:87:100:100:49:51:40:46:49:51:41:46 chr11 130780225 . C A 1158.13 PASS AO=122;DP=124;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.100328;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.3138;QD=37.3591;RBI=0.120697;REFB=0;REVB=0.0670974;RO=1;SAF=53;SAR=69;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00683565;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00144382;OID=.;OPOS=130780225;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:124:124:1:0:122:124:69:53:0:1:70:54:0:0 chr11 130784754 . C G 58.04 PASS AO=17;DP=46;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=27;FSRR=2;FWDB=0.00798347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.9331;QD=5.04682;RBI=0.0286342;REFB=-0.00860567;REVB=-0.0274988;RO=29;SAF=13;SAR=4;SRF=27;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.305839;STB=0.672117;TYPE=snp;VARB=0.0173513;OID=.;OPOS=130784754;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:46:46:29:29:17:17:4:13:27:2:4:13:27:2 chr11 130784971 . C G 148.27 PASS AO=27;DP=53;FAO=31;FDP=57;FR=.;FRO=26;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.0203615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.2148;QD=10.4045;RBI=0.0347253;REFB=-0.0425541;REVB=0.0281293;RO=24;SAF=18;SAR=9;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148968;STB=0.552934;TYPE=snp;VARB=0.0308164;OID=.;OPOS=130784971;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:57:24:26:27:31:9:18:12:12:12:19:13:13 chr11 131531000 . T C 2743.89 PASS AO=117;DP=255;FAO=285;FDP=289;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=155;FSAR=130;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000679746;FXX=0.00344816;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.986;QD=37.9777;RBI=0.00401034;REFB=0;REVB=-0.00395231;RO=0;SAF=103;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.64031e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000471291;OID=.;OPOS=131531000;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:149:289:0:0:117:285:14:103:0:0:130:155:0:0 chr11 131531015 . T G 3225.03 PASS AO=340;DP=343;FAO=340;FDP=340;FR=.;FRO=0;FSAF=167;FSAR=173;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0278073;FXX=0.0087461;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.789;QD=37.9415;RBI=0.0295851;REFB=-0.0251511;REVB=0.0101009;RO=1;SAF=167;SAR=173;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00284829;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000102111;OID=.;OPOS=131531015;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:343:340:1:0:340:340:173:167:1:0:173:167:0:0 chr11 131531223 . A G 2573.76 PASS AO=276;DP=281;FAO=276;FDP=276;FR=.;FRO=0;FSAF=110;FSAR=166;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00239538;FXX=0.017793;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.2245;QD=37.3008;RBI=0.0418733;REFB=0.00290469;REVB=-0.0418047;RO=5;SAF=110;SAR=166;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141425;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000269574;OID=.;OPOS=131531223;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:281:276:5:0:276:276:166:110:0:5:166:110:0:0 chr11 131531564 . A T 2472.85 PASS AO=260;DP=261;FAO=260;FDP=260;FR=.;FRO=0;FSAF=158;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155373;FXX=0.00383127;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.963;QD=38.0438;RBI=0.0449052;REFB=-0.0133583;REVB=-0.0421316;RO=1;SAF=158;SAR=102;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00300798;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.85445e-06;OID=.;OPOS=131531564;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:261:260:1:0:260:260:102:158:1:0:102:158:0:0 chr11 131531720 . C T 991.14 PASS AO=101;DP=102;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107434;FXX=0.0188661;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.9741;QD=38.1207;RBI=0.0218948;REFB=0;REVB=-0.0190778;RO=0;SAF=62;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.32893e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.6525e-05;OID=.;OPOS=131531720;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:102:104:0:0:101:104:39:62:0:0:39:65:0:0 chr11 132177633 . A C 1790.93 PASS AO=137;DP=205;FAO=196;FDP=196;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=104;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0253794;FXX=0.0150746;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.784;QD=36.5496;RBI=0.0277866;REFB=0;REVB=0.0113129;RO=0;SAF=97;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00090577;OID=.;OPOS=132177633;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:201:196:0:0:137:196:40:97:0:0:92:104:0:0 chr11 133788992 . T C 435.24 PASS AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.161;QD=37.8469;RBI=0.0217285;REFB=0;REVB=0.0182008;RO=0;SAF=21;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.85991e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000125648;OID=.;OPOS=133788992;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:46:46:0:0:46:46:25:21:0:0:25:21:0:0 chr11 133805585 . C T 632.71 PASS AO=71;DP=75;FAO=71;FDP=74;FR=.;FRO=3;FSAF=47;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.047292;FXX=0.0133316;HRUN=4;LEN=1;MLLD=136.116;QD=34.2003;RBI=0.0479658;REFB=-0.0428112;REVB=0.00801195;RO=3;SAF=47;SAR=24;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0278367;STB=0.514739;TYPE=snp;VARB=0.000365374;OID=.;OPOS=133805585;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:75:74:3:3:71:71:24:47:1:2:24:47:1:2 chr11 133814191 . A G 1313.46 PASS AO=137;DP=137;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00628548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.674;QD=38.3492;RBI=0.010934;REFB=0;REVB=-0.00894678;RO=0;SAF=62;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.52807e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.53202e-05;OID=.;OPOS=133814191;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:137:137:0:0:137:137:75:62:0:0:75:62:0:0 chr11 133814264 . G A 95.14 PASS AO=9;DP=85;FAO=29;FDP=81;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=49;FSAF=6;FSAR=23;FSRF=10;FSRR=39;FWDB=-0.00452224;FXX=0.0121936;HRUN=5;LEN=1;MLLD=140.24;QD=4.69834;RBI=0.0647665;REFB=-0.0372822;REVB=-0.0646084;RO=12;SAF=5;SAR=4;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196246;STB=0.502701;TYPE=snp;VARB=0.0438725;OID=.;OPOS=133814264;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:43:81:12:49:9:29:4:5:9:3:23:6:10:39 chr11 134151975 . G C 1382.19 PASS AO=109;DP=144;FAO=144;FDP=144;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=50;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.348;QD=38.3942;RBI=0.0865027;REFB=0;REVB=0.0849148;RO=0;SAF=48;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000267414;OID=.;OPOS=134151975;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:144:144:0:0:109:144:61:48:0:0:94:50:0:0 chr11 134158745 . A G 142.69 PASS AO=30;DP=59;FAO=30;FDP=58;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=24;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.0205876;FXX=0.0333278;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.097;QD=9.84045;RBI=0.0309049;REFB=-0.0138868;REVB=0.0230492;RO=28;SAF=6;SAR=24;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219922;STB=0.623762;TYPE=snp;VARB=0.0283073;OID=.;OPOS=134158745;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:58:28:28:30:30:24:6:11:17:24:6:11:17 chr11 134182375 . G A 863.96 PASS AO=90;DP=93;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148729;FXX=0.0319115;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.668;QD=37.9764;RBI=0.0570583;REFB=0;REVB=0.0550858;RO=0;SAF=41;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.45651e-05;OID=.;OPOS=134182375;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:93:91:0:0:90:91:49:41:0:0:50:41:0:0 chr11 134188542 . T C 465.28 PASS AO=115;DP=241;FAO=115;FDP=241;FR=.;FRO=126;FSAF=32;FSAR=83;FSRF=30;FSRR=96;FWDB=-0.0378223;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=94.2316;QD=7.72254;RBI=0.0394957;REFB=-0.00961355;REVB=-0.0113747;RO=123;SAF=32;SAR=83;SRF=29;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0510059;STB=0.526757;TYPE=snp;VARB=0.00625255;OID=.;OPOS=134188542;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:241:241:123:126:115:115:83:32:29:94:83:32:30:96 chr11 134249321 . T C 137.85 PASS AO=39;DP=160;FAO=60;FDP=189;FR=.;FRO=129;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=61;FSRR=68;FWDB=0.0244185;FXX=0.00526288;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.882;QD=2.91741;RBI=0.0327884;REFB=-0.00918495;REVB=0.0218819;RO=120;SAF=26;SAR=13;SRF=56;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252502;STB=0.504248;TYPE=snp;VARB=0.0187416;OID=.;OPOS=134249321;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:189:120:129:39:60:13:26:56:64:32:28:61:68 chr12 87276 . A AC 51.66 PASS AO=4;DP=8;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=15.3853;QD=25.8283;RBI=0.310197;REFB=-0.0514488;REVB=0.310197;RO=4;SAF=0;SAR=4;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.084307;OID=.;OPOS=87277;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:4:8:7:8:1:0:7:0:1:5:4:0:4:0:4 chr12 90914 . C T 212.28 PASS AO=45;DP=88;FAO=46;FDP=89;FR=.;FRO=43;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=0.00621198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.773;QD=9.54068;RBI=0.00719584;REFB=-0.00711252;REVB=0.00363201;RO=43;SAF=18;SAR=27;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100284;STB=0.559414;TYPE=snp;VARB=0.00759352;OID=.;OPOS=90914;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:89:43:43:45:46:27:18:22:21:28:18:22:21 chr12 176139 . A T 63.28 PASS AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=0.0303739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.023;QD=13.3224;RBI=0.0361816;REFB=-0.0113674;REVB=-0.0196605;RO=7;SAF=6;SAR=5;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.32916;STB=0.699704;TYPE=snp;VARB=0.0135465;OID=.;OPOS=176139;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:19:19:7:8:11:11:5:6:7:0:5:6:8:0 chr12 235022 . C T 170.86 PASS AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00460329;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=202.207;QD=37.9687;RBI=0.121019;REFB=0;REVB=0.120931;RO=0;SAF=14;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000366674;OID=.;OPOS=235022;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:18:0:0:18:18:4:14:0:0:4:14:0:0 chr12 248202 . C G 86.76 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.299;QD=38.5593;RBI=0.0235731;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=9;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00010871;OID=.;OPOS=248202;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:0:9:0:0:0:9:0:0 chr12 274647 . T C 346.02 PASS AO=84;DP=174;FAO=84;FDP=174;FR=.;FRO=90;FSAF=22;FSAR=62;FSRF=41;FSRR=49;FWDB=0.0164514;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=242.397;QD=7.95444;RBI=0.0189221;REFB=-0.0145391;REVB=-0.00934868;RO=90;SAF=22;SAR=62;SRF=41;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207675;STB=0.615283;TYPE=snp;VARB=0.0148406;OID=.;OPOS=274647;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:174:90:90:84:84:62:22:41:49:62:22:41:49 chr12 280349 . C A 399.96 PASS AO=95;DP=242;FAO=109;FDP=245;FR=.;FRO=136;FSAF=54;FSAR=55;FSRF=69;FSRR=67;FWDB=0.00961449;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.1796;QD=6.53002;RBI=0.0345928;REFB=0.0181588;REVB=-0.0332299;RO=91;SAF=51;SAR=44;SRF=61;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121112;STB=0.506626;TYPE=snp;VARB=-0.0204219;OID=.;OPOS=280349;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:226:245:91:136:95:109:44:51:61:30:55:54:69:67 chr12 284058 . T C 101.95 PASS AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0788542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.917;QD=37.0741;RBI=0.0798187;REFB=0;REVB=-0.0123709;RO=0;SAF=1;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00236045;OID=.;OPOS=284058;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:11:11:10:1:0:0:10:1:0:0 chr12 319111 . T C 840.92 PASS AO=88;DP=89;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0271753;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.949;QD=36.9634;RBI=0.0517321;REFB=-0.0552141;REVB=0.0440194;RO=0;SAF=26;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.23631e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000529857;OID=.;OPOS=319111;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:89:91:0:0:88:91:62:26:0:0:64:27:0:0 chr12 319125 . A G 760.11 PASS AO=80;DP=81;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00748732;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8865;QD=38.0057;RBI=0.0097005;REFB=0;REVB=0.00616763;RO=0;SAF=26;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.21304e-05;OID=.;OPOS=319125;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:81:80:0:0:80:80:54:26:0:0:54:26:0:0 chr12 332362 . C T 102.4 PASS AO=28;DP=68;FAO=28;FDP=68;FR=.;FRO=40;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=27;FSRR=13;FWDB=0.0154129;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.271;QD=6.02335;RBI=0.0237837;REFB=-0.0214977;REVB=-0.0181138;RO=40;SAF=17;SAR=11;SRF=27;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0750246;STB=0.542571;TYPE=snp;VARB=0.0235199;OID=.;OPOS=332362;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:40:40:28:28:11:17:27:13:11:17:27:13 chr12 406292 . G A 290.98 PASS AO=85;DP=205;FAO=85;FDP=205;FR=.;FRO=120;FSAF=36;FSAR=49;FSRF=46;FSRR=74;FWDB=-0.00201395;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.945;QD=5.67768;RBI=0.021609;REFB=-0.0258565;REVB=-0.021515;RO=119;SAF=36;SAR=49;SRF=46;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0397881;STB=0.524266;TYPE=snp;VARB=0.0304273;OID=.;OPOS=406292;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:205:119:120:85:85:49:36:46:73:49:36:46:74 chr12 427575 . A G 376.47 PASS AO=82;DP=171;FAO=89;FDP=177;FR=.;FRO=88;FSAF=43;FSAR=46;FSRF=40;FSRR=48;FWDB=0.0696319;FXX=0.0166657;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.2959;QD=8.50768;RBI=0.0734438;REFB=-0.00948912;REVB=-0.0233536;RO=81;SAF=38;SAR=44;SRF=33;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0511036;STB=0.514246;TYPE=snp;VARB=0.00957486;OID=.;OPOS=427575;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:177:81:88:82:89:44:38:33:48:46:43:40:48 chr12 496439 . A T 251 PASS AO=75;DP=189;FAO=76;FDP=190;FR=.;FRO=114;FSAF=25;FSAR=51;FSRF=41;FSRR=73;FWDB=-0.0133294;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=258.662;QD=5.28411;RBI=0.0332771;REFB=-0.0152252;REVB=-0.0304909;RO=112;SAF=25;SAR=50;SRF=39;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177065;STB=0.520564;TYPE=snp;VARB=0.0235456;OID=.;OPOS=496439;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:190:112:114:75:76:50:25:39:73:51:25:41:73 chr12 520947 . A C 191.84 PASS AO=56;DP=141;FAO=57;FDP=142;FR=.;FRO=85;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=47;FSRR=38;FWDB=-0.00209134;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.778;QD=5.40391;RBI=0.0127544;REFB=-0.0119234;REVB=0.0125818;RO=85;SAF=31;SAR=25;SRF=47;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000680782;STB=0.505135;TYPE=snp;VARB=0.016408;OID=.;OPOS=520947;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:142:85:85:56:57:25:31:47:38:25:32:47:38 chr12 662448 . T C 1242.06 PASS AO=129;DP=129;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00587344;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.625;QD=38.5134;RBI=0.0290073;REFB=0;REVB=0.0284065;RO=0;SAF=65;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.05633e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.19786e-05;OID=.;OPOS=662448;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:129:129:0:0:129:129:64:65:0:0:64:65:0:0 chr12 662873 . C T 36.03 PASS AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0153809;FXX=0.124844;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.5735;QD=20.5868;RBI=0.118667;REFB=-0.104637;REVB=0.117666;RO=2;SAF=1;SAR=4;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190062;STB=0.614874;TYPE=snp;VARB=0.0636642;OID=.;OPOS=662873;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:7:7:2:2:5:5:4:1:1:1:4:1:1:1 chr12 862989 . T C 276.91 PASS AO=28;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0310738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.6454;QD=38.1941;RBI=0.0387323;REFB=0;REVB=-0.0231216;RO=0;SAF=11;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31638e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000737127;OID=.;OPOS=862989;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:29:29:0:0:28:29:17:11:0:0:18:11:0:0 chr12 890356 . T C 333.05 PASS AO=77;DP=157;FAO=78;FDP=157;FR=.;FRO=79;FSAF=42;FSAR=36;FSRF=45;FSRR=34;FWDB=0.00472261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.004;QD=8.48531;RBI=0.0153084;REFB=-0.0178797;REVB=0.0145617;RO=79;SAF=41;SAR=36;SRF=46;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0461215;STB=0.515806;TYPE=snp;VARB=0.0176479;OID=.;OPOS=890356;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:157:79:79:77:78:36:41:46:33:36:42:45:34 chr12 939302 . A G 255.03 PASS AO=59;DP=119;FAO=59;FDP=119;FR=.;FRO=60;FSAF=18;FSAR=41;FSRF=21;FSRR=39;FWDB=0.0102938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.297;QD=8.57242;RBI=0.010295;REFB=-0.0286771;REVB=0.000159478;RO=59;SAF=18;SAR=41;SRF=21;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0529371;STB=0.526151;TYPE=snp;VARB=0.0255411;OID=.;OPOS=939302;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:59:60:59:59:41:18:21:38:41:18:21:39 chr12 974355 . T TC 106.22 PASS AO=41;DP=111;FAO=44;FDP=97;FR=.;FRO=53;FSAF=3;FSAR=41;FSRF=17;FSRR=36;FWDB=-0.125702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=22.1846;QD=4.38037;RBI=0.131895;REFB=-0.00905888;REVB=0.039942;RO=70;SAF=3;SAR=38;SRF=31;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.589655;STB=0.78004;TYPE=ins;VARB=0.00404106;OID=.;OPOS=974356;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:41:111:44:97:53:3:41:17:36:99:70:3:38:31:39 chr12 974404 . T C 693.7 PASS AO=72;DP=72;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.487;QD=38.0107;RBI=0.0124954;REFB=0;REVB=0.0124954;RO=0;SAF=0;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000119055;OID=.;OPOS=974404;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:72:73:0:0:72:73:72:0:0:0:73:0:0:0 chr12 977170 . C T 345.92 PASS AO=77;DP=149;FAO=77;FDP=149;FR=.;FRO=72;FSAF=30;FSAR=47;FSRF=14;FSRR=58;FWDB=0.0194721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.676;QD=9.28653;RBI=0.021323;REFB=-0.00471219;REVB=0.0086893;RO=71;SAF=30;SAR=47;SRF=14;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186047;STB=0.603655;TYPE=snp;VARB=0.00574913;OID=.;OPOS=977170;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:71:72:77:77:47:30:14:57:47:30:14:58 chr12 987482 . G A 122.45 PASS AO=28;DP=58;FAO=28;FDP=58;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=21;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=-0.0478325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.322;QD=8.44512;RBI=0.0499391;REFB=0.0109239;REVB=-0.0143515;RO=30;SAF=7;SAR=21;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165824;STB=0.593679;TYPE=snp;VARB=-0.00977157;OID=.;OPOS=987482;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:30:30:28:28:21:7:12:18:21:7:12:18 chr12 990912 . A C 1575.55 PASS AO=154;DP=161;FAO=164;FDP=164;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017495;FXX=0.0238081;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.186;QD=38.4281;RBI=0.0191752;REFB=0;REVB=0.00784943;RO=0;SAF=63;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.54013e-05;OID=.;OPOS=990912;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:161:164:0:0:154:164:91:63:0:0:93:71:0:0 chr12 993930 . C T 1234 PASS AO=129;DP=131;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.064508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2165;QD=37.6795;RBI=0.0662369;REFB=0;REVB=0.0150347;RO=1;SAF=14;SAR=115;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0327313;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000125481;OID=.;OPOS=993930;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:131:131:1:0:129:131:115:14:1:0:115:16:0:0 chr12 994487 . G C 1142.31 PASS AO=120;DP=122;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0310722;FXX=0.0163921;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.316;QD=38.0771;RBI=0.0315008;REFB=0;REVB=0.00517868;RO=0;SAF=65;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.0722e-05;OID=.;OPOS=994487;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:122:120:0:0:120:120:55:65:0:0:55:65:0:0 chr12 1017197 . C T 435.28 PASS AO=41;DP=41;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0707766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.529;QD=37.8505;RBI=0.0713389;REFB=0;REVB=-0.00893978;RO=0;SAF=10;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.09277e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000331149;OID=.;OPOS=1017197;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:41:46:0:0:41:46:31:10:0:0:36:10:0:0 chr12 1590013 . C T 131.72 PASS AO=32;DP=70;FAO=32;FDP=70;FR=.;FRO=38;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.0200983;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.753;QD=7.52683;RBI=0.0276424;REFB=-0.0108826;REVB=0.0189778;RO=37;SAF=18;SAR=14;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0471824;STB=0.534151;TYPE=snp;VARB=0.00791856;OID=.;OPOS=1590013;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:37:38:32:32:14:18:19:18:14:18:19:19 chr12 1590069 . G A 166.41 PASS AO=30;DP=50;FAO=30;FDP=50;FR=.;FRO=20;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.0678434;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.5595;QD=13.3126;RBI=0.0725973;REFB=0.0022518;REVB=0.0258388;RO=20;SAF=17;SAR=13;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0850927;STB=0.546885;TYPE=snp;VARB=0.000663079;OID=.;OPOS=1590069;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:50:50:20:20:30:30:13:17:9:11:13:17:9:11 chr12 1890199 . G A 424.78 PASS AO=111;DP=248;FAO=113;FDP=252;FR=.;FRO=139;FSAF=46;FSAR=67;FSRF=46;FSRR=93;FWDB=-0.0186994;FXX=0.00395241;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.918;QD=6.74249;RBI=0.0196252;REFB=-0.0081034;REVB=-0.0059567;RO=132;SAF=46;SAR=65;SRF=46;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0676343;STB=0.54421;TYPE=snp;VARB=0.0103585;OID=.;OPOS=1890199;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:248:252:132:139:111:113:65:46:46:86:67:46:46:93 chr12 1893077 . C A 187.03 PASS AO=59;DP=159;FAO=61;FDP=161;FR=.;FRO=100;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=35;FSRR=65;FWDB=0.0126745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.0934;QD=4.64673;RBI=0.0676559;REFB=-0.015932;REVB=0.0664581;RO=99;SAF=28;SAR=31;SRF=35;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135467;STB=0.568919;TYPE=snp;VARB=0.0237318;OID=.;OPOS=1893077;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:161:99:100:59:61:31:28:35:64:33:28:35:65 chr12 1893170 . C T 460.6 PASS AO=122;DP=272;FAO=122;FDP=270;FR=.;FRO=148;FSAF=36;FSAR=86;FSRF=67;FSRR=81;FWDB=0.0246151;FXX=0.0109886;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.996;QD=6.82368;RBI=0.0379873;REFB=-0.015022;REVB=-0.0289333;RO=145;SAF=36;SAR=86;SRF=65;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166367;STB=0.59568;TYPE=snp;VARB=0.0205276;OID=.;OPOS=1893170;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:272:270:145:148:122:122:86:36:65:80:86:36:67:81 chr12 1897284 . A T 321.79 PASS AO=89;DP=205;FAO=89;FDP=205;FR=.;FRO=116;FSAF=36;FSAR=53;FSRF=50;FSRR=66;FWDB=0.0209405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.431;QD=6.27882;RBI=0.0211411;REFB=-0.0292445;REVB=0.00290601;RO=116;SAF=36;SAR=53;SRF=50;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0278055;STB=0.515491;TYPE=snp;VARB=0.02738;OID=.;OPOS=1897284;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:205:116:116:89:89:53:36:50:66:53:36:50:66 chr12 1910791 . TC T 20.64 PASS AO=20;DP=82;FAO=20;FDP=71;FR=.;FRO=51;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=29;FWDB=-0.0261449;FXX=0.0273935;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.3204;QD=1.16284;RBI=0.148323;REFB=-0.0788338;REVB=0.146;RO=43;SAF=12;SAR=8;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0.318538;SSSB=0.207655;STB=0.549247;TYPE=del;VARB=0.101376;OID=.;OPOS=1910792;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:20:69:20:71:51:10:10:22:29:20:43:12:8:18:25 chr12 1995403 . T C 2507.63 PASS AO=262;DP=262;FAO=262;FDP=262;FR=.;FRO=0;FSAF=132;FSAR=130;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0219593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.009;QD=38.2844;RBI=0.0693821;REFB=0;REVB=0.0658154;RO=0;SAF=132;SAR=130;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.22576e-05;OID=.;OPOS=1995403;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:262:262:0:0:262:262:130:132:0:0:130:132:0:0 chr12 2062323 . T TTGC 63.9 PASS AO=27;DP=159;FAO=30;FDP=108;FR=.;FRO=78;FSAF=4;FSAR=26;FSRF=64;FSRR=14;FWDB=-0.0896574;FXX=0.0769165;HRUN=2;LEN=3;MLLD=134.324;QD=2.36671;RBI=0.0953331;REFB=-0.0345676;REVB=0.0324028;RO=127;SAF=3;SAR=24;SRF=89;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.680109;STB=0.916795;TYPE=ins;VARB=0.107358;OID=.;OPOS=2062324;OREF=-;OALT=TGC;OMAPALT=TTGC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:27:159:30:108:78:4:26:64:14:63:127:3:24:89:38 chr12 2100324 . A C 434.25 PASS AO=75;DP=115;FAO=75;FDP=114;FR=.;FRO=39;FSAF=11;FSAR=64;FSRF=10;FSRR=29;FWDB=0.020953;FXX=0.0172399;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.801;QD=15.2369;RBI=0.0216182;REFB=-0.00920247;REVB=0.00532153;RO=37;SAF=9;SAR=66;SRF=10;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183112;STB=0.567788;TYPE=snp;VARB=0.00567699;OID=.;OPOS=2100324;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:114:37:39:75:75:66:9:10:27:64:11:10:29 chr12 2558186 . G A 2372.89 PASS AO=248;DP=280;FAO=258;FDP=258;FR=.;FRO=0;FSAF=148;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00441201;FXX=0.0818476;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.511;QD=36.7889;RBI=0.0102164;REFB=0.00314353;REVB=-0.00921462;RO=2;SAF=147;SAR=101;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00146436;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00201397;OID=.;OPOS=2558186;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:280:258:2:0:248:258:101:147:1:1:110:148:0:0 chr12 2750893 . C T 616.57 PASS AO=134;DP=260;FAO=138;FDP=264;FR=.;FRO=126;FSAF=58;FSAR=80;FSRF=55;FSRR=71;FWDB=0.00165571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.527;QD=9.34192;RBI=0.0105957;REFB=-0.0156259;REVB=0.0104656;RO=122;SAF=56;SAR=78;SRF=55;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0293278;STB=0.507921;TYPE=snp;VARB=0.0129543;OID=.;OPOS=2750893;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:260:264:122:126:134:138:78:56:55:67:80:58:55:71 chr12 2788879 . G A 83.81 PASS AO=16;DP=31;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0219814;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.403;QD=10.8141;RBI=0.0226944;REFB=-0.00890691;REVB=0.00564389;RO=14;SAF=7;SAR=9;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0679609;STB=0.551664;TYPE=snp;VARB=0.0166998;OID=.;OPOS=2788879;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:31:31:14:14:16:17:9:7:5:9:9:8:5:9 chr12 2791130 . C T 120.87 PASS AO=31;DP=72;FAO=31;FDP=71;FR=.;FRO=40;FSAF=9;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=25;FWDB=0.00256937;FXX=0.013887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.786;QD=6.80954;RBI=0.0118691;REFB=-0.0060369;REVB=-0.0115877;RO=40;SAF=9;SAR=22;SRF=15;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0972987;STB=0.555168;TYPE=snp;VARB=0.00702136;OID=.;OPOS=2791130;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:71:40:40:31:31:22:9:15:25:22:9:15:25 chr12 2791132 . A G 144.48 PASS AO=35;DP=76;FAO=35;FDP=75;FR=.;FRO=40;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=14;FSRR=26;FWDB=-0.00595034;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.039;QD=7.70549;RBI=0.007387;REFB=0.00527364;REVB=-0.00437737;RO=39;SAF=13;SAR=22;SRF=13;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0389029;STB=0.512308;TYPE=snp;VARB=-0.00757216;OID=.;OPOS=2791132;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:75:39:40:35:35:22:13:13:26:22:13:14:26 chr12 2791205 . A G 707.28 PASS AO=79;DP=82;FAO=79;FDP=81;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=64;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00961477;FXX=0.0121936;HRUN=3;LEN=1;MLLD=213.538;QD=34.9275;RBI=0.0108279;REFB=0.0144204;REVB=-0.00497999;RO=2;SAF=15;SAR=64;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0231755;STB=0.512253;TYPE=snp;VARB=-1.20606e-05;OID=.;OPOS=2791205;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:82:81:2:2:79:79:64:15:1:1:64:15:1:1 chr12 2794977 . G A 361.22 PASS AO=71;DP=125;FAO=73;FDP=128;FR=.;FRO=55;FSAF=35;FSAR=38;FSRF=21;FSRR=34;FWDB=0.0160625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.592;QD=11.2883;RBI=0.0274148;REFB=-0.00501543;REVB=-0.0222163;RO=54;SAF=35;SAR=36;SRF=21;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0825637;STB=0.542157;TYPE=snp;VARB=0.00466115;OID=.;OPOS=2794977;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:128:54:55:71:73:36:35:21:33:38:35:21:34 chr12 2797894 . TGGGGC TGGGC,TGGG 32.5 PASS AO=3,3;DP=20;FAO=10,0;FDP=17;FR=.;FRO=7;FSAF=4,0;FSAR=6,0;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.172418,-0.795788;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,2;MLLD=12.6811,15.7727;QD=7.64699;RBI=0.247729,0.81207;REFB=-0.0868868,-0.0245942;REVB=-0.177881,-0.161797;RO=5;SAF=0,0;SAR=3,3;SRF=0;SRR=5;SSEN=0.43408,0.43408;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.549903,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.0716773,0.0910719;OID=.,.;OPOS=2797895,2797898;OREF=G,GC;OALT=-,-;OMAPALT=TGGGC,TGGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:3,3:15:10,0:17:7:4,0:6,0:2:5:19:5:0,0:3,3:0:5 chr12 2800197 . CG C 44.52 PASS AO=18;DP=60;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=20;FWDB=0.0291265;FXX=0.166632;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.7346;QD=4.4522;RBI=0.307233;REFB=-0.0269665;REVB=0.30585;RO=18;SAF=15;SAR=3;SRF=1;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.644373;STB=0.84874;TYPE=del;VARB=0.116802;OID=.;OPOS=2800198;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:18:46:19:40:21:15:4:1:20:43:18:15:3:1:17 chr12 2801469 . C CT 93.97 PASS AO=69;DP=239;FAO=93;FDP=206;FR=.;FRO=113;FSAF=61;FSAR=32;FSRF=81;FSRR=32;FWDB=-0.00842332;FXX=0.00483068;HRUN=5;LEN=1;MLLD=9.46119;QD=1.82459;RBI=0.049556;REFB=-0.014814;REVB=-0.0488349;RO=139;SAF=52;SAR=17;SRF=100;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0517606;STB=0.537871;TYPE=ins;VARB=-0.00936362;OID=.;OPOS=2801470;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:69:239:93:206:113:61:32:81:32:93:139:52:17:100:39 chr12 2968458 . T C 733.25 PASS AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0549373;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.9457;QD=37.6025;RBI=0.0566891;REFB=0;REVB=-0.0139835;RO=0;SAF=58;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00242795;OID=.;OPOS=2968458;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:78:78:0:0:78:78:20:58:0:0:20:58:0:0 chr12 2996174 . A G 847.81 PASS AO=158;DP=256;FAO=158;FDP=256;FR=.;FRO=98;FSAF=64;FSAR=94;FSRF=55;FSRR=43;FWDB=-0.00448616;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.569;QD=13.247;RBI=0.00674787;REFB=-0.00394675;REVB=0.00504065;RO=98;SAF=64;SAR=94;SRF=55;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112253;STB=0.560582;TYPE=snp;VARB=0.0029185;OID=.;OPOS=2996174;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:256:256:98:98:158:158:94:64:55:43:94:64:55:43 chr12 2997397 . G A 145.59 PASS AO=36;DP=79;FAO=36;FDP=79;FR=.;FRO=43;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=30;FWDB=-0.0053866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.1693;QD=7.37171;RBI=0.00539233;REFB=-0.0259947;REVB=0.000248408;RO=43;SAF=14;SAR=22;SRF=13;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0906415;STB=0.550654;TYPE=snp;VARB=0.0243359;OID=.;OPOS=2997397;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:43:43:36:36:22:14:13:30:22:14:13:30 chr12 3310439 . C T 174.52 PASS AO=53;DP=136;FAO=53;FDP=135;FR=.;FRO=82;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=39;FSRR=43;FWDB=-0.00469003;FXX=0.0217376;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.868;QD=5.17106;RBI=0.00963509;REFB=-0.00117537;REVB=-0.00841656;RO=82;SAF=29;SAR=24;SRF=40;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0638769;STB=0.54348;TYPE=snp;VARB=0.00172397;OID=.;OPOS=3310439;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:135:82:82:53:53:24:29:40:42:24:29:39:43 chr12 3391032 . T G 203.33 PASS AO=29;DP=68;FAO=39;FDP=67;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=28;FSRF=3;FSRR=25;FWDB=-0.00708531;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.847;QD=12.1389;RBI=0.0214888;REFB=-0.0299393;REVB=-0.0202871;RO=21;SAF=2;SAR=27;SRF=3;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178124;STB=0.597904;TYPE=snp;VARB=0.0222747;OID=.;OPOS=3391032;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:67:21:28:29:39:27:2:3:18:28:11:3:25 chr12 3392558 . C T 44.46 PASS AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.00252755;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.896;QD=9.36064;RBI=0.0268675;REFB=0.000843088;REVB=0.0267484;RO=9;SAF=2;SAR=7;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22915;STB=0.617362;TYPE=snp;VARB=-0.000791986;OID=.;OPOS=3392558;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:18:19:9:10:9:9:7:2:4:5:7:2:4:6 chr12 3393419 . C T 188.19 PASS AO=45;DP=94;FAO=45;FDP=94;FR=.;FRO=49;FSAF=12;FSAR=33;FSRF=17;FSRR=32;FWDB=0.00902622;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=208.594;QD=8.00817;RBI=0.0105965;REFB=-0.0133644;REVB=-0.00555089;RO=49;SAF=12;SAR=33;SRF=17;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0911957;STB=0.550926;TYPE=snp;VARB=0.0135273;OID=.;OPOS=3393419;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:49:49:45:45:33:12:17:32:33:12:17:32 chr12 3409277 . C T 383.61 PASS AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0132688;FXX=0.0238039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.285;QD=37.4251;RBI=0.0526917;REFB=0;REVB=0.0509937;RO=0;SAF=13;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.29373e-06;OID=.;OPOS=3409277;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:42:41:0:0:41:41:28:13:0:0:28:13:0:0 chr12 3724583 . T C 184.4 PASS AO=41;DP=81;FAO=41;FDP=80;FR=.;FRO=39;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=-0.012042;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.3443;QD=9.22022;RBI=0.0192213;REFB=-0.0320244;REVB=0.0149816;RO=39;SAF=21;SAR=20;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000550445;STB=0.500305;TYPE=snp;VARB=0.0294219;OID=.;OPOS=3724583;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:80:39:39:41:41:20:21:20:19:20:21:20:19 chr12 3749874 . T C 966.2 PASS AO=107;DP=111;FAO=109;FDP=111;FR=.;FRO=2;FSAF=78;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.016174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.05;QD=34.8181;RBI=0.0493845;REFB=-0.0961673;REVB=0.0466608;RO=0;SAF=78;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.63313e-08;STB=0.515622;TYPE=snp;VARB=0.00112672;OID=.;OPOS=3749874;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:111:111:0:2:107:109:29:78:0:0:31:78:0:2 chr12 3788145 . C T 328.64 PASS AO=88;DP=199;FAO=89;FDP=203;FR=.;FRO=114;FSAF=45;FSAR=44;FSRF=53;FSRR=61;FWDB=0.0424519;FXX=0.00975562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.594;QD=6.4756;RBI=0.0468578;REFB=-0.0121702;REVB=-0.0198367;RO=109;SAF=44;SAR=44;SRF=50;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0411271;STB=0.522845;TYPE=snp;VARB=0.0263742;OID=.;OPOS=3788145;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:199:203:109:114:88:89:44:44:50:59:44:45:53:61 chr12 3788222 . G A 280.48 PASS AO=77;DP=179;FAO=77;FDP=178;FR=.;FRO=101;FSAF=31;FSAR=46;FSRF=32;FSRR=69;FWDB=0.0179261;FXX=0.00558628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.55;QD=6.30301;RBI=0.0198703;REFB=-0.0220061;REVB=0.00857233;RO=101;SAF=31;SAR=46;SRF=32;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0927905;STB=0.551588;TYPE=snp;VARB=0.0305791;OID=.;OPOS=3788222;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:178:101:101:77:77:46:31:32:69:46:31:32:69 chr12 3788260 . G A 227.39 PASS AO=58;DP=128;FAO=58;FDP=128;FR=.;FRO=70;FSAF=23;FSAR=35;FSRF=24;FSRR=46;FWDB=0.0213146;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.454;QD=7.10577;RBI=0.0220818;REFB=-0.0171311;REVB=-0.00577036;RO=68;SAF=23;SAR=35;SRF=23;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0600188;STB=0.531061;TYPE=snp;VARB=0.0208127;OID=.;OPOS=3788260;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:68:70:58:58:35:23:23:45:35:23:24:46 chr12 3835401 . G A 101.96 PASS AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0282325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6002;QD=37.0753;RBI=0.0868828;REFB=0;REVB=-0.0821678;RO=0;SAF=6;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00291751;OID=.;OPOS=3835401;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:11:11:5:6:0:0:5:6:0:0 chr12 4388084 . C G 624.11 PASS AO=70;DP=72;FAO=70;FDP=72;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=60;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00218709;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.7114;QD=34.6727;RBI=0.0322122;REFB=-0.033405;REVB=-0.0321379;RO=2;SAF=10;SAR=60;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0371464;STB=0.519679;TYPE=snp;VARB=0.00119677;OID=.;OPOS=4388084;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:72:72:2:2:70:70:60:10:1:1:60:10:1:1 chr12 4412762 . A G 174.56 PASS AO=33;DP=56;FAO=33;FDP=56;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=-0.0112049;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=260.842;QD=12.4689;RBI=0.0195619;REFB=-0.0125287;REVB=-0.0160349;RO=23;SAF=10;SAR=23;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00116249;STB=0.50064;TYPE=snp;VARB=0.00701767;OID=.;OPOS=4412762;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:56:56:23:23:33:33:23:10:7:16:23:10:7:16 chr12 4414126 . G A 170.86 PASS AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.4926;QD=37.9684;RBI=0.0108325;REFB=0;REVB=0.0108325;RO=0;SAF=0;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000221921;OID=.;OPOS=4414126;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:18:0:0:18:18:18:0:0:0:18:0:0:0 chr12 4461485 . G A 249.61 PASS AO=64;DP=140;FAO=64;FDP=141;FR=.;FRO=77;FSAF=39;FSAR=25;FSRF=41;FSRR=36;FWDB=0.00504095;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=247.966;QD=7.08124;RBI=0.0155418;REFB=-0.00654171;REVB=-0.0147015;RO=76;SAF=39;SAR=25;SRF=41;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0703598;STB=0.543261;TYPE=snp;VARB=0.00736722;OID=.;OPOS=4461485;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:141:76:77:64:64:25:39:41:35:25:39:41:36 chr12 4478080 . T A 436.96 PASS AO=88;DP=157;FAO=89;FDP=158;FR=.;FRO=69;FSAF=34;FSAR=55;FSRF=39;FSRR=30;FWDB=0.0170598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.322;QD=11.0624;RBI=0.0249642;REFB=-0.0141939;REVB=0.0182257;RO=67;SAF=34;SAR=54;SRF=38;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145703;STB=0.581444;TYPE=snp;VARB=0.0112874;OID=.;OPOS=4478080;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:158:67:69:88:89:54:34:38:29:55:34:39:30 chr12 4553332 . A G 293.84 PASS AO=67;DP=135;FAO=68;FDP=136;FR=.;FRO=68;FSAF=11;FSAR=57;FSRF=19;FSRR=49;FWDB=-0.05333;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.922;QD=8.64234;RBI=0.0634787;REFB=-0.0123002;REVB=0.0344304;RO=68;SAF=11;SAR=56;SRF=19;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16617;STB=0.594545;TYPE=snp;VARB=0.0131788;OID=.;OPOS=4553332;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:136:68:68:67:68:56:11:19:49:57:11:19:49 chr12 4553383 . A G 188.59 PASS AO=49;DP=107;FAO=48;FDP=106;FR=.;FRO=58;FSAF=6;FSAR=42;FSRF=14;FSRR=44;FWDB=0.0260526;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.24;QD=7.1167;RBI=0.0263294;REFB=0.00469159;REVB=0.00380826;RO=58;SAF=6;SAR=43;SRF=14;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215752;STB=0.619412;TYPE=snp;VARB=-0.00600324;OID=.;OPOS=4553383;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:106:58:58:49:48:43:6:14:44:42:6:14:44 chr12 4554413 . C T 142.06 PASS AO=35;DP=76;FAO=35;FDP=76;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=26;FWDB=0.0192599;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.629;QD=7.47692;RBI=0.0525524;REFB=-0.0100345;REVB=0.0488959;RO=41;SAF=17;SAR=18;SRF=15;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116067;STB=0.564918;TYPE=snp;VARB=0.013725;OID=.;OPOS=4554413;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:41:41:35:35:18:17:15:26:18:17:15:26 chr12 4554548 . G C 589.38 PASS AO=59;DP=60;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=50;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00224053;FXX=0.0151492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.993;QD=36.2698;RBI=0.0377851;REFB=-0.0794666;REVB=0.0377187;RO=1;SAF=11;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0409638;STB=0.517236;TYPE=snp;VARB=0.00370595;OID=.;OPOS=4554548;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:60:65:1:1:59:64:48:11:1:0:50:14:1:0 chr12 4554630 . A G 60.68 PASS AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.00815954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.525;QD=8.98973;RBI=0.0172057;REFB=0.0150268;REVB=0.0151478;RO=14;SAF=2;SAR=11;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.268587;STB=0.657839;TYPE=snp;VARB=-0.00888017;OID=.;OPOS=4554630;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:27:27:14:14:13:13:11:2:5:9:11:2:5:9 chr12 4736495 . C T 1522.81 PASS AO=156;DP=161;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=111;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0220169;FXX=0.0245384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.867;QD=38.3096;RBI=0.0426699;REFB=0;REVB=0.0365511;RO=0;SAF=109;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.17355e-05;OID=.;OPOS=4736495;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:161:159:0:0:156:159:47:109:0:0:48:111:0:0 chr12 4736631 . A G 2510.62 PASS AO=270;DP=275;FAO=271;FDP=276;FR=.;FRO=5;FSAF=89;FSAR=182;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0208706;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.2094;QD=36.3858;RBI=0.0269543;REFB=-0.127269;REVB=0.0170574;RO=5;SAF=89;SAR=181;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00509197;STB=0.502641;TYPE=snp;VARB=0.00136297;OID=.;OPOS=4736631;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:275:276:5:5:270:271:181:89:1:4:182:89:1:4 chr12 4736677 . G C 2085.52 PASS AO=212;DP=237;FAO=223;FDP=223;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=141;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226001;FXX=0.0860621;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.7856;QD=37.4084;RBI=0.0551162;REFB=-0.0167478;REVB=0.0502696;RO=1;SAF=78;SAR=134;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0035422;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00077373;OID=.;OPOS=4736677;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:92:237:223:1:0:212:223:134:78:0:1:141:82:0:0 chr12 4736690 . A G 2070.79 PASS AO=228;DP=235;FAO=227;FDP=232;FR=.;FRO=5;FSAF=82;FSAR=145;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.00100045;FXX=0.0127654;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.8577;QD=35.7033;RBI=0.0178624;REFB=-0.0994245;REVB=-0.0178344;RO=6;SAF=84;SAR=144;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0194371;STB=0.508474;TYPE=snp;VARB=0.000389999;OID=.;OPOS=4736690;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:235:232:6:5:228:227:144:84:0:6:145:82:0:5 chr12 4737000 . C T 133.75 PASS AO=48;DP=132;FAO=48;FDP=139;FR=.;FRO=91;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=35;FSRR=56;FWDB=-0.0216396;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.63;QD=3.84891;RBI=0.0253618;REFB=-0.00348727;REVB=-0.0132269;RO=82;SAF=22;SAR=26;SRF=33;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0627366;STB=0.548976;TYPE=snp;VARB=0.00594902;OID=.;OPOS=4737000;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:139:82:91:48:48:26:22:33:49:26:22:35:56 chr12 4737042 . G A 1207.71 PASS AO=126;DP=127;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166496;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.516;QD=38.34;RBI=0.0498599;REFB=0;REVB=0.0469978;RO=0;SAF=54;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000142017;OID=.;OPOS=4737042;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:127:126:0:0:126:126:72:54:0:0:72:54:0:0 chr12 4737318 . A G 706.85 PASS AO=72;DP=76;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0128324;FXX=0.038956;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.739;QD=38.2081;RBI=0.0132141;REFB=0;REVB=-0.00315328;RO=0;SAF=30;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1178e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.04788e-05;OID=.;OPOS=4737318;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:76:74:0:0:72:74:42:30:0:0:43:31:0:0 chr12 4737459 . C T 936.44 PASS AO=100;DP=101;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276522;FXX=0.00990001;HRUN=3;LEN=1;MLLD=180.825;QD=37.4577;RBI=0.0277917;REFB=-0.115236;REVB=-0.00278048;RO=0;SAF=61;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.39894e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000393893;OID=.;OPOS=4737459;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:101:100:0:0:100:100:39:61:0:0:39:61:0:0 chr12 4737715 . C T 2302.07 PASS AO=253;DP=261;FAO=253;FDP=260;FR=.;FRO=7;FSAF=115;FSAR=138;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.045242;FXX=0.00383127;HRUN=3;LEN=1;MLLD=211.921;QD=35.4165;RBI=0.0488967;REFB=-0.0601834;REVB=0.0185485;RO=7;SAF=115;SAR=138;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00134335;STB=0.500705;TYPE=snp;VARB=0.000887513;OID=.;OPOS=4737715;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:261:260:7:7:253:253:138:115:3:4:138:115:3:4 chr12 4835882 . T G 169.92 PASS AO=45;DP=103;FAO=45;FDP=103;FR=.;FRO=58;FSAF=29;FSAR=16;FSRF=34;FSRR=24;FWDB=-0.0234491;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=238.213;QD=6.59868;RBI=0.0234782;REFB=-0.00379609;REVB=0.00116925;RO=58;SAF=29;SAR=16;SRF=34;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0623761;STB=0.535039;TYPE=snp;VARB=0.00480072;OID=.;OPOS=4835882;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:58:58:45:45:16:29:34:24:16:29:34:24 chr12 4873163 . G T 660.77 PASS AO=113;DP=301;FAO=158;FDP=322;FR=.,HEALED;FRO=164;FSAF=47;FSAR=111;FSRF=67;FSRR=97;FWDB=-0.0112;FXX=0.00309588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.1031;QD=8.20833;RBI=0.0193007;REFB=-0.0218236;REVB=0.0157187;RO=104;SAF=2;SAR=111;SRF=7;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.364529;STB=0.564147;TYPE=snp;VARB=0.0225771;OID=.;OPOS=4873163;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:268:322:104:164:113:158:111:2:7:97:111:47:67:97 chr12 4881766 . C T 698.16 PASS AO=77;DP=78;FAO=76;FDP=78;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=56;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0507468;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.4704;QD=35.8031;RBI=0.057444;REFB=0.0532559;REVB=-0.0269179;RO=1;SAF=21;SAR=56;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0219995;STB=0.523803;TYPE=snp;VARB=-0.00228718;OID=.;OPOS=4881766;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:78:78:1:2:77:76:56:21:1:0:56:20:2:0 chr12 4959904 . G GA 672.69 PASS AO=91;DP=116;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0828082;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.3043;QD=23.398;RBI=0.0829948;REFB=0;REVB=0.00556311;RO=15;SAF=27;SAR=64;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0730603;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00223121;OID=.;OPOS=4959905;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:91:116:115:115:0:38:77:0:0:60:15:27:64:8:7 chr12 4959987 . C T 1007.81 PASS AO=105;DP=107;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0446566;FXX=0.0186898;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.191;QD=38.3929;RBI=0.0576008;REFB=0;REVB=0.036382;RO=0;SAF=30;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.65602e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000226814;OID=.;OPOS=4959987;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:107:105:0:0:105:105:75:30:0:0:75:30:0:0 chr12 4959993 . C A 1036.79 PASS AO=106;DP=107;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0585618;FXX=0.00917347;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.3758;QD=38.3998;RBI=0.0717254;REFB=0;REVB=0.0414131;RO=0;SAF=29;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000713895;OID=.;OPOS=4959993;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:107:108:0:0:106:108:77:29:0:0:78:30:0:0 chr12 4960023 . C A 1142.54 PASS AO=119;DP=119;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0319594;FXX=0.00826378;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.398;QD=38.0846;RBI=0.0321168;REFB=0;REVB=0.00317561;RO=0;SAF=40;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000115752;OID=.;OPOS=4960023;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:119:120:0:0:119:120:79:40:0:0:79:41:0:0 chr12 5021984 . T A 191.69 PASS AO=40;DP=74;FAO=40;FDP=74;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=29;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=-0.0905206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.4;QD=10.3614;RBI=0.0905341;REFB=-0.0304689;REVB=0.00156133;RO=34;SAF=11;SAR=29;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132661;STB=0.573537;TYPE=snp;VARB=0.0234887;OID=.;OPOS=5021984;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:34:34:40:40:29:11:14:20:29:11:14:20 chr12 5026471 . C T 281.4 PASS AO=53;DP=88;FAO=53;FDP=88;FR=.;FRO=35;FSAF=20;FSAR=33;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=-0.00360685;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0903;QD=12.791;RBI=0.0124557;REFB=0.0234205;REVB=0.0119221;RO=35;SAF=20;SAR=33;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205096;STB=0.611859;TYPE=snp;VARB=-0.013361;OID=.;OPOS=5026471;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:35:35:53:53:33:20:23:12:33:20:23:12 chr12 5154462 . T C 316.55 PASS AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0423992;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.4201;QD=37.2411;RBI=0.0430819;REFB=0;REVB=0.00763923;RO=0;SAF=16;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000292081;OID=.;OPOS=5154462;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:34:0:0:34:34:18:16:0:0:18:16:0:0 chr12 5155663 . A T 516.95 PASS AO=157;DP=382;FAO=156;FDP=381;FR=.;FRO=225;FSAF=67;FSAR=89;FSRF=67;FSRR=158;FWDB=-0.048946;FXX=0.00261773;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.155;QD=5.42728;RBI=0.0497622;REFB=-0.00849107;REVB=-0.00897601;RO=221;SAF=68;SAR=89;SRF=64;SRR=157;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157748;STB=0.581167;TYPE=snp;VARB=0.0123913;OID=.;OPOS=5155663;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:382:381:221:225:157:156:89:68:64:157:89:67:67:158 chr12 5674754 . G A 275.31 PASS AO=49;DP=78;FAO=49;FDP=78;FR=.;FRO=29;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.0116957;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.805;QD=14.1185;RBI=0.0354025;REFB=-0.0190823;REVB=0.0334148;RO=29;SAF=27;SAR=22;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0232472;STB=0.512653;TYPE=snp;VARB=0.00723508;OID=.;OPOS=5674754;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:78:78:29:29:49:49:22:27:15:14:22:27:15:14 chr12 5841733 . A C 436.75 PASS AO=99;DP=196;FAO=101;FDP=201;FR=.;FRO=100;FSAF=36;FSAR=65;FSRF=44;FSRR=56;FWDB=-0.0307788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.1028;QD=8.69162;RBI=0.0649476;REFB=-0.0193025;REVB=0.0571914;RO=96;SAF=37;SAR=62;SRF=40;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0406281;STB=0.544152;TYPE=snp;VARB=0.0181361;OID=.;OPOS=5841733;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:201:96:100:99:101:62:37:40:56:65:36:44:56 chr12 5848256 . G GC 175.01 PASS AO=49;DP=117;FAO=59;FDP=114;FR=.;FRO=55;FSAF=19;FSAR=40;FSRF=24;FSRR=31;FWDB=0.00465362;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=20.9156;QD=6.14084;RBI=0.0518603;REFB=-0.0406107;REVB=-0.051651;RO=57;SAF=10;SAR=39;SRF=26;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.29683;STB=0.560422;TYPE=ins;VARB=0.0352185;OID=.;OPOS=5848257;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:49:117:59:114:55:19:40:24:31:99:57:10:39:26:31 chr12 6054395 . A G 210.59 PASS AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.134379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.471;QD=36.6242;RBI=0.141893;REFB=0;REVB=0.0455624;RO=0;SAF=1;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.47154e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000863448;OID=.;OPOS=6054395;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:0:0:23:23:22:1:0:0:22:1:0:0 chr12 6127943 . A G 723.89 PASS AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00701695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.63;QD=38.0994;RBI=0.0120331;REFB=0;REVB=-0.00977532;RO=0;SAF=34;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6391e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.8606e-05;OID=.;OPOS=6127943;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:76:76:0:0:76:76:42:34:0:0:42:34:0:0 chr12 6128443 . T C 401.9 PASS AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0318535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.7857;QD=37.3856;RBI=0.0318582;REFB=0;REVB=0.000547854;RO=0;SAF=12;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41862e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000514941;OID=.;OPOS=6128443;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:43:43:0:0:43:43:31:12:0:0:31:12:0:0 chr12 6143984 . T C 669.83 PASS AO=80;DP=81;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0151525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.045;QD=37.7368;RBI=0.0165938;REFB=0;REVB=0.00676433;RO=0;SAF=65;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00113113;OID=.;OPOS=6143984;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:81:71:0:0:80:71:15:65:0:0:15:56:0:0 chr12 6167196 . A G 98.79 PASS AO=24;DP=54;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=0.0438551;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.697;QD=7.45596;RBI=0.0511978;REFB=-0.0144477;REVB=-0.0264187;RO=29;SAF=9;SAR=15;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0394532;STB=0.522369;TYPE=snp;VARB=0.0172557;OID=.;OPOS=6167196;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:54:53:29:29:24:24:15:9:12:17:15:9:12:17 chr12 6172202 . T C 682.46 PASS AO=51;DP=71;FAO=70;FDP=70;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=31;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.140616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.992;QD=38.9975;RBI=0.142381;REFB=0;REVB=0.0223501;RO=0;SAF=12;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00114333;OID=.;OPOS=6172202;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:69:70:0:0:51:70:39:12:0:0:39:31:0:0 chr12 6174414 . T G 169.11 PASS AO=43;DP=95;FAO=43;FDP=95;FR=.;FRO=52;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=19;FSRR=33;FWDB=-0.00900278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.229;QD=7.12058;RBI=0.0121178;REFB=-0.00322123;REVB=-0.00811111;RO=52;SAF=19;SAR=24;SRF=19;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0767198;STB=0.542838;TYPE=snp;VARB=0.00408036;OID=.;OPOS=6174414;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:52:52:43:43:24:19:19:33:24:19:19:33 chr12 6174423 . T A 156.58 PASS AO=40;DP=89;FAO=40;FDP=90;FR=.;FRO=50;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=18;FSRR=32;FWDB=-0.0151329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.322;QD=6.95901;RBI=0.0376962;REFB=-0.0325908;REVB=-0.0345254;RO=49;SAF=18;SAR=22;SRF=18;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0828992;STB=0.550995;TYPE=snp;VARB=0.0273179;OID=.;OPOS=6174423;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:90:49:50:40:40:22:18:18:31:22:18:18:32 chr12 6182828 . A T 61.92 PASS AO=17;DP=52;FAO=19;FDP=53;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.0466553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8485;QD=4.67304;RBI=0.0494999;REFB=-0.0113043;REVB=0.0165387;RO=33;SAF=11;SAR=6;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185236;STB=0.624082;TYPE=snp;VARB=0.0332647;OID=.;OPOS=6182828;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:52:53:33:34:17:19:6:11:16:17:6:13:17:17 chr12 6204902 . CA C 156.39 PASS AO=33;DP=68;FAO=34;FDP=65;FR=.;FRO=31;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.0521995;FXX=0.0298463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=35.3093;QD=9.62408;RBI=0.056115;REFB=-0.0128205;REVB=0.0205939;RO=31;SAF=17;SAR=16;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0552866;STB=0.537049;TYPE=del;VARB=0.0103459;OID=.;OPOS=6204903;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:33:67:34:65:31:18:16:14:17:99:31:17:16:14:17 chr12 6344600 . C A 163.63 PASS AO=64;DP=192;FAO=63;FDP=189;FR=.;FRO=126;FSAF=38;FSAR=25;FSRF=71;FSRR=55;FWDB=-0.00755217;FXX=0.0156242;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.716;QD=3.46298;RBI=0.0165744;REFB=-0.00329964;REVB=0.0147538;RO=128;SAF=39;SAR=25;SRF=72;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0562387;STB=0.527311;TYPE=snp;VARB=0.00693213;OID=.;OPOS=6344600;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:189:128:126:64:63:25:39:72:56:25:38:71:55 chr12 6421495 . G A 397.49 PASS AO=98;DP=206;FAO=98;FDP=205;FR=.;FRO=107;FSAF=47;FSAR=51;FSRF=40;FSRR=67;FWDB=-0.0342429;FXX=0.00485413;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.511;QD=7.7559;RBI=0.0363525;REFB=-0.0134958;REVB=0.0122036;RO=107;SAF=47;SAR=51;SRF=40;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100834;STB=0.555533;TYPE=snp;VARB=0.013651;OID=.;OPOS=6421495;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:206:205:107:107:98:98:51:47:40:67:51:47:40:67 chr12 6427052 . C T 203.74 PASS AO=42;DP=77;FAO=42;FDP=77;FR=.;FRO=35;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=-0.00277702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.8877;QD=10.584;RBI=0.0369858;REFB=-0.0301388;REVB=0.0368814;RO=34;SAF=22;SAR=20;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0526271;STB=0.534809;TYPE=snp;VARB=0.0244784;OID=.;OPOS=6427052;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:34:35:42:42:20:22:20:14:20:22:21:14 chr12 6428116 . T G 225.01 PASS AO=63;DP=149;FAO=63;FDP=149;FR=.;FRO=86;FSAF=18;FSAR=45;FSRF=29;FSRR=57;FWDB=-0.00441608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.546;QD=6.04051;RBI=0.00441744;REFB=-0.017519;REVB=-0.000109693;RO=86;SAF=18;SAR=45;SRF=29;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0628469;STB=0.535296;TYPE=snp;VARB=0.0233468;OID=.;OPOS=6428116;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:86:86:63:63:45:18:29:57:45:18:29:57 chr12 6437004 . AG A,AGG 23.88 PASS AO=22,13;DP=98;FAO=24,0;FDP=80;FR=.;FRO=56;FSAF=9,0;FSAR=15,0;FSRF=7;FSRR=49;FWDB=-0.0596632,0.061955;FXX=0.0361402;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=9.81721,9.55867;QD=1.19423;RBI=0.180858,0.210953;REFB=-0.0247648,0.0265691;REVB=0.170733,-0.20165;RO=44;SAF=7,1;SAR=15,12;SRF=7;SRR=37;SSEN=0,0;SSEP=0.364532,0;SSSB=0.234069,-0.245235;STB=0.705753,0.5;TYPE=del,ins;VARB=0.0778001,-0.0101136;OID=.,.;OPOS=6437005,6437005;OREF=G,-;OALT=-,G;OMAPALT=A,AGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:22,13:80:24,0:80:56:9,0:15,0:7:49:23:44:7,1:15,12:7:37 chr12 6437069 . CGG CG,C 24.36 PASS AO=4,5;DP=27;FAO=9,1;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=1,0;FSAR=8,1;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0584667,0.0344153;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,2;MLLD=8.11874,13.6227;QD=4.87159;RBI=0.285829,0.154537;REFB=-0.122004,-0.0676899;REVB=-0.279786,-0.150657;RO=0;SAF=0,0;SAR=4,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.305263,0.305263;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.740083,0.987514;TYPE=del,del;VARB=-0.0201018,0.0724149;OID=.,.;OPOS=6437070,6437070;OREF=G,GG;OALT=-,-;OMAPALT=CG,C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:4,5:17:9,1:20:10:1,0:8,1:4:6:15:0:0,0:4,5:0:0 chr12 6439470 . A G 311.21 PASS AO=61;DP=105;FAO=61;FDP=105;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=47;FSRF=12;FSRR=32;FWDB=-0.0125828;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=254.797;QD=11.8557;RBI=0.0125828;REFB=0.00229817;REVB=1.90518e-05;RO=44;SAF=14;SAR=47;SRF=12;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0455525;STB=0.524906;TYPE=snp;VARB=-0.00187922;OID=.;OPOS=6439470;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:44:44:61:61:47:14:12:32:47:14:12:32 chr12 6440009 . T C 171.85 PASS AO=42;DP=94;FAO=45;FDP=98;FR=.;FRO=53;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=23;FSRR=30;FWDB=-0.00205009;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.8003;QD=7.01447;RBI=0.00788453;REFB=-0.0168842;REVB=0.00761334;RO=52;SAF=15;SAR=27;SRF=23;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0887335;STB=0.5318;TYPE=snp;VARB=0.0244443;OID=.;OPOS=6440009;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:98:52:53:42:45:27:15:23:29:28:17:23:30 chr12 6442346 . A G 113.99 PASS AO=22;DP=40;FAO=22;FDP=40;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=14;FWDB=-0.0717635;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.827;QD=11.3994;RBI=0.0717648;REFB=0.0103618;REVB=0.000435449;RO=18;SAF=8;SAR=14;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128491;STB=0.571367;TYPE=snp;VARB=-0.0103891;OID=.;OPOS=6442346;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:40:40:18:18:22:22:14:8:4:14:14:8:4:14 chr12 6450945 . T C 89.04 PASS AO=19;DP=38;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.00835725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.358;QD=9.37212;RBI=0.00996823;REFB=-0.0447519;REVB=-0.0054334;RO=19;SAF=9;SAR=10;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0467664;STB=0.526435;TYPE=snp;VARB=0.0439727;OID=.;OPOS=6450945;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:38:38:19:19:19:19:10:9:8:11:10:9:8:11 chr12 6457062 . T C 104.75 PASS AO=38;DP=116;FAO=39;FDP=117;FR=.;FRO=78;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=55;FWDB=-0.0849063;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.7243;QD=3.58118;RBI=0.0869392;REFB=-0.00574232;REVB=0.0186909;RO=76;SAF=18;SAR=20;SRF=23;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201731;STB=0.613674;TYPE=snp;VARB=0.0110056;OID=.;OPOS=6457062;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:117:76:78:38:39:20:18:23:53:21:18:23:55 chr12 6484709 . T C 84.68 PASS AO=15;DP=43;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=-0.000642436;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.02;QD=6.91275;RBI=0.0367907;REFB=-0.0326405;REVB=-0.0367851;RO=28;SAF=10;SAR=5;SRF=19;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0148419;STB=0.585279;TYPE=snp;VARB=0.0377302;OID=.;OPOS=6484709;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:43:49:28:28:15:21:5:10:19:9:5:16:18:10 chr12 6495275 . C A 92.87 PASS AO=22;DP=48;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=1;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=26;FWDB=0.0344169;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.824;QD=7.73918;RBI=0.0739089;REFB=-0.0500542;REVB=-0.0654065;RO=24;SAF=1;SAR=21;SRF=0;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.334974;STB=0.691064;TYPE=snp;VARB=0.0546173;OID=.;OPOS=6495275;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:48:48:24:26:22:22:21:1:0:24:21:1:0:26 chr12 6499385 . A G 89.83 PASS AO=26;DP=62;FAO=24;FDP=60;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=0.0172579;FXX=0.0322529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.334;QD=5.98835;RBI=0.0196984;REFB=-0.00609406;REVB=-0.00949689;RO=36;SAF=11;SAR=15;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0222127;STB=0.517031;TYPE=snp;VARB=0.00935827;OID=.;OPOS=6499385;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:62:60:36:36:26:24:15:11:16:20:14:10:16:20 chr12 6500105 . T G 139.97 PASS AO=19;DP=23;FAO=19;FDP=23;FR=.;FRO=4;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.00703532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.455;QD=24.342;RBI=0.0391543;REFB=0.00813741;REVB=-0.0385171;RO=4;SAF=7;SAR=12;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0442778;STB=0.524246;TYPE=snp;VARB=-0.0020714;OID=.;OPOS=6500105;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:23:23:4:4:19:19:12:7:2:2:12:7:2:2 chr12 6560473 . A G 150.15 PASS AO=16;DP=17;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0131829;FXX=0.0587889;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.801;QD=37.5385;RBI=0.0232657;REFB=0;REVB=-0.0191704;RO=0;SAF=4;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07465e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000316125;OID=.;OPOS=6560473;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:17:16:0:0:16:16:12:4:0:0:12:4:0:0 chr12 6619284 . C G 1819.98 PASS AO=184;DP=187;FAO=189;FDP=189;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0256342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.676;QD=38.5181;RBI=0.026311;REFB=0;REVB=0.00592932;RO=0;SAF=92;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.90779e-05;OID=.;OPOS=6619284;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:187:189:0:0:184:189:92:92:0:0:93:96:0:0 chr12 6631169 . C A 689.96 PASS AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0444561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7013;QD=37.8059;RBI=0.0517189;REFB=0;REVB=-0.0264292;RO=0;SAF=9;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000151597;OID=.;OPOS=6631169;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:73:73:0:0:73:73:64:9:0:0:64:9:0:0 chr12 6637845 . T C 401.64 PASS AO=41;DP=41;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0297891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.5162;QD=37.3618;RBI=0.0623053;REFB=0;REVB=0.0547226;RO=0;SAF=21;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02085e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000162776;OID=.;OPOS=6637845;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:41:43:0:0:41:43:20:21:0:0:22:21:0:0 chr12 6638116 . C T 1188.31 PASS AO=124;DP=126;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00229203;FXX=0.0158718;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.332;QD=38.3327;RBI=0.023374;REFB=0;REVB=0.0232614;RO=0;SAF=58;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00059757;OID=.;OPOS=6638116;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:126:124:0:0:124:124:66:58:0:0:66:58:0:0 chr12 6639088 . A G 1394.31 PASS AO=129;DP=131;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0655936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.3694;QD=37.9405;RBI=0.065661;REFB=0;REVB=-0.00297589;RO=0;SAF=41;SAR=88;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000166205;OID=.;OPOS=6639088;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:131:147:0:0:129:147:88:41:0:0:93:54:0:0 chr12 6664605 . C A 10.38 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.1985;QD=5.93183;RBI=0.0214998;REFB=-0.0418244;REVB=-0.0214998;RO=5;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0666444;OID=.;OPOS=6664605;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:5:5:2:2:2:0:0:5:2:0:0:5 chr12 6707526 . G A 351.19 PASS AO=55;DP=74;FAO=56;FDP=77;FR=.;FRO=21;FSAF=34;FSAR=22;FSRF=16;FSRR=5;FWDB=0.00378714;FXX=0.124986;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.3;QD=18.2438;RBI=0.0221733;REFB=-0.018137;REVB=0.0218475;RO=19;SAF=34;SAR=21;SRF=16;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116927;STB=0.545078;TYPE=snp;VARB=0.00672695;OID=.;OPOS=6707526;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:74:77:19:21:55:56:21:34:16:3:22:34:16:5 chr12 6709059 . G A 631.13 PASS AO=128;DP=244;FAO=135;FDP=249;FR=.;FRO=114;FSAF=41;FSAR=94;FSRF=40;FSRR=74;FWDB=0.014814;FXX=0.00796781;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.156;QD=10.1387;RBI=0.0151702;REFB=-0.0114244;REVB=0.00326807;RO=116;SAF=37;SAR=91;SRF=41;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0659121;STB=0.525027;TYPE=snp;VARB=0.00973302;OID=.;OPOS=6709059;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:249:116:114:128:135:91:37:41:75:94:41:40:74 chr12 6711147 . C A 284.29 PASS AO=58;DP=105;FAO=58;FDP=104;FR=.;FRO=46;FSAF=31;FSAR=27;FSRF=31;FSRR=15;FWDB=0.000273561;FXX=0.0095229;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.113;QD=10.9342;RBI=0.0593919;REFB=-0.0253025;REVB=-0.0593913;RO=43;SAF=31;SAR=27;SRF=29;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110647;STB=0.562479;TYPE=snp;VARB=0.0177675;OID=.;OPOS=6711147;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:104:43:46:58:58:27:31:29:14:27:31:31:15 chr12 6747295 . G A 351.11 PASS AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00215971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.958;QD=37.9579;RBI=0.0522606;REFB=0;REVB=0.0522159;RO=0;SAF=35;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.50694e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00017092;OID=.;OPOS=6747295;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:37:37:0:0:37:37:2:35:0:0:2:35:0:0 chr12 6747342 . G C 94.55 PASS AO=22;DP=47;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=18;FSAR=4;FSRF=22;FSRR=3;FWDB=-0.0212063;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=235.282;QD=8.04701;RBI=0.0295573;REFB=0.0065306;REVB=-0.0205894;RO=25;SAF=18;SAR=4;SRF=22;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10594;STB=0.559391;TYPE=snp;VARB=-0.00732564;OID=.;OPOS=6747342;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:47:47:25:25:22:22:4:18:22:3:4:18:22:3 chr12 6775967 . A G 221.67 PASS AO=44;DP=95;FAO=52;FDP=103;FR=.;FRO=51;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=14;FSRR=37;FWDB=0.0320008;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.943;QD=8.60862;RBI=0.0586412;REFB=-0.0325316;REVB=0.04914;RO=51;SAF=19;SAR=25;SRF=14;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158728;STB=0.56822;TYPE=snp;VARB=0.027291;OID=.;OPOS=6775967;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:103:51:51:44:52:25:19:14:37:31:21:14:37 chr12 6887020 . T C 344.78 PASS AO=88;DP=193;FAO=89;FDP=194;FR=.;FRO=105;FSAF=38;FSAR=51;FSRF=43;FSRR=62;FWDB=-0.0289008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.872;QD=7.10882;RBI=0.0423228;REFB=-0.0251128;REVB=-0.0309186;RO=104;SAF=38;SAR=50;SRF=42;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0279875;STB=0.509671;TYPE=snp;VARB=0.0303679;OID=.;OPOS=6887020;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:194:104:105:88:89:50:38:42:62:51:38:43:62 chr12 6925149 . C T 122.94 PASS AO=30;DP=66;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=9;FWDB=-0.0171058;FXX=0.0151492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.672;QD=7.56553;RBI=0.0334941;REFB=-0.0302291;REVB=0.0287966;RO=35;SAF=13;SAR=17;SRF=26;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.290628;STB=0.662236;TYPE=snp;VARB=0.0281164;OID=.;OPOS=6925149;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:65:35:35:30:30:17:13:26:9:17:13:26:9 chr12 6926363 . T C 246.86 PASS AO=60;DP=126;FAO=61;FDP=130;FR=.;FRO=69;FSAF=25;FSAR=36;FSRF=31;FSRR=38;FWDB=0.0158906;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=74.9487;QD=7.59581;RBI=0.0570242;REFB=-0.0528721;REVB=-0.0547653;RO=66;SAF=25;SAR=35;SRF=31;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0510073;STB=0.521462;TYPE=snp;VARB=0.0405428;OID=.;OPOS=6926363;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:130:66:69:60:61:35:25:31:35:36:25:31:38 chr12 6928074 . GT G 25.8 PASS AO=8;DP=47;FAO=12;FDP=44;FR=.;FRO=32;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=24;FWDB=-0.194033;FXX=0.0434688;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.938;QD=2.34566;RBI=0.19413;REFB=-0.00478704;REVB=0.00613878;RO=23;SAF=1;SAR=7;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.258438;STB=0.738295;TYPE=del;VARB=0.00726521;OID=.;OPOS=6928075;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:8:40:12:44:32:1:11:8:24:25:23:1:7:6:17 chr12 6928586 . CA AG 957.64 PASS AO=122;DP=187;FAO=137;FDP=169;FR=.;FRO=32;FSAF=56;FSAR=81;FSRF=4;FSRR=28;FWDB=0.102002;FXX=0.0451952;HRUN=4;LEN=2;MLLD=37.0657;QD=22.6659;RBI=0.102022;REFB=-0.0333752;REVB=-0.00202084;RO=0;SAF=44;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.06142e-08;STB=0.556723;TYPE=mnp;VARB=0.00620286;OID=.;OPOS=6928586;OREF=CA;OALT=AG;OMAPALT=AG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:153:169:0:32:122:137:78:44:0:0:81:56:4:28 chr12 6935977 . A G 84.69 PASS AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=-0.0553919;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.9161;QD=7.05728;RBI=0.0558077;REFB=0.00443511;REVB=-0.00679976;RO=27;SAF=14;SAR=7;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.040354;STB=0.523055;TYPE=snp;VARB=-0.00756572;OID=.;OPOS=6935977;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:48:48:27:27:21:21:7:14:17:10:7:14:17:10 chr12 6939850 . A G 190.68 PASS AO=28;DP=39;FAO=28;FDP=38;FR=.;FRO=10;FSAF=24;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.0230681;FXX=0.0256345;HRUN=3;LEN=1;MLLD=108.851;QD=20.0714;RBI=0.0282027;REFB=-0.0203015;REVB=0.0162251;RO=10;SAF=24;SAR=4;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.328983;STB=0.681666;TYPE=snp;VARB=0.0232822;OID=.;OPOS=6939850;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:39:38:10:10:28:28:4:24:4:6:4:24:4:6 chr12 6941021 . G A 61.35 PASS AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.0244311;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=214.866;QD=6.13491;RBI=0.0247946;REFB=-0.0191318;REVB=-0.00423033;RO=24;SAF=8;SAR=8;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172932;STB=0.59988;TYPE=snp;VARB=0.024954;OID=.;OPOS=6941021;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:40:40:24:24:16:16:8:8:16:8:8:8:16:8 chr12 6942823 . A G 157.56 PASS AO=33;DP=63;FAO=33;FDP=62;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.0211892;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.473;QD=10.1651;RBI=0.0267449;REFB=-0.0111471;REVB=-0.016319;RO=29;SAF=17;SAR=16;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0308972;STB=0.51713;TYPE=snp;VARB=0.0108326;OID=.;OPOS=6942823;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:62:29:29:33:33:16:17:16:13:16:17:16:13 chr12 6946247 . G T 31.63 PASS AO=7;DP=17;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0122078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.001;QD=7.44219;RBI=0.0128914;REFB=-0.0209984;REVB=-0.00414232;RO=10;SAF=4;SAR=3;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164676;STB=0.599717;TYPE=snp;VARB=0.0183736;OID=.;OPOS=6946247;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:17:17:10:10:7:7:3:4:4:6:3:4:4:6 chr12 6948468 . T C 48.75 PASS AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=-0.0192673;FXX=0.0555247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.091;QD=11.4712;RBI=0.0452467;REFB=-0.0260436;REVB=-0.0409394;RO=8;SAF=8;SAR=1;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219741;STB=0.631235;TYPE=snp;VARB=0.0194937;OID=.;OPOS=6948468;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:18:17:8:8:9:9:1:8:6:2:1:8:6:2 chr12 7045389 . TG T 49.13 PASS AO=18;DP=55;FAO=26;FDP=55;FR=.;FRO=29;FSAF=2;FSAR=24;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.15567;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.3619;QD=3.5732;RBI=0.157326;REFB=-0.0511031;REVB=-0.0227653;RO=27;SAF=1;SAR=17;SRF=14;SRR=13;SSEN=0.375;SSEP=0;SSSB=-0.658285;STB=0.842642;TYPE=del;VARB=0.117829;OID=.;OPOS=7045390;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:18:54:26:55:29:2:24:15:14:48:27:1:17:14:13 chr12 7047143 . C A 138.86 PASS AO=15;DP=16;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132304;FXX=0.062461;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7752;QD=37.0296;RBI=0.0984248;REFB=0;REVB=0.0975315;RO=0;SAF=6;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00331427;OID=.;OPOS=7047143;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:15:0:0:15:15:9:6:0:0:9:6:0:0 chr12 7052978 . G A 262.84 PASS AO=50;DP=84;FAO=50;FDP=84;FR=.;FRO=34;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=31;FSRR=3;FWDB=-0.00769904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.319;QD=12.516;RBI=0.0189844;REFB=-0.0114804;REVB=0.0173532;RO=34;SAF=28;SAR=22;SRF=31;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.276788;STB=0.649597;TYPE=snp;VARB=0.0084103;OID=.;OPOS=7052978;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:34:34:50:50:22:28:31:3:22:28:31:3 chr12 7055860 . T C 231.77 PASS AO=23;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0219528;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.029;QD=37.0834;RBI=0.021963;REFB=0;REVB=-0.000668843;RO=0;SAF=13;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.2862e-05;OID=.;OPOS=7055860;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:25:25:0:0:23:25:10:13:0:0:10:15:0:0 chr12 7065635 . T C 555.77 PASS AO=41;DP=56;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00681629;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.907;QD=38.3286;RBI=0.032267;REFB=0;REVB=0.0315388;RO=0;SAF=15;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000109971;OID=.;OPOS=7065635;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:41:58:0:0:41:58:26:15:0:0:29:29:0:0 chr12 7079215 . T G 543.52 PASS AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000428405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.465;QD=38.1421;RBI=0.00747209;REFB=0;REVB=0.0074598;RO=0;SAF=20;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.87443e-05;OID=.;OPOS=7079215;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:57:57:0:0:57:57:37:20:0:0:37:20:0:0 chr12 7080212 . T C 300.29 PASS AO=34;DP=39;FAO=35;FDP=37;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.012978;FXX=0.0512689;HRUN=3;LEN=1;MLLD=160.152;QD=32.4633;RBI=0.055427;REFB=0.177729;REVB=0.0538863;RO=2;SAF=16;SAR=18;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00306052;STB=0.500772;TYPE=snp;VARB=-0.00157965;OID=.;OPOS=7080212;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:39:37:2:2:34:35:18:16:1:1:18:17:1:1 chr12 7244956 . A T 278.59 PASS AO=60;DP=116;FAO=60;FDP=113;FR=.;FRO=53;FSAF=9;FSAR=51;FSRF=15;FSRR=38;FWDB=0.00892212;FXX=0.0341851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.671;QD=9.86141;RBI=0.0095251;REFB=-0.0108154;REVB=0.00333517;RO=49;SAF=9;SAR=51;SRF=15;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208174;STB=0.604405;TYPE=snp;VARB=0.0131253;OID=.;OPOS=7244956;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:113:49:53:60:60:51:9:15:34:51:9:15:38 chr12 7244962 . T G 268.29 PASS AO=58;DP=115;FAO=60;FDP=115;FR=.;FRO=55;FSAF=10;FSAR=50;FSRF=16;FSRR=39;FWDB=0.0402898;FXX=0.00861995;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.9279;QD=9.3317;RBI=0.0506918;REFB=0.0297567;REVB=-0.0307634;RO=56;SAF=8;SAR=50;SRF=18;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.26552;STB=0.593573;TYPE=snp;VARB=-0.0319502;OID=.;OPOS=7244962;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:56:55:58:60:50:8:18:38:50:10:16:39 chr12 7249598 . T C 176.34 PASS AO=48;DP=110;FAO=48;FDP=112;FR=.;FRO=64;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=30;FSRR=34;FWDB=0.00286745;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.066;QD=6.29776;RBI=0.0342175;REFB=-0.00636599;REVB=-0.0340971;RO=60;SAF=21;SAR=27;SRF=29;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0459085;STB=0.518051;TYPE=snp;VARB=0.0111067;OID=.;OPOS=7249598;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:112:60:64:48:48:27:21:29:31:27:21:30:34 chr12 7277236 . T A 54.76 PASS AO=18;DP=51;FAO=17;FDP=50;FR=.;FRO=33;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=29;FWDB=0.0134068;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.387;QD=4.38076;RBI=0.0211432;REFB=-0.00743058;REVB=-0.016349;RO=33;SAF=4;SAR=14;SRF=4;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184027;STB=0.617531;TYPE=snp;VARB=0.0113064;OID=.;OPOS=7277236;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:51:50:33:33:18:17:14:4:4:29:13:4:4:29 chr12 7309199 . G A 23.52 PASS AO=6;DP=17;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.0180963;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=95.8907;QD=5.22644;RBI=0.0227917;REFB=-0.0228671;REVB=-0.0138559;RO=11;SAF=2;SAR=4;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0730921;STB=0.565012;TYPE=snp;VARB=0.0448351;OID=.;OPOS=7309199;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:17:18:11:12:6:6:4:2:3:8:4:2:3:9 chr12 7309471 . C A 339.21 PASS AO=32;DP=32;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0346811;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=179.604;QD=37.69;RBI=0.0391734;REFB=0;REVB=0.0182146;RO=0;SAF=21;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000157702;OID=.;OPOS=7309471;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:32:36:0:0:32:36:11:21:0:0:13:23:0:0 chr12 7309473 . G C 99.9 PASS AO=19;DP=33;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=0.00216805;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.977;QD=10.7999;RBI=0.00293167;REFB=-0.0214994;REVB=0.00197339;RO=14;SAF=13;SAR=6;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0356576;STB=0.501482;TYPE=snp;VARB=0.0192199;OID=.;OPOS=7309473;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:33:37:14:17:19:20:6:13:9:5:7:13:11:6 chr12 7310306 . C T 75.4 PASS AO=20;DP=54;FAO=20;FDP=50;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=0.00475846;FXX=0.0908926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.367;QD=6.03177;RBI=0.00985642;REFB=-0.0391512;REVB=0.00863168;RO=24;SAF=7;SAR=13;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22611;STB=0.64985;TYPE=snp;VARB=0.0303479;OID=.;OPOS=7310306;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:54:50:24:30:20:20:13:7:14:10:13:7:18:12 chr12 7463241 . A T 2929.07 PASS AO=176;DP=309;FAO=307;FDP=307;FR=.;FRO=0;FSAF=128;FSAR=179;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0296531;FXX=0.025396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.02;QD=38.1638;RBI=0.0296984;REFB=0.0446735;REVB=0.00164043;RO=0;SAF=94;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.99267e-06;OID=.;OPOS=7463241;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:178:307:0:0:176:307:82:94:0:0:179:128:0:0 chr12 7520771 . G A 263.84 PASS AO=79;DP=198;FAO=80;FDP=200;FR=.;FRO=120;FSAF=17;FSAR=63;FSRF=57;FSRR=63;FWDB=-0.00875801;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.018;QD=5.27675;RBI=0.0104849;REFB=-0.00800829;REVB=0.00576453;RO=119;SAF=17;SAR=62;SRF=57;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.326055;STB=0.685134;TYPE=snp;VARB=0.0102568;OID=.;OPOS=7520771;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:200:119:120:79:80:62:17:57:62:63:17:57:63 chr12 7528471 . G A 600.09 PASS AO=135;DP=283;FAO=144;FDP=292;FR=.;FRO=148;FSAF=68;FSAR=76;FSRF=64;FSRR=84;FWDB=-0.00480018;FXX=0.00680249;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.674;QD=8.22036;RBI=0.0109292;REFB=-0.0120437;REVB=0.00981859;RO=145;SAF=65;SAR=70;SRF=63;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0443955;STB=0.520273;TYPE=snp;VARB=0.0132941;OID=.;OPOS=7528471;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:283:292:145:148:135:144:70:65:63:82:76:68:64:84 chr12 7551022 . A T 1235.23 PASS AO=128;DP=129;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272315;FXX=0.0153834;HRUN=3;LEN=1;MLLD=259.831;QD=38.6008;RBI=0.0363929;REFB=0;REVB=0.024143;RO=0;SAF=54;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.92503e-05;OID=.;OPOS=7551022;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:129:128:0:0:128:128:74:54:0:0:74:54:0:0 chr12 7551050 . A C 1289.43 PASS AO=135;DP=135;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0252941;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=278.771;QD=38.2052;RBI=0.0311751;REFB=0;REVB=0.0182235;RO=0;SAF=61;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.04946e-06;OID=.;OPOS=7551050;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:135:135:0:0:135:135:74:61:0:0:74:61:0:0 chr12 7585247 . T C 31.13 PASS AO=9;DP=17;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=10;FWDB=-0.103943;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.718;QD=7.32525;RBI=0.133231;REFB=-0.0730133;REVB=-0.0833449;RO=8;SAF=1;SAR=8;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.297832;STB=0.726875;TYPE=snp;VARB=0.0998562;OID=.;OPOS=7585247;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:17:17:8:10:9:7:8:1:0:8:6:1:0:10 chr12 7585971 . A G 228.74 PASS AO=62;DP=146;FAO=63;FDP=147;FR=.;FRO=84;FSAF=19;FSAR=44;FSRF=18;FSRR=66;FWDB=0.0307442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.753;QD=6.22427;RBI=0.0343851;REFB=-0.0365006;REVB=0.0153988;RO=83;SAF=19;SAR=43;SRF=18;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113792;STB=0.562112;TYPE=snp;VARB=0.0376876;OID=.;OPOS=7585971;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:147:83:84:62:63:43:19:18:65:44:19:18:66 chr12 7649484 . T C 1229.49 PASS AO=128;DP=128;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0359696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.6288;QD=38.4217;RBI=0.0518676;REFB=0;REVB=0.0373689;RO=0;SAF=67;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.14595e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000355951;OID=.;OPOS=7649484;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:128:128:0:0:128:128:61:67:0:0:61:67:0:0 chr12 7649653 . T C 753.58 PASS AO=70;DP=70;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0338518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.003;QD=38.156;RBI=0.0344384;REFB=0;REVB=-0.00632922;RO=0;SAF=35;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.35486e-05;OID=.;OPOS=7649653;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:70:79:0:0:70:79:35:35:0:0:37:42:0:0 chr12 7655137 . A G 563.27 PASS AO=65;DP=70;FAO=65;FDP=70;FR=.;FRO=5;FSAF=42;FSAR=23;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.00330628;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.7985;QD=32.1866;RBI=0.0597881;REFB=0.0369671;REVB=0.0596966;RO=5;SAF=42;SAR=23;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0529917;STB=0.528081;TYPE=snp;VARB=-0.00881276;OID=.;OPOS=7655137;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:70:5:5:65:65:23:42:5:0:23:42:5:0 chr12 7655278 . T A 1878.81 PASS AO=196;DP=196;FAO=196;FDP=196;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0262081;FXX=0.00507588;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.4111;QD=38.3431;RBI=0.0290627;REFB=0;REVB=-0.0125608;RO=0;SAF=86;SAR=110;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000113272;OID=.;OPOS=7655278;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:89:196:196:0:0:196:196:110:86:0:0:110:86:0:0 chr12 7779227 . A G 1309.65 PASS AO=128;DP=128;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.151021;FXX=0.00724585;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.4357;QD=38.2379;RBI=0.155001;REFB=0;REVB=0.0348996;RO=0;SAF=36;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17504e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00036448;OID=.;OPOS=7779227;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:128:137:0:0:128:137:92:36:0:0:93:44:0:0 chr12 7805236 . C G 1279.8 PASS AO=134;DP=135;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0227246;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9335;QD=38.2029;RBI=0.0260863;REFB=0;REVB=0.0128098;RO=0;SAF=62;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.71502e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.13245e-05;OID=.;OPOS=7805236;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:135:134:0:0:134:134:72:62:0:0:72:62:0:0 chr12 7867847 . G C 620.58 PASS AO=163;DP=365;FAO=165;FDP=365;FR=.;FRO=200;FSAF=83;FSAR=82;FSRF=47;FSRR=153;FWDB=0.00485358;FXX=0.0108398;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.435;QD=6.80083;RBI=0.00848633;REFB=-0.00758995;REVB=0.00696135;RO=193;SAF=81;SAR=82;SRF=42;SRR=151;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.277221;STB=0.646594;TYPE=snp;VARB=0.00633882;OID=.;OPOS=7867847;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:365:365:193:200:163:165:82:81:42:151:82:83:47:153 chr12 7945559 . T C 128.36 PASS AO=50;DP=153;FAO=52;FDP=160;FR=.;FRO=108;FSAF=33;FSAR=19;FSRF=54;FSRR=54;FWDB=-0.070074;FXX=0.0243888;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.4148;QD=3.20897;RBI=0.0736431;REFB=-0.025653;REVB=-0.0226482;RO=102;SAF=31;SAR=19;SRF=49;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164149;STB=0.593021;TYPE=snp;VARB=0.0492877;OID=.;OPOS=7945559;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:160:102:108:50:52:19:31:49:53:19:33:54:54 chr12 7945640 . G T 73.86 PASS AO=27;DP=83;FAO=27;FDP=83;FR=.;FRO=56;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=42;FWDB=0.00906971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.7155;QD=3.55945;RBI=0.0178048;REFB=-0.000899285;REVB=-0.0153216;RO=56;SAF=13;SAR=14;SRF=14;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.274958;STB=0.658124;TYPE=snp;VARB=0.00142349;OID=.;OPOS=7945640;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:83:83:56:56:27:27:14:13:14:42:14:13:14:42 chr12 7945670 . G A 36.49 PASS AO=16;DP=60;FAO=16;FDP=60;FR=.;FRO=44;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=31;FWDB=-0.0028832;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=276.99;QD=2.43251;RBI=0.0226427;REFB=0.00154291;REVB=0.0224584;RO=44;SAF=6;SAR=10;SRF=13;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106131;STB=0.564144;TYPE=snp;VARB=-0.00446653;OID=.;OPOS=7945670;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:60:60:44:44:16:16:10:6:13:31:10:6:13:31 chr12 7947304 . T C 75.03 PASS AO=30;DP=97;FAO=30;FDP=97;FR=.;FRO=67;FSAF=2;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=67;FWDB=0.0245047;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=267.987;QD=3.09421;RBI=0.0261219;REFB=0.00690691;REVB=0.00904856;RO=67;SAF=2;SAR=28;SRF=0;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.502905;STB=0.77227;TYPE=snp;VARB=-0.0138743;OID=.;OPOS=7947304;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:97:97:67:67:30:30:28:2:0:67:28:2:0:67 chr12 7966958 . C T 497.34 PASS AO=136;DP=308;FAO=136;FDP=308;FR=.;FRO=172;FSAF=69;FSAR=67;FSRF=50;FSRR=122;FWDB=-0.00897984;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=194.499;QD=6.45891;RBI=0.0126584;REFB=-0.0128265;REVB=0.00892174;RO=172;SAF=69;SAR=67;SRF=50;SRR=122;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21865;STB=0.620569;TYPE=snp;VARB=0.012251;OID=.;OPOS=7966958;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:308:308:172:172:136:136:67:69:50:122:67:69:50:122 chr12 7982399 . T C 152.05 PASS AO=51;DP=143;FAO=52;FDP=144;FR=.;FRO=92;FSAF=51;FSAR=1;FSRF=69;FSRR=23;FWDB=0.09711;FXX=0.00689608;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.9527;QD=4.22369;RBI=0.0978643;REFB=-0.135016;REVB=-0.0121276;RO=87;SAF=51;SAR=0;SRF=64;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.81192;STB=0.91047;TYPE=snp;VARB=0.060361;OID=.;OPOS=7982399;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:144:87:92:51:52:0:51:64:23:1:51:69:23 chr12 8043688 . G C 2200.97 PASS AO=233;DP=237;FAO=233;FDP=233;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=142;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0312283;FXX=0.0168769;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.856;QD=37.7849;RBI=0.0312402;REFB=0.00540062;REVB=-0.000863491;RO=2;SAF=91;SAR=142;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00186367;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.59854e-05;OID=.;OPOS=8043688;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:237:233:2:0:233:233:142:91:1:1:142:91:0:0 chr12 8082367 . T C 488.52 PASS AO=49;DP=50;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00465176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.356;QD=37.5783;RBI=0.0209486;REFB=0;REVB=0.0204256;RO=0;SAF=38;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000162152;OID=.;OPOS=8082367;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:50:52:0:0:49:52:11:38:0:0:12:40:0:0 chr12 8278181 . A T 1366.22 PASS AO=145;DP=149;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016035;FXX=0.0201329;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.4367;QD=37.4306;RBI=0.0170941;REFB=-0.024779;REVB=0.00592351;RO=2;SAF=80;SAR=65;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00135257;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.08417e-05;OID=.;OPOS=8278181;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:149:146:2:0:145:146:65:80:1:1:65:81:0:0 chr12 8329652 . A G 316.55 PASS AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.025791;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.1586;QD=37.2411;RBI=0.0271555;REFB=0;REVB=-0.00849971;RO=0;SAF=22;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.75716e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000271626;OID=.;OPOS=8329652;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:34:0:0:34:34:12:22:0:0:12:22:0:0 chr12 8329676 . C T 290.01 PASS AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00391255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.099;QD=37.4205;RBI=0.0292599;REFB=0;REVB=-0.0289972;RO=0;SAF=21;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000273905;OID=.;OPOS=8329676;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:31:31:0:0:31:31:10:21:0:0:10:21:0:0 chr12 8329700 . A C 351.11 PASS AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00404845;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=141.753;QD=37.9579;RBI=0.0492054;REFB=0;REVB=0.0490385;RO=0;SAF=23;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.91909e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000115837;OID=.;OPOS=8329700;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:37:37:0:0:37:37:14:23:0:0:14:23:0:0 chr12 8329833 . G A 195.12 PASS AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0858764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.0876;QD=37.1662;RBI=0.0860397;REFB=0;REVB=0.00529896;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00333957;OID=.;OPOS=8329833;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:21:21:0:0:21:21:9:12:0:0:9:12:0:0 chr12 8374770 . G A 101.95 PASS AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00700671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.201;QD=37.0726;RBI=0.216885;REFB=0;REVB=0.216772;RO=0;SAF=7;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00421113;OID=.;OPOS=8374770;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:11:11:4:7:0:0:4:7:0:0 chr12 8374781 . C CACG 53.81 PASS AO=7;DP=10;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0105559;FXX=0;HRUN=0;LEN=3;MLLD=223.945;QD=23.916;RBI=0.0312029;REFB=-0.0230922;REVB=0.0293632;RO=3;SAF=3;SAR=4;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.288883;STB=0.624651;TYPE=ins;VARB=0.00247731;OID=.;OPOS=8374782;OREF=-;OALT=ACG;OMAPALT=CACG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:7:10:7:9:2:3:4:2:0:10:3:3:4:3:0 chr12 8376110 . T C 1015.51 PASS AO=104;DP=105;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0178397;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.009;QD=38.3209;RBI=0.0178893;REFB=0;REVB=0.00133077;RO=0;SAF=38;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.70806e-05;OID=.;OPOS=8376110;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:105:106:0:0:104:106:66:38:0:0:67:39:0:0 chr12 8637403 . G T 574.03 PASS AO=148;DP=343;FAO=156;FDP=347;FR=.;FRO=191;FSAF=59;FSAR=97;FSRF=85;FSRR=106;FWDB=-0.0113906;FXX=0.00287348;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.405;QD=6.61701;RBI=0.0131212;REFB=-0.0207474;REVB=0.00651293;RO=185;SAF=57;SAR=91;SRF=80;SRR=105;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0494036;STB=0.538365;TYPE=snp;VARB=0.0219988;OID=.;OPOS=8637403;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:343:347:185:191:148:156:91:57:80:105:97:59:85:106 chr12 8637417 . A C 730.82 PASS AO=162;DP=310;FAO=162;FDP=308;FR=.;FRO=146;FSAF=66;FSAR=96;FSRF=49;FSRR=97;FWDB=0.0125283;FXX=0.0064514;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.661;QD=9.49112;RBI=0.0137854;REFB=-0.0216572;REVB=0.00575151;RO=145;SAF=66;SAR=96;SRF=49;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0631641;STB=0.535701;TYPE=snp;VARB=0.017779;OID=.;OPOS=8637417;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:310:308:145:146:162:162:96:66:49:96:96:66:49:97 chr12 8666378 . C A 129.84 PASS AO=32;DP=66;FAO=31;FDP=66;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=7;FSRR=28;FWDB=-0.00222568;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.4858;QD=7.86936;RBI=0.0766591;REFB=0.0104922;REVB=-0.0766268;RO=33;SAF=11;SAR=21;SRF=7;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140003;STB=0.594539;TYPE=snp;VARB=-0.013724;OID=.;OPOS=8666378;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:33:35:32:31:21:11:7:26:20:11:7:28 chr12 8667897 . A G 491.38 PASS AO=122;DP=261;FAO=124;FDP=263;FR=.;FRO=139;FSAF=75;FSAR=49;FSRF=52;FSRR=87;FWDB=0.0044195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.298;QD=7.4734;RBI=0.0214578;REFB=-0.0244163;REVB=0.0209978;RO=137;SAF=74;SAR=48;SRF=51;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223199;STB=0.621061;TYPE=snp;VARB=0.0271642;OID=.;OPOS=8667897;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:261:263:137:139:122:124:48:74:51:86:49:75:52:87 chr12 8693333 . G A 434.84 PASS AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00598441;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.5984;QD=36.2368;RBI=0.0498309;REFB=-0.0728101;REVB=0.0494702;RO=1;SAF=24;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200087;STB=0.510634;TYPE=snp;VARB=0.00975606;OID=.;OPOS=8693333;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:48:48:1:1:47:47:23:24:0:1:23:24:0:1 chr12 8757481 . G A 431.52 PASS AO=112;DP=248;FAO=113;FDP=249;FR=.;FRO=136;FSAF=54;FSAR=59;FSRF=59;FSRR=77;FWDB=-0.00563761;FXX=0.0119043;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.8848;QD=6.93204;RBI=0.00574885;REFB=-0.00245349;REVB=0.00112544;RO=136;SAF=53;SAR=59;SRF=59;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0392118;STB=0.524155;TYPE=snp;VARB=0.00371273;OID=.;OPOS=8757481;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:248:249:136:136:112:113:59:53:59:77:59:54:59:77 chr12 8808006 . T C 153.88 PASS AO=43;DP=103;FAO=43;FDP=103;FR=.;FRO=60;FSAF=27;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=33;FWDB=-0.00249391;FXX=0.00961446;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.997;QD=5.97582;RBI=0.0170264;REFB=-0.00239614;REVB=0.0168428;RO=59;SAF=27;SAR=16;SRF=26;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194001;STB=0.604889;TYPE=snp;VARB=0.00431998;OID=.;OPOS=8808006;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:59:60:43:43:16:27:26:33:16:27:27:33 chr12 8926011 . T C 3776 PASS AO=394;DP=395;FAO=395;FDP=395;FR=.;FRO=0;FSAF=159;FSAR=236;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191409;FXX=0.0124997;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.12;QD=38.238;RBI=0.0566126;REFB=0;REVB=0.0532786;RO=0;SAF=163;SAR=231;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.5218e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.55666e-05;OID=.;OPOS=8926011;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:395:395:0:0:394:395:231:163:0:0:236:159:0:0 chr12 8975901 . C T 201.34 PASS AO=72;DP=222;FAO=79;FDP=237;FR=.;FRO=158;FSAF=17;FSAR=62;FSRF=79;FSRR=79;FWDB=0.0269105;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=207.92;QD=3.39809;RBI=0.0340685;REFB=-0.00103669;REVB=0.0208923;RO=150;SAF=17;SAR=55;SRF=79;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.364419;STB=0.712842;TYPE=snp;VARB=0.00216383;OID=.;OPOS=8975901;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:237:150:158:72:79:55:17:79:71:62:17:79:79 chr12 8976426 . G C 265.62 PASS AO=61;DP=123;FAO=61;FDP=122;FR=.;FRO=61;FSAF=22;FSAR=39;FSRF=29;FSRR=32;FWDB=-0.0137568;FXX=0.00812942;HRUN=4;LEN=1;MLLD=183.912;QD=8.70888;RBI=0.0194596;REFB=-0.00730574;REVB=-0.0137633;RO=61;SAF=22;SAR=39;SRF=29;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108692;STB=0.560104;TYPE=snp;VARB=0.0103172;OID=.;OPOS=8976426;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:122:61:61:61:61:39:22:29:32:39:22:29:32 chr12 8988240 . T C 45.38 PASS AO=26;DP=108;FAO=26;FDP=108;FR=.;FRO=82;FSAF=23;FSAR=3;FSRF=68;FSRR=14;FWDB=-0.0578398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.366;QD=1.68084;RBI=0.0717741;REFB=-0.000690339;REVB=0.042498;RO=82;SAF=23;SAR=3;SRF=68;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142526;STB=0.588779;TYPE=snp;VARB=0.00195843;OID=.;OPOS=8988240;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:108:108:82:82:26:26:3:23:68:14:3:23:68:14 chr12 8995756 . A G 84.98 PASS AO=34;DP=110;FAO=34;FDP=109;FR=.;FRO=75;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=35;FSRR=40;FWDB=-0.00355605;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.6153;QD=3.11844;RBI=0.0417853;REFB=-0.00262416;REVB=-0.0416337;RO=73;SAF=20;SAR=14;SRF=33;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15901;STB=0.583734;TYPE=snp;VARB=0.00764081;OID=.;OPOS=8995756;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:110:109:73:75:34:34:14:20:33:40:14:20:35:40 chr12 9004512 . G A 1906.93 PASS AO=197;DP=200;FAO=202;FDP=202;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=116;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0125326;FXX=0.00980344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.277;QD=37.7611;RBI=0.0212201;REFB=0;REVB=-0.0171239;RO=1;SAF=84;SAR=113;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00563599;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000252174;OID=.;OPOS=9004512;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:89:200:202:1:0:197:202:113:84:1:0:116:86:0:0 chr12 9004892 . C A 1082.22 PASS AO=114;DP=115;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122054;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.958;QD=37.6424;RBI=0.0140033;REFB=-0.0891292;REVB=0.00686448;RO=1;SAF=46;SAR=68;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0102105;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.17271e-05;OID=.;OPOS=9004892;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:115:115:1:0:114:115:68:46:1:0:69:46:0:0 chr12 9009820 . G A 220.14 PASS AO=52;DP=107;FAO=52;FDP=107;FR=.;FRO=55;FSAF=20;FSAR=32;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=0.007649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.734;QD=8.22967;RBI=0.0285244;REFB=-0.0220703;REVB=0.0274797;RO=55;SAF=20;SAR=32;SRF=29;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134674;STB=0.574751;TYPE=snp;VARB=0.0222381;OID=.;OPOS=9009820;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:55:55:52:52:32:20:29:26:32:20:29:26 chr12 9010671 . G A 104.99 PASS AO=26;DP=52;FAO=26;FDP=59;FR=.;FRO=33;FSAF=5;FSAR=21;FSRF=7;FSRR=26;FWDB=-0.0149328;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=92.1582;QD=7.11779;RBI=0.0363988;REFB=-0.0284189;REVB=-0.0331946;RO=26;SAF=5;SAR=21;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101885;STB=0.51744;TYPE=snp;VARB=0.0288563;OID=.;OPOS=9010671;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:59:26:33:26:26:21:5:7:19:21:5:7:26 chr12 9013747 . AG A 95.84 PASS AO=91;DP=245;FAO=84;FDP=230;FR=.;FRO=146;FSAF=52;FSAR=32;FSRF=74;FSRR=72;FWDB=-0.0863859;FXX=0.033612;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.731;QD=1.66682;RBI=0.0865573;REFB=-0.0142502;REVB=-0.00544506;RO=131;SAF=54;SAR=37;SRF=68;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0.441176;SSSB=0.0797251;STB=0.572864;TYPE=del;VARB=-0.0171767;OID=.;OPOS=9013748;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:91:238:84:230:146:52:32:74:72:95:131:54:37:68:63 chr12 9013755 . C T 336.74 PASS AO=103;DP=260;FAO=104;FDP=260;FR=.;FRO=156;FSAF=61;FSAR=43;FSRF=68;FSRR=88;FWDB=0.0221505;FXX=0.0188672;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.596;QD=5.1806;RBI=0.0236234;REFB=-0.0105608;REVB=0.00821089;RO=153;SAF=61;SAR=42;SRF=66;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171314;STB=0.590247;TYPE=snp;VARB=0.0126505;OID=.;OPOS=9013755;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:260:260:153:156:103:104:42:61:66:87:43:61:68:88 chr12 9016573 . A G 2108.19 PASS AO=219;DP=219;FAO=219;FDP=219;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=131;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00274979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.292;QD=38.5058;RBI=0.0581847;REFB=0;REVB=-0.0581197;RO=0;SAF=88;SAR=131;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.67537e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.34801e-05;OID=.;OPOS=9016573;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:219:219:0:0:219:219:131:88:0:0:131:88:0:0 chr12 9020489 . A G 677.13 PASS AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.156;QD=38.6929;RBI=0.0560672;REFB=0;REVB=0.0508756;RO=0;SAF=64;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000134874;OID=.;OPOS=9020489;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:70:70:0:0:70:70:6:64:0:0:6:64:0:0 chr12 9020912 . A G 1012.48 PASS AO=114;DP=120;FAO=114;FDP=120;FR=.;FRO=6;FSAF=56;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.00624909;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.977;QD=33.7493;RBI=0.00778367;REFB=-0.0249629;REVB=-0.00464051;RO=5;SAF=56;SAR=58;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0391883;STB=0.524586;TYPE=snp;VARB=0.000700423;OID=.;OPOS=9020912;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:120:120:5:6:114:114:58:56:0:5:58:56:0:6 chr12 9070366 . T A 206.16 PASS AO=62;DP=156;FAO=62;FDP=155;FR=.;FRO=93;FSAF=40;FSAR=22;FSRF=45;FSRR=48;FWDB=0.00523226;FXX=0.00640985;HRUN=3;LEN=1;MLLD=206.222;QD=5.32037;RBI=0.0133157;REFB=-0.0169303;REVB=-0.0122446;RO=93;SAF=40;SAR=22;SRF=45;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176349;STB=0.599539;TYPE=snp;VARB=0.0265371;OID=.;OPOS=9070366;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:155:93:93:62:62:22:40:45:48:22:40:45:48 chr12 9074259 . C T 35.86 PASS AO=13;DP=45;FAO=13;FDP=44;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.0016494;FXX=0.0222173;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.951;QD=3.25956;RBI=0.0237686;REFB=-0.00891719;REVB=0.0237113;RO=27;SAF=6;SAR=7;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105416;STB=0.605379;TYPE=snp;VARB=0.0183738;OID=.;OPOS=9074259;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:45:44:27:31:13:13:7:6:15:12:7:6:19:12 chr12 9086898 . A G 711.83 PASS AO=189;DP=404;FAO=185;FDP=400;FR=.;FRO=215;FSAF=89;FSAR=96;FSRF=107;FSRR=108;FWDB=-0.00359459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.98;QD=7.11827;RBI=0.0148639;REFB=-0.00956016;REVB=0.0144227;RO=212;SAF=94;SAR=95;SRF=107;SRR=105;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00707189;STB=0.508925;TYPE=snp;VARB=0.0124026;OID=.;OPOS=9086898;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:404:400:212:215:189:185:95:94:107:105:96:89:107:108 chr12 9090423 . AG A 2210.61 PASS AO=313;DP=371;FAO=361;FDP=361;FR=.;FRO=0;FSAF=236;FSAR=125;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.124297;FXX=0.0190212;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.5367;QD=24.4943;RBI=0.12532;REFB=0;REVB=0.0159787;RO=31;SAF=205;SAR=108;SRF=24;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0227635;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.000791213;OID=.;OPOS=9090424;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:313:364:361:361:0:236:125:0:0:99:31:205:108:24:7 chr12 9093001 . G A 669.61 PASS AO=58;DP=66;FAO=86;FDP=92;FR=.;FRO=6;FSAF=60;FSAR=26;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.0221712;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=35.8171;QD=29.1134;RBI=0.386323;REFB=-0.073462;REVB=0.385687;RO=8;SAF=52;SAR=6;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0672738;STB=0.523804;TYPE=snp;VARB=0.0232889;OID=.;OPOS=9093001;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:66:92:8:6:58:86:6:52:8:0:26:60:6:0 chr12 9142297 . T C 126.97 PASS AO=38;DP=99;FAO=38;FDP=99;FR=.;FRO=61;FSAF=8;FSAR=30;FSRF=22;FSRR=39;FWDB=-0.0525162;FXX=0.0198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.409;QD=5.12999;RBI=0.0532493;REFB=0.0127146;REVB=-0.00880538;RO=60;SAF=8;SAR=30;SRF=21;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194253;STB=0.619766;TYPE=snp;VARB=-0.0116619;OID=.;OPOS=9142297;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:60:61:38:38:30:8:21:39:30:8:22:39 chr12 9161648 . T C 131.11 PASS AO=47;DP=137;FAO=47;FDP=136;FR=.;FRO=89;FSAF=16;FSAR=31;FSRF=28;FSRR=61;FWDB=0.0185282;FXX=0.00729874;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.7175;QD=3.85604;RBI=0.0411781;REFB=0.00425837;REVB=0.0367742;RO=88;SAF=16;SAR=31;SRF=28;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0284621;STB=0.519033;TYPE=snp;VARB=-0.00839972;OID=.;OPOS=9161648;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:136:88:89:47:47:31:16:28:60:31:16:28:61 chr12 9248233 . T C 1937.89 PASS AO=204;DP=206;FAO=204;FDP=204;FR=.;FRO=0;FSAF=106;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144909;FXX=0.00970827;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.586;QD=37.9978;RBI=0.0435028;REFB=-0.0664169;REVB=0.0410184;RO=1;SAF=106;SAR=98;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00447259;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000385286;OID=.;OPOS=9248233;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:206:204:1:0:204:204:98:106:1:0:98:106:0:0 chr12 9305473 . T C 456.93 PASS AO=143;DP=359;FAO=143;FDP=359;FR=.;FRO=216;FSAF=57;FSAR=86;FSRF=96;FSRR=120;FWDB=-0.00159947;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=249.49;QD=5.09115;RBI=0.00414267;REFB=-0.00236733;REVB=-0.00382144;RO=213;SAF=57;SAR=86;SRF=95;SRR=118;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0522013;STB=0.52843;TYPE=snp;VARB=0.00373665;OID=.;OPOS=9305473;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:359:359:213:216:143:143:86:57:95:118:86:57:96:120 chr12 9315209 . A G 326.47 PASS AO=83;DP=182;FAO=84;FDP=183;FR=.;FRO=99;FSAF=36;FSAR=48;FSRF=45;FSRR=54;FWDB=-0.00736325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.431;QD=7.136;RBI=0.0161309;REFB=0.000727121;REVB=-0.0143523;RO=98;SAF=35;SAR=48;SRF=45;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0372742;STB=0.514282;TYPE=snp;VARB=-0.000995137;OID=.;OPOS=9315209;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:183:98:99:83:84:48:35:45:53:48:36:45:54 chr12 9316773 . T C 333.2 PASS AO=93;DP=201;FAO=93;FDP=218;FR=.;FRO=125;FSAF=29;FSAR=64;FSRF=50;FSRR=75;FWDB=-0.100203;FXX=0.004566;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.9699;QD=6.11377;RBI=0.101661;REFB=-0.041802;REVB=-0.0171575;RO=107;SAF=29;SAR=64;SRF=36;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0273908;STB=0.556387;TYPE=snp;VARB=0.0476342;OID=.;OPOS=9316773;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:218:107:125:93:93:64:29:36:71:64:29:50:75 chr12 9317784 . A G 283.99 PASS AO=50;DP=147;FAO=74;FDP=155;FR=.,HEALED;FRO=81;FSAF=34;FSAR=40;FSRF=24;FSRR=57;FWDB=0.0171201;FXX=0.0432072;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.32;QD=7.3287;RBI=0.0172144;REFB=-0.00406863;REVB=0.00179891;RO=81;SAF=32;SAR=18;SRF=24;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.362303;STB=0.587019;TYPE=snp;VARB=0.00526186;OID=.;OPOS=9317784;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:155:81:81:50:74:18:32:24:57:40:34:24:57 chr12 9317885 . G A 181.22 PASS AO=48;DP=112;FAO=48;FDP=110;FR=.;FRO=62;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=43;FSRR=19;FWDB=0.00228303;FXX=0.0178555;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.652;QD=6.58989;RBI=0.00766564;REFB=-0.014219;REVB=0.00731777;RO=61;SAF=22;SAR=26;SRF=43;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243865;STB=0.630545;TYPE=snp;VARB=0.0161066;OID=.;OPOS=9317885;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:110:61:62:48:48:26:22:43:18:26:22:43:19 chr12 9321501 . C T 286.78 PASS AO=71;DP=151;FAO=71;FDP=151;FR=.;FRO=80;FSAF=32;FSAR=39;FSRF=30;FSRR=50;FWDB=-0.00764419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.4066;QD=7.5967;RBI=0.00811371;REFB=-0.0226161;REVB=-0.00272005;RO=78;SAF=32;SAR=39;SRF=30;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0636358;STB=0.540817;TYPE=snp;VARB=0.0163304;OID=.;OPOS=9321501;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:151:78:80:71:71:39:32:30:48:39:32:30:50 chr12 9334571 . C T 261.05 PASS AO=70;DP=151;FAO=68;FDP=151;FR=.;FRO=83;FSAF=29;FSAR=39;FSRF=47;FSRR=36;FWDB=-0.0006642;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2753;QD=6.91516;RBI=0.0141014;REFB=-0.0076289;REVB=-0.0140857;RO=80;SAF=30;SAR=40;SRF=45;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128808;STB=0.576743;TYPE=snp;VARB=0.0107897;OID=.;OPOS=9334571;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:151:80:83:70:68:40:30:45:35:39:29:47:36 chr12 9345274 . C G 160.71 PASS AO=62;DP=183;FAO=63;FDP=192;FR=.;FRO=129;FSAF=14;FSAR=49;FSRF=45;FSRR=84;FWDB=-0.00490676;FXX=0.00518108;HRUN=3;LEN=1;MLLD=155.17;QD=3.34803;RBI=0.0187417;REFB=-0.0179633;REVB=-0.0180879;RO=118;SAF=14;SAR=48;SRF=42;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185996;STB=0.60821;TYPE=snp;VARB=0.0180051;OID=.;OPOS=9345274;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:192:118:129:62:63:48:14:42:76:49:14:45:84 chr12 9346792 . G C 123.8 PASS AO=59;DP=220;FAO=66;FDP=219;FR=.;FRO=153;FSAF=43;FSAR=23;FSRF=65;FSRR=88;FWDB=-0.0462189;FXX=0.0309721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=41.0243;QD=2.26122;RBI=0.0466387;REFB=-0.0530297;REVB=0.00624367;RO=134;SAF=43;SAR=16;SRF=58;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.360246;STB=0.657662;TYPE=snp;VARB=0.112987;OID=.;OPOS=9346792;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:220:219:134:153:59:66:16:43:58:76:23:43:65:88 chr12 9439294 . T C 470.3 PASS AO=124;DP=273;FAO=124;FDP=273;FR=.;FRO=149;FSAF=56;FSAR=68;FSRF=77;FSRR=72;FWDB=-0.00577863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.309;QD=6.89078;RBI=0.0093368;REFB=0.0158552;REVB=-0.00733371;RO=148;SAF=56;SAR=68;SRF=77;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0676684;STB=0.535649;TYPE=snp;VARB=-0.0156026;OID=.;OPOS=9439294;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:273:273:148:149:124:124:68:56:77:71:68:56:77:72 chr12 9450357 . A G 73.84 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0634702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.6062;QD=36.9199;RBI=0.0642643;REFB=0;REVB=0.0100712;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00339056;OID=.;OPOS=9450357;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:5:3:0:0:5:3:0:0 chr12 9450373 . A T 89.04 PASS AO=19;DP=38;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=-0.0129415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.0472;QD=9.37235;RBI=0.0205341;REFB=-0.0241322;REVB=-0.0159426;RO=18;SAF=11;SAR=8;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209274;STB=0.629295;TYPE=snp;VARB=0.0339421;OID=.;OPOS=9450373;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:38:38:18:19:19:19:8:11:6:12:8:11:6:13 chr12 9451818 . T C 61.39 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0140705;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.7161;QD=35.0804;RBI=0.0140705;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=7;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00207337;OID=.;OPOS=9451818;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:0:7:0:0:0:7:0:0 chr12 9571452 . G C 22.49 PASS AO=6;DP=19;FAO=6;FDP=19;FR=.;FRO=13;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.0434177;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.793;QD=4.73398;RBI=0.0470612;REFB=-0.0315588;REVB=-0.0181566;RO=12;SAF=1;SAR=5;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.403885;STB=0.74376;TYPE=snp;VARB=0.0621256;OID=.;OPOS=9571452;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:19:19:12:13:6:6:5:1:6:6:5:1:6:7 chr12 9573130 . C T 46.55 PASS AO=26;DP=109;FAO=26;FDP=109;FR=.;FRO=83;FSAF=22;FSAR=4;FSRF=51;FSRR=32;FWDB=0.00741064;FXX=0.0180164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.54;QD=1.70834;RBI=0.0179271;REFB=-0.00444595;REVB=-0.0163237;RO=83;SAF=22;SAR=4;SRF=51;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.367078;STB=0.730422;TYPE=snp;VARB=0.0165466;OID=.;OPOS=9573130;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:109:109:83:83:26:26:4:22:51:32:4:22:51:32 chr12 9573224 . C T 119.99 PASS AO=43;DP=125;FAO=43;FDP=125;FR=.;FRO=82;FSAF=32;FSAR=11;FSRF=45;FSRR=37;FWDB=0.0257341;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.567;QD=3.83965;RBI=0.0286467;REFB=-0.00362405;REVB=-0.0125854;RO=82;SAF=32;SAR=11;SRF=45;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.248991;STB=0.644494;TYPE=snp;VARB=0.00844354;OID=.;OPOS=9573224;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:82:82:43:43:11:32:45:37:11:32:45:37 chr12 9574002 . C T 76.89 PASS AO=14;DP=32;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=0.013996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.129;QD=8.78739;RBI=0.0233164;REFB=-0.0216054;REVB=0.0186485;RO=18;SAF=4;SAR=10;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.414085;STB=0.753963;TYPE=snp;VARB=0.0272175;OID=.;OPOS=9574002;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:32:35:18:18:14:17:10:4:13:5:13:4:13:5 chr12 9574042 . C A 87.36 PASS AO=19;DP=39;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.015529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.915;QD=8.95994;RBI=0.0250229;REFB=-0.0262841;REVB=0.0196214;RO=20;SAF=5;SAR=14;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.3223;STB=0.683705;TYPE=snp;VARB=0.0375472;OID=.;OPOS=9574042;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:39:39:20:20:19:19:14:5:12:8:14:5:12:8 chr12 9578197 . A T 126.32 PASS AO=31;DP=68;FAO=31;FDP=68;FR=.;FRO=37;FSAF=7;FSAR=24;FSRF=11;FSRR=26;FWDB=0.000703755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.069;QD=7.43046;RBI=0.0272289;REFB=-0.0335869;REVB=-0.0272198;RO=37;SAF=7;SAR=24;SRF=11;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0926422;STB=0.552394;TYPE=snp;VARB=0.0339866;OID=.;OPOS=9578197;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:37:37:31:31:24:7:11:26:24:7:11:26 chr12 9580395 . C G 122.73 PASS AO=19;DP=27;FAO=19;FDP=27;FR=.;FRO=8;FSAF=17;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0196034;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.965;QD=18.1816;RBI=0.0221026;REFB=0.00931374;REVB=-0.0102094;RO=8;SAF=17;SAR=2;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.368817;STB=0.708063;TYPE=snp;VARB=-0.00568759;OID=.;OPOS=9580395;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:27:27:8:8:19:19:2:17:4:4:2:17:4:4 chr12 9580403 . G A 113.84 PASS AO=17;DP=24;FAO=17;FDP=23;FR=.;FRO=6;FSAF=15;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0612746;FXX=0.0416493;HRUN=3;LEN=1;MLLD=190.922;QD=19.7977;RBI=0.0622228;REFB=-0.00243786;REVB=0.0108211;RO=6;SAF=15;SAR=2;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.399809;STB=0.725483;TYPE=snp;VARB=0.00204273;OID=.;OPOS=9580403;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:24:23:6:6:17:17:2:15:2:4:2:15:2:4 chr12 9584962 . C T 22.3 PASS AO=4;DP=9;FAO=4;FDP=9;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.118641;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5011;QD=9.91201;RBI=0.123969;REFB=0.0262608;REVB=0.0359527;RO=5;SAF=3;SAR=1;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.386089;STB=0.726523;TYPE=snp;VARB=-0.00513981;OID=.;OPOS=9584962;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:9:9:5:5:4:4:1:3:5:0:1:3:5:0 chr12 9590055 . C A 40.51 PASS AO=14;DP=45;FAO=14;FDP=45;FR=.;FRO=31;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=22;FWDB=0.0770896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.252;QD=3.60095;RBI=0.0780884;REFB=-0.0252191;REVB=0.0124493;RO=30;SAF=3;SAR=11;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130075;STB=0.57132;TYPE=snp;VARB=0.037791;OID=.;OPOS=9590055;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:45:45:30:31:14:14:11:3:9:21:11:3:9:22 chr12 9597776 . G A 580.04 PASS AO=141;DP=293;FAO=142;FDP=293;FR=.;FRO=151;FSAF=81;FSAR=61;FSRF=61;FSRR=90;FWDB=0.00382417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.877;QD=7.91862;RBI=0.00413116;REFB=0.0126236;REVB=-0.00156275;RO=149;SAF=80;SAR=61;SRF=61;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147185;STB=0.585399;TYPE=snp;VARB=-0.0103706;OID=.;OPOS=9597776;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:293:293:149:151:141:142:61:80:61:88:61:81:61:90 chr12 9750669 . A G 239.8 PASS AO=69;DP=167;FAO=69;FDP=166;FR=.;FRO=97;FSAF=29;FSAR=40;FSRF=65;FSRR=32;FWDB=0.0639603;FXX=0.00598767;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.8708;QD=5.77821;RBI=0.0646164;REFB=-0.0044543;REVB=-0.00918486;RO=96;SAF=29;SAR=40;SRF=64;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251732;STB=0.642915;TYPE=snp;VARB=0.00250529;OID=.;OPOS=9750669;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:166:96:97:69:69:40:29:64:32:40:29:65:32 chr12 9833524 . C G 321.07 PASS AO=98;DP=241;FAO=97;FDP=240;FR=.;FRO=143;FSAF=51;FSAR=46;FSRF=76;FSRR=67;FWDB=0.0123102;FXX=0.00414921;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.906;QD=5.35119;RBI=0.0134855;REFB=0.0151053;REVB=-0.00550613;RO=142;SAF=52;SAR=46;SRF=76;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00488057;STB=0.503403;TYPE=snp;VARB=-0.0194798;OID=.;OPOS=9833524;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:241:240:142:143:98:97:46:52:76:66:46:51:76:67 chr12 9833628 . C T 237.55 PASS AO=69;DP=167;FAO=69;FDP=167;FR=.;FRO=98;FSAF=14;FSAR=55;FSRF=24;FSRR=74;FWDB=-0.0253754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.623;QD=5.68973;RBI=0.0392761;REFB=-0.00625207;REVB=-0.0299784;RO=95;SAF=14;SAR=55;SRF=23;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0599484;STB=0.536437;TYPE=snp;VARB=0.0136793;OID=.;OPOS=9833628;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:167:95:98:69:69:55:14:23:72:55:14:24:74 chr12 9885707 . A ATAAGT 374.85 PASS AO=92;DP=228;FAO=100;FDP=221;FR=.;FRO=121;FSAF=49;FSAR=51;FSRF=58;FSRR=63;FWDB=-0.00886379;FXX=0.0221229;HRUN=1;LEN=5;MLLD=224.37;QD=6.78465;RBI=0.00901694;REFB=-0.00157083;REVB=0.00165484;RO=126;SAF=47;SAR=45;SRF=60;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0358895;STB=0.50584;TYPE=ins;VARB=0.00124375;OID=.;OPOS=9885708;OREF=-;OALT=TAAGT;OMAPALT=ATAAGT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:92:228:100:221:121:49:51:58:63:99:126:47:45:60:66 chr12 9905690 . A G 456.41 PASS AO=115;DP=244;FAO=115;FDP=244;FR=.;FRO=129;FSAF=43;FSAR=72;FSRF=50;FSRR=79;FWDB=0.0166496;FXX=0.00408147;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.763;QD=7.48206;RBI=0.0167086;REFB=-0.00414722;REVB=0.00140256;RO=128;SAF=43;SAR=72;SRF=49;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00905089;STB=0.507694;TYPE=snp;VARB=0.0059163;OID=.;OPOS=9905690;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:244:128:129:115:115:72:43:49:79:72:43:50:79 chr12 9994445 . GTGT G 1299.19 PASS AO=136;DP=142;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00541543;FXX=0.0354585;HRUN=1;LEN=3;MLLD=256.526;QD=38.2114;RBI=0.00620903;REFB=0;REVB=-0.00303729;RO=4;SAF=72;SAR=64;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0152035;STB=0.5;TYPE=del;VARB=1.29647e-06;OID=.;OPOS=9994446;OREF=TGT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:136:141:136:136:0:72:64:0:0:61:4:72:64:1:3 chr12 10015177 . A G 121.51 PASS AO=36;DP=92;FAO=36;FDP=92;FR=.;FRO=56;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=27;FSRR=29;FWDB=-0.0166693;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=147.171;QD=5.28308;RBI=0.0271869;REFB=-0.00472484;REVB=-0.021477;RO=56;SAF=13;SAR=23;SRF=27;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133938;STB=0.576398;TYPE=snp;VARB=0.0108961;OID=.;OPOS=10015177;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:56:56:36:36:23:13:27:29:23:13:27:29 chr12 10041364 . G A 1657.76 PASS AO=173;DP=176;FAO=173;FDP=173;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00591366;FXX=0.0170445;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.418;QD=38.3297;RBI=0.00828417;REFB=0;REVB=0.00580139;RO=0;SAF=89;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.18338e-05;OID=.;OPOS=10041364;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:176:173:0:0:173:173:84:89:0:0:84:89:0:0 chr12 10046047 . T TA 703.71 PASS AO=26;DP=168;FAO=165;FDP=165;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.185673;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=9.8561;QD=17.0595;RBI=0.186534;REFB=0.140952;REVB=-0.0179029;RO=137;SAF=17;SAR=9;SRF=76;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131515;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.0171936;OID=.;OPOS=10046048;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:26:168:165:165:0:92:73:0:0:52:137:17:9:76:61 chr12 10046052 . C A 1521.46 PASS AO=149;DP=155;FAO=166;FDP=166;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170002;FXX=0.00598767;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2396;QD=36.6616;RBI=0.0543063;REFB=-0.078285;REVB=0.0515768;RO=6;SAF=91;SAR=58;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0213407;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0057542;OID=.;OPOS=10046052;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:155:166:6:0:149:166:58:91:2:4:72:94:0:0 chr12 10136672 . GA G,AA 1274.27 PASS AO=80,74;DP=199;FAO=96,81;FDP=179;FR=.;FRO=2;FSAF=55,31;FSAR=41,50;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.108518,-0.00778837;FXX=0.0376324;HRUN=5,1;LEN=1,1;MLLD=14.9127,157.47;QD=28.4753;RBI=0.232515,0.0421879;REFB=-0.0387897,0.011165;REVB=-0.205638,0.0414627;RO=10;SAF=47,31;SAR=33,43;SRF=1;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.103241,0.0744169;STB=0.511902,0.509802;TYPE=del,snp;VARB=0.0570918,0.0180926;OID=.,.;OPOS=10136673,10136672;OREF=A,G;OALT=-,A;OMAPALT=G,AA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:178:179:10:2:80,74:96,81:33,43:47,31:1:9:41,50:55,31:0:2 chr12 10137557 . A C 89.3 PASS AO=23;DP=55;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=0.0191882;FXX=0.0181785;HRUN=7;LEN=1;MLLD=198.779;QD=6.61464;RBI=0.0214216;REFB=0.00804927;REVB=0.00952369;RO=31;SAF=9;SAR=14;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0741136;STB=0.542133;TYPE=snp;VARB=-0.00962985;OID=.;OPOS=10137557;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:55:54:31:31:23:23:14:9:10:21:14:9:10:21 chr12 10149406 . T C 449.32 PASS AO=87;DP=151;FAO=88;FDP=151;FR=.;FRO=63;FSAF=41;FSAR=47;FSRF=34;FSRR=29;FWDB=-0.0156159;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0986;QD=11.9025;RBI=0.0435888;REFB=0.0175461;REVB=-0.0406955;RO=64;SAF=40;SAR=47;SRF=35;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0678812;STB=0.530787;TYPE=snp;VARB=-0.0209765;OID=.;OPOS=10149406;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:151:64:63:87:88:47:40:35:29:47:41:34:29 chr12 10149851 . C T 2714.16 PASS AO=289;DP=292;FAO=289;FDP=289;FR=.;FRO=0;FSAF=107;FSAR=182;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110446;FXX=0.0102736;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.584;QD=37.5662;RBI=0.0194715;REFB=-0.0405002;REVB=0.016036;RO=3;SAF=107;SAR=182;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00621608;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000343784;OID=.;OPOS=10149851;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:292:289:3:0:289:289:182:107:2:1:182:107:0:0 chr12 10150974 . A G 82.14 PASS AO=24;DP=70;FAO=26;FDP=71;FR=.;FRO=45;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=35;FWDB=-0.00523005;FXX=0.0273935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.129;QD=4.62777;RBI=0.0194171;REFB=-0.0265178;REVB=0.0186995;RO=45;SAF=11;SAR=13;SRF=11;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.250778;STB=0.635745;TYPE=snp;VARB=0.047465;OID=.;OPOS=10150974;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:70:71:45:45:24:26:13:11:11:34:15:11:10:35 chr12 10151642 . T C 2646.88 PASS AO=298;DP=322;FAO=311;FDP=330;FR=.;FRO=19;FSAF=157;FSAR=154;FSRF=0;FSRR=19;FWDB=-0.0124453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.1517;QD=32.0834;RBI=0.15092;REFB=-0.199483;REVB=0.150406;RO=2;SAF=153;SAR=145;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00653243;STB=0.52905;TYPE=snp;VARB=0.00457297;OID=.;OPOS=10151642;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:322:330:2:19:298:311:145:153:0:2:154:157:0:19 chr12 10165469 . A G 2448.76 PASS AO=251;DP=262;FAO=259;FDP=259;FR=.;FRO=0;FSAF=123;FSAR=136;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0410908;FXX=0.0299614;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.577;QD=37.8187;RBI=0.066423;REFB=-0.0787369;REVB=0.0521877;RO=2;SAF=121;SAR=130;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00727649;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000562714;OID=.;OPOS=10165469;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:262:259:2:0:251:259:130:121:0:2:136:123:0:0 chr12 10167277 . G C 938.13 PASS AO=96;DP=100;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0580437;FXX=0.019998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.832;QD=38.2908;RBI=0.0747353;REFB=0;REVB=0.0470775;RO=0;SAF=35;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000310497;OID=.;OPOS=10167277;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:100:98:0:0:96:98:61:35:0:0:61:37:0:0 chr12 10206925 . A G 935.31 PASS AO=99;DP=99;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0318784;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.49;QD=37.4124;RBI=0.0371432;REFB=-0.0225297;REVB=-0.0190627;RO=0;SAF=35;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000386646;OID=.;OPOS=10206925;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:99:100:0:0:99:100:64:35:0:0:65:35:0:0 chr12 10236797 . A G 741.22 PASS AO=81;DP=86;FAO=81;FDP=83;FR=.;FRO=2;FSAF=50;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0254226;FXX=0.0348797;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.36;QD=35.7214;RBI=0.0779546;REFB=0.0110332;REVB=0.0736927;RO=2;SAF=50;SAR=31;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0056528;STB=0.502986;TYPE=snp;VARB=8.33475e-05;OID=.;OPOS=10236797;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:86:83:2:2:81:81:31:50:1:1:31:50:1:1 chr12 10236824 . C T 863.8 PASS AO=92;DP=92;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0121653;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.136;QD=37.9692;RBI=0.0145387;REFB=0;REVB=-0.00796118;RO=0;SAF=57;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.00578e-05;OID=.;OPOS=10236824;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:92:91:0:0:92:91:35:57:0:0:35:56:0:0 chr12 10236921 . G T 808.18 PASS AO=84;DP=84;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0497137;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.5274;QD=38.0321;RBI=0.0757671;REFB=0;REVB=-0.0571769;RO=0;SAF=44;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000922506;OID=.;OPOS=10236921;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:84:85:0:0:84:85:40:44:0:0:41:44:0:0 chr12 10236942 . C G 514.6 PASS AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.031699;FXX=0.0508388;HRUN=3;LEN=1;MLLD=218.814;QD=36.7575;RBI=0.0344126;REFB=-0.123003;REVB=-0.0133941;RO=1;SAF=28;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165384;STB=0.508769;TYPE=snp;VARB=0.000620463;OID=.;OPOS=10236942;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:56:56:1:1:55:55:27:28:1:0:27:28:1:0 chr12 10237014 . T C 289.06 PASS AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0989508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.494;QD=38.5407;RBI=0.102668;REFB=0;REVB=-0.0273764;RO=0;SAF=13;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.63861e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000340816;OID=.;OPOS=10237014;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:30:30:0:0:30:30:17:13:0:0:17:13:0:0 chr12 10251445 . C G 1054.55 PASS AO=113;DP=115;FAO=114;FDP=116;FR=.;FRO=2;FSAF=55;FSAR=59;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0520107;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.0063;QD=36.3638;RBI=0.118721;REFB=0.0622615;REVB=-0.106722;RO=1;SAF=54;SAR=59;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00871196;STB=0.508927;TYPE=snp;VARB=-0.00331232;OID=.;OPOS=10251445;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:115:116:1:2:113:114:59:54:1:0:59:55:2:0 chr12 10271055 . T C 1767.51 PASS AO=182;DP=189;FAO=186;FDP=186;FR=.;FRO=0;FSAF=126;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0321117;FXX=0.0362676;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.563;QD=38.0111;RBI=0.0321524;REFB=0;REVB=-0.00161825;RO=0;SAF=122;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.77612e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000227795;OID=.;OPOS=10271055;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:189:186:0:0:182:186:60:122:0:0:60:126:0:0 chr12 10277991 . G A 261.15 PASS AO=59;DP=116;FAO=59;FDP=116;FR=.;FRO=57;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=23;FSRR=34;FWDB=0.014282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.172;QD=9.00519;RBI=0.0147777;REFB=-0.011768;REVB=0.00379543;RO=57;SAF=27;SAR=32;SRF=23;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0488159;STB=0.526898;TYPE=snp;VARB=0.0111779;OID=.;OPOS=10277991;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:57:57:59:59:32:27:23:34:32:27:23:34 chr12 10462052 . T G 1699.79 PASS AO=144;DP=156;FAO=181;FDP=181;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.225832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.889;QD=37.5644;RBI=0.227382;REFB=0;REVB=0.0265076;RO=2;SAF=59;SAR=85;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0158444;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000682599;OID=.;OPOS=10462052;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:156:181:2:0:144:181:85:59:2:0:86:95:0:0 chr12 10467533 . T A 1294.11 PASS AO=141;DP=143;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00529248;FXX=0.0279701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.168;QD=37.2406;RBI=0.00725154;REFB=-0.000977525;REVB=-0.00495726;RO=2;SAF=45;SAR=96;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00552092;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000282421;OID=.;OPOS=10467533;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:143:139:2:0:141:139:96:45:1:1:95:44:0:0 chr12 10525740 . C T 1869.61 PASS AO=195;DP=196;FAO=195;FDP=195;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=112;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110085;FXX=0.00510178;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.136;QD=38.3511;RBI=0.025372;REFB=0;REVB=-0.0228594;RO=0;SAF=83;SAR=112;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.03612e-06;OID=.;OPOS=10525740;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:196:195:0:0:195:195:112:83:0:0:112:83:0:0 chr12 10532111 . T G 254.96 PASS AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00573645;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=240.169;QD=37.7722;RBI=0.011914;REFB=0;REVB=-0.010442;RO=0;SAF=12;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.16187e-05;OID=.;OPOS=10532111;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:27:27:0:0:27:27:15:12:0:0:15:12:0:0 chr12 10532326 . T C 1221.11 PASS AO=132;DP=135;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00566105;FXX=0.0148137;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.506;QD=36.7252;RBI=0.0192281;REFB=-0.0956079;REVB=0.0183759;RO=2;SAF=50;SAR=82;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0186289;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000225733;OID=.;OPOS=10532326;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:135:133:2:0:132:133:82:50:2:0:82:51:0:0 chr12 10560957 . T C 1066.63 PASS AO=126;DP=140;FAO=127;FDP=139;FR=.;FRO=12;FSAF=74;FSAR=53;FSRF=1;FSRR=11;FWDB=0.0727709;FXX=0.00714235;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.2027;QD=30.6943;RBI=0.0752292;REFB=-0.0547324;REVB=-0.0190741;RO=11;SAF=74;SAR=52;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0767335;STB=0.543673;TYPE=snp;VARB=0.00206632;OID=.;OPOS=10560957;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:140:139:11:12:126:127:52:74:1:10:53:74:1:11 chr12 10562025 . C T 2622.38 PASS AO=276;DP=279;FAO=276;FDP=276;FR=.;FRO=0;FSAF=170;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150001;FXX=0.0107523;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.819;QD=38.0054;RBI=0.020007;REFB=-0.0670549;REVB=0.0132392;RO=2;SAF=170;SAR=106;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00891044;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.39434e-05;OID=.;OPOS=10562025;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:279:276:2:0:276:276:106:170:0:2:106:170:0:0 chr12 10562089 . A C 2756 PASS AO=287;DP=303;FAO=288;FDP=288;FR=.;FRO=0;FSAF=168;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0236895;FXX=0.067959;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.283;QD=38.2777;RBI=0.0239624;REFB=-0.0364278;REVB=0.00360578;RO=0;SAF=167;SAR=120;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.61385e-05;OID=.;OPOS=10562089;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:303:288:0:0:287:288:120:167:0:0:120:168:0:0 chr12 10570965 . C G 2587.19 PASS AO=270;DP=275;FAO=275;FDP=275;FR=.;FRO=0;FSAF=133;FSAR=142;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0598671;FXX=0.0248218;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8559;QD=37.6319;RBI=0.0692234;REFB=-0.0176398;REVB=0.0347535;RO=2;SAF=132;SAR=138;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00716876;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000173841;OID=.;OPOS=10570965;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:275:275:2:0:270:275:138:132:2:0:142:133:0:0 chr12 10571042 . A G 2644.45 PASS AO=285;DP=291;FAO=286;FDP=291;FR=.;FRO=5;FSAF=114;FSAR=172;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0273085;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.7695;QD=36.3498;RBI=0.0330575;REFB=-0.0414863;REVB=0.0186291;RO=5;SAF=114;SAR=171;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.27935e-08;STB=0.500025;TYPE=snp;VARB=0.000757525;OID=.;OPOS=10571042;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:291:291:5:5:285:286:171:114:2:3:172:114:2:3 chr12 10571091 . T G 2091.91 PASS AO=218;DP=218;FAO=217;FDP=217;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=129;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117137;FXX=0.0136357;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.887;QD=38.5605;RBI=0.0138879;REFB=0;REVB=-0.00746079;RO=0;SAF=86;SAR=132;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.73217e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.07699e-05;OID=.;OPOS=10571091;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:218:217:0:0:218:217:132:86:0:0:129:88:0:0 chr12 10571106 . G C 1956.95 PASS AO=203;DP=207;FAO=204;FDP=204;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=121;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0222147;FXX=0.0144921;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.4694;QD=38.3715;RBI=0.0227079;REFB=0;REVB=-0.00470677;RO=0;SAF=82;SAR=121;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.26681e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000107623;OID=.;OPOS=10571106;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:92:207:204:0:0:203:204:121:82:0:0:121:83:0:0 chr12 10571710 . ATTTTTA ATTTTA,ATTTTTT 51.19 PASS AO=2,4;DP=9;FAO=2,6;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=0,0;FSAR=2,6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0,0;FXX=0;HRUN=5,1;LEN=1,1;MLLD=4.34963,292.26;QD=22.7509;RBI=0.0789039,0.000261662;REFB=-0.0369689,0.023182;REVB=-0.0789039,0.000261662;RO=1;SAF=0,0;SAR=2,4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.129992,-0.00283381;OID=.,.;OPOS=10571711,10571716;OREF=T,A;OALT=-,T;OMAPALT=ATTTTA,ATTTTTT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:2,4:8:2,6:9:1:0,0:2,6:0:1:8:1:0,0:2,4:0:1 chr12 10572982 . A G 1907.18 PASS AO=200;DP=200;FAO=200;FDP=200;FR=.;FRO=0;FSAF=110;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00198936;FXX=0.0147776;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7425;QD=38.1436;RBI=0.0290963;REFB=0;REVB=0.0290282;RO=0;SAF=110;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.27558e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.08375e-05;OID=.;OPOS=10572982;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:200:200:0:0:200:200:90:110:0:0:90:110:0:0 chr12 10573094 . C G 651.91 PASS AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0326895;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.837;QD=38.3477;RBI=0.0503904;REFB=0;REVB=-0.0383483;RO=0;SAF=33;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.79357e-05;OID=.;OPOS=10573094;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:68:68:0:0:68:68:35:33:0:0:35:33:0:0 chr12 10573095 . A G 631.98 PASS AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0232105;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.158;QD=38.302;RBI=0.0631108;REFB=0;REVB=-0.0586877;RO=0;SAF=32;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.75585e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.05956e-05;OID=.;OPOS=10573095;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:67:66:0:0:66:66:34:32:0:0:34:32:0:0 chr12 10573145 . C T 20.76 PASS AO=17;DP=103;FAO=19;FDP=104;FR=.;FRO=85;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=74;FWDB=0.00345536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.526;QD=0.798551;RBI=0.00641446;REFB=-0.00745482;REVB=0.00540423;RO=85;SAF=8;SAR=9;SRF=11;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.491294;STB=0.814317;TYPE=snp;VARB=0.0150772;OID=.;OPOS=10573145;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:103:104:85:85:17:19:9:8:11:74:9:10:11:74 chr12 10587111 . A G 3515.26 PASS AO=1527;DP=1579;FAO=387;FDP=400;FR=.;FRO=13;FSAF=191;FSAR=196;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.00535897;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=259.765;QD=35.1526;RBI=0.00698916;REFB=-0.0663606;REVB=-0.00448663;RO=47;SAF=754;SAR=773;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000251913;STB=0.50104;TYPE=snp;VARB=0.00016267;OID=.;OPOS=10587111;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:1579:400:47:13:1527:387:773:754:23:24:196:191:6:7 chr12 10587631 . C T 416.32 PASS AO=126;DP=311;FAO=127;FDP=312;FR=.;FRO=185;FSAF=46;FSAR=81;FSRF=74;FSRR=111;FWDB=0.0147293;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.966;QD=5.33742;RBI=0.0195581;REFB=-0.0113985;REVB=0.0128672;RO=185;SAF=45;SAR=81;SRF=74;SRR=111;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0487869;STB=0.523929;TYPE=snp;VARB=0.0150617;OID=.;OPOS=10587631;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:311:312:185:185:126:127:81:45:74:111:81:46:74:111 chr12 10588530 . C G 287.54 PASS AO=135;DP=420;FAO=126;FDP=400;FR=.;FRO=274;FSAF=59;FSAR=67;FSRF=130;FSRR=144;FWDB=-0.0538033;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.599;QD=2.87537;RBI=0.054456;REFB=-0.00598967;REVB=-0.00840617;RO=285;SAF=64;SAR=71;SRF=137;SRR=148;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00785549;STB=0.50426;TYPE=snp;VARB=0.0143933;OID=.;OPOS=10588530;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:420:400:285:274:135:126:71:64:137:148:67:59:130:144 chr12 10588581 . T C 700.96 PASS AO=181;DP=390;FAO=181;FDP=390;FR=.;FRO=209;FSAF=79;FSAR=102;FSRF=75;FSRR=134;FWDB=0.0217978;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.638;QD=7.1893;RBI=0.0218348;REFB=-0.0280831;REVB=-0.00126959;RO=208;SAF=79;SAR=102;SRF=74;SRR=134;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0806151;STB=0.542729;TYPE=snp;VARB=0.0184201;OID=.;OPOS=10588581;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:390:390:208:209:181:181:102:79:74:134:102:79:75:134 chr12 10603670 . T C 2873.56 PASS AO=346;DP=381;FAO=348;FDP=381;FR=.;FRO=33;FSAF=158;FSAR=190;FSRF=3;FSRR=30;FWDB=0.0336761;FXX=0.0305336;HRUN=5;LEN=1;MLLD=168.608;QD=30.1686;RBI=0.0340658;REFB=-0.152048;REVB=-0.00513802;RO=33;SAF=157;SAR=189;SRF=2;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0660897;STB=0.531903;TYPE=snp;VARB=0.00142144;OID=.;OPOS=10603670;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:381:381:33:33:346:348:189:157:2:31:190:158:3:30 chr12 10659438 . T C 3810.4 PASS AO=471;DP=475;FAO=397;FDP=397;FR=.;FRO=0;FSAF=157;FSAR=240;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00268066;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.371;QD=38.3919;RBI=0.0167393;REFB=0;REVB=0.0165233;RO=0;SAF=185;SAR=286;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.22095e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000136968;OID=.;OPOS=10659438;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:475:397:0:0:471:397:286:185:0:0:240:157:0:0 chr12 10659964 . C G 2552.85 PASS AO=263;DP=264;FAO=266;FDP=266;FR=.;FRO=0;FSAF=109;FSAR=157;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.402;QD=38.3887;RBI=0.0274456;REFB=0;REVB=0.024969;RO=0;SAF=107;SAR=156;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.08541e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.31311e-05;OID=.;OPOS=10659964;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:264:266:0:0:263:266:156:107:0:0:157:109:0:0 chr12 10675250 . G C 170.06 PASS AO=43;DP=102;FAO=45;FDP=103;FR=.;FRO=58;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=34;FSRR=24;FWDB=-0.0532797;FXX=0.0190458;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.0786;QD=6.60411;RBI=0.053291;REFB=-0.0243843;REVB=0.00109962;RO=57;SAF=26;SAR=17;SRF=33;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0270598;STB=0.508061;TYPE=snp;VARB=0.0182087;OID=.;OPOS=10675250;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:103:57:58:43:45:17:26:33:24:18:27:34:24 chr12 10763205 . T C 101.29 PASS AO=21;DP=41;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=2;FSAR=19;FSRF=3;FSRR=17;FWDB=-0.0456059;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.0305;QD=9.88226;RBI=0.0540675;REFB=0.0179011;REVB=0.0290412;RO=20;SAF=2;SAR=19;SRF=3;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120854;STB=0.56879;TYPE=snp;VARB=-0.0458257;OID=.;OPOS=10763205;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:41:41:20:20:21:21:19:2:3:17:19:2:3:17 chr12 10763236 . G C 116.63 PASS AO=30;DP=69;FAO=30;FDP=69;FR=.;FRO=39;FSAF=7;FSAR=23;FSRF=7;FSRR=32;FWDB=-0.0602361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.4205;QD=6.76098;RBI=0.0648081;REFB=-0.014857;REVB=-0.0239103;RO=38;SAF=7;SAR=23;SRF=7;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0711901;STB=0.544526;TYPE=snp;VARB=0.0234923;OID=.;OPOS=10763236;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:38:39:30:30:23:7:7:31:23:7:7:32 chr12 10782115 . T C 1440.2 PASS AO=151;DP=152;FAO=151;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0637646;FXX=0.00657851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.523;QD=38.151;RBI=0.0686118;REFB=0;REVB=-0.0253307;RO=0;SAF=86;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.77232e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000127425;OID=.;OPOS=10782115;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:152:151:0:0:151:151:65:86:0:0:65:86:0:0 chr12 10871667 . A G 1765.43 PASS AO=190;DP=195;FAO=192;FDP=195;FR=.;FRO=3;FSAF=140;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0241518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.6429;QD=36.2139;RBI=0.0303901;REFB=-0.00881325;REVB=0.0184458;RO=3;SAF=139;SAR=51;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0148906;STB=0.514017;TYPE=snp;VARB=0.000537941;OID=.;OPOS=10871667;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:195:195:3:3:190:192:51:139:1:2:52:140:0:3 chr12 10958658 . T C 478.3 PASS AO=107;DP=208;FAO=107;FDP=206;FR=.;FRO=99;FSAF=41;FSAR=66;FSRF=40;FSRR=59;FWDB=0.00784476;FXX=0.00961492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.727;QD=9.28735;RBI=0.0512045;REFB=-0.0213252;REVB=0.0506;RO=97;SAF=41;SAR=66;SRF=40;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.026638;STB=0.510551;TYPE=snp;VARB=0.0190571;OID=.;OPOS=10958658;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:206:97:99:107:107:66:41:40:57:66:41:40:59 chr12 10959031 . C T 423.98 PASS AO=95;DP=188;FAO=96;FDP=187;FR=.;FRO=91;FSAF=47;FSAR=49;FSRF=59;FSRR=32;FWDB=-0.00284933;FXX=0.0105815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.319;QD=9.06915;RBI=0.00725546;REFB=0.00782975;REVB=0.00667256;RO=86;SAF=47;SAR=48;SRF=55;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125659;STB=0.577031;TYPE=snp;VARB=-0.00781788;OID=.;OPOS=10959031;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:187:86:91:95:96:48:47:55:31:49:47:59:32 chr12 10962022 . C T 509.92 PASS AO=122;DP=245;FAO=122;FDP=249;FR=.;FRO=127;FSAF=62;FSAR=60;FSRF=39;FSRR=88;FWDB=-0.00872012;FXX=0.00796781;HRUN=3;LEN=1;MLLD=232.589;QD=8.19149;RBI=0.00875523;REFB=-0.00270363;REVB=0.000783359;RO=123;SAF=62;SAR=60;SRF=35;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204669;STB=0.602242;TYPE=snp;VARB=0.00241989;OID=.;OPOS=10962022;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:245:249:123:127:122:122:60:62:35:88:60:62:39:88 chr12 10962115 . A G 241.39 PASS AO=63;DP=149;FAO=64;FDP=144;FR=.;FRO=80;FSAF=23;FSAR=41;FSRF=39;FSRR=41;FWDB=0.0563307;FXX=0.0335548;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.2267;QD=6.70527;RBI=0.0644825;REFB=-0.0167348;REVB=-0.0313822;RO=62;SAF=23;SAR=40;SRF=28;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0817554;STB=0.57405;TYPE=snp;VARB=0.0199679;OID=.;OPOS=10962115;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:144:62:80:63:64:40:23:28:34:41:23:39:41 chr12 10978402 . G A 115.82 PASS AO=28;DP=63;FAO=28;FDP=62;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=0.00115416;FXX=0.0746157;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.41;QD=7.47217;RBI=0.00423738;REFB=-0.00393491;REVB=-0.00407717;RO=33;SAF=13;SAR=15;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0980495;STB=0.561873;TYPE=snp;VARB=0.00498756;OID=.;OPOS=10978402;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:62:33:34:28:28:15:13:12:21:15:13:12:22 chr12 10999708 . T C 443.55 PASS AO=108;DP=227;FAO=109;FDP=227;FR=.;FRO=118;FSAF=81;FSAR=28;FSRF=91;FSRR=27;FWDB=-0.0169092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.784;QD=7.81586;RBI=0.037708;REFB=-0.0154557;REVB=0.0337041;RO=117;SAF=80;SAR=28;SRF=91;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0467311;STB=0.519466;TYPE=snp;VARB=0.0167785;OID=.;OPOS=10999708;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:227:227:117:118:108:109:28:80:91:26:28:81:91:27 chr12 10999780 . C T 295.74 PASS AO=75;DP=191;FAO=83;FDP=192;FR=.;FRO=109;FSAF=73;FSAR=10;FSRF=96;FSRR=13;FWDB=0.00209475;FXX=0.0153838;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9328;QD=6.1612;RBI=0.0381211;REFB=-0.0283763;REVB=-0.0380635;RO=97;SAF=65;SAR=10;SRF=86;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0454058;STB=0.501632;TYPE=snp;VARB=0.0314915;OID=.;OPOS=10999780;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:191:192:97:109:75:83:10:65:86:11:10:73:96:13 chr12 11061122 . T C 218.3 PASS AO=51;DP=110;FAO=53;FDP=112;FR=.;FRO=59;FSAF=19;FSAR=34;FSRF=27;FSRR=32;FWDB=-0.0121414;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.248;QD=7.79647;RBI=0.0231818;REFB=-0.0151385;REVB=-0.019748;RO=59;SAF=17;SAR=34;SRF=27;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127866;STB=0.554982;TYPE=snp;VARB=0.0149459;OID=.;OPOS=11061122;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:112:59:59:51:53:34:17:27:32:34:19:27:32 chr12 11083677 . T C 593.89 PASS AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00201805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.341;QD=37.7072;RBI=0.0218914;REFB=0;REVB=-0.0217982;RO=0;SAF=16;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.63052e-05;OID=.;OPOS=11083677;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:63:63:0:0:63:63:47:16:0:0:47:16:0:0 chr12 11091432 . C T 604.61 PASS AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210159;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=271.043;QD=37.7883;RBI=0.0266616;REFB=0;REVB=0.0164066;RO=0;SAF=29;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.3077e-05;OID=.;OPOS=11091432;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:64:64:0:0:64:64:35:29:0:0:35:29:0:0 chr12 11091551 . T C 413.37 PASS AO=88;DP=166;FAO=89;FDP=166;FR=.;FRO=77;FSAF=48;FSAR=41;FSRF=38;FSRR=39;FWDB=-0.0201252;FXX=0.00598767;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.037;QD=9.96082;RBI=0.0221539;REFB=-0.0123512;REVB=0.00926127;RO=74;SAF=48;SAR=40;SRF=38;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0268452;STB=0.521309;TYPE=snp;VARB=0.00956005;OID=.;OPOS=11091551;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:166:74:77:88:89:40:48:38:36:41:48:38:39 chr12 11138683 . C T 1780.53 PASS AO=190;DP=192;FAO=190;FDP=190;FR=.;FRO=0;FSAF=111;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000721092;FXX=0.0104161;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.007;QD=37.4848;RBI=0.0205452;REFB=-0.0330478;REVB=0.0205326;RO=1;SAF=111;SAR=79;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00598954;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000138294;OID=.;OPOS=11138683;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:192:190:1:0:190:190:79:111:0:1:79:111:0:0 chr12 11149711 . C A 367.03 PASS AO=97;DP=215;FAO=97;FDP=215;FR=.;FRO=118;FSAF=42;FSAR=55;FSRF=36;FSRR=82;FWDB=-0.00758066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.148;QD=6.82844;RBI=0.035972;REFB=-0.016657;REVB=-0.0351642;RO=117;SAF=42;SAR=55;SRF=35;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13773;STB=0.572865;TYPE=snp;VARB=0.0206757;OID=.;OPOS=11149711;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:215:117:118:97:97:55:42:35:82:55:42:36:82 chr12 11149720 . A G 386.43 PASS AO=105;DP=238;FAO=105;FDP=238;FR=.;FRO=133;FSAF=46;FSAR=59;FSRF=41;FSRR=92;FWDB=-0.0160024;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=176.507;QD=6.49457;RBI=0.0395324;REFB=-0.0172773;REVB=-0.0361488;RO=132;SAF=46;SAR=59;SRF=40;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140853;STB=0.575034;TYPE=snp;VARB=0.0170699;OID=.;OPOS=11149720;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:238:238:132:133:105:105:59:46:40:92:59:46:41:92 chr12 11149769 . T C 484.14 PASS AO=121;DP=263;FAO=124;FDP=264;FR=.;FRO=140;FSAF=51;FSAR=73;FSRF=46;FSRR=94;FWDB=-0.00929946;FXX=0.00377344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.85;QD=7.3355;RBI=0.0512665;REFB=-0.0151208;REVB=0.050416;RO=139;SAF=51;SAR=70;SRF=46;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0915254;STB=0.546024;TYPE=snp;VARB=0.0203491;OID=.;OPOS=11149769;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:263:264:139:140:121:124:70:51:46:93:73:51:46:94 chr12 11150033 . G T 123.12 PASS AO=41;DP=162;FAO=57;FDP=178;FR=.;FRO=121;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=55;FSRR=66;FWDB=-0.00380018;FXX=0.0378358;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.841;QD=2.76684;RBI=0.0155369;REFB=-0.00899358;REVB=0.0150649;RO=114;SAF=24;SAR=17;SRF=51;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169572;STB=0.501092;TYPE=snp;VARB=0.0291717;OID=.;OPOS=11150033;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:178:114:121:41:57:17:24:51:63:31:26:55:66 chr12 11150046 . G T 155.17 PASS AO=60;DP=181;FAO=60;FDP=181;FR=.;FRO=121;FSAF=35;FSAR=25;FSRF=62;FSRR=59;FWDB=0.0146909;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7852;QD=3.42906;RBI=0.0149602;REFB=-0.00108347;REVB=-0.00282583;RO=121;SAF=34;SAR=26;SRF=63;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0539371;STB=0.54798;TYPE=snp;VARB=0.00222245;OID=.;OPOS=11150046;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:181:121:121:60:60:26:34:63:58:25:35:62:59 chr12 11150214 . G A 172.82 PASS AO=43;DP=87;FAO=41;FDP=86;FR=.;FRO=45;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=-0.046303;FXX=0.0114929;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.2606;QD=8.03793;RBI=0.113384;REFB=-0.029977;REVB=-0.103499;RO=44;SAF=24;SAR=19;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0325417;STB=0.526303;TYPE=snp;VARB=0.0264195;OID=.;OPOS=11150214;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:86:44:45:43:41:19:24:23:21:18:23:23:22 chr12 11150319 . T C 69.35 PASS AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.0052739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.6545;QD=10.2746;RBI=0.0354462;REFB=0.0148682;REVB=0.0350516;RO=13;SAF=10;SAR=4;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.290292;STB=0.66642;TYPE=snp;VARB=-0.011056;OID=.;OPOS=11150319;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:27:27:13:13:14:14:4:10:5:8:4:10:5:8 chr12 11174276 . G A 1403.41 PASS AO=146;DP=147;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000985787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.658;QD=38.1881;RBI=0.00688404;REFB=0;REVB=-0.00681309;RO=0;SAF=81;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.00316e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.89866e-05;OID=.;OPOS=11174276;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:147:147:0:0:146:147:65:81:0:0:66:81:0:0 chr12 11174498 . T C 325.94 PASS AO=96;DP=240;FAO=98;FDP=241;FR=.;FRO=143;FSAF=48;FSAR=50;FSRF=50;FSRR=93;FWDB=-0.000587103;FXX=0.00823011;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.7105;QD=5.40975;RBI=0.00524205;REFB=-0.0157724;REVB=0.00520907;RO=142;SAF=48;SAR=48;SRF=50;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157922;STB=0.583459;TYPE=snp;VARB=0.0249654;OID=.;OPOS=11174498;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:240:241:142:143:96:98:48:48:50:92:50:48:50:93 chr12 11174715 . T A 113.76 PASS AO=32;DP=79;FAO=32;FDP=79;FR=.;FRO=47;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=-0.0475926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5101;QD=5.76008;RBI=0.0544148;REFB=0.0110658;REVB=-0.0263801;RO=46;SAF=14;SAR=18;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0427117;STB=0.531081;TYPE=snp;VARB=-0.0191802;OID=.;OPOS=11174715;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:46:47:32:32:18:14:22:24:18:14:23:24 chr12 11174753 . G A 755.35 PASS AO=73;DP=73;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.025103;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.972;QD=37.7673;RBI=0.0483894;REFB=0;REVB=0.0413688;RO=0;SAF=41;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000169696;OID=.;OPOS=11174753;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:73:80:0:0:73:80:32:41:0:0:35:45:0:0 chr12 11175087 . G A 210.67 PASS AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013796;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.269;QD=36.6387;RBI=0.0307582;REFB=0;REVB=0.0274906;RO=0;SAF=13;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000274031;OID=.;OPOS=11175087;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:0:0:23:23:10:13:0:0:10:13:0:0 chr12 11183092 . C A 367.49 PASS AO=246;DP=687;FAO=139;FDP=400;FR=.;FRO=261;FSAF=83;FSAR=56;FSRF=117;FSRR=144;FWDB=-0.00567843;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=248.226;QD=3.67486;RBI=0.018604;REFB=-0.0111789;REVB=-0.0177163;RO=437;SAF=136;SAR=110;SRF=199;SRR=238;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110228;STB=0.597108;TYPE=snp;VARB=0.0226284;OID=.;OPOS=11183092;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:687:400:437:261:246:139:110:136:199:238:56:83:117:144 chr12 11183108 . G C 180.39 PASS AO=165;DP=497;FAO=101;FDP=385;FR=.;FRO=284;FSAF=31;FSAR=70;FSRF=142;FSRR=142;FWDB=-0.0242294;FXX=0.0374991;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.7421;QD=1.87416;RBI=0.0729794;REFB=-0.0521129;REVB=-0.0688398;RO=328;SAF=57;SAR=108;SRF=232;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.404657;STB=0.648187;TYPE=snp;VARB=0.0765656;OID=.;OPOS=11183108;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:497:385:328:284:165:101:108:57:232:96:70:31:142:142 chr12 11183217 . C T 239.74 PASS AO=89;DP=260;FAO=89;FDP=258;FR=.;FRO=169;FSAF=48;FSAR=41;FSRF=59;FSRR=110;FWDB=-0.0197253;FXX=0.0190107;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.244;QD=3.71686;RBI=0.0357503;REFB=-0.00477546;REVB=-0.029816;RO=162;SAF=48;SAR=41;SRF=59;SRR=103;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197259;STB=0.622922;TYPE=snp;VARB=0.0186432;OID=.;OPOS=11183217;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:260:258:162:169:89:89:41:48:59:103:41:48:59:110 chr12 11183224 . T A 783.89 PASS AO=149;DP=260;FAO=154;FDP=262;FR=.;FRO=108;FSAF=53;FSAR=101;FSRF=43;FSRR=65;FWDB=0.00963927;FXX=0.015037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.033;QD=11.9678;RBI=0.0157265;REFB=-0.0218613;REVB=0.012426;RO=107;SAF=52;SAR=97;SRF=42;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0364802;STB=0.524275;TYPE=snp;VARB=0.0135804;OID=.;OPOS=11183224;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:260:262:107:108:149:154:97:52:42:65:101:53:43:65 chr12 11183255 . G A 1900.66 PASS AO=187;DP=196;FAO=200;FDP=200;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=126;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0632368;FXX=0.00497488;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.669;QD=38.0132;RBI=0.0642276;REFB=0;REVB=0.0112378;RO=0;SAF=69;SAR=118;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.98313e-05;OID=.;OPOS=11183255;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:196:200:0:0:187:200:118:69:0:0:126:74:0:0 chr12 11183286 . G C 366.12 PASS AO=86;DP=174;FAO=86;FDP=173;FR=.;FRO=87;FSAF=33;FSAR=53;FSRF=41;FSRR=46;FWDB=0.00479163;FXX=0.0057468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.955;QD=8.46515;RBI=0.0120103;REFB=-0.00399305;REVB=0.0110131;RO=87;SAF=33;SAR=53;SRF=41;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0826575;STB=0.545545;TYPE=snp;VARB=0.00398622;OID=.;OPOS=11183286;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:173:87:87:86:86:53:33:41:46:53:33:41:46 chr12 11183451 . A T 1965.01 PASS AO=208;DP=210;FAO=209;FDP=209;FR=.;FRO=0;FSAF=106;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00900214;FXX=0.00947822;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.6752;QD=37.6078;RBI=0.0290109;REFB=-0.0722261;REVB=-0.0275789;RO=1;SAF=106;SAR=102;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00464748;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000165557;OID=.;OPOS=11183451;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:210:209:1:0:208:209:102:106:0:1:103:106:0:0 chr12 11183642 . A G 25.7 PASS AO=32;DP=178;FAO=31;FDP=176;FR=.;FRO=145;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=83;FSRR=62;FWDB=0.0148731;FXX=0.0056494;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.1847;QD=0.584001;RBI=0.0243159;REFB=-0.00392886;REVB=-0.0192368;RO=142;SAF=14;SAR=18;SRF=83;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186946;STB=0.624199;TYPE=snp;VARB=0.0195606;OID=.;OPOS=11183642;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:178:176:142:145:32:31:18:14:83:59:18:13:83:62 chr12 11183676 . C T 43.48 PASS AO=38;DP=180;FAO=37;FDP=179;FR=.;FRO=142;FSAF=12;FSAR=25;FSRF=79;FSRR=63;FWDB=-0.05729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.2974;QD=0.971557;RBI=0.0578193;REFB=-0.00314041;REVB=-0.00780531;RO=142;SAF=13;SAR=25;SRF=79;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.27177;STB=0.68288;TYPE=snp;VARB=0.0107513;OID=.;OPOS=11183676;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:180:179:142:142:38:37:25:13:79:63:25:12:79:63 chr12 11183697 . C A 28.54 PASS AO=30;DP=168;FAO=31;FDP=167;FR=.;FRO=136;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=80;FSRR=56;FWDB=-0.00490953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1403;QD=0.683477;RBI=0.0360503;REFB=-0.00718526;REVB=-0.0357144;RO=135;SAF=12;SAR=18;SRF=80;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24306;STB=0.660021;TYPE=snp;VARB=0.0286741;OID=.;OPOS=11183697;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:168:167:135:136:30:31:18:12:80:55:19:12:80:56 chr12 11183722 . A C 16.37 PASS AO=24;DP=150;FAO=24;FDP=152;FR=.;FRO=128;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=81;FSRR=47;FWDB=-0.0102835;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.4855;QD=0.430844;RBI=0.01421;REFB=-0.00526789;REVB=0.00980687;RO=126;SAF=9;SAR=15;SRF=80;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.322574;STB=0.707388;TYPE=snp;VARB=0.0173703;OID=.;OPOS=11183722;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:150:152:126:128:24:24:15:9:80:46:15:9:81:47 chr12 11183832 . G A 119.99 PASS AO=32;DP=75;FAO=32;FDP=75;FR=.;FRO=43;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=-0.00313754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.36;QD=6.39969;RBI=0.00369256;REFB=-0.0158262;REVB=-0.001947;RO=43;SAF=17;SAR=15;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0274131;STB=0.515497;TYPE=snp;VARB=0.0223836;OID=.;OPOS=11183832;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:43:43:32:32:15:17:24:19:15:17:24:19 chr12 11214212 . A T 920.62 PASS AO=216;DP=417;FAO=208;FDP=400;FR=.;FRO=192;FSAF=96;FSAR=112;FSRF=107;FSRR=85;FWDB=-0.00337233;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=240.855;QD=9.20617;RBI=0.0190289;REFB=-0.00642167;REVB=-0.0187277;RO=200;SAF=98;SAR=118;SRF=112;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.093577;STB=0.545904;TYPE=snp;VARB=0.00608467;OID=.;OPOS=11214212;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:417:400:200:192:216:208:118:98:112:88:112:96:107:85 chr12 11214360 . C T 358.33 PASS AO=136;DP=397;FAO=136;FDP=392;FR=.;FRO=256;FSAF=65;FSAR=71;FSRF=108;FSRR=148;FWDB=-0.00585045;FXX=0.0101008;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.125;QD=3.65639;RBI=0.00611531;REFB=-0.00563473;REVB=0.00178025;RO=254;SAF=65;SAR=71;SRF=107;SRR=147;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.065378;STB=0.5368;TYPE=snp;VARB=0.0108405;OID=.;OPOS=11214360;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:397:392:254:256:136:136:71:65:107:147:71:65:108:148 chr12 11243912 . GT G,GG 303.81 PASS AO=21,15;DP=42;FAO=22,13;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=22,1;FSAR=0,12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0387157,-0.0119857;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=71.4413,76.3704;QD=33.7561;RBI=0.0597665,0.0555722;REFB=0.0651028,0.0813342;REVB=-0.0455316,-0.0542643;RO=1;SAF=21,2;SAR=0,13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-0.180145;STB=0.5,0.666346;TYPE=del,snp;VARB=0.000568378,0.0199268;OID=.,.;OPOS=11243913,11243913;OREF=T,T;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:21,15:37:22,13:36:1:22,1:0,12:1:0:52:1:21,2:0,13:1:0 chr12 11243940 . T C 86.64 PASS AO=16;DP=25;FAO=15;FDP=24;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.088387;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=86.8608;QD=14.4402;RBI=0.090573;REFB=-0.0158781;REVB=-0.019779;RO=9;SAF=8;SAR=8;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0357466;STB=0.533289;TYPE=snp;VARB=0.0146693;OID=.;OPOS=11243940;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:25:24:9:9:16:15:8:8:4:5:7:8:4:5 chr12 11243946 . A G 68.42 PASS AO=13;DP=22;FAO=12;FDP=21;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.00350907;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=144.879;QD=13.0315;RBI=0.00808569;REFB=-0.0208287;REVB=0.00728456;RO=8;SAF=5;SAR=8;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00684983;STB=0.512175;TYPE=snp;VARB=0.0177686;OID=.;OPOS=11243946;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:22:21:8:9:13:12:8:5:3:5:7:5:4:5 chr12 11243947 . A C 144.07 PASS AO=19;DP=22;FAO=18;FDP=21;FR=.;FRO=3;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0111936;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=238.572;QD=27.4409;RBI=0.0187153;REFB=-0.0484201;REVB=-0.0149989;RO=3;SAF=6;SAR=13;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18245;STB=0.599885;TYPE=snp;VARB=0.00442288;OID=.;OPOS=11243947;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:22:21:3:3:19:18:13:6:3:0:12:6:3:0 chr12 11243960 . A T 12.53 PASS AO=6;DP=31;FAO=6;FDP=31;FR=.;FRO=25;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=0.022765;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=236.292;QD=1.61673;RBI=0.0334048;REFB=0.00426175;REVB=-0.0244465;RO=25;SAF=1;SAR=5;SRF=18;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.596216;STB=0.886785;TYPE=snp;VARB=-0.0168073;OID=.;OPOS=11243960;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:31:31:25:25:6:6:5:1:18:7:5:1:18:7 chr12 11244070 . T C 706.79 PASS AO=87;DP=95;FAO=86;FDP=95;FR=.;FRO=9;FSAF=38;FSAR=48;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0567945;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6609;QD=29.7597;RBI=0.099411;REFB=0.0211227;REVB=-0.08159;RO=8;SAF=39;SAR=48;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0117963;STB=0.500248;TYPE=snp;VARB=-0.0127274;OID=.;OPOS=11244070;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:95:95:8:9:87:86:48:39:3:5:48:38:4:5 chr12 11244166 . G C 1138.44 PASS AO=124;DP=130;FAO=125;FDP=129;FR=.;FRO=4;FSAF=54;FSAR=71;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.00279552;FXX=0.00769172;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.821;QD=35.3004;RBI=0.0258618;REFB=-0.0124691;REVB=0.0257103;RO=4;SAF=54;SAR=70;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0038902;STB=0.502147;TYPE=snp;VARB=0.000415697;OID=.;OPOS=11244166;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:130:129:4:4:124:125:70:54:2:2:71:54:2:2 chr12 11244230 . C A 865.49 PASS AO=87;DP=87;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0158123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.214;QD=38.4664;RBI=0.0408845;REFB=0;REVB=0.037703;RO=0;SAF=36;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000619711;OID=.;OPOS=11244230;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:87:90:0:0:87:90:51:36:0:0:54:36:0:0 chr12 11244319 . A C 530.71 PASS AO=55;DP=56;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0155681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=303.717;QD=36.6006;RBI=0.0191302;REFB=-0.0365246;REVB=0.0111175;RO=1;SAF=36;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129164;STB=0.506847;TYPE=snp;VARB=3.79557e-05;OID=.;OPOS=11244319;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:56:58:1:1:55:57:19:36:1:0:21:36:1:0 chr12 11244369 . G C 401.27 PASS AO=42;DP=44;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0396487;FXX=0.0869376;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.669;QD=38.216;RBI=0.0431594;REFB=0;REVB=0.0170503;RO=0;SAF=32;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.96961e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000337766;OID=.;OPOS=11244369;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:44:42:0:0:42:42:10:32:0:0:12:30:0:0 chr12 11244559 . C T 471.58 PASS AO=48;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0680022;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.804;QD=37.7267;RBI=0.0852537;REFB=0;REVB=0.0514188;RO=0;SAF=27;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000198421;OID=.;OPOS=11244559;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:49:50:0:0:48:50:21:27:0:0:23:27:0:0 chr12 11244678 . GAGCAGTGAGAATTTGGTC G 330.48 PASS AO=35;DP=57;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00481906;FXX=0.166627;HRUN=1;LEN=18;MLLD=415.797;QD=37.7687;RBI=0.020322;REFB=0;REVB=0.0197423;RO=0;SAF=22;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.39865e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=3.34192e-05;OID=.;OPOS=11244679;OREF=AGCAGTGAGAATTTGGTC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:35:39:35:35:0:22:13:0:0:16:0:22:13:0:0 chr12 11244871 . G A 10.3 PASS AO=2;DP=8;FAO=2;FDP=8;FR=.;FRO=6;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.63;QD=5.14829;RBI=0.0270389;REFB=-0.00277416;REVB=0.0270389;RO=6;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0332259;OID=.;OPOS=11244871;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:8:6:6:2:2:2:0:0:6:2:0:0:6 chr12 11244878 . A G 10.3 PASS AO=2;DP=8;FAO=2;FDP=8;FR=.;FRO=6;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=268.472;QD=5.1483;RBI=0.00176672;REFB=0.00962931;REVB=0.00176672;RO=6;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0247388;OID=.;OPOS=11244878;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:8:6:6:2:2:2:0:0:6:2:0:0:6 chr12 11286088 . A C 3745.13 PASS AO=456;DP=469;FAO=400;FDP=400;FR=.;FRO=0;FSAF=177;FSAR=223;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0528284;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=41.989;QD=37.4513;RBI=0.0535363;REFB=0;REVB=-0.00867754;RO=13;SAF=204;SAR=252;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00335623;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000158984;OID=.;OPOS=11286088;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:469:400:13:0:456:400:252:204:5:8:223:177:0:0 chr12 11286379 . T C 345.76 PASS AO=66;DP=112;FAO=66;FDP=111;FR=.;FRO=45;FSAF=44;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=-0.00256795;FXX=0.00892777;HRUN=4;LEN=1;MLLD=206.573;QD=12.4596;RBI=0.0144593;REFB=-0.00790184;REVB=-0.0142294;RO=45;SAF=44;SAR=22;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124154;STB=0.567721;TYPE=snp;VARB=0.00576785;OID=.;OPOS=11286379;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:111:45:45:66:66:22:44:23:22:22:44:23:22 chr12 11286486 . G A 281.42 PASS AO=59;DP=106;FAO=58;FDP=105;FR=.;FRO=47;FSAF=41;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=0.00559171;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.818;QD=10.7209;RBI=0.0124867;REFB=-0.0160135;REVB=-0.0111647;RO=45;SAF=42;SAR=17;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158785;STB=0.597415;TYPE=snp;VARB=0.0161054;OID=.;OPOS=11286486;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:105:45:47:59:58:17:42:24:21:17:41:24:23 chr12 11286790 . A C 321.01 PASS AO=41;DP=48;FAO=41;FDP=48;FR=.;FRO=7;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0676064;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.58;QD=26.7504;RBI=0.0681804;REFB=-0.124584;REVB=0.00882797;RO=4;SAF=17;SAR=24;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0983997;STB=0.523353;TYPE=snp;VARB=0.0033924;OID=.;OPOS=11286790;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:48:48:4:7:41:41:24:17:4:0:24:17:4:3 chr12 11338613 . C G 820.9 PASS AO=82;DP=82;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0128976;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.236;QD=37.3137;RBI=0.0132188;REFB=0;REVB=0.00289633;RO=0;SAF=40;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00190033;OID=.;OPOS=11338613;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:82:88:0:0:82:88:42:40:0:0:48:40:0:0 chr12 11338614 . A G 844.09 PASS AO=86;DP=87;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0129046;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.267;QD=38.3675;RBI=0.0162624;REFB=0;REVB=-0.00989626;RO=0;SAF=39;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.17051e-05;OID=.;OPOS=11338614;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:87:88:0:0:86:88:47:39:0:0:49:39:0:0 chr12 11338669 . C T 220.72 PASS AO=65;DP=162;FAO=66;FDP=164;FR=.;FRO=98;FSAF=23;FSAR=43;FSRF=51;FSRR=47;FWDB=0.0159816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.883;QD=5.3835;RBI=0.0175635;REFB=-0.00757288;REVB=-0.00728464;RO=96;SAF=23;SAR=42;SRF=51;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1922;STB=0.605832;TYPE=snp;VARB=0.00810153;OID=.;OPOS=11338669;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:164:96:98:65:66:42:23:51:45:43:23:51:47 chr12 11338750 . T C 335.51 PASS AO=89;DP=199;FAO=89;FDP=199;FR=.;FRO=110;FSAF=29;FSAR=60;FSRF=51;FSRR=59;FWDB=0.00022267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.242;QD=6.744;RBI=0.00707696;REFB=0.00337788;REVB=0.00707346;RO=109;SAF=29;SAR=60;SRF=51;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150465;STB=0.581729;TYPE=snp;VARB=-0.00542155;OID=.;OPOS=11338750;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:199:199:109:110:89:89:60:29:51:58:60:29:51:59 chr12 11338781 . C A 1295.15 PASS AO=138;DP=138;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0652128;FXX=0.00724585;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.4909;QD=37.8145;RBI=0.0652615;REFB=-0.0365026;REVB=-0.00252084;RO=0;SAF=47;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.92354e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000141358;OID=.;OPOS=11338781;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:138:137:0:0:138:137:91:47:0:0:90:47:0:0 chr12 11338957 . A G 64.26 PASS AO=14;DP=30;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=0.00651348;FXX=0.0588062;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.2;QD=8.03234;RBI=0.0458982;REFB=-0.0196147;REVB=0.0454337;RO=14;SAF=8;SAR=6;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.245508;STB=0.655546;TYPE=snp;VARB=0.0287931;OID=.;OPOS=11338957;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:30:32:14:17:14:15:6:8:4:10:7:8:4:13 chr12 11338983 . T C 235.44 PASS AO=24;DP=26;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0250711;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.9024;QD=33.6341;RBI=0.0532341;REFB=-0.0633413;REVB=0.0469607;RO=1;SAF=8;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0280951;STB=0.512811;TYPE=snp;VARB=0.00182437;OID=.;OPOS=11338983;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:26:28:1:1:24:27:16:8:0:1:19:8:0:1 chr12 11339020 . T A 66.03 PASS AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.0132154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.876;QD=9.10753;RBI=0.0185901;REFB=-0.0143034;REVB=0.0130746;RO=13;SAF=3;SAR=11;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10776;STB=0.582654;TYPE=snp;VARB=0.0189313;OID=.;OPOS=11339020;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:28:29:13:15:14:14:11:3:4:9:11:3:5:10 chr12 11418954 . A G 1342.12 PASS AO=141;DP=142;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0329191;FXX=0.00704176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.667;QD=38.0742;RBI=0.0361916;REFB=0;REVB=0.0150388;RO=0;SAF=58;SAR=83;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.37582e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.63824e-05;OID=.;OPOS=11418954;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:142:141:0:0:141:141:83:58:0:0:83:58:0:0 chr12 11420375 . G A 86.76 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.172385;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.9375;QD=38.5591;RBI=0.172385;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=9;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0108382;OID=.;OPOS=11420375;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:0:9:0:0:0:9:0:0 chr12 11420501 . G A 10.47 PASS AO=2;DP=6;FAO=2;FDP=6;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.059254;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.8648;QD=6.97944;RBI=0.059254;REFB=-0.0245182;REVB=0;RO=4;SAF=2;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0653135;OID=.;OPOS=11420501;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:4:4:2:2:0:2:4:0:0:2:4:0 chr12 11461271 . G A 212.9 PASS AO=25;DP=27;FAO=25;FDP=27;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=0;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.117939;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.504;QD=31.541;RBI=0.117939;REFB=-0.143084;REVB=0;RO=2;SAF=25;SAR=0;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00438144;OID=.;OPOS=11461271;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:27:27:2:2:25:25:0:25:2:0:0:25:2:0 chr12 11462275 . A G 251.99 PASS AO=58;DP=116;FAO=58;FDP=116;FR=.;FRO=58;FSAF=37;FSAR=21;FSRF=32;FSRR=26;FWDB=-0.00794505;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=234.947;QD=8.68934;RBI=0.0112121;REFB=0.00948349;REVB=-0.00791126;RO=57;SAF=37;SAR=21;SRF=32;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0726082;STB=0.545467;TYPE=snp;VARB=-0.00875071;OID=.;OPOS=11462275;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:57:58:58:58:21:37:32:25:21:37:32:26 chr12 11506893 . C T 73.84 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.074831;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.5322;QD=36.9197;RBI=0.074831;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=8;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00588467;OID=.;OPOS=11506893;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:0:8:0:0:0:8:0:0 chr12 12044393 . T TTA 135.07 PASS AO=134;DP=779;FAO=95;FDP=390;FR=.;FRO=295;FSAF=54;FSAR=41;FSRF=123;FSRR=172;FWDB=-0.00264542;FXX=0.0249994;HRUN=2;LEN=2;MLLD=196.388;QD=1.38533;RBI=0.0285737;REFB=0.000562047;REVB=-0.028451;RO=630;SAF=75;SAR=59;SRF=257;SRR=373;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196094;STB=0.613122;TYPE=ins;VARB=-0.00120032;OID=.;OPOS=12044394;OREF=-;OALT=TA;OMAPALT=TTA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:134:779:95:390:295:54:41:123:172:99:630:75:59:257:373 chr12 12045264 . G T 206.35 PASS AO=58;DP=148;FAO=61;FDP=150;FR=.;FRO=89;FSAF=8;FSAR=53;FSRF=11;FSRR=78;FWDB=0.105687;FXX=0.00662208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.159;QD=5.50276;RBI=0.107257;REFB=-0.0156939;REVB=0.0182902;RO=90;SAF=6;SAR=52;SRF=12;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.079814;STB=0.509972;TYPE=snp;VARB=0.0221943;OID=.;OPOS=12045264;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:150:90:89:58:61:52:6:12:78:53:8:11:78 chr12 12230938 . C G 117.15 PASS AO=30;DP=72;FAO=31;FDP=72;FR=.;FRO=41;FSAF=8;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=0.0243437;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.2332;QD=6.50815;RBI=0.0289951;REFB=-0.00605164;REVB=-0.0157511;RO=39;SAF=8;SAR=22;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.337323;STB=0.708544;TYPE=snp;VARB=0.00788616;OID=.;OPOS=12230938;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:39:41:30:31:22:8:23:16:23:8:25:16 chr12 12240199 . C T 593.76 PASS AO=129;DP=243;FAO=130;FDP=244;FR=.;FRO=114;FSAF=58;FSAR=72;FSRF=68;FSRR=46;FWDB=0.00367067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.826;QD=9.73384;RBI=0.00528171;REFB=-0.00824039;REVB=-0.00379772;RO=114;SAF=58;SAR=71;SRF=68;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125788;STB=0.569982;TYPE=snp;VARB=0.00811014;OID=.;OPOS=12240199;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:243:244:114:114:129:130:71:58:68:46:72:58:68:46 chr12 12247616 . T C 356.06 PASS AO=115;DP=297;FAO=115;FDP=297;FR=.;FRO=182;FSAF=58;FSAR=57;FSRF=110;FSRR=72;FWDB=-0.0137511;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=254.196;QD=4.79546;RBI=0.0351704;REFB=-0.0090574;REVB=-0.0323707;RO=182;SAF=58;SAR=57;SRF=110;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109358;STB=0.561368;TYPE=snp;VARB=0.0143733;OID=.;OPOS=12247616;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:297:297:182:182:115:115:57:58:110:72:57:58:110:72 chr12 12271767 . CAGT C 75.3 PASS AO=34;DP=104;FAO=29;FDP=92;FR=.;FRO=63;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=26;FSRR=37;FWDB=-0.00977063;FXX=0.0212743;HRUN=1;LEN=3;MLLD=240.385;QD=3.27372;RBI=0.0246437;REFB=-0.012515;REVB=-0.022624;RO=67;SAF=20;SAR=14;SRF=30;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160577;STB=0.571273;TYPE=del;VARB=0.0237931;OID=.;OPOS=12271768;OREF=AGT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:34:102:29:92:63:15:14:26:37:75:67:20:14:30:37 chr12 12284915 . G A 134.66 PASS AO=32;DP=68;FAO=32;FDP=68;FR=.;FRO=36;FSAF=31;FSAR=1;FSRF=32;FSRR=4;FWDB=-0.0490261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.3575;QD=7.92086;RBI=0.0541967;REFB=-0.0189006;REVB=-0.0231026;RO=36;SAF=31;SAR=1;SRF=32;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.36207;STB=0.710829;TYPE=snp;VARB=0.056778;OID=.;OPOS=12284915;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:36:36:32:32:1:31:32:4:1:31:32:4 chr12 12300371 . AG A 1686.11 PASS AO=212;DP=289;FAO=276;FDP=276;FR=.;FRO=0;FSAF=111;FSAR=165;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.32532;FXX=0.0349638;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.4132;QD=24.4363;RBI=0.35244;REFB=0;REVB=0.135577;RO=45;SAF=81;SAR=131;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0.509804;SSSB=-0.0598028;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00444;OID=.;OPOS=12300372;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:212:279:276:276:0:111:165:0:0:99:45:81:131:25:20 chr12 12301898 . C T 1540.37 PASS AO=153;DP=156;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0654767;FXX=0.0232545;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.4208;QD=36.6754;RBI=0.0678798;REFB=0;REVB=-0.0179017;RO=0;SAF=48;SAR=105;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0139872;OID=.;OPOS=12301898;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:156:168:0:0:153:168:105:48:0:0:105:63:0:0 chr12 12442164 . A G 53.42 PASS AO=23;DP=81;FAO=23;FDP=81;FR=.;FRO=58;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=30;FSRR=28;FWDB=-0.00379992;FXX=0;HRUN=13;LEN=1;MLLD=170.517;QD=2.63817;RBI=0.00430612;REFB=5.12591e-05;REVB=0.00202565;RO=48;SAF=16;SAR=7;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.279776;STB=0.634799;TYPE=snp;VARB=-0.00019862;OID=.;OPOS=12442164;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:81:81:48:58:23:23:7:16:22:26:7:16:30:28 chr12 12483275 . G A 2109.13 PASS AO=223;DP=229;FAO=226;FDP=230;FR=.;FRO=4;FSAF=124;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.000871999;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.789;QD=36.6805;RBI=0.00459333;REFB=-0.00989824;REVB=-0.0045098;RO=6;SAF=122;SAR=101;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0107475;STB=0.509615;TYPE=snp;VARB=0.000389073;OID=.;OPOS=12483275;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:229:230:6:4:223:226:101:122:2:4:102:124:0:4 chr12 12483713 . A G 662.46 PASS AO=73;DP=75;FAO=73;FDP=75;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0462124;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8699;QD=35.3312;RBI=0.0532314;REFB=0.00863162;REVB=-0.0264196;RO=1;SAF=37;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129584;STB=0.500183;TYPE=snp;VARB=-0.000684626;OID=.;OPOS=12483713;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:75:75:1:2:73:73:36:37:0:1:37:36:1:1 chr12 12510097 . C T 842.27 PASS AO=96;DP=101;FAO=96;FDP=101;FR=.;FRO=5;FSAF=40;FSAR=56;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0346329;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.646;QD=33.3574;RBI=0.0557646;REFB=0.0179663;REVB=0.0437065;RO=5;SAF=40;SAR=56;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0556705;STB=0.529406;TYPE=snp;VARB=-5.71315e-05;OID=.;OPOS=12510097;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:101:101:5:5:96:96:56:40:5:0:56:40:5:0 chr12 12796067 . G T 213.59 PASS AO=43;DP=77;FAO=43;FDP=77;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=10;FSRR=24;FWDB=0.0321859;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.188;QD=11.0955;RBI=0.0364524;REFB=-0.0296059;REVB=0.0171128;RO=32;SAF=17;SAR=26;SRF=9;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.095023;STB=0.537532;TYPE=snp;VARB=0.0238051;OID=.;OPOS=12796067;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:32:34:43:43:26:17:9:23:27:16:10:24 chr12 12814818 . C T 1677.73 PASS AO=177;DP=179;FAO=180;FDP=180;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=137;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0264512;FXX=0.0270256;HRUN=3;LEN=1;MLLD=120.321;QD=37.2828;RBI=0.0373186;REFB=-0.0645342;REVB=-0.0263251;RO=2;SAF=43;SAR=134;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0216211;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.79608e-05;OID=.;OPOS=12814818;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:179:180:2:0:177:180:134:43:2:0:137:43:0:0 chr12 12871099 . T G 129.22 PASS AO=37;DP=87;FAO=37;FDP=91;FR=.;FRO=54;FSAF=12;FSAR=25;FSRF=27;FSRR=27;FWDB=-0.00721955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.3877;QD=5.68008;RBI=0.039956;REFB=-0.0352609;REVB=-0.0392984;RO=49;SAF=12;SAR=25;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176729;STB=0.609695;TYPE=snp;VARB=0.0503141;OID=.;OPOS=12871099;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:91:49:54:37:37:25:12:24:25:25:12:27:27 chr12 12941884 . C T 1478.78 PASS AO=156;DP=157;FAO=156;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00963616;FXX=0.00636902;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.755;QD=37.9173;RBI=0.0137426;REFB=-0.0116045;REVB=-0.00979813;RO=1;SAF=81;SAR=75;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00630122;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.45585e-05;OID=.;OPOS=12941884;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:157:156:1:0:156:156:75:81:0:1:75:81:0:0 chr12 12941956 . A ATCCT 135.04 PASS AO=48;DP=151;FAO=49;FDP=144;FR=.;FRO=95;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=48;FSRR=47;FWDB=-0.00915594;FXX=0.0270252;HRUN=1;LEN=4;MLLD=272.455;QD=3.75115;RBI=0.00919723;REFB=-0.00377671;REVB=-0.000870467;RO=98;SAF=27;SAR=21;SRF=48;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.084745;STB=0.543982;TYPE=ins;VARB=0.00764873;OID=.;OPOS=12941957;OREF=-;OALT=TCCT;OMAPALT=ATCCT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:48:151:49:144:95:28:21:48:47:99:98:27:21:48:50 chr12 13028652 . CA C,CG 203.5 PASS AO=11,12;DP=24;FAO=4,19;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=3,2;FSAR=1,17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00970861,0.0337792;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=117.226,128.078;QD=35.3904;RBI=0.021391,0.034535;REFB=0,0;REVB=-0.0190608,0.00718567;RO=0;SAF=3,2;SAR=8,10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.0587915,0.000215127;OID=.,.;OPOS=13028653,13028653;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:11,12:23:4,19:23:0:3,2:1,17:0:0:6:0:3,2:8,10:0:0 chr12 13061294 . C T 104.17 PASS AO=24;DP=52;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.00162761;FXX=0.0192271;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.889;QD=8.17006;RBI=0.00348141;REFB=-0.00472841;REVB=0.00307752;RO=23;SAF=10;SAR=14;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0228617;STB=0.505046;TYPE=snp;VARB=0.00421454;OID=.;OPOS=13061294;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:51:23:27:24:24:14:10:9:14:14:10:11:16 chr12 13102605 . G A 234.12 PASS AO=45;DP=77;FAO=45;FDP=77;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=-0.0154238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.727;QD=12.1619;RBI=0.0223317;REFB=-0.0173609;REVB=0.0161497;RO=31;SAF=18;SAR=27;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0100403;STB=0.510865;TYPE=snp;VARB=0.00613479;OID=.;OPOS=13102605;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:31:32:45:45:27:18:12:19:27:18:12:20 chr12 13136623 . T C 237.55 PASS AO=56;DP=126;FAO=57;FDP=119;FR=.;FRO=62;FSAF=7;FSAR=50;FSRF=15;FSRR=47;FWDB=0.00921355;FXX=0.070307;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.9878;QD=7.98498;RBI=0.0238401;REFB=-0.00119333;REVB=-0.0219878;RO=46;SAF=7;SAR=49;SRF=12;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208275;STB=0.618277;TYPE=snp;VARB=0.00439609;OID=.;OPOS=13136623;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:119:46:62:56:57:49:7:12:34:50:7:15:47 chr12 13214537 . A G 1024.68 PASS AO=107;DP=107;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.002;QD=38.306;RBI=0.0313857;REFB=0;REVB=0.0233131;RO=0;SAF=61;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.73491e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.04806e-05;OID=.;OPOS=13214537;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:107:107:0:0:107:107:46:61:0:0:46:61:0:0 chr12 13221606 . T C 1014.03 PASS AO=106;DP=107;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0155035;FXX=0.0183469;HRUN=3;LEN=1;MLLD=87.0773;QD=37.9076;RBI=0.0168628;REFB=-0.0703638;REVB=0.00663292;RO=1;SAF=44;SAR=62;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00759391;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000144283;OID=.;OPOS=13221606;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:107:107:1:0:106:107:62:44:0:1:63:44:0:0 chr12 13369196 . C T 311.88 PASS AO=85;DP=195;FAO=85;FDP=194;FR=.;FRO=109;FSAF=42;FSAR=43;FSRF=56;FSRR=53;FWDB=-0.0899654;FXX=0.00512794;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5997;QD=6.4306;RBI=0.0905328;REFB=0.00299156;REVB=-0.0101197;RO=110;SAF=42;SAR=43;SRF=57;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0243696;STB=0.511033;TYPE=snp;VARB=-0.00492355;OID=.;OPOS=13369196;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:194:110:109:85:85:43:42:57:53:43:42:56:53 chr12 13369574 . A G 305.81 PASS AO=79;DP=173;FAO=79;FDP=173;FR=.;FRO=94;FSAF=35;FSAR=44;FSRF=39;FSRR=55;FWDB=-0.00475509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.092;QD=7.07074;RBI=0.00525773;REFB=-0.0253019;REVB=-0.00224341;RO=93;SAF=35;SAR=44;SRF=38;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0341766;STB=0.515544;TYPE=snp;VARB=0.0250875;OID=.;OPOS=13369574;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:173:93:94:79:79:44:35:38:55:44:35:39:55 chr12 13593879 . G A 278.45 PASS AO=50;DP=81;FAO=50;FDP=80;FR=.;FRO=30;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.00913962;FXX=0.0243873;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.906;QD=13.9225;RBI=0.00917143;REFB=-0.0149801;REVB=-0.000763122;RO=29;SAF=29;SAR=21;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0431178;STB=0.530475;TYPE=snp;VARB=0.0102072;OID=.;OPOS=13593879;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:81:80:29:30:50:50:21:29:15:14:21:29:15:15 chr12 13716638 . G A 117.99 PASS AO=21;DP=34;FAO=21;FDP=34;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=17;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=0.0469312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.363;QD=13.881;RBI=0.0473877;REFB=-0.0470941;REVB=0.00656171;RO=13;SAF=4;SAR=17;SRF=2;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0421894;STB=0.523343;TYPE=snp;VARB=0.0303488;OID=.;OPOS=13716638;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:34:34:13:13:21:21:17:4:2:11:17:4:2:11 chr12 13717508 . G A 355.57 PASS AO=67;DP=113;FAO=68;FDP=114;FR=.;FRO=46;FSAF=28;FSAR=40;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=-0.00283378;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.568;QD=12.4761;RBI=0.00305053;REFB=-0.00408307;REVB=-0.00112934;RO=46;SAF=28;SAR=39;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0623464;STB=0.536267;TYPE=snp;VARB=0.0041995;OID=.;OPOS=13717508;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:114:46:46:67:68:39:28:23:23:40:28:23:23 chr12 13764774 . G A 100.13 PASS AO=20;DP=37;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=17;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=-0.0423234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.2325;QD=10.8249;RBI=0.0845855;REFB=-0.0676952;REVB=-0.0732355;RO=17;SAF=3;SAR=17;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192936;STB=0.609742;TYPE=snp;VARB=0.0477049;OID=.;OPOS=13764774;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:37:37:17:17:20:20:17:3:5:12:17:3:5:12 chr12 13836561 . T A 747.55 PASS AO=57;DP=76;FAO=79;FDP=79;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=34;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00683233;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1989;QD=37.8504;RBI=0.0983486;REFB=0;REVB=0.098111;RO=0;SAF=19;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000469634;OID=.;OPOS=13836561;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:78:79:0:0:57:79:38:19:0:0:45:34:0:0 chr12 13836562 . C A 31.39 PASS AO=19;DP=82;FAO=19;FDP=82;FR=.;FRO=63;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=23;FSRR=40;FWDB=-0.0307491;FXX=0.0120467;HRUN=4;LEN=1;MLLD=40.8797;QD=1.53118;RBI=0.0318252;REFB=-0.0368622;REVB=0.00820569;RO=63;SAF=13;SAR=6;SRF=23;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.383072;STB=0.734411;TYPE=snp;VARB=0.134071;OID=.;OPOS=13836562;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:82:82:63:63:19:19:6:13:23:40:6:13:23:40 chr12 13836650 . G A 266.99 PASS AO=58;DP=111;FAO=58;FDP=111;FR=.;FRO=53;FSAF=21;FSAR=37;FSRF=17;FSRR=36;FWDB=-0.0278002;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=244.437;QD=9.62131;RBI=0.0285742;REFB=0.000667028;REVB=0.00660557;RO=53;SAF=21;SAR=37;SRF=17;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0392967;STB=0.521599;TYPE=snp;VARB=-0.000793001;OID=.;OPOS=13836650;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:53:53:58:58:37:21:17:36:37:21:17:36 chr12 14018777 . G C 153.18 PASS AO=42;DP=140;FAO=45;FDP=118;FR=.;FRO=73;FSAF=32;FSAR=13;FSRF=40;FSRR=33;FWDB=0.00440406;FXX=0.163109;HRUN=5;LEN=1;MLLD=78.4405;QD=5.1924;RBI=0.046453;REFB=-0.0139166;REVB=-0.0462438;RO=51;SAF=32;SAR=10;SRF=34;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118807;STB=0.611244;TYPE=snp;VARB=0.0312084;OID=.;OPOS=14018777;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:118:51:73:42:45:10:32:34:17:13:32:40:33 chr12 14577892 . A T 231.01 PASS AO=45;DP=80;FAO=45;FDP=79;FR=.;FRO=34;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=9;FSRR=25;FWDB=0.020579;FXX=0.0124984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.7714;QD=11.6968;RBI=0.0444372;REFB=-0.0104823;REVB=0.0393849;RO=32;SAF=24;SAR=21;SRF=7;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23661;STB=0.614308;TYPE=snp;VARB=0.00971229;OID=.;OPOS=14577892;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:79:32:34:45:45:21:24:7:25:21:24:9:25 chr12 14587301 . A G 172.13 PASS AO=49;DP=120;FAO=49;FDP=119;FR=.;FRO=70;FSAF=17;FSAR=32;FSRF=32;FSRR=38;FWDB=-0.00995169;FXX=0.00833264;HRUN=3;LEN=1;MLLD=243.331;QD=5.78573;RBI=0.00996317;REFB=0.00420996;REVB=0.000478125;RO=68;SAF=17;SAR=32;SRF=32;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13406;STB=0.568499;TYPE=snp;VARB=-0.0057302;OID=.;OPOS=14587301;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:119:68:70:49:49:32:17:32:36:32:17:32:38 chr12 14656768 . G C 272.6 PASS AO=71;DP=157;FAO=71;FDP=157;FR=.;FRO=86;FSAF=61;FSAR=10;FSRF=76;FSRR=10;FWDB=-0.0225955;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0451;QD=6.94532;RBI=0.0256958;REFB=-0.00954294;REVB=0.0122359;RO=85;SAF=61;SAR=10;SRF=75;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0490237;STB=0.52895;TYPE=snp;VARB=0.0113521;OID=.;OPOS=14656768;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:157:85:86:71:71:10:61:75:10:10:61:76:10 chr12 14688644 . C T 1973.9 PASS AO=205;DP=205;FAO=206;FDP=206;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=124;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0274158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.4135;QD=38.3282;RBI=0.0340748;REFB=0;REVB=-0.0202353;RO=0;SAF=81;SAR=124;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.83078e-05;OID=.;OPOS=14688644;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:205:206:0:0:205:206:124:81:0:0:124:82:0:0 chr12 14794062 . G A 2230.4 PASS AO=243;DP=245;FAO=240;FDP=244;FR=.;FRO=4;FSAF=85;FSAR=155;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.0235263;FXX=0.00408147;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2979;QD=36.5639;RBI=0.0402742;REFB=-0.0996899;REVB=0.0326883;RO=2;SAF=86;SAR=157;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00603283;STB=0.506369;TYPE=snp;VARB=0.00203196;OID=.;OPOS=14794062;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:245:244:2:4:243:240:157:86:0:2:155:85:0:4 chr12 14827463 . AATC A 2281.22 PASS AO=288;DP=307;FAO=294;FDP=294;FR=.;FRO=0;FSAF=148;FSAR=146;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0263777;FXX=0.0423439;HRUN=2;LEN=3;MLLD=315.358;QD=31.037;RBI=0.0313105;REFB=-0.000623059;REVB=-0.0168691;RO=0;SAF=145;SAR=143;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.09689e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-5.00879e-05;OID=.;OPOS=14827464;OREF=ATC;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:288:300:294:294:0:148:146:0:0:99:0:145:143:0:0 chr12 14829893 . A C 3629.64 PASS AO=619;DP=636;FAO=392;FDP=392;FR=.;FRO=0;FSAF=177;FSAR=215;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0779767;FXX=0.0199995;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.3098;QD=37.0371;RBI=0.0999855;REFB=-0.149491;REVB=0.0625838;RO=17;SAF=310;SAR=309;SRF=3;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0165438;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00220315;OID=.;OPOS=14829893;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:636:392:17:0:619:392:309:310:3:14:215:177:0:0 chr12 14836077 . G A 207.15 PASS AO=55;DP=128;FAO=56;FDP=129;FR=.;FRO=73;FSAF=20;FSAR=36;FSRF=19;FSRR=54;FWDB=0.00287972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=344.239;QD=6.42317;RBI=0.0069382;REFB=-0.00941127;REVB=0.00631236;RO=73;SAF=19;SAR=36;SRF=19;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0996371;STB=0.561777;TYPE=snp;VARB=0.0106653;OID=.;OPOS=14836077;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:129:73:73:55:56:36:19:19:54:36:20:19:54 chr12 14926504 . A G 221.51 PASS AO=49;DP=95;FAO=49;FDP=95;FR=.;FRO=46;FSAF=33;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=0.00130361;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=238.14;QD=9.32664;RBI=0.00164815;REFB=0.00823592;REVB=0.00100846;RO=46;SAF=33;SAR=16;SRF=18;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253355;STB=0.640153;TYPE=snp;VARB=-0.00502353;OID=.;OPOS=14926504;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:46:46:49:49:16:33:18:28:16:33:18:28 chr12 14928493 . G A 364.14 PASS AO=91;DP=197;FAO=92;FDP=197;FR=.;FRO=105;FSAF=37;FSAR=55;FSRF=45;FSRR=60;FWDB=-0.0178802;FXX=0.00505025;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.555;QD=7.39368;RBI=0.0182273;REFB=0.0104254;REVB=0.00354016;RO=102;SAF=37;SAR=54;SRF=43;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.014788;STB=0.514543;TYPE=snp;VARB=-0.0127064;OID=.;OPOS=14928493;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:197:102:105:91:92:54:37:43:59:55:37:45:60 chr12 14929872 . A G 1537.19 PASS AO=162;DP=163;FAO=163;FDP=163;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0676333;FXX=0.0121205;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.358;QD=37.7226;RBI=0.0680064;REFB=-0.036828;REVB=-0.00711343;RO=1;SAF=72;SAR=90;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00656304;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000336938;OID=.;OPOS=14929872;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:163:163:1:0:162:163:90:72:1:0:90:73:0:0 chr12 14993439 . C T 398.51 PASS AO=106;DP=232;FAO=105;FDP=232;FR=.;FRO=127;FSAF=55;FSAR=50;FSRF=47;FSRR=80;FWDB=-0.0243719;FXX=0.00429166;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.244;QD=6.87079;RBI=0.0244884;REFB=0.0142985;REVB=0.00238631;RO=126;SAF=56;SAR=50;SRF=47;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151654;STB=0.583658;TYPE=snp;VARB=-0.0159396;OID=.;OPOS=14993439;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:232:126:127:106:105:50:56:47:79:50:55:47:80 chr12 14993608 . G A 681.4 PASS AO=104;DP=293;FAO=155;FDP=300;FR=.;FRO=145;FSAF=69;FSAR=86;FSRF=65;FSRR=80;FWDB=0.00459093;FXX=0.0066223;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.679;QD=9.08532;RBI=0.0104603;REFB=-0.0191916;REVB=0.00939899;RO=121;SAF=61;SAR=43;SRF=53;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144709;STB=0.501523;TYPE=snp;VARB=0.0186758;OID=.;OPOS=14993608;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:243:300:121:145:104:155:43:61:53:68:86:69:65:80 chr12 14993854 . A G 479.44 PASS AO=112;DP=224;FAO=112;FDP=223;FR=.;FRO=111;FSAF=53;FSAR=59;FSRF=70;FSRR=41;FWDB=-0.0141861;FXX=0.00446409;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.355;QD=8.59982;RBI=0.0187316;REFB=-0.00207109;REVB=-0.0122323;RO=111;SAF=53;SAR=59;SRF=70;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142166;STB=0.577911;TYPE=snp;VARB=0.00165798;OID=.;OPOS=14993854;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:224:223:111:111:112:112:59:53:70:41:59:53:70:41 chr12 15035081 . T C 303.57 PASS AO=88;DP=216;FAO=90;FDP=220;FR=.;FRO=130;FSAF=57;FSAR=33;FSRF=78;FSRR=52;FWDB=-0.00248742;FXX=0.00452468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.9201;QD=5.51943;RBI=0.00327572;REFB=-0.00852064;REVB=-0.00213144;RO=123;SAF=56;SAR=32;SRF=72;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0563706;STB=0.520963;TYPE=snp;VARB=0.00914724;OID=.;OPOS=15035081;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:216:220:123:130:88:90:32:56:72:51:33:57:78:52 chr12 15081897 . A C 1139.72 PASS AO=124;DP=127;FAO=124;FDP=127;FR=.;FRO=3;FSAF=50;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.017737;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.007;QD=35.8968;RBI=0.0178186;REFB=-0.00563241;REVB=0.00170275;RO=2;SAF=50;SAR=74;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126669;STB=0.509932;TYPE=snp;VARB=-6.04203e-05;OID=.;OPOS=15081897;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:127:127:2:3:124:124:74:50:0:2:74:50:0:3 chr12 15095558 . C G 182.36 PASS AO=39;DP=86;FAO=43;FDP=90;FR=.;FRO=47;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=0.0271781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.422;QD=8.10479;RBI=0.0350364;REFB=-0.0271621;REVB=-0.022111;RO=46;SAF=22;SAR=17;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0624014;STB=0.561319;TYPE=snp;VARB=0.0282162;OID=.;OPOS=15095558;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:90:46:47:39:43:17:22:23:23:17:26:23:24 chr12 15103605 . A G 2315.32 PASS AO=243;DP=245;FAO=243;FDP=243;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=158;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137606;FXX=0.0121946;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8618;QD=38.1122;RBI=0.024718;REFB=-0.0417582;REVB=0.0205335;RO=0;SAF=85;SAR=158;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000275263;OID=.;OPOS=15103605;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:245:243:0:0:243:243:158:85:0:0:158:85:0:0 chr12 15262179 . G A 242.03 PASS AO=63;DP=144;FAO=64;FDP=143;FR=.;FRO=79;FSAF=29;FSAR=35;FSRF=26;FSRR=53;FWDB=0.00925454;FXX=0.0205465;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.353;QD=6.77012;RBI=0.0153896;REFB=-0.0102439;REVB=0.012296;RO=77;SAF=28;SAR=35;SRF=26;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108497;STB=0.570003;TYPE=snp;VARB=0.0102982;OID=.;OPOS=15262179;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:143:77:79:63:64:35:28:26:51:35:29:26:53 chr12 15669737 . T C 433.72 PASS AO=83;DP=238;FAO=101;FDP=238;FR=.,HEALED;FRO=120;FSAF=48;FSAR=53;FSRF=77;FSRR=43;FWDB=0.00379985;FXX=0.0205753;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.222;QD=7.2894;RBI=0.00619349;REFB=-0.0229921;REVB=0.00489086;RO=86;SAF=44;SAR=39;SRF=68;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247402;STB=0.589763;TYPE=snp;VARB=0.0114984;OID=.;OPOS=15669737;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:238:86:120:83:101:39:44:68:18:53:48:77:43 chr12 15679120 . C A 456.95 PASS AO=111;DP=228;FAO=111;FDP=228;FR=.;FRO=117;FSAF=52;FSAR=59;FSRF=34;FSRR=83;FWDB=-0.00547219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.0626;QD=8.01664;RBI=0.070929;REFB=-0.0652706;REVB=-0.0707176;RO=117;SAF=52;SAR=59;SRF=34;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169156;STB=0.592696;TYPE=snp;VARB=0.0720646;OID=.;OPOS=15679120;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:228:228:117:117:111:111:59:52:34:83:59:52:34:83 chr12 16055926 . G GT 161.32 PASS AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0722018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=30.1052;QD=32.2633;RBI=0.0758721;REFB=0;REVB=-0.0233127;RO=0;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0487e-08;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00364185;OID=.;OPOS=16055927;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:20:20:20:20:0:9:11:0:0:14:0:9:11:0:0 chr12 16347308 . G A 597.11 PASS AO=143;DP=289;FAO=143;FDP=290;FR=.;FRO=147;FSAF=70;FSAR=73;FSRF=88;FSRR=59;FWDB=-0.0211064;FXX=0.0102386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.5395;QD=8.23605;RBI=0.0326087;REFB=-0.00858851;REVB=-0.0248565;RO=143;SAF=70;SAR=73;SRF=84;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0891889;STB=0.555206;TYPE=snp;VARB=0.01145;OID=.;OPOS=16347308;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:289:290:143:147:143:143:73:70:84:59:73:70:88:59 chr12 16369828 . A T 484.56 PASS AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0194719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.748;QD=38.7649;RBI=0.04196;REFB=0;REVB=0.0371684;RO=0;SAF=27;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.16641e-05;OID=.;OPOS=16369828;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:50:50:0:0:50:50:23:27:0:0:23:27:0:0 chr12 16397677 . G A 2650.25 PASS AO=280;DP=285;FAO=282;FDP=282;FR=.;FRO=0;FSAF=152;FSAR=130;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0079159;FXX=0.017421;HRUN=3;LEN=1;MLLD=228.504;QD=37.5922;RBI=0.011453;REFB=-0.0750493;REVB=0.00827709;RO=3;SAF=152;SAR=128;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00426485;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.79448e-05;OID=.;OPOS=16397677;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:285:282:3:0:280:282:128:152:1:2:130:152:0:0 chr12 16397734 . C A 360.3 PASS AO=94;DP=209;FAO=94;FDP=207;FR=.;FRO=113;FSAF=57;FSAR=37;FSRF=39;FSRR=74;FWDB=0.0216137;FXX=0.00956892;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2266;QD=6.96225;RBI=0.044639;REFB=0.015975;REVB=-0.0390575;RO=115;SAF=57;SAR=37;SRF=41;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.24494;STB=0.64042;TYPE=snp;VARB=-0.0193115;OID=.;OPOS=16397734;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:207:115:113:94:94:37:57:41:74:37:57:39:74 chr12 16430284 . G A 1447.19 PASS AO=150;DP=150;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00581912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.53;QD=38.5918;RBI=0.0182616;REFB=0;REVB=0.0173096;RO=0;SAF=83;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.63235e-05;OID=.;OPOS=16430284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:150:150:0:0:150:150:67:83:0:0:67:83:0:0 chr12 18234256 . T C 253.11 PASS AO=61;DP=123;FAO=61;FDP=127;FR=.;FRO=66;FSAF=39;FSAR=22;FSRF=22;FSRR=44;FWDB=-0.00910148;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=101.804;QD=7.97196;RBI=0.00913613;REFB=-0.00958076;REVB=0.000795008;RO=62;SAF=39;SAR=22;SRF=18;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.31281;STB=0.657252;TYPE=snp;VARB=0.0118036;OID=.;OPOS=18234256;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:127:62:66:61:61:22:39:18:44:22:39:22:44 chr12 18238628 . C G 128.7 PASS AO=28;DP=55;FAO=28;FDP=55;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.000744746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.301;QD=9.36032;RBI=0.00974106;REFB=-0.016529;REVB=-0.00971255;RO=26;SAF=15;SAR=13;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0308883;STB=0.508469;TYPE=snp;VARB=0.0169704;OID=.;OPOS=18238628;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:26:27:28:28:13:15:13:13:13:15:14:13 chr12 18435398 . GCCC G 590.74 PASS AO=71;DP=73;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0211812;FXX=0;HRUN=4;LEN=3;MLLD=56.6982;QD=31.9319;RBI=0.0212194;REFB=0;REVB=0.00127306;RO=0;SAF=28;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0.472222;SSSB=4.30751e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-4.29409e-05;OID=.;OPOS=18435399;OREF=CCC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:71:71:74:74:0:29:45:0:0:52:0:28:43:0:0 chr12 18435452 . C T 555.77 PASS AO=57;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000814266;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.653;QD=38.3288;RBI=0.0143086;REFB=0;REVB=0.0142854;RO=0;SAF=30;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.86482e-05;OID=.;OPOS=18435452;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:57:58:0:0:57:58:27:30:0:0:28:30:0:0 chr12 19329493 . T C 94.22 PASS AO=26;DP=64;FAO=26;FDP=64;FR=.;FRO=38;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=25;FWDB=0.080414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.652;QD=5.88883;RBI=0.0804263;REFB=-0.0112163;REVB=-0.00140614;RO=35;SAF=6;SAR=20;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17642;STB=0.584546;TYPE=snp;VARB=0.0107628;OID=.;OPOS=19329493;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:64:64:35:38:26:26:20:6:13:22:20:6:13:25 chr12 19423103 . A G 1729.2 PASS AO=186;DP=191;FAO=188;FDP=188;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019165;FXX=0.0259054;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.5593;QD=36.7915;RBI=0.0208161;REFB=0.0124106;REVB=0.00812475;RO=3;SAF=105;SAR=81;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00314045;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.19227e-05;OID=.;OPOS=19423103;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:191:188:3:0:186:188:81:105:2:1:83:105:0:0 chr12 19456605 . C T 577.08 PASS AO=33;DP=58;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0303885;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=181.34;QD=37.8415;RBI=0.0396403;REFB=0;REVB=-0.0254537;RO=0;SAF=33;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.74564e-05;OID=.;OPOS=19456605;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:33:61:0:0:33:61:0:33:0:0:27:34:0:0 chr12 19598956 . C A 200.85 PASS AO=46;DP=95;FAO=47;FDP=96;FR=.;FRO=49;FSAF=15;FSAR=32;FSRF=27;FSRR=22;FWDB=0.00521382;FXX=0.0103082;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.6894;QD=8.36882;RBI=0.0181386;REFB=0.00494296;REVB=0.0173731;RO=49;SAF=15;SAR=31;SRF=27;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216911;STB=0.623901;TYPE=snp;VARB=-0.00812818;OID=.;OPOS=19598956;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:96:49:49:46:47:31:15:27:22:32:15:27:22 chr12 19877449 . A G 773.62 PASS AO=248;DP=543;FAO=192;FDP=400;FR=.;FRO=208;FSAF=72;FSAR=120;FSRF=84;FSRR=124;FWDB=-1.84153e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.085;QD=7.73624;RBI=0.0094377;REFB=-0.000123541;REVB=-0.00943769;RO=294;SAF=97;SAR=151;SRF=122;SRR=172;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0244632;STB=0.515871;TYPE=snp;VARB=0.000104189;OID=.;OPOS=19877449;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:543:400:294:208:248:192:151:97:122:172:120:72:84:124 chr12 20522252 . G A 60.71 PASS AO=9;DP=15;FAO=10;FDP=16;FR=.,HEALED;FRO=6;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.0749651;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=36.068;QD=15.1781;RBI=0.200565;REFB=-0.124112;REVB=0.186028;RO=4;SAF=8;SAR=1;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17833;STB=0.6248;TYPE=snp;VARB=0.0714573;OID=.;OPOS=20522252;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:16:16:4:6:9:10:1:8:4:0:1:9:6:0 chr12 20766559 . C T 1145.77 PASS AO=93;DP=93;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0627071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.799;QD=38.5132;RBI=0.0697754;REFB=0;REVB=-0.030601;RO=0;SAF=21;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.54662e-05;OID=.;OPOS=20766559;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:93:119:0:0:93:119:72:21:0:0:97:22:0:0 chr12 20801798 . T C 287.9 PASS AO=70;DP=146;FAO=70;FDP=146;FR=.;FRO=76;FSAF=25;FSAR=45;FSRF=34;FSRR=42;FWDB=-8.82009e-05;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.371;QD=7.88774;RBI=0.00490585;REFB=0.0151551;REVB=0.00490505;RO=73;SAF=25;SAR=45;SRF=33;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0925669;STB=0.549675;TYPE=snp;VARB=-0.0139892;OID=.;OPOS=20801798;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:73:76:70:70:45:25:33:40:45:25:34:42 chr12 20864356 . C T 151.69 PASS AO=43;DP=108;FAO=43;FDP=105;FR=.;FRO=62;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=30;FSRR=32;FWDB=-0.0256289;FXX=0.0277752;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.707;QD=5.7787;RBI=0.025629;REFB=-0.015893;REVB=8.52126e-05;RO=60;SAF=25;SAR=18;SRF=29;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102046;STB=0.558009;TYPE=snp;VARB=0.0232144;OID=.;OPOS=20864356;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:105:60:62:43:43:18:25:29:31:18:25:30:32 chr12 20903757 . T C 2095.25 PASS AO=221;DP=222;FAO=221;FDP=221;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=149;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171726;FXX=0.0045043;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.25;QD=37.9231;RBI=0.0231752;REFB=-0.081778;REVB=-0.0155626;RO=1;SAF=72;SAR=149;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00657135;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000302646;OID=.;OPOS=20903757;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:91:222:221:1:0:221:221:149:72:1:0:149:72:0:0 chr12 20905250 . C T 1910.41 PASS AO=191;DP=191;FAO=201;FDP=201;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000598693;FXX=0.00495025;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.075;QD=38.0182;RBI=0.0273369;REFB=0;REVB=0.0273303;RO=0;SAF=82;SAR=109;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.73325e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000245061;OID=.;OPOS=20905250;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:91:191:201:0:0:191:201:109:82:0:0:113:88:0:0 chr12 21011480 . T G 2517.9 PASS AO=262;DP=262;FAO=263;FDP=263;FR=.;FRO=0;FSAF=110;FSAR=153;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00739751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.13;QD=38.295;RBI=0.0104852;REFB=0;REVB=0.00743073;RO=0;SAF=109;SAR=153;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.08981e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.34526e-06;OID=.;OPOS=21011480;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:262:263:0:0:262:263:153:109:0:0:153:110:0:0 chr12 21011813 . C T 1443.88 PASS AO=175;DP=183;FAO=170;FDP=183;FR=.;FRO=13;FSAF=92;FSAR=78;FSRF=1;FSRR=12;FWDB=-0.00350732;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.947;QD=31.5602;RBI=0.0207937;REFB=-0.00371361;REVB=0.0204957;RO=8;SAF=93;SAR=82;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0442022;STB=0.53302;TYPE=snp;VARB=0.00272122;OID=.;OPOS=21011813;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:183:183:8:13:175:170:82:93:0:8:78:92:1:12 chr12 21013948 . C T 671.82 PASS AO=71;DP=73;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0374093;FXX=0.0273935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.6161;QD=37.8492;RBI=0.0430222;REFB=0;REVB=-0.0212475;RO=0;SAF=44;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000164581;OID=.;OPOS=21013948;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:73:71:0:0:71:71:27:44:0:0:27:44:0:0 chr12 21015760 . G A 3331.87 PASS AO=349;DP=353;FAO=352;FDP=352;FR=.;FRO=0;FSAF=156;FSAR=196;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0456367;FXX=0.00283278;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.6912;QD=37.8621;RBI=0.0535768;REFB=-0.0115688;REVB=0.0280672;RO=1;SAF=153;SAR=196;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00242823;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000119461;OID=.;OPOS=21015760;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:353:352:1:0:349:352:196:153:0:1:196:156:0:0 chr12 21028208 . G C 274.55 PASS AO=82;DP=202;FAO=82;FDP=202;FR=.;FRO=120;FSAF=21;FSAR=61;FSRF=23;FSRR=97;FWDB=-0.0268069;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.035;QD=5.43665;RBI=0.0285568;REFB=-0.00143337;REVB=-0.00984295;RO=119;SAF=21;SAR=61;SRF=23;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0919689;STB=0.552804;TYPE=snp;VARB=0.0022432;OID=.;OPOS=21028208;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:202:119:120:82:82:61:21:23:96:61:21:23:97 chr12 21036411 . A G 2855.22 PASS AO=297;DP=301;FAO=298;FDP=298;FR=.;FRO=0;FSAF=147;FSAR=151;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0462514;FXX=0.00996645;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8003;QD=38.3251;RBI=0.0676179;REFB=0;REVB=0.0493253;RO=0;SAF=147;SAR=150;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000146568;OID=.;OPOS=21036411;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:301:298:0:0:297:298:150:147:0:0:151:147:0:0 chr12 21054369 . G A 2763.57 PASS AO=299;DP=305;FAO=299;FDP=305;FR=.;FRO=6;FSAF=163;FSAR=136;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0441536;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=245.222;QD=36.2435;RBI=0.0446737;REFB=-0.0734621;REVB=0.00679686;RO=5;SAF=163;SAR=136;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0144017;STB=0.505721;TYPE=snp;VARB=0.000446376;OID=.;OPOS=21054369;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:305:305:5:6:299:299:136:163:5:0:136:163:5:1 chr12 21054918 . T C 484.43 PASS AO=112;DP=223;FAO=112;FDP=221;FR=.;FRO=109;FSAF=40;FSAR=72;FSRF=56;FSRR=53;FWDB=-0.00109998;FXX=0.00896821;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.069;QD=8.76804;RBI=0.00726528;REFB=-0.00454691;REVB=-0.00718153;RO=107;SAF=40;SAR=72;SRF=56;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153303;STB=0.580241;TYPE=snp;VARB=0.00543994;OID=.;OPOS=21054918;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:221:107:109:112:112:72:40:56:51:72:40:56:53 chr12 21176135 . T C 2934.07 PASS AO=304;DP=306;FAO=305;FDP=305;FR=.;FRO=0;FSAF=197;FSAR=108;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0119948;FXX=0.00973994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.743;QD=38.4796;RBI=0.154189;REFB=0;REVB=0.153722;RO=0;SAF=196;SAR=108;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000134253;OID=.;OPOS=21176135;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:306:305:0:0:304:305:108:196:0:0:108:197:0:0 chr12 21196424 . T A 455.58 PASS AO=132;DP=313;FAO=132;FDP=313;FR=.;FRO=181;FSAF=45;FSAR=87;FSRF=68;FSRR=113;FWDB=-0.0011293;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=206.126;QD=5.82204;RBI=0.0237596;REFB=-0.00262984;REVB=-0.0237328;RO=181;SAF=45;SAR=87;SRF=68;SRR=113;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0395635;STB=0.522061;TYPE=snp;VARB=0.0033356;OID=.;OPOS=21196424;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:313:313:181:181:132:132:87:45:68:113:87:45:68:113 chr12 21200089 . A G 579.36 PASS AO=130;DP=250;FAO=130;FDP=250;FR=.;FRO=120;FSAF=64;FSAR=66;FSRF=61;FSRR=59;FWDB=0.00547149;FXX=0.00793619;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.347;QD=9.26975;RBI=0.0262053;REFB=-0.00882347;REVB=-0.0256277;RO=120;SAF=64;SAR=66;SRF=61;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140663;STB=0.507691;TYPE=snp;VARB=0.00884443;OID=.;OPOS=21200089;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:250:250:120:120:130:130:66:64:61:59:66:64:61:59 chr12 21201663 . G A 736.3 PASS AO=162;DP=313;FAO=164;FDP=314;FR=.;FRO=150;FSAF=47;FSAR=117;FSRF=55;FSRR=95;FWDB=0.00947603;FXX=0.0368087;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.52;QD=9.37956;RBI=0.0240275;REFB=-0.0121843;REVB=0.02208;RO=145;SAF=45;SAR=117;SRF=53;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.090226;STB=0.544976;TYPE=snp;VARB=0.0146677;OID=.;OPOS=21201663;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:313:314:145:150:162:164:117:45:53:92:117:47:55:95 chr12 21207389 . T C 349.7 PASS AO=86;DP=179;FAO=86;FDP=181;FR=.;FRO=95;FSAF=53;FSAR=33;FSRF=61;FSRR=34;FWDB=-0.00423685;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=130.093;QD=7.72819;RBI=0.0125843;REFB=-0.0183815;REVB=-0.0118497;RO=91;SAF=53;SAR=33;SRF=60;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0429556;STB=0.514423;TYPE=snp;VARB=0.0184017;OID=.;OPOS=21207389;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:181:91:95:86:86:33:53:60:31:33:53:61:34 chr12 21329738 . A G 121.7 PASS AO=34;DP=85;FAO=35;FDP=88;FR=.;FRO=53;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=25;FWDB=0.0740042;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.6743;QD=5.53172;RBI=0.0755862;REFB=-0.0220542;REVB=-0.0153834;RO=51;SAF=13;SAR=21;SRF=27;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157125;STB=0.577937;TYPE=snp;VARB=0.0370534;OID=.;OPOS=21329738;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:88:51:53:34:35:21:13:27:24:21:14:28:25 chr12 21331625 . C T 636.31 PASS AO=160;DP=343;FAO=162;FDP=346;FR=.;FRO=184;FSAF=47;FSAR=115;FSRF=65;FSRR=119;FWDB=-0.00115622;FXX=0.00288176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.948;QD=7.35617;RBI=0.0056278;REFB=-0.0154533;REVB=0.00550775;RO=178;SAF=46;SAR=114;SRF=64;SRR=114;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0806921;STB=0.539404;TYPE=snp;VARB=0.0151129;OID=.;OPOS=21331625;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:343:346:178:184:160:162:114:46:64:114:115:47:65:119 chr12 21375307 . A G 415.12 PASS AO=122;DP=289;FAO=120;FDP=276;FR=.;FRO=156;FSAF=10;FSAR=110;FSRF=6;FSRR=150;FWDB=0.0674681;FXX=0.0515446;HRUN=26;LEN=1;MLLD=35.1429;QD=6.01623;RBI=0.068446;REFB=0.00322339;REVB=-0.0115284;RO=166;SAF=9;SAR=113;SRF=17;SRR=149;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0974115;STB=0.596317;TYPE=snp;VARB=-0.0040545;OID=.;OPOS=21375307;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:289:276:166:156:122:120:113:9:17:149:110:10:6:150 chr12 21391976 . A C 831.71 PASS AO=236;DP=489;FAO=199;FDP=398;FR=.;FRO=199;FSAF=89;FSAR=110;FSRF=87;FSRR=112;FWDB=0.0172895;FXX=0.00499988;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.9693;QD=8.35886;RBI=0.0187162;REFB=-0.0166474;REVB=0.00716724;RO=251;SAF=108;SAR=128;SRF=118;SRR=133;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0118064;STB=0.505087;TYPE=snp;VARB=0.0179955;OID=.;OPOS=21391976;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:489:398:251:199:236:199:128:108:118:133:110:89:87:112 chr12 21526651 . G A 79.79 PASS AO=24;DP=64;FAO=24;FDP=64;FR=.;FRO=40;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=26;FWDB=-0.00306758;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=80.7018;QD=4.98663;RBI=0.0329746;REFB=0.00430507;REVB=0.0328317;RO=40;SAF=12;SAR=12;SRF=14;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163149;STB=0.593675;TYPE=snp;VARB=-0.00748276;OID=.;OPOS=21526651;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:64:64:40:40:24:24:12:12:14:26:12:12:14:26 chr12 21654831 . G T 24.08 PASS AO=7;DP=28;FAO=8;FDP=28;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=16;FWDB=0.0204694;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.109;QD=3.43962;RBI=0.0208617;REFB=-0.0107122;REVB=-0.00402656;RO=20;SAF=2;SAR=5;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.052215;STB=0.642551;TYPE=snp;VARB=0.0320279;OID=.;OPOS=21654831;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:28:28:20:20:7:8:5:2:5:15:5:3:4:16 chr12 21690035 . C G 515.42 PASS AO=148;DP=350;FAO=149;FDP=352;FR=.;FRO=203;FSAF=54;FSAR=95;FSRF=92;FSRR=111;FWDB=-0.019036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.123;QD=5.85699;RBI=0.0571149;REFB=-0.023742;REVB=0.0538492;RO=201;SAF=54;SAR=94;SRF=91;SRR=110;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.095143;STB=0.554926;TYPE=snp;VARB=0.0402908;OID=.;OPOS=21690035;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:350:352:201:203:148:149:94:54:91:110:95:54:92:111 chr12 21712574 . C T 114.24 PASS AO=49;DP=167;FAO=51;FDP=169;FR=.;FRO=118;FSAF=19;FSAR=32;FSRF=61;FSRR=57;FWDB=-0.0138076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.5434;QD=2.70396;RBI=0.0446606;REFB=-0.00432216;REVB=0.0424726;RO=115;SAF=19;SAR=30;SRF=60;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161934;STB=0.602171;TYPE=snp;VARB=0.0146277;OID=.;OPOS=21712574;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:169:115:118:49:51:30:19:60:55:32:19:61:57 chr12 21713402 . T C 254.65 PASS AO=79;DP=210;FAO=83;FDP=214;FR=.;FRO=131;FSAF=39;FSAR=44;FSRF=32;FSRR=99;FWDB=0.0531331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.969;QD=4.75988;RBI=0.0532476;REFB=-0.00192733;REVB=-0.00349007;RO=125;SAF=36;SAR=43;SRF=30;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.244627;STB=0.64093;TYPE=snp;VARB=0.00429871;OID=.;OPOS=21713402;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:210:214:125:131:79:83:43:36:30:95:44:39:32:99 chr12 21797029 . A G 929.78 PASS AO=99;DP=102;FAO=102;FDP=104;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0567341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.034;QD=35.7609;RBI=0.0567969;REFB=-0.0427571;REVB=-0.00266888;RO=0;SAF=25;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.65554e-08;STB=0.506578;TYPE=snp;VARB=0.000360654;OID=.;OPOS=21797029;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:102:104:0:2:99:102:74:25:0:0:75:27:0:2 chr12 22017422 . A G 447.61 PASS AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0307896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.328;QD=38.0946;RBI=0.031234;REFB=0;REVB=0.0052498;RO=0;SAF=15;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000193181;OID=.;OPOS=22017422;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:46:47:0:0:46:47:31:15:0:0:31:16:0:0 chr12 22063115 . A G 1946.97 PASS AO=204;DP=204;FAO=204;FDP=204;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00386505;FXX=0.00487781;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.951;QD=38.1759;RBI=0.00492929;REFB=0;REVB=0.0030593;RO=0;SAF=105;SAR=99;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.07288e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.47927e-05;OID=.;OPOS=22063115;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:92:204:204:0:0:204:204:99:105:0:0:99:105:0:0 chr12 22348500 . A G 369.06 PASS AO=101;DP=231;FAO=101;FDP=231;FR=.;FRO=130;FSAF=46;FSAR=55;FSRF=62;FSRR=68;FWDB=0.0271122;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.287;QD=6.39069;RBI=0.0271411;REFB=-0.00507618;REVB=0.00125401;RO=130;SAF=46;SAR=55;SRF=62;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218606;STB=0.512155;TYPE=snp;VARB=0.00616271;OID=.;OPOS=22348500;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:231:231:130:130:101:101:55:46:62:68:55:46:62:68 chr12 22354921 . A G 152.45 PASS AO=41;DP=99;FAO=42;FDP=99;FR=.;FRO=57;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=22;FSRR=35;FWDB=0.00515891;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.601;QD=6.15945;RBI=0.00759304;REFB=-0.0120557;REVB=-0.00557134;RO=55;SAF=13;SAR=28;SRF=20;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0533772;STB=0.533317;TYPE=snp;VARB=0.0170277;OID=.;OPOS=22354921;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:55:57:41:42:28:13:20:35:28:14:22:35 chr12 22478425 . A G 189.96 PASS AO=54;DP=131;FAO=54;FDP=131;FR=.;FRO=77;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=31;FSRR=46;FWDB=0.00305885;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=183.951;QD=5.80024;RBI=0.00311993;REFB=0.00648542;REVB=0.000614296;RO=69;SAF=24;SAR=30;SRF=30;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00982515;STB=0.525034;TYPE=snp;VARB=-0.0118309;OID=.;OPOS=22478425;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:69:77:54:54:30:24:30:39:30:24:31:46 chr12 22602796 . A G 869.95 PASS AO=94;DP=97;FAO=95;FDP=96;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0540263;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2165;QD=36.248;RBI=0.0564689;REFB=-0.0796737;REVB=0.0164282;RO=0;SAF=36;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504273;TYPE=snp;VARB=-0.000640042;OID=.;OPOS=22602796;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:97:96:0:1:94:95:58:36:0:0:58:37:0:1 chr12 22625661 . A G 439.35 PASS AO=110;DP=239;FAO=112;FDP=240;FR=.;FRO=128;FSAF=67;FSAR=45;FSRF=72;FSRR=56;FWDB=0.00717672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.949;QD=7.32243;RBI=0.00735033;REFB=0.00230111;REVB=0.00158809;RO=128;SAF=66;SAR=44;SRF=72;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.037656;STB=0.519656;TYPE=snp;VARB=-0.00261398;OID=.;OPOS=22625661;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:239:240:128:128:110:112:44:66:72:56:45:67:72:56 chr12 22841092 . A C 164.88 PASS AO=74;DP=217;FAO=71;FDP=216;FR=.;FRO=145;FSAF=31;FSAR=40;FSRF=70;FSRR=75;FWDB=0.00587238;FXX=0.00460808;HRUN=7;LEN=1;MLLD=33.0145;QD=3.05334;RBI=0.0154976;REFB=-0.00138824;REVB=-0.014342;RO=126;SAF=32;SAR=42;SRF=59;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0402751;STB=0.531221;TYPE=snp;VARB=0.00226431;OID=.;OPOS=22841092;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:217:216:126:145:74:71:42:32:59:67:40:31:70:75 chr12 24365357 . AGTTGT A 52.34 PASS AO=16;DP=55;FAO=17;FDP=51;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=23;FSRR=11;FWDB=-0.0310584;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=5;MLLD=249.646;QD=4.10489;RBI=0.0310617;REFB=-0.0158632;REVB=-0.000449922;RO=32;SAF=11;SAR=5;SRF=22;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.46795e-08;STB=0.521714;TYPE=del;VARB=0.0230517;OID=.;OPOS=24365358;OREF=GTTGT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:16:53:17:51:34:11:6:23:11:52:32:11:5:22:10 chr12 24859899 . G A 1117.5 PASS AO=125;DP=131;FAO=127;FDP=131;FR=.;FRO=4;FSAF=24;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.00963945;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=199.547;QD=34.1222;RBI=0.0173811;REFB=-0.174715;REVB=0.0144631;RO=5;SAF=24;SAR=101;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0229394;STB=0.509522;TYPE=snp;VARB=0.000685336;OID=.;OPOS=24859899;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:131:131:5:4:125:127:101:24:0:5:103:24:0:4 chr12 24859918 . G A 124.48 PASS AO=48;DP=133;FAO=46;FDP=133;FR=.;FRO=87;FSAF=9;FSAR=37;FSRF=12;FSRR=75;FWDB=-0.0887471;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.8323;QD=3.74377;RBI=0.0963976;REFB=-0.0189012;REVB=0.0376359;RO=77;SAF=9;SAR=39;SRF=12;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0590309;STB=0.56468;TYPE=snp;VARB=0.0579234;OID=.;OPOS=24859918;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:77:87:48:46:39:9:12:65:37:9:12:75 chr12 24964383 . T C 127.42 PASS AO=36;DP=89;FAO=36;FDP=89;FR=.;FRO=53;FSAF=25;FSAR=11;FSRF=34;FSRR=19;FWDB=-0.0141583;FXX=0.0219756;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.3327;QD=5.72668;RBI=0.0166495;REFB=0.00704806;REVB=-0.00876064;RO=53;SAF=25;SAR=11;SRF=34;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0634373;STB=0.536077;TYPE=snp;VARB=-0.0100345;OID=.;OPOS=24964383;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:53:53:36:36:11:25:34:19:11:25:34:19 chr12 24964523 . C T 216.38 PASS AO=60;DP=134;FAO=59;FDP=136;FR=.;FRO=77;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=51;FSRR=26;FWDB=0.0463437;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.1677;QD=6.36425;RBI=0.0490442;REFB=-0.0171994;REVB=0.0160497;RO=72;SAF=29;SAR=31;SRF=50;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206412;STB=0.605404;TYPE=snp;VARB=0.0528588;OID=.;OPOS=24964523;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:136:72:77:60:59:31:29:50:22:31:28:51:26 chr12 24968131 . G A 70.17 PASS AO=16;DP=38;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0175118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.669;QD=7.19669;RBI=0.0226785;REFB=-0.0127553;REVB=-0.0144101;RO=22;SAF=8;SAR=8;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0454969;STB=0.50908;TYPE=snp;VARB=0.0143366;OID=.;OPOS=24968131;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:38:39:22:22:16:17:8:8:10:12:9:8:10:12 chr12 24968150 . A C 53.66 PASS AO=17;DP=51;FAO=17;FDP=50;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=0.0133162;FXX=0.019604;HRUN=3;LEN=1;MLLD=151.334;QD=4.29311;RBI=0.0139632;REFB=-0.00152493;REVB=0.00420114;RO=33;SAF=8;SAR=9;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0522456;STB=0.53077;TYPE=snp;VARB=0.00472359;OID=.;OPOS=24968150;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:51:50:33:33:17:17:9:8:14:19:9:8:14:19 chr12 24970708 . G A 420.46 PASS AO=94;DP=190;FAO=95;FDP=187;FR=.;FRO=92;FSAF=40;FSAR=55;FSRF=27;FSRR=65;FWDB=-0.0455468;FXX=0.0742538;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.4326;QD=8.9937;RBI=0.0499501;REFB=-0.0361433;REVB=-0.0205062;RO=71;SAF=40;SAR=54;SRF=25;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0600099;STB=0.565691;TYPE=snp;VARB=0.040258;OID=.;OPOS=24970708;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:187:71:92:94:95:54:40:25:46:55:40:27:65 chr12 25054891 . G A 429.51 PASS AO=88;DP=157;FAO=88;FDP=157;FR=.;FRO=69;FSAF=44;FSAR=44;FSRF=36;FSRR=33;FWDB=0.031301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.4735;QD=10.9428;RBI=0.0522437;REFB=-0.0254303;REVB=0.0418288;RO=69;SAF=44;SAR=44;SRF=36;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.017525;STB=0.509552;TYPE=snp;VARB=0.0248033;OID=.;OPOS=25054891;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:157:69:69:88:88:44:44:36:33:44:44:36:33 chr12 25148755 . C G 2314.92 PASS AO=255;DP=266;FAO=258;FDP=268;FR=.;FRO=10;FSAF=158;FSAR=100;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.00555905;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=98.8253;QD=34.5511;RBI=0.0530643;REFB=-0.141916;REVB=0.0527723;RO=4;SAF=155;SAR=100;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0110179;STB=0.503448;TYPE=snp;VARB=0.00143235;OID=.;OPOS=25148755;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:266:268:4:10:255:258:100:155:1:3:100:158:7:3 chr12 25242595 . C G 1952.62 PASS AO=208;DP=212;FAO=208;FDP=208;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=112;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132473;FXX=0.018867;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.8472;QD=37.5504;RBI=0.0374985;REFB=-0.047836;REVB=-0.0350806;RO=2;SAF=96;SAR=112;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00981965;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.36424e-05;OID=.;OPOS=25242595;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:212:208:2:0:208:208:112:96:2:0:112:96:0:0 chr12 25261735 . G T 101.96 PASS AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0101647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.664;QD=37.0753;RBI=0.0169106;REFB=0;REVB=0.0135148;RO=0;SAF=1;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000102313;OID=.;OPOS=25261735;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:11:11:10:1:0:0:10:1:0:0 chr12 25267613 . T C 316.02 PASS AO=102;DP=267;FAO=102;FDP=265;FR=.;FRO=163;FSAF=51;FSAR=51;FSRF=98;FSRR=65;FWDB=0.0125082;FXX=0.0185178;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.513;QD=4.77016;RBI=0.0218139;REFB=-0.0245319;REVB=0.0178715;RO=159;SAF=51;SAR=51;SRF=95;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105802;STB=0.562252;TYPE=snp;VARB=0.0342173;OID=.;OPOS=25267613;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:267:265:159:163:102:102:51:51:95:64:51:51:98:65 chr12 25361091 . T C 2503.5 PASS AO=269;DP=276;FAO=270;FDP=275;FR=.;FRO=5;FSAF=197;FSAR=73;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0448599;FXX=0.00362306;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.885;QD=36.4146;RBI=0.0718388;REFB=-0.0918248;REVB=0.0561106;RO=3;SAF=197;SAR=72;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0017598;STB=0.507542;TYPE=snp;VARB=0.000450098;OID=.;OPOS=25361091;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:276:275:3:5:269:270:72:197:2:1:73:197:2:3 chr12 25362465 . G A 539.58 PASS AO=51;DP=54;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0228477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.515;QD=37.2123;RBI=0.0541839;REFB=0;REVB=0.0491313;RO=0;SAF=37;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000569273;OID=.;OPOS=25362465;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:54:58:0:0:51:58:14:37:0:0:18:40:0:0 chr12 25368462 . C T 1643.3 PASS AO=187;DP=200;FAO=188;FDP=198;FR=.;FRO=10;FSAF=78;FSAR=110;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.0154822;FXX=0.0099995;HRUN=3;LEN=1;MLLD=179.461;QD=33.1979;RBI=0.0164274;REFB=-0.00296196;REVB=-0.00549181;RO=5;SAF=77;SAR=110;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0299126;STB=0.509595;TYPE=snp;VARB=0.000146191;OID=.;OPOS=25368462;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:200:198:5:10:187:188:110:77:5:0:110:78:6:4 chr12 25557226 . C T 315.09 PASS AO=67;DP=124;FAO=67;FDP=124;FR=.;FRO=57;FSAF=40;FSAR=27;FSRF=24;FSRR=33;FWDB=0.0165974;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.758;QD=10.1642;RBI=0.0166014;REFB=0.0108576;REVB=-0.000363836;RO=56;SAF=40;SAR=27;SRF=24;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141031;STB=0.581371;TYPE=snp;VARB=-0.0111922;OID=.;OPOS=25557226;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:56:57:67:67:27:40:24:32:27:40:24:33 chr12 25593891 . C T 609.53 PASS AO=106;DP=162;FAO=106;FDP=161;FR=.;FRO=55;FSAF=67;FSAR=39;FSRF=26;FSRR=29;FWDB=0.0550006;FXX=0.00617246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.3067;QD=15.1435;RBI=0.0614721;REFB=-0.0248886;REVB=-0.0274547;RO=55;SAF=67;SAR=39;SRF=26;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105304;STB=0.556753;TYPE=snp;VARB=0.0214594;OID=.;OPOS=25593891;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:161:55:55:106:106:39:67:26:29:39:67:26:29 chr12 25593912 . AC A 195.66 PASS AO=42;DP=120;FAO=56;FDP=71;FR=.;FRO=15;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.106821;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=10.5567;QD=11.0228;RBI=0.286966;REFB=0.0906299;REVB=-0.266343;RO=16;SAF=21;SAR=21;SRF=7;SRR=9;SSEN=0.48834;SSEP=0;SSSB=0.0318768;STB=0.517392;TYPE=del;VARB=0.0144614;OID=.;OPOS=25593913;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:42:68:56:71:15:27:29:6:9:6:16:21:21:7:9 chr12 25671759 . T A 445.51 PASS AO=117;DP=258;FAO=117;FDP=258;FR=.;FRO=141;FSAF=62;FSAR=55;FSRF=77;FSRR=64;FWDB=0.00251011;FXX=0.0152666;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3316;QD=6.9071;RBI=0.00917979;REFB=-0.0306073;REVB=0.00882994;RO=140;SAF=62;SAR=55;SRF=76;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0127975;STB=0.508885;TYPE=snp;VARB=0.0271162;OID=.;OPOS=25671759;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:258:258:140:141:117:117:55:62:76:64:55:62:77:64 chr12 26491838 . G A 1236.2 PASS AO=123;DP=126;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0315195;FXX=0.0153834;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.176;QD=38.6312;RBI=0.0436409;REFB=0;REVB=0.0301835;RO=0;SAF=39;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.90446e-05;OID=.;OPOS=26491838;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:126:128:0:0:123:128:84:39:0:0:85:43:0:0 chr12 26725673 . T C 359.63 PASS AO=111;DP=283;FAO=113;FDP=286;FR=.;FRO=173;FSAF=66;FSAR=47;FSRF=99;FSRR=74;FWDB=0.057753;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2553;QD=5.02985;RBI=0.0772707;REFB=-0.00660287;REVB=0.0513356;RO=169;SAF=66;SAR=45;SRF=98;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0163536;STB=0.507336;TYPE=snp;VARB=0.0119288;OID=.;OPOS=26725673;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:283:286:169:173:111:113:45:66:98:71:47:66:99:74 chr12 26755546 . C T 687.79 PASS AO=447;DP=1020;FAO=182;FDP=400;FR=.;FRO=218;FSAF=92;FSAR=90;FSRF=94;FSRR=124;FWDB=-0.0338472;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.5641;QD=6.87787;RBI=0.0472229;REFB=-0.017102;REVB=-0.0329297;RO=572;SAF=229;SAR=218;SRF=262;SRR=310;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0550692;STB=0.540459;TYPE=snp;VARB=0.019221;OID=.;OPOS=26755546;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:1020:400:572:218:447:182:218:229:262:310:90:92:94:124 chr12 26784850 . G A 248.27 PASS AO=68;DP=162;FAO=70;FDP=162;FR=.;FRO=92;FSAF=41;FSAR=29;FSRF=35;FSRR=57;FWDB=-0.0128986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.705;QD=6.13008;RBI=0.0640351;REFB=-0.0277308;REVB=0.0627225;RO=90;SAF=39;SAR=29;SRF=33;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208603;STB=0.615325;TYPE=snp;VARB=0.024391;OID=.;OPOS=26784850;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:162:90:92:68:70:29:39:33:57:29:41:35:57 chr12 26810777 . T C 523.8 PASS AO=132;DP=287;FAO=134;FDP=288;FR=.;FRO=154;FSAF=67;FSAR=67;FSRF=79;FSRR=75;FWDB=-0.0199589;FXX=0.00689631;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.215;QD=7.27498;RBI=0.0308316;REFB=-0.00522341;REVB=0.0234995;RO=154;SAF=66;SAR=66;SRF=80;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0189914;STB=0.506943;TYPE=snp;VARB=0.00588124;OID=.;OPOS=26810777;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:287:288:154:154:132:134:66:66:80:74:67:67:79:75 chr12 26834804 . T TACTC 2672.94 PASS AO=298;DP=337;FAO=311;FDP=331;FR=.;FRO=20;FSAF=164;FSAR=147;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.0196199;FXX=0.0178036;HRUN=1;LEN=4;MLLD=289.696;QD=32.3014;RBI=0.0449251;REFB=-0.0561365;REVB=0.0404143;RO=20;SAF=161;SAR=137;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0048476;STB=0.501656;TYPE=ins;VARB=0.00239867;OID=.;OPOS=26834805;OREF=-;OALT=ACTC;OMAPALT=TACTC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:298:337:311:331:20:164:147:10:10:26:20:161:137:10:10 chr12 26868322 . T C 507.29 PASS AO=125;DP=258;FAO=125;FDP=261;FR=.;FRO=136;FSAF=59;FSAR=66;FSRF=62;FSRR=74;FWDB=0.0138128;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=260.979;QD=7.77454;RBI=0.0141434;REFB=-0.00409019;REVB=-0.00304001;RO=133;SAF=59;SAR=66;SRF=61;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125617;STB=0.508431;TYPE=snp;VARB=0.00478616;OID=.;OPOS=26868322;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:258:261:133:136:125:125:66:59:61:72:66:59:62:74 chr12 26943170 . A T 224.17 PASS AO=61;DP=142;FAO=61;FDP=141;FR=.;FRO=80;FSAF=35;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=56;FWDB=-0.0152174;FXX=0.00704176;HRUN=4;LEN=1;MLLD=237.698;QD=6.35942;RBI=0.0210216;REFB=-0.00950739;REVB=-0.014503;RO=80;SAF=35;SAR=26;SRF=24;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.272664;STB=0.651633;TYPE=snp;VARB=0.0177593;OID=.;OPOS=26943170;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:141:80:80:61:61:26:35:24:56:26:35:24:56 chr12 27064232 . C T 316.17 PASS AO=86;DP=199;FAO=87;FDP=200;FR=.;FRO=113;FSAF=32;FSAR=55;FSRF=44;FSRR=69;FWDB=0.000557696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.574;QD=6.32331;RBI=0.00952183;REFB=-0.00950448;REVB=0.00950549;RO=112;SAF=31;SAR=55;SRF=44;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0352425;STB=0.513006;TYPE=snp;VARB=0.0102974;OID=.;OPOS=27064232;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:199:200:112:113:86:87:55:31:44:68:55:32:44:69 chr12 27175640 . A G 598.68 PASS AO=63;DP=63;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00870423;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.3309;QD=37.4177;RBI=0.0839912;REFB=0;REVB=-0.083539;RO=0;SAF=27;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.31521e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00100026;OID=.;OPOS=27175640;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:63:64:0:0:63:64:36:27:0:0:37:27:0:0 chr12 27234200 . T C 278.49 PASS AO=81;DP=195;FAO=81;FDP=195;FR=.;FRO=114;FSAF=38;FSAR=43;FSRF=56;FSRR=58;FWDB=-0.0143938;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=242.015;QD=5.71252;RBI=0.0155206;REFB=-0.00787272;REVB=-0.0058057;RO=112;SAF=38;SAR=43;SRF=56;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0320771;STB=0.512941;TYPE=snp;VARB=0.00933282;OID=.;OPOS=27234200;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:195:112:114:81:81:43:38:56:56:43:38:56:58 chr12 27234999 . T C 285.94 PASS AO=78;DP=179;FAO=79;FDP=183;FR=.;FRO=104;FSAF=37;FSAR=42;FSRF=62;FSRR=42;FWDB=-0.0256936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.186;QD=6.24998;RBI=0.0256966;REFB=-0.00646293;REVB=-0.000390602;RO=99;SAF=37;SAR=41;SRF=59;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121762;STB=0.572236;TYPE=snp;VARB=0.00586311;OID=.;OPOS=27234999;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:183:99:104:78:79:41:37:59:40:42:37:62:42 chr12 27470866 . G A 847.48 PASS AO=88;DP=89;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206461;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.789;QD=38.5218;RBI=0.0264067;REFB=0;REVB=0.0164636;RO=0;SAF=69;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.39765e-05;OID=.;OPOS=27470866;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:89:88:0:0:88:88:19:69:0:0:19:69:0:0 chr12 27475721 . A G 124.53 PASS AO=35;DP=91;FAO=38;FDP=92;FR=.;FRO=54;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=30;FWDB=-0.00695445;FXX=0.0315756;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.2368;QD=5.41433;RBI=0.02265;REFB=-0.0198963;REVB=0.0215559;RO=56;SAF=23;SAR=12;SRF=24;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.248775;STB=0.594777;TYPE=snp;VARB=0.0403325;OID=.;OPOS=27475721;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:92:56:54:35:38:12:23:24:32:15:23:24:30 chr12 27627805 . G A 100.7 PASS AO=51;DP=183;FAO=51;FDP=183;FR=.;FRO=132;FSAF=16;FSAR=35;FSRF=18;FSRR=114;FWDB=-0.0445601;FXX=0.0108102;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.475;QD=2.20108;RBI=0.0447396;REFB=-0.0090486;REVB=0.00400407;RO=132;SAF=16;SAR=35;SRF=18;SRR=114;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.292658;STB=0.666988;TYPE=snp;VARB=0.0246591;OID=.;OPOS=27627805;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:183:132:132:51:51:35:16:18:114:35:16:18:114 chr12 27641473 . G A 110.39 PASS AO=32;DP=92;FAO=36;FDP=96;FR=.;FRO=60;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=49;FSRR=11;FWDB=0.0098212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.288;QD=4.59953;RBI=0.0511425;REFB=-0.0248657;REVB=0.0501906;RO=59;SAF=24;SAR=8;SRF=49;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131164;STB=0.61339;TYPE=snp;VARB=0.0341842;OID=.;OPOS=27641473;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:96:59:60:32:36:8:24:49:10:12:24:49:11 chr12 27648777 . C T 172.51 PASS AO=41;DP=87;FAO=41;FDP=86;FR=.;FRO=45;FSAF=8;FSAR=33;FSRF=10;FSRR=35;FWDB=-0.00600721;FXX=0.0337041;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.1078;QD=8.02355;RBI=0.0531542;REFB=-0.00321025;REVB=-0.0528137;RO=44;SAF=8;SAR=33;SRF=10;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.045937;STB=0.521957;TYPE=snp;VARB=-0.00144096;OID=.;OPOS=27648777;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:86:44:45:41:41:33:8:10:34:33:8:10:35 chr12 27648786 . A G 173.01 PASS AO=40;DP=82;FAO=40;FDP=82;FR=.;FRO=42;FSAF=8;FSAR=32;FSRF=11;FSRR=31;FWDB=-0.022234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.247;QD=8.43941;RBI=0.0393499;REFB=-0.037947;REVB=0.0324663;RO=42;SAF=8;SAR=32;SRF=11;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0835728;STB=0.546738;TYPE=snp;VARB=0.0398187;OID=.;OPOS=27648786;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:42:42:40:40:32:8:11:31:32:8:11:31 chr12 27800746 . G T 2242.79 PASS AO=240;DP=242;FAO=238;FDP=238;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=150;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0394499;FXX=0.0165282;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.4142;QD=37.694;RBI=0.0646833;REFB=-0.164846;REVB=0.0512605;RO=2;SAF=89;SAR=151;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00627065;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00324559;OID=.;OPOS=27800746;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:242:238:2:0:240:238:151:89:0:2:150:88:0:0 chr12 27826778 . T TG 506.28 PASS AO=18;DP=82;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.133775;FXX=0.182905;HRUN=1;LEN=1;MLLD=23.8042;QD=30.2258;RBI=0.137211;REFB=0;REVB=-0.0305133;RO=56;SAF=9;SAR=9;SRF=36;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177103;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.0025868;OID=.;OPOS=27826779;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:18:82:67:67:0:43:24:0:0:46:56:9:9:36:20 chr12 27849795 . C T 263.15 PASS AO=54;DP=98;FAO=54;FDP=98;FR=.;FRO=44;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=16;FSRR=28;FWDB=0.0136101;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.429;QD=10.7407;RBI=0.0171691;REFB=0.000968948;REVB=0.0104663;RO=44;SAF=26;SAR=28;SRF=16;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0970616;STB=0.553172;TYPE=snp;VARB=-0.000958894;OID=.;OPOS=27849795;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:44:44:54:54:28:26:16:28:28:26:16:28 chr12 27849796 . A G 902.15 PASS AO=96;DP=97;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0257362;FXX=0.0103082;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.7677;QD=37.5894;RBI=0.0322266;REFB=-0.0103303;REVB=-0.0193958;RO=1;SAF=40;SAR=56;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00839387;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.5327e-05;OID=.;OPOS=27849796;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:97:96:1:0:96:96:56:40:0:1:56:40:0:0 chr12 27867706 . C T 189.6 PASS AO=44;DP=91;FAO=44;FDP=90;FR=.;FRO=46;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=33;FWDB=-0.00417706;FXX=0.0217368;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.169;QD=8.42655;RBI=0.00709299;REFB=-0.0308763;REVB=0.0057326;RO=44;SAF=25;SAR=19;SRF=12;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.261872;STB=0.642866;TYPE=snp;VARB=0.0229374;OID=.;OPOS=27867706;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:90:44:46:44:44:19:25:12:32:19:25:13:33 chr12 27915718 . A T 1536.19 PASS AO=165;DP=165;FAO=164;FDP=164;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0226125;FXX=0.00606024;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.273;QD=37.4681;RBI=0.0231749;REFB=0.0508777;REVB=-0.00507442;RO=0;SAF=92;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.14381e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000121901;OID=.;OPOS=27915718;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:165:164:0:0:165:164:73:92:0:0:73:91:0:0 chr12 27959201 . G A 255.48 PASS AO=59;DP=119;FAO=59;FDP=119;FR=.;FRO=60;FSAF=39;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=34;FWDB=-0.00546362;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=174.15;QD=8.58746;RBI=0.0106134;REFB=-0.00765602;REVB=0.00909907;RO=60;SAF=39;SAR=20;SRF=26;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.213617;STB=0.61828;TYPE=snp;VARB=0.00772675;OID=.;OPOS=27959201;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:60:60:59:59:20:39:26:34:20:39:26:34 chr12 28122893 . A G 1652.21 PASS AO=159;DP=160;FAO=173;FDP=173;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136639;FXX=0.0057468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.424;QD=38.2015;RBI=0.0201206;REFB=0;REVB=0.0147694;RO=0;SAF=76;SAR=83;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34543e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000162666;OID=.;OPOS=28122893;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:160:173:0:0:159:173:83:76:0:0:88:85:0:0 chr12 28412372 . G A 501.78 PASS AO=101;DP=178;FAO=101;FDP=178;FR=.;FRO=77;FSAF=59;FSAR=42;FSRF=47;FSRR=30;FWDB=-0.0442481;FXX=0.0111105;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.635;QD=11.2759;RBI=0.0446039;REFB=-0.00356791;REVB=-0.0056227;RO=72;SAF=59;SAR=42;SRF=44;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0213516;STB=0.511722;TYPE=snp;VARB=0.00165442;OID=.;OPOS=28412372;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:178:72:77:101:101:42:59:44:28:42:59:47:30 chr12 28457618 . A C 2563.79 PASS AO=273;DP=278;FAO=275;FDP=275;FR=.;FRO=0;FSAF=126;FSAR=149;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0386546;FXX=0.010791;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.113;QD=37.2915;RBI=0.0563148;REFB=-0.0656311;REVB=0.0409533;RO=1;SAF=125;SAR=148;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00379926;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000363695;OID=.;OPOS=28457618;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:278:275:1:0:273:275:148:125:1:0:149:126:0:0 chr12 28605426 . G A 1617.3 PASS AO=164;DP=166;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104929;FXX=0.011764;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.563;QD=38.5071;RBI=0.0109759;REFB=0;REVB=-0.00322023;RO=0;SAF=103;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.36019e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00010056;OID=.;OPOS=28605426;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:166:168:0:0:164:168:61:103:0:0:65:103:0:0 chr12 28637115 . G A 184.56 PASS AO=43;DP=90;FAO=43;FDP=89;FR=.;FRO=46;FSAF=6;FSAR=37;FSRF=8;FSRR=38;FWDB=0.0226992;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.361;QD=8.29489;RBI=0.0229011;REFB=0.00127042;REVB=0.00303427;RO=47;SAF=6;SAR=37;SRF=8;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0568869;STB=0.535107;TYPE=snp;VARB=-0.00146282;OID=.;OPOS=28637115;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:89:47:46:43:43:37:6:8:39:37:6:8:38 chr12 28658350 . C T 424.36 PASS AO=96;DP=187;FAO=96;FDP=187;FR=.;FRO=91;FSAF=46;FSAR=50;FSRF=50;FSRR=41;FWDB=0.010905;FXX=0.00531887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.675;QD=9.07727;RBI=0.0162887;REFB=-0.00954608;REVB=-0.0120997;RO=90;SAF=46;SAR=50;SRF=49;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0575628;STB=0.534157;TYPE=snp;VARB=0.00652834;OID=.;OPOS=28658350;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:187:90:91:96:96:50:46:49:41:50:46:50:41 chr12 29597118 . TC T 882.44 PASS AO=138;DP=193;FAO=182;FDP=188;FR=.;FRO=6;FSAF=84;FSAR=98;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.276289;FXX=0.00529073;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.1705;QD=18.7752;RBI=0.279328;REFB=-0.0561583;REVB=0.0410931;RO=20;SAF=57;SAR=81;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0.615385;SSSB=0.0405528;STB=0.506578;TYPE=del;VARB=0.0359754;OID=.;OPOS=29597119;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:138:187:182:188:6:84:98:4:2:43:20:57:81:5:15 chr12 29604392 . C G 1061.2 PASS AO=115;DP=115;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0045773;FXX=0.0173898;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.151;QD=37.5647;RBI=0.0360019;REFB=0.047165;REVB=-0.0357097;RO=0;SAF=87;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000108078;OID=.;OPOS=29604392;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:115:113:0:0:115:113:28:87:0:0:28:85:0:0 chr12 29628016 . G A 1321.29 PASS AO=142;DP=144;FAO=142;FDP=144;FR=.;FRO=2;FSAF=80;FSAR=62;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0487758;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.566;QD=36.7024;RBI=0.0487854;REFB=0.0127499;REVB=0.000968201;RO=2;SAF=80;SAR=62;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0017008;STB=0.500894;TYPE=snp;VARB=-0.000160834;OID=.;OPOS=29628016;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:144:144:2:2:142:142:62:80:1:1:62:80:1:1 chr12 29630081 . G A 1256.93 PASS AO=132;DP=133;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0102706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.6621;QD=37.8023;RBI=0.0106742;REFB=0;REVB=0.00290746;RO=0;SAF=76;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.94421e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.31323e-05;OID=.;OPOS=29630081;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:133:133:0:0:132:133:56:76:0:0:56:77:0:0 chr12 29639186 . T C 1201.69 PASS AO=132;DP=136;FAO=132;FDP=136;FR=.;FRO=4;FSAF=57;FSAR=75;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0241176;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=220.191;QD=35.344;RBI=0.0246861;REFB=-0.121458;REVB=-0.00526733;RO=1;SAF=57;SAR=75;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00826558;STB=0.509509;TYPE=snp;VARB=0.000524278;OID=.;OPOS=29639186;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:136:136:1:4:132:132:75:57:1:0:75:57:3:1 chr12 29642573 . A C 305.19 PASS AO=62;DP=139;FAO=77;FDP=150;FR=.;FRO=73;FSAF=46;FSAR=31;FSRF=46;FSRR=27;FWDB=0.0299883;FXX=0.0259723;HRUN=2;LEN=1;MLLD=37.8229;QD=8.13849;RBI=0.0362532;REFB=-0.0430419;REVB=0.0203714;RO=72;SAF=34;SAR=28;SRF=46;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0893548;STB=0.516662;TYPE=snp;VARB=0.0606968;OID=.;OPOS=29642573;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:150:72:73:62:77:28:34:46:26:31:46:46:27 chr12 29648275 . G A 2395.33 PASS AO=269;DP=282;FAO=270;FDP=282;FR=.;FRO=12;FSAF=122;FSAR=148;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.0159929;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.186;QD=33.9763;RBI=0.0378664;REFB=-0.0202226;REVB=0.0343233;RO=12;SAF=121;SAR=148;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0109525;STB=0.505641;TYPE=snp;VARB=0.00108702;OID=.;OPOS=29648275;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:282:282:12:12:269:270:148:121:7:5:148:122:7:5 chr12 29650558 . AG A 441.12 PASS AO=62;DP=80;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00803786;FXX=0.0253133;HRUN=2;LEN=1;MLLD=14.4779;QD=22.9153;RBI=0.23032;REFB=-0.106702;REVB=0.230179;RO=7;SAF=16;SAR=46;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0.508475;SSSB=0.0291546;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0227932;OID=.;OPOS=29650559;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:62:76:77:77:0:21:56:0:0:27:7:16:46:1:6 chr12 29653882 . G C 638.35 PASS AO=338;DP=800;FAO=175;FDP=396;FR=.;FRO=221;FSAF=75;FSAR=100;FSRF=104;FSRR=117;FWDB=-0.0038702;FXX=0.00999975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.456;QD=6.44799;RBI=0.020901;REFB=-0.0197189;REVB=-0.0205395;RO=449;SAF=140;SAR=198;SRF=211;SRR=238;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0584233;STB=0.523772;TYPE=snp;VARB=0.0224714;OID=.;OPOS=29653882;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:800:396:449:221:338:175:198:140:211:238:100:75:104:117 chr12 30781912 . A G 961.33 PASS AO=101;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00230774;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=246.252;QD=38.0726;RBI=0.0195599;REFB=0;REVB=0.0194233;RO=0;SAF=53;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11453e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.53835e-05;OID=.;OPOS=30781912;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:101:101:0:0:101:101:48:53:0:0:48:53:0:0 chr12 30782076 . T C 980.79 PASS AO=104;DP=104;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0203184;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.069;QD=38.0891;RBI=0.0279527;REFB=0;REVB=0.0191968;RO=0;SAF=55;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000103012;OID=.;OPOS=30782076;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:104:103:0:0:104:103:49:55:0:0:48:55:0:0 chr12 30783475 . A G 1504.4 PASS AO=168;DP=175;FAO=169;FDP=175;FR=.;FRO=6;FSAF=135;FSAR=34;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.00822044;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=248.142;QD=34.3862;RBI=0.0240449;REFB=-0.0178159;REVB=0.0225961;RO=6;SAF=135;SAR=33;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.063336;STB=0.524108;TYPE=snp;VARB=0.000134077;OID=.;OPOS=30783475;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:175:175:6:6:168:169:33:135:1:5:34:135:2:4 chr12 30823971 . A G 2903.22 PASS AO=303;DP=309;FAO=305;FDP=305;FR=.;FRO=0;FSAF=136;FSAR=169;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0127926;FXX=0.0224352;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.8343;QD=38.0751;RBI=0.0838844;REFB=-0.0491698;REVB=-0.0829032;RO=0;SAF=135;SAR=168;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000397332;OID=.;OPOS=30823971;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:309:305:0:0:303:305:168:135:0:0:169:136:0:0 chr12 30868002 . C T 2036.62 PASS AO=214;DP=217;FAO=214;FDP=214;FR=.;FRO=0;FSAF=135;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00194761;FXX=0.0138242;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.208;QD=38.0677;RBI=0.0100795;REFB=0.0329216;REVB=0.00988954;RO=0;SAF=135;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.01305e-05;OID=.;OPOS=30868002;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:217:214:0:0:214:214:79:135:0:0:79:135:0:0 chr12 30877391 . G T 3207.02 PASS AO=341;DP=349;FAO=346;FDP=346;FR=.;FRO=0;FSAF=147;FSAR=199;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0981744;FXX=0.00859574;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.2418;QD=37.0753;RBI=0.101277;REFB=-0.0819997;REVB=-0.0248758;RO=5;SAF=142;SAR=199;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0164982;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00194778;OID=.;OPOS=30877391;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:349:346:5:0:341:346:199:142:5:0:199:147:0:0 chr12 30881809 . T C 1575.42 PASS AO=166;DP=167;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=112;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0264576;FXX=0.0175428;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.292;QD=37.5099;RBI=0.0376365;REFB=-0.0711974;REVB=0.0267675;RO=0;SAF=111;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.45873e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00033132;OID=.;OPOS=30881809;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:167:168:0:0:166:168:55:111:0:0:56:112:0:0 chr12 30881810 . G A 211.99 PASS AO=66;DP=173;FAO=66;FDP=169;FR=.;FRO=103;FSAF=46;FSAR=20;FSRF=67;FSRR=36;FWDB=-0.0236873;FXX=0.0231201;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.974;QD=5.01757;RBI=0.0523236;REFB=-0.0178947;REVB=0.0466548;RO=103;SAF=46;SAR=20;SRF=67;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0577432;STB=0.532661;TYPE=snp;VARB=0.0320582;OID=.;OPOS=30881810;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:169:103:103:66:66:20:46:67:36:20:46:67:36 chr12 30888001 . T C 3276.42 PASS AO=349;DP=353;FAO=351;FDP=351;FR=.;FRO=0;FSAF=179;FSAR=172;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00379027;FXX=0.0112673;HRUN=3;LEN=1;MLLD=278.414;QD=37.3382;RBI=0.0167016;REFB=0.0242058;REVB=-0.0162658;RO=3;SAF=177;SAR=172;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00824796;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.98177e-06;OID=.;OPOS=30888001;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:353:351:3:0:349:351:172:177:0:3:172:179:0:0 chr12 30948848 . G C 285.72 PASS AO=28;DP=29;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.14588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.17;QD=36.8668;RBI=0.1466;REFB=0;REVB=0.014507;RO=0;SAF=0;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000359953;OID=.;OPOS=30948848;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:29:31:0:0:28:31:28:0:0:0:29:2:0:0 chr12 31107131 . A G 129.88 PASS AO=43;DP=118;FAO=43;FDP=118;FR=.;FRO=75;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=33;FSRR=42;FWDB=0.0116374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.273;QD=4.40277;RBI=0.0207159;REFB=-0.0112959;REVB=-0.0171383;RO=75;SAF=23;SAR=20;SRF=33;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105171;STB=0.560066;TYPE=snp;VARB=0.0196228;OID=.;OPOS=31107131;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:75:75:43:43:20:23:33:42:20:23:33:42 chr12 31107955 . G A 664.58 PASS AO=62;DP=62;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0318884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.659;QD=37.9761;RBI=0.0426472;REFB=0;REVB=0.0283181;RO=0;SAF=16;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.50785e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000147745;OID=.;OPOS=31107955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:62:70:0:0:62:70:46:16:0:0:50:20:0:0 chr12 31135478 . T C 580.74 PASS AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0528997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.7087;QD=38.716;RBI=0.0573878;REFB=0;REVB=-0.0222482;RO=0;SAF=19;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.31043e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000847747;OID=.;OPOS=31135478;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:60:60:0:0:60:60:41:19:0:0:41:19:0:0 chr12 31135579 . T C 411.3 PASS AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0219109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.609;QD=35.7651;RBI=0.0383747;REFB=-0.0833226;REVB=0.0315044;RO=0;SAF=4;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506021;TYPE=snp;VARB=0.000681198;OID=.;OPOS=31135579;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:46:46:0:1:45:45:41:4:0:0:41:4:0:1 chr12 31237700 . G A 134.47 PASS AO=33;DP=73;FAO=33;FDP=72;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=13;FWDB=0.00160496;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.095;QD=7.4707;RBI=0.0253249;REFB=-0.00185677;REVB=0.025274;RO=39;SAF=12;SAR=21;SRF=26;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.288379;STB=0.661595;TYPE=snp;VARB=0.00286372;OID=.;OPOS=31237700;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:72:39:39:33:33:21:12:26:13:21:12:26:13 chr12 31240862 . A T 124 PASS AO=36;DP=86;FAO=35;FDP=86;FR=.;FRO=51;FSAF=26;FSAR=9;FSRF=28;FSRR=23;FWDB=0.0063567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.9347;QD=5.76727;RBI=0.010318;REFB=-0.0286567;REVB=-0.00812729;RO=50;SAF=26;SAR=10;SRF=28;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186986;STB=0.631179;TYPE=snp;VARB=0.0405732;OID=.;OPOS=31240862;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:50:51:36:35:10:26:28:22:9:26:28:23 chr12 31240925 . A G 315.8 PASS AO=71;DP=142;FAO=72;FDP=142;FR=.;FRO=70;FSAF=37;FSAR=35;FSRF=30;FSRR=40;FWDB=-0.0103474;FXX=0.00699252;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.4529;QD=8.89576;RBI=0.0127179;REFB=0.00506507;REVB=0.00739447;RO=70;SAF=37;SAR=34;SRF=30;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0832714;STB=0.541981;TYPE=snp;VARB=-0.00706528;OID=.;OPOS=31240925;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:70:70:71:72:34:37:30:40:35:37:30:40 chr12 31242399 . T C 244.24 PASS AO=73;DP=182;FAO=73;FDP=181;FR=.;FRO=108;FSAF=33;FSAR=40;FSRF=46;FSRR=62;FWDB=-0.0305972;FXX=0.0054942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.646;QD=5.39754;RBI=0.049422;REFB=-0.0250505;REVB=-0.0388117;RO=107;SAF=33;SAR=40;SRF=46;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0237282;STB=0.515779;TYPE=snp;VARB=0.0365313;OID=.;OPOS=31242399;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:181:107:108:73:73:40:33:46:61:40:33:46:62 chr12 31249861 . C G 189.11 PASS AO=46;DP=101;FAO=47;FDP=102;FR=.;FRO=55;FSAF=43;FSAR=4;FSRF=50;FSRR=5;FWDB=0.0383054;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.5591;QD=7.41603;RBI=0.0413556;REFB=-0.0149164;REVB=0.015588;RO=54;SAF=42;SAR=4;SRF=49;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0168725;STB=0.509877;TYPE=snp;VARB=0.0170652;OID=.;OPOS=31249861;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:102:54:55:46:47:4:42:49:5:4:43:50:5 chr12 31253995 . C T 96.18 PASS AO=23;DP=50;FAO=23;FDP=51;FR=.;FRO=28;FSAF=1;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.0799135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.016;QD=7.54353;RBI=0.0799521;REFB=-0.0180453;REVB=-0.00248493;RO=27;SAF=1;SAR=22;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.670123;STB=0.892291;TYPE=snp;VARB=0.0117512;OID=.;OPOS=31253995;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:50:51:27:28:23:23:22:1:13:14:22:1:13:15 chr12 31255263 . G A 40.66 PASS AO=13;DP=40;FAO=13;FDP=40;FR=.;FRO=27;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=26;FWDB=0.0916012;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=229.078;QD=4.06647;RBI=0.0916597;REFB=-0.0167366;REVB=-0.00327463;RO=27;SAF=3;SAR=10;SRF=1;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.407714;STB=0.729505;TYPE=snp;VARB=0.0441864;OID=.;OPOS=31255263;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:40:40:27:27:13:13:10:3:1:26:10:3:1:26 chr12 31256905 . T C 85.43 PASS AO=27;DP=74;FAO=27;FDP=74;FR=.;FRO=47;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=-0.0653418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.1498;QD=4.61765;RBI=0.068721;REFB=-0.029464;REVB=-0.0212842;RO=47;SAF=11;SAR=16;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0444254;STB=0.525648;TYPE=snp;VARB=0.0540712;OID=.;OPOS=31256905;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:74:74:47:47:27:27:16:11:21:26:16:11:21:26 chr12 31267744 . A C 44.13 PASS AO=29;DP=127;FAO=29;FDP=127;FR=.;FRO=98;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=58;FSRR=40;FWDB=-0.0234218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.254;QD=1.38987;RBI=0.0238392;REFB=-0.00752943;REVB=-0.00444136;RO=98;SAF=16;SAR=13;SRF=58;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0514238;STB=0.53147;TYPE=snp;VARB=0.0329281;OID=.;OPOS=31267744;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:127:127:98:98:29:29:13:16:58:40:13:16:58:40 chr12 31282765 . A T 56.07 PASS AO=27;DP=100;FAO=27;FDP=100;FR=.;FRO=73;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=52;FSRR=21;FWDB=-0.000280254;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=223.759;QD=2.24287;RBI=0.00796775;REFB=0.00251484;REVB=-0.00796282;RO=73;SAF=11;SAR=16;SRF=52;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.361015;STB=0.712228;TYPE=snp;VARB=-0.0141854;OID=.;OPOS=31282765;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:100:100:73:73:27:27:16:11:52:21:16:11:52:21 chr12 31282784 . A G 98.36 PASS AO=35;DP=103;FAO=35;FDP=103;FR=.;FRO=68;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=45;FSRR=23;FWDB=-0.0199594;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.788;QD=3.81981;RBI=0.0200737;REFB=-0.00797503;REVB=-0.00213894;RO=68;SAF=14;SAR=21;SRF=45;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.292222;STB=0.667833;TYPE=snp;VARB=0.0107081;OID=.;OPOS=31282784;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:103:103:68:68:35:35:21:14:45:23:21:14:45:23 chr12 31283446 . T G 320.65 PASS AO=74;DP=151;FAO=76;FDP=152;FR=.;FRO=76;FSAF=63;FSAR=13;FSRF=55;FSRR=21;FWDB=0.0300796;FXX=0.0129862;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4278;QD=8.43805;RBI=0.052602;REFB=-0.0121584;REVB=0.0431531;RO=76;SAF=61;SAR=13;SRF=55;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142087;STB=0.582675;TYPE=snp;VARB=0.00985745;OID=.;OPOS=31283446;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:152:76:76:74:76:13:61:55:21:13:63:55:21 chr12 31288955 . G A 374.46 PASS AO=85;DP=181;FAO=92;FDP=186;FR=.;FRO=94;FSAF=39;FSAR=53;FSRF=54;FSRR=40;FWDB=0.000291492;FXX=0.0210515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.796;QD=8.05285;RBI=0.0479401;REFB=-0.000617814;REVB=0.0479392;RO=89;SAF=36;SAR=49;SRF=50;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128483;STB=0.57607;TYPE=snp;VARB=0.00115684;OID=.;OPOS=31288955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:186:89:94:85:92:49:36:50:39:53:39:54:40 chr12 31297871 . G C 882.22 PASS AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0128631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.3388;QD=37.945;RBI=0.0563724;REFB=0;REVB=0.0548853;RO=0;SAF=43;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000573212;OID=.;OPOS=31297871;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:93:93:0:0:93:93:50:43:0:0:50:43:0:0 chr12 31300891 . C A 2385.46 PASS AO=250;DP=251;FAO=253;FDP=253;FR=.;FRO=0;FSAF=189;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00733703;FXX=0.00784283;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.767;QD=37.7147;RBI=0.0158516;REFB=-0.0302862;REVB=0.0140514;RO=1;SAF=188;SAR=62;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00252898;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000109857;OID=.;OPOS=31300891;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:96:251:253:1:0:250:253:62:188:1:0:64:189:0:0 chr12 31301888 . T C 1665.19 PASS AO=181;DP=185;FAO=181;FDP=185;FR=.;FRO=4;FSAF=70;FSAR=111;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0121567;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=267.657;QD=36.0042;RBI=0.0291975;REFB=-0.0387049;REVB=0.0265464;RO=3;SAF=70;SAR=111;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00174787;STB=0.503121;TYPE=snp;VARB=0.000433993;OID=.;OPOS=31301888;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:185:185:3:4:181:181:111:70:1:2:111:70:1:3 chr12 31310983 . G A 1338.29 PASS AO=139;DP=139;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00352636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.419;QD=38.512;RBI=0.0269683;REFB=0;REVB=0.0267367;RO=0;SAF=51;SAR=88;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.69261e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.39596e-05;OID=.;OPOS=31310983;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:139:139:0:0:139:139:88:51:0:0:88:51:0:0 chr12 31311973 . G A 1425.69 PASS AO=136;DP=139;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.106578;FXX=0.0129862;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.2518;QD=37.518;RBI=0.10699;REFB=0.0812545;REVB=-0.00938812;RO=1;SAF=39;SAR=97;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00487624;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000100344;OID=.;OPOS=31311973;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:139:152:1:0:136:152:97:39:0:1:98:54:0:0 chr12 31539492 . G T 331.57 PASS AO=72;DP=133;FAO=72;FDP=136;FR=.;FRO=64;FSAF=60;FSAR=12;FSRF=41;FSRR=23;FWDB=-0.0506218;FXX=0.00729874;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3186;QD=9.75212;RBI=0.0520836;REFB=-0.0216255;REVB=0.0122528;RO=61;SAF=60;SAR=12;SRF=40;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221562;STB=0.634016;TYPE=snp;VARB=0.013511;OID=.;OPOS=31539492;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:136:61:64:72:72:12:60:40:21:12:60:41:23 chr12 31648826 . C T 96.09 PASS AO=30;DP=83;FAO=30;FDP=81;FR=.;FRO=51;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=25;FWDB=0.00385558;FXX=0.0240935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.29;QD=4.74499;RBI=0.00437294;REFB=-0.00939943;REVB=-0.00206327;RO=52;SAF=13;SAR=17;SRF=26;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0738885;STB=0.548355;TYPE=snp;VARB=0.0232249;OID=.;OPOS=31648826;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:83:81:52:51:30:30:17:13:26:26:17:13:26:25 chr12 31850283 . T C 1016.44 PASS AO=128;DP=153;FAO=128;FDP=146;FR=.;FRO=18;FSAF=54;FSAR=74;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0115833;FXX=0.0580608;HRUN=4;LEN=1;MLLD=144.914;QD=27.8477;RBI=0.0119451;REFB=-0.0201689;REVB=-0.0029175;RO=16;SAF=54;SAR=74;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101146;STB=0.502849;TYPE=snp;VARB=0.000195009;OID=.;OPOS=31850283;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:153:146:16:18:128:128:74:54:6:10:74:54:8:10 chr12 31944567 . T G 132.49 PASS AO=42;DP=112;FAO=42;FDP=112;FR=.;FRO=70;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=51;FSRR=19;FWDB=-0.00612697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.863;QD=4.7319;RBI=0.00635025;REFB=-0.0101513;REVB=0.00166908;RO=70;SAF=19;SAR=23;SRF=51;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.298753;STB=0.668531;TYPE=snp;VARB=0.0160405;OID=.;OPOS=31944567;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:70:70:42:42:23:19:51:19:23:19:51:19 chr12 32134240 . C T 1639.66 PASS AO=170;DP=170;FAO=170;FDP=170;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0129939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.805;QD=38.5803;RBI=0.0232331;REFB=0;REVB=-0.0192597;RO=0;SAF=89;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.85996e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.86649e-05;OID=.;OPOS=32134240;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:170:170:0:0:170:170:81:89:0:0:81:89:0:0 chr12 32134638 . T C 693.99 PASS AO=69;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0266852;FXX=0.0266631;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.423;QD=38.0268;RBI=0.0290484;REFB=0;REVB=-0.0114765;RO=0;SAF=23;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00051225;OID=.;OPOS=32134638;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:73:73:0:0:69:73:46:23:0:0:47:26:0:0 chr12 32134943 . A G 584.21 PASS AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00939614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.086;QD=37.6913;RBI=0.0196482;REFB=0;REVB=0.0172558;RO=0;SAF=22;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.34732e-05;OID=.;OPOS=32134943;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:62:62:0:0:62:62:40:22:0:0:40:22:0:0 chr12 32135441 . T C 676.11 PASS AO=67;DP=67;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.497;QD=38.6347;RBI=0.0268854;REFB=0;REVB=0.0239143;RO=0;SAF=30;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.14607e-05;OID=.;OPOS=32135441;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:67:70:0:0:67:70:37:30:0:0:38:32:0:0 chr12 32137447 . C T 710.24 PASS AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0184888;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=241.866;QD=36.8956;RBI=0.0222024;REFB=-0.00609905;REVB=0.0122926;RO=1;SAF=38;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122906;STB=0.506492;TYPE=snp;VARB=5.30105e-05;OID=.;OPOS=32137447;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:77:77:1:1:76:76:38:38:0:1:38:38:0:1 chr12 32137512 . C G 1055.81 PASS AO=110;DP=110;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00811493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.478;QD=38.0472;RBI=0.00817432;REFB=0;REVB=-0.000983541;RO=0;SAF=62;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.52354e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.58505e-06;OID=.;OPOS=32137512;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:110:111:0:0:110:111:48:62:0:0:48:63:0:0 chr12 32261239 . A G 339.48 PASS AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0191353;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=197.74;QD=35.7347;RBI=0.0234741;REFB=-0.084624;REVB=-0.0135969;RO=1;SAF=20;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0228411;STB=0.512189;TYPE=snp;VARB=0.000393375;OID=.;OPOS=32261239;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:38:38:1:1:37:37:17:20:1:0:17:20:1:0 chr12 32261252 . A C 298.52 PASS AO=35;DP=38;FAO=35;FDP=38;FR=.;FRO=3;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.00866197;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=214.53;QD=31.4233;RBI=0.0379385;REFB=0.00650538;REVB=-0.0369365;RO=3;SAF=21;SAR=14;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0405437;STB=0.521727;TYPE=snp;VARB=-0.000374999;OID=.;OPOS=32261252;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:3:3:35:35:14:21:1:2:14:21:1:2 chr12 32261435 . A G 975.9 PASS AO=105;DP=108;FAO=105;FDP=107;FR=.;FRO=2;FSAF=67;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0111397;FXX=0.0092584;HRUN=3;LEN=1;MLLD=166.465;QD=36.4823;RBI=0.0201443;REFB=-0.0744984;REVB=0.016784;RO=2;SAF=67;SAR=38;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0243179;STB=0.512818;TYPE=snp;VARB=2.32196e-05;OID=.;OPOS=32261435;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:108:107:2:2:105:105:38:67:0:2:38:67:0:2 chr12 32481093 . G C 225.5 PASS AO=72;DP=183;FAO=71;FDP=183;FR=.;FRO=112;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=58;FSRR=54;FWDB=-0.00979883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.279;QD=4.92893;RBI=0.0376048;REFB=0.00431748;REVB=0.0363057;RO=109;SAF=38;SAR=34;SRF=56;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0150286;STB=0.502004;TYPE=snp;VARB=-0.00490291;OID=.;OPOS=32481093;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:183:109:112:72:71:34:38:56:53:34:37:58:54 chr12 32481369 . C T 56.56 PASS AO=8;DP=45;FAO=15;FDP=40;FR=.,HEALED;FRO=25;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.00852851;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=168.753;QD=5.65619;RBI=0.230195;REFB=0.0011543;REVB=-0.230037;RO=13;SAF=7;SAR=1;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.296557;STB=0.582673;TYPE=snp;VARB=-0.00870071;OID=.;OPOS=32481369;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:33:40:13:25:8:15:1:7:9:4:7:8:10:15 chr12 32490764 . G A 184.7 PASS AO=30;DP=48;FAO=33;FDP=52;FR=.;FRO=19;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.00349041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.327;QD=14.2074;RBI=0.0284472;REFB=-0.050581;REVB=0.0282323;RO=18;SAF=19;SAR=11;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.024678;STB=0.501886;TYPE=snp;VARB=0.0323556;OID=.;OPOS=32490764;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:48:52:18:19:30:33:11:19:12:6:12:21:12:7 chr12 32552769 . C G 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0201569;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=273.228;QD=35.0875;RBI=0.0226282;REFB=0;REVB=-0.0102827;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00030854;OID=.;OPOS=32552769;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:3:4:0:0:3:4:0:0 chr12 32735236 . C T 426.08 PASS AO=48;DP=49;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0554879;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.6171;QD=37.8734;RBI=0.0767508;REFB=0;REVB=0.0530263;RO=0;SAF=29;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00123393;OID=.;OPOS=32735236;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:49:45:0:0:48:45:19:29:0:0:18:27:0:0 chr12 32764184 . G A 142.56 PASS AO=50;DP=140;FAO=49;FDP=138;FR=.;FRO=89;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=38;FSRR=51;FWDB=0.0309897;FXX=0.0142847;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.4515;QD=4.13223;RBI=0.0315064;REFB=0.00199285;REVB=-0.00568231;RO=89;SAF=26;SAR=24;SRF=38;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104054;STB=0.566522;TYPE=snp;VARB=-0.00442016;OID=.;OPOS=32764184;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:138:89:89:50:49:24:26:38:51:23:26:38:51 chr12 32777362 . G A 287.13 PASS AO=70;DP=147;FAO=70;FDP=147;FR=.;FRO=77;FSAF=34;FSAR=36;FSRF=38;FSRR=39;FWDB=-0.00479032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.402;QD=7.81294;RBI=0.0275874;REFB=-0.033601;REVB=-0.0271683;RO=77;SAF=34;SAR=36;SRF=38;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00737763;STB=0.504083;TYPE=snp;VARB=0.0376588;OID=.;OPOS=32777362;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:147:77:77:70:70:36:34:38:39:36:34:38:39 chr12 32791796 . G A 359.43 PASS AO=107;DP=260;FAO=107;FDP=261;FR=.;FRO=154;FSAF=49;FSAR=58;FSRF=64;FSRR=90;FWDB=-0.0113914;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=244.117;QD=5.50848;RBI=0.0221864;REFB=-0.0116905;REVB=0.0190388;RO=153;SAF=49;SAR=58;SRF=64;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0422197;STB=0.525274;TYPE=snp;VARB=0.0135033;OID=.;OPOS=32791796;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:260:261:153:154:107:107:58:49:64:89:58:49:64:90 chr12 32854366 . A C 378.37 PASS AO=89;DP=183;FAO=90;FDP=183;FR=.;FRO=93;FSAF=44;FSAR=46;FSRF=49;FSRR=44;FWDB=-0.00833986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.511;QD=8.27031;RBI=0.00945235;REFB=-0.00712578;REVB=-0.00444901;RO=92;SAF=43;SAR=46;SRF=48;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0356073;STB=0.519297;TYPE=snp;VARB=0.0066134;OID=.;OPOS=32854366;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:183:92:93:89:90:46:43:48:44:46:44:49:44 chr12 32860302 . G A 110.81 PASS AO=27;DP=60;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.0150019;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=215.42;QD=7.38728;RBI=0.0267859;REFB=0.00779543;REVB=-0.0221908;RO=33;SAF=10;SAR=17;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144324;STB=0.581688;TYPE=snp;VARB=-0.00701144;OID=.;OPOS=32860302;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:33:33:27:27:17:10:17:16:17:10:17:16 chr12 32875406 . A G 278.61 PASS AO=70;DP=149;FAO=70;FDP=151;FR=.;FRO=81;FSAF=23;FSAR=47;FSRF=43;FSRR=38;FWDB=0.0209989;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.781;QD=7.38035;RBI=0.0393813;REFB=-0.00740035;REVB=-0.0333157;RO=79;SAF=23;SAR=47;SRF=43;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21422;STB=0.613374;TYPE=snp;VARB=0.0107904;OID=.;OPOS=32875406;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:151:79:81:70:70:47:23:43:36:47:23:43:38 chr12 32896365 . G C 497.58 PASS AO=95;DP=160;FAO=95;FDP=159;FR=.;FRO=64;FSAF=41;FSAR=54;FSRF=45;FSRR=19;FWDB=0.00235303;FXX=0.0124216;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.739;QD=12.5178;RBI=0.0666869;REFB=-0.00618711;REVB=0.0666453;RO=63;SAF=41;SAR=54;SRF=45;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205766;STB=0.60807;TYPE=snp;VARB=0.0149614;OID=.;OPOS=32896365;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:159:63:64:95:95:54:41:45:18:54:41:45:19 chr12 32908237 . C A 84.56 PASS AO=17;DP=30;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=15;FSRF=2;FSRR=14;FWDB=-0.000140565;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=30.9855;QD=9.94765;RBI=0.03809;REFB=-0.0992254;REVB=0.0380897;RO=13;SAF=2;SAR=15;SRF=0;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.276593;STB=0.536998;TYPE=snp;VARB=0.0861407;OID=.;OPOS=32908237;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:30:34:13:16:17:18:15:2:0:13:15:3:2:14 chr12 32908518 . G A 118.53 PASS AO=21;DP=35;FAO=21;FDP=34;FR=.;FRO=13;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=0.0208623;FXX=0.0285633;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.753;QD=13.9448;RBI=0.0579837;REFB=-0.00334928;REVB=0.0541005;RO=12;SAF=16;SAR=5;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106884;STB=0.503872;TYPE=snp;VARB=0.00196782;OID=.;OPOS=32908518;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:35:34:12:13:21:21:5:16:9:3:5:16:10:3 chr12 32943927 . C T 1313.99 PASS AO=134;DP=134;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.486;QD=38.3646;RBI=0.0225407;REFB=0;REVB=0.00355321;RO=0;SAF=76;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.70999e-06;OID=.;OPOS=32943927;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:134:137:0:0:134:137:58:76:0:0:59:78:0:0 chr12 33021934 . A G 180.17 PASS AO=57;DP=149;FAO=57;FDP=149;FR=.;FRO=92;FSAF=20;FSAR=37;FSRF=46;FSRR=46;FWDB=0.00308702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.145;QD=4.83673;RBI=0.0152855;REFB=-0.00719608;REVB=-0.0149706;RO=90;SAF=20;SAR=37;SRF=45;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166712;STB=0.595285;TYPE=snp;VARB=0.0103679;OID=.;OPOS=33021934;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:90:92:57:57:37:20:45:45:37:20:46:46 chr12 33529062 . G A 149.37 PASS AO=27;DP=43;FAO=27;FDP=43;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.023343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.309;QD=13.8946;RBI=0.0233511;REFB=-0.00825279;REVB=-0.000612371;RO=16;SAF=8;SAR=19;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108411;STB=0.559875;TYPE=snp;VARB=0.00415623;OID=.;OPOS=33529062;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:43:43:16:16:27:27:19:8:7:9:19:8:7:9 chr12 33529487 . C G 316.83 PASS AO=62;DP=121;FAO=68;FDP=127;FR=.;FRO=59;FSAF=40;FSAR=28;FSRF=34;FSRR=25;FWDB=0.0139727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.546;QD=9.97875;RBI=0.0212568;REFB=-0.0216153;REVB=0.0160191;RO=57;SAF=36;SAR=26;SRF=33;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00151716;STB=0.505723;TYPE=snp;VARB=0.0131465;OID=.;OPOS=33529487;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:127:57:59:62:68:26:36:33:24:28:40:34:25 chr12 33535289 . G A 600.47 PASS AO=158;DP=349;FAO=158;FDP=346;FR=.;FRO=188;FSAF=90;FSAR=68;FSRF=125;FSRR=63;FWDB=-0.0126778;FXX=0.00859574;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.601;QD=6.94181;RBI=0.0279592;REFB=-0.0133972;REVB=-0.0249197;RO=187;SAF=90;SAR=68;SRF=124;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0951621;STB=0.553572;TYPE=snp;VARB=0.0186382;OID=.;OPOS=33535289;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:349:346:187:188:158:158:68:90:124:63:68:90:125:63 chr12 38712142 . C G 3819.63 PASS AO=585;DP=588;FAO=396;FDP=396;FR=.;FRO=0;FSAF=213;FSAR=183;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314437;FXX=0.00999975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.993;QD=38.5821;RBI=0.0354388;REFB=0;REVB=0.0163465;RO=0;SAF=317;SAR=268;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.07459e-06;OID=.;OPOS=38712142;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:588:396:0:0:585:396:268:317:0:0:183:213:0:0 chr12 38715000 . A G 496.56 PASS AO=115;DP=229;FAO=115;FDP=228;FR=.;FRO=113;FSAF=55;FSAR=60;FSRF=71;FSRR=42;FWDB=0.0167504;FXX=0.00436662;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.087;QD=8.71162;RBI=0.0168081;REFB=0.00583484;REVB=-0.00139181;RO=113;SAF=55;SAR=60;SRF=71;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135128;STB=0.574019;TYPE=snp;VARB=-0.00583968;OID=.;OPOS=38715000;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:229:228:113:113:115:115:60:55:71:42:60:55:71:42 chr12 38717678 . T C 298.9 PASS AO=83;DP=196;FAO=83;FDP=193;FR=.;FRO=110;FSAF=47;FSAR=36;FSRF=49;FSRR=61;FWDB=-0.000610773;FXX=0.0153053;HRUN=5;LEN=1;MLLD=221.061;QD=6.19488;RBI=0.00928911;REFB=-0.00281887;REVB=0.00926901;RO=109;SAF=47;SAR=36;SRF=48;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128045;STB=0.568792;TYPE=snp;VARB=0.00378332;OID=.;OPOS=38717678;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:193:109:110:83:83:36:47:48:61:36:47:49:61 chr12 40085906 . A T 431.36 PASS AO=125;DP=297;FAO=125;FDP=297;FR=.;FRO=172;FSAF=45;FSAR=80;FSRF=71;FSRR=101;FWDB=0.011511;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.443;QD=5.80956;RBI=0.0190894;REFB=-0.00851166;REVB=0.0152283;RO=168;SAF=45;SAR=80;SRF=68;SRR=100;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0492066;STB=0.532563;TYPE=snp;VARB=0.0132414;OID=.;OPOS=40085906;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:297:297:168:172:125:125:80:45:68:100:80:45:71:101 chr12 40148894 . TTA T,TT 157.04 PASS AO=31,28;DP=169;FAO=68,0;FDP=126;FR=.;FRO=58;FSAF=54,0;FSAR=14,0;FSRF=41;FSRR=17;FWDB=-0.162944,-0.355064;FXX=0.059697;HRUN=7,7;LEN=2,1;MLLD=15.7879,8.31022;QD=4.98553;RBI=0.189622,0.43089;REFB=-0.076359,-0.0668214;REVB=-0.0969836,-0.244123;RO=26;SAF=26,18;SAR=5,10;SRF=15;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.301829,0.0606427;STB=0.557239,0.5;TYPE=del,del;VARB=-0.0138206,0;OID=.,.;OPOS=40148895,40148896;OREF=TA,A;OALT=-,-;OMAPALT=T,TT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:31,28:134:68,0:126:58:54,0:14,0:41:17:99:26:26,18:5,10:15:11 chr12 40152900 . G A 1669.21 PASS AO=173;DP=173;FAO=174;FDP=174;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.024407;FXX=0.0169482;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.505;QD=38.3727;RBI=0.0834277;REFB=0;REVB=0.0797777;RO=0;SAF=82;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.69694e-05;OID=.;OPOS=40152900;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:173:174:0:0:173:174:91:82:0:0:93:81:0:0 chr12 40619082 . G A 1322.56 PASS AO=137;DP=138;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00966756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.733;QD=38.3351;RBI=0.0138803;REFB=0;REVB=0.00996001;RO=0;SAF=71;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.49328e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00027574;OID=.;OPOS=40619082;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:138:138:0:0:137:138:66:71:0:0:67:71:0:0 chr12 40631791 . T C 189.82 PASS AO=68;DP=193;FAO=68;FDP=193;FR=.;FRO=125;FSAF=45;FSAR=23;FSRF=66;FSRR=59;FWDB=0.00495007;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.94;QD=3.93418;RBI=0.00528054;REFB=-0.00988736;REVB=0.00183872;RO=125;SAF=45;SAR=23;SRF=66;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159073;STB=0.591035;TYPE=snp;VARB=0.0193648;OID=.;OPOS=40631791;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:193:125:125:68:68:23:45:66:59:23:45:66:59 chr12 40713834 . C A 672.71 PASS AO=53;DP=75;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00222131;FXX=0.0273935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.467;QD=37.899;RBI=0.00224614;REFB=0;REVB=0.000333071;RO=0;SAF=35;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.35671e-05;OID=.;OPOS=40713834;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:53:71:0:0:53:71:18:35:0:0:36:35:0:0 chr12 40713873 . A G 572.94 PASS AO=69;DP=76;FAO=69;FDP=76;FR=.;FRO=7;FSAF=29;FSAR=40;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.00182117;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=231.015;QD=30.1548;RBI=0.0105859;REFB=-0.0855653;REVB=-0.0104281;RO=7;SAF=29;SAR=40;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0518598;STB=0.527533;TYPE=snp;VARB=0.00113974;OID=.;OPOS=40713873;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:76:76:7:7:69:69:40:29:5:2:40:29:5:2 chr12 40716260 . T C 1994.06 PASS AO=206;DP=210;FAO=207;FDP=207;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=137;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0138816;FXX=0.014285;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.4345;QD=38.5326;RBI=0.0607353;REFB=0;REVB=0.0591276;RO=0;SAF=70;SAR=136;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.4477e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000108058;OID=.;OPOS=40716260;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:94:210:207:0:0:206:207:136:70:0:0:137:70:0:0 chr12 40742254 . G A 102.81 PASS AO=38;DP=115;FAO=39;FDP=118;FR=.;FRO=79;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=34;FSRR=45;FWDB=0.0104665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.366;QD=3.48519;RBI=0.0106539;REFB=-0.00390025;REVB=0.00198968;RO=76;SAF=16;SAR=22;SRF=31;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0155916;STB=0.513844;TYPE=snp;VARB=0.00707556;OID=.;OPOS=40742254;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:118:76:79:38:39:22:16:31:45:23:16:34:45 chr12 40758652 . T C 1457.14 PASS AO=151;DP=152;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00794819;FXX=0.0129024;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.49;QD=38.0951;RBI=0.0114446;REFB=0;REVB=0.00823438;RO=0;SAF=86;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.77232e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000100755;OID=.;OPOS=40758652;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:152:153:0:0:151:153:65:86:0:0:65:88:0:0 chr12 40761663 . T C 302.59 PASS AO=80;DP=179;FAO=80;FDP=179;FR=.;FRO=99;FSAF=42;FSAR=38;FSRF=45;FSRR=54;FWDB=0.000185644;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=268.537;QD=6.76169;RBI=0.00218633;REFB=-0.0062974;REVB=0.00217843;RO=98;SAF=42;SAR=38;SRF=45;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0651474;STB=0.538902;TYPE=snp;VARB=0.00709199;OID=.;OPOS=40761663;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:179:98:99:80:80:38:42:45:53:38:42:45:54 chr12 40821176 . G A 1451.21 PASS AO=155;DP=157;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0192733;FXX=0.012738;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0017;QD=37.4506;RBI=0.0579314;REFB=0.0246038;REVB=-0.0546314;RO=2;SAF=71;SAR=84;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111911;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000938155;OID=.;OPOS=40821176;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:157:155:2:0:155:155:84:71:0:2:84:71:0:0 chr12 40821839 . C T 370.86 PASS AO=108;DP=260;FAO=108;FDP=259;FR=.;FRO=151;FSAF=18;FSAR=90;FSRF=24;FSRR=127;FWDB=-0.0300499;FXX=0.00384601;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.096;QD=5.72758;RBI=0.0307774;REFB=-0.00778425;REVB=-0.0066519;RO=150;SAF=18;SAR=90;SRF=24;SRR=126;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126309;STB=0.508195;TYPE=snp;VARB=0.00982393;OID=.;OPOS=40821839;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:260:259:150:151:108:108:90:18:24:126:90:18:24:127 chr12 40825487 . G A 359.88 PASS AO=105;DP=252;FAO=105;FDP=252;FR=.;FRO=147;FSAF=47;FSAR=58;FSRF=63;FSRR=84;FWDB=0.00732183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.645;QD=5.71237;RBI=0.032671;REFB=-0.00466662;REVB=-0.03184;RO=146;SAF=47;SAR=58;SRF=62;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0242687;STB=0.511259;TYPE=snp;VARB=0.00811976;OID=.;OPOS=40825487;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:252:252:146:147:105:105:58:47:62:84:58:47:63:84 chr12 40827579 . C T 203.12 PASS AO=55;DP=127;FAO=55;FDP=127;FR=.;FRO=72;FSAF=36;FSAR=19;FSRF=34;FSRR=38;FWDB=-0.00833916;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.4186;QD=6.3975;RBI=0.0331887;REFB=0.0304589;REVB=-0.032124;RO=72;SAF=36;SAR=19;SRF=34;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190204;STB=0.606702;TYPE=snp;VARB=-0.0331631;OID=.;OPOS=40827579;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:72:72:55:55:19:36:34:38:19:36:34:38 chr12 40835749 . T C 389.19 PASS AO=110;DP=268;FAO=114;FDP=272;FR=.;FRO=158;FSAF=35;FSAR=79;FSRF=70;FSRR=88;FWDB=-0.00952924;FXX=0.007299;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.458;QD=5.72335;RBI=0.00998085;REFB=-0.00737096;REVB=-0.00296832;RO=158;SAF=33;SAR=77;SRF=70;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165456;STB=0.586618;TYPE=snp;VARB=0.00775519;OID=.;OPOS=40835749;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:268:272:158:158:110:114:77:33:70:88:79:35:70:88 chr12 40837264 . T C 185.18 PASS AO=48;DP=108;FAO=48;FDP=109;FR=.;FRO=61;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=22;FSRR=39;FWDB=-0.00795136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.759;QD=6.79571;RBI=0.00948943;REFB=-0.00438836;REVB=0.0051793;RO=59;SAF=19;SAR=29;SRF=22;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0238086;STB=0.520749;TYPE=snp;VARB=0.0024248;OID=.;OPOS=40837264;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:109:59:61:48:48:29:19:22:37:29:19:22:39 chr12 40843504 . A C 71.93 PASS AO=37;DP=138;FAO=37;FDP=138;FR=.;FRO=101;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=50;FSRR=51;FWDB=0.000347332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.312;QD=2.08486;RBI=0.000449791;REFB=-0.00663378;REVB=-0.000285785;RO=100;SAF=19;SAR=18;SRF=49;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0288326;STB=0.513506;TYPE=snp;VARB=0.034377;OID=.;OPOS=40843504;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:138:138:100:101:37:37:18:19:49:51:18:19:50:51 chr12 40857943 . A C 135.44 PASS AO=37;DP=88;FAO=37;FDP=88;FR=.;FRO=51;FSAF=6;FSAR=31;FSRF=8;FSRR=43;FWDB=-0.00497388;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=190.084;QD=6.15647;RBI=0.00737265;REFB=-0.0178225;REVB=0.0054421;RO=51;SAF=6;SAR=31;SRF=8;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0100883;STB=0.505692;TYPE=snp;VARB=0.0278175;OID=.;OPOS=40857943;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:51:51:37:37:31:6:8:43:31:6:8:43 chr12 40928574 . C T 142.77 PASS AO=44;DP=114;FAO=44;FDP=114;FR=.;FRO=70;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=40;FSRR=30;FWDB=0.0202799;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.743;QD=5.00956;RBI=0.0240842;REFB=0.0104392;REVB=-0.0129913;RO=70;SAF=20;SAR=24;SRF=40;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12584;STB=0.571396;TYPE=snp;VARB=-0.030415;OID=.;OPOS=40928574;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:70:70:44:44:24:20:40:30:24:20:40:30 chr12 40930709 . G C 173.38 PASS AO=55;DP=144;FAO=55;FDP=144;FR=.;FRO=89;FSAF=24;FSAR=31;FSRF=47;FSRR=42;FWDB=-0.00695325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.4646;QD=4.81611;RBI=0.00720588;REFB=-0.00845102;REVB=-0.00189131;RO=88;SAF=24;SAR=31;SRF=47;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106243;STB=0.556772;TYPE=snp;VARB=0.0158613;OID=.;OPOS=40930709;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:144:88:89:55:55:31:24:47:41:31:24:47:42 chr12 40943970 . G A 165.54 PASS AO=43;DP=97;FAO=43;FDP=97;FR=.;FRO=54;FSAF=29;FSAR=14;FSRF=28;FSRR=26;FWDB=-0.0203896;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.8901;QD=6.82618;RBI=0.0234239;REFB=-0.0150078;REVB=-0.0115302;RO=54;SAF=29;SAR=14;SRF=28;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164291;STB=0.592397;TYPE=snp;VARB=0.0277831;OID=.;OPOS=40943970;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:54:54:43:43:14:29:28:26:14:29:28:26 chr12 40951950 . G A 164.75 PASS AO=54;DP=145;FAO=54;FDP=145;FR=.;FRO=91;FSAF=16;FSAR=38;FSRF=38;FSRR=53;FWDB=-0.036855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.3869;QD=4.54491;RBI=0.0381314;REFB=-0.000683157;REVB=0.0097835;RO=91;SAF=16;SAR=38;SRF=38;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148627;STB=0.584916;TYPE=snp;VARB=0.000882396;OID=.;OPOS=40951950;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:91:91:54:54:38:16:38:53:38:16:38:53 chr12 40951961 . G C 141.42 PASS AO=49;DP=138;FAO=49;FDP=138;FR=.;FRO=89;FSAF=15;FSAR=34;FSRF=35;FSRR=54;FWDB=-0.0190828;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.318;QD=4.09924;RBI=0.0190844;REFB=-0.0129778;REVB=-0.000241138;RO=87;SAF=15;SAR=34;SRF=33;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0921261;STB=0.562887;TYPE=snp;VARB=0.0173111;OID=.;OPOS=40951961;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:87:89:49:49:34:15:33:54:34:15:35:54 chr12 40957395 . A G 408.78 PASS AO=100;DP=208;FAO=104;FDP=223;FR=.;FRO=119;FSAF=43;FSAR=61;FSRF=47;FSRR=72;FWDB=0.0173598;FXX=0.00446409;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.5464;QD=7.33242;RBI=0.0178775;REFB=0.0148241;REVB=0.00427117;RO=108;SAF=43;SAR=57;SRF=47;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00497641;STB=0.510213;TYPE=snp;VARB=-0.00927952;OID=.;OPOS=40957395;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:223:108:119:100:104:57:43:47:61:61:43:47:72 chr12 41337435 . C T 397.55 PASS AO=79;DP=144;FAO=82;FDP=148;FR=.;FRO=66;FSAF=45;FSAR=37;FSRF=37;FSRR=29;FWDB=0.00632935;FXX=0.00671096;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.216;QD=10.7444;RBI=0.0373827;REFB=-0.0119083;REVB=-0.036843;RO=63;SAF=45;SAR=34;SRF=36;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00149876;STB=0.505328;TYPE=snp;VARB=0.0114196;OID=.;OPOS=41337435;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:148:63:66:79:82:34:45:36:27:37:45:37:29 chr12 41967677 . G A 290.06 PASS AO=70;DP=144;FAO=70;FDP=145;FR=.;FRO=75;FSAF=25;FSAR=45;FSRF=21;FSRR=54;FWDB=-0.0077102;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.3895;QD=8.00165;RBI=0.0440017;REFB=-0.00518416;REVB=-0.043321;RO=74;SAF=25;SAR=45;SRF=20;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0908082;STB=0.544542;TYPE=snp;VARB=0.00519089;OID=.;OPOS=41967677;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:145:74:75:70:70:45:25:20:54:45:25:21:54 chr12 42481545 . T C 380.12 PASS AO=85;DP=168;FAO=86;FDP=168;FR=.;FRO=82;FSAF=41;FSAR=45;FSRF=48;FSRR=34;FWDB=-0.00215468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.936;QD=9.05047;RBI=0.00238643;REFB=0.000733116;REVB=0.00102587;RO=82;SAF=40;SAR=45;SRF=48;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102301;STB=0.552859;TYPE=snp;VARB=-0.000778453;OID=.;OPOS=42481545;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:82:82:85:86:45:40:48:34:45:41:48:34 chr12 42503467 . T C 214.22 PASS AO=67;DP=179;FAO=68;FDP=177;FR=.;FRO=109;FSAF=26;FSAR=42;FSRF=48;FSRR=61;FWDB=0.0142769;FXX=0.0166657;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.678;QD=4.84115;RBI=0.0258087;REFB=-0.00966548;REVB=-0.0215002;RO=108;SAF=25;SAR=42;SRF=47;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0707922;STB=0.537148;TYPE=snp;VARB=0.0124638;OID=.;OPOS=42503467;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:177:108:109:67:68:42:25:47:61:42:26:48:61 chr12 42554505 . A G 421.49 PASS AO=82;DP=136;FAO=81;FDP=136;FR=.;FRO=55;FSAF=12;FSAR=69;FSRF=24;FSRR=31;FWDB=0.0139045;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.5661;QD=12.3967;RBI=0.0406646;REFB=0.0293;REVB=-0.0382135;RO=54;SAF=13;SAR=69;SRF=23;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.284996;STB=0.674217;TYPE=snp;VARB=-0.0179557;OID=.;OPOS=42554505;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:54:55:82:81:69:13:23:31:69:12:24:31 chr12 42599696 . T A 123.65 PASS AO=34;DP=82;FAO=34;FDP=82;FR=.;FRO=48;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=0.00199517;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.876;QD=6.03192;RBI=0.0120263;REFB=-0.00633878;REVB=0.0118596;RO=48;SAF=14;SAR=20;SRF=21;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.027273;STB=0.515455;TYPE=snp;VARB=0.0123484;OID=.;OPOS=42599696;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:48:48:34:34:20:14:21:27:20:14:21:27 chr12 42629550 . T C 361.72 PASS AO=80;DP=153;FAO=80;FDP=153;FR=.;FRO=73;FSAF=54;FSAR=26;FSRF=53;FSRR=20;FWDB=-0.0318484;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.59;QD=9.45667;RBI=0.0318489;REFB=-0.0209106;REVB=-0.000174844;RO=73;SAF=54;SAR=26;SRF=53;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0516822;STB=0.528288;TYPE=snp;VARB=0.01991;OID=.;OPOS=42629550;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:153:73:73:80:80:26:54:53:20:26:54:53:20 chr12 42631445 . G A 27.39 PASS AO=9;DP=34;FAO=11;FDP=36;FR=.;FRO=25;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.0345324;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=33.9258;QD=3.04332;RBI=0.0651514;REFB=-0.0482456;REVB=0.0552469;RO=25;SAF=3;SAR=6;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17736;STB=0.65544;TYPE=snp;VARB=0.129997;OID=.;OPOS=42631445;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:34:36:25:25:9:11:6:3:12:13:8:3:12:13 chr12 42636124 . A G 177.2 PASS AO=40;DP=86;FAO=42;FDP=88;FR=.;FRO=46;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=31;FWDB=-0.0241786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.542;QD=8.05448;RBI=0.0242737;REFB=-0.00278969;REVB=0.00214653;RO=46;SAF=23;SAR=17;SRF=15;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234854;STB=0.614263;TYPE=snp;VARB=0.00294888;OID=.;OPOS=42636124;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:88:46:46:40:42:17:23:15:31:19:23:15:31 chr12 42839836 . A C 542.89 PASS AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0247834;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.987;QD=36.8058;RBI=0.0251331;REFB=-0.0320411;REVB=0.00417829;RO=1;SAF=24;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136737;STB=0.507244;TYPE=snp;VARB=0.000378647;OID=.;OPOS=42839836;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:59:59:1:1:58:58:34:24:0:1:34:24:0:1 chr12 42853520 . A G 228.46 PASS AO=61;DP=139;FAO=61;FDP=139;FR=.;FRO=78;FSAF=37;FSAR=24;FSRF=56;FSRR=22;FWDB=-0.0198324;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.96;QD=6.57434;RBI=0.0201533;REFB=-0.0014555;REVB=-0.00358259;RO=76;SAF=37;SAR=24;SRF=55;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126318;STB=0.56734;TYPE=snp;VARB=0.00161795;OID=.;OPOS=42853520;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:76:78:61:61:24:37:55:21:24:37:56:22 chr12 42854205 . A G 357.39 PASS AO=93;DP=204;FAO=93;FDP=204;FR=.;FRO=111;FSAF=72;FSAR=21;FSRF=82;FSRR=29;FWDB=-0.0194906;FXX=0.00487781;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.876;QD=7.00765;RBI=0.0263616;REFB=-0.00542518;REVB=-0.0177497;RO=111;SAF=72;SAR=21;SRF=82;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0481843;STB=0.526772;TYPE=snp;VARB=0.0117699;OID=.;OPOS=42854205;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:204:111:111:93:93:21:72:82:29:21:72:82:29 chr12 42854208 . A G 318.57 PASS AO=88;DP=203;FAO=88;FDP=203;FR=.;FRO=115;FSAF=70;FSAR=18;FSRF=85;FSRR=30;FWDB=-0.0120173;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=246.794;QD=6.27719;RBI=0.0258716;REFB=-0.0159981;REVB=-0.0229112;RO=115;SAF=70;SAR=18;SRF=85;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0827717;STB=0.54633;TYPE=snp;VARB=0.016732;OID=.;OPOS=42854208;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:203:115:115:88:88:18:70:85:30:18:70:85:30 chr12 42866211 . G A 265.89 PASS AO=57;DP=117;FAO=60;FDP=117;FR=.;FRO=57;FSAF=40;FSAR=20;FSRF=28;FSRR=29;FWDB=0.039656;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=37.8259;QD=9.09016;RBI=0.0902815;REFB=-0.0229646;REVB=0.0811058;RO=56;SAF=37;SAR=20;SRF=28;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139813;STB=0.59033;TYPE=snp;VARB=0.0210634;OID=.;OPOS=42866211;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:56:57:57:60:20:37:28:28:20:40:28:29 chr12 44191625 . G A 432.22 PASS AO=101;DP=202;FAO=101;FDP=202;FR=.;FRO=101;FSAF=49;FSAR=52;FSRF=49;FSRR=52;FWDB=-0.0249441;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.568;QD=8.55884;RBI=0.0251671;REFB=-0.000854176;REVB=-0.00334293;RO=99;SAF=49;SAR=52;SRF=47;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00938847;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000735894;OID=.;OPOS=44191625;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:202:99:101:101:101:52:49:47:52:52:49:49:52 chr12 45269284 . C T 225.36 PASS AO=46;DP=83;FAO=46;FDP=83;FR=.;FRO=37;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=27;FSRR=10;FWDB=0.0416077;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.8684;QD=10.8608;RBI=0.045446;REFB=-0.0241819;REVB=-0.0182795;RO=37;SAF=25;SAR=21;SRF=27;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155015;STB=0.58486;TYPE=snp;VARB=0.0296702;OID=.;OPOS=45269284;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:37:37:46:46:21:25:27:10:21:25:27:10 chr12 45408849 . T G 366.62 PASS AO=86;DP=173;FAO=86;FDP=173;FR=.;FRO=87;FSAF=28;FSAR=58;FSRF=25;FSRR=62;FWDB=0.0080177;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=308.922;QD=8.47666;RBI=0.0132276;REFB=0.00160999;REVB=-0.0105208;RO=86;SAF=28;SAR=58;SRF=25;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0366512;STB=0.522221;TYPE=snp;VARB=-0.00178329;OID=.;OPOS=45408849;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:173:86:87:86:86:58:28:25:61:58:28:25:62 chr12 45410075 . A G 749.91 PASS AO=127;DP=224;FAO=145;FDP=243;FR=.;FRO=98;FSAF=86;FSAR=59;FSRF=35;FSRR=63;FWDB=0.000187972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.92;QD=12.3442;RBI=0.000789181;REFB=0.00109421;REVB=-0.000766468;RO=97;SAF=69;SAR=58;SRF=35;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144679;STB=0.595075;TYPE=snp;VARB=-0.000607635;OID=.;OPOS=45410075;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:224:243:97:98:127:145:58:69:35:62:59:86:35:63 chr12 45417666 . T C 149.13 PASS AO=35;DP=76;FAO=36;FDP=77;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=28;FSRR=13;FWDB=0.0119109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.912;QD=7.74711;RBI=0.021587;REFB=0.0146837;REVB=-0.0180036;RO=40;SAF=12;SAR=23;SRF=27;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.312742;STB=0.668229;TYPE=snp;VARB=-0.0230661;OID=.;OPOS=45417666;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:77:40:41:35:36:23:12:27:13:23:13:28:13 chr12 46121310 . TG T 46.27 PASS AO=10;DP=33;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=0.0777453;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=20.0772;QD=8.41192;RBI=0.0826123;REFB=-0.0112049;REVB=-0.0279368;RO=10;SAF=1;SAR=9;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.645156;STB=0.883199;TYPE=del;VARB=0.0252929;OID=.;OPOS=46121311;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:10:22:12:22:10:1:11:8:2:28:10:1:9:8:2 chr12 46299735 . C T 26.43 PASS AO=3;DP=6;FAO=4;FDP=6;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0250283;FXX=0.142653;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.254;QD=17.6188;RBI=0.0258506;REFB=-0.0121326;REVB=0.00646816;RO=2;SAF=2;SAR=1;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.39997;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0063005;OID=.;OPOS=46299735;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:6:6:2:2:3:4:1:2:0:2:2:2:1:1 chr12 46367944 . A G 235.05 PASS AO=71;DP=177;FAO=71;FDP=177;FR=.;FRO=106;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=40;FSRR=66;FWDB=-0.000580398;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=226.027;QD=5.31188;RBI=0.0204071;REFB=-0.0154122;REVB=0.0203989;RO=106;SAF=36;SAR=35;SRF=40;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13815;STB=0.577488;TYPE=snp;VARB=0.0204079;OID=.;OPOS=46367944;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:177:106:106:71:71:35:36:40:66:35:36:40:66 chr12 46577071 . G A 564.77 PASS AO=138;DP=287;FAO=138;FDP=285;FR=.;FRO=147;FSAF=60;FSAR=78;FSRF=67;FSRR=80;FWDB=-0.00152298;FXX=0.0069684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.964;QD=7.92663;RBI=0.00423467;REFB=-0.0022333;REVB=0.00395132;RO=144;SAF=60;SAR=78;SRF=66;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0221913;STB=0.510986;TYPE=snp;VARB=0.00306743;OID=.;OPOS=46577071;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:287:285:144:147:138:138:78:60:66:78:78:60:67:80 chr12 46589988 . C T 63.57 PASS AO=18;DP=47;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=2;FSRF=24;FSRR=5;FWDB=-0.000433561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.5916;QD=5.41053;RBI=0.0843591;REFB=-0.0148629;REVB=-0.0843579;RO=28;SAF=16;SAR=2;SRF=24;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0776266;STB=0.58323;TYPE=snp;VARB=0.0230061;OID=.;OPOS=46589988;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:47:47:28:29:18:18:2:16:24:4:2:16:24:5 chr12 46622959 . T C 481.54 PASS AO=123;DP=273;FAO=127;FDP=280;FR=.;FRO=153;FSAF=51;FSAR=76;FSRF=84;FSRR=69;FWDB=-0.0187072;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.4105;QD=6.87908;RBI=0.0950231;REFB=-0.0234248;REVB=-0.0931634;RO=150;SAF=51;SAR=72;SRF=84;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144476;STB=0.581126;TYPE=snp;VARB=0.0269635;OID=.;OPOS=46622959;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:273:280:150:153:123:127:72:51:84:66:76:51:84:69 chr12 46758494 . A G 184.85 PASS AO=29;DP=72;FAO=44;FDP=87;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=0.0307005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.854;QD=8.49895;RBI=0.044435;REFB=-0.0169885;REVB=0.0321239;RO=31;SAF=12;SAR=17;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0052746;STB=0.553597;TYPE=snp;VARB=0.021356;OID=.;OPOS=46758494;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:87:31:43:29:44:17:12:13:18:29:15:19:24 chr12 46759017 . T A 110.79 PASS AO=31;DP=75;FAO=31;FDP=76;FR=.;FRO=45;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=-0.0185214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.595;QD=5.8313;RBI=0.0185609;REFB=-0.00949915;REVB=-0.00120931;RO=44;SAF=15;SAR=16;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0303629;STB=0.523389;TYPE=snp;VARB=0.0128677;OID=.;OPOS=46759017;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:76:44:45:31:31:16:15:20:24:16:15:20:25 chr12 46761127 . G A 236.79 PASS AO=39;DP=58;FAO=39;FDP=58;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=30;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.00929629;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.521;QD=16.3304;RBI=0.0121713;REFB=-0.0481415;REVB=-0.00785624;RO=18;SAF=9;SAR=30;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157741;STB=0.599945;TYPE=snp;VARB=0.0165866;OID=.;OPOS=46761127;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:58:58:18:19:39:39:30:9:8:10:30:9:9:10 chr12 47168898 . G A 1289.63 PASS AO=142;DP=147;FAO=144;FDP=147;FR=.;FRO=3;FSAF=88;FSAR=56;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0209036;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=205.58;QD=35.0919;RBI=0.0482048;REFB=-0.12477;REVB=0.0434366;RO=2;SAF=87;SAR=55;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0169739;STB=0.501193;TYPE=snp;VARB=0.000426801;OID=.;OPOS=47168898;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:147:147:2:3:142:144:55:87:0:2:56:88:2:1 chr12 47186770 . C T 104.98 PASS AO=37;DP=108;FAO=37;FDP=107;FR=.;FRO=70;FSAF=11;FSAR=26;FSRF=25;FSRR=45;FWDB=-0.00576094;FXX=0.0092584;HRUN=3;LEN=1;MLLD=195.921;QD=3.92448;RBI=0.00583599;REFB=0.00119186;REVB=-0.000932928;RO=68;SAF=11;SAR=26;SRF=24;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0721412;STB=0.545112;TYPE=snp;VARB=-0.00242681;OID=.;OPOS=47186770;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:107:68:70:37:37:26:11:24:44:26:11:25:45 chr12 47470223 . T TTACTA 849.04 PASS AO=83;DP=112;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0157712;FXX=0.0980296;HRUN=3;LEN=5;MLLD=276.122;QD=36.9149;RBI=0.0176002;REFB=0.0169377;REVB=0.00781259;RO=16;SAF=24;SAR=59;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117271;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=3.12073e-06;OID=.;OPOS=47470224;OREF=-;OALT=TACTA;OMAPALT=TTACTA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:83:112:92:92:0:28:64:0:0:34:16:24:59:10:6 chr12 47470264 . T C 145.99 PASS AO=40;DP=97;FAO=40;FDP=96;FR=.;FRO=56;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=23;FSRR=33;FWDB=-0.00254409;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.994;QD=6.08285;RBI=0.00624716;REFB=-0.0116164;REVB=0.00570567;RO=56;SAF=15;SAR=25;SRF=23;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0388801;STB=0.521967;TYPE=snp;VARB=0.0172466;OID=.;OPOS=47470264;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:96:56:56:40:40:25:15:23:33:25:15:23:33 chr12 47471439 . G A 358.74 PASS AO=68;DP=114;FAO=69;FDP=118;FR=.;FRO=49;FSAF=23;FSAR=46;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=0.00253686;FXX=0.00840265;HRUN=4;LEN=1;MLLD=124.173;QD=12.1607;RBI=0.00418024;REFB=-0.0364085;REVB=-0.00332247;RO=46;SAF=23;SAR=45;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127681;STB=0.57829;TYPE=snp;VARB=0.0181947;OID=.;OPOS=47471439;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:118:46:49:68:69:45:23:23:23:46:23:25:24 chr12 47581629 . T C 2273.6 PASS AO=229;DP=233;FAO=239;FDP=239;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=162;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0338022;FXX=0.00416649;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.158;QD=38.0519;RBI=0.0341806;REFB=-0.0025571;REVB=0.00507191;RO=1;SAF=71;SAR=158;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00666409;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.6941e-05;OID=.;OPOS=47581629;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:233:239:1:0:229:239:158:71:1:0:162:77:0:0 chr12 47629368 . G T 362.91 PASS AO=101;DP=234;FAO=101;FDP=234;FR=.;FRO=133;FSAF=42;FSAR=59;FSRF=37;FSRR=96;FWDB=0.00708014;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=202.833;QD=6.20351;RBI=0.00807235;REFB=-0.00326804;REVB=0.00387743;RO=133;SAF=42;SAR=59;SRF=37;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149474;STB=0.582743;TYPE=snp;VARB=0.00518267;OID=.;OPOS=47629368;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:234:234:133:133:101:101:59:42:37:96:59:42:37:96 chr12 47740069 . C A 188.16 PASS AO=55;DP=134;FAO=55;FDP=134;FR=.;FRO=79;FSAF=35;FSAR=20;FSRF=43;FSRR=36;FWDB=-0.0380329;FXX=0.0147048;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.811;QD=5.61671;RBI=0.0434223;REFB=-0.0165391;REVB=0.0209522;RO=75;SAF=36;SAR=19;SRF=40;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131146;STB=0.556797;TYPE=snp;VARB=0.0273347;OID=.;OPOS=47740069;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:75:79:55:55:19:36:40:35:20:35:43:36 chr12 48134695 . T C 147.37 PASS AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.105532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.9273;QD=36.8414;RBI=0.126069;REFB=0;REVB=-0.0689653;RO=0;SAF=5;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.36667e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00170423;OID=.;OPOS=48134695;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:16:0:0:16:16:11:5:0:0:11:5:0:0 chr12 48144925 . T C 406.5 PASS AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00242888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.862;QD=36.9545;RBI=0.0652884;REFB=0;REVB=0.0652432;RO=0;SAF=23;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000152494;OID=.;OPOS=48144925;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:43:44:0:0:43:44:20:23:0:0:21:23:0:0 chr12 48151822 . C G 181.93 PASS AO=44;DP=93;FAO=44;FDP=93;FR=.;FRO=49;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=13;FSRR=36;FWDB=0.0464857;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9803;QD=7.8248;RBI=0.0510466;REFB=-0.0132875;REVB=0.021091;RO=49;SAF=15;SAR=29;SRF=13;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0821497;STB=0.545587;TYPE=snp;VARB=0.0166836;OID=.;OPOS=48151822;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:49:49:44:44:29:15:13:36:29:15:13:36 chr12 48174641 . T C 128.08 PASS AO=29;DP=60;FAO=29;FDP=60;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.0290762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.311;QD=8.53856;RBI=0.0319709;REFB=-0.0202953;REVB=0.0132933;RO=31;SAF=17;SAR=12;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0052746;STB=0.502957;TYPE=snp;VARB=0.021008;OID=.;OPOS=48174641;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:31:31:29:29:12:17:18:13:12:17:18:13 chr12 48176792 . C T 1012.21 PASS AO=105;DP=105;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0835116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.1896;QD=38.1965;RBI=0.134443;REFB=0;REVB=0.10536;RO=0;SAF=43;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0010601;OID=.;OPOS=48176792;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:105:106:0:0:105:106:62:43:0:0:63:43:0:0 chr12 48176898 . CTT CT,CTG 315.5 PASS AO=12,17;DP=41;FAO=21,16;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=3,6;FSAR=18,10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00051565,-0.0549634;FXX=0.0512689;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=18.0239,19.8363;QD=34.1081;RBI=0.107742,0.0584824;REFB=0,0;REVB=-0.107741,0.0199805;RO=0;SAF=1,7;SAR=11,10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.23983e-08,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.0314068,0.00915522;OID=.,.;OPOS=48176899,48176900;OREF=T,T;OALT=-,G;OMAPALT=CT,CTG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:12,17:38:21,16:37:0:3,6:18,10:0:0:52:0:1,7:11,10:0:0 chr12 48177238 . A G 778.39 PASS AO=79;DP=79;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0330882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.14;QD=37.5126;RBI=0.0492132;REFB=0;REVB=0.0364294;RO=0;SAF=30;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53895e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00021745;OID=.;OPOS=48177238;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:79:83:0:0:79:83:49:30:0:0:50:33:0:0 chr12 48177906 . C T 124.32 PASS AO=22;DP=39;FAO=24;FDP=42;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=3;FWDB=0.0125098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.963;QD=11.8403;RBI=0.139905;REFB=-0.0182264;REVB=0.139345;RO=17;SAF=13;SAR=9;SRF=14;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197022;STB=0.628473;TYPE=snp;VARB=0.0186975;OID=.;OPOS=48177906;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:39:42:17:18:22:24:9:13:14:3:11:13:15:3 chr12 48178513 . A G 375.71 PASS AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0603337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.945;QD=38.5341;RBI=0.0608311;REFB=0;REVB=0.0077633;RO=0;SAF=15;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000257333;OID=.;OPOS=48178513;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:39:39:0:0:39:39:24:15:0:0:24:15:0:0 chr12 48189440 . GC G 105.99 PASS AO=13;DP=23;FAO=19;FDP=20;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.329006;FXX=0.0475964;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.6283;QD=21.1981;RBI=0.367847;REFB=0.0359691;REVB=0.164518;RO=7;SAF=10;SAR=3;SRF=5;SRR=2;SSEN=0.423729;SSEP=0;SSSB=0.0465113;STB=0.555494;TYPE=del;VARB=0.0494135;OID=.;OPOS=48189441;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:13:21:19:20:1:15:4:0:1:7:7:10:3:5:2 chr12 48190044 . C T 263.67 PASS AO=41;DP=57;FAO=41;FDP=58;FR=.;FRO=17;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=-0.0053713;FXX=0.0169463;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.793;QD=18.1843;RBI=0.00990734;REFB=-0.0238231;REVB=-0.00832493;RO=16;SAF=26;SAR=15;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0300928;STB=0.522925;TYPE=snp;VARB=0.00990332;OID=.;OPOS=48190044;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:57:58:16:17:41:41:15:26:11:5:15:26:12:5 chr12 48237735 . CA C 130.16 PASS AO=27;DP=59;FAO=30;FDP=61;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=10;FWDB=-0.0111362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.957;QD=8.53505;RBI=0.0283664;REFB=0.00453636;REVB=-0.026089;RO=28;SAF=15;SAR=12;SRF=19;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115002;STB=0.574231;TYPE=del;VARB=-0.00548888;OID=.;OPOS=48237736;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:27:58:30:61:31:16:14:21:10:99:28:15:12:19:9 chr12 48238757 . A G 54.42 PASS AO=14;DP=39;FAO=15;FDP=40;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=21;FWDB=-0.00613113;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.7729;QD=5.4419;RBI=0.0242549;REFB=0.000485087;REVB=-0.0234672;RO=24;SAF=7;SAR=7;SRF=4;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.366817;STB=0.697378;TYPE=snp;VARB=-0.00143638;OID=.;OPOS=48238757;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:39:40:24:25:14:15:7:7:4:20:8:7:4:21 chr12 48272895 . A G 701.08 PASS AO=73;DP=73;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0469268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.196;QD=37.8961;RBI=0.0470413;REFB=0;REVB=-0.00328018;RO=0;SAF=15;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.73872e-05;OID=.;OPOS=48272895;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:73:74:0:0:73:74:58:15:0:0:59:15:0:0 chr12 48375568 . A G 243.11 PASS AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0205897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.817;QD=37.4015;RBI=0.0218836;REFB=0;REVB=-0.00741325;RO=0;SAF=15;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000225786;OID=.;OPOS=48375568;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:25:26:0:0:25:26:10:15:0:0:10:16:0:0 chr12 48375965 . C T 28.98 PASS AO=7;DP=19;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.00434839;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.1717;QD=6.10206;RBI=0.0212169;REFB=-0.0566851;REVB=0.0207665;RO=12;SAF=1;SAR=6;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.439197;STB=0.776868;TYPE=snp;VARB=0.0638559;OID=.;OPOS=48375965;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:19:19:12:12:7:7:6:1:6:6:6:1:6:6 chr12 48376291 . G A 45.7 PASS AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.0128303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.9232;QD=13.0566;RBI=0.0133001;REFB=-0.00275173;REVB=0.00350389;RO=6;SAF=1;SAR=7;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260084;STB=0.655787;TYPE=snp;VARB=0.00501725;OID=.;OPOS=48376291;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:14:14:6:6:8:8:7:1:2:4:7:1:2:4 chr12 48380682 . G A 189.62 PASS AO=50;DP=120;FAO=52;FDP=122;FR=.;FRO=70;FSAF=19;FSAR=33;FSRF=42;FSRR=28;FWDB=-0.0162097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.635;QD=6.21717;RBI=0.0166842;REFB=-0.00857621;REVB=-0.0039507;RO=70;SAF=17;SAR=33;SRF=42;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.270832;STB=0.634564;TYPE=snp;VARB=0.00646278;OID=.;OPOS=48380682;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:122:70:70:50:52:33:17:42:28:33:19:42:28 chr12 48389023 . C T 59.48 PASS AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.018703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.062;QD=6.60921;RBI=0.0241681;REFB=-0.0138504;REVB=-0.0153067;RO=21;SAF=11;SAR=4;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.362175;STB=0.710739;TYPE=snp;VARB=0.018058;OID=.;OPOS=48389023;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:36:36:21:21:15:15:4:11:8:13:4:11:8:13 chr12 48389643 . A C 1022.82 PASS AO=111;DP=113;FAO=111;FDP=113;FR=.;FRO=2;FSAF=52;FSAR=59;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0177512;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.004;QD=36.206;RBI=0.0368387;REFB=0.0597114;REVB=0.0322798;RO=2;SAF=52;SAR=59;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0179073;STB=0.509432;TYPE=snp;VARB=-0.000260405;OID=.;OPOS=48389643;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:113:113:2:2:111:111:59:52:2:0:59:52:2:0 chr12 48391416 . G T 287.65 PASS AO=71;DP=161;FAO=71;FDP=150;FR=.;FRO=79;FSAF=43;FSAR=28;FSRF=28;FSRR=51;FWDB=0.00777806;FXX=0.0683187;HRUN=6;LEN=1;MLLD=137.54;QD=7.67053;RBI=0.00853106;REFB=0.00303275;REVB=-0.0035044;RO=69;SAF=43;SAR=28;SRF=28;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179387;STB=0.63079;TYPE=snp;VARB=-0.00688456;OID=.;OPOS=48391416;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:150:69:79:71:71:28:43:28:41:28:43:28:51 chr12 48391657 . T A 217.19 PASS AO=72;DP=197;FAO=73;FDP=197;FR=.;FRO=124;FSAF=36;FSAR=37;FSRF=61;FSRR=63;FWDB=-0.0055307;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=254.611;QD=4.4099;RBI=0.0107033;REFB=0.00731114;REVB=0.00916362;RO=123;SAF=35;SAR=37;SRF=61;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0109285;STB=0.500765;TYPE=snp;VARB=-0.0128277;OID=.;OPOS=48391657;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:197:123:124:72:73:37:35:61:62:37:36:61:63 chr12 48398080 . T A 306.11 PASS AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00429681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.064;QD=37.1045;RBI=0.057429;REFB=0;REVB=0.057268;RO=0;SAF=6;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.86929e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00048902;OID=.;OPOS=48398080;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:33:33:0:0:33:33:27:6:0:0:27:6:0:0 chr12 48438140 . CAT C 155.5 PASS AO=27;DP=115;FAO=35;FDP=67;FR=.;FRO=32;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=0.037227;FXX=0.118405;HRUN=1;LEN=2;MLLD=102.425;QD=9.28337;RBI=0.0393216;REFB=-0.128049;REVB=0.0126625;RO=25;SAF=18;SAR=9;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.267064;STB=0.549328;TYPE=del;VARB=0.0833781;OID=.;OPOS=48438141;OREF=AT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:27:65:35:67:32:20:15:15:17:99:25:18:9:9:16 chr12 48477422 . A G 532.22 PASS AO=121;DP=239;FAO=122;FDP=239;FR=.;FRO=117;FSAF=90;FSAR=32;FSRF=63;FSRR=54;FWDB=-0.0160984;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=212.266;QD=8.90741;RBI=0.0274694;REFB=-0.00757626;REVB=-0.0222578;RO=115;SAF=89;SAR=32;SRF=63;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192208;STB=0.612516;TYPE=snp;VARB=0.00883928;OID=.;OPOS=48477422;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:239:239:115:117:121:122:32:89:63:52:32:90:63:54 chr12 48512285 . C A 1236.78 PASS AO=111;DP=111;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101026;FXX=0.00769172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.938;QD=38.3498;RBI=0.0674777;REFB=0;REVB=0.0667172;RO=0;SAF=60;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.42743e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00128493;OID=.;OPOS=48512285;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:111:129:0:0:111:129:51:60:0:0:66:63:0:0 chr12 48512331 . C T 271.31 PASS AO=67;DP=143;FAO=67;FDP=142;FR=.;FRO=75;FSAF=34;FSAR=33;FSRF=21;FSRR=54;FWDB=0.0239601;FXX=0.00699252;HRUN=3;LEN=1;MLLD=197.658;QD=7.64254;RBI=0.0254927;REFB=-0.0243069;REVB=-0.00870566;RO=75;SAF=34;SAR=33;SRF=21;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217177;STB=0.619702;TYPE=snp;VARB=0.0298577;OID=.;OPOS=48512331;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:142:75:75:67:67:33:34:21:54:33:34:21:54 chr12 48525861 . A G 183.03 PASS AO=40;DP=94;FAO=47;FDP=100;FR=.;FRO=53;FSAF=30;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=32;FWDB=0.0442349;FXX=0.0476145;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.905;QD=7.32119;RBI=0.0443454;REFB=-0.0470275;REVB=-0.00312868;RO=49;SAF=30;SAR=10;SRF=20;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.35586;STB=0.628956;TYPE=snp;VARB=0.0455101;OID=.;OPOS=48525861;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:100:49:53:40:47:10:30:20:29:17:30:21:32 chr12 48526712 . G A 293.62 PASS AO=72;DP=149;FAO=71;FDP=148;FR=.;FRO=77;FSAF=27;FSAR=44;FSRF=34;FSRR=43;FWDB=-0.00462581;FXX=0.00671096;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.276;QD=7.93566;RBI=0.022059;REFB=-0.0165659;REVB=0.0215686;RO=77;SAF=28;SAR=44;SRF=34;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0511072;STB=0.533271;TYPE=snp;VARB=0.0221034;OID=.;OPOS=48526712;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:148:77:77:72:71:44:28:34:43:44:27:34:43 chr12 48539482 . T G 303.16 PASS AO=66;DP=127;FAO=67;FDP=128;FR=.;FRO=61;FSAF=21;FSAR=46;FSRF=21;FSRR=40;FWDB=-0.0197812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.189;QD=9.47366;RBI=0.0202739;REFB=-0.00929093;REVB=-0.00444258;RO=61;SAF=21;SAR=45;SRF=20;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00970925;STB=0.516849;TYPE=snp;VARB=0.0117387;OID=.;OPOS=48539482;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:128:61:61:66:67:45:21:20:41:46:21:21:40 chr12 48541757 . A G 112.72 PASS AO=35;DP=96;FAO=36;FDP=97;FR=.;FRO=61;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=28;FSRR=33;FWDB=-0.00323377;FXX=0.010203;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.711;QD=4.64836;RBI=0.00758219;REFB=-0.0136158;REVB=0.00685802;RO=58;SAF=12;SAR=23;SRF=27;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140427;STB=0.564296;TYPE=snp;VARB=0.0238685;OID=.;OPOS=48541757;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:97:58:61:35:36:23:12:27:31:23:13:28:33 chr12 48543237 . C T 111.91 PASS AO=29;DP=68;FAO=29;FDP=67;FR=.;FRO=38;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=-3.47673e-06;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.7238;QD=6.6812;RBI=0.00718254;REFB=-0.0195609;REVB=-0.00718254;RO=34;SAF=21;SAR=8;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.313619;STB=0.666911;TYPE=snp;VARB=0.0342199;OID=.;OPOS=48543237;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:67:34:38:29:29:8:21:14:20:8:21:17:21 chr12 48543771 . AG A 904.56 PASS AO=110;DP=159;FAO=158;FDP=159;FR=.;FRO=1;FSAF=61;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.330835;FXX=0.0124216;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.0334;QD=22.7563;RBI=0.387751;REFB=0.0401532;REVB=-0.202236;RO=22;SAF=33;SAR=77;SRF=20;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0.212963;SSSB=-0.207012;STB=0.502564;TYPE=del;VARB=0.00739408;OID=.;OPOS=48543772;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:110:154:158:159:1:61:97:0:1:66:22:33:77:20:2 chr12 48578325 . A C 292.03 PASS AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000392991;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.955;QD=38.9374;RBI=0.0552459;REFB=0;REVB=0.0552445;RO=0;SAF=11;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000234762;OID=.;OPOS=48578325;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:30:30:0:0:30:30:19:11:0:0:19:11:0:0 chr12 48578631 . G C 292.7 PASS AO=59;DP=105;FAO=59;FDP=104;FR=.;FRO=45;FSAF=38;FSAR=21;FSRF=33;FSRR=12;FWDB=0.0036798;FXX=0.0095229;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.973;QD=11.2575;RBI=0.00475584;REFB=0.0052996;REVB=-0.00301282;RO=45;SAF=38;SAR=21;SRF=33;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0791425;STB=0.543155;TYPE=snp;VARB=-0.00475957;OID=.;OPOS=48578631;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:104:45:45:59:59:21:38:33:12:21:38:33:12 chr12 48578809 . T C 986.16 PASS AO=104;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115779;FXX=0.00943307;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.799;QD=37.568;RBI=0.0236317;REFB=-0.020368;REVB=-0.0206012;RO=0;SAF=31;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.86759e-05;OID=.;OPOS=48578809;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:105:105:0:0:104:105:73:31:0:0:74:31:0:0 chr12 48579665 . G T 50.25 PASS AO=10;DP=23;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=13;FWDB=0.039872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.304;QD=8.37428;RBI=0.0449658;REFB=-0.0157499;REVB=0.0207882;RO=12;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.485332;STB=0.75967;TYPE=snp;VARB=0.0154037;OID=.;OPOS=48579665;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:23:24:12:13:10:11:5:5:0:12:6:5:0:13 chr12 48596241 . A G 405.76 PASS AO=99;DP=209;FAO=100;FDP=209;FR=.;FRO=109;FSAF=58;FSAR=42;FSRF=73;FSRR=36;FWDB=-0.00229835;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.461;QD=7.76572;RBI=0.017405;REFB=-0.000802545;REVB=0.0172526;RO=109;SAF=58;SAR=41;SRF=73;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0835375;STB=0.548764;TYPE=snp;VARB=0.000761242;OID=.;OPOS=48596241;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:209:109:109:99:100:41:58:73:36:42:58:73:36 chr12 48597053 . A G 208.26 PASS AO=54;DP=121;FAO=54;FDP=121;FR=.;FRO=67;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=20;FSRR=47;FWDB=0.022815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.119;QD=6.88451;RBI=0.0258389;REFB=-0.00582463;REVB=-0.0121294;RO=67;SAF=27;SAR=27;SRF=20;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200827;STB=0.611531;TYPE=snp;VARB=0.00329649;OID=.;OPOS=48597053;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:67:67:54:54:27:27:20:47:27:27:20:47 chr12 48723324 . C G 96.62 PASS AO=32;DP=93;FAO=33;FDP=94;FR=.;FRO=61;FSAF=6;FSAR=27;FSRF=12;FSRR=49;FWDB=0.0495818;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.7226;QD=4.11168;RBI=0.0795883;REFB=-0.0178388;REVB=-0.0622571;RO=61;SAF=6;SAR=26;SRF=12;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0169131;STB=0.515914;TYPE=snp;VARB=0.0308335;OID=.;OPOS=48723324;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:93:94:61:61:32:33:26:6:12:49:27:6:12:49 chr12 48723595 . G A 58.48 PASS AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=10;FSRR=2;FWDB=-0.0451919;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.323;QD=9.74629;RBI=0.0597719;REFB=0.0171301;REVB=0.0391201;RO=12;SAF=11;SAR=1;SRF=10;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188202;STB=0.610894;TYPE=snp;VARB=-0.00940925;OID=.;OPOS=48723595;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:24:24:12:12:12:12:1:11:10:2:1:11:10:2 chr12 48736985 . T G 125.36 PASS AO=26;DP=50;FAO=26;FDP=50;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.0166619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.258;QD=10.0288;RBI=0.0248645;REFB=-0.0167546;REVB=-0.0184559;RO=24;SAF=6;SAR=20;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233978;STB=0.63186;TYPE=snp;VARB=0.020307;OID=.;OPOS=48736985;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:24:24:26:26:20:6:11:13:20:6:11:13 chr12 48737245 . A C 122.16 PASS AO=59;DP=182;FAO=55;FDP=184;FR=.;FRO=129;FSAF=21;FSAR=34;FSRF=72;FSRR=57;FWDB=-0.00731821;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.7774;QD=2.6556;RBI=0.0252251;REFB=0.00414096;REVB=-0.0241402;RO=109;SAF=25;SAR=34;SRF=54;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0820487;STB=0.623255;TYPE=snp;VARB=-0.0268001;OID=.;OPOS=48737245;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:184:109:129:59:55:34:25:54:55:34:21:72:57 chr12 48953682 . G A 1338.3 PASS AO=138;DP=138;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0436239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.5831;QD=38.5122;RBI=0.0984982;REFB=0;REVB=0.0883111;RO=0;SAF=91;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.92354e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000506137;OID=.;OPOS=48953682;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:138:139:0:0:138:139:47:91:0:0:48:91:0:0 chr12 48953932 . G A 1063.51 PASS AO=124;DP=130;FAO=121;FDP=127;FR=.;FRO=6;FSAF=73;FSAR=48;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0720231;FXX=0.0230751;HRUN=5;LEN=1;MLLD=45.3;QD=33.4963;RBI=0.109951;REFB=-0.146585;REVB=0.0830773;RO=4;SAF=75;SAR=49;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00902682;STB=0.50313;TYPE=snp;VARB=0.00625234;OID=.;OPOS=48953932;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:130:127:4:6:124:121:49:75:3:1:48:73:4:2 chr12 48954030 . G A 898.91 PASS AO=106;DP=119;FAO=107;FDP=117;FR=.;FRO=10;FSAF=74;FSAR=33;FSRF=10;FSRR=0;FWDB=0.0117333;FXX=0.0168053;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.447;QD=30.7319;RBI=0.0529135;REFB=-0.0240059;REVB=0.0515962;RO=9;SAF=74;SAR=32;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0543085;STB=0.53164;TYPE=snp;VARB=0.00493966;OID=.;OPOS=48954030;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:119:117:9:10:106:107:32:74:9:0:33:74:10:0 chr12 48954040 . A G 1149.21 PASS AO=118;DP=119;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026003;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.288;QD=38.6288;RBI=0.0289266;REFB=0;REVB=-0.0126725;RO=0;SAF=85;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.74343e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.54382e-05;OID=.;OPOS=48954040;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:119:119:0:0:118:119:33:85:0:0:33:86:0:0 chr12 48954175 . C T 1022.94 PASS AO=108;DP=109;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00305328;FXX=0.00917347;HRUN=3;LEN=1;MLLD=199.245;QD=37.8867;RBI=0.0118219;REFB=0.00367643;REVB=0.0114208;RO=1;SAF=39;SAR=69;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00683021;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.88679e-06;OID=.;OPOS=48954175;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:109:108:1:0:108:108:69:39:0:1:69:39:0:0 chr12 48954225 . G C 869.94 PASS AO=89;DP=89;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0677261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.903;QD=38.664;RBI=0.0725238;REFB=0;REVB=0.02594;RO=0;SAF=33;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0005058;OID=.;OPOS=48954225;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:89:90:0:0:89:90:56:33:0:0:57:33:0:0 chr12 49177112 . CT C,CG 154.44 PASS AO=25,18;DP=111;FAO=26,19;FDP=105;FR=.;FRO=60;FSAF=25,5;FSAR=1,14;FSRF=27;FSRR=33;FWDB=-0.0291088,-0.0341037;FXX=0.0454504;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=167.994,177.538;QD=5.88353;RBI=0.0307526,0.0374203;REFB=-0.0289169,-0.0290233;REVB=-0.00991976,-0.0154019;RO=65;SAF=24,4;SAR=1,14;SRF=32;SRR=33;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.704116,-0.359584;STB=0.941947,0.655756;TYPE=del,snp;VARB=0.0218523,0.0369195;OID=.,.;OPOS=49177113,49177113;OREF=T,T;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:25,18:108:26,19:105:60:25,5:1,14:27:33:60:65:24,4:1,14:32:33 chr12 49221622 . G A 86.39 PASS AO=21;DP=53;FAO=23;FDP=55;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=0.0282075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.826;QD=6.28293;RBI=0.0323618;REFB=-0.0228493;REVB=0.0158625;RO=32;SAF=7;SAR=14;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149778;STB=0.573977;TYPE=snp;VARB=0.028742;OID=.;OPOS=49221622;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:53:55:32:32:21:23:14:7:15:17:15:8:15:17 chr12 49222217 . T C 111.17 PASS AO=20;DP=33;FAO=20;FDP=33;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.0280572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.9013;QD=13.4747;RBI=0.0735132;REFB=0.0156924;REVB=-0.0679484;RO=13;SAF=9;SAR=11;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0469859;STB=0.526128;TYPE=snp;VARB=-0.00878405;OID=.;OPOS=49222217;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:33:33:13:13:20:20:11:9:5:8:11:9:5:8 chr12 49230035 . T G 149.53 PASS AO=40;DP=100;FAO=42;FDP=101;FR=.;FRO=59;FSAF=6;FSAR=36;FSRF=14;FSRR=45;FWDB=-0.0480098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.993;QD=5.9218;RBI=0.0492547;REFB=-0.001478;REVB=-0.0110039;RO=59;SAF=6;SAR=34;SRF=14;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155643;STB=0.596963;TYPE=snp;VARB=0.00185319;OID=.;OPOS=49230035;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:101:59:59:40:42:34:6:14:45:36:6:14:45 chr12 49255798 . G C 477.06 PASS AO=110;DP=218;FAO=110;FDP=217;FR=.;FRO=107;FSAF=70;FSAR=40;FSRF=47;FSRR=60;FWDB=0.0122053;FXX=0.00458695;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.9386;QD=8.79374;RBI=0.0462191;REFB=-0.0162834;REVB=-0.0445784;RO=106;SAF=70;SAR=40;SRF=47;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176458;STB=0.599297;TYPE=snp;VARB=0.0154774;OID=.;OPOS=49255798;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:218:217:106:107:110:110:40:70:47:59:40:70:47:60 chr12 49308284 . A G 454.21 PASS AO=89;DP=153;FAO=89;FDP=152;FR=.;FRO=63;FSAF=32;FSAR=57;FSRF=42;FSRR=21;FWDB=-0.0212819;FXX=0.00653552;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5756;QD=11.9528;RBI=0.0342458;REFB=-0.0250151;REVB=-0.0268301;RO=63;SAF=32;SAR=57;SRF=42;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235866;STB=0.62821;TYPE=snp;VARB=0.0168423;OID=.;OPOS=49308284;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:152:63:63:89:89:57:32:42:21:57:32:42:21 chr12 49312593 . A G 2115.94 PASS AO=219;DP=219;FAO=221;FDP=221;FR=.;FRO=0;FSAF=108;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00498813;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4794;QD=38.2975;RBI=0.00637895;REFB=0;REVB=0.00397613;RO=0;SAF=108;SAR=111;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53434e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.93728e-05;OID=.;OPOS=49312593;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:219:221:0:0:219:221:111:108:0:0:113:108:0:0 chr12 49314862 . C A 413.21 PASS AO=118;DP=271;FAO=117;FDP=271;FR=.;FRO=154;FSAF=61;FSAR=56;FSRF=62;FSRR=92;FWDB=-0.00793118;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.8983;QD=6.09898;RBI=0.0344248;REFB=-0.0244366;REVB=-0.0334987;RO=147;SAF=62;SAR=56;SRF=60;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11695;STB=0.567217;TYPE=snp;VARB=0.0455348;OID=.;OPOS=49314862;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:271:271:147:154:118:117:56:62:60:87:56:61:62:92 chr12 49314994 . A G 315.02 PASS AO=65;DP=120;FAO=66;FDP=120;FR=.;FRO=54;FSAF=33;FSAR=33;FSRF=31;FSRR=23;FWDB=0.00235206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.334;QD=10.5008;RBI=0.0073116;REFB=-0.00194257;REVB=-0.00692295;RO=54;SAF=33;SAR=32;SRF=31;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0550677;STB=0.533323;TYPE=snp;VARB=0.00210139;OID=.;OPOS=49314994;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:54:54:65:66:32:33:31:23:33:33:31:23 chr12 49332092 . G A 160.86 PASS AO=54;DP=147;FAO=54;FDP=148;FR=.;FRO=94;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=37;FSRR=57;FWDB=-0.0177682;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.3902;QD=4.34749;RBI=0.0419454;REFB=-0.00466486;REVB=0.0379961;RO=92;SAF=26;SAR=28;SRF=35;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112876;STB=0.556094;TYPE=snp;VARB=0.00668088;OID=.;OPOS=49332092;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:148:92:94:54:54:28:26:35:57:28:26:37:57 chr12 49332366 . C T 120.94 PASS AO=20;DP=31;FAO=20;FDP=31;FR=.;FRO=11;FSAF=17;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=0.016347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.584;QD=15.6047;RBI=0.0255722;REFB=0.00174552;REVB=0.0196651;RO=11;SAF=17;SAR=3;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0385959;STB=0.52145;TYPE=snp;VARB=-0.000128117;OID=.;OPOS=49332366;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:31:31:11:11:20:20:3:17:9:2:3:17:9:2 chr12 49333799 . G A 415.82 PASS AO=101;DP=209;FAO=101;FDP=209;FR=.;FRO=108;FSAF=51;FSAR=50;FSRF=67;FSRR=41;FWDB=0.000264668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.098;QD=7.95819;RBI=0.0244389;REFB=0.00655864;REVB=-0.0244375;RO=108;SAF=50;SAR=51;SRF=67;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117541;STB=0.559708;TYPE=snp;VARB=-0.00687055;OID=.;OPOS=49333799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:209:108:108:101:101:51:50:67:41:50:51:67:41 chr12 49334762 . G C 1337.38 PASS AO=102;DP=134;FAO=139;FDP=139;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=57;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0934401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.3979;QD=38.4857;RBI=0.0937269;REFB=0;REVB=0.00732617;RO=0;SAF=21;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00220167;OID=.;OPOS=49334762;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:131:139:0:0:102:139:81:21:0:0:82:57:0:0 chr12 49359587 . T G 392.12 PASS AO=121;DP=305;FAO=123;FDP=311;FR=.;FRO=188;FSAF=62;FSAR=61;FSRF=79;FSRR=109;FWDB=0.0111404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.744;QD=5.04329;RBI=0.0183791;REFB=-0.012935;REVB=0.0146179;RO=184;SAF=62;SAR=59;SRF=79;SRR=105;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0892643;STB=0.550642;TYPE=snp;VARB=0.0163974;OID=.;OPOS=49359587;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:305:311:184:188:121:123:59:62:79:105:61:62:79:109 chr12 49359989 . G A 147.02 PASS AO=30;DP=55;FAO=30;FDP=55;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=6;FSRR=19;FWDB=0.0281357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.264;QD=10.6925;RBI=0.0283092;REFB=-0.0192068;REVB=-0.00312868;RO=25;SAF=13;SAR=17;SRF=6;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166079;STB=0.591598;TYPE=snp;VARB=0.0186051;OID=.;OPOS=49359989;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:25:25:30:30:17:13:6:19:17:13:6:19 chr12 49390677 . T C 266.61 PASS AO=58;DP=153;FAO=73;FDP=167;FR=.;FRO=94;FSAF=28;FSAR=45;FSRF=29;FSRR=65;FWDB=0.00830961;FXX=0.0346801;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.089;QD=6.38592;RBI=0.0109516;REFB=-0.0178835;REVB=0.00713355;RO=93;SAF=26;SAR=32;SRF=30;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141157;STB=0.545603;TYPE=snp;VARB=0.0270621;OID=.;OPOS=49390677;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:167:93:94:58:73:32:26:30:63:45:28:29:65 chr12 49425978 . T C 111.99 PASS AO=31;DP=75;FAO=31;FDP=75;FR=.;FRO=44;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=-0.0524589;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.6843;QD=5.97283;RBI=0.0529191;REFB=-0.0177013;REVB=0.0069644;RO=43;SAF=17;SAR=14;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0139396;STB=0.501735;TYPE=snp;VARB=0.0266929;OID=.;OPOS=49425978;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:43:44:31:31:14:17:23:20:14:17:24:20 chr12 49432719 . GAC G,GA 99.64 PASS AO=3,11;DP=19;FAO=0,17;FDP=19;FR=.;FRO=2;FSAF=0,7;FSAR=0,10;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0329198,0.178511;FXX=0;HRUN=1,3;LEN=2,1;MLLD=173.073,14.6064;QD=20.977;RBI=0.0380361,0.181937;REFB=-0.00282522,-0.0378664;REVB=-0.0190534,-0.0351396;RO=4;SAF=0,5;SAR=3,6;SRF=3;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0.300628;SSSB=-0.729277,-0.138896;STB=0.5,0.509543;TYPE=del,del;VARB=0.01793,0.0461548;OID=.,.;OPOS=49432720,49432721;OREF=AC,C;OALT=-,-;OMAPALT=G,GA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:3,11:19:0,17:19:2:0,7:0,10:1:1:6:4:0,5:3,6:3:1 chr12 49434074 . C A 22 PASS AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.00354509;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=31.2856;QD=4.88967;RBI=0.00646807;REFB=-0.0225829;REVB=-0.00541002;RO=12;SAF=4;SAR=2;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181968;STB=0.61499;TYPE=snp;VARB=0.0529751;OID=.;OPOS=49434074;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:18:18:12:12:6:6:2:4:6:6:2:4:6:6 chr12 49444545 . G A 45.13 PASS AO=15;DP=46;FAO=15;FDP=46;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=0.0776271;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6288;QD=3.92422;RBI=0.0776437;REFB=-0.0214952;REVB=-0.00160287;RO=31;SAF=9;SAR=6;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237481;STB=0.640842;TYPE=snp;VARB=0.0478958;OID=.;OPOS=49444545;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:46:46:31:31:15:15:6:9:12:19:6:9:12:19 chr12 49500398 . G A 654.68 PASS AO=131;DP=230;FAO=132;FDP=231;FR=.;FRO=99;FSAF=83;FSAR=49;FSRF=47;FSRR=52;FWDB=-0.0103804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.45;QD=11.3365;RBI=0.0222852;REFB=-0.0164767;REVB=0.0197199;RO=95;SAF=82;SAR=49;SRF=45;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121668;STB=0.568213;TYPE=snp;VARB=0.0107215;OID=.;OPOS=49500398;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:230:231:95:99:131:132:49:82:45:50:49:83:47:52 chr12 49500509 . C T 347.3 PASS AO=82;DP=166;FAO=82;FDP=166;FR=.;FRO=84;FSAF=44;FSAR=38;FSRF=31;FSRR=53;FWDB=0.000529278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.678;QD=8.36867;RBI=0.00118313;REFB=-0.0190751;REVB=-0.00105814;RO=84;SAF=44;SAR=38;SRF=31;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153016;STB=0.584164;TYPE=snp;VARB=0.0119095;OID=.;OPOS=49500509;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:166:84:84:82:82:38:44:31:53:38:44:31:53 chr12 49522578 . T C 89.49 PASS AO=36;DP=120;FAO=37;FDP=120;FR=.;FRO=83;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=63;FSRR=20;FWDB=-0.0165534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.074;QD=2.98311;RBI=0.0610524;REFB=0.000454337;REVB=0.0587654;RO=83;SAF=23;SAR=13;SRF=63;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165147;STB=0.5881;TYPE=snp;VARB=-0.000433281;OID=.;OPOS=49522578;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:120:120:83:83:36:37:13:23:63:20:13:24:63:20 chr12 49522605 . C T 223.54 PASS AO=57;DP=131;FAO=59;FDP=133;FR=.;FRO=74;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=54;FSRR=20;FWDB=0.000450968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.858;QD=6.72291;RBI=0.0620948;REFB=-0.0158937;REVB=0.0620931;RO=74;SAF=31;SAR=26;SRF=54;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194054;STB=0.615269;TYPE=snp;VARB=0.0260435;OID=.;OPOS=49522605;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:133:74:74:57:59:26:31:54:20:28:31:54:20 chr12 49579072 . AG A 443.01 PASS AO=31;DP=71;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.295061;FXX=0.0447694;HRUN=2;LEN=1;MLLD=17.7313;QD=27.688;RBI=0.393354;REFB=0;REVB=0.260128;RO=14;SAF=20;SAR=11;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0.368336;SSSB=0.0877021;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.020135;OID=.;OPOS=49579073;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:31:45:64:64:0:26:38:0:0:37:14:20:11:7:7 chr12 49579696 . C G 238.74 PASS AO=73;DP=188;FAO=74;FDP=188;FR=.;FRO=114;FSAF=50;FSAR=24;FSRF=69;FSRR=45;FWDB=-0.0109207;FXX=0.00529073;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.247;QD=5.07964;RBI=0.0204577;REFB=-0.00515091;REVB=0.017299;RO=113;SAF=50;SAR=23;SRF=69;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0890731;STB=0.547085;TYPE=snp;VARB=0.00782058;OID=.;OPOS=49579696;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:188:113:114:73:74:23:50:69:44:24:50:69:45 chr12 49580180 . T C 580.35 PASS AO=127;DP=238;FAO=127;FDP=239;FR=.;FRO=112;FSAF=68;FSAR=59;FSRF=60;FSRR=52;FWDB=0.0396068;FXX=0.00829841;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.2086;QD=9.71291;RBI=0.0424527;REFB=-0.0276244;REVB=-0.0152819;RO=111;SAF=69;SAR=58;SRF=59;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101275;STB=0.500132;TYPE=snp;VARB=0.0230955;OID=.;OPOS=49580180;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:238:239:111:112:127:127:58:69:59:52:59:68:60:52 chr12 49666413 . C T 297 PASS AO=56;DP=92;FAO=56;FDP=93;FR=.;FRO=37;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=6;FSRR=31;FWDB=0.0277556;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.3913;QD=12.7743;RBI=0.061737;REFB=0.00264195;REVB=-0.055146;RO=35;SAF=22;SAR=34;SRF=5;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194919;STB=0.600303;TYPE=snp;VARB=-0.00160375;OID=.;OPOS=49666413;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:93:35:37:56:56:34:22:5:30:34:22:6:31 chr12 49667103 . A T 1781.81 PASS AO=186;DP=186;FAO=186;FDP=186;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=135;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108902;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.686;QD=38.3185;RBI=0.0185633;REFB=0;REVB=0.0150333;RO=0;SAF=51;SAR=135;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07135e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.14559e-05;OID=.;OPOS=49667103;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:186:186:0:0:186:186:135:51:0:0:135:51:0:0 chr12 49992540 . T G 14.37 PASS AO=3;DP=10;FAO=3;FDP=10;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=-0.00557554;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.5828;QD=5.74609;RBI=0.00557554;REFB=0.0787113;REVB=0;RO=7;SAF=3;SAR=0;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00916146;OID=.;OPOS=49992540;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:10:10:7:7:3:3:0:3:7:0:0:3:7:0 chr12 50025257 . TCC TC,T,TCCC 31.34 PASS AO=4,4,5;DP=25;FAO=0,13,0;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=0,9,0;FSAR=0,4,0;FSRF=0;FSRR=14;FWDB=0.0213647,0.0109381,-0.0191305;FXX=0;HRUN=7,7,7;LEN=1,2,1;MLLD=6.35964,11.4973,9.65655;QD=4.64241;RBI=0.389068,0.211828,0.396566;REFB=-0.123823,-0.0635506,0.112706;REVB=0.388481,0.211546,-0.396104;RO=12;SAF=2,4,0;SAR=2,0,5;SRF=1;SRR=11;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.510671,0.813265,-0.636071;STB=0.5,0.817796,0.5;TYPE=del,del,ins;VARB=-0.00485155,0.133712,0;OID=.,.,.;OPOS=50025258,50025258,50025258;OREF=C,CC,-;OALT=-,-,C;OMAPALT=TC,T,TCCC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:4,4,5:25:0,13,0:27:14:0,9,0:0,4,0:0:14:25:12:2,4,0:2,0,5:1:11 chr12 50189807 . C A 39.27 PASS AO=8;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=0.0205052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.011;QD=9.23972;RBI=0.0739439;REFB=0.0227288;REVB=0.0710439;RO=9;SAF=6;SAR=2;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186888;STB=0.608461;TYPE=snp;VARB=-0.0404318;OID=.;OPOS=50189807;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:17:17:9:9:8:8:2:6:8:1:2:6:8:1 chr12 50189834 . T G 44.71 PASS AO=8;DP=18;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=1;FWDB=0.00409115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.13;QD=9.41226;RBI=0.0558315;REFB=-0.0260454;REVB=0.0556814;RO=10;SAF=8;SAR=0;SRF=9;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.72965;STB=0.515118;TYPE=snp;VARB=0.0282971;OID=.;OPOS=50189834;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:18:19:10:10:8:9:0:8:9:1:1:8:9:1 chr12 50263147 . TG T,TA 537.59 PASS AO=36,22;DP=95;FAO=49,41;FDP=94;FR=.;FRO=4;FSAF=21,25;FSAR=28,16;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.226351,-0.0693469;FXX=0.0105252;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=13.3477,82.619;QD=22.8762;RBI=0.398288,0.120592;REFB=-0.0573901,-0.0404349;REVB=-0.327716,-0.0986582;RO=7;SAF=18,6;SAR=18,16;SRF=7;SRR=0;SSEN=0.539062,0;SSEP=0.432526,0;SSSB=-0.151532,-0.335263;STB=0.54346,0.537019;TYPE=del,snp;VARB=0.0821597,0.00699439;OID=.,.;OPOS=50263148,50263148;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=T,TA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:36,22:76:49,41:94:4:21,25:28,16:4:0:99:7:18,6:18,16:7:0 chr12 50348078 . T C 401.9 PASS AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0390238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.388;QD=37.3858;RBI=0.0594979;REFB=0;REVB=-0.0449127;RO=0;SAF=26;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.75441e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.35331e-05;OID=.;OPOS=50348078;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:43:43:0:0:43:43:17:26:0:0:17:26:0:0 chr12 50452708 . C G 1096.96 PASS AO=115;DP=115;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00606284;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=251.496;QD=38.155;RBI=0.00606348;REFB=0;REVB=8.76186e-05;RO=0;SAF=41;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.91839e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.29135e-06;OID=.;OPOS=50452708;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:115:115:0:0:115:115:74:41:0:0:74:41:0:0 chr12 50467644 . G T 88.75 PASS AO=9;DP=51;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=0.0212521;FXX=0.0181785;HRUN=3;LEN=1;MLLD=94.6743;QD=6.57414;RBI=0.0243648;REFB=-0.00165333;REVB=0.0119161;RO=25;SAF=5;SAR=4;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134386;STB=0.623101;TYPE=snp;VARB=0.00587654;OID=.;OPOS=50467644;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:40:54:25:31:9:23:4:5:11:14:18:5:12:19 chr12 50467769 . G A 136.99 PASS AO=27;DP=48;FAO=27;FDP=49;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=23;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=-0.0271984;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.329;QD=11.1829;RBI=0.0272164;REFB=-0.0134755;REVB=0.000989848;RO=21;SAF=4;SAR=23;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232556;STB=0.650814;TYPE=snp;VARB=0.0088237;OID=.;OPOS=50467769;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:48:49:21:22:27:27:23:4:7:14:23:4:8:14 chr12 50476158 . G T 606.11 PASS AO=155;DP=315;FAO=154;FDP=327;FR=.;FRO=173;FSAF=62;FSAR=92;FSRF=101;FSRR=72;FWDB=0.00543716;FXX=0.0267849;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.412;QD=7.41413;RBI=0.0175145;REFB=-0.00792459;REVB=-0.0166492;RO=156;SAF=62;SAR=93;SRF=101;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224456;STB=0.595918;TYPE=snp;VARB=0.00846244;OID=.;OPOS=50476158;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:315:327:156:173:155:154:93:62:101:55:92:62:101:72 chr12 50493779 . AG A 607.47 PASS AO=96;DP=139;FAO=130;FDP=131;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.114977;FXX=0.00757518;HRUN=3;LEN=1;MLLD=10.6856;QD=18.5487;RBI=0.115402;REFB=-0.00690291;REVB=0.00989233;RO=20;SAF=32;SAR=64;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0.227976;SSSB=-0.0767896;STB=0.503067;TYPE=del;VARB=0.00916825;OID=.;OPOS=50493780;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:96:132:130:131:1:49:81:0:1:36:20:32:64:11:9 chr12 50503269 . C T 104.12 PASS AO=38;DP=113;FAO=39;FDP=118;FR=.;FRO=79;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=50;FSRR=29;FWDB=0.0103601;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.1019;QD=3.52962;RBI=0.074432;REFB=-0.0365875;REVB=-0.0737075;RO=75;SAF=20;SAR=18;SRF=46;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101032;STB=0.564206;TYPE=snp;VARB=0.0709538;OID=.;OPOS=50503269;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:118:75:79:38:39:18:20:46:29:18:21:50:29 chr12 50523947 . A G 206.07 PASS AO=62;DP=151;FAO=63;FDP=160;FR=.;FRO=97;FSAF=34;FSAR=29;FSRF=36;FSRR=61;FWDB=-0.087231;FXX=0.0123449;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.8246;QD=5.15163;RBI=0.0873001;REFB=0.00736003;REVB=-0.0034725;RO=89;SAF=35;SAR=27;SRF=32;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212534;STB=0.601148;TYPE=snp;VARB=-0.00987685;OID=.;OPOS=50523947;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:160:89:97:62:63:27:35:32:57:29:34:36:61 chr12 50523964 . T C 276.93 PASS AO=71;DP=163;FAO=74;FDP=167;FR=.;FRO=93;FSAF=38;FSAR=36;FSRF=34;FSRR=59;FWDB=-0.0378464;FXX=0.0118336;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.713;QD=6.63308;RBI=0.0408515;REFB=-0.0126592;REVB=-0.0153783;RO=87;SAF=37;SAR=34;SRF=34;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128627;STB=0.582049;TYPE=snp;VARB=0.0187092;OID=.;OPOS=50523964;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:167:87:93:71:74:34:37:34:53:36:38:34:59 chr12 50529314 . C T 191.8 PASS AO=49;DP=108;FAO=49;FDP=108;FR=.;FRO=59;FSAF=40;FSAR=9;FSRF=46;FSRR=13;FWDB=0.00591876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.856;QD=7.10382;RBI=0.0372908;REFB=-0.0194531;REVB=-0.0368181;RO=58;SAF=40;SAR=9;SRF=45;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0623846;STB=0.53203;TYPE=snp;VARB=0.0369586;OID=.;OPOS=50529314;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:58:59:49:49:9:40:45:13:9:40:46:13 chr12 50529736 . G A 265.29 PASS AO=41;DP=57;FAO=41;FDP=57;FR=.;FRO=16;FSAF=39;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.00145739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.561;QD=18.6166;RBI=0.0857266;REFB=-0.0344301;REVB=0.0857142;RO=16;SAF=39;SAR=2;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.548213;STB=0.805576;TYPE=snp;VARB=0.0108325;OID=.;OPOS=50529736;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:57:57:16:16:41:41:2:39:8:8:2:39:8:8 chr12 50537815 . A G 403.96 PASS AO=99;DP=205;FAO=99;FDP=206;FR=.;FRO=107;FSAF=39;FSAR=60;FSRF=58;FSRR=49;FWDB=0.0104099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.916;QD=7.84393;RBI=0.0130723;REFB=-0.00681918;REVB=0.00790702;RO=105;SAF=39;SAR=60;SRF=58;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149457;STB=0.577881;TYPE=snp;VARB=0.00531108;OID=.;OPOS=50537815;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:206:105:107:99:99:60:39:58:47:60:39:58:49 chr12 50616346 . A G 132.14 PASS AO=50;DP=148;FAO=50;FDP=148;FR=.;FRO=98;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=37;FSRR=61;FWDB=-0.0429859;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.1639;QD=3.57129;RBI=0.0639917;REFB=-0.00903715;REVB=-0.0474041;RO=96;SAF=22;SAR=28;SRF=37;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0640581;STB=0.542366;TYPE=snp;VARB=0.0177747;OID=.;OPOS=50616346;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:96:98:50:50:28:22:37:59:28:22:37:61 chr12 50650057 . T C 172.76 PASS AO=38;DP=74;FAO=38;FDP=74;FR=.;FRO=36;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=-0.0440886;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.4598;QD=9.33842;RBI=0.0440887;REFB=-0.0202418;REVB=8.7018e-05;RO=36;SAF=18;SAR=20;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0749604;STB=0.541526;TYPE=snp;VARB=0.0163269;OID=.;OPOS=50650057;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:36:36:38:38:20:18:14:22:20:18:14:22 chr12 50727706 . G C 380.65 PASS AO=98;DP=222;FAO=100;FDP=221;FR=.;FRO=121;FSAF=42;FSAR=58;FSRF=48;FSRR=73;FWDB=-0.0296496;FXX=0.0045043;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.123;QD=6.88953;RBI=0.0297873;REFB=-0.0082957;REVB=0.00286094;RO=121;SAF=40;SAR=58;SRF=48;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0118484;STB=0.513148;TYPE=snp;VARB=0.00993524;OID=.;OPOS=50727706;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:221:121:121:98:100:58:40:48:73:58:42:48:73 chr12 50744119 . G A 342.92 PASS AO=81;DP=164;FAO=81;FDP=164;FR=.;FRO=83;FSAF=42;FSAR=39;FSRF=64;FSRR=19;FWDB=-0.0241458;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.833;QD=8.36401;RBI=0.0323415;REFB=-0.0237039;REVB=0.0215163;RO=83;SAF=42;SAR=39;SRF=64;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236155;STB=0.629194;TYPE=snp;VARB=0.0210131;OID=.;OPOS=50744119;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:164:83:83:81:81:39:42:64:19:39:42:64:19 chr12 50744171 . T C 579.55 PASS AO=120;DP=228;FAO=125;FDP=231;FR=.;FRO=106;FSAF=74;FSAR=51;FSRF=80;FSRR=26;FWDB=0.0295725;FXX=0.00858332;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.31;QD=10.0355;RBI=0.0386765;REFB=0.00303178;REVB=0.0249266;RO=105;SAF=72;SAR=48;SRF=80;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149543;STB=0.579533;TYPE=snp;VARB=-0.00128835;OID=.;OPOS=50744171;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:228:231:105:106:120:125:48:72:80:25:51:74:80:26 chr12 50744753 . T C 243.43 PASS AO=52;DP=98;FAO=52;FDP=98;FR=.;FRO=46;FSAF=44;FSAR=8;FSRF=34;FSRR=12;FWDB=-0.0274632;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=247.103;QD=9.93569;RBI=0.0279418;REFB=-0.00371194;REVB=0.00514926;RO=46;SAF=44;SAR=8;SRF=34;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153142;STB=0.58507;TYPE=snp;VARB=0.00285253;OID=.;OPOS=50744753;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:46:46:52:52:8:44:34:12:8:44:34:12 chr12 50749221 . G C 1477.32 PASS AO=163;DP=166;FAO=162;FDP=167;FR=.;FRO=5;FSAF=100;FSAR=62;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0250366;FXX=0.00595203;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7415;QD=35.3849;RBI=0.0366669;REFB=-0.010875;REVB=-0.0267886;RO=3;SAF=100;SAR=63;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00192827;STB=0.505804;TYPE=snp;VARB=0.00258917;OID=.;OPOS=50749221;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:166:167:3:5:163:162:63:100:2:1:62:100:4:1 chr12 50749227 . T G 1216.88 PASS AO=154;DP=176;FAO=154;FDP=176;FR=.;FRO=22;FSAF=100;FSAR=54;FSRF=5;FSRR=17;FWDB=0.00241409;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=176.135;QD=27.6565;RBI=0.00494155;REFB=-0.0940723;REVB=-0.00431174;RO=2;SAF=100;SAR=54;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0172894;STB=0.555983;TYPE=snp;VARB=0.00140456;OID=.;OPOS=50749227;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:176:176:2:22:154:154:54:100:0:2:54:100:5:17 chr12 50749294 . A G 610.46 PASS AO=134;DP=256;FAO=134;FDP=252;FR=.;FRO=118;FSAF=66;FSAR=68;FSRF=67;FSRR=51;FWDB=-0.00939151;FXX=0.0156244;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.7088;QD=9.68976;RBI=0.047296;REFB=-0.00901028;REVB=-0.0463542;RO=117;SAF=66;SAR=68;SRF=67;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0684046;STB=0.535206;TYPE=snp;VARB=0.00681626;OID=.;OPOS=50749294;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:256:252:117:118:134:134:68:66:67:50:68:66:67:51 chr12 50754563 . T G 94.19 PASS AO=35;DP=106;FAO=35;FDP=106;FR=.;FRO=71;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=20;FSRR=51;FWDB=-0.0248057;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=277.34;QD=3.55438;RBI=0.0250824;REFB=-0.00551067;REVB=-0.00371501;RO=70;SAF=11;SAR=24;SRF=19;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0588445;STB=0.525798;TYPE=snp;VARB=0.010273;OID=.;OPOS=50754563;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:106:106:70:71:35:35:24:11:19:51:24:11:20:51 chr12 50824275 . C T 263.64 PASS AO=62;DP=141;FAO=68;FDP=147;FR=.;FRO=79;FSAF=39;FSAR=29;FSRF=40;FSRR=39;FWDB=-0.00106522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.053;QD=7.17385;RBI=0.00529862;REFB=-0.00972383;REVB=-0.00519044;RO=79;SAF=33;SAR=29;SRF=40;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0260795;STB=0.536506;TYPE=snp;VARB=0.0109315;OID=.;OPOS=50824275;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:147:79:79:62:68:29:33:40:39:29:39:40:39 chr12 50870145 . G A 3766.72 PASS AO=523;DP=533;FAO=395;FDP=395;FR=.;FRO=0;FSAF=162;FSAR=233;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0321328;FXX=0.0124997;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.23;QD=38.144;RBI=0.0496522;REFB=-0.047042;REVB=-0.0378527;RO=4;SAF=219;SAR=304;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00492711;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.0075e-05;OID=.;OPOS=50870145;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:533:395:4:0:523:395:304:219:3:1:233:162:0:0 chr12 50870804 . A T 19.26 PASS AO=7;DP=19;FAO=7;FDP=31;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=18;FSRR=6;FWDB=-0.0343618;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=19.4836;QD=2.4846;RBI=0.0793119;REFB=-0.0310237;REVB=0.0714817;RO=10;SAF=7;SAR=0;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.723022;STB=0.635916;TYPE=snp;VARB=0.176027;OID=.;OPOS=50870804;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:19:31:10:24:7:7:0:7:8:2:1:6:18:6 chr12 50882355 . G A 166.98 PASS AO=34;DP=63;FAO=34;FDP=62;FR=.;FRO=28;FSAF=24;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=0.0089829;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.6227;QD=10.7726;RBI=0.0228957;REFB=-0.00482162;REVB=-0.02106;RO=28;SAF=24;SAR=10;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.241463;STB=0.634064;TYPE=snp;VARB=0.00128912;OID=.;OPOS=50882355;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:62:28:28:34:34:10:24:12:16:10:24:12:16 chr12 51089734 . T A 403.47 PASS AO=84;DP=152;FAO=84;FDP=152;FR=.;FRO=68;FSAF=36;FSAR=48;FSRF=32;FSRR=36;FWDB=0.00309094;FXX=0.00653552;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.412;QD=10.6176;RBI=0.0410262;REFB=-0.0212619;REVB=0.0409096;RO=67;SAF=36;SAR=48;SRF=31;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0281834;STB=0.519079;TYPE=snp;VARB=0.0203944;OID=.;OPOS=51089734;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:152:67:68:84:84:48:36:31:36:48:36:32:36 chr12 51135275 . T C 1167.34 PASS AO=125;DP=128;FAO=125;FDP=127;FR=.;FRO=2;FSAF=71;FSAR=54;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.000342658;FXX=0.00781189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.4205;QD=36.7666;RBI=0.0735855;REFB=-0.0213458;REVB=0.0735847;RO=2;SAF=71;SAR=54;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00207222;STB=0.501091;TYPE=snp;VARB=0.00183298;OID=.;OPOS=51135275;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:128:127:2:2:125:125:54:71:1:1:54:71:1:1 chr12 51141883 . A G 1165.38 PASS AO=129;DP=133;FAO=129;FDP=133;FR=.;FRO=4;FSAF=64;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0165038;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.953;QD=35.0489;RBI=0.0165056;REFB=0.060696;REVB=-0.000247562;RO=4;SAF=64;SAR=65;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.028345;STB=0.514923;TYPE=snp;VARB=-0.000720098;OID=.;OPOS=51141883;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:133:133:4:4:129:129:65:64:0:4:65:64:0:4 chr12 51203371 . C T 254.19 PASS AO=63;DP=134;FAO=63;FDP=134;FR=.;FRO=71;FSAF=24;FSAR=39;FSRF=20;FSRR=51;FWDB=0.0171296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.107;QD=7.58787;RBI=0.0210785;REFB=-0.00353305;REVB=-0.0122833;RO=70;SAF=24;SAR=39;SRF=20;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.098684;STB=0.557258;TYPE=snp;VARB=0.00363899;OID=.;OPOS=51203371;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:70:71:63:63:39:24:20:50:39:24:20:51 chr12 51213765 . T C 239.2 PASS AO=63;DP=142;FAO=64;FDP=144;FR=.;FRO=80;FSAF=23;FSAR=41;FSRF=27;FSRR=53;FWDB=0.0339206;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.0425;QD=6.64434;RBI=0.0339301;REFB=-0.011661;REVB=-0.00080305;RO=79;SAF=23;SAR=40;SRF=26;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0392058;STB=0.513291;TYPE=snp;VARB=0.014417;OID=.;OPOS=51213765;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:144:79:80:63:64:40:23:26:53:41:23:27:53 chr12 51235317 . A G 1047.27 PASS AO=110;DP=112;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00057149;FXX=0.0178555;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.762;QD=38.0826;RBI=0.0266093;REFB=0;REVB=-0.0266031;RO=0;SAF=55;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.45231e-05;OID=.;OPOS=51235317;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:112:110:0:0:110:110:55:55:0:0:55:55:0:0 chr12 51237816 . G A 307.9 PASS AO=79;DP=180;FAO=81;FDP=182;FR=.;FRO=101;FSAF=33;FSAR=48;FSRF=21;FSRR=80;FWDB=0.00468414;FXX=0.116499;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.489;QD=6.76705;RBI=0.0301556;REFB=-0.0164855;REVB=0.0297896;RO=100;SAF=33;SAR=46;SRF=21;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225278;STB=0.619692;TYPE=snp;VARB=0.0235829;OID=.;OPOS=51237816;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:182:100:101:79:81:46:33:21:79:48:33:21:80 chr12 51333796 . C CA 164.17 PASS AO=55;DP=109;FAO=55;FDP=109;FR=.;FRO=54;FSAF=20;FSAR=35;FSRF=15;FSRR=39;FWDB=0.0199996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=28.1981;QD=6.02464;RBI=0.0823165;REFB=0.0339453;REVB=-0.07985;RO=54;SAF=20;SAR=35;SRF=15;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0855967;STB=0.547118;TYPE=ins;VARB=-0.0332132;OID=.;OPOS=51333797;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:55:109:55:109:54:20:35:15:39:99:54:20:35:15:39 chr12 51402905 . T G 1222.32 PASS AO=127;DP=130;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235776;FXX=0.0300729;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.561;QD=37.9015;RBI=0.0488133;REFB=0;REVB=0.0427415;RO=0;SAF=58;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000356725;OID=.;OPOS=51402905;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:130:129:0:0:127:129:69:58:0:0:70:59:0:0 chr12 51404467 . C T 139.23 PASS AO=37;DP=86;FAO=37;FDP=86;FR=.;FRO=49;FSAF=12;FSAR=25;FSRF=16;FSRR=33;FWDB=0.00353343;FXX=0.0227247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.1867;QD=6.47587;RBI=0.0202027;REFB=-0.00965931;REVB=0.0198913;RO=42;SAF=12;SAR=25;SRF=16;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0598222;STB=0.501432;TYPE=snp;VARB=0.012944;OID=.;OPOS=51404467;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:42:49:37:37:25:12:16:26:25:12:16:33 chr12 51442944 . G A 767.52 PASS AO=211;DP=449;FAO=191;FDP=399;FR=.;FRO=208;FSAF=65;FSAR=126;FSRF=93;FSRR=115;FWDB=-0.00917539;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.895;QD=7.69447;RBI=0.0119538;REFB=0.00138235;REVB=0.00766192;RO=235;SAF=69;SAR=142;SRF=105;SRR=130;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123871;STB=0.559632;TYPE=snp;VARB=-0.00109057;OID=.;OPOS=51442944;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:449:399:235:208:211:191:142:69:105:130:126:65:93:115 chr12 51453682 . G A 314.27 PASS AO=80;DP=179;FAO=81;FDP=178;FR=.;FRO=97;FSAF=32;FSAR=49;FSRF=51;FSRR=46;FWDB=-0.0292364;FXX=0.0165737;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.646;QD=7.06215;RBI=0.0350768;REFB=-0.0209861;REVB=-0.0193808;RO=96;SAF=32;SAR=48;SRF=50;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120264;STB=0.572235;TYPE=snp;VARB=0.0201086;OID=.;OPOS=51453682;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:178:96:97:80:81:48:32:50:46:49:32:51:46 chr12 51518787 . C G 212.6 PASS AO=47;DP=91;FAO=47;FDP=92;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=8;FSRR=37;FWDB=0.0127067;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.223;QD=9.24356;RBI=0.0129418;REFB=-0.0293372;REVB=-0.00245525;RO=44;SAF=18;SAR=29;SRF=7;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221279;STB=0.611697;TYPE=snp;VARB=0.0251087;OID=.;OPOS=51518787;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:92:44:45:47:47:29:18:7:37:29:18:8:37 chr12 51636259 . C T 277.91 PASS AO=69;DP=148;FAO=69;FDP=147;FR=.;FRO=78;FSAF=35;FSAR=34;FSRF=29;FSRR=49;FWDB=0.00625325;FXX=0.0067563;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.84;QD=7.56229;RBI=0.0161794;REFB=-0.00404993;REVB=-0.0149221;RO=79;SAF=35;SAR=34;SRF=30;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122684;STB=0.571717;TYPE=snp;VARB=0.00472953;OID=.;OPOS=51636259;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:147:79:78:69:69:34:35:30:49:34:35:29:49 chr12 51681903 . T C 3054.22 PASS AO=325;DP=333;FAO=325;FDP=325;FR=.;FRO=0;FSAF=169;FSAR=156;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0152625;FXX=0.0240233;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.177;QD=37.5904;RBI=0.0354559;REFB=-0.0910087;REVB=0.0320027;RO=2;SAF=169;SAR=156;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00561159;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000181306;OID=.;OPOS=51681903;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:333:325:2:0:325:325:156:169:2:0:156:169:0:0 chr12 51685831 . T C 267.65 PASS AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0253574;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=266.073;QD=34.5349;RBI=0.0344911;REFB=-0.0373045;REVB=0.0233803;RO=1;SAF=3;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0169618;STB=0.509085;TYPE=snp;VARB=0.00160429;OID=.;OPOS=51685831;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:31:31:1:1:30:30:27:3:0:1:27:3:0:1 chr12 51722311 . C T 301.31 PASS AO=95;DP=243;FAO=96;FDP=245;FR=.;FRO=149;FSAF=52;FSAR=44;FSRF=74;FSRR=75;FWDB=-0.0108508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.353;QD=4.91937;RBI=0.0198169;REFB=-0.0122908;REVB=-0.0165822;RO=148;SAF=52;SAR=43;SRF=73;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0587577;STB=0.527441;TYPE=snp;VARB=0.0169107;OID=.;OPOS=51722311;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:243:245:148:149:95:96:43:52:73:75:44:52:74:75 chr12 51737562 . T C 123.51 PASS AO=35;DP=86;FAO=35;FDP=86;FR=.;FRO=51;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=26;FSRR=25;FWDB=-0.0399083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.0639;QD=5.74461;RBI=0.103246;REFB=-0.0272304;REVB=0.0952207;RO=50;SAF=13;SAR=22;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157266;STB=0.584022;TYPE=snp;VARB=0.00885373;OID=.;OPOS=51737562;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:50:51:35:35:22:13:26:24:22:13:26:25 chr12 51740387 . ACTGG A,AATGG 668.68 PASS AO=28,45;DP=79;FAO=28,45;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=16,22;FSAR=12,23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00460995,0.016874;FXX=0.0135117;HRUN=1,1;LEN=4,1;MLLD=175.184,81.6397;QD=36.64;RBI=0.0236391,0.020373;REFB=0,0;REVB=0.0231852,0.0114161;RO=0;SAF=16,22;SAR=12,23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.00249525,0.0108699;OID=.,.;OPOS=51740388,51740388;OREF=CTGG,C;OALT=-,A;OMAPALT=A,AATGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:28,45:73:28,45:73:0:16,22:12,23:0:0:93:0:16,22:12,23:0:0 chr12 51740392 . ACCATATCCACTT ACATATCCACTT,AC 161.87 PASS AO=13,28;DP=75;FAO=16,29;FDP=70;FR=.;FRO=25;FSAF=16,17;FSAR=0,12;FSRF=2;FSRR=23;FWDB=-0.0277921,-0.0243699;FXX=0.0277739;HRUN=2,2;LEN=1,11;MLLD=21.7097,407.994;QD=9.24984;RBI=0.0800544,0.0252501;REFB=-0.0859119,-0.00140014;REVB=-0.0750754,-0.00660878;RO=24;SAF=13,16;SAR=0,12;SRF=2;SRR=22;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.866529,0.393081;STB=0.999451,0.722831;TYPE=del,del;VARB=0.0524985,0.0136121;OID=.,.;OPOS=51740393,51740394;OREF=C,CATATCCACTT;OALT=-,-;OMAPALT=ACATATCCACTT,AC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:13,28:68:16,29:70:25:16,17:0,12:2:23:76:24:13,16:0,12:2:22 chr12 51740409 . T G 72.67 PASS AO=28;DP=89;FAO=28;FDP=89;FR=.;FRO=61;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=32;FSRR=29;FWDB=-0.0120044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.639;QD=3.26622;RBI=0.0168108;REFB=0.00500833;REVB=0.0117684;RO=59;SAF=16;SAR=12;SRF=31;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0539047;STB=0.532444;TYPE=snp;VARB=-0.0086913;OID=.;OPOS=51740409;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:89:89:59:61:28:28:12:16:31:28:12:16:32:29 chr12 51740410 . A G 72.65 PASS AO=28;DP=89;FAO=28;FDP=89;FR=.;FRO=61;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=32;FSRR=29;FWDB=-0.0264408;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.3952;QD=3.26521;RBI=0.0307048;REFB=0.010899;REVB=-0.0156099;RO=61;SAF=16;SAR=12;SRF=32;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0552972;STB=0.532444;TYPE=snp;VARB=-0.028845;OID=.;OPOS=51740410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:89:89:61:61:28:28:12:16:32:29:12:16:32:29 chr12 51740416 . C G 66.87 PASS AO=26;DP=87;FAO=27;FDP=89;FR=.;FRO=62;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=32;FSRR=30;FWDB=-0.0101231;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.671;QD=3.00549;RBI=0.0150067;REFB=-0.00374684;REVB=0.0110781;RO=61;SAF=17;SAR=9;SRF=31;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17769;STB=0.581135;TYPE=snp;VARB=0.00666325;OID=.;OPOS=51740416;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:87:89:61:62:26:27:9:17:31:30:10:17:32:30 chr12 51901390 . A G 1217.95 PASS AO=157;DP=183;FAO=158;FDP=183;FR=.;FRO=25;FSAF=38;FSAR=120;FSRF=19;FSRR=6;FWDB=0.0629629;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.2643;QD=26.6219;RBI=0.074869;REFB=-0.0496222;REVB=-0.0405096;RO=25;SAF=37;SAR=120;SRF=19;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170267;STB=0.588223;TYPE=snp;VARB=0.0498877;OID=.;OPOS=51901390;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:183:183:25:25:157:158:120:37:19:6:120:38:19:6 chr12 52080965 . C T 2302.84 PASS AO=244;DP=248;FAO=250;FDP=250;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=149;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0350433;FXX=0.042144;HRUN=3;LEN=1;MLLD=219.837;QD=36.8454;RBI=0.0374457;REFB=-0.0981105;REVB=0.0131967;RO=4;SAF=97;SAR=147;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0112789;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000210143;OID=.;OPOS=52080965;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:248:250:4:0:244:250:147:97:3:1:149:101:0:0 chr12 52164462 . GC G 385.58 PASS AO=50;DP=78;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.259039;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.669;QD=20.8422;RBI=0.333709;REFB=-0.00757805;REVB=0.210382;RO=14;SAF=25;SAR=25;SRF=14;SRR=0;SSEN=0.348568;SSEP=0;SSSB=-0.204305;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0195765;OID=.;OPOS=52164463;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:50:73:74:74:0:49:25:0:0:33:14:25:25:14:0 chr12 52184271 . T C 339.35 PASS AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0817369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.663;QD=37.7056;RBI=0.0819482;REFB=0;REVB=0.00587985;RO=0;SAF=7;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000188543;OID=.;OPOS=52184271;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:35:36:0:0:35:36:28:7:0:0:28:8:0:0 chr12 52200742 . C A 537.14 PASS AO=65;DP=71;FAO=65;FDP=71;FR=.;FRO=6;FSAF=29;FSAR=36;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0263268;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.323;QD=30.2616;RBI=0.0889132;REFB=-0.0597126;REVB=0.0849261;RO=3;SAF=29;SAR=36;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0185311;STB=0.504598;TYPE=snp;VARB=0.0094087;OID=.;OPOS=52200742;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:71:71:3:6:65:65:36:29:2:1:36:29:3:3 chr12 52204246 . T C 1409.26 PASS AO=146;DP=146;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=108;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0269778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.068;QD=38.3471;RBI=0.028405;REFB=0;REVB=0.00889042;RO=0;SAF=39;SAR=107;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.05071e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.64783e-05;OID=.;OPOS=52204246;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:146:147:0:0:146:147:107:39:0:0:108:39:0:0 chr12 52211942 . G A 517.42 PASS AO=52;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0946918;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.457;QD=36.9585;RBI=0.0947353;REFB=0;REVB=0.00287016;RO=0;SAF=15;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00131604;OID=.;OPOS=52211942;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:55:56:0:0:52:56:37:15:0:0:41:15:0:0 chr12 52215858 . CT C,CC 130.58 PASS AO=5,9;DP=18;FAO=7,10;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=5,9;FSAR=2,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.127934,0.0471115;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=23.0582,30.2884;QD=30.7243;RBI=0.356332,0.396632;REFB=-0.0335133,-0.0416935;REVB=0.332574,0.393824;RO=1;SAF=5,9;SAR=0,0;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0.45756,0;SSSB=0.767767,0.81244;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0881806,0.0360122;OID=.,.;OPOS=52215859,52215859;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:5,9:17:7,10:17:0:5,9:2,1:0:0:24:1:5,9:0,0:0:1 chr12 52282060 . C T 281.51 PASS AO=66;DP=135;FAO=66;FDP=134;FR=.;FRO=68;FSAF=22;FSAR=44;FSRF=24;FSRR=44;FWDB=-0.0428432;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.3888;QD=8.40332;RBI=0.0438525;REFB=-0.025411;REVB=-0.00935382;RO=62;SAF=22;SAR=44;SRF=23;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.036727;STB=0.511108;TYPE=snp;VARB=0.0275412;OID=.;OPOS=52282060;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:134:62:68:66:66:44:22:23:39:44:22:24:44 chr12 52282748 . G A 216.02 PASS AO=25;DP=27;FAO=25;FDP=27;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00249932;FXX=0.0357015;HRUN=4;LEN=1;MLLD=123.598;QD=32.0027;RBI=0.0259954;REFB=-0.0366018;REVB=0.025875;RO=2;SAF=21;SAR=4;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0812192;STB=0.544004;TYPE=snp;VARB=0.000795447;OID=.;OPOS=52282748;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:27:27:2:2:25:25:4:21:1:1:4:21:1:1 chr12 52282873 . A T 412.41 PASS AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175952;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.672;QD=37.492;RBI=0.0271712;REFB=0;REVB=-0.0207047;RO=0;SAF=23;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.46357e-05;OID=.;OPOS=52282873;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:43:44:0:0:43:44:20:23:0:0:20:24:0:0 chr12 52284233 . T C 531.19 PASS AO=55;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00783928;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.998;QD=37.9424;RBI=0.0165511;REFB=0;REVB=-0.0145768;RO=0;SAF=16;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11947e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.89741e-06;OID=.;OPOS=52284233;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:55:56:0:0:55:56:39:16:0:0:40:16:0:0 chr12 52284274 . G A 417.6 PASS AO=44;DP=46;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0328409;FXX=0.0434688;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.612;QD=37.964;RBI=0.0453432;REFB=0;REVB=0.0312646;RO=0;SAF=5;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000164236;OID=.;OPOS=52284274;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:46:44:0:0:44:44:39:5:0:0:39:5:0:0 chr12 52284483 . A G 136.28 PASS AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0389961;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.4867;QD=36.3411;RBI=0.0414035;REFB=0;REVB=-0.0139121;RO=0;SAF=7;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00111476;OID=.;OPOS=52284483;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:15:0:0:15:15:8:7:0:0:8:7:0:0 chr12 52284668 . C A 878.37 PASS AO=77;DP=101;FAO=96;FDP=97;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=36;FSAR=60;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.105644;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.1253;QD=36.2212;RBI=0.213891;REFB=0.00916534;REVB=0.18598;RO=2;SAF=31;SAR=46;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0048442;STB=0.506848;TYPE=snp;VARB=0.00247036;OID=.;OPOS=52284668;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:95:97:2:1:77:96:46:31:1:1:60:36:1:0 chr12 52452757 . C T 246.17 PASS AO=31;DP=38;FAO=32;FDP=38;FR=.;FRO=6;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.0258569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.4686;QD=25.9123;RBI=0.0781648;REFB=-0.101443;REVB=0.0737642;RO=7;SAF=16;SAR=15;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17538;STB=0.578899;TYPE=snp;VARB=0.0103707;OID=.;OPOS=52452757;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:38:38:7:6:31:32:15:16:0:7:16:16:0:6 chr12 52564449 . C T 79.92 PASS AO=26;DP=75;FAO=27;FDP=76;FR=.;FRO=49;FSAF=24;FSAR=3;FSRF=42;FSRR=7;FWDB=0.0284076;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.0483;QD=4.20647;RBI=0.206465;REFB=-0.0164268;REVB=0.204501;RO=48;SAF=23;SAR=3;SRF=42;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0256445;STB=0.547907;TYPE=snp;VARB=0.0396848;OID=.;OPOS=52564449;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:75:76:48:49:26:27:3:23:42:6:3:24:42:7 chr12 52565322 . G T 404.3 PASS AO=48;DP=52;FAO=48;FDP=52;FR=.;FRO=4;FSAF=41;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0302126;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=215.273;QD=31.1001;RBI=0.0410351;REFB=-0.171623;REVB=0.0277683;RO=3;SAF=41;SAR=7;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0331942;STB=0.515717;TYPE=snp;VARB=0.000830246;OID=.;OPOS=52565322;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:52:52:3:4:48:48:7:41:3:0:7:41:3:1 chr12 52566047 . G A 259.32 PASS AO=29;DP=31;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0185285;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.5912;QD=34.5757;RBI=0.0393669;REFB=-0.0977789;REVB=0.0347339;RO=1;SAF=11;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0251798;STB=0.513504;TYPE=snp;VARB=0.0031888;OID=.;OPOS=52566047;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:31:30:1:1:29:29:18:11:0:1:18:11:0:1 chr12 52602013 . C T 215.48 PASS AO=58;DP=133;FAO=58;FDP=133;FR=.;FRO=75;FSAF=23;FSAR=35;FSRF=35;FSRR=40;FWDB=-0.0130855;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.466;QD=6.48066;RBI=0.0238326;REFB=-0.0236825;REVB=0.0199189;RO=74;SAF=23;SAR=35;SRF=34;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0648814;STB=0.540598;TYPE=snp;VARB=0.0317391;OID=.;OPOS=52602013;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:74:75:58:58:35:23:34:40:35:23:35:40 chr12 52631313 . A G 1315.14 PASS AO=137;DP=140;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=130;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00138891;FXX=0.0212751;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3936;QD=38.1199;RBI=0.0818974;REFB=0;REVB=0.0818857;RO=0;SAF=129;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000170997;OID=.;OPOS=52631313;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:140:138:0:0:137:138:8:129:0:0:8:130:0:0 chr12 52635360 . G A 238.93 PASS AO=27;DP=29;FAO=27;FDP=29;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0831907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.1278;QD=32.9556;RBI=0.194121;REFB=-0.134235;REVB=0.175392;RO=0;SAF=10;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.527758;TYPE=snp;VARB=0.0134233;OID=.;OPOS=52635360;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:29:29:0:2:27:27:17:10:0:0:17:10:0:2 chr12 52639302 . G C 555.7 PASS AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0423529;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=56.7527;QD=38.3238;RBI=0.06547;REFB=0;REVB=0.0499255;RO=0;SAF=25;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.18678e-05;OID=.;OPOS=52639302;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:58:58:0:0:58:58:33:25:0:0:33:25:0:0 chr12 52699547 . CT C,CC 1320.81 PASS AO=105,30;DP=138;FAO=136,3;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=23,2;FSAR=113,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00109155,-0.107078;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=197.262,175.19;QD=38.009;RBI=0.0254204,0.107426;REFB=0,0;REVB=0.0253969,0.00864696;RO=0;SAF=0,23;SAR=105,7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.000176089,0.0371093;OID=.,.;OPOS=52699548,52699548;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:105,30:137:136,3:139:0:23,2:113,1:0:0:27:0:0,23:105,7:0:0 chr12 52708420 . G A 620.36 PASS AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0467264;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.74;QD=38.1761;RBI=0.049194;REFB=0;REVB=0.0153846;RO=0;SAF=22;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000169524;OID=.;OPOS=52708420;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:65:65:0:0:65:65:43:22:0:0:43:22:0:0 chr12 52708565 . A G 327.65 PASS AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0354385;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.862;QD=37.4458;RBI=0.045688;REFB=0;REVB=0.0288358;RO=0;SAF=10;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.03206e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000276381;OID=.;OPOS=52708565;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:35:35:0:0:35:35:25:10:0:0:25:10:0:0 chr12 52712975 . G A 686.19 PASS AO=74;DP=81;FAO=77;FDP=79;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0361064;FXX=0.0246883;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.838;QD=34.7436;RBI=0.0385289;REFB=-0.0587646;REVB=0.0134464;RO=2;SAF=33;SAR=41;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00272103;STB=0.500825;TYPE=snp;VARB=0.00149781;OID=.;OPOS=52712975;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:81:79:2:2:74:77:41:33:1:1:41:36:1:1 chr12 52753861 . C T 1196.72 PASS AO=125;DP=125;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0619167;FXX=0.0157468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.2924;QD=38.2951;RBI=0.0623294;REFB=0;REVB=0.00716125;RO=0;SAF=73;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000289759;OID=.;OPOS=52753861;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:125:125:0:0:125:125:52:73:0:0:52:73:0:0 chr12 52760957 . C T 89.81 PASS AO=22;DP=50;FAO=22;FDP=50;FR=.;FRO=28;FSAF=3;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.0379496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.16;QD=7.18495;RBI=0.03796;REFB=-0.0311605;REVB=-0.000888632;RO=28;SAF=3;SAR=19;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.48355;STB=0.780526;TYPE=snp;VARB=0.0315426;OID=.;OPOS=52760957;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:50:50:28:28:22:22:19:3:15:13:19:3:15:13 chr12 52773702 . G A 253.62 PASS AO=65;DP=129;FAO=62;FDP=129;FR=.;FRO=67;FSAF=20;FSAR=42;FSRF=22;FSRR=45;FWDB=0.0473805;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=35.9287;QD=7.86404;RBI=0.0841368;REFB=-0.0517599;REVB=0.0695277;RO=62;SAF=22;SAR=43;SRF=20;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0158167;STB=0.503424;TYPE=snp;VARB=0.0540578;OID=.;OPOS=52773702;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:62:67:65:62:43:22:20:42:42:20:22:45 chr12 52774158 . G A 113.48 PASS AO=25;DP=53;FAO=26;FDP=54;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=-0.0265146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.7245;QD=8.40616;RBI=0.0352581;REFB=-0.0541063;REVB=0.0232401;RO=20;SAF=13;SAR=12;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0956004;STB=0.574018;TYPE=snp;VARB=0.0283569;OID=.;OPOS=52774158;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:54:20:28:25:26:12:13:8:12:13:13:10:18 chr12 52774235 . A G 351.09 PASS AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.035124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.8043;QD=37.9557;RBI=0.0630934;REFB=0;REVB=-0.0524126;RO=0;SAF=14;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.91909e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000342264;OID=.;OPOS=52774235;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:37:37:0:0:37:37:23:14:0:0:23:14:0:0 chr12 52774305 . A G 65.36 PASS AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0184758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.835;QD=14.5243;RBI=0.0198639;REFB=-0.04487;REVB=-0.00729512;RO=7;SAF=2;SAR=9;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230775;STB=0.63353;TYPE=snp;VARB=0.0162415;OID=.;OPOS=52774305;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:18:18:7:7:11:11:9:2:3:4:9:2:3:4 chr12 52777439 . A G 233.75 PASS AO=60;DP=133;FAO=61;FDP=134;FR=.;FRO=73;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=25;FSRR=48;FWDB=-0.0528657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.0377;QD=6.9776;RBI=0.052867;REFB=-0.0158037;REVB=-0.000362138;RO=72;SAF=28;SAR=32;SRF=25;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118884;STB=0.56458;TYPE=snp;VARB=0.0190473;OID=.;OPOS=52777439;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:134:72:73:60:61:32:28:25:47:33:28:25:48 chr12 52777502 . A G 155.06 PASS AO=52;DP=145;FAO=53;FDP=147;FR=.;FRO=94;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=42;FSRR=52;FWDB=0.00272174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.54;QD=4.21922;RBI=0.0129611;REFB=-0.0121008;REVB=-0.0126721;RO=93;SAF=30;SAR=22;SRF=42;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140571;STB=0.576008;TYPE=snp;VARB=0.0243256;OID=.;OPOS=52777502;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:147:93:94:52:53:22:30:42:51:23:30:42:52 chr12 52777513 . T C 133.48 PASS AO=48;DP=139;FAO=48;FDP=139;FR=.;FRO=91;FSAF=30;FSAR=18;FSRF=41;FSRR=50;FWDB=0.017564;FXX=0.00714235;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.627;QD=3.84121;RBI=0.0535155;REFB=-0.0103081;REVB=0.0505511;RO=88;SAF=30;SAR=18;SRF=40;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193788;STB=0.61478;TYPE=snp;VARB=0.00441864;OID=.;OPOS=52777513;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:88:91:48:48:18:30:40:48:18:30:41:50 chr12 52777578 . C T 102.97 PASS AO=39;DP=118;FAO=39;FDP=119;FR=.;FRO=80;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=31;FSRR=49;FWDB=-0.0284867;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.33;QD=3.46105;RBI=0.0289684;REFB=-0.0102917;REVB=0.0052607;RO=78;SAF=16;SAR=23;SRF=31;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.015319;STB=0.51589;TYPE=snp;VARB=0.0202104;OID=.;OPOS=52777578;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:119:78:80:39:39:23:16:31:47:23:16:31:49 chr12 52777580 . A C 86.87 PASS AO=35;DP=113;FAO=36;FDP=115;FR=.;FRO=79;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=30;FSRR=49;FWDB=-0.0110879;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.789;QD=3.02141;RBI=0.0133228;REFB=-0.0118986;REVB=-0.00738623;RO=76;SAF=14;SAR=21;SRF=28;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0389988;STB=0.526301;TYPE=snp;VARB=0.0190198;OID=.;OPOS=52777580;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:113:115:76:79:35:36:21:14:28:48:21:15:30:49 chr12 52778947 . A G 639.84 PASS AO=119;DP=199;FAO=121;FDP=200;FR=.;FRO=79;FSAF=79;FSAR=42;FSRF=45;FSRR=34;FWDB=3.78934e-05;FXX=0.00497488;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.2196;QD=12.7969;RBI=0.0104514;REFB=-0.0275886;REVB=-0.0104513;RO=77;SAF=78;SAR=41;SRF=44;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0659802;STB=0.535492;TYPE=snp;VARB=0.0166813;OID=.;OPOS=52778947;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:199:200:77:79:119:121:41:78:44:33:42:79:45:34 chr12 52779244 . A G 76.48 PASS AO=34;DP=119;FAO=36;FDP=121;FR=.;FRO=85;FSAF=27;FSAR=9;FSRF=62;FSRR=23;FWDB=-0.000742601;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.101;QD=2.52813;RBI=0.0207596;REFB=-0.00444928;REVB=0.0207464;RO=80;SAF=27;SAR=7;SRF=57;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133489;STB=0.518908;TYPE=snp;VARB=0.0146801;OID=.;OPOS=52779244;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:119:121:80:85:34:36:7:27:57:23:9:27:62:23 chr12 52788928 . G A 113.54 PASS AO=21;DP=38;FAO=22;FDP=39;FR=.;FRO=17;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.00560467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.2101;QD=11.6447;RBI=0.0099026;REFB=-0.0595938;REVB=-0.00816389;RO=17;SAF=13;SAR=8;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121483;STB=0.57481;TYPE=snp;VARB=0.0172991;OID=.;OPOS=52788928;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:38:39:17:17:21:22:8:13:8:9:8:14:8:9 chr12 52788945 . C G 36.93 PASS AO=9;DP=30;FAO=11;FDP=32;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.0255141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.312;QD=4.6157;RBI=0.0414245;REFB=-0.0191166;REVB=0.0326347;RO=21;SAF=6;SAR=3;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114753;STB=0.51721;TYPE=snp;VARB=0.0403994;OID=.;OPOS=52788945;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:30:32:21:21:9:11:3:6:12:9:5:6:12:9 chr12 52789509 . T C 408.76 PASS AO=37;DP=37;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0231249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.649;QD=37.16;RBI=0.0935473;REFB=0;REVB=0.090644;RO=0;SAF=14;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.91909e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000443156;OID=.;OPOS=52789509;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:37:44:0:0:37:44:23:14:0:0:25:19:0:0 chr12 52789597 . A G 375.71 PASS AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0230577;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=206.621;QD=38.5341;RBI=0.0250966;REFB=0;REVB=0.00990861;RO=0;SAF=17;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.92241e-05;OID=.;OPOS=52789597;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:39:39:0:0:39:39:22:17:0:0:22:17:0:0 chr12 52789605 . T A 383.95 PASS AO=39;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0267942;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.519;QD=37.4582;RBI=0.02712;REFB=0;REVB=0.00419107;RO=0;SAF=20;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3303e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000533456;OID=.;OPOS=52789605;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:40:41:0:0:39:41:19:20:0:0:21:20:0:0 chr12 52818504 . T G 133.53 PASS AO=33;DP=68;FAO=34;FDP=77;FR=.;FRO=43;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=14;FSRR=29;FWDB=0.0191284;FXX=0.0128189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.408;QD=6.93653;RBI=0.0255353;REFB=-0.0287949;REVB=-0.0169161;RO=35;SAF=12;SAR=21;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0357409;STB=0.516882;TYPE=snp;VARB=0.032603;OID=.;OPOS=52818504;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:77:35:43:33:34:21:12:14:21:22:12:14:29 chr12 52822258 . A G 60.43 PASS AO=23;DP=74;FAO=23;FDP=74;FR=.;FRO=51;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=37;FSRR=14;FWDB=-0.0389974;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.534;QD=3.26659;RBI=0.039444;REFB=-0.028351;REVB=0.0059184;RO=51;SAF=9;SAR=14;SRF=37;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.376499;STB=0.71858;TYPE=snp;VARB=0.0393434;OID=.;OPOS=52822258;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:74:74:51:51:23:23:14:9:37:14:14:9:37:14 chr12 52824352 . G A 196.62 PASS AO=66;DP=179;FAO=66;FDP=179;FR=.;FRO=113;FSAF=21;FSAR=45;FSRF=33;FSRR=80;FWDB=-0.0173883;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.7191;QD=4.39376;RBI=0.0376063;REFB=-0.00652011;REVB=-0.0333448;RO=113;SAF=21;SAR=45;SRF=33;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0340294;STB=0.519282;TYPE=snp;VARB=0.0152129;OID=.;OPOS=52824352;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:179:113:113:66:66:45:21:33:80:45:21:33:80 chr12 52825363 . G A 223.66 PASS AO=59;DP=128;FAO=59;FDP=133;FR=.;FRO=74;FSAF=26;FSAR=33;FSRF=38;FSRR=36;FWDB=-0.0292251;FXX=0.00746213;HRUN=3;LEN=1;MLLD=101.886;QD=6.72663;RBI=0.0301945;REFB=-0.0291629;REVB=0.00758958;RO=68;SAF=26;SAR=33;SRF=38;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113716;STB=0.540693;TYPE=snp;VARB=0.0372198;OID=.;OPOS=52825363;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:133:68:74:59:59:33:26:38:30:33:26:38:36 chr12 52827818 . T C 155.69 PASS AO=34;DP=68;FAO=35;FDP=69;FR=.;FRO=34;FSAF=4;FSAR=31;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.0325023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.881;QD=9.02519;RBI=0.0340638;REFB=0.00706036;REVB=-0.0101953;RO=33;SAF=4;SAR=30;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.482151;STB=0.772053;TYPE=snp;VARB=-0.00544608;OID=.;OPOS=52827818;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:69:33:34:34:35:30:4:17:16:31:4:17:17 chr12 52841765 . G A 90 PASS AO=33;DP=100;FAO=33;FDP=100;FR=.;FRO=67;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=46;FSRR=21;FWDB=-0.0285944;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.301;QD=3.60009;RBI=0.0291932;REFB=-0.0115486;REVB=0.0058825;RO=67;SAF=10;SAR=23;SRF=46;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.425703;STB=0.74523;TYPE=snp;VARB=0.0222092;OID=.;OPOS=52841765;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:100:100:67:67:33:33:23:10:46:21:23:10:46:21 chr12 52844265 . T C 387.93 PASS AO=107;DP=245;FAO=107;FDP=245;FR=.;FRO=138;FSAF=37;FSAR=70;FSRF=35;FSRR=103;FWDB=-0.000964273;FXX=0.00406488;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.48;QD=6.33349;RBI=0.0100943;REFB=-0.0165834;REVB=-0.0100482;RO=138;SAF=37;SAR=70;SRF=35;SRR=103;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107531;STB=0.559469;TYPE=snp;VARB=0.0241882;OID=.;OPOS=52844265;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:245:245:138:138:107:107:70:37:35:103:70:37:35:103 chr12 52845801 . T C 101.24 PASS AO=16;DP=23;FAO=16;FDP=23;FR=.;FRO=7;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=0.00349553;FXX=0.0416493;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.934;QD=17.6073;RBI=0.00365139;REFB=-0.0215261;REVB=0.00105543;RO=7;SAF=12;SAR=4;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0820924;STB=0.5454;TYPE=snp;VARB=0.0113278;OID=.;OPOS=52845801;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:23:23:7:7:16:16:4:12:6:1:4:12:6:1 chr12 52863038 . G A 328.44 PASS AO=62;DP=104;FAO=62;FDP=103;FR=.;FRO=41;FSAF=38;FSAR=24;FSRF=26;FSRR=15;FWDB=-0.0271399;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.506;QD=12.7548;RBI=0.0869466;REFB=-0.0239739;REVB=0.0826023;RO=40;SAF=38;SAR=24;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0283967;STB=0.508943;TYPE=snp;VARB=0.0157225;OID=.;OPOS=52863038;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:103:40:41:62:62:24:38:26:14:24:38:26:15 chr12 52863213 . C T 382.13 PASS AO=83;DP=156;FAO=83;FDP=156;FR=.;FRO=73;FSAF=58;FSAR=25;FSRF=52;FSRR=21;FWDB=0.0422521;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.4165;QD=9.79819;RBI=0.044388;REFB=-0.0263292;REVB=-0.0136036;RO=73;SAF=58;SAR=25;SRF=52;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0138257;STB=0.507566;TYPE=snp;VARB=0.0192035;OID=.;OPOS=52863213;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:156:73:73:83:83:25:58:52:21:25:58:52:21 chr12 52863621 . T G 206.08 PASS AO=41;DP=78;FAO=43;FDP=80;FR=.;FRO=37;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.00439244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.612;QD=10.3042;RBI=0.0269355;REFB=-0.00737799;REVB=-0.026575;RO=37;SAF=23;SAR=18;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0873184;STB=0.556832;TYPE=snp;VARB=0.00598695;OID=.;OPOS=52863621;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:80:37:37:41:43:18:23:17:20:18:25:17:20 chr12 52866060 . C T 481.19 PASS AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129979;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.088;QD=37.7406;RBI=0.0325952;REFB=0;REVB=0.0298915;RO=0;SAF=16;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.5765e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000221592;OID=.;OPOS=52866060;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:51:51:0:0:51:51:35:16:0:0:35:16:0:0 chr12 52867363 . T TG 16.01 PASS AO=3;DP=6;FAO=3;FDP=6;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0382381;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=183.408;QD=10.6745;RBI=0.0382381;REFB=-0.00931154;REVB=0;RO=3;SAF=3;SAR=0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.0795785;OID=.;OPOS=52867364;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:3:6:3:6:3:3:0:3:0:13:3:3:0:3:0 chr12 52886478 . T C 154.68 PASS AO=46;DP=116;FAO=46;FDP=116;FR=.;FRO=70;FSAF=32;FSAR=14;FSRF=36;FSRR=34;FWDB=0.0235894;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.504;QD=5.3338;RBI=0.0258893;REFB=-0.0100639;REVB=0.0106674;RO=69;SAF=32;SAR=14;SRF=36;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197724;STB=0.61731;TYPE=snp;VARB=0.0101263;OID=.;OPOS=52886478;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:69:70:46:46:14:32:36:33:14:32:36:34 chr12 52886490 . A G 172.69 PASS AO=41;DP=113;FAO=49;FDP=119;FR=.;FRO=70;FSAF=35;FSAR=14;FSRF=37;FSRR=33;FWDB=-0.0208094;FXX=0.0165276;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.277;QD=5.80477;RBI=0.0467291;REFB=-0.0210754;REVB=-0.0418399;RO=66;SAF=27;SAR=14;SRF=36;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129436;STB=0.620001;TYPE=snp;VARB=0.0173688;OID=.;OPOS=52886490;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:119:66:70:41:49:14:27:36:30:14:35:37:33 chr12 52938364 . T C 126 PASS AO=26;DP=59;FAO=30;FDP=62;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=0.00827765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.82;QD=8.12909;RBI=0.0261575;REFB=-0.0115796;REVB=0.0248132;RO=32;SAF=11;SAR=15;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0452043;STB=0.536399;TYPE=snp;VARB=0.00915371;OID=.;OPOS=52938364;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:62:32:32:26:30:15:11:15:17:18:12:15:17 chr12 52938497 . A C 43.45 PASS AO=13;DP=37;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=0.0540117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.302;QD=4.69684;RBI=0.0561967;REFB=-0.0196868;REVB=-0.0155181;RO=24;SAF=2;SAR=11;SRF=7;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227947;STB=0.638466;TYPE=snp;VARB=0.0357825;OID=.;OPOS=52938497;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:37:37:24:24:13:13:11:2:7:17:11:2:7:17 chr12 52939407 . AGAG A 131.9 PASS AO=29;DP=67;FAO=29;FDP=59;FR=.;FRO=30;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=-0.00767075;FXX=0.119385;HRUN=1;LEN=3;MLLD=202.486;QD=8.94244;RBI=0.0316629;REFB=-0.00662221;REVB=-0.0307197;RO=26;SAF=19;SAR=10;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.263658;STB=0.647371;TYPE=del;VARB=0.00766532;OID=.;OPOS=52939408;OREF=GAG;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:29:58:29:59:30:19:10:11:19:99:26:19:10:9:17 chr12 52943144 . G A 194.84 PASS AO=43;DP=85;FAO=43;FDP=85;FR=.;FRO=42;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=16;FSRR=26;FWDB=0.0392889;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=37.9174;QD=9.16893;RBI=0.0863608;REFB=-0.0266555;REVB=0.0769062;RO=41;SAF=20;SAR=23;SRF=16;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0667214;STB=0.542016;TYPE=snp;VARB=0.0169016;OID=.;OPOS=52943144;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:41:42:43:43:23:20:16:25:23:20:16:26 chr12 52965173 . T G 1189.19 PASS AO=127;DP=129;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0050719;FXX=0.0155027;HRUN=3;LEN=1;MLLD=191.875;QD=37.4549;RBI=0.0235979;REFB=0.0219773;REVB=-0.0230464;RO=2;SAF=75;SAR=52;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00275643;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.14995e-05;OID=.;OPOS=52965173;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:129:127:2:0:127:127:52:75:1:1:52:75:0:0 chr12 52965722 . T C 625.25 PASS AO=39;DP=68;FAO=65;FDP=65;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=31;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.100532;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.794;QD=38.4768;RBI=0.101935;REFB=0;REVB=-0.0168529;RO=0;SAF=6;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000307528;OID=.;OPOS=52965722;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:67:65:0:0:39:65:33:6:0:0:34:31:0:0 chr12 52965761 . C T 773.15 PASS AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0373436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.082;QD=38.6577;RBI=0.0759012;REFB=0;REVB=0.0660792;RO=0;SAF=31;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.85194e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00029628;OID=.;OPOS=52965761;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:80:80:0:0:80:80:49:31:0:0:49:31:0:0 chr12 52965782 . T C 735.94 PASS AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0364986;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3377;QD=38.2307;RBI=0.0454896;REFB=0;REVB=-0.0271505;RO=0;SAF=24;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.08692e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000620716;OID=.;OPOS=52965782;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:77:77:0:0:77:77:53:24:0:0:53:24:0:0 chr12 52981442 . C A 1003.95 PASS AO=110;DP=113;FAO=111;FDP=113;FR=.;FRO=2;FSAF=65;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.103627;FXX=0.0173898;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.4676;QD=35.5379;RBI=0.119125;REFB=-0.131171;REVB=0.058754;RO=2;SAF=65;SAR=45;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0206281;STB=0.510636;TYPE=snp;VARB=0.00338598;OID=.;OPOS=52981442;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:113:113:2:2:110:111:45:65:0:2:46:65:0:2 chr12 52984620 . C T 1048.69 PASS AO=112;DP=114;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0208066;FXX=0.0175423;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6041;QD=37.4533;RBI=0.0229476;REFB=-0.055704;REVB=0.00967883;RO=1;SAF=57;SAR=55;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00855451;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00194038;OID=.;OPOS=52984620;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:114:112:1:0:112:112:55:57:0:1:55:57:0:0 chr12 52985293 . A G 1165.02 PASS AO=128;DP=133;FAO=130;FDP=133;FR=.;FRO=3;FSAF=42;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0664473;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.1925;QD=35.0381;RBI=0.0747685;REFB=0.0525845;REVB=-0.0342795;RO=4;SAF=40;SAR=88;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00419216;STB=0.508379;TYPE=snp;VARB=-0.00119806;OID=.;OPOS=52985293;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:133:133:4:3:128:130:88:40:1:3:88:42:0:3 chr12 52986187 . T C 428.36 PASS AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124084;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.239;QD=38.0766;RBI=0.0137535;REFB=0;REVB=0.00593226;RO=0;SAF=22;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.41794e-05;OID=.;OPOS=52986187;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:46:45:0:0:45:45:23:22:0:0:23:22:0:0 chr12 52992812 . T C 1125.52 PASS AO=123;DP=130;FAO=126;FDP=131;FR=.;FRO=5;FSAF=45;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.0240601;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.8194;QD=34.367;RBI=0.0245731;REFB=-0.0820724;REVB=-0.00499506;RO=7;SAF=41;SAR=82;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108963;STB=0.514968;TYPE=snp;VARB=0.0141919;OID=.;OPOS=52992812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:130:131:7:5:123:126:82:41:3:4:81:45:0:5 chr12 53045777 . G A 258.71 PASS AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0832478;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.769;QD=38.3272;RBI=0.0834269;REFB=0;REVB=-0.00546242;RO=0;SAF=11;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5146e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000821361;OID=.;OPOS=53045777;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:27:27:0:0:27:27:16:11:0:0:16:11:0:0 chr12 53070121 . T G 864.13 PASS AO=94;DP=95;FAO=94;FDP=95;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0137621;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.8941;QD=36.3846;RBI=0.0501388;REFB=0.0202676;REVB=-0.0482132;RO=1;SAF=29;SAR=65;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00723976;STB=0.503816;TYPE=snp;VARB=-0.000428584;OID=.;OPOS=53070121;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:95:95:1:1:94:94:65:29:0:1:65:29:0:1 chr12 53070145 . G A 780.64 PASS AO=85;DP=87;FAO=85;FDP=87;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=59;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0439183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4657;QD=35.8915;RBI=0.0514433;REFB=-0.0564212;REVB=0.026788;RO=1;SAF=26;SAR=59;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.017869;STB=0.505232;TYPE=snp;VARB=0.000505447;OID=.;OPOS=53070145;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:87:87:1:2:85:85:59:26:1:0:59:26:1:1 chr12 53085089 . T C 68.51 PASS AO=7;DP=8;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0599622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.182;QD=30.4467;RBI=0.0922804;REFB=0.0272709;REVB=0.0701443;RO=1;SAF=1;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.2842;STB=0.666169;TYPE=snp;VARB=0.00045022;OID=.;OPOS=53085089;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:8:9:1:1:7:8:6:1:1:0:7:1:1:0 chr12 53086645 . G A 1011.67 PASS AO=106;DP=111;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109051;FXX=0.0442439;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.519;QD=37.4692;RBI=0.0529332;REFB=-0.137103;REVB=0.0517977;RO=1;SAF=32;SAR=74;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00637117;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0029744;OID=.;OPOS=53086645;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:111:108:1:0:106:108:74:32:0:1:76:32:0:0 chr12 53090190 . C T 831.51 PASS AO=90;DP=93;FAO=91;FDP=93;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0490831;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.5587;QD=35.7637;RBI=0.0519765;REFB=-0.0123294;REVB=-0.0171001;RO=3;SAF=42;SAR=48;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00818754;STB=0.510202;TYPE=snp;VARB=0.000933892;OID=.;OPOS=53090190;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:93:93:3:2:90:91:48:42:1:2:48:43:0:2 chr12 53091566 . C A 1487.22 PASS AO=157;DP=159;FAO=158;FDP=158;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0421565;FXX=0.00628891;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.35;QD=37.6511;RBI=0.0640056;REFB=-0.0550486;REVB=0.0481618;RO=1;SAF=56;SAR=101;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00841955;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000546775;OID=.;OPOS=53091566;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:159:158:1:0:157:158:101:56:1:0:102:56:0:0 chr12 53096913 . G A 315.34 PASS AO=35;DP=38;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0.0526177;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.188;QD=35.0377;RBI=0.00770611;REFB=-0.111785;REVB=0.00770611;RO=0;SAF=0;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00190725;OID=.;OPOS=53096913;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:38:36:0:1:35:35:35:0:0:0:35:0:0:1 chr12 53162773 . A G 43.01 PASS AO=6;DP=8;FAO=6;FDP=8;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0196455;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1585;QD=21.5072;RBI=0.0686137;REFB=-0.0811945;REVB=-0.0657411;RO=2;SAF=4;SAR=2;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0772509;STB=0.545299;TYPE=snp;VARB=0.0421124;OID=.;OPOS=53162773;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:8:2:2:6:6:2:4:1:1:2:4:1:1 chr12 53164848 . G A 227.42 PASS AO=58;DP=127;FAO=58;FDP=127;FR=.;FRO=69;FSAF=45;FSAR=13;FSRF=57;FSRR=12;FWDB=0.0143047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.309;QD=7.16296;RBI=0.018686;REFB=-0.00734592;REVB=0.0120225;RO=68;SAF=45;SAR=13;SRF=56;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0696245;STB=0.54099;TYPE=snp;VARB=0.00657497;OID=.;OPOS=53164848;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:68:69:58:58:13:45:56:12:13:45:57:12 chr12 53165940 . C T 327.76 PASS AO=62;DP=103;FAO=62;FDP=103;FR=.;FRO=41;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=12;FSRR=29;FWDB=0.0144205;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.2874;QD=12.7284;RBI=0.0228643;REFB=-0.0168562;REVB=-0.0177433;RO=40;SAF=34;SAR=28;SRF=11;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195275;STB=0.600712;TYPE=snp;VARB=0.0338438;OID=.;OPOS=53165940;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:40:41:62:62:28:34:11:29:28:34:12:29 chr12 53165949 . C T 97.9 PASS AO=34;DP=97;FAO=33;FDP=95;FR=.;FRO=62;FSAF=7;FSAR=26;FSRF=34;FSRR=28;FWDB=-0.0125026;FXX=0.0306091;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.182;QD=4.12203;RBI=0.0244742;REFB=-0.00687644;REVB=-0.0210398;RO=61;SAF=8;SAR=26;SRF=34;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.380331;STB=0.738073;TYPE=snp;VARB=0.0118409;OID=.;OPOS=53165949;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:97:95:61:62:34:33:26:8:34:27:26:7:34:28 chr12 53185492 . C T 319.39 PASS AO=67;DP=125;FAO=68;FDP=126;FR=.;FRO=58;FSAF=27;FSAR=41;FSRF=13;FSRR=45;FWDB=-0.0142392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.9187;QD=10.1393;RBI=0.0831037;REFB=-0.0256282;REVB=0.0818747;RO=58;SAF=27;SAR=40;SRF=13;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163591;STB=0.586044;TYPE=snp;VARB=0.0244077;OID=.;OPOS=53185492;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:126:58:58:67:68:40:27:13:45:41:27:13:45 chr12 53186088 . G C 169.12 PASS AO=43;DP=93;FAO=43;FDP=95;FR=.;FRO=52;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=19;FSRR=33;FWDB=0.00241348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.66;QD=7.12068;RBI=0.00696178;REFB=-0.00791123;REVB=-0.00653004;RO=50;SAF=17;SAR=26;SRF=18;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.035918;STB=0.517269;TYPE=snp;VARB=0.00950544;OID=.;OPOS=53186088;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:95:50:52:43:43:26:17:18:32:26:17:19:33 chr12 53186122 . G A 137.82 PASS AO=34;DP=75;FAO=35;FDP=78;FR=.;FRO=43;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=28;FWDB=0.0213109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.012;QD=7.06763;RBI=0.0215051;REFB=0.000776831;REVB=0.00288375;RO=41;SAF=13;SAR=21;SRF=14;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0426422;STB=0.529713;TYPE=snp;VARB=-0.000981127;OID=.;OPOS=53186122;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:78:41:43:34:35:21:13:14:27:21:14:15:28 chr12 53204614 . C T 283.49 PASS AO=63;DP=121;FAO=64;FDP=127;FR=.;FRO=63;FSAF=15;FSAR=49;FSRF=10;FSRR=53;FWDB=-0.0293583;FXX=0.0451094;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.753;QD=8.92888;RBI=0.0304209;REFB=-0.00048942;REVB=-0.00797022;RO=51;SAF=15;SAR=48;SRF=8;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0970569;STB=0.555338;TYPE=snp;VARB=0.000718958;OID=.;OPOS=53204614;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:127:51:63:63:64:48:15:8:43:49:15:10:53 chr12 53298775 . A T 165.45 PASS AO=40;DP=87;FAO=40;FDP=85;FR=.;FRO=45;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=36;FSRR=9;FWDB=0.0244909;FXX=0.0229859;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.5545;QD=7.78609;RBI=0.0370383;REFB=-0.00840298;REVB=0.0277854;RO=44;SAF=24;SAR=16;SRF=35;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201582;STB=0.615332;TYPE=snp;VARB=0.00938776;OID=.;OPOS=53298775;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:85:44:45:40:40:16:24:35:9:16:24:36:9 chr12 53343461 . A AC 58.63 PASS AO=27;DP=82;FAO=29;FDP=72;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=31;FSRR=12;FWDB=0.0268696;FXX=0.0999875;HRUN=3;LEN=1;MLLD=17.8643;QD=3.25746;RBI=0.240962;REFB=-0.00622303;REVB=-0.239459;RO=51;SAF=15;SAR=12;SRF=37;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200874;STB=0.622745;TYPE=ins;VARB=-0.0276697;OID=.;OPOS=53343462;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:27:82:29:72:43:15:14:31:12:58:51:15:12:37:14 chr12 53433089 . C A 1841.99 PASS AO=195;DP=198;FAO=196;FDP=196;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=123;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0503344;FXX=0.0101005;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.541;QD=37.5917;RBI=0.0554378;REFB=-0.0849602;REVB=0.0232336;RO=2;SAF=73;SAR=122;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00259122;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000220747;OID=.;OPOS=53433089;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:198:196:2:0:195:196:122:73:1:1:123:73:0:0 chr12 53433486 . C T 345.95 PASS AO=72;DP=132;FAO=72;FDP=131;FR=.;FRO=59;FSAF=45;FSAR=27;FSRF=42;FSRR=17;FWDB=-0.00823697;FXX=0.00757518;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.328;QD=10.5635;RBI=0.00868514;REFB=0.00290956;REVB=-0.00275392;RO=59;SAF=45;SAR=27;SRF=42;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0781012;STB=0.542608;TYPE=snp;VARB=-0.00246518;OID=.;OPOS=53433486;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:131:59:59:72:72:27:45:42:17:27:45:42:17 chr12 53434105 . C A 389.98 PASS AO=64;DP=94;FAO=64;FDP=92;FR=.;FRO=28;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.0278512;FXX=0.0212743;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5728;QD=16.9555;RBI=0.0289343;REFB=0.0203929;REVB=-0.00784246;RO=28;SAF=32;SAR=32;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0201668;STB=0.510866;TYPE=snp;VARB=-0.000408325;OID=.;OPOS=53434105;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:94:92:28:28:64:64:32:32:13:15:32:32:13:15 chr12 53442955 . A AC 292.42 PASS AO=12;DP=77;FAO=50;FDP=71;FR=.;FRO=21;FSAF=31;FSAR=19;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=0.0100177;FXX=0.0273935;HRUN=0;LEN=1;MLLD=55.8301;QD=16.4741;RBI=0.0394072;REFB=-0.0427044;REVB=-0.0381126;RO=61;SAF=6;SAR=6;SRF=41;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218716;STB=0.514744;TYPE=ins;VARB=0.0655011;OID=.;OPOS=53442956;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:12:77:50:71:21:31:19:14:7:50:61:6:6:41:20 chr12 53442956 . G C 170.15 PASS AO=38;DP=75;FAO=38;FDP=75;FR=.;FRO=37;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=-0.000470249;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=64.0407;QD=9.07468;RBI=0.0202798;REFB=-0.052808;REVB=-0.0202744;RO=37;SAF=25;SAR=13;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0353013;STB=0.51962;TYPE=snp;VARB=0.102818;OID=.;OPOS=53442956;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:37:37:38:38:13:25:23:14:13:25:23:14 chr12 53456596 . AG A 167.55 PASS AO=22;DP=32;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.157773;FXX=0.0333222;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.2341;QD=23.1105;RBI=0.163636;REFB=-0.0840517;REVB=0.0434101;RO=4;SAF=9;SAR=13;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0.618056;SSSB=-0.0976385;STB=0.517229;TYPE=del;VARB=0.0253477;OID=.;OPOS=53456597;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:22:29:28:29:1:14:14:0:1:9:4:9:13:3:1 chr12 53574395 . G A 116.52 PASS AO=14;DP=15;FAO=14;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.139455;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.5417;QD=31.0722;RBI=0.139455;REFB=-0.106441;REVB=0;RO=1;SAF=14;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0521346;OID=.;OPOS=53574395;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:15:15:1:1:14:14:0:14:1:0:0:14:1:0 chr12 53586536 . C T 101.37 PASS AO=23;DP=48;FAO=23;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.0344309;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.0961;QD=8.44767;RBI=0.0504924;REFB=-0.0153335;REVB=-0.0369323;RO=24;SAF=12;SAR=11;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0560942;STB=0.519983;TYPE=snp;VARB=0.0222505;OID=.;OPOS=53586536;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:24:25:23:23:11:12:14:10:11:12:14:11 chr12 53605496 . C T 132.32 PASS AO=34;DP=77;FAO=34;FDP=77;FR=.;FRO=43;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=-0.0038287;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=262.009;QD=6.87349;RBI=0.0137943;REFB=0.000136743;REVB=0.0132523;RO=43;SAF=20;SAR=14;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0771103;STB=0.543452;TYPE=snp;VARB=-0.000145337;OID=.;OPOS=53605496;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:43:43:34:34:14:20:22:21:14:20:22:21 chr12 53647373 . T C 168.24 PASS AO=38;DP=76;FAO=38;FDP=76;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=-0.00480423;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.495;QD=8.85464;RBI=0.0505267;REFB=-0.0245557;REVB=-0.0502977;RO=38;SAF=19;SAR=19;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0473374;STB=0.526302;TYPE=snp;VARB=0.0200596;OID=.;OPOS=53647373;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:38:38:38:38:19:19:17:21:19:19:17:21 chr12 53662624 . C A 173.13 PASS AO=57;DP=156;FAO=57;FDP=154;FR=.;FRO=97;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=58;FSRR=39;FWDB=0.00128743;FXX=0.0374977;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.614;QD=4.49685;RBI=0.0701215;REFB=-0.0102045;REVB=-0.0701097;RO=95;SAF=32;SAR=25;SRF=58;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0554024;STB=0.523491;TYPE=snp;VARB=0.0198165;OID=.;OPOS=53662624;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:154:95:97:57:57:25:32:58:37:25:32:58:39 chr12 53670545 . C A 135.31 PASS AO=33;DP=68;FAO=33;FDP=72;FR=.;FRO=39;FSAF=30;FSAR=3;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=0.00272903;FXX=0.0526247;HRUN=4;LEN=1;MLLD=95.8778;QD=7.51729;RBI=0.0289091;REFB=-0.00204398;REVB=-0.02878;RO=35;SAF=30;SAR=3;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.571141;STB=0.8415;TYPE=snp;VARB=0.00344953;OID=.;OPOS=53670545;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:72:35:39:33:33:3:30:16:19:3:30:17:22 chr12 53681883 . A T 375.26 PASS AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0011942;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=135.348;QD=38.4884;RBI=0.00538184;REFB=0;REVB=-0.00524767;RO=0;SAF=10;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.36384e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.80165e-05;OID=.;OPOS=53681883;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:39:39:0:0:39:39:29:10:0:0:29:10:0:0 chr12 53682326 . G A 410.19 PASS AO=92;DP=176;FAO=91;FDP=175;FR=.;FRO=84;FSAF=70;FSAR=21;FSRF=53;FSRR=31;FWDB=0.0859057;FXX=0.0056815;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.8032;QD=9.37586;RBI=0.111677;REFB=-0.0345172;REVB=0.0713587;RO=79;SAF=71;SAR=21;SRF=50;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150623;STB=0.584907;TYPE=snp;VARB=0.0396945;OID=.;OPOS=53682326;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:175:79:84:92:91:21:71:50:29:21:70:53:31 chr12 53682457 . G A 272.39 PASS AO=10;DP=101;FAO=59;FDP=112;FR=.;FRO=53;FSAF=42;FSAR=17;FSRF=39;FSRR=14;FWDB=0.000808789;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.856;QD=9.72817;RBI=0.028503;REFB=-0.00163546;REVB=0.0284916;RO=6;SAF=8;SAR=2;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249643;STB=0.513993;TYPE=snp;VARB=0.00143796;OID=.;OPOS=53682457;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:19:112:6:53:10:59:2:8:3:3:17:42:39:14 chr12 53682986 . C T 372.32 PASS AO=75;DP=131;FAO=75;FDP=132;FR=.;FRO=57;FSAF=17;FSAR=58;FSRF=23;FSRR=34;FWDB=0.0264085;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.551;QD=11.2824;RBI=0.0317967;REFB=-0.0341079;REVB=-0.0177094;RO=56;SAF=17;SAR=58;SRF=23;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182173;STB=0.597294;TYPE=snp;VARB=0.0177382;OID=.;OPOS=53682986;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:132:56:57:75:75:58:17:23:33:58:17:23:34 chr12 53686703 . G A 423.47 PASS AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0422644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.3129;QD=37.642;RBI=0.0508906;REFB=0;REVB=0.0283474;RO=0;SAF=27;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000723893;OID=.;OPOS=53686703;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:45:45:0:0:45:45:18:27:0:0:18:27:0:0 chr12 53693532 . A G 125.84 PASS AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0395682;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.12;QD=35.9534;RBI=0.043476;REFB=0;REVB=-0.0180144;RO=0;SAF=8;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000277113;OID=.;OPOS=53693532;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:14:14:0:0:14:14:6:8:0:0:6:8:0:0 chr12 53693533 . A C 125.84 PASS AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0387938;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.338;QD=35.9535;RBI=0.0395212;REFB=0;REVB=-0.00754773;RO=0;SAF=8;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000311085;OID=.;OPOS=53693533;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:14:14:0:0:14:14:6:8:0:0:6:8:0:0 chr12 53700848 . C T 712.04 PASS AO=74;DP=74;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00715245;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.8408;QD=37.9753;RBI=0.0583486;REFB=0;REVB=0.0579086;RO=0;SAF=36;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.79579e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000438525;OID=.;OPOS=53700848;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:74:75:0:0:74:75:38:36:0:0:38:37:0:0 chr12 53700860 . A G 698.01 PASS AO=73;DP=77;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00395086;FXX=0.0519413;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.737;QD=38.2472;RBI=0.007479;REFB=0;REVB=0.00635029;RO=0;SAF=38;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.90268e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000187856;OID=.;OPOS=53700860;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:77:73:0:0:73:73:35:38:0:0:35:38:0:0 chr12 53703021 . G A 997.79 PASS AO=106;DP=107;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0906709;FXX=0.00934492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.393;QD=37.6523;RBI=0.104978;REFB=-0.0649968;REVB=0.0529075;RO=0;SAF=45;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.81716e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00173976;OID=.;OPOS=53703021;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:107:106:0:0:106:106:61:45:0:0:61:45:0:0 chr12 53722098 . A G 277.59 PASS AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0162572;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.78;QD=38.2876;RBI=0.037678;REFB=0;REVB=-0.0339902;RO=0;SAF=8;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.4007e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00134483;OID=.;OPOS=53722098;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:30:29:0:0:29:29:21:8:0:0:21:8:0:0 chr12 53722128 . G A 223.26 PASS AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0202117;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.207;QD=37.2101;RBI=0.0671419;REFB=0;REVB=0.0640275;RO=0;SAF=7;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00241154;OID=.;OPOS=53722128;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:25:24:0:0:24:24:17:7:0:0:17:7:0:0 chr12 53723130 . AG A 365.97 PASS AO=44;DP=64;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.253923;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.0968;QD=24.3979;RBI=0.357024;REFB=-0.0355589;REVB=0.250977;RO=14;SAF=23;SAR=21;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0.484375;SSSB=-0.0218783;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0226844;OID=.;OPOS=53723131;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:44:59:60:60:0:33:27:0:0:28:14:23:21:8:6 chr12 53925573 . C T 214.82 PASS AO=52;DP=117;FAO=54;FDP=118;FR=.;FRO=64;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=37;FSRR=27;FWDB=-0.0157008;FXX=0.0247913;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.796;QD=7.282;RBI=0.0160017;REFB=-0.00859448;REVB=-0.00308882;RO=64;SAF=28;SAR=24;SRF=37;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0395698;STB=0.542357;TYPE=snp;VARB=0.0110267;OID=.;OPOS=53925573;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:118:64:64:52:54:24:28:37:27:27:27:37:27 chr12 53928407 . TGG TG,TGT 1357.28 PASS AO=76,45;DP=236;FAO=189,43;FDP=232;FR=.;FRO=0;FSAF=93,0;FSAR=96,43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=1.05168,0.18806;FXX=0.0127654;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=10.3757,123.618;QD=23.4014;RBI=1.0581,0.18815;REFB=0.00987725,0.0160242;REVB=0.116363,-0.00580633;RO=94;SAF=3,0;SAR=73,45;SRF=77;SRR=17;SSEN=0.425926,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.815065,-0.876098;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.00755693,0.0543346;OID=.,.;OPOS=53928408,53928409;OREF=G,G;OALT=-,T;OMAPALT=TG,TGT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:76,45:234:189,43:232:0:93,0:96,43:0:0:36:94:3,0:73,45:77:17 chr12 54067544 . A G 220.86 PASS AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0548242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.5735;QD=36.8106;RBI=0.060692;REFB=0;REVB=0.0260353;RO=0;SAF=6;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00188535;OID=.;OPOS=54067544;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:24:24:0:0:24:24:18:6:0:0:18:6:0:0 chr12 54105728 . TC T 23.77 PASS AO=7;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=0.0801009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=13.3391;QD=5.59185;RBI=0.109449;REFB=-0.184179;REVB=0.0745848;RO=9;SAF=6;SAR=1;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0642184;STB=0.517199;TYPE=del;VARB=0.178511;OID=.;OPOS=54105729;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:7:17:8:17:9:7:1:8:1:23:9:6:1:8:1 chr12 54117854 . G A 29.49 PASS AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0518209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.525;QD=11.7975;RBI=0.0518209;REFB=-0.0687525;REVB=0;RO=4;SAF=5;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0717267;OID=.;OPOS=54117854;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:10:10:4:5:5:5:0:5:4:0:0:5:5:0 chr12 54117878 . G A 44.46 PASS AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=9;FSAR=0;FSRF=10;FSRR=0;FWDB=0.00907262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.708;QD=9.36059;RBI=0.00907262;REFB=-0.0223275;REVB=0;RO=10;SAF=9;SAR=0;SRF=10;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0094013;OID=.;OPOS=54117878;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:19:19:10:10:9:9:0:9:10:0:0:9:10:0 chr12 54340077 . G A 449.02 PASS AO=104;DP=209;FAO=105;FDP=210;FR=.;FRO=105;FSAF=60;FSAR=45;FSRF=43;FSRR=62;FWDB=0.00381294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.178;QD=8.55275;RBI=0.00936591;REFB=-0.007031;REVB=-0.00855463;RO=105;SAF=59;SAR=45;SRF=43;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143814;STB=0.580717;TYPE=snp;VARB=0.00727708;OID=.;OPOS=54340077;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:210:105:105:104:105:45:59:43:62:45:60:43:62 chr12 54367061 . T G 657.51 PASS AO=70;DP=71;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0153769;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.842;QD=36.5285;RBI=0.015481;REFB=-0.0189871;REVB=-0.00179226;RO=0;SAF=37;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507244;TYPE=snp;VARB=0.000412313;OID=.;OPOS=54367061;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:71:72:0:1:70:71:33:37:0:0:34:37:0:1 chr12 54369667 . T TGCCCCACTACTTTAGGGG 256.27 PASS AO=21;DP=77;FAO=34;FDP=40;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.0421425;FXX=0.473622;HRUN=1;LEN=18;MLLD=333.829;QD=25.6267;RBI=0.0549497;REFB=-0.0100193;REVB=0.035263;RO=12;SAF=1;SAR=20;SRF=0;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212656;STB=0.542834;TYPE=ins;VARB=0.00572216;OID=.;OPOS=54369668;OREF=-;OALT=GCCCCACTACTTTAGGGG;OMAPALT=TGCCCCACTACTTTAGGGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:21:77:34:40:6:2:32:0:6:8:12:1:20:0:12 chr12 54370108 . G T 320.02 PASS AO=70;DP=133;FAO=70;FDP=133;FR=.;FRO=63;FSAF=36;FSAR=34;FSRF=38;FSRR=25;FWDB=-0.0576591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.292;QD=9.62468;RBI=0.0599927;REFB=-0.0086577;REVB=-0.0165695;RO=62;SAF=36;SAR=34;SRF=37;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0708806;STB=0.542229;TYPE=snp;VARB=0.00886213;OID=.;OPOS=54370108;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:62:63:70:70:34:36:37:25:34:36:38:25 chr12 54379343 . C T 397.31 PASS AO=85;DP=158;FAO=85;FDP=158;FR=.;FRO=73;FSAF=40;FSAR=45;FSRF=31;FSRR=42;FWDB=0.0376345;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4025;QD=10.0585;RBI=0.037769;REFB=-0.0111405;REVB=-0.00318491;RO=72;SAF=40;SAR=45;SRF=30;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.045536;STB=0.521343;TYPE=snp;VARB=0.0100236;OID=.;OPOS=54379343;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:158:72:73:85:85:45:40:30:42:45:40:31:42 chr12 54385599 . C T 719.61 PASS AO=77;DP=80;FAO=80;FDP=82;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=53;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0657254;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.919;QD=35.1031;RBI=0.0667512;REFB=-0.0825575;REVB=0.0116579;RO=1;SAF=27;SAR=50;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00937273;STB=0.504418;TYPE=snp;VARB=0.00180757;OID=.;OPOS=54385599;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:80:82:1:2:77:80:50:27:0:1:53:27:1:1 chr12 54496166 . G T 132.3 PASS AO=33;DP=73;FAO=33;FDP=73;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=25;FWDB=0.0167315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.5768;QD=7.24941;RBI=0.0203844;REFB=-0.0184867;REVB=0.0116438;RO=40;SAF=15;SAR=18;SRF=15;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0789015;STB=0.544277;TYPE=snp;VARB=0.0223941;OID=.;OPOS=54496166;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:40:40:33:33:18:15:15:25:18:15:15:25 chr12 54796757 . C T 135.21 PASS AO=30;DP=55;FAO=31;FDP=63;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.0198407;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=117.617;QD=8.58475;RBI=0.0258748;REFB=-0.0360845;REVB=-0.0166088;RO=25;SAF=18;SAR=12;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0338478;STB=0.541467;TYPE=snp;VARB=0.0368871;OID=.;OPOS=54796757;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:63:25:32:30:31:12:18:14:11:13:18:16:16 chr12 54799450 . A G 339.2 PASS AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.751;QD=37.6885;RBI=0.0571146;REFB=0;REVB=-0.0538928;RO=0;SAF=23;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21415e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.56721e-05;OID=.;OPOS=54799450;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:36:36:0:0:36:36:13:23:0:0:13:23:0:0 chr12 54905815 . C G 1391.82 PASS AO=146;DP=147;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0909027;FXX=0.0067563;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.207;QD=37.8725;RBI=0.0936277;REFB=0;REVB=-0.0224243;RO=0;SAF=51;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000119921;OID=.;OPOS=54905815;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:147:147:0:0:146:147:95:51:0:0:95:52:0:0 chr12 54970454 . T C 361.26 PASS AO=87;DP=179;FAO=88;FDP=181;FR=.;FRO=93;FSAF=41;FSAR=47;FSRF=33;FSRR=60;FWDB=0.00993736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.7485;QD=7.9836;RBI=0.0201984;REFB=-0.0286797;REVB=-0.0175848;RO=90;SAF=41;SAR=46;SRF=33;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.097612;STB=0.557775;TYPE=snp;VARB=0.0254076;OID=.;OPOS=54970454;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:181:90:93:87:88:46:41:33:57:47:41:33:60 chr12 54972992 . T C 188.81 PASS AO=38;DP=71;FAO=39;FDP=72;FR=.;FRO=33;FSAF=4;FSAR=35;FSRF=6;FSRR=27;FWDB=-0.0247442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.05;QD=10.4897;RBI=0.0316892;REFB=-0.035047;REVB=0.0197973;RO=33;SAF=4;SAR=34;SRF=6;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146946;STB=0.585235;TYPE=snp;VARB=0.0315607;OID=.;OPOS=54972992;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:72:33:33:38:39:34:4:6:27:35:4:6:27 chr12 54973623 . T C 687.1 PASS AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0249023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.871;QD=36.6454;RBI=0.0249751;REFB=-0.115353;REVB=0.00190537;RO=1;SAF=40;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0137108;STB=0.507244;TYPE=snp;VARB=0.000345124;OID=.;OPOS=54973623;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:75:75:1:1:74:74:34:40:0:1:34:40:0:1 chr12 54974803 . C T 523.02 PASS AO=131;DP=284;FAO=134;FDP=288;FR=.;FRO=154;FSAF=26;FSAR=108;FSRF=46;FSRR=108;FWDB=0.0430922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.769;QD=7.26422;RBI=0.0432131;REFB=-0.0100837;REVB=-0.003231;RO=153;SAF=24;SAR=107;SRF=46;SRR=107;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167254;STB=0.580632;TYPE=snp;VARB=0.0114924;OID=.;OPOS=54974803;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:284:288:153:154:131:134:107:24:46:107:108:26:46:108 chr12 54975837 . T C 904.46 PASS AO=110;DP=114;FAO=108;FDP=116;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=102;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0367894;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.1902;QD=31.1883;RBI=0.104373;REFB=0.0273274;REVB=-0.0976742;RO=4;SAF=6;SAR=104;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234579;STB=0.640379;TYPE=snp;VARB=-0.000294465;OID=.;OPOS=54975837;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:114:116:4:8:110:108:104:6:4:0:102:6:5:3 chr12 55248357 . G T 418.96 PASS AO=103;DP=211;FAO=104;FDP=216;FR=.;FRO=112;FSAF=67;FSAR=37;FSRF=57;FSRR=55;FWDB=-0.0770015;FXX=0.00460808;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.664;QD=7.75844;RBI=0.0775114;REFB=-0.0122342;REVB=-0.00887567;RO=108;SAF=66;SAR=37;SRF=54;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135896;STB=0.573274;TYPE=snp;VARB=0.015645;OID=.;OPOS=55248357;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:216:108:112:103:104:37:66:54:54:37:67:57:55 chr12 55250612 . A G 1172.48 PASS AO=120;DP=121;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132975;FXX=0.00806387;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.363;QD=38.1295;RBI=0.0163322;REFB=0;REVB=-0.00948259;RO=0;SAF=51;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.33881e-05;OID=.;OPOS=55250612;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:121:123:0:0:120:123:69:51:0:0:71:52:0:0 chr12 55344024 . G A 438.03 PASS AO=105;DP=215;FAO=105;FDP=214;FR=.;FRO=109;FSAF=62;FSAR=43;FSRF=65;FSRR=44;FWDB=-0.0193243;FXX=0.00465095;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0385;QD=8.18757;RBI=0.0929084;REFB=-0.0343871;REVB=0.0908766;RO=108;SAF=62;SAR=43;SRF=65;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108678;STB=0.503086;TYPE=snp;VARB=0.0306963;OID=.;OPOS=55344024;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:214:108:109:105:105:43:62:65:43:43:62:65:44 chr12 55344133 . C G 641.78 PASS AO=148;DP=291;FAO=148;FDP=291;FR=.;FRO=143;FSAF=76;FSAR=72;FSRF=74;FSRR=69;FWDB=0.0173475;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.568;QD=8.82169;RBI=0.0211647;REFB=-0.00694431;REVB=-0.0121247;RO=139;SAF=76;SAR=72;SRF=74;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0167257;STB=0.501952;TYPE=snp;VARB=0.00711424;OID=.;OPOS=55344133;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:291:291:139:143:148:148:72:76:74:65:72:76:74:69 chr12 55355033 . C T 557.99 PASS AO=106;DP=177;FAO=107;FDP=180;FR=.;FRO=73;FSAF=36;FSAR=71;FSRF=26;FSRR=47;FWDB=0.0296468;FXX=0.00552456;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.4595;QD=12.3998;RBI=0.038642;REFB=0.0292858;REVB=-0.0247844;RO=71;SAF=37;SAR=69;SRF=26;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0138945;STB=0.5089;TYPE=snp;VARB=-0.0171122;OID=.;OPOS=55355033;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:180:71:73:106:107:69:37:26:45:71:36:26:47 chr12 55368245 . G A 617.76 PASS AO=133;DP=246;FAO=133;FDP=246;FR=.;FRO=113;FSAF=60;FSAR=73;FSRF=72;FSRR=41;FWDB=-0.00949592;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.676;QD=10.0449;RBI=0.0104948;REFB=-0.00254678;REVB=0.0044685;RO=112;SAF=60;SAR=73;SRF=71;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152458;STB=0.584838;TYPE=snp;VARB=0.00178425;OID=.;OPOS=55368245;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:246:246:112:113:133:133:73:60:71:41:73:60:72:41 chr12 55420584 . C G 73.14 PASS AO=27;DP=87;FAO=27;FDP=85;FR=.;FRO=58;FSAF=25;FSAR=2;FSRF=45;FSRR=13;FWDB=-0.0050487;FXX=0.0449388;HRUN=3;LEN=1;MLLD=235.374;QD=3.44195;RBI=0.0435408;REFB=-0.012332;REVB=-0.0432471;RO=49;SAF=25;SAR=2;SRF=40;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.298853;STB=0.727936;TYPE=snp;VARB=0.0202682;OID=.;OPOS=55420584;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:87:85:49:58:27:27:2:25:40:9:2:25:45:13 chr12 55688267 . G A 1341.96 PASS AO=107;DP=156;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00441789;FXX=0.0206882;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.718;QD=37.8018;RBI=0.0272392;REFB=-0.0184091;REVB=0.0268786;RO=0;SAF=25;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.87025e-05;OID=.;OPOS=55688267;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:108:142:0:0:107:142:82:25:0:0:87:55:0:0 chr12 55714406 . C CA 1182.96 PASS AO=148;DP=158;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0347959;FXX=0.0196066;HRUN=1;LEN=1;MLLD=27.1721;QD=31.5457;RBI=0.0716833;REFB=0;REVB=-0.0626717;RO=7;SAF=75;SAR=73;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0178073;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-0.000322535;OID=.;OPOS=55714407;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:148:158:150:150:0:75:75:0:0:99:7:75:73:5:2 chr12 55714772 . G A 904.51 PASS AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0352794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.492;QD=38.0848;RBI=0.0373199;REFB=0;REVB=0.0121712;RO=0;SAF=21;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.36325e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000170161;OID=.;OPOS=55714772;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:95:95:0:0:95:95:74:21:0:0:74:21:0:0 chr12 55714876 . C G 1434.95 PASS AO=149;DP=149;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111398;FXX=0.00662208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.2635;QD=38.2655;RBI=0.0113105;REFB=0;REVB=0.00195738;RO=0;SAF=69;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.8194e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00103774;OID=.;OPOS=55714876;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:149:150:0:0:149:150:80:69:0:0:81:69:0:0 chr12 55715119 . G A 1099.67 PASS AO=116;DP=118;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272955;FXX=0.0169477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.113;QD=37.9196;RBI=0.0298444;REFB=-0.0889243;REVB=0.0120685;RO=1;SAF=47;SAR=69;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00683355;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000329464;OID=.;OPOS=55715119;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:118:116:1:0:116:116:69:47:0:1:69:47:0:0 chr12 55794976 . A G 1784.4 PASS AO=194;DP=200;FAO=196;FDP=200;FR=.;FRO=4;FSAF=130;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.00294849;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=172.08;QD=35.688;RBI=0.00665929;REFB=-0.101301;REVB=-0.00597098;RO=6;SAF=129;SAR=65;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0315529;STB=0.514704;TYPE=snp;VARB=0.000337265;OID=.;OPOS=55794976;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:200:200:6:4:194:196:65:129:1:5:66:130:0:4 chr12 55805617 . A C 3470.31 PASS AO=351;DP=353;FAO=364;FDP=364;FR=.;FRO=0;FSAF=189;FSAR=175;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00555143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.544;QD=38.1352;RBI=0.0282344;REFB=0;REVB=0.0276833;RO=0;SAF=187;SAR=164;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000140151;OID=.;OPOS=55805617;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:353:364:0:0:351:364:164:187:0:0:175:189:0:0 chr12 55805787 . C A 2978.36 PASS AO=305;DP=307;FAO=311;FDP=311;FR=.;FRO=0;FSAF=175;FSAR=136;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0036493;FXX=0.00320503;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.428;QD=38.3069;RBI=0.00375533;REFB=0;REVB=0.000886093;RO=0;SAF=170;SAR=135;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.70311e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.33773e-06;OID=.;OPOS=55805787;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:307:311:0:0:305:311:135:170:0:0:136:175:0:0 chr12 55806238 . A G 1857.6 PASS AO=191;DP=191;FAO=194;FDP=194;FR=.;FRO=0;FSAF=122;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0029345;FXX=0.00512794;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.411;QD=38.301;RBI=0.0144073;REFB=0;REVB=0.0141053;RO=0;SAF=121;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.99478e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.54174e-05;OID=.;OPOS=55806238;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:191:194:0:0:191:194:70:121:0:0:72:122:0:0 chr12 55807293 . A G 24.08 PASS AO=4;DP=6;FAO=4;FDP=6;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0278862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.9198;QD=16.0549;RBI=0.0509047;REFB=-0.0321587;REVB=0.042587;RO=2;SAF=3;SAR=1;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210252;STB=0.624469;TYPE=snp;VARB=0.00728752;OID=.;OPOS=55807293;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:2:2:4:4:1:3:2:0:1:3:2:0 chr12 55808298 . G C 127.57 PASS AO=33;DP=75;FAO=33;FDP=75;FR=.;FRO=42;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=26;FWDB=0.0541844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.67;QD=6.80351;RBI=0.0703019;REFB=-0.0200766;REVB=0.044793;RO=42;SAF=21;SAR=12;SRF=16;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252844;STB=0.642426;TYPE=snp;VARB=0.030059;OID=.;OPOS=55808298;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:42:42:33:33:12:21:16:26:12:21:16:26 chr12 55808469 . C G 1130.41 PASS AO=119;DP=120;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010008;FXX=0.0396794;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.437;QD=37.3691;RBI=0.04422;REFB=-0.0668665;REVB=-0.0430726;RO=1;SAF=87;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00542905;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.21846e-05;OID=.;OPOS=55808469;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:120:121:1:0:119:121:32:87:1:0:33:88:0:0 chr12 55820121 . C T 1835.34 PASS AO=192;DP=194;FAO=195;FDP=195;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169242;FXX=0.0101518;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.9826;QD=37.6481;RBI=0.0171006;REFB=0.00719933;REVB=0.00244972;RO=2;SAF=84;SAR=108;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00873633;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.73328e-06;OID=.;OPOS=55820121;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:194:195:2:0:192:195:108:84:0:2:109:86:0:0 chr12 55863381 . A G 699.58 PASS AO=84;DP=91;FAO=84;FDP=91;FR=.;FRO=7;FSAF=37;FSAR=47;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.00680166;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.5838;QD=30.7507;RBI=0.0238921;REFB=-0.035924;REVB=0.0229035;RO=5;SAF=38;SAR=46;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0271325;STB=0.510191;TYPE=snp;VARB=0.0104967;OID=.;OPOS=55863381;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:91:91:5:7:84:84:46:38:1:4:47:37:4:3 chr12 55886294 . G A 701.8 PASS AO=75;DP=83;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0223266;FXX=0.0722804;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.042;QD=36.4572;RBI=0.0232217;REFB=-0.0017796;REVB=0.00638503;RO=0;SAF=51;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504853;TYPE=snp;VARB=0.000476808;OID=.;OPOS=55886294;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:83:77:0:1:75:76:24:51:0:0:25:51:1:0 chr12 55945119 . A G 1477.75 PASS AO=153;DP=154;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235821;FXX=0.0304859;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.248;QD=37.1762;RBI=0.0565039;REFB=-0.0815529;REVB=0.0513476;RO=1;SAF=76;SAR=77;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00613805;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000438577;OID=.;OPOS=55945119;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:154:159:1:0:153:159:77:76:0:1:77:82:0:0 chr12 56030938 . C T 283.5 PASS AO=64;DP=126;FAO=64;FDP=125;FR=.;FRO=61;FSAF=28;FSAR=36;FSRF=29;FSRR=32;FWDB=-0.0248495;FXX=0.00793588;HRUN=4;LEN=1;MLLD=216.969;QD=9.07197;RBI=0.0256252;REFB=0.00241471;REVB=-0.00625726;RO=61;SAF=28;SAR=36;SRF=29;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0339537;STB=0.5187;TYPE=snp;VARB=-0.00264743;OID=.;OPOS=56030938;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:125:61:61:64:64:36:28:29:32:36:28:29:32 chr12 56031273 . G A 82.01 PASS AO=15;DP=27;FAO=15;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.0204454;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.8793;QD=12.6171;RBI=0.0222444;REFB=0.000470473;REVB=-0.0087635;RO=11;SAF=5;SAR=10;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166822;STB=0.594465;TYPE=snp;VARB=-0.000918526;OID=.;OPOS=56031273;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:27:26:11:11:15:15:10:5:6:5:10:5:6:5 chr12 56089357 . C T 248.28 PASS AO=56;DP=111;FAO=56;FDP=111;FR=.;FRO=55;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=32;FWDB=0.0100807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.012;QD=8.9469;RBI=0.0380544;REFB=-0.0199691;REVB=-0.0366949;RO=54;SAF=32;SAR=24;SRF=22;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145557;STB=0.575808;TYPE=snp;VARB=0.0295011;OID=.;OPOS=56089357;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:54:55:56:56:24:32:22:32:24:32:23:32 chr12 56090761 . G C 17.5 PASS AO=10;DP=47;FAO=10;FDP=49;FR=.;FRO=39;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=-0.0115044;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=241.616;QD=1.42884;RBI=0.0117818;REFB=-0.00412758;REVB=0.00254201;RO=37;SAF=4;SAR=6;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.26505;STB=0.647713;TYPE=snp;VARB=0.0115011;OID=.;OPOS=56090761;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:47:49:37:39:10:10:6:4:23:14:6:4:23:16 chr12 56115585 . C T 146 PASS AO=24;DP=42;FAO=27;FDP=43;FR=.;FRO=16;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=-0.00448539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.773;QD=13.5815;RBI=0.00982173;REFB=-0.0157782;REVB=-0.00873771;RO=14;SAF=15;SAR=9;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0647896;STB=0.561999;TYPE=snp;VARB=0.00665889;OID=.;OPOS=56115585;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:42:43:14:16:24:27:9:15:10:4:11:16:12:4 chr12 56236531 . A G 1621.96 PASS AO=156;DP=157;FAO=170;FDP=170;FR=.;FRO=0;FSAF=161;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0653227;FXX=0.0395458;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.078;QD=38.1638;RBI=0.0705638;REFB=0;REVB=0.026687;RO=0;SAF=147;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.98664e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000516133;OID=.;OPOS=56236531;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:157:170:0:0:156:170:9:147:0:0:9:161:0:0 chr12 56295734 . A G 186.95 PASS AO=18;DP=18;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0469342;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.387;QD=37.3895;RBI=0.0585259;REFB=0;REVB=0.0349638;RO=0;SAF=2;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00075227;OID=.;OPOS=56295734;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:18:20:0:0:18:20:16:2:0:0:19:1:0:0 chr12 56330572 . G A 1802.89 PASS AO=193;DP=196;FAO=193;FDP=193;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=167;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0378392;FXX=0.0102559;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.666;QD=37.3655;RBI=0.0613664;REFB=-0.0639412;REVB=0.0483118;RO=2;SAF=26;SAR=167;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00566922;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000481803;OID=.;OPOS=56330572;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:196:193:2:0:193:193:167:26:0:2:167:26:0:0 chr12 56335107 . A G 1035.52 PASS AO=109;DP=110;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0282641;FXX=0.00909008;HRUN=3;LEN=1;MLLD=222.723;QD=38.0008;RBI=0.0354224;REFB=0.0211088;REVB=0.0213516;RO=1;SAF=61;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0077189;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0001596;OID=.;OPOS=56335107;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:110:109:1:0:109:109:48:61:1:0:48:61:0:0 chr12 56347185 . GC G 1162.13 PASS AO=156;DP=183;FAO=175;FDP=178;FR=.;FRO=3;FSAF=46;FSAR=129;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.328256;FXX=0.00558628;HRUN=3;LEN=1;MLLD=19.0447;QD=26.1154;RBI=0.336504;REFB=0.0200524;REVB=-0.0740451;RO=16;SAF=33;SAR=123;SRF=12;SRR=4;SSEN=0.220994;SSEP=0;SSSB=-0.130487;STB=0.50153;TYPE=del;VARB=0.00756218;OID=.;OPOS=56347186;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:156:178:175:178:3:46:129:1:2:75:16:33:123:12:4 chr12 56348028 . G A 1113.94 PASS AO=123;DP=128;FAO=126;FDP=128;FR=.;FRO=2;FSAF=81;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0450116;FXX=0.022899;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.3099;QD=34.8105;RBI=0.0450402;REFB=-0.107443;REVB=0.00160506;RO=4;SAF=80;SAR=43;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0260943;STB=0.510868;TYPE=snp;VARB=0.00150951;OID=.;OPOS=56348028;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:128:128:4:2:123:126:43:80:1:3:45:81:0:2 chr12 56351346 . G A 865.01 PASS AO=77;DP=99;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00586127;FXX=0.029997;HRUN=4;LEN=1;MLLD=158.203;QD=35.6704;RBI=0.00598769;REFB=0;REVB=0.0012239;RO=0;SAF=34;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.11157e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00320613;OID=.;OPOS=56351346;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:77:97:0:0:77:97:43:34:0:0:58:39:0:0 chr12 56398454 . G C 1202.47 PASS AO=127;DP=129;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00386936;FXX=0.0155027;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.8289;QD=37.8732;RBI=0.0413625;REFB=-0.0386184;REVB=0.0411812;RO=2;SAF=71;SAR=56;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00176384;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00483659;OID=.;OPOS=56398454;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:129:127:2:0:127:127:56:71:1:1:56:71:0:0 chr12 56435929 . C G 435.21 PASS AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00548077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.875;QD=36.2675;RBI=0.0146491;REFB=-0.126966;REVB=-0.0135851;RO=0;SAF=10;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506664;TYPE=snp;VARB=-0.000531317;OID=.;OPOS=56435929;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:48:48:0:1:47:47:37:10:0:0:37:10:0:1 chr12 56551339 . C CAA,CAAA 35.11 PASS AO=5,7;DP=33;FAO=0,12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=0,3;FSAR=0,9;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.0528263,0.0352777;FXX=0.096743;HRUN=6,6;LEN=2,3;MLLD=19.6042,27.2264;QD=5.01539;RBI=0.152457,0.102882;REFB=-0.0135522,-0.0116633;REVB=0.143012,0.0966444;RO=17;SAF=1,2;SAR=4,5;SRF=11;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.491989,-0.393932;STB=0.5,0.72184;TYPE=ins,ins;VARB=-0.0709179,0.0283397;OID=.,.;OPOS=56551340,56551340;OREF=-,-;OALT=AA,AAA;OMAPALT=CAA,CAAA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:5,7:33:0,12:28:16:0,3:0,9:10:6:31:17:1,2:4,5:11:6 chr12 56647911 . G C 943.73 PASS AO=98;DP=99;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0413091;FXX=0.0101;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.7268;QD=38.5197;RBI=0.0420763;REFB=0;REVB=-0.007998;RO=0;SAF=57;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00035035;OID=.;OPOS=56647911;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:99:98:0:0:98:98:41:57:0:0:41:57:0:0 chr12 56649601 . A G 1924.05 PASS AO=200;DP=200;FAO=201;FDP=201;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=127;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0335288;FXX=0.00985173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.944;QD=38.2895;RBI=0.0522295;REFB=0;REVB=0.0400467;RO=0;SAF=74;SAR=126;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.63938e-05;OID=.;OPOS=56649601;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:91:200:201:0:0:200:201:126:74:0:0:127:74:0:0 chr12 56651101 . GC G 138.31 PASS AO=30;DP=51;FAO=33;FDP=47;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=13;FWDB=0.249554;FXX=0.020829;HRUN=2;LEN=1;MLLD=19.0808;QD=11.7713;RBI=0.319744;REFB=-0.0276995;REVB=-0.199897;RO=14;SAF=1;SAR=29;SRF=2;SRR=12;SSEN=0.349185;SSEP=0;SSSB=-0.32029;STB=0.53672;TYPE=del;VARB=0.0116693;OID=.;OPOS=56651102;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:30:47:33:47:14:4:29:1:13:20:14:1:29:2:12 chr12 56722060 . T G 1293.79 PASS AO=140;DP=145;FAO=144;FDP=149;FR=.;FRO=5;FSAF=44;FSAR=100;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0132724;FXX=0.0132442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.1206;QD=34.7326;RBI=0.025164;REFB=-0.0294751;REVB=0.0213792;RO=5;SAF=43;SAR=97;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00712346;STB=0.503723;TYPE=snp;VARB=0.000802467;OID=.;OPOS=56722060;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:145:149:5:5:140:144:97:43:2:3:100:44:2:3 chr12 56812091 . GC G 618.58 PASS AO=77;DP=99;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.252177;FXX=0.010203;HRUN=3;LEN=1;MLLD=18.1021;QD=25.5084;RBI=0.356705;REFB=-0.0110709;REVB=0.25228;RO=18;SAF=32;SAR=45;SRF=12;SRR=6;SSEN=0.325771;SSEP=0;SSSB=-0.0902885;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0132058;OID=.;OPOS=56812092;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:77:98:97:97:0:45:52:0:0:49:18:32:45:12:6 chr12 56814653 . G A 2236.3 PASS AO=237;DP=239;FAO=238;FDP=238;FR=.;FRO=0;FSAF=140;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00118666;FXX=0.0124476;HRUN=3;LEN=1;MLLD=92.2928;QD=37.5848;RBI=0.0241565;REFB=-0.0455568;REVB=0.0241273;RO=2;SAF=140;SAR=97;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00149578;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000248905;OID=.;OPOS=56814653;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:89:239:238:2:0:237:238:97:140:1:1:98:140:0:0 chr12 56815141 . G C 319.42 PASS AO=77;DP=160;FAO=77;FDP=160;FR=.;FRO=83;FSAF=32;FSAR=45;FSRF=40;FSRR=43;FWDB=0.00157934;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.7008;QD=7.98541;RBI=0.0432924;REFB=-0.00332893;REVB=-0.0432635;RO=83;SAF=32;SAR=45;SRF=40;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0633146;STB=0.534997;TYPE=snp;VARB=0.00308963;OID=.;OPOS=56815141;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:160:83:83:77:77:45:32:40:43:45:32:40:43 chr12 56827694 . C G 953.22 PASS AO=97;DP=97;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.9984;QD=38.5138;RBI=0.0393986;REFB=0;REVB=-0.037509;RO=0;SAF=53;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000195963;OID=.;OPOS=56827694;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:97:99:0:0:97:99:44:53:0:0:46:53:0:0 chr12 56862886 . T C 543.17 PASS AO=58;DP=60;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0195571;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.1106;QD=35.6174;RBI=0.0250368;REFB=-0.0882995;REVB=-0.0156321;RO=0;SAF=11;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505049;TYPE=snp;VARB=7.21873e-05;OID=.;OPOS=56862886;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:60:61:0:1:58:60:47:11:0:0:49:11:0:1 chr12 56864053 . C T 134.21 PASS AO=33;DP=74;FAO=34;FDP=75;FR=.;FRO=41;FSAF=4;FSAR=30;FSRF=3;FSRR=38;FWDB=-0.014327;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.3675;QD=7.15802;RBI=0.0205434;REFB=0.012525;REVB=0.0147231;RO=41;SAF=4;SAR=29;SRF=3;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124079;STB=0.564281;TYPE=snp;VARB=-0.0128639;OID=.;OPOS=56864053;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:75:41:41:33:34:29:4:3:38:30:4:3:38 chr12 56956213 . T C 1205.03 PASS AO=126;DP=126;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0236673;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.523;QD=38.2549;RBI=0.0296919;REFB=0;REVB=0.0179296;RO=0;SAF=64;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.29882e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.0071e-05;OID=.;OPOS=56956213;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:126:126:0:0:126:126:62:64:0:0:62:64:0:0 chr12 56989729 . GTT GT,G 315.94 PASS AO=45,18;DP=83;FAO=78,0;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=28,0;FSAR=50,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.323384,-0.165679;FXX=0;HRUN=8,8;LEN=1,2;MLLD=8.34007,9.56208;QD=16.2018;RBI=0.363147,0.185812;REFB=0.0588143,0.0738296;REVB=-0.165224,-0.0841222;RO=6;SAF=15,7;SAR=30,11;SRF=0;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.085228,0.195861;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=-0.000469779,0;OID=.,.;OPOS=56989730,56989730;OREF=T,TT;OALT=-,-;OMAPALT=GT,G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:45,18:76:78,0:78:0:28,0:50,0:0:0:25:6:15,7:30,11:0:6 chr12 57106660 . A T 1428.39 PASS AO=152;DP=154;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00117485;FXX=0.0129024;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.912;QD=37.3437;RBI=0.0233914;REFB=0.0168785;REVB=-0.0233619;RO=2;SAF=73;SAR=79;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0128523;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000112473;OID=.;OPOS=57106660;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:154:153:2:0:152:153:79:73:2:0:80:73:0:0 chr12 57108203 . A G 2172.74 PASS AO=223;DP=225;FAO=229;FDP=229;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=134;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0365097;FXX=0.0129305;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.3526;QD=37.9517;RBI=0.038793;REFB=-0.00941687;REVB=-0.0131127;RO=1;SAF=92;SAR=131;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0036236;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.82624e-05;OID=.;OPOS=57108203;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:94:225:229:1:0:223:229:131:92:0:1:134:95:0:0 chr12 57109792 . A G 649.89 PASS AO=65;DP=65;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0741308;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.632;QD=38.229;RBI=0.0748166;REFB=0;REVB=-0.0101073;RO=0;SAF=34;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.90682e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000612648;OID=.;OPOS=57109792;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:65:68:0:0:65:68:31:34:0:0:31:37:0:0 chr12 57109931 . A T 354.86 PASS AO=35;DP=36;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.042353;FXX=0.0714116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.207;QD=36.3957;RBI=0.128802;REFB=0;REVB=0.12164;RO=0;SAF=29;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.61498e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000920865;OID=.;OPOS=57109931;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:36:39:0:0:35:39:6:29:0:0:10:29:0:0 chr12 57109932 . G T 10.43 PASS AO=7;DP=42;FAO=7;FDP=42;FR=.;FRO=35;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=29;FSRR=6;FWDB=-0.0427811;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=67.3652;QD=0.993614;RBI=0.0875864;REFB=-0.0184069;REVB=0.0764274;RO=35;SAF=3;SAR=4;SRF=29;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.49206;STB=0.809528;TYPE=snp;VARB=0.00965881;OID=.;OPOS=57109932;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:42:42:35:35:7:7:4:3:29:6:4:3:29:6 chr12 57112637 . G A 239.25 PASS AO=24;DP=24;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.061;QD=36.8082;RBI=0.0490735;REFB=0;REVB=0.04224;RO=0;SAF=20;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.83186e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000495466;OID=.;OPOS=57112637;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:24:26:0:0:24:26:4:20:0:0:6:20:0:0 chr12 57112723 . GC G 99.12 PASS AO=8;DP=28;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.312407;FXX=0.0624805;HRUN=4;LEN=1;MLLD=7.61869;QD=13.2162;RBI=0.326691;REFB=-0.0287633;REVB=-0.0955448;RO=9;SAF=8;SAR=0;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0.466357;SSSB=0;STB=0.510631;TYPE=del;VARB=0.0366419;OID=.;OPOS=57112724;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:8:25:29:30:1:23:6:1:0:6:9:8:0:9:0 chr12 57114100 . A G 556.84 PASS AO=63;DP=66;FAO=63;FDP=66;FR=.;FRO=3;FSAF=32;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.011017;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=187.948;QD=33.7478;RBI=0.0156862;REFB=0.0189702;REVB=-0.0111661;RO=3;SAF=32;SAR=31;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.043529;STB=0.52307;TYPE=snp;VARB=-0.000138987;OID=.;OPOS=57114100;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:66:66:3:3:63:63:31:32:0:3:31:32:0:3 chr12 57114307 . A T 693.95 PASS AO=73;DP=77;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.037034;FXX=0.0384566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.942;QD=37.0107;RBI=0.0373651;REFB=-0.126198;REVB=0.00496284;RO=0;SAF=51;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510635;TYPE=snp;VARB=0.00129186;OID=.;OPOS=57114307;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:77:75:0:1:73:74:22:51:0:0:23:51:0:1 chr12 57133140 . T G 1219.22 PASS AO=130;DP=133;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154631;FXX=0.0150365;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.7659;QD=37.228;RBI=0.0356035;REFB=-0.0616873;REVB=0.0320703;RO=1;SAF=67;SAR=63;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00704085;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00176087;OID=.;OPOS=57133140;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:133:131:1:0:130:131:63:67:1:0:63:68:0:0 chr12 57137828 . T A 1385.14 PASS AO=145;DP=145;FAO=145;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117674;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.808;QD=38.2106;RBI=0.0167784;REFB=0;REVB=0.0119602;RO=0;SAF=74;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.01112e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.80189e-05;OID=.;OPOS=57137828;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:145:145:0:0:145:145:71:74:0:0:71:74:0:0 chr12 57146069 . T G 31.62 PASS AO=7;DP=17;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.0999991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.4235;QD=7.44096;RBI=0.103899;REFB=-0.0553969;REVB=0.0282004;RO=10;SAF=3;SAR=4;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164676;STB=0.599717;TYPE=snp;VARB=0.0606964;OID=.;OPOS=57146069;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:17:17:10:10:7:7:4:3:6:4:4:3:6:4 chr12 57255195 . T C 327.05 PASS AO=86;DP=192;FAO=86;FDP=191;FR=.;FRO=105;FSAF=39;FSAR=47;FSRF=62;FSRR=43;FWDB=0.0102168;FXX=0.00520806;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.72;QD=6.84911;RBI=0.047182;REFB=-0.00946944;REVB=0.0460625;RO=105;SAF=39;SAR=47;SRF=62;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135025;STB=0.574889;TYPE=snp;VARB=0.0146829;OID=.;OPOS=57255195;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:191:105:105:86:86:47:39:62:43:47:39:62:43 chr12 57348706 . AGGC AGC,AG 103.21 PASS AO=15,9;DP=52;FAO=29,0;FDP=47;FR=.;FRO=18;FSAF=18,0;FSAR=11,0;FSRF=3;FSRR=15;FWDB=-0.236078,-0.0940167;FXX=0.059988;HRUN=2,2;LEN=1,2;MLLD=21.0323,94.6024;QD=8.7841;RBI=0.253536,0.0943751;REFB=-0.04882,-0.022671;REVB=0.0924534,-0.00821709;RO=19;SAF=6,9;SAR=9,0;SRF=2;SRR=17;SSEN=0,0;SSEP=0.25346,0.25346;SSSB=0.327475,0.848272;STB=0.669415,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.0449317,0;OID=.,.;OPOS=57348707,57348708;OREF=G,GC;OALT=-,-;OMAPALT=AGC,AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:15,9:50:29,0:47:18:18,0:11,0:3:15:36:19:6,9:9,0:2:17 chr12 57472477 . AG A 709.42 PASS AO=69;DP=123;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.193419;FXX=0.00751823;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.1469;QD=21.4976;RBI=0.369151;REFB=-0.0293708;REVB=0.314423;RO=37;SAF=13;SAR=56;SRF=10;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0813289;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0120823;OID=.;OPOS=57472478;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:69:118:132:132:0:44:88:0:0:58:37:13:56:10:27 chr12 57489648 . C T 261.13 PASS AO=75;DP=180;FAO=75;FDP=180;FR=.;FRO=105;FSAF=34;FSAR=41;FSRF=35;FSRR=70;FWDB=0.0717756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.4558;QD=5.80292;RBI=0.0718823;REFB=-0.0155818;REVB=0.00391446;RO=104;SAF=34;SAR=41;SRF=35;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124311;STB=0.57154;TYPE=snp;VARB=0.0241325;OID=.;OPOS=57489648;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:180:104:105:75:75:41:34:35:69:41:34:35:70 chr12 57489709 . T C 256.18 PASS AO=72;DP=172;FAO=73;FDP=172;FR=.;FRO=99;FSAF=23;FSAR=50;FSRF=19;FSRR=80;FWDB=0.00913864;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.0588;QD=5.95755;RBI=0.013576;REFB=0.0122773;REVB=0.0100396;RO=100;SAF=22;SAR=50;SRF=20;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137974;STB=0.587404;TYPE=snp;VARB=-0.0119472;OID=.;OPOS=57489709;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:172:100:99:72:73:50:22:20:80:50:23:19:80 chr12 57535266 . C T 171.04 PASS AO=32;DP=55;FAO=33;FDP=57;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.00280701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.685;QD=12.0028;RBI=0.00965082;REFB=-0.0179507;REVB=0.00923358;RO=20;SAF=13;SAR=19;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116491;STB=0.521345;TYPE=snp;VARB=0.0120463;OID=.;OPOS=57535266;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:55:57:20:24:32:33:19:13:5:15:19:14:9:15 chr12 57585144 . C T 36.07 PASS AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.082;QD=24.0466;RBI=0.024334;REFB=-0.153113;REVB=0.024334;RO=1;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00804459;OID=.;OPOS=57585144;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:6:6:1:1:5:5:5:0:0:1:5:0:0:1 chr12 57589784 . A C 189.04 PASS AO=10;DP=21;FAO=19;FDP=20;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.267576;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=32.5711;QD=37.8079;RBI=0.267725;REFB=0;REVB=0.00892007;RO=0;SAF=1;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.8593e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00539832;OID=.;OPOS=57589784;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:17:20:0:0:10:19:9:1:0:0:9:10:0:0 chr12 57590869 . T C 1121.93 PASS AO=116;DP=116;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00543038;FXX=0.00826378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.655;QD=37.3977;RBI=0.0321178;REFB=0.0642361;REVB=-0.0316554;RO=0;SAF=36;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000397537;OID=.;OPOS=57590869;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:116:120:0:0:116:120:80:36:0:0:83:37:0:0 chr12 57593101 . G A 593.23 PASS AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00502186;FXX=0.0307645;HRUN=3;LEN=1;MLLD=101.702;QD=37.6651;RBI=0.0148953;REFB=0;REVB=-0.0140232;RO=0;SAF=24;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51964e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000217647;OID=.;OPOS=57593101;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:63:63:0:0:63:63:39:24:0:0:39:24:0:0 chr12 57637593 . G A 61.28 PASS AO=26;DP=89;FAO=26;FDP=89;FR=.;FRO=63;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=35;FSRR=28;FWDB=0.00568682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.924;QD=2.75418;RBI=0.0195874;REFB=-0.0107888;REVB=0.0187436;RO=57;SAF=8;SAR=18;SRF=33;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.318012;STB=0.67762;TYPE=snp;VARB=0.0348242;OID=.;OPOS=57637593;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:89:89:57:63:26:26:18:8:33:24:18:8:35:28 chr12 57647663 . C CA,A 45.62 PASS AO=10,10;DP=58;FAO=20,0;FDP=56;FR=.;FRO=36;FSAF=19,0;FSAR=1,0;FSRF=28;FSRR=8;FWDB=-0.0834059,0.0387452;FXX=0.0967586;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=14.0044,125.032;QD=3.25887;RBI=0.102817,0.0483713;REFB=-0.0849117,-0.0017209;REVB=-0.0601224,-0.0289584;RO=36;SAF=9,10;SAR=1,0;SRF=28;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.275371,0.677132;STB=0.784009,0.5;TYPE=ins,snp;VARB=0.186588,0;OID=.,.;OPOS=57647664,57647663;OREF=-,C;OALT=A,A;OMAPALT=CA,A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:58:56:36:36:10,10:20,0:1,0:9,10:28:8:1,0:19,0:28:8 chr12 57649840 . C T 186.58 PASS AO=56;DP=141;FAO=56;FDP=141;FR=.;FRO=85;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=42;FSRR=43;FWDB=0.0126984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.181;QD=5.29291;RBI=0.0127003;REFB=-0.0197554;REVB=0.000219368;RO=85;SAF=24;SAR=32;SRF=42;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0705995;STB=0.539863;TYPE=snp;VARB=0.0250925;OID=.;OPOS=57649840;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:85:85:56:56:32:24:42:43:32:24:42:43 chr12 57651783 . AC A 26.83 PASS AO=20;DP=60;FAO=25;FDP=56;FR=.;FRO=31;FSAF=23;FSAR=2;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.131317;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.5844;QD=1.91667;RBI=0.158482;REFB=-0.0915664;REVB=0.0887265;RO=37;SAF=18;SAR=2;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.459748;STB=0.8211;TYPE=del;VARB=0.0842374;OID=.;OPOS=57651784;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:20:61:25:56:31:23:2:17:14:26:37:18:2:23:14 chr12 57848708 . C G 118.65 PASS AO=25;DP=49;FAO=25;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.0311638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.6903;QD=9.68537;RBI=0.0329955;REFB=-0.0393452;REVB=0.0108407;RO=24;SAF=13;SAR=12;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0901406;STB=0.550448;TYPE=snp;VARB=0.0251348;OID=.;OPOS=57848708;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:24:24:25:25:12:13:10:14:12:13:10:14 chr12 57860046 . C T 169.45 PASS AO=38;DP=82;FAO=39;FDP=79;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=12;FWDB=-0.00318135;FXX=0.048187;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.795;QD=8.57963;RBI=0.0275618;REFB=-0.026951;REVB=0.0273776;RO=38;SAF=17;SAR=21;SRF=26;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210703;STB=0.619172;TYPE=snp;VARB=0.028216;OID=.;OPOS=57860046;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:79:38:40:38:39:21:17:26:12:21:18:28:12 chr12 57865821 . G C 217.63 PASS AO=44;DP=80;FAO=44;FDP=80;FR=.;FRO=36;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=-0.0091696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.7412;QD=10.8814;RBI=0.0224557;REFB=0.00778871;REVB=-0.0204982;RO=36;SAF=23;SAR=21;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0727272;STB=0.539982;TYPE=snp;VARB=-0.0100988;OID=.;OPOS=57865821;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:36:36:44:44:21:23:22:14:21:23:22:14 chr12 57868243 . G A 719.71 PASS AO=180;DP=376;FAO=180;FDP=377;FR=.;FRO=197;FSAF=83;FSAR=97;FSRF=90;FSRR=107;FWDB=0.0175348;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=286.849;QD=7.63619;RBI=0.0181568;REFB=-0.0103367;REVB=0.00471177;RO=196;SAF=83;SAR=97;SRF=90;SRR=106;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.001839;STB=0.502239;TYPE=snp;VARB=0.0114362;OID=.;OPOS=57868243;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:376:377:196:197:180:180:97:83:90:106:97:83:90:107 chr12 57869582 . T C 39.58 PASS AO=5;DP=7;FAO=6;FDP=8;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0879602;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8124;QD=19.7904;RBI=0.0888839;REFB=-0.0156097;REVB=-0.0127804;RO=2;SAF=1;SAR=4;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190062;STB=0.545299;TYPE=snp;VARB=0.0116047;OID=.;OPOS=57869582;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:8:2:2:5:6:4:1:1:1:4:2:1:1 chr12 57871437 . C T 76.6 PASS AO=14;DP=25;FAO=14;FDP=24;FR=.;FRO=10;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=0.0404854;FXX=0.0768935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.391;QD=12.7672;RBI=0.0450576;REFB=-0.000350426;REVB=-0.0197767;RO=10;SAF=10;SAR=4;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.378329;STB=0.679983;TYPE=snp;VARB=0.000901396;OID=.;OPOS=57871437;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:25:24:10:10:14:14:4:10:2:8:5:9:2:8 chr12 57873042 . T C 344.16 PASS AO=64;DP=119;FAO=72;FDP=126;FR=.;FRO=54;FSAF=13;FSAR=59;FSRF=8;FSRR=46;FWDB=0.0393827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.386;QD=10.9256;RBI=0.0402794;REFB=0.00287482;REVB=-0.00845182;RO=54;SAF=5;SAR=59;SRF=8;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16865;STB=0.524187;TYPE=snp;VARB=-0.00200367;OID=.;OPOS=57873042;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:126:54:54:64:72:59:5:8:46:59:13:8:46 chr12 57911160 . G A 1801.07 PASS AO=184;DP=185;FAO=190;FDP=190;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145867;FXX=0.0155432;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.3513;QD=37.9173;RBI=0.0526569;REFB=-0.0640034;REVB=0.0505962;RO=1;SAF=102;SAR=82;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00577099;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000801842;OID=.;OPOS=57911160;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:185:190:1:0:184:190:82:102:0:1:89:101:0:0 chr12 57920493 . GC G 189.37 PASS AO=23;DP=37;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.257475;FXX=0.0555401;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.5301;QD=22.2789;RBI=0.347831;REFB=-0.0114301;REVB=0.233866;RO=6;SAF=18;SAR=5;SRF=5;SRR=1;SSEN=0.444606;SSEP=0;SSSB=-0.0288128;STB=0.510198;TYPE=del;VARB=0.0355493;OID=.;OPOS=57920494;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:23:35:33:34:1:24:9:1:0:12:6:18:5:5:1 chr12 57927805 . TG T 111.31 PASS AO=76;DP=257;FAO=100;FDP=226;FR=.;FRO=126;FSAF=46;FSAR=54;FSRF=78;FSRR=48;FWDB=0.0339796;FXX=0.025861;HRUN=7;LEN=1;MLLD=6.80268;QD=1.97008;RBI=0.0521577;REFB=-0.104186;REVB=-0.0395703;RO=91;SAF=29;SAR=47;SRF=59;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.258872;STB=0.58797;TYPE=del;VARB=0.102018;OID=.;OPOS=57927806;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:76:214:100:226:126:46:54:78:48:99:91:29:47:59:32 chr12 57958313 . A G 1761.82 PASS AO=182;DP=182;FAO=185;FDP=185;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.364;QD=38.0933;RBI=0.0119678;REFB=0;REVB=0.000828881;RO=0;SAF=75;SAR=107;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.26869e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.0042e-05;OID=.;OPOS=57958313;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:182:185:0:0:182:185:107:75:0:0:110:75:0:0 chr12 57977003 . C T 946.83 PASS AO=98;DP=100;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0351061;FXX=0.019998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.19;QD=38.646;RBI=0.0353802;REFB=0;REVB=0.00439498;RO=0;SAF=13;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.82705e-07;OID=.;OPOS=57977003;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:100:98:0:0:98:98:85:13:0:0:85:13:0:0 chr12 57977040 . C A 574.11 PASS AO=64;DP=67;FAO=64;FDP=67;FR=.;FRO=3;FSAF=8;FSAR=56;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00079969;FXX=0.0147037;HRUN=3;LEN=1;MLLD=209.499;QD=34.2754;RBI=0.0158905;REFB=-0.0944957;REVB=0.0158704;RO=3;SAF=8;SAR=56;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0389108;STB=0.520654;TYPE=snp;VARB=0.00318462;OID=.;OPOS=57977040;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:67:67:3:3:64:64:56:8:1:2:56:8:1:2 chr12 57994743 . T G 1792.51 PASS AO=189;DP=191;FAO=190;FDP=190;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0260507;FXX=0.00523533;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4781;QD=37.737;RBI=0.0700637;REFB=-0.0221001;REVB=-0.0650406;RO=1;SAF=79;SAR=110;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0043095;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000218636;OID=.;OPOS=57994743;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:191:190:1:0:189:190:110:79:0:1:111:79:0:0 chr12 57995089 . T C 1049.54 PASS AO=109;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0178361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.902;QD=38.5154;RBI=0.0245693;REFB=0;REVB=0.0168974;RO=0;SAF=61;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.02123e-06;OID=.;OPOS=57995089;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:109:109:0:0:109:109:48:61:0:0:48:61:0:0 chr12 58009372 . G A 321.22 PASS AO=82;DP=179;FAO=82;FDP=178;FR=.;FRO=96;FSAF=39;FSAR=43;FSRF=45;FSRR=51;FWDB=0.0214717;FXX=0.00558628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.121;QD=7.21835;RBI=0.0499874;REFB=-0.00335789;REVB=0.0451409;RO=94;SAF=39;SAR=43;SRF=44;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00727773;STB=0.503709;TYPE=snp;VARB=0.00553349;OID=.;OPOS=58009372;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:178:94:96:82:82:43:39:44:50:43:39:45:51 chr12 58010163 . A G 691.13 PASS AO=72;DP=72;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00437684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.748;QD=37.3585;RBI=0.0193221;REFB=0;REVB=0.0188199;RO=0;SAF=43;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.16073e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.52498e-05;OID=.;OPOS=58010163;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:72:74:0:0:72:74:29:43:0:0:30:44:0:0 chr12 58017701 . T G 289.9 PASS AO=65;DP=123;FAO=65;FDP=125;FR=.;FRO=60;FSAF=25;FSAR=40;FSRF=22;FSRR=38;FWDB=-0.0179713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.331;QD=9.27688;RBI=0.023905;REFB=-0.0212099;REVB=0.0157633;RO=58;SAF=25;SAR=40;SRF=22;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00481691;STB=0.509136;TYPE=snp;VARB=0.0125907;OID=.;OPOS=58017701;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:125:58:60:65:65:40:25:22:36:40:25:22:38 chr12 58019472 . T G 296.77 PASS AO=31;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0706401;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.0422;QD=37.0957;RBI=0.0902252;REFB=0;REVB=-0.0561299;RO=0;SAF=7;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71661e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00203848;OID=.;OPOS=58019472;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:31:32:0:0:31:32:24:7:0:0:25:7:0:0 chr12 58023981 . C A 83.19 PASS AO=35;DP=111;FAO=34;FDP=111;FR=.;FRO=77;FSAF=7;FSAR=27;FSRF=18;FSRR=59;FWDB=0.0604871;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9638;QD=2.99789;RBI=0.0620265;REFB=-0.0143729;REVB=0.0137332;RO=76;SAF=7;SAR=28;SRF=18;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0640961;STB=0.528565;TYPE=snp;VARB=0.0447599;OID=.;OPOS=58023981;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:111:111:76:77:35:34:28:7:18:58:27:7:18:59 chr12 58026021 . A G 54.44 PASS AO=9;DP=48;FAO=15;FDP=48;FR=.,HEALED;FRO=31;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=28;FSRR=3;FWDB=0.00349829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.878;QD=4.53664;RBI=0.0158869;REFB=-0.0170041;REVB=0.015497;RO=29;SAF=6;SAR=3;SRF=27;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.457407;STB=0.784047;TYPE=snp;VARB=0.0337204;OID=.;OPOS=58026021;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:48:48:29:31:9:15:3:6:27:2:8:7:28:3 chr12 58112189 . A G 152.97 PASS AO=39;DP=87;FAO=39;FDP=87;FR=.;FRO=48;FSAF=12;FSAR=27;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=-0.00983152;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=244.58;QD=7.0333;RBI=0.0184406;REFB=-0.0207634;REVB=-0.0156012;RO=48;SAF=12;SAR=27;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201672;STB=0.613576;TYPE=snp;VARB=0.0245127;OID=.;OPOS=58112189;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:48:48:39:39:27:12:24:24:27:12:24:24 chr12 58119044 . TG T 106 PASS AO=24;DP=73;FAO=39;FDP=55;FR=.;FRO=16;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.0515691;FXX=0.0677851;HRUN=7;LEN=1;MLLD=8.42071;QD=7.70916;RBI=0.137987;REFB=-0.0328008;REVB=0.127988;RO=20;SAF=14;SAR=10;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.227824;STB=0.518086;TYPE=del;VARB=0.0961445;OID=.;OPOS=58119045;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:24:58:39:55:16:17:22:6:10:8:20:14:10:6:14 chr12 58125375 . C T 376.6 PASS AO=77;DP=141;FAO=78;FDP=141;FR=.;FRO=63;FSAF=22;FSAR=56;FSRF=10;FSRR=53;FWDB=-0.000956152;FXX=0.00704176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.337;QD=10.6836;RBI=0.00392242;REFB=-0.00985411;REVB=-0.0038041;RO=64;SAF=21;SAR=56;SRF=10;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130589;STB=0.572298;TYPE=snp;VARB=0.00537302;OID=.;OPOS=58125375;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:64:63:77:78:56:21:10:54:56:22:10:53 chr12 58126234 . C A 287.26 PASS AO=58;DP=105;FAO=58;FDP=105;FR=.;FRO=47;FSAF=23;FSAR=35;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=-0.00137861;FXX=0.0366939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.731;QD=10.9433;RBI=0.0211817;REFB=-0.00805362;REVB=0.0211368;RO=47;SAF=25;SAR=33;SRF=27;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11727;STB=0.580403;TYPE=snp;VARB=0.00563204;OID=.;OPOS=58126234;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:47:47:58:58:33:25:27:20:35:23:27:20 chr12 58152948 . C T 635.49 PASS AO=117;DP=189;FAO=117;FDP=189;FR=.;FRO=72;FSAF=39;FSAR=78;FSRF=23;FSRR=49;FWDB=0.00904805;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=210.283;QD=13.4495;RBI=0.01304;REFB=-0.0118008;REVB=0.00939013;RO=72;SAF=39;SAR=78;SRF=23;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0110659;STB=0.505975;TYPE=snp;VARB=0.00686569;OID=.;OPOS=58152948;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:189:72:72:117:117:78:39:23:49:78:39:23:49 chr12 58204283 . T C 1281.29 PASS AO=136;DP=138;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0403831;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=110.124;QD=37.1387;RBI=0.042423;REFB=-0.0511091;REVB=0.0129969;RO=0;SAF=61;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.60175e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000174758;OID=.;OPOS=58204283;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:138:138:0:0:136:138:75:61:0:0:77:61:0:0 chr12 58240188 . G A 12.58 PASS AO=16;DP=103;FAO=16;FDP=103;FR=.;FRO=87;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=64;FWDB=-0.0345443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.117;QD=0.488541;RBI=0.0388333;REFB=-0.00446001;REVB=0.0177402;RO=86;SAF=2;SAR=14;SRF=22;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260121;STB=0.691413;TYPE=snp;VARB=0.0285663;OID=.;OPOS=58240188;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:103:103:86:87:16:16:14:2:22:64:14:2:23:64 chr12 58240189 . C T 12.98 PASS AO=16;DP=102;FAO=16;FDP=102;FR=.;FRO=86;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=63;FWDB=0.0122355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.946;QD=0.508908;RBI=0.0509342;REFB=-0.00908963;REVB=-0.0494428;RO=85;SAF=2;SAR=14;SRF=23;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280743;STB=0.694153;TYPE=snp;VARB=0.0365055;OID=.;OPOS=58240189;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:102:102:85:86:16:16:14:2:23:62:14:2:23:63 chr12 58240210 . G T 28.42 PASS AO=18;DP=83;FAO=18;FDP=83;FR=.;FRO=65;FSAF=2;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=50;FWDB=0.000741729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.781;QD=1.36958;RBI=0.00832281;REFB=0.00147755;REVB=-0.00828969;RO=65;SAF=2;SAR=16;SRF=15;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265219;STB=0.673035;TYPE=snp;VARB=-0.00535712;OID=.;OPOS=58240210;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:83:83:65:65:18:18:16:2:15:50:16:2:15:50 chr12 58240229 . C T 42.95 PASS AO=15;DP=48;FAO=15;FDP=48;FR=.;FRO=33;FSAF=1;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=28;FWDB=-0.006598;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=141.435;QD=3.57936;RBI=0.0136963;REFB=-0.0215993;REVB=-0.0120023;RO=33;SAF=1;SAR=14;SRF=5;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267055;STB=0.666388;TYPE=snp;VARB=0.0214842;OID=.;OPOS=58240229;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:48:48:33:33:15:15:14:1:5:28:14:1:5:28 chr12 58240231 . C A 45.22 PASS AO=15;DP=46;FAO=15;FDP=46;FR=.;FRO=31;FSAF=1;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=26;FWDB=0.0475736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.692;QD=3.93214;RBI=0.0483899;REFB=-0.0344509;REVB=0.00885078;RO=29;SAF=1;SAR=14;SRF=5;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.30473;STB=0.67712;TYPE=snp;VARB=0.0239377;OID=.;OPOS=58240231;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:46:46:29:31:15:15:14:1:5:24:14:1:5:26 chr12 58335626 . A T 152.09 PASS AO=31;DP=57;FAO=31;FDP=57;FR=.;FRO=26;FSAF=29;FSAR=2;FSRF=23;FSRR=3;FWDB=-0.0059948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.091;QD=10.6726;RBI=0.0131507;REFB=-0.0176094;REVB=-0.0117048;RO=26;SAF=29;SAR=2;SRF=23;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146458;STB=0.582269;TYPE=snp;VARB=0.0179193;OID=.;OPOS=58335626;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:26:26:31:31:2:29:23:3:2:29:23:3 chr12 58350631 . C T 631.08 PASS AO=140;DP=268;FAO=141;FDP=268;FR=.;FRO=127;FSAF=45;FSAR=96;FSRF=45;FSRR=82;FWDB=-0.0127615;FXX=0.00371733;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1799;QD=9.41915;RBI=0.0187892;REFB=-0.0202459;REVB=-0.0137905;RO=126;SAF=45;SAR=95;SRF=44;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0272991;STB=0.518916;TYPE=snp;VARB=0.022267;OID=.;OPOS=58350631;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:268:268:126:127:140:141:95:45:44:82:96:45:45:82 chr12 60161941 . G GA 40.32 PASS AO=24;DP=81;FAO=26;FDP=75;FR=.;FRO=49;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=29;FWDB=0.248471;FXX=0.0624922;HRUN=4;LEN=1;MLLD=16.0562;QD=2.15036;RBI=0.250237;REFB=0.00383979;REVB=0.0296762;RO=53;SAF=9;SAR=15;SRF=20;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0029333;STB=0.510003;TYPE=ins;VARB=0.003764;OID=.;OPOS=60161942;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:24:81:26:75:49:11:15:20:29:40:53:9:15:20:33 chr12 60735645 . A G 1223.14 PASS AO=94;DP=116;FAO=127;FDP=127;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=69;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0272651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.709;QD=38.5242;RBI=0.0512062;REFB=0;REVB=0.0433438;RO=0;SAF=67;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000430468;OID=.;OPOS=60735645;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:113:127:0:0:94:127:27:67:0:0:58:69:0:0 chr12 62114671 . T C 106.21 PASS AO=35;DP=97;FAO=35;FDP=97;FR=.;FRO=62;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=33;FSRR=29;FWDB=0.00586613;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9022;QD=4.37996;RBI=0.0547679;REFB=0.018713;REVB=0.0544529;RO=62;SAF=17;SAR=18;SRF=33;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0517433;STB=0.529706;TYPE=snp;VARB=-0.0294426;OID=.;OPOS=62114671;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:62:62:35:35:18:17:33:29:18:17:33:29 chr12 62696599 . C T 553.02 PASS AO=134;DP=274;FAO=134;FDP=274;FR=.;FRO=140;FSAF=73;FSAR=61;FSRF=61;FSRR=79;FWDB=0.0127156;FXX=0.00363623;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.883;QD=8.07334;RBI=0.0154297;REFB=0.00355113;REVB=-0.0087402;RO=139;SAF=73;SAR=61;SRF=61;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0980309;STB=0.555608;TYPE=snp;VARB=-0.00403184;OID=.;OPOS=62696599;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:274:274:139:140:134:134:61:73:61:78:61:73:61:79 chr12 62706046 . A T 135.3 PASS AO=31;DP=70;FAO=33;FDP=70;FR=.;FRO=37;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.0184365;FXX=0.0277739;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.185;QD=7.73152;RBI=0.0187656;REFB=-0.00839862;REVB=-0.00349932;RO=38;SAF=14;SAR=17;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00418904;STB=0.500866;TYPE=snp;VARB=0.00918883;OID=.;OPOS=62706046;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:38:37:31:33:17:14:17:21:17:16:18:19 chr12 62778065 . A G 1058.95 PASS AO=113;DP=114;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0646868;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9586;QD=37.4849;RBI=0.0822938;REFB=-0.0135538;REVB=0.0508713;RO=1;SAF=63;SAR=50;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0094016;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000795336;OID=.;OPOS=62778065;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:114:113:1:0:113:113:50:63:0:1:50:63:0:0 chr12 62783462 . A G 563.61 PASS AO=128;DP=251;FAO=129;FDP=252;FR=.;FRO=123;FSAF=56;FSAR=73;FSRF=43;FSRR=80;FWDB=0.00625217;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.218;QD=8.94614;RBI=0.0189996;REFB=-0.0136767;REVB=0.0179415;RO=122;SAF=55;SAR=73;SRF=43;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0710835;STB=0.542444;TYPE=snp;VARB=0.0128283;OID=.;OPOS=62783462;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:251:252:122:123:128:129:73:55:43:79:73:56:43:80 chr12 62810961 . AG A,AA 1572.31 PASS AO=61,85;DP=158;FAO=168,2;FDP=170;FR=.;FRO=0;FSAF=118,0;FSAR=50,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.051388,-0.0495818;FXX=0.00584761;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=203.199,200.832;QD=36.9955;RBI=0.0651703,0.0636684;REFB=-0.035954,-0.0321631;REVB=0.0400804,0.0399413;RO=1;SAF=34,75;SAR=27,10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0171613,0.0450307;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.00827838,0.0140466;OID=.,.;OPOS=62810962,62810962;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:61,85:147:168,2:170:0:118,0:50,2:0:0:8:1:34,75:27,10:0:1 chr12 62979216 . G A 700.76 PASS AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0133042;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=368.653;QD=37.8788;RBI=0.0146537;REFB=0;REVB=0.0061425;RO=0;SAF=9;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.43815e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.58848e-06;OID=.;OPOS=62979216;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:74:74:0:0:74:74:65:9:0:0:65:9:0:0 chr12 63359168 . G A 2188.68 PASS AO=234;DP=240;FAO=240;FDP=247;FR=.;FRO=7;FSAF=91;FSAR=149;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0154508;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.629;QD=35.4442;RBI=0.0254963;REFB=-0.0354104;REVB=0.0202814;RO=6;SAF=90;SAR=144;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00258073;STB=0.502816;TYPE=snp;VARB=0.00159191;OID=.;OPOS=63359168;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:240:247:6:7:234:240:144:90:2:4:149:91:2:5 chr12 63359409 . C A 1214.87 PASS AO=128;DP=129;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183242;FXX=0.00775134;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.404;QD=37.9647;RBI=0.0493629;REFB=-0.0402747;REVB=-0.0458358;RO=1;SAF=49;SAR=79;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00959905;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000108603;OID=.;OPOS=63359409;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:129:128:1:0:128:128:79:49:1:0:79:49:0:0 chr12 63544209 . A G 131.06 PASS AO=27;DP=50;FAO=27;FDP=51;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=4;FWDB=-0.0657021;FXX=0.0192271;HRUN=3;LEN=1;MLLD=65.4359;QD=10.2794;RBI=0.0957114;REFB=-0.0163662;REVB=-0.0695982;RO=23;SAF=11;SAR=16;SRF=20;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.369211;STB=0.692606;TYPE=snp;VARB=0.0185792;OID=.;OPOS=63544209;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:51:23:24:27:27:16:11:20:3:16:11:20:4 chr12 63954300 . C T 553.9 PASS AO=151;DP=342;FAO=152;FDP=344;FR=.;FRO=192;FSAF=76;FSAR=76;FSRF=100;FSRR=92;FWDB=0.0218279;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.179;QD=6.44067;RBI=0.0219189;REFB=0.0078783;REVB=-0.00199479;RO=190;SAF=75;SAR=76;SRF=100;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0297922;STB=0.511626;TYPE=snp;VARB=-0.00848923;OID=.;OPOS=63954300;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:342:344:190:192:151:152:76:75:100:90:76:76:100:92 chr12 63954304 . T C 3027.75 PASS AO=331;DP=342;FAO=332;FDP=332;FR=.;FRO=0;FSAF=170;FSAR=162;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00675992;FXX=0.0292389;HRUN=3;LEN=1;MLLD=93.1186;QD=36.4789;RBI=0.0494934;REFB=-0.0483567;REVB=-0.0490295;RO=8;SAF=169;SAR=162;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0117258;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000199528;OID=.;OPOS=63954304;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:342:332:8:0:331:332:162:169:2:6:162:170:0:0 chr12 63974439 . C T 581.19 PASS AO=141;DP=291;FAO=141;FDP=290;FR=.;FRO=149;FSAF=91;FSAR=50;FSRF=61;FSRR=88;FWDB=-0.0109054;FXX=0.00343631;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.427;QD=8.01639;RBI=0.0196211;REFB=-0.0166731;REVB=-0.0163113;RO=148;SAF=91;SAR=50;SRF=60;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226393;STB=0.622961;TYPE=snp;VARB=0.0140531;OID=.;OPOS=63974439;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:291:290:148:149:141:141:50:91:60:88:50:91:61:88 chr12 64020321 . C A 265.21 PASS AO=19;DP=30;FAO=30;FDP=31;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=2;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00762557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.105;QD=34.2212;RBI=0.0179372;REFB=0.0305717;REVB=-0.0162355;RO=1;SAF=2;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0263155;STB=0.508766;TYPE=snp;VARB=0.00195618;OID=.;OPOS=64020321;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:30:31:1:1:19:30:17:2:0:1:28:2:0:1 chr12 64173807 . G A 171.28 PASS AO=29;DP=44;FAO=29;FDP=44;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=14;FWDB=0.0127147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.5534;QD=15.5709;RBI=0.053924;REFB=-0.00200721;REVB=0.0524036;RO=15;SAF=6;SAR=23;SRF=1;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146673;STB=0.579585;TYPE=snp;VARB=0.00293408;OID=.;OPOS=64173807;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:44:44:15:15:29:29:23:6:1:14:23:6:1:14 chr12 64472803 . A T 1835.33 PASS AO=198;DP=202;FAO=198;FDP=198;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=112;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.078175;FXX=0.019801;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3259;QD=37.0774;RBI=0.0825892;REFB=-0.108907;REVB=0.0266392;RO=2;SAF=86;SAR=112;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00127227;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00132314;OID=.;OPOS=64472803;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:202:198:2:0:198:198:112:86:1:1:112:86:0:0 chr12 64519806 . T C 1645.13 PASS AO=168;DP=169;FAO=172;FDP=172;FR=.;FRO=0;FSAF=115;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.022468;FXX=0.00578001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.232;QD=38.2589;RBI=0.0299456;REFB=0;REVB=0.0197972;RO=0;SAF=114;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43062e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.1088e-06;OID=.;OPOS=64519806;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:169:172:0:0:168:172:54:114:0:0:57:115:0:0 chr12 64521783 . G T 13.08 PASS AO=2;DP=10;FAO=2;FDP=9;FR=.,HEALED;FRO=6;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=284.361;QD=5.81436;RBI=0.000354387;REFB=0.00452825;REVB=-0.000354387;RO=4;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00399332;OID=.;OPOS=64521783;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:9:9:4:6:2:2:2:0:0:4:2:0:0:6 chr12 64587633 . C A 1533.09 PASS AO=162;DP=163;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0277108;FXX=0.0181807;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.583;QD=37.8542;RBI=0.0288056;REFB=-0.0277768;REVB=0.00786567;RO=1;SAF=96;SAR=66;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00493123;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.17915e-05;OID=.;OPOS=64587633;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:163:162:1:0:162:162:66:96:1:0:66:96:0:0 chr12 64609562 . C T 1398.94 PASS AO=151;DP=154;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.035695;FXX=0.0129862;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.277;QD=36.8143;RBI=0.0514416;REFB=-0.0954321;REVB=0.0370419;RO=2;SAF=81;SAR=70;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0115988;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000783403;OID=.;OPOS=64609562;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:154:152:2:0:151:152:70:81:2:0:70:82:0:0 chr12 64669090 . C A 3751.84 PASS AO=704;DP=709;FAO=397;FDP=397;FR=.;FRO=0;FSAF=231;FSAR=166;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0328448;FXX=0.00749981;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3258;QD=37.802;RBI=0.0551678;REFB=0.0125623;REVB=-0.044325;RO=5;SAF=397;SAR=307;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00049418;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00044137;OID=.;OPOS=64669090;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:709:397:5:0:704:397:307:397:3:2:166:231:0:0 chr12 64712511 . A G 1569.68 PASS AO=164;DP=165;FAO=164;FDP=164;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0146609;FXX=0.00606024;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.577;QD=38.2848;RBI=0.0175722;REFB=0;REVB=0.00968701;RO=0;SAF=79;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.14401e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.46382e-05;OID=.;OPOS=64712511;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:165:164:0:0:164:164:85:79:0:0:85:79:0:0 chr12 64712546 . A AGTT 1157.87 PASS AO=144;DP=169;FAO=144;FDP=163;FR=.;FRO=19;FSAF=81;FSAR=63;FSRF=15;FSRR=4;FWDB=0.00104704;FXX=0.0355009;HRUN=1;LEN=3;MLLD=201.851;QD=28.4139;RBI=0.0123328;REFB=-0.0574922;REVB=0.0122882;RO=19;SAF=81;SAR=63;SRF=15;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0512198;STB=0.527055;TYPE=ins;VARB=0.00610574;OID=.;OPOS=64712547;OREF=-;OALT=GTT;OMAPALT=AGTT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:144:169:144:163:19:81:63:15:4:4:19:81:63:15:4 chr12 64746833 . C T 115 PASS AO=41;DP=129;FAO=44;FDP=134;FR=.;FRO=90;FSAF=11;FSAR=33;FSRF=38;FSRR=52;FWDB=0.00835246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.274;QD=3.43277;RBI=0.0125676;REFB=-0.00242992;REVB=-0.00939045;RO=79;SAF=10;SAR=31;SRF=34;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.244201;STB=0.633556;TYPE=snp;VARB=0.00488092;OID=.;OPOS=64746833;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:134:79:90:41:44:31:10:34:45:33:11:38:52 chr12 64749591 . A G 297.37 PASS AO=57;DP=116;FAO=71;FDP=146;FR=.;FRO=75;FSAF=34;FSAR=37;FSRF=38;FSRR=37;FWDB=0.0350608;FXX=0.00680226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.537;QD=8.1472;RBI=0.0377109;REFB=-0.00777869;REVB=0.0138872;RO=58;SAF=26;SAR=31;SRF=30;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0558456;STB=0.514282;TYPE=snp;VARB=0.00807275;OID=.;OPOS=64749591;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:146:58:75:57:71:31:26:30:28:37:34:38:37 chr12 64749600 . A G 255.58 PASS AO=54;DP=114;FAO=64;FDP=138;FR=.;FRO=74;FSAF=27;FSAR=37;FSRF=37;FSRR=37;FWDB=-0.000585089;FXX=0.00719373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.466;QD=7.40824;RBI=0.0208342;REFB=-0.00995842;REVB=0.020826;RO=59;SAF=22;SAR=32;SRF=30;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0964064;STB=0.54236;TYPE=snp;VARB=0.0178375;OID=.;OPOS=64749600;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:138:59:74:54:64:32:22:30:29:37:27:37:37 chr12 64875787 . T A 328.55 PASS AO=82;DP=175;FAO=82;FDP=174;FR=.;FRO=92;FSAF=35;FSAR=47;FSRF=41;FSRR=51;FWDB=-0.0167207;FXX=0.00571396;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.36;QD=7.55295;RBI=0.0190106;REFB=-0.0083242;REVB=0.00904552;RO=92;SAF=35;SAR=47;SRF=41;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0183247;STB=0.510137;TYPE=snp;VARB=0.00815883;OID=.;OPOS=64875787;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:174:92:92:82:82:47:35:41:51:47:35:41:51 chr12 64895830 . GTA G 357.28 PASS AO=72;DP=160;FAO=78;FDP=148;FR=.;FRO=70;FSAF=40;FSAR=38;FSRF=32;FSRR=38;FWDB=0.0121802;FXX=0.0512788;HRUN=1;LEN=2;MLLD=239.95;QD=9.65607;RBI=0.0128646;REFB=-0.00290931;REVB=-0.00414006;RO=64;SAF=36;SAR=36;SRF=32;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.526309;TYPE=del;VARB=0.00232659;OID=.;OPOS=64895831;OREF=TA;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:72:152:78:148:70:40:38:32:38:99:64:36:36:32:32 chr12 65108160 . G C 370.52 PASS AO=92;DP=198;FAO=93;FDP=199;FR=.;FRO=106;FSAF=37;FSAR=56;FSRF=45;FSRR=61;FWDB=0.00384307;FXX=0.00499975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.521;QD=7.44754;RBI=0.0156014;REFB=0.00223712;REVB=0.0151207;RO=106;SAF=37;SAR=55;SRF=45;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0223695;STB=0.514737;TYPE=snp;VARB=-0.00260576;OID=.;OPOS=65108160;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:199:106:106:92:93:55:37:45:61:56:37:45:61 chr12 65146532 . C T 2079.86 PASS AO=216;DP=216;FAO=216;FDP=216;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=130;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0231883;FXX=0.013698;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.532;QD=38.516;RBI=0.0238116;REFB=0;REVB=0.00541214;RO=0;SAF=86;SAR=130;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.57845e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000229434;OID=.;OPOS=65146532;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:216:216:0:0:216:216:130:86:0:0:130:86:0:0 chr12 65150485 . C T 1491.77 PASS AO=157;DP=158;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0164741;FXX=0.00632871;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6065;QD=38.007;RBI=0.0173629;REFB=0.0109103;REVB=0.00548408;RO=0;SAF=78;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00050132;OID=.;OPOS=65150485;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:158:157:0:0:157:157:79:78:0:0:79:78:0:0 chr12 65332874 . G A 95.54 PASS AO=20;DP=47;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=24;FWDB=0.0148425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.726;QD=7.64324;RBI=0.0275932;REFB=0.0101368;REVB=0.0232612;RO=17;SAF=13;SAR=7;SRF=2;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.416042;STB=0.73405;TYPE=snp;VARB=-0.00388589;OID=.;OPOS=65332874;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:47:50:17:27:20:23:7:13:2:15:10:13:3:24 chr12 65514266 . T C 1056.69 PASS AO=129;DP=146;FAO=132;FDP=146;FR=.;FRO=14;FSAF=59;FSAR=73;FSRF=14;FSRR=0;FWDB=0.0442496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.0596;QD=28.9505;RBI=0.054761;REFB=-0.154286;REVB=0.0322604;RO=17;SAF=56;SAR=73;SRF=17;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124585;STB=0.553022;TYPE=snp;VARB=0.0164285;OID=.;OPOS=65514266;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:146:146:17:14:129:132:73:56:17:0:73:59:14:0 chr12 65857555 . T A 327.53 PASS AO=82;DP=158;FAO=82;FDP=175;FR=.;FRO=93;FSAF=46;FSAR=36;FSRF=40;FSRR=53;FWDB=0.0112041;FXX=0.0056815;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.006;QD=7.48648;RBI=0.011435;REFB=-0.0172667;REVB=0.00228626;RO=75;SAF=46;SAR=36;SRF=40;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0243531;STB=0.569385;TYPE=snp;VARB=0.0220397;OID=.;OPOS=65857555;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:175:75:93:82:82:36:46:40:35:36:46:40:53 chr12 66358347 . C T 1844.41 PASS AO=193;DP=193;FAO=193;FDP=193;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0256572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.1144;QD=38.2262;RBI=0.0391427;REFB=0;REVB=0.0295612;RO=0;SAF=92;SAR=101;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.55348e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.02574e-05;OID=.;OPOS=66358347;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:87:193:193:0:0:193:193:101:92:0:0:101:92:0:0 chr12 66359752 . C A 2720.37 PASS AO=278;DP=278;FAO=284;FDP=284;FR=.;FRO=0;FSAF=131;FSAR=153;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0340573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.704;QD=38.3151;RBI=0.0369512;REFB=0;REVB=0.0143351;RO=0;SAF=129;SAR=149;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.41835e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.50862e-05;OID=.;OPOS=66359752;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:278:284:0:0:278:284:149:129:0:0:153:131:0:0 chr12 66546100 . A G 199.74 PASS AO=47;DP=98;FAO=47;FDP=97;FR=.;FRO=50;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=28;FSRR=22;FWDB=-0.0234247;FXX=0.010203;HRUN=4;LEN=1;MLLD=154.303;QD=8.23669;RBI=0.0328448;REFB=0.00604265;REVB=-0.0230231;RO=48;SAF=25;SAR=22;SRF=27;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0280437;STB=0.514557;TYPE=snp;VARB=-0.00773281;OID=.;OPOS=66546100;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:97:48:50:47:47:22:25:27:21:22:25:28:22 chr12 66605228 . A G 1426.3 PASS AO=148;DP=149;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0433681;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.607;QD=38.2901;RBI=0.0494166;REFB=0;REVB=-0.0236898;RO=1;SAF=60;SAR=88;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0078608;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.72167e-05;OID=.;OPOS=66605228;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:149:149:1:0:148:149:88:60:1:0:88:61:0:0 chr12 66725160 . C T 1216.66 PASS AO=131;DP=134;FAO=131;FDP=133;FR=.;FRO=2;FSAF=45;FSAR=86;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0150718;FXX=0.00746213;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.043;QD=36.5912;RBI=0.0349256;REFB=-0.0749977;REVB=-0.0315062;RO=1;SAF=45;SAR=86;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104439;STB=0.510868;TYPE=snp;VARB=0.000141914;OID=.;OPOS=66725160;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:134:133:1:2:131:131:86:45:1:0:86:45:2:0 chr12 66725202 . C T 1300.06 PASS AO=140;DP=142;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0076796;FXX=0.0140835;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.153;QD=37.1447;RBI=0.0162184;REFB=-0.132661;REVB=0.0142849;RO=0;SAF=42;SAR=98;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000239873;OID=.;OPOS=66725202;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:142:140:0:0:140:140:98:42:0:0:98:42:0:0 chr12 66731864 . C A 550.63 PASS AO=60;DP=62;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0333494;FXX=0.0161264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.36;QD=36.107;RBI=0.044469;REFB=-0.0887046;REVB=0.0294163;RO=0;SAF=33;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.7886e-08;STB=0.509088;TYPE=snp;VARB=0.000508027;OID=.;OPOS=66731864;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:62:61:0:1:60:60:27:33:0:0:27:33:0:1 chr12 66739539 . A G 1033.55 PASS AO=112;DP=114;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00422295;FXX=0.0175423;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.2232;QD=36.9126;RBI=0.0253994;REFB=-0.0982752;REVB=0.0250459;RO=1;SAF=45;SAR=67;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104336;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000177887;OID=.;OPOS=66739539;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:114:112:1:0:112:112:67:45:1:0:67:45:0:0 chr12 66786091 . G C 664.5 PASS AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00701486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.516;QD=38.5216;RBI=0.0384351;REFB=0;REVB=0.0377896;RO=0;SAF=50;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.45441e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000213522;OID=.;OPOS=66786091;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:69:69:0:0:69:69:19:50:0:0:19:50:0:0 chr12 66814487 . C A 1750.77 PASS AO=190;DP=198;FAO=192;FDP=198;FR=.;FRO=6;FSAF=91;FSAR=101;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.00275966;FXX=0.0099995;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.094;QD=35.3691;RBI=0.0484186;REFB=-0.051072;REVB=0.0483399;RO=3;SAF=91;SAR=99;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0142087;STB=0.504274;TYPE=snp;VARB=0.000695483;OID=.;OPOS=66814487;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:198:198:3:6:190:192:99:91:0:3:101:91:2:4 chr12 67706466 . G A 888.99 PASS AO=92;DP=92;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0211984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.7473;QD=37.8292;RBI=0.035611;REFB=0;REVB=0.0286142;RO=0;SAF=67;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.11795e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000231343;OID=.;OPOS=67706466;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:92:94:0:0:92:94:25:67:0:0:27:67:0:0 chr12 68045403 . G A 891.55 PASS AO=186;DP=333;FAO=187;FDP=334;FR=.;FRO=147;FSAF=62;FSAR=125;FSRF=53;FSRR=94;FWDB=-0.00147694;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.279;QD=10.6773;RBI=0.00147719;REFB=-0.0116218;REVB=-2.71348e-05;RO=147;SAF=61;SAR=125;SRF=53;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0296981;STB=0.514255;TYPE=snp;VARB=0.00950767;OID=.;OPOS=68045403;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:333:334:147:147:186:187:125:61:53:94:125:62:53:94 chr12 68052032 . TC T 72.94 PASS AO=17;DP=36;FAO=20;FDP=33;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=2;FWDB=0.222911;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=15.2098;QD=8.84134;RBI=0.222968;REFB=-0.0266237;REVB=0.00504948;RO=13;SAF=1;SAR=16;SRF=11;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.722417;STB=0.806444;TYPE=del;VARB=0.0554703;OID=.;OPOS=68052033;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:17:32:20:33:13:3:17:11:2:26:13:1:16:11:2 chr12 68052178 . G T 145.42 PASS AO=41;DP=101;FAO=41;FDP=100;FR=.;FRO=59;FSAF=27;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=44;FWDB=0.00383778;FXX=0.00990001;HRUN=5;LEN=1;MLLD=119.243;QD=5.8166;RBI=0.00903907;REFB=-0.00540589;REVB=-0.0081839;RO=55;SAF=27;SAR=14;SRF=13;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.4115;STB=0.726917;TYPE=snp;VARB=0.013917;OID=.;OPOS=68052178;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:100:55:59:41:41:14:27:13:42:14:27:15:44 chr12 68645323 . A G 191.85 PASS AO=49;DP=108;FAO=49;FDP=108;FR=.;FRO=59;FSAF=4;FSAR=45;FSRF=3;FSRR=56;FWDB=0.0450127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.748;QD=7.1057;RBI=0.0450367;REFB=-0.00341468;REVB=-0.00147012;RO=53;SAF=4;SAR=45;SRF=3;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0848516;STB=0.561869;TYPE=snp;VARB=0.00432798;OID=.;OPOS=68645323;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:53:59:49:49:45:4:3:50:45:4:3:56 chr12 68707287 . G A 221.1 PASS AO=61;DP=194;FAO=64;FDP=159;FR=.;FRO=95;FSAF=44;FSAR=20;FSRF=51;FSRR=44;FWDB=-0.0100738;FXX=0.163149;HRUN=4;LEN=1;MLLD=145.855;QD=5.56236;RBI=0.0633159;REFB=-0.0165731;REVB=-0.0625094;RO=75;SAF=42;SAR=19;SRF=39;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178993;STB=0.597085;TYPE=snp;VARB=0.0233146;OID=.;OPOS=68707287;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:159:75:95:61:64:19:42:39:36:20:44:51:44 chr12 68708761 . C T 1520.76 PASS AO=159;DP=160;FAO=160;FDP=160;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0356907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.739;QD=38.0189;RBI=0.0358252;REFB=0;REVB=0.00310218;RO=0;SAF=103;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.65863e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000131197;OID=.;OPOS=68708761;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:160:160:0:0:159:160:56:103:0:0:56:104:0:0 chr12 68720335 . C T 177.48 PASS AO=40;DP=83;FAO=41;FDP=82;FR=.;FRO=41;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=0.0134866;FXX=0.03529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.8272;QD=8.65759;RBI=0.0223089;REFB=-0.0106953;REVB=-0.0177707;RO=41;SAF=25;SAR=15;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106109;STB=0.563436;TYPE=snp;VARB=0.0105698;OID=.;OPOS=68720335;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:82:41:41:40:41:15:25:21:20:15:26:21:20 chr12 68720627 . G A 2600.54 PASS AO=267;DP=268;FAO=272;FDP=272;FR=.;FRO=0;FSAF=120;FSAR=152;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151767;FXX=0.00366287;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.344;QD=38.2432;RBI=0.0160732;REFB=0;REVB=-0.00529279;RO=0;SAF=117;SAR=150;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.86271e-06;OID=.;OPOS=68720627;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:268:272:0:0:267:272:150:117:0:0:152:120:0:0 chr12 68724951 . G T 2766.22 PASS AO=284;DP=284;FAO=287;FDP=287;FR=.;FRO=0;FSAF=108;FSAR=179;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0321591;FXX=0.0103445;HRUN=2;LEN=1;MLLD=221.883;QD=38.5535;RBI=0.0356509;REFB=0;REVB=0.0153876;RO=0;SAF=108;SAR=176;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.81606e-06;OID=.;OPOS=68724951;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:284:287:0:0:284:287:176:108:0:0:179:108:0:0 chr12 69186904 . G A 328.47 PASS AO=77;DP=154;FAO=77;FDP=155;FR=.;FRO=78;FSAF=35;FSAR=42;FSRF=24;FSRR=54;FWDB=0.0138505;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.1691;QD=8.47655;RBI=0.0381632;REFB=-0.0219529;REVB=0.0355612;RO=76;SAF=35;SAR=42;SRF=24;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12825;STB=0.575521;TYPE=snp;VARB=0.0186538;OID=.;OPOS=69186904;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:155:76:78:77:77:42:35:24:52:42:35:24:54 chr12 69187427 . T A 1003.18 PASS AO=104;DP=111;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189961;FXX=0.0535666;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.193;QD=37.8557;RBI=0.0200739;REFB=0;REVB=-0.00648918;RO=0;SAF=40;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000876845;OID=.;OPOS=69187427;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:111:106:0:0:104:106:64:40:0:0:66:40:0:0 chr12 69187585 . G GA 1273.09 PASS AO=153;DP=176;FAO=166;FDP=166;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0280702;FXX=0.0726216;HRUN=0;LEN=1;MLLD=80.9086;QD=30.677;RBI=0.0656455;REFB=0;REVB=0.0593413;RO=6;SAF=67;SAR=86;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.004519;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=9.825e-05;OID=.;OPOS=69187586;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:153:176:166:166:0:69:97:0:0:99:6:67:86:3:3 chr12 69252715 . A G 739.09 PASS AO=156;DP=281;FAO=155;FDP=280;FR=.;FRO=125;FSAF=87;FSAR=68;FSRF=70;FSRR=55;FWDB=0.0220188;FXX=0.00355859;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.2243;QD=10.5585;RBI=0.0226543;REFB=-0.0406858;REVB=0.00532797;RO=124;SAF=87;SAR=69;SRF=70;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00564036;STB=0.500585;TYPE=snp;VARB=0.0450107;OID=.;OPOS=69252715;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:281:280:124:125:156:155:69:87:70:54:68:87:70:55 chr12 69265578 . A G 366.17 PASS AO=87;DP=177;FAO=87;FDP=177;FR=.;FRO=90;FSAF=50;FSAR=37;FSRF=50;FSRR=40;FWDB=-0.00450978;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.241;QD=8.27507;RBI=0.0136947;REFB=-0.0201937;REVB=-0.0129308;RO=90;SAF=50;SAR=37;SRF=50;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0180263;STB=0.509932;TYPE=snp;VARB=0.0174983;OID=.;OPOS=69265578;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:177:90:90:87:87:37:50:50:40:37:50:50:40 chr12 69645864 . A G 524.9 PASS AO=34;DP=54;FAO=55;FDP=56;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=33;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0461388;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.118;QD=37.4931;RBI=0.0497817;REFB=0;REVB=0.0186931;RO=0;SAF=17;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000212372;OID=.;OPOS=69645864;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:50:56:0:0:34:55:17:17:0:0:22:33:0:0 chr12 69665309 . T C 263.08 PASS AO=78;DP=178;FAO=75;FDP=176;FR=.;FRO=101;FSAF=30;FSAR=45;FSRF=35;FSRR=66;FWDB=-0.0200231;FXX=0.0112353;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.0885;QD=5.97915;RBI=0.104026;REFB=-0.00153409;REVB=-0.102081;RO=97;SAF=33;SAR=45;SRF=33;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0860289;STB=0.532366;TYPE=snp;VARB=0.00504776;OID=.;OPOS=69665309;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:176:97:101:78:75:45:33:33:64:45:30:35:66 chr12 69742188 . C T 635.57 PASS AO=147;DP=290;FAO=147;FDP=290;FR=.;FRO=143;FSAF=101;FSAR=46;FSRF=89;FSRR=54;FWDB=-0.00159663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3114;QD=8.76653;RBI=0.00201293;REFB=-0.0158853;REVB=-0.00122584;RO=140;SAF=101;SAR=46;SRF=88;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0590722;STB=0.536088;TYPE=snp;VARB=0.0195554;OID=.;OPOS=69742188;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:290:290:140:143:147:147:46:101:88:52:46:101:89:54 chr12 69783937 . T C 140.45 PASS AO=37;DP=85;FAO=37;FDP=85;FR=.;FRO=48;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=0.00284666;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.677;QD=6.60958;RBI=0.00289293;REFB=-0.00673411;REVB=-0.00051531;RO=48;SAF=21;SAR=16;SRF=20;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150702;STB=0.584765;TYPE=snp;VARB=0.00942031;OID=.;OPOS=69783937;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:48:48:37:37:16:21:20:28:16:21:20:28 chr12 69794856 . G A 210.34 PASS AO=58;DP=132;FAO=57;FDP=131;FR=.;FRO=74;FSAF=38;FSAR=19;FSRF=32;FSRR=42;FWDB=0.0562344;FXX=0.00757518;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9575;QD=6.42256;RBI=0.0588423;REFB=-0.0167122;REVB=0.0173238;RO=72;SAF=39;SAR=19;SRF=29;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.271578;STB=0.635368;TYPE=snp;VARB=0.0424645;OID=.;OPOS=69794856;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:131:72:74:58:57:19:39:29:43:19:38:32:42 chr12 69967862 . G A 2958.9 PASS AO=288;DP=289;FAO=309;FDP=309;FR=.;FRO=0;FSAF=142;FSAR=167;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00101183;FXX=0.0032257;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.441;QD=38.303;RBI=0.0497145;REFB=-0.028874;REVB=-0.0497042;RO=0;SAF=141;SAR=147;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.63298e-05;OID=.;OPOS=69967862;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:289:309:0:0:288:309:147:141:0:0:167:142:0:0 chr12 69971474 . G A 374.08 PASS AO=39;DP=43;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=9.40283e-05;FXX=0.0697512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.2892;QD=37.4081;RBI=0.0907737;REFB=0;REVB=0.0907737;RO=0;SAF=27;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00410065;OID=.;OPOS=69971474;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:43:40:0:0:39:40:12:27:0:0:13:27:0:0 chr12 69971500 . C T 519.8 PASS AO=53;DP=53;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.142;QD=37.8036;RBI=0.035609;REFB=0;REVB=0.0334296;RO=0;SAF=30;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.72004e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.25356e-05;OID=.;OPOS=69971500;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:53:55:0:0:53:55:23:30:0:0:23:32:0:0 chr12 69971713 . C T 2172.32 PASS AO=233;DP=238;FAO=233;FDP=237;FR=.;FRO=4;FSAF=118;FSAR=115;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0327574;FXX=0.0042015;HRUN=3;LEN=1;MLLD=237.246;QD=36.6636;RBI=0.0372169;REFB=-0.0720312;REVB=0.0176648;RO=3;SAF=118;SAR=115;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119598;STB=0.504111;TYPE=snp;VARB=0.000164887;OID=.;OPOS=69971713;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:238:237:3:4:233:233:115:118:3:0:115:118:3:1 chr12 69972381 . G A 1251.55 PASS AO=130;DP=131;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135233;FXX=0.00751823;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.794;QD=37.9259;RBI=0.0311654;REFB=0;REVB=0.0280785;RO=0;SAF=45;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00158541;OID=.;OPOS=69972381;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:131:132:0:0:130:132:85:45:0:0:87:45:0:0 chr12 69973192 . CA C 955.16 PASS AO=122;DP=134;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0303721;FXX=0.0387567;HRUN=3;LEN=1;MLLD=22.9422;QD=30.8114;RBI=0.0397272;REFB=0;REVB=-0.0256084;RO=0;SAF=44;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.06142e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.000579307;OID=.;OPOS=69973193;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:122:129:124:124:0:44:80:0:0:85:0:44:78:0:0 chr12 69993775 . C G 727.91 PASS AO=138;DP=252;FAO=150;FDP=264;FR=.;FRO=114;FSAF=44;FSAR=106;FSRF=44;FSRR=70;FWDB=-0.0237572;FXX=0.00751851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.782;QD=11.029;RBI=0.0252693;REFB=-0.0144643;REVB=0.00861018;RO=110;SAF=44;SAR=94;SRF=44;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0738381;STB=0.546385;TYPE=snp;VARB=0.0116472;OID=.;OPOS=69993775;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:252:264:110:114:138:150:94:44:44:66:106:44:44:70 chr12 70064295 . C T 237.48 PASS AO=68;DP=166;FAO=68;FDP=163;FR=.;FRO=95;FSAF=33;FSAR=35;FSRF=51;FSRR=44;FWDB=0.00253565;FXX=0.0180712;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.384;QD=5.8278;RBI=0.0321373;REFB=-0.0171896;REVB=-0.0320371;RO=90;SAF=33;SAR=35;SRF=50;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0715439;STB=0.530007;TYPE=snp;VARB=0.0225517;OID=.;OPOS=70064295;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:163:90:95:68:68:35:33:50:40:35:33:51:44 chr12 70091432 . T C 1409.66 PASS AO=147;DP=147;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00602969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.565;QD=38.3582;RBI=0.140238;REFB=0;REVB=0.140109;RO=0;SAF=87;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000143107;OID=.;OPOS=70091432;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:147:147:0:0:147:147:60:87:0:0:60:87:0:0 chr12 70209475 . A C 1696.34 PASS AO=72;DP=196;FAO=174;FDP=181;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=61;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0512321;FXX=0.0621729;HRUN=14;LEN=1;MLLD=255.055;QD=37.4882;RBI=0.0512432;REFB=-0.0400664;REVB=-0.00106493;RO=1;SAF=23;SAR=49;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00955569;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00397545;OID=.;OPOS=70209475;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:123:181:1:0:72:174:49:23:0:1:113:61:0:0 chr12 70274066 . A G 769.9 PASS AO=206;DP=429;FAO=192;FDP=400;FR=.;FRO=208;FSAF=77;FSAR=115;FSRF=90;FSRR=118;FWDB=-0.0223808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.781;QD=7.699;RBI=0.0259253;REFB=-0.0160462;REVB=0.0130851;RO=221;SAF=87;SAR=119;SRF=100;SRR=121;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0289748;STB=0.517012;TYPE=snp;VARB=0.0171163;OID=.;OPOS=70274066;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:429:400:221:208:206:192:119:87:100:121:115:77:90:118 chr12 70330087 . A G 1605.19 PASS AO=164;DP=165;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0385584;FXX=0.011764;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.865;QD=38.2188;RBI=0.0405268;REFB=-0.0151062;REVB=0.0124768;RO=1;SAF=62;SAR=102;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00761321;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.79137e-05;OID=.;OPOS=70330087;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:165:168:1:0:164:168:102:62:1:0:104:64:0:0 chr12 70351680 . AGGGC AGGC,AGGGA 164.99 PASS AO=14,16;DP=49;FAO=17,16;FDP=48;FR=.;FRO=15;FSAF=12,9;FSAR=5,7;FSRF=1;FSRR=14;FWDB=0.136704,-0.0019062;FXX=0;HRUN=3,1;LEN=1,1;MLLD=15.4821,187.4;QD=13.7495;RBI=0.162125,0.00192287;REFB=-0.104487,-0.00401872;REVB=-0.0871584,0.000252597;RO=17;SAF=9,9;SAR=5,7;SRF=3;SRR=14;SSEN=0.40293,0;SSEP=0.227976,0;SSSB=0.421714,0.34105;STB=0.777864,0.729489;TYPE=del,snp;VARB=0.104531,0.0146601;OID=.,.;OPOS=70351681,70351684;OREF=G,C;OALT=-,A;OMAPALT=AGGC,AGGGA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:14,16:48:17,16:48:15:12,9:5,7:1:14:70:17:9,9:5,7:3:14 chr12 70912510 . C T 1939.66 PASS AO=203;DP=204;FAO=204;FDP=204;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114692;FXX=0.00970827;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.147;QD=38.0326;RBI=0.0116954;REFB=-0.0286785;REVB=0.00228895;RO=1;SAF=86;SAR=117;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00550638;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.16195e-05;OID=.;OPOS=70912510;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:204:204:1:0:203:204:117:86:1:0:118:86:0:0 chr12 70928616 . G A 276.41 PASS AO=71;DP=155;FAO=71;FDP=155;FR=.;FRO=84;FSAF=24;FSAR=47;FSRF=46;FSRR=38;FWDB=0.00120045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.651;QD=7.13327;RBI=0.0140356;REFB=-0.0203114;REVB=0.0139842;RO=83;SAF=24;SAR=47;SRF=46;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215825;STB=0.617227;TYPE=snp;VARB=0.0213852;OID=.;OPOS=70928616;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:83:84:71:71:47:24:46:37:47:24:46:38 chr12 70928724 . A G 1045.07 PASS AO=107;DP=110;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0116602;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.979;QD=38.0025;RBI=0.0168627;REFB=0;REVB=-0.0121816;RO=0;SAF=41;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.87293e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.42004e-07;OID=.;OPOS=70928724;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:110:110:0:0:107:110:66:41:0:0:66:44:0:0 chr12 70949085 . G A 288.07 PASS AO=50;DP=79;FAO=50;FDP=78;FR=.;FRO=28;FSAF=19;FSAR=31;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=-0.0111412;FXX=0.0126566;HRUN=6;LEN=1;MLLD=190.427;QD=14.7728;RBI=0.0111483;REFB=-0.0223592;REVB=0.00039755;RO=26;SAF=20;SAR=30;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0151023;STB=0.518331;TYPE=snp;VARB=0.0109745;OID=.;OPOS=70949085;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:79:78:26:28:50:50:30:20:11:15:31:19:12:16 chr12 70989977 . T C 298.39 PASS AO=73;DP=153;FAO=73;FDP=153;FR=.;FRO=80;FSAF=38;FSAR=35;FSRF=44;FSRR=36;FWDB=-0.0232901;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=206.469;QD=7.80104;RBI=0.0306443;REFB=-0.0239291;REVB=-0.019916;RO=79;SAF=38;SAR=35;SRF=44;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0343502;STB=0.515441;TYPE=snp;VARB=0.0230815;OID=.;OPOS=70989977;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:153:79:80:73:73:35:38:44:35:35:38:44:36 chr12 71002865 . T A 427.55 PASS AO=110;DP=239;FAO=110;FDP=239;FR=.;FRO=129;FSAF=51;FSAR=59;FSRF=66;FSRR=63;FWDB=0.00321111;FXX=0.00416649;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.967;QD=7.15563;RBI=0.00940341;REFB=-0.000795952;REVB=0.00883815;RO=126;SAF=51;SAR=59;SRF=66;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0581814;STB=0.525938;TYPE=snp;VARB=0.001096;OID=.;OPOS=71002865;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:239:239:126:129:110:110:59:51:66:60:59:51:66:63 chr12 71002893 . C T 509.8 PASS AO=135;DP=302;FAO=136;FDP=302;FR=.;FRO=166;FSAF=63;FSAR=73;FSRF=94;FSRR=72;FWDB=-0.000907519;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.9961;QD=6.75229;RBI=0.00240816;REFB=0.00618449;REVB=-0.00223061;RO=166;SAF=62;SAR=73;SRF=95;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11224;STB=0.556459;TYPE=snp;VARB=-0.00849629;OID=.;OPOS=71002893;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:302:302:166:166:135:136:73:62:95:71:73:63:94:72 chr12 71139664 . T C 397.22 PASS AO=72;DP=181;FAO=82;FDP=179;FR=.,HEALED;FRO=81;FSAF=50;FSAR=32;FSRF=40;FSRR=41;FWDB=0.00806372;FXX=0.0164826;HRUN=3;LEN=1;MLLD=142.921;QD=8.87649;RBI=0.0235542;REFB=-0.0844678;REVB=-0.0221309;RO=44;SAF=48;SAR=24;SRF=39;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18586;STB=0.558944;TYPE=snp;VARB=0.0240607;OID=.;OPOS=71139664;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:179:44:81:72:82:24:48:39:5:32:50:40:41 chr12 71155380 . A G 84.89 PASS AO=34;DP=107;FAO=34;FDP=109;FR=.;FRO=75;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=35;FSRR=40;FWDB=0.00830035;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=119.952;QD=3.11537;RBI=0.0256466;REFB=-0.00766851;REVB=-0.0242663;RO=73;SAF=13;SAR=21;SRF=35;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116118;STB=0.559653;TYPE=snp;VARB=0.0301993;OID=.;OPOS=71155380;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:107:109:73:75:34:34:21:13:35:38:21:13:35:40 chr12 71314102 . C T 423.89 PASS AO=92;DP=181;FAO=94;FDP=179;FR=.;FRO=85;FSAF=52;FSAR=42;FSRF=40;FSRR=45;FWDB=0.00483688;FXX=0.0218567;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.735;QD=9.47233;RBI=0.0440453;REFB=0.00599246;REVB=0.0437789;RO=86;SAF=51;SAR=41;SRF=41;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0686034;STB=0.539334;TYPE=snp;VARB=-0.00355316;OID=.;OPOS=71314102;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:179:86:85:92:94:41:51:41:45:42:52:40:45 chr12 71526593 . G A 296.34 PASS AO=75;DP=162;FAO=75;FDP=162;FR=.;FRO=87;FSAF=35;FSAR=40;FSRF=39;FSRR=48;FWDB=-0.0297079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.5567;QD=7.31699;RBI=0.0305432;REFB=-0.0219303;REVB=0.00709431;RO=87;SAF=35;SAR=40;SRF=39;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0179166;STB=0.509931;TYPE=snp;VARB=0.0251283;OID=.;OPOS=71526593;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:162:87:87:75:75:40:35:39:48:40:35:39:48 chr12 71960208 . G A 1501.49 PASS AO=147;DP=153;FAO=158;FDP=158;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142249;FXX=0.0124992;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.12;QD=38.0124;RBI=0.0257336;REFB=0;REVB=-0.0214447;RO=0;SAF=81;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94291e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000207014;OID=.;OPOS=71960208;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:153:158:0:0:147:158:66:81:0:0:69:89:0:0 chr12 72013832 . A G 868.51 PASS AO=75;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=42;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0083805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.303;QD=37.7613;RBI=0.0844515;REFB=0;REVB=0.0840347;RO=0;SAF=42;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000127485;OID=.;OPOS=72013832;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:91:92:0:0:75:92:33:42:0:0:50:42:0:0 chr12 72033252 . TAGTC T 2678.09 PASS AO=275;DP=337;FAO=279;FDP=279;FR=.;FRO=0;FSAF=136;FSAR=143;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-1.14543e-05;FXX=0.0574305;HRUN=1;LEN=4;MLLD=243.893;QD=38.3956;RBI=0.00854797;REFB=0;REVB=0.00854796;RO=0;SAF=134;SAR=141;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=4.9832e-06;OID=.;OPOS=72033253;OREF=AGTC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:275:291:279:279:0:136:143:0:0:99:0:134:141:0:0 chr12 72372862 . A G 1025.84 PASS AO=112;DP=112;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0174744;FXX=0.0178555;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.671;QD=37.3031;RBI=0.0175612;REFB=0;REVB=0.00174377;RO=0;SAF=35;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.78464e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000394788;OID=.;OPOS=72372862;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:112:110:0:0:112:110:77:35:0:0:77:33:0:0 chr12 72416235 . A T 2095.99 PASS AO=215;DP=215;FAO=219;FDP=219;FR=.;FRO=0;FSAF=107;FSAR=112;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000121648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.964;QD=38.2828;RBI=0.00288943;REFB=0;REVB=-0.00288686;RO=0;SAF=103;SAR=112;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.67211e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000176316;OID=.;OPOS=72416235;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:215:219:0:0:215:219:112:103:0:0:112:107:0:0 chr12 73058186 . G A 3214.35 PASS AO=335;DP=335;FAO=335;FDP=335;FR=.;FRO=0;FSAF=144;FSAR=191;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0109301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.739;QD=38.3803;RBI=0.0319747;REFB=0;REVB=0.0300485;RO=0;SAF=144;SAR=191;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.09203e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.83499e-06;OID=.;OPOS=73058186;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:335:335:0:0:335:335:191:144:0:0:191:144:0:0 chr12 74932159 . G C 1153.41 PASS AO=115;DP=115;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0111675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.747;QD=38.1293;RBI=0.0456345;REFB=0;REVB=0.044247;RO=0;SAF=51;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.60451e-05;OID=.;OPOS=74932159;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:115:121:0:0:115:121:64:51:0:0:65:56:0:0 chr12 74932565 . T C 989.01 PASS AO=103;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0337906;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.2804;QD=38.039;RBI=0.034873;REFB=0;REVB=0.0086209;RO=0;SAF=41;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000124355;OID=.;OPOS=74932565;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:104:104:0:0:103:104:62:41:0:0:62:42:0:0 chr12 74933166 . G A 1503.55 PASS AO=158;DP=159;FAO=158;FDP=158;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147061;FXX=0.00628891;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.478;QD=38.0645;RBI=0.0173347;REFB=0.0450455;REVB=0.00917738;RO=1;SAF=64;SAR=94;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00503496;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.18416e-05;OID=.;OPOS=74933166;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:159:158:1:0:158:158:94:64:0:1:94:64:0:0 chr12 74934634 . G A 995.38 PASS AO=106;DP=106;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000966529;FXX=0.0188661;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.087;QD=38.2837;RBI=0.0247764;REFB=0;REVB=0.0247576;RO=0;SAF=59;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.87695e-05;OID=.;OPOS=74934634;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:106:104:0:0:106:104:47:59:0:0:45:59:0:0 chr12 74934637 . T C 873.46 PASS AO=94;DP=96;FAO=94;FDP=96;FR=.;FRO=2;FSAF=58;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00581977;FXX=0.0303;HRUN=4;LEN=1;MLLD=166.131;QD=36.3939;RBI=0.0181738;REFB=-0.135439;REVB=-0.0172168;RO=2;SAF=58;SAR=36;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00488306;STB=0.502576;TYPE=snp;VARB=-3.52788e-05;OID=.;OPOS=74934637;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:96:96:2:2:94:94:36:58:1:1:36:58:1:1 chr12 74934743 . G T 253.7 PASS AO=60;DP=141;FAO=65;FDP=142;FR=.;FRO=77;FSAF=36;FSAR=29;FSRF=51;FSRR=26;FWDB=-0.00900413;FXX=0.0138879;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.446;QD=7.14655;RBI=0.0275013;REFB=0.00327118;REVB=-0.0259855;RO=69;SAF=32;SAR=28;SRF=47;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144989;STB=0.560275;TYPE=snp;VARB=-0.00382558;OID=.;OPOS=74934743;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:142:69:77:60:65:28:32:47:22:29:36:51:26 chr12 75824460 . T C 382.87 PASS AO=103;DP=235;FAO=104;FDP=235;FR=.;FRO=131;FSAF=55;FSAR=49;FSRF=75;FSRR=56;FWDB=-0.0141261;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=124.359;QD=6.51684;RBI=0.014956;REFB=-0.025962;REVB=0.00491278;RO=129;SAF=54;SAR=49;SRF=74;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.049726;STB=0.524491;TYPE=snp;VARB=0.0286213;OID=.;OPOS=75824460;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:235:235:129:131:103:104:49:54:74:55:49:55:75:56 chr12 75824893 . G A 89.63 PASS AO=17;DP=31;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=0;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=14;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.4854;QD=11.5655;RBI=0.00769313;REFB=-0.0207078;REVB=0.00769313;RO=14;SAF=0;SAR=17;SRF=0;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0151254;OID=.;OPOS=75824893;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:31:31:14:14:17:17:17:0:0:14:17:0:0:14 chr12 75893381 . CAA C 139.89 PASS AO=71;DP=203;FAO=73;FDP=186;FR=.;FRO=113;FSAF=27;FSAR=46;FSRF=51;FSRR=62;FWDB=-0.014528;FXX=0.0362676;HRUN=3;LEN=2;MLLD=38.3447;QD=3.00837;RBI=0.0425685;REFB=-0.0214183;REVB=-0.0400126;RO=107;SAF=27;SAR=44;SRF=50;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0958876;STB=0.551646;TYPE=del;VARB=0.0319909;OID=.;OPOS=75893382;OREF=AA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:71:185:73:186:113:27:46:51:62:99:107:27:44:50:57 chr12 75893388 . T A 256.12 PASS AO=78;DP=198;FAO=79;FDP=200;FR=.;FRO=121;FSAF=29;FSAR=50;FSRF=54;FSRR=67;FWDB=0.0135008;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.9072;QD=5.12241;RBI=0.0141575;REFB=-0.0272399;REVB=-0.00426186;RO=120;SAF=29;SAR=49;SRF=54;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0876785;STB=0.550166;TYPE=snp;VARB=0.0313499;OID=.;OPOS=75893388;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:200:120:121:78:79:49:29:54:66:50:29:54:67 chr12 75893399 . T G 202.81 PASS AO=66;DP=172;FAO=67;FDP=181;FR=.;FRO=114;FSAF=28;FSAR=39;FSRF=48;FSRR=66;FWDB=-0.0192928;FXX=0.0216205;HRUN=3;LEN=1;MLLD=129.038;QD=4.48196;RBI=0.0216822;REFB=-0.0251007;REVB=0.00989479;RO=104;SAF=28;SAR=38;SRF=39;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0551949;STB=0.502032;TYPE=snp;VARB=0.0302474;OID=.;OPOS=75893399;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:181:104:114:66:67:38:28:39:65:39:28:48:66 chr12 75893404 . C A 269.25 PASS AO=78;DP=189;FAO=78;FDP=188;FR=.;FRO=110;FSAF=34;FSAR=44;FSRF=44;FSRR=66;FWDB=-0.0104584;FXX=0.00529073;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.543;QD=5.72866;RBI=0.0104586;REFB=-0.00785848;REVB=-6.06135e-05;RO=110;SAF=34;SAR=44;SRF=44;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0383719;STB=0.521467;TYPE=snp;VARB=0.0128358;OID=.;OPOS=75893404;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:188:110:110:78:78:44:34:44:66:44:34:44:66 chr12 75900382 . C T 112.43 PASS AO=38;DP=103;FAO=37;FDP=102;FR=.;FRO=65;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=39;FSRR=26;FWDB=-0.0256562;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.107;QD=4.40906;RBI=0.0256991;REFB=-0.0129385;REVB=-0.00148445;RO=64;SAF=21;SAR=17;SRF=38;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0459342;STB=0.538358;TYPE=snp;VARB=0.0172659;OID=.;OPOS=75900382;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:102:64:65:38:37:17:21:38:26:17:20:39:26 chr12 75900588 . A G 376.71 PASS AO=89;DP=182;FAO=89;FDP=181;FR=.;FRO=92;FSAF=45;FSAR=44;FSRF=46;FSRR=46;FWDB=-0.00025345;FXX=0.0054942;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.326;QD=8.32508;RBI=0.00855561;REFB=-0.0109047;REVB=-0.00855185;RO=92;SAF=45;SAR=44;SRF=46;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0051845;STB=0.502855;TYPE=snp;VARB=0.0103653;OID=.;OPOS=75900588;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:181:92:92:89:89:44:45:46:46:44:45:46:46 chr12 76351726 . C G 65.57 PASS AO=33;DP=123;FAO=33;FDP=123;FR=.;FRO=90;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=55;FSRR=35;FWDB=0.0447154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.3465;QD=2.13247;RBI=0.046874;REFB=-0.00683692;REVB=0.0140608;RO=90;SAF=19;SAR=14;SRF=55;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0447827;STB=0.526674;TYPE=snp;VARB=0.0201622;OID=.;OPOS=76351726;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:123:123:90:90:33:33:14:19:55:35:14:19:55:35 chr12 76422999 . T C 278.52 PASS AO=58;DP=128;FAO=67;FDP=137;FR=.;FRO=70;FSAF=28;FSAR=39;FSRF=28;FSRR=42;FWDB=0.0197785;FXX=0.0486077;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.939;QD=8.13201;RBI=0.0224342;REFB=-0.0102259;REVB=-0.0105877;RO=68;SAF=19;SAR=39;SRF=28;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0892578;STB=0.509431;TYPE=snp;VARB=0.0119497;OID=.;OPOS=76422999;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:137:68:70:58:67:39:19:28:40:39:28:28:42 chr12 76424937 . TTGC T 26.26 PASS AO=7;DP=18;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=-0.00864862;FXX=0.0475964;HRUN=2;LEN=3;MLLD=137.39;QD=5.25139;RBI=0.0485948;REFB=-0.0673783;REVB=0.047819;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.78504;TYPE=del;VARB=0.0658047;OID=.;OPOS=76424938;OREF=TGC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:7:10:8:20:12:2:6:9:3:26:0:3:4:0:0 chr12 76426877 . C T 37.85 PASS AO=10;DP=27;FAO=10;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.00192921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.763;QD=5.6076;RBI=0.0484377;REFB=-0.00624196;REVB=-0.0483992;RO=17;SAF=9;SAR=1;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.512113;STB=0.81741;TYPE=snp;VARB=0.00654554;OID=.;OPOS=76426877;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:27:27:17:17:10:10:1:9:9:8:1:9:9:8 chr12 76427547 . C CTTAAT 73.03 PASS AO=23;DP=84;FAO=26;FDP=78;FR=.;FRO=52;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=29;FWDB=-0.010165;FXX=0.0602337;HRUN=2;LEN=5;MLLD=258.891;QD=3.74532;RBI=0.0102466;REFB=-0.007456;REVB=0.0012908;RO=54;SAF=15;SAR=8;SRF=21;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.306141;STB=0.642037;TYPE=ins;VARB=0.0126943;OID=.;OPOS=76427548;OREF=-;OALT=TTAAT;OMAPALT=CTTAAT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:23:84:26:78:52:17:9:23:29:73:54:15:8:21:33 chr12 76449900 . T C 196.54 PASS AO=49;DP=130;FAO=57;FDP=139;FR=.;FRO=82;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=38;FSRR=44;FWDB=0.0247577;FXX=0.00714235;HRUN=6;LEN=1;MLLD=42.3612;QD=5.65584;RBI=0.0532208;REFB=-0.0373327;REVB=-0.0471117;RO=80;SAF=20;SAR=29;SRF=38;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0742547;STB=0.516417;TYPE=snp;VARB=0.054555;OID=.;OPOS=76449900;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:139:80:82:49:57:29:20:38:42:29:28:38:44 chr12 76453966 . G A 254.85 PASS AO=73;DP=177;FAO=73;FDP=175;FR=.;FRO=102;FSAF=45;FSAR=28;FSRF=64;FSRR=38;FWDB=0.012504;FXX=0.0112988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.0204;QD=5.82522;RBI=0.0203604;REFB=-0.0104929;REVB=-0.0160685;RO=101;SAF=45;SAR=28;SRF=64;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0189901;STB=0.506806;TYPE=snp;VARB=0.012703;OID=.;OPOS=76453966;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:175:101:102:73:73:28:45:64:37:28:45:64:38 chr12 76709606 . T C 1120.96 PASS AO=114;DP=115;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0168723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.612;QD=38.3236;RBI=0.0264694;REFB=0;REVB=0.020395;RO=0;SAF=65;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.29464e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.13342e-06;OID=.;OPOS=76709606;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:115:117:0:0:114:117:49:65:0:0:51:66:0:0 chr12 76709610 . T C 1065.01 PASS AO=110;DP=115;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00281981;FXX=0.0967664;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.084;QD=38.036;RBI=0.00729992;REFB=0;REVB=0.00673332;RO=0;SAF=62;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.52354e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00246216;OID=.;OPOS=76709610;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:115:112:0:0:110:112:48:62:0:0:48:64:0:0 chr12 76747081 . GTTT GTT,GTTG 286.67 PASS AO=12,13;DP=85;FAO=29,44;FDP=80;FR=.;FRO=7;FSAF=8,26;FSAR=21,18;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.471645,0.00835817;FXX=0.0588166;HRUN=16,16;LEN=1,1;MLLD=3.19923,168.263;QD=14.3335;RBI=0.494827,0.0421186;REFB=-0.159022,-0.0351677;REVB=-0.149683,-0.0412809;RO=6;SAF=3,6;SAR=9,7;SRF=2;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0629385,0.0729992;STB=0.597303,0.517617;TYPE=del,snp;VARB=0.32539,0.00218639;OID=.,.;OPOS=76747082,76747084;OREF=T,T;OALT=-,G;OMAPALT=GTT,GTTG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:12,13:48:29,44:80:7:8,26:21,18:5:2:52:6:3,6:9,7:2:4 chr12 77235768 . A G 368.65 PASS AO=134;DP=376;FAO=134;FDP=375;FR=.;FRO=241;FSAF=36;FSAR=98;FSRF=98;FSRR=143;FWDB=-0.0320416;FXX=0.0026595;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.032;QD=3.93221;RBI=0.0371639;REFB=-0.00273771;REVB=0.018828;RO=238;SAF=36;SAR=98;SRF=97;SRR=141;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179583;STB=0.602148;TYPE=snp;VARB=0.0057588;OID=.;OPOS=77235768;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:376:375:238:241:134:134:98:36:97:141:98:36:98:143 chr12 77256681 . T G 159.12 PASS AO=39;DP=84;FAO=39;FDP=84;FR=.;FRO=45;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=14;FSRR=31;FWDB=-0.0261192;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7227;QD=7.57709;RBI=0.0405977;REFB=-0.0125728;REVB=0.0310799;RO=45;SAF=14;SAR=25;SRF=14;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0507018;STB=0.528288;TYPE=snp;VARB=0.0174871;OID=.;OPOS=77256681;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:45:45:39:39:25:14:14:31:25:14:14:31 chr12 77417509 . G T 422.53 PASS AO=74;DP=191;FAO=77;FDP=193;FR=.,HEALED;FRO=85;FSAF=31;FSAR=46;FSRF=58;FSRR=27;FWDB=-0.0580615;FXX=0.00515437;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.358;QD=8.75709;RBI=0.0581661;REFB=-0.00311516;REVB=-0.0034868;RO=76;SAF=28;SAR=46;SRF=54;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.299186;STB=0.643978;TYPE=snp;VARB=0.00765732;OID=.;OPOS=77417509;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:191:193:76:85:74:77:46:28:54:22:46:31:58:27 chr12 77449790 . A G 3397.19 PASS AO=358;DP=362;FAO=359;FDP=359;FR=.;FRO=0;FSAF=187;FSAR=172;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0052703;FXX=0.011019;HRUN=3;LEN=1;MLLD=252.984;QD=37.8517;RBI=0.0114453;REFB=0.0109905;REVB=-0.0101596;RO=0;SAF=187;SAR=171;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.108e-06;OID=.;OPOS=77449790;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:362:359:0:0:358:359:171:187:0:0:172:187:0:0 chr12 78225374 . A G 1437.92 PASS AO=148;DP=148;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0297719;FXX=0.00666622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.2542;QD=38.6019;RBI=0.0334201;REFB=0;REVB=-0.0151834;RO=0;SAF=69;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.86736e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.14654e-05;OID=.;OPOS=78225374;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:148:149:0:0:148:149:79:69:0:0:80:69:0:0 chr12 78334194 . A G 343.04 PASS AO=103;DP=258;FAO=104;FDP=258;FR=.;FRO=154;FSAF=37;FSAR=67;FSRF=69;FSRR=85;FWDB=0.0183693;FXX=0.00769201;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.493;QD=5.31846;RBI=0.0194391;REFB=-0.0201506;REVB=0.0063598;RO=154;SAF=37;SAR=66;SRF=68;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0925792;STB=0.558059;TYPE=snp;VARB=0.0305349;OID=.;OPOS=78334194;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:258:258:154:154:103:104:66:37:68:86:67:37:69:85 chr12 78400884 . G A 241.5 PASS AO=52;DP=99;FAO=52;FDP=99;FR=.;FRO=47;FSAF=17;FSAR=35;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=-0.00740939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.996;QD=9.75746;RBI=0.0114602;REFB=0.00514045;REVB=-0.00874279;RO=47;SAF=17;SAR=35;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167777;STB=0.592693;TYPE=snp;VARB=-0.00658865;OID=.;OPOS=78400884;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:47:47:52:52:35:17:24:23:35:17:24:23 chr12 78530979 . G A 125.27 PASS AO=27;DP=59;FAO=28;FDP=58;FR=.;FRO=30;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=3;FSRR=27;FWDB=-0.00673469;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.382;QD=8.63929;RBI=0.00673665;REFB=-0.00777029;REVB=-0.000162692;RO=29;SAF=14;SAR=13;SRF=3;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.384058;STB=0.719294;TYPE=snp;VARB=0.0136225;OID=.;OPOS=78530979;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:58:29:30:27:28:13:14:3:26:13:15:3:27 chr12 79611374 . C T 1291.79 PASS AO=135;DP=136;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0435973;FXX=0.0073524;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.1384;QD=38.2751;RBI=0.0478116;REFB=0;REVB=-0.0196271;RO=0;SAF=69;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.62241e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.01821e-05;OID=.;OPOS=79611374;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:136:135:0:0:135:135:66:69:0:0:66:69:0:0 chr12 79918717 . C T 244.56 PASS AO=50;DP=91;FAO=50;FDP=91;FR=.;FRO=41;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=13;FSRR=28;FWDB=0.0294978;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=87.7804;QD=10.75;RBI=0.0402472;REFB=0.0237718;REVB=0.0273811;RO=41;SAF=23;SAR=27;SRF=13;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119482;STB=0.565464;TYPE=snp;VARB=-0.0119654;OID=.;OPOS=79918717;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:41:41:50:50:27:23:13:28:27:23:13:28 chr12 80014907 . A T 568.49 PASS AO=138;DP=283;FAO=138;FDP=283;FR=.;FRO=145;FSAF=64;FSAR=74;FSRF=62;FSRR=83;FWDB=0.0158463;FXX=0.003521;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.169;QD=8.03513;RBI=0.0163063;REFB=0.0037821;REVB=-0.00384593;RO=144;SAF=64;SAR=74;SRF=62;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0311183;STB=0.518684;TYPE=snp;VARB=-0.00365201;OID=.;OPOS=80014907;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:283:283:144:145:138:138:74:64:62:82:74:64:62:83 chr12 80203752 . T G 590.44 PASS AO=131;DP=250;FAO=131;FDP=250;FR=.;FRO=119;FSAF=42;FSAR=89;FSRF=47;FSRR=72;FWDB=0.0267314;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.961;QD=9.44696;RBI=0.0279626;REFB=-0.027012;REVB=0.00820584;RO=119;SAF=42;SAR=89;SRF=47;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0720785;STB=0.539461;TYPE=snp;VARB=0.0263728;OID=.;OPOS=80203752;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:250:250:119:119:131:131:89:42:47:72:89:42:47:72 chr12 80712420 . G A 2299.22 PASS AO=240;DP=240;FAO=240;FDP=240;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=151;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.013817;FXX=0.00826412;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.948;QD=38.3203;RBI=0.028608;REFB=0;REVB=0.0250501;RO=0;SAF=91;SAR=149;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.12765e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000203219;OID=.;OPOS=80712420;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:240:240:0:0:240:240:149:91:0:0:151:89:0:0 chr12 80735771 . T C 842.62 PASS AO=89;DP=93;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00246823;FXX=0.0322546;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.349;QD=37.4498;RBI=0.0343362;REFB=0;REVB=0.0342473;RO=0;SAF=49;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.54288e-05;OID=.;OPOS=80735771;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:93:90:0:0:89:90:40:49:0:0:41:49:0:0 chr12 80737521 . C T 345.47 PASS AO=83;DP=148;FAO=83;FDP=171;FR=.;FRO=88;FSAF=34;FSAR=49;FSRF=34;FSRR=54;FWDB=-0.0523973;FXX=0.0284075;HRUN=3;LEN=1;MLLD=114.113;QD=8.08114;RBI=0.0529913;REFB=-0.0479829;REVB=-0.00791163;RO=58;SAF=35;SAR=48;SRF=4;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.290273;STB=0.512435;TYPE=snp;VARB=0.028126;OID=.;OPOS=80737521;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:171:58:88:83:83:48:35:4:54:49:34:34:54 chr12 80747242 . A G 947.24 PASS AO=98;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00177929;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2035;QD=38.2723;RBI=0.0421407;REFB=0;REVB=0.0421031;RO=0;SAF=31;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000359154;OID=.;OPOS=80747242;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:99:99:0:0:98:99:67:31:0:0:67:32:0:0 chr12 80752660 . A G 1349.71 PASS AO=145;DP=149;FAO=145;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010694;FXX=0.0333311;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.7833;QD=37.2333;RBI=0.0115382;REFB=-0.105575;REVB=-0.00433224;RO=0;SAF=71;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.01112e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.04376e-05;OID=.;OPOS=80752660;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:149:145:0:0:145:145:74:71:0:0:74:71:0:0 chr12 80761430 . G A 1309.89 PASS AO=136;DP=136;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224185;FXX=0.0215812;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.616;QD=38.5262;RBI=0.0298234;REFB=0;REVB=0.0196684;RO=0;SAF=56;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.31745e-05;OID=.;OPOS=80761430;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:136:136:0:0:136:136:80:56:0:0:80:56:0:0 chr12 80761465 . G A 1116.22 PASS AO=119;DP=120;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00461404;FXX=0.0325177;HRUN=3;LEN=1;MLLD=72.7824;QD=37.52;RBI=0.0584939;REFB=-0.0955655;REVB=-0.0583116;RO=1;SAF=41;SAR=78;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114432;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000709636;OID=.;OPOS=80761465;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:120:119:1:0:119:119:78:41:1:0:78:41:0:0 chr12 80765800 . A G 1326.78 PASS AO=139;DP=141;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00970506;FXX=0.0141834;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.877;QD=38.1808;RBI=0.0110377;REFB=0;REVB=-0.00525767;RO=0;SAF=59;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46196e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.80463e-07;OID=.;OPOS=80765800;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:141:139:0:0:139:139:80:59:0:0:80:59:0:0 chr12 80771813 . G A 1454.82 PASS AO=154;DP=155;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0015459;FXX=0.0064512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.502;QD=37.7874;RBI=0.00480563;REFB=0.0150102;REVB=0.0045502;RO=1;SAF=77;SAR=77;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00613824;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.14405e-06;OID=.;OPOS=80771813;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:155:154:1:0:154:154:77:77:0:1:77:77:0:0 chr12 80816492 . C T 723.88 PASS AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0606458;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.9901;QD=38.0989;RBI=0.0640453;REFB=0;REVB=-0.0205885;RO=0;SAF=37;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000760862;OID=.;OPOS=80816492;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:76:76:0:0:76:76:39:37:0:0:39:37:0:0 chr12 80818876 . A G 2447.84 PASS AO=282;DP=296;FAO=281;FDP=294;FR=.;FRO=13;FSAF=104;FSAR=177;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=-0.0662886;FXX=0.00675653;HRUN=4;LEN=1;MLLD=42.8917;QD=33.3039;RBI=0.068299;REFB=-0.0749804;REVB=-0.0164491;RO=6;SAF=105;SAR=177;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00875784;STB=0.510309;TYPE=snp;VARB=0.00265819;OID=.;OPOS=80818876;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:296:294:6:13:282:281:177:105:1:5:177:104:2:11 chr12 80855803 . G A 15.78 PASS AO=3;DP=7;FAO=3;FDP=7;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.398;QD=9.01796;RBI=0.00755333;REFB=-0.0126386;REVB=-0.00755333;RO=4;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0544274;OID=.;OPOS=80855803;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:7:7:4:4:3:3:3:0:0:4:3:0:0:4 chr12 80889829 . T A 2219.14 PASS AO=239;DP=244;FAO=239;FDP=239;FR=.;FRO=0;FSAF=121;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249784;FXX=0.020491;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.864;QD=37.1403;RBI=0.0314589;REFB=-0.0260901;REVB=-0.0191245;RO=4;SAF=121;SAR=118;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00764631;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.18947e-05;OID=.;OPOS=80889829;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:244:239:4:0:239:239:118:121:3:1:118:121:0:0 chr12 80899901 . C A 538.77 PASS AO=51;DP=51;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.031326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.564;QD=37.8082;RBI=0.0376103;REFB=0;REVB=0.0208139;RO=0;SAF=14;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.4464e-05;OID=.;OPOS=80899901;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:51:57:0:0:51:57:37:14:0:0:40:17:0:0 chr12 80900397 . C G 881.37 PASS AO=93;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0100282;FXX=0.0208312;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3799;QD=37.5052;RBI=0.0345849;REFB=0;REVB=-0.0330991;RO=0;SAF=47;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000133167;OID=.;OPOS=80900397;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:94:94:0:0:93:94:46:47:0:0:47:47:0:0 chr12 81329536 . A C 1364.61 PASS AO=152;DP=158;FAO=153;FDP=157;FR=.;FRO=4;FSAF=86;FSAR=67;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.047674;FXX=0.00632871;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.8083;QD=34.7671;RBI=0.0507475;REFB=-0.134598;REVB=0.0173926;RO=4;SAF=85;SAR=67;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00944419;STB=0.511362;TYPE=snp;VARB=0.00426253;OID=.;OPOS=81329536;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:158:157:4:4:152:153:67:85:3:1:67:86:4:0 chr12 81661039 . G A 197.45 PASS AO=43;DP=91;FAO=45;FDP=91;FR=.;FRO=46;FSAF=14;FSAR=31;FSRF=13;FSRR=33;FWDB=-0.0194976;FXX=0.0108684;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.902;QD=8.67898;RBI=0.0485267;REFB=-0.00175833;REVB=-0.0444374;RO=45;SAF=12;SAR=31;SRF=12;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0142865;STB=0.517015;TYPE=snp;VARB=0.000254532;OID=.;OPOS=81661039;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:45:46:43:45:31:12:12:33:31:14:13:33 chr12 81696487 . G A 388.66 PASS AO=97;DP=209;FAO=98;FDP=210;FR=.;FRO=112;FSAF=50;FSAR=48;FSRF=48;FSRR=64;FWDB=0.00558007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.272;QD=7.40312;RBI=0.00627009;REFB=-0.0216106;REVB=-0.00285952;RO=108;SAF=50;SAR=47;SRF=44;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10291;STB=0.543469;TYPE=snp;VARB=0.031833;OID=.;OPOS=81696487;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:210:108:112:97:98:47:50:44:64:48:50:48:64 chr12 82152226 . A G 41.1 PASS AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0102327;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.162;QD=10.2738;RBI=0.0413453;REFB=-0.0178;REVB=-0.0400591;RO=8;SAF=1;SAR=7;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.427785;STB=0.760088;TYPE=snp;VARB=0.0194994;OID=.;OPOS=82152226;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:16:16:8:8:8:8:7:1:4:4:7:1:4:4 chr12 82783668 . C T 748.46 PASS AO=77;DP=77;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000449847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.165;QD=38.3827;RBI=0.00733615;REFB=0;REVB=0.00732234;RO=0;SAF=36;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.52206e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.56255e-05;OID=.;OPOS=82783668;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:77:78:0:0:77:78:41:36:0:0:41:37:0:0 chr12 82792787 . C A 807.23 PASS AO=74;DP=76;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.824;QD=37.1138;RBI=0.0425291;REFB=0;REVB=0.0409854;RO=0;SAF=30;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.93382e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000115916;OID=.;OPOS=82792787;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:76:87:0:0:74:87:44:30:0:0:54:33:0:0 chr12 83415719 . G C 188.86 PASS AO=34;DP=110;FAO=47;FDP=103;FR=.,HEALED;FRO=56;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=33;FWDB=-0.0254384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7852;QD=7.33427;RBI=0.0255852;REFB=0.00645639;REVB=-0.00273614;RO=38;SAF=22;SAR=12;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119379;STB=0.565583;TYPE=snp;VARB=-0.007865;OID=.;OPOS=83415719;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:103:38:56:34:47:12:22:20:18:22:25:23:33 chr12 85277561 . T A 349.45 PASS AO=96;DP=229;FAO=99;FDP=232;FR=.;FRO=133;FSAF=42;FSAR=57;FSRF=68;FSRR=65;FWDB=-0.00736093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.682;QD=6.02499;RBI=0.008979;REFB=-0.01217;REVB=0.0051419;RO=131;SAF=41;SAR=55;SRF=66;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0799833;STB=0.550279;TYPE=snp;VARB=0.0112438;OID=.;OPOS=85277561;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:229:232:131:133:96:99:55:41:66:65:57:42:68:65 chr12 85277608 . C T 463.94 PASS AO=119;DP=253;FAO=118;FDP=252;FR=.;FRO=134;FSAF=47;FSAR=71;FSRF=63;FSRR=71;FWDB=-0.0187675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.9533;QD=7.36418;RBI=0.026427;REFB=-0.00519248;REVB=-0.0186056;RO=133;SAF=48;SAR=71;SRF=62;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0615567;STB=0.539209;TYPE=snp;VARB=0.00680807;OID=.;OPOS=85277608;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:253:252:133:134:119:118:71:48:62:71:71:47:63:71 chr12 85432040 . T A 360.99 PASS AO=105;DP=252;FAO=105;FDP=251;FR=.;FRO=146;FSAF=45;FSAR=60;FSRF=64;FSRR=82;FWDB=0.0391757;FXX=0.0039681;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.9347;QD=5.7528;RBI=0.066044;REFB=-0.000293378;REVB=-0.0531703;RO=147;SAF=45;SAR=60;SRF=65;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0144711;STB=0.505799;TYPE=snp;VARB=0.00011722;OID=.;OPOS=85432040;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:252:251:147:146:105:105:60:45:65:82:60:45:64:82 chr12 85438499 . G A 258.37 PASS AO=81;DP=212;FAO=81;FDP=209;FR=.;FRO=128;FSAF=36;FSAR=45;FSRF=60;FSRR=68;FWDB=-0.0469795;FXX=0.0141503;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.475;QD=4.94489;RBI=0.0506322;REFB=-0.00552565;REVB=-0.0188824;RO=125;SAF=36;SAR=45;SRF=58;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0212838;STB=0.515018;TYPE=snp;VARB=0.00913446;OID=.;OPOS=85438499;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:209:125:128:81:81:45:36:58:67:45:36:60:68 chr12 85449465 . T A 602.41 PASS AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0159934;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.763;QD=36.5098;RBI=0.0160286;REFB=-0.00703611;REVB=0.00106101;RO=1;SAF=24;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192744;STB=0.510201;TYPE=snp;VARB=-5.20556e-07;OID=.;OPOS=85449465;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:66:66:1:1:65:65:41:24:1:0:41:24:1:0 chr12 85466723 . G A 317.85 PASS AO=87;DP=201;FAO=87;FDP=200;FR=.;FRO=113;FSAF=37;FSAR=50;FSRF=58;FSRR=55;FWDB=-0.00820342;FXX=0.00497488;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.997;QD=6.35696;RBI=0.011355;REFB=-0.00674769;REVB=-0.00785118;RO=110;SAF=37;SAR=50;SRF=58;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102894;STB=0.550075;TYPE=snp;VARB=0.00954613;OID=.;OPOS=85466723;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:200:110:113:87:87:50:37:58:52:50:37:58:55 chr12 85556602 . T C 222.05 PASS AO=81;DP=233;FAO=82;FDP=236;FR=.;FRO=154;FSAF=34;FSAR=48;FSRF=34;FSRR=120;FWDB=-0.00412348;FXX=0.00840301;HRUN=3;LEN=1;MLLD=130.552;QD=3.76351;RBI=0.0202841;REFB=-0.00658864;REVB=-0.0198605;RO=152;SAF=34;SAR=47;SRF=34;SRR=118;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243716;STB=0.636334;TYPE=snp;VARB=0.0106296;OID=.;OPOS=85556602;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:233:236:152:154:81:82:47:34:34:118:48:34:34:120 chr12 88440676 . G C 2501.97 PASS AO=272;DP=274;FAO=270;FDP=270;FR=.;FRO=0;FSAF=152;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0284962;FXX=0.0181812;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.535;QD=37.0663;RBI=0.0446989;REFB=0.0142309;REVB=0.0344377;RO=1;SAF=151;SAR=121;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00314732;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.4623e-05;OID=.;OPOS=88440676;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:274:270:1:0:272:270:121:151:1:0:118:152:0:0 chr12 88505078 . T C 524.45 PASS AO=60;DP=63;FAO=60;FDP=63;FR=.;FRO=3;FSAF=51;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0239711;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.9115;QD=33.2981;RBI=0.0262357;REFB=-0.16044;REVB=0.010663;RO=2;SAF=51;SAR=9;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0404336;STB=0.516712;TYPE=snp;VARB=0.00753372;OID=.;OPOS=88505078;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:63:63:2:3:60:60:9:51:1:1:9:51:2:1 chr12 88505633 . A G 556.85 PASS AO=127;DP=259;FAO=132;FDP=263;FR=.;FRO=131;FSAF=46;FSAR=86;FSRF=56;FSRR=75;FWDB=-0.019637;FXX=0.00378774;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.801;QD=8.46915;RBI=0.0204583;REFB=-0.0166435;REVB=0.00573862;RO=130;SAF=43;SAR=84;SRF=55;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0841118;STB=0.542211;TYPE=snp;VARB=0.0142783;OID=.;OPOS=88505633;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:259:263:130:131:127:132:84:43:55:75:86:46:56:75 chr12 88547277 . T C 1301.84 PASS AO=137;DP=139;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247977;FXX=0.0143875;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.441;QD=38.0098;RBI=0.053909;REFB=-0.0800712;REVB=0.047867;RO=0;SAF=49;SAR=88;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.883e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000444666;OID=.;OPOS=88547277;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:139:137:0:0:137:137:88:49:0:0:88:49:0:0 chr12 89743223 . G A 2993.81 PASS AO=306;DP=307;FAO=315;FDP=315;FR=.;FRO=0;FSAF=119;FSAR=196;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0313471;FXX=0.00316446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.1115;QD=38.0166;RBI=0.0445911;REFB=0;REVB=0.0317131;RO=0;SAF=118;SAR=188;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000318933;OID=.;OPOS=89743223;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:307:315:0:0:306:315:188:118:0:0:196:119:0:0 chr12 89745477 . C A 243.15 PASS AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134765;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6115;QD=37.407;RBI=0.0153568;REFB=0;REVB=0.00736295;RO=0;SAF=13;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000628986;OID=.;OPOS=89745477;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:26:26:0:0:26:26:13:13:0:0:13:13:0:0 chr12 89853408 . G A 1578.42 PASS AO=142;DP=161;FAO=171;FDP=171;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0268413;FXX=0.0172404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.764;QD=36.922;RBI=0.0881892;REFB=-0.036488;REVB=0.0840052;RO=0;SAF=100;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.01609e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000677323;OID=.;OPOS=89853408;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:161:171:0:0:142:171:42:100:0:0:67:104:0:0 chr12 89866054 . TAGAAAGAAGA T 533.88 PASS AO=55;DP=99;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108498;FXX=0.151492;HRUN=1;LEN=10;MLLD=250.955;QD=38.1344;RBI=0.0108504;REFB=0;REVB=-0.000108735;RO=0;SAF=31;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=1.51952e-05;OID=.;OPOS=89866055;OREF=AGAAAGAAGA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:55:57:56:56:0:32:24:0:0:25:0:31:24:0:0 chr12 89915906 . G A 161.46 PASS AO=44;DP=103;FAO=45;FDP=104;FR=.;FRO=59;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=29;FSRR=30;FWDB=0.000908745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.092;QD=6.21009;RBI=0.00198652;REFB=-0.0229827;REVB=-0.00176647;RO=58;SAF=23;SAR=21;SRF=28;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0404462;STB=0.511106;TYPE=snp;VARB=0.0183627;OID=.;OPOS=89915906;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:104:58:59:44:45:21:23:28:30:22:23:29:30 chr12 89916811 . C T 2166.05 PASS AO=229;DP=231;FAO=231;FDP=231;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=136;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0497309;FXX=0.00858332;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.1773;QD=37.5074;RBI=0.052404;REFB=-0.0114364;REVB=-0.0165233;RO=2;SAF=94;SAR=135;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00152551;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.64634e-05;OID=.;OPOS=89916811;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:231:231:2:0:229:231:135:94:1:1:136:95:0:0 chr12 89917037 . GT G 43.96 PASS AO=40;DP=194;FAO=66;FDP=183;FR=.;FRO=117;FSAF=19;FSAR=47;FSRF=43;FSRR=74;FWDB=-6.25896e-05;FXX=0.0566981;HRUN=5;LEN=1;MLLD=8.88091;QD=0.960848;RBI=0.0412303;REFB=-0.0558987;REVB=-0.0412303;RO=97;SAF=4;SAR=36;SRF=37;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.482186;STB=0.558969;TYPE=del;VARB=0.0377349;OID=.;OPOS=89917038;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:40:179:66:183:117:19:47:43:74:43:97:4:36:37:60 chr12 89917518 . A G 1469.02 PASS AO=151;DP=155;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.131499;FXX=0.0064512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.6679;QD=38.1563;RBI=0.132665;REFB=0;REVB=0.0175496;RO=3;SAF=71;SAR=80;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0196706;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000494418;OID=.;OPOS=89917518;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:155:154:3:0:151:154:80:71:3:0:80:74:0:0 chr12 91348786 . G T 478.99 PASS AO=56;DP=61;FAO=56;FDP=60;FR=.;FRO=4;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.00391224;FXX=0.0163908;HRUN=5;LEN=1;MLLD=192.963;QD=31.9325;RBI=0.00531838;REFB=0.0155117;REVB=0.00360272;RO=4;SAF=26;SAR=30;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0671936;STB=0.535702;TYPE=snp;VARB=-8.81473e-05;OID=.;OPOS=91348786;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:61:60:4:4:56:56:30:26:4:0:30:26:4:0 chr12 91449852 . A G 164.74 PASS AO=50;DP=125;FAO=51;FDP=128;FR=.;FRO=77;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=53;FWDB=-0.0515305;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.6898;QD=5.14796;RBI=0.14316;REFB=-0.00200414;REVB=-0.133564;RO=74;SAF=29;SAR=21;SRF=24;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.265467;STB=0.661836;TYPE=snp;VARB=0.000445547;OID=.;OPOS=91449852;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:128:74:77:50:51:21:29:24:50:21:30:24:53 chr12 91449990 . C T 619.54 PASS AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00649003;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.902;QD=38.1256;RBI=0.0358587;REFB=0;REVB=-0.0352665;RO=0;SAF=27;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.04073e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.14482e-05;OID=.;OPOS=91449990;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:65:65:0:0:65:65:38:27:0:0:38:27:0:0 chr12 92537706 . A T 312.57 PASS AO=19;DP=86;FAO=68;FDP=69;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=37;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0594225;FXX=0.054787;HRUN=4;LEN=1;MLLD=9.1527;QD=18.1199;RBI=0.256253;REFB=0.0756467;REVB=-0.249268;RO=25;SAF=2;SAR=17;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.534979;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0926678;OID=.;OPOS=92537706;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:86:69:25:0:19:68:17:2:13:12:31:37:0:0 chr12 92818482 . C T 73.82 PASS AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.0405216;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.718;QD=8.94796;RBI=0.0780466;REFB=-0.00154096;REVB=0.0667029;RO=17;SAF=7;SAR=9;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135474;STB=0.577262;TYPE=snp;VARB=0.00673936;OID=.;OPOS=92818482;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:33:33:17:17:16:16:9:7:10:7:9:7:10:7 chr12 92818786 . A G 798.71 PASS AO=90;DP=95;FAO=90;FDP=94;FR=.;FRO=4;FSAF=39;FSAR=51;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.00372501;FXX=0.0105252;HRUN=5;LEN=1;MLLD=205.8;QD=33.9877;RBI=0.0167796;REFB=-0.0666728;REVB=-0.0163609;RO=3;SAF=39;SAR=51;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0144828;STB=0.502885;TYPE=snp;VARB=0.000144773;OID=.;OPOS=92818786;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:95:94:3:4:90:90:51:39:2:1:51:39:2:2 chr12 92818999 . G T 324.46 PASS AO=52;DP=78;FAO=54;FDP=80;FR=.;FRO=26;FSAF=23;FSAR=31;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=0.0220908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.209;QD=16.2228;RBI=0.0297793;REFB=-0.00209647;REVB=0.01997;RO=26;SAF=21;SAR=31;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0371653;STB=0.526708;TYPE=snp;VARB=0.0013769;OID=.;OPOS=92818999;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:78:80:26:26:52:54:31:21:9:17:31:23:9:17 chr12 92819139 . A C 412.47 PASS AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0307712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.5297;QD=37.4972;RBI=0.0418452;REFB=0;REVB=0.0283577;RO=0;SAF=20;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30465e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000495896;OID=.;OPOS=92819139;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:44:44:0:0:44:44:24:20:0:0:24:20:0:0 chr12 92819466 . C T 331.91 PASS AO=87;DP=195;FAO=88;FDP=197;FR=.;FRO=109;FSAF=42;FSAR=46;FSRF=60;FSRR=49;FWDB=-0.0171145;FXX=0.0100497;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.844;QD=6.73923;RBI=0.0339049;REFB=-0.00262844;REVB=0.0292684;RO=107;SAF=42;SAR=45;SRF=60;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0773467;STB=0.540419;TYPE=snp;VARB=0.00370193;OID=.;OPOS=92819466;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:197:107:109:87:88:45:42:60:47:46:42:60:49 chr12 92819699 . A G 164.23 PASS AO=34;DP=63;FAO=34;FDP=63;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=28;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=0.00956088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.764;QD=10.4271;RBI=0.017887;REFB=0.00137554;REVB=-0.0151173;RO=29;SAF=6;SAR=28;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.269494;STB=0.651062;TYPE=snp;VARB=-0.000820744;OID=.;OPOS=92819699;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:29:29:34:34:28:6:12:17:28:6:12:17 chr12 92821860 . CT C 405.87 PASS AO=105;DP=304;FAO=128;FDP=311;FR=.;FRO=183;FSAF=51;FSAR=77;FSRF=91;FSRR=92;FWDB=0.029801;FXX=0.0158223;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.668;QD=5.22014;RBI=0.0422216;REFB=-0.0227763;REVB=0.0299094;RO=182;SAF=33;SAR=72;SRF=90;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212366;STB=0.559189;TYPE=del;VARB=0.0247325;OID=.;OPOS=92821861;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:105:302:128:311:183:51:77:91:92:99:182:33:72:90:92 chr12 92822903 . G C 120.26 PASS AO=33;DP=81;FAO=33;FDP=80;FR=.;FRO=47;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=36;FWDB=-0.0181657;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.957;QD=6.01285;RBI=0.0221468;REFB=-0.000861605;REVB=0.0126683;RO=44;SAF=14;SAR=19;SRF=11;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187624;STB=0.618408;TYPE=snp;VARB=0.00090938;OID=.;OPOS=92822903;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:80:44:47:33:33:19:14:11:33:19:14:11:36 chr12 93102295 . G A 407.86 PASS AO=107;DP=241;FAO=108;FDP=240;FR=.;FRO=132;FSAF=52;FSAR=56;FSRF=47;FSRR=85;FWDB=-0.00311567;FXX=0.00826412;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.0964;QD=6.7977;RBI=0.0237739;REFB=-0.00158144;REVB=-0.0235689;RO=131;SAF=52;SAR=55;SRF=46;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134886;STB=0.569419;TYPE=snp;VARB=0.00042441;OID=.;OPOS=93102295;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:241:240:131:132:107:108:55:52:46:85:56:52:47:85 chr12 93147907 . A T 550.44 PASS AO=124;DP=240;FAO=124;FDP=240;FR=.;FRO=116;FSAF=77;FSAR=47;FSRF=49;FSRR=67;FWDB=0.0378968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.477;QD=9.17394;RBI=0.0391752;REFB=-0.0297264;REVB=0.00992604;RO=116;SAF=77;SAR=47;SRF=49;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177347;STB=0.597127;TYPE=snp;VARB=0.027025;OID=.;OPOS=93147907;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:240:240:116:116:124:124:47:77:49:67:47:77:49:67 chr12 93150102 . T C 215.53 PASS AO=54;DP=118;FAO=54;FDP=118;FR=.;FRO=64;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=32;FSRR=32;FWDB=0.0116466;FXX=0.0166653;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.223;QD=7.30617;RBI=0.022393;REFB=-0.00425422;REVB=0.019126;RO=60;SAF=28;SAR=26;SRF=32;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140648;STB=0.510047;TYPE=snp;VARB=0.00632507;OID=.;OPOS=93150102;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:60:64:54:54:26:28:32:28:26:28:32:32 chr12 93155535 . G A 1602.17 PASS AO=165;DP=165;FAO=167;FDP=167;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0161047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.131;QD=38.3754;RBI=0.0280619;REFB=0;REVB=0.0229806;RO=0;SAF=72;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.1532e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.17516e-06;OID=.;OPOS=93155535;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:165:167:0:0:165:167:93:72:0:0:94:73:0:0 chr12 93166538 . A G 550.56 PASS AO=121;DP=229;FAO=121;FDP=229;FR=.;FRO=108;FSAF=40;FSAR=81;FSRF=53;FSRR=55;FWDB=-0.00293696;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=220.093;QD=9.61673;RBI=0.00834796;REFB=-0.00560193;REVB=0.00781426;RO=106;SAF=40;SAR=81;SRF=52;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145834;STB=0.580654;TYPE=snp;VARB=0.00403429;OID=.;OPOS=93166538;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:229:229:106:108:121:121:81:40:52:54:81:40:53:55 chr12 93196422 . T G 248.8 PASS AO=47;DP=80;FAO=47;FDP=80;FR=.;FRO=33;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=0.00372263;FXX=0;HRUN=9;LEN=1;MLLD=221.8;QD=12.4398;RBI=0.00737146;REFB=0.016342;REVB=0.00636243;RO=33;SAF=22;SAR=25;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102888;STB=0.55619;TYPE=snp;VARB=-0.00937425;OID=.;OPOS=93196422;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:33:33:47:47:25:22:11:22:25:22:11:22 chr12 93202801 . C T 471.45 PASS AO=90;DP=237;FAO=129;FDP=277;FR=.;FRO=148;FSAF=70;FSAR=59;FSRF=92;FSRR=56;FWDB=0.0089381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.022;QD=6.80791;RBI=0.0605448;REFB=-0.00850245;REVB=0.0598814;RO=146;SAF=71;SAR=19;SRF=90;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.236889;STB=0.542815;TYPE=snp;VARB=0.0159244;OID=.;OPOS=93202801;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:237:277:146:148:90:129:19:71:90:56:59:70:92:56 chr12 93246053 . A G 272.32 PASS AO=76;DP=178;FAO=76;FDP=178;FR=.;FRO=102;FSAF=23;FSAR=53;FSRF=38;FSRR=64;FWDB=-0.0228771;FXX=0.00558628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.074;QD=6.11945;RBI=0.0228778;REFB=0.00119923;REVB=-0.000181682;RO=101;SAF=23;SAR=53;SRF=38;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0854807;STB=0.545734;TYPE=snp;VARB=-0.00162424;OID=.;OPOS=93246053;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:178:101:102:76:76:53:23:38:63:53:23:38:64 chr12 93258665 . A G 237.82 PASS AO=60;DP=131;FAO=60;FDP=131;FR=.;FRO=71;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=44;FSRR=27;FWDB=0.0882555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9721;QD=7.26164;RBI=0.104491;REFB=-0.0412719;REVB=0.0559402;RO=70;SAF=25;SAR=35;SRF=44;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203409;STB=0.609044;TYPE=snp;VARB=0.0374774;OID=.;OPOS=93258665;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:70:71:60:60:35:25:44:26:35:25:44:27 chr12 93659420 . G A 111.77 PASS AO=34;DP=89;FAO=34;FDP=89;FR=.;FRO=55;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=36;FWDB=0.0222325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.102;QD=5.02351;RBI=0.0493838;REFB=0.00549383;REVB=-0.0440963;RO=55;SAF=20;SAR=14;SRF=19;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.258136;STB=0.646747;TYPE=snp;VARB=-0.00900898;OID=.;OPOS=93659420;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:55:55:34:34:14:20:19:36:14:20:19:36 chr12 93692934 . G A 1170.85 PASS AO=123;DP=123;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00143227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.775;QD=38.0763;RBI=0.0239042;REFB=0;REVB=0.0238613;RO=0;SAF=22;SAR=101;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.33838e-05;OID=.;OPOS=93692934;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:123:123:0:0:123:123:101:22:0:0:101:22:0:0 chr12 94645255 . A G 2242.37 PASS AO=234;DP=235;FAO=234;FDP=234;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=129;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016807;FXX=0.00425514;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.916;QD=38.3312;RBI=0.0183767;REFB=0;REVB=0.00743148;RO=0;SAF=105;SAR=129;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.13013e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.00255e-05;OID=.;OPOS=94645255;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:235:234:0:0:234:234:129:105:0:0:129:105:0:0 chr12 94671743 . G C 1295.65 PASS AO=137;DP=138;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0920781;FXX=0.00724585;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.352;QD=37.8291;RBI=0.0931183;REFB=0.00673361;REVB=0.0138799;RO=1;SAF=28;SAR=109;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00434212;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000195851;OID=.;OPOS=94671743;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:138:137:1:0:137:137:109:28:0:1:109:28:0:0 chr12 94673509 . GC G 49.78 PASS AO=11;DP=25;FAO=14;FDP=25;FR=.;FRO=11;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=0;FWDB=0.0825324;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=14.7278;QD=7.96498;RBI=0.134582;REFB=0.119768;REVB=-0.106305;RO=7;SAF=8;SAR=3;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0.365854;SSSB=-0.273278;STB=0.689445;TYPE=del;VARB=-0.0818461;OID=.;OPOS=94673510;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:11:25:14:25:11:9:5:11:0:27:7:8:3:7:0 chr12 94769758 . A G 1588.85 PASS AO=170;DP=172;FAO=170;FDP=170;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00117083;FXX=0.0116272;HRUN=3;LEN=1;MLLD=253.477;QD=37.3848;RBI=0.0102107;REFB=-0.126771;REVB=-0.0101434;RO=0;SAF=76;SAR=94;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.91328e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.73388e-06;OID=.;OPOS=94769758;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:172:170:0:0:170:170:94:76:0:0:94:76:0:0 chr12 94909304 . A G 459.7 PASS AO=49;DP=52;FAO=53;FDP=55;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.128215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.1802;QD=33.4327;RBI=0.13775;REFB=-0.170622;REVB=0.0503599;RO=2;SAF=10;SAR=39;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0235265;STB=0.512191;TYPE=snp;VARB=0.00755955;OID=.;OPOS=94909304;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:52:55:2:2:49:53:39:10:0:2:40:13:0:2 chr12 94955585 . T C 196.34 PASS AO=38;DP=67;FAO=39;FDP=68;FR=.;FRO=29;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.0160701;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.1717;QD=11.5492;RBI=0.0833801;REFB=-0.00688528;REVB=-0.0818168;RO=29;SAF=20;SAR=18;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200536;STB=0.505692;TYPE=snp;VARB=0.00325308;OID=.;OPOS=94955585;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:68:29:29:38:39:18:20:16:13:18:21:16:13 chr12 94955607 . G T 216.03 PASS AO=46;DP=88;FAO=46;FDP=88;FR=.;FRO=42;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=-0.0176962;FXX=0.0112347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.829;QD=9.81965;RBI=0.0204924;REFB=-0.0230658;REVB=0.0103336;RO=41;SAF=20;SAR=26;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0247818;STB=0.519991;TYPE=snp;VARB=0.0251205;OID=.;OPOS=94955607;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:41:42:46:46:26:20:19:22:26:20:20:22 chr12 94955644 . G T 315.45 PASS AO=82;DP=179;FAO=82;FDP=181;FR=.;FRO=99;FSAF=30;FSAR=52;FSRF=43;FSRR=56;FWDB=-0.0647749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.832;QD=6.97133;RBI=0.0648623;REFB=-0.01119;REVB=-0.00336635;RO=96;SAF=30;SAR=52;SRF=42;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0733614;STB=0.539501;TYPE=snp;VARB=0.0100474;OID=.;OPOS=94955644;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:181:96:99:82:82:52:30:42:54:52:30:43:56 chr12 94963611 . C T 119.77 PASS AO=29;DP=63;FAO=29;FDP=63;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=8;FSRR=26;FWDB=0.0581069;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.6246;QD=7.60443;RBI=0.0638804;REFB=0.0110261;REVB=-0.0265386;RO=34;SAF=10;SAR=19;SRF=8;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121856;STB=0.568138;TYPE=snp;VARB=-0.0127556;OID=.;OPOS=94963611;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:34:34:29:29:19:10:8:26:19:10:8:26 chr12 95228286 . G C 357.96 PASS AO=69;DP=117;FAO=69;FDP=117;FR=.;FRO=48;FSAF=34;FSAR=35;FSRF=29;FSRR=19;FWDB=0.0597409;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.743;QD=12.2378;RBI=0.0608843;REFB=-0.00651374;REVB=0.0117442;RO=48;SAF=34;SAR=35;SRF=29;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0839094;STB=0.545644;TYPE=snp;VARB=0.00562813;OID=.;OPOS=95228286;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:48:48:69:69:35:34:29:19:35:34:29:19 chr12 95470600 . A ATCTT 346.64 PASS AO=122;DP=457;FAO=136;FDP=395;FR=.;FRO=259;FSAF=42;FSAR=94;FSRF=99;FSRR=160;FWDB=-0.0114671;FXX=0.0124997;HRUN=1;LEN=4;MLLD=198.302;QD=3.51026;RBI=0.0123814;REFB=-0.00947586;REVB=0.00466941;RO=309;SAF=37;SAR=85;SRF=118;SRR=191;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107983;STB=0.554042;TYPE=ins;VARB=0.016083;OID=.;OPOS=95470601;OREF=-;OALT=TCTT;OMAPALT=ATCTT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:122:457:136:395:259:42:94:99:160:99:309:37:85:118:191 chr12 95500727 . C G 88.45 PASS AO=26;DP=70;FAO=26;FDP=69;FR=.;FRO=43;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=26;FWDB=-0.00252559;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3991;QD=5.12767;RBI=0.00314047;REFB=-0.0471267;REVB=-0.00186654;RO=43;SAF=17;SAR=9;SRF=17;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.2787;STB=0.660255;TYPE=snp;VARB=0.0694645;OID=.;OPOS=95500727;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:70:69:43:43:26:26:9:17:17:26:9:17:17:26 chr12 95681554 . C T 405.57 PASS AO=107;DP=239;FAO=107;FDP=237;FR=.;FRO=130;FSAF=35;FSAR=72;FSRF=67;FSRR=63;FWDB=0.0116528;FXX=0.0124995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.822;QD=6.84505;RBI=0.0135315;REFB=-0.00551518;REVB=-0.00687852;RO=128;SAF=35;SAR=72;SRF=67;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201771;STB=0.60848;TYPE=snp;VARB=0.00522226;OID=.;OPOS=95681554;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:239:237:128:130:107:107:72:35:67:61:72:35:67:63 chr12 95694394 . G A 147.03 PASS AO=43;DP=107;FAO=43;FDP=107;FR=.;FRO=64;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=41;FWDB=-0.0393791;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.91;QD=5.49647;RBI=0.0408795;REFB=-0.0225023;REVB=-0.0109736;RO=64;SAF=20;SAR=23;SRF=23;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113628;STB=0.564096;TYPE=snp;VARB=0.0254136;OID=.;OPOS=95694394;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:64:64:43:43:23:20:23:41:23:20:23:41 chr12 95927762 . T C 573.29 PASS AO=131;DP=259;FAO=132;FDP=259;FR=.;FRO=127;FSAF=54;FSAR=78;FSRF=67;FSRR=60;FWDB=-0.00361816;FXX=0.00384601;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1617;QD=8.85397;RBI=0.0148954;REFB=-0.0360185;REVB=0.0144493;RO=125;SAF=54;SAR=77;SRF=65;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.097258;STB=0.558783;TYPE=snp;VARB=0.0254745;OID=.;OPOS=95927762;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:259:259:125:127:131:132:77:54:65:60:78:54:67:60 chr12 96052721 . G A 187.33 PASS AO=53;DP=127;FAO=53;FDP=127;FR=.;FRO=74;FSAF=42;FSAR=11;FSRF=42;FSRR=32;FWDB=0.030217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.394;QD=5.90025;RBI=0.0310156;REFB=-0.0110249;REVB=0.00699297;RO=69;SAF=42;SAR=11;SRF=41;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.250997;STB=0.661471;TYPE=snp;VARB=0.0157958;OID=.;OPOS=96052721;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:69:74:53:53:11:42:41:28:11:42:42:32 chr12 96131895 . A G 596.91 PASS AO=110;DP=182;FAO=112;FDP=183;FR=.;FRO=71;FSAF=49;FSAR=63;FSRF=27;FSRR=44;FWDB=0.0270908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.9442;QD=13.0473;RBI=0.0284158;REFB=-0.0282258;REVB=-0.00857582;RO=72;SAF=48;SAR=62;SRF=28;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0354556;STB=0.522676;TYPE=snp;VARB=0.0275795;OID=.;OPOS=96131895;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:183:72:71:110:112:62:48:28:44:63:49:27:44 chr12 96260947 . A G 251.01 PASS AO=64;DP=150;FAO=69;FDP=155;FR=.;FRO=86;FSAF=40;FSAR=29;FSRF=41;FSRR=45;FWDB=-0.0659853;FXX=0.012738;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.78;QD=6.47762;RBI=0.0743459;REFB=-0.00751136;REVB=-0.0342529;RO=86;SAF=35;SAR=29;SRF=42;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0600724;STB=0.557527;TYPE=snp;VARB=0.00818227;OID=.;OPOS=96260947;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:155:86:86:64:69:29:35:42:44:29:40:41:45 chr12 96284650 . A G 1192.54 PASS AO=126;DP=128;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0258266;FXX=0.0230751;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.364;QD=37.5603;RBI=0.0353376;REFB=-0.0996893;REVB=-0.0241192;RO=0;SAF=47;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000289197;OID=.;OPOS=96284650;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:128:127:0:0:126:127:79:47:0:0:81:46:0:0 chr12 96292170 . C G 231.48 PASS AO=67;DP=169;FAO=67;FDP=162;FR=.;FRO=95;FSAF=24;FSAR=43;FSRF=20;FSRR=75;FWDB=0.062;FXX=0.0414177;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.433;QD=5.71555;RBI=0.0627867;REFB=-0.0152749;REVB=-0.0099081;RO=90;SAF=24;SAR=43;SRF=17;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203028;STB=0.599465;TYPE=snp;VARB=0.0414136;OID=.;OPOS=96292170;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:162:90:95:67:67:43:24:17:73:43:24:20:75 chr12 96312686 . C A 448.14 PASS AO=98;DP=199;FAO=105;FDP=206;FR=.;FRO=101;FSAF=57;FSAR=48;FSRF=60;FSRR=41;FWDB=0.029405;FXX=0.00483068;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.967;QD=8.7018;RBI=0.0486792;REFB=-0.0374998;REVB=0.0387945;RO=100;SAF=54;SAR=44;SRF=59;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0363303;STB=0.525395;TYPE=snp;VARB=0.0339434;OID=.;OPOS=96312686;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:199:206:100:101:98:105:44:54:59:41:48:57:60:41 chr12 96374563 . T C 355.41 PASS AO=91;DP=197;FAO=91;FDP=197;FR=.;FRO=106;FSAF=42;FSAR=49;FSRF=42;FSRR=64;FWDB=-0.00506129;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=278.557;QD=7.21652;RBI=0.0180601;REFB=-0.0083362;REVB=-0.0173364;RO=99;SAF=42;SAR=49;SRF=36;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0938751;STB=0.535537;TYPE=snp;VARB=0.00895151;OID=.;OPOS=96374563;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:197:99:106:91:91:49:42:36:63:49:42:42:64 chr12 96374614 . C T 322.21 PASS AO=72;DP=142;FAO=73;FDP=143;FR=.;FRO=70;FSAF=32;FSAR=41;FSRF=19;FSRR=51;FWDB=-0.0185733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.454;QD=9.01283;RBI=0.0191835;REFB=-0.00669221;REVB=0.00479975;RO=70;SAF=31;SAR=41;SRF=19;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149263;STB=0.584685;TYPE=snp;VARB=0.008624;OID=.;OPOS=96374614;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:143:70:70:72:73:41:31:19:51:41:32:19:51 chr12 96387621 . A G 1565.97 PASS AO=167;DP=174;FAO=170;FDP=173;FR=.;FRO=3;FSAF=61;FSAR=109;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0325434;FXX=0.0057468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.3689;QD=36.2075;RBI=0.0613432;REFB=-0.0192552;REVB=-0.0519992;RO=5;SAF=60;SAR=107;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0143874;STB=0.505781;TYPE=snp;VARB=0.000818869;OID=.;OPOS=96387621;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:174:173:5:3:167:170:107:60:3:2:109:61:2:1 chr12 96673764 . T C 664.45 PASS AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0384644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.6324;QD=38.5189;RBI=0.0488764;REFB=0;REVB=0.0301562;RO=0;SAF=32;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.83957e-05;OID=.;OPOS=96673764;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:69:69:0:0:69:69:37:32:0:0:37:32:0:0 chr12 96676330 . C A 1177.37 PASS AO=117;DP=117;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180973;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.891;QD=37.6758;RBI=0.0191251;REFB=0;REVB=0.00618516;RO=0;SAF=30;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000328711;OID=.;OPOS=96676330;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:117:125:0:0:117:125:87:30:0:0:94:31:0:0 chr12 96697149 . C T 1391.87 PASS AO=154;DP=165;FAO=159;FDP=168;FR=.;FRO=9;FSAF=104;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=0.00430522;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.8959;QD=33.1398;RBI=0.0634126;REFB=-0.0938002;REVB=0.0632663;RO=9;SAF=101;SAR=53;SRF=1;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0619105;STB=0.531512;TYPE=snp;VARB=0.00483218;OID=.;OPOS=96697149;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:165:168:9:9:154:159:53:101:1:8:55:104:1:8 chr12 96821251 . A T 263.74 PASS AO=73;DP=166;FAO=72;FDP=165;FR=.;FRO=93;FSAF=17;FSAR=55;FSRF=33;FSRR=60;FWDB=0.0367473;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1646;QD=6.39378;RBI=0.0537651;REFB=0.00920835;REVB=0.039247;RO=91;SAF=17;SAR=56;SRF=33;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162244;STB=0.58446;TYPE=snp;VARB=-0.0109218;OID=.;OPOS=96821251;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:165:91:93:73:72:56:17:33:58:55:17:33:60 chr12 96992494 . C T 1177.87 PASS AO=123;DP=124;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177098;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.739;QD=37.6919;RBI=0.0382887;REFB=-0.0221797;REVB=0.0339468;RO=1;SAF=59;SAR=64;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00798452;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000266212;OID=.;OPOS=96992494;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:124:125:1:0:123:125:64:59:1:0:66:59:0:0 chr12 97020673 . T C 2431.93 PASS AO=250;DP=250;FAO=254;FDP=254;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=184;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00764555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.317;QD=38.2981;RBI=0.0102358;REFB=0;REVB=-0.00680571;RO=0;SAF=69;SAR=181;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.20461e-05;OID=.;OPOS=97020673;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:250:254:0:0:250:254:181:69:0:0:184:70:0:0 chr12 97023937 . A C 1201.18 PASS AO=122;DP=127;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0254758;FXX=0.0155027;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.0523;QD=37.8323;RBI=0.0957375;REFB=-0.0540852;REVB=0.0922857;RO=4;SAF=59;SAR=63;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0292062;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000427954;OID=.;OPOS=97023937;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:127:127:4:0:122:127:63:59:0:4:68:59:0:0 chr12 97051846 . C G 639.49 PASS AO=136;DP=247;FAO=135;FDP=246;FR=.;FRO=111;FSAF=55;FSAR=80;FSRF=34;FSRR=77;FWDB=0.0254211;FXX=0.00404842;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.6756;QD=10.3982;RBI=0.025468;REFB=-0.0127107;REVB=0.0015457;RO=110;SAF=55;SAR=81;SRF=34;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.082871;STB=0.548073;TYPE=snp;VARB=0.0106773;OID=.;OPOS=97051846;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:247:246:110:111:136:135:81:55:34:76:80:55:34:77 chr12 97098549 . T C 112.8 PASS AO=43;DP=115;FAO=39;FDP=110;FR=.;FRO=71;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=35;FSRR=36;FWDB=-0.0359964;FXX=0.0434745;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.4089;QD=4.10184;RBI=0.0539955;REFB=-0.0138942;REVB=0.0402463;RO=72;SAF=30;SAR=13;SRF=35;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243817;STB=0.598035;TYPE=snp;VARB=0.0390014;OID=.;OPOS=97098549;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:110:72:71:43:39:13:30:35:37:14:25:35:36 chr12 97102578 . G A 86.49 PASS AO=25;DP=64;FAO=25;FDP=64;FR=.;FRO=39;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=38;FWDB=-0.0969106;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5148;QD=5.40593;RBI=0.0979108;REFB=-0.0135977;REVB=-0.0139589;RO=38;SAF=7;SAR=18;SRF=1;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.415359;STB=0.731222;TYPE=snp;VARB=0.0260311;OID=.;OPOS=97102578;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:64:64:38:39:25:25:18:7:1:37:18:7:1:38 chr12 97136239 . G A 445.02 PASS AO=100;DP=193;FAO=100;FDP=193;FR=.;FRO=93;FSAF=69;FSAR=31;FSRF=61;FSRR=32;FWDB=-0.0139049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.131;QD=9.2233;RBI=0.0158862;REFB=-0.0100771;REVB=-0.00768267;RO=92;SAF=69;SAR=31;SRF=61;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0272244;STB=0.518917;TYPE=snp;VARB=0.00778402;OID=.;OPOS=97136239;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:193:92:93:100:100:31:69:61:31:31:69:61:32 chr12 97254620 . G A 435.58 PASS AO=124;DP=290;FAO=124;FDP=291;FR=.;FRO=167;FSAF=60;FSAR=64;FSRF=82;FSRR=85;FWDB=-0.0142239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.03;QD=5.9873;RBI=0.0196985;REFB=-0.016618;REVB=-0.0136276;RO=166;SAF=60;SAR=64;SRF=81;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0042015;STB=0.504104;TYPE=snp;VARB=0.022693;OID=.;OPOS=97254620;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:290:291:166:167:124:124:64:60:81:85:64:60:82:85 chr12 98115544 . T C 47.56 PASS AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0418255;FXX=0.0312402;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.212;QD=6.13637;RBI=0.0500834;REFB=-0.00482533;REVB=-0.0275496;RO=19;SAF=1;SAR=11;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.644134;STB=0.887471;TYPE=snp;VARB=0.0200679;OID=.;OPOS=98115544;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:31:31:19:19:12:12:11:1:12:7:11:1:12:7 chr12 98332904 . TCA T 652.88 PASS AO=54;DP=77;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0205549;FXX=0.0540468;HRUN=1;LEN=2;MLLD=197.42;QD=37.3071;RBI=0.0274778;REFB=0;REVB=0.0182352;RO=0;SAF=45;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17126e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.000176245;OID=.;OPOS=98332905;OREF=CA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:54:63:70:70:0:61:9:0:0:31:0:45:9:0:0 chr12 98811687 . G C 470.8 PASS AO=114;DP=235;FAO=114;FDP=234;FR=.;FRO=120;FSAF=55;FSAR=59;FSRF=47;FSRR=73;FWDB=-0.012645;FXX=0.00425514;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7681;QD=8.04789;RBI=0.0155987;REFB=0.0025534;REVB=-0.00913374;RO=120;SAF=55;SAR=59;SRF=47;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0850897;STB=0.546761;TYPE=snp;VARB=-0.00253994;OID=.;OPOS=98811687;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:235:234:120:120:114:114:59:55:47:73:59:55:47:73 chr12 98849074 . T A 345.57 PASS AO=102;DP=248;FAO=102;FDP=247;FR=.;FRO=145;FSAF=38;FSAR=64;FSRF=53;FSRR=92;FWDB=0.0149733;FXX=0.0040321;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.7123;QD=5.59625;RBI=0.0181421;REFB=-0.00250833;REVB=-0.0102438;RO=144;SAF=38;SAR=64;SRF=52;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0128657;STB=0.504424;TYPE=snp;VARB=0.00265793;OID=.;OPOS=98849074;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:248:247:144:145:102:102:64:38:52:92:64:38:53:92 chr12 98849314 . A T 675.75 PASS AO=150;DP=284;FAO=150;FDP=284;FR=.;FRO=134;FSAF=80;FSAR=70;FSRF=59;FSRR=75;FWDB=-0.00777495;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.021;QD=9.51758;RBI=0.0260535;REFB=-0.0144852;REVB=-0.0248663;RO=134;SAF=80;SAR=70;SRF=59;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0803305;STB=0.543829;TYPE=snp;VARB=0.0154038;OID=.;OPOS=98849314;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:284:284:134:134:150:150:70:80:59:75:70:80:59:75 chr12 98940228 . A AT 120.59 PASS AO=54;DP=126;FAO=55;FDP=125;FR=.;FRO=70;FSAF=33;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=45;FWDB=0.0894026;FXX=0.00793588;HRUN=2;LEN=1;MLLD=20.0299;QD=3.85889;RBI=0.106776;REFB=-0.0208124;REVB=0.0583798;RO=68;SAF=32;SAR=22;SRF=24;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235967;STB=0.634022;TYPE=ins;VARB=0.0359244;OID=.;OPOS=98940229;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:54:126:55:125:70:33:22:25:45:99:68:32:22:24:44 chr12 99020125 . T C 229.97 PASS AO=68;DP=167;FAO=68;FDP=167;FR=.;FRO=99;FSAF=31;FSAR=37;FSRF=51;FSRR=48;FWDB=-0.0150683;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=247.227;QD=5.5083;RBI=0.0200591;REFB=-0.00734935;REVB=-0.0132406;RO=97;SAF=31;SAR=37;SRF=51;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0732541;STB=0.535181;TYPE=snp;VARB=0.0102282;OID=.;OPOS=99020125;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:167:97:99:68:68:37:31:51:46:37:31:51:48 chr12 99640428 . T C 274.09 PASS AO=85;DP=217;FAO=86;FDP=218;FR=.;FRO=132;FSAF=43;FSAR=43;FSRF=68;FSRR=64;FWDB=-0.00702688;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.095;QD=5.02915;RBI=0.0070882;REFB=-0.00268902;REVB=0.000930278;RO=131;SAF=42;SAR=43;SRF=67;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0186838;STB=0.509172;TYPE=snp;VARB=0.00386923;OID=.;OPOS=99640428;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:217:218:131:132:85:86:43:42:67:64:43:43:68:64 chr12 99640557 . T C 327.81 PASS AO=95;DP=229;FAO=96;FDP=230;FR=.;FRO=134;FSAF=42;FSAR=54;FSRF=60;FSRR=74;FWDB=0.0235798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.99;QD=5.70111;RBI=0.0241632;REFB=-0.0232229;REVB=0.00527778;RO=129;SAF=41;SAR=54;SRF=58;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0189106;STB=0.506063;TYPE=snp;VARB=0.0316679;OID=.;OPOS=99640557;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:229:230:129:134:95:96:54:41:58:71:54:42:60:74 chr12 100042040 . C G 251.27 PASS AO=61;DP=149;FAO=71;FDP=159;FR=.;FRO=88;FSAF=33;FSAR=38;FSRF=47;FSRR=41;FWDB=-0.010461;FXX=0.00624961;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.254;QD=6.32124;RBI=0.0261094;REFB=-0.00828677;REVB=0.0239221;RO=87;SAF=32;SAR=29;SRF=47;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0164204;STB=0.538328;TYPE=snp;VARB=0.0125578;OID=.;OPOS=100042040;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:159:87:88:61:71:29:32:47:40:38:33:47:41 chr12 100042163 . A G 137.37 PASS AO=41;DP=104;FAO=41;FDP=104;FR=.;FRO=63;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=36;FSRR=27;FWDB=-0.0120274;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.886;QD=5.28358;RBI=0.0136001;REFB=-0.0109076;REVB=-0.00634865;RO=63;SAF=17;SAR=24;SRF=36;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166876;STB=0.594624;TYPE=snp;VARB=0.0196579;OID=.;OPOS=100042163;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:63:63:41:41:24:17:36:27:24:17:36:27 chr12 101017445 . T C 1932.74 PASS AO=207;DP=214;FAO=211;FDP=215;FR=.;FRO=4;FSAF=92;FSAR=119;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.00384299;FXX=0.00462942;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.736;QD=35.9579;RBI=0.0615896;REFB=-0.0389769;REVB=0.0614695;RO=3;SAF=90;SAR=117;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00641266;STB=0.505929;TYPE=snp;VARB=8.68805e-05;OID=.;OPOS=101017445;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:214:215:3:4:207:211:117:90:2:1:119:92:3:1 chr12 101018014 . T C 691.45 PASS AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0878437;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.8239;QD=37.8877;RBI=0.0905406;REFB=0;REVB=0.0219334;RO=0;SAF=21;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000577398;OID=.;OPOS=101018014;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:74:73:0:0:73:73:52:21:0:0:52:21:0:0 chr12 101018061 . C T 85.17 PASS AO=20;DP=49;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.0164822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.0633;QD=6.55184;RBI=0.018311;REFB=-0.00762438;REVB=0.00797684;RO=28;SAF=8;SAR=12;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138851;STB=0.553143;TYPE=snp;VARB=0.0118995;OID=.;OPOS=101018061;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:49:52:28:30:20:22:12:8:15:13:13:9:15:15 chr12 101018161 . C T 90.82 PASS AO=23;DP=55;FAO=23;FDP=53;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=6;FSRR=24;FWDB=0.00354017;FXX=0.036357;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.072;QD=6.85424;RBI=0.00537619;REFB=0.0219194;REVB=-0.00404606;RO=29;SAF=7;SAR=16;SRF=5;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165919;STB=0.573711;TYPE=snp;VARB=-0.0225096;OID=.;OPOS=101018161;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:55:53:29:30:23:23:16:7:5:24:16:7:6:24 chr12 101133748 . A C 224.19 PASS AO=56;DP=122;FAO=56;FDP=121;FR=.;FRO=65;FSAF=18;FSAR=38;FSRF=16;FSRR=49;FWDB=-0.00467805;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.599;QD=7.41129;RBI=0.0122208;REFB=-0.00284893;REVB=0.01129;RO=66;SAF=18;SAR=38;SRF=17;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0734409;STB=0.547919;TYPE=snp;VARB=0.00358195;OID=.;OPOS=101133748;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:121:66:65:56:56:38:18:17:49:38:18:16:49 chr12 101520689 . A G 302.53 PASS AO=80;DP=179;FAO=80;FDP=179;FR=.;FRO=99;FSAF=43;FSAR=37;FSRF=41;FSRR=58;FWDB=-0.00970809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.9266;QD=6.76051;RBI=0.0117403;REFB=-0.00462776;REVB=-0.00660206;RO=99;SAF=43;SAR=37;SRF=41;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122256;STB=0.567896;TYPE=snp;VARB=0.0109497;OID=.;OPOS=101520689;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:179:99:99:80:80:37:43:41:58:37:43:41:58 chr12 101522078 . C G 289.2 PASS AO=84;DP=202;FAO=84;FDP=202;FR=.;FRO=118;FSAF=44;FSAR=40;FSRF=63;FSRR=55;FWDB=-0.0529439;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.6248;QD=5.72665;RBI=0.0577867;REFB=-0.00616533;REVB=-0.0231568;RO=117;SAF=44;SAR=40;SRF=62;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00637109;STB=0.505909;TYPE=snp;VARB=0.00619835;OID=.;OPOS=101522078;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:202:117:118:84:84:40:44:62:55:40:44:63:55 chr12 101552075 . G A 1974.24 PASS AO=206;DP=206;FAO=206;FDP=206;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=114;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0380098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8392;QD=38.3347;RBI=0.0476266;REFB=0;REVB=0.0286976;RO=0;SAF=92;SAR=114;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.87816e-05;OID=.;OPOS=101552075;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:206:206:0:0:206:206:114:92:0:0:114:92:0:0 chr12 101679658 . G A 213.17 PASS AO=63;DP=155;FAO=63;FDP=155;FR=.;FRO=92;FSAF=35;FSAR=28;FSRF=37;FSRR=55;FWDB=0.0300707;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3403;QD=5.50105;RBI=0.0304556;REFB=0.00139184;REVB=0.00482671;RO=92;SAF=35;SAR=28;SRF=37;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160839;STB=0.590299;TYPE=snp;VARB=-0.00159257;OID=.;OPOS=101679658;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:92:92:63:63:28:35:37:55:28:35:37:55 chr12 101685852 . G A 245.07 PASS AO=72;DP=178;FAO=72;FDP=176;FR=.;FRO=104;FSAF=37;FSAR=35;FSRF=42;FSRR=62;FWDB=-0.0308724;FXX=0.0112353;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.7088;QD=5.56987;RBI=0.0309948;REFB=-0.00333552;REVB=-0.00275089;RO=104;SAF=37;SAR=35;SRF=42;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1157;STB=0.564823;TYPE=snp;VARB=0.00430778;OID=.;OPOS=101685852;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:176:104:104:72:72:35:37:42:62:35:37:42:62 chr12 101693534 . C G 560.23 PASS AO=151;DP=339;FAO=151;FDP=338;FR=.;FRO=187;FSAF=68;FSAR=83;FSRF=93;FSRR=94;FWDB=0.0088315;FXX=0.00588218;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.949;QD=6.62989;RBI=0.0147923;REFB=-0.000791478;REVB=0.0118667;RO=187;SAF=68;SAR=83;SRF=93;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0471768;STB=0.52612;TYPE=snp;VARB=0.000891582;OID=.;OPOS=101693534;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:339:338:187:187:151:151:83:68:93:94:83:68:93:94 chr12 101732655 . C T 101.11 PASS AO=19;DP=33;FAO=19;FDP=33;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=16;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=-0.00269906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.2;QD=12.2557;RBI=0.0117735;REFB=-0.0108744;REVB=-0.0114599;RO=12;SAF=3;SAR=16;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192553;STB=0.58937;TYPE=snp;VARB=0.0142325;OID=.;OPOS=101732655;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:33:33:12:14:19:19:16:3:4:8:16:3:4:10 chr12 101750814 . T A 1527.32 PASS AO=163;DP=164;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000644253;FXX=0.0121944;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.371;QD=37.7115;RBI=0.0183845;REFB=-0.0371038;REVB=0.0183732;RO=1;SAF=85;SAR=78;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00556564;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000191844;OID=.;OPOS=101750814;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:164:162:1:0:163:162:78:85:1:0:78:84:0:0 chr12 101776996 . G C 483.44 PASS AO=119;DP=247;FAO=119;FDP=248;FR=.;FRO=129;FSAF=38;FSAR=81;FSRF=59;FSRR=70;FWDB=-0.0171473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.864;QD=7.79748;RBI=0.0229298;REFB=-0.0183631;REVB=0.0152232;RO=126;SAF=38;SAR=81;SRF=58;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142509;STB=0.57792;TYPE=snp;VARB=0.0167457;OID=.;OPOS=101776996;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:247:248:126:129:119:119:81:38:58:68:81:38:59:70 chr12 101866174 . C A 1816.66 PASS AO=188;DP=188;FAO=189;FDP=189;FR=.;FRO=0;FSAF=102;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0382791;FXX=0.00526288;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.8588;QD=38.4479;RBI=0.0411343;REFB=0;REVB=0.0150578;RO=0;SAF=101;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.49031e-05;OID=.;OPOS=101866174;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:188:189:0:0:188:189:87:101:0:0:87:102:0:0 chr12 102036305 . C T 261.03 PASS AO=52;DP=102;FAO=59;FDP=116;FR=.;FRO=57;FSAF=15;FSAR=44;FSRF=18;FSRR=39;FWDB=-0.0386826;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.289;QD=9.0011;RBI=0.0386827;REFB=-0.0285826;REVB=-5.91615e-05;RO=49;SAF=15;SAR=37;SRF=18;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0810133;STB=0.538363;TYPE=snp;VARB=0.0197109;OID=.;OPOS=102036305;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:116:49:57:52:59:37:15:18:31:44:15:18:39 chr12 102045031 . A T 262.65 PASS AO=60;DP=121;FAO=60;FDP=120;FR=.;FRO=60;FSAF=44;FSAR=16;FSRF=40;FSRR=20;FWDB=0.0239152;FXX=0.00826378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.699;QD=8.75494;RBI=0.0363273;REFB=-0.00121634;REVB=0.0273447;RO=58;SAF=44;SAR=16;SRF=38;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0848651;STB=0.540969;TYPE=snp;VARB=0.00179404;OID=.;OPOS=102045031;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:120:58:60:60:60:16:44:38:20:16:44:40:20 chr12 102045163 . C G 173.55 PASS AO=43;DP=94;FAO=43;FDP=93;FR=.;FRO=50;FSAF=31;FSAR=12;FSRF=41;FSRR=9;FWDB=0.0128778;FXX=0.0210504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9952;QD=7.46442;RBI=0.0749612;REFB=-0.0118675;REVB=-0.0738468;RO=50;SAF=31;SAR=12;SRF=41;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126875;STB=0.570267;TYPE=snp;VARB=0.0150105;OID=.;OPOS=102045163;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:93:50:50:43:43:12:31:41:9:12:31:41:9 chr12 102064118 . T C 365.6 PASS AO=89;DP=183;FAO=89;FDP=183;FR=.;FRO=94;FSAF=49;FSAR=40;FSRF=29;FSRR=65;FWDB=-0.0601378;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.2134;QD=7.99132;RBI=0.0607997;REFB=0.0121989;REVB=-0.00894705;RO=91;SAF=49;SAR=40;SRF=29;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210689;STB=0.622478;TYPE=snp;VARB=-0.0153955;OID=.;OPOS=102064118;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:183:91:94:89:89:40:49:29:62:40:49:29:65 chr12 102079418 . G A 1544.95 PASS AO=161;DP=162;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00787026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.052;QD=38.1469;RBI=0.0439889;REFB=0;REVB=0.0432792;RO=0;SAF=74;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.58752e-05;OID=.;OPOS=102079418;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:162:162:0:0:161:162:87:74:0:0:88:74:0:0 chr12 102108345 . T C 2072.79 PASS AO=298;DP=357;FAO=286;FDP=348;FR=.;FRO=62;FSAF=152;FSAR=134;FSRF=35;FSRR=27;FWDB=-0.0179351;FXX=0.0252094;HRUN=8;LEN=1;MLLD=32.4024;QD=23.8252;RBI=0.0230441;REFB=-0.112537;REVB=-0.0144695;RO=6;SAF=162;SAR=136;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00466716;STB=0.505915;TYPE=snp;VARB=0.0322429;OID=.;OPOS=102108345;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:357:348:6:62:298:286:136:162:4:2:134:152:35:27 chr12 102117589 . C T 2370.26 PASS AO=242;DP=244;FAO=249;FDP=249;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=156;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00792747;FXX=0.0119043;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.324;QD=38.0765;RBI=0.0693232;REFB=0;REVB=0.0688684;RO=0;SAF=91;SAR=151;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.08647e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000243097;OID=.;OPOS=102117589;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:244:249:0:0:242:249:151:91:0:0:156:93:0:0 chr12 102140676 . CT C 35.78 PASS AO=20;DP=91;FAO=41;FDP=104;FR=.;FRO=63;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=38;FWDB=-0.0726831;FXX=0.0188661;HRUN=5;LEN=1;MLLD=9.65714;QD=1.37615;RBI=0.0811341;REFB=-0.0451118;REVB=-0.0360543;RO=54;SAF=3;SAR=17;SRF=21;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.372159;STB=0.58403;TYPE=del;VARB=0.00400962;OID=.;OPOS=102140677;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:20:86:41:104:63:22:19:25:38:35:54:3:17:21:33 chr12 102158763 . T C 431.49 PASS AO=98;DP=181;FAO=95;FDP=177;FR=.;FRO=82;FSAF=57;FSAR=38;FSRF=46;FSRR=36;FWDB=-0.00518427;FXX=0.0220982;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.403;QD=9.75113;RBI=0.0287907;REFB=0.0175693;REVB=-0.0283201;RO=82;SAF=61;SAR=37;SRF=46;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0537359;STB=0.518688;TYPE=snp;VARB=-0.011585;OID=.;OPOS=102158763;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:177:82:82:98:95:37:61:46:36:38:57:46:36 chr12 102173654 . T C 839.92 PASS AO=97;DP=103;FAO=97;FDP=103;FR=.;FRO=6;FSAF=57;FSAR=40;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0491877;FXX=0.00961446;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.519;QD=32.6184;RBI=0.04935;REFB=-0.084711;REVB=0.0039997;RO=2;SAF=57;SAR=40;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0034608;STB=0.504757;TYPE=snp;VARB=0.0036801;OID=.;OPOS=102173654;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:103:103:2:6:97:97:40:57:1:1:40:57:4:2 chr12 102279115 . C T 346.92 PASS AO=75;DP=142;FAO=75;FDP=141;FR=.;FRO=66;FSAF=47;FSAR=28;FSRF=50;FSRR=16;FWDB=-0.0291896;FXX=0.00704176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.796;QD=9.84177;RBI=0.030153;REFB=-0.0293207;REVB=-0.00756122;RO=66;SAF=47;SAR=28;SRF=50;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124105;STB=0.567709;TYPE=snp;VARB=0.0275041;OID=.;OPOS=102279115;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:141:66:66:75:75:28:47:50:16:28:47:50:16 chr12 102279193 . G A 1302.26 PASS AO=136;DP=138;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=99;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.019028;FXX=0.0215812;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.0736;QD=38.3018;RBI=0.0223985;REFB=0;REVB=-0.0118163;RO=0;SAF=99;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.74747e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000386166;OID=.;OPOS=102279193;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:138:136:0:0:136:136:37:99:0:0:37:99:0:0 chr12 102315359 . G T 255.1 PASS AO=60;DP=133;FAO=65;FDP=138;FR=.;FRO=73;FSAF=31;FSAR=34;FSRF=16;FSRR=57;FWDB=-0.00224768;FXX=0.00719373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.096;QD=7.39408;RBI=0.00670937;REFB=0.00281756;REVB=0.00632167;RO=63;SAF=31;SAR=29;SRF=15;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.257463;STB=0.638341;TYPE=snp;VARB=-0.0025167;OID=.;OPOS=102315359;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:138:63:73:60:65:29:31:15:48:34:31:16:57 chr12 102517753 . T C 195.4 PASS AO=53;DP=127;FAO=54;FDP=126;FR=.;FRO=72;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=39;FSRR=33;FWDB=0.0325961;FXX=0.0156238;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.532;QD=6.20328;RBI=0.0329587;REFB=-0.0126436;REVB=0.00487516;RO=72;SAF=29;SAR=24;SRF=39;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00569434;STB=0.50266;TYPE=snp;VARB=0.0128935;OID=.;OPOS=102517753;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:126:72:72:53:54:24:29:39:33:25:29:39:33 chr12 103237468 . G C 286.01 PASS AO=70;DP=147;FAO=70;FDP=147;FR=.;FRO=77;FSAF=27;FSAR=43;FSRF=34;FSRR=43;FWDB=-0.00884586;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.712;QD=7.78253;RBI=0.0476634;REFB=-0.0100625;REVB=-0.0468354;RO=77;SAF=27;SAR=43;SRF=34;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0549252;STB=0.530426;TYPE=snp;VARB=0.0120125;OID=.;OPOS=103237468;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:147:77:77:70:70:43:27:34:43:43:27:34:43 chr12 103248924 . C T 696.96 PASS AO=160;DP=321;FAO=162;FDP=320;FR=.;FRO=158;FSAF=83;FSAR=79;FSRF=65;FSRR=93;FWDB=0.00668397;FXX=0.00928764;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.655;QD=8.71194;RBI=0.0290231;REFB=-0.0215365;REVB=0.028243;RO=157;SAF=81;SAR=79;SRF=62;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100677;STB=0.549747;TYPE=snp;VARB=0.0157292;OID=.;OPOS=103248924;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:321:320:157:158:160:162:79:81:62:95:79:83:65:93 chr12 103307583 . A G 351.1 PASS AO=81;DP=165;FAO=82;FDP=165;FR=.;FRO=83;FSAF=51;FSAR=31;FSRF=40;FSRR=43;FWDB=0.0214598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.983;QD=8.51152;RBI=0.0850989;REFB=-0.0103694;REVB=0.0823487;RO=81;SAF=51;SAR=30;SRF=40;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127221;STB=0.572234;TYPE=snp;VARB=0.00927916;OID=.;OPOS=103307583;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:165:81:83:81:82:30:51:40:41:31:51:40:43 chr12 103670917 . A G 936.79 PASS AO=107;DP=116;FAO=111;FDP=116;FR=.;FRO=5;FSAF=57;FSAR=54;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.146559;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=122.624;QD=32.303;RBI=0.147144;REFB=-0.265595;REVB=-0.0131026;RO=6;SAF=53;SAR=54;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0507558;STB=0.503731;TYPE=snp;VARB=0.0066216;OID=.;OPOS=103670917;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:116:116:6:5:107:111:54:53:6:0:54:57:3:2 chr12 103696182 . T G 58.37 PASS AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=2;FSRF=20;FSRR=6;FWDB=0.00888929;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=154.245;QD=5.55948;RBI=0.123354;REFB=-0.0111125;REVB=-0.123034;RO=24;SAF=14;SAR=2;SRF=19;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164837;STB=0.622046;TYPE=snp;VARB=0.0236221;OID=.;OPOS=103696182;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:40:42:24:26:16:16:2:14:19:5:2:14:20:6 chr12 103762691 . C T 167.95 PASS AO=41;DP=87;FAO=41;FDP=88;FR=.;FRO=47;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=0.0171319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.624;QD=7.63424;RBI=0.0349566;REFB=0.000795098;REVB=-0.0304707;RO=46;SAF=24;SAR=17;SRF=27;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0015527;STB=0.50598;TYPE=snp;VARB=-0.00134444;OID=.;OPOS=103762691;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:88:46:47:41:41:17:24:27:19:17:24:27:20 chr12 103872172 . T G 778.13 PASS AO=85;DP=90;FAO=85;FDP=88;FR=.;FRO=3;FSAF=45;FSAR=40;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.00329969;FXX=0.0222198;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.669;QD=35.3694;RBI=0.00495059;REFB=0.0291575;REVB=0.00369058;RO=2;SAF=45;SAR=40;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0205873;STB=0.516125;TYPE=snp;VARB=-0.00188133;OID=.;OPOS=103872172;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:90:88:2:3:85:85:40:45:2:0:40:45:3:0 chr12 104067812 . C T 1000.74 PASS AO=105;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0662608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.29;QD=38.1236;RBI=0.067887;REFB=0;REVB=0.0147698;RO=0;SAF=40;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.02925e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.95597e-05;OID=.;OPOS=104067812;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:105:105:0:0:105:105:65:40:0:0:65:40:0:0 chr12 104086631 . C T 867.04 PASS AO=93;DP=94;FAO=93;FDP=94;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=74;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.11295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.364;QD=36.8954;RBI=0.113148;REFB=-0.0539165;REVB=-0.00669863;RO=1;SAF=19;SAR=74;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0242935;STB=0.512818;TYPE=snp;VARB=-3.83382e-06;OID=.;OPOS=104086631;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:94:94:1:1:93:93:74:19:1:0:74:19:1:0 chr12 104092996 . T C 2617.82 PASS AO=277;DP=280;FAO=278;FDP=278;FR=.;FRO=0;FSAF=135;FSAR=143;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173665;FXX=0.0071426;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.6072;QD=37.6664;RBI=0.0268987;REFB=-0.128462;REVB=0.0205413;RO=3;SAF=135;SAR=142;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0099657;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000457139;OID=.;OPOS=104092996;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:280:278:3:0:277:278:142:135:0:3:143:135:0:0 chr12 104100617 . C T 2927.25 PASS AO=309;DP=312;FAO=311;FDP=311;FR=.;FRO=0;FSAF=187;FSAR=124;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.079137;FXX=0.00955384;HRUN=3;LEN=1;MLLD=90.355;QD=37.6495;RBI=0.0792624;REFB=-0.0626119;REVB=0.00445706;RO=3;SAF=185;SAR=124;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00505883;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000202039;OID=.;OPOS=104100617;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:312:311:3:0:309:311:124:185:1:2:124:187:0:0 chr12 104153004 . C G 1417.9 PASS AO=134;DP=135;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0302394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.26;QD=37.313;RBI=0.0410064;REFB=0;REVB=0.0276967;RO=0;SAF=50;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000110185;OID=.;OPOS=104153004;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:135:152:0:0:134:152:84:50:0:0:102:50:0:0 chr12 104186946 . G T 100.5 PASS AO=30;DP=79;FAO=30;FDP=78;FR=.;FRO=48;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=-0.0228683;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.921;QD=5.15377;RBI=0.0373314;REFB=-0.0166637;REVB=-0.0295072;RO=46;SAF=15;SAR=15;SRF=19;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.092297;STB=0.551248;TYPE=snp;VARB=0.0296122;OID=.;OPOS=104186946;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:78:46:48:30:30:15:15:19:27:15:15:20:28 chr12 104254932 . G A 217.8 PASS AO=61;DP=144;FAO=61;FDP=144;FR=.;FRO=83;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=44;FSRR=39;FWDB=0.00618834;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3063;QD=6.04986;RBI=0.0576244;REFB=-0.00365302;REVB=0.0572912;RO=83;SAF=33;SAR=28;SRF=44;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0112372;STB=0.506295;TYPE=snp;VARB=0.00605149;OID=.;OPOS=104254932;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:144:83:83:61:61:28:33:44:39:28:33:44:39 chr12 104260208 . C T 300.84 PASS AO=64;DP=120;FAO=64;FDP=120;FR=.;FRO=56;FSAF=23;FSAR=41;FSRF=31;FSRR=25;FWDB=0.0164576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.424;QD=10.028;RBI=0.0234896;REFB=-0.0318671;REVB=-0.0167604;RO=56;SAF=23;SAR=41;SRF=31;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169576;STB=0.593218;TYPE=snp;VARB=0.019298;OID=.;OPOS=104260208;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:56:56:64:64:41:23:31:25:41:23:31:25 chr12 104341103 . C T 239.96 PASS AO=56;DP=115;FAO=56;FDP=114;FR=.;FRO=58;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=32;FSRR=26;FWDB=-0.00700459;FXX=0.0086949;HRUN=3;LEN=1;MLLD=144.197;QD=8.4198;RBI=0.00814554;REFB=-0.028161;REVB=0.00415759;RO=58;SAF=22;SAR=34;SRF=32;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147564;STB=0.58172;TYPE=snp;VARB=0.0220599;OID=.;OPOS=104341103;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:114:58:58:56:56:34:22:32:26:34:22:32:26 chr12 104349525 . T C 209.02 PASS AO=50;DP=104;FAO=50;FDP=104;FR=.;FRO=54;FSAF=31;FSAR=19;FSRF=26;FSRR=28;FWDB=0.0302452;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.723;QD=8.03923;RBI=0.0419879;REFB=0.0132664;REVB=0.0291241;RO=54;SAF=31;SAR=19;SRF=26;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132371;STB=0.573592;TYPE=snp;VARB=-0.0216634;OID=.;OPOS=104349525;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:54:54:50:50:19:31:26:28:19:31:26:28 chr12 104382264 . G A 190.2 PASS AO=54;DP=130;FAO=54;FDP=130;FR=.;FRO=76;FSAF=33;FSAR=21;FSRF=33;FSRR=43;FWDB=0.00258864;FXX=0.0298485;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.2914;QD=5.85228;RBI=0.00731413;REFB=-0.0202123;REVB=0.00684072;RO=71;SAF=33;SAR=21;SRF=31;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177793;STB=0.603735;TYPE=snp;VARB=0.0254858;OID=.;OPOS=104382264;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:71:76:54:54:21:33:31:40:21:33:33:43 chr12 104512832 . G A 268.34 PASS AO=57;DP=109;FAO=59;FDP=112;FR=.;FRO=53;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=36;FSRR=17;FWDB=0.0401079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.8566;QD=9.58355;RBI=0.0435661;REFB=-0.0236849;REVB=-0.0170105;RO=51;SAF=28;SAR=29;SRF=34;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150522;STB=0.596122;TYPE=snp;VARB=0.0222014;OID=.;OPOS=104512832;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:112:51:53:57:59:29:28:34:17:31:28:36:17 chr12 104645363 . G A 425.98 PASS AO=92;DP=171;FAO=92;FDP=172;FR=.;FRO=80;FSAF=56;FSAR=36;FSRF=48;FSRR=32;FWDB=-0.0337922;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.444;QD=9.90651;RBI=0.0547257;REFB=-0.0291233;REVB=0.0430463;RO=79;SAF=56;SAR=36;SRF=47;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0121659;STB=0.504236;TYPE=snp;VARB=0.0224041;OID=.;OPOS=104645363;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:172:79:80:92:92:36:56:47:32:36:56:48:32 chr12 104645405 . T C 406.73 PASS AO=83;DP=148;FAO=83;FDP=148;FR=.;FRO=65;FSAF=50;FSAR=33;FSRF=38;FSRR=27;FWDB=0.0080871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.901;QD=10.9926;RBI=0.008089;REFB=-0.0147846;REVB=0.000175304;RO=65;SAF=50;SAR=33;SRF=38;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149016;STB=0.508128;TYPE=snp;VARB=0.0101543;OID=.;OPOS=104645405;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:65:65:83:83:33:50:38:27:33:50:38:27 chr12 104698582 . A G 188.1 PASS AO=46;DP=100;FAO=46;FDP=99;FR=.;FRO=53;FSAF=36;FSAR=10;FSRF=32;FSRR=21;FWDB=-0.0127375;FXX=0.009999;HRUN=3;LEN=1;MLLD=243.69;QD=7.59982;RBI=0.0141827;REFB=-0.00315624;REVB=-0.00623747;RO=52;SAF=36;SAR=10;SRF=32;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202098;STB=0.621323;TYPE=snp;VARB=0.00327434;OID=.;OPOS=104698582;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:99:52:53:46:46:10:36:32:20:10:36:32:21 chr12 104703836 . A G 182.96 PASS AO=48;DP=109;FAO=48;FDP=109;FR=.;FRO=61;FSAF=30;FSAR=18;FSRF=34;FSRR=27;FWDB=0.00871544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.111;QD=6.71411;RBI=0.00901076;REFB=-0.0080201;REVB=0.00228799;RO=61;SAF=30;SAR=18;SRF=34;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0705436;STB=0.539552;TYPE=snp;VARB=0.00998064;OID=.;OPOS=104703836;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:61:61:48:48:18:30:34:27:18:30:34:27 chr12 104709559 . C T 200.78 PASS AO=59;DP=143;FAO=59;FDP=143;FR=.;FRO=84;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=39;FSRR=45;FWDB=0.00442426;FXX=0.00694396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.612;QD=5.61608;RBI=0.0489161;REFB=0.0016501;REVB=-0.0487156;RO=81;SAF=35;SAR=24;SRF=36;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153847;STB=0.56597;TYPE=snp;VARB=-0.0029311;OID=.;OPOS=104709559;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:81:84:59:59:24:35:36:45:25:34:39:45 chr12 104744020 . AC A,AA 190.25 PASS AO=11,23;DP=58;FAO=34,2;FDP=60;FR=.;FRO=24;FSAF=10,1;FSAR=24,1;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=0.00262016,0.00362707;FXX=0.0322529;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=240.391,240.305;QD=12.6834;RBI=0.0281085,0.0269155;REFB=0.0173991,0.01704;REVB=-0.0279861,-0.02667;RO=23;SAF=4,4;SAR=7,19;SRF=17;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.401832,-0.52932;STB=0.676303,0.690678;TYPE=del,snp;VARB=-0.0169207,0.0212769;OID=.,.;OPOS=104744021,104744021;OREF=C,C;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:11,23:57:34,2:60:24:10,1:24,1:17:7:95:23:4,4:7,19:17:6 chr12 104985407 . T C 130.03 PASS AO=24;DP=42;FAO=24;FDP=41;FR=.;FRO=17;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=-0.00389907;FXX=0.0238039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.324;QD=12.6855;RBI=0.0209844;REFB=-0.00934938;REVB=-0.020619;RO=16;SAF=16;SAR=8;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170291;STB=0.518503;TYPE=snp;VARB=0.0151884;OID=.;OPOS=104985407;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:42:41:16:17:24:24:8:16:11:5:8:16:12:5 chr12 104985443 . G A 48.25 PASS AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.0411967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.308;QD=7.71925;RBI=0.0428477;REFB=-0.0106233;REVB=0.0117797;RO=13;SAF=6;SAR=5;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0659235;STB=0.555457;TYPE=snp;VARB=0.00809487;OID=.;OPOS=104985443;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:25:25:13:14:11:11:5:6:8:5:5:6:9:5 chr12 105199038 . G A 312.15 PASS AO=78;DP=166;FAO=78;FDP=166;FR=.;FRO=88;FSAF=33;FSAR=45;FSRF=42;FSRR=46;FWDB=-0.00383376;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.302;QD=7.52177;RBI=0.0109879;REFB=0.00534263;REVB=-0.0102974;RO=88;SAF=33;SAR=45;SRF=42;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0526489;STB=0.529155;TYPE=snp;VARB=-0.00604796;OID=.;OPOS=105199038;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:166:88:88:78:78:45:33:42:46:45:33:42:46 chr12 105433523 . T A 270.44 PASS AO=72;DP=164;FAO=73;FDP=166;FR=.;FRO=93;FSAF=40;FSAR=33;FSRF=31;FSRR=62;FWDB=0.00147028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.153;QD=6.51653;RBI=0.0163593;REFB=-0.00533892;REVB=-0.0162931;RO=91;SAF=40;SAR=32;SRF=29;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234346;STB=0.618559;TYPE=snp;VARB=0.00928196;OID=.;OPOS=105433523;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:166:91:93:72:73:32:40:29:62:33:40:31:62 chr12 105434467 . C T 320.11 PASS AO=82;DP=180;FAO=82;FDP=179;FR=.;FRO=97;FSAF=49;FSAR=33;FSRF=42;FSRR=55;FWDB=0.0264868;FXX=0.00555525;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.454;QD=7.15323;RBI=0.0341788;REFB=0.00865638;REVB=-0.0216018;RO=96;SAF=49;SAR=33;SRF=42;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156357;STB=0.589452;TYPE=snp;VARB=-0.0120216;OID=.;OPOS=105434467;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:179:96:97:82:82:33:49:42:54:33:49:42:55 chr12 105546172 . G A 2179.6 PASS AO=225;DP=227;FAO=227;FDP=227;FR=.;FRO=0;FSAF=113;FSAR=114;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00613677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.834;QD=38.4071;RBI=0.0353789;REFB=0;REVB=0.0348426;RO=2;SAF=113;SAR=112;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00843219;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.03218e-05;OID=.;OPOS=105546172;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:227:227:2:0:225:227:112:113:0:2:114:113:0:0 chr12 105561664 . C T 168.15 PASS AO=39;DP=85;FAO=41;FDP=86;FR=.;FRO=45;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=31;FSRR=14;FWDB=-0.00368007;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.475;QD=7.82079;RBI=0.0161311;REFB=-0.0172607;REVB=-0.0157057;RO=35;SAF=22;SAR=17;SRF=27;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186053;STB=0.581035;TYPE=snp;VARB=0.019908;OID=.;OPOS=105561664;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:86:35:45:39:41:17:22:27:8:19:22:31:14 chr12 105567068 . T A 1859.02 PASS AO=200;DP=205;FAO=201;FDP=205;FR=.;FRO=4;FSAF=90;FSAR=111;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0256657;FXX=0.00485413;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.1051;QD=36.2736;RBI=0.0294247;REFB=-0.038365;REVB=0.0143905;RO=4;SAF=89;SAR=111;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00737549;STB=0.503904;TYPE=snp;VARB=-1.25878e-05;OID=.;OPOS=105567068;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:205:205:4:4:200:201:111:89:1:3:111:90:1:3 chr12 105567070 . T A 1973.76 PASS AO=206;DP=206;FAO=206;FDP=206;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.668;QD=38.3254;RBI=0.01801;REFB=0;REVB=0.0130226;RO=0;SAF=91;SAR=115;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.04607e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.10229e-05;OID=.;OPOS=105567070;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:206:206:0:0:206:206:115:91:0:0:115:91:0:0 chr12 105567087 . T TA 1400.24 PASS AO=32;DP=209;FAO=198;FDP=198;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=108;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.015218;FXX=0.0294103;HRUN=1;LEN=1;MLLD=21.1685;QD=28.2876;RBI=0.0157657;REFB=0;REVB=0.00411944;RO=174;SAF=9;SAR=23;SRF=88;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.293615;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.000360648;OID=.;OPOS=105567088;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:32:209:198:198:0:90:108:0:0:99:174:9:23:88:86 chr12 105567089 . T A 1244.6 PASS AO=164;DP=200;FAO=170;FDP=204;FR=.;FRO=34;FSAF=85;FSAR=85;FSRF=10;FSRR=24;FWDB=-0.00609678;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=33.2416;QD=24.4039;RBI=0.0325102;REFB=-0.22838;REVB=0.0319334;RO=35;SAF=79;SAR=85;SRF=11;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0557632;STB=0.53431;TYPE=snp;VARB=0.0433207;OID=.;OPOS=105567089;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:200:204:35:34:164:170:85:79:11:24:85:85:10:24 chr12 105568122 . G A 449.66 PASS AO=226;DP=576;FAO=148;FDP=387;FR=.;FRO=239;FSAF=44;FSAR=104;FSRF=93;FSRR=146;FWDB=-0.00279026;FXX=0.0324992;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.4263;QD=4.64765;RBI=0.0100662;REFB=-0.0149213;REVB=0.00967172;RO=326;SAF=70;SAR=156;SRF=130;SRR=196;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105044;STB=0.564313;TYPE=snp;VARB=0.0324681;OID=.;OPOS=105568122;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:576:387:326:239:226:148:156:70:130:196:104:44:93:146 chr12 105568176 . G A 550.19 PASS AO=130;DP=471;FAO=164;FDP=396;FR=.;FRO=232;FSAF=35;FSAR=129;FSRF=82;FSRR=150;FWDB=-0.00130807;FXX=0.00999975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.8677;QD=5.55745;RBI=0.00192564;REFB=-0.0102208;REVB=-0.00141317;RO=224;SAF=27;SAR=103;SRF=75;SRR=149;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18729;STB=0.607154;TYPE=snp;VARB=0.0143003;OID=.;OPOS=105568176;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:397:396:224:232:130:164:103:27:75:149:129:35:82:150 chr12 106460938 . G C 152.47 PASS AO=39;DP=84;FAO=39;FDP=89;FR=.;FRO=50;FSAF=27;FSAR=12;FSRF=36;FSRR=14;FWDB=-0.0363941;FXX=0.0219756;HRUN=3;LEN=1;MLLD=87.1589;QD=6.85237;RBI=0.0505988;REFB=-0.113424;REVB=0.0351527;RO=43;SAF=27;SAR=12;SRF=29;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.019543;STB=0.518509;TYPE=snp;VARB=0.0288462;OID=.;OPOS=106460938;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:89:43:50:39:39:12:27:29:14:12:27:36:14 chr12 106704974 . G A 1917.19 PASS AO=197;DP=201;FAO=204;FDP=204;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0955866;FXX=0.0144921;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.871;QD=37.5919;RBI=0.096192;REFB=-0.0429063;REVB=0.0107753;RO=0;SAF=94;SAR=103;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.3711e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000195093;OID=.;OPOS=106704974;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:201:204:0:0:197:204:103:94:0:0:103:101:0:0 chr12 106706034 . CATTT CT,CA 106.5 PASS AO=4,3;DP=21;FAO=10,8;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=10,4;FSAR=0,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0547466,-0.0776401;FXX=0;HRUN=1,21;LEN=3,3;MLLD=59.7063,4.40772;QD=23.6659;RBI=0.168554,0.194545;REFB=0,0;REVB=0.159416,0.178381;RO=0;SAF=4,2;SAR=0,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=-0.000356191,-0.0229163;OID=.,.;OPOS=106706035,106706036;OREF=ATT,TTT;OALT=-,-;OMAPALT=CT,CA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:4,3:18:10,8:18:0:10,4:0,4:0:0:33:0:4,2:0,1:0:0 chr12 106838340 . T C 151.14 PASS AO=39;DP=88;FAO=39;FDP=88;FR=.;FRO=49;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=30;FWDB=-0.0225198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.622;QD=6.86988;RBI=0.0247004;REFB=0.00485647;REVB=-0.0101474;RO=46;SAF=18;SAR=21;SRF=16;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111925;STB=0.541572;TYPE=snp;VARB=-0.00595399;OID=.;OPOS=106838340;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:46:49:39:39:21:18:16:30:21:18:19:30 chr12 106893863 . G T 366.39 PASS AO=91;DP=193;FAO=91;FDP=192;FR=.;FRO=101;FSAF=54;FSAR=37;FSRF=48;FSRR=53;FWDB=0.00325916;FXX=0.00518108;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.406;QD=7.63321;RBI=0.0325827;REFB=-0.0238454;REVB=-0.0324193;RO=97;SAF=54;SAR=37;SRF=44;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131773;STB=0.562877;TYPE=snp;VARB=0.021024;OID=.;OPOS=106893863;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:192:97:101:91:91:37:54:44:53:37:54:48:53 chr12 106893930 . A T 244.85 PASS AO=64;DP=142;FAO=64;FDP=142;FR=.;FRO=78;FSAF=16;FSAR=48;FSRF=35;FSRR=43;FWDB=-0.00652303;FXX=0.0138879;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.757;QD=6.8971;RBI=0.00652648;REFB=0.00511009;REVB=0.000212141;RO=78;SAF=16;SAR=48;SRF=35;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226523;STB=0.627007;TYPE=snp;VARB=-0.005682;OID=.;OPOS=106893930;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:78:78:64:64:48:16:35:43:48:16:35:43 chr12 106903321 . T C 219.77 PASS AO=63;DP=156;FAO=65;FDP=157;FR=.;FRO=92;FSAF=22;FSAR=43;FSRF=52;FSRR=40;FWDB=0.0102676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.191;QD=5.59925;RBI=0.0102853;REFB=-0.00673387;REVB=0.000603025;RO=93;SAF=21;SAR=42;SRF=52;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243948;STB=0.635341;TYPE=snp;VARB=0.0103652;OID=.;OPOS=106903321;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:157:93:92:63:65:42:21:52:41:43:22:52:40 chr12 107090201 . T C 198.52 PASS AO=61;DP=155;FAO=61;FDP=155;FR=.;FRO=94;FSAF=25;FSAR=36;FSRF=47;FSRR=47;FWDB=0.04539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.01;QD=5.12302;RBI=0.0487486;REFB=-0.00997794;REVB=-0.0177812;RO=92;SAF=25;SAR=36;SRF=45;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.085821;STB=0.555371;TYPE=snp;VARB=0.019951;OID=.;OPOS=107090201;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:92:94:61:61:36:25:45:47:36:25:47:47 chr12 107395106 . A G 973.4 PASS AO=102;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0374208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.443;QD=37.8019;RBI=0.0872833;REFB=0;REVB=0.0788546;RO=0;SAF=58;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000322544;OID=.;OPOS=107395106;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:103:103:0:0:102:103:44:58:0:0:44:59:0:0 chr12 107713696 . G A 136.31 PASS AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123502;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.6282;QD=36.3482;RBI=0.0782579;REFB=0;REVB=0.0772772;RO=0;SAF=9;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00183232;OID=.;OPOS=107713696;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:15:0:0:15:15:6:9:0:0:6:9:0:0 chr12 107880411 . A T 220.54 PASS AO=51;DP=103;FAO=51;FDP=103;FR=.;FRO=52;FSAF=35;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=21;FWDB=0.0201365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.627;QD=8.56457;RBI=0.0502557;REFB=-0.0139679;REVB=-0.0460452;RO=51;SAF=35;SAR=16;SRF=30;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0983824;STB=0.550809;TYPE=snp;VARB=0.0124287;OID=.;OPOS=107880411;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:51:52:51:51:16:35:30:21:16:35:31:21 chr12 107937768 . G A 147.9 PASS AO=35;DP=61;FAO=28;FDP=48;FR=.;FRO=20;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=5;FWDB=-0.0350537;FXX=0.020404;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.792;QD=12.3249;RBI=0.0356232;REFB=-0.0397949;REVB=-0.00634456;RO=25;SAF=21;SAR=14;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0621669;STB=0.534941;TYPE=snp;VARB=0.0266817;OID=.;OPOS=107937768;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:61:48:25:20:35:28:14:21:13:12:9:19:15:5 chr12 108618630 . C T 445.61 PASS AO=94;DP=172;FAO=95;FDP=175;FR=.;FRO=80;FSAF=36;FSAR=59;FSRF=35;FSRR=45;FWDB=-0.0465415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.079;QD=10.1853;RBI=0.0488933;REFB=-0.0081474;REVB=0.0149814;RO=77;SAF=36;SAR=58;SRF=34;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.050438;STB=0.528041;TYPE=snp;VARB=0.00634722;OID=.;OPOS=108618630;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:175:77:80:94:95:58:36:34:43:59:36:35:45 chr12 108686008 . C G 133.8 PASS AO=28;DP=53;FAO=28;FDP=53;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=-0.0148899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.204;QD=10.098;RBI=0.0585119;REFB=-0.0223474;REVB=-0.0565856;RO=25;SAF=9;SAR=19;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0368214;STB=0.520533;TYPE=snp;VARB=0.0188705;OID=.;OPOS=108686008;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:25:25:28:28:19:9:9:16:19:9:9:16 chr12 108910962 . C T 85.8 PASS AO=19;DP=40;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=16;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.0120413;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.123;QD=8.57974;RBI=0.018584;REFB=-0.0272744;REVB=-0.0141553;RO=21;SAF=16;SAR=3;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.517856;STB=0.797313;TYPE=snp;VARB=0.0127142;OID=.;OPOS=108910962;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:40:40:21:21:19:19:3:16:7:14:3:16:7:14 chr12 108913377 . GTTTT GTTT,GTTTA 156.61 PASS AO=11,13;DP=67;FAO=33,7;FDP=65;FR=.;FRO=25;FSAF=10,2;FSAR=23,5;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.105287,-0.0658026;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=10.8311,10.5075;QD=9.63759;RBI=0.111386,0.0925282;REFB=-0.0907549,-0.116505;REVB=0.0363516,-0.0650499;RO=13;SAF=4,4;SAR=7,9;SRF=5;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0208455,-0.075581;STB=0.547589,0.5997;TYPE=del,snp;VARB=0.0826777,0.0533976;OID=.,.;OPOS=108913378,108913381;OREF=T,T;OALT=-,A;OMAPALT=GTTT,GTTTA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:11,13:60:33,7:65:25:10,2:23,5:10:15:37:13:4,4:7,9:5:8 chr12 108918146 . C T 538.58 PASS AO=133;DP=277;FAO=133;FDP=277;FR=.;FRO=144;FSAF=64;FSAR=69;FSRF=65;FSRR=79;FWDB=-0.00978132;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.095;QD=7.77737;RBI=0.010068;REFB=-0.00705337;REVB=-0.00238545;RO=144;SAF=64;SAR=69;SRF=65;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0282368;STB=0.515537;TYPE=snp;VARB=0.00799101;OID=.;OPOS=108918146;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:277:277:144:144:133:133:69:64:65:79:69:64:65:79 chr12 108923950 . A G 87.54 PASS AO=35;DP=113;FAO=35;FDP=112;FR=.;FRO=77;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=31;FSRR=46;FWDB=-0.0367288;FXX=0.0175423;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.7913;QD=3.12626;RBI=0.0371102;REFB=-0.0219714;REVB=-0.00530684;RO=75;SAF=14;SAR=21;SRF=30;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.501858;TYPE=snp;VARB=0.0463735;OID=.;OPOS=108923950;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:113:112:75:77:35:35:21:14:30:45:21:14:31:46 chr12 108930284 . A T 101.45 PASS AO=38;DP=112;FAO=38;FDP=116;FR=.;FRO=78;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=52;FSRR=26;FWDB=-0.0233863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.273;QD=3.4982;RBI=0.0286118;REFB=0.00706924;REVB=-0.0164838;RO=65;SAF=24;SAR=14;SRF=41;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000959067;STB=0.525678;TYPE=snp;VARB=-0.0195815;OID=.;OPOS=108930284;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:116:65:78:38:38:14:24:41:24:14:24:52:26 chr12 108941700 . C G 281.49 PASS AO=56;DP=100;FAO=56;FDP=99;FR=.;FRO=43;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=0.00849439;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.388;QD=11.3732;RBI=0.0135749;REFB=0.00475119;REVB=0.0105888;RO=42;SAF=25;SAR=31;SRF=17;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0331667;STB=0.512253;TYPE=snp;VARB=-0.00369896;OID=.;OPOS=108941700;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:99:42:43:56:56:31:25:17:25:31:25:18:25 chr12 108954823 . C T 77.87 PASS AO=22;DP=56;FAO=22;FDP=56;FR=.;FRO=34;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=24;FWDB=0.0330488;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4043;QD=5.56219;RBI=0.0373649;REFB=-0.00536451;REVB=0.017433;RO=34;SAF=7;SAR=15;SRF=10;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0296429;STB=0.51703;TYPE=snp;VARB=0.00942737;OID=.;OPOS=108954823;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:56:56:34:34:22:22:15:7:10:24:15:7:10:24 chr12 108955106 . C CT 464.36 PASS AO=53;DP=63;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.037268;FXX=0.031741;HRUN=1;LEN=1;MLLD=21.488;QD=30.4495;RBI=0.0392872;REFB=0;REVB=-0.0124333;RO=3;SAF=14;SAR=39;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0507744;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-0.00158865;OID=.;OPOS=108955107;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:53:63:61:61:0:20:41:0:0:42:3:14:39:2:1 chr12 108955158 . T A 88.3 PASS AO=24;DP=59;FAO=24;FDP=59;FR=.;FRO=35;FSAF=4;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=-0.00971385;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.057;QD=5.98646;RBI=0.0241524;REFB=0.00622194;REVB=0.0221128;RO=35;SAF=4;SAR=20;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.290386;STB=0.66913;TYPE=snp;VARB=-0.0106023;OID=.;OPOS=108955158;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:59:59:35:35:24:24:20:4:13:22:20:4:13:22 chr12 108986112 . G C 76.66 PASS AO=13;DP=23;FAO=14;FDP=24;FR=.;FRO=10;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0190099;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.85;QD=12.7767;RBI=0.0196646;REFB=-0.00233254;REVB=-0.00503167;RO=10;SAF=10;SAR=3;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.316108;STB=0.640814;TYPE=snp;VARB=0.00476234;OID=.;OPOS=108986112;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:23:24:10:10:13:14:3:10:4:6:4:10:4:6 chr12 109017612 . C G 86.41 PASS AO=16;DP=28;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0352854;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.2322;QD=12.3446;RBI=0.0541185;REFB=-0.0178317;REVB=-0.0410335;RO=12;SAF=10;SAR=6;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160942;STB=0.590794;TYPE=snp;VARB=0.0208374;OID=.;OPOS=109017612;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:28:28:12:12:16:16:6:10:5:7:6:10:5:7 chr12 109182049 . T C 107.28 PASS AO=25;DP=53;FAO=25;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.104749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.99;QD=8.09636;RBI=0.104812;REFB=0.00584496;REVB=-0.00363507;RO=28;SAF=12;SAR=13;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0147504;STB=0.508314;TYPE=snp;VARB=-0.0113262;OID=.;OPOS=109182049;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:28:28:25:25:13:12:13:15:13:12:13:15 chr12 109205077 . G A 431.69 PASS AO=113;DP=248;FAO=113;FDP=248;FR=.;FRO=135;FSAF=43;FSAR=70;FSRF=53;FSRR=82;FWDB=0.0343065;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.6718;QD=6.96275;RBI=0.0424402;REFB=0.0181931;REVB=-0.0249847;RO=135;SAF=43;SAR=70;SRF=53;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125348;STB=0.506939;TYPE=snp;VARB=-0.0213784;OID=.;OPOS=109205077;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:248:248:135:135:113:113:70:43:53:82:70:43:53:82 chr12 109221123 . G A 462.68 PASS AO=108;DP=215;FAO=108;FDP=215;FR=.;FRO=107;FSAF=52;FSAR=56;FSRF=54;FSRR=53;FWDB=-0.03202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.3773;QD=8.60793;RBI=0.0364257;REFB=-0.0161103;REVB=-0.0173651;RO=105;SAF=52;SAR=56;SRF=53;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0209288;STB=0.511546;TYPE=snp;VARB=0.0110429;OID=.;OPOS=109221123;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:215:105:107:108:108:56:52:53:52:56:52:54:53 chr12 109511256 . T C 1251.82 PASS AO=131;DP=132;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0360179;FXX=0.00751823;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.761;QD=37.9341;RBI=0.0371674;REFB=0;REVB=0.00917178;RO=0;SAF=50;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.19503e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000430111;OID=.;OPOS=109511256;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:132:132:0:0:131:132:81:50:0:0:81:51:0:0 chr12 109605730 . C T 1204.2 PASS AO=126;DP=127;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0368268;FXX=0.0078734;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.606;QD=38.2284;RBI=0.0379903;REFB=0;REVB=0.0093302;RO=0;SAF=44;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.4827e-05;OID=.;OPOS=109605730;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:127:126:0:0:126:126:82:44:0:0:82:44:0:0 chr12 109617865 . T C 928.47 PASS AO=97;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.035;QD=38.2874;RBI=0.0241271;REFB=0;REVB=0.0158948;RO=0;SAF=48;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.02568e-05;OID=.;OPOS=109617865;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:97:97:0:0:97:97:49:48:0:0:49:48:0:0 chr12 109623516 . G A 767.56 PASS AO=81;DP=82;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0336546;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.792;QD=37.9042;RBI=0.0370814;REFB=0;REVB=-0.0155691;RO=0;SAF=9;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.86106e-05;OID=.;OPOS=109623516;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:82:81:0:0:81:81:72:9:0:0:72:9:0:0 chr12 109675029 . T C 1222.08 PASS AO=131;DP=135;FAO=132;FDP=134;FR=.;FRO=2;FSAF=68;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00751425;FXX=0.00740686;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.046;QD=36.4801;RBI=0.0198913;REFB=0.000752198;REVB=0.0184174;RO=3;SAF=68;SAR=63;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0220908;STB=0.507691;TYPE=snp;VARB=-2.90858e-05;OID=.;OPOS=109675029;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:135:134:3:2:131:132:63:68:0:3:64:68:0:2 chr12 109696838 . G A 1407.98 PASS AO=149;DP=151;FAO=151;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0353483;FXX=0.0194793;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.189;QD=37.2974;RBI=0.0375303;REFB=-0.053435;REVB=0.0126104;RO=0;SAF=56;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000219182;OID=.;OPOS=109696838;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:151:151:0:0:149:151:93:56:0:0:94:57:0:0 chr12 109717697 . A G 88.81 PASS AO=23;DP=54;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=10;FWDB=0.00171272;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.5899;QD=6.57868;RBI=0.0126496;REFB=-0.0324199;REVB=0.0125331;RO=30;SAF=12;SAR=11;SRF=21;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180114;STB=0.590169;TYPE=snp;VARB=0.0449584;OID=.;OPOS=109717697;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:54:54:30:31:23:23:11:12:21:9:11:12:21:10 chr12 109826634 . C A 215.94 PASS AO=62;DP=150;FAO=62;FDP=150;FR=.;FRO=88;FSAF=17;FSAR=45;FSRF=39;FSRR=49;FWDB=0.00682925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7894;QD=5.75846;RBI=0.00973421;REFB=-0.00143906;REVB=-0.00693659;RO=88;SAF=17;SAR=45;SRF=39;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198115;STB=0.611909;TYPE=snp;VARB=0.00161687;OID=.;OPOS=109826634;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:150:88:88:62:62:45:17:39:49:45:17:39:49 chr12 109835590 . A G 161.38 PASS AO=40;DP=87;FAO=40;FDP=87;FR=.;FRO=47;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=25;FWDB=-0.0191972;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=152.072;QD=7.41984;RBI=0.0211958;REFB=-0.0157384;REVB=-0.00898497;RO=47;SAF=19;SAR=21;SRF=22;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00669571;STB=0.503745;TYPE=snp;VARB=0.0158921;OID=.;OPOS=109835590;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:47:47:40:40:21:19:22:25:21:19:22:25 chr12 109839042 . G C 370.23 PASS AO=102;DP=235;FAO=103;FDP=235;FR=.;FRO=132;FSAF=42;FSAR=61;FSRF=53;FSRR=79;FWDB=-0.0108797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.974;QD=6.30176;RBI=0.0176522;REFB=0.00282016;REVB=-0.0139008;RO=132;SAF=42;SAR=60;SRF=53;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0107552;STB=0.50364;TYPE=snp;VARB=-0.00346663;OID=.;OPOS=109839042;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:235:235:132:132:102:103:60:42:53:79:61:42:53:79 chr12 109848567 . T C 1345.96 PASS AO=140;DP=140;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0316196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.795;QD=38.1831;RBI=0.0317925;REFB=0;REVB=0.00331148;RO=0;SAF=71;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.29942e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.77872e-05;OID=.;OPOS=109848567;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:140:141:0:0:140:141:69:71:0:0:70:71:0:0 chr12 109883374 . T C 639.75 PASS AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0255681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.622;QD=38.1942;RBI=0.0358511;REFB=0;REVB=0.0251312;RO=0;SAF=44;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.11549e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.18789e-05;OID=.;OPOS=109883374;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:67:67:0:0:67:67:23:44:0:0:23:44:0:0 chr12 109887525 . C T 31.85 PASS AO=11;DP=37;FAO=11;FDP=37;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=0.0170979;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.446;QD=3.44351;RBI=0.0203698;REFB=-0.000440155;REVB=0.011072;RO=26;SAF=6;SAR=5;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128107;STB=0.577753;TYPE=snp;VARB=0.00130719;OID=.;OPOS=109887525;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:37:37:26:26:11:11:5:6:17:9:5:6:17:9 chr12 109894028 . A G 485.44 PASS AO=118;DP=240;FAO=118;FDP=243;FR=.;FRO=125;FSAF=39;FSAR=79;FSRF=36;FSRR=89;FWDB=-0.0548273;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.475;QD=7.9907;RBI=0.0550303;REFB=-0.00573959;REVB=-0.00472319;RO=122;SAF=39;SAR=79;SRF=35;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0464473;STB=0.525122;TYPE=snp;VARB=0.00496101;OID=.;OPOS=109894028;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:240:243:122:125:118:118:79:39:35:87:79:39:36:89 chr12 109937534 . G A 782.49 PASS AO=86;DP=90;FAO=87;FDP=90;FR=.;FRO=3;FSAF=11;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.027904;FXX=0.0109878;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.708;QD=34.7772;RBI=0.0345377;REFB=0.0301293;REVB=0.0203524;RO=3;SAF=11;SAR=75;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0185746;STB=0.509675;TYPE=snp;VARB=-0.00027852;OID=.;OPOS=109937534;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:90:90:3:3:86:87:75:11:0:3:76:11:0:3 chr12 109955708 . A C 111.25 PASS AO=50;DP=168;FAO=50;FDP=168;FR=.;FRO=118;FSAF=30;FSAR=20;FSRF=70;FSRR=48;FWDB=-0.0227353;FXX=0.00591681;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.218;QD=2.64877;RBI=0.0245871;REFB=-0.00815491;REVB=-0.00936112;RO=116;SAF=30;SAR=20;SRF=69;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00644007;STB=0.504948;TYPE=snp;VARB=0.0160732;OID=.;OPOS=109955708;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:116:118:50:50:20:30:69:47:20:30:70:48 chr12 109971481 . C G 31.96 PASS AO=10;DP=32;FAO=10;FDP=32;FR=.;FRO=22;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=19;FWDB=-0.00760395;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=265.079;QD=3.9945;RBI=0.02224;REFB=-0.0192109;REVB=-0.0208997;RO=22;SAF=1;SAR=9;SRF=3;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100431;STB=0.562363;TYPE=snp;VARB=0.0339666;OID=.;OPOS=109971481;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:32:32:22:22:10:10:9:1:3:19:9:1:3:19 chr12 109993942 . G T 134.13 PASS AO=26;DP=47;FAO=26;FDP=46;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=3;FSRR=17;FWDB=0.0317743;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.735;QD=11.6632;RBI=0.0354991;REFB=-0.0185601;REVB=-0.0158297;RO=20;SAF=9;SAR=17;SRF=3;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181755;STB=0.59993;TYPE=snp;VARB=0.0145802;OID=.;OPOS=109993942;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:47:46:20:20:26:26:17:9:3:17:17:9:3:17 chr12 109994453 . T A 48.56 PASS AO=12;DP=32;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=1;FSRF=15;FSRR=5;FWDB=0.0290266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.638;QD=5.88608;RBI=0.0819965;REFB=-0.0580902;REVB=-0.0766869;RO=19;SAF=11;SAR=1;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.365445;STB=0.726821;TYPE=snp;VARB=0.0913512;OID=.;OPOS=109994453;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:32:33:19:20:12:13:1:11:14:5:1:12:15:5 chr12 109994870 . A T 633.14 PASS AO=62;DP=63;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00129385;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.819;QD=37.7992;RBI=0.0189011;REFB=0;REVB=-0.0188568;RO=0;SAF=28;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.87162e-05;OID=.;OPOS=109994870;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:63:67:0:0:62:67:34:28:0:0:36:31:0:0 chr12 110004804 . C T 114.35 PASS AO=35;DP=92;FAO=35;FDP=92;FR=.;FRO=57;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=32;FSRR=25;FWDB=-0.000573835;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=258.891;QD=4.97165;RBI=0.0151037;REFB=-0.0103563;REVB=0.0150928;RO=56;SAF=13;SAR=22;SRF=32;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216211;STB=0.618296;TYPE=snp;VARB=0.0222567;OID=.;OPOS=110004804;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:56:57:35:35:22:13:32:24:22:13:32:25 chr12 110011229 . G T 62.69 PASS AO=12;DP=26;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=0;FWDB=-0.0161503;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.342;QD=9.64453;RBI=0.032014;REFB=-0.0296429;REVB=0.0276418;RO=13;SAF=1;SAR=11;SRF=13;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.758651;STB=0.881833;TYPE=snp;VARB=0.0113703;OID=.;OPOS=110011229;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:26:26:13:13:12:13:11:1:13:0:11:2:13:0 chr12 110011230 . C T 69.38 PASS AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=0;FWDB=-0.038457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.7817;QD=10.2789;RBI=0.118139;REFB=0.00294352;REVB=0.111705;RO=13;SAF=3;SAR=11;SRF=13;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.608263;STB=0.841678;TYPE=snp;VARB=0.000790382;OID=.;OPOS=110011230;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:27:27:13:13:14:14:11:3:13:0:11:3:13:0 chr12 110013879 . G A 196.16 PASS AO=51;DP=114;FAO=51;FDP=114;FR=.;FRO=63;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=38;FSRR=25;FWDB=-0.0115475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.073;QD=6.88295;RBI=0.0148867;REFB=-0.00125224;REVB=0.0093952;RO=63;SAF=27;SAR=24;SRF=38;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0736482;STB=0.541087;TYPE=snp;VARB=0.00235662;OID=.;OPOS=110013879;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:63:63:51:51:24:27:38:25:24:27:38:25 chr12 110019338 . C T 127.11 PASS AO=25;DP=48;FAO=25;FDP=46;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=3;FSRR=18;FWDB=-0.0278706;FXX=0.061212;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.9106;QD=11.0528;RBI=0.042379;REFB=-0.0057175;REVB=0.0319251;RO=19;SAF=8;SAR=17;SRF=3;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1549;STB=0.5995;TYPE=snp;VARB=0.00336417;OID=.;OPOS=110019338;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:48:46:19:21:25:25:17:8:3:16:17:8:3:18 chr12 110024541 . A G 258.18 PASS AO=44;DP=134;FAO=61;FDP=127;FR=.,HEALED;FRO=66;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=37;FSRR=29;FWDB=-0.0311994;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.9516;QD=8.13167;RBI=0.0321531;REFB=-0.00333071;REVB=-0.00777295;RO=38;SAF=15;SAR=29;SRF=10;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0748138;STB=0.527259;TYPE=snp;VARB=0.00281243;OID=.;OPOS=110024541;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:127:38:66:44:61:29:15:10:28:30:31:37:29 chr12 110100880 . T TG 77.29 PASS AO=30;DP=76;FAO=33;FDP=74;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=27;FWDB=-0.122382;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=17.7994;QD=4.17789;RBI=0.17069;REFB=0.0267072;REVB=-0.118987;RO=44;SAF=14;SAR=16;SRF=15;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133754;STB=0.563872;TYPE=ins;VARB=-0.066599;OID=.;OPOS=110100881;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:30:76:33:74:41:15:18:14:27:77:44:14:16:15:29 chr12 110226379 . G A 233.74 PASS AO=52;DP=96;FAO=50;FDP=94;FR=.;FRO=44;FSAF=33;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=0.00514764;FXX=0.0208312;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.273;QD=9.94628;RBI=0.0328877;REFB=-0.0143113;REVB=-0.0324824;RO=44;SAF=35;SAR=17;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115263;STB=0.557511;TYPE=snp;VARB=0.00689506;OID=.;OPOS=110226379;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:94:44:44:52:50:17:35:24:20:17:33:24:20 chr12 110240838 . T G 75.55 PASS AO=17;DP=36;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=-0.0124991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.195;QD=8.39427;RBI=0.0206091;REFB=-0.0116308;REVB=-0.0163861;RO=19;SAF=3;SAR=14;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123809;STB=0.571338;TYPE=snp;VARB=0.0164857;OID=.;OPOS=110240838;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:36:36:19:19:17:17:14:3:5:14:14:3:5:14 chr12 110290073 . G A 65.06 PASS AO=24;DP=75;FAO=24;FDP=75;FR=.;FRO=51;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=33;FWDB=0.00701131;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.334;QD=3.4701;RBI=0.00934492;REFB=0.00799282;REVB=0.00617811;RO=47;SAF=12;SAR=12;SRF=17;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157516;STB=0.59992;TYPE=snp;VARB=-0.0142288;OID=.;OPOS=110290073;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:75:75:47:51:24:24:12:12:17:30:12:12:18:33 chr12 110368201 . G A 375.4 PASS AO=102;DP=231;FAO=103;FDP=234;FR=.;FRO=131;FSAF=39;FSAR=64;FSRF=50;FSRR=81;FWDB=-0.0211968;FXX=0.00847422;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.199;QD=6.41701;RBI=0.0303113;REFB=0.00152055;REVB=0.0216672;RO=116;SAF=39;SAR=63;SRF=45;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.005677;STB=0.501806;TYPE=snp;VARB=-0.00186511;OID=.;OPOS=110368201;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:231:234:116:131:102:103:63:39:45:71:64:39:50:81 chr12 110974744 . G C 122.39 PASS AO=41;DP=115;FAO=41;FDP=114;FR=.;FRO=73;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=40;FSRR=33;FWDB=-0.0163625;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.859;QD=4.29444;RBI=0.0193181;REFB=-0.0184329;REVB=-0.0102693;RO=73;SAF=15;SAR=26;SRF=40;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205172;STB=0.617653;TYPE=snp;VARB=0.0220292;OID=.;OPOS=110974744;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:114:73:73:41:41:26:15:40:33:26:15:40:33 chr12 110974890 . T C 232.34 PASS AO=30;DP=39;FAO=32;FDP=40;FR=.;FRO=8;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.000784231;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.681;QD=23.2341;RBI=0.0368005;REFB=0.000319681;REVB=-0.0367922;RO=8;SAF=13;SAR=17;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0262607;STB=0.51928;TYPE=snp;VARB=-0.000292803;OID=.;OPOS=110974890;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:39:40:8:8:30:32:17:13:4:4:19:13:4:4 chr12 111336892 . G A 241.75 PASS AO=60;DP=127;FAO=60;FDP=129;FR=.;FRO=69;FSAF=46;FSAR=14;FSRF=33;FSRR=36;FWDB=0.0119623;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=201.662;QD=7.49621;RBI=0.0119799;REFB=-0.0139593;REVB=0.00064974;RO=66;SAF=46;SAR=14;SRF=33;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.289033;STB=0.675216;TYPE=snp;VARB=0.0171236;OID=.;OPOS=111336892;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:129:66:69:60:60:14:46:33:33:14:46:33:36 chr12 111342558 . G T 434.7 PASS AO=44;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0712916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.048;QD=37.8;RBI=0.0713448;REFB=0;REVB=-0.00275492;RO=0;SAF=1;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000114115;OID=.;OPOS=111342558;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:45:46:0:0:44:46:43:1:0:0:44:2:0:0 chr12 111375170 . A G 63.37 PASS AO=35;DP=142;FAO=36;FDP=143;FR=.;FRO=107;FSAF=7;FSAR=29;FSRF=39;FSRR=68;FWDB=0.0479253;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6894;QD=1.77271;RBI=0.0479476;REFB=0.000334149;REVB=0.0014646;RO=107;SAF=6;SAR=29;SRF=39;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.309771;STB=0.662592;TYPE=snp;VARB=-0.000238626;OID=.;OPOS=111375170;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:142:143:107:107:35:36:29:6:39:68:29:7:39:68 chr12 111375172 . C T 110.67 PASS AO=45;DP=140;FAO=45;FDP=143;FR=.;FRO=98;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=30;FSRR=68;FWDB=0.042535;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=263.638;QD=3.09561;RBI=0.043999;REFB=-0.00044415;REVB=0.0112553;RO=95;SAF=16;SAR=29;SRF=30;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0518058;STB=0.537752;TYPE=snp;VARB=0.00099745;OID=.;OPOS=111375172;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:143:95:98:45:45:29:16:30:65:29:16:30:68 chr12 111760251 . G C 26.14 PASS AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=0.0308063;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.7434;QD=6.53446;RBI=0.105735;REFB=-0.00814549;REVB=-0.101148;RO=9;SAF=3;SAR=3;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.27543;STB=0.686962;TYPE=snp;VARB=0.00730039;OID=.;OPOS=111760251;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:15:16:9:10:6:6:3:3:2:7:3:3:2:8 chr12 111785586 . T C 69.5 PASS AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=-0.00699595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.631;QD=10.297;RBI=0.0154378;REFB=-0.0134815;REVB=0.0137616;RO=13;SAF=11;SAR=3;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0203139;STB=0.511611;TYPE=snp;VARB=0.0119017;OID=.;OPOS=111785586;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:27:27:13:13:14:14:3:11:10:3:3:11:10:3 chr12 111786082 . G C 292.47 PASS AO=27;DP=27;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.51;QD=38.9965;RBI=0.130177;REFB=0;REVB=0.12875;RO=0;SAF=14;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39874e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0016981;OID=.;OPOS=111786082;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:27:30:0:0:27:30:13:14:0:0:16:14:0:0 chr12 111786892 . T C 226.24 PASS AO=70;DP=178;FAO=70;FDP=178;FR=.;FRO=108;FSAF=28;FSAR=42;FSRF=52;FSRR=56;FWDB=-0.0230683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.711;QD=5.08402;RBI=0.0243945;REFB=-0.0149588;REVB=0.00793382;RO=107;SAF=28;SAR=42;SRF=51;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0839503;STB=0.550444;TYPE=snp;VARB=0.0197396;OID=.;OPOS=111786892;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:178:107:108:70:70:42:28:51:56:42:28:52:56 chr12 111798553 . A G 190.77 PASS AO=54;DP=126;FAO=54;FDP=130;FR=.;FRO=76;FSAF=33;FSAR=21;FSRF=25;FSRR=51;FWDB=-0.0479475;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.9747;QD=5.86983;RBI=0.0483112;REFB=-0.00302293;REVB=-0.00591703;RO=71;SAF=33;SAR=21;SRF=20;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.325042;STB=0.661044;TYPE=snp;VARB=0.00326027;OID=.;OPOS=111798553;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:130:71:76:54:54:21:33:20:51:21:33:25:51 chr12 111884608 . T C 919.1 PASS AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0188524;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.36;QD=38.296;RBI=0.0233555;REFB=0;REVB=0.0137864;RO=0;SAF=55;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.74204e-05;OID=.;OPOS=111884608;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:96:96:0:0:96:96:41:55:0:0:41:55:0:0 chr12 112681251 . C T 281.93 PASS AO=59;DP=111;FAO=60;FDP=112;FR=.;FRO=52;FSAF=37;FSAR=23;FSRF=20;FSRR=32;FWDB=0.0086475;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.755;QD=10.0689;RBI=0.0185954;REFB=-0.0294285;REVB=0.0164623;RO=52;SAF=37;SAR=22;SRF=20;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208;STB=0.608153;TYPE=snp;VARB=0.0173901;OID=.;OPOS=112681251;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:112:52:52:59:60:22:37:20:32:23:37:20:32 chr12 113319600 . C T 198.54 PASS AO=40;DP=72;FAO=40;FDP=72;FR=.;FRO=32;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=7;FSRR=25;FWDB=0.0472517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.9321;QD=11.0297;RBI=0.0539049;REFB=-0.0171883;REVB=0.0259426;RO=32;SAF=22;SAR=18;SRF=7;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.263471;STB=0.644346;TYPE=snp;VARB=0.0115845;OID=.;OPOS=113319600;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:32:32:40:40:18:22:7:25:18:22:7:25 chr12 113325629 . T C 311.87 PASS AO=85;DP=197;FAO=85;FDP=194;FR=.;FRO=109;FSAF=21;FSAR=64;FSRF=29;FSRR=80;FWDB=0.00726039;FXX=0.0152277;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.969;QD=6.4302;RBI=0.0089036;REFB=-0.00671038;REVB=-0.00515372;RO=108;SAF=21;SAR=64;SRF=29;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0284943;STB=0.514135;TYPE=snp;VARB=0.00792654;OID=.;OPOS=113325629;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:194:108:109:85:85:64:21:29:79:64:21:29:80 chr12 113348870 . G A 1182.2 PASS AO=121;DP=121;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0339339;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.2091;QD=38.1355;RBI=0.0528984;REFB=0;REVB=0.0405799;RO=0;SAF=62;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.19945e-05;OID=.;OPOS=113348870;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:121:124:0:0:121:124:59:62:0:0:62:62:0:0 chr12 113357193 . G A 533.36 PASS AO=52;DP=54;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0959855;FXX=0.0175408;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.2619;QD=38.0968;RBI=0.0960653;REFB=0;REVB=-0.00391687;RO=1;SAF=33;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140615;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00139443;OID=.;OPOS=113357193;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:54:56:1:0:52:56:19:33:1:0:21:35:0:0 chr12 113357209 . G A 873.46 PASS AO=92;DP=93;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0296425;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.4831;QD=37.9766;RBI=0.055207;REFB=0;REVB=-0.046574;RO=0;SAF=51;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.99529e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000414716;OID=.;OPOS=113357209;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:93:92:0:0:92:92:41:51:0:0:41:51:0:0 chr12 113357237 . G C 1348.94 PASS AO=143;DP=144;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0303228;FXX=0.0137922;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.6328;QD=37.7326;RBI=0.0888239;REFB=0.0501014;REVB=-0.0834878;RO=1;SAF=80;SAR=63;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00590723;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000339604;OID=.;OPOS=113357237;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:144:143:1:0:143:143:63:80:1:0:63:80:0:0 chr12 113357442 . G A 1397.35 PASS AO=143;DP=143;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.065062;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.1684;QD=38.2834;RBI=0.0791111;REFB=0;REVB=0.0450055;RO=0;SAF=70;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.12326e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000561985;OID=.;OPOS=113357442;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:143:146:0:0:143:146:73:70:0:0:76:70:0:0 chr12 113369715 . TA T 1007.06 PASS AO=102;DP=111;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000453624;FXX=0.0366939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.112;QD=38.3641;RBI=0.00296629;REFB=0;REVB=0.0029314;RO=0;SAF=39;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.00015545;OID=.;OPOS=113369716;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:102:108:105:105:0:40:65:0:0:48:0:39:63:0:0 chr12 113369759 . G C 901.71 PASS AO=97;DP=99;FAO=97;FDP=99;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=60;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00349535;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.0355;QD=36.4329;RBI=0.0266754;REFB=0.026527;REVB=-0.0264454;RO=2;SAF=37;SAR=60;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00480596;STB=0.502534;TYPE=snp;VARB=-0.000627015;OID=.;OPOS=113369759;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:99:99:2:2:97:97:60:37:1:1:60:37:1:1 chr12 113376388 . G A 166.66 PASS AO=18;DP=20;FAO=19;FDP=20;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0233246;FXX=0.0475964;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.1279;QD=33.3319;RBI=0.111954;REFB=-0.0576626;REVB=0.109497;RO=2;SAF=4;SAR=14;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181817;STB=0.555494;TYPE=snp;VARB=0.0115818;OID=.;OPOS=113376388;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:2:1:18:19:14:4:2:0:15:4:1:0 chr12 113386779 . C G 10.3 PASS AO=2;DP=8;FAO=2;FDP=8;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.00611921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.182;QD=5.1483;RBI=0.031766;REFB=-0.00338283;REVB=-0.031171;RO=5;SAF=1;SAR=1;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.576642;STB=0.748118;TYPE=snp;VARB=0.0128561;OID=.;OPOS=113386779;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:8:5:6:2:2:1:1:5:0:1:1:5:1 chr12 113386950 . T C 923.86 PASS AO=99;DP=103;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0366031;FXX=0.0388312;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.827;QD=37.3276;RBI=0.0366427;REFB=-0.0353936;REVB=0.00170273;RO=0;SAF=18;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.58805e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.96499e-05;OID=.;OPOS=113386950;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:103:99:0:0:99:99:81:18:0:0:81:18:0:0 chr12 113401199 . G A 125.38 PASS AO=36;DP=91;FAO=36;FDP=90;FR=.;FRO=54;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=33;FWDB=-0.0215913;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.812;QD=5.57262;RBI=0.0216787;REFB=-0.0207768;REVB=-0.00194561;RO=54;SAF=20;SAR=16;SRF=21;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174682;STB=0.598968;TYPE=snp;VARB=0.0252942;OID=.;OPOS=113401199;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:90:54:54:36:36:16:20:21:33:16:20:21:33 chr12 113403684 . C T 152.33 PASS AO=37;DP=85;FAO=39;FDP=87;FR=.;FRO=48;FSAF=27;FSAR=12;FSRF=28;FSRR=20;FWDB=0.0118326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.65;QD=7.00386;RBI=0.0243209;REFB=-0.0268311;REVB=0.0212484;RO=48;SAF=25;SAR=12;SRF=28;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10108;STB=0.566894;TYPE=snp;VARB=0.0209971;OID=.;OPOS=113403684;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:87:48:48:37:39:12:25:28:20:12:27:28:20 chr12 113424893 . C G 675.05 PASS AO=151;DP=289;FAO=151;FDP=289;FR=.;FRO=138;FSAF=79;FSAR=72;FSRF=83;FSRR=55;FWDB=-0.00217864;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=181.472;QD=9.34331;RBI=0.00229403;REFB=0.00366239;REVB=0.0007184;RO=138;SAF=79;SAR=72;SRF=83;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0688642;STB=0.537581;TYPE=snp;VARB=-0.00335296;OID=.;OPOS=113424893;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:289:289:138:138:151:151:72:79:83:55:72:79:83:55 chr12 113425154 . C G 657.42 PASS AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0115994;FXX=0.028165;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.898;QD=38.1114;RBI=0.0133585;REFB=0;REVB=0.00662599;RO=0;SAF=18;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.64454e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.29989e-06;OID=.;OPOS=113425154;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:69:69:0:0:69:69:51:18:0:0:51:18:0:0 chr12 113435450 . A T 2278.97 PASS AO=236;DP=237;FAO=237;FDP=237;FR=.;FRO=0;FSAF=124;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00530461;FXX=0.0042015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.867;QD=38.4637;RBI=0.0210264;REFB=0;REVB=-0.0203463;RO=0;SAF=124;SAR=112;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.10615e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.49707e-05;OID=.;OPOS=113435450;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:237:237:0:0:236:237:112:124:0:0:113:124:0:0 chr12 113448288 . A G 1326.52 PASS AO=141;DP=142;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0294639;FXX=0.00704176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.071;QD=37.6318;RBI=0.0340977;REFB=-0.0339073;REVB=0.0171618;RO=1;SAF=65;SAR=76;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00725914;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000222311;OID=.;OPOS=113448288;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:142:141:1:0:141:141:76:65:1:0:76:65:0:0 chr12 113532885 . C T 130.2 PASS AO=18;DP=50;FAO=28;FDP=56;FR=.,HEALED;FRO=28;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=0.00110579;FXX=0.0508388;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.856;QD=9.30029;RBI=0.0125067;REFB=-0.00950042;REVB=0.0124577;RO=18;SAF=17;SAR=1;SRF=17;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.520158;TYPE=snp;VARB=0.0104425;OID=.;OPOS=113532885;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:56:18:28:18:28:1:17:17:1:9:19:18:10 chr12 113537562 . C T 166.24 PASS AO=24;DP=34;FAO=26;FDP=36;FR=.;FRO=10;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.016837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.058;QD=18.4707;RBI=0.0207797;REFB=-0.0304216;REVB=0.0121783;RO=10;SAF=9;SAR=15;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.043459;STB=0.514275;TYPE=snp;VARB=0.0146177;OID=.;OPOS=113537562;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:34:36:10:10:24:26:15:9:3:7:17:9:3:7 chr12 113537773 . C T 105.04 PASS AO=19;DP=31;FAO=19;FDP=32;FR=.;FRO=13;FSAF=16;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.0681845;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.0935;QD=13.1298;RBI=0.0686718;REFB=0.00379717;REVB=0.00816713;RO=12;SAF=16;SAR=3;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109266;STB=0.598814;TYPE=snp;VARB=0.000461382;OID=.;OPOS=113537773;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:31:32:12:13:19:19:3:16:9:3:3:16:9:4 chr12 113538415 . A T 211.92 PASS AO=47;DP=92;FAO=47;FDP=92;FR=.;FRO=45;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=0.00966326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.288;QD=9.21401;RBI=0.0441458;REFB=-0.0186484;REVB=-0.0430752;RO=45;SAF=28;SAR=19;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115499;STB=0.563907;TYPE=snp;VARB=0.0175224;OID=.;OPOS=113538415;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:45:45:47:47:19:28:21:24:19:28:21:24 chr12 113542098 . A G 59.03 PASS AO=13;DP=28;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=12;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.00955858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.652;QD=8.43319;RBI=0.0317853;REFB=-0.0108915;REVB=-0.030314;RO=15;SAF=12;SAR=1;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.620656;STB=0.868876;TYPE=snp;VARB=0.0332306;OID=.;OPOS=113542098;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:28:28:15:15:13:13:1:12:6:9:1:12:6:9 chr12 113553481 . C T 57.92 PASS AO=15;DP=37;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.0307208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.93;QD=6.26129;RBI=0.0339216;REFB=-0.0257964;REVB=0.0143842;RO=21;SAF=2;SAR=13;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.51596;STB=0.79779;TYPE=snp;VARB=0.0103398;OID=.;OPOS=113553481;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:37:37:21:22:15:15:13:2:12:9:13:2:12:10 chr12 113554946 . G A 64.53 PASS AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.00618714;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=238.519;QD=8.60415;RBI=0.00628958;REFB=-0.0128567;REVB=0.00113052;RO=16;SAF=7;SAR=7;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.057851;STB=0.533286;TYPE=snp;VARB=0.0106742;OID=.;OPOS=113554946;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:30:30:16:16:14:14:7:7:9:7:7:7:9:7 chr12 113565933 . G A 65.57 PASS AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=18;FWDB=-0.00796366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.045;QD=7.08882;RBI=0.00852968;REFB=0.00958916;REVB=0.00305543;RO=20;SAF=11;SAR=5;SRF=3;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.486615;STB=0.782976;TYPE=snp;VARB=-0.00759223;OID=.;OPOS=113565933;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:36:37:20:21:16:16:5:11:3:17:5:11:3:18 chr12 113589762 . A G 153.95 PASS AO=40;DP=92;FAO=40;FDP=91;FR=.;FRO=51;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=28;FSRR=23;FWDB=-0.00117513;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.136;QD=6.76722;RBI=0.00820754;REFB=-0.0116136;REVB=-0.00812298;RO=50;SAF=17;SAR=23;SRF=28;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133627;STB=0.569585;TYPE=snp;VARB=0.0116277;OID=.;OPOS=113589762;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:91:50:51:40:40:23:17:28:22:23:17:28:23 chr12 113596866 . G A 105.32 PASS AO=18;DP=33;FAO=20;FDP=35;FR=.;FRO=15;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.0274489;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=79.4742;QD=12.0367;RBI=0.0413093;REFB=-0.0197776;REVB=0.0308709;RO=15;SAF=14;SAR=4;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119099;STB=0.516762;TYPE=snp;VARB=0.0277845;OID=.;OPOS=113596866;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:33:35:15:15:18:20:4:14:10:5:6:14:10:5 chr12 113600940 . C T 141.1 PASS AO=44;DP=115;FAO=44;FDP=115;FR=.;FRO=71;FSAF=14;FSAR=30;FSRF=23;FSRR=48;FWDB=-0.0138201;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=108.529;QD=4.90786;RBI=0.0156172;REFB=-0.013254;REVB=-0.00727337;RO=68;SAF=14;SAR=30;SRF=23;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0244641;STB=0.504085;TYPE=snp;VARB=0.0182661;OID=.;OPOS=113600940;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:68:71:44:44:30:14:23:45:30:14:23:48 chr12 113623241 . C G 16.08 PASS AO=3;DP=6;FAO=3;FDP=6;FR=.;FRO=3;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=232.235;QD=10.7182;RBI=0.00905729;REFB=0.015161;REVB=-0.00905729;RO=3;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0175288;OID=.;OPOS=113623241;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:6:6:3:3:3:3:3:0:0:3:3:0:0:3 chr12 113629471 . C A 135.62 PASS AO=35;DP=85;FAO=40;FDP=91;FR=.;FRO=51;FSAF=4;FSAR=36;FSRF=11;FSRR=40;FWDB=-0.0172283;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.721;QD=5.96146;RBI=0.017292;REFB=-0.00729369;REVB=-0.00148291;RO=47;SAF=4;SAR=31;SRF=10;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199675;STB=0.639727;TYPE=snp;VARB=0.0116394;OID=.;OPOS=113629471;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:91:47:51:35:40:31:4:10:37:36:4:11:40 chr12 113635424 . A G 466.28 PASS AO=49;DP=216;FAO=96;FDP=198;FR=.,HEALED;FRO=86;FSAF=24;FSAR=72;FSRF=40;FSRR=46;FWDB=0.00137724;FXX=0.0294103;HRUN=4;LEN=1;MLLD=194.855;QD=9.41975;RBI=0.0177026;REFB=-0.0380795;REVB=-0.0176489;RO=61;SAF=21;SAR=28;SRF=35;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143632;STB=0.619328;TYPE=snp;VARB=0.0261144;OID=.;OPOS=113635424;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:198:61:86:49:96:28:21:35:26:72:24:40:46 chr12 113726152 . C T 86.79 PASS AO=22;DP=48;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=7;FWDB=-0.00127122;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.045;QD=7.38629;RBI=0.0154792;REFB=-0.00295457;REVB=-0.0154269;RO=26;SAF=16;SAR=6;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0042153;STB=0.523138;TYPE=snp;VARB=0.00373044;OID=.;OPOS=113726152;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:48:47:26:26:22:21:6:16:19:7:5:16:19:7 chr12 113733830 . C T 123.38 PASS AO=22;DP=36;FAO=22;FDP=36;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=13;FWDB=-0.0463961;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=58.8448;QD=13.7087;RBI=0.0784835;REFB=-0.0503933;REVB=0.0633014;RO=13;SAF=5;SAR=17;SRF=1;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158888;STB=0.595162;TYPE=snp;VARB=0.0301139;OID=.;OPOS=113733830;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:36:36:13:14:22:22:17:5:1:12:17:5:1:13 chr12 113758166 . G A 129.66 PASS AO=29;DP=59;FAO=29;FDP=59;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=-0.00513078;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.952;QD=8.79066;RBI=0.0121592;REFB=-0.0156672;REVB=0.0110236;RO=30;SAF=10;SAR=19;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0542911;STB=0.530436;TYPE=snp;VARB=0.0127503;OID=.;OPOS=113758166;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:30:30:29:29:19:10:12:18:19:10:12:18 chr12 113863514 . A T 92.93 PASS AO=19;DP=36;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=1;FSAR=18;FSRF=2;FSRR=15;FWDB=-0.0169047;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=190.823;QD=10.3254;RBI=0.0298621;REFB=-0.00925389;REVB=-0.0246166;RO=15;SAF=1;SAR=18;SRF=2;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235301;STB=0.620536;TYPE=snp;VARB=0.0147539;OID=.;OPOS=113863514;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:36:36:15:17:19:19:18:1:2:13:18:1:2:15 chr12 113863963 . C G 258.66 PASS AO=44;DP=67;FAO=44;FDP=67;FR=.;FRO=23;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=4;FSRR=19;FWDB=0.0103917;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=148.445;QD=15.4426;RBI=0.0301363;REFB=-0.0283683;REVB=0.028288;RO=21;SAF=16;SAR=28;SRF=3;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149006;STB=0.573139;TYPE=snp;VARB=0.0161409;OID=.;OPOS=113863963;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:67:67:21:23:44:44:28:16:3:18:28:16:4:19 chr12 113863969 . C T 304.02 PASS AO=53;DP=82;FAO=53;FDP=82;FR=.;FRO=29;FSAF=20;FSAR=33;FSRF=6;FSRR=23;FWDB=0.000835242;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=178.517;QD=14.8301;RBI=0.00337679;REFB=-0.0134898;REVB=0.00327186;RO=29;SAF=20;SAR=33;SRF=6;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122483;STB=0.566205;TYPE=snp;VARB=0.00832149;OID=.;OPOS=113863969;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:82:82:29:29:53:53:33:20:6:23:33:20:6:23 chr12 114261053 . G A 144.97 PASS AO=48;DP=132;FAO=48;FDP=131;FR=.;FRO=83;FSAF=33;FSAR=15;FSRF=61;FSRR=22;FWDB=0.00355673;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.616;QD=4.42644;RBI=0.00763293;REFB=-0.0103148;REVB=0.00675361;RO=81;SAF=33;SAR=15;SRF=59;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0538351;STB=0.535903;TYPE=snp;VARB=0.0339902;OID=.;OPOS=114261053;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:131:81:83:48:48:15:33:59:22:15:33:61:22 chr12 114362483 . C T 171.88 PASS AO=49;DP=119;FAO=49;FDP=119;FR=.;FRO=70;FSAF=38;FSAR=11;FSRF=42;FSRR=28;FWDB=0.00896258;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=297.66;QD=5.77744;RBI=0.00896633;REFB=0.00225632;REVB=0.000259428;RO=69;SAF=38;SAR=11;SRF=41;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229279;STB=0.627378;TYPE=snp;VARB=-0.00321797;OID=.;OPOS=114362483;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:69:70:49:49:11:38:41:28:11:38:42:28 chr12 114374887 . T C 194.54 PASS AO=59;DP=149;FAO=59;FDP=149;FR=.;FRO=90;FSAF=23;FSAR=36;FSRF=21;FSRR=69;FWDB=-0.0536634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.4984;QD=5.22255;RBI=0.0537975;REFB=-0.0201595;REVB=-0.0037953;RO=89;SAF=23;SAR=36;SRF=21;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18188;STB=0.603869;TYPE=snp;VARB=0.0300729;OID=.;OPOS=114374887;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:89:90:59:59:36:23:21:68:36:23:21:69 chr12 114377835 . A G 154.04 PASS AO=36;DP=79;FAO=37;FDP=79;FR=.;FRO=42;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=29;FWDB=-0.00961504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.486;QD=7.7993;RBI=0.0155004;REFB=-0.0210722;REVB=-0.0121579;RO=42;SAF=16;SAR=20;SRF=13;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133981;STB=0.581256;TYPE=snp;VARB=0.0253823;OID=.;OPOS=114377835;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:42:42:36:37:20:16:13:29:20:17:13:29 chr12 114377877 . T C 150.49 PASS AO=30;DP=56;FAO=30;FDP=54;FR=.;FRO=24;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=0.0220297;FXX=0.0357079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.597;QD=11.1473;RBI=0.0234017;REFB=-0.00950626;REVB=-0.00789506;RO=24;SAF=20;SAR=10;SRF=7;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.300715;STB=0.666556;TYPE=snp;VARB=0.00607334;OID=.;OPOS=114377877;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:56:54:24:24:30:30:10:20:7:17:10:20:7:17 chr12 114377899 . G C 475.03 PASS AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00201236;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=158.513;QD=35.8515;RBI=0.0595404;REFB=-0.112556;REVB=0.0595064;RO=1;SAF=32;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0229661;STB=0.51219;TYPE=snp;VARB=0.00106264;OID=.;OPOS=114377899;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:53:53:1:1:52:52:20:32:0:1:20:32:0:1 chr12 114383651 . C T 262.85 PASS AO=75;DP=197;FAO=82;FDP=203;FR=.;FRO=121;FSAF=31;FSAR=51;FSRF=41;FSRR=80;FWDB=-0.00549542;FXX=0.0145624;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.194;QD=5.17934;RBI=0.0109542;REFB=-0.0134124;REVB=0.00947606;RO=120;SAF=30;SAR=45;SRF=41;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0674001;STB=0.525146;TYPE=snp;VARB=0.019813;OID=.;OPOS=114383651;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:203:120:121:75:82:45:30:41:79:51:31:41:80 chr12 114386572 . C T 126.81 PASS AO=32;DP=71;FAO=32;FDP=72;FR=.;FRO=40;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=15;FWDB=0.00308732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.015;QD=7.04494;RBI=0.00313372;REFB=-0.00241396;REVB=-0.000537273;RO=39;SAF=10;SAR=22;SRF=24;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.299781;STB=0.675328;TYPE=snp;VARB=0.00180176;OID=.;OPOS=114386572;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:72:39:40:32:32:22:10:24:15:22:10:25:15 chr12 114386639 . A G 165.66 PASS AO=48;DP=118;FAO=48;FDP=118;FR=.;FRO=70;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=47;FWDB=0.00305455;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.0905;QD=5.61563;RBI=0.0622525;REFB=-0.012694;REVB=-0.0621775;RO=70;SAF=24;SAR=24;SRF=23;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181052;STB=0.601654;TYPE=snp;VARB=0.0179005;OID=.;OPOS=114386639;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:70:70:48:48:24:24:23:47:24:24:23:47 chr12 114395651 . T C 315.94 PASS AO=78;DP=172;FAO=82;FDP=178;FR=.;FRO=96;FSAF=33;FSAR=49;FSRF=50;FSRR=46;FWDB=-0.00460131;FXX=0.00558628;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.7204;QD=7.09983;RBI=0.0143712;REFB=-0.0549187;REVB=-0.0136147;RO=94;SAF=30;SAR=48;SRF=49;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136889;STB=0.564688;TYPE=snp;VARB=0.0442337;OID=.;OPOS=114395651;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:178:94:96:78:82:48:30:49:45:49:33:50:46 chr12 114793240 . C T 835.91 PASS AO=87;DP=88;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00471723;FXX=0.0113623;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.581;QD=38.4327;RBI=0.012599;REFB=0;REVB=0.0116826;RO=0;SAF=60;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000136164;OID=.;OPOS=114793240;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:88:87:0:0:87:87:27:60:0:0:27:60:0:0 chr12 114793260 . T C 224.08 PASS AO=49;DP=94;FAO=49;FDP=94;FR=.;FRO=45;FSAF=33;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=18;FWDB=-0.00166546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.382;QD=9.53516;RBI=0.0106131;REFB=-0.00323421;REVB=-0.0104816;RO=45;SAF=33;SAR=16;SRF=27;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0703538;STB=0.538889;TYPE=snp;VARB=0.00260084;OID=.;OPOS=114793260;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:45:45:49:49:16:33:27:18:16:33:27:18 chr12 115108136 . T C 57.15 PASS AO=16;DP=51;FAO=19;FDP=55;FR=.;FRO=36;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.00495324;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.561;QD=4.15603;RBI=0.0111734;REFB=-0.0186448;REVB=-0.0100155;RO=35;SAF=3;SAR=13;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.41592;STB=0.626369;TYPE=snp;VARB=0.0495827;OID=.;OPOS=115108136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:51:55:35:36:16:19:13:3:18:17:13:6:18:18 chr12 115112507 . C G 67.74 PASS AO=11;DP=17;FAO=11;FDP=17;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0891075;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2002;QD=15.939;RBI=0.111535;REFB=-0.0246378;REVB=-0.0670808;RO=6;SAF=4;SAR=7;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190712;STB=0.608495;TYPE=snp;VARB=0.014091;OID=.;OPOS=115112507;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:17:17:6:6:11:11:7:4:4:2:7:4:4:2 chr12 116408538 . A G 336.22 PASS AO=92;DP=211;FAO=92;FDP=211;FR=.;FRO=119;FSAF=58;FSAR=34;FSRF=63;FSRR=56;FWDB=-0.0304588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.398;QD=6.37388;RBI=0.0341278;REFB=-0.010343;REVB=0.0153939;RO=119;SAF=58;SAR=34;SRF=63;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106259;STB=0.559233;TYPE=snp;VARB=0.0126235;OID=.;OPOS=116408538;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:211:119:119:92:92:34:58:63:56:34:58:63:56 chr12 116429689 . A G 21.5 PASS AO=6;DP=20;FAO=6;FDP=20;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=13;FWDB=0.0739517;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.397;QD=4.29959;RBI=0.0752755;REFB=-0.00082042;REVB=-0.0140552;RO=14;SAF=2;SAR=4;SRF=1;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.403663;STB=0.738597;TYPE=snp;VARB=0.00519175;OID=.;OPOS=116429689;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:20:20:14:14:6:6:4:2:1:13:4:2:1:13 chr12 116446445 . C T 369.66 PASS AO=88;DP=177;FAO=87;FDP=176;FR=.;FRO=89;FSAF=36;FSAR=51;FSRF=41;FSRR=48;FWDB=-0.0357887;FXX=0.0056494;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.712;QD=8.40124;RBI=0.0388613;REFB=0.00313145;REVB=-0.0151452;RO=89;SAF=37;SAR=51;SRF=41;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.037436;STB=0.524223;TYPE=snp;VARB=-0.00377129;OID=.;OPOS=116446445;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:176:89:89:88:87:51:37:41:48:51:36:41:48 chr12 116586414 . CTATA C 460.39 PASS AO=58;DP=327;FAO=89;FDP=147;FR=.;FRO=58;FSAF=36;FSAR=53;FSRF=18;FSRR=40;FWDB=0.0399786;FXX=0.183323;HRUN=1;LEN=4;MLLD=109.419;QD=12.5276;RBI=0.068126;REFB=-0.15246;REVB=0.0551621;RO=47;SAF=20;SAR=38;SRF=8;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167998;STB=0.539122;TYPE=del;VARB=0.0920881;OID=.;OPOS=116586415;OREF=TATA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:58:145:89:147:58:36:53:18:40:99:47:20:38:8:39 chr12 117014131 . G GA,GAA 336.2 PASS AO=59,20;DP=109;FAO=93,0;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=57,0;FSAR=36,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0747411,-0.0400401;FXX=0.0605999;HRUN=6,6;LEN=1,2;MLLD=7.835,8.57053;QD=14.4603;RBI=0.172375,0.0918321;REFB=0.0773167,0.08011;REVB=-0.155329,-0.0826434;RO=27;SAF=37,11;SAR=22,9;SRF=11;SRR=16;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.131473,0.142165;STB=0.5,0.5;TYPE=ins,ins;VARB=-0.00355833,0;OID=.,.;OPOS=117014132,117014132;OREF=-,-;OALT=A,AA;OMAPALT=GA,GAA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:59,20:109:93,0:93:0:57,0:36,0:0:0:23:27:37,11:22,9:11:16 chr12 117217141 . T C 949.7 PASS AO=102;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0545992;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.111;QD=36.8817;RBI=0.0835697;REFB=0;REVB=0.0632679;RO=0;SAF=41;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.18616e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000234145;OID=.;OPOS=117217141;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:103:103:0:0:102:103:61:41:0:0:61:42:0:0 chr12 117219947 . G A 195.87 PASS AO=18;DP=18;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0633089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.239;QD=39.1741;RBI=0.231633;REFB=0;REVB=0.222813;RO=0;SAF=13;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00353559;OID=.;OPOS=117219947;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:18:20:0:0:18:20:5:13:0:0:7:13:0:0 chr12 117289613 . G C 865.15 PASS AO=94;DP=96;FAO=94;FDP=96;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=58;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0134113;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.354;QD=36.0479;RBI=0.0293297;REFB=-0.0488268;REVB=0.0260838;RO=1;SAF=36;SAR=58;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129878;STB=0.502576;TYPE=snp;VARB=0.000330352;OID=.;OPOS=117289613;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:96:96:1:2:94:94:58:36:1:0:58:36:1:1 chr12 117290182 . T TTTCCCC 505.72 PASS AO=46;DP=62;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0143407;FXX=0.0508388;HRUN=3;LEN=6;MLLD=265.51;QD=36.1228;RBI=0.0170374;REFB=0.0042692;REVB=0.00919885;RO=10;SAF=12;SAR=34;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.097758;STB=0.506171;TYPE=ins;VARB=0.000582084;OID=.;OPOS=117290183;OREF=-;OALT=TTCCCC;OMAPALT=TTTCCCC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:46:62:55:56:1:15:40:0:1:18:10:12:34:5:5 chr12 117383320 . G A 1528.29 PASS AO=149;DP=149;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0266762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.8665;QD=38.4477;RBI=0.062496;REFB=0;REVB=0.0565167;RO=0;SAF=57;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000211727;OID=.;OPOS=117383320;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:149:159:0:0:149:159:92:57:0:0:102:57:0:0 chr12 117462124 . G A 531.45 PASS AO=144;DP=324;FAO=144;FDP=323;FR=.;FRO=179;FSAF=67;FSAR=77;FSRF=72;FSRR=107;FWDB=0.00121636;FXX=0.00308632;HRUN=3;LEN=1;MLLD=209.692;QD=6.58138;RBI=0.00947179;REFB=-0.00952844;REVB=0.00939336;RO=179;SAF=67;SAR=77;SRF=72;SRR=107;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0637599;STB=0.535274;TYPE=snp;VARB=0.0117832;OID=.;OPOS=117462124;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:324:323:179:179:144:144:77:67:72:107:77:67:72:107 chr12 117465857 . T C 687.31 PASS AO=72;DP=75;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0128428;FXX=0.0399947;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.46;QD=38.1837;RBI=0.0178157;REFB=0;REVB=0.0123476;RO=0;SAF=50;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000324436;OID=.;OPOS=117465857;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:75:72:0:0:72:72:22:50:0:0:22:50:0:0 chr12 117593387 . G A 1614.54 PASS AO=170;DP=172;FAO=172;FDP=172;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0224697;FXX=0.00578001;HRUN=3;LEN=1;MLLD=147.52;QD=37.5475;RBI=0.0333192;REFB=-0.0718014;REVB=0.0246025;RO=1;SAF=86;SAR=84;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00563252;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00012063;OID=.;OPOS=117593387;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:172:172:1:0:170:172:84:86:0:1:85:87:0:0 chr12 117593391 . A G 1639.71 PASS AO=170;DP=170;FAO=170;FDP=170;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0384284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.311;QD=38.5813;RBI=0.0389884;REFB=0;REVB=-0.00658444;RO=0;SAF=85;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.71906e-05;OID=.;OPOS=117593391;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:170:170:0:0:170:170:85:85:0:0:85:85:0:0 chr12 117701714 . A G 904.54 PASS AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249658;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.446;QD=38.086;RBI=0.064873;REFB=0;REVB=-0.0598766;RO=0;SAF=53;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.69587e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.37287e-05;OID=.;OPOS=117701714;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:95:95:0:0:95:95:42:53:0:0:42:53:0:0 chr12 117890947 . T C 251.29 PASS AO=78;DP=200;FAO=78;FDP=198;FR=.;FRO=120;FSAF=32;FSAR=46;FSRF=43;FSRR=77;FWDB=-0.00508186;FXX=0.0099995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.375;QD=5.07661;RBI=0.021421;REFB=-0.027931;REVB=0.0208095;RO=115;SAF=32;SAR=46;SRF=40;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0695659;STB=0.532892;TYPE=snp;VARB=0.0305553;OID=.;OPOS=117890947;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:200:198:115:120:78:78:46:32:40:75:46:32:43:77 chr12 117891273 . A C 322.36 PASS AO=81;DP=174;FAO=81;FDP=173;FR=.;FRO=92;FSAF=20;FSAR=61;FSRF=21;FSRR=71;FWDB=-0.0249431;FXX=0.0057468;HRUN=4;LEN=1;MLLD=230.52;QD=7.45331;RBI=0.0251926;REFB=-0.0267668;REVB=0.00353663;RO=91;SAF=20;SAR=61;SRF=21;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0210234;STB=0.513515;TYPE=snp;VARB=0.0262216;OID=.;OPOS=117891273;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:173:91:92:81:81:61:20:21:70:61:20:21:71 chr12 117993064 . C T 608.42 PASS AO=138;DP=270;FAO=139;FDP=269;FR=.;FRO=130;FSAF=65;FSAR=74;FSRF=31;FSRR=99;FWDB=4.95582e-05;FXX=0.011029;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.571;QD=9.0471;RBI=0.0153255;REFB=0.00368354;REVB=0.0153254;RO=128;SAF=64;SAR=74;SRF=30;SRR=98;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207437;STB=0.612825;TYPE=snp;VARB=-0.00703428;OID=.;OPOS=117993064;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:270:269:128:130:138:139:74:64:30:98:74:65:31:99 chr12 117993101 . G A 362.56 PASS AO=96;DP=213;FAO=96;FDP=213;FR=.;FRO=117;FSAF=15;FSAR=81;FSRF=51;FSRR=66;FWDB=-0.0185681;FXX=0.00930189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.031;QD=6.80863;RBI=0.0185743;REFB=-0.0234379;REVB=0.000480087;RO=115;SAF=15;SAR=81;SRF=51;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.374587;STB=0.707936;TYPE=snp;VARB=0.0163502;OID=.;OPOS=117993101;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:213:213:115:117:96:96:81:15:51:64:81:15:51:66 chr12 118020115 . G A 107.12 PASS AO=22;DP=42;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=18;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=2;FWDB=-0.0162991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.216;QD=10.2015;RBI=0.0268416;REFB=-0.0463335;REVB=-0.0213263;RO=20;SAF=18;SAR=4;SRF=18;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12867;STB=0.57137;TYPE=snp;VARB=0.0247984;OID=.;OPOS=118020115;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:42:42:20:20:22:22:4:18:18:2:4:18:18:2 chr12 118199286 . C G 458.99 PASS AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0329214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.706;QD=38.2493;RBI=0.0478771;REFB=0;REVB=0.034762;RO=0;SAF=23;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000319311;OID=.;OPOS=118199286;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:48:48:0:0:48:48:25:23:0:0:25:23:0:0 chr12 118467553 . A G 283.29 PASS AO=81;DP=204;FAO=83;FDP=201;FR=.;FRO=118;FSAF=30;FSAR=53;FSRF=48;FSRR=70;FWDB=-0.00728417;FXX=0.0336522;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.732;QD=5.63761;RBI=0.00764727;REFB=-0.00543103;REVB=-0.00232842;RO=108;SAF=29;SAR=52;SRF=43;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0440082;STB=0.528367;TYPE=snp;VARB=0.00709483;OID=.;OPOS=118467553;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:201:108:118:81:83:52:29:43:65:53:30:48:70 chr12 118506186 . A T 219.95 PASS AO=54;DP=118;FAO=55;FDP=119;FR=.;FRO=64;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=30;FSRR=34;FWDB=0.0110614;FXX=0.0165276;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.455;QD=7.39317;RBI=0.0151433;REFB=-0.00721664;REVB=0.0103423;RO=64;SAF=27;SAR=27;SRF=30;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0304221;STB=0.511922;TYPE=snp;VARB=0.00632129;OID=.;OPOS=118506186;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:119:64:64:54:55:27:27:30:34:28:27:30:34 chr12 118520170 . G A 122.78 PASS AO=33;DP=78;FAO=33;FDP=78;FR=.;FRO=45;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=27;FWDB=-0.0312167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.462;QD=6.2965;RBI=0.0529622;REFB=-0.00998635;REVB=0.0427845;RO=44;SAF=13;SAR=20;SRF=18;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159704;STB=0.503653;TYPE=snp;VARB=0.0130373;OID=.;OPOS=118520170;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:44:45:33:33:20:13:18:26:20:13:18:27 chr12 118636987 . C T 200.64 PASS AO=54;DP=123;FAO=54;FDP=124;FR=.;FRO=70;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=31;FSRR=39;FWDB=-0.0431767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.2725;QD=6.4722;RBI=0.0764404;REFB=-0.00884326;REVB=-0.0630785;RO=69;SAF=30;SAR=24;SRF=30;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120848;STB=0.563483;TYPE=snp;VARB=0.0144869;OID=.;OPOS=118636987;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:124:69:70:54:54:24:30:30:39:24:30:31:39 chr12 118682751 . C T 236.3 PASS AO=53;DP=107;FAO=54;FDP=108;FR=.;FRO=54;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=34;FSRR=20;FWDB=-0.0484753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.5617;QD=8.7518;RBI=0.0484794;REFB=-0.026941;REVB=0.000632316;RO=54;SAF=29;SAR=24;SRF=34;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.076571;STB=0.537801;TYPE=snp;VARB=0.0260539;OID=.;OPOS=118682751;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:108:54:54:53:54:24:29:34:20:24:30:34:20 chr12 118828801 . A G 171.74 PASS AO=46;DP=106;FAO=46;FDP=106;FR=.;FRO=60;FSAF=17;FSAR=29;FSRF=28;FSRR=32;FWDB=-0.018745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.759;QD=6.48061;RBI=0.0401374;REFB=-0.0103344;REVB=-0.0354914;RO=60;SAF=17;SAR=29;SRF=28;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101761;STB=0.557191;TYPE=snp;VARB=0.0145138;OID=.;OPOS=118828801;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:60:60:46:46:29:17:28:32:29:17:28:32 chr12 118855405 . A G 1820.53 PASS AO=191;DP=193;FAO=192;FDP=192;FR=.;FRO=0;FSAF=124;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0173637;FXX=0.0103087;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.798;QD=37.9277;RBI=0.0267894;REFB=-0.041667;REVB=0.0204003;RO=1;SAF=123;SAR=68;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00695118;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.46838e-05;OID=.;OPOS=118855405;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:193:192:1:0:191:192:68:123:0:1:68:124:0:0 chr12 118855483 . T G 39.58 PASS AO=23;DP=71;FAO=31;FDP=83;FR=.;FRO=52;FSAF=24;FSAR=7;FSRF=27;FSRR=25;FWDB=-0.00439592;FXX=0.0459717;HRUN=15;LEN=1;MLLD=21.9271;QD=1.90745;RBI=0.0537425;REFB=-0.00617113;REVB=-0.0535624;RO=44;SAF=21;SAR=2;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.558744;STB=0.682539;TYPE=snp;VARB=0.134521;OID=.;OPOS=118855483;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:71:83:44:52:23:31:2:21:24:20:7:24:27:25 chr12 119431750 . G T 845.63 PASS AO=94;DP=99;FAO=94;FDP=98;FR=.;FRO=4;FSAF=43;FSAR=51;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.00984023;FXX=0.0101;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.163;QD=34.5156;RBI=0.0200249;REFB=-0.0391748;REVB=0.0174403;RO=4;SAF=43;SAR=51;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00331241;STB=0.501749;TYPE=snp;VARB=0.000996744;OID=.;OPOS=119431750;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:99:98:4:4:94:94:51:43:2:2:51:43:2:2 chr12 119588962 . G A 996.68 PASS AO=103;DP=105;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00758241;FXX=0.0280348;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.4295;QD=38.3339;RBI=0.0372105;REFB=0;REVB=0.0364297;RO=0;SAF=42;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.08734e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000724194;OID=.;OPOS=119588962;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:105:104:0:0:103:104:61:42:0:0:64:40:0:0 chr12 119594354 . C T 348.94 PASS AO=43;DP=49;FAO=43;FDP=49;FR=.;FRO=6;FSAF=0;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.16;QD=28.4845;RBI=0.100621;REFB=-0.135924;REVB=0.100621;RO=6;SAF=0;SAR=43;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0256471;OID=.;OPOS=119594354;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:49:49:6:6:43:43:43:0:0:6:43:0:0:6 chr12 119595485 . C T 18.23 PASS AO=10;DP=52;FAO=11;FDP=53;FR=.;FRO=42;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=40;FWDB=0.0333275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.887;QD=1.3761;RBI=0.0349671;REFB=0.00332685;REVB=0.010582;RO=42;SAF=0;SAR=10;SRF=2;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.621831;STB=0.624822;TYPE=snp;VARB=-0.00624656;OID=.;OPOS=119595485;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:52:53:42:42:10:11:10:0:2:40:10:1:2:40 chr12 119871387 . A G 1473.09 PASS AO=154;DP=154;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=114;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00597609;FXX=0.0064512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.7672;QD=38.262;RBI=0.0278976;REFB=0;REVB=-0.02725;RO=0;SAF=40;SAR=114;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.62574e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.98659e-05;OID=.;OPOS=119871387;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:154:154:0:0:154:154:114:40:0:0:114:40:0:0 chr12 119968835 . A G 289.76 PASS AO=71;DP=150;FAO=71;FDP=150;FR=.;FRO=79;FSAF=31;FSAR=40;FSRF=39;FSRR=40;FWDB=0.0152037;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.553;QD=7.72691;RBI=0.017275;REFB=-0.0050843;REVB=0.00820207;RO=77;SAF=31;SAR=40;SRF=38;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0539492;STB=0.530294;TYPE=snp;VARB=0.00607153;OID=.;OPOS=119968835;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:150:77:79:71:71:40:31:38:39:40:31:39:40 chr12 120067561 . T C 327.95 PASS AO=81;DP=172;FAO=81;FDP=171;FR=.;FRO=90;FSAF=42;FSAR=39;FSRF=42;FSRR=48;FWDB=-0.040716;FXX=0.00581362;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.006;QD=7.6714;RBI=0.0407655;REFB=-0.00375678;REVB=-0.0020073;RO=87;SAF=42;SAR=39;SRF=41;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0442994;STB=0.527266;TYPE=snp;VARB=0.00359855;OID=.;OPOS=120067561;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:171:87:90:81:81:39:42:41:46:39:42:42:48 chr12 120119183 . T G 640.06 PASS AO=153;DP=311;FAO=153;FDP=310;FR=.;FRO=157;FSAF=88;FSAR=65;FSRF=94;FSRR=63;FWDB=-0.00257402;FXX=0.00321533;HRUN=3;LEN=1;MLLD=244.68;QD=8.25883;RBI=0.00979339;REFB=-0.00485878;REVB=-0.00944907;RO=156;SAF=88;SAR=65;SRF=93;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.019835;STB=0.512253;TYPE=snp;VARB=0.00512854;OID=.;OPOS=120119183;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:311:310:156:157:153:153:65:88:93:63:65:88:94:63 chr12 120126074 . A AAGG 596.84 PASS AO=62;DP=93;FAO=72;FDP=79;FR=.;FRO=7;FSAF=23;FSAR=49;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=0.0207155;FXX=0.112347;HRUN=2;LEN=3;MLLD=142.98;QD=30.2199;RBI=0.068283;REFB=-0.0677304;REVB=0.0650649;RO=18;SAF=20;SAR=42;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0824199;STB=0.552688;TYPE=ins;VARB=0.0042264;OID=.;OPOS=120126075;OREF=-;OALT=AGG;OMAPALT=AAGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:62:93:72:79:7:23:49:6:1:4:18:20:42:9:9 chr12 120156141 . G A 110.03 PASS AO=21;DP=37;FAO=21;FDP=37;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0137974;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.037;QD=11.8948;RBI=0.014666;REFB=-0.0374087;REVB=-0.00497224;RO=15;SAF=10;SAR=11;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0426929;STB=0.510299;TYPE=snp;VARB=0.0280767;OID=.;OPOS=120156141;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:37:37:15:16:21:21:11:10:8:7:11:10:8:8 chr12 120171995 . T C 951.93 PASS AO=107;DP=108;FAO=104;FDP=107;FR=.;FRO=3;FSAF=35;FSAR=69;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0595658;FXX=0.0092584;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.0519;QD=35.5862;RBI=0.0699085;REFB=0.14974;REVB=-0.0365939;RO=1;SAF=37;SAR=70;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00673297;STB=0.510292;TYPE=snp;VARB=-0.0205722;OID=.;OPOS=120171995;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:108:107:1:3:107:104:70:37:0:1:69:35:2:1 chr12 120172173 . G A 93.39 PASS AO=33;DP=102;FAO=34;FDP=102;FR=.;FRO=68;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=45;FWDB=0.0078111;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.422;QD=3.66241;RBI=0.0120753;REFB=-0.00270562;REVB=0.00920872;RO=67;SAF=9;SAR=24;SRF=23;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0967056;STB=0.534392;TYPE=snp;VARB=0.00897385;OID=.;OPOS=120172173;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:102:102:67:68:33:34:24:9:23:44:24:10:23:45 chr12 120189879 . A G 30.21 PASS AO=13;DP=48;FAO=13;FDP=50;FR=.;FRO=37;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=25;FWDB=-0.0131523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.495;QD=2.41681;RBI=0.0309823;REFB=-0.0243687;REVB=-0.0280521;RO=35;SAF=6;SAR=7;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144769;STB=0.603623;TYPE=snp;VARB=0.0474049;OID=.;OPOS=120189879;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:48:50:35:37:13:13:7:6:12:23:7:6:12:25 chr12 120189888 . T C 29.43 PASS AO=11;DP=44;FAO=12;FDP=45;FR=.;FRO=33;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=25;FWDB=-0.0303148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.5257;QD=2.61572;RBI=0.0308417;REFB=-0.0252303;REVB=-0.0056766;RO=33;SAF=6;SAR=5;SRF=8;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.362636;STB=0.688619;TYPE=snp;VARB=0.099771;OID=.;OPOS=120189888;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:44:45:33:33:11:12:5:6:8:25:6:6:8:25 chr12 120572134 . GT G 22.15 PASS AO=19;DP=59;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=3;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=29;FWDB=-0.0731625;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.8895;QD=1.77238;RBI=0.0770827;REFB=-0.105452;REVB=-0.024269;RO=27;SAF=3;SAR=16;SRF=1;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.293726;STB=0.6278;TYPE=del;VARB=0.133712;OID=.;OPOS=120572135;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:19:50:19:50:31:3:16:2:29:22:27:3:16:1:26 chr12 120575549 . A C 1059.17 PASS AO=110;DP=110;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0334779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.623;QD=37.8273;RBI=0.038284;REFB=0;REVB=0.0185713;RO=0;SAF=44;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6109e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000135622;OID=.;OPOS=120575549;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:110:112:0:0:110:112:66:44:0:0:68:44:0:0 chr12 120589160 . A G 447.29 PASS AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0577977;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.804;QD=36.5132;RBI=0.0607124;REFB=0.14842;REVB=0.0185853;RO=1;SAF=12;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012892;STB=0.506846;TYPE=snp;VARB=-0.00286253;OID=.;OPOS=120589160;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:49:49:1:1:48:48:36:12:0:1:36:12:0:1 chr12 120649970 . C T 136.31 PASS AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00366133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.116;QD=36.3483;RBI=0.00946266;REFB=0;REVB=-0.00872563;RO=0;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.66643e-05;OID=.;OPOS=120649970;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:15:0:0:15:15:10:5:0:0:10:5:0:0 chr12 120661977 . T C 215.35 PASS AO=23;DP=23;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0203916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.945;QD=35.892;RBI=0.0573997;REFB=0;REVB=0.0536555;RO=0;SAF=10;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000297362;OID=.;OPOS=120661977;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:23:24:0:0:23:24:13:10:0:0:13:11:0:0 chr12 120882217 . G T 293.34 PASS AO=74;DP=160;FAO=74;FDP=160;FR=.;FRO=86;FSAF=54;FSAR=20;FSRF=59;FSRR=27;FWDB=-0.00423897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.145;QD=7.33351;RBI=0.00651509;REFB=-0.00974882;REVB=-0.00494748;RO=85;SAF=54;SAR=20;SRF=58;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0561137;STB=0.528962;TYPE=snp;VARB=0.0121801;OID=.;OPOS=120882217;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:160:85:86:74:74:20:54:58:27:20:54:59:27 chr12 120882264 . AAAG A 238.72 PASS AO=49;DP=161;FAO=77;FDP=148;FR=.;FRO=71;FSAF=52;FSAR=25;FSRF=44;FSRR=27;FWDB=-0.0274105;FXX=0.0451584;HRUN=7;LEN=3;MLLD=179.274;QD=6.45192;RBI=0.0274216;REFB=0.0164928;REVB=0.00077961;RO=80;SAF=42;SAR=7;SRF=49;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.370119;STB=0.529773;TYPE=del;VARB=-0.0205849;OID=.;OPOS=120882265;OREF=AAG;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:49:155:77:148:71:52:25:44:27:99:80:42:7:49:31 chr12 120884291 . C T 46.83 PASS AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=4;FWDB=-0.00452827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.641;QD=6.04274;RBI=0.0128562;REFB=-0.00622973;REVB=0.0120323;RO=17;SAF=7;SAR=5;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195748;STB=0.635637;TYPE=snp;VARB=0.010096;OID=.;OPOS=120884291;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:31:31:17:19:12:12:5:7:13:4:5:7:15:4 chr12 120884328 . C T 114.49 PASS AO=18;DP=26;FAO=18;FDP=27;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.030618;FXX=0.0689417;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.9825;QD=16.9609;RBI=0.0343626;REFB=-0.0679869;REVB=0.0155991;RO=7;SAF=8;SAR=10;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206766;STB=0.573689;TYPE=snp;VARB=0.0312185;OID=.;OPOS=120884328;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:26:27:7:9:18:18:10:8:6:1:10:8:6:3 chr12 120934407 . C T 136.39 PASS AO=32;DP=68;FAO=35;FDP=73;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=-0.00259155;FXX=0.0135117;HRUN=6;LEN=1;MLLD=35.4516;QD=7.47334;RBI=0.111893;REFB=-0.0397194;REVB=0.111863;RO=36;SAF=11;SAR=21;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154163;STB=0.566628;TYPE=snp;VARB=0.0983557;OID=.;OPOS=120934407;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:73:36:38:32:35:21:11:18:18:21:14:20:18 chr12 120934624 . A C 72.73 PASS AO=16;DP=41;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.00593695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.733;QD=6.92644;RBI=0.0094613;REFB=-0.00503304;REVB=-0.00736673;RO=22;SAF=3;SAR=13;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.442902;STB=0.682111;TYPE=snp;VARB=0.00816127;OID=.;OPOS=120934624;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:41:42:22:24:16:18:13:3:13:9:13:5:14:10 chr12 120941444 . T C 363.82 PASS AO=99;DP=231;FAO=101;FDP=230;FR=.;FRO=129;FSAF=30;FSAR=71;FSRF=62;FSRR=67;FWDB=0.0169087;FXX=0.00432882;HRUN=3;LEN=1;MLLD=183.348;QD=6.32728;RBI=0.0173353;REFB=-0.0226505;REVB=0.00382221;RO=130;SAF=28;SAR=71;SRF=64;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232332;STB=0.612046;TYPE=snp;VARB=0.0229579;OID=.;OPOS=120941444;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:231:230:130:129:99:101:71:28:64:66:71:30:62:67 chr12 120966920 . GA G 42.05 PASS AO=8;DP=27;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=-0.0473197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.392;QD=6.22915;RBI=0.0512904;REFB=-0.03565;REVB=0.0197875;RO=15;SAF=1;SAR=7;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152616;STB=0.5384;TYPE=del;VARB=0.0506929;OID=.;OPOS=120966921;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:8:27:12:27:15:3:9:3:12:42:15:1:7:3:12 chr12 121017171 . A G 2326.22 PASS AO=249;DP=259;FAO=251;FDP=251;FR=.;FRO=0;FSAF=136;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166644;FXX=0.0383127;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.6878;QD=37.0713;RBI=0.0312281;REFB=-0.0731737;REVB=0.0264101;RO=4;SAF=136;SAR=113;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00619766;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.25459e-05;OID=.;OPOS=121017171;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:259:251:4:0:249:251:113:136:3:1:115:136:0:0 chr12 121093629 . CGTGCGT C,CGTGC 176.3 PASS AO=11,4;DP=23;FAO=15,5;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=7,5;FSAR=8,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00312551,-0.0754242;FXX=0.166597;HRUN=1,1;LEN=6,2;MLLD=167.454,52.3413;QD=35.2589;RBI=0.053935,0.0838945;REFB=0,0;REVB=0.0538443,0.0367352;RO=0;SAF=4,4;SAR=7,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.0295275,0.00421531;OID=.,.;OPOS=121093630,121093634;OREF=GTGCGT,GT;OALT=-,-;OMAPALT=C,CGTGC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:11,4:16:15,5:20:0:7,5:8,0:0:0:15:0:4,4:7,0:0:0 chr12 121131891 . C T 1948.48 PASS AO=202;DP=203;FAO=204;FDP=204;FR=.;FRO=0;FSAF=102;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129026;FXX=0.00487781;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.979;QD=38.2055;RBI=0.0141214;REFB=0;REVB=-0.00573923;RO=0;SAF=101;SAR=101;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.02344e-05;OID=.;OPOS=121131891;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:92:203:204:0:0:202:204:101:101:0:0:102:102:0:0 chr12 121174899 . T C 232.05 PASS AO=27;DP=31;FAO=27;FDP=29;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0326059;FXX=0.0644953;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.2307;QD=32.0073;RBI=0.0333074;REFB=-0.110806;REVB=0.00680017;RO=1;SAF=13;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0344248;STB=0.501278;TYPE=snp;VARB=0.00965132;OID=.;OPOS=121174899;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:31:29:1:2:27:27:14:13:1:0:14:13:1:1 chr12 121175984 . T C 181.06 PASS AO=18;DP=21;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0387487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.539;QD=31.4887;RBI=0.0578007;REFB=-0.0520674;REVB=0.0428889;RO=1;SAF=12;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0367456;STB=0.517226;TYPE=snp;VARB=0.00196224;OID=.;OPOS=121175984;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:21:23:1:1:18:22:6:12:1:0:8:14:1:0 chr12 121176083 . G A 292.03 PASS AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00246414;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=255.215;QD=38.9374;RBI=0.00747916;REFB=0;REVB=-0.00706158;RO=0;SAF=21;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.72692e-05;OID=.;OPOS=121176083;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:30:30:0:0:30:30:9:21:0:0:9:21:0:0 chr12 121176679 . C T 232.44 PASS AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0145475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.539;QD=34.4355;RBI=0.0230818;REFB=-0.134097;REVB=0.0179204;RO=1;SAF=13;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0343929;STB=0.518504;TYPE=snp;VARB=0.00673322;OID=.;OPOS=121176679;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:27:27:1:1:26:26:13:13:1:0:13:13:1:0 chr12 121432019 . T C 14.85 PASS AO=14;DP=83;FAO=14;FDP=82;FR=.;FRO=68;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=33;FSRR=35;FWDB=-0.0090285;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.711;QD=0.724365;RBI=0.0265097;REFB=-0.00732433;REVB=-0.0249249;RO=68;SAF=12;SAR=2;SRF=33;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.4929;STB=0.830957;TYPE=snp;VARB=0.0306831;OID=.;OPOS=121432019;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:83:82:68:68:14:14:2:12:33:35:2:12:33:35 chr12 121437382 . A G 158.92 PASS AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.908;QD=37.393;RBI=0.0141491;REFB=0;REVB=0.0141491;RO=0;SAF=0;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00010645;OID=.;OPOS=121437382;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:17:17:0:0:17:17:17:0:0:0:17:0:0:0 chr12 121458400 . C T 2083.89 PASS AO=220;DP=220;FAO=220;FDP=220;FR=.;FRO=0;FSAF=123;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0189321;FXX=0.00452468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.3924;QD=37.8889;RBI=0.0417638;REFB=-0.071235;REVB=0.0372262;RO=0;SAF=123;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00028707;OID=.;OPOS=121458400;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:220:220:0:0:220:220:97:123:0:0:97:123:0:0 chr12 121615103 . G A 724.09 PASS AO=181;DP=381;FAO=181;FDP=380;FR=.;FRO=199;FSAF=58;FSAR=123;FSRF=100;FSRR=99;FWDB=-0.0189056;FXX=0.0026246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.428;QD=7.62195;RBI=0.0234274;REFB=-0.011407;REVB=-0.0138356;RO=196;SAF=58;SAR=123;SRF=97;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175727;STB=0.601474;TYPE=snp;VARB=0.0142099;OID=.;OPOS=121615103;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:381:380:196:199:181:181:123:58:97:99:123:58:100:99 chr12 121622196 . A G 138.82 PASS AO=48;DP=135;FAO=48;FDP=135;FR=.;FRO=87;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=42;FSRR=45;FWDB=-0.0106326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.486;QD=4.11332;RBI=0.0109879;REFB=-0.0167394;REVB=-0.00277165;RO=87;SAF=21;SAR=27;SRF=42;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0513564;STB=0.5294;TYPE=snp;VARB=0.0256755;OID=.;OPOS=121622196;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:87:87:48:48:27:21:42:45:27:21:42:45 chr12 121622304 . A C 90.03 PASS AO=19;DP=39;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=18;FWDB=0.017075;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.624;QD=9.47734;RBI=0.0187897;REFB=-0.0261578;REVB=-0.00784207;RO=19;SAF=8;SAR=11;SRF=1;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.363823;STB=0.700739;TYPE=snp;VARB=0.03172;OID=.;OPOS=121622304;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:39:38:19:19:19:19:11:8:1:18:11:8:1:18 chr12 121622520 . A T 559.35 PASS AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0154834;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.117;QD=36.0868;RBI=0.0260494;REFB=-0.00198165;REVB=0.0209484;RO=1;SAF=22;SAR=39;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119514;STB=0.506327;TYPE=snp;VARB=7.85109e-05;OID=.;OPOS=121622520;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:62:62:1:1:61:61:39:22:0:1:39:22:0:1 chr12 121622563 . G A 134.71 PASS AO=24;DP=49;FAO=27;FDP=50;FR=.;FRO=23;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=17;FWDB=0.00283138;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.791;QD=10.777;RBI=0.00699226;REFB=-0.0263976;REVB=-0.00639335;RO=24;SAF=14;SAR=10;SRF=6;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.290254;STB=0.649169;TYPE=snp;VARB=0.00942551;OID=.;OPOS=121622563;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:49:50:24:23:24:27:10:14:6:18:11:16:6:17 chr12 121660787 . T C 508.49 PASS AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.9828;QD=37.6662;RBI=0.0347055;REFB=0;REVB=0.0299998;RO=0;SAF=12;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00041805;OID=.;OPOS=121660787;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:54:54:0:0:54:54:42:12:0:0:42:12:0:0 chr12 121666646 . A G 116.25 PASS AO=33;DP=89;FAO=35;FDP=91;FR=.;FRO=56;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=24;FSRR=32;FWDB=-0.0141573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.566;QD=5.11006;RBI=0.017132;REFB=-0.00402337;REVB=-0.00964763;RO=55;SAF=15;SAR=18;SRF=23;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0402024;STB=0.517756;TYPE=snp;VARB=0.00711057;OID=.;OPOS=121666646;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:91:55:56:33:35:18:15:23:32:19:16:24:32 chr12 121691096 . G A 116.18 PASS AO=27;DP=54;FAO=27;FDP=57;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=4;FSRR=26;FWDB=0.0592504;FXX=0.0172384;HRUN=3;LEN=1;MLLD=249.403;QD=8.15297;RBI=0.060911;REFB=0.0112228;REVB=-0.0141261;RO=27;SAF=7;SAR=20;SRF=4;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140137;STB=0.594034;TYPE=snp;VARB=-0.0110279;OID=.;OPOS=121691096;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:57:27:30:27:27:20:7:4:23:20:7:4:26 chr12 121707321 . G A 1311.37 PASS AO=140;DP=142;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140305;FXX=0.00699252;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.779;QD=36.94;RBI=0.0178238;REFB=-0.111062;REVB=0.0109923;RO=2;SAF=68;SAR=72;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0137771;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000288173;OID=.;OPOS=121707321;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:142:142:2:0:140:142:72:68:2:0:72:70:0:0 chr12 121712077 . T A 259.75 PASS AO=28;DP=30;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0268594;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.5824;QD=35.8275;RBI=0.0393488;REFB=0.00444187;REVB=0.0287559;RO=1;SAF=19;SAR=9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0238715;STB=0.512811;TYPE=snp;VARB=0.000966125;OID=.;OPOS=121712077;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:30:29:1:1:28:28:9:19:1:0:9:19:1:0 chr12 121853164 . T C 154.28 PASS AO=34;DP=67;FAO=34;FDP=67;FR=.;FRO=33;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=9;FWDB=-0.0191948;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.145;QD=9.21085;RBI=0.027533;REFB=0.0179624;REVB=0.019739;RO=33;SAF=20;SAR=14;SRF=24;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130839;STB=0.57245;TYPE=snp;VARB=-0.0164236;OID=.;OPOS=121853164;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:33:33:34:34:14:20:24:9:14:20:24:9 chr12 121870922 . G A 144.38 PASS AO=31;DP=60;FAO=32;FDP=64;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=10;FWDB=-0.0237374;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.2841;QD=9.0237;RBI=0.0484769;REFB=-0.0516618;REVB=0.0422676;RO=28;SAF=18;SAR=13;SRF=19;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0873476;STB=0.564477;TYPE=snp;VARB=0.0647916;OID=.;OPOS=121870922;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:64:28:32:31:32:13:18:19:9:14:18:22:10 chr12 121871006 . A C 158.66 PASS AO=34;DP=64;FAO=34;FDP=64;FR=.;FRO=30;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=-0.00643912;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=143.891;QD=9.9165;RBI=0.0143217;REFB=-0.00967798;REVB=-0.0127925;RO=30;SAF=18;SAR=16;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0601529;STB=0.533314;TYPE=snp;VARB=0.00537306;OID=.;OPOS=121871006;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:30:30:34:34:16:18:18:12:16:18:18:12 chr12 121878659 . C T 206.81 PASS AO=48;DP=102;FAO=50;FDP=104;FR=.;FRO=54;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=0.00289268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.302;QD=7.95404;RBI=0.011198;REFB=-0.00841207;REVB=0.0108179;RO=54;SAF=25;SAR=23;SRF=25;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0549902;STB=0.529581;TYPE=snp;VARB=0.0071352;OID=.;OPOS=121878659;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:104:54:54:48:50:23:25:25:29:24:26:25:29 chr12 121880520 . G A 122.41 PASS AO=28;DP=58;FAO=28;FDP=58;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=0.0547467;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.303;QD=8.44207;RBI=0.0552263;REFB=-0.0218493;REVB=0.00726222;RO=29;SAF=16;SAR=12;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203557;STB=0.621275;TYPE=snp;VARB=0.0196151;OID=.;OPOS=121880520;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:29:30:28:28:12:16:10:19:12:16:10:20 chr12 121881528 . G A 159.48 PASS AO=21;DP=27;FAO=22;FDP=27;FR=.;FRO=5;FSAF=22;FSAR=0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.104113;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.408;QD=23.6259;RBI=0.104113;REFB=-0.262864;REVB=0;RO=6;SAF=21;SAR=0;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0267794;OID=.;OPOS=121881528;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:27:27:6:5:21:22:0:21:6:0:0:22:5:0 chr12 121881548 . T A 15.77 PASS AO=3;DP=7;FAO=3;FDP=7;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0146871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.0475;QD=9.01322;RBI=0.0146871;REFB=-0.0411773;REVB=0;RO=4;SAF=3;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0724965;OID=.;OPOS=121881548;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:7:7:4:4:3:3:0:3:4:0:0:3:4:0 chr12 121881848 . G A 119.21 PASS AO=24;DP=50;FAO=26;FDP=52;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=0.0067703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.428;QD=9.16972;RBI=0.00864582;REFB=-0.00531646;REVB=0.0053771;RO=26;SAF=12;SAR=12;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142266;STB=0.576865;TYPE=snp;VARB=0.00265087;OID=.;OPOS=121881848;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:52:26:26:24:26:12:12:9:17:13:13:9:17 chr12 122042844 . A G 428.83 PASS AO=47;DP=49;FAO=51;FDP=54;FR=.;FRO=3;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0191517;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=40.6788;QD=31.765;RBI=0.0592007;REFB=-0.153723;REVB=0.0560173;RO=2;SAF=25;SAR=22;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0408476;STB=0.5098;TYPE=snp;VARB=0.0386071;OID=.;OPOS=122042844;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:49:54:2:3:47:51:22:25:0:2:25:26:1:2 chr12 122042849 . G A 48.01 PASS AO=17;DP=54;FAO=17;FDP=54;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.0363304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.354;QD=3.55601;RBI=0.0442682;REFB=-0.0132581;REVB=-0.0252938;RO=37;SAF=10;SAR=7;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148118;STB=0.588131;TYPE=snp;VARB=0.0356554;OID=.;OPOS=122042849;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:54:54:37:37:17:17:7:10:17:20:7:10:17:20 chr12 122186268 . C T 55.77 PASS AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=0.0106966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.1957;QD=6.56163;RBI=0.0412763;REFB=-0.0257077;REVB=0.0398662;RO=20;SAF=9;SAR=5;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.381446;STB=0.71971;TYPE=snp;VARB=0.0317221;OID=.;OPOS=122186268;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:34:34:20:20:14:14:5:9:5:15:5:9:5:15 chr12 122186317 . G A 90.58 PASS AO=18;DP=36;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=14;FWDB=0.0442177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4;QD=9.7927;RBI=0.065172;REFB=0.000198944;REVB=0.0478768;RO=18;SAF=10;SAR=8;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.289186;STB=0.645924;TYPE=snp;VARB=0.00440767;OID=.;OPOS=122186317;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:36:37:18:18:18:19:8:10:4:14:9:10:4:14 chr12 122234089 . T A 570.99 PASS AO=31;DP=69;FAO=64;FDP=64;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=45;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0464282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.6128;QD=35.687;RBI=0.0494244;REFB=0;REVB=0.0169469;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000131206;OID=.;OPOS=122234089;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:63:64:0:0:31:64:17:14:0:0:19:45:0:0 chr12 122243905 . C T 1043.37 PASS AO=108;DP=108;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0521006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.431;QD=38.2888;RBI=0.0658356;REFB=0;REVB=0.0402474;RO=0;SAF=27;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.47152e-05;OID=.;OPOS=122243905;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:108:109:0:0:108:109:81:27:0:0:81:28:0:0 chr12 122248582 . C G 236.17 PASS AO=27;DP=29;FAO=27;FDP=29;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0302269;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=211.437;QD=32.5752;RBI=0.0314843;REFB=-0.0788897;REVB=0.00880886;RO=1;SAF=10;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0265715;STB=0.50953;TYPE=snp;VARB=0.000672637;OID=.;OPOS=122248582;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:1:2:27:27:17:10:0:1:17:10:1:1 chr12 122257746 . GC G 22.42 PASS AO=10;DP=25;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.0344003;FXX=0.0434594;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.2198;QD=4.07656;RBI=0.135005;REFB=-0.0867495;REVB=-0.130549;RO=11;SAF=7;SAR=3;SRF=6;SRR=5;SSEN=0.440476;SSEP=0;SSSB=0.151801;STB=0.533258;TYPE=del;VARB=0.109026;OID=.;OPOS=122257747;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:10:23:9:22:13:6:3:8:5:22:11:7:3:6:5 chr12 122261456 . G A 301.39 PASS AO=30;DP=111;FAO=54;FDP=104;FR=.,HEALED;FRO=35;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=3;FSRR=32;FWDB=0.0786857;FXX=0.0188661;HRUN=3;LEN=1;MLLD=155.712;QD=11.5918;RBI=0.0799195;REFB=-0.0516474;REVB=0.0139889;RO=40;SAF=7;SAR=23;SRF=9;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0118423;STB=0.668257;TYPE=snp;VARB=0.0327559;OID=.;OPOS=122261456;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:104:40:35:30:54:23:7:9:31:26:28:3:32 chr12 122261457 . G A 35.14 PASS AO=24;DP=111;FAO=24;FDP=110;FR=.;FRO=86;FSAF=22;FSAR=2;FSRF=24;FSRR=62;FWDB=-0.00182385;FXX=0.0090082;HRUN=3;LEN=1;MLLD=121.291;QD=1.27765;RBI=0.00663226;REFB=-0.00427764;REVB=0.00637655;RO=85;SAF=22;SAR=2;SRF=23;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.731095;STB=0.938354;TYPE=snp;VARB=0.0134107;OID=.;OPOS=122261457;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:111:110:85:86:24:24:2:22:23:62:2:22:24:62 chr12 122295335 . T C 104.45 PASS AO=27;DP=63;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.000403127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.6652;QD=6.63197;RBI=0.0139187;REFB=-0.0242881;REVB=-0.0139129;RO=35;SAF=17;SAR=10;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0899779;STB=0.560394;TYPE=snp;VARB=0.0235947;OID=.;OPOS=122295335;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:35:36:27:27:10:17:19:16:10:17:19:17 chr12 122326812 . T C 157.14 PASS AO=19;DP=21;FAO=19;FDP=21;FR=.;FRO=2;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0697111;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9668;QD=29.9311;RBI=0.0722247;REFB=-0.00355583;REVB=0.0188881;RO=2;SAF=12;SAR=7;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0707039;STB=0.538422;TYPE=snp;VARB=-0.00162856;OID=.;OPOS=122326812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:21:21:2:2:19:19:7:12:2:0:7:12:2:0 chr12 122355716 . C T 1583.62 PASS AO=151;DP=151;FAO=166;FDP=166;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=144;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0382141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.758;QD=38.1594;RBI=0.0998109;REFB=0;REVB=0.0922058;RO=0;SAF=21;SAR=130;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.86214e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000132351;OID=.;OPOS=122355716;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:151:166:0:0:151:166:130:21:0:0:144:22:0:0 chr12 122497001 . T C 304.66 PASS AO=70;DP=140;FAO=70;FDP=140;FR=.;FRO=70;FSAF=28;FSAR=42;FSRF=25;FSRR=45;FWDB=-0.0250288;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=217.702;QD=8.70465;RBI=0.0267847;REFB=-0.00935525;REVB=-0.00953811;RO=70;SAF=28;SAR=42;SRF=25;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0408964;STB=0.522516;TYPE=snp;VARB=0.00978155;OID=.;OPOS=122497001;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:70:70:70:70:42:28:25:45:42:28:25:45 chr12 122674032 . C T 559.5 PASS AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.038726;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.8966;QD=36.0969;RBI=0.0389462;REFB=-0.138761;REVB=-0.00413603;RO=0;SAF=11;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.6915e-08;STB=0.504949;TYPE=snp;VARB=0.00139029;OID=.;OPOS=122674032;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:62:62:0:1:61:61:50:11:0:0:50:11:0:1 chr12 122674758 . G A 501.55 PASS AO=53;DP=54;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0334511;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.6401;QD=36.4762;RBI=0.0446446;REFB=0;REVB=0.0295662;RO=1;SAF=38;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0303689;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00128596;OID=.;OPOS=122674758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:54:55:1:0:53:55:15:38:0:1:17:38:0:0 chr12 122676013 . A C 1662.32 PASS AO=162;DP=162;FAO=174;FDP=174;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0553402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.854;QD=38.2143;RBI=0.0576046;REFB=0;REVB=-0.0159923;RO=0;SAF=83;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.21923e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.34316e-05;OID=.;OPOS=122676013;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:162:174:0:0:162:174:79:83:0:0:86:88:0:0 chr12 122689161 . C G 37.31 PASS AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=-0.0258561;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3827;QD=6.48948;RBI=0.0552334;REFB=-0.00740357;REVB=0.0488076;RO=14;SAF=8;SAR=1;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206442;STB=0.62712;TYPE=snp;VARB=0.0183964;OID=.;OPOS=122689161;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:23:23:14:14:9:9:1:8:11:3:1:8:11:3 chr12 122689181 . C G 59.21 PASS AO=11;DP=22;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0587019;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=37.0809;QD=9.86803;RBI=0.0799152;REFB=-0.0988602;REVB=-0.0542267;RO=11;SAF=9;SAR=2;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.300456;STB=0.672746;TYPE=snp;VARB=0.0819553;OID=.;OPOS=122689181;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:22:24:11:12:11:12:2:9:6:5:2:10:7:5 chr12 122689244 . C T 56.56 PASS AO=18;DP=48;FAO=17;FDP=47;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=23;FWDB=0.0668399;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=41.2398;QD=4.81373;RBI=0.0827267;REFB=-0.033767;REVB=0.0487456;RO=29;SAF=13;SAR=5;SRF=7;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.484205;STB=0.852075;TYPE=snp;VARB=0.0588014;OID=.;OPOS=122689244;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:48:47:29:30:18:17:5:13:7:22:3:14:7:23 chr12 122691428 . G A 86.7 PASS AO=16;DP=28;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0293508;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.2743;QD=12.385;RBI=0.0293683;REFB=-0.0157633;REVB=-0.00101279;RO=10;SAF=3;SAR=13;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.405834;STB=0.706233;TYPE=snp;VARB=0.0208123;OID=.;OPOS=122691428;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:28:28:10:12:16:16:13:3:7:3:13:3:7:5 chr12 122691738 . C A 520.32 PASS AO=54;DP=54;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0879824;FXX=0.0483793;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.214;QD=35.2762;RBI=0.0923631;REFB=0;REVB=0.0281076;RO=0;SAF=21;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.70667e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00339616;OID=.;OPOS=122691738;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:54:59:0:0:54:59:33:21:0:0:33:26:0:0 chr12 122692820 . T C 25.89 PASS AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.0111281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.031;QD=8.63109;RBI=0.0338862;REFB=-0.00997475;REVB=0.0320068;RO=7;SAF=3;SAR=2;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115149;STB=0.571156;TYPE=snp;VARB=0.0140294;OID=.;OPOS=122692820;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:12:12:7:7:5:5:2:3:5:2:2:3:5:2 chr12 122756342 . G A 427.11 PASS AO=94;DP=198;FAO=103;FDP=207;FR=.;FRO=104;FSAF=72;FSAR=31;FSRF=59;FSRR=45;FWDB=0.0298086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.956;QD=8.25335;RBI=0.0301864;REFB=-0.0133718;REVB=-0.00476091;RO=101;SAF=65;SAR=29;SRF=57;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131662;STB=0.573991;TYPE=snp;VARB=0.0153566;OID=.;OPOS=122756342;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:207:101:104:94:103:29:65:57:44:31:72:59:45 chr12 122812503 . G C 423.66 PASS AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0126106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.2451;QD=37.6586;RBI=0.044108;REFB=0;REVB=-0.0422668;RO=0;SAF=6;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.44635e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00107076;OID=.;OPOS=122812503;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:45:45:0:0:45:45:39:6:0:0:39:6:0:0 chr12 122989235 . A C 3742.09 PASS AO=266;DP=395;FAO=387;FDP=396;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=243;FSAR=144;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0348512;FXX=0.005025;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.8656;QD=37.7989;RBI=0.356601;REFB=-0.0171558;REVB=0.354894;RO=2;SAF=241;SAR=25;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00394026;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0010227;OID=.;OPOS=122989235;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:392:396:2:0:266:387:25:241:2:0:144:243:0:0 chr12 123087442 . A G 1752.13 PASS AO=180;DP=181;FAO=184;FDP=184;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.073;QD=38.0897;RBI=0.0279864;REFB=0;REVB=-0.0150713;RO=0;SAF=72;SAR=108;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.79395e-05;OID=.;OPOS=123087442;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:181:184:0:0:180:184:108:72:0:0:111:73:0:0 chr12 123200247 . G C 2404.29 PASS AO=253;DP=259;FAO=255;FDP=255;FR=.;FRO=0;FSAF=156;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226922;FXX=0.0267165;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.099;QD=37.7144;RBI=0.0236011;REFB=-0.0221931;REVB=0.0064867;RO=2;SAF=153;SAR=100;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0094371;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.23475e-05;OID=.;OPOS=123200247;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:259:255:2:0:253:255:100:153:0:2:99:156:0:0 chr12 123214070 . G A 167.21 PASS AO=47;DP=117;FAO=48;FDP=117;FR=.;FRO=69;FSAF=15;FSAR=33;FSRF=20;FSRR=49;FWDB=0.0132645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.39;QD=5.71654;RBI=0.0190748;REFB=0.00244672;REVB=-0.0137077;RO=68;SAF=15;SAR=32;SRF=19;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0489907;STB=0.515717;TYPE=snp;VARB=-0.00617027;OID=.;OPOS=123214070;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:68:69:47:48:32:15:19:49:33:15:20:49 chr12 123253856 . C CAT,T 2964.24 PASS AO=379,103;DP=550;FAO=298,69;FDP=397;FR=.;FRO=30;FSAF=201,45;FSAR=97,24;FSRF=23;FSRR=7;FWDB=-0.0256001,-0.0415038;FXX=0.00749981;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=139.921,54.5332;QD=29.8664;RBI=0.0257612,0.0857336;REFB=-0.0403249,-0.0431313;REVB=-0.00287651,-0.0750179;RO=49;SAF=266,65;SAR=113,38;SRF=36;SRR=13;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0085617,-0.0681289;STB=0.509663,0.539137;TYPE=ins,snp;VARB=0.00932771,0.0172498;OID=.,.;OPOS=123253857,123253856;OREF=-,C;OALT=AT,T;OMAPALT=CAT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:58:550:397:49:30:379,103:298,69:113,38:266,65:36:13:97,24:201,45:23:7 chr12 123333065 . C T 435.33 PASS AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0499978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.9158;QD=37.8546;RBI=0.057401;REFB=0;REVB=-0.0281975;RO=0;SAF=5;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000206349;OID=.;OPOS=123333065;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:46:46:0:0:46:46:41:5:0:0:41:5:0:0 chr12 123340454 . C CCG 16.12 PASS AO=2;DP=10;FAO=3;FDP=8;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.157603;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=27.3962;QD=8.05796;RBI=0.170077;REFB=0.0675277;REVB=-0.0639326;RO=7;SAF=1;SAR=1;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.224092;STB=0.599397;TYPE=ins;VARB=-0.0787489;OID=.;OPOS=123340455;OREF=-;OALT=CG;OMAPALT=CCG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:2:10:3:8:5:1:2:1:4:15:7:1:1:2:5 chr12 123345736 . C G 220.87 PASS AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0125948;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=246.852;QD=36.8114;RBI=0.0270312;REFB=0;REVB=0.0239177;RO=0;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000217043;OID=.;OPOS=123345736;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:24:24:0:0:24:24:11:13:0:0:11:13:0:0 chr12 123345756 . G GC 49 PASS AO=9;DP=25;FAO=14;FDP=23;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.00162878;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=15.6236;QD=8.52242;RBI=0.052244;REFB=-0.072244;REVB=-0.0522186;RO=14;SAF=5;SAR=4;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0565464;STB=0.622464;TYPE=ins;VARB=0.0497179;OID=.;OPOS=123345757;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:9:25:14:23:9:5:9:6:3:22:14:5:4:7:7 chr12 123806219 . C T 1362.2 PASS AO=143;DP=143;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0167508;FXX=0.00694396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.22;QD=38.1035;RBI=0.0237193;REFB=0;REVB=0.0167933;RO=0;SAF=71;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.12165e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.4573e-05;OID=.;OPOS=123806219;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:143:143:0:0:143:143:72:71:0:0:73:70:0:0 chr12 123825559 . C T 1207.46 PASS AO=118;DP=118;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0444305;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.504;QD=38.3319;RBI=0.0712251;REFB=0;REVB=0.0556682;RO=0;SAF=60;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.03419e-05;OID=.;OPOS=123825559;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:118:126:0:0:118:126:58:60:0:0:64:62:0:0 chr12 123892095 . T C 21.05 PASS AO=35;DP=219;FAO=35;FDP=219;FR=.;FRO=184;FSAF=6;FSAR=29;FSRF=40;FSRR=144;FWDB=-0.0526397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.909;QD=0.384483;RBI=0.0528919;REFB=-0.00332474;REVB=0.00515893;RO=184;SAF=6;SAR=29;SRF=40;SRR=144;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0938186;STB=0.562356;TYPE=snp;VARB=0.0155372;OID=.;OPOS=123892095;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:219:219:184:184:35:35:29:6:40:144:29:6:40:144 chr12 123892590 . C T 88.64 PASS AO=62;DP=263;FAO=62;FDP=262;FR=.;FRO=200;FSAF=19;FSAR=43;FSRF=108;FSRR=92;FWDB=-0.00178248;FXX=0.00380214;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.526;QD=1.35325;RBI=0.0155596;REFB=-0.0140112;REVB=-0.0154571;RO=199;SAF=19;SAR=43;SRF=108;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.301725;STB=0.680355;TYPE=snp;VARB=0.0406166;OID=.;OPOS=123892590;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:263:262:199:200:62:62:43:19:108:91:43:19:108:92 chr12 123892824 . C T 2320.07 PASS AO=143;DP=265;FAO=252;FDP=257;FR=.;FRO=5;FSAF=201;FSAR=51;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.012707;FXX=0.0301875;HRUN=4;LEN=1;MLLD=143.779;QD=36.11;RBI=0.0141916;REFB=0.0139404;REVB=0.00631931;RO=0;SAF=95;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.500072;TYPE=snp;VARB=-6.32915e-06;OID=.;OPOS=123892824;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:150:257:0:5:143:252:48:95:0:0:51:201:4:1 chr12 123951099 . C T 30.04 PASS AO=11;DP=88;FAO=11;FDP=59;FR=.,HEALED;FRO=48;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=-0.00117966;FXX=0.119385;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.342;QD=2.03677;RBI=0.00528909;REFB=0.000114403;REVB=0.00515585;RO=18;SAF=1;SAR=10;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.553037;STB=0.879511;TYPE=snp;VARB=0.0223815;OID=.;OPOS=123951099;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:65:59:18:48:11:11:10:1:9:9:10:1:24:24 chr12 124008073 . A G 1334.51 PASS AO=143;DP=146;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0116147;FXX=0.0136977;HRUN=3;LEN=1;MLLD=71.8247;QD=37.0699;RBI=0.0199703;REFB=0.0530997;REVB=0.0162453;RO=2;SAF=104;SAR=39;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00748497;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00127252;OID=.;OPOS=124008073;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:146:144:2:0:143:144:39:104:1:1:40:104:0:0 chr12 124017850 . G C 58.48 PASS AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=-0.018546;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.518;QD=9.7474;RBI=0.0185694;REFB=-0.0184552;REVB=-0.000931361;RO=12;SAF=3;SAR=9;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0228886;OID=.;OPOS=124017850;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:24:24:12:12:12:12:9:3:3:9:9:3:3:9 chr12 124069213 . T C 201.54 PASS AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.074276;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4508;QD=36.6436;RBI=0.0844664;REFB=0;REVB=-0.0402201;RO=0;SAF=15;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.79751e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00351825;OID=.;OPOS=124069213;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:22:22:0:0:22:22:7:15:0:0:7:15:0:0 chr12 124090453 . A G 2694 PASS AO=278;DP=278;FAO=280;FDP=280;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=213;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.353;QD=38.4857;RBI=0.0275395;REFB=0;REVB=-0.0219665;RO=0;SAF=67;SAR=211;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.03313e-06;OID=.;OPOS=124090453;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:278:280:0:0:278:280:211:67:0:0:213:67:0:0 chr12 124101347 . G C 451.44 PASS AO=77;DP=121;FAO=80;FDP=123;FR=.;FRO=43;FSAF=39;FSAR=41;FSRF=14;FSRR=29;FWDB=0.0111852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.971;QD=14.6811;RBI=0.0174402;REFB=-0.0242608;REVB=0.013381;RO=43;SAF=39;SAR=38;SRF=14;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119848;STB=0.556788;TYPE=snp;VARB=0.0262748;OID=.;OPOS=124101347;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:123:43:43:77:80:38:39:14:29:41:39:14:29 chr12 124102433 . CGTTTTCAGATAGAATGCCTA C 26.48 PASS AO=16;DP=91;FAO=16;FDP=73;FR=.;FRO=57;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=36;FSRR=21;FWDB=-0.00720598;FXX=0.0759398;HRUN=1;LEN=20;MLLD=515.576;QD=1.45101;RBI=0.00973266;REFB=-0.00607145;REVB=-0.00654206;RO=50;SAF=5;SAR=11;SRF=33;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.408427;STB=0.737854;TYPE=del;VARB=0.0165899;OID=.;OPOS=124102434;OREF=GTTTTCAGATAGAATGCCTA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:16:74:16:73:57:5:11:36:21:26:50:5:11:33:17 chr12 124104049 . A G 337.64 PASS AO=78;DP=147;FAO=83;FDP=163;FR=.;FRO=80;FSAF=36;FSAR=47;FSRF=37;FSRR=43;FWDB=-0.0685224;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=34.0309;QD=8.28575;RBI=0.115661;REFB=-0.0465282;REVB=-0.0931783;RO=69;SAF=31;SAR=47;SRF=28;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00746188;STB=0.514312;TYPE=snp;VARB=0.0318683;OID=.;OPOS=124104049;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:163:69:80:78:83:47:31:28:41:47:36:37:43 chr12 124104686 . G A 41.7 PASS AO=12;DP=38;FAO=13;FDP=39;FR=.;FRO=26;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=22;FWDB=-0.0042478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.6388;QD=4.27643;RBI=0.05215;REFB=-0.0217428;REVB=0.0519768;RO=26;SAF=2;SAR=10;SRF=4;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0267692;STB=0.578205;TYPE=snp;VARB=0.0460174;OID=.;OPOS=124104686;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:38:39:26:26:12:13:10:2:4:22:10:3:4:22 chr12 124144395 . A G 377.32 PASS AO=96;DP=189;FAO=90;FDP=183;FR=.;FRO=93;FSAF=17;FSAR=73;FSRF=31;FSRR=62;FWDB=-0.00826828;FXX=0.0418826;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.319;QD=8.24749;RBI=0.00830604;REFB=-0.00610056;REVB=-0.000791043;RO=90;SAF=24;SAR=72;SRF=28;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0689765;STB=0.604217;TYPE=snp;VARB=0.006532;OID=.;OPOS=124144395;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:183:90:93:96:90:72:24:28:62:73:17:31:62 chr12 124179417 . T C 186.97 PASS AO=40;DP=141;FAO=55;FDP=133;FR=.,HEALED;FRO=78;FSAF=20;FSAR=35;FSRF=29;FSRR=49;FWDB=0.0630318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.8344;QD=5.62331;RBI=0.0712144;REFB=-0.00606614;REVB=0.0331433;RO=54;SAF=10;SAR=30;SRF=10;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0933286;STB=0.505153;TYPE=snp;VARB=0.0157561;OID=.;OPOS=124179417;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:133:54:78:40:55:30:10:10:44:35:20:29:49 chr12 124181049 . C T 705.02 PASS AO=252;DP=577;FAO=184;FDP=400;FR=.;FRO=216;FSAF=99;FSAR=85;FSRF=86;FSRR=130;FWDB=0.0083863;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.5258;QD=7.05021;RBI=0.0102535;REFB=-0.010039;REVB=0.00589948;RO=324;SAF=132;SAR=120;SRF=137;SRR=187;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102349;STB=0.575107;TYPE=snp;VARB=0.0138155;OID=.;OPOS=124181049;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:577:400:324:216:252:184:120:132:137:187:85:99:86:130 chr12 124209332 . T C 23.82 PASS AO=9;DP=36;FAO=9;FDP=34;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=5;FWDB=0.00368882;FXX=0.0555401;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.7388;QD=2.80248;RBI=0.0377555;REFB=0.0110289;REVB=0.0375748;RO=24;SAF=4;SAR=5;SRF=20;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.451877;STB=0.749559;TYPE=snp;VARB=-0.00361867;OID=.;OPOS=124209332;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:36:34:24:25:9:9:5:4:20:4:5:4:20:5 chr12 124210782 . T C 214.05 PASS AO=53;DP=114;FAO=53;FDP=114;FR=.;FRO=61;FSAF=38;FSAR=15;FSRF=43;FSRR=18;FWDB=-0.001199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.48;QD=7.51059;RBI=0.0576795;REFB=-0.011608;REVB=0.0576671;RO=54;SAF=38;SAR=15;SRF=36;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.054897;STB=0.507895;TYPE=snp;VARB=0.0137612;OID=.;OPOS=124210782;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:54:61:53:53:15:38:36:18:15:38:43:18 chr12 124229429 . T C 398.63 PASS AO=106;DP=237;FAO=107;FDP=237;FR=.;FRO=130;FSAF=45;FSAR=62;FSRF=85;FSRR=45;FWDB=0.0143401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.141;QD=6.72795;RBI=0.0143854;REFB=-0.0224988;REVB=0.00114093;RO=130;SAF=45;SAR=61;SRF=84;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217603;STB=0.625996;TYPE=snp;VARB=0.0230212;OID=.;OPOS=124229429;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:237:237:130:130:106:107:61:45:84:46:62:45:85:45 chr12 124242770 . T C 56.02 PASS AO=19;DP=52;FAO=19;FDP=58;FR=.;FRO=39;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=-0.0386656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.5575;QD=3.86342;RBI=0.0387876;REFB=-0.0119117;REVB=0.00307417;RO=33;SAF=11;SAR=8;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0370945;STB=0.510193;TYPE=snp;VARB=0.0523324;OID=.;OPOS=124242770;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:52:58:33:39:19:19:8:11:18:15:8:11:22:17 chr12 124243707 . T C 361.89 PASS AO=76;DP=142;FAO=78;FDP=146;FR=.;FRO=68;FSAF=30;FSAR=48;FSRF=35;FSRR=33;FWDB=-0.0488761;FXX=0.00680226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.3996;QD=9.91477;RBI=0.0488856;REFB=-0.00393129;REVB=0.000961903;RO=63;SAF=30;SAR=46;SRF=31;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0827063;STB=0.562146;TYPE=snp;VARB=0.00449924;OID=.;OPOS=124243707;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:146:63:68:76:78:46:30:31:32:48:30:35:33 chr12 124265687 . T C 442.33 PASS AO=108;DP=225;FAO=109;FDP=228;FR=.;FRO=119;FSAF=59;FSAR=50;FSRF=57;FSRR=62;FWDB=-0.0276242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.788;QD=7.76018;RBI=0.0302619;REFB=0.000456039;REVB=-0.0123568;RO=117;SAF=59;SAR=49;SRF=57;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0559274;STB=0.532554;TYPE=snp;VARB=-0.000835731;OID=.;OPOS=124265687;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:225:228:117:119:108:109:49:59:57:60:50:59:57:62 chr12 124267703 . T C 431.36 PASS AO=110;DP=240;FAO=111;FDP=240;FR=.;FRO=129;FSAF=44;FSAR=67;FSRF=55;FSRR=74;FWDB=-0.012945;FXX=0.00414921;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.527;QD=7.18928;RBI=0.0141478;REFB=-0.0147157;REVB=-0.00570851;RO=129;SAF=44;SAR=66;SRF=55;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0266209;STB=0.516706;TYPE=snp;VARB=0.0193489;OID=.;OPOS=124267703;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:240:240:129:129:110:111:66:44:55:74:67:44:55:74 chr12 124274474 . A G 647.31 PASS AO=148;DP=318;FAO=158;FDP=326;FR=.;FRO=168;FSAF=86;FSAR=72;FSRF=68;FSRR=100;FWDB=0.00132853;FXX=0.00911826;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.652;QD=7.94241;RBI=0.00343013;REFB=-0.0112222;REVB=0.0031624;RO=158;SAF=80;SAR=68;SRF=65;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12086;STB=0.571552;TYPE=snp;VARB=0.0125326;OID=.;OPOS=124274474;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:318:326:158:168:148:158:68:80:65:93:72:86:68:100 chr12 124325977 . T G 1906.1 PASS AO=204;DP=207;FAO=204;FDP=204;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0212018;FXX=0.0144921;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.972;QD=37.3745;RBI=0.0306734;REFB=0.0557953;REVB=-0.0221663;RO=3;SAF=98;SAR=106;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00406604;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000643382;OID=.;OPOS=124325977;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:207:204:3:0:204:204:106:98:1:2:106:98:0:0 chr12 124417889 . C T 510.71 PASS AO=108;DP=198;FAO=108;FDP=198;FR=.;FRO=90;FSAF=55;FSAR=53;FSRF=42;FSRR=48;FWDB=0.0340327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.2258;QD=10.3174;RBI=0.0405286;REFB=-0.0181301;REVB=-0.0220077;RO=89;SAF=55;SAR=53;SRF=41;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0402411;STB=0.519349;TYPE=snp;VARB=0.0207562;OID=.;OPOS=124417889;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:198:89:90:108:108:53:55:41:48:53:55:42:48 chr12 124418674 . C T 201.99 PASS AO=29;DP=38;FAO=29;FDP=38;FR=.;FRO=9;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.00339539;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.6275;QD=21.2619;RBI=0.0387588;REFB=-0.00676255;REVB=-0.0386098;RO=9;SAF=20;SAR=9;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0662832;STB=0.536057;TYPE=snp;VARB=0.00398965;OID=.;OPOS=124418674;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:38:38:9:9:29:29:9:20:5:4:9:20:5:4 chr12 124419062 . A C 27.2 PASS AO=9;DP=31;FAO=9;FDP=31;FR=.;FRO=22;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=17;FWDB=-0.0330453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.934;QD=3.50935;RBI=0.0359895;REFB=-0.0123702;REVB=-0.0142569;RO=21;SAF=2;SAR=7;SRF=4;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0542631;STB=0.505143;TYPE=snp;VARB=0.0279455;OID=.;OPOS=124419062;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:31:31:21:22:9:9:7:2:4:17:7:2:5:17 chr12 124421584 . C T 140.1 PASS AO=18;DP=24;FAO=19;FDP=23;FR=.;FRO=4;FSAF=17;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.00732274;FXX=0.079968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8523;QD=24.3646;RBI=0.0444279;REFB=0.0575556;REVB=0.0438203;RO=3;SAF=17;SAR=1;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0745013;STB=0.55258;TYPE=snp;VARB=-0.0065149;OID=.;OPOS=124421584;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:24:23:3:4:18:19:1:17:3:0:2:17:4:0 chr12 124422262 . G A 93.06 PASS AO=27;DP=73;FAO=27;FDP=70;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=17;FWDB=-0.0085976;FXX=0.078937;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.406;QD=5.31774;RBI=0.0087941;REFB=-0.00989794;REVB=0.00184865;RO=34;SAF=15;SAR=12;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0327271;STB=0.530722;TYPE=snp;VARB=0.0142358;OID=.;OPOS=124422262;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:73:70:34:43:27:27:12:15:20:14:12:15:26:17 chr12 124427306 . T A 338.46 PASS AO=88;DP=189;FAO=88;FDP=193;FR=.;FRO=105;FSAF=43;FSAR=45;FSRF=62;FSRR=43;FWDB=-0.0290813;FXX=0.0102559;HRUN=4;LEN=1;MLLD=54.2865;QD=7.01473;RBI=0.0483609;REFB=-0.0321283;REVB=-0.0386401;RO=101;SAF=43;SAR=45;SRF=58;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0825918;STB=0.555282;TYPE=snp;VARB=0.0533978;OID=.;OPOS=124427306;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:193:101:105:88:88:45:43:58:43:45:43:62:43 chr12 124499542 . G A 194.04 PASS AO=50;DP=114;FAO=51;FDP=115;FR=.;FRO=64;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=25;FSRR=39;FWDB=-0.0177116;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.102;QD=6.74925;RBI=0.0181899;REFB=-0.00697664;REVB=0.00414394;RO=64;SAF=22;SAR=28;SRF=25;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0506213;STB=0.523251;TYPE=snp;VARB=0.00926081;OID=.;OPOS=124499542;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:115:64:64:50:51:28:22:25:39:29:22:25:39 chr12 124499839 . C T 658.24 PASS AO=147;DP=294;FAO=153;FDP=300;FR=.;FRO=147;FSAF=68;FSAR=85;FSRF=79;FSRR=68;FWDB=-0.0205973;FXX=0.00332215;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.5948;QD=8.77648;RBI=0.0228619;REFB=-0.0133645;REVB=-0.00992047;RO=147;SAF=68;SAR=79;SRF=79;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0682445;STB=0.545651;TYPE=snp;VARB=0.0160295;OID=.;OPOS=124499839;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:294:300:147:147:147:153:79:68:79:68:85:68:79:68 chr12 124821666 . G A 53.81 PASS AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0311016;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=233.527;QD=23.916;RBI=0.0311016;REFB=-0.0306402;REVB=0;RO=2;SAF=7;SAR=0;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00870708;OID=.;OPOS=124821666;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:2:2:7:7:0:7:2:0:0:7:2:0 chr12 124829234 . C T 401.69 PASS AO=41;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00253254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.5124;QD=37.3665;RBI=0.0535288;REFB=0;REVB=0.0534688;RO=0;SAF=11;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000328682;OID=.;OPOS=124829234;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:42:43:0:0:41:43:30:11:0:0:32:11:0:0 chr12 124829255 . A G 361.72 PASS AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00366901;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.978;QD=38.0759;RBI=0.00756659;REFB=0;REVB=-0.00661753;RO=0;SAF=11;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000622783;OID=.;OPOS=124829255;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:37:38:0:0:37:38:26:11:0:0:27:11:0:0 chr12 124856660 . T A 161.63 PASS AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00456909;FXX=0.0555247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4418;QD=38.0309;RBI=0.029323;REFB=0;REVB=0.0289648;RO=0;SAF=2;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.95117e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000897189;OID=.;OPOS=124856660;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:17:0:0:17:17:15:2:0:0:15:2:0:0 chr12 124941665 . GGC G,GG 235.38 PASS AO=6,14;DP=44;FAO=34,0;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=28,0;FSAR=6,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.281226,-0.163144;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=2,1;MLLD=16.2534,8.47865;QD=27.6918;RBI=0.297444,0.6098;REFB=0,0;REVB=0.0968736,0.587572;RO=6;SAF=6,14;SAR=0,0;SRF=1;SRR=5;SSEN=0.466667,0;SSEP=0,0.439024;SSSB=0.802799,0.848476;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.0137024,0;OID=.,.;OPOS=124941666,124941667;OREF=GC,C;OALT=-,-;OMAPALT=G,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:6,14:33:34,0:34:0:28,0:6,0:0:0:21:6:6,14:0,0:1:5 chr12 124968349 . T C 65.53 PASS AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=-0.0335429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.5581;QD=7.94333;RBI=0.0349128;REFB=-0.0111813;REVB=-0.00968381;RO=16;SAF=12;SAR=3;SRF=13;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0178367;STB=0.561316;TYPE=snp;VARB=0.00469465;OID=.;OPOS=124968349;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:33:33:16:18:15:15:3:12:13:3:3:12:13:5 chr12 124979789 . T G 61.29 PASS AO=17;DP=46;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=-0.00309151;FXX=0.061212;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.118;QD=5.32928;RBI=0.00649713;REFB=-0.0222623;REVB=0.00571448;RO=28;SAF=6;SAR=11;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.269569;STB=0.666473;TYPE=snp;VARB=0.0333844;OID=.;OPOS=124979789;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:46:46:28:29:17:17:11:6:17:11:11:6:18:11 chr12 125324553 . C T 79.86 PASS AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00910035;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=219.682;QD=31.943;RBI=0.0119205;REFB=0.00514512;REVB=-0.00769941;RO=1;SAF=8;SAR=1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0524171;STB=0.529348;TYPE=snp;VARB=-7.74187e-05;OID=.;OPOS=125324553;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:10:10:1:1:9:9:1:8:1:0:1:8:1:0 chr12 125386076 . T C 751.52 PASS AO=77;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188808;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.8;QD=38.5396;RBI=0.0667391;REFB=0;REVB=0.0640127;RO=0;SAF=54;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.18563e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000353891;OID=.;OPOS=125386076;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:78:78:0:0:77:78:23:54:0:0:23:55:0:0 chr12 125396488 . T C 769.69 PASS AO=84;DP=86;FAO=84;FDP=86;FR=.;FRO=2;FSAF=61;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0051086;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=234.75;QD=35.7995;RBI=0.00613676;REFB=0.0404703;REVB=0.0034003;RO=2;SAF=61;SAR=23;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0124456;STB=0.506573;TYPE=snp;VARB=-1.68914e-05;OID=.;OPOS=125396488;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:86:86:2:2:84:84:23:61:1:1:23:61:1:1 chr12 125396833 . G A 128.76 PASS AO=25;DP=44;FAO=25;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0187484;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.172;QD=11.7052;RBI=0.0198456;REFB=-0.00485755;REVB=0.00650718;RO=19;SAF=17;SAR=8;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170902;STB=0.595252;TYPE=snp;VARB=0.00388855;OID=.;OPOS=125396833;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:44:44:19:19:25:25:8:17:9:10:8:17:9:10 chr12 125397061 . G A 423.68 PASS AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110886;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.125;QD=37.6601;RBI=0.0507681;REFB=0;REVB=0.0495423;RO=0;SAF=36;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00023846;OID=.;OPOS=125397061;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:45:45:0:0:45:45:9:36:0:0:9:36:0:0 chr12 125397364 . A G 543.34 PASS AO=57;DP=58;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0245836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.482;QD=36.8368;RBI=0.0280091;REFB=-0.0404378;REVB=-0.0134224;RO=1;SAF=36;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.021926;STB=0.511624;TYPE=snp;VARB=0.00082755;OID=.;OPOS=125397364;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:58:59:1:1:57:58:21:36:0:1:21:37:0:1 chr12 125397750 . A G 326.63 PASS AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00907272;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.1215;QD=37.3293;RBI=0.071502;REFB=0;REVB=-0.0709241;RO=0;SAF=22;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.39865e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00117565;OID=.;OPOS=125397750;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:35:35:0:0:35:35:13:22:0:0:13:22:0:0 chr12 125398039 . G C 970.05 PASS AO=99;DP=100;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0342993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.1819;QD=37.6719;RBI=0.0513135;REFB=0;REVB=0.0381658;RO=0;SAF=71;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.26295e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000813981;OID=.;OPOS=125398039;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:100:103:0:0:99:103:28:71:0:0:32:71:0:0 chr12 125398081 . G A 225.46 PASS AO=43;DP=92;FAO=51;FDP=99;FR=.;FRO=48;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=37;FSRR=11;FWDB=0.023349;FXX=0.0198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.027;QD=9.10958;RBI=0.042113;REFB=-0.0478979;REVB=0.0350475;RO=49;SAF=21;SAR=22;SRF=37;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254989;STB=0.651865;TYPE=snp;VARB=0.0371214;OID=.;OPOS=125398081;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:99:49:48:43:51:22:21:37:12:28:23:37:11 chr12 125398517 . G A 674.06 PASS AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=76;FR=.;FRO=2;FSAF=50;FSAR=24;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00827813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.51;QD=35.477;RBI=0.0110967;REFB=-0.0023513;REVB=-0.00738975;RO=0;SAF=51;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509801;TYPE=snp;VARB=0.000124992;OID=.;OPOS=125398517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:74:76:0:2:74:74:23:51:0:0:24:50:2:0 chr12 125399068 . C T 426.56 PASS AO=46;DP=46;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0492447;FXX=0.0217344;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.7668;QD=37.9161;RBI=0.0591631;REFB=0;REVB=0.0327908;RO=0;SAF=20;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00185423;OID=.;OPOS=125399068;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:46:45:0:0:46:45:26:20:0:0:26:19:0:0 chr12 125399167 . T C 1245.58 PASS AO=128;DP=130;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176664;FXX=0.00769172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.976;QD=38.6227;RBI=0.0296635;REFB=0;REVB=-0.023829;RO=0;SAF=65;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.1359e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.71162e-06;OID=.;OPOS=125399167;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:130:129:0:0:128:129:63:65:0:0:63:66:0:0 chr12 125411882 . G A 843.97 PASS AO=89;DP=90;FAO=89;FDP=90;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.007231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.043;QD=37.5097;RBI=0.0623292;REFB=-0.051161;REVB=0.0619083;RO=1;SAF=34;SAR=55;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.013734;STB=0.507245;TYPE=snp;VARB=0.000372129;OID=.;OPOS=125411882;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:90:90:1:1:89:89:55:34:1:0:55:34:1:0 chr12 125411883 . T C 855.79 PASS AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0350163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.8952;QD=38.4626;RBI=0.0364584;REFB=0;REVB=-0.0101523;RO=0;SAF=34;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.58117e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000150316;OID=.;OPOS=125411883;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:89:89:0:0:89:89:55:34:0:0:55:34:0:0 chr12 125412470 . C T 677.1 PASS AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.742;QD=38.6916;RBI=0.0564918;REFB=0;REVB=0.0542576;RO=0;SAF=18;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000311468;OID=.;OPOS=125412470;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:70:70:0:0:70:70:52:18:0:0:52:18:0:0 chr12 125424502 . A G 141.21 PASS AO=42;DP=106;FAO=42;FDP=106;FR=.;FRO=64;FSAF=27;FSAR=15;FSRF=41;FSRR=23;FWDB=-0.0077977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.742;QD=5.3285;RBI=0.0510217;REFB=-0.00285737;REVB=-0.0504223;RO=64;SAF=27;SAR=15;SRF=41;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00258563;STB=0.501466;TYPE=snp;VARB=0.00333621;OID=.;OPOS=125424502;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:64:64:42:42:15:27:41:23:15:27:41:23 chr12 125424510 . T A 169.39 PASS AO=33;DP=106;FAO=41;FDP=105;FR=.,HEALED;FRO=54;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=41;FSRR=13;FWDB=-0.00630689;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.983;QD=6.45291;RBI=0.00638667;REFB=-0.0324016;REVB=-0.00100627;RO=38;SAF=22;SAR=11;SRF=35;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.311019;STB=0.579883;TYPE=snp;VARB=0.00698522;OID=.;OPOS=125424510;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:105:38:54:33:41:11:22:35:3:15:26:41:13 chr12 125434580 . C T 78.32 PASS AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.0005726;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.521;QD=7.28598;RBI=0.0200694;REFB=-0.0239473;REVB=0.0200613;RO=23;SAF=13;SAR=6;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0349629;STB=0.511224;TYPE=snp;VARB=0.0226898;OID=.;OPOS=125434580;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:43:43:23:24:19:19:6:13:15:8:6:13:16:8 chr12 125434716 . G A 101.73 PASS AO=24;DP=52;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=-0.00602262;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=235.438;QD=7.8252;RBI=0.0207305;REFB=-0.0190622;REVB=-0.0198363;RO=28;SAF=14;SAR=10;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147263;STB=0.583264;TYPE=snp;VARB=0.0191789;OID=.;OPOS=125434716;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:28:28:24:24:10:14:12:16:10:14:12:16 chr12 125437019 . T C 71.66 PASS AO=13;DP=26;FAO=14;FDP=26;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.0376261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.4543;QD=11.0246;RBI=0.0480372;REFB=-0.00861306;REVB=-0.0298639;RO=12;SAF=9;SAR=4;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101817;STB=0.569516;TYPE=snp;VARB=0.00409176;OID=.;OPOS=125437019;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:26:26:12:12:13:14:4:9:7:5:4:10:7:5 chr12 125438516 . T C 88.13 PASS AO=20;DP=48;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=7;FWDB=-0.0301911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.076;QD=6.9124;RBI=0.0434779;REFB=-0.0269255;REVB=0.0312862;RO=28;SAF=10;SAR=10;SRF=22;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.29437;STB=0.668849;TYPE=snp;VARB=0.0533357;OID=.;OPOS=125438516;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:48:51:28:29:20:22:10:10:22:6:12:10:22:7 chr12 125438523 . C T 83.75 PASS AO=19;DP=48;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=7;FWDB=0.0254434;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.5575;QD=6.83688;RBI=0.0804039;REFB=-0.0392396;REVB=0.076272;RO=27;SAF=8;SAR=11;SRF=20;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.318298;STB=0.67781;TYPE=snp;VARB=0.0558481;OID=.;OPOS=125438523;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:48:49:27:28:19:21:11:8:20:7:12:9:21:7 chr12 125448960 . C T 604.48 PASS AO=62;DP=62;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0245471;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.566;QD=37.7802;RBI=0.0425611;REFB=0;REVB=0.0347691;RO=0;SAF=37;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000104397;OID=.;OPOS=125448960;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:62:64:0:0:62:64:25:37:0:0:27:37:0:0 chr12 125449470 . G A 166.88 PASS AO=32;DP=55;FAO=32;FDP=55;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=23;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.088131;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.1;QD=12.1366;RBI=0.0958594;REFB=0.000106216;REVB=0.0377089;RO=23;SAF=9;SAR=23;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.060455;STB=0.533403;TYPE=snp;VARB=0.00125492;OID=.;OPOS=125449470;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:55:55:23:23:32:32:23:9:8:15:23:9:8:15 chr12 125561151 . A G 311.92 PASS AO=82;DP=182;FAO=82;FDP=182;FR=.;FRO=100;FSAF=20;FSAR=62;FSRF=29;FSRR=71;FWDB=0.00106331;FXX=0.00546418;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.932;QD=6.85545;RBI=0.00248534;REFB=-0.0119672;REVB=-0.00224639;RO=99;SAF=20;SAR=62;SRF=28;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0503659;STB=0.533161;TYPE=snp;VARB=0.0159679;OID=.;OPOS=125561151;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:182:99:100:82:82:62:20:28:71:62:20:29:71 chr12 125562784 . C T 329.15 PASS AO=71;DP=133;FAO=71;FDP=133;FR=.;FRO=62;FSAF=63;FSAR=8;FSRF=43;FSRR=19;FWDB=-0.0170582;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.796;QD=9.89938;RBI=0.0326628;REFB=-0.00671905;REVB=0.0278545;RO=62;SAF=63;SAR=8;SRF=43;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.299901;STB=0.667264;TYPE=snp;VARB=0.0140553;OID=.;OPOS=125562784;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:62:62:71:71:8:63:43:19:8:63:43:19 chr12 125562809 . G A 928.96 PASS AO=83;DP=123;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108518;FXX=0.155725;HRUN=4;LEN=1;MLLD=121.509;QD=36.0762;RBI=0.0388164;REFB=0;REVB=0.0372686;RO=0;SAF=81;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00569693;OID=.;OPOS=125562809;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:94:103:0:0:83:103:2:81:0:0:18:85:0:0 chr12 125562892 . C T 468 PASS AO=80;DP=122;FAO=80;FDP=121;FR=.;FRO=41;FSAF=54;FSAR=26;FSRF=27;FSRR=14;FWDB=0.000879394;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.869;QD=15.471;RBI=0.0392679;REFB=-0.0302508;REVB=-0.039258;RO=40;SAF=54;SAR=26;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0174889;STB=0.506328;TYPE=snp;VARB=0.0167333;OID=.;OPOS=125562892;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:121:40:41:80:80:26:54:26:14:26:54:27:14 chr12 125834395 . T C 136.5 PASS AO=32;DP=67;FAO=32;FDP=67;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=0.00602048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.5556;QD=8.14895;RBI=0.0112585;REFB=-0.0150392;REVB=-0.0095136;RO=35;SAF=12;SAR=20;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133155;STB=0.574665;TYPE=snp;VARB=0.0156833;OID=.;OPOS=125834395;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:35:35:32:32:20:12:18:17:20:12:18:17 chr12 126068417 . T C 2499.86 PASS AO=258;DP=260;FAO=260;FDP=260;FR=.;FRO=0;FSAF=190;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0339609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.028;QD=38.4594;RBI=0.0450738;REFB=0;REVB=0.0296362;RO=1;SAF=188;SAR=70;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0025292;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.42238e-06;OID=.;OPOS=126068417;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:260:260:1:0:258:260:70:188:1:0:70:190:0:0 chr12 126141880 . CCCG C,CCTG 741.49 PASS AO=14,49;DP=86;FAO=20,62;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=0,61;FSAR=20,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0763424,-0.0952419;FXX=0.0574647;HRUN=3,3;LEN=3,1;MLLD=38.131,40.5254;QD=36.1702;RBI=0.0792839,0.097343;REFB=0,0;REVB=-0.0213957,-0.0201159;RO=0;SAF=0,49;SAR=14,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0.560811,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.010682,-0.000460071;OID=.,.;OPOS=126141881,126141882;OREF=CCG,C;OALT=-,T;OMAPALT=C,CCTG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:14,49:73:20,62:82:0:0,61:20,1:0:0:32:0:0,49:14,0:0:0 chr12 127067995 . GA G,GC 35.7 PASS AO=4,2;DP=15;FAO=6,0;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=1,0;FSAR=5,0;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.0951296,0.0444941;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=25.7101,23.901;QD=12.9827;RBI=0.132276,0.103465;REFB=-0.0270943,-0.0376161;REVB=0.0919089,0.0934094;RO=5;SAF=1,0;SAR=3,2;SRF=1;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0609289,-0.544828;STB=0.526224,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0228227,0;OID=.,.;OPOS=127067996,127067996;OREF=A,A;OALT=-,C;OMAPALT=G,GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:4,2:11:6,0:11:5:1,0:5,0:1:4:26:5:1,0:3,2:1:4 chr12 127068865 . A G 444.78 PASS AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00379501;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.9816;QD=37.8538;RBI=0.0459829;REFB=0;REVB=0.0458261;RO=0;SAF=17;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000354757;OID=.;OPOS=127068865;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:48:47:0:0:47:47:30:17:0:0:30:17:0:0 chr12 127068892 . C T 120.5 PASS AO=40;DP=111;FAO=40;FDP=111;FR=.;FRO=71;FSAF=9;FSAR=31;FSRF=12;FSRR=59;FWDB=-0.0109929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.5788;QD=4.34241;RBI=0.0381481;REFB=-0.00242547;REVB=-0.0365299;RO=71;SAF=9;SAR=31;SRF=12;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0957538;STB=0.554389;TYPE=snp;VARB=0.00326317;OID=.;OPOS=127068892;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:71:71:40:40:31:9:12:59:31:9:12:59 chr12 127650467 . G C 1632.78 PASS AO=190;DP=203;FAO=190;FDP=203;FR=.;FRO=13;FSAF=93;FSAR=97;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.00159654;FXX=0.00490172;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.493;QD=32.1729;RBI=0.0101967;REFB=-0.00821077;REVB=-0.010071;RO=13;SAF=93;SAR=97;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00596104;STB=0.503138;TYPE=snp;VARB=0.000322956;OID=.;OPOS=127650467;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:203:203:13:13:190:190:97:93:7:6:97:93:7:6 chr12 127650472 . T G 1815.31 PASS AO=205;DP=215;FAO=205;FDP=215;FR=.;FRO=10;FSAF=108;FSAR=97;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.00132953;FXX=0.00462942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.028;QD=33.7733;RBI=0.0210582;REFB=-0.00902134;REVB=-0.0210162;RO=10;SAF=108;SAR=97;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0112434;STB=0.505912;TYPE=snp;VARB=0.000121068;OID=.;OPOS=127650472;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:215:215:10:10:205:205:97:108:4:6:97:108:4:6 chr12 127650538 . A G 2804.23 PASS AO=319;DP=332;FAO=317;FDP=332;FR=.;FRO=15;FSAF=122;FSAR=195;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.00762779;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.5766;QD=33.7859;RBI=0.0698562;REFB=0.0532054;REVB=-0.0694385;RO=13;SAF=122;SAR=197;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00623495;STB=0.500722;TYPE=snp;VARB=-0.00556493;OID=.;OPOS=127650538;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:332:332:13:15:319:317:197:122:6:7:195:122:6:9 chr12 127650583 . T G 2257.74 PASS AO=250;DP=260;FAO=253;FDP=263;FR=.;FRO=10;FSAF=84;FSAR=169;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.0332625;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2036;QD=34.3382;RBI=0.0332999;REFB=0.0299103;REVB=-0.00157616;RO=10;SAF=84;SAR=166;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0052412;STB=0.502908;TYPE=snp;VARB=-0.00265993;OID=.;OPOS=127650583;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:260:263:10:10:250:253:166:84:4:6:169:84:4:6 chr12 127650599 . A G 1600.36 PASS AO=167;DP=172;FAO=175;FDP=180;FR=.;FRO=5;FSAF=30;FSAR=145;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0171644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.195;QD=35.5635;RBI=0.0199997;REFB=-0.0235833;REVB=0.0102651;RO=4;SAF=27;SAR=140;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0272035;STB=0.520389;TYPE=snp;VARB=0.00043425;OID=.;OPOS=127650599;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:172:180:4:5:167:175:140:27:2:2:145:30:3:2 chr12 127650616 . G A 49.82 PASS AO=37;DP=167;FAO=37;FDP=168;FR=.;FRO=131;FSAF=9;FSAR=28;FSRF=7;FSRR=124;FWDB=-0.046224;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.0515;QD=1.1862;RBI=0.050579;REFB=0.00145742;REVB=0.0205323;RO=130;SAF=9;SAR=28;SRF=7;SRR=123;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.444327;STB=0.753223;TYPE=snp;VARB=-0.0103138;OID=.;OPOS=127650616;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:167:168:130:131:37:37:28:9:7:123:28:9:7:124 chr12 127650639 . A G 1042.36 PASS AO=115;DP=119;FAO=117;FDP=122;FR=.;FRO=5;FSAF=9;FSAR=108;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.066719;FXX=0.039367;HRUN=3;LEN=1;MLLD=162.399;QD=34.1758;RBI=0.0676011;REFB=-0.0618577;REVB=-0.0108855;RO=4;SAF=9;SAR=106;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0857552;STB=0.543202;TYPE=snp;VARB=0.00111725;OID=.;OPOS=127650639;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:119:122:4:5:115:117:106:9:2:2:108:9:2:3 chr12 127650662 . T C 285.71 PASS AO=28;DP=34;FAO=33;FDP=35;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=31;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0497656;FXX=0.0540395;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.396;QD=32.6529;RBI=0.0503597;REFB=-0.0696757;REVB=0.00771255;RO=2;SAF=1;SAR=27;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.45161;STB=0.666539;TYPE=snp;VARB=0.00287233;OID=.;OPOS=127650662;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:34:35:2:2:28:33:27:1:2:0:31:2:2:0 chr12 127650863 . C T 62.47 PASS AO=10;DP=16;FAO=10;FDP=15;FR=.;FRO=5;FSAF=10;FSAR=0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0133983;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.067;QD=16.659;RBI=0.0133983;REFB=-0.0495401;REVB=0;RO=5;SAF=10;SAR=0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0232867;OID=.;OPOS=127650863;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:16:15:5:5:10:10:0:10:5:0:0:10:5:0 chr12 127650865 . A T 116.96 PASS AO=18;DP=20;FAO=13;FDP=14;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0326472;FXX=0.263019;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.076;QD=33.4166;RBI=0.0326472;REFB=-0.0606013;REVB=0;RO=0;SAF=18;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0101264;OID=.;OPOS=127650865;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:20:14:0:1:18:13:0:18:0:0:0:13:1:0 chr12 127650883 . G T 353.97 PASS AO=38;DP=39;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017197;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.53;QD=38.2673;RBI=0.0184548;REFB=0;REVB=-0.00669639;RO=0;SAF=37;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.26946e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.67558e-05;OID=.;OPOS=127650883;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:39:37:0:0:38:37:1:37:0:0:1:36:0:0 chr12 127650890 . G C 396.14 PASS AO=47;DP=52;FAO=46;FDP=50;FR=.;FRO=4;FSAF=45;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0109831;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=202.09;QD=31.6911;RBI=0.0180775;REFB=-0.00197159;REVB=0.0143585;RO=5;SAF=46;SAR=1;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0484479;STB=0.521268;TYPE=snp;VARB=0.000186191;OID=.;OPOS=127650890;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:52:50:5:4:47:46:1:46:5:0:1:45:4:0 chr12 127805964 . A G 833.33 PASS AO=169;DP=304;FAO=174;FDP=312;FR=.;FRO=138;FSAF=104;FSAR=70;FSRF=72;FSRR=66;FWDB=-0.00543143;FXX=0.00319479;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.788;QD=10.6837;RBI=0.00559491;REFB=-0.00658588;REVB=0.00134261;RO=132;SAF=104;SAR=65;SRF=70;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0712261;STB=0.534458;TYPE=snp;VARB=0.00452783;OID=.;OPOS=127805964;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:304:312:132:138:169:174:65:104:70:62:70:104:72:66 chr12 128899673 . A G 291.51 PASS AO=63;DP=122;FAO=64;FDP=123;FR=.;FRO=59;FSAF=21;FSAR=43;FSRF=22;FSRR=37;FWDB=0.0195924;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.6323;QD=9.48002;RBI=0.0250203;REFB=-0.0220235;REVB=-0.0155613;RO=59;SAF=21;SAR=42;SRF=22;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0384901;STB=0.523937;TYPE=snp;VARB=0.0214255;OID=.;OPOS=128899673;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:123:59:59:63:64:42:21:22:37:43:21:22:37 chr12 128900005 . G A 45.86 PASS AO=14;DP=41;FAO=14;FDP=41;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=20;FWDB=0.0233364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.608;QD=4.47392;RBI=0.025103;REFB=-0.0141343;REVB=-0.00925066;RO=27;SAF=9;SAR=5;SRF=7;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.406384;STB=0.737401;TYPE=snp;VARB=0.0329618;OID=.;OPOS=128900005;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:41:41:27:27:14:14:5:9:7:20:5:9:7:20 chr12 129181810 . A G 2625.3 PASS AO=274;DP=274;FAO=274;FDP=274;FR=.;FRO=0;FSAF=145;FSAR=129;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.003367;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.755;QD=38.3256;RBI=0.0336671;REFB=0;REVB=-0.0334983;RO=0;SAF=145;SAR=129;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.53969e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.99428e-05;OID=.;OPOS=129181810;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:274:274:0:0:274:274:129:145:0:0:129:145:0:0 chr12 129181834 . A G 2609 PASS AO=273;DP=274;FAO=274;FDP=274;FR=.;FRO=0;FSAF=131;FSAR=143;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0375531;FXX=0.0108299;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.8096;QD=38.0876;RBI=0.0518193;REFB=-0.0556819;REVB=0.0357071;RO=1;SAF=130;SAR=143;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00332287;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000107417;OID=.;OPOS=129181834;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:274:274:1:0:273:274:143:130:0:1:143:131:0:0 chr12 129189941 . G A 67.56 PASS AO=7;DP=19;FAO=14;FDP=19;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0291206;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=109.052;QD=14.2224;RBI=0.042793;REFB=-0.0239022;REVB=0.0313565;RO=4;SAF=5;SAR=2;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.298189;STB=0.546155;TYPE=snp;VARB=0.0497081;OID=.;OPOS=129189941;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:11:19:4:5:7:14:2:5:1:3:9:5:1:4 chr12 129190021 . A G 201.68 PASS AO=25;DP=26;FAO=24;FDP=26;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.027992;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.499;QD=31.0271;RBI=0.0280309;REFB=-0.0143789;REVB=-0.0014757;RO=1;SAF=21;SAR=4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102546;STB=0.54344;TYPE=snp;VARB=0.00654828;OID=.;OPOS=129190021;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:26:26:1:2:25:24:4:21:0:1:4:20:1:1 chr12 129190474 . G A 227.53 PASS AO=57;DP=125;FAO=57;FDP=123;FR=.;FRO=66;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=35;FSRR=31;FWDB=0.0237234;FXX=0.0159987;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.247;QD=7.39928;RBI=0.0270222;REFB=-0.00801774;REVB=-0.0129382;RO=65;SAF=29;SAR=28;SRF=35;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0284899;STB=0.511557;TYPE=snp;VARB=0.00926193;OID=.;OPOS=129190474;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:123:65:66:57:57:28:29:35:30:28:29:35:31 chr12 129278864 . A G 66.73 PASS AO=14;DP=31;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.00765831;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=40.6903;QD=7.85006;RBI=0.0614382;REFB=-0.0113333;REVB=-0.060959;RO=17;SAF=1;SAR=13;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.568954;STB=0.674283;TYPE=snp;VARB=-0.00428103;OID=.;OPOS=129278864;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:31:34:17:18:14:16:13:1:8:9:13:3:8:10 chr12 129293346 . C T 201.33 PASS AO=41;DP=74;FAO=41;FDP=74;FR=.;FRO=33;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=0.02305;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.211;QD=10.8827;RBI=0.0322191;REFB=-0.00688473;REVB=0.0225115;RO=33;SAF=20;SAR=21;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0956202;STB=0.552606;TYPE=snp;VARB=0.00597946;OID=.;OPOS=129293346;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:33:33:41:41:21:20:20:13:21:20:20:13 chr12 129298735 . C G 225.03 PASS AO=98;DP=314;FAO=100;FDP=319;FR=.;FRO=219;FSAF=75;FSAR=25;FSRF=157;FSRR=62;FWDB=0.0656517;FXX=0.0031249;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6567;QD=2.82162;RBI=0.0664401;REFB=-0.0524867;REVB=-0.0102054;RO=215;SAF=74;SAR=24;SRF=156;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.046082;STB=0.529406;TYPE=snp;VARB=0.110222;OID=.;OPOS=129298735;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:314:319:215:219:98:100:24:74:156:59:25:75:157:62 chr12 129298777 . G A 41.82 PASS AO=44;DP=222;FAO=43;FDP=222;FR=.;FRO=179;FSAF=13;FSAR=30;FSRF=67;FSRR=112;FWDB=-0.00773601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.3773;QD=0.753465;RBI=0.0122018;REFB=-0.0309305;REVB=0.00943601;RO=174;SAF=14;SAR=30;SRF=64;SRR=110;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0706998;STB=0.565206;TYPE=snp;VARB=0.114261;OID=.;OPOS=129298777;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:222:222:174:179:44:43:30:14:64:110:30:13:67:112 chr12 129328752 . C A 207.49 PASS AO=42;DP=126;FAO=54;FDP=119;FR=.,HEALED;FRO=65;FSAF=11;FSAR=43;FSRF=33;FSRR=32;FWDB=0.00451395;FXX=0.0325177;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.2308;QD=6.97442;RBI=0.0199551;REFB=-0.0402594;REVB=0.0194379;RO=39;SAF=3;SAR=39;SRF=9;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.340376;STB=0.696276;TYPE=snp;VARB=0.0516279;OID=.;OPOS=129328752;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:119:39:65:42:54:39:3:9:30:43:11:33:32 chr12 129329045 . A G 15.88 PASS AO=12;DP=47;FAO=11;FDP=49;FR=.;FRO=38;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=-0.028384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.6032;QD=1.29629;RBI=0.0455245;REFB=-0.0309791;REVB=-0.0355925;RO=29;SAF=10;SAR=2;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.420159;STB=0.739776;TYPE=snp;VARB=0.156174;OID=.;OPOS=129329045;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:47:49:29:38:12:11:2:10:15:14:2:9:21:17 chr12 129329082 . T C 62.69 PASS AO=13;DP=26;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=-0.0628143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6578;QD=9.64461;RBI=0.073425;REFB=-0.0819716;REVB=-0.038021;RO=13;SAF=2;SAR=11;SRF=2;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0649806;OID=.;OPOS=129329082;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:26:26:13:13:13:13:11:2:2:11:11:2:2:11 chr12 129559557 . C T 339.61 PASS AO=83;DP=174;FAO=83;FDP=173;FR=.;FRO=90;FSAF=36;FSAR=47;FSRF=51;FSRR=39;FWDB=0.00917568;FXX=0.0057468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.008;QD=7.85218;RBI=0.00946738;REFB=0.00460217;REVB=0.00233197;RO=90;SAF=36;SAR=47;SRF=51;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125127;STB=0.569086;TYPE=snp;VARB=-0.00793759;OID=.;OPOS=129559557;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:173:90:90:83:83:47:36:51:39:47:36:51:39 chr12 130649543 . C G 387.33 PASS AO=88;DP=173;FAO=88;FDP=172;FR=.;FRO=84;FSAF=28;FSAR=60;FSRF=35;FSRR=49;FWDB=-0.017314;FXX=0.00578001;HRUN=3;LEN=1;MLLD=133.444;QD=9.00765;RBI=0.0215911;REFB=0.00288847;REVB=-0.0128996;RO=83;SAF=28;SAR=60;SRF=35;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100967;STB=0.553266;TYPE=snp;VARB=-0.00312467;OID=.;OPOS=130649543;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:172:83:84:88:88:60:28:35:48:60:28:35:49 chr12 130649770 . C T 152.1 PASS AO=39;DP=88;FAO=39;FDP=88;FR=.;FRO=49;FSAF=10;FSAR=29;FSRF=19;FSRR=30;FWDB=0.0097046;FXX=0.0112347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.92;QD=6.91383;RBI=0.0121702;REFB=0.00143193;REVB=0.007344;RO=48;SAF=10;SAR=29;SRF=19;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162595;STB=0.587653;TYPE=snp;VARB=-0.00325191;OID=.;OPOS=130649770;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:48:49:39:39:29:10:19:29:29:10:19:30 chr12 130649962 . C T 178.29 PASS AO=57;DP=144;FAO=57;FDP=145;FR=.;FRO=88;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=26;FSRR=62;FWDB=-0.0057364;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.3914;QD=4.91824;RBI=0.00649249;REFB=-0.00314355;REVB=0.00304075;RO=84;SAF=28;SAR=29;SRF=25;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206967;STB=0.619309;TYPE=snp;VARB=0.00506892;OID=.;OPOS=130649962;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:145:84:88:57:57:29:28:25:59:29:28:26:62 chr12 130650016 . G C 201.09 PASS AO=58;DP=150;FAO=61;FDP=153;FR=.;FRO=92;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=33;FSRR=59;FWDB=0.0373175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.969;QD=5.25728;RBI=0.037343;REFB=-0.0216901;REVB=0.00137936;RO=87;SAF=29;SAR=29;SRF=32;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141059;STB=0.589627;TYPE=snp;VARB=0.0394288;OID=.;OPOS=130650016;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:153:87:92:58:61:29:29:32:55:30:31:33:59 chr12 130847389 . A G 1803.63 PASS AO=184;DP=187;FAO=190;FDP=190;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0271727;FXX=0.0686241;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.636;QD=37.9711;RBI=0.0272953;REFB=0;REVB=0.00258406;RO=0;SAF=82;SAR=102;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00377769;OID=.;OPOS=130847389;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:187:190:0:0:184:190:102:82:0:0:104:86:0:0 chr12 130884347 . A G 1027.47 PASS AO=83;DP=111;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0128836;FXX=0.0357111;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.912;QD=38.0544;RBI=0.0131619;REFB=0;REVB=-0.00269231;RO=0;SAF=33;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.15707e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.9268e-05;OID=.;OPOS=130884347;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:83:108:0:0:83:108:50:33:0:0:54:54:0:0 chr12 130897150 . G T 296.29 PASS AO=80;DP=182;FAO=80;FDP=182;FR=.;FRO=102;FSAF=16;FSAR=64;FSRF=28;FSRR=74;FWDB=0.00368832;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=244.982;QD=6.51183;RBI=0.0180618;REFB=-0.0149947;REVB=-0.0176812;RO=102;SAF=16;SAR=64;SRF=28;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107981;STB=0.560493;TYPE=snp;VARB=0.0191281;OID=.;OPOS=130897150;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:182:102:102:80:80:64:16:28:74:64:16:28:74 chr12 131275484 . G A 528.82 PASS AO=112;DP=207;FAO=113;FDP=209;FR=.;FRO=96;FSAF=53;FSAR=60;FSRF=47;FSRR=49;FWDB=-0.0113455;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.681;QD=10.1209;RBI=0.0190351;REFB=-0.00140298;REVB=0.0152845;RO=93;SAF=52;SAR=60;SRF=45;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0163566;STB=0.509466;TYPE=snp;VARB=0.00121122;OID=.;OPOS=131275484;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:209:93:96:112:113:60:52:45:48:60:53:47:49 chr12 131276448 . G T 1807.54 PASS AO=188;DP=190;FAO=194;FDP=194;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0290595;FXX=0.0102036;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.657;QD=37.2689;RBI=0.0959018;REFB=0.0219692;REVB=0.0913931;RO=2;SAF=103;SAR=85;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00915538;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000105663;OID=.;OPOS=131276448;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:190:194:2:0:188:194:85:103:2:0:90:104:0:0 chr12 131299974 . A G 1289.41 PASS AO=135;DP=135;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00275414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.848;QD=38.2047;RBI=0.00446803;REFB=0;REVB=-0.00351823;RO=0;SAF=56;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.46027e-05;OID=.;OPOS=131299974;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:135:135:0:0:135:135:79:56:0:0:79:56:0:0 chr12 131306314 . C G 420.52 PASS AO=95;DP=190;FAO=97;FDP=192;FR=.;FRO=95;FSAF=39;FSAR=58;FSRF=40;FSRR=55;FWDB=4.70875e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.2783;QD=8.76086;RBI=0.0194186;REFB=-0.0298682;REVB=0.0194186;RO=95;SAF=39;SAR=56;SRF=40;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00986938;STB=0.509732;TYPE=snp;VARB=0.0314079;OID=.;OPOS=131306314;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:192:95:95:95:97:56:39:40:55:58:39:40:55 chr12 131360405 . G A 299.04 PASS AO=86;DP=212;FAO=87;FDP=208;FR=.;FRO=121;FSAF=22;FSAR=65;FSRF=32;FSRR=89;FWDB=0.00394324;FXX=0.0755522;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.73;QD=5.75081;RBI=0.00886678;REFB=0.00292367;REVB=0.0079417;RO=86;SAF=22;SAR=64;SRF=27;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0666954;STB=0.508841;TYPE=snp;VARB=-0.0062054;OID=.;OPOS=131360405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:208:86:121:86:87:64:22:27:59:65:22:32:89 chr12 131466562 . T C 1120.87 PASS AO=121;DP=124;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00903342;FXX=0.0241916;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.258;QD=37.0534;RBI=0.0159446;REFB=-0.0742678;REVB=0.0131388;RO=2;SAF=65;SAR=56;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.016661;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000223271;OID=.;OPOS=131466562;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:124:121:2:0:121:121:56:65:0:2:56:65:0:0 chr12 131590404 . G A 146.42 PASS AO=34;DP=70;FAO=34;FDP=71;FR=.;FRO=37;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=-0.0114298;FXX=0.0273935;HRUN=3;LEN=1;MLLD=155.73;QD=8.24925;RBI=0.012149;REFB=-0.0266274;REVB=-0.00411811;RO=33;SAF=16;SAR=18;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.012651;STB=0.536402;TYPE=snp;VARB=0.0229868;OID=.;OPOS=131590404;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:71:33:37:34:34:18:16:16:17:18:16:20:17 chr12 131620588 . A G 388.66 PASS AO=42;DP=43;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0607533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.7014;QD=35.3328;RBI=0.0708863;REFB=-0.108403;REVB=0.0365226;RO=0;SAF=19;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510199;TYPE=snp;VARB=0.00375283;OID=.;OPOS=131620588;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:43:44:0:1:42:43:23:19:0:0:24:19:0:1 chr12 131622735 . T C 40.99 PASS AO=9;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.030889;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.652;QD=6.5576;RBI=0.0325651;REFB=-0.0189;REVB=0.0103129;RO=14;SAF=3;SAR=6;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.310035;STB=0.580483;TYPE=snp;VARB=0.029811;OID=.;OPOS=131622735;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:25:25:14:15:9:10:6:3:9:5:6:4:8:7 chr12 132237848 . T C 316.53 PASS AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0198772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.727;QD=37.2385;RBI=0.0207721;REFB=0;REVB=-0.00603133;RO=0;SAF=4;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.64158e-05;OID=.;OPOS=132237848;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:34:0:0:34:34:30:4:0:0:30:4:0:0 chr12 132241116 . AG A,GA 93.88 PASS AO=3,7;DP=19;FAO=11,0;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=11,0;FSAR=0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.257174,-0.0829934;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=21.2721,13.7256;QD=34.1365;RBI=0.257174,0.0829934;REFB=0,0;REVB=0,0;RO=1;SAF=3,7;SAR=0,0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,mnp;VARB=0.0367571,0;OID=.,.;OPOS=132241117,132241116;OREF=G,AG;OALT=-,GA;OMAPALT=A,GA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:11:11:1:0:3,7:11,0:0,0:3,7:1:0:0,0:11,0:0:0 chr12 132271113 . T C 435.34 PASS AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.131;QD=37.8553;RBI=0.025141;REFB=0;REVB=0.021556;RO=0;SAF=19;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000239963;OID=.;OPOS=132271113;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:46:46:0:0:46:46:27:19:0:0:27:19:0:0 chr12 132285934 . G A 447.25 PASS AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0570899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.4551;QD=38.0639;RBI=0.0623551;REFB=0;REVB=-0.0250781;RO=0;SAF=28;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000417926;OID=.;OPOS=132285934;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:47:47:0:0:47:47:19:28:0:0:19:28:0:0 chr12 132325239 . G A 171.61 PASS AO=42;DP=93;FAO=43;FDP=93;FR=.;FRO=50;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=-0.0210627;FXX=0.0210504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.832;QD=7.38116;RBI=0.043554;REFB=-0.00285658;REVB=0.0381223;RO=48;SAF=19;SAR=23;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0655135;STB=0.542149;TYPE=snp;VARB=0.00493853;OID=.;OPOS=132325239;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:48:50:42:43:23:19:25:23:24:19:26:24 chr12 132335592 . G A 100.86 PASS AO=21;DP=41;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=20;FWDB=-0.0302261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.229;QD=9.1691;RBI=0.0353908;REFB=-0.027798;REVB=0.018409;RO=19;SAF=8;SAR=13;SRF=2;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.268862;STB=0.660074;TYPE=snp;VARB=0.029515;OID=.;OPOS=132335592;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:41:44:19:22:21:22:13:8:2:17:14:8:2:20 chr12 132396603 . C T 1432.22 PASS AO=148;DP=150;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0699498;FXX=0.0248432;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.4223;QD=36.4897;RBI=0.0827577;REFB=-0.0746456;REVB=0.0442251;RO=0;SAF=55;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00217657;OID=.;OPOS=132396603;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:150:157:0:0:148:157:93:55:0:0:94:63:0:0 chr12 132401566 . C T 39.25 PASS AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.00950303;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=227.445;QD=6.03787;RBI=0.0143057;REFB=-0.00889165;REVB=0.0106932;RO=15;SAF=6;SAR=4;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0714454;STB=0.516097;TYPE=snp;VARB=0.0139418;OID=.;OPOS=132401566;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:26:26:15:16:10:10:4:6:10:5:4:6:10:6 chr12 132402020 . T C 120.89 PASS AO=26;DP=55;FAO=28;FDP=56;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=5;FSRR=23;FWDB=0.03691;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.0656;QD=8.63527;RBI=0.0373111;REFB=0.00342311;REVB=0.00545638;RO=28;SAF=12;SAR=14;SRF=5;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.271836;STB=0.646503;TYPE=snp;VARB=-0.00334546;OID=.;OPOS=132402020;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:56:28:28:26:28:14:12:5:23:15:13:5:23 chr12 132403161 . A G 254.96 PASS AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00949164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.899;QD=37.7721;RBI=0.0132686;REFB=0;REVB=-0.00927174;RO=0;SAF=10;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.71087e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.24105e-07;OID=.;OPOS=132403161;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:26:27:0:0:26:27:16:10:0:0:17:10:0:0 chr12 132562126 . G A 223.31 PASS AO=50;DP=101;FAO=50;FDP=99;FR=.;FRO=49;FSAF=15;FSAR=35;FSRF=9;FSRR=40;FWDB=-0.0261446;FXX=0.0198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.4613;QD=9.02273;RBI=0.0749224;REFB=-0.0302722;REVB=0.0702127;RO=47;SAF=15;SAR=35;SRF=8;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145363;STB=0.572492;TYPE=snp;VARB=0.0459877;OID=.;OPOS=132562126;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:99:47:49:50:50:35:15:8:39:35:15:9:40 chr12 132626668 . T C 201.65 PASS AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0197107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.405;QD=36.6634;RBI=0.0241528;REFB=0;REVB=0.0139587;RO=0;SAF=11;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000180939;OID=.;OPOS=132626668;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:22:22:0:0:22:22:11:11:0:0:11:11:0:0 chr12 132628263 . A AG 11.6 PASS AO=3;DP=15;FAO=4;FDP=15;FR=.;FRO=11;FSAF=0;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=11;FWDB=0;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=96.0379;QD=3.0937;RBI=0.0131788;REFB=-0.0035231;REVB=-0.0131788;RO=10;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.111603;OID=.;OPOS=132628264;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:3:15:4:15:11:0:4:0:11:11:10:0:3:0:10 chr12 132628320 . C G 23.19 PASS AO=4;DP=7;FAO=4;FDP=8;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=35.0693;QD=11.5952;RBI=0.102418;REFB=-0.0544581;REVB=0.102418;RO=3;SAF=0;SAR=4;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0205062;OID=.;OPOS=132628320;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:7:8:3:4:4:4:4:0:0:3:4:0:0:4 chr12 132628321 . A C 22.75 PASS AO=4;DP=7;FAO=4;FDP=8;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.638;QD=11.3734;RBI=0.0386846;REFB=0.0104675;REVB=-0.0386846;RO=3;SAF=0;SAR=4;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0636322;OID=.;OPOS=132628321;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:7:8:3:4:4:4:4:0:0:3:4:0:0:4 chr12 132630822 . C T 1874.29 PASS AO=166;DP=190;FAO=196;FDP=198;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=102;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0181057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.63;QD=37.8644;RBI=0.0600989;REFB=0;REVB=0.0573067;RO=0;SAF=98;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.1686e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00185206;OID=.;OPOS=132630822;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:197:198:0:0:166:196:68:98:0:0:94:102:0:0 chr12 132635521 . T C 73.84 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0349214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.417;QD=36.9199;RBI=0.0824306;REFB=0;REVB=0.074668;RO=0;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.78849e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00159638;OID=.;OPOS=132635521;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:7:1:0:0:7:1:0:0 chr12 132682481 . T G 770.23 PASS AO=72;DP=73;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0197791;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.424;QD=38.5113;RBI=0.0394644;REFB=0;REVB=0.03415;RO=0;SAF=23;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000860579;OID=.;OPOS=132682481;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:73:80:0:0:72:80:49:23:0:0:55:25:0:0 chr12 132682484 . A G 769.64 PASS AO=79;DP=79;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00602095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.037;QD=38.4822;RBI=0.00602485;REFB=0;REVB=0.000216792;RO=0;SAF=24;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.57191e-05;OID=.;OPOS=132682484;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:79:80:0:0:79:80:55:24:0:0:55:25:0:0 chr12 132688137 . A G 89.03 PASS AO=19;DP=38;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0102184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.953;QD=9.37164;RBI=0.0259089;REFB=-0.0295558;REVB=-0.0238088;RO=19;SAF=6;SAR=13;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102566;STB=0.558219;TYPE=snp;VARB=0.0378504;OID=.;OPOS=132688137;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:38:38:19:19:19:19:13:6:8:11:13:6:8:11 chr12 132824450 . G T 93 PASS AO=17;DP=30;FAO=17;FDP=30;FR=.;FRO=13;FSAF=0;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=13;FWDB=0;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=222.818;QD=12.3998;RBI=0.0218872;REFB=-0.0361453;REVB=-0.0218872;RO=12;SAF=0;SAR=17;SRF=0;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0317977;OID=.;OPOS=132824450;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:30:30:12:13:17:17:17:0:0:12:17:0:0:13 chr12 132862868 . G A 69.95 PASS AO=12;DP=22;FAO=13;FDP=23;FR=.;FRO=10;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.0280271;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.962;QD=12.1647;RBI=0.0379955;REFB=-0.0534064;REVB=0.0256543;RO=10;SAF=9;SAR=3;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144193;STB=0.593066;TYPE=snp;VARB=0.0240393;OID=.;OPOS=132862868;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:22:23:10:10:12:13:3:9:6:4:3:10:6:4 chr12 133124609 . G A 49.44 PASS AO=14;DP=38;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.0231738;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.568;QD=5.20435;RBI=0.0250549;REFB=-0.0228791;REVB=0.00952477;RO=24;SAF=8;SAR=6;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0130458;STB=0.507681;TYPE=snp;VARB=0.0348248;OID=.;OPOS=133124609;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:38:38:24:24:14:14:6:8:14:10:6:8:14:10 chr12 133128014 . C T 67.73 PASS AO=4;DP=16;FAO=11;FDP=17;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.0263778;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=222.036;QD=15.9365;RBI=0.026923;REFB=-0.0450476;REVB=0.00539071;RO=5;SAF=1;SAR=3;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0609289;STB=0.681408;TYPE=snp;VARB=0.0224405;OID=.;OPOS=133128014;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:9:17:5:6:4:11:3:1:1:4:10:1:2:4 chr12 133181399 . T C 61.19 PASS AO=12;DP=23;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.00331086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.854;QD=10.6415;RBI=0.0167402;REFB=0.0152722;REVB=-0.0164095;RO=11;SAF=2;SAR=10;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23622;STB=0.638036;TYPE=snp;VARB=-0.0107385;OID=.;OPOS=133181399;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:23:23:11:11:12:12:10:2:4:7:10:2:4:7 chr12 133182818 . G A 13.59 PASS AO=5;DP=23;FAO=5;FDP=23;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.00788854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.8543;QD=2.3628;RBI=0.011383;REFB=-0.010878;REVB=-0.00820632;RO=18;SAF=3;SAR=2;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.239063;STB=0.660401;TYPE=snp;VARB=0.0497542;OID=.;OPOS=133182818;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:23:23:18:18:5:5:2:3:7:11:2:3:7:11 chr12 133201947 . T C 52.27 PASS AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.0261549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7036;QD=6.53361;RBI=0.0417383;REFB=0.00728678;REVB=-0.032527;RO=16;SAF=6;SAR=7;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0957353;STB=0.59985;TYPE=snp;VARB=-0.0109148;OID=.;OPOS=133201947;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:32:32:16:19:13:13:7:6:9:7:7:6:12:7 chr12 133202004 . C T 39.24 PASS AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0225466;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.4011;QD=6.03692;RBI=0.0681247;REFB=-0.0409413;REVB=0.0642855;RO=16;SAF=4;SAR=6;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167304;STB=0.5998;TYPE=snp;VARB=0.0757994;OID=.;OPOS=133202004;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:26:26:16:16:10:10:6:4:9:7:6:4:9:7 chr12 133208979 . T C 355.61 PASS AO=93;DP=223;FAO=98;FDP=225;FR=.;FRO=127;FSAF=39;FSAR=59;FSRF=55;FSRR=72;FWDB=-0.0534062;FXX=0.00442458;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.095;QD=6.32196;RBI=0.0538623;REFB=-0.015788;REVB=-0.00699476;RO=117;SAF=34;SAR=59;SRF=50;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0653393;STB=0.520503;TYPE=snp;VARB=0.0179075;OID=.;OPOS=133208979;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:225:117:127:93:98:59:34:50:67:59:39:55:72 chr12 133219831 . T C 224.53 PASS AO=56;DP=121;FAO=56;FDP=121;FR=.;FRO=65;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=40;FSRR=25;FWDB=-0.0156691;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.352;QD=7.42246;RBI=0.0159509;REFB=-0.0028183;REVB=-0.00298495;RO=64;SAF=32;SAR=24;SRF=39;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0374091;STB=0.524263;TYPE=snp;VARB=0.00209227;OID=.;OPOS=133219831;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:64:65:56:56:24:32:39:25:24:32:40:25 chr12 133236000 . C T 263.22 PASS AO=58;DP=114;FAO=59;FDP=115;FR=.;FRO=56;FSAF=16;FSAR=43;FSRF=28;FSRR=28;FWDB=0.00303493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.958;QD=9.15539;RBI=0.0101619;REFB=-0.0269913;REVB=-0.00969814;RO=56;SAF=16;SAR=42;SRF=28;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.221145;STB=0.62479;TYPE=snp;VARB=0.023591;OID=.;OPOS=133236000;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:115:56:56:58:59:42:16:28:28:43:16:28:28 chr12 133306589 . C T 159.89 PASS AO=9;DP=83;FAO=34;FDP=64;FR=.,HEALED;FRO=30;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=8;FWDB=0.0120172;FXX=0.0302984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.843;QD=9.99317;RBI=0.014948;REFB=-0.0319636;REVB=-0.00888982;RO=10;SAF=1;SAR=8;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166059;STB=0.558967;TYPE=snp;VARB=0.0164822;OID=.;OPOS=133306589;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:43:64:10:30:9:34:8:1:2:8:13:21:22:8 chr12 133306590 . G T 20.73 PASS AO=14;DP=69;FAO=14;FDP=70;FR=.;FRO=56;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=34;FSRR=22;FWDB=-0.00552624;FXX=0.0140825;HRUN=6;LEN=1;MLLD=148.955;QD=1.1846;RBI=0.0187434;REFB=-0.00370507;REVB=0.0179102;RO=54;SAF=11;SAR=3;SRF=33;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.255319;STB=0.670464;TYPE=snp;VARB=0.0101867;OID=.;OPOS=133306590;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:69:70:54:56:14:14:3:11:33:21:3:11:34:22 chr12 133331537 . G A 462.96 PASS AO=114;DP=207;FAO=114;FDP=237;FR=.;FRO=123;FSAF=48;FSAR=66;FSRF=53;FSRR=70;FWDB=0.0083237;FXX=0.0286874;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.13;QD=7.81359;RBI=0.0449311;REFB=-0.0260798;REVB=-0.0441534;RO=91;SAF=48;SAR=66;SRF=52;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123043;STB=0.505229;TYPE=snp;VARB=0.031007;OID=.;OPOS=133331537;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:237:91:123:114:114:66:48:52:39:66:48:53:70 chr12 133357412 . T C 228.87 PASS AO=43;DP=74;FAO=44;FDP=75;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=32;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=-0.0356416;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.8736;QD=12.2063;RBI=0.0549187;REFB=-0.00643819;REVB=-0.041782;RO=31;SAF=11;SAR=32;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122445;STB=0.556495;TYPE=snp;VARB=0.00362599;OID=.;OPOS=133357412;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:75:31:31:43:44:32:11:12:19:32:12:12:19 chr12 133363006 . G A 45.36 PASS AO=13;DP=36;FAO=13;FDP=36;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.0128364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.458;QD=5.03944;RBI=0.0377865;REFB=-0.0254616;REVB=0.0355394;RO=23;SAF=11;SAR=2;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.423117;STB=0.756163;TYPE=snp;VARB=0.0313287;OID=.;OPOS=133363006;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:36:36:23:23:13:13:2:11:12:11:2:11:12:11 chr12 133363376 . G T 72.68 PASS AO=23;DP=60;FAO=23;FDP=62;FR=.;FRO=39;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=29;FSRR=10;FWDB=0.00567234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.671;QD=4.6889;RBI=0.0103418;REFB=-0.0203819;REVB=-0.00864738;RO=37;SAF=9;SAR=14;SRF=27;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.350515;STB=0.711064;TYPE=snp;VARB=0.0274995;OID=.;OPOS=133363376;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:60:62:37:39:23:23:14:9:27:10:14:9:29:10 chr12 133378440 . C T 208.93 PASS AO=47;DP=96;FAO=48;FDP=97;FR=.;FRO=49;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=15;FSRR=34;FWDB=0.0540516;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.014;QD=8.61548;RBI=0.0541161;REFB=-0.00672233;REVB=0.00264118;RO=49;SAF=19;SAR=28;SRF=15;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0958741;STB=0.558535;TYPE=snp;VARB=0.00590539;OID=.;OPOS=133378440;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:97:49:49:47:48:28:19:15:34:28:20:15:34 chr12 133411987 . G C 2038.55 PASS AO=223;DP=229;FAO=223;FDP=223;FR=.;FRO=0;FSAF=111;FSAR=112;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0290533;FXX=0.0261997;HRUN=3;LEN=1;MLLD=230.085;QD=36.5659;RBI=0.0339146;REFB=0.0435155;REVB=-0.0174959;RO=5;SAF=111;SAR=112;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0207919;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.00499e-05;OID=.;OPOS=133411987;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:229:223:5:0:223:223:112:111:0:5:112:111:0:0 chr12 133417982 . T TAA 47.24 PASS AO=14;DP=38;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0459222;FXX=0.0256345;HRUN=3;LEN=2;MLLD=34.3114;QD=4.97276;RBI=0.0625648;REFB=0.0268578;REVB=0.0424913;RO=20;SAF=7;SAR=7;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0504553;STB=0.536235;TYPE=ins;VARB=-0.0324913;OID=.;OPOS=133417983;OREF=-;OALT=AA;OMAPALT=TAA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:14:38:17:38:21:10:7:11:10:47:20:7:7:11:9 chr12 133423662 . C T 75.29 PASS AO=24;DP=67;FAO=24;FDP=67;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=0.0155616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.841;QD=4.49467;RBI=0.0211158;REFB=-0.0102544;REVB=-0.0142728;RO=43;SAF=10;SAR=14;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105749;STB=0.561352;TYPE=snp;VARB=0.0239757;OID=.;OPOS=133423662;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:67:67:43:43:24:24:14:10:22:21:14:10:22:21 chr12 133428242 . G A 79.82 PASS AO=14;DP=23;FAO=14;FDP=23;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.016256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3538;QD=13.8821;RBI=0.0697127;REFB=-0.010995;REVB=0.0677909;RO=9;SAF=7;SAR=7;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193534;STB=0.608548;TYPE=snp;VARB=0.00730775;OID=.;OPOS=133428242;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:23:23:9:9:14:14:7:7:7:2:7:7:7:2 chr12 133433173 . T C 700.1 PASS AO=78;DP=79;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.102264;FXX=0.0379699;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.7256;QD=36.8472;RBI=0.128026;REFB=-0.0240252;REVB=-0.0770235;RO=0;SAF=47;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505616;TYPE=snp;VARB=-0.00107168;OID=.;OPOS=133433173;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:79:76:0:1:78:75:31:47:0:0:31:44:1:0 chr12 133433237 . C T 65.45 PASS AO=19;DP=51;FAO=19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.0136142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7219;QD=5.13306;RBI=0.0759515;REFB=-0.0243528;REVB=-0.0747213;RO=32;SAF=13;SAR=6;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208191;STB=0.621607;TYPE=snp;VARB=0.0346137;OID=.;OPOS=133433237;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:51:51:32:32:19:19:6:13:16:16:6:13:16:16 chr12 133587980 . C T 1361.05 PASS AO=144;DP=146;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135075;FXX=0.0136977;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.277;QD=37.8069;RBI=0.0149476;REFB=0.0446087;REVB=-0.00640145;RO=1;SAF=70;SAR=74;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00638312;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.58324e-05;OID=.;OPOS=133587980;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:146:144:1:0:144:144:74:70:0:1:74:70:0:0 chr12 133634450 . A C 411.08 PASS AO=40;DP=42;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.785;QD=37.3706;RBI=0.0174833;REFB=0;REVB=0.00969656;RO=0;SAF=22;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19993e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.93197e-05;OID=.;OPOS=133634450;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:42:44:0:0:40:44:18:22:0:0:20:24:0:0 chr12 133660718 . A G 289.3 PASS AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0392185;FXX=0.0605877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.913;QD=37.3285;RBI=0.0392775;REFB=0;REVB=-0.00215234;RO=0;SAF=9;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.15349e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000220345;OID=.;OPOS=133660718;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:32:31:0:0:31:31:22:9:0:0:22:9:0:0 chr12 133682655 . A G 165.49 PASS AO=42;DP=93;FAO=42;FDP=93;FR=.;FRO=51;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=29;FSRR=22;FWDB=-0.0189566;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=273.594;QD=7.11798;RBI=0.0211557;REFB=-0.0133964;REVB=-0.00939199;RO=51;SAF=20;SAR=22;SRF=29;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0903456;STB=0.550538;TYPE=snp;VARB=0.0180817;OID=.;OPOS=133682655;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:51:51:42:42:22:20:29:22:22:20:29:22 chr12 133683261 . T C 215.76 PASS AO=47;DP=91;FAO=47;FDP=91;FR=.;FRO=44;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=-0.0289894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.507;QD=9.4841;RBI=0.0438533;REFB=-0.0148019;REVB=0.0329048;RO=44;SAF=20;SAR=27;SRF=18;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0147508;STB=0.508146;TYPE=snp;VARB=0.0062416;OID=.;OPOS=133683261;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:44:44:47:47:27:20:18:26:27:20:18:26 chr12 133683280 . A T 187.12 PASS AO=42;DP=96;FAO=48;FDP=102;FR=.;FRO=54;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=24;FSRR=30;FWDB=0.000535348;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=32.2483;QD=7.33816;RBI=0.00626283;REFB=-0.0464456;REVB=-0.0062399;RO=54;SAF=21;SAR=21;SRF=24;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.055668;STB=0.5294;TYPE=snp;VARB=0.0116845;OID=.;OPOS=133683280;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:102:54:54:42:48:21:21:24:30:24:24:24:30 chr12 133683595 . GC G 489.66 PASS AO=75;DP=105;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.176312;FXX=0.00961446;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.6588;QD=19.0159;RBI=0.18566;REFB=-0.0350598;REVB=-0.0581722;RO=18;SAF=35;SAR=40;SRF=10;SRR=8;SSEN=0.58;SSEP=0;SSSB=-0.03231;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0131631;OID=.;OPOS=133683596;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:75:104:103:103:0:46:57:0:0:32:18:35:40:10:8 chr12 133683628 . A T 130.62 PASS AO=42;DP=113;FAO=42;FDP=113;FR=.;FRO=71;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=38;FSRR=33;FWDB=0.00436573;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=131.037;QD=4.62381;RBI=0.0276726;REFB=-0.0111716;REVB=-0.027326;RO=71;SAF=16;SAR=26;SRF=38;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171418;STB=0.597909;TYPE=snp;VARB=0.0235676;OID=.;OPOS=133683628;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:71:71:42:42:26:16:38:33:26:16:38:33 chr12 133683750 . C A 167.85 PASS AO=42;DP=104;FAO=45;FDP=104;FR=.;FRO=59;FSAF=15;FSAR=30;FSRF=32;FSRR=27;FWDB=0.00610683;FXX=0.0280348;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.098;QD=6.45578;RBI=0.0247549;REFB=-0.00700404;REVB=0.0239898;RO=62;SAF=14;SAR=28;SRF=35;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247829;STB=0.622461;TYPE=snp;VARB=0.0131957;OID=.;OPOS=133683750;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:62:59:42:45:28:14:35:27:30:15:32:27 chr12 133697130 . C G 409.12 PASS AO=113;DP=259;FAO=113;FDP=259;FR=.;FRO=146;FSAF=53;FSAR=60;FSRF=78;FSRR=68;FWDB=-0.0109098;FXX=0.00384601;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.798;QD=6.31838;RBI=0.0120362;REFB=-0.0117091;REVB=0.00508387;RO=144;SAF=53;SAR=60;SRF=78;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0732162;STB=0.536732;TYPE=snp;VARB=0.00367799;OID=.;OPOS=133697130;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:259:259:144:146:113:113:60:53:78:66:60:53:78:68 chr12 133697131 . A G 387.36 PASS AO=111;DP=264;FAO=111;FDP=262;FR=.;FRO=151;FSAF=53;FSAR=58;FSRF=78;FSRR=73;FWDB=-0.00784501;FXX=0.00757547;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.85;QD=5.91386;RBI=0.0224625;REFB=-0.00492772;REVB=-0.021048;RO=149;SAF=53;SAR=58;SRF=77;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0404404;STB=0.522518;TYPE=snp;VARB=0.00674617;OID=.;OPOS=133697131;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:264:262:149:151:111:111:58:53:77:72:58:53:78:73 chr12 133698537 . G C 37.82 PASS AO=10;DP=27;FAO=10;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=16;FWDB=0.119793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.51;QD=5.60366;RBI=0.122209;REFB=-0.0125148;REVB=-0.0241832;RO=17;SAF=4;SAR=6;SRF=1;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.431837;STB=0.745422;TYPE=snp;VARB=0.0250482;OID=.;OPOS=133698537;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:27:27:17:17:10:10:6:4:1:16:6:4:1:16 chr12 133768553 . A T 253.15 PASS AO=72;DP=184;FAO=75;FDP=184;FR=.;FRO=109;FSAF=40;FSAR=35;FSRF=55;FSRR=54;FWDB=0.012517;FXX=0.0160419;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.955;QD=5.50321;RBI=0.0275431;REFB=-0.0075076;REVB=0.0245346;RO=111;SAF=38;SAR=34;SRF=57;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0153872;STB=0.517062;TYPE=snp;VARB=0.0103419;OID=.;OPOS=133768553;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:184:111:109:72:75:34:38:57:54:35:40:55:54 chr12 133770096 . G A 228.34 PASS AO=63;DP=148;FAO=63;FDP=147;FR=.;FRO=84;FSAF=43;FSAR=20;FSRF=45;FSRR=39;FWDB=-0.0343955;FXX=0.0067563;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.352;QD=6.21324;RBI=0.034569;REFB=-0.0304707;REVB=-0.00345901;RO=82;SAF=43;SAR=20;SRF=44;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158752;STB=0.590382;TYPE=snp;VARB=0.0365204;OID=.;OPOS=133770096;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:147:82:84:63:63:20:43:44:38:20:43:45:39 chr12 133780851 . G C 132.04 PASS AO=25;DP=43;FAO=25;FDP=43;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=0.00321779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.2951;QD=12.2824;RBI=0.0143351;REFB=0.00323983;REVB=0.0139693;RO=18;SAF=11;SAR=14;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126691;STB=0.570004;TYPE=snp;VARB=-0.00115532;OID=.;OPOS=133780851;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:43:43:18:18:25:25:14:11:5:13:14:11:5:13 chr12 133781231 . GA G 1086.62 PASS AO=138;DP=148;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.040633;FXX=0.0342442;HRUN=3;LEN=1;MLLD=24.7604;QD=30.8262;RBI=0.102647;REFB=0;REVB=0.0942617;RO=1;SAF=86;SAR=52;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00905462;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00187641;OID=.;OPOS=133781232;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:138:145:141:141:0:88:53:0:0:95:1:86:52:0:1 chr12 133781428 . A C 2063.39 PASS AO=226;DP=233;FAO=226;FDP=226;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=133;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00824658;FXX=0.0300416;HRUN=4;LEN=1;MLLD=179.962;QD=36.5201;RBI=0.0103878;REFB=-0.0619532;REVB=-0.00631664;RO=3;SAF=93;SAR=133;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00201511;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.75318e-05;OID=.;OPOS=133781428;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:233:226:3:0:226:226:133:93:1:2:133:93:0:0 chr12 133781605 . A G 1038.33 PASS AO=114;DP=120;FAO=114;FDP=118;FR=.;FRO=4;FSAF=55;FSAR=59;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0367596;FXX=0.0166653;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.25;QD=35.1976;RBI=0.0370574;REFB=-0.0749716;REVB=-0.00468862;RO=4;SAF=55;SAR=59;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.014977;STB=0.507893;TYPE=snp;VARB=0.00341941;OID=.;OPOS=133781605;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:120:118:4:4:114:114:59:55:1:3:59:55:1:3 chr12 133795885 . G A 293 PASS AO=71;DP=148;FAO=71;FDP=148;FR=.;FRO=77;FSAF=15;FSAR=56;FSRF=18;FSRR=59;FWDB=0.01911;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=147.643;QD=7.91886;RBI=0.0191709;REFB=-0.011943;REVB=0.00152656;RO=75;SAF=15;SAR=56;SRF=17;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0211644;STB=0.517208;TYPE=snp;VARB=0.017215;OID=.;OPOS=133795885;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:75:77:71:71:56:15:17:58:56:15:18:59 chr12 133795960 . A G 360.23 PASS AO=72;DP=124;FAO=72;FDP=124;FR=.;FRO=52;FSAF=13;FSAR=59;FSRF=8;FSRR=44;FWDB=0.000988729;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=186.307;QD=11.6203;RBI=0.0184477;REFB=-0.0122749;REVB=-0.0184211;RO=52;SAF=13;SAR=59;SRF=8;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0356754;STB=0.51939;TYPE=snp;VARB=0.00866816;OID=.;OPOS=133795960;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:52:52:72:72:59:13:8:44:59:13:8:44 chr12 133803551 . G C 65.5 PASS AO=16;DP=37;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=19;FSRR=2;FWDB=-0.0553816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.0486;QD=7.0812;RBI=0.055727;REFB=0.0024824;REVB=0.00619529;RO=21;SAF=12;SAR=4;SRF=19;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235475;STB=0.632517;TYPE=snp;VARB=-0.00156758;OID=.;OPOS=133803551;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:37:37:21:21:16:16:4:12:19:2:4:12:19:2 chr12 133808129 . C T 42.4 PASS AO=16;DP=56;FAO=16;FDP=54;FR=.;FRO=38;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=-0.00422037;FXX=0.0357079;HRUN=2;LEN=1;MLLD=221.079;QD=3.14056;RBI=0.00463989;REFB=-0.00729611;REVB=-0.00192798;RO=35;SAF=7;SAR=9;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0557634;STB=0.525669;TYPE=snp;VARB=0.0223116;OID=.;OPOS=133808129;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:56:54:35:38:16:16:9:7:17:18:9:7:18:20 chr12 133810703 . G C 110.2 PASS AO=25;DP=52;FAO=25;FDP=52;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.0224971;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.9667;QD=8.47723;RBI=0.0555678;REFB=0.0326427;REVB=-0.05081;RO=27;SAF=11;SAR=14;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00415439;STB=0.502338;TYPE=snp;VARB=-0.0743815;OID=.;OPOS=133810703;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:27:27:25:25:14:11:12:15:14:11:12:15 chr13 19600126 . G A 345.74 PASS AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109903;FXX=0.0526177;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.955;QD=38.416;RBI=0.0110397;REFB=0;REVB=0.00104244;RO=0;SAF=21;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000328091;OID=.;OPOS=19600126;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:37:36:0:0:36:36:15:21:0:0:15:21:0:0 chr13 19600200 . C T 438.03 PASS AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0483333;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.087;QD=38.0891;RBI=0.0668942;REFB=0;REVB=-0.0462465;RO=0;SAF=27;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.32958e-06;OID=.;OPOS=19600200;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:47:46:0:0:46:46:19:27:0:0:19:27:0:0 chr13 19600475 . C A 1842.61 PASS AO=193;DP=195;FAO=194;FDP=194;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=112;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156836;FXX=0.0102036;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5004;QD=37.992;RBI=0.0157389;REFB=-0.058886;REVB=0.00131874;RO=1;SAF=82;SAR=111;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00577216;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000270126;OID=.;OPOS=19600475;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:195:194:1:0:193:194:111:82:1:0:112:82:0:0 chr13 19748038 . C T 203.56 PASS AO=22;DP=71;FAO=41;FDP=71;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=31;FSRF=5;FSRR=25;FWDB=0.0185403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.1188;QD=11.4683;RBI=0.0243456;REFB=-0.00430806;REVB=-0.0157787;RO=21;SAF=10;SAR=12;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194677;STB=0.54632;TYPE=snp;VARB=0.00349318;OID=.;OPOS=19748038;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:71:21:30:22:41:12:10:5:16:31:10:5:25 chr13 19751229 . T C 229.4 PASS AO=60;DP=130;FAO=58;FDP=128;FR=.;FRO=70;FSAF=37;FSAR=21;FSRF=44;FSRR=26;FWDB=-0.00232638;FXX=0.0153834;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.54;QD=7.16875;RBI=0.0322846;REFB=-0.0208564;REVB=0.0322006;RO=69;SAF=38;SAR=22;SRF=44;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00451234;STB=0.505521;TYPE=snp;VARB=0.0236746;OID=.;OPOS=19751229;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:128:69:70:60:58:22:38:44:25:21:37:44:26 chr13 19751544 . C T 89.82 PASS AO=36;DP=109;FAO=35;FDP=110;FR=.;FRO=75;FSAF=26;FSAR=9;FSRF=42;FSRR=33;FWDB=-0.0359289;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.3148;QD=3.26625;RBI=0.0384276;REFB=-0.0088322;REVB=0.0136306;RO=72;SAF=27;SAR=9;SRF=40;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.251865;STB=0.640759;TYPE=snp;VARB=0.0155515;OID=.;OPOS=19751544;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:109:110:72:75:36:35:9:27:40:32:9:26:42:33 chr13 19751657 . G T 140.72 PASS AO=36;DP=85;FAO=37;FDP=85;FR=.;FRO=48;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=31;FWDB=0.0149816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.848;QD=6.62218;RBI=0.0196445;REFB=-0.0175983;REVB=0.0127067;RO=46;SAF=13;SAR=23;SRF=16;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0144164;STB=0.501741;TYPE=snp;VARB=0.0246169;OID=.;OPOS=19751657;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:46:48:36:37:23:13:16:30:24:13:17:31 chr13 19751694 . A G 38.26 PASS AO=15;DP=54;FAO=15;FDP=52;FR=.;FRO=37;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=-0.0213149;FXX=0.0714158;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.7024;QD=2.94276;RBI=0.0231813;REFB=-0.0144052;REVB=-0.00911299;RO=32;SAF=2;SAR=13;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.410801;STB=0.774406;TYPE=snp;VARB=0.0490645;OID=.;OPOS=19751694;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:54:52:32:37:15:15:13:2:13:19:13:2:16:21 chr13 19753554 . C T 295.77 PASS AO=78;DP=175;FAO=79;FDP=178;FR=.;FRO=99;FSAF=37;FSAR=42;FSRF=34;FSRR=65;FWDB=0.00210674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.695;QD=6.64655;RBI=0.0209132;REFB=0.00256059;REVB=0.0208068;RO=95;SAF=37;SAR=41;SRF=34;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116435;STB=0.570362;TYPE=snp;VARB=-0.00332567;OID=.;OPOS=19753554;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:178:95:99:78:79:41:37:34:61:42:37:34:65 chr13 19753575 . A G 388.65 PASS AO=94;DP=199;FAO=95;FDP=198;FR=.;FRO=103;FSAF=48;FSAR=47;FSRF=36;FSRR=67;FWDB=0.0211188;FXX=0.0149246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.063;QD=7.85149;RBI=0.0211242;REFB=-0.00434577;REVB=-0.000474766;RO=90;SAF=48;SAR=46;SRF=27;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18762;STB=0.580875;TYPE=snp;VARB=0.00649275;OID=.;OPOS=19753575;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:199:198:90:103:94:95:46:48:27:63:47:48:36:67 chr13 19761359 . T G 142.93 PASS AO=45;DP=120;FAO=45;FDP=119;FR=.;FRO=74;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=31;FSRR=43;FWDB=-0.0401305;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.083;QD=4.80427;RBI=0.0422422;REFB=-0.00557607;REVB=-0.0131887;RO=74;SAF=16;SAR=29;SRF=31;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0735465;STB=0.541929;TYPE=snp;VARB=0.00881745;OID=.;OPOS=19761359;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:119:74:74:45:45:29:16:31:43:29:16:31:43 chr13 19761398 . G A 150.43 PASS AO=44;DP=110;FAO=44;FDP=110;FR=.;FRO=66;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=26;FSRR=40;FWDB=0.0233047;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.735;QD=5.4702;RBI=0.0233709;REFB=-0.00294016;REVB=-0.00175794;RO=64;SAF=17;SAR=27;SRF=24;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012613;STB=0.50478;TYPE=snp;VARB=0.00550576;OID=.;OPOS=19761398;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:64:66:44:44:27:17:24:40:27:17:26:40 chr13 19761432 . T C 206.26 PASS AO=60;DP=149;FAO=60;FDP=147;FR=.;FRO=87;FSAF=12;FSAR=48;FSRF=25;FSRR=62;FWDB=-0.018029;FXX=0.0134219;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.644;QD=5.61249;RBI=0.0259616;REFB=-0.0239371;REVB=0.0186804;RO=87;SAF=12;SAR=48;SRF=25;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12987;STB=0.573617;TYPE=snp;VARB=0.0348356;OID=.;OPOS=19761432;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:147:87:87:60:60:48:12:25:62:48:12:25:62 chr13 19999130 . G A 11.34 PASS AO=17;DP=108;FAO=16;FDP=107;FR=.;FRO=91;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=25;FSRR=66;FWDB=-0.0770855;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9349;QD=0.423878;RBI=0.101443;REFB=0.00188416;REVB=0.0659436;RO=91;SAF=14;SAR=3;SRF=25;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.620551;STB=0.886865;TYPE=snp;VARB=-0.0131638;OID=.;OPOS=19999130;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:108:107:91:91:17:16:3:14:25:66:3:13:25:66 chr13 19999913 . G A 491.95 PASS AO=54;DP=54;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0321396;FXX=0.0370302;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.624;QD=37.8419;RBI=0.0337646;REFB=0;REVB=-0.0103485;RO=0;SAF=9;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17126e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000887498;OID=.;OPOS=19999913;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:54:52:0:0:54:52:45:9:0:0:43:9:0:0 chr13 19999927 . T G 119.19 PASS AO=26;DP=58;FAO=28;FDP=60;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=3;FSRR=29;FWDB=0.0207725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.594;QD=7.94602;RBI=0.0240219;REFB=-0.00849369;REVB=0.0120647;RO=32;SAF=7;SAR=19;SRF=3;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.250472;STB=0.64044;TYPE=snp;VARB=0.0103977;OID=.;OPOS=19999927;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:60:32:32:26:28:19:7:3:29:20:8:3:29 chr13 19999944 . C T 138.13 PASS AO=32;DP=66;FAO=32;FDP=66;FR=.;FRO=34;FSAF=2;FSAR=30;FSRF=11;FSRR=23;FWDB=-0.0128038;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.204;QD=8.37156;RBI=0.0131834;REFB=-0.00215044;REVB=-0.0031409;RO=32;SAF=2;SAR=30;SRF=9;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.44476;STB=0.786049;TYPE=snp;VARB=0.00162063;OID=.;OPOS=19999944;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:32:34:32:32:30:2:9:23:30:2:11:23 chr13 20000417 . C T 70.42 PASS AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.0121424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.613;QD=7.22284;RBI=0.0745551;REFB=0.0213356;REVB=-0.0735596;RO=22;SAF=10;SAR=7;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131602;STB=0.575668;TYPE=snp;VARB=-0.00600557;OID=.;OPOS=20000417;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:39:39:22:22:17:17:7:10:10:12:7:10:10:12 chr13 20000630 . T C 902.11 PASS AO=95;DP=97;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00609841;FXX=0.0204061;HRUN=4;LEN=1;MLLD=143.565;QD=37.588;RBI=0.0219274;REFB=-0.0718476;REVB=-0.0210623;RO=1;SAF=57;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00824724;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.24374e-06;OID=.;OPOS=20000630;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:97:96:1:0:95:96:38:57:1:0:39:57:0:0 chr13 20025375 . A G 178.42 PASS AO=58;DP=161;FAO=59;FDP=160;FR=.;FRO=101;FSAF=26;FSAR=33;FSRF=39;FSRR=62;FWDB=0.0137837;FXX=0.00621079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.759;QD=4.46058;RBI=0.0310612;REFB=0.0118494;REVB=0.0278353;RO=103;SAF=27;SAR=31;SRF=39;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.098958;STB=0.535199;TYPE=snp;VARB=-0.0286387;OID=.;OPOS=20025375;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:160:103:101:58:59:31:27:39:64:33:26:39:62 chr13 20038584 . A G 138.82 PASS AO=43;DP=115;FAO=44;FDP=116;FR=.;FRO=72;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=51;FSRR=21;FWDB=0.0131194;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=210.395;QD=4.78683;RBI=0.0162801;REFB=-0.00597794;REVB=-0.00963977;RO=72;SAF=23;SAR=20;SRF=51;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19586;STB=0.616617;TYPE=snp;VARB=0.0123563;OID=.;OPOS=20038584;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:116:72:72:43:44:20:23:51:21:21:23:51:21 chr13 20224202 . G T 167.69 PASS AO=37;DP=72;FAO=36;FDP=70;FR=.;FRO=34;FSAF=30;FSAR=6;FSRF=28;FSRR=6;FWDB=-0.0160584;FXX=0.0277739;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.739;QD=9.582;RBI=0.0679779;REFB=0.00737453;REVB=0.0660539;RO=33;SAF=31;SAR=6;SRF=27;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0300266;STB=0.50847;TYPE=snp;VARB=-0.00471178;OID=.;OPOS=20224202;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:70:33:34:37:36:6:31:27:6:6:30:28:6 chr13 20224387 . A G 264.54 PASS AO=70;DP=157;FAO=70;FDP=157;FR=.;FRO=87;FSAF=46;FSAR=24;FSRF=30;FSRR=57;FWDB=0.0140213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.911;QD=6.73979;RBI=0.0170031;REFB=-0.0233553;REVB=-0.00961818;RO=86;SAF=46;SAR=24;SRF=29;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.313584;STB=0.671303;TYPE=snp;VARB=0.0379955;OID=.;OPOS=20224387;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:157:86:87:70:70:24:46:29:57:24:46:30:57 chr13 20233816 . A T 202.23 PASS AO=10;DP=70;FAO=32;FDP=61;FR=.,HEALED;FRO=17;FSAF=23;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.00747905;FXX=0.061529;HRUN=14;LEN=1;MLLD=142.947;QD=13.2609;RBI=0.0192401;REFB=0.0361527;REVB=0.0177269;RO=11;SAF=7;SAR=3;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0654152;STB=0.597339;TYPE=snp;VARB=-0.0383613;OID=.;OPOS=20233816;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:54:61:11:17:10:32:3:7:7:4:9:23:8:9 chr13 20247226 . CGG CG,CGT 73.91 PASS AO=8,4;DP=22;FAO=14,0;FDP=23;FR=.;FRO=9;FSAF=11,0;FSAR=3,0;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.0262392,0.0908604;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=25.7233,25.4976;QD=12.8538;RBI=0.108853,0.0941143;REFB=0.000870999,-0.0395907;REVB=0.105644,-0.0245333;RO=7;SAF=5,4;SAR=3,0;SRF=5;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0775671,0.668993;STB=0.504581,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0160464,-0.0400452;OID=.,.;OPOS=20247227,20247228;OREF=G,G;OALT=-,T;OMAPALT=CG,CGT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:8,4:23:14,0:23:9:11,0:3,0:7:2:38:7:5,4:3,0:5:2 chr13 20247238 . GTT G,TTT 96.96 PASS AO=6,5;DP=24;FAO=14,6;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=10,4;FSAR=4,2;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0260844,0.0142201;FXX=0.159936;HRUN=12,1;LEN=2,1;MLLD=13.4648,165.801;QD=18.4677;RBI=0.181213,0.0553247;REFB=-0.106301,-0.024503;REVB=-0.179326,0.053466;RO=2;SAF=6,4;SAR=0,1;SRF=1;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.767694,0.190062;STB=0.523776,0.555378;TYPE=del,snp;VARB=0.0496815,0.0345151;OID=.,.;OPOS=20247239,20247238;OREF=TT,G;OALT=-,T;OMAPALT=G,TTT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:19:21:21:2:1:6,5:14,6:0,1:6,4:1:1:4,2:10,4:1:0 chr13 20398669 . T C 178.7 PASS AO=49;DP=114;FAO=49;FDP=114;FR=.;FRO=65;FSAF=16;FSAR=33;FSRF=37;FSRR=28;FWDB=0.0437242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.1857;QD=6.2702;RBI=0.0444899;REFB=-0.0312721;REVB=-0.00821886;RO=64;SAF=16;SAR=33;SRF=37;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.259209;STB=0.641776;TYPE=snp;VARB=0.0333938;OID=.;OPOS=20398669;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:64:65:49:49:33:16:37:27:33:16:37:28 chr13 20398742 . C T 258.23 PASS AO=61;DP=127;FAO=62;FDP=128;FR=.;FRO=66;FSAF=29;FSAR=33;FSRF=38;FSRR=28;FWDB=-0.00671673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.5139;QD=8.06968;RBI=0.00784708;REFB=-0.0236016;REVB=-0.00405736;RO=64;SAF=29;SAR=32;SRF=36;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0804662;STB=0.55551;TYPE=snp;VARB=0.0177164;OID=.;OPOS=20398742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:128:64:66:61:62:32:29:36:28:33:29:38:28 chr13 20579253 . G A 32.03 PASS AO=16;DP=64;FAO=16;FDP=64;FR=.;FRO=48;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=34;FWDB=-0.0346472;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.398;QD=2.00177;RBI=0.0347021;REFB=-0.00687892;REVB=0.00195192;RO=48;SAF=10;SAR=6;SRF=14;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.390612;STB=0.735035;TYPE=snp;VARB=0.0196952;OID=.;OPOS=20579253;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:64:64:48:48:16:16:6:10:14:34:6:10:14:34 chr13 20608465 . T C 1405.94 PASS AO=145;DP=146;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0261887;FXX=0.0132442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.4435;QD=37.7433;RBI=0.0439851;REFB=-0.0220787;REVB=0.035339;RO=1;SAF=73;SAR=72;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00655941;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000188408;OID=.;OPOS=20608465;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:146:149:1:0:145:149:72:73:0:1:74:75:0:0 chr13 20716411 . C T 10.3 PASS AO=2;DP=8;FAO=2;FDP=8;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.045374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.057;QD=5.14829;RBI=0.0462107;REFB=-0.00854;REVB=0.00875421;RO=6;SAF=1;SAR=1;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.359974;STB=0.748118;TYPE=snp;VARB=0.07828;OID=.;OPOS=20716411;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:8:6:6:2:2:1:1:5:1:1:1:5:1 chr13 20716533 . G T 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.179825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.4748;QD=35.0844;RBI=0.23766;REFB=0;REVB=0.155388;RO=0;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.27427e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0230684;OID=.;OPOS=20716533;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:5:2:0:0:5:2:0:0 chr13 21086599 . G A 904.53 PASS AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0392119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.467;QD=38.0857;RBI=0.040198;REFB=0;REVB=-0.00884895;RO=0;SAF=50;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.10537e-05;OID=.;OPOS=21086599;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:95:95:0:0:95:95:45:50:0:0:45:50:0:0 chr13 21205192 . G A 938.92 PASS AO=96;DP=97;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0421872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.2387;QD=38.3233;RBI=0.0543255;REFB=0;REVB=0.0342273;RO=0;SAF=40;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000403727;OID=.;OPOS=21205192;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:97:98:0:0:96:98:56:40:0:0:56:42:0:0 chr13 21358061 . A G 684.42 PASS AO=72;DP=73;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0237669;FXX=0.038956;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.7367;QD=36.9958;RBI=0.0368634;REFB=-0.0861446;REVB=0.0281789;RO=1;SAF=33;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0141159;STB=0.507461;TYPE=snp;VARB=0.00203304;OID=.;OPOS=21358061;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:73:74:1:1:72:73:39:33:1:0:40:33:1:0 chr13 21547317 . T C 155.82 PASS AO=49;DP=130;FAO=49;FDP=130;FR=.;FRO=81;FSAF=19;FSAR=30;FSRF=45;FSRR=36;FWDB=0.0234526;FXX=0.0151504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.648;QD=4.79445;RBI=0.0255763;REFB=-0.00295903;REVB=0.0102041;RO=73;SAF=19;SAR=30;SRF=39;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156745;STB=0.604872;TYPE=snp;VARB=0.00508218;OID=.;OPOS=21547317;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:73:81:49:49:30:19:39:34:30:19:45:36 chr13 21562832 . C T 107.04 PASS AO=13;DP=14;FAO=13;FDP=14;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0374352;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=133.15;QD=30.5838;RBI=0.0471508;REFB=-0.134948;REVB=0.0286672;RO=1;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0533084;STB=0.529367;TYPE=snp;VARB=0.00490308;OID=.;OPOS=21562832;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:14:14:1:1:13:13:8:5:0:1:8:5:0:1 chr13 21562948 . G A 107.81 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0163071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.946;QD=35.9381;RBI=0.0172365;REFB=0;REVB=-0.00558368;RO=0;SAF=2;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00109335;OID=.;OPOS=21562948;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:10:2:0:0:10:2:0:0 chr13 21612791 . G A 2008.4 PASS AO=172;DP=216;FAO=214;FDP=214;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=92;FSAR=122;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0841331;FXX=0.00465095;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.677;QD=37.5402;RBI=0.0886886;REFB=0;REVB=0.0280588;RO=0;SAF=52;SAR=120;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.38549e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00722055;OID=.;OPOS=21612791;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:96:215:214:0:0:172:214:120:52:0:0:122:92:0:0 chr13 21620085 . T C 1236.42 PASS AO=131;DP=134;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109024;FXX=0.029195;HRUN=4;LEN=1;MLLD=230.477;QD=37.1855;RBI=0.0296879;REFB=-0.0171138;REVB=0.0276136;RO=2;SAF=72;SAR=59;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00143191;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000136463;OID=.;OPOS=21620085;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:134:133:2:0:131:133:59:72:1:1:59:74:0:0 chr13 21729883 . C A 433.34 PASS AO=104;DP=217;FAO=104;FDP=212;FR=.;FRO=108;FSAF=64;FSAR=40;FSRF=59;FSRR=49;FWDB=0.0138647;FXX=0.0230404;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.7296;QD=8.1763;RBI=0.0154235;REFB=-0.0294906;REVB=0.00675684;RO=104;SAF=64;SAR=40;SRF=57;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0635923;STB=0.536542;TYPE=snp;VARB=0.0245351;OID=.;OPOS=21729883;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:217:212:104:108:104:104:40:64:57:47:40:64:59:49 chr13 21732094 . C T 1532.01 PASS AO=162;DP=165;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0245543;FXX=0.0181807;HRUN=2;LEN=1;MLLD=244.095;QD=37.8275;RBI=0.0252616;REFB=-0.0531856;REVB=-0.00593587;RO=0;SAF=74;SAR=88;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.92087e-06;OID=.;OPOS=21732094;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:165:162:0:0:162:162:88:74:0:0:88:74:0:0 chr13 21735998 . T C 341.54 PASS AO=87;DP=188;FAO=87;FDP=188;FR=.;FRO=101;FSAF=38;FSAR=49;FSRF=33;FSRR=68;FWDB=-0.0074646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.953;QD=7.26673;RBI=0.0274285;REFB=-0.000724071;REVB=0.0263932;RO=100;SAF=38;SAR=49;SRF=33;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106686;STB=0.560996;TYPE=snp;VARB=0.000599507;OID=.;OPOS=21735998;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:188:100:101:87:87:49:38:33:67:49:38:33:68 chr13 21751528 . A AC 758.96 PASS AO=112;DP=175;FAO=156;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0134809;FXX=0.0126574;HRUN=5;LEN=1;MLLD=9.61795;QD=19.4605;RBI=0.141508;REFB=0;REVB=0.140865;RO=48;SAF=45;SAR=67;SRF=20;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0086445;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.000122253;OID=.;OPOS=21751529;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:112:175:156:156:0:60:96:0:0:68:48:45:67:20:28 chr13 21752154 . G A 843.76 PASS AO=84;DP=84;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0116991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.365;QD=38.3526;RBI=0.0188366;REFB=0;REVB=0.0147631;RO=0;SAF=30;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.70206e-05;OID=.;OPOS=21752154;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:84:88:0:0:84:88:54:30:0:0:56:32:0:0 chr13 21752936 . T A 10.47 PASS AO=2;DP=6;FAO=2;FDP=6;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0079053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.856;QD=6.97936;RBI=0.0079053;REFB=0.0275685;REVB=0;RO=4;SAF=2;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00452821;OID=.;OPOS=21752936;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:4:4:2:2:0:2:4:0:0:2:4:0 chr13 21752938 . T A 10.47 PASS AO=2;DP=6;FAO=2;FDP=6;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.00708421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.453;QD=6.97934;RBI=0.00708421;REFB=0.0227622;REVB=0;RO=3;SAF=2;SAR=0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00708124;OID=.;OPOS=21752938;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:3:4:2:2:0:2:3:0:0:2:4:0 chr13 22275394 . A G 1854.74 PASS AO=194;DP=195;FAO=195;FDP=195;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=122;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00640476;FXX=0.0101518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.299;QD=38.046;RBI=0.0150774;REFB=-0.0270302;REVB=0.0136494;RO=1;SAF=73;SAR=121;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00647885;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.40633e-05;OID=.;OPOS=22275394;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:195:195:1:0:194:195:121:73:1:0:122:73:0:0 chr13 22275583 . G A 1694.21 PASS AO=171;DP=173;FAO=177;FDP=177;FR=.;FRO=0;FSAF=109;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0239732;FXX=0.0111726;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.238;QD=38.2873;RBI=0.0244707;REFB=0;REVB=-0.00490924;RO=0;SAF=105;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000338954;OID=.;OPOS=22275583;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:173:177:0:0:171:177:66:105:0:0:68:109:0:0 chr13 23238308 . C T 17.9 PASS AO=7;DP=26;FAO=7;FDP=27;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=-0.00350845;FXX=0.0689417;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.014;QD=2.65197;RBI=0.00354936;REFB=0.0035617;REVB=0.000537333;RO=15;SAF=4;SAR=3;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11411;STB=0.896228;TYPE=snp;VARB=-0.00522147;OID=.;OPOS=23238308;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:26:27:15:20:7:7:3:4:7:8:1:6:5:15 chr13 23251016 . CT C 30.93 PASS AO=10;DP=27;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.10327;FXX=0.11534;HRUN=4;LEN=1;MLLD=18.7054;QD=5.37976;RBI=0.112544;REFB=-0.0792512;REVB=-0.0447365;RO=11;SAF=4;SAR=6;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.286528;STB=0.660708;TYPE=del;VARB=0.0717456;OID=.;OPOS=23251017;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:10:23:10:23:13:4:6:9:4:30:11:4:6:8:3 chr13 23253313 . T C 966.92 PASS AO=94;DP=103;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000892661;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.792;QD=36.4875;RBI=0.128053;REFB=0;REVB=0.12805;RO=0;SAF=57;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.95516e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00307391;OID=.;OPOS=23253313;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:103:106:0:0:94:106:37:57:0:0:48:58:0:0 chr13 23253471 . G A 71.9 PASS AO=16;DP=37;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=0;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=21;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.953;QD=7.56875;RBI=0.0149317;REFB=-0.0111364;REVB=0.0149317;RO=21;SAF=0;SAR=16;SRF=0;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0339139;OID=.;OPOS=23253471;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:37:38:21:21:16:17:16:0:0:21:17:0:0:21 chr13 23824783 . T G 645.56 PASS AO=135;DP=244;FAO=135;FDP=243;FR=.;FRO=108;FSAF=53;FSAR=82;FSRF=45;FSRR=63;FWDB=-0.0357899;FXX=0.00409819;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.0626;QD=10.6265;RBI=0.0418224;REFB=-0.0319909;REVB=-0.0216377;RO=108;SAF=53;SAR=82;SRF=45;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0205158;STB=0.511162;TYPE=snp;VARB=0.0238864;OID=.;OPOS=23824783;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:243:108:108:135:135:82:53:45:63:82:53:45:63 chr13 23898509 . T C 164.71 PASS AO=51;DP=132;FAO=51;FDP=132;FR=.;FRO=81;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=38;FSRR=43;FWDB=-0.0445168;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.7337;QD=4.99108;RBI=0.0447328;REFB=-0.014733;REVB=-0.00439026;RO=81;SAF=28;SAR=23;SRF=38;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0864824;STB=0.549;TYPE=snp;VARB=0.0326399;OID=.;OPOS=23898509;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:81:81:51:51:23:28:38:43:23:28:38:43 chr13 23898664 . A G 399.6 PASS AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0471911;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.64;QD=35.5203;RBI=0.0522871;REFB=0.0291349;REVB=-0.0225154;RO=1;SAF=12;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0375364;STB=0.519991;TYPE=snp;VARB=-5.80484e-05;OID=.;OPOS=23898664;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:45:45:1:1:44:44:32:12:1:0:32:12:1:0 chr13 23907677 . C T 1355.4 PASS AO=143;DP=143;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0125171;FXX=0.00699252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.442;QD=38.1803;RBI=0.0136718;REFB=0;REVB=0.00549927;RO=0;SAF=90;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.41716e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.87802e-05;OID=.;OPOS=23907677;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:143:142:0:0:143:142:53:90:0:0:53:89:0:0 chr13 23908034 . A G 283.7 PASS AO=75;DP=168;FAO=75;FDP=168;FR=.;FRO=93;FSAF=42;FSAR=33;FSRF=32;FSRR=61;FWDB=-0.0138428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.218;QD=6.75474;RBI=0.014223;REFB=-0.00499313;REVB=-0.00326647;RO=93;SAF=42;SAR=33;SRF=32;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21241;STB=0.61781;TYPE=snp;VARB=0.00479843;OID=.;OPOS=23908034;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:93:93:75:75:33:42:32:61:33:42:32:61 chr13 23929095 . T C 172.34 PASS AO=34;DP=61;FAO=34;FDP=61;FR=.;FRO=27;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=19;FWDB=-0.0179823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.2298;QD=11.3012;RBI=0.0742935;REFB=-0.00725668;REVB=0.0720844;RO=26;SAF=19;SAR=15;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195281;STB=0.614587;TYPE=snp;VARB=0.0030332;OID=.;OPOS=23929095;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:26:27:34:34:15:19:8:18:15:19:8:19 chr13 23930055 . A T 373.19 PASS AO=105;DP=247;FAO=106;FDP=248;FR=.;FRO=142;FSAF=49;FSAR=57;FSRF=68;FSRR=74;FWDB=-0.00142844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.873;QD=6.01913;RBI=0.0142334;REFB=-0.0133393;REVB=0.0141616;RO=114;SAF=49;SAR=56;SRF=68;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122129;STB=0.509549;TYPE=snp;VARB=0.017551;OID=.;OPOS=23930055;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:247:248:114:142:105:106:56:49:68:46:57:49:68:74 chr13 24233219 . C T 194.52 PASS AO=46;DP=95;FAO=46;FDP=95;FR=.;FRO=49;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=21;FSRR=28;FWDB=0.0497046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.9594;QD=8.19009;RBI=0.0552876;REFB=-0.00801749;REVB=-0.0242109;RO=49;SAF=20;SAR=26;SRF=21;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00586984;STB=0.50326;TYPE=snp;VARB=0.0139066;OID=.;OPOS=24233219;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:49:49:46:46:26:20:21:28:26:20:21:28 chr13 24234517 . A G 1640.44 PASS AO=171;DP=174;FAO=173;FDP=173;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0871872;FXX=0.0057468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.789;QD=37.9292;RBI=0.0881795;REFB=0;REVB=0.0131911;RO=0;SAF=76;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000286175;OID=.;OPOS=24234517;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:174:173:0:0:171:173:95:76:0:0:95:78:0:0 chr13 24243200 . T C 822.55 PASS AO=90;DP=92;FAO=90;FDP=92;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.134403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.159;QD=35.7632;RBI=0.138805;REFB=-0.0873335;REVB=0.0346796;RO=1;SAF=27;SAR=63;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00746502;STB=0.507811;TYPE=snp;VARB=0.00026381;OID=.;OPOS=24243200;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:92:92:1:2:90:90:63:27:0:1:63:27:0:2 chr13 24411772 . T C 1606.96 PASS AO=160;DP=161;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000884882;FXX=0.011764;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.279;QD=38.2609;RBI=0.079728;REFB=-0.0208894;REVB=0.0797231;RO=1;SAF=71;SAR=89;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00665442;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.77148e-05;OID=.;OPOS=24411772;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:161:168:1:0:160:168:89:71:1:0:98:70:0:0 chr13 24436475 . C T 186.44 PASS AO=59;DP=141;FAO=55;FDP=137;FR=.;FRO=82;FSAF=22;FSAR=33;FSRF=43;FSRR=39;FWDB=-0.00193662;FXX=0.0352088;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.081;QD=5.44349;RBI=0.00295378;REFB=-0.0141613;REVB=0.00223032;RO=80;SAF=27;SAR=32;SRF=41;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0564445;STB=0.575194;TYPE=snp;VARB=0.01886;OID=.;OPOS=24436475;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:137:80:82:59:55:32:27:41:39:33:22:43:39 chr13 24465743 . A G 700.23 PASS AO=75;DP=84;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0114932;FXX=0.0238067;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.672;QD=34.1577;RBI=0.0303616;REFB=-0.123332;REVB=0.0281022;RO=0;SAF=19;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504064;TYPE=snp;VARB=0.000711157;OID=.;OPOS=24465743;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:84:82:0:1:75:81:56:19:0:0:61:20:0:1 chr13 24468704 . G A 288.42 PASS AO=120;DP=369;FAO=120;FDP=369;FR=.;FRO=249;FSAF=74;FSAR=46;FSRF=136;FSRR=113;FWDB=0.0140658;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.8408;QD=3.12649;RBI=0.0213776;REFB=0.0106935;REVB=0.0160983;RO=249;SAF=74;SAR=46;SRF=136;SRR=113;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.085574;STB=0.549138;TYPE=snp;VARB=-0.0217648;OID=.;OPOS=24468704;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:369:369:249:249:120:120:46:74:136:113:46:74:136:113 chr13 24468711 . G C 140.49 PASS AO=91;DP=363;FAO=91;FDP=364;FR=.;FRO=273;FSAF=54;FSAR=37;FSRF=150;FSRR=123;FWDB=-0.0187317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.31;QD=1.54385;RBI=0.0188317;REFB=-0.000819378;REVB=0.00193874;RO=272;SAF=54;SAR=37;SRF=149;SRR=123;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0586466;STB=0.533721;TYPE=snp;VARB=0.00296369;OID=.;OPOS=24468711;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:363:364:272:273:91:91:37:54:149:123:37:54:150:123 chr13 24468763 . T C 62.57 PASS AO=59;DP=287;FAO=59;FDP=287;FR=.;FRO=228;FSAF=33;FSAR=26;FSRF=94;FSRR=134;FWDB=0.00829277;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.745;QD=0.872045;RBI=0.00934518;REFB=0.00358512;REVB=-0.0043084;RO=225;SAF=33;SAR=26;SRF=93;SRR=132;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186079;STB=0.615203;TYPE=snp;VARB=-0.0130494;OID=.;OPOS=24468763;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:287:287:225:228:59:59:26:33:93:132:26:33:94:134 chr13 24471039 . T G 131.59 PASS AO=68;DP=244;FAO=68;FDP=244;FR=.;FRO=176;FSAF=46;FSAR=22;FSRF=68;FSRR=108;FWDB=-0.00352877;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.867;QD=2.15725;RBI=0.0352582;REFB=-0.00230482;REVB=-0.0350811;RO=176;SAF=46;SAR=22;SRF=68;SRR=108;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.349474;STB=0.704466;TYPE=snp;VARB=0.00563957;OID=.;OPOS=24471039;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:244:176:176:68:68:22:46:68:108:22:46:68:108 chr13 24876752 . T C 36.8 PASS AO=11;DP=33;FAO=11;FDP=33;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=18;FWDB=-0.0167042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.115;QD=4.46089;RBI=0.0167815;REFB=-0.0163392;REVB=-0.00160891;RO=22;SAF=4;SAR=7;SRF=4;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.239551;STB=0.640806;TYPE=snp;VARB=0.0182043;OID=.;OPOS=24876752;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:33:33:22:22:11:11:7:4:4:18:7:4:4:18 chr13 24890157 . C T 540.5 PASS AO=116;DP=224;FAO=120;FDP=229;FR=.;FRO=109;FSAF=65;FSAR=55;FSRF=60;FSRR=49;FWDB=0.030095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.299;QD=9.44104;RBI=0.0315342;REFB=-0.0155112;REVB=-0.00941796;RO=103;SAF=61;SAR=55;SRF=58;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0322093;STB=0.504216;TYPE=snp;VARB=0.0141713;OID=.;OPOS=24890157;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:224:229:103:109:116:120:55:61:58:45:55:65:60:49 chr13 24890228 . A C 432.31 PASS AO=91;DP=165;FAO=91;FDP=166;FR=.;FRO=75;FSAF=45;FSAR=46;FSRF=33;FSRR=42;FWDB=-0.0136338;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.39;QD=10.4171;RBI=0.0173982;REFB=0.00671364;REVB=-0.0108082;RO=73;SAF=45;SAR=46;SRF=31;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0570679;STB=0.524637;TYPE=snp;VARB=-0.00610104;OID=.;OPOS=24890228;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:166:73:75:91:91:46:45:31:42:46:45:33:42 chr13 24895437 . G A 138.27 PASS AO=16;DP=17;FAO=16;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.011639;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=201.827;QD=32.5349;RBI=0.0354426;REFB=-0.0138226;REVB=0.033477;RO=1;SAF=9;SAR=7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0481057;STB=0.526283;TYPE=snp;VARB=0.00122765;OID=.;OPOS=24895437;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:17:17:1:1:16:16:7:9:1:0:7:9:1:0 chr13 24895559 . A G 50.51 PASS AO=32;DP=136;FAO=32;FDP=136;FR=.;FRO=104;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=56;FSRR=48;FWDB=-0.00546729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.0091;QD=1.48567;RBI=0.0062021;REFB=-0.00345097;REVB=-0.00292827;RO=101;SAF=14;SAR=18;SRF=55;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133406;STB=0.576875;TYPE=snp;VARB=0.0198551;OID=.;OPOS=24895559;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:136:136:101:104:32:32:18:14:55:46:18:14:56:48 chr13 24895684 . A G 2454.23 PASS AO=253;DP=259;FAO=262;FDP=262;FR=.;FRO=0;FSAF=141;FSAR=121;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0168424;FXX=0.0113203;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.3206;QD=37.4692;RBI=0.0296257;REFB=-0.0737012;REVB=0.0243724;RO=6;SAF=135;SAR=118;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00590225;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000162503;OID=.;OPOS=24895684;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:259:262:6:0:253:262:118:135:4:2:121:141:0:0 chr13 24895745 . A G 69.41 PASS AO=69;DP=332;FAO=68;FDP=333;FR=.;FRO=265;FSAF=43;FSAR=25;FSRF=151;FSRR=114;FWDB=-0.0103219;FXX=0.00299392;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.778;QD=0.833712;RBI=0.0135851;REFB=-0.00408136;REVB=-0.00883249;RO=259;SAF=44;SAR=25;SRF=148;SRR=111;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0890984;STB=0.55203;TYPE=snp;VARB=0.0158476;OID=.;OPOS=24895745;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:332:333:259:265:69:68:25:44:148:111:25:43:151:114 chr13 25000617 . C G 1530.9 PASS AO=156;DP=156;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0128079;FXX=0.00624961;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.633;QD=38.5133;RBI=0.0243194;REFB=0;REVB=-0.0206735;RO=0;SAF=83;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.40279e-05;OID=.;OPOS=25000617;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:156:159:0:0:156:159:73:83:0:0:74:85:0:0 chr13 25008588 . A G 1483.99 PASS AO=157;DP=161;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0476917;FXX=0.0248432;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.629;QD=37.8087;RBI=0.0500372;REFB=-0.0511915;REVB=0.0151402;RO=1;SAF=90;SAR=67;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00525719;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00058987;OID=.;OPOS=25008588;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:161:157:1:0:157:157:67:90:1:0:67:90:0:0 chr13 25008630 . A G 1756.54 PASS AO=187;DP=188;FAO=188;FDP=188;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0249686;FXX=0.015706;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.635;QD=37.3731;RBI=0.0249805;REFB=-0.0165111;REVB=-0.000769377;RO=0;SAF=103;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.88849e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00014552;OID=.;OPOS=25008630;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:188:188:0:0:187:188:84:103:0:0:83:105:0:0 chr13 25008903 . G T 205.63 PASS AO=26;DP=31;FAO=26;FDP=30;FR=.;FRO=4;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0167618;FXX=0.0322477;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.238;QD=27.4168;RBI=0.0193949;REFB=-0.0121295;REVB=0.00975732;RO=4;SAF=13;SAR=13;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123348;STB=0.566616;TYPE=snp;VARB=0.0021065;OID=.;OPOS=25008903;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:31:30:4:4:26:26:13:13:0:4:13:13:0:4 chr13 25009099 . A C 904.52 PASS AO=93;DP=93;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0236411;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.6149;QD=38.085;RBI=0.0480052;REFB=0;REVB=-0.0417803;RO=0;SAF=45;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.55791e-05;OID=.;OPOS=25009099;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:93:95:0:0:93:95:48:45:0:0:50:45:0:0 chr13 25009297 . G T 965.74 PASS AO=106;DP=110;FAO=107;FDP=110;FR=.;FRO=3;FSAF=75;FSAR=32;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0163695;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=94.4836;QD=35.1179;RBI=0.108374;REFB=-0.105685;REVB=0.107131;RO=2;SAF=74;SAR=32;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.012654;STB=0.501113;TYPE=snp;VARB=0.00192843;OID=.;OPOS=25009297;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:110:110:2:3:106:107:32:74:2:0:32:75:2:1 chr13 25009441 . C G 1104.78 PASS AO=121;DP=124;FAO=121;FDP=124;FR=.;FRO=3;FSAF=74;FSAR=47;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0282426;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.238;QD=35.638;RBI=0.033147;REFB=-0.0256389;REVB=0.0173516;RO=3;SAF=74;SAR=47;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00266548;STB=0.501403;TYPE=snp;VARB=5.61763e-05;OID=.;OPOS=25009441;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:124:124:3:3:121:121:47:74:2:1:47:74:2:1 chr13 25009485 . C G 844.72 PASS AO=89;DP=91;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0922602;FXX=0.0217368;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.4027;QD=37.543;RBI=0.0957061;REFB=0;REVB=-0.0254502;RO=0;SAF=52;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000267286;OID=.;OPOS=25009485;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:91:90:0:0:89:90:37:52:0:0:38:52:0:0 chr13 25016008 . C T 1558.11 PASS AO=161;DP=167;FAO=163;FDP=163;FR=.;FRO=0;FSAF=100;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00106848;FXX=0.0467809;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.278;QD=38.2359;RBI=0.00158031;REFB=0;REVB=0.00116436;RO=0;SAF=101;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.48295e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00017291;OID=.;OPOS=25016008;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:167:163:0:0:161:163:60:101:0:0:63:100:0:0 chr13 25016092 . C T 976.11 PASS AO=103;DP=104;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0220707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.6123;QD=36.8344;RBI=0.0618173;REFB=-0.0303119;REVB=0.0577431;RO=1;SAF=48;SAR=55;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00978283;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00166972;OID=.;OPOS=25016092;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:104:106:1:0:103:106:55:48:1:0:55:51:0:0 chr13 25020863 . G A 1114.56 PASS AO=115;DP=115;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.828;QD=38.1047;RBI=0.0130193;REFB=0;REVB=0.000759103;RO=0;SAF=48;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000612236;OID=.;OPOS=25020863;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:115:117:0:0:115:117:67:48:0:0:67:50:0:0 chr13 25020906 . TG T 548.79 PASS AO=13;DP=86;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.111484;FXX=0.0487745;HRUN=4;LEN=1;MLLD=18.691;QD=28.143;RBI=0.121351;REFB=0;REVB=0.0479299;RO=70;SAF=12;SAR=1;SRF=19;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.711919;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00539809;OID=.;OPOS=25020907;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:13:85:78:78:0:28:50:0:0:51:70:12:1:19:51 chr13 25021200 . A C 471.98 PASS AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0138973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.11;QD=38.5286;RBI=0.0144326;REFB=0;REVB=0.00389417;RO=0;SAF=28;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.13657e-05;OID=.;OPOS=25021200;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:49:49:0:0:49:49:21:28:0:0:21:28:0:0 chr13 25021211 . C T 474.36 PASS AO=50;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0117637;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.569;QD=37.2049;RBI=0.0434949;REFB=0;REVB=0.0418739;RO=0;SAF=28;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.15703e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000416845;OID=.;OPOS=25021211;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:50:51:0:0:50:51:22:28:0:0:23:28:0:0 chr13 25021245 . A G 543.5 PASS AO=56;DP=56;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.2066;QD=38.14;RBI=0.0396246;REFB=0;REVB=-0.0366707;RO=0;SAF=26;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.29784e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000182667;OID=.;OPOS=25021245;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:56:57:0:0:56:57:30:26:0:0:30:27:0:0 chr13 25027744 . A G 1970.65 PASS AO=207;DP=209;FAO=208;FDP=208;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0479955;FXX=0.00952336;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.415;QD=37.8971;RBI=0.0690258;REFB=-0.123038;REVB=0.0496084;RO=1;SAF=102;SAR=105;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00464743;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000687089;OID=.;OPOS=25027744;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:209:208:1:0:207:208:105:102:1:0:105:103:0:0 chr13 25029218 . C T 1812.83 PASS AO=189;DP=192;FAO=190;FDP=190;FR=.;FRO=0;FSAF=110;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0607053;FXX=0.0104161;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7038;QD=38.1649;RBI=0.086804;REFB=0;REVB=0.0620468;RO=0;SAF=110;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.86773e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000494375;OID=.;OPOS=25029218;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:192:190:0:0:189:190:79:110:0:0:80:110:0:0 chr13 25265103 . A G 191.24 PASS AO=44;DP=90;FAO=44;FDP=90;FR=.;FRO=46;FSAF=10;FSAR=34;FSRF=17;FSRR=29;FWDB=0.00120232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.547;QD=8.49935;RBI=0.004925;REFB=-0.033796;REVB=-0.00477598;RO=46;SAF=10;SAR=34;SRF=17;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166161;STB=0.592978;TYPE=snp;VARB=0.0322031;OID=.;OPOS=25265103;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:46:46:44:44:34:10:17:29:34:10:17:29 chr13 25265139 . T C 218.31 PASS AO=57;DP=128;FAO=57;FDP=128;FR=.;FRO=71;FSAF=20;FSAR=37;FSRF=28;FSRR=43;FWDB=-0.0528771;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.3547;QD=6.82211;RBI=0.0768824;REFB=-0.0161242;REVB=-0.0558115;RO=69;SAF=20;SAR=37;SRF=28;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.05799;STB=0.526057;TYPE=snp;VARB=0.0188449;OID=.;OPOS=25265139;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:69:71:57:57:37:20:28:41:37:20:28:43 chr13 25356053 . T C 184.28 PASS AO=60;DP=160;FAO=60;FDP=160;FR=.;FRO=100;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=35;FSRR=65;FWDB=0.0189647;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=95.9404;QD=4.60693;RBI=0.0209892;REFB=-0.00307901;REVB=0.00899383;RO=100;SAF=26;SAR=34;SRF=35;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0950808;STB=0.553769;TYPE=snp;VARB=0.00649073;OID=.;OPOS=25356053;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:160:100:100:60:60:34:26:35:65:34:26:35:65 chr13 25363477 . A T 47.17 PASS AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=43;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=22;FWDB=0.0337315;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=36.1019;QD=4.388;RBI=0.114537;REFB=-0.0549685;REVB=-0.109458;RO=24;SAF=9;SAR=7;SRF=5;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.358386;STB=0.756485;TYPE=snp;VARB=0.0120681;OID=.;OPOS=25363477;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:40:43:24:27:16:16:7:9:5:19:6:10:5:22 chr13 25367282 . A C 166.53 PASS AO=38;DP=77;FAO=38;FDP=77;FR=.;FRO=39;FSAF=27;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=-0.00324178;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=223.763;QD=8.65072;RBI=0.00543086;REFB=-0.00908489;REVB=-0.0043572;RO=39;SAF=27;SAR=11;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173855;STB=0.5972;TYPE=snp;VARB=0.0097906;OID=.;OPOS=25367282;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:39:39:38:38:11:27:21:18:11:27:21:18 chr13 25419176 . A G 417.87 PASS AO=104;DP=219;FAO=104;FDP=220;FR=.;FRO=116;FSAF=28;FSAR=76;FSRF=29;FSRR=87;FWDB=0.004387;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.9842;QD=7.59771;RBI=0.0134553;REFB=0.00685887;REVB=0.01272;RO=115;SAF=28;SAR=76;SRF=28;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0316933;STB=0.513037;TYPE=snp;VARB=-0.00594687;OID=.;OPOS=25419176;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:219:220:115:116:104:104:76:28:28:87:76:28:29:87 chr13 25428002 . C A 169.99 PASS AO=34;DP=69;FAO=37;FDP=72;FR=.;FRO=35;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=0.012774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.8253;QD=9.44379;RBI=0.0253338;REFB=-0.00775109;REVB=0.0218775;RO=35;SAF=23;SAR=11;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131128;STB=0.539884;TYPE=snp;VARB=0.00933088;OID=.;OPOS=25428002;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:72:35:35:34:37:11:23:19:16:14:23:19:16 chr13 25460428 . A G 567.49 PASS AO=66;DP=69;FAO=65;FDP=69;FR=.;FRO=4;FSAF=34;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.00438157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.196;QD=32.8977;RBI=0.00574022;REFB=-0.155763;REVB=-0.00370837;RO=0;SAF=34;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.75585e-08;STB=0.530294;TYPE=snp;VARB=0.00114767;OID=.;OPOS=25460428;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:69:69:0:4:66:65:32:34:0:0:31:34:0:4 chr13 25466955 . T C 832.2 PASS AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00186968;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=209.823;QD=38.2621;RBI=0.0120558;REFB=0;REVB=0.0119099;RO=0;SAF=74;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.42146e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.68147e-06;OID=.;OPOS=25466955;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:87:87:0:0:87:87:13:74:0:0:13:74:0:0 chr13 25487103 . T C 236.04 PASS AO=73;DP=191;FAO=75;FDP=194;FR=.;FRO=119;FSAF=29;FSAR=46;FSRF=54;FSRR=65;FWDB=-0.0431458;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.316;QD=4.86672;RBI=0.0431946;REFB=-0.0212528;REVB=0.00205223;RO=117;SAF=28;SAR=45;SRF=54;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0876846;STB=0.542549;TYPE=snp;VARB=0.0246261;OID=.;OPOS=25487103;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:191:194:117:119:73:75:45:28:54:63:46:29:54:65 chr13 25542441 . G A 269.45 PASS AO=58;DP=113;FAO=64;FDP=126;FR=.;FRO=62;FSAF=20;FSAR=44;FSRF=19;FSRR=43;FWDB=0.139146;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=36.1439;QD=8.55386;RBI=0.159001;REFB=-0.0646835;REVB=0.0769402;RO=53;SAF=20;SAR=38;SRF=18;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00500497;STB=0.503471;TYPE=snp;VARB=0.0576996;OID=.;OPOS=25542441;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:126:53:62:58:64:38:20:18:35:44:20:19:43 chr13 25672895 . T A 462.35 PASS AO=112;DP=231;FAO=112;FDP=231;FR=.;FRO=119;FSAF=50;FSAR=62;FSRF=48;FSRR=71;FWDB=-0.00773344;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=245.279;QD=8.00599;RBI=0.0083187;REFB=-0.00108889;REVB=-0.00306508;RO=118;SAF=50;SAR=62;SRF=48;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0375782;STB=0.522548;TYPE=snp;VARB=0.00100265;OID=.;OPOS=25672895;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:231:231:118:119:112:112:62:50:48:70:62:50:48:71 chr13 25744189 . GC G 244.11 PASS AO=32;DP=51;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.181692;FXX=0.059988;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.9489;QD=20.7756;RBI=0.182284;REFB=-0.0079436;REVB=0.0146754;RO=6;SAF=7;SAR=25;SRF=5;SRR=1;SSEN=0.356912;SSEP=0;SSSB=-0.225485;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0321033;OID=.;OPOS=25744190;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:32:49:47:47:0:18:29:0:0:16:6:7:25:5:1 chr13 25744281 . GC G 36.36 PASS AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.101276;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=16.458;QD=5.01547;RBI=0.157685;REFB=-0.0734049;REVB=-0.120863;RO=14;SAF=4;SAR=9;SRF=10;SRR=4;SSEN=0.384121;SSEP=0;SSSB=-0.361002;STB=0.706492;TYPE=del;VARB=0.0575855;OID=.;OPOS=25744282;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:13:29:13:29:16:4:9:11:5:36:14:4:9:10:4 chr13 25825889 . T C 2482.79 PASS AO=263;DP=266;FAO=263;FDP=263;FR=.;FRO=0;FSAF=133;FSAR=130;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140485;FXX=0.0112778;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.58;QD=37.7611;RBI=0.0182616;REFB=-0.1421;REVB=-0.0116673;RO=1;SAF=133;SAR=130;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00357125;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000128997;OID=.;OPOS=25825889;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:266:263:1:0:263:263:130:133:1:0:130:133:0:0 chr13 25831888 . T C 1741.63 PASS AO=200;DP=213;FAO=202;FDP=214;FR=.;FRO=12;FSAF=133;FSAR=69;FSRF=1;FSRR=11;FWDB=-0.000342013;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.6335;QD=32.5538;RBI=0.00269878;REFB=-0.0886506;REVB=0.00267702;RO=4;SAF=133;SAR=67;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0172772;STB=0.535046;TYPE=snp;VARB=0.00505536;OID=.;OPOS=25831888;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:213:214:4:12:200:202:67:133:1:3:69:133:1:11 chr13 25876011 . G A 117.36 PASS AO=24;DP=53;FAO=27;FDP=56;FR=.;FRO=29;FSAF=4;FSAR=23;FSRF=3;FSRR=26;FWDB=0.154622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.648;QD=8.38307;RBI=0.154671;REFB=-0.00906437;REVB=0.00389234;RO=29;SAF=2;SAR=22;SRF=3;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0595604;STB=0.548986;TYPE=snp;VARB=0.0204613;OID=.;OPOS=25876011;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:56:29:29:24:27:22:2:3:26:23:4:3:26 chr13 26148966 . C T 431.07 PASS AO=133;DP=339;FAO=135;FDP=340;FR=.;FRO=205;FSAF=66;FSAR=69;FSRF=92;FSRR=113;FWDB=-0.051313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4203;QD=5.07145;RBI=0.0514993;REFB=-0.013006;REVB=0.00437627;RO=200;SAF=64;SAR=69;SRF=89;SRR=111;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0389617;STB=0.524217;TYPE=snp;VARB=0.016137;OID=.;OPOS=26148966;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:339:340:200:205:133:135:69:64:89:111:69:66:92:113 chr13 26273385 . G C 1195.88 PASS AO=124;DP=125;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226929;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8981;QD=38.2682;RBI=0.0291368;REFB=0;REVB=-0.0182754;RO=0;SAF=47;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000164721;OID=.;OPOS=26273385;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:125:125:0:0:124:125:77:47:0:0:78:47:0:0 chr13 26349076 . C T 424.48 PASS AO=122;DP=290;FAO=123;FDP=292;FR=.;FRO=169;FSAF=50;FSAR=73;FSRF=71;FSRR=98;FWDB=0.0108222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.771;QD=5.81482;RBI=0.0153028;REFB=0.00682566;REVB=0.0108193;RO=166;SAF=49;SAR=73;SRF=69;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0150407;STB=0.508139;TYPE=snp;VARB=-0.00864936;OID=.;OPOS=26349076;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:290:292:166:169:122:123:73:49:69:97:73:50:71:98 chr13 26518714 . A T 64.61 PASS AO=21;DP=59;FAO=21;FDP=61;FR=.;FRO=40;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=26;FWDB=-0.0117132;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.84;QD=4.23682;RBI=0.0158119;REFB=-0.00782688;REVB=-0.0106216;RO=38;SAF=9;SAR=12;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0687899;STB=0.553349;TYPE=snp;VARB=0.014233;OID=.;OPOS=26518714;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:59:61:38:40:21:21:12:9:14:24:12:9:14:26 chr13 26518724 . A G 86.79 PASS AO=25;DP=64;FAO=25;FDP=64;FR=.;FRO=39;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=26;FWDB=0.0150115;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.512;QD=5.42434;RBI=0.044635;REFB=0.00113998;REVB=-0.042035;RO=39;SAF=11;SAR=14;SRF=13;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117199;STB=0.566958;TYPE=snp;VARB=-0.00120916;OID=.;OPOS=26518724;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:64:64:39:39:25:25:14:11:13:26:14:11:13:26 chr13 26518853 . G T 125.67 PASS AO=29;DP=61;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=-0.0404469;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.364;QD=8.24036;RBI=0.04081;REFB=-0.0142283;REVB=0.00543155;RO=32;SAF=11;SAR=18;SRF=11;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0356535;STB=0.519986;TYPE=snp;VARB=0.0123047;OID=.;OPOS=26518853;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:32:32:29:29:18:11:11:21:18:11:11:21 chr13 26620818 . GC G 913.27 PASS AO=104;DP=159;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.026585;FXX=0.0128197;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.1857;QD=23.7212;RBI=0.356008;REFB=-0.00275489;REVB=0.355014;RO=29;SAF=68;SAR=36;SRF=4;SRR=25;SSEN=0.369369;SSEP=0;SSSB=0.216318;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00600403;OID=.;OPOS=26620819;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:104:154:154:154:0:87:67:0:0:81:29:68:36:4:25 chr13 26788114 . A G 2105.67 PASS AO=222;DP=223;FAO=222;FDP=222;FR=.;FRO=0;FSAF=118;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00324265;FXX=0.00892817;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.1936;QD=37.9399;RBI=0.0142986;REFB=-0.0656041;REVB=0.0139261;RO=1;SAF=118;SAR=104;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00402101;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000501979;OID=.;OPOS=26788114;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:92:223:222:1:0:222:222:104:118:1:0:104:118:0:0 chr13 28009920 . G C 1526.38 PASS AO=156;DP=161;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0385738;FXX=0.0421661;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.09;QD=38.3995;RBI=0.0386973;REFB=0;REVB=-0.00308967;RO=0;SAF=54;SAR=102;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000450437;OID=.;OPOS=28009920;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:161:159:0:0:156:159:102:54:0:0:103:56:0:0 chr13 28121707 . G A 413.95 PASS AO=82;DP=142;FAO=82;FDP=142;FR=.;FRO=60;FSAF=38;FSAR=44;FSRF=20;FSRR=40;FWDB=-0.0111693;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.794;QD=11.6604;RBI=0.012199;REFB=-0.00618;REVB=-0.00490535;RO=58;SAF=38;SAR=44;SRF=20;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0916209;STB=0.555697;TYPE=snp;VARB=0.00275712;OID=.;OPOS=28121707;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:58:60:82:82:44:38:20:38:44:38:20:40 chr13 28143229 . A G 1639.73 PASS AO=158;DP=159;FAO=173;FDP=173;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00160832;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.2874;QD=37.9128;RBI=0.0627939;REFB=0;REVB=0.0627733;RO=1;SAF=83;SAR=75;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.005698;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000341244;OID=.;OPOS=28143229;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:159:173:1:0:158:173:75:83:1:0:88:85:0:0 chr13 28537242 . A C 224.75 PASS AO=31;DP=36;FAO=30;FDP=36;FR=.;FRO=6;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.00834752;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.7917;QD=24.9718;RBI=0.0500122;REFB=-0.0126565;REVB=-0.0493107;RO=5;SAF=19;SAR=12;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108153;STB=0.571383;TYPE=snp;VARB=0.0230244;OID=.;OPOS=28537242;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:36:36:5:6:31:30:12:19:5:0:12:18:6:0 chr13 28537277 . AC A 39.55 PASS AO=16;DP=34;FAO=18;FDP=31;FR=.;FRO=13;FSAF=16;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0274645;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=8.17757;QD=5.10377;RBI=0.174922;REFB=-0.0185014;REVB=0.172752;RO=13;SAF=15;SAR=1;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.556075;STB=0.699728;TYPE=del;VARB=0.0549405;OID=.;OPOS=28537278;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:16:31:18:31:13:16:2:8:5:20:13:15:1:7:6 chr13 28537317 . G A 272.99 PASS AO=33;DP=37;FAO=34;FDP=37;FR=.;FRO=3;FSAF=30;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0416821;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.626;QD=29.5124;RBI=0.055455;REFB=-0.0609493;REVB=0.0365768;RO=2;SAF=30;SAR=3;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23044;STB=0.63627;TYPE=snp;VARB=0.00440702;OID=.;OPOS=28537317;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:37:37:2:3:33:34:3:30:0:2:4:30:0:3 chr13 28562605 . T G 314.05 PASS AO=88;DP=209;FAO=89;FDP=210;FR=.;FRO=121;FSAF=43;FSAR=46;FSRF=55;FSRR=66;FWDB=-0.0077331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.402;QD=5.98189;RBI=0.0119267;REFB=-0.00186687;REVB=-0.00907995;RO=120;SAF=43;SAR=45;SRF=55;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0313574;STB=0.516513;TYPE=snp;VARB=0.00193149;OID=.;OPOS=28562605;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:210:120:121:88:89:45:43:55:65:46:43:55:66 chr13 28577814 . T C 262.48 PASS AO=82;DP=212;FAO=83;FDP=212;FR=.;FRO=129;FSAF=30;FSAR=53;FSRF=34;FSRR=95;FWDB=-0.0111281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.803;QD=4.95239;RBI=0.011329;REFB=-0.00366185;REVB=0.00212378;RO=130;SAF=29;SAR=53;SRF=35;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104429;STB=0.56689;TYPE=snp;VARB=0.013729;OID=.;OPOS=28577814;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:212:130:129:82:83:53:29:35:95:53:30:34:95 chr13 28610183 . A G 236.02 PASS AO=58;DP=123;FAO=58;FDP=123;FR=.;FRO=65;FSAF=34;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=42;FWDB=-0.0105127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.68;QD=7.67527;RBI=0.0133905;REFB=-0.00645859;REVB=-0.00829378;RO=65;SAF=34;SAR=24;SRF=23;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218791;STB=0.621221;TYPE=snp;VARB=0.00947817;OID=.;OPOS=28610183;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:65:65:58:58:24:34:23:42:24:34:23:42 chr13 28636084 . G A 2304.24 PASS AO=239;DP=240;FAO=239;FDP=239;FR=.;FRO=0;FSAF=122;FSAR=117;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0327527;FXX=0.00416649;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.648;QD=38.5646;RBI=0.0358374;REFB=0;REVB=0.0145459;RO=0;SAF=122;SAR=117;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.98482e-05;OID=.;OPOS=28636084;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:240:239:0:0:239:239:117:122:0:0:117:122:0:0 chr13 28835527 . T TC 3288.61 PASS AO=337;DP=372;FAO=351;FDP=351;FR=.;FRO=0;FSAF=182;FSAR=169;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0106466;FXX=0.0564501;HRUN=0;LEN=1;MLLD=235.285;QD=37.4771;RBI=0.0155701;REFB=-0.053356;REVB=-0.0113612;RO=12;SAF=171;SAR=166;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00497573;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-0.000158245;OID=.;OPOS=28835528;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:337:372:351:351:0:182:169:0:0:99:12:171:166:7:5 chr13 28867563 . G A 10.89 PASS AO=6;DP=35;FAO=6;FDP=34;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=28;FSRR=0;FWDB=-0.020551;FXX=0.0285633;HRUN=7;LEN=1;MLLD=233.627;QD=1.28144;RBI=0.0400799;REFB=0.000560652;REVB=-0.0344101;RO=27;SAF=5;SAR=1;SRF=27;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.651716;STB=0.868036;TYPE=snp;VARB=-0.00360553;OID=.;OPOS=28867563;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:35:34:27:28:6:6:1:5:27:0:1:5:28:0 chr13 28883061 . G A 904.53 PASS AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00946239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.001;QD=38.0855;RBI=0.0154072;REFB=0;REVB=0.0121592;RO=0;SAF=37;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.87092e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.65185e-06;OID=.;OPOS=28883061;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:95:95:0:0:95:95:58:37:0:0:58:37:0:0 chr13 28968770 . T C 626.29 PASS AO=137;DP=257;FAO=137;FDP=257;FR=.;FRO=120;FSAF=52;FSAR=85;FSRF=60;FSRR=60;FWDB=-0.0056489;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=233.912;QD=9.74776;RBI=0.00576051;REFB=-0.0280811;REVB=-0.00112846;RO=120;SAF=52;SAR=85;SRF=60;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106223;STB=0.558022;TYPE=snp;VARB=0.0229779;OID=.;OPOS=28968770;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:257:257:120:120:137:137:85:52:60:60:85:52:60:60 chr13 28970917 . C T 380.01 PASS AO=44;DP=47;FAO=44;FDP=47;FR=.;FRO=3;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0196296;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3437;QD=32.3412;RBI=0.0615058;REFB=-0.0219433;REVB=0.0582893;RO=3;SAF=28;SAR=16;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.003923;STB=0.502091;TYPE=snp;VARB=0.00992376;OID=.;OPOS=28970917;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:47:47:3:3:44:44:16:28:2:1:16:28:2:1 chr13 29041007 . A T 159.83 PASS AO=44;DP=104;FAO=44;FDP=104;FR=.;FRO=60;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=25;FSRR=35;FWDB=-0.0171087;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=238.2;QD=6.14741;RBI=0.0198868;REFB=-0.0126028;REVB=0.0101378;RO=60;SAF=19;SAR=25;SRF=25;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0158652;STB=0.508925;TYPE=snp;VARB=0.018463;OID=.;OPOS=29041007;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:60:60:44:44:25:19:25:35:25:19:25:35 chr13 29275102 . T C 1291.03 PASS AO=135;DP=139;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=7.0868e-05;FXX=0.0425502;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.018;QD=38.2526;RBI=0.0344537;REFB=0;REVB=0.0344536;RO=0;SAF=57;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000111114;OID=.;OPOS=29275102;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:139:135:0:0:135:135:78:57:0:0:78:57:0:0 chr13 29275129 . C T 202.05 PASS AO=57;DP=127;FAO=54;FDP=124;FR=.;FRO=70;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=34;FSRR=36;FWDB=-0.0355274;FXX=0.0312476;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.851;QD=6.51769;RBI=0.036631;REFB=-0.0126239;REVB=-0.00892373;RO=69;SAF=28;SAR=29;SRF=33;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0127477;STB=0.512885;TYPE=snp;VARB=0.0172765;OID=.;OPOS=29275129;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:124:69:70:57:54:29:28:33:36:29:25:34:36 chr13 29898768 . A C 639.75 PASS AO=66;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.016734;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.809;QD=38.1942;RBI=0.0172704;REFB=0;REVB=-0.00427066;RO=0;SAF=21;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.47552e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.86348e-05;OID=.;OPOS=29898768;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:66:67:0:0:66:67:45:21:0:0:46:21:0:0 chr13 29933450 . C T 168.24 PASS AO=38;DP=76;FAO=38;FDP=76;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=12;FSRR=26;FWDB=0.00141284;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.736;QD=8.85468;RBI=0.00480244;REFB=-0.00815051;REVB=-0.00458992;RO=38;SAF=15;SAR=23;SRF=12;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.075779;STB=0.542014;TYPE=snp;VARB=0.00864596;OID=.;OPOS=29933450;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:38:38:38:38:23:15:12:26:23:15:12:26 chr13 30084173 . G A 1238.02 PASS AO=130;DP=130;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0406971;FXX=0.0153834;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.443;QD=38.6882;RBI=0.0452201;REFB=0;REVB=-0.0197129;RO=0;SAF=66;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.98038e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.1641e-05;OID=.;OPOS=30084173;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:130:128:0:0:130:128:64:66:0:0:63:65:0:0 chr13 30087778 . T A 520.19 PASS AO=56;DP=59;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0134111;FXX=0.0338926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.274;QD=36.5048;RBI=0.0157112;REFB=-0.0788475;REVB=-0.00818438;RO=1;SAF=29;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.015982;STB=0.508472;TYPE=snp;VARB=-0.000478995;OID=.;OPOS=30087778;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:59:57:1:1:56:56:27:29:1:0:27:29:1:0 chr13 30091714 . G A 1886.31 PASS AO=194;DP=195;FAO=198;FDP=198;FR=.;FRO=0;FSAF=124;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00290686;FXX=0.0099995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.015;QD=38.1073;RBI=0.00547227;REFB=-0.040907;REVB=-0.00463637;RO=0;SAF=123;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84525e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.89543e-05;OID=.;OPOS=30091714;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:195:198:0:0:194:198:71:123:0:0:74:124:0:0 chr13 30091819 . G C 3389.35 PASS AO=257;DP=364;FAO=358;FDP=364;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=196;FSAR=162;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.076099;FXX=0.0135498;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.681;QD=37.2456;RBI=0.0761595;REFB=0;REVB=0.00303309;RO=0;SAF=105;SAR=152;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.31758e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00358795;OID=.;OPOS=30091819;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:348:364:0:0:257:358:152:105:0:0:162:196:0:0 chr13 30781111 . C A 200.13 PASS AO=44;DP=89;FAO=45;FDP=90;FR=.;FRO=45;FSAF=4;FSAR=41;FSRF=6;FSRR=39;FWDB=-0.0473781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.068;QD=8.89444;RBI=0.0474626;REFB=-0.00720196;REVB=0.00283167;RO=45;SAF=4;SAR=40;SRF=6;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104712;STB=0.561614;TYPE=snp;VARB=0.00648746;OID=.;OPOS=30781111;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:90:45:45:44:45:40:4:6:39:41:4:6:39 chr13 31036681 . A G 1204.38 PASS AO=122;DP=123;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206763;FXX=0.0234357;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.305;QD=38.5401;RBI=0.0251858;REFB=0;REVB=0.014381;RO=0;SAF=53;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.31844e-05;OID=.;OPOS=31036681;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:123:125:0:0:122:125:69:53:0:0:72:53:0:0 chr13 31231806 . T C 1467.22 PASS AO=159;DP=167;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0118598;FXX=0.0299383;HRUN=3;LEN=1;MLLD=66.7809;QD=36.2277;RBI=0.026673;REFB=-0.110312;REVB=0.0238913;RO=3;SAF=52;SAR=107;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000251643;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000888778;OID=.;OPOS=31231806;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:167:162:3:0:159:162:107:52:1:2:109:53:0:0 chr13 31233063 . G A 1247.76 PASS AO=132;DP=132;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00932036;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.0346;QD=38.0996;RBI=0.0095942;REFB=0;REVB=0.00227585;RO=0;SAF=67;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.83182e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000262464;OID=.;OPOS=31233063;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:132:131:0:0:132:131:65:67:0:0:65:66:0:0 chr13 31287979 . G GTA 659.8 PASS AO=60;DP=121;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0892335;FXX=0.3168;HRUN=1;LEN=2;MLLD=115.361;QD=38.2491;RBI=0.106088;REFB=0;REVB=0.0573769;RO=58;SAF=12;SAR=48;SRF=25;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.262591;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00547402;OID=.;OPOS=31287980;OREF=-;OALT=TA;OMAPALT=GTA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:60:121:69:69:0:19:50:0:0:32:58:12:48:25:33 chr13 31287981 . G A 204.54 PASS AO=54;DP=125;FAO=55;FDP=126;FR=.;FRO=71;FSAF=21;FSAR=34;FSRF=14;FSRR=57;FWDB=-0.00632548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.1127;QD=6.49323;RBI=0.0133557;REFB=-0.0338758;REVB=0.0117627;RO=71;SAF=21;SAR=33;SRF=14;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217944;STB=0.616215;TYPE=snp;VARB=0.0278651;OID=.;OPOS=31287981;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:126:71:71:54:55:33:21:14:57:34:21:14:57 chr13 31531009 . G A 409.75 PASS AO=93;DP=182;FAO=93;FDP=182;FR=.;FRO=89;FSAF=54;FSAR=39;FSRF=39;FSRR=50;FWDB=0.012974;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7382;QD=9.00548;RBI=0.0329804;REFB=-0.00651912;REVB=0.0303213;RO=89;SAF=54;SAR=39;SRF=39;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127323;STB=0.569889;TYPE=snp;VARB=0.00707471;OID=.;OPOS=31531009;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:182:89:89:93:93:39:54:39:50:39:54:39:50 chr13 31543095 . C T 108 PASS AO=28;DP=66;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=29;FSRR=8;FWDB=0.00316395;FXX=0.0298463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.886;QD=6.64639;RBI=0.00528227;REFB=-0.0335867;REVB=0.00422987;RO=37;SAF=20;SAR=8;SRF=29;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0897009;STB=0.550528;TYPE=snp;VARB=0.0580443;OID=.;OPOS=31543095;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:65:37:37:28:28:8:20:29:8:8:20:29:8 chr13 31725260 . A G 469.75 PASS AO=128;DP=290;FAO=128;FDP=290;FR=.;FRO=162;FSAF=56;FSAR=72;FSRF=55;FSRR=107;FWDB=-0.00048003;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=231.26;QD=6.47933;RBI=0.0209665;REFB=-0.00257712;REVB=0.020961;RO=162;SAF=56;SAR=72;SRF=55;SRR=107;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101932;STB=0.556386;TYPE=snp;VARB=0.00285192;OID=.;OPOS=31725260;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:290:290:162:162:128:128:72:56:55:107:72:56:55:107 chr13 31728703 . T C 286.54 PASS AO=53;DP=87;FAO=53;FDP=87;FR=.;FRO=34;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.00194241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.041;QD=13.1741;RBI=0.0209213;REFB=-0.0271313;REVB=0.0208309;RO=34;SAF=30;SAR=23;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0478508;STB=0.526075;TYPE=snp;VARB=0.0154412;OID=.;OPOS=31728703;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:34:34:53:53:23:30:17:17:23:30:17:17 chr13 31729729 . A G 386.1 PASS AO=93;DP=197;FAO=93;FDP=192;FR=.;FRO=99;FSAF=45;FSAR=48;FSRF=44;FSRR=55;FWDB=0.00397156;FXX=0.0351741;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.4809;QD=8.04382;RBI=0.00599453;REFB=0.0121908;REVB=-0.00449012;RO=95;SAF=45;SAR=48;SRF=42;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0384521;STB=0.520373;TYPE=snp;VARB=-0.0116471;OID=.;OPOS=31729729;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:192:95:99:93:93:48:45:42:53:48:45:44:55 chr13 31821240 . C T 437.91 PASS AO=92;DP=168;FAO=92;FDP=168;FR=.;FRO=76;FSAF=31;FSAR=61;FSRF=26;FSRR=50;FWDB=0.0159227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.1764;QD=10.4265;RBI=0.0322158;REFB=-0.0190608;REVB=0.0280057;RO=76;SAF=31;SAR=61;SRF=26;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00476519;STB=0.502601;TYPE=snp;VARB=0.0105489;OID=.;OPOS=31821240;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:76:76:92:92:61:31:26:50:61:31:26:50 chr13 31821992 . T C 1346.84 PASS AO=158;DP=172;FAO=160;FDP=173;FR=.;FRO=13;FSAF=79;FSAR=81;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0142832;FXX=0.0335177;HRUN=5;LEN=1;MLLD=132.6;QD=31.1407;RBI=0.015602;REFB=-0.112919;REVB=0.0062779;RO=14;SAF=78;SAR=80;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0100515;STB=0.502421;TYPE=snp;VARB=0.00155156;OID=.;OPOS=31821992;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:172:173:14:13:158:160:80:78:6:8:81:79:6:7 chr13 31891746 . G A 1241.87 PASS AO=126;DP=127;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.68;QD=38.5077;RBI=0.0138803;REFB=0;REVB=0.00889289;RO=0;SAF=56;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.67837e-05;OID=.;OPOS=31891746;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:127:129:0:0:126:129:70:56:0:0:72:57:0:0 chr13 31905557 . C T 1521.41 PASS AO=170;DP=171;FAO=172;FDP=172;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.216851;FXX=0.00578001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.508;QD=35.3816;RBI=0.257227;REFB=-0.128752;REVB=0.138352;RO=1;SAF=73;SAR=97;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00488173;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0202035;OID=.;OPOS=31905557;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:171:172:1:0:170:172:97:73:0:1:97:75:0:0 chr13 32360547 . A G 282.43 PASS AO=87;DP=219;FAO=87;FDP=219;FR=.;FRO=132;FSAF=41;FSAR=46;FSRF=57;FSRR=75;FWDB=-0.00792042;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=257.96;QD=5.15855;RBI=0.0135922;REFB=-0.00168023;REVB=0.0110461;RO=131;SAF=41;SAR=46;SRF=56;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0471723;STB=0.523915;TYPE=snp;VARB=0.00229441;OID=.;OPOS=32360547;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:219:219:131:132:87:87:46:41:56:75:46:41:57:75 chr13 32376718 . A G 123.67 PASS AO=44;DP=127;FAO=44;FDP=127;FR=.;FRO=83;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=35;FSRR=48;FWDB=0.0292007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.3203;QD=3.89499;RBI=0.0493618;REFB=-0.0101887;REVB=0.0397984;RO=82;SAF=24;SAR=20;SRF=34;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147429;STB=0.580334;TYPE=snp;VARB=0.0270818;OID=.;OPOS=32376718;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:82:83:44:44:20:24:34:48:20:24:35:48 chr13 32660137 . T G 1325.81 PASS AO=130;DP=130;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00925877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.375;QD=38.4293;RBI=0.0147376;REFB=0;REVB=0.0114662;RO=0;SAF=25;SAR=105;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.00707e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.46602e-05;OID=.;OPOS=32660137;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:130:138:0:0:130:138:105:25:0:0:110:28:0:0 chr13 32676114 . A G 809.89 PASS AO=94;DP=103;FAO=96;FDP=101;FR=.;FRO=5;FSAF=40;FSAR=56;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0207168;FXX=0.0288434;HRUN=4;LEN=1;MLLD=172.612;QD=32.0748;RBI=0.023613;REFB=-0.119256;REVB=-0.0113308;RO=7;SAF=40;SAR=54;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0381368;STB=0.511071;TYPE=snp;VARB=0.00116845;OID=.;OPOS=32676114;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:103:101:7:5:94:96:54:40:1:6:56:40:1:4 chr13 32776153 . T C 327.2 PASS AO=74;DP=150;FAO=75;FDP=149;FR=.;FRO=74;FSAF=31;FSAR=44;FSRF=22;FSRR=52;FWDB=-0.0176904;FXX=0.0132442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.314;QD=8.78386;RBI=0.0234777;REFB=-0.0248676;REVB=-0.0154353;RO=73;SAF=31;SAR=43;SRF=21;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124715;STB=0.560648;TYPE=snp;VARB=0.0330353;OID=.;OPOS=32776153;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:149:73:74:74:75:43:31:21:52:44:31:22:52 chr13 32776603 . T C 481.64 PASS AO=111;DP=222;FAO=112;FDP=222;FR=.;FRO=110;FSAF=46;FSAR=66;FSRF=58;FSRR=52;FWDB=0.00638979;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.095;QD=8.67827;RBI=0.0133383;REFB=-0.00988283;REVB=0.0117081;RO=109;SAF=46;SAR=65;SRF=57;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0990021;STB=0.558401;TYPE=snp;VARB=0.0126909;OID=.;OPOS=32776603;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:222:109:110:111:112:65:46:57:52:66:46:58:52 chr13 32776616 . T A 426.08 PASS AO=105;DP=219;FAO=104;FDP=216;FR=.;FRO=112;FSAF=53;FSAR=51;FSRF=45;FSRR=67;FWDB=-0.0142668;FXX=0.013698;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.51;QD=7.89039;RBI=0.0167376;REFB=-0.0114045;REVB=0.00875246;RO=111;SAF=54;SAR=51;SRF=45;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101456;STB=0.555802;TYPE=snp;VARB=0.0109567;OID=.;OPOS=32776616;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:219:216:111:112:105:104:51:54:45:66:51:53:45:67 chr13 32785086 . G A 62.51 PASS AO=11;DP=43;FAO=16;FDP=44;FR=.,HEALED;FRO=25;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.0359594;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.959;QD=5.68256;RBI=0.0416127;REFB=-0.0239211;REVB=-0.0209414;RO=17;SAF=8;SAR=3;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.431914;STB=0.734658;TYPE=snp;VARB=0.0130532;OID=.;OPOS=32785086;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:41:44:17:25:11:16:3:8:5:12:3:13:12:13 chr13 32811974 . C T 140.58 PASS AO=32;DP=69;FAO=33;FDP=70;FR=.;FRO=37;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=14;FSRR=23;FWDB=0.00768171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.993;QD=8.0331;RBI=0.0139433;REFB=-0.0100371;REVB=-0.0116364;RO=37;SAF=13;SAR=19;SRF=14;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0277647;STB=0.524985;TYPE=snp;VARB=0.0139228;OID=.;OPOS=32811974;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:70:37:37:32:33:19:13:14:23:19:14:14:23 chr13 32832149 . T C 1745.08 PASS AO=184;DP=186;FAO=184;FDP=184;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145769;FXX=0.0107521;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.498;QD=37.9364;RBI=0.0362702;REFB=-0.180778;REVB=0.0332121;RO=1;SAF=82;SAR=102;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0046452;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000644165;OID=.;OPOS=32832149;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:186:184:1:0:184:184:102:82:0:1:102:82:0:0 chr13 32906729 . A C 288.24 PASS AO=79;DP=182;FAO=79;FDP=182;FR=.;FRO=103;FSAF=37;FSAR=42;FSRF=46;FSRR=57;FWDB=-0.00783859;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=151.133;QD=6.33499;RBI=0.0127709;REFB=-0.0104511;REVB=-0.0100823;RO=101;SAF=37;SAR=42;SRF=44;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.033177;STB=0.512376;TYPE=snp;VARB=0.0109455;OID=.;OPOS=32906729;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:182:101:103:79:79:42:37:44:57:42:37:46:57 chr13 32913055 . A G 2658.97 PASS AO=282;DP=291;FAO=287;FDP=287;FR=.;FRO=0;FSAF=142;FSAR=145;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0604166;FXX=0.0137452;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.2225;QD=37.0588;RBI=0.067779;REFB=-0.0699378;REVB=0.0307217;RO=5;SAF=137;SAR=145;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.017081;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00229614;OID=.;OPOS=32913055;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:291:287:5:0:282:287:145:137:5:0:145:142:0:0 chr13 32915005 . G C 1409.57 PASS AO=147;DP=147;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00836342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.7297;QD=38.3556;RBI=0.027351;REFB=0;REVB=0.0260409;RO=0;SAF=84;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.98315e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.38801e-05;OID=.;OPOS=32915005;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:147:147:0:0:147:147:63:84:0:0:63:84:0:0 chr13 32929387 . T C 297.38 PASS AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0538811;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.548;QD=37.172;RBI=0.0539004;REFB=0;REVB=0.00144353;RO=0;SAF=12;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00043605;OID=.;OPOS=32929387;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:33:32:0:0:32:32:20:12:0:0:20:12:0:0 chr13 32976640 . TTTG T 128.07 PASS AO=63;DP=246;FAO=71;FDP=185;FR=.;FRO=114;FSAF=9;FSAR=62;FSRF=55;FSRR=59;FWDB=-0.0109294;FXX=0.031412;HRUN=3;LEN=3;MLLD=170.022;QD=2.76914;RBI=0.0131232;REFB=-0.012023;REVB=-0.00726417;RO=111;SAF=9;SAR=54;SRF=54;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.470948;STB=0.784561;TYPE=del;VARB=0.0217335;OID=.;OPOS=32976641;OREF=TTG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:63:181:71:185:114:9:62:55:59:99:111:9:54:54:57 chr13 32976645 . T A 240.11 PASS AO=65;DP=185;FAO=74;FDP=185;FR=.;FRO=111;FSAF=11;FSAR=63;FSRF=49;FSRR=62;FWDB=-0.0156799;FXX=0.0463894;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.243;QD=5.19158;RBI=0.0280483;REFB=-0.00381289;REVB=-0.0232561;RO=118;SAF=10;SAR=55;SRF=58;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.456722;STB=0.733195;TYPE=snp;VARB=0.00816529;OID=.;OPOS=32976645;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:185:118:111:65:74:55:10:58:60:63:11:49:62 chr13 32976648 . G C 238.49 PASS AO=65;DP=170;FAO=72;FDP=180;FR=.;FRO=108;FSAF=10;FSAR=62;FSRF=48;FSRR=60;FWDB=0.00313516;FXX=0.00552456;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.6713;QD=5.29987;RBI=0.00601151;REFB=-0.0120177;REVB=0.00512924;RO=105;SAF=10;SAR=55;SRF=48;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.417083;STB=0.746597;TYPE=snp;VARB=0.0290088;OID=.;OPOS=32976648;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:180:105:108:65:72:55:10:48:57:62:10:48:60 chr13 32994533 . T C 299.34 PASS AO=101;DP=271;FAO=101;FDP=271;FR=.;FRO=170;FSAF=49;FSAR=52;FSRF=78;FSRR=92;FWDB=-0.000816664;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=270.202;QD=4.41833;RBI=0.000979521;REFB=0.0014398;REVB=-0.000540852;RO=170;SAF=49;SAR=52;SRF=78;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0292873;STB=0.516541;TYPE=snp;VARB=-0.0022423;OID=.;OPOS=32994533;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:271:271:170:170:101:101:52:49:78:92:52:49:78:92 chr13 33017043 . T C 212.44 PASS AO=76;DP=216;FAO=78;FDP=218;FR=.;FRO=140;FSAF=38;FSAR=40;FSRF=35;FSRR=105;FWDB=-0.0217683;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.098;QD=3.89798;RBI=0.0229193;REFB=-0.00543456;REVB=0.00717187;RO=115;SAF=38;SAR=38;SRF=35;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210723;STB=0.653583;TYPE=snp;VARB=0.0139495;OID=.;OPOS=33017043;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:216:218:115:140:76:78:38:38:35:80:40:38:35:105 chr13 33232435 . A G 140.77 PASS AO=47;DP=131;FAO=47;FDP=130;FR=.;FRO=83;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=44;FSRR=39;FWDB=0.000985567;FXX=0.00763301;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.083;QD=4.33122;RBI=0.0195474;REFB=-0.00461795;REVB=0.0195225;RO=80;SAF=25;SAR=22;SRF=42;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00766731;STB=0.50115;TYPE=snp;VARB=0.0071661;OID=.;OPOS=33232435;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:130:80:83:47:47:22:25:42:38:22:25:44:39 chr13 33315206 . G A 92.29 PASS AO=21;DP=46;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=6;FWDB=-0.0256774;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.965;QD=8.20372;RBI=0.0265365;REFB=0.00956459;REVB=0.00669762;RO=21;SAF=13;SAR=8;SRF=17;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189913;STB=0.576675;TYPE=snp;VARB=-0.00882624;OID=.;OPOS=33315206;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:46:45:21:24:21:21:8:13:17:4:8:13:18:6 chr13 33590851 . T C 73.84 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0327175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.772;QD=36.9197;RBI=0.0538;REFB=0;REVB=-0.0427083;RO=0;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000393883;OID=.;OPOS=33590851;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:4:4:0:0:4:4:0:0 chr13 33628138 . T G 357.4 PASS AO=96;DP=218;FAO=97;FDP=218;FR=.;FRO=121;FSAF=37;FSAR=60;FSRF=45;FSRR=76;FWDB=-0.00741795;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=143.094;QD=6.55782;RBI=0.0547343;REFB=-0.0129533;REVB=-0.0542293;RO=120;SAF=36;SAR=60;SRF=44;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00891557;STB=0.505626;TYPE=snp;VARB=0.0153421;OID=.;OPOS=33628138;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:218:218:120:121:96:97:60:36:44:76:60:37:45:76 chr13 33628193 . G C 320.72 PASS AO=95;DP=221;FAO=92;FDP=217;FR=.;FRO=125;FSAF=30;FSAR=62;FSRF=47;FSRR=78;FWDB=-0.0177007;FXX=0.0225215;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.794;QD=5.91188;RBI=0.0184069;REFB=-0.000765033;REVB=-0.00504972;RO=124;SAF=33;SAR=62;SRF=46;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.026211;STB=0.531974;TYPE=snp;VARB=0.0014682;OID=.;OPOS=33628193;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:217:124:125:95:92:62:33:46:78:62:30:47:78 chr13 33628239 . G A 344.07 PASS AO=84;DP=188;FAO=89;FDP=193;FR=.;FRO=104;FSAF=29;FSAR=60;FSRF=37;FSRR=67;FWDB=-0.0151137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.028;QD=7.1309;RBI=0.037591;REFB=-0.014711;REVB=0.0344189;RO=102;SAF=25;SAR=59;SRF=36;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0633327;STB=0.518117;TYPE=snp;VARB=0.0176343;OID=.;OPOS=33628239;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:193:102:104:84:89:59:25:36:66:60:29:37:67 chr13 33635463 . T C 2109.47 PASS AO=211;DP=212;FAO=219;FDP=219;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=167;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0443433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.224;QD=38.5291;RBI=0.0630239;REFB=0;REVB=0.0447849;RO=0;SAF=52;SAR=159;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.12253e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.04544e-07;OID=.;OPOS=33635463;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:212:219:0:0:211:219:159:52:0:0:167:52:0:0 chr13 33635835 . T C 872.48 PASS AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0190158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.859;QD=37.9339;RBI=0.0267218;REFB=0;REVB=0.0187737;RO=0;SAF=40;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.0217e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.0519e-07;OID=.;OPOS=33635835;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:92:92:0:0:92:92:52:40:0:0:52:40:0:0 chr13 33678505 . C T 163.16 PASS AO=52;DP=137;FAO=52;FDP=137;FR=.;FRO=85;FSAF=32;FSAR=20;FSRF=34;FSRR=51;FWDB=0.021678;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=178.619;QD=4.76373;RBI=0.0269947;REFB=0.00380308;REVB=0.0160865;RO=85;SAF=32;SAR=20;SRF=34;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233689;STB=0.632466;TYPE=snp;VARB=-0.00732384;OID=.;OPOS=33678505;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:85:85:52:52:20:32:34:51:20:32:34:51 chr13 34674900 . C T 466.93 PASS AO=126;DP=286;FAO=127;FDP=286;FR=.;FRO=159;FSAF=73;FSAR=54;FSRF=72;FSRR=87;FWDB=0.0020037;FXX=0.0034842;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.941;QD=6.53042;RBI=0.00775806;REFB=-0.021552;REVB=-0.00749484;RO=156;SAF=72;SAR=54;SRF=69;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128903;STB=0.567942;TYPE=snp;VARB=0.0210463;OID=.;OPOS=34674900;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:286:286:156:159:126:127:54:72:69:87:54:73:72:87 chr13 35692596 . A G 799.8 PASS AO=286;DP=593;FAO=194;FDP=397;FR=.;FRO=203;FSAF=59;FSAR=135;FSRF=77;FSRR=126;FWDB=-0.0171123;FXX=0.00749981;HRUN=3;LEN=1;MLLD=69.9845;QD=8.05843;RBI=0.0173194;REFB=-0.0125038;REVB=-0.00267028;RO=306;SAF=87;SAR=199;SRF=107;SRR=199;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0494618;STB=0.54385;TYPE=snp;VARB=0.0101475;OID=.;OPOS=35692596;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:593:397:306:203:286:194:199:87:107:199:135:59:77:126 chr13 36385031 . G T 171.12 PASS AO=78;DP=258;FAO=78;FDP=258;FR=.;FRO=180;FSAF=13;FSAR=65;FSRF=70;FSRR=110;FWDB=-0.00336847;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=222.652;QD=2.65305;RBI=0.0138357;REFB=-0.00342336;REVB=-0.0134194;RO=178;SAF=13;SAR=65;SRF=70;SRR=108;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.347954;STB=0.70333;TYPE=snp;VARB=0.00871301;OID=.;OPOS=36385031;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:258:258:178:180:78:78:65:13:70:108:65:13:70:110 chr13 36402426 . A G 1947.94 PASS AO=201;DP=215;FAO=204;FDP=204;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0606038;FXX=0.0642172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.6043;QD=38.195;RBI=0.0635893;REFB=-0.0433019;REVB=0.0192558;RO=0;SAF=95;SAR=106;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000258249;OID=.;OPOS=36402426;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:215:204:0:0:201:204:106:95:0:0:106:98:0:0 chr13 36639771 . A C 166.7 PASS AO=54;DP=142;FAO=53;FDP=139;FR=.;FRO=86;FSAF=1;FSAR=52;FSRF=31;FSRR=55;FWDB=0.0135513;FXX=0.0211253;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1712;QD=4.79715;RBI=0.0445112;REFB=-0.0114346;REVB=0.0423983;RO=82;SAF=2;SAR=52;SRF=30;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.657497;STB=0.939338;TYPE=snp;VARB=0.0414207;OID=.;OPOS=36639771;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:139:82:86:54:53:52:2:30:52:52:1:31:55 chr13 36744910 . C T 287.2 PASS AO=72;DP=154;FAO=72;FDP=154;FR=.;FRO=82;FSAF=29;FSAR=43;FSRF=25;FSRR=57;FWDB=0.00697982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.544;QD=7.45969;RBI=0.00704541;REFB=-0.00815191;REVB=-0.000959145;RO=79;SAF=29;SAR=43;SRF=24;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0996573;STB=0.555328;TYPE=snp;VARB=0.00854159;OID=.;OPOS=36744910;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:154:79:82:72:72:43:29:24:55:43:29:25:57 chr13 36801415 . C T 367.08 PASS AO=115;DP=290;FAO=115;FDP=291;FR=.;FRO=176;FSAF=75;FSAR=40;FSRF=107;FSRR=69;FWDB=0.0492702;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.318;QD=5.04572;RBI=0.0493161;REFB=-0.00516087;REVB=-0.00212738;RO=174;SAF=75;SAR=40;SRF=107;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0433491;STB=0.52895;TYPE=snp;VARB=0.00968652;OID=.;OPOS=36801415;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:290:291:174:176:115:115:40:75:107:67:40:75:107:69 chr13 36828237 . T C 283.25 PASS AO=78;DP=184;FAO=79;FDP=184;FR=.;FRO=105;FSAF=34;FSAR=45;FSRF=59;FSRR=46;FWDB=-0.00376231;FXX=0.00540511;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.9921;QD=6.15752;RBI=0.078459;REFB=0.0186542;REVB=0.0783687;RO=106;SAF=34;SAR=44;SRF=60;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133825;STB=0.574923;TYPE=snp;VARB=-0.0243503;OID=.;OPOS=36828237;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:184:106:105:78:79:44:34:60:46:45:34:59:46 chr13 36855375 . C T 201.05 PASS AO=44;DP=116;FAO=49;FDP=108;FR=.,HEALED;FRO=59;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=43;FSRR=16;FWDB=-0.0782495;FXX=0.0270246;HRUN=4;LEN=1;MLLD=35.846;QD=7.44631;RBI=0.0806109;REFB=-0.0506316;REVB=0.0193683;RO=37;SAF=19;SAR=25;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134735;STB=0.639767;TYPE=snp;VARB=0.0275568;OID=.;OPOS=36855375;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:108:37:59:44:49:25:19:22:15:26:23:43:16 chr13 36855405 . A G 156.63 PASS AO=40;DP=89;FAO=40;FDP=90;FR=.;FRO=50;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=29;FSRR=21;FWDB=0.0153072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.14;QD=6.96112;RBI=0.0154277;REFB=-0.0099348;REVB=-0.00192476;RO=49;SAF=14;SAR=26;SRF=29;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.239658;STB=0.629439;TYPE=snp;VARB=0.0165056;OID=.;OPOS=36855405;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:90:49:50:40:40:26:14:29:20:26:14:29:21 chr13 36857639 . T C 369.64 PASS AO=89;DP=183;FAO=89;FDP=183;FR=.;FRO=94;FSAF=47;FSAR=42;FSRF=51;FSRR=43;FWDB=-0.00441729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.1884;QD=8.0796;RBI=0.00635642;REFB=-0.00584938;REVB=-0.00457073;RO=92;SAF=47;SAR=42;SRF=49;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0041843;STB=0.507457;TYPE=snp;VARB=0.00471186;OID=.;OPOS=36857639;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:183:92:94:89:89:42:47:49:43:42:47:51:43 chr13 36877978 . T C 224.15 PASS AO=53;DP=109;FAO=53;FDP=110;FR=.;FRO=57;FSAF=17;FSAR=36;FSRF=21;FSRR=36;FWDB=0.0030614;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=188.65;QD=8.15106;RBI=0.00398668;REFB=-0.00287907;REVB=0.00255372;RO=56;SAF=17;SAR=36;SRF=21;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0562836;STB=0.527767;TYPE=snp;VARB=0.00245763;OID=.;OPOS=36877978;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:110:56:57:53:53:36:17:21:35:36:17:21:36 chr13 36886469 . T C 365.78 PASS AO=92;DP=196;FAO=92;FDP=196;FR=.;FRO=104;FSAF=48;FSAR=44;FSRF=54;FSRR=50;FWDB=0.0243414;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.79;QD=7.46498;RBI=0.0338174;REFB=-0.0183589;REVB=0.0234758;RO=104;SAF=48;SAR=44;SRF=54;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00241163;STB=0.501333;TYPE=snp;VARB=0.0253328;OID=.;OPOS=36886469;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:196:104:104:92:92:44:48:54:50:44:48:54:50 chr13 36939688 . C T 445.22 PASS AO=129;DP=305;FAO=129;FDP=306;FR=.;FRO=177;FSAF=73;FSAR=56;FSRF=78;FSRR=99;FWDB=-0.0168359;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.2503;QD=5.81981;RBI=0.0367368;REFB=-0.00666584;REVB=-0.0326519;RO=176;SAF=73;SAR=56;SRF=77;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132778;STB=0.572292;TYPE=snp;VARB=0.00638738;OID=.;OPOS=36939688;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:305:306:176:177:129:129:56:73:77:99:56:73:78:99 chr13 36939758 . A G 412.23 PASS AO=144;DP=394;FAO=144;FDP=393;FR=.;FRO=249;FSAF=71;FSAR=73;FSRF=106;FSRR=143;FWDB=0.00967997;FXX=0.0100753;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.675;QD=4.19572;RBI=0.0267131;REFB=-0.0036272;REVB=-0.0248975;RO=248;SAF=71;SAR=73;SRF=105;SRR=143;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0782401;STB=0.542727;TYPE=snp;VARB=0.006971;OID=.;OPOS=36939758;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:394:393:248:249:144:144:73:71:105:143:73:71:106:143 chr13 37269675 . C A 251.2 PASS AO=76;DP=200;FAO=76;FDP=191;FR=.;FRO=115;FSAF=35;FSAR=41;FSRF=45;FSRR=70;FWDB=0.021554;FXX=0.0682894;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.3192;QD=5.26064;RBI=0.0252223;REFB=-0.0133817;REVB=0.0130992;RO=98;SAF=35;SAR=41;SRF=43;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0221641;STB=0.542208;TYPE=snp;VARB=0.0140408;OID=.;OPOS=37269675;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:200:191:98:115:76:76:41:35:43:55:41:35:45:70 chr13 37269835 . G A 1710.93 PASS AO=181;DP=182;FAO=181;FDP=181;FR=.;FRO=0;FSAF=114;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0238412;FXX=0.0054942;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.484;QD=37.8105;RBI=0.0489089;REFB=-0.0819679;REVB=0.0427046;RO=1;SAF=114;SAR=67;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00415815;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000348826;OID=.;OPOS=37269835;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:182:181:1:0:181:181:67:114:1:0:67:114:0:0 chr13 37271163 . C A 503.4 PASS AO=111;DP=211;FAO=111;FDP=211;FR=.;FRO=100;FSAF=67;FSAR=44;FSRF=55;FSRR=45;FWDB=-0.0140824;FXX=0.00471676;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.255;QD=9.54302;RBI=0.0234754;REFB=-0.0221222;REVB=-0.0187824;RO=97;SAF=67;SAR=44;SRF=52;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0593699;STB=0.526251;TYPE=snp;VARB=0.0230359;OID=.;OPOS=37271163;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:211:97:100:111:111:44:67:52:45:44:67:55:45 chr13 37271428 . GCA G 420.68 PASS AO=33;DP=98;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0463547;FXX=0.281206;HRUN=1;LEN=2;MLLD=107.557;QD=36.5804;RBI=0.0593204;REFB=0;REVB=0.0370155;RO=0;SAF=8;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00223711;OID=.;OPOS=37271429;OREF=CA;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:33:40:46:46:0:11:35:0:0:20:0:8:25:0:0 chr13 37372429 . T C 363.51 PASS AO=36;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0371906;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0919;QD=38.2644;RBI=0.0980407;REFB=0;REVB=0.090713;RO=1;SAF=21;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.021769;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00112821;OID=.;OPOS=37372429;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:37:38:1:0:36:38:15:21:1:0:16:22:0:0 chr13 37580139 . G A 326.65 PASS AO=80;DP=173;FAO=82;FDP=175;FR=.;FRO=93;FSAF=34;FSAR=48;FSRF=38;FSRR=55;FWDB=-0.0224859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.555;QD=7.46627;RBI=0.0262292;REFB=-0.0205578;REVB=0.0135039;RO=90;SAF=33;SAR=47;SRF=37;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00137106;STB=0.503305;TYPE=snp;VARB=0.0252904;OID=.;OPOS=37580139;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:175:90:93:80:82:47:33:37:53:48:34:38:55 chr13 37583831 . G A 207.32 PASS AO=45;DP=86;FAO=45;FDP=86;FR=.;FRO=41;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=0.0378071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.7216;QD=9.64296;RBI=0.0385909;REFB=-0.0339654;REVB=-0.00773785;RO=36;SAF=26;SAR=19;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.018344;STB=0.515693;TYPE=snp;VARB=0.0342441;OID=.;OPOS=37583831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:36:41:45:45:19:26:20:16:19:26:25:16 chr13 37625601 . T C 604.54 PASS AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0322157;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=96.08;QD=37.7839;RBI=0.03527;REFB=0;REVB=0.0143569;RO=0;SAF=46;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.12145e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.82364e-05;OID=.;OPOS=37625601;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:64:64:0:0:64:64:18:46:0:0:18:46:0:0 chr13 37679268 . G T 145.17 PASS AO=39;DP=94;FAO=40;FDP=95;FR=.;FRO=55;FSAF=31;FSAR=9;FSRF=46;FSRR=9;FWDB=0.0356064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.6573;QD=6.11233;RBI=0.0444903;REFB=-0.0257217;REVB=0.0266752;RO=54;SAF=30;SAR=9;SRF=45;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0991727;STB=0.553932;TYPE=snp;VARB=0.0325504;OID=.;OPOS=37679268;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:95:54:55:39:40:9:30:45:9:9:31:46:9 chr13 37679535 . G C 188.5 PASS AO=33;DP=52;FAO=33;FDP=52;FR=.;FRO=19;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.00819583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.747;QD=14.4997;RBI=0.00861359;REFB=-0.0305173;REVB=-0.00264998;RO=19;SAF=14;SAR=19;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103733;STB=0.556823;TYPE=snp;VARB=0.0115248;OID=.;OPOS=37679535;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:52:52:19:19:33:33:19:14:11:8:19:14:11:8 chr13 37679729 . C T 14.36 PASS AO=3;DP=10;FAO=3;FDP=10;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.0278612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.3011;QD=5.74347;RBI=0.0327765;REFB=-0.0200274;REVB=-0.0172642;RO=7;SAF=1;SAR=2;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.056032;STB=0.538213;TYPE=snp;VARB=0.0823013;OID=.;OPOS=37679729;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:10:10:7:7:3:3:2:1:2:5:2:1:2:5 chr13 38138689 . C T 469.39 PASS AO=119;DP=255;FAO=119;FDP=254;FR=.;FRO=135;FSAF=65;FSAR=54;FSRF=71;FSRR=64;FWDB=-0.0174236;FXX=0.0116727;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.153;QD=7.39202;RBI=0.0194325;REFB=0.000712723;REVB=0.00860451;RO=134;SAF=65;SAR=54;SRF=70;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0230142;STB=0.510855;TYPE=snp;VARB=-0.00086743;OID=.;OPOS=38138689;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:255:254:134:135:119:119:54:65:70:64:54:65:71:64 chr13 38237564 . A G 170.58 PASS AO=43;DP=97;FAO=44;FDP=97;FR=.;FRO=53;FSAF=34;FSAR=10;FSRF=31;FSRR=22;FWDB=-0.0262496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.697;QD=7.03434;RBI=0.0320783;REFB=-0.00779742;REVB=0.0184384;RO=52;SAF=33;SAR=10;SRF=30;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223776;STB=0.625945;TYPE=snp;VARB=0.0134466;OID=.;OPOS=38237564;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:52:53:43:44:10:33:30:22:10:34:31:22 chr13 38357384 . G A 382.83 PASS AO=97;DP=215;FAO=99;FDP=215;FR=.;FRO=116;FSAF=42;FSAR=57;FSRF=55;FSRR=61;FWDB=0.00416299;FXX=0.00921617;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.459;QD=7.12245;RBI=0.00780498;REFB=-0.00747474;REVB=-0.00660206;RO=117;SAF=42;SAR=55;SRF=55;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0370349;STB=0.527319;TYPE=snp;VARB=0.00822886;OID=.;OPOS=38357384;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:215:117:116:97:99:55:42:55:62:57:42:55:61 chr13 38357471 . G A 376.15 PASS AO=79;DP=146;FAO=79;FDP=145;FR=.;FRO=66;FSAF=21;FSAR=58;FSRF=31;FSRR=35;FWDB=-0.0561193;FXX=0.0136045;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.922;QD=10.3765;RBI=0.0609592;REFB=-0.0245541;REVB=0.0238044;RO=64;SAF=21;SAR=58;SRF=30;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191058;STB=0.606934;TYPE=snp;VARB=0.0148376;OID=.;OPOS=38357471;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:145:64:66:79:79:58:21:30:34:58:21:31:35 chr13 38429073 . G A 121.46 PASS AO=30;DP=66;FAO=30;FDP=66;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.0280078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.321;QD=7.36124;RBI=0.0282556;REFB=-0.00386472;REVB=0.00373431;RO=35;SAF=13;SAR=17;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0506246;STB=0.521458;TYPE=snp;VARB=0.00443569;OID=.;OPOS=38429073;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:35:36:30:30:17:13:17:18:17:13:17:19 chr13 38924083 . A T 2227.59 PASS AO=179;DP=244;FAO=234;FDP=234;FR=.;FRO=0;FSAF=116;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0335476;FXX=0.0330565;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.5051;QD=38.0784;RBI=0.0345198;REFB=0;REVB=-0.00813511;RO=0;SAF=107;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.48708e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000889;OID=.;OPOS=38924083;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:185:234:0:0:179:234:72:107:0:0:118:116:0:0 chr13 38924263 . T C 1233.73 PASS AO=130;DP=136;FAO=135;FDP=138;FR=.;FRO=3;FSAF=64;FSAR=71;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0246097;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.7978;QD=35.7604;RBI=0.0260803;REFB=-0.133235;REVB=0.0086341;RO=5;SAF=61;SAR=69;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00922403;STB=0.504196;TYPE=snp;VARB=0.00308169;OID=.;OPOS=38924263;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:136:138:5:3:130:135:69:61:3:2:71:64:2:1 chr13 38932208 . A T 158.02 PASS AO=70;DP=273;FAO=93;FDP=297;FR=.;FRO=204;FSAF=60;FSAR=33;FSRF=115;FSRR=89;FWDB=0.0254972;FXX=0.0388337;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.944;QD=2.1282;RBI=0.0277975;REFB=-0.0117734;REVB=-0.0110721;RO=165;SAF=46;SAR=24;SRF=99;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0741786;STB=0.558979;TYPE=snp;VARB=0.0215118;OID=.;OPOS=38932208;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:273:297:165:204:70:93:24:46:99:66:33:60:115:89 chr13 39262057 . G A 392.39 PASS AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00176998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.228;QD=37.3707;RBI=0.0366697;REFB=0;REVB=0.036627;RO=0;SAF=26;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00021608;OID=.;OPOS=39262057;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:42:42:0:0:42:42:16:26:0:0:16:26:0:0 chr13 39263713 . GT G,GC 845.56 PASS AO=42,42;DP=91;FAO=89,0;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=44,0;FSAR=45,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0223134,0.0215591;FXX=0.0111099;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=49.7013,44.5017;QD=38.0028;RBI=0.0277529,0.300106;REFB=0,0;REVB=-0.0165026,-0.29933;RO=0;SAF=39,2;SAR=3,40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.96959e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.0125253,0.0121499;OID=.,.;OPOS=39263714,39263714;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=G,GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:42,42:88:89,0:89:0:44,0:45,0:0:0:39:0:39,2:3,40:0:0 chr13 39264690 . T C 181.98 PASS AO=43;DP=91;FAO=43;FDP=90;FR=.;FRO=47;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=25;FWDB=-0.0221288;FXX=0.0109878;HRUN=3;LEN=1;MLLD=187.347;QD=8.088;RBI=0.022291;REFB=-0.0113813;REVB=0.00268361;RO=46;SAF=24;SAR=19;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0744644;STB=0.547128;TYPE=snp;VARB=0.0169556;OID=.;OPOS=39264690;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:90:46:47:43:43:19:24:22:24:19:24:22:25 chr13 39343822 . C T 242.88 PASS AO=44;DP=71;FAO=44;FDP=71;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=36;FSRF=2;FSRR=25;FWDB=0.00761905;FXX=0.0273935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.9021;QD=13.6831;RBI=0.057804;REFB=-0.011997;REVB=0.0572996;RO=26;SAF=8;SAR=36;SRF=2;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132107;STB=0.575441;TYPE=snp;VARB=0.00633465;OID=.;OPOS=39343822;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:71:71:26:27:44:44:36:8:2:24:36:8:2:25 chr13 39430314 . C T 241.92 PASS AO=84;DP=230;FAO=84;FDP=231;FR=.;FRO=147;FSAF=33;FSAR=51;FSRF=55;FSRR=92;FWDB=0.0103761;FXX=0.0211855;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.606;QD=4.18912;RBI=0.023789;REFB=-0.0104159;REVB=-0.0214068;RO=140;SAF=33;SAR=51;SRF=55;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512542;TYPE=snp;VARB=0.0185038;OID=.;OPOS=39430314;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:230:231:140:147:84:84:51:33:55:85:51:33:55:92 chr13 39433606 . A G 213.12 PASS AO=68;DP=177;FAO=68;FDP=177;FR=.;FRO=109;FSAF=27;FSAR=41;FSRF=41;FSRR=68;FWDB=-0.000543785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.885;QD=4.81634;RBI=0.0158649;REFB=-0.00655826;REVB=-0.0158556;RO=107;SAF=27;SAR=41;SRF=41;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0157653;STB=0.513519;TYPE=snp;VARB=0.00984398;OID=.;OPOS=39433606;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:177:107:109:68:68:41:27:41:66:41:27:41:68 chr13 39540589 . TC T 205.03 PASS AO=58;DP=145;FAO=58;FDP=139;FR=.;FRO=81;FSAF=17;FSAR=41;FSRF=30;FSRR=51;FWDB=0.0102805;FXX=0.0211253;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.855;QD=5.90006;RBI=0.015427;REFB=-0.0108682;REVB=-0.0115023;RO=84;SAF=17;SAR=41;SRF=31;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0918561;STB=0.551972;TYPE=del;VARB=0.016068;OID=.;OPOS=39540590;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:58:143:58:139:81:17:41:30:51:99:84:17:41:31:53 chr13 39586343 . G C 381.37 PASS AO=97;DP=214;FAO=99;FDP=216;FR=.;FRO=117;FSAF=23;FSAR=76;FSRF=55;FSRR=62;FWDB=-0.00823068;FXX=0.00460808;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.647;QD=7.06244;RBI=0.016105;REFB=0.000922539;REVB=0.013843;RO=116;SAF=23;SAR=74;SRF=54;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260687;STB=0.651252;TYPE=snp;VARB=-0.00116721;OID=.;OPOS=39586343;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:216:116:117:97:99:74:23:54:62:76:23:55:62 chr13 39587677 . A G 39.28 PASS AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=0.0606313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.2108;QD=7.14243;RBI=0.0606908;REFB=-0.00137876;REVB=-0.00268797;RO=13;SAF=4;SAR=5;SRF=2;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.310814;STB=0.680515;TYPE=snp;VARB=0.00322396;OID=.;OPOS=39587677;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:22:22:13:13:9:9:5:4:2:11:5:4:2:11 chr13 39587865 . A C 168.59 PASS AO=43;DP=97;FAO=44;FDP=99;FR=.;FRO=55;FSAF=32;FSAR=12;FSRF=31;FSRR=24;FWDB=-0.0047174;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.468;QD=6.81177;RBI=0.0140048;REFB=-0.0143665;REVB=-0.0131863;RO=54;SAF=32;SAR=11;SRF=31;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196365;STB=0.603724;TYPE=snp;VARB=0.0194281;OID=.;OPOS=39587865;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:99:54:55:43:44:11:32:31:23:12:32:31:24 chr13 39587889 . T C 222.63 PASS AO=60;DP=137;FAO=61;FDP=139;FR=.;FRO=78;FSAF=41;FSAR=20;FSRF=46;FSRR=32;FWDB=-0.00128622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.1396;QD=6.40665;RBI=0.0259613;REFB=-0.0163941;REVB=-0.0259294;RO=77;SAF=41;SAR=19;SRF=46;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0956569;STB=0.550603;TYPE=snp;VARB=0.0223328;OID=.;OPOS=39587889;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:139:77:78:60:61:19:41:46:31:20:41:46:32 chr13 40229842 . A AG,G 68.22 PASS AO=8,3;DP=17;FAO=18,0;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=12,0;FSAR=6,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.112348,0.0206652;FXX=0;HRUN=5,1;LEN=1,1;MLLD=8.04637,35.8661;QD=15.1604;RBI=0.135288,0.0902087;REFB=-0.0321961,-0.0242118;REVB=-0.0753701,-0.0878097;RO=5;SAF=7,1;SAR=1,2;SRF=3;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.2967,-0.247694;STB=0.5,0.5;TYPE=ins,snp;VARB=-0.0279837,0;OID=.,.;OPOS=40229843,40229842;OREF=-,A;OALT=G,G;OMAPALT=AG,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:17:18:5:0:8,3:18,0:1,2:7,1:3:2:6,0:12,0:0:0 chr13 40229891 . G A 271.31 PASS AO=30;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=7.33884e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.4042;QD=33.9131;RBI=0.25407;REFB=-0.0458195;REVB=0.25407;RO=2;SAF=24;SAR=6;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13229;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0169555;OID=.;OPOS=40229891;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:32:32:2:0:30:32:6:24:0:2:8:24:0:0 chr13 40229957 . T A 368.36 PASS AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0335411;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.475;QD=38.775;RBI=0.0383664;REFB=0;REVB=0.0186272;RO=0;SAF=25;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00057105;OID=.;OPOS=40229957;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:39:38:0:0:38:38:13:25:0:0:13:25:0:0 chr13 40230229 . C T 894.96 PASS AO=100;DP=109;FAO=100;FDP=104;FR=.;FRO=4;FSAF=67;FSAR=33;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.00204268;FXX=0.0458673;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0188;QD=34.4216;RBI=0.0910908;REFB=0.0386824;REVB=0.0910679;RO=7;SAF=65;SAR=35;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0284527;STB=0.51449;TYPE=snp;VARB=-0.0215928;OID=.;OPOS=40230229;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:109:104:7:4:100:100:35:65:6:1:33:67:4:0 chr13 40230294 . T C 2469.51 PASS AO=260;DP=262;FAO=260;FDP=260;FR=.;FRO=0;FSAF=114;FSAR=146;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000380131;FXX=0.0076333;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.56;QD=37.9924;RBI=0.0494814;REFB=-0.0318285;REVB=0.0494799;RO=1;SAF=114;SAR=146;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00325431;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.97757e-05;OID=.;OPOS=40230294;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:262:260:1:0:260:260:146:114:0:1:146:114:0:0 chr13 40238175 . C T 1169.49 PASS AO=122;DP=123;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00174615;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.644;QD=38.0323;RBI=0.0077762;REFB=0;REVB=-0.00757762;RO=0;SAF=47;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.98065e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.28551e-06;OID=.;OPOS=40238175;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:123:123:0:0:122:123:75:47:0:0:76:47:0:0 chr13 40298636 . TTTA T,TTT,TTTT 93.91 PASS AO=4,6,8;DP=23;FAO=0,18,0;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=0,13,0;FSAR=0,5,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162899,0.0362781,0.0128718;FXX=0.142789;HRUN=18,3,3;LEN=3,1,1;MLLD=6.17396,6.82761,4.99943;QD=20.8684;RBI=0.0332018,0.0362803,0.0359301;REFB=0,0,0;REVB=-0.0289309,-0.000400002,0.0335453;RO=0;SAF=3,5,4;SAR=1,1,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=4.86674e-08,-3.18042e-08,0;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=del,del,snp;VARB=0.159652,0.00869133,0;OID=.,.,.;OPOS=40298637,40298639,40298639;OREF=TTA,A,A;OALT=-,-,T;OMAPALT=T,TTT,TTTT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:4,6,8:23:0,18,0:18:0:0,13,0:0,5,0:0:0:5:0:3,5,4:1,1,4:0:0 chr13 41134329 . AG A 1062.86 PASS AO=129;DP=160;FAO=172;FDP=172;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.208315;FXX=0.00578001;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.7848;QD=24.7176;RBI=0.223428;REFB=0;REVB=-0.0807774;RO=13;SAF=79;SAR=50;SRF=11;SRR=2;SSEN=0.55;SSEP=0;SSSB=-0.0431374;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00416269;OID=.;OPOS=41134330;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:129:154:172:172:0:95:77:0:0:95:13:79:50:11:2 chr13 41382711 . A T 1016.56 PASS AO=103;DP=103;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159227;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.519;QD=38.0023;RBI=0.0210856;REFB=0;REVB=-0.0138228;RO=0;SAF=41;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.03582e-06;OID=.;OPOS=41382711;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:103:107:0:0:103:107:62:41:0:0:64:43:0:0 chr13 41515286 . T A 749.55 PASS AO=248;DP=509;FAO=189;FDP=399;FR=.;FRO=210;FSAF=104;FSAR=85;FSRF=128;FSRR=82;FWDB=-0.0080476;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.428;QD=7.51425;RBI=0.0082177;REFB=-0.00766277;REVB=0.00166333;RO=260;SAF=141;SAR=107;SRF=159;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0411869;STB=0.531705;TYPE=snp;VARB=0.00528149;OID=.;OPOS=41515286;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:509:399:260:210:248:189:107:141:159:101:85:104:128:82 chr13 41517985 . A G 362.07 PASS AO=115;DP=297;FAO=115;FDP=294;FR=.;FRO=179;FSAF=58;FSAR=57;FSRF=106;FSRR=73;FWDB=0.00892904;FXX=0.0101007;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.951;QD=4.92613;RBI=0.00962218;REFB=-0.00658871;REVB=-0.00358588;RO=179;SAF=58;SAR=57;SRF=106;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0954326;STB=0.55352;TYPE=snp;VARB=0.00951811;OID=.;OPOS=41517985;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:297:294:179:179:115:115:57:58:106:73:57:58:106:73 chr13 41533052 . T C 204.85 PASS AO=57;DP=135;FAO=57;FDP=135;FR=.;FRO=78;FSAF=23;FSAR=34;FSRF=16;FSRR=62;FWDB=0.0403995;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.418;QD=6.06975;RBI=0.0419458;REFB=-0.00715507;REVB=-0.011284;RO=78;SAF=23;SAR=34;SRF=16;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225023;STB=0.624749;TYPE=snp;VARB=0.0111629;OID=.;OPOS=41533052;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:78:78:57:57:34:23:16:62:34:23:16:62 chr13 41705495 . A G 1166.26 PASS AO=123;DP=124;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272437;FXX=0.00799936;HRUN=3;LEN=1;MLLD=227.63;QD=37.6211;RBI=0.0484284;REFB=-0.0621732;REVB=0.0400387;RO=1;SAF=76;SAR=47;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00621073;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00036287;OID=.;OPOS=41705495;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:124:124:1:0:123:124:47:76:1:0:48:76:0:0 chr13 41706800 . A G 389.13 PASS AO=43;DP=45;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00671025;FXX=0.0222173;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.676;QD=35.3756;RBI=0.0152564;REFB=-0.0648862;REVB=0.0137015;RO=0;SAF=22;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511106;TYPE=snp;VARB=0.000155178;OID=.;OPOS=41706800;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:45:44:0:1:43:43:21:22:0:0:21:22:1:0 chr13 41767338 . A G 820.13 PASS AO=85;DP=85;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.404;QD=38.1455;RBI=0.0127415;REFB=0;REVB=0.00671529;RO=0;SAF=36;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.92457e-05;OID=.;OPOS=41767338;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:85:86:0:0:85:86:49:36:0:0:50:36:0:0 chr13 41767341 . A G 819.29 PASS AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0428795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.27;QD=38.1065;RBI=0.0429819;REFB=0;REVB=0.00296427;RO=0;SAF=36;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.96996e-05;OID=.;OPOS=41767341;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:86:86:0:0:86:86:50:36:0:0:50:36:0:0 chr13 41768690 . G C 73.84 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0187701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.741;QD=36.9199;RBI=0.035732;REFB=0;REVB=0.0304049;RO=0;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.78849e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000138882;OID=.;OPOS=41768690;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:7:1:0:0:7:1:0:0 chr13 41834744 . C T 237.98 PASS AO=87;DP=242;FAO=86;FDP=243;FR=.;FRO=157;FSAF=36;FSAR=50;FSRF=72;FSRR=85;FWDB=0.0289613;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.5384;QD=3.91732;RBI=0.0309568;REFB=0.00893617;REVB=0.0109347;RO=154;SAF=36;SAR=51;SRF=70;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0468095;STB=0.52631;TYPE=snp;VARB=-0.0224565;OID=.;OPOS=41834744;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:242:243:154:157:87:86:51:36:70:84:50:36:72:85 chr13 41835039 . T C 106.56 PASS AO=16;DP=22;FAO=16;FDP=22;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.0432362;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.134;QD=19.3747;RBI=0.0475861;REFB=-0.031659;REVB=0.0198764;RO=6;SAF=4;SAR=12;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18245;STB=0.59989;TYPE=snp;VARB=0.028557;OID=.;OPOS=41835039;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:22:22:6:6:16:16:12:4:0:6:12:4:0:6 chr13 41902939 . T C 1179.84 PASS AO=128;DP=131;FAO=129;FDP=132;FR=.;FRO=3;FSAF=83;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0244162;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.3487;QD=35.7528;RBI=0.0256151;REFB=-0.0536995;REVB=-0.00774494;RO=3;SAF=82;SAR=46;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0144506;STB=0.507644;TYPE=snp;VARB=7.72901e-05;OID=.;OPOS=41902939;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:131:132:3:3:128:129:46:82:1:2:46:83:1:2 chr13 42381889 . T C 70.27 PASS AO=27;DP=85;FAO=27;FDP=86;FR=.;FRO=59;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=33;FSRR=26;FWDB=-0.00735746;FXX=0.0114929;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.458;QD=3.26852;RBI=0.0524421;REFB=-0.0050639;REVB=0.0519234;RO=57;SAF=15;SAR=12;SRF=32;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00686719;STB=0.502616;TYPE=snp;VARB=0.0118484;OID=.;OPOS=42381889;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:85:86:57:59:27:27:12:15:32:25:12:15:33:26 chr13 42438738 . C T 16.26 PASS AO=4;DP=14;FAO=4;FDP=14;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=0;FSRF=10;FSRR=0;FWDB=0.00138479;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.361;QD=4.64556;RBI=0.00138479;REFB=-0.00890991;REVB=0;RO=10;SAF=4;SAR=0;SRF=10;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0179662;OID=.;OPOS=42438738;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:14:14:10:10:4:4:0:4:10:0:0:4:10:0 chr13 42457549 . TC T 47.13 PASS AO=38;DP=99;FAO=36;FDP=97;FR=.;FRO=61;FSAF=10;FSAR=26;FSRF=32;FSRR=29;FWDB=-0.118921;FXX=0.0396;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.2865;QD=1.94354;RBI=0.184376;REFB=-0.0621412;REVB=-0.140899;RO=55;SAF=13;SAR=25;SRF=29;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0.610084;SSSB=-0.198965;STB=0.664947;TYPE=del;VARB=0.0284466;OID=.;OPOS=42457550;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:38:99:36:97:61:10:26:32:29:47:55:13:25:29:26 chr13 42703682 . T C 302.01 PASS AO=72;DP=149;FAO=72;FDP=148;FR=.;FRO=76;FSAF=20;FSAR=52;FSRF=32;FSRR=44;FWDB=0.0371844;FXX=0.00671096;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.6403;QD=8.16237;RBI=0.038307;REFB=0.00445598;REVB=0.00920611;RO=73;SAF=20;SAR=52;SRF=31;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15373;STB=0.58475;TYPE=snp;VARB=-0.00437004;OID=.;OPOS=42703682;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:148:73:76:72:72:52:20:31:42:52:20:32:44 chr13 42764564 . C G 192.65 PASS AO=35;DP=61;FAO=36;FDP=60;FR=.;FRO=24;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.0120901;FXX=0.0163908;HRUN=4;LEN=1;MLLD=83.977;QD=12.8436;RBI=0.0621425;REFB=-0.0557266;REVB=0.0609551;RO=21;SAF=17;SAR=18;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0260784;STB=0.527762;TYPE=snp;VARB=0.0486522;OID=.;OPOS=42764564;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:61:60:21:24:35:36:18:17:11:10:19:17:13:11 chr13 42872719 . A G 119.22 PASS AO=36;DP=92;FAO=36;FDP=93;FR=.;FRO=57;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=41;FSRR=16;FWDB=0.00399792;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.181;QD=5.12756;RBI=0.00400441;REFB=-0.00288284;REVB=-0.0002278;RO=56;SAF=20;SAR=16;SRF=40;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176955;STB=0.603906;TYPE=snp;VARB=0.00440584;OID=.;OPOS=42872719;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:93:56:57:36:36:16:20:40:16:16:20:41:16 chr13 42872779 . C T 287.2 PASS AO=72;DP=154;FAO=72;FDP=154;FR=.;FRO=82;FSAF=34;FSAR=38;FSRF=50;FSRR=32;FWDB=-0.00828736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.625;QD=7.45984;RBI=0.0145588;REFB=-0.000133337;REVB=0.0119699;RO=79;SAF=34;SAR=38;SRF=48;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127535;STB=0.572844;TYPE=snp;VARB=0.000145359;OID=.;OPOS=42872779;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:154:79:82:72:72:38:34:48:31:38:34:50:32 chr13 42873782 . G A 314.51 PASS AO=76;DP=157;FAO=76;FDP=158;FR=.;FRO=82;FSAF=40;FSAR=36;FSRF=35;FSRR=47;FWDB=-0.0153628;FXX=0.00628891;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.2661;QD=7.96237;RBI=0.0185326;REFB=-0.0195061;REVB=-0.0103654;RO=80;SAF=40;SAR=36;SRF=33;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105451;STB=0.551482;TYPE=snp;VARB=0.0130484;OID=.;OPOS=42873782;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:158:80:82:76:76:36:40:33:47:36:40:35:47 chr13 42877265 . G C 202.64 PASS AO=46;DP=92;FAO=46;FDP=92;FR=.;FRO=46;FSAF=38;FSAR=8;FSRF=36;FSRR=10;FWDB=-0.00494523;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.991;QD=8.81034;RBI=0.0714892;REFB=-0.0204304;REVB=-0.071318;RO=46;SAF=38;SAR=8;SRF=36;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0647632;STB=0.536034;TYPE=snp;VARB=0.0173913;OID=.;OPOS=42877265;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:46:46:46:46:8:38:36:10:8:38:36:10 chr13 42882620 . C T 48.53 PASS AO=22;DP=81;FAO=22;FDP=80;FR=.;FRO=58;FSAF=17;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=45;FWDB=-0.0263454;FXX=0.0123442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.536;QD=2.42633;RBI=0.0287814;REFB=-0.00372133;REVB=0.0115883;RO=57;SAF=17;SAR=5;SRF=13;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.595621;STB=0.849737;TYPE=snp;VARB=0.0175643;OID=.;OPOS=42882620;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:81:80:57:58:22:22:5:17:13:44:5:17:13:45 chr13 43148658 . G A 10.38 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.090614;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.8588;QD=5.93125;RBI=0.090614;REFB=0.0122023;REVB=0;RO=5;SAF=2;SAR=0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000223356;OID=.;OPOS=43148658;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:5:5:2:2:0:2:5:0:0:2:5:0 chr13 43469157 . G A 393.52 PASS AO=87;DP=166;FAO=87;FDP=166;FR=.;FRO=79;FSAF=65;FSAR=22;FSRF=45;FSRR=34;FWDB=0.00475159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.415;QD=9.48247;RBI=0.0328563;REFB=-0.017124;REVB=-0.0325109;RO=79;SAF=65;SAR=22;SRF=45;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182616;STB=0.600635;TYPE=snp;VARB=0.0105233;OID=.;OPOS=43469157;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:166:79:79:87:87:22:65:45:34:22:65:45:34 chr13 43469211 . G A 388.16 PASS AO=88;DP=172;FAO=88;FDP=172;FR=.;FRO=84;FSAF=61;FSAR=27;FSRF=51;FSRR=33;FWDB=-0.00946679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.11;QD=9.02688;RBI=0.010758;REFB=-0.0115536;REVB=-0.0051103;RO=82;SAF=61;SAR=27;SRF=49;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0946049;STB=0.547565;TYPE=snp;VARB=0.0123504;OID=.;OPOS=43469211;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:172:82:84:88:88:27:61:49:33:27:61:51:33 chr13 43597865 . A G 69.5 PASS AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=-0.0476204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.635;QD=10.297;RBI=0.0477001;REFB=-0.00980593;REVB=-0.00275616;RO=12;SAF=1;SAR=13;SRF=1;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0349549;STB=0.618845;TYPE=snp;VARB=0.0103276;OID=.;OPOS=43597865;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:27:27:12:13:14:14:13:1:1:11:13:1:2:11 chr13 43639845 . A C 101.89 PASS AO=26;DP=69;FAO=30;FDP=75;FR=.;FRO=45;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=27;FWDB=-0.00571608;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.397;QD=5.43426;RBI=0.0218815;REFB=-0.0129585;REVB=0.0211217;RO=43;SAF=12;SAR=14;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0469818;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0214468;OID=.;OPOS=43639845;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:75:43:45:26:30:14:12:18:25:18:12:18:27 chr13 43788158 . G A 1229.72 PASS AO=125;DP=127;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0264474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.741;QD=38.4289;RBI=0.0298172;REFB=0;REVB=-0.0137696;RO=0;SAF=54;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.48324e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.68473e-05;OID=.;OPOS=43788158;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:127:128:0:0:125:128:71:54:0:0:71:57:0:0 chr13 43895193 . C T 437.12 PASS AO=72;DP=110;FAO=75;FDP=113;FR=.;FRO=38;FSAF=49;FSAR=26;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=0.0175016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.152;QD=15.4734;RBI=0.0278664;REFB=-0.0217231;REVB=-0.0216847;RO=38;SAF=47;SAR=25;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171337;STB=0.590627;TYPE=snp;VARB=0.00673274;OID=.;OPOS=43895193;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:113:38:38:72:75:25:47:15:23:26:49:15:23 chr13 44455493 . T A 94.6 PASS AO=25;DP=60;FAO=25;FDP=60;FR=.;FRO=35;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=24;FWDB=0.0166546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.178;QD=6.30641;RBI=0.0302692;REFB=-0.0327241;REVB=0.0252755;RO=35;SAF=18;SAR=7;SRF=11;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.409569;STB=0.733062;TYPE=snp;VARB=0.0422335;OID=.;OPOS=44455493;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:60:60:35:35:25:25:7:18:11:24:7:18:11:24 chr13 45563464 . G C 1045.9 PASS AO=103;DP=104;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017681;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.913;QD=37.6902;RBI=0.0470326;REFB=0;REVB=0.0435826;RO=0;SAF=59;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.03381e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000112048;OID=.;OPOS=45563464;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:104:111:0:0:103:111:44:59:0:0:51:60:0:0 chr13 45910491 . GA G 291.83 PASS AO=51;DP=92;FAO=55;FDP=89;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=44;FSRF=5;FSRR=29;FWDB=0.0611015;FXX=0.0219756;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.7808;QD=13.1161;RBI=0.0709871;REFB=-0.0383805;REVB=-0.0361354;RO=34;SAF=9;SAR=42;SRF=6;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.532835;TYPE=del;VARB=0.017397;OID=.;OPOS=45910492;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:51:91:55:89:34:11:44:5:29:99:34:9:42:6:28 chr13 45914702 . GT G 23.23 PASS AO=15;DP=56;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.145211;FXX=0.119019;HRUN=4;LEN=1;MLLD=11.8239;QD=2.51131;RBI=0.146141;REFB=-0.108571;REVB=-0.016457;RO=19;SAF=7;SAR=8;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0964265;STB=0.594481;TYPE=del;VARB=0.131612;OID=.;OPOS=45914703;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:15:40:16:37:21:8:8:7:14:23:19:7:8:7:12 chr13 46039290 . C G 63.13 PASS AO=10;DP=18;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=0.0111096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.5919;QD=13.2916;RBI=0.15959;REFB=-0.0231038;REVB=0.159202;RO=8;SAF=7;SAR=3;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175521;STB=0.584277;TYPE=snp;VARB=0.0253831;OID=.;OPOS=46039290;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:18:19:8:8:10:11:3:7:7:1:3:8:7:1 chr13 46067593 . G A 244.72 PASS AO=71;DP=160;FAO=69;FDP=163;FR=.;FRO=94;FSAF=21;FSAR=48;FSRF=32;FSRR=62;FWDB=-0.0997701;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.9708;QD=6.00549;RBI=0.0998235;REFB=0.00913035;REVB=-0.00326455;RO=89;SAF=23;SAR=48;SRF=28;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106939;STB=0.524097;TYPE=snp;VARB=-0.0126318;OID=.;OPOS=46067593;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:163:89:94:71:69:48:23:28:61:48:21:32:62 chr13 46077381 . G A 44.14 PASS AO=18;DP=63;FAO=18;FDP=63;FR=.;FRO=45;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=0.00873285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.599;QD=2.80257;RBI=0.0139039;REFB=-0.0030812;REVB=0.0108192;RO=45;SAF=11;SAR=7;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171938;STB=0.603424;TYPE=snp;VARB=0.00620819;OID=.;OPOS=46077381;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:63:63:45:45:18:18:7:11:21:24:7:11:21:24 chr13 46103935 . A G 239.65 PASS AO=70;DP=171;FAO=70;FDP=171;FR=.;FRO=101;FSAF=40;FSAR=30;FSRF=53;FSRR=48;FWDB=0.0250745;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.792;QD=5.60598;RBI=0.0443258;REFB=-0.0109446;REVB=0.036552;RO=99;SAF=40;SAR=30;SRF=52;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.048836;STB=0.527911;TYPE=snp;VARB=0.0138;OID=.;OPOS=46103935;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:171:99:101:70:70:30:40:52:47:30:40:53:48 chr13 46108853 . T C 1977.54 PASS AO=212;DP=215;FAO=212;FDP=215;FR=.;FRO=3;FSAF=88;FSAR=124;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0376814;FXX=0.00462942;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.669;QD=36.7915;RBI=0.0377551;REFB=-0.032346;REVB=0.0023579;RO=2;SAF=88;SAR=124;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00155622;STB=0.50361;TYPE=snp;VARB=0.000327603;OID=.;OPOS=46108853;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:215:215:2:3:212:212:124:88:1:1:124:88:2:1 chr13 46108854 . G A 470.46 PASS AO=108;DP=215;FAO=108;FDP=212;FR=.;FRO=104;FSAF=39;FSAR=69;FSRF=50;FSRR=54;FWDB=-0.0162692;FXX=0.0139528;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.05;QD=8.87651;RBI=0.0224167;REFB=-0.0154436;REVB=-0.0154215;RO=104;SAF=39;SAR=69;SRF=50;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111834;STB=0.561426;TYPE=snp;VARB=0.0125255;OID=.;OPOS=46108854;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:212:104:104:108:108:69:39:50:54:69:39:50:54 chr13 46115731 . C A 353.77 PASS AO=86;DP=187;FAO=89;FDP=190;FR=.;FRO=101;FSAF=30;FSAR=59;FSRF=48;FSRR=53;FWDB=0.0252653;FXX=0.0155432;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.2043;QD=7.44787;RBI=0.0793426;REFB=-0.025827;REVB=0.0752124;RO=100;SAF=28;SAR=58;SRF=47;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149854;STB=0.577977;TYPE=snp;VARB=0.0285175;OID=.;OPOS=46115731;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:190:100:101:86:89:58:28:47:53:59:30:48:53 chr13 46137837 . T C 325.39 PASS AO=115;DP=317;FAO=115;FDP=317;FR=.;FRO=202;FSAF=63;FSAR=52;FSRF=119;FSRR=83;FWDB=0.00573774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.953;QD=4.10582;RBI=0.00589395;REFB=-0.0093611;REVB=-0.00134792;RO=194;SAF=63;SAR=52;SRF=117;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.062521;STB=0.52668;TYPE=snp;VARB=0.015886;OID=.;OPOS=46137837;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:317:317:194:202:115:115:52:63:117:77:52:63:119:83 chr13 46170609 . C T 190.81 PASS AO=39;DP=73;FAO=40;FDP=74;FR=.;FRO=34;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=0.0227139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.474;QD=10.3141;RBI=0.0232935;REFB=-0.0341744;REVB=0.00516367;RO=32;SAF=24;SAR=15;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0185722;STB=0.503595;TYPE=snp;VARB=0.0283683;OID=.;OPOS=46170609;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:74:32:34:39:40:15:24:19:13:15:25:21:13 chr13 46170726 . A G 22.99 PASS AO=7;DP=24;FAO=7;FDP=24;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.119883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.5167;QD=3.83242;RBI=0.123236;REFB=-0.0359451;REVB=-0.0285524;RO=17;SAF=5;SAR=2;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.393932;STB=0.74645;TYPE=snp;VARB=0.127041;OID=.;OPOS=46170726;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:24:24:17:17:7:7:2:5:6:11:2:5:6:11 chr13 46541673 . T A 147.24 PASS AO=40;DP=94;FAO=40;FDP=94;FR=.;FRO=54;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=0.00381684;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=227.564;QD=6.26538;RBI=0.00393501;REFB=-0.00768019;REVB=-0.00095708;RO=54;SAF=25;SAR=15;SRF=25;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167628;STB=0.594547;TYPE=snp;VARB=0.0101125;OID=.;OPOS=46541673;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:54:54:40:40:15:25:25:29:15:25:25:29 chr13 46562935 . A G 210.88 PASS AO=65;DP=166;FAO=65;FDP=165;FR=.;FRO=100;FSAF=35;FSAR=30;FSRF=40;FSRR=60;FWDB=-0.00241555;FXX=0.00602373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.029;QD=5.11212;RBI=0.0027777;REFB=-0.0142071;REVB=-0.0013714;RO=96;SAF=35;SAR=30;SRF=38;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150358;STB=0.583308;TYPE=snp;VARB=0.0193021;OID=.;OPOS=46562935;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:165:96:100:65:65:30:35:38:58:30:35:40:60 chr13 46629944 . A G 64.42 PASS AO=38;DP=154;FAO=38;FDP=153;FR=.;FRO=115;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=49;FSRR=66;FWDB=0.0011915;FXX=0.00649309;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.737;QD=1.68425;RBI=0.00951115;REFB=-0.00172177;REVB=0.00943622;RO=105;SAF=24;SAR=14;SRF=47;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226189;STB=0.652538;TYPE=snp;VARB=0.0149884;OID=.;OPOS=46629944;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:154:153:105:115:38:38:14:24:47:58:14:24:49:66 chr13 46700642 . G T 215.9 PASS AO=49;DP=123;FAO=59;FDP=134;FR=.;FRO=75;FSAF=38;FSAR=21;FSRF=30;FSRR=45;FWDB=0.0119303;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.873;QD=6.44461;RBI=0.0275326;REFB=0.00325015;REVB=0.0248135;RO=74;SAF=30;SAR=19;SRF=30;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219062;STB=0.637148;TYPE=snp;VARB=-0.00339164;OID=.;OPOS=46700642;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:134:74:75:49:59:19:30:30:44:21:38:30:45 chr13 46708291 . T C 1676.13 PASS AO=180;DP=183;FAO=180;FDP=180;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00145647;FXX=0.0163925;HRUN=3;LEN=1;MLLD=226.366;QD=37.2474;RBI=0.019514;REFB=-0.0492975;REVB=0.0194596;RO=1;SAF=84;SAR=96;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00493355;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.21018e-05;OID=.;OPOS=46708291;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:183:180:1:0:180:180:96:84:0:1:96:84:0:0 chr13 46948660 . A G 145.96 PASS AO=61;DP=199;FAO=62;FDP=197;FR=.;FRO=135;FSAF=9;FSAR=53;FSRF=73;FSRR=62;FWDB=0.00913069;FXX=0.0149993;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.537;QD=2.96356;RBI=0.0120252;REFB=-0.0119009;REVB=-0.00782534;RO=135;SAF=9;SAR=52;SRF=73;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.520752;STB=0.807547;TYPE=snp;VARB=0.0264515;OID=.;OPOS=46948660;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:199:197:135:135:61:62:52:9:73:62:53:9:73:62 chr13 47260054 . T C 1124.95 PASS AO=126;DP=132;FAO=128;FDP=132;FR=.;FRO=4;FSAF=58;FSAR=70;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.103807;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.3472;QD=34.0893;RBI=0.103833;REFB=-0.100999;REVB=-0.00232477;RO=6;SAF=56;SAR=70;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0338194;STB=0.509059;TYPE=snp;VARB=0.00981368;OID=.;OPOS=47260054;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:132:132:6:4:126:128:70:56:5:1:70:58:3:1 chr13 47273458 . G C 1299.11 PASS AO=136;DP=136;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168655;FXX=0.0489476;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.397;QD=38.2092;RBI=0.0221168;REFB=0;REVB=-0.0143076;RO=0;SAF=80;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.6754e-05;OID=.;OPOS=47273458;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:136:136:0:0:136:136:56:80:0:0:56:80:0:0 chr13 47279454 . A G 2336.56 PASS AO=243;DP=244;FAO=244;FDP=244;FR=.;FRO=0;FSAF=109;FSAR=135;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00925935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.34;QD=38.3042;RBI=0.0131838;REFB=0;REVB=0.00938492;RO=0;SAF=109;SAR=134;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.80758e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.88177e-08;OID=.;OPOS=47279454;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:244:244:0:0:243:244:134:109:0:0:135:109:0:0 chr13 47308109 . A G 2922.9 PASS AO=306;DP=322;FAO=311;FDP=311;FR=.;FRO=0;FSAF=132;FSAR=179;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0354802;FXX=0.0341604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.1483;QD=37.5936;RBI=0.0373198;REFB=-0.049698;REVB=0.0115727;RO=2;SAF=132;SAR=174;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00545049;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00129075;OID=.;OPOS=47308109;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:322:311:2:0:306:311:174:132:0:2:179:132:0:0 chr13 47315984 . T C 1658.87 PASS AO=163;DP=168;FAO=189;FDP=192;FR=.;FRO=3;FSAF=75;FSAR=114;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.13356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.828;QD=34.5599;RBI=0.136066;REFB=-0.0563416;REVB=-0.0259915;RO=5;SAF=49;SAR=114;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0199688;STB=0.501037;TYPE=snp;VARB=0.00695225;OID=.;OPOS=47315984;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:168:192:5:3:163:189:114:49:3:2:114:75:1:2 chr13 47469940 . G A 767.23 PASS AO=157;DP=279;FAO=158;FDP=281;FR=.;FRO=123;FSAF=66;FSAR=92;FSRF=55;FSRR=68;FWDB=0.0106317;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.043;QD=10.9215;RBI=0.0216558;REFB=-0.00708538;REVB=0.0188665;RO=121;SAF=66;SAR=91;SRF=55;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0279594;STB=0.513183;TYPE=snp;VARB=0.00536556;OID=.;OPOS=47469940;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:279:281:121:123:157:158:91:66:55:66:92:66:55:68 chr13 47470824 . C T 568.97 PASS AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0203465;FXX=0.0161264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.1517;QD=37.3095;RBI=0.073845;REFB=0;REVB=0.0709866;RO=0;SAF=41;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.14674e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00142839;OID=.;OPOS=47470824;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:61:61:0:0:61:61:20:41:0:0:21:40:0:0 chr13 48033224 . G A 940.77 PASS AO=97;DP=97;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000505905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.8093;QD=38.3989;RBI=0.00556173;REFB=0;REVB=0.00553867;RO=0;SAF=58;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.13904e-05;OID=.;OPOS=48033224;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:97:98:0:0:97:98:39:58:0:0:39:59:0:0 chr13 48547467 . A T 1012.54 PASS AO=106;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.9925;QD=38.2092;RBI=0.025122;REFB=0;REVB=-0.013647;RO=0;SAF=13;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.33338e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.42372e-05;OID=.;OPOS=48547467;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:106:106:0:0:106:106:93:13:0:0:93:13:0:0 chr13 48985439 . G T 184.57 PASS AO=40;DP=77;FAO=40;FDP=77;FR=.;FRO=37;FSAF=27;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=-0.036696;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.8524;QD=9.5879;RBI=0.0368906;REFB=0.0133162;REVB=0.00378454;RO=37;SAF=27;SAR=13;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218826;STB=0.621468;TYPE=snp;VARB=-0.0114145;OID=.;OPOS=48985439;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:37:37:40:40:13:27:16:21:13:27:16:21 chr13 48986490 . A G 315.69 PASS AO=71;DP=139;FAO=71;FDP=139;FR=.;FRO=68;FSAF=50;FSAR=21;FSRF=46;FSRR=22;FWDB=0.0274307;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.876;QD=9.08445;RBI=0.0343037;REFB=-0.0185165;REVB=0.0205986;RO=68;SAF=50;SAR=21;SRF=46;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0291956;STB=0.516078;TYPE=snp;VARB=0.0204004;OID=.;OPOS=48986490;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:68:68:71:71:21:50:46:22:21:50:46:22 chr13 48987166 . G A 235.89 PASS AO=66;DP=159;FAO=67;FDP=160;FR=.;FRO=93;FSAF=21;FSAR=46;FSRF=37;FSRR=56;FWDB=0.0446572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.351;QD=5.89731;RBI=0.0633616;REFB=-0.0189599;REVB=0.0449491;RO=89;SAF=20;SAR=46;SRF=37;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128576;STB=0.554661;TYPE=snp;VARB=0.0263117;OID=.;OPOS=48987166;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:160:89:93:66:67:46:20:37:52:46:21:37:56 chr13 49107241 . T C 116.19 PASS AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.061981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.451;QD=35.7501;RBI=0.0646185;REFB=0;REVB=-0.018273;RO=0;SAF=3;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00132234;OID=.;OPOS=49107241;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:13:0:0:13:13:10:3:0:0:10:3:0:0 chr13 49840024 . A G 1727.59 PASS AO=171;DP=171;FAO=180;FDP=180;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0751494;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.1194;QD=38.3908;RBI=0.0970158;REFB=0;REVB=0.0613566;RO=0;SAF=101;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.98782e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.55e-05;OID=.;OPOS=49840024;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:171:180:0:0:171:180:70:101:0:0:79:101:0:0 chr13 49866869 . G C 554.47 PASS AO=130;DP=284;FAO=136;FDP=276;FR=.;FRO=140;FSAF=67;FSAR=69;FSRF=78;FSRR=62;FWDB=-0.00738647;FXX=0.0383262;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.1256;QD=8.0358;RBI=0.00949053;REFB=-0.0166796;REVB=0.00595905;RO=129;SAF=62;SAR=68;SRF=70;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0596312;STB=0.532686;TYPE=snp;VARB=0.0226595;OID=.;OPOS=49866869;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:284:276:129:140:130:136:68:62:70:59:69:67:78:62 chr13 49951142 . T C 1281.1 PASS AO=134;DP=135;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00138572;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.156;QD=38.2418;RBI=0.0400701;REFB=0;REVB=0.0400462;RO=0;SAF=65;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000251846;OID=.;OPOS=49951142;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:135:134:0:0:134:134:69:65:0:0:69:65:0:0 chr13 49951193 . T C 1148.77 PASS AO=135;DP=156;FAO=135;FDP=146;FR=.;FRO=11;FSAF=64;FSAR=71;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=-0.0155152;FXX=0.0640985;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.7045;QD=31.4733;RBI=0.0157436;REFB=-0.013753;REVB=-0.00267214;RO=9;SAF=64;SAR=71;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0491706;STB=0.525922;TYPE=snp;VARB=0.000278447;OID=.;OPOS=49951193;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:156:146:9:11:135:135:71:64:8:1:71:64:9:2 chr13 50008301 . A G 1454.81 PASS AO=154;DP=155;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0117104;FXX=0.0064512;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.01;QD=37.7873;RBI=0.0117155;REFB=0.0244052;REVB=0.000343963;RO=1;SAF=60;SAR=94;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00786231;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000118865;OID=.;OPOS=50008301;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:155:154:1:0:154:154:94:60:1:0:94:60:0:0 chr13 50050620 . A G 1210.05 PASS AO=126;DP=129;FAO=132;FDP=135;FR=.;FRO=3;FSAF=85;FSAR=47;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0619341;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.2954;QD=35.8533;RBI=0.093314;REFB=-0.109228;REVB=-0.0697974;RO=3;SAF=82;SAR=44;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000771503;STB=0.500551;TYPE=snp;VARB=0.00131446;OID=.;OPOS=50050620;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:129:135:3:3:126:132:44:82:2:1:47:85:2:1 chr13 50057097 . G A 955.89 PASS AO=101;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0182434;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.6506;QD=37.4858;RBI=0.0417867;REFB=0;REVB=-0.0375939;RO=1;SAF=56;SAR=45;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0083971;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000351875;OID=.;OPOS=50057097;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:102:102:1:0:101:102:45:56:1:0:45:57:0:0 chr13 50057633 . A G 612.16 PASS AO=184;DP=429;FAO=172;FDP=397;FR=.;FRO=225;FSAF=112;FSAR=60;FSRF=137;FSRR=88;FWDB=-0.00272664;FXX=0.00749981;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.754;QD=6.1679;RBI=0.00355334;REFB=-0.0114889;REVB=-0.00227852;RO=241;SAF=121;SAR=63;SRF=150;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.039357;STB=0.525952;TYPE=snp;VARB=0.0141117;OID=.;OPOS=50057633;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:429:397:241:225:184:172:63:121:150:91:60:112:137:88 chr13 50080847 . A G 115.95 PASS AO=34;DP=85;FAO=34;FDP=86;FR=.;FRO=52;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=29;FSRR=23;FWDB=0.00990319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.696;QD=5.39283;RBI=0.0208242;REFB=-0.0131514;REVB=-0.0183187;RO=51;SAF=13;SAR=21;SRF=28;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177154;STB=0.606539;TYPE=snp;VARB=0.0167775;OID=.;OPOS=50080847;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:86:51:52:34:34:21:13:28:23:21:13:29:23 chr13 50106550 . GA G 49.57 PASS AO=20;DP=51;FAO=21;FDP=51;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=9;FWDB=0.00833794;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=22.682;QD=3.8881;RBI=0.0910703;REFB=0.0475174;REVB=0.0906878;RO=29;SAF=12;SAR=8;SRF=21;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13815;STB=0.551677;TYPE=del;VARB=-0.0459476;OID=.;OPOS=50106551;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:20:51:21:51:30:13:8:21:9:49:29:12:8:21:8 chr13 50106584 . G A 85.65 PASS AO=22;DP=52;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=10;FWDB=-0.0086069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.838;QD=6.58876;RBI=0.0240459;REFB=-0.0199871;REVB=-0.0224528;RO=27;SAF=14;SAR=8;SRF=19;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0723099;STB=0.519067;TYPE=snp;VARB=0.0258717;OID=.;OPOS=50106584;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:52:52:27:30:22:22:8:14:19:8:8:14:20:10 chr13 50123622 . G C 126.73 PASS AO=32;DP=72;FAO=32;FDP=72;FR=.;FRO=40;FSAF=25;FSAR=7;FSRF=33;FSRR=7;FWDB=-0.0120062;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.2187;QD=7.04073;RBI=0.0664992;REFB=0.0101889;REVB=0.0654064;RO=40;SAF=25;SAR=7;SRF=33;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0660377;STB=0.537015;TYPE=snp;VARB=-0.0147495;OID=.;OPOS=50123622;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:40:40:32:32:7:25:33:7:7:25:33:7 chr13 50141345 . G A 123.5 PASS AO=39;DP=105;FAO=39;FDP=104;FR=.;FRO=65;FSAF=9;FSAR=30;FSRF=8;FSRR=57;FWDB=-0.0876138;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.828;QD=4.7501;RBI=0.0876572;REFB=-0.00958616;REVB=0.00275591;RO=62;SAF=9;SAR=30;SRF=8;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173389;STB=0.605522;TYPE=snp;VARB=0.016421;OID=.;OPOS=50141345;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:104:62:65:39:39:30:9:8:54:30:9:8:57 chr13 50205025 . T C 24.34 PASS AO=7;DP=27;FAO=8;FDP=28;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.012771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.822;QD=3.47767;RBI=0.0162311;REFB=-0.00244;REVB=-0.0100174;RO=20;SAF=5;SAR=2;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.357767;STB=0.657509;TYPE=snp;VARB=0.00558564;OID=.;OPOS=50205025;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:27:28:20:20:7:8:2:5:8:12:3:5:8:12 chr13 50206328 . G C 446.52 PASS AO=107;DP=215;FAO=104;FDP=211;FR=.;FRO=107;FSAF=72;FSAR=32;FSRF=62;FSRR=45;FWDB=-0.00648997;FXX=0.0321086;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.891;QD=8.46478;RBI=0.00704364;REFB=-0.00210897;REVB=-0.00273737;RO=98;SAF=75;SAR=32;SRF=55;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136288;STB=0.56386;TYPE=snp;VARB=0.00308144;OID=.;OPOS=50206328;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:211:98:107:107:104:32:75:55:43:32:72:62:45 chr13 50207133 . A G 242.15 PASS AO=50;DP=93;FAO=51;FDP=95;FR=.;FRO=44;FSAF=9;FSAR=42;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=0.031547;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.2167;QD=10.1958;RBI=0.0366198;REFB=-0.000147089;REVB=-0.0185957;RO=43;SAF=9;SAR=41;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.368157;STB=0.703206;TYPE=snp;VARB=0.000351856;OID=.;OPOS=50207133;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:95:43:44:50:51:41:9:23:20:42:9:23:21 chr13 50207220 . T G 119.63 PASS AO=25;DP=49;FAO=25;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=3;FSAR=22;FSRF=6;FSRR=18;FWDB=0.0624966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.321;QD=9.76532;RBI=0.0680264;REFB=-0.00103227;REVB=-0.0268659;RO=24;SAF=3;SAR=22;SRF=6;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21521;STB=0.622528;TYPE=snp;VARB=0.00203901;OID=.;OPOS=50207220;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:24:24:25:25:22:3:6:18:22:3:6:18 chr13 50275515 . C T 411.86 PASS AO=104;DP=221;FAO=104;FDP=222;FR=.;FRO=118;FSAF=58;FSAR=46;FSRF=49;FSRR=69;FWDB=-0.0069726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.222;QD=7.42088;RBI=0.0359943;REFB=-0.00955899;REVB=-0.0353125;RO=115;SAF=58;SAR=46;SRF=48;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133084;STB=0.575382;TYPE=snp;VARB=0.00979345;OID=.;OPOS=50275515;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:222:115:118:104:104:46:58:48:67:46:58:49:69 chr13 50296115 . C T 244.28 PASS AO=52;DP=110;FAO=57;FDP=112;FR=.;FRO=55;FSAF=48;FSAR=9;FSRF=49;FSRR=6;FWDB=0.018317;FXX=0.074374;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.1288;QD=8.72438;RBI=0.0282146;REFB=-0.0253454;REVB=0.0214604;RO=43;SAF=48;SAR=4;SRF=38;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102376;STB=0.548007;TYPE=snp;VARB=0.0261286;OID=.;OPOS=50296115;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:112:43:55:52:57:4:48:38:5:9:48:49:6 chr13 50466633 . C T 259.88 PASS AO=63;DP=132;FAO=63;FDP=132;FR=.;FRO=69;FSAF=18;FSAR=45;FSRF=30;FSRR=39;FWDB=-0.00338061;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.594;QD=7.87528;RBI=0.0158735;REFB=-0.0259873;REVB=-0.0155094;RO=67;SAF=18;SAR=45;SRF=28;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14014;STB=0.588206;TYPE=snp;VARB=0.0286945;OID=.;OPOS=50466633;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:67:69:63:63:45:18:28:39:45:18:30:39 chr13 50466911 . G A 161.27 PASS AO=41;DP=94;FAO=42;FDP=95;FR=.;FRO=53;FSAF=13;FSAR=29;FSRF=12;FSRR=41;FWDB=-0.00385438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.207;QD=6.79039;RBI=0.0105036;REFB=0.00344577;REVB=-0.00977084;RO=53;SAF=12;SAR=29;SRF=12;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0838326;STB=0.556549;TYPE=snp;VARB=-0.00320593;OID=.;OPOS=50466911;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:95:53:53:41:42:29:12:12:41:29:13:12:41 chr13 50587718 . A G 317.88 PASS AO=31;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0606616;FXX=0.0555401;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.396;QD=37.3978;RBI=0.0932683;REFB=0;REVB=0.0708459;RO=0;SAF=9;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.15349e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000778809;OID=.;OPOS=50587718;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:33:34:0:0:31:34:22:9:0:0:25:9:0:0 chr13 50588476 . A T 43.63 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0380489;FXX=0;HRUN=32;LEN=1;MLLD=27.2694;QD=29.085;RBI=0.0380489;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00725619;OID=.;OPOS=50588476;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:0:6:0:0:0:6:0:0 chr13 50588478 . A T 49.49 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106829;FXX=0;HRUN=32;LEN=1;MLLD=38.2667;QD=32.9905;RBI=0.0106829;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000500724;OID=.;OPOS=50588478;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:0:6:0:0:0:6:0:0 chr13 50588480 . A T 73.83 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0580651;FXX=0;HRUN=32;LEN=1;MLLD=83.9607;QD=36.9155;RBI=0.0580651;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=8;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00163312;OID=.;OPOS=50588480;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:0:8:0:0:0:8:0:0 chr13 50588496 . T C 270.35 PASS AO=57;DP=110;FAO=59;FDP=110;FR=.;FRO=51;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=35;FSRR=16;FWDB=0.0169222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.8344;QD=9.83089;RBI=0.0800965;REFB=-0.0596569;REVB=0.0782885;RO=52;SAF=32;SAR=25;SRF=35;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0997953;STB=0.567953;TYPE=snp;VARB=0.0801701;OID=.;OPOS=50588496;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:52:51:57:59:25:32:35:17:27:32:35:16 chr13 50588498 . C T 86.45 PASS AO=36;DP=118;FAO=36;FDP=118;FR=.;FRO=82;FSAF=30;FSAR=6;FSRF=41;FSRR=41;FWDB=-0.0334799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.1589;QD=2.93048;RBI=0.0512233;REFB=-0.0496261;REVB=-0.0387675;RO=82;SAF=30;SAR=6;SRF=41;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.450261;STB=0.767809;TYPE=snp;VARB=0.079815;OID=.;OPOS=50588498;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:118:118:82:82:36:36:6:30:41:41:6:30:41:41 chr13 50588500 . C T 107.16 PASS AO=42;DP=127;FAO=42;FDP=127;FR=.;FRO=85;FSAF=34;FSAR=8;FSRF=43;FSRR=42;FWDB=-0.0062496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.9059;QD=3.37501;RBI=0.103416;REFB=-0.0546955;REVB=-0.103227;RO=85;SAF=34;SAR=8;SRF=43;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.399204;STB=0.733902;TYPE=snp;VARB=0.0593065;OID=.;OPOS=50588500;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:85:85:42:42:8:34:43:42:8:34:43:42 chr13 50588502 . C T 103.1 PASS AO=43;DP=133;FAO=42;FDP=132;FR=.;FRO=90;FSAF=36;FSAR=6;FSRF=46;FSRR=44;FWDB=-0.0164307;FXX=0.0149243;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.2087;QD=3.12423;RBI=0.1282;REFB=-0.0688264;REVB=-0.127143;RO=87;SAF=36;SAR=7;SRF=44;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.447041;STB=0.785186;TYPE=snp;VARB=0.0623125;OID=.;OPOS=50588502;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:132:87:90:43:42:7:36:44:43:6:36:46:44 chr13 50589230 . A T 32.31 PASS AO=10;DP=31;FAO=10;FDP=31;FR=.;FRO=21;FSAF=0;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=21;FWDB=0;FXX=0;HRUN=20;LEN=1;MLLD=107.13;QD=4.16948;RBI=0.00562022;REFB=0.00536611;REVB=-0.00562022;RO=21;SAF=0;SAR=10;SRF=0;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0233753;OID=.;OPOS=50589230;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:31:31:21:21:10:10:10:0:0:21:10:0:0:21 chr13 50589231 . A T 33.39 PASS AO=11;DP=29;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=0;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=18;FWDB=0;FXX=0;HRUN=20;LEN=1;MLLD=89.6516;QD=4.60564;RBI=0.0228997;REFB=-0.000620402;REVB=0.0228997;RO=18;SAF=0;SAR=11;SRF=0;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.111663;OID=.;OPOS=50589231;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:29:29:18:18:11:11:11:0:0:18:11:0:0:18 chr13 50590292 . T TCTC 218.69 PASS AO=54;DP=138;FAO=58;FDP=131;FR=.;FRO=73;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=37;FSRR=36;FWDB=-0.00463902;FXX=0.0437924;HRUN=1;LEN=3;MLLD=227.629;QD=6.67749;RBI=0.0181248;REFB=-0.00972986;REVB=0.0175211;RO=77;SAF=27;SAR=27;SRF=38;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00678331;STB=0.505794;TYPE=ins;VARB=0.0127564;OID=.;OPOS=50590293;OREF=-;OALT=CTC;OMAPALT=TCTC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:54:138:58:131:73:30:28:37:36:99:77:27:27:38:39 chr13 50590838 . C G 714.01 PASS AO=139;DP=236;FAO=139;FDP=235;FR=.;FRO=96;FSAF=88;FSAR=51;FSRF=43;FSRR=53;FWDB=0.00239303;FXX=0.00423711;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.339;QD=12.1534;RBI=0.00744687;REFB=-0.0131513;REVB=0.00705191;RO=96;SAF=88;SAR=51;SRF=43;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143942;STB=0.578022;TYPE=snp;VARB=0.00926141;OID=.;OPOS=50590838;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:236:235:96:96:139:139:51:88:43:53:51:88:43:53 chr13 50591342 . T A 105.08 PASS AO=42;DP=119;FAO=44;FDP=136;FR=.;FRO=92;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=38;FSRR=54;FWDB=0.0232346;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=33.6006;QD=3.09048;RBI=0.0232971;REFB=-0.0509188;REVB=0.00170429;RO=77;SAF=15;SAR=27;SRF=37;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143867;STB=0.535394;TYPE=snp;VARB=0.030291;OID=.;OPOS=50591342;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:136:77:92:42:44:27:15:37:40:28:16:38:54 chr13 50591480 . T C 987.91 PASS AO=103;DP=103;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0229921;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.317;QD=37.9965;RBI=0.0423975;REFB=0;REVB=0.0356218;RO=0;SAF=46;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99381e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00012309;OID=.;OPOS=50591480;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:103:104:0:0:103:104:57:46:0:0:58:46:0:0 chr13 50592060 . T G 404.23 PASS AO=97;DP=199;FAO=97;FDP=199;FR=.;FRO=102;FSAF=40;FSAR=57;FSRF=45;FSRR=57;FWDB=0.0096328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.214;QD=8.1253;RBI=0.00964597;REFB=-0.0120357;REVB=0.000503823;RO=99;SAF=40;SAR=57;SRF=44;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0301905;STB=0.515148;TYPE=snp;VARB=0.0135708;OID=.;OPOS=50592060;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:199:199:99:102:97:97:57:40:44:55:57:40:45:57 chr13 50592572 . T G 339.05 PASS AO=73;DP=141;FAO=74;FDP=141;FR=.;FRO=67;FSAF=17;FSAR=57;FSRF=10;FSRR=57;FWDB=-0.0108437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.61;QD=9.61835;RBI=0.0302331;REFB=-0.0264562;REVB=0.0282215;RO=67;SAF=17;SAR=56;SRF=10;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109185;STB=0.557363;TYPE=snp;VARB=0.0285507;OID=.;OPOS=50592572;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:67:67:73:74:56:17:10:57:57:17:10:57 chr13 51287408 . C G 1932.82 PASS AO=177;DP=177;FAO=202;FDP=202;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=125;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147478;FXX=0.00492587;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.718;QD=38.2737;RBI=0.0147484;REFB=0;REVB=0.000125626;RO=0;SAF=56;SAR=121;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.69982e-06;OID=.;OPOS=51287408;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:91:177:202:0:0:177:202:121:56:0:0:125:77:0:0 chr13 51387124 . A G 307.66 PASS AO=85;DP=183;FAO=81;FDP=180;FR=.;FRO=99;FSAF=37;FSAR=44;FSRF=57;FSRR=42;FWDB=0.026412;FXX=0.0163925;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.0242;QD=6.83695;RBI=0.0271492;REFB=-0.0113098;REVB=-0.00628392;RO=95;SAF=41;SAR=44;SRF=51;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.051975;STB=0.565166;TYPE=snp;VARB=0.0294527;OID=.;OPOS=51387124;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:180:95:99:85:81:44:41:51:44:44:37:57:42 chr13 51594741 . T G 258.48 PASS AO=60;DP=117;FAO=59;FDP=117;FR=.;FRO=58;FSAF=10;FSAR=49;FSRF=16;FSRR=42;FWDB=0.00547011;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.0112;QD=8.83675;RBI=0.026468;REFB=0.00495806;REVB=-0.0258966;RO=52;SAF=10;SAR=50;SRF=15;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161749;STB=0.583302;TYPE=snp;VARB=-0.0236899;OID=.;OPOS=51594741;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:52:58:60:59:50:10:15:37:49:10:16:42 chr13 51603768 . T C 264.16 PASS AO=66;DP=144;FAO=66;FDP=142;FR=.;FRO=76;FSAF=46;FSAR=20;FSRF=29;FSRR=47;FWDB=-0.0248928;FXX=0.0138879;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.32;QD=7.44098;RBI=0.0269563;REFB=-0.0143666;REVB=0.0103437;RO=75;SAF=46;SAR=20;SRF=28;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.315969;STB=0.672579;TYPE=snp;VARB=0.0131132;OID=.;OPOS=51603768;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:142:75:76:66:66:20:46:28:47:20:46:29:47 chr13 51825601 . C T 160.96 PASS AO=39;DP=83;FAO=39;FDP=83;FR=.;FRO=44;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=-0.00286431;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=140.242;QD=7.75704;RBI=0.00332985;REFB=-0.0132302;REVB=-0.00169813;RO=44;SAF=25;SAR=14;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159941;STB=0.589501;TYPE=snp;VARB=0.0185037;OID=.;OPOS=51825601;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:44:44:39:39:14:25:21:23:14:25:21:23 chr13 52313195 . C T 239.95 PASS AO=62;DP=137;FAO=62;FDP=137;FR=.;FRO=75;FSAF=18;FSAR=44;FSRF=31;FSRR=44;FWDB=-0.00465145;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.544;QD=7.00589;RBI=0.0235168;REFB=-0.0148869;REVB=-0.0230522;RO=73;SAF=18;SAR=44;SRF=29;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118687;STB=0.576445;TYPE=snp;VARB=0.0193882;OID=.;OPOS=52313195;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:73:75:62:62:44:18:29:44:44:18:31:44 chr13 52365354 . G T 200.73 PASS AO=50;DP=107;FAO=50;FDP=107;FR=.;FRO=57;FSAF=32;FSAR=18;FSRF=40;FSRR=17;FWDB=-0.0114234;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.701;QD=7.50396;RBI=0.0215389;REFB=-0.00688888;REVB=0.01826;RO=56;SAF=33;SAR=17;SRF=39;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0391393;STB=0.53641;TYPE=snp;VARB=0.0085921;OID=.;OPOS=52365354;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:56:57:50:50:17:33:39:17:18:32:40:17 chr13 52440130 . A G 115.36 PASS AO=30;DP=71;FAO=31;FDP=72;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=0.0177334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.391;QD=6.40886;RBI=0.0178756;REFB=-0.000299869;REVB=-0.00225049;RO=40;SAF=14;SAR=16;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0336858;STB=0.534569;TYPE=snp;VARB=0.000495118;OID=.;OPOS=52440130;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:72:40:41:30:31:16:14:20:20:17:14:21:20 chr13 52515354 . A G 432.05 PASS AO=87;DP=178;FAO=98;FDP=185;FR=.;FRO=87;FSAF=34;FSAR=64;FSRF=26;FSRR=61;FWDB=0.0961922;FXX=0.0159566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.323;QD=9.34157;RBI=0.0965453;REFB=-0.00526025;REVB=0.00824978;RO=89;SAF=28;SAR=59;SRF=28;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00763217;STB=0.525335;TYPE=snp;VARB=0.00474862;OID=.;OPOS=52515354;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:185:89:87:87:98:59:28:28:61:64:34:26:61 chr13 52515982 . A AAC 228.77 PASS AO=58;DP=147;FAO=64;FDP=145;FR=.;FRO=81;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=39;FSRR=42;FWDB=0.00455535;FXX=0.0202689;HRUN=2;LEN=2;MLLD=197.037;QD=6.31081;RBI=0.00981617;REFB=-0.000433574;REVB=-0.00869517;RO=87;SAF=28;SAR=30;SRF=42;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510342;TYPE=ins;VARB=0.000308377;OID=.;OPOS=52515983;OREF=-;OALT=AC;OMAPALT=AAC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:58:147:64:145:81:32:32:39:42:99:87:28:30:42:45 chr13 52523808 . C T 136.65 PASS AO=34;DP=75;FAO=34;FDP=75;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=0.0246666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.474;QD=7.28788;RBI=0.0253101;REFB=-0.00983007;REVB=0.00567125;RO=40;SAF=17;SAR=17;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0240761;STB=0.506663;TYPE=snp;VARB=0.013876;OID=.;OPOS=52523808;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:40:41:34:34:17:17:21:19:17:17:21:20 chr13 52524488 . T C 96.79 PASS AO=36;DP=109;FAO=36;FDP=109;FR=.;FRO=73;FSAF=2;FSAR=34;FSRF=17;FSRR=56;FWDB=-0.0299011;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.3939;QD=3.55176;RBI=0.0631096;REFB=0.0020014;REVB=-0.0555765;RO=73;SAF=2;SAR=34;SRF=17;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.462779;STB=0.781868;TYPE=snp;VARB=-0.00616155;OID=.;OPOS=52524488;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:109:109:73:73:36:36:34:2:17:56:34:2:17:56 chr13 52544805 . C G 326.58 PASS AO=89;DP=203;FAO=89;FDP=203;FR=.;FRO=114;FSAF=36;FSAR=53;FSRF=53;FSRR=61;FWDB=-0.0428347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.0669;QD=6.43498;RBI=0.0611157;REFB=0.0143825;REVB=-0.0435926;RO=113;SAF=36;SAR=53;SRF=52;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0573691;STB=0.534739;TYPE=snp;VARB=-0.0204509;OID=.;OPOS=52544805;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:203:113:114:89:89:53:36:52:61:53:36:53:61 chr13 52548140 . A C 457.35 PASS AO=79;DP=251;FAO=121;FDP=264;FR=.,HEALED;FRO=143;FSAF=81;FSAR=40;FSRF=95;FSRR=48;FWDB=-0.0112406;FXX=0.0537615;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.2359;QD=6.92954;RBI=0.0503317;REFB=0.00484507;REVB=-0.0490605;RO=90;SAF=76;SAR=3;SRF=87;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0316282;STB=0.503105;TYPE=snp;VARB=-0.0126787;OID=.;OPOS=52548140;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:235:264:90:143:79:121:3:76:87:3:40:81:95:48 chr13 52603194 . G T 2904.34 PASS AO=308;DP=313;FAO=309;FDP=309;FR=.;FRO=0;FSAF=171;FSAR=138;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118154;FXX=0.0127791;HRUN=3;LEN=1;MLLD=176.711;QD=37.5967;RBI=0.0154048;REFB=-0.0876439;REVB=0.00988445;RO=2;SAF=170;SAR=138;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0055781;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.91287e-05;OID=.;OPOS=52603194;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:313:309:2:0:308:309:138:170:2:0:138:171:0:0 chr13 52603775 . C T 712.13 PASS AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0107421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.111;QD=37.98;RBI=0.0130145;REFB=0;REVB=0.0073474;RO=0;SAF=46;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.89405e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.65572e-05;OID=.;OPOS=52603775;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:75:75:0:0:75:75:29:46:0:0:29:46:0:0 chr13 52605366 . TTA T 50.85 PASS AO=30;DP=125;FAO=36;FDP=97;FR=.;FRO=61;FSAF=7;FSAR=29;FSRF=34;FSRR=27;FWDB=0.00119246;FXX=0.14158;HRUN=6;LEN=2;MLLD=16.6459;QD=2.09685;RBI=0.0921231;REFB=-0.0679489;REVB=-0.0921154;RO=66;SAF=5;SAR=25;SRF=36;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.486033;STB=0.751905;TYPE=del;VARB=0.0237215;OID=.;OPOS=52605367;OREF=TA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:30:124:36:97:61:7:29:34:27:50:66:5:25:36:30 chr13 52605675 . A G 410.91 PASS AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00884977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.128;QD=37.3555;RBI=0.0223952;REFB=0;REVB=0.0205725;RO=0;SAF=30;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000327408;OID=.;OPOS=52605675;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:44:44:0:0:44:44:14:30:0:0:14:30:0:0 chr13 52607169 . T C 778.92 PASS AO=82;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00778283;FXX=0.0114929;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.6428;QD=36.2287;RBI=0.0621193;REFB=-0.0448551;REVB=0.0616298;RO=2;SAF=28;SAR=54;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0326237;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000491228;OID=.;OPOS=52607169;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:86:86:2:0:82:86:54:28:2:0:56:30:0:0 chr13 52709938 . A C 520.72 PASS AO=99;DP=204;FAO=115;FDP=213;FR=.;FRO=98;FSAF=64;FSAR=51;FSRF=56;FSRR=42;FWDB=-0.00204312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.767;QD=9.77868;RBI=0.0307501;REFB=-0.0127011;REVB=0.0306822;RO=80;SAF=54;SAR=45;SRF=46;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0244862;STB=0.506957;TYPE=snp;VARB=0.00962276;OID=.;OPOS=52709938;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:213:80:98:99:115:45:54:46:34:51:64:56:42 chr13 52718050 . C CT,CTT 394.4 PASS AO=75,27;DP=140;FAO=131,0;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=73,0;FSAR=58,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.131477,-0.0689155;FXX=0.036762;HRUN=7,7;LEN=1,2;MLLD=7.06432,9.59258;QD=12.0426;RBI=0.159542,0.0789525;REFB=0.0478625,0.0573747;REVB=0.0903751,0.0385246;RO=31;SAF=43,17;SAR=32,10;SRF=16;SRR=15;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0316395,0.111398;STB=0.5,0.5;TYPE=ins,ins;VARB=-0.000965656,0;OID=.,.;OPOS=52718051,52718051;OREF=-,-;OALT=T,TT;OMAPALT=CT,CTT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:75,27:140:131,0:131:0:73,0:58,0:0:0:22:31:43,17:32,10:16:15 chr13 52971893 . G A 760.64 PASS AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00736887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.2819;QD=38.5133;RBI=0.0317649;REFB=0;REVB=0.0308984;RO=0;SAF=45;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40017e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000147387;OID=.;OPOS=52971893;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:79:79:0:0:79:79:34:45:0:0:34:45:0:0 chr13 53035783 . T C 769.07 PASS AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0119186;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.3424;QD=37.9787;RBI=0.0169202;REFB=0;REVB=0.01201;RO=0;SAF=28;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.50795e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.23009e-07;OID=.;OPOS=53035783;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:81:81:0:0:81:81:53:28:0:0:53:28:0:0 chr13 53035925 . A G 593.89 PASS AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0432885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.885;QD=37.7072;RBI=0.0434255;REFB=0;REVB=0.00344606;RO=0;SAF=16;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.55374e-05;OID=.;OPOS=53035925;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:63:63:0:0:63:63:47:16:0:0:47:16:0:0 chr13 53049033 . GA G 20.55 PASS AO=29;DP=167;FAO=37;FDP=149;FR=.;FRO=112;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=66;FSRR=46;FWDB=0.0514709;FXX=0.080242;HRUN=8;LEN=1;MLLD=5.71832;QD=0.551619;RBI=0.127438;REFB=-0.124981;REVB=0.116582;RO=78;SAF=23;SAR=6;SRF=45;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.30825;STB=0.516695;TYPE=del;VARB=0.0870332;OID=.;OPOS=53049034;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:29:159:37:149:112:21:16:66:46:20:78:23:6:45:33 chr13 53050479 . G A 2278.67 PASS AO=237;DP=237;FAO=237;FDP=237;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=143;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0203869;FXX=0.0042015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.599;QD=38.4586;RBI=0.0282057;REFB=0;REVB=0.0194919;RO=0;SAF=94;SAR=143;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.1545e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.04559e-06;OID=.;OPOS=53050479;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:237:237:0:0:237:237:143:94:0:0:143:94:0:0 chr13 53217270 . A G 10.37 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.125163;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.9333;QD=5.92837;RBI=0.125163;REFB=-0.0317164;REVB=0;RO=5;SAF=2;SAR=0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0556274;OID=.;OPOS=53217270;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:5:5:2:2:0:2:5:0:0:2:5:0 chr13 53422553 . A G 108.8 PASS AO=30;DP=73;FAO=30;FDP=73;FR=.;FRO=43;FSAF=5;FSAR=25;FSRF=3;FSRR=40;FWDB=-0.0410791;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1896;QD=5.96185;RBI=0.100934;REFB=-0.00852797;REVB=-0.0921959;RO=43;SAF=5;SAR=25;SRF=3;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214129;STB=0.618983;TYPE=snp;VARB=0.00944444;OID=.;OPOS=53422553;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:43:43:30:30:25:5:3:40:25:5:3:40 chr13 53608632 . C T 173.51 PASS AO=42;DP=89;FAO=42;FDP=90;FR=.;FRO=48;FSAF=11;FSAR=31;FSRF=16;FSRR=32;FWDB=0.00365667;FXX=0.0109878;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.911;QD=7.71134;RBI=0.00910953;REFB=-0.0116992;REVB=-0.0083434;RO=45;SAF=11;SAR=31;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0817836;STB=0.547036;TYPE=snp;VARB=0.00973107;OID=.;OPOS=53608632;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:90:45:48:42:42:31:11:15:30:31:11:16:32 chr13 55748673 . T C 1771.76 PASS AO=184;DP=185;FAO=184;FDP=184;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=108;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00849531;FXX=0.0264536;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.7823;QD=38.5165;RBI=0.0214051;REFB=0;REVB=0.0196471;RO=0;SAF=76;SAR=108;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.15191e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00069033;OID=.;OPOS=55748673;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:185:184:0:0:184:184:108:76:0:0:108:76:0:0 chr13 58207711 . G T 148.51 PASS AO=43;DP=106;FAO=43;FDP=106;FR=.;FRO=63;FSAF=15;FSAR=28;FSRF=29;FSRR=34;FWDB=0.0192432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.4;QD=5.60406;RBI=0.0568709;REFB=-0.0119209;REVB=0.0535164;RO=63;SAF=15;SAR=28;SRF=29;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123174;STB=0.569809;TYPE=snp;VARB=0.0198594;OID=.;OPOS=58207711;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:63:63:43:43:28:15:29:34:28:15:29:34 chr13 58458579 . C T 704.58 PASS AO=270;DP=600;FAO=184;FDP=400;FR=.;FRO=216;FSAF=86;FSAR=98;FSRF=113;FSRR=103;FWDB=-0.00497278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.315;QD=7.04581;RBI=0.033499;REFB=-0.0186457;REVB=-0.0331279;RO=318;SAF=118;SAR=152;SRF=161;SRR=157;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0683849;STB=0.530115;TYPE=snp;VARB=0.0204417;OID=.;OPOS=58458579;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:600:400:318:216:270:184:152:118:161:157:98:86:113:103 chr13 60348386 . T A 10.07 PASS AO=3;DP=15;FAO=3;FDP=15;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=0.0434541;FXX=0.062461;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9783;QD=2.68576;RBI=0.0516657;REFB=-0.00228335;REVB=0.0279478;RO=11;SAF=1;SAR=2;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.408883;STB=0.798401;TYPE=snp;VARB=0.113091;OID=.;OPOS=60348386;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:15:15:11:12:3:3:2:1:8:3:2:1:9:3 chr13 61986918 . C A 1093.18 PASS AO=124;DP=127;FAO=122;FDP=127;FR=.;FRO=5;FSAF=66;FSAR=56;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0292739;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3056;QD=34.4309;RBI=0.0520387;REFB=0.0303066;REVB=-0.043024;RO=2;SAF=68;SAR=56;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0137676;STB=0.510282;TYPE=snp;VARB=-0.00667185;OID=.;OPOS=61986918;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:127:127:2:5:124:122:56:68:2:0:56:66:4:1 chr13 61989175 . G T 199.52 PASS AO=48;DP=116;FAO=53;FDP=122;FR=.;FRO=69;FSAF=20;FSAR=33;FSRF=21;FSRR=48;FWDB=-0.00246432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.746;QD=6.54179;RBI=0.00328115;REFB=-0.00972673;REVB=-0.00216635;RO=68;SAF=20;SAR=28;SRF=21;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118491;STB=0.544888;TYPE=snp;VARB=0.0104238;OID=.;OPOS=61989175;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:122:68:69:48:53:28:20:21:47:33:20:21:48 chr13 62232195 . A ATGATCCC 10.4 PASS AO=5;DP=30;FAO=5;FDP=28;FR=.;FRO=23;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.00196672;FXX=0.0666445;HRUN=1;LEN=7;MLLD=238.001;QD=1.48541;RBI=0.010562;REFB=-0.00164887;REVB=-0.0103773;RO=23;SAF=2;SAR=3;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0922723;STB=0.564955;TYPE=ins;VARB=0.00816415;OID=.;OPOS=62232196;OREF=-;OALT=TGATCCC;OMAPALT=ATGATCCC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:5:30:5:28:23:2:3:11:12:10:23:2:3:11:12 chr13 64413891 . T A 94.58 PASS AO=22;DP=48;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=0.0146915;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.5458;QD=8.04946;RBI=0.0559293;REFB=0.031378;REVB=-0.0539652;RO=25;SAF=14;SAR=8;SRF=18;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0874709;STB=0.549313;TYPE=snp;VARB=-0.00893451;OID=.;OPOS=64413891;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:48:47:25:25:22:22:8:14:18:7:8:14:18:7 chr13 64417631 . G T 147.25 PASS AO=16;DP=18;FAO=17;FDP=19;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0121793;FXX=0.049975;HRUN=5;LEN=1;MLLD=245.12;QD=31.0007;RBI=0.021428;REFB=-0.142801;REVB=0.0176302;RO=2;SAF=2;SAR=14;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0609953;STB=0.531215;TYPE=snp;VARB=0.00255897;OID=.;OPOS=64417631;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:18:19:2:2:16:17:14:2:0:2:15:2:0:2 chr13 67800935 . G A 296 PASS AO=88;DP=222;FAO=89;FDP=221;FR=.;FRO=132;FSAF=36;FSAR=53;FSRF=41;FSRR=91;FWDB=-0.00811042;FXX=0.0045043;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.493;QD=5.3575;RBI=0.0116876;REFB=0.00205867;REVB=-0.00841548;RO=132;SAF=36;SAR=52;SRF=40;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120637;STB=0.559512;TYPE=snp;VARB=-0.0036681;OID=.;OPOS=67800935;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:221:132:132:88:89:52:36:40:92:53:36:41:91 chr13 67802339 . A T 2114.95 PASS AO=225;DP=228;FAO=226;FDP=226;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=136;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204873;FXX=0.00877155;HRUN=3;LEN=1;MLLD=256.049;QD=37.4327;RBI=0.021937;REFB=-0.0201428;REVB=-0.00784226;RO=3;SAF=89;SAR=136;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00709517;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.07134e-05;OID=.;OPOS=67802339;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:228:226:3:0:225:226:136:89:2:1:136:90:0:0 chr13 70377107 . A G 1131.45 PASS AO=119;DP=120;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0567997;FXX=0.00833264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.6701;QD=38.032;RBI=0.0573708;REFB=-0.00291053;REVB=-0.00807497;RO=1;SAF=56;SAR=63;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00748016;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000340403;OID=.;OPOS=70377107;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:120:119:1:0:119:119:63:56:0:1:63:56:0:0 chr13 70377165 . C T 1101.69 PASS AO=119;DP=121;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139182;FXX=0.0165276;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.386;QD=37.0316;RBI=0.0140722;REFB=-0.0426325;REVB=0.0020761;RO=2;SAF=46;SAR=73;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00375104;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.42013e-05;OID=.;OPOS=70377165;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:121:119:2:0:119:119:73:46:1:1:73:46:0:0 chr13 71033601 . T C 155.28 PASS AO=22;DP=29;FAO=22;FDP=29;FR=.;FRO=7;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.0137096;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.5;QD=21.418;RBI=0.0314926;REFB=0.0218212;REVB=0.0283519;RO=7;SAF=16;SAR=6;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217516;STB=0.619603;TYPE=snp;VARB=-0.0114832;OID=.;OPOS=71033601;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:29:29:7:7:22:22:6:16:2:5:6:16:2:5 chr13 73280182 . T C 710.77 PASS AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0118803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.547;QD=36.9232;RBI=0.0227748;REFB=-0.111624;REVB=0.0194307;RO=0;SAF=42;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6391e-08;STB=0.507244;TYPE=snp;VARB=0.000516966;OID=.;OPOS=73280182;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:77:77:0:1:76:76:34:42:0:0:34:42:0:1 chr13 73301655 . A C 136.31 PASS AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=245.606;QD=36.3484;RBI=0.00890417;REFB=0;REVB=-0.00890417;RO=0;SAF=0;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.50052e-05;OID=.;OPOS=73301655;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:15:0:0:15:15:15:0:0:0:15:0:0:0 chr13 73302326 . G A 136.24 PASS AO=35;DP=81;FAO=35;FDP=80;FR=.;FRO=45;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=34;FWDB=0.0159254;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.8361;QD=6.81219;RBI=0.0488935;REFB=-0.0167202;REVB=0.0462272;RO=45;SAF=16;SAR=19;SRF=11;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220395;STB=0.623007;TYPE=snp;VARB=0.0108044;OID=.;OPOS=73302326;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:80:45:45:35:35:19:16:11:34:19:16:11:34 chr13 73329358 . G A 1434.53 PASS AO=149;DP=149;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0116449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.009;QD=38.5108;RBI=0.0159132;REFB=0;REVB=0.0108456;RO=0;SAF=71;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.72512e-07;OID=.;OPOS=73329358;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:149:149:0:0:149:149:78:71:0:0:78:71:0:0 chr13 73343039 . C T 700.76 PASS AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0608757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.883;QD=37.8787;RBI=0.0608913;REFB=0;REVB=0.00138096;RO=0;SAF=39;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.80413e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000322846;OID=.;OPOS=73343039;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:74:74:0:0:74:74:35:39:0:0:35:39:0:0 chr13 73349359 . G C 336.13 PASS AO=87;DP=191;FAO=87;FDP=191;FR=.;FRO=104;FSAF=50;FSAR=37;FSRF=71;FSRR=33;FWDB=-0.00410505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.394;QD=7.03943;RBI=0.0149644;REFB=-0.0132507;REVB=0.0143903;RO=102;SAF=50;SAR=37;SRF=69;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103408;STB=0.561225;TYPE=snp;VARB=0.0166143;OID=.;OPOS=73349359;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:191:191:102:104:87:87:37:50:69:33:37:50:71:33 chr13 73350079 . T C 598.26 PASS AO=179;DP=412;FAO=172;FDP=398;FR=.;FRO=226;FSAF=74;FSAR=98;FSRF=101;FSRR=125;FWDB=0.00540959;FXX=0.00499988;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.023;QD=6.01269;RBI=0.00705216;REFB=-0.0074184;REVB=-0.00452429;RO=232;SAF=78;SAR=101;SRF=106;SRR=126;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218113;STB=0.509627;TYPE=snp;VARB=0.00826835;OID=.;OPOS=73350079;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:412:398:232:226:179:172:101:78:106:126:98:74:101:125 chr13 73455273 . T C 16.47 PASS AO=10;DP=54;FAO=10;FDP=53;FR=.;FRO=43;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=-0.0295515;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.227;QD=1.24293;RBI=0.0296163;REFB=-0.00506726;REVB=-0.00195859;RO=43;SAF=4;SAR=6;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137541;STB=0.590727;TYPE=snp;VARB=0.028157;OID=.;OPOS=73455273;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:54:53:43:43:10:10:6:4:22:21:6:4:22:21 chr13 73650112 . C A 570.67 PASS AO=57;DP=57;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00122637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.378;QD=37.421;RBI=0.0152089;REFB=0;REVB=0.0151593;RO=0;SAF=42;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.08575e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.94328e-06;OID=.;OPOS=73650112;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:57:61:0:0:57:61:15:42:0:0:16:45:0:0 chr13 73650117 . G A 578.07 PASS AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0450903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.411;QD=37.2951;RBI=0.0533094;REFB=0;REVB=0.0284386;RO=0;SAF=46;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.50785e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000147297;OID=.;OPOS=73650117;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:62:62:0:0:62:62:16:46:0:0:16:46:0:0 chr13 74339104 . G T 173.34 PASS AO=33;DP=72;FAO=38;FDP=73;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.0133463;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.183;QD=9.49811;RBI=0.0469438;REFB=0.000939666;REVB=0.0450066;RO=32;SAF=10;SAR=23;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.241663;STB=0.58663;TYPE=snp;VARB=-0.000506404;OID=.;OPOS=74339104;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:73:32:35:33:38:23:10:18:14:25:13:18:17 chr13 74518210 . G A 566.38 PASS AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0184901;FXX=0.0322529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.07;QD=37.7586;RBI=0.0233495;REFB=0;REVB=0.0142589;RO=0;SAF=22;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000162522;OID=.;OPOS=74518210;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:61:60:0:0:60:60:38:22:0:0:38:22:0:0 chr13 74863339 . C A 185.84 PASS AO=42;DP=93;FAO=46;FDP=100;FR=.;FRO=54;FSAF=11;FSAR=35;FSRF=14;FSRR=40;FWDB=0.00735578;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.995;QD=7.43342;RBI=0.0237369;REFB=-0.0104126;REVB=-0.0225684;RO=51;SAF=11;SAR=31;SRF=14;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0158156;STB=0.514699;TYPE=snp;VARB=0.00805238;OID=.;OPOS=74863339;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:100:51:54:42:46:31:11:14:37:35:11:14:40 chr13 74988714 . C T 426.69 PASS AO=91;DP=170;FAO=91;FDP=170;FR=.;FRO=79;FSAF=29;FSAR=62;FSRF=52;FSRR=27;FWDB=-0.0210392;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.9154;QD=10.0398;RBI=0.0219478;REFB=-0.0254719;REVB=0.0062496;RO=77;SAF=29;SAR=62;SRF=52;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.302754;STB=0.660493;TYPE=snp;VARB=0.0311158;OID=.;OPOS=74988714;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:170:77:79:91:91:62:29:52:25:62:29:52:27 chr13 75814018 . C T 593.88 PASS AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.031264;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=239.058;QD=37.7064;RBI=0.0406169;REFB=0;REVB=0.0259286;RO=0;SAF=23;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.56747e-06;OID=.;OPOS=75814018;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:63:63:0:0:63:63:40:23:0:0:40:23:0:0 chr13 75814070 . C G 66.86 PASS AO=18;DP=46;FAO=18;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=23;FWDB=-0.0218308;FXX=0.0217344;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.472;QD=5.94349;RBI=0.0285471;REFB=0.00396588;REVB=0.0183944;RO=27;SAF=7;SAR=11;SRF=4;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.288032;STB=0.662802;TYPE=snp;VARB=-0.00731939;OID=.;OPOS=75814070;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:46:45:27:27:18:18:11:7:4:23:11:7:4:23 chr13 75814344 . C A 353.58 PASS AO=69;DP=115;FAO=69;FDP=119;FR=.;FRO=50;FSAF=41;FSAR=28;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=-0.0522709;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.7901;QD=11.885;RBI=0.0864104;REFB=-0.0536552;REVB=-0.0688078;RO=46;SAF=41;SAR=28;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.086789;STB=0.531927;TYPE=snp;VARB=0.0392637;OID=.;OPOS=75814344;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:119:46:50:69:69:28:41:22:24:28:41:26:24 chr13 75814384 . C T 161.4 PASS AO=48;DP=121;FAO=48;FDP=121;FR=.;FRO=73;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=38;FSRR=35;FWDB=-0.0280248;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.44;QD=5.33558;RBI=0.0320409;REFB=-0.0167222;REVB=-0.0155317;RO=70;SAF=24;SAR=24;SRF=38;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0450629;STB=0.512392;TYPE=snp;VARB=0.0290383;OID=.;OPOS=75814384;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:70:73:48:48:24:24:38:32:24:24:38:35 chr13 75866284 . G A 223.79 PASS AO=53;DP=111;FAO=53;FDP=110;FR=.;FRO=57;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=28;FSRR=29;FWDB=-0.0175615;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.997;QD=8.13764;RBI=0.0182929;REFB=-0.00242601;REVB=-0.00512083;RO=56;SAF=26;SAR=27;SRF=27;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00780985;STB=0.500343;TYPE=snp;VARB=0.00305445;OID=.;OPOS=75866284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:110:56:57:53:53:27:26:27:29:27:26:28:29 chr13 75876389 . G A 331.87 PASS AO=103;DP=265;FAO=103;FDP=260;FR=.;FRO=157;FSAF=77;FSAR=26;FSRF=92;FSRR=65;FWDB=-0.0102924;FXX=0.0225555;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.969;QD=5.10565;RBI=0.0114847;REFB=0.00273028;REVB=-0.00509552;RO=160;SAF=77;SAR=26;SRF=92;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215858;STB=0.614571;TYPE=snp;VARB=-0.00318116;OID=.;OPOS=75876389;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:265:260:160:157:103:103:26:77:92:68:26:77:92:65 chr13 75884216 . C T 1610.55 PASS AO=166;DP=168;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146641;FXX=0.0718192;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.801;QD=38.3464;RBI=0.0190121;REFB=0;REVB=0.0121006;RO=0;SAF=64;SAR=102;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00213349;OID=.;OPOS=75884216;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:168:168:0:0:166:168:102:64:0:0:102:66:0:0 chr13 75936519 . C G 356.86 PASS AO=41;DP=43;FAO=41;FDP=43;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0199645;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=282.388;QD=33.1965;RBI=0.0262566;REFB=-0.0964969;REVB=-0.0170537;RO=2;SAF=39;SAR=2;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0234633;STB=0.512494;TYPE=snp;VARB=0.000363714;OID=.;OPOS=75936519;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:43:43:2:2:41:41:2:39:2:0:2:39:2:0 chr13 76124151 . C T 297.21 PASS AO=53;DP=82;FAO=52;FDP=81;FR=.;FRO=29;FSAF=32;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.0120531;FXX=0.0121936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.166;QD=14.6768;RBI=0.116299;REFB=0.00589177;REVB=-0.115673;RO=29;SAF=32;SAR=21;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0581044;STB=0.536475;TYPE=snp;VARB=-0.00506795;OID=.;OPOS=76124151;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:82:81:29:29:53:52:21:32:15:14:20:32:15:14 chr13 76335109 . A G 167.01 PASS AO=37;DP=180;FAO=41;FDP=180;FR=.,HEALED;FRO=115;FSAF=29;FSAR=12;FSRF=71;FSRR=44;FWDB=-0.0169944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.39;QD=3.71141;RBI=0.0231207;REFB=0.00123818;REVB=-0.0156767;RO=114;SAF=29;SAR=8;SRF=71;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242691;STB=0.575033;TYPE=snp;VARB=-3.29957e-05;OID=.;OPOS=76335109;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:180:180:114:115:37:41:8:29:71:43:12:29:71:44 chr13 76378459 . T C 2424.9 PASS AO=265;DP=273;FAO=265;FDP=271;FR=.;FRO=6;FSAF=145;FSAR=120;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0184383;FXX=0.00732574;HRUN=3;LEN=1;MLLD=135.278;QD=35.7919;RBI=0.0235885;REFB=-0.1495;REVB=0.0147121;RO=3;SAF=145;SAR=120;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00460221;STB=0.502671;TYPE=snp;VARB=0.000630797;OID=.;OPOS=76378459;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:273:271:3:6:265:265:120:145:1:2:120:145:4:2 chr13 76382100 . C T 167.84 PASS AO=34;DP=62;FAO=34;FDP=62;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=28;FSRF=5;FSRR=23;FWDB=0.0179768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.167;QD=10.8286;RBI=0.0496092;REFB=-0.0224544;REVB=0.0462375;RO=28;SAF=6;SAR=28;SRF=5;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0029432;STB=0.501628;TYPE=snp;VARB=0.0183116;OID=.;OPOS=76382100;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:28:28:34:34:28:6:5:23:28:6:5:23 chr13 76395620 . C T 181.27 PASS AO=38;DP=73;FAO=39;FDP=74;FR=.;FRO=35;FSAF=5;FSAR=34;FSRF=8;FSRR=27;FWDB=-0.039935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.053;QD=9.79831;RBI=0.0439027;REFB=0.00576212;REVB=-0.0182385;RO=35;SAF=5;SAR=33;SRF=8;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157867;STB=0.591647;TYPE=snp;VARB=-0.00457252;OID=.;OPOS=76395620;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:74:35:35:38:39:33:5:8:27:34:5:8:27 chr13 76397731 . G A 278.47 PASS AO=62;DP=121;FAO=62;FDP=121;FR=.;FRO=59;FSAF=31;FSAR=31;FSRF=25;FSRR=34;FWDB=0.0110299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.1226;QD=9.20569;RBI=0.0411653;REFB=-0.00869361;REVB=-0.0396601;RO=58;SAF=31;SAR=31;SRF=24;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0757297;STB=0.537178;TYPE=snp;VARB=0.00960174;OID=.;OPOS=76397731;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:58:59:62:62:31:31:24:34:31:31:25:34 chr13 76423248 . T C 1867.04 PASS AO=192;DP=192;FAO=195;FDP=195;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.4997;QD=38.2982;RBI=0.0454599;REFB=0;REVB=0.0399794;RO=0;SAF=88;SAR=104;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000115713;OID=.;OPOS=76423248;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:192:195:0:0:192:195:104:88:0:0:107:88:0:0 chr13 76457183 . T C 259.64 PASS AO=72;DP=185;FAO=79;FDP=190;FR=.;FRO=111;FSAF=38;FSAR=41;FSRF=51;FSRR=60;FWDB=-0.0223811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.162;QD=5.46618;RBI=0.0241513;REFB=-0.00442917;REVB=0.00907582;RO=110;SAF=37;SAR=35;SRF=50;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0636366;STB=0.512619;TYPE=snp;VARB=0.0061842;OID=.;OPOS=76457183;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:190:110:111:72:79:35:37:50:60:41:38:51:60 chr13 76709108 . G A 969.79 PASS AO=96;DP=96;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0471685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.906;QD=38.0309;RBI=0.0621702;REFB=0;REVB=0.0405002;RO=0;SAF=44;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.45691e-05;OID=.;OPOS=76709108;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:96:102:0:0:96:102:52:44:0:0:55:47:0:0 chr13 76709223 . C A 1528.65 PASS AO=154;DP=158;FAO=165;FDP=168;FR=.;FRO=3;FSAF=75;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.00732151;FXX=0.00591681;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.5952;QD=36.3965;RBI=0.0591962;REFB=-0.194575;REVB=0.0587417;RO=1;SAF=74;SAR=80;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00590956;STB=0.508196;TYPE=snp;VARB=0.00444568;OID=.;OPOS=76709223;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:158:168:1:3:154:165:80:74:0:1:90:75:0:3 chr13 77454382 . A C 217.48 PASS AO=58;DP=124;FAO=55;FDP=121;FR=.;FRO=66;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=25;FSRR=41;FWDB=0.0155934;FXX=0.0396794;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.832;QD=7.18944;RBI=0.0167982;REFB=-0.00614825;REVB=-0.00624691;RO=63;SAF=28;SAR=30;SRF=25;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.081134;STB=0.54197;TYPE=snp;VARB=0.00520781;OID=.;OPOS=77454382;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:121:63:66:58:55:30:28:25:38:30:25:25:41 chr13 77527764 . T A 470.9 PASS AO=116;DP=242;FAO=116;FDP=242;FR=.;FRO=126;FSAF=53;FSAR=63;FSRF=61;FSRR=65;FWDB=0.0113701;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=268.87;QD=7.78346;RBI=0.012928;REFB=0.000236634;REVB=-0.00615256;RO=124;SAF=53;SAR=63;SRF=60;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0254381;STB=0.514246;TYPE=snp;VARB=-0.000253885;OID=.;OPOS=77527764;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:242:242:124:126:116:116:63:53:60:64:63:53:61:65 chr13 77574983 . A G 294.73 PASS AO=80;DP=183;FAO=80;FDP=182;FR=.;FRO=102;FSAF=36;FSAR=44;FSRF=40;FSRR=62;FWDB=-0.00952779;FXX=0.00546418;HRUN=3;LEN=1;MLLD=216.865;QD=6.4775;RBI=0.0178259;REFB=-0.00402513;REVB=-0.015066;RO=101;SAF=36;SAR=44;SRF=40;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0550393;STB=0.532953;TYPE=snp;VARB=0.00547689;OID=.;OPOS=77574983;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:182:101:102:80:80:44:36:40:61:44:36:40:62 chr13 77575137 . A G 345.26 PASS AO=83;DP=172;FAO=83;FDP=171;FR=.;FRO=88;FSAF=47;FSAR=36;FSRF=48;FSRR=40;FWDB=0.0224612;FXX=0.00581362;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.5757;QD=8.07617;RBI=0.0265726;REFB=-0.00776143;REVB=0.0141985;RO=87;SAF=47;SAR=36;SRF=48;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0137053;STB=0.510867;TYPE=snp;VARB=0.00940845;OID=.;OPOS=77575137;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:171:87:88:83:83:36:47:48:39:36:47:48:40 chr13 77632470 . C T 2063.74 PASS AO=212;DP=213;FAO=220;FDP=220;FR=.;FRO=0;FSAF=110;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0440344;FXX=0.00452468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.77;QD=37.5226;RBI=0.0441843;REFB=-0.0189074;REVB=-0.00363754;RO=0;SAF=103;SAR=109;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.09156e-05;OID=.;OPOS=77632470;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:213:220:0:0:212:220:109:103:0:0:110:110:0:0 chr13 77751892 . C T 1798.62 PASS AO=193;DP=201;FAO=193;FDP=196;FR=.;FRO=3;FSAF=91;FSAR=102;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-8.99709e-05;FXX=0.0248744;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.016;QD=36.7065;RBI=0.0271891;REFB=0.0109747;REVB=-0.027189;RO=2;SAF=91;SAR=102;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000558449;STB=0.502122;TYPE=snp;VARB=-8.79517e-05;OID=.;OPOS=77751892;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:201:196:2:3:193:193:102:91:1:1:102:91:1:2 chr13 78146301 . C T 1588.7 PASS AO=172;DP=177;FAO=174;FDP=176;FR=.;FRO=2;FSAF=76;FSAR=98;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0351498;FXX=0.0056494;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.7996;QD=36.1068;RBI=0.0460349;REFB=-0.193746;REVB=-0.0297272;RO=1;SAF=75;SAR=97;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00630407;STB=0.50073;TYPE=snp;VARB=0.0046568;OID=.;OPOS=78146301;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:177:176:1:2:172:174:97:75:1:0:98:76:1:1 chr13 78178550 . G A 97.94 PASS AO=37;DP=118;FAO=38;FDP=118;FR=.;FRO=80;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=54;FWDB=-0.0383739;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.977;QD=3.31995;RBI=0.0583821;REFB=-0.00938523;REVB=0.043999;RO=81;SAF=21;SAR=16;SRF=27;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.271063;STB=0.667162;TYPE=snp;VARB=0.00823614;OID=.;OPOS=78178550;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:118:118:81:80:37:38:16:21:27:54:16:22:26:54 chr13 78338016 . A G 384.64 PASS AO=96;DP=205;FAO=96;FDP=203;FR=.;FRO=107;FSAF=27;FSAR=69;FSRF=17;FSRR=90;FWDB=-0.00551333;FXX=0.00975562;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.912;QD=7.57917;RBI=0.0181561;REFB=-0.012422;REVB=0.0172988;RO=105;SAF=27;SAR=69;SRF=17;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151144;STB=0.585739;TYPE=snp;VARB=0.0141443;OID=.;OPOS=78338016;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:203:105:107:96:96:69:27:17:88:69:27:17:90 chr13 78475313 . T C 280.32 PASS AO=55;DP=95;FAO=55;FDP=95;FR=.;FRO=40;FSAF=39;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=-0.0221146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.6221;QD=11.8031;RBI=0.0305477;REFB=-0.0324198;REVB=0.0210739;RO=37;SAF=39;SAR=16;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140441;STB=0.597918;TYPE=snp;VARB=0.0314798;OID=.;OPOS=78475313;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:37:40:55:55:16:39:20:17:16:39:20:20 chr13 78477674 . A G 998.19 PASS AO=106;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0328055;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.512;QD=37.6677;RBI=0.070025;REFB=0.0548082;REVB=-0.0618652;RO=0;SAF=36;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000158998;OID=.;OPOS=78477674;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:106:106:0:0:106:106:70:36:0:0:70:36:0:0 chr13 79940811 . T C 142.26 PASS AO=26;DP=43;FAO=26;FDP=43;FR=.;FRO=17;FSAF=24;FSAR=2;FSRF=14;FSRR=3;FWDB=-0.00147606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.866;QD=13.2334;RBI=0.0129156;REFB=0.00589217;REVB=-0.0128309;RO=16;SAF=24;SAR=2;SRF=13;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211205;STB=0.612143;TYPE=snp;VARB=-0.00444144;OID=.;OPOS=79940811;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:43:43:16:17:26:26:2:24:13:3:2:24:14:3 chr13 80910786 . C A 395.06 PASS AO=99;DP=206;FAO=98;FDP=206;FR=.;FRO=108;FSAF=38;FSAR=60;FSRF=55;FSRR=53;FWDB=-0.0256738;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.2068;QD=7.67107;RBI=0.0328847;REFB=0.0105258;REVB=-0.020549;RO=106;SAF=39;SAR=60;SRF=53;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101596;STB=0.565107;TYPE=snp;VARB=-0.00944055;OID=.;OPOS=80910786;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:206:206:106:108:99:98:60:39:53:53:60:38:55:53 chr13 80910792 . T G 365 PASS AO=92;DP=199;FAO=92;FDP=197;FR=.;FRO=105;FSAF=36;FSAR=56;FSRF=53;FSRR=52;FWDB=-0.0302617;FXX=0.0100497;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.308;QD=7.41114;RBI=0.0302734;REFB=-0.00608021;REVB=0.000840911;RO=104;SAF=36;SAR=56;SRF=52;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106564;STB=0.561754;TYPE=snp;VARB=0.00671193;OID=.;OPOS=80910792;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:199:197:104:105:92:92:56:36:52:52:56:36:53:52 chr13 84452392 . C T 164.23 PASS AO=40;DP=89;FAO=41;FDP=90;FR=.;FRO=49;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=18;FWDB=0.026032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.312;QD=7.29896;RBI=0.0321632;REFB=-0.010719;REVB=0.0188893;RO=46;SAF=24;SAR=16;SRF=29;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.030569;STB=0.513167;TYPE=snp;VARB=0.0182203;OID=.;OPOS=84452392;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:90:46:49:40:41:16:24:29:17:16:25:31:18 chr13 84456487 . G C 22.52 PASS AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.188;QD=11.2583;RBI=0.0185526;REFB=-0.00409802;REVB=0.0185526;RO=3;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00160735;OID=.;OPOS=84456487;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:8:8:3:3:5:5:5:0:0:3:5:0:0:3 chr13 86369120 . C T 657.41 PASS AO=68;DP=69;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00291859;FXX=0.0277739;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.971;QD=37.5662;RBI=0.0284648;REFB=0;REVB=0.0283148;RO=0;SAF=43;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00103247;OID=.;OPOS=86369120;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:69:70:0:0:68:70:25:43:0:0:25:45:0:0 chr13 92345807 . TG T 730.46 PASS AO=89;DP=117;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.193739;FXX=0.00909008;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.1102;QD=26.8057;RBI=0.311905;REFB=0;REVB=0.244439;RO=16;SAF=15;SAR=74;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0.455026;SSSB=-0.00963048;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00879126;OID=.;OPOS=92345808;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:89:110:109:109:0:18:91:0:0:65:16:15:74:3:13 chr13 92380829 . G A 297.85 PASS AO=74;DP=248;FAO=96;FDP=249;FR=.;FRO=153;FSAF=38;FSAR=58;FSRF=42;FSRR=111;FWDB=0.00602357;FXX=0.0235285;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.825;QD=4.78472;RBI=0.0144351;REFB=-0.0107646;REVB=0.0131182;RO=126;SAF=20;SAR=54;SRF=28;SRR=98;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0704954;STB=0.58053;TYPE=snp;VARB=0.016565;OID=.;OPOS=92380829;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:248:249:126:153:74:96:54:20:28:98:58:38:42:111 chr13 95034763 . G A 67.2 PASS AO=17;DP=40;FAO=17;FDP=41;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=0.0221544;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.603;QD=6.5562;RBI=0.0314924;REFB=-0.0287455;REVB=-0.0223819;RO=22;SAF=7;SAR=10;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0492737;STB=0.548137;TYPE=snp;VARB=0.0820631;OID=.;OPOS=95034763;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:40:41:22:24:17:17:10:7:8:14:10:7:8:16 chr13 95097956 . C T 654.75 PASS AO=76;DP=88;FAO=79;FDP=87;FR=.;FRO=8;FSAF=28;FSAR=51;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0291537;FXX=0.0113623;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.2275;QD=30.1033;RBI=0.0398411;REFB=-0.0829488;REVB=0.0271547;RO=12;SAF=29;SAR=47;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0593372;STB=0.510554;TYPE=snp;VARB=0.00891276;OID=.;OPOS=95097956;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:88:87:12:8:76:79:47:29:2:10:51:28:2:6 chr13 95279467 . A G 157.16 PASS AO=50;DP=136;FAO=51;FDP=136;FR=.;FRO=85;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=33;FSRR=52;FWDB=-0.0027775;FXX=0.00729874;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.789;QD=4.62236;RBI=0.00584272;REFB=-0.0041932;REVB=0.00514032;RO=84;SAF=22;SAR=28;SRF=34;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0396331;STB=0.527677;TYPE=snp;VARB=0.00910128;OID=.;OPOS=95279467;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:84:85:50:51:28:22:34:50:29:22:33:52 chr13 95364046 . C G 136.96 PASS AO=37;DP=87;FAO=37;FDP=87;FR=.;FRO=50;FSAF=27;FSAR=10;FSRF=37;FSRR=13;FWDB=-0.0131783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.959;QD=6.2968;RBI=0.0177551;REFB=-0.00593619;REVB=-0.0118986;RO=50;SAF=27;SAR=10;SRF=37;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133595;STB=0.50753;TYPE=snp;VARB=0.00894052;OID=.;OPOS=95364046;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:50:50:37:37:10:27:37:13:10:27:37:13 chr13 95672950 . A G 1308.76 PASS AO=136;DP=136;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.022435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.867;QD=38.2121;RBI=0.0270651;REFB=0;REVB=-0.015139;RO=0;SAF=53;SAR=83;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.78586e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.01119e-05;OID=.;OPOS=95672950;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:136:137:0:0:136:137:83:53:0:0:83:54:0:0 chr13 95673135 . C T 1105.03 PASS AO=131;DP=139;FAO=129;FDP=139;FR=.;FRO=10;FSAF=80;FSAR=49;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=-0.0113819;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.4129;QD=31.7995;RBI=0.0408556;REFB=-0.0187162;REVB=-0.0392381;RO=8;SAF=80;SAR=51;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0451893;STB=0.513821;TYPE=snp;VARB=0.00684511;OID=.;OPOS=95673135;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:139:139:8:10:131:129:51:80:8:0:49:80:8:2 chr13 95673938 . TA T,TG 2504.12 PASS AO=62,203;DP=289;FAO=63,212;FDP=275;FR=.;FRO=0;FSAF=32,106;FSAR=31,106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121468,0.0165622;FXX=0.00362306;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=70.7562,85.3692;QD=36.4236;RBI=0.0152877,0.0212608;REFB=0,0;REVB=0.00928263,0.0133309;RO=2;SAF=31,102;SAR=31,101;SRF=1;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,4.57637e-05;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0147397,-0.00288748;OID=.,.;OPOS=95673939,95673939;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=T,TG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:62,203:277:63,212:275:0:32,106:31,106:0:0:65:2:31,102:31,101:1:1 chr13 95714976 . C T 1565.68 PASS AO=158;DP=158;FAO=165;FDP=165;FR=.;FRO=0;FSAF=113;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.054;QD=37.956;RBI=0.0236146;REFB=0;REVB=0.0141326;RO=0;SAF=111;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000305145;OID=.;OPOS=95714976;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:158:165:0:0:158:165:47:111:0:0:52:113:0:0 chr13 95726541 . A G 1437.37 PASS AO=151;DP=154;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199166;FXX=0.0064512;HRUN=3;LEN=1;MLLD=162.725;QD=37.3343;RBI=0.0777111;REFB=-0.0607877;REVB=0.0751155;RO=2;SAF=63;SAR=88;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00211555;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000213644;OID=.;OPOS=95726541;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:154:154:2:0:151:154:88:63:1:1:89:65:0:0 chr13 95727780 . T C 1190.15 PASS AO=125;DP=125;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00414485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.3366;QD=38.0849;RBI=0.0155666;REFB=0;REVB=-0.0150047;RO=0;SAF=63;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.04329e-05;OID=.;OPOS=95727780;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:125:125:0:0:125:125:62:63:0:0:63:62:0:0 chr13 95815834 . A G 68.91 PASS AO=20;DP=53;FAO=20;FDP=53;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=-0.0123916;FXX=0.036357;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.092;QD=5.20047;RBI=0.0413016;REFB=-0.00257336;REVB=0.0393988;RO=31;SAF=9;SAR=11;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0696766;STB=0.559263;TYPE=snp;VARB=0.00466423;OID=.;OPOS=95815834;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:53:53:31:33:20:20:11:9:16:15:11:9:18:15 chr13 95858978 . T C 65.47 PASS AO=19;DP=51;FAO=19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=0.00758801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.127;QD=5.13478;RBI=0.00888288;REFB=0.00178255;REVB=0.00461819;RO=32;SAF=5;SAR=14;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142071;STB=0.583241;TYPE=snp;VARB=-0.00249124;OID=.;OPOS=95858978;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:51:51:32:32:19:19:14:5:12:20:14:5:12:20 chr13 95858996 . T C 56.5 PASS AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=17;FWDB=0.00579695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.882;QD=5.94759;RBI=0.00716981;REFB=-0.00781537;REVB=0.00421919;RO=23;SAF=3;SAR=12;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0914783;STB=0.55377;TYPE=snp;VARB=0.0116841;OID=.;OPOS=95858996;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:38:38:23:23:15:15:12:3:6:17:12:3:6:17 chr13 95861804 . A G 287.84 PASS AO=73;DP=157;FAO=73;FDP=158;FR=.;FRO=85;FSAF=28;FSAR=45;FSRF=44;FSRR=41;FWDB=0.010776;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.46;QD=7.28699;RBI=0.0231031;REFB=-0.0283973;REVB=-0.0204361;RO=84;SAF=28;SAR=45;SRF=43;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126494;STB=0.573634;TYPE=snp;VARB=0.0363429;OID=.;OPOS=95861804;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:158:84:85:73:73:45:28:43:41:45:28:44:41 chr13 95988412 . T C 352.81 PASS AO=73;DP=132;FAO=73;FDP=132;FR=.;FRO=59;FSAF=38;FSAR=35;FSRF=24;FSRR=35;FWDB=0.0080931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.997;QD=10.6912;RBI=0.0174181;REFB=0.00591767;REVB=-0.0154238;RO=59;SAF=38;SAR=35;SRF=24;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0928355;STB=0.550711;TYPE=snp;VARB=-0.00547603;OID=.;OPOS=95988412;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:59:59:73:73:35:38:24:35:35:38:24:35 chr13 96234436 . CTG C 196.93 PASS AO=80;DP=285;FAO=84;FDP=265;FR=.;FRO=181;FSAF=61;FSAR=23;FSRF=86;FSRR=95;FWDB=-0.0133707;FXX=0.0363623;HRUN=1;LEN=2;MLLD=271.773;QD=2.97255;RBI=0.0152338;REFB=-0.0141711;REVB=-0.0073002;RO=173;SAF=57;SAR=23;SRF=84;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.281324;STB=0.68036;TYPE=del;VARB=0.0327757;OID=.;OPOS=96234437;OREF=TG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:80:269:84:265:181:61:23:86:95:99:173:57:23:84:89 chr13 96540141 . T C 3626.02 PASS AO=559;DP=575;FAO=392;FDP=392;FR=.;FRO=0;FSAF=145;FSAR=247;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00194363;FXX=0.0199995;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.3627;QD=37.0002;RBI=0.00971529;REFB=-0.0391893;REVB=-0.00951889;RO=14;SAF=210;SAR=349;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00447606;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000488981;OID=.;OPOS=96540141;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:575:392:14:0:559:392:349:210:4:10:247:145:0:0 chr13 96540143 . T C 3815.67 PASS AO=582;DP=587;FAO=398;FDP=398;FR=.;FRO=0;FSAF=145;FSAR=253;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00170982;FXX=0.00499988;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.421;QD=38.3485;RBI=0.0523804;REFB=0.0269138;REVB=0.0523525;RO=2;SAF=216;SAR=366;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00440108;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.20839e-05;OID=.;OPOS=96540143;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:587:398:2:0:582:398:366:216:2:0:253:145:0:0 chr13 96638636 . A C 714.92 PASS AO=171;DP=341;FAO=171;FDP=345;FR=.;FRO=174;FSAF=70;FSAR=101;FSRF=75;FSRR=99;FWDB=0.0116611;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.093;QD=8.28892;RBI=0.0186139;REFB=-0.0157858;REVB=-0.0145085;RO=169;SAF=70;SAR=101;SRF=74;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0266096;STB=0.511257;TYPE=snp;VARB=0.0147401;OID=.;OPOS=96638636;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:341:345:169:174:171:171:101:70:74:95:101:70:75:99 chr13 96821982 . G T 698.26 PASS AO=72;DP=73;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00135735;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=238.971;QD=36.7504;RBI=0.010939;REFB=-0.00623813;REVB=0.0108545;RO=1;SAF=38;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122839;STB=0.506492;TYPE=snp;VARB=1.67854e-05;OID=.;OPOS=96821982;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:73:76:1:1:72:75:34:38:1:0:37:38:1:0 chr13 97489457 . G A 222.07 PASS AO=68;DP=172;FAO=68;FDP=172;FR=.;FRO=104;FSAF=27;FSAR=41;FSRF=46;FSRR=58;FWDB=-0.0106215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.476;QD=5.16442;RBI=0.0279725;REFB=-0.00179151;REVB=0.0258775;RO=104;SAF=27;SAR=41;SRF=46;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0500648;STB=0.52823;TYPE=snp;VARB=0.00529333;OID=.;OPOS=97489457;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:172:104:104:68:68:41:27:46:58:41:27:46:58 chr13 97639414 . C T 200.28 PASS AO=63;DP=172;FAO=65;FDP=172;FR=.;FRO=107;FSAF=34;FSAR=31;FSRF=51;FSRR=56;FWDB=-0.00589246;FXX=0.00578001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.962;QD=4.65761;RBI=0.0153488;REFB=-0.0129085;REVB=-0.0141727;RO=108;SAF=33;SAR=30;SRF=52;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0470399;STB=0.528866;TYPE=snp;VARB=0.0201258;OID=.;OPOS=97639414;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:172:108:107:63:65:30:33:52:56:31:34:51:56 chr13 98829176 . T C 279.43 PASS AO=28;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0036408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.885;QD=38.5422;RBI=0.00364589;REFB=0;REVB=-0.000192594;RO=0;SAF=6;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.38859e-06;OID=.;OPOS=98829176;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:28:29:0:0:28:29:22:6:0:0:23:6:0:0 chr13 98896776 . C T 322.89 PASS AO=77;DP=157;FAO=77;FDP=158;FR=.;FRO=81;FSAF=56;FSAR=21;FSRF=68;FSRR=13;FWDB=-0.00711467;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.5808;QD=8.17445;RBI=0.00809538;REFB=-0.0159016;REVB=-0.00386221;RO=80;SAF=56;SAR=21;SRF=67;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138269;STB=0.577621;TYPE=snp;VARB=0.016873;OID=.;OPOS=98896776;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:158:80:81:77:77:21:56:67:13:21:56:68:13 chr13 99088006 . G A 350.69 PASS AO=83;DP=169;FAO=83;FDP=169;FR=.;FRO=86;FSAF=42;FSAR=41;FSRF=44;FSRR=42;FWDB=0.0253407;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1113;QD=8.30046;RBI=0.0254322;REFB=0.0213038;REVB=0.00215567;RO=86;SAF=42;SAR=41;SRF=44;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00517466;STB=0.502852;TYPE=snp;VARB=-0.0345945;OID=.;OPOS=99088006;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:169:86:86:83:83:41:42:44:42:41:42:44:42 chr13 99088113 . C T 255.93 PASS AO=67;DP=150;FAO=67;FDP=150;FR=.;FRO=83;FSAF=29;FSAR=38;FSRF=39;FSRR=44;FWDB=0.0100866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.955;QD=6.82471;RBI=0.0112243;REFB=-0.0111628;REVB=0.00492401;RO=80;SAF=29;SAR=38;SRF=36;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170631;STB=0.520752;TYPE=snp;VARB=0.012117;OID=.;OPOS=99088113;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:150:80:83:67:67:38:29:36:44:38:29:39:44 chr13 99090040 . T G 447.61 PASS AO=84;DP=139;FAO=84;FDP=139;FR=.;FRO=55;FSAF=51;FSAR=33;FSRF=25;FSRR=30;FWDB=-0.033832;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.0299;QD=12.8807;RBI=0.0364579;REFB=0.0030404;REVB=-0.0135859;RO=53;SAF=51;SAR=33;SRF=24;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112345;STB=0.5616;TYPE=snp;VARB=-0.00213831;OID=.;OPOS=99090040;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:53:55:84:84:33:51:24:29:33:51:25:30 chr13 99102477 . GC G 496.61 PASS AO=166;DP=338;FAO=182;FDP=333;FR=.;FRO=151;FSAF=95;FSAR=87;FSRF=77;FSRR=74;FWDB=-0.0367957;FXX=0.00596997;HRUN=4;LEN=1;MLLD=15.859;QD=5.96524;RBI=0.130842;REFB=-0.0310881;REVB=-0.125561;RO=139;SAF=83;SAR=83;SRF=71;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0.377358;SSSB=-0.0090367;STB=0.505469;TYPE=del;VARB=0.0198015;OID=.;OPOS=99102478;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:166:332:182:333:151:95:87:77:74:99:139:83:83:71:68 chr13 99102607 . C T 441.63 PASS AO=107;DP=212;FAO=104;FDP=209;FR=.;FRO=105;FSAF=32;FSAR=72;FSRF=48;FSRR=57;FWDB=-0.0628863;FXX=0.0279057;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.2009;QD=8.45217;RBI=0.0629543;REFB=-0.0188056;REVB=0.0029243;RO=101;SAF=35;SAR=72;SRF=43;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0954539;STB=0.582508;TYPE=snp;VARB=0.0372684;OID=.;OPOS=99102607;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:209:101:105:107:104:72:35:43:58:72:32:48:57 chr13 99105395 . G A 35.62 PASS AO=9;DP=24;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=0.202124;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=37.3452;QD=5.93703;RBI=0.217511;REFB=-0.00892438;REVB=0.0803546;RO=15;SAF=1;SAR=8;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186349;STB=0.615088;TYPE=snp;VARB=0.0323095;OID=.;OPOS=99105395;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:24:24:15:15:9:9:8:1:3:12:8:1:3:12 chr13 99338469 . GC G 23.24 PASS AO=44;DP=122;FAO=30;FDP=118;FR=.;FRO=88;FSAF=4;FSAR=26;FSRF=53;FSRR=35;FWDB=-0.185221;FXX=0.0166653;HRUN=2;LEN=1;MLLD=19.8888;QD=0.787854;RBI=0.185555;REFB=-0.0354284;REVB=-0.0111279;RO=71;SAF=18;SAR=26;SRF=38;SRR=33;SSEN=0.668663;SSEP=0;SSSB=-0.137516;STB=0.858388;TYPE=del;VARB=0.0492354;OID=.;OPOS=99338470;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:44:119:30:118:88:4:26:53:35:23:71:18:26:38:33 chr13 99356612 . A G 3668.18 PASS AO=384;DP=384;FAO=384;FDP=384;FR=.;FRO=0;FSAF=212;FSAR=172;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209906;FXX=0.00518121;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.644;QD=38.2102;RBI=0.0221084;REFB=0.00682213;REVB=-0.0069409;RO=0;SAF=212;SAR=172;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.89709e-05;OID=.;OPOS=99356612;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:384:384:0:0:384:384:172:212:0:0:172:212:0:0 chr13 99447005 . T C 400.3 PASS AO=112;DP=260;FAO=112;FDP=260;FR=.;FRO=148;FSAF=48;FSAR=64;FSRF=72;FSRR=76;FWDB=0.00849422;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.8378;QD=6.1585;RBI=0.0151078;REFB=-0.0037286;REVB=0.0124937;RO=148;SAF=48;SAR=64;SRF=72;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0598753;STB=0.533327;TYPE=snp;VARB=0.00454099;OID=.;OPOS=99447005;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:260:260:148:148:112:112:64:48:72:76:64:48:72:76 chr13 99448441 . T A 77.41 PASS AO=26;DP=75;FAO=26;FDP=75;FR=.;FRO=49;FSAF=23;FSAR=3;FSRF=31;FSRR=18;FWDB=0.00449343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.257;QD=4.12872;RBI=0.0125388;REFB=0.0116136;REVB=-0.0117061;RO=48;SAF=23;SAR=3;SRF=30;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.422179;STB=0.748604;TYPE=snp;VARB=-0.0122229;OID=.;OPOS=99448441;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:75:75:48:49:26:26:3:23:30:18:3:23:31:18 chr13 99512723 . C G 281.59 PASS AO=56;DP=116;FAO=65;FDP=127;FR=.;FRO=62;FSAF=34;FSAR=31;FSRF=21;FSRR=41;FWDB=0.00599389;FXX=0.0155027;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.56;QD=8.86886;RBI=0.00631263;REFB=-0.0295442;REVB=-0.00198056;RO=60;SAF=26;SAR=30;SRF=22;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0923808;STB=0.589427;TYPE=snp;VARB=0.0255007;OID=.;OPOS=99512723;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:127:60:62:56:65:30:26:22:38:31:34:21:41 chr13 99540395 . A G 48.24 PASS AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=-0.0294499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.1598;QD=7.71886;RBI=0.0547578;REFB=0.00912909;REVB=-0.046164;RO=14;SAF=10;SAR=1;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.257402;STB=0.655393;TYPE=snp;VARB=-0.015934;OID=.;OPOS=99540395;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:25:25:14:14:11:11:1:10:11:3:1:10:11:3 chr13 99857984 . T C 165.68 PASS AO=35;DP=66;FAO=35;FDP=66;FR=.;FRO=31;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=23;FWDB=-0.0178367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5553;QD=10.041;RBI=0.0890431;REFB=-0.0313226;REVB=0.0872383;RO=31;SAF=22;SAR=13;SRF=8;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.307691;STB=0.669957;TYPE=snp;VARB=0.0278578;OID=.;OPOS=99857984;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:31:31:35:35:13:22:8:23:13:22:8:23 chr13 99858103 . G A 118.71 PASS AO=29;DP=58;FAO=27;FDP=56;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=8;FWDB=0.00620876;FXX=0.0344768;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5091;QD=8.47955;RBI=0.0527003;REFB=-0.015315;REVB=0.0523333;RO=29;SAF=12;SAR=17;SRF=21;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.272216;STB=0.659681;TYPE=snp;VARB=0.0151883;OID=.;OPOS=99858103;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:56:29:29:29:27:17:12:21:8:16:11:21:8 chr13 99948178 . C A 193.72 PASS AO=54;DP=137;FAO=57;FDP=140;FR=.;FRO=83;FSAF=37;FSAR=20;FSRF=33;FSRR=50;FWDB=0.038429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.393;QD=5.53482;RBI=0.0402046;REFB=-0.00823197;REVB=-0.0118163;RO=83;SAF=34;SAR=20;SRF=33;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.247489;STB=0.649071;TYPE=snp;VARB=0.00800697;OID=.;OPOS=99948178;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:140:83:83:54:57:20:34:33:50:20:37:33:50 chr13 100436131 . CAT C 437.33 PASS AO=116;DP=285;FAO=120;FDP=274;FR=.;FRO=154;FSAF=62;FSAR=58;FSRF=76;FSRR=78;FWDB=0.0197521;FXX=0.0774385;HRUN=1;LEN=2;MLLD=174.961;QD=6.3844;RBI=0.0197549;REFB=-0.000334922;REVB=-0.000328748;RO=153;SAF=61;SAR=55;SRF=75;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0364888;STB=0.513018;TYPE=del;VARB=0.000222978;OID=.;OPOS=100436132;OREF=AT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:116:276:120:274:154:62:58:76:78:99:153:61:55:75:78 chr13 100436228 . G C 522.04 PASS AO=134;DP=298;FAO=136;FDP=298;FR=.;FRO=162;FSAF=54;FSAR=82;FSRF=75;FSRR=87;FWDB=-0.00945396;FXX=0.0324665;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.3177;QD=7.0073;RBI=0.0112704;REFB=-0.00987541;REVB=0.0061356;RO=153;SAF=52;SAR=82;SRF=69;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0629423;STB=0.53684;TYPE=snp;VARB=0.0154682;OID=.;OPOS=100436228;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:298:298:153:162:134:136:82:52:69:84:82:54:75:87 chr13 100517195 . CTG C,CTGTG 582.47 PASS AO=35,22;DP=185;FAO=62,35;FDP=127;FR=.;FRO=30;FSAF=29,23;FSAR=33,12;FSRF=20;FSRR=10;FWDB=-0.058997,0.0373778;FXX=0.225596;HRUN=1,1;LEN=2,2;MLLD=87.6836,59.3346;QD=18.3456;RBI=0.0596528,0.0400481;REFB=-0.0533008,-0.0499301;REVB=-0.00882098,0.0143789;RO=30;SAF=15,13;SAR=20,9;SRF=21;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.223401,-0.117181;STB=0.564574,0.50489;TYPE=del,ins;VARB=-0.0117295,0.0619626;OID=.,.;OPOS=100517196,100517196;OREF=TG,-;OALT=-,TG;OMAPALT=C,CTGTG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:35,22:137:62,35:127:30:29,23:33,12:20:10:96:30:15,13:20,9:21:9 chr13 100518580 . A G 2397.92 PASS AO=251;DP=255;FAO=252;FDP=252;FR=.;FRO=0;FSAF=142;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00323149;FXX=0.0117642;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.5771;QD=38.0622;RBI=0.0172523;REFB=-0.0644174;REVB=-0.016947;RO=0;SAF=142;SAR=109;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000411004;OID=.;OPOS=100518580;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:255:252:0:0:251:252:109:142:0:0:110:142:0:0 chr13 100518634 . C T 613.54 PASS AO=136;DP=255;FAO=135;FDP=255;FR=.;FRO=120;FSAF=62;FSAR=73;FSRF=70;FSRR=50;FWDB=0.0248589;FXX=0.0039061;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.3279;QD=9.62409;RBI=0.0670061;REFB=-0.0152957;REVB=-0.0622242;RO=118;SAF=62;SAR=74;SRF=69;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109482;STB=0.558212;TYPE=snp;VARB=0.0141239;OID=.;OPOS=100518634;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:255:255:118:120:136:135:74:62:69:49:73:62:70:50 chr13 100537232 . T C 261.35 PASS AO=72;DP=167;FAO=72;FDP=167;FR=.;FRO=95;FSAF=27;FSAR=45;FSRF=52;FSRR=43;FWDB=0.0269091;FXX=0.00595203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.019;QD=6.25988;RBI=0.027306;REFB=-0.022971;REVB=0.00463872;RO=95;SAF=27;SAR=45;SRF=52;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177799;STB=0.599365;TYPE=snp;VARB=0.0251149;OID=.;OPOS=100537232;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:167:95:95:72:72:45:27:52:43:45:27:52:43 chr13 100638251 . T G 349.57 PASS AO=90;DP=195;FAO=90;FDP=196;FR=.;FRO=106;FSAF=17;FSAR=73;FSRF=44;FSRR=62;FWDB=0.00864666;FXX=0.00507588;HRUN=3;LEN=1;MLLD=206.199;QD=7.13415;RBI=0.0159461;REFB=-0.0169057;REVB=-0.0133982;RO=100;SAF=17;SAR=73;SRF=38;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.244007;STB=0.659859;TYPE=snp;VARB=0.0176462;OID=.;OPOS=100638251;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:196:100:106:90:90:73:17:38:62:73:17:44:62 chr13 100764074 . ATG A 224.33 PASS AO=52;DP=184;FAO=69;FDP=172;FR=.;FRO=103;FSAF=30;FSAR=39;FSRF=58;FSRR=45;FWDB=-0.00501743;FXX=0.049721;HRUN=1;LEN=2;MLLD=237.818;QD=5.217;RBI=0.0237417;REFB=0.00198959;REVB=-0.0232054;RO=88;SAF=23;SAR=29;SRF=52;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16307;STB=0.576591;TYPE=del;VARB=-0.00440701;OID=.;OPOS=100764075;OREF=TG;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:52:178:69:172:103:30:39:58:45:99:88:23:29:52:36 chr13 100888122 . A G 2905.08 PASS AO=317;DP=325;FAO=317;FDP=325;FR=.;FRO=8;FSAF=140;FSAR=177;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.00837317;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=269.154;QD=35.7549;RBI=0.0184505;REFB=0.0102129;REVB=-0.0164412;RO=6;SAF=140;SAR=177;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00209506;STB=0.501456;TYPE=snp;VARB=-0.000125255;OID=.;OPOS=100888122;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:325:325:6:8:317:317:177:140:3:3:177:140:4:4 chr13 100945533 . G A 2092.85 PASS AO=219;DP=220;FAO=219;FDP=219;FR=.;FRO=0;FSAF=128;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0116023;FXX=0.00454525;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.859;QD=38.2256;RBI=0.0177361;REFB=-0.0158533;REVB=0.0134148;RO=0;SAF=128;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.15098e-05;OID=.;OPOS=100945533;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:220:219:0:0:219:219:91:128:0:0:91:128:0:0 chr13 101287340 . C T 237.58 PASS AO=57;DP=118;FAO=57;FDP=119;FR=.;FRO=62;FSAF=19;FSAR=38;FSRF=21;FSRR=41;FWDB=-0.0033913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.848;QD=7.98571;RBI=0.0342747;REFB=-0.0164069;REVB=-0.0341065;RO=61;SAF=19;SAR=38;SRF=21;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114159;STB=0.503144;TYPE=snp;VARB=0.0277175;OID=.;OPOS=101287340;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:119:61:62:57:57:38:19:21:40:38:19:21:41 chr13 101287365 . T C 1150.75 PASS AO=120;DP=121;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0332147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.867;QD=38.0412;RBI=0.0387176;REFB=0;REVB=-0.0198955;RO=0;SAF=45;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.11218e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00013047;OID=.;OPOS=101287365;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:121:121:0:0:120:121:75:45:0:0:76:45:0:0 chr13 101287404 . G A 262.31 PASS AO=61;DP=117;FAO=61;FDP=123;FR=.;FRO=62;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=29;FSRR=33;FWDB=-0.0108152;FXX=0.0159987;HRUN=4;LEN=1;MLLD=218.475;QD=8.53029;RBI=0.0118526;REFB=0.00172713;REVB=0.00484925;RO=54;SAF=28;SAR=33;SRF=22;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0446026;STB=0.504423;TYPE=snp;VARB=-0.00208221;OID=.;OPOS=101287404;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:123:54:62:61:61:33:28:22:32:33:28:29:33 chr13 101289969 . C T 250.74 PASS AO=48;DP=87;FAO=50;FDP=89;FR=.;FRO=39;FSAF=17;FSAR=33;FSRF=12;FSRR=27;FWDB=-0.0763909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.35;QD=11.2691;RBI=0.0763959;REFB=-0.0126272;REVB=0.000873027;RO=36;SAF=17;SAR=31;SRF=12;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0179129;STB=0.515927;TYPE=snp;VARB=0.004762;OID=.;OPOS=101289969;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:89:36:39:48:50:31:17:12:24:33:17:12:27 chr13 101322622 . G C 102.86 PASS AO=34;DP=94;FAO=34;FDP=95;FR=.;FRO=61;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=40;FWDB=-0.0219771;FXX=0.0104156;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.071;QD=4.33076;RBI=0.036451;REFB=-0.00547729;REVB=0.0290806;RO=60;SAF=11;SAR=23;SRF=21;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0330763;STB=0.515037;TYPE=snp;VARB=0.0105014;OID=.;OPOS=101322622;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:95:60:61:34:34:23:11:21:39:23:11:21:40 chr13 101735211 . G A 555.56 PASS AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.011726;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=274.337;QD=37.0371;RBI=0.0130331;REFB=-0.070131;REVB=0.00568883;RO=1;SAF=17;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0269414;STB=0.514281;TYPE=snp;VARB=0.000142996;OID=.;OPOS=101735211;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:60:60:1:1:59:59:42:17:1:0:42:17:1:0 chr13 101736075 . A G 1270.05 PASS AO=131;DP=134;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000885292;FXX=0.0352088;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.0722;QD=37.0817;RBI=0.170735;REFB=-0.0541013;REVB=-0.170733;RO=2;SAF=86;SAR=45;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0109242;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00025415;OID=.;OPOS=101736075;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:134:137:2:0:131:137:45:86:2:0:51:86:0:0 chr13 103346806 . C G 85.91 PASS AO=15;DP=28;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.0241735;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=262.523;QD=12.2732;RBI=0.024225;REFB=0.0196203;REVB=0.00157934;RO=13;SAF=2;SAR=13;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148635;STB=0.603301;TYPE=snp;VARB=-0.0161829;OID=.;OPOS=103346806;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:28:28:13:12:15:16:13:2:3:10:14:2:3:9 chr13 103383417 . T C 295.07 PASS AO=85;DP=203;FAO=85;FDP=203;FR=.;FRO=118;FSAF=27;FSAR=58;FSRF=46;FSRR=72;FWDB=-0.00262747;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=221.432;QD=5.81412;RBI=0.0026278;REFB=-0.000397481;REVB=4.19616e-05;RO=115;SAF=27;SAR=58;SRF=43;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0649213;STB=0.546735;TYPE=snp;VARB=0.000424915;OID=.;OPOS=103383417;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:203:115:118:85:85:58:27:43:72:58:27:46:72 chr13 103384824 . G A 246.79 PASS AO=59;DP=122;FAO=59;FDP=122;FR=.;FRO=63;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=31;FSRR=32;FWDB=0.00161042;FXX=0.0239981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.574;QD=8.09139;RBI=0.00205777;REFB=0.00692591;REVB=0.00128101;RO=62;SAF=34;SAR=25;SRF=30;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0862524;STB=0.543909;TYPE=snp;VARB=-0.00394585;OID=.;OPOS=103384824;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:62:63:59:59:25:34:30:32:25:34:31:32 chr13 103385015 . A G 2024.28 PASS AO=121;DP=222;FAO=194;FDP=216;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=103;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00270015;FXX=0.00460808;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.308;QD=37.4866;RBI=0.0837448;REFB=0;REVB=0.0837013;RO=0;SAF=100;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000750054;OID=.;OPOS=103385015;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:215:216:0:0:121:194:21:100:0:0:91:103:0:0 chr13 103385299 . A C 1531.49 PASS AO=165;DP=171;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00243084;FXX=0.0175428;HRUN=3;LEN=1;MLLD=162.414;QD=36.464;RBI=0.0175902;REFB=0.0148303;REVB=0.0174214;RO=2;SAF=68;SAR=97;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0137884;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000265296;OID=.;OPOS=103385299;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:171:168:2:0:165:168:97:68:2:0:100:68:0:0 chr13 103385798 . T C 856.27 PASS AO=93;DP=95;FAO=93;FDP=95;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=65;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0097874;FXX=0.0104156;HRUN=3;LEN=1;MLLD=98.6999;QD=36.0533;RBI=0.0106682;REFB=-0.0682214;REVB=0.00424479;RO=2;SAF=28;SAR=65;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00939159;STB=0.504955;TYPE=snp;VARB=0.00306887;OID=.;OPOS=103385798;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:95:95:2:2:93:93:65:28:1:1:65:28:1:1 chr13 103386116 . C G 1242.06 PASS AO=129;DP=129;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0598207;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.91;QD=38.5135;RBI=0.0613766;REFB=0;REVB=0.0137324;RO=0;SAF=70;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.33694e-05;OID=.;OPOS=103386116;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:129:129:0:0:129:129:59:70:0:0:59:70:0:0 chr13 103386283 . A G 3032.07 PASS AO=318;DP=324;FAO=318;FDP=318;FR=.;FRO=0;FSAF=131;FSAR=187;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140137;FXX=0.0185179;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.214;QD=38.1392;RBI=0.0232301;REFB=-0.0115507;REVB=0.0185272;RO=1;SAF=131;SAR=187;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00362745;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.94251e-05;OID=.;OPOS=103386283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:324:318:1:0:318:318:187:131:1:0:187:131:0:0 chr13 103388220 . A G 1398.98 PASS AO=148;DP=149;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00543149;FXX=0.0134219;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.591;QD=38.0674;RBI=0.0211567;REFB=0.0389612;REVB=-0.0204476;RO=0;SAF=70;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.8951e-05;OID=.;OPOS=103388220;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:149:147:0:0:148:147:78:70:0:0:77:70:0:0 chr13 103391634 . C T 288.17 PASS AO=62;DP=119;FAO=62;FDP=117;FR=.;FRO=55;FSAF=31;FSAR=31;FSRF=28;FSRR=27;FWDB=0.0162142;FXX=0.0168053;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1856;QD=9.85185;RBI=0.0240519;REFB=-0.0267941;REVB=0.017765;RO=55;SAF=31;SAR=31;SRF=28;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00777778;STB=0.504272;TYPE=snp;VARB=0.0138241;OID=.;OPOS=103391634;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:117:55:55:62:62:31:31:28:27:31:31:28:27 chr13 103394003 . G A 122.45 PASS AO=28;DP=58;FAO=28;FDP=58;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=10;FWDB=0.0194543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.899;QD=8.44507;RBI=0.0248884;REFB=-0.0135858;REVB=0.015523;RO=30;SAF=13;SAR=15;SRF=20;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185226;STB=0.603587;TYPE=snp;VARB=0.0212057;OID=.;OPOS=103394003;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:30:30:28:28:15:13:20:10:15:13:20:10 chr13 103394613 . T G 114.6 PASS AO=19;DP=30;FAO=19;FDP=30;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0212305;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.3779;QD=15.2802;RBI=0.0256841;REFB=-0.0169107;REVB=-0.0144548;RO=11;SAF=4;SAR=15;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.270717;STB=0.651997;TYPE=snp;VARB=0.00991031;OID=.;OPOS=103394613;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:30:30:11:11:19:19:15:4:6:5:15:4:6:5 chr13 103394716 . T C 238.22 PASS AO=64;DP=146;FAO=64;FDP=146;FR=.;FRO=82;FSAF=57;FSAR=7;FSRF=61;FSRR=21;FWDB=0.00486498;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.074;QD=6.52659;RBI=0.0348245;REFB=0.00923725;REVB=0.034483;RO=80;SAF=57;SAR=7;SRF=60;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.268557;STB=0.6589;TYPE=snp;VARB=-0.0066332;OID=.;OPOS=103394716;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:80:82:64:64:7:57:60:20:7:57:61:21 chr13 103395819 . C T 1568.18 PASS AO=165;DP=167;FAO=166;FDP=166;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165557;FXX=0.00598767;HRUN=3;LEN=1;MLLD=120.576;QD=37.7875;RBI=0.0166171;REFB=0.0231463;REVB=-0.0014275;RO=1;SAF=76;SAR=89;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00531725;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.47264e-05;OID=.;OPOS=103395819;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:167:166:1:0:165:166:89:76:0:1:90:76:0:0 chr13 103396716 . C G 241.05 PASS AO=57;DP=116;FAO=57;FDP=117;FR=.;FRO=60;FSAF=22;FSAR=35;FSRF=3;FSRR=57;FWDB=-0.0200295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.274;QD=8.24101;RBI=0.0205168;REFB=-0.00477342;REVB=-0.00444486;RO=59;SAF=22;SAR=35;SRF=3;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.361712;STB=0.698118;TYPE=snp;VARB=0.00849826;OID=.;OPOS=103396716;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:117:59:60:57:57:35:22:3:56:35:22:3:57 chr13 103397583 . C G 411.4 PASS AO=104;DP=222;FAO=105;FDP=226;FR=.;FRO=121;FSAF=52;FSAR=53;FSRF=64;FSRR=57;FWDB=0.0103925;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1648;QD=7.28137;RBI=0.0752429;REFB=-0.0124693;REVB=-0.0745217;RO=118;SAF=51;SAR=53;SRF=64;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0499941;STB=0.518028;TYPE=snp;VARB=0.0141031;OID=.;OPOS=103397583;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:226:118:121:104:105:53:51:64:54:53:52:64:57 chr13 103397937 . T G 182.45 PASS AO=37;DP=72;FAO=39;FDP=74;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=11;FSRR=24;FWDB=0.00551258;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.906;QD=9.86211;RBI=0.0205479;REFB=0.00476645;REVB=0.0197946;RO=35;SAF=15;SAR=22;SRF=11;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.084436;STB=0.535696;TYPE=snp;VARB=-0.00686774;OID=.;OPOS=103397937;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:74:35:35:37:39:22:15:11:24:24:15:11:24 chr13 103400083 . G A 477.52 PASS AO=115;DP=236;FAO=115;FDP=235;FR=.;FRO=120;FSAF=52;FSAR=63;FSRF=58;FSRR=62;FWDB=-0.00619569;FXX=0.00423711;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.9574;QD=8.12792;RBI=0.0186119;REFB=-0.0159337;REVB=-0.0175504;RO=120;SAF=52;SAR=63;SRF=58;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0291013;STB=0.516006;TYPE=snp;VARB=0.0169425;OID=.;OPOS=103400083;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:236:235:120:120:115:115:63:52:58:62:63:52:58:62 chr13 103400729 . G A 105.98 PASS AO=32;DP=86;FAO=33;FDP=87;FR=.;FRO=54;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=29;FSRR=25;FWDB=0.0141775;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=129.285;QD=4.87278;RBI=0.0204435;REFB=-0.0224335;REVB=0.0147286;RO=54;SAF=14;SAR=18;SRF=29;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108937;STB=0.57009;TYPE=snp;VARB=0.0291405;OID=.;OPOS=103400729;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:87:54:54:32:33:18:14:29:25:19:14:29:25 chr13 103402522 . C T 337.02 PASS AO=89;DP=194;FAO=89;FDP=198;FR=.;FRO=109;FSAF=52;FSAR=37;FSRF=63;FSRR=46;FWDB=-0.00138343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.381;QD=6.80844;RBI=0.0343574;REFB=-0.0131349;REVB=-0.0343295;RO=101;SAF=52;SAR=37;SRF=60;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00970289;STB=0.503558;TYPE=snp;VARB=0.0155111;OID=.;OPOS=103402522;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:198:101:109:89:89:37:52:60:41:37:52:63:46 chr13 103410782 . T C 38.33 PASS AO=20;DP=84;FAO=20;FDP=81;FR=.;FRO=61;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=38;FSRR=23;FWDB=0.00644421;FXX=0.03571;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.098;QD=1.8929;RBI=0.033912;REFB=0.0040805;REVB=0.0332941;RO=58;SAF=15;SAR=5;SRF=37;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162316;STB=0.613018;TYPE=snp;VARB=-0.0102223;OID=.;OPOS=103410782;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:84:81:58:61:20:20:5:15:37:21:5:15:38:23 chr13 103410914 . A T 220.86 PASS AO=64;DP=156;FAO=64;FDP=155;FR=.;FRO=91;FSAF=29;FSAR=35;FSRF=53;FSRR=38;FWDB=-0.000458982;FXX=0.00640985;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.413;QD=5.69948;RBI=0.00169736;REFB=-0.00668659;REVB=-0.00163413;RO=91;SAF=29;SAR=35;SRF=53;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134602;STB=0.575473;TYPE=snp;VARB=0.0173868;OID=.;OPOS=103410914;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:155:91:91:64:64:35:29:53:38:35:29:53:38 chr13 103420680 . C A 137.11 PASS AO=35;DP=88;FAO=38;FDP=89;FR=.;FRO=51;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=25;FSRR=26;FWDB=0.0304838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.2123;QD=6.16214;RBI=0.081587;REFB=0.0090536;REVB=0.0756781;RO=51;SAF=15;SAR=20;SRF=25;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0650154;STB=0.524675;TYPE=snp;VARB=-0.00381498;OID=.;OPOS=103420680;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:89:51:51:35:38:20:15:25:26:21:17:25:26 chr13 103449202 . T C 392.91 PASS AO=112;DP=264;FAO=112;FDP=263;FR=.;FRO=151;FSAF=73;FSAR=39;FSRF=99;FSRR=52;FWDB=-0.00794496;FXX=0.00378774;HRUN=3;LEN=1;MLLD=234.679;QD=5.97581;RBI=0.0116803;REFB=-0.00641019;REVB=0.00856198;RO=150;SAF=73;SAR=39;SRF=99;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00933552;STB=0.502434;TYPE=snp;VARB=0.00876107;OID=.;OPOS=103449202;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:264:263:150:151:112:112:39:73:99:51:39:73:99:52 chr13 103504517 . T C 500.6 PASS AO=121;DP=250;FAO=121;FDP=248;FR=.;FRO=127;FSAF=60;FSAR=61;FSRF=58;FSRR=69;FWDB=-0.00190919;FXX=0.0197621;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.608;QD=8.07411;RBI=0.00974552;REFB=0.00671535;REVB=0.00955668;RO=126;SAF=60;SAR=61;SRF=57;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0403757;STB=0.520066;TYPE=snp;VARB=-0.00534517;OID=.;OPOS=103504517;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:250:248:126:127:121:121:61:60:57:69:61:60:58:69 chr13 103511301 . T C 237.15 PASS AO=48;DP=109;FAO=58;FDP=119;FR=.;FRO=61;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=12;FSRR=49;FWDB=0.0020321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.595;QD=7.97131;RBI=0.00458015;REFB=-0.0239339;REVB=0.00410467;RO=61;SAF=24;SAR=24;SRF=12;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.30683;STB=0.62668;TYPE=snp;VARB=0.0279615;OID=.;OPOS=103511301;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:119:61:61:48:58:24:24:12:49:33:25:12:49 chr13 103527849 . G C 664 PASS AO=87;DP=103;FAO=87;FDP=102;FR=.;FRO=15;FSAF=31;FSAR=56;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=0.00770852;FXX=0.0097078;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.066;QD=26.0391;RBI=0.027486;REFB=-0.0218556;REVB=0.0263829;RO=9;SAF=31;SAR=56;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00444085;STB=0.514488;TYPE=snp;VARB=0.0050582;OID=.;OPOS=103527849;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:103:102:9:15:87:87:56:31:3:6:56:31:4:11 chr13 103527930 . G C 1030.99 PASS AO=109;DP=110;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00250577;FXX=0.0090082;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.154;QD=37.4904;RBI=0.0234078;REFB=-0.0392012;REVB=0.0232733;RO=1;SAF=46;SAR=63;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0102074;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.49003e-05;OID=.;OPOS=103527930;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:110:110:1:0:109:110:63:46:1:0:64:46:0:0 chr13 103528002 . G C 280.97 PASS AO=65;DP=131;FAO=65;FDP=131;FR=.;FRO=66;FSAF=23;FSAR=42;FSRF=20;FSRR=46;FWDB=-0.00689416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.8233;QD=8.57929;RBI=0.0133155;REFB=-0.013711;REVB=0.0113918;RO=66;SAF=23;SAR=42;SRF=20;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0516454;STB=0.528451;TYPE=snp;VARB=0.00957243;OID=.;OPOS=103528002;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:66:66:65:65:42:23:20:46:42:23:20:46 chr13 103705044 . A C 1774.42 PASS AO=190;DP=195;FAO=191;FDP=191;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=116;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0362102;FXX=0.0449978;HRUN=3;LEN=1;MLLD=142.712;QD=37.1606;RBI=0.0468735;REFB=-0.0148117;REVB=0.0297649;RO=3;SAF=74;SAR=116;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0121542;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000464119;OID=.;OPOS=103705044;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:195:191:3:0:190:191:116:74:0:3:116:75:0:0 chr13 106119446 . G A 488.98 PASS AO=91;DP=158;FAO=97;FDP=163;FR=.;FRO=66;FSAF=59;FSAR=38;FSRF=32;FSRR=34;FWDB=0.0356947;FXX=0.00609719;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.5493;QD=11.9995;RBI=0.0374442;REFB=-0.0166813;REVB=-0.0113118;RO=65;SAF=55;SAR=36;SRF=31;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.099784;STB=0.551248;TYPE=snp;VARB=0.0186132;OID=.;OPOS=106119446;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:163:65:66:91:97:36:55:31:34:38:59:32:34 chr13 106142235 . C T 63.32 PASS AO=26;DP=87;FAO=26;FDP=87;FR=.;FRO=61;FSAF=23;FSAR=3;FSRF=53;FSRR=8;FWDB=-0.00735969;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.296;QD=2.91127;RBI=0.0926586;REFB=-0.0114338;REVB=-0.0923659;RO=59;SAF=23;SAR=3;SRF=52;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.009303;STB=0.525967;TYPE=snp;VARB=0.0255975;OID=.;OPOS=106142235;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:87:87:59:61:26:26:3:23:52:7:3:23:53:8 chr13 107144320 . G A 122.02 PASS AO=46;DP=138;FAO=46;FDP=138;FR=.;FRO=92;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=51;FSRR=41;FWDB=-0.04152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.723;QD=3.53683;RBI=0.0428435;REFB=-0.0245299;REVB=-0.0105669;RO=92;SAF=18;SAR=28;SRF=51;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188365;STB=0.608648;TYPE=snp;VARB=0.0402345;OID=.;OPOS=107144320;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:92:92:46:46:28:18:51:41:28:18:51:41 chr13 107145463 . G C 1051.93 PASS AO=91;DP=111;FAO=109;FDP=109;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=62;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0769748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.769;QD=38.6031;RBI=0.0771336;REFB=0;REVB=0.00494619;RO=0;SAF=44;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.04952e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000112395;OID=.;OPOS=107145463;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:109:109:0:0:91:109:47:44:0:0:47:62:0:0 chr13 109661359 . C G 113.72 PASS AO=39;DP=112;FAO=40;FDP=115;FR=.;FRO=75;FSAF=11;FSAR=29;FSRF=20;FSRR=55;FWDB=0.00459531;FXX=0.00861995;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.566;QD=3.9553;RBI=0.0484868;REFB=-0.0120635;REVB=-0.0482686;RO=73;SAF=11;SAR=28;SRF=20;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0113651;STB=0.506853;TYPE=snp;VARB=0.025605;OID=.;OPOS=109661359;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:115:73:75:39:40:28:11:20:53:29:11:20:55 chr13 109717928 . A G 21.52 PASS AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.0128183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.834;QD=4.78269;RBI=0.0128415;REFB=-0.0171121;REVB=-0.000770535;RO=12;SAF=3;SAR=3;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0202894;OID=.;OPOS=109717928;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:18:18:12:12:6:6:3:3:6:6:3:3:6:6 chr13 109779906 . C T 76.38 PASS AO=9;DP=45;FAO=15;FDP=45;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=23;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.0142636;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=33.762;QD=6.78967;RBI=0.105547;REFB=-0.0213319;REVB=-0.104578;RO=13;SAF=7;SAR=2;SRF=12;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.249493;STB=0.52171;TYPE=snp;VARB=0.0250509;OID=.;OPOS=109779906;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:40:45:13:23:9:15:2:7:12:1:6:9:13:10 chr13 109793720 . A C 1374.19 PASS AO=141;DP=142;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.341;QD=38.1719;RBI=0.0114756;REFB=0;REVB=-0.00270867;RO=0;SAF=62;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.52848e-06;OID=.;OPOS=109793720;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:142:144:0:0:141:144:79:62:0:0:80:64:0:0 chr13 110408608 . C T 1850.63 PASS AO=195;DP=195;FAO=195;FDP=195;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00827866;FXX=0.0151508;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.077;QD=37.9616;RBI=0.0163091;REFB=-0.0439506;REVB=0.0140517;RO=0;SAF=91;SAR=104;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.81862e-05;OID=.;OPOS=110408608;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:195:195:0:0:195:195:104:91:0:0:106:89:0:0 chr13 110435953 . A G 147.37 PASS AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.471;QD=36.8436;RBI=0.0730488;REFB=0;REVB=-0.0712884;RO=0;SAF=11;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.36667e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000572076;OID=.;OPOS=110435953;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:16:0:0:16:16:5:11:0:0:5:11:0:0 chr13 110436232 . G A 183.11 PASS AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0369911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.338;QD=38.5503;RBI=0.0370059;REFB=0;REVB=0.00104447;RO=0;SAF=2;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.41729e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000195588;OID=.;OPOS=110436232;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:19:19:0:0:19:19:17:2:0:0:17:2:0:0 chr13 110818598 . T G 374.74 PASS AO=103;DP=238;FAO=104;FDP=240;FR=.;FRO=136;FSAF=44;FSAR=60;FSRF=77;FSRR=59;FWDB=-0.00604404;FXX=0.00414921;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.71;QD=6.24559;RBI=0.0294759;REFB=-0.00716123;REVB=0.0288496;RO=135;SAF=43;SAR=60;SRF=76;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148292;STB=0.58097;TYPE=snp;VARB=0.00896617;OID=.;OPOS=110818598;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:238:240:135:136:103:104:60:43:76:59:60:44:77:59 chr13 110819586 . G A 479.86 PASS AO=114;DP=231;FAO=114;FDP=231;FR=.;FRO=117;FSAF=52;FSAR=62;FSRF=54;FSRR=63;FWDB=0.010209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.733;QD=8.30925;RBI=0.0429841;REFB=-0.00756241;REVB=0.0417542;RO=116;SAF=52;SAR=62;SRF=54;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00866609;STB=0.502753;TYPE=snp;VARB=0.00715871;OID=.;OPOS=110819586;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:231:231:116:117:114:114:62:52:54:62:62:52:54:63 chr13 110827574 . T A 1382.73 PASS AO=151;DP=158;FAO=157;FDP=158;FR=.;FRO=1;FSAF=64;FSAR=93;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0226311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.9013;QD=35.0059;RBI=0.024309;REFB=-0.0863135;REVB=0.00887482;RO=0;SAF=64;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503875;TYPE=snp;VARB=0.00105437;OID=.;OPOS=110827574;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:158:158:0:1:151:157:87:64:0:0:93:64:1:0 chr13 110827580 . C T 1464.24 PASS AO=156;DP=158;FAO=156;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0858031;FXX=0.0126574;HRUN=3;LEN=1;MLLD=165.812;QD=37.5446;RBI=0.0896129;REFB=-0.102326;REVB=-0.0258516;RO=2;SAF=60;SAR=96;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0155912;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000419521;OID=.;OPOS=110827580;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:158:156:2:0:156:156:96:60:2:0:96:60:0:0 chr13 110833702 . C T 918.82 PASS AO=95;DP=98;FAO=100;FDP=102;FR=.;FRO=2;FSAF=41;FSAR=59;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.015177;FXX=0.0097078;HRUN=4;LEN=1;MLLD=114.257;QD=36.0322;RBI=0.017635;REFB=-0.00650132;REVB=0.00898057;RO=1;SAF=41;SAR=54;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114249;STB=0.501822;TYPE=snp;VARB=0.000831753;OID=.;OPOS=110833702;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:98:102:1:2:95:100:54:41:1:0:59:41:1:1 chr13 110839550 . T G 926.19 PASS AO=80;DP=108;FAO=99;FDP=99;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=33;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0719885;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.7033;QD=37.4216;RBI=0.074049;REFB=0;REVB=-0.017347;RO=0;SAF=15;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00603123;OID=.;OPOS=110839550;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:100:99:0:0:80:99:65:15:0:0:66:33:0:0 chr13 110843985 . T C 821.98 PASS AO=90;DP=92;FAO=90;FDP=92;FR=.;FRO=2;FSAF=45;FSAR=45;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00340762;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=191.4;QD=35.7383;RBI=0.00354412;REFB=-0.0219043;REVB=0.000974088;RO=2;SAF=45;SAR=45;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0205972;STB=0.510867;TYPE=snp;VARB=-2.73692e-06;OID=.;OPOS=110843985;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:92:92:2:2:90:90:45:45:2:0:45:45:2:0 chr13 110857823 . C T 1556.44 PASS AO=163;DP=165;FAO=164;FDP=164;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00570873;FXX=0.017963;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.212;QD=37.9619;RBI=0.0138561;REFB=-0.0448893;REVB=0.0126255;RO=1;SAF=74;SAR=89;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00638715;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.38058e-06;OID=.;OPOS=110857823;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:165:164:1:0:163:164:89:74:1:0:89:75:0:0 chr13 110857895 . A G 1120.96 PASS AO=117;DP=117;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00903061;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=111.541;QD=38.3233;RBI=0.0163722;REFB=0;REVB=-0.0136564;RO=0;SAF=49;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.15086e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.7898e-05;OID=.;OPOS=110857895;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:117:117:0:0:117:117:68:49:0:0:68:49:0:0 chr13 110861785 . C G 422.87 PASS AO=90;DP=168;FAO=90;FDP=168;FR=.;FRO=78;FSAF=21;FSAR=69;FSRF=40;FSRR=38;FWDB=-0.0259262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.2406;QD=10.0682;RBI=0.0271641;REFB=-0.0303611;REVB=0.00810656;RO=78;SAF=21;SAR=69;SRF=40;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.275837;STB=0.651915;TYPE=snp;VARB=0.0254313;OID=.;OPOS=110861785;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:78:78:90:90:69:21:40:38:69:21:40:38 chr13 110864225 . A T 825.47 PASS AO=161;DP=274;FAO=162;FDP=275;FR=.;FRO=113;FSAF=70;FSAR=92;FSRF=58;FSRR=55;FWDB=-0.00717297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.715;QD=12.0068;RBI=0.00865224;REFB=-0.0132521;REVB=0.00483836;RO=112;SAF=70;SAR=91;SRF=57;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0567146;STB=0.533668;TYPE=snp;VARB=0.00810106;OID=.;OPOS=110864225;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:274:275:112:113:161:162:91:70:57:55:92:70:58:55 chr13 111077197 . G A 1232.84 PASS AO=144;DP=161;FAO=145;FDP=155;FR=.;FRO=10;FSAF=66;FSAR=79;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.0162232;FXX=0.0432072;HRUN=3;LEN=1;MLLD=117.376;QD=31.8153;RBI=0.0441651;REFB=-0.166892;REVB=0.0410775;RO=11;SAF=66;SAR=78;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0117946;STB=0.509402;TYPE=snp;VARB=0.00225533;OID=.;OPOS=111077197;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:161:155:11:10:144:145:78:66:6:5:79:66:6:4 chr13 111090909 . T C 124.33 PASS AO=33;DP=77;FAO=33;FDP=77;FR=.;FRO=44;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=27;FSRR=17;FWDB=0.0124134;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.3237;QD=6.45847;RBI=0.02372;REFB=-0.00785612;REVB=0.0202125;RO=44;SAF=19;SAR=14;SRF=27;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0394961;STB=0.52229;TYPE=snp;VARB=0.00985076;OID=.;OPOS=111090909;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:44:44:33:33:14:19:27:17:14:19:27:17 chr13 111090924 . G A 142.23 PASS AO=34;DP=78;FAO=34;FDP=74;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=-0.0213068;FXX=0.0632831;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.954;QD=7.68806;RBI=0.03511;REFB=-0.00904523;REVB=0.0279058;RO=38;SAF=16;SAR=18;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0277631;STB=0.502391;TYPE=snp;VARB=0.0145815;OID=.;OPOS=111090924;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:74:38:40:34:34:18:16:19:19:18:16:19:21 chr13 111098226 . C T 244.44 PASS AO=29;DP=124;FAO=56;FDP=112;FR=.;FRO=56;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=15;FSRR=41;FWDB=0.00338484;FXX=0.0260847;HRUN=3;LEN=1;MLLD=156.787;QD=8.72991;RBI=0.0309044;REFB=-0.00976346;REVB=-0.0307185;RO=25;SAF=6;SAR=23;SRF=1;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.250698;STB=0.583972;TYPE=snp;VARB=0.0112619;OID=.;OPOS=111098226;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:112:25:56:29:56:23:6:1:24:32:24:15:41 chr13 111102042 . G A 211.49 PASS AO=43;DP=78;FAO=43;FDP=78;FR=.;FRO=35;FSAF=28;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=0.0209349;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=112.282;QD=10.8455;RBI=0.0220221;REFB=0.000581477;REVB=0.00683405;RO=35;SAF=28;SAR=15;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186839;STB=0.603028;TYPE=snp;VARB=-0.000390342;OID=.;OPOS=111102042;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:35:35:43:43:15:28:15:20:15:28:15:20 chr13 111102126 . C T 83.68 PASS AO=19;DP=39;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=16;FWDB=0.0667282;FXX=0.0512689;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.602;QD=9.04635;RBI=0.0674838;REFB=0.00152557;REVB=0.0100703;RO=19;SAF=8;SAR=11;SRF=3;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252438;STB=0.653938;TYPE=snp;VARB=-0.0105963;OID=.;OPOS=111102126;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:39:37:19:19:19:18:11:8:3:16:10:8:3:16 chr13 111109157 . G A 89.63 PASS AO=17;DP=31;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=14;FWDB=0.0579145;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7194;QD=11.5653;RBI=0.071203;REFB=0.0325875;REVB=0.041422;RO=14;SAF=4;SAR=13;SRF=0;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.319528;STB=0.674847;TYPE=snp;VARB=-0.0185574;OID=.;OPOS=111109157;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:31:31:14:14:17:17:13:4:0:14:13:4:0:14 chr13 111109859 . A G 166.82 PASS AO=44;DP=101;FAO=44;FDP=101;FR=.;FRO=57;FSAF=11;FSAR=33;FSRF=21;FSRR=36;FWDB=-0.0112252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2382;QD=6.60678;RBI=0.011378;REFB=-0.00654906;REVB=-0.00185857;RO=57;SAF=11;SAR=33;SRF=21;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144792;STB=0.581779;TYPE=snp;VARB=0.00621352;OID=.;OPOS=111109859;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:57:57:44:44:33:11:21:36:33:11:21:36 chr13 111111173 . G A 133.35 PASS AO=32;DP=68;FAO=32;FDP=69;FR=.;FRO=37;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=29;FSRR=8;FWDB=-0.0355434;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=165.664;QD=7.73016;RBI=0.0466544;REFB=-0.0374394;REVB=0.0302209;RO=35;SAF=19;SAR=13;SRF=27;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1796;STB=0.609908;TYPE=snp;VARB=0.0319701;OID=.;OPOS=111111173;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:69:35:37:32:32:13:19:27:8:13:19:29:8 chr13 111111235 . G A 191.2 PASS AO=30;DP=44;FAO=31;FDP=45;FR=.;FRO=14;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.00428073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.435;QD=16.9958;RBI=0.0181691;REFB=-0.00404448;REVB=0.0176577;RO=14;SAF=16;SAR=14;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0194624;STB=0.505018;TYPE=snp;VARB=0.0026369;OID=.;OPOS=111111235;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:44:45:14:14:30:31:14:16:7:7:15:16:7:7 chr13 111121620 . C T 195.11 PASS AO=37;DP=123;FAO=52;FDP=122;FR=.;FRO=70;FSAF=20;FSAR=32;FSRF=39;FSRR=31;FWDB=-0.0149251;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.1273;QD=6.39689;RBI=0.01976;REFB=-0.0467677;REVB=0.0129498;RO=32;SAF=19;SAR=18;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0897989;STB=0.599707;TYPE=snp;VARB=0.0259356;OID=.;OPOS=111121620;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:122:32:70:37:52:18:19:13:19:32:20:39:31 chr13 111154058 . T A 1142.82 PASS AO=120;DP=125;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272959;FXX=0.0399968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.8183;QD=38.0939;RBI=0.0303356;REFB=0;REVB=-0.0132356;RO=0;SAF=63;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000710422;OID=.;OPOS=111154058;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:125:120:0:0:120:120:57:63:0:0:57:63:0:0 chr13 111154061 . T C 1129.28 PASS AO=122;DP=125;FAO=124;FDP=125;FR=.;FRO=1;FSAF=66;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0132035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.9415;QD=36.1369;RBI=0.0135403;REFB=-0.123721;REVB=-0.00300127;RO=0;SAF=65;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504273;TYPE=snp;VARB=0.000345727;OID=.;OPOS=111154061;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:125:125:0:1:122:124:57:65:0:0:58:66:0:1 chr13 111155773 . T C 462.5 PASS AO=42;DP=44;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0397656;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.038;QD=38.542;RBI=0.047491;REFB=0;REVB=0.0259632;RO=0;SAF=23;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000165657;OID=.;OPOS=111155773;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:44:48:0:0:42:48:19:23:0:0:19:29:0:0 chr13 111155779 . G A 110.25 PASS AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.00722782;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=268.656;QD=9.1871;RBI=0.00733738;REFB=-0.00457444;REVB=0.00126324;RO=24;SAF=16;SAR=8;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0806712;STB=0.545416;TYPE=snp;VARB=0.00433207;OID=.;OPOS=111155779;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:24:24:24:24:8:16:14:10:8:16:14:10 chr13 111156499 . C T 1048.89 PASS AO=91;DP=110;FAO=109;FDP=109;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=60;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.187311;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.7232;QD=38.4913;RBI=0.250729;REFB=0;REVB=0.166671;RO=0;SAF=49;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00237046;OID=.;OPOS=111156499;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:109:109:0:0:91:109:42:49:0:0:49:60:0:0 chr13 111158874 . A G 382.56 PASS AO=17;DP=39;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0924927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.78;QD=34.7784;RBI=0.140362;REFB=0;REVB=0.105577;RO=0;SAF=0;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0041282;OID=.;OPOS=111158874;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:17:44:0:0:17:44:17:0:0:0:18:26:0:0 chr13 111164614 . T C 107.31 PASS AO=28;DP=69;FAO=29;FDP=71;FR=.;FRO=42;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=-0.0142953;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=197.655;QD=6.04561;RBI=0.0168179;REFB=0.000351209;REVB=-0.00885923;RO=39;SAF=14;SAR=14;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0131215;STB=0.510197;TYPE=snp;VARB=-0.000861272;OID=.;OPOS=111164614;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:71:39:42:28:29:14:14:20:19:15:14:21:21 chr13 111176393 . A G 133.72 PASS AO=23;DP=35;FAO=23;FDP=37;FR=.;FRO=14;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0242133;FXX=0.0263089;HRUN=3;LEN=1;MLLD=117.998;QD=14.4557;RBI=0.123958;REFB=-0.0197362;REVB=-0.12157;RO=12;SAF=14;SAR=9;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12148;STB=0.595661;TYPE=snp;VARB=0.0052345;OID=.;OPOS=111176393;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:35:37:12:14:23:23:9:14:5:7:9:14:5:9 chr13 111291044 . T C 249.51 PASS AO=73;DP=180;FAO=74;FDP=182;FR=.;FRO=108;FSAF=19;FSAR=55;FSRF=31;FSRR=77;FWDB=-0.0146946;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=217.604;QD=5.48377;RBI=0.0283804;REFB=-0.0171172;REVB=-0.0242799;RO=106;SAF=19;SAR=54;SRF=31;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0429582;STB=0.523006;TYPE=snp;VARB=0.0271977;OID=.;OPOS=111291044;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:182:106:108:73:74:54:19:31:75:55:19:31:77 chr13 111298392 . A G 62.64 PASS AO=11;DP=25;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.0733765;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=88.315;QD=9.63621;RBI=0.0767066;REFB=-0.0109469;REVB=-0.022356;RO=7;SAF=1;SAR=10;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.567703;STB=0.84144;TYPE=snp;VARB=0.0079157;OID=.;OPOS=111298392;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:21:26:7:13:11:13:10:1:5:2:12:1:7:6 chr13 111315405 . G A 82.69 PASS AO=16;DP=41;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=2;FWDB=0.0250617;FXX=0.0238039;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.5117;QD=8.06731;RBI=0.0276361;REFB=0.0307172;REVB=0.0116476;RO=25;SAF=11;SAR=5;SRF=24;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.406416;STB=0.634212;TYPE=snp;VARB=-0.0149037;OID=.;OPOS=111315405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:41:41:25:22:16:19:5:11:24:1:5:14:20:2 chr13 111319754 . T C 679.42 PASS AO=140;DP=250;FAO=140;FDP=250;FR=.;FRO=110;FSAF=58;FSAR=82;FSRF=48;FSRR=62;FWDB=-0.00569444;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=127.452;QD=10.8708;RBI=0.0284939;REFB=-0.0210952;REVB=-0.0279191;RO=110;SAF=58;SAR=82;SRF=48;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0183468;STB=0.509973;TYPE=snp;VARB=0.0159784;OID=.;OPOS=111319754;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:250:250:110:110:140:140:82:58:48:62:82:58:48:62 chr13 111340101 . T A 115.18 PASS AO=25;DP=57;FAO=27;FDP=57;FR=.,HEALED;FRO=30;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=24;FWDB=-0.00763589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.607;QD=8.08244;RBI=0.222326;REFB=0.0307105;REVB=0.222194;RO=7;SAF=12;SAR=13;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150951;STB=0.634057;TYPE=snp;VARB=-0.0161487;OID=.;OPOS=111340101;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:7:30:25:27:13:12:6:1:15:12:6:24 chr13 111350281 . C T 88.87 PASS AO=23;DP=54;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=22;FWDB=-0.0244784;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2811;QD=6.58283;RBI=0.0245576;REFB=0.010164;REVB=-0.00197007;RO=30;SAF=15;SAR=8;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.341647;STB=0.700768;TYPE=snp;VARB=-0.0145119;OID=.;OPOS=111350281;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:54:54:30:31:23:23:8:15:9:21:8:15:9:22 chr13 111365104 . A G 110.18 PASS AO=25;DP=52;FAO=25;FDP=52;FR=.;FRO=27;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=6;FWDB=-0.0288493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1427;QD=8.47535;RBI=0.0294562;REFB=-0.0469531;REVB=0.0059482;RO=27;SAF=17;SAR=8;SRF=21;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108785;STB=0.56084;TYPE=snp;VARB=0.0295067;OID=.;OPOS=111365104;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:27:27:25:25:8:17:21:6:8:17:21:6 chr13 111372392 . T A 210.67 PASS AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0350135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.505;QD=36.6376;RBI=0.0578326;REFB=0;REVB=0.046029;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00042048;OID=.;OPOS=111372392;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:0:0:23:23:12:11:0:0:12:11:0:0 chr13 111932913 . G A 326.5 PASS AO=91;DP=218;FAO=93;FDP=220;FR=.;FRO=127;FSAF=43;FSAR=50;FSRF=69;FSRR=58;FWDB=0.00527426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.4529;QD=5.93629;RBI=0.00560814;REFB=-0.0154594;REVB=-0.00190615;RO=127;SAF=43;SAR=48;SRF=69;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0736768;STB=0.546651;TYPE=snp;VARB=0.0290511;OID=.;OPOS=111932913;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:218:220:127:127:91:93:48:43:69:58:50:43:69:58 chr13 111947173 . T G 310.31 PASS AO=77;DP=165;FAO=78;FDP=167;FR=.;FRO=89;FSAF=41;FSAR=37;FSRF=39;FSRR=50;FWDB=0.00272201;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=213.581;QD=7.43255;RBI=0.0170051;REFB=-0.000862127;REVB=-0.0167858;RO=88;SAF=40;SAR=37;SRF=39;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0733546;STB=0.546487;TYPE=snp;VARB=0.000989489;OID=.;OPOS=111947173;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:167:88:89:77:78:37:40:39:49:37:41:39:50 chr13 111947494 . A T 519.5 PASS AO=108;DP=206;FAO=123;FDP=243;FR=.;FRO=120;FSAF=45;FSAR=78;FSRF=61;FSRR=59;FWDB=0.0141865;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=28.7822;QD=8.5514;RBI=0.0287698;REFB=-0.0572851;REVB=-0.0250289;RO=98;SAF=46;SAR=62;SRF=52;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0916433;STB=0.572842;TYPE=snp;VARB=0.0508045;OID=.;OPOS=111947494;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:206:243:98:120:108:123:62:46:52:46:78:45:61:59 chr13 111992288 . C T 11.61 PASS AO=3;DP=13;FAO=3;FDP=13;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=0.0433573;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=37.702;QD=3.57285;RBI=0.0709489;REFB=0.0163774;REVB=0.0561595;RO=10;SAF=1;SAR=2;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.477992;STB=0.816578;TYPE=snp;VARB=-0.0214692;OID=.;OPOS=111992288;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:13:13:10:10:3:3:2:1:8:2:2:1:8:2 chr13 112725791 . G A 198.38 PASS AO=47;DP=105;FAO=49;FDP=105;FR=.;FRO=56;FSAF=35;FSAR=14;FSRF=32;FSRR=24;FWDB=0.0508937;FXX=0.00943307;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.6053;QD=7.55718;RBI=0.0509353;REFB=-0.00790458;REVB=0.00205838;RO=58;SAF=33;SAR=14;SRF=34;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128307;STB=0.586383;TYPE=snp;VARB=0.0107859;OID=.;OPOS=112725791;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:58:56:47:49:14:33:34:24:14:35:32:24 chr13 113052388 . A G 1011.29 PASS AO=108;DP=108;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126206;FXX=0.0185168;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.009;QD=38.1618;RBI=0.026279;REFB=0;REVB=0.02305;RO=0;SAF=69;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.89526e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000869234;OID=.;OPOS=113052388;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:108:106:0:0:108:106:39:69:0:0:39:67:0:0 chr13 113053470 . T A 1684.79 PASS AO=177;DP=178;FAO=177;FDP=177;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0178595;FXX=0.00561766;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.951;QD=38.0743;RBI=0.0273505;REFB=-0.0734737;REVB=0.0207144;RO=1;SAF=104;SAR=73;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0064764;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000211651;OID=.;OPOS=113053470;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:178:177:1:0:177:177:73:104:0:1:73:104:0:0 chr13 113534907 . T C 209.85 PASS AO=45;DP=87;FAO=46;FDP=89;FR=.;FRO=43;FSAF=6;FSAR=40;FSRF=15;FSRR=28;FWDB=-0.00151404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.804;QD=9.43149;RBI=0.0261517;REFB=-0.010277;REVB=-0.0261079;RO=41;SAF=6;SAR=39;SRF=15;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.315724;STB=0.672988;TYPE=snp;VARB=0.0218619;OID=.;OPOS=113534907;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:89:41:43:45:46:39:6:15:26:40:6:15:28 chr13 113536132 . T C 14.3 PASS AO=3;DP=10;FAO=3;FDP=10;FR=.,HEALED;FRO=7;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.369;QD=5.72075;RBI=0.106115;REFB=-0.00470706;REVB=-0.106115;RO=5;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00631025;OID=.;OPOS=113536132;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:10:10:5:7:3:3:3:0:0:5:3:0:0:7 chr13 113656216 . C T 327.65 PASS AO=33;DP=33;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00627329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.121;QD=37.4457;RBI=0.0340136;REFB=0;REVB=0.0334301;RO=0;SAF=7;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.44409e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000133833;OID=.;OPOS=113656216;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:33:35:0:0:33:35:26:7:0:0:28:7:0:0 chr13 113719525 . A G 14.37 PASS AO=3;DP=10;FAO=3;FDP=10;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.9337;QD=5.74606;RBI=0.0122393;REFB=-0.0139056;REVB=0.0122393;RO=7;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0356323;OID=.;OPOS=113719525;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:10:10:7:7:3:3:3:0:0:7:3:0:0:7 chr13 113741590 . G A 34.81 PASS AO=13;DP=45;FAO=13;FDP=45;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.00225508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.779;QD=3.09412;RBI=0.00226898;REFB=-0.00477139;REVB=0.000250779;RO=32;SAF=7;SAR=6;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00845992;STB=0.505147;TYPE=snp;VARB=0.012043;OID=.;OPOS=113741590;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:45:45:32:32:13:13:6:7:17:15:6:7:17:15 chr13 113747093 . TG T 74.14 PASS AO=18;DP=46;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.00117012;FXX=0.0666519;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.512;QD=7.06084;RBI=0.00653825;REFB=-0.0177823;REVB=0.0064327;RO=21;SAF=8;SAR=10;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107884;STB=0.516111;TYPE=del;VARB=0.0167383;OID=.;OPOS=113747094;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:18:43:18:42:24:8:10:10:14:74:21:8:10:7:14 chr13 113747124 . A G 362.19 PASS AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.028891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.719;QD=38.1254;RBI=0.044433;REFB=0;REVB=-0.033758;RO=0;SAF=15;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.82408e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000374383;OID=.;OPOS=113747124;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:37:38:0:0:37:38:22:15:0:0:23:15:0:0 chr13 113747135 . T C 363.23 PASS AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0234597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.3865;QD=38.2345;RBI=0.0270903;REFB=0;REVB=-0.0135472;RO=0;SAF=15;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000417916;OID=.;OPOS=113747135;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:38:38:0:0:38:38:23:15:0:0:23:15:0:0 chr13 113747258 . T C 77.84 PASS AO=20;DP=54;FAO=22;FDP=56;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=28;FSRR=6;FWDB=-0.0163584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.101;QD=5.56021;RBI=0.0206479;REFB=-0.00731913;REVB=0.0125991;RO=33;SAF=8;SAR=12;SRF=27;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.431068;STB=0.716814;TYPE=snp;VARB=0.0169263;OID=.;OPOS=113747258;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:54:56:33:34:20:22:12:8:27:6:12:10:28:6 chr13 113752573 . G A 276.36 PASS AO=54;DP=93;FAO=54;FDP=93;FR=.;FRO=39;FSAF=22;FSAR=32;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=-0.0165913;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=190.209;QD=11.8863;RBI=0.0206476;REFB=-0.0035713;REVB=0.0122903;RO=38;SAF=22;SAR=32;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00994318;STB=0.50993;TYPE=snp;VARB=0.00225705;OID=.;OPOS=113752573;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:38:39:54:54:32:22:15:23:32:22:15:24 chr13 113770068 . C T 394.22 PASS AO=80;DP=143;FAO=80;FDP=142;FR=.;FRO=62;FSAF=23;FSAR=57;FSRF=29;FSRR=33;FWDB=0.0161892;FXX=0.00699252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.693;QD=11.1049;RBI=0.0182151;REFB=-0.0171776;REVB=0.00834865;RO=61;SAF=23;SAR=57;SRF=29;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167174;STB=0.588773;TYPE=snp;VARB=0.0177635;OID=.;OPOS=113770068;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:142:61:62:80:80:57:23:29:32:57:23:29:33 chr13 113773159 . G A 76.47 PASS AO=19;DP=67;FAO=20;FDP=51;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=0.0181355;FXX=0.177391;HRUN=4;LEN=1;MLLD=130.961;QD=5.99802;RBI=0.0184352;REFB=-0.0319438;REVB=-0.00331031;RO=26;SAF=15;SAR=4;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132603;STB=0.646302;TYPE=snp;VARB=0.0498273;OID=.;OPOS=113773159;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:48:51:26:31:19:20:4:15:18:8:4:16:19:12 chr13 113792754 . T C 99.99 PASS AO=32;DP=88;FAO=32;FDP=88;FR=.;FRO=56;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=36;FWDB=-0.00686116;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=204.037;QD=4.54517;RBI=0.0199526;REFB=0.000328563;REVB=-0.0187358;RO=54;SAF=18;SAR=14;SRF=20;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208001;STB=0.628414;TYPE=snp;VARB=-0.000683286;OID=.;OPOS=113792754;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:54:56:32:32:14:18:20:34:14:18:20:36 chr13 113801737 . C T 882.24 PASS AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0275076;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.148;QD=37.9457;RBI=0.0440996;REFB=0;REVB=0.034469;RO=0;SAF=47;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.50677e-05;OID=.;OPOS=113801737;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:93:93:0:0:93:93:46:47:0:0:46:47:0:0 chr13 113812962 . G A 423.92 PASS AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0465079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.89;QD=36.078;RBI=0.1457;REFB=-0.121074;REVB=0.138078;RO=0;SAF=13;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.94744e-08;STB=0.507459;TYPE=snp;VARB=0.00146261;OID=.;OPOS=113812962;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:47:47:0:1:46:46:33:13:0:0:33:13:0:1 chr13 113818900 . A G 1145.18 PASS AO=119;DP=119;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0224716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.8137;QD=38.4935;RBI=0.0270921;REFB=0;REVB=0.0151329;RO=0;SAF=47;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.20685e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.34776e-05;OID=.;OPOS=113818900;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:119:119:0:0:119:119:72:47:0:0:72:47:0:0 chr13 113965176 . C A 99.8 PASS AO=15;DP=23;FAO=17;FDP=27;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=10;FWDB=0.0453805;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.318;QD=14.7851;RBI=0.0461071;REFB=-0.0506614;REVB=0.00815305;RO=0;SAF=4;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33019e-08;STB=0.638757;TYPE=snp;VARB=0.0178776;OID=.;OPOS=113965176;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:16:27:0:10:15:17:11:4:0:0:13:4:0:10 chr13 113979934 . GGCC GC,GG 304.09 PASS AO=9,10;DP=46;FAO=44,0;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=23,0;FSAR=21,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0474107,-0.47366;FXX=0.0222173;HRUN=4,5;LEN=2,2;MLLD=17.3637,7.26528;QD=27.6441;RBI=0.338513,0.503736;REFB=0,0;REVB=0.335177,0.171454;RO=9;SAF=0,10;SAR=9,0;SRF=0;SRR=9;SSEN=0.594203,0;SSEP=0,0.30137;SSSB=0,0.854471;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.0069117,0;OID=.,.;OPOS=113979935,113979936;OREF=GC,CC;OALT=-,-;OMAPALT=GC,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:9,10:36:44,0:44:0:23,0:21,0:0:0:28:9:0,10:9,0:0:9 chr13 114076259 . C T 84.82 PASS AO=24;DP=61;FAO=24;FDP=61;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=0.005537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.027;QD=5.5619;RBI=0.00703162;REFB=-0.00580129;REVB=0.0043342;RO=36;SAF=11;SAR=13;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0146552;STB=0.500687;TYPE=snp;VARB=0.0175466;OID=.;OPOS=114076259;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:61:61:36:37:24:24:13:11:16:20:13:11:17:20 chr13 114175038 . G A 243.29 PASS AO=58;DP=120;FAO=58;FDP=120;FR=.;FRO=62;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=19;FSRR=43;FWDB=0.0172767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.494;QD=8.10957;RBI=0.0174978;REFB=-0.0164217;REVB=0.00277325;RO=61;SAF=30;SAR=28;SRF=19;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190041;STB=0.608188;TYPE=snp;VARB=0.0246806;OID=.;OPOS=114175038;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:61:62:58:58:28:30:19:42:28:30:19:43 chr13 114288440 . GC G 700.41 PASS AO=104;DP=148;FAO=128;FDP=129;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.191314;FXX=0.0227256;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.4274;QD=21.718;RBI=0.228957;REFB=0.124284;REVB=0.125779;RO=9;SAF=23;SAR=81;SRF=1;SRR=8;SSEN=0.39666;SSEP=0;SSSB=0.0244311;STB=0.502702;TYPE=del;VARB=0.000789706;OID=.;OPOS=114288441;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:104:130:128:129:1:36:92:0:1:48:9:23:81:1:8 chr13 114303764 . C T 425.44 PASS AO=79;DP=130;FAO=79;FDP=130;FR=.;FRO=51;FSAF=41;FSAR=38;FSRF=27;FSRR=24;FWDB=0.00441485;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.77;QD=13.0904;RBI=0.00453701;REFB=-0.0185344;REVB=-0.00104576;RO=50;SAF=41;SAR=38;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000724906;STB=0.504096;TYPE=snp;VARB=0.0165676;OID=.;OPOS=114303764;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:50:51:79:79:38:41:26:24:38:41:27:24 chr13 114312354 . T G 236.89 PASS AO=25;DP=27;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0630238;FXX=0.0740466;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.064;QD=37.9024;RBI=0.0630238;REFB=0;REVB=7.97911e-06;RO=0;SAF=17;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000216703;OID=.;OPOS=114312354;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:27:25:0:0:25:25:8:17:0:0:8:17:0:0 chr13 114322289 . A G 76.36 PASS AO=23;DP=57;FAO=22;FDP=57;FR=.;FRO=35;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.0179239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.143;QD=5.35888;RBI=0.0582788;REFB=-0.00161139;REVB=-0.055454;RO=33;SAF=9;SAR=14;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129261;STB=0.611548;TYPE=snp;VARB=0.0057228;OID=.;OPOS=114322289;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:57:57:33:35:23:22:14:9:17:16:14:8:19:16 chr13 114453605 . C CTGTGTGCACG 22.51 PASS AO=14;DP=79;FAO=15;FDP=74;FR=.;FRO=59;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=46;FWDB=-0.0422737;FXX=0.0263123;HRUN=1;LEN=10;MLLD=241.092;QD=1.21694;RBI=0.0437012;REFB=-0.00590764;REVB=-0.0110785;RO=60;SAF=2;SAR=12;SRF=11;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0925472;STB=0.622815;TYPE=ins;VARB=0.0253823;OID=.;OPOS=114453606;OREF=-;OALT=TGTGTGCACG;OMAPALT=CTGTGTGCACG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:14:79:15:74:59:2:13:13:46:22:60:2:12:11:49 chr13 114453873 . G C 59.93 PASS AO=18;DP=50;FAO=18;FDP=50;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=21;FSRR=11;FWDB=0.00145445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.7078;QD=4.79409;RBI=0.0651038;REFB=-0.0181261;REVB=-0.0650875;RO=31;SAF=13;SAR=5;SRF=21;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0584177;STB=0.550207;TYPE=snp;VARB=0.0262223;OID=.;OPOS=114453873;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:50:50:31:32:18:18:5:13:21:10:5:13:21:11 chr13 114453912 . C T 104.18 PASS AO=22;DP=52;FAO=25;FDP=54;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.002894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.372;QD=7.71681;RBI=0.0261924;REFB=-0.0221913;REVB=0.026032;RO=26;SAF=13;SAR=9;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0879897;STB=0.559952;TYPE=snp;VARB=0.0189178;OID=.;OPOS=114453912;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:54:26:29:22:25:9:13:13:13:11:14:13:16 chr13 114498154 . G C 317.02 PASS AO=75;DP=166;FAO=80;FDP=171;FR=.;FRO=91;FSAF=33;FSAR=47;FSRF=27;FSRR=64;FWDB=-0.0171643;FXX=0.00581362;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.8113;QD=7.41571;RBI=0.0175095;REFB=-0.00851359;REVB=0.0034598;RO=91;SAF=30;SAR=45;SRF=27;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109116;STB=0.565001;TYPE=snp;VARB=0.0149894;OID=.;OPOS=114498154;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:171:91:91:75:80:45:30:27:64:47:33:27:64 chr13 114524944 . A G 121.27 PASS AO=31;DP=72;FAO=31;FDP=71;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=-0.000247465;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.567;QD=6.83203;RBI=0.00204088;REFB=-0.0178792;REVB=-0.00202583;RO=39;SAF=18;SAR=13;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0678509;STB=0.545926;TYPE=snp;VARB=0.0233667;OID=.;OPOS=114524944;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:71:39:40:31:31:13:18:20:19:13:18:20:20 chr13 114622597 . A G 86.69 PASS AO=16;DP=30;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=2;FWDB=-0.0145551;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=215.307;QD=12.3841;RBI=0.0197101;REFB=-0.0235097;REVB=-0.0132904;RO=14;SAF=11;SAR=5;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0259739;STB=0.576834;TYPE=snp;VARB=0.0150844;OID=.;OPOS=114622597;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:30:28:14:12:16:16:5:11:10:4:5:11:10:2 chr13 114623880 . G A 863.46 PASS AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0650142;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.3997;QD=37.9541;RBI=0.0693414;REFB=0;REVB=0.0241119;RO=0;SAF=32;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.53094e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000350455;OID=.;OPOS=114623880;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:91:91:0:0:91:91:59:32:0:0:58:33:0:0 chr13 114747187 . G C 656.64 PASS AO=75;DP=77;FAO=75;FDP=77;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.219672;FXX=0.0128189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.4624;QD=34.1111;RBI=0.219986;REFB=-0.0450605;REVB=0.0117574;RO=1;SAF=5;SAR=70;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0067131;STB=0.50704;TYPE=snp;VARB=0.00922538;OID=.;OPOS=114747187;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:77:77:1:2:75:75:70:5:0:1:70:5:0:2 chr14 19378030 . T A 242.55 PASS AO=37;DP=51;FAO=37;FDP=51;FR=.;FRO=14;FSAF=33;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.000903818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.653;QD=19.0232;RBI=0.107362;REFB=-0.0545295;REVB=0.107358;RO=14;SAF=33;SAR=4;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252351;STB=0.638621;TYPE=snp;VARB=0.022966;OID=.;OPOS=19378030;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:51:51:14:14:37:37:4:33:9:5:4:33:9:5 chr14 19553712 . G GA 10.44 PASS AO=2;DP=12;FAO=3;FDP=12;FR=.;FRO=9;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=0;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=22.6874;QD=3.48073;RBI=0.0526205;REFB=0.0364358;REVB=0.0526205;RO=10;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-0.0855015;OID=.;OPOS=19553713;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:2:12:3:12:9:0:3:0:9:10:10:0:2:0:10 chr14 19553715 . A C 14.28 PASS AO=2;DP=12;FAO=3;FDP=10;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0.166528;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.7745;QD=5.71273;RBI=0.0269664;REFB=-0.0383331;REVB=-0.0269664;RO=4;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.124493;OID=.;OPOS=19553715;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:11:10:4:7:2:3:2:0:0:4:3:0:0:7 chr14 19553717 . T A 17.49 PASS AO=4;DP=12;FAO=4;FDP=12;FR=.;FRO=8;FSAF=0;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=31.4118;QD=5.82863;RBI=0.0406509;REFB=-0.0872943;REVB=0.0406509;RO=8;SAF=0;SAR=4;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.196461;OID=.;OPOS=19553717;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:12:12:8:8:4:4:4:0:0:8:4:0:0:8 chr14 19553764 . A G 44.02 PASS AO=13;DP=37;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=18;FWDB=-0.103081;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.6447;QD=4.75942;RBI=0.134257;REFB=0.0119838;REVB=-0.0860197;RO=24;SAF=5;SAR=8;SRF=6;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163948;STB=0.596194;TYPE=snp;VARB=-0.0297991;OID=.;OPOS=19553764;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:37:37:24:24:13:13:8:5:6:18:8:5:6:18 chr14 19553795 . G A 11.13 PASS AO=4;DP=20;FAO=4;FDP=20;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.0334273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.017;QD=2.22612;RBI=0.0334337;REFB=0.00944523;REVB=0.000655357;RO=16;SAF=2;SAR=2;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0292074;OID=.;OPOS=19553795;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:20:20:16:16:4:4:2:2:8:8:2:2:8:8 chr14 19571357 . T C 16.58 PASS AO=13;DP=70;FAO=13;FDP=71;FR=.;FRO=58;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=21;FSRR=37;FWDB=0.00696013;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=264.992;QD=0.934324;RBI=0.00704848;REFB=-0.00433345;REVB=-0.00111251;RO=57;SAF=6;SAR=7;SRF=21;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119116;STB=0.582659;TYPE=snp;VARB=0.0243198;OID=.;OPOS=19571357;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:70:71:57:58:13:13:7:6:21:36:7:6:21:37 chr14 19686710 . G A 23.95 PASS AO=3;DP=11;FAO=4;FDP=10;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.025885;FXX=0.0908265;HRUN=4;LEN=1;MLLD=85.513;QD=9.58195;RBI=0.0429236;REFB=-0.0251862;REVB=-0.0342404;RO=5;SAF=3;SAR=0;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.658479;STB=0.665777;TYPE=snp;VARB=0.0558348;OID=.;OPOS=19686710;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:8:10:5:6:3:4:0:3:3:2:1:3:3:3 chr14 20002286 . A G 60.23 PASS AO=21;DP=64;FAO=21;FDP=64;FR=.;FRO=43;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=0.00396859;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.179;QD=3.76415;RBI=0.0211259;REFB=-0.0156471;REVB=0.0207498;RO=43;SAF=11;SAR=10;SRF=19;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0933938;STB=0.554844;TYPE=snp;VARB=0.0227462;OID=.;OPOS=20002286;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:64:64:43:43:21:21:10:11:19:24:10:11:19:24 chr14 20010130 . T C 47.15 PASS AO=7;DP=11;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0852892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.397;QD=17.1439;RBI=0.0887424;REFB=0.00838978;REVB=-0.0245147;RO=4;SAF=1;SAR=6;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120201;STB=0.571204;TYPE=snp;VARB=-0.00453514;OID=.;OPOS=20010130;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:11:11:4:4:7:7:6:1:1:3:6:1:1:3 chr14 20181502 . C T 125.38 PASS AO=41;DP=113;FAO=41;FDP=112;FR=.;FRO=71;FSAF=30;FSAR=11;FSRF=56;FSRR=15;FWDB=0.0374423;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.4622;QD=4.4778;RBI=0.0374622;REFB=-0.000268731;REVB=-0.0012212;RO=70;SAF=30;SAR=11;SRF=55;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.079557;STB=0.548066;TYPE=snp;VARB=0.00147265;OID=.;OPOS=20181502;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:112:70:71:41:41:11:30:55:15:11:30:56:15 chr14 20215989 . A G 109.05 PASS AO=115;DP=543;FAO=89;FDP=398;FR=.;FRO=309;FSAF=45;FSAR=44;FSRF=149;FSRR=160;FWDB=-0.00196757;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.868;QD=1.09598;RBI=0.00708329;REFB=-0.0107928;REVB=-0.00680453;RO=425;SAF=62;SAR=53;SRF=207;SRR=218;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0671353;STB=0.518172;TYPE=snp;VARB=0.0369019;OID=.;OPOS=20215989;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:543:398:425:309:115:89:53:62:207:218:44:45:149:160 chr14 20216298 . T C 1829.04 PASS AO=313;DP=435;FAO=290;FDP=398;FR=.;FRO=108;FSAF=115;FSAR=175;FSRF=53;FSRR=55;FWDB=0.00074813;FXX=0.00499988;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3242;QD=18.3823;RBI=0.00695685;REFB=-0.0182511;REVB=0.00691651;RO=121;SAF=128;SAR=185;SRF=60;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0465974;STB=0.526408;TYPE=snp;VARB=0.00809713;OID=.;OPOS=20216298;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:435:398:121:108:313:290:185:128:60:61:175:115:53:55 chr14 20228354 . A G 447.7 PASS AO=114;DP=244;FAO=114;FDP=244;FR=.;FRO=130;FSAF=89;FSAR=25;FSRF=91;FSRR=39;FWDB=-0.00656807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.111;QD=7.33937;RBI=0.0198717;REFB=-0.0337418;REVB=0.0187548;RO=126;SAF=89;SAR=25;SRF=88;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106276;STB=0.55864;TYPE=snp;VARB=0.0363217;OID=.;OPOS=20228354;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:244:126:130:114:114:25:89:88:38:25:89:91:39 chr14 20295763 . C T 36.79 PASS AO=73;DP=473;FAO=66;FDP=398;FR=.;FRO=332;FSAF=35;FSAR=31;FSRF=142;FSRR=190;FWDB=-0.00889274;FXX=0.00499988;HRUN=3;LEN=1;MLLD=113.511;QD=0.369727;RBI=0.0150836;REFB=-0.00396817;REVB=-0.0121834;RO=400;SAF=37;SAR=36;SRF=168;SRR=232;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112802;STB=0.584985;TYPE=snp;VARB=0.0128082;OID=.;OPOS=20295763;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:473:398:400:332:73:66:36:37:168:232:31:35:142:190 chr14 20295778 . CC AG 135.59 PASS AO=95;DP=446;FAO=89;FDP=358;FR=.;FRO=269;FSAF=62;FSAR=27;FSRF=84;FSRR=185;FWDB=0.00603936;FXX=0.104997;HRUN=6;LEN=2;MLLD=194.162;QD=1.51496;RBI=0.0109482;REFB=0.001256;REVB=0.00913183;RO=202;SAF=67;SAR=28;SRF=59;SRR=143;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.464692;STB=0.76923;TYPE=mnp;VARB=-0.00228715;OID=.;OPOS=20295778;OREF=CC;OALT=AG;OMAPALT=AG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:388:358:202:269:95:89:28:67:59:143:27:62:84:185 chr14 20295834 . T C 551.19 PASS AO=236;DP=591;FAO=165;FDP=400;FR=.;FRO=235;FSAF=71;FSAR=94;FSRF=72;FSRR=163;FWDB=0.0124291;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.795;QD=5.51186;RBI=0.0152204;REFB=0.00420392;REVB=0.00878506;RO=355;SAF=102;SAR=134;SRF=118;SRR=237;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111539;STB=0.575806;TYPE=snp;VARB=-0.00670052;OID=.;OPOS=20295834;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:591:400:355:235:236:165:134:102:118:237:94:71:72:163 chr14 20296004 . C T 884.93 PASS AO=304;DP=639;FAO=205;FDP=394;FR=.;FRO=189;FSAF=93;FSAR=112;FSRF=111;FSRR=78;FWDB=0.0157248;FXX=0.0149996;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.5367;QD=8.98402;RBI=0.0344644;REFB=-0.00251805;REVB=-0.030668;RO=335;SAF=131;SAR=173;SRF=190;SRR=145;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129996;STB=0.563891;TYPE=snp;VARB=0.00325025;OID=.;OPOS=20296004;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:639:394:335:189:304:205:173:131:190:145:112:93:111:78 chr14 20296010 . G C 782.31 PASS AO=306;DP=637;FAO=193;FDP=400;FR=.;FRO=207;FSAF=83;FSAR=110;FSRF=114;FSRR=93;FWDB=0.0056471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.5494;QD=7.82309;RBI=0.0292164;REFB=-0.0190967;REVB=0.0286655;RO=327;SAF=134;SAR=172;SRF=186;SRR=141;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123161;STB=0.562573;TYPE=snp;VARB=0.0200887;OID=.;OPOS=20296010;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:637:400:327:207:306:193:172:134:186:141:110:83:114:93 chr14 20345346 . A T 487.42 PASS AO=212;DP=534;FAO=157;FDP=399;FR=.;FRO=242;FSAF=94;FSAR=63;FSRF=126;FSRR=116;FWDB=0.00837394;FXX=0.00249994;HRUN=3;LEN=1;MLLD=37.5828;QD=4.88637;RBI=0.0558138;REFB=-0.00143789;REVB=0.055182;RO=305;SAF=122;SAR=90;SRF=155;SRR=150;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0719419;STB=0.548322;TYPE=snp;VARB=0.00168226;OID=.;OPOS=20345346;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:534:399:305:242:212:157:90:122:155:150:63:94:126:116 chr14 20389699 . T G 104.48 PASS AO=71;DP=292;FAO=71;FDP=294;FR=.;FRO=223;FSAF=22;FSAR=49;FSRF=91;FSRR=132;FWDB=-0.0199612;FXX=0.00338972;HRUN=3;LEN=1;MLLD=168.382;QD=1.42149;RBI=0.0207893;REFB=-0.00519704;REVB=0.00580897;RO=219;SAF=22;SAR=49;SRF=90;SRR=129;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138755;STB=0.581655;TYPE=snp;VARB=0.0153558;OID=.;OPOS=20389699;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:292:294:219:223:71:71:49:22:90:129:49:22:91:132 chr14 20404091 . G A 80.54 PASS AO=46;DP=179;FAO=46;FDP=179;FR=.;FRO=133;FSAF=6;FSAR=40;FSRF=47;FSRR=86;FWDB=-0.0220811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.5791;QD=1.79974;RBI=0.0371681;REFB=-0.00882269;REVB=0.029898;RO=130;SAF=6;SAR=40;SRF=46;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.385001;STB=0.737012;TYPE=snp;VARB=0.0332613;OID=.;OPOS=20404091;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:179:179:130:133:46:46:40:6:46:84:40:6:47:86 chr14 20404614 . C A 83.8 PASS AO=78;DP=375;FAO=79;FDP=376;FR=.;FRO=297;FSAF=36;FSAR=43;FSRF=148;FSRR=149;FWDB=-0.00223417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.556;QD=0.891489;RBI=0.0144281;REFB=-0.00323354;REVB=-0.0142541;RO=295;SAF=36;SAR=42;SRF=146;SRR=149;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.043065;STB=0.533721;TYPE=snp;VARB=0.0128654;OID=.;OPOS=20404614;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:375:376:295:297:78:79:42:36:146:149:43:36:148:149 chr14 20404735 . C T 85.23 PASS AO=48;DP=188;FAO=48;FDP=187;FR=.;FRO=139;FSAF=12;FSAR=36;FSRF=58;FSRR=81;FWDB=-0.044693;FXX=0.00531887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.131;QD=1.82301;RBI=0.0449385;REFB=-0.00532325;REVB=-0.00469053;RO=135;SAF=12;SAR=36;SRF=57;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24065;STB=0.642138;TYPE=snp;VARB=0.0168862;OID=.;OPOS=20404735;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:188:187:135:139:48:48:36:12:57:78:36:12:58:81 chr14 20404736 . G A 30.73 PASS AO=33;DP=185;FAO=34;FDP=186;FR=.;FRO=152;FSAF=9;FSAR=25;FSRF=60;FSRR=92;FWDB=-0.0212337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.03;QD=0.660891;RBI=0.0231455;REFB=-0.00866429;REVB=0.00921119;RO=152;SAF=8;SAR=25;SRF=60;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222762;STB=0.620875;TYPE=snp;VARB=0.0447464;OID=.;OPOS=20404736;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:185:186:152:152:33:34:25:8:60:92:25:9:60:92 chr14 20404767 . A G 15.28 PASS AO=27;DP=176;FAO=27;FDP=178;FR=.;FRO=151;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=50;FSRR=101;FWDB=-0.0233141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.876;QD=0.343313;RBI=0.0238518;REFB=0.00465387;REVB=0.00503573;RO=146;SAF=8;SAR=19;SRF=47;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0382523;STB=0.534406;TYPE=snp;VARB=-0.0219658;OID=.;OPOS=20404767;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:176:178:146:151:27:27:19:8:47:99:19:8:50:101 chr14 20444490 . C T 1174.45 PASS AO=123;DP=123;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0312417;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.638;QD=38.1934;RBI=0.0349407;REFB=0;REVB=0.0156463;RO=0;SAF=46;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.98242e-05;OID=.;OPOS=20444490;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:123:123:0:0:123:123:77:46:0:0:77:46:0:0 chr14 20470399 . G A 1897.05 PASS AO=202;DP=204;FAO=202;FDP=202;FR=.;FRO=0;FSAF=110;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00646923;FXX=0.00980344;HRUN=3;LEN=1;MLLD=133.532;QD=37.5654;RBI=0.0120996;REFB=0.00494819;REVB=0.010225;RO=1;SAF=110;SAR=92;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00514919;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.74188e-05;OID=.;OPOS=20470399;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:204:202:1:0:202:202:92:110:0:1:92:110:0:0 chr14 20482471 . C T 567.06 PASS AO=58;DP=58;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0227854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.47;QD=38.4445;RBI=0.0402906;REFB=0;REVB=0.0332288;RO=0;SAF=37;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3149e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000264675;OID=.;OPOS=20482471;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:58:59:0:0:58:59:21:37:0:0:22:37:0:0 chr14 20502120 . C T 417.77 PASS AO=90;DP=170;FAO=90;FDP=169;FR=.;FRO=79;FSAF=47;FSAR=43;FSRF=38;FSRR=41;FWDB=-0.0237771;FXX=0.00588201;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.545;QD=9.88796;RBI=0.0237973;REFB=-0.0211231;REVB=0.00097909;RO=79;SAF=47;SAR=43;SRF=38;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0352114;STB=0.519264;TYPE=snp;VARB=0.014473;OID=.;OPOS=20502120;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:169:79:79:90:90:43:47:38:41:43:47:38:41 chr14 20528207 . G A 142.56 PASS AO=46;DP=123;FAO=46;FDP=123;FR=.;FRO=77;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=38;FSRR=39;FWDB=0.061844;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.3736;QD=4.63597;RBI=0.0621233;REFB=-0.0132947;REVB=-0.00588375;RO=74;SAF=23;SAR=23;SRF=37;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504063;TYPE=snp;VARB=0.0223247;OID=.;OPOS=20528207;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:74:77:46:46:23:23:37:37:23:23:38:39 chr14 20528321 . A G 90.58 PASS AO=29;DP=80;FAO=29;FDP=80;FR=.;FRO=51;FSAF=7;FSAR=22;FSRF=26;FSRR=25;FWDB=0.0426776;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.672;QD=4.52879;RBI=0.0458696;REFB=-0.00955729;REVB=0.0168121;RO=50;SAF=7;SAR=22;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.331951;STB=0.688013;TYPE=snp;VARB=0.00963628;OID=.;OPOS=20528321;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:80:80:50:51:29:29:22:7:26:24:22:7:26:25 chr14 20528359 . G T 578.8 PASS AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0299349;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.2195;QD=36.1747;RBI=0.0304008;REFB=-0.10529;REVB=-0.00530227;RO=1;SAF=25;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122662;STB=0.506491;TYPE=snp;VARB=0.0015144;OID=.;OPOS=20528359;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:64:64:1:1:63:63:38:25:0:1:38:25:0:1 chr14 20528362 . A G 42.04 PASS AO=18;DP=65;FAO=18;FDP=65;FR=.;FRO=47;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=-0.0125255;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.704;QD=2.58683;RBI=0.0130758;REFB=-0.0058755;REVB=-0.00375344;RO=47;SAF=5;SAR=13;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21991;STB=0.633989;TYPE=snp;VARB=0.0170263;OID=.;OPOS=20528362;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:65:65:47:47:18:18:13:5:21:26:13:5:21:26 chr14 20528448 . TCATAGATTTGCTCACTGAC T 67.42 PASS AO=21;DP=74;FAO=23;FDP=67;FR=.;FRO=44;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=18;FWDB=-0.0151786;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=19;MLLD=519.302;QD=4.02489;RBI=0.0158838;REFB=-0.00983935;REVB=-0.0046804;RO=37;SAF=11;SAR=10;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108458;STB=0.545653;TYPE=del;VARB=0.0167192;OID=.;OPOS=20528449;OREF=CATAGATTTGCTCACTGAC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:21:64:23:67:44:12:11:26:18:67:37:11:10:23:14 chr14 20528505 . T A 140.46 PASS AO=48;DP=134;FAO=48;FDP=134;FR=.;FRO=86;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=33;FSRR=53;FWDB=-0.0151479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.661;QD=4.19272;RBI=0.0196875;REFB=0.00429543;REVB=0.0125753;RO=86;SAF=24;SAR=24;SRF=33;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130847;STB=0.574596;TYPE=snp;VARB=-0.00619571;OID=.;OPOS=20528505;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:86:86:48:48:24:24:33:53:24:24:33:53 chr14 20528528 . G A 226.67 PASS AO=70;DP=179;FAO=70;FDP=178;FR=.;FRO=108;FSAF=26;FSAR=44;FSRF=42;FSRR=66;FWDB=1.07454e-05;FXX=0.00558628;HRUN=5;LEN=1;MLLD=233.326;QD=5.09372;RBI=0.0103329;REFB=-0.00961326;REVB=-0.0103329;RO=107;SAF=26;SAR=44;SRF=42;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0240549;STB=0.511275;TYPE=snp;VARB=0.0134021;OID=.;OPOS=20528528;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:178:107:108:70:70:44:26:42:65:44:26:42:66 chr14 20529019 . C T 462.35 PASS AO=124;DP=279;FAO=125;FDP=279;FR=.;FRO=154;FSAF=48;FSAR=77;FSRF=61;FSRR=93;FWDB=0.0114366;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.142;QD=6.62868;RBI=0.0116716;REFB=-0.010174;REVB=-0.00233045;RO=154;SAF=48;SAR=76;SRF=60;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00264529;STB=0.507037;TYPE=snp;VARB=0.0118583;OID=.;OPOS=20529019;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:279:279:154:154:124:125:76:48:60:94:77:48:61:93 chr14 20529043 . C G 454.83 PASS AO=119;DP=263;FAO=119;FDP=261;FR=.;FRO=142;FSAF=43;FSAR=76;FSRF=56;FSRR=86;FWDB=0.0418467;FXX=0.00760427;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.2567;QD=6.97063;RBI=0.0491736;REFB=0.00352345;REVB=0.0258243;RO=141;SAF=43;SAR=76;SRF=56;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0375704;STB=0.519251;TYPE=snp;VARB=-0.00364283;OID=.;OPOS=20529043;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:263:261:141:142:119:119:76:43:56:85:76:43:56:86 chr14 20586042 . G C 269.58 PASS AO=64;DP=138;FAO=67;FDP=141;FR=.;FRO=74;FSAF=40;FSAR=27;FSRF=25;FSRR=49;FWDB=0.00402297;FXX=0.013985;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.961;QD=7.64773;RBI=0.00580031;REFB=-0.00551175;REVB=0.00417843;RO=70;SAF=42;SAR=22;SRF=22;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.318517;STB=0.633955;TYPE=snp;VARB=0.00678314;OID=.;OPOS=20586042;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:141:70:74:64:67:22:42:22:48:27:40:25:49 chr14 20586432 . C T 246.9 PASS AO=65;DP=147;FAO=65;FDP=146;FR=.;FRO=81;FSAF=37;FSAR=28;FSRF=39;FSRR=42;FWDB=-0.0112943;FXX=0.00680226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.125;QD=6.76444;RBI=0.0431813;REFB=-0.0141169;REVB=0.0416781;RO=80;SAF=37;SAR=28;SRF=38;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0937552;STB=0.548946;TYPE=snp;VARB=0.0177308;OID=.;OPOS=20586432;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:146:80:81:65:65:28:37:38:42:28:37:39:42 chr14 20665790 . T A 109.64 PASS AO=38;DP=109;FAO=38;FDP=109;FR=.;FRO=71;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=33;FSRR=38;FWDB=0.00195797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.481;QD=4.02357;RBI=0.0077211;REFB=0.00354267;REVB=-0.00746872;RO=71;SAF=20;SAR=18;SRF=33;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0695116;STB=0.539998;TYPE=snp;VARB=-0.00554295;OID=.;OPOS=20665790;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:71:71:38:38:18:20:33:38:18:20:33:38 chr14 20665840 . G A 174.62 PASS AO=45;DP=105;FAO=47;FDP=106;FR=.;FRO=59;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=34;FWDB=0.00363543;FXX=0.0185168;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.0041;QD=6.5893;RBI=0.00599991;REFB=-0.0454634;REVB=0.00477312;RO=59;SAF=27;SAR=18;SRF=27;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144848;STB=0.595704;TYPE=snp;VARB=0.0194146;OID=.;OPOS=20665840;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:106:59:59:45:47:18:27:27:32:19:28:25:34 chr14 20665887 . G C 1143.61 PASS AO=119;DP=121;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214544;FXX=0.00826378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.1398;QD=38.1202;RBI=0.0222205;REFB=0;REVB=-0.0057842;RO=0;SAF=56;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.20187e-05;OID=.;OPOS=20665887;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:121:120:0:0:119:120:63:56:0:0:63:57:0:0 chr14 20692188 . T C 861.83 PASS AO=97;DP=102;FAO=97;FDP=101;FR=.;FRO=4;FSAF=92;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0226822;FXX=0.00980296;HRUN=2;LEN=1;MLLD=255.163;QD=34.1318;RBI=0.0231244;REFB=-0.039442;REVB=0.00450017;RO=3;SAF=92;SAR=5;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151856;STB=0.578079;TYPE=snp;VARB=0.000638696;OID=.;OPOS=20692188;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:102:101:3:4:97:97:5:92:1:2:5:92:2:2 chr14 20692291 . C T 1422.58 PASS AO=151;DP=152;FAO=151;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.044133;FXX=0.00657851;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.914;QD=37.6842;RBI=0.0461137;REFB=-0.0279773;REVB=-0.0133696;RO=1;SAF=105;SAR=46;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0102273;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.51184e-05;OID=.;OPOS=20692291;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:152:151:1:0:151:151:46:105:0:1:46:105:0:0 chr14 20692353 . T C 313.53 PASS AO=93;DP=218;FAO=90;FDP=215;FR=.;FRO=125;FSAF=52;FSAR=38;FSRF=72;FSRR=53;FWDB=-0.00546105;FXX=0.0137608;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.92;QD=5.83317;RBI=0.00551414;REFB=-0.0112111;REVB=0.000763295;RO=122;SAF=55;SAR=38;SRF=70;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.018504;STB=0.501059;TYPE=snp;VARB=0.01405;OID=.;OPOS=20692353;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:218:215:122:125:93:90:38:55:70:52:38:52:72:53 chr14 20692453 . G T 1806.92 PASS AO=186;DP=188;FAO=191;FDP=191;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=121;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214639;FXX=0.0103622;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.7013;QD=37.8412;RBI=0.0445253;REFB=-0.031179;REVB=-0.0390103;RO=1;SAF=65;SAR=121;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0039191;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.25068e-05;OID=.;OPOS=20692453;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:188:191:1:0:186:191:121:65:0:1:121:70:0:0 chr14 20692574 . T C 1547.56 PASS AO=166;DP=169;FAO=166;FDP=169;FR=.;FRO=3;FSAF=106;FSAR=60;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00823701;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.409;QD=36.6287;RBI=0.0406254;REFB=-0.122301;REVB=0.0397816;RO=1;SAF=106;SAR=60;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00786522;STB=0.500541;TYPE=snp;VARB=0.000505743;OID=.;OPOS=20692574;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:169:169:1:3:166:166:60:106:0:1:60:106:2:1 chr14 20692643 . T C 1730.87 PASS AO=179;DP=180;FAO=180;FDP=180;FR=.;FRO=0;FSAF=115;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0293925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.445;QD=38.4639;RBI=0.029402;REFB=0;REVB=0.00075011;RO=0;SAF=114;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00011136;OID=.;OPOS=20692643;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:180:180:0:0:179:180:65:114:0:0:65:115:0:0 chr14 20698068 . G T 217.67 PASS AO=26;DP=29;FAO=26;FDP=29;FR=.;FRO=3;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0376648;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.8965;QD=30.0238;RBI=0.0397597;REFB=0.0164858;REVB=0.0127355;RO=3;SAF=13;SAR=13;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0958076;STB=0.551685;TYPE=snp;VARB=-0.0168464;OID=.;OPOS=20698068;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:29:29:3:3:26:26:13:13:0:3:13:13:0:3 chr14 20698239 . T C 1116.77 PASS AO=115;DP=119;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0435515;FXX=0.0245881;HRUN=3;LEN=1;MLLD=79.805;QD=37.5386;RBI=0.0536063;REFB=0;REVB=-0.0312555;RO=1;SAF=13;SAR=102;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0351258;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000107777;OID=.;OPOS=20698239;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:119:119:1:0:115:119:102:13:1:0:105:14:0:0 chr14 20698298 . T G 1206.17 PASS AO=135;DP=142;FAO=138;FDP=145;FR=.;FRO=7;FSAF=13;FSAR=125;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0.0744178;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.6239;QD=33.2738;RBI=0.0753502;REFB=-0.0299804;REVB=0.0118172;RO=7;SAF=13;SAR=122;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0264941;STB=0.513617;TYPE=snp;VARB=0.00994027;OID=.;OPOS=20698298;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:142:145:7:7:135:138:122:13:0:7:125:13:0:7 chr14 20711852 . C G 205.41 PASS AO=73;DP=205;FAO=73;FDP=205;FR=.;FRO=132;FSAF=33;FSAR=40;FSRF=53;FSRR=79;FWDB=-0.00921021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.3649;QD=4.00798;RBI=0.0301833;REFB=-0.0284729;REVB=-0.0287438;RO=132;SAF=33;SAR=40;SRF=53;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0581204;STB=0.533044;TYPE=snp;VARB=0.0543473;OID=.;OPOS=20711852;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:205:132:132:73:73:40:33:53:79:40:33:53:79 chr14 20764585 . A C 1577.38 PASS AO=165;DP=165;FAO=165;FDP=165;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0102786;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.492;QD=38.2394;RBI=0.0107733;REFB=0;REVB=-0.00322697;RO=0;SAF=63;SAR=102;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.28568e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.86894e-05;OID=.;OPOS=20764585;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:165:165:0:0:165:165:102:63:0:0:102:63:0:0 chr14 20770036 . T C 1891.95 PASS AO=207;DP=214;FAO=209;FDP=214;FR=.;FRO=5;FSAF=110;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0082589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.359;QD=35.3636;RBI=0.022008;REFB=-0.092786;REVB=0.0203995;RO=7;SAF=110;SAR=97;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0331359;STB=0.512314;TYPE=snp;VARB=0.00165552;OID=.;OPOS=20770036;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:214:214:7:5:207:209:97:110:0:7:99:110:0:5 chr14 20824181 . T C 232.47 PASS AO=94;DP=95;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0562796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.244;QD=34.4398;RBI=0.0780163;REFB=-0.0674509;REVB=0.0540292;RO=0;SAF=38;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.513503;TYPE=snp;VARB=0.00297267;OID=.;OPOS=20824181;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:95:27:0:1:94:26:56:38:0:0:18:8:0:1 chr14 20852029 . A G 120.73 PASS AO=30;DP=77;FAO=33;FDP=79;FR=.;FRO=46;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=0.022021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.878;QD=6.11309;RBI=0.0224716;REFB=-0.0192939;REVB=-0.00447741;RO=45;SAF=12;SAR=18;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164053;STB=0.599939;TYPE=snp;VARB=0.0230314;OID=.;OPOS=20852029;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:79:45:46:30:33:18:12:25:20:20:13:26:20 chr14 20854734 . A G 339.21 PASS AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0266047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.654;QD=37.6897;RBI=0.0311656;REFB=0;REVB=0.0162322;RO=0;SAF=11;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000104535;OID=.;OPOS=20854734;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:35:36:0:0:35:36:24:11:0:0:25:11:0:0 chr14 20859205 . C T 193.94 PASS AO=37;DP=63;FAO=37;FDP=63;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=32;FSRF=5;FSRR=21;FWDB=-0.00636004;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.322;QD=12.3135;RBI=0.0118758;REFB=-0.015171;REVB=-0.0100292;RO=26;SAF=5;SAR=32;SRF=5;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0850475;STB=0.546981;TYPE=snp;VARB=0.011502;OID=.;OPOS=20859205;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:63:63:26:26:37:37:32:5:5:21:32:5:5:21 chr14 20859250 . CG C 77.13 PASS AO=22;DP=40;FAO=24;FDP=36;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=23;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.129307;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.5132;QD=8.56954;RBI=0.141911;REFB=-0.0624365;REVB=-0.0584667;RO=12;SAF=1;SAR=21;SRF=4;SRR=8;SSEN=0.650794;SSEP=0;SSSB=-0.493911;STB=0.821045;TYPE=del;VARB=0.0754715;OID=.;OPOS=20859251;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:22:36:24:36:12:1:23:5:7:15:12:1:21:4:8 chr14 20897064 . C T 184.54 PASS AO=13;DP=23;FAO=20;FDP=20;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0438978;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.365;QD=36.9076;RBI=0.0439011;REFB=0;REVB=0.000536063;RO=0;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60098e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000474214;OID=.;OPOS=20897064;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:19:20:0:0:13:20:8:5:0:0:13:7:0:0 chr14 20897065 . G T 10.55 PASS AO=4;DP=21;FAO=4;FDP=21;FR=.;FRO=17;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=-0.00563495;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=73.5286;QD=2.01016;RBI=0.0495012;REFB=-0.0811248;REVB=0.0491794;RO=17;SAF=1;SAR=3;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137231;STB=0.599468;TYPE=snp;VARB=0.0507115;OID=.;OPOS=20897065;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:21:21:17:17:4:4:3:1:6:11:3:1:6:11 chr14 20898442 . C T 181.41 PASS AO=34;DP=59;FAO=34;FDP=58;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.0397642;FXX=0.0169463;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9651;QD=12.5107;RBI=0.0701249;REFB=-0.0196253;REVB=0.0577608;RO=25;SAF=11;SAR=23;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191543;STB=0.612938;TYPE=snp;VARB=0.0172446;OID=.;OPOS=20898442;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:59:58:25:24:34:34:23:11:14:11:23:11:14:10 chr14 20916249 . T C 135.33 PASS AO=27;DP=95;FAO=37;FDP=94;FR=.,HEALED;FRO=53;FSAF=10;FSAR=27;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=-0.0993925;FXX=0.0105252;HRUN=6;LEN=1;MLLD=162.939;QD=5.7587;RBI=0.0996291;REFB=-0.0132249;REVB=-0.00686178;RO=39;SAF=3;SAR=24;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.513224;STB=0.642775;TYPE=snp;VARB=0.0156434;OID=.;OPOS=20916249;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:94:39:53:27:37:24:3:19:20:27:10:26:27 chr14 20916958 . T C 174.53 PASS AO=53;DP=133;FAO=53;FDP=134;FR=.;FRO=81;FSAF=15;FSAR=38;FSRF=14;FSRR=67;FWDB=-0.0483555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.691;QD=5.20998;RBI=0.0532109;REFB=-0.012482;REVB=0.0222068;RO=80;SAF=16;SAR=37;SRF=13;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193887;STB=0.588315;TYPE=snp;VARB=0.0232151;OID=.;OPOS=20916958;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:134:80:81:53:53:37:16:13:67:38:15:14:67 chr14 20920250 . T C 192.44 PASS AO=46;DP=96;FAO=46;FDP=96;FR=.;FRO=50;FSAF=10;FSAR=36;FSRF=12;FSRR=38;FWDB=-0.0221628;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.396;QD=8.01839;RBI=0.026987;REFB=-0.0101614;REVB=-0.0153984;RO=50;SAF=10;SAR=36;SRF=12;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0304537;STB=0.516964;TYPE=snp;VARB=0.0134211;OID=.;OPOS=20920250;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:50:50:46:46:36:10:12:38:36:10:12:38 chr14 20925154 . T G 133.62 PASS AO=23;DP=36;FAO=23;FDP=36;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.00113388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.145;QD=14.8466;RBI=0.0328734;REFB=-0.021967;REVB=0.0328538;RO=13;SAF=9;SAR=14;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.058241;STB=0.532106;TYPE=snp;VARB=0.0135452;OID=.;OPOS=20925154;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:36:36:13:13:23:23:14:9:4:9:14:9:4:9 chr14 20925424 . AGGC AGC,AG 208.48 PASS AO=22,13;DP=50;FAO=41,0;FDP=47;FR=.;FRO=6;FSAF=15,0;FSAR=26,0;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.109589,-0.0188308;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,2;MLLD=15.1408,98.0982;QD=17.7428;RBI=0.257508,0.0446858;REFB=-0.201329,0.00932422;REVB=0.233025,-0.0405243;RO=9;SAF=13,2;SAR=9,11;SRF=3;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0.302763,0.302763;SSSB=0.136763,-0.204625;STB=0.518263,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.0388556,0;OID=.,.;OPOS=20925425,20925426;OREF=G,GC;OALT=-,-;OMAPALT=AGC,AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:22,13:46:41,0:47:6:15,0:26,0:3:3:5:9:13,2:9,11:3:6 chr14 21024619 . A G 2630.07 PASS AO=274;DP=276;FAO=274;FDP=274;FR=.;FRO=0;FSAF=171;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206292;FXX=0.00724611;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1186;QD=38.3952;RBI=0.0290205;REFB=0;REVB=-0.0204114;RO=0;SAF=171;SAR=103;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.82115e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.96535e-05;OID=.;OPOS=21024619;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:276:274:0:0:274:274:103:171:0:0:103:171:0:0 chr14 21024786 . A G 3203.41 PASS AO=348;DP=356;FAO=348;FDP=356;FR=.;FRO=8;FSAF=180;FSAR=168;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.00497043;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=241.236;QD=35.9934;RBI=0.0166075;REFB=-0.0458053;REVB=0.0158463;RO=7;SAF=180;SAR=168;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00871392;STB=0.503199;TYPE=snp;VARB=0.000269649;OID=.;OPOS=21024786;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:91:356:356:7:8:348:348:168:180:2:5:168:180:3:5 chr14 21077579 . C T 374.65 PASS AO=86;DP=178;FAO=89;FDP=179;FR=.;FRO=90;FSAF=36;FSAR=53;FSRF=36;FSRR=54;FWDB=0.0606409;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.0667;QD=8.37213;RBI=0.0617765;REFB=-0.0331752;REVB=0.0117906;RO=89;SAF=36;SAR=50;SRF=36;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0134136;STB=0.502347;TYPE=snp;VARB=0.0569968;OID=.;OPOS=21077579;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:179:89:90:86:89:50:36:36:53:53:36:36:54 chr14 21078339 . T C 96.84 PASS AO=36;DP=122;FAO=39;FDP=124;FR=.;FRO=85;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=50;FSRR=35;FWDB=-0.00988139;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.6877;QD=3.12392;RBI=0.108017;REFB=-0.00623435;REVB=0.107564;RO=86;SAF=19;SAR=17;SRF=51;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0789834;STB=0.551841;TYPE=snp;VARB=0.00983586;OID=.;OPOS=21078339;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:122:124:86:85:36:39:17:19:51:35:19:20:50:35 chr14 21081642 . T C 440.2 PASS AO=108;DP=229;FAO=110;FDP=231;FR=.;FRO=121;FSAF=47;FSAR=63;FSRF=70;FSRR=51;FWDB=-0.0105207;FXX=0.00431016;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.435;QD=7.62257;RBI=0.0125438;REFB=-0.0123184;REVB=-0.00683095;RO=120;SAF=47;SAR=61;SRF=70;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140886;STB=0.579057;TYPE=snp;VARB=0.00458267;OID=.;OPOS=21081642;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:229:231:120:121:108:110:61:47:70:50:63:47:70:51 chr14 21081996 . C T 1708.32 PASS AO=181;DP=184;FAO=184;FDP=184;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=112;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0269837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.858;QD=37.1374;RBI=0.0292634;REFB=0;REVB=0.0113238;RO=2;SAF=71;SAR=110;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0023495;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.87198e-05;OID=.;OPOS=21081996;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:184:184:2:0:181:184:110:71:1:1:112:72:0:0 chr14 21082032 . T G 229.07 PASS AO=69;DP=173;FAO=69;FDP=172;FR=.;FRO=103;FSAF=24;FSAR=45;FSRF=37;FSRR=66;FWDB=-0.00620985;FXX=0.00578001;HRUN=4;LEN=1;MLLD=202.125;QD=5.32731;RBI=0.0128675;REFB=-0.0214721;REVB=-0.0112699;RO=103;SAF=24;SAR=45;SRF=37;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133028;STB=0.507485;TYPE=snp;VARB=0.0263238;OID=.;OPOS=21082032;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:172:103:103:69:69:45:24:37:66:45:24:37:66 chr14 21099313 . C T 246.12 PASS AO=73;DP=180;FAO=73;FDP=180;FR=.;FRO=107;FSAF=28;FSAR=45;FSRF=56;FSRR=51;FWDB=-0.00542307;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.429;QD=5.4693;RBI=0.0345819;REFB=-0.0123589;REVB=-0.034154;RO=103;SAF=28;SAR=45;SRF=52;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129223;STB=0.584392;TYPE=snp;VARB=0.00926308;OID=.;OPOS=21099313;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:180:103:107:73:73:45:28:52:51:45:28:56:51 chr14 21099400 . G A 1256.74 PASS AO=130;DP=130;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0573779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.242;QD=38.083;RBI=0.0593188;REFB=0;REVB=0.0150497;RO=0;SAF=30;SAR=100;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.50619e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.10951e-05;OID=.;OPOS=21099400;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:130:132:0:0:130:132:100:30:0:0:101:31:0:0 chr14 21101155 . C T 1543.37 PASS AO=159;DP=159;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0289443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.27;QD=38.1079;RBI=0.0291036;REFB=0;REVB=-0.00304065;RO=0;SAF=92;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.42359e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000117717;OID=.;OPOS=21101155;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:159:162:0:0:159:162:67:92:0:0:67:95:0:0 chr14 21101236 . CCTTTA C 172.18 PASS AO=63;DP=161;FAO=67;FDP=147;FR=.;FRO=80;FSAF=35;FSAR=32;FSRF=32;FSRR=48;FWDB=-0.0347419;FXX=0.0925869;HRUN=4;LEN=5;MLLD=241.355;QD=4.68527;RBI=0.034745;REFB=0.00473338;REVB=-0.000462895;RO=80;SAF=31;SAR=32;SRF=33;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0799706;STB=0.566324;TYPE=del;VARB=-0.00512162;OID=.;OPOS=21101237;OREF=CTTTA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:63:153:67:147:80:35:32:32:48:99:80:31:32:33:47 chr14 21109141 . C T 253.35 PASS AO=62;DP=135;FAO=64;FDP=137;FR=.;FRO=73;FSAF=51;FSAR=13;FSRF=47;FSRR=26;FWDB=-0.00505095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.393;QD=7.39716;RBI=0.00670845;REFB=-0.0306443;REVB=0.00441488;RO=73;SAF=49;SAR=13;SRF=47;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187045;STB=0.609524;TYPE=snp;VARB=0.0324098;OID=.;OPOS=21109141;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:137:73:73:62:64:13:49:47:26:13:51:47:26 chr14 21109170 . T A 1229.55 PASS AO=128;DP=128;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.971;QD=38.4233;RBI=0.0176703;REFB=0;REVB=0.0110882;RO=0;SAF=72;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.21615e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.83581e-05;OID=.;OPOS=21109170;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:128:128:0:0:128:128:56:72:0:0:56:72:0:0 chr14 21109278 . A T 227.43 PASS AO=51;DP=101;FAO=51;FDP=101;FR=.;FRO=50;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=18;FSRR=32;FWDB=0.0143232;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.626;QD=9.00697;RBI=0.0215379;REFB=-0.0294999;REVB=-0.0160851;RO=49;SAF=24;SAR=27;SRF=17;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111064;STB=0.555273;TYPE=snp;VARB=0.0228932;OID=.;OPOS=21109278;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:49:50:51:51:27:24:17:32:27:24:18:32 chr14 21109385 . C T 38.09 PASS AO=14;DP=50;FAO=14;FDP=49;FR=.;FRO=35;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=0.00215061;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.952;QD=3.10903;RBI=0.0169333;REFB=-0.010768;REVB=-0.0167961;RO=35;SAF=6;SAR=8;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231908;STB=0.639808;TYPE=snp;VARB=0.0589282;OID=.;OPOS=21109385;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:50:49:35:35:14:14:8:6:22:13:8:6:22:13 chr14 21109671 . A G 341.65 PASS AO=77;DP=168;FAO=85;FDP=176;FR=.;FRO=91;FSAF=38;FSAR=47;FSRF=34;FSRR=57;FWDB=0.00558601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.314;QD=7.76478;RBI=0.00892911;REFB=-0.00363194;REVB=0.00696602;RO=74;SAF=36;SAR=41;SRF=32;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0314954;STB=0.538704;TYPE=snp;VARB=0.00316896;OID=.;OPOS=21109671;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:176:74:91:77:85:41:36:32:42:47:38:34:57 chr14 21109726 . G A 339.65 PASS AO=84;DP=176;FAO=84;FDP=177;FR=.;FRO=93;FSAF=38;FSAR=46;FSRF=38;FSRR=55;FWDB=-0.0243014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.791;QD=7.67574;RBI=0.0243018;REFB=-0.0157959;REVB=-0.00013058;RO=91;SAF=38;SAR=46;SRF=37;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0437394;STB=0.523311;TYPE=snp;VARB=0.0202333;OID=.;OPOS=21109726;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:177:91:93:84:84:46:38:37:54:46:38:38:55 chr14 21128133 . T C 371.67 PASS AO=98;DP=217;FAO=98;FDP=217;FR=.;FRO=119;FSAF=36;FSAR=62;FSRF=59;FSRR=60;FWDB=-0.0108871;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.6097;QD=6.85111;RBI=0.0116841;REFB=-0.00469139;REVB=0.00424146;RO=118;SAF=36;SAR=62;SRF=59;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134819;STB=0.572831;TYPE=snp;VARB=0.00616538;OID=.;OPOS=21128133;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:217:217:118:119:98:98:62:36:59:59:62:36:59:60 chr14 21149930 . T C 427.4 PASS AO=104;DP=214;FAO=103;FDP=212;FR=.;FRO=109;FSAF=62;FSAR=41;FSRF=54;FSRR=55;FWDB=-0.0251764;FXX=0.00934536;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.231;QD=8.06419;RBI=0.0258202;REFB=-0.00582651;REVB=0.00573002;RO=109;SAF=62;SAR=42;SRF=54;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0952025;STB=0.555835;TYPE=snp;VARB=0.00931137;OID=.;OPOS=21149930;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:212:109:109:104:103:42:62:54:55:41:62:54:55 chr14 21151483 . T G 909.23 PASS AO=218;DP=431;FAO=207;FDP=399;FR=.;FRO=192;FSAF=128;FSAR=79;FSRF=140;FSRR=52;FWDB=0.0177303;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.5493;QD=9.11508;RBI=0.0186482;REFB=-0.0184633;REVB=-0.00577857;RO=210;SAF=133;SAR=85;SRF=152;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110517;STB=0.558034;TYPE=snp;VARB=0.018561;OID=.;OPOS=21151483;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:431:399:210:192:218:207:85:133:152:58:79:128:140:52 chr14 21152167 . G C 344.8 PASS AO=76;DP=147;FAO=77;FDP=148;FR=.;FRO=71;FSAF=48;FSAR=29;FSRF=49;FSRR=22;FWDB=0.0148659;FXX=0.00671096;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.064;QD=9.31882;RBI=0.0413434;REFB=0.0098989;REVB=0.0385782;RO=71;SAF=48;SAR=28;SRF=49;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0563202;STB=0.53468;TYPE=snp;VARB=-0.00865643;OID=.;OPOS=21152167;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:148:71:71:76:77:28:48:49:22:29:48:49:22 chr14 21167833 . G A 427.91 PASS AO=93;DP=164;FAO=93;FDP=174;FR=.;FRO=81;FSAF=47;FSAR=46;FSRF=38;FSRR=43;FWDB=-0.00687018;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.0857;QD=9.83713;RBI=0.0164467;REFB=-0.0300846;REVB=-0.014943;RO=71;SAF=47;SAR=46;SRF=36;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00132481;STB=0.516863;TYPE=snp;VARB=0.0228474;OID=.;OPOS=21167833;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:174:71:81:93:93:46:47:36:35:46:47:38:43 chr14 21215997 . C T 268.72 PASS AO=76;DP=184;FAO=78;FDP=185;FR=.;FRO=107;FSAF=57;FSAR=21;FSRF=81;FSRR=26;FWDB=0.00987432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.008;QD=5.81014;RBI=0.0200839;REFB=-0.0201308;REVB=-0.0174889;RO=107;SAF=55;SAR=21;SRF=81;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0445778;STB=0.519629;TYPE=snp;VARB=0.0285857;OID=.;OPOS=21215997;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:185:107:107:76:78:21:55:81:26:21:57:81:26 chr14 21216499 . C T 1765.72 PASS AO=184;DP=184;FAO=185;FDP=185;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=141;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.050235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.7744;QD=38.1778;RBI=0.0502352;REFB=0;REVB=0.000149426;RO=0;SAF=43;SAR=141;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.48729e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00065163;OID=.;OPOS=21216499;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:184:185:0:0:184:185:141:43:0:0:141:44:0:0 chr14 21238318 . G A 228.49 PASS AO=42;DP=70;FAO=42;FDP=70;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=36;FSRF=5;FSRR=23;FWDB=-0.0431237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.5738;QD=13.0568;RBI=0.0489624;REFB=0.00879508;REVB=0.0231875;RO=28;SAF=6;SAR=36;SRF=5;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0509747;STB=0.527986;TYPE=snp;VARB=-0.00815313;OID=.;OPOS=21238318;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:28:28:42:42:36:6:5:23:36:6:5:23 chr14 21238798 . T C 405.24 PASS AO=88;DP=163;FAO=87;FDP=162;FR=.;FRO=75;FSAF=45;FSAR=42;FSRF=41;FSRR=34;FWDB=-0.0091225;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=236.727;QD=10.006;RBI=0.00948424;REFB=-0.01672;REVB=0.00259438;RO=75;SAF=46;SAR=42;SRF=41;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0202113;STB=0.513649;TYPE=snp;VARB=0.0158678;OID=.;OPOS=21238798;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:162:75:75:88:87:42:46:41:34:42:45:41:34 chr14 21250124 . G A 570.89 PASS AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0239392;FXX=0.0166639;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.368;QD=38.7047;RBI=0.0305738;REFB=0;REVB=0.0190177;RO=0;SAF=25;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03209e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.79829e-05;OID=.;OPOS=21250124;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:59:59:0:0:59:59:34:25:0:0:34:25:0:0 chr14 21250212 . T C 85.15 PASS AO=17;DP=38;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=17;FSRF=4;FSRR=17;FWDB=-0.00532713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3871;QD=8.51453;RBI=0.106409;REFB=-0.0512435;REVB=0.106276;RO=21;SAF=2;SAR=15;SRF=4;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144907;STB=0.59988;TYPE=snp;VARB=0.0639282;OID=.;OPOS=21250212;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:38:40:21:21:17:19:15:2:4:17:17:2:4:17 chr14 21250366 . T C 2339.86 PASS AO=247;DP=252;FAO=252;FDP=252;FR=.;FRO=0;FSAF=125;FSAR=127;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0500627;FXX=0.0156244;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.9034;QD=37.1407;RBI=0.0507369;REFB=-0.0851794;REVB=0.00824353;RO=2;SAF=125;SAR=122;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=9.29582e-05;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000426376;OID=.;OPOS=21250366;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:252:252:2:0:247:252:122:125:1:1:127:125:0:0 chr14 21360216 . C G 315.89 PASS AO=72;DP=142;FAO=72;FDP=142;FR=.;FRO=70;FSAF=34;FSAR=38;FSRF=28;FSRR=42;FWDB=-0.0114892;FXX=0.00699252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.788;QD=8.8984;RBI=0.0503931;REFB=0.00600677;REVB=0.0490659;RO=70;SAF=34;SAR=38;SRF=28;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0651872;STB=0.535845;TYPE=snp;VARB=-0.00510983;OID=.;OPOS=21360216;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:70:70:72:72:38:34:28:42:38:34:28:42 chr14 21360344 . G C 238.72 PASS AO=50;DP=95;FAO=51;FDP=95;FR=.;FRO=44;FSAF=8;FSAR=43;FSRF=4;FSRR=40;FWDB=0.029623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2977;QD=10.0516;RBI=0.0360372;REFB=-0.0499737;REVB=-0.0205221;RO=42;SAF=8;SAR=42;SRF=3;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15414;STB=0.56269;TYPE=snp;VARB=0.0475607;OID=.;OPOS=21360344;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:42:44:50:51:42:8:3:39:43:8:4:40 chr14 21387994 . A G 606.01 PASS AO=153;DP=321;FAO=153;FDP=326;FR=.;FRO=173;FSAF=64;FSAR=89;FSRF=84;FSRR=89;FWDB=-0.0178215;FXX=0.0151053;HRUN=4;LEN=1;MLLD=137.655;QD=7.43575;RBI=0.0216046;REFB=-0.022306;REVB=-0.0122129;RO=167;SAF=64;SAR=89;SRF=82;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0699287;STB=0.536227;TYPE=snp;VARB=0.0283067;OID=.;OPOS=21387994;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:321:326:167:173:153:153:89:64:82:85:89:64:84:89 chr14 21388266 . G C 281.31 PASS AO=74;DP=167;FAO=74;FDP=165;FR=.;FRO=91;FSAF=16;FSAR=58;FSRF=27;FSRR=64;FWDB=-0.022446;FXX=0.0119753;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.085;QD=6.81957;RBI=0.0254083;REFB=-0.0139076;REVB=-0.0119061;RO=91;SAF=16;SAR=58;SRF=27;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108947;STB=0.560936;TYPE=snp;VARB=0.0234875;OID=.;OPOS=21388266;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:165:91:91:74:74:58:16:27:64:58:16:27:64 chr14 21458320 . CCCCG C 274.26 PASS AO=95;DP=254;FAO=112;FDP=244;FR=.;FRO=132;FSAF=44;FSAR=68;FSRF=67;FSRR=65;FWDB=-0.000506295;FXX=0.0161284;HRUN=5;LEN=4;MLLD=213.971;QD=4.49603;RBI=0.0128554;REFB=-0.00376171;REVB=0.0128454;RO=130;SAF=39;SAR=56;SRF=63;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0779322;STB=0.563272;TYPE=del;VARB=0.00452276;OID=.;OPOS=21458321;OREF=CCCG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:95:236:112:244:132:44:68:67:65:99:130:39:56:63:67 chr14 21463050 . G C 602.52 PASS AO=135;DP=260;FAO=135;FDP=259;FR=.;FRO=124;FSAF=32;FSAR=103;FSRF=40;FSRR=84;FWDB=0.0125992;FXX=0.00384601;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.995;QD=9.30537;RBI=0.0182335;REFB=-0.00530194;REVB=0.0131803;RO=120;SAF=32;SAR=103;SRF=38;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0896417;STB=0.553425;TYPE=snp;VARB=0.00453489;OID=.;OPOS=21463050;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:260:259:120:124:135:135:103:32:38:82:103:32:40:84 chr14 21467913 . T G 1972.73 PASS AO=205;DP=205;FAO=206;FDP=206;FR=.;FRO=0;FSAF=112;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.439;QD=38.3055;RBI=0.042343;REFB=0;REVB=0.0382487;RO=0;SAF=111;SAR=94;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000100563;OID=.;OPOS=21467913;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:205:206:0:0:205:206:94:111:0:0:94:112:0:0 chr14 21486137 . G C 1223.08 PASS AO=125;DP=125;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.0469;QD=37.9249;RBI=0.0110269;REFB=0;REVB=0.00196469;RO=0;SAF=56;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.44067e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.90654e-05;OID=.;OPOS=21486137;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:125:129:0:0:125:129:69:56:0:0:70:59:0:0 chr14 21500455 . T A 163.15 PASS AO=44;DP=100;FAO=43;FDP=99;FR=.;FRO=56;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=36;FWDB=-0.0126589;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.808;QD=6.5921;RBI=0.0173052;REFB=-0.011347;REVB=-0.0117992;RO=55;SAF=25;SAR=19;SRF=19;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218159;STB=0.612194;TYPE=snp;VARB=0.0126482;OID=.;OPOS=21500455;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:99:55:56:44:43:19:25:19:36:19:24:20:36 chr14 21511458 . G C 472.01 PASS AO=28;DP=58;FAO=53;FDP=53;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.374159;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=27.3073;QD=35.6236;RBI=0.397752;REFB=0;REVB=-0.13495;RO=0;SAF=8;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.75204e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0135643;OID=.;OPOS=21511458;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:44:53:0:0:28:53:20:8:0:0:29:24:0:0 chr14 21511497 . C T 1248.44 PASS AO=131;DP=133;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00341355;FXX=0.0150365;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.24;QD=38.1203;RBI=0.0083416;REFB=0;REVB=0.00761117;RO=0;SAF=45;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.50415e-05;OID=.;OPOS=21511497;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:133:131:0:0:131:131:86:45:0:0:86:45:0:0 chr14 21526079 . C T 200.91 PASS AO=25;DP=29;FAO=25;FDP=29;FR=.;FRO=4;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.00742705;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=148.42;QD=27.7115;RBI=0.0103535;REFB=0.0087354;REVB=-0.00721345;RO=4;SAF=11;SAR=14;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154613;STB=0.508373;TYPE=snp;VARB=-0.000438909;OID=.;OPOS=21526079;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:29:29:4:4:25:25:14:11:2:2:14:11:2:2 chr14 21551058 . G A 782.6 PASS AO=84;DP=85;FAO=84;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00825042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.622;QD=36.8284;RBI=0.0525105;REFB=-0.0800028;REVB=0.0518583;RO=0;SAF=47;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.99643e-08;STB=0.506665;TYPE=snp;VARB=0.000388689;OID=.;OPOS=21551058;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:85:85:0:1:84:84:37:47:0:0:37:47:0:1 chr14 21551069 . T C 796.87 PASS AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0305503;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.904;QD=37.9463;RBI=0.0325373;REFB=0;REVB=0.011196;RO=0;SAF=46;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.981e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.49298e-05;OID=.;OPOS=21551069;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:84:84:0:0:84:84:38:46:0:0:38:46:0:0 chr14 21556963 . A AT 546.34 PASS AO=61;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.030235;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=21.7801;QD=29.5321;RBI=0.125151;REFB=0;REVB=0.121444;RO=5;SAF=25;SAR=36;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.03113;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00303242;OID=.;OPOS=21556964;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:61:74:74:74:0:32:42:0:0:49:5:25:36:1:4 chr14 21562560 . T C 367.05 PASS AO=42;DP=44;FAO=42;FDP=44;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0186215;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.1817;QD=33.3685;RBI=0.0220772;REFB=0.0171187;REVB=0.0118593;RO=2;SAF=27;SAR=15;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0585501;STB=0.531235;TYPE=snp;VARB=-0.00255908;OID=.;OPOS=21562560;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:44:44:2:2:42:42:15:27:0:2:15:27:0:2 chr14 21570273 . T C 327.5 PASS AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0198422;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=172.763;QD=35.4052;RBI=0.0212151;REFB=-0.0816911;REVB=0.00750787;RO=1;SAF=28;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0549407;STB=0.529395;TYPE=snp;VARB=0.00442004;OID=.;OPOS=21570273;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:37:37:1:1:36:36:8:28:0:1:8:28:0:1 chr14 21570614 . A C 796.17 PASS AO=83;DP=83;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.426;QD=37.913;RBI=0.0212808;REFB=0;REVB=0.00867987;RO=0;SAF=40;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.84151e-05;OID=.;OPOS=21570614;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:83:84:0:0:83:84:43:40:0:0:43:41:0:0 chr14 21623290 . T C 428.89 PASS AO=102;DP=208;FAO=103;FDP=210;FR=.;FRO=107;FSAF=55;FSAR=48;FSRF=55;FSRR=52;FWDB=0.00168793;FXX=0.0186907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.651;QD=8.16926;RBI=0.00249883;REFB=-0.0145123;REVB=0.00184257;RO=103;SAF=55;SAR=47;SRF=54;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0137263;STB=0.510202;TYPE=snp;VARB=0.0146775;OID=.;OPOS=21623290;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:210:103:107:102:103:47:55:54:49:48:55:55:52 chr14 21623648 . G A 105.65 PASS AO=21;DP=58;FAO=26;FDP=58;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=28;FSRR=4;FWDB=0.00226277;FXX=0.0169463;HRUN=5;LEN=1;MLLD=131.942;QD=7.28625;RBI=0.0178434;REFB=0.00756709;REVB=0.0176993;RO=21;SAF=18;SAR=3;SRF=20;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204327;STB=0.61145;TYPE=snp;VARB=-0.00767165;OID=.;OPOS=21623648;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:58:21:32:21:26:3:18:20:1:7:19:28:4 chr14 21623836 . G A 336.51 PASS AO=70;DP=131;FAO=77;FDP=142;FR=.;FRO=65;FSAF=37;FSAR=40;FSRF=45;FSRR=20;FWDB=0.0189469;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.6556;QD=9.47913;RBI=0.0357282;REFB=-0.0282797;REVB=0.0302906;RO=61;SAF=37;SAR=33;SRF=45;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180979;STB=0.596339;TYPE=snp;VARB=0.0254514;OID=.;OPOS=21623836;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:142:61:65:70:77:33:37:45:16:40:37:45:20 chr14 21624197 . T C 143.47 PASS AO=27;DP=46;FAO=27;FDP=46;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0179041;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=204.407;QD=12.4759;RBI=0.0201745;REFB=-0.0273649;REVB=0.00929811;RO=19;SAF=7;SAR=20;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186368;STB=0.603692;TYPE=snp;VARB=0.0172566;OID=.;OPOS=21624197;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:46:46:19:19:27:27:20:7:9:10:20:7:9:10 chr14 21770730 . A G 1723.99 PASS AO=176;DP=177;FAO=180;FDP=180;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=122;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0370679;FXX=0.0270256;HRUN=3;LEN=1;MLLD=177.847;QD=38.3109;RBI=0.0374234;REFB=0;REVB=-0.00514611;RO=0;SAF=58;SAR=118;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.46397e-05;OID=.;OPOS=21770730;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:177:180:0:0:176:180:118:58:0:0:122:58:0:0 chr14 21778717 . AAAT A 82.43 PASS AO=29;DP=71;FAO=31;FDP=68;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=0.0328837;FXX=0.0144907;HRUN=4;LEN=3;MLLD=195.7;QD=4.84857;RBI=0.033842;REFB=-0.00279845;REVB=0.00799656;RO=26;SAF=11;SAR=18;SRF=12;SRR=14;SSEN=0.328205;SSEP=0;SSSB=-0.0725723;STB=0.608953;TYPE=del;VARB=0.00396009;OID=.;OPOS=21778718;OREF=AAT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:29:67:31:68:37:13:18:23:14:82:26:11:18:12:14 chr14 21778792 . T C 225.96 PASS AO=53;DP=111;FAO=54;FDP=111;FR=.;FRO=57;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=28;FSRR=29;FWDB=0.00579646;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.327;QD=8.14272;RBI=0.0126267;REFB=-0.0167094;REVB=0.0112176;RO=58;SAF=24;SAR=29;SRF=29;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0445675;STB=0.514558;TYPE=snp;VARB=0.0162688;OID=.;OPOS=21778792;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:58:57:53:54:29:24:29:29:29:25:28:29 chr14 21790040 . G T 272.7 PASS AO=68;DP=144;FAO=68;FDP=145;FR=.;FRO=77;FSAF=34;FSAR=34;FSRF=24;FSRR=53;FWDB=0.00235477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.295;QD=7.52264;RBI=0.00263887;REFB=-0.00500223;REVB=-0.00119109;RO=76;SAF=34;SAR=34;SRF=23;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188783;STB=0.599972;TYPE=snp;VARB=0.00638438;OID=.;OPOS=21790040;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:145:76:77:68:68:34:34:23:53:34:34:24:53 chr14 21792811 . G A 645 PASS AO=135;DP=248;FAO=137;FDP=251;FR=.;FRO=114;FSAF=73;FSAR=64;FSRF=62;FSRR=52;FWDB=0.0143687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.5827;QD=10.2789;RBI=0.04625;REFB=-0.0239057;REVB=-0.0439614;RO=111;SAF=72;SAR=63;SRF=61;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0135139;STB=0.505026;TYPE=snp;VARB=0.0277013;OID=.;OPOS=21792811;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:248:251:111:114:135:137:63:72:61:50:64:73:62:52 chr14 21796784 . G C 140.14 PASS AO=23;DP=34;FAO=23;FDP=34;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=10;FWDB=0.00526161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.2651;QD=16.487;RBI=0.0289841;REFB=-0.0199851;REVB=-0.0285025;RO=11;SAF=7;SAR=16;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159523;STB=0.587028;TYPE=snp;VARB=0.00798861;OID=.;OPOS=21796784;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:34:34:11:11:23:23:16:7:1:10:16:7:1:10 chr14 21829129 . C G 2226.39 PASS AO=247;DP=258;FAO=248;FDP=248;FR=.;FRO=0;FSAF=114;FSAR=134;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0273329;FXX=0.0746241;HRUN=4;LEN=1;MLLD=119.848;QD=35.9095;RBI=0.0373708;REFB=-0.13893;REVB=-0.025485;RO=10;SAF=114;SAR=133;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0251668;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000478983;OID=.;OPOS=21829129;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:258:248:10:0:247:248:133:114:8:2:134:114:0:0 chr14 21831052 . T C 1366.56 PASS AO=143;DP=146;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132384;FXX=0.00680226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.85;QD=37.4401;RBI=0.0933145;REFB=0;REVB=0.0923707;RO=2;SAF=77;SAR=66;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00101465;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000170551;OID=.;OPOS=21831052;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:146:146:2:0:143:146:66:77:1:1:68:78:0:0 chr14 21871653 . C T 1686.56 PASS AO=175;DP=175;FAO=176;FDP=176;FR=.;FRO=0;FSAF=115;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.8598;QD=38.331;RBI=0.0190604;REFB=0;REVB=-0.0156984;RO=0;SAF=114;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.63803e-05;OID=.;OPOS=21871653;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:175:176:0:0:175:176:61:114:0:0:61:115:0:0 chr14 21899631 . C T 574.23 PASS AO=122;DP=219;FAO=124;FDP=231;FR=.;FRO=107;FSAF=66;FSAR=58;FSRF=55;FSRR=52;FWDB=0.0440305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.34;QD=9.94328;RBI=0.044034;REFB=-0.00300884;REVB=0.000557802;RO=97;SAF=66;SAR=56;SRF=55;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0213729;STB=0.508473;TYPE=snp;VARB=0.00274682;OID=.;OPOS=21899631;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:219:231:97:107:122:124:56:66:55:42:58:66:55:52 chr14 21960816 . T C 1612.75 PASS AO=171;DP=172;FAO=171;FDP=171;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=128;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0329929;FXX=0.00581362;HRUN=3;LEN=1;MLLD=223.198;QD=37.7251;RBI=0.0378748;REFB=0.104613;REVB=-0.0186004;RO=1;SAF=43;SAR=128;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00370429;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000190052;OID=.;OPOS=21960816;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:172:171:1:0:171:171:128:43:0:1:128:43:0:0 chr14 21991626 . C G 107.81 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114934;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=219.042;QD=35.937;RBI=0.0127865;REFB=0;REVB=-0.00560325;RO=0;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.00692e-05;OID=.;OPOS=21991626;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:5:7:0:0:5:7:0:0 chr14 21992275 . TG T 35.9 PASS AO=23;DP=115;FAO=39;FDP=105;FR=.;FRO=66;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=43;FSRR=23;FWDB=0.138319;FXX=0.0707902;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.21821;QD=1.36755;RBI=0.147404;REFB=-0.0317638;REVB=-0.050948;RO=57;SAF=14;SAR=9;SRF=42;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169811;STB=0.648278;TYPE=del;VARB=-0.0328289;OID=.;OPOS=21992276;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:23:107:39:105:66:16:23:43:23:35:57:14:9:42:15 chr14 21993498 . G A 140.48 PASS AO=38;DP=90;FAO=38;FDP=90;FR=.;FRO=52;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=35;FSRR=17;FWDB=0.0340939;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.0557;QD=6.24374;RBI=0.106128;REFB=0.00398515;REVB=0.100502;RO=52;SAF=20;SAR=18;SRF=35;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152659;STB=0.585755;TYPE=snp;VARB=-0.00317667;OID=.;OPOS=21993498;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:52:52:38:38:18:20:35:17:18:20:35:17 chr14 22038125 . C T 990.89 PASS AO=102;DP=107;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00221845;FXX=0.046292;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.052;QD=38.4812;RBI=0.00963651;REFB=0;REVB=-0.00937768;RO=0;SAF=32;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.67392e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000443364;OID=.;OPOS=22038125;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:107:103:0:0:102:103:70:32:0:0:71:32:0:0 chr14 22038450 . G A 574.74 PASS AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.000160999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.8653;QD=35.9212;RBI=0.0145167;REFB=-0.0495424;REVB=0.0145158;RO=1;SAF=31;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149896;STB=0.507934;TYPE=snp;VARB=0.000788783;OID=.;OPOS=22038450;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:64:64:1:1:63:63:32:31:1:0:32:31:1:0 chr14 22038525 . G T 769.12 PASS AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00915966;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=261.522;QD=37.9812;RBI=0.0162413;REFB=0;REVB=0.0134119;RO=0;SAF=44;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.80255e-05;OID=.;OPOS=22038525;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:81:81:0:0:81:81:37:44:0:0:37:44:0:0 chr14 22038659 . T C 729.85 PASS AO=68;DP=68;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0499243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.776;QD=37.9143;RBI=0.0786368;REFB=0;REVB=0.0607561;RO=0;SAF=52;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.11257e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000210061;OID=.;OPOS=22038659;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:68:77:0:0:68:77:16:52:0:0:24:53:0:0 chr14 22090594 . C G 548.21 PASS AO=206;DP=525;FAO=163;FDP=395;FR=.;FRO=232;FSAF=77;FSAR=86;FSRF=127;FSRR=105;FWDB=0.0263124;FXX=0.0124997;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.105;QD=5.55149;RBI=0.0368285;REFB=-0.00232999;REVB=-0.0257682;RO=318;SAF=106;SAR=100;SRF=172;SRR=146;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0285866;STB=0.543978;TYPE=snp;VARB=0.0027221;OID=.;OPOS=22090594;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:525:395:318:232:206:163:100:106:172:146:86:77:127:105 chr14 22133648 . G A 515.01 PASS AO=128;DP=270;FAO=128;FDP=269;FR=.;FRO=141;FSAF=83;FSAR=45;FSRF=66;FSRR=75;FWDB=0.00614206;FXX=0.00370357;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.0579;QD=7.65809;RBI=0.0090009;REFB=-0.0146065;REVB=-0.00657961;RO=141;SAF=83;SAR=45;SRF=66;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176906;STB=0.597644;TYPE=snp;VARB=0.0177441;OID=.;OPOS=22133648;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:270:269:141:141:128:128:45:83:66:75:45:83:66:75 chr14 22133997 . A G 461.25 PASS AO=113;DP=241;FAO=116;FDP=246;FR=.;FRO=130;FSAF=46;FSAR=70;FSRF=58;FSRR=72;FWDB=-0.0196556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.475;QD=7.49999;RBI=0.0203176;REFB=0.00650841;REVB=-0.00514386;RO=126;SAF=44;SAR=69;SRF=57;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0622754;STB=0.527073;TYPE=snp;VARB=-0.00735743;OID=.;OPOS=22133997;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:241:246:126:130:113:116:69:44:57:69:70:46:58:72 chr14 22204568 . G A 472.9 PASS AO=94;DP=179;FAO=108;FDP=211;FR=.;FRO=103;FSAF=49;FSAR=59;FSRF=51;FSRR=52;FWDB=0.0347065;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=84.0107;QD=8.96487;RBI=0.0377738;REFB=0.00191951;REVB=0.0149103;RO=84;SAF=49;SAR=45;SRF=50;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0641132;STB=0.520324;TYPE=snp;VARB=-0.00199935;OID=.;OPOS=22204568;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:211:84:103:94:108:45:49:50:34:59:49:51:52 chr14 22236771 . C T 1627.34 PASS AO=157;DP=157;FAO=171;FDP=171;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0473419;FXX=0.00581362;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.214;QD=38.0665;RBI=0.0614274;REFB=0;REVB=0.0391416;RO=0;SAF=100;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000857483;OID=.;OPOS=22236771;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:157:171:0:0:157:171:57:100:0:0:66:105:0:0 chr14 22237127 . C T 1927.33 PASS AO=210;DP=215;FAO=210;FDP=210;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00748065;FXX=0.0232547;HRUN=4;LEN=1;MLLD=200.233;QD=36.711;RBI=0.0120894;REFB=-0.00860295;REVB=0.00949697;RO=3;SAF=95;SAR=115;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00579782;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.44866e-06;OID=.;OPOS=22237127;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:215:210:3:0:210:210:115:95:2:1:115:95:0:0 chr14 22237187 . C T 1413.8 PASS AO=148;DP=149;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212553;FXX=0.013157;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.881;QD=37.7012;RBI=0.0365119;REFB=0.0186824;REVB=0.0296872;RO=0;SAF=82;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.79046e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000118851;OID=.;OPOS=22237187;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:149:150:0:0:148:150:66:82:0:0:69:81:0:0 chr14 22320728 . T C 1396.47 PASS AO=146;DP=146;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00859184;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.064;QD=38.2594;RBI=0.00905408;REFB=0;REVB=-0.00285599;RO=0;SAF=83;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.03072e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.52156e-06;OID=.;OPOS=22320728;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:146:146:0:0:146:146:63:83:0:0:63:83:0:0 chr14 22321124 . T C 1195.43 PASS AO=126;DP=128;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00465633;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.094;QD=37.3572;RBI=0.0166312;REFB=-0.0975522;REVB=0.015966;RO=0;SAF=66;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.27878e-05;OID=.;OPOS=22321124;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:128:128:0:0:126:128:60:66:0:0:61:67:0:0 chr14 22322690 . G A 1202.65 PASS AO=131;DP=134;FAO=132;FDP=134;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=104;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0384036;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.1133;QD=35.8999;RBI=0.0454329;REFB=-0.041397;REVB=0.0242758;RO=3;SAF=28;SAR=103;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.007531;STB=0.506379;TYPE=snp;VARB=0.00133526;OID=.;OPOS=22322690;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:134:134:3:2:131:132:103:28:1:2:104:28:1:1 chr14 22509188 . T C 627.68 PASS AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195148;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.488;QD=38.0414;RBI=0.0201725;REFB=0;REVB=-0.00510917;RO=0;SAF=18;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.99443e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.10806e-05;OID=.;OPOS=22509188;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:66:66:0:0:66:66:48:18:0:0:48:18:0:0 chr14 22521051 . G A 1266.95 PASS AO=133;DP=133;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0401441;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.794;QD=38.1039;RBI=0.0425573;REFB=0;REVB=0.0141272;RO=0;SAF=70;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.77216e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.47106e-05;OID=.;OPOS=22521051;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:133:133:0:0:133:133:63:70:0:0:63:70:0:0 chr14 22591988 . C A 347.7 PASS AO=48;DP=104;FAO=59;FDP=96;FR=.,HEALED;FRO=33;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=-0.0330863;FXX=0.0495;HRUN=6;LEN=1;MLLD=179.825;QD=14.4877;RBI=0.0337636;REFB=0.00129314;REVB=-0.00672895;RO=23;SAF=22;SAR=26;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115493;STB=0.534143;TYPE=snp;VARB=-0.00763316;OID=.;OPOS=22591988;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:89:96:23:33:48:59:26:22:15:8:27:32:21:12 chr14 22600490 . C T 333.61 PASS AO=80;DP=161;FAO=78;FDP=158;FR=.;FRO=80;FSAF=42;FSAR=36;FSRF=32;FSRR=48;FWDB=0.0534754;FXX=0.030673;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.769;QD=8.44592;RBI=0.0534758;REFB=-0.0294043;REVB=-0.00019921;RO=81;SAF=41;SAR=39;SRF=32;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107119;STB=0.56975;TYPE=snp;VARB=0.0310418;OID=.;OPOS=22600490;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:158:81:80:80:78:39:41:32:49:36:42:32:48 chr14 22600863 . G A 353.6 PASS AO=80;DP=160;FAO=81;FDP=160;FR=.;FRO=79;FSAF=57;FSAR=24;FSRF=55;FSRR=24;FWDB=-0.000131977;FXX=0.00621079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=300.839;QD=8.8401;RBI=0.00515721;REFB=0.00140308;REVB=0.00515552;RO=80;SAF=56;SAR=24;SRF=56;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504424;TYPE=snp;VARB=-0.00132725;OID=.;OPOS=22600863;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:160:80:79:80:81:24:56:56:24:24:57:55:24 chr14 22690209 . A C 1127.51 PASS AO=93;DP=121;FAO=118;FDP=118;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=57;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.178121;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.0449;QD=38.2208;RBI=0.184877;REFB=0;REVB=-0.0495213;RO=0;SAF=34;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.20828e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00110435;OID=.;OPOS=22690209;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:113:118:0:0:93:118:59:34:0:0:61:57:0:0 chr14 22694926 . C T 760.4 PASS AO=82;DP=83;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0303392;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.778;QD=36.6456;RBI=0.0322406;REFB=0.00278815;REVB=-0.0109081;RO=1;SAF=27;SAR=55;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00853372;STB=0.504503;TYPE=snp;VARB=5.61619e-05;OID=.;OPOS=22694926;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:83:83:1:1:82:82:55:27:0:1:55:27:0:1 chr14 22695084 . C T 574.17 PASS AO=58;DP=58;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0553326;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.6467;QD=38.2782;RBI=0.0903177;REFB=0;REVB=0.0713833;RO=0;SAF=22;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00142317;OID=.;OPOS=22695084;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:58:60:0:0:58:60:36:22:0:0:38:22:0:0 chr14 22695128 . A G 386.2 PASS AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0561889;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.852;QD=38.6197;RBI=0.0599176;REFB=0;REVB=-0.0208069;RO=0;SAF=10;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.36384e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00055491;OID=.;OPOS=22695128;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:39:40:0:0:39:40:29:10:0:0:29:11:0:0 chr14 22739862 . A T 882.24 PASS AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0168365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.0199;QD=37.9458;RBI=0.0595189;REFB=0;REVB=-0.0570879;RO=0;SAF=58;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000580936;OID=.;OPOS=22739862;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:93:93:0:0:93:93:35:58:0:0:35:58:0:0 chr14 22740245 . A G 1454.36 PASS AO=154;DP=156;FAO=156;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.032914;FXX=0.00636902;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.504;QD=37.2913;RBI=0.0410451;REFB=0.031145;REVB=-0.0245228;RO=1;SAF=54;SAR=100;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00872752;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000130696;OID=.;OPOS=22740245;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:156:156:1:0:154:156:100:54:1:0:101:55:0:0 chr14 22740270 . G A 1493.56 PASS AO=156;DP=157;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0306413;FXX=0.0125778;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.975;QD=38.0524;RBI=0.0364149;REFB=-0.0785638;REVB=-0.0196763;RO=0;SAF=53;SAR=103;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000130114;OID=.;OPOS=22740270;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:157:157:0:0:156:157:103:53:0:0:105:52:0:0 chr14 22788610 . T C 444.89 PASS AO=104;DP=208;FAO=104;FDP=208;FR=.;FRO=104;FSAF=63;FSAR=41;FSRF=51;FSRR=53;FWDB=0.0249968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.109;QD=8.55559;RBI=0.0429351;REFB=-0.0119556;REVB=0.0349082;RO=104;SAF=63;SAR=41;SRF=51;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107082;STB=0.558879;TYPE=snp;VARB=0.00937101;OID=.;OPOS=22788610;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:208:104:104:104:104:41:63:51:53:41:63:51:53 chr14 22887459 . CG C 54.12 PASS AO=55;DP=182;FAO=56;FDP=179;FR=.;FRO=123;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=53;FSRR=70;FWDB=0.0719709;FXX=0.0164826;HRUN=4;LEN=1;MLLD=17.9139;QD=1.20929;RBI=0.140258;REFB=-0.00520929;REVB=0.120385;RO=110;SAF=29;SAR=26;SRF=50;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0.492754;SSSB=0.0840826;STB=0.559557;TYPE=del;VARB=0.0217234;OID=.;OPOS=22887460;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:55:178:56:179:123:29:27:53:70:54:110:29:26:50:60 chr14 22891794 . G A 121.32 PASS AO=25;DP=53;FAO=25;FDP=51;FR=.,HEALED;FRO=25;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.0236786;FXX=0.0192271;HRUN=4;LEN=1;MLLD=103.765;QD=9.51498;RBI=0.0322749;REFB=-0.0501692;REVB=0.0219316;RO=17;SAF=10;SAR=15;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0962864;STB=0.54095;TYPE=snp;VARB=0.0189537;OID=.;OPOS=22891794;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:51:17:25:25:25:15:10:9:8:15:10:12:13 chr14 22891883 . G C 222.89 PASS AO=46;DP=87;FAO=47;FDP=88;FR=.;FRO=41;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=11;FSRR=30;FWDB=-0.00257315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.421;QD=10.1314;RBI=0.017896;REFB=-0.019223;REVB=0.01771;RO=41;SAF=20;SAR=26;SRF=11;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148384;STB=0.5766;TYPE=snp;VARB=0.0152544;OID=.;OPOS=22891883;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:88:41:41:46:47:26:20:11:30:27:20:11:30 chr14 22938211 . G A 179.67 PASS AO=47;DP=106;FAO=47;FDP=106;FR=.;FRO=59;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=22;FSRR=37;FWDB=-0.00537814;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=259.184;QD=6.78;RBI=0.016404;REFB=-0.0100684;REVB=-0.0154974;RO=59;SAF=25;SAR=22;SRF=22;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157298;STB=0.587847;TYPE=snp;VARB=0.0120901;OID=.;OPOS=22938211;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:59:59:47:47:22:25:22:37:22:25:22:37 chr14 22938561 . A T 67.11 PASS AO=20;DP=54;FAO=20;FDP=54;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.0128097;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=137.046;QD=4.97138;RBI=0.0135706;REFB=0.0006009;REVB=-0.00448021;RO=31;SAF=12;SAR=8;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123459;STB=0.5999;TYPE=snp;VARB=-0.00139616;OID=.;OPOS=22938561;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:54:54:31:34:20:20:8:12:15:16:8:12:15:19 chr14 22942890 . G T 1924.06 PASS AO=203;DP=204;FAO=203;FDP=203;FR=.;FRO=0;FSAF=106;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0205689;FXX=0.00490172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.403;QD=37.9126;RBI=0.0577702;REFB=-0.0447447;REVB=0.0539844;RO=0;SAF=106;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00032896;OID=.;OPOS=22942890;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:204:203:0:0:203:203:97:106:0:0:97:106:0:0 chr14 22944295 . C T 141.48 PASS AO=41;DP=102;FAO=41;FDP=102;FR=.;FRO=61;FSAF=28;FSAR=13;FSRF=36;FSRR=25;FWDB=0.0192231;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=217.105;QD=5.54814;RBI=0.0192488;REFB=0.0030291;REVB=0.000994152;RO=61;SAF=28;SAR=13;SRF=36;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107616;STB=0.561151;TYPE=snp;VARB=-0.00604862;OID=.;OPOS=22944295;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:61:61:41:41:13:28:36:25:13:28:36:25 chr14 22961854 . A G 577.06 PASS AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0488097;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=91.1711;QD=37.8403;RBI=0.0536014;REFB=0;REVB=0.0221521;RO=0;SAF=43;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000109008;OID=.;OPOS=22961854;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:61:61:0:0:61:61:18:43:0:0:18:43:0:0 chr14 22972742 . G A 2096.16 PASS AO=221;DP=222;FAO=221;FDP=221;FR=.;FRO=0;FSAF=106;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0310597;FXX=0.00896821;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.229;QD=37.9395;RBI=0.0358965;REFB=-0.0166668;REVB=0.0179959;RO=0;SAF=106;SAR=115;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.47609e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.80845e-05;OID=.;OPOS=22972742;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:91:222:221:0:0:221:221:115:106:0:0:115:106:0:0 chr14 22972783 . AC A 1568.56 PASS AO=195;DP=215;FAO=200;FDP=200;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.075107;FXX=0.0196069;HRUN=2;LEN=1;MLLD=29.4486;QD=31.3711;RBI=0.100547;REFB=0;REVB=-0.0668477;RO=0;SAF=96;SAR=99;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.45244e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.0010571;OID=.;OPOS=22972784;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:195:202:200:200:0:97:103:0:0:99:0:96:99:0:0 chr14 22972815 . C T 1767.27 PASS AO=185;DP=186;FAO=186;FDP=186;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00830351;FXX=0.00534731;HRUN=2;LEN=1;MLLD=257.743;QD=38.0057;RBI=0.0110128;REFB=-0.00679628;REVB=0.00723424;RO=0;SAF=83;SAR=102;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.99524e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.17659e-07;OID=.;OPOS=22972815;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:186:186:0:0:185:186:102:83:0:0:102:84:0:0 chr14 22975700 . T G 1539.41 PASS AO=163;DP=164;FAO=163;FDP=163;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.021731;FXX=0.00609719;HRUN=4;LEN=1;MLLD=206.341;QD=37.7769;RBI=0.0339029;REFB=0.0153338;REVB=-0.0260225;RO=1;SAF=92;SAR=71;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.006655;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.62894e-05;OID=.;OPOS=22975700;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:164:163:1:0:163:163:71:92:0:1:71:92:0:0 chr14 22978335 . C T 2377.57 PASS AO=250;DP=251;FAO=250;FDP=250;FR=.;FRO=0;FSAF=138;FSAR=112;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0080229;FXX=0.0118572;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.8722;QD=38.0412;RBI=0.0923406;REFB=-0.0495036;REVB=0.0919914;RO=1;SAF=138;SAR=112;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00344175;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000208782;OID=.;OPOS=22978335;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:251:250:1:0:250:250:112:138:1:0:112:138:0:0 chr14 22993278 . A AG 756.79 PASS AO=105;DP=126;FAO=123;FDP=124;FR=.;FRO=1;FSAF=59;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0815673;FXX=0.00799936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=16.4337;QD=24.4127;RBI=0.0893163;REFB=0.0271669;REVB=0.0363892;RO=14;SAF=57;SAR=48;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0572377;STB=0.503875;TYPE=ins;VARB=0.0142858;OID=.;OPOS=22993279;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:105:126:123:124:1:59:64:0:1:54:14:57:48:4:10 chr14 22998590 . AG A 1242.56 PASS AO=159;DP=172;FAO=163;FDP=163;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0312245;FXX=0.0121205;HRUN=3;LEN=1;MLLD=24.059;QD=30.4923;RBI=0.106619;REFB=0;REVB=0.101945;RO=0;SAF=80;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00155253;OID=.;OPOS=22998591;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:159:165:163:163:0:81:82:0:0:99:0:80:79:0:0 chr14 22998619 . AC A 1079.71 PASS AO=133;DP=155;FAO=145;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019629;FXX=0.0764283;HRUN=3;LEN=1;MLLD=23.4897;QD=29.785;RBI=0.0326903;REFB=0;REVB=0.0261411;RO=2;SAF=62;SAR=71;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0131997;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00210684;OID=.;OPOS=22998620;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:133:152:145:145:0:69:76:0:0:93:2:62:71:0:2 chr14 23025932 . A T 336.82 PASS AO=92;DP=211;FAO=93;FDP=214;FR=.;FRO=121;FSAF=36;FSAR=57;FSRF=37;FSRR=84;FWDB=-0.00361935;FXX=0.00465095;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.211;QD=6.29571;RBI=0.0257812;REFB=-0.020835;REVB=0.0255259;RO=117;SAF=35;SAR=57;SRF=36;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0795364;STB=0.549519;TYPE=snp;VARB=0.0231468;OID=.;OPOS=23025932;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:214:117:121:92:93:57:35:36:81:57:36:37:84 chr14 23044002 . G T 159.99 PASS AO=41;DP=92;FAO=41;FDP=92;FR=.;FRO=51;FSAF=28;FSAR=13;FSRF=47;FSRR=4;FWDB=-0.00229333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.542;QD=6.95591;RBI=0.0238386;REFB=-0.00712976;REVB=0.023728;RO=51;SAF=28;SAR=13;SRF=47;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.31396;STB=0.671885;TYPE=snp;VARB=0.0151997;OID=.;OPOS=23044002;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:51:51:41:41:13:28:47:4:13:28:47:4 chr14 23078810 . A T 450.48 PASS AO=103;DP=202;FAO=103;FDP=202;FR=.;FRO=99;FSAF=48;FSAR=55;FSRF=52;FSRR=47;FWDB=0.0158925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.1439;QD=8.9204;RBI=0.0204907;REFB=-0.0261078;REVB=-0.0129343;RO=98;SAF=48;SAR=55;SRF=52;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0574526;STB=0.529044;TYPE=snp;VARB=0.0288308;OID=.;OPOS=23078810;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:202:98:99:103:103:55:48:52:46:55:48:52:47 chr14 23081223 . T C 655.17 PASS AO=77;DP=90;FAO=85;FDP=97;FR=.;FRO=12;FSAF=29;FSAR=56;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.0484241;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.8302;QD=27.0172;RBI=0.0568205;REFB=-0.0113921;REVB=0.0297266;RO=10;SAF=23;SAR=54;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122457;STB=0.543536;TYPE=snp;VARB=0.0101324;OID=.;OPOS=23081223;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:90:97:10:12:77:85:54:23:8:2:56:29:8:4 chr14 23242828 . T C 895.28 PASS AO=98;DP=107;FAO=104;FDP=108;FR=.;FRO=4;FSAF=47;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.00814696;FXX=0.00917347;HRUN=3;LEN=1;MLLD=83.2993;QD=33.1584;RBI=0.0219554;REFB=0.021088;REVB=0.0203879;RO=4;SAF=41;SAR=57;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0321242;STB=0.516946;TYPE=snp;VARB=0.00239979;OID=.;OPOS=23242828;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:107:108:4:4:98:104:57:41:0:4:57:47:0:4 chr14 23282110 . A G 38.35 PASS AO=13;DP=42;FAO=13;FDP=42;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=21;FSRR=8;FWDB=-0.000115942;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=191.56;QD=3.65208;RBI=0.0202881;REFB=-0.0293412;REVB=0.0202878;RO=29;SAF=9;SAR=4;SRF=21;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0437464;STB=0.526276;TYPE=snp;VARB=0.0468819;OID=.;OPOS=23282110;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:42:42:29:29:13:13:4:9:21:8:4:9:21:8 chr14 23282449 . C T 285.67 PASS AO=65;DP=129;FAO=65;FDP=129;FR=.;FRO=64;FSAF=23;FSAR=42;FSRF=32;FSRR=32;FWDB=-0.00375006;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=181.209;QD=8.85794;RBI=0.0146718;REFB=-0.0198978;REVB=0.0141845;RO=62;SAF=23;SAR=42;SRF=30;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12088;STB=0.575749;TYPE=snp;VARB=0.0190257;OID=.;OPOS=23282449;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:62:64:65:65:42:23:30:32:42:23:32:32 chr14 23299135 . G T 291.04 PASS AO=75;DP=164;FAO=75;FDP=164;FR=.;FRO=89;FSAF=44;FSAR=31;FSRF=52;FSRR=37;FWDB=-0.0153354;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=160.196;QD=7.09859;RBI=0.0227302;REFB=-0.0160077;REVB=0.0167776;RO=89;SAF=44;SAR=31;SRF=52;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00241454;STB=0.50134;TYPE=snp;VARB=0.0235463;OID=.;OPOS=23299135;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:164:89:89:75:75:31:44:52:37:31:44:52:37 chr14 23299286 . T C 20.85 PASS AO=8;DP=32;FAO=8;FDP=32;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.0259898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.954;QD=2.60635;RBI=0.0444704;REFB=-0.0087291;REVB=-0.0360852;RO=23;SAF=4;SAR=4;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179244;STB=0.624707;TYPE=snp;VARB=0.0425303;OID=.;OPOS=23299286;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:32:32:23:24:8:8:4:4:8:15:4:4:8:16 chr14 23303641 . A C 291.69 PASS AO=61;DP=161;FAO=69;FDP=146;FR=.;FRO=77;FSAF=31;FSAR=38;FSRF=32;FSRR=45;FWDB=-0.0154257;FXX=0.0931619;HRUN=5;LEN=1;MLLD=148.136;QD=7.9914;RBI=0.0156495;REFB=-0.0245647;REVB=0.00263693;RO=57;SAF=27;SAR=34;SRF=21;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0666011;STB=0.518014;TYPE=snp;VARB=0.0208616;OID=.;OPOS=23303641;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:146:57:77:61:69:34:27:21:36:38:31:32:45 chr14 23312923 . T C 117.37 PASS AO=30;DP=87;FAO=37;FDP=99;FR=.;FRO=62;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=39;FSRR=23;FWDB=-0.0592179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.5801;QD=4.74207;RBI=0.0599158;REFB=-0.0254783;REVB=0.00911868;RO=36;SAF=12;SAR=18;SRF=24;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254304;STB=0.621238;TYPE=snp;VARB=0.0441141;OID=.;OPOS=23312923;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:99:36:62:30:37:18:12:24:12:21:16:39:23 chr14 23321900 . G A 594.12 PASS AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.27;QD=37.7221;RBI=0.0280051;REFB=0;REVB=0.0187346;RO=0;SAF=16;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.50785e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00010584;OID=.;OPOS=23321900;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:62:63:0:0:62:63:46:16:0:0:47:16:0:0 chr14 23371055 . G C 250.8 PASS AO=30;DP=34;FAO=31;FDP=33;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0436717;FXX=0.0294031;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.868;QD=30.3993;RBI=0.0590713;REFB=-0.0966673;REVB=0.039777;RO=2;SAF=27;SAR=3;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115575;STB=0.562769;TYPE=snp;VARB=0.00403483;OID=.;OPOS=23371055;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:34:33:2:2:30:31:3:27:1:1:3:28:1:1 chr14 23374435 . G A 539.88 PASS AO=85;DP=150;FAO=101;FDP=162;FR=.;FRO=61;FSAF=41;FSAR=60;FSRF=17;FSRR=44;FWDB=0.0314715;FXX=0.0299383;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.522;QD=13.3304;RBI=0.0432207;REFB=-0.0658577;REVB=0.0296238;RO=64;SAF=41;SAR=44;SRF=17;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172857;STB=0.55061;TYPE=snp;VARB=0.0327208;OID=.;OPOS=23374435;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:162:64:61:85:101:44:41:17:47:60:41:17:44 chr14 23374862 . C T 240.44 PASS AO=51;DP=96;FAO=51;FDP=95;FR=.;FRO=44;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=0.0197326;FXX=0.0104156;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.74;QD=10.1236;RBI=0.0255445;REFB=-0.011769;REVB=-0.0162217;RO=44;SAF=24;SAR=27;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0135628;STB=0.50746;TYPE=snp;VARB=0.0113007;OID=.;OPOS=23374862;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:95:44:44:51:51:27:24:20:24:27:24:20:24 chr14 23375564 . G A 547.81 PASS AO=129;DP=257;FAO=130;FDP=259;FR=.;FRO=129;FSAF=58;FSAR=72;FSRF=77;FSRR=52;FWDB=0.0176821;FXX=0.0114499;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.7716;QD=8.46038;RBI=0.0197066;REFB=-0.0183092;REVB=-0.00870024;RO=125;SAF=57;SAR=72;SRF=75;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141462;STB=0.574728;TYPE=snp;VARB=0.0191606;OID=.;OPOS=23375564;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:257:259:125:129:129:130:72:57:75:50:72:58:77:52 chr14 23398902 . C T 170.16 PASS AO=39;DP=80;FAO=39;FDP=80;FR=.;FRO=41;FSAF=34;FSAR=5;FSRF=30;FSRR=11;FWDB=0.0278769;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.622;QD=8.50805;RBI=0.0279951;REFB=-0.0510132;REVB=0.0025703;RO=39;SAF=34;SAR=5;SRF=28;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242556;STB=0.629553;TYPE=snp;VARB=0.0490932;OID=.;OPOS=23398902;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:39:41:39:39:5:34:28:11:5:34:30:11 chr14 23398990 . T G 210.37 PASS AO=54;DP=121;FAO=54;FDP=120;FR=.;FRO=66;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=40;FSRR=26;FWDB=0.0394965;FXX=0.00826378;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.1665;QD=7.01242;RBI=0.0457727;REFB=-0.00875563;REVB=-0.0231336;RO=66;SAF=26;SAR=28;SRF=40;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122504;STB=0.568241;TYPE=snp;VARB=0.00693207;OID=.;OPOS=23398990;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:120:66:66:54:54:28:26:40:26:28:26:40:26 chr14 23398995 . G A 198.71 PASS AO=54;DP=122;FAO=54;FDP=126;FR=.;FRO=72;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=40;FSRR=32;FWDB=-0.000677406;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.7779;QD=6.30825;RBI=0.0143748;REFB=-0.036545;REVB=0.0143588;RO=67;SAF=27;SAR=27;SRF=40;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0963068;STB=0.531734;TYPE=snp;VARB=0.0569484;OID=.;OPOS=23398995;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:126:67:72:54:54:27:27:40:27:27:27:40:32 chr14 23426182 . C A 17.48 PASS AO=3;DP=8;FAO=3;FDP=7;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0110304;FXX=0.124844;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.513;QD=9.98928;RBI=0.0128054;REFB=-0.0834014;REVB=0.00650445;RO=4;SAF=2;SAR=1;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.348651;STB=0.725852;TYPE=snp;VARB=0.0225188;OID=.;OPOS=23426182;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:8:7:4:4:3:3:1:2:1:3:1:2:1:3 chr14 23440742 . A G 82.23 PASS AO=26;DP=72;FAO=26;FDP=72;FR=.;FRO=46;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=30;FWDB=0.00407761;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.959;QD=4.5685;RBI=0.00495679;REFB=-0.00778208;REVB=0.00281831;RO=46;SAF=13;SAR=13;SRF=16;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168943;STB=0.59715;TYPE=snp;VARB=0.0134006;OID=.;OPOS=23440742;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:72:72:46:46:26:26:13:13:16:30:13:13:16:30 chr14 23441179 . G A 280.99 PASS AO=67;DP=138;FAO=67;FDP=138;FR=.;FRO=71;FSAF=25;FSAR=42;FSRF=18;FSRR=53;FWDB=-0.0090883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.4257;QD=8.14455;RBI=0.0208735;REFB=-0.0127058;REVB=-0.0187911;RO=71;SAF=25;SAR=42;SRF=18;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123678;STB=0.568027;TYPE=snp;VARB=0.0140847;OID=.;OPOS=23441179;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:71:71:67:67:42:25:18:53:42:25:18:53 chr14 23522763 . CCG C,CC 32.63 PASS AO=4,6;DP=24;FAO=0,10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=0,2;FSAR=0,8;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.094719,0.0403569;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=2,1;MLLD=17.1035,13.1568;QD=6.86866;RBI=0.156886,0.0693486;REFB=-0.00864607,-0.0983168;REVB=-0.125066,0.0563963;RO=9;SAF=1,1;SAR=3,5;SRF=6;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.422489,-0.503774;STB=0.5,0.743659;TYPE=del,del;VARB=0.0627344,0.119797;OID=.,.;OPOS=23522764,23522765;OREF=CG,G;OALT=-,-;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:4,6:20:0,10:19:9:0,2:0,8:6:3:23:9:1,1:3,5:6:3 chr14 23548783 . A AGAACGT 347.45 PASS AO=122;DP=359;FAO=125;FDP=347;FR=.;FRO=222;FSAF=53;FSAR=72;FSRF=129;FSRR=93;FWDB=-0.0040932;FXX=0.0307254;HRUN=1;LEN=6;MLLD=236.293;QD=4.0052;RBI=0.00918578;REFB=-0.0186179;REVB=-0.0082234;RO=217;SAF=52;SAR=70;SRF=129;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188533;STB=0.599737;TYPE=ins;VARB=0.0305719;OID=.;OPOS=23548784;OREF=-;OALT=GAACGT;OMAPALT=AGAACGT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:122:359:125:347:222:53:72:129:93:99:217:52:70:129:88 chr14 23549285 . G A 215.11 PASS AO=58;DP=134;FAO=58;FDP=133;FR=.;FRO=75;FSAF=36;FSAR=22;FSRF=39;FSRR=36;FWDB=0.0215716;FXX=0.00746213;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.222;QD=6.46939;RBI=0.0216832;REFB=0.00972964;REVB=-0.00219693;RO=76;SAF=36;SAR=22;SRF=40;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0987098;STB=0.558567;TYPE=snp;VARB=-0.0117166;OID=.;OPOS=23549285;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:133:76:75:58:58:22:36:40:36:22:36:39:36 chr14 23549319 . A G 311.66 PASS AO=79;DP=171;FAO=79;FDP=171;FR=.;FRO=92;FSAF=50;FSAR=29;FSRF=44;FSRR=48;FWDB=-0.0155472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.743;QD=7.29019;RBI=0.0286807;REFB=-0.0247564;REVB=-0.0241013;RO=92;SAF=50;SAR=29;SRF=44;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153905;STB=0.58544;TYPE=snp;VARB=0.0300483;OID=.;OPOS=23549319;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:171:92:92:79:79:29:50:44:48:29:50:44:48 chr14 23549379 . C G 1346.24 PASS AO=114;DP=148;FAO=135;FDP=144;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=81;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000320312;FXX=0.00689608;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.735;QD=37.3955;RBI=0.0355869;REFB=0;REVB=0.0355854;RO=0;SAF=75;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5875e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00476104;OID=.;OPOS=23549379;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:143:144:0:0:114:135:39:75:0:0:54:81:0:0 chr14 23549383 . G T 206.19 PASS AO=61;DP=150;FAO=61;FDP=152;FR=.;FRO=91;FSAF=42;FSAR=19;FSRF=47;FSRR=44;FWDB=0.00980562;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=274.509;QD=5.42604;RBI=0.0125526;REFB=-0.000554871;REVB=-0.0078369;RO=83;SAF=42;SAR=19;SRF=45;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162713;STB=0.610062;TYPE=snp;VARB=0.000919834;OID=.;OPOS=23549383;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:152:83:91:61:61:19:42:45:38:19:42:47:44 chr14 23549785 . T C 343.18 PASS AO=85;DP=180;FAO=85;FDP=180;FR=.;FRO=95;FSAF=43;FSAR=42;FSRF=34;FSRR=61;FWDB=-0.0027038;FXX=0.00552456;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.193;QD=7.62614;RBI=0.00295546;REFB=-0.0161501;REVB=0.00119341;RO=94;SAF=43;SAR=42;SRF=33;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147188;STB=0.577954;TYPE=snp;VARB=0.0163615;OID=.;OPOS=23549785;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:180:94:95:85:85:42:43:33:61:42:43:34:61 chr14 23549878 . TTCC T 54.37 PASS AO=28;DP=101;FAO=29;FDP=83;FR=.;FRO=54;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=27;FSRR=27;FWDB=-0.0384837;FXX=0.0674082;HRUN=2;LEN=3;MLLD=131.835;QD=2.62027;RBI=0.0594432;REFB=-0.0238057;REVB=-0.0453044;RO=19;SAF=10;SAR=18;SRF=4;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121943;STB=0.580097;TYPE=del;VARB=0.0437818;OID=.;OPOS=23549879;OREF=TCC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:28:62:29:83:54:11:18:27:27:54:19:10:18:4:15 chr14 23567774 . T A 211.37 PASS AO=63;DP=157;FAO=63;FDP=158;FR=.;FRO=95;FSAF=35;FSAR=28;FSRF=42;FSRR=53;FWDB=-0.0233454;FXX=0.0124992;HRUN=4;LEN=1;MLLD=146.096;QD=5.35113;RBI=0.0422105;REFB=-0.00140832;REVB=-0.035167;RO=88;SAF=35;SAR=28;SRF=38;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128147;STB=0.568001;TYPE=snp;VARB=0.0014007;OID=.;OPOS=23567774;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:158:88:95:63:63:28:35:38:50:28:35:42:53 chr14 23567991 . C G 218.9 PASS AO=40;DP=65;FAO=40;FDP=65;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=29;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=0.0290126;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.938;QD=13.4707;RBI=0.0328704;REFB=-0.0430146;REVB=-0.015451;RO=25;SAF=11;SAR=29;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0720899;STB=0.539514;TYPE=snp;VARB=0.0271714;OID=.;OPOS=23567991;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:65:65:25:25:40:40:29:11:9:16:29:11:9:16 chr14 23568018 . G A 72.49 PASS AO=18;DP=43;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=20;FWDB=0.0139037;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.4754;QD=6.90392;RBI=0.0210589;REFB=-0.00525492;REVB=0.0158167;RO=24;SAF=9;SAR=9;SRF=4;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.337636;STB=0.690295;TYPE=snp;VARB=0.0149951;OID=.;OPOS=23568018;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:43:42:24:24:18:18:9:9:4:20:9:9:4:20 chr14 23568286 . A G 147.12 PASS AO=43;DP=113;FAO=44;FDP=110;FR=.;FRO=66;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=33;FSRR=33;FWDB=0.000603222;FXX=0.0265463;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.976;QD=5.34965;RBI=0.0082632;REFB=0.00558376;REVB=0.00824116;RO=60;SAF=19;SAR=24;SRF=30;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0603799;STB=0.527351;TYPE=snp;VARB=-0.0104385;OID=.;OPOS=23568286;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:110:60:66:43:44:24:19:30:30:24:20:33:33 chr14 23568376 . G A 232.61 PASS AO=66;DP=160;FAO=66;FDP=159;FR=.;FRO=93;FSAF=25;FSAR=41;FSRF=52;FSRR=41;FWDB=0.0080746;FXX=0.0124216;HRUN=4;LEN=1;MLLD=139.817;QD=5.85194;RBI=0.00823602;REFB=-0.0064822;REVB=-0.00162258;RO=93;SAF=25;SAR=41;SRF=52;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189364;STB=0.606267;TYPE=snp;VARB=0.00976328;OID=.;OPOS=23568376;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:159:93:93:66:66:41:25:52:41:41:25:52:41 chr14 23569026 . C G 99.41 PASS AO=26;DP=72;FAO=29;FDP=74;FR=.;FRO=45;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=0.0385589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.5974;QD=5.37326;RBI=0.0387377;REFB=-0.00307316;REVB=-0.00371701;RO=44;SAF=14;SAR=12;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0172232;STB=0.51127;TYPE=snp;VARB=0.00549214;OID=.;OPOS=23569026;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:74:44:45:26:29:12:14:23:21:13:16:24:21 chr14 23569106 . A G 821.79 PASS AO=90;DP=92;FAO=90;FDP=92;FR=.;FRO=2;FSAF=52;FSAR=38;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0217209;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.747;QD=35.7302;RBI=0.0221501;REFB=0.028693;REVB=-0.00433911;RO=2;SAF=52;SAR=38;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0178795;STB=0.509432;TYPE=snp;VARB=-6.32792e-05;OID=.;OPOS=23569106;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:92:92:2:2:90:90:38:52:2:0:38:52:2:0 chr14 23571371 . G A 131.73 PASS AO=31;DP=65;FAO=31;FDP=65;FR=.;FRO=34;FSAF=24;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.0188848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.171;QD=8.10613;RBI=0.0365951;REFB=-0.0278428;REVB=-0.0313459;RO=34;SAF=24;SAR=7;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.295865;STB=0.667322;TYPE=snp;VARB=0.0154467;OID=.;OPOS=23571371;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:34:34:31:31:7:24:17:17:7:24:17:17 chr14 23571609 . G A 156.39 PASS AO=42;DP=97;FAO=42;FDP=98;FR=.;FRO=56;FSAF=27;FSAR=15;FSRF=31;FSRR=25;FWDB=0.0525129;FXX=0.0101;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.4411;QD=6.38335;RBI=0.0525296;REFB=-0.0283679;REVB=-0.00132679;RO=55;SAF=27;SAR=15;SRF=32;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0655107;STB=0.55382;TYPE=snp;VARB=0.0253169;OID=.;OPOS=23571609;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:98:55:56:42:42:15:27:32:23:15:27:31:25 chr14 23571671 . A T 739.46 PASS AO=75;DP=75;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00673812;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.8;QD=38.4136;RBI=0.00680348;REFB=0;REVB=0.000940739;RO=0;SAF=38;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.41959e-05;OID=.;OPOS=23571671;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:75:77:0:0:75:77:37:38:0:0:40:37:0:0 chr14 23598952 . A G 1220.94 PASS AO=124;DP=125;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00469667;FXX=0.00781189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.555;QD=38.455;RBI=0.00475591;REFB=0;REVB=0.000748269;RO=0;SAF=57;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000135605;OID=.;OPOS=23598952;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:125:127:0:0:124:127:67:57:0:0:70:57:0:0 chr14 23598976 . G A 150.94 PASS AO=48;DP=125;FAO=48;FDP=127;FR=.;FRO=79;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=33;FSRR=46;FWDB=-0.0196033;FXX=0.00781189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.4165;QD=4.75394;RBI=0.098625;REFB=-0.0175036;REVB=0.0966572;RO=70;SAF=23;SAR=25;SRF=32;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0232208;STB=0.538395;TYPE=snp;VARB=0.035839;OID=.;OPOS=23598976;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:127:70:79:48:48:25:23:32:38:25:23:33:46 chr14 23652004 . G A 178.12 PASS AO=52;DP=128;FAO=52;FDP=128;FR=.;FRO=76;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=46;FSRR=30;FWDB=-0.0032486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.743;QD=5.56637;RBI=0.0155386;REFB=0.000379249;REVB=0.0151953;RO=76;SAF=30;SAR=22;SRF=46;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0307558;STB=0.51732;TYPE=snp;VARB=-0.000460228;OID=.;OPOS=23652004;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:76:76:52:52:22:30:46:30:22:30:46:30 chr14 23745533 . C T 541.52 PASS AO=107;DP=186;FAO=107;FDP=185;FR=.;FRO=78;FSAF=40;FSAR=67;FSRF=31;FSRR=47;FWDB=0.0586692;FXX=0.0211629;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.3286;QD=11.7086;RBI=0.0660653;REFB=-0.0234215;REVB=-0.0303735;RO=74;SAF=40;SAR=67;SRF=29;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0144804;STB=0.51057;TYPE=snp;VARB=0.0201566;OID=.;OPOS=23745533;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:185:74:78:107:107:67:40:29:45:67:40:31:47 chr14 23777099 . G A 232.28 PASS AO=41;DP=69;FAO=41;FDP=66;FR=.;FRO=25;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=0.0158436;FXX=0.043472;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.567;QD=14.0776;RBI=0.0623189;REFB=-0.0349935;REVB=0.0602713;RO=24;SAF=20;SAR=21;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0765657;STB=0.548531;TYPE=snp;VARB=0.0171628;OID=.;OPOS=23777099;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:69:66:24:25:41:41:21:20:9:15:21:20:9:16 chr14 23777374 . A G 673.07 PASS AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0127695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.241;QD=37.9193;RBI=0.0131735;REFB=0;REVB=-0.00323742;RO=0;SAF=53;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.70806e-05;OID=.;OPOS=23777374;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:71:71:0:0:71:71:18:53:0:0:18:53:0:0 chr14 23851276 . CA C 45.68 PASS AO=25;DP=88;FAO=37;FDP=83;FR=.;FRO=46;FSAF=8;FSAR=29;FSRF=19;FSRR=27;FWDB=-0.0825469;FXX=0.0235266;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.4411;QD=2.2016;RBI=0.170748;REFB=-0.055485;REVB=-0.149469;RO=44;SAF=5;SAR=20;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.307826;STB=0.635988;TYPE=del;VARB=0.0141614;OID=.;OPOS=23851277;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:25:85:37:83:46:8:29:19:27:45:44:5:20:19:25 chr14 23861811 . A G 65.53 PASS AO=16;DP=37;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.00215043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.411;QD=7.08427;RBI=0.0107418;REFB=0.00742474;REVB=0.0105243;RO=21;SAF=9;SAR=7;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0851303;STB=0.549091;TYPE=snp;VARB=-0.0106923;OID=.;OPOS=23861811;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:37:37:21:21:16:16:7:9:10:11:7:9:10:11 chr14 23874523 . C T 107.24 PASS AO=23;DP=45;FAO=23;FDP=45;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0399336;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.1303;QD=9.5325;RBI=0.0427242;REFB=0.00692824;REVB=0.0151876;RO=22;SAF=13;SAR=10;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0965742;STB=0.554216;TYPE=snp;VARB=-0.00701689;OID=.;OPOS=23874523;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:45:45:22:22:23:23:10:13:10:12:10:13:10:12 chr14 23892888 . A G 213.26 PASS AO=60;DP=130;FAO=60;FDP=142;FR=.;FRO=82;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=38;FSRR=44;FWDB=-0.0508796;FXX=0.0405378;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.1608;QD=6.00728;RBI=0.148832;REFB=-0.0639621;REVB=-0.139865;RO=68;SAF=32;SAR=28;SRF=38;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0245469;STB=0.540324;TYPE=snp;VARB=0.0725436;OID=.;OPOS=23892888;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:142:68:82:60:60:28:32:38:30:28:32:38:44 chr14 23899027 . C T 196.99 PASS AO=48;DP=110;FAO=51;FDP=113;FR=.;FRO=62;FSAF=31;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=39;FWDB=0.00543512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.979;QD=6.97312;RBI=0.0179614;REFB=-0.0344235;REVB=-0.0171193;RO=60;SAF=28;SAR=20;SRF=23;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196989;STB=0.628688;TYPE=snp;VARB=0.0308615;OID=.;OPOS=23899027;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:113:60:62:48:51:20:28:23:37:20:31:23:39 chr14 23944505 . G A 1781.08 PASS AO=188;DP=191;FAO=188;FDP=188;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=130;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186196;FXX=0.015706;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.8863;QD=37.8953;RBI=0.0721548;REFB=-0.0554237;REVB=0.069711;RO=1;SAF=58;SAR=130;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00364901;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000231705;OID=.;OPOS=23944505;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:191:188:1:0:188:188:130:58:0:1:130:58:0:0 chr14 23944514 . C A 1793.47 PASS AO=184;DP=185;FAO=187;FDP=187;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=132;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0150223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.487;QD=38.3631;RBI=0.0185845;REFB=0;REVB=-0.0109415;RO=1;SAF=55;SAR=129;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00367688;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.32115e-05;OID=.;OPOS=23944514;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:185:187:1:0:184:187:129:55:0:1:132:55:0:0 chr14 23947374 . G A 2129.44 PASS AO=220;DP=234;FAO=224;FDP=224;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=130;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127694;FXX=0.0427332;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.866;QD=38.0258;RBI=0.0366239;REFB=0;REVB=0.0343257;RO=0;SAF=94;SAR=126;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.14391e-06;OID=.;OPOS=23947374;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:234:224:0:0:220:224:126:94:0:0:130:94:0:0 chr14 24003500 . TG T 177.58 PASS AO=22;DP=30;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.206811;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=18.9144;QD=24.4934;RBI=0.343665;REFB=-0.0470444;REVB=0.274472;RO=9;SAF=18;SAR=4;SRF=6;SRR=3;SSEN=0.453125;SSEP=0;SSSB=0.122083;STB=0.511103;TYPE=del;VARB=0.0326213;OID=.;OPOS=24003501;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:22:31:28:29:1:22:6:1:0:11:9:18:4:6:3 chr14 24033027 . G A 156.17 PASS AO=42;DP=89;FAO=40;FDP=90;FR=.;FRO=50;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=0.0255105;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.6907;QD=6.94087;RBI=0.0257844;REFB=-0.0185135;REVB=-0.00374805;RO=47;SAF=20;SAR=22;SRF=22;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00769458;STB=0.502783;TYPE=snp;VARB=0.0257571;OID=.;OPOS=24033027;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:90:47:50:42:40:22:20:22:25:21:19:24:26 chr14 24533539 . C A 220.02 PASS AO=68;DP=164;FAO=68;FDP=173;FR=.;FRO=105;FSAF=30;FSAR=38;FSRF=27;FSRR=78;FWDB=-0.00710339;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.345;QD=5.08705;RBI=0.0233604;REFB=-0.0214759;REVB=-0.0222542;RO=95;SAF=30;SAR=38;SRF=26;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182068;STB=0.616334;TYPE=snp;VARB=0.0280576;OID=.;OPOS=24533539;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:173:95:105:68:68:38:30:26:69:38:30:27:78 chr14 24545375 . C T 316.55 PASS AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109442;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.5615;QD=37.2409;RBI=0.0182209;REFB=0;REVB=0.014568;RO=0;SAF=13;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000321889;OID=.;OPOS=24545375;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:34:0:0:34:34:21:13:0:0:21:13:0:0 chr14 24567498 . A C 988.61 PASS AO=101;DP=103;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0283849;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.962;QD=38.0236;RBI=0.0417251;REFB=0;REVB=-0.0305824;RO=0;SAF=52;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.10807e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.37044e-05;OID=.;OPOS=24567498;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:103:104:0:0:101:104:49:52:0:0:50:54:0:0 chr14 24600626 . G C 10.38 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.533;QD=5.93124;RBI=0.00964629;REFB=-0.0141728;REVB=0.00964629;RO=5;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0264668;OID=.;OPOS=24600626;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:5:5:2:2:2:0:0:5:2:0:0:5 chr14 24605456 . G GC 71.73 PASS AO=20;DP=48;FAO=24;FDP=42;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=20;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=-0.0357599;FXX=0.0454442;HRUN=6;LEN=1;MLLD=12.5225;QD=6.83103;RBI=0.0458079;REFB=-0.0578115;REVB=-0.0286285;RO=25;SAF=2;SAR=18;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.373926;STB=0.576853;TYPE=ins;VARB=0.0376577;OID=.;OPOS=24605457;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:20:48:24:42:18:4:20:5:13:30:25:2:18:8:17 chr14 24606928 . G A 73.07 PASS AO=29;DP=98;FAO=30;FDP=99;FR=.;FRO=69;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=29;FSRR=40;FWDB=0.0150787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.266;QD=2.95227;RBI=0.0153294;REFB=-0.013195;REVB=-0.00276098;RO=61;SAF=8;SAR=21;SRF=25;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175055;STB=0.592363;TYPE=snp;VARB=0.0209413;OID=.;OPOS=24606928;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:98:99:61:69:29:30:21:8:25:36:21:9:29:40 chr14 24607340 . C G 527.57 PASS AO=146;DP=334;FAO=146;FDP=333;FR=.;FRO=187;FSAF=83;FSAR=63;FSRF=94;FSRR=93;FWDB=0.0201348;FXX=0.00299392;HRUN=4;LEN=1;MLLD=176.746;QD=6.33722;RBI=0.0203546;REFB=-0.0136221;REVB=-0.00298353;RO=186;SAF=83;SAR=63;SRF=93;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0697466;STB=0.537279;TYPE=snp;VARB=0.0127759;OID=.;OPOS=24607340;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:334:333:186:187:146:146:63:83:93:93:63:83:94:93 chr14 24614361 . T G 1935.63 PASS AO=199;DP=199;FAO=203;FDP=203;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0513074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.667;QD=38.1405;RBI=0.0561895;REFB=0;REVB=0.0229086;RO=0;SAF=90;SAR=109;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.31456e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000125854;OID=.;OPOS=24614361;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:92:199:203:0:0:199:203:109:90:0:0:113:90:0:0 chr14 24615435 . T C 519.72 PASS AO=124;DP=258;FAO=127;FDP=263;FR=.;FRO=136;FSAF=85;FSAR=42;FSRF=86;FSRR=50;FWDB=-0.0234603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7829;QD=7.90454;RBI=0.0234939;REFB=-0.0428769;REVB=-0.00125581;RO=133;SAF=83;SAR=41;SRF=84;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.039482;STB=0.52126;TYPE=snp;VARB=0.0465762;OID=.;OPOS=24615435;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:258:263:133:136:124:127:41:83:84:49:42:85:86:50 chr14 24642348 . C T 157.29 PASS AO=39;DP=84;FAO=39;FDP=84;FR=.;FRO=45;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=28;FSRR=17;FWDB=-0.003408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.388;QD=7.48992;RBI=0.0235704;REFB=0.00207982;REVB=0.0233227;RO=43;SAF=15;SAR=24;SRF=26;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206726;STB=0.626529;TYPE=snp;VARB=-0.00576983;OID=.;OPOS=24642348;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:43:45:39:39:24:15:26:17:24:15:28:17 chr14 24646406 . G GGAA 505.08 PASS AO=65;DP=81;FAO=65;FDP=76;FR=.;FRO=11;FSAF=50;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=10;FWDB=-0.00169684;FXX=0.0256377;HRUN=2;LEN=3;MLLD=215.724;QD=26.5831;RBI=0.00811425;REFB=-0.035042;REVB=-0.00793484;RO=15;SAF=50;SAR=15;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240885;STB=0.620307;TYPE=ins;VARB=0.00631667;OID=.;OPOS=24646407;OREF=-;OALT=GAA;OMAPALT=GGAA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:65:81:65:76:11:50:15:1:10:9:15:50:15:3:12 chr14 24679877 . C T 353.31 PASS AO=50;DP=65;FAO=50;FDP=63;FR=.;FRO=13;FSAF=11;FSAR=39;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.0472995;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.752;QD=22.4324;RBI=0.0519539;REFB=-0.0210343;REVB=0.0214933;RO=0;SAF=11;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.98453e-08;STB=0.546869;TYPE=snp;VARB=0.00602089;OID=.;OPOS=24679877;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:52:63:0:13:50:50:39:11:0:0:39:11:5:8 chr14 24718516 . G A 66.45 PASS AO=25;DP=79;FAO=25;FDP=79;FR=.;FRO=54;FSAF=20;FSAR=5;FSRF=24;FSRR=30;FWDB=-0.00966834;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=110.553;QD=3.36456;RBI=0.0523146;REFB=-0.0563524;REVB=0.0514134;RO=54;SAF=20;SAR=5;SRF=24;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.439763;STB=0.760648;TYPE=snp;VARB=0.0152997;OID=.;OPOS=24718516;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:79:79:54:54:25:25:5:20:24:30:5:20:24:30 chr14 24736027 . G A 60.52 PASS AO=23;DP=74;FAO=23;FDP=74;FR=.;FRO=51;FSAF=3;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=41;FWDB=0.0444639;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.4043;QD=3.27136;RBI=0.0790391;REFB=-0.0135161;REVB=0.0653463;RO=49;SAF=3;SAR=20;SRF=10;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158427;STB=0.586823;TYPE=snp;VARB=0.0321921;OID=.;OPOS=24736027;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:74:74:49:51:23:23:20:3:10:39:20:3:10:41 chr14 24736961 . T C 143.73 PASS AO=36;DP=81;FAO=36;FDP=80;FR=.;FRO=44;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=-0.00188935;FXX=0.0123442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.624;QD=7.18629;RBI=0.0343443;REFB=-0.00485044;REVB=-0.0342923;RO=43;SAF=21;SAR=15;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0930347;STB=0.558791;TYPE=snp;VARB=0.00466483;OID=.;OPOS=24736961;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:80:43:44:36:36:15:21:21:22:15:21:21:23 chr14 24760764 . G A 377.14 PASS AO=81;DP=152;FAO=81;FDP=151;FR=.;FRO=70;FSAF=57;FSAR=24;FSRF=52;FSRR=18;FWDB=-0.020543;FXX=0.013071;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.317;QD=9.99043;RBI=0.0284142;REFB=-0.0287818;REVB=-0.0196304;RO=67;SAF=57;SAR=24;SRF=49;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0278198;STB=0.52215;TYPE=snp;VARB=0.0150535;OID=.;OPOS=24760764;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:151:67:70:81:81:24:57:49:18:24:57:52:18 chr14 24771256 . T C 2547.95 PASS AO=264;DP=266;FAO=270;FDP=270;FR=.;FRO=0;FSAF=133;FSAR=137;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0397038;FXX=0.00735267;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.857;QD=37.7474;RBI=0.0657854;REFB=-0.0710319;REVB=0.0524531;RO=1;SAF=132;SAR=132;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00359824;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000214802;OID=.;OPOS=24771256;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:266:270:1:0:264:270:132:132:0:1:137:133:0:0 chr14 24786060 . G A 284.27 PASS AO=65;DP=130;FAO=65;FDP=130;FR=.;FRO=65;FSAF=34;FSAR=31;FSRF=28;FSRR=37;FWDB=6.68613e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.81;QD=8.74677;RBI=0.0108063;REFB=-0.0228295;REVB=0.0108061;RO=62;SAF=34;SAR=31;SRF=25;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105986;STB=0.546042;TYPE=snp;VARB=0.0222511;OID=.;OPOS=24786060;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:62:65:65:65:31:34:25:37:31:34:28:37 chr14 24786293 . T G 528.63 PASS AO=71;DP=103;FAO=75;FDP=95;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=70;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.0126152;FXX=0.0104156;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.688;QD=22.2581;RBI=0.0129834;REFB=-0.0163315;REVB=-0.00307037;RO=0;SAF=3;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17784e-08;STB=0.70751;TYPE=snp;VARB=0.0073206;OID=.;OPOS=24786293;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:73:95:0:20:71:75:68:3:0:0:70:5:9:11 chr14 24786976 . T C 1134.34 PASS AO=114;DP=115;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00383924;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.035;QD=37.4987;RBI=0.0486477;REFB=-0.0267189;REVB=0.048496;RO=1;SAF=41;SAR=73;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.01144;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000231317;OID=.;OPOS=24786976;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:115:121:1:0:114:121:73:41:1:0:79:42:0:0 chr14 24793600 . G A 447.18 PASS AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.106949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.087;QD=38.0577;RBI=0.10696;REFB=0;REVB=0.00152534;RO=0;SAF=18;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000211853;OID=.;OPOS=24793600;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:47:47:0:0:47:47:29:18:0:0:29:18:0:0 chr14 24805463 . G T 236.1 PASS AO=44;DP=73;FAO=46;FDP=79;FR=.;FRO=33;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=0.0911968;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=32.2942;QD=11.9544;RBI=0.0922942;REFB=-0.0910343;REVB=0.0141906;RO=29;SAF=23;SAR=21;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0463343;STB=0.511893;TYPE=snp;VARB=0.0577126;OID=.;OPOS=24805463;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:79:29:33:44:46:21:23:17:12:21:25:17:16 chr14 24808168 . G A 75.49 PASS AO=20;DP=48;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.0199284;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.5076;QD=6.16226;RBI=0.0502657;REFB=-0.00344529;REVB=-0.0461465;RO=28;SAF=16;SAR=4;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.353678;STB=0.716743;TYPE=snp;VARB=0.00242141;OID=.;OPOS=24808168;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:48:49:28:29:20:20:4:16:14:14:4:16:14:15 chr14 24821299 . C T 465.72 PASS AO=85;DP=136;FAO=85;FDP=136;FR=.;FRO=51;FSAF=39;FSAR=46;FSRF=31;FSRR=20;FWDB=0.018023;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4215;QD=13.6975;RBI=0.026364;REFB=0.0076719;REVB=-0.0192415;RO=50;SAF=39;SAR=46;SRF=31;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110065;STB=0.555734;TYPE=snp;VARB=-0.00471447;OID=.;OPOS=24821299;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:50:51:85:85:46:39:31:19:46:39:31:20 chr14 24843620 . T C 92.23 PASS AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.000709618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.471;QD=8.38472;RBI=0.0322504;REFB=-0.0135073;REVB=-0.0322426;RO=23;SAF=9;SAR=12;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165294;STB=0.59346;TYPE=snp;VARB=0.01827;OID=.;OPOS=24843620;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:44:44:23:23:21:21:12:9:14:9:12:9:14:9 chr14 24845841 . T C 21.87 PASS AO=6;DP=18;FAO=5;FDP=16;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=11;FWDB=-0.0414697;FXX=0.111049;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.551;QD=5.46661;RBI=0.041543;REFB=-0.0104642;REVB=-0.00246691;RO=12;SAF=2;SAR=4;SRF=1;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.36112;STB=0.822857;TYPE=snp;VARB=0.0224986;OID=.;OPOS=24845841;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:18:16:12:11:6:5:4:2:1:11:3:2:0:11 chr14 24846757 . A G 115.11 PASS AO=33;DP=78;FAO=32;FDP=78;FR=.;FRO=46;FSAF=24;FSAR=8;FSRF=36;FSRR=10;FWDB=-0.00479911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.216;QD=5.90325;RBI=0.00962793;REFB=-0.00848108;REVB=-0.00834659;RO=45;SAF=25;SAR=8;SRF=35;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0285565;STB=0.5263;TYPE=snp;VARB=0.00645023;OID=.;OPOS=24846757;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:45:46:33:32:8:25:35:10:8:24:36:10 chr14 24868619 . AGGGGC AGGC,AGC,AGG 217.47 PASS AO=8,5,8;DP=30;FAO=0,1,26;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=0,1,6;FSAR=0,0,20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.141966,0.0978554,0.00818134;FXX=0;HRUN=4,4,4;LEN=2,3,3;MLLD=22.5225,9.74729,29.6473;QD=32.2174;RBI=0.221168,0.150558,0.0213206;REFB=0,0,0;REVB=-0.16959,-0.114421,0.0196885;RO=1;SAF=0,0,4;SAR=8,5,4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0.509542,0.509542,0.509542;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.803989,-0.767767,-0.0978599;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=del,del,del;VARB=0,-0.0710202,0.00707685;OID=.,.,.;OPOS=24868620,24868620,24868622;OREF=GG,GGG,GGC;OALT=-,-,-;OMAPALT=AGGC,AGC,AGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 3/3:8,5,8:26:0,1,26:27:0:0,1,6:0,0,20:0:0:11:1:0,0,4:8,5,4:1:0 chr14 24883887 . G A 1034.2 PASS AO=109;DP=116;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159073;FXX=0.0603396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.7755;QD=37.9523;RBI=0.03388;REFB=0;REVB=0.0299134;RO=0;SAF=64;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.64032e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.5163e-05;OID=.;OPOS=24883887;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:116:109:0:0:109:109:45:64:0:0:45:64:0:0 chr14 24896830 . G T 149.07 PASS AO=35;DP=73;FAO=35;FDP=73;FR=.;FRO=38;FSAF=29;FSAR=6;FSRF=28;FSRR=10;FWDB=0.00321068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.498;QD=8.16822;RBI=0.0626561;REFB=-0.00665363;REVB=-0.0625738;RO=37;SAF=29;SAR=6;SRF=28;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106423;STB=0.575635;TYPE=snp;VARB=0.00665772;OID=.;OPOS=24896830;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:37:38:35:35:6:29:28:9:6:29:28:10 chr14 24898558 . C T 144.34 PASS AO=35;DP=77;FAO=35;FDP=75;FR=.;FRO=40;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=-0.00448931;FXX=0.0259707;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.724;QD=7.69811;RBI=0.00479928;REFB=-0.00397511;REVB=-0.00169683;RO=40;SAF=20;SAR=15;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0279067;STB=0.515616;TYPE=snp;VARB=0.00551746;OID=.;OPOS=24898558;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:75:40:40:35:35:15:20:24:16:15:20:24:16 chr14 24901249 . A C 35.57 PASS AO=9;DP=24;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=0;FSRF=15;FSRR=0;FWDB=-0.000730689;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=228.191;QD=5.9275;RBI=0.000730689;REFB=-0.00278444;REVB=0;RO=15;SAF=9;SAR=0;SRF=15;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00359369;OID=.;OPOS=24901249;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:24:24:15:15:9:9:0:9:15:0:0:9:15:0 chr14 24901276 . G T 64.88 PASS AO=10;DP=16;FAO=11;FDP=17;FR=.;FRO=6;FSAF=11;FSAR=0;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.04201;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=25.872;QD=15.2666;RBI=0.04201;REFB=-0.161185;REVB=0;RO=6;SAF=10;SAR=0;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0768797;OID=.;OPOS=24901276;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:16:17:6:6:10:11:0:10:6:0:0:11:6:0 chr14 24909362 . T C 967.85 PASS AO=102;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0185645;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.106;QD=37.955;RBI=0.0203812;REFB=0;REVB=0.00841129;RO=0;SAF=34;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.15096e-05;OID=.;OPOS=24909362;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:102:102:0:0:102:102:68:34:0:0:69:33:0:0 chr14 24909475 . C G 280.17 PASS AO=34;DP=38;FAO=34;FDP=38;FR=.;FRO=4;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0361699;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.08;QD=29.4913;RBI=0.0376947;REFB=-0.0352385;REVB=0.0106124;RO=4;SAF=18;SAR=16;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00578303;STB=0.503104;TYPE=snp;VARB=0.0011838;OID=.;OPOS=24909475;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:38:38:4:4:34:34:16:18:2:2:16:18:2:2 chr14 24909731 . C T 422.88 PASS AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0272035;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.3946;QD=35.9898;RBI=0.0282735;REFB=-0.0456203;REVB=-0.00770441;RO=0;SAF=10;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.54368e-08;STB=0.506846;TYPE=snp;VARB=0.000406618;OID=.;OPOS=24909731;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:47:47:0:1:46:46:36:10:0:0:36:10:0:1 chr14 24910210 . C A 2475.95 PASS AO=271;DP=285;FAO=277;FDP=282;FR=.;FRO=5;FSAF=99;FSAR=178;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.00266432;FXX=0.0105259;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.331;QD=35.1199;RBI=0.00266432;REFB=-0.0603819;REVB=-6.79403e-06;RO=5;SAF=99;SAR=172;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00616585;STB=0.500822;TYPE=snp;VARB=0.000645708;OID=.;OPOS=24910210;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:285:282:5:5:271:277:172:99:1:4:178:99:2:3 chr14 24910973 . T G 927.99 PASS AO=97;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0565101;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.1347;QD=38.2674;RBI=0.120709;REFB=0;REVB=0.106665;RO=0;SAF=48;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00117712;OID=.;OPOS=24910973;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:97:97:0:0:97:97:49:48:0:0:49:48:0:0 chr14 24910974 . T A 919.09 PASS AO=97;DP=97;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0290833;FXX=0.0103082;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.842;QD=38.2952;RBI=0.0539402;REFB=0;REVB=0.0454281;RO=0;SAF=48;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000352463;OID=.;OPOS=24910974;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:97:96:0:0:97:96:49:48:0:0:49:47:0:0 chr14 24912008 . T C 316.55 PASS AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00372702;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=268.157;QD=37.2412;RBI=0.0136652;REFB=0;REVB=0.0131472;RO=0;SAF=2;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.47699e-05;OID=.;OPOS=24912008;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:34:0:0:34:34:32:2:0:0:32:2:0:0 chr14 24970942 . A G 631.23 PASS AO=70;DP=72;FAO=70;FDP=72;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=49;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0279744;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.9858;QD=35.0685;RBI=0.0305935;REFB=0.0861943;REVB=-0.0123854;RO=1;SAF=21;SAR=49;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0219783;STB=0.506577;TYPE=snp;VARB=-0.00359677;OID=.;OPOS=24970942;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:72:72:1:2:70:70:49:21:1:0:49:21:1:1 chr14 24975435 . G T 327.65 PASS AO=34;DP=34;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143196;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=228.428;QD=37.4458;RBI=0.0144906;REFB=0;REVB=0.00222012;RO=0;SAF=4;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.46046e-05;OID=.;OPOS=24975435;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:34:35:0:0:34:35:30:4:0:0:31:4:0:0 chr14 25043671 . T C 86.41 PASS AO=20;DP=43;FAO=20;FDP=43;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.0102998;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.434;QD=8.03769;RBI=0.0129028;REFB=-0.0262122;REVB=0.00777157;RO=23;SAF=5;SAR=15;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113971;STB=0.565149;TYPE=snp;VARB=0.0177784;OID=.;OPOS=25043671;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:43:43:23:23:20:20:15:5:8:15:15:5:8:15 chr14 25076836 . G A 31.47 PASS AO=54;DP=327;FAO=54;FDP=327;FR=.;FRO=273;FSAF=48;FSAR=6;FSRF=216;FSRR=57;FWDB=0.00616765;FXX=0.00304869;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.5613;QD=0.384901;RBI=0.0520208;REFB=-0.00956143;REVB=-0.0516539;RO=268;SAF=48;SAR=6;SRF=211;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.239232;STB=0.656181;TYPE=snp;VARB=0.0650285;OID=.;OPOS=25076836;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:327:327:268:273:54:54:6:48:211:57:6:48:216:57 chr14 25076906 . C T 463.38 PASS AO=146;DP=401;FAO=146;FDP=368;FR=.;FRO=222;FSAF=70;FSAR=76;FSRF=131;FSRR=91;FWDB=-0.0185869;FXX=0.079998;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.163;QD=5.03678;RBI=0.0234149;REFB=-0.00579968;REVB=-0.0142403;RO=221;SAF=70;SAR=76;SRF=132;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126391;STB=0.566482;TYPE=snp;VARB=0.00743605;OID=.;OPOS=25076906;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:401:368:221:222:146:146:76:70:132:89:76:70:131:91 chr14 25100282 . A G 205.96 PASS AO=34;DP=51;FAO=34;FDP=51;FR=.;FRO=17;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=-0.00295712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.798;QD=16.1533;RBI=0.0117494;REFB=-0.00978171;REVB=-0.0113712;RO=17;SAF=22;SAR=12;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252806;STB=0.637969;TYPE=snp;VARB=0.00118856;OID=.;OPOS=25100282;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:51:51:17:17:34:34:12:22:4:13:12:22:4:13 chr14 25101548 . G A 15.29 PASS AO=25;DP=162;FAO=25;FDP=162;FR=.;FRO=137;FSAF=22;FSAR=3;FSRF=119;FSRR=18;FWDB=-0.00979213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7728;QD=0.377542;RBI=0.0549989;REFB=-0.00866999;REVB=-0.0541202;RO=135;SAF=22;SAR=3;SRF=117;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0383245;STB=0.522016;TYPE=snp;VARB=0.0475454;OID=.;OPOS=25101548;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:162:162:135:137:25:25:3:22:117:18:3:22:119:18 chr14 25101589 . G C 19.58 PASS AO=35;DP=226;FAO=35;FDP=225;FR=.;FRO=190;FSAF=32;FSAR=3;FSRF=130;FSRR=60;FWDB=0.00127617;FXX=0.00881018;HRUN=3;LEN=1;MLLD=255.6;QD=0.348171;RBI=0.0281532;REFB=-0.00341326;REVB=-0.0281243;RO=186;SAF=32;SAR=3;SRF=127;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.439319;STB=0.805534;TYPE=snp;VARB=0.0142609;OID=.;OPOS=25101589;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:226:225:186:190:35:35:3:32:127:59:3:32:130:60 chr14 25101629 . T C 38.2 PASS AO=39;DP=208;FAO=40;FDP=212;FR=.;FRO=172;FSAF=32;FSAR=8;FSRF=89;FSRR=83;FWDB=-0.00282282;FXX=0.00469462;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.3122;QD=0.720708;RBI=0.0227889;REFB=0.00473238;REVB=-0.0226133;RO=168;SAF=31;SAR=8;SRF=85;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.395017;STB=0.750381;TYPE=snp;VARB=-0.0207819;OID=.;OPOS=25101629;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:208:212:168:172:39:40:8:31:85:83:8:32:89:83 chr14 25101878 . C CT 259.4 PASS AO=113;DP=276;FAO=115;FDP=264;FR=.;FRO=149;FSAF=64;FSAR=51;FSRF=74;FSRR=75;FWDB=0.0389274;FXX=0.0149248;HRUN=1;LEN=1;MLLD=30.5348;QD=3.93031;RBI=0.0666766;REFB=0.0187968;REVB=0.0541335;RO=158;SAF=63;SAR=50;SRF=81;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0471889;STB=0.533963;TYPE=ins;VARB=-0.023588;OID=.;OPOS=25101879;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:113:276:115:264:149:64:51:74:75:99:158:63:50:81:77 chr14 25102160 . C T 243.69 PASS AO=60;DP=133;FAO=62;FDP=135;FR=.;FRO=73;FSAF=36;FSAR=26;FSRF=29;FSRR=44;FWDB=0.0106925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.9284;QD=7.22033;RBI=0.0148078;REFB=-0.00970248;REVB=0.0102441;RO=73;SAF=36;SAR=24;SRF=29;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198924;STB=0.598543;TYPE=snp;VARB=0.00960684;OID=.;OPOS=25102160;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:135:73:73:60:62:24:36:29:44:26:36:29:44 chr14 25103414 . G A 364.31 PASS AO=70;DP=121;FAO=70;FDP=119;FR=.;FRO=49;FSAF=29;FSAR=41;FSRF=16;FSRR=33;FWDB=0.0355653;FXX=0.0165276;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.72;QD=12.2457;RBI=0.0388226;REFB=-0.012706;REVB=0.0155662;RO=49;SAF=29;SAR=41;SRF=16;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0693663;STB=0.537699;TYPE=snp;VARB=0.0110103;OID=.;OPOS=25103414;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:119:49:49:70:70:41:29:16:33:41:29:16:33 chr14 27065164 . G T 117.98 PASS AO=22;DP=38;FAO=22;FDP=38;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.000560478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.55;QD=12.4188;RBI=0.0322;REFB=-0.00494905;REVB=-0.0321951;RO=16;SAF=10;SAR=12;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128295;STB=0.571364;TYPE=snp;VARB=0.000148955;OID=.;OPOS=27065164;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:38:38:16:16:22:22:12:10:10:6:12:10:10:6 chr14 27065165 . A T 117.89 PASS AO=22;DP=38;FAO=22;FDP=38;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.0235011;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.6341;QD=12.4092;RBI=0.0273485;REFB=0.00686359;REVB=0.0139872;RO=16;SAF=10;SAR=12;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128295;STB=0.571364;TYPE=snp;VARB=-0.0755653;OID=.;OPOS=27065165;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:38:38:16:16:22:22:12:10:10:6:12:10:10:6 chr14 28733843 . A C 140.13 PASS AO=34;DP=74;FAO=34;FDP=73;FR=.;FRO=39;FSAF=24;FSAR=10;FSRF=28;FSRR=11;FWDB=-0.00255534;FXX=0.0135117;HRUN=3;LEN=1;MLLD=246.024;QD=7.67854;RBI=0.0304267;REFB=0.00345636;REVB=-0.0303192;RO=34;SAF=24;SAR=10;SRF=24;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507808;TYPE=snp;VARB=-0.0112738;OID=.;OPOS=28733843;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:73:34:39:34:34:10:24:24:10:10:24:28:11 chr14 28733847 . G A 152.54 PASS AO=38;DP=81;FAO=37;FDP=80;FR=.;FRO=43;FSAF=29;FSAR=8;FSRF=29;FSRR=14;FWDB=0.0136539;FXX=0.0123442;HRUN=5;LEN=1;MLLD=265.437;QD=7.62721;RBI=0.0148046;REFB=-0.00669336;REVB=-0.00572248;RO=42;SAF=29;SAR=9;SRF=29;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0891089;STB=0.578902;TYPE=snp;VARB=0.00715246;OID=.;OPOS=28733847;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:80:42:43:38:37:9:29:29:13:8:29:29:14 chr14 28733956 . G A 418.42 PASS AO=104;DP=237;FAO=111;FDP=245;FR=.;FRO=134;FSAF=70;FSAR=41;FSRF=88;FSRR=46;FWDB=0.00924457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.555;QD=6.83139;RBI=0.0109775;REFB=-0.0374431;REVB=0.00591973;RO=112;SAF=65;SAR=39;SRF=84;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130591;STB=0.515433;TYPE=snp;VARB=0.039453;OID=.;OPOS=28733956;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:237:245:112:134:104:111:39:65:84:28:41:70:88:46 chr14 29238428 . CCTTTT C 733.4 PASS AO=82;DP=105;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00319175;FXX=0.089991;HRUN=2;LEN=5;MLLD=258.785;QD=32.2372;RBI=0.0170063;REFB=0;REVB=0.0167041;RO=0;SAF=36;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.14462e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.000136212;OID=.;OPOS=29238429;OREF=CTTTT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:82:93:91:91:0:42:49:0:0:64:0:36:46:0:0 chr14 29261304 . TAAAAA TAAAA,TAAAAAAAC 143.64 PASS AO=16,17;DP=91;FAO=15,29;FDP=80;FR=.;FRO=36;FSAF=9,18;FSAR=6,11;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=0.0194455,-0.0322045;FXX=0.0697593;HRUN=8,8;LEN=1,3;MLLD=6.76159,139.401;QD=7.18192;RBI=0.0627803,0.0415609;REFB=-0.0534153,-0.00377728;REVB=0.0596929,0.0262712;RO=24;SAF=10,14;SAR=6,3;SRF=14;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0451865,0.312956;STB=0.512179,0.521724;TYPE=del,ins;VARB=0.102562,0.000656923;OID=.,.;OPOS=29261305,29261310;OREF=A,-;OALT=-,AAC;OMAPALT=TAAAA,TAAAAAAAC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:16,17:83:15,29:80:36:9,18:6,11:21:15:99:24:10,14:6,3:14:10 chr14 30045978 . C T 2010.06 PASS AO=206;DP=208;FAO=212;FDP=212;FR=.;FRO=0;FSAF=113;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00827115;FXX=0.031962;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.133;QD=37.9256;RBI=0.0304607;REFB=-0.0387262;REVB=0.0293162;RO=2;SAF=116;SAR=90;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00814142;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000190354;OID=.;OPOS=30045978;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:208:212:2:0:206:212:90:116:2:0:99:113:0:0 chr14 31099738 . A G 296.13 PASS AO=80;DP=179;FAO=79;FDP=178;FR=.;FRO=99;FSAF=34;FSAR=45;FSRF=39;FSRR=60;FWDB=0.00304129;FXX=0.00558628;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.6778;QD=6.65458;RBI=0.0511414;REFB=0.00433541;REVB=-0.0510508;RO=98;SAF=35;SAR=45;SRF=38;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0504706;STB=0.520783;TYPE=snp;VARB=-0.00785636;OID=.;OPOS=31099738;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:178:98:99:80:79:45:35:38:60:45:34:39:60 chr14 31355096 . C G 2113.18 PASS AO=217;DP=217;FAO=221;FDP=221;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0440829;FXX=0.00896821;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.98;QD=38.2476;RBI=0.0454384;REFB=0;REVB=-0.0110159;RO=0;SAF=97;SAR=120;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.40954e-06;OID=.;OPOS=31355096;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:217:221:0:0:217:221:120:97:0:0:120:101:0:0 chr14 31359847 . T A 1142.79 PASS AO=120;DP=120;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186666;FXX=0.0163921;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.537;QD=38.0929;RBI=0.0349976;REFB=0;REVB=0.0296039;RO=0;SAF=53;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000766403;OID=.;OPOS=31359847;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:120:120:0:0:120:120:67:53:0:0:67:53:0:0 chr14 31381351 . T C 1868.41 PASS AO=202;DP=206;FAO=202;FDP=202;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=121;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0190912;FXX=0.0194165;HRUN=2;LEN=1;MLLD=255.747;QD=36.9982;RBI=0.0216257;REFB=-0.0346007;REVB=0.0101587;RO=3;SAF=81;SAR=121;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00196335;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.26879e-06;OID=.;OPOS=31381351;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:206:202:3:0:202:202:121:81:1:2:121:81:0:0 chr14 31582380 . A G 1561.01 PASS AO=181;DP=197;FAO=183;FDP=197;FR=.;FRO=14;FSAF=160;FSAR=23;FSRF=13;FSRR=1;FWDB=0.068308;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.7543;QD=31.6956;RBI=0.0782987;REFB=-0.0393453;REVB=0.0382716;RO=14;SAF=158;SAR=23;SRF=13;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0173377;STB=0.508888;TYPE=snp;VARB=0.0119177;OID=.;OPOS=31582380;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:197:197:14:14:181:183:23:158:13:1:23:160:13:1 chr14 31795361 . A G 310.29 PASS AO=62;DP=110;FAO=62;FDP=110;FR=.;FRO=48;FSAF=24;FSAR=38;FSRF=30;FSRR=18;FWDB=0.00717827;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.3235;QD=11.2834;RBI=0.0639566;REFB=-0.0269998;REVB=0.0635524;RO=47;SAF=24;SAR=38;SRF=30;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198573;STB=0.604207;TYPE=snp;VARB=0.0204706;OID=.;OPOS=31795361;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:47:48:62:62:38:24:30:17:38:24:30:18 chr14 31819046 . AC A,AT 1820.89 PASS AO=45,154;DP=204;FAO=43,160;FDP=203;FR=.;FRO=0;FSAF=36,88;FSAR=7,72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0304486,0.0291386;FXX=0.00975562;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=69.4934,82.0579;QD=35.8796;RBI=0.0309334,0.0305412;REFB=0,0;REVB=-0.00545553,0.00914909;RO=0;SAF=35,85;SAR=10,69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.64128e-08,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0216224,-0.00609395;OID=.,.;OPOS=31819047,31819047;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=A,AT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:45,154:201:43,160:203:0:36,88:7,72:0:0:43:0:35,85:10,69:0:0 chr14 31819913 . A G 783.77 PASS AO=82;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0544363;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.7786;QD=37.7722;RBI=0.0629121;REFB=0;REVB=0.0315376;RO=1;SAF=40;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116923;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000406212;OID=.;OPOS=31819913;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:83:83:1:0:82:83:42:40:1:0:42:41:0:0 chr14 31858187 . C T 146.63 PASS AO=48;DP=132;FAO=49;FDP=133;FR=.;FRO=84;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=40;FSRR=44;FWDB=-0.0167191;FXX=0.00746213;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.949;QD=4.40987;RBI=0.0167491;REFB=0.00927339;REVB=0.00100118;RO=84;SAF=19;SAR=29;SRF=40;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0914545;STB=0.543732;TYPE=snp;VARB=-0.0151931;OID=.;OPOS=31858187;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:133:84:84:48:49:29:19:40:44:29:20:40:44 chr14 31858209 . C T 117.88 PASS AO=41;DP=117;FAO=41;FDP=117;FR=.;FRO=76;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=35;FSRR=41;FWDB=-0.0014296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.6265;QD=4.02992;RBI=0.00822392;REFB=-0.0244474;REVB=-0.00809871;RO=75;SAF=16;SAR=25;SRF=34;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0731441;STB=0.546952;TYPE=snp;VARB=0.0412251;OID=.;OPOS=31858209;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:75:76:41:41:25:16:34:41:25:16:35:41 chr14 31864485 . G C 2643.33 PASS AO=276;DP=279;FAO=278;FDP=278;FR=.;FRO=0;FSAF=114;FSAR=164;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0156585;FXX=0.0071426;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.564;QD=38.0335;RBI=0.0181933;REFB=-0.00875587;REVB=0.00926334;RO=1;SAF=113;SAR=163;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00420095;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.12719e-05;OID=.;OPOS=31864485;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:279:278:1:0:276:278:163:113:1:0:164:114:0:0 chr14 32071665 . G A 2248.2 PASS AO=236;DP=237;FAO=236;FDP=236;FR=.;FRO=0;FSAF=113;FSAR=123;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233934;FXX=0.00421923;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.157;QD=38.1051;RBI=0.0257412;REFB=0.0185907;REVB=-0.0107405;RO=1;SAF=113;SAR=123;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00419905;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.12529e-05;OID=.;OPOS=32071665;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:237:236:1:0:236:236:123:113:1:0:123:113:0:0 chr14 32328508 . G C 358.33 PASS AO=92;DP=201;FAO=92;FDP=200;FR=.;FRO=108;FSAF=40;FSAR=52;FSRF=33;FSRR=75;FWDB=0.0068314;FXX=0.0147776;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.0715;QD=7.16669;RBI=0.00713471;REFB=-0.025189;REVB=-0.00205817;RO=104;SAF=40;SAR=52;SRF=32;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126796;STB=0.572315;TYPE=snp;VARB=0.0302073;OID=.;OPOS=32328508;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:200:104:108:92:92:52:40:32:72:52:40:33:75 chr14 32414145 . C A 751.34 PASS AO=80;DP=86;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0370893;FXX=0.0581328;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.893;QD=37.1032;RBI=0.0432439;REFB=-0.0304214;REVB=0.0222356;RO=0;SAF=44;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.28538e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000105234;OID=.;OPOS=32414145;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:86:81:0:0:80:81:36:44:0:0:37:44:0:0 chr14 32419331 . C T 270.5 PASS AO=71;DP=186;FAO=80;FDP=195;FR=.;FRO=115;FSAF=32;FSAR=48;FSRF=70;FSRR=45;FWDB=0.009013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.559;QD=5.54861;RBI=0.0107975;REFB=-0.00403743;REVB=0.00594568;RO=115;SAF=25;SAR=46;SRF=70;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.279073;STB=0.621921;TYPE=snp;VARB=0.00746791;OID=.;OPOS=32419331;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:195:115:115:71:80:46:25:70:45:48:32:70:45 chr14 32960254 . G A 272.39 PASS AO=72;DP=168;FAO=74;FDP=170;FR=.;FRO=96;FSAF=16;FSAR=58;FSRF=43;FSRR=53;FWDB=-0.0299998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.9541;QD=6.40927;RBI=0.0300001;REFB=0.00772727;REVB=0.000115713;RO=96;SAF=15;SAR=57;SRF=43;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.295815;STB=0.658283;TYPE=snp;VARB=-0.0115035;OID=.;OPOS=32960254;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:170:96:96:72:74:57:15:43:53:58:16:43:53 chr14 33014869 . C T 128.45 PASS AO=27;DP=55;FAO=29;FDP=57;FR=.;FRO=28;FSAF=26;FSAR=3;FSRF=22;FSRR=6;FWDB=0.00348194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.074;QD=9.0138;RBI=0.00381334;REFB=-0.0195225;REVB=-0.00155488;RO=28;SAF=24;SAR=3;SRF=22;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193222;STB=0.618952;TYPE=snp;VARB=0.0227682;OID=.;OPOS=33014869;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:57:28:28:27:29:3:24:22:6:3:26:22:6 chr14 33015014 . G A 243.16 PASS AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0252729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.365;QD=37.4101;RBI=0.0322413;REFB=0;REVB=-0.0200195;RO=0;SAF=22;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.50493e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.7678e-05;OID=.;OPOS=33015014;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:26:26:0:0:26:26:4:22:0:0:4:22:0:0 chr14 33015082 . A G 131.71 PASS AO=32;DP=70;FAO=32;FDP=70;FR=.;FRO=38;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=0.00368694;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.682;QD=7.52625;RBI=0.0310586;REFB=-0.00440595;REVB=-0.030839;RO=38;SAF=21;SAR=11;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0801865;STB=0.545163;TYPE=snp;VARB=0.00502467;OID=.;OPOS=33015082;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:38:38:32:32:11:21:22:16:11:21:22:16 chr14 33015973 . C A 341.02 PASS AO=58;DP=90;FAO=58;FDP=89;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=42;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=0.0218579;FXX=0.0111099;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.201;QD=15.3266;RBI=0.0575763;REFB=-0.013901;REVB=-0.0532659;RO=31;SAF=16;SAR=42;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0855301;STB=0.546452;TYPE=snp;VARB=0.0119569;OID=.;OPOS=33015973;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:90:89:31:31:58:58:42:16:12:19:42:16:12:19 chr14 33046388 . A G 1087.4 PASS AO=119;DP=123;FAO=121;FDP=124;FR=.;FRO=3;FSAF=55;FSAR=66;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00404521;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=219.708;QD=35.0776;RBI=0.0275465;REFB=0.000124118;REVB=0.0272479;RO=4;SAF=54;SAR=65;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184053;STB=0.505169;TYPE=snp;VARB=2.47288e-05;OID=.;OPOS=33046388;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:123:124:4:3:119:121:65:54:3:1:66:55:2:1 chr14 33292743 . A C 106.77 PASS AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0231925;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=247.093;QD=8.54123;RBI=0.0242412;REFB=-0.0131732;REVB=-0.00705289;RO=24;SAF=9;SAR=15;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0772338;STB=0.546835;TYPE=snp;VARB=0.0129386;OID=.;OPOS=33292743;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:50:24:26:24:24:15:9:11:13:15:9:12:14 chr14 33293122 . A G 183.85 PASS AO=45;DP=96;FAO=45;FDP=96;FR=.;FRO=51;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=29;FWDB=-0.00633214;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.003;QD=7.66048;RBI=0.0101935;REFB=-0.00790329;REVB=0.00798818;RO=51;SAF=26;SAR=19;SRF=22;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139512;STB=0.577743;TYPE=snp;VARB=0.00643448;OID=.;OPOS=33293122;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:51:51:45:45:19:26:22:29:19:26:22:29 chr14 33293531 . T A 430.62 PASS AO=104;DP=220;FAO=111;FDP=241;FR=.;FRO=130;FSAF=61;FSAR=50;FSRF=51;FSRR=79;FWDB=-0.0271008;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=131.62;QD=7.14725;RBI=0.0273336;REFB=-0.00253365;REVB=0.00355972;RO=114;SAF=61;SAR=43;SRF=50;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140668;STB=0.584215;TYPE=snp;VARB=0.00489218;OID=.;OPOS=33293531;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:220:241:114:130:104:111:43:61:50:64:50:61:51:79 chr14 33294042 . G A 249.1 PASS AO=60;DP=138;FAO=64;FDP=141;FR=.;FRO=77;FSAF=30;FSAR=34;FSRF=32;FSRR=45;FWDB=-0.0140176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.433;QD=7.06678;RBI=0.0143746;REFB=0.00250347;REVB=-0.00318398;RO=77;SAF=30;SAR=30;SRF=32;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0850026;STB=0.529245;TYPE=snp;VARB=-0.0031763;OID=.;OPOS=33294042;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:141:77:77:60:64:30:30:32:45:34:30:32:45 chr14 34047414 . T C 91.32 PASS AO=16;DP=26;FAO=16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.00994331;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.1088;QD=14.049;RBI=0.00994364;REFB=0.0190343;REVB=8.14086e-05;RO=10;SAF=8;SAR=8;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0117339;OID=.;OPOS=34047414;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:26:26:10:10:16:16:8:8:5:5:8:8:5:5 chr14 34047441 . C T 111.98 PASS AO=15;DP=19;FAO=15;FDP=19;FR=.;FRO=4;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0382712;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=214.217;QD=23.5751;RBI=0.0453866;REFB=-0.045051;REVB=0.0243981;RO=4;SAF=8;SAR=7;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0833399;STB=0.546039;TYPE=snp;VARB=0.0110214;OID=.;OPOS=34047441;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:19:19:4:4:15:15:7:8:3:1:7:8:3:1 chr14 34249813 . A C 232.66 PASS AO=55;DP=113;FAO=55;FDP=113;FR=.;FRO=58;FSAF=31;FSAR=24;FSRF=27;FSRR=31;FWDB=0.00127406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.318;QD=8.23582;RBI=0.0115804;REFB=-0.0291604;REVB=-0.0115101;RO=57;SAF=31;SAR=24;SRF=27;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0830337;STB=0.550514;TYPE=snp;VARB=0.0452997;OID=.;OPOS=34249813;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:57:58:55:55:24:31:27:30:24:31:27:31 chr14 34393602 . A G 274.54 PASS AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.000177492;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.4964;QD=34.3172;RBI=0.017546;REFB=-0.151915;REVB=-0.0175451;RO=1;SAF=16;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0300873;STB=0.516119;TYPE=snp;VARB=0.0070799;OID=.;OPOS=34393602;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:32:32:1:1:31:31:15:16:0:1:15:16:0:1 chr14 34395148 . GA G 1273.74 PASS AO=121;DP=139;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112583;FXX=0.0689608;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.023;QD=37.7406;RBI=0.0287351;REFB=0;REVB=0.0264378;RO=1;SAF=17;SAR=104;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00454656;STB=0.5;TYPE=del;VARB=5.14299e-06;OID=.;OPOS=34395149;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:121:137:135:135:0:17:118:0:0:61:1:17:104:0:1 chr14 34985645 . G A 467.51 PASS AO=89;DP=213;FAO=97;FDP=203;FR=.,HEALED;FRO=94;FSAF=49;FSAR=48;FSRF=36;FSRR=58;FWDB=0.0196444;FXX=0.00975562;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.681;QD=9.2121;RBI=0.0261456;REFB=-0.0775197;REVB=0.0172537;RO=60;SAF=43;SAR=46;SRF=10;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.238555;STB=0.560048;TYPE=snp;VARB=0.0355437;OID=.;OPOS=34985645;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:203:60:94:89:97:46:43:10:50:48:49:36:58 chr14 35062312 . C T 1000.76 PASS AO=105;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156538;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.067;QD=38.1241;RBI=0.0415568;REFB=0;REVB=0.0384958;RO=0;SAF=43;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.38922e-05;OID=.;OPOS=35062312;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:105:105:0:0:105:105:62:43:0:0:62:43:0:0 chr14 35098790 . AG A 58.68 PASS AO=6;DP=32;FAO=18;FDP=28;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=15;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0499946;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.7283;QD=8.38354;RBI=0.0892365;REFB=-0.0559958;REVB=0.0739167;RO=15;SAF=2;SAR=4;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.57683;TYPE=del;VARB=0.114526;OID=.;OPOS=35098791;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:6:21:18:28:10:3:15:3:7:16:15:2:4:5:10 chr14 35099099 . A G 46.2 PASS AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=-0.0881517;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.0126;QD=10.2676;RBI=0.0931413;REFB=0.0398711;REVB=0.0300761;RO=9;SAF=5;SAR=4;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.305668;STB=0.674995;TYPE=snp;VARB=-0.0463115;OID=.;OPOS=35099099;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:18:18:9:9:9:9:4:5:8:1:4:5:8:1 chr14 35242828 . G A 340.42 PASS AO=75;DP=145;FAO=76;FDP=145;FR=.;FRO=69;FSAF=47;FSAR=29;FSRF=34;FSRR=35;FWDB=0.00564169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.335;QD=9.39087;RBI=0.0192189;REFB=-0.0261834;REVB=-0.0183722;RO=69;SAF=46;SAR=29;SRF=34;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107819;STB=0.561492;TYPE=snp;VARB=0.0232781;OID=.;OPOS=35242828;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:69:69:75:76:29:46:34:35:29:47:34:35 chr14 35591107 . CTGTT C 178.95 PASS AO=39;DP=105;FAO=43;FDP=92;FR=.;FRO=49;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=29;FSRR=20;FWDB=-0.00693674;FXX=0.0416623;HRUN=1;LEN=4;MLLD=250.054;QD=7.7804;RBI=0.00831576;REFB=-0.00651785;REVB=0.00458622;RO=48;SAF=22;SAR=17;SRF=29;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0403209;STB=0.507113;TYPE=del;VARB=0.00551993;OID=.;OPOS=35591108;OREF=TGTT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:39:98:43:92:49:26:17:29:20:99:48:22:17:29:19 chr14 35591174 . T C 149.55 PASS AO=40;DP=92;FAO=40;FDP=92;FR=.;FRO=52;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=26;FSRR=26;FWDB=-0.0953659;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.9266;QD=6.50235;RBI=0.0959868;REFB=-0.00635446;REVB=-0.0109001;RO=50;SAF=17;SAR=23;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0946164;STB=0.542789;TYPE=snp;VARB=0.00689505;OID=.;OPOS=35591174;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:50:52:40:40:23:17:26:24:23:17:26:26 chr14 35592538 . C G 168.86 PASS AO=57;DP=156;FAO=57;FDP=156;FR=.;FRO=99;FSAF=34;FSAR=23;FSRF=56;FSRR=43;FWDB=-0.000666413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.9906;QD=4.32973;RBI=0.0131792;REFB=0.0017659;REVB=0.0131623;RO=99;SAF=34;SAR=23;SRF=56;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0353931;STB=0.52016;TYPE=snp;VARB=-0.00293429;OID=.;OPOS=35592538;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:156:99:99:57:57:23:34:56:43:23:34:56:43 chr14 35761675 . C G 292.79 PASS AO=54;DP=89;FAO=54;FDP=89;FR=.;FRO=35;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=-0.0300555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.498;QD=13.1589;RBI=0.0603207;REFB=-0.0294478;REVB=0.0522997;RO=35;SAF=24;SAR=30;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0917418;STB=0.549981;TYPE=snp;VARB=0.0232259;OID=.;OPOS=35761675;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:35:35:54:54:30:24:20:15:30:24:20:15 chr14 36005659 . T C 107.9 PASS AO=34;DP=91;FAO=34;FDP=91;FR=.;FRO=57;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=31;FWDB=-0.00755609;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.8529;QD=4.74284;RBI=0.0410744;REFB=-0.0193263;REVB=0.0403734;RO=56;SAF=17;SAR=17;SRF=26;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0388547;STB=0.509086;TYPE=snp;VARB=0.0333466;OID=.;OPOS=36005659;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:56:57:34:34:17:17:26:30:18:16:26:31 chr14 36153177 . T C 471.88 PASS AO=128;DP=290;FAO=128;FDP=289;FR=.;FRO=161;FSAF=37;FSAR=91;FSRF=68;FSRR=93;FWDB=-0.00480462;FXX=0.00344816;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.645;QD=6.53126;RBI=0.0061332;REFB=-0.023377;REVB=-0.00381205;RO=161;SAF=37;SAR=91;SRF=68;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150693;STB=0.583926;TYPE=snp;VARB=0.0253359;OID=.;OPOS=36153177;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:290:289:161:161:128:128:91:37:68:93:91:37:68:93 chr14 36194269 . AT A,ATT 23.75 PASS AO=24,20;DP=117;FAO=28,0;FDP=114;FR=.;FRO=86;FSAF=7,0;FSAR=21,0;FSRF=44;FSRR=42;FWDB=0.187716,-0.199302;FXX=0.0086949;HRUN=8,8;LEN=1,1;MLLD=6.32347,8.07593;QD=0.833328;RBI=0.221325,0.247943;REFB=-0.031743,0.000543742;REVB=0.11725,-0.147494;RO=62;SAF=6,9;SAR=18,11;SRF=30;SRR=32;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.303793,-0.041936;STB=0.708178,0.5;TYPE=del,ins;VARB=0.170066,-0.0533578;OID=.,.;OPOS=36194270,36194270;OREF=T,-;OALT=-,T;OMAPALT=A,ATT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:24,20:113:28,0:114:86:7,0:21,0:44:42:24:62:6,9:18,11:30:32 chr14 36789729 . T G 705.09 PASS AO=70;DP=70;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0622197;FXX=0.0259707;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.969;QD=37.6049;RBI=0.0622478;REFB=0;REVB=-0.00187171;RO=0;SAF=25;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00065338;OID=.;OPOS=36789729;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:70:75:0:0:70:75:45:25:0:0:46:29:0:0 chr14 36789775 . A T 473.41 PASS AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0086104;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.823;QD=35.7293;RBI=0.00962914;REFB=-0.0123615;REVB=0.0043106;RO=1;SAF=17;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0268968;STB=0.51428;TYPE=snp;VARB=-1.67529e-05;OID=.;OPOS=36789775;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:53:53:1:1:52:52:35:17:1:0:35:17:1:0 chr14 36789795 . G A 423.66 PASS AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0600892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.1432;QD=37.6582;RBI=0.0667032;REFB=0;REVB=0.0289588;RO=0;SAF=11;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00105944;OID=.;OPOS=36789795;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:45:45:0:0:45:45:34:11:0:0:34:11:0:0 chr14 36840650 . A T 1870.93 PASS AO=196;DP=207;FAO=201;FDP=201;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105201;FXX=0.0518843;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.3096;QD=37.2325;RBI=0.0128902;REFB=-0.03038;REVB=-0.00744875;RO=3;SAF=81;SAR=115;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0173083;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000151026;OID=.;OPOS=36840650;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:207:201:3:0:196:201:115:81:3:0:118:83:0:0 chr14 36840695 . A G 2449.59 PASS AO=249;DP=252;FAO=260;FDP=260;FR=.;FRO=0;FSAF=109;FSAR=151;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02681;FXX=0.0076333;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.495;QD=37.686;RBI=0.0355601;REFB=-0.0518079;REVB=0.0233612;RO=2;SAF=106;SAR=143;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00890776;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.78929e-05;OID=.;OPOS=36840695;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:252:260:2:0:249:260:143:106:2:0:151:109:0:0 chr14 36942909 . A T 482.97 PASS AO=118;DP=243;FAO=118;FDP=244;FR=.;FRO=126;FSAF=61;FSAR=57;FSRF=84;FSRR=42;FWDB=-0.0416933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.8127;QD=7.91757;RBI=0.0418514;REFB=0.00678878;REVB=-0.00363436;RO=124;SAF=61;SAR=57;SRF=83;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143274;STB=0.577798;TYPE=snp;VARB=-0.00453214;OID=.;OPOS=36942909;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:243:244:124:126:118:118:57:61:83:41:57:61:84:42 chr14 37063123 . C T 200.8 PASS AO=43;DP=84;FAO=44;FDP=85;FR=.;FRO=41;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=0.0177283;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.863;QD=9.44948;RBI=0.0180682;REFB=-0.0318841;REVB=0.00348841;RO=39;SAF=18;SAR=25;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0376726;STB=0.526822;TYPE=snp;VARB=0.0223006;OID=.;OPOS=37063123;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:85:39:41:43:44:25:18:18:21:26:18:19:22 chr14 37063294 . A G 100.89 PASS AO=32;DP=83;FAO=31;FDP=82;FR=.;FRO=51;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=38;FWDB=-0.00920093;FXX=0.0120467;HRUN=3;LEN=1;MLLD=115.102;QD=4.92163;RBI=0.0433453;REFB=-0.0148323;REVB=-0.0423575;RO=50;SAF=14;SAR=18;SRF=13;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19996;STB=0.608631;TYPE=snp;VARB=0.0156239;OID=.;OPOS=37063294;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:82:50:51:32:31:18:14:13:37:18:13:13:38 chr14 37135752 . C T 113.73 PASS AO=24;DP=46;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.0119975;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.6771;QD=9.67913;RBI=0.0453764;REFB=-0.00568696;REVB=0.0437616;RO=21;SAF=8;SAR=16;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.04556;STB=0.50793;TYPE=snp;VARB=0.0307275;OID=.;OPOS=37135752;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:47:21:23:24:24:16:8:6:15:16:8:8:15 chr14 37135753 . G C 95.74 PASS AO=20;DP=46;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.00399021;FXX=0.041658;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.561;QD=8.32487;RBI=0.0196352;REFB=-0.0287349;REVB=-0.0192255;RO=24;SAF=6;SAR=14;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.037267;STB=0.517226;TYPE=snp;VARB=0.0103828;OID=.;OPOS=37135753;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:46:46:24:24:20:22:14:6:8:16:14:8:8:16 chr14 37344229 . A AG 874.74 PASS AO=77;DP=99;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0329642;FXX=0.0210504;HRUN=0;LEN=1;MLLD=107.393;QD=37.6234;RBI=0.0367856;REFB=0;REVB=0.0163261;RO=6;SAF=8;SAR=69;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254825;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.0001085;OID=.;OPOS=37344230;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:77:99:93:93:0:15:78:0:0:42:6:8:69:6:0 chr14 37641880 . C A 151.44 PASS AO=29;DP=53;FAO=30;FDP=54;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=0.0418283;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.4415;QD=11.2178;RBI=0.0464501;REFB=-0.0343934;REVB=-0.0201992;RO=24;SAF=8;SAR=21;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0568449;STB=0.53656;TYPE=snp;VARB=0.0306499;OID=.;OPOS=37641880;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:53:54:24:24:29:30:21:8:8:16:22:8:8:16 chr14 38061742 . C T 68.41 PASS AO=12;DP=21;FAO=12;FDP=21;FR=.;FRO=9;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.0074862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.945;QD=13.0305;RBI=0.0508938;REFB=-0.0166885;REVB=-0.0503402;RO=8;SAF=11;SAR=1;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.484843;STB=0.774057;TYPE=snp;VARB=0.00412408;OID=.;OPOS=38061742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:21:21:8:9:12:12:1:11:4:4:1:11:5:4 chr14 38266074 . C T 307.03 PASS AO=85;DP=195;FAO=85;FDP=196;FR=.;FRO=111;FSAF=21;FSAR=64;FSRF=29;FSRR=82;FWDB=0.0111493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2375;QD=6.26588;RBI=0.0780427;REFB=-0.00902985;REVB=-0.0772422;RO=109;SAF=21;SAR=64;SRF=29;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0253627;STB=0.51069;TYPE=snp;VARB=0.0103639;OID=.;OPOS=38266074;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:196:109:111:85:85:64:21:29:80:64:21:29:82 chr14 38277999 . C T 98.62 PASS AO=38;DP=117;FAO=38;FDP=117;FR=.;FRO=79;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=43;FSRR=36;FWDB=-0.00376549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.5303;QD=3.37148;RBI=0.0237412;REFB=-0.0146925;REVB=-0.0234407;RO=79;SAF=22;SAR=16;SRF=43;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0409724;STB=0.523797;TYPE=snp;VARB=0.0328573;OID=.;OPOS=38277999;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:117:117:79:79:38:38:16:22:43:36:16:22:43:36 chr14 38680740 . G A 34.25 PASS AO=10;DP=27;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=3;FWDB=-0.0091886;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=89.7836;QD=4.89354;RBI=0.0236045;REFB=-0.0425595;REVB=0.0217426;RO=13;SAF=6;SAR=4;SRF=11;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.266518;STB=0.666388;TYPE=snp;VARB=0.059834;OID=.;OPOS=38680740;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:27:28:13:18:10:10:4:6:11:2:4:6:15:3 chr14 38681113 . G A 308.61 PASS AO=78;DP=168;FAO=78;FDP=168;FR=.;FRO=90;FSAF=32;FSAR=46;FSRF=48;FSRR=42;FWDB=0.00642024;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=213.521;QD=7.34796;RBI=0.00645118;REFB=0.00175736;REVB=0.000631026;RO=84;SAF=32;SAR=46;SRF=43;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0966195;STB=0.566485;TYPE=snp;VARB=-0.00176797;OID=.;OPOS=38681113;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:84:90:78:78:46:32:43:41:46:32:48:42 chr14 38681269 . C T 243.69 PASS AO=58;DP=115;FAO=57;FDP=115;FR=.;FRO=58;FSAF=25;FSAR=32;FSRF=17;FSRR=41;FWDB=-0.0666084;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.9374;QD=8.47625;RBI=0.0697829;REFB=-0.0104763;REVB=-0.0208082;RO=56;SAF=25;SAR=33;SRF=16;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135135;STB=0.575866;TYPE=snp;VARB=0.0234873;OID=.;OPOS=38681269;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:56:58:58:57:33:25:16:40:32:25:17:41 chr14 39545199 . A G 297.62 PASS AO=90;DP=223;FAO=90;FDP=223;FR=.;FRO=133;FSAF=46;FSAR=44;FSRF=71;FSRR=62;FWDB=-0.0119794;FXX=0.00446409;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.647;QD=5.33845;RBI=0.0236365;REFB=0.00674793;REVB=-0.0203759;RO=131;SAF=46;SAR=44;SRF=71;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.032709;STB=0.513564;TYPE=snp;VARB=-0.0110542;OID=.;OPOS=39545199;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:223:131:133:90:90:44:46:71:60:44:46:71:62 chr14 39556185 . G C 2071.45 PASS AO=214;DP=218;FAO=219;FDP=219;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=167;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0963628;FXX=0.00454525;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.2768;QD=37.8347;RBI=0.0964874;REFB=0;REVB=-0.00490308;RO=2;SAF=47;SAR=167;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0198361;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000868657;OID=.;OPOS=39556185;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:91:218:219:2:0:214:219:167:47:2:0:167:52:0:0 chr14 39644498 . G A 316.77 PASS AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00711512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.792;QD=37.2667;RBI=0.0308238;REFB=0;REVB=0.0299913;RO=0;SAF=13;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.82173e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000184626;OID=.;OPOS=39644498;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:33:34:0:0:33:34:20:13:0:0:21:13:0:0 chr14 39650234 . A T 170.84 PASS AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00376286;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=166.189;QD=37.9651;RBI=0.00386734;REFB=0;REVB=0.000892845;RO=0;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.20667e-05;OID=.;OPOS=39650234;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:18:0:0:18:18:9:9:0:0:9:9:0:0 chr14 39651193 . A G 1056.7 PASS AO=114;DP=116;FAO=114;FDP=116;FR=.;FRO=2;FSAF=44;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0227302;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=236.443;QD=36.4378;RBI=0.0297286;REFB=0.0376742;REVB=-0.0191606;RO=2;SAF=44;SAR=70;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.013373;STB=0.507041;TYPE=snp;VARB=-3.84889e-05;OID=.;OPOS=39651193;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:116:116:2:2:114:114:70:44:0:2:70:44:0:2 chr14 39703324 . A G 677.53 PASS AO=168;DP=341;FAO=168;FDP=350;FR=.;FRO=182;FSAF=102;FSAR=66;FSRF=66;FSRR=116;FWDB=-0.0392619;FXX=0.00849834;HRUN=4;LEN=1;MLLD=101.711;QD=7.74322;RBI=0.0394978;REFB=-0.0122464;REVB=-0.0043106;RO=171;SAF=102;SAR=66;SRF=60;SRR=111;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233775;STB=0.626047;TYPE=snp;VARB=0.0150998;OID=.;OPOS=39703324;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:341:350:171:182:168:168:66:102:60:111:66:102:66:116 chr14 39716201 . A G 530.33 PASS AO=138;DP=298;FAO=137;FDP=297;FR=.;FRO=160;FSAF=69;FSAR=68;FSRF=83;FSRR=77;FWDB=-0.016071;FXX=0.00335559;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.209;QD=7.14251;RBI=0.0167984;REFB=-0.000178555;REVB=0.00488994;RO=158;SAF=69;SAR=69;SRF=82;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0183706;STB=0.508135;TYPE=snp;VARB=0.000427105;OID=.;OPOS=39716201;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:298:297:158:160:138:137:69:69:82:76:68:69:83:77 chr14 39716808 . T C 676.77 PASS AO=149;DP=280;FAO=148;FDP=278;FR=.;FRO=130;FSAF=57;FSAR=91;FSRF=63;FSRR=67;FWDB=-0.0901181;FXX=0.0071426;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.6458;QD=9.73773;RBI=0.10137;REFB=0.0172696;REVB=-0.0464168;RO=129;SAF=58;SAR=91;SRF=63;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0867635;STB=0.548021;TYPE=snp;VARB=-0.0278721;OID=.;OPOS=39716808;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:280:278:129:130:149:148:91:58:63:66:91:57:63:67 chr14 39722023 . G C 289.15 PASS AO=65;DP=127;FAO=65;FDP=127;FR=.;FRO=62;FSAF=24;FSAR=41;FSRF=36;FSRR=26;FWDB=-0.0417507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.3126;QD=9.10719;RBI=0.0420684;REFB=-0.0210749;REVB=-0.00516063;RO=60;SAF=24;SAR=41;SRF=35;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189439;STB=0.604687;TYPE=snp;VARB=0.0277611;OID=.;OPOS=39722023;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:60:62:65:65:41:24:35:25:41:24:36:26 chr14 39736680 . T C 301.92 PASS AO=33;DP=38;FAO=36;FDP=38;FR=.;FRO=2;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0436674;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.046;QD=31.7812;RBI=0.0453927;REFB=-0.0525868;REVB=0.0123955;RO=1;SAF=14;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239571;STB=0.506132;TYPE=snp;VARB=0.00212232;OID=.;OPOS=39736680;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:38:38:1:2:33:36:19:14:0:1:22:14:1:1 chr14 39777676 . G C 894.67 PASS AO=398;DP=777;FAO=203;FDP=393;FR=.;FRO=190;FSAF=79;FSAR=124;FSRF=110;FSRR=80;FWDB=-0.00886942;FXX=0.0174996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.579;QD=9.10603;RBI=0.0115377;REFB=-0.0274404;REVB=0.00737921;RO=351;SAF=150;SAR=248;SRF=172;SRR=179;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100863;STB=0.592527;TYPE=snp;VARB=0.0189737;OID=.;OPOS=39777676;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:777:393:351:190:398:203:248:150:172:179:124:79:110:80 chr14 39784014 . A G 379.32 PASS AO=60;DP=84;FAO=60;FDP=84;FR=.;FRO=24;FSAF=47;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=0.0557533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.7235;QD=18.0627;RBI=0.0738729;REFB=-0.0503269;REVB=0.0484642;RO=22;SAF=47;SAR=13;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.25788;STB=0.655862;TYPE=snp;VARB=0.0217551;OID=.;OPOS=39784014;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:84:84:22:24:60:60:13:47:8:14:13:47:8:16 chr14 39818028 . A G 631.75 PASS AO=135;DP=249;FAO=135;FDP=249;FR=.;FRO=114;FSAF=63;FSAR=72;FSRF=54;FSRR=60;FWDB=-0.0126301;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.133;QD=10.1486;RBI=0.0470853;REFB=-0.0120216;REVB=0.0453597;RO=112;SAF=63;SAR=72;SRF=54;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129298;STB=0.503225;TYPE=snp;VARB=0.010322;OID=.;OPOS=39818028;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:249:249:112:114:135:135:72:63:54:58:72:63:54:60 chr14 39818145 . G A 372.44 PASS AO=77;DP=153;FAO=86;FDP=166;FR=.;FRO=80;FSAF=26;FSAR=60;FSRF=25;FSRR=55;FWDB=-0.057739;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=40.9442;QD=8.97445;RBI=0.0699226;REFB=-0.0514293;REVB=0.0394382;RO=72;SAF=20;SAR=57;SRF=17;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0274567;STB=0.505784;TYPE=snp;VARB=0.0413527;OID=.;OPOS=39818145;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:166:72:80:77:86:57:20:17:55:60:26:25:55 chr14 39819734 . T G 2163.61 PASS AO=253;DP=274;FAO=257;FDP=274;FR=.;FRO=17;FSAF=153;FSAR=104;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=0.00527216;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=152.292;QD=31.5855;RBI=0.0462788;REFB=-0.205405;REVB=0.0459776;RO=18;SAF=153;SAR=100;SRF=1;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.071359;STB=0.522976;TYPE=snp;VARB=0.00232358;OID=.;OPOS=39819734;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:274:274:18:17:253:257:100:153:1:17:104:153:4:13 chr14 39856130 . AG A,GA 51.22 PASS AO=14,8;DP=40;FAO=23,0;FDP=39;FR=.;FRO=16;FSAF=22,0;FSAR=1,0;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.0258975,-0.0194137;FXX=0;HRUN=4,1;LEN=1,2;MLLD=9.82484,76.1504;QD=5.25294;RBI=0.098745,0.0226963;REFB=-0.150562,-0.00656784;REVB=0.0952885,0.0117571;RO=15;SAF=13,8;SAR=1,0;SRF=5;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0.425532,0;SSSB=0.659212,0.796202;STB=0.895832,0.5;TYPE=del,mnp;VARB=0.134693,0.0112189;OID=.,.;OPOS=39856131,39856130;OREF=G,AG;OALT=-,GA;OMAPALT=A,GA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:39:39:15:16:14,8:23,0:1,0:13,8:5:10:1,0:22,0:6:10 chr14 39867672 . T C 10.47 PASS AO=2;DP=6;FAO=2;FDP=6;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0191453;FXX=0;HRUN=16;LEN=1;MLLD=277.287;QD=6.97934;RBI=0.0191453;REFB=0.00183372;REVB=0;RO=4;SAF=2;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00472666;OID=.;OPOS=39867672;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:4:4:2:2:0:2:4:0:0:2:4:0 chr14 39871017 . T C 191.41 PASS AO=43;DP=88;FAO=44;FDP=89;FR=.;FRO=45;FSAF=12;FSAR=32;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=0.0113345;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=91.6806;QD=8.60254;RBI=0.0127826;REFB=-0.0308687;REVB=0.00590965;RO=45;SAF=11;SAR=32;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.262389;STB=0.63342;TYPE=snp;VARB=0.0261075;OID=.;OPOS=39871017;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:89:45:45:43:44:32:11:23:22:32:12:23:22 chr14 42360633 . T C 2217.48 PASS AO=221;DP=221;FAO=232;FDP=232;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=158;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.769;QD=38.2325;RBI=0.0541711;REFB=0;REVB=0.0531926;RO=0;SAF=73;SAR=148;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.92203e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.37858e-05;OID=.;OPOS=42360633;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:221:232:0:0:221:232:148:73:0:0:158:74:0:0 chr14 42997963 . A G 230.5 PASS AO=56;DP=118;FAO=56;FDP=118;FR=.;FRO=62;FSAF=21;FSAR=35;FSRF=25;FSRR=37;FWDB=0.0544615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.121;QD=7.81343;RBI=0.0554791;REFB=-0.00371236;REVB=-0.0105776;RO=62;SAF=21;SAR=35;SRF=25;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.028252;STB=0.515689;TYPE=snp;VARB=0.00345931;OID=.;OPOS=42997963;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:62:62:56:56:35:21:25:37:35:21:25:37 chr14 42998026 . T C 1092.1 PASS AO=118;DP=121;FAO=118;FDP=120;FR=.;FRO=2;FSAF=51;FSAR=67;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00777041;FXX=0.00826378;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.272;QD=36.4033;RBI=0.0182147;REFB=-0.0979618;REVB=0.0164741;RO=1;SAF=51;SAR=67;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00922187;STB=0.501151;TYPE=snp;VARB=0.00171613;OID=.;OPOS=42998026;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:121:120:1:2:118:118:67:51:1:0:67:51:1:1 chr14 44974922 . A T 544.71 PASS AO=111;DP=195;FAO=111;FDP=196;FR=.;FRO=85;FSAF=54;FSAR=57;FSRF=52;FSRR=33;FWDB=-0.0116351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.438;QD=11.1166;RBI=0.0184498;REFB=-0.00904631;REVB=-0.0143186;RO=82;SAF=54;SAR=57;SRF=51;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105788;STB=0.554201;TYPE=snp;VARB=0.00707272;OID=.;OPOS=44974922;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:196:82:85:111:111:57:54:51:31:57:54:52:33 chr14 44975510 . C T 380.17 PASS AO=83;DP=173;FAO=83;FDP=158;FR=.;FRO=75;FSAF=31;FSAR=52;FSRF=31;FSRR=44;FWDB=-0.000872812;FXX=0.0867002;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.083;QD=9.62453;RBI=0.00852494;REFB=0.00610448;REVB=0.00848014;RO=56;SAF=31;SAR=52;SRF=17;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0563712;STB=0.519995;TYPE=snp;VARB=-0.00228698;OID=.;OPOS=44975510;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:158:56:75:83:83:52:31:17:39:52:31:31:44 chr14 44975511 . G A 117.82 PASS AO=50;DP=170;FAO=50;FDP=163;FR=.;FRO=113;FSAF=13;FSAR=37;FSRF=46;FSRR=67;FWDB=0.00578406;FXX=0.0523225;HRUN=5;LEN=1;MLLD=182.344;QD=2.8913;RBI=0.0066451;REFB=-0.000549979;REVB=-0.0032714;RO=113;SAF=13;SAR=37;SRF=46;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200031;STB=0.617489;TYPE=snp;VARB=0.00422721;OID=.;OPOS=44975511;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:163:113:113:50:50:37:13:46:67:37:13:46:67 chr14 45481271 . C T 169.56 PASS AO=45;DP=104;FAO=45;FDP=103;FR=.;FRO=58;FSAF=14;FSAR=31;FSRF=32;FSRR=26;FWDB=-0.0205345;FXX=0.00961446;HRUN=4;LEN=1;MLLD=183.669;QD=6.58483;RBI=0.0243444;REFB=-0.0100111;REVB=-0.0130761;RO=58;SAF=14;SAR=31;SRF=32;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.250828;STB=0.641122;TYPE=snp;VARB=0.0101691;OID=.;OPOS=45481271;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:103:58:58:45:45:31:14:32:26:31:14:32:26 chr14 47310821 . C T 50.78 PASS AO=17;DP=35;FAO=16;FDP=43;FR=.;FRO=27;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.0237358;FXX=0.0444346;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.825;QD=4.72408;RBI=0.0298809;REFB=-0.004885;REVB=0.0181516;RO=17;SAF=9;SAR=8;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104816;STB=0.722604;TYPE=snp;VARB=0.0102357;OID=.;OPOS=47310821;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:35:43:17:27:17:16:8:9:11:6:12:4:16:11 chr14 47341055 . C G 68.86 PASS AO=20;DP=53;FAO=20;FDP=53;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=0.00365097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.5475;QD=5.19734;RBI=0.021211;REFB=-0.0269264;REVB=-0.0208944;RO=30;SAF=13;SAR=7;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0559353;STB=0.549245;TYPE=snp;VARB=0.0436438;OID=.;OPOS=47341055;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:53:53:30:33:20:20:7:13:18:12:7:13:19:14 chr14 47341131 . C G 164.65 PASS AO=18;DP=20;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0238279;FXX=0.049975;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.4968;QD=34.6627;RBI=0.0286367;REFB=0.0649734;REVB=-0.0158838;RO=1;SAF=5;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0831815;STB=0.545402;TYPE=snp;VARB=-0.00303832;OID=.;OPOS=47341131;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:19:1:1:18:18:13:5:1:0:13:5:1:0 chr14 47528470 . T C 1201.41 PASS AO=131;DP=134;FAO=131;FDP=134;FR=.;FRO=3;FSAF=34;FSAR=97;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0120913;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=65.2353;QD=35.8631;RBI=0.0387443;REFB=-0.220214;REVB=0.0368092;RO=0;SAF=34;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18979e-08;STB=0.502144;TYPE=snp;VARB=0.00337752;OID=.;OPOS=47528470;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:134:134:0:3:131:131:97:34:0:0:97:34:1:2 chr14 47528551 . T A 180.65 PASS AO=54;DP=135;FAO=54;FDP=135;FR=.;FRO=81;FSAF=14;FSAR=40;FSRF=12;FSRR=69;FWDB=0.010986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.417;QD=5.35244;RBI=0.0126412;REFB=-0.00507656;REVB=0.00625362;RO=81;SAF=14;SAR=40;SRF=12;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170056;STB=0.594669;TYPE=snp;VARB=0.00955457;OID=.;OPOS=47528551;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:81:81:54:54:40:14:12:69:40:14:12:69 chr14 50019391 . A C 290.01 PASS AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.071022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.004;QD=37.4205;RBI=0.0746675;REFB=0;REVB=0.0230456;RO=0;SAF=7;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71661e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000587683;OID=.;OPOS=50019391;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:31:31:0:0:31:31:24:7:0:0:24:7:0:0 chr14 50019417 . G C 327.65 PASS AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00968888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.611;QD=37.4455;RBI=0.0103241;REFB=0;REVB=-0.00356562;RO=0;SAF=6;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.61498e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000104634;OID=.;OPOS=50019417;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:35:35:0:0:35:35:29:6:0:0:29:6:0:0 chr14 50044392 . T C 1144.13 PASS AO=127;DP=133;FAO=128;FDP=133;FR=.;FRO=5;FSAF=41;FSAR=87;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.000687414;FXX=0.00746213;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.421;QD=34.41;RBI=0.0163913;REFB=-0.098427;REVB=-0.0163769;RO=5;SAF=40;SAR=87;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00961505;STB=0.505212;TYPE=snp;VARB=0.000657485;OID=.;OPOS=50044392;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:133:133:5:5:127:128:87:40:1:4:87:41:1:4 chr14 50058984 . A G 759.95 PASS AO=81;DP=81;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00756524;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.72;QD=37.9974;RBI=0.0525297;REFB=0;REVB=0.0519821;RO=0;SAF=46;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.46682e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.77262e-05;OID=.;OPOS=50058984;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:81:80:0:0:81:80:35:46:0:0:35:45:0:0 chr14 50065359 . C G 736.13 PASS AO=83;DP=83;FAO=81;FDP=83;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=53;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0873949;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.5885;QD=35.4763;RBI=0.0944273;REFB=0.0477727;REVB=-0.0357582;RO=0;SAF=30;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517237;TYPE=snp;VARB=-0.000658817;OID=.;OPOS=50065359;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:83:83:0:2:83:81:53:30:0:0:53:28:2:0 chr14 50065717 . G C 773.3 PASS AO=79;DP=79;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0464721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.914;QD=38.6651;RBI=0.0538039;REFB=0;REVB=0.0271147;RO=0;SAF=37;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.6162e-05;OID=.;OPOS=50065717;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:79:80:0:0:79:80:42:37:0:0:43:37:0:0 chr14 50068299 . C G 1993.94 PASS AO=208;DP=214;FAO=216;FDP=216;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=129;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00246659;FXX=0.0313887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.608;QD=36.9248;RBI=0.00863693;REFB=-0.122537;REVB=0.00827723;RO=4;SAF=85;SAR=123;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0152365;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.88304e-05;OID=.;OPOS=50068299;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:214:216:4:0:208:216:123:85:0:4:129:87:0:0 chr14 50087753 . T C 126.04 PASS AO=13;DP=13;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0394604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.621;QD=36.0099;RBI=0.0411072;REFB=0;REVB=0.0115186;RO=0;SAF=9;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0011967;OID=.;OPOS=50087753;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:14:0:0:13:14:4:9:0:0:4:10:0:0 chr14 50089696 . C G 226.57 PASS AO=68;DP=173;FAO=69;FDP=173;FR=.;FRO=104;FSAF=38;FSAR=31;FSRF=53;FSRR=51;FWDB=0.0198096;FXX=0.0114279;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.7924;QD=5.23855;RBI=0.0237865;REFB=-0.01234;REVB=-0.0131673;RO=100;SAF=37;SAR=31;SRF=52;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0256666;STB=0.524837;TYPE=snp;VARB=0.0253008;OID=.;OPOS=50089696;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:173:100:104:68:69:31:37:52:48:31:38:53:51 chr14 50092471 . T C 882.28 PASS AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00732314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.946;QD=37.9475;RBI=0.0137659;REFB=0;REVB=0.0116564;RO=0;SAF=54;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.96098e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.16436e-06;OID=.;OPOS=50092471;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:93:93:0:0:93:93:39:54:0:0:39:54:0:0 chr14 50100386 . T C 116.19 PASS AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0435234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.841;QD=35.7496;RBI=0.0479892;REFB=0;REVB=0.0202158;RO=0;SAF=6;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000302631;OID=.;OPOS=50100386;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:13:0:0:13:13:7:6:0:0:7:6:0:0 chr14 50101370 . G A 451.15 PASS AO=51;DP=53;FAO=51;FDP=53;FR=.;FRO=2;FSAF=9;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0963676;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.2573;QD=34.049;RBI=0.0992194;REFB=-0.0693502;REVB=0.0236172;RO=2;SAF=9;SAR=42;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0384142;STB=0.520438;TYPE=snp;VARB=0.00240141;OID=.;OPOS=50101370;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:53:53:2:2:51:51:42:9:1:1:42:9:1:1 chr14 50101682 . C G 327.64 PASS AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0441248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.247;QD=37.4449;RBI=0.0448571;REFB=0;REVB=-0.0080726;RO=0;SAF=26;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00022236;OID=.;OPOS=50101682;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:35:35:0:0:35:35:9:26:0:0:9:26:0:0 chr14 50151312 . GC G 550.34 PASS AO=59;DP=86;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.124716;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.5379;QD=23.172;RBI=0.350625;REFB=0;REVB=0.327694;RO=18;SAF=21;SAR=38;SRF=6;SRR=12;SSEN=0.243808;SSEP=0;SSSB=0.0107767;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.010505;OID=.;OPOS=50151313;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:59:79:95:95:0:43:52:0:0:47:18:21:38:6:12 chr14 50195679 . A G 3393.61 PASS AO=352;DP=354;FAO=355;FDP=355;FR=.;FRO=0;FSAF=158;FSAR=197;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00184353;FXX=0.00560208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.521;QD=38.2378;RBI=0.0182447;REFB=-0.040345;REVB=0.0181513;RO=1;SAF=158;SAR=194;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00301032;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.96725e-06;OID=.;OPOS=50195679;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:354:355:1:0:352:355:194:158:1:0:197:158:0:0 chr14 50251369 . A G 1952.69 PASS AO=205;DP=211;FAO=206;FDP=206;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182122;FXX=0.0283006;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.707;QD=37.9163;RBI=0.0189665;REFB=-0.0707284;REVB=-0.00529566;RO=0;SAF=105;SAR=100;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.03237e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.59875e-05;OID=.;OPOS=50251369;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:211:206:0:0:205:206:100:105:0:0:101:105:0:0 chr14 50298962 . T A 1527.83 PASS AO=165;DP=170;FAO=166;FDP=169;FR=.;FRO=3;FSAF=72;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0198573;FXX=0.00588201;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.776;QD=36.1617;RBI=0.0201122;REFB=-0.131883;REVB=0.00319232;RO=4;SAF=72;SAR=93;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200243;STB=0.507852;TYPE=snp;VARB=0.000538019;OID=.;OPOS=50298962;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:170:169:4:3:165:166:93:72:0:4:94:72:0:3 chr14 50320391 . A G 241.8 PASS AO=25;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0261889;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.428;QD=37.2006;RBI=0.109533;REFB=0;REVB=-0.106356;RO=0;SAF=22;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.65945e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000414353;OID=.;OPOS=50320391;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:26:26:0:0:25:26:3:22:0:0:3:23:0:0 chr14 50477643 . G C 1148.87 PASS AO=119;DP=120;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0477791;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.685;QD=38.6175;RBI=0.049448;REFB=0;REVB=-0.0127381;RO=0;SAF=74;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.15375e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.44583e-05;OID=.;OPOS=50477643;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:120:119:0:0:119:119:45:74:0:0:45:74:0:0 chr14 50575411 . A G 136.15 PASS AO=34;DP=76;FAO=34;FDP=75;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=0.00583396;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.69;QD=7.26138;RBI=0.0266151;REFB=-0.00852658;REVB=-0.0259679;RO=41;SAF=15;SAR=19;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.026284;STB=0.514756;TYPE=snp;VARB=0.00902019;OID=.;OPOS=50575411;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:75:41:41:34:34:19:15:17:24:19:15:17:24 chr14 50583822 . T C 97.14 PASS AO=32;DP=91;FAO=32;FDP=90;FR=.;FRO=58;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=46;FWDB=0.0239035;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.276;QD=4.3173;RBI=0.0254491;REFB=-0.00917474;REVB=0.00873393;RO=56;SAF=21;SAR=11;SRF=12;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.46143;STB=0.767164;TYPE=snp;VARB=0.0123087;OID=.;OPOS=50583822;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:91:90:56:58:32:32:11:21:12:44:11:21:12:46 chr14 50616878 . G A 488.86 PASS AO=130;DP=292;FAO=132;FDP=293;FR=.;FRO=161;FSAF=57;FSAR=75;FSRF=90;FSRR=71;FWDB=-0.0331335;FXX=0.00677943;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.864;QD=6.67381;RBI=0.0389111;REFB=-0.00771309;REVB=-0.020402;RO=158;SAF=56;SAR=74;SRF=89;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131236;STB=0.569845;TYPE=snp;VARB=0.00883578;OID=.;OPOS=50616878;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:292:293:158:161:130:132:74:56:89:69:75:57:90:71 chr14 50623657 . G A 707.59 PASS AO=190;DP=402;FAO=187;FDP=398;FR=.;FRO=211;FSAF=89;FSAR=98;FSRF=116;FSRR=95;FWDB=-0.0187525;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.1162;QD=7.1115;RBI=0.0201284;REFB=-0.0143752;REVB=-0.00731407;RO=202;SAF=89;SAR=101;SRF=117;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103697;STB=0.539079;TYPE=snp;VARB=0.0164075;OID=.;OPOS=50623657;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:402:398:202:211:190:187:101:89:117:85:98:89:116:95 chr14 50623679 . G A 389.76 PASS AO=138;DP=379;FAO=138;FDP=379;FR=.;FRO=241;FSAF=67;FSAR=71;FSRF=123;FSRR=118;FWDB=-0.0175162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.9967;QD=4.11356;RBI=0.041108;REFB=-0.0273861;REVB=-0.0371894;RO=236;SAF=67;SAR=71;SRF=119;SRR=117;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0209372;STB=0.515809;TYPE=snp;VARB=0.0559754;OID=.;OPOS=50623679;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:379:379:236:241:138:138:71:67:119:117:71:67:123:118 chr14 50623683 . A G 405.2 PASS AO=136;DP=355;FAO=135;FDP=355;FR=.;FRO=220;FSAF=66;FSAR=69;FSRF=111;FSRR=109;FWDB=0.0079291;FXX=0.0247246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.5215;QD=4.56564;RBI=0.012413;REFB=-0.0126938;REVB=0.00955055;RO=214;SAF=68;SAR=68;SRF=106;SRR=108;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00508833;STB=0.509702;TYPE=snp;VARB=0.0403006;OID=.;OPOS=50623683;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:355:355:214:220:136:135:68:68:106:108:69:66:111:109 chr14 50704331 . C T 91.22 PASS AO=29;DP=81;FAO=29;FDP=80;FR=.;FRO=51;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=33;FWDB=-0.0130465;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.036;QD=4.56114;RBI=0.0232043;REFB=-0.0131852;REVB=-0.0191892;RO=50;SAF=15;SAR=14;SRF=18;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17259;STB=0.604044;TYPE=snp;VARB=0.0310709;OID=.;OPOS=50704331;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:81:80:50:51:29:29:14:15:18:32:14:15:18:33 chr14 50704435 . G A 127.39 PASS AO=29;DP=66;FAO=31;FDP=67;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=0.0127718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.927;QD=7.60517;RBI=0.0160059;REFB=-0.0115134;REVB=0.00964728;RO=36;SAF=13;SAR=16;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0314642;STB=0.536209;TYPE=snp;VARB=0.0119562;OID=.;OPOS=50704435;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:67:36:36:29:31:16:13:15:21:16:15:15:21 chr14 50713679 . T G 592.41 PASS AO=62;DP=65;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0071823;FXX=0.0605969;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.121;QD=38.2201;RBI=0.0218583;REFB=0;REVB=0.0206446;RO=0;SAF=45;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000236281;OID=.;OPOS=50713679;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:65:62:0:0:62:62:17:45:0:0:17:45:0:0 chr14 50769717 . G A 230.36 PASS AO=48;DP=89;FAO=48;FDP=89;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=35;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=0.0440667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.0585;QD=10.3534;RBI=0.0657585;REFB=0.0196012;REVB=-0.0488089;RO=39;SAF=13;SAR=35;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220743;STB=0.635643;TYPE=snp;VARB=-0.0180508;OID=.;OPOS=50769717;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:39:41:48:48:35:13:20:19:35:13:22:19 chr14 50778816 . A C 18.64 PASS AO=4;DP=10;FAO=4;FDP=12;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=0.000658877;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=270.017;QD=6.21353;RBI=0.0502705;REFB=-0.00596358;REVB=-0.0502662;RO=6;SAF=3;SAR=1;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.426205;STB=0.624475;TYPE=snp;VARB=0.00719135;OID=.;OPOS=50778816;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:10:12:6:8:4:4:1:3:6:0:1:3:7:1 chr14 50786004 . A G 206.9 PASS AO=38;DP=66;FAO=40;FDP=68;FR=.;FRO=28;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=8;FSRR=20;FWDB=0.00943112;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=38.1281;QD=12.1704;RBI=0.0126086;REFB=0.00513683;REVB=-0.00836841;RO=28;SAF=15;SAR=23;SRF=8;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0900612;STB=0.549976;TYPE=snp;VARB=-0.00598513;OID=.;OPOS=50786004;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:68:28:28:38:40:23:15:8:20:24:16:8:20 chr14 50788213 . C T 443.55 PASS AO=95;DP=177;FAO=95;FDP=177;FR=.;FRO=82;FSAF=29;FSAR=66;FSRF=38;FSRR=44;FWDB=0.00525142;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.79;QD=10.0238;RBI=0.00796495;REFB=-0.000758701;REVB=-0.00598857;RO=81;SAF=29;SAR=66;SRF=37;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140932;STB=0.580907;TYPE=snp;VARB=0.000884822;OID=.;OPOS=50788213;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:177:81:82:95:95:66:29:37:44:66:29:38:44 chr14 50798743 . G A 116.43 PASS AO=28;DP=62;FAO=28;FDP=61;FR=.;FRO=33;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.00915309;FXX=0.0161264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.617;QD=7.63489;RBI=0.0146593;REFB=-0.00955439;REVB=0.0114507;RO=33;SAF=20;SAR=8;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180045;STB=0.602018;TYPE=snp;VARB=0.0218922;OID=.;OPOS=50798743;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:61:33:33:28:28:8:20:18:15:8:20:18:15 chr14 50799126 . G C 410.09 PASS AO=94;DP=186;FAO=94;FDP=185;FR=.;FRO=91;FSAF=36;FSAR=58;FSRF=30;FSRR=61;FWDB=0.042403;FXX=0.00537606;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1732;QD=8.86673;RBI=0.0427054;REFB=-0.00345674;REVB=-0.00507365;RO=91;SAF=36;SAR=58;SRF=30;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0512619;STB=0.528101;TYPE=snp;VARB=0.00437214;OID=.;OPOS=50799126;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:185:91:91:94:94:58:36:30:61:58:36:30:61 chr14 50802727 . A C 157.2 PASS AO=47;DP=124;FAO=49;FDP=127;FR=.;FRO=78;FSAF=16;FSAR=33;FSRF=42;FSRR=36;FWDB=-0.0274386;FXX=0.00781189;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.6756;QD=4.9513;RBI=0.0503162;REFB=-0.0268888;REVB=-0.0421764;RO=77;SAF=16;SAR=31;SRF=42;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228147;STB=0.634139;TYPE=snp;VARB=0.03266;OID=.;OPOS=50802727;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:127:77:78:47:49:31:16:42:35:33:16:42:36 chr14 50802840 . A G 140.45 PASS AO=37;DP=85;FAO=37;FDP=85;FR=.;FRO=48;FSAF=5;FSAR=32;FSRF=14;FSRR=34;FWDB=-0.0288852;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.804;QD=6.60961;RBI=0.0313563;REFB=-0.00688456;REVB=0.0122011;RO=48;SAF=5;SAR=32;SRF=14;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.258394;STB=0.648094;TYPE=snp;VARB=0.00421864;OID=.;OPOS=50802840;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:48:48:37:37:32:5:14:34:32:5:14:34 chr14 50824839 . G A 313.22 PASS AO=73;DP=147;FAO=72;FDP=144;FR=.;FRO=72;FSAF=25;FSAR=47;FSRF=37;FSRR=35;FWDB=-0.0138602;FXX=0.0136977;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.7857;QD=8.70057;RBI=0.0143568;REFB=-0.0112608;REVB=-0.00374332;RO=71;SAF=25;SAR=48;SRF=36;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15451;STB=0.587002;TYPE=snp;VARB=0.0155525;OID=.;OPOS=50824839;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:144:71:72:73:72:48:25:36:35:47:25:37:35 chr14 50844367 . G GA 115.98 PASS AO=44;DP=175;FAO=71;FDP=178;FR=.;FRO=107;FSAF=47;FSAR=24;FSRF=46;FSRR=61;FWDB=0.0481207;FXX=0.0326069;HRUN=1;LEN=1;MLLD=19.4208;QD=2.60631;RBI=0.0952674;REFB=-0.0206239;REVB=0.0822208;RO=122;SAF=43;SAR=1;SRF=51;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.775323;STB=0.641521;TYPE=ins;VARB=0.0396935;OID=.;OPOS=50844368;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:44:175:71:178:107:47:24:46:61:99:122:43:1:51:71 chr14 50935150 . A G 1237.36 PASS AO=133;DP=135;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0092004;FXX=0.0148137;HRUN=4;LEN=1;MLLD=193.639;QD=37.2139;RBI=0.014409;REFB=-0.133194;REVB=0.0110893;RO=0;SAF=56;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.88062e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.93911e-05;OID=.;OPOS=50935150;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:135:133:0:0:133:133:77:56:0:0:77:56:0:0 chr14 51057727 . G A 464.62 PASS AO=112;DP=232;FAO=113;FDP=233;FR=.;FRO=120;FSAF=49;FSAR=64;FSRF=49;FSRR=71;FWDB=-0.0274118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.914;QD=7.97636;RBI=0.0284345;REFB=-0.00890016;REVB=-0.00755725;RO=119;SAF=49;SAR=63;SRF=49;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0245553;STB=0.513306;TYPE=snp;VARB=0.0121928;OID=.;OPOS=51057727;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:233:119:120:112:113:63:49:49:70:64:49:49:71 chr14 51104518 . G C 86.45 PASS AO=29;DP=83;FAO=29;FDP=83;FR=.;FRO=54;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=29;FSRR=25;FWDB=0.0216376;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=274.78;QD=4.16627;RBI=0.0305927;REFB=-0.000641024;REVB=-0.021627;RO=54;SAF=12;SAR=17;SRF=29;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138739;STB=0.580294;TYPE=snp;VARB=0.00129418;OID=.;OPOS=51104518;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:83:83:54:54:29:29:17:12:29:25:17:12:29:25 chr14 51192659 . G A 644.75 PASS AO=208;DP=445;FAO=176;FDP=399;FR=.;FRO=223;FSAF=100;FSAR=76;FSRF=118;FSRR=105;FWDB=0.00955941;FXX=0.00249994;HRUN=3;LEN=1;MLLD=90.8836;QD=6.46368;RBI=0.042052;REFB=-0.0149459;REVB=-0.040951;RO=235;SAF=120;SAR=88;SRF=136;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00177784;STB=0.522093;TYPE=snp;VARB=0.0192233;OID=.;OPOS=51192659;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:445:399:235:223:208:176:88:120:136:99:76:100:118:105 chr14 51204996 . C T 321.96 PASS AO=81;DP=176;FAO=84;FDP=185;FR=.;FRO=101;FSAF=39;FSAR=45;FSRF=60;FSRR=41;FWDB=-0.0114835;FXX=0.00537606;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8903;QD=6.96132;RBI=0.026355;REFB=-0.00790563;REVB=0.0237216;RO=95;SAF=40;SAR=41;SRF=58;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113614;STB=0.570479;TYPE=snp;VARB=0.00786394;OID=.;OPOS=51204996;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:185:95:101:81:84:41:40:58:37:45:39:60:41 chr14 51223789 . C T 306.17 PASS AO=61;DP=107;FAO=61;FDP=107;FR=.;FRO=46;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=11;FSRR=35;FWDB=0.00414887;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=213.742;QD=11.4454;RBI=0.0199162;REFB=-0.0147946;REVB=-0.0194793;RO=45;SAF=30;SAR=31;SRF=11;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193771;STB=0.609009;TYPE=snp;VARB=0.00675549;OID=.;OPOS=51223789;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:45:46:61:61:31:30:11:34:31:30:11:35 chr14 51224374 . T G 229.4 PASS AO=53;DP=109;FAO=53;FDP=108;FR=.;FRO=55;FSAF=20;FSAR=33;FSRF=18;FSRR=37;FWDB=-0.00854836;FXX=0.0181802;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.679;QD=8.49622;RBI=0.0229208;REFB=-0.0268329;REVB=0.0212671;RO=55;SAF=21;SAR=32;SRF=18;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0674013;STB=0.527495;TYPE=snp;VARB=0.0152762;OID=.;OPOS=51224374;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:108:55:55:53:53:32:21:18:37:33:20:18:37 chr14 51224417 . G C 149.03 PASS AO=45;DP=114;FAO=45;FDP=114;FR=.;FRO=69;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=23;FSRR=46;FWDB=-0.0376928;FXX=0.0086949;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.5982;QD=5.22913;RBI=0.037701;REFB=-0.033434;REVB=0.000784957;RO=69;SAF=19;SAR=26;SRF=23;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0993497;STB=0.542732;TYPE=snp;VARB=0.0508687;OID=.;OPOS=51224417;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:69:69:45:45:26:19:23:46:27:18:23:46 chr14 51237701 . A G 290.19 PASS AO=69;DP=144;FAO=70;FDP=145;FR=.;FRO=75;FSAF=28;FSAR=42;FSRF=39;FSRR=36;FWDB=0.0834558;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.318;QD=8.00519;RBI=0.0857615;REFB=0.00308062;REVB=0.0197527;RO=75;SAF=27;SAR=42;SRF=39;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123234;STB=0.563007;TYPE=snp;VARB=-0.00215371;OID=.;OPOS=51237701;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:145:75:75:69:70:42:27:39:36:42:28:39:36 chr14 51239067 . C G 1327.42 PASS AO=141;DP=142;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00982706;FXX=0.00704176;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.4718;QD=37.6572;RBI=0.0359538;REFB=-0.0929273;REVB=0.0345848;RO=1;SAF=83;SAR=58;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00812734;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00102417;OID=.;OPOS=51239067;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:142:141:1:0:141:141:58:83:0:1:58:83:0:0 chr14 51368610 . A G 523.63 PASS AO=143;DP=323;FAO=143;FDP=323;FR=.;FRO=180;FSAF=57;FSAR=86;FSRF=47;FSRR=133;FWDB=-0.00210811;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.348;QD=6.48457;RBI=0.0198064;REFB=-0.0180426;REVB=-0.0196939;RO=176;SAF=57;SAR=86;SRF=45;SRR=131;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154595;STB=0.582572;TYPE=snp;VARB=0.0176253;OID=.;OPOS=51368610;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:323:323:176:180:143:143:86:57:45:131:86:57:47:133 chr14 51378517 . C G 399.7 PASS AO=114;DP=268;FAO=114;FDP=268;FR=.;FRO=154;FSAF=71;FSAR=43;FSRF=101;FSRR=53;FWDB=0.00562194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.415;QD=5.9657;RBI=0.0082639;REFB=0.00563474;REVB=0.00605688;RO=154;SAF=71;SAR=43;SRF=101;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0366758;STB=0.520402;TYPE=snp;VARB=-0.00826825;OID=.;OPOS=51378517;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:268:268:154:154:114:114:43:71:101:53:43:71:101:53 chr14 51378590 . CT C 225.44 PASS AO=87;DP=274;FAO=134;FDP=295;FR=.;FRO=161;FSAF=88;FSAR=46;FSRF=123;FSRR=38;FWDB=0.0520043;FXX=0.0199329;HRUN=3;LEN=1;MLLD=18.1087;QD=3.05687;RBI=0.0949513;REFB=-0.0330188;REVB=-0.0794438;RO=144;SAF=74;SAR=13;SRF=112;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138848;STB=0.567659;TYPE=del;VARB=0.0280377;OID=.;OPOS=51378591;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:87:265:134:295:161:88:46:123:38:99:144:74:13:112:32 chr14 51383432 . G A 171.29 PASS AO=43;DP=94;FAO=43;FDP=94;FR=.;FRO=51;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=11;FSRR=40;FWDB=-0.0199232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.937;QD=7.28881;RBI=0.0265319;REFB=-0.00768921;REVB=-0.0175217;RO=50;SAF=21;SAR=22;SRF=10;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.282817;STB=0.64899;TYPE=snp;VARB=0.00868915;OID=.;OPOS=51383432;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:50:51:43:43:22:21:10:40:22:21:11:40 chr14 51446216 . T G 612.03 PASS AO=142;DP=281;FAO=142;FDP=281;FR=.;FRO=139;FSAF=80;FSAR=62;FSRF=54;FSRR=85;FWDB=-0.00612518;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=93.1924;QD=8.71219;RBI=0.0400285;REFB=-0.000956664;REVB=-0.039557;RO=138;SAF=80;SAR=62;SRF=54;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154104;STB=0.585996;TYPE=snp;VARB=0.00102089;OID=.;OPOS=51446216;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:281:281:138:139:142:142:62:80:54:84:62:80:54:85 chr14 51712092 . T C 456.67 PASS AO=112;DP=239;FAO=114;FDP=241;FR=.;FRO=127;FSAF=41;FSAR=73;FSRF=59;FSRR=68;FWDB=-0.00072376;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.357;QD=7.57959;RBI=0.00124637;REFB=-0.00870362;REVB=0.0010147;RO=127;SAF=41;SAR=71;SRF=59;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0989543;STB=0.558051;TYPE=snp;VARB=0.0149628;OID=.;OPOS=51712092;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:239:241:127:127:112:114:71:41:59:68:73:41:59:68 chr14 51716188 . T G 1082.28 PASS AO=127;DP=137;FAO=127;FDP=137;FR=.;FRO=10;FSAF=35;FSAR=92;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0182954;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.97;QD=31.5995;RBI=0.0232281;REFB=-0.170594;REVB=0.0143117;RO=10;SAF=35;SAR=92;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0213198;STB=0.511255;TYPE=snp;VARB=0.00130248;OID=.;OPOS=51716188;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:137:137:10:10:127:127:92:35:4:6:92:35:4:6 chr14 51716467 . G A 953.27 PASS AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0497313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.012;QD=38.5158;RBI=0.0497337;REFB=0;REVB=0.000494823;RO=0;SAF=39;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.47126e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000102268;OID=.;OPOS=51716467;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:99:99:0:0:99:99:60:39:0:0:60:39:0:0 chr14 52182081 . T A 1310.7 PASS AO=136;DP=137;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149743;FXX=0.00724585;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.48;QD=38.2687;RBI=0.0363343;REFB=0;REVB=0.0331052;RO=0;SAF=54;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.86373e-05;OID=.;OPOS=52182081;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:137:137:0:0:136:137:82:54:0:0:83:54:0:0 chr14 52182164 . A G 447.59 PASS AO=113;DP=247;FAO=114;FDP=245;FR=.;FRO=131;FSAF=40;FSAR=74;FSRF=61;FSRR=70;FWDB=0.0473268;FXX=0.0120963;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.177;QD=7.30751;RBI=0.0514977;REFB=-0.00573518;REVB=-0.0203024;RO=131;SAF=40;SAR=73;SRF=61;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113976;STB=0.564746;TYPE=snp;VARB=0.00489908;OID=.;OPOS=52182164;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:247:245:131:131:113:114:73:40:61:70:74:40:61:70 chr14 52186972 . A G 986.35 PASS AO=103;DP=103;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.585;QD=37.9365;RBI=0.0580003;REFB=0;REVB=-0.055865;RO=0;SAF=55;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000124144;OID=.;OPOS=52186972;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:103:104:0:0:103:104:48:55:0:0:48:56:0:0 chr14 52195290 . G A 531.42 PASS AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00442055;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.463;QD=37.9588;RBI=0.0215263;REFB=0;REVB=0.0210675;RO=0;SAF=26;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.29784e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.42521e-05;OID=.;OPOS=52195290;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:56:56:0:0:56:56:30:26:0:0:30:26:0:0 chr14 52195320 . A G 602.65 PASS AO=63;DP=64;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0160936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.012;QD=36.5245;RBI=0.0185412;REFB=-0.0486144;REVB=0.00920727;RO=0;SAF=28;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506847;TYPE=snp;VARB=0.000225108;OID=.;OPOS=52195320;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:64:66:0:1:63:65:35:28:0:0:36:29:0:1 chr14 52418655 . G A 218.3 PASS AO=52;DP=108;FAO=52;FDP=108;FR=.;FRO=56;FSAF=15;FSAR=37;FSRF=13;FSRR=43;FWDB=-0.0384365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.858;QD=8.08529;RBI=0.0385251;REFB=-0.00897961;REVB=-0.00261107;RO=55;SAF=15;SAR=37;SRF=13;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0606754;STB=0.536659;TYPE=snp;VARB=0.00717134;OID=.;OPOS=52418655;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:55:56:52:52:37:15:13:42:37:15:13:43 chr14 52466502 . G A 261.69 PASS AO=72;DP=168;FAO=72;FDP=167;FR=.;FRO=95;FSAF=41;FSAR=31;FSRF=49;FSRR=46;FWDB=-0.0566532;FXX=0.0118336;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.1697;QD=6.26804;RBI=0.0570545;REFB=0.0127944;REVB=0.00675539;RO=95;SAF=41;SAR=31;SRF=49;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0552307;STB=0.530847;TYPE=snp;VARB=-0.025982;OID=.;OPOS=52466502;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:167:95:95:72:72:31:41:49:46:31:41:49:46 chr14 52478315 . A G 215.85 PASS AO=47;DP=92;FAO=48;FDP=92;FR=.;FRO=44;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=14;FSRR=30;FWDB=0.0504078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.262;QD=9.38461;RBI=0.0539599;REFB=-0.00780387;REVB=-0.0192544;RO=45;SAF=19;SAR=28;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0661371;STB=0.549222;TYPE=snp;VARB=0.00719875;OID=.;OPOS=52478315;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:45:44:47:48:28:19:15:30:28:20:14:30 chr14 52481917 . C T 78.06 PASS AO=21;DP=52;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=22;FWDB=0.0185618;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=179.486;QD=6.00462;RBI=0.0186447;REFB=0.00579026;REVB=-0.00175645;RO=31;SAF=12;SAR=9;SRF=9;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.285859;STB=0.662956;TYPE=snp;VARB=-0.00476942;OID=.;OPOS=52481917;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:52:52:31:31:21:21:9:12:9:22:9:12:9:22 chr14 52496387 . C A 2002.83 PASS AO=214;DP=219;FAO=215;FDP=215;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=114;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00203129;FXX=0.0227262;HRUN=4;LEN=1;MLLD=264.194;QD=37.2619;RBI=0.0173649;REFB=0.116349;REVB=0.0172457;RO=4;SAF=101;SAR=113;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000982806;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.21316e-05;OID=.;OPOS=52496387;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:219:215:4:0:214:215:113:101:2:2:114:101:0:0 chr14 52496407 . C T 1923.02 PASS AO=205;DP=206;FAO=204;FDP=204;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00306676;FXX=0.0144921;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.1188;QD=37.7062;RBI=0.0419388;REFB=-0.00609423;REVB=-0.0418265;RO=1;SAF=95;SAR=110;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00498772;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000117849;OID=.;OPOS=52496407;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:206:204:1:0:205:204:110:95:1:0:110:94:0:0 chr14 52508853 . GT G 23.71 PASS AO=30;DP=128;FAO=36;FDP=126;FR=.;FRO=90;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=33;FSRR=57;FWDB=-0.067036;FXX=0.0156238;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.4114;QD=0.752594;RBI=0.0967364;REFB=-0.0500265;REVB=0.0697432;RO=80;SAF=14;SAR=16;SRF=27;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161374;STB=0.504287;TYPE=del;VARB=0.0594879;OID=.;OPOS=52508854;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:30:121:36:126:90:13:23:33:57:23:80:14:16:27:53 chr14 52520368 . C T 1951.03 PASS AO=211;DP=218;FAO=212;FDP=217;FR=.;FRO=5;FSAF=130;FSAR=82;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0408739;FXX=0.009132;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.406;QD=35.9636;RBI=0.0769493;REFB=-0.11094;REVB=0.065196;RO=2;SAF=129;SAR=82;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00732819;STB=0.509433;TYPE=snp;VARB=0.00130439;OID=.;OPOS=52520368;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:218:217:2:5:211:212:82:129:2:0:82:130:5:0 chr14 52520746 . G T 285.32 PASS AO=72;DP=153;FAO=72;FDP=154;FR=.;FRO=82;FSAF=51;FSAR=21;FSRF=55;FSRR=27;FWDB=-0.00102549;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=286.997;QD=7.41089;RBI=0.00442424;REFB=0.00280617;REVB=0.00430375;RO=80;SAF=51;SAR=21;SRF=55;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0236795;STB=0.523742;TYPE=snp;VARB=-0.00286549;OID=.;OPOS=52520746;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:154:80:82:72:72:21:51:55:25:21:51:55:27 chr14 52520853 . A G 1934.28 PASS AO=201;DP=203;FAO=203;FDP=203;FR=.;FRO=0;FSAF=107;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00875731;FXX=0.00490172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.081;QD=38.1138;RBI=0.0159008;REFB=0;REVB=0.013272;RO=0;SAF=105;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00011375;OID=.;OPOS=52520853;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:92:203:203:0:0:201:203:96:105:0:0:96:107:0:0 chr14 52535648 . G T 254.96 PASS AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0584582;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.198;QD=37.7719;RBI=0.0644318;REFB=0;REVB=0.0270942;RO=0;SAF=7;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.41836e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000499598;OID=.;OPOS=52535648;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:27:27:0:0:27:27:20:7:0:0:20:7:0:0 chr14 52536512 . T C 654.82 PASS AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0320964;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.6085;QD=38.5189;RBI=0.0325003;REFB=0;REVB=0.00510765;RO=0;SAF=28;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000302067;OID=.;OPOS=52536512;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:68:68:0:0:68:68:40:28:0:0:40:28:0:0 chr14 52741950 . A G 228.49 PASS AO=66;DP=161;FAO=66;FDP=160;FR=.;FRO=94;FSAF=26;FSAR=40;FSRF=33;FSRR=61;FWDB=0.00272197;FXX=0.00621079;HRUN=6;LEN=1;MLLD=222.353;QD=5.71218;RBI=0.00280334;REFB=-0.00332835;REVB=0.000670507;RO=93;SAF=26;SAR=40;SRF=33;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0431887;STB=0.526667;TYPE=snp;VARB=0.00481735;OID=.;OPOS=52741950;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:160:93:94:66:66:40:26:33:60:40:26:33:61 chr14 52906081 . T G 331.78 PASS AO=81;DP=172;FAO=81;FDP=169;FR=.;FRO=88;FSAF=34;FSAR=47;FSRF=48;FSRR=40;FWDB=-0.0266346;FXX=0.028734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.141;QD=7.85267;RBI=0.0276287;REFB=0.00152596;REVB=-0.00734442;RO=88;SAF=34;SAR=47;SRF=48;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118997;STB=0.56575;TYPE=snp;VARB=-0.00165249;OID=.;OPOS=52906081;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:169:88:88:81:81:47:34:48:40:47:34:48:40 chr14 52907353 . C T 526.29 PASS AO=125;DP=247;FAO=124;FDP=248;FR=.;FRO=124;FSAF=66;FSAR=58;FSRF=60;FSRR=64;FWDB=-0.00435445;FXX=0.0040159;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.187;QD=8.48848;RBI=0.00463994;REFB=-0.0119576;REVB=-0.00160244;RO=121;SAF=67;SAR=58;SRF=58;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0509122;STB=0.524215;TYPE=snp;VARB=0.0100607;OID=.;OPOS=52907353;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:247:248:121:124:125:124:58:67:58:63:58:66:60:64 chr14 53331183 . G A 760.75 PASS AO=174;DP=347;FAO=177;FDP=349;FR=.;FRO=172;FSAF=80;FSAR=97;FSRF=80;FSRR=92;FWDB=0.00861039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.07;QD=8.71924;RBI=0.0158504;REFB=-0.0240178;REVB=0.0133078;RO=170;SAF=80;SAR=94;SRF=79;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00448394;STB=0.506527;TYPE=snp;VARB=0.0229358;OID=.;OPOS=53331183;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:347:349:170:172:174:177:94:80:79:91:97:80:80:92 chr14 53345378 . G A 872.48 PASS AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0225163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.779;QD=37.934;RBI=0.0291357;REFB=0;REVB=0.0184906;RO=0;SAF=40;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.0217e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000149016;OID=.;OPOS=53345378;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:92:92:0:0:92:92:52:40:0:0:52:40:0:0 chr14 53529669 . A T 419.39 PASS AO=95;DP=188;FAO=96;FDP=189;FR=.;FRO=93;FSAF=47;FSAR=49;FSRF=45;FSRR=48;FWDB=0.0199516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.867;QD=8.87606;RBI=0.0208472;REFB=-0.00492316;REVB=0.00604498;RO=92;SAF=45;SAR=50;SRF=45;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0138674;STB=0.502812;TYPE=snp;VARB=0.00447622;OID=.;OPOS=53529669;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:189:92:93:95:96:50:45:45:47:49:47:45:48 chr14 53619544 . G A 48.81 PASS AO=8;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0175605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.468;QD=15.0171;RBI=0.0274862;REFB=-0.0213545;REVB=0.0211452;RO=5;SAF=7;SAR=1;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.428999;STB=0.755986;TYPE=snp;VARB=0.015186;OID=.;OPOS=53619544;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:13:13:5:5:8:8:1:7:2:3:1:7:2:3 chr14 53619681 . C T 10.38 PASS AO=2;DP=6;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.00265744;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.0006;QD=5.93123;RBI=0.0470726;REFB=-0.0407508;REVB=0.0469976;RO=3;SAF=1;SAR=1;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142842;STB=0.71253;TYPE=snp;VARB=0.0543204;OID=.;OPOS=53619681;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:7:3:5:2:2:1:1:1:2:1:1:1:4 chr14 54868224 . AAT A 182.84 PASS AO=79;DP=367;FAO=118;FDP=312;FR=.;FRO=194;FSAF=69;FSAR=49;FSRF=59;FSRR=135;FWDB=-0.0537199;FXX=0.0458702;HRUN=5;LEN=2;MLLD=18.7251;QD=2.34415;RBI=0.12235;REFB=-0.0970484;REVB=-0.109926;RO=165;SAF=38;SAR=41;SRF=54;SRR=111;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183629;STB=0.669311;TYPE=del;VARB=0.0974206;OID=.;OPOS=54868225;OREF=AT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:79:321:118:312:194:69:49:59:135:99:165:38:41:54:111 chr14 54875276 . C A 243.21 PASS AO=54;DP=105;FAO=54;FDP=105;FR=.;FRO=51;FSAF=22;FSAR=32;FSRF=26;FSRR=25;FWDB=-0.00117064;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.4557;QD=9.26528;RBI=0.00136176;REFB=-0.0229683;REVB=-0.000695698;RO=49;SAF=22;SAR=32;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0725286;STB=0.550519;TYPE=snp;VARB=0.0196095;OID=.;OPOS=54875276;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:49:51:54:54:32:22:24:25:32:22:26:25 chr14 54875514 . A G 321.48 PASS AO=60;DP=100;FAO=60;FDP=100;FR=.;FRO=40;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=0.0822849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6634;QD=12.8592;RBI=0.0847075;REFB=-0.0140494;REVB=0.0201137;RO=40;SAF=27;SAR=33;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0185062;STB=0.510077;TYPE=snp;VARB=0.010666;OID=.;OPOS=54875514;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:40:40:60:60:33:27:19:21:33:27:19:21 chr14 55221543 . T C 368.71 PASS AO=83;DP=167;FAO=85;FDP=170;FR=.;FRO=85;FSAF=26;FSAR=59;FSRF=29;FSRR=56;FWDB=0.00816465;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.1551;QD=8.67549;RBI=0.0114968;REFB=-0.0381886;REVB=0.00809415;RO=84;SAF=25;SAR=58;SRF=28;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0342904;STB=0.520444;TYPE=snp;VARB=0.0401197;OID=.;OPOS=55221543;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:170:84:85:83:85:58:25:28:56:59:26:29:56 chr14 55255673 . C T 615.56 PASS AO=137;DP=252;FAO=137;FDP=261;FR=.;FRO=124;FSAF=71;FSAR=66;FSRF=54;FSRR=70;FWDB=0.0150314;FXX=0.00760427;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.729;QD=9.43386;RBI=0.0199921;REFB=-0.0359831;REVB=-0.013181;RO=113;SAF=71;SAR=66;SRF=54;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0335156;STB=0.539255;TYPE=snp;VARB=0.0330957;OID=.;OPOS=55255673;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:252:261:113:124:137:137:66:71:54:59:66:71:54:70 chr14 55308770 . C A 2726.65 PASS AO=290;DP=295;FAO=291;FDP=291;FR=.;FRO=0;FSAF=165;FSAR=126;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.050969;FXX=0.0168913;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.8385;QD=37.4797;RBI=0.0617196;REFB=0.00958095;REVB=-0.0348062;RO=4;SAF=165;SAR=125;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00479102;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.61705e-05;OID=.;OPOS=55308770;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:295:291:4:0:290:291:125:165:3:1:126:165:0:0 chr14 55344901 . C T 137.61 PASS AO=41;DP=110;FAO=43;FDP=110;FR=.;FRO=67;FSAF=33;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=44;FWDB=0.00626394;FXX=0.0178555;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.032;QD=5.00387;RBI=0.00626401;REFB=-0.0135062;REVB=3.07641e-05;RO=69;SAF=32;SAR=9;SRF=24;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.479697;STB=0.760766;TYPE=snp;VARB=0.0222545;OID=.;OPOS=55344901;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:69:67:41:43:9:32:24:45:10:33:23:44 chr14 55511364 . T TTTTTC 371.99 PASS AO=87;DP=363;FAO=122;FDP=302;FR=.;FRO=180;FSAF=60;FSAR=62;FSRF=73;FSRR=107;FWDB=0.0349108;FXX=0.0903587;HRUN=5;LEN=5;MLLD=212.11;QD=4.92704;RBI=0.0362812;REFB=0.00409396;REVB=-0.00987741;RO=239;SAF=41;SAR=46;SRF=110;SRR=129;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0137483;STB=0.551498;TYPE=ins;VARB=-0.00577243;OID=.;OPOS=55511365;OREF=-;OALT=TTTTC;OMAPALT=TTTTTC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:87:363:122:302:180:60:62:73:107:99:239:41:46:110:129 chr14 55512273 . C A 93.37 PASS AO=39;DP=127;FAO=39;FDP=127;FR=.;FRO=88;FSAF=28;FSAR=11;FSRF=37;FSRR=51;FWDB=0.0228414;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7881;QD=2.94091;RBI=0.0259367;REFB=0.0126148;REVB=-0.0122874;RO=86;SAF=28;SAR=11;SRF=36;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.356307;STB=0.708174;TYPE=snp;VARB=-0.0286901;OID=.;OPOS=55512273;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:127:127:86:88:39:39:11:28:36:50:11:28:37:51 chr14 55513848 . G C 350.73 PASS AO=74;DP=137;FAO=74;FDP=136;FR=.;FRO=62;FSAF=26;FSAR=48;FSRF=14;FSRR=48;FWDB=0.000173836;FXX=0.00729874;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.398;QD=10.3157;RBI=0.034851;REFB=-0.0423282;REVB=0.0348506;RO=62;SAF=26;SAR=48;SRF=14;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119722;STB=0.565201;TYPE=snp;VARB=0.0265275;OID=.;OPOS=55513848;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:136:62:62:74:74:48:26:14:48:48:26:14:48 chr14 55604843 . AG A 67.47 PASS AO=37;DP=99;FAO=45;FDP=85;FR=.;FRO=40;FSAF=7;FSAR=38;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=0.0475989;FXX=0.034087;HRUN=5;LEN=1;MLLD=8.70815;QD=3.17498;RBI=0.140442;REFB=-0.0941271;REVB=-0.13213;RO=35;SAF=7;SAR=30;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0.440476;SSSB=-0.347323;STB=0.693331;TYPE=del;VARB=0.0690546;OID=.;OPOS=55604844;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:37:85:45:85:40:7:38:18:22:65:35:7:30:18:17 chr14 55604935 . C A 248.92 PASS AO=54;DP=107;FAO=55;FDP=107;FR=.;FRO=52;FSAF=31;FSAR=24;FSRF=18;FSRR=34;FWDB=0.0137899;FXX=0.0183469;HRUN=3;LEN=1;MLLD=158.299;QD=9.30524;RBI=0.0137899;REFB=-0.0157648;REVB=3.65858e-06;RO=52;SAF=30;SAR=24;SRF=18;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184455;STB=0.604536;TYPE=snp;VARB=0.0188109;OID=.;OPOS=55604935;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:52:52:54:55:24:30:18:34:24:31:18:34 chr14 55605036 . A C 145.87 PASS AO=21;DP=53;FAO=28;FDP=49;FR=.,HEALED;FRO=21;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.0738569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.192;QD=11.9081;RBI=0.0827292;REFB=-0.0458164;REVB=-0.0372731;RO=13;SAF=9;SAR=12;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180237;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0226516;OID=.;OPOS=55605036;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:46:49:13:21:21:28:12:9:9:4:12:16:12:9 chr14 55619311 . A G 106.08 PASS AO=25;DP=57;FAO=26;FDP=58;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=0.0266409;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.178;QD=7.31551;RBI=0.0293453;REFB=-0.00716552;REVB=-0.012305;RO=29;SAF=17;SAR=8;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16507;STB=0.571372;TYPE=snp;VARB=0.0103417;OID=.;OPOS=55619311;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:58:29:32:25:26:8:17:15:14:9:17:17:15 chr14 55817708 . T C 103.11 PASS AO=23;DP=47;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=18;FWDB=-0.0352675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.3821;QD=8.77546;RBI=0.0356825;REFB=-0.0200308;REVB=-0.0054263;RO=24;SAF=8;SAR=15;SRF=6;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101572;STB=0.556915;TYPE=snp;VARB=0.0215446;OID=.;OPOS=55817708;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:24:24:23:23:15:8:6:18:15:8:6:18 chr14 55818403 . T C 543.45 PASS AO=142;DP=310;FAO=142;FDP=310;FR=.;FRO=168;FSAF=65;FSAR=77;FSRF=71;FSRR=97;FWDB=-0.0147403;FXX=0.00641005;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.572;QD=7.01228;RBI=0.0215302;REFB=-0.00131232;REVB=-0.0156931;RO=166;SAF=65;SAR=77;SRF=70;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0355831;STB=0.519233;TYPE=snp;VARB=0.00105615;OID=.;OPOS=55818403;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:310:310:166:168:142:142:77:65:70:96:77:65:71:97 chr14 55818517 . T A 420.03 PASS AO=105;DP=232;FAO=109;FDP=238;FR=.;FRO=129;FSAF=54;FSAR=55;FSRF=51;FSRR=78;FWDB=-0.0568566;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.5416;QD=7.05934;RBI=0.0734961;REFB=-0.0110054;REVB=-0.0465727;RO=127;SAF=50;SAR=55;SRF=49;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0900256;STB=0.554285;TYPE=snp;VARB=0.0111927;OID=.;OPOS=55818517;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:238:127:129:105:109:55:50:49:78:55:54:51:78 chr14 55818706 . T C 403.25 PASS AO=103;DP=220;FAO=103;FDP=222;FR=.;FRO=119;FSAF=51;FSAR=52;FSRF=77;FSRR=42;FWDB=0.00433793;FXX=0.00892817;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.836;QD=7.2658;RBI=0.00801495;REFB=-0.0164304;REVB=-0.00673957;RO=116;SAF=51;SAR=52;SRF=77;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161937;STB=0.581295;TYPE=snp;VARB=0.0180021;OID=.;OPOS=55818706;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:220:222:116:119:103:103:52:51:77:39:52:51:77:42 chr14 55834828 . T TAAA 133.18 PASS AO=40;DP=174;FAO=60;FDP=140;FR=.;FRO=80;FSAF=24;FSAR=36;FSRF=28;FSRR=52;FWDB=-0.00102022;FXX=0.135794;HRUN=3;LEN=3;MLLD=45.1345;QD=3.8052;RBI=0.0162508;REFB=0.0151678;REVB=-0.0162187;RO=92;SAF=17;SAR=23;SRF=29;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137955;STB=0.530111;TYPE=ins;VARB=-0.0183875;OID=.;OPOS=55834829;OREF=-;OALT=AAA;OMAPALT=TAAA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:40:174:60:140:80:24:36:28:52:99:92:17:23:29:63 chr14 55835773 . A AAAT 348.99 PASS AO=85;DP=233;FAO=96;FDP=216;FR=.;FRO=120;FSAF=25;FSAR=71;FSRF=38;FSRR=82;FWDB=0.00912657;FXX=0.0270258;HRUN=4;LEN=3;MLLD=236.186;QD=6.46284;RBI=0.0146185;REFB=-0.00794552;REVB=-0.0114195;RO=137;SAF=22;SAR=63;SRF=49;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130074;STB=0.539037;TYPE=ins;VARB=0.00801029;OID=.;OPOS=55835774;OREF=-;OALT=AAT;OMAPALT=AAAT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:85:233:96:216:120:25:71:38:82:99:137:22:63:49:88 chr14 55907172 . C G 173.3 PASS AO=43;DP=132;FAO=45;FDP=124;FR=.,HEALED;FRO=70;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=26;FSRR=44;FWDB=-0.0466204;FXX=0.00799936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=35.7598;QD=5.59041;RBI=0.0466218;REFB=-0.0703124;REVB=0.000361623;RO=54;SAF=24;SAR=19;SRF=10;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.362562;STB=0.623709;TYPE=snp;VARB=0.0328724;OID=.;OPOS=55907172;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:124:54:70:43:45:19:24:10:44:19:26:26:44 chr14 56958247 . C T 299.31 PASS AO=83;DP=195;FAO=84;FDP=194;FR=.;FRO=110;FSAF=35;FSAR=49;FSRF=61;FSRR=49;FWDB=-0.0145096;FXX=0.0102036;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4663;QD=6.17133;RBI=0.0417274;REFB=0.00438304;REVB=0.0391235;RO=111;SAF=33;SAR=50;SRF=63;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174608;STB=0.578295;TYPE=snp;VARB=-0.00604202;OID=.;OPOS=56958247;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:194:111:110:83:84:50:33:63:48:49:35:61:49 chr14 57072338 . C T 227.29 PASS AO=67;DP=165;FAO=67;FDP=165;FR=.;FRO=98;FSAF=38;FSAR=29;FSRF=37;FSRR=61;FWDB=-0.0194816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.5191;QD=5.50997;RBI=0.0690914;REFB=-0.020616;REVB=-0.0662879;RO=98;SAF=38;SAR=29;SRF=37;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19839;STB=0.611228;TYPE=snp;VARB=0.0164187;OID=.;OPOS=57072338;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:165:98:98:67:67:29:38:37:61:29:38:37:61 chr14 57099859 . G A 1670.53 PASS AO=162;DP=164;FAO=181;FDP=181;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=108;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0228914;FXX=0.0109284;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.4773;QD=36.9179;RBI=0.0304851;REFB=-0.0157067;REVB=0.0201327;RO=0;SAF=66;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.21332e-05;OID=.;OPOS=57099859;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:164:181:0:0:162:181:96:66:0:0:108:73:0:0 chr14 57101682 . A G 378.68 PASS AO=111;DP=267;FAO=111;FDP=268;FR=.;FRO=157;FSAF=56;FSAR=55;FSRF=73;FSRR=84;FWDB=-0.0120332;FXX=0.00371733;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.2985;QD=5.65188;RBI=0.049654;REFB=-0.00611387;REVB=-0.0481739;RO=154;SAF=56;SAR=55;SRF=72;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0385018;STB=0.523149;TYPE=snp;VARB=0.00795918;OID=.;OPOS=57101682;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:267:268:154:157:111:111:55:56:72:82:55:56:73:84 chr14 57115622 . C G 382.94 PASS AO=81;DP=149;FAO=81;FDP=150;FR=.;FRO=69;FSAF=34;FSAR=47;FSRF=30;FSRR=39;FWDB=-0.019632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.5494;QD=10.2117;RBI=0.0365061;REFB=-0.00673851;REVB=-0.0307778;RO=68;SAF=34;SAR=47;SRF=30;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0182884;STB=0.507078;TYPE=snp;VARB=0.00942288;OID=.;OPOS=57115622;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:150:68:69:81:81:47:34:30:38:47:34:30:39 chr14 57755564 . G A 80.87 PASS AO=29;DP=87;FAO=29;FDP=87;FR=.;FRO=58;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=32;FWDB=0.0309576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8927;QD=3.71805;RBI=0.0921259;REFB=-0.0172073;REVB=-0.0867687;RO=53;SAF=16;SAR=13;SRF=26;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0685202;STB=0.568673;TYPE=snp;VARB=0.0563339;OID=.;OPOS=57755564;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:87:87:53:58:29:29:13:16:26:27:13:16:26:32 chr14 57866623 . A G 1429.45 PASS AO=154;DP=158;FAO=154;FDP=157;FR=.;FRO=3;FSAF=40;FSAR=114;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.00258582;FXX=0.00632871;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.435;QD=36.419;RBI=0.0205372;REFB=0.00485538;REVB=-0.0203737;RO=3;SAF=40;SAR=114;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0123531;STB=0.506493;TYPE=snp;VARB=-0.000157922;OID=.;OPOS=57866623;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:158:157:3:3:154:154:114:40:0:3:114:40:0:3 chr14 57876265 . G A 3178.18 PASS AO=330;DP=330;FAO=330;FDP=330;FR=.;FRO=0;FSAF=193;FSAR=137;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000975476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.9575;QD=38.5234;RBI=0.0185859;REFB=0;REVB=-0.0185603;RO=0;SAF=193;SAR=137;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.43201e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.77827e-05;OID=.;OPOS=57876265;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:330:330:0:0:330:330:137:193:0:0:137:193:0:0 chr14 57876575 . T C 1754.73 PASS AO=198;DP=216;FAO=206;FDP=221;FR=.;FRO=15;FSAF=122;FSAR=84;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=-0.0126417;FXX=0.0045043;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.2262;QD=31.7598;RBI=0.0456681;REFB=-0.0486521;REVB=0.0438835;RO=6;SAF=119;SAR=79;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0234039;STB=0.52728;TYPE=snp;VARB=0.0134747;OID=.;OPOS=57876575;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:216:221:6:15:198:206:79:119:6:0:84:122:3:12 chr14 57938124 . C T 926.85 PASS AO=96;DP=99;FAO=98;FDP=99;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0370707;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2064;QD=37.4483;RBI=0.0458821;REFB=-0.0821323;REVB=-0.0270357;RO=3;SAF=49;SAR=47;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00897906;STB=0.505262;TYPE=snp;VARB=0.000539293;OID=.;OPOS=57938124;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:99:99:3:1:96:98:47:49:2:1:47:51:0:1 chr14 57938260 . T C 845.44 PASS AO=92;DP=95;FAO=94;FDP=96;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=60;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0369786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.0629;QD=35.2268;RBI=0.0369837;REFB=-0.192025;REVB=0.000612893;RO=0;SAF=33;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.36474e-08;STB=0.503114;TYPE=snp;VARB=0.00421807;OID=.;OPOS=57938260;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:95:96:0:2:92:94:59:33:0:0:60:34:1:1 chr14 57945689 . G A 1145.74 PASS AO=119;DP=119;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0390898;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.326;QD=38.5123;RBI=0.0409341;REFB=0;REVB=-0.0121486;RO=0;SAF=77;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.23797e-05;OID=.;OPOS=57945689;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:119:119:0:0:119:119:42:77:0:0:42:77:0:0 chr14 57948380 . T C 1284.33 PASS AO=104;DP=135;FAO=134;FDP=134;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=18;FSAR=116;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0508013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.798;QD=38.3382;RBI=0.0870693;REFB=0;REVB=0.0707128;RO=0;SAF=17;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000305681;OID=.;OPOS=57948380;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:133:134:0:0:104:134:87:17:0:0:116:18:0:0 chr14 57957664 . T A 3408.01 PASS AO=359;DP=361;FAO=359;FDP=359;FR=.;FRO=0;FSAF=185;FSAR=174;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00395465;FXX=0.00554001;HRUN=4;LEN=1;MLLD=292.909;QD=37.9723;RBI=0.0101898;REFB=0.0043874;REVB=-0.00939108;RO=2;SAF=185;SAR=174;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000162087;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.81678e-06;OID=.;OPOS=57957664;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:361:359:2:0:359:359:174:185:1:1:174:185:0:0 chr14 58563694 . G C 216.25 PASS AO=40;DP=66;FAO=40;FDP=66;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=34;FSRF=2;FSRR=24;FWDB=-0.0302708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.514;QD=13.1061;RBI=0.0353255;REFB=-0.0309551;REVB=0.0182091;RO=26;SAF=6;SAR=34;SRF=2;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112845;STB=0.561262;TYPE=snp;VARB=0.0164036;OID=.;OPOS=58563694;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:66:66:26:26:40:40:34:6:2:24:34:6:2:24 chr14 58599944 . C A 305.65 PASS AO=96;DP=246;FAO=96;FDP=244;FR=.;FRO=148;FSAF=57;FSAR=39;FSRF=84;FSRR=64;FWDB=-0.00400092;FXX=0.00812975;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.281;QD=5.01067;RBI=0.0161582;REFB=0.000801832;REVB=0.015655;RO=146;SAF=57;SAR=39;SRF=83;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0279422;STB=0.516355;TYPE=snp;VARB=-0.00162933;OID=.;OPOS=58599944;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:246:244:146:148:96:96:39:57:83:63:39:57:84:64 chr14 58706609 . C T 662.6 PASS AO=191;DP=437;FAO=179;FDP=400;FR=.;FRO=221;FSAF=89;FSAR=90;FSRF=123;FSRR=98;FWDB=0.00108985;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=199.11;QD=6.62604;RBI=0.0114071;REFB=0.00397515;REVB=-0.011355;RO=246;SAF=97;SAR=94;SRF=136;SRR=110;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0457674;STB=0.532779;TYPE=snp;VARB=-0.00429437;OID=.;OPOS=58706609;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:437:400:246:221:191:179:94:97:136:110:90:89:123:98 chr14 58766617 . A G 231.58 PASS AO=60;DP=132;FAO=60;FDP=132;FR=.;FRO=72;FSAF=18;FSAR=42;FSRF=33;FSRR=39;FWDB=0.0557697;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.8869;QD=7.01751;RBI=0.0565442;REFB=-0.00487402;REVB=-0.00932668;RO=72;SAF=18;SAR=42;SRF=33;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169872;STB=0.594967;TYPE=snp;VARB=0.0061308;OID=.;OPOS=58766617;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:72:72:60:60:42:18:33:39:42:18:33:39 chr14 58831142 . A G 171.09 PASS AO=42;DP=93;FAO=43;FDP=92;FR=.;FRO=49;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=15;FSRR=34;FWDB=0.00111681;FXX=0.0107515;HRUN=6;LEN=1;MLLD=249.047;QD=7.43886;RBI=0.0150892;REFB=-0.00361395;REVB=-0.0150478;RO=49;SAF=19;SAR=23;SRF=15;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145012;STB=0.574524;TYPE=snp;VARB=0.0047776;OID=.;OPOS=58831142;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:92:49:49:42:43:23:19:15:34:24:19:15:34 chr14 58838668 . A G 154.04 PASS AO=46;DP=117;FAO=46;FDP=116;FR=.;FRO=70;FSAF=11;FSAR=35;FSRF=25;FSRR=45;FWDB=0.0109491;FXX=0.0169477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.723;QD=5.31181;RBI=0.0221807;REFB=-0.00837991;REVB=-0.0192898;RO=70;SAF=11;SAR=35;SRF=25;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155596;STB=0.588744;TYPE=snp;VARB=0.0163371;OID=.;OPOS=58838668;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:116:70:70:46:46:35:11:25:45:35:11:25:45 chr14 58838701 . C T 123.8 PASS AO=35;DP=90;FAO=36;FDP=91;FR=.;FRO=55;FSAF=9;FSAR=27;FSRF=22;FSRR=33;FWDB=0.0243925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.102;QD=5.44193;RBI=0.0248297;REFB=-0.0145274;REVB=0.00463889;RO=55;SAF=8;SAR=27;SRF=22;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222067;STB=0.607779;TYPE=snp;VARB=0.0245477;OID=.;OPOS=58838701;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:91:55:55:35:36:27:8:22:33:27:9:22:33 chr14 58839339 . A C 1716.54 PASS AO=183;DP=185;FAO=183;FDP=183;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0111367;FXX=0.0108102;HRUN=4;LEN=1;MLLD=194.901;QD=37.5199;RBI=0.0117452;REFB=0.00690501;REVB=-0.00373131;RO=2;SAF=83;SAR=100;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00942622;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.82965e-06;OID=.;OPOS=58839339;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:185:183:2:0:183:183:100:83:0:2:100:83:0:0 chr14 58874079 . GC G 1340.33 PASS AO=171;DP=220;FAO=219;FDP=219;FR=.;FRO=0;FSAF=118;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.186272;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.9916;QD=24.4809;RBI=0.22749;REFB=-0.00618223;REVB=-0.130594;RO=11;SAF=90;SAR=81;SRF=10;SRR=1;SSEN=0.204724;SSEP=0;SSSB=-0.044174;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00130278;OID=.;OPOS=58874080;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:171:218:219:219:0:118:101:0:0:99:11:90:81:10:1 chr14 58895121 . T C 731.21 PASS AO=179;DP=367;FAO=179;FDP=369;FR=.;FRO=190;FSAF=50;FSAR=129;FSRF=74;FSRR=116;FWDB=0.0102783;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.295;QD=7.92641;RBI=0.0308042;REFB=-0.0140011;REVB=0.0290388;RO=187;SAF=50;SAR=129;SRF=74;SRR=113;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125844;STB=0.566303;TYPE=snp;VARB=0.0152204;OID=.;OPOS=58895121;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:367:369:187:190:179:179:129:50:74:113:129:50:74:116 chr14 58917454 . G A 2087.01 PASS AO=209;DP=211;FAO=219;FDP=219;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=188;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.695;QD=38.1188;RBI=0.0195962;REFB=0;REVB=0.0149261;RO=0;SAF=31;SAR=178;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.83733e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.80864e-05;OID=.;OPOS=58917454;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:96:211:219:0:0:209:219:178:31:0:0:188:31:0:0 chr14 58937416 . T C 1608.33 PASS AO=170;DP=171;FAO=171;FDP=171;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=108;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0640434;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8132;QD=37.6219;RBI=0.0686124;REFB=-0.0498087;REVB=-0.0246193;RO=1;SAF=62;SAR=108;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00761441;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000767207;OID=.;OPOS=58937416;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:171:171:1:0:170:171:108:62:1:0:108:63:0:0 chr14 58953746 . C G 1639.98 PASS AO=177;DP=178;FAO=177;FDP=177;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0225788;FXX=0.0111726;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.6239;QD=37.0617;RBI=0.0841355;REFB=-0.064041;REVB=-0.0810493;RO=1;SAF=93;SAR=84;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00509144;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000292456;OID=.;OPOS=58953746;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:178:177:1:0:177:177:84:93:1:0:83:94:0:0 chr14 59112475 . C T 251.57 PASS AO=63;DP=140;FAO=66;FDP=147;FR=.;FRO=81;FSAF=48;FSAR=18;FSRF=58;FSRR=23;FWDB=0.014141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.2184;QD=6.84538;RBI=0.0205606;REFB=-0.00212543;REVB=-0.0149255;RO=76;SAF=48;SAR=15;SRF=57;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.015951;STB=0.507738;TYPE=snp;VARB=0.00265277;OID=.;OPOS=59112475;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:147:76:81:63:66:15:48:57:19:18:48:58:23 chr14 59113430 . G A 147.82 PASS AO=32;DP=61;FAO=32;FDP=62;FR=.;FRO=30;FSAF=26;FSAR=6;FSRF=22;FSRR=8;FWDB=0.0159558;FXX=0.0158705;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.83;QD=9.53696;RBI=0.0195504;REFB=-0.0266437;REVB=0.0112974;RO=29;SAF=26;SAR=6;SRF=22;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0715157;STB=0.558243;TYPE=snp;VARB=0.0279993;OID=.;OPOS=59113430;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:62:29:30:32:32:6:26:22:7:6:26:22:8 chr14 59114770 . C G 706.75 PASS AO=163;DP=321;FAO=163;FDP=320;FR=.;FRO=157;FSAF=94;FSAR=69;FSRF=63;FSRR=94;FWDB=0.0175456;FXX=0.00311517;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.536;QD=8.8344;RBI=0.0538527;REFB=-0.0157227;REVB=-0.0509143;RO=156;SAF=94;SAR=69;SRF=63;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154188;STB=0.585805;TYPE=snp;VARB=0.0131435;OID=.;OPOS=59114770;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:321:320:156:157:163:163:69:94:63:93:69:94:63:94 chr14 59789892 . G T 287.32 PASS AO=61;DP=114;FAO=62;FDP=115;FR=.;FRO=53;FSAF=21;FSAR=41;FSRF=25;FSRR=28;FWDB=-0.00932041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.387;QD=9.99371;RBI=0.00937119;REFB=-0.0191521;REVB=0.000974301;RO=53;SAF=20;SAR=41;SRF=25;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130927;STB=0.565496;TYPE=snp;VARB=0.0143594;OID=.;OPOS=59789892;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:115:53:53:61:62:41:20:25:28:41:21:25:28 chr14 59797235 . A G 517.63 PASS AO=61;DP=69;FAO=63;FDP=69;FR=.;FRO=6;FSAF=37;FSAR=26;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0318813;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.983;QD=30.0074;RBI=0.0470993;REFB=-0.0958221;REVB=-0.0346689;RO=4;SAF=35;SAR=26;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0209587;STB=0.522592;TYPE=snp;VARB=0.00497401;OID=.;OPOS=59797235;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:69:69:4:6:61:63:26:35:3:1:26:37:2:4 chr14 59797373 . G A 187.19 PASS AO=30;DP=43;FAO=30;FDP=43;FR=.;FRO=13;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.00901877;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.196;QD=17.4126;RBI=0.00981364;REFB=-0.0377631;REVB=0.00386903;RO=13;SAF=15;SAR=15;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106644;STB=0.558101;TYPE=snp;VARB=0.0165441;OID=.;OPOS=59797373;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:43:43:13:13:30:30:15:15:4:9:15:15:4:9 chr14 59835968 . C A 94.4 PASS AO=22;DP=58;FAO=25;FDP=61;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=0.00286976;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.138;QD=6.19029;RBI=0.00494548;REFB=-0.0075514;REVB=-0.00402768;RO=36;SAF=6;SAR=16;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175356;STB=0.545152;TYPE=snp;VARB=0.00601314;OID=.;OPOS=59835968;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:58:61:36:36:22:25:16:6:15:21:17:8:14:22 chr14 59835972 . A C 117.01 PASS AO=28;DP=61;FAO=28;FDP=61;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=0.00768355;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=191.449;QD=7.67249;RBI=0.00770385;REFB=-0.00291551;REVB=-0.000558861;RO=33;SAF=10;SAR=18;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0379273;STB=0.521395;TYPE=snp;VARB=0.00807454;OID=.;OPOS=59835972;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:33:33:28:28:18:10:13:20:18:10:13:20 chr14 59931086 . G A 89.69 PASS AO=14;DP=21;FAO=14;FDP=21;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0128753;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9053;QD=17.083;RBI=0.0286244;REFB=-0.00927639;REVB=0.0255653;RO=7;SAF=4;SAR=10;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00594292;OID=.;OPOS=59931086;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:21:21:7:7:14:14:10:4:2:5:10:4:2:5 chr14 59939727 . T C 516.17 PASS AO=115;DP=224;FAO=117;FDP=225;FR=.;FRO=108;FSAF=54;FSAR=63;FSRF=55;FSRR=53;FWDB=-0.0056172;FXX=0.00442458;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.575;QD=9.17626;RBI=0.0102105;REFB=-0.019492;REVB=0.00852654;RO=108;SAF=53;SAR=62;SRF=54;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0347103;STB=0.522957;TYPE=snp;VARB=0.0181151;OID=.;OPOS=59939727;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:224:225:108:108:115:117:62:53:54:54:63:54:55:53 chr14 59939804 . G A 366.99 PASS AO=79;DP=148;FAO=79;FDP=148;FR=.;FRO=69;FSAF=28;FSAR=51;FSRF=35;FSRR=34;FWDB=-0.0113499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7344;QD=9.91866;RBI=0.0128654;REFB=0.00585931;REVB=0.00605781;RO=69;SAF=28;SAR=51;SRF=35;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135692;STB=0.574449;TYPE=snp;VARB=-0.00368563;OID=.;OPOS=59939804;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:69:69:79:79:51:28:35:34:51:28:35:34 chr14 59950417 . T G 118.91 PASS AO=29;DP=70;FAO=34;FDP=80;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=-0.0244817;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=31.8097;QD=5.94547;RBI=0.0291952;REFB=-0.0618479;REVB=0.0159062;RO=41;SAF=18;SAR=11;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16402;STB=0.512493;TYPE=snp;VARB=0.0878035;OID=.;OPOS=59950417;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:80:41:46:29:34:11:18:19:22:17:17:24:22 chr14 59971334 . T C 130.93 PASS AO=34;DP=82;FAO=35;FDP=82;FR=.;FRO=47;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=28;FSRR=19;FWDB=-0.0560091;FXX=0.0238067;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.8024;QD=6.38664;RBI=0.0665984;REFB=-0.0118964;REVB=0.0360324;RO=45;SAF=15;SAR=19;SRF=27;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159234;STB=0.595102;TYPE=snp;VARB=0.0105655;OID=.;OPOS=59971334;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:45:47:34:35:19:15:27:18:20:15:28:19 chr14 59977232 . T C 945.17 PASS AO=207;DP=385;FAO=207;FDP=387;FR=.;FRO=180;FSAF=136;FSAR=71;FSRF=84;FSRR=96;FWDB=-0.00976027;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.432;QD=9.7692;RBI=0.00990298;REFB=-0.0175221;REVB=-0.00167515;RO=176;SAF=136;SAR=71;SRF=82;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168398;STB=0.592498;TYPE=snp;VARB=0.0125653;OID=.;OPOS=59977232;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:385:387:176:180:207:207:71:136:82:94:71:136:84:96 chr14 60004844 . C T 162.28 PASS AO=33;DP=61;FAO=33;FDP=61;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=8;FSRR=20;FWDB=-0.0833259;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0095;QD=10.641;RBI=0.0862858;REFB=-0.0102313;REVB=-0.0224062;RO=28;SAF=14;SAR=19;SRF=8;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120236;STB=0.566351;TYPE=snp;VARB=0.00613613;OID=.;OPOS=60004844;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:28:28:33:33:19:14:8:20:19:14:8:20 chr14 60011922 . C T 183.47 PASS AO=67;DP=164;FAO=61;FDP=164;FR=.;FRO=103;FSAF=34;FSAR=27;FSRF=55;FSRR=48;FWDB=-0.0350822;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.2544;QD=4.47477;RBI=0.03878;REFB=0.0259952;REVB=0.0165266;RO=92;SAF=40;SAR=27;SRF=45;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112875;STB=0.514835;TYPE=snp;VARB=-0.00237689;OID=.;OPOS=60011922;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:164:92:103:67:61:27:40:45:47:27:34:55:48 chr14 60027907 . C T 287.94 PASS AO=81;DP=200;FAO=83;FDP=200;FR=.;FRO=117;FSAF=43;FSAR=40;FSRF=60;FSRR=57;FWDB=0.0101022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.149;QD=5.75885;RBI=0.0184496;REFB=-0.00596244;REVB=-0.015438;RO=117;SAF=41;SAR=40;SRF=60;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00700883;STB=0.503075;TYPE=snp;VARB=0.00741842;OID=.;OPOS=60027907;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:200:200:117:117:81:83:40:41:60:57:40:43:60:57 chr14 60031996 . G A 596.51 PASS AO=132;DP=238;FAO=132;FDP=251;FR=.;FRO=119;FSAF=55;FSAR=77;FSRF=67;FSRR=52;FWDB=-0.00634085;FXX=0.0118106;HRUN=3;LEN=1;MLLD=230.292;QD=9.50614;RBI=0.00646188;REFB=-0.00543191;REVB=-0.00124483;RO=104;SAF=55;SAR=77;SRF=62;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145657;STB=0.569703;TYPE=snp;VARB=0.00432859;OID=.;OPOS=60031996;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:238:251:104:119:132:132:77:55:62:42:77:55:67:52 chr14 60043422 . A G 517.76 PASS AO=53;DP=53;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0445752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.531;QD=37.6556;RBI=0.0446524;REFB=0;REVB=0.00262438;RO=0;SAF=18;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.94137e-05;OID=.;OPOS=60043422;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:53:55:0:0:53:55:35:18:0:0:35:20:0:0 chr14 60063472 . A G 1961.76 PASS AO=209;DP=213;FAO=209;FDP=209;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=141;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0877246;FXX=0.0233634;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.3236;QD=37.5457;RBI=0.0911742;REFB=-0.109016;REVB=0.0248419;RO=2;SAF=68;SAR=141;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0138019;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000789138;OID=.;OPOS=60063472;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:213:209:2:0:209:209:141:68:2:0:141:68:0:0 chr14 60070631 . G A 433.62 PASS AO=113;DP=248;FAO=113;FDP=247;FR=.;FRO=134;FSAF=51;FSAR=62;FSRF=49;FSRR=85;FWDB=-0.0240321;FXX=0.0040321;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.867;QD=7.0221;RBI=0.0661838;REFB=-0.0156472;REVB=0.0616665;RO=134;SAF=51;SAR=62;SRF=49;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.085718;STB=0.547338;TYPE=snp;VARB=0.0215979;OID=.;OPOS=60070631;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:248:247:134:134:113:113:62:51:49:85:62:51:49:85 chr14 60574539 . A G 1632.93 PASS AO=168;DP=171;FAO=174;FDP=174;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000557934;FXX=0.011363;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.9238;QD=37.5387;RBI=0.00950532;REFB=0;REVB=0.00948893;RO=2;SAF=82;SAR=86;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011465;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.34692e-05;OID=.;OPOS=60574539;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:171:174:2:0:168:174:86:82:2:0:89:85:0:0 chr14 60575240 . T C 950.54 PASS AO=111;DP=120;FAO=111;FDP=120;FR=.;FRO=9;FSAF=58;FSAR=53;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=-0.00818738;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.43;QD=31.6845;RBI=0.0320732;REFB=0.000920617;REVB=0.0310106;RO=9;SAF=58;SAR=53;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0363843;STB=0.519213;TYPE=snp;VARB=-0.000429575;OID=.;OPOS=60575240;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:120:120:9:9:111:111:53:58:7:2:53:58:7:2 chr14 60575512 . G A 58.79 PASS AO=24;DP=80;FAO=24;FDP=81;FR=.;FRO=57;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=41;FWDB=0.00840449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.843;QD=2.90324;RBI=0.0231657;REFB=0.000166221;REVB=0.0215874;RO=56;SAF=6;SAR=18;SRF=17;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.079852;STB=0.527976;TYPE=snp;VARB=-0.000150108;OID=.;OPOS=60575512;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:80:81:56:57:24:24:18:6:17:39:18:6:16:41 chr14 60575869 . A G 2217.8 PASS AO=236;DP=241;FAO=241;FDP=245;FR=.;FRO=4;FSAF=102;FSAR=139;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.0323295;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.369;QD=36.2089;RBI=0.0332277;REFB=-0.02983;REVB=0.00767334;RO=5;SAF=102;SAR=134;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.017447;STB=0.507092;TYPE=snp;VARB=0.000380315;OID=.;OPOS=60575869;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:241:245:5:4:236:241:134:102:0:5:139:102:0:4 chr14 60576241 . G C 375.71 PASS AO=36;DP=36;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.257;QD=38.5341;RBI=0.0195951;REFB=0;REVB=0.00866004;RO=0;SAF=18;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.76894e-05;OID=.;OPOS=60576241;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:36:39:0:0:36:39:18:18:0:0:18:21:0:0 chr14 60576308 . G A 119.76 PASS AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0402378;FXX=0.0713776;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.537;QD=36.8487;RBI=0.0403653;REFB=0;REVB=-0.00320672;RO=0;SAF=1;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.00075e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000919314;OID=.;OPOS=60576308;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:13:0:0:13:13:12:1:0:0:12:1:0:0 chr14 60576637 . A T 2024.95 PASS AO=209;DP=210;FAO=210;FDP=210;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=122;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243413;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=273.684;QD=38.5705;RBI=0.0299795;REFB=0;REVB=0.0175006;RO=0;SAF=88;SAR=121;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97716e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.38662e-05;OID=.;OPOS=60576637;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:210:210:0:0:209:210:121:88:0:0:122:88:0:0 chr14 60576951 . A G 1474.94 PASS AO=155;DP=155;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000244678;FXX=0.0064512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.445;QD=38.3102;RBI=0.0149106;REFB=0;REVB=0.0149086;RO=0;SAF=62;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.11838e-05;OID=.;OPOS=60576951;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:155:154:0:0:155:154:93:62:0:0:92:62:0:0 chr14 60581863 . G A 1450.22 PASS AO=168;DP=180;FAO=168;FDP=179;FR=.;FRO=11;FSAF=72;FSAR=96;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=-0.00705361;FXX=0.0110491;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.577;QD=32.4073;RBI=0.0212351;REFB=0.00311088;REVB=0.0200294;RO=11;SAF=72;SAR=96;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0460765;STB=0.524269;TYPE=snp;VARB=-0.000834889;OID=.;OPOS=60581863;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:180:179:11:11:168:168:96:72:9:2:96:72:9:2 chr14 60581935 . C T 1671.95 PASS AO=175;DP=175;FAO=174;FDP=174;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174969;FXX=0.0169482;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.425;QD=38.4356;RBI=0.0174999;REFB=0;REVB=-0.000328614;RO=0;SAF=84;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.20133e-05;OID=.;OPOS=60581935;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:175:174:0:0:175:174:91:84:0:0:89:85:0:0 chr14 60582053 . G A 901.96 PASS AO=94;DP=99;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0379313;FXX=0.049995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.906;QD=37.9772;RBI=0.0396071;REFB=-0.0744685;REVB=0.011399;RO=1;SAF=29;SAR=65;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00723976;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000130588;OID=.;OPOS=60582053;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:99:95:1:0:94:95:65:29:0:1:65:30:0:0 chr14 60923783 . C T 1363.17 PASS AO=141;DP=141;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0359327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.6646;QD=38.1305;RBI=0.036387;REFB=0;REVB=-0.00573217;RO=0;SAF=31;SAR=110;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.17748e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.24436e-05;OID=.;OPOS=60923783;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:141:143:0:0:141:143:110:31:0:0:110:33:0:0 chr14 60976537 . C A 1521.23 PASS AO=157;DP=158;FAO=158;FDP=158;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0340909;FXX=0.00628891;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.434;QD=38.5123;RBI=0.0434718;REFB=0;REVB=0.0269742;RO=0;SAF=71;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.45549e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.00858e-05;OID=.;OPOS=60976537;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:158:158:0:0:157:158:86:71:0:0:86:72:0:0 chr14 61013237 . G T 1365.2 PASS AO=134;DP=134;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0509745;FXX=0.0135126;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.071;QD=37.4028;RBI=0.0511226;REFB=0;REVB=0.0038893;RO=0;SAF=34;SAR=100;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.09527e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00156693;OID=.;OPOS=61013237;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:134:146:0:0:134:146:100:34:0:0:104:42:0:0 chr14 61124940 . A G 1674.42 PASS AO=175;DP=175;FAO=175;FDP=175;FR=.;FRO=0;FSAF=108;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000221104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.266;QD=38.2724;RBI=0.0331987;REFB=0;REVB=-0.033198;RO=0;SAF=108;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.08884e-05;OID=.;OPOS=61124940;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:175:175:0:0:175:175:67:108:0:0:67:108:0:0 chr14 61176485 . T C 1057.18 PASS AO=111;DP=112;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0320193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.995;QD=37.7564;RBI=0.0350434;REFB=0;REVB=0.0142411;RO=0;SAF=51;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.42743e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000118569;OID=.;OPOS=61176485;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:112:112:0:0:111:112:60:51:0:0:60:52:0:0 chr14 61180657 . T G 332.82 PASS AO=93;DP=215;FAO=93;FDP=216;FR=.;FRO=123;FSAF=63;FSAR=30;FSRF=65;FSRR=58;FWDB=0.0143177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.849;QD=6.16333;RBI=0.0250732;REFB=-0.0119831;REVB=-0.0205832;RO=119;SAF=63;SAR=30;SRF=61;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176396;STB=0.590773;TYPE=snp;VARB=0.0178207;OID=.;OPOS=61180657;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:216:119:123:93:93:30:63:61:58:30:63:65:58 chr14 61445967 . A G 1048.31 PASS AO=111;DP=111;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156393;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.946;QD=38.1204;RBI=0.0544892;REFB=0;REVB=0.0521966;RO=0;SAF=53;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.26986e-05;OID=.;OPOS=61445967;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:111:110:0:0:111:110:58:53:0:0:57:53:0:0 chr14 61449328 . T A 2080.78 PASS AO=238;DP=253;FAO=238;FDP=251;FR=.;FRO=13;FSAF=69;FSAR=169;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.00383829;FXX=0.00790483;HRUN=4;LEN=1;MLLD=239.332;QD=33.1599;RBI=0.0128569;REFB=-0.134851;REVB=0.0122706;RO=9;SAF=69;SAR=169;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00571723;STB=0.505926;TYPE=snp;VARB=0.000678484;OID=.;OPOS=61449328;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:253:251:9:13:238:238:169:69:2:7:169:69:5:8 chr14 61509924 . T C 831.56 PASS AO=91;DP=93;FAO=91;FDP=93;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0141321;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.707;QD=35.7659;RBI=0.0348486;REFB=-0.0289536;REVB=0.0318545;RO=2;SAF=31;SAR=60;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.015538;STB=0.508195;TYPE=snp;VARB=0.000622831;OID=.;OPOS=61509924;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:93:93:2:2:91:91:60:31:0:2:60:31:0:2 chr14 61748487 . C G 562.16 PASS AO=140;DP=301;FAO=142;FDP=300;FR=.;FRO=158;FSAF=74;FSAR=68;FSRF=87;FSRR=71;FWDB=-0.0395176;FXX=0.0066223;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.5699;QD=7.49551;RBI=0.0452102;REFB=-0.00871063;REVB=-0.021962;RO=151;SAF=72;SAR=68;SRF=84;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0397113;STB=0.515586;TYPE=snp;VARB=0.00954954;OID=.;OPOS=61748487;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:301:300:151:158:140:142:68:72:84:67:68:74:87:71 chr14 61748544 . A G 545.14 PASS AO=135;DP=282;FAO=135;FDP=282;FR=.;FRO=147;FSAF=68;FSAR=67;FSRF=79;FSRR=68;FWDB=0.0123561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.526;QD=7.73254;RBI=0.0213319;REFB=-0.0119333;REVB=-0.017389;RO=147;SAF=68;SAR=67;SRF=79;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0319352;STB=0.517576;TYPE=snp;VARB=0.0113707;OID=.;OPOS=61748544;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:282:282:147:147:135:135:67:68:79:68:67:68:79:68 chr14 61997226 . C T 2471.87 PASS AO=257;DP=260;FAO=258;FDP=258;FR=.;FRO=0;FSAF=147;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0377787;FXX=0.0152666;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.9801;QD=38.3236;RBI=0.0495473;REFB=0;REVB=-0.0320579;RO=0;SAF=146;SAR=111;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.23686e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000277607;OID=.;OPOS=61997226;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:260:258:0:0:257:258:111:146:0:0:111:147:0:0 chr14 62213848 . T C 1754.3 PASS AO=186;DP=189;FAO=186;FDP=186;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=123;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00845285;FXX=0.0158722;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.577;QD=37.7268;RBI=0.0188239;REFB=0.0265489;REVB=0.0168193;RO=1;SAF=63;SAR=123;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00749753;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.46932e-06;OID=.;OPOS=62213848;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:189:186:1:0:186:186:123:63:1:0:123:63:0:0 chr14 62462766 . T C 1020.61 PASS AO=107;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216862;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.408;QD=37.8005;RBI=0.0270263;REFB=0;REVB=-0.0161286;RO=1;SAF=12;SAR=95;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00497085;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.91618e-05;OID=.;OPOS=62462766;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:108:108:1:0:107:108:95:12:0:1:96:12:0:0 chr14 62463129 . G T 516.58 PASS AO=88;DP=139;FAO=92;FDP=143;FR=.;FRO=51;FSAF=27;FSAR=65;FSRF=15;FSRR=36;FWDB=0.00286318;FXX=0.00694396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.227;QD=14.4499;RBI=0.0104983;REFB=-0.0326529;REVB=0.0101003;RO=49;SAF=26;SAR=62;SRF=15;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00845175;STB=0.500275;TYPE=snp;VARB=0.0190371;OID=.;OPOS=62463129;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:143:49:51:88:92:62:26:15:34:65:27:15:36 chr14 62463214 . C T 435.46 PASS AO=49;DP=51;FAO=49;FDP=51;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=32;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0398355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.442;QD=34.1539;RBI=0.0403211;REFB=-0.160807;REVB=-0.00623856;RO=1;SAF=17;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0268741;STB=0.527766;TYPE=snp;VARB=0.00171631;OID=.;OPOS=62463214;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:51:51:1:2:49:49:32:17:1:0:32:17:2:0 chr14 63174616 . T C 2122.01 PASS AO=226;DP=228;FAO=226;FDP=226;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=145;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164883;FXX=0.0130999;HRUN=5;LEN=1;MLLD=49.3155;QD=37.5578;RBI=0.125648;REFB=0.0456873;REVB=-0.124562;RO=1;SAF=81;SAR=145;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00584632;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000187114;OID=.;OPOS=63174616;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:228:226:1:0:226:226:145:81:1:0:145:81:0:0 chr14 63784407 . A AG,G 629.45 PASS AO=31,26;DP=75;FAO=72,2;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=29,1;FSAR=43,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0412319,-0.025498;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=1,1;MLLD=20.0315,9.59343;QD=34.0244;RBI=0.0430375,0.193981;REFB=0,0;REVB=0.0123353,-0.192298;RO=17;SAF=17,2;SAR=14,24;SRF=11;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0648792,-0.597385;STB=0.5,0.5;TYPE=ins,snp;VARB=0.00124756,0.00264534;OID=.,.;OPOS=63784408,63784407;OREF=-,A;OALT=G,G;OMAPALT=AG,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:75:74:17:0:31,26:72,2:14,24:17,2:11:6:43,1:29,1:0:0 chr14 63841388 . A T 26.85 PASS AO=7;DP=19;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=14;FSRR=0;FWDB=-0.0194819;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=205.403;QD=5.11453;RBI=0.0572152;REFB=-0.0179617;REVB=0.0537962;RO=12;SAF=6;SAR=1;SRF=12;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.443355;STB=0.768827;TYPE=snp;VARB=0.05415;OID=.;OPOS=63841388;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:19:21:12:14:7:7:1:6:12:0:1:6:14:0 chr14 63841416 . G GT,T 76.13 PASS AO=12,13;DP=51;FAO=35,7;FDP=49;FR=.;FRO=7;FSAF=18,2;FSAR=17,5;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.338784,0.00694677;FXX=0.0576812;HRUN=9,1;LEN=1,1;MLLD=4.2125,200.398;QD=6.21464;RBI=0.386969,0.0242013;REFB=0.00173683,-0.00433402;REVB=0.187003,0.0231829;RO=22;SAF=4,5;SAR=8,8;SRF=15;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.366444,-0.30826;STB=0.533405,0.713673;TYPE=ins,snp;VARB=0.0466936,0.0184466;OID=.,.;OPOS=63841417,63841416;OREF=-,G;OALT=T,T;OMAPALT=GT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:11:51:49:22:7:12,13:35,7:8,8:4,5:15:7:17,5:18,2:5:2 chr14 63856396 . T C 160.29 PASS AO=49;DP=122;FAO=49;FDP=126;FR=.;FRO=77;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=50;FSRR=27;FWDB=-0.0179607;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.905;QD=5.08858;RBI=0.0181668;REFB=-0.0154948;REVB=0.00272841;RO=72;SAF=22;SAR=27;SRF=46;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198334;STB=0.620642;TYPE=snp;VARB=0.018738;OID=.;OPOS=63856396;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:126:72:77:49:49:27:22:46:26:27:22:50:27 chr14 64423187 . C A 221.19 PASS AO=63;DP=150;FAO=63;FDP=151;FR=.;FRO=88;FSAF=26;FSAR=37;FSRF=38;FSRR=50;FWDB=0.00485429;FXX=0.00657851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.691;QD=5.85924;RBI=0.0131277;REFB=-0.0103071;REVB=-0.0121972;RO=87;SAF=27;SAR=36;SRF=38;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00865817;STB=0.511443;TYPE=snp;VARB=0.0166864;OID=.;OPOS=64423187;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:151:87:88:63:63:36:27:38:49:37:26:38:50 chr14 64447776 . T C 431.5 PASS AO=106;DP=222;FAO=106;FDP=221;FR=.;FRO=115;FSAF=44;FSAR=62;FSRF=55;FSRR=60;FWDB=0.0349933;FXX=0.0045043;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.782;QD=7.80986;RBI=0.0401766;REFB=-0.00256357;REVB=0.0197389;RO=114;SAF=44;SAR=62;SRF=54;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0561014;STB=0.533454;TYPE=snp;VARB=0.00330305;OID=.;OPOS=64447776;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:221:114:115:106:106:62:44:54:60:62:44:55:60 chr14 64491695 . T C 543.12 PASS AO=111;DP=208;FAO=115;FDP=209;FR=.;FRO=94;FSAF=65;FSAR=50;FSRF=59;FSRR=35;FWDB=0.0211707;FXX=0.00476168;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.034;QD=10.3946;RBI=0.0371059;REFB=0.0118031;REVB=0.0304738;RO=94;SAF=64;SAR=47;SRF=58;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0350281;STB=0.52878;TYPE=snp;VARB=-0.0104131;OID=.;OPOS=64491695;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:209:94:94:111:115:47:64:58:36:50:65:59:35 chr14 64494278 . C T 379.44 PASS AO=97;DP=213;FAO=99;FDP=213;FR=.;FRO=114;FSAF=64;FSAR=35;FSRF=75;FSRR=39;FWDB=0.00708035;FXX=0.0138882;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.676;QD=7.12556;RBI=0.0444065;REFB=-0.00146981;REVB=-0.0438384;RO=115;SAF=63;SAR=34;SRF=74;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00644447;STB=0.506717;TYPE=snp;VARB=0.00161755;OID=.;OPOS=64494278;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:213:213:115:114:97:99:34:63:74:41:35:64:75:39 chr14 64496749 . C T 198.47 PASS AO=61;DP=155;FAO=61;FDP=155;FR=.;FRO=94;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=38;FSRR=56;FWDB=0.00670313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.862;QD=5.1218;RBI=0.00755421;REFB=-0.0177084;REVB=-0.00348339;RO=92;SAF=30;SAR=31;SRF=37;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0959496;STB=0.553183;TYPE=snp;VARB=0.026796;OID=.;OPOS=64496749;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:92:94:61:61:31:30:37:55:31:30:38:56 chr14 64497930 . G A 161.4 PASS AO=38;DP=83;FAO=39;FDP=83;FR=.;FRO=44;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=18;FWDB=0.0053086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.806;QD=7.77826;RBI=0.0236337;REFB=-0.00214643;REVB=-0.0230298;RO=43;SAF=21;SAR=17;SRF=25;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0277205;STB=0.514494;TYPE=snp;VARB=0.00183251;OID=.;OPOS=64497930;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:43:44:38:39:17:21:25:18:17:22:26:18 chr14 64498037 . G A 118.84 PASS AO=31;DP=72;FAO=31;FDP=72;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=12;FWDB=0.0122875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.013;QD=6.60227;RBI=0.0360688;REFB=-0.0203497;REVB=0.0339113;RO=41;SAF=16;SAR=15;SRF=29;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195234;STB=0.609689;TYPE=snp;VARB=0.0271534;OID=.;OPOS=64498037;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:41:41:31:31:15:16:29:12:15:16:29:12 chr14 64519035 . A G 91.95 PASS AO=27;DP=71;FAO=27;FDP=70;FR=.;FRO=43;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=16;FWDB=0.0322011;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.5983;QD=5.25447;RBI=0.0322016;REFB=-0.00197645;REVB=0.000173608;RO=43;SAF=11;SAR=16;SRF=27;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233038;STB=0.633237;TYPE=snp;VARB=0.00214032;OID=.;OPOS=64519035;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:71:70:43:43:27:27:16:11:27:16:16:11:27:16 chr14 64519455 . A G 40.65 PASS AO=13;DP=40;FAO=13;FDP=40;FR=.;FRO=27;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=8;FWDB=0.00209163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.6419;QD=4.06481;RBI=0.00505075;REFB=0.00391369;REVB=0.0045973;RO=27;SAF=5;SAR=8;SRF=19;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.347731;STB=0.705592;TYPE=snp;VARB=-0.0111837;OID=.;OPOS=64519455;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:40:40:27:27:13:13:8:5:19:8:8:5:19:8 chr14 64522674 . G C 196.27 PASS AO=47;DP=99;FAO=47;FDP=99;FR=.;FRO=52;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=33;FSRR=19;FWDB=-0.00943903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.3103;QD=7.93001;RBI=0.0342782;REFB=-0.00746095;REVB=-0.032953;RO=51;SAF=24;SAR=23;SRF=33;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128429;STB=0.565303;TYPE=snp;VARB=0.00636431;OID=.;OPOS=64522674;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:51:52:47:47:23:24:33:18:23:24:33:19 chr14 64522843 . A G 159.88 PASS AO=47;DP=117;FAO=47;FDP=117;FR=.;FRO=70;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=43;FSRR=27;FWDB=0.0465363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.2587;QD=5.46605;RBI=0.0513317;REFB=-0.0344672;REVB=0.0216639;RO=66;SAF=23;SAR=24;SRF=43;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168134;STB=0.574506;TYPE=snp;VARB=0.0694774;OID=.;OPOS=64522843;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:66:70:47:47:24:23:43:23:24:23:43:27 chr14 64551688 . C T 342.39 PASS AO=91;DP=202;FAO=91;FDP=203;FR=.;FRO=112;FSAF=46;FSAR=45;FSRF=50;FSRR=62;FWDB=0.0373031;FXX=0.00490172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.24;QD=6.7465;RBI=0.041429;REFB=-0.0224814;REVB=-0.0180233;RO=109;SAF=46;SAR=45;SRF=48;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0640021;STB=0.532562;TYPE=snp;VARB=0.0214416;OID=.;OPOS=64551688;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:203:109:112:91:91:45:46:48:61:45:46:50:62 chr14 64560091 . T C 185.46 PASS AO=75;DP=236;FAO=75;FDP=231;FR=.;FRO=156;FSAF=32;FSAR=43;FSRF=62;FSRR=94;FWDB=0.0029428;FXX=0.0253154;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.347;QD=3.21148;RBI=0.0625672;REFB=0.00243367;REVB=0.062498;RO=125;SAF=32;SAR=43;SRF=60;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0595476;STB=0.520289;TYPE=snp;VARB=-0.00702735;OID=.;OPOS=64560091;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:236:231:125:156:75:75:43:32:60:65:43:32:62:94 chr14 64560092 . G A 168.84 PASS AO=72;DP=203;FAO=72;FDP=231;FR=.;FRO=159;FSAF=31;FSAR=41;FSRF=63;FSRR=96;FWDB=-0.00472614;FXX=0.00858332;HRUN=3;LEN=1;MLLD=157.019;QD=2.92355;RBI=0.0430075;REFB=-0.00785079;REVB=-0.0427471;RO=128;SAF=31;SAR=41;SRF=61;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0523157;STB=0.52425;TYPE=snp;VARB=0.0244981;OID=.;OPOS=64560092;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:231:128:159:72:72:41:31:61:67:41:31:63:96 chr14 64604592 . C G 242.43 PASS AO=81;DP=214;FAO=81;FDP=217;FR=.;FRO=136;FSAF=39;FSAR=42;FSRF=71;FSRR=65;FWDB=-0.00335008;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.159;QD=4.46882;RBI=0.0421832;REFB=-0.00807347;REVB=-0.04205;RO=133;SAF=39;SAR=42;SRF=71;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0575298;STB=0.525412;TYPE=snp;VARB=0.012868;OID=.;OPOS=64604592;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:217:133:136:81:81:42:39:71:62:42:39:71:65 chr14 64612858 . C A 171.5 PASS AO=39;DP=82;FAO=39;FDP=79;FR=.;FRO=40;FSAF=34;FSAR=5;FSRF=26;FSRR=14;FWDB=-0.000441805;FXX=0.0365809;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.972;QD=8.68345;RBI=0.00923583;REFB=-0.0186255;REVB=-0.00922526;RO=40;SAF=34;SAR=5;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.322475;STB=0.682764;TYPE=snp;VARB=0.0197042;OID=.;OPOS=64612858;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:79:40:40:39:39:5:34:26:14:5:34:26:14 chr14 64634067 . A G 449.83 PASS AO=106;DP=213;FAO=106;FDP=213;FR=.;FRO=107;FSAF=54;FSAR=52;FSRF=45;FSRR=62;FWDB=-0.0148254;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.988;QD=8.44755;RBI=0.0236649;REFB=-0.0144232;REVB=-0.0184454;RO=106;SAF=54;SAR=52;SRF=45;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0772252;STB=0.544578;TYPE=snp;VARB=0.00838875;OID=.;OPOS=64634067;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:213:213:106:107:106:106:52:54:45:61:52:54:45:62 chr14 64656855 . T C 782.08 PASS AO=84;DP=85;FAO=84;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=59;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0229347;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.906;QD=36.8035;RBI=0.0255012;REFB=-0.013892;REVB=0.0111495;RO=1;SAF=59;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0185671;STB=0.509802;TYPE=snp;VARB=7.13741e-05;OID=.;OPOS=64656855;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:85:85:1:1:84:84:25:59:0:1:25:59:0:1 chr14 64657684 . C A 1526.81 PASS AO=163;DP=166;FAO=163;FDP=163;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00635226;FXX=0.0180712;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.953;QD=37.4676;RBI=0.0129311;REFB=0.0173031;REVB=0.0112633;RO=1;SAF=74;SAR=89;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00638715;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00019046;OID=.;OPOS=64657684;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:166:163:1:0:163:163:89:74:1:0:89:74:0:0 chr14 64686125 . G T 361.43 PASS AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0095261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.982;QD=35.2615;RBI=0.128303;REFB=-0.0367873;REVB=0.127949;RO=0;SAF=32;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.64961e-08;STB=0.507459;TYPE=snp;VARB=0.00166202;OID=.;OPOS=64686125;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:39:41:0:1:39:40:7:32:0:0:7:33:1:0 chr14 64855041 . T C 1602.86 PASS AO=155;DP=157;FAO=171;FDP=171;FR=.;FRO=0;FSAF=109;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.717;QD=37.4938;RBI=0.0233187;REFB=0;REVB=0.0206515;RO=0;SAF=100;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.83552e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000747392;OID=.;OPOS=64855041;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:157:171:0:0:155:171:55:100:0:0:62:109:0:0 chr14 64882380 . A G 1011.35 PASS AO=111;DP=114;FAO=112;FDP=114;FR=.;FRO=2;FSAF=57;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0127577;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=211.87;QD=35.4861;RBI=0.0134797;REFB=-0.129474;REVB=0.00435248;RO=3;SAF=57;SAR=54;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0090014;STB=0.500157;TYPE=snp;VARB=-3.82657e-06;OID=.;OPOS=64882380;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:114:114:3:2:111:112:54:57:1:2:55:57:1:1 chr14 64935411 . C T 430.68 PASS AO=50;DP=53;FAO=50;FDP=53;FR=.;FRO=3;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0126716;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.718;QD=32.5039;RBI=0.0171937;REFB=-0.0151367;REVB=-0.0116212;RO=2;SAF=26;SAR=24;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0376207;STB=0.51057;TYPE=snp;VARB=0.00131647;OID=.;OPOS=64935411;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:53:53:2:3:50:50:24:26:0:2:24:26:1:2 chr14 64935720 . C T 475.23 PASS AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00165656;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.558;QD=38.7943;RBI=0.0244428;REFB=0;REVB=0.0243866;RO=0;SAF=12;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.75957e-05;OID=.;OPOS=64935720;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:49:49:0:0:49:49:37:12:0:0:37:12:0:0 chr14 64988279 . A G 709.82 PASS AO=74;DP=77;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00518385;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.275;QD=36.4009;RBI=0.0254313;REFB=0.058923;REVB=0.0248973;RO=1;SAF=54;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0230622;STB=0.511108;TYPE=snp;VARB=-0.000412769;OID=.;OPOS=64988279;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:77:78:1:1:74:77:20:54:0:1:22:55:0:1 chr14 64988924 . T C 1912.92 PASS AO=203;DP=207;FAO=205;FDP=205;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=136;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0658005;FXX=0.0144224;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.237;QD=37.3252;RBI=0.0683856;REFB=-0.132498;REVB=0.0186249;RO=2;SAF=68;SAR=135;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0138004;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.9591e-05;OID=.;OPOS=64988924;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:207:205:2:0:203:205:135:68:2:0:136:69:0:0 chr14 65008251 . C T 385.46 PASS AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.022624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.299;QD=37.6057;RBI=0.0387479;REFB=0;REVB=0.0314572;RO=0;SAF=20;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02085e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000208685;OID=.;OPOS=65008251;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:41:41:0:0:41:41:21:20:0:0:21:20:0:0 chr14 65009534 . C T 11.75 PASS AO=8;DP=45;FAO=8;FDP=47;FR=.;FRO=39;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=0.00397307;FXX=0.0961354;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.581;QD=1.00008;RBI=0.0566359;REFB=-0.00300678;REVB=-0.0564964;RO=20;SAF=5;SAR=3;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144365;STB=0.531835;TYPE=snp;VARB=0.0207918;OID=.;OPOS=65009534;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:45:47:20:39:8:8:3:5:10:10:4:4:21:18 chr14 65016702 . T G 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0676764;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.662;QD=33.022;RBI=0.0713314;REFB=0;REVB=0.0225403;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00127621;OID=.;OPOS=65016702;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:4:2:0:0:4:2:0:0 chr14 65198849 . C T 185.63 PASS AO=60;DP=159;FAO=60;FDP=159;FR=.;FRO=99;FSAF=35;FSAR=25;FSRF=20;FSRR=79;FWDB=-0.00150985;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.321;QD=4.6699;RBI=0.0226665;REFB=-0.007089;REVB=0.0226161;RO=99;SAF=35;SAR=25;SRF=20;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.404913;STB=0.725758;TYPE=snp;VARB=0.00875503;OID=.;OPOS=65198849;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:159:99:99:60:60:25:35:20:79:25:35:20:79 chr14 65207819 . C T 306.17 PASS AO=61;DP=109;FAO=61;FDP=108;FR=.;FRO=47;FSAF=22;FSAR=39;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=0.0109109;FXX=0.0181802;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.3279;QD=11.3396;RBI=0.0113423;REFB=-0.0233119;REVB=-0.00309854;RO=45;SAF=22;SAR=39;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156177;STB=0.577297;TYPE=snp;VARB=0.0222436;OID=.;OPOS=65207819;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:108:45:47:61:61:39:22:25:20:39:22:25:22 chr14 65246623 . T C 67.38 PASS AO=22;DP=67;FAO=23;FDP=68;FR=.;FRO=45;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=30;FSRR=15;FWDB=-0.0687683;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=43.9012;QD=3.96349;RBI=0.128882;REFB=-0.0110156;REVB=-0.109002;RO=45;SAF=10;SAR=12;SRF=30;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.240241;STB=0.623472;TYPE=snp;VARB=0.0126734;OID=.;OPOS=65246623;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:67:68:45:45:22:23:12:10:30:15:12:11:30:15 chr14 65253232 . T C 29.02 PASS AO=11;DP=40;FAO=11;FDP=40;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=21;FSRR=8;FWDB=-0.049437;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.7272;QD=2.90242;RBI=0.0980727;REFB=0.0011686;REVB=0.0847009;RO=28;SAF=9;SAR=2;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171943;STB=0.5998;TYPE=snp;VARB=-0.000664089;OID=.;OPOS=65253232;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:40:40:28:29:11:11:2:9:20:8:2:9:21:8 chr14 65260143 . GA G 20.61 PASS AO=18;DP=57;FAO=19;FDP=57;FR=.;FRO=38;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=28;FWDB=-0.108938;FXX=0.0172384;HRUN=5;LEN=1;MLLD=8.88904;QD=1.44625;RBI=0.108958;REFB=-0.0794317;REVB=0.00209348;RO=28;SAF=9;SAR=9;SRF=7;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.265694;STB=0.578435;TYPE=del;VARB=0.0151315;OID=.;OPOS=65260144;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:18:55:19:57:38:7:12:10:28:20:28:9:9:7:21 chr14 65260227 . T G 119.33 PASS AO=24;DP=43;FAO=24;FDP=43;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=0.0176395;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=158.218;QD=11.1001;RBI=0.0204753;REFB=-0.00882264;REVB=-0.0103964;RO=19;SAF=9;SAR=15;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0508788;STB=0.528279;TYPE=snp;VARB=0.00843152;OID=.;OPOS=65260227;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:43:43:19:19:24:24:15:9:6:13:15:9:6:13 chr14 65263300 . C T 426.52 PASS AO=82;DP=143;FAO=85;FDP=148;FR=.;FRO=63;FSAF=32;FSAR=53;FSRF=39;FSRR=24;FWDB=0.0147385;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.057;QD=11.5275;RBI=0.0517337;REFB=-0.00831818;REVB=0.0495898;RO=61;SAF=31;SAR=51;SRF=38;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193356;STB=0.604279;TYPE=snp;VARB=0.00712852;OID=.;OPOS=65263300;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:148:61:63:82:85:51:31:38:23:53:32:39:24 chr14 65263347 . C T 466.62 PASS AO=97;DP=177;FAO=98;FDP=179;FR=.;FRO=81;FSAF=40;FSAR=58;FSRF=47;FSRR=34;FWDB=0.0359344;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.117;QD=10.4272;RBI=0.0407666;REFB=0.00278418;REVB=0.0192518;RO=79;SAF=40;SAR=57;SRF=45;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130128;STB=0.578256;TYPE=snp;VARB=-0.00165702;OID=.;OPOS=65263347;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:179:79:81:97:98:57:40:45:34:58:40:47:34 chr14 65392722 . T C 117.07 PASS AO=28;DP=61;FAO=28;FDP=61;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=-0.0240194;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=165.05;QD=7.67702;RBI=0.0267028;REFB=-0.0511136;REVB=0.0116665;RO=33;SAF=12;SAR=16;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197467;STB=0.611033;TYPE=snp;VARB=0.0357449;OID=.;OPOS=65392722;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:33:33:28:28:16:12:21:12:16:12:21:12 chr14 65412748 . G C 140.47 PASS AO=35;DP=77;FAO=35;FDP=77;FR=.;FRO=42;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=15;FSRR=27;FWDB=-0.00555189;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.633;QD=7.29697;RBI=0.0162293;REFB=-0.0134738;REVB=0.0152502;RO=40;SAF=12;SAR=23;SRF=13;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0190037;STB=0.508595;TYPE=snp;VARB=0.0154653;OID=.;OPOS=65412748;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:40:42:35:35:23:12:13:27:23:12:15:27 chr14 65419293 . A G 220.62 PASS AO=47;DP=89;FAO=47;FDP=89;FR=.;FRO=42;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=0.0100071;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.5145;QD=9.91563;RBI=0.0344138;REFB=0.0146716;REVB=-0.0329266;RO=42;SAF=19;SAR=28;SRF=17;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000449815;STB=0.500248;TYPE=snp;VARB=-0.0137661;OID=.;OPOS=65419293;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:42:42:47:47:28:19:17:25:28:19:17:25 chr14 65544367 . C A 54.42 PASS AO=6;DP=31;FAO=11;FDP=24;FR=.,HEALED;FRO=13;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.0260073;FXX=0.172354;HRUN=4;LEN=1;MLLD=217.358;QD=9.06966;RBI=0.0397003;REFB=-0.0441527;REVB=-0.0299955;RO=9;SAF=4;SAR=2;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.318047;STB=0.691913;TYPE=snp;VARB=0.0341163;OID=.;OPOS=65544367;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:25:24:9:13:6:11:2:4:3:6:2:9:7:6 chr14 65879057 . GC G 26.8 PASS AO=10;DP=22;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0102211;FXX=0.0475964;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.5351;QD=5.35996;RBI=0.0546235;REFB=-0.0955901;REVB=0.0536587;RO=9;SAF=6;SAR=4;SRF=4;SRR=5;SSEN=0.303571;SSEP=0;SSSB=0.128055;STB=0.545372;TYPE=del;VARB=0.17026;OID=.;OPOS=65879058;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:10:21:11:20:9:6:5:4:5:21:9:6:4:4:5 chr14 66082793 . A C 464.49 PASS AO=109;DP=224;FAO=111;FDP=224;FR=.;FRO=113;FSAF=66;FSAR=45;FSRF=46;FSRR=67;FWDB=-0.0379743;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.3938;QD=8.29442;RBI=0.0384984;REFB=0.0269901;REVB=-0.00633077;RO=115;SAF=64;SAR=45;SRF=48;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158331;STB=0.594578;TYPE=snp;VARB=-0.0244335;OID=.;OPOS=66082793;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:224:224:115:113:109:111:45:64:48:67:45:66:46:67 chr14 66136163 . C A 232.39 PASS AO=47;DP=94;FAO=51;FDP=99;FR=.;FRO=48;FSAF=2;FSAR=49;FSRF=1;FSRR=47;FWDB=-0.0331252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.503;QD=9.38933;RBI=0.0362877;REFB=-0.0200769;REVB=0.0148161;RO=45;SAF=2;SAR=45;SRF=1;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125739;STB=0.566349;TYPE=snp;VARB=0.0167631;OID=.;OPOS=66136163;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:99:45:48:47:51:45:2:1:44:49:2:1:47 chr14 66479652 . G T 54.66 PASS AO=22;DP=73;FAO=22;FDP=74;FR=.;FRO=52;FSAF=4;FSAR=18;FSRF=8;FSRR=44;FWDB=-0.00891079;FXX=0.0133316;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.333;QD=2.95475;RBI=0.0173404;REFB=0.00187513;REVB=0.0148758;RO=51;SAF=4;SAR=18;SRF=8;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0515922;STB=0.534453;TYPE=snp;VARB=-0.00457854;OID=.;OPOS=66479652;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:73:74:51:52:22:22:18:4:8:43:18:4:8:44 chr14 66479768 . A C 267.56 PASS AO=74;DP=173;FAO=74;FDP=172;FR=.;FRO=98;FSAF=27;FSAR=47;FSRF=56;FSRR=42;FWDB=-0.0297066;FXX=0.00578001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.2499;QD=6.22221;RBI=0.0386634;REFB=-0.0157541;REVB=0.0247462;RO=96;SAF=27;SAR=47;SRF=55;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212496;STB=0.618781;TYPE=snp;VARB=0.0300774;OID=.;OPOS=66479768;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:172:96:98:74:74:47:27:55:41:47:27:56:42 chr14 66480286 . G A 498.78 PASS AO=136;DP=314;FAO=138;FDP=314;FR=.;FRO=176;FSAF=46;FSAR=92;FSRF=71;FSRR=105;FWDB=-0.0398192;FXX=0.0156735;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.037;QD=6.35383;RBI=0.039825;REFB=0.00747714;REVB=-0.000677606;RO=172;SAF=45;SAR=91;SRF=68;SRR=104;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0712035;STB=0.542917;TYPE=snp;VARB=-0.00961205;OID=.;OPOS=66480286;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:314:314:172:176:136:138:91:45:68:104:92:46:71:105 chr14 66974474 . T C 19.5 PASS AO=6;DP=22;FAO=6;FDP=22;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.10487;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.421;QD=3.54617;RBI=0.106465;REFB=-0.0169544;REVB=-0.0183566;RO=16;SAF=2;SAR=4;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192221;STB=0.624574;TYPE=snp;VARB=0.0244599;OID=.;OPOS=66974474;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:22:22:16:16:6:6:4:2:8:8:4:2:8:8 chr14 67147816 . T C 360.6 PASS AO=66;DP=108;FAO=66;FDP=107;FR=.;FRO=41;FSAF=26;FSAR=40;FSRF=27;FSRR=14;FWDB=-0.0127158;FXX=0.0092584;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.8178;QD=13.4805;RBI=0.0129879;REFB=-0.0232182;REVB=-0.00264478;RO=40;SAF=26;SAR=40;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178726;STB=0.601558;TYPE=snp;VARB=0.0170463;OID=.;OPOS=67147816;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:107:40:41:66:66:40:26:26:14:40:26:27:14 chr14 67390981 . A G 143.24 PASS AO=29;DP=53;FAO=29;FDP=53;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=0.0142323;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.957;QD=10.8102;RBI=0.0154507;REFB=-0.025338;REVB=-0.00601394;RO=24;SAF=11;SAR=18;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0402918;STB=0.522331;TYPE=snp;VARB=0.0136398;OID=.;OPOS=67390981;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:24:24:29:29:18:11:8:16:18:11:8:16 chr14 67671293 . T C 357.53 PASS AO=94;DP=208;FAO=94;FDP=208;FR=.;FRO=114;FSAF=43;FSAR=51;FSRF=54;FSRR=60;FWDB=-0.0189571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.934;QD=6.8756;RBI=0.0238567;REFB=-0.0172592;REVB=0.0144833;RO=114;SAF=43;SAR=51;SRF=54;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0161356;STB=0.508949;TYPE=snp;VARB=0.0214302;OID=.;OPOS=67671293;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:208:114:114:94:94:51:43:54:60:51:43:54:60 chr14 67675021 . C T 256.73 PASS AO=58;DP=120;FAO=60;FDP=122;FR=.;FRO=62;FSAF=41;FSAR=19;FSRF=26;FSRR=36;FWDB=0.0152559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.34;QD=8.41732;RBI=0.0153463;REFB=-0.0312725;REVB=0.00166254;RO=62;SAF=39;SAR=19;SRF=26;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.24244;STB=0.639125;TYPE=snp;VARB=0.0141335;OID=.;OPOS=67675021;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:122:62:62:58:60:19:39:26:36:19:41:26:36 chr14 67800815 . G A 325.32 PASS AO=76;DP=162;FAO=81;FDP=169;FR=.;FRO=88;FSAF=39;FSAR=42;FSRF=31;FSRR=57;FWDB=0.0681982;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.1543;QD=7.69997;RBI=0.099499;REFB=-0.0234672;REVB=0.0724505;RO=86;SAF=35;SAR=41;SRF=30;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109007;STB=0.567694;TYPE=snp;VARB=0.0283122;OID=.;OPOS=67800815;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:169:86:88:76:81:41:35:30:56:42:39:31:57 chr14 67849324 . C T 180.94 PASS AO=41;DP=84;FAO=41;FDP=82;FR=.;FRO=41;FSAF=7;FSAR=34;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=0.00640971;FXX=0.0238067;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.876;QD=8.82617;RBI=0.01977;REFB=0.00159529;REVB=0.0187021;RO=41;SAF=7;SAR=34;SRF=16;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.274324;STB=0.654308;TYPE=snp;VARB=-0.0013542;OID=.;OPOS=67849324;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:82:41:41:41:41:34:7:16:25:34:7:16:25 chr14 67862269 . G A 242.43 PASS AO=48;DP=85;FAO=48;FDP=84;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=34;FSRF=12;FSRR=24;FWDB=0.0911605;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1744;QD=11.5441;RBI=0.0936589;REFB=-0.00918176;REVB=0.0214886;RO=35;SAF=14;SAR=34;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0465971;STB=0.521217;TYPE=snp;VARB=0.00919123;OID=.;OPOS=67862269;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:84:35:36:48:48:34:14:12:23:34:14:12:24 chr14 67878765 . G A 63.28 PASS AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=-0.0107908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.6957;QD=13.3225;RBI=0.0108229;REFB=0.0287215;REVB=-0.000832633;RO=8;SAF=2;SAR=9;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.276859;STB=0.653632;TYPE=snp;VARB=-0.0204843;OID=.;OPOS=67878765;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:19:19:8:8:11:11:9:2:0:8:9:2:0:8 chr14 68029313 . G A 256.44 PASS AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.040886;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=209.998;QD=35.3713;RBI=0.0486315;REFB=-0.0954239;REVB=0.0263317;RO=1;SAF=13;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0300185;STB=0.516118;TYPE=snp;VARB=0.000716156;OID=.;OPOS=68029313;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:29:29:1:1:28:28:15:13:0:1:15:13:0:1 chr14 68042255 . A G 1350.89 PASS AO=140;DP=140;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0603125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1034;QD=38.597;RBI=0.0611046;REFB=0;REVB=0.00980694;RO=0;SAF=38;SAR=102;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.43417e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000375503;OID=.;OPOS=68042255;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:140:140:0:0:140:140:102:38:0:0:102:38:0:0 chr14 68042574 . A G 952.94 PASS AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0245256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.4218;QD=38.5026;RBI=0.0562046;REFB=0;REVB=0.0505712;RO=0;SAF=50;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000343646;OID=.;OPOS=68042574;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:99:99:0:0:99:99:49:50:0:0:49:50:0:0 chr14 68045935 . G A 664.49 PASS AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.120915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.537;QD=38.5213;RBI=0.124704;REFB=0;REVB=0.0305086;RO=0;SAF=26;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000588117;OID=.;OPOS=68045935;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:69:69:0:0:69:69:43:26:0:0:43:26:0:0 chr14 68053149 . A G 1502.15 PASS AO=161;DP=163;FAO=161;FDP=161;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=131;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195457;FXX=0.0122692;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.773;QD=37.3206;RBI=0.0211719;REFB=0.0946607;REVB=-0.00813715;RO=2;SAF=30;SAR=131;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0072091;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.55186e-05;OID=.;OPOS=68053149;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:163:161:2:0:161:161:131:30:0:2:131:30:0:0 chr14 68053977 . A C 1572.11 PASS AO=207;DP=227;FAO=203;FDP=225;FR=.;FRO=22;FSAF=75;FSAR=128;FSRF=16;FSRR=6;FWDB=0.0376287;FXX=0.0131573;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.0908;QD=27.9486;RBI=0.089685;REFB=-0.0629396;REVB=0.0814093;RO=15;SAF=77;SAR=130;SRF=14;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0754913;STB=0.53682;TYPE=snp;VARB=0.0405013;OID=.;OPOS=68053977;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:227:225:15:22:207:203:130:77:14:1:128:75:16:6 chr14 68055613 . C G 1617.55 PASS AO=168;DP=169;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=106;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00924947;FXX=0.00591681;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.492;QD=38.5131;RBI=0.033085;REFB=0;REVB=-0.0317658;RO=0;SAF=106;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.21347e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.46982e-05;OID=.;OPOS=68055613;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:169:168:0:0:168:168:62:106:0:0:62:106:0:0 chr14 68172894 . C T 1227.83 PASS AO=127;DP=129;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000278359;FXX=0.0230751;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7583;QD=38.6719;RBI=0.00628918;REFB=0;REVB=0.00628301;RO=0;SAF=50;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.46198e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000493414;OID=.;OPOS=68172894;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:129:127:0:0:127:127:77:50:0:0:77:50:0:0 chr14 68213744 . G A 1004.77 PASS AO=105;DP=107;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0421292;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.528;QD=37.2138;RBI=0.0423182;REFB=-0.100748;REVB=0.00399494;RO=1;SAF=57;SAR=48;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00978419;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000584201;OID=.;OPOS=68213744;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:107:108:1:0:105:108:48:57:0:1:51:57:0:0 chr14 68213792 . A G 953.28 PASS AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0344929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.905;QD=38.5164;RBI=0.0685385;REFB=0;REVB=0.0592264;RO=0;SAF=37;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000244109;OID=.;OPOS=68213792;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:99:99:0:0:99:99:62:37:0:0:62:37:0:0 chr14 68234539 . T C 1624.32 PASS AO=174;DP=179;FAO=174;FDP=174;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00292627;FXX=0.0279314;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.884;QD=37.3408;RBI=0.0123775;REFB=0.00922762;REVB=0.0120266;RO=2;SAF=74;SAR=100;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126891;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.27072e-06;OID=.;OPOS=68234539;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:179:174:2:0:174:174:100:74:2:0:100:74:0:0 chr14 68257352 . T A 2013.19 PASS AO=212;DP=213;FAO=212;FDP=212;FR=.;FRO=0;FSAF=117;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0337521;FXX=0.0139528;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.812;QD=37.9846;RBI=0.0344336;REFB=-0.00372608;REVB=0.00681725;RO=1;SAF=117;SAR=95;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00405457;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.03666e-05;OID=.;OPOS=68257352;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:87:213:212:1:0:212:212:95:117:1:0:95:117:0:0 chr14 68264867 . A G 390.3 PASS AO=25;DP=46;FAO=42;FDP=42;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.137137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.806;QD=37.1711;RBI=0.14096;REFB=0;REVB=0.0326058;RO=0;SAF=0;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000538648;OID=.;OPOS=68264867;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:42:42:0:0:25:42:25:0:0:0:33:9:0:0 chr14 68616597 . G A 480.74 PASS AO=53;DP=55;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0425465;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.3279;QD=34.9631;RBI=0.0997478;REFB=-0.066131;REVB=0.0902187;RO=2;SAF=19;SAR=34;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0470366;STB=0.512191;TYPE=snp;VARB=0.00490584;OID=.;OPOS=68616597;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:55:55:2:1:53:54:34:19:2:0:34:20:1:0 chr14 68935789 . T C 1651.87 PASS AO=173;DP=173;FAO=173;FDP=173;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00458696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.0768;QD=38.1935;RBI=0.0266777;REFB=0;REVB=-0.0262804;RO=0;SAF=98;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.9341e-05;OID=.;OPOS=68935789;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:173:173:0:0:173:173:75:98:0:0:75:98:0:0 chr14 69012355 . C G 294.65 PASS AO=65;DP=127;FAO=66;FDP=129;FR=.;FRO=63;FSAF=24;FSAR=42;FSRF=22;FSRR=41;FWDB=0.0336292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.945;QD=9.13645;RBI=0.0353359;REFB=-0.00800578;REVB=0.0108492;RO=61;SAF=24;SAR=41;SRF=22;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00811821;STB=0.507643;TYPE=snp;VARB=0.00851139;OID=.;OPOS=69012355;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:129:61:63:65:66:41:24:22:39:42:24:22:41 chr14 69117512 . T C 134.05 PASS AO=38;DP=93;FAO=38;FDP=93;FR=.;FRO=55;FSAF=29;FSAR=9;FSRF=49;FSRR=6;FWDB=0.00680973;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.3864;QD=5.7656;RBI=0.0110698;REFB=-0.0234229;REVB=0.00872749;RO=53;SAF=29;SAR=9;SRF=47;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200332;STB=0.617362;TYPE=snp;VARB=0.0177957;OID=.;OPOS=69117512;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:53:55:38:38:9:29:47:6:9:29:49:6 chr14 69259662 . C A 100.71 PASS AO=25;DP=56;FAO=25;FDP=56;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.0364612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.412;QD=7.19384;RBI=0.0393982;REFB=-0.0181665;REVB=0.0149265;RO=31;SAF=6;SAR=19;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.240456;STB=0.637465;TYPE=snp;VARB=0.0259084;OID=.;OPOS=69259662;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:31:31:25:25:19:6:14:17:19:6:14:17 chr14 69262441 . A G 61.13 PASS AO=12;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=0.0047449;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.522;QD=9.7804;RBI=0.018755;REFB=-0.00171469;REVB=-0.0181449;RO=12;SAF=4;SAR=8;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.352618;STB=0.708774;TYPE=snp;VARB=0.00544924;OID=.;OPOS=69262441;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:25:25:12:12:12:13:8:4:9:3:9:4:9:3 chr14 69263074 . G A 91.33 PASS AO=16;DP=26;FAO=16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=9;FWDB=0.058924;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.9956;QD=14.0513;RBI=0.05975;REFB=-0.021044;REVB=-0.00990079;RO=10;SAF=5;SAR=11;SRF=1;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184742;STB=0.602295;TYPE=snp;VARB=0.0310457;OID=.;OPOS=69263074;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:26:26:10:10:16:16:11:5:1:9:11:5:1:9 chr14 69521345 . G A 2199.46 PASS AO=152;DP=246;FAO=245;FDP=252;FR=.;FRO=7;FSAF=108;FSAR=137;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0350214;FXX=0.0156244;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.295;QD=34.9121;RBI=0.0367732;REFB=-0.0336398;REVB=0.0112147;RO=0;SAF=31;SAR=121;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50841;TYPE=snp;VARB=0.000848179;OID=.;OPOS=69521345;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:159:252:0:7:152:245:121:31:0:0:137:108:1:6 chr14 69795199 . G A 250.43 PASS AO=51;DP=98;FAO=53;FDP=100;FR=.;FRO=47;FSAF=20;FSAR=33;FSRF=17;FSRR=30;FWDB=-0.0211531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.946;QD=10.0172;RBI=0.0211825;REFB=-0.0225357;REVB=0.00111593;RO=47;SAF=20;SAR=31;SRF=17;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0279741;STB=0.507857;TYPE=snp;VARB=0.0187516;OID=.;OPOS=69795199;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:100:47:47:51:53:31:20:17:30:33:20:17:30 chr14 69799892 . A G 62.81 PASS AO=13;DP=30;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.0091536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.154;QD=8.10483;RBI=0.0302807;REFB=0.00322118;REVB=-0.0288641;RO=16;SAF=6;SAR=7;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0230345;STB=0.548319;TYPE=snp;VARB=-0.00363452;OID=.;OPOS=69799892;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:30:31:16:17:13:14:7:6:7:9:7:7:7:10 chr14 69820946 . C A 370.57 PASS AO=41;DP=45;FAO=43;FDP=46;FR=.;FRO=3;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.00346449;FXX=0.0212721;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.967;QD=32.2232;RBI=0.00539817;REFB=-0.022114;REVB=-0.00413975;RO=3;SAF=19;SAR=22;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0597911;STB=0.529398;TYPE=snp;VARB=0.00140661;OID=.;OPOS=69820946;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:45:46:3:3:41:43:22:19:0:3:24:19:0:3 chr14 69966850 . G A 44.1 PASS AO=16;DP=60;FAO=18;FDP=62;FR=.;FRO=44;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=-0.00333621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.628;QD=2.84493;RBI=0.00367432;REFB=-0.0112139;REVB=-0.00153959;RO=40;SAF=7;SAR=9;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.015044;STB=0.514965;TYPE=snp;VARB=0.0254037;OID=.;OPOS=69966850;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:60:62:40:44:16:18:9:7:17:23:11:7:18:26 chr14 70037611 . A T 538.7 PASS AO=119;DP=228;FAO=119;FDP=226;FR=.;FRO=107;FSAF=67;FSAR=52;FSRF=42;FSRR=65;FWDB=-0.00814237;FXX=0.00877155;HRUN=4;LEN=1;MLLD=245.956;QD=9.53456;RBI=0.0155317;REFB=-0.0158025;REVB=0.0132264;RO=107;SAF=67;SAR=52;SRF=42;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147098;STB=0.580352;TYPE=snp;VARB=0.0166188;OID=.;OPOS=70037611;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:228:226:107:107:119:119:52:67:42:65:52:67:42:65 chr14 70038786 . A G 101.96 PASS AO=10;DP=10;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0566238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.2499;QD=37.0751;RBI=0.0746516;REFB=0;REVB=-0.0486478;RO=0;SAF=2;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00390688;OID=.;OPOS=70038786;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:10:11:0:0:10:11:8:2:0:0:8:3:0:0 chr14 70171418 . T C 273.3 PASS AO=66;DP=134;FAO=65;FDP=133;FR=.;FRO=68;FSAF=30;FSAR=35;FSRF=25;FSRR=43;FWDB=-0.0584652;FXX=0.00746213;HRUN=3;LEN=1;MLLD=90.5308;QD=8.21962;RBI=0.0629397;REFB=-0.0225731;REVB=-0.0233074;RO=66;SAF=31;SAR=35;SRF=23;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111323;STB=0.548637;TYPE=snp;VARB=0.0332953;OID=.;OPOS=70171418;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:133:66:68:66:65:35:31:23:43:35:30:25:43 chr14 70180778 . C G 2841.46 PASS AO=292;DP=293;FAO=296;FDP=296;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=193;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.607;QD=38.3981;RBI=0.0136287;REFB=0;REVB=0.00614862;RO=0;SAF=101;SAR=191;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.54754e-06;OID=.;OPOS=70180778;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:293:296:0:0:292:296:191:101:0:0:193:103:0:0 chr14 70234336 . G A 12.61 PASS AO=6;DP=31;FAO=6;FDP=31;FR=.;FRO=25;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.0230366;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.6642;QD=1.62734;RBI=0.0273094;REFB=-0.0155331;REVB=-0.0146669;RO=25;SAF=2;SAR=4;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222387;STB=0.651662;TYPE=snp;VARB=0.0608452;OID=.;OPOS=70234336;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:31:31:25:25:6:6:4:2:13:12:4:2:13:12 chr14 70634087 . A G 2311.17 PASS AO=246;DP=251;FAO=248;FDP=248;FR=.;FRO=0;FSAF=125;FSAR=123;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118324;FXX=0.0119517;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.264;QD=37.2769;RBI=0.0120338;REFB=-0.0445918;REVB=-0.00219221;RO=1;SAF=125;SAR=121;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0037981;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000323582;OID=.;OPOS=70634087;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:251:248:1:0:246:248:121:125:1:0:123:125:0:0 chr14 70634200 . T C 465.74 PASS AO=101;DP=190;FAO=101;FDP=190;FR=.;FRO=89;FSAF=38;FSAR=63;FSRF=39;FSRR=50;FWDB=-0.0109203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.114;QD=9.805;RBI=0.020436;REFB=-0.00947283;REVB=-0.0172737;RO=89;SAF=38;SAR=63;SRF=39;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0556389;STB=0.530448;TYPE=snp;VARB=0.00830865;OID=.;OPOS=70634200;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:190:89:89:101:101:63:38:39:50:63:38:39:50 chr14 70712880 . A C 473.41 PASS AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00447621;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.783;QD=35.7291;RBI=0.0150337;REFB=-0.0116774;REVB=0.0143518;RO=1;SAF=28;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.016526;STB=0.508769;TYPE=snp;VARB=0.00018533;OID=.;OPOS=70712880;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:53:53:1:1:52:52:24:28:1:0:24:28:1:0 chr14 70713156 . G A 564.42 PASS AO=125;DP=238;FAO=125;FDP=238;FR=.;FRO=113;FSAF=66;FSAR=59;FSRF=50;FSRR=63;FWDB=-0.0154766;FXX=0.00418393;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.538;QD=9.48599;RBI=0.0504817;REFB=-0.0202168;REVB=-0.0480507;RO=111;SAF=66;SAR=59;SRF=48;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0821611;STB=0.540541;TYPE=snp;VARB=0.0198387;OID=.;OPOS=70713156;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:238:238:111:113:125:125:59:66:48:63:59:66:50:63 chr14 70713858 . T C 658.88 PASS AO=117;DP=247;FAO=149;FDP=279;FR=.;FRO=130;FSAF=36;FSAR=113;FSRF=32;FSRR=98;FWDB=0.0857782;FXX=0.0312489;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.4009;QD=9.44636;RBI=0.0869232;REFB=-0.0342058;REVB=0.0140627;RO=127;SAF=4;SAR=113;SRF=31;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.566557;STB=0.502879;TYPE=snp;VARB=0.0392124;OID=.;OPOS=70713858;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:247:279:127:130:117:149:113:4:31:96:113:36:32:98 chr14 70827773 . T C 1676.56 PASS AO=175;DP=176;FAO=175;FDP=175;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0771103;FXX=0.0056815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.0794;QD=38.3213;RBI=0.0816158;REFB=0;REVB=0.0267421;RO=0;SAF=84;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.48691e-05;OID=.;OPOS=70827773;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:176:175:0:0:175:175:91:84:0:0:91:84:0:0 chr14 70839389 . A C 229.05 PASS AO=47;DP=79;FAO=44;FDP=76;FR=.;FRO=32;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=-0.0174651;FXX=0.0379699;HRUN=6;LEN=1;MLLD=201.264;QD=12.0552;RBI=0.0176474;REFB=-0.00409154;REVB=-0.00252996;RO=32;SAF=23;SAR=24;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0384794;STB=0.535826;TYPE=snp;VARB=0.00340966;OID=.;OPOS=70839389;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:76:32:32:47:44:24:23:14:18:21:23:14:18 chr14 70924249 . A G 130.7 PASS AO=52;DP=195;FAO=61;FDP=206;FR=.;FRO=145;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=90;FSRR=55;FWDB=-0.0237469;FXX=0.0143534;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.299;QD=2.53782;RBI=0.0257307;REFB=-0.00976115;REVB=-0.00990717;RO=141;SAF=29;SAR=23;SRF=89;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0934363;STB=0.579384;TYPE=snp;VARB=0.0224094;OID=.;OPOS=70924249;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:206:141:145:52:61:23:29:89:52:30:31:90:55 chr14 70924462 . A G 540.63 PASS AO=111;DP=202;FAO=113;FDP=202;FR=.;FRO=89;FSAF=52;FSAR=61;FSRF=37;FSRR=52;FWDB=0.00663742;FXX=0.00980344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.474;QD=10.7055;RBI=0.0094135;REFB=-0.0177861;REVB=0.00667523;RO=90;SAF=51;SAR=60;SRF=38;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0308986;STB=0.519767;TYPE=snp;VARB=0.0144453;OID=.;OPOS=70924462;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:202:90:89:111:113:60:51:38:52:61:52:37:52 chr14 70924501 . C G 1657.25 PASS AO=181;DP=189;FAO=182;FDP=188;FR=.;FRO=6;FSAF=81;FSAR=101;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0216682;FXX=0.0105258;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.229;QD=35.2606;RBI=0.0227741;REFB=-0.0276719;REVB=0.00701061;RO=6;SAF=80;SAR=101;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0170694;STB=0.50901;TYPE=snp;VARB=0.0016612;OID=.;OPOS=70924501;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:189:188:6:6:181:182:101:80:1:5:101:81:1:5 chr14 70924507 . A C 545.45 PASS AO=79;DP=188;FAO=108;FDP=187;FR=.,HEALED;FRO=79;FSAF=50;FSAR=58;FSRF=32;FSRR=47;FWDB=0.0143242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.334;QD=11.6674;RBI=0.0765669;REFB=-0.044683;REVB=0.075215;RO=78;SAF=50;SAR=29;SRF=31;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214242;STB=0.524681;TYPE=snp;VARB=0.0322664;OID=.;OPOS=70924507;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:187:78:79:79:108:29:50:31:47:58:50:32:47 chr14 70924566 . C G 51.11 PASS AO=36;DP=166;FAO=37;FDP=167;FR=.;FRO=130;FSAF=10;FSAR=27;FSRF=70;FSRR=60;FWDB=-0.0588448;FXX=0.017646;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.1158;QD=1.22421;RBI=0.0670269;REFB=-0.000877969;REVB=-0.032092;RO=130;SAF=9;SAR=27;SRF=70;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.374115;STB=0.712754;TYPE=snp;VARB=0.00129743;OID=.;OPOS=70924566;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:166:167:130:130:36:37:27:9:70:60:27:10:70:60 chr14 70924567 . A T 43.29 PASS AO=35;DP=169;FAO=35;FDP=167;FR=.;FRO=132;FSAF=9;FSAR=26;FSRF=70;FSRR=62;FWDB=0.000541669;FXX=0.0290681;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.276;QD=1.03679;RBI=0.00494771;REFB=0.00100969;REVB=0.00491797;RO=131;SAF=9;SAR=26;SRF=69;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.351976;STB=0.721585;TYPE=snp;VARB=-0.00487409;OID=.;OPOS=70924567;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:169:167:131:132:35:35:26:9:69:62:26:9:70:62 chr14 70924693 . T C 15.27 PASS AO=25;DP=163;FAO=25;FDP=163;FR=.;FRO=138;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=89;FSRR=49;FWDB=-0.0159264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.686;QD=0.37475;RBI=0.0167174;REFB=-0.00395611;REVB=-0.00508142;RO=135;SAF=14;SAR=11;SRF=88;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122421;STB=0.574195;TYPE=snp;VARB=0.0191948;OID=.;OPOS=70924693;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:163:163:135:138:25:25:11:14:88:47:11:14:89:49 chr14 70924955 . A C 158.37 PASS AO=72;DP=240;FAO=72;FDP=239;FR=.;FRO=167;FSAF=34;FSAR=38;FSRF=83;FSRR=84;FWDB=0.00537676;FXX=0.00829841;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.566;QD=2.65049;RBI=0.0279482;REFB=-0.0250182;REVB=0.0274261;RO=167;SAF=34;SAR=38;SRF=83;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.029831;STB=0.517333;TYPE=snp;VARB=0.0454923;OID=.;OPOS=70924955;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:240:239:167:167:72:72:38:34:83:84:38:34:83:84 chr14 70925256 . TA T,TG 775.71 PASS AO=40,37;DP=83;FAO=82,0;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=35,0;FSAR=47,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0172506,-0.374282;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=67.1351,54.6814;QD=37.8394;RBI=0.017804,0.378358;REFB=0,0;REVB=-0.00440462,-0.0553903;RO=0;SAF=0,30;SAR=40,7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.00464e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.000324864,0.00212195;OID=.,.;OPOS=70925257,70925257;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=T,TG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:40,37:77:82,0:82:0:35,0:47,0:0:0:36:0:0,30:40,7:0:0 chr14 70991650 . A C 65.85 PASS AO=18;DP=39;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=-0.000825322;FXX=0.0256345;HRUN=5;LEN=1;MLLD=43.6038;QD=6.93174;RBI=0.0944462;REFB=-0.0358539;REVB=-0.0944426;RO=21;SAF=11;SAR=7;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0560012;STB=0.571343;TYPE=snp;VARB=0.0535786;OID=.;OPOS=70991650;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:39:38:21:22:18:16:7:11:14:7:7:9:15:7 chr14 71109153 . C G 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0076381;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=133.296;QD=33.022;RBI=0.0123261;REFB=0;REVB=0.00967433;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000495625;OID=.;OPOS=71109153;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:5:1:0:0:5:1:0:0 chr14 71139279 . G T 442.91 PASS AO=117;DP=267;FAO=119;FDP=266;FR=.;FRO=147;FSAF=21;FSAR=98;FSRF=43;FSRR=104;FWDB=-0.0146253;FXX=0.011152;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.14;QD=6.66028;RBI=0.0152117;REFB=-0.010207;REVB=-0.00418281;RO=144;SAF=20;SAR=97;SRF=38;SRR=106;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144593;STB=0.59652;TYPE=snp;VARB=0.0155474;OID=.;OPOS=71139279;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:267:266:144:147:117:119:97:20:38:106:98:21:43:104 chr14 71443815 . C G 207.02 PASS AO=73;DP=205;FAO=73;FDP=204;FR=.;FRO=131;FSAF=19;FSAR=54;FSRF=68;FSRR=63;FWDB=0.0131096;FXX=0.00487781;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.5696;QD=4.05925;RBI=0.0224502;REFB=-0.00830614;REVB=-0.0182249;RO=131;SAF=19;SAR=54;SRF=68;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.31218;STB=0.678752;TYPE=snp;VARB=0.024346;OID=.;OPOS=71443815;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:204:131:131:73:73:54:19:68:63:54:19:68:63 chr14 71444788 . G A 735.99 PASS AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00635316;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=273.485;QD=38.2331;RBI=0.0191777;REFB=0;REVB=0.0180948;RO=0;SAF=24;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.08692e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.53243e-05;OID=.;OPOS=71444788;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:77:77:0:0:77:77:53:24:0:0:53:24:0:0 chr14 71581398 . C CT,CTT 615.98 PASS AO=84,23;DP=130;FAO=123,1;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=64,1;FSAR=59,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.113951,-0.0584386;FXX=0.0158718;HRUN=6,6;LEN=1,2;MLLD=11.8654,10.5035;QD=19.8705;RBI=0.174512,0.0894258;REFB=0.0972059,0.0897732;REVB=-0.132173,-0.0676898;RO=17;SAF=45,11;SAR=39,12;SRF=10;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0167199,-0.0838134;STB=0.5,0.5;TYPE=ins,ins;VARB=-0.00712592,-0.0938417;OID=.,.;OPOS=71581399,71581399;OREF=-,-;OALT=T,TT;OMAPALT=CT,CTT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:84,23:130:123,1:124:0:64,1:59,0:0:0:38:17:45,11:39,12:10:7 chr14 71915415 . T TGTG,G 150.84 PASS AO=26,16;DP=90;FAO=33,7;FDP=86;FR=.;FRO=46;FSAF=22,3;FSAR=11,4;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=-0.00237701,-0.0122063;FXX=0.0337041;HRUN=1,2;LEN=3,1;MLLD=169.731,53.6825;QD=7.01566;RBI=0.0211295,0.0349442;REFB=-0.00470048,-0.0100403;REVB=-0.0209954,-0.032743;RO=46;SAF=19,5;SAR=7,11;SRF=26;SRR=20;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.205041,-0.305793;STB=0.576529,0.598651;TYPE=ins,snp;VARB=0.0037202,-0.083565;OID=.,.;OPOS=71915416,71915415;OREF=-,T;OALT=GTG,G;OMAPALT=TGTG,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:86:46:46:26,16:33,7:7,11:19,5:26:20:11,4:22,3:25:21 chr14 72055468 . A C 926.04 PASS AO=102;DP=105;FAO=102;FDP=105;FR=.;FRO=3;FSAF=66;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.00262361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.4111;QD=35.2776;RBI=0.0171615;REFB=-0.159689;REVB=0.0169597;RO=3;SAF=66;SAR=36;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0379032;STB=0.519996;TYPE=snp;VARB=0.00198625;OID=.;OPOS=72055468;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:105:105:3:3:102:102:36:66:0:3:36:66:0:3 chr14 72117156 . T C 1699.42 PASS AO=179;DP=180;FAO=178;FDP=178;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.123317;FXX=0.0111105;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.0502;QD=38.1892;RBI=0.123399;REFB=0.0333791;REVB=-0.00449533;RO=1;SAF=87;SAR=92;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00544065;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000900874;OID=.;OPOS=72117156;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:180:178:1:0:179:178:92:87:1:0:91:87:0:0 chr14 73220020 . A G 107.89 PASS AO=21;DP=38;FAO=21;FDP=38;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=16;FWDB=-0.0811463;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.776;QD=11.3565;RBI=0.0847713;REFB=-0.000576861;REVB=-0.0245245;RO=17;SAF=5;SAR=16;SRF=1;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.227414;STB=0.624901;TYPE=snp;VARB=-0.00126347;OID=.;OPOS=73220020;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:38:38:17:17:21:21:16:5:1:16:16:5:1:16 chr14 73240486 . A G 37.72 PASS AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.0230798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2065;QD=8.38189;RBI=0.0234327;REFB=-0.018522;REVB=-0.00405128;RO=10;SAF=7;SAR=1;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.51755;STB=0.815763;TYPE=snp;VARB=0.0178832;OID=.;OPOS=73240486;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:18:18:10:10:8:8:1:7:4:6:1:7:4:6 chr14 73358945 . A C 2675.63 PASS AO=290;DP=295;FAO=290;FDP=290;FR=.;FRO=0;FSAF=99;FSAR=191;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191578;FXX=0.0522859;HRUN=4;LEN=1;MLLD=122.308;QD=36.9052;RBI=0.0195402;REFB=-0.128174;REVB=0.00384686;RO=3;SAF=100;SAR=190;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140884;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00213285;OID=.;OPOS=73358945;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:295:290:3:0:290:290:190:100:3:0:191:99:0:0 chr14 73360819 . T TTGTC 384.37 PASS AO=44;DP=49;FAO=44;FDP=47;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0167839;FXX=0.020829;HRUN=2;LEN=4;MLLD=289.128;QD=32.7121;RBI=0.0274171;REFB=-0.0620073;REVB=0.0216795;RO=4;SAF=1;SAR=43;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0417393;STB=0.516846;TYPE=ins;VARB=0.00425613;OID=.;OPOS=73360820;OREF=-;OALT=TGTC;OMAPALT=TTGTC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:44:49:44:47:3:1:43:0:3:6:4:1:43:0:4 chr14 73422350 . T G 404.87 PASS AO=88;DP=168;FAO=89;FDP=170;FR=.;FRO=81;FSAF=41;FSAR=48;FSRF=35;FSRR=46;FWDB=-0.00801348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.648;QD=9.52637;RBI=0.0125057;REFB=-0.0200928;REVB=-0.00960083;RO=80;SAF=41;SAR=47;SRF=35;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0248518;STB=0.513727;TYPE=snp;VARB=0.0176527;OID=.;OPOS=73422350;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:170:80:81:88:89:47:41:35:45:48:41:35:46 chr14 73429755 . G A 194.01 PASS AO=47;DP=101;FAO=47;FDP=100;FR=.;FRO=53;FSAF=15;FSAR=32;FSRF=3;FSRR=50;FWDB=-0.0305543;FXX=0.00990001;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.4;QD=7.76052;RBI=0.0306509;REFB=0.0135558;REVB=0.00243138;RO=53;SAF=15;SAR=32;SRF=3;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.33297;STB=0.681004;TYPE=snp;VARB=-0.0160809;OID=.;OPOS=73429755;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:100:53:53:47:47:32:15:3:50:32:15:3:50 chr14 73440864 . C T 159.39 PASS AO=40;DP=88;FAO=40;FDP=88;FR=.;FRO=48;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=15;FSRR=33;FWDB=-0.0100899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.351;QD=7.24502;RBI=0.0111573;REFB=0.00150945;REVB=-0.00476225;RO=48;SAF=14;SAR=26;SRF=15;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0407462;STB=0.522774;TYPE=snp;VARB=-0.00192136;OID=.;OPOS=73440864;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:48:48:40:40:26:14:15:33:26:14:15:33 chr14 73712376 . C T 10.64 PASS AO=2;DP=6;FAO=2;FDP=6;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.372;QD=7.09468;RBI=0.0138638;REFB=-0.00577063;REVB=0.0138638;RO=4;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.074923;OID=.;OPOS=73712376;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:4:4:2:2:2:0:0:4:2:0:0:4 chr14 73716774 . G A 116.9 PASS AO=27;DP=63;FAO=28;FDP=64;FR=.,HEALED;FRO=35;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=0.0132078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.5285;QD=7.30609;RBI=0.0320223;REFB=-0.00707273;REVB=0.0291716;RO=26;SAF=11;SAR=16;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0925673;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0090921;OID=.;OPOS=73716774;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:64:26:35:27:28:16:11:8:18:16:12:15:20 chr14 73727509 . T G 17.62 PASS AO=6;DP=23;FAO=6;FDP=24;FR=.;FRO=18;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.0242192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.823;QD=2.93595;RBI=0.0273588;REFB=-0.00908109;REVB=-0.0127252;RO=17;SAF=1;SAR=5;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206131;STB=0.672417;TYPE=snp;VARB=0.0291746;OID=.;OPOS=73727509;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:23:24:17:18:6:6:5:1:5:12:5:1:6:12 chr14 73958375 . T C 89.21 PASS AO=20;DP=42;FAO=20;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=4;FWDB=0.00465601;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=271.729;QD=8.49583;RBI=0.00704603;REFB=-0.00128715;REVB=-0.00528848;RO=21;SAF=15;SAR=5;SRF=18;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140981;STB=0.549953;TYPE=snp;VARB=0.00160954;OID=.;OPOS=73958375;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:42:42:21:22:20:20:5:15:18:3:5:15:18:4 chr14 73958812 . T C 357.69 PASS AO=70;DP=141;FAO=79;FDP=149;FR=.;FRO=70;FSAF=38;FSAR=41;FSRF=29;FSRR=41;FWDB=-0.000557716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.145;QD=9.60246;RBI=0.0314366;REFB=-0.0269596;REVB=-0.0314317;RO=70;SAF=32;SAR=38;SRF=29;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.039324;STB=0.531461;TYPE=snp;VARB=0.0205023;OID=.;OPOS=73958812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:149:70:70:70:79:38:32:29:41:41:38:29:41 chr14 73963383 . T C 639.74 PASS AO=126;DP=223;FAO=129;FDP=225;FR=.;FRO=96;FSAF=52;FSAR=77;FSRF=49;FSRR=47;FWDB=-0.015506;FXX=0.00442458;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.709;QD=11.3732;RBI=0.0180049;REFB=-0.0227529;REVB=0.00915087;RO=96;SAF=51;SAR=75;SRF=49;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.08565;STB=0.546706;TYPE=snp;VARB=0.0142558;OID=.;OPOS=73963383;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:225:96:96:126:129:75:51:49:47:77:52:49:47 chr14 73989859 . C T 429.34 PASS AO=94;DP=175;FAO=94;FDP=178;FR=.;FRO=84;FSAF=33;FSAR=61;FSRF=36;FSRR=48;FWDB=0.0152569;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.601;QD=9.64802;RBI=0.0159309;REFB=-0.00958511;REVB=-0.00458482;RO=81;SAF=33;SAR=61;SRF=36;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0842389;STB=0.539192;TYPE=snp;VARB=0.0105986;OID=.;OPOS=73989859;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:178:81:84:94:94:61:33:36:45:61:33:36:48 chr14 74060508 . C A 110.95 PASS AO=65;DP=253;FAO=65;FDP=251;FR=.;FRO=186;FSAF=46;FSAR=19;FSRF=75;FSRR=111;FWDB=-0.00844149;FXX=0.00790483;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.069;QD=1.76817;RBI=0.01057;REFB=-0.00708659;REVB=0.00636125;RO=186;SAF=46;SAR=19;SRF=75;SRR=111;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.375159;STB=0.722242;TYPE=snp;VARB=0.0153662;OID=.;OPOS=74060508;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:253:251:186:186:65:65:19:46:75:111:19:46:75:111 chr14 74060514 . C A 21.08 PASS AO=38;DP=241;FAO=38;FDP=241;FR=.;FRO=203;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=92;FSRR=111;FWDB=0.00628145;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.898;QD=0.349847;RBI=0.0118711;REFB=-0.00572569;REVB=0.010073;RO=198;SAF=22;SAR=16;SRF=92;SRR=106;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146532;STB=0.604969;TYPE=snp;VARB=0.0740417;OID=.;OPOS=74060514;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:241:241:198:203:38:38:16:22:92:106:16:22:92:111 chr14 74060515 . T A 87.5 PASS AO=58;DP=237;FAO=58;FDP=241;FR=.;FRO=183;FSAF=40;FSAR=18;FSRF=73;FSRR=110;FWDB=0.0325835;FXX=0.00413206;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.725;QD=1.4522;RBI=0.0345613;REFB=-0.025629;REVB=-0.011524;RO=178;SAF=40;SAR=18;SRF=73;SRR=105;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.347119;STB=0.715611;TYPE=snp;VARB=0.0398127;OID=.;OPOS=74060515;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:237:241:178:183:58:58:18:40:73:105:18:40:73:110 chr14 74060517 . A G 52.64 PASS AO=52;DP=244;FAO=49;FDP=241;FR=.;FRO=192;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=80;FSRR=112;FWDB=0.0203391;FXX=0.0122946;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.89;QD=0.873634;RBI=0.0222444;REFB=-0.0231363;REVB=-0.00900735;RO=185;SAF=34;SAR=18;SRF=74;SRR=111;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.317433;STB=0.66848;TYPE=snp;VARB=0.0374344;OID=.;OPOS=74060517;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:244:241:185:192:52:49:18:34:74:111:18:31:80:112 chr14 74061968 . T C 238.6 PASS AO=56;DP=114;FAO=56;FDP=114;FR=.;FRO=58;FSAF=17;FSAR=39;FSRF=15;FSRR=43;FWDB=-0.0273351;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.033;QD=8.37174;RBI=0.0362359;REFB=-0.0223251;REVB=0.0237872;RO=58;SAF=17;SAR=39;SRF=15;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0500343;STB=0.527621;TYPE=snp;VARB=0.0188865;OID=.;OPOS=74061968;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:58:58:56:56:39:17:15:43:39:17:15:43 chr14 74164718 . A G 1625.02 PASS AO=170;DP=173;FAO=174;FDP=174;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0232868;FXX=0.011363;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.226;QD=37.3567;RBI=0.0235439;REFB=-0.132275;REVB=-0.00346999;RO=3;SAF=78;SAR=92;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00690073;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000182894;OID=.;OPOS=74164718;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:173:174:3:0:170:174:92:78:2:1:95:79:0:0 chr14 74168625 . G A 1660.17 PASS AO=175;DP=180;FAO=176;FDP=176;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=124;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02233;FXX=0.022221;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.841;QD=37.7311;RBI=0.0297892;REFB=-0.0742945;REVB=0.0197171;RO=2;SAF=52;SAR=123;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00767696;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000107649;OID=.;OPOS=74168625;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:180:176:2:0:175:176:123:52:0:2:124:52:0:0 chr14 74182810 . G A 318.03 PASS AO=60;DP=92;FAO=59;FDP=92;FR=.;FRO=33;FSAF=19;FSAR=40;FSRF=7;FSRR=26;FWDB=0.0398782;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=24.4416;QD=13.8275;RBI=0.0468437;REFB=-0.0793505;REVB=0.0245776;RO=29;SAF=18;SAR=42;SRF=7;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0429189;STB=0.546628;TYPE=snp;VARB=0.0270423;OID=.;OPOS=74182810;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:92:92:29:33:60:59:42:18:7:22:40:19:7:26 chr14 74196844 . T C 740.96 PASS AO=87;DP=96;FAO=89;FDP=98;FR=.;FRO=9;FSAF=24;FSAR=65;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=0.00604958;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=214.669;QD=30.2431;RBI=0.0121509;REFB=-0.0333956;REVB=-0.0105379;RO=6;SAF=22;SAR=65;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140211;STB=0.518799;TYPE=snp;VARB=0.000203801;OID=.;OPOS=74196844;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:96:98:6:9:87:89:65:22:1:5:65:24:1:8 chr14 74206481 . T C 279.43 PASS AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0206754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.5514;QD=38.5417;RBI=0.0358884;REFB=0;REVB=-0.0293344;RO=0;SAF=18;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00138483;OID=.;OPOS=74206481;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:29:29:0:0:29:29:11:18:0:0:11:18:0:0 chr14 74340797 . A T 2559.16 PASS AO=267;DP=269;FAO=267;FDP=267;FR=.;FRO=0;FSAF=131;FSAR=136;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162789;FXX=0.0183817;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.4922;QD=38.3394;RBI=0.0295165;REFB=0;REVB=0.0246216;RO=0;SAF=131;SAR=136;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000287286;OID=.;OPOS=74340797;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:269:267:0:0:267:267:136:131:0:0:136:131:0:0 chr14 74388908 . T C 2095.38 PASS AO=219;DP=221;FAO=221;FDP=221;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=165;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0206402;FXX=0.00896821;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.135;QD=37.9254;RBI=0.0251514;REFB=-0.0548534;REVB=0.0143728;RO=1;SAF=56;SAR=163;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00291437;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.40509e-05;OID=.;OPOS=74388908;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:91:221:221:1:0:219:221:163:56:0:1:165:56:0:0 chr14 74398828 . C T 178.47 PASS AO=42;DP=85;FAO=42;FDP=87;FR=.;FRO=45;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=0.0714755;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.3961;QD=8.20568;RBI=0.0732957;REFB=0.0112333;REVB=-0.0162335;RO=43;SAF=15;SAR=27;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103316;STB=0.571149;TYPE=snp;VARB=-0.0116909;OID=.;OPOS=74398828;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:87:43:45:42:42:27:15:20:23:27:15:22:23 chr14 74401030 . G A 346.94 PASS AO=91;DP=206;FAO=92;FDP=204;FR=.;FRO=112;FSAF=52;FSAR=40;FSRF=56;FSRR=56;FWDB=-0.0113581;FXX=0.00970827;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.519;QD=6.80283;RBI=0.0113796;REFB=0.000822589;REVB=0.000698867;RO=112;SAF=51;SAR=40;SRF=56;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0604353;STB=0.536075;TYPE=snp;VARB=-0.00103162;OID=.;OPOS=74401030;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:206:204:112:112:91:92:40:51:56:56:40:52:56:56 chr14 74404756 . T C 1203.43 PASS AO=127;DP=128;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0407001;FXX=0.00781189;HRUN=5;LEN=1;MLLD=207.008;QD=37.9034;RBI=0.0423614;REFB=-0.0884575;REVB=0.0117471;RO=0;SAF=46;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000112435;OID=.;OPOS=74404756;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:128:127:0:0:127:127:81:46:0:0:81:46:0:0 chr14 74413129 . C G 1623.38 PASS AO=176;DP=181;FAO=178;FDP=178;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00627882;FXX=0.0481258;HRUN=3;LEN=1;MLLD=201.188;QD=36.4804;RBI=0.0186396;REFB=-0.0767869;REVB=-0.0175502;RO=4;SAF=75;SAR=101;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0076231;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.89553e-05;OID=.;OPOS=74413129;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:181:178:4:0:176:178:101:75:1:3:102:76:0:0 chr14 74424938 . T C 2490.73 PASS AO=261;DP=273;FAO=264;FDP=264;FR=.;FRO=0;FSAF=134;FSAR=130;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0278116;FXX=0.036495;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.596;QD=37.7383;RBI=0.0314284;REFB=0;REVB=0.0146376;RO=0;SAF=134;SAR=127;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000689498;OID=.;OPOS=74424938;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:273:264:0:0:261:264:127:134:0:0:130:134:0:0 chr14 74425056 . C A 1765.63 PASS AO=185;DP=187;FAO=186;FDP=186;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0128391;FXX=0.0106377;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.534;QD=37.9705;RBI=0.0149972;REFB=0.0291942;REVB=0.00775056;RO=0;SAF=66;SAR=119;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.38448e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.08735e-05;OID=.;OPOS=74425056;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:187:186:0:0:185:186:119:66:0:0:120:66:0:0 chr14 74428445 . G A 1459.32 PASS AO=151;DP=151;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0262715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.051;QD=38.1521;RBI=0.038105;REFB=0;REVB=-0.0276007;RO=0;SAF=73;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000299962;OID=.;OPOS=74428445;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:151:153:0:0:151:153:78:73:0:0:79:74:0:0 chr14 74441684 . G A 896.45 PASS AO=93;DP=93;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0154981;FXX=0.0208312;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.1551;QD=38.1467;RBI=0.0156185;REFB=0;REVB=-0.00193546;RO=0;SAF=11;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.79147e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000268151;OID=.;OPOS=74441684;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:93:94:0:0:93:94:82:11:0:0:83:11:0:0 chr14 74711883 . C T 696.18 PASS AO=75;DP=77;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0495944;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.4762;QD=36.1653;RBI=0.0556363;REFB=0.0476375;REVB=-0.0252149;RO=1;SAF=46;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101759;STB=0.505262;TYPE=snp;VARB=-0.000720115;OID=.;OPOS=74711883;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:77:77:1:1:75:76:29:46:1:0:29:47:1:0 chr14 74759006 . C T 161.48 PASS AO=37;DP=75;FAO=37;FDP=75;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=0.0544532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.124;QD=8.61236;RBI=0.0582068;REFB=0.00376448;REVB=-0.0205641;RO=38;SAF=14;SAR=23;SRF=24;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229667;STB=0.627805;TYPE=snp;VARB=-0.0023818;OID=.;OPOS=74759006;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:38:38:37:37:23:14:24:14:23:14:24:14 chr14 74759301 . G T 93.91 PASS AO=17;DP=39;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.00735808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.2053;QD=8.7362;RBI=0.13461;REFB=-0.0334686;REVB=0.134409;RO=22;SAF=13;SAR=4;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.250006;STB=0.539133;TYPE=snp;VARB=0.050773;OID=.;OPOS=74759301;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:39:43:22:22:17:21:4:13:12:10:8:13:12:10 chr14 74759477 . C T 334.09 PASS AO=83;DP=178;FAO=83;FDP=175;FR=.;FRO=92;FSAF=37;FSAR=46;FSRF=45;FSRR=47;FWDB=0.000667575;FXX=0.0331473;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.4869;QD=7.63636;RBI=0.0239872;REFB=-0.00985427;REVB=0.0239779;RO=89;SAF=38;SAR=45;SRF=43;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0238424;STB=0.522939;TYPE=snp;VARB=0.00874133;OID=.;OPOS=74759477;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:175:89:92:83:83:45:38:43:46:46:37:45:47 chr14 74766352 . A G 224.35 PASS AO=71;DP=173;FAO=69;FDP=174;FR=.;FRO=105;FSAF=40;FSAR=29;FSRF=45;FSRR=60;FWDB=0.047817;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4036;QD=5.15757;RBI=0.0501795;REFB=-0.00999371;REVB=0.0152158;RO=102;SAF=40;SAR=31;SRF=45;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128155;STB=0.590845;TYPE=snp;VARB=0.0292094;OID=.;OPOS=74766352;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:174:102:105:71:69:31:40:45:57:29:40:45:60 chr14 74824575 . GC G 134.46 PASS AO=24;DP=39;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.275697;FXX=0.0270197;HRUN=6;LEN=1;MLLD=7.04955;QD=14.9399;RBI=0.386852;REFB=-0.00173472;REVB=0.271377;RO=10;SAF=5;SAR=19;SRF=2;SRR=8;SSEN=0.54717;SSEP=0;SSSB=0.00680492;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0292149;OID=.;OPOS=74824576;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:24:37:36:36:0:7:29:0:0:12:10:5:19:2:8 chr14 74943295 . T C 32.94 PASS AO=11;DP=36;FAO=11;FDP=36;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0378959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.4974;QD=3.65978;RBI=0.0433129;REFB=-0.00042314;REVB=0.0209741;RO=25;SAF=7;SAR=4;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136125;STB=0.583179;TYPE=snp;VARB=0.00165359;OID=.;OPOS=74943295;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:36:36:25:25:11:11:4:7:13:12:4:7:13:12 chr14 74975958 . AG A 28.12 PASS AO=25;DP=83;FAO=28;FDP=80;FR=.;FRO=52;FSAF=23;FSAR=5;FSRF=24;FSRR=28;FWDB=-0.265475;FXX=0.0123442;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.0592;QD=1.40601;RBI=0.286955;REFB=-0.0852181;REVB=0.108934;RO=38;SAF=21;SAR=4;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0.384615;SSSB=0.513255;STB=0.763376;TYPE=del;VARB=0.12401;OID=.;OPOS=74975959;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:25:79:28:80:52:23:5:24:28:28:38:21:4:15:23 chr14 74991855 . A G 289.73 PASS AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.643;QD=37.3848;RBI=0.077492;REFB=0;REVB=0.0765938;RO=0;SAF=17;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.63861e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000554209;OID=.;OPOS=74991855;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:30:31:0:0:30:31:13:17:0:0:13:18:0:0 chr14 74992800 . A G 183.53 PASS AO=41;DP=83;FAO=42;FDP=84;FR=.;FRO=42;FSAF=29;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=-0.0220347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.099;QD=8.73966;RBI=0.0264141;REFB=-0.0108018;REVB=0.0145664;RO=42;SAF=29;SAR=12;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226404;STB=0.61435;TYPE=snp;VARB=0.0110616;OID=.;OPOS=74992800;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:84:42:42:41:42:12:29:20:22:13:29:20:22 chr14 75230837 . A G 273.34 PASS AO=48;DP=77;FAO=49;FDP=77;FR=.;FRO=28;FSAF=18;FSAR=31;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.00796671;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.6869;QD=14.1996;RBI=0.0318344;REFB=-0.0675148;REVB=0.0308214;RO=29;SAF=18;SAR=30;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00317498;STB=0.509922;TYPE=snp;VARB=0.0305052;OID=.;OPOS=75230837;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:77:77:29:28:48:49:30:18:11:18:31:18:11:17 chr14 75279395 . T A 270.98 PASS AO=43;DP=160;FAO=72;FDP=161;FR=.;FRO=89;FSAF=49;FSAR=23;FSRF=39;FSRR=50;FWDB=-0.02697;FXX=0.024241;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.817;QD=6.73237;RBI=0.0270301;REFB=-0.0153778;REVB=-0.0018016;RO=74;SAF=22;SAR=21;SRF=30;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117512;STB=0.638596;TYPE=snp;VARB=0.0260168;OID=.;OPOS=75279395;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:161:74:89:43:72:21:22:30:44:23:49:39:50 chr14 75359670 . G A 118.34 PASS AO=40;DP=117;FAO=42;FDP=123;FR=.;FRO=81;FSAF=6;FSAR=36;FSRF=18;FSRR=63;FWDB=0.0214582;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.446;QD=3.8483;RBI=0.0224019;REFB=-0.00738261;REVB=-0.00643353;RO=76;SAF=7;SAR=33;SRF=16;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0660767;STB=0.592543;TYPE=snp;VARB=0.0139963;OID=.;OPOS=75359670;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:123:76:81:40:42:33:7:16:60:36:6:18:63 chr14 75367807 . C T 962.96 PASS AO=224;DP=421;FAO=212;FDP=398;FR=.;FRO=186;FSAF=120;FSAR=92;FSRF=92;FSRR=94;FWDB=0.0220541;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.7964;QD=9.67802;RBI=0.0341873;REFB=-0.0222415;REVB=-0.0261226;RO=195;SAF=125;SAR=99;SRF=96;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0565393;STB=0.533662;TYPE=snp;VARB=0.0155799;OID=.;OPOS=75367807;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:421:398:195:186:224:212:99:125:96:99:92:120:92:94 chr14 75386576 . G A 102.61 PASS AO=26;DP=58;FAO=26;FDP=60;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=31;FSRR=3;FWDB=-0.0436061;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.323;QD=6.84049;RBI=0.0487261;REFB=-0.0354423;REVB=0.0217427;RO=32;SAF=16;SAR=10;SRF=29;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.332716;STB=0.693099;TYPE=snp;VARB=0.0456985;OID=.;OPOS=75386576;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:60:32:34:26:26:10:16:29:3:10:16:31:3 chr14 75388183 . C T 115.29 PASS AO=20;DP=32;FAO=20;FDP=32;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0332518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.555;QD=14.4107;RBI=0.0335131;REFB=-0.00358773;REVB=-0.00417719;RO=12;SAF=10;SAR=10;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0562357;STB=0.531219;TYPE=snp;VARB=0.00388414;OID=.;OPOS=75388183;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:32:32:12:12:20:20:10:10:5:7:10:10:5:7 chr14 75412908 . A G 450.27 PASS AO=44;DP=45;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0188266;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.19;QD=36.7569;RBI=0.0246397;REFB=-0.0431066;REVB=-0.0158957;RO=1;SAF=27;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170841;STB=0.509087;TYPE=snp;VARB=0.00231001;OID=.;OPOS=75412908;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:45:49:1:1:44:48:17:27:1:0:21:27:1:0 chr14 75483812 . T C 429.13 PASS AO=109;DP=235;FAO=110;FDP=237;FR=.;FRO=127;FSAF=54;FSAR=56;FSRF=68;FSRR=59;FWDB=-0.0223493;FXX=0.00836785;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.629;QD=7.24261;RBI=0.0249889;REFB=-0.0278913;REVB=-0.0111784;RO=125;SAF=54;SAR=55;SRF=66;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0314994;STB=0.523842;TYPE=snp;VARB=0.0310266;OID=.;OPOS=75483812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:235:237:125:127:109:110:55:54:66:59:56:54:68:59 chr14 75513828 . G A 492.91 PASS AO=104;DP=190;FAO=105;FDP=193;FR=.;FRO=88;FSAF=58;FSAR=47;FSRF=46;FSRR=42;FWDB=-0.0216074;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5986;QD=10.2159;RBI=0.0254345;REFB=0.00409157;REVB=-0.0134178;RO=86;SAF=57;SAR=47;SRF=45;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0207412;STB=0.513629;TYPE=snp;VARB=-0.00383187;OID=.;OPOS=75513828;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:193:86:88:104:105:47:57:45:41:47:58:46:42 chr14 75513883 . T C 1605.54 PASS AO=170;DP=172;FAO=170;FDP=170;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0179875;FXX=0.0116272;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.527;QD=37.7775;RBI=0.0463718;REFB=-0.0589237;REVB=0.042741;RO=1;SAF=96;SAR=74;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00638833;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.33308e-05;OID=.;OPOS=75513883;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:172:170:1:0:170:170:74:96:0:1:74:96:0:0 chr14 75514489 . C G 426.05 PASS AO=88;DP=161;FAO=88;FDP=159;FR=.;FRO=71;FSAF=50;FSAR=38;FSRF=34;FSRR=37;FWDB=-0.00388273;FXX=0.00624961;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.2213;QD=10.7182;RBI=0.0113849;REFB=-0.0330936;REVB=-0.0107024;RO=71;SAF=50;SAR=38;SRF=34;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0736198;STB=0.540181;TYPE=snp;VARB=0.0141169;OID=.;OPOS=75514489;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:159:71:71:88:88:38:50:34:37:38:50:34:37 chr14 75530167 . A C 245.58 PASS AO=61;DP=153;FAO=73;FDP=185;FR=.,HEALED;FRO=111;FSAF=30;FSAR=43;FSRF=60;FSRR=51;FWDB=-0.0235775;FXX=0.0263144;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.774;QD=5.30992;RBI=0.0236311;REFB=-0.0130929;REVB=-0.00159094;RO=62;SAF=27;SAR=34;SRF=56;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.410096;STB=0.578454;TYPE=snp;VARB=0.0150447;OID=.;OPOS=75530167;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:185:62:111:61:73:34:27:56:6:43:30:60:51 chr14 75537381 . C T 166.96 PASS AO=48;DP=121;FAO=49;FDP=122;FR=.;FRO=73;FSAF=11;FSAR=38;FSRF=31;FSRR=42;FWDB=-0.00415148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.957;QD=5.47423;RBI=0.00745214;REFB=-0.0103872;REVB=0.00618866;RO=72;SAF=11;SAR=37;SRF=30;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23785;STB=0.644524;TYPE=snp;VARB=0.0176416;OID=.;OPOS=75537381;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:122:72:73:48:49:37:11:30:42:38:11:31:42 chr14 75538217 . G T 68.01 PASS AO=22;DP=63;FAO=22;FDP=63;FR=.;FRO=41;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=28;FWDB=0.0009036;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0322;QD=4.31798;RBI=0.011852;REFB=0.00479132;REVB=0.0118175;RO=40;SAF=11;SAR=11;SRF=12;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223697;STB=0.618945;TYPE=snp;VARB=-0.00888297;OID=.;OPOS=75538217;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:63:63:40:41:22:22:11:11:12:28:11:11:13:28 chr14 75544470 . T A 155.53 PASS AO=41;DP=94;FAO=42;FDP=95;FR=.;FRO=53;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=15;FSRR=38;FWDB=-0.00385958;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.473;QD=6.54871;RBI=0.0118089;REFB=-0.0118677;REVB=-0.0111604;RO=52;SAF=13;SAR=28;SRF=14;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0564451;STB=0.532243;TYPE=snp;VARB=0.0151612;OID=.;OPOS=75544470;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:95:52:53:41:42:28:13:14:38:28:14:15:38 chr14 75574087 . C T 212.75 PASS AO=53;DP=114;FAO=53;FDP=114;FR=.;FRO=61;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=35;FSRR=26;FWDB=0.0139642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.241;QD=7.46485;RBI=0.027009;REFB=-0.020498;REVB=0.023119;RO=60;SAF=33;SAR=20;SRF=35;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0394666;STB=0.527439;TYPE=snp;VARB=0.0188132;OID=.;OPOS=75574087;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:60:61:53:53:20:33:35:25:20:33:35:26 chr14 75590822 . G A 307.07 PASS AO=80;DP=182;FAO=82;FDP=185;FR=.;FRO=103;FSAF=55;FSAR=27;FSRF=39;FSRR=64;FWDB=0.0186153;FXX=0.00537606;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.2772;QD=6.63945;RBI=0.0202351;REFB=-0.0325835;REVB=-0.00793282;RO=98;SAF=53;SAR=27;SRF=36;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.292434;STB=0.663489;TYPE=snp;VARB=0.0362152;OID=.;OPOS=75590822;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:185:98:103:80:82:27:53:36:62:27:55:39:64 chr14 75590846 . A T 404.98 PASS AO=94;DP=182;FAO=94;FDP=187;FR=.;FRO=93;FSAF=33;FSAR=61;FSRF=57;FSRR=36;FWDB=-0.0215254;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.022;QD=8.66265;RBI=0.0264204;REFB=-0.0246629;REVB=0.0153196;RO=88;SAF=33;SAR=61;SRF=53;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224921;STB=0.63166;TYPE=snp;VARB=0.0247463;OID=.;OPOS=75590846;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:187:88:93:94:94:61:33:53:35:61:33:57:36 chr14 75600697 . C T 65.71 PASS AO=21;DP=56;FAO=21;FDP=56;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=0.00206464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.06;QD=4.69374;RBI=0.00301856;REFB=-0.00593504;REVB=-0.00220204;RO=35;SAF=10;SAR=11;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0102856;STB=0.505957;TYPE=snp;VARB=0.0145573;OID=.;OPOS=75600697;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:56:56:35:35:21:21:11:10:17:18:11:10:17:18 chr14 75705656 . G A 209.76 PASS AO=50;DP=105;FAO=51;FDP=108;FR=.;FRO=57;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=38;FSRR=19;FWDB=-0.0455229;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.9652;QD=7.76888;RBI=0.0476044;REFB=-0.012972;REVB=0.0139229;RO=55;SAF=27;SAR=23;SRF=36;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109967;STB=0.573291;TYPE=snp;VARB=0.00804742;OID=.;OPOS=75705656;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:108:55:57:50:51:23:27:36:19:24:27:38:19 chr14 75705863 . C T 273.74 PASS AO=78;DP=186;FAO=78;FDP=185;FR=.;FRO=107;FSAF=45;FSAR=33;FSRF=67;FSRR=40;FWDB=0.00854809;FXX=0.00537606;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.342;QD=5.91864;RBI=0.0188797;REFB=-0.00341738;REVB=-0.0168337;RO=107;SAF=45;SAR=33;SRF=67;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0527152;STB=0.52943;TYPE=snp;VARB=0.00352251;OID=.;OPOS=75705863;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:185:107:107:78:78:33:45:67:40:33:45:67:40 chr14 75745754 . CG C 242.98 PASS AO=21;DP=43;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0527803;FXX=0.0454442;HRUN=4;LEN=1;MLLD=14.5092;QD=23.141;RBI=0.150019;REFB=-0.0198675;REVB=0.140428;RO=4;SAF=5;SAR=16;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260198;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0197818;OID=.;OPOS=75745755;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:21:39:42:42:0:17:25:0:0:20:4:5:16:4:0 chr14 75746690 . C T 356.16 PASS AO=38;DP=40;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.033053;FXX=0.0249938;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.8059;QD=36.5296;RBI=0.0546424;REFB=-0.0969477;REVB=0.043512;RO=0;SAF=11;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509086;TYPE=snp;VARB=0.00182236;OID=.;OPOS=75746690;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:40:39:0:1:38:38:27:11:0:0:27:11:0:1 chr14 75758885 . A G 1215.2 PASS AO=128;DP=130;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00982441;FXX=0.0151504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4567;QD=37.3908;RBI=0.01859;REFB=-0.103314;REVB=0.0157819;RO=0;SAF=65;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.1359e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.84724e-05;OID=.;OPOS=75758885;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:130:130:0:0:128:130:63:65:0:0:65:65:0:0 chr14 75759060 . C T 98.28 PASS AO=29;DP=86;FAO=30;FDP=84;FR=.;FRO=54;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=34;FWDB=0.0302972;FXX=0.142843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.517;QD=4.68015;RBI=0.0328809;REFB=-0.0189297;REVB=-0.0127763;RO=51;SAF=8;SAR=21;SRF=18;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100529;STB=0.551595;TYPE=snp;VARB=0.0456433;OID=.;OPOS=75759060;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:86:84:51:54:29:30:21:8:18:33:21:9:20:34 chr14 75904660 . A G 777.03 PASS AO=80;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0674558;FXX=0.0238067;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.116;QD=37.9041;RBI=0.0769856;REFB=0;REVB=-0.0371011;RO=0;SAF=29;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.51863e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000121852;OID=.;OPOS=75904660;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:82:82:0:0:80:82:51:29:0:0:53:29:0:0 chr14 75936790 . GCC GC,G 156.22 PASS AO=20,12;DP=44;FAO=33,6;FDP=43;FR=.;FRO=4;FSAF=27,6;FSAR=6,0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.160145,-0.0826529;FXX=0.0227221;HRUN=3,3;LEN=1,2;MLLD=10.5891,15.5638;QD=14.5317;RBI=0.390642,0.232612;REFB=0.174323,0.10397;REVB=0.356307,0.217433;RO=9;SAF=17,12;SAR=3,0;SRF=6;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.172822,0.803185;STB=0.534463,0.5;TYPE=del,del;VARB=-0.0271539,0.0493282;OID=.,.;OPOS=75936791,75936791;OREF=C,CC;OALT=-,-;OMAPALT=GC,G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:20,12:44:33,6:43:4:27,6:6,0:4:0:3:9:17,12:3,0:6:3 chr14 75937022 . G A 592.8 PASS AO=62;DP=62;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0435854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.21;QD=37.05;RBI=0.046142;REFB=0;REVB=-0.015146;RO=0;SAF=33;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000137077;OID=.;OPOS=75937022;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:62:64:0:0:62:64:29:33:0:0:29:35:0:0 chr14 76045858 . G A 37.72 PASS AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=-0.0143833;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.574;QD=8.38325;RBI=0.0177885;REFB=-0.0267728;REVB=-0.0104666;RO=10;SAF=4;SAR=4;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.283851;STB=0.666296;TYPE=snp;VARB=0.0336282;OID=.;OPOS=76045858;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:18:18:10:10:8:8:4:4:2:8:4:4:2:8 chr14 76045963 . C G 141.86 PASS AO=21;DP=29;FAO=21;FDP=29;FR=.;FRO=8;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.00923668;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.3228;QD=19.567;RBI=0.00950636;REFB=0.0231472;REVB=-0.00224824;RO=8;SAF=10;SAR=11;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.051041;STB=0.528026;TYPE=snp;VARB=-0.0101645;OID=.;OPOS=76045963;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:29:29:8:8:21:21:11:10:3:5:11:10:3:5 chr14 76156609 . C T 211.41 PASS AO=54;DP=128;FAO=59;FDP=134;FR=.;FRO=75;FSAF=33;FSAR=26;FSRF=32;FSRR=43;FWDB=0.0047626;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.01;QD=6.31086;RBI=0.0390264;REFB=-0.014391;REVB=0.0387347;RO=70;SAF=31;SAR=23;SRF=30;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146438;STB=0.57396;TYPE=snp;VARB=0.0152229;OID=.;OPOS=76156609;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:134:70:75:54:59:23:31:30:40:26:33:32:43 chr14 76175565 . C A 223.54 PASS AO=63;DP=150;FAO=63;FDP=150;FR=.;FRO=87;FSAF=37;FSAR=26;FSRF=32;FSRR=55;FWDB=-0.0248986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.295;QD=5.96114;RBI=0.0250197;REFB=-0.00335737;REVB=-0.00245931;RO=87;SAF=37;SAR=26;SRF=32;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.224443;STB=0.625509;TYPE=snp;VARB=0.00456331;OID=.;OPOS=76175565;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:150:87:87:63:63:26:37:32:55:26:37:32:55 chr14 76175594 . G A 177.85 PASS AO=50;DP=122;FAO=50;FDP=120;FR=.;FRO=70;FSAF=33;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=46;FWDB=0.0288726;FXX=0.0163921;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.847;QD=5.9284;RBI=0.0315669;REFB=-0.000916478;REVB=0.0127609;RO=72;SAF=33;SAR=17;SRF=24;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.335973;STB=0.682015;TYPE=snp;VARB=0.00168456;OID=.;OPOS=76175594;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:120:72:70:50:50:17:33:24:48:17:33:24:46 chr14 76224153 . T A 294.33 PASS AO=83;DP=201;FAO=85;FDP=202;FR=.;FRO=117;FSAF=51;FSAR=34;FSRF=49;FSRR=68;FWDB=0.00421695;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.5784;QD=5.82831;RBI=0.0232542;REFB=0.00632593;REVB=0.0228686;RO=118;SAF=51;SAR=32;SRF=49;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20863;STB=0.604719;TYPE=snp;VARB=-0.00861748;OID=.;OPOS=76224153;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:202:118:117:83:85:32:51:49:69:34:51:49:68 chr14 76330181 . G A 108.93 PASS AO=27;DP=60;FAO=27;FDP=61;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=24;FWDB=-0.025575;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.786;QD=7.14323;RBI=0.0325406;REFB=-0.0108816;REVB=0.0201199;RO=32;SAF=10;SAR=17;SRF=8;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12949;STB=0.546633;TYPE=snp;VARB=0.0125337;OID=.;OPOS=76330181;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:61:32:34:27:27:17:10:8:24:17:10:10:24 chr14 76349049 . C T 137.06 PASS AO=42;DP=109;FAO=42;FDP=109;FR=.;FRO=67;FSAF=29;FSAR=13;FSRF=42;FSRR=25;FWDB=-0.0135654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.319;QD=5.02975;RBI=0.0642035;REFB=-0.0180605;REVB=-0.062754;RO=67;SAF=29;SAR=13;SRF=42;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0774719;STB=0.544176;TYPE=snp;VARB=0.0220968;OID=.;OPOS=76349049;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:67:67:42:42:13:29:42:25:13:29:42:25 chr14 76370530 . T C 338.08 PASS AO=69;DP=136;FAO=76;FDP=141;FR=.;FRO=65;FSAF=20;FSAR=56;FSRF=28;FSRR=37;FWDB=0.0543254;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.383;QD=9.59091;RBI=0.0551749;REFB=-0.0373904;REVB=-0.00964516;RO=66;SAF=13;SAR=56;SRF=29;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.288398;STB=0.591004;TYPE=snp;VARB=0.0358478;OID=.;OPOS=76370530;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:141:66:65:69:76:56:13:29:37:56:20:28:37 chr14 76619167 . A C 1196.8 PASS AO=131;DP=136;FAO=132;FDP=136;FR=.;FRO=4;FSAF=68;FSAR=64;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.00333202;FXX=0.00729874;HRUN=3;LEN=1;MLLD=108.633;QD=35.2;RBI=0.0191982;REFB=-0.0884358;REVB=0.0189069;RO=3;SAF=68;SAR=63;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00628803;STB=0.500446;TYPE=snp;VARB=8.85215e-06;OID=.;OPOS=76619167;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:136:136:3:4:131:132:63:68:2:1:64:68:2:2 chr14 76662446 . C T 1502.76 PASS AO=160;DP=160;FAO=161;FDP=161;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0699647;FXX=0.00617246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.5884;QD=37.3358;RBI=0.0703136;REFB=0;REVB=-0.00699606;RO=0;SAF=61;SAR=99;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.49476e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00253013;OID=.;OPOS=76662446;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:160:161:0:0:160:161:99:61:0:0:100:61:0:0 chr14 76957887 . T C 712.11 PASS AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0247708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.7814;QD=37.9792;RBI=0.0272227;REFB=0;REVB=0.011291;RO=0;SAF=37;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.88354e-05;OID=.;OPOS=76957887;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:75:75:0:0:75:75:38:37:0:0:38:37:0:0 chr14 77236380 . C T 893.1 PASS AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0704596;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.3066;QD=38.0044;RBI=0.0722009;REFB=0;REVB=0.0157616;RO=0;SAF=11;SAR=83;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000539288;OID=.;OPOS=77236380;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:94:94:0:0:94:94:83:11:0:0:83:11:0:0 chr14 77239567 . A G 908.72 PASS AO=97;DP=103;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175195;FXX=0.0582468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.551;QD=37.4731;RBI=0.0189293;REFB=0.0110147;REVB=-0.00716837;RO=0;SAF=50;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.68933e-05;OID=.;OPOS=77239567;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:103:97:0:0:97:97:47:50:0:0:47:50:0:0 chr14 77293018 . GC G 456.13 PASS AO=57;DP=99;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.333823;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.1813;QD=23.3914;RBI=0.348776;REFB=-0.0297997;REVB=0.10103;RO=12;SAF=25;SAR=32;SRF=10;SRR=2;SSEN=0.299398;SSEP=0;SSSB=-0.128208;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.016182;OID=.;OPOS=77293019;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:57:77:78:78:0:42:36:0:0:35:12:25:32:10:2 chr14 77294950 . C T 1130.4 PASS AO=118;DP=118;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00551354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.1596;QD=38.3188;RBI=0.0253918;REFB=0;REVB=0.024786;RO=0;SAF=35;SAR=83;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.61457e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.24297e-05;OID=.;OPOS=77294950;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:118:118:0:0:118:118:83:35:0:0:83:35:0:0 chr14 77332367 . C T 1765.82 PASS AO=135;DP=209;FAO=197;FDP=205;FR=.;FRO=8;FSAF=62;FSAR=135;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.000680927;FXX=0.00966137;HRUN=4;LEN=1;MLLD=120.111;QD=34.455;RBI=0.0371928;REFB=0.0329309;REVB=0.0371866;RO=1;SAF=1;SAR=134;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00353492;STB=0.502934;TYPE=snp;VARB=-0.000309811;OID=.;OPOS=77332367;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:140:205:1:8:135:197:134:1:0:1:135:62:2:6 chr14 77332408 . T C 287.03 PASS AO=87;DP=219;FAO=87;FDP=217;FR=.;FRO=130;FSAF=32;FSAR=55;FSRF=36;FSRR=94;FWDB=-0.00158217;FXX=0.0180987;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.9667;QD=5.29093;RBI=0.0232944;REFB=-0.02806;REVB=-0.0232406;RO=129;SAF=32;SAR=55;SRF=36;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105204;STB=0.5604;TYPE=snp;VARB=0.0396827;OID=.;OPOS=77332408;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:219:217:129:130:87:87:55:32:36:93:55:32:36:94 chr14 77492891 . G A 976.04 PASS AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.895;QD=37.9044;RBI=0.0329414;REFB=0;REVB=0.0253359;RO=0;SAF=51;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.77084e-05;OID=.;OPOS=77492891;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:103:103:0:0:103:103:52:51:0:0:52:51:0:0 chr14 77494682 . G A 272.56 PASS AO=29;DP=31;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.126555;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.2356;QD=34.0699;RBI=0.147772;REFB=-0.110267;REVB=0.0762912;RO=2;SAF=10;SAR=19;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0465475;STB=0.512187;TYPE=snp;VARB=0.0103963;OID=.;OPOS=77494682;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:31:32:2:1:29:31:19:10:0:2:20:11:0:1 chr14 77494845 . G C 10.38 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.818;QD=5.93125;RBI=0.0321403;REFB=-0.0173517;REVB=0.0321403;RO=5;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0460035;OID=.;OPOS=77494845;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:5:5:2:2:2:0:0:5:2:0:0:5 chr14 77691753 . T C 12.17 PASS AO=5;DP=25;FAO=5;FDP=25;FR=.;FRO=20;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.0035655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.991;QD=1.94763;RBI=0.0109546;REFB=-0.00217017;REVB=0.0103581;RO=20;SAF=1;SAR=4;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.368133;STB=0.757524;TYPE=snp;VARB=0.0113672;OID=.;OPOS=77691753;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:25:25:20:20:5:5:4:1:10:10:4:1:10:10 chr14 77697967 . A G 1215.48 PASS AO=128;DP=130;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168322;FXX=0.0153834;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.782;QD=37.9839;RBI=0.0233824;REFB=-0.0404023;REVB=0.0162301;RO=0;SAF=96;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4231e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.18788e-05;OID=.;OPOS=77697967;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:130:128:0:0:128:128:32:96:0:0:32:96:0:0 chr14 77708804 . C T 547.08 PASS AO=60;DP=62;FAO=61;FDP=63;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0152808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.528;QD=34.7349;RBI=0.042881;REFB=-0.0417533;REVB=-0.0400659;RO=1;SAF=27;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140874;STB=0.514701;TYPE=snp;VARB=0.00616714;OID=.;OPOS=77708804;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:62:63:1:2:60:61:33:27:0:1:33:28:0:2 chr14 77745193 . A C 163.67 PASS AO=45;DP=106;FAO=45;FDP=108;FR=.;FRO=63;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=26;FSRR=37;FWDB=-0.00639002;FXX=0.0270246;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.2;QD=6.06187;RBI=0.0141455;REFB=-0.0163668;REVB=-0.0126199;RO=61;SAF=17;SAR=28;SRF=26;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0518963;STB=0.521428;TYPE=snp;VARB=0.0206216;OID=.;OPOS=77745193;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:108:61:63:45:45:28:17:26:35:28:17:26:37 chr14 77746777 . A G 83.93 PASS AO=32;DP=101;FAO=32;FDP=100;FR=.;FRO=68;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=43;FSRR=25;FWDB=0.00770112;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.26;QD=3.35707;RBI=0.023499;REFB=0.000873861;REVB=-0.0222012;RO=65;SAF=17;SAR=15;SRF=42;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134852;STB=0.569578;TYPE=snp;VARB=-0.00309322;OID=.;OPOS=77746777;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:101:100:65:68:32:32:15:17:42:23:15:17:43:25 chr14 77751925 . C T 492.02 PASS AO=102;DP=188;FAO=104;FDP=190;FR=.;FRO=86;FSAF=28;FSAR=76;FSRF=40;FSRR=46;FWDB=0.071717;FXX=0.00523533;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.1202;QD=10.3584;RBI=0.110395;REFB=0.0109813;REVB=0.0839268;RO=86;SAF=27;SAR=75;SRF=40;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193195;STB=0.60203;TYPE=snp;VARB=-0.0083869;OID=.;OPOS=77751925;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:190:86:86:102:104:75:27:40:46:76:28:40:46 chr14 77794283 . T C 92.05 PASS AO=36;DP=113;FAO=36;FDP=113;FR=.;FRO=77;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=37;FSRR=40;FWDB=-0.0174914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8192;QD=3.25831;RBI=0.0177854;REFB=-0.0100582;REVB=0.00322052;RO=77;SAF=14;SAR=22;SRF=37;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109343;STB=0.563783;TYPE=snp;VARB=0.0216562;OID=.;OPOS=77794283;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:113:113:77:77:36:36:22:14:37:40:22:14:37:40 chr14 77796641 . G A 94.01 PASS AO=32;DP=90;FAO=32;FDP=92;FR=.;FRO=60;FSAF=8;FSAR=24;FSRF=19;FSRR=41;FWDB=0.102906;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.2435;QD=4.08722;RBI=0.110738;REFB=0.00986486;REVB=0.0409048;RO=57;SAF=8;SAR=24;SRF=19;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114574;STB=0.554759;TYPE=snp;VARB=-0.016363;OID=.;OPOS=77796641;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:90:92:57:60:32:32:24:8:19:38:24:8:19:41 chr14 77843814 . T C 351.11 PASS AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0486929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.058;QD=37.9583;RBI=0.0487887;REFB=0;REVB=0.00305556;RO=0;SAF=24;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000146952;OID=.;OPOS=77843814;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:37:37:0:0:37:37:13:24:0:0:13:24:0:0 chr14 77843971 . C T 1316.62 PASS AO=137;DP=138;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0377748;FXX=0.00724585;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.8535;QD=38.4414;RBI=0.097921;REFB=0;REVB=0.0903415;RO=0;SAF=55;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000690291;OID=.;OPOS=77843971;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:138:137:0:0:137:137:82:55:0:0:82:55:0:0 chr14 77844265 . G A 724.77 PASS AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00394528;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.0286;QD=38.1458;RBI=0.0169872;REFB=0;REVB=-0.0165227;RO=0;SAF=42;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6391e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.94643e-05;OID=.;OPOS=77844265;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:76:76:0:0:76:76:34:42:0:0:34:42:0:0 chr14 77844592 . T A 484.56 PASS AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.2273;QD=38.7648;RBI=0.104204;REFB=0;REVB=0.103597;RO=0;SAF=42;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.81061e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00121569;OID=.;OPOS=77844592;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:50:50:0:0:50:50:8:42:0:0:8:42:0:0 chr14 77844869 . A G 860.85 PASS AO=71;DP=108;FAO=104;FDP=108;FR=.;FRO=4;FSAF=67;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.00836865;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=38.9121;QD=31.8833;RBI=0.00963218;REFB=-0.120194;REVB=0.00476913;RO=7;SAF=49;SAR=22;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0773464;STB=0.515778;TYPE=snp;VARB=0.00804746;OID=.;OPOS=77844869;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:81:108:7:4:71:104:22:49:2:5:37:67:1:3 chr14 77845121 . A G 841.42 PASS AO=98;DP=105;FAO=98;FDP=105;FR=.;FRO=7;FSAF=15;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0.0317173;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=81.8124;QD=32.054;RBI=0.0666355;REFB=-0.096054;REVB=0.0586029;RO=7;SAF=15;SAR=83;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0383405;STB=0.520227;TYPE=snp;VARB=0.00172743;OID=.;OPOS=77845121;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:105:105:7:7:98:98:83:15:0:7:83:15:0:7 chr14 77880305 . C T 115.26 PASS AO=21;DP=38;FAO=22;FDP=39;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=-0.00670752;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.6789;QD=11.8217;RBI=0.0227391;REFB=-0.0504408;REVB=-0.0217273;RO=17;SAF=8;SAR=13;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.256824;STB=0.627472;TYPE=snp;VARB=0.0427951;OID=.;OPOS=77880305;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:38:39:17:17:21:22:13:8:12:5:13:9:12:5 chr14 77928525 . A G 280.31 PASS AO=66;DP=134;FAO=66;FDP=134;FR=.;FRO=68;FSAF=24;FSAR=42;FSRF=31;FSRR=37;FWDB=0.0115354;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.3032;QD=8.36757;RBI=0.0223587;REFB=-0.000423089;REVB=-0.0191533;RO=68;SAF=24;SAR=42;SRF=31;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0889581;STB=0.5492;TYPE=snp;VARB=0.000370195;OID=.;OPOS=77928525;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:68:68:66:66:42:24:31:37:42:24:31:37 chr14 77951124 . C T 261.91 PASS AO=50;DP=83;FAO=50;FDP=84;FR=.;FRO=34;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.0180266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.084;QD=12.4721;RBI=0.0184752;REFB=-0.0147168;REVB=0.00404657;RO=33;SAF=27;SAR=23;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0181863;STB=0.516246;TYPE=snp;VARB=0.015925;OID=.;OPOS=77951124;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:84:33:34:50:50:23:27:17:16:23:27:17:17 chr14 77976325 . T C 112.33 PASS AO=34;DP=88;FAO=34;FDP=88;FR=.;FRO=54;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=32;FWDB=-0.00841868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.931;QD=5.10605;RBI=0.0431084;REFB=-0.0096432;REVB=-0.0422784;RO=54;SAF=17;SAR=17;SRF=22;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0997128;STB=0.556785;TYPE=snp;VARB=0.013854;OID=.;OPOS=77976325;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:54:54:34:34:17:17:22:32:17:17:22:32 chr14 77987958 . C A 253.69 PASS AO=67;DP=150;FAO=67;FDP=151;FR=.;FRO=84;FSAF=27;FSAR=40;FSRF=46;FSRR=38;FWDB=-0.00534704;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.057;QD=6.72037;RBI=0.00542304;REFB=-0.00900505;REVB=-0.000904669;RO=82;SAF=27;SAR=40;SRF=44;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133209;STB=0.580955;TYPE=snp;VARB=0.0163213;OID=.;OPOS=77987958;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:151:82:84:67:67:40:27:44:38:40:27:46:38 chr14 78028803 . A G 1037.04 PASS AO=106;DP=106;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0127175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.438;QD=38.4088;RBI=0.0128632;REFB=0;REVB=-0.00193045;RO=0;SAF=44;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.48169e-05;OID=.;OPOS=78028803;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:106:108:0:0:106:108:62:44:0:0:62:46:0:0 chr14 78174473 . A C 1449.52 PASS AO=152;DP=152;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00768724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4938;QD=38.1452;RBI=0.0452242;REFB=0;REVB=-0.044566;RO=0;SAF=60;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000150894;OID=.;OPOS=78174473;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:152:152:0:0:152:152:92:60:0:0:92:60:0:0 chr14 78184566 . C A 320.29 PASS AO=96;DP=245;FAO=99;FDP=247;FR=.;FRO=148;FSAF=67;FSAR=32;FSRF=97;FSRR=51;FWDB=-0.0107644;FXX=0.0040321;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.673;QD=5.18683;RBI=0.014069;REFB=-0.0105305;REVB=-0.00905902;RO=147;SAF=65;SAR=31;SRF=97;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0210053;STB=0.514476;TYPE=snp;VARB=0.0160953;OID=.;OPOS=78184566;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:245:247:147:148:96:99:31:65:97:50:32:67:97:51 chr14 78197365 . C T 155.25 PASS AO=34;DP=70;FAO=35;FDP=71;FR=.;FRO=36;FSAF=25;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=0.00630392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.443;QD=8.74621;RBI=0.0202039;REFB=0.00306305;REVB=-0.0191953;RO=36;SAF=24;SAR=10;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154061;STB=0.590855;TYPE=snp;VARB=-0.00345117;OID=.;OPOS=78197365;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:71:36:36:34:35:10:24:20:16:10:25:20:16 chr14 78217698 . A G 372.4 PASS AO=100;DP=230;FAO=101;FDP=229;FR=.;FRO=128;FSAF=42;FSAR=59;FSRF=54;FSRR=74;FWDB=0.0315561;FXX=0.0129305;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.831;QD=6.50477;RBI=0.031895;REFB=-0.0202013;REVB=0.00463757;RO=126;SAF=41;SAR=59;SRF=53;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0110053;STB=0.503466;TYPE=snp;VARB=0.0253242;OID=.;OPOS=78217698;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:230:229:126:128:100:101:59:41:53:73:59:42:54:74 chr14 78353478 . G T 439.05 PASS AO=82;DP=134;FAO=82;FDP=134;FR=.;FRO=52;FSAF=35;FSAR=47;FSRF=22;FSRR=30;FWDB=-0.0026298;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.534;QD=13.1059;RBI=0.0200946;REFB=-0.000657669;REVB=0.0199218;RO=51;SAF=35;SAR=47;SRF=22;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00328383;STB=0.501488;TYPE=snp;VARB=0.000434213;OID=.;OPOS=78353478;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:51:52:82:82:47:35:22:29:47:35:22:30 chr14 78374172 . C T 259.42 PASS AO=56;DP=106;FAO=56;FDP=106;FR=.;FRO=50;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=0.0310024;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.057;QD=9.78955;RBI=0.0334968;REFB=-0.0179697;REVB=0.012684;RO=44;SAF=23;SAR=33;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0912052;STB=0.561584;TYPE=snp;VARB=0.0182629;OID=.;OPOS=78374172;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:44:50:56:56:33:23:23:21:33:23:27:23 chr14 78710044 . G A 567.4 PASS AO=62;DP=64;FAO=63;FDP=65;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0584671;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.858;QD=34.9172;RBI=0.0587538;REFB=-0.129622;REVB=0.00579649;RO=1;SAF=36;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129354;STB=0.502241;TYPE=snp;VARB=0.00137569;OID=.;OPOS=78710044;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:64:65:1:2:62:63:26:36:1:0:27:36:1:1 chr14 79181226 . C T 252.17 PASS AO=72;DP=172;FAO=72;FDP=172;FR=.;FRO=100;FSAF=30;FSAR=42;FSRF=46;FSRR=54;FWDB=-0.0268228;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.371;QD=5.86443;RBI=0.033299;REFB=-0.000408612;REVB=0.0197321;RO=100;SAF=30;SAR=42;SRF=46;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.045851;STB=0.525684;TYPE=snp;VARB=0.000599453;OID=.;OPOS=79181226;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:172:100:100:72:72:42:30:46:54:42:30:46:54 chr14 79454519 . G C 229.39 PASS AO=83;DP=236;FAO=83;FDP=235;FR=.;FRO=152;FSAF=45;FSAR=38;FSRF=74;FSRR=78;FWDB=0.0219626;FXX=0.00423711;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.2809;QD=3.90451;RBI=0.023121;REFB=-0.0112416;REVB=0.00722659;RO=150;SAF=45;SAR=38;SRF=73;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0628859;STB=0.535816;TYPE=snp;VARB=0.0228233;OID=.;OPOS=79454519;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:236:235:150:152:83:83:38:45:73:77:38:45:74:78 chr14 80329805 . A G 204.91 PASS AO=55;DP=126;FAO=55;FDP=126;FR=.;FRO=71;FSAF=23;FSAR=32;FSRF=48;FSRR=23;FWDB=-0.00156998;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=210.789;QD=6.50509;RBI=0.00975155;REFB=0.00749628;REVB=-0.00962434;RO=68;SAF=23;SAR=32;SRF=45;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237826;STB=0.642302;TYPE=snp;VARB=-0.0104399;OID=.;OPOS=80329805;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:68:71:55:55:32:23:45:23:32:23:48:23 chr14 80963383 . A AGC 1471.51 PASS AO=148;DP=210;FAO=164;FDP=169;FR=.;FRO=5;FSAF=90;FSAR=74;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.0114293;FXX=0.0815173;HRUN=0;LEN=2;MLLD=268.747;QD=34.8287;RBI=0.0216474;REFB=-0.00533804;REVB=-0.0183843;RO=42;SAF=79;SAR=69;SRF=38;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156977;STB=0.513512;TYPE=ins;VARB=6.09593e-05;OID=.;OPOS=80963384;OREF=-;OALT=GC;OMAPALT=AGC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:148:210:164:169:5:90:74:5:0:38:42:79:69:38:4 chr14 81251255 . T C 189.75 PASS AO=49;DP=110;FAO=49;FDP=110;FR=.;FRO=61;FSAF=34;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=35;FWDB=-0.00836112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.299;QD=6.89986;RBI=0.00851565;REFB=-0.0172687;REVB=0.00161493;RO=61;SAF=34;SAR=15;SRF=26;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.274247;STB=0.653782;TYPE=snp;VARB=0.0158609;OID=.;OPOS=81251255;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:61:61:49:49:15:34:26:35:15:34:26:35 chr14 81360958 . C T 102.4 PASS AO=20;DP=36;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.0028552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.04;QD=11.3778;RBI=0.0198654;REFB=0.00276627;REVB=0.0196592;RO=16;SAF=14;SAR=6;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.313542;STB=0.675957;TYPE=snp;VARB=-0.00404144;OID=.;OPOS=81360958;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:36:36:16:16:20:20:6:14:5:11:6:14:5:11 chr14 81422178 . C A 177.79 PASS AO=46;DP=103;FAO=46;FDP=104;FR=.;FRO=58;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=34;FWDB=-0.034417;FXX=0.0095229;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.0269;QD=6.83797;RBI=0.0396091;REFB=-0.00113452;REVB=-0.019605;RO=56;SAF=20;SAR=26;SRF=24;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00620964;STB=0.51194;TYPE=snp;VARB=-0.00259584;OID=.;OPOS=81422178;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:104:56:58:46:46:26:20:24:32:26:20:24:34 chr14 81562998 . T C 346.52 PASS AO=109;DP=281;FAO=110;FDP=281;FR=.;FRO=171;FSAF=64;FSAR=46;FSRF=87;FSRR=84;FWDB=0.0242269;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1591;QD=4.93269;RBI=0.0248134;REFB=-0.0128552;REVB=0.00536286;RO=169;SAF=64;SAR=45;SRF=86;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0858289;STB=0.544994;TYPE=snp;VARB=0.0225756;OID=.;OPOS=81562998;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:281:281:169:171:109:110:45:64:86:83:46:64:87:84 chr14 81574959 . A G 126.93 PASS AO=35;DP=84;FAO=35;FDP=84;FR=.;FRO=49;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=28;FWDB=-0.00112285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.764;QD=6.04434;RBI=0.0214229;REFB=-0.0125999;REVB=-0.0213934;RO=49;SAF=17;SAR=18;SRF=21;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0590868;STB=0.533405;TYPE=snp;VARB=0.0174237;OID=.;OPOS=81574959;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:49:49:35:35:18:17:21:28:18:17:21:28 chr14 81575005 . C A 70.89 PASS AO=22;DP=68;FAO=24;FDP=70;FR=.;FRO=46;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=30;FWDB=-0.00758749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.29;QD=4.05103;RBI=0.00899144;REFB=-0.0104832;REVB=-0.00482451;RO=44;SAF=5;SAR=17;SRF=15;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162708;STB=0.543019;TYPE=snp;VARB=0.0180431;OID=.;OPOS=81575005;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:68:70:44:46:22:24:17:5:15:29:17:7:16:30 chr14 81610583 . G C 1064.77 PASS AO=112;DP=112;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0208682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.2338;QD=38.0274;RBI=0.0230208;REFB=0;REVB=-0.0097199;RO=0;SAF=30;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000154001;OID=.;OPOS=81610583;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:112:112:0:0:112:112:82:30:0:0:82:30:0:0 chr14 81737076 . A C 2805.4 PASS AO=292;DP=294;FAO=293;FDP=293;FR=.;FRO=0;FSAF=166;FSAR=127;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00188803;FXX=0.0101348;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.546;QD=38.299;RBI=0.0218018;REFB=0;REVB=0.0217199;RO=0;SAF=165;SAR=127;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.05432e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.13246e-05;OID=.;OPOS=81737076;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:294:293:0:0:292:293:127:165:0:0:127:166:0:0 chr14 81744736 . A G 2008.94 PASS AO=210;DP=211;FAO=212;FDP=212;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=162;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00898463;FXX=0.00469462;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7593;QD=37.9045;RBI=0.00908092;REFB=0.00275672;REVB=0.00131891;RO=1;SAF=50;SAR=160;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00943112;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.39138e-05;OID=.;OPOS=81744736;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:87:211:212:1:0:210:212:160:50:1:0:162:50:0:0 chr14 84640016 . A C 1141.31 PASS AO=118;DP=118;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00980709;FXX=0.0166653;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.877;QD=38.6884;RBI=0.0290125;REFB=0;REVB=0.0273047;RO=0;SAF=58;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000231577;OID=.;OPOS=84640016;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:118:118:0:0:118:118:60:58:0:0:60:58:0:0 chr14 86088056 . T C 1639.58 PASS AO=166;DP=166;FAO=170;FDP=170;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0632857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.482;QD=38.5783;RBI=0.0647036;REFB=0;REVB=-0.0134712;RO=0;SAF=74;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.10158e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.23353e-05;OID=.;OPOS=86088056;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:166:170:0:0:166:170:92:74:0:0:92:78:0:0 chr14 86091415 . G A 1159.34 PASS AO=121;DP=122;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.7496;QD=38.0112;RBI=0.036639;REFB=0;REVB=-0.028771;RO=0;SAF=26;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.25312e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.2101e-05;OID=.;OPOS=86091415;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:122:122:0:0:121:122:95:26:0:0:96:26:0:0 chr14 86092246 . A G 1770.31 PASS AO=188;DP=190;FAO=188;FDP=188;FR=.;FRO=0;FSAF=107;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146171;FXX=0.0208322;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.1051;QD=37.6661;RBI=0.090765;REFB=-0.0537722;REVB=0.0895803;RO=0;SAF=107;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000108708;OID=.;OPOS=86092246;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:190:188:0:0:188:188:81:107:0:0:81:107:0:0 chr14 86093344 . C T 1886.12 PASS AO=199;DP=201;FAO=199;FDP=199;FR=.;FRO=0;FSAF=120;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0219059;FXX=0.0148508;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7349;QD=37.912;RBI=0.0225809;REFB=-0.0232768;REVB=-0.00548007;RO=0;SAF=120;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00028139;OID=.;OPOS=86093344;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:201:199:0:0:199:199:79:120:0:0:79:120:0:0 chr14 86093921 . T TAC 152.35 PASS AO=35;DP=164;FAO=49;FDP=126;FR=.;FRO=77;FSAF=5;FSAR=44;FSRF=56;FSRR=21;FWDB=-0.0989156;FXX=0.038165;HRUN=1;LEN=2;MLLD=87.8836;QD=4.83635;RBI=0.14586;REFB=-0.0365777;REVB=0.107195;RO=118;SAF=1;SAR=34;SRF=69;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.752322;STB=0.891827;TYPE=ins;VARB=0.0875192;OID=.;OPOS=86093922;OREF=-;OALT=AC;OMAPALT=TAC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:35:164:49:126:77:5:44:56:21:99:118:1:34:69:49 chr14 87379878 . A G 101.06 PASS AO=28;DP=69;FAO=28;FDP=69;FR=.;FRO=41;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=-0.00881281;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=209.651;QD=5.85843;RBI=0.00902617;REFB=-0.00513171;REVB=0.00195091;RO=41;SAF=9;SAR=19;SRF=16;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0792635;STB=0.545317;TYPE=snp;VARB=0.00718911;OID=.;OPOS=87379878;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:41:41:28:28:19:9:16:25:19:9:16:25 chr14 88400353 . C T 869.05 PASS AO=91;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0258768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.5296;QD=37.7847;RBI=0.0358848;REFB=0;REVB=-0.0248617;RO=0;SAF=23;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.36453e-05;OID=.;OPOS=88400353;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:92:92:0:0:91:92:68:23:0:0:68:24:0:0 chr14 88400449 . T C 1230.24 PASS AO=132;DP=136;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00817462;FXX=0.0294096;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.724;QD=37.2799;RBI=0.0272509;REFB=-0.0221811;REVB=0.0259959;RO=0;SAF=47;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000223701;OID=.;OPOS=88400449;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:136:132:0:0:132:132:85:47:0:0:85:47:0:0 chr14 88400450 . G A 1263.35 PASS AO=134;DP=138;FAO=135;FDP=137;FR=.;FRO=2;FSAF=50;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0172959;FXX=0.00724585;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.338;QD=36.8861;RBI=0.0201961;REFB=-0.0482843;REVB=0.0104276;RO=2;SAF=50;SAR=84;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111826;STB=0.505813;TYPE=snp;VARB=0.000181534;OID=.;OPOS=88400450;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:138:137:2:2:134:135:84:50:0:2:85:50:0:2 chr14 88401213 . T C 1067.41 PASS AO=112;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00250804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.6657;QD=37.7843;RBI=0.132598;REFB=0;REVB=0.132575;RO=0;SAF=33;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.02371e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000806631;OID=.;OPOS=88401213;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:113:113:0:0:112:113:79:33:0:0:80:33:0:0 chr14 88407875 . T A 2110.41 PASS AO=189;DP=189;FAO=220;FDP=220;FR=.;FRO=0;FSAF=110;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0618512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.155;QD=38.3711;RBI=0.0618841;REFB=0;REVB=-0.00201972;RO=0;SAF=82;SAR=107;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.77582e-05;OID=.;OPOS=88407875;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:189:220:0:0:189:220:107:82:0:0:110:110:0:0 chr14 88407888 . A G 2073.87 PASS AO=216;DP=217;FAO=216;FDP=216;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=112;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.048725;FXX=0.00460808;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9476;QD=38.4051;RBI=0.0548334;REFB=0;REVB=0.025151;RO=0;SAF=104;SAR=112;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000205413;OID=.;OPOS=88407888;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:217:216:0:0:216:216:112:104:0:0:112:104:0:0 chr14 88411947 . T C 2691.75 PASS AO=279;DP=281;FAO=281;FDP=281;FR=.;FRO=0;FSAF=138;FSAR=143;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0388432;FXX=0.00706689;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.907;QD=38.3168;RBI=0.0400429;REFB=0;REVB=0.00972798;RO=0;SAF=138;SAR=141;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-8.72932e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.26585e-05;OID=.;OPOS=88411947;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:281:281:0:0:279:281:141:138:0:0:143:138:0:0 chr14 88414211 . G A 1274.71 PASS AO=133;DP=136;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0596781;FXX=0.0220572;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.47;QD=38.3372;RBI=0.0598285;REFB=0;REVB=-0.00423897;RO=0;SAF=22;SAR=111;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000359629;OID=.;OPOS=88414211;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:136:133:0:0:133:133:111:22:0:0:111:22:0:0 chr14 88651962 . C T 643.19 PASS AO=156;DP=320;FAO=156;FDP=320;FR=.;FRO=164;FSAF=68;FSAR=88;FSRF=56;FSRR=108;FWDB=-0.0188105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.9882;QD=8.03992;RBI=0.0200723;REFB=-0.0069504;REVB=0.00700457;RO=161;SAF=68;SAR=88;SRF=55;SRR=106;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0900072;STB=0.549829;TYPE=snp;VARB=0.00735962;OID=.;OPOS=88651962;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:320:320:161:164:156:156:88:68:55:106:88:68:56:108 chr14 88652389 . C T 427.43 PASS AO=81;DP=139;FAO=81;FDP=136;FR=.;FRO=55;FSAF=59;FSAR=22;FSRF=42;FSRR=13;FWDB=0.0098064;FXX=0.0215812;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.739;QD=12.5715;RBI=0.0310462;REFB=-0.0367721;REVB=-0.0294567;RO=52;SAF=59;SAR=22;SRF=39;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0198913;STB=0.518307;TYPE=snp;VARB=0.0234384;OID=.;OPOS=88652389;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:136:52:55:81:81:22:59:39:13:22:59:42:13 chr14 88693725 . G C 202.24 PASS AO=61;DP=153;FAO=61;FDP=153;FR=.;FRO=92;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=43;FSRR=49;FWDB=0.0142881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3995;QD=5.2872;RBI=0.0343506;REFB=-0.0135971;REVB=-0.031238;RO=90;SAF=33;SAR=28;SRF=41;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0903203;STB=0.544213;TYPE=snp;VARB=0.0199496;OID=.;OPOS=88693725;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:153:90:92:61:61:28:33:41:49:28:33:43:49 chr14 88792816 . T G 1048.68 PASS AO=110;DP=111;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00394273;FXX=0.0350846;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.404;QD=38.1338;RBI=0.00823786;REFB=0;REVB=0.00723307;RO=0;SAF=30;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.9962e-06;OID=.;OPOS=88792816;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:111:110:0:0:110:110:80:30:0:0:80:30:0:0 chr14 88852279 . TG T 201.68 PASS AO=23;DP=32;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162002;FXX=0.0999667;HRUN=4;LEN=1;MLLD=24.3623;QD=29.8789;RBI=0.0984387;REFB=0;REVB=-0.0970965;RO=0;SAF=16;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.289157;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.000506526;OID=.;OPOS=88852280;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:23:28:27:27:0:17:10:0:0:18:0:16:7:0:0 chr14 88862529 . G A 168.79 PASS AO=49;DP=121;FAO=49;FDP=121;FR=.;FRO=72;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=39;FSRR=33;FWDB=-0.0111751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.1193;QD=5.57984;RBI=0.013761;REFB=-0.0087295;REVB=0.00803017;RO=72;SAF=28;SAR=21;SRF=39;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.031851;STB=0.517978;TYPE=snp;VARB=0.00779271;OID=.;OPOS=88862529;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:72:72:49:49:21:28:39:33:21:28:39:33 chr14 88894004 . TA T 53.63 PASS AO=18;DP=78;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=26;FSAR=1;FSRF=25;FSRR=11;FWDB=-0.0572514;FXX=0.0307645;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.9676;QD=3.40478;RBI=0.0972434;REFB=-0.0410601;REVB=-0.0786037;RO=33;SAF=17;SAR=1;SRF=22;SRR=11;SSEN=0.3125;SSEP=0;SSSB=0.549648;STB=0.859119;TYPE=del;VARB=0.0297897;OID=.;OPOS=88894005;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:18:64:27:63:36:26:1:25:11:53:33:17:1:22:11 chr14 88934205 . C T 179.98 PASS AO=61;DP=167;FAO=61;FDP=167;FR=.;FRO=106;FSAF=34;FSAR=27;FSRF=57;FSRR=49;FWDB=-0.0109012;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.528;QD=4.31086;RBI=0.0120984;REFB=0.00135804;REVB=-0.00524749;RO=93;SAF=34;SAR=27;SRF=46;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0674628;STB=0.512593;TYPE=snp;VARB=-0.00252624;OID=.;OPOS=88934205;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:167:93:106:61:61:27:34:46:47:27:34:57:49 chr14 88935925 . A G 597.94 PASS AO=189;DP=441;FAO=171;FDP=399;FR=.;FRO=228;FSAF=82;FSAR=89;FSRF=127;FSRR=101;FWDB=0.00619151;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.01;QD=5.99441;RBI=0.0156863;REFB=-0.00341105;REVB=-0.0144127;RO=251;SAF=90;SAR=99;SRF=139;SRR=112;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.079616;STB=0.544186;TYPE=snp;VARB=0.00396643;OID=.;OPOS=88935925;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:441:399:251:228:189:171:99:90:139:112:89:82:127:101 chr14 88938652 . A G 381.59 PASS AO=110;DP=264;FAO=111;FDP=264;FR=.;FRO=153;FSAF=47;FSAR=64;FSRF=65;FSRR=88;FWDB=0.00983543;FXX=0.0112355;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.696;QD=5.78159;RBI=0.0239953;REFB=-0.0162926;REVB=0.021887;RO=151;SAF=47;SAR=63;SRF=65;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00337987;STB=0.500838;TYPE=snp;VARB=0.0221329;OID=.;OPOS=88938652;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:264:264:151:153:110:111:63:47:65:86:64:47:65:88 chr14 88946622 . G A 126.45 PASS AO=20;DP=29;FAO=20;FDP=30;FR=.;FRO=10;FSAF=17;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=1;FWDB=-0.0870846;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.1538;QD=16.8596;RBI=0.0880753;REFB=-9.8372e-05;REVB=-0.0131733;RO=9;SAF=17;SAR=3;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0444571;STB=0.534214;TYPE=snp;VARB=-0.00392759;OID=.;OPOS=88946622;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:29:30:9:10:20:20:3:17:8:1:3:17:9:1 chr14 89037482 . C CAT,CATT 1143.87 PASS AO=33,52;DP=164;FAO=100,26;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=38,16;FSAR=62,10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0167787,-0.0133096;FXX=0.059697;HRUN=0,0;LEN=2,3;MLLD=45.05,44.1619;QD=36.3134;RBI=0.144435,0.156332;REFB=0,0;REVB=-0.143457,-0.155764;RO=44;SAF=15,17;SAR=18,35;SRF=26;SRR=18;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.137201,-0.227779;STB=0.5,0.5;TYPE=ins,ins;VARB=-0.022455,0.0185708;OID=.,.;OPOS=89037483,89037483;OREF=-,-;OALT=AT,ATT;OMAPALT=CAT,CATT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:33,52:164:100,26:126:0:38,16:62,10:0:0:14:44:15,17:18,35:26:18 chr14 89037483 . T A 57.08 PASS AO=37;DP=161;FAO=38;FDP=162;FR=.;FRO=124;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=48;FSRR=76;FWDB=-0.0025655;FXX=0;HRUN=10;LEN=1;MLLD=45.936;QD=1.40933;RBI=0.0187351;REFB=0.0119577;REVB=0.0185587;RO=124;SAF=20;SAR=17;SRF=48;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192607;STB=0.605616;TYPE=snp;VARB=-0.0129848;OID=.;OPOS=89037483;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:161:162:124:124:37:38:17:20:48:76:18:20:48:76 chr14 89088266 . C T 73.78 PASS AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0259106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.686;QD=8.94266;RBI=0.0425591;REFB=-0.0118555;REVB=-0.0337626;RO=17;SAF=11;SAR=5;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206431;STB=0.61832;TYPE=snp;VARB=0.015631;OID=.;OPOS=89088266;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:33:33:17:17:16:16:5:11:8:9:5:11:8:9 chr14 89094243 . G C 998.38 PASS AO=106;DP=107;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00751001;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.3997;QD=37.6748;RBI=0.0233842;REFB=-0.0808296;REVB=0.0221455;RO=1;SAF=68;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00692901;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000385882;OID=.;OPOS=89094243;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:107:106:1:0:106:106:38:68:1:0:38:68:0:0 chr14 89205265 . T C 285.27 PASS AO=66;DP=135;FAO=67;FDP=136;FR=.;FRO=69;FSAF=13;FSAR=54;FSRF=21;FSRR=48;FWDB=0.0278794;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.728;QD=8.39032;RBI=0.0278828;REFB=-0.0158142;REVB=-0.000437778;RO=69;SAF=13;SAR=53;SRF=21;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140976;STB=0.580619;TYPE=snp;VARB=0.0122133;OID=.;OPOS=89205265;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:136:69:69:66:67:53:13:21:48:54:13:21:48 chr14 89445481 . C T 286.24 PASS AO=68;DP=141;FAO=68;FDP=140;FR=.;FRO=72;FSAF=34;FSAR=34;FSRF=47;FSRR=25;FWDB=-0.0208352;FXX=0.0070917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.5269;QD=8.17822;RBI=0.0211174;REFB=-0.0530376;REVB=0.00344076;RO=69;SAF=34;SAR=34;SRF=45;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139206;STB=0.578549;TYPE=snp;VARB=0.0579547;OID=.;OPOS=89445481;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:140:69:72:68:68:34:34:45:24:34:34:47:25 chr14 89750819 . A G 254.59 PASS AO=62;DP=129;FAO=62;FDP=129;FR=.;FRO=67;FSAF=41;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=39;FWDB=0.0231594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.447;QD=7.89442;RBI=0.033546;REFB=-0.012694;REVB=0.0242688;RO=67;SAF=41;SAR=21;SRF=28;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233074;STB=0.629274;TYPE=snp;VARB=0.0116874;OID=.;OPOS=89750819;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:67:67:62:62:21:41:28:39:21:41:28:39 chr14 89867978 . T C 2462.7 PASS AO=255;DP=258;FAO=258;FDP=258;FR=.;FRO=0;FSAF=122;FSAR=136;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011992;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.7191;QD=38.1814;RBI=0.0126423;REFB=0;REVB=0.00400235;RO=3;SAF=122;SAR=133;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106296;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.83837e-05;OID=.;OPOS=89867978;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:258:258:3:0:255:258:133:122:0:3:136:122:0:0 chr14 89884022 . A C 118.03 PASS AO=21;DP=34;FAO=21;FDP=34;FR=.;FRO=13;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=1;FWDB=-0.00250611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.78;QD=13.8856;RBI=0.0877009;REFB=0.00763363;REVB=-0.0876651;RO=13;SAF=11;SAR=10;SRF=12;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.282621;STB=0.655139;TYPE=snp;VARB=-0.0100547;OID=.;OPOS=89884022;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:34:34:13:13:21:21:10:11:12:1:10:11:12:1 chr14 90095445 . T C 246.21 PASS AO=55;DP=108;FAO=55;FDP=108;FR=.;FRO=53;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=20;FSRR=33;FWDB=0.00555051;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.474;QD=9.11886;RBI=0.00597752;REFB=-0.0268454;REVB=0.00221868;RO=52;SAF=25;SAR=30;SRF=19;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0799597;STB=0.538448;TYPE=snp;VARB=0.0225161;OID=.;OPOS=90095445;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:52:53:55:55:30:25:19:33:30:25:20:33 chr14 90178913 . T C 293.5 PASS AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0319173;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=129.013;QD=34.5292;RBI=0.0331019;REFB=-0.0185553;REVB=0.00877597;RO=1;SAF=21;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0217319;STB=0.511621;TYPE=snp;VARB=0.000212154;OID=.;OPOS=90178913;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:34:34:1:1:33:33:12:21:1:0:12:21:1:0 chr14 90303383 . A G 811.71 PASS AO=54;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=48;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.116;QD=38.1981;RBI=0.197088;REFB=0;REVB=0.196654;RO=0;SAF=44;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000376646;OID=.;OPOS=90303383;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:85:85:0:0:54:85:10:44:0:0:37:48:0:0 chr14 90303435 . T A 683.36 PASS AO=79;DP=84;FAO=79;FDP=84;FR=.;FRO=5;FSAF=36;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.00932675;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=266.255;QD=32.541;RBI=0.0203782;REFB=-0.0629803;REVB=0.0181186;RO=4;SAF=36;SAR=43;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0189234;STB=0.515378;TYPE=snp;VARB=0.000264744;OID=.;OPOS=90303435;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:84:84:4:5:79:79:43:36:1:3:43:36:1:4 chr14 90303445 . T C 756.04 PASS AO=76;DP=84;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00488096;FXX=0.03571;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.6344;QD=37.3351;RBI=0.0463636;REFB=0;REVB=0.046106;RO=0;SAF=38;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00371933;OID=.;OPOS=90303445;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:84:81:0:0:76:81:38:38:0:0:42:39:0:0 chr14 90341494 . G A 784.73 PASS AO=125;DP=127;FAO=84;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=58;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0293438;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.8865;QD=36.9283;RBI=0.0643749;REFB=-0.0727345;REVB=-0.0572981;RO=1;SAF=45;SAR=80;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104409;STB=0.509432;TYPE=snp;VARB=0.00026342;OID=.;OPOS=90341494;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:127:85:1:1:125:84:80:45:1:0:58:26:1:0 chr14 90730071 . C T 633.5 PASS AO=148;DP=292;FAO=149;FDP=296;FR=.;FRO=147;FSAF=59;FSAR=90;FSRF=54;FSRR=93;FWDB=-0.0114163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.5826;QD=8.56085;RBI=0.0189881;REFB=-0.0131901;REVB=0.0151729;RO=138;SAF=59;SAR=89;SRF=53;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0134735;STB=0.51495;TYPE=snp;VARB=0.0167161;OID=.;OPOS=90730071;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:292:296:138:147:148:149:89:59:53:85:90:59:54:93 chr14 90745422 . T C 273.38 PASS AO=72;DP=162;FAO=72;FDP=161;FR=.;FRO=89;FSAF=35;FSAR=37;FSRF=41;FSRR=48;FWDB=-0.000522836;FXX=0.00617246;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.799;QD=6.79216;RBI=0.0158772;REFB=-0.00278259;REVB=-0.0158686;RO=89;SAF=35;SAR=37;SRF=41;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0253111;STB=0.514079;TYPE=snp;VARB=0.00342401;OID=.;OPOS=90745422;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:161:89:89:72:72:37:35:41:48:37:35:41:48 chr14 90767607 . C T 1810.34 PASS AO=180;DP=183;FAO=192;FDP=192;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=131;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.077793;FXX=0.0103087;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9613;QD=37.7153;RBI=0.114359;REFB=0;REVB=0.0838223;RO=0;SAF=50;SAR=130;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000535097;OID=.;OPOS=90767607;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:183:192:0:0:180:192:130:50:0:0:131:61:0:0 chr14 90865462 . C G 388.22 PASS AO=95;DP=196;FAO=95;FDP=198;FR=.;FRO=103;FSAF=39;FSAR=56;FSRF=51;FSRR=52;FWDB=0.0232752;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.272;QD=7.8428;RBI=0.0233017;REFB=-0.00305801;REVB=0.00111176;RO=100;SAF=39;SAR=56;SRF=51;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0938109;STB=0.544738;TYPE=snp;VARB=0.00326982;OID=.;OPOS=90865462;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:198:100:103:95:95:56:39:51:49:56:39:51:52 chr14 91123575 . T C 326.81 PASS AO=33;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00717996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.743;QD=37.3498;RBI=0.031047;REFB=0;REVB=-0.0302054;RO=0;SAF=8;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000197461;OID=.;OPOS=91123575;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:35:35:0:0:33:35:25:8:0:0:25:10:0:0 chr14 91161862 . C T 717.01 PASS AO=464;DP=1028;FAO=185;FDP=399;FR=.;FRO=214;FSAF=110;FSAR=75;FSRF=136;FSRR=78;FWDB=0.00293419;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.718;QD=7.18802;RBI=0.00932417;REFB=-0.0076666;REVB=-0.00885046;RO=560;SAF=286;SAR=178;SRF=367;SRR=193;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0413803;STB=0.522957;TYPE=snp;VARB=0.00818091;OID=.;OPOS=91161862;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:1028:399:560:214:464:185:178:286:367:193:75:110:136:78 chr14 91165541 . G A 199.28 PASS AO=63;DP=144;FAO=63;FDP=162;FR=.;FRO=99;FSAF=25;FSAR=38;FSRF=42;FSRR=57;FWDB=-0.11498;FXX=0.00613459;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8398;QD=4.92053;RBI=0.115064;REFB=-0.0597582;REVB=-0.00438762;RO=81;SAF=25;SAR=38;SRF=25;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0951264;STB=0.517369;TYPE=snp;VARB=0.082112;OID=.;OPOS=91165541;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:162:81:99:63:63:38:25:25:56:38:25:42:57 chr14 91165572 . G A 1244.52 PASS AO=125;DP=126;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0128762;FXX=0.00769172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.8104;QD=38.5896;RBI=0.0146624;REFB=0;REVB=-0.00701344;RO=0;SAF=44;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.89864e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.47092e-05;OID=.;OPOS=91165572;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:126:129:0:0:125:129:81:44:0:0:84:45:0:0 chr14 91636395 . C T 299.54 PASS AO=61;DP=110;FAO=61;FDP=110;FR=.;FRO=49;FSAF=22;FSAR=39;FSRF=18;FSRR=31;FWDB=0.0552999;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.547;QD=10.8925;RBI=0.057447;REFB=0.000756387;REVB=-0.0155588;RO=49;SAF=22;SAR=39;SRF=18;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00588938;STB=0.503225;TYPE=snp;VARB=-0.000129989;OID=.;OPOS=91636395;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:49:49:61:61:39:22:18:31:39:22:18:31 chr14 91636532 . C T 184.59 PASS AO=27;DP=38;FAO=27;FDP=37;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.207628;FXX=0.0749813;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.258;QD=19.9555;RBI=0.207696;REFB=-0.0440305;REVB=-0.00534387;RO=9;SAF=8;SAR=19;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0415704;STB=0.501198;TYPE=snp;VARB=0.0219609;OID=.;OPOS=91636532;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:38:37:9:10:27:27:19:8:2:7:19:8:3:7 chr14 91681888 . G A 106.76 PASS AO=29;DP=73;FAO=30;FDP=74;FR=.;FRO=44;FSAF=4;FSAR=26;FSRF=11;FSRR=33;FWDB=-0.0180772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.126;QD=5.77094;RBI=0.0185217;REFB=-0.0123695;REVB=-0.00403319;RO=44;SAF=4;SAR=25;SRF=11;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202747;STB=0.622909;TYPE=snp;VARB=0.009571;OID=.;OPOS=91681888;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:74:44:44:29:30:25:4:11:33:26:4:11:33 chr14 91739081 . A G 78.51 PASS AO=20;DP=53;FAO=22;FDP=54;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=3;FSRF=25;FSRR=7;FWDB=0.00605476;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.689;QD=5.81525;RBI=0.0101384;REFB=-0.0199639;REVB=0.00813191;RO=32;SAF=19;SAR=1;SRF=26;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.40682;STB=0.589971;TYPE=snp;VARB=0.0295918;OID=.;OPOS=91739081;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:53:54:32:32:20:22:1:19:26:6:3:19:25:7 chr14 91751788 . TC T 98.01 PASS AO=43;DP=113;FAO=49;FDP=108;FR=.;FRO=59;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=27;FSRR=32;FWDB=0.0135316;FXX=0.0442439;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.1708;QD=3.63016;RBI=0.101401;REFB=-0.048837;REVB=0.100494;RO=51;SAF=25;SAR=18;SRF=21;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164107;STB=0.53981;TYPE=del;VARB=0.0816589;OID=.;OPOS=91751789;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:43:106:49:108:59:26:23:27:32:97:51:25:18:21:30 chr14 91773568 . T C 639.7 PASS AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00355561;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=154.63;QD=38.1908;RBI=0.0114009;REFB=0;REVB=0.0108323;RO=0;SAF=29;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.61158e-05;OID=.;OPOS=91773568;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:67:67:0:0:67:67:38:29:0:0:38:29:0:0 chr14 91792320 . G A 287.81 PASS AO=71;DP=156;FAO=73;FDP=155;FR=.;FRO=82;FSAF=16;FSAR=57;FSRF=40;FSRR=42;FWDB=-0.0260815;FXX=0.0548747;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.167;QD=7.42733;RBI=0.0263528;REFB=-0.000542102;REVB=0.00377219;RO=76;SAF=14;SAR=57;SRF=36;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.317259;STB=0.668291;TYPE=snp;VARB=0.00116982;OID=.;OPOS=91792320;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:155:76:82:71:73:57:14:36:40:57:16:40:42 chr14 91883129 . G A 163.91 PASS AO=37;DP=74;FAO=37;FDP=74;FR=.;FRO=37;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=0.0312267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.172;QD=8.85996;RBI=0.0324185;REFB=-0.0232942;REVB=-0.00870923;RO=37;SAF=22;SAR=15;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0250466;STB=0.513934;TYPE=snp;VARB=0.012229;OID=.;OPOS=91883129;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:37:37:37:37:15:22:21:16:15:22:21:16 chr14 91883499 . G A 61.46 PASS AO=8;DP=50;FAO=18;FDP=49;FR=.;FRO=31;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=-0.0247665;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.6379;QD=5.01738;RBI=0.0274877;REFB=-0.0275687;REVB=0.0119247;RO=10;SAF=1;SAR=7;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.270467;STB=0.557574;TYPE=snp;VARB=0.0558883;OID=.;OPOS=91883499;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:27:49:10:31:8:18:7:1:3:7:13:5:11:20 chr14 91925027 . G T 192.38 PASS AO=54;DP=144;FAO=60;FDP=150;FR=.;FRO=90;FSAF=35;FSAR=25;FSRF=36;FSRR=54;FWDB=0.00798914;FXX=0.00662208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.135;QD=5.13013;RBI=0.00802632;REFB=-0.00491703;REVB=0.000771669;RO=86;SAF=31;SAR=23;SRF=33;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204305;STB=0.608995;TYPE=snp;VARB=0.00702321;OID=.;OPOS=91925027;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:150:86:90:54:60:23:31:33:53:25:35:36:54 chr14 92084004 . C G 255.7 PASS AO=54;DP=101;FAO=54;FDP=101;FR=.;FRO=47;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=32;FSRR=15;FWDB=-0.0487561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.2536;QD=10.1267;RBI=0.0520786;REFB=-0.0176164;REVB=-0.0183036;RO=47;SAF=26;SAR=28;SRF=32;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168172;STB=0.592235;TYPE=snp;VARB=0.016428;OID=.;OPOS=92084004;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:47:47:54:54:28:26:32:15:28:26:32:15 chr14 92087964 . G T 146.72 PASS AO=44;DP=112;FAO=44;FDP=112;FR=.;FRO=68;FSAF=30;FSAR=14;FSRF=26;FSRR=42;FWDB=0.0257301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.3263;QD=5.23995;RBI=0.0650631;REFB=-0.000963332;REVB=-0.0597592;RO=68;SAF=30;SAR=14;SRF=26;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.320614;STB=0.681736;TYPE=snp;VARB=0.000846024;OID=.;OPOS=92087964;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:68:68:44:44:14:30:26:42:14:30:26:42 chr14 92088016 . G A 244.08 PASS AO=77;DP=196;FAO=77;FDP=198;FR=.;FRO=121;FSAF=43;FSAR=34;FSRF=42;FSRR=79;FWDB=-0.0119421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.058;QD=4.93081;RBI=0.0133211;REFB=0.00029621;REVB=0.00590217;RO=119;SAF=43;SAR=34;SRF=42;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218965;STB=0.627017;TYPE=snp;VARB=-0.000402232;OID=.;OPOS=92088016;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:198:119:121:77:77:34:43:42:77:34:43:42:79 chr14 92181405 . G A 978.4 PASS AO=105;DP=109;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0266051;FXX=0.0363603;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.949;QD=36.9208;RBI=0.030602;REFB=-0.0454363;REVB=-0.0151213;RO=1;SAF=41;SAR=64;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00735807;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000547673;OID=.;OPOS=92181405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:109:106:1:0:105:106:64:41:0:1:65:41:0:0 chr14 92249126 . G A 2626.34 PASS AO=255;DP=257;FAO=283;FDP=283;FR=.;FRO=0;FSAF=109;FSAR=174;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100589;FXX=0.003521;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.058;QD=37.1214;RBI=0.107631;REFB=0;REVB=0.10716;RO=0;SAF=96;SAR=159;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000962438;OID=.;OPOS=92249126;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:257:283:0:0:255:283:159:96:0:0:174:109:0:0 chr14 92268615 . T G 1124.26 PASS AO=117;DP=118;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0292082;FXX=0.00847386;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.388;QD=38.4363;RBI=0.032483;REFB=0;REVB=0.0142135;RO=0;SAF=64;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.09512e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.83669e-05;OID=.;OPOS=92268615;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:118:117:0:0:117:117:53:64:0:0:53:64:0:0 chr14 92280037 . T C 227.21 PASS AO=52;DP=106;FAO=52;FDP=104;FR=.;FRO=52;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=27;FSRR=25;FWDB=0.00633192;FXX=0.0280348;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.221;QD=8.73873;RBI=0.0504016;REFB=-0.00161771;REVB=0.0500023;RO=47;SAF=30;SAR=22;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0208604;STB=0.529268;TYPE=snp;VARB=0.00180718;OID=.;OPOS=92280037;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:104:47:52:52:52:22:30:26:21:22:30:27:25 chr14 92344300 . A G 71.06 PASS AO=15;DP=31;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.000224938;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.945;QD=9.16965;RBI=0.00201456;REFB=0.00873553;REVB=0.00200196;RO=16;SAF=8;SAR=7;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0264526;STB=0.515131;TYPE=snp;VARB=-0.0100884;OID=.;OPOS=92344300;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:31:31:16:16:15:15:7:8:9:7:7:8:9:7 chr14 92347680 . A G 904.77 PASS AO=99;DP=103;FAO=101;FDP=105;FR=.;FRO=4;FSAF=42;FSAR=59;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0252914;FXX=0.00943307;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.7732;QD=34.4674;RBI=0.0274587;REFB=-0.0361956;REVB=0.0106923;RO=4;SAF=40;SAR=59;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0117984;STB=0.506515;TYPE=snp;VARB=0.000141271;OID=.;OPOS=92347680;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:103:105:4:4:99:101:59:40:1:3:59:42:1:3 chr14 92349338 . AG A 47.69 PASS AO=19;DP=41;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=1;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.0154077;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.84;QD=4.65305;RBI=0.157229;REFB=-0.0931392;REVB=0.156473;RO=20;SAF=1;SAR=18;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0.38206;SSSB=-0.637963;STB=0.8679;TYPE=del;VARB=0.11026;OID=.;OPOS=92349339;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:19:41:19:41:22:1:18:10:12:46:20:1:18:10:10 chr14 92549586 . G A 440.8 PASS AO=97;DP=182;FAO=97;FDP=183;FR=.;FRO=86;FSAF=48;FSAR=49;FSRF=36;FSRR=50;FWDB=-0.00329906;FXX=0.0108102;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.5;QD=9.63486;RBI=0.00799076;REFB=0.000192535;REVB=0.00727794;RO=85;SAF=49;SAR=48;SRF=36;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0696927;STB=0.535852;TYPE=snp;VARB=-9.91811e-05;OID=.;OPOS=92549586;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:183:85:86:97:97:48:49:36:49:49:48:36:50 chr14 92792255 . G A 1105.41 PASS AO=116;DP=117;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0215539;FXX=0.0169477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.2637;QD=38.1177;RBI=0.0215765;REFB=0;REVB=0.000987094;RO=0;SAF=77;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.49548e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000500175;OID=.;OPOS=92792255;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:117:116:0:0:116:116:39:77:0:0:39:77:0:0 chr14 92909073 . T C 649.22 PASS AO=59;DP=72;FAO=70;FDP=72;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=35;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0157512;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.274;QD=36.0677;RBI=0.104311;REFB=-0.0992707;REVB=0.103114;RO=1;SAF=32;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171544;STB=0.50704;TYPE=snp;VARB=0.000461996;OID=.;OPOS=92909073;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:72:72:1:1:59:70:27:32:0:1:35:35:0:1 chr14 92920371 . C T 510.03 PASS AO=122;DP=248;FAO=122;FDP=248;FR=.;FRO=126;FSAF=54;FSAR=68;FSRF=56;FSRR=70;FWDB=0.00149144;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.722;QD=8.2263;RBI=0.0101155;REFB=-0.0204763;REVB=0.0100049;RO=126;SAF=54;SAR=68;SRF=56;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00170601;STB=0.500937;TYPE=snp;VARB=0.018076;OID=.;OPOS=92920371;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:248:248:126:126:122:122:68:54:56:70:68:54:56:70 chr14 92959216 . G A 987.17 PASS AO=98;DP=98;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00321932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.323;QD=37.968;RBI=0.054649;REFB=0;REVB=0.0545541;RO=0;SAF=35;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000190443;OID=.;OPOS=92959216;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:98:104:0:0:98:104:63:35:0:0:69:35:0:0 chr14 92981606 . C G 246.9 PASS AO=72;DP=166;FAO=74;FDP=175;FR=.;FRO=101;FSAF=44;FSAR=30;FSRF=44;FSRR=57;FWDB=0.0133986;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=36.4639;QD=5.64348;RBI=0.0233684;REFB=-0.0291324;REVB=0.0191458;RO=94;SAF=44;SAR=28;SRF=41;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178374;STB=0.591812;TYPE=snp;VARB=0.0554977;OID=.;OPOS=92981606;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:175:94:101:72:74:28:44:41:53:30:44:44:57 chr14 93107590 . C T 86.3 PASS AO=21;DP=47;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.036883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.7627;QD=7.34429;RBI=0.0914448;REFB=-0.00565398;REVB=0.0836767;RO=26;SAF=9;SAR=12;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106976;STB=0.560917;TYPE=snp;VARB=0.0136601;OID=.;OPOS=93107590;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:47:47:26:26:21:21:12:9:14:12:12:9:14:12 chr14 93118038 . A G 171.89 PASS AO=46;DP=107;FAO=46;FDP=106;FR=.;FRO=60;FSAF=10;FSAR=36;FSRF=7;FSRR=53;FWDB=0.0193605;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.688;QD=6.48639;RBI=0.0194224;REFB=-0.00576068;REVB=0.00155022;RO=60;SAF=10;SAR=36;SRF=7;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167194;STB=0.592508;TYPE=snp;VARB=0.0134805;OID=.;OPOS=93118038;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:106:60:60:46:46:36:10:7:53:36:10:7:53 chr14 93118229 . C T 21.11 PASS AO=4;DP=10;FAO=4;FDP=10;FR=.;FRO=6;FSAF=0;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.7485;QD=8.44491;RBI=0.0366505;REFB=-0.0113236;REVB=-0.0366505;RO=6;SAF=0;SAR=4;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.053442;OID=.;OPOS=93118229;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:10:10:6:6:4:4:4:0:0:6:4:0:0:6 chr14 93118669 . G A 115.14 PASS AO=20;DP=32;FAO=20;FDP=32;FR=.;FRO=12;FSAF=17;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=0.0143491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7413;QD=14.3926;RBI=0.0332035;REFB=-0.000625957;REVB=0.0299429;RO=10;SAF=17;SAR=3;SRF=1;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.519286;STB=0.794636;TYPE=snp;VARB=0.000488171;OID=.;OPOS=93118669;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:32:32:10:12:20:20:3:17:1:9:3:17:2:10 chr14 93170993 . C T 850.32 PASS AO=88;DP=90;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0114924;FXX=0.0222198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2105;QD=38.6508;RBI=0.0230162;REFB=0;REVB=-0.0199416;RO=0;SAF=47;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000225898;OID=.;OPOS=93170993;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:90:88:0:0:88:88:41:47:0:0:41:47:0:0 chr14 93178191 . A G 2532.44 PASS AO=275;DP=281;FAO=275;FDP=281;FR=.;FRO=6;FSAF=99;FSAR=176;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0512788;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.912;QD=36.049;RBI=0.0513262;REFB=-0.0381973;REVB=-0.00220473;RO=6;SAF=99;SAR=176;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0207669;STB=0.510899;TYPE=snp;VARB=0.00137751;OID=.;OPOS=93178191;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:281:281:6:6:275:275:176:99:5:1:176:99:5:1 chr14 93276654 . T C 1081.14 PASS AO=116;DP=119;FAO=117;FDP=120;FR=.;FRO=3;FSAF=59;FSAR=58;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.00548248;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=265.531;QD=36.0379;RBI=0.00831473;REFB=0.0491182;REVB=-0.00625117;RO=3;SAF=59;SAR=57;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00756637;STB=0.50406;TYPE=snp;VARB=-0.000214626;OID=.;OPOS=93276654;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:119:120:3:3:116:117:57:59:2:1:58:59:2:1 chr14 93406232 . T C 672.01 PASS AO=156;DP=309;FAO=156;FDP=308;FR=.;FRO=152;FSAF=82;FSAR=74;FSRF=94;FSRR=58;FWDB=0.00134254;FXX=0.00323614;HRUN=4;LEN=1;MLLD=234.906;QD=8.72743;RBI=0.0119913;REFB=-0.00871133;REVB=-0.0119159;RO=152;SAF=82;SAR=74;SRF=94;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0843431;STB=0.54612;TYPE=snp;VARB=0.00932616;OID=.;OPOS=93406232;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:309:308:152:152:156:156:74:82:94:58:74:82:94:58 chr14 93407134 . C T 36.09 PASS AO=17;DP=71;FAO=18;FDP=72;FR=.;FRO=54;FSAF=1;FSAR=17;FSRF=28;FSRR=26;FWDB=0.00685567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.3907;QD=2.00517;RBI=0.0112571;REFB=-0.0147803;REVB=-0.00892879;RO=54;SAF=1;SAR=16;SRF=28;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.654898;STB=0.919234;TYPE=snp;VARB=0.0368858;OID=.;OPOS=93407134;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:71:72:54:54:17:18:16:1:28:26:17:1:28:26 chr14 93407301 . C A 571.29 PASS AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00680483;FXX=0.0166639;HRUN=4;LEN=1;MLLD=209.223;QD=38.7318;RBI=0.00945755;REFB=0;REVB=0.00656807;RO=0;SAF=23;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.68976e-06;OID=.;OPOS=93407301;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:60:59:0:0:59:59:36:23:0:0:36:23:0:0 chr14 93703854 . G A 412.47 PASS AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.029435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.4521;QD=37.4971;RBI=0.064162;REFB=0;REVB=-0.0570118;RO=0;SAF=27;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.54734e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00113097;OID=.;OPOS=93703854;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:44:44:0:0:44:44:17:27:0:0:17:27:0:0 chr14 93708224 . G A 43.51 PASS AO=28;DP=122;FAO=28;FDP=122;FR=.;FRO=94;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=49;FSRR=45;FWDB=-0.000784865;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.61;QD=1.42654;RBI=0.00352799;REFB=-0.0044216;REVB=-0.00343958;RO=92;SAF=20;SAR=8;SRF=49;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.24128;STB=0.657451;TYPE=snp;VARB=0.0164519;OID=.;OPOS=93708224;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:122:122:92:94:28:28:8:20:49:43:8:20:49:45 chr14 93943998 . G A 490.61 PASS AO=125;DP=271;FAO=125;FDP=269;FR=.;FRO=144;FSAF=71;FSAR=54;FSRF=49;FSRR=95;FWDB=-0.011002;FXX=0.0073798;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.32;QD=7.29538;RBI=0.0507844;REFB=-0.0124136;REVB=-0.0495784;RO=140;SAF=71;SAR=54;SRF=47;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219809;STB=0.620123;TYPE=snp;VARB=0.013431;OID=.;OPOS=93943998;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:271:269:140:144:125:125:54:71:47:93:54:71:49:95 chr14 94088587 . G A 117.21 PASS AO=18;DP=25;FAO=18;FDP=25;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0.0797689;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.172;QD=18.7542;RBI=0.0837292;REFB=-0.0250466;REVB=0.0254459;RO=7;SAF=2;SAR=16;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164671;STB=0.589658;TYPE=snp;VARB=0.0124696;OID=.;OPOS=94088587;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:25:25:7:7:18:18:16:2:0:7:16:2:0:7 chr14 94103602 . G A 177.33 PASS AO=45;DP=100;FAO=45;FDP=100;FR=.;FRO=55;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=22;FSRR=33;FWDB=-0.00335539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.519;QD=7.09332;RBI=0.0125644;REFB=-0.0173179;REVB=0.012108;RO=55;SAF=20;SAR=25;SRF=22;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0445164;STB=0.524876;TYPE=snp;VARB=0.0210836;OID=.;OPOS=94103602;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:55:55:45:45:25:20:22:33:25:20:22:33 chr14 94187832 . C T 255.05 PASS AO=34;DP=41;FAO=34;FDP=41;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=32;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0424968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.2987;QD=24.8824;RBI=0.0440579;REFB=-0.0331203;REVB=0.0116244;RO=7;SAF=2;SAR=32;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.421856;STB=0.732642;TYPE=snp;VARB=0.0118385;OID=.;OPOS=94187832;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:41:41:7:7:34:34:32:2:4:3:32:2:4:3 chr14 94245649 . A G 73.84 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0299962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.53;QD=36.9194;RBI=0.0299962;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=8;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000966726;OID=.;OPOS=94245649;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:0:8:0:0:0:8:0:0 chr14 94245652 . C T 43.02 PASS AO=6;DP=8;FAO=6;FDP=8;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.000174379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.266;QD=21.5082;RBI=0.000174379;REFB=0.00983206;REVB=0;RO=2;SAF=6;SAR=0;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00875396;OID=.;OPOS=94245652;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:8:2:2:6:6:0:6:2:0:0:6:2:0 chr14 94391699 . G A 481.16 PASS AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0354733;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=85.9451;QD=37.7383;RBI=0.0367906;REFB=0;REVB=0.00975663;RO=0;SAF=20;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.13361e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000319506;OID=.;OPOS=94391699;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:51:51:0:0:51:51:31:20:0:0:31:20:0:0 chr14 94417421 . G A 1783.91 PASS AO=185;DP=188;FAO=186;FDP=186;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00352771;FXX=0.0106377;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.53;QD=38.3636;RBI=0.0265029;REFB=0;REVB=0.0262671;RO=0;SAF=103;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00087529;OID=.;OPOS=94417421;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:188:186:0:0:185:186:82:103:0:0:83:103:0:0 chr14 94417541 . A G 467.46 PASS AO=48;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00951638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.538;QD=38.16;RBI=0.0109561;REFB=0;REVB=-0.00542914;RO=0;SAF=13;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.61818e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000283365;OID=.;OPOS=94417541;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:48:49:0:0:48:49:35:13:0:0:35:14:0:0 chr14 94417586 . G A 292.02 PASS AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0712335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.3815;QD=38.9358;RBI=0.0771923;REFB=0;REVB=0.0297395;RO=0;SAF=11;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00160543;OID=.;OPOS=94417586;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:30:30:0:0:30:30:19:11:0:0:19:11:0:0 chr14 94528655 . AG A 925.89 PASS AO=102;DP=164;FAO=156;FDP=157;FR=.;FRO=1;FSAF=80;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.368889;FXX=0.0248432;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.9744;QD=23.5896;RBI=0.393569;REFB=0.130293;REVB=-0.137177;RO=27;SAF=46;SAR=56;SRF=23;SRR=4;SSEN=0.354633;SSEP=0;SSSB=-0.156536;STB=0.503268;TYPE=del;VARB=0.00292608;OID=.;OPOS=94528656;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:102:157:156:157:1:80:76:0:1:67:27:46:56:23:4 chr14 94582130 . T TGGCCATGGC 366.07 PASS AO=40;DP=48;FAO=42;FDP=45;FR=.;FRO=3;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0149242;FXX=0.062487;HRUN=2;LEN=9;MLLD=348.878;QD=32.5399;RBI=0.016175;REFB=-0.0177287;REVB=0.00623693;RO=3;SAF=21;SAR=19;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0624129;STB=0.5319;TYPE=ins;VARB=-0.000281381;OID=.;OPOS=94582131;OREF=-;OALT=GGCCATGGC;OMAPALT=TGGCCATGGC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:40:48:42:45:3:22:20:3:0:6:3:21:19:3:0 chr14 94772504 . G A 324 PASS AO=84;DP=184;FAO=84;FDP=184;FR=.;FRO=100;FSAF=31;FSAR=53;FSRF=31;FSRR=69;FWDB=-0.0293479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.9278;QD=7.04347;RBI=0.0312414;REFB=-0.00561662;REVB=-0.010711;RO=100;SAF=31;SAR=53;SRF=31;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0634034;STB=0.53508;TYPE=snp;VARB=0.00523055;OID=.;OPOS=94772504;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:184:100:100:84:84:53:31:31:69:53:31:31:69 chr14 94776219 . C T 520.08 PASS AO=115;DP=218;FAO=115;FDP=219;FR=.;FRO=104;FSAF=55;FSAR=60;FSRF=42;FSRR=62;FWDB=0.0436304;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.916;QD=9.49913;RBI=0.0499613;REFB=-0.0182262;REVB=0.0243418;RO=102;SAF=55;SAR=60;SRF=41;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0660091;STB=0.535509;TYPE=snp;VARB=0.0186226;OID=.;OPOS=94776219;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:218:219:102:104:115:115:60:55:41:61:60:55:42:62 chr14 94776221 . A C 369.22 PASS AO=96;DP=215;FAO=97;FDP=214;FR=.;FRO=117;FSAF=36;FSAR=61;FSRF=56;FSRR=61;FWDB=-0.00870941;FXX=0.00925883;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.832;QD=6.90126;RBI=0.0094829;REFB=-0.00804185;REVB=0.00375121;RO=113;SAF=35;SAR=61;SRF=52;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0975988;STB=0.560963;TYPE=snp;VARB=0.0107844;OID=.;OPOS=94776221;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:214:113:117:96:97:61:35:52:61:61:36:56:61 chr14 94912799 . G A 815.1 PASS AO=181;DP=344;FAO=182;FDP=346;FR=.;FRO=164;FSAF=75;FSAR=107;FSRF=90;FSRR=74;FWDB=-0.00470496;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.4;QD=9.42307;RBI=0.0194463;REFB=0.00498773;REVB=0.0188685;RO=163;SAF=75;SAR=106;SRF=90;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120476;STB=0.565315;TYPE=snp;VARB=-0.0058206;OID=.;OPOS=94912799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:344:346:163:164:181:182:106:75:90:73:107:75:90:74 chr14 94912896 . T G 584.75 PASS AO=143;DP=299;FAO=143;FDP=296;FR=.;FRO=153;FSAF=55;FSAR=88;FSRF=71;FSRR=82;FWDB=-0.0304706;FXX=0.00671118;HRUN=3;LEN=1;MLLD=88.3801;QD=7.90201;RBI=0.0307313;REFB=-0.0159057;REVB=-0.00399445;RO=153;SAF=55;SAR=88;SRF=70;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0709936;STB=0.542513;TYPE=snp;VARB=0.0148245;OID=.;OPOS=94912896;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:299:296:153:153:143:143:88:55:70:83:88:55:71:82 chr14 94929541 . G A 2450.57 PASS AO=189;DP=263;FAO=260;FDP=260;FR=.;FRO=0;FSAF=129;FSAR=131;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00729694;FXX=0.00383127;HRUN=4;LEN=1;MLLD=80.741;QD=37.7011;RBI=0.0108903;REFB=-0.0834884;REVB=0.00808409;RO=0;SAF=123;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.21071e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000261079;OID=.;OPOS=94929541;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:190:260:0:0:189:260:66:123:0:0:131:129:0:0 chr14 94931105 . A G 1257.88 PASS AO=129;DP=131;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00769207;FXX=0.00746213;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.838;QD=37.8311;RBI=0.00815898;REFB=0;REVB=-0.00272049;RO=0;SAF=61;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.59609e-07;OID=.;OPOS=94931105;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:131:133:0:0:129:133:68:61:0:0:72:61:0:0 chr14 94933473 . C A 330.45 PASS AO=87;DP=193;FAO=87;FDP=193;FR=.;FRO=106;FSAF=38;FSAR=49;FSRF=33;FSRR=73;FWDB=0.0032191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.142;QD=6.84872;RBI=0.0189696;REFB=-0.0114315;REVB=0.0186945;RO=106;SAF=38;SAR=49;SRF=33;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1289;STB=0.571272;TYPE=snp;VARB=0.0174402;OID=.;OPOS=94933473;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:193:106:106:87:87:49:38:33:73:49:38:33:73 chr14 94933640 . A T 256.16 PASS AO=60;DP=122;FAO=60;FDP=122;FR=.;FRO=62;FSAF=21;FSAR=39;FSRF=27;FSRR=35;FWDB=0.00624574;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.882;QD=8.39872;RBI=0.0116209;REFB=0.00165332;REVB=-0.00979976;RO=61;SAF=21;SAR=39;SRF=27;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0899037;STB=0.546394;TYPE=snp;VARB=-0.00140841;OID=.;OPOS=94933640;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:61:62:60:60:39:21:27:34:39:21:27:35 chr14 94933695 . G A 180.74 PASS AO=42;DP=89;FAO=43;FDP=90;FR=.;FRO=47;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=16;FSRR=31;FWDB=0.0845604;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.3218;QD=8.0329;RBI=0.0915967;REFB=-0.00070877;REVB=0.0352064;RO=47;SAF=17;SAR=25;SRF=16;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0641856;STB=0.530364;TYPE=snp;VARB=0.00503344;OID=.;OPOS=94933695;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:90:47:47:42:43:25:17:16:31:26:17:16:31 chr14 94933709 . C T 162.91 PASS AO=36;DP=78;FAO=39;FDP=81;FR=.;FRO=42;FSAF=12;FSAR=27;FSRF=15;FSRR=27;FWDB=-0.000544081;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.05;QD=8.04485;RBI=0.0232196;REFB=-0.0193677;REVB=0.0232132;RO=42;SAF=11;SAR=25;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0568138;STB=0.529396;TYPE=snp;VARB=0.0201947;OID=.;OPOS=94933709;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:81:42:42:36:39:25:11:15:27:27:12:15:27 chr14 94935566 . G A 246.08 PASS AO=72;DP=176;FAO=72;FDP=175;FR=.;FRO=103;FSAF=39;FSAR=33;FSRF=55;FSRR=48;FWDB=-0.0113939;FXX=0.0056815;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.858;QD=5.62465;RBI=0.0123521;REFB=-0.0120456;REVB=0.00477003;RO=99;SAF=39;SAR=33;SRF=53;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00657198;STB=0.504551;TYPE=snp;VARB=0.0159509;OID=.;OPOS=94935566;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:175:99:103:72:72:33:39:53:46:33:39:55:48 chr14 95029852 . G T 259.43 PASS AO=60;DP=117;FAO=59;FDP=117;FR=.;FRO=58;FSAF=33;FSAR=26;FSRF=18;FSRR=40;FWDB=-0.0318754;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6726;QD=8.86923;RBI=0.0446185;REFB=-0.0290908;REVB=0.0312213;RO=57;SAF=34;SAR=26;SRF=18;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219085;STB=0.621535;TYPE=snp;VARB=0.0258978;OID=.;OPOS=95029852;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:57:58:60:59:26:34:18:39:26:33:18:40 chr14 95035841 . G A 299.97 PASS AO=61;DP=110;FAO=61;FDP=110;FR=.;FRO=49;FSAF=21;FSAR=40;FSRF=17;FSRR=32;FWDB=-0.0151332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.595;QD=10.9081;RBI=0.0230083;REFB=-0.0308231;REVB=0.0173311;RO=49;SAF=21;SAR=40;SRF=17;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00240877;STB=0.501319;TYPE=snp;VARB=0.0221874;OID=.;OPOS=95035841;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:49:49:61:61:40:21:17:32:40:21:17:32 chr14 95053890 . G A 209.36 PASS AO=49;DP=101;FAO=49;FDP=101;FR=.;FRO=52;FSAF=11;FSAR=38;FSRF=24;FSRR=28;FWDB=0.0137926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.483;QD=8.29151;RBI=0.0139554;REFB=0.00408982;REVB=-0.00212542;RO=51;SAF=11;SAR=38;SRF=24;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.268706;STB=0.646822;TYPE=snp;VARB=-0.00212511;OID=.;OPOS=95053890;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:51:52:49:49:38:11:24:27:38:11:24:28 chr14 95054176 . T C 184.13 PASS AO=44;DP=95;FAO=46;FDP=97;FR=.;FRO=51;FSAF=16;FSAR=30;FSRF=30;FSRR=21;FWDB=-0.038167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.705;QD=7.59293;RBI=0.0386851;REFB=-0.00470969;REVB=0.00631022;RO=50;SAF=14;SAR=30;SRF=30;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.274585;STB=0.628359;TYPE=snp;VARB=0.00338421;OID=.;OPOS=95054176;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:97:50:51:44:46:30:14:30:20:30:16:30:21 chr14 95056457 . AC A 822.12 PASS AO=103;DP=145;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.194424;FXX=0.0684885;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.0398;QD=24.18;RBI=0.201365;REFB=-0.0165471;REVB=-0.0524136;RO=13;SAF=57;SAR=46;SRF=11;SRR=2;SSEN=0.422576;SSEP=0;SSSB=-0.0631594;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00586922;OID=.;OPOS=95056458;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:103:140:136:136:0:76:60:0:0:62:13:57:46:11:2 chr14 95058462 . A C 220.12 PASS AO=58;DP=131;FAO=58;FDP=130;FR=.;FRO=72;FSAF=21;FSAR=37;FSRF=28;FSRR=44;FWDB=-0.0580052;FXX=0.00763301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.1796;QD=6.773;RBI=0.058333;REFB=-0.00509331;REVB=-0.00617532;RO=72;SAF=21;SAR=37;SRF=28;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.028538;STB=0.515931;TYPE=snp;VARB=0.00544705;OID=.;OPOS=95058462;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:130:72:72:58:58:37:21:28:44:37:21:28:44 chr14 95081081 . A G 193.09 PASS AO=74;DP=217;FAO=74;FDP=219;FR=.;FRO=145;FSAF=40;FSAR=34;FSRF=49;FSRR=96;FWDB=0.053711;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.2076;QD=3.52674;RBI=0.091074;REFB=-0.0139486;REVB=0.07355;RO=142;SAF=41;SAR=33;SRF=47;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253091;STB=0.632108;TYPE=snp;VARB=0.0299;OID=.;OPOS=95081081;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:217:219:142:145:74:74:33:41:47:95:34:40:49:96 chr14 95109952 . C T 380.98 PASS AO=69;DP=112;FAO=69;FDP=110;FR=.;FRO=41;FSAF=30;FSAR=39;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=0.00329141;FXX=0.0265463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.0703;QD=13.8539;RBI=0.0255234;REFB=-0.00980657;REVB=0.0253103;RO=41;SAF=30;SAR=39;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0199659;STB=0.510823;TYPE=snp;VARB=0.00608469;OID=.;OPOS=95109952;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:110:41:41:69:69:39:30:19:22:39:30:19:22 chr14 95110017 . G T 91.4 PASS AO=30;DP=84;FAO=30;FDP=84;FR=.;FRO=54;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=34;FWDB=-0.013505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.424;QD=4.35261;RBI=0.0139739;REFB=-0.013818;REVB=-0.00358922;RO=53;SAF=18;SAR=12;SRF=20;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243336;STB=0.644766;TYPE=snp;VARB=0.0196172;OID=.;OPOS=95110017;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:84:84:53:54:30:30:12:18:20:33:12:18:20:34 chr14 95555205 . C T 1742.94 PASS AO=182;DP=182;FAO=182;FDP=182;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00706861;FXX=0.010869;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.0285;QD=38.3064;RBI=0.0167114;REFB=0;REVB=0.0151428;RO=0;SAF=75;SAR=107;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.26869e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00101795;OID=.;OPOS=95555205;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:182:182:0:0:182:182:107:75:0:0:107:75:0:0 chr14 95660242 . A G 219.09 PASS AO=57;DP=128;FAO=57;FDP=128;FR=.;FRO=71;FSAF=19;FSAR=38;FSRF=38;FSRR=33;FWDB=-0.015057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.336;QD=6.8466;RBI=0.0205537;REFB=-0.0117707;REVB=0.0139907;RO=71;SAF=19;SAR=38;SRF=38;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207654;STB=0.616174;TYPE=snp;VARB=0.0142436;OID=.;OPOS=95660242;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:71:71:57:57:38:19:38:33:38:19:38:33 chr14 95884323 . G A 106.3 PASS AO=22;DP=43;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.000636287;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.625;QD=10.1235;RBI=0.0218347;REFB=-0.0142197;REVB=0.0218254;RO=14;SAF=7;SAR=15;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138114;STB=0.592936;TYPE=snp;VARB=0.00933935;OID=.;OPOS=95884323;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:43:42:14:20:22:22:15:7:7:7:15:7:10:10 chr14 95898481 . AGGGGGG AGGGGG,AGGGGGA 158.77 PASS AO=11,17;DP=54;FAO=19,24;FDP=55;FR=.;FRO=12;FSAF=3,6;FSAR=16,18;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.145174,0.133923;FXX=0.112885;HRUN=6,6;LEN=1,1;MLLD=8.91194,10.3979;QD=11.5467;RBI=0.145184,0.134148;REFB=0.0241514,-0.0759703;REVB=-0.00172069,-0.00776645;RO=10;SAF=2,3;SAR=9,14;SRF=3;SRR=7;SSEN=0.5,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.144334,-0.126749;STB=0.561334,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0350806,0.042942;OID=.,.;OPOS=95898482,95898487;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=AGGGGG,AGGGGGA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:11,17:46:19,24:55:12:3,6:16,18:3:9:34:10:2,3:9,14:3:7 chr14 95906321 . G A 420.38 PASS AO=98;DP=207;FAO=101;FDP=205;FR=.;FRO=104;FSAF=1;FSAR=100;FSRF=1;FSRR=103;FWDB=-0.0631148;FXX=0.0191378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.474;QD=8.20251;RBI=0.0632893;REFB=-0.0132962;REVB=0.00469674;RO=103;SAF=1;SAR=97;SRF=1;SRR=102;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0115627;STB=0.503721;TYPE=snp;VARB=0.0150325;OID=.;OPOS=95906321;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:205:103:104:98:101:97:1:1:102:100:1:1:103 chr14 95910933 . T C 126.61 PASS AO=28;DP=57;FAO=30;FDP=63;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.00539498;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.5733;QD=8.03872;RBI=0.00727956;REFB=-0.0333522;REVB=0.00488735;RO=29;SAF=7;SAR=21;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.271712;STB=0.643926;TYPE=snp;VARB=0.0271644;OID=.;OPOS=95910933;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:63:29:33:28:30:21:7:15:14:22:8:17:16 chr14 95918625 . T C 164.23 PASS AO=34;DP=63;FAO=34;FDP=63;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=25;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=-0.0159359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.387;QD=10.4273;RBI=0.0173218;REFB=-0.00315444;REVB=0.00678918;RO=29;SAF=9;SAR=25;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0815847;STB=0.545323;TYPE=snp;VARB=0.00184475;OID=.;OPOS=95918625;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:29:29:34:34:25:9:10:19:25:9:10:19 chr14 95921741 . C T 98.48 PASS AO=10;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.,HEALED;FRO=4;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0166681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.998;QD=21.8851;RBI=0.0224012;REFB=-0.0156376;REVB=0.0149662;RO=4;SAF=3;SAR=7;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23879;STB=0.604744;TYPE=snp;VARB=0.00538048;OID=.;OPOS=95921741;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:17:18:4:4:10:11:7:3:3:1:7:4:3:1 chr14 95923670 . A C 53.91 PASS AO=13;DP=33;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=0.0343052;FXX=0.0555401;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.613;QD=6.3427;RBI=0.0358119;REFB=-0.00855719;REVB=-0.0102781;RO=20;SAF=0;SAR=13;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.770377;STB=0.735408;TYPE=snp;VARB=0.0172635;OID=.;OPOS=95923670;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:33:34:20:20:13:14:13:0:5:15:13:1:5:15 chr14 95983898 . A T 680.1 PASS AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.627;QD=37.7831;RBI=0.090391;REFB=0;REVB=0.0876771;RO=0;SAF=44;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21139e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000462178;OID=.;OPOS=95983898;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:72:72:0:0:72:72:28:44:0:0:28:44:0:0 chr14 95983975 . G A 796.42 PASS AO=90;DP=94;FAO=90;FDP=94;FR=.;FRO=4;FSAF=61;FSAR=29;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.00395997;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.24;QD=33.89;RBI=0.00880063;REFB=-0.0409875;REVB=-0.00785937;RO=4;SAF=61;SAR=29;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0300684;STB=0.515869;TYPE=snp;VARB=0.00105657;OID=.;OPOS=95983975;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:94:94:4:4:90:90:29:61:4:0:29:61:4:0 chr14 95999820 . T C 453.2 PASS AO=106;DP=212;FAO=106;FDP=212;FR=.;FRO=106;FSAF=49;FSAR=57;FSRF=57;FSRR=49;FWDB=-0.0257279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.001;QD=8.55088;RBI=0.035944;REFB=-0.0100474;REVB=-0.0251007;RO=105;SAF=49;SAR=57;SRF=56;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0644281;STB=0.537729;TYPE=snp;VARB=0.00687678;OID=.;OPOS=95999820;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:212:105:106:106:106:57:49:56:49:57:49:57:49 chr14 96131432 . A G 735.93 PASS AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0459069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.4215;QD=38.2301;RBI=0.0484988;REFB=0;REVB=-0.0156428;RO=0;SAF=42;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000450939;OID=.;OPOS=96131432;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:77:77:0:0:77:77:35:42:0:0:35:42:0:0 chr14 96136794 . A G 254.13 PASS AO=47;DP=79;FAO=47;FDP=78;FR=.;FRO=31;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=0.00296417;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5878;QD=13.0323;RBI=0.0433681;REFB=-0.0230707;REVB=-0.0432667;RO=30;SAF=25;SAR=22;SRF=20;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0973805;STB=0.545435;TYPE=snp;VARB=0.0202991;OID=.;OPOS=96136794;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:78:30:31:47:47:22:25:20:10:22:25:20:11 chr14 96157187 . G A 213.22 PASS AO=48;DP=99;FAO=49;FDP=99;FR=.;FRO=50;FSAF=12;FSAR=37;FSRF=17;FSRR=33;FWDB=0.0188497;FXX=0.0198;HRUN=3;LEN=1;MLLD=166.959;QD=8.61488;RBI=0.0190786;REFB=0.00373345;REVB=0.0029468;RO=50;SAF=12;SAR=36;SRF=17;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103496;STB=0.560873;TYPE=snp;VARB=-0.00313764;OID=.;OPOS=96157187;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:50:50:48:49:36:12:17:33:37:12:17:33 chr14 96556914 . T C 1436.36 PASS AO=150;DP=152;FAO=151;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113291;FXX=0.00657851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.492;QD=38.0493;RBI=0.0462239;REFB=0;REVB=0.0448141;RO=0;SAF=65;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.81633e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000113035;OID=.;OPOS=96556914;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:152:151:0:0:150:151:85:65:0:0:86:65:0:0 chr14 96557121 . T C 526.2 PASS AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.345089;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.3546;QD=36.2895;RBI=0.347779;REFB=-0.0606095;REVB=0.0431682;RO=0;SAF=18;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0105882;OID=.;OPOS=96557121;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:59:58:0:0:58:58:40:18:0:0:40:18:0:0 chr14 96557187 . T A 83.88 PASS AO=26;DP=71;FAO=26;FDP=71;FR=.;FRO=45;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=28;FWDB=-0.0130871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.8919;QD=4.72569;RBI=0.0168412;REFB=0.00371337;REVB=-0.0105998;RO=45;SAF=11;SAR=15;SRF=17;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.051467;STB=0.529653;TYPE=snp;VARB=-0.00880529;OID=.;OPOS=96557187;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:71:71:45:45:26:26:15:11:17:28:15:11:17:28 chr14 96557873 . G T 100.14 PASS AO=11;DP=30;FAO=17;FDP=27;FR=.;FRO=10;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.00150451;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.734;QD=14.8354;RBI=0.024519;REFB=-0.0215603;REVB=-0.0244728;RO=6;SAF=8;SAR=3;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161641;STB=0.594481;TYPE=snp;VARB=0.016149;OID=.;OPOS=96557873;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:20:27:6:10:11:17:3:8:3:3:6:11:4:6 chr14 96558235 . T C 313.63 PASS AO=62;DP=109;FAO=62;FDP=109;FR=.;FRO=47;FSAF=47;FSAR=15;FSRF=33;FSRR=14;FWDB=0.0357228;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.5182;QD=11.5094;RBI=0.0358936;REFB=0.00277744;REVB=0.00349702;RO=47;SAF=47;SAR=15;SRF=33;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0580378;STB=0.531788;TYPE=snp;VARB=-0.00430554;OID=.;OPOS=96558235;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:47:47:62:62:15:47:33:14:15:47:33:14 chr14 96558549 . G A 132.07 PASS AO=29;DP=58;FAO=29;FDP=58;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=-0.0138693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.287;QD=9.10854;RBI=0.019748;REFB=-0.0373258;REVB=0.014058;RO=29;SAF=14;SAR=15;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124366;STB=0.569331;TYPE=snp;VARB=0.043934;OID=.;OPOS=96558549;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:29:29:29:29:15:14:10:19:15:14:10:19 chr14 96558881 . C G 1561.16 PASS AO=167;DP=170;FAO=167;FDP=170;FR=.;FRO=3;FSAF=47;FSAR=120;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.000891194;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.891;QD=36.7332;RBI=0.00413571;REFB=-0.104987;REVB=-0.00403855;RO=2;SAF=47;SAR=120;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00606756;STB=0.501131;TYPE=snp;VARB=0.000273078;OID=.;OPOS=96558881;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:170:170:2:3:167:167:120:47:1:1:120:47:1:2 chr14 96559459 . C A 425.88 PASS AO=100;DP=203;FAO=101;FDP=204;FR=.;FRO=103;FSAF=67;FSAR=34;FSRF=71;FSRR=32;FWDB=-0.0241922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.695;QD=8.35067;RBI=0.0286374;REFB=-0.0293446;REVB=0.0153243;RO=99;SAF=67;SAR=33;SRF=66;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00340868;STB=0.514809;TYPE=snp;VARB=0.0276607;OID=.;OPOS=96559459;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:204:99:103:100:101:33:67:66:33:34:67:71:32 chr14 96559723 . G A 266.55 PASS AO=66;DP=143;FAO=67;FDP=144;FR=.;FRO=77;FSAF=31;FSAR=36;FSRF=53;FSRR=24;FWDB=-0.0141077;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=206.385;QD=7.40408;RBI=0.0141077;REFB=-0.00380846;REVB=3.49497e-06;RO=77;SAF=31;SAR=35;SRF=53;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210572;STB=0.61913;TYPE=snp;VARB=0.0025422;OID=.;OPOS=96559723;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:144:77:77:66:67:35:31:53:24:36:31:53:24 chr14 96559732 . G C 278.92 PASS AO=64;DP=129;FAO=64;FDP=128;FR=.;FRO=64;FSAF=40;FSAR=24;FSRF=32;FSRR=32;FWDB=-0.0125566;FXX=0.0153834;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.3458;QD=8.71617;RBI=0.0160898;REFB=-0.0124444;REVB=-0.0100605;RO=61;SAF=40;SAR=24;SRF=32;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0923517;STB=0.564496;TYPE=snp;VARB=0.0186738;OID=.;OPOS=96559732;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:128:61:64:64:64:24:40:32:29:24:40:32:32 chr14 96559791 . C T 256.92 PASS AO=62;DP=130;FAO=62;FDP=130;FR=.;FRO=68;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=39;FSRR=29;FWDB=-0.00238155;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.379;QD=7.90507;RBI=0.00661033;REFB=-0.0058785;REVB=0.00616642;RO=66;SAF=28;SAR=34;SRF=37;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1014;STB=0.563562;TYPE=snp;VARB=0.0193172;OID=.;OPOS=96559791;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:66:68:62:62:34:28:37:29:34:28:39:29 chr14 96560083 . A T 477.01 PASS AO=108;DP=213;FAO=109;FDP=213;FR=.;FRO=104;FSAF=54;FSAR=55;FSRF=56;FSRR=48;FWDB=-0.00432976;FXX=0.00467268;HRUN=3;LEN=1;MLLD=261.765;QD=8.95786;RBI=0.0159504;REFB=-0.0103987;REVB=-0.0153515;RO=104;SAF=54;SAR=54;SRF=56;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0344093;STB=0.521009;TYPE=snp;VARB=0.00973814;OID=.;OPOS=96560083;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:213:213:104:104:108:109:54:54:56:48:55:54:56:48 chr14 96560092 . G A 405.07 PASS AO=97;DP=200;FAO=97;FDP=199;FR=.;FRO=102;FSAF=53;FSAR=44;FSRF=53;FSRR=49;FWDB=-0.0203848;FXX=0.00994975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.4022;QD=8.14201;RBI=0.0315951;REFB=-0.0255753;REVB=-0.0241394;RO=101;SAF=53;SAR=44;SRF=53;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0201767;STB=0.513809;TYPE=snp;VARB=0.0264335;OID=.;OPOS=96560092;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:200:199:101:102:97:97:44:53:53:48:44:53:53:49 chr14 96671222 . G T 141.87 PASS AO=21;DP=29;FAO=21;FDP=29;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0173885;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=128.213;QD=19.5684;RBI=0.0287821;REFB=-0.0376222;REVB=0.0229358;RO=7;SAF=7;SAR=14;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0478891;STB=0.512808;TYPE=snp;VARB=0.00844607;OID=.;OPOS=96671222;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:29:29:7:8:21:21:14:7:3:4:14:7:3:5 chr14 96703484 . C T 218.44 PASS AO=63;DP=148;FAO=62;FDP=148;FR=.;FRO=86;FSAF=24;FSAR=38;FSRF=29;FSRR=57;FWDB=-0.00322616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.6346;QD=5.90377;RBI=0.0317418;REFB=-0.0208808;REVB=0.0315774;RO=85;SAF=24;SAR=39;SRF=29;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0438247;STB=0.530964;TYPE=snp;VARB=0.0222398;OID=.;OPOS=96703484;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:85:86:63:62:39:24:29:56:38:24:29:57 chr14 96707457 . A G 664.35 PASS AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0348408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.6805;QD=38.5132;RBI=0.0371003;REFB=0;REVB=-0.0127494;RO=0;SAF=30;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000156599;OID=.;OPOS=96707457;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:69:69:0:0:69:69:39:30:0:0:39:30:0:0 chr14 96708667 . T C 903.17 PASS AO=93;DP=93;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00334784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.684;QD=38.0281;RBI=0.0067063;REFB=0;REVB=0.00581089;RO=0;SAF=56;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.59752e-05;OID=.;OPOS=96708667;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:93:95:0:0:93:95:37:56:0:0:37:58:0:0 chr14 96709349 . G C 171.84 PASS AO=41;DP=85;FAO=41;FDP=86;FR=.;FRO=45;FSAF=13;FSAR=28;FSRF=16;FSRR=29;FWDB=0.02046;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=270.358;QD=7.99241;RBI=0.0209092;REFB=-0.0364687;REVB=0.00431106;RO=42;SAF=13;SAR=28;SRF=14;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0169602;STB=0.522848;TYPE=snp;VARB=0.0324984;OID=.;OPOS=96709349;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:86:42:45:41:41:28:13:14:28:28:13:16:29 chr14 96709359 . A AC 638.03 PASS AO=80;DP=85;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0516844;FXX=0.0238067;HRUN=1;LEN=1;MLLD=26.081;QD=31.1236;RBI=0.147442;REFB=0;REVB=0.138087;RO=4;SAF=25;SAR=55;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0194833;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00322436;OID=.;OPOS=96709360;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:80:85:82:82:0:27:55:0:0:57:4:25:55:2:2 chr14 96709422 . A T 64.36 PASS AO=19;DP=55;FAO=20;FDP=54;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.000890011;FXX=0.0181785;HRUN=4;LEN=1;MLLD=186.179;QD=4.76729;RBI=0.0106451;REFB=-0.0130923;REVB=-0.0106079;RO=34;SAF=11;SAR=8;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150851;STB=0.5999;TYPE=snp;VARB=0.0252952;OID=.;OPOS=96709422;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:55:54:34:34:19:20:8:11:15:19:8:12:15:19 chr14 96730142 . A G 2631.56 PASS AO=278;DP=282;FAO=281;FDP=281;FR=.;FRO=0;FSAF=140;FSAR=141;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00147059;FXX=0.0310334;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.819;QD=37.4599;RBI=0.0386007;REFB=-0.0931133;REVB=-0.0385727;RO=4;SAF=139;SAR=139;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000748533;OID=.;OPOS=96730142;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:282:281:4:0:278:281:139:139:2:2:141:140:0:0 chr14 96751010 . T C 659.75 PASS AO=108;DP=160;FAO=109;FDP=160;FR=.;FRO=51;FSAF=54;FSAR=55;FSRF=23;FSRR=28;FWDB=0.0204355;FXX=0.0476162;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.372;QD=16.4937;RBI=0.0212494;REFB=-0.0163519;REVB=-0.00582444;RO=38;SAF=54;SAR=54;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0384473;STB=0.514165;TYPE=snp;VARB=0.00767815;OID=.;OPOS=96751010;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:160:38:51:108:109:54:54:22:16:55:54:23:28 chr14 96771959 . A G 1912.59 PASS AO=198;DP=199;FAO=199;FDP=199;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0139592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.7263;QD=38.4439;RBI=0.0140155;REFB=0;REVB=-0.00125514;RO=0;SAF=104;SAR=94;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.35354e-05;OID=.;OPOS=96771959;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:199:199:0:0:198:199:94:104:0:0:95:104:0:0 chr14 96781912 . T C 2678.93 PASS AO=226;DP=287;FAO=281;FDP=281;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=106;FSAR=175;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.18582;FXX=0.00706689;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.9928;QD=38.1342;RBI=0.190959;REFB=0;REVB=-0.0440041;RO=0;SAF=55;SAR=171;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000165203;OID=.;OPOS=96781912;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:277:281:0:0:226:281:171:55:0:0:175:106:0:0 chr14 96797724 . G A 1698.29 PASS AO=177;DP=177;FAO=177;FDP=177;FR=.;FRO=0;FSAF=116;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0269706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.88;QD=38.3794;RBI=0.0410521;REFB=0;REVB=0.0309493;RO=0;SAF=116;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.98661e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000101509;OID=.;OPOS=96797724;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:177:177:0:0:177:177:61:116:0:0:61:116:0:0 chr14 96829290 . G A 71.29 PASS AO=16;DP=35;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=17;FWDB=0.00538632;FXX=0.0285633;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.227;QD=8.38742;RBI=0.0205358;REFB=-0.0237989;REVB=0.0198168;RO=18;SAF=4;SAR=12;SRF=1;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.285898;STB=0.658936;TYPE=snp;VARB=0.028755;OID=.;OPOS=96829290;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:35:34:18:18:16:16:12:4:1:17:12:4:1:17 chr14 96851111 . C T 378.22 PASS AO=85;DP=167;FAO=86;FDP=168;FR=.;FRO=82;FSAF=30;FSAR=56;FSRF=35;FSRR=47;FWDB=0.028164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.6289;QD=9.00523;RBI=0.0338315;REFB=-0.00290349;REVB=-0.0187446;RO=82;SAF=30;SAR=55;SRF=35;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0705224;STB=0.540852;TYPE=snp;VARB=0.00283742;OID=.;OPOS=96851111;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:168:82:82:85:86:55:30:35:47:56:30:35:47 chr14 96871104 . G A 103.61 PASS AO=31;DP=80;FAO=31;FDP=81;FR=.;FRO=50;FSAF=27;FSAR=4;FSRF=32;FSRR=18;FWDB=0.00122034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.934;QD=5.11676;RBI=0.0294173;REFB=-0.0231465;REVB=-0.0293919;RO=49;SAF=27;SAR=4;SRF=32;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.351878;STB=0.715496;TYPE=snp;VARB=0.0281885;OID=.;OPOS=96871104;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:81:49:50:31:31:4:27:32:17:4:27:32:18 chr14 96922752 . C G 2221.83 PASS AO=230;DP=232;FAO=232;FDP=232;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=134;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0275394;FXX=0.0127654;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.995;QD=38.3074;RBI=0.0277249;REFB=0;REVB=-0.00320198;RO=0;SAF=98;SAR=132;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.55388e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.80394e-05;OID=.;OPOS=96922752;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:232:232:0:0:230:232:132:98:0:0:134:98:0:0 chr14 97104758 . A G 1172.65 PASS AO=92;DP=124;FAO=123;FDP=123;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=64;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0157085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.193;QD=38.1351;RBI=0.114197;REFB=0;REVB=0.113111;RO=0;SAF=60;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.44018e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0001455;OID=.;OPOS=97104758;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:120:123:0:0:92:123:32:60:0:0:59:64:0:0 chr14 97299853 . A G 264.48 PASS AO=68;DP=149;FAO=68;FDP=150;FR=.;FRO=82;FSAF=21;FSAR=47;FSRF=31;FSRR=51;FWDB=-0.000946262;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.1297;QD=7.05266;RBI=0.0199274;REFB=-0.0269676;REVB=0.0199049;RO=81;SAF=21;SAR=47;SRF=31;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0814843;STB=0.542857;TYPE=snp;VARB=0.0353193;OID=.;OPOS=97299853;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:150:81:82:68:68:47:21:31:50:47:21:31:51 chr14 97327098 . T TTG 245.64 PASS AO=68;DP=192;FAO=72;FDP=175;FR=.;FRO=103;FSAF=20;FSAR=52;FSRF=41;FSRR=62;FWDB=-0.00825109;FXX=0.0223451;HRUN=3;LEN=2;MLLD=234.389;QD=5.61461;RBI=0.0243929;REFB=0.00613262;REVB=-0.022955;RO=120;SAF=19;SAR=49;SRF=48;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154;STB=0.581781;TYPE=ins;VARB=-0.00722695;OID=.;OPOS=97327099;OREF=-;OALT=TG;OMAPALT=TTG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:68:192:72:175:103:20:52:41:62:99:120:19:49:48:72 chr14 98435696 . T C 3307.96 PASS AO=347;DP=359;FAO=353;FDP=353;FR=.;FRO=0;FSAF=190;FSAR=163;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00354564;FXX=0.0167126;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.846;QD=37.484;RBI=0.107012;REFB=-0.0315333;REVB=0.106953;RO=2;SAF=190;SAR=157;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00603858;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000458601;OID=.;OPOS=98435696;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:359:353:2:0:347:353:157:190:0:2:163:190:0:0 chr14 98435838 . G A 712.33 PASS AO=157;DP=300;FAO=157;FDP=297;FR=.;FRO=140;FSAF=78;FSAR=79;FSRF=43;FSRR=97;FWDB=-0.00184534;FXX=0.00999967;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.852;QD=9.5936;RBI=0.0151636;REFB=-0.0274499;REVB=-0.0150509;RO=139;SAF=78;SAR=79;SRF=43;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16201;STB=0.589502;TYPE=snp;VARB=0.0243529;OID=.;OPOS=98435838;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:300:297:139:140:157:157:79:78:43:96:79:78:43:97 chr14 98444369 . T C 448.16 PASS AO=49;DP=53;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00874128;FXX=0.0377287;HRUN=3;LEN=1;MLLD=205.598;QD=35.1498;RBI=0.0177287;REFB=-0.0111515;REVB=0.0154239;RO=1;SAF=19;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0241219;STB=0.512815;TYPE=snp;VARB=0.00063219;OID=.;OPOS=98444369;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:53:51:1:1:49:50:30:19:1:0:31:19:1:0 chr14 98817896 . T C 1493.71 PASS AO=155;DP=155;FAO=156;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0259638;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7894;QD=38.3003;RBI=0.026855;REFB=0;REVB=-0.00686093;RO=0;SAF=59;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00014882;OID=.;OPOS=98817896;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:155:156:0:0:155:156:96:59:0:0:97:59:0:0 chr14 99182535 . C T 188.41 PASS AO=44;DP=91;FAO=44;FDP=91;FR=.;FRO=47;FSAF=29;FSAR=15;FSRF=32;FSRR=15;FWDB=-0.00411697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.453;QD=8.28162;RBI=0.0368386;REFB=-0.0142601;REVB=0.0366078;RO=47;SAF=29;SAR=15;SRF=32;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.022682;STB=0.512599;TYPE=snp;VARB=0.021747;OID=.;OPOS=99182535;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:47:47:44:44:15:29:32:15:15:29:32:15 chr14 99876505 . A G 392.42 PASS AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00461193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.45;QD=37.3735;RBI=0.0490521;REFB=0;REVB=0.0488348;RO=0;SAF=33;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.27702e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.99866e-05;OID=.;OPOS=99876505;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:42:42:0:0:42:42:9:33:0:0:9:33:0:0 chr14 100039109 . C G 452.38 PASS AO=110;DP=227;FAO=110;FDP=227;FR=.;FRO=117;FSAF=44;FSAR=66;FSRF=34;FSRR=83;FWDB=0.0189763;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=273.252;QD=7.97139;RBI=0.0245857;REFB=-0.00969789;REVB=-0.0156319;RO=116;SAF=44;SAR=66;SRF=33;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115479;STB=0.56014;TYPE=snp;VARB=0.00894265;OID=.;OPOS=100039109;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:227:227:116:117:110:110:66:44:33:83:66:44:34:83 chr14 100189287 . C T 258.44 PASS AO=69;DP=157;FAO=69;FDP=156;FR=.;FRO=87;FSAF=35;FSAR=34;FSRF=44;FSRR=43;FWDB=-0.0117175;FXX=0.00636902;HRUN=4;LEN=1;MLLD=162.633;QD=6.62677;RBI=0.0136808;REFB=-0.00474308;REVB=0.00706147;RO=88;SAF=35;SAR=34;SRF=44;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0072844;STB=0.500836;TYPE=snp;VARB=0.00525947;OID=.;OPOS=100189287;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:156:88:87:69:69:34:35:44:44:34:35:44:43 chr14 100380948 . T C 1216.53 PASS AO=128;DP=129;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0367124;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.114;QD=38.0167;RBI=0.0369529;REFB=0;REVB=0.00420943;RO=0;SAF=39;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.46366e-05;OID=.;OPOS=100380948;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:129:128:0:0:128:128:89:39:0:0:90:38:0:0 chr14 100411774 . G A 1000.76 PASS AO=100;DP=100;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.183;QD=38.1243;RBI=0.0297527;REFB=0;REVB=0.0230311;RO=0;SAF=45;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.00706e-05;OID=.;OPOS=100411774;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:100:105:0:0:100:105:55:45:0:0:60:45:0:0 chr14 100602323 . G C 15.21 PASS AO=4;DP=15;FAO=4;FDP=15;FR=.;FRO=11;FSAF=0;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=11;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=304.564;QD=4.05712;RBI=0.000829527;REFB=-0.00425151;REVB=0.000829527;RO=11;SAF=0;SAR=4;SRF=0;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00417719;OID=.;OPOS=100602323;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:15:15:11:11:4:4:4:0:0:11:4:0:0:11 chr14 100615665 . T C 447.3 PASS AO=47;DP=48;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0287225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.511;QD=36.5143;RBI=0.0358931;REFB=-0.0869871;REVB=0.0215251;RO=1;SAF=21;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218674;STB=0.511623;TYPE=snp;VARB=0.000410861;OID=.;OPOS=100615665;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:48:49:1:1:47:48:26:21:1:0:27:21:1:0 chr14 100758502 . G A 168.59 PASS AO=47;DP=115;FAO=48;FDP=116;FR=.;FRO=68;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=29;FSRR=39;FWDB=-0.0417414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.181;QD=5.81341;RBI=0.061899;REFB=-0.0270572;REVB=-0.0457071;RO=66;SAF=16;SAR=31;SRF=27;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0768962;STB=0.545088;TYPE=snp;VARB=0.0415708;OID=.;OPOS=100758502;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:116:66:68:47:48:31:16:27:39:31:17:29:39 chr14 100759046 . C A 24.8 PASS AO=4;DP=8;FAO=4;FDP=8;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0441278;FXX=0.110988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.112;QD=12.3987;RBI=0.0445146;REFB=-0.0021287;REVB=-0.00585572;RO=4;SAF=2;SAR=2;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00071651;OID=.;OPOS=100759046;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:8:8:4:4:4:4:2:2:2:2:2:2:2:2 chr14 100759277 . C T 79.7 PASS AO=16;DP=32;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.000697616;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=109.497;QD=9.37626;RBI=0.0140978;REFB=-0.0149227;REVB=0.0140805;RO=16;SAF=5;SAR=11;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.329008;STB=0.680634;TYPE=snp;VARB=0.0204609;OID=.;OPOS=100759277;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:32:34:16:17:16:17:11:5:11:5:12:5:11:6 chr14 100792482 . C A 540.09 PASS AO=59;DP=60;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0599096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.814;QD=34.2917;RBI=0.0633417;REFB=-0.208199;REVB=0.0205671;RO=0;SAF=23;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510201;TYPE=snp;VARB=0.00215381;OID=.;OPOS=100792482;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:60:63:0:1:59:62:36:23:0:0:38:24:1:0 chr14 100795139 . G T 47.14 PASS AO=7;DP=11;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0509618;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.079;QD=17.1432;RBI=0.0619969;REFB=-0.0224455;REVB=0.0353059;RO=4;SAF=5;SAR=2;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149414;STB=0.58797;TYPE=snp;VARB=0.00925955;OID=.;OPOS=100795139;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:11:11:4:4:7:7:2:5:2:2:2:5:2:2 chr14 100808845 . G A 1262.52 PASS AO=129;DP=130;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0265897;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.257;QD=37.6872;RBI=0.0758152;REFB=-0.0488453;REVB=0.0709995;RO=1;SAF=73;SAR=56;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00646609;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00027129;OID=.;OPOS=100808845;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:130:134:1:0:129:134:56:73:1:0:61:73:0:0 chr14 100832391 . T C 1280.84 PASS AO=131;DP=132;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173989;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.839;QD=38.234;RBI=0.0349517;REFB=0;REVB=0.0303134;RO=0;SAF=61;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.92737e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000102432;OID=.;OPOS=100832391;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:132:134:0:0:131:134:70:61:0:0:70:64:0:0 chr14 100847523 . T C 887.82 PASS AO=98;DP=106;FAO=101;FDP=107;FR=.;FRO=6;FSAF=47;FSAR=54;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0192939;FXX=0.0183469;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.3504;QD=33.1896;RBI=0.02207;REFB=-0.00212895;REVB=-0.0107159;RO=5;SAF=44;SAR=54;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0324919;STB=0.511323;TYPE=snp;VARB=-0.000267273;OID=.;OPOS=100847523;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:106:107:5:6:98:101:54:44:4:1:54:47:4:2 chr14 100847707 . A G 1421.97 PASS AO=147;DP=148;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0534966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.799;QD=38.4315;RBI=0.0536526;REFB=0;REVB=0.0040883;RO=0;SAF=54;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1973e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.03621e-05;OID=.;OPOS=100847707;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:148:148:0:0:147:148:93:54:0:0:93:55:0:0 chr14 100847930 . A G 689.98 PASS AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.204;QD=37.8072;RBI=0.0173614;REFB=0;REVB=0.00571355;RO=0;SAF=56;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.45227e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.34083e-05;OID=.;OPOS=100847930;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:73:73:0:0:73:73:17:56:0:0:17:56:0:0 chr14 100934427 . GC G 22.06 PASS AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.104441;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=19.8572;QD=5.51467;RBI=0.106438;REFB=-0.00823286;REVB=0.020521;RO=9;SAF=5;SAR=2;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.354212;STB=0.713673;TYPE=del;VARB=0.0584593;OID=.;OPOS=100934428;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:7:16:7:16:9:5:2:3:6:21:9:5:2:3:6 chr14 101138230 . A C 977.1 PASS AO=107;DP=112;FAO=109;FDP=111;FR=.;FRO=2;FSAF=53;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0398204;FXX=0.00892777;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.4182;QD=35.2108;RBI=0.100269;REFB=-0.177282;REVB=0.092023;RO=4;SAF=51;SAR=56;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0155328;STB=0.50877;TYPE=snp;VARB=0.0103745;OID=.;OPOS=101138230;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:112:111:4:2:107:109:56:51:1:3:56:53:0:2 chr14 101198417 . A G 867.58 PASS AO=87;DP=87;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0202552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.375;QD=38.559;RBI=0.021943;REFB=0;REVB=-0.00843929;RO=0;SAF=32;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92665e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.71426e-05;OID=.;OPOS=101198417;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:87:90:0:0:87:90:55:32:0:0:58:32:0:0 chr14 101200860 . G A 49.68 PASS AO=9;DP=20;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.0270356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.0973;QD=9.46265;RBI=0.0354442;REFB=-0.0262005;REVB=-0.0229209;RO=11;SAF=7;SAR=2;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0645154;STB=0.555438;TYPE=snp;VARB=0.022012;OID=.;OPOS=101200860;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:20:21:11:11:9:10:2:7:8:3:2:8:8:3 chr14 101302211 . G T 155.28 PASS AO=29;DP=54;FAO=31;FDP=54;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=23;FSRF=4;FSRR=19;FWDB=0.0202091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.318;QD=11.5024;RBI=0.0303625;REFB=-0.0299649;REVB=0.02266;RO=20;SAF=7;SAR=22;SRF=3;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0979413;STB=0.54899;TYPE=snp;VARB=0.0155459;OID=.;OPOS=101302211;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:54:54:20:23:29:31:22:7:3:17:23:8:4:19 chr14 101302283 . C T 48.24 PASS AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.0191482;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.803;QD=7.71878;RBI=0.0346539;REFB=-0.00115812;REVB=0.0288832;RO=14;SAF=2;SAR=9;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146265;STB=0.586784;TYPE=snp;VARB=0.000861457;OID=.;OPOS=101302283;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:25:25:14:14:11:11:9:2:4:10:9:2:4:10 chr14 101347300 . G T 18.63 PASS AO=4;DP=12;FAO=4;FDP=12;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=0;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=-0.00731084;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=119.994;QD=6.20936;RBI=0.00731084;REFB=-0.0112558;REVB=0;RO=8;SAF=4;SAR=0;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00207796;OID=.;OPOS=101347300;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:12:12:8:8:4:4:0:4:8:0:0:4:8:0 chr14 101347411 . CG C 48.05 PASS AO=5;DP=9;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.257189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=10.7095;QD=24.0274;RBI=0.257189;REFB=-0.0234035;REVB=0;RO=3;SAF=5;SAR=0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0663378;OID=.;OPOS=101347412;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:5:8:8:8:0:8:0:0:0:3:3:5:0:3:0 chr14 101507727 . C T 200.25 PASS AO=43;DP=82;FAO=43;FDP=82;FR=.;FRO=39;FSAF=28;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=28;FWDB=-0.010557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.761;QD=9.76826;RBI=0.0109267;REFB=-0.0109929;REVB=-0.00281836;RO=39;SAF=28;SAR=15;SRF=11;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.313493;STB=0.672922;TYPE=snp;VARB=0.0101766;OID=.;OPOS=101507727;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:39:39:43:43:15:28:11:28:15:28:11:28 chr14 101522556 . T C 1788.05 PASS AO=186;DP=188;FAO=186;FDP=186;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0231628;FXX=0.0106377;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.286;QD=38.4526;RBI=0.026477;REFB=0;REVB=0.0128264;RO=0;SAF=89;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.89893e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.44522e-05;OID=.;OPOS=101522556;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:188:186:0:0:186:186:97:89:0:0:97:89:0:0 chr14 102463407 . A G 1001.94 PASS AO=200;DP=344;FAO=200;FDP=344;FR=.;FRO=144;FSAF=95;FSAR=105;FSRF=64;FSRR=80;FWDB=-0.00372628;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.457;QD=11.6505;RBI=0.00450733;REFB=-0.0150471;REVB=-0.00253591;RO=130;SAF=95;SAR=105;SRF=51;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0607585;STB=0.512838;TYPE=snp;VARB=0.00837652;OID=.;OPOS=102463407;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:344:344:130:144:200:200:105:95:51:79:105:95:64:80 chr14 102493761 . A G 363.73 PASS AO=88;DP=182;FAO=88;FDP=182;FR=.;FRO=94;FSAF=12;FSAR=76;FSRF=30;FSRR=64;FWDB=0.0106309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.0802;QD=7.99399;RBI=0.0280747;REFB=-0.0152026;REVB=0.0259841;RO=92;SAF=12;SAR=76;SRF=30;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.282998;STB=0.655131;TYPE=snp;VARB=0.0148104;OID=.;OPOS=102493761;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:182:92:94:88:88:76:12:30:62:76:12:30:64 chr14 102514227 . T C 188.76 PASS AO=32;DP=50;FAO=32;FDP=50;FR=.;FRO=18;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.00844051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.471;QD=15.1007;RBI=0.0185571;REFB=-0.0512068;REVB=-0.0165264;RO=18;SAF=20;SAR=12;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0097048;STB=0.505316;TYPE=snp;VARB=0.0273137;OID=.;OPOS=102514227;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:50:50:18:18:32:32:12:20:11:7:12:20:11:7 chr14 102548703 . T G 607.32 PASS AO=148;DP=305;FAO=148;FDP=304;FR=.;FRO=156;FSAF=78;FSAR=70;FSRF=65;FSRR=91;FWDB=-9.19652e-05;FXX=0.00327858;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.222;QD=7.99104;RBI=0.00190544;REFB=-0.0198532;REVB=0.00190322;RO=156;SAF=78;SAR=70;SRF=65;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102802;STB=0.556444;TYPE=snp;VARB=0.017753;OID=.;OPOS=102548703;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:305:304:156:156:148:148:70:78:65:91:70:78:65:91 chr14 102675350 . G C 2254.67 PASS AO=240;DP=247;FAO=243;FDP=243;FR=.;FRO=0;FSAF=127;FSAR=116;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00678129;FXX=0.0240954;HRUN=4;LEN=1;MLLD=215.816;QD=37.114;RBI=0.0181816;REFB=0.00968446;REVB=0.0168697;RO=1;SAF=127;SAR=113;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00419922;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.52868e-05;OID=.;OPOS=102675350;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:247:243:1:0:240:243:113:127:0:1:116:127:0:0 chr14 102692657 . T C 1364.81 PASS AO=143;DP=144;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0293761;FXX=0.00694396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.73;QD=38.1766;RBI=0.0540575;REFB=0;REVB=0.0453791;RO=0;SAF=74;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.12649e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000116034;OID=.;OPOS=102692657;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:144:143:0:0:143:143:69:74:0:0:69:74:0:0 chr14 102695693 . T C 53.05 PASS AO=8;DP=8;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0190928;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.7829;QD=26.5229;RBI=0.049176;REFB=-0.144713;REVB=0.0453182;RO=0;SAF=7;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.78849e-08;STB=0.538356;TYPE=snp;VARB=0.0304076;OID=.;OPOS=102695693;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:8:8:0:1:8:7:1:7:0:0:1:6:1:0 chr14 102729886 . G A 173.63 PASS AO=41;DP=85;FAO=41;FDP=85;FR=.;FRO=44;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=19;FWDB=-0.0262775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.63;QD=8.17087;RBI=0.0283503;REFB=-0.0147736;REVB=0.010641;RO=44;SAF=23;SAR=18;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00680533;STB=0.503788;TYPE=snp;VARB=0.0178864;OID=.;OPOS=102729886;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:44:44:41:41:18:23:25:19:18:23:25:19 chr14 102745064 . G C 779.21 PASS AO=177;DP=344;FAO=177;FDP=343;FR=.;FRO=166;FSAF=55;FSAR=122;FSRF=60;FSRR=106;FWDB=-0.0456094;FXX=0.00290689;HRUN=3;LEN=1;MLLD=229.378;QD=9.08701;RBI=0.0460076;REFB=-0.00895173;REVB=-0.00604;RO=159;SAF=55;SAR=122;SRF=53;SRR=106;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0226536;STB=0.528036;TYPE=snp;VARB=0.00716199;OID=.;OPOS=102745064;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:344:343:159:166:177:177:122:55:53:106:122:55:60:106 chr14 102792386 . T C 632.57 PASS AO=134;DP=266;FAO=143;FDP=275;FR=.;FRO=132;FSAF=61;FSAR=82;FSRF=67;FSRR=65;FWDB=0.00876408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.831;QD=9.20098;RBI=0.0164535;REFB=-0.0109829;REVB=0.0139251;RO=129;SAF=53;SAR=81;SRF=65;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.099073;STB=0.539274;TYPE=snp;VARB=0.00963405;OID=.;OPOS=102792386;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:266:275:129:132:134:143:81:53:65:64:82:61:67:65 chr14 102792631 . G A 34.64 PASS AO=12;DP=40;FAO=12;FDP=40;FR=.;FRO=28;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.00269572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.265;QD=3.46391;RBI=0.0195373;REFB=-0.00113876;REVB=-0.0193504;RO=28;SAF=2;SAR=10;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.401745;STB=0.749531;TYPE=snp;VARB=0.00233861;OID=.;OPOS=102792631;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:40:40:28:28:12:12:10:2:13:15:10:2:13:15 chr14 102808655 . G C 229.33 PASS AO=55;DP=119;FAO=56;FDP=118;FR=.;FRO=62;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=38;FWDB=-0.013154;FXX=0.00840265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.309;QD=7.77381;RBI=0.0135308;REFB=-0.0129977;REVB=-0.00317129;RO=59;SAF=30;SAR=25;SRF=23;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14449;STB=0.57759;TYPE=snp;VARB=0.00676487;OID=.;OPOS=102808655;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:118:59:62:55:56:25:30:23:36:26:30:24:38 chr14 102814945 . G A 104 PASS AO=26;DP=62;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=27;FWDB=0.0109032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.65;QD=6.60322;RBI=0.020651;REFB=-0.00427788;REVB=0.017538;RO=36;SAF=14;SAR=12;SRF=9;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.291332;STB=0.651818;TYPE=snp;VARB=0.00764339;OID=.;OPOS=102814945;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:63:36:36:26:27:12:14:9:27:13:14:9:27 chr14 102815042 . C T 81.56 PASS AO=24;DP=63;FAO=24;FDP=63;FR=.;FRO=39;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=-0.040249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.1921;QD=5.17824;RBI=0.0484846;REFB=-0.0165177;REVB=-0.0270329;RO=39;SAF=6;SAR=18;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.37822;STB=0.718819;TYPE=snp;VARB=0.0367954;OID=.;OPOS=102815042;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:63:63:39:39:24:24:18:6:23:16:18:6:23:16 chr14 102894593 . G A 1152.83 PASS AO=121;DP=121;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.1742;QD=38.1099;RBI=0.0138681;REFB=0;REVB=0.00694939;RO=0;SAF=41;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.20281e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.44636e-05;OID=.;OPOS=102894593;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:121:121:0:0:121:121:80:41:0:0:80:41:0:0 chr14 102901201 . A G 64.53 PASS AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0482745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.082;QD=8.60401;RBI=0.0483948;REFB=-0.01196;REVB=-0.00341129;RO=16;SAF=7;SAR=7;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0125781;OID=.;OPOS=102901201;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:30:30:16:16:14:14:7:7:8:8:7:7:8:8 chr14 103161736 . A AG 1415.93 PASS AO=167;DP=196;FAO=186;FDP=186;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.041837;FXX=0.0158722;HRUN=1;LEN=1;MLLD=23.432;QD=30.4502;RBI=0.11311;REFB=0;REVB=-0.105088;RO=14;SAF=80;SAR=87;SRF=14;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0763379;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-0.000622352;OID=.;OPOS=103161737;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:167:196:186:186:0:87:99:0:0:99:14:80:87:14:0 chr14 103193028 . G A 1292.52 PASS AO=130;DP=133;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0398472;FXX=0.0215812;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.3846;QD=38.0153;RBI=0.0510255;REFB=-0.0339042;REVB=0.0318717;RO=0;SAF=51;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000488922;OID=.;OPOS=103193028;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:133:136:0:0:130:136:79:51:0:0:81:55:0:0 chr14 103196055 . C T 270.53 PASS AO=67;DP=147;FAO=68;FDP=146;FR=.;FRO=78;FSAF=24;FSAR=44;FSRF=26;FSRR=52;FWDB=0.0234872;FXX=0.00680226;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.2213;QD=7.41177;RBI=0.0343608;REFB=0.00976141;REVB=0.0250802;RO=79;SAF=23;SAR=44;SRF=26;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0153934;STB=0.511542;TYPE=snp;VARB=-0.0114708;OID=.;OPOS=103196055;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:146:79:78:67:68:44:23:26:53:44:24:26:52 chr14 103370114 . CG C 23.13 PASS AO=9;DP=26;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.219479;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=21.1297;QD=3.85478;RBI=0.219528;REFB=0.000494026;REVB=-0.00464209;RO=14;SAF=4;SAR=5;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19924;STB=0.636074;TYPE=del;VARB=-0.034374;OID=.;OPOS=103370115;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:9:24:9:24:15:4:5:10:5:23:14:4:5:9:5 chr14 103388999 . T C 183.14 PASS AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.054028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.629;QD=38.5549;RBI=0.0540285;REFB=0;REVB=0.000237215;RO=0;SAF=14;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000195991;OID=.;OPOS=103388999;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:19:19:0:0:19:19:5:14:0:0:5:14:0:0 chr14 103389003 . G C 183.14 PASS AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00557342;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=191.566;QD=38.5547;RBI=0.093574;REFB=0;REVB=-0.0934079;RO=0;SAF=14;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000478568;OID=.;OPOS=103389003;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:19:19:0:0:19:19:5:14:0:0:5:14:0:0 chr14 103410272 . GC G 75.76 PASS AO=19;DP=32;FAO=23;FDP=31;FR=.;FRO=8;FSAF=20;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.0585235;FXX=0.0312402;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.5686;QD=9.77517;RBI=0.0586798;REFB=-0.124118;REVB=0.00428039;RO=8;SAF=16;SAR=3;SRF=3;SRR=5;SSEN=0.281852;SSEP=0;SSSB=0.342107;STB=0.698484;TYPE=del;VARB=0.0781649;OID=.;OPOS=103410273;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:19:30:23:31:8:20:3:3:5:13:8:16:3:3:5 chr14 103440473 . G C 531.5 PASS AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.2276;QD=37.9639;RBI=0.0218682;REFB=0;REVB=0.00120868;RO=0;SAF=12;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000157106;OID=.;OPOS=103440473;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:56:56:0:0:56:56:44:12:0:0:44:12:0:0 chr14 103566785 . C T 209.04 PASS AO=50;DP=104;FAO=50;FDP=104;FR=.;FRO=54;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=31;FSRR=23;FWDB=0.00504971;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.69;QD=8.03986;RBI=0.0125169;REFB=-0.000268626;REVB=0.0114531;RO=54;SAF=25;SAR=25;SRF=31;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0692917;STB=0.538446;TYPE=snp;VARB=0.000265478;OID=.;OPOS=103566785;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:54:54:50:50:25:25:31:23:25:25:31:23 chr14 103566835 . C G 154.1 PASS AO=22;DP=96;FAO=27;FDP=94;FR=.,HEALED;FRO=52;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=30;FSRR=22;FWDB=0.00965648;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.569;QD=6.55762;RBI=0.0513953;REFB=-0.0314873;REVB=-0.05048;RO=52;SAF=8;SAR=14;SRF=30;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.250465;STB=0.562571;TYPE=snp;VARB=0.0468012;OID=.;OPOS=103566835;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:95:94:52:52:22:27:14:8:30:22:14:13:30:22 chr14 103568614 . T A 26.5 PASS AO=10;DP=36;FAO=10;FDP=37;FR=.;FRO=27;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.00646222;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=173.32;QD=2.86435;RBI=0.0072841;REFB=-0.0132891;REVB=-0.00336124;RO=26;SAF=2;SAR=8;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217118;STB=0.657184;TYPE=snp;VARB=0.0517714;OID=.;OPOS=103568614;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:36:37:26:27:10:10:8:2:9:17:8:2:10:17 chr14 103576415 . A G 422.67 PASS AO=43;DP=43;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.0609;QD=37.5706;RBI=0.0443965;REFB=0;REVB=0.0431529;RO=0;SAF=15;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02792e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000910336;OID=.;OPOS=103576415;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:43:45:0:0:43:45:28:15:0:0:30:15:0:0 chr14 103593950 . C G 86.76 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0292028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.949;QD=38.5593;RBI=0.0625833;REFB=0;REVB=0.0553522;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00188888;OID=.;OPOS=103593950;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:5:4:0:0:5:4:0:0 chr14 103602278 . A G 305.49 PASS AO=31;DP=32;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.475;QD=37.0296;RBI=0.0136284;REFB=0;REVB=0.00509078;RO=0;SAF=8;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39343e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000198996;OID=.;OPOS=103602278;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:32:33:0:0:31:33:23:8:0:0:25:8:0:0 chr14 103852725 . C T 1454.87 PASS AO=154;DP=155;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230543;FXX=0.0064512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.542;QD=37.7887;RBI=0.0279378;REFB=-0.0248831;REVB=-0.0157804;RO=1;SAF=72;SAR=82;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0065614;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.54094e-05;OID=.;OPOS=103852725;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:155:154:1:0:154:154:82:72:1:0:82:72:0:0 chr14 103934488 . T C 2413.52 PASS AO=275;DP=291;FAO=277;FDP=291;FR=.;FRO=14;FSAF=111;FSAR=166;FSRF=12;FSRR=2;FWDB=0.0133362;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=220.303;QD=33.1755;RBI=0.0133368;REFB=-0.126377;REVB=-0.000129725;RO=11;SAF=109;SAR=166;SRF=10;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0388939;STB=0.522652;TYPE=snp;VARB=0.000390617;OID=.;OPOS=103934488;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:291:291:11:14:275:277:166:109:10:1:166:111:12:2 chr14 103969909 . A G 530.64 PASS AO=135;DP=292;FAO=136;FDP=292;FR=.;FRO=156;FSAF=69;FSAR=67;FSRF=71;FSRR=85;FWDB=-0.0292374;FXX=0.00341285;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.485;QD=7.26899;RBI=0.0347231;REFB=-0.0113686;REVB=-0.0187315;RO=154;SAF=68;SAR=67;SRF=70;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0474757;STB=0.52788;TYPE=snp;VARB=0.0150603;OID=.;OPOS=103969909;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:292:292:154:156:135:136:67:68:70:84:67:69:71:85 chr14 103986255 . C T 579.36 PASS AO=59;DP=60;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0264114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.504;QD=36.21;RBI=0.0388807;REFB=0.0477728;REVB=0.0285332;RO=1;SAF=39;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119466;STB=0.505745;TYPE=snp;VARB=-8.94049e-05;OID=.;OPOS=103986255;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:60:64:1:1:59:63:20:39:1:0:20:43:1:0 chr14 103996396 . G A 445.75 PASS AO=46;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00064262;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.522;QD=37.146;RBI=0.00892423;REFB=0;REVB=0.00890106;RO=1;SAF=21;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218604;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000113159;OID=.;OPOS=103996396;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:47:48:1:0:46:48:25:21:1:0:26:22:0:0 chr14 104001517 . G A 88.21 PASS AO=19;DP=40;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=5;FWDB=0.00976954;FXX=0.0249938;HRUN=6;LEN=1;MLLD=140.696;QD=9.04716;RBI=0.0150334;REFB=-0.0148831;REVB=-0.0114263;RO=20;SAF=15;SAR=4;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0516387;STB=0.52938;TYPE=snp;VARB=0.0136286;OID=.;OPOS=104001517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:40:39:20:20:19:19:4:15:15:5:4:15:15:5 chr14 104025893 . T C 380.59 PASS AO=96;DP=204;FAO=96;FDP=205;FR=.;FRO=109;FSAF=50;FSAR=46;FSRF=46;FSRR=63;FWDB=-0.0260729;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=115.839;QD=7.42609;RBI=0.0291499;REFB=-0.0135328;REVB=-0.0130355;RO=107;SAF=50;SAR=46;SRF=46;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0866201;STB=0.552391;TYPE=snp;VARB=0.0177901;OID=.;OPOS=104025893;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:205:107:109:96:96:46:50:46:61:46:50:46:63 chr14 104028270 . T C 257.14 PASS AO=61;DP=125;FAO=61;FDP=125;FR=.;FRO=64;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=28;FSRR=36;FWDB=-0.0138098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.397;QD=8.22851;RBI=0.014809;REFB=0.0109744;REVB=0.0053476;RO=64;SAF=31;SAR=30;SRF=28;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0653911;STB=0.536152;TYPE=snp;VARB=-0.0115566;OID=.;OPOS=104028270;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:64:64:61:61:30:31:28:36:30:31:28:36 chr14 104167075 . C T 583.55 PASS AO=47;DP=59;FAO=62;FDP=62;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=24;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.141021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.098;QD=37.6483;RBI=0.141221;REFB=0;REVB=-0.00751775;RO=0;SAF=11;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000413045;OID=.;OPOS=104167075;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:59:62:0:0:47:62:36:11:0:0:38:24:0:0 chr14 104167545 . G A 235.16 PASS AO=25;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0940649;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.4595;QD=34.8389;RBI=0.100572;REFB=-0.0381896;REVB=0.0355891;RO=1;SAF=2;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0197596;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00837308;OID=.;OPOS=104167545;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:27:27:1:0:25:27:23:2:0:1:24:3:0:0 chr14 104178186 . A G 306.11 PASS AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00814165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8292;QD=37.1045;RBI=0.0339558;REFB=0;REVB=-0.0329653;RO=0;SAF=14;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.71297e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000478651;OID=.;OPOS=104178186;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:33:33:0:0:33:33:19:14:0:0:19:14:0:0 chr14 104178445 . G GGCCCGGCGTGGA 75.93 PASS AO=7;DP=21;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135539;FXX=0.27248;HRUN=2;LEN=12;MLLD=393.638;QD=37.9661;RBI=0.0147268;REFB=0;REVB=-0.00575941;RO=11;SAF=4;SAR=3;SRF=11;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.508907;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.0116055;OID=.;OPOS=104178446;OREF=-;OALT=GCCCGGCGTGGA;OMAPALT=GGCCCGGCGTGGA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:7:21:8:8:0:5:3:0:0:3:11:4:3:11:0 chr14 104194196 . C G 604.58 PASS AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.283;QD=37.7859;RBI=0.0300263;REFB=0;REVB=0.0235931;RO=0;SAF=45;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000300122;OID=.;OPOS=104194196;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:64:64:0:0:64:64:19:45:0:0:19:45:0:0 chr14 104199356 . C T 994.32 PASS AO=109;DP=111;FAO=109;FDP=111;FR=.;FRO=2;FSAF=82;FSAR=27;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00415734;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.7765;QD=35.8313;RBI=0.121847;REFB=-0.169549;REVB=0.121776;RO=1;SAF=83;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00568572;STB=0.506023;TYPE=snp;VARB=0.00124483;OID=.;OPOS=104199356;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:111:111:1:2:109:109:26:83:1:0:27:82:2:0 chr14 104205123 . G A 83.37 PASS AO=22;DP=53;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=0.050366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.329;QD=6.2919;RBI=0.0526571;REFB=-0.0126841;REVB=0.0153635;RO=31;SAF=12;SAR=10;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00301997;STB=0.501729;TYPE=snp;VARB=0.0174869;OID=.;OPOS=104205123;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:53:53:31:31:22:22:10:12:17:14:10:12:17:14 chr14 104394850 . C T 114.78 PASS AO=21;DP=33;FAO=20;FDP=32;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0174536;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.7648;QD=14.3476;RBI=0.0208154;REFB=-0.0151291;REVB=0.0113425;RO=12;SAF=8;SAR=13;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0246589;STB=0.527;TYPE=snp;VARB=0.00996493;OID=.;OPOS=104394850;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:33:32:12:12:21:20:13:8:5:7:13:7:5:7 chr14 104429453 . A G 1960.61 PASS AO=210;DP=213;FAO=211;FDP=211;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0416548;FXX=0.00938923;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.636;QD=37.1679;RBI=0.0722218;REFB=-0.0530505;REVB=0.0589988;RO=1;SAF=101;SAR=109;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00469337;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000233992;OID=.;OPOS=104429453;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:213:211:1:0:210:211:109:101:1:0:110:101:0:0 chr14 104436931 . C T 271.96 PASS AO=57;DP=107;FAO=58;FDP=109;FR=.;FRO=51;FSAF=15;FSAR=43;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=-0.004758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.093;QD=9.98003;RBI=0.00843102;REFB=0.0100505;REVB=0.00696014;RO=49;SAF=15;SAR=42;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181454;STB=0.614919;TYPE=snp;VARB=-0.00768702;OID=.;OPOS=104436931;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:109:49:51:57:58:42:15:22:27:43:15:24:27 chr14 104452640 . G A 379.02 PASS AO=93;DP=193;FAO=93;FDP=194;FR=.;FRO=101;FSAF=47;FSAR=46;FSRF=48;FSRR=53;FWDB=0.0186579;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.446;QD=7.81476;RBI=0.0191938;REFB=-0.0220897;REVB=0.00450387;RO=100;SAF=47;SAR=46;SRF=47;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0332258;STB=0.515679;TYPE=snp;VARB=0.0273898;OID=.;OPOS=104452640;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:194:100:101:93:93:46:47:47:53:46:47:48:53 chr14 104465037 . T C 1667.12 PASS AO=174;DP=185;FAO=182;FDP=186;FR=.;FRO=4;FSAF=85;FSAR=97;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0555077;FXX=0.00534731;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.277;QD=35.8519;RBI=0.143115;REFB=-0.0133523;REVB=0.131912;RO=11;SAF=79;SAR=95;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0413049;STB=0.500712;TYPE=snp;VARB=0.00216966;OID=.;OPOS=104465037;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:185:186:11:4:174:182:95:79:9:2:97:85:2:2 chr14 104480201 . C A 1219.37 PASS AO=125;DP=127;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0550087;FXX=0.00781189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.673;QD=38.4055;RBI=0.0551989;REFB=0;REVB=0.00457845;RO=0;SAF=50;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00015853;OID=.;OPOS=104480201;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:127:127:0:0:125:127:75:50:0:0:76:51:0:0 chr14 104481083 . T C 220.29 PASS AO=52;DP=108;FAO=52;FDP=107;FR=.;FRO=55;FSAF=12;FSAR=40;FSRF=28;FSRR=27;FWDB=0.00116125;FXX=0.0092584;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.713;QD=8.23509;RBI=0.0454613;REFB=-0.0376855;REVB=0.0454464;RO=53;SAF=12;SAR=40;SRF=27;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.292479;STB=0.665488;TYPE=snp;VARB=0.0337893;OID=.;OPOS=104481083;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:107:53:55:52:52:40:12:27:26:40:12:28:27 chr14 104497543 . C T 214.72 PASS AO=68;DP=176;FAO=68;FDP=176;FR=.;FRO=108;FSAF=29;FSAR=39;FSRF=61;FSRR=47;FWDB=0.0531661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.6352;QD=4.87998;RBI=0.0546888;REFB=0.0087367;REVB=-0.0128152;RO=108;SAF=29;SAR=39;SRF=61;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149862;STB=0.584585;TYPE=snp;VARB=-0.012976;OID=.;OPOS=104497543;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:176:108:108:68:68:39:29:61:47:39:29:61:47 chr14 104559623 . T C 930.67 PASS AO=92;DP=93;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208153;FXX=0.019998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.804;QD=37.9866;RBI=0.0537941;REFB=0;REVB=0.0496037;RO=0;SAF=41;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.99529e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0018428;OID=.;OPOS=104559623;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:93:98:0:0:92:98:51:41:0:0:51:47:0:0 chr14 104641792 . C T 76.89 PASS AO=15;DP=28;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=13;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=2;FWDB=0.0268716;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.62;QD=10.9839;RBI=0.0395667;REFB=-0.00707725;REVB=0.0290421;RO=13;SAF=13;SAR=2;SRF=11;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0350725;STB=0.519972;TYPE=snp;VARB=0.0087426;OID=.;OPOS=104641792;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:28:28:13:13:15:15:2:13:11:2:2:13:11:2 chr14 104642341 . A G 121.38 PASS AO=23;DP=42;FAO=24;FDP=43;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=18;FWDB=-0.0576766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.41;QD=11.2915;RBI=0.0576771;REFB=-0.0219271;REVB=-0.000225229;RO=17;SAF=3;SAR=20;SRF=1;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135407;STB=0.58203;TYPE=snp;VARB=0.0148461;OID=.;OPOS=104642341;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:42:43:17:19:23:24:20:3:1:16:21:3:1:18 chr14 104642526 . GC G 175.29 PASS AO=24;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.174453;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=11.4784;QD=19.4762;RBI=0.322618;REFB=0.00141505;REVB=0.271382;RO=9;SAF=20;SAR=4;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0.357513;SSSB=0.133736;STB=0.538438;TYPE=del;VARB=0.0221497;OID=.;OPOS=104642527;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:24:35:35:36:1:29:6:0:1:11:9:20:4:6:3 chr14 104642567 . GC G 163.51 PASS AO=19;DP=21;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.241266;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.6422;QD=23.3582;RBI=0.342963;REFB=0;REVB=0.24375;RO=7;SAF=11;SAR=8;SRF=4;SRR=3;SSEN=0.369369;SSEP=0;SSSB=0.00376217;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0296891;OID=.;OPOS=104642568;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:19:28:28:28:0:16:12:0:0:15:7:11:8:4:3 chr14 104643721 . C A 22.3 PASS AO=4;DP=9;FAO=4;FDP=9;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0126821;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.405;QD=9.91248;RBI=0.023515;REFB=-0.0284785;REVB=-0.019802;RO=5;SAF=2;SAR=2;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0874326;STB=0.555281;TYPE=snp;VARB=0.0620821;OID=.;OPOS=104643721;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:9:9:5:5:4:4:2:2:2:3:2:2:2:3 chr14 104710651 . C T 316.54 PASS AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0064207;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.9094;QD=37.2402;RBI=0.00753015;REFB=0;REVB=-0.00393417;RO=0;SAF=23;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000206961;OID=.;OPOS=104710651;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:34:0:0:34:34:11:23:0:0:11:23:0:0 chr14 105058498 . A G 497.29 PASS AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0722716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.524;QD=37.5315;RBI=0.0723453;REFB=0;REVB=0.00326556;RO=0;SAF=19;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97342e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000294024;OID=.;OPOS=105058498;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:53:53:0:0:53:53:34:19:0:0:34:19:0:0 chr14 105059827 . C T 100.98 PASS AO=27;DP=69;FAO=28;FDP=69;FR=.;FRO=41;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=31;FSRR=10;FWDB=0.036921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.959;QD=5.85391;RBI=0.0369686;REFB=-0.0115182;REVB=-0.00187443;RO=41;SAF=9;SAR=18;SRF=31;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.425325;STB=0.744207;TYPE=snp;VARB=0.0120805;OID=.;OPOS=105059827;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:41:41:27:28:18:9:31:10:19:9:31:10 chr14 105167807 . C T 44.46 PASS AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.015709;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=213.546;QD=9.36092;RBI=0.0179055;REFB=-0.0240846;REVB=0.00859274;RO=10;SAF=1;SAR=8;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.534587;STB=0.822687;TYPE=snp;VARB=0.0207374;OID=.;OPOS=105167807;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:19:19:10:10:9:9:8:1:6:4:8:1:6:4 chr14 105177351 . CA C 77.78 PASS AO=20;DP=56;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.0122202;FXX=0.0370302;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.183;QD=5.98284;RBI=0.0710482;REFB=-0.00272845;REVB=-0.0699893;RO=31;SAF=17;SAR=3;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.485488;STB=0.741952;TYPE=del;VARB=0.0198917;OID=.;OPOS=105177352;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:20:55:21:52:31:17:4:14:17:77:31:17:3:14:17 chr14 105179194 . T C 115.33 PASS AO=20;DP=31;FAO=20;FDP=32;FR=.;FRO=12;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0400542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.468;QD=14.4158;RBI=0.0422414;REFB=-0.0363722;REVB=-0.0134163;RO=11;SAF=9;SAR=11;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00293581;STB=0.518849;TYPE=snp;VARB=0.0235391;OID=.;OPOS=105179194;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:31:32:11:12:20:20:11:9:5:6:11:9:6:6 chr14 105180565 . T C 50.32 PASS AO=11;DP=33;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0099652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.4589;QD=5.59165;RBI=0.01791;REFB=-0.0568161;REVB=-0.0148816;RO=21;SAF=5;SAR=6;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0237364;STB=0.516106;TYPE=snp;VARB=0.0809623;OID=.;OPOS=105180565;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:33:36:21:22:11:14:6:5:10:11:8:6:10:12 chr14 105180706 . A C 29.21 PASS AO=11;DP=49;FAO=13;FDP=50;FR=.;FRO=37;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=-0.00102236;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.39;QD=2.33655;RBI=0.0247102;REFB=0.000952285;REVB=0.0246891;RO=37;SAF=3;SAR=8;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.357701;STB=0.754317;TYPE=snp;VARB=-0.00412218;OID=.;OPOS=105180706;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:49:50:37:37:11:13:8:3:21:16:10:3:21:16 chr14 105268228 . G A 195.1 PASS AO=20;DP=20;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.007;QD=37.161;RBI=0.0142992;REFB=0;REVB=0.00314596;RO=0;SAF=15;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000191517;OID=.;OPOS=105268228;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:20:21:0:0:20:21:5:15:0:0:6:15:0:0 chr14 105269779 . T C 257.8 PASS AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00412674;FXX=0.0357015;HRUN=3;LEN=1;MLLD=252.673;QD=38.1931;RBI=0.0138173;REFB=0;REVB=0.0131866;RO=0;SAF=11;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5146e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.4682e-06;OID=.;OPOS=105269779;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:28:27:0:0:27:27:16:11:0:0:16:11:0:0 chr14 105270483 . G T 73.79 PASS AO=11;DP=15;FAO=11;FDP=15;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0244378;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=88.1466;QD=19.6766;RBI=0.033879;REFB=-0.00819103;REVB=0.0234644;RO=4;SAF=1;SAR=10;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150097;STB=0.583201;TYPE=snp;VARB=0.00465941;OID=.;OPOS=105270483;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:15:15:4:4:11:11:10:1:0:4:10:1:0:4 chr14 105270485 . G T 136.31 PASS AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0262065;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=115.485;QD=36.3482;RBI=0.0316015;REFB=0;REVB=0.01766;RO=0;SAF=1;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000437789;OID=.;OPOS=105270485;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:15:0:0:15:15:14:1:0:0:14:1:0:0 chr14 105309608 . C T 48.88 PASS AO=5;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.110222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.36;QD=32.5834;RBI=0.112713;REFB=0;REVB=0.0235669;RO=0;SAF=3;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00688133;OID=.;OPOS=105309608;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:5:6:2:3:0:0:3:3:0:0 chr14 105309966 . G A 87.06 PASS AO=8;DP=8;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0164893;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.03;QD=38.6919;RBI=0.0272514;REFB=0;REVB=0.0216966;RO=0;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.58669e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00010905;OID=.;OPOS=105309966;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:9:0:0:8:9:6:2:0:0:7:2:0:0 chr14 105310163 . G A 117.09 PASS AO=14;DP=15;FAO=14;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0941741;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.9973;QD=31.2232;RBI=0.120809;REFB=-0.143351;REVB=0.075671;RO=1;SAF=1;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0337274;STB=0.518492;TYPE=snp;VARB=0.0215569;OID=.;OPOS=105310163;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:15:15:1:1:14:14:13:1:0:1:13:1:0:1 chr14 105310498 . T C 951.6 PASS AO=68;DP=103;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0346994;FXX=0.0188661;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.2856;QD=36.5999;RBI=0.0363454;REFB=0.0854921;REVB=-0.0108139;RO=0;SAF=38;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0016664;OID=.;OPOS=105310498;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:70:104:0:0:68:104:30:38:0:0:59:45:0:0 chr14 105310677 . T G 340.47 PASS AO=33;DP=33;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0808475;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.674;QD=35.8387;RBI=0.0808568;REFB=0.00227191;REVB=0.00122523;RO=0;SAF=8;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.521727;TYPE=snp;VARB=0.000143988;OID=.;OPOS=105310677;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:33:38:0:1:33:37:25:8:0:0:26:11:1:0 chr14 105312054 . A G 978.71 PASS AO=98;DP=98;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.02411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.403;QD=38.0083;RBI=0.028787;REFB=0;REVB=0.015729;RO=0;SAF=26;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.9035e-06;OID=.;OPOS=105312054;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:98:103:0:0:98:103:72:26:0:0:77:26:0:0 chr14 105312067 . T C 989.28 PASS AO=104;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0283536;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.746;QD=38.0493;RBI=0.0298955;REFB=0;REVB=0.00947709;RO=0;SAF=28;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000102169;OID=.;OPOS=105312067;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:104:104:0:0:104:104:76:28:0:0:76:28:0:0 chr14 105344293 . C T 656.11 PASS AO=68;DP=70;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0610863;FXX=0.028165;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.545;QD=38.0354;RBI=0.063695;REFB=0;REVB=0.0180421;RO=0;SAF=40;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000179236;OID=.;OPOS=105344293;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:70:69:0:0:68:69:28:40:0:0:28:41:0:0 chr14 105344761 . C T 380.58 PASS AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0642706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.678;QD=37.1294;RBI=0.0721074;REFB=0;REVB=0.032692;RO=0;SAF=23;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.4817e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000618737;OID=.;OPOS=105344761;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:40:41:0:0:40:41:17:23:0:0:17:24:0:0 chr14 105349388 . A C 116.58 PASS AO=8;DP=14;FAO=13;FDP=13;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.116335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.546;QD=35.87;RBI=0.118518;REFB=0;REVB=-0.0226432;RO=0;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46938e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000842119;OID=.;OPOS=105349388;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:13:0:0:8:13:3:5:0:0:3:10:0:0 chr14 105350355 . A G 221.35 PASS AO=12;DP=26;FAO=24;FDP=25;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0304937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.1826;QD=35.4164;RBI=0.0306068;REFB=0;REVB=-0.00262804;RO=1;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0818676;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000546094;OID=.;OPOS=105350355;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:24:25:1:0:12:24:5:7:0:1:15:9:0:0 chr14 105350868 . C T 86.76 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=231.622;QD=38.5593;RBI=0.038325;REFB=0;REVB=0.038325;RO=0;SAF=0;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000490295;OID=.;OPOS=105350868;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:9:0:0:0:9:0:0:0 chr14 105353222 . GC G 32.36 PASS AO=8;DP=16;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.282529;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=8.4529;QD=8.62868;RBI=0.351603;REFB=0.0602204;REVB=0.209288;RO=5;SAF=4;SAR=4;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0661115;STB=0.588041;TYPE=del;VARB=0.0750633;OID=.;OPOS=105353223;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:8:15:9:15:6:5:4:2:4:9:5:4:4:2:3 chr14 105353767 . A C 29.46 PASS AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=-0.0660432;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.4387;QD=8.41755;RBI=0.0710837;REFB=-0.0283588;REVB=0.0262906;RO=8;SAF=1;SAR=5;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.074933;STB=0.545312;TYPE=snp;VARB=0.0620209;OID=.;OPOS=105353767;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:14:14:8:8:6:6:5:1:1:7:5:1:1:7 chr14 105354293 . A G 195.71 PASS AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0102595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.605;QD=39.1415;RBI=0.0264808;REFB=0;REVB=-0.0244126;RO=0;SAF=6;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5931e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000296356;OID=.;OPOS=105354293;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:20:20:0:0:20:20:14:6:0:0:14:6:0:0 chr14 105361934 . T C 116.33 PASS AO=11;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00386171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.517;QD=35.793;RBI=0.051673;REFB=0;REVB=0.0515285;RO=0;SAF=3;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00459686;OID=.;OPOS=105361934;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:13:0:0:11:13:8:3:0:0:9:4:0:0 chr14 105393508 . GC G 34.47 PASS AO=17;DP=51;FAO=18;FDP=44;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=0.00979982;FXX=0.0222173;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.111;QD=3.13338;RBI=0.0340979;REFB=-0.039912;REVB=-0.0326593;RO=23;SAF=6;SAR=11;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.294677;STB=0.705662;TYPE=del;VARB=0.0660745;OID=.;OPOS=105393509;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:17:43:18:44:26:6:12:18:8:34:23:6:11:15:8 chr14 105393556 . G C 102.2 PASS AO=17;DP=26;FAO=17;FDP=26;FR=.;FRO=9;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.0336129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5822;QD=15.7228;RBI=0.0435005;REFB=-0.0223251;REVB=0.0276127;RO=9;SAF=11;SAR=6;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133928;STB=0.507454;TYPE=snp;VARB=0.00952209;OID=.;OPOS=105393556;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:26:26:9:9:17:17:6:11:6:3:6:11:6:3 chr14 105405599 . G C 418.63 PASS AO=81;DP=141;FAO=82;FDP=141;FR=.;FRO=59;FSAF=41;FSAR=41;FSRF=31;FSRR=28;FWDB=-0.00582561;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=255.025;QD=11.8761;RBI=0.00588778;REFB=0.00609019;REVB=0.000853331;RO=59;SAF=41;SAR=40;SRF=31;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149105;STB=0.510636;TYPE=snp;VARB=-0.00391427;OID=.;OPOS=105405599;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:59:59:81:82:40:41:31:28:41:41:31:28 chr14 105405942 . G A 350.6 PASS AO=75;DP=142;FAO=76;FDP=143;FR=.;FRO=67;FSAF=33;FSAR=43;FSRF=26;FSRR=41;FWDB=0.0507329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.248;QD=9.80693;RBI=0.0517683;REFB=-0.0305167;REVB=-0.0103017;RO=67;SAF=32;SAR=43;SRF=26;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0341495;STB=0.522126;TYPE=snp;VARB=0.029098;OID=.;OPOS=105405942;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:143:67:67:75:76:43:32:26:41:43:33:26:41 chr14 105406238 . A C 54.43 PASS AO=16;DP=44;FAO=16;FDP=44;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=0.00409009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.618;QD=4.94835;RBI=0.0369245;REFB=-0.0100215;REVB=-0.0366972;RO=28;SAF=7;SAR=9;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00984449;STB=0.505773;TYPE=snp;VARB=0.0162439;OID=.;OPOS=105406238;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:44:44:28:28:16:16:9:7:12:16:9:7:12:16 chr14 105406372 . C T 162.95 PASS AO=26;DP=38;FAO=26;FDP=38;FR=.;FRO=12;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.0196386;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=221.253;QD=17.1527;RBI=0.022492;REFB=-0.0152921;REVB=-0.0109643;RO=11;SAF=14;SAR=12;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143562;STB=0.590293;TYPE=snp;VARB=0.00569175;OID=.;OPOS=105406372;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:38:38:11:12:26:26:12:14:3:8:12:14:3:9 chr14 105406797 . C A 200.52 PASS AO=46;DP=94;FAO=45;FDP=89;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=31;FSRF=12;FSRR=32;FWDB=-0.011473;FXX=0.0631512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.487;QD=9.01221;RBI=0.0181227;REFB=-0.00566086;REVB=-0.0140286;RO=37;SAF=15;SAR=31;SRF=11;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0268551;STB=0.522502;TYPE=snp;VARB=0.00608342;OID=.;OPOS=105406797;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:89:37:44:46:45:31:15:11:26:31:14:12:32 chr14 105407031 . A G 194.82 PASS AO=27;DP=38;FAO=29;FDP=40;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=22;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=-0.00689788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.912;QD=19.4817;RBI=0.0239556;REFB=-0.018321;REVB=0.022941;RO=11;SAF=6;SAR=21;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0377299;STB=0.51162;TYPE=snp;VARB=0.00651175;OID=.;OPOS=105407031;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:38:40:11:11:27:29:21:6:3:8:22:7:3:8 chr14 105407208 . T C 133.66 PASS AO=30;DP=62;FAO=30;FDP=61;FR=.;FRO=31;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.003191;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.5219;QD=8.76459;RBI=0.0284037;REFB=0.00121755;REVB=0.0282239;RO=29;SAF=19;SAR=11;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16649;STB=0.59435;TYPE=snp;VARB=-0.00151598;OID=.;OPOS=105407208;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:61:29:31:30:30:11:19:13:16:11:19:14:17 chr14 105407798 . T C 188.51 PASS AO=43;DP=88;FAO=43;FDP=87;FR=.;FRO=44;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=0.00360299;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.888;QD=8.66725;RBI=0.0167732;REFB=0.0139332;REVB=-0.0163817;RO=43;SAF=24;SAR=19;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0631903;STB=0.529588;TYPE=snp;VARB=-0.0144855;OID=.;OPOS=105407798;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:87:43:44:43:43:19:24:21:22:19:24:22:22 chr14 105408030 . A G 108.01 PASS AO=21;DP=39;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=-0.00200462;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.359;QD=11.0778;RBI=0.00278847;REFB=-0.00128482;REVB=-0.00193831;RO=17;SAF=6;SAR=15;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.342722;STB=0.703508;TYPE=snp;VARB=0.00212631;OID=.;OPOS=105408030;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:39:39:17:18:21:21:15:6:12:5:15:6:13:5 chr14 105408182 . T G 47.31 PASS AO=18;DP=60;FAO=18;FDP=60;FR=.;FRO=42;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=31;FWDB=-0.00595798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.516;QD=3.15399;RBI=0.0164657;REFB=0.00331225;REVB=0.0153499;RO=42;SAF=12;SAR=6;SRF=11;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.448602;STB=0.76263;TYPE=snp;VARB=-0.00474734;OID=.;OPOS=105408182;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:60:60:42:42:18:18:6:12:11:31:6:12:11:31 chr14 105408315 . T C 268.94 PASS AO=67;DP=143;FAO=67;FDP=143;FR=.;FRO=76;FSAF=39;FSAR=28;FSRF=36;FSRR=40;FWDB=-0.0785746;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=74.3264;QD=7.52275;RBI=0.0803357;REFB=-0.0139672;REVB=0.016729;RO=73;SAF=39;SAR=28;SRF=36;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0847128;STB=0.558063;TYPE=snp;VARB=0.0301939;OID=.;OPOS=105408315;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:73:76:67:67:28:39:36:37:28:39:36:40 chr14 105408811 . A G 103.98 PASS AO=26;DP=58;FAO=26;FDP=59;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=-0.004329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.8535;QD=7.04915;RBI=0.0716256;REFB=-0.0321171;REVB=-0.0714947;RO=31;SAF=17;SAR=9;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.286346;STB=0.661355;TYPE=snp;VARB=0.0349623;OID=.;OPOS=105408811;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:59:31:33:26:26:9:17:11:20:9:17:12:21 chr14 105408827 . A C 49.17 PASS AO=18;DP=58;FAO=18;FDP=58;FR=.;FRO=40;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=25;FWDB=0.0174116;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5602;QD=3.39086;RBI=0.0192462;REFB=-0.00879916;REVB=0.00820079;RO=38;SAF=12;SAR=6;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.308168;STB=0.696417;TYPE=snp;VARB=0.0298179;OID=.;OPOS=105408827;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:58:58:38:40:18:18:6:12:15:23:6:12:15:25 chr14 105409907 . T C 173.56 PASS AO=47;DP=110;FAO=47;FDP=110;FR=.;FRO=63;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=32;FSRR=31;FWDB=0.006598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.743;QD=6.31126;RBI=0.0389793;REFB=-0.0109618;REVB=0.0384168;RO=63;SAF=28;SAR=19;SRF=32;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0910022;STB=0.551159;TYPE=snp;VARB=0.0211651;OID=.;OPOS=105409907;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:63:63:47:47:19:28:32:31:19:28:32:31 chr14 105409959 . G T 234.44 PASS AO=54;DP=118;FAO=58;FDP=122;FR=.;FRO=64;FSAF=45;FSAR=13;FSRF=36;FSRR=28;FWDB=0.0402513;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.3535;QD=7.68654;RBI=0.0830251;REFB=-0.0255;REVB=0.0726154;RO=64;SAF=41;SAR=13;SRF=36;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225722;STB=0.636595;TYPE=snp;VARB=0.0360784;OID=.;OPOS=105409959;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:122:64:64:54:58:13:41:36:28:13:45:36:28 chr14 105410183 . T C 201.1 PASS AO=50;DP=108;FAO=50;FDP=108;FR=.;FRO=58;FSAF=19;FSAR=31;FSRF=32;FSRR=26;FWDB=-0.0241612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.058;QD=7.44811;RBI=0.0246912;REFB=-0.0129635;REVB=0.00508825;RO=58;SAF=19;SAR=31;SRF=32;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167562;STB=0.593431;TYPE=snp;VARB=0.0134097;OID=.;OPOS=105410183;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:58:58:50:50:31:19:32:26:31:19:32:26 chr14 105410411 . C T 222.63 PASS AO=50;DP=101;FAO=51;FDP=102;FR=.;FRO=51;FSAF=38;FSAR=13;FSRF=38;FSRR=13;FWDB=0.00818862;FXX=0.0192289;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.127;QD=8.73054;RBI=0.00819186;REFB=-0.000532276;REVB=-0.000230057;RO=50;SAF=37;SAR=13;SRF=37;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000499005;OID=.;OPOS=105410411;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:102:50:51:50:51:13:37:37:13:13:38:38:13 chr14 105410775 . A G 67.27 PASS AO=22;DP=62;FAO=22;FDP=63;FR=.;FRO=41;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=-0.0172246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.199;QD=4.27096;RBI=0.0434306;REFB=-0.00978447;REVB=-0.0398689;RO=39;SAF=8;SAR=14;SRF=24;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.27384;STB=0.657978;TYPE=snp;VARB=0.0290528;OID=.;OPOS=105410775;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:62:63:39:41:22:22:14:8:24:15:14:8:25:16 chr14 105410827 . C T 142.24 PASS AO=35;DP=76;FAO=35;FDP=76;FR=.;FRO=41;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=-0.000633099;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=247.742;QD=7.48642;RBI=0.00977535;REFB=-0.00541932;REVB=-0.00975483;RO=41;SAF=12;SAR=23;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.258638;STB=0.645102;TYPE=snp;VARB=0.00653136;OID=.;OPOS=105410827;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:41:41:35:35:23:12:25:16:23:12:25:16 chr14 105411153 . G A 128.54 PASS AO=26;DP=50;FAO=28;FDP=52;FR=.;FRO=24;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=18;FWDB=0.00990984;FXX=0.0188644;HRUN=4;LEN=1;MLLD=69.7567;QD=9.88772;RBI=0.0476079;REFB=0.00275236;REVB=0.0465651;RO=24;SAF=17;SAR=9;SRF=6;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.339502;STB=0.660747;TYPE=snp;VARB=-0.00518107;OID=.;OPOS=105411153;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:52:24:24:26:28:9:17:6:18:11:17:6:18 chr14 105411700 . A G 218.6 PASS AO=43;DP=75;FAO=43;FDP=75;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=30;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.0252364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.745;QD=11.6584;RBI=0.0260634;REFB=-0.0255423;REVB=0.00651321;RO=32;SAF=13;SAR=30;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168111;STB=0.592598;TYPE=snp;VARB=0.0178836;OID=.;OPOS=105411700;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:32:32:43:43:30:13:16:16:30:13:16:16 chr14 105411781 . G A 157.76 PASS AO=36;DP=73;FAO=36;FDP=73;FR=.;FRO=37;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=11;FWDB=-0.00106025;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.033;QD=8.64434;RBI=0.0455327;REFB=-0.00727507;REVB=0.0455204;RO=37;SAF=21;SAR=15;SRF=26;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114464;STB=0.563515;TYPE=snp;VARB=0.0121866;OID=.;OPOS=105411781;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:37:37:36:36:15:21:26:11:15:21:26:11 chr14 105411957 . G A 28.42 PASS AO=10;DP=35;FAO=10;FDP=35;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=19;FSRR=6;FWDB=-0.00063642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.277;QD=3.24829;RBI=0.0257467;REFB=0.0150814;REVB=0.0257389;RO=24;SAF=4;SAR=6;SRF=18;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.388559;STB=0.741525;TYPE=snp;VARB=-0.0179104;OID=.;OPOS=105411957;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:35:35:24:25:10:10:6:4:18:6:6:4:19:6 chr14 105411971 . T C 19.18 PASS AO=8;DP=34;FAO=8;FDP=34;FR=.;FRO=26;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=7;FWDB=-0.00407889;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.804;QD=2.25636;RBI=0.0211398;REFB=-0.00498399;REVB=-0.0207426;RO=24;SAF=3;SAR=5;SRF=19;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.468511;STB=0.752886;TYPE=snp;VARB=0.0181432;OID=.;OPOS=105411971;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:34:34:24:26:8:8:5:3:19:5:5:3:19:7 chr14 105412066 . C T 14.28 PASS AO=4;DP=16;FAO=4;FDP=16;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=-0.0312374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.9165;QD=3.5695;RBI=0.0314644;REFB=-0.0147824;REVB=-0.00377285;RO=12;SAF=3;SAR=1;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.582086;STB=0.867086;TYPE=snp;VARB=0.0556978;OID=.;OPOS=105412066;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:16:16:12:12:4:4:1:3:2:10:1:3:2:10 chr14 105412778 . A T 110.33 PASS AO=33;DP=84;FAO=33;FDP=85;FR=.;FRO=52;FSAF=24;FSAR=9;FSRF=26;FSRR=26;FWDB=-0.0282695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.8669;QD=5.19192;RBI=0.0581101;REFB=-0.0158796;REVB=-0.0507702;RO=51;SAF=24;SAR=9;SRF=26;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.251843;STB=0.651066;TYPE=snp;VARB=0.0273756;OID=.;OPOS=105412778;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:85:51:52:33:33:9:24:26:25:9:24:26:26 chr14 105413204 . G T 146.8 PASS AO=45;DP=117;FAO=45;FDP=116;FR=.;FRO=71;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=51;FWDB=0.00630207;FXX=0.00854628;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.77;QD=5.06192;RBI=0.0261891;REFB=-0.00727923;REVB=0.0254195;RO=71;SAF=26;SAR=19;SRF=20;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.312015;STB=0.675503;TYPE=snp;VARB=0.0127514;OID=.;OPOS=105413204;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:116:71:71:45:45:19:26:20:51:19:26:20:51 chr14 105413223 . A G 153.87 PASS AO=46;DP=119;FAO=47;FDP=120;FR=.;FRO=73;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=24;FSRR=49;FWDB=-0.0173145;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.381;QD=5.12895;RBI=0.0232121;REFB=0.00107413;REVB=-0.0154598;RO=72;SAF=24;SAR=22;SRF=24;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202085;STB=0.610125;TYPE=snp;VARB=-0.00200539;OID=.;OPOS=105413223;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:120:72:73:46:47:22:24:24:48:23:24:24:49 chr14 105413790 . G A 252.62 PASS AO=60;DP=126;FAO=61;FDP=128;FR=.;FRO=67;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=30;FSRR=37;FWDB=-0.0231138;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.519;QD=7.89441;RBI=0.0313322;REFB=-0.0163986;REVB=0.0211532;RO=64;SAF=27;SAR=33;SRF=28;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0117853;STB=0.502723;TYPE=snp;VARB=0.0170662;OID=.;OPOS=105413790;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:128:64:67:60:61:33:27:28:36:34:27:30:37 chr14 105414238 . C A 76.88 PASS AO=20;DP=48;FAO=20;FDP=48;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=0.0116937;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=230.657;QD=6.40626;RBI=0.0121664;REFB=-0.00585668;REVB=0.0033584;RO=28;SAF=8;SAR=12;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0299912;STB=0.517224;TYPE=snp;VARB=0.00991923;OID=.;OPOS=105414238;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:48:48:28:28:20:20:12:8:12:16:12:8:12:16 chr14 105414252 . C T 71.4 PASS AO=20;DP=52;FAO=20;FDP=52;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=0.0250698;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.8501;QD=5.49264;RBI=0.0337446;REFB=-0.0175414;REVB=-0.0225878;RO=32;SAF=7;SAR=13;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0640753;STB=0.537152;TYPE=snp;VARB=0.0442099;OID=.;OPOS=105414252;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:52:52:32:32:20:20:13:7:13:19:13:7:13:19 chr14 105414280 . T G 392.92 PASS AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0417296;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.454;QD=37.4207;RBI=0.0539043;REFB=0;REVB=0.034122;RO=0;SAF=18;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000763186;OID=.;OPOS=105414280;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:43:42:0:0:42:42:24:18:0:0:24:18:0:0 chr14 105414629 . G A 105.49 PASS AO=26;DP=58;FAO=26;FDP=58;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=0.00542275;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=266.182;QD=7.27513;RBI=0.0104676;REFB=-0.0080219;REVB=0.00895344;RO=32;SAF=7;SAR=19;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154872;STB=0.588164;TYPE=snp;VARB=0.0104585;OID=.;OPOS=105414629;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:32:32:26:26:19:7:13:19:19:7:13:19 chr14 105414790 . A G 144.08 PASS AO=37;DP=81;FAO=36;FDP=80;FR=.;FRO=44;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=0.0148651;FXX=0.0123442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9374;QD=7.20403;RBI=0.0885936;REFB=-0.00679119;REVB=-0.0873376;RO=40;SAF=13;SAR=24;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0487892;STB=0.541153;TYPE=snp;VARB=0.00557446;OID=.;OPOS=105414790;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:80:40:44:37:36:24:13:16:24:23:13:19:25 chr14 105414810 . C G 183.73 PASS AO=43;DP=89;FAO=43;FDP=89;FR=.;FRO=46;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=0.0267011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.338;QD=8.25747;RBI=0.0271925;REFB=-0.0137914;REVB=-0.00514635;RO=46;SAF=16;SAR=27;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122473;STB=0.568235;TYPE=snp;VARB=0.0123252;OID=.;OPOS=105414810;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:46:46:43:43:27:16:23:23:27:16:23:23 chr14 105415200 . G C 57.05 PASS AO=18;DP=51;FAO=18;FDP=52;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=24;FWDB=-0.0289356;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.37;QD=4.38872;RBI=0.0289373;REFB=-0.00517775;REVB=0.000317976;RO=32;SAF=9;SAR=9;SRF=10;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206764;STB=0.634477;TYPE=snp;VARB=0.0193371;OID=.;OPOS=105415200;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:51:52:32:34:18:18:9:9:10:22:9:9:10:24 chr14 105415229 . T C 55.88 PASS AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0225028;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.857;QD=6.57365;RBI=0.0343721;REFB=-0.0043554;REVB=-0.025982;RO=19;SAF=8;SAR=6;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00761006;STB=0.512802;TYPE=snp;VARB=0.00529513;OID=.;OPOS=105415229;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:34:34:19:20:14:14:6:8:11:8:6:8:11:9 chr14 105415293 . C T 10.48 PASS AO=4;DP=21;FAO=4;FDP=21;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.0146128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.8155;QD=1.99593;RBI=0.0274646;REFB=-0.00153669;REVB=0.0232544;RO=17;SAF=2;SAR=2;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1006;STB=0.571079;TYPE=snp;VARB=0.0058042;OID=.;OPOS=105415293;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:21:21:17:17:4:4:2:2:10:7:2:2:10:7 chr14 105415346 . T C 86.76 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0353233;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.885;QD=38.5593;RBI=0.0578401;REFB=0;REVB=-0.0458011;RO=0;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000218374;OID=.;OPOS=105415346;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:4:5:0:0:4:5:0:0 chr14 105415352 . G C 73.84 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0684668;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.332;QD=36.9198;RBI=0.068524;REFB=0;REVB=-0.00279961;RO=0;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46938e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00133635;OID=.;OPOS=105415352;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:3:5:0:0:3:5:0:0 chr14 105415662 . A G 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0231684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.633;QD=33.022;RBI=0.061659;REFB=0;REVB=-0.0571407;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00029404;OID=.;OPOS=105415662;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:5:0:0:1:5:0:0 chr14 105415666 . G A 49.5 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0658786;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=48.0235;QD=33.0024;RBI=0.0658786;REFB=0;REVB=7.80838e-05;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00597587;OID=.;OPOS=105415666;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:5:0:0:1:5:0:0 chr14 105415745 . C G 147.38 PASS AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0488071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.353;QD=36.8439;RBI=0.0504155;REFB=0;REVB=0.012633;RO=0;SAF=11;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.36667e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000982139;OID=.;OPOS=105415745;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:16:0:0:16:16:5:11:0:0:5:11:0:0 chr14 105415748 . G A 158.92 PASS AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014225;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.808;QD=37.393;RBI=0.017327;REFB=0;REVB=0.00989313;RO=0;SAF=12;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000288068;OID=.;OPOS=105415748;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:17:17:0:0:17:17:5:12:0:0:5:12:0:0 chr14 105416010 . T C 170.86 PASS AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0313063;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=335.25;QD=37.9687;RBI=0.0314409;REFB=0;REVB=-0.00290594;RO=0;SAF=8;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.16815e-05;OID=.;OPOS=105416010;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:18:0:0:18:18:10:8:0:0:10:8:0:0 chr14 105416220 . T A 306.11 PASS AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000785832;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.049;QD=37.1047;RBI=0.0664965;REFB=0;REVB=0.0664919;RO=0;SAF=23;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000275779;OID=.;OPOS=105416220;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:33:33:0:0:33:33:10:23:0:0:10:23:0:0 chr14 105416649 . G A 268.72 PASS AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00299382;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.647;QD=35.8293;RBI=0.073323;REFB=-0.0177867;REVB=0.0732618;RO=0;SAF=11;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.521724;TYPE=snp;VARB=0.000587391;OID=.;OPOS=105416649;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:30:30:0:1:29:29:18:11:0:0:18:11:1:0 chr14 105416685 . C G 243.12 PASS AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00372457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2719;QD=37.4031;RBI=0.0650332;REFB=0;REVB=-0.0649265;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00139219;OID=.;OPOS=105416685;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:26:26:0:0:26:26:15:11:0:0:15:11:0:0 chr14 105416959 . A G 250.32 PASS AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0461811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.3815;QD=37.0851;RBI=0.0512351;REFB=0;REVB=-0.0221889;RO=0;SAF=15;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00216621;OID=.;OPOS=105416959;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:26:27:0:0:26:27:11:15:0:0:12:15:0:0 chr14 105417102 . T C 279.43 PASS AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.842;QD=38.5422;RBI=0.0225855;REFB=0;REVB=-0.00896208;RO=0;SAF=7;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.85325e-05;OID=.;OPOS=105417102;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:29:29:0:0:29:29:22:7:0:0:22:7:0:0 chr14 105417103 . G A 279.43 PASS AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226056;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=310.447;QD=38.5423;RBI=0.0258938;REFB=0;REVB=0.0126283;RO=0;SAF=7;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.63658e-05;OID=.;OPOS=105417103;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:29:29:0:0:29:29:22:7:0:0:22:7:0:0 chr14 105417147 . A G 195.16 PASS AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00131023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.755;QD=37.1733;RBI=0.00856079;REFB=0;REVB=-0.00845993;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.52307e-05;OID=.;OPOS=105417147;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:21:21:0:0:21:21:12:9:0:0:12:9:0:0 chr14 105417222 . C T 91.4 PASS AO=12;DP=13;FAO=11;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.100795;FXX=0.076864;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.8538;QD=30.4652;RBI=0.112979;REFB=0.12745;REVB=0.0510353;RO=1;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.069361;STB=0.538392;TYPE=snp;VARB=-0.00147171;OID=.;OPOS=105417222;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:13:12:1:1:12:11:6:6:0:1:6:5:0:1 chr14 105417225 . C G 96.63 PASS AO=10;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0255629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.431;QD=35.1382;RBI=0.026377;REFB=0;REVB=-0.00650269;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00427481;OID=.;OPOS=105417225;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:10:11:4:6:0:0:5:6:0:0 chr14 105417228 . C T 101.96 PASS AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0959191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.948;QD=37.0748;RBI=0.107611;REFB=0;REVB=0.0487826;RO=0;SAF=6;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00235236;OID=.;OPOS=105417228;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:11:11:5:6:0:0:5:6:0:0 chr14 105417243 . T C 73.84 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.049671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.608;QD=36.9199;RBI=0.0599234;REFB=0;REVB=0.0335203;RO=0;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46938e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00183154;OID=.;OPOS=105417243;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:3:5:0:0:3:5:0:0 chr14 105417699 . G A 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00562036;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.844;QD=35.0875;RBI=0.0111831;REFB=0;REVB=-0.00966811;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000273468;OID=.;OPOS=105417699;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:3:4:0:0:3:4:0:0 chr14 105417725 . C G 99.27 PASS AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.103;QD=39.7067;RBI=0.0185573;REFB=0;REVB=0.00201141;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000300465;OID=.;OPOS=105417725;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:4:6:0:0:4:6:0:0 chr14 105417731 . G C 99.27 PASS AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207306;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.7718;QD=39.7067;RBI=0.0369948;REFB=0;REVB=0.0306408;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00377654;OID=.;OPOS=105417731;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:4:6:0:0:4:6:0:0 chr14 105417732 . G A 99.27 PASS AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00398171;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.6582;QD=39.7067;RBI=0.106426;REFB=0;REVB=0.106352;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0057599;OID=.;OPOS=105417732;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:4:6:0:0:4:6:0:0 chr14 105417738 . G C 99.25 PASS AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.113452;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.4657;QD=39.6986;RBI=0.123415;REFB=0;REVB=0.0485782;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0123259;OID=.;OPOS=105417738;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:4:6:0:0:4:6:0:0 chr14 105417747 . A G 107.82 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0394844;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.733;QD=35.9384;RBI=0.0462975;REFB=0;REVB=-0.0241753;RO=0;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000242158;OID=.;OPOS=105417747;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:6:6:0:0:6:6:0:0 chr14 105417774 . G A 193.01 PASS AO=22;DP=23;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0364961;FXX=0.0869187;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.6921;QD=36.7642;RBI=0.0365;REFB=0;REVB=0.000529328;RO=0;SAF=7;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.79751e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000370822;OID=.;OPOS=105417774;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:23:21:0:0:22:21:15:7:0:0:14:7:0:0 chr14 105417894 . C G 290.01 PASS AO=28;DP=28;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0138404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.621;QD=37.4205;RBI=0.0336995;REFB=0;REVB=0.0307262;RO=0;SAF=12;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000144104;OID=.;OPOS=105417894;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:28:31:0:0:28:31:16:12:0:0:19:12:0:0 chr14 105418344 . T G 45.39 PASS AO=11;DP=35;FAO=13;FDP=36;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.0337181;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.8304;QD=5.043;RBI=0.0669602;REFB=0.0161793;REVB=-0.0578511;RO=24;SAF=5;SAR=6;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237362;STB=0.545386;TYPE=snp;VARB=-0.0384413;OID=.;OPOS=105418344;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:35:36:24:23:11:13:6:5:16:8:6:7:14:9 chr14 105418391 . C T 71.01 PASS AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=5;FWDB=0.000659902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.045;QD=7.28307;RBI=0.0126463;REFB=-0.0215325;REVB=0.0126291;RO=18;SAF=9;SAR=8;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230665;STB=0.63985;TYPE=snp;VARB=0.0322459;OID=.;OPOS=105418391;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:38:39:18:22:17:17:8:9:14:4:8:9:17:5 chr14 105420927 . A G 239.56 PASS AO=44;DP=95;FAO=54;FDP=103;FR=.;FRO=49;FSAF=31;FSAR=23;FSRF=31;FSRR=18;FWDB=0.00134141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.6505;QD=9.30331;RBI=0.0177423;REFB=-0.0303303;REVB=0.0176915;RO=48;SAF=29;SAR=15;SRF=30;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0350655;STB=0.528725;TYPE=snp;VARB=0.039917;OID=.;OPOS=105420927;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:103:48:49:44:54:15:29:30:18:23:31:31:18 chr14 105421050 . T G 54.9 PASS AO=19;DP=53;FAO=19;FDP=55;FR=.;FRO=36;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=-0.00226941;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.2415;QD=3.99253;RBI=0.0350137;REFB=-0.0335048;REVB=0.0349401;RO=34;SAF=5;SAR=14;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153;STB=0.596305;TYPE=snp;VARB=0.0975587;OID=.;OPOS=105421050;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:53:55:34:36:19:19:14:5:13:21:14:5:14:22 chr14 105460995 . AC A 22.1 PASS AO=18;DP=61;FAO=19;FDP=66;FR=.;FRO=47;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=34;FSRR=13;FWDB=0.00643536;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=13.1745;QD=1.33917;RBI=0.0748422;REFB=-0.060948;REVB=-0.074565;RO=37;SAF=6;SAR=12;SRF=29;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.480769;STB=0.73741;TYPE=del;VARB=0.11325;OID=.;OPOS=105460996;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:18:65:19:66:47:7:12:34:13:22:37:6:12:29:8 chr14 105461067 . C T 927.41 PASS AO=97;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0273926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.68;QD=38.2436;RBI=0.0353928;REFB=0;REVB=0.022412;RO=0;SAF=56;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.55487e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000174371;OID=.;OPOS=105461067;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:97:97:0:0:97:97:41:56:0:0:41:56:0:0 chr14 105478102 . G A 451.04 PASS AO=51;DP=53;FAO=51;FDP=53;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0290489;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.372;QD=34.0409;RBI=0.0311158;REFB=-0.0821772;REVB=0.0111515;RO=2;SAF=29;SAR=22;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00496269;STB=0.502637;TYPE=snp;VARB=0.00114808;OID=.;OPOS=105478102;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:53:53:2:2:51:51:22:29:1:1:22:29:1:1 chr14 105608921 . G GT 29.96 PASS AO=23;DP=63;FAO=32;FDP=58;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.188118;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=5.26065;QD=2.0659;RBI=0.219332;REFB=-0.044736;REVB=0.112775;RO=27;SAF=12;SAR=11;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0323443;STB=0.51091;TYPE=ins;VARB=0.0590172;OID=.;OPOS=105608922;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:23:63:32:58:26:14:18:12:14:26:27:12:11:15:12 chr14 105609335 . A G 49.9 PASS AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.00941909;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.593;QD=12.4738;RBI=0.0699778;REFB=-0.0399868;REVB=-0.069341;RO=7;SAF=7;SAR=2;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0657708;STB=0.538372;TYPE=snp;VARB=0.0291234;OID=.;OPOS=105609335;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:16:16:7:7:9:9:2:7:5:2:2:7:5:2 chr14 105611282 . A G 49.68 PASS AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.00664144;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.291;QD=9.46352;RBI=0.0304676;REFB=-0.00956837;REVB=-0.0297349;RO=11;SAF=7;SAR=3;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151801;STB=0.589287;TYPE=snp;VARB=0.00942377;OID=.;OPOS=105611282;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:21:21:11:11:10:10:3:7:6:5:3:7:6:5 chr14 105615648 . C T 119.43 PASS AO=30;DP=70;FAO=30;FDP=68;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=13;FWDB=0.0228017;FXX=0.0285673;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.405;QD=7.02527;RBI=0.0256835;REFB=-0.00291604;REVB=-0.0118204;RO=38;SAF=11;SAR=19;SRF=25;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.284246;STB=0.660127;TYPE=snp;VARB=0.00205119;OID=.;OPOS=105615648;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:68:38:38:30:30:19:11:25:13:19:11:25:13 chr14 105617404 . A G 12.19 PASS AO=5;DP=25;FAO=5;FDP=25;FR=.;FRO=20;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=20;FWDB=0;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=108.137;QD=1.94966;RBI=0.0169598;REFB=-0.0332793;REVB=-0.0169598;RO=20;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0042901;OID=.;OPOS=105617404;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:25:25:20:20:5:5:5:0:0:20:5:0:0:20 chr14 105643619 . G A 10.38 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.00346348;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.105;QD=5.93125;RBI=0.0238483;REFB=-0.0123384;REVB=-0.0235955;RO=5;SAF=1;SAR=1;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0967026;STB=0.57073;TYPE=snp;VARB=0.0337421;OID=.;OPOS=105643619;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:5:5:2:2:1:1:3:2:1:1:3:2 chr14 105677594 . G T 32.7 PASS AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=0;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=14;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.2908;QD=5.94621;RBI=0.0476772;REFB=-0.117417;REVB=0.0476772;RO=14;SAF=0;SAR=8;SRF=0;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0851075;OID=.;OPOS=105677594;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:22:22:14:14:8:8:8:0:0:14:8:0:0:14 chr14 105683997 . GC G 46.13 PASS AO=14;DP=39;FAO=24;FDP=39;FR=.;FRO=15;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=3;FWDB=-0.147492;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=9.50895;QD=4.73143;RBI=0.152134;REFB=-0.0721285;REVB=0.037296;RO=17;SAF=9;SAR=5;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0667651;STB=0.601671;TYPE=del;VARB=0.0813252;OID=.;OPOS=105683998;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:14:38:24:39:15:13:11:12:3:31:17:9:5:12:5 chr14 105707609 . G A 22.51 PASS AO=5;DP=14;FAO=5;FDP=14;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.029895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.574;QD=6.43188;RBI=0.0322712;REFB=-0.0162377;REVB=0.0121539;RO=6;SAF=4;SAR=1;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.370384;STB=0.614877;TYPE=snp;VARB=0.00360624;OID=.;OPOS=105707609;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:14:14:6:9:5:5:1:4:6:0:1:4:6:3 chr14 105722726 . T C 250.22 PASS AO=28;DP=58;FAO=40;FDP=56;FR=.,HEALED;FRO=16;FSAF=28;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.0604369;FXX=0.0344768;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.0691;QD=17.8728;RBI=0.0626459;REFB=-0.0520541;REVB=0.0164892;RO=13;SAF=27;SAR=1;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.610658;STB=0.58329;TYPE=snp;VARB=0.0632753;OID=.;OPOS=105722726;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:54:56:13:16:28:40:1:27:7:6:12:28:7:9 chr14 105916420 . C T 477.76 PASS AO=55;DP=59;FAO=55;FDP=59;FR=.;FRO=4;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0991494;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.329;QD=32.3902;RBI=0.0993419;REFB=-0.0807007;REVB=0.00618187;RO=4;SAF=30;SAR=25;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0263726;STB=0.514014;TYPE=snp;VARB=0.00560377;OID=.;OPOS=105916420;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:59:59:4:4:55:55:25:30:3:1:25:30:3:1 chr14 105930406 . G A 423.69 PASS AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00906201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.541;QD=37.6611;RBI=0.0187332;REFB=0;REVB=0.0163955;RO=0;SAF=16;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.49331e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.51299e-05;OID=.;OPOS=105930406;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:45:45:0:0:45:45:29:16:0:0:29:16:0:0 chr14 105935824 . G A 315.31 PASS AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0650599;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.777;QD=35.0348;RBI=0.0695507;REFB=0.0145501;REVB=0.0245867;RO=1;SAF=13;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0207916;STB=0.511105;TYPE=snp;VARB=-0.00193664;OID=.;OPOS=105935824;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:36:36:1:1:35:35:22:13:0:1:22:13:0:1 chr14 105939784 . G A 182.61 PASS AO=20;DP=55;FAO=26;FDP=55;FR=.,HEALED;FRO=21;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=4;FWDB=-0.0188942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.411;QD=13.2805;RBI=0.0284753;REFB=-0.0285713;REVB=0.0213039;RO=21;SAF=11;SAR=9;SRF=17;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246527;STB=0.6382;TYPE=snp;VARB=0.037166;OID=.;OPOS=105939784;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:55:55:21:21:20:26:9:11:17:4:13:13:17:4 chr14 105962234 . T C 438.95 PASS AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00695036;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.469;QD=38.1693;RBI=0.0433091;REFB=0;REVB=0.0427477;RO=0;SAF=35;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.31358e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000602552;OID=.;OPOS=105962234;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:46:46:0:0:46:46:11:35:0:0:11:35:0:0 chr14 105962369 . A G 484.59 PASS AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0391735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.42;QD=38.7675;RBI=0.041566;REFB=0;REVB=0.0138984;RO=0;SAF=13;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.32377e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000187942;OID=.;OPOS=105962369;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:50:50:0:0:50:50:37:13:0:0:37:13:0:0 chr14 105964215 . CG C 32.54 PASS AO=14;DP=35;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=0.0430836;FXX=0.0588062;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.9774;QD=4.06764;RBI=0.0457523;REFB=-0.0943973;REVB=-0.0153973;RO=17;SAF=1;SAR=13;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.356599;STB=0.59985;TYPE=del;VARB=0.135289;OID=.;OPOS=105964216;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:14:33:15:32:17:2:13:4:13:32:17:1:13:4:13 chr14 106054428 . C G 187.27 PASS AO=16;DP=21;FAO=20;FDP=20;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0346414;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.8135;QD=37.4549;RBI=0.0475567;REFB=0;REVB=0.0325824;RO=0;SAF=10;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00026195;OID=.;OPOS=106054428;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:21:20:0:0:16:20:6:10:0:0:10:10:0:0 chr14 106054456 . A G 367.01 PASS AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0645899;FXX=0.0243843;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.1992;QD=36.7009;RBI=0.126013;REFB=0;REVB=-0.1082;RO=0;SAF=20;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3303e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00486432;OID=.;OPOS=106054456;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:39:40:0:0:39:40:19:20:0:0:20:20:0:0 chr14 106066454 . T C 664.49 PASS AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0292722;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.286;QD=38.5212;RBI=0.0501272;REFB=0;REVB=0.0406925;RO=0;SAF=29;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.02429e-05;OID=.;OPOS=106066454;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:69:69:0:0:69:69:40:29:0:0:40:29:0:0 chr14 106090846 . T C 231.02 PASS AO=98;DP=307;FAO=98;FDP=307;FR=.;FRO=209;FSAF=45;FSAR=53;FSRF=117;FSRR=92;FWDB=-0.00256019;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.107;QD=3.01005;RBI=0.00726716;REFB=0.00164054;REVB=-0.00680126;RO=208;SAF=45;SAR=53;SRF=117;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12165;STB=0.568182;TYPE=snp;VARB=-0.00332156;OID=.;OPOS=106090846;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:307:307:208:209:98:98:53:45:117:91:53:45:117:92 chr14 106090927 . G T 3833.64 PASS AO=478;DP=478;FAO=399;FDP=399;FR=.;FRO=0;FSAF=211;FSAR=188;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0231392;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.648;QD=38.4325;RBI=0.0247278;REFB=0;REVB=-0.00872011;RO=0;SAF=256;SAR=222;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.05343e-05;OID=.;OPOS=106090927;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:478:399:0:0:478:399:222:256:0:0:188:211:0:0 chr14 106090956 . C T 171.99 PASS AO=116;DP=455;FAO=104;FDP=399;FR=.;FRO=295;FSAF=57;FSAR=47;FSRF=148;FSRR=147;FWDB=-0.0180332;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5944;QD=1.72417;RBI=0.0575471;REFB=0.00909042;REVB=0.0546486;RO=327;SAF=60;SAR=56;SRF=161;SRR=166;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0311156;STB=0.534377;TYPE=snp;VARB=-0.028027;OID=.;OPOS=106090956;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:455:399:327:295:116:104:56:60:161:166:47:57:148:147 chr14 106090968 . C T 124.25 PASS AO=105;DP=448;FAO=92;FDP=392;FR=.;FRO=300;FSAF=41;FSAR=51;FSRF=145;FSRR=155;FWDB=0.0327764;FXX=0.0199995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.231;QD=1.26786;RBI=0.052389;REFB=0.000556776;REVB=-0.0408694;RO=299;SAF=50;SAR=55;SRF=139;SRR=160;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141974;STB=0.528992;TYPE=snp;VARB=-0.00273918;OID=.;OPOS=106090968;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:448:392:299:300:105:92:55:50:139:160:51:41:145:155 chr14 106091329 . G C 324.08 PASS AO=124;DP=359;FAO=124;FDP=361;FR=.;FRO=237;FSAF=61;FSAR=63;FSRF=116;FSRR=121;FWDB=0.0349298;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.6014;QD=3.59093;RBI=0.0487487;REFB=-0.00688988;REVB=-0.034005;RO=234;SAF=61;SAR=63;SRF=115;SRR=119;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00055447;STB=0.501631;TYPE=snp;VARB=0.0128979;OID=.;OPOS=106091329;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:359:361:234:237:124:124:63:61:115:119:63:61:116:121 chr14 106091504 . A G 222.67 PASS AO=66;DP=160;FAO=65;FDP=159;FR=.;FRO=94;FSAF=27;FSAR=38;FSRF=45;FSRR=49;FWDB=-0.0211878;FXX=0.00624961;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.355;QD=5.60169;RBI=0.022906;REFB=-0.00597625;REVB=-0.00870411;RO=92;SAF=28;SAR=38;SRF=45;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0681394;STB=0.538041;TYPE=snp;VARB=0.00846177;OID=.;OPOS=106091504;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:159:92:94:66:65:38:28:45:47:38:27:45:49 chr14 106091555 . C T 228.18 PASS AO=58;DP=127;FAO=58;FDP=127;FR=.;FRO=69;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=31;FSRR=38;FWDB=0.0152007;FXX=0.00781189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.505;QD=7.18674;RBI=0.0229846;REFB=-0.0207471;REVB=0.0172405;RO=69;SAF=26;SAR=32;SRF=31;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000985743;STB=0.500549;TYPE=snp;VARB=0.0166313;OID=.;OPOS=106091555;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:69:69:58:58:32:26:31:38:32:26:31:38 chr14 106091697 . T C 22.83 PASS AO=11;DP=52;FAO=11;FDP=48;FR=.;FRO=37;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=-0.0016416;FXX=0.0943218;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.7796;QD=1.90288;RBI=0.00164594;REFB=-0.00910025;REVB=0.000119398;RO=34;SAF=6;SAR=5;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0193791;STB=0.51721;TYPE=snp;VARB=0.0350865;OID=.;OPOS=106091697;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:52:48:34:37:11:11:5:6:18:16:5:6:21:16 chr14 106091743 . CA C,CAG 29.38 PASS AO=6,5;DP=35;FAO=6,4;FDP=31;FR=.;FRO=21;FSAF=3,4;FSAR=3,0;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.0351091,0.0662356;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=171.128,21.6013;QD=3.791;RBI=0.0516556,0.110699;REFB=-0.00682109,-0.045829;REVB=-0.03789,-0.0886963;RO=19;SAF=3,5;SAR=3,0;SRF=11;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0913776,0.66854;STB=0.592295,0.996613;TYPE=del,ins;VARB=0.0145416,0.114413;OID=.,.;OPOS=106091744,106091745;OREF=A,-;OALT=-,G;OMAPALT=C,CAG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:6,5:33:6,4:31:21:3,4:3,0:13:8:15:19:3,5:3,0:11:8 chr14 106092152 . G A 546.9 PASS AO=108;DP=186;FAO=109;FDP=187;FR=.;FRO=78;FSAF=61;FSAR=48;FSRF=40;FSRR=38;FWDB=0.0088931;FXX=0.00531887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.0084;QD=11.6984;RBI=0.0422641;REFB=0.00603186;REVB=0.0413179;RO=78;SAF=61;SAR=47;SRF=40;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0406007;STB=0.519711;TYPE=snp;VARB=-0.0033078;OID=.;OPOS=106092152;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:187:78:78:108:109:47:61:40:38:48:61:40:38 chr14 106092335 . G C 14.09 PASS AO=5;DP=21;FAO=5;FDP=22;FR=.;FRO=17;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=14;FWDB=-0.156505;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.2012;QD=2.56153;RBI=0.163692;REFB=-0.0190722;REVB=0.0479701;RO=16;SAF=1;SAR=4;SRF=2;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154553;STB=0.529298;TYPE=snp;VARB=0.0140767;OID=.;OPOS=106092335;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:21:22:16:17:5:5:4:1:2:14:4:1:3:14 chr14 106092383 . C G 116.16 PASS AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0646977;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.1748;QD=35.7419;RBI=0.0928763;REFB=0;REVB=0.066635;RO=0;SAF=1;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.00075e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00664649;OID=.;OPOS=106092383;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:13:0:0:13:13:12:1:0:0:12:1:0:0 chr14 106109573 . T C 133.05 PASS AO=40;DP=104;FAO=40;FDP=103;FR=.;FRO=63;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=32;FSRR=31;FWDB=0.00934737;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.15;QD=5.1668;RBI=0.0138699;REFB=-0.0121775;REVB=-0.010247;RO=63;SAF=21;SAR=19;SRF=32;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0183784;STB=0.510447;TYPE=snp;VARB=0.0215702;OID=.;OPOS=106109573;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:103:63:63:40:40:19:21:32:31:19:21:32:31 chr14 106109752 . A C 1036.99 PASS AO=108;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0445724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.589;QD=38.4071;RBI=0.0480116;REFB=0;REVB=0.0178444;RO=0;SAF=47;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.4652e-05;OID=.;OPOS=106109752;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:108:108:0:0:108:108:61:47:0:0:61:47:0:0 chr14 106110057 . G A 518.55 PASS AO=135;DP=299;FAO=137;FDP=301;FR=.;FRO=164;FSAF=44;FSAR=93;FSRF=63;FSRR=101;FWDB=0.04124;FXX=0.00331115;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.5362;QD=6.89097;RBI=0.0555505;REFB=-0.00995952;REVB=0.0372173;RO=161;SAF=45;SAR=90;SRF=62;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.05601;STB=0.538264;TYPE=snp;VARB=0.0145778;OID=.;OPOS=106110057;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:299:301:161:164:135:137:90:45:62:99:93:44:63:101 chr14 106110137 . C T 600.02 PASS AO=131;DP=249;FAO=132;FDP=250;FR=.;FRO=118;FSAF=53;FSAR=79;FSRF=41;FSRR=77;FWDB=0.00212232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.167;QD=9.6003;RBI=0.00461401;REFB=-0.00818403;REVB=-0.00409693;RO=118;SAF=52;SAR=79;SRF=41;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0453373;STB=0.526822;TYPE=snp;VARB=0.00723558;OID=.;OPOS=106110137;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:249:250:118:118:131:132:79:52:41:77:79:53:41:77 chr14 106110914 . G T 254.78 PASS AO=53;DP=123;FAO=59;FDP=122;FR=.,HEALED;FRO=62;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=36;FSRR=26;FWDB=0.0116029;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=128.45;QD=8.35333;RBI=0.0441605;REFB=-0.0333446;REVB=-0.0426089;RO=43;SAF=25;SAR=28;SRF=31;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202172;STB=0.554172;TYPE=snp;VARB=0.0313403;OID=.;OPOS=106110914;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:122:43:62:53:59:28:25:31:12:31:28:36:26 chr14 106110966 . C T 249.17 PASS AO=28;DP=109;FAO=28;FDP=78;FR=.,HEALED;FRO=25;FSAF=26;FSAR=2;FSRF=20;FSRR=5;FWDB=0.0208198;FXX=0.264126;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.4035;QD=12.7781;RBI=0.106853;REFB=0.0109154;REVB=-0.104805;RO=23;SAF=26;SAR=2;SRF=19;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.236563;STB=0.664088;TYPE=snp;VARB=0.0180842;OID=.;OPOS=106110966;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:23:25:28:28:2:26:19:4:2:26:20:5 chr14 106111113 . GC G 262.34 PASS AO=38;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.112909;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=10.8666;QD=21.4157;RBI=0.242711;REFB=-0.0200088;REVB=0.214849;RO=7;SAF=19;SAR=19;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0.538824;SSSB=0.0206777;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0214541;OID=.;OPOS=106111114;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:38:49:49:49:0:24:25:0:0:22:7:19:19:3:4 chr14 106173808 . G A 31.62 PASS AO=7;DP=17;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=10;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.1646;QD=7.44108;RBI=0.0086881;REFB=-0.0472582;REVB=0.0086881;RO=10;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0620438;OID=.;OPOS=106173808;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:17:17:10:10:7:7:7:0:0:10:7:0:0:10 chr14 106174261 . C G 369.21 PASS AO=63;DP=98;FAO=64;FDP=99;FR=.;FRO=35;FSAF=44;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.0237227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.614;QD=14.9177;RBI=0.0306081;REFB=-0.0216792;REVB=-0.0193414;RO=35;SAF=43;SAR=20;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121498;STB=0.567621;TYPE=snp;VARB=0.0147672;OID=.;OPOS=106174261;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:99:35:35:63:64:20:43:18:17:20:44:18:17 chr14 106188230 . C T 69.69 PASS AO=22;DP=62;FAO=22;FDP=62;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=28;FWDB=0.0367709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.35;QD=4.49597;RBI=0.0412171;REFB=0.00525192;REVB=0.0186212;RO=40;SAF=15;SAR=7;SRF=12;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.407576;STB=0.735093;TYPE=snp;VARB=-0.0147621;OID=.;OPOS=106188230;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:62:62:40:40:22:22:7:15:12:28:7:15:12:28 chr14 106207822 . A G 27.76 PASS AO=13;DP=53;FAO=13;FDP=52;FR=.;FRO=39;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=0.00443147;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.461;QD=2.13522;RBI=0.0112018;REFB=-0.000606447;REVB=-0.0102879;RO=36;SAF=11;SAR=2;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.486678;STB=0.824475;TYPE=snp;VARB=0.00209632;OID=.;OPOS=106207822;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:53:52:36:39:13:13:2:11:17:19:2:11:17:22 chr14 106207843 . T C 869.49 PASS AO=97;DP=101;FAO=98;FDP=101;FR=.;FRO=3;FSAF=37;FSAR=61;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.000973644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.882;QD=34.4351;RBI=0.0123224;REFB=0.0104421;REVB=-0.0122839;RO=3;SAF=36;SAR=61;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00230381;STB=0.501398;TYPE=snp;VARB=3.40872e-05;OID=.;OPOS=106207843;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:101:101:3:3:97:98:61:36:1:2:61:37:1:2 chr14 106207933 . G A 278.89 PASS AO=82;DP=205;FAO=84;FDP=205;FR=.;FRO=121;FSAF=48;FSAR=36;FSRF=51;FSRR=70;FWDB=-0.00568952;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.523;QD=5.44184;RBI=0.0590397;REFB=-0.0260543;REVB=0.0587649;RO=121;SAF=47;SAR=35;SRF=51;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160388;STB=0.588051;TYPE=snp;VARB=0.0503358;OID=.;OPOS=106207933;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:205:121:121:82:84:35:47:51:70:36:48:51:70 chr14 106208082 . G T 14.27 PASS AO=10;DP=55;FAO=10;FDP=55;FR=.;FRO=45;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=27;FSRR=18;FWDB=-0.0133274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.58;QD=1.03754;RBI=0.0586684;REFB=-0.00490823;REVB=0.0571346;RO=45;SAF=6;SAR=4;SRF=27;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0256393;OID=.;OPOS=106208082;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:55:55:45:45:10:10:4:6:27:18:4:6:27:18 chr14 106208086 . A C 26.31 PASS AO=13;DP=56;FAO=13;FDP=55;FR=.;FRO=42;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=-0.00985479;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.08;QD=1.91358;RBI=0.038368;REFB=-0.00741147;REVB=-0.0370808;RO=43;SAF=9;SAR=4;SRF=26;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117554;STB=0.581408;TYPE=snp;VARB=0.0265231;OID=.;OPOS=106208086;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:56:55:43:42:13:13:4:9:26:17:4:9:25:17 chr14 106209119 . T C 43.93 PASS AO=19;DP=69;FAO=19;FDP=69;FR=.;FRO=50;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=32;FSRR=18;FWDB=-0.0203651;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=182.142;QD=2.54639;RBI=0.0204884;REFB=-0.0101518;REVB=-0.00224388;RO=50;SAF=13;SAR=6;SRF=32;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0595416;STB=0.536044;TYPE=snp;VARB=0.0229229;OID=.;OPOS=106209119;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:69:69:50:50:19:19:6:13:32:18:6:13:32:18 chr14 106209340 . T C 338.08 PASS AO=34;DP=38;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0600194;FXX=0.0749813;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.325;QD=36.5497;RBI=0.0632314;REFB=-0.107694;REVB=0.0198969;RO=1;SAF=16;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0283217;STB=0.513506;TYPE=snp;VARB=0.00608333;OID=.;OPOS=106209340;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:38:37:1:1:34:36:18:16:1:0:18:18:1:0 chr14 106209394 . GC G 427.92 PASS AO=49;DP=71;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.292712;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.663;QD=23.4477;RBI=0.356595;REFB=-0.0286367;REVB=0.203667;RO=11;SAF=13;SAR=36;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0.538824;SSSB=-0.115386;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0176963;OID=.;OPOS=106209395;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:49:71:73:73:0:27:46:0:0:36:11:13:36:6:5 chr14 106235611 . A T 147.04 PASS AO=53;DP=152;FAO=53;FDP=153;FR=.;FRO=100;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=41;FSRR=59;FWDB=0.00350762;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.6227;QD=3.84425;RBI=0.0115922;REFB=-0.0113839;REVB=0.0110488;RO=99;SAF=30;SAR=23;SRF=40;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182658;STB=0.600989;TYPE=snp;VARB=0.0227223;OID=.;OPOS=106235611;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:153:99:100:53:53:23:30:40:59:23:30:41:59 chr14 106235766 . G A 53.51 PASS AO=33;DP=137;FAO=33;FDP=137;FR=.;FRO=104;FSAF=3;FSAR=30;FSRF=40;FSRR=64;FWDB=-0.00629988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.5857;QD=1.56244;RBI=0.0215066;REFB=-0.0120938;REVB=0.0205632;RO=102;SAF=3;SAR=30;SRF=40;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.513826;STB=0.82037;TYPE=snp;VARB=0.0527797;OID=.;OPOS=106235766;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:137:137:102:104:33:33:30:3:40:62:30:3:40:64 chr14 106235767 . C T 37.93 PASS AO=32;DP=137;FAO=29;FDP=137;FR=.;FRO=108;FSAF=1;FSAR=28;FSRF=42;FSRR=66;FWDB=-0.0197326;FXX=0.00724585;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.98;QD=1.10757;RBI=0.0215507;REFB=-0.00287225;REVB=0.00866364;RO=105;SAF=3;SAR=29;SRF=40;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.49625;STB=0.927193;TYPE=snp;VARB=0.00601811;OID=.;OPOS=106235767;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:137:137:105:108:32:29:29:3:40:65:28:1:42:66 chr14 106236128 . T A 284.96 PASS AO=107;DP=308;FAO=107;FDP=309;FR=.;FRO=202;FSAF=57;FSAR=50;FSRF=84;FSRR=118;FWDB=-0.00958506;FXX=0.0032257;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.856;QD=3.68878;RBI=0.0101958;REFB=-0.0189024;REVB=-0.00347579;RO=194;SAF=57;SAR=50;SRF=80;SRR=114;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136033;STB=0.575951;TYPE=snp;VARB=0.0190137;OID=.;OPOS=106236128;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:308:309:194:202:107:107:50:57:80:114:50:57:84:118 chr14 106236143 . G A 1011.95 PASS AO=187;DP=302;FAO=188;FDP=303;FR=.;FRO=115;FSAF=77;FSAR=111;FSRF=53;FSRR=62;FWDB=0.00505704;FXX=0.00328937;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.063;QD=13.3591;RBI=0.01013;REFB=-0.029127;REVB=0.00877741;RO=114;SAF=77;SAR=110;SRF=52;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0319895;STB=0.519979;TYPE=snp;VARB=0.0167736;OID=.;OPOS=106236143;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:302:303:114:115:187:188:110:77:52:62:111:77:53:62 chr14 106236451 . T G 65.23 PASS AO=17;DP=42;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=0.0349811;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.973;QD=6.21198;RBI=0.0363721;REFB=-0.00703846;REVB=-0.00996233;RO=24;SAF=10;SAR=7;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253895;STB=0.633456;TYPE=snp;VARB=0.00816748;OID=.;OPOS=106236451;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:42:42:24:25:17:17:7:10:8:16:7:10:9:16 chr14 106236458 . C T 39.39 PASS AO=11;DP=35;FAO=11;FDP=32;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.0151709;FXX=0.157853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.0509;QD=4.92367;RBI=0.0517579;REFB=-0.000330717;REVB=-0.0494846;RO=15;SAF=8;SAR=3;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.330769;STB=0.750938;TYPE=snp;VARB=0.00260909;OID=.;OPOS=106236458;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:35:32:15:21:11:11:3:8:6:9:3:8:7:14 chr14 106237642 . T G 125.84 PASS AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0187216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.564;QD=35.9529;RBI=0.0321472;REFB=0;REVB=-0.0261332;RO=0;SAF=11;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000484684;OID=.;OPOS=106237642;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:14:14:0:0:14:14:3:11:0:0:3:11:0:0 chr14 106237729 . GC G 209.22 PASS AO=26;DP=32;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.125136;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=18.8624;QD=26.9956;RBI=0.254158;REFB=0;REVB=0.221218;RO=3;SAF=11;SAR=15;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0.538824;SSSB=0.017655;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0240258;OID=.;OPOS=106237730;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:26:31:31:31:0:14:17:0:0:18:3:11:15:1:2 chr14 106303846 . C T 488.25 PASS AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.658;QD=37.5579;RBI=0.0488803;REFB=0;REVB=0.0475894;RO=0;SAF=34;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.19096e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000237253;OID=.;OPOS=106303846;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:52:52:0:0:52:52:18:34:0:0:18:34:0:0 chr14 106306841 . C T 117.27 PASS AO=19;DP=29;FAO=19;FDP=29;FR=.;FRO=10;FSAF=17;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=0;FWDB=0.0112569;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=187.861;QD=16.1745;RBI=0.0919386;REFB=-0.0149527;REVB=0.0912468;RO=9;SAF=17;SAR=2;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192286;STB=0.613539;TYPE=snp;VARB=0.00728984;OID=.;OPOS=106306841;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:29:29:9:10:19:19:2:17:9:0:2:17:10:0 chr14 106307418 . G A 1113.17 PASS AO=119;DP=123;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0309839;FXX=0.0325177;HRUN=2;LEN=1;MLLD=247.542;QD=37.4174;RBI=0.0316824;REFB=-0.0620878;REVB=0.00661573;RO=1;SAF=37;SAR=82;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.012663;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.16856e-05;OID=.;OPOS=106307418;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:123:119:1:0:119:119:82:37:1:0:82:37:0:0 chr14 106311204 . GC G 65.88 PASS AO=6;DP=21;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.276785;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=7.80883;QD=13.8694;RBI=0.299364;REFB=-0.0124445;REVB=0.114057;RO=10;SAF=2;SAR=4;SRF=9;SRR=1;SSEN=0.290445;SSEP=0;SSSB=-0.530397;STB=0.518498;TYPE=del;VARB=0.057988;OID=.;OPOS=106311205;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:6:19:18:19:1:13:5:1:0:5:10:2:4:9:1 chr14 106321590 . C A 389.3 PASS AO=40;DP=41;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0133989;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.945;QD=35.3912;RBI=0.178566;REFB=-0.0413263;REVB=0.178063;RO=1;SAF=30;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0445938;STB=0.51851;TYPE=snp;VARB=0.0010797;OID=.;OPOS=106321590;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:41:44:1:1:40:43:10:30:0:1:13:30:0:1 chr14 106321663 . T C 47.88 PASS AO=16;DP=49;FAO=16;FDP=50;FR=.;FRO=34;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=11;FWDB=-0.0499019;FXX=0.0384541;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.7989;QD=3.83025;RBI=0.0525841;REFB=-0.0238683;REVB=0.0165796;RO=32;SAF=8;SAR=8;SRF=21;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176845;STB=0.658351;TYPE=snp;VARB=0.0322342;OID=.;OPOS=106321663;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:49:50:32:34:16:16:8:8:21:11:9:7:23:11 chr14 106321913 . G A 18.62 PASS AO=4;DP=12;FAO=4;FDP=12;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.000749785;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.598;QD=6.20788;RBI=0.00310371;REFB=-0.0498343;REVB=-0.00301178;RO=8;SAF=1;SAR=3;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.272394;STB=0.680854;TYPE=snp;VARB=0.104824;OID=.;OPOS=106321913;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:12:12:8:8:4:4:3:1:4:4:3:1:4:4 chr14 106329435 . T G 100.43 PASS AO=40;DP=126;FAO=40;FDP=126;FR=.;FRO=86;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=63;FWDB=0.0710918;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.9359;QD=3.18836;RBI=0.0710973;REFB=-0.00751535;REVB=0.000885875;RO=84;SAF=16;SAR=24;SRF=23;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160551;STB=0.597893;TYPE=snp;VARB=0.0169742;OID=.;OPOS=106329435;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:84:86:40:40:24:16:23:61:24:16:23:63 chr14 106329451 . G A 97.94 PASS AO=40;DP=129;FAO=40;FDP=128;FR=.;FRO=88;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=19;FSRR=69;FWDB=0.0187778;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.829;QD=3.06072;RBI=0.0225038;REFB=-0.0147396;REVB=-0.0124022;RO=88;SAF=14;SAR=26;SRF=19;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187829;STB=0.607813;TYPE=snp;VARB=0.0154189;OID=.;OPOS=106329451;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:129:128:88:88:40:40:26:14:19:69:26:14:19:69 chr14 106329452 . T C 100.32 PASS AO=40;DP=127;FAO=40;FDP=126;FR=.;FRO=86;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=19;FSRR=67;FWDB=-0.052747;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.0293;QD=3.18471;RBI=0.0671742;REFB=-0.0446765;REVB=-0.0415948;RO=84;SAF=14;SAR=26;SRF=19;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170181;STB=0.602731;TYPE=snp;VARB=0.051872;OID=.;OPOS=106329452;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:126:84:86:40:40:26:14:19:65:26:14:19:67 chr14 106329453 . A C 99.18 PASS AO=40;DP=127;FAO=40;FDP=127;FR=.;FRO=87;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=20;FSRR=67;FWDB=-0.0434063;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.6112;QD=3.1237;RBI=0.0434063;REFB=-0.0289546;REVB=-5.33744e-06;RO=83;SAF=14;SAR=26;SRF=18;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183456;STB=0.595565;TYPE=snp;VARB=0.0214733;OID=.;OPOS=106329453;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:83:87:40:40:26:14:18:65:26:14:20:67 chr14 106347371 . T A 738.84 PASS AO=441;DP=960;FAO=188;FDP=398;FR=.;FRO=210;FSAF=61;FSAR=127;FSRF=62;FSRR=148;FWDB=-0.00453283;FXX=0.00499988;HRUN=3;LEN=1;MLLD=79.2978;QD=7.42554;RBI=0.00464925;REFB=-0.0311662;REVB=0.00103388;RO=511;SAF=150;SAR=291;SRF=140;SRR=371;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0740041;STB=0.517809;TYPE=snp;VARB=0.0356125;OID=.;OPOS=106347371;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:960:398:511:210:441:188:291:150:140:371:127:61:62:148 chr14 106347420 . T C 804.98 PASS AO=352;DP=793;FAO=195;FDP=398;FR=.;FRO=203;FSAF=51;FSAR=144;FSRF=49;FSRR=154;FWDB=0.0188243;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.6099;QD=8.0902;RBI=0.0278463;REFB=-0.0211218;REVB=0.0205198;RO=432;SAF=103;SAR=249;SRF=90;SRR=342;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107212;STB=0.513479;TYPE=snp;VARB=0.0183337;OID=.;OPOS=106347420;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:793:398:432:203:352:195:249:103:90:342:144:51:49:154 chr14 106350696 . A G 654.85 PASS AO=239;DP=538;FAO=178;FDP=399;FR=.;FRO=221;FSAF=89;FSAR=89;FSRF=98;FSRR=123;FWDB=-0.00138167;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.325;QD=6.56486;RBI=0.0306281;REFB=0.000791221;REVB=-0.030597;RO=297;SAF=124;SAR=115;SRF=133;SRR=164;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0711104;STB=0.531325;TYPE=snp;VARB=-0.000806371;OID=.;OPOS=106350696;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:538:399:297:221:239:178:115:124:133:164:89:89:98:123 chr14 106354418 . G A 509.76 PASS AO=160;DP=406;FAO=159;FDP=398;FR=.;FRO=239;FSAF=85;FSAR=74;FSRF=121;FSRR=118;FWDB=0.0177595;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.622;QD=5.12325;RBI=0.0190424;REFB=-0.0060803;REVB=0.0068711;RO=244;SAF=84;SAR=76;SRF=123;SRR=121;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0225705;STB=0.517043;TYPE=snp;VARB=0.00897884;OID=.;OPOS=106354418;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:406:398:244:239:160:159:76:84:123:121:74:85:121:118 chr14 106354450 . A G 230.67 PASS AO=98;DP=322;FAO=98;FDP=309;FR=.;FRO=211;FSAF=58;FSAR=40;FSRF=146;FSRR=65;FWDB=-0.00324374;FXX=0.0403714;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.208;QD=2.98606;RBI=0.0223625;REFB=-0.00785355;REVB=-0.022126;RO=180;SAF=58;SAR=40;SRF=129;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152858;STB=0.572617;TYPE=snp;VARB=0.0190979;OID=.;OPOS=106354450;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:322:309:180:211:98:98:40:58:129:51:40:58:146:65 chr14 106366544 . G A 38.25 PASS AO=11;DP=30;FAO=11;FDP=33;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=0.0060711;FXX=0.0571265;HRUN=4;LEN=1;MLLD=85.5388;QD=4.63656;RBI=0.00607141;REFB=-0.0190563;REVB=6.09212e-05;RO=19;SAF=5;SAR=6;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151945;STB=0.593059;TYPE=snp;VARB=0.038114;OID=.;OPOS=106366544;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:30:33:19:22:11:11:6:5:6:13:6:5:7:15 chr14 106370603 . G C 434.75 PASS AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0053964;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.9261;QD=36.2288;RBI=0.038299;REFB=-0.0153776;REVB=0.0379169;RO=1;SAF=34;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136345;STB=0.507243;TYPE=snp;VARB=0.00455492;OID=.;OPOS=106370603;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:48:48:1:1:47:47:13:34:1:0:13:34:1:0 chr14 106382687 . C T 828.15 PASS AO=43;DP=94;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0453779;FXX=0.0439512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7377;QD=38.076;RBI=0.0471484;REFB=0;REVB=0.0127991;RO=0;SAF=35;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.54187e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000222662;OID=.;OPOS=106382687;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:44:87:0:0:43:87:8:35:0:0:46:41:0:0 chr14 106385332 . G C 534.62 PASS AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0236449;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.1602;QD=38.1871;RBI=0.0246204;REFB=0;REVB=-0.00686184;RO=0;SAF=38;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76069e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000295835;OID=.;OPOS=106385332;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:56:56:0:0:56:56:18:38:0:0:18:38:0:0 chr14 106436780 . A G 1123.9 PASS AO=117;DP=118;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0223743;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.212;QD=38.4238;RBI=0.0305497;REFB=0;REVB=0.0208008;RO=0;SAF=79;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.49722e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.18164e-05;OID=.;OPOS=106436780;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:118:117:0:0:117:117:38:79:0:0:38:79:0:0 chr14 106452766 . T A 1070.08 PASS AO=111;DP=113;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0591346;FXX=0.0260847;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.298;QD=38.2171;RBI=0.059819;REFB=0;REVB=0.00902264;RO=0;SAF=50;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.22387e-05;OID=.;OPOS=106452766;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:113:112:0:0:111:112:61:50:0:0:62:50:0:0 chr14 106471268 . A G 882.02 PASS AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00195179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2923;QD=37.9365;RBI=0.0193821;REFB=0;REVB=-0.0192835;RO=0;SAF=28;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000109065;OID=.;OPOS=106471268;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:93:93:0:0:93:93:65:28:0:0:65:28:0:0 chr14 106471273 . C T 877.42 PASS AO=97;DP=101;FAO=97;FDP=100;FR=.;FRO=3;FSAF=30;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0472549;FXX=0.00990001;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.6488;QD=35.0969;RBI=0.0491386;REFB=-0.1889;REVB=0.0134751;RO=4;SAF=30;SAR=67;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0274733;STB=0.510947;TYPE=snp;VARB=0.0131616;OID=.;OPOS=106471273;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:101:100:4:3:97:97:67:30:0:4:67:30:0:3 chr14 106471353 . C T 1448.9 PASS AO=149;DP=151;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00106224;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.9987;QD=38.1289;RBI=0.0336366;REFB=0;REVB=0.0336198;RO=2;SAF=38;SAR=111;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0243697;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000149773;OID=.;OPOS=106471353;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:151:152:2:0:149:152:111:38:2:0:111:41:0:0 chr14 106471388 . C A 1370.25 PASS AO=144;DP=147;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249007;FXX=0.0197355;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.529;QD=36.7854;RBI=0.0254618;REFB=-0.100998;REVB=0.00531586;RO=2;SAF=38;SAR=106;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0243654;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00016183;OID=.;OPOS=106471388;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:147:149:2:0:144:149:106:38:2:0:111:38:0:0 chr14 106471528 . C A 710.34 PASS AO=79;DP=81;FAO=78;FDP=80;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=49;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0160126;FXX=0.0123442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.979;QD=35.5168;RBI=0.0161768;REFB=-0.0222916;REVB=-0.00229865;RO=2;SAF=29;SAR=50;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00666958;STB=0.503424;TYPE=snp;VARB=9.54513e-05;OID=.;OPOS=106471528;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:81:80:2:2:79:78:50:29:1:1:49:29:1:1 chr14 106471534 . A G 661.61 PASS AO=69;DP=72;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0366237;FXX=0.0277739;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5907;QD=37.8065;RBI=0.114254;REFB=0;REVB=-0.108225;RO=1;SAF=28;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165827;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000717523;OID=.;OPOS=106471534;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:72:70:1:0:69:70:41:28:1:0:41:29:0:0 chr14 106471547 . A G 637.88 PASS AO=49;DP=68;FAO=67;FDP=67;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=36;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0436508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.282;QD=38.0821;RBI=0.123971;REFB=0;REVB=0.116032;RO=0;SAF=33;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000627597;OID=.;OPOS=106471547;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:64:67:0:0:49:67:16:33:0:0:31:36:0:0 chr14 106471689 . A C 355.12 PASS AO=68;DP=129;FAO=75;FDP=136;FR=.;FRO=61;FSAF=21;FSAR=54;FSRF=31;FSRR=30;FWDB=-0.00188965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.0431;QD=10.4447;RBI=0.0322504;REFB=-0.0122622;REVB=-0.032195;RO=61;SAF=21;SAR=47;SRF=31;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18478;STB=0.614141;TYPE=snp;VARB=0.0103707;OID=.;OPOS=106471689;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:136:61:61:68:75:47:21:31:30:54:21:31:30 chr14 106478137 . C T 142.82 PASS AO=26;DP=44;FAO=27;FDP=44;FR=.;FRO=17;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=0;FWDB=0.0361087;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.517;QD=12.9837;RBI=0.0532546;REFB=-0.0440524;REVB=0.0391435;RO=16;SAF=19;SAR=7;SRF=16;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.273494;STB=0.649035;TYPE=snp;VARB=0.0341041;OID=.;OPOS=106478137;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:44:44:16:17:26:27:7:19:16:0:7:20:17:0 chr14 106478513 . C G 484.59 PASS AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0258448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.197;QD=38.7673;RBI=0.0263473;REFB=0;REVB=-0.00512095;RO=0;SAF=10;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.02812e-05;OID=.;OPOS=106478513;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:50:50:0:0:50:50:40:10:0:0:40:10:0:0 chr14 106494269 . T C 1056.51 PASS AO=138;DP=168;FAO=160;FDP=198;FR=.;FRO=38;FSAF=29;FSAR=131;FSRF=36;FSRR=2;FWDB=0.00119028;FXX=0.0099995;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.2666;QD=21.3437;RBI=0.0584588;REFB=-0.0101555;REVB=-0.0584467;RO=29;SAF=10;SAR=128;SRF=26;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.515885;STB=0.688221;TYPE=snp;VARB=0.0151586;OID=.;OPOS=106494269;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:168:198:29:38:138:160:128:10:26:3:131:29:36:2 chr14 106518418 . A G 302.64 PASS AO=40;DP=53;FAO=42;FDP=50;FR=.;FRO=8;FSAF=11;FSAR=31;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=0.0505168;FXX=0.0740604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.5495;QD=24.2114;RBI=0.0562097;REFB=-0.0403286;REVB=0.0246493;RO=8;SAF=12;SAR=28;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232007;STB=0.633266;TYPE=snp;VARB=0.0028364;OID=.;OPOS=106518418;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:53:50:8:8:40:42:28:12:8:0:31:11:8:0 chr14 106518848 . T C 869.45 PASS AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0118116;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.4268;QD=38.642;RBI=0.0266354;REFB=0;REVB=-0.0238732;RO=0;SAF=65;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.46981e-05;OID=.;OPOS=106518848;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:90:90:0:0:90:90:25:65:0:0:25:65:0:0 chr14 106573248 . C A 12.93 PASS AO=8;DP=37;FAO=7;FDP=37;FR=.;FRO=30;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=21;FWDB=0.0384184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.68;QD=1.39803;RBI=0.0482168;REFB=0.00417786;REVB=-0.0291357;RO=29;SAF=2;SAR=6;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0896408;STB=0.513978;TYPE=snp;VARB=-0.0153618;OID=.;OPOS=106573248;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:37:37:29:30:8:7:6:2:9:20:5:2:9:21 chr14 106573251 . G A 171.99 PASS AO=26;DP=37;FAO=26;FDP=36;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=24;FSRF=10;FSRR=0;FWDB=0.0279865;FXX=0.0526177;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.607;QD=19.1096;RBI=0.0385601;REFB=-0.024295;REVB=0.0265261;RO=10;SAF=2;SAR=24;SRF=10;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.640393;STB=0.856802;TYPE=snp;VARB=0.00353515;OID=.;OPOS=106573251;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:37:36:10:10:26:26:24:2:10:0:24:2:10:0 chr14 106573311 . C T 759.88 PASS AO=82;DP=85;FAO=83;FDP=85;FR=.;FRO=2;FSAF=14;FSAR=69;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0529175;FXX=0.0116266;HRUN=3;LEN=1;MLLD=220.409;QD=35.7589;RBI=0.065619;REFB=-0.134289;REVB=0.0388019;RO=2;SAF=13;SAR=69;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0674478;STB=0.533325;TYPE=snp;VARB=0.00078887;OID=.;OPOS=106573311;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:85:85:2:2:82:83:69:13:2:0:69:14:2:0 chr14 106573354 . A G 340.47 PASS AO=69;DP=124;FAO=69;FDP=123;FR=.;FRO=54;FSAF=23;FSAR=46;FSRF=15;FSRR=39;FWDB=0.0349536;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9504;QD=11.0723;RBI=0.0358399;REFB=-0.00234511;REVB=-0.00792081;RO=54;SAF=23;SAR=46;SRF=15;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0512451;STB=0.527942;TYPE=snp;VARB=0.00151336;OID=.;OPOS=106573354;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:123:54:54:69:69:46:23:15:39:46:23:15:39 chr14 106573361 . TACC T,TACT 877.35 PASS AO=31,80;DP=128;FAO=33,80;FDP=128;FR=.;FRO=15;FSAF=9,23;FSAR=24,57;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.0020964,0.0119846;FXX=0.00775134;HRUN=1,2;LEN=3,1;MLLD=167.465,149.574;QD=27.4171;RBI=0.0161188,0.0265696;REFB=-0.00402451,-0.00513822;REVB=0.0159818,0.0237131;RO=15;SAF=9,23;SAR=22,57;SRF=5;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0306648,-0.0164691;STB=0.52335,0.508764;TYPE=del,snp;VARB=0.0239782,0.000789878;OID=.,.;OPOS=106573362,106573364;OREF=ACC,C;OALT=-,T;OMAPALT=T,TACT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:31,80:127:33,80:128:15:9,23:24,57:5:10:79:15:9,23:22,57:5:10 chr14 106573378 . T G 70.03 PASS AO=35;DP=133;FAO=36;FDP=135;FR=.;FRO=99;FSAF=9;FSAR=27;FSRF=32;FSRR=67;FWDB=-0.0349674;FXX=0.0073524;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.058;QD=2.07489;RBI=0.0420226;REFB=-0.0107619;REVB=0.0233063;RO=97;SAF=9;SAR=26;SRF=30;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0795317;STB=0.566781;TYPE=snp;VARB=0.024272;OID=.;OPOS=106573378;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:133:135:97:99:35:36:26:9:30:67:27:9:32:67 chr14 106573383 . A G 72.59 PASS AO=37;DP=138;FAO=37;FDP=139;FR=.;FRO=102;FSAF=9;FSAR=28;FSRF=33;FSRR=69;FWDB=-0.0140439;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=183.927;QD=2.0889;RBI=0.0250461;REFB=-0.0105644;REVB=-0.0207383;RO=97;SAF=10;SAR=27;SRF=29;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0431883;STB=0.573896;TYPE=snp;VARB=0.0243665;OID=.;OPOS=106573383;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:138:139:97:102:37:37:27:10:29:68:28:9:33:69 chr14 106573418 . T C 60.9 PASS AO=38;DP=163;FAO=39;FDP=165;FR=.;FRO=126;FSAF=10;FSAR=29;FSRF=46;FSRR=80;FWDB=-0.0172498;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.573;QD=1.47638;RBI=0.0281455;REFB=-0.00891901;REVB=-0.02224;RO=122;SAF=10;SAR=28;SRF=42;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121137;STB=0.598325;TYPE=snp;VARB=0.0182863;OID=.;OPOS=106573418;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:163:165:122:126:38:39:28:10:42:80:29:10:46:80 chr14 106573423 . C T 58.57 PASS AO=37;DP=164;FAO=39;FDP=167;FR=.;FRO=128;FSAF=10;FSAR=29;FSRF=47;FSRR=81;FWDB=0.00612887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.114;QD=1.40297;RBI=0.022954;REFB=-0.0208009;REVB=-0.0221206;RO=126;SAF=9;SAR=28;SRF=45;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172005;STB=0.600381;TYPE=snp;VARB=0.0512228;OID=.;OPOS=106573423;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:164:167:126:128:37:39:28:9:45:81:29:10:47:81 chr14 106586259 . T G 961.02 PASS AO=95;DP=97;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0016433;FXX=0.0192289;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.533;QD=37.6869;RBI=0.0206935;REFB=0;REVB=0.0206281;RO=0;SAF=46;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00057586;OID=.;OPOS=106586259;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:97:102:0:0:95:102:49:46:0:0:52:50:0:0 chr14 106641761 . A G 740.63 PASS AO=123;DP=185;FAO=126;FDP=188;FR=.;FRO=62;FSAF=79;FSAR=47;FSRF=35;FSRR=27;FWDB=0.0103793;FXX=0.0208322;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.888;QD=15.758;RBI=0.0175906;REFB=-0.00420558;REVB=-0.0142021;RO=62;SAF=77;SAR=46;SRF=35;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0404708;STB=0.521774;TYPE=snp;VARB=0.00216211;OID=.;OPOS=106641761;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:188:62:62:123:126:46:77:35:27:47:79:35:27 chr14 106667810 . C A 95.17 PASS AO=22;DP=49;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=0.00467249;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.762;QD=7.61361;RBI=0.00920019;REFB=-0.00028804;REVB=0.00792536;RO=27;SAF=6;SAR=16;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111716;STB=0.571363;TYPE=snp;VARB=0.00339147;OID=.;OPOS=106667810;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:49:50:27:27:22:23:16:6:10:17:17:6:10:17 chr14 106691778 . T A 108.26 PASS AO=47;DP=155;FAO=47;FDP=155;FR=.;FRO=108;FSAF=14;FSAR=33;FSRF=36;FSRR=72;FWDB=0.00102314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.4114;QD=2.79381;RBI=0.0401227;REFB=-0.00714075;REVB=0.0401097;RO=107;SAF=14;SAR=33;SRF=35;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0407281;STB=0.528834;TYPE=snp;VARB=0.0170308;OID=.;OPOS=106691778;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:107:108:47:47:33:14:35:72:33:14:36:72 chr14 106733437 . G C 38.78 PASS AO=39;DP=172;FAO=37;FDP=190;FR=.;FRO=153;FSAF=26;FSAR=11;FSRF=60;FSRR=93;FWDB=-0.0140625;FXX=0.0206175;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.7911;QD=0.816476;RBI=0.0143149;REFB=-0.0100791;REVB=-0.0026765;RO=131;SAF=27;SAR=12;SRF=54;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.349049;STB=0.740698;TYPE=snp;VARB=0.0269475;OID=.;OPOS=106733437;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:172:190:131:153:39:37:12:27:54:77:11:26:60:93 chr14 106733520 . C A 90.89 PASS AO=59;DP=250;FAO=61;FDP=254;FR=.;FRO=193;FSAF=36;FSAR=25;FSRF=74;FSRR=119;FWDB=-0.00406901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9553;QD=1.4314;RBI=0.0462914;REFB=-0.00852664;REVB=0.0461123;RO=190;SAF=35;SAR=24;SRF=72;SRR=118;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.266315;STB=0.653342;TYPE=snp;VARB=0.0345173;OID=.;OPOS=106733520;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:250:254:190:193:59:61:24:35:72:118:25:36:74:119 chr14 106733532 . G A 106.78 PASS AO=66;DP=260;FAO=66;FDP=262;FR=.;FRO=196;FSAF=38;FSAR=28;FSRF=83;FSRR=113;FWDB=-0.00911844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.539;QD=1.63021;RBI=0.0133951;REFB=-0.00397342;REVB=0.00981232;RO=191;SAF=37;SAR=29;SRF=82;SRR=109;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162977;STB=0.612589;TYPE=snp;VARB=0.00943299;OID=.;OPOS=106733532;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:260:262:191:196:66:66:29:37:82:109:28:38:83:113 chr14 106733555 . A G 111.57 PASS AO=73;DP=283;FAO=71;FDP=284;FR=.;FRO=213;FSAF=44;FSAR=27;FSRF=98;FSRR=115;FWDB=-0.0166858;FXX=0.00350865;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.8809;QD=1.57146;RBI=0.047939;REFB=-0.0130475;REVB=-0.0449415;RO=206;SAF=43;SAR=30;SRF=96;SRR=110;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153226;STB=0.619685;TYPE=snp;VARB=0.0432397;OID=.;OPOS=106733555;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:283:284:206:213:73:71:30:43:96:110:27:44:98:115 chr14 106733593 . G T 127.19 PASS AO=73;DP=275;FAO=73;FDP=277;FR=.;FRO=204;FSAF=31;FSAR=42;FSRF=100;FSRR=104;FWDB=0.0128405;FXX=0.00359699;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.144;QD=1.83662;RBI=0.0387422;REFB=-0.00297187;REVB=0.0365524;RO=201;SAF=31;SAR=42;SRF=99;SRR=102;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0848526;STB=0.54865;TYPE=snp;VARB=0.0130649;OID=.;OPOS=106733593;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:275:277:201:204:73:73:42:31:99:102:42:31:100:104 chr14 106791006 . C T 1181.59 PASS AO=198;DP=300;FAO=203;FDP=305;FR=.;FRO=102;FSAF=119;FSAR=84;FSRF=46;FSRR=56;FWDB=0.0199937;FXX=0.00651445;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.478;QD=15.4962;RBI=0.0200241;REFB=-0.0191053;REVB=0.00110444;RO=101;SAF=117;SAR=81;SRF=46;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0866822;STB=0.545867;TYPE=snp;VARB=0.00943737;OID=.;OPOS=106791006;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:300:305:101:102:198:203:81:117:46:55:84:119:46:56 chr14 106791119 . A G 286.44 PASS AO=119;DP=356;FAO=116;FDP=352;FR=.;FRO=236;FSAF=32;FSAR=84;FSRF=77;FSRR=159;FWDB=0.00786171;FXX=0.00564956;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.296;QD=3.25505;RBI=0.021688;REFB=-0.0123449;REVB=-0.020213;RO=236;SAF=33;SAR=86;SRF=76;SRR=160;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0626314;STB=0.540744;TYPE=snp;VARB=0.0216844;OID=.;OPOS=106791119;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:356:352:236:236:119:116:86:33:76:160:84:32:77:159 chr14 106791131 . A G 283.72 PASS AO=116;DP=358;FAO=117;FDP=356;FR=.;FRO=239;FSAF=31;FSAR=86;FSRF=77;FSRR=162;FWDB=-0.00418689;FXX=0.00280104;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.6914;QD=3.1879;RBI=0.00837641;REFB=-0.00869853;REVB=-0.00725494;RO=238;SAF=32;SAR=84;SRF=78;SRR=160;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.073014;STB=0.547117;TYPE=snp;VARB=0.0253797;OID=.;OPOS=106791131;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:358:356:238:239:116:117:84:32:78:160:86:31:77:162 chr14 106791200 . G A 178.4 PASS AO=71;DP=215;FAO=71;FDP=216;FR=.;FRO=145;FSAF=19;FSAR=52;FSRF=40;FSRR=105;FWDB=0.0370167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.121;QD=3.30366;RBI=0.0423285;REFB=-0.00547447;REVB=0.0205297;RO=143;SAF=19;SAR=52;SRF=40;SRR=103;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.017789;STB=0.507022;TYPE=snp;VARB=0.00355186;OID=.;OPOS=106791200;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:216:143:145:71:71:52:19:40:103:52:19:40:105 chr14 106805212 . C G 358.06 PASS AO=44;DP=57;FAO=50;FDP=62;FR=.;FRO=12;FSAF=33;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=2;FWDB=0.0894996;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.7139;QD=23.1007;RBI=0.0979569;REFB=-0.0923592;REVB=0.0398169;RO=13;SAF=29;SAR=15;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0529168;STB=0.538277;TYPE=snp;VARB=0.0323038;OID=.;OPOS=106805212;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:57:62:13:12:44:50:15:29:10:3:17:33:10:2 chr14 106805236 . C T 289.65 PASS AO=64;DP=126;FAO=65;FDP=125;FR=.;FRO=60;FSAF=15;FSAR=50;FSRF=24;FSRR=36;FWDB=-0.00728224;FXX=0.00793588;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.998;QD=9.26886;RBI=0.0304895;REFB=-0.0463066;REVB=-0.029607;RO=57;SAF=15;SAR=49;SRF=22;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162773;STB=0.601818;TYPE=snp;VARB=0.0428765;OID=.;OPOS=106805236;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:125:57:60:64:65:49:15:22:35:50:15:24:36 chr14 106805278 . A G 1559.86 PASS AO=275;DP=416;FAO=267;FDP=399;FR=.;FRO=132;FSAF=81;FSAR=186;FSRF=15;FSRR=117;FWDB=0.0152751;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.495;QD=15.6377;RBI=0.0232743;REFB=0.00219603;REVB=-0.0175603;RO=140;SAF=84;SAR=191;SRF=18;SRR=122;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139541;STB=0.578853;TYPE=snp;VARB=-0.000731839;OID=.;OPOS=106805278;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:416:399:140:132:275:267:191:84:18:122:186:81:15:117 chr14 106805381 . T G 1102.64 PASS AO=301;DP=445;FAO=226;FDP=397;FR=.;FRO=171;FSAF=56;FSAR=170;FSRF=33;FSRR=138;FWDB=0.0518001;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.722;QD=11.1097;RBI=0.0518816;REFB=0.000443164;REVB=0.00290768;RO=140;SAF=68;SAR=233;SRF=24;SRR=116;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0476282;STB=0.532705;TYPE=snp;VARB=-0.000271438;OID=.;OPOS=106805381;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:445:397:140:171:301:226:233:68:24:116:170:56:33:138 chr14 106805395 . G A 1059.89 PASS AO=234;DP=423;FAO=222;FDP=399;FR=.;FRO=177;FSAF=51;FSAR=171;FSRF=41;FSRR=136;FWDB=-0.0113114;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.605;QD=10.6255;RBI=0.014666;REFB=-0.00886778;REVB=0.00933516;RO=187;SAF=54;SAR=180;SRF=42;SRR=145;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00714503;STB=0.501195;TYPE=snp;VARB=0.00946818;OID=.;OPOS=106805395;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:423:399:187:177:234:222:180:54:42:145:171:51:41:136 chr14 106805402 . T G 26.06 PASS AO=66;DP=423;FAO=61;FDP=399;FR=.;FRO=338;FSAF=11;FSAR=50;FSRF=79;FSRR=259;FWDB=-0.0298102;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.978;QD=0.261283;RBI=0.0308609;REFB=0.00198728;REVB=-0.00798451;RO=355;SAF=13;SAR=53;SRF=85;SRR=270;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0802783;STB=0.569668;TYPE=snp;VARB=-0.00836819;OID=.;OPOS=106805402;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:423:399:355:338:66:61:53:13:85:270:50:11:79:259 chr14 106805408 . C T 912.57 PASS AO=211;DP=411;FAO=207;FDP=398;FR=.;FRO=191;FSAF=52;FSAR=155;FSRF=47;FSRR=144;FWDB=0.0267374;FXX=0.00499988;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.994;QD=9.17156;RBI=0.0310369;REFB=-0.00914646;REVB=0.0157606;RO=196;SAF=51;SAR=160;SRF=48;SRR=148;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00383237;STB=0.503285;TYPE=snp;VARB=0.00995552;OID=.;OPOS=106805408;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:411:398:196:191:211:207:160:51:48:148:155:52:47:144 chr14 106805439 . T C 31.71 PASS AO=55;DP=322;FAO=53;FDP=319;FR=.;FRO=266;FSAF=11;FSAR=42;FSRF=94;FSRR=172;FWDB=-0.0309539;FXX=0.0031249;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.843;QD=0.397645;RBI=0.0309734;REFB=-0.0078007;REVB=-0.00110017;RO=263;SAF=12;SAR=43;SRF=93;SRR=170;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212478;STB=0.651918;TYPE=snp;VARB=0.0279672;OID=.;OPOS=106805439;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:322:319:263:266:55:53:43:12:93:170:42:11:94:172 chr14 106805440 . A G 2953.4 PASS AO=309;DP=311;FAO=307;FDP=307;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=204;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00861085;FXX=0.00647228;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.453;QD=38.4808;RBI=0.0192271;REFB=0;REVB=0.0171912;RO=0;SAF=104;SAR=205;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.56731e-05;OID=.;OPOS=106805440;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:311:307:0:0:309:307:205:104:0:0:204:103:0:0 chr14 106805508 . G A 931.15 PASS AO=98;DP=100;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00437839;FXX=0.009999;HRUN=4;LEN=1;MLLD=93.3047;QD=37.6222;RBI=0.0247158;REFB=-0.0489843;REVB=0.0243249;RO=1;SAF=51;SAR=47;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00998494;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.4e-05;OID=.;OPOS=106805508;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:100:99:1:0:98:99:47:51:0:1:48:51:0:0 chr14 106845417 . C T 237.33 PASS AO=69;DP=163;FAO=68;FDP=163;FR=.;FRO=95;FSAF=22;FSAR=46;FSRF=38;FSRR=57;FWDB=-0.018481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.875;QD=5.8241;RBI=0.022191;REFB=-0.00131243;REVB=-0.0122837;RO=92;SAF=22;SAR=47;SRF=38;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105758;STB=0.54913;TYPE=snp;VARB=0.0016114;OID=.;OPOS=106845417;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:163:92:95:69:68:47:22:38:54:46:22:38:57 chr14 106866427 . G A 60.2 PASS AO=43;DP=183;FAO=42;FDP=183;FR=.;FRO=141;FSAF=4;FSAR=38;FSRF=68;FSRR=73;FWDB=0.00388662;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.6;QD=1.3159;RBI=0.00467395;REFB=-0.00435252;REVB=0.00259615;RO=140;SAF=4;SAR=39;SRF=67;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.578655;STB=0.86018;TYPE=snp;VARB=0.0248138;OID=.;OPOS=106866427;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:183:183:140:141:43:42:39:4:67:73:38:4:68:73 chr14 106866434 . C T 77.43 PASS AO=45;DP=187;FAO=47;FDP=179;FR=.,HEALED;FRO=132;FSAF=6;FSAR=41;FSRF=60;FSRR=72;FWDB=-0.0521162;FXX=0.00555525;HRUN=3;LEN=1;MLLD=72.9465;QD=1.73018;RBI=0.184195;REFB=-0.0194828;REVB=-0.176668;RO=88;SAF=6;SAR=39;SRF=53;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.581141;STB=0.799498;TYPE=snp;VARB=0.0990685;OID=.;OPOS=106866434;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:178:179:88:132:45:47:39:6:53:35:41:6:60:72 chr14 106866449 . T C 123.77 PASS AO=58;DP=199;FAO=59;FDP=201;FR=.;FRO=142;FSAF=12;FSAR=47;FSRF=59;FSRR=83;FWDB=0.00746073;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.1202;QD=2.46315;RBI=0.0232394;REFB=-0.0166588;REVB=-0.0220093;RO=141;SAF=12;SAR=46;SRF=59;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.30335;STB=0.68137;TYPE=snp;VARB=0.0312453;OID=.;OPOS=106866449;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:199:201:141:142:58:59:46:12:59:82:47:12:59:83 chr14 106866465 . A G 201.14 PASS AO=75;DP=215;FAO=74;FDP=213;FR=.;FRO=139;FSAF=18;FSAR=56;FSRF=54;FSRR=85;FWDB=-0.0174463;FXX=0.00930189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.516;QD=3.77723;RBI=0.026718;REFB=-0.00496018;REVB=-0.0202355;RO=138;SAF=18;SAR=57;SRF=54;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204893;STB=0.613666;TYPE=snp;VARB=0.00887025;OID=.;OPOS=106866465;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:213:138:139:75:74:57:18:54:84:56:18:54:85 chr14 106866565 . C A 678 PASS AO=159;DP=307;FAO=159;FDP=317;FR=.;FRO=158;FSAF=58;FSAR=101;FSRF=45;FSRR=113;FWDB=-0.0330514;FXX=0.00314456;HRUN=4;LEN=1;MLLD=123.314;QD=8.5552;RBI=0.0473625;REFB=-0.029473;REVB=0.0339236;RO=148;SAF=58;SAR=101;SRF=35;SRR=113;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127272;STB=0.544023;TYPE=snp;VARB=0.0203026;OID=.;OPOS=106866565;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:307:317:148:158:159:159:101:58:35:113:101:58:45:113 chr14 106866588 . T C 683.81 PASS AO=149;DP=285;FAO=151;FDP=286;FR=.;FRO=135;FSAF=58;FSAR=93;FSRF=39;FSRR=96;FWDB=0.0339171;FXX=0.0103803;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.855;QD=9.56371;RBI=0.0381168;REFB=-0.026777;REVB=-0.017393;RO=131;SAF=56;SAR=93;SRF=39;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0729812;STB=0.54856;TYPE=snp;VARB=0.020909;OID=.;OPOS=106866588;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:285:286:131:135:149:151:93:56:39:92:93:58:39:96 chr14 106866654 . T C 333.71 PASS AO=78;DP=185;FAO=90;FDP=197;FR=.;FRO=107;FSAF=37;FSAR=53;FSRF=39;FSRR=68;FWDB=0.0515393;FXX=0.00505025;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.086;QD=6.77578;RBI=0.0516403;REFB=-0.00638033;REVB=-0.00322905;RO=106;SAF=25;SAR=53;SRF=38;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0440713;STB=0.52639;TYPE=snp;VARB=0.00805583;OID=.;OPOS=106866654;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:197:106:107:78:90:53:25:38:68:53:37:39:68 chr14 106866668 . C A 297.38 PASS AO=79;DP=181;FAO=81;FDP=186;FR=.;FRO=105;FSAF=34;FSAR=47;FSRF=40;FSRR=65;FWDB=-0.0108842;FXX=0.0106377;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.211;QD=6.39534;RBI=0.0248256;REFB=-0.0114625;REVB=-0.0223125;RO=102;SAF=32;SAR=47;SRF=39;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239604;STB=0.522641;TYPE=snp;VARB=0.0220834;OID=.;OPOS=106866668;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:186:102:105:79:81:47:32:39:63:47:34:40:65 chr14 106866675 . C G 245.5 PASS AO=72;DP=178;FAO=73;FDP=180;FR=.;FRO=107;FSAF=32;FSAR=41;FSRF=44;FSRR=63;FWDB=-0.0130245;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=51.5478;QD=5.45547;RBI=0.0145911;REFB=-0.0195677;REVB=0.00657748;RO=99;SAF=31;SAR=41;SRF=41;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0173664;STB=0.516445;TYPE=snp;VARB=0.0169711;OID=.;OPOS=106866675;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:180:99:107:72:73:41:31:41:58:41:32:44:63 chr14 106866810 . C T 148.33 PASS AO=58;DP=176;FAO=58;FDP=176;FR=.;FRO=118;FSAF=31;FSAR=27;FSRF=74;FSRR=44;FWDB=0.0176993;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.463;QD=3.37108;RBI=0.0187588;REFB=-0.00756345;REVB=-0.0062151;RO=117;SAF=31;SAR=27;SRF=73;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105578;STB=0.562926;TYPE=snp;VARB=0.0130057;OID=.;OPOS=106866810;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:176:117:118:58:58:27:31:73:44:27:31:74:44 chr14 106866822 . C G 131.05 PASS AO=54;DP=171;FAO=54;FDP=171;FR=.;FRO=117;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=73;FSRR=44;FWDB=-0.01413;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.125;QD=3.06554;RBI=0.0192213;REFB=0.000318593;REVB=-0.0130308;RO=117;SAF=26;SAR=28;SRF=73;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167905;STB=0.596864;TYPE=snp;VARB=-0.00172191;OID=.;OPOS=106866822;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:171:117:117:54:54:28:26:73:44:28:26:73:44 chr14 106866865 . G C 79.1 PASS AO=45;DP=175;FAO=45;FDP=175;FR=.;FRO=130;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=75;FSRR=55;FWDB=-0.0378756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8911;QD=1.80804;RBI=0.0407342;REFB=-0.000415698;REVB=0.0149907;RO=129;SAF=20;SAR=25;SRF=75;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168868;STB=0.597442;TYPE=snp;VARB=0.000520975;OID=.;OPOS=106866865;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:175:175:129:130:45:45:25:20:75:54:25:20:75:55 chr14 106866869 . G A 77.5 PASS AO=45;DP=177;FAO=45;FDP=177;FR=.;FRO=132;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=74;FSRR=58;FWDB=0.00451135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.316;QD=1.75147;RBI=0.0175382;REFB=-0.00818684;REVB=-0.016948;RO=131;SAF=20;SAR=25;SRF=74;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149085;STB=0.585997;TYPE=snp;VARB=0.0215718;OID=.;OPOS=106866869;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:177:177:131:132:45:45:25:20:74:57:25:20:74:58 chr14 106877390 . C G 1277.15 PASS AO=225;DP=349;FAO=225;FDP=347;FR=.;FRO=122;FSAF=173;FSAR=52;FSRF=87;FSRR=35;FWDB=-0.0111107;FXX=0.00573049;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.377;QD=14.7222;RBI=0.0146023;REFB=-0.0101073;REVB=0.00947526;RO=120;SAF=173;SAR=52;SRF=87;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0390581;STB=0.52679;TYPE=snp;VARB=0.00548918;OID=.;OPOS=106877390;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:349:347:120:122:225:225:52:173:87:33:52:173:87:35 chr14 106877445 . C T 1099.13 PASS AO=203;DP=323;FAO=203;FDP=325;FR=.;FRO=122;FSAF=146;FSAR=57;FSRF=85;FSRR=37;FWDB=-0.0126003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.7522;QD=13.5278;RBI=0.0136305;REFB=-0.022004;REVB=-0.00519844;RO=119;SAF=146;SAR=57;SRF=84;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0112691;STB=0.510356;TYPE=snp;VARB=0.0187228;OID=.;OPOS=106877445;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:323:325:119:122:203:203:57:146:84:35:57:146:85:37 chr14 106877447 . A ATGATCT 1047.56 PASS AO=182;DP=321;FAO=193;FDP=309;FR=.;FRO=116;FSAF=138;FSAR=55;FSRF=81;FSRR=35;FWDB=0.0323732;FXX=0.037382;HRUN=0;LEN=6;MLLD=240.102;QD=13.5607;RBI=0.0538265;REFB=-0.0128937;REVB=0.0430031;RO=116;SAF=129;SAR=53;SRF=81;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00914939;STB=0.507663;TYPE=ins;VARB=0.00771251;OID=.;OPOS=106877448;OREF=-;OALT=TGATCT;OMAPALT=ATGATCT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:182:321:193:309:116:138:55:81:35:99:116:129:53:81:35 chr14 106877519 . A G 877.75 PASS AO=135;DP=183;FAO=135;FDP=183;FR=.;FRO=48;FSAF=70;FSAR=65;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=-0.013457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.921;QD=19.1858;RBI=0.0155586;REFB=-0.0237802;REVB=-0.00780886;RO=48;SAF=70;SAR=65;SRF=27;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0216599;STB=0.51156;TYPE=snp;VARB=0.00844777;OID=.;OPOS=106877519;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:183:183:48:48:135:135:65:70:27:21:65:70:27:21 chr14 106877535 . C G 609.36 PASS AO=95;DP=134;FAO=96;FDP=133;FR=.;FRO=37;FSAF=44;FSAR=52;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=0.0465472;FXX=0.00746213;HRUN=3;LEN=1;MLLD=94.452;QD=18.3266;RBI=0.0477828;REFB=-0.0598042;REVB=-0.0107962;RO=34;SAF=43;SAR=52;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0380047;STB=0.530439;TYPE=snp;VARB=0.0181173;OID=.;OPOS=106877535;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:134:133:34:37:95:96:52:43:18:16:52:44:21:16 chr14 106877550 . GA G,GC 568.16 PASS AO=14,49;DP=82;FAO=13,50;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=6,20;FSAR=7,30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0428137,0.0275475;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=45.7212,59.2282;QD=36.0738;RBI=0.0922244,0.108583;REFB=0,0;REVB=0.0816842,0.105031;RO=0;SAF=8,17;SAR=6,32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,4.70321e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.080154,-0.0193183;OID=.,.;OPOS=106877551,106877551;OREF=A,A;OALT=-,C;OMAPALT=G,GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:14,49:64:13,50:63:0:6,20:7,30:0:0:19:0:8,17:6,32:0:0 chr14 106877555 . C G,T 363.63 PASS AO=15,36;DP=63;FAO=28,24;FDP=64;FR=.;FRO=12;FSAF=21,0;FSAR=7,24;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0158769,0.012388;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=53.995,108.479;QD=22.7267;RBI=0.0510522,0.0125734;REFB=-0.00150409,0.00186764;REVB=-0.0485206,0.00215155;RO=12;SAF=8,12;SAR=7,24;SRF=7;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0395277,-0.1238;STB=0.562453,0.999327;TYPE=snp,snp;VARB=0.00792654,0.0043658;OID=.,.;OPOS=106877555,106877555;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:63:64:12:12:15,36:28,24:7,24:8,12:7:5:7,24:21,0:7:5 chr14 106877556 . C T 33.05 PASS AO=16;DP=64;FAO=16;FDP=64;FR=.;FRO=48;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=29;FWDB=0.0127507;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=95.7024;QD=2.0654;RBI=0.0139687;REFB=-0.0114437;REVB=-0.00570459;RO=48;SAF=9;SAR=7;SRF=19;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200957;STB=0.622928;TYPE=snp;VARB=0.0118306;OID=.;OPOS=106877556;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:64:64:48:48:16:16:7:9:19:29:7:9:19:29 chr14 106877583 . T G 161.96 PASS AO=32;DP=57;FAO=32;FDP=57;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.0161473;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=227.31;QD=11.3656;RBI=0.0214058;REFB=-0.000709962;REVB=-0.0140524;RO=24;SAF=14;SAR=18;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0496535;STB=0.516768;TYPE=snp;VARB=0.000365793;OID=.;OPOS=106877583;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:57:57:24:25:32:32:18:14:9:15:18:14:10:15 chr14 106877618 . G C 156.33 PASS AO=39;DP=85;FAO=39;FDP=85;FR=.;FRO=46;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=27;FWDB=-0.00773037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.2128;QD=7.35669;RBI=0.00776682;REFB=-0.040471;REVB=-0.000751633;RO=46;SAF=22;SAR=17;SRF=19;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145437;STB=0.58134;TYPE=snp;VARB=0.0447775;OID=.;OPOS=106877618;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:46:46:39:39:17:22:19:27:17:22:19:27 chr14 106877637 . A G 332.64 PASS AO=64;DP=118;FAO=69;FDP=124;FR=.;FRO=55;FSAF=20;FSAR=49;FSRF=25;FSRR=30;FWDB=-0.0129812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.6361;QD=10.7302;RBI=0.0453751;REFB=-0.029894;REVB=0.0434786;RO=54;SAF=20;SAR=44;SRF=25;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137422;STB=0.582538;TYPE=snp;VARB=0.0285845;OID=.;OPOS=106877637;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:124:54:55:64:69:44:20:25:29:49:20:25:30 chr14 106877700 . G T 1633.55 PASS AO=254;DP=350;FAO=254;FDP=348;FR=.;FRO=94;FSAF=89;FSAR=165;FSRF=45;FSRR=49;FWDB=0.0171432;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.962;QD=18.7765;RBI=0.0350749;REFB=-0.0251867;REVB=0.0306;RO=95;SAF=89;SAR=165;SRF=45;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0676139;STB=0.537221;TYPE=snp;VARB=0.0109355;OID=.;OPOS=106877700;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:350:348:95:94:254:254:165:89:45:50:165:89:45:49 chr14 106877753 . A G 2063.02 PASS AO=309;DP=402;FAO=305;FDP=399;FR=.;FRO=94;FSAF=97;FSAR=208;FSRF=41;FSRR=53;FWDB=-0.0355583;FXX=0.00249994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.2958;QD=20.6819;RBI=0.0770904;REFB=-0.00291626;REVB=-0.0683998;RO=93;SAF=99;SAR=210;SRF=40;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0537138;STB=0.531347;TYPE=snp;VARB=0.000618756;OID=.;OPOS=106877753;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:402:399:93:94:309:305:210:99:40:53:208:97:41:53 chr14 106877796 . G C 1334.73 PASS AO=209;DP=285;FAO=205;FDP=277;FR=.;FRO=72;FSAF=52;FSAR=153;FSRF=25;FSRR=47;FWDB=-0.0396314;FXX=0.0212007;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.8452;QD=19.2741;RBI=0.04431;REFB=0.0202936;REVB=0.0198173;RO=72;SAF=54;SAR=155;SRF=25;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0541361;STB=0.531127;TYPE=snp;VARB=-0.0071768;OID=.;OPOS=106877796;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:285:277:72:72:209:205:155:54:25:47:153:52:25:47 chr14 106877836 . C T 802.24 PASS AO=134;DP=203;FAO=137;FDP=206;FR=.;FRO=69;FSAF=31;FSAR=106;FSRF=26;FSRR=43;FWDB=0.0185363;FXX=0.00961492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.284;QD=15.5775;RBI=0.0189037;REFB=-0.0168906;REVB=-0.00370908;RO=69;SAF=28;SAR=106;SRF=26;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14515;STB=0.566728;TYPE=snp;VARB=0.0106204;OID=.;OPOS=106877836;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:206:69:69:134:137:106:28:26:43:106:31:26:43 chr14 106877837 . C A 771.86 PASS AO=132;DP=204;FAO=133;FDP=201;FR=.;FRO=68;FSAF=27;FSAR=106;FSRF=26;FSRR=42;FWDB=0.04184;FXX=0.0242707;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.601;QD=15.3605;RBI=0.0433059;REFB=0.000347787;REVB=0.0111719;RO=69;SAF=27;SAR=105;SRF=26;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15177;STB=0.584342;TYPE=snp;VARB=0.00102537;OID=.;OPOS=106877837;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:201:69:68:132:133:105:27:26:43:106:27:26:42 chr14 106877912 . G C 173.02 PASS AO=37;DP=70;FAO=37;FDP=71;FR=.;FRO=34;FSAF=3;FSAR=34;FSRF=10;FSRR=24;FWDB=-0.054869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.931;QD=9.74762;RBI=0.0548887;REFB=-0.0320353;REVB=-0.00147098;RO=33;SAF=4;SAR=33;SRF=9;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.271102;STB=0.717382;TYPE=snp;VARB=0.0304604;OID=.;OPOS=106877912;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:71:33:34:37:37:33:4:9:24:34:3:10:24 chr14 106878020 . C T 12.93 PASS AO=7;DP=37;FAO=7;FDP=37;FR=.;FRO=30;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=-0.0171307;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.684;QD=1.39803;RBI=0.017195;REFB=0.00154467;REVB=0.00148589;RO=30;SAF=4;SAR=3;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.282511;STB=0.686083;TYPE=snp;VARB=-0.00622856;OID=.;OPOS=106878020;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:37:37:30:30:7:7:3:4:10:20:3:4:10:20 chr14 106878038 . G A 34.87 PASS AO=11;DP=39;FAO=12;FDP=40;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=0.0026606;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.665;QD=3.48671;RBI=0.00307711;REFB=-0.00144689;REVB=-0.00154589;RO=28;SAF=6;SAR=5;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217753;STB=0.654226;TYPE=snp;VARB=0.00456178;OID=.;OPOS=106878038;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:39:40:28:28:11:12:5:6:10:18:5:7:10:18 chr14 106878056 . T G 62.61 PASS AO=16;DP=39;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.0365779;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=220.227;QD=6.42191;RBI=0.040726;REFB=-0.0126728;REVB=-0.0179071;RO=23;SAF=7;SAR=9;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00280785;STB=0.501627;TYPE=snp;VARB=0.0149115;OID=.;OPOS=106878056;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:39:39:23:23:16:16:9:7:10:13:9:7:10:13 chr14 106878067 . T G 91.75 PASS AO=21;DP=45;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.0548377;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.322;QD=8.34073;RBI=0.0549648;REFB=-0.0103935;REVB=0.00373544;RO=24;SAF=7;SAR=14;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0850068;STB=0.557321;TYPE=snp;VARB=0.00806629;OID=.;OPOS=106878067;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:45:44:24:23:21:21:14:7:10:14:14:7:10:13 chr14 106926223 . T C 1203.82 PASS AO=187;DP=256;FAO=187;FDP=256;FR=.;FRO=69;FSAF=61;FSAR=126;FSRF=17;FSRR=52;FWDB=0.0161151;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.252;QD=18.8097;RBI=0.0429615;REFB=-0.0521712;REVB=0.0398245;RO=69;SAF=61;SAR=126;SRF=17;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0467391;STB=0.524893;TYPE=snp;VARB=0.0193771;OID=.;OPOS=106926223;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:256:256:69:69:187:187:126:61:17:52:126:61:17:52 chr14 106926287 . G A 884.31 PASS AO=156;DP=248;FAO=161;FDP=251;FR=.;FRO=90;FSAF=19;FSAR=142;FSRF=28;FSRR=62;FWDB=-0.0132346;FXX=0.0195305;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.0494;QD=14.0926;RBI=0.0428203;REFB=0.00694711;REVB=0.0407238;RO=79;SAF=15;SAR=141;SRF=24;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.278538;STB=0.632587;TYPE=snp;VARB=-0.00492198;OID=.;OPOS=106926287;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:248:251:79:90:156:161:141:15:24:55:142:19:28:62 chr14 106926311 . T G 424.48 PASS AO=115;DP=272;FAO=120;FDP=277;FR=.;FRO=157;FSAF=19;FSAR=101;FSRF=36;FSRR=121;FWDB=0.010784;FXX=0.0142344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.014;QD=6.1297;RBI=0.0115385;REFB=-0.018905;REVB=-0.00410383;RO=157;SAF=14;SAR=101;SRF=36;SRR=121;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210307;STB=0.56839;TYPE=snp;VARB=0.0224963;OID=.;OPOS=106926311;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:272:277:157:157:115:120:101:14:36:121:101:19:36:121 chr14 106926388 . T C 916.84 PASS AO=153;DP=224;FAO=153;FDP=224;FR=.;FRO=71;FSAF=39;FSAR=114;FSRF=25;FSRR=46;FWDB=-0.014409;FXX=0.00884917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2979;QD=16.3722;RBI=0.039452;REFB=-0.0415809;REVB=-0.0367265;RO=69;SAF=39;SAR=114;SRF=25;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0784669;STB=0.539002;TYPE=snp;VARB=0.017637;OID=.;OPOS=106926388;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:224:224:69:71:153:153:114:39:25:44:114:39:25:46 chr14 106926649 . C A 543.48 PASS AO=76;DP=95;FAO=76;FDP=95;FR=.;FRO=19;FSAF=49;FSAR=27;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.0469022;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.5305;QD=22.8835;RBI=0.0474807;REFB=-0.0193888;REVB=-0.00738904;RO=19;SAF=49;SAR=27;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0476808;STB=0.525462;TYPE=snp;VARB=0.0148906;OID=.;OPOS=106926649;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:95:95:19:19:76:76:27:49:10:9:27:49:10:9 chr14 106926651 . TTC T 346.2 PASS AO=67;DP=100;FAO=69;FDP=94;FR=.;FRO=25;FSAF=44;FSAR=25;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.00888108;FXX=0.0208312;HRUN=2;LEN=2;MLLD=221.784;QD=14.732;RBI=0.017086;REFB=-0.0229124;REVB=0.0145966;RO=22;SAF=43;SAR=24;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0911438;STB=0.522077;TYPE=del;VARB=0.00832815;OID=.;OPOS=106926652;OREF=TC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:67:97:69:94:25:44:25:14:11:25:22:43:24:10:12 chr14 106963326 . G A 96.18 PASS AO=45;DP=156;FAO=45;FDP=156;FR=.;FRO=111;FSAF=38;FSAR=7;FSRF=50;FSRR=61;FWDB=-0.0153567;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.4942;QD=2.46619;RBI=0.0173265;REFB=-0.0060009;REVB=0.00802365;RO=111;SAF=38;SAR=7;SRF=50;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.516987;STB=0.807353;TYPE=snp;VARB=0.00991567;OID=.;OPOS=106963326;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:156:156:111:111:45:45:7:38:50:61:7:38:50:61 chr14 106993886 . A G 47.56 PASS AO=20;DP=71;FAO=20;FDP=71;FR=.;FRO=51;FSAF=3;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=0.00788073;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.547;QD=2.67963;RBI=0.0121184;REFB=-0.00284328;REVB=-0.00920599;RO=51;SAF=3;SAR=17;SRF=24;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.450434;STB=0.776336;TYPE=snp;VARB=0.00775614;OID=.;OPOS=106993886;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:71:71:51:51:20:20:17:3:24:27:17:3:24:27 chr14 106993945 . T C 31.08 PASS AO=21;DP=100;FAO=22;FDP=102;FR=.;FRO=80;FSAF=3;FSAR=19;FSRF=30;FSRR=50;FWDB=-0.0676026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.918;QD=1.21897;RBI=0.0676341;REFB=-0.0169524;REVB=0.00206343;RO=79;SAF=3;SAR=18;SRF=29;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.367174;STB=0.751529;TYPE=snp;VARB=0.0572999;OID=.;OPOS=106993945;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:100:102:79:80:21:22:18:3:29:50:19:3:30:50 chr14 106994015 . G A 109.34 PASS AO=28;DP=66;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=6;FSAR=22;FSRF=9;FSRR=28;FWDB=-0.033893;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.181;QD=6.72888;RBI=0.0341666;REFB=-0.0165244;REVB=-0.00431494;RO=36;SAF=6;SAR=22;SRF=9;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0507559;STB=0.523792;TYPE=snp;VARB=0.0163648;OID=.;OPOS=106994015;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:65:36:37:28:28:22:6:9:27:22:6:9:28 chr14 106994063 . C T 165.18 PASS AO=36;DP=69;FAO=35;FDP=67;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=26;FSRF=10;FSRR=22;FWDB=-0.0094544;FXX=0.0289813;HRUN=6;LEN=1;MLLD=252.946;QD=9.86172;RBI=0.0109975;REFB=-0.00313116;REVB=0.00561785;RO=33;SAF=9;SAR=27;SRF=10;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.058794;STB=0.533458;TYPE=snp;VARB=0.00276808;OID=.;OPOS=106994063;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:67:33:32:36:35:27:9:10:23:26:9:10:22 chr14 107013129 . A C 124.26 PASS AO=32;DP=73;FAO=32;FDP=73;FR=.;FRO=41;FSAF=6;FSAR=26;FSRF=11;FSRR=30;FWDB=-0.0261633;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.8349;QD=6.80853;RBI=0.0444509;REFB=-0.00316543;REVB=-0.0359356;RO=38;SAF=6;SAR=26;SRF=8;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0354737;STB=0.568078;TYPE=snp;VARB=0.00226387;OID=.;OPOS=107013129;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:38:41:32:32:26:6:8:30:26:6:11:30 chr14 107013201 . G T 145.74 PASS AO=28;DP=52;FAO=30;FDP=54;FR=.;FRO=24;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.00819358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.789;QD=10.7956;RBI=0.0146483;REFB=-0.00898403;REVB=-0.0121424;RO=23;SAF=14;SAR=14;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159294;STB=0.588178;TYPE=snp;VARB=0.00921747;OID=.;OPOS=107013201;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:52:54:23:24:28:30:14:14:7:16:14:16:8:16 chr14 107034705 . G A 17.62 PASS AO=10;DP=46;FAO=10;FDP=49;FR=.;FRO=39;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=-0.00202631;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=176.393;QD=1.43804;RBI=0.0213138;REFB=-0.00570476;REVB=-0.0212173;RO=36;SAF=9;SAR=1;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.463568;STB=0.826243;TYPE=snp;VARB=0.043487;OID=.;OPOS=107034705;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:46:49:36:39:10:10:1:9:22:14:1:9:23:16 chr14 107034707 . G T 14.77 PASS AO=10;DP=54;FAO=10;FDP=54;FR=.;FRO=44;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=25;FSRR=19;FWDB=-0.000514146;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=255.949;QD=1.09407;RBI=0.0177294;REFB=-0.00581335;REVB=-0.0177219;RO=44;SAF=9;SAR=1;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.493318;STB=0.84032;TYPE=snp;VARB=0.02182;OID=.;OPOS=107034707;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:54:54:44:44:10:10:1:9:25:19:1:9:25:19 chr14 107034789 . G A 30.04 PASS AO=32;DP=169;FAO=31;FDP=170;FR=.;FRO=139;FSAF=27;FSAR=4;FSRF=84;FSRR=55;FWDB=-0.0172711;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.913;QD=0.706895;RBI=0.0211052;REFB=-0.00612301;REVB=0.01213;RO=137;SAF=26;SAR=6;SRF=82;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.323822;STB=0.781819;TYPE=snp;VARB=0.029612;OID=.;OPOS=107034789;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:169:170:137:139:32:31:6:26:82:55:4:27:84:55 chr14 107034807 . G A 23.37 PASS AO=33;DP=171;FAO=29;FDP=168;FR=.;FRO=139;FSAF=25;FSAR=4;FSRF=81;FSRR=58;FWDB=-0.0370842;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.445;QD=0.556355;RBI=0.0548322;REFB=-0.020257;REVB=-0.0403898;RO=138;SAF=25;SAR=8;SRF=80;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.254215;STB=0.784982;TYPE=snp;VARB=0.0863237;OID=.;OPOS=107034807;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:171:168:138:139:33:29:8:25:80:58:4:25:81:58 chr14 107034822 . C G 22.63 PASS AO=33;DP=174;FAO=29;FDP=170;FR=.;FRO=141;FSAF=25;FSAR=4;FSRF=81;FSRR=60;FWDB=0.00540878;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.8267;QD=0.532421;RBI=0.022101;REFB=-0.00302332;REVB=0.021429;RO=140;SAF=25;SAR=8;SRF=81;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.255579;STB=0.790285;TYPE=snp;VARB=0.00810115;OID=.;OPOS=107034822;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:174:170:140:141:33:29:8:25:81:59:4:25:81:60 chr14 107034846 . T G 18.61 PASS AO=33;DP=193;FAO=30;FDP=189;FR=.;FRO=159;FSAF=25;FSAR=5;FSRF=85;FSRR=74;FWDB=-0.00565696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.717;QD=0.393861;RBI=0.0156015;REFB=-0.00417466;REVB=-0.0145398;RO=160;SAF=25;SAR=8;SRF=85;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.309388;STB=0.781973;TYPE=snp;VARB=0.0905563;OID=.;OPOS=107034846;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:193:189:160:159:33:30:8:25:85:75:5:25:85:74 chr14 107034854 . C A 21.76 PASS AO=37;DP=207;FAO=33;FDP=202;FR=.;FRO=169;FSAF=29;FSAR=4;FSRF=87;FSRR=82;FWDB=0.0216436;FXX=0.00492587;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.106;QD=0.430813;RBI=0.0220607;REFB=0.000579646;REVB=0.00426928;RO=165;SAF=29;SAR=8;SRF=82;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.386774;STB=0.842908;TYPE=snp;VARB=-0.00690802;OID=.;OPOS=107034854;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:207:202:165:169:37:33:8:29:82:83:4:29:87:82 chr14 107034863 . C T 31.2 PASS AO=41;DP=208;FAO=37;FDP=205;FR=.;FRO=168;FSAF=32;FSAR=5;FSRF=84;FSRR=84;FWDB=0.000778294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.473;QD=0.608699;RBI=0.108986;REFB=-0.00152067;REVB=-0.108983;RO=161;SAF=32;SAR=9;SRF=83;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.363641;STB=0.830611;TYPE=snp;VARB=0.00220903;OID=.;OPOS=107034863;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:208:205:161:168:41:37:9:32:83:78:5:32:84:84 chr14 107034920 . C T 88.85 PASS AO=55;DP=221;FAO=55;FDP=221;FR=.;FRO=166;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=63;FSRR=103;FWDB=0.0284227;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.4;QD=1.60816;RBI=0.0320147;REFB=-0.00699573;REVB=-0.0147339;RO=163;SAF=26;SAR=29;SRF=60;SRR=103;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133175;STB=0.570738;TYPE=snp;VARB=0.0241493;OID=.;OPOS=107034920;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:221:221:163:166:55:55:29:26:60:103:29:26:63:103 chr14 107034967 . T C 148.74 PASS AO=60;DP=185;FAO=60;FDP=186;FR=.;FRO=126;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=48;FSRR=78;FWDB=-0.0291421;FXX=0.00534731;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.8065;QD=3.19866;RBI=0.0480408;REFB=-0.0170803;REVB=0.0381924;RO=125;SAF=32;SAR=28;SRF=47;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183248;STB=0.60224;TYPE=snp;VARB=0.025577;OID=.;OPOS=107034967;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:186:125:126:60:60:28:32:47:78:28:32:48:78 chr14 107035002 . A G 149.99 PASS AO=55;DP=164;FAO=56;FDP=165;FR=.;FRO=109;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=49;FSRR=60;FWDB=-0.00620894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.777;QD=3.63618;RBI=0.0384434;REFB=-0.0143724;REVB=-0.0379387;RO=103;SAF=28;SAR=27;SRF=49;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0379632;STB=0.545026;TYPE=snp;VARB=0.0249402;OID=.;OPOS=107035002;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:165:103:109:55:56:27:28:49:54:27:29:49:60 chr14 107035020 . C T 123.63 PASS AO=54;DP=183;FAO=55;FDP=181;FR=.;FRO=126;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=60;FSRR=66;FWDB=0.0314575;FXX=0.0109284;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7538;QD=2.73213;RBI=0.032319;REFB=-0.00825425;REVB=-0.00741231;RO=128;SAF=25;SAR=29;SRF=60;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00700075;STB=0.502417;TYPE=snp;VARB=0.023627;OID=.;OPOS=107035020;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:181:128:126:54:55:29:25:60:68:29:26:60:66 chr14 107035163 . G C 25.54 PASS AO=20;DP=108;FAO=21;FDP=109;FR=.;FRO=88;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=47;FSRR=41;FWDB=0.0581745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.8771;QD=0.937271;RBI=0.0929164;REFB=0.0212162;REVB=0.0724512;RO=88;SAF=9;SAR=11;SRF=47;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106279;STB=0.623248;TYPE=snp;VARB=-0.0167836;OID=.;OPOS=107035163;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:108:109:88:88:20:21:11:9:47:41:13:8:47:41 chr14 107035164 . A C 21.82 PASS AO=21;DP=110;FAO=20;FDP=108;FR=.;FRO=88;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=47;FSRR=41;FWDB=-0.00845633;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.773;QD=0.808294;RBI=0.00995765;REFB=-0.0160128;REVB=-0.00525788;RO=88;SAF=8;SAR=13;SRF=47;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193663;STB=0.64985;TYPE=snp;VARB=0.0433441;OID=.;OPOS=107035164;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:110:108:88:88:21:20:13:8:47:41:13:7:47:41 chr14 107035168 . T A 28.11 PASS AO=23;DP=110;FAO=22;FDP=109;FR=.;FRO=87;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=47;FSRR=40;FWDB=-0.00162694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.367;QD=1.03164;RBI=0.0238354;REFB=0.000675999;REVB=-0.0237798;RO=86;SAF=9;SAR=14;SRF=46;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180857;STB=0.640472;TYPE=snp;VARB=-0.00370605;OID=.;OPOS=107035168;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:110:109:86:87:23:22:14:9:46:40:14:8:47:40 chr14 107035182 . T G 12.73 PASS AO=15;DP=95;FAO=15;FDP=95;FR=.;FRO=80;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=43;FSRR=37;FWDB=0.000192848;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.329;QD=0.536194;RBI=0.00810149;REFB=-0.000795733;REVB=-0.00809919;RO=79;SAF=5;SAR=10;SRF=43;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263486;STB=0.671101;TYPE=snp;VARB=0.003272;OID=.;OPOS=107035182;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:95:95:79:80:15:15:10:5:43:36:10:5:43:37 chr14 107048944 . A T 10.38 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0178258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.8364;QD=5.9314;RBI=0.112442;REFB=-0.0309627;REVB=-0.11102;RO=5;SAF=1;SAR=1;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0967026;STB=0.57073;TYPE=snp;VARB=0.0276514;OID=.;OPOS=107048944;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:5:5:2:2:1:1:2:3:1:1:2:3 chr14 107049049 . A G 146.56 PASS AO=38;DP=86;FAO=38;FDP=86;FR=.;FRO=48;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=-0.027279;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.705;QD=6.8168;RBI=0.0389854;REFB=0.00521064;REVB=-0.0278518;RO=48;SAF=22;SAR=16;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0376908;STB=0.521186;TYPE=snp;VARB=-0.00822066;OID=.;OPOS=107049049;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:48:48:38:38:16:22:26:22:16:22:26:22 chr14 107049080 . A G 201.56 PASS AO=47;DP=94;FAO=47;FDP=97;FR=.;FRO=50;FSAF=29;FSAR=18;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=-0.00306367;FXX=0.029997;HRUN=4;LEN=1;MLLD=269.288;QD=8.3119;RBI=0.0112909;REFB=-0.019185;REVB=-0.0108673;RO=46;SAF=29;SAR=18;SRF=26;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0483084;STB=0.541175;TYPE=snp;VARB=0.0190916;OID=.;OPOS=107049080;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:97:46:50:47:47:18:29:26:20:18:29:27:23 chr14 107078567 . T C 1049.32 PASS AO=109;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0587583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.498;QD=38.5072;RBI=0.0590464;REFB=0;REVB=0.00582555;RO=0;SAF=38;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00020422;OID=.;OPOS=107078567;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:109:109:0:0:109:109:71:38:0:0:71:38:0:0 chr14 107078790 . C T 989.67 PASS AO=105;DP=106;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0373155;FXX=0.0186898;HRUN=3;LEN=1;MLLD=182.945;QD=37.7018;RBI=0.0502156;REFB=-0.0417481;REVB=0.033603;RO=1;SAF=47;SAR=58;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00811238;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000110647;OID=.;OPOS=107078790;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:106:105:1:0:105:105:58:47:0:1:58:47:0:0 chr14 107095326 . C T 2452.88 PASS AO=263;DP=267;FAO=263;FDP=263;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=213;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0347359;FXX=0.018656;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.198;QD=37.3062;RBI=0.0347684;REFB=0.00047416;REVB=0.00150348;RO=3;SAF=50;SAR=213;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0049829;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.23116e-05;OID=.;OPOS=107095326;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:267:263:3:0:263:263:213:50:1:2:213:50:0:0 chr14 107113763 . A G 172.36 PASS AO=56;DP=158;FAO=58;FDP=159;FR=.;FRO=101;FSAF=3;FSAR=55;FSRF=62;FSRR=39;FWDB=0.00236046;FXX=0.00624961;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.671;QD=4.3361;RBI=0.0307753;REFB=0.000495832;REVB=0.0306846;RO=101;SAF=3;SAR=53;SRF=62;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.7324;STB=0.926716;TYPE=snp;VARB=-0.00136831;OID=.;OPOS=107113763;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:159:101:101:56:58:53:3:62:39:55:3:62:39 chr14 107113780 . G A 223.92 PASS AO=69;DP=180;FAO=70;FDP=180;FR=.;FRO=110;FSAF=6;FSAR=64;FSRF=65;FSRR=45;FWDB=-0.012027;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.666;QD=4.97597;RBI=0.0163777;REFB=0.00167084;REVB=0.0111166;RO=109;SAF=6;SAR=63;SRF=65;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.652033;STB=0.874059;TYPE=snp;VARB=-0.00346005;OID=.;OPOS=107113780;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:180:109:110:69:70:63:6:65:44:64:6:65:45 chr14 107113785 . C T 253.66 PASS AO=76;DP=188;FAO=76;FDP=188;FR=.;FRO=112;FSAF=6;FSAR=70;FSRF=66;FSRR=46;FWDB=-0.0563611;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.964;QD=5.39697;RBI=0.0623062;REFB=-0.00748226;REVB=0.0265611;RO=108;SAF=6;SAR=70;SRF=63;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.655899;STB=0.878544;TYPE=snp;VARB=0.0237302;OID=.;OPOS=107113785;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:188:108:112:76:76:70:6:63:45:70:6:66:46 chr14 107113846 . A G 515.7 PASS AO=112;DP=231;FAO=114;FDP=216;FR=.;FRO=102;FSAF=10;FSAR=104;FSRF=30;FSRR=72;FWDB=-0.0256872;FXX=0.0729582;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.657;QD=9.54997;RBI=0.0278523;REFB=-0.010174;REVB=-0.0107667;RO=96;SAF=9;SAR=103;SRF=30;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.403289;STB=0.702658;TYPE=snp;VARB=0.00922331;OID=.;OPOS=107113846;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:231:216:96:102:112:114:103:9:30:66:104:10:30:72 chr14 107113855 . A G 669.24 PASS AO=136;DP=240;FAO=136;FDP=240;FR=.;FRO=104;FSAF=21;FSAR=115;FSRF=28;FSRR=76;FWDB=-0.00974734;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.645;QD=11.1541;RBI=0.0206473;REFB=-0.0212916;REVB=0.0182017;RO=102;SAF=21;SAR=115;SRF=27;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147088;STB=0.584166;TYPE=snp;VARB=0.0130994;OID=.;OPOS=107113855;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:240:240:102:104:136:136:115:21:27:75:115:21:28:76 chr14 107113858 . A G 672.92 PASS AO=138;DP=244;FAO=138;FDP=244;FR=.;FRO=106;FSAF=23;FSAR=115;FSRF=28;FSRR=78;FWDB=-0.038074;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.01;QD=11.0315;RBI=0.0387099;REFB=-0.00427451;REVB=-0.00698782;RO=104;SAF=23;SAR=115;SRF=27;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120139;STB=0.569186;TYPE=snp;VARB=0.00403027;OID=.;OPOS=107113858;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:244:104:106:138:138:115:23:27:77:115:23:28:78 chr14 107113968 . C A 352.65 PASS AO=66;DP=110;FAO=66;FDP=110;FR=.;FRO=44;FSAF=17;FSAR=49;FSRF=15;FSRR=29;FWDB=-0.0118116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.806;QD=12.8235;RBI=0.018409;REFB=-0.0233435;REVB=0.0141201;RO=44;SAF=17;SAR=49;SRF=15;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0766355;STB=0.541798;TYPE=snp;VARB=0.0161255;OID=.;OPOS=107113968;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:44:44:66:66:49:17:15:29:49:17:15:29 chr14 107114009 . T C 53.39 PASS AO=24;DP=75;FAO=22;FDP=75;FR=.;FRO=53;FSAF=2;FSAR=20;FSRF=12;FSRR=41;FWDB=-0.00429859;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6064;QD=2.84724;RBI=0.0473383;REFB=0.00685432;REVB=-0.0471428;RO=41;SAF=3;SAR=21;SRF=10;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230688;STB=0.696295;TYPE=snp;VARB=-0.0426954;OID=.;OPOS=107114009;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:75:75:41:53:24:22:21:3:10:31:20:2:12:41 chr14 107131034 . C T 33.26 PASS AO=22;DP=93;FAO=21;FDP=94;FR=.;FRO=73;FSAF=20;FSAR=1;FSRF=57;FSRR=16;FWDB=0.0180256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.643;QD=1.41515;RBI=0.0395382;REFB=-0.013972;REVB=-0.0351902;RO=71;SAF=21;SAR=1;SRF=55;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.49042;STB=0.814926;TYPE=snp;VARB=0.0213425;OID=.;OPOS=107131034;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:93:94:71:73:22:21:1:21:55:16:1:20:57:16 chr14 107131128 . G T 11.89 PASS AO=13;DP=84;FAO=13;FDP=82;FR=.;FRO=69;FSAF=12;FSAR=1;FSRF=50;FSRR=19;FWDB=-0.00215944;FXX=0.0238067;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.472;QD=0.57992;RBI=0.017117;REFB=-0.00589731;REVB=-0.0169802;RO=69;SAF=12;SAR=1;SRF=50;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.4053;STB=0.794112;TYPE=snp;VARB=0.0275983;OID=.;OPOS=107131128;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:84:82:69:69:13:13:1:12:50:19:1:12:50:19 chr14 107170005 . T C 481.15 PASS AO=110;DP=215;FAO=110;FDP=215;FR=.;FRO=105;FSAF=40;FSAR=70;FSRF=18;FSRR=87;FWDB=-0.00194226;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=138.732;QD=8.95158;RBI=0.0134998;REFB=-0.015605;REVB=-0.0133594;RO=105;SAF=40;SAR=70;SRF=18;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197557;STB=0.607333;TYPE=snp;VARB=0.0109553;OID=.;OPOS=107170005;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:215:105:105:110:110:70:40:18:87:70:40:18:87 chr14 107178832 . A G 3735.89 PASS AO=409;DP=414;FAO=395;FDP=395;FR=.;FRO=0;FSAF=198;FSAR=197;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0128169;FXX=0.0124997;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.7793;QD=37.8318;RBI=0.0862852;REFB=-0.0199403;REVB=-0.085328;RO=3;SAF=205;SAR=204;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00696631;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.14737e-05;OID=.;OPOS=107178832;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:414:395:3:0:409:395:204:205:0:3:197:198:0:0 chr14 107178941 . T A 496.31 PASS AO=185;DP=488;FAO=158;FDP=400;FR=.;FRO=242;FSAF=63;FSAR=95;FSRF=105;FSRR=137;FWDB=-0.0154225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.972;QD=4.96306;RBI=0.0200944;REFB=-0.00556874;REVB=0.0128815;RO=303;SAF=78;SAR=107;SRF=125;SRR=178;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0103024;STB=0.521975;TYPE=snp;VARB=0.00677956;OID=.;OPOS=107178941;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:488:400:303:242:185:158:107:78:125:178:95:63:105:137 chr14 107178965 . A C 493.21 PASS AO=159;DP=402;FAO=157;FDP=398;FR=.;FRO=241;FSAF=57;FSAR=100;FSRF=85;FSRR=156;FWDB=0.0217967;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.47;QD=4.9569;RBI=0.0259926;REFB=-2.23009e-05;REVB=0.0141606;RO=239;SAF=58;SAR=101;SRF=82;SRR=157;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.025325;STB=0.506807;TYPE=snp;VARB=5.85559e-05;OID=.;OPOS=107178965;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:402:398:239:241:159:157:101:58:82:157:100:57:85:156 chr14 107179017 . A G 494.34 PASS AO=136;DP=311;FAO=136;FDP=310;FR=.;FRO=174;FSAF=63;FSAR=73;FSRF=77;FSRR=97;FWDB=0.0093234;FXX=0.00321533;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.458;QD=6.37853;RBI=0.0374013;REFB=-0.0139489;REVB=-0.0362206;RO=173;SAF=63;SAR=73;SRF=77;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184499;STB=0.511704;TYPE=snp;VARB=0.0123513;OID=.;OPOS=107179017;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:311:310:173:174:136:136:73:63:77:96:73:63:77:97 chr14 107179106 . C T 462.25 PASS AO=131;DP=302;FAO=130;FDP=301;FR=.;FRO=171;FSAF=85;FSAR=45;FSRF=83;FSRR=88;FWDB=0.0202139;FXX=0.00331115;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.585;QD=6.1429;RBI=0.0204304;REFB=0.00159981;REVB=0.00296613;RO=169;SAF=86;SAR=45;SRF=82;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180147;STB=0.599242;TYPE=snp;VARB=-0.00275707;OID=.;OPOS=107179106;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:302:301:169:171:131:130:45:86:82:87:45:85:83:88 chr14 107259782 . A G 125.27 PASS AO=29;DP=60;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=1;FSAR=28;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=-0.0244979;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.9063;QD=8.21432;RBI=0.0962789;REFB=0.0512449;REVB=-0.09311;RO=31;SAF=2;SAR=27;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.497211;STB=0.883114;TYPE=snp;VARB=-0.0669323;OID=.;OPOS=107259782;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:61:31:32:29:29:27:2:11:20:28:1:12:20 chr14 107259787 . A C 113.93 PASS AO=25;DP=58;FAO=28;FDP=61;FR=.;FRO=33;FSAF=1;FSAR=27;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=0.00649368;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.768;QD=7.47053;RBI=0.00912785;REFB=-0.0174725;REVB=-0.0064148;RO=32;SAF=1;SAR=24;SRF=11;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.61168;STB=0.87931;TYPE=snp;VARB=0.0267349;OID=.;OPOS=107259787;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:61:32:33:25:28:24:1:11:21:27:1:12:21 chr14 107282769 . G A 108.01 PASS AO=37;DP=101;FAO=36;FDP=101;FR=.;FRO=65;FSAF=4;FSAR=32;FSRF=21;FSRR=44;FWDB=0.0158297;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1808;QD=4.27776;RBI=0.0374112;REFB=0.0186633;REVB=0.0338972;RO=64;SAF=4;SAR=33;SRF=21;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.391061;STB=0.724485;TYPE=snp;VARB=-0.0332596;OID=.;OPOS=107282769;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:64:65:37:36:33:4:21:43:32:4:21:44 chr15 20362818 . G T 16.98 PASS AO=8;DP=38;FAO=8;FDP=37;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=23;FWDB=-0.0240336;FXX=0.0263089;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.3068;QD=1.83521;RBI=0.0382073;REFB=0.0184106;REVB=0.0297015;RO=30;SAF=6;SAR=2;SRF=6;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.596432;STB=0.861394;TYPE=snp;VARB=-0.050609;OID=.;OPOS=20362818;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:38:37:30:29:8:8:2:6:6:24:2:6:6:23 chr15 20462585 . A G 70.62 PASS AO=36;DP=134;FAO=36;FDP=134;FR=.;FRO=98;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=58;FSRR=40;FWDB=-0.0177305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.533;QD=2.10801;RBI=0.021117;REFB=-0.0139411;REVB=-0.0114699;RO=98;SAF=20;SAR=16;SRF=58;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0454183;STB=0.527012;TYPE=snp;VARB=0.0346069;OID=.;OPOS=20462585;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:134:134:98:98:36:36:16:20:58:40:16:20:58:40 chr15 20462613 . G C 79.55 PASS AO=30;DP=134;FAO=32;FDP=133;FR=.,HEALED;FRO=93;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=66;FSRR=27;FWDB=0.0137473;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=87.4733;QD=2.39253;RBI=0.0189115;REFB=-0.0020261;REVB=-0.0129868;RO=73;SAF=17;SAR=13;SRF=66;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.463007;STB=0.635451;TYPE=snp;VARB=-0.0356689;OID=.;OPOS=20462613;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:132:133:73:93:30:32:13:17:66:7:15:17:66:27 chr15 20476906 . T C 160.35 PASS AO=70;DP=230;FAO=70;FDP=228;FR=.;FRO=158;FSAF=30;FSAR=40;FSRF=86;FSRR=72;FWDB=-0.0237202;FXX=0.00869527;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.392;QD=2.81307;RBI=0.0313542;REFB=-0.0122891;REVB=0.0205047;RO=153;SAF=30;SAR=40;SRF=81;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119713;STB=0.579977;TYPE=snp;VARB=0.0318705;OID=.;OPOS=20476906;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:230:228:153:158:70:70:40:30:81:72:40:30:86:72 chr15 20476942 . C T 118.5 PASS AO=57;DP=198;FAO=57;FDP=198;FR=.;FRO=141;FSAF=25;FSAR=32;FSRF=80;FSRR=61;FWDB=-0.00712896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.233;QD=2.39394;RBI=0.0249629;REFB=-0.00750315;REVB=0.0239233;RO=138;SAF=25;SAR=32;SRF=78;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152363;STB=0.590997;TYPE=snp;VARB=0.01577;OID=.;OPOS=20476942;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:198:138:141:57:57:32:25:78:60:32:25:80:61 chr15 20613928 . G A 81.77 PASS AO=45;DP=172;FAO=45;FDP=172;FR=.;FRO=127;FSAF=30;FSAR=15;FSRF=66;FSRR=61;FWDB=-0.0380071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9777;QD=1.90154;RBI=0.0411316;REFB=-0.00745996;REVB=0.0157248;RO=127;SAF=30;SAR=15;SRF=66;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188652;STB=0.612852;TYPE=snp;VARB=0.0156985;OID=.;OPOS=20613928;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:172:172:127:127:45:45:15:30:66:61:15:30:66:61 chr15 20874846 . G A 73.88 PASS AO=118;DP=569;FAO=78;FDP=393;FR=.;FRO=315;FSAF=35;FSAR=43;FSRF=156;FSRR=159;FWDB=-0.025899;FXX=0.0174996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.3201;QD=0.751985;RBI=0.0283779;REFB=-0.00232592;REVB=0.0115996;RO=444;SAF=60;SAR=58;SRF=224;SRR=220;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00512815;STB=0.537385;TYPE=snp;VARB=0.00952538;OID=.;OPOS=20874846;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:569:393:444:315:118:78:58:60:224:220:43:35:156:159 chr15 20874897 . A G 3789.15 PASS AO=645;DP=650;FAO=397;FDP=397;FR=.;FRO=0;FSAF=179;FSAR=218;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0727794;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.598;QD=38.1778;RBI=0.0736366;REFB=-0.0700229;REVB=0.0112027;RO=3;SAF=296;SAR=349;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00481582;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000163643;OID=.;OPOS=20874897;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:650:397:3:0:645:397:349:296:3:0:218:179:0:0 chr15 20874927 . T A 60.16 PASS AO=105;DP=636;FAO=74;FDP=395;FR=.;FRO=321;FSAF=33;FSAR=41;FSRF=134;FSRR=187;FWDB=0.0019382;FXX=0.0124997;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.176;QD=0.609261;RBI=0.0172462;REFB=0.000438406;REVB=0.0171369;RO=510;SAF=51;SAR=54;SRF=220;SRR=290;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0711444;STB=0.523548;TYPE=snp;VARB=-0.00163066;OID=.;OPOS=20874927;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:636:395:510:321:105:74:54:51:220:290:41:33:134:187 chr15 20876515 . A G 3739.5 PASS AO=417;DP=421;FAO=394;FDP=394;FR=.;FRO=0;FSAF=230;FSAR=164;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226308;FXX=0.0149996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.093;QD=37.9645;RBI=0.0444553;REFB=-0.136814;REVB=0.0382638;RO=2;SAF=243;SAR=174;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0039121;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.82293e-05;OID=.;OPOS=20876515;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:421:394:2:0:417:394:174:243:2:0:164:230:0:0 chr15 22016194 . G A 15.91 PASS AO=5;DP=20;FAO=5;FDP=20;FR=.;FRO=15;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.0087077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.421;QD=3.18296;RBI=0.0319753;REFB=-0.00544377;REVB=-0.0307668;RO=15;SAF=1;SAR=4;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.333329;STB=0.726282;TYPE=snp;VARB=0.0203141;OID=.;OPOS=22016194;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:20:20:15:15:5:5:4:1:7:8:4:1:7:8 chr15 22368862 . G A 1408.78 PASS AO=271;DP=434;FAO=254;FDP=399;FR=.;FRO=145;FSAF=114;FSAR=140;FSRF=85;FSRR=60;FWDB=0.00749781;FXX=0.00249994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5981;QD=14.1232;RBI=0.00769679;REFB=0.0155859;REVB=0.00173877;RO=160;SAF=119;SAR=152;SRF=97;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115368;STB=0.549937;TYPE=snp;VARB=-0.00918707;OID=.;OPOS=22368862;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:434:399:160:145:271:254:152:119:97:63:140:114:85:60 chr15 22368905 . G A 966.68 PASS AO=198;DP=354;FAO=198;FDP=350;FR=.;FRO=152;FSAF=91;FSAR=107;FSRF=72;FSRR=80;FWDB=0.0171033;FXX=0.0112991;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.827;QD=11.0478;RBI=0.0179196;REFB=-0.0133565;REVB=0.00534678;RO=149;SAF=91;SAR=107;SRF=72;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0188105;STB=0.506152;TYPE=snp;VARB=0.00883119;OID=.;OPOS=22368905;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:354:350:149:152:198:198:107:91:72:77:107:91:72:80 chr15 22369248 . T C 1060.09 PASS AO=113;DP=114;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00385241;FXX=0.00877116;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.413;QD=37.5252;RBI=0.0447079;REFB=-0.0747701;REVB=0.0445416;RO=1;SAF=36;SAR=77;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00612728;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000310228;OID=.;OPOS=22369248;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:114:113:1:0:113:113:77:36:0:1:77:36:0:0 chr15 22369290 . A G 481.39 PASS AO=106;DP=207;FAO=107;FDP=205;FR=.;FRO=98;FSAF=45;FSAR=62;FSRF=37;FSRR=61;FWDB=0.0252075;FXX=0.00966137;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.6578;QD=9.39301;RBI=0.0350359;REFB=-0.0147747;REVB=0.024333;RO=95;SAF=45;SAR=61;SRF=37;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0311738;STB=0.521232;TYPE=snp;VARB=0.00875506;OID=.;OPOS=22369290;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:205:95:98:106:107:61:45:37:58:62:45:37:61 chr15 22369426 . G A 3853.9 PASS AO=428;DP=428;FAO=400;FDP=400;FR=.;FRO=0;FSAF=171;FSAR=229;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00090706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.439;QD=38.539;RBI=0.0283612;REFB=0;REVB=0.0283466;RO=0;SAF=181;SAR=247;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.81008e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.88139e-06;OID=.;OPOS=22369426;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:428:400:0:0:428:400:247:181:0:0:229:171:0:0 chr15 22382739 . A G 1310.31 PASS AO=148;DP=155;FAO=148;FDP=155;FR=.;FRO=7;FSAF=72;FSAR=76;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.00267358;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=207.369;QD=33.8145;RBI=0.008851;REFB=-0.126343;REVB=0.00843754;RO=7;SAF=72;SAR=76;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0172412;STB=0.509077;TYPE=snp;VARB=0.000425406;OID=.;OPOS=22382739;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:155:155:7:7:148:148:76:72:2:5:76:72:2:5 chr15 22383066 . A G 2290.1 PASS AO=244;DP=247;FAO=244;FDP=244;FR=.;FRO=0;FSAF=122;FSAR=122;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00267896;FXX=0.0121453;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.0056;QD=37.5427;RBI=0.0310471;REFB=-0.0161023;REVB=-0.0309313;RO=3;SAF=122;SAR=122;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00385806;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.28862e-05;OID=.;OPOS=22383066;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:247:244:3:0:244:244:122:122:1:2:122:122:0:0 chr15 22383189 . G A 2566.5 PASS AO=264;DP=265;FAO=267;FDP=267;FR=.;FRO=0;FSAF=120;FSAR=147;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00795484;FXX=0.0037312;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.288;QD=38.4494;RBI=0.0445275;REFB=0;REVB=0.0438111;RO=0;SAF=119;SAR=145;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.91964e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.29454e-05;OID=.;OPOS=22383189;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:265:267:0:0:264:267:145:119:0:0:147:120:0:0 chr15 22383249 . G A 379.8 PASS AO=104;DP=238;FAO=104;FDP=238;FR=.;FRO=134;FSAF=57;FSAR=47;FSRF=59;FSRR=75;FWDB=-0.0383093;FXX=0.00833299;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.3235;QD=6.38311;RBI=0.0402004;REFB=-0.00958084;REVB=0.0121848;RO=133;SAF=57;SAR=47;SRF=59;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105304;STB=0.560524;TYPE=snp;VARB=0.0136471;OID=.;OPOS=22383249;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:238:238:133:134:104:104:47:57:59:74:47:57:59:75 chr15 22383482 . GA G 629.4 PASS AO=65;DP=77;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0058144;FXX=0.0294074;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.804;QD=38.1456;RBI=0.0058778;REFB=0;REVB=0.000860943;RO=0;SAF=37;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.99207e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.000192158;OID=.;OPOS=22383483;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:65:69:66:66:0:38:28:0:0:30:0:37:28:0:0 chr15 22413700 . A G 2220.06 PASS AO=240;DP=243;FAO=240;FDP=240;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=148;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00706599;FXX=0.0123452;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5906;QD=37.0009;RBI=0.0538357;REFB=0.0314464;REVB=-0.0533699;RO=2;SAF=93;SAR=147;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00186587;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00139511;OID=.;OPOS=22413700;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:243:240:2:0:240:240:147:93:1:1:148:92:0:0 chr15 22413825 . C T 1171.18 PASS AO=327;DP=572;FAO=233;FDP=397;FR=.;FRO=164;FSAF=122;FSAR=111;FSRF=77;FSRR=87;FWDB=-0.00532562;FXX=0.00749981;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.553;QD=11.8003;RBI=0.0922043;REFB=-0.0324995;REVB=-0.0920504;RO=236;SAF=175;SAR=152;SRF=112;SRR=124;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0470627;STB=0.522346;TYPE=snp;VARB=0.0213856;OID=.;OPOS=22413825;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:572:397:236:164:327:233:152:175:112:124:111:122:77:87 chr15 22413940 . T C 347.1 PASS AO=177;DP=496;FAO=136;FDP=400;FR=.;FRO=264;FSAF=88;FSAR=48;FSRF=131;FSRR=133;FWDB=0.0116078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.348;QD=3.47101;RBI=0.0138126;REFB=-0.0213826;REVB=0.00748633;RO=317;SAF=110;SAR=67;SRF=160;SRR=157;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135247;STB=0.602405;TYPE=snp;VARB=0.0275531;OID=.;OPOS=22413940;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:496:400:317:264:177:136:67:110:160:157:48:88:131:133 chr15 22414262 . C T 79.54 PASS AO=53;DP=222;FAO=53;FDP=222;FR=.;FRO=169;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=110;FSRR=59;FWDB=0.0237812;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.463;QD=1.43319;RBI=0.0297674;REFB=-0.00667098;REVB=-0.017904;RO=161;SAF=32;SAR=21;SRF=103;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0478623;STB=0.538059;TYPE=snp;VARB=0.0150352;OID=.;OPOS=22414262;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:222:222:161:169:53:53:21:32:103:58:21:32:110:59 chr15 22440297 . A G 43.12 PASS AO=16;DP=71;FAO=20;FDP=75;FR=.;FRO=55;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=30;FSRR=25;FWDB=-0.0300662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.431;QD=2.29984;RBI=0.0402561;REFB=-0.0169132;REVB=0.026769;RO=55;SAF=8;SAR=8;SRF=30;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0563011;STB=0.540942;TYPE=snp;VARB=0.0443725;OID=.;OPOS=22440297;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:71:75:55:55:16:20:8:8:30:25:8:12:30:25 chr15 22709918 . C T 53.81 PASS AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0268528;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.3317;QD=23.9159;RBI=0.109238;REFB=0.0113741;REVB=0.105886;RO=2;SAF=1;SAR=6;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.422723;STB=0.749163;TYPE=snp;VARB=0.00972761;OID=.;OPOS=22709918;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:2:2:7:7:6:1:2:0:6:1:2:0 chr15 22840279 . G T 89.67 PASS AO=24;DP=58;FAO=24;FDP=58;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.00942456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.216;QD=6.18448;RBI=0.0363329;REFB=-0.00849558;REVB=-0.0350893;RO=34;SAF=12;SAR=12;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0603607;STB=0.534454;TYPE=snp;VARB=0.0115077;OID=.;OPOS=22840279;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:58:58:34:34:24:24:12:12:15:19:12:12:15:19 chr15 22873784 . C T 574.05 PASS AO=137;DP=277;FAO=137;FDP=277;FR=.;FRO=140;FSAF=53;FSAR=84;FSRF=53;FSRR=87;FWDB=0.0228614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.6859;QD=8.28959;RBI=0.0235537;REFB=-0.00612928;REVB=0.00566853;RO=139;SAF=53;SAR=84;SRF=53;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0053918;STB=0.504424;TYPE=snp;VARB=0.00476809;OID=.;OPOS=22873784;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:277:277:139:140:137:137:84:53:53:86:84:53:53:87 chr15 22926229 . G A 1695.25 PASS AO=176;DP=179;FAO=176;FDP=176;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150607;FXX=0.0167588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.0327;QD=38.5284;RBI=0.0360761;REFB=0;REVB=0.0327821;RO=0;SAF=92;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000127551;OID=.;OPOS=22926229;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:179:176:0:0:176:176:84:92:0:0:84:92:0:0 chr15 22960868 . G C 101.83 PASS AO=20;DP=42;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.0127979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.357;QD=9.69845;RBI=0.0235778;REFB=-0.0176197;REVB=0.0198022;RO=19;SAF=13;SAR=7;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0658045;STB=0.543438;TYPE=snp;VARB=0.0218503;OID=.;OPOS=22960868;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:42:42:19:20:20:22:7:13:11:8:7:15:12:8 chr15 22969231 . CG C,CA 404.35 PASS AO=18,43;DP=78;FAO=17,43;FDP=76;FR=.;FRO=16;FSAF=17,16;FSAR=0,27;FSRF=0;FSRR=16;FWDB=-0.206387,-0.0474394;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=27.0657,158.76;QD=21.2814;RBI=0.228381,0.0480902;REFB=-0.0432075,-0.0247528;REVB=-0.0977866,0.00788529;RO=15;SAF=17,16;SAR=1,27;SRF=0;SRR=15;SSEN=0,0;SSEP=0.235955,0;SSSB=0.780675,0.202761;STB=0.999394,0.614238;TYPE=del,snp;VARB=-0.124289,0.0283361;OID=.,.;OPOS=22969232,22969232;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=C,CA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:18,43:76:17,43:76:16:17,16:0,27:0:16:39:15:17,16:1,27:0:15 chr15 23049273 . GGC G 27.89 PASS AO=15;DP=57;FAO=18;FDP=54;FR=.;FRO=36;FSAF=2;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=-0.0495314;FXX=0.0181785;HRUN=3;LEN=2;MLLD=26.9224;QD=2.06614;RBI=0.0531495;REFB=-0.0889089;REVB=-0.0192747;RO=40;SAF=3;SAR=12;SRF=22;SRR=18;SSEN=0.395911;SSEP=0;SSSB=-0.437499;STB=0.864427;TYPE=del;VARB=0.197504;OID=.;OPOS=23049274;OREF=GC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:15:55:18:54:36:2:16:22:14:27:40:3:12:22:18 chr15 23052632 . T C 1429.27 PASS AO=153;DP=155;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0345887;FXX=0.0129024;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.96;QD=37.3665;RBI=0.0365561;REFB=-0.0798154;REVB=0.0118309;RO=1;SAF=66;SAR=87;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00543668;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000143194;OID=.;OPOS=23052632;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:155:153:1:0:153:153:87:66:0:1:87:66:0:0 chr15 23059394 . C T 1049.81 PASS AO=112;DP=114;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00474322;FXX=0.0423693;HRUN=3;LEN=1;MLLD=86.9766;QD=37.1615;RBI=0.00641965;REFB=-0.0267651;REVB=-0.00432594;RO=2;SAF=60;SAR=52;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0155616;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000576974;OID=.;OPOS=23059394;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:114:113:2:0:112:113:52:60:2:0:53:60:0:0 chr15 23098401 . C T 649.88 PASS AO=65;DP=67;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=58;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0777091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.381;QD=36.1042;RBI=0.0830626;REFB=-0.0506111;REVB=0.0293378;RO=1;SAF=54;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00866996;STB=0.504272;TYPE=snp;VARB=0.000873359;OID=.;OPOS=23098401;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:67:72:1:1:65:71:11:54:1:0:13:58:1:0 chr15 23098449 . C T 878.43 PASS AO=114;DP=134;FAO=114;FDP=133;FR=.;FRO=19;FSAF=84;FSAR=30;FSRF=15;FSRR=4;FWDB=-0.0279192;FXX=0.00746213;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.286;QD=26.419;RBI=0.0295207;REFB=0.00572517;REVB=0.00959124;RO=18;SAF=84;SAR=30;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136806;STB=0.509782;TYPE=snp;VARB=-0.000749792;OID=.;OPOS=23098449;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:134:133:18:19:114:114:30:84:14:4:30:84:15:4 chr15 23158339 . G C 53.28 PASS AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.0156911;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.5589;QD=8.88026;RBI=0.0437252;REFB=0.00391955;REVB=-0.0408128;RO=12;SAF=10;SAR=2;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.294028;STB=0.672746;TYPE=snp;VARB=-0.011268;OID=.;OPOS=23158339;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:24:24:12:12:12:12:2:10:7:5:2:10:7:5 chr15 23261950 . A G 47.59 PASS AO=28;DP=116;FAO=28;FDP=116;FR=.;FRO=88;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=33;FSRR=55;FWDB=-0.0462328;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.7331;QD=1.64088;RBI=0.0757644;REFB=-0.0148833;REVB=-0.0600231;RO=88;SAF=17;SAR=11;SRF=33;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.283407;STB=0.670936;TYPE=snp;VARB=0.0413414;OID=.;OPOS=23261950;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:116:116:88:88:28:28:11:17:33:55:11:17:33:55 chr15 23313161 . GC G 111.48 PASS AO=17;DP=22;FAO=21;FDP=23;FR=.;FRO=2;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.180442;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.3277;QD=19.3886;RBI=0.245385;REFB=-0.0213724;REVB=0.166297;RO=3;SAF=12;SAR=5;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115735;STB=0.516113;TYPE=del;VARB=0.0183778;OID=.;OPOS=23313162;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:17:23:21:23:2:14:7:1:1:5:3:12:5:1:2 chr15 23445448 . A G 136.29 PASS AO=14;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.083927;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.3703;QD=36.3448;RBI=0.121113;REFB=0;REVB=-0.0873194;RO=1;SAF=3;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128919;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000167019;OID=.;OPOS=23445448;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:15:1:0:14:15:11:3:1:0:11:4:0:0 chr15 23686518 . T C 21.99 PASS AO=5;DP=17;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=12;FSRR=0;FWDB=-0.0303586;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.2527;QD=4.88736;RBI=0.0303586;REFB=-0.0189083;REVB=0;RO=12;SAF=5;SAR=0;SRF=12;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.176769;OID=.;OPOS=23686518;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:17:18:12:12:5:6:0:5:12:0:0:6:12:0 chr15 23686598 . T C 147.31 PASS AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0328733;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.6526;QD=36.8284;RBI=0.0328733;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=16;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00122472;OID=.;OPOS=23686598;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:16:0:0:16:16:0:16:0:0:0:16:0:0 chr15 23686673 . G A 342.51 PASS AO=38;DP=40;FAO=38;FDP=40;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0121162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4762;QD=34.2509;RBI=0.05634;REFB=-0.139828;REVB=0.0550217;RO=2;SAF=33;SAR=5;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0275613;STB=0.514698;TYPE=snp;VARB=0.00946293;OID=.;OPOS=23686673;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:40:40:2:2:38:38:5:33:2:0:5:33:2:0 chr15 23687214 . C G 1118.54 PASS AO=121;DP=123;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00987609;FXX=0.0162588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.669;QD=36.9766;RBI=0.0167752;REFB=-0.0774322;REVB=-0.0135599;RO=0;SAF=28;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000295405;OID=.;OPOS=23687214;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:123:121:0:0:121:121:93:28:0:0:93:28:0:0 chr15 23687577 . C T 73.53 PASS AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=1;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=20;FWDB=0.0742612;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.8856;QD=7.94896;RBI=0.0814993;REFB=-0.0161938;REVB=0.0335769;RO=20;SAF=1;SAR=16;SRF=0;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.352072;STB=0.69216;TYPE=snp;VARB=0.0227996;OID=.;OPOS=23687577;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:37:37:20:20:17:17:16:1:0:20:16:1:0:20 chr15 23688944 . A G 1421.79 PASS AO=152;DP=156;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00446012;FXX=0.0256394;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.8729;QD=37.4155;RBI=0.00547372;REFB=0.00102188;REVB=0.00317317;RO=2;SAF=65;SAR=87;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0144091;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.17932e-05;OID=.;OPOS=23688944;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:156:152:2:0:152:152:87:65:2:0:87:65:0:0 chr15 23690543 . T C 104.56 PASS AO=11;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0353706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.809;QD=34.8544;RBI=0.0484328;REFB=0;REVB=-0.0330856;RO=1;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0599362;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.9642e-05;OID=.;OPOS=23690543;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:1:0:11:12:7:4:0:1:8:4:0:0 chr15 23811592 . C T 138.64 PASS AO=5;DP=55;FAO=28;FDP=54;FR=.,HEALED;FRO=25;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.135971;FXX=0.0181785;HRUN=5;LEN=1;MLLD=105.193;QD=10.2696;RBI=0.139047;REFB=-0.0355626;REVB=0.0290896;RO=10;SAF=1;SAR=4;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141542;STB=0.505491;TYPE=snp;VARB=0.0097563;OID=.;OPOS=23811592;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:32:54:10:25:5:28:4:1:3:7:12:16:14:11 chr15 23890980 . C T 10.3 PASS AO=2;DP=8;FAO=2;FDP=8;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.0382999;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.1092;QD=5.14882;RBI=0.0382999;REFB=-0.00809518;REVB=0;RO=6;SAF=2;SAR=0;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0259855;OID=.;OPOS=23890980;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:8:6:6:2:2:0:2:6:0:0:2:6:0 chr15 24921771 . G C 279.43 PASS AO=28;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0460192;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.0503;QD=38.5416;RBI=0.0485666;REFB=0;REVB=-0.0155225;RO=0;SAF=11;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31638e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00147536;OID=.;OPOS=24921771;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:28:29:0:0:28:29:17:11:0:0:18:11:0:0 chr15 24924752 . ATCCAC A 495.22 PASS AO=50;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0219432;FXX=0;HRUN=1;LEN=5;MLLD=258.211;QD=37.3752;RBI=0.0222297;REFB=0;REVB=-0.00355689;RO=0;SAF=33;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.56458e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-2.00525e-05;OID=.;OPOS=24924753;OREF=TCCAC;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:50:50:53:53:0:34:19:0:0:24:0:33:17:0:0 chr15 24928291 . C T 13.38 PASS AO=4;DP=17;FAO=4;FDP=17;FR=.;FRO=13;FSAF=0;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=13;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.1966;QD=3.14788;RBI=0.0143009;REFB=-0.0142198;REVB=-0.0143009;RO=13;SAF=0;SAR=4;SRF=0;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0400045;OID=.;OPOS=24928291;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:17:17:13:13:4:4:4:0:0:13:4:0:0:13 chr15 25307562 . A G 1160.99 PASS AO=118;DP=119;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0274421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.344;QD=38.0653;RBI=0.0278155;REFB=0;REVB=0.00454238;RO=0;SAF=31;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.89334e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.76578e-05;OID=.;OPOS=25307562;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:119:122:0:0:118:122:87:31:0:0:90:32:0:0 chr15 25330550 . T A 295.13 PASS AO=73;DP=153;FAO=73;FDP=154;FR=.;FRO=81;FSAF=20;FSAR=53;FSRF=19;FSRR=62;FWDB=-0.00881038;FXX=0.0064512;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.474;QD=7.66558;RBI=0.0188774;REFB=-0.00171339;REVB=0.0166953;RO=79;SAF=20;SAR=53;SRF=19;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0404189;STB=0.52667;TYPE=snp;VARB=0.00182849;OID=.;OPOS=25330550;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:154:79:81:73:73:53:20:19:60:53:20:19:62 chr15 25925094 . C G 44.56 PASS AO=13;DP=36;FAO=13;FDP=38;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.0061055;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=227.175;QD=4.69101;RBI=0.0155435;REFB=0.00038946;REVB=-0.0142942;RO=20;SAF=7;SAR=6;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0397392;STB=0.514264;TYPE=snp;VARB=-0.000554386;OID=.;OPOS=25925094;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:36:38:20:25:13:13:6:7:10:10:6:7:14:11 chr15 25926186 . G A 432.75 PASS AO=116;DP=260;FAO=116;FDP=260;FR=.;FRO=144;FSAF=59;FSAR=57;FSRF=62;FSRR=82;FWDB=-0.00829682;FXX=0.00383127;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.366;QD=6.65776;RBI=0.0151019;REFB=-0.0101145;REVB=0.0126186;RO=143;SAF=59;SAR=57;SRF=62;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0747172;STB=0.543177;TYPE=snp;VARB=0.011689;OID=.;OPOS=25926186;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:260:260:143:144:116:116:57:59:62:81:57:59:62:82 chr15 25961964 . A G 769.08 PASS AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.03185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.034;QD=37.9791;RBI=0.0367255;REFB=0;REVB=0.018285;RO=0;SAF=31;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.35858e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.4821e-05;OID=.;OPOS=25961964;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:81:81:0:0:81:81:50:31:0:0:50:31:0:0 chr15 26063160 . CTTA C 225.08 PASS AO=70;DP=170;FAO=83;FDP=174;FR=.;FRO=91;FSAF=40;FSAR=43;FSRF=44;FSRR=47;FWDB=0.00806388;FXX=0.0224706;HRUN=2;LEN=3;MLLD=203.515;QD=5.17428;RBI=0.00873764;REFB=0.00185387;REVB=0.00336454;RO=90;SAF=28;SAR=42;SRF=43;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.080157;STB=0.500832;TYPE=del;VARB=-0.00223216;OID=.;OPOS=26063161;OREF=TTA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:70:166:83:174:91:40:43:44:47:99:90:28:42:43:47 chr15 26327370 . A G 39.59 PASS AO=37;DP=179;FAO=36;FDP=177;FR=.;FRO=141;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=74;FSRR=67;FWDB=0.0142072;FXX=0.0111726;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.5705;QD=0.894754;RBI=0.0143457;REFB=0.0028368;REVB=-0.00198825;RO=138;SAF=22;SAR=15;SRF=75;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.06642;STB=0.547161;TYPE=snp;VARB=-0.0164577;OID=.;OPOS=26327370;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:179:177:138:141:37:36:15:22:75:63:15:21:74:67 chr15 26327375 . C T 60.68 PASS AO=41;DP=176;FAO=41;FDP=176;FR=.;FRO=135;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=71;FSRR=64;FWDB=0.0354551;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.257;QD=1.37915;RBI=0.0361774;REFB=-0.00240898;REVB=-0.00719286;RO=134;SAF=22;SAR=19;SRF=70;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0179742;STB=0.508206;TYPE=snp;VARB=0.0103779;OID=.;OPOS=26327375;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:176:176:134:135:41:41:19:22:70:64:19:22:71:64 chr15 26327463 . A G 564.23 PASS AO=93;DP=135;FAO=93;FDP=135;FR=.;FRO=42;FSAF=33;FSAR=60;FSRF=13;FSRR=29;FWDB=-0.0783985;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.601;QD=16.7179;RBI=0.0784184;REFB=0.0069627;REVB=0.00176342;RO=42;SAF=33;SAR=60;SRF=13;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.028928;STB=0.515531;TYPE=snp;VARB=-0.0033254;OID=.;OPOS=26327463;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:42:42:93:93:60:33:13:29:60:33:13:29 chr15 26327466 . C T 87.19 PASS AO=39;DP=132;FAO=39;FDP=133;FR=.;FRO=94;FSAF=12;FSAR=27;FSRF=33;FSRR=61;FWDB=0.010644;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.554;QD=2.6222;RBI=0.0337699;REFB=-0.00430933;REVB=-0.0320486;RO=93;SAF=12;SAR=27;SRF=33;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0642069;STB=0.534988;TYPE=snp;VARB=0.00875195;OID=.;OPOS=26327466;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:132:133:93:94:39:39:27:12:33:60:27:12:33:61 chr15 27182357 . T C 206.28 PASS AO=57;DP=136;FAO=58;FDP=136;FR=.;FRO=78;FSAF=13;FSAR=45;FSRF=32;FSRR=46;FWDB=0.00900501;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=210.272;QD=6.06705;RBI=0.00902115;REFB=-0.00400872;REVB=-0.000539394;RO=78;SAF=12;SAR=45;SRF=32;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254852;STB=0.631185;TYPE=snp;VARB=0.00686305;OID=.;OPOS=27182357;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:78:78:57:58:45:12:32:46:45:13:32:46 chr15 27184435 . C T 132.03 PASS AO=38;DP=94;FAO=38;FDP=94;FR=.;FRO=56;FSAF=2;FSAR=36;FSRF=4;FSRR=52;FWDB=0.0530708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.433;QD=5.61812;RBI=0.0541958;REFB=0.0131708;REVB=0.010985;RO=56;SAF=2;SAR=36;SRF=4;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0890652;STB=0.550991;TYPE=snp;VARB=-0.0195966;OID=.;OPOS=27184435;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:56:56:38:38:36:2:4:52:36:2:4:52 chr15 27184482 . C T 129.93 PASS AO=33;DP=74;FAO=33;FDP=74;FR=.;FRO=41;FSAF=4;FSAR=29;FSRF=2;FSRR=39;FWDB=0.0113902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.431;QD=7.02325;RBI=0.0152429;REFB=-0.00488727;REVB=-0.0101296;RO=41;SAF=4;SAR=29;SRF=2;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199192;STB=0.609811;TYPE=snp;VARB=0.0071313;OID=.;OPOS=27184482;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:41:41:33:33:29:4:2:39:29:4:2:39 chr15 27184517 . G A 151.44 PASS AO=31;DP=57;FAO=31;FDP=57;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=3;FSRR=23;FWDB=0.0137834;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.368;QD=10.6271;RBI=0.0157876;REFB=0.00352977;REVB=0.00769847;RO=26;SAF=12;SAR=19;SRF=3;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253479;STB=0.638705;TYPE=snp;VARB=-0.00134582;OID=.;OPOS=27184517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:26:26:31:31:19:12:3:23:19:12:3:23 chr15 27188459 . C T 102.42 PASS AO=27;DP=65;FAO=28;FDP=68;FR=.;FRO=40;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=27;FWDB=-0.0448643;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.261;QD=6.02458;RBI=0.0571372;REFB=-0.00823687;REVB=0.0353816;RO=38;SAF=12;SAR=15;SRF=11;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165502;STB=0.583276;TYPE=snp;VARB=0.0120263;OID=.;OPOS=27188459;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:68:38:40:27:28:15:12:11:27:15:13:13:27 chr15 27516740 . GAGTC G 318.36 PASS AO=32;DP=44;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00162519;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=4;MLLD=318.805;QD=37.4537;RBI=0.0361201;REFB=0;REVB=0.0360835;RO=11;SAF=12;SAR=20;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168757;STB=0.5;TYPE=del;VARB=9.43292e-05;OID=.;OPOS=27516741;OREF=AGTC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:32:43:34:34:0:13:21:0:0:15:11:12:20:8:3 chr15 27772676 . C T 2404.42 PASS AO=251;DP=251;FAO=251;FDP=251;FR=.;FRO=0;FSAF=117;FSAR=134;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149358;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.042;QD=38.3175;RBI=0.0149709;REFB=0;REVB=0.00102445;RO=0;SAF=117;SAR=134;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.41209e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.67337e-06;OID=.;OPOS=27772676;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:251:251:0:0:251:251:134:117:0:0:134:117:0:0 chr15 27997247 . G A 300.64 PASS AO=66;DP=126;FAO=66;FDP=126;FR=.;FRO=60;FSAF=42;FSAR=24;FSRF=33;FSRR=27;FWDB=-0.0166163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.9733;QD=9.5441;RBI=0.0174626;REFB=-0.016431;REVB=0.0053704;RO=60;SAF=42;SAR=24;SRF=33;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0788166;STB=0.543366;TYPE=snp;VARB=0.0145438;OID=.;OPOS=27997247;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:60:60:66:66:24:42:33:27:24:42:33:27 chr15 28096538 . A G 583.62 PASS AO=52;DP=63;FAO=62;FDP=63;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=22;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0521477;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.0085;QD=37.0551;RBI=0.0709075;REFB=0;REVB=0.0480469;RO=0;SAF=20;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.00761e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00448253;OID=.;OPOS=28096538;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:63:63:0:0:52:62:32:20:0:0:40:22:0:0 chr15 28211921 . G A 910.47 PASS AO=99;DP=101;FAO=99;FDP=101;FR=.;FRO=2;FSAF=61;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0307792;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.276;QD=36.0582;RBI=0.0403802;REFB=-0.0446371;REVB=0.026138;RO=1;SAF=61;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0123185;STB=0.502428;TYPE=snp;VARB=0.00113672;OID=.;OPOS=28211921;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:101:101:1:2:99:99:38:61:0:1:38:61:1:1 chr15 28231793 . T C 1458.91 PASS AO=151;DP=159;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112942;FXX=0.089815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.582;QD=38.3923;RBI=0.0383519;REFB=0;REVB=0.0366512;RO=0;SAF=64;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000670464;OID=.;OPOS=28231793;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:159:152:0:0:151:152:87:64:0:0:88:64:0:0 chr15 28235773 . C T 710.01 PASS AO=75;DP=76;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=52;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0215893;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.289;QD=36.8839;RBI=0.0480411;REFB=-0.0505462;REVB=0.0429167;RO=1;SAF=24;SAR=51;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0193036;STB=0.510201;TYPE=snp;VARB=0.000672198;OID=.;OPOS=28235773;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:76:77:1:1:75:76:51:24:1:0:52:24:1:0 chr15 28356557 . G GA,GAA 26.44 PASS AO=49,29;DP=176;FAO=52,0;FDP=153;FR=.;FRO=101;FSAF=16,0;FSAR=36,0;FSRF=39;FSRR=62;FWDB=-0.263238,-0.184026;FXX=0.0254761;HRUN=8,8;LEN=1,2;MLLD=5.5263,9.36113;QD=0.691364;RBI=0.349047,0.229397;REFB=-0.132286,-0.0896738;REVB=-0.229216,-0.136958;RO=82;SAF=18,7;SAR=31,22;SRF=44;SRR=38;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.188567,-0.376405;STB=0.558038,0.5;TYPE=ins,ins;VARB=0.0253863,-0.00641003;OID=.,.;OPOS=28356558,28356558;OREF=-,-;OALT=A,AA;OMAPALT=GA,GAA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:49,29:176:52,0:153:101:16,0:36,0:39:62:20:82:18,7:31,22:44:38 chr15 28362459 . G A 106.56 PASS AO=16;DP=22;FAO=16;FDP=22;FR=.;FRO=6;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.0064875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.739;QD=19.3744;RBI=0.0123659;REFB=-0.0514164;REVB=0.0105275;RO=6;SAF=11;SAR=5;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0867463;STB=0.547888;TYPE=snp;VARB=0.0116719;OID=.;OPOS=28362459;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:22:22:6:6:16:16:5:11:5:1:5:11:5:1 chr15 28414665 . T C 519.75 PASS AO=131;DP=277;FAO=131;FDP=277;FR=.;FRO=146;FSAF=70;FSAR=61;FSRF=81;FSRR=65;FWDB=-0.0102055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.7525;QD=7.5054;RBI=0.010972;REFB=-0.0224267;REVB=-0.00402881;RO=142;SAF=70;SAR=61;SRF=80;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.027624;STB=0.510841;TYPE=snp;VARB=0.0313683;OID=.;OPOS=28414665;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:277:277:142:146:131:131:61:70:80:62:61:70:81:65 chr15 28422609 . C T 293.89 PASS AO=62;DP=115;FAO=63;FDP=119;FR=.;FRO=56;FSAF=17;FSAR=46;FSRF=22;FSRR=34;FWDB=0.00546457;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.625;QD=9.87861;RBI=0.0200006;REFB=-0.00368161;REVB=0.0192396;RO=52;SAF=17;SAR=45;SRF=22;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143814;STB=0.568779;TYPE=snp;VARB=0.0031984;OID=.;OPOS=28422609;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:119:52:56:62:63:45:17:22:30:46:17:22:34 chr15 28447612 . G A 94.09 PASS AO=16;DP=25;FAO=16;FDP=25;FR=.;FRO=9;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0378563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.1369;QD=15.055;RBI=0.0378563;REFB=0.0226254;REVB=1.33877e-05;RO=9;SAF=10;SAR=6;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189362;STB=0.605927;TYPE=snp;VARB=-0.0112749;OID=.;OPOS=28447612;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:25:25:9:9:16:16:6:10:3:6:6:10:3:6 chr15 28517436 . T C 294.4 PASS AO=90;DP=225;FAO=89;FDP=222;FR=.;FRO=133;FSAF=54;FSAR=35;FSRF=81;FSRR=52;FWDB=-0.0141444;FXX=0.0263146;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.331;QD=5.30445;RBI=0.0146717;REFB=-0.0123367;REVB=-0.00389771;RO=107;SAF=55;SAR=35;SRF=65;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00374258;STB=0.501432;TYPE=snp;VARB=0.014119;OID=.;OPOS=28517436;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:225:222:107:133:90:89:35:55:65:42:35:54:81:52 chr15 28630358 . A C 17.09 PASS AO=4;DP=13;FAO=4;FDP=13;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=0.0905892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.5887;QD=5.25917;RBI=0.0915449;REFB=-0.0123943;REVB=0.0131937;RO=9;SAF=3;SAR=1;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233048;STB=0.646469;TYPE=snp;VARB=0.0295523;OID=.;OPOS=28630358;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:13:13:9:9:4:4:1:3:8:1:1:3:8:1 chr15 28632793 . G C 16.58 PASS AO=8;DP=38;FAO=8;FDP=38;FR=.;FRO=30;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=-0.113721;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.2852;QD=1.74481;RBI=0.12802;REFB=-0.0354886;REVB=0.0587944;RO=30;SAF=5;SAR=3;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.303012;STB=0.695743;TYPE=snp;VARB=0.111324;OID=.;OPOS=28632793;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:38:38:30:30:8:8:3:5:11:19:3:5:11:19 chr15 29415560 . G A 262.29 PASS AO=29;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0465163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.815;QD=33.8442;RBI=0.0712629;REFB=-0.108803;REVB=0.0539874;RO=1;SAF=16;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0344827;STB=0.51723;TYPE=snp;VARB=0.00195076;OID=.;OPOS=29415560;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:31:31:1:1:29:30:13:16:0:1:14:16:0:1 chr15 29415698 . A G 927.98 PASS AO=94;DP=96;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0316113;FXX=0.0198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.663;QD=37.4941;RBI=0.0521634;REFB=-0.0946467;REVB=0.041494;RO=0;SAF=37;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.95516e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00110435;OID=.;OPOS=29415698;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:96:99:0:0:94:99:57:37:0:0:57:42:0:0 chr15 29418520 . C T 212.23 PASS AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00195785;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.635;QD=36.9101;RBI=0.00663951;REFB=0;REVB=0.00634428;RO=0;SAF=14;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84921e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.33815e-05;OID=.;OPOS=29418520;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:24:23:0:0:23:23:9:14:0:0:9:14:0:0 chr15 29418573 . A G 73.84 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000380413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=352.766;QD=36.9199;RBI=0.000380413;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=8;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.78637e-06;OID=.;OPOS=29418573;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:0:8:0:0:0:8:0:0 chr15 29418574 . T C 73.84 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0258987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.9832;QD=36.9197;RBI=0.0258987;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=8;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00242592;OID=.;OPOS=29418574;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:0:8:0:0:0:8:0:0 chr15 29421014 . G C 123.17 PASS AO=35;DP=84;FAO=35;FDP=85;FR=.;FRO=50;FSAF=9;FSAR=26;FSRF=12;FSRR=38;FWDB=0.00594041;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.066;QD=5.79636;RBI=0.00799298;REFB=-0.00657451;REVB=-0.00534783;RO=49;SAF=9;SAR=26;SRF=12;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0166831;STB=0.513361;TYPE=snp;VARB=0.0081462;OID=.;OPOS=29421014;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:85:49:50:35:35:26:9:12:37:26:9:12:38 chr15 29544656 . T C 1074.55 PASS AO=112;DP=112;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00993739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.653;QD=38.0372;RBI=0.0543477;REFB=0;REVB=0.0534314;RO=0;SAF=56;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000111714;OID=.;OPOS=29544656;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:112:113:0:0:112:113:56:56:0:0:57:56:0:0 chr15 29992654 . T C 180.23 PASS AO=50;DP=121;FAO=50;FDP=120;FR=.;FRO=70;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=35;FSRR=35;FWDB=-0.0058574;FXX=0.00826378;HRUN=5;LEN=1;MLLD=45.5049;QD=6.00768;RBI=0.0359474;REFB=-0.0169963;REVB=-0.035467;RO=70;SAF=21;SAR=29;SRF=34;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0689964;STB=0.559298;TYPE=snp;VARB=0.0060829;OID=.;OPOS=29992654;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:120:70:70:50:50:29:21:34:36:30:20:35:35 chr15 30008856 . C A 1267.45 PASS AO=132;DP=133;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00115744;FXX=0.0222206;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.394;QD=38.4075;RBI=0.0268706;REFB=0;REVB=0.0268457;RO=0;SAF=80;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00101282;OID=.;OPOS=30008856;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:133:132:0:0:132:132:52:80:0:0:52:80:0:0 chr15 30008889 . G A 1372.47 PASS AO=149;DP=152;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0271436;FXX=0.0261421;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.0155;QD=36.8448;RBI=0.0271481;REFB=0.0242317;REVB=-0.000491956;RO=3;SAF=73;SAR=76;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00587996;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000705498;OID=.;OPOS=30008889;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:152:149:3:0:149:149:76:73:1:2:76:73:0:0 chr15 30018627 . T C 212.01 PASS AO=55;DP=125;FAO=56;FDP=126;FR=.;FRO=70;FSAF=41;FSAR=15;FSRF=39;FSRR=31;FWDB=0.0112235;FXX=0.0078734;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.03;QD=6.73057;RBI=0.0211249;REFB=-0.0077323;REVB=-0.0178967;RO=69;SAF=40;SAR=15;SRF=38;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19803;STB=0.611105;TYPE=snp;VARB=0.00764588;OID=.;OPOS=30018627;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:126:69:70:55:56:15:40:38:31:15:41:39:31 chr15 30664453 . C T 335.12 PASS AO=36;DP=39;FAO=39;FDP=41;FR=.;FRO=2;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0953817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.4674;QD=32.6947;RBI=0.135852;REFB=-0.106274;REVB=0.0967379;RO=3;SAF=14;SAR=22;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0596598;STB=0.519221;TYPE=snp;VARB=0.013575;OID=.;OPOS=30664453;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:39:41:3:2:36:39:22:14:0:3:25:14:0:2 chr15 30665280 . TCA T 23.92 PASS AO=9;DP=35;FAO=8;FDP=29;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=0.0281604;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=2;MLLD=289.349;QD=3.29911;RBI=0.0319501;REFB=-0.00541833;REVB=0.0150931;RO=25;SAF=3;SAR=6;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0176808;STB=0.533247;TYPE=del;VARB=0.0124229;OID=.;OPOS=30665281;OREF=CA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:9:34:8:29:21:2:6:6:15:23:25:3:6:8:17 chr15 30846081 . A T 32.73 PASS AO=4;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.285123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=25.8778;QD=21.8215;RBI=0.285123;REFB=-0.15643;REVB=0;RO=2;SAF=4;SAR=0;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0904854;OID=.;OPOS=30846081;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:6:6:2:1:4:5:0:4:2:0:0:5:1:0 chr15 31197564 . G A 1044.26 PASS AO=113;DP=115;FAO=113;FDP=115;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0520341;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.9591;QD=36.3221;RBI=0.0520478;REFB=-0.0660775;REVB=0.00119455;RO=2;SAF=36;SAR=77;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0121728;STB=0.506409;TYPE=snp;VARB=0.00491772;OID=.;OPOS=31197564;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:115:115:2:2:113:113:77:36:0:2:77:36:0:2 chr15 31229420 . T C 2602.24 PASS AO=268;DP=268;FAO=270;FDP=270;FR=.;FRO=0;FSAF=130;FSAR=140;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0719891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.5173;QD=38.5517;RBI=0.0818363;REFB=0;REVB=0.0389196;RO=0;SAF=129;SAR=139;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000240424;OID=.;OPOS=31229420;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:268:270:0:0:268:270:139:129:0:0:140:130:0:0 chr15 31231190 . T C 576.85 PASS AO=63;DP=68;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.028089;FXX=0.0596926;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.339;QD=36.6256;RBI=0.0316605;REFB=0.0290572;REVB=-0.0146082;RO=1;SAF=17;SAR=46;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0269626;STB=0.514281;TYPE=snp;VARB=-0.00173778;OID=.;OPOS=31231190;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:68:63:1:1:63:62:46:17:1:0:45:17:1:0 chr15 31267147 . C T 1285.61 PASS AO=145;DP=152;FAO=146;FDP=153;FR=.;FRO=7;FSAF=77;FSAR=69;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=-0.00516431;FXX=0.00649309;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.163;QD=33.6108;RBI=0.00906748;REFB=-0.0257353;REVB=0.00745312;RO=7;SAF=77;SAR=68;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0286849;STB=0.515155;TYPE=snp;VARB=0.000777805;OID=.;OPOS=31267147;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:152:153:7:7:145:146:68:77:6:1:69:77:6:1 chr15 31330280 . A G 605.7 PASS AO=152;DP=329;FAO=152;FDP=322;FR=.;FRO=170;FSAF=94;FSAR=58;FSRF=80;FSRR=90;FWDB=0.0190995;FXX=0.0359271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.459;QD=7.52427;RBI=0.0213954;REFB=-0.0141619;REVB=-0.00964213;RO=159;SAF=94;SAR=58;SRF=74;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145037;STB=0.579559;TYPE=snp;VARB=0.0161995;OID=.;OPOS=31330280;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:329:322:159:170:152:152:58:94:74:85:58:94:80:90 chr15 31342744 . C T 135.67 PASS AO=52;DP=144;FAO=46;FDP=128;FR=.;FRO=82;FSAF=7;FSAR=39;FSRF=15;FSRR=67;FWDB=0.0198991;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.6152;QD=4.23952;RBI=0.0314846;REFB=-0.0154165;REVB=-0.0243989;RO=90;SAF=7;SAR=45;SRF=15;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.071417;STB=0.536233;TYPE=snp;VARB=0.0209308;OID=.;OPOS=31342744;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:128:90:82:52:46:45:7:15:75:39:7:15:67 chr15 31362352 . C T 222.64 PASS AO=36;DP=74;FAO=48;FDP=85;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=33;FSRF=14;FSRR=23;FWDB=0.0300543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.365;QD=10.4771;RBI=0.0411958;REFB=-0.0172918;REVB=0.028175;RO=34;SAF=9;SAR=27;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169644;STB=0.53254;TYPE=snp;VARB=0.0148732;OID=.;OPOS=31362352;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:85:34:37:36:48:27:9:14:20:33:15:14:23 chr15 31369123 . A G 567.75 PASS AO=130;DP=255;FAO=130;FDP=254;FR=.;FRO=124;FSAF=64;FSAR=66;FSRF=59;FSRR=65;FWDB=0.0320186;FXX=0.00392141;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.3384;QD=8.94096;RBI=0.0525598;REFB=-0.0154677;REVB=0.0416814;RO=124;SAF=64;SAR=66;SRF=59;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0147198;STB=0.508058;TYPE=snp;VARB=0.0220615;OID=.;OPOS=31369123;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:255:254:124:124:130:130:66:64:59:65:66:64:59:65 chr15 31793930 . A G 325.82 PASS AO=64;DP=111;FAO=64;FDP=111;FR=.;FRO=47;FSAF=51;FSAR=13;FSRF=34;FSRR=13;FWDB=0.00102718;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.292;QD=11.7413;RBI=0.0180047;REFB=-0.00730956;REVB=0.0179754;RO=47;SAF=51;SAR=13;SRF=34;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.082949;STB=0.54544;TYPE=snp;VARB=0.0047113;OID=.;OPOS=31793930;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:47:47:64:64:13:51:34:13:13:51:34:13 chr15 31942001 . G A 94.77 PASS AO=22;DP=42;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.00877184;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=123.011;QD=7.73637;RBI=0.120865;REFB=-0.0288986;REVB=-0.120546;RO=20;SAF=14;SAR=8;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.032955;STB=0.579067;TYPE=snp;VARB=0.0236807;OID=.;OPOS=31942001;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:42:49:20:26:22:23:8:14:12:8:9:14:12:14 chr15 32450704 . G A 70.09 PASS AO=23;DP=65;FAO=23;FDP=65;FR=.;FRO=42;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=-0.00926383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.5695;QD=4.31301;RBI=0.0159912;REFB=-0.0276879;REVB=-0.0130346;RO=42;SAF=16;SAR=7;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177361;STB=0.60368;TYPE=snp;VARB=0.0438239;OID=.;OPOS=32450704;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:65:65:42:42:23:23:7:16:23:19:7:16:23:19 chr15 33010483 . T C 23.02 PASS AO=7;DP=24;FAO=7;FDP=24;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=14;FSRR=3;FWDB=0.0167696;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.88;QD=3.83666;RBI=0.024198;REFB=-0.00822715;REVB=-0.0174449;RO=17;SAF=6;SAR=1;SRF=14;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.070928;STB=0.545316;TYPE=snp;VARB=0.0174205;OID=.;OPOS=33010483;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:24:24:17:17:7:7:1:6:14:3:1:6:14:3 chr15 33023670 . C T 285.22 PASS AO=64;DP=129;FAO=65;FDP=129;FR=.;FRO=64;FSAF=31;FSAR=34;FSRF=30;FSRR=34;FWDB=0.0348935;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.533;QD=8.844;RBI=0.0601636;REFB=0.0131283;REVB=0.0490112;RO=65;SAF=30;SAR=34;SRF=31;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00748322;STB=0.504064;TYPE=snp;VARB=-0.0157273;OID=.;OPOS=33023670;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:65:64:64:65:34:30:31:34:34:31:30:34 chr15 33023685 . A C 316.78 PASS AO=70;DP=134;FAO=70;FDP=134;FR=.;FRO=64;FSAF=35;FSAR=35;FSRF=35;FSRR=29;FWDB=0.00159768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.558;QD=9.4562;RBI=0.00315126;REFB=-0.00922621;REVB=-0.00271622;RO=64;SAF=35;SAR=35;SRF=35;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0407625;STB=0.522382;TYPE=snp;VARB=0.0124876;OID=.;OPOS=33023685;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:64:64:70:70:35:35:35:29:35:35:35:29 chr15 33023951 . T C 204.24 PASS AO=60;DP=150;FAO=60;FDP=148;FR=.;FRO=88;FSAF=24;FSAR=36;FSRF=31;FSRR=57;FWDB=-0.00107431;FXX=0.0133324;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.5489;QD=5.51988;RBI=0.0255615;REFB=-0.0144371;REVB=-0.0255389;RO=88;SAF=24;SAR=36;SRF=31;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0532383;STB=0.529905;TYPE=snp;VARB=0.0215299;OID=.;OPOS=33023951;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:148:88:88:60:60:36:24:31:57:36:24:31:57 chr15 33023985 . A G 149.77 PASS AO=44;DP=104;FAO=43;FDP=104;FR=.;FRO=61;FSAF=15;FSAR=28;FSRF=17;FSRR=44;FWDB=0.0240332;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.1094;QD=5.76055;RBI=0.0569903;REFB=0.00626307;REVB=0.0516749;RO=51;SAF=15;SAR=29;SRF=16;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0294226;STB=0.546538;TYPE=snp;VARB=-0.00989133;OID=.;OPOS=33023985;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:51:61:44:43:29:15:16:35:28:15:17:44 chr15 33024394 . C T 357.05 PASS AO=98;DP=223;FAO=98;FDP=224;FR=.;FRO=126;FSAF=61;FSAR=37;FSRF=60;FSRR=66;FWDB=0.0190622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.4437;QD=6.37583;RBI=0.0496332;REFB=0.00473133;REVB=0.0458267;RO=123;SAF=61;SAR=37;SRF=59;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145937;STB=0.583905;TYPE=snp;VARB=-0.00735292;OID=.;OPOS=33024394;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:224:123:126:98:98:37:61:59:64:37:61:60:66 chr15 33024567 . C T 269.82 PASS AO=52;DP=92;FAO=53;FDP=92;FR=.;FRO=39;FSAF=42;FSAR=11;FSRF=25;FSRR=14;FWDB=-0.0342479;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0616;QD=11.7315;RBI=0.0451187;REFB=-0.00609032;REVB=0.029373;RO=40;SAF=41;SAR=11;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148165;STB=0.587541;TYPE=snp;VARB=0.00427167;OID=.;OPOS=33024567;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:40:39:52:53:11:41:26:14:11:42:25:14 chr15 33024808 . G A 660.92 PASS AO=154;DP=303;FAO=154;FDP=304;FR=.;FRO=150;FSAF=53;FSAR=101;FSRF=71;FSRR=79;FWDB=0.0167329;FXX=0.00327858;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.1705;QD=8.69635;RBI=0.04367;REFB=-0.0144278;REVB=0.040337;RO=149;SAF=53;SAR=101;SRF=71;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12576;STB=0.567612;TYPE=snp;VARB=0.0125459;OID=.;OPOS=33024808;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:303:304:149:150:154:154:101:53:71:78:101:53:71:79 chr15 33025627 . C T 214.83 PASS AO=54;DP=135;FAO=57;FDP=131;FR=.,HEALED;FRO=74;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=36;FSRR=38;FWDB=0.00935442;FXX=0.0223864;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.468;QD=6.55971;RBI=0.0259115;REFB=-0.0109858;REVB=-0.024164;RO=48;SAF=28;SAR=26;SRF=36;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200816;STB=0.512583;TYPE=snp;VARB=0.0148047;OID=.;OPOS=33025627;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:131:48:74:54:57:26:28:36:12:28:29:36:38 chr15 33025979 . C T 137.25 PASS AO=33;DP=71;FAO=33;FDP=71;FR=.;FRO=38;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=0.0084237;FXX=0.013887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.8508;QD=7.73216;RBI=0.0235721;REFB=-0.00476864;REVB=0.0220155;RO=38;SAF=13;SAR=20;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176944;STB=0.599255;TYPE=snp;VARB=0.00608431;OID=.;OPOS=33025979;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:38:38:33:33:20:13:22:16:20:13:22:16 chr15 33026667 . A T 133.38 PASS AO=45;DP=121;FAO=45;FDP=124;FR=.;FRO=79;FSAF=29;FSAR=16;FSRF=46;FSRR=33;FWDB=-0.0275495;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.1629;QD=4.30256;RBI=0.0362924;REFB=-0.0272479;REVB=0.0236255;RO=76;SAF=29;SAR=16;SRF=45;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0615123;STB=0.54214;TYPE=snp;VARB=0.0485676;OID=.;OPOS=33026667;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:124:76:79:45:45:16:29:45:31:16:29:46:33 chr15 33066582 . T A 95 PASS AO=26;DP=66;FAO=27;FDP=68;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=27;FWDB=-0.0146077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.862;QD=5.58822;RBI=0.0152888;REFB=0.00290287;REVB=-0.00451274;RO=40;SAF=14;SAR=12;SRF=13;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223928;STB=0.605985;TYPE=snp;VARB=-0.0131198;OID=.;OPOS=33066582;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:66:68:40:41:26:27:12:14:13:27:13:14:14:27 chr15 33091079 . A G 212.73 PASS AO=56;DP=125;FAO=56;FDP=127;FR=.;FRO=71;FSAF=35;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=48;FWDB=-0.0279862;FXX=0.0155027;HRUN=3;LEN=1;MLLD=92.7316;QD=6.70025;RBI=0.028677;REFB=0.00221579;REVB=-0.00625607;RO=69;SAF=35;SAR=21;SRF=22;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.297245;STB=0.664683;TYPE=snp;VARB=-0.00416451;OID=.;OPOS=33091079;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:127:69:71:56:56:21:35:22:47:21:35:23:48 chr15 33191023 . A G 160.3 PASS AO=51;DP=137;FAO=52;FDP=137;FR=.;FRO=85;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=41;FSRR=44;FWDB=0.00242994;FXX=0.0143875;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.913;QD=4.68025;RBI=0.00470761;REFB=-0.00641763;REVB=0.004032;RO=84;SAF=24;SAR=27;SRF=40;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00615385;STB=0.51296;TYPE=snp;VARB=0.00944174;OID=.;OPOS=33191023;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:84:85:51:52:27:24:40:44:28:24:41:44 chr15 33357262 . A G 1535.73 PASS AO=158;DP=161;FAO=165;FDP=165;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0313816;FXX=0.0119753;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.544;QD=37.2297;RBI=0.0331693;REFB=-0.00794131;REVB=0.0107423;RO=2;SAF=74;SAR=84;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000755591;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.90753e-05;OID=.;OPOS=33357262;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:161:165:2:0:158:165:84:74:1:1:85:80:0:0 chr15 33359297 . T C 14.67 PASS AO=10;DP=50;FAO=10;FDP=53;FR=.;FRO=43;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=-0.050255;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=30.0484;QD=1.10723;RBI=0.0815482;REFB=-0.0186446;REVB=-0.0642226;RO=40;SAF=2;SAR=8;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.413665;STB=0.78067;TYPE=snp;VARB=0.0130927;OID=.;OPOS=33359297;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:50:53:40:43:10:10:8:2:21:19:8:2:23:20 chr15 33359370 . C T 246.78 PASS AO=70;DP=165;FAO=70;FDP=166;FR=.;FRO=96;FSAF=13;FSAR=57;FSRF=33;FSRR=63;FWDB=-0.0300685;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=267.083;QD=5.94661;RBI=0.0308249;REFB=0.0064579;REVB=0.00678662;RO=95;SAF=13;SAR=57;SRF=32;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21523;STB=0.626932;TYPE=snp;VARB=-0.00855919;OID=.;OPOS=33359370;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:166:95:96:70:70:57:13:32:63:57:13:33:63 chr15 33359574 . C A 1054.62 PASS AO=110;DP=112;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.113897;FXX=0.00877116;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1451;QD=37.3318;RBI=0.125661;REFB=-0.051407;REVB=0.0530862;RO=2;SAF=54;SAR=56;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000308213;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00199848;OID=.;OPOS=33359574;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:112:113:2:0:110:113:56:54:1:1:56:57:0:0 chr15 33381000 . A T 302.75 PASS AO=87;DP=211;FAO=88;FDP=212;FR=.;FRO=124;FSAF=64;FSAR=24;FSRF=58;FSRR=66;FWDB=-0.00645559;FXX=0.00469462;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.044;QD=5.71219;RBI=0.0271355;REFB=0.00247823;REVB=0.0263565;RO=122;SAF=62;SAR=25;SRF=58;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.263041;STB=0.662945;TYPE=snp;VARB=-0.00272529;OID=.;OPOS=33381000;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:212:122:124:87:88:25:62:58:64:24:64:58:66 chr15 33446258 . G A 279.97 PASS AO=64;DP=127;FAO=64;FDP=127;FR=.;FRO=63;FSAF=2;FSAR=62;FSRF=7;FSRR=56;FWDB=0.0267613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.7944;QD=8.81797;RBI=0.026781;REFB=-0.00653411;REVB=-0.00102752;RO=63;SAF=2;SAR=62;SRF=7;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.356127;STB=0.702685;TYPE=snp;VARB=0.00757528;OID=.;OPOS=33446258;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:63:63:64:64:62:2:7:56:62:2:7:56 chr15 33446311 . G C 272.68 PASS AO=60;DP=115;FAO=60;FDP=115;FR=.;FRO=55;FSAF=7;FSAR=53;FSRF=6;FSRR=49;FWDB=0.0163539;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=199.553;QD=9.48446;RBI=0.0163576;REFB=-0.0187215;REVB=0.000343802;RO=55;SAF=7;SAR=53;SRF=6;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0162095;STB=0.508907;TYPE=snp;VARB=0.0148897;OID=.;OPOS=33446311;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:55:55:60:60:53:7:6:49:53:7:6:49 chr15 33446879 . G T 143.04 PASS AO=50;DP=142;FAO=50;FDP=143;FR=.;FRO=93;FSAF=19;FSAR=31;FSRF=47;FSRR=46;FWDB=-0.0414464;FXX=0.00694396;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.8256;QD=4.00118;RBI=0.0416387;REFB=-0.0179494;REVB=0.00399739;RO=92;SAF=19;SAR=31;SRF=46;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138328;STB=0.583038;TYPE=snp;VARB=0.0241242;OID=.;OPOS=33446879;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:143:92:93:50:50:31:19:46:46:31:19:47:46 chr15 33446947 . A C 220 PASS AO=60;DP=144;FAO=62;FDP=146;FR=.;FRO=84;FSAF=12;FSAR=50;FSRF=19;FSRR=65;FWDB=-0.0566861;FXX=0.0135126;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.0605;QD=6.02744;RBI=0.081121;REFB=-0.029946;REVB=0.0580285;RO=78;SAF=12;SAR=48;SRF=18;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0469231;STB=0.529001;TYPE=snp;VARB=0.0474915;OID=.;OPOS=33446947;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:146:78:84:60:62:48:12:18:60:50:12:19:65 chr15 33840414 . A G 908.86 PASS AO=119;DP=131;FAO=115;FDP=131;FR=.;FRO=16;FSAF=54;FSAR=61;FSRF=15;FSRR=1;FWDB=0.0444198;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.4757;QD=27.7514;RBI=0.0762414;REFB=-0.0314288;REVB=-0.0619648;RO=11;SAF=58;SAR=61;SRF=11;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0820051;STB=0.556957;TYPE=snp;VARB=0.0249882;OID=.;OPOS=33840414;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:131:131:11:16:119:115:61:58:11:0:61:54:15:1 chr15 33842400 . A T 43.39 PASS AO=16;DP=55;FAO=17;FDP=55;FR=.;FRO=38;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=-0.00169775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3224;QD=3.15536;RBI=0.0178232;REFB=-0.0267744;REVB=0.0177422;RO=39;SAF=7;SAR=9;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00191467;STB=0.525134;TYPE=snp;VARB=0.0749897;OID=.;OPOS=33842400;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:55:55:39:38:16:17:9:7:17:22:10:7:17:21 chr15 33872177 . C T 940.78 PASS AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.758;QD=38.399;RBI=0.0203277;REFB=0;REVB=0.00752851;RO=0;SAF=68;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.80941e-05;OID=.;OPOS=33872177;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:98:98:0:0:98:98:30:68:0:0:30:68:0:0 chr15 33905410 . A G 370.9 PASS AO=62;DP=92;FAO=62;FDP=92;FR=.;FRO=30;FSAF=22;FSAR=40;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.0243053;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.0494;QD=16.1262;RBI=0.094595;REFB=0.0138975;REVB=-0.0914192;RO=30;SAF=22;SAR=40;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133545;STB=0.572243;TYPE=snp;VARB=-0.0110428;OID=.;OPOS=33905410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:92:92:30:30:62:62:40:22:17:13:40:22:17:13 chr15 33954652 . C T 1141.13 PASS AO=123;DP=125;FAO=123;FDP=125;FR=.;FRO=2;FSAF=69;FSAR=54;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0569999;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.513;QD=36.5163;RBI=0.0975213;REFB=-0.0883307;REVB=0.0791291;RO=0;SAF=69;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507142;TYPE=snp;VARB=0.000727207;OID=.;OPOS=33954652;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:125:125:0:2:123:123:54:69:0:0:54:69:2:0 chr15 34015013 . G A 52.5 PASS AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.0129213;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.8661;QD=7.77798;RBI=0.0167885;REFB=-0.0399198;REVB=0.0107189;RO=14;SAF=6;SAR=6;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13274;STB=0.555464;TYPE=snp;VARB=0.0446375;OID=.;OPOS=34015013;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:26:27:14:15:12:12:6:6:5:9:6:6:6:9 chr15 34016274 . G A 236.29 PASS AO=56;DP=115;FAO=56;FDP=115;FR=.;FRO=59;FSAF=20;FSAR=36;FSRF=10;FSRR=49;FWDB=-0.0105357;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=225.361;QD=8.21867;RBI=0.0193393;REFB=0.00252001;REVB=0.0162175;RO=59;SAF=20;SAR=36;SRF=10;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203419;STB=0.611475;TYPE=snp;VARB=-0.00248481;OID=.;OPOS=34016274;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:59:59:56:56:36:20:10:49:36:20:10:49 chr15 34094101 . T C 339.19 PASS AO=92;DP=212;FAO=93;FDP=213;FR=.;FRO=120;FSAF=53;FSAR=40;FSRF=56;FSRR=64;FWDB=0.0382733;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.8285;QD=6.36982;RBI=0.0525771;REFB=-0.0231823;REVB=0.0360487;RO=118;SAF=52;SAR=40;SRF=56;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0918646;STB=0.558334;TYPE=snp;VARB=0.0299142;OID=.;OPOS=34094101;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:213:118:120:92:93:40:52:56:62:40:53:56:64 chr15 34113010 . C T 217.96 PASS AO=54;DP=112;FAO=53;FDP=112;FR=.;FRO=59;FSAF=21;FSAR=32;FSRF=17;FSRR=42;FWDB=0.0145344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.5728;QD=7.78416;RBI=0.0158848;REFB=-0.00141425;REVB=0.00640935;RO=58;SAF=21;SAR=33;SRF=17;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0966347;STB=0.560989;TYPE=snp;VARB=0.00172361;OID=.;OPOS=34113010;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:58:59:54:53:33:21:17:41:32:21:17:42 chr15 34113536 . A G 1429.79 PASS AO=148;DP=148;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0157324;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.6355;QD=38.3837;RBI=0.0258398;REFB=0;REVB=0.0204985;RO=0;SAF=74;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000278044;OID=.;OPOS=34113536;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:148:149:0:0:148:149:74:74:0:0:75:74:0:0 chr15 34119443 . C T 169.97 PASS AO=40;DP=83;FAO=40;FDP=83;FR=.;FRO=43;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=4;FSRR=39;FWDB=0.0279147;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.96;QD=8.19137;RBI=0.0284188;REFB=-0.0237614;REVB=-0.00532875;RO=43;SAF=14;SAR=26;SRF=4;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.293266;STB=0.660312;TYPE=snp;VARB=0.0176713;OID=.;OPOS=34119443;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:43:43:40:40:26:14:4:39:26:14:4:39 chr15 34158266 . A G 2707.47 PASS AO=285;DP=289;FAO=285;FDP=285;FR=.;FRO=0;FSAF=163;FSAR=122;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00213994;FXX=0.0138404;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.6355;QD=37.9996;RBI=0.00214405;REFB=-0.013606;REVB=0.000132665;RO=1;SAF=163;SAR=122;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00291675;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000104425;OID=.;OPOS=34158266;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:289:285:1:0:285:285:122:163:1:0:122:163:0:0 chr15 34356988 . G A 1767.56 PASS AO=180;DP=181;FAO=185;FDP=185;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00253619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.959;QD=38.2176;RBI=0.0208161;REFB=0;REVB=0.020661;RO=0;SAF=104;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.33008e-05;OID=.;OPOS=34356988;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:181:185:0:0:180:185:76:104:0:0:81:104:0:0 chr15 34357259 . T A 1190.88 PASS AO=136;DP=145;FAO=137;FDP=145;FR=.;FRO=8;FSAF=45;FSAR=92;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0131086;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=228.545;QD=32.8517;RBI=0.0186582;REFB=-0.0883419;REVB=-0.0132775;RO=6;SAF=45;SAR=91;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0300747;STB=0.518307;TYPE=snp;VARB=0.000451909;OID=.;OPOS=34357259;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:145:145:6:8:136:137:91:45:4:2:92:45:5:3 chr15 34434041 . AT A 121.65 PASS AO=56;DP=125;FAO=65;FDP=121;FR=.;FRO=56;FSAF=39;FSAR=26;FSRF=36;FSRR=20;FWDB=-0.0321832;FXX=0.0162588;HRUN=7;LEN=1;MLLD=8.72144;QD=4.02161;RBI=0.149656;REFB=0.000887728;REVB=-0.146155;RO=50;SAF=32;SAR=24;SRF=32;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0606525;STB=0.520827;TYPE=del;VARB=0.0215927;OID=.;OPOS=34434042;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:56:122:65:121:56:39:26:36:20:71:50:32:24:32:18 chr15 34517371 . T C 264.49 PASS AO=60;DP=119;FAO=60;FDP=119;FR=.;FRO=59;FSAF=23;FSAR=37;FSRF=25;FSRR=34;FWDB=-0.0150675;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.1314;QD=8.89025;RBI=0.0155663;REFB=-0.00639868;REVB=-0.00390872;RO=59;SAF=23;SAR=37;SRF=25;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.037977;STB=0.520967;TYPE=snp;VARB=0.00543791;OID=.;OPOS=34517371;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:59:59:60:60:37:23:25:34:37:23:25:34 chr15 34517929 . T C 540.72 PASS AO=153;DP=357;FAO=153;FDP=355;FR=.;FRO=202;FSAF=60;FSAR=93;FSRF=95;FSRR=107;FWDB=-0.00335503;FXX=0.00560208;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.161;QD=6.09265;RBI=0.0115279;REFB=-0.00563981;REVB=0.0110288;RO=199;SAF=60;SAR=93;SRF=95;SRR=104;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0890115;STB=0.545707;TYPE=snp;VARB=0.00590581;OID=.;OPOS=34517929;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:357:355:199:202:153:153:93:60:95:104:93:60:95:107 chr15 34517995 . T G 562.14 PASS AO=122;DP=228;FAO=122;FDP=228;FR=.;FRO=106;FSAF=51;FSAR=71;FSRF=37;FSRR=69;FWDB=0.0110424;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=190.16;QD=9.86214;RBI=0.0146616;REFB=-0.0222915;REVB=-0.00964502;RO=106;SAF=51;SAR=71;SRF=37;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0611101;STB=0.533308;TYPE=snp;VARB=0.0185732;OID=.;OPOS=34517995;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:228:228:106:106:122:122:71:51:37:69:71:51:37:69 chr15 34522935 . GAGAC G 291.85 PASS AO=88;DP=239;FAO=88;FDP=220;FR=.;FRO=132;FSAF=43;FSAR=45;FSRF=65;FSRR=67;FWDB=-0.00869108;FXX=0.047617;HRUN=1;LEN=4;MLLD=243.117;QD=5.30642;RBI=0.0186374;REFB=-0.00467845;REVB=-0.0164869;RO=115;SAF=43;SAR=45;SRF=57;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00713679;STB=0.502273;TYPE=del;VARB=0.00698439;OID=.;OPOS=34522936;OREF=AGAC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:88:213:88:220:132:43:45:65:67:99:115:43:45:57:58 chr15 34522985 . C G 2268.71 PASS AO=239;DP=242;FAO=239;FDP=239;FR=.;FRO=0;FSAF=129;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0422311;FXX=0.0123962;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.0947;QD=37.97;RBI=0.0793846;REFB=-0.0697206;REVB=0.0672194;RO=1;SAF=129;SAR=110;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00431309;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000555566;OID=.;OPOS=34522985;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:242:239:1:0:239:239:110:129:0:1:110:129:0:0 chr15 34523042 . C CAG 167.19 PASS AO=42;DP=166;FAO=59;FDP=160;FR=.;FRO=101;FSAF=23;FSAR=36;FSRF=49;FSRR=52;FWDB=0.0131987;FXX=0.0419137;HRUN=0;LEN=2;MLLD=103.565;QD=4.17985;RBI=0.048989;REFB=-0.00457292;REVB=0.0471775;RO=82;SAF=20;SAR=22;SRF=48;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124825;STB=0.561504;TYPE=ins;VARB=0.0398542;OID=.;OPOS=34523043;OREF=-;OALT=AG;OMAPALT=CAG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:42:166:59:160:101:23:36:49:52:99:82:20:22:48:34 chr15 34524995 . G T 390.78 PASS AO=97;DP=213;FAO=99;FDP=212;FR=.;FRO=113;FSAF=47;FSAR=52;FSRF=34;FSRR=79;FWDB=-0.0332084;FXX=0.0139528;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.182;QD=7.37327;RBI=0.041914;REFB=-0.00391661;REVB=-0.0255731;RO=108;SAF=47;SAR=50;SRF=30;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199801;STB=0.593771;TYPE=snp;VARB=0.00415032;OID=.;OPOS=34524995;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:213:212:108:113:97:99:50:47:30:78:52:47:34:79 chr15 34542872 . C G 166.67 PASS AO=48;DP=122;FAO=49;FDP=123;FR=.;FRO=74;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=36;FSRR=38;FWDB=0.00869047;FXX=0.0238076;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.1187;QD=5.42022;RBI=0.00900694;REFB=-0.0278805;REVB=0.00236658;RO=74;SAF=31;SAR=17;SRF=36;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17533;STB=0.551381;TYPE=snp;VARB=0.0426424;OID=.;OPOS=34542872;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:123:74:74:48:49:17:31:36:38:21:28:36:38 chr15 34544468 . C T 280.96 PASS AO=76;DP=181;FAO=79;FDP=185;FR=.;FRO=106;FSAF=45;FSAR=34;FSRF=58;FSRR=48;FWDB=-0.0307584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.9045;QD=6.07479;RBI=0.0348557;REFB=-0.00134734;REVB=0.0163963;RO=105;SAF=43;SAR=33;SRF=57;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0241024;STB=0.513067;TYPE=snp;VARB=0.00142764;OID=.;OPOS=34544468;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:185:105:106:76:79:33:43:57:48:34:45:58:48 chr15 34551082 . G A 439.97 PASS AO=105;DP=221;FAO=108;FDP=224;FR=.;FRO=116;FSAF=41;FSAR=67;FSRF=70;FSRR=46;FWDB=0.00942088;FXX=0.00444425;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.784;QD=7.85654;RBI=0.0168996;REFB=-0.00634497;REVB=-0.01403;RO=116;SAF=41;SAR=64;SRF=70;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202426;STB=0.616134;TYPE=snp;VARB=0.00838343;OID=.;OPOS=34551082;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:224:116:116:105:108:64:41:70:46:67:41:70:46 chr15 34635200 . C T 267.12 PASS AO=83;DP=209;FAO=83;FDP=208;FR=.;FRO=125;FSAF=36;FSAR=47;FSRF=42;FSRR=83;FWDB=0.0170887;FXX=0.00478446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.2697;QD=5.13695;RBI=0.0900326;REFB=0.0134725;REVB=0.088396;RO=124;SAF=36;SAR=47;SRF=41;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114231;STB=0.560733;TYPE=snp;VARB=-0.0142787;OID=.;OPOS=34635200;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:208:124:125:83:83:47:36:41:83:47:36:42:83 chr15 34635863 . G C 374.06 PASS AO=112;DP=274;FAO=112;FDP=275;FR=.;FRO=163;FSAF=48;FSAR=64;FSRF=72;FSRR=91;FWDB=-0.0247659;FXX=0.0143364;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.7621;QD=5.44082;RBI=0.0258752;REFB=-0.0112843;REVB=-0.00749522;RO=157;SAF=48;SAR=64;SRF=72;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0318714;STB=0.507935;TYPE=snp;VARB=0.0128992;OID=.;OPOS=34635863;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:274:275:157:163:112:112:64:48:72:85:64:48:72:91 chr15 34638198 . A G 238.89 PASS AO=72;DP=183;FAO=74;FDP=185;FR=.;FRO=111;FSAF=30;FSAR=44;FSRF=39;FSRR=72;FWDB=0.00483453;FXX=0.00537606;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.013;QD=5.16517;RBI=0.0117196;REFB=-0.00763682;REVB=-0.010676;RO=111;SAF=30;SAR=42;SRF=39;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0734855;STB=0.534061;TYPE=snp;VARB=0.0105923;OID=.;OPOS=34638198;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:185:111:111:72:74:42:30:39:72:44:30:39:72 chr15 34640218 . C T 1502.37 PASS AO=168;DP=176;FAO=169;FDP=175;FR=.;FRO=6;FSAF=40;FSAR=129;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.0180478;FXX=0.0056815;HRUN=4;LEN=1;MLLD=129.407;QD=34.3399;RBI=0.0204333;REFB=-0.11658;REVB=0.00958112;RO=2;SAF=40;SAR=128;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00737821;STB=0.511362;TYPE=snp;VARB=0.00067163;OID=.;OPOS=34640218;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:176:175:2:6:168:169:128:40:0:2:129:40:0:6 chr15 34640378 . T C 513.88 PASS AO=52;DP=60;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0202956;FXX=0.116647;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.657;QD=38.7837;RBI=0.0205711;REFB=0;REVB=-0.00335541;RO=0;SAF=17;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.31071e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00049574;OID=.;OPOS=34640378;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:60:53:0:0:52:53:35:17:0:0:36:17:0:0 chr15 34673722 . C T 138.79 PASS AO=26;DP=44;FAO=26;FDP=44;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.015655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.171;QD=12.6174;RBI=0.0156688;REFB=-0.0319647;REVB=-0.00065738;RO=18;SAF=12;SAR=14;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0962419;STB=0.553151;TYPE=snp;VARB=0.0174199;OID=.;OPOS=34673722;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:44:44:18:18:26:26:14:12:6:12:14:12:6:12 chr15 35045312 . T A 82.58 PASS AO=23;DP=58;FAO=23;FDP=58;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.0202082;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.387;QD=5.69542;RBI=0.0217749;REFB=-0.0175455;REVB=0.00810998;RO=34;SAF=9;SAR=14;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145083;STB=0.575276;TYPE=snp;VARB=0.0189691;OID=.;OPOS=35045312;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:58:58:34:35:23:23:14:9:18:16:14:9:18:17 chr15 35080931 . T C 1560.59 PASS AO=157;DP=159;FAO=164;FDP=164;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00144851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.756;QD=38.0633;RBI=0.0151831;REFB=0;REVB=0.0151139;RO=0;SAF=90;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.49904e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.35931e-05;OID=.;OPOS=35080931;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:159:164:0:0:157:164:67:90:0:0:71:93:0:0 chr15 35082225 . C T 334.81 PASS AO=76;DP=150;FAO=76;FDP=150;FR=.;FRO=74;FSAF=35;FSAR=41;FSRF=38;FSRR=36;FWDB=-0.0134703;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.143;QD=8.92831;RBI=0.0225786;REFB=-0.00448505;REVB=0.0181202;RO=74;SAF=35;SAR=41;SRF=38;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0476023;STB=0.526189;TYPE=snp;VARB=0.00397756;OID=.;OPOS=35082225;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:150:74:74:76:76:41:35:38:36:41:35:38:36 chr15 35149008 . C T 275.64 PASS AO=72;DP=181;FAO=76;FDP=177;FR=.;FRO=101;FSAF=39;FSAR=37;FSRF=10;FSRR=91;FWDB=0.000301804;FXX=0.0166657;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.561;QD=6.22912;RBI=0.024854;REFB=0.00358741;REVB=0.0248521;RO=0;SAF=37;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.73353;TYPE=snp;VARB=-0.00428984;OID=.;OPOS=35149008;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:177:0:101:72:76:35:37:0:0:37:39:10:91 chr15 35230934 . A ATAGT 635.27 PASS AO=76;DP=95;FAO=76;FDP=83;FR=.;FRO=7;FSAF=30;FSAR=46;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.00510598;FXX=0.117009;HRUN=1;LEN=4;MLLD=202.114;QD=30.6156;RBI=0.0143931;REFB=-0.0148063;REVB=-0.013457;RO=9;SAF=30;SAR=46;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0785074;STB=0.527861;TYPE=ins;VARB=0.000424288;OID=.;OPOS=35230935;OREF=-;OALT=TAGT;OMAPALT=ATAGT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:76:95:76:83:7:30:46:5:2:5:9:30:46:7:2 chr15 35256624 . C G 1941.93 PASS AO=203;DP=205;FAO=205;FDP=205;FR=.;FRO=0;FSAF=113;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206839;FXX=0.00485413;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.8;QD=37.8913;RBI=0.0272306;REFB=-0.0287922;REVB=-0.0177111;RO=1;SAF=112;SAR=91;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00423403;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.66458e-05;OID=.;OPOS=35256624;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:205:205:1:0:203:205:91:112:1:0:92:113:0:0 chr15 35272234 . C G 152.67 PASS AO=34;DP=73;FAO=35;FDP=72;FR=.;FRO=37;FSAF=8;FSAR=27;FSRF=9;FSRR=28;FWDB=0.0359667;FXX=0.0270234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.562;QD=8.48162;RBI=0.0361176;REFB=-0.0245344;REVB=0.00329755;RO=35;SAF=8;SAR=26;SRF=8;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00853895;STB=0.510561;TYPE=snp;VARB=0.0248192;OID=.;OPOS=35272234;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:72:35:37:34:35:26:8:8:27:27:8:9:28 chr15 36946303 . C G 576.95 PASS AO=148;DP=319;FAO=148;FDP=318;FR=.;FRO=170;FSAF=72;FSAR=76;FSRF=84;FSRR=86;FWDB=-0.0149955;FXX=0.0031347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.037;QD=7.25726;RBI=0.0166066;REFB=-0.0317044;REVB=-0.00713541;RO=170;SAF=72;SAR=76;SRF=84;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00739941;STB=0.504081;TYPE=snp;VARB=0.0365126;OID=.;OPOS=36946303;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:319:318:170:170:148:148:76:72:84:86:76:72:84:86 chr15 36983962 . T C 285.03 PASS AO=80;DP=190;FAO=82;FDP=196;FR=.;FRO=114;FSAF=20;FSAR=62;FSRF=45;FSRR=69;FWDB=-0.0175422;FXX=0.00507588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.284;QD=5.81698;RBI=0.0214906;REFB=-0.0271329;REVB=-0.0124143;RO=110;SAF=20;SAR=60;SRF=45;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194211;STB=0.605987;TYPE=snp;VARB=0.0360404;OID=.;OPOS=36983962;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:196:110:114:80:82:60:20:45:65:62:20:45:69 chr15 37173267 . G A 425.87 PASS AO=106;DP=219;FAO=108;FDP=230;FR=.;FRO=122;FSAF=56;FSAR=52;FSRF=65;FSRR=57;FWDB=-0.0870869;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.4893;QD=7.40639;RBI=0.0900974;REFB=-0.0219266;REVB=-0.023096;RO=108;SAF=55;SAR=51;SRF=56;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000321193;STB=0.507582;TYPE=snp;VARB=0.0245035;OID=.;OPOS=37173267;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:219:230:108:122:106:108:51:55:56:52:52:56:65:57 chr15 37343040 . C G 197.69 PASS AO=51;DP=116;FAO=51;FDP=114;FR=.;FRO=63;FSAF=11;FSAR=40;FSRF=24;FSRR=39;FWDB=-0.0141923;FXX=0.0338954;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.721;QD=6.9364;RBI=0.0450585;REFB=-0.011797;REVB=-0.042765;RO=61;SAF=11;SAR=40;SRF=23;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200993;STB=0.616962;TYPE=snp;VARB=0.0244379;OID=.;OPOS=37343040;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:114:61:63:51:51:40:11:23:38:40:11:24:39 chr15 38233869 . T C 1769.28 PASS AO=185;DP=185;FAO=185;FDP=185;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00383078;FXX=0.00537606;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.446;QD=38.2546;RBI=0.0222038;REFB=0;REVB=0.0218709;RO=0;SAF=104;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000125745;OID=.;OPOS=38233869;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:185:185:0:0:185:185:81:104:0:0:81:104:0:0 chr15 38614525 . G A 597.72 PASS AO=125;DP=235;FAO=129;FDP=238;FR=.;FRO=109;FSAF=51;FSAR=78;FSRF=52;FSRR=57;FWDB=-0.000382136;FXX=0.00833299;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.488;QD=10.0457;RBI=0.00750236;REFB=0.0134781;REVB=-0.00749263;RO=109;SAF=49;SAR=76;SRF=52;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.074734;STB=0.538502;TYPE=snp;VARB=-0.0114639;OID=.;OPOS=38614525;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:235:238:109:109:125:129:76:49:52:57:78:51:52:57 chr15 38643574 . T C 435.7 PASS AO=88;DP=158;FAO=89;FDP=159;FR=.;FRO=70;FSAF=33;FSAR=56;FSRF=26;FSRR=44;FWDB=-0.00554266;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.864;QD=10.9611;RBI=0.0185982;REFB=-0.0279393;REVB=-0.0177531;RO=70;SAF=33;SAR=55;SRF=26;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0030971;STB=0.500303;TYPE=snp;VARB=0.0171878;OID=.;OPOS=38643574;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:159:70:70:88:89:55:33:26:44:56:33:26:44 chr15 38644701 . AT A 33.33 PASS AO=46;DP=191;FAO=49;FDP=176;FR=.;FRO=127;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=39;FSRR=88;FWDB=-0.103329;FXX=0.0588204;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.4954;QD=0.757597;RBI=0.109208;REFB=-0.0575836;REVB=0.0353477;RO=112;SAF=23;SAR=23;SRF=38;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195601;STB=0.63256;TYPE=del;VARB=0.0694896;OID=.;OPOS=38644702;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:46:184:49:176:127:24:25:39:88:33:112:23:23:38:74 chr15 38645589 . A C 486.87 PASS AO=117;DP=245;FAO=118;FDP=242;FR=.;FRO=124;FSAF=42;FSAR=76;FSRF=50;FSRR=74;FWDB=-0.0170674;FXX=0.0162595;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.825;QD=8.04745;RBI=0.044343;REFB=0.0126907;REVB=0.0409269;RO=117;SAF=42;SAR=75;SRF=45;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.025159;STB=0.526026;TYPE=snp;VARB=-0.00848774;OID=.;OPOS=38645589;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:245:242:117:124:117:118:75:42:45:72:76:42:50:74 chr15 38794566 . A G 444.7 PASS AO=101;DP=197;FAO=101;FDP=197;FR=.;FRO=96;FSAF=40;FSAR=61;FSRF=48;FSRR=48;FWDB=6.57608e-05;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=64.2786;QD=9.02943;RBI=0.00807517;REFB=-0.0266717;REVB=-0.0080749;RO=96;SAF=40;SAR=61;SRF=48;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0943843;STB=0.551799;TYPE=snp;VARB=0.0195636;OID=.;OPOS=38794566;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:197:96:96:101:101:61:40:48:48:61:40:48:48 chr15 38857631 . C G 74.2 PASS AO=20;DP=52;FAO=20;FDP=50;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=-0.00394325;FXX=0.0384541;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.45;QD=5.93609;RBI=0.00510552;REFB=0.000746671;REVB=-0.00324301;RO=30;SAF=13;SAR=7;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0189129;STB=0.510906;TYPE=snp;VARB=-0.00105881;OID=.;OPOS=38857631;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:52:50:30:30:20:20:7:13:19:11:7:13:19:11 chr15 39545032 . T G 2050.3 PASS AO=232;DP=243;FAO=232;FDP=243;FR=.;FRO=11;FSAF=114;FSAR=118;FSRF=1;FSRR=10;FWDB=0.0144204;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=161.842;QD=33.7499;RBI=0.0205511;REFB=-0.0817185;REVB=0.0146424;RO=9;SAF=114;SAR=118;SRF=1;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0270529;STB=0.518143;TYPE=snp;VARB=0.000518814;OID=.;OPOS=39545032;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:243:243:9:11:232:232:118:114:1:8:118:114:1:10 chr15 39545268 . G A 927.68 PASS AO=101;DP=104;FAO=101;FDP=103;FR=.;FRO=2;FSAF=53;FSAR=48;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0297893;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.505;QD=36.0265;RBI=0.083579;REFB=-0.0857543;REVB=0.07809;RO=1;SAF=53;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00886767;STB=0.509257;TYPE=snp;VARB=0.0011266;OID=.;OPOS=39545268;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:104:103:1:2:101:101:48:53:1:0:48:53:2:0 chr15 40226495 . T C 212.88 PASS AO=25;DP=27;FAO=25;FDP=27;FR=.;FRO=2;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0105802;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.183;QD=31.538;RBI=0.0194255;REFB=0.0229312;REVB=0.0162915;RO=2;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0661725;STB=0.535686;TYPE=snp;VARB=-0.000720758;OID=.;OPOS=40226495;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:27:27:2:2:25:25:13:12:0:2:13:12:0:2 chr15 40265799 . A G 734.14 PASS AO=78;DP=80;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00376777;FXX=0.0123442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0118;QD=36.7072;RBI=0.0973159;REFB=-0.117472;REVB=-0.097243;RO=2;SAF=31;SAR=47;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0295566;STB=0.50769;TYPE=snp;VARB=0.00181163;OID=.;OPOS=40265799;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:80:80:2:1:78:79:47:31:2:0:47:32:1:0 chr15 40268998 . G GGACGAC,C 95.99 PASS AO=16,10;DP=59;FAO=17,9;FDP=60;FR=.;FRO=34;FSAF=9,3;FSAR=8,6;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=-0.0177717,-0.0460627;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=6,1;MLLD=158.214,80.2955;QD=6.39933;RBI=0.0189803,0.0472993;REFB=-0.0160472,0.00640804;REVB=0.00666453,0.0107445;RO=33;SAF=9,3;SAR=7,7;SRF=21;SRR=12;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0864058,-0.391849;STB=0.559372,0.715962;TYPE=ins,snp;VARB=0.0343562,-0.0125825;OID=.,.;OPOS=40268999,40268998;OREF=-,G;OALT=GACGAC,C;OMAPALT=GGACGAC,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:59:60:33:34:16,10:17,9:7,7:9,3:21:12:8,6:9,3:21:13 chr15 40327793 . CCTG C 182.56 PASS AO=137;DP=440;FAO=131;FDP=386;FR=.;FRO=255;FSAF=46;FSAR=85;FSRF=94;FSRR=161;FWDB=0.010648;FXX=0.0349991;HRUN=2;LEN=3;MLLD=249.918;QD=1.8918;RBI=0.0208306;REFB=-0.00761397;REVB=-0.0179035;RO=192;SAF=46;SAR=91;SRF=67;SRR=125;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0153813;STB=0.512576;TYPE=del;VARB=0.0158184;OID=.;OPOS=40327794;OREF=CTG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:137:403:131:386:255:46:85:94:161:99:192:46:91:67:125 chr15 40328575 . G C 1151.61 PASS AO=128;DP=137;FAO=128;FDP=133;FR=.;FRO=5;FSAF=68;FSAR=60;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0562394;FXX=0.029195;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.679;QD=34.6349;RBI=0.0860345;REFB=-0.106684;REVB=0.0651081;RO=3;SAF=68;SAR=60;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.023164;STB=0.51248;TYPE=snp;VARB=0.000874687;OID=.;OPOS=40328575;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:137:133:3:5:128:128:60:68:0:3:60:68:1:4 chr15 40328665 . G A 214.73 PASS AO=39;DP=88;FAO=49;FDP=98;FR=.;FRO=49;FSAF=9;FSAR=40;FSRF=13;FSRR=36;FWDB=0.0237763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.452;QD=8.76461;RBI=0.0240521;REFB=-0.00417599;REVB=-0.00363164;RO=35;SAF=0;SAR=39;SRF=1;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.825769;STB=0.562633;TYPE=snp;VARB=0.00434632;OID=.;OPOS=40328665;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:98:35:49:39:49:39:0:1:34:40:9:13:36 chr15 40330518 . T G 170.16 PASS AO=45;DP=106;FAO=46;FDP=107;FR=.;FRO=61;FSAF=28;FSAR=18;FSRF=32;FSRR=29;FWDB=-0.0163704;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.3675;QD=6.36092;RBI=0.0165111;REFB=-0.0223599;REVB=-0.00215036;RO=61;SAF=28;SAR=17;SRF=32;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103029;STB=0.549227;TYPE=snp;VARB=0.0203308;OID=.;OPOS=40330518;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:107:61:61:45:46:17:28:32:29:18:28:32:29 chr15 40330564 . C T 639.97 PASS AO=73;DP=75;FAO=72;FDP=75;FR=.;FRO=3;FSAF=24;FSAR=48;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0395637;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.2698;QD=34.1317;RBI=0.052011;REFB=-0.0474701;REVB=-0.0337618;RO=1;SAF=24;SAR=49;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192984;STB=0.514847;TYPE=snp;VARB=0.0109245;OID=.;OPOS=40330564;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:75:75:1:3:73:72:49:24:1:0:48:24:2:1 chr15 40383347 . T C 599.74 PASS AO=60;DP=60;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.64;QD=37.4836;RBI=0.0336584;REFB=0;REVB=0.0197355;RO=0;SAF=33;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.7886e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.0296e-05;OID=.;OPOS=40383347;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:60:64:0:0:60:64:27:33:0:0:27:37:0:0 chr15 40383779 . A C 602.42 PASS AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00282988;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=310.427;QD=36.51;RBI=0.0161239;REFB=0.027464;REVB=-0.0158737;RO=1;SAF=30;SAR=35;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0133067;STB=0.50704;TYPE=snp;VARB=-0.000211689;OID=.;OPOS=40383779;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:66:66:1:1:65:65:35:30:0:1:35:30:0:1 chr15 40426913 . C A 443.05 PASS AO=108;DP=226;FAO=108;FDP=226;FR=.;FRO=118;FSAF=30;FSAR=78;FSRF=42;FSRR=76;FWDB=0.0129064;FXX=0.0173905;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.074;QD=7.84155;RBI=0.0144117;REFB=-0.00919426;REVB=-0.00641263;RO=117;SAF=30;SAR=78;SRF=42;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0908952;STB=0.548643;TYPE=snp;VARB=0.00836693;OID=.;OPOS=40426913;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:226:226:117:118:108:108:78:30:42:75:78:30:42:76 chr15 40462846 . T C 270.53 PASS AO=66;DP=139;FAO=66;FDP=139;FR=.;FRO=73;FSAF=18;FSAR=48;FSRF=24;FSRR=49;FWDB=-0.0223804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.989;QD=7.78503;RBI=0.0224337;REFB=0.00533865;REVB=0.00154517;RO=73;SAF=18;SAR=48;SRF=24;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0645904;STB=0.535874;TYPE=snp;VARB=-0.00545006;OID=.;OPOS=40462846;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:73:73:66:66:48:18:24:49:48:18:24:49 chr15 40477831 . G A 342.61 PASS AO=91;DP=203;FAO=91;FDP=203;FR=.;FRO=112;FSAF=56;FSAR=35;FSRF=28;FSRR=84;FWDB=0.0431788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9442;QD=6.75085;RBI=0.0473756;REFB=0.00248878;REVB=0.0194945;RO=112;SAF=56;SAR=35;SRF=28;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.35154;STB=0.693838;TYPE=snp;VARB=-0.00233534;OID=.;OPOS=40477831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:203:112:112:91:91:35:56:28:84:35:56:28:84 chr15 40568823 . C A 127.03 PASS AO=37;DP=88;FAO=36;FDP=89;FR=.;FRO=53;FSAF=10;FSAR=26;FSRF=28;FSRR=25;FWDB=0.0847443;FXX=0.0111099;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.3946;QD=5.709;RBI=0.0850652;REFB=0.0104077;REVB=0.00738173;RO=51;SAF=10;SAR=27;SRF=26;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.26641;STB=0.659453;TYPE=snp;VARB=-0.0368288;OID=.;OPOS=40568823;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:89:51:53:37:36:27:10:26:25:26:10:28:25 chr15 40573675 . G T 88.1 PASS AO=13;DP=18;FAO=13;FDP=18;FR=.;FRO=5;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0323438;FXX=0.0526039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.32;QD=19.5778;RBI=0.0482337;REFB=-0.0354762;REVB=0.0357823;RO=5;SAF=6;SAR=7;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166735;STB=0.59308;TYPE=snp;VARB=0.00756356;OID=.;OPOS=40573675;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:18:18:5:5:13:13:7:6:4:1:7:6:4:1 chr15 40573678 . GC G 20.35 PASS AO=8;DP=19;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.326866;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.427;QD=4.28403;RBI=0.360479;REFB=-0.0794316;REVB=-0.151999;RO=9;SAF=6;SAR=2;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.380371;STB=0.834892;TYPE=del;VARB=0.00949985;OID=.;OPOS=40573679;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:8:19:8:19:11:7:1:4:7:20:9:6:2:3:6 chr15 40573690 . AG A 35.13 PASS AO=8;DP=19;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.0109053;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=25.4877;QD=8.26532;RBI=0.0473077;REFB=-0.0261854;REVB=0.0460336;RO=8;SAF=7;SAR=1;SRF=1;SRR=7;SSEN=0.365079;SSEP=0;SSSB=0.633614;STB=0.875837;TYPE=del;VARB=0.0339788;OID=.;OPOS=40573691;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:8:17:9:17:8:8:1:1:7:27:8:7:1:1:7 chr15 40573716 . A G 158.92 PASS AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0176093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.26;QD=37.3925;RBI=0.0248288;REFB=0;REVB=-0.0175038;RO=0;SAF=9;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.126e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000493532;OID=.;OPOS=40573716;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:17:17:0:0:17:17:8:9:0:0:8:9:0:0 chr15 40583876 . T G 116.18 PASS AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0125297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.383;QD=35.7475;RBI=0.032871;REFB=0;REVB=0.0303893;RO=0;SAF=10;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000882393;OID=.;OPOS=40583876;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:13:0:0:13:13:3:10:0:0:3:10:0:0 chr15 40590134 . G A 173.29 PASS AO=45;DP=103;FAO=45;FDP=101;FR=.;FRO=56;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=43;FSRR=13;FWDB=-0.0115627;FXX=0.0194156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.905;QD=6.86292;RBI=0.0358573;REFB=-0.0126025;REVB=-0.0339419;RO=56;SAF=27;SAR=18;SRF=43;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181611;STB=0.600817;TYPE=snp;VARB=0.0198721;OID=.;OPOS=40590134;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:101:56:56:45:45:18:27:43:13:18:27:43:13 chr15 40629559 . AG A 84.82 PASS AO=14;DP=17;FAO=15;FDP=17;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.220088;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=16.9438;QD=19.9584;RBI=0.222554;REFB=0.0456619;REVB=0.0330395;RO=3;SAF=4;SAR=10;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.244872;STB=0.583219;TYPE=del;VARB=0.0196156;OID=.;OPOS=40629560;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:14:17:15:17:2:5:10:2:0:3:3:4:10:3:0 chr15 40633138 . A T 112.29 PASS AO=21;DP=36;FAO=21;FDP=36;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=15;FWDB=0.035969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.269;QD=12.4762;RBI=0.0361061;REFB=-0.022813;REVB=0.00314444;RO=14;SAF=2;SAR=19;SRF=0;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.247867;STB=0.641407;TYPE=snp;VARB=0.0134726;OID=.;OPOS=40633138;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:36:36:14:15:21:21:19:2:0:14:19:2:0:15 chr15 40646520 . CT C 596.59 PASS AO=96;DP=149;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0398615;FXX=0.00689608;HRUN=8;LEN=1;MLLD=8.63328;QD=16.572;RBI=0.250941;REFB=0.0533029;REVB=-0.247755;RO=12;SAF=60;SAR=36;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0281847;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0077313;OID=.;OPOS=40646521;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:96:141:144:144:0:88:56:0:0:41:12:60:36:9:3 chr15 40655845 . C G 92.09 PASS AO=11;DP=12;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=32.7939;QD=28.3368;RBI=0.0500649;REFB=-0.0632104;REVB=0.0500649;RO=1;SAF=0;SAR=11;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.017092;OID=.;OPOS=40655845;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:12:13:1:1:11:12:11:0:0:1:12:0:0:1 chr15 40656141 . T C 30.21 PASS AO=9;DP=28;FAO=9;FDP=28;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=15;FWDB=-0.0334532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.22;QD=4.31529;RBI=0.0334806;REFB=-0.00633401;REVB=0.00135328;RO=19;SAF=3;SAR=6;SRF=4;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165991;STB=0.5998;TYPE=snp;VARB=0.00974344;OID=.;OPOS=40656141;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:28:28:19:19:9:9:6:3:4:15:6:3:4:15 chr15 40662501 . G A 136.85 PASS AO=31;DP=63;FAO=31;FDP=63;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=0.00312206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.338;QD=8.68884;RBI=0.00500772;REFB=-0.0322303;REVB=-0.00391535;RO=32;SAF=13;SAR=18;SRF=11;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0715676;STB=0.539911;TYPE=snp;VARB=0.0364362;OID=.;OPOS=40662501;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:32:32:31:31:18:13:11:21:18:13:11:21 chr15 40675481 . A AC 24.6 PASS AO=9;DP=21;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=0;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=13;FWDB=0;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=51.6321;QD=4.68511;RBI=0.0108089;REFB=-0.0334734;REVB=-0.0108089;RO=12;SAF=0;SAR=9;SRF=0;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.174501;OID=.;OPOS=40675482;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:9:21:8:21:13:0:8:0:13:24:12:0:9:0:12 chr15 40684232 . G A 308.56 PASS AO=78;DP=168;FAO=78;FDP=168;FR=.;FRO=90;FSAF=41;FSAR=37;FSRF=34;FSRR=56;FWDB=0.0198265;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.68;QD=7.34663;RBI=0.0223409;REFB=-0.012003;REVB=0.0102968;RO=90;SAF=41;SAR=37;SRF=34;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142387;STB=0.57876;TYPE=snp;VARB=0.0126119;OID=.;OPOS=40684232;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:90:90:78:78:37:41:34:56:37:41:34:56 chr15 40685406 . A T 352.02 PASS AO=92;DP=202;FAO=92;FDP=203;FR=.;FRO=111;FSAF=32;FSAR=60;FSRF=51;FSRR=60;FWDB=-0.00384009;FXX=0.00490172;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.006;QD=6.93642;RBI=0.0148017;REFB=-0.0104618;REVB=-0.0142949;RO=110;SAF=32;SAR=60;SRF=51;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120008;STB=0.564611;TYPE=snp;VARB=0.0110372;OID=.;OPOS=40685406;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:203:110:111:92:92:60:32:51:59:60:32:51:60 chr15 40705225 . C T 419.09 PASS AO=82;DP=141;FAO=82;FDP=141;FR=.;FRO=59;FSAF=35;FSAR=47;FSRF=26;FSRR=33;FWDB=0.00476326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.4549;QD=11.889;RBI=0.0153231;REFB=-0.0148281;REVB=0.014564;RO=57;SAF=35;SAR=47;SRF=26;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0225129;STB=0.50591;TYPE=snp;VARB=0.0126422;OID=.;OPOS=40705225;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:57:59:82:82:47:35:26:31:47:35:26:33 chr15 40710723 . G A 382.47 PASS AO=75;DP=131;FAO=76;FDP=132;FR=.;FRO=56;FSAF=41;FSAR=35;FSRF=37;FSRR=19;FWDB=0.00427252;FXX=0.00751823;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7531;QD=11.5901;RBI=0.0333083;REFB=-0.00589472;REVB=-0.0330331;RO=56;SAF=40;SAR=35;SRF=38;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11559;STB=0.552171;TYPE=snp;VARB=0.00395433;OID=.;OPOS=40710723;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:132:56:56:75:76:35:40:38:18:35:41:37:19 chr15 40751555 . C A 254.95 PASS AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0626137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.1283;QD=37.7699;RBI=0.0695313;REFB=0;REVB=0.0302346;RO=0;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00108624;OID=.;OPOS=40751555;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:26:27:0:0:26:27:12:14:0:0:12:15:0:0 chr15 40756685 . GC G 305.13 PASS AO=41;DP=49;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.241298;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=15.2724;QD=25.9685;RBI=0.266942;REFB=0;REVB=-0.114164;RO=8;SAF=20;SAR=21;SRF=4;SRR=4;SSEN=0.384121;SSEP=0;SSSB=-0.00371039;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00437183;OID=.;OPOS=40756686;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:41:49:47:47:0:24:23:0:0:26:8:20:21:4:4 chr15 40845952 . A G 59.6 PASS AO=23;DP=80;FAO=24;FDP=80;FR=.;FRO=56;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=36;FSRR=20;FWDB=-0.01882;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.779;QD=2.97995;RBI=0.0192327;REFB=-0.0207011;REVB=-0.00396325;RO=56;SAF=17;SAR=6;SRF=36;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135748;STB=0.590828;TYPE=snp;VARB=0.052126;OID=.;OPOS=40845952;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:80:80:56:56:23:24:6:17:36:20:6:18:36:20 chr15 40855210 . T A 124.49 PASS AO=32;DP=73;FAO=32;FDP=73;FR=.;FRO=41;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=-0.0232802;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=265.746;QD=6.82147;RBI=0.0232826;REFB=0.00454031;REVB=0.00033058;RO=41;SAF=12;SAR=20;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0912575;STB=0.551569;TYPE=snp;VARB=-0.00579261;OID=.;OPOS=40855210;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:41:41:32:32:20:12:19:22:20:12:19:22 chr15 40856989 . C T 476.4 PASS AO=52;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0322427;FXX=0.0185151;HRUN=4;LEN=1;MLLD=108.14;QD=35.9544;RBI=0.0349019;REFB=-0.0389739;REVB=0.0133624;RO=1;SAF=6;SAR=46;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101327;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.97787e-05;OID=.;OPOS=40856989;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:53:53:1:0:52:53:46:6:0:1:47:6:0:0 chr15 40861631 . AG A 364.31 PASS AO=40;DP=77;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.289938;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=9.07314;QD=20.2393;RBI=0.396317;REFB=0;REVB=0.27019;RO=16;SAF=14;SAR=26;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0.443878;SSSB=-0.118189;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0150391;OID=.;OPOS=40861632;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:40:70:72:72:0:34:38:0:0:34:16:14:26:9:7 chr15 40861908 . A G 176.34 PASS AO=39;DP=87;FAO=43;FDP=91;FR=.;FRO=48;FSAF=33;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=-0.0318861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.303;QD=7.75119;RBI=0.0436344;REFB=-0.0157889;REVB=0.0297864;RO=47;SAF=33;SAR=6;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.433013;STB=0.673382;TYPE=snp;VARB=0.0149386;OID=.;OPOS=40861908;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:91:47:48:39:43:6:33:23:24:10:33:23:25 chr15 40862064 . C T 327 PASS AO=64;DP=113;FAO=65;FDP=112;FR=.;FRO=47;FSAF=25;FSAR=40;FSRF=14;FSRR=33;FWDB=0.0632952;FXX=0.00884877;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.417;QD=11.6785;RBI=0.0701446;REFB=-0.00932635;REVB=-0.0302322;RO=47;SAF=24;SAR=40;SRF=14;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0650803;STB=0.539132;TYPE=snp;VARB=0.0147263;OID=.;OPOS=40862064;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:112:47:47:64:65:40:24:14:33:40:25:14:33 chr15 40886015 . C T 308.03 PASS AO=67;DP=127;FAO=67;FDP=127;FR=.;FRO=60;FSAF=41;FSAR=26;FSRF=33;FSRR=27;FWDB=0.0118819;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.215;QD=9.70163;RBI=0.016004;REFB=-0.00598998;REVB=0.0107214;RO=60;SAF=41;SAR=26;SRF=33;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0552858;STB=0.530379;TYPE=snp;VARB=0.00547039;OID=.;OPOS=40886015;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:60:60:67:67:26:41:33:27:26:41:33:27 chr15 40886017 . C T 311.02 PASS AO=66;DP=124;FAO=67;FDP=125;FR=.;FRO=58;FSAF=41;FSAR=26;FSRF=31;FSRR=27;FWDB=0.0201593;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.415;QD=9.95267;RBI=0.0791519;REFB=-0.0292161;REVB=-0.0765417;RO=58;SAF=41;SAR=25;SRF=31;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0768243;STB=0.537195;TYPE=snp;VARB=0.018269;OID=.;OPOS=40886017;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:125:58:58:66:67:25:41:31:27:26:41:31:27 chr15 40886020 . C G 297.04 PASS AO=65;DP=124;FAO=65;FDP=124;FR=.;FRO=59;FSAF=39;FSAR=26;FSRF=31;FSRR=28;FWDB=0.00403638;FXX=0.0158718;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7105;QD=9.58196;RBI=0.0068614;REFB=-0.0336126;REVB=0.00554856;RO=59;SAF=39;SAR=26;SRF=31;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0662145;STB=0.536413;TYPE=snp;VARB=0.0287626;OID=.;OPOS=40886020;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:59:59:65:65:26:39:31:28:26:39:31:28 chr15 40898643 . G C 1038.92 PASS AO=109;DP=111;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00527868;FXX=0.0180164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.541;QD=38.1254;RBI=0.0131081;REFB=0;REVB=0.0119982;RO=0;SAF=46;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.61771e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.33008e-06;OID=.;OPOS=40898643;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:111:109:0:0:109:109:63:46:0:0:63:46:0:0 chr15 40899491 . C T 168.8 PASS AO=37;DP=75;FAO=38;FDP=76;FR=.;FRO=38;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=0.018286;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.757;QD=8.88417;RBI=0.0182912;REFB=-0.0135086;REVB=-0.000436715;RO=37;SAF=16;SAR=21;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.51343;TYPE=snp;VARB=0.0117594;OID=.;OPOS=40899491;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:76:37:38:37:38:21:16:16:21:22:16:17:21 chr15 40903684 . A G 2980.14 PASS AO=329;DP=347;FAO=330;FDP=341;FR=.;FRO=11;FSAF=102;FSAR=228;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.0194127;FXX=0.0172906;HRUN=3;LEN=1;MLLD=154.479;QD=34.9576;RBI=0.0368493;REFB=-0.130658;REVB=-0.0313212;RO=8;SAF=101;SAR=228;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0298272;STB=0.515603;TYPE=snp;VARB=0.000440549;OID=.;OPOS=40903684;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:347:341:8:11:329:330:228:101:7:1:228:102:8:3 chr15 40913840 . G T 2435.9 PASS AO=251;DP=255;FAO=254;FDP=254;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=173;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0351422;FXX=0.0116727;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.125;QD=38.3606;RBI=0.0362456;REFB=0;REVB=-0.00887519;RO=0;SAF=76;SAR=175;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18988e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000606561;OID=.;OPOS=40913840;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:255:254:0:0:251:254:175:76:0:0:173:81:0:0 chr15 40914177 . T C 209.18 PASS AO=50;DP=103;FAO=50;FDP=104;FR=.;FRO=54;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=0.00440231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.648;QD=8.04554;RBI=0.00544854;REFB=-0.0171669;REVB=-0.00321033;RO=53;SAF=23;SAR=27;SRF=25;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0109054;STB=0.501547;TYPE=snp;VARB=0.0155496;OID=.;OPOS=40914177;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:104:53:54:50:50:27:23:25:28:27:23:25:29 chr15 40914772 . C T 155.08 PASS AO=41;DP=94;FAO=41;FDP=94;FR=.;FRO=53;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=33;FSRR=20;FWDB=0.00522518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.631;QD=6.5992;RBI=0.006786;REFB=-0.00797145;REVB=-0.00432982;RO=52;SAF=19;SAR=22;SRF=32;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150553;STB=0.589041;TYPE=snp;VARB=0.00734495;OID=.;OPOS=40914772;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:52:53:41:41:22:19:32:20:22:19:33:20 chr15 40915045 . T G 129.26 PASS AO=36;DP=87;FAO=36;FDP=87;FR=.;FRO=51;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=13;FSRR=38;FWDB=-0.00597359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.975;QD=5.94289;RBI=0.0163141;REFB=-0.00174975;REVB=-0.0151811;RO=50;SAF=12;SAR=24;SRF=12;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113262;STB=0.553543;TYPE=snp;VARB=0.00244025;OID=.;OPOS=40915045;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:50:51:36:36:24:12:12:38:24:12:13:38 chr15 40915190 . A G 351.35 PASS AO=23;DP=38;FAO=37;FDP=37;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0677672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.945;QD=37.9836;RBI=0.0867993;REFB=0;REVB=0.0542377;RO=0;SAF=15;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00360427;OID=.;OPOS=40915190;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:37:37:0:0:23:37:8:15:0:0:14:23:0:0 chr15 40915894 . T C 589.69 PASS AO=126;DP=235;FAO=127;FDP=235;FR=.;FRO=108;FSAF=64;FSAR=63;FSRF=51;FSRR=57;FWDB=0.0214587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.2749;QD=10.0372;RBI=0.0288442;REFB=-0.00528239;REVB=0.0192747;RO=107;SAF=63;SAR=63;SRF=51;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0196779;STB=0.514571;TYPE=snp;VARB=0.00497542;OID=.;OPOS=40915894;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:235:235:107:108:126:127:63:63:51:56:63:64:51:57 chr15 40916237 . A G 324.14 PASS AO=68;DP=128;FAO=69;FDP=129;FR=.;FRO=60;FSAF=35;FSAR=34;FSRF=33;FSRR=27;FWDB=-0.0493843;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.2583;QD=10.0508;RBI=0.0493921;REFB=-0.0146437;REVB=-0.000875099;RO=60;SAF=35;SAR=33;SRF=33;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0302086;STB=0.519895;TYPE=snp;VARB=0.0110323;OID=.;OPOS=40916237;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:129:60:60:68:69:33:35:33:27:34:35:33:27 chr15 40916801 . A G 244.98 PASS AO=61;DP=132;FAO=61;FDP=131;FR=.;FRO=70;FSAF=24;FSAR=37;FSRF=37;FSRR=33;FWDB=0.0184482;FXX=0.00757518;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.166;QD=7.48017;RBI=0.0225891;REFB=0.00176377;REVB=0.0130359;RO=68;SAF=24;SAR=37;SRF=36;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13102;STB=0.573255;TYPE=snp;VARB=-0.00143891;OID=.;OPOS=40916801;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:131:68:70:61:61:37:24:36:32:37:24:37:33 chr15 41063244 . C T 285.91 PASS AO=31;DP=36;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00660488;FXX=0.0833102;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.831;QD=34.6553;RBI=0.0223003;REFB=-0.057692;REVB=0.0212997;RO=1;SAF=29;SAR=2;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184523;STB=0.571379;TYPE=snp;VARB=0.00312685;OID=.;OPOS=41063244;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:36:33:1:1:31:32:2:29:0:1:3:29:0:1 chr15 41064176 . C T 88.28 PASS AO=19;DP=39;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=4;FWDB=0.0357878;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.474;QD=9.05428;RBI=0.0395135;REFB=-0.0200046;REVB=0.0167495;RO=19;SAF=13;SAR=6;SRF=16;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175082;STB=0.572298;TYPE=snp;VARB=0.017643;OID=.;OPOS=41064176;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:39:39:19:20:19:19:6:13:16:3:6:13:16:4 chr15 41064187 . C T 80.56 PASS AO=10;DP=41;FAO=15;FDP=41;FR=.,HEALED;FRO=22;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=5;FWDB=0.0197319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.185;QD=7.85912;RBI=0.0250773;REFB=-0.0213505;REVB=-0.0154766;RO=22;SAF=5;SAR=5;SRF=17;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.314542;STB=0.574376;TYPE=snp;VARB=0.0654762;OID=.;OPOS=41064187;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:41:41:22:22:10:15:5:5:17:5:5:10:17:5 chr15 41105926 . T G 741.56 PASS AO=80;DP=82;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0129761;FXX=0.0121936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.883;QD=36.6205;RBI=0.0348247;REFB=-0.10158;REVB=0.0323169;RO=1;SAF=39;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114082;STB=0.506023;TYPE=snp;VARB=0.00053414;OID=.;OPOS=41105926;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:82:81:1:1:80:80:41:39:0:1:41:39:0:1 chr15 41148199 . C T 487.42 PASS AO=50;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0292954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.533;QD=37.4937;RBI=0.048052;REFB=0;REVB=0.038089;RO=0;SAF=24;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.10374e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000719414;OID=.;OPOS=41148199;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:52:52:0:0:50:52:26:24:0:0:27:25:0:0 chr15 41149161 . G C 183.14 PASS AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0299333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.311;QD=38.5549;RBI=0.0313954;REFB=0;REVB=0.0094694;RO=0;SAF=1;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000263138;OID=.;OPOS=41149161;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:19:19:0:0:19:19:18:1:0:0:18:1:0:0 chr15 41271718 . C T 2954.55 PASS AO=308;DP=308;FAO=313;FDP=313;FR=.;FRO=0;FSAF=126;FSAR=187;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00307301;FXX=0.0126179;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.354;QD=37.7578;RBI=0.0104604;REFB=0.0103956;REVB=0.00999888;RO=0;SAF=124;SAR=184;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.68283e-05;OID=.;OPOS=41271718;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:308:313:0:0:308:313:184:124:0:0:187:126:0:0 chr15 41308365 . A C 153.28 PASS AO=36;DP=73;FAO=35;FDP=71;FR=.;FRO=36;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=24;FWDB=0.0198345;FXX=0.0273935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.618;QD=8.63556;RBI=0.0198444;REFB=-0.0198693;REVB=0.000626929;RO=37;SAF=19;SAR=17;SRF=12;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184087;STB=0.591295;TYPE=snp;VARB=0.0215953;OID=.;OPOS=41308365;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:71:37:36:36:35:17:19:12:25:17:18:12:24 chr15 41476209 . T C 1913.78 PASS AO=193;DP=193;FAO=199;FDP=199;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=137;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.012844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7422;QD=38.468;RBI=0.0160772;REFB=0;REVB=0.00966995;RO=0;SAF=60;SAR=133;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.56481e-05;OID=.;OPOS=41476209;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:193:199:0:0:193:199:133:60:0:0:137:62:0:0 chr15 41476465 . G A 695.47 PASS AO=138;DP=241;FAO=140;FDP=241;FR=.;FRO=101;FSAF=77;FSAR=63;FSRF=35;FSRR=66;FWDB=0.0123418;FXX=0.00413206;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.038;QD=11.5431;RBI=0.0229296;REFB=-0.00150851;REVB=0.0193248;RO=101;SAF=75;SAR=63;SRF=35;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152564;STB=0.58466;TYPE=snp;VARB=0.000986631;OID=.;OPOS=41476465;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:241:241:101:101:138:140:63:75:35:66:63:77:35:66 chr15 41483682 . A G 351.35 PASS AO=97;DP=237;FAO=102;FDP=239;FR=.;FRO=137;FSAF=47;FSAR=55;FSRF=51;FSRR=86;FWDB=0.00871726;FXX=0.00416649;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.0411;QD=5.88026;RBI=0.00989685;REFB=0.00194701;REVB=0.00468583;RO=136;SAF=45;SAR=52;SRF=50;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102138;STB=0.551459;TYPE=snp;VARB=-0.00175851;OID=.;OPOS=41483682;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:237:239:136:137:97:102:52:45:50:86:55:47:51:86 chr15 41484287 . C A 55.23 PASS AO=19;DP=58;FAO=19;FDP=58;FR=.;FRO=39;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=32;FWDB=0.00856836;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=263.141;QD=3.80893;RBI=0.0140427;REFB=-0.00124215;REVB=0.0111256;RO=39;SAF=5;SAR=14;SRF=7;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133783;STB=0.577815;TYPE=snp;VARB=0.00271585;OID=.;OPOS=41484287;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:58:58:39:39:19:19:14:5:7:32:14:5:7:32 chr15 41509288 . T A 114.08 PASS AO=33;DP=83;FAO=33;FDP=83;FR=.;FRO=50;FSAF=9;FSAR=24;FSRF=33;FSRR=17;FWDB=-0.0177846;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.393;QD=5.4977;RBI=0.0229086;REFB=-0.0124753;REVB=0.0144398;RO=50;SAF=9;SAR=24;SRF=33;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.407759;STB=0.731886;TYPE=snp;VARB=0.0115949;OID=.;OPOS=41509288;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:50:50:33:33:24:9:33:17:24:9:33:17 chr15 41556395 . G A 158.24 PASS AO=33;DP=62;FAO=33;FDP=62;FR=.;FRO=29;FSAF=4;FSAR=29;FSRF=6;FSRR=23;FWDB=-0.0172299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.2066;QD=10.2092;RBI=0.0411307;REFB=0.0171693;REVB=0.0373479;RO=28;SAF=4;SAR=29;SRF=6;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155295;STB=0.582274;TYPE=snp;VARB=-0.0143164;OID=.;OPOS=41556395;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:28:29:33:33:29:4:6:22:29:4:6:23 chr15 41688732 . C T 57.63 PASS AO=21;DP=65;FAO=21;FDP=66;FR=.;FRO=45;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=0.029048;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=42.5689;QD=3.4927;RBI=0.0328816;REFB=-0.0177095;REVB=0.0154082;RO=44;SAF=10;SAR=11;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0794151;STB=0.538868;TYPE=snp;VARB=0.041341;OID=.;OPOS=41688732;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:65:66:44:45:21:21:11:10:24:20:11:10:24:21 chr15 41813279 . C T 104 PASS AO=26;DP=59;FAO=26;FDP=59;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=0.02122;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=250.831;QD=7.05056;RBI=0.0217074;REFB=-0.00259053;REVB=0.00457401;RO=33;SAF=10;SAR=16;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0543053;STB=0.530703;TYPE=snp;VARB=0.00457906;OID=.;OPOS=41813279;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:33:33:26:26:16:10:11:22:16:10:11:22 chr15 41815516 . G C 786.12 PASS AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0293786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.71;QD=37.8853;RBI=0.0401904;REFB=0;REVB=0.0274257;RO=0;SAF=18;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000113649;OID=.;OPOS=41815516;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:83:83:0:0:83:83:65:18:0:0:65:18:0:0 chr15 41819716 . C T 388.85 PASS AO=118;DP=287;FAO=117;FDP=286;FR=.;FRO=169;FSAF=44;FSAR=73;FSRF=70;FSRR=99;FWDB=0.00071309;FXX=0.0069442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.787;QD=5.43851;RBI=0.0110264;REFB=-0.0137587;REVB=0.0110033;RO=168;SAF=45;SAR=73;SRF=69;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0324105;STB=0.523722;TYPE=snp;VARB=0.0139289;OID=.;OPOS=41819716;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:287:286:168:169:118:117:73:45:69:99:73:44:70:99 chr15 41821752 . T C 152.32 PASS AO=43;DP=102;FAO=43;FDP=104;FR=.;FRO=61;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=27;FSRR=34;FWDB=-0.0287975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.8213;QD=5.8586;RBI=0.03107;REFB=-0.0132824;REVB=0.0116639;RO=59;SAF=16;SAR=27;SRF=26;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0736286;STB=0.543265;TYPE=snp;VARB=0.0193336;OID=.;OPOS=41821752;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:104:59:61:43:43:27:16:26:33:27:16:27:34 chr15 41829230 . A G 375.71 PASS AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0102683;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.692;QD=38.5341;RBI=0.0123835;REFB=0;REVB=-0.00692201;RO=0;SAF=20;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3303e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.94449e-05;OID=.;OPOS=41829230;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:39:39:0:0:39:39:19:20:0:0:19:20:0:0 chr15 41860490 . T A 240.83 PASS AO=55;DP=115;FAO=56;FDP=112;FR=.;FRO=56;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=21;FSRR=35;FWDB=-0.0021135;FXX=0.0260847;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.526;QD=8.60092;RBI=0.0102418;REFB=-0.00848253;REVB=0.0100214;RO=50;SAF=21;SAR=34;SRF=19;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0016658;STB=0.509393;TYPE=snp;VARB=0.00829024;OID=.;OPOS=41860490;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:112:50:56:55:56:34:21:19:31:34:22:21:35 chr15 41991315 . A T 137.01 PASS AO=39;DP=102;FAO=41;FDP=104;FR=.;FRO=63;FSAF=9;FSAR=32;FSRF=18;FSRR=45;FWDB=0.0217337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8875;QD=5.26943;RBI=0.0226637;REFB=0.00263655;REVB=-0.00642553;RO=60;SAF=9;SAR=30;SRF=16;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.052028;STB=0.554885;TYPE=snp;VARB=-0.00185606;OID=.;OPOS=41991315;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:104:60:63:39:41:30:9:16:44:32:9:18:45 chr15 42026764 . C T 512.87 PASS AO=151;DP=365;FAO=154;FDP=373;FR=.;FRO=219;FSAF=75;FSAR=79;FSRF=103;FSRR=116;FWDB=0.00407484;FXX=0.00267373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.114;QD=5.49999;RBI=0.0240044;REFB=-0.0236058;REVB=-0.023656;RO=212;SAF=74;SAR=77;SRF=100;SRR=112;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192644;STB=0.509812;TYPE=snp;VARB=0.0310111;OID=.;OPOS=42026764;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:365:373:212:219:151:154:77:74:100:112:79:75:103:116 chr15 42041712 . G A 157.86 PASS AO=35;DP=67;FAO=34;FDP=66;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=6;FSRR=26;FWDB=0.0305553;FXX=0.0294074;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.958;QD=9.56702;RBI=0.0312164;REFB=-0.0117108;REVB=0.00639022;RO=32;SAF=10;SAR=25;SRF=7;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0733361;STB=0.565575;TYPE=snp;VARB=0.0135062;OID=.;OPOS=42041712;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:66:32:32:35:34:25:10:7:25:24:10:6:26 chr15 42103822 . C T 488.56 PASS AO=122;DP=262;FAO=123;FDP=260;FR=.;FRO=137;FSAF=58;FSAR=65;FSRF=55;FSRR=82;FWDB=0.0191964;FXX=0.0114064;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.109;QD=7.51626;RBI=0.0263177;REFB=-0.0185213;REVB=-0.0180033;RO=134;SAF=58;SAR=64;SRF=54;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.069282;STB=0.5372;TYPE=snp;VARB=0.0198612;OID=.;OPOS=42103822;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:262:260:134:137:122:123:64:58:54:80:65:58:55:82 chr15 42105918 . C G 155.46 PASS AO=37;DP=78;FAO=37;FDP=78;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=27;FSRF=15;FSRR=26;FWDB=-0.00859219;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.607;QD=7.97242;RBI=0.00894161;REFB=-0.0346288;REVB=-0.00247521;RO=39;SAF=10;SAR=27;SRF=14;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0978621;STB=0.560132;TYPE=snp;VARB=0.0284854;OID=.;OPOS=42105918;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:39:41:37:37:27:10:14:25:27:10:15:26 chr15 42109223 . T C 294.95 PASS AO=34;DP=36;FAO=34;FDP=36;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0128396;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.15;QD=32.7724;RBI=0.0337189;REFB=0.00379005;REVB=-0.0311786;RO=2;SAF=23;SAR=11;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0389367;STB=0.520821;TYPE=snp;VARB=-0.000756082;OID=.;OPOS=42109223;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:36:36:2:2:34:34:11:23:2:0:11:23:2:0 chr15 42111745 . C CAGGG 197.63 PASS AO=8;DP=50;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0827345;FXX=0.456423;HRUN=0;LEN=4;MLLD=61.5551;QD=31.6201;RBI=0.0827345;REFB=-0.101093;REVB=0;RO=29;SAF=8;SAR=0;SRF=29;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.0178834;OID=.;OPOS=42111746;OREF=-;OALT=AGGG;OMAPALT=CAGGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:8:50:24:25:1:24:0:1:0:6:29:8:0:29:0 chr15 42117783 . G C 85.96 PASS AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=10;FWDB=-0.0187004;FXX=0.0188644;HRUN=6;LEN=1;MLLD=120.594;QD=6.61194;RBI=0.051663;REFB=-0.0154392;REVB=0.0481597;RO=27;SAF=6;SAR=16;SRF=18;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.384829;STB=0.727066;TYPE=snp;VARB=0.0221762;OID=.;OPOS=42117783;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:49:52:27:30:22:22:16:6:18:9:16:6:20:10 chr15 42119900 . T C 351.55 PASS AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0039698;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2362;QD=36.0564;RBI=0.0331258;REFB=0.105361;REVB=-0.0328871;RO=1;SAF=26;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0374416;STB=0.519989;TYPE=snp;VARB=-0.0187564;OID=.;OPOS=42119900;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:39:39:1:1:38:38:12:26:0:1:12:26:0:1 chr15 42128553 . C T 180.51 PASS AO=33;DP=53;FAO=33;FDP=54;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.00640796;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=166.073;QD=13.3712;RBI=0.0318155;REFB=-0.038317;REVB=0.0311635;RO=20;SAF=13;SAR=20;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00436034;STB=0.51401;TYPE=snp;VARB=0.0167318;OID=.;OPOS=42128553;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:53:54:20:21:33:33:20:13:8:12:20:13:9:12 chr15 42135988 . C T 263.69 PASS AO=59;DP=119;FAO=60;FDP=119;FR=.;FRO=59;FSAF=19;FSAR=41;FSRF=22;FSRR=37;FWDB=0.00553725;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.416;QD=8.86349;RBI=0.0185685;REFB=-0.0247042;REVB=0.0177236;RO=59;SAF=18;SAR=41;SRF=23;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0868272;STB=0.531447;TYPE=snp;VARB=0.0227642;OID=.;OPOS=42135988;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:59:59:59:60:41:18:23:36:41:19:22:37 chr15 42138321 . A G 102.7 PASS AO=24;DP=54;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=4;FWDB=0.0164281;FXX=0.0370302;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.18;QD=7.89985;RBI=0.0272472;REFB=-0.0109091;REVB=-0.0217377;RO=27;SAF=14;SAR=10;SRF=23;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.276497;STB=0.659609;TYPE=snp;VARB=0.013961;OID=.;OPOS=42138321;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:52:27:28:24:24:10:14:23:4:10:14:24:4 chr15 42138456 . G A 334.85 PASS AO=69;DP=124;FAO=69;FDP=124;FR=.;FRO=55;FSAF=37;FSAR=32;FSRF=31;FSRR=24;FWDB=-0.011674;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2346;QD=10.8017;RBI=0.0630446;REFB=0.0150965;REVB=0.0619543;RO=54;SAF=37;SAR=32;SRF=30;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0156291;STB=0.512238;TYPE=snp;VARB=-0.0136216;OID=.;OPOS=42138456;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:54:55:69:69:32:37:30:24:32:37:31:24 chr15 42143533 . T G 399.49 PASS AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0816237;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.552;QD=35.5097;RBI=0.082145;REFB=-0.0297002;REVB=-0.00923919;RO=1;SAF=14;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154053;STB=0.508193;TYPE=snp;VARB=-0.00064623;OID=.;OPOS=42143533;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:45:45:1:1:44:44:30:14:0:1:30:14:0:1 chr15 42145936 . G C 161.25 PASS AO=38;DP=75;FAO=37;FDP=75;FR=.;FRO=38;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=26;FWDB=-0.0316347;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.6797;QD=8.60001;RBI=0.0720697;REFB=-0.0342982;REVB=0.0647556;RO=32;SAF=20;SAR=18;SRF=11;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150433;STB=0.612477;TYPE=snp;VARB=0.0452319;OID=.;OPOS=42145936;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:32:38:38:37:18:20:11:21:17:20:12:26 chr15 42149472 . T C 74.87 PASS AO=24;DP=67;FAO=24;FDP=67;FR=.;FRO=43;FSAF=5;FSAR=19;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=-0.0303454;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.133;QD=4.46972;RBI=0.0385491;REFB=-0.0122324;REVB=0.0237738;RO=41;SAF=5;SAR=19;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.39311;STB=0.731567;TYPE=snp;VARB=0.0221945;OID=.;OPOS=42149472;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:67:67:41:43:24:24:19:5:22:19:19:5:23:20 chr15 42149506 . G C 80.91 PASS AO=23;DP=59;FAO=23;FDP=60;FR=.;FRO=37;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=0.000770959;FXX=0.0322529;HRUN=3;LEN=1;MLLD=134.686;QD=5.39408;RBI=0.00638678;REFB=-0.0229543;REVB=-0.00634008;RO=36;SAF=5;SAR=18;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.412627;STB=0.733327;TYPE=snp;VARB=0.0202279;OID=.;OPOS=42149506;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:59:60:36:37:23:23:18:5:21:15:18:5:21:16 chr15 42149596 . C G 179.92 PASS AO=38;DP=74;FAO=39;FDP=75;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=29;FSRF=8;FSRR=28;FWDB=-0.0255558;FXX=0.0131562;HRUN=4;LEN=1;MLLD=99.0924;QD=9.59572;RBI=0.0268269;REFB=-0.00160766;REVB=-0.00815983;RO=36;SAF=10;SAR=28;SRF=8;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0475538;STB=0.521967;TYPE=snp;VARB=0.00164854;OID=.;OPOS=42149596;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:75:36:36:38:39:28:10:8:28:29:10:8:28 chr15 42150888 . G A 78.8 PASS AO=20;DP=48;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.0166259;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.709;QD=6.70617;RBI=0.0511423;REFB=-0.00934715;REVB=0.0483644;RO=27;SAF=7;SAR=13;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.244461;STB=0.640116;TYPE=snp;VARB=0.0116945;OID=.;OPOS=42150888;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:48:47:27:27:20:20:13:7:16:11:13:7:16:11 chr15 42166500 . C T 379.02 PASS AO=85;DP=165;FAO=85;FDP=164;FR=.;FRO=79;FSAF=52;FSAR=33;FSRF=52;FSRR=27;FWDB=0.034435;FXX=0.00606024;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.998;QD=9.24435;RBI=0.0407578;REFB=-0.0203194;REVB=0.0218043;RO=75;SAF=52;SAR=33;SRF=52;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0750042;STB=0.523804;TYPE=snp;VARB=0.0211;OID=.;OPOS=42166500;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:164:75:79:85:85:33:52:52:23:33:52:52:27 chr15 42169129 . G A 54.24 PASS AO=11;DP=25;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=14;FWDB=0.00920124;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=183.873;QD=8.34507;RBI=0.0124912;REFB=-0.0128383;REVB=0.00844796;RO=14;SAF=2;SAR=9;SRF=0;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.394267;STB=0.705656;TYPE=snp;VARB=0.0145916;OID=.;OPOS=42169129;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:25:26:14:14:11:12:9:2:0:14:10:2:0:14 chr15 42171462 . C T 240.51 PASS AO=66;DP=154;FAO=66;FDP=153;FR=.;FRO=87;FSAF=43;FSAR=23;FSRF=48;FSRR=39;FWDB=0.0227923;FXX=0.00649309;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.35;QD=6.28792;RBI=0.0231933;REFB=-0.00517771;REVB=0.00429402;RO=86;SAF=43;SAR=23;SRF=47;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112384;STB=0.560183;TYPE=snp;VARB=0.00533882;OID=.;OPOS=42171462;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:153:86:87:66:66:23:43:47:39:23:43:48:39 chr15 42171537 . A G 1429.38 PASS AO=143;DP=145;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=106;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0583435;FXX=0.00666622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.62;QD=38.3726;RBI=0.0587457;REFB=0;REVB=0.0068623;RO=0;SAF=101;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.30063e-05;OID=.;OPOS=42171537;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:145:149:0:0:143:149:42:101:0:0:43:106:0:0 chr15 42178155 . T C 435.55 PASS AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0156318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.737;QD=36.2956;RBI=0.0160464;REFB=-0.043151;REVB=0.00362408;RO=0;SAF=27;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.51219;TYPE=snp;VARB=0.00054087;OID=.;OPOS=42178155;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:48:48:0:1:47:47:20:27:0:0:20:27:0:1 chr15 42187492 . T C 57.72 PASS AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0735793;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.272;QD=6.99601;RBI=0.0808817;REFB=0.00705085;REVB=0.0335848;RO=19;SAF=6;SAR=8;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0971452;STB=0.556441;TYPE=snp;VARB=-0.0124927;OID=.;OPOS=42187492;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:33:33:19:19:14:14:8:6:10:9:8:6:10:9 chr15 42211486 . A G 104.95 PASS AO=30;DP=71;FAO=32;FDP=81;FR=.;FRO=49;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=33;FSRR=16;FWDB=0.00233311;FXX=0.0240935;HRUN=3;LEN=1;MLLD=219.007;QD=5.18275;RBI=0.0541239;REFB=-0.00721731;REVB=-0.0540736;RO=41;SAF=17;SAR=13;SRF=32;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232031;STB=0.587262;TYPE=snp;VARB=0.0126563;OID=.;OPOS=42211486;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:81:41:49:30:32:13:17:32:9:15:17:33:16 chr15 42287578 . G A 795.48 PASS AO=84;DP=87;FAO=87;FDP=90;FR=.;FRO=3;FSAF=44;FSAR=43;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.038452;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.6468;QD=35.3547;RBI=0.0414613;REFB=-0.167373;REVB=0.0155075;RO=3;SAF=44;SAR=40;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00934929;STB=0.505364;TYPE=snp;VARB=0.00306215;OID=.;OPOS=42287578;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:87:90:3:3:84:87:40:44:2:1:43:44:2:1 chr15 42371752 . A T 63.28 PASS AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.000222809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.968;QD=13.3225;RBI=0.0022034;REFB=0.0284707;REVB=0.0021921;RO=8;SAF=10;SAR=1;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.383323;STB=0.726749;TYPE=snp;VARB=-0.00420636;OID=.;OPOS=42371752;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:19:19:8:8:11:11:1:10:5:3:1:10:5:3 chr15 42373810 . G C 379.09 PASS AO=115;DP=257;FAO=115;FDP=284;FR=.;FRO=169;FSAF=34;FSAR=81;FSRF=86;FSRR=83;FWDB=-0.0518769;FXX=0.0307157;HRUN=3;LEN=1;MLLD=110.98;QD=5.33928;RBI=0.0576794;REFB=-0.0323207;REVB=0.0252132;RO=138;SAF=34;SAR=81;SRF=57;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130145;STB=0.635436;TYPE=snp;VARB=0.0644599;OID=.;OPOS=42373810;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:257:284:138:169:115:115:81:34:57:81:81:34:86:83 chr15 42377744 . C G 98.89 PASS AO=33;DP=93;FAO=33;FDP=93;FR=.;FRO=60;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=45;FWDB=0.0278757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.565;QD=4.25349;RBI=0.0314391;REFB=-0.0148471;REVB=0.0145382;RO=59;SAF=13;SAR=20;SRF=15;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171449;STB=0.601367;TYPE=snp;VARB=0.0222476;OID=.;OPOS=42377744;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:93:93:59:60:33:33:20:13:15:44:20:13:15:45 chr15 42433802 . A G 145.27 PASS AO=33;DP=67;FAO=33;FDP=67;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=6;FSRR=28;FWDB=0.00771799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.239;QD=8.67254;RBI=0.0379815;REFB=-0.00862332;REVB=-0.0371891;RO=34;SAF=12;SAR=21;SRF=6;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196746;STB=0.608636;TYPE=snp;VARB=0.00475359;OID=.;OPOS=42433802;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:34:34:33:33:21:12:6:28:21:12:6:28 chr15 42434254 . G A 111.68 PASS AO=29;DP=67;FAO=29;FDP=67;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=-0.00298845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.037;QD=6.66727;RBI=0.0304247;REFB=-0.00480434;REVB=-0.0302776;RO=38;SAF=12;SAR=17;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165012;STB=0.593365;TYPE=snp;VARB=0.00984931;OID=.;OPOS=42434254;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:38:38:29:29:17:12:22:16:17:12:22:16 chr15 42434837 . T C 198.34 PASS AO=37;DP=61;FAO=37;FDP=62;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.00714414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.422;QD=12.7961;RBI=0.0541223;REFB=-0.0217269;REVB=0.0536487;RO=24;SAF=15;SAR=22;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00836472;STB=0.502261;TYPE=snp;VARB=0.0139966;OID=.;OPOS=42434837;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:61:62:24:25:37:37:22:15:10:14:22:15:10:15 chr15 42553217 . AAT A,AA,AAA 781.02 PASS AO=15,40,33;DP=98;FAO=0,81,3;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=0,47,1;FSAR=0,34,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112368,0.0266653,0.027616;FXX=0.0344788;HRUN=7,1,1;LEN=2,1,1;MLLD=193.647,197.986,194.849;QD=37.1916;RBI=0.0160167,0.0284768,0.0290452;REFB=0,0,0;REVB=-0.0114135,-0.00999456,-0.00899868;RO=2;SAF=11,22,15;SAR=4,18,18;SRF=0;SRR=2;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.180627,0.0492943,0.0491206;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=del,del,snp;VARB=0.0122057,-0.00727393,-0.00714017;OID=.,.,.;OPOS=42553218,42553219,42553219;OREF=AT,T,T;OALT=-,-,A;OMAPALT=A,AA,AAA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:15,40,33:90:0,81,3:84:0:0,47,1:0,34,2:0:0:5:2:11,22,15:4,18,18:0:2 chr15 42565588 . C A 83.33 PASS AO=39;DP=79;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0375162;FXX=0.0434688;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.398;QD=7.57542;RBI=0.0422588;REFB=-0.00839301;REVB=-0.0194509;RO=37;SAF=17;SAR=22;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115576;STB=0.518415;TYPE=snp;VARB=0.0131569;OID=.;OPOS=42565588;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:79:44:37:24:39:20:22:17:21:16:11:9:10:14 chr15 42568547 . C G 795.95 PASS AO=85;DP=91;FAO=86;FDP=87;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0345212;FXX=0.0543419;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.248;QD=36.5953;RBI=0.0554899;REFB=-0.185164;REVB=0.0434445;RO=0;SAF=21;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.87826e-08;STB=0.503875;TYPE=snp;VARB=0.0036539;OID=.;OPOS=42568547;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:91:87:0:1:85:86:64:21:0:0:64:22:0:1 chr15 42570718 . A G 1059.61 PASS AO=103;DP=103;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0582087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.317;QD=38.5311;RBI=0.0609442;REFB=0;REVB=0.0180538;RO=0;SAF=40;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.15547e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000114097;OID=.;OPOS=42570718;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:103:110:0:0:103:110:63:40:0:0:67:43:0:0 chr15 42575963 . A G 1229.48 PASS AO=128;DP=128;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0644143;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.1389;QD=38.4214;RBI=0.078256;REFB=0;REVB=0.0444388;RO=0;SAF=71;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.30639e-05;OID=.;OPOS=42575963;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:128:128:0:0:128:128:57:71:0:0:57:71:0:0 chr15 42579948 . T C 1555.33 PASS AO=162;DP=163;FAO=163;FDP=163;FR=.;FRO=0;FSAF=106;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0447398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.551;QD=38.1676;RBI=0.0463423;REFB=0;REVB=0.0120813;RO=0;SAF=105;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.80256e-05;OID=.;OPOS=42579948;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:163:163:0:0:162:163:57:105:0:0:57:106:0:0 chr15 42618531 . T A 459.69 PASS AO=102;DP=202;FAO=105;FDP=205;FR=.;FRO=100;FSAF=40;FSAR=65;FSRF=35;FSRR=65;FWDB=0.0136285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.036;QD=8.96948;RBI=0.0157904;REFB=-0.0222104;REVB=0.00797492;RO=98;SAF=38;SAR=64;SRF=34;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0246502;STB=0.516126;TYPE=snp;VARB=0.0185451;OID=.;OPOS=42618531;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:205:98:100:102:105:64:38:34:64:65:40:35:65 chr15 42834962 . C T 252.64 PASS AO=73;DP=177;FAO=73;FDP=176;FR=.;FRO=103;FSAF=44;FSAR=29;FSRF=65;FSRR=38;FWDB=-0.0201163;FXX=0.0112353;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.09;QD=5.7418;RBI=0.0216692;REFB=-0.00972951;REVB=0.00805529;RO=104;SAF=44;SAR=29;SRF=66;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0351942;STB=0.517429;TYPE=snp;VARB=0.0158407;OID=.;OPOS=42834962;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:176:104:103:73:73:29:44:66:38:29:44:65:38 chr15 42953382 . T G 664.5 PASS AO=143;DP=267;FAO=144;FDP=268;FR=.;FRO=124;FSAF=58;FSAR=86;FSRF=82;FSRR=42;FWDB=0.00348163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.739;QD=9.91795;RBI=0.00863937;REFB=-0.00843959;REVB=0.00790676;RO=122;SAF=58;SAR=85;SRF=81;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216436;STB=0.618562;TYPE=snp;VARB=0.00800667;OID=.;OPOS=42953382;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:267:268:122:124:143:144:85:58:81:41:86:58:82:42 chr15 42955592 . TC T 464.91 PASS AO=61;DP=86;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.226874;FXX=0.0705799;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.8006;QD=23.5397;RBI=0.328253;REFB=0.0158953;REVB=0.23723;RO=24;SAF=26;SAR=35;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0.567227;SSSB=-0.0392961;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0420885;OID=.;OPOS=42955593;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:61:86:79:79:0:31:48:0:0:33:24:26:35:12:12 chr15 42957532 . T G 188.04 PASS AO=59;DP=153;FAO=60;FDP=155;FR=.;FRO=95;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=38;FSRR=57;FWDB=0.0376117;FXX=0.012738;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.837;QD=4.85252;RBI=0.0376533;REFB=-0.0268708;REVB=-0.00176955;RO=93;SAF=24;SAR=35;SRF=36;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0221805;STB=0.51054;TYPE=snp;VARB=0.0561474;OID=.;OPOS=42957532;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:155:93:95:59:60:35:24:36:57:35:25:38:57 chr15 42977526 . A C 84.05 PASS AO=16;DP=38;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=3;FSAR=18;FSRF=6;FSRR=18;FWDB=-0.0191003;FXX=0.0217344;HRUN=2;LEN=1;MLLD=36.1249;QD=7.47148;RBI=0.0697821;REFB=-0.0134125;REVB=0.0671172;RO=22;SAF=4;SAR=12;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0297311;STB=0.599893;TYPE=snp;VARB=0.0396358;OID=.;OPOS=42977526;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:38:45:22:24:16:21:12:4:6:16:18:3:6:18 chr15 42977676 . G A 138.96 PASS AO=28;DP=73;FAO=33;FDP=70;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=0.000331837;FXX=0.078937;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.374;QD=7.94072;RBI=0.0144869;REFB=-0.0149526;REVB=-0.0144831;RO=27;SAF=8;SAR=20;SRF=8;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0113173;STB=0.541641;TYPE=snp;VARB=0.0191677;OID=.;OPOS=42977676;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:70:27:37:28:33:20:8:8:19:22:11:15:22 chr15 42981022 . A G 408.76 PASS AO=104;DP=225;FAO=104;FDP=223;FR=.;FRO=119;FSAF=49;FSAR=55;FSRF=44;FSRR=75;FWDB=0.0168887;FXX=0.00888849;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.9;QD=7.332;RBI=0.0203536;REFB=-0.0124813;REVB=-0.0113596;RO=119;SAF=49;SAR=55;SRF=44;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0990296;STB=0.554626;TYPE=snp;VARB=0.0167824;OID=.;OPOS=42981022;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:225:223:119:119:104:104:55:49:44:75:55:49:44:75 chr15 42981806 . G A 181.04 PASS AO=50;DP=116;FAO=50;FDP=118;FR=.;FRO=68;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=33;FSRR=35;FWDB=-0.0118308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.481;QD=6.13705;RBI=0.0124917;REFB=0.00347898;REVB=0.00400961;RO=64;SAF=28;SAR=22;SRF=31;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0761171;STB=0.543209;TYPE=snp;VARB=-0.00413431;OID=.;OPOS=42981806;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:118:64:68:50:50:22:28:31:33:22:28:33:35 chr15 42982340 . C T 259.28 PASS AO=56;DP=106;FAO=56;FDP=106;FR=.;FRO=50;FSAF=19;FSAR=37;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=0.0164103;FXX=0.00934492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.0803;QD=9.78404;RBI=0.0164377;REFB=-0.0201412;REVB=0.000949172;RO=48;SAF=19;SAR=37;SRF=21;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0889274;STB=0.551217;TYPE=snp;VARB=0.0127493;OID=.;OPOS=42982340;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:48:50:56:56:37:19:21:27:37:19:22:28 chr15 42982891 . A C 299.98 PASS AO=61;DP=110;FAO=61;FDP=110;FR=.;FRO=49;FSAF=11;FSAR=50;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=0.0222709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.302;QD=10.9084;RBI=0.0313043;REFB=-0.0197697;REVB=-0.0219993;RO=49;SAF=11;SAR=50;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.340521;STB=0.68853;TYPE=snp;VARB=0.0232153;OID=.;OPOS=42982891;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:49:49:61:61:50:11:25:24:50:11:25:24 chr15 42983923 . A G 462.28 PASS AO=87;DP=146;FAO=89;FDP=148;FR=.;FRO=59;FSAF=29;FSAR=60;FSRF=16;FSRR=43;FWDB=0.0224351;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.3429;QD=12.4939;RBI=0.0236716;REFB=-0.0263508;REVB=0.00755035;RO=59;SAF=27;SAR=60;SRF=17;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0194799;STB=0.525227;TYPE=snp;VARB=0.0195692;OID=.;OPOS=42983923;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:148:59:59:87:89:60:27:17:42:60:29:16:43 chr15 43011011 . GA G 29.48 PASS AO=36;DP=137;FAO=40;FDP=125;FR=.;FRO=85;FSAF=8;FSAR=32;FSRF=25;FSRR=60;FWDB=0.0624572;FXX=0.0310053;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.1643;QD=0.943208;RBI=0.0634517;REFB=-0.0615064;REVB=-0.0111904;RO=66;SAF=8;SAR=28;SRF=22;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160315;STB=0.589237;TYPE=del;VARB=0.0811464;OID=.;OPOS=43011012;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:36:118:40:125:85:8:32:25:60:29:66:8:28:22:44 chr15 43017426 . T G 170.84 PASS AO=49;DP=116;FAO=48;FDP=116;FR=.;FRO=68;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=41;FSRR=27;FWDB=0.00508476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.9333;QD=5.8911;RBI=0.0210707;REFB=-0.000708641;REVB=-0.020448;RO=64;SAF=24;SAR=25;SRF=40;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1365;STB=0.572216;TYPE=snp;VARB=-0.000561895;OID=.;OPOS=43017426;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:64:68:49:48:25:24:40:24:25:23:41:27 chr15 43020983 . G A 28.99 PASS AO=7;DP=19;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=0.0762331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.371;QD=6.10307;RBI=0.0873244;REFB=0.00435862;REVB=0.042592;RO=12;SAF=5;SAR=2;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.520913;STB=0.810067;TYPE=snp;VARB=0.000620809;OID=.;OPOS=43020983;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:19:19:12:12:7:7:2:5:2:10:2:5:2:10 chr15 43021563 . G A 161.49 PASS AO=37;DP=74;FAO=37;FDP=75;FR=.;FRO=38;FSAF=8;FSAR=29;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=-0.0590906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.34;QD=8.61272;RBI=0.077126;REFB=-0.0239882;REVB=0.0495654;RO=37;SAF=8;SAR=29;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214544;STB=0.630358;TYPE=snp;VARB=0.0248345;OID=.;OPOS=43021563;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:75:37:38:37:37:29:8:15:22:29:8:16:22 chr15 43023482 . T C 222.3 PASS AO=54;DP=122;FAO=57;FDP=126;FR=.;FRO=69;FSAF=34;FSAR=23;FSRF=34;FSRR=35;FWDB=-0.0103088;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.492;QD=7.05709;RBI=0.0165181;REFB=-0.0152248;REVB=-0.0129065;RO=64;SAF=32;SAR=22;SRF=32;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0914846;STB=0.557672;TYPE=snp;VARB=0.0220741;OID=.;OPOS=43023482;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:126:64:69:54:57:22:32:32:32:23:34:34:35 chr15 43028592 . G A 22.49 PASS AO=6;DP=19;FAO=6;FDP=19;FR=.;FRO=13;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=0.0792093;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=188.298;QD=4.73395;RBI=0.0835289;REFB=-0.0194454;REVB=0.0265135;RO=13;SAF=1;SAR=5;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110573;STB=0.57117;TYPE=snp;VARB=0.0433363;OID=.;OPOS=43028592;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:19:19:13:13:6:6:5:1:3:10:5:1:3:10 chr15 43044852 . T C 328.13 PASS AO=70;DP=142;FAO=76;FDP=147;FR=.;FRO=71;FSAF=42;FSAR=34;FSRF=24;FSRR=47;FWDB=0.0068487;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.8943;QD=8.92883;RBI=0.0639978;REFB=-0.00132048;REVB=0.0636303;RO=70;SAF=41;SAR=29;SRF=23;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230311;STB=0.602524;TYPE=snp;VARB=0.00411528;OID=.;OPOS=43044852;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:147:70:71:70:76:29:41:23:47:34:42:24:47 chr15 43170793 . A G 19.03 PASS AO=8;DP=38;FAO=9;FDP=39;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=0.0219401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.19;QD=1.95142;RBI=0.030084;REFB=-0.0138117;REVB=-0.0205834;RO=27;SAF=7;SAR=1;SRF=19;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.306345;STB=0.779731;TYPE=snp;VARB=0.031867;OID=.;OPOS=43170793;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:38:39:27:30:8:9:1:7:19:8:1:8:19:11 chr15 43258421 . AGG AG,A 612.47 PASS AO=63,19;DP=116;FAO=91,20;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=37,11;FSAR=54,9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0327603,0.0178072;FXX=0.00892777;HRUN=4,4;LEN=1,2;MLLD=12.412,13.5632;QD=22.071;RBI=0.40083,0.213103;REFB=-0.0165006,-0.0203541;REVB=0.399489,0.212357;RO=23;SAF=25,15;SAR=38,4;SRF=4;SRR=19;SSEN=0.515464,0.515464;SSEP=0,0;SSSB=0.119259,0.56369;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=-0.0259007,0.053127;OID=.,.;OPOS=43258422,43258422;OREF=G,GG;OALT=-,-;OMAPALT=AG,A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:63,19:108:91,20:111:0:37,11:54,9:0:0:6:23:25,15:38,4:4:19 chr15 43545728 . G A 95.16 PASS AO=25;DP=61;FAO=25;FDP=60;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=29;FSRR=6;FWDB=0.0028535;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.431;QD=6.34399;RBI=0.0241614;REFB=-0.0281625;REVB=-0.0239923;RO=33;SAF=17;SAR=8;SRF=29;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.257281;STB=0.607185;TYPE=snp;VARB=0.0235558;OID=.;OPOS=43545728;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:61:60:33:35:25:25:8:17:29:4:8:17:29:6 chr15 43571390 . C G 101.88 PASS AO=52;DP=182;FAO=52;FDP=182;FR=.;FRO=130;FSAF=8;FSAR=44;FSRF=69;FSRR=61;FWDB=-0.0300366;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3432;QD=2.23903;RBI=0.0333668;REFB=-0.00944295;REVB=0.0145309;RO=130;SAF=8;SAR=44;SRF=69;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.505987;STB=0.801198;TYPE=snp;VARB=0.0214431;OID=.;OPOS=43571390;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:182:130:130:52:52:44:8:69:61:44:8:69:61 chr15 43579566 . A G 52.89 PASS AO=16;DP=45;FAO=16;FDP=45;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=20;FWDB=0.0287534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.389;QD=4.70099;RBI=0.0421132;REFB=-0.01459;REVB=-0.0307696;RO=28;SAF=8;SAR=8;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194986;STB=0.622079;TYPE=snp;VARB=0.0102578;OID=.;OPOS=43579566;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:45:45:28:29:16:16:8:8:9:19:8:8:9:20 chr15 43632549 . T C 266.33 PASS AO=61;DP=131;FAO=64;FDP=133;FR=.;FRO=69;FSAF=18;FSAR=46;FSRF=14;FSRR=55;FWDB=-0.0103768;FXX=0.00746213;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.102;QD=8.00993;RBI=0.0213844;REFB=-0.00460909;REVB=0.0186979;RO=67;SAF=17;SAR=44;SRF=12;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124979;STB=0.552568;TYPE=snp;VARB=0.00628569;OID=.;OPOS=43632549;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:133:67:69:61:64:44:17:12:55:46:18:14:55 chr15 43650384 . G A 130.89 PASS AO=24;DP=50;FAO=28;FDP=54;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=21;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.00170402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.128;QD=9.69527;RBI=0.025005;REFB=-0.0242703;REVB=-0.0249469;RO=26;SAF=7;SAR=17;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173108;STB=0.619474;TYPE=snp;VARB=0.0269923;OID=.;OPOS=43650384;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:54:26:26:24:28:17:7:12:14:21:7:12:14 chr15 43653322 . G A 441.49 PASS AO=108;DP=224;FAO=108;FDP=224;FR=.;FRO=116;FSAF=49;FSAR=59;FSRF=55;FSRR=61;FWDB=-0.0178246;FXX=0.0132153;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8182;QD=7.88374;RBI=0.0182484;REFB=-0.0309623;REVB=-0.00390987;RO=116;SAF=49;SAR=59;SRF=55;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0193326;STB=0.510651;TYPE=snp;VARB=0.0272686;OID=.;OPOS=43653322;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:224:224:116:116:108:108:59:49:55:61:59:49:55:61 chr15 43658935 . C T 88.58 PASS AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=0.0367466;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=193.181;QD=10.4216;RBI=0.0369606;REFB=0.007921;REVB=0.00397161;RO=16;SAF=5;SAR=13;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0990444;STB=0.555497;TYPE=snp;VARB=-0.00558385;OID=.;OPOS=43658935;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:34:34:16:16:18:18:13:5:3:13:13:5:3:13 chr15 43661802 . T C 365.42 PASS AO=66;DP=105;FAO=66;FDP=105;FR=.;FRO=39;FSAF=27;FSAR=39;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=0.00132147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.268;QD=13.9207;RBI=0.00775337;REFB=-0.0107546;REVB=-0.00763992;RO=38;SAF=27;SAR=39;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0803851;STB=0.539264;TYPE=snp;VARB=0.00576297;OID=.;OPOS=43661802;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:38:39:66:66:39:27:20:18:39:27:20:19 chr15 43707808 . A T 393.8 PASS AO=108;DP=246;FAO=108;FDP=246;FR=.;FRO=138;FSAF=81;FSAR=27;FSRF=81;FSRR=57;FWDB=0.00089056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.215;QD=6.40324;RBI=0.0222862;REFB=-0.0110395;REVB=-0.0222684;RO=137;SAF=81;SAR=27;SRF=81;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189292;STB=0.608674;TYPE=snp;VARB=0.0127188;OID=.;OPOS=43707808;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:246:246:137:138:108:108:27:81:81:56:27:81:81:57 chr15 43724646 . T G 397.22 PASS AO=106;DP=239;FAO=106;FDP=238;FR=.;FRO=132;FSAF=69;FSAR=37;FSRF=69;FSRR=63;FWDB=-0.0211871;FXX=0.00418393;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.639;QD=6.67603;RBI=0.0239448;REFB=-0.0145663;REVB=-0.0111561;RO=131;SAF=69;SAR=37;SRF=68;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137573;STB=0.574698;TYPE=snp;VARB=0.0227484;OID=.;OPOS=43724646;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:239:238:131:132:106:106:37:69:68:63:37:69:69:63 chr15 43748304 . A G 269.28 PASS AO=65;DP=135;FAO=65;FDP=135;FR=.;FRO=70;FSAF=23;FSAR=42;FSRF=20;FSRR=50;FWDB=0.0138012;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.273;QD=7.97863;RBI=0.0151448;REFB=-0.00142783;REVB=0.0062363;RO=66;SAF=23;SAR=42;SRF=16;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115883;STB=0.539509;TYPE=snp;VARB=0.00122904;OID=.;OPOS=43748304;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:66:70:65:65:42:23:16:50:42:23:20:50 chr15 43767774 . G C 399.93 PASS AO=78;DP=133;FAO=78;FDP=133;FR=.;FRO=55;FSAF=44;FSAR=34;FSRF=28;FSRR=27;FWDB=-0.030798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.6505;QD=12.028;RBI=0.0328589;REFB=-0.0570794;REVB=-0.0114539;RO=54;SAF=44;SAR=34;SRF=28;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.034694;STB=0.522987;TYPE=snp;VARB=0.0393559;OID=.;OPOS=43767774;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:54:55:78:78:34:44:28:26:34:44:28:27 chr15 43815999 . C T 28.55 PASS AO=16;DP=70;FAO=16;FDP=70;FR=.;FRO=54;FSAF=1;FSAR=15;FSRF=33;FSRR=21;FWDB=-0.0314828;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=133.648;QD=1.63138;RBI=0.0336688;REFB=-0.00684346;REVB=0.0119341;RO=51;SAF=1;SAR=15;SRF=30;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.681753;STB=0.93351;TYPE=snp;VARB=0.0315449;OID=.;OPOS=43815999;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:70:70:51:54:16:16:15:1:30:21:15:1:33:21 chr15 43816000 . G T 11.23 PASS AO=11;DP=67;FAO=11;FDP=69;FR=.;FRO=58;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=23;FSRR=35;FWDB=-0.0310655;FXX=0.0142837;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.479;QD=0.65116;RBI=0.0310655;REFB=-0.0156752;REVB=1.72104e-05;RO=54;SAF=10;SAR=1;SRF=19;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.649356;STB=0.915302;TYPE=snp;VARB=0.0434499;OID=.;OPOS=43816000;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:67:69:54:58:11:11:1:10:19:35:1:10:23:35 chr15 43816917 . G A 245.41 PASS AO=40;DP=91;FAO=49;FDP=91;FR=.,HEALED;FRO=41;FSAF=33;FSAR=16;FSRF=33;FSRR=8;FWDB=0.00421844;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=138.975;QD=10.7874;RBI=0.0542948;REFB=-0.0532613;REVB=0.0541306;RO=26;SAF=25;SAR=15;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0832329;STB=0.571401;TYPE=snp;VARB=0.00991727;OID=.;OPOS=43816917;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:91:26:41:40:49:15:25:19:7:16:33:33:8 chr15 43817404 . G A 47.36 PASS AO=21;DP=65;FAO=19;FDP=65;FR=.;FRO=46;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=33;FWDB=-0.036889;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.7069;QD=2.9142;RBI=0.0491832;REFB=-0.00151451;REVB=-0.0325299;RO=44;SAF=8;SAR=13;SRF=13;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107944;STB=0.603672;TYPE=snp;VARB=0.000501305;OID=.;OPOS=43817404;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:65:65:44:46:21:19:13:8:13:31:11:8:13:33 chr15 43817406 . T C 53.77 PASS AO=19;DP=65;FAO=20;FDP=62;FR=.;FRO=42;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=29;FWDB=-0.0433842;FXX=0.0461467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.8524;QD=3.46877;RBI=0.0483896;REFB=-0.0148918;REVB=-0.0214329;RO=38;SAF=8;SAR=11;SRF=13;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0936002;STB=0.565454;TYPE=snp;VARB=0.0254912;OID=.;OPOS=43817406;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:65:62:38:42:19:20:11:8:13:25:12:8:13:29 chr15 43818079 . G A 43.21 PASS AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.0377493;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.9116;QD=8.64172;RBI=0.0638794;REFB=-0.0454761;REVB=0.0515322;RO=8;SAF=6;SAR=3;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.238988;STB=0.620415;TYPE=snp;VARB=0.0196767;OID=.;OPOS=43818079;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:20:20:8:11:9:9:3:6:3:5:3:6:5:6 chr15 44038899 . C T 247.35 PASS AO=31;DP=35;FAO=31;FDP=35;FR=.;FRO=4;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0165717;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=172.024;QD=28.2686;RBI=0.0166311;REFB=-0.0392028;REVB=-0.00140432;RO=4;SAF=16;SAR=15;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0498038;STB=0.526785;TYPE=snp;VARB=0.00214359;OID=.;OPOS=44038899;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:35:35:4:4:31:31:15:16:3:1:15:16:3:1 chr15 44061802 . C T 1345.58 PASS AO=140;DP=140;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0328646;FXX=0.00704176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.7524;QD=38.1724;RBI=0.0413012;REFB=0;REVB=0.0250141;RO=0;SAF=50;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.68063e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000164568;OID=.;OPOS=44061802;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:140:141:0:0:140:141:90:50:0:0:91:50:0:0 chr15 44120559 . T G 1462.3 PASS AO=81;DP=175;FAO=173;FDP=173;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=74;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0578212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.982;QD=33.8104;RBI=0.0651096;REFB=0;REVB=0.0299328;RO=0;SAF=48;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.28649e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000241388;OID=.;OPOS=44120559;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:165:173:0:0:81:173:33:48:0:0:99:74:0:0 chr15 44120560 . C G 384.11 PASS AO=82;DP=167;FAO=88;FDP=173;FR=.;FRO=85;FSAF=21;FSAR=67;FSRF=52;FSRR=33;FWDB=0.00644576;FXX=0.0057468;HRUN=3;LEN=1;MLLD=82.082;QD=8.88108;RBI=0.0294368;REFB=-0.101176;REVB=0.0287225;RO=84;SAF=21;SAR=61;SRF=52;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.352607;STB=0.699566;TYPE=snp;VARB=0.0245496;OID=.;OPOS=44120560;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:173:84:85:82:88:61:21:52:32:67:21:52:33 chr15 44943757 . A G 472.31 PASS AO=100;DP=183;FAO=100;FDP=183;FR=.;FRO=83;FSAF=69;FSAR=31;FSRF=50;FSRR=33;FWDB=-0.0117948;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=254.428;QD=10.3237;RBI=0.0132633;REFB=-0.00324942;REVB=0.00606607;RO=83;SAF=69;SAR=31;SRF=50;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0820035;STB=0.54484;TYPE=snp;VARB=0.00263003;OID=.;OPOS=44943757;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:183:83:83:100:100:31:69:50:33:31:69:50:33 chr15 44966389 . T C 306.1 PASS AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0511486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.0592;QD=37.1035;RBI=0.0511919;REFB=0;REVB=-0.00210454;RO=0;SAF=12;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00105295;OID=.;OPOS=44966389;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:33:33:0:0:33:33:21:12:0:0:21:12:0:0 chr15 45047573 . C T 179.45 PASS AO=51;DP=123;FAO=51;FDP=123;FR=.;FRO=72;FSAF=17;FSAR=34;FSRF=41;FSRR=31;FWDB=-0.080184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.713;QD=5.83571;RBI=0.0816812;REFB=-0.0186606;REVB=-0.0155676;RO=71;SAF=17;SAR=34;SRF=40;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.242908;STB=0.640828;TYPE=snp;VARB=0.0204938;OID=.;OPOS=45047573;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:71:72:51:51:34:17:40:31:34:17:41:31 chr15 45048651 . C T 317.81 PASS AO=67;DP=125;FAO=68;FDP=126;FR=.;FRO=58;FSAF=33;FSAR=35;FSRF=28;FSRR=30;FWDB=-0.00182431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.637;QD=10.0893;RBI=0.00704335;REFB=-0.0349346;REVB=0.00680299;RO=58;SAF=32;SAR=35;SRF=28;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00436169;STB=0.501168;TYPE=snp;VARB=0.0425411;OID=.;OPOS=45048651;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:126:58:58:67:68:35:32:28:30:35:33:28:30 chr15 45265763 . CT C 54.94 PASS AO=41;DP=129;FAO=41;FDP=126;FR=.;FRO=85;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=44;FSRR=41;FWDB=0.0792587;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=21.4996;QD=1.74427;RBI=0.0844514;REFB=-0.000813838;REVB=-0.0291565;RO=80;SAF=17;SAR=24;SRF=42;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126938;STB=0.569837;TYPE=del;VARB=0.00315434;OID=.;OPOS=45265764;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:41:126:41:126:85:17:24:44:41:54:80:17:24:42:38 chr15 45353230 . C T 180.42 PASS AO=48;DP=108;FAO=48;FDP=108;FR=.;FRO=60;FSAF=13;FSAR=35;FSRF=38;FSRR=22;FWDB=-0.0449556;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.8428;QD=6.6821;RBI=0.0602553;REFB=-0.0194009;REVB=-0.040121;RO=58;SAF=13;SAR=35;SRF=36;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.353831;STB=0.706563;TYPE=snp;VARB=0.0229336;OID=.;OPOS=45353230;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:58:60:48:48:35:13:36:22:35:13:38:22 chr15 45361180 . A T 202.09 PASS AO=55;DP=131;FAO=56;FDP=132;FR=.;FRO=76;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=40;FSRR=36;FWDB=0.0065233;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.471;QD=6.12393;RBI=0.00652472;REFB=-0.00934789;REVB=0.000136426;RO=76;SAF=28;SAR=27;SRF=40;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0178096;STB=0.515146;TYPE=snp;VARB=0.0126015;OID=.;OPOS=45361180;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:132:76:76:55:56:27:28:40:36:28:28:40:36 chr15 45365724 . C T 49.08 PASS AO=36;DP=164;FAO=36;FDP=164;FR=.;FRO=128;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=104;FWDB=-0.0123335;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=176.067;QD=1.19707;RBI=0.0183166;REFB=-0.00497193;REVB=-0.0135419;RO=128;SAF=22;SAR=14;SRF=24;SRR=104;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.515371;STB=0.801112;TYPE=snp;VARB=0.0211707;OID=.;OPOS=45365724;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:164:164:128:128:36:36:14:22:24:104:14:22:24:104 chr15 45365905 . G C 134.39 PASS AO=37;DP=93;FAO=38;FDP=93;FR=.;FRO=55;FSAF=12;FSAR=26;FSRF=38;FSRR=17;FWDB=9.9953e-05;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=188.611;QD=5.78035;RBI=0.000556357;REFB=-0.00650498;REVB=-0.000547304;RO=55;SAF=11;SAR=26;SRF=38;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.405433;STB=0.715749;TYPE=snp;VARB=0.011497;OID=.;OPOS=45365905;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:55:55:37:38:26:11:38:17:26:12:38:17 chr15 45392075 . G A 28.57 PASS AO=15;DP=69;FAO=16;FDP=70;FR=.;FRO=54;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=35;FWDB=0.0511212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.249;QD=1.63236;RBI=0.0602171;REFB=-0.00077097;REVB=0.0318233;RO=51;SAF=3;SAR=12;SRF=19;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260051;STB=0.594701;TYPE=snp;VARB=0.00235114;OID=.;OPOS=45392075;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:69:70:51:54:15:16:12:3:19:32:12:4:19:35 chr15 45400358 . C G 83.32 PASS AO=3;DP=38;FAO=18;FDP=34;FR=.,HEALED;FRO=16;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.116753;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=179.713;QD=9.80251;RBI=0.116816;REFB=0.0192956;REVB=0.00385944;RO=13;SAF=0;SAR=3;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.64472;STB=0.675452;TYPE=snp;VARB=-0.0293628;OID=.;OPOS=45400358;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:20:34:13:16:3:18:3:0:7:6:3:15:9:7 chr15 45404066 . G A 170.8 PASS AO=30;DP=48;FAO=30;FDP=48;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=4;FWDB=0.00515351;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=197.588;QD=14.2333;RBI=0.00669433;REFB=-0.0178539;REVB=-0.00427264;RO=16;SAF=14;SAR=16;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178654;STB=0.615311;TYPE=snp;VARB=0.0104771;OID=.;OPOS=45404066;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:48:48:16:18:30:30:16:14:12:4:16:14:14:4 chr15 45408414 . C G 460.53 PASS AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0169466;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6574;QD=36.8428;RBI=0.074021;REFB=-0.122563;REVB=0.072055;RO=1;SAF=23;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.017757;STB=0.50943;TYPE=snp;VARB=0.00532123;OID=.;OPOS=45408414;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:50:50:1:1:49:49:26:23:0:1:26:23:0:1 chr15 45408933 . T C 86.91 PASS AO=23;DP=55;FAO=23;FDP=55;FR=.;FRO=32;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.0144352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.515;QD=6.32089;RBI=0.019242;REFB=-0.0134885;REVB=0.0127233;RO=32;SAF=6;SAR=17;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267022;STB=0.653704;TYPE=snp;VARB=0.0130699;OID=.;OPOS=45408933;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:55:55:32:32:23:23:17:6:16:16:17:6:16:16 chr15 45409732 . C G 61.9 PASS AO=20;DP=113;FAO=35;FDP=127;FR=.;FRO=92;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=33;FSRR=59;FWDB=-0.0147527;FXX=0.0155027;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.85;QD=1.94949;RBI=0.0322254;REFB=-0.0132873;REVB=0.0286502;RO=85;SAF=11;SAR=9;SRF=31;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232904;STB=0.509922;TYPE=snp;VARB=0.0444249;OID=.;OPOS=45409732;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:113:127:85:92:20:35:9:11:31:54:22:13:33:59 chr15 45412435 . G A 89.09 PASS AO=26;DP=66;FAO=26;FDP=67;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=-0.056675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.3228;QD=5.31894;RBI=0.0867535;REFB=-0.0405248;REVB=-0.065682;RO=40;SAF=10;SAR=16;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0445202;STB=0.534579;TYPE=snp;VARB=0.062982;OID=.;OPOS=45412435;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:66:67:40:41:26:26:16:10:17:23:16:10:18:23 chr15 45444518 . A G 152.92 PASS AO=30;DP=53;FAO=30;FDP=53;FR=.;FRO=23;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=3;FWDB=0.00976114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.1528;QD=11.5415;RBI=0.0330195;REFB=-0.0521739;REVB=-0.0315437;RO=23;SAF=17;SAR=13;SRF=20;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253435;STB=0.638696;TYPE=snp;VARB=0.0233336;OID=.;OPOS=45444518;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:53:53:23:23:30:30:13:17:20:3:13:17:20:3 chr15 45446156 . C T 295.63 PASS AO=65;DP=136;FAO=69;FDP=140;FR=.;FRO=71;FSAF=35;FSAR=34;FSRF=25;FSRR=46;FWDB=-0.00336669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.879;QD=8.44662;RBI=0.012162;REFB=-0.00303339;REVB=-0.0116868;RO=71;SAF=31;SAR=34;SRF=25;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118885;STB=0.57849;TYPE=snp;VARB=0.00138246;OID=.;OPOS=45446156;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:140:71:71:65:69:34:31:25:46:34:35:25:46 chr15 45457458 . G T 433.81 PASS AO=124;DP=295;FAO=124;FDP=291;FR=.;FRO=167;FSAF=57;FSAR=67;FSRF=56;FSRR=111;FWDB=-0.0785769;FXX=0.0135589;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5579;QD=5.96298;RBI=0.0821038;REFB=0.00701468;REVB=0.0238056;RO=167;SAF=57;SAR=67;SRF=56;SRR=111;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130983;STB=0.572659;TYPE=snp;VARB=-0.0106724;OID=.;OPOS=45457458;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:295:291:167:167:124:124:67:57:56:111:67:57:56:111 chr15 45457519 . T G 671.33 PASS AO=140;DP=255;FAO=141;FDP=253;FR=.;FRO=112;FSAF=20;FSAR=121;FSRF=28;FSRR=84;FWDB=-0.0213655;FXX=0.00784283;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.2672;QD=10.6139;RBI=0.027876;REFB=-0.00451978;REVB=-0.0179049;RO=111;SAF=19;SAR=121;SRF=27;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160984;STB=0.586179;TYPE=snp;VARB=0.00746618;OID=.;OPOS=45457519;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:255:253:111:112:140:141:121:19:27:84:121:20:28:84 chr15 45467540 . C G 375.69 PASS AO=38;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.046441;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.364;QD=38.5323;RBI=0.0554232;REFB=0;REVB=0.0302483;RO=0;SAF=11;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000138082;OID=.;OPOS=45467540;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:38:39:0:0:38:39:27:11:0:0:28:11:0:0 chr15 45491136 . C G 185.19 PASS AO=34;DP=56;FAO=34;FDP=56;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=-0.0725515;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7742;QD=13.2276;RBI=0.077552;REFB=-0.0121146;REVB=-0.0273969;RO=21;SAF=12;SAR=22;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0521784;STB=0.515072;TYPE=snp;VARB=0.0065174;OID=.;OPOS=45491136;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:56:56:21:22:34:34:22:12:6:15:22:12:7:15 chr15 45554267 . C A 288.68 PASS AO=89;DP=226;FAO=90;FDP=228;FR=.;FRO=138;FSAF=53;FSAR=37;FSRF=58;FSRR=80;FWDB=-0.0143231;FXX=0.00436662;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.681;QD=5.06456;RBI=0.0165061;REFB=-0.00887834;REVB=0.00820362;RO=136;SAF=53;SAR=36;SRF=58;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181374;STB=0.601549;TYPE=snp;VARB=0.0125406;OID=.;OPOS=45554267;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:226:228:136:138:89:90:36:53:58:78:37:53:58:80 chr15 45653707 . T C 72.88 PASS AO=18;DP=42;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.00756326;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=248.647;QD=6.94133;RBI=0.0104297;REFB=-0.0137996;REVB=0.00718156;RO=24;SAF=8;SAR=10;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0966124;STB=0.555494;TYPE=snp;VARB=0.0170078;OID=.;OPOS=45653707;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:42:42:24:24:18:18:10:8:13:11:10:8:13:11 chr15 45654327 . A G 323.98 PASS AO=81;DP=169;FAO=80;FDP=169;FR=.;FRO=89;FSAF=65;FSAR=15;FSRF=56;FSRR=33;FWDB=0.0183716;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.9564;QD=7.66825;RBI=0.0431416;REFB=0.0191971;REVB=0.0390344;RO=84;SAF=66;SAR=15;SRF=53;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232836;STB=0.632182;TYPE=snp;VARB=-0.0257494;OID=.;OPOS=45654327;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:169:84:89:81:80:15:66:53:31:15:65:56:33 chr15 45661678 . T A 607.24 PASS AO=148;DP=305;FAO=149;FDP=306;FR=.;FRO=157;FSAF=73;FSAR=76;FSRF=75;FSRR=82;FWDB=-0.030365;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.217;QD=7.9378;RBI=0.0338014;REFB=-0.00451406;REVB=0.0148494;RO=156;SAF=73;SAR=75;SRF=74;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0176455;STB=0.506276;TYPE=snp;VARB=0.00520464;OID=.;OPOS=45661678;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:305:306:156:157:148:149:75:73:74:82:76:73:75:82 chr15 45695695 . G A 194.59 PASS AO=46;DP=95;FAO=46;FDP=95;FR=.;FRO=49;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=0.0267675;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.9088;QD=8.19344;RBI=0.0611692;REFB=-0.012438;REVB=0.0550016;RO=46;SAF=19;SAR=27;SRF=26;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137752;STB=0.561174;TYPE=snp;VARB=0.0237976;OID=.;OPOS=45695695;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:46:49:46:46:27:19:26:20:27:19:26:23 chr15 45779810 . G A 269.69 PASS AO=78;DP=188;FAO=78;FDP=188;FR=.;FRO=110;FSAF=43;FSAR=35;FSRF=45;FSRR=65;FWDB=-0.0154598;FXX=0.0105258;HRUN=4;LEN=1;MLLD=148.871;QD=5.73801;RBI=0.0154728;REFB=-0.00797487;REVB=0.000635191;RO=108;SAF=43;SAR=35;SRF=43;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157943;STB=0.582635;TYPE=snp;VARB=0.0126469;OID=.;OPOS=45779810;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:188:108:110:78:78:35:43:43:65:35:43:45:65 chr15 45968435 . T C 298.2 PASS AO=71;DP=147;FAO=71;FDP=146;FR=.;FRO=75;FSAF=27;FSAR=44;FSRF=37;FSRR=38;FWDB=0.0173962;FXX=0.0135126;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.987;QD=8.1698;RBI=0.0225636;REFB=-0.00655697;REVB=-0.0143696;RO=74;SAF=27;SAR=44;SRF=36;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101201;STB=0.559824;TYPE=snp;VARB=0.0151604;OID=.;OPOS=45968435;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:146:74:75:71:71:44:27:36:38:44:27:37:38 chr15 48053229 . C A 96.6 PASS AO=35;DP=104;FAO=35;FDP=104;FR=.;FRO=69;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=32;FSRR=37;FWDB=0.0414148;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.5582;QD=3.71528;RBI=0.0445748;REFB=-0.00709652;REVB=0.0164843;RO=65;SAF=21;SAR=14;SRF=32;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122752;STB=0.590682;TYPE=snp;VARB=0.0168239;OID=.;OPOS=48053229;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:104:104:65:69:35:35:14:21:32:33:14:21:32:37 chr15 48056958 . C T 332.16 PASS AO=76;DP=151;FAO=76;FDP=151;FR=.;FRO=75;FSAF=32;FSAR=44;FSRF=44;FSRR=31;FWDB=-0.0128072;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.468;QD=8.79903;RBI=0.0150106;REFB=-0.0242017;REVB=0.00782901;RO=75;SAF=32;SAR=44;SRF=44;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149277;STB=0.582151;TYPE=snp;VARB=0.0212101;OID=.;OPOS=48056958;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:151:75:75:76:76:44:32:44:31:44:32:44:31 chr15 48063076 . T C 1992.74 PASS AO=209;DP=210;FAO=210;FDP=210;FR=.;FRO=0;FSAF=116;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114808;FXX=0.00473911;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.766;QD=37.957;RBI=0.0221714;REFB=0;REVB=-0.0189674;RO=0;SAF=116;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.92554e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.89201e-05;OID=.;OPOS=48063076;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:210:210:0:0:209:210:93:116:0:0:94:116:0:0 chr15 48065487 . C T 2852.33 PASS AO=300;DP=300;FAO=298;FDP=298;FR=.;FRO=0;FSAF=147;FSAR=151;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144276;FXX=0.00666644;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7885;QD=38.2863;RBI=0.0145425;REFB=-0.026959;REVB=0.00182432;RO=0;SAF=149;SAR=151;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000255669;OID=.;OPOS=48065487;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:300:298:0:0:300:298:151:149:0:0:151:147:0:0 chr15 48443699 . T C 1277.67 PASS AO=135;DP=136;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00495781;FXX=0.0145975;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.2516;QD=37.8569;RBI=0.0241214;REFB=0.0510327;REVB=-0.0236064;RO=1;SAF=64;SAR=71;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00664856;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000452231;OID=.;OPOS=48443699;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:136:135:1:0:135:135:71:64:0:1:71:64:0:0 chr15 48460927 . C T 2198.63 PASS AO=233;DP=235;FAO=233;FDP=233;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=128;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0675708;FXX=0.00851028;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.6;QD=37.7448;RBI=0.0761317;REFB=-0.0422977;REVB=-0.0350744;RO=1;SAF=105;SAR=128;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00451712;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000106848;OID=.;OPOS=48460927;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:235:233:1:0:233:233:128:105:1:0:128:105:0:0 chr15 48495508 . C T 1439.92 PASS AO=148;DP=148;FAO=151;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0354175;FXX=0.00657851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.137;QD=38.1436;RBI=0.0483961;REFB=0;REVB=0.0329816;RO=0;SAF=56;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000120934;OID=.;OPOS=48495508;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:148:151:0:0:148:151:92:56:0:0:92:59:0:0 chr15 48539587 . T C 338.8 PASS AO=91;DP=209;FAO=91;FDP=205;FR=.;FRO=114;FSAF=47;FSAR=44;FSRF=45;FSRR=69;FWDB=0.000828915;FXX=0.0144224;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.9516;QD=6.61081;RBI=0.0189397;REFB=-0.0051594;REVB=0.0189216;RO=112;SAF=47;SAR=44;SRF=43;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131451;STB=0.567461;TYPE=snp;VARB=0.00705471;OID=.;OPOS=48539587;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:205:112:114:91:91:44:47:43:69:44:47:45:69 chr15 48580713 . T C 886.76 PASS AO=94;DP=97;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0616425;FXX=0.0206164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.332;QD=37.3371;RBI=0.0623493;REFB=0;REVB=0.00936147;RO=1;SAF=12;SAR=82;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00574842;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.92932e-05;OID=.;OPOS=48580713;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:97:95:1:0:94:95:82:12:0:1:83:12:0:0 chr15 48595192 . G T 953.28 PASS AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0418305;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.835;QD=38.5162;RBI=0.0427611;REFB=0;REVB=0.00887211;RO=0;SAF=40;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.43337e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00013273;OID=.;OPOS=48595192;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:99:99:0:0:99:99:59:40:0:0:59:40:0:0 chr15 48701029 . C T 815.1 PASS AO=89;DP=91;FAO=89;FDP=91;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00893135;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=217.992;QD=35.8287;RBI=0.0288054;REFB=-0.0287417;REVB=0.0273858;RO=2;SAF=36;SAR=53;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.017547;STB=0.509257;TYPE=snp;VARB=4.70572e-05;OID=.;OPOS=48701029;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:91:91:2:2:89:89:53:36:0:2:53:36:0:2 chr15 48702457 . C A 1286.68 PASS AO=142;DP=146;FAO=142;FDP=146;FR=.;FRO=4;FSAF=42;FSAR=100;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0487035;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.944;QD=35.2514;RBI=0.0521193;REFB=-0.181774;REVB=0.0185578;RO=3;SAF=42;SAR=100;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.01405;STB=0.501507;TYPE=snp;VARB=0.00183467;OID=.;OPOS=48702457;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:146:146:3:4:142:142:100:42:0:3:100:42:1:3 chr15 48807637 . C T 2256.42 PASS AO=235;DP=238;FAO=235;FDP=235;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=154;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0513837;FXX=0.0126045;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.1531;QD=38.4071;RBI=0.0523796;REFB=0;REVB=0.0101654;RO=0;SAF=81;SAR=154;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000391766;OID=.;OPOS=48807637;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:238:235:0:0:235:235:154:81:0:0:154:81:0:0 chr15 49118087 . C T 296.39 PASS AO=79;DP=177;FAO=79;FDP=179;FR=.;FRO=100;FSAF=45;FSAR=34;FSRF=63;FSRR=37;FWDB=-0.00363319;FXX=0.0110491;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.362;QD=6.62319;RBI=0.0710044;REFB=-0.0123394;REVB=-0.0709113;RO=95;SAF=45;SAR=34;SRF=62;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0845075;STB=0.534723;TYPE=snp;VARB=0.0177396;OID=.;OPOS=49118087;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:179:95:100:79:79:34:45:62:33:34:45:63:37 chr15 49168841 . G A 749.99 PASS AO=209;DP=450;FAO=189;FDP=399;FR=.;FRO=210;FSAF=155;FSAR=34;FSRF=170;FSRR=40;FWDB=0.03385;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.356;QD=7.5187;RBI=0.0390361;REFB=-0.00145482;REVB=0.0194422;RO=238;SAF=172;SAR=37;SRF=193;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.019678;STB=0.509324;TYPE=snp;VARB=0.00160675;OID=.;OPOS=49168841;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:450:399:238:210:209:189:37:172:193:45:34:155:170:40 chr15 49288160 . A G 843.99 PASS AO=99;DP=105;FAO=98;FDP=103;FR=.;FRO=5;FSAF=53;FSAR=45;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.0327547;FXX=0.0190458;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.2181;QD=32.7764;RBI=0.0582875;REFB=-0.10889;REVB=0.0482137;RO=2;SAF=54;SAR=45;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00172095;STB=0.51269;TYPE=snp;VARB=0.00589341;OID=.;OPOS=49288160;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:105:103:2:5:99:98:45:54:1:1:45:53:4:1 chr15 49293194 . C A 442.27 PASS AO=85;DP=172;FAO=97;FDP=182;FR=.;FRO=85;FSAF=45;FSAR=52;FSRF=35;FSRR=50;FWDB=0.0126408;FXX=0.010869;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.762;QD=9.72028;RBI=0.0224553;REFB=-0.0233884;REVB=0.0185594;RO=87;SAF=45;SAR=40;SRF=36;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10588;STB=0.524566;TYPE=snp;VARB=0.0207256;OID=.;OPOS=49293194;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:182:87:85:85:97:40:45:36:51:52:45:35:50 chr15 49320837 . G T 360.98 PASS AO=105;DP=253;FAO=106;FDP=255;FR=.;FRO=149;FSAF=39;FSAR=67;FSRF=60;FSRR=89;FWDB=-0.0603093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.726;QD=5.66239;RBI=0.0621597;REFB=-0.00431208;REVB=-0.0150541;RO=148;SAF=38;SAR=67;SRF=60;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0485094;STB=0.521581;TYPE=snp;VARB=0.00656406;OID=.;OPOS=49320837;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:253:255:148:149:105:106:67:38:60:88:67:39:60:89 chr15 49325289 . A C 443.96 PASS AO=97;DP=186;FAO=98;FDP=186;FR=.;FRO=88;FSAF=31;FSAR=67;FSRF=37;FSRR=51;FWDB=-0.00536983;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=248.873;QD=9.54743;RBI=0.00537668;REFB=-0.012969;REVB=0.000271416;RO=87;SAF=30;SAR=67;SRF=36;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100924;STB=0.554651;TYPE=snp;VARB=0.0108512;OID=.;OPOS=49325289;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:186:87:88:97:98:67:30:36:51:67:31:37:51 chr15 49620200 . C T 951.35 PASS AO=179;DP=293;FAO=179;FDP=292;FR=.;FRO=113;FSAF=90;FSAR=89;FSRF=66;FSRR=47;FWDB=0.000812223;FXX=0.00341285;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.619;QD=13.0322;RBI=0.013404;REFB=-0.0157001;REVB=-0.0133794;RO=113;SAF=90;SAR=89;SRF=66;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0583556;STB=0.531462;TYPE=snp;VARB=0.0132069;OID=.;OPOS=49620200;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:293:292:113:113:179:179:89:90:66:47:89:90:66:47 chr15 49907377 . A T 184.14 PASS AO=51;DP=121;FAO=51;FDP=121;FR=.;FRO=70;FSAF=15;FSAR=36;FSRF=24;FSRR=46;FWDB=-0.108266;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.8517;QD=6.08709;RBI=0.109261;REFB=0.00441679;REVB=0.0147143;RO=70;SAF=15;SAR=36;SRF=24;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0586299;STB=0.533016;TYPE=snp;VARB=-0.00727554;OID=.;OPOS=49907377;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:70:70:51:51:36:15:24:46:36:15:24:46 chr15 49917401 . G A 188.15 PASS AO=42;DP=81;FAO=41;FDP=80;FR=.;FRO=39;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=25;FWDB=0.0291686;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9183;QD=9.40744;RBI=0.0494872;REFB=-0.00479416;REVB=-0.0399772;RO=39;SAF=25;SAR=17;SRF=14;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204265;STB=0.609379;TYPE=snp;VARB=0.00263957;OID=.;OPOS=49917401;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:80:39:39:42:41:17:25:14:25:17:24:14:25 chr15 50151140 . A G 83.36 PASS AO=22;DP=53;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=3;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=-0.018652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.37;QD=6.29148;RBI=0.0316819;REFB=-0.00891109;REVB=0.0256096;RO=31;SAF=3;SAR=19;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.36538;STB=0.714055;TYPE=snp;VARB=0.0170219;OID=.;OPOS=50151140;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:53:53:31:31:22:22:19:3:12:19:19:3:12:19 chr15 50152583 . G T 1518.32 PASS AO=158;DP=158;FAO=158;FDP=158;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00681384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.451;QD=38.4385;RBI=0.0253307;REFB=0;REVB=0.0243971;RO=0;SAF=79;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.26975e-05;OID=.;OPOS=50152583;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:158:158:0:0:158:158:79:79:0:0:79:79:0:0 chr15 50189448 . C A 136.26 PASS AO=30;DP=70;FAO=35;FDP=75;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=27;FWDB=0.0103896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.157;QD=7.26717;RBI=0.0106619;REFB=-0.00254571;REVB=0.00239433;RO=39;SAF=14;SAR=16;SRF=12;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162342;STB=0.571833;TYPE=snp;VARB=0.00273476;OID=.;OPOS=50189448;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:75:39:40:30:35:16:14:12:27:19:16:13:27 chr15 50226313 . G T 293.43 PASS AO=72;DP=154;FAO=74;FDP=160;FR=.;FRO=86;FSAF=43;FSAR=31;FSRF=63;FSRR=23;FWDB=-0.0599207;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4746;QD=7.33566;RBI=0.0628973;REFB=0.00703143;REVB=0.0191202;RO=82;SAF=43;SAR=29;SRF=59;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12595;STB=0.585927;TYPE=snp;VARB=-0.00829137;OID=.;OPOS=50226313;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:160:82:86:72:74:29:43:59:23:31:43:63:23 chr15 50279662 . T C 268.84 PASS AO=78;DP=187;FAO=78;FDP=187;FR=.;FRO=109;FSAF=38;FSAR=40;FSRF=48;FSRR=61;FWDB=0.0146906;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.236;QD=5.75063;RBI=0.0214899;REFB=-0.0057758;REVB=-0.0156844;RO=109;SAF=38;SAR=40;SRF=48;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0488723;STB=0.527336;TYPE=snp;VARB=0.0123383;OID=.;OPOS=50279662;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:187:109:109:78:78:40:38:48:61:40:38:48:61 chr15 50311135 . C A 839.57 PASS AO=90;DP=91;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0605017;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.1701;QD=37.3143;RBI=0.0611539;REFB=0;REVB=-0.00890755;RO=0;SAF=43;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.16558e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000516162;OID=.;OPOS=50311135;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:91:90:0:0:90:90:47:43:0:0:46:44:0:0 chr15 50311148 . A G 899.37 PASS AO=94;DP=96;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010863;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=168.072;QD=37.0876;RBI=0.0125121;REFB=0;REVB=0.00620869;RO=1;SAF=45;SAR=49;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00957862;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000254301;OID=.;OPOS=50311148;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:96:97:1:0:94:97:49:45:0:1:51:46:0:0 chr15 50474900 . C T 161.49 PASS AO=37;DP=75;FAO=37;FDP=75;FR=.;FRO=38;FSAF=29;FSAR=8;FSRF=26;FSRR=12;FWDB=0.000337848;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=249.675;QD=8.61264;RBI=0.0288881;REFB=-0.00806544;REVB=0.0288862;RO=38;SAF=29;SAR=8;SRF=26;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122413;STB=0.568588;TYPE=snp;VARB=0.00863194;OID=.;OPOS=50474900;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:38:38:37:37:8:29:26:12:8:29:26:12 chr15 50555544 . G A 340.3 PASS AO=64;DP=106;FAO=64;FDP=106;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=53;FSRF=6;FSRR=36;FWDB=0.0240382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.216;QD=12.8416;RBI=0.0270264;REFB=-0.0316486;REVB=0.0123527;RO=42;SAF=11;SAR=53;SRF=6;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0382214;STB=0.520738;TYPE=snp;VARB=0.0252009;OID=.;OPOS=50555544;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:42:42:64:64:53:11:6:36:53:11:6:36 chr15 50570369 . T C 173.78 PASS AO=43;DP=93;FAO=43;FDP=93;FR=.;FRO=50;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=32;FSRR=18;FWDB=0.00916942;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=240.772;QD=7.4742;RBI=0.00917879;REFB=0.023268;REVB=-0.000414557;RO=50;SAF=22;SAR=21;SRF=32;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124315;STB=0.569246;TYPE=snp;VARB=-0.0271685;OID=.;OPOS=50570369;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:50:50:43:43:21:22:32:18:21:22:32:18 chr15 50773755 . G A 1720.6 PASS AO=183;DP=183;FAO=182;FDP=182;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00543398;FXX=0.00546418;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.03;QD=37.8153;RBI=0.0220111;REFB=-0.0359935;REVB=0.0213298;RO=0;SAF=88;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.0579e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.03807e-05;OID=.;OPOS=50773755;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:183:182:0:0:183:182:95:88:0:0:95:87:0:0 chr15 50782703 . A G 143.49 PASS AO=33;DP=68;FAO=33;FDP=68;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.0114241;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.07;QD=8.44062;RBI=0.0120402;REFB=-0.0310883;REVB=0.00380235;RO=34;SAF=13;SAR=20;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0984634;STB=0.548416;TYPE=snp;VARB=0.0360158;OID=.;OPOS=50782703;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:34:35:33:33:20:13:17:17:20:13:17:18 chr15 50867082 . G A 931.18 PASS AO=97;DP=98;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000593777;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.823;QD=38.399;RBI=0.0281769;REFB=0;REVB=0.0281706;RO=0;SAF=22;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.71152e-05;OID=.;OPOS=50867082;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:98:97:0:0:97:97:75:22:0:0:75:22:0:0 chr15 50981098 . T C 1031.79 PASS AO=113;DP=113;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0202447;FXX=0.0176975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.426;QD=37.1817;RBI=0.0348252;REFB=0;REVB=0.0283364;RO=0;SAF=68;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.42864e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00028044;OID=.;OPOS=50981098;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:113:111:0:0:113:111:45:68:0:0:44:67:0:0 chr15 51012201 . G C 190.29 PASS AO=56;DP=140;FAO=56;FDP=139;FR=.;FRO=83;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=40;FSRR=43;FWDB=-0.0367919;FXX=0.00714235;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1672;QD=5.47597;RBI=0.0713232;REFB=-0.00886513;REVB=0.0611012;RO=82;SAF=25;SAR=31;SRF=40;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0439057;STB=0.521338;TYPE=snp;VARB=0.0102771;OID=.;OPOS=51012201;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:139:82:83:56:56:31:25:40:42:31:25:40:43 chr15 51018578 . A C 301.17 PASS AO=80;DP=180;FAO=80;FDP=180;FR=.;FRO=100;FSAF=40;FSAR=40;FSRF=52;FSRR=48;FWDB=-0.00285959;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=297.146;QD=6.69268;RBI=0.00403204;REFB=-0.00792259;REVB=-0.00284256;RO=99;SAF=40;SAR=40;SRF=51;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0150731;STB=0.511108;TYPE=snp;VARB=0.00929143;OID=.;OPOS=51018578;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:180:99:100:80:80:40:40:51:48:40:40:52:48 chr15 51675625 . C T 478.54 PASS AO=116;DP=238;FAO=116;FDP=239;FR=.;FRO=123;FSAF=62;FSAR=54;FSRF=41;FSRR=82;FWDB=-0.0195129;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=279.168;QD=8.00904;RBI=0.0205725;REFB=0.00618273;REVB=-0.00651734;RO=122;SAF=62;SAR=54;SRF=41;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183626;STB=0.602527;TYPE=snp;VARB=-0.00955909;OID=.;OPOS=51675625;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:238:239:122:123:116:116:54:62:41:81:54:62:41:82 chr15 51693813 . G A 214.83 PASS AO=48;DP=94;FAO=48;FDP=94;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=0.00408048;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.1606;QD=9.14159;RBI=0.0171779;REFB=0.0266468;REVB=-0.0166863;RO=46;SAF=17;SAR=31;SRF=18;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0354771;STB=0.519628;TYPE=snp;VARB=-0.0241909;OID=.;OPOS=51693813;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:46:46:48:48:31:17:18:28:31:17:18:28 chr15 51698922 . C T 294.78 PASS AO=67;DP=131;FAO=67;FDP=131;FR=.;FRO=64;FSAF=14;FSAR=53;FSRF=15;FSRR=49;FWDB=0.0109525;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.334;QD=9.00078;RBI=0.0111994;REFB=-0.00778604;REVB=0.0023387;RO=62;SAF=14;SAR=53;SRF=14;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0219379;STB=0.518376;TYPE=snp;VARB=0.0106935;OID=.;OPOS=51698922;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:62:64:67:67:53:14:14:48:53:14:15:49 chr15 51783820 . T C 215.71 PASS AO=80;DP=258;FAO=89;FDP=264;FR=.;FRO=175;FSAF=11;FSAR=78;FSRF=43;FSRR=132;FWDB=0.0284684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.168;QD=3.26831;RBI=0.0285343;REFB=-0.00332662;REVB=0.00193769;RO=146;SAF=3;SAR=77;SRF=16;SRR=130;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.340879;STB=0.645776;TYPE=snp;VARB=0.00898291;OID=.;OPOS=51783820;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:258:264:146:175:80:89:77:3:16:130:78:11:43:132 chr15 51791559 . A G 211.89 PASS AO=48;DP=99;FAO=49;FDP=100;FR=.;FRO=51;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=15;FSRR=36;FWDB=0.0601533;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.5843;QD=8.4755;RBI=0.0608266;REFB=0.00210859;REVB=0.0090254;RO=51;SAF=19;SAR=29;SRF=15;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101296;STB=0.561531;TYPE=snp;VARB=-0.00104218;OID=.;OPOS=51791559;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:100:51:51:48:49:29:19:15:36:29:20:15:36 chr15 51795172 . G A 518.76 PASS AO=127;DP=264;FAO=127;FDP=263;FR=.;FRO=136;FSAF=39;FSAR=88;FSRF=57;FSRR=79;FWDB=0.0110056;FXX=0.0112778;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.814;QD=7.88991;RBI=0.0190528;REFB=0.00403539;REVB=0.0155527;RO=135;SAF=39;SAR=88;SRF=57;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11985;STB=0.564658;TYPE=snp;VARB=-0.00443435;OID=.;OPOS=51795172;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:264:263:135:136:127:127:88:39:57:78:88:39:57:79 chr15 51829812 . G A 714.62 PASS AO=184;DP=397;FAO=184;FDP=396;FR=.;FRO=212;FSAF=85;FSAR=99;FSRF=93;FSRR=119;FWDB=0.00457686;FXX=0.00751861;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.811;QD=7.21842;RBI=0.0272937;REFB=-0.00727261;REVB=0.0269072;RO=187;SAF=85;SAR=99;SRF=89;SRR=98;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129165;STB=0.512557;TYPE=snp;VARB=0.00917355;OID=.;OPOS=51829812;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:397:396:187:212:184:184:99:85:89:98:99:85:93:119 chr15 51868373 . A G 30.14 PASS AO=9;DP=28;FAO=9;FDP=28;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=0.108979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=45.7662;QD=4.30527;RBI=0.109513;REFB=0.042252;REVB=0.0108035;RO=19;SAF=6;SAR=3;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0913134;STB=0.555438;TYPE=snp;VARB=-0.087614;OID=.;OPOS=51868373;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:28:28:19:19:9:9:3:6:14:5:3:6:14:5 chr15 51914662 . G A 488.89 PASS AO=66;DP=152;FAO=77;FDP=151;FR=.,HEALED;FRO=48;FSAF=36;FSAR=41;FSRF=44;FSRR=4;FWDB=0.0587656;FXX=0.00657851;HRUN=4;LEN=1;MLLD=30.8581;QD=12.9507;RBI=0.138105;REFB=-0.0595701;REVB=0.124978;RO=45;SAF=35;SAR=31;SRF=42;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.310638;STB=0.669348;TYPE=snp;VARB=0.0448612;OID=.;OPOS=51914662;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:151:45:48:66:77:31:35:42:3:41:36:44:4 chr15 51914716 . T C 442.18 PASS AO=68;DP=139;FAO=91;FDP=161;FR=.;FRO=70;FSAF=29;FSAR=62;FSRF=35;FSRR=35;FWDB=0.0243207;FXX=0.0122692;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.87;QD=10.9858;RBI=0.0315288;REFB=-0.0383388;REVB=0.0200642;RO=70;SAF=19;SAR=49;SRF=33;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196923;STB=0.585145;TYPE=snp;VARB=0.0295785;OID=.;OPOS=51914716;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:161:70:70:68:91:49:19:33:37:62:29:35:35 chr15 52414996 . C T 169.48 PASS AO=34;DP=67;FAO=37;FDP=72;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=26;FSRF=9;FSRR=26;FWDB=-0.0182305;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.697;QD=9.41564;RBI=0.0185203;REFB=-0.0131408;REVB=0.00326369;RO=32;SAF=9;SAR=25;SRF=8;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0166315;STB=0.523797;TYPE=snp;VARB=0.0180043;OID=.;OPOS=52414996;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:72:32:35:34:37:25:9:8:24:26:11:9:26 chr15 52531941 . A G 3242.21 PASS AO=343;DP=347;FAO=343;FDP=343;FR=.;FRO=0;FSAF=195;FSAR=148;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0213607;FXX=0.011527;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.198;QD=37.81;RBI=0.0285458;REFB=-0.0361999;REVB=0.0189363;RO=1;SAF=195;SAR=148;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00244051;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.14678e-05;OID=.;OPOS=52531941;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:347:343:1:0:343:343:148:195:1:0:148:195:0:0 chr15 52534344 . G A 1707.27 PASS AO=180;DP=182;FAO=181;FDP=181;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0268845;FXX=0.0109284;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.7418;QD=37.7298;RBI=0.0281805;REFB=0.00479164;REVB=-0.00844756;RO=0;SAF=79;SAR=101;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.29834e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.27901e-05;OID=.;OPOS=52534344;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:182:181:0:0:180:181:101:79:0:0:101:80:0:0 chr15 52539673 . C T 1175.27 PASS AO=126;DP=131;FAO=130;FDP=132;FR=.;FRO=2;FSAF=55;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.018954;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.8562;QD=35.6143;RBI=0.0816378;REFB=-0.107499;REVB=0.079407;RO=3;SAF=53;SAR=73;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0191242;STB=0.506578;TYPE=snp;VARB=0.00175657;OID=.;OPOS=52539673;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:131:132:3:2:126:130:73:53:0:3:75:55:0:2 chr15 52556429 . A G 1227.71 PASS AO=130;DP=131;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.434;QD=37.4874;RBI=0.0232223;REFB=0;REVB=-0.00503414;RO=0;SAF=69;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000467576;OID=.;OPOS=52556429;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:131:131:0:0:130:131:61:69:0:0:61:70:0:0 chr15 52604136 . A ATTTGTCATT 792.95 PASS AO=64;DP=104;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166918;FXX=0.0561735;HRUN=3;LEN=9;MLLD=245.896;QD=37.7597;RBI=0.0432645;REFB=0;REVB=0.039915;RO=19;SAF=24;SAR=40;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157775;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00260666;OID=.;OPOS=52604137;OREF=-;OALT=TTTGTCATT;OMAPALT=ATTTGTCATT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:64:104:84:84:0:28:56:0:0:38:19:24:40:14:5 chr15 52605153 . T C 387.71 PASS AO=90;DP=182;FAO=90;FDP=180;FR=.;FRO=90;FSAF=40;FSAR=50;FSRF=43;FSRR=47;FWDB=0.00699884;FXX=0.0425509;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.7225;QD=8.61579;RBI=0.0261485;REFB=-0.0412017;REVB=0.0251944;RO=66;SAF=40;SAR=50;SRF=20;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113147;STB=0.516808;TYPE=snp;VARB=0.0371365;OID=.;OPOS=52605153;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:180:66:90:90:90:50:40:20:46:50:40:43:47 chr15 52611451 . A G 2707.55 PASS AO=284;DP=286;FAO=284;FDP=284;FR=.;FRO=0;FSAF=191;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0367154;FXX=0.00699276;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.527;QD=38.1346;RBI=0.0392145;REFB=-0.0298327;REVB=-0.0137751;RO=1;SAF=191;SAR=93;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00509974;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.42178e-07;OID=.;OPOS=52611451;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:286:284:1:0:284:284:93:191:0:1:93:191:0:0 chr15 52667552 . G A 2036.94 PASS AO=210;DP=210;FAO=213;FDP=213;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.063;QD=38.2523;RBI=0.0253262;REFB=0;REVB=0.0173057;RO=0;SAF=90;SAR=120;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.1154e-05;OID=.;OPOS=52667552;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:96:210:213:0:0:210:213:120:90:0:0:120:93:0:0 chr15 52689526 . T C 1736.88 PASS AO=184;DP=187;FAO=185;FDP=185;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0715613;FXX=0.0106946;HRUN=3;LEN=1;MLLD=80.581;QD=37.5541;RBI=0.0785957;REFB=-0.0482124;REVB=0.0325002;RO=2;SAF=78;SAR=106;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0120498;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000515217;OID=.;OPOS=52689526;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:187:185:2:0:184:185:106:78:2:0:106:79:0:0 chr15 52689631 . T G 1653.18 PASS AO=172;DP=176;FAO=180;FDP=183;FR=.;FRO=3;FSAF=69;FSAR=111;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0448007;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.826;QD=36.1351;RBI=0.0709954;REFB=-0.0456414;REVB=-0.0550748;RO=4;SAF=65;SAR=107;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0056053;STB=0.500867;TYPE=snp;VARB=0.000548531;OID=.;OPOS=52689631;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:176:183:4:3:172:180:107:65:2:2:111:69:1:2 chr15 52901283 . T C 49.02 PASS AO=20;DP=70;FAO=20;FDP=69;FR=.;FRO=49;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=38;FSRR=11;FWDB=-0.0404048;FXX=0.0142837;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.3135;QD=2.84196;RBI=0.0845407;REFB=-0.0115787;REVB=0.0742603;RO=49;SAF=13;SAR=7;SRF=38;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176754;STB=0.603967;TYPE=snp;VARB=0.0542308;OID=.;OPOS=52901283;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:70:69:49:49:20:20:7:13:38:11:7:13:38:11 chr15 52901284 . T C 47.86 PASS AO=20;DP=70;FAO=20;FDP=70;FR=.;FRO=50;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=39;FSRR=11;FWDB=0.0155712;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.6445;QD=2.73504;RBI=0.0398887;REFB=-0.0299714;REVB=0.036724;RO=49;SAF=13;SAR=7;SRF=38;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176754;STB=0.608598;TYPE=snp;VARB=0.0177926;OID=.;OPOS=52901284;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:70:70:49:50:20:20:7:13:38:11:7:13:39:11 chr15 52901914 . T C 186.21 PASS AO=45;DP=94;FAO=45;FDP=95;FR=.;FRO=50;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=0.027156;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.2769;QD=7.8405;RBI=0.0401613;REFB=0.0141603;REVB=0.0295886;RO=48;SAF=19;SAR=26;SRF=20;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0052906;STB=0.509556;TYPE=snp;VARB=-0.0162769;OID=.;OPOS=52901914;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:95:48:50:45:45:26:19:20:28:26:19:22:28 chr15 52903772 . T C 355.42 PASS AO=86;DP=177;FAO=86;FDP=178;FR=.;FRO=92;FSAF=58;FSAR=28;FSRF=34;FSRR=58;FWDB=-0.00325353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.384;QD=7.98695;RBI=0.00385341;REFB=-0.0200611;REVB=-0.00206478;RO=91;SAF=58;SAR=28;SRF=34;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.283984;STB=0.659402;TYPE=snp;VARB=0.0110869;OID=.;OPOS=52903772;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:178:91:92:86:86:28:58:34:57:28:58:34:58 chr15 53081800 . G C 16.26 PASS AO=4;DP=14;FAO=4;FDP=14;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=9;FWDB=-0.0461385;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=229.842;QD=4.64588;RBI=0.0624439;REFB=-0.00771972;REVB=-0.0420771;RO=8;SAF=1;SAR=3;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197909;STB=0.666027;TYPE=snp;VARB=0.0163492;OID=.;OPOS=53081800;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:14:14:8:10:4:4:3:1:1:7:3:1:1:9 chr15 54003091 . G A 862.36 PASS AO=87;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0108161;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4374;QD=38.3273;RBI=0.100703;REFB=0;REVB=0.10012;RO=2;SAF=58;SAR=29;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00795799;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000644148;OID=.;OPOS=54003091;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:90:90:2:0:87:90:29:58:1:1:31:59:0:0 chr15 54008795 . T C 1647.14 PASS AO=175;DP=178;FAO=175;FDP=175;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0135291;FXX=0.016853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.4311;QD=37.6489;RBI=0.0903597;REFB=-0.0977591;REVB=0.0893411;RO=2;SAF=105;SAR=70;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00223944;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00111189;OID=.;OPOS=54008795;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:178:175:2:0:175:175:70:105:1:1:70:105:0:0 chr15 54008845 . T C 1663.58 PASS AO=179;DP=184;FAO=182;FDP=182;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0490053;FXX=0.010869;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.7579;QD=36.5621;RBI=0.0495479;REFB=-0.118616;REVB=-0.00731237;RO=1;SAF=105;SAR=74;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00638978;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.10491e-05;OID=.;OPOS=54008845;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:184:182:1:0:179:182:74:105:0:1:77:105:0:0 chr15 54008889 . GA G 1279.2 PASS AO=158;DP=168;FAO=161;FDP=161;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0460435;FXX=0.00617246;HRUN=2;LEN=1;MLLD=34.1234;QD=31.7814;RBI=0.130481;REFB=0;REVB=-0.122087;RO=0;SAF=92;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.000719537;OID=.;OPOS=54008890;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:158:162:161:161:0:94:67:0:0:99:0:92:66:0:0 chr15 54306925 . G A 1077.26 PASS AO=112;DP=113;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0213114;FXX=0.00861995;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.5772;QD=37.47;RBI=0.0741102;REFB=-0.0531749;REVB=-0.0709798;RO=1;SAF=88;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00536561;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00100983;OID=.;OPOS=54306925;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:113:115:1:0:112:115:24:88:1:0:26:89:0:0 chr15 54624313 . T A 328.69 PASS AO=91;DP=211;FAO=97;FDP=235;FR=.;FRO=138;FSAF=50;FSAR=47;FSRF=70;FSRR=68;FWDB=-0.00223933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.671;QD=5.59471;RBI=0.0199367;REFB=-0.00668586;REVB=0.0198105;RO=118;SAF=48;SAR=43;SRF=60;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0193015;STB=0.504828;TYPE=snp;VARB=0.00943292;OID=.;OPOS=54624313;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:235:118:138:91:97:43:48:60:58:47:50:70:68 chr15 54919047 . A G 347.64 PASS AO=84;DP=180;FAO=87;FDP=183;FR=.;FRO=96;FSAF=54;FSAR=33;FSRF=45;FSRR=51;FWDB=0.0195808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.0096;QD=7.59872;RBI=0.0327051;REFB=2.04397e-05;REVB=0.0261957;RO=96;SAF=52;SAR=32;SRF=45;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147354;STB=0.581296;TYPE=snp;VARB=0.000196049;OID=.;OPOS=54919047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:183:96:96:84:87:32:52:45:51:33:54:45:51 chr15 55611607 . CGG CG,C,CGC 93.7 PASS AO=7,6,4;DP=24;FAO=17,0,4;FDP=26;FR=.;FRO=5;FSAF=4,0,0;FSAR=13,0,4;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.148092,0.0876777,0.00488128;FXX=0;HRUN=5,5,5;LEN=1,2,1;MLLD=10.1214,13.0816,144.766;QD=14.4158;RBI=0.324129,0.179781,0.0938502;REFB=0.0302962,0.0196748,0.0201997;REVB=-0.28832,-0.156952,-0.0937232;RO=4;SAF=2,0,0;SAR=5,6,4;SRF=3;SRR=1;SSEN=0.392857,0.392857,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.298189,-0.787851,-0.755207;STB=0.649809,0.5,0.997219;TYPE=del,del,snp;VARB=-0.0748304,0,0.169369;OID=.,.,.;OPOS=55611608,55611608,55611609;OREF=G,GG,G;OALT=-,-,C;OMAPALT=CG,C,CGC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:7,6,4:22:17,0,4:26:5:4,0,0:13,0,4:4:1:11:4:2,0,0:5,6,4:3:1 chr15 55647492 . C T 228.3 PASS AO=59;DP=132;FAO=59;FDP=131;FR=.;FRO=72;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=39;FSRR=33;FWDB=-0.0227348;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.887;QD=6.97083;RBI=0.0325706;REFB=-0.0141577;REVB=-0.0233231;RO=72;SAF=34;SAR=25;SRF=39;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.034714;STB=0.519351;TYPE=snp;VARB=0.0162018;OID=.;OPOS=55647492;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:131:72:72:59:59:25:34:39:33:25:34:39:33 chr15 55653031 . A G 355.34 PASS AO=42;DP=43;FAO=41;FDP=43;FR=.;FRO=2;FSAF=11;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0241319;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.1262;QD=33.0552;RBI=0.0685055;REFB=-0.106295;REVB=-0.0641144;RO=1;SAF=11;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149055;STB=0.516121;TYPE=snp;VARB=0.0259484;OID=.;OPOS=55653031;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:43:43:1:2:42:41:31:11:0:1:30:11:0:2 chr15 55664110 . G C 292.86 PASS AO=93;DP=238;FAO=93;FDP=239;FR=.;FRO=146;FSAF=50;FSAR=43;FSRF=93;FSRR=53;FWDB=-0.0225278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.97;QD=4.90148;RBI=0.0402387;REFB=-0.00139045;REVB=-0.0333415;RO=145;SAF=50;SAR=43;SRF=92;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106706;STB=0.561591;TYPE=snp;VARB=0.00245637;OID=.;OPOS=55664110;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:238:239:145:146:93:93:43:50:92:53:43:50:93:53 chr15 55664220 . G A 492.29 PASS AO=119;DP=252;FAO=123;FDP=257;FR=.;FRO=134;FSAF=40;FSAR=83;FSRF=63;FSRR=71;FWDB=-0.0294435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6325;QD=7.66212;RBI=0.029821;REFB=-0.0255063;REVB=0.00472983;RO=133;SAF=38;SAR=81;SRF=63;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158587;STB=0.581195;TYPE=snp;VARB=0.0233094;OID=.;OPOS=55664220;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:252:257:133:134:119:123:81:38:63:70:83:40:63:71 chr15 55700981 . C A 563.36 PASS AO=138;DP=298;FAO=144;FDP=303;FR=.;FRO=159;FSAF=51;FSAR=93;FSRF=100;FSRR=59;FWDB=-0.0150619;FXX=0.00655716;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.302;QD=7.4371;RBI=0.0151385;REFB=-0.0292592;REVB=0.0015207;RO=157;SAF=46;SAR=92;SRF=100;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.29386;STB=0.644302;TYPE=snp;VARB=0.0334235;OID=.;OPOS=55700981;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:298:303:157:159:138:144:92:46:100:57:93:51:100:59 chr15 55722882 . C A 202.89 PASS AO=54;DP=123;FAO=54;FDP=123;FR=.;FRO=69;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=30;FSRR=39;FWDB=-0.0349097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.2731;QD=6.59792;RBI=0.035854;REFB=-0.0592637;REVB=-0.00817447;RO=69;SAF=25;SAR=29;SRF=30;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0284976;STB=0.515927;TYPE=snp;VARB=0.033993;OID=.;OPOS=55722882;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:69:69:54:54:29:25:30:39:29:25:30:39 chr15 55790530 . C T 64.86 PASS AO=25;DP=82;FAO=25;FDP=81;FR=.;FRO=56;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=30;FWDB=0.0408568;FXX=0.0121936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.974;QD=3.20277;RBI=0.0410671;REFB=-0.000522911;REVB=0.00415087;RO=56;SAF=13;SAR=12;SRF=26;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0652392;STB=0.538431;TYPE=snp;VARB=0.00162105;OID=.;OPOS=55790530;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:82:81:56:56:25:25:12:13:26:30:12:13:26:30 chr15 55911813 . G C 365.07 PASS AO=82;DP=160;FAO=82;FDP=160;FR=.;FRO=78;FSAF=53;FSAR=29;FSRF=51;FSRR=27;FWDB=0.00309878;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=250.785;QD=9.12684;RBI=0.00915039;REFB=0.000313825;REVB=0.00860971;RO=77;SAF=53;SAR=29;SRF=50;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00290577;STB=0.50401;TYPE=snp;VARB=-0.000303077;OID=.;OPOS=55911813;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:160:77:78:82:82:29:53:50:27:29:53:51:27 chr15 55970041 . A G 383.78 PASS AO=80;DP=145;FAO=80;FDP=145;FR=.;FRO=65;FSAF=43;FSAR=37;FSRF=41;FSRR=24;FWDB=0.0128393;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.2749;QD=10.587;RBI=0.0147548;REFB=-0.0184253;REVB=0.00727023;RO=64;SAF=43;SAR=37;SRF=41;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0851158;STB=0.542303;TYPE=snp;VARB=0.0184017;OID=.;OPOS=55970041;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:64:65:80:80:37:43:41:23:37:43:41:24 chr15 55972797 . T C 738.83 PASS AO=179;DP=365;FAO=179;FDP=365;FR=.;FRO=186;FSAF=72;FSAR=107;FSRF=81;FSRR=105;FWDB=0.00627887;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.335;QD=8.0968;RBI=0.00723263;REFB=0.000525073;REVB=-0.00358981;RO=185;SAF=72;SAR=107;SRF=81;SRR=104;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0340322;STB=0.517494;TYPE=snp;VARB=-0.000598157;OID=.;OPOS=55972797;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:365:365:185:186:179:179:107:72:81:104:107:72:81:105 chr15 56120962 . T C 159.35 PASS AO=46;DP=112;FAO=46;FDP=113;FR=.;FRO=67;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=24;FSRR=43;FWDB=0.00632665;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.581;QD=5.64054;RBI=0.00857836;REFB=0.00229965;REVB=-0.00579325;RO=66;SAF=19;SAR=27;SRF=24;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0538636;STB=0.533908;TYPE=snp;VARB=-0.0033982;OID=.;OPOS=56120962;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:113:66:67:46:46:27:19:24:42:27:19:24:43 chr15 56122741 . A C 293.3 PASS AO=67;DP=134;FAO=67;FDP=133;FR=.;FRO=66;FSAF=37;FSAR=30;FSRF=32;FSRR=34;FWDB=0.00117761;FXX=0.00746213;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.3;QD=8.82091;RBI=0.00650403;REFB=-0.0134114;REVB=0.00639653;RO=66;SAF=37;SAR=30;SRF=32;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0608959;STB=0.533564;TYPE=snp;VARB=0.0116959;OID=.;OPOS=56122741;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:133:66:66:67:67:30:37:32:34:30:37:32:34 chr15 56139153 . T C 1017 PASS AO=106;DP=108;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0270157;FXX=0.0272702;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.903;QD=38.0187;RBI=0.0716871;REFB=-0.1318;REVB=0.0664017;RO=1;SAF=45;SAR=61;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00771739;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000616978;OID=.;OPOS=56139153;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:108:107:1:0:106:107:61:45:0:1:62:45:0:0 chr15 56152729 . T C 341.27 PASS AO=100;DP=241;FAO=100;FDP=241;FR=.;FRO=141;FSAF=63;FSAR=37;FSRF=72;FSRR=69;FWDB=-0.00144605;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.294;QD=5.66416;RBI=0.0246724;REFB=-0.00671503;REVB=0.02463;RO=141;SAF=63;SAR=37;SRF=72;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128755;STB=0.572075;TYPE=snp;VARB=0.00649856;OID=.;OPOS=56152729;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:241:241:141:141:100:100:37:63:72:69:37:63:72:69 chr15 56152872 . C T 443.47 PASS AO=111;DP=237;FAO=111;FDP=235;FR=.;FRO=124;FSAF=56;FSAR=55;FSRF=68;FSRR=56;FWDB=0.00869481;FXX=0.0126045;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.1949;QD=7.54843;RBI=0.0264195;REFB=0.00914299;REVB=-0.0249477;RO=123;SAF=56;SAR=55;SRF=69;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0538666;STB=0.523162;TYPE=snp;VARB=-0.0124548;OID=.;OPOS=56152872;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:237:235:123:124:111:111:55:56:69:54:55:56:68:56 chr15 56207811 . T G 402.74 PASS AO=93;DP=184;FAO=93;FDP=184;FR=.;FRO=91;FSAF=56;FSAR=37;FSRF=38;FSRR=53;FWDB=8.0051e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.739;QD=8.75514;RBI=0.00892193;REFB=-0.00228889;REVB=0.00892157;RO=89;SAF=56;SAR=37;SRF=38;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157056;STB=0.591668;TYPE=snp;VARB=0.00223783;OID=.;OPOS=56207811;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:184:89:91:93:93:37:56:38:51:37:56:38:53 chr15 56207983 . C T 488.36 PASS AO=117;DP=238;FAO=117;FDP=239;FR=.;FRO=122;FSAF=63;FSAR=54;FSRF=55;FSRR=67;FWDB=-0.0145123;FXX=0.00416649;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.02;QD=8.17338;RBI=0.0243424;REFB=0.00126962;REVB=0.0195434;RO=120;SAF=63;SAR=54;SRF=53;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0890555;STB=0.544687;TYPE=snp;VARB=-0.00194485;OID=.;OPOS=56207983;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:238:239:120:122:117:117:54:63:53:67:54:63:55:67 chr15 56208141 . G A 270.27 PASS AO=69;DP=151;FAO=69;FDP=151;FR=.;FRO=82;FSAF=29;FSAR=40;FSRF=44;FSRR=38;FWDB=-0.0307646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.245;QD=7.15947;RBI=0.0308092;REFB=-0.000368552;REVB=0.00165716;RO=82;SAF=29;SAR=40;SRF=44;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114212;STB=0.563471;TYPE=snp;VARB=0.000267583;OID=.;OPOS=56208141;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:151:82:82:69:69:40:29:44:38:40:29:44:38 chr15 56208535 . G A 447.8 PASS AO=104;DP=210;FAO=105;FDP=211;FR=.;FRO=106;FSAF=41;FSAR=64;FSRF=49;FSRR=57;FWDB=-0.0135879;FXX=0.00471676;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.11;QD=8.48903;RBI=0.0339957;REFB=-0.0244189;REVB=-0.0311621;RO=104;SAF=40;SAR=64;SRF=47;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0635923;STB=0.537256;TYPE=snp;VARB=0.0264099;OID=.;OPOS=56208535;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:210:211:104:106:104:105:64:40:47:57:64:41:49:57 chr15 56243766 . C T 198.55 PASS AO=51;DP=113;FAO=51;FDP=113;FR=.;FRO=62;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=29;FSRR=33;FWDB=0.0113136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.562;QD=7.02831;RBI=0.0115145;REFB=0.00159298;REVB=-0.0021414;RO=62;SAF=21;SAR=30;SRF=29;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0561066;STB=0.531337;TYPE=snp;VARB=-0.00192697;OID=.;OPOS=56243766;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:62:62:51:51:30:21:29:33:30:21:29:33 chr15 56322148 . C T 639.72 PASS AO=66;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.034131;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.612;QD=38.1921;RBI=0.0347789;REFB=0;REVB=0.00668163;RO=0;SAF=27;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.91393e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000332449;OID=.;OPOS=56322148;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:66:67:0:0:66:67:39:27:0:0:39:28:0:0 chr15 56322156 . T C 102.61 PASS AO=25;DP=59;FAO=26;FDP=60;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=-0.0839272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8887;QD=6.84055;RBI=0.0839821;REFB=-0.0122539;REVB=0.00303727;RO=34;SAF=13;SAR=12;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138902;STB=0.58772;TYPE=snp;VARB=0.0138038;OID=.;OPOS=56322156;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:60:34:34:25:26:12:13:13:21:12:14:13:21 chr15 56386577 . T G 1998.66 PASS AO=211;DP=212;FAO=211;FDP=211;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0068052;FXX=0.00471676;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.759;QD=37.8892;RBI=0.0179558;REFB=-0.0436898;REVB=0.0166162;RO=0;SAF=101;SAR=110;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.237e-05;OID=.;OPOS=56386577;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:87:212:211:0:0:211:211:110:101:0:0:110:101:0:0 chr15 56387931 . C T 1625.03 PASS AO=171;DP=171;FAO=170;FDP=170;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=123;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0335969;FXX=0.00584761;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4554;QD=38.236;RBI=0.060148;REFB=0;REVB=-0.0498901;RO=0;SAF=48;SAR=123;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000122592;OID=.;OPOS=56387931;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:171:170:0:0:171:170:123:48:0:0:123:47:0:0 chr15 56721264 . G A 906.27 PASS AO=95;DP=96;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0459487;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.673;QD=38.1588;RBI=0.0467664;REFB=0;REVB=-0.00870671;RO=0;SAF=62;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.10899e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000127416;OID=.;OPOS=56721264;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:96:95:0:0:95:95:33:62:0:0:33:62:0:0 chr15 56756285 . T G 385.61 PASS AO=98;DP=211;FAO=98;FDP=211;FR=.;FRO=113;FSAF=76;FSAR=22;FSRF=87;FSRR=26;FWDB=0.0180297;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.1494;QD=7.31015;RBI=0.0395434;REFB=-0.0296465;REVB=-0.0351939;RO=113;SAF=76;SAR=22;SRF=87;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00774418;STB=0.504284;TYPE=snp;VARB=0.0337991;OID=.;OPOS=56756285;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:211:113:113:98:98:22:76:87:26:22:76:87:26 chr15 56923714 . G A 1450.34 PASS AO=152;DP=153;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012839;FXX=0.00653552;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.894;QD=38.1669;RBI=0.0206534;REFB=0;REVB=0.0161779;RO=0;SAF=79;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.3138e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.19402e-06;OID=.;OPOS=56923714;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:153:152:0:0:152:152:73:79:0:0:73:79:0:0 chr15 56924212 . C T 322.76 PASS AO=83;DP=173;FAO=81;FDP=173;FR=.;FRO=92;FSAF=46;FSAR=35;FSRF=45;FSRR=47;FWDB=0.00463351;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5233;QD=7.46275;RBI=0.0179173;REFB=0.0235882;REVB=-0.0173078;RO=87;SAF=48;SAR=35;SRF=43;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0788342;STB=0.542177;TYPE=snp;VARB=-0.042028;OID=.;OPOS=56924212;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:173:87:92:83:81:35:48:43:44:35:46:45:47 chr15 56946980 . T G 1345.87 PASS AO=167;DP=185;FAO=166;FDP=185;FR=.;FRO=19;FSAF=75;FSAR=91;FSRF=2;FSRR=17;FWDB=-0.0399985;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.2948;QD=29.0998;RBI=0.0405314;REFB=-0.0264173;REVB=-0.0065508;RO=18;SAF=75;SAR=92;SRF=2;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0634462;STB=0.536171;TYPE=snp;VARB=0.00513873;OID=.;OPOS=56946980;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:185:185:18:19:167:166:92:75:2:16:91:75:2:17 chr15 57731335 . A C 652.02 PASS AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.028856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.7556;QD=38.3538;RBI=0.0526588;REFB=0;REVB=0.0440487;RO=0;SAF=27;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.6787e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00062858;OID=.;OPOS=57731335;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:68:68:0:0:68:68:41:27:0:0:41:27:0:0 chr15 57731573 . C T 83.68 PASS AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.093494;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9666;QD=6.97363;RBI=0.0935049;REFB=0.0329336;REVB=0.00142178;RO=27;SAF=5;SAR=16;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200194;STB=0.615266;TYPE=snp;VARB=-0.0403617;OID=.;OPOS=57731573;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:48:48:27:27:21:21:16:5:11:16:16:5:11:16 chr15 57731728 . A G 1205.08 PASS AO=125;DP=125;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164544;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.198;QD=38.2564;RBI=0.0208043;REFB=0;REVB=0.0127308;RO=0;SAF=59;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.44294e-05;OID=.;OPOS=57731728;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:125:126:0:0:125:126:66:59:0:0:66:60:0:0 chr15 57910241 . T C 349.38 PASS AO=87;DP=184;FAO=87;FDP=184;FR=.;FRO=97;FSAF=52;FSAR=35;FSRF=54;FSRR=43;FWDB=-0.00458807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.304;QD=7.59515;RBI=0.00494159;REFB=-0.00309277;REVB=-0.00183547;RO=96;SAF=52;SAR=35;SRF=53;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0445677;STB=0.522271;TYPE=snp;VARB=0.00397512;OID=.;OPOS=57910241;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:184:96:97:87:87:35:52:53:43:35:52:54:43 chr15 57918069 . A G 158.92 PASS AO=58;DP=175;FAO=60;FDP=178;FR=.;FRO=118;FSAF=23;FSAR=37;FSRF=31;FSRR=87;FWDB=0.022881;FXX=0.0165737;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.308;QD=3.57126;RBI=0.0273137;REFB=-0.00253083;REVB=-0.0149163;RO=115;SAF=21;SAR=37;SRF=31;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121064;STB=0.588014;TYPE=snp;VARB=0.00484232;OID=.;OPOS=57918069;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:178:115:118:58:60:37:21:31:84:37:23:31:87 chr15 57918090 . A G 1515.21 PASS AO=164;DP=166;FAO=163;FDP=166;FR=.;FRO=3;FSAF=45;FSAR=118;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0407723;FXX=0.00598767;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.6814;QD=36.5111;RBI=0.0410804;REFB=-0.0456339;REVB=0.0050212;RO=2;SAF=46;SAR=118;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0202354;STB=0.50876;TYPE=snp;VARB=0.00299848;OID=.;OPOS=57918090;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:166:166:2:3:164:163:118:46:2:0:118:45:2:1 chr15 57925836 . C T 329.68 PASS AO=69;DP=126;FAO=69;FDP=126;FR=.;FRO=57;FSAF=41;FSAR=28;FSRF=29;FSRR=28;FWDB=0.020498;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.8225;QD=10.4661;RBI=0.023015;REFB=-0.012645;REVB=0.0104651;RO=57;SAF=41;SAR=28;SRF=29;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0720557;STB=0.539462;TYPE=snp;VARB=0.00910636;OID=.;OPOS=57925836;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:57:57:69:69:28:41:29:28:28:41:29:28 chr15 57967219 . T C 1803.01 PASS AO=188;DP=189;FAO=187;FDP=187;FR=.;FRO=0;FSAF=120;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00642003;FXX=0.0105815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.36;QD=38.5671;RBI=0.00751551;REFB=0;REVB=-0.00390718;RO=0;SAF=120;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.18356e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000147492;OID=.;OPOS=57967219;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:189:187:0:0:188:187:68:120:0:0:67:120:0:0 chr15 58000981 . C T 215.81 PASS AO=61;DP=145;FAO=61;FDP=145;FR=.;FRO=84;FSAF=42;FSAR=19;FSRF=63;FSRR=21;FWDB=0.000721086;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.403;QD=5.9535;RBI=0.0137533;REFB=-0.00681203;REVB=-0.0137343;RO=83;SAF=42;SAR=19;SRF=63;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0881113;STB=0.542844;TYPE=snp;VARB=0.00894838;OID=.;OPOS=58000981;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:83:84:61:61:19:42:63:20:19:42:63:21 chr15 58256127 . C T 1514.93 PASS AO=153;DP=157;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0364708;FXX=0.0187488;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.445;QD=38.5969;RBI=0.0364929;REFB=0;REVB=0.00126977;RO=0;SAF=61;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000236797;OID=.;OPOS=58256127;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:157:157:0:0:153:157:92:61:0:0:93:64:0:0 chr15 58444720 . A T 2044.92 PASS AO=206;DP=206;FAO=214;FDP=214;FR=.;FRO=0;FSAF=122;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000730181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.194;QD=38.2228;RBI=0.0135761;REFB=0;REVB=0.0135564;RO=0;SAF=115;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.04607e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.66914e-06;OID=.;OPOS=58444720;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:97:206:214:0:0:206:214:91:115:0:0:92:122:0:0 chr15 58471368 . C T 1255.81 PASS AO=122;DP=122;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0221033;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.862;QD=37.487;RBI=0.0237053;REFB=0;REVB=0.00856635;RO=0;SAF=49;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000484995;OID=.;OPOS=58471368;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:122:134:0:0:122:134:73:49:0:0:78:56:0:0 chr15 58476281 . A G 1538.73 PASS AO=158;DP=160;FAO=163;FDP=163;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0509081;FXX=0.00609719;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.41;QD=37.7601;RBI=0.0513301;REFB=0;REVB=0.00656844;RO=0;SAF=70;SAR=88;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.42551e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.03254e-05;OID=.;OPOS=58476281;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:160:163:0:0:158:163:88:70:0:0:93:70:0:0 chr15 58571401 . A T 377.63 PASS AO=59;DP=86;FAO=61;FDP=87;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=47;FSRF=4;FSRR=22;FWDB=0.0345941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.423;QD=17.3625;RBI=0.0410256;REFB=-0.00378175;REVB=-0.0220533;RO=26;SAF=14;SAR=45;SRF=4;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0680634;STB=0.533102;TYPE=snp;VARB=0.00503351;OID=.;OPOS=58571401;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:86:87:26:26:59:61:45:14:4:22:47:14:4:22 chr15 58834741 . G T 267.69 PASS AO=62;DP=133;FAO=65;FDP=136;FR=.;FRO=71;FSAF=31;FSAR=34;FSRF=38;FSRR=33;FWDB=0.0379486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.588;QD=7.8732;RBI=0.0384703;REFB=-0.00496657;REVB=0.0063139;RO=71;SAF=28;SAR=34;SRF=38;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0804158;STB=0.5304;TYPE=snp;VARB=0.00515926;OID=.;OPOS=58834741;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:136:71:71:62:65:34:28:38:33:34:31:38:33 chr15 58838010 . A G 377.23 PASS AO=105;DP=246;FAO=105;FDP=243;FR=.;FRO=138;FSAF=49;FSAR=56;FSRF=45;FSRR=93;FWDB=0.00858468;FXX=0.0161937;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.4704;QD=6.20952;RBI=0.008954;REFB=-0.00537343;REVB=0.00254508;RO=122;SAF=50;SAR=55;SRF=38;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162428;STB=0.581044;TYPE=snp;VARB=0.00583385;OID=.;OPOS=58838010;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:246:243:122:138:105:105:55:50:38:84:56:49:45:93 chr15 58838038 . C G 474.69 PASS AO=113;DP=225;FAO=112;FDP=226;FR=.;FRO=114;FSAF=39;FSAR=73;FSRF=53;FSRR=61;FWDB=0.018196;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=253.789;QD=8.40158;RBI=0.0182273;REFB=-0.00885941;REVB=0.00106787;RO=111;SAF=40;SAR=73;SRF=52;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10888;STB=0.562373;TYPE=snp;VARB=0.00845376;OID=.;OPOS=58838038;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:225:226:111:114:113:112:73:40:52:59:73:39:53:61 chr15 58853079 . C A 791.89 PASS AO=83;DP=83;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0296612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.489;QD=37.2652;RBI=0.0307449;REFB=0;REVB=0.00809085;RO=0;SAF=80;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000728915;OID=.;OPOS=58853079;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:83:85:0:0:83:85:3:80:0:0:5:80:0:0 chr15 58853109 . A G 304.65 PASS AO=32;DP=32;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.044079;FXX=0.0571265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.087;QD=36.9277;RBI=0.0727739;REFB=0;REVB=0.0579058;RO=0;SAF=23;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02243e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00115501;OID=.;OPOS=58853109;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:32:33:0:0:32:33:9:23:0:0:10:23:0:0 chr15 58855857 . AG A 363.82 PASS AO=49;DP=76;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.305626;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=10.4722;QD=20.212;RBI=0.311857;REFB=0.00632503;REVB=-0.0620258;RO=12;SAF=14;SAR=35;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158128;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0128121;OID=.;OPOS=58855858;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:49:72:72:72:0:26:46:0:0:30:12:14:35:8:4 chr15 58857378 . A G 220.7 PASS AO=45;DP=90;FAO=48;FDP=92;FR=.;FRO=44;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=0.0102734;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.72;QD=9.59573;RBI=0.0356838;REFB=-0.00732847;REVB=0.034173;RO=44;SAF=23;SAR=22;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0103752;STB=0.520825;TYPE=snp;VARB=0.00769274;OID=.;OPOS=58857378;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:92:44:44:45:48:22:23:23:21:25:23:23:21 chr15 59147037 . A T 944.23 PASS AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00676919;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.214;QD=38.5398;RBI=0.00677151;REFB=0;REVB=0.000177342;RO=0;SAF=55;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.423e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000298475;OID=.;OPOS=59147037;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:98:98:0:0:98:98:43:55:0:0:43:55:0:0 chr15 59147413 . T A 1182.24 PASS AO=127;DP=129;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00402641;FXX=0.0451094;HRUN=4;LEN=1;MLLD=177.377;QD=37.2358;RBI=0.00771023;REFB=-0.000928745;REVB=-0.00657539;RO=2;SAF=60;SAR=67;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0139719;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00111828;OID=.;OPOS=59147413;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:129:127:2:0:127:127:67:60:0:2:67:60:0:0 chr15 59347929 . C A 455.99 PASS AO=105;DP=206;FAO=105;FDP=207;FR=.;FRO=102;FSAF=59;FSAR=46;FSRF=62;FSRR=40;FWDB=-0.0437236;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7166;QD=8.81139;RBI=0.0563322;REFB=0.0223971;REVB=0.0355184;RO=101;SAF=59;SAR=46;SRF=62;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.047509;STB=0.523116;TYPE=snp;VARB=-0.0221576;OID=.;OPOS=59347929;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:206:207:101:102:105:105:46:59:62:39:46:59:62:40 chr15 59368167 . G A 427.94 PASS AO=99;DP=196;FAO=99;FDP=196;FR=.;FRO=97;FSAF=58;FSAR=41;FSRF=47;FSRR=50;FWDB=-0.0134737;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.1466;QD=8.73341;RBI=0.0382382;REFB=-0.00451731;REVB=0.0357857;RO=97;SAF=58;SAR=41;SRF=47;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0923897;STB=0.550757;TYPE=snp;VARB=0.00386677;OID=.;OPOS=59368167;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:196:97:97:99:99:41:58:47:50:41:58:47:50 chr15 59499179 . G A 421.59 PASS AO=70;DP=104;FAO=71;FDP=105;FR=.;FRO=34;FSAF=33;FSAR=38;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.0147999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.946;QD=16.0605;RBI=0.0150562;REFB=-0.0169439;REVB=0.00276621;RO=34;SAF=32;SAR=38;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.026093;STB=0.511437;TYPE=snp;VARB=0.00771843;OID=.;OPOS=59499179;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:104:105:34:34:70:71:38:32:17:17:38:33:17:17 chr15 59499228 . C T 423.71 PASS AO=79;DP=131;FAO=79;FDP=130;FR=.;FRO=51;FSAF=34;FSAR=45;FSRF=30;FSRR=21;FWDB=-0.00334527;FXX=0.00763301;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.145;QD=13.0371;RBI=0.00672992;REFB=-0.0154993;REVB=0.00583961;RO=50;SAF=34;SAR=45;SRF=29;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107269;STB=0.562045;TYPE=snp;VARB=0.00826684;OID=.;OPOS=59499228;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:130:50:51:79:79:45:34:29:21:45:34:30:21 chr15 59499274 . C A 340.69 PASS AO=73;DP=136;FAO=73;FDP=136;FR=.;FRO=63;FSAF=34;FSAR=39;FSRF=40;FSRR=23;FWDB=-0.00831753;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=227.946;QD=10.0203;RBI=0.0091146;REFB=0.00514371;REVB=0.00372753;RO=63;SAF=34;SAR=39;SRF=40;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142331;STB=0.577872;TYPE=snp;VARB=-0.00440428;OID=.;OPOS=59499274;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:63:63:73:73:39:34:40:23:39:34:40:23 chr15 59500116 . T C 288.97 PASS AO=75;DP=169;FAO=76;FDP=170;FR=.;FRO=94;FSAF=47;FSAR=29;FSRF=41;FSRR=53;FWDB=0.00205647;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.1616;QD=6.79918;RBI=0.00304304;REFB=-0.00334456;REVB=0.002243;RO=94;SAF=47;SAR=28;SRF=41;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192187;STB=0.601597;TYPE=snp;VARB=0.00547416;OID=.;OPOS=59500116;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:170:94:94:75:76:28:47:41:53:29:47:41:53 chr15 59682428 . G A 1101 PASS AO=114;DP=116;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136258;FXX=0.0170926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.915;QD=38.2955;RBI=0.0230458;REFB=0;REVB=0.0185861;RO=0;SAF=55;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.6541e-05;OID=.;OPOS=59682428;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:116:115:0:0:114:115:59:55:0:0:60:55:0:0 chr15 59682486 . G GT 824.21 PASS AO=101;DP=114;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0234308;FXX=0.0624944;HRUN=2;LEN=1;MLLD=23.1023;QD=31.3984;RBI=0.0333628;REFB=0;REVB=0.0237503;RO=8;SAF=44;SAR=57;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00907528;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00106849;OID=.;OPOS=59682487;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:101:114:105:105:0:46:59:0:0:74:8:44:57:4:4 chr15 59784493 . C T 1902.41 PASS AO=230;DP=255;FAO=231;FDP=255;FR=.;FRO=24;FSAF=112;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=24;FWDB=0.0129821;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=280.739;QD=29.8417;RBI=0.0131172;REFB=-0.00253286;REVB=-0.00187792;RO=24;SAF=111;SAR=119;SRF=0;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0869805;STB=0.545798;TYPE=snp;VARB=0.000239683;OID=.;OPOS=59784493;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:255:255:24:24:230:231:119:111:0:24:119:112:0:24 chr15 59911892 . G T 2772.15 PASS AO=294;DP=299;FAO=297;FDP=297;FR=.;FRO=0;FSAF=144;FSAR=153;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0054807;FXX=0.0165557;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.847;QD=37.3354;RBI=0.0305045;REFB=-0.106431;REVB=0.0300081;RO=0;SAF=142;SAR=152;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000528235;OID=.;OPOS=59911892;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:299:297:0:0:294:297:152:142:0:0:153:144:0:0 chr15 59912253 . A C 1433.82 PASS AO=152;DP=154;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.105737;FXX=0.00649309;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.6314;QD=37.4855;RBI=0.10849;REFB=-0.114056;REVB=0.0242875;RO=1;SAF=62;SAR=90;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00525644;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00050873;OID=.;OPOS=59912253;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:154:153:1:0:152:153:90:62:0:1:91:62:0:0 chr15 59912625 . G A 414.85 PASS AO=41;DP=43;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0405226;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.612;QD=36.074;RBI=0.123673;REFB=0;REVB=0.116846;RO=2;SAF=28;SAR=13;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0323448;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00082432;OID=.;OPOS=59912625;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:43:46:2:0:41:46:13:28:2:0:15:31:0:0 chr15 59963488 . A G 141.2 PASS AO=42;DP=106;FAO=42;FDP=106;FR=.;FRO=64;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=25;FSRR=39;FWDB=0.0338079;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.562;QD=5.32826;RBI=0.0409574;REFB=-0.00328032;REVB=0.02312;RO=64;SAF=16;SAR=26;SRF=25;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108827;STB=0.50617;TYPE=snp;VARB=0.00387128;OID=.;OPOS=59963488;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:64:64:42:42:26:16:25:39:26:16:25:39 chr15 60298221 . C A 435.27 PASS AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0311493;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=51.2831;QD=37.8497;RBI=0.0326617;REFB=0;REVB=0.00982379;RO=0;SAF=3;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.94467e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000356717;OID=.;OPOS=60298221;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:46:46:0:0:46:46:43:3:0:0:43:3:0:0 chr15 60678298 . T A 65.54 PASS AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.0543294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.188;QD=7.94416;RBI=0.0543622;REFB=0.0105124;REVB=-0.00188769;RO=18;SAF=8;SAR=7;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188278;STB=0.607861;TYPE=snp;VARB=-0.0141299;OID=.;OPOS=60678298;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:33:33:18:18:15:15:7:8:6:12:7:8:6:12 chr15 60715800 . T G 192.28 PASS AO=42;DP=138;FAO=57;FDP=135;FR=.;FRO=78;FSAF=36;FSAR=21;FSRF=51;FSRR=27;FWDB=-0.0529015;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=34.5857;QD=5.69727;RBI=0.0647266;REFB=-0.0547886;REVB=0.0372956;RO=46;SAF=23;SAR=19;SRF=32;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142828;STB=0.513919;TYPE=snp;VARB=0.070093;OID=.;OPOS=60715800;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:135:46:78:42:57:19:23:32:14:21:36:51:27 chr15 60724118 . C G 182.03 PASS AO=44;DP=95;FAO=44;FDP=93;FR=.;FRO=49;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=28;FSRR=21;FWDB=0.013233;FXX=0.0210504;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.362;QD=7.82907;RBI=0.0286776;REFB=0.00222081;REVB=-0.025442;RO=49;SAF=25;SAR=19;SRF=28;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00312965;STB=0.501743;TYPE=snp;VARB=-0.00315559;OID=.;OPOS=60724118;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:93:49:49:44:44:19:25:28:21:19:25:28:21 chr15 60734697 . A G 173.5 PASS AO=41;DP=86;FAO=41;FDP=85;FR=.;FRO=44;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=25;FSRR=19;FWDB=0.0454355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.453;QD=8.16469;RBI=0.0460406;REFB=-0.000372946;REVB=0.00743961;RO=45;SAF=21;SAR=20;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0407767;STB=0.529026;TYPE=snp;VARB=0.000577476;OID=.;OPOS=60734697;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:85:45:44:41:41:20:21:25:20:20:21:25:19 chr15 60789798 . G T 1163.34 PASS AO=124;DP=128;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0519269;FXX=0.0234357;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.6742;QD=37.2268;RBI=0.0533355;REFB=-0.0799675;REVB=-0.012177;RO=2;SAF=47;SAR=77;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0197847;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000534265;OID=.;OPOS=60789798;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:128:125:2:0:124:125:77:47:2:0:77:48:0:0 chr15 60885047 . G A 154.08 PASS AO=35;DP=72;FAO=35;FDP=71;FR=.;FRO=36;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=10;FWDB=0.0493078;FXX=0.013887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9831;QD=8.68036;RBI=0.052989;REFB=-0.0168078;REVB=-0.0194055;RO=37;SAF=18;SAR=17;SRF=26;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175339;STB=0.606101;TYPE=snp;VARB=0.033313;OID=.;OPOS=60885047;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:71:37:36:35:35:17:18:26:11:17:18:26:10 chr15 62259637 . C T 638.46 PASS AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0224425;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.503;QD=37.012;RBI=0.0491187;REFB=-0.0956693;REVB=0.0436919;RO=1;SAF=32;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129488;STB=0.506847;TYPE=snp;VARB=0.00672814;OID=.;OPOS=62259637;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:69:69:1:1:68:68:36:32:0:1:36:32:0:1 chr15 62539781 . A G 163.55 PASS AO=35;DP=67;FAO=35;FDP=67;FR=.;FRO=32;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=11;FWDB=-0.0157212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.878;QD=9.76429;RBI=0.0432017;REFB=-0.0236819;REVB=-0.0402397;RO=32;SAF=23;SAR=12;SRF=21;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000852293;STB=0.500473;TYPE=snp;VARB=0.0206809;OID=.;OPOS=62539781;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:32:32:35:35:12:23:21:11:12:23:21:11 chr15 63009804 . C T 392.11 PASS AO=44;DP=47;FAO=45;FDP=48;FR=.;FRO=3;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0540948;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.528;QD=32.6758;RBI=0.055888;REFB=-0.133509;REVB=0.0140435;RO=3;SAF=16;SAR=28;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.080277;STB=0.542838;TYPE=snp;VARB=0.00316896;OID=.;OPOS=63009804;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:47:48:3:3:44:45:28:16:3:0:29:16:3:0 chr15 63047778 . C T 956.29 PASS AO=100;DP=102;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0686519;FXX=0.0194156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.3355;QD=37.8728;RBI=0.0974471;REFB=0;REVB=0.0691582;RO=0;SAF=29;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.0826e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000496516;OID=.;OPOS=63047778;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:102:101:0:0:100:101:71:29:0:0:72:29:0:0 chr15 63092924 . AG A 296.76 PASS AO=46;DP=71;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129148;FXX=0.0294074;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.7819;QD=17.9854;RBI=0.0940955;REFB=-0.060404;REVB=0.093205;RO=12;SAF=19;SAR=27;SRF=1;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0.348568;SSSB=0.134606;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.021978;OID=.;OPOS=63092925;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:46:68:66:66:0:21:45:0:0:20:12:19:27:1:11 chr15 63111739 . T C 125.67 PASS AO=29;DP=60;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.0118422;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.1314;QD=8.24037;RBI=0.0281543;REFB=-0.02208;REVB=-0.0255427;RO=30;SAF=10;SAR=19;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117102;STB=0.568814;TYPE=snp;VARB=0.0146131;OID=.;OPOS=63111739;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:61:30:32:29:29:19:10:14:16:19:10:15:17 chr15 63127983 . G A 268.25 PASS AO=52;DP=110;FAO=65;FDP=139;FR=.;FRO=74;FSAF=49;FSAR=16;FSRF=59;FSRR=15;FWDB=0.00868796;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.799;QD=7.71954;RBI=0.0393991;REFB=-0.0522685;REVB=-0.0384292;RO=58;SAF=48;SAR=4;SRF=58;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.351082;STB=0.532174;TYPE=snp;VARB=0.041984;OID=.;OPOS=63127983;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:139:58:74:52:65:4:48:58:0:16:49:59:15 chr15 63131117 . T A 296.55 PASS AO=68;DP=142;FAO=71;FDP=147;FR=.;FRO=76;FSAF=33;FSAR=38;FSRF=39;FSRR=37;FWDB=-0.00537418;FXX=0.0134219;HRUN=4;LEN=1;MLLD=221.173;QD=8.06925;RBI=0.0123981;REFB=-0.00859362;REVB=-0.0111728;RO=74;SAF=33;SAR=35;SRF=38;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0265708;STB=0.525036;TYPE=snp;VARB=0.0120796;OID=.;OPOS=63131117;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:147:74:76:68:71:35:33:38:36:38:33:39:37 chr15 63351840 . C A 621.42 PASS AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=71;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0260443;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3698;QD=35.0095;RBI=0.0273562;REFB=0.0187126;REVB=0.00836993;RO=1;SAF=37;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145434;STB=0.515147;TYPE=snp;VARB=-3.9411e-05;OID=.;OPOS=63351840;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:70:71:1:2:69:69:32:37:0:1:32:37:0:2 chr15 63363490 . T C 673.82 PASS AO=117;DP=179;FAO=117;FDP=179;FR=.;FRO=62;FSAF=45;FSAR=72;FSRF=27;FSRR=35;FWDB=0.00445131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.1752;QD=15.0573;RBI=0.0193685;REFB=-0.0301309;REVB=0.0188501;RO=61;SAF=45;SAR=72;SRF=27;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0386267;STB=0.518449;TYPE=snp;VARB=0.0218256;OID=.;OPOS=63363490;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:179:61:62:117:117:72:45:27:34:72:45:27:35 chr15 63421823 . C T 366.85 PASS AO=100;DP=228;FAO=100;FDP=228;FR=.;FRO=128;FSAF=38;FSAR=62;FSRF=44;FSRR=84;FWDB=-0.00491947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.4258;QD=6.43603;RBI=0.0163747;REFB=-0.0174953;REVB=-0.0156183;RO=128;SAF=38;SAR=62;SRF=44;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0393005;STB=0.521817;TYPE=snp;VARB=0.0163843;OID=.;OPOS=63421823;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:228:228:128:128:100:100:62:38:44:84:62:38:44:84 chr15 63433766 . G A 1614 PASS AO=159;DP=163;FAO=172;FDP=172;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.111543;FXX=0.0114936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.1047;QD=37.535;RBI=0.127863;REFB=-0.118204;REVB=0.0625073;RO=3;SAF=83;SAR=76;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184073;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00264542;OID=.;OPOS=63433766;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:163:172:3:0:159:172:76:83:0:3:80:92:0:0 chr15 63569902 . C T 146.47 PASS AO=31;DP=60;FAO=31;FDP=60;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=8;FSRR=21;FWDB=0.0200272;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.478;QD=9.76458;RBI=0.0247011;REFB=-0.00769078;REVB=0.0144588;RO=29;SAF=10;SAR=21;SRF=8;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0473537;STB=0.526299;TYPE=snp;VARB=0.00793569;OID=.;OPOS=63569902;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:29:29:31:31:21:10:8:21:21:10:8:21 chr15 63918305 . TG T 61.68 PASS AO=38;DP=90;FAO=40;FDP=74;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=0.132738;FXX=0.0133316;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.98244;QD=3.33387;RBI=0.138378;REFB=-0.162331;REVB=-0.0391046;RO=33;SAF=12;SAR=26;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228471;STB=0.533316;TYPE=del;VARB=0.155433;OID=.;OPOS=63918306;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:38:75:40:74:34:16:24:16:18:50:33:12:26:19:14 chr15 63922752 . T A 1374.43 PASS AO=143;DP=143;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0123344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.826;QD=38.1786;RBI=0.0224042;REFB=0;REVB=0.0187033;RO=0;SAF=68;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.13135e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.61588e-06;OID=.;OPOS=63922752;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:143:144:0:0:143:144:75:68:0:0:76:68:0:0 chr15 63932513 . G C 2783.43 PASS AO=307;DP=319;FAO=308;FDP=308;FR=.;FRO=0;FSAF=174;FSAR=134;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148256;FXX=0.0374988;HRUN=3;LEN=1;MLLD=207.688;QD=36.1485;RBI=0.0202727;REFB=-0.0903027;REVB=0.0138269;RO=7;SAF=174;SAR=133;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0244363;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000122195;OID=.;OPOS=63932513;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:319:308:7:0:307:308:133:174:0:7:134:174:0:0 chr15 63937209 . C G 1942.96 PASS AO=204;DP=204;FAO=203;FDP=203;FR=.;FRO=0;FSAF=119;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0195595;FXX=0.00490172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=300.462;QD=38.2849;RBI=0.0195974;REFB=0;REVB=0.00121833;RO=0;SAF=119;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.18562e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.72043e-06;OID=.;OPOS=63937209;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:92:204:203:0:0:204:203:85:119:0:0:84:119:0:0 chr15 63953151 . GA G 563.96 PASS AO=25;DP=95;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0353626;FXX=0.0103082;HRUN=2;LEN=1;MLLD=13.3372;QD=23.4982;RBI=0.182326;REFB=0;REVB=0.178864;RO=59;SAF=25;SAR=0;SRF=8;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.873039;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0045926;OID=.;OPOS=63953152;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:25:95:96:96:0:44:52:0:0:54:59:25:0:8:51 chr15 63954029 . C T 1670.12 PASS AO=178;DP=182;FAO=179;FDP=179;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140959;FXX=0.0164826;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.116;QD=37.3211;RBI=0.0185713;REFB=-0.0941681;REVB=-0.0120912;RO=1;SAF=72;SAR=106;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00656584;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000110685;OID=.;OPOS=63954029;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:182:179:1:0:178:179:106:72:1:0:106:73:0:0 chr15 63970456 . T C 1205.08 PASS AO=127;DP=127;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.777;QD=38.2565;RBI=0.0198788;REFB=0;REVB=-0.0151036;RO=0;SAF=57;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.53395e-06;OID=.;OPOS=63970456;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:127:126:0:0:127:126:70:57:0:0:69:57:0:0 chr15 63988357 . C G 1752.2 PASS AO=186;DP=190;FAO=190;FDP=193;FR=.;FRO=3;FSAF=103;FSAR=87;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0988249;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.7193;QD=36.315;RBI=0.10024;REFB=-0.171418;REVB=-0.0167815;RO=3;SAF=100;SAR=86;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140676;STB=0.507176;TYPE=snp;VARB=0.00912434;OID=.;OPOS=63988357;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:190:193:3:3:186:190:86:100:3:0:87:103:3:0 chr15 64214954 . G C 143.53 PASS AO=31;DP=61;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=8;FWDB=-0.0212884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9068;QD=9.41203;RBI=0.0367281;REFB=-0.0212577;REVB=0.0299292;RO=29;SAF=18;SAR=13;SRF=22;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164251;STB=0.579016;TYPE=snp;VARB=0.0220191;OID=.;OPOS=64214954;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:29:30:31:31:13:18:22:7:13:18:22:8 chr15 64215375 . G C 1032.17 PASS AO=109;DP=111;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0547668;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.129;QD=37.5336;RBI=0.0554328;REFB=-0.0323954;REVB=0.00856692;RO=1;SAF=48;SAR=61;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00978674;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000866311;OID=.;OPOS=64215375;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:111:110:1:0:109:110:61:48:1:0:62:48:0:0 chr15 64385851 . T C 189.41 PASS AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0122535;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.628;QD=32.9407;RBI=0.0351837;REFB=0.0339046;REVB=-0.0329809;RO=1;SAF=6;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0280287;STB=0.515138;TYPE=snp;VARB=-0.0226144;OID=.;OPOS=64385851;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:23:23:1:1:22:22:16:6:0:1:16:6:0:1 chr15 64418397 . G A 725.57 PASS AO=62;DP=81;FAO=80;FDP=80;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=5;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.5548;QD=36.2783;RBI=0.0176866;REFB=0;REVB=-0.00323921;RO=0;SAF=2;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000249209;OID=.;OPOS=64418397;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:79:80:0:0:62:80:60:2:0:0:75:5:0:0 chr15 64418398 . C A 21.9 PASS AO=16;DP=81;FAO=16;FDP=81;FR=.;FRO=65;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=63;FWDB=0.0156956;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=83.895;QD=1.08154;RBI=0.0205791;REFB=-0.0707549;REVB=0.0133097;RO=65;SAF=3;SAR=13;SRF=2;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.486378;STB=0.777978;TYPE=snp;VARB=0.0268201;OID=.;OPOS=64418398;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:81:81:65:65:16:16:13:3:2:63:13:3:2:63 chr15 64430607 . T C 339.2 PASS AO=11;DP=37;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.075577;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.337;QD=37.6893;RBI=0.0766315;REFB=0;REVB=0.012669;RO=0;SAF=1;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00027901;OID=.;OPOS=64430607;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:11:36:0:0:11:36:10:1:0:0:30:6:0:0 chr15 64634884 . C A 820.12 PASS AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0180489;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.325;QD=38.1453;RBI=0.0468399;REFB=0;REVB=-0.0432228;RO=0;SAF=25;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000177368;OID=.;OPOS=64634884;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:86:86:0:0:86:86:61:25:0:0:61:25:0:0 chr15 64710827 . T C 606.25 PASS AO=143;DP=288;FAO=144;FDP=288;FR=.;FRO=144;FSAF=71;FSAR=73;FSRF=79;FSRR=65;FWDB=0.0131781;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.848;QD=8.42009;RBI=0.0211119;REFB=-0.00870077;REVB=0.0164939;RO=144;SAF=71;SAR=72;SRF=79;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0476618;STB=0.527758;TYPE=snp;VARB=0.00994046;OID=.;OPOS=64710827;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:288:288:144:144:143:144:72:71:79:65:73:71:79:65 chr15 64710874 . G C 542.8 PASS AO=129;DP=261;FAO=129;FDP=261;FR=.;FRO=132;FSAF=58;FSAR=71;FSRF=57;FSRR=75;FWDB=-0.00933485;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.026;QD=8.3187;RBI=0.0427205;REFB=-0.0190315;REVB=0.0416882;RO=130;SAF=58;SAR=71;SRF=55;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.024592;STB=0.509107;TYPE=snp;VARB=0.0159876;OID=.;OPOS=64710874;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:261:261:130:132:129:129:71:58:55:75:71:58:57:75 chr15 64737225 . G A 1190.39 PASS AO=124;DP=125;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0114233;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.605;QD=37.7901;RBI=0.0154501;REFB=-0.0130496;REVB=0.0104026;RO=1;SAF=75;SAR=49;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00959722;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.61894e-06;OID=.;OPOS=64737225;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:125:126:1:0:124:126:49:75:0:1:50:76:0:0 chr15 64792896 . G A 2210.11 PASS AO=198;DP=200;FAO=232;FDP=232;FR=.;FRO=0;FSAF=109;FSAR=123;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00375612;FXX=0.0169484;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.081;QD=38.1053;RBI=0.0224607;REFB=0.0248322;REVB=0.0221444;RO=0;SAF=103;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.32534e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.67404e-05;OID=.;OPOS=64792896;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:96:200:232:0:0:198:232:95:103:0:0:123:109:0:0 chr15 64793617 . A G 2177.68 PASS AO=227;DP=229;FAO=228;FDP=228;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=131;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0274207;FXX=0.00436662;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.151;QD=38.2049;RBI=0.0287798;REFB=0;REVB=0.00873979;RO=0;SAF=97;SAR=130;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.14842e-05;OID=.;OPOS=64793617;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:229:228:0:0:227:228:130:97:0:0:131:97:0:0 chr15 64915106 . C T 1618.31 PASS AO=172;DP=173;FAO=171;FDP=171;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=108;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102293;FXX=0.01156;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.5894;QD=37.8552;RBI=0.0114807;REFB=-0.0476902;REVB=-0.00521224;RO=0;SAF=64;SAR=108;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.05635e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000168181;OID=.;OPOS=64915106;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:173:171:0:0:172:171:108:64:0:0:108:63:0:0 chr15 64962630 . A C 430.28 PASS AO=76;DP=195;FAO=133;FDP=310;FR=.;FRO=177;FSAF=45;FSAR=88;FSRF=59;FSRR=118;FWDB=0.0187749;FXX=0.00321533;HRUN=2;LEN=1;MLLD=35.1956;QD=5.55201;RBI=0.025245;REFB=-0.0195882;REVB=-0.0168764;RO=117;SAF=19;SAR=57;SRF=22;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.094278;STB=0.503202;TYPE=snp;VARB=0.0400881;OID=.;OPOS=64962630;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:310:117:177:76:133:57:19:22:95:88:45:59:118 chr15 64977358 . GT G 80.25 PASS AO=35;DP=93;FAO=42;FDP=77;FR=.;FRO=35;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=7;FSRR=28;FWDB=-0.221883;FXX=0.114929;HRUN=7;LEN=1;MLLD=8.32288;QD=4.16895;RBI=0.240872;REFB=-0.140379;REVB=0.0937421;RO=33;SAF=23;SAR=12;SRF=4;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.444095;STB=0.664187;TYPE=del;VARB=0.158723;OID=.;OPOS=64977359;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:35:84:42:77:35:24:18:7:28:37:33:23:12:4:29 chr15 65041622 . C A 306.11 PASS AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0226696;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.99;QD=37.1046;RBI=0.0228551;REFB=0;REVB=0.00290647;RO=0;SAF=16;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.60901e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000246603;OID=.;OPOS=65041622;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:33:33:0:0:33:33:17:16:0:0:17:16:0:0 chr15 65108479 . T C 85.43 PASS AO=28;DP=79;FAO=28;FDP=79;FR=.;FRO=51;FSAF=23;FSAR=5;FSRF=45;FSRR=6;FWDB=-0.05514;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.3416;QD=4.32532;RBI=0.0612752;REFB=0.0092845;REVB=0.0267253;RO=51;SAF=23;SAR=5;SRF=45;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128641;STB=0.573309;TYPE=snp;VARB=-0.0168757;OID=.;OPOS=65108479;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:79:79:51:51:28:28:5:23:45:6:5:23:45:6 chr15 65108504 . A T 244.59 PASS AO=44;DP=72;FAO=45;FDP=73;FR=.;FRO=28;FSAF=44;FSAR=1;FSRF=24;FSRR=4;FWDB=-0.014403;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.047;QD=13.402;RBI=0.0283469;REFB=0.0109982;REVB=-0.0244151;RO=28;SAF=44;SAR=0;SRF=24;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.850987;STB=0.763717;TYPE=snp;VARB=-0.00772504;OID=.;OPOS=65108504;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:72:73:28:28:44:45:0:44:24:4:1:44:24:4 chr15 65153690 . G A 89.15 PASS AO=18;DP=44;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.0289066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.275;QD=7.42914;RBI=0.0326714;REFB=-0.0311804;REVB=0.0152258;RO=26;SAF=4;SAR=14;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.38938;STB=0.674533;TYPE=snp;VARB=0.02617;OID=.;OPOS=65153690;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:44:48:26:26:18:22:14:4:15:11:16:6:15:11 chr15 65157482 . C T 96.3 PASS AO=20;DP=39;FAO=20;FDP=39;FR=.;FRO=19;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=2;FWDB=0.0213706;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.563;QD=9.87708;RBI=0.0221777;REFB=-0.0101372;REVB=-0.00592828;RO=19;SAF=15;SAR=5;SRF=17;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186798;STB=0.603683;TYPE=snp;VARB=0.0245043;OID=.;OPOS=65157482;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:39:39:19:19:20:20:5:15:17:2:5:15:17:2 chr15 65159797 . T G 13.38 PASS AO=4;DP=17;FAO=4;FDP=17;FR=.;FRO=13;FSAF=0;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=13;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=135.821;QD=3.14786;RBI=0.0581705;REFB=0.000706549;REVB=-0.0581705;RO=13;SAF=0;SAR=4;SRF=0;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0201447;OID=.;OPOS=65159797;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:17:17:13:13:4:4:4:0:0:13:4:0:0:13 chr15 65235776 . A G 74.25 PASS AO=24;DP=69;FAO=25;FDP=69;FR=.;FRO=44;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=32;FWDB=-0.111716;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.122;QD=4.30411;RBI=0.112491;REFB=-0.00428452;REVB=0.0131753;RO=44;SAF=7;SAR=17;SRF=12;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.025884;STB=0.505776;TYPE=snp;VARB=0.0120125;OID=.;OPOS=65235776;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:69:69:44:44:24:25:17:7:12:32:18:7:12:32 chr15 65236875 . T C 396.92 PASS AO=93;DP=207;FAO=100;FDP=213;FR=.;FRO=113;FSAF=25;FSAR=75;FSRF=43;FSRR=70;FWDB=-0.0139574;FXX=0.00467268;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.328;QD=7.45394;RBI=0.0421808;REFB=-0.0187682;REVB=0.0398047;RO=113;SAF=23;SAR=70;SRF=43;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159936;STB=0.584509;TYPE=snp;VARB=0.0238055;OID=.;OPOS=65236875;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:213:113:113:93:100:70:23:43:70:75:25:43:70 chr15 65294903 . A G 127.09 PASS AO=32;DP=107;FAO=38;FDP=97;FR=.;FRO=59;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=27;FSRR=32;FWDB=0.010734;FXX=0;HRUN=9;LEN=1;MLLD=251.819;QD=5.24087;RBI=0.0107349;REFB=0.00162203;REVB=0.000140973;RO=20;SAF=15;SAR=17;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0568793;STB=0.506298;TYPE=snp;VARB=-0.0024782;OID=.;OPOS=65294903;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:97:20:59:32:38:17:15:11:9:21:17:27:32 chr15 65308797 . G A 577.37 PASS AO=145;DP=305;FAO=145;FDP=305;FR=.;FRO=160;FSAF=67;FSAR=78;FSRF=61;FSRR=99;FWDB=0.0262243;FXX=0.00326787;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.8877;QD=7.57211;RBI=0.0276167;REFB=0.000718012;REVB=0.00865831;RO=159;SAF=67;SAR=78;SRF=60;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0816129;STB=0.542914;TYPE=snp;VARB=-0.000370524;OID=.;OPOS=65308797;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:305:305:159:160:145:145:78:67:60:99:78:67:61:99 chr15 65370353 . T C 488.84 PASS AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00619111;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.6501;QD=37.6029;RBI=0.015483;REFB=0;REVB=-0.0141914;RO=0;SAF=36;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000165894;OID=.;OPOS=65370353;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:53:52:0:0:52:52:16:36:0:0:16:36:0:0 chr15 65449169 . C T 1858.67 PASS AO=194;DP=196;FAO=196;FDP=196;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=134;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0029749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.524;QD=37.9321;RBI=0.0602639;REFB=0;REVB=0.0601905;RO=1;SAF=62;SAR=132;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00359444;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.04982e-05;OID=.;OPOS=65449169;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:196:196:1:0:194:196:132:62:0:1:134:62:0:0 chr15 65489128 . C T 327.65 PASS AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115582;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.403;QD=37.4458;RBI=0.0147941;REFB=0;REVB=0.00923434;RO=0;SAF=15;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.5885e-05;OID=.;OPOS=65489128;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:35:35:0:0:35:35:20:15:0:0:20:15:0:0 chr15 65489688 . T C 1152.87 PASS AO=120;DP=120;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00750651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.885;QD=38.1114;RBI=0.0131808;REFB=0;REVB=-0.0108345;RO=0;SAF=69;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.95202e-06;OID=.;OPOS=65489688;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:120:121:0:0:120:121:51:69:0:0:52:69:0:0 chr15 65490901 . T C 1615.45 PASS AO=190;DP=206;FAO=191;FDP=207;FR=.;FRO=16;FSAF=101;FSAR=90;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=-0.00409889;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=168.944;QD=31.2164;RBI=0.00410116;REFB=0.0591262;REVB=0.000136395;RO=16;SAF=101;SAR=89;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0324077;STB=0.517187;TYPE=snp;VARB=-1.80107e-05;OID=.;OPOS=65490901;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:206:207:16:16:190:191:89:101:12:4:90:101:12:4 chr15 65494212 . A G 33.07 PASS AO=15;DP=58;FAO=15;FDP=58;FR=.;FRO=43;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=28;FWDB=-0.00927766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.3708;QD=2.28042;RBI=0.0186863;REFB=-0.0123994;REVB=-0.0162205;RO=42;SAF=4;SAR=11;SRF=14;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0959898;STB=0.572501;TYPE=snp;VARB=0.0360207;OID=.;OPOS=65494212;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:58:58:42:43:15:15:11:4:14:28:11:4:15:28 chr15 65619427 . T A 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.586;QD=33.022;RBI=0.000125502;REFB=0;REVB=-0.000125502;RO=0;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.3468e-06;OID=.;OPOS=65619427;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:6:0:0:0:6:0:0:0 chr15 65620156 . C T 506.91 PASS AO=56;DP=59;FAO=57;FDP=60;FR=.;FRO=3;FSAF=12;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0355153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.1137;QD=33.7937;RBI=0.0610618;REFB=-0.0903881;REVB=0.049671;RO=2;SAF=11;SAR=45;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0204978;STB=0.509135;TYPE=snp;VARB=0.00629;OID=.;OPOS=65620156;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:59:60:2:3:56:57:45:11:0:2:45:12:1:2 chr15 65621441 . C A 158.6 PASS AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0215376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.018;QD=37.3185;RBI=0.134173;REFB=0;REVB=0.132433;RO=0;SAF=6;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00169697;OID=.;OPOS=65621441;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:17:17:0:0:17:17:11:6:0:0:11:6:0:0 chr15 65621857 . T C 448.16 PASS AO=44;DP=46;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.1248;QD=37.3467;RBI=0.135376;REFB=0;REVB=0.133307;RO=0;SAF=15;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00195771;OID=.;OPOS=65621857;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:46:48:0:0:44:48:29:15:0:0:33:15:0:0 chr15 65667724 . A G 197.32 PASS AO=45;DP=91;FAO=45;FDP=91;FR=.;FRO=46;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=0.000812472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.766;QD=8.67359;RBI=0.00275425;REFB=-0.0152622;REVB=0.00263169;RO=45;SAF=20;SAR=25;SRF=17;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0614034;STB=0.527351;TYPE=snp;VARB=0.0185649;OID=.;OPOS=65667724;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:45:46:45:45:25:20:17:28:25:20:18:28 chr15 65674036 . C T 213.33 PASS AO=53;DP=114;FAO=52;FDP=110;FR=.;FRO=58;FSAF=39;FSAR=13;FSRF=45;FSRR=13;FWDB=-0.0118223;FXX=0.0350846;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.46;QD=7.75735;RBI=0.0129853;REFB=-0.0304202;REVB=-0.00537136;RO=52;SAF=40;SAR=13;SRF=41;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0418955;STB=0.518512;TYPE=snp;VARB=0.029706;OID=.;OPOS=65674036;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:110:52:58:53:52:13:40:41:11:13:39:45:13 chr15 65994733 . C T 448.01 PASS AO=120;DP=282;FAO=126;FDP=289;FR=.;FRO=163;FSAF=72;FSAR=54;FSRF=93;FSRR=70;FWDB=0.00227228;FXX=0.00687262;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.269;QD=6.20088;RBI=0.0551411;REFB=-0.00855404;REVB=0.0550943;RO=159;SAF=72;SAR=48;SRF=92;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.022695;STB=0.500504;TYPE=snp;VARB=0.0130116;OID=.;OPOS=65994733;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:282:289:159:163:120:126:48:72:92:67:54:72:93:70 chr15 66021961 . G A 169.03 PASS AO=45;DP=99;FAO=44;FDP=101;FR=.;FRO=57;FSAF=34;FSAR=10;FSRF=34;FSRR=23;FWDB=-0.020696;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.8939;QD=6.69415;RBI=0.107298;REFB=-0.0318561;REVB=-0.105283;RO=54;SAF=34;SAR=11;SRF=33;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170798;STB=0.622581;TYPE=snp;VARB=0.0404235;OID=.;OPOS=66021961;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:101:54:57:45:44:11:34:33:21:10:34:34:23 chr15 66023799 . G T 308 PASS AO=59;DP=102;FAO=59;FDP=100;FR=.;FRO=41;FSAF=37;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=28;FWDB=0.0285671;FXX=0.0384578;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.4009;QD=12.3199;RBI=0.0335236;REFB=0.00370075;REVB=0.0175429;RO=37;SAF=37;SAR=22;SRF=12;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215641;STB=0.627076;TYPE=snp;VARB=-0.000347751;OID=.;OPOS=66023799;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:100:37:41:59:59:22:37:12:25:22:37:13:28 chr15 66257408 . T C 363.24 PASS AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0431333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.0723;QD=38.2355;RBI=0.0507174;REFB=0;REVB=0.0266791;RO=0;SAF=24;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76123e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000290098;OID=.;OPOS=66257408;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:38:38:0:0:38:38:14:24:0:0:14:24:0:0 chr15 66411441 . C T 925.89 PASS AO=98;DP=100;FAO=101;FDP=103;FR=.;FRO=2;FSAF=52;FSAR=49;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00879143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.937;QD=35.9569;RBI=0.0412839;REFB=-0.00780484;REVB=0.040337;RO=2;SAF=52;SAR=46;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0178913;STB=0.509432;TYPE=snp;VARB=0.000177638;OID=.;OPOS=66411441;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:100:103:2:2:98:101:46:52:2:0:49:52:2:0 chr15 66629403 . C A 2290.41 PASS AO=237;DP=237;FAO=238;FDP=238;FR=.;FRO=0;FSAF=113;FSAR=125;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194379;FXX=0.00418393;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.298;QD=38.4943;RBI=0.0237775;REFB=0;REVB=0.0136945;RO=0;SAF=113;SAR=124;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02618e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.24815e-05;OID=.;OPOS=66629403;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:237:238:0:0:237:238:124:113:0:0:125:113:0:0 chr15 66640619 . C A 555.78 PASS AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.81;QD=38.3297;RBI=0.0182965;REFB=0;REVB=0.00448379;RO=0;SAF=8;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.21959e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.84589e-05;OID=.;OPOS=66640619;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:58:58:0:0:58:58:50:8:0:0:50:8:0:0 chr15 66644521 . C G 916.34 PASS AO=85;DP=85;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0048503;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.234;QD=38.1809;RBI=0.00775522;REFB=0;REVB=-0.00605128;RO=0;SAF=43;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.00363e-05;OID=.;OPOS=66644521;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:85:96:0:0:85:96:42:43:0:0:53:43:0:0 chr15 67234251 . A G 1991.25 PASS AO=211;DP=216;FAO=212;FDP=212;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=122;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190349;FXX=0.0185177;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.848;QD=37.5707;RBI=0.0198037;REFB=-0.076138;REVB=-0.00546451;RO=1;SAF=90;SAR=121;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00526382;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.43746e-05;OID=.;OPOS=67234251;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:216:212:1:0:211:212:121:90:1:0:122:90:0:0 chr15 67457335 . A G 784.69 PASS AO=82;DP=83;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115741;FXX=0.03529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.735;QD=38.2774;RBI=0.0209429;REFB=0;REVB=0.017454;RO=0;SAF=37;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000980086;OID=.;OPOS=67457335;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:83:82:0:0:82:82:45:37:0:0:45:37:0:0 chr15 67473790 . C T 179.03 PASS AO=38;DP=78;FAO=40;FDP=79;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=13;FSRR=26;FWDB=0.0735263;FXX=0.0246883;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2049;QD=9.06456;RBI=0.082263;REFB=0.0131108;REVB=-0.0368927;RO=37;SAF=16;SAR=22;SRF=14;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0391702;STB=0.534742;TYPE=snp;VARB=-0.0120897;OID=.;OPOS=67473790;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:79:37:39:38:40:22:16:14:23:24:16:13:26 chr15 67486775 . T C 89.23 PASS AO=30;DP=85;FAO=30;FDP=85;FR=.;FRO=55;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=35;FWDB=-0.00267675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.634;QD=4.19895;RBI=0.0483541;REFB=0.000559878;REVB=0.0482799;RO=55;SAF=19;SAR=11;SRF=20;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.296618;STB=0.670649;TYPE=snp;VARB=1.28397e-05;OID=.;OPOS=67486775;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:85:85:55:55:30:30:11:19:20:35:11:19:20:35 chr15 67486847 . T C 92.06 PASS AO=27;DP=70;FAO=27;FDP=70;FR=.;FRO=43;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=31;FWDB=-0.013991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.451;QD=5.26075;RBI=0.0140993;REFB=-0.000946824;REVB=-0.00174414;RO=42;SAF=12;SAR=15;SRF=11;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203365;STB=0.60519;TYPE=snp;VARB=0.00354273;OID=.;OPOS=67486847;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:70:70:42:43:27:27:15:12:11:31:15:12:12:31 chr15 67494304 . T G 201.68 PASS AO=42;DP=78;FAO=42;FDP=78;FR=.;FRO=36;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=10;FSRR=26;FWDB=0.0221525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.968;QD=10.3425;RBI=0.0230377;REFB=0.00144206;REVB=-0.0063245;RO=35;SAF=16;SAR=26;SRF=10;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0853474;STB=0.5517;TYPE=snp;VARB=-0.00125797;OID=.;OPOS=67494304;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:35:36:42:42:26:16:10:25:26:16:10:26 chr15 67528374 . T G 285.23 PASS AO=78;DP=177;FAO=78;FDP=177;FR=.;FRO=99;FSAF=45;FSAR=33;FSRF=56;FSRR=43;FWDB=0.00694999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.8557;QD=6.44576;RBI=0.0111594;REFB=-0.00752438;REVB=0.00873097;RO=99;SAF=45;SAR=33;SRF=56;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0115664;STB=0.50644;TYPE=snp;VARB=0.0120817;OID=.;OPOS=67528374;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:177:99:99:78:78:33:45:56:43:33:45:56:43 chr15 67574440 . C G 280.99 PASS AO=62;DP=125;FAO=65;FDP=131;FR=.;FRO=66;FSAF=17;FSAR=48;FSRF=23;FSRR=43;FWDB=0.0200606;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.394;QD=8.57989;RBI=0.0206765;REFB=-0.0103905;REVB=-0.00500921;RO=63;SAF=17;SAR=45;SRF=23;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0986548;STB=0.553776;TYPE=snp;VARB=0.0102635;OID=.;OPOS=67574440;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:131:63:66:62:65:45:17:23:40:48:17:23:43 chr15 67692502 . T C 2460.49 PASS AO=266;DP=272;FAO=268;FDP=274;FR=.;FRO=6;FSAF=125;FSAR=143;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0221314;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.389;QD=35.9195;RBI=0.0227595;REFB=-0.0980114;REVB=0.00530979;RO=6;SAF=123;SAR=143;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00158895;STB=0.500739;TYPE=snp;VARB=0.00120328;OID=.;OPOS=67692502;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:272:274:6:6:266:268:143:123:3:3:143:125:3:3 chr15 67757539 . C T 430.94 PASS AO=122;DP=288;FAO=122;FDP=285;FR=.;FRO=163;FSAF=63;FSAR=59;FSRF=80;FSRR=83;FWDB=-0.00503769;FXX=0.0138404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6552;QD=6.04829;RBI=0.0389624;REFB=-0.0127813;REVB=-0.0386353;RO=163;SAF=63;SAR=59;SRF=80;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0263103;STB=0.514638;TYPE=snp;VARB=0.0191664;OID=.;OPOS=67757539;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:288:285:163:163:122:122:59:63:80:83:59:63:80:83 chr15 67768151 . G C 2471.59 PASS AO=257;DP=260;FAO=258;FDP=258;FR=.;FRO=0;FSAF=112;FSAR=146;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0289455;FXX=0.0152666;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.675;QD=38.3192;RBI=0.0654619;REFB=0;REVB=0.0587147;RO=0;SAF=112;SAR=145;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2259e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.1615e-06;OID=.;OPOS=67768151;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:260:258:0:0:257:258:145:112:0:0:146:112:0:0 chr15 67962763 . A G 511.54 PASS AO=142;DP=326;FAO=142;FDP=326;FR=.;FRO=184;FSAF=56;FSAR=86;FSRF=54;FSRR=130;FWDB=-0.000423781;FXX=0.00609737;HRUN=3;LEN=1;MLLD=230.068;QD=6.27655;RBI=0.00172799;REFB=0.00793124;REVB=0.00167522;RO=184;SAF=56;SAR=86;SRF=54;SRR=130;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11059;STB=0.561135;TYPE=snp;VARB=-0.0102842;OID=.;OPOS=67962763;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:326:326:184:184:142:142:86:56:54:130:86:56:54:130 chr15 68114499 . G A 21.11 PASS AO=4;DP=10;FAO=4;FDP=10;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0168261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.753;QD=8.44498;RBI=0.0168265;REFB=-0.0291323;REVB=0.000116737;RO=6;SAF=1;SAR=3;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113038;STB=0.5711;TYPE=snp;VARB=0.0684645;OID=.;OPOS=68114499;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:10:10:6:6:4:4:3:1:1:5:3:1:1:5 chr15 68124665 . C A 21.2 PASS AO=19;DP=54;FAO=6;FDP=21;FR=.;FRO=15;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=0.142734;FXX=0.0869187;HRUN=1;LEN=1;MLLD=45.9765;QD=4.03722;RBI=0.200464;REFB=-0.0151098;REVB=0.140757;RO=32;SAF=8;SAR=11;SRF=9;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160488;STB=0.609348;TYPE=snp;VARB=0.0621393;OID=.;OPOS=68124665;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:54:21:32:15:19:6:11:8:9:23:5:1:4:11 chr15 68503585 . TGGGC TGGC,TGG 90.48 PASS AO=3,7;DP=20;FAO=0,16;FDP=20;FR=.;FRO=4;FSAF=0,4;FSAR=0,12;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.428356,0.354114;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,2;MLLD=13.0245,22.8309;QD=18.096;RBI=0.428506,0.388493;REFB=-0.158126,-0.219211;REVB=-0.0113381,0.159781;RO=9;SAF=0,1;SAR=3,6;SRF=5;SRR=4;SSEN=0.5,0.5;SSEP=0,0;SSSB=-0.670564,-0.45597;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=0,0.0965384;OID=.,.;OPOS=68503586,68503588;OREF=G,GC;OALT=-,-;OMAPALT=TGGC,TGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:3,7:20:0,16:20:4:0,4:0,12:1:3:5:9:0,1:3,6:5:4 chr15 68583175 . T C 1840.5 PASS AO=194;DP=195;FAO=194;FDP=194;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00116031;FXX=0.00512794;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.036;QD=37.9485;RBI=0.0138909;REFB=-0.0358229;REVB=0.0138424;RO=1;SAF=96;SAR=98;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00483489;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000137737;OID=.;OPOS=68583175;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:195:194:1:0:194:194:98:96:0:1:98:96:0:0 chr15 68603625 . C T 1293.13 PASS AO=139;DP=141;FAO=139;FDP=141;FR=.;FRO=2;FSAF=81;FSAR=58;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0353129;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.838;QD=36.6845;RBI=0.0406185;REFB=-0.0479353;REVB=0.0200714;RO=1;SAF=81;SAR=58;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00583396;STB=0.506097;TYPE=snp;VARB=0.000374677;OID=.;OPOS=68603625;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:141:141:1:2:139:139:58:81:1:0:58:81:2:0 chr15 68605169 . G A 626.54 PASS AO=67;DP=68;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0435727;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=272.197;QD=36.8552;RBI=0.0438877;REFB=0.0605463;REVB=-0.00524843;RO=1;SAF=24;SAR=43;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108646;STB=0.505745;TYPE=snp;VARB=-0.000368256;OID=.;OPOS=68605169;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:68:68:1:1:67:67:43:24:0:1:43:24:0:1 chr15 68624396 . A C 657.01 PASS AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010854;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.809;QD=38.6474;RBI=0.0169097;REFB=0;REVB=-0.0129665;RO=0;SAF=41;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.6787e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000431172;OID=.;OPOS=68624396;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:69:68:0:0:68:68:27:41:0:0:27:41:0:0 chr15 68628143 . C T 689.99 PASS AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120953;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=129.662;QD=37.8075;RBI=0.0235905;REFB=0;REVB=0.0202538;RO=0;SAF=27;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1792e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.46117e-05;OID=.;OPOS=68628143;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:73:73:0:0:73:73:46:27:0:0:46:27:0:0 chr15 68643740 . G C 203.48 PASS AO=47;DP=98;FAO=48;FDP=99;FR=.;FRO=51;FSAF=15;FSAR=33;FSRF=28;FSRR=23;FWDB=-0.0512951;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.056;QD=8.22123;RBI=0.0539365;REFB=-0.0336598;REVB=0.0166719;RO=51;SAF=15;SAR=32;SRF=28;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224425;STB=0.628099;TYPE=snp;VARB=0.0246806;OID=.;OPOS=68643740;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:99:51:51:47:48:32:15:28:23:33:15:28:23 chr15 68649587 . G A 1202.71 PASS AO=127;DP=130;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0308747;FXX=0.0303007;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.386;QD=37.5848;RBI=0.0375371;REFB=-0.0630472;REVB=0.0213492;RO=0;SAF=59;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000364722;OID=.;OPOS=68649587;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:130:128:0:0:127:128:68:59:0:0:69:59:0:0 chr15 69006909 . C T 80.89 PASS AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=2;FSAR=17;FSRF=6;FSRR=17;FWDB=0.0230501;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.557;QD=7.70402;RBI=0.025614;REFB=0.011204;REVB=0.01117;RO=22;SAF=2;SAR=17;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.296369;STB=0.666455;TYPE=snp;VARB=-0.00974703;OID=.;OPOS=69006909;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:42:42:22:23:19:19:17:2:6:16:17:2:6:17 chr15 69019582 . G C 734.83 PASS AO=78;DP=79;FAO=78;FDP=79;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.057426;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.784;QD=37.2065;RBI=0.0574607;REFB=-0.117692;REVB=-0.00199806;RO=1;SAF=41;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114055;STB=0.506023;TYPE=snp;VARB=0.000973884;OID=.;OPOS=69019582;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:79:79:1:1:78:78:37:41:1:0:37:41:1:0 chr15 69238445 . G A 161.2 PASS AO=34;DP=64;FAO=34;FDP=64;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=0.0542283;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=192.799;QD=10.0751;RBI=0.054388;REFB=0.000178817;REVB=-0.00416517;RO=30;SAF=13;SAR=21;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140921;STB=0.507808;TYPE=snp;VARB=4.85253e-05;OID=.;OPOS=69238445;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:30:30:34:34:21:13:11:19:21:13:11:19 chr15 69325581 . C T 283.03 PASS AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0774843;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.7595;QD=39.0391;RBI=0.0839484;REFB=0;REVB=0.0323035;RO=0;SAF=21;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.4007e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00350296;OID=.;OPOS=69325581;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:29:29:0:0:29:29:8:21:0:0:8:21:0:0 chr15 69327825 . C T 556.91 PASS AO=62;DP=64;FAO=63;FDP=65;FR=.;FRO=2;FSAF=54;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00395166;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.571;QD=34.2714;RBI=0.0371147;REFB=-0.0527284;REVB=0.0369037;RO=1;SAF=54;SAR=8;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00866534;STB=0.521732;TYPE=snp;VARB=0.00150791;OID=.;OPOS=69327825;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:64:65:1:2:62:63:8:54:1:0:9:54:1:1 chr15 69328226 . C T 147.89 PASS AO=31;DP=59;FAO=31;FDP=59;FR=.;FRO=28;FSAF=23;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=9;FWDB=0.0102836;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8977;QD=10.0266;RBI=0.0373123;REFB=-0.0177338;REVB=0.0358672;RO=28;SAF=23;SAR=8;SRF=19;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0677912;STB=0.537802;TYPE=snp;VARB=0.0199589;OID=.;OPOS=69328226;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:28:28:31:31:8:23:19:9:8:23:19:9 chr15 69542968 . G A 59.62 PASS AO=15;DP=42;FAO=17;FDP=45;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.00627342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8018;QD=5.2993;RBI=0.0243481;REFB=-0.0243562;REVB=0.023526;RO=27;SAF=5;SAR=10;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207634;STB=0.636704;TYPE=snp;VARB=0.0626389;OID=.;OPOS=69542968;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:42:45:27:28:15:17:10:5:14:13:12:5:14:14 chr15 69561518 . G A 115.29 PASS AO=30;DP=66;FAO=29;FDP=65;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.0154085;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.666;QD=7.09465;RBI=0.0180875;REFB=-0.00315384;REVB=0.00947292;RO=36;SAF=11;SAR=19;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106278;STB=0.574415;TYPE=snp;VARB=0.00273087;OID=.;OPOS=69561518;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:65:36:36:30:29:19:11:17:19:19:10:17:19 chr15 69564343 . C T 491.55 PASS AO=124;DP=231;FAO=124;FDP=260;FR=.;FRO=136;FSAF=34;FSAR=90;FSRF=52;FSRR=84;FWDB=-0.130676;FXX=0.0114064;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.8816;QD=7.56234;RBI=0.132919;REFB=-0.0467024;REVB=-0.0243126;RO=104;SAF=35;SAR=89;SRF=22;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0759102;STB=0.566773;TYPE=snp;VARB=0.0443169;OID=.;OPOS=69564343;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:231:260:104:136:124:124:89:35:22:82:90:34:52:84 chr15 69683945 . C G 630.65 PASS AO=65;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00142038;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.6182;QD=38.2212;RBI=0.0339421;REFB=0;REVB=0.0339124;RO=0;SAF=33;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00028761;OID=.;OPOS=69683945;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:66:66:0:0:65:66:32:33:0:0:32:34:0:0 chr15 69690141 . T C 21.1 PASS AO=5;DP=15;FAO=5;FDP=15;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.035606;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.395;QD=5.62555;RBI=0.0556298;REFB=-0.0198997;REVB=-0.0427421;RO=10;SAF=1;SAR=4;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.347085;STB=0.726281;TYPE=snp;VARB=0.0341571;OID=.;OPOS=69690141;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:15:15:10:10:5:5:4:1:5:5:4:1:5:5 chr15 69697756 . G A 1413.02 PASS AO=148;DP=150;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00184878;FXX=0.0263141;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.118;QD=38.1897;RBI=0.0330703;REFB=0;REVB=0.0330185;RO=0;SAF=77;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000173598;OID=.;OPOS=69697756;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:150:148:0:0:148:148:71:77:0:0:71:77:0:0 chr15 69728530 . A C 382.2 PASS AO=103;DP=237;FAO=104;FDP=237;FR=.;FRO=133;FSAF=63;FSAR=41;FSRF=79;FSRR=54;FWDB=-0.00672456;FXX=0.00836785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.132;QD=6.45062;RBI=0.0455112;REFB=-0.00849549;REVB=0.0450117;RO=131;SAF=63;SAR=40;SRF=78;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171321;STB=0.506901;TYPE=snp;VARB=0.00897112;OID=.;OPOS=69728530;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:237:237:131:133:103:104:40:63:78:53:41:63:79:54 chr15 69728949 . A G 3749.13 PASS AO=391;DP=391;FAO=391;FDP=391;FR=.;FRO=0;FSAF=224;FSAR=167;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00226403;FXX=0.00255096;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.724;QD=38.3542;RBI=0.00484654;REFB=0;REVB=0.00428523;RO=0;SAF=224;SAR=167;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.55121e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.55132e-05;OID=.;OPOS=69728949;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:391:391:0:0:391:391:167:224:0:0:167:224:0:0 chr15 69732736 . C T 1485.04 PASS AO=159;DP=161;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=136;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00400921;FXX=0.0124216;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.936;QD=37.3596;RBI=0.00733216;REFB=-0.151691;REVB=-0.00613895;RO=1;SAF=136;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00348611;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000730236;OID=.;OPOS=69732736;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:161:159:1:0:159:159:23:136:1:0:23:136:0:0 chr15 69740350 . A G 1383.89 PASS AO=147;DP=150;FAO=147;FDP=149;FR=.;FRO=2;FSAF=58;FSAR=89;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0397517;FXX=0.00666622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.8636;QD=37.1515;RBI=0.0440875;REFB=-0.0754876;REVB=0.0190659;RO=0;SAF=58;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50148;TYPE=snp;VARB=0.00363527;OID=.;OPOS=69740350;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:150:149:0:2:147:147:89:58:0:0:89:58:1:1 chr15 69750313 . G C 48.77 PASS AO=20;DP=69;FAO=20;FDP=69;FR=.;FRO=49;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=32;FSRR=17;FWDB=-0.0312361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.5133;QD=2.82751;RBI=0.0953423;REFB=-0.0110573;REVB=-0.0900802;RO=49;SAF=14;SAR=6;SRF=32;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0639887;STB=0.538422;TYPE=snp;VARB=0.0403864;OID=.;OPOS=69750313;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:69:69:49:49:20:20:6:14:32:17:6:14:32:17 chr15 70345626 . C T 908.47 PASS AO=99;DP=101;FAO=99;FDP=101;FR=.;FRO=2;FSAF=32;FSAR=67;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0133693;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.98;QD=35.9788;RBI=0.0138486;REFB=-0.0556693;REVB=-0.00361174;RO=1;SAF=32;SAR=67;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.014591;STB=0.515148;TYPE=snp;VARB=0.000427675;OID=.;OPOS=70345626;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:101:101:1:2:99:99:67:32:1:0:67:32:2:0 chr15 70346923 . C T 210.67 PASS AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0564585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3914;QD=36.6385;RBI=0.0910839;REFB=0;REVB=0.0714753;RO=0;SAF=1;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.47154e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000411498;OID=.;OPOS=70346923;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:0:0:23:23:22:1:0:0:22:1:0:0 chr15 70347362 . C A 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0372947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.811;QD=33.022;RBI=0.0372947;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00173096;OID=.;OPOS=70347362;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:0:6:0:0:0:6:0:0 chr15 70347816 . A AG 770.06 PASS AO=78;DP=87;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00646473;FXX=0.0795364;HRUN=0;LEN=1;MLLD=150.214;QD=38.0275;RBI=0.0135786;REFB=0;REVB=0.0119409;RO=3;SAF=30;SAR=48;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0286658;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00144742;OID=.;OPOS=70347817;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:78:87:81:81:0:31:50:0:0:37:3:30:48:0:3 chr15 70347920 . T C 1287.86 PASS AO=134;DP=134;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000662906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.668;QD=38.1589;RBI=0.0225771;REFB=0;REVB=-0.0225674;RO=0;SAF=62;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.71502e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.31856e-05;OID=.;OPOS=70347920;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:134:135:0:0:134:135:72:62:0:0:73:62:0:0 chr15 70351788 . T C 1181.57 PASS AO=110;DP=110;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0798154;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.11;QD=37.8103;RBI=0.0816554;REFB=0;REVB=0.0172368;RO=0;SAF=52;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.4768e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000534668;OID=.;OPOS=70351788;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:110:125:0:0:110:125:58:52:0:0:60:65:0:0 chr15 70960068 . G A 364.14 PASS AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0110261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.492;QD=36.4143;RBI=0.0146379;REFB=-0.0192895;REVB=-0.00962776;RO=0;SAF=15;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510199;TYPE=snp;VARB=6.12265e-05;OID=.;OPOS=70960068;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:40:40:0:1:39:39:24:15:0:0:24:15:0:1 chr15 70991925 . G C 3047.6 PASS AO=132;DP=140;FAO=337;FDP=337;FR=.;FRO=0;FSAF=153;FSAR=184;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0312942;FXX=0.0174922;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.71;QD=36.1733;RBI=0.0376053;REFB=0;REVB=0.0208526;RO=1;SAF=70;SAR=62;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0067419;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000187957;OID=.;OPOS=70991925;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:140:337:1:0:132:337:62:70:1:0:184:153:0:0 chr15 71125093 . G A 472.2 PASS AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00517492;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.2857;QD=37.7759;RBI=0.109742;REFB=0;REVB=0.10962;RO=0;SAF=29;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.20481e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000876926;OID=.;OPOS=71125093;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:51:50:0:0:50:50:21:29:0:0:21:29:0:0 chr15 71125204 . A G 638.65 PASS AO=59;DP=77;FAO=78;FDP=80;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0312888;FXX=0.0243873;HRUN=5;LEN=1;MLLD=94.7564;QD=31.9326;RBI=0.0326572;REFB=-0.0805429;REVB=-0.0093545;RO=0;SAF=20;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512192;TYPE=snp;VARB=0.00238038;OID=.;OPOS=71125204;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:60:80:0:2:59:78:39:20:0:0:40:38:0:2 chr15 71125339 . G A 235.48 PASS AO=36;DP=58;FAO=40;FDP=58;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=27;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=0.0953216;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=39.8597;QD=16.2398;RBI=0.186385;REFB=-0.0404548;REVB=0.160166;RO=22;SAF=12;SAR=24;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186506;STB=0.611356;TYPE=snp;VARB=0.0283726;OID=.;OPOS=71125339;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:58:58:22:18:36:40:24:12:13:9:27:13:12:6 chr15 71184245 . C T 10.44 PASS AO=2;DP=9;FAO=2;FDP=9;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.578;QD=4.63796;RBI=0.0836105;REFB=-0.020012;REVB=-0.0836105;RO=7;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.227457;OID=.;OPOS=71184245;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:7:7:2:2:2:0:0:7:2:0:0:7 chr15 71276480 . GCAA G 944.94 PASS AO=93;DP=98;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0264179;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=243.238;QD=38.1795;RBI=0.0328823;REFB=0;REVB=-0.019579;RO=0;SAF=40;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.92821e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-1.59122e-05;OID=.;OPOS=71276481;OREF=CAA;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:93:96:99:99:0:43:56:0:0:45:0:40:53:0:0 chr15 71305225 . G A 311.06 PASS AO=86;DP=198;FAO=86;FDP=199;FR=.;FRO=113;FSAF=40;FSAR=46;FSRF=38;FSRR=75;FWDB=0.0131059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.784;QD=6.25241;RBI=0.027268;REFB=-0.0189009;REVB=-0.0239119;RO=110;SAF=40;SAR=46;SRF=37;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132225;STB=0.57426;TYPE=snp;VARB=0.019852;OID=.;OPOS=71305225;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:199:110:113:86:86:46:40:37:73:46:40:38:75 chr15 72040774 . C T 380.76 PASS AO=86;DP=169;FAO=86;FDP=168;FR=.;FRO=82;FSAF=37;FSAR=49;FSRF=40;FSRR=42;FWDB=-0.0255255;FXX=0.00591681;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.568;QD=9.0658;RBI=0.0383863;REFB=-0.0223525;REVB=-0.0286698;RO=81;SAF=37;SAR=49;SRF=40;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0567887;STB=0.528425;TYPE=snp;VARB=0.0148053;OID=.;OPOS=72040774;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:168:81:82:86:86:49:37:40:41:49:37:40:42 chr15 72070067 . A G 88.1 PASS AO=21;DP=46;FAO=21;FDP=46;FR=.;FRO=25;FSAF=3;FSAR=18;FSRF=2;FSRR=23;FWDB=0.00385597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.7536;QD=7.66048;RBI=0.0804246;REFB=-0.0598632;REVB=-0.0803321;RO=25;SAF=3;SAR=18;SRF=2;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138235;STB=0.5774;TYPE=snp;VARB=0.0764051;OID=.;OPOS=72070067;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:46:46:25:25:21:21:18:3:2:23:18:3:2:23 chr15 72073003 . C T 276.63 PASS AO=54;DP=105;FAO=59;FDP=111;FR=.;FRO=52;FSAF=21;FSAR=38;FSRF=22;FSRR=30;FWDB=0.00106419;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=108.679;QD=9.9685;RBI=0.00690384;REFB=-0.0242677;REVB=-0.00682132;RO=43;SAF=20;SAR=34;SRF=16;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00149233;STB=0.533627;TYPE=snp;VARB=0.0174157;OID=.;OPOS=72073003;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:111:43:52:54:59:34:20:16:27:38:21:22:30 chr15 72073189 . G A 330.95 PASS AO=75;DP=147;FAO=75;FDP=147;FR=.;FRO=72;FSAF=27;FSAR=48;FSRF=30;FSRR=42;FWDB=-0.00206523;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=267.181;QD=9.00545;RBI=0.00225748;REFB=-0.00159498;REVB=0.000911616;RO=71;SAF=27;SAR=48;SRF=30;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0588661;STB=0.529609;TYPE=snp;VARB=0.00148216;OID=.;OPOS=72073189;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:147:71:72:75:75:48:27:30:41:48:27:30:42 chr15 72104404 . AG A 159.96 PASS AO=21;DP=31;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.184913;FXX=0.0624805;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.0423;QD=21.3276;RBI=0.18501;REFB=-0.0511282;REVB=0.00598439;RO=4;SAF=7;SAR=14;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0278057;STB=0.51162;TYPE=del;VARB=0.0158082;OID=.;OPOS=72104405;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:21:31:29:30:1:8:21:0:1:8:4:7:14:1:3 chr15 72105928 . AC A 551.98 PASS AO=73;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00975895;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=16.1993;QD=27.2582;RBI=0.114522;REFB=0;REVB=-0.114105;RO=0;SAF=34;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.00146964;OID=.;OPOS=72105929;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:73:79:81:81:0:35:46:0:0:49:0:34:39:0:0 chr15 72180409 . T A 311.92 PASS AO=68;DP=130;FAO=68;FDP=130;FR=.;FRO=62;FSAF=38;FSAR=30;FSRF=25;FSRR=37;FWDB=-0.0228898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.4317;QD=9.59757;RBI=0.0462424;REFB=-0.0145213;REVB=0.0401797;RO=62;SAF=38;SAR=30;SRF=25;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134629;STB=0.573919;TYPE=snp;VARB=0.015987;OID=.;OPOS=72180409;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:62:62:68:68:30:38:25:37:30:38:25:37 chr15 72191073 . T C 1544.2 PASS AO=160;DP=161;FAO=164;FDP=164;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00298889;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.027;QD=37.6634;RBI=0.00358936;REFB=0;REVB=0.00198747;RO=1;SAF=88;SAR=72;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00537647;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.03907e-05;OID=.;OPOS=72191073;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:161:164:1:0:160:164:72:88:1:0:72:92:0:0 chr15 72191266 . C T 1885.8 PASS AO=193;DP=196;FAO=199;FDP=199;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103655;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7365;QD=37.9056;RBI=0.0151268;REFB=0;REVB=0.0110171;RO=2;SAF=88;SAR=105;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000866968;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000209046;OID=.;OPOS=72191266;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:196:199:2:0:193:199:105:88:1:1:109:90:0:0 chr15 72432583 . A G 1073.58 PASS AO=112;DP=114;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0420704;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.853;QD=38.0027;RBI=0.0433206;REFB=0;REVB=-0.0103324;RO=0;SAF=30;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000389588;OID=.;OPOS=72432583;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:114:113:0:0:112:113:82:30:0:0:83:30:0:0 chr15 72433144 . A G 1462.43 PASS AO=152;DP=154;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0255412;FXX=0.0129024;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.756;QD=38.2336;RBI=0.0282595;REFB=0;REVB=0.0120933;RO=0;SAF=70;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6741e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.37245e-05;OID=.;OPOS=72433144;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:154:153:0:0:152:153:82:70:0:0:82:71:0:0 chr15 72612062 . GC G 26.48 PASS AO=15;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.311134;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=15.2936;QD=3.65187;RBI=0.320932;REFB=-0.155576;REVB=-0.0786952;RO=12;SAF=9;SAR=6;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0.44186;SSSB=0.207806;STB=0.521244;TYPE=del;VARB=0.144852;OID=.;OPOS=72612063;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:15:29:13:29:16:6:7:8:8:26:12:9:6:4:8 chr15 72637795 . T C 878.38 PASS AO=94;DP=95;FAO=94;FDP=95;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0142815;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.229;QD=36.9846;RBI=0.0146798;REFB=-0.00875435;REVB=-0.00339628;RO=1;SAF=25;SAR=69;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00682322;STB=0.503596;TYPE=snp;VARB=8.40395e-05;OID=.;OPOS=72637795;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:95:95:1:1:94:94:69:25:0:1:69:25:0:1 chr15 72638892 . T C 1325.05 PASS AO=137;DP=140;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00729543;FXX=0.00714235;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.275;QD=38.131;RBI=0.0158563;REFB=0;REVB=-0.0140783;RO=0;SAF=79;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.59527e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.72484e-06;OID=.;OPOS=72638892;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:140:139:0:0:137:139:58:79:0:0:60:79:0:0 chr15 72879653 . A ATTG 680.71 PASS AO=95;DP=131;FAO=100;FDP=129;FR=.;FRO=29;FSAF=48;FSAR=52;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.0116226;FXX=0.015266;HRUN=2;LEN=3;MLLD=237.341;QD=21.1071;RBI=0.0116796;REFB=-0.00127532;REVB=-0.00115217;RO=30;SAF=47;SAR=48;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0023648;STB=0.500621;TYPE=ins;VARB=0.000184257;OID=.;OPOS=72879654;OREF=-;OALT=TTG;OMAPALT=ATTG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:95:131:100:129:29:48:52:14:15:43:30:47:48:15:15 chr15 72987588 . G T 1559.66 PASS AO=170;DP=175;FAO=170;FDP=170;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=112;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.04041;FXX=0.0285698;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4621;QD=36.6978;RBI=0.0410156;REFB=0.0106726;REVB=-0.00702232;RO=4;SAF=57;SAR=113;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00805605;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000291261;OID=.;OPOS=72987588;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:175:170:4:0:170:170:113:57:2:2:112:58:0:0 chr15 73002035 . G A 1494.41 PASS AO=154;DP=159;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156512;FXX=0.0251557;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.169;QD=38.5653;RBI=0.0368944;REFB=0;REVB=0.0334101;RO=0;SAF=74;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0019356;OID=.;OPOS=73002035;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:159:155:0:0:154:155:80:74:0:0:81:74:0:0 chr15 73023937 . T C 2113.01 PASS AO=234;DP=243;FAO=235;FDP=242;FR=.;FRO=7;FSAF=53;FSAR=182;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.122815;FXX=0.00411506;HRUN=3;LEN=1;MLLD=74.7186;QD=34.9257;RBI=0.123088;REFB=-0.0784224;REVB=0.00819622;RO=5;SAF=52;SAR=182;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101838;STB=0.508328;TYPE=snp;VARB=0.00265075;OID=.;OPOS=73023937;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:243:242:5:7:234:235:182:52:2:3:182:53:3:4 chr15 73027478 . T C 1338.51 PASS AO=138;DP=140;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0024709;FXX=0.00714235;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9658;QD=38.5183;RBI=0.0306973;REFB=0;REVB=0.0305977;RO=0;SAF=84;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.64241e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.64372e-05;OID=.;OPOS=73027478;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:140:139:0:0:138:139:54:84:0:0:55:84:0:0 chr15 73044575 . G A 1727.79 PASS AO=167;DP=175;FAO=183;FDP=183;FR=.;FRO=0;FSAF=116;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.991;QD=37.7659;RBI=0.0393856;REFB=0;REVB=0.034794;RO=0;SAF=105;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00148163;OID=.;OPOS=73044575;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:82:175:183:0:0:167:183:62:105:0:0:67:116:0:0 chr15 73067234 . T C 895.26 PASS AO=92;DP=93;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0197269;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.184;QD=38.0962;RBI=0.0341947;REFB=0;REVB=0.0279307;RO=0;SAF=54;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.09023e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.76145e-05;OID=.;OPOS=73067234;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:93:94:0:0:92:94:38:54:0:0:40:54:0:0 chr15 73545732 . T C 18.79 PASS AO=10;DP=47;FAO=10;FDP=47;FR=.;FRO=37;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.0151473;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=100.009;QD=1.59939;RBI=0.024014;REFB=0.00719416;REVB=0.0186341;RO=36;SAF=4;SAR=6;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0553158;STB=0.54773;TYPE=snp;VARB=-0.0163378;OID=.;OPOS=73545732;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:47:47:36:37:10:10:6:4:16:20:6:4:17:20 chr15 73614114 . T C 42.79 PASS AO=17;DP=60;FAO=17;FDP=59;FR=.;FRO=42;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=28;FSRR=14;FWDB=-0.0239116;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.6707;QD=2.90099;RBI=0.0263049;REFB=-0.00590675;REVB=-0.0109627;RO=40;SAF=4;SAR=13;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.474428;STB=0.793565;TYPE=snp;VARB=0.0128589;OID=.;OPOS=73614114;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:60:59:40:42:17:17:13:4:26:14:13:4:28:14 chr15 73614834 . T C 38.95 PASS AO=15;DP=52;FAO=15;FDP=52;FR=.;FRO=37;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=24;FWDB=-0.00836412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.476;QD=2.99626;RBI=0.0107373;REFB=0.00518283;REVB=-0.00673288;RO=35;SAF=3;SAR=12;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24944;STB=0.639793;TYPE=snp;VARB=-0.0178492;OID=.;OPOS=73614834;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:52:52:35:37:15:15:12:3:13:22:12:3:13:24 chr15 73994806 . C T 57.3 PASS AO=10;DP=17;FAO=10;FDP=17;FR=.;FRO=7;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=0.0993167;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=85.8664;QD=13.4812;RBI=0.0996261;REFB=-0.0414391;REVB=0.0078463;RO=7;SAF=9;SAR=1;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251249;STB=0.639784;TYPE=snp;VARB=0.0182552;OID=.;OPOS=73994806;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:17:17:7:7:10:10:1:9:7:0:1:9:7:0 chr15 73995165 . A C 24.78 PASS AO=4;DP=15;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.0111794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.361;QD=5.83152;RBI=0.0169442;REFB=-0.0138214;REVB=-0.0127329;RO=10;SAF=2;SAR=2;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107009;STB=0.583047;TYPE=snp;VARB=0.0261215;OID=.;OPOS=73995165;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:15:17:10:11:4:6:2:2:4:6:4:2:5:6 chr15 73995173 . C T 92.75 PASS AO=17;DP=30;FAO=17;FDP=30;FR=.;FRO=13;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0156701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.2393;QD=12.3662;RBI=0.11265;REFB=-0.0208766;REVB=0.111555;RO=13;SAF=13;SAR=4;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.26923;STB=0.652773;TYPE=snp;VARB=0.0198399;OID=.;OPOS=73995173;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:30:30:13:13:17:17:4:13:6:7:4:13:6:7 chr15 73996066 . G A 22.3 PASS AO=4;DP=9;FAO=4;FDP=9;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.0516808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.212;QD=9.91248;RBI=0.0542306;REFB=-0.0293283;REVB=0.0164333;RO=5;SAF=3;SAR=1;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0609289;STB=0.538276;TYPE=snp;VARB=0.0481064;OID=.;OPOS=73996066;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:9:9:5:5:4:4:1:3:4:1:1:3:4:1 chr15 73996101 . G A 37.17 PASS AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.0139714;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9457;QD=10.6195;RBI=0.0716238;REFB=-0.0514666;REVB=0.0702479;RO=7;SAF=5;SAR=2;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0589151;OID=.;OPOS=73996101;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:14:14:7:7:7:7:2:5:5:2:2:5:5:2 chr15 74000729 . G C 358.97 PASS AO=94;DP=207;FAO=94;FDP=207;FR=.;FRO=113;FSAF=51;FSAR=43;FSRF=69;FSRR=44;FWDB=0.0225978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.3255;QD=6.93669;RBI=0.0546487;REFB=-0.0245354;REVB=0.0497576;RO=113;SAF=51;SAR=43;SRF=69;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0680232;STB=0.53766;TYPE=snp;VARB=0.0360627;OID=.;OPOS=74000729;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:207:113:113:94:94:43:51:69:44:43:51:69:44 chr15 74001993 . T C 82.44 PASS AO=17;DP=33;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.00972847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.284;QD=9.99324;RBI=0.0481574;REFB=0.0147269;REVB=0.0471645;RO=16;SAF=6;SAR=11;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183655;STB=0.60427;TYPE=snp;VARB=-0.0060256;OID=.;OPOS=74001993;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:33:33:16:16:17:17:11:6:9:7:11:6:9:7 chr15 74003533 . G A 239.74 PASS AO=59;DP=125;FAO=59;FDP=125;FR=.;FRO=66;FSAF=42;FSAR=17;FSRF=42;FSRR=24;FWDB=0.00245738;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.762;QD=7.67175;RBI=0.00425506;REFB=-0.0105511;REVB=-0.00347373;RO=65;SAF=42;SAR=17;SRF=41;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0891866;STB=0.54665;TYPE=snp;VARB=0.00918803;OID=.;OPOS=74003533;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:65:66:59:59:17:42:41:24:17:42:42:24 chr15 74032783 . A G 34.99 PASS AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.0448005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.8177;QD=6.99709;RBI=0.0448365;REFB=-0.0513146;REVB=-0.00179537;RO=12;SAF=5;SAR=3;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206895;STB=0.624687;TYPE=snp;VARB=0.0769711;OID=.;OPOS=74032783;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:20:20:12:12:8:8:3:5:5:7:3:5:5:7 chr15 74336633 . T C 409.24 PASS AO=78;DP=142;FAO=84;FDP=149;FR=.;FRO=65;FSAF=55;FSAR=29;FSRF=42;FSRR=23;FWDB=0.0393144;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.6629;QD=10.9862;RBI=0.0438342;REFB=-0.0371919;REVB=-0.019386;RO=63;SAF=49;SAR=29;SRF=41;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0198946;STB=0.504141;TYPE=snp;VARB=0.0326272;OID=.;OPOS=74336633;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:149:63:65:78:84:29:49:41:22:29:55:42:23 chr15 74429122 . T C 66.16 PASS AO=11;DP=14;FAO=10;FDP=14;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0469489;FXX=0.0666222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.6872;QD=18.9038;RBI=0.0525369;REFB=0.00060053;REVB=0.0235783;RO=3;SAF=1;SAR=10;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21804;STB=0.710001;TYPE=snp;VARB=-0.00221332;OID=.;OPOS=74429122;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:14:14:3:4:11:10:10:1:1:2:9:1:2:2 chr15 74467856 . G A 195.16 PASS AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0501937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.966;QD=37.1726;RBI=0.0558989;REFB=0;REVB=-0.0246024;RO=0;SAF=8;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000253557;OID=.;OPOS=74467856;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:21:21:0:0:21:21:13:8:0:0:13:8:0:0 chr15 74703929 . T C 453.38 PASS AO=45;DP=46;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0634891;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=35.7822;QD=34.875;RBI=0.0748373;REFB=0.0742406;REVB=0.0396201;RO=1;SAF=15;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154108;STB=0.50746;TYPE=snp;VARB=-0.00641709;OID=.;OPOS=74703929;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:46:52:1:1:45:51:30:15:0:1:33:18:0:1 chr15 74710593 . C T 437.08 PASS AO=48;DP=50;FAO=48;FDP=50;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.021073;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=241.073;QD=34.9664;RBI=0.0235289;REFB=-0.0692025;REVB=0.0104661;RO=2;SAF=24;SAR=24;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00181726;OID=.;OPOS=74710593;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:50:50:2:2:48:48:24:24:1:1:24:24:1:1 chr15 74889298 . C T 677 PASS AO=68;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.105186;FXX=0.0399947;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.906;QD=37.611;RBI=0.119398;REFB=0;REVB=0.0564963;RO=0;SAF=33;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000876655;OID=.;OPOS=74889298;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:72:72:0:0:68:72:35:33:0:0:37:35:0:0 chr15 75047426 . C T 36.29 PASS AO=8;DP=22;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.0602014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.5935;QD=6.04876;RBI=0.0603281;REFB=-0.0144346;REVB=-0.00390783;RO=13;SAF=3;SAR=5;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.242792;STB=0.636074;TYPE=snp;VARB=0.0114314;OID=.;OPOS=75047426;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:22:24:13:15:8:9:5:3:8:5:5:4:10:5 chr15 75081078 . G A 219.04 PASS AO=60;DP=140;FAO=60;FDP=140;FR=.;FRO=80;FSAF=35;FSAR=25;FSRF=27;FSRR=53;FWDB=-0.024218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.472;QD=6.2583;RBI=0.0293529;REFB=-0.00116616;REVB=0.0165855;RO=79;SAF=35;SAR=25;SRF=27;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.241814;STB=0.637806;TYPE=snp;VARB=0.00254953;OID=.;OPOS=75081078;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:79:80:60:60:25:35:27:52:25:35:27:53 chr15 75131661 . A G 143.59 PASS AO=33;DP=67;FAO=33;FDP=67;FR=.;FRO=34;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=0.0138141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.166;QD=8.5726;RBI=0.0280698;REFB=-0.0212514;REVB=-0.0244353;RO=34;SAF=21;SAR=12;SRF=12;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.256669;STB=0.643157;TYPE=snp;VARB=0.0276124;OID=.;OPOS=75131661;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:34:34:33:33:12:21:12:22:12:21:12:22 chr15 75131959 . A G 47.84 PASS AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.00353259;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=210.03;QD=11.2562;RBI=0.00927029;REFB=-0.00570302;REVB=-0.00857083;RO=8;SAF=3;SAR=6;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0782009;STB=0.545357;TYPE=snp;VARB=0.00413025;OID=.;OPOS=75131959;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:17:17:8:8:9:9:6:3:2:6:6:3:2:6 chr15 75189930 . A G 181.32 PASS AO=51;DP=121;FAO=51;FDP=122;FR=.;FRO=71;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=47;FSRR=24;FWDB=-0.042488;FXX=0.0161277;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.533;QD=5.94502;RBI=0.0428565;REFB=0.0186465;REVB=0.00560778;RO=69;SAF=21;SAR=30;SRF=46;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.256726;STB=0.642668;TYPE=snp;VARB=-0.017253;OID=.;OPOS=75189930;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:122:69:71:51:51:30:21:46:23:30:21:47:24 chr15 75336729 . A G 885.12 PASS AO=92;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.016688;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.0839;QD=37.6648;RBI=0.0194608;REFB=0;REVB=0.0100116;RO=0;SAF=59;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.36474e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000947982;OID=.;OPOS=75336729;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:94:94:0:0:92:94:33:59:0:0:35:59:0:0 chr15 75498548 . A G 1145.9 PASS AO=112;DP=112;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00426965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.625;QD=38.5177;RBI=0.021195;REFB=0;REVB=0.0207605;RO=0;SAF=34;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.95543e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.93434e-05;OID=.;OPOS=75498548;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:112:119:0:0:112:119:78:34:0:0:84:35:0:0 chr15 75499602 . C A 390.32 PASS AO=40;DP=40;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0695519;FXX=0.0454442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.9466;QD=37.1736;RBI=0.075691;REFB=0;REVB=0.0298607;RO=0;SAF=7;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.48559e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00106317;OID=.;OPOS=75499602;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:40:42:0:0:40:42:33:7:0:0:33:9:0:0 chr15 75499619 . T C 391.64 PASS AO=38;DP=38;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112661;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.876;QD=37.2988;RBI=0.019363;REFB=0;REVB=-0.015748;RO=0;SAF=6;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.29107e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.00635e-06;OID=.;OPOS=75499619;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:38:42:0:0:38:42:32:6:0:0:32:10:0:0 chr15 75499861 . G A 231.01 PASS AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181671;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=67.4805;QD=36.9611;RBI=0.0198141;REFB=0;REVB=0.00790939;RO=0;SAF=17;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000442022;OID=.;OPOS=75499861;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:25:25:0:0:25:25:8:17:0:0:8:17:0:0 chr15 75499995 . T G 203.44 PASS AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000359884;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.669;QD=36.9896;RBI=0.0557146;REFB=0;REVB=0.0557134;RO=0;SAF=17;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.58081e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000902023;OID=.;OPOS=75499995;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:22:0:0:22:22:5:17:0:0:5:17:0:0 chr15 75500824 . AG A 29.5 PASS AO=18;DP=51;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=0.0985954;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=11.5956;QD=2.40804;RBI=0.101277;REFB=-0.0823556;REVB=0.0231504;RO=26;SAF=4;SAR=14;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205776;STB=0.563816;TYPE=del;VARB=0.115495;OID=.;OPOS=75500825;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:18:49:22:49:27:6:16:10:17:29:26:4:14:10:16 chr15 75503147 . G A 579.53 PASS AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0394633;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.847;QD=36.2205;RBI=0.0442389;REFB=0.0213231;REVB=0.0199932;RO=1;SAF=28;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165659;STB=0.508769;TYPE=snp;VARB=-0.00011934;OID=.;OPOS=75503147;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:64:64:1:1:63:63:35:28:1:0:35:28:1:0 chr15 75650836 . G A 128.68 PASS AO=28;DP=56;FAO=28;FDP=55;FR=.;FRO=27;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.02519;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.886;QD=9.35881;RBI=0.0268128;REFB=-0.00431918;REVB=0.00918628;RO=27;SAF=16;SAR=12;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141965;STB=0.507931;TYPE=snp;VARB=0.00532889;OID=.;OPOS=75650836;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:55:27:27:28:28:12:16:15:12:12:16:15:12 chr15 75932129 . G T 42.65 PASS AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=-0.0087486;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.841;QD=7.10901;RBI=0.00915318;REFB=-0.0145129;REVB=-0.00269124;RO=14;SAF=1;SAR=9;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.330288;STB=0.702621;TYPE=snp;VARB=0.0187385;OID=.;OPOS=75932129;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:24:24:14:14:10:10:9:1:4:10:9:1:4:10 chr15 75950898 . CG C 97.17 PASS AO=15;DP=84;FAO=67;FDP=98;FR=.;FRO=31;FSAF=37;FSAR=30;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.373715;FXX=0.0297;HRUN=7;LEN=1;MLLD=6.45575;QD=3.96601;RBI=0.390517;REFB=-0.0900084;REVB=-0.113316;RO=43;SAF=2;SAR=13;SRF=30;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.642398;STB=0.511517;TYPE=del;VARB=0.162852;OID=.;OPOS=75950899;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:15:77:67:98:31:37:30:16:15:22:43:2:13:30:13 chr15 75969335 . C T 65.06 PASS AO=18;DP=46;FAO=18;FDP=46;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.0113294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=277.774;QD=5.65763;RBI=0.0208259;REFB=-0.000781064;REVB=0.0174746;RO=28;SAF=13;SAR=5;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214985;STB=0.625521;TYPE=snp;VARB=0.00148793;OID=.;OPOS=75969335;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:46:46:28:28:18:18:5:13:15:13:5:13:15:13 chr15 75972086 . T C 15.9 PASS AO=5;DP=20;FAO=5;FDP=20;FR=.;FRO=15;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=15;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.367;QD=3.18051;RBI=0.0282964;REFB=0.000119647;REVB=-0.0282964;RO=15;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00471981;OID=.;OPOS=75972086;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:20:20:15:15:5:5:5:0:0:15:5:0:0:15 chr15 75982833 . GC G 348.32 PASS AO=40;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0714428;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.7465;QD=25.8017;RBI=0.376578;REFB=-0.0396886;REVB=0.369739;RO=11;SAF=29;SAR=11;SRF=2;SRR=9;SSEN=0.531646;SSEP=0;SSSB=0.239775;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0198865;OID=.;OPOS=75982834;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:40:52:54:54:0:33:21:0:0:28:11:29:11:2:9 chr15 76017452 . C T 145.32 PASS AO=40;DP=96;FAO=40;FDP=95;FR=.;FRO=55;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=16;FSRR=39;FWDB=0.0109862;FXX=0.0104156;HRUN=2;LEN=1;MLLD=259.307;QD=6.11869;RBI=0.0147902;REFB=-0.0178732;REVB=-0.00990213;RO=51;SAF=15;SAR=25;SRF=13;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133386;STB=0.553288;TYPE=snp;VARB=0.0173694;OID=.;OPOS=76017452;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:95:51:55:40:40:25:15:13:38:25:15:16:39 chr15 76019496 . GCC GC,G 289.79 PASS AO=31,10;DP=55;FAO=52,0;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=26,0;FSAR=26,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.223021,-0.11568;FXX=0.0370302;HRUN=3,3;LEN=1,2;MLLD=13.3789,11.2065;QD=22.2914;RBI=0.38105,0.197701;REFB=0.00461903,0.008027;REVB=0.308967,0.160323;RO=8;SAF=15,10;SAR=16,0;SRF=1;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.137059,0.839099;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=-0.0333049,0.0758613;OID=.,.;OPOS=76019497,76019497;OREF=C,CC;OALT=-,-;OMAPALT=GC,G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:31,10:53:52,0:52:0:26,0:26,0:0:0:21:8:15,10:16,0:1:7 chr15 76191802 . G A 2119.65 PASS AO=221;DP=223;FAO=222;FDP=222;FR=.;FRO=0;FSAF=112;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00064277;FXX=0.00892817;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.3477;QD=38.1918;RBI=0.0167624;REFB=0;REVB=0.01675;RO=0;SAF=111;SAR=110;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000484167;OID=.;OPOS=76191802;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:223:222:0:0:221:222:110:111:0:0:110:112:0:0 chr15 76298132 . A G 32.13 PASS AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0173254;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.6421;QD=5.84212;RBI=0.0190577;REFB=0.000446463;REVB=-0.0079388;RO=10;SAF=4;SAR=4;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00100385;OID=.;OPOS=76298132;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:22:22:10:14:8:8:4:4:5:5:4:4:7:7 chr15 76496232 . G A 178.02 PASS AO=24;DP=30;FAO=24;FDP=30;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.115493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=45.1981;QD=23.7364;RBI=0.115507;REFB=-0.146514;REVB=-0.00181697;RO=6;SAF=4;SAR=20;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120689;STB=0.565168;TYPE=snp;VARB=0.0392547;OID=.;OPOS=76496232;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:30:30:6:6:24:24:20:4:0:6:20:4:0:6 chr15 76496977 . G C 978.46 PASS AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.782;QD=37.9983;RBI=0.0182829;REFB=0;REVB=-0.0063582;RO=0;SAF=34;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.12039e-05;OID=.;OPOS=76496977;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:103:103:0:0:103:103:69:34:0:0:69:34:0:0 chr15 76603679 . G C 29.01 PASS AO=8;DP=24;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.0107653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.4768;QD=4.83535;RBI=0.014935;REFB=0.0115816;REVB=0.010352;RO=15;SAF=1;SAR=7;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.399313;STB=0.776955;TYPE=snp;VARB=-0.0177789;OID=.;OPOS=76603679;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:24:24:15:16:8:8:7:1:6:9:7:1:7:9 chr15 76630303 . T C 508.51 PASS AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00796181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.34;QD=37.6671;RBI=0.0103197;REFB=0;REVB=0.00656557;RO=0;SAF=11;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000108664;OID=.;OPOS=76630303;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:54:54:0:0:54:54:43:11:0:0:43:11:0:0 chr15 76634680 . T C 925.22 PASS AO=101;DP=104;FAO=101;FDP=103;FR=.;FRO=2;FSAF=46;FSAR=55;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0110784;FXX=0.00961446;HRUN=3;LEN=1;MLLD=249.526;QD=35.9309;RBI=0.0160236;REFB=-0.102588;REVB=0.011577;RO=2;SAF=46;SAR=55;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0201774;STB=0.510636;TYPE=snp;VARB=-5.37368e-05;OID=.;OPOS=76634680;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:104:103:2:2:101:101:55:46:2:0:55:46:2:0 chr15 76668572 . G T 401.52 PASS AO=89;DP=171;FAO=89;FDP=171;FR=.;FRO=82;FSAF=25;FSAR=64;FSRF=31;FSRR=51;FWDB=0.0203952;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.534;QD=9.3922;RBI=0.021551;REFB=-0.0116531;REVB=-0.00696306;RO=81;SAF=25;SAR=64;SRF=30;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0917385;STB=0.554872;TYPE=snp;VARB=0.0100555;OID=.;OPOS=76668572;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:171:81:82:89:89:64:25:30:51:64:25:31:51 chr15 76673716 . T C 1721.41 PASS AO=182;DP=183;FAO=182;FDP=182;FR=.;FRO=0;FSAF=128;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00747956;FXX=0.010869;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.404;QD=37.8331;RBI=0.0784561;REFB=-0.0190191;REVB=0.0780987;RO=1;SAF=128;SAR=54;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00873422;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000104037;OID=.;OPOS=76673716;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:183:182:1:0:182:182:54:128:0:1:54:128:0:0 chr15 76726465 . G T 2672.57 PASS AO=315;DP=335;FAO=318;FDP=335;FR=.;FRO=17;FSAF=198;FSAR=120;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=0.0838659;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=37.7892;QD=31.9112;RBI=0.109818;REFB=-0.141942;REVB=0.0708986;RO=19;SAF=194;SAR=121;SRF=16;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0260578;STB=0.504504;TYPE=snp;VARB=0.0180542;OID=.;OPOS=76726465;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:335:335:19:17:315:318:121:194:16:3:120:198:12:5 chr15 77176158 . T C 488.27 PASS AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000564747;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.827;QD=37.5589;RBI=0.026867;REFB=0;REVB=0.0268611;RO=0;SAF=26;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000137969;OID=.;OPOS=77176158;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:52:52:0:0:52:52:26:26:0:0:26:26:0:0 chr15 77176200 . A T 331.37 PASS AO=38;DP=43;FAO=38;FDP=40;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0155855;FXX=0.0697512;HRUN=3;LEN=1;MLLD=173.005;QD=33.1373;RBI=0.0233592;REFB=-0.0237567;REVB=0.0173995;RO=2;SAF=17;SAR=21;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0425532;STB=0.522715;TYPE=snp;VARB=0.000240303;OID=.;OPOS=77176200;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:43:40:2:2:38:38:21:17:0:2:21:17:0:2 chr15 77241542 . T C 1490.29 PASS AO=154;DP=155;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=123;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000637433;FXX=0.00632871;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.0473;QD=37.9692;RBI=0.000652196;REFB=-0.0403356;REVB=0.000137981;RO=1;SAF=34;SAR=120;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0137835;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000172923;OID=.;OPOS=77241542;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:155:157:1:0:154:157:120:34:1:0:123:34:0:0 chr15 77324879 . GA G,GG 450.53 PASS AO=20,30;DP=52;FAO=9,39;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=0,13;FSAR=9,26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0323422,-0.0298383;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=252.742,258.862;QD=37.5446;RBI=0.0497241,0.0464263;REFB=0,0;REVB=0.0377687,0.035568;RO=0;SAF=0,13;SAR=20,17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-5.63861e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.015552,0.00421283;OID=.,.;OPOS=77324880,77324880;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:20,30:50:9,39:48:0:0,13:9,26:0:0:10:0:0,13:20,17:0:0 chr15 77344793 . T A 1624.16 PASS AO=169;DP=171;FAO=171;FDP=171;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300639;FXX=0.0172404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.1;QD=37.992;RBI=0.0320462;REFB=0;REVB=0.0110961;RO=0;SAF=89;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000101323;OID=.;OPOS=77344793;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:171:171:0:0:169:171:80:89:0:0:83:88:0:0 chr15 77401143 . A C 206.9 PASS AO=60;DP=150;FAO=62;FDP=154;FR=.;FRO=92;FSAF=24;FSAR=38;FSRF=40;FSRR=52;FWDB=-0.058767;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=40.6147;QD=5.37404;RBI=0.0702291;REFB=-0.0105351;REVB=-0.0384521;RO=90;SAF=22;SAR=38;SRF=39;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.074555;STB=0.529607;TYPE=snp;VARB=0.0186209;OID=.;OPOS=77401143;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:154:90:92:60:62:38:22:39:51:38:24:40:52 chr15 77404160 . G C 589.86 PASS AO=61;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0500757;FXX=0.0461467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5748;QD=38.0553;RBI=0.0522554;REFB=0;REVB=0.014935;RO=0;SAF=55;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000659334;OID=.;OPOS=77404160;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:62:62:0:0:61:62:6:55:0:0:6:56:0:0 chr15 77405165 . TA T 28.08 PASS AO=13;DP=52;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=3;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=0.378071;FXX=0.127632;HRUN=7;LEN=1;MLLD=8.87075;QD=2.73916;RBI=0.386309;REFB=-0.0830185;REVB=-0.0793521;RO=21;SAF=0;SAR=13;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.778414;STB=0.617138;TYPE=del;VARB=0.142667;OID=.;OPOS=77405166;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:13:44:18:41:23:3:15:7:16:28:21:0:13:7:14 chr15 77450964 . C T 3715.78 PASS AO=415;DP=420;FAO=392;FDP=392;FR=.;FRO=0;FSAF=152;FSAR=240;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0357169;FXX=0.0199995;HRUN=4;LEN=1;MLLD=52.9832;QD=37.9162;RBI=0.0452849;REFB=-0.0449928;REVB=0.0278392;RO=4;SAF=167;SAR=248;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0018479;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00144311;OID=.;OPOS=77450964;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:420:392:4:0:415:392:248:167:2:2:240:152:0:0 chr15 77907145 . G A 401.84 PASS AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00186;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.613;QD=37.3803;RBI=0.00861352;REFB=0;REVB=0.0084103;RO=0;SAF=16;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.818e-05;OID=.;OPOS=77907145;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:43:43:0:0:43:43:27:16:0:0:27:16:0:0 chr15 77907535 . C G 1216.2 PASS AO=128;DP=129;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0284127;FXX=0.0153834;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.395;QD=38.0061;RBI=0.0333142;REFB=-0.097343;REVB=-0.0173941;RO=1;SAF=25;SAR=103;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00459199;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000525755;OID=.;OPOS=77907535;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:129:128:1:0:128:128:103:25:0:1:103:25:0:0 chr15 77907775 . T C 584.68 PASS AO=61;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0328112;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.2267;QD=37.7214;RBI=0.0332234;REFB=0;REVB=0.00521723;RO=0;SAF=38;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000263499;OID=.;OPOS=77907775;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:62:62:0:0:61:62:23:38:0:0:24:38:0:0 chr15 77907784 . G A 616.06 PASS AO=63;DP=63;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0265641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.723;QD=37.9111;RBI=0.0332409;REFB=0;REVB=0.0199826;RO=0;SAF=42;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000109619;OID=.;OPOS=77907784;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:63:65:0:0:63:65:21:42:0:0:22:43:0:0 chr15 78207601 . G A 201.65 PASS AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0334984;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.912;QD=36.6634;RBI=0.0339271;REFB=0;REVB=-0.00537632;RO=0;SAF=8;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000326629;OID=.;OPOS=78207601;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:22:22:0:0:22:22:14:8:0:0:14:8:0:0 chr15 78207625 . A G 125.83 PASS AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.033749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.1146;QD=35.9525;RBI=0.0482895;REFB=0;REVB=-0.034538;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00230609;OID=.;OPOS=78207625;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:14:14:0:0:14:14:9:5:0:0:9:5:0:0 chr15 78208880 . G A 591.42 PASS AO=65;DP=67;FAO=65;FDP=67;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0396918;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.6985;QD=35.3087;RBI=0.0815957;REFB=-0.0403208;REVB=0.0712911;RO=2;SAF=34;SAR=31;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00130335;STB=0.50069;TYPE=snp;VARB=0.0023682;OID=.;OPOS=78208880;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:67:67:2:2:65:65:31:34:1:1:31:34:1:1 chr15 78209131 . T C 21.57 PASS AO=14;DP=68;FAO=14;FDP=68;FR=.;FRO=54;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=31;FSRR=23;FWDB=-0.034927;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.1452;QD=1.26867;RBI=0.0959563;REFB=0.00345663;REVB=0.089374;RO=54;SAF=9;SAR=5;SRF=31;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0896035;STB=0.557438;TYPE=snp;VARB=-0.0101448;OID=.;OPOS=78209131;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:68:68:54:54:14:14:5:9:31:23:5:9:31:23 chr15 78209436 . C T 391.59 PASS AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114091;FXX=0.0232504;HRUN=3;LEN=1;MLLD=197.747;QD=37.294;RBI=0.0136499;REFB=0;REVB=0.00749345;RO=0;SAF=15;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.13648e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.58825e-05;OID=.;OPOS=78209436;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:43:42:0:0:42:42:27:15:0:0:27:15:0:0 chr15 78211164 . G A 45.01 PASS AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.02199;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.7142;QD=25.7184;RBI=0.02199;REFB=-0.142612;REVB=0;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.032665;OID=.;OPOS=78211164;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:7:7:0:1:6:6:0:6:0:0:0:6:1:0 chr15 78211345 . A G 403.44 PASS AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190649;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.95;QD=37.5289;RBI=0.0382024;REFB=0;REVB=0.0331052;RO=0;SAF=12;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41862e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000402832;OID=.;OPOS=78211345;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:44:43:0:0:43:43:31:12:0:0:31:12:0:0 chr15 78211393 . A T 233.52 PASS AO=50;DP=94;FAO=50;FDP=94;FR=.;FRO=44;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=15;FSRR=29;FWDB=0.0022246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.011;QD=9.9368;RBI=0.0763154;REFB=-0.0278196;REVB=-0.076283;RO=44;SAF=23;SAR=27;SRF=15;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102981;STB=0.55659;TYPE=snp;VARB=0.0229855;OID=.;OPOS=78211393;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:44:44:50:50:27:23:15:29:27:23:15:29 chr15 78233849 . A G 18.65 PASS AO=5;DP=17;FAO=5;FDP=17;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0257171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.568;QD=4.38722;RBI=0.0461178;REFB=-0.0105585;REVB=-0.0382816;RO=10;SAF=2;SAR=3;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105052;STB=0.512146;TYPE=snp;VARB=0.0224951;OID=.;OPOS=78233849;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:17:17:10:12:5:5:3:2:5:5:3:2:5:7 chr15 78234093 . C G 26.3 PASS AO=11;DP=43;FAO=11;FDP=43;FR=.;FRO=32;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=26;FWDB=-0.0425073;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.1046;QD=2.44607;RBI=0.0600604;REFB=0.0116441;REVB=-0.0424309;RO=32;SAF=3;SAR=8;SRF=6;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140776;STB=0.586066;TYPE=snp;VARB=-0.0436439;OID=.;OPOS=78234093;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:43:43:32:32:11:11:8:3:6:26:8:3:6:26 chr15 78234455 . T C 58.5 PASS AO=6;DP=6;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0528334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.044;QD=33.4284;RBI=0.0528334;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00131332;OID=.;OPOS=78234455;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:7:0:0:6:7:0:6:0:0:0:7:0:0 chr15 78234461 . G A 59.03 PASS AO=6;DP=6;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.612;QD=33.7318;RBI=0.0183943;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000732858;OID=.;OPOS=78234461;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:7:0:0:6:7:0:6:0:0:0:7:0:0 chr15 78234477 . A G 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00300597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.1876;QD=35.0851;RBI=0.00300597;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=7;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000272767;OID=.;OPOS=78234477;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:0:7:0:0:0:7:0:0 chr15 78276660 . A G 700.62 PASS AO=72;DP=72;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0463969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.64;QD=37.8714;RBI=0.0524044;REFB=0;REVB=-0.0243628;RO=0;SAF=35;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00016257;OID=.;OPOS=78276660;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:72:74:0:0:72:74:37:35:0:0:39:35:0:0 chr15 78403004 . A G 988.21 PASS AO=105;DP=107;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0461968;FXX=0.0186898;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.46;QD=37.6461;RBI=0.124319;REFB=-0.0523872;REVB=0.115417;RO=1;SAF=62;SAR=43;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0109082;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00089584;OID=.;OPOS=78403004;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:107:105:1:0:105:105:43:62:0:1:43:62:0:0 chr15 78466127 . T C 1057.42 PASS AO=111;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0361533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.4425;QD=38.1052;RBI=0.0364743;REFB=0;REVB=-0.00482858;RO=0;SAF=17;SAR=94;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.28158e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.09665e-05;OID=.;OPOS=78466127;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:111:111:0:0:111:111:94:17:0:0:94:17:0:0 chr15 78558584 . CAT C 258 PASS AO=68;DP=172;FAO=70;FDP=160;FR=.;FRO=90;FSAF=45;FSAR=25;FSRF=46;FSRR=44;FWDB=-0.0135847;FXX=0.0532513;HRUN=1;LEN=2;MLLD=248.409;QD=6.44991;RBI=0.013634;REFB=-0.000817836;REVB=-0.00115784;RO=94;SAF=44;SAR=24;SRF=46;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168492;STB=0.577115;TYPE=del;VARB=0.000790094;OID=.;OPOS=78558585;OREF=AT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:68:167:70:160:90:45:25:46:44:99:94:44:24:46:48 chr15 78565478 . C T 336.75 PASS AO=84;DP=183;FAO=87;FDP=186;FR=.;FRO=99;FSAF=48;FSAR=39;FSRF=53;FSRR=46;FWDB=0.0154367;FXX=0.00534731;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.226;QD=7.24195;RBI=0.017414;REFB=-0.0244842;REVB=0.00805952;RO=98;SAF=49;SAR=35;SRF=52;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0521554;STB=0.50879;TYPE=snp;VARB=0.0259717;OID=.;OPOS=78565478;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:186:98:99:84:87:35:49:52:46:39:48:53:46 chr15 78587910 . A G 3072.53 PASS AO=307;DP=308;FAO=322;FDP=322;FR=.;FRO=0;FSAF=124;FSAR=198;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136655;FXX=0.0152901;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.816;QD=38.1681;RBI=0.0250103;REFB=0;REVB=0.0209468;RO=0;SAF=124;SAR=183;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.49079e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.0058e-05;OID=.;OPOS=78587910;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:308:322:0:0:307:322:183:124:0:0:198:124:0:0 chr15 78632830 . C G 114.7 PASS AO=19;DP=30;FAO=19;FDP=30;FR=.;FRO=11;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.012809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5262;QD=15.2927;RBI=0.0369912;REFB=-0.00896889;REVB=-0.0347027;RO=11;SAF=10;SAR=9;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134246;STB=0.574392;TYPE=snp;VARB=0.00540448;OID=.;OPOS=78632830;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:30:30:11:11:19:19:9:10:8:3:9:10:8:3 chr15 78633594 . GT G 19.71 PASS AO=6;DP=35;FAO=8;FDP=32;FR=.;FRO=24;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=18;FWDB=-0.0276909;FXX=0.0588062;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.81;QD=2.46374;RBI=0.0283561;REFB=-0.00919894;REVB=-0.00610561;RO=23;SAF=0;SAR=6;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.643457;STB=0.661683;TYPE=del;VARB=0.0347293;OID=.;OPOS=78633595;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:6:34:8:32:24:1:7:6:18:19:23:0:6:6:17 chr15 78758677 . G C 1828.18 PASS AO=191;DP=191;FAO=192;FDP=192;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0149473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.472;QD=38.087;RBI=0.0177892;REFB=0;REVB=0.00964542;RO=0;SAF=87;SAR=104;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.16581e-06;OID=.;OPOS=78758677;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:87:191:192:0:0:191:192:104:87:0:0:104:88:0:0 chr15 78780104 . T C 1574.18 PASS AO=165;DP=167;FAO=167;FDP=167;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182294;FXX=0.0118336;HRUN=3;LEN=1;MLLD=204.46;QD=37.705;RBI=0.0224737;REFB=-0.0992515;REVB=-0.0131437;RO=2;SAF=56;SAR=109;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00865135;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.84637e-05;OID=.;OPOS=78780104;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:167:167:2:0:165:167:109:56:0:2:109:58:0:0 chr15 78789488 . C T 213.27 PASS AO=63;DP=156;FAO=63;FDP=155;FR=.;FRO=92;FSAF=32;FSAR=31;FSRF=50;FSRR=42;FWDB=0.0104223;FXX=0.00640985;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.201;QD=5.50363;RBI=0.016038;REFB=-0.00687411;REVB=0.0121899;RO=90;SAF=32;SAR=31;SRF=48;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.026621;STB=0.521109;TYPE=snp;VARB=0.00991993;OID=.;OPOS=78789488;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:155:90:92:63:63:31:32:48:42:31:32:50:42 chr15 78789676 . T C 204.69 PASS AO=50;DP=106;FAO=50;FDP=106;FR=.;FRO=56;FSAF=17;FSAR=33;FSRF=22;FSRR=34;FWDB=-0.0160383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.334;QD=7.72405;RBI=0.0211895;REFB=0.00670533;REVB=0.0138481;RO=56;SAF=17;SAR=33;SRF=22;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0547418;STB=0.530491;TYPE=snp;VARB=-0.00611649;OID=.;OPOS=78789676;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:56:56:50:50:33:17:22:34:33:17:22:34 chr15 78825562 . C T 86.72 PASS AO=15;DP=24;FAO=15;FDP=24;FR=.;FRO=9;FSAF=13;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.00487641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.242;QD=14.4529;RBI=0.0639532;REFB=-0.0124107;REVB=-0.063767;RO=9;SAF=13;SAR=2;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229359;STB=0.630866;TYPE=snp;VARB=0.00928089;OID=.;OPOS=78825562;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:24:24:9:9:15:15:2:13:6:3:2:13:6:3 chr15 78825917 . A G 300.79 PASS AO=56;DP=101;FAO=62;FDP=109;FR=.;FRO=47;FSAF=15;FSAR=47;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=-0.0732751;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=40.6293;QD=11.0382;RBI=0.0967631;REFB=-0.0180772;REVB=-0.0631969;RO=45;SAF=10;SAR=46;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.307867;STB=0.626403;TYPE=snp;VARB=0.0106198;OID=.;OPOS=78825917;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:109:45:47:56:62:46:10:21:24:47:15:23:24 chr15 78841220 . T C 95.88 PASS AO=30;DP=89;FAO=32;FDP=91;FR=.;FRO=59;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=31;FSRR=28;FWDB=0.0192396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.162;QD=4.21436;RBI=0.0204873;REFB=-0.00927362;REVB=0.00704042;RO=58;SAF=14;SAR=16;SRF=31;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0769472;STB=0.557048;TYPE=snp;VARB=0.0163213;OID=.;OPOS=78841220;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:89:91:58:59:30:32:16:14:31:27:18:14:31:28 chr15 78841353 . T C 240.43 PASS AO=66;DP=157;FAO=67;FDP=157;FR=.;FRO=90;FSAF=25;FSAR=42;FSRF=51;FSRR=39;FWDB=-0.00907818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.501;QD=6.12549;RBI=0.0281593;REFB=-0.000119787;REVB=0.0266558;RO=89;SAF=24;SAR=42;SRF=50;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205651;STB=0.611812;TYPE=snp;VARB=0.000228044;OID=.;OPOS=78841353;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:157:89:90:66:67:42:24:50:39:42:25:51:39 chr15 78882925 . G A 157.91 PASS AO=32;DP=59;FAO=32;FDP=59;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.0162796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.365;QD=10.706;RBI=0.0364305;REFB=-0.0128006;REVB=-0.0325908;RO=26;SAF=15;SAR=17;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0253516;STB=0.522785;TYPE=snp;VARB=0.00879669;OID=.;OPOS=78882925;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:26:27:32:32:17:15:13:13:17:15:14:13 chr15 78887709 . G GTCTC 250.79 PASS AO=85;DP=266;FAO=88;FDP=244;FR=.;FRO=156;FSAF=39;FSAR=49;FSRF=69;FSRR=87;FWDB=0.0291057;FXX=0.0431356;HRUN=1;LEN=4;MLLD=232.197;QD=4.11132;RBI=0.0313852;REFB=-0.011781;REVB=0.0117424;RO=171;SAF=36;SAR=49;SRF=79;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0454876;STB=0.500566;TYPE=ins;VARB=0.0198116;OID=.;OPOS=78887710;OREF=-;OALT=TCTC;OMAPALT=GTCTC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:85:266:88:244:156:39:49:69:87:99:171:36:49:79:92 chr15 78894339 . G A 372.99 PASS AO=90;DP=184;FAO=90;FDP=184;FR=.;FRO=94;FSAF=63;FSAR=27;FSRF=52;FSRR=42;FWDB=-0.00283477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.59;QD=8.10856;RBI=0.0415233;REFB=-0.00141938;REVB=0.0414265;RO=87;SAF=63;SAR=27;SRF=45;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178667;STB=0.583314;TYPE=snp;VARB=0.00201783;OID=.;OPOS=78894339;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:184:87:94:90:90:27:63:45:42:27:63:52:42 chr15 78909452 . T C 107.52 PASS AO=25;DP=51;FAO=25;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=20;FWDB=-0.0288478;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=90.1903;QD=8.11497;RBI=0.0417316;REFB=-0.0109572;REVB=-0.030155;RO=26;SAF=8;SAR=17;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.054188;STB=0.52111;TYPE=snp;VARB=0.00678092;OID=.;OPOS=78909452;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:53:26:28:25:25:17:8:7:19:17:8:8:20 chr15 78911181 . T C 112.48 PASS AO=28;DP=59;FAO=27;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=21;FSAR=6;FSRF=21;FSRR=10;FWDB=-0.0186417;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.2;QD=7.75701;RBI=0.021265;REFB=-0.0105487;REVB=-0.0102316;RO=30;SAF=22;SAR=6;SRF=20;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146271;STB=0.571372;TYPE=snp;VARB=0.0140479;OID=.;OPOS=78911181;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:58:30:31:28:27:6:22:20:10:6:21:21:10 chr15 78917399 . A G 384.64 PASS AO=81;DP=148;FAO=81;FDP=149;FR=.;FRO=68;FSAF=42;FSAR=39;FSRF=30;FSRR=38;FWDB=-0.0119938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.959;QD=10.3258;RBI=0.0184948;REFB=-0.0156605;REVB=-0.0140786;RO=67;SAF=42;SAR=39;SRF=29;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0708807;STB=0.535245;TYPE=snp;VARB=0.0119763;OID=.;OPOS=78917399;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:149:67:68:81:81:39:42:29:38:39:42:30:38 chr15 79045517 . G A 176.61 PASS AO=31;DP=50;FAO=31;FDP=50;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=22;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0399573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.1347;QD=14.1289;RBI=0.0409988;REFB=0.00255006;REVB=-0.00918241;RO=19;SAF=9;SAR=22;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143096;STB=0.578894;TYPE=snp;VARB=-0.00277778;OID=.;OPOS=79045517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:50:50:19:19:31:31:22:9:9:10:22:9:9:10 chr15 79045521 . T C 435.33 PASS AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0407537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.168;QD=37.8548;RBI=0.0481884;REFB=0;REVB=-0.0257148;RO=0;SAF=14;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.4801e-05;OID=.;OPOS=79045521;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:46:46:0:0:46:46:32:14:0:0:32:14:0:0 chr15 79051721 . G A 70.5 PASS AO=11;DP=16;FAO=11;FDP=16;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0168464;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=132.635;QD=17.6255;RBI=0.0334529;REFB=0.0196959;REVB=0.0289015;RO=5;SAF=5;SAR=6;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.296967;STB=0.666388;TYPE=snp;VARB=-0.00669161;OID=.;OPOS=79051721;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:16:16:5:5:11:11:6:5:5:0:6:5:5:0 chr15 79058013 . C T 173.76 PASS AO=19;DP=20;FAO=19;FDP=20;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.028065;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.122;QD=34.7512;RBI=0.0304669;REFB=0.0101714;REVB=0.0118568;RO=1;SAF=3;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0279067;STB=0.515136;TYPE=snp;VARB=7.25728e-05;OID=.;OPOS=79058013;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:1:1:19:19:16:3:0:1:16:3:0:1 chr15 79058298 . T C 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00155165;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.378;QD=33.022;RBI=0.00155165;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.99051e-05;OID=.;OPOS=79058298;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:0:6:0:0:0:6:0:0 chr15 79058533 . C G 10.15 PASS AO=2;DP=9;FAO=2;FDP=9;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=0.050451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6529;QD=4.51238;RBI=0.050451;REFB=-0.0121066;REVB=0;RO=7;SAF=2;SAR=0;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0851069;OID=.;OPOS=79058533;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:7:7:2:2:0:2:7:0:0:2:7:0 chr15 79058572 . T G 170.86 PASS AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0533359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.068;QD=37.968;RBI=0.0533359;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=18;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00188982;OID=.;OPOS=79058572;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:18:0:0:18:18:0:18:0:0:0:18:0:0 chr15 79058923 . G A 166.72 PASS AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0378219;FXX=0.049975;HRUN=4;LEN=1;MLLD=90.317;QD=35.099;RBI=0.0948004;REFB=0.0100589;REVB=0.0869288;RO=1;SAF=14;SAR=4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101506;STB=0.55549;TYPE=snp;VARB=0.00271631;OID=.;OPOS=79058923;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:1:1:18:18:4:14:0:1:4:14:0:1 chr15 79058951 . T C 134.94 PASS AO=24;DP=41;FAO=24;FDP=40;FR=.;FRO=16;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.00966522;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.82;QD=13.4935;RBI=0.0398369;REFB=-0.00469538;REVB=0.0386466;RO=14;SAF=16;SAR=8;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0927365;STB=0.509426;TYPE=snp;VARB=0.00290644;OID=.;OPOS=79058951;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:41:40:14:16:24:24:8:16:11:3:8:16:11:5 chr15 79064080 . G A 193.8 PASS AO=36;DP=62;FAO=37;FDP=63;FR=.;FRO=26;FSAF=34;FSAR=3;FSRF=22;FSRR=4;FWDB=0.0098507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.479;QD=12.3047;RBI=0.0101934;REFB=-0.046674;REVB=-0.00262102;RO=25;SAF=34;SAR=2;SRF=21;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.266528;STB=0.586154;TYPE=snp;VARB=0.0268912;OID=.;OPOS=79064080;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:62:63:25:26:36:37:2:34:21:4:3:34:22:4 chr15 79064143 . C G 412.69 PASS AO=96;DP=190;FAO=96;FDP=190;FR=.;FRO=94;FSAF=27;FSAR=69;FSRF=26;FSRR=68;FWDB=-0.00290931;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.5552;QD=8.68813;RBI=0.0264377;REFB=0.0103938;REVB=-0.0262771;RO=92;SAF=27;SAR=69;SRF=24;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0227444;STB=0.502854;TYPE=snp;VARB=-0.0111768;OID=.;OPOS=79064143;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:190:92:94:96:96:69:27:24:68:69:27:26:68 chr15 79069121 . A G 64.76 PASS AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=-0.0130299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.581;QD=10.3608;RBI=0.0165859;REFB=-0.0270025;REVB=-0.0102623;RO=12;SAF=4;SAR=9;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149263;STB=0.584496;TYPE=snp;VARB=0.022464;OID=.;OPOS=79069121;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:25:25:12:12:13:13:9:4:2:10:9:4:2:10 chr15 79089007 . T C 136.83 PASS AO=31;DP=63;FAO=31;FDP=63;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=11;FWDB=-0.0179033;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.771;QD=8.68759;RBI=0.0272735;REFB=-0.0254688;REVB=0.0205747;RO=32;SAF=14;SAR=17;SRF=21;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184364;STB=0.602772;TYPE=snp;VARB=0.0136101;OID=.;OPOS=79089007;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:32:32:31:31:17:14:21:11:17:14:21:11 chr15 79089111 . A G 33.67 PASS AO=15;DP=65;FAO=17;FDP=67;FR=.;FRO=50;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=33;FWDB=-0.0495943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.139;QD=2.01028;RBI=0.0509636;REFB=0.00102054;REVB=-0.0117344;RO=49;SAF=8;SAR=7;SRF=16;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253594;STB=0.59882;TYPE=snp;VARB=-0.00789725;OID=.;OPOS=79089111;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:65:67:49:50:15:17:7:8:16:33:9:8:17:33 chr15 79092750 . G C 67.12 PASS AO=14;DP=31;FAO=14;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.0087767;FXX=0.0644953;HRUN=2;LEN=1;MLLD=221.07;QD=9.25861;RBI=0.0252497;REFB=-0.0182653;REVB=0.0236752;RO=15;SAF=8;SAR=6;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0263751;STB=0.51513;TYPE=snp;VARB=0.020072;OID=.;OPOS=79092750;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:31:29:15:15:14:14:6:8:9:6:6:8:9:6 chr15 79168921 . GA G 186.44 PASS AO=66;DP=155;FAO=79;FDP=141;FR=.;FRO=62;FSAF=24;FSAR=55;FSRF=26;FSRR=36;FWDB=0.0217578;FXX=0.0342442;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.7457;QD=5.28915;RBI=0.0567128;REFB=-0.0940296;REVB=-0.0523731;RO=58;SAF=16;SAR=50;SRF=28;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.239194;STB=0.557342;TYPE=del;VARB=0.10272;OID=.;OPOS=79168922;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:66:144:79:141:62:24:55:26:36:78:58:16:50:28:30 chr15 79185877 . A G 156.63 PASS AO=40;DP=90;FAO=40;FDP=90;FR=.;FRO=50;FSAF=13;FSAR=27;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=-0.00293796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.878;QD=6.96137;RBI=0.0163039;REFB=0.0152359;REVB=-0.016037;RO=50;SAF=13;SAR=27;SRF=24;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163023;STB=0.591777;TYPE=snp;VARB=-0.0171607;OID=.;OPOS=79185877;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:50:50:40:40:27:13:24:26:27:13:24:26 chr15 79185898 . C A 162.97 PASS AO=42;DP=94;FAO=42;FDP=94;FR=.;FRO=52;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=24;FSRR=28;FWDB=0.0344979;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.4673;QD=6.93487;RBI=0.0349269;REFB=-0.0425546;REVB=0.00545767;RO=51;SAF=14;SAR=28;SRF=24;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142688;STB=0.57572;TYPE=snp;VARB=0.0524265;OID=.;OPOS=79185898;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:51:52:42:42:28:14:24:27:28:14:24:28 chr15 79214461 . G A 45.01 PASS AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.121589;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.855;QD=25.7205;RBI=0.121589;REFB=-0.234848;REVB=0;RO=1;SAF=6;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0952979;OID=.;OPOS=79214461;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:7:7:1:1:6:6:0:6:1:0:0:6:1:0 chr15 79217690 . G C 529.07 PASS AO=53;DP=54;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0492054;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.5386;QD=37.7909;RBI=0.0780098;REFB=0;REVB=0.0605339;RO=1;SAF=18;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0254518;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00176087;OID=.;OPOS=79217690;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:54:56:1:0:53:56:35:18:1:0:36:20:0:0 chr15 79224747 . C T 213.63 PASS AO=38;DP=63;FAO=39;FDP=63;FR=.;FRO=24;FSAF=29;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=5;FWDB=0.0745492;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.171;QD=13.564;RBI=0.0767207;REFB=-0.0180385;REVB=-0.018124;RO=24;SAF=28;SAR=10;SRF=19;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0514217;STB=0.524578;TYPE=snp;VARB=0.0100042;OID=.;OPOS=79224747;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:63:63:24:24:38:39:10:28:19:5:10:29:19:5 chr15 79231518 . A G 41.62 PASS AO=36;DP=174;FAO=36;FDP=178;FR=.;FRO=142;FSAF=8;FSAR=28;FSRF=68;FSRR=74;FWDB=-0.00559624;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=148.633;QD=0.93527;RBI=0.00788728;REFB=0.000707485;REVB=-0.00555799;RO=133;SAF=8;SAR=28;SRF=64;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.354844;STB=0.722694;TYPE=snp;VARB=-0.00473491;OID=.;OPOS=79231518;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:174:178:133:142:36:36:28:8:64:69:28:8:68:74 chr15 79237247 . C G 296.79 PASS AO=31;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.996;QD=37.0983;RBI=0.0263471;REFB=0;REVB=0.0126866;RO=0;SAF=9;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.15349e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000130959;OID=.;OPOS=79237247;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:31:32:0:0:31:32:22:9:0:0:22:10:0:0 chr15 79237324 . C A 170.86 PASS AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.124912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5837;QD=37.9678;RBI=0.141495;REFB=0;REVB=0.0664649;RO=0;SAF=2;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00635599;OID=.;OPOS=79237324;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:18:0:0:18:18:16:2:0:0:16:2:0:0 chr15 79277247 . A C 1839.99 PASS AO=191;DP=192;FAO=195;FDP=195;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=148;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0426385;FXX=0.00510178;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.007;QD=37.7434;RBI=0.0435781;REFB=0;REVB=-0.00900032;RO=0;SAF=45;SAR=146;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.21962e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.30844e-05;OID=.;OPOS=79277247;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:192:195:0:0:191:195:146:45:0:0:148:47:0:0 chr15 79296172 . G A 56.12 PASS AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.00242564;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=130.289;QD=7.48223;RBI=0.0339278;REFB=-0.0249483;REVB=-0.033841;RO=16;SAF=7;SAR=6;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0835315;STB=0.528454;TYPE=snp;VARB=0.0472809;OID=.;OPOS=79296172;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:29:30:16:17:13:13:6:7:10:6:6:7:10:7 chr15 79298523 . G A 250.43 PASS AO=50;DP=89;FAO=50;FDP=89;FR=.;FRO=39;FSAF=36;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=0.0282167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.451;QD=11.2551;RBI=0.0307424;REFB=-0.00370675;REVB=0.012203;RO=39;SAF=36;SAR=14;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246641;STB=0.63586;TYPE=snp;VARB=0.00260797;OID=.;OPOS=79298523;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:39:39:50:50:14:36:17:22:14:36:17:22 chr15 79586361 . T C 68.71 PASS AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0434496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.137;QD=10.1798;RBI=0.0452303;REFB=-0.0180565;REVB=0.0125662;RO=13;SAF=2;SAR=12;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.479895;STB=0.778764;TYPE=snp;VARB=0.011572;OID=.;OPOS=79586361;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:27:27:13:13:14:14:12:2:8:5:12:2:8:5 chr15 79588710 . C T 247.84 PASS AO=70;DP=149;FAO=71;FDP=170;FR=.;FRO=99;FSAF=32;FSAR=39;FSRF=52;FSRR=47;FWDB=0.00261276;FXX=0.0229872;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.541;QD=5.83141;RBI=0.0543298;REFB=-0.0276611;REVB=-0.054267;RO=78;SAF=32;SAR=38;SRF=47;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137711;STB=0.543452;TYPE=snp;VARB=0.0361108;OID=.;OPOS=79588710;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:170:78:99:70:71:38:32:47:31:39:32:52:47 chr15 79589174 . C G 101.72 PASS AO=23;DP=51;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.0025402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.719;QD=7.8249;RBI=0.0256808;REFB=-0.0118639;REVB=-0.0255549;RO=28;SAF=7;SAR=16;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267621;STB=0.631467;TYPE=snp;VARB=0.0158846;OID=.;OPOS=79589174;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:52:28:28:23:24:16:7:16:12:16:8:16:12 chr15 79590208 . A G 232.11 PASS AO=50;DP=98;FAO=51;FDP=99;FR=.;FRO=48;FSAF=13;FSAR=38;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=0.0188736;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.684;QD=9.37802;RBI=0.0248597;REFB=-0.00806634;REVB=0.0161799;RO=48;SAF=13;SAR=37;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.239545;STB=0.635567;TYPE=snp;VARB=0.00589775;OID=.;OPOS=79590208;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:99:48:48:50:51:37:13:24:24:38:13:24:24 chr15 79606137 . G A 1465.53 PASS AO=154;DP=155;FAO=156;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01528;FXX=0.0126574;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.258;QD=37.5776;RBI=0.0251484;REFB=-0.105188;REVB=0.019974;RO=1;SAF=103;SAR=51;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00459662;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.35399e-05;OID=.;OPOS=79606137;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:155:156:1:0:154:156:51:103:1:0:53:103:0:0 chr15 79614418 . A G 1688.25 PASS AO=174;DP=174;FAO=176;FDP=176;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00500109;FXX=0.0056494;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.306;QD=38.3693;RBI=0.0101628;REFB=0;REVB=-0.00884717;RO=0;SAF=71;SAR=103;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.43844e-05;OID=.;OPOS=79614418;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:174:176:0:0:174:176:103:71:0:0:104:72:0:0 chr15 79675301 . T C 168.75 PASS AO=47;DP=105;FAO=46;FDP=108;FR=.;FRO=62;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=27;FSRR=35;FWDB=-0.0225045;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.7866;QD=6.25003;RBI=0.0783142;REFB=-0.02587;REVB=-0.0750111;RO=58;SAF=27;SAR=20;SRF=24;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158067;STB=0.574265;TYPE=snp;VARB=0.0130012;OID=.;OPOS=79675301;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:108:58:62:47:46:20:27:24:34:20:26:27:35 chr15 79750127 . A G 33.88 PASS AO=11;DP=50;FAO=14;FDP=50;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=-0.0279311;FXX=0.137907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.689;QD=2.71077;RBI=0.0279524;REFB=-0.0127264;REVB=0.00109206;RO=39;SAF=8;SAR=3;SRF=25;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121752;STB=0.52937;TYPE=snp;VARB=0.0592832;OID=.;OPOS=79750127;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:50:50:39:36:11:14:3:8:25:14:6:8:22:14 chr15 79750307 . T C 664.6 PASS AO=71;DP=72;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0337346;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.766;QD=36.4164;RBI=0.0352114;REFB=-0.00377559;REVB=0.0100905;RO=1;SAF=46;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0185371;STB=0.509431;TYPE=snp;VARB=-2.42384e-06;OID=.;OPOS=79750307;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:72:73:1:1:71:72:25:46:0:1:26:46:0:1 chr15 79750419 . A T 68.13 PASS AO=19;DP=49;FAO=19;FDP=49;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.00312179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.996;QD=5.5615;RBI=0.0312545;REFB=-0.0374466;REVB=-0.0310982;RO=29;SAF=12;SAR=7;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0500627;STB=0.541716;TYPE=snp;VARB=0.0483481;OID=.;OPOS=79750419;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:49:49:29:30:19:19:7:12:17:12:7:12:17:13 chr15 79762525 . A C 269.61 PASS AO=46;DP=179;FAO=76;FDP=179;FR=.;FRO=103;FSAF=59;FSAR=17;FSRF=66;FSRR=37;FWDB=-0.00641623;FXX=0.0271724;HRUN=7;LEN=1;MLLD=123.911;QD=6.02477;RBI=0.0172314;REFB=-0.00211293;REVB=-0.0159923;RO=60;SAF=35;SAR=11;SRF=40;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120537;STB=0.599859;TYPE=snp;VARB=0.00464843;OID=.;OPOS=79762525;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:179:60:103:46:76:11:35:40:20:17:59:66:37 chr15 79764056 . G T 345.08 PASS AO=63;DP=148;FAO=85;FDP=170;FR=.;FRO=85;FSAF=53;FSAR=32;FSRF=35;FSRR=50;FWDB=-0.00107699;FXX=0.0229872;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.719;QD=8.11951;RBI=0.0337921;REFB=0.0091564;REVB=0.0337749;RO=49;SAF=38;SAR=25;SRF=27;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0431277;STB=0.606788;TYPE=snp;VARB=-0.00566751;OID=.;OPOS=79764056;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:170:49:85:63:85:25:38:27:22:32:53:35:50 chr15 80191343 . G A 502.11 PASS AO=115;DP=225;FAO=115;FDP=225;FR=.;FRO=110;FSAF=61;FSAR=54;FSRF=49;FSRR=61;FWDB=-0.00389551;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.174;QD=8.92635;RBI=0.0113197;REFB=0.0341698;REVB=0.0106283;RO=110;SAF=61;SAR=54;SRF=49;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0757192;STB=0.541483;TYPE=snp;VARB=-0.0218225;OID=.;OPOS=80191343;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:225:225:110:110:115:115:54:61:49:61:54:61:49:61 chr15 80216165 . G T 64.53 PASS AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.0204043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.164;QD=8.60386;RBI=0.0266076;REFB=-0.0247583;REVB=-0.0170773;RO=16;SAF=3;SAR=11;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251797;STB=0.646828;TYPE=snp;VARB=0.0377678;OID=.;OPOS=80216165;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:30:30:16:16:14:14:11:3:7:9:11:3:7:9 chr15 80216931 . T C 83.34 PASS AO=26;DP=74;FAO=26;FDP=71;FR=.;FRO=45;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=-0.0171026;FXX=0.0405351;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.908;QD=4.69524;RBI=0.0207048;REFB=-0.0090405;REVB=-0.01167;RO=47;SAF=12;SAR=14;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.078145;STB=0.55935;TYPE=snp;VARB=0.017538;OID=.;OPOS=80216931;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:74:71:47:45:26:26:14:12:25:22:14:12:25:20 chr15 80762646 . C T 193.96 PASS AO=37;DP=63;FAO=37;FDP=63;FR=.;FRO=26;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=0.0692639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.5296;QD=12.3147;RBI=0.0696385;REFB=-0.0198759;REVB=-0.0072137;RO=25;SAF=24;SAR=13;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0386671;STB=0.514917;TYPE=snp;VARB=0.0306587;OID=.;OPOS=80762646;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:63:63:25:26:37:37:13:24:15:10:13:24:16:10 chr15 81212608 . G A 496.89 PASS AO=18;DP=78;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190811;FXX=0.0128189;HRUN=4;LEN=1;MLLD=39.4284;QD=25.8125;RBI=0.180261;REFB=0;REVB=0.179248;RO=0;SAF=13;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0246112;OID=.;OPOS=81212608;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:18:77:0:0:18:77:5:13:0:0:61:16:0:0 chr15 81582868 . G A 2194.11 PASS AO=225;DP=225;FAO=228;FDP=228;FR=.;FRO=0;FSAF=107;FSAR=121;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114731;FXX=0.00436662;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.219;QD=38.4931;RBI=0.0127791;REFB=0;REVB=0.00562783;RO=0;SAF=103;SAR=122;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.8267e-05;OID=.;OPOS=81582868;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:225:228:0:0:225:228:122:103:0:0:121:107:0:0 chr15 81592802 . A G 278.54 PASS AO=36;DP=78;FAO=42;FDP=77;FR=.,HEALED;FRO=23;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.0272204;FXX=0.0609682;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.67;QD=14.4697;RBI=0.0330329;REFB=-0.00937793;REVB=0.0187141;RO=17;SAF=16;SAR=20;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0195401;STB=0.504948;TYPE=snp;VARB=0.0219285;OID=.;OPOS=81592802;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:73:77:17:23:36:42:20:16:7:10:25:17:9:14 chr15 81600995 . A G 1049.53 PASS AO=109;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0483443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.63;QD=38.515;RBI=0.0503815;REFB=0;REVB=-0.0141818;RO=0;SAF=17;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3517e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.66422e-05;OID=.;OPOS=81600995;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:109:109:0:0:109:109:92:17:0:0:92:17:0:0 chr15 81616329 . G A 55.57 PASS AO=11;DP=22;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=-0.00958876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.944;QD=10.1036;RBI=0.016818;REFB=-0.00973082;REVB=0.0138166;RO=11;SAF=1;SAR=10;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.632409;STB=0.873014;TYPE=snp;VARB=0.002246;OID=.;OPOS=81616329;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:22:22:11:11:11:11:10:1:8:3:10:1:8:3 chr15 81624768 . C T 339.59 PASS AO=34;DP=34;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.004325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.266;QD=37.7326;RBI=0.0632683;REFB=0;REVB=0.0631203;RO=0;SAF=12;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.75716e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000294296;OID=.;OPOS=81624768;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:34:36:0:0:34:36:22:12:0:0:23:13:0:0 chr15 81625028 . C T 86.76 PASS AO=24;DP=81;FAO=29;FDP=84;FR=.;FRO=55;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=33;FSRR=22;FWDB=-0.0073941;FXX=0.0344788;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.513;QD=4.13132;RBI=0.0159803;REFB=-0.00239595;REVB=0.0141668;RO=55;SAF=17;SAR=7;SRF=31;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18567;STB=0.514276;TYPE=snp;VARB=0.00677426;OID=.;OPOS=81625028;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:81:84:55:55:24:29:7:17:31:24:11:18:33:22 chr15 81625385 . C T 118.86 PASS AO=31;DP=72;FAO=31;FDP=72;FR=.;FRO=41;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=-0.00632502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.54;QD=6.60312;RBI=0.0151981;REFB=-0.0289604;REVB=-0.0138194;RO=41;SAF=20;SAR=11;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163262;STB=0.592532;TYPE=snp;VARB=0.029268;OID=.;OPOS=81625385;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:41:41:31:31:11:20:20:21:11:20:20:21 chr15 81636267 . C T 807.96 PASS AO=82;DP=83;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000915205;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.423;QD=38.0215;RBI=0.0101241;REFB=0;REVB=0.0100827;RO=1;SAF=30;SAR=52;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0155226;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.65357e-06;OID=.;OPOS=81636267;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:83:85:1:0:82:85:52:30:1:0:54:31:0:0 chr15 81637284 . G A 638.09 PASS AO=171;DP=380;FAO=171;FDP=380;FR=.;FRO=209;FSAF=82;FSAR=89;FSRF=87;FSRR=122;FWDB=0.0152898;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=239.735;QD=6.71677;RBI=0.015551;REFB=0.00256132;REVB=0.00283839;RO=208;SAF=82;SAR=89;SRF=86;SRR=122;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0659549;STB=0.534949;TYPE=snp;VARB=-0.00343377;OID=.;OPOS=81637284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:380:380:208:209:171:171:89:82:86:122:89:82:87:122 chr15 82387862 . G C 765.31 PASS AO=89;DP=95;FAO=89;FDP=95;FR=.;FRO=6;FSAF=36;FSAR=53;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.015408;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.6844;QD=32.2235;RBI=0.0660505;REFB=-0.107543;REVB=0.0642282;RO=5;SAF=36;SAR=53;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.061399;STB=0.527805;TYPE=snp;VARB=0.00726882;OID=.;OPOS=82387862;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:95:95:5:6:89:89:53:36:5:0:53:36:5:1 chr15 82443939 . G A 1216.53 PASS AO=121;DP=122;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00728548;FXX=0.00781189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.7368;QD=38.3159;RBI=0.0719553;REFB=0;REVB=0.0715855;RO=1;SAF=69;SAR=52;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00904767;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00106365;OID=.;OPOS=82443939;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:122:127:1:0:121:127:52:69:0:1:55:72:0:0 chr15 82444437 . A G 2031.12 PASS AO=211;DP=220;FAO=212;FDP=212;FR=.;FRO=0;FSAF=135;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00309951;FXX=0.109239;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.316;QD=38.3229;RBI=0.0140187;REFB=0.00306051;REVB=0.0136718;RO=1;SAF=134;SAR=77;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00354215;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000976747;OID=.;OPOS=82444437;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:220:212:1:0:211:212:77:134:1:0:77:135:0:0 chr15 82512429 . C G 846.53 PASS AO=91;DP=92;FAO=91;FDP=92;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=53;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0173077;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.32;QD=36.8056;RBI=0.0359966;REFB=-0.015021;REVB=-0.0315626;RO=1;SAF=38;SAR=53;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0123103;STB=0.506492;TYPE=snp;VARB=4.58093e-05;OID=.;OPOS=82512429;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:92:92:1:1:91:91:53:38:1:0:53:38:1:0 chr15 82558034 . G C 1436.19 PASS AO=142;DP=143;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140038;FXX=0.00666622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.227;QD=38.5554;RBI=0.0177795;REFB=0;REVB=0.0109547;RO=0;SAF=52;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.50162e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.18351e-05;OID=.;OPOS=82558034;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:143:149:0:0:142:149:90:52:0:0:91:58:0:0 chr15 82563991 . C T 1353.32 PASS AO=142;DP=142;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00470244;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.86;QD=38.1216;RBI=0.0295184;REFB=0;REVB=-0.0291415;RO=0;SAF=61;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.26383e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.92016e-05;OID=.;OPOS=82563991;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:142:142:0:0:142:142:81:61:0:0:81:61:0:0 chr15 82637061 . C T 56.3 PASS AO=7;DP=8;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=91.6692;QD=28.1509;RBI=0.0513434;REFB=0.105979;REVB=0.0513434;RO=1;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00814649;OID=.;OPOS=82637061;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:8:8:1:1:7:7:7:0:0:1:7:0:0:1 chr15 82637079 . C T 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=302.757;QD=35.0875;RBI=0.0190145;REFB=0;REVB=-0.0190145;RO=0;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000246646;OID=.;OPOS=82637079;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:7:0:0:0:7:0:0:0 chr15 83224696 . C T 1475.37 PASS AO=156;DP=157;FAO=156;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0309473;FXX=0.0370348;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.965;QD=37.8301;RBI=0.0315122;REFB=-0.0932935;REVB=0.00593988;RO=1;SAF=86;SAR=70;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00674795;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000781882;OID=.;OPOS=83224696;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:157:156:1:0:156:156:70:86:0:1:70:86:0:0 chr15 83332381 . GA G 56.03 PASS AO=25;DP=107;FAO=41;FDP=94;FR=.;FRO=53;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=37;FSRR=16;FWDB=-0.012896;FXX=0.0408122;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.1365;QD=2.38415;RBI=0.0660442;REFB=-0.0589007;REVB=-0.0647729;RO=42;SAF=15;SAR=10;SRF=30;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134261;STB=0.682054;TYPE=del;VARB=0.0862989;OID=.;OPOS=83332382;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:25:97:41:94:53:15:26:37:16:56:42:15:10:30:12 chr15 83481880 . A G 2885.59 PASS AO=306;DP=309;FAO=307;FDP=307;FR=.;FRO=0;FSAF=160;FSAR=147;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0369229;FXX=0.00324665;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.332;QD=37.5972;RBI=0.0393714;REFB=-0.0375224;REVB=0.0136679;RO=2;SAF=160;SAR=146;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000283958;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000377607;OID=.;OPOS=83481880;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:309:307:2:0:306:307:146:160:1:1:147:160:0:0 chr15 83680287 . A G 471.97 PASS AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0384453;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=161.937;QD=38.5279;RBI=0.0447506;REFB=0;REVB=-0.0229035;RO=0;SAF=20;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.02468e-05;OID=.;OPOS=83680287;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:49:49:0:0:49:49:29:20:0:0:29:20:0:0 chr15 83680329 . G A 76.72 PASS AO=15;DP=36;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=1;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.11536;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.8097;QD=8.07527;RBI=0.126958;REFB=-0.0722614;REVB=0.0530135;RO=20;SAF=1;SAR=14;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.544133;STB=0.840145;TYPE=snp;VARB=0.0871794;OID=.;OPOS=83680329;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:36:38:20:20:15:18:14:1:8:12:17:1:8:12 chr15 83781631 . C T 141.61 PASS AO=59;DP=205;FAO=67;FDP=224;FR=.;FRO=157;FSAF=15;FSAR=52;FSRF=48;FSRR=109;FWDB=-0.0223706;FXX=0.0344813;HRUN=4;LEN=1;MLLD=118.43;QD=2.52878;RBI=0.0272843;REFB=-0.0107592;REVB=-0.0156201;RO=144;SAF=7;SAR=52;SRF=36;SRR=108;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.276444;STB=0.575622;TYPE=snp;VARB=0.0251857;OID=.;OPOS=83781631;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:224:144:157:59:67:52:7:36:108:52:15:48:109 chr15 83808025 . G T 270.82 PASS AO=56;DP=102;FAO=56;FDP=102;FR=.;FRO=46;FSAF=15;FSAR=41;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=-0.0268052;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.2909;QD=10.6204;RBI=0.0364517;REFB=0.000578341;REVB=-0.0247024;RO=46;SAF=15;SAR=41;SRF=18;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120855;STB=0.566558;TYPE=snp;VARB=-0.000344757;OID=.;OPOS=83808025;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:46:46:56:56:41:15:18:28:41:15:18:28 chr15 84278014 . T C 219.18 PASS AO=60;DP=135;FAO=60;FDP=140;FR=.;FRO=80;FSAF=41;FSAR=19;FSRF=54;FSRR=26;FWDB=-0.00136164;FXX=0.0070917;HRUN=3;LEN=1;MLLD=180.821;QD=6.26239;RBI=0.0768254;REFB=-0.0181345;REVB=-0.0768133;RO=74;SAF=41;SAR=19;SRF=50;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00872835;STB=0.505478;TYPE=snp;VARB=0.0239116;OID=.;OPOS=84278014;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:140:74:80:60:60:19:41:50:24:19:41:54:26 chr15 84488636 . A G 481.88 PASS AO=78;DP=235;FAO=113;FDP=227;FR=.,HEALED;FRO=114;FSAF=44;FSAR=69;FSRF=41;FSRR=73;FWDB=0.0344946;FXX=0.00873324;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.618;QD=8.49132;RBI=0.0364563;REFB=0.0052996;REVB=-0.0117978;RO=77;SAF=20;SAR=58;SRF=14;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0931516;STB=0.515807;TYPE=snp;VARB=-0.00578906;OID=.;OPOS=84488636;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:227:77:114:78:113:58:20:14:63:69:44:41:73 chr15 84493651 . T C 440.34 PASS AO=126;DP=290;FAO=125;FDP=290;FR=.;FRO=165;FSAF=51;FSAR=74;FSRF=64;FSRR=101;FWDB=0.0176171;FXX=0.00343631;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.3538;QD=6.07361;RBI=0.0233859;REFB=-0.00143087;REVB=-0.0153798;RO=164;SAF=52;SAR=74;SRF=63;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0301735;STB=0.511899;TYPE=snp;VARB=0.00173961;OID=.;OPOS=84493651;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:290:290:164:165:126:125:74:52:63:101:74:51:64:101 chr15 84539619 . C G 1199.67 PASS AO=136;DP=147;FAO=138;FDP=146;FR=.;FRO=8;FSAF=65;FSAR=73;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.00968975;FXX=0.0135126;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.6378;QD=32.8677;RBI=0.0345793;REFB=-0.191578;REVB=0.0331939;RO=0;SAF=65;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56186e-08;STB=0.519063;TYPE=snp;VARB=0.00498305;OID=.;OPOS=84539619;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:147:146:0:8:136:138:71:65:0:0:73:65:1:7 chr15 84581889 . G A 392.37 PASS AO=48;DP=53;FAO=48;FDP=53;FR=.;FRO=5;FSAF=35;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.027134;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=108.373;QD=29.6125;RBI=0.040161;REFB=-0.0114267;REVB=0.0296083;RO=4;SAF=35;SAR=13;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00381425;STB=0.508522;TYPE=snp;VARB=0.000321755;OID=.;OPOS=84581889;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:53:53:4:5:48:48:13:35:3:1:13:35:4:1 chr15 84581904 . T C 479.62 PASS AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0446533;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9249;QD=37.6174;RBI=0.0994868;REFB=0;REVB=0.0889028;RO=0;SAF=40;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000851277;OID=.;OPOS=84581904;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:52:51:0:0:51:51:11:40:0:0:11:40:0:0 chr15 84582124 . G T 966.21 PASS AO=97;DP=97;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0125047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.4539;QD=38.6486;RBI=0.0444813;REFB=0;REVB=0.0426875;RO=0;SAF=26;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.66521e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000118704;OID=.;OPOS=84582124;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:97:100:0:0:97:100:71:26:0:0:73:27:0:0 chr15 84651290 . T C 440.51 PASS AO=45;DP=47;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0226267;FXX=0.041658;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.739;QD=38.3048;RBI=0.0228185;REFB=0;REVB=0.00295208;RO=0;SAF=20;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.09779e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.90095e-06;OID=.;OPOS=84651290;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:47:46:0:0:45:46:25:20:0:0:26:20:0:0 chr15 84958495 . G A 35.06 PASS AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.0592417;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=255.372;QD=7.01149;RBI=0.073451;REFB=-0.00650652;REVB=-0.043422;RO=12;SAF=6;SAR=2;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.272725;STB=0.666222;TYPE=snp;VARB=0.0145666;OID=.;OPOS=84958495;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:20:20:12:12:8:8:2:6:6:6:2:6:6:6 chr15 85149771 . G T 1653.19 PASS AO=173;DP=173;FAO=173;FDP=173;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00341427;FXX=0.0057468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.1287;QD=38.224;RBI=0.0656209;REFB=0;REVB=0.065532;RO=0;SAF=87;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.64744e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000188536;OID=.;OPOS=85149771;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:173:173:0:0:173:173:86:87:0:0:86:87:0:0 chr15 85163998 . G C 1107.39 PASS AO=86;DP=125;FAO=120;FDP=122;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=70;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0052221;FXX=0.0161277;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.138;QD=36.308;RBI=0.086276;REFB=-0.051111;REVB=0.0861178;RO=2;SAF=60;SAR=26;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0350504;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00618474;OID=.;OPOS=85163998;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:119:122:2:0:86:120:26:60:0:2:50:70:0:0 chr15 85164077 . AG A 668.81 PASS AO=81;DP=111;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.288558;FXX=0.0183469;HRUN=4;LEN=1;MLLD=13.7066;QD=25.0022;RBI=0.364127;REFB=0;REVB=0.222087;RO=21;SAF=31;SAR=50;SRF=6;SRR=15;SSEN=0.560669;SSEP=0;SSSB=0.0400298;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00946241;OID=.;OPOS=85164078;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:81:107:107:107:0:39:68:0:0:59:21:31:50:6:15 chr15 85186837 . T C 685.41 PASS AO=172;DP=371;FAO=175;FDP=373;FR=.;FRO=198;FSAF=85;FSAR=90;FSRF=91;FSRR=107;FWDB=-0.0309387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.658;QD=7.35024;RBI=0.0337679;REFB=-0.0163828;REVB=0.0135303;RO=198;SAF=83;SAR=89;SRF=91;SRR=107;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0223391;STB=0.513885;TYPE=snp;VARB=0.0203342;OID=.;OPOS=85186837;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:371:373:198:198:172:175:89:83:91:107:90:85:91:107 chr15 85188839 . C T 54.03 PASS AO=15;DP=39;FAO=15;FDP=40;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.0240295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.7416;QD=5.40311;RBI=0.0533178;REFB=-0.0295754;REVB=-0.0475959;RO=24;SAF=9;SAR=6;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0628468;STB=0.550952;TYPE=snp;VARB=0.0229842;OID=.;OPOS=85188839;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:39:40:24:25:15:15:6:9:13:11:6:9:13:12 chr15 85188994 . T C 411.23 PASS AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0337402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.401;QD=37.3846;RBI=0.0465789;REFB=0;REVB=0.0321122;RO=0;SAF=13;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.4071e-06;OID=.;OPOS=85188994;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:43:44:0:0:43:44:30:13:0:0:31:13:0:0 chr15 85198362 . G T 651.31 PASS AO=67;DP=67;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.442;QD=38.3125;RBI=0.0419756;REFB=0;REVB=0.037755;RO=0;SAF=33;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.61397e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.21703e-05;OID=.;OPOS=85198362;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:67:68:0:0:67:68:34:33:0:0:34:34:0:0 chr15 85327228 . GCCCCCA GCCCCA,GCCCC 40.64 PASS AO=14,17;DP=89;FAO=30,0;FDP=63;FR=.;FRO=33;FSAF=14,0;FSAR=16,0;FSRF=7;FSRR=26;FWDB=-0.226343,-0.0386948;FXX=0.0869439;HRUN=5,5;LEN=1,2;MLLD=8.73312,94.1065;QD=2.58053;RBI=0.24252,0.0404954;REFB=-0.186543,-0.02169;REVB=-0.0870881,-0.0119409;RO=23;SAF=5,4;SAR=9,13;SRF=5;SRR=18;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.172385,0.0252351;STB=0.636281,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.144911,0;OID=.,.;OPOS=85327229,85327233;OREF=C,CA;OALT=-,-;OMAPALT=GCCCCA,GCCCC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:14,17:68:30,0:63:33:14,0:16,0:7:26:41:23:5,4:9,13:5:18 chr15 85333953 . A G 336.48 PASS AO=73;DP=138;FAO=73;FDP=138;FR=.;FRO=65;FSAF=34;FSAR=39;FSRF=30;FSRR=35;FWDB=0.00224228;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=265.233;QD=9.75308;RBI=0.0116805;REFB=-0.0136306;REVB=0.0114633;RO=65;SAF=34;SAR=39;SRF=30;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0036373;STB=0.501995;TYPE=snp;VARB=0.0154597;OID=.;OPOS=85333953;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:65:65:73:73:39:34:30:35:39:34:30:35 chr15 85341859 . G A 89.35 PASS AO=25;DP=61;FAO=25;FDP=62;FR=.;FRO=37;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=-0.0356281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.134;QD=5.76482;RBI=0.0401971;REFB=-0.0223318;REVB=0.0186132;RO=32;SAF=9;SAR=16;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260879;STB=0.639888;TYPE=snp;VARB=0.036544;OID=.;OPOS=85341859;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:61:62:32:37:25:25:16:9:20:12:16:9:22:15 chr15 85360101 . T C 187.91 PASS AO=50;DP=116;FAO=50;FDP=114;FR=.;FRO=64;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=30;FSRR=34;FWDB=-0.00113776;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.264;QD=6.59314;RBI=0.0177693;REFB=-0.0340234;REVB=-0.0177329;RO=64;SAF=20;SAR=30;SRF=31;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0863186;STB=0.539552;TYPE=snp;VARB=0.0452079;OID=.;OPOS=85360101;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:114:64:64:50:50:30:20:31:33:30:20:30:34 chr15 85383836 . TGGG TGG,TGGA 307.05 PASS AO=8,26;DP=57;FAO=13,35;FDP=55;FR=.;FRO=7;FSAF=0,11;FSAR=13,24;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.0224988,0.00205306;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=12.0876,222.707;QD=22.3312;RBI=0.0534423,0.00311528;REFB=-0.0199036,-0.0165414;REVB=0.0484756,0.00234306;RO=5;SAF=0,7;SAR=8,19;SRF=2;SRR=3;SSEN=0.289855,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.782212,-0.0481623;STB=0.998843,0.573091;TYPE=del,snp;VARB=0.0943076,0.00709999;OID=.,.;OPOS=85383837,85383839;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=TGG,TGGA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:8,26:42:13,35:55:7:0,11:13,24:5:2:27:5:0,7:8,19:2:3 chr15 85401259 . C T 283.69 PASS AO=33;DP=36;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0562332;FXX=0.0277701;HRUN=4;LEN=1;MLLD=43.1917;QD=32.4217;RBI=0.143055;REFB=-0.0528717;REVB=0.131539;RO=1;SAF=10;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0198849;STB=0.510198;TYPE=snp;VARB=0.0150099;OID=.;OPOS=85401259;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:36:35:1:1:33:34:23:10:0:1:24:10:0:1 chr15 85401419 . T C 41.39 PASS AO=16;DP=69;FAO=20;FDP=73;FR=.;FRO=53;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=21;FSRR=32;FWDB=-0.000583398;FXX=0.0266631;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.699;QD=2.26812;RBI=0.010031;REFB=-0.016347;REVB=-0.010014;RO=52;SAF=14;SAR=2;SRF=20;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.603141;STB=0.680361;TYPE=snp;VARB=0.0531719;OID=.;OPOS=85401419;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:69:73:52:53:16:20:2:14:20:32:7:13:21:32 chr15 85411941 . A G 98.12 PASS AO=30;DP=81;FAO=30;FDP=80;FR=.;FRO=50;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=12;FSRR=38;FWDB=-0.00471639;FXX=0.0123442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.8433;QD=4.90578;RBI=0.00604641;REFB=0.00158141;REVB=0.00378349;RO=50;SAF=10;SAR=20;SRF=12;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120505;STB=0.568585;TYPE=snp;VARB=-0.00227002;OID=.;OPOS=85411941;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:81:80:50:50:30:30:20:10:12:38:20:10:12:38 chr15 85447431 . G A 255.47 PASS AO=75;DP=189;FAO=76;FDP=186;FR=.;FRO=110;FSAF=36;FSAR=40;FSRF=59;FSRR=51;FWDB=-0.00389017;FXX=0.0210515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.944;QD=5.49403;RBI=0.0241175;REFB=-0.0219771;REVB=0.0238017;RO=106;SAF=36;SAR=39;SRF=59;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0799465;STB=0.537017;TYPE=snp;VARB=0.0286816;OID=.;OPOS=85447431;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:186:106:110:75:76:39:36:59:47:40:36:59:51 chr15 85448875 . C A 464.52 PASS AO=109;DP=225;FAO=112;FDP=228;FR=.;FRO=116;FSAF=64;FSAR=48;FSRF=43;FSRR=73;FWDB=-0.000562075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.557;QD=8.14939;RBI=0.0281124;REFB=-0.0296926;REVB=0.0281068;RO=97;SAF=64;SAR=45;SRF=43;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12469;STB=0.601224;TYPE=snp;VARB=0.0226314;OID=.;OPOS=85448875;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:225:228:97:116:109:112:45:64:43:54:48:64:43:73 chr15 85476441 . G A 249.46 PASS AO=60;DP=136;FAO=67;FDP=147;FR=.;FRO=80;FSAF=29;FSAR=38;FSRF=46;FSRR=34;FWDB=0.0532883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.6798;QD=6.78795;RBI=0.0618815;REFB=-0.0366587;REVB=0.0314592;RO=71;SAF=24;SAR=36;SRF=37;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119519;STB=0.577134;TYPE=snp;VARB=0.0615947;OID=.;OPOS=85476441;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:147:71:80:60:67:36:24:37:34:38:29:46:34 chr15 85478410 . A G 223.85 PASS AO=23;DP=77;FAO=24;FDP=74;FR=.,HEALED;FRO=26;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.0153284;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.0162;QD=12.1;RBI=0.0689258;REFB=-0.00719304;REVB=-0.0671997;RO=23;SAF=10;SAR=13;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.521721;TYPE=snp;VARB=0.0472074;OID=.;OPOS=85478410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:74:23:26:23:24:13:10:10:13:13:11:13:13 chr15 85482888 . G A 223.77 PASS AO=53;DP=107;FAO=52;FDP=106;FR=.;FRO=54;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=30;FWDB=0.00505588;FXX=0.00934492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.0002;QD=8.44422;RBI=0.0597789;REFB=-0.0110808;REVB=-0.0595647;RO=53;SAF=30;SAR=23;SRF=24;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10257;STB=0.567659;TYPE=snp;VARB=0.0072704;OID=.;OPOS=85482888;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:106:53:54:53:52:23:30:24:29:22:30:24:30 chr15 85607670 . G T 1545.82 PASS AO=162;DP=162;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00615463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.8687;QD=38.1684;RBI=0.0148855;REFB=0;REVB=-0.0135535;RO=0;SAF=77;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.37313e-05;OID=.;OPOS=85607670;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:162:162:0:0:162:162:85:77:0:0:85:77:0:0 chr15 86087309 . T C 1388.71 PASS AO=146;DP=146;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=112;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00528358;FXX=0.00680226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.401;QD=38.0467;RBI=0.0143474;REFB=0;REVB=0.0133391;RO=0;SAF=34;SAR=112;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.53483e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000143312;OID=.;OPOS=86087309;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:146:146:0:0:146:146:112:34:0:0:112:34:0:0 chr15 86122654 . T C 412.44 PASS AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0326347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.054;QD=37.4942;RBI=0.0328699;REFB=0;REVB=-0.00392484;RO=0;SAF=27;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.54734e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000258995;OID=.;OPOS=86122654;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:44:44:0:0:44:44:17:27:0:0:17:27:0:0 chr15 86122779 . T C 1338.04 PASS AO=142;DP=144;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00680806;FXX=0.0138879;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.713;QD=37.6913;RBI=0.0161651;REFB=0.0530146;REVB=0.0146615;RO=0;SAF=78;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.22027e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.89532e-05;OID=.;OPOS=86122779;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:144:142:0:0:142:142:64:78:0:0:64:78:0:0 chr15 86122916 . T C 1656.94 PASS AO=174;DP=175;FAO=176;FDP=176;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0317269;FXX=0.0112353;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.344;QD=37.6578;RBI=0.0352457;REFB=-0.0280163;REVB=0.0153513;RO=1;SAF=85;SAR=89;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0055673;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000229786;OID=.;OPOS=86122916;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:175:176:1:0:174:176:89:85:1:0:91:85:0:0 chr15 86123019 . C T 928.43 PASS AO=96;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0391314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.192;QD=38.2856;RBI=0.0506606;REFB=0;REVB=0.0321751;RO=0;SAF=51;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000150903;OID=.;OPOS=86123019;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:97:97:0:0:96:97:45:51:0:0:45:52:0:0 chr15 86123170 . G T 392.42 PASS AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143743;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=227.803;QD=37.3735;RBI=0.0195728;REFB=0;REVB=-0.0132843;RO=0;SAF=8;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.67012e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.07359e-06;OID=.;OPOS=86123170;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:42:42:0:0:42:42:34:8:0:0:34:8:0:0 chr15 86123833 . T C 791.93 PASS AO=84;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0124027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.332;QD=37.2672;RBI=0.0162841;REFB=0;REVB=0.0105521;RO=0;SAF=52;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.81082e-05;OID=.;OPOS=86123833;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:85:85:0:0:84:85:32:52:0:0:33:52:0:0 chr15 86123924 . C T 910.4 PASS AO=99;DP=101;FAO=99;FDP=101;FR=.;FRO=2;FSAF=48;FSAR=51;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0169357;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=178.552;QD=36.0556;RBI=0.0582813;REFB=-0.0703689;REVB=0.0557664;RO=0;SAF=48;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510202;TYPE=snp;VARB=0.000185556;OID=.;OPOS=86123924;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:101:101:0:2:99:99:51:48:0:0:51:48:2:0 chr15 86123988 . G A 961.31 PASS AO=101;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00670572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.7549;QD=38.0717;RBI=0.0111856;REFB=0;REVB=0.00895267;RO=0;SAF=39;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.32893e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.76318e-05;OID=.;OPOS=86123988;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:101:101:0:0:101:101:62:39:0:0:62:39:0:0 chr15 86124419 . C T 543.41 PASS AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0205227;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.848;QD=38.1342;RBI=0.0212133;REFB=0;REVB=0.00536858;RO=0;SAF=33;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.25003e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000140769;OID=.;OPOS=86124419;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:57:57:0:0:57:57:24:33:0:0:24:33:0:0 chr15 86124483 . C G 868.63 PASS AO=92;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00751857;FXX=0.0105252;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.0452;QD=36.9629;RBI=0.102443;REFB=-0.0930481;REVB=-0.102167;RO=2;SAF=59;SAR=33;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.015798;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0013698;OID=.;OPOS=86124483;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:94:94:2:0:92:94:33:59:2:0:34:60:0:0 chr15 86124555 . G A 1195.31 PASS AO=121;DP=121;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00965862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.232;QD=37.9464;RBI=0.0099037;REFB=0;REVB=0.00218961;RO=0;SAF=83;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000366869;OID=.;OPOS=86124555;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:121:126:0:0:121:126:38:83:0:0:41:85:0:0 chr15 86124946 . T C 231.77 PASS AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.816;QD=37.083;RBI=0.0360323;REFB=0;REVB=0.0308826;RO=0;SAF=13;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94263e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000316566;OID=.;OPOS=86124946;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:25:25:0:0:25:25:12:13:0:0:12:13:0:0 chr15 86124968 . G A 249.78 PASS AO=27;DP=30;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0187093;FXX=0.0666445;HRUN=3;LEN=1;MLLD=182.241;QD=35.6831;RBI=0.0453239;REFB=-0.0514089;REVB=0.0412822;RO=1;SAF=16;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0281787;STB=0.51514;TYPE=snp;VARB=0.00465213;OID=.;OPOS=86124968;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:30:28:1:1:27:27:11:16:1:0:11:16:1:0 chr15 86125031 . G A 505.21 PASS AO=60;DP=64;FAO=59;FDP=63;FR=.;FRO=4;FSAF=38;FSAR=21;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0262779;FXX=0.0156226;HRUN=5;LEN=1;MLLD=235.204;QD=32.0766;RBI=0.0352465;REFB=-0.173223;REVB=0.0234901;RO=4;SAF=38;SAR=22;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0148509;STB=0.507363;TYPE=snp;VARB=0.00125272;OID=.;OPOS=86125031;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:64:63:4:4:60:59:22:38:3:1:21:38:3:1 chr15 86278309 . G A 1718.94 PASS AO=185;DP=189;FAO=187;FDP=187;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=124;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100599;FXX=0.0209413;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.881;QD=36.7687;RBI=0.0191604;REFB=-0.0613399;REVB=0.0163071;RO=3;SAF=61;SAR=124;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0115279;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.11551e-05;OID=.;OPOS=86278309;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:189:187:3:0:185:187:124:61:2:1:124:63:0:0 chr15 86288518 . G C 693.62 PASS AO=54;DP=75;FAO=73;FDP=73;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=28;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.270401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.8215;QD=38.0067;RBI=0.274077;REFB=0;REVB=-0.0447422;RO=0;SAF=9;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17126e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00257883;OID=.;OPOS=86288518;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:73:73:0:0:54:73:45:9:0:0:45:28:0:0 chr15 86290940 . A C 1379.91 PASS AO=161;DP=177;FAO=163;FDP=176;FR=.;FRO=13;FSAF=59;FSAR=104;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0252069;FXX=0.0382493;HRUN=5;LEN=1;MLLD=108.532;QD=31.3615;RBI=0.0254792;REFB=-0.157918;REVB=-0.00371523;RO=13;SAF=59;SAR=102;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0144499;STB=0.507926;TYPE=snp;VARB=0.00246348;OID=.;OPOS=86290940;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:177:176:13:13:161:163:102:59:6:7:104:59:6:7 chr15 86291747 . AG A 24.57 PASS AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.201069;FXX=0.0644953;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.5122;QD=3.38874;RBI=0.201071;REFB=-0.0377571;REVB=0.000850471;RO=17;SAF=1;SAR=11;SRF=8;SRR=9;SSEN=0.32197;SSEP=0;SSSB=-0.544758;STB=0.83124;TYPE=del;VARB=0.0923004;OID=.;OPOS=86291748;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:12:31:12:29:17:1:11:8:9:24:17:1:11:8:9 chr15 86311695 . G A 1411.56 PASS AO=117;DP=156;FAO=144;FDP=154;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=70;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121317;FXX=0.0128197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.779;QD=36.6638;RBI=0.0537587;REFB=0;REVB=0.0523719;RO=0;SAF=66;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.11903e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00734839;OID=.;OPOS=86311695;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:152:154:0:0:117:144:51:66:0:0:74:70:0:0 chr15 86311742 . C T 206.94 PASS AO=60;DP=145;FAO=60;FDP=146;FR=.;FRO=86;FSAF=24;FSAR=36;FSRF=47;FSRR=39;FWDB=0.0103356;FXX=0.00680226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.109;QD=5.66963;RBI=0.0169826;REFB=-0.00467838;REVB=-0.0134754;RO=85;SAF=24;SAR=36;SRF=47;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160204;STB=0.586748;TYPE=snp;VARB=0.00940051;OID=.;OPOS=86311742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:146:85:86:60:60:36:24:47:38:36:24:47:39 chr15 86312681 . G A 775.05 PASS AO=79;DP=79;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0677191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.593;QD=37.8071;RBI=0.0694799;REFB=0;REVB=0.0155431;RO=0;SAF=25;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000160136;OID=.;OPOS=86312681;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:79:82:0:0:79:82:54:25:0:0:55:27:0:0 chr15 86313048 . T C 254.96 PASS AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0499271;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.964;QD=37.7714;RBI=0.0787992;REFB=0;REVB=0.0609639;RO=0;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39874e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000735267;OID=.;OPOS=86313048;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:27:27:0:0:27:27:14:13:0:0:14:13:0:0 chr15 86368898 . G A 856.28 PASS AO=92;DP=93;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0138954;FXX=0.0107515;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.018;QD=37.2294;RBI=0.0456354;REFB=-0.0129911;REVB=-0.0434685;RO=1;SAF=57;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00824513;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000190928;OID=.;OPOS=86368898;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:93:92:1:0:92:92:35:57:1:0:35:57:0:0 chr15 86368922 . C T 370.64 PASS AO=68;DP=128;FAO=70;FDP=117;FR=.;FRO=47;FSAF=39;FSAR=31;FSRF=32;FSRR=15;FWDB=-0.00281372;FXX=0.0859308;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.787;QD=12.6715;RBI=0.0462533;REFB=0.00430443;REVB=-0.0461676;RO=42;SAF=38;SAR=30;SRF=28;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0777988;STB=0.550924;TYPE=snp;VARB=-0.00442327;OID=.;OPOS=86368922;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:117:42:47:68:70:30:38:28:14:31:39:32:15 chr15 86368959 . A T 1698.05 PASS AO=139;DP=186;FAO=184;FDP=184;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=92;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.141502;FXX=0.0107521;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.4091;QD=36.9142;RBI=0.202666;REFB=-0.0613823;REVB=0.145088;RO=1;SAF=59;SAR=80;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00799016;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00207852;OID=.;OPOS=86368959;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:183:184:1:0:139:184:80:59:1:0:92:92:0:0 chr15 86800209 . CG C,TG 685.53 PASS AO=67,31;DP=185;FAO=75,51;FDP=157;FR=.;FRO=31;FSAF=2,23;FSAR=73,28;FSRF=29;FSRR=2;FWDB=-0.0321806,0.00089984;FXX=0.173675;HRUN=3,4;LEN=1,1;MLLD=14.1791,92.6722;QD=17.4656;RBI=0.159023,0.0113789;REFB=-0.0674428,-0.0200351;REVB=-0.155733,0.0113433;RO=26;SAF=0,20;SAR=67,11;SRF=24;SRR=2;SSEN=0.378698,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.899624,-0.275837;STB=0.937677,0.678408;TYPE=del,snp;VARB=0.0293474,0.0449067;OID=.,.;OPOS=86800210,86800209;OREF=G,C;OALT=-,T;OMAPALT=C,TG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:138:157:26:31:67,31:75,51:67,11:0,20:24:2:73,28:2,23:29:2 chr15 86806029 . C T 628.28 PASS AO=161;DP=347;FAO=165;FDP=360;FR=.;FRO=195;FSAF=79;FSAR=86;FSRF=91;FSRR=104;FWDB=-0.00451139;FXX=0.00277001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.8573;QD=6.98089;RBI=0.0177308;REFB=-0.0243736;REVB=-0.0171473;RO=184;SAF=77;SAR=84;SRF=89;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00526658;STB=0.50658;TYPE=snp;VARB=0.0318768;OID=.;OPOS=86806029;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:347:360:184:195:161:165:84:77:89:95:86:79:91:104 chr15 86807542 . C T 248.13 PASS AO=62;DP=133;FAO=62;FDP=133;FR=.;FRO=71;FSAF=25;FSAR=37;FSRF=27;FSRR=44;FWDB=0.0169275;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.5366;QD=7.46264;RBI=0.0401326;REFB=-0.0079448;REVB=0.036388;RO=69;SAF=25;SAR=37;SRF=25;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0407585;STB=0.512784;TYPE=snp;VARB=0.0112835;OID=.;OPOS=86807542;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:69:71:62:62:37:25:25:44:37:25:27:44 chr15 86807840 . GCCT GCT,GCCC 248.24 PASS AO=14,22;DP=59;FAO=12,33;FDP=57;FR=.;FRO=12;FSAF=0,6;FSAR=12,27;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.267592,-0.024763;FXX=0.0172384;HRUN=2,1;LEN=1,1;MLLD=15.6446,209.104;QD=17.4202;RBI=0.267954,0.0330697;REFB=-0.196108,-0.0151531;REVB=-0.0139324,0.021918;RO=9;SAF=0,2;SAR=14,20;SRF=6;SRR=3;SSEN=0.319864,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.839439,-0.491389;STB=0.998818,0.646309;TYPE=del,snp;VARB=0.28955,0.0101296;OID=.,.;OPOS=86807841,86807843;OREF=C,T;OALT=-,C;OMAPALT=GCT,GCCC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:14,22:54:12,33:57:12:0,6:12,27:7:5:25:9:0,2:14,20:6:3 chr15 86807884 . A C 345.32 PASS AO=61;DP=91;FAO=61;FDP=95;FR=.;FRO=34;FSAF=22;FSAR=39;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.00781995;FXX=0.0104156;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.4441;QD=14.5398;RBI=0.0774476;REFB=-0.0274214;REVB=-0.0770518;RO=29;SAF=22;SAR=39;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0981373;STB=0.5307;TYPE=snp;VARB=0.0103668;OID=.;OPOS=86807884;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:95:29:34:61:61:39:22:15:14:39:22:15:19 chr15 86814866 . A G 153.34 PASS AO=43;DP=106;FAO=44;FDP=108;FR=.;FRO=64;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=18;FSRR=46;FWDB=-0.015932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.7868;QD=5.67931;RBI=0.0159442;REFB=-0.0222302;REVB=-0.00062426;RO=62;SAF=21;SAR=22;SRF=18;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209704;STB=0.629575;TYPE=snp;VARB=0.0306089;OID=.;OPOS=86814866;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:108:62:64:43:44:22:21:18:44:22:22:18:46 chr15 86940622 . T C 525.78 PASS AO=102;DP=209;FAO=118;FDP=225;FR=.;FRO=107;FSAF=62;FSAR=56;FSRF=54;FSRR=53;FWDB=-0.012321;FXX=0.00442458;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.035;QD=9.34724;RBI=0.0465304;REFB=-0.0575401;REVB=0.0448695;RO=106;SAF=62;SAR=40;SRF=53;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102079;STB=0.509882;TYPE=snp;VARB=0.0490397;OID=.;OPOS=86940622;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:225:106:107:102:118:40:62:53:53:56:62:54:53 chr15 87217613 . A G 865.04 PASS AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0607267;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.621;QD=38.0236;RBI=0.0644722;REFB=0;REVB=-0.0216549;RO=0;SAF=35;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000159024;OID=.;OPOS=87217613;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:91:91:0:0:91:91:56:35:0:0:56:35:0:0 chr15 87531281 . A C 2282.17 PASS AO=233;DP=237;FAO=238;FDP=238;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=148;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.03218;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.4761;QD=38.3558;RBI=0.0327417;REFB=0;REVB=0.00603897;RO=3;SAF=89;SAR=144;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00124817;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.43193e-05;OID=.;OPOS=87531281;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:237:238:3:0:233:238:144:89:1:2:148:90:0:0 chr15 88576185 . G C 1775.44 PASS AO=170;DP=180;FAO=203;FDP=206;FR=.;FRO=3;FSAF=107;FSAR=96;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.085224;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=33.0429;QD=34.4745;RBI=0.182433;REFB=-0.102773;REVB=0.161303;RO=9;SAF=93;SAR=77;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.031208;STB=0.502829;TYPE=snp;VARB=0.0120712;OID=.;OPOS=88576185;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:180:206:9:3:170:203:77:93:2:7:96:107:1:2 chr15 88671982 . A G 66.53 PASS AO=25;DP=79;FAO=25;FDP=79;FR=.;FRO=54;FSAF=4;FSAR=21;FSRF=32;FSRR=22;FWDB=-0.00930529;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.219;QD=3.36849;RBI=0.011573;REFB=0.00917662;REVB=-0.00688085;RO=54;SAF=4;SAR=21;SRF=32;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.530722;STB=0.814389;TYPE=snp;VARB=-0.0218161;OID=.;OPOS=88671982;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:79:79:54:54:25:25:21:4:32:22:21:4:32:22 chr15 88679785 . G A 1891.1 PASS AO=196;DP=197;FAO=200;FDP=200;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0330777;FXX=0.00497488;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.463;QD=37.822;RBI=0.049201;REFB=-0.060281;REVB=0.0364226;RO=0;SAF=93;SAR=103;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000614889;OID=.;OPOS=88679785;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:197:200:0:0:196:200:103:93:0:0:107:93:0:0 chr15 89169703 . C G 187.75 PASS AO=35;DP=60;FAO=35;FDP=60;FR=.;FRO=25;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=6;FWDB=-0.00461161;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.927;QD=12.5165;RBI=0.094169;REFB=-0.0513085;REVB=-0.094056;RO=23;SAF=24;SAR=11;SRF=17;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0456658;STB=0.536869;TYPE=snp;VARB=0.0410445;OID=.;OPOS=89169703;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:60:60:23:25:35:35:11:24:17:6:11:24:19:6 chr15 89169858 . A G 341.76 PASS AO=39;DP=41;FAO=39;FDP=41;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0092323;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.195;QD=33.3424;RBI=0.00960494;REFB=-0.00252387;REVB=-0.00264944;RO=2;SAF=23;SAR=16;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00845566;STB=0.504514;TYPE=snp;VARB=0.000159166;OID=.;OPOS=89169858;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:41:41:2:2:39:39:16:23:1:1:16:23:1:1 chr15 89172558 . G C 454.9 PASS AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.023;QD=37.9085;RBI=0.0230485;REFB=0;REVB=-0.011264;RO=0;SAF=20;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.56477e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.79738e-05;OID=.;OPOS=89172558;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:48:48:0:0:48:48:28:20:0:0:28:20:0:0 chr15 89173657 . A T 482.16 PASS AO=38;DP=54;FAO=48;FDP=54;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=34;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0214008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.407;QD=35.7152;RBI=0.0613627;REFB=0;REVB=0.0575099;RO=0;SAF=34;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00244488;OID=.;OPOS=89173657;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:54:54:0:0:38:48:4:34:0:0:14:34:0:0 chr15 89173732 . T C 953.04 PASS AO=97;DP=97;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00313988;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5521;QD=38.5068;RBI=0.0568382;REFB=0;REVB=-0.0567515;RO=0;SAF=42;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000459782;OID=.;OPOS=89173732;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:97:99:0:0:97:99:55:42:0:0:55:44:0:0 chr15 89174748 . G C 1224.09 PASS AO=138;DP=142;FAO=137;FDP=141;FR=.;FRO=4;FSAF=74;FSAR=63;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0376779;FXX=0.00704176;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.9548;QD=34.7258;RBI=0.037708;REFB=-0.201569;REVB=0.00150583;RO=4;SAF=75;SAR=63;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0246777;STB=0.513156;TYPE=snp;VARB=0.00897664;OID=.;OPOS=89174748;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:142:141:4:4:138:137:63:75:4:0:63:74:4:0 chr15 89195178 . G C 378.82 PASS AO=87;DP=171;FAO=87;FDP=171;FR=.;FRO=84;FSAF=48;FSAR=39;FSRF=53;FSRR=31;FWDB=-0.030649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.528;QD=8.86118;RBI=0.0315516;REFB=-0.00527429;REVB=0.00749269;RO=84;SAF=48;SAR=39;SRF=53;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0722905;STB=0.539654;TYPE=snp;VARB=0.0052778;OID=.;OPOS=89195178;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:171:84:84:87:87:39:48:53:31:39:48:53:31 chr15 89195526 . A G 46.84 PASS AO=13;DP=35;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.0137887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.929;QD=5.35354;RBI=0.0532535;REFB=-0.0180477;REVB=-0.0514374;RO=22;SAF=6;SAR=7;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10609;STB=0.562406;TYPE=snp;VARB=0.0290207;OID=.;OPOS=89195526;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:35:35:22:22:13:13:7:6:8:14:7:6:8:14 chr15 89391160 . C A 746.94 PASS AO=83;DP=89;FAO=85;FDP=89;FR=.;FRO=4;FSAF=25;FSAR=60;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.00738564;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=195.612;QD=33.5704;RBI=0.0138485;REFB=-0.0950953;REVB=-0.0117146;RO=1;SAF=25;SAR=58;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00809714;STB=0.511038;TYPE=snp;VARB=0.00011867;OID=.;OPOS=89391160;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:89:89:1:4:83:85:58:25:0:1:60:25:2:2 chr15 89392745 . T C 1203.6 PASS AO=106;DP=106;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0202465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.2609;QD=38.2096;RBI=0.0215487;REFB=0;REVB=0.00737758;RO=0;SAF=30;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.59566e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000167847;OID=.;OPOS=89392745;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:106:126:0:0:106:126:76:30:0:0:94:32:0:0 chr15 89398105 . C T 484.2 PASS AO=54;DP=56;FAO=54;FDP=56;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00361991;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=151.236;QD=34.5854;RBI=0.0357516;REFB=-0.183491;REVB=0.0355679;RO=0;SAF=25;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.519224;TYPE=snp;VARB=0.00158021;OID=.;OPOS=89398105;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:56:56:0:2:54:54:29:25:0:0:29:25:2:0 chr15 89398330 . G A 546.35 PASS AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00499809;FXX=0.0172384;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.19;QD=38.3407;RBI=0.0116548;REFB=0;REVB=-0.0105287;RO=0;SAF=14;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.61875e-05;OID=.;OPOS=89398330;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:58:57:0:0:57:57:43:14:0:0:43:14:0:0 chr15 89398605 . G T 654.93 PASS AO=69;DP=71;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0326902;FXX=0.028165;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.02;QD=37.9668;RBI=0.0472755;REFB=0;REVB=0.0341514;RO=0;SAF=44;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000172597;OID=.;OPOS=89398605;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:71:69:0:0:69:69:25:44:0:0:25:44:0:0 chr15 89398631 . T A 588.88 PASS AO=36;DP=67;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.015204;FXX=0.0461467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.057;QD=37.9923;RBI=0.0269949;REFB=0;REVB=0.0223062;RO=0;SAF=36;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000197368;OID=.;OPOS=89398631;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:39:62:0:0:36:62:0:36:0:0:24:38:0:0 chr15 89398767 . C T 10.39 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0985674;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.115;QD=5.93913;RBI=0.0988454;REFB=-0.00725688;REVB=-0.00740813;RO=5;SAF=1;SAR=1;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0967026;STB=0.57073;TYPE=snp;VARB=0.0329495;OID=.;OPOS=89398767;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:5:5:2:2:1:1:2:3:1:1:2:3 chr15 89400339 . A C 837.57 PASS AO=90;DP=93;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0125449;FXX=0.0322546;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.843;QD=37.2252;RBI=0.0183735;REFB=0.0387189;REVB=0.0134243;RO=1;SAF=29;SAR=61;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0077077;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.60175e-05;OID=.;OPOS=89400339;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:93:90:1:0:90:90:61:29:0:1:61:29:0:0 chr15 89401109 . A G 2779.92 PASS AO=287;DP=288;FAO=290;FDP=290;FR=.;FRO=0;FSAF=138;FSAR=152;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0212044;FXX=0.00343631;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.481;QD=38.3438;RBI=0.0230514;REFB=0;REVB=0.00904113;RO=0;SAF=138;SAR=149;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.21541e-06;OID=.;OPOS=89401109;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:288:290:0:0:287:290:149:138:0:0:152:138:0:0 chr15 89401615 . T G 566.39 PASS AO=57;DP=57;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00467917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.42;QD=38.3994;RBI=0.0198928;REFB=0;REVB=-0.0193346;RO=0;SAF=37;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.81978e-05;OID=.;OPOS=89401615;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:57:59:0:0:57:59:20:37:0:0:20:39:0:0 chr15 89402051 . A G 270.1 PASS AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00806239;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.041;QD=38.5862;RBI=0.0211094;REFB=0;REVB=0.0195091;RO=0;SAF=14;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.3197e-05;OID=.;OPOS=89402051;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:29:28:0:0:28:28:14:14:0:0:14:14:0:0 chr15 89402239 . T C 712.1 PASS AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0715241;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.559;QD=37.9787;RBI=0.0715892;REFB=0;REVB=0.00305146;RO=0;SAF=24;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000183175;OID=.;OPOS=89402239;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:75:75:0:0:75:75:51:24:0:0:51:24:0:0 chr15 89402596 . T G 1251.4 PASS AO=133;DP=135;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0032474;FXX=0.0218962;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.19;QD=37.3551;RBI=0.0440565;REFB=-0.00783988;REVB=0.0439367;RO=2;SAF=31;SAR=102;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104466;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.7991e-05;OID=.;OPOS=89402596;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:135:134:2:0:133:134:102:31:1:1:103:31:0:0 chr15 89430562 . GGGC G,GG,GGG 195.19 PASS AO=6,4,4;DP=22;FAO=4,21,0;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=0,8,0;FSAR=4,13,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.166234,0.151586,-0.189506;FXX=0.0384468;HRUN=4,4,4;LEN=3,2,1;MLLD=18.304,24.0844,12.0189;QD=31.2305;RBI=0.185817,0.164405,0.655224;REFB=0,0,0;REVB=-0.0830295,0.0636453,0.627221;RO=4;SAF=0,4,4;SAR=6,0,0;SRF=0;SRR=4;SSEN=0.43408,0.43408,0;SSEP=0,0,0.450091;SSSB=0,0.794086,0.794086;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=del,del,del;VARB=0.0295711,-0.0236354,0;OID=.,.,.;OPOS=89430563,89430564,89430565;OREF=GGC,GC,C;OALT=-,-,-;OMAPALT=G,GG,GGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:6,4,4:20:4,21,0:25:0:0,8,0:4,13,0:0:0:4:4:0,4,4:6,0,0:0:4 chr15 89436244 . T C 471.77 PASS AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00294875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.0782;QD=38.5119;RBI=0.00820444;REFB=0;REVB=0.00765622;RO=0;SAF=31;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58521e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000118233;OID=.;OPOS=89436244;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:49:49:0:0:49:49:18:31:0:0:18:31:0:0 chr15 89450546 . C T 627.7 PASS AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0555364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.907;QD=38.0426;RBI=0.0702505;REFB=0;REVB=0.0430214;RO=0;SAF=23;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000268998;OID=.;OPOS=89450546;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:66:66:0:0:66:66:43:23:0:0:43:23:0:0 chr15 89450587 . G T 435.34 PASS AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122286;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.778;QD=37.8552;RBI=0.0233603;REFB=0;REVB=0.0199038;RO=0;SAF=11;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31358e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000139256;OID=.;OPOS=89450587;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:46:46:0:0:46:46:35:11:0:0:35:11:0:0 chr15 89739259 . G C 733.52 PASS AO=79;DP=81;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=61;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00723486;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.1893;QD=36.6762;RBI=0.0179038;REFB=-0.0432438;REVB=-0.0163769;RO=1;SAF=61;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00769888;STB=0.504064;TYPE=snp;VARB=-0.000219916;OID=.;OPOS=89739259;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:81:80:1:1:79:79:18:61:1:0:18:61:1:0 chr15 89740616 . G A 2173.98 PASS AO=221;DP=228;FAO=228;FDP=228;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=149;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019729;FXX=0.0129865;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.8048;QD=38.1399;RBI=0.0221185;REFB=0;REVB=0.00999964;RO=0;SAF=78;SAR=143;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.79896e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00106527;OID=.;OPOS=89740616;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:228:228:0:0:221:228:143:78:0:0:149:79:0:0 chr15 89744476 . G T 3374.43 PASS AO=339;DP=340;FAO=356;FDP=356;FR=.;FRO=0;FSAF=193;FSAR=163;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.107083;FXX=0.00835631;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.425;QD=37.915;RBI=0.110855;REFB=0;REVB=0.0286742;RO=0;SAF=175;SAR=164;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.41392e-05;OID=.;OPOS=89744476;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:340:356:0:0:339:356:164:175:0:0:163:193:0:0 chr15 89803950 . C T 345.27 PASS AO=90;DP=198;FAO=90;FDP=198;FR=.;FRO=108;FSAF=64;FSAR=26;FSRF=66;FSRR=42;FWDB=0.0327301;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=192.247;QD=6.97523;RBI=0.0343344;REFB=-0.0150556;REVB=-0.0103725;RO=102;SAF=64;SAR=26;SRF=60;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134055;STB=0.562841;TYPE=snp;VARB=0.0223267;OID=.;OPOS=89803950;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:198:102:108:90:90:26:64:60:42:26:64:66:42 chr15 89838236 . G A 1996.24 PASS AO=191;DP=193;FAO=210;FDP=210;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00853207;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.1861;QD=38.0237;RBI=0.0498001;REFB=0;REVB=0.0490638;RO=1;SAF=92;SAR=99;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00514804;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00205351;OID=.;OPOS=89838236;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:94:193:210:1:0:191:210:99:92:1:0:115:95:0:0 chr15 89878362 . GTC G,GT 197.62 PASS AO=46,23;DP=166;FAO=0,72;FDP=146;FR=.;FRO=74;FSAF=0,49;FSAR=0,23;FSRF=57;FSRR=17;FWDB=-0.20695,-0.0478102;FXX=0.0135126;HRUN=1,2;LEN=2,1;MLLD=36.0901,12.1063;QD=5.41413;RBI=0.22932,0.0518569;REFB=-0.00536345,-0.162213;REVB=-0.0987874,-0.0200829;RO=58;SAF=46,6;SAR=0,17;SRF=43;SRR=15;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.82911,-0.534683;STB=0.5,0.554329;TYPE=del,del;VARB=0,0.170966;OID=.,.;OPOS=89878363,89878364;OREF=TC,C;OALT=-,-;OMAPALT=G,GT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:46,23:145:0,72:146:74:0,49:0,23:57:17:99:58:46,6:0,17:43:15 chr15 89878377 . A T 2118.42 PASS AO=222;DP=224;FAO=223;FDP=223;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=133;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0334361;FXX=0.00888849;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.313;QD=37.9986;RBI=0.0365447;REFB=-0.0943731;REVB=-0.0147492;RO=0;SAF=90;SAR=132;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.56696e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000222079;OID=.;OPOS=89878377;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:92:224:223:0:0:222:223:132:90:0:0:133:90:0:0 chr15 90126121 . C T 255.66 PASS AO=66;DP=148;FAO=66;FDP=147;FR=.;FRO=81;FSAF=34;FSAR=32;FSRF=31;FSRR=50;FWDB=0.0023774;FXX=0.0067563;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.49;QD=6.95672;RBI=0.00969931;REFB=0.000460867;REVB=-0.00940344;RO=81;SAF=34;SAR=32;SRF=31;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130827;STB=0.572698;TYPE=snp;VARB=-0.000232209;OID=.;OPOS=90126121;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:147:81:81:66:66:32:34:31:50:32:34:31:50 chr15 90128966 . C T 318.49 PASS AO=94;DP=230;FAO=94;FDP=229;FR=.;FRO=135;FSAF=41;FSAR=53;FSRF=51;FSRR=84;FWDB=-0.0110526;FXX=0.00434764;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.852;QD=5.56319;RBI=0.0694317;REFB=-0.00833166;REVB=-0.0685463;RO=130;SAF=41;SAR=53;SRF=46;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.088255;STB=0.535302;TYPE=snp;VARB=0.00937662;OID=.;OPOS=90128966;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:230:229:130:135:94:94:53:41:46:84:53:41:51:84 chr15 90138670 . C T 2063.11 PASS AO=221;DP=224;FAO=221;FDP=221;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=130;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0202604;FXX=0.0133923;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.578;QD=37.3414;RBI=0.0205;REFB=-0.0530266;REVB=-0.0031245;RO=3;SAF=91;SAR=130;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154453;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.42666e-05;OID=.;OPOS=90138670;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:224:221:3:0:221:221:130:91:3:0:130:91:0:0 chr15 90168108 . C T 952.23 PASS AO=102;DP=103;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0478825;FXX=0.0097078;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.618;QD=37.3423;RBI=0.0591967;REFB=-0.0480877;REVB=0.0348068;RO=0;SAF=32;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.67392e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000625343;OID=.;OPOS=90168108;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:103:102:0:0:102:102:70:32:0:0:70:32:0:0 chr15 90168693 . T A 111.67 PASS AO=29;DP=67;FAO=29;FDP=67;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.011115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.021;QD=6.66698;RBI=0.0116329;REFB=-0.0152861;REVB=0.00343229;RO=38;SAF=15;SAR=14;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00910152;STB=0.505151;TYPE=snp;VARB=0.0246489;OID=.;OPOS=90168693;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:38:38:29:29:14:15:20:18:14:15:20:18 chr15 90170237 . C T 257.73 PASS AO=74;DP=177;FAO=74;FDP=177;FR=.;FRO=103;FSAF=28;FSAR=46;FSRF=65;FSRR=38;FWDB=-0.0194157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.461;QD=5.82443;RBI=0.019417;REFB=-0.00264705;REVB=0.000223528;RO=103;SAF=28;SAR=46;SRF=65;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.259835;STB=0.64521;TYPE=snp;VARB=0.002206;OID=.;OPOS=90170237;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:177:103:103:74:74:46:28:65:38:46:28:65:38 chr15 90174789 . C T 173.09 PASS AO=36;DP=67;FAO=36;FDP=67;FR=.;FRO=31;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.0546704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.7258;QD=10.334;RBI=0.0547518;REFB=-0.0173626;REVB=0.00298386;RO=31;SAF=20;SAR=16;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0212984;STB=0.511778;TYPE=snp;VARB=0.0187544;OID=.;OPOS=90174789;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:31:31:36:36:16:20:18:13:16:20:18:13 chr15 90174824 . C T 130.56 PASS AO=29;DP=60;FAO=29;FDP=59;FR=.;FRO=30;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=0.00449689;FXX=0.0166639;HRUN=4;LEN=1;MLLD=108.623;QD=8.85141;RBI=0.0102431;REFB=-0.0347276;REVB=0.00920316;RO=29;SAF=19;SAR=10;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0665225;STB=0.530436;TYPE=snp;VARB=0.0385734;OID=.;OPOS=90174824;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:59:29:30:29:29:10:19:17:12:10:19:18:12 chr15 90176073 . C A 170.18 PASS AO=39;DP=80;FAO=39;FDP=80;FR=.;FRO=41;FSAF=12;FSAR=27;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=0.0168172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.577;QD=8.50884;RBI=0.0194761;REFB=-0.00195784;REVB=0.00982339;RO=41;SAF=12;SAR=27;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133192;STB=0.574428;TYPE=snp;VARB=0.00171474;OID=.;OPOS=90176073;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:41:41:39:39:27:12:18:23:27:12:18:23 chr15 90176432 . T G 744.03 PASS AO=68;DP=69;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0555117;FXX=0.0249969;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.734;QD=38.1552;RBI=0.058989;REFB=0;REVB=0.0199536;RO=0;SAF=42;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000267164;OID=.;OPOS=90176432;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:69:78:0:0:68:78:26:42:0:0:29:49:0:0 chr15 90188392 . A T 247.09 PASS AO=46;DP=76;FAO=46;FDP=76;FR=.;FRO=30;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=-0.00180825;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.567;QD=13.005;RBI=0.0236728;REFB=-0.0150416;REVB=0.0236036;RO=30;SAF=20;SAR=26;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119375;STB=0.565189;TYPE=snp;VARB=0.0103723;OID=.;OPOS=90188392;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:30:30:46:46:26:20:18:12:26:20:18:12 chr15 90191827 . T C 61.38 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.142197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.3871;QD=35.0729;RBI=0.166659;REFB=0;REVB=0.0869209;RO=0;SAF=5;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.27427e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0169016;OID=.;OPOS=90191827;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:2:5:0:0:2:5:0:0 chr15 90195967 . C G 760.82 PASS AO=85;DP=87;FAO=86;FDP=87;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.129682;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=68.1196;QD=34.98;RBI=0.130236;REFB=-0.111621;REVB=-0.0119944;RO=1;SAF=35;SAR=50;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133422;STB=0.504949;TYPE=snp;VARB=0.00761384;OID=.;OPOS=90195967;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:87:87:1:1:85:86:50:35:1:0:50:36:0:1 chr15 90196008 . C T 254.78 PASS AO=42;DP=69;FAO=44;FDP=69;FR=.;FRO=25;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=0.000885615;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.566;QD=14.7699;RBI=0.00344939;REFB=-0.0144105;REVB=-0.00333376;RO=25;SAF=15;SAR=27;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0279108;STB=0.525639;TYPE=snp;VARB=0.013853;OID=.;OPOS=90196008;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:69:69:25:25:42:44:27:15:8:17:27:17:8:17 chr15 90213229 . G C 447.29 PASS AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00886526;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.65;QD=38.0671;RBI=0.0413262;REFB=0;REVB=-0.0403642;RO=0;SAF=28;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000133593;OID=.;OPOS=90213229;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:47:47:0:0:47:47:19:28:0:0:19:28:0:0 chr15 90226947 . C A 371.81 PASS AO=101;DP=232;FAO=102;FDP=233;FR=.;FRO=131;FSAF=51;FSAR=51;FSRF=49;FSRR=82;FWDB=-0.00662448;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9739;QD=6.383;RBI=0.0186071;REFB=0.0112015;REVB=-0.0173879;RO=131;SAF=51;SAR=50;SRF=49;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132972;STB=0.570802;TYPE=snp;VARB=-0.0173908;OID=.;OPOS=90226947;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:233:131:131:101:102:50:51:49:82:51:51:49:82 chr15 90245174 . T A 239.54 PASS AO=65;DP=150;FAO=65;FDP=150;FR=.;FRO=85;FSAF=15;FSAR=50;FSRF=35;FSRR=50;FWDB=0.00507883;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.2544;QD=6.38767;RBI=0.00682176;REFB=0.0119704;REVB=0.00455433;RO=85;SAF=15;SAR=50;SRF=35;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22178;STB=0.624958;TYPE=snp;VARB=-0.0134128;OID=.;OPOS=90245174;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:150:85:85:65:65:50:15:35:50:50:15:35:50 chr15 90245253 . C T 76.38 PASS AO=22;DP=57;FAO=22;FDP=57;FR=.;FRO=35;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=0.00890037;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.684;QD=5.36024;RBI=0.0199447;REFB=-0.00194501;REVB=0.0178486;RO=35;SAF=7;SAR=15;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0298307;STB=0.517226;TYPE=snp;VARB=0.00417145;OID=.;OPOS=90245253;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:57:57:35:35:22:22:15:7:12:23:15:7:12:23 chr15 90246336 . A G 288.94 PASS AO=61;DP=120;FAO=64;FDP=123;FR=.;FRO=59;FSAF=18;FSAR=46;FSRF=32;FSRR=27;FWDB=0.00105061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.021;QD=9.39644;RBI=0.00150627;REFB=-0.0158497;REVB=-0.00107938;RO=58;SAF=17;SAR=44;SRF=31;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246229;STB=0.636369;TYPE=snp;VARB=0.0161112;OID=.;OPOS=90246336;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:123:58:59:61:64:44:17:31:27:46:18:32:27 chr15 90248819 . A T 968.84 PASS AO=103;DP=103;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0417066;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.0547;QD=37.9939;RBI=0.0428655;REFB=0;REVB=0.00990033;RO=0;SAF=35;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.39991e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000136403;OID=.;OPOS=90248819;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:103:102:0:0:103:102:68:35:0:0:67:35:0:0 chr15 90260145 . T A 224.11 PASS AO=49;DP=94;FAO=49;FDP=94;FR=.;FRO=45;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=16;FSRR=29;FWDB=-0.0315531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9226;QD=9.53663;RBI=0.0346583;REFB=-0.0145338;REVB=-0.0143387;RO=43;SAF=22;SAR=27;SRF=15;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0868365;STB=0.545597;TYPE=snp;VARB=0.0128444;OID=.;OPOS=90260145;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:43:45:49:49:27:22:15:28:27:22:16:29 chr15 90309135 . A G 143.4 PASS AO=17;DP=41;FAO=24;FDP=40;FR=.,HEALED;FRO=15;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.00440872;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.402;QD=14.3398;RBI=0.048393;REFB=-0.0632055;REVB=0.0481918;RO=15;SAF=13;SAR=4;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.227543;STB=0.503223;TYPE=snp;VARB=0.0542632;OID=.;OPOS=90309135;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:41:40:15:15:17:24:4:13:8:7:11:13:8:7 chr15 90321377 . C T 33.95 PASS AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.31;QD=19.4;RBI=0.109149;REFB=-0.173038;REVB=0.109149;RO=1;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0584611;OID=.;OPOS=90321377;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:6:7:1:2:5:5:5:0:0:1:5:0:0:2 chr15 90334240 . A G 574.25 PASS AO=128;DP=244;FAO=128;FDP=244;FR=.;FRO=116;FSAF=74;FSAR=54;FSRF=61;FSRR=55;FWDB=0.0334792;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.007;QD=9.41394;RBI=0.0337522;REFB=-0.00972152;REVB=0.00428413;RO=116;SAF=74;SAR=54;SRF=61;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0462107;STB=0.525263;TYPE=snp;VARB=0.00867546;OID=.;OPOS=90334240;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:244:116:116:128:128:54:74:61:55:54:74:61:55 chr15 90335534 . G A 75.29 PASS AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=5;FWDB=0.0342404;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.9784;QD=7.34563;RBI=0.0796165;REFB=0.00973235;REVB=0.0718776;RO=22;SAF=8;SAR=10;SRF=17;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.310326;STB=0.684026;TYPE=snp;VARB=-0.00553479;OID=.;OPOS=90335534;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:40:41:22:23:18:18:10:8:17:5:10:8:18:5 chr15 90335788 . C T 65.51 PASS AO=20;DP=55;FAO=20;FDP=55;FR=.;FRO=35;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.0287603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.819;QD=4.76448;RBI=0.0399442;REFB=-0.00613967;REVB=-0.0277198;RO=35;SAF=7;SAR=13;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153652;STB=0.5897;TYPE=snp;VARB=0.0120908;OID=.;OPOS=90335788;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:55:55:35:35:20:20:13:7:17:18:13:7:17:18 chr15 90346861 . C T 116.27 PASS AO=23;DP=42;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=19;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=4;FWDB=0.0328942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.432;QD=11.0732;RBI=0.0408449;REFB=-0.0208847;REVB=-0.0242132;RO=19;SAF=19;SAR=4;SRF=15;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0495374;STB=0.527753;TYPE=snp;VARB=0.0170681;OID=.;OPOS=90346861;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:42:42:19:19:23:23:4:19:15:4:4:19:15:4 chr15 90347793 . AG A 255.68 PASS AO=41;DP=63;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.092322;FXX=0.0172384;HRUN=3;LEN=1;MLLD=10.5979;QD=17.9424;RBI=0.204019;REFB=-0.0137869;REVB=0.181935;RO=21;SAF=16;SAR=25;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0.299652;SSSB=0.102218;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0131394;OID=.;OPOS=90347794;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:41:64:57:57:0:18:39:0:0:22:21:16:25:5:16 chr15 90349558 . C T 328.34 PASS AO=78;DP=160;FAO=78;FDP=160;FR=.;FRO=82;FSAF=37;FSAR=41;FSRF=36;FSRR=46;FWDB=-0.0139344;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=128.857;QD=8.20855;RBI=0.0182777;REFB=-0.015825;REVB=0.0118283;RO=81;SAF=37;SAR=41;SRF=36;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0277523;STB=0.518186;TYPE=snp;VARB=0.0151205;OID=.;OPOS=90349558;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:160:81:82:78:78:41:37:36:45:41:37:36:46 chr15 90623052 . T C 119.86 PASS AO=29;DP=63;FAO=29;FDP=63;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=11;FWDB=-0.038888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.063;QD=7.6101;RBI=0.0390166;REFB=-0.0118873;REVB=-0.00316519;RO=34;SAF=12;SAR=17;SRF=23;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247827;STB=0.639005;TYPE=snp;VARB=0.0066268;OID=.;OPOS=90623052;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:34:34:29:29:17:12:23:11:17:12:23:11 chr15 90673809 . G C 627.7 PASS AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0103025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.971;QD=38.0426;RBI=0.0103508;REFB=0;REVB=0.000998918;RO=0;SAF=42;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.1333e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.75126e-05;OID=.;OPOS=90673809;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:66:66:0:0:66:66:24:42:0:0:24:42:0:0 chr15 90709545 . G A 1438.21 PASS AO=154;DP=156;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0129625;FXX=0.00640985;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.452;QD=37.115;RBI=0.016016;REFB=-0.0674703;REVB=-0.00940662;RO=1;SAF=84;SAR=70;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00674752;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00068536;OID=.;OPOS=90709545;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:156:155:1:0:154:155:70:84:0:1:71:84:0:0 chr15 90760991 . T C 304.78 PASS AO=63;DP=113;FAO=63;FDP=114;FR=.;FRO=51;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=14;FSRR=37;FWDB=0.00952567;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.254;QD=10.6939;RBI=0.0248031;REFB=0.000829807;REVB=-0.0229009;RO=49;SAF=30;SAR=33;SRF=14;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154434;STB=0.591188;TYPE=snp;VARB=-0.000781561;OID=.;OPOS=90760991;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:114:49:51:63:63:33:30:14:35:33:30:14:37 chr15 90768271 . C T 107.82 PASS AO=26;DP=59;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.09962;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.6747;QD=7.18798;RBI=0.0996323;REFB=0.00560271;REVB=0.00157004;RO=33;SAF=16;SAR=10;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0713967;STB=0.548351;TYPE=snp;VARB=-0.00345055;OID=.;OPOS=90768271;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:60:33:33:26:27:10:16:18:15:10:17:18:15 chr15 90771750 . T G 35.48 PASS AO=13;DP=39;FAO=13;FDP=40;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=1;FSRF=20;FSRR=7;FWDB=0.0223742;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.406;QD=3.54791;RBI=0.0234221;REFB=-0.0152547;REVB=-0.00692738;RO=23;SAF=12;SAR=1;SRF=18;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.332722;STB=0.7495;TYPE=snp;VARB=0.0274233;OID=.;OPOS=90771750;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:39:40:23:27:13:13:1:12:18:5:1:12:20:7 chr15 90772156 . A G 82.29 PASS AO=33;DP=106;FAO=33;FDP=106;FR=.;FRO=73;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=36;FSRR=37;FWDB=-0.0152132;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=305.447;QD=3.10539;RBI=0.0155837;REFB=-0.000806603;REVB=-0.00337826;RO=73;SAF=18;SAR=15;SRF=36;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0616341;STB=0.536061;TYPE=snp;VARB=0.00204802;OID=.;OPOS=90772156;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:106:106:73:73:33:33:15:18:36:37:15:18:36:37 chr15 90772831 . C T 175.42 PASS AO=47;DP=110;FAO=47;FDP=109;FR=.;FRO=62;FSAF=13;FSAR=34;FSRF=22;FSRR=40;FWDB=0.0303046;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.8335;QD=6.43739;RBI=0.114378;REFB=0.00174696;REVB=0.11029;RO=62;SAF=13;SAR=34;SRF=22;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0939785;STB=0.552951;TYPE=snp;VARB=-0.000134871;OID=.;OPOS=90772831;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:109:62:62:47:47:34:13:22:40:34:13:22:40 chr15 90774447 . TAGAG T 90.76 PASS AO=22;DP=58;FAO=23;FDP=53;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=-0.0182902;FXX=0.0535619;HRUN=1;LEN=4;MLLD=257.524;QD=6.84991;RBI=0.0183439;REFB=-0.0290898;REVB=0.00140252;RO=27;SAF=7;SAR=15;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.303746;STB=0.670989;TYPE=del;VARB=0.0324851;OID=.;OPOS=90774448;OREF=AGAG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:22:54:23:53:30:7:16:18:12:90:27:7:15:17:10 chr15 90784207 . A G 2454.2 PASS AO=221;DP=225;FAO=265;FDP=265;FR=.;FRO=0;FSAF=147;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00180292;FXX=0.00375926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.483;QD=37.0446;RBI=0.054694;REFB=-0.0772214;REVB=0.0546643;RO=1;SAF=143;SAR=78;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00606923;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000392088;OID=.;OPOS=90784207;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:225:265:1:0:221:265:78:143:0:1:118:147:0:0 chr15 90784250 . T C 691.16 PASS AO=148;DP=272;FAO=148;FDP=272;FR=.;FRO=124;FSAF=83;FSAR=65;FSRF=64;FSRR=60;FWDB=-0.0119964;FXX=0.00366287;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.427;QD=10.1641;RBI=0.0149126;REFB=-0.00986702;REVB=0.00885853;RO=121;SAF=83;SAR=65;SRF=63;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0335337;STB=0.520569;TYPE=snp;VARB=0.00804764;OID=.;OPOS=90784250;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:272:272:121:124:148:148:65:83:63:58:65:83:64:60 chr15 90809633 . G A 809.93 PASS AO=87;DP=87;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00745848;FXX=0.0227247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.3372;QD=37.671;RBI=0.00882257;REFB=-0.0631174;REVB=0.00471261;RO=0;SAF=34;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000588682;OID=.;OPOS=90809633;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:87:86:0:0:87:86:53:34:0:0:52:34:0:0 chr15 90819641 . A C 507.9 PASS AO=104;DP=185;FAO=104;FDP=185;FR=.;FRO=81;FSAF=54;FSAR=50;FSRF=54;FSRR=27;FWDB=0.0494516;FXX=0.00537606;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.246;QD=10.9817;RBI=0.053955;REFB=-0.00804068;REVB=-0.0215796;RO=81;SAF=54;SAR=50;SRF=54;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119566;STB=0.56496;TYPE=snp;VARB=0.00861086;OID=.;OPOS=90819641;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:185:81:81:104:104:50:54:54:27:50:54:54:27 chr15 90819876 . T C 111.07 PASS AO=30;DP=72;FAO=30;FDP=72;FR=.;FRO=42;FSAF=5;FSAR=25;FSRF=8;FSRR=34;FWDB=-0.0910113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.9665;QD=6.17065;RBI=0.0910232;REFB=-0.0071236;REVB=0.00147026;RO=42;SAF=5;SAR=25;SRF=8;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0424387;STB=0.524177;TYPE=snp;VARB=0.00909062;OID=.;OPOS=90819876;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:42:42:30:30:25:5:8:34:25:5:8:34 chr15 90892293 . C T 727.69 PASS AO=165;DP=311;FAO=162;FDP=308;FR=.;FRO=146;FSAF=50;FSAR=112;FSRF=55;FSRR=91;FWDB=0.0144533;FXX=0.0128201;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.5551;QD=9.45049;RBI=0.0366437;REFB=-0.00217127;REVB=0.0336729;RO=141;SAF=54;SAR=111;SRF=49;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192969;STB=0.536737;TYPE=snp;VARB=0.0024681;OID=.;OPOS=90892293;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:311:308:141:146:165:162:111:54:49:92:112:50:55:91 chr15 90903311 . A G 79.17 PASS AO=38;DP=137;FAO=38;FDP=137;FR=.;FRO=99;FSAF=30;FSAR=8;FSRF=61;FSRR=38;FWDB=-0.0204421;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.67;QD=2.31162;RBI=0.0291873;REFB=-0.00649533;REVB=0.0208332;RO=97;SAF=30;SAR=8;SRF=59;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.26575;STB=0.654559;TYPE=snp;VARB=0.0146804;OID=.;OPOS=90903311;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:137:137:97:99:38:38:8:30:59:38:8:30:61:38 chr15 90969370 . C T 138.34 PASS AO=46;DP=126;FAO=46;FDP=126;FR=.;FRO=80;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=43;FSRR=37;FWDB=0.0171203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.641;QD=4.39183;RBI=0.0175232;REFB=-0.00356002;REVB=0.00373612;RO=80;SAF=24;SAR=22;SRF=43;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0175732;STB=0.51003;TYPE=snp;VARB=0.00937845;OID=.;OPOS=90969370;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:80:80:46:46:22:24:43:37:22:24:43:37 chr15 90969387 . A G 148.3 PASS AO=47;DP=124;FAO=47;FDP=124;FR=.;FRO=77;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=42;FSRR=35;FWDB=0.0221338;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.429;QD=4.78394;RBI=0.0390162;REFB=-0.00131927;REVB=-0.0321304;RO=77;SAF=25;SAR=22;SRF=42;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0148649;STB=0.508448;TYPE=snp;VARB=0.00186201;OID=.;OPOS=90969387;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:77:77:47:47:22:25:42:35:22:25:42:35 chr15 91083353 . G A 904.39 PASS AO=90;DP=90;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.495;QD=38.0795;RBI=0.0279865;REFB=0;REVB=0.0209263;RO=0;SAF=39;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.24868e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.94127e-05;OID=.;OPOS=91083353;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:90:95:0:0:90:95:51:39:0:0:56:39:0:0 chr15 91421457 . GGCC G,GG 133.92 PASS AO=4,8;DP=24;FAO=17,0;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=12,0;FSAR=5,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.212573,0.0749228;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=3,2;MLLD=28.6553,21.5818;QD=31.5098;RBI=0.377045,0.696286;REFB=0,0;REVB=0.311409,0.692243;RO=3;SAF=4,8;SAR=0,0;SRF=0;SRR=3;SSEN=0.5,0;SSEP=0,0.450091;SSSB=0.782218,0.819744;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.0114046,-0.0056022;OID=.,.;OPOS=91421458,91421459;OREF=GCC,CC;OALT=-,-;OMAPALT=G,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:4,8:15:17,0:17:0:12,0:5,0:0:0:12:3:4,8:0,0:0:3 chr15 91424574 . G C 1124.43 PASS AO=107;DP=216;FAO=153;FDP=185;FR=.;FRO=32;FSAF=39;FSAR=114;FSRF=29;FSRR=3;FWDB=-0.00290498;FXX=0.0703482;HRUN=3;LEN=1;MLLD=217.713;QD=24.3121;RBI=0.021125;REFB=0.00206491;REVB=0.0209243;RO=0;SAF=0;SAR=107;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.629458;TYPE=snp;VARB=-0.000496387;OID=.;OPOS=91424574;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:122:185:0:32:107:153:107:0:0:0:114:39:29:3 chr15 91428290 . C T 276.05 PASS AO=33;DP=36;FAO=33;FDP=36;FR=.;FRO=3;FSAF=28;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0500382;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.023;QD=30.672;RBI=0.0593876;REFB=-0.160002;REVB=0.0319853;RO=3;SAF=28;SAR=5;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138464;STB=0.57473;TYPE=snp;VARB=0.0044692;OID=.;OPOS=91428290;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:36:36:3:3:33:33:5:28:1:2:5:28:1:2 chr15 91428589 . T G 676.75 PASS AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.034141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.656;QD=38.6714;RBI=0.0357158;REFB=0;REVB=0.0104886;RO=0;SAF=27;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.81046e-05;OID=.;OPOS=91428589;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:70:70:0:0:70:70:43:27:0:0:43:27:0:0 chr15 91428636 . G A 530.77 PASS AO=58;DP=60;FAO=59;FDP=61;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0351215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.993;QD=34.8044;RBI=0.0876471;REFB=-0.120697;REVB=0.0803025;RO=2;SAF=23;SAR=35;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0261941;STB=0.513884;TYPE=snp;VARB=0.0019166;OID=.;OPOS=91428636;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:60:61:2:2:58:59:35:23:0:2:35:24:0:2 chr15 91430436 . T C 534.41 PASS AO=55;DP=55;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0220197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.231;QD=37.5021;RBI=0.0424047;REFB=0;REVB=0.0362394;RO=0;SAF=13;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.70796e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.94076e-05;OID=.;OPOS=91430436;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:55:57:0:0:55:57:42:13:0:0:43:14:0:0 chr15 91455453 . GC G 46.38 PASS AO=29;DP=58;FAO=25;FDP=57;FR=.;FRO=32;FSAF=3;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=0.200341;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.5184;QD=3.2549;RBI=0.241259;REFB=-0.0875468;REVB=-0.134422;RO=24;SAF=2;SAR=27;SRF=10;SRR=14;SSEN=0.30719;SSEP=0;SSSB=-0.519801;STB=0.740819;TYPE=del;VARB=0.0832862;OID=.;OPOS=91455454;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:29:56:25:57:32:3:22:13:19:46:24:2:27:10:14 chr15 91459475 . G A 96.64 PASS AO=19;DP=34;FAO=19;FDP=35;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.0222075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.37;QD=11.0449;RBI=0.0582464;REFB=-0.0328397;REVB=-0.0538467;RO=14;SAF=12;SAR=7;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00920605;STB=0.503222;TYPE=snp;VARB=0.0381654;OID=.;OPOS=91459475;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:34:35:14:16:19:19:7:12:9:5:7:12:10:6 chr15 91461545 . G A 166.97 PASS AO=44;DP=101;FAO=44;FDP=101;FR=.;FRO=57;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=23;FSRR=34;FWDB=-0.0219253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.347;QD=6.61264;RBI=0.0293824;REFB=-0.0112296;REVB=-0.0195603;RO=57;SAF=15;SAR=29;SRF=23;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0681683;STB=0.538331;TYPE=snp;VARB=0.0195943;OID=.;OPOS=91461545;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:57:57:44:44:29:15:23:34:29:15:23:34 chr15 91465224 . T C 81.56 PASS AO=24;DP=63;FAO=24;FDP=63;FR=.;FRO=39;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=-0.00403838;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.187;QD=5.17852;RBI=0.00609391;REFB=0.00470151;REVB=0.00456369;RO=39;SAF=8;SAR=16;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172838;STB=0.599914;TYPE=snp;VARB=-0.00739577;OID=.;OPOS=91465224;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:63:63:39:39:24:24:16:8:19:20:16:8:19:20 chr15 91475274 . G A 249.75 PASS AO=53;DP=100;FAO=53;FDP=100;FR=.;FRO=47;FSAF=39;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=0.00552449;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=226.74;QD=9.99011;RBI=0.0131482;REFB=0.00327932;REVB=0.0119313;RO=45;SAF=39;SAR=14;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194447;STB=0.620597;TYPE=snp;VARB=-0.00227884;OID=.;OPOS=91475274;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:45:47:53:53:14:39:24:21:14:39:24:23 chr15 91486305 . C T 151.15 PASS AO=35;DP=80;FAO=39;FDP=88;FR=.;FRO=49;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=9;FSRR=40;FWDB=0.0384091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.367;QD=6.8704;RBI=0.0389056;REFB=0.00128028;REVB=-0.00619586;RO=43;SAF=13;SAR=22;SRF=7;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237254;STB=0.612743;TYPE=snp;VARB=-0.00369407;OID=.;OPOS=91486305;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:88:43:49:35:39:22:13:7:36:25:14:9:40 chr15 91489919 . A G 158.8 PASS AO=27;DP=75;FAO=36;FDP=72;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.0434318;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.9228;QD=8.82197;RBI=0.0480938;REFB=-0.01098;REVB=-0.0206565;RO=27;SAF=10;SAR=17;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0350412;STB=0.541579;TYPE=snp;VARB=0.0134248;OID=.;OPOS=91489919;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:72:27:36:27:36:17:10:11:16:19:17:20:16 chr15 91492877 . C T 96.39 PASS AO=22;DP=46;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.00567198;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=202.02;QD=8.38152;RBI=0.0144574;REFB=-0.0050383;REVB=0.0132983;RO=24;SAF=13;SAR=9;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19783;STB=0.611664;TYPE=snp;VARB=0.00355462;OID=.;OPOS=91492877;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:46:46:24:24:22:22:9:13:9:15:9:13:9:15 chr15 91513674 . T C 241.3 PASS AO=59;DP=136;FAO=62;FDP=137;FR=.;FRO=75;FSAF=23;FSAR=39;FSRF=37;FSRR=38;FWDB=0.0205644;FXX=0.021427;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.103;QD=7.04531;RBI=0.0270172;REFB=-0.0330128;REVB=-0.0175224;RO=74;SAF=20;SAR=39;SRF=36;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154478;STB=0.569182;TYPE=snp;VARB=0.0299489;OID=.;OPOS=91513674;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:137:74:75:59:62:39:20:36:38:39:23:37:38 chr15 91524841 . G T 2145.42 PASS AO=224;DP=227;FAO=228;FDP=228;FR=.;FRO=0;FSAF=114;FSAR=114;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00637089;FXX=0.0129865;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.272;QD=37.639;RBI=0.00873289;REFB=0;REVB=0.00597287;RO=1;SAF=116;SAR=108;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00439171;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000160175;OID=.;OPOS=91524841;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:227:228:1:0:224:228:108:116:0:1:114:114:0:0 chr15 91525197 . C T 145.27 PASS AO=46;DP=125;FAO=47;FDP=126;FR=.;FRO=79;FSAF=17;FSAR=30;FSRF=32;FSRR=47;FWDB=0.0336992;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.358;QD=4.61186;RBI=0.0372012;REFB=-0.00356944;REVB=-0.0157572;RO=76;SAF=16;SAR=30;SRF=29;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0400917;STB=0.528955;TYPE=snp;VARB=0.00696841;OID=.;OPOS=91525197;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:126:76:79:46:47:30:16:29:47:30:17:32:47 chr15 91543761 . C T 315.8 PASS AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00639179;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.946;QD=35.0889;RBI=0.0144591;REFB=0.0816035;REVB=0.0129696;RO=1;SAF=12;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199081;STB=0.510632;TYPE=snp;VARB=-0.00103027;OID=.;OPOS=91543761;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:36:36:1:1:35:35:23:12:0:1:23:12:0:1 chr15 91557674 . GAA G 78.03 PASS AO=13;DP=56;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.0314296;FXX=0.119976;HRUN=3;LEN=2;MLLD=31.3637;QD=7.09373;RBI=0.047546;REFB=0.021112;REVB=-0.0356763;RO=14;SAF=6;SAR=7;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0954316;STB=0.589315;TYPE=del;VARB=-0.0204057;OID=.;OPOS=91557675;OREF=AA;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:13:39:23:44:21:12:11:7:14:61:14:6:7:5:9 chr15 91561061 . G T 116.63 PASS AO=27;DP=57;FAO=27;FDP=57;FR=.;FRO=30;FSAF=21;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=0.0250431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.95;QD=8.18486;RBI=0.0258818;REFB=-0.00831838;REVB=0.00653553;RO=30;SAF=21;SAR=6;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207031;STB=0.617552;TYPE=snp;VARB=0.0121344;OID=.;OPOS=91561061;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:30:30:27:27:6:21:18:12:6:21:18:12 chr15 91825027 . C T 446.9 PASS AO=84;DP=140;FAO=85;FDP=142;FR=.;FRO=57;FSAF=24;FSAR=61;FSRF=17;FSRR=40;FWDB=-0.00301525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.339;QD=12.5886;RBI=0.0089024;REFB=-0.0257546;REVB=0.00837622;RO=55;SAF=24;SAR=60;SRF=16;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.004631;STB=0.507815;TYPE=snp;VARB=0.0134061;OID=.;OPOS=91825027;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:142:55:57:84:85:60:24:16:39:61:24:17:40 chr15 91827264 . C T 279.82 PASS AO=78;DP=183;FAO=78;FDP=182;FR=.;FRO=104;FSAF=45;FSAR=33;FSRF=59;FSRR=45;FWDB=0.00541806;FXX=0.00546418;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.442;QD=6.14979;RBI=0.0112762;REFB=-0.00873689;REVB=-0.00988931;RO=104;SAF=45;SAR=33;SRF=59;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0100614;STB=0.505617;TYPE=snp;VARB=0.00942529;OID=.;OPOS=91827264;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:182:104:104:78:78:33:45:59:45:33:45:59:45 chr15 91836683 . T C 2123.19 PASS AO=221;DP=221;FAO=222;FDP=222;FR=.;FRO=0;FSAF=106;FSAR=116;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0114506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.2;QD=38.2557;RBI=0.0618317;REFB=0;REVB=0.0607622;RO=0;SAF=105;SAR=116;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.47895e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.71108e-05;OID=.;OPOS=91836683;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:221:222:0:0:221:222:116:105:0:0:116:106:0:0 chr15 92638193 . G A 656.78 PASS AO=154;DP=299;FAO=156;FDP=307;FR=.;FRO=151;FSAF=82;FSAR=74;FSRF=81;FSRR=70;FWDB=0.0130372;FXX=0.00324665;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.699;QD=8.55737;RBI=0.0144625;REFB=-0.0327797;REVB=-0.00626077;RO=145;SAF=79;SAR=75;SRF=75;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00377618;STB=0.50532;TYPE=snp;VARB=0.0319675;OID=.;OPOS=92638193;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:299:307:145:151:154:156:75:79:75:70:74:82:81:70 chr15 92647645 . G C 67.3 PASS AO=21;DP=62;FAO=22;FDP=63;FR=.;FRO=41;FSAF=2;FSAR=20;FSRF=3;FSRR=38;FWDB=-0.00496838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.779;QD=4.27278;RBI=0.0121673;REFB=-0.00752872;REVB=-0.0111067;RO=39;SAF=2;SAR=19;SRF=2;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167947;STB=0.537005;TYPE=snp;VARB=0.00856181;OID=.;OPOS=92647645;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:62:63:39:41:21:22:19:2:2:37:20:2:3:38 chr15 93015427 . G A 296.67 PASS AO=65;DP=126;FAO=65;FDP=124;FR=.;FRO=59;FSAF=39;FSAR=26;FSRF=39;FSRR=20;FWDB=0.0232121;FXX=0.0158718;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.6371;QD=9.56989;RBI=0.0253252;REFB=-0.00288637;REVB=-0.0101273;RO=59;SAF=39;SAR=26;SRF=39;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0557765;STB=0.530603;TYPE=snp;VARB=0.00168702;OID=.;OPOS=93015427;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:124:59:59:65:65:26:39:39:20:26:39:39:20 chr15 93198671 . A G 116.17 PASS AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0460504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.3249;QD=35.7446;RBI=0.0479064;REFB=0;REVB=-0.0132054;RO=0;SAF=1;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.00075e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00139859;OID=.;OPOS=93198671;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:13:0:0:13:13:12:1:0:0:12:1:0:0 chr15 93198678 . TTGGAGCTGGA TTGGA,TTGGAGCTGCC 96.27 PASS AO=5,5;DP=13;FAO=6,4;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=1,0;FSAR=5,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0985069,0.0985069;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=6,2;MLLD=242.243,106.766;QD=38.5073;RBI=0.0992235,0.100999;REFB=0,0;REVB=0.0119034,0.0222978;RO=0;SAF=0,1;SAR=5,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,mnp;VARB=0.0136295,0.0494526;OID=.,.;OPOS=93198679,93198687;OREF=TGGAGC,GA;OALT=-,CC;OMAPALT=TTGGA,TTGGAGCTGCC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:5,5:10:6,4:10:0:1,0:5,4:0:0:22:0:0,1:5,4:0:0 chr15 93198697 . T C 13.43 PASS AO=3;DP=11;FAO=3;FDP=11;FR=.;FRO=8;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.054;QD=4.88264;RBI=0.0166162;REFB=-0.0518521;REVB=0.0166162;RO=8;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.048971;OID=.;OPOS=93198697;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:11:11:8:8:3:3:3:0:0:8:3:0:0:8 chr15 93510603 . A G 349.88 PASS AO=80;DP=158;FAO=80;FDP=158;FR=.;FRO=78;FSAF=38;FSAR=42;FSRF=35;FSRR=43;FWDB=-0.00455193;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=199.048;QD=8.85758;RBI=0.016613;REFB=-0.0101928;REVB=-0.0159773;RO=78;SAF=38;SAR=42;SRF=35;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0236848;STB=0.513021;TYPE=snp;VARB=0.010624;OID=.;OPOS=93510603;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:158:78:78:80:80:42:38:35:43:42:38:35:43 chr15 93521604 . A G 351.76 PASS AO=105;DP=255;FAO=105;FDP=256;FR=.;FRO=151;FSAF=53;FSAR=52;FSRF=69;FSRR=82;FWDB=-0.00760689;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=212.427;QD=5.49622;RBI=0.0343235;REFB=-0.0129751;REVB=-0.0334699;RO=150;SAF=53;SAR=52;SRF=69;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0470863;STB=0.528181;TYPE=snp;VARB=0.015746;OID=.;OPOS=93521604;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:255:256:150:151:105:105:52:53:69:81:52:53:69:82 chr15 93570241 . T C 3084.95 PASS AO=340;DP=355;FAO=341;FDP=351;FR=.;FRO=10;FSAF=142;FSAR=199;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0537096;FXX=0.0112673;HRUN=3;LEN=1;MLLD=149.705;QD=35.1561;RBI=0.0578757;REFB=-0.193812;REVB=0.0215608;RO=4;SAF=142;SAR=198;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00382505;STB=0.500481;TYPE=snp;VARB=0.000642101;OID=.;OPOS=93570241;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:355:351:4:10:340:341:198:142:1:3:199:142:4:6 chr15 93586633 . G A 799.8 PASS AO=83;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00104256;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.408;QD=38.0855;RBI=0.00992908;REFB=0;REVB=-0.00987419;RO=0;SAF=62;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000380533;OID=.;OPOS=93586633;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:84:84:0:0:83:84:21:62:0:0:21:63:0:0 chr15 93588289 . G A 43.01 PASS AO=6;DP=8;FAO=6;FDP=8;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0028975;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=68.676;QD=21.506;RBI=0.0517112;REFB=-0.0543866;REVB=-0.0516299;RO=2;SAF=4;SAR=2;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0772509;STB=0.545299;TYPE=snp;VARB=0.00443324;OID=.;OPOS=93588289;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:8:2:2:6:6:2:4:1:1:2:4:1:1 chr15 93588336 . A C 316.53 PASS AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0278514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.9496;QD=37.2385;RBI=0.0280814;REFB=0;REVB=-0.00358639;RO=0;SAF=23;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000395202;OID=.;OPOS=93588336;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:34:0:0:34:34:11:23:0:0:11:23:0:0 chr15 93609460 . A T 361.91 PASS AO=86;DP=175;FAO=86;FDP=176;FR=.;FRO=90;FSAF=27;FSAR=59;FSRF=30;FSRR=60;FWDB=-0.00810713;FXX=0.0112353;HRUN=3;LEN=1;MLLD=109.605;QD=8.22525;RBI=0.0462763;REFB=0.0014118;REVB=-0.0455606;RO=89;SAF=27;SAR=59;SRF=29;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126651;STB=0.511402;TYPE=snp;VARB=-0.00135415;OID=.;OPOS=93609460;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:176:89:90:86:86:59:27:29:60:59:27:30:60 chr15 93616933 . C G 1217.17 PASS AO=127;DP=127;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0159055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.845;QD=38.3361;RBI=0.0457774;REFB=0;REVB=0.0429254;RO=0;SAF=66;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.22321e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.53319e-05;OID=.;OPOS=93616933;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:127:127:0:0:127:127:61:66:0:0:61:66:0:0 chr15 93616975 . A G 554.53 PASS AO=56;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.089054;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.596;QD=38.2433;RBI=0.0890571;REFB=0;REVB=-0.000741211;RO=0;SAF=11;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000211428;OID=.;OPOS=93616975;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:58:58:0:0:56:58:45:11:0:0:44:14:0:0 chr15 93749883 . G A 206.03 PASS AO=49;DP=102;FAO=49;FDP=102;FR=.;FRO=53;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=29;FWDB=0.0222621;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.4;QD=8.07953;RBI=0.022686;REFB=-0.0121516;REVB=-0.00436504;RO=53;SAF=29;SAR=20;SRF=24;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130871;STB=0.572723;TYPE=snp;VARB=0.0148828;OID=.;OPOS=93749883;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:53:53:49:49:20:29:24:29:20:29:24:29 chr15 93750256 . G T 154.55 PASS AO=40;DP=91;FAO=40;FDP=91;FR=.;FRO=51;FSAF=5;FSAR=35;FSRF=15;FSRR=36;FWDB=-0.00768971;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.867;QD=6.79337;RBI=0.0186216;REFB=0.00226931;REVB=0.0169597;RO=50;SAF=5;SAR=35;SRF=14;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265656;STB=0.66341;TYPE=snp;VARB=-0.00240376;OID=.;OPOS=93750256;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:50:51:40:40:35:5:14:36:35:5:15:36 chr15 94304132 . C T 246.07 PASS AO=67;DP=154;FAO=67;FDP=154;FR=.;FRO=87;FSAF=60;FSAR=7;FSRF=80;FSRR=7;FWDB=0.0211089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4925;QD=6.3915;RBI=0.0213354;REFB=-0.0147094;REVB=-0.00310072;RO=87;SAF=60;SAR=7;SRF=80;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0693422;STB=0.538451;TYPE=snp;VARB=0.0191383;OID=.;OPOS=94304132;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:154:87:87:67:67:7:60:80:7:7:60:80:7 chr15 94304189 . T C 426.51 PASS AO=106;DP=223;FAO=106;FDP=223;FR=.;FRO=117;FSAF=85;FSAR=21;FSRF=88;FSRR=29;FWDB=-0.00169042;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.011;QD=7.65046;RBI=0.0540729;REFB=-0.00428449;REVB=-0.0540464;RO=116;SAF=85;SAR=21;SRF=87;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0732716;STB=0.539127;TYPE=snp;VARB=0.00404173;OID=.;OPOS=94304189;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:223:116:117:106:106:21:85:87:29:21:85:88:29 chr15 94884108 . G C 715.42 PASS AO=167;DP=329;FAO=167;FDP=329;FR=.;FRO=162;FSAF=81;FSAR=86;FSRF=94;FSRR=68;FWDB=0.0234095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.2592;QD=8.69816;RBI=0.0411642;REFB=-0.011832;REVB=0.0338598;RO=161;SAF=81;SAR=86;SRF=94;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0885334;STB=0.54679;TYPE=snp;VARB=0.0142351;OID=.;OPOS=94884108;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:329:329:161:162:167:167:86:81:94:67:86:81:94:68 chr15 94945719 . G T 1056.96 PASS AO=112;DP=113;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00940194;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.217;QD=37.7485;RBI=0.0119803;REFB=0;REVB=-0.00742501;RO=0;SAF=68;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.3621e-06;OID=.;OPOS=94945719;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:113:112:0:0:112:112:44:68:0:0:44:68:0:0 chr15 96289064 . T A 400.1 PASS AO=86;DP=162;FAO=87;FDP=162;FR=.;FRO=75;FSAF=56;FSAR=31;FSRF=40;FSRR=35;FWDB=0.0156656;FXX=0.00613459;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.446;QD=9.87888;RBI=0.0156698;REFB=-0.0075198;REVB=0.000365103;RO=76;SAF=55;SAR=31;SRF=41;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0902576;STB=0.553944;TYPE=snp;VARB=0.00782457;OID=.;OPOS=96289064;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:162:76:75:86:87:31:55:41:35:31:56:40:35 chr15 96881264 . C CAACA 1496.77 PASS AO=152;DP=172;FAO=158;FDP=158;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00902646;FXX=0.053889;HRUN=0;LEN=4;MLLD=243.141;QD=37.8928;RBI=0.0115105;REFB=-0.0187972;REVB=-0.0071424;RO=13;SAF=59;SAR=93;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0115077;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=4.2677e-06;OID=.;OPOS=96881265;OREF=-;OALT=AACA;OMAPALT=CAACA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:152:172:158:158:0:59:99:0:0:63:13:59:93:6:7 chr15 97327393 . C T 385.44 PASS AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0321196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8578;QD=37.6039;RBI=0.0439863;REFB=0;REVB=0.030052;RO=0;SAF=13;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000967788;OID=.;OPOS=97327393;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:41:41:0:0:41:41:28:13:0:0:28:13:0:0 chr15 97896843 . T C 141.07 PASS AO=45;DP=115;FAO=44;FDP=115;FR=.;FRO=71;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=25;FSRR=46;FWDB=0.00825778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.746;QD=4.9069;RBI=0.00969223;REFB=-0.00647939;REVB=-0.0050743;RO=70;SAF=17;SAR=28;SRF=25;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0237304;STB=0.522516;TYPE=snp;VARB=0.0145233;OID=.;OPOS=97896843;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:70:71:45:44:28:17:25:45:27:17:25:46 chr15 97970963 . T C 286.28 PASS AO=60;DP=111;FAO=60;FDP=111;FR=.;FRO=51;FSAF=23;FSAR=37;FSRF=28;FSRR=23;FWDB=-0.0360228;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=165.737;QD=10.3163;RBI=0.03637;REFB=-0.014271;REVB=-0.00501331;RO=51;SAF=23;SAR=37;SRF=28;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141225;STB=0.577568;TYPE=snp;VARB=0.00919479;OID=.;OPOS=97970963;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:51:51:60:60:37:23:28:23:37:23:28:23 chr15 98015489 . A G 934.62 PASS AO=100;DP=101;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0321128;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.875;QD=37.3849;RBI=0.0332145;REFB=-0.0599196;REVB=-0.00848353;RO=1;SAF=32;SAR=68;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.014592;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000534992;OID=.;OPOS=98015489;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:101:100:1:0:100:100:68:32:1:0:68:32:0:0 chr15 98301845 . C T 558.46 PASS AO=55;DP=56;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0306065;FXX=0.0327815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.729;QD=37.8614;RBI=0.0400655;REFB=0;REVB=0.0258551;RO=0;SAF=25;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00209992;OID=.;OPOS=98301845;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:56:59:0:0:55:59:30:25:0:0:30:29:0:0 chr15 98515952 . A G 517.74 PASS AO=106;DP=200;FAO=111;FDP=205;FR=.;FRO=94;FSAF=55;FSAR=56;FSRF=33;FSRR=61;FWDB=0.0751864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.612;QD=10.1022;RBI=0.0761889;REFB=-0.00983313;REVB=-0.012319;RO=92;SAF=52;SAR=54;SRF=32;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121958;STB=0.5663;TYPE=snp;VARB=0.00674595;OID=.;OPOS=98515952;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:200:205:92:94:106:111:54:52:32:60:56:55:33:61 chr15 98995081 . A G 1379.68 PASS AO=125;DP=125;FAO=145;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.129;QD=38.0602;RBI=0.10972;REFB=0;REVB=0.107994;RO=0;SAF=87;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17948e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000195096;OID=.;OPOS=98995081;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:125:145:0:0:125:145:38:87:0:0:57:88:0:0 chr15 99023968 . T G 123.14 PASS AO=43;DP=123;FAO=43;FDP=122;FR=.;FRO=79;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=44;FSRR=35;FWDB=-0.0092941;FXX=0.00812942;HRUN=3;LEN=1;MLLD=166.497;QD=4.03742;RBI=0.0179051;REFB=-0.0126336;REVB=-0.015304;RO=76;SAF=17;SAR=26;SRF=41;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161576;STB=0.604602;TYPE=snp;VARB=0.022393;OID=.;OPOS=99023968;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:122:76:79:43:43:26:17:41:35:26:17:44:35 chr15 99478225 . G A 435.48 PASS AO=95;DP=196;FAO=102;FDP=203;FR=.;FRO=101;FSAF=39;FSAR=63;FSRF=46;FSRR=55;FWDB=-0.0174422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.819;QD=8.58082;RBI=0.0228673;REFB=-0.0252176;REVB=0.0147879;RO=101;SAF=37;SAR=58;SRF=46;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0637719;STB=0.537805;TYPE=snp;VARB=0.022709;OID=.;OPOS=99478225;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:203:101:101:95:102:58:37:46:55:63:39:46:55 chr15 99503199 . GGT G 370.48 PASS AO=59;DP=98;FAO=75;FDP=101;FR=.;FRO=26;FSAF=48;FSAR=27;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.00396247;FXX=0.0194156;HRUN=3;LEN=2;MLLD=150.357;QD=14.6726;RBI=0.0262152;REFB=-0.0448001;REVB=0.025914;RO=0;SAF=41;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.49224e-08;STB=0.527911;TYPE=del;VARB=0.0264813;OID=.;OPOS=99503200;OREF=GT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:59:65:75:101:26:48:27:14:12:24:0:41:18:0:0 chr15 99504671 . C T 1837.26 PASS AO=177;DP=179;FAO=195;FDP=195;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0397238;FXX=0.0151508;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.3018;QD=37.6875;RBI=0.102295;REFB=-0.0220617;REVB=0.0942671;RO=0;SAF=70;SAR=107;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00113448;OID=.;OPOS=99504671;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:179:195:0:0:177:195:107:70:0:0:118:77:0:0 chr15 99511793 . C G 2274.79 PASS AO=237;DP=238;FAO=238;FDP=238;FR=.;FRO=0;FSAF=121;FSAR=117;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0158263;FXX=0.00418393;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.329;QD=38.2318;RBI=0.0158888;REFB=-0.0286778;REVB=0.00140742;RO=0;SAF=121;SAR=116;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.21487e-05;OID=.;OPOS=99511793;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:238:238:0:0:237:238:116:121:0:0:117:121:0:0 chr15 99511804 . A AC 1600.45 PASS AO=199;DP=221;FAO=210;FDP=210;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.201865;FXX=0.00943352;HRUN=1;LEN=1;MLLD=27.9836;QD=30.4848;RBI=0.209299;REFB=-0.00810398;REVB=0.0552872;RO=20;SAF=95;SAR=104;SRF=20;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0903688;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00224796;OID=.;OPOS=99511805;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:199:221:210:210:0:103:107:0:0:99:20:95:104:20:0 chr15 99653800 . T C 812.47 PASS AO=91;DP=98;FAO=95;FDP=98;FR=.;FRO=3;FSAF=46;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0343201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.0486;QD=33.162;RBI=0.17963;REFB=-0.182339;REVB=0.176321;RO=1;SAF=46;SAR=45;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0104175;STB=0.514848;TYPE=snp;VARB=0.00973986;OID=.;OPOS=99653800;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:98:98:1:3:91:95:45:46:0:1:49:46:0:3 chr15 99666979 . G A 157.93 PASS AO=48;DP=124;FAO=49;FDP=124;FR=.;FRO=75;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=36;FSRR=39;FWDB=-0.0139352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.162;QD=5.09454;RBI=0.0173621;REFB=-0.00941442;REVB=0.0103563;RO=72;SAF=20;SAR=28;SRF=36;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.089373;STB=0.531456;TYPE=snp;VARB=0.014859;OID=.;OPOS=99666979;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:72:75:48:49:28:20:36:36:28:21:36:39 chr15 99670518 . T C 177.34 PASS AO=39;DP=76;FAO=39;FDP=76;FR=.;FRO=37;FSAF=34;FSAR=5;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=-0.0247395;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.52;QD=9.3338;RBI=0.0252931;REFB=-0.0199637;REVB=0.00526287;RO=37;SAF=34;SAR=5;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.343006;STB=0.693759;TYPE=snp;VARB=0.0191334;OID=.;OPOS=99670518;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:37:37:39:39:5:34:23:14:5:34:23:14 chr15 99670989 . T C 688.28 PASS AO=60;DP=71;FAO=71;FDP=73;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=27;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0431106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.817;QD=37.7139;RBI=0.073437;REFB=0;REVB=0.0594514;RO=0;SAF=25;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.89445e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000921437;OID=.;OPOS=99670989;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:71:73:0:0:60:71:35:25:0:0:44:27:0:0 chr15 99671760 . T C 519.79 PASS AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00438614;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=143.139;QD=37.8031;RBI=0.0517186;REFB=0;REVB=-0.0515322;RO=0;SAF=36;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.75811e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00019341;OID=.;OPOS=99671760;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:55:55:0:0:55:55:19:36:0:0:19:36:0:0 chr15 99672722 . A G 158.08 PASS AO=38;DP=87;FAO=40;FDP=89;FR=.;FRO=49;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=32;FSRR=17;FWDB=-0.0059788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.707;QD=7.10459;RBI=0.0150403;REFB=-0.0101333;REVB=0.0138009;RO=48;SAF=20;SAR=18;SRF=31;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120185;STB=0.571151;TYPE=snp;VARB=0.0132868;OID=.;OPOS=99672722;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:89:48:49:38:40:18:20:31:17:19:21:32:17 chr15 99678257 . G A 115.51 PASS AO=27;DP=57;FAO=27;FDP=57;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.0121485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.039;QD=8.10586;RBI=0.0147705;REFB=-0.00526883;REVB=-0.00840138;RO=30;SAF=9;SAR=18;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194429;STB=0.609673;TYPE=snp;VARB=0.00442582;OID=.;OPOS=99678257;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:30:30:27:27:18:9:16:14:18:9:16:14 chr15 99679489 . GAGAT G 171.6 PASS AO=44;DP=103;FAO=44;FDP=98;FR=.;FRO=54;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=37;FSRR=17;FWDB=0.0128672;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=4;MLLD=250.292;QD=7.00425;RBI=0.029322;REFB=-0.00510064;REVB=0.026348;RO=53;SAF=22;SAR=22;SRF=37;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1945;STB=0.601996;TYPE=del;VARB=0.00721435;OID=.;OPOS=99679490;OREF=AGAT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:44:99:44:98:54:22:22:37:17:99:53:22:22:37:16 chr15 99715352 . A G 893.09 PASS AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00344337;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.3617;QD=38.0039;RBI=0.0354711;REFB=0;REVB=-0.0353035;RO=0;SAF=20;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000184576;OID=.;OPOS=99715352;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:94:94:0:0:94:94:74:20:0:0:74:20:0:0 chr15 100246936 . T C 1078.97 PASS AO=114;DP=117;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115704;FXX=0.0170926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.733;QD=37.5295;RBI=0.0362622;REFB=-0.0321875;REVB=-0.0343668;RO=2;SAF=52;SAR=62;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0014467;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.26442e-05;OID=.;OPOS=100246936;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:117:115:2:0:114:115:62:52:1:1:63:52:0:0 chr15 100246942 . G A 1133.5 PASS AO=110;DP=110;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00748838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.202;QD=37.4711;RBI=0.0165997;REFB=0;REVB=-0.0148147;RO=0;SAF=50;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.49535e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00017547;OID=.;OPOS=100246942;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:110:121:0:0:110:121:60:50:0:0:69:52:0:0 chr15 100252805 . G T 25.89 PASS AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=189.744;QD=8.63103;RBI=0.0115792;REFB=-0.0191067;REVB=0.0115792;RO=7;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0180708;OID=.;OPOS=100252805;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:12:12:7:7:5:5:5:0:0:7:5:0:0:7 chr15 100256618 . A C 217.19 PASS AO=49;DP=97;FAO=49;FDP=97;FR=.;FRO=48;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=-0.0121378;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.392;QD=8.95647;RBI=0.030073;REFB=-0.0100073;REVB=-0.0275148;RO=48;SAF=30;SAR=19;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0653252;STB=0.536166;TYPE=snp;VARB=0.00697328;OID=.;OPOS=100256618;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:48:48:49:49:19:30:26:22:19:30:26:22 chr15 100256857 . A ACG 36.71 PASS AO=15;DP=68;FAO=16;FDP=61;FR=.;FRO=45;FSAF=1;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=33;FWDB=-0.0131107;FXX=0.061529;HRUN=1;LEN=2;MLLD=269.618;QD=2.40733;RBI=0.0138756;REFB=0.00826178;REVB=0.00454317;RO=46;SAF=1;SAR=14;SRF=13;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.465432;STB=0.80196;TYPE=ins;VARB=-0.0240969;OID=.;OPOS=100256858;OREF=-;OALT=CG;OMAPALT=ACG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:15:68:16:61:45:1:15:12:33:36:46:1:14:13:33 chr15 100257713 . T TCAGATTGGGGCTTAAAACAC 46.03 PASS AO=19;DP=93;FAO=23;FDP=87;FR=.;FRO=64;FSAF=19;FSAR=4;FSRF=34;FSRR=30;FWDB=0.0120272;FXX=0.0543419;HRUN=1;LEN=20;MLLD=508.332;QD=2.11641;RBI=0.0136084;REFB=-0.0063272;REVB=-0.00636681;RO=64;SAF=15;SAR=4;SRF=35;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.336314;STB=0.75267;TYPE=ins;VARB=0.0197713;OID=.;OPOS=100257714;OREF=-;OALT=CAGATTGGGGCTTAAAACAC;OMAPALT=TCAGATTGGGGCTTAAAACAC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:19:93:23:87:64:19:4:34:30:46:64:15:4:35:29 chr15 100257796 . C CCAGCTGTTG 87.16 PASS AO=23;DP=79;FAO=28;FDP=76;FR=.;FRO=48;FSAF=27;FSAR=1;FSRF=36;FSRR=12;FWDB=-0.00391893;FXX=0;HRUN=3;LEN=9;MLLD=273.445;QD=4.5875;RBI=0.0194816;REFB=-0.00581209;REVB=-0.0190834;RO=53;SAF=22;SAR=1;SRF=41;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.505839;STB=0.847464;TYPE=ins;VARB=0.0103599;OID=.;OPOS=100257797;OREF=-;OALT=CAGCTGTTG;OMAPALT=CCAGCTGTTG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:23:79:28:76:48:27:1:36:12:87:53:22:1:41:12 chr15 100269680 . G C 244.06 PASS AO=62;DP=136;FAO=62;FDP=135;FR=.;FRO=73;FSAF=31;FSAR=31;FSRF=42;FSRR=31;FWDB=0.00913791;FXX=0.0073524;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.103;QD=7.23143;RBI=0.00940353;REFB=-0.0274627;REVB=-0.00221923;RO=73;SAF=32;SAR=30;SRF=42;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0577973;STB=0.540728;TYPE=snp;VARB=0.0321571;OID=.;OPOS=100269680;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:135:73:73:62:62:30:32:42:31:31:31:42:31 chr15 100269796 . A G 519.79 PASS AO=53;DP=53;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0400151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.857;QD=37.8031;RBI=0.0443657;REFB=0;REVB=-0.01916;RO=0;SAF=17;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.19417e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.65201e-05;OID=.;OPOS=100269796;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:53:55:0:0:53:55:36:17:0:0:38:17:0:0 chr15 100332648 . C T 453 PASS AO=47;DP=49;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0269534;FXX=0.040808;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.3734;QD=38.5533;RBI=0.0373995;REFB=0;REVB=0.0259276;RO=0;SAF=34;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.45132e-05;OID=.;OPOS=100332648;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:49:47:0:0:47:47:13:34:0:0:13:34:0:0 chr15 100332876 . CT C,CC 155.31 PASS AO=6,13;DP=23;FAO=20,0;FDP=23;FR=.;FRO=3;FSAF=8,0;FSAR=12,0;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0202006,0.0775796;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=37.877,29.2097;QD=27.01;RBI=0.0350231,0.483808;REFB=-0.0692074,-0.0839788;REVB=-0.0286104,-0.477548;RO=3;SAF=6,0;SAR=0,13;SRF=3;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-0.844812;STB=0.578868,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0178365,0;OID=.,.;OPOS=100332877,100332877;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:6,13:22:20,0:23:3:8,0:12,0:3:0:5:3:6,0:0,13:3:0 chr15 100332919 . T C 116.69 PASS AO=14;DP=15;FAO=14;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.109335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.009;QD=31.1172;RBI=0.11823;REFB=-0.00161756;REVB=0.0449894;RO=1;SAF=3;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128919;STB=0.571319;TYPE=snp;VARB=-0.000918119;OID=.;OPOS=100332919;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:15:15:1:1:14:14:11:3:1:0:11:3:1:0 chr15 100340061 . C T 24.08 PASS AO=4;DP=6;FAO=4;FDP=6;FR=.;FRO=2;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0242371;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.36;QD=16.0547;RBI=0.0633225;REFB=0.00503854;REVB=0.0585004;RO=2;SAF=1;SAR=3;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161039;STB=0.599463;TYPE=snp;VARB=0.0039109;OID=.;OPOS=100340061;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:2:2:4:4:3:1:1:1:3:1:1:1 chr15 100345096 . C T 316.12 PASS AO=34;DP=35;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0336008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.951;QD=35.1246;RBI=0.0373855;REFB=0.0438877;REVB=0.0163908;RO=1;SAF=8;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.017647;STB=0.509086;TYPE=snp;VARB=-0.000578221;OID=.;OPOS=100345096;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:35:36:1:1:34:35:26:8:0:1:27:8:0:1 chr15 100348476 . T C 1054.34 PASS AO=110;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00221739;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.61;QD=37.9944;RBI=0.0538598;REFB=0;REVB=0.0538142;RO=0;SAF=45;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.58497e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.30515e-05;OID=.;OPOS=100348476;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:111:111:0:0:110:111:65:45:0:0:65:46:0:0 chr15 100649248 . G A 116.28 PASS AO=37;DP=104;FAO=38;FDP=104;FR=.;FRO=66;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=47;FSRR=19;FWDB=0.0266067;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.1308;QD=4.4721;RBI=0.0470297;REFB=-0.0207195;REVB=0.0387799;RO=64;SAF=19;SAR=18;SRF=46;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230951;STB=0.63455;TYPE=snp;VARB=0.0194843;OID=.;OPOS=100649248;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:64:66:37:38:18:19:46:18:19:19:47:19 chr15 100672237 . T G 267.06 PASS AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0276076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.962;QD=38.1516;RBI=0.0325456;REFB=0;REVB=-0.0172347;RO=0;SAF=17;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000209435;OID=.;OPOS=100672237;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:27:28:0:0:27:28:10:17:0:0:11:17:0:0 chr15 100794363 . C T 841.1 PASS AO=94;DP=96;FAO=93;FDP=96;FR=.;FRO=3;FSAF=26;FSAR=67;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0167456;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.9335;QD=35.0459;RBI=0.0168679;REFB=-0.0402049;REVB=0.00202767;RO=2;SAF=26;SAR=68;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0350762;STB=0.514816;TYPE=snp;VARB=0.00799558;OID=.;OPOS=100794363;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:96:96:2:3:94:93:68:26:2:0:67:26:2:1 chr15 100801698 . G A 300.68 PASS AO=66;DP=126;FAO=66;FDP=126;FR=.;FRO=60;FSAF=38;FSAR=28;FSRF=42;FSRR=18;FWDB=0.00862608;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.923;QD=9.54532;RBI=0.0295613;REFB=-0.00976199;REVB=0.0282747;RO=60;SAF=38;SAR=28;SRF=42;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112582;STB=0.561667;TYPE=snp;VARB=0.00851314;OID=.;OPOS=100801698;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:60:60:66:66:28:38:42:18:28:38:42:18 chr15 100821467 . G A 663.33 PASS AO=35;DP=69;FAO=71;FDP=71;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=63;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0412342;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.603;QD=37.3708;RBI=0.042058;REFB=0;REVB=0.00828364;RO=0;SAF=25;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.03206e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000116385;OID=.;OPOS=100821467;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:63:71:0:0:35:71:10:25:0:0:8:63:0:0 chr15 100821576 . G A 750.5 PASS AO=84;DP=87;FAO=85;FDP=90;FR=.;FRO=5;FSAF=23;FSAR=62;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.00891424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.218;QD=33.3554;RBI=0.0111515;REFB=-0.063441;REVB=0.00670016;RO=2;SAF=22;SAR=62;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0411239;STB=0.509029;TYPE=snp;VARB=0.0013626;OID=.;OPOS=100821576;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:87:90:2:5:84:85:62:22:2:0:62:23:2:3 chr15 100942962 . T C 462.06 PASS AO=37;DP=56;FAO=48;FDP=51;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=12;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0744559;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.648;QD=36.24;RBI=0.0829137;REFB=0;REVB=0.0364827;RO=0;SAF=4;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.7801e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00381148;OID=.;OPOS=100942962;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:52:51:0:0:37:48:33:4:0:0:36:12:0:0 chr15 101041896 . T C 1226.58 PASS AO=118;DP=118;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00685041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.417;QD=38.3306;RBI=0.0726406;REFB=0;REVB=0.0723169;RO=0;SAF=66;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.05954e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000173469;OID=.;OPOS=101041896;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:118:128:0:0:118:128:52:66:0:0:62:66:0:0 chr15 101042043 . C T 128.51 PASS AO=40;DP=105;FAO=40;FDP=105;FR=.;FRO=65;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=28;FSRR=37;FWDB=0.0168174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.846;QD=4.89545;RBI=0.0168182;REFB=-0.00301749;REVB=0.000162213;RO=65;SAF=16;SAR=24;SRF=28;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0345194;STB=0.519675;TYPE=snp;VARB=0.00956313;OID=.;OPOS=101042043;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:65:65:40:40:24:16:28:37:24:16:28:37 chr15 101109677 . C A 263.02 PASS AO=60;DP=106;FAO=60;FDP=118;FR=.;FRO=58;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=29;FSRR=29;FWDB=0.0308186;FXX=0.0559955;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.3001;QD=8.9159;RBI=0.0854341;REFB=-0.0418774;REVB=-0.0796818;RO=46;SAF=32;SAR=28;SRF=29;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0779154;STB=0.516416;TYPE=snp;VARB=0.0218245;OID=.;OPOS=101109677;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:118:46:58:60:60:28:32:29:17:28:32:29:29 chr15 101109794 . C G 360.57 PASS AO=70;DP=120;FAO=70;FDP=120;FR=.;FRO=50;FSAF=41;FSAR=29;FSRF=16;FSRR=34;FWDB=0.000631063;FXX=0.00826378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.553;QD=12.0189;RBI=0.0198486;REFB=-0.0133082;REVB=-0.0198385;RO=50;SAF=40;SAR=30;SRF=17;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175889;STB=0.609742;TYPE=snp;VARB=0.0117288;OID=.;OPOS=101109794;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:50:50:70:70:30:40:17:33:29:41:16:34 chr15 101109818 . G A 416.01 PASS AO=77;DP=125;FAO=77;FDP=125;FR=.;FRO=48;FSAF=45;FSAR=32;FSRF=19;FSRR=29;FWDB=0.0087025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.12;QD=13.3124;RBI=0.0282292;REFB=-0.0304695;REVB=0.0268543;RO=47;SAF=45;SAR=32;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126662;STB=0.572691;TYPE=snp;VARB=0.0220518;OID=.;OPOS=101109818;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:47:48:77:77:32:45:19:28:32:45:19:29 chr15 101109893 . C A 325.65 PASS AO=73;DP=139;FAO=73;FDP=142;FR=.;FRO=69;FSAF=52;FSAR=21;FSRF=47;FSRR=22;FWDB=-0.0187412;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=251.36;QD=9.17332;RBI=0.0197418;REFB=-0.00778563;REVB=0.00620518;RO=66;SAF=52;SAR=21;SRF=47;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000219062;STB=0.518187;TYPE=snp;VARB=0.0104023;OID=.;OPOS=101109893;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:142:66:69:73:73:21:52:47:19:21:52:47:22 chr15 101110265 . T A 365.29 PASS AO=98;DP=222;FAO=98;FDP=221;FR=.;FRO=123;FSAF=60;FSAR=38;FSRF=45;FSRR=78;FWDB=-0.000167877;FXX=0.0045043;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.518;QD=6.61158;RBI=0.00261566;REFB=0.0013046;REVB=0.00261027;RO=123;SAF=60;SAR=38;SRF=45;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.244492;STB=0.635589;TYPE=snp;VARB=-0.00116284;OID=.;OPOS=101110265;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:221:123:123:98:98:38:60:45:78:38:60:45:78 chr15 101110302 . C G 263.39 PASS AO=78;DP=195;FAO=79;FDP=196;FR=.;FRO=117;FSAF=45;FSAR=34;FSRF=40;FSRR=77;FWDB=0.009049;FXX=0.00507588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.714;QD=5.37536;RBI=0.0164654;REFB=-0.00202017;REVB=-0.013756;RO=108;SAF=44;SAR=34;SRF=35;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.245482;STB=0.633449;TYPE=snp;VARB=0.0028025;OID=.;OPOS=101110302;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:196:108:117:78:79:34:44:35:73:34:45:40:77 chr15 101113862 . C T 3138.99 PASS AO=326;DP=327;FAO=328;FDP=328;FR=.;FRO=0;FSAF=146;FSAR=182;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000231176;FXX=0.00606042;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.92;QD=38.2803;RBI=0.0199104;REFB=-0.0189297;REVB=0.019909;RO=1;SAF=145;SAR=181;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00262842;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.7371e-05;OID=.;OPOS=101113862;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:327:328:1:0:326:328:181:145:0:1:182:146:0:0 chr15 101113949 . GA G 467.36 PASS AO=105;DP=233;FAO=116;FDP=231;FR=.;FRO=115;FSAF=49;FSAR=67;FSRF=54;FSRR=61;FWDB=-0.00825454;FXX=0.0170206;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.6818;QD=8.09274;RBI=0.0121961;REFB=-0.00023995;REVB=-0.00897822;RO=114;SAF=45;SAR=60;SRF=54;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0431692;STB=0.52387;TYPE=del;VARB=-0.000428583;OID=.;OPOS=101113950;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:105:229:116:231:115:49:67:54:61:99:114:45:60:54:60 chr15 101114418 . G A 171.37 PASS AO=36;DP=71;FAO=38;FDP=73;FR=.;FRO=35;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=11;FWDB=-0.0192642;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.9885;QD=9.38991;RBI=0.0876608;REFB=-0.0222313;REVB=0.0855178;RO=33;SAF=19;SAR=17;SRF=23;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148169;STB=0.565377;TYPE=snp;VARB=0.0202634;OID=.;OPOS=101114418;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:73:33:35:36:38:17:19:23:10:17:21:24:11 chr15 101120963 . T C 196.46 PASS AO=50;DP=113;FAO=51;FDP=114;FR=.;FRO=63;FSAF=42;FSAR=9;FSRF=51;FSRR=12;FWDB=-0.00596281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.622;QD=6.89327;RBI=0.0208167;REFB=-0.00376767;REVB=-0.0199444;RO=59;SAF=41;SAR=9;SRF=47;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0373263;STB=0.513084;TYPE=snp;VARB=0.00505977;OID=.;OPOS=101120963;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:114:59:63:50:51:9:41:47:12:9:42:51:12 chr15 101324497 . A T 221.01 PASS AO=23;DP=23;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0453034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.0753;QD=36.8356;RBI=0.0584362;REFB=0;REVB=0.0369106;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00152455;OID=.;OPOS=101324497;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:23:24:0:0:23:24:12:11:0:0:12:12:0:0 chr15 101464915 . T C 583.98 PASS AO=117;DP=204;FAO=117;FDP=203;FR=.;FRO=86;FSAF=41;FSAR=76;FSRF=40;FSRR=46;FWDB=-0.0046388;FXX=0.00490172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.6627;QD=11.5071;RBI=0.0317424;REFB=-0.0254858;REVB=0.0314016;RO=82;SAF=41;SAR=76;SRF=37;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0817781;STB=0.551703;TYPE=snp;VARB=0.0139865;OID=.;OPOS=101464915;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:203:82:86:117:117:76:41:37:45:76:41:40:46 chr15 101562793 . G A 270.19 PASS AO=29;DP=29;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0241876;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.12;QD=38.5991;RBI=0.0249119;REFB=0;REVB=0.00596332;RO=0;SAF=8;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.4007e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00105883;OID=.;OPOS=101562793;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:29:28:0:0:29:28:21:8:0:0:21:7:0:0 chr15 101569287 . AG A 58.08 PASS AO=81;DP=208;FAO=65;FDP=197;FR=.;FRO=132;FSAF=54;FSAR=11;FSRF=55;FSRR=77;FWDB=-0.0702639;FXX=0.00505025;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.4744;QD=1.17938;RBI=0.246526;REFB=-0.0688367;REVB=-0.236301;RO=100;SAF=56;SAR=25;SRF=47;SRR=53;SSEN=0.33871;SSEP=0;SSSB=0.231474;STB=0.798424;TYPE=del;VARB=0.0464696;OID=.;OPOS=101569288;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:81:192:65:197:132:54:11:55:77:58:100:56:25:47:53 chr15 101598200 . G A 987.75 PASS AO=103;DP=105;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0281672;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.977;QD=37.9903;RBI=0.0334126;REFB=0;REVB=0.0179726;RO=0;SAF=46;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99381e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000189775;OID=.;OPOS=101598200;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:105:104:0:0:103:104:57:46:0:0:57:47:0:0 chr15 101598314 . C T 1720.5 PASS AO=180;DP=187;FAO=182;FDP=182;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0170699;FXX=0.0267365;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.349;QD=37.8133;RBI=0.0171972;REFB=0.00241453;REVB=0.00208842;RO=1;SAF=78;SAR=102;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00606439;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.14411e-05;OID=.;OPOS=101598314;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:187:182:1:0:180:182:102:78:1:0:103:79:0:0 chr15 101606889 . G A 188.15 PASS AO=55;DP=135;FAO=55;FDP=135;FR=.;FRO=80;FSAF=22;FSAR=33;FSRF=42;FSRR=38;FWDB=0.00140525;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.1825;QD=5.57471;RBI=0.0291887;REFB=0.00191486;REVB=0.0291548;RO=79;SAF=22;SAR=33;SRF=41;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126034;STB=0.574823;TYPE=snp;VARB=-0.00424771;OID=.;OPOS=101606889;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:79:80:55:55:33:22:41:38:33:22:42:38 chr15 101606890 . C A 197.44 PASS AO=56;DP=135;FAO=56;FDP=134;FR=.;FRO=78;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=41;FSRR=37;FWDB=0.0103908;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.198;QD=5.89384;RBI=0.0108545;REFB=-0.0131119;REVB=-0.00313854;RO=78;SAF=22;SAR=34;SRF=41;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139253;STB=0.578266;TYPE=snp;VARB=0.014644;OID=.;OPOS=101606890;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:134:78:78:56:56:34:22:41:37:34:22:41:37 chr15 101607513 . T C 576.74 PASS AO=66;DP=71;FAO=68;FDP=73;FR=.;FRO=5;FSAF=10;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.02344;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.6275;QD=31.6021;RBI=0.0799282;REFB=0.071533;REVB=0.0764139;RO=5;SAF=10;SAR=56;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0403453;STB=0.520655;TYPE=snp;VARB=-0.00468558;OID=.;OPOS=101607513;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:71:73:5:5:66:68:56:10:0:5:58:10:0:5 chr15 101717680 . G T 1586.46 PASS AO=176;DP=182;FAO=176;FDP=182;FR=.;FRO=6;FSAF=73;FSAR=103;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0336537;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=230.643;QD=34.8672;RBI=0.036556;REFB=-0.0514975;REVB=0.0142746;RO=4;SAF=73;SAR=103;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00370885;STB=0.502891;TYPE=snp;VARB=0.000626245;OID=.;OPOS=101717680;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:182:182:4:6:176:176:103:73:2:2:103:73:3:3 chr15 101718097 . C G 1184.21 PASS AO=124;DP=125;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0242782;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.943;QD=38.2005;RBI=0.0242784;REFB=0;REVB=0.00010982;RO=0;SAF=68;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51989e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000313168;OID=.;OPOS=101718097;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:125:124:0:0:124:124:56:68:0:0:56:68:0:0 chr15 101791359 . C G 45.7 PASS AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.00752913;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=154.382;QD=13.057;RBI=0.0185156;REFB=0.00752172;REVB=0.0169156;RO=6;SAF=5;SAR=3;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0946669;STB=0.555414;TYPE=snp;VARB=-0.00333852;OID=.;OPOS=101791359;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:14:14:6:6:8:8:3:5:3:3:3:5:3:3 chr15 101827855 . C T 569.68 PASS AO=111;DP=189;FAO=111;FDP=189;FR=.;FRO=78;FSAF=59;FSAR=52;FSRF=42;FSRR=36;FWDB=-0.0057918;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.174;QD=12.0567;RBI=0.0119558;REFB=0.0131703;REVB=0.0104593;RO=78;SAF=59;SAR=52;SRF=42;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00529613;STB=0.502872;TYPE=snp;VARB=-0.0106838;OID=.;OPOS=101827855;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:189:78:78:111:111:52:59:42:36:52:59:42:36 chr15 101922323 . A G 417.91 PASS AO=44;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00361543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.9407;QD=37.1473;RBI=0.00362416;REFB=0;REVB=-0.000251338;RO=0;SAF=16;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00126869;OID=.;OPOS=101922323;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:45:45:0:0:44:45:28:16:0:0:29:16:0:0 chr15 102185368 . T A 35.64 PASS AO=7;DP=27;FAO=7;FDP=22;FR=.,HEALED;FRO=12;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=12;FWDB=0;FXX=0.0434594;HRUN=2;LEN=1;MLLD=25.7935;QD=6.48034;RBI=0.0163636;REFB=-0.0513869;REVB=0.0163636;RO=6;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.111288;OID=.;OPOS=102185368;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:23:22:6:12:7:7:7:0:0:6:7:0:0:12 chr15 102277480 . G C 1375.09 PASS AO=143;DP=148;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148097;FXX=0.0337815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.2426;QD=38.4639;RBI=0.0699183;REFB=0;REVB=0.0683319;RO=0;SAF=74;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.12649e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000270975;OID=.;OPOS=102277480;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:148:143:0:0:143:143:69:74:0:0:69:74:0:0 chr15 102514421 . C G 53.45 PASS AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.05921;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.179;QD=11.2518;RBI=0.0592101;REFB=0.0044772;REVB=-5.02836e-05;RO=9;SAF=5;SAR=5;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136379;STB=0.578793;TYPE=snp;VARB=-0.00130062;OID=.;OPOS=102514421;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:19:19:9:9:10:10:5:5:3:6:5:5:3:6 chr15 102514426 . C A 36.82 PASS AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.00813633;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=158.698;QD=13.3893;RBI=0.0106836;REFB=-0.012143;REVB=0.00692391;RO=5;SAF=3;SAR=3;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229845;STB=0.635942;TYPE=snp;VARB=0.0271983;OID=.;OPOS=102514426;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:11:11:5:5:6:6:3:3:1:4:3:3:1:4 chr16 64458 . G A 158.88 PASS AO=39;DP=84;FAO=39;FDP=84;FR=.;FRO=45;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=0.00215983;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=150.514;QD=7.56555;RBI=0.0477939;REFB=-0.0193736;REVB=0.047745;RO=45;SAF=17;SAR=22;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13553;STB=0.575737;TYPE=snp;VARB=0.0236498;OID=.;OPOS=64458;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:45:45:39:39:22:17:26:19:22:17:26:19 chr16 65561 . G C 55.53 PASS AO=9;DP=17;FAO=10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0613586;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.597;QD=12.3401;RBI=0.0624229;REFB=-0.000431096;REVB=-0.0114776;RO=8;SAF=4;SAR=5;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0450094;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000918002;OID=.;OPOS=65561;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:17:18:8:8:9:10:5:4:4:4:5:5:4:4 chr16 103517 . A C 201.65 PASS AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00707393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.587;QD=36.6628;RBI=0.00719275;REFB=0;REVB=0.00130199;RO=0;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.42993e-05;OID=.;OPOS=103517;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:22:22:0:0:22:22:12:10:0:0:12:10:0:0 chr16 108581 . ACCCT ACT,ACCC 271.95 PASS AO=15,21;DP=75;FAO=19,29;FDP=69;FR=.;FRO=21;FSAF=19,18;FSAR=0,11;FSRF=0;FSRR=21;FWDB=0.0782816,0.0227911;FXX=0;HRUN=3,1;LEN=2,1;MLLD=31.6127,144.895;QD=15.7654;RBI=0.0986821,0.0608712;REFB=-0.0329027,0.0134212;REVB=-0.0600845,-0.0564435;RO=19;SAF=15,17;SAR=0,4;SRF=0;SRR=19;SSEN=0.22314,0;SSEP=0.565445,0;SSSB=0.879462,0.633332;STB=0.9995,0.744041;TYPE=del,del;VARB=0.0599532,-0.0151809;OID=.,.;OPOS=108582,108585;OREF=CC,T;OALT=-,-;OMAPALT=ACT,ACCC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:15,21:67:19,29:69:21:19,18:0,11:0:21:81:19:15,17:0,4:0:19 chr16 113883 . G GCC 245.19 PASS AO=29;DP=33;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0527507;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=35.6447;QD=31.6369;RBI=0.0765804;REFB=0;REVB=0.0555151;RO=2;SAF=19;SAR=10;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0465475;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=4.51106e-05;OID=.;OPOS=113884;OREF=-;OALT=CC;OMAPALT=GCC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:29:33:31:31:0:20:11:0:0:22:2:19:10:2:0 chr16 113886 . GC G 189.38 PASS AO=25;DP=31;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193385;FXX=0.0333222;HRUN=5;LEN=1;MLLD=14.5287;QD=26.1209;RBI=0.0719344;REFB=0;REVB=0.0692863;RO=3;SAF=18;SAR=7;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0130117;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00647064;OID=.;OPOS=113887;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:25:30:29:29:0:20:9:0:0:18:3:18:7:2:1 chr16 138772 . A AG 418.3 PASS AO=50;DP=75;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.209903;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=13.0411;QD=24.606;RBI=0.222647;REFB=0;REVB=-0.0742453;RO=16;SAF=34;SAR=16;SRF=15;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141286;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00643904;OID=.;OPOS=138773;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:50:75:68:68:0:43:25:0:0:41:16:34:16:15:1 chr16 322934 . C T 91.33 PASS AO=16;DP=26;FAO=16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0957295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.5855;QD=14.0514;RBI=0.110207;REFB=-0.0328478;REVB=0.0546031;RO=10;SAF=10;SAR=6;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0558137;STB=0.531212;TYPE=snp;VARB=0.0285606;OID=.;OPOS=322934;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:26:26:10:10:16:16:6:10:7:3:6:10:7:3 chr16 324837 . A G 151.22 PASS AO=37;DP=71;FAO=35;FDP=72;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=10;FSRR=27;FWDB=-0.00796208;FXX=0.0270234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.7221;QD=8.40084;RBI=0.0240732;REFB=-0.023341;REVB=-0.0227184;RO=33;SAF=14;SAR=23;SRF=7;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157826;STB=0.526746;TYPE=snp;VARB=0.0247873;OID=.;OPOS=324837;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:72:33:37:37:35:23:14:7:26:24:11:10:27 chr16 336660 . G A 279.43 PASS AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013108;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.502;QD=38.542;RBI=0.0842307;REFB=0;REVB=0.0832045;RO=0;SAF=17;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.0947e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000521683;OID=.;OPOS=336660;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:29:29:0:0:29:29:12:17:0:0:12:17:0:0 chr16 455646 . A G 236.57 PASS AO=52;DP=110;FAO=56;FDP=113;FR=.;FRO=57;FSAF=19;FSAR=37;FSRF=23;FSRR=34;FWDB=0.00138727;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.47;QD=8.37404;RBI=0.0129806;REFB=-0.0399968;REVB=-0.0129063;RO=57;SAF=18;SAR=34;SRF=23;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0583583;STB=0.535295;TYPE=snp;VARB=0.0353874;OID=.;OPOS=455646;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:113:57:57:52:56:34:18:23:34:37:19:23:34 chr16 456416 . T G 84.78 PASS AO=16;DP=29;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=14;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.0133145;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.913;QD=11.6931;RBI=0.0301826;REFB=0.00464672;REVB=0.0270871;RO=13;SAF=14;SAR=2;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253422;STB=0.645939;TYPE=snp;VARB=-0.0043205;OID=.;OPOS=456416;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:29:29:13:13:16:16:2:14:9:4:2:14:9:4 chr16 546884 . G A 381.62 PASS AO=88;DP=179;FAO=92;FDP=184;FR=.;FRO=92;FSAF=49;FSAR=43;FSRF=36;FSRR=56;FWDB=0.00724097;FXX=0.00540511;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.694;QD=8.29614;RBI=0.0292796;REFB=-0.0121686;REVB=0.0283701;RO=69;SAF=47;SAR=41;SRF=32;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0567117;STB=0.570288;TYPE=snp;VARB=0.00810229;OID=.;OPOS=546884;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:184:69:92:88:92:41:47:32:37:43:49:36:56 chr16 547297 . T C 178.65 PASS AO=42;DP=87;FAO=42;FDP=87;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=-0.00307444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.913;QD=8.21375;RBI=0.00953894;REFB=-0.0233774;REVB=-0.0090299;RO=44;SAF=18;SAR=24;SRF=26;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148899;STB=0.577013;TYPE=snp;VARB=0.0231825;OID=.;OPOS=547297;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:44:45:42:42:24:18:26:18:24:18:26:19 chr16 570557 . T C 497.84 PASS AO=51;DP=51;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00916614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.691;QD=37.573;RBI=0.0102217;REFB=0;REVB=0.00452391;RO=0;SAF=16;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.5765e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.2771e-05;OID=.;OPOS=570557;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:51:53:0:0:51:53:35:16:0:0:37:16:0:0 chr16 593277 . T G 455.14 PASS AO=64;DP=118;FAO=83;FDP=133;FR=.;FRO=50;FSAF=45;FSAR=38;FSRF=23;FSRR=27;FWDB=0.00858716;FXX=0.00746213;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.831;QD=13.6883;RBI=0.00900132;REFB=-0.0261298;REVB=-0.002699;RO=47;SAF=27;SAR=37;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0197565;STB=0.530942;TYPE=snp;VARB=0.0118775;OID=.;OPOS=593277;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:133:47:50:64:83:37:27:21:26:38:45:23:27 chr16 597813 . C T 38.93 PASS AO=12;DP=36;FAO=12;FDP=36;FR=.;FRO=24;FSAF=0;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=24;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.6087;QD=4.32522;RBI=0.0142512;REFB=0.00193606;REVB=0.0142512;RO=21;SAF=0;SAR=12;SRF=0;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00407948;OID=.;OPOS=597813;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:36:36:21:24:12:12:12:0:0:21:12:0:0:24 chr16 601632 . T C 131.88 PASS AO=31;DP=65;FAO=31;FDP=65;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=-0.0499333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7413;QD=8.11551;RBI=0.071332;REFB=-0.0639621;REVB=-0.0509404;RO=34;SAF=14;SAR=17;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0657862;STB=0.536808;TYPE=snp;VARB=0.0490156;OID=.;OPOS=601632;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:34:34:31:31:17:14:13:21:17:14:13:21 chr16 602430 . C T 15.23 PASS AO=4;DP=15;FAO=4;FDP=15;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=1;FWDB=0.0882222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.0928;QD=4.06181;RBI=0.0890271;REFB=-0.0165183;REVB=0.0119444;RO=11;SAF=2;SAR=2;SRF=10;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.488976;STB=0.799036;TYPE=snp;VARB=0.0299475;OID=.;OPOS=602430;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:15:15:11:11:4:4:2:2:10:1:2:2:10:1 chr16 603471 . A G 46.91 PASS AO=13;DP=35;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=-0.0600313;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.4471;QD=5.36066;RBI=0.0602032;REFB=-0.0130455;REVB=-0.00454663;RO=20;SAF=1;SAR=12;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.477545;STB=0.779924;TYPE=snp;VARB=0.0118369;OID=.;OPOS=603471;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:35:35:20:22:13:13:12:1:7:13:12:1:7:15 chr16 679814 . T C 342.48 PASS AO=33;DP=39;FAO=38;FDP=40;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=34;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0571042;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7389;QD=34.2476;RBI=0.0585352;REFB=-0.0255686;REVB=0.0128639;RO=1;SAF=1;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0143836;STB=0.59994;TYPE=snp;VARB=0.00201361;OID=.;OPOS=679814;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:39:40:1:2:33:38:32:1:0:1:34:4:2:0 chr16 705795 . C T 68.22 PASS AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.014;QD=30.322;RBI=0.0919687;REFB=-0.200138;REVB=0.0919687;RO=1;SAF=0;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.04745;OID=.;OPOS=705795;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:9:9:1:1:8:8:8:0:0:1:8:0:0:1 chr16 775053 . GGC G,GG 338.14 PASS AO=4,8;DP=56;FAO=47,0;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=41,0;FSAR=6,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.098739,-0.23821;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=2,1;MLLD=19.548,9.36563;QD=28.7778;RBI=0.182151,0.88478;REFB=0,0;REVB=-0.153068,0.85211;RO=5;SAF=4,8;SAR=0,0;SRF=3;SRR=2;SSEN=0.418605,0;SSEP=0,0.436937;SSSB=0.700982,0.782212;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.00107813,0;OID=.,.;OPOS=775054,775055;OREF=GC,C;OALT=-,-;OMAPALT=G,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:4,8:22:47,0:47:0:41,0:6,0:0:0:31:5:4,8:0,0:3:2 chr16 813650 . G A 207.11 PASS AO=43;DP=80;FAO=43;FDP=80;FR=.;FRO=37;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=13;FSRR=24;FWDB=0.00954664;FXX=0.0588166;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.189;QD=10.3556;RBI=0.0108903;REFB=-0.0115318;REVB=0.00524026;RO=24;SAF=18;SAR=25;SRF=4;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176417;STB=0.532272;TYPE=snp;VARB=0.01428;OID=.;OPOS=813650;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:24:37:43:43:25:18:4:20:25:18:13:24 chr16 814924 . GGC G 35.33 PASS AO=6;DP=28;FAO=12;FDP=15;FR=.;FRO=3;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0311095;FXX=0.249875;HRUN=4;LEN=2;MLLD=14.7476;QD=9.42147;RBI=0.281376;REFB=-0.250164;REVB=-0.279651;RO=13;SAF=6;SAR=0;SRF=10;SRR=3;SSEN=0.404762;SSEP=0;SSSB=0.687665;STB=0.59984;TYPE=del;VARB=0.133192;OID=.;OPOS=814925;OREF=GC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:6:20:12:15:3:6:6:3:0:11:13:6:0:10:3 chr16 818559 . A G 39.77 PASS AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.0165931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.611;QD=12.2377;RBI=0.0442037;REFB=-0.0314882;REVB=0.0409712;RO=6;SAF=5;SAR=2;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.329175;STB=0.6871;TYPE=snp;VARB=0.0377376;OID=.;OPOS=818559;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:13:13:6:6:7:7:2:5:6:0:2:5:6:0 chr16 818802 . G A 26.7 PASS AO=7;DP=21;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=0.00350011;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.745;QD=5.08661;RBI=0.012892;REFB=0.00416043;REVB=0.0124078;RO=13;SAF=3;SAR=4;SRF=2;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.322577;STB=0.651795;TYPE=snp;VARB=-0.0077926;OID=.;OPOS=818802;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:21:21:13:14:7:7:4:3:2:11:4:3:3:11 chr16 820888 . T C 73.97 PASS AO=22;DP=66;FAO=23;FDP=67;FR=.;FRO=44;FSAF=20;FSAR=3;FSRF=29;FSRR=15;FWDB=-0.0183623;FXX=0.0694348;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.289;QD=4.416;RBI=0.0504549;REFB=-0.00805789;REVB=-0.0469949;RO=44;SAF=20;SAR=2;SRF=29;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.453158;STB=0.709841;TYPE=snp;VARB=0.0246247;OID=.;OPOS=820888;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:66:67:44:44:22:23:2:20:29:15:3:20:29:15 chr16 820944 . T A 188.79 PASS AO=41;DP=84;FAO=43;FDP=87;FR=.;FRO=44;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=-0.00502132;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.7261;QD=8.6799;RBI=0.0273785;REFB=-0.018438;REVB=0.0269141;RO=39;SAF=23;SAR=18;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0652895;STB=0.505374;TYPE=snp;VARB=0.0190414;OID=.;OPOS=820944;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:87:39:44:41:43:18:23:19:20:20:23:24:20 chr16 835298 . C T 23.57 PASS AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.0073855;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.549;QD=5.23862;RBI=0.0247532;REFB=-0.0192565;REVB=0.0236257;RO=12;SAF=3;SAR=3;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177981;STB=0.610759;TYPE=snp;VARB=0.0351951;OID=.;OPOS=835298;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:18:18:12:12:6:6:3:3:8:4:3:3:8:4 chr16 839262 . A G 711.34 PASS AO=52;DP=77;FAO=75;FDP=75;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=43;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.18597;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2244;QD=37.9383;RBI=0.186276;REFB=0;REVB=-0.0106824;RO=1;SAF=20;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229661;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00132578;OID=.;OPOS=839262;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:74:75:1:0:52:75:32:20:1:0:32:43:0:0 chr16 839996 . T C 85.04 PASS AO=28;DP=75;FAO=27;FDP=75;FR=.;FRO=48;FSAF=5;FSAR=22;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=-0.0386115;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.0042;QD=4.53554;RBI=0.127753;REFB=-0.0185006;REVB=-0.121778;RO=47;SAF=5;SAR=23;SRF=27;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.471195;STB=0.765838;TYPE=snp;VARB=0.0298367;OID=.;OPOS=839996;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:75:75:47:48:28:27:23:5:27:20:22:5:27:21 chr16 840014 . A C 82.36 PASS AO=26;DP=77;FAO=27;FDP=77;FR=.;FRO=50;FSAF=5;FSAR=22;FSRF=30;FSRR=20;FWDB=-0.0213263;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.136;QD=4.27845;RBI=0.0229434;REFB=-0.00557344;REVB=0.00846082;RO=50;SAF=5;SAR=21;SRF=30;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.481409;STB=0.785492;TYPE=snp;VARB=0.0117861;OID=.;OPOS=840014;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:77:77:50:50:26:27:21:5:30:20:22:5:30:20 chr16 840378 . A G 27.8 PASS AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.0507798;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.149;QD=5.56002;RBI=0.105633;REFB=-0.0366644;REVB=-0.0926268;RO=13;SAF=5;SAR=2;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.34615;STB=0.713673;TYPE=snp;VARB=0.0721289;OID=.;OPOS=840378;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:20:20:13:13:7:7:2:5:5:8:2:5:5:8 chr16 840409 . T C 15.21 PASS AO=4;DP=15;FAO=4;FDP=15;FR=.;FRO=11;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.0174568;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.102;QD=4.05615;RBI=0.0748728;REFB=-0.00186151;REVB=-0.0728093;RO=11;SAF=1;SAR=3;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.241825;STB=0.665779;TYPE=snp;VARB=0.0051915;OID=.;OPOS=840409;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:15:15:11:11:4:4:3:1:5:6:3:1:5:6 chr16 842450 . C T 13.43 PASS AO=3;DP=11;FAO=3;FDP=11;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.00700129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.792;QD=4.88245;RBI=0.0399693;REFB=-0.00235522;REVB=0.0393514;RO=8;SAF=1;SAR=2;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.296653;STB=0.704562;TYPE=snp;VARB=0.00790696;OID=.;OPOS=842450;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:11:11:8:8:3:3:2:1:5:3:2:1:5:3 chr16 847743 . C T 78.37 PASS AO=8;DP=48;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=0;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=27;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=248.207;QD=6.67014;RBI=0.00432883;REFB=-0.0259808;REVB=-0.00432883;RO=22;SAF=0;SAR=8;SRF=0;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0407881;OID=.;OPOS=847743;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:34:47:22:27:8:20:8:0:0:22:20:0:0:27 chr16 855717 . C G 49.23 PASS AO=18;DP=58;FAO=18;FDP=58;FR=.;FRO=40;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=27;FWDB=0.00350776;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.671;QD=3.39535;RBI=0.0251047;REFB=0.00127674;REVB=0.0248584;RO=40;SAF=5;SAR=13;SRF=13;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0654663;STB=0.539126;TYPE=snp;VARB=-0.00325447;OID=.;OPOS=855717;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:58:58:40:40:18:18:13:5:13:27:13:5:13:27 chr16 943317 . C CT 78.58 PASS AO=27;DP=65;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=3;FSAR=26;FSRF=5;FSRR=27;FWDB=0.138683;FXX=0.0468677;HRUN=3;LEN=1;MLLD=22.2278;QD=5.15302;RBI=0.21705;REFB=0.00472497;REVB=0.166966;RO=35;SAF=3;SAR=24;SRF=6;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132337;STB=0.566707;TYPE=ins;VARB=0.0183314;OID=.;OPOS=943318;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:27:65:29:61:32:3:26:5:27:78:35:3:24:6:29 chr16 943361 . T C 329.76 PASS AO=72;DP=138;FAO=73;FDP=138;FR=.;FRO=65;FSAF=5;FSAR=68;FSRF=8;FSRR=57;FWDB=-0.0165557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.6028;QD=9.55826;RBI=0.0209414;REFB=-0.0328207;REVB=0.0128239;RO=66;SAF=5;SAR=67;SRF=8;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147931;STB=0.585792;TYPE=snp;VARB=0.034872;OID=.;OPOS=943361;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:66:65:72:73:67:5:8:58:68:5:8:57 chr16 1034834 . T C 187.24 PASS AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0496721;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.6934;QD=37.4487;RBI=0.0732831;REFB=0;REVB=-0.0538804;RO=0;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0487e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00419005;OID=.;OPOS=1034834;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:21:20:0:0:20:20:11:9:0:0:11:9:0:0 chr16 1252369 . C T 40.84 PASS AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.0255353;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.583;QD=6.53472;RBI=0.0289491;REFB=-0.0158106;REVB=0.0136382;RO=15;SAF=8;SAR=2;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.480118;STB=0.786298;TYPE=snp;VARB=0.0185084;OID=.;OPOS=1252369;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:25:25:15:15:10:10:2:8:5:10:2:8:5:10 chr16 1260481 . T C 380.79 PASS AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00142569;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.736;QD=39.0558;RBI=0.00477979;REFB=0;REVB=0.00456222;RO=0;SAF=16;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43889e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000513223;OID=.;OPOS=1260481;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:39:39:0:0:39:39:23:16:0:0:23:16:0:0 chr16 1261219 . A G 121.71 PASS AO=33;DP=78;FAO=33;FDP=79;FR=.;FRO=46;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=27;FWDB=-0.0378444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.715;QD=6.16252;RBI=0.0555465;REFB=-0.0327653;REVB=-0.0406596;RO=45;SAF=20;SAR=13;SRF=18;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209065;STB=0.612021;TYPE=snp;VARB=0.0530348;OID=.;OPOS=1261219;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:79:45:46:33:33:13:20:18:27:13:20:19:27 chr16 1261222 . A G 118.89 PASS AO=32;DP=77;FAO=32;FDP=76;FR=.;FRO=44;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=27;FWDB=-0.032601;FXX=0.0256377;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.5344;QD=6.2576;RBI=0.0572491;REFB=-0.0449528;REVB=-0.0470599;RO=44;SAF=20;SAR=12;SRF=17;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242454;STB=0.63717;TYPE=snp;VARB=0.0666038;OID=.;OPOS=1261222;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:76:44:44:32:32:12:20:17:27:12:20:17:27 chr16 1261282 . T C 449.72 PASS AO=48;DP=50;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0104968;FXX=0.019996;HRUN=4;LEN=1;MLLD=262.808;QD=36.7119;RBI=0.0177431;REFB=0.00710062;REVB=-0.0143051;RO=1;SAF=16;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0284913;STB=0.515145;TYPE=snp;VARB=-6.33543e-05;OID=.;OPOS=1261282;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:50:49:1:1:48:48:32:16:1:0:32:16:1:0 chr16 1268485 . C T 145.16 PASS AO=21;DP=28;FAO=21;FDP=28;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0185186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.511;QD=20.7376;RBI=0.0198782;REFB=-0.030543;REVB=-0.00722522;RO=7;SAF=5;SAR=16;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0293485;STB=0.516113;TYPE=snp;VARB=0.00297137;OID=.;OPOS=1268485;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:28:28:7:7:21:21:16:5:2:5:16:5:2:5 chr16 1268494 . C T 17.62 PASS AO=6;DP=24;FAO=6;FDP=24;FR=.;FRO=18;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=0.0044985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.1633;QD=2.93584;RBI=0.0357139;REFB=-0.0268039;REVB=-0.0354294;RO=18;SAF=1;SAR=5;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185376;STB=0.624531;TYPE=snp;VARB=0.0158368;OID=.;OPOS=1268494;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:24:24:18:18:6:6:5:1:5:13:5:1:5:13 chr16 1270111 . G A 326.14 PASS AO=60;DP=96;FAO=60;FDP=98;FR=.;FRO=38;FSAF=13;FSAR=47;FSRF=13;FSRR=25;FWDB=0.0291818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.209;QD=13.3116;RBI=0.0292817;REFB=-0.012962;REVB=-0.00241689;RO=36;SAF=13;SAR=47;SRF=12;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110075;STB=0.566242;TYPE=snp;VARB=0.00370087;OID=.;OPOS=1270111;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:98:36:38:60:60:47:13:12:24:47:13:13:25 chr16 1270162 . G A 76.59 PASS AO=22;DP=54;FAO=21;FDP=53;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=27;FWDB=-0.0763078;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.735;QD=5.78036;RBI=0.102879;REFB=-0.0368807;REVB=0.0690015;RO=31;SAF=9;SAR=13;SRF=4;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.322661;STB=0.654273;TYPE=snp;VARB=0.0594231;OID=.;OPOS=1270162;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:54:53:31:32:22:21:13:9:4:27:13:8:5:27 chr16 1270349 . T C 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0373845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.14;QD=33.022;RBI=0.0398151;REFB=0;REVB=0.0136981;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00129249;OID=.;OPOS=1270349;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:3:3:0:0:3:3:0:0 chr16 1271890 . G T 114.75 PASS AO=19;DP=30;FAO=19;FDP=30;FR=.;FRO=11;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.000907068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.944;QD=15.3003;RBI=0.0631639;REFB=-0.00146621;REVB=0.0631574;RO=11;SAF=14;SAR=5;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148936;STB=0.583241;TYPE=snp;VARB=0.00148784;OID=.;OPOS=1271890;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:30:30:11:11:19:19:5:14:6:5:5:14:6:5 chr16 1272038 . G A 170.86 PASS AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00187837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.922;QD=37.9682;RBI=0.0219941;REFB=0;REVB=0.0219138;RO=0;SAF=1;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000338227;OID=.;OPOS=1272038;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:18:0:0:18:18:17:1:0:0:17:1:0:0 chr16 1272865 . G A 1083.25 PASS AO=124;DP=125;FAO=121;FDP=126;FR=.;FRO=5;FSAF=59;FSAR=62;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.00203712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.636;QD=34.3888;RBI=0.0020401;REFB=0.0142097;REVB=0.000110207;RO=1;SAF=60;SAR=64;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00785291;STB=0.503479;TYPE=snp;VARB=-0.000119153;OID=.;OPOS=1272865;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:125:126:1:5:124:121:64:60:1:0:62:59:2:3 chr16 1278744 . C T 68.7 PASS AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0159794;FXX=0.142789;HRUN=4;LEN=1;MLLD=158.705;QD=15.2657;RBI=0.0655365;REFB=-0.0141515;REVB=0.0635586;RO=7;SAF=7;SAR=4;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145526;STB=0.583179;TYPE=snp;VARB=0.00787018;OID=.;OPOS=1278744;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:18:18:7:7:11:11:4:7:3:4:4:7:3:4 chr16 1278767 . C T 62.47 PASS AO=10;DP=15;FAO=10;FDP=15;FR=.;FRO=5;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0524991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.637;QD=16.6591;RBI=0.0525445;REFB=-0.0360701;REVB=0.00218462;RO=5;SAF=8;SAR=2;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160449;STB=0.592391;TYPE=snp;VARB=0.0195411;OID=.;OPOS=1278767;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:15:15:5:5:10:10:2:8:3:2:2:8:3:2 chr16 1279574 . C G 17.41 PASS AO=4;DP=13;FAO=4;FDP=13;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.0143148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.679;QD=5.35682;RBI=0.0159303;REFB=-0.0207871;REVB=0.00699002;RO=9;SAF=2;SAR=2;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0579645;STB=0.53827;TYPE=snp;VARB=0.0691976;OID=.;OPOS=1279574;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:13:13:9:9:4:4:2:2:5:4:2:2:5:4 chr16 1279584 . T C 17.35 PASS AO=4;DP=13;FAO=4;FDP=13;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.0305127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.348;QD=5.3395;RBI=0.0516725;REFB=-0.0112478;REVB=-0.0417016;RO=9;SAF=2;SAR=2;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0579645;STB=0.53827;TYPE=snp;VARB=0.0871784;OID=.;OPOS=1279584;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:13:13:9:9:4:4:2:2:5:4:2:2:5:4 chr16 1279623 . G A 35.34 PASS AO=4;DP=20;FAO=8;FDP=21;FR=.,HEALED;FRO=13;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.00409369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2785;QD=6.73061;RBI=0.0171478;REFB=-0.00641385;REVB=-0.0166519;RO=9;SAF=1;SAR=3;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225088;STB=0.571254;TYPE=snp;VARB=0.015966;OID=.;OPOS=1279623;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:17:21:9:13:4:8:3:1:4:5:4:4:5:8 chr16 1279704 . A G 10.16 PASS AO=3;DP=13;FAO=3;FDP=15;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.0123313;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.0348;QD=2.70883;RBI=0.0410853;REFB=-0.0145482;REVB=-0.039191;RO=10;SAF=1;SAR=2;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181205;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0456276;OID=.;OPOS=1279704;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:13:15:10:12:3:3:2:1:2:8:2:1:4:8 chr16 1279710 . G A 12.51 PASS AO=3;DP=11;FAO=3;FDP=12;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.0442604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.0587;QD=4.17138;RBI=0.073673;REFB=-0.0189443;REVB=0.0588959;RO=7;SAF=1;SAR=2;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.056032;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0443406;OID=.;OPOS=1279710;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:11:12:7:9:3:3:2:1:2:5:2:1:3:6 chr16 1279714 . A G 12.53 PASS AO=3;DP=11;FAO=3;FDP=12;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.0537193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.843;QD=4.17575;RBI=0.0787291;REFB=-0.00629271;REVB=-0.0575543;RO=8;SAF=1;SAR=2;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103748;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0249008;OID=.;OPOS=1279714;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:11:12:8:9:3:3:2:1:2:6:2:1:3:6 chr16 1279717 . C T 12.53 PASS AO=3;DP=11;FAO=3;FDP=12;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0801473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.029;QD=4.17567;RBI=0.0827933;REFB=-0.0154968;REVB=-0.0207639;RO=8;SAF=1;SAR=2;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103748;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.040205;OID=.;OPOS=1279717;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:11:12:8:9:3:3:2:1:2:6:2:1:3:6 chr16 1291597 . C G 20.85 PASS AO=8;DP=32;FAO=8;FDP=32;FR=.;FRO=24;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=20;FWDB=-0.00566024;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.811;QD=2.60637;RBI=0.0121908;REFB=-0.0145659;REVB=0.0107971;RO=23;SAF=1;SAR=7;SRF=4;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113398;STB=0.56434;TYPE=snp;VARB=0.0357755;OID=.;OPOS=1291597;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:32:32:23:24:8:8:7:1:4:19:7:1:4:20 chr16 1306671 . G A 54.22 PASS AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.038294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.122;QD=8.34225;RBI=0.0398625;REFB=-0.00699133;REVB=0.011072;RO=14;SAF=3;SAR=9;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121912;STB=0.571303;TYPE=snp;VARB=0.0146153;OID=.;OPOS=1306671;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:26:26:14:14:12:12:9:3:5:9:9:3:5:9 chr16 1306681 . G A 42.66 PASS AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.00632093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.84;QD=7.10978;RBI=0.0272404;REFB=-0.0397861;REVB=0.0264969;RO=14;SAF=2;SAR=8;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202882;STB=0.621953;TYPE=snp;VARB=0.0320168;OID=.;OPOS=1306681;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:24:24:14:14:10:10:8:2:5:9:8:2:5:9 chr16 1306918 . C T 15.26 PASS AO=14;DP=81;FAO=14;FDP=81;FR=.;FRO=67;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=28;FSRR=39;FWDB=-0.00755437;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.787;QD=0.753414;RBI=0.0287475;REFB=-0.002682;REVB=-0.0277371;RO=61;SAF=10;SAR=4;SRF=26;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.35557;STB=0.738501;TYPE=snp;VARB=0.020843;OID=.;OPOS=1306918;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:81:81:61:67:14:14:4:10:26:35:4:10:28:39 chr16 1306921 . G A 19.85 PASS AO=15;DP=78;FAO=15;FDP=78;FR=.;FRO=63;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=29;FSRR=34;FWDB=-0.0128538;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=219.56;QD=1.01793;RBI=0.0173332;REFB=-0.00116373;REVB=0.0116284;RO=63;SAF=10;SAR=5;SRF=29;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.258357;STB=0.666445;TYPE=snp;VARB=0.00714059;OID=.;OPOS=1306921;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:78:78:63:63:15:15:5:10:29:34:5:10:29:34 chr16 1306927 . C T 15.95 PASS AO=15;DP=88;FAO=15;FDP=86;FR=.;FRO=71;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=28;FSRR=43;FWDB=0.0467789;FXX=0.0227247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.6144;QD=0.742014;RBI=0.0624292;REFB=-0.0102812;REVB=0.0413418;RO=71;SAF=10;SAR=5;SRF=28;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.333276;STB=0.716144;TYPE=snp;VARB=0.0156892;OID=.;OPOS=1306927;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:88:86:71:71:15:15:5:10:28:43:5:10:28:43 chr16 1306971 . A G 21.14 PASS AO=17;DP=89;FAO=17;FDP=89;FR=.;FRO=72;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=33;FSRR=39;FWDB=-0.0172927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.033;QD=0.950037;RBI=0.0934368;REFB=-0.00794721;REVB=-0.0918226;RO=71;SAF=11;SAR=6;SRF=33;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229255;STB=0.651996;TYPE=snp;VARB=0.0459134;OID=.;OPOS=1306971;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:89:89:71:72:17:17:6:11:33:38:6:11:33:39 chr16 1306973 . A G 18.4 PASS AO=16;DP=88;FAO=16;FDP=88;FR=.;FRO=72;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=33;FSRR=39;FWDB=-0.0412889;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7982;QD=0.836505;RBI=0.0972485;REFB=-0.0164683;REVB=-0.0880482;RO=71;SAF=10;SAR=6;SRF=33;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201058;STB=0.635425;TYPE=snp;VARB=0.066378;OID=.;OPOS=1306973;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:88:88:71:72:16:16:6:10:33:38:6:10:33:39 chr16 1306986 . C T 23.79 PASS AO=17;DP=84;FAO=17;FDP=84;FR=.;FRO=67;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=27;FSRR=40;FWDB=0.0268734;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.6746;QD=1.13303;RBI=0.0410796;REFB=0.00152775;REVB=0.0310701;RO=67;SAF=11;SAR=6;SRF=27;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.300029;STB=0.689159;TYPE=snp;VARB=-0.00363106;OID=.;OPOS=1306986;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:84:84:67:67:17:17:6:11:27:40:6:11:27:40 chr16 1311333 . A G 67.91 PASS AO=6;DP=30;FAO=9;FDP=31;FR=.,HEALED;FRO=16;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0190924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.066;QD=8.76233;RBI=0.026991;REFB=-0.0295039;REVB=0.0190787;RO=15;SAF=6;SAR=0;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.724028;STB=0.817349;TYPE=snp;VARB=0.039813;OID=.;OPOS=1311333;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:28:31:15:16:6:9:0:6:8:7:1:8:8:8 chr16 1312546 . T A 159.86 PASS AO=29;DP=53;FAO=32;FDP=58;FR=.;FRO=26;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0130887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.7;QD=11.0248;RBI=0.0219397;REFB=-0.0137392;REVB=-0.0176078;RO=24;SAF=16;SAR=13;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109943;STB=0.560006;TYPE=snp;VARB=0.011503;OID=.;OPOS=1312546;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:58:24:26:29:32:13:16:10:14:13:19:12:14 chr16 1312826 . A G 108.73 PASS AO=27;DP=61;FAO=27;FDP=61;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=-0.0169355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.6861;QD=7.12949;RBI=0.0210931;REFB=-0.0202599;REVB=-0.0125741;RO=34;SAF=16;SAR=11;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00443704;STB=0.502511;TYPE=snp;VARB=0.0169467;OID=.;OPOS=1312826;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:34:34:27:27:11:16:20:14:11:16:20:14 chr16 1370597 . G C 244.46 PASS AO=24;DP=25;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0360892;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.304;QD=34.9229;RBI=0.0494618;REFB=-0.121223;REVB=0.0338237;RO=0;SAF=8;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512811;TYPE=snp;VARB=0.00161411;OID=.;OPOS=1370597;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:25:28:0:1:24:27:16:8:0:0:19:8:0:1 chr16 1370614 . C G 201.2 PASS AO=14;DP=19;FAO=22;FDP=22;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=4;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00506489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.3087;QD=36.5819;RBI=0.112316;REFB=0;REVB=0.112202;RO=0;SAF=4;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.63386e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0018175;OID=.;OPOS=1370614;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:19:22:0:0:14:22:10:4:0:0:18:4:0:0 chr16 1370630 . A G 182.69 PASS AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0686563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.2404;QD=38.46;RBI=0.0757555;REFB=0;REVB=-0.0320189;RO=0;SAF=2;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.41729e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000677815;OID=.;OPOS=1370630;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:19:19:0:0:19:19:17:2:0:0:17:2:0:0 chr16 1374818 . A G 93.55 PASS AO=23;DP=52;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.00180837;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=262.233;QD=7.19598;RBI=0.0154993;REFB=-0.0141685;REVB=-0.0153935;RO=29;SAF=9;SAR=14;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125424;STB=0.571366;TYPE=snp;VARB=0.0177329;OID=.;OPOS=1374818;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:52:52:29:29:23:23:14:9:15:14:14:9:15:14 chr16 1389153 . C A 180.68 PASS AO=19;DP=23;FAO=22;FDP=25;FR=.;FRO=3;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0702509;FXX=0.0740466;HRUN=4;LEN=1;MLLD=40.7355;QD=28.9082;RBI=0.157215;REFB=-0.215346;REVB=0.140646;RO=3;SAF=12;SAR=7;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161263;STB=0.565158;TYPE=snp;VARB=0.0321731;OID=.;OPOS=1389153;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:23:25:3:3:19:22:7:12:0:3:10:12:0:3 chr16 1393020 . G A 158.7 PASS AO=16;DP=16;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.109466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.108;QD=37.3414;RBI=0.116408;REFB=0;REVB=0.0395977;RO=0;SAF=6;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00280622;OID=.;OPOS=1393020;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:16:17:0:0:16:17:10:6:0:0:10:7:0:0 chr16 1394507 . A C 838.14 PASS AO=79;DP=80;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00805939;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.8541;QD=37.6694;RBI=0.0257526;REFB=0;REVB=0.024459;RO=0;SAF=39;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33478e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00106042;OID=.;OPOS=1394507;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:80:89:0:0:79:89:40:39:0:0:49:40:0:0 chr16 1397815 . C T 125.84 PASS AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.079268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.512;QD=35.9534;RBI=0.0793075;REFB=0;REVB=0.00250491;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000441369;OID=.;OPOS=1397815;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:14:14:0:0:14:14:8:6:0:0:8:6:0:0 chr16 1414910 . T C 46.77 PASS AO=17;DP=56;FAO=17;FDP=55;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=0.00107022;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.145;QD=3.40119;RBI=0.0132805;REFB=-0.00332211;REVB=-0.0132373;RO=38;SAF=12;SAR=5;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.357829;STB=0.713127;TYPE=snp;VARB=0.0134904;OID=.;OPOS=1414910;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:56:55:38:38:17:17:5:12:15:23:5:12:15:23 chr16 1417778 . C G 10.8 PASS AO=2;DP=6;FAO=2;FDP=6;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=21.9569;QD=7.19737;RBI=0.0694488;REFB=-0.0921478;REVB=0.0694488;RO=4;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.130962;OID=.;OPOS=1417778;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:4:4:2:2:2:0:0:4:2:0:0:4 chr16 1419947 . A G 201.65 PASS AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00435688;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.384;QD=36.6634;RBI=0.0150307;REFB=0;REVB=0.0143854;RO=0;SAF=13;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2029e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.8129e-05;OID=.;OPOS=1419947;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:22:22:0:0:22:22:9:13:0:0:9:13:0:0 chr16 1433766 . T C 771.05 PASS AO=79;DP=79;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00427415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.3184;QD=38.5526;RBI=0.0364729;REFB=0;REVB=-0.0362216;RO=0;SAF=41;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.67198e-05;OID=.;OPOS=1433766;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:79:80:0:0:79:80:38:41:0:0:38:42:0:0 chr16 1447278 . A G 296.8 PASS AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.046658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.311;QD=37.0993;RBI=0.0531994;REFB=0;REVB=0.0255579;RO=0;SAF=12;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000436501;OID=.;OPOS=1447278;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:32:32:0:0:32:32:20:12:0:0:20:12:0:0 chr16 1484392 . G C 392.42 PASS AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000931026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.1407;QD=37.3729;RBI=0.104542;REFB=0;REVB=0.104538;RO=0;SAF=19;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00148288;OID=.;OPOS=1484392;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:42:42:0:0:42:42:23:19:0:0:23:19:0:0 chr16 1484473 . A G 339.35 PASS AO=34;DP=34;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.502;QD=37.7055;RBI=0.0277066;REFB=0;REVB=-0.0248068;RO=0;SAF=13;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.45505e-05;OID=.;OPOS=1484473;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:34:36:0:0:34:36:21:13:0:0:22:14:0:0 chr16 1503879 . T A 220.89 PASS AO=57;DP=126;FAO=57;FDP=126;FR=.;FRO=69;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=44;FSRR=25;FWDB=-0.00666963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.653;QD=7.01224;RBI=0.00668064;REFB=-0.0266554;REVB=0.000383404;RO=68;SAF=26;SAR=31;SRF=43;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170894;STB=0.598422;TYPE=snp;VARB=0.0257671;OID=.;OPOS=1503879;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:68:69:57:57:31:26:43:25:31:26:44:25 chr16 1536321 . CAA CA,CAG 122.58 PASS AO=4,9;DP=15;FAO=5,9;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=4,4;FSAR=1,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0734881,-0.0993991;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=27.7777,33.0303;QD=35.0226;RBI=0.0877965,0.121477;REFB=0,0;REVB=-0.0480389,-0.0698322;RO=0;SAF=3,4;SAR=1,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.86674e-08,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.0255852,0.0323999;OID=.,.;OPOS=1536322,1536323;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=CA,CAG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:4,9:14:5,9:14:0:4,4:1,5:0:0:18:0:3,4:1,5:0:0 chr16 1536379 . A AT 108.64 PASS AO=2;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0773759;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=161.105;QD=33.4286;RBI=0.0834657;REFB=0;REVB=0.0312968;RO=11;SAF=1;SAR=1;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142187;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00128723;OID=.;OPOS=1536380;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:2:13:13:13:0:5:8:0:0:6:11:1:1:4:7 chr16 1536380 . G T 83.07 PASS AO=11;DP=13;FAO=11;FDP=13;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00826628;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=181.975;QD=25.5599;RBI=0.0345554;REFB=-0.0565668;REVB=0.0335521;RO=2;SAF=4;SAR=7;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0399473;STB=0.522347;TYPE=snp;VARB=0.00294978;OID=.;OPOS=1536380;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:13:13:2:2:11:11:7:4:1:1:7:4:1:1 chr16 1536499 . G T 294.96 PASS AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151738;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.647;QD=36.8705;RBI=0.0989159;REFB=0;REVB=0.0977452;RO=0;SAF=19;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00108457;OID=.;OPOS=1536499;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:32:32:0:0:32:32:13:19:0:0:13:19:0:0 chr16 1536535 . C T 191.55 PASS AO=25;DP=29;FAO=25;FDP=29;FR=.;FRO=4;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0435421;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2815;QD=26.421;RBI=0.043726;REFB=-0.0234286;REVB=-0.00400548;RO=3;SAF=13;SAR=12;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0957196;STB=0.566615;TYPE=snp;VARB=0.0181858;OID=.;OPOS=1536535;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:29:29:3:4:25:25:12:13:3:0:12:13:4:0 chr16 1537414 . C T 192 PASS AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0717243;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9018;QD=33.3921;RBI=0.0739926;REFB=-0.120222;REVB=0.0181805;RO=1;SAF=14;SAR=8;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.031885;STB=0.517226;TYPE=snp;VARB=0.00958524;OID=.;OPOS=1537414;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:23:23:1:1:22:22:8:14:1:0:8:14:1:0 chr16 1537455 . T C 70.97 PASS AO=7;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.320817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.3378;QD=35.4848;RBI=0.322303;REFB=0;REVB=0.0309187;RO=0;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00800821;OID=.;OPOS=1537455;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:7:8:7:0:0:0:7:1:0:0 chr16 1537693 . C A 79.86 PASS AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0278097;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.158;QD=31.9423;RBI=0.056867;REFB=-0.0313323;REVB=0.0496031;RO=1;SAF=8;SAR=1;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.28888;STB=0.666218;TYPE=snp;VARB=0.00201649;OID=.;OPOS=1537693;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:10:10:1:1:9:9:1:8:0:1:1:8:0:1 chr16 1538363 . C A 710.54 PASS AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0510077;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=228.503;QD=36.911;RBI=0.0610655;REFB=-0.0517123;REVB=0.0335738;RO=1;SAF=51;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00918967;STB=0.504853;TYPE=snp;VARB=0.000181903;OID=.;OPOS=1538363;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:77:77:1:1:76:76:25:51:1:0:25:51:1:0 chr16 1545448 . A G 77.87 PASS AO=17;DP=41;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.0140502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.7795;QD=7.244;RBI=0.0189418;REFB=-0.0304973;REVB=0.0127037;RO=24;SAF=10;SAR=7;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0481477;STB=0.521175;TYPE=snp;VARB=0.0336149;OID=.;OPOS=1545448;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:41:43:24:24:17:19:7:10:13:11:8:11:13:11 chr16 1545511 . TG T 66.74 PASS AO=21;DP=40;FAO=25;FDP=36;FR=.;FRO=11;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=0;FWDB=-0.0552395;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.1481;QD=7.41551;RBI=0.137678;REFB=-0.0737985;REVB=-0.126111;RO=10;SAF=10;SAR=11;SRF=10;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0.372913;SSSB=-0.304641;STB=0.677286;TYPE=del;VARB=0.0116429;OID=.;OPOS=1545512;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:21:35:25:36:11:10:15:11:0:19:10:10:11:10:0 chr16 1551750 . C T 62.94 PASS AO=5;DP=22;FAO=11;FDP=20;FR=.,HEALED;FRO=9;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.0856365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.545;QD=12.5882;RBI=0.0858454;REFB=-0.0241891;REVB=0.00598581;RO=2;SAF=5;SAR=0;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.642612;TYPE=snp;VARB=0.0270703;OID=.;OPOS=1551750;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:14:20:2:9:5:11:0:5:2:0:5:6:2:7 chr16 1555589 . A G 99.49 PASS AO=17;DP=27;FAO=17;FDP=27;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=-0.0291011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.322;QD=14.739;RBI=0.0320337;REFB=0.0072869;REVB=-0.0133897;RO=10;SAF=2;SAR=15;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117016;STB=0.565952;TYPE=snp;VARB=-0.00298017;OID=.;OPOS=1555589;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:27:27:10:10:17:17:15:2:2:8:15:2:2:8 chr16 1559838 . T C 86.7 PASS AO=22;DP=52;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.0130287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.442;QD=6.42237;RBI=0.0137143;REFB=-0.0367458;REVB=-0.00428171;RO=28;SAF=17;SAR=5;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.305269;STB=0.67748;TYPE=snp;VARB=0.0212865;OID=.;OPOS=1559838;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:52:54:28:31:22:23:5:17:14:14:6:17:14:17 chr16 1574863 . G A 127.23 PASS AO=29;DP=63;FAO=30;FDP=63;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=0.010282;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.1948;QD=8.07833;RBI=0.0425654;REFB=-0.0304678;REVB=0.0413049;RO=33;SAF=18;SAR=11;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159513;STB=0.576871;TYPE=snp;VARB=0.0268508;OID=.;OPOS=1574863;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:33:33:29:30:11:18:15:18:12:18:15:18 chr16 1591962 . G A 81.46 PASS AO=22;DP=53;FAO=22;FDP=54;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=-0.014027;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.367;QD=6.03401;RBI=0.0144003;REFB=-0.034913;REVB=-0.00325758;RO=30;SAF=11;SAR=11;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101053;STB=0.555506;TYPE=snp;VARB=0.0330097;OID=.;OPOS=1591962;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:53:54:30:32:22:22:11:11:12:18:11:11:13:19 chr16 1591997 . TG T 189.1 PASS AO=24;DP=37;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.296087;FXX=0.0277701;HRUN=4;LEN=1;MLLD=11.6177;QD=21.6118;RBI=0.393705;REFB=0.0313561;REVB=0.259492;RO=8;SAF=11;SAR=13;SRF=4;SRR=4;SSEN=0.558824;SSEP=0;SSSB=-0.019155;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0280796;OID=.;OPOS=1591998;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:24:36:35:35:0:16:19:0:0:16:8:11:13:4:4 chr16 1608082 . A G 249.62 PASS AO=60;DP=128;FAO=61;FDP=129;FR=.;FRO=68;FSAF=14;FSAR=47;FSRF=33;FSRR=35;FWDB=-0.00540637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.548;QD=7.7402;RBI=0.0072797;REFB=0.00454806;REVB=-0.00487495;RO=64;SAF=13;SAR=47;SRF=32;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.309805;STB=0.657972;TYPE=snp;VARB=-0.00647659;OID=.;OPOS=1608082;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:129:64:68:60:61:47:13:32:32:47:14:33:35 chr16 1614097 . A G 187.9 PASS AO=50;DP=114;FAO=50;FDP=114;FR=.;FRO=64;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=24;FSRR=40;FWDB=0.0469043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.785;QD=6.59312;RBI=0.0470429;REFB=-0.0103844;REVB=-0.00360973;RO=64;SAF=21;SAR=29;SRF=24;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0467443;STB=0.526133;TYPE=snp;VARB=0.0139044;OID=.;OPOS=1614097;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:64:64:50:50:29:21:24:40:29:21:24:40 chr16 1682281 . A G 57.69 PASS AO=19;DP=55;FAO=19;FDP=56;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.0391114;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.4751;QD=4.12074;RBI=0.0415453;REFB=-0.014941;REVB=0.014011;RO=36;SAF=12;SAR=7;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209588;STB=0.614679;TYPE=snp;VARB=0.0385211;OID=.;OPOS=1682281;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:55:56:36:37:19:19:7:12:16:20:7:12:17:20 chr16 1818503 . G C 21.11 PASS AO=4;DP=10;FAO=4;FDP=10;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.0894914;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=107.144;QD=8.44501;RBI=0.089495;REFB=-0.00692703;REVB=0.000806948;RO=5;SAF=1;SAR=3;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.386089;STB=0.749235;TYPE=snp;VARB=0.0497999;OID=.;OPOS=1818503;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:10:10:5:6:4:4:3:1:0:5:3:1:0:6 chr16 1820992 . T A 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.45;QD=33.022;RBI=0.0610177;REFB=0;REVB=0.0598716;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000997711;OID=.;OPOS=1820992;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:5:0:0:1:5:0:0 chr16 1827836 . T C 577.08 PASS AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00493076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.849;QD=37.8415;RBI=0.0534855;REFB=0;REVB=0.0532577;RO=0;SAF=24;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000155492;OID=.;OPOS=1827836;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:61:61:0:0:61:61:37:24:0:0:37:24:0:0 chr16 1836796 . C A 177.79 PASS AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0261525;FXX=0.09995;HRUN=5;LEN=1;MLLD=102.265;QD=39.508;RBI=0.0296764;REFB=0;REVB=0.0140263;RO=0;SAF=13;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.8946e-05;OID=.;OPOS=1836796;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:18:0:0:18:18:5:13:0:0:5:13:0:0 chr16 1838640 . T C 734.41 PASS AO=75;DP=78;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196407;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.337;QD=38.1513;RBI=0.0229434;REFB=0;REVB=0.0118593;RO=0;SAF=45;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.12515e-05;OID=.;OPOS=1838640;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:78:77:0:0:75:77:30:45:0:0:32:45:0:0 chr16 1841902 . A T 132.55 PASS AO=14;DP=18;FAO=16;FDP=18;FR=.;FRO=2;FSAF=16;FSAR=0;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.248493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.8397;QD=29.4563;RBI=0.248493;REFB=-0.219447;REVB=0;RO=4;SAF=14;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0905191;OID=.;OPOS=1841902;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:18:18:4:2:14:16:0:14:4:0:0:16:2:0 chr16 1841906 . G A 34.36 PASS AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.155251;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=32.2498;QD=11.4542;RBI=0.155251;REFB=-0.116152;REVB=0;RO=6;SAF=6;SAR=0;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.111989;OID=.;OPOS=1841906;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:12:12:6:6:6:6:0:6:6:0:0:6:6:0 chr16 1841912 . G A 31.27 PASS AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=5;FSAR=0;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0151583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.3748;QD=15.6344;RBI=0.0151583;REFB=-0.0790264;REVB=0;RO=3;SAF=5;SAR=0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.23302;OID=.;OPOS=1841912;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:8:8:3:3:5:5:0:5:3:0:0:5:3:0 chr16 1842209 . A G 136.31 PASS AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00751814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.142;QD=36.3481;RBI=0.102845;REFB=0;REVB=-0.102569;RO=0;SAF=10;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00133092;OID=.;OPOS=1842209;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:15:0:0:15:15:5:10:0:0:5:10:0:0 chr16 1843672 . T C 768.37 PASS AO=80;DP=80;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.089138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.9663;QD=37.4813;RBI=0.11655;REFB=0;REVB=0.0750882;RO=0;SAF=30;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000828301;OID=.;OPOS=1843672;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:80:82:0:0:80:82:50:30:0:0:52:30:0:0 chr16 1859432 . G C 99.25 PASS AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0574024;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.288;QD=39.6993;RBI=0.0836514;REFB=0;REVB=0.0608483;RO=0;SAF=2;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00236857;OID=.;OPOS=1859432;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:8:2:0:0:8:2:0:0 chr16 1903268 . C T 190.64 PASS AO=46;DP=106;FAO=49;FDP=109;FR=.;FRO=60;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=36;FWDB=0.093419;FXX=0.0267833;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.3621;QD=6.99606;RBI=0.0934315;REFB=0.00183804;REVB=-0.00153139;RO=60;SAF=24;SAR=22;SRF=25;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105734;STB=0.582556;TYPE=snp;VARB=-0.00074136;OID=.;OPOS=1903268;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:109:60:60:46:49:22:24:25:35:22:27:24:36 chr16 1918125 . T G 3796.31 PASS AO=434;DP=438;FAO=395;FDP=395;FR=.;FRO=0;FSAF=233;FSAR=162;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0506901;FXX=0.0124997;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.454;QD=38.4437;RBI=0.0535306;REFB=0;REVB=0.017206;RO=0;SAF=254;SAR=180;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.72594e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.97326e-05;OID=.;OPOS=1918125;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:438:395:0:0:434:395:180:254:0:0:162:233:0:0 chr16 1990994 . T C 160.07 PASS AO=40;DP=102;FAO=44;FDP=104;FR=.;FRO=60;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=36;FWDB=0.00798779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.885;QD=6.15667;RBI=0.00809827;REFB=-0.00692216;REVB=0.00133309;RO=60;SAF=15;SAR=25;SRF=24;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0279734;STB=0.505432;TYPE=snp;VARB=0.00962016;OID=.;OPOS=1990994;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:104:60:60:40:44:25:15:24:36:26:18:24:36 chr16 2014283 . A G 389.46 PASS AO=36;DP=45;FAO=42;FDP=42;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000703492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.072;QD=37.0917;RBI=0.104461;REFB=0;REVB=0.104458;RO=0;SAF=25;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.58193e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000498133;OID=.;OPOS=2014283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:43:42:0:0:36:42:11:25:0:0:16:26:0:0 chr16 2024131 . T C 128.23 PASS AO=14;DP=15;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0954383;FXX=0.0666222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.943;QD=36.6356;RBI=0.100412;REFB=0;REVB=0.0312117;RO=0;SAF=7;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00208122;OID=.;OPOS=2024131;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:15:14:0:0:14:14:7:7:0:0:7:7:0:0 chr16 2025206 . A C 136.31 PASS AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0510403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8926;QD=36.3483;RBI=0.0525132;REFB=0;REVB=-0.0123501;RO=0;SAF=8;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0029045;OID=.;OPOS=2025206;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:15:0:0:15:15:7:8:0:0:7:8:0:0 chr16 2025411 . G C 208.22 PASS AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0691454;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.196;QD=36.2128;RBI=0.191279;REFB=0;REVB=0.178344;RO=0;SAF=19;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00710385;OID=.;OPOS=2025411;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:0:0:23:23:4:19:0:0:4:19:0:0 chr16 2025602 . A G 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.794;QD=35.0875;RBI=0.00304785;REFB=0;REVB=0.00304785;RO=0;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.43535e-05;OID=.;OPOS=2025602;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:7:0:0:0:7:0:0:0 chr16 2026292 . T C 296.8 PASS AO=31;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0145715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.486;QD=37.0999;RBI=0.0172108;REFB=0;REVB=0.00915862;RO=0;SAF=13;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.33668e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.72911e-05;OID=.;OPOS=2026292;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:31:32:0:0:31:32:18:13:0:0:19:13:0:0 chr16 2026891 . T C 1373.91 PASS AO=143;DP=143;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=128;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.014704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.2755;QD=38.1642;RBI=0.0172994;REFB=0;REVB=-0.00911381;RO=0;SAF=16;SAR=127;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.33549e-05;OID=.;OPOS=2026891;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:143:144:0:0:143:144:127:16:0:0:128:16:0:0 chr16 2028402 . A C 393.1 PASS AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00315486;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.485;QD=37.438;RBI=0.0138413;REFB=0;REVB=0.013477;RO=0;SAF=22;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.73449e-06;OID=.;OPOS=2028402;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:43:42:0:0:42:42:20:22:0:0:20:22:0:0 chr16 2028677 . A G 471.89 PASS AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.7729;QD=38.5217;RBI=0.0446036;REFB=0;REVB=-0.0446036;RO=0;SAF=0;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000645067;OID=.;OPOS=2028677;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:49:49:0:0:49:49:49:0:0:0:49:0:0:0 chr16 2029788 . T C 254.96 PASS AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00475092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.759;QD=37.7722;RBI=0.0174896;REFB=0;REVB=-0.0168319;RO=0;SAF=19;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.06954e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000129426;OID=.;OPOS=2029788;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:27:27:0:0:27:27:8:19:0:0:8:19:0:0 chr16 2035907 . T C 1063.92 PASS AO=112;DP=112;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.057239;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3043;QD=37.9972;RBI=0.0630817;REFB=0;REVB=0.0265142;RO=0;SAF=74;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.73037e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000197003;OID=.;OPOS=2035907;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:112:112:0:0:112:112:38:74:0:0:38:74:0:0 chr16 2035999 . C T 854.48 PASS AO=90;DP=92;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0296053;FXX=0.0217368;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.3182;QD=37.9769;RBI=0.0774882;REFB=0;REVB=0.0716097;RO=0;SAF=39;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.24868e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000677801;OID=.;OPOS=2035999;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:92:90:0:0:90:90:51:39:0:0:51:39:0:0 chr16 2043818 . C A 61.19 PASS AO=12;DP=23;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.0138173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.953;QD=10.6412;RBI=0.0157032;REFB=-0.00740552;REVB=0.00746146;RO=11;SAF=1;SAR=11;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.598842;STB=0.85365;TYPE=snp;VARB=0.00582356;OID=.;OPOS=2043818;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:23:23:11:11:12:12:11:1:7:4:11:1:7:4 chr16 2048826 . C G 97.46 PASS AO=16;DP=24;FAO=16;FDP=24;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0801721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.392;QD=16.2436;RBI=0.0817597;REFB=-0.0347467;REVB=0.0160337;RO=8;SAF=5;SAR=11;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0443367;STB=0.524661;TYPE=snp;VARB=0.0159753;OID=.;OPOS=2048826;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:24:24:8:8:16:16:11:5:2:6:11:5:2:6 chr16 2049640 . A G 170.8 PASS AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000850887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.672;QD=37.9547;RBI=0.0732171;REFB=0;REVB=-0.0732122;RO=0;SAF=15;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.32e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000911611;OID=.;OPOS=2049640;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:18:0:0:18:18:3:15:0:0:3:15:0:0 chr16 2052340 . G A 53.45 PASS AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=-0.0104489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.665;QD=11.2516;RBI=0.0403988;REFB=-0.0179407;REVB=0.0390241;RO=9;SAF=6;SAR=4;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157971;STB=0.590739;TYPE=snp;VARB=0.0161915;OID=.;OPOS=2052340;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:19:19:9:9:10:10:4:6:7:2:4:6:7:2 chr16 2070200 . G C 16.44 PASS AO=3;DP=6;FAO=3;FDP=6;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.00371617;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=99.2351;QD=10.9581;RBI=0.00930976;REFB=-0.0352191;REVB=-0.0085359;RO=2;SAF=1;SAR=2;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111102;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0153239;OID=.;OPOS=2070200;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:6:6:2:3:3:3:2:1:1:1:2:1:1:2 chr16 2070568 . A C 61.38 PASS AO=14;DP=40;FAO=17;FDP=43;FR=.;FRO=26;FSAF=1;FSAR=16;FSRF=6;FSRR=20;FWDB=-0.00961332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=38.1313;QD=5.70975;RBI=0.0161447;REFB=-0.0675519;REVB=0.0129705;RO=25;SAF=1;SAR=13;SRF=5;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.328422;STB=0.756349;TYPE=snp;VARB=0.0980528;OID=.;OPOS=2070568;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:40:43:25:26:14:17:13:1:5:20:16:1:6:20 chr16 2083358 . A G 15.09 PASS AO=5;DP=21;FAO=5;FDP=21;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=14;FSRR=2;FWDB=-0.0423253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.7719;QD=2.87339;RBI=0.0533993;REFB=-0.00509308;REVB=-0.0325584;RO=16;SAF=4;SAR=1;SRF=14;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154553;STB=0.599656;TYPE=snp;VARB=0.0269644;OID=.;OPOS=2083358;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:21:21:16:16:5:5:1:4:14:2:1:4:14:2 chr16 2096132 . TG T 42.23 PASS AO=13;DP=34;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=13;FWDB=0.139919;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=8.41041;QD=5.27881;RBI=0.246769;REFB=-0.0211801;REVB=0.203268;RO=12;SAF=3;SAR=10;SRF=0;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.339403;STB=0.640893;TYPE=del;VARB=0.077185;OID=.;OPOS=2096133;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:13:32:18:32:14:6:12:1:13:20:12:3:10:0:12 chr16 2150306 . G C 143.54 PASS AO=31;DP=61;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.0236777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.6434;QD=9.41246;RBI=0.0478405;REFB=-0.0278053;REVB=-0.0415702;RO=30;SAF=14;SAR=17;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.042866;STB=0.523895;TYPE=snp;VARB=0.018166;OID=.;OPOS=2150306;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:30:30:31:31:17:14:15:15:17:14:15:15 chr16 2152189 . G A 16.08 PASS AO=3;DP=6;FAO=3;FDP=6;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0255219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.102;QD=10.7183;RBI=0.101202;REFB=-0.000422445;REVB=0.0979311;RO=3;SAF=2;SAR=1;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.255936;STB=0.665552;TYPE=snp;VARB=0.00384014;OID=.;OPOS=2152189;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:6:6:3:3:3:3:1:2:1:2:1:2:1:2 chr16 2257105 . C G 42.71 PASS AO=15;DP=52;FAO=16;FDP=52;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=-0.0145987;FXX=0.0188644;HRUN=4;LEN=1;MLLD=114.983;QD=3.28515;RBI=0.0376103;REFB=-0.0147283;REVB=-0.0346614;RO=34;SAF=8;SAR=7;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139853;STB=0.557621;TYPE=snp;VARB=0.029174;OID=.;OPOS=2257105;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:52:52:34:36:15:16:7:8:14:20:8:8:15:21 chr16 2260567 . C T 27.54 PASS AO=13;DP=54;FAO=13;FDP=54;FR=.;FRO=41;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=27;FWDB=-0.0336209;FXX=0.0526223;HRUN=5;LEN=1;MLLD=114.927;QD=2.03975;RBI=0.0340454;REFB=-0.0165229;REVB=-0.00535955;RO=41;SAF=2;SAR=11;SRF=14;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.30743;STB=0.698058;TYPE=snp;VARB=0.0395124;OID=.;OPOS=2260567;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:54:54:41:41:13:13:11:2:14:27:11:2:14:27 chr16 2263146 . A G 135.26 PASS AO=36;DP=86;FAO=40;FDP=95;FR=.;FRO=55;FSAF=35;FSAR=5;FSRF=27;FSRR=28;FWDB=-0.00473881;FXX=0.0104156;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.2863;QD=5.69514;RBI=0.0278254;REFB=-0.00972266;REVB=-0.0274189;RO=42;SAF=36;SAR=0;SRF=26;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.838763;STB=0.788226;TYPE=snp;VARB=0.0380099;OID=.;OPOS=2263146;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:95:42:55:36:40:0:36:26:16:5:35:27:28 chr16 2263507 . C T 69.08 PASS AO=16;DP=35;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.00906053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.425;QD=7.89538;RBI=0.0292622;REFB=-0.0168163;REVB=-0.0278242;RO=19;SAF=3;SAR=13;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.283035;STB=0.664884;TYPE=snp;VARB=0.0159037;OID=.;OPOS=2263507;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:35:35:19:19:16:16:13:3:8:11:13:3:8:11 chr16 2263516 . A G 63.22 PASS AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=15;FWDB=0.0855893;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.0846;QD=7.43769;RBI=0.0855969;REFB=-0.00806251;REVB=-0.00113489;RO=19;SAF=7;SAR=8;SRF=4;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.257336;STB=0.646411;TYPE=snp;VARB=0.021342;OID=.;OPOS=2263516;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:34:34:19:19:15:15:8:7:4:15:8:7:4:15 chr16 2282256 . G A 107.8 PASS AO=5;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0621554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.4912;QD=35.9335;RBI=0.0883397;REFB=0;REVB=0.0627742;RO=0;SAF=4;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00640188;OID=.;OPOS=2282256;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:6:12:0:0:5:12:1:4:0:0:3:9:0:0 chr16 2285357 . C T 39.25 PASS AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=-0.00411953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.864;QD=6.03818;RBI=0.0209118;REFB=-0.0132284;REVB=-0.020502;RO=16;SAF=6;SAR=4;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169434;STB=0.599815;TYPE=snp;VARB=0.0197258;OID=.;OPOS=2285357;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:26:26:16:16:10:10:4:6:12:4:4:6:12:4 chr16 2331430 . A G 604.89 PASS AO=62;DP=62;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0160714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.735;QD=37.8054;RBI=0.03043;REFB=0;REVB=0.0258398;RO=0;SAF=23;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75648e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.56276e-05;OID=.;OPOS=2331430;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:62:64:0:0:62:64:39:23:0:0:41:23:0:0 chr16 2512523 . G A 19.9 PASS AO=4;DP=11;FAO=4;FDP=11;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=-0.0285238;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.286;QD=7.23724;RBI=0.0446735;REFB=-0.0145225;REVB=0.0343819;RO=7;SAF=1;SAR=3;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.545627;STB=0.838612;TYPE=snp;VARB=0.0203455;OID=.;OPOS=2512523;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:11:11:7:7:4:4:3:1:6:1:3:1:6:1 chr16 2550927 . GCCT GCT,GC 217.99 PASS AO=14,5;DP=35;FAO=34,0;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=11,0;FSAR=23,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.174392,-0.0088606;FXX=0.0285633;HRUN=2,2;LEN=1,2;MLLD=14.3294,51.9834;QD=25.6462;RBI=0.376637,0.148943;REFB=0,0;REVB=0.33383,0.148679;RO=7;SAF=2,4;SAR=12,1;SRF=2;SRR=5;SSEN=0.306517,0.306517;SSEP=0,0;SSSB=-0.150362,0.478981;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.0236075,0;OID=.,.;OPOS=2550928,2550929;OREF=C,CT;OALT=-,-;OMAPALT=GCT,GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:14,5:29:34,0:34:0:11,0:23,0:0:0:21:7:2,4:12,1:2:5 chr16 2647700 . TG T 25.55 PASS AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=0.0554688;FXX=0.117578;HRUN=2;LEN=1;MLLD=16.8006;QD=6.81444;RBI=0.0578523;REFB=-0.0495349;REVB=-0.0164345;RO=8;SAF=1;SAR=6;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.683595;STB=0.899038;TYPE=del;VARB=0.0762909;OID=.;OPOS=2647701;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:7:17:7:15:8:1:6:8:0:23:8:1:6:8:0 chr16 2812890 . A G 818.34 PASS AO=86;DP=87;FAO=87;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0202264;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=248.322;QD=37.1974;RBI=0.0202527;REFB=-0.0461493;REVB=0.00103177;RO=1;SAF=30;SAR=56;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00838625;STB=0.504424;TYPE=snp;VARB=6.94259e-05;OID=.;OPOS=2812890;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:87:88:1:1:86:87:56:30:0:1:56:31:0:1 chr16 2812939 . C A 256.21 PASS AO=43;DP=64;FAO=43;FDP=64;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=35;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=0.0379019;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.9529;QD=16.0131;RBI=0.0571273;REFB=-0.0458567;REVB=0.0427431;RO=21;SAF=8;SAR=35;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0926673;STB=0.550537;TYPE=snp;VARB=0.02342;OID=.;OPOS=2812939;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:64:64:21:21:43:43:35:8:6:15:35:8:6:15 chr16 2814162 . G A 1044.96 PASS AO=113;DP=115;FAO=113;FDP=115;FR=.;FRO=2;FSAF=84;FSAR=29;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0159139;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=246.928;QD=36.3466;RBI=0.0258153;REFB=0.00417183;REVB=-0.0203268;RO=2;SAF=84;SAR=29;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011171;STB=0.505881;TYPE=snp;VARB=-0.000136422;OID=.;OPOS=2814162;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:115:115:2:2:113:113:29:84:2:0:29:84:2:0 chr16 2815237 . A C 653.76 PASS AO=73;DP=78;FAO=77;FDP=82;FR=.;FRO=5;FSAF=40;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-9.37947e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.874;QD=31.891;RBI=0.0603837;REFB=-0.0992356;REVB=0.0603837;RO=4;SAF=39;SAR=34;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.052458;STB=0.531637;TYPE=snp;VARB=0.0106412;OID=.;OPOS=2815237;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:78:82:4:5:73:77:34:39:0:4:37:40:0:5 chr16 2818161 . T C 1176.18 PASS AO=122;DP=123;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0185996;FXX=0.00793588;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3896;QD=37.6377;RBI=0.0416196;REFB=0.0491477;REVB=-0.0372324;RO=1;SAF=69;SAR=53;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00887909;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0019853;OID=.;OPOS=2818161;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:123:125:1:0:122:125:53:69:0:1:53:72:0:0 chr16 2818704 . T G 689.98 PASS AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000703678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.159;QD=37.8072;RBI=0.0466292;REFB=0;REVB=0.0466239;RO=0;SAF=41;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000237479;OID=.;OPOS=2818704;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:73:73:0:0:73:73:32:41:0:0:32:41:0:0 chr16 2819886 . A C 190.39 PASS AO=24;DP=31;FAO=26;FDP=32;FR=.;FRO=6;FSAF=0;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.465;QD=23.7991;RBI=0.173242;REFB=-0.232379;REVB=0.173242;RO=7;SAF=0;SAR=24;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0260581;OID=.;OPOS=2819886;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:31:32:7:6:24:26:24:0:0:7:26:0:0:6 chr16 2821573 . C T 401.9 PASS AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0196737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.22;QD=37.3859;RBI=0.0250935;REFB=0;REVB=0.0155765;RO=0;SAF=22;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.04953e-05;OID=.;OPOS=2821573;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:43:43:0:0:43:43:21:22:0:0:21:22:0:0 chr16 2821988 . TC T 166.42 PASS AO=18;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0405011;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=27.8854;QD=30.2572;RBI=0.064006;REFB=0;REVB=0.0495624;RO=0;SAF=11;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.228917;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.000777649;OID=.;OPOS=2821989;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:18:22:22:22:0:11:11:0:0:15:0:11:7:0:0 chr16 2849411 . C G 193.4 PASS AO=49;DP=108;FAO=49;FDP=108;FR=.;FRO=59;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=35;FSRR=24;FWDB=-0.0226982;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.427;QD=7.16301;RBI=0.0257451;REFB=-0.00318399;REVB=-0.0121492;RO=59;SAF=28;SAR=21;SRF=35;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218492;STB=0.51219;TYPE=snp;VARB=0.00304396;OID=.;OPOS=2849411;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:59:59:49:49:21:28:35:24:21:28:35:24 chr16 2871555 . G A 568.05 PASS AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00410794;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.614;QD=37.8701;RBI=0.0247974;REFB=0;REVB=0.0244548;RO=0;SAF=27;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.7886e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.37675e-05;OID=.;OPOS=2871555;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:61:60:0:0:60:60:33:27:0:0:33:27:0:0 chr16 2902974 . CAGAGGT C 53.53 PASS AO=5;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0813861;FXX=0.142653;HRUN=1;LEN=6;MLLD=265.297;QD=35.6866;RBI=0.0967048;REFB=0;REVB=0.0522315;RO=0;SAF=4;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0018387;OID=.;OPOS=2902975;OREF=AGAGGT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:5:6:6:6:0:5:1:0:0:3:0:4:1:0:0 chr16 2977666 . G A 325.09 PASS AO=68;DP=124;FAO=68;FDP=124;FR=.;FRO=56;FSAF=29;FSAR=39;FSRF=25;FSRR=31;FWDB=0.0100412;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.92;QD=10.4866;RBI=0.0107428;REFB=-0.00467774;REVB=-0.00381854;RO=56;SAF=29;SAR=39;SRF=25;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0167796;STB=0.509185;TYPE=snp;VARB=0.00671139;OID=.;OPOS=2977666;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:56:56:68:68:39:29:25:31:39:29:25:31 chr16 2983516 . C T 54.24 PASS AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.0664046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.078;QD=8.34445;RBI=0.0664132;REFB=-0.0091033;REVB=-0.00107134;RO=14;SAF=6;SAR=6;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199941;STB=0.615202;TYPE=snp;VARB=0.0121951;OID=.;OPOS=2983516;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:26:26:14:14:12:12:6:6:4:10:6:6:4:10 chr16 2987315 . G A 34.49 PASS AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0722126;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.4;QD=22.9964;RBI=0.0833717;REFB=-0.0904959;REVB=-0.0416673;RO=1;SAF=3;SAR=2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121807;STB=0.571154;TYPE=snp;VARB=0.00792829;OID=.;OPOS=2987315;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:6:6:1:1:5:5:2:3:1:0:2:3:1:0 chr16 2990062 . A T 358.9 PASS AO=74;DP=133;FAO=74;FDP=133;FR=.;FRO=59;FSAF=52;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=36;FWDB=-0.062758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.4522;QD=10.794;RBI=0.0643148;REFB=-0.00586909;REVB=0.0140651;RO=58;SAF=52;SAR=22;SRF=23;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.259918;STB=0.646337;TYPE=snp;VARB=0.00409098;OID=.;OPOS=2990062;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:58:59:74:74:22:52:23:35:22:52:23:36 chr16 3075999 . C G 1835.57 PASS AO=198;DP=202;FAO=199;FDP=199;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=117;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0316507;FXX=0.0197035;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.826;QD=36.8959;RBI=0.0316663;REFB=-0.0535695;REVB=0.000992979;RO=1;SAF=82;SAR=116;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00577275;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00019861;OID=.;OPOS=3075999;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:202:199:1:0:198:199:116:82:1:0:117:82:0:0 chr16 3077388 . C T 50.31 PASS AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=19;FWDB=0.0328238;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.92;QD=6.09818;RBI=0.0332041;REFB=-0.0231111;REVB=-0.00501106;RO=20;SAF=3;SAR=10;SRF=1;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.328549;STB=0.684834;TYPE=snp;VARB=0.0405552;OID=.;OPOS=3077388;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:33:33:20:20:13:13:10:3:1:19:10:3:1:19 chr16 3085335 . G C 627.7 PASS AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.058;QD=38.0426;RBI=0.0962405;REFB=0;REVB=0.0941529;RO=0;SAF=39;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.91393e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000434091;OID=.;OPOS=3085335;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:66:66:0:0:66:66:27:39:0:0:27:39:0:0 chr16 3085375 . G A 652.53 PASS AO=74;DP=86;FAO=78;FDP=85;FR=.;FRO=7;FSAF=32;FSAR=46;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.102142;FXX=0.034087;HRUN=3;LEN=1;MLLD=176.349;QD=30.7073;RBI=0.105176;REFB=-0.0720769;REVB=0.025081;RO=6;SAF=30;SAR=44;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0380355;STB=0.525626;TYPE=snp;VARB=0.000862131;OID=.;OPOS=3085375;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:86:85:6:7:74:78:44:30:4:2:46:32:5:2 chr16 3086447 . C G 288.29 PASS AO=28;DP=29;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0481919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.929;QD=37.1982;RBI=0.0494306;REFB=0;REVB=-0.0109968;RO=1;SAF=3;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131957;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.07218e-05;OID=.;OPOS=3086447;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:29:31:1:0:28:31:25:3:1:0:26:5:0:0 chr16 3100095 . C T 972.94 PASS AO=104;DP=106;FAO=105;FDP=107;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0465829;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.3901;QD=36.3715;RBI=0.064423;REFB=-0.0229682;REVB=0.0445013;RO=2;SAF=38;SAR=66;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141619;STB=0.507461;TYPE=snp;VARB=0.000937392;OID=.;OPOS=3100095;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:106:107:2:2:104:105:66:38:0:2:66:39:0:2 chr16 3119167 . T C 19.37 PASS AO=11;DP=47;FAO=10;FDP=46;FR=.;FRO=36;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=-0.0350323;FXX=0.0212721;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.784;QD=1.68417;RBI=0.0390598;REFB=0.000954577;REVB=0.0172745;RO=36;SAF=5;SAR=6;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116305;STB=0.608489;TYPE=snp;VARB=-0.00479633;OID=.;OPOS=3119167;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:47:46:36:36:11:10:6:5:13:23:5:5:13:23 chr16 3119304 . A G 72.52 PASS AO=24;DP=72;FAO=24;FDP=71;FR=.;FRO=47;FSAF=1;FSAR=23;FSRF=13;FSRR=34;FWDB=-0.0497333;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.542;QD=4.0859;RBI=0.0502173;REFB=-0.00234703;REVB=0.00695545;RO=46;SAF=1;SAR=23;SRF=12;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.549477;STB=0.849189;TYPE=snp;VARB=0.00275192;OID=.;OPOS=3119304;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:72:71:46:47:24:24:23:1:12:34:23:1:13:34 chr16 3131663 . A G 29.48 PASS AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.0085176;FXX=0.049975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=339.69;QD=6.20549;RBI=0.00904197;REFB=0.00513313;REVB=0.00303444;RO=13;SAF=4;SAR=3;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0350874;STB=0.545324;TYPE=snp;VARB=-0.01063;OID=.;OPOS=3131663;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:20:19:13:12:7:7:3:4:7:6:3:4:6:6 chr16 3132197 . A G 309.28 PASS AO=61;DP=108;FAO=61;FDP=107;FR=.;FRO=46;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=30;FSRR=16;FWDB=0.0292566;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.7448;QD=11.5617;RBI=0.064767;REFB=-0.00642167;REVB=-0.0577825;RO=46;SAF=29;SAR=32;SRF=30;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138529;STB=0.575585;TYPE=snp;VARB=0.00375971;OID=.;OPOS=3132197;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:107:46:46:61:61:32:29:30:16:32:29:30:16 chr16 3139310 . G C 41.47 PASS AO=6;DP=9;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.00532929;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.436;QD=18.4312;RBI=0.0805001;REFB=-0.0400924;REVB=0.0803235;RO=3;SAF=5;SAR=1;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200664;STB=0.615062;TYPE=snp;VARB=0.0366503;OID=.;OPOS=3139310;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:9:9:3:3:6:6:1:5:3:0:1:5:3:0 chr16 3165425 . A G 132.82 PASS AO=34;DP=78;FAO=34;FDP=77;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=7;FSRR=36;FWDB=0.000171849;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.882;QD=6.89994;RBI=0.0274105;REFB=-0.013229;REVB=-0.02741;RO=43;SAF=15;SAR=19;SRF=7;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.295275;STB=0.663634;TYPE=snp;VARB=0.0221534;OID=.;OPOS=3165425;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:77:43:43:34:34:19:15:7:36:19:15:7:36 chr16 3169822 . C T 42.83 PASS AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0.0315402;FXX=0.062461;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.273;QD=11.422;RBI=0.0329596;REFB=-0.054891;REVB=-0.0095683;RO=7;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.29599;STB=0.666364;TYPE=snp;VARB=0.0390438;OID=.;OPOS=3169822;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:16:15:7:7:8:8:7:1:0:7:7:1:0:7 chr16 3199713 . C T 47.09 PASS AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=2;FWDB=0.0623837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.1108;QD=8.56161;RBI=0.0640473;REFB=-0.0103319;REVB=0.0145028;RO=12;SAF=8;SAR=2;SRF=10;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0502873;STB=0.529355;TYPE=snp;VARB=0.0148138;OID=.;OPOS=3199713;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:22:22:12:12:10:10:2:8:10:2:2:8:10:2 chr16 3202685 . C CA 175.74 PASS AO=78;DP=169;FAO=81;FDP=166;FR=.;FRO=85;FSAF=33;FSAR=48;FSRF=28;FSRR=57;FWDB=-0.00851853;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.2027;QD=4.23468;RBI=0.0672025;REFB=-0.0126818;REVB=0.0666605;RO=85;SAF=30;SAR=48;SRF=28;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0558888;STB=0.541989;TYPE=ins;VARB=0.0136618;OID=.;OPOS=3202686;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:78:169:81:166:85:33:48:28:57:99:85:30:48:28:57 chr16 3207446 . G A 1617.45 PASS AO=178;DP=184;FAO=179;FDP=184;FR=.;FRO=5;FSAF=91;FSAR=88;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0387653;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=267.664;QD=35.162;RBI=0.040672;REFB=-0.0423626;REVB=0.0123071;RO=5;SAF=91;SAR=87;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0254342;STB=0.513368;TYPE=snp;VARB=0.000311145;OID=.;OPOS=3207446;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:184:184:5:5:178:179:87:91:5:0:88:91:5:0 chr16 3208911 . G A 195.22 PASS AO=20;DP=20;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0123038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.107;QD=37.1856;RBI=0.0149466;REFB=0;REVB=0.00848635;RO=0;SAF=13;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.89275e-05;OID=.;OPOS=3208911;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:20:21:0:0:20:21:7:13:0:0:7:14:0:0 chr16 3208914 . T C 174.58 PASS AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00995747;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=102.669;QD=33.2533;RBI=0.0111852;REFB=-0.142017;REVB=-0.00509481;RO=0;SAF=14;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5931e-08;STB=0.538422;TYPE=snp;VARB=0.00577345;OID=.;OPOS=3208914;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:0:1:20:20:6:14:0:0:6:14:0:1 chr16 3234217 . C T 59.12 PASS AO=18;DP=51;FAO=18;FDP=51;FR=.;FRO=33;FSAF=2;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=23;FWDB=0.00258132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.274;QD=4.63652;RBI=0.0137685;REFB=-0.00703368;REVB=0.0135244;RO=32;SAF=2;SAR=16;SRF=10;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.358024;STB=0.710824;TYPE=snp;VARB=0.0120857;OID=.;OPOS=3234217;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:51:51:32:33:18:18:16:2:10:22:16:2:10:23 chr16 3241975 . G T 154.16 PASS AO=39;DP=86;FAO=39;FDP=86;FR=.;FRO=47;FSAF=27;FSAR=12;FSRF=29;FSRR=18;FWDB=-0.00737352;FXX=0.0227247;HRUN=3;LEN=1;MLLD=240.53;QD=7.17003;RBI=0.0397687;REFB=-0.011726;REVB=-0.0390792;RO=47;SAF=27;SAR=12;SRF=29;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0828158;STB=0.546534;TYPE=snp;VARB=0.0107278;OID=.;OPOS=3241975;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:47:47:39:39:12:27:29:18:12:27:29:18 chr16 3243904 . G A 87.73 PASS AO=43;DP=155;FAO=43;FDP=154;FR=.;FRO=111;FSAF=38;FSAR=5;FSRF=39;FSRR=72;FWDB=0.00377232;FXX=0.0064512;HRUN=3;LEN=1;MLLD=125.571;QD=2.27883;RBI=0.0336621;REFB=-0.0178925;REVB=-0.0334501;RO=112;SAF=38;SAR=5;SRF=39;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.651542;STB=0.883543;TYPE=snp;VARB=0.0327518;OID=.;OPOS=3243904;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:155:154:112:111:43:43:5:38:39:73:5:38:39:72 chr16 3243922 . C A 55.82 PASS AO=45;DP=162;FAO=41;FDP=161;FR=.;FRO=120;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=42;FSRR=78;FWDB=0.0950077;FXX=0.00617246;HRUN=4;LEN=1;MLLD=69.6915;QD=1.38694;RBI=0.101194;REFB=-0.0525481;REVB=-0.0348395;RO=117;SAF=26;SAR=19;SRF=42;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.262919;STB=0.686648;TYPE=snp;VARB=0.0619949;OID=.;OPOS=3243922;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:162:161:117:120:45:41:19:26:42:75:16:25:42:78 chr16 3243942 . T C 231.07 PASS AO=71;DP=181;FAO=71;FDP=180;FR=.;FRO=109;FSAF=19;FSAR=52;FSRF=31;FSRR=78;FWDB=0.0247049;FXX=0.00552456;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.181;QD=5.13485;RBI=0.0279876;REFB=-0.00691475;REVB=-0.0131519;RO=109;SAF=19;SAR=52;SRF=31;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0227273;STB=0.512817;TYPE=snp;VARB=0.00958446;OID=.;OPOS=3243942;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:180:109:109:71:71:52:19:31:78:52:19:31:78 chr16 3243951 . C T 243.4 PASS AO=74;DP=185;FAO=74;FDP=185;FR=.;FRO=111;FSAF=22;FSAR=52;FSRF=33;FSRR=78;FWDB=0.0328864;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.2621;QD=5.26267;RBI=0.0331923;REFB=0.0198645;REVB=-0.00449571;RO=111;SAF=22;SAR=52;SRF=33;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.45074e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0303909;OID=.;OPOS=3243951;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:185:111:111:74:74:52:22:33:78:52:22:33:78 chr16 3254470 . T C 100.15 PASS AO=31;DP=83;FAO=31;FDP=83;FR=.;FRO=52;FSAF=8;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=31;FWDB=-0.0185446;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.021;QD=4.82644;RBI=0.0730586;REFB=-0.0153622;REVB=-0.0706658;RO=52;SAF=8;SAR=23;SRF=21;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184766;STB=0.606842;TYPE=snp;VARB=0.0261394;OID=.;OPOS=3254470;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:52:52:31:31:23:8:21:31:23:8:21:31 chr16 3254972 . T C 545.44 PASS AO=111;DP=219;FAO=126;FDP=249;FR=.;FRO=123;FSAF=36;FSAR=90;FSRF=37;FSRR=86;FWDB=-0.00354475;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.116;QD=8.76203;RBI=0.00778421;REFB=-0.0278361;REVB=0.00693027;RO=108;SAF=35;SAR=76;SRF=37;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0280485;STB=0.509064;TYPE=snp;VARB=0.0339986;OID=.;OPOS=3254972;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:219:249:108:123:111:126:76:35:37:71:90:36:37:86 chr16 3266071 . A G 77.67 PASS AO=32;DP=105;FAO=32;FDP=105;FR=.;FRO=73;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=39;FSRR=34;FWDB=-0.00186232;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.661;QD=2.95898;RBI=0.0230005;REFB=-0.00151922;REVB=-0.022925;RO=73;SAF=21;SAR=11;SRF=39;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150615;STB=0.588728;TYPE=snp;VARB=0.00257881;OID=.;OPOS=3266071;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:105:105:73:73:32:32:11:21:39:34:11:21:39:34 chr16 3293888 . C T 828.53 PASS AO=89;DP=93;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.005166;FXX=0.0430061;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.546;QD=37.2374;RBI=0.031107;REFB=-0.0449695;REVB=0.030675;RO=1;SAF=69;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0231015;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.22485e-05;OID=.;OPOS=3293888;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:93:89:1:0:89:89:20:69:0:1:20:69:0:0 chr16 3293922 . A T 847.49 PASS AO=115;DP=133;FAO=118;FDP=131;FR=.;FRO=13;FSAF=83;FSAR=35;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.0685861;FXX=0.0150365;HRUN=7;LEN=1;MLLD=45.3857;QD=25.8775;RBI=0.0968732;REFB=-0.228999;REVB=0.0684133;RO=6;SAF=84;SAR=31;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0462827;STB=0.510375;TYPE=snp;VARB=0.0460179;OID=.;OPOS=3293922;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:133:131:6:13:115:118:31:84:2:4:35:83:8:5 chr16 3304463 . C T 34.49 PASS AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.786;QD=22.9962;RBI=0.000190989;REFB=0.00564517;REVB=-0.000190989;RO=1;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00203728;OID=.;OPOS=3304463;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:6:6:1:1:5:5:5:0:0:1:5:0:0:1 chr16 3304573 . G T 86.76 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0420732;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.133;QD=38.5591;RBI=0.058962;REFB=0;REVB=-0.0413082;RO=0;SAF=8;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.071e-05;OID=.;OPOS=3304573;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:8:0:0:1:8:0:0 chr16 3304654 . T C 424.27 PASS AO=40;DP=41;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0538655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.948;QD=37.7133;RBI=0.0763689;REFB=0;REVB=0.0541361;RO=0;SAF=18;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19993e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000191127;OID=.;OPOS=3304654;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:41:45:0:0:40:45:22:18:0:0:23:22:0:0 chr16 3304762 . A G 1065.09 PASS AO=111;DP=111;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0125341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.805;QD=38.0389;RBI=0.0142114;REFB=0;REVB=-0.00669786;RO=0;SAF=45;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.53129e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.90198e-05;OID=.;OPOS=3304762;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:111:112:0:0:111:112:66:45:0:0:66:46:0:0 chr16 3339435 . G C 249.29 PASS AO=57;DP=117;FAO=58;FDP=116;FR=.;FRO=58;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=36;FSRR=22;FWDB=0.00556385;FXX=0.00854628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.993;QD=8.59634;RBI=0.00565054;REFB=-0.0218936;REVB=0.000986012;RO=59;SAF=29;SAR=28;SRF=36;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0935048;STB=0.551954;TYPE=snp;VARB=0.0250103;OID=.;OPOS=3339435;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:116:59:58:57:58:28:29:36:23:28:30:36:22 chr16 3340845 . C T 331.67 PASS AO=85;DP=190;FAO=87;FDP=192;FR=.;FRO=105;FSAF=52;FSAR=35;FSRF=44;FSRR=61;FWDB=0.0543462;FXX=0.0204071;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.1893;QD=6.90985;RBI=0.0875967;REFB=-0.0384989;REVB=-0.0686998;RO=101;SAF=50;SAR=35;SRF=44;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149675;STB=0.597679;TYPE=snp;VARB=0.0542757;OID=.;OPOS=3340845;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:192:101:105:85:87:35:50:44:57:35:52:44:61 chr16 3350639 . A G 121.89 PASS AO=27;DP=54;FAO=27;FDP=54;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=-0.00628436;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.314;QD=9.02925;RBI=0.00779973;REFB=0.00653937;REVB=-0.0046198;RO=26;SAF=12;SAR=15;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123727;STB=0.556921;TYPE=snp;VARB=-0.00462896;OID=.;OPOS=3350639;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:26:27:27:27:15:12:8:18:15:12:9:18 chr16 3367229 . T C 119.8 PASS AO=29;DP=63;FAO=29;FDP=63;FR=.;FRO=34;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=11;FWDB=-0.0584422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.267;QD=7.60631;RBI=0.0615909;REFB=-0.00506007;REVB=-0.0194409;RO=34;SAF=8;SAR=21;SRF=23;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.386316;STB=0.7176;TYPE=snp;VARB=0.00377377;OID=.;OPOS=3367229;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:34:34:29:29:21:8:23:11:21:8:23:11 chr16 3405994 . A G 249.57 PASS AO=70;DP=161;FAO=69;FDP=160;FR=.;FRO=91;FSAF=32;FSAR=37;FSRF=40;FSRR=51;FWDB=-0.0166588;FXX=0.00621079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.831;QD=6.23928;RBI=0.0166655;REFB=-0.00104546;REVB=-0.000473589;RO=89;SAF=33;SAR=37;SRF=40;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0221889;STB=0.513865;TYPE=snp;VARB=0.00150712;OID=.;OPOS=3405994;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:160:89:91:70:69:37:33:40:49:37:32:40:51 chr16 3406387 . C G 435.41 PASS AO=43;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0363766;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.923;QD=37.0562;RBI=0.125343;REFB=0;REVB=0.119948;RO=0;SAF=38;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00352357;OID=.;OPOS=3406387;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:46:47:0:0:43:47:5:38:0:0:9:38:0:0 chr16 3419934 . G T 1189.31 PASS AO=122;DP=122;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0355219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.693;QD=38.058;RBI=0.0431053;REFB=0;REVB=0.0244185;RO=0;SAF=72;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.83711e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000188088;OID=.;OPOS=3419934;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:122:125:0:0:122:125:50:72:0:0:51:74:0:0 chr16 3533577 . C G 1539.52 PASS AO=122;DP=184;FAO=166;FDP=166;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=76;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.100091;FXX=0.023528;HRUN=2;LEN=1;MLLD=36.4323;QD=37.0969;RBI=0.124734;REFB=-0.0262999;REVB=0.0744338;RO=2;SAF=54;SAR=68;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0137662;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00343269;OID=.;OPOS=3533577;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:164:166:2:0:122:166:68:54:0:2:90:76:0:0 chr16 3534892 . G A 472.33 PASS AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0138035;FXX=0.019604;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.369;QD=37.786;RBI=0.020151;REFB=0;REVB=0.0146808;RO=0;SAF=1;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.26621e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.30549e-05;OID=.;OPOS=3534892;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:51:50:0:0:50:50:49:1:0:0:49:1:0:0 chr16 3535116 . T C 1437.62 PASS AO=149;DP=150;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=106;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.049286;FXX=0.00666622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3213;QD=38.5939;RBI=0.0499346;REFB=0;REVB=0.00802244;RO=0;SAF=106;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.62552e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00020059;OID=.;OPOS=3535116;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:150:149:0:0:149:149:43:106:0:0:43:106:0:0 chr16 3535540 . G A 601.99 PASS AO=62;DP=66;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139254;FXX=0.0596926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.925;QD=38.2214;RBI=0.0493689;REFB=0;REVB=0.0473643;RO=0;SAF=35;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.46408e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.48275e-05;OID=.;OPOS=3535540;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:66:63:0:0:62:63:27:35:0:0:28:35:0:0 chr16 3536872 . G A 357.34 PASS AO=34;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0840954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.437;QD=37.6148;RBI=0.0841197;REFB=0;REVB=0.00202146;RO=0;SAF=13;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000629432;OID=.;OPOS=3536872;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:37:38:0:0:34:38:21:13:0:0:22:16:0:0 chr16 3586230 . C T 220.04 PASS AO=57;DP=131;FAO=58;FDP=131;FR=.;FRO=73;FSAF=22;FSAR=36;FSRF=27;FSRR=46;FWDB=0.0256582;FXX=0.00757518;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.498;QD=6.71866;RBI=0.0256584;REFB=-0.012433;REVB=9.43147e-05;RO=72;SAF=22;SAR=35;SRF=26;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0263935;STB=0.505603;TYPE=snp;VARB=0.0138675;OID=.;OPOS=3586230;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:72:73:57:58:35:22:26:46:36:22:27:46 chr16 3602227 . AG A 690.65 PASS AO=84;DP=97;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.204771;FXX=0.0107515;HRUN=3;LEN=1;MLLD=20.1387;QD=30.0284;RBI=0.214203;REFB=0;REVB=-0.0628641;RO=0;SAF=38;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.981e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.00499479;OID=.;OPOS=3602228;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:84:92:92:92:0:43:49:0:0:62:0:38:46:0:0 chr16 3613120 . G A 10.38 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.0526205;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=298.88;QD=5.93126;RBI=0.0526205;REFB=-0.0122672;REVB=0;RO=5;SAF=2;SAR=0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0425415;OID=.;OPOS=3613120;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:5:5:2:2:0:2:5:0:0:2:5:0 chr16 3613150 . A G 10.38 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.012892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.2307;QD=5.93132;RBI=0.012892;REFB=-0.0102336;REVB=0;RO=5;SAF=2;SAR=0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0367993;OID=.;OPOS=3613150;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:5:5:2:2:0:2:5:0:0:2:5:0 chr16 3613327 . G A 61.44 PASS AO=11;DP=20;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.00381483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.96;QD=12.2875;RBI=0.109631;REFB=0.00530966;REVB=0.109564;RO=9;SAF=3;SAR=8;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.241378;STB=0.639731;TYPE=snp;VARB=0.000129774;OID=.;OPOS=3613327;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:20:20:9:9:11:11:8:3:5:4:8:3:5:4 chr16 3639139 . A G 316.21 PASS AO=75;DP=155;FAO=76;FDP=156;FR=.;FRO=80;FSAF=27;FSAR=49;FSRF=30;FSRR=50;FWDB=-0.0128807;FXX=0.0126574;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.957;QD=8.1079;RBI=0.0235811;REFB=-0.0205683;REVB=-0.0197524;RO=79;SAF=26;SAR=49;SRF=29;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0207841;STB=0.510974;TYPE=snp;VARB=0.0142778;OID=.;OPOS=3639139;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:156:79:80:75:76:49:26:29:50:49:27:30:50 chr16 3724465 . G C 1610.64 PASS AO=166;DP=169;FAO=173;FDP=173;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0187307;FXX=0.0057468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.7357;QD=37.2403;RBI=0.0514542;REFB=-0.0699963;REVB=0.0479238;RO=3;SAF=76;SAR=90;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.018411;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00130038;OID=.;OPOS=3724465;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:169:173:3:0:166:173:90:76:3:0:94:79:0:0 chr16 3778281 . AG A 83.4 PASS AO=12;DP=20;FAO=16;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.267349;FXX=0.0555247;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.8642;QD=19.6228;RBI=0.267509;REFB=0.0343284;REVB=0.00924098;RO=3;SAF=5;SAR=7;SRF=1;SRR=2;SSEN=0.458333;SSEP=0;SSSB=0.0308588;STB=0.52378;TYPE=del;VARB=0.0217805;OID=.;OPOS=3778282;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:12:18:16:17:1:6:10:0:1:6:3:5:7:1:2 chr16 4013467 . C T 267.82 PASS AO=53;DP=95;FAO=54;FDP=96;FR=.;FRO=42;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=0.0134979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.716;QD=11.1593;RBI=0.0194306;REFB=-0.0172573;REVB=0.0139769;RO=41;SAF=29;SAR=24;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00849274;STB=0.503512;TYPE=snp;VARB=0.0120344;OID=.;OPOS=4013467;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:96:41:42:53:54:24:29:22:19:24:30:23:19 chr16 4015313 . A G 87.71 PASS AO=26;DP=76;FAO=28;FDP=79;FR=.;FRO=51;FSAF=21;FSAR=7;FSRF=23;FSRR=28;FWDB=-0.051788;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.984;QD=4.44101;RBI=0.0631409;REFB=0.000765852;REVB=-0.0361217;RO=48;SAF=20;SAR=6;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.371832;STB=0.704545;TYPE=snp;VARB=-0.00162728;OID=.;OPOS=4015313;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:76:79:48:51:26:28:6:20:22:26:7:21:23:28 chr16 4015316 . A G 87.68 PASS AO=28;DP=77;FAO=28;FDP=77;FR=.;FRO=49;FSAF=22;FSAR=6;FSRF=21;FSRR=28;FWDB=-0.0431514;FXX=0.0253133;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.9221;QD=4.55493;RBI=0.0740231;REFB=-0.00273651;REVB=-0.0601446;RO=49;SAF=21;SAR=7;SRF=21;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.369512;STB=0.743355;TYPE=snp;VARB=0.00235003;OID=.;OPOS=4015316;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:77:77:49:49:28:28:7:21:21:28:6:22:21:28 chr16 4016676 . A G 1024.35 PASS AO=106;DP=107;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0069677;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.851;QD=38.2935;RBI=0.0113839;REFB=0;REVB=-0.00900249;RO=0;SAF=71;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21654e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.04219e-06;OID=.;OPOS=4016676;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:107:107:0:0:106:107:35:71:0:0:36:71:0:0 chr16 4016943 . A G 24.08 PASS AO=4;DP=6;FAO=4;FDP=6;FR=.;FRO=2;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00168294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=278.585;QD=16.0537;RBI=0.0103207;REFB=-0.0242229;REVB=0.0101826;RO=2;SAF=1;SAR=3;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161039;STB=0.599463;TYPE=snp;VARB=0.0108313;OID=.;OPOS=4016943;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:2:2:4:4:3:1:1:1:3:1:1:1 chr16 4164260 . A G 10.23 PASS AO=2;DP=9;FAO=2;FDP=9;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=-0.0343577;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=80.4146;QD=4.54452;RBI=0.0343577;REFB=-0.0171639;REVB=0;RO=7;SAF=2;SAR=0;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0832782;OID=.;OPOS=4164260;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:7:7:2:2:0:2:7:0:0:2:7:0 chr16 4165432 . T C 211.91 PASS AO=23;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0316101;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.3376;QD=35.319;RBI=0.0587171;REFB=0;REVB=0.0494824;RO=0;SAF=5;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00844896;OID=.;OPOS=4165432;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:24:24:0:0:23:24:18:5:0:0:19:5:0:0 chr16 4242028 . A T 1070.42 PASS AO=112;DP=113;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0112255;FXX=0.0086949;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.42;QD=37.5586;RBI=0.0121564;REFB=0.00424208;REVB=0.00466538;RO=0;SAF=27;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.24803e-05;OID=.;OPOS=4242028;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:113:114:0:0:112:114:85:27:0:0:87:27:0:0 chr16 4242093 . C T 1249.14 PASS AO=128;DP=131;FAO=134;FDP=136;FR=.;FRO=2;FSAF=56;FSAR=78;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.111693;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9245;QD=36.7393;RBI=0.112411;REFB=-0.119502;REVB=-0.0126837;RO=3;SAF=55;SAR=73;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104997;STB=0.50124;TYPE=snp;VARB=0.00688136;OID=.;OPOS=4242093;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:131:136:3:2:128:134:73:55:2:1:78:56:1:1 chr16 4245693 . A G 1429.78 PASS AO=149;DP=150;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00264324;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.909;QD=37.6259;RBI=0.0561906;REFB=0;REVB=0.0561284;RO=0;SAF=82;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.67496e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.99681e-05;OID=.;OPOS=4245693;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:150:152:0:0:149:152:67:82:0:0:70:82:0:0 chr16 4257281 . A C 17.75 PASS AO=3;DP=12;FAO=4;FDP=12;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0943036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.611;QD=5.91762;RBI=0.0948687;REFB=-0.0143368;REVB=-0.0103393;RO=6;SAF=0;SAR=3;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.606014;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0355997;OID=.;OPOS=4257281;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:11:12:6:8:3:4:3:0:1:5:3:1:2:6 chr16 4257286 . T C 15.21 PASS AO=4;DP=15;FAO=4;FDP=15;FR=.;FRO=11;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.0360662;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.434;QD=4.05713;RBI=0.065433;REFB=0.0083302;REVB=0.0545959;RO=11;SAF=1;SAR=3;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.241825;STB=0.665779;TYPE=snp;VARB=-0.0132393;OID=.;OPOS=4257286;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:15:15:11:11:4:4:3:1:5:6:3:1:5:6 chr16 4307646 . A G 234.97 PASS AO=68;DP=166;FAO=68;FDP=164;FR=.;FRO=96;FSAF=33;FSAR=35;FSRF=54;FSRR=42;FWDB=-0.0177958;FXX=0.0120475;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.6554;QD=5.73094;RBI=0.056076;REFB=0.00130427;REVB=0.0531773;RO=96;SAF=33;SAR=35;SRF=52;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0587917;STB=0.5451;TYPE=snp;VARB=-0.0024834;OID=.;OPOS=4307646;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:164:96:96:68:68:35:33:52:44:35:33:54:42 chr16 4310468 . C G 217.53 PASS AO=49;DP=100;FAO=50;FDP=101;FR=.;FRO=51;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=20;FSRR=31;FWDB=0.0204303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.511;QD=8.61515;RBI=0.021043;REFB=-0.00870317;REVB=0.00504071;RO=50;SAF=22;SAR=27;SRF=20;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0453706;STB=0.524647;TYPE=snp;VARB=0.00863284;OID=.;OPOS=4310468;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:101:50:51:49:50:27:22:20:30:28:22:20:31 chr16 4386814 . T C 738.55 PASS AO=76;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0342948;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.623;QD=38.3661;RBI=0.0360749;REFB=0;REVB=0.0111924;RO=0;SAF=32;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.13339e-05;OID=.;OPOS=4386814;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:77:77:0:0:76:77:44:32:0:0:45:32:0:0 chr16 4414987 . G A 47.84 PASS AO=10;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=9;FSAR=0;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=-0.0728548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.6169;QD=11.2562;RBI=0.0728548;REFB=0.0258502;REVB=0;RO=7;SAF=10;SAR=0;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.026845;OID=.;OPOS=4414987;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:17:17:7:8:10:9:0:10:7:0:0:9:8:0 chr16 4431202 . A G 190.25 PASS AO=51;DP=114;FAO=50;FDP=113;FR=.;FRO=63;FSAF=18;FSAR=32;FSRF=9;FSRR=54;FWDB=0.138972;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.046;QD=6.73444;RBI=0.140294;REFB=-0.0118834;REVB=-0.0192144;RO=62;SAF=19;SAR=32;SRF=8;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280764;STB=0.641743;TYPE=snp;VARB=0.0178946;OID=.;OPOS=4431202;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:113:62:63:51:50:32:19:8:54:32:18:9:54 chr16 4432029 . A C 33.64 PASS AO=8;DP=21;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=-0.0221005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.46;QD=6.40833;RBI=0.0264547;REFB=-0.025877;REVB=-0.0145402;RO=13;SAF=1;SAR=7;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196049;STB=0.621869;TYPE=snp;VARB=0.0323977;OID=.;OPOS=4432029;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:21:21:13:13:8:8:7:1:3:10:7:1:3:10 chr16 4445327 . C T 110.92 PASS AO=26;DP=55;FAO=26;FDP=55;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.0205775;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.502;QD=8.06697;RBI=0.0469793;REFB=-0.0128086;REVB=0.0422329;RO=29;SAF=14;SAR=12;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125;STB=0.507037;TYPE=snp;VARB=0.0138423;OID=.;OPOS=4445327;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:29:29:26:26:12:14:16:13:12:14:16:13 chr16 4476089 . T C 85.17 PASS AO=16;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.0103341;FXX=0.0302939;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.55;QD=10.6461;RBI=0.0173738;REFB=-0.0156539;REVB=0.0139661;RO=15;SAF=6;SAR=10;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24656;STB=0.646886;TYPE=snp;VARB=0.0114379;OID=.;OPOS=4476089;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:32:32:15:15:16:17:10:6:10:5:11:6:10:5 chr16 4484396 . A T 126.41 PASS AO=35;DP=89;FAO=36;FDP=89;FR=.;FRO=53;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=28;FWDB=-0.00426607;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3378;QD=5.68154;RBI=0.0225368;REFB=0.0149371;REVB=-0.0221294;RO=54;SAF=13;SAR=22;SRF=26;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120877;STB=0.550677;TYPE=snp;VARB=-0.0162962;OID=.;OPOS=4484396;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:54:53:35:36:22:13:26:28:22:14:25:28 chr16 4496973 . T A 277.24 PASS AO=86;DP=195;FAO=80;FDP=190;FR=.;FRO=110;FSAF=33;FSAR=47;FSRF=53;FSRR=57;FWDB=-0.0325972;FXX=0.0452239;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.103;QD=5.83668;RBI=0.0346737;REFB=0.00860149;REVB=-0.011819;RO=107;SAF=39;SAR=47;SRF=51;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.023232;STB=0.540798;TYPE=snp;VARB=-0.00970345;OID=.;OPOS=4496973;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:190:107:110:86:80:47:39:51:56:47:33:53:57 chr16 4519439 . G A 263.85 PASS AO=58;DP=114;FAO=58;FDP=112;FR=.;FRO=54;FSAF=11;FSAR=47;FSRF=8;FSRR=46;FWDB=0.0041195;FXX=0.0175423;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.852;QD=9.42329;RBI=0.00412905;REFB=-0.00117731;REVB=-0.000280739;RO=53;SAF=11;SAR=47;SRF=7;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0865226;STB=0.533914;TYPE=snp;VARB=0.0011292;OID=.;OPOS=4519439;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:112:53:54:58:58:47:11:7:46:47:11:8:46 chr16 4625274 . A G 45.7 PASS AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0284167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.444;QD=13.0569;RBI=0.0482684;REFB=-0.0133648;REVB=0.039017;RO=6;SAF=4;SAR=4;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0166723;OID=.;OPOS=4625274;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:14:14:6:6:8:8:4:4:3:3:4:4:3:3 chr16 4625937 . GA G 20.45 PASS AO=4;DP=17;FAO=5;FDP=16;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=10;FWDB=0.0213007;FXX=0.111049;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.145;QD=5.11127;RBI=0.0227915;REFB=0.000429921;REVB=-0.00810765;RO=11;SAF=3;SAR=1;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.639821;STB=0.89684;TYPE=del;VARB=-0.000184288;OID=.;OPOS=4625938;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:4:17:5:16:11:4:1:1:10:20:11:3:1:1:10 chr16 4625939 . TG T,TT 67.37 PASS AO=5,3;DP=18;FAO=5,5;FDP=13;FR=.;FRO=3;FSAF=0,4;FSAR=5,1;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.00525566,0.0811518;FXX=0.277624;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=14.7604,18.5632;QD=20.7281;RBI=0.0164621,0.08496;REFB=-0.179389,-0.131966;REVB=-0.0156006,0.025151;RO=3;SAF=0,2;SAR=5,1;SRF=2;SRR=1;SSEN=0.45,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.762666,0;STB=0.996984,0.57112;TYPE=del,snp;VARB=0.0791576,0.0770611;OID=.,.;OPOS=4625940,4625940;OREF=G,G;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:5,3:14:5,5:13:3:0,4:5,1:2:1:23:3:0,2:5,1:2:1 chr16 4626215 . C T 132.01 PASS AO=15;DP=17;FAO=16;FDP=18;FR=.;FRO=2;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00398178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.495;QD=29.3348;RBI=0.0252187;REFB=-0.0547589;REVB=0.0249024;RO=2;SAF=9;SAR=6;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0910485;STB=0.549939;TYPE=snp;VARB=0.0159979;OID=.;OPOS=4626215;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:17:18:2:2:15:16:6:9:2:0:7:9:2:0 chr16 4708959 . G C 35.55 PASS AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=0.0404367;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.8618;QD=5.92539;RBI=0.043501;REFB=-0.0220722;REVB=0.0160377;RO=15;SAF=5;SAR=4;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193811;STB=0.615148;TYPE=snp;VARB=0.0225498;OID=.;OPOS=4708959;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:25:24:15:15:9:9:4:5:11:4:4:5:11:4 chr16 4709131 . C A 25.1 PASS AO=9;DP=33;FAO=9;FDP=33;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0417926;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.7562;QD=3.04236;RBI=0.0530431;REFB=-0.0371084;REVB=0.0326642;RO=24;SAF=5;SAR=4;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160116;STB=0.599782;TYPE=snp;VARB=0.0610326;OID=.;OPOS=4709131;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:33:33:24:24:9:9:4:5:10:14:4:5:10:14 chr16 4721468 . T C 978.4 PASS AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0254784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.0163;QD=37.9963;RBI=0.0307818;REFB=0;REVB=0.0172734;RO=0;SAF=33;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.64597e-05;OID=.;OPOS=4721468;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:103:103:0:0:103:103:70:33:0:0:70:33:0:0 chr16 4736316 . C T 837.29 PASS AO=87;DP=88;FAO=91;FDP=92;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0595907;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.2034;QD=36.4039;RBI=0.0657011;REFB=-0.00952114;REVB=-0.027669;RO=1;SAF=48;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00976975;STB=0.505154;TYPE=snp;VARB=0.000455368;OID=.;OPOS=4736316;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:88:92:1:1:87:91:39:48:1:0:43:48:1:0 chr16 4748825 . C T 28.15 PASS AO=6;DP=17;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0213849;FXX=0.117578;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.8026;QD=7.50596;RBI=0.0423632;REFB=0.0448693;REVB=0.0365695;RO=11;SAF=2;SAR=4;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0346033;STB=0.571184;TYPE=snp;VARB=-0.0940886;OID=.;OPOS=4748825;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:17:15:11:9:6:6:4:2:4:7:4:2:4:5 chr16 4751045 . C T 126.19 PASS AO=28;DP=56;FAO=28;FDP=56;FR=.;FRO=28;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.116641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.507;QD=9.0136;RBI=0.124525;REFB=-0.0147064;REVB=-0.0436032;RO=28;SAF=16;SAR=12;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0323845;STB=0.518122;TYPE=snp;VARB=0.0219573;OID=.;OPOS=4751045;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:28:28:28:28:12:16:15:13:12:16:15:13 chr16 4752134 . A G 249.51 PASS AO=48;DP=84;FAO=49;FDP=85;FR=.;FRO=36;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.00993626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.436;QD=11.7416;RBI=0.0625458;REFB=-0.0280949;REVB=-0.0617515;RO=36;SAF=30;SAR=18;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101201;STB=0.548941;TYPE=snp;VARB=0.0200762;OID=.;OPOS=4752134;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:85:36:36:48:49:18:30:18:18:19:30:18:18 chr16 4790273 . G A 286.91 PASS AO=66;DP=134;FAO=67;FDP=135;FR=.;FRO=68;FSAF=30;FSAR=37;FSRF=37;FSRR=31;FWDB=0.0314347;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0578;QD=8.50089;RBI=0.0527652;REFB=0.0115495;REVB=0.0423795;RO=68;SAF=29;SAR=37;SRF=38;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10973;STB=0.548558;TYPE=snp;VARB=-0.011679;OID=.;OPOS=4790273;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:135:68:68:66:67:37:29:38:30:37:30:37:31 chr16 4794873 . C T 196.17 PASS AO=51;DP=114;FAO=51;FDP=114;FR=.;FRO=63;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=27;FSRR=36;FWDB=-0.00121983;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.383;QD=6.88297;RBI=0.00158613;REFB=-0.00688649;REVB=0.00101381;RO=63;SAF=29;SAR=22;SRF=27;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138222;STB=0.577183;TYPE=snp;VARB=0.0084045;OID=.;OPOS=4794873;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:63:63:51:51:22:29:27:36:22:29:27:36 chr16 4796393 . A G 234.97 PASS AO=53;DP=114;FAO=57;FDP=119;FR=.;FRO=62;FSAF=41;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=31;FWDB=0.0195484;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.6084;QD=7.89805;RBI=0.0195484;REFB=-0.0122131;REVB=4.82026e-06;RO=45;SAF=41;SAR=12;SRF=29;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140087;STB=0.625806;TYPE=snp;VARB=0.0143327;OID=.;OPOS=4796393;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:119:45:62:53:57:12:41:29:16:16:41:31:31 chr16 4796399 . C T 234.07 PASS AO=58;DP=128;FAO=59;FDP=128;FR=.;FRO=69;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=42;FSRR=27;FWDB=0.0826202;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.6236;QD=7.31472;RBI=0.0966314;REFB=-0.00460585;REVB=0.0501151;RO=70;SAF=28;SAR=30;SRF=43;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128816;STB=0.563024;TYPE=snp;VARB=0.00806604;OID=.;OPOS=4796399;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:70:69:58:59:30:28:43:27:30:29:42:27 chr16 4797457 . C T 160.37 PASS AO=39;DP=87;FAO=42;FDP=97;FR=.;FRO=55;FSAF=12;FSAR=30;FSRF=30;FSRR=25;FWDB=0.00435269;FXX=0.010203;HRUN=4;LEN=1;MLLD=39.5302;QD=6.61314;RBI=0.0236007;REFB=0.00895857;REVB=-0.0231958;RO=48;SAF=9;SAR=30;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.301586;STB=0.656172;TYPE=snp;VARB=-0.0139202;OID=.;OPOS=4797457;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:97:48:55:39:42:30:9:24:24:30:12:30:25 chr16 4802386 . G T 211.56 PASS AO=50;DP=103;FAO=51;FDP=104;FR=.;FRO=53;FSAF=15;FSAR=36;FSRF=25;FSRR=28;FWDB=0.0837902;FXX=0.0095229;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.5654;QD=8.13702;RBI=0.105887;REFB=-0.0319882;REVB=0.0647401;RO=53;SAF=15;SAR=35;SRF=25;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174074;STB=0.599959;TYPE=snp;VARB=0.0515948;OID=.;OPOS=4802386;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:104:53:53:50:51:35:15:25:28:36:15:25:28 chr16 4815602 . T C 58.66 PASS AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.0512111;FXX=0.039984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.0115;QD=9.77662;RBI=0.0772887;REFB=0.0400004;REVB=0.0578875;RO=12;SAF=5;SAR=7;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214087;STB=0.623086;TYPE=snp;VARB=-0.0303104;OID=.;OPOS=4815602;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:24:24:12:12:12:12:7:5:8:4:7:5:8:4 chr16 4815608 . A G 254.95 PASS AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0481027;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.4212;QD=37.7704;RBI=0.0853551;REFB=0;REVB=0.0705097;RO=0;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39874e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0014956;OID=.;OPOS=4815608;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:27:27:0:0:27:27:14:13:0:0:14:13:0:0 chr16 4815666 . TC T 23.35 PASS AO=5;DP=21;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=-0.146095;FXX=0.049975;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.8554;QD=4.91614;RBI=0.309024;REFB=0.0355758;REVB=0.272308;RO=8;SAF=3;SAR=2;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0.4;SSSB=0.570417;STB=0.732852;TYPE=del;VARB=0.0658199;OID=.;OPOS=4815667;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:5:20:9:19:10:6:3:2:8:21:8:3:2:0:8 chr16 4861709 . G C 989.31 PASS AO=104;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00116485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.974;QD=38.0505;RBI=0.0527398;REFB=0;REVB=0.0527269;RO=0;SAF=52;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.25158e-05;OID=.;OPOS=4861709;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:104:104:0:0:104:104:52:52:0:0:52:52:0:0 chr16 4933939 . G C 659.88 PASS AO=68;DP=68;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.038169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.3;QD=38.2537;RBI=0.0434245;REFB=0;REVB=0.0207078;RO=0;SAF=34;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.34562e-05;OID=.;OPOS=4933939;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:68:69:0:0:68:69:34:34:0:0:35:34:0:0 chr16 4934549 . G A 158.92 PASS AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0804319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.231;QD=37.3925;RBI=0.0969473;REFB=0;REVB=0.0541248;RO=0;SAF=13;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00128361;OID=.;OPOS=4934549;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:17:17:0:0:17:17:4:13:0:0:4:13:0:0 chr16 4934564 . C G 231.75 PASS AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.041389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.282;QD=37.0805;RBI=0.045438;REFB=0;REVB=-0.0187501;RO=0;SAF=17;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000147933;OID=.;OPOS=4934564;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:25:25:0:0:25:25:8:17:0:0:8:17:0:0 chr16 4938160 . T G 934.27 PASS AO=97;DP=99;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0232698;FXX=0.0202;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.022;QD=38.5265;RBI=0.0244457;REFB=0;REVB=-0.00749056;RO=0;SAF=49;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.04443e-05;OID=.;OPOS=4938160;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:99:97:0:0:97:97:48:49:0:0:48:49:0:0 chr16 4940809 . A G 836.77 PASS AO=83;DP=84;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102661;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.3406;QD=36.7811;RBI=0.0873684;REFB=0;REVB=-0.0867631;RO=0;SAF=47;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00256846;OID=.;OPOS=4940809;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:84:91:0:0:83:91:36:47:0:0:37:54:0:0 chr16 4942099 . C T 425.74 PASS AO=53;DP=61;FAO=54;FDP=61;FR=.;FRO=7;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0.0292173;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=240.322;QD=27.9175;RBI=0.029301;REFB=0.0181799;REVB=-0.0022133;RO=7;SAF=25;SAR=28;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104294;STB=0.555535;TYPE=snp;VARB=-0.000117596;OID=.;OPOS=4942099;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:61:61:7:7:53:54:28:25:0:7:28:26:0:7 chr16 4944518 . C G 288.74 PASS AO=29;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000579931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.137;QD=38.4992;RBI=0.0109764;REFB=0;REVB=-0.0109611;RO=0;SAF=19;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.93363e-05;OID=.;OPOS=4944518;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:29:30:0:0:29:30:10:19:0:0:11:19:0:0 chr16 5050897 . G C 100.46 PASS AO=22;DP=47;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.00580654;FXX=0.020829;HRUN=4;LEN=1;MLLD=126.766;QD=8.5498;RBI=0.0176997;REFB=-0.0153091;REVB=0.0167201;RO=22;SAF=13;SAR=9;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161331;STB=0.554683;TYPE=snp;VARB=0.016978;OID=.;OPOS=5050897;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:22:24:22:23:9:13:9:13:10:13:11:13 chr16 5061151 . GC G 26.77 PASS AO=17;DP=43;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.0791693;FXX=0.139502;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.25191;QD=2.89433;RBI=0.0853728;REFB=-0.130328;REVB=0.031949;RO=17;SAF=10;SAR=7;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.254444;STB=0.601881;TYPE=del;VARB=0.158119;OID=.;OPOS=5061152;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:17:42:16:37:21:9:7:8:13:25:17:10:7:5:12 chr16 5064917 . C T 96.96 PASS AO=32;DP=91;FAO=32;FDP=90;FR=.;FRO=58;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=7;FSRR=51;FWDB=0.0843249;FXX=0.0109878;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.7128;QD=4.3094;RBI=0.0843994;REFB=-0.015386;REVB=-0.00354724;RO=58;SAF=11;SAR=21;SRF=7;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.315753;STB=0.676836;TYPE=snp;VARB=0.0213948;OID=.;OPOS=5064917;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:91:90:58:58:32:32:21:11:7:51:21:11:7:51 chr16 5068029 . A C 41 PASS AO=22;DP=99;FAO=22;FDP=89;FR=.;FRO=67;FSAF=1;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=46;FWDB=-0.0522993;FXX=0.1188;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.1017;QD=1.84251;RBI=0.0879875;REFB=-0.00687507;REVB=-0.0707572;RO=75;SAF=1;SAR=21;SRF=31;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.631711;STB=0.872878;TYPE=snp;VARB=0.032136;OID=.;OPOS=5068029;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:99:89:75:67:22:22:21:1:31:44:21:1:21:46 chr16 5074952 . C T 968.78 PASS AO=103;DP=103;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00641447;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.016;QD=37.2607;RBI=0.0478878;REFB=-0.0573573;REVB=0.0474562;RO=0;SAF=41;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000126484;OID=.;OPOS=5074952;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:103:104:0:0:103:104:62:41:0:0:62:42:0:0 chr16 5075226 . G A 48.48 PASS AO=13;DP=34;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0101086;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.457;QD=5.70341;RBI=0.0402247;REFB=-0.00382005;REVB=0.0389338;RO=21;SAF=2;SAR=11;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.414735;STB=0.749559;TYPE=snp;VARB=0.00462145;OID=.;OPOS=5075226;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:34:34:21:21:13:13:11:2:10:11:11:2:10:11 chr16 5075542 . G A 71.22 PASS AO=24;DP=72;FAO=24;FDP=71;FR=.;FRO=47;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=0.014708;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.721;QD=4.01252;RBI=0.0167341;REFB=0.0177585;REVB=-0.00798143;RO=47;SAF=8;SAR=16;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22987;STB=0.634501;TYPE=snp;VARB=-0.0234952;OID=.;OPOS=5075542;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:72:71:47:47:24:24:16:8:25:22:16:8:25:22 chr16 5075633 . G A 150.03 PASS AO=31;DP=58;FAO=31;FDP=58;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.0339679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.24;QD=10.3466;RBI=0.0340657;REFB=-0.0211323;REVB=-0.00257966;RO=27;SAF=15;SAR=16;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00200484;STB=0.501113;TYPE=snp;VARB=0.0243478;OID=.;OPOS=5075633;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:27:27:31:31:16:15:13:14:16:15:13:14 chr16 5097947 . A G 134.07 PASS AO=43;DP=115;FAO=43;FDP=115;FR=.;FRO=72;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=29;FSRR=43;FWDB=-0.0179861;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.889;QD=4.66344;RBI=0.0360221;REFB=-0.00122409;REVB=0.0312104;RO=72;SAF=20;SAR=23;SRF=29;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.069256;STB=0.539418;TYPE=snp;VARB=0.002293;OID=.;OPOS=5097947;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:72:72:43:43:23:20:29:43:23:20:29:43 chr16 5106184 . C T 311.8 PASS AO=71;DP=137;FAO=72;FDP=144;FR=.;FRO=72;FSAF=41;FSAR=31;FSRF=32;FSRR=40;FWDB=0.00414939;FXX=0.0335548;HRUN=5;LEN=1;MLLD=75.2148;QD=8.66099;RBI=0.0459764;REFB=-0.0479276;REVB=-0.0457888;RO=62;SAF=41;SAR=30;SRF=29;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0940059;STB=0.562603;TYPE=snp;VARB=0.0235424;OID=.;OPOS=5106184;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:144:62:72:71:72:30:41:29:33:31:41:32:40 chr16 5132636 . C T 484.22 PASS AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0312254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.476;QD=38.7376;RBI=0.0675691;REFB=0;REVB=0.0599212;RO=0;SAF=27;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000338111;OID=.;OPOS=5132636;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:50:50:0:0:50:50:23:27:0:0:23:27:0:0 chr16 5139186 . G C 27.78 PASS AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.0263412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.634;QD=12.3462;RBI=0.0292854;REFB=-0.00960641;REVB=-0.0127976;RO=4;SAF=1;SAR=4;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.28673;STB=0.666163;TYPE=snp;VARB=0.0123131;OID=.;OPOS=5139186;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:9:9:4:4:5:5:4:1:0:4:4:1:0:4 chr16 5139217 . C G 125.84 PASS AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0105274;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=231.471;QD=35.9535;RBI=0.037058;REFB=0;REVB=-0.0355312;RO=0;SAF=2;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000359537;OID=.;OPOS=5139217;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:14:14:0:0:14:14:12:2:0:0:12:2:0:0 chr16 6533549 . C A 48.47 PASS AO=11;DP=26;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.051776;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.233;QD=7.75491;RBI=0.0532143;REFB=-0.0104604;REVB=-0.0122885;RO=15;SAF=3;SAR=8;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143835;STB=0.556415;TYPE=snp;VARB=0.00758849;OID=.;OPOS=6533549;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:26:25:15:14:11:11:8:3:6:9:8:3:5:9 chr16 6923966 . A G 376.84 PASS AO=81;DP=152;FAO=81;FDP=152;FR=.;FRO=71;FSAF=45;FSAR=36;FSRF=37;FSRR=34;FWDB=-0.00806178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.4182;QD=9.9169;RBI=0.00933668;REFB=-0.0222388;REVB=0.00470972;RO=71;SAF=45;SAR=36;SRF=37;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0296163;STB=0.51622;TYPE=snp;VARB=0.0238254;OID=.;OPOS=6923966;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:152:71:71:81:81:36:45:37:34:36:45:37:34 chr16 7054010 . A T 69.23 PASS AO=19;DP=48;FAO=19;FDP=49;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.00726471;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=170.4;QD=5.65164;RBI=0.00754285;REFB=-0.00375687;REVB=-0.00202943;RO=29;SAF=11;SAR=8;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0652617;STB=0.528354;TYPE=snp;VARB=0.00484538;OID=.;OPOS=7054010;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:48:49:29:30:19:19:8:11:15:14:8:11:16:14 chr16 7102036 . CT C,CC 272.82 PASS AO=61,36;DP=238;FAO=75,24;FDP=225;FR=.;FRO=126;FSAF=55,15;FSAR=20,9;FSRF=78;FSRR=48;FWDB=-0.162275,-0.13799;FXX=0.0425514;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=16.8856,21.9786;QD=4.85012;RBI=0.162349,0.147444;REFB=0.00863463,-0.00438651;REVB=-0.00492638,0.0519466;RO=120;SAF=46,27;SAR=15,9;SRF=74;SRR=46;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.188473,0.19478;STB=0.584351,0.505315;TYPE=del,snp;VARB=-0.0323781,0.0101567;OID=.,.;OPOS=7102037,7102037;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:61,36:230:75,24:225:126:55,15:20,9:78:48:99:120:46,27:15,9:74:46 chr16 7760884 . T G 208.28 PASS AO=53;DP=122;FAO=53;FDP=117;FR=.;FRO=64;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=28;FSRR=36;FWDB=-0.00671733;FXX=0.0409802;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.3253;QD=7.12059;RBI=0.011532;REFB=0.00259713;REVB=-0.0093736;RO=62;SAF=25;SAR=28;SRF=27;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0352574;STB=0.5188;TYPE=snp;VARB=-0.00565616;OID=.;OPOS=7760884;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:117:62:64:53:53:28:25:27:35:28:25:28:36 chr16 7761529 . C T 639.58 PASS AO=66;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0402712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.257;QD=38.1837;RBI=0.0417804;REFB=0;REVB=0.0111281;RO=0;SAF=26;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000119114;OID=.;OPOS=7761529;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:66:67:0:0:66:67:40:26:0:0:40:27:0:0 chr16 8728953 . C T 1333.37 PASS AO=138;DP=141;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0472901;FXX=0.00694396;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.247;QD=37.2969;RBI=0.0473367;REFB=0;REVB=0.00209825;RO=1;SAF=54;SAR=84;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00872256;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000583667;OID=.;OPOS=8728953;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:141:143:1:0:138:143:84:54:1:0:87:56:0:0 chr16 8736028 . T C 2632.65 PASS AO=273;DP=277;FAO=276;FDP=276;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=212;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0237473;FXX=0.00360998;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.1722;QD=38.1544;RBI=0.0370004;REFB=0.0178132;REVB=-0.0283742;RO=4;SAF=63;SAR=210;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000745253;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000236905;OID=.;OPOS=8736028;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:277:276:4:0:273:276:210:63:1:3:212:64:0:0 chr16 8738427 . T C 604.61 PASS AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0274754;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.252;QD=37.788;RBI=0.0278186;REFB=0;REVB=0.00435624;RO=0;SAF=55;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000132699;OID=.;OPOS=8738427;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:64:64:0:0:64:64:9:55:0:0:9:55:0:0 chr16 8738499 . G A 466.01 PASS AO=48;DP=50;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0540914;FXX=0.039992;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.6277;QD=38.8341;RBI=0.0602365;REFB=0;REVB=0.0265057;RO=0;SAF=32;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000239913;OID=.;OPOS=8738499;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:50:48:0:0:48:48:16:32:0:0:16:32:0:0 chr16 8738579 . A G 481.19 PASS AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.075535;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.816;QD=37.7406;RBI=0.0790648;REFB=0;REVB=0.0233601;RO=0;SAF=20;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.13361e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000294752;OID=.;OPOS=8738579;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:51:51:0:0:51:51:31:20:0:0:31:20:0:0 chr16 8739954 . G A 1908.98 PASS AO=196;DP=202;FAO=202;FDP=202;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145801;FXX=0.042652;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7807;QD=37.8015;RBI=0.0158568;REFB=0;REVB=0.00623377;RO=0;SAF=87;SAR=109;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46257e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00530111;OID=.;OPOS=8739954;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:91:202:202:0:0:196:202:109:87:0:0:111:91:0:0 chr16 8740015 . A C 2052.73 PASS AO=221;DP=228;FAO=225;FDP=231;FR=.;FRO=6;FSAF=95;FSAR=130;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0488354;FXX=0.00431016;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2448;QD=35.5451;RBI=0.0523419;REFB=-0.0191924;REVB=0.0188355;RO=5;SAF=93;SAR=128;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000899715;STB=0.502069;TYPE=snp;VARB=0.00115957;OID=.;OPOS=8740015;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:228:231:5:6:221:225:128:93:2:3:130:95:3:3 chr16 8740151 . G A 390.59 PASS AO=70;DP=198;FAO=95;FDP=197;FR=.;FRO=102;FSAF=38;FSAR=57;FSRF=50;FSRR=52;FWDB=0.0132486;FXX=0.00505025;HRUN=4;LEN=1;MLLD=171.239;QD=7.93072;RBI=0.0157117;REFB=-0.0100198;REVB=0.00844581;RO=81;SAF=33;SAR=37;SRF=37;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0142128;STB=0.547708;TYPE=snp;VARB=0.00791622;OID=.;OPOS=8740151;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:197:81:102:70:95:37:33:37:44:57:38:50:52 chr16 8740235 . T C 479.65 PASS AO=117;DP=242;FAO=117;FDP=242;FR=.;FRO=125;FSAF=40;FSAR=77;FSRF=51;FSRR=74;FWDB=0.00559677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.308;QD=7.92814;RBI=0.0281301;REFB=-0.0298441;REVB=0.0275677;RO=122;SAF=40;SAR=77;SRF=51;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0763139;STB=0.537052;TYPE=snp;VARB=0.0313876;OID=.;OPOS=8740235;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:242:242:122:125:117:117:77:40:51:71:77:40:51:74 chr16 8740418 . T C 1459.45 PASS AO=153;DP=153;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127791;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.8207;QD=38.1556;RBI=0.0290131;REFB=0;REVB=0.0260471;RO=0;SAF=68;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.64903e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00011336;OID=.;OPOS=8740418;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:153:153:0:0:153:153:85:68:0:0:85:68:0:0 chr16 8740503 . G A 1119.75 PASS AO=107;DP=107;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0708331;FXX=0.0168053;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.248;QD=38.282;RBI=0.0774612;REFB=0;REVB=0.0313514;RO=0;SAF=54;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.66183e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000315458;OID=.;OPOS=8740503;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:107:117:0:0:107:117:53:54:0:0:60:57:0:0 chr16 8839954 . A G 820.47 PASS AO=85;DP=85;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0359402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.578;QD=38.1613;RBI=0.03638;REFB=0;REVB=0.0056397;RO=0;SAF=42;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.39349e-05;OID=.;OPOS=8839954;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:85:86:0:0:85:86:43:42:0:0:44:42:0:0 chr16 8841960 . T C 2638.11 PASS AO=251;DP=253;FAO=278;FDP=278;FR=.;FRO=0;FSAF=119;FSAR=159;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0273997;FXX=0.0035841;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.358;QD=37.9584;RBI=0.0662361;REFB=-0.054027;REVB=0.0603032;RO=1;SAF=113;SAR=138;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00344188;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000164871;OID=.;OPOS=8841960;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:253:278:1:0:251:278:138:113:0:1:159:119:0:0 chr16 8875763 . T C 75.2 PASS AO=20;DP=59;FAO=22;FDP=62;FR=.,HEALED;FRO=38;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=28;FWDB=0.00038445;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.657;QD=4.85139;RBI=0.0469634;REFB=-0.00960598;REVB=-0.0469618;RO=29;SAF=11;SAR=9;SRF=8;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.278284;STB=0.674412;TYPE=snp;VARB=0.0132345;OID=.;OPOS=8875763;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:59:62:29:38:20:22:9:11:8:21:10:12:10:28 chr16 8877854 . C G 257.44 PASS AO=51;DP=90;FAO=51;FDP=90;FR=.;FRO=39;FSAF=42;FSAR=9;FSRF=30;FSRR=9;FWDB=0.0242941;FXX=0.0217368;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.788;QD=11.4416;RBI=0.0291516;REFB=-0.0200501;REVB=-0.0161125;RO=36;SAF=42;SAR=9;SRF=30;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0128914;STB=0.538446;TYPE=snp;VARB=0.0118777;OID=.;OPOS=8877854;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:36:39:51:51:9:42:30:6:9:42:30:9 chr16 8900241 . G A 342.43 PASS AO=76;DP=152;FAO=78;FDP=152;FR=.;FRO=74;FSAF=48;FSAR=30;FSRF=38;FSRR=36;FWDB=0.0116118;FXX=0.0129862;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.7509;QD=9.01128;RBI=0.0141346;REFB=-0.0142125;REVB=0.00805935;RO=73;SAF=47;SAR=29;SRF=37;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102361;STB=0.551135;TYPE=snp;VARB=0.0144082;OID=.;OPOS=8900241;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:152:73:74:76:78:29:47:37:36:30:48:38:36 chr16 8948433 . C T 63.27 PASS AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.013271;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.307;QD=13.3209;RBI=0.0145933;REFB=0.00701563;REVB=-0.00606993;RO=8;SAF=1;SAR=10;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.474169;STB=0.780601;TYPE=snp;VARB=-0.0459526;OID=.;OPOS=8948433;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:19:19:8:8:11:11:10:1:4:4:10:1:4:4 chr16 8948437 . C T 63.28 PASS AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.00596825;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.052;QD=13.3224;RBI=0.00990406;REFB=0.00384134;REVB=0.00790382;RO=8;SAF=1;SAR=10;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.474169;STB=0.780601;TYPE=snp;VARB=-0.00533024;OID=.;OPOS=8948437;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:19:19:8:8:11:11:10:1:4:4:10:1:4:4 chr16 8952248 . A G 460.49 PASS AO=39;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.033187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.697;QD=38.3742;RBI=0.0756093;REFB=0;REVB=0.0679367;RO=0;SAF=16;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43889e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00040493;OID=.;OPOS=8952248;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:47:48:0:0:39:48:23:16:0:0:31:17:0:0 chr16 8953081 . C G 61.29 PASS AO=15;DP=47;FAO=16;FDP=40;FR=.,HEALED;FRO=24;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=24;FWDB=0.00913701;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=260.414;QD=6.12903;RBI=0.0458561;REFB=-0.0182236;REVB=-0.0449366;RO=14;SAF=6;SAR=9;SRF=0;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.396324;STB=0.785489;TYPE=snp;VARB=0.0246972;OID=.;OPOS=8953081;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:38:40:14:24:15:16:9:6:0:14:9:7:0:24 chr16 8979046 . A G 580.21 PASS AO=60;DP=60;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.912;QD=37.4326;RBI=0.0223429;REFB=0;REVB=-0.016831;RO=0;SAF=32;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.17391e-06;OID=.;OPOS=8979046;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:60:62:0:0:60:62:28:32:0:0:30:32:0:0 chr16 9000400 . CA C 21.57 PASS AO=34;DP=149;FAO=40;FDP=137;FR=.;FRO=97;FSAF=10;FSAR=30;FSRF=39;FSRR=58;FWDB=0.00150847;FXX=0.0283668;HRUN=5;LEN=1;MLLD=8.56898;QD=0.629702;RBI=0.10468;REFB=-0.0571227;REVB=-0.10467;RO=83;SAF=8;SAR=26;SRF=34;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243301;STB=0.625465;TYPE=del;VARB=-0.0714361;OID=.;OPOS=9000401;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:34:141:40:137:97:10:30:39:58:21:83:8:26:34:49 chr16 9030444 . C G 1155.82 PASS AO=123;DP=124;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0272689;FXX=0.00806387;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.8628;QD=37.5878;RBI=0.0416187;REFB=-0.0760846;REVB=0.0314407;RO=1;SAF=41;SAR=82;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00575915;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000625442;OID=.;OPOS=9030444;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:124:123:1:0:123:123:82:41:0:1:82:41:0:0 chr16 9693953 . C G 39.94 PASS AO=10;DP=31;FAO=10;FDP=29;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=14;FWDB=-0.0439173;FXX=0.0644953;HRUN=3;LEN=1;MLLD=236.031;QD=5.50828;RBI=0.0446109;REFB=-0.0144475;REVB=-0.00783609;RO=13;SAF=4;SAR=6;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0945612;STB=0.624777;TYPE=snp;VARB=0.0127935;OID=.;OPOS=9693953;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:31:29:13:18:10:10:6:4:4:9:6:4:4:14 chr16 9693997 . C G 14.45 PASS AO=6;DP=28;FAO=6;FDP=28;FR=.;FRO=22;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=18;FWDB=-0.0705501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9623;QD=2.06375;RBI=0.0705713;REFB=-0.00392263;REVB=-0.00173273;RO=22;SAF=2;SAR=4;SRF=4;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229048;STB=0.646651;TYPE=snp;VARB=0.00522933;OID=.;OPOS=9693997;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:28:28:22:22:6:6:4:2:4:18:4:2:4:18 chr16 9857574 . G C 174.59 PASS AO=48;DP=113;FAO=48;FDP=113;FR=.;FRO=65;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=17;FSRR=48;FWDB=-0.0566964;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.5975;QD=6.18031;RBI=0.0755795;REFB=-0.0170383;REVB=0.0499778;RO=64;SAF=23;SAR=25;SRF=17;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221648;STB=0.626678;TYPE=snp;VARB=0.0253655;OID=.;OPOS=9857574;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:64:65:48:48:25:23:17:47:25:23:17:48 chr16 9858502 . C G 607.25 PASS AO=159;DP=352;FAO=159;FDP=348;FR=.;FRO=189;FSAF=59;FSAR=100;FSRF=78;FSRR=111;FWDB=0.0162199;FXX=0.0141639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.0589;QD=6.97982;RBI=0.0162987;REFB=-0.0149424;REVB=-0.00160081;RO=185;SAF=59;SAR=100;SRF=78;SRR=107;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0519446;STB=0.523918;TYPE=snp;VARB=0.0262074;OID=.;OPOS=9858502;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:352:348:185:189:159:159:100:59:78:107:100:59:78:111 chr16 10315838 . T C 35.27 PASS AO=18;DP=73;FAO=18;FDP=73;FR=.;FRO=55;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=43;FWDB=-0.00310578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.6392;QD=1.93274;RBI=0.0578024;REFB=-0.0175199;REVB=-0.0577189;RO=54;SAF=6;SAR=12;SRF=11;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196894;STB=0.604292;TYPE=snp;VARB=0.0311808;OID=.;OPOS=10315838;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:73:73:54:55:18:18:12:6:11:43:12:6:12:43 chr16 10575824 . C A 287.29 PASS AO=61;DP=114;FAO=62;FDP=117;FR=.;FRO=55;FSAF=17;FSAR=45;FSRF=22;FSRR=33;FWDB=0.0479764;FXX=0.00847386;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.0569;QD=9.82177;RBI=0.0510638;REFB=0.00127056;REVB=0.0174866;RO=52;SAF=18;SAR=43;SRF=21;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104138;STB=0.569597;TYPE=snp;VARB=-0.00206303;OID=.;OPOS=10575824;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:117:52:55:61:62:43:18:21:31:45:17:22:33 chr16 10769958 . T C 307.01 PASS AO=66;DP=121;FAO=65;FDP=121;FR=.;FRO=56;FSAF=52;FSAR=13;FSRF=42;FSRR=14;FWDB=-0.0146901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.555;QD=10.149;RBI=0.0202755;REFB=-0.02409;REVB=-0.0139748;RO=53;SAF=53;SAR=13;SRF=41;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0368807;STB=0.534642;TYPE=snp;VARB=0.0165224;OID=.;OPOS=10769958;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:53:56:66:65:13:53:41:12:13:52:42:14 chr16 10788624 . T C 310.87 PASS AO=76;DP=163;FAO=81;FDP=179;FR=.;FRO=98;FSAF=40;FSAR=41;FSRF=47;FSRR=51;FWDB=-0.0237569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.06;QD=6.94689;RBI=0.026304;REFB=-0.0174897;REVB=0.0112921;RO=87;SAF=40;SAR=36;SRF=47;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0134515;STB=0.507794;TYPE=snp;VARB=0.0171624;OID=.;OPOS=10788624;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:179:87:98:76:81:36:40:47:40:41:40:47:51 chr16 10862964 . A G 498.39 PASS AO=56;DP=59;FAO=56;FDP=59;FR=.;FRO=3;FSAF=17;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00496041;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=92.9912;QD=33.789;RBI=0.0245537;REFB=-0.169337;REVB=0.0240475;RO=0;SAF=17;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.87981e-08;STB=0.501786;TYPE=snp;VARB=0.00335642;OID=.;OPOS=10862964;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:59:59:0:3:56:56:39:17:0:0:39:17:1:2 chr16 10995933 . A G 284.75 PASS AO=24;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.034979;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.02;QD=36.7423;RBI=0.0818014;REFB=0;REVB=0.0739455;RO=0;SAF=10;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00160348;OID=.;OPOS=10995933;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:31:31:0:0:24:31:14:10:0:0:21:10:0:0 chr16 11002133 . C G 543.52 PASS AO=54;DP=54;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0614518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.3535;QD=38.1417;RBI=0.0617911;REFB=0;REVB=0.00646654;RO=0;SAF=29;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000379055;OID=.;OPOS=11002133;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:54:57:0:0:54:57:25:29:0:0:28:29:0:0 chr16 11002904 . G A 940.68 PASS AO=102;DP=104;FAO=103;FDP=105;FR=.;FRO=2;FSAF=58;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0522339;FXX=0.00943307;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.0927;QD=35.8355;RBI=0.0525016;REFB=-0.00965595;REVB=0.00529451;RO=1;SAF=58;SAR=44;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106609;STB=0.501221;TYPE=snp;VARB=0.000349037;OID=.;OPOS=11002904;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:104:105:1:2:102:103:44:58:0:1:45:58:1:1 chr16 11002927 . A G 1115.34 PASS AO=117;DP=117;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00620017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.594;QD=38.1314;RBI=0.0270948;REFB=0;REVB=0.0263759;RO=0;SAF=58;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.3468e-05;OID=.;OPOS=11002927;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:117:117:0:0:117:117:59:58:0:0:59:58:0:0 chr16 11056378 . C T 509.09 PASS AO=122;DP=249;FAO=122;FDP=249;FR=.;FRO=127;FSAF=57;FSAR=65;FSRF=64;FSRR=63;FWDB=0.00650852;FXX=0.00399984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.951;QD=8.17808;RBI=0.016284;REFB=-0.0121634;REVB=0.0149267;RO=124;SAF=57;SAR=65;SRF=61;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0227497;STB=0.518762;TYPE=snp;VARB=0.0140525;OID=.;OPOS=11056378;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:249:249:124:127:122:122:65:57:61:63:65:57:64:63 chr16 11154770 . G A 172.83 PASS AO=34;DP=61;FAO=34;FDP=61;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=28;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.0503823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.174;QD=11.3329;RBI=0.0519954;REFB=-0.0215365;REVB=0.012851;RO=27;SAF=6;SAR=28;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.288485;STB=0.66131;TYPE=snp;VARB=0.0104216;OID=.;OPOS=11154770;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:27:27:34:34:28:6:12:15:28:6:12:15 chr16 11367143 . G A 267.06 PASS AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0242278;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=233.936;QD=38.1519;RBI=0.0326418;REFB=0;REVB=0.0218747;RO=0;SAF=13;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000126279;OID=.;OPOS=11367143;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:28:28:0:0:28:28:15:13:0:0:15:13:0:0 chr16 11367154 . C T 249.59 PASS AO=26;DP=28;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00502964;FXX=0.0714031;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.7609;QD=38.3981;RBI=0.0212276;REFB=0;REVB=0.0206231;RO=0;SAF=13;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000369462;OID=.;OPOS=11367154;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:28:26:0:0:26:26:13:13:0:0:13:13:0:0 chr16 11367195 . G C 48.23 PASS AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.0611089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.0781;QD=7.71728;RBI=0.0679307;REFB=-0.032495;REVB=0.0296695;RO=14;SAF=2;SAR=9;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.363052;STB=0.716372;TYPE=snp;VARB=0.0273499;OID=.;OPOS=11367195;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:25:25:14:14:11:11:9:2:7:7:9:2:7:7 chr16 11374866 . G T 218.97 PASS AO=59;DP=135;FAO=59;FDP=135;FR=.;FRO=76;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=31;FSRR=45;FWDB=0.0526667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.1621;QD=6.48799;RBI=0.0526785;REFB=0.00432149;REVB=-0.00111484;RO=75;SAF=25;SAR=34;SRF=31;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106871;STB=0.509149;TYPE=snp;VARB=-0.00457752;OID=.;OPOS=11374866;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:75:76:59:59:34:25:31:44:34:25:31:45 chr16 11387117 . A G 2801.16 PASS AO=301;DP=306;FAO=301;FDP=301;FR=.;FRO=0;FSAF=146;FSAR=155;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.002298;FXX=0.0163393;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.044;QD=37.2247;RBI=0.021686;REFB=0.0234652;REVB=-0.0215639;RO=5;SAF=146;SAR=155;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00889126;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000310814;OID=.;OPOS=11387117;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:306:301:5:0:301:301:155:146:1:4:155:146:0:0 chr16 11387125 . C T 533.86 PASS AO=137;DP=296;FAO=138;FDP=299;FR=.;FRO=161;FSAF=62;FSAR=76;FSRF=77;FSRR=84;FWDB=0.010199;FXX=0.00333322;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.056;QD=7.14196;RBI=0.0548702;REFB=-0.0241108;REVB=-0.053914;RO=158;SAF=61;SAR=76;SRF=77;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0411188;STB=0.515717;TYPE=snp;VARB=0.0270257;OID=.;OPOS=11387125;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:296:299:158:161:137:138:76:61:77:81:76:62:77:84 chr16 11387164 . T C 1898.19 PASS AO=171;DP=213;FAO=199;FDP=199;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=79;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00254756;FXX=0.00499975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.735;QD=38.1546;RBI=0.0626256;REFB=0;REVB=0.0625738;RO=0;SAF=74;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00191283;OID=.;OPOS=11387164;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:89:204:199:0:0:171:199:97:74:0:0:120:79:0:0 chr16 11540712 . T C 419 PASS AO=32;DP=49;FAO=44;FDP=44;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0843214;FXX=0.0434688;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.932;QD=38.0908;RBI=0.125081;REFB=0;REVB=0.0923863;RO=0;SAF=7;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00081827;OID=.;OPOS=11540712;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:46:44:0:0:32:44:25:7:0:0:29:15:0:0 chr16 11541896 . G A 187.05 PASS AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3926;QD=37.4095;RBI=0.058431;REFB=0;REVB=0.058431;RO=0;SAF=0;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00181066;OID=.;OPOS=11541896;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:21:20:0:0:20:20:20:0:0:0:20:0:0:0 chr16 11542894 . C T 1013.86 PASS AO=108;DP=112;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.123222;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.249;QD=36.5354;RBI=0.130623;REFB=0.0502318;REVB=0.0433449;RO=3;SAF=40;SAR=68;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0342704;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00038123;OID=.;OPOS=11542894;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:112:111:3:0:108:111:68:40:3:0:68:43:0:0 chr16 11544509 . C G 190.87 PASS AO=33;DP=55;FAO=35;FDP=59;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.0125293;FXX=0.0166639;HRUN=3;LEN=1;MLLD=142.206;QD=12.9404;RBI=0.0425608;REFB=-0.0215343;REVB=0.0406747;RO=22;SAF=15;SAR=18;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0332166;STB=0.546315;TYPE=snp;VARB=0.0152653;OID=.;OPOS=11544509;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:55:59:22:24:33:35:18:15:11:11:20:15:13:11 chr16 11544673 . G A 385.44 PASS AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.002437;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.319;QD=37.604;RBI=0.00432113;REFB=0;REVB=0.00356836;RO=0;SAF=12;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.60807e-06;OID=.;OPOS=11544673;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:41:41:0:0:41:41:29:12:0:0:29:12:0:0 chr16 11553842 . G C 1089.72 PASS AO=113;DP=114;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0173873;FXX=0.0172399;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.3217;QD=38.2358;RBI=0.031903;REFB=0;REVB=0.0267485;RO=0;SAF=60;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000283557;OID=.;OPOS=11553842;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:114:114:0:0:113:114:53:60:0:0:53:61:0:0 chr16 11554867 . C T 497.73 PASS AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0419707;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=128.404;QD=37.5641;RBI=0.0423247;REFB=0;REVB=0.00546233;RO=0;SAF=22;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76368e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000128647;OID=.;OPOS=11554867;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:53:53:0:0:53:53:31:22:0:0:31:22:0:0 chr16 11556121 . A G 327.65 PASS AO=30;DP=30;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00709437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.179;QD=37.4454;RBI=0.0208078;REFB=0;REVB=0.0195611;RO=0;SAF=20;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.6675e-05;OID=.;OPOS=11556121;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:30:35:0:0:30:35:10:20:0:0:15:20:0:0 chr16 11643631 . G A 195.4 PASS AO=45;DP=94;FAO=45;FDP=91;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=20;FSRR=26;FWDB=0.00188909;FXX=0.0319115;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.174;QD=8.58919;RBI=0.0304239;REFB=-0.0103116;REVB=-0.0303652;RO=42;SAF=17;SAR=28;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0465268;STB=0.530181;TYPE=snp;VARB=0.00813059;OID=.;OPOS=11643631;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:91:42:46:45:45:28:17:18:24:28:17:20:26 chr16 11844655 . C A 105.45 PASS AO=23;DP=47;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.0575896;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=39.7927;QD=8.7874;RBI=0.157724;REFB=0.00586249;REVB=0.146834;RO=24;SAF=13;SAR=10;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0595413;STB=0.520888;TYPE=snp;VARB=0.00223047;OID=.;OPOS=11844655;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:48:24:24:23:24:10:13:12:12:11:13:12:12 chr16 11852354 . A C 178.68 PASS AO=45;DP=99;FAO=45;FDP=99;FR=.;FRO=54;FSAF=29;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=33;FWDB=-0.0306244;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.0375;QD=7.21928;RBI=0.0503564;REFB=0.0172718;REVB=-0.0399739;RO=54;SAF=29;SAR=16;SRF=21;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.250011;STB=0.63974;TYPE=snp;VARB=-0.0121693;OID=.;OPOS=11852354;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:54:54:45:45:16:29:21:33:16:29:21:33 chr16 11940390 . T C 1190.81 PASS AO=123;DP=125;FAO=130;FDP=131;FR=.;FRO=1;FSAF=68;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00247334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.956;QD=36.3605;RBI=0.00256543;REFB=-0.0947231;REVB=-0.000681207;RO=1;SAF=66;SAR=57;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00826211;STB=0.503999;TYPE=snp;VARB=0.000583738;OID=.;OPOS=11940390;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:125:131:1:1:123:130:57:66:0:1:62:68:0:1 chr16 11981487 . G A 823.47 PASS AO=183;DP=348;FAO=183;FDP=347;FR=.;FRO=164;FSAF=106;FSAR=77;FSRF=81;FSRR=83;FWDB=-0.00737432;FXX=0.00287348;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.752;QD=9.49239;RBI=0.0145658;REFB=-0.00384645;REVB=-0.0125611;RO=161;SAF=106;SAR=77;SRF=80;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0716012;STB=0.540829;TYPE=snp;VARB=0.00289059;OID=.;OPOS=11981487;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:348:347:161:164:183:183:77:106:80:81:77:106:81:83 chr16 12027474 . CAT C 586.09 PASS AO=61;DP=69;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0515503;FXX=0.0735186;HRUN=1;LEN=2;MLLD=185.816;QD=37.2121;RBI=0.0516375;REFB=0;REVB=-0.00299995;RO=0;SAF=18;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00152325;OID=.;OPOS=12027475;OREF=AT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:61:66:63:63:0:19:44:0:0:28:0:18:43:0:0 chr16 12031448 . T C 292.03 PASS AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0953191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.793;QD=38.9369;RBI=0.0953307;REFB=0;REVB=-0.00148281;RO=0;SAF=16;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.56309e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000402997;OID=.;OPOS=12031448;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:30:30:0:0:30:30:14:16:0:0:14:16:0:0 chr16 12060163 . A G 2553.56 PASS AO=281;DP=293;FAO=286;FDP=293;FR=.;FRO=7;FSAF=116;FSAR=170;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0221892;FXX=0.00677943;HRUN=3;LEN=1;MLLD=168.454;QD=34.8609;RBI=0.0372751;REFB=-0.201163;REVB=0.0299512;RO=8;SAF=115;SAR=166;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0155514;STB=0.502973;TYPE=snp;VARB=0.000894417;OID=.;OPOS=12060163;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:293:293:8:7:281:286:166:115:1:7:170:116:2:5 chr16 12621176 . C G 409.51 PASS AO=74;DP=119;FAO=74;FDP=118;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=58;FSRF=16;FSRR=28;FWDB=-0.0457653;FXX=0.00840265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.864;QD=13.8816;RBI=0.0483457;REFB=-0.0294528;REVB=-0.0155834;RO=43;SAF=16;SAR=58;SRF=15;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122197;STB=0.574236;TYPE=snp;VARB=0.019536;OID=.;OPOS=12621176;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:118:43:44:74:74:58:16:15:28:58:16:16:28 chr16 12662420 . C T 74.24 PASS AO=19;DP=54;FAO=22;FDP=57;FR=.;FRO=35;FSAF=1;FSAR=21;FSRF=2;FSRR=33;FWDB=0.0350664;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=34.68;QD=5.20978;RBI=0.151857;REFB=-0.058588;REVB=0.147753;RO=35;SAF=1;SAR=18;SRF=2;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0243031;STB=0.538424;TYPE=snp;VARB=0.108033;OID=.;OPOS=12662420;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:54:57:35:35:19:22:18:1:2:33:21:1:2:33 chr16 12666984 . T A 901.93 PASS AO=94;DP=95;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00869735;FXX=0.0309246;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.786;QD=38.3802;RBI=0.0331361;REFB=0;REVB=0.0319743;RO=0;SAF=40;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000340013;OID=.;OPOS=12666984;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:95:94:0:0:94:94:54:40:0:0:54:40:0:0 chr16 12667393 . G A 253.88 PASS AO=83;DP=219;FAO=83;FDP=219;FR=.;FRO=136;FSAF=41;FSAR=42;FSRF=65;FSRR=71;FWDB=-0.0175296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.817;QD=4.63698;RBI=0.0175355;REFB=-0.002075;REVB=0.000455972;RO=136;SAF=41;SAR=42;SRF=65;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0176352;STB=0.509959;TYPE=snp;VARB=0.00322786;OID=.;OPOS=12667393;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:219:219:136:136:83:83:42:41:65:71:42:41:65:71 chr16 12667409 . C G 279.7 PASS AO=79;DP=186;FAO=79;FDP=186;FR=.;FRO=107;FSAF=38;FSAR=41;FSRF=43;FSRR=64;FWDB=-0.00114997;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.465;QD=6.015;RBI=0.0256745;REFB=-0.00208225;REVB=-0.0256487;RO=107;SAF=38;SAR=41;SRF=43;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.081995;STB=0.545742;TYPE=snp;VARB=0.0030047;OID=.;OPOS=12667409;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:186:107:107:79:79:41:38:43:64:41:38:43:64 chr16 12667945 . C T 562.63 PASS AO=156;DP=351;FAO=154;FDP=349;FR=.;FRO=195;FSAF=60;FSAR=94;FSRF=105;FSRR=90;FWDB=-0.014805;FXX=0.00569784;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.3069;QD=6.44844;RBI=0.018409;REFB=0.000643048;REVB=-0.0109409;RO=193;SAF=62;SAR=94;SRF=104;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142624;STB=0.58417;TYPE=snp;VARB=-0.0012156;OID=.;OPOS=12667945;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:351:349:193:195:156:154:94:62:104:89:94:60:105:90 chr16 12757352 . TA T 40.18 PASS AO=24;DP=162;FAO=59;FDP=164;FR=.;FRO=105;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=59;FSRR=46;FWDB=0.0595585;FXX=0.0409333;HRUN=6;LEN=1;MLLD=7.51509;QD=0.979882;RBI=0.217629;REFB=-0.114383;REVB=-0.209321;RO=75;SAF=5;SAR=19;SRF=51;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.552235;STB=0.588109;TYPE=del;VARB=0.028585;OID=.;OPOS=12757353;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:24:150:59:164:105:25:34:59:46:40:75:5:19:51:24 chr16 12758966 . T C 1003.16 PASS AO=104;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168021;FXX=0.00943307;HRUN=3;LEN=1;MLLD=215.197;QD=38.2156;RBI=0.0168023;REFB=0;REVB=7.65145e-05;RO=0;SAF=32;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.42843e-05;OID=.;OPOS=12758966;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:105:105:0:0:104:105:72:32:0:0:73:32:0:0 chr16 12897578 . G T 188.5 PASS AO=50;DP=119;FAO=50;FDP=116;FR=.;FRO=66;FSAF=30;FSAR=20;FSRF=28;FSRR=38;FWDB=-0.0062473;FXX=0.025208;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.416;QD=6.49996;RBI=0.0762076;REFB=-0.00231593;REVB=0.0759511;RO=63;SAF=30;SAR=20;SRF=26;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186347;STB=0.59996;TYPE=snp;VARB=0.00261084;OID=.;OPOS=12897578;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:116:63:66:50:50:20:30:26:37:20:30:28:38 chr16 13002359 . T C 1517.84 PASS AO=159;DP=162;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0453895;FXX=0.0185174;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.485;QD=38.1846;RBI=0.0493625;REFB=0;REVB=0.0194022;RO=0;SAF=69;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39823e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.08774e-05;OID=.;OPOS=13002359;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:162:159:0:0:159:159:90:69:0:0:90:69:0:0 chr16 14041958 . T C 182.19 PASS AO=39;DP=74;FAO=39;FDP=74;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.0675712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.627;QD=9.84829;RBI=0.067717;REFB=-0.00452195;REVB=-0.00444178;RO=35;SAF=16;SAR=23;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0410392;STB=0.522716;TYPE=snp;VARB=0.00314072;OID=.;OPOS=14041958;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:35:35:39:39:23:16:16:19:23:16:16:19 chr16 14042077 . A G 91.8 PASS AO=13;DP=17;FAO=13;FDP=17;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0602957;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.3163;QD=21.6005;RBI=0.0605501;REFB=0.0123859;REVB=0.00554502;RO=4;SAF=4;SAR=9;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0289225;STB=0.516104;TYPE=snp;VARB=-0.00668687;OID=.;OPOS=14042077;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:17:17:4:4:13:13:9:4:1:3:9:4:1:3 chr16 14046149 . AT A 221.91 PASS AO=104;DP=252;FAO=140;FDP=222;FR=.;FRO=82;FSAF=77;FSAR=63;FSRF=37;FSRR=45;FWDB=0.0906716;FXX=0.0593195;HRUN=8;LEN=1;MLLD=6.95616;QD=3.9983;RBI=0.0953725;REFB=0.0064705;REVB=0.0295734;RO=81;SAF=61;SAR=43;SRF=36;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115201;STB=0.53658;TYPE=del;VARB=0.0757365;OID=.;OPOS=14046150;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:104:232:140:222:82:77:63:37:45:53:81:61:43:36:45 chr16 14969016 . T A 96.72 PASS AO=31;DP=88;FAO=32;FDP=89;FR=.;FRO=57;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=26;FWDB=0.00980604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.082;QD=4.34701;RBI=0.0166342;REFB=-0.00993998;REVB=0.0134364;RO=56;SAF=15;SAR=16;SRF=30;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0578038;STB=0.528072;TYPE=snp;VARB=0.0166658;OID=.;OPOS=14969016;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:88:89:56:57:31:32:16:15:30:26:16:16:31:26 chr16 14988868 . A G 42.98 PASS AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.0195598;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.4191;QD=14.3277;RBI=0.0798989;REFB=0.0400935;REVB=-0.0774677;RO=5;SAF=5;SAR=2;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.477379;STB=0.777056;TYPE=snp;VARB=-0.0404352;OID=.;OPOS=14988868;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:12:12:5:5:7:7:2:5:0:5:2:5:0:5 chr16 14989420 . C T 58.39 PASS AO=8;DP=11;FAO=8;FDP=11;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0556238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.042;QD=21.232;RBI=0.0562129;REFB=-0.01576;REVB=0.00811678;RO=3;SAF=1;SAR=7;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185472;STB=0.608384;TYPE=snp;VARB=0.00600563;OID=.;OPOS=14989420;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:11:11:3:3:8:8:7:1:1:2:7:1:1:2 chr16 15032140 . C T 87.36 PASS AO=10;DP=20;FAO=13;FDP=18;FR=.;FRO=5;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.105166;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.9301;QD=19.4124;RBI=0.10564;REFB=-0.00665478;REVB=0.00999591;RO=1;SAF=8;SAR=2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0526894;STB=0.592469;TYPE=snp;VARB=0.00693254;OID=.;OPOS=15032140;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:14:18:1:5:10:13:2:8:1:0:2:11:5:0 chr16 15082865 . C T 33.9 PASS AO=19;DP=80;FAO=19;FDP=81;FR=.;FRO=62;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=35;FSRR=27;FWDB=0.0641281;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.8643;QD=1.67399;RBI=0.118191;REFB=-0.0115801;REVB=0.0992811;RO=61;SAF=13;SAR=6;SRF=34;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166415;STB=0.598219;TYPE=snp;VARB=0.0400701;OID=.;OPOS=15082865;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:80:81:61:62:19:19:6:13:34:27:6:13:35:27 chr16 15083131 . A T 18.18 PASS AO=20;DP=111;FAO=19;FDP=110;FR=.;FRO=91;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=40;FSRR=51;FWDB=-0.00500321;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.382;QD=0.661004;RBI=0.00514914;REFB=-0.00543569;REVB=-0.00121716;RO=91;SAF=13;SAR=7;SRF=40;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.26423;STB=0.656442;TYPE=snp;VARB=0.0295661;OID=.;OPOS=15083131;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:111:110:91:91:20:19:7:13:40:51:7:12:40:51 chr16 15091601 . G C 29.16 PASS AO=14;DP=58;FAO=14;FDP=57;FR=.;FRO=43;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=34;FWDB=0.0155693;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.216;QD=2.04642;RBI=0.0155731;REFB=0.000328334;REVB=-0.000343993;RO=43;SAF=3;SAR=11;SRF=9;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00905617;STB=0.50561;TYPE=snp;VARB=-0.00295288;OID=.;OPOS=15091601;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:58:57:43:43:14:14:11:3:9:34:11:3:9:34 chr16 15095675 . C A 108.69 PASS AO=41;DP=132;FAO=43;FDP=134;FR=.;FRO=91;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=47;FSRR=44;FWDB=-0.0319977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1863;QD=3.24451;RBI=0.0322531;REFB=-0.0238829;REVB=0.00405086;RO=87;SAF=15;SAR=26;SRF=43;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153754;STB=0.583002;TYPE=snp;VARB=0.0459986;OID=.;OPOS=15095675;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:134:87:91:41:43:26:15:43:44:26:17:47:44 chr16 15098047 . C G 155.65 PASS AO=75;DP=257;FAO=75;FDP=257;FR=.;FRO=182;FSAF=47;FSAR=28;FSRF=96;FSRR=86;FWDB=-0.00354289;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=263.654;QD=2.4226;RBI=0.0301132;REFB=-0.00835958;REVB=-0.0299041;RO=182;SAF=47;SAR=28;SRF=96;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123674;STB=0.572294;TYPE=snp;VARB=0.0193944;OID=.;OPOS=15098047;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:257:257:182:182:75:75:28:47:96:86:28:47:96:86 chr16 15110077 . C T 55.8 PASS AO=26;DP=95;FAO=27;FDP=98;FR=.;FRO=71;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=38;FSRR=33;FWDB=0.0332517;FXX=0.0101;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.2671;QD=2.27773;RBI=0.0346143;REFB=-0.0136186;REVB=-0.00961621;RO=67;SAF=11;SAR=15;SRF=37;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155278;STB=0.565562;TYPE=snp;VARB=0.0353175;OID=.;OPOS=15110077;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:95:98:67:71:26:27:15:11:37:30:15:12:38:33 chr16 15116625 . G T 382.44 PASS AO=75;DP=135;FAO=78;FDP=137;FR=.;FRO=59;FSAF=36;FSAR=42;FSRF=14;FSRR=45;FWDB=0.0603046;FXX=0.0143875;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.5891;QD=11.166;RBI=0.0603626;REFB=-0.0356212;REVB=0.00264618;RO=59;SAF=34;SAR=41;SRF=14;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179783;STB=0.5986;TYPE=snp;VARB=0.0272157;OID=.;OPOS=15116625;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:137:59:59:75:78:41:34:14:45:42:36:14:45 chr16 15129940 . C T 177.36 PASS AO=34;DP=76;FAO=42;FDP=87;FR=.;FRO=45;FSAF=4;FSAR=38;FSRF=17;FSRR=28;FWDB=0.00322833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.15;QD=8.15431;RBI=0.0128049;REFB=-0.0232822;REVB=-0.0123913;RO=40;SAF=4;SAR=30;SRF=15;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.385555;STB=0.751261;TYPE=snp;VARB=0.0398577;OID=.;OPOS=15129940;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:87:40:45:34:42:30:4:15:25:38:4:17:28 chr16 15129970 . A G 122.05 PASS AO=29;DP=67;FAO=31;FDP=68;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=27;FWDB=-0.00495869;FXX=0.0684838;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.343;QD=7.17945;RBI=0.0359305;REFB=-0.0267573;REVB=-0.0355867;RO=37;SAF=10;SAR=19;SRF=10;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0845613;STB=0.56903;TYPE=snp;VARB=0.0196891;OID=.;OPOS=15129970;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:68:37:37:29:31:19:10:10:27:19:12:10:27 chr16 15131962 . A G 315.56 PASS AO=74;DP=194;FAO=91;FDP=215;FR=.;FRO=124;FSAF=48;FSAR=43;FSRF=46;FSRR=78;FWDB=-0.0528969;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.2292;QD=5.8709;RBI=0.099693;REFB=-0.00172329;REVB=-0.0845022;RO=120;SAF=31;SAR=43;SRF=45;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0498915;STB=0.589625;TYPE=snp;VARB=0.00207491;OID=.;OPOS=15131962;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:215:120:124:74:91:43:31:45:75:43:48:46:78 chr16 15131974 . G T 259.9 PASS AO=82;DP=204;FAO=81;FDP=204;FR=.;FRO=123;FSAF=44;FSAR=37;FSRF=46;FSRR=77;FWDB=-0.00869611;FXX=0.00487781;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.6641;QD=5.09599;RBI=0.0129289;REFB=-0.00306885;REVB=-0.00956741;RO=122;SAF=45;SAR=37;SRF=45;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189971;STB=0.600982;TYPE=snp;VARB=0.00914822;OID=.;OPOS=15131974;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:204:122:123:82:81:37:45:45:77:37:44:46:77 chr16 15133889 . T G 509.54 PASS AO=133;DP=291;FAO=135;FDP=295;FR=.;FRO=160;FSAF=76;FSAR=59;FSRF=93;FSRR=67;FWDB=0.0142157;FXX=0.00337826;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.935;QD=6.90905;RBI=0.0175377;REFB=-0.0243343;REVB=0.0102705;RO=158;SAF=74;SAR=59;SRF=92;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0258463;STB=0.510102;TYPE=snp;VARB=0.0195274;OID=.;OPOS=15133889;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:291:295:158:160:133:135:59:74:92:66:59:76:93:67 chr16 15166891 . T C 232.66 PASS AO=52;DP=101;FAO=52;FDP=101;FR=.;FRO=49;FSAF=10;FSAR=42;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=-0.0125641;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=78.4254;QD=9.21428;RBI=0.0171281;REFB=-0.0262132;REVB=-0.011641;RO=48;SAF=10;SAR=42;SRF=21;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.275529;STB=0.660698;TYPE=snp;VARB=0.0224077;OID=.;OPOS=15166891;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:48:49:52:52:42:10:21:27:42:10:22:27 chr16 15170452 . C A 442.24 PASS AO=108;DP=255;FAO=120;FDP=266;FR=.;FRO=146;FSAF=59;FSAR=61;FSRF=69;FSRR=77;FWDB=0.0197501;FXX=0.00374518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.738;QD=6.65021;RBI=0.0197822;REFB=-0.00436607;REVB=-0.00112501;RO=145;SAF=47;SAR=61;SRF=69;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0422895;STB=0.510468;TYPE=snp;VARB=0.00642539;OID=.;OPOS=15170452;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:255:266:145:146:108:120:61:47:69:76:61:59:69:77 chr16 15178499 . G A 24.99 PASS AO=35;DP=206;FAO=35;FDP=207;FR=.;FRO=172;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=93;FSRR=79;FWDB=-0.0357992;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.606;QD=0.482908;RBI=0.0393003;REFB=-0.00633955;REVB=-0.016215;RO=169;SAF=24;SAR=11;SRF=93;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182789;STB=0.626557;TYPE=snp;VARB=0.0269702;OID=.;OPOS=15178499;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:206:207:169:172:35:35:11:24:93:76:11:24:93:79 chr16 15185186 . C T 158.96 PASS AO=44;DP=107;FAO=45;FDP=108;FR=.;FRO=63;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=39;FSRR=24;FWDB=-0.00451755;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.325;QD=5.8873;RBI=0.00712495;REFB=-0.00911224;REVB=0.00550968;RO=61;SAF=21;SAR=23;SRF=37;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132899;STB=0.575675;TYPE=snp;VARB=0.0109209;OID=.;OPOS=15185186;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:108:61:63:44:45:23:21:37:24:23:22:39:24 chr16 15198457 . C T 52.72 PASS AO=18;DP=55;FAO=18;FDP=55;FR=.;FRO=37;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=26;FSRR=11;FWDB=0.02616;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.45;QD=3.83398;RBI=0.0313789;REFB=-0.00379626;REVB=-0.0173289;RO=37;SAF=14;SAR=4;SRF=26;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113122;STB=0.567488;TYPE=snp;VARB=0.00999188;OID=.;OPOS=15198457;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:55:55:37:37:18:18:4:14:26:11:4:14:26:11 chr16 15198598 . C T 30.47 PASS AO=8;DP=23;FAO=8;FDP=23;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=0.000473627;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.441;QD=5.2996;RBI=0.00721817;REFB=-0.011745;REVB=-0.00720262;RO=15;SAF=6;SAR=2;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.489546;STB=0.795235;TYPE=snp;VARB=0.0170972;OID=.;OPOS=15198598;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:23:23:15:15:8:8:2:6:4:11:2:6:4:11 chr16 15221957 . T C 243.13 PASS AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00437329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.987;QD=37.405;RBI=0.0111609;REFB=0;REVB=0.0102684;RO=0;SAF=20;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.14057e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.93215e-05;OID=.;OPOS=15221957;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:26:26:0:0:26:26:6:20:0:0:6:20:0:0 chr16 15225148 . G C 10.43 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=6;FR=.,HEALED;FRO=4;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.139159;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.6194;QD=6.95551;RBI=0.139159;REFB=-0.0393008;REVB=0;RO=2;SAF=2;SAR=0;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.032689;OID=.;OPOS=15225148;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:2:4:2:2:0:2:2:0:0:2:4:0 chr16 15457767 . C T 16.29 PASS AO=11;DP=64;FAO=12;FDP=65;FR=.;FRO=53;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=34;FWDB=-0.031511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0289;QD=1.0023;RBI=0.0500996;REFB=-0.0103612;REVB=0.0389491;RO=53;SAF=1;SAR=10;SRF=19;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.450736;STB=0.829499;TYPE=snp;VARB=0.0974658;OID=.;OPOS=15457767;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:64:65:53:53:11:12:10:1:19:34:11:1:19:34 chr16 15781054 . A G 1142.98 PASS AO=115;DP=115;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.576;QD=38.4196;RBI=0.0407754;REFB=0;REVB=0.0387788;RO=0;SAF=68;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.28385e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000113904;OID=.;OPOS=15781054;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:115:119:0:0:115:119:47:68:0:0:49:70:0:0 chr16 15785049 . C T 159.62 PASS AO=39;DP=82;FAO=40;FDP=89;FR=.;FRO=49;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=36;FSRR=13;FWDB=0.0240143;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=177.238;QD=7.17383;RBI=0.0314243;REFB=0.000945802;REVB=0.0202683;RO=43;SAF=19;SAR=20;SRF=30;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197661;STB=0.629153;TYPE=snp;VARB=-0.00141416;OID=.;OPOS=15785049;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:89:43:49:39:40:20:19:30:13:20:20:36:13 chr16 15811023 . C T 280.41 PASS AO=66;DP=134;FAO=66;FDP=134;FR=.;FRO=68;FSAF=29;FSAR=37;FSRF=33;FSRR=35;FWDB=0.0245861;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.3517;QD=8.37032;RBI=0.0319203;REFB=-0.0253799;REVB=0.0203575;RO=68;SAF=29;SAR=37;SRF=33;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0425431;STB=0.523498;TYPE=snp;VARB=0.0397751;OID=.;OPOS=15811023;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:68:68:66:66:37:29:33:35:37:29:33:35 chr16 15811062 . C T 231.43 PASS AO=46;DP=85;FAO=51;FDP=99;FR=.;FRO=48;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=17;FSRR=31;FWDB=0.0288584;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.3881;QD=9.35083;RBI=0.0326718;REFB=-0.06386;REVB=-0.0153179;RO=37;SAF=20;SAR=26;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0202908;STB=0.566125;TYPE=snp;VARB=0.0357533;OID=.;OPOS=15811062;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:99:37:48:46:51:26:20:17:20:26:25:17:31 chr16 15818141 . A C 2234.87 PASS AO=235;DP=237;FAO=235;FDP=235;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=139;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00712767;FXX=0.00843846;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.476;QD=38.0403;RBI=0.00722496;REFB=-0.0283614;REVB=0.00118167;RO=1;SAF=96;SAR=139;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00341646;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.72577e-05;OID=.;OPOS=15818141;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:97:237:235:1:0:235:235:139:96:0:1:139:96:0:0 chr16 15843899 . G A 212.13 PASS AO=18;DP=27;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01149;FXX=0.0370233;HRUN=4;LEN=1;MLLD=194.791;QD=32.6347;RBI=0.0841783;REFB=0;REVB=0.0833905;RO=0;SAF=17;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000433523;OID=.;OPOS=15843899;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:18:26:0:0:18:26:1:17:0:0:9:17:0:0 chr16 15850204 . A G 102.52 PASS AO=27;DP=66;FAO=28;FDP=67;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=27;FWDB=-0.0278488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.06;QD=6.12065;RBI=0.0312024;REFB=-0.0214341;REVB=-0.0140726;RO=37;SAF=17;SAR=10;SRF=12;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.304159;STB=0.689311;TYPE=snp;VARB=0.0327783;OID=.;OPOS=15850204;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:67:37:39:27:28:10:17:12:25:10:18:12:27 chr16 15917197 . G A 211.8 PASS AO=61;DP=145;FAO=61;FDP=147;FR=.;FRO=86;FSAF=22;FSAR=39;FSRF=37;FSRR=49;FWDB=-0.00935661;FXX=0.0067563;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.7274;QD=5.76326;RBI=0.0436125;REFB=-0.00464365;REVB=0.042597;RO=82;SAF=23;SAR=38;SRF=35;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0533939;STB=0.543059;TYPE=snp;VARB=0.00520064;OID=.;OPOS=15917197;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:147:82:86:61:61:38:23:35:47:39:22:37:49 chr16 15971028 . C G 1214.49 PASS AO=127;DP=144;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156211;FXX=0.115638;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.1433;QD=37.3689;RBI=0.0423371;REFB=-0.0795019;REVB=0.0393498;RO=0;SAF=61;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.22321e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000815759;OID=.;OPOS=15971028;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:144:130:0:0:127:130:66:61:0:0:68:62:0:0 chr16 15973654 . G T 1265.83 PASS AO=132;DP=132;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287229;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.82;QD=37.5059;RBI=0.103866;REFB=0;REVB=0.0998158;RO=0;SAF=75;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000368129;OID=.;OPOS=15973654;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:132:135:0:0:132:135:57:75:0:0:58:77:0:0 chr16 16138322 . T C 1832.19 PASS AO=200;DP=205;FAO=200;FDP=200;FR=.;FRO=0;FSAF=122;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00379094;FXX=0.0243891;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.93;QD=36.6438;RBI=0.0123728;REFB=-0.0460556;REVB=0.0117778;RO=4;SAF=122;SAR=78;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0237935;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.322e-05;OID=.;OPOS=16138322;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:205:200:4:0:200:200:78:122:0:4:78:122:0:0 chr16 16139714 . T C 1649.48 PASS AO=175;DP=179;FAO=177;FDP=177;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0102224;FXX=0.0166657;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.1169;QD=37.2764;RBI=0.102916;REFB=-0.0547722;REVB=0.102407;RO=1;SAF=88;SAR=87;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00544018;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00138187;OID=.;OPOS=16139714;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:179:177:1:0:175:177:87:88:0:1:89:88:0:0 chr16 16162019 . T C 1365.62 PASS AO=109;DP=149;FAO=147;FDP=151;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=79;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.191348;FXX=0.0194793;HRUN=2;LEN=1;MLLD=35.689;QD=36.1753;RBI=0.195202;REFB=0;REVB=0.0385966;RO=1;SAF=42;SAR=67;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111676;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00422362;OID=.;OPOS=16162019;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:148:151:1:0:109:147:67:42:1:0:68:79:0:0 chr16 16173232 . G T 28.19 PASS AO=11;DP=41;FAO=11;FDP=41;FR=.;FRO=30;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=-0.0466862;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.338;QD=2.7502;RBI=0.121302;REFB=-0.00711412;REVB=0.111958;RO=30;SAF=4;SAR=7;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.045488;STB=0.52825;TYPE=snp;VARB=0.0216132;OID=.;OPOS=16173232;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:41:41:30:30:11:11:7:4:12:18:7:4:12:18 chr16 16196502 . G A 115.32 PASS AO=29;DP=65;FAO=29;FDP=65;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=-0.00598997;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.9992;QD=7.0965;RBI=0.00623129;REFB=-0.0459054;REVB=0.00171732;RO=35;SAF=15;SAR=14;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0527445;STB=0.536716;TYPE=snp;VARB=0.0653643;OID=.;OPOS=16196502;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:35:36:29:29:14:15:20:15:14:15:21:15 chr16 16271357 . T C 1356.93 PASS AO=142;DP=144;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00458711;FXX=0.0138879;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.567;QD=38.2233;RBI=0.0474465;REFB=0;REVB=0.0472242;RO=0;SAF=49;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000100878;OID=.;OPOS=16271357;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:144:142:0:0:142:142:93:49:0:0:93:49:0:0 chr16 16271409 . G A 1491.5 PASS AO=179;DP=196;FAO=179;FDP=196;FR=.;FRO=17;FSAF=80;FSAR=99;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0154126;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.688;QD=30.4387;RBI=0.0206689;REFB=-0.0296998;REVB=0.0137716;RO=17;SAF=80;SAR=99;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00393543;STB=0.502074;TYPE=snp;VARB=0.00327567;OID=.;OPOS=16271409;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:196:196:17:17:179:179:99:80:8:9:99:80:8:9 chr16 16272669 . GT G,GC 1147.5 PASS AO=49,66;DP=123;FAO=72,53;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=21,46;FSAR=51,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0443809,-0.087289;FXX=0.00793588;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=71.4233,70.4802;QD=36.7199;RBI=0.0471592,0.0908462;REFB=0,0;REVB=-0.0159476,-0.0251727;RO=0;SAF=2,60;SAR=47,6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.40231e-08,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.018286,0.0386331;OID=.,.;OPOS=16272670,16272670;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=G,GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:49,66:117:72,53:125:0:21,46:51,7:0:0:99:0:2,60:47,6:0:0 chr16 16278050 . C T 101.96 PASS AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00717729;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.819;QD=37.0753;RBI=0.0251179;REFB=0;REVB=0.0240706;RO=0;SAF=2;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.96661e-05;OID=.;OPOS=16278050;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:11:11:9:2:0:0:9:2:0:0 chr16 16278863 . G T 1602.22 PASS AO=167;DP=167;FAO=167;FDP=167;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0221639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.071;QD=38.3766;RBI=0.0247235;REFB=0;REVB=0.010955;RO=0;SAF=67;SAR=100;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.15183e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.554e-06;OID=.;OPOS=16278863;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:167:167:0:0:167:167:100:67:0:0:100:67:0:0 chr16 16278869 . G C 1614.46 PASS AO=168;DP=168;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0492405;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.72;QD=38.4396;RBI=0.0500738;REFB=0;REVB=0.00909744;RO=0;SAF=67;SAR=101;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.26912e-05;OID=.;OPOS=16278869;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:168:168:0:0:168:168:101:67:0:0:101:67:0:0 chr16 16281007 . A G 116.19 PASS AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0395879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.5332;QD=35.7501;RBI=0.0396186;REFB=0;REVB=0.00156078;RO=0;SAF=6;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00156921;OID=.;OPOS=16281007;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:13:0:0:13:13:7:6:0:0:7:6:0:0 chr16 16291971 . C T 193.17 PASS AO=69;DP=199;FAO=70;FDP=198;FR=.;FRO=128;FSAF=39;FSAR=31;FSRF=75;FSRR=53;FWDB=0.0533704;FXX=0.00502487;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.8525;QD=3.90251;RBI=0.0721372;REFB=-0.0167172;REVB=0.0485323;RO=129;SAF=38;SAR=31;SRF=76;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0445559;STB=0.518937;TYPE=snp;VARB=0.0183797;OID=.;OPOS=16291971;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:199:198:129:128:69:70:31:38:76:53:31:39:75:53 chr16 16291983 . A G 215.81 PASS AO=72;DP=196;FAO=73;FDP=197;FR=.;FRO=124;FSAF=41;FSAR=32;FSRF=70;FSRR=54;FWDB=-0.00895531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.422;QD=4.38189;RBI=0.0165058;REFB=-0.0131252;REVB=-0.0138652;RO=118;SAF=41;SAR=31;SRF=65;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0207453;STB=0.501836;TYPE=snp;VARB=0.0160239;OID=.;OPOS=16291983;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:197:118:124:72:73:31:41:65:53:32:41:70:54 chr16 16302586 . T C 69.63 PASS AO=24;DP=91;FAO=29;FDP=96;FR=.;FRO=67;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=27;FSRR=40;FWDB=0.00613781;FXX=0.0303;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.218;QD=2.90112;RBI=0.0063259;REFB=-0.00358729;REVB=0.0015311;RO=65;SAF=4;SAR=20;SRF=25;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.336683;STB=0.571378;TYPE=snp;VARB=0.00969988;OID=.;OPOS=16302586;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:91:96:65:67:24:29:20:4:25:40:20:9:27:40 chr16 16468294 . C T 63.99 PASS AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.0247863;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.407;QD=6.73595;RBI=0.0556565;REFB=-0.0220306;REVB=-0.0498326;RO=21;SAF=7;SAR=9;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177126;STB=0.613498;TYPE=snp;VARB=0.0318531;OID=.;OPOS=16468294;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:38:38:21:22:16:16:9:7:13:8:9:7:14:8 chr16 17196433 . G C 118.84 PASS AO=31;DP=72;FAO=31;FDP=72;FR=.;FRO=41;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=35;FSRR=6;FWDB=-0.0240065;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.6987;QD=6.60198;RBI=0.0244147;REFB=-0.00904721;REVB=-0.00444575;RO=41;SAF=21;SAR=10;SRF=35;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224557;STB=0.624931;TYPE=snp;VARB=0.0214373;OID=.;OPOS=17196433;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:41:41:31:31:10:21:35:6:10:21:35:6 chr16 17196621 . A ATTC 136.69 PASS AO=10;DP=51;FAO=29;FDP=49;FR=.;FRO=20;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.0224116;FXX=0.019996;HRUN=8;LEN=3;MLLD=254.648;QD=11.1581;RBI=0.0226337;REFB=-0.0294438;REVB=-0.00316258;RO=32;SAF=2;SAR=8;SRF=24;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.599636;STB=0.53017;TYPE=ins;VARB=0.0246581;OID=.;OPOS=17196622;OREF=-;OALT=TTC;OMAPALT=ATTC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:10:51:29:49:20:18:11:11:9:77:32:2:8:24:8 chr16 17196622 . T TTC 57.14 PASS AO=16;DP=51;FAO=17;FDP=48;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.00472926;FXX=0.039992;HRUN=8;LEN=2;MLLD=252.495;QD=4.76171;RBI=0.00472951;REFB=-0.00746574;REVB=-4.89755e-05;RO=34;SAF=13;SAR=3;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.45327;STB=0.768886;TYPE=ins;VARB=0.00608532;OID=.;OPOS=17196623;OREF=-;OALT=TC;OMAPALT=TTC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:16:51:17:48:31:14:3:14:17:57:34:13:3:15:19 chr16 17228368 . G A 522.61 PASS AO=108;DP=195;FAO=108;FDP=193;FR=.;FRO=85;FSAF=38;FSAR=70;FSRF=38;FSRR=47;FWDB=-0.003851;FXX=0.0153053;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.626;QD=10.8314;RBI=0.00428072;REFB=-0.0600839;REVB=0.00186932;RO=83;SAF=38;SAR=70;SRF=36;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0699894;STB=0.544739;TYPE=snp;VARB=0.0438713;OID=.;OPOS=17228368;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:193:83:85:108:108:70:38:36:47:70:38:38:47 chr16 18823379 . T C 1887.01 PASS AO=232;DP=258;FAO=231;FDP=256;FR=.;FRO=25;FSAF=142;FSAR=89;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.0172722;FXX=0.00775164;HRUN=7;LEN=1;MLLD=173.732;QD=29.4846;RBI=0.0197389;REFB=-0.0596172;REVB=0.00955499;RO=9;SAF=142;SAR=90;SRF=1;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.037151;STB=0.505625;TYPE=snp;VARB=0.00175266;OID=.;OPOS=18823379;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:258:256:9:25:232:231:90:142:1:8:89:142:14:11 chr16 18846429 . G A 279.28 PASS AO=56;DP=100;FAO=56;FDP=100;FR=.;FRO=44;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=29;FSRR=15;FWDB=-0.0430254;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.2709;QD=11.1712;RBI=0.0435179;REFB=-0.0170423;REVB=0.00652887;RO=44;SAF=32;SAR=24;SRF=29;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0728035;STB=0.539809;TYPE=snp;VARB=0.0149369;OID=.;OPOS=18846429;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:44:44:56:56:24:32:29:15:24:32:29:15 chr16 19041595 . G A 1503.65 PASS AO=170;DP=182;FAO=172;FDP=180;FR=.;FRO=8;FSAF=73;FSAR=99;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.0139453;FXX=0.0109884;HRUN=4;LEN=1;MLLD=211.108;QD=33.4145;RBI=0.0142934;REFB=-0.0375865;REVB=0.00313529;RO=9;SAF=73;SAR=97;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0230427;STB=0.514741;TYPE=snp;VARB=0.000128333;OID=.;OPOS=19041595;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:182:180:9:8:170:172:97:73:6:3:99:73:6:2 chr16 19067933 . G A 1308.54 PASS AO=138;DP=142;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0288127;FXX=0.0279701;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.3843;QD=37.6558;RBI=0.0387299;REFB=-0.080782;REVB=0.0258812;RO=1;SAF=54;SAR=84;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00872256;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000224086;OID=.;OPOS=19067933;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:142:139:1:0:138:139:84:54:1:0:84:55:0:0 chr16 19080184 . C T 1916.93 PASS AO=195;DP=195;FAO=199;FDP=199;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151542;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.2861;QD=38.5314;RBI=0.015413;REFB=0;REVB=-0.00281276;RO=0;SAF=75;SAR=120;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.8059e-05;OID=.;OPOS=19080184;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:195:199:0:0:195:199:120:75:0:0:120:79:0:0 chr16 19080227 . C CTG 975.26 PASS AO=103;DP=143;FAO=107;FDP=110;FR=.;FRO=3;FSAF=38;FSAR=69;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0499197;FXX=0.219843;HRUN=0;LEN=2;MLLD=235.872;QD=35.464;RBI=0.0505688;REFB=0.0372603;REVB=-0.00807656;RO=16;SAF=37;SAR=66;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0303722;STB=0.509223;TYPE=ins;VARB=-0.00148373;OID=.;OPOS=19080228;OREF=-;OALT=TG;OMAPALT=CTG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:103:143:107:110:3:38:69:2:1:27:16:37:66:4:12 chr16 19085298 . C T 2960 PASS AO=308;DP=311;FAO=309;FDP=309;FR=.;FRO=0;FSAF=170;FSAR=139;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00587724;FXX=0.00961508;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.731;QD=38.3172;RBI=0.00769426;REFB=0;REVB=-0.00496585;RO=0;SAF=169;SAR=139;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.49556e-05;OID=.;OPOS=19085298;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:311:309:0:0:308:309:139:169:0:0:139:170:0:0 chr16 19195130 . C T 130.98 PASS AO=35;DP=83;FAO=35;FDP=82;FR=.;FRO=47;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=0.0618625;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.298;QD=6.38948;RBI=0.0637622;REFB=-0.0180804;REVB=-0.0154483;RO=47;SAF=21;SAR=14;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197806;STB=0.611587;TYPE=snp;VARB=0.0296651;OID=.;OPOS=19195130;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:82:47:47:35:35:14:21:19:28:14:21:19:28 chr16 19261332 . C G 209.1 PASS AO=50;DP=104;FAO=50;FDP=104;FR=.;FRO=54;FSAF=15;FSAR=35;FSRF=30;FSRR=24;FWDB=-0.00714797;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=241.656;QD=8.04237;RBI=0.0178341;REFB=-0.0171527;REVB=0.0163389;RO=54;SAF=15;SAR=35;SRF=30;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251564;STB=0.640186;TYPE=snp;VARB=0.0160724;OID=.;OPOS=19261332;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:54:54:50:50:35:15:30:24:35:15:30:24 chr16 19297219 . T G 123.49 PASS AO=30;DP=65;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=7;FSRR=28;FWDB=0.00655301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.8577;QD=7.5992;RBI=0.0595517;REFB=-0.00807473;REVB=-0.0591901;RO=35;SAF=13;SAR=17;SRF=7;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.238076;STB=0.632353;TYPE=snp;VARB=0.0056015;OID=.;OPOS=19297219;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:35:35:30:30:17:13:7:28:17:13:7:28 chr16 19310092 . T C 194.36 PASS AO=50;DP=110;FAO=50;FDP=111;FR=.;FRO=61;FSAF=17;FSAR=33;FSRF=33;FSRR=28;FWDB=-0.0213423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.198;QD=7.00397;RBI=0.0216184;REFB=-0.0191435;REVB=-0.00344427;RO=59;SAF=17;SAR=33;SRF=32;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202502;STB=0.614021;TYPE=snp;VARB=0.0187774;OID=.;OPOS=19310092;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:111:59:61:50:50:33:17:32:27:33:17:33:28 chr16 19509938 . G GCA 992.01 PASS AO=180;DP=299;FAO=183;FDP=291;FR=.;FRO=108;FSAF=162;FSAR=21;FSRF=8;FSRR=100;FWDB=0.0513385;FXX=0.0234891;HRUN=1;LEN=2;MLLD=214.488;QD=13.6358;RBI=0.0514672;REFB=-0.0612542;REVB=0.00363791;RO=110;SAF=162;SAR=18;SRF=8;SRR=102;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.669389;STB=0.845892;TYPE=ins;VARB=0.0109861;OID=.;OPOS=19509939;OREF=-;OALT=CA;OMAPALT=GCA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:180:299:183:291:108:162:21:8:100:99:110:162:18:8:102 chr16 19514483 . C T 1420.92 PASS AO=145;DP=145;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0522804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9022;QD=38.1456;RBI=0.0524121;REFB=0;REVB=-0.00371387;RO=0;SAF=41;SAR=104;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00149388;OID=.;OPOS=19514483;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:145:149:0:0:145:149:104:41:0:0:104:45:0:0 chr16 19547747 . C G 332.71 PASS AO=35;DP=37;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177254;FXX=0.0540395;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.9624;QD=38.0244;RBI=0.0364769;REFB=0;REVB=0.0318806;RO=0;SAF=14;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.27896e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00102697;OID=.;OPOS=19547747;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:37:35:0:0:35:35:21:14:0:0:21:14:0:0 chr16 19711717 . C T 143.54 PASS AO=31;DP=61;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=0.0144863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.186;QD=9.41248;RBI=0.0226094;REFB=-0.0114746;REVB=0.017359;RO=30;SAF=11;SAR=20;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219066;STB=0.622238;TYPE=snp;VARB=0.0142396;OID=.;OPOS=19711717;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:30:30:31:31:20:11:18:12:20:11:18:12 chr16 19800213 . T C 271.49 PASS AO=56;DP=114;FAO=61;FDP=119;FR=.;FRO=58;FSAF=19;FSAR=42;FSRF=31;FSRR=27;FWDB=-0.00482817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.003;QD=9.12558;RBI=0.021819;REFB=-0.0187437;REVB=0.0212781;RO=58;SAF=18;SAR=38;SRF=31;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205524;STB=0.615616;TYPE=snp;VARB=0.014365;OID=.;OPOS=19800213;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:119:58:58:56:61:38:18:31:27:42:19:31:27 chr16 19868687 . G C 1702.95 PASS AO=197;DP=223;FAO=200;FDP=214;FR=.;FRO=14;FSAF=62;FSAR=138;FSRF=13;FSRR=1;FWDB=0.0250132;FXX=0.0446409;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.184;QD=31.8309;RBI=0.0252414;REFB=-0.0311519;REVB=0.00338587;RO=15;SAF=61;SAR=136;SRF=13;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0844566;STB=0.545651;TYPE=snp;VARB=0.00223745;OID=.;OPOS=19868687;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:223:214:15:14:197:200:136:61:13:2:138:62:13:1 chr16 19883364 . G A 104.86 PASS AO=25;DP=53;FAO=25;FDP=54;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.00452524;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.079;QD=7.76728;RBI=0.0498794;REFB=-0.0125251;REVB=0.0496737;RO=27;SAF=7;SAR=18;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205488;STB=0.601921;TYPE=snp;VARB=0.0235079;OID=.;OPOS=19883364;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:54:27:29:25:25:18:7:13:14:18:7:13:16 chr16 20043330 . T C 366.91 PASS AO=82;DP=159;FAO=82;FDP=159;FR=.;FRO=77;FSAF=30;FSAR=52;FSRF=36;FSRR=41;FWDB=-0.0198273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.118;QD=9.23032;RBI=0.0295806;REFB=-0.0480552;REVB=0.0219519;RO=76;SAF=30;SAR=52;SRF=36;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0987248;STB=0.551578;TYPE=snp;VARB=0.0256728;OID=.;OPOS=20043330;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:159:76:77:82:82:52:30:36:40:52:30:36:41 chr16 20359633 . C T 318.46 PASS AO=63;DP=115;FAO=65;FDP=116;FR=.;FRO=51;FSAF=31;FSAR=34;FSRF=32;FSRR=19;FWDB=0.0501965;FXX=0.00854628;HRUN=4;LEN=1;MLLD=50.601;QD=10.9814;RBI=0.0596894;REFB=0.0194149;REVB=0.0322976;RO=52;SAF=31;SAR=32;SRF=33;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117576;STB=0.565898;TYPE=snp;VARB=-0.0144714;OID=.;OPOS=20359633;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:116:52:51:63:65:32:31:33:19:34:31:32:19 chr16 20359831 . C T 243.48 PASS AO=48;DP=86;FAO=49;FDP=86;FR=.;FRO=37;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=12;FSRR=25;FWDB=-0.00448637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.4413;QD=11.3247;RBI=0.0914413;REFB=-0.020869;REVB=0.0913312;RO=38;SAF=20;SAR=28;SRF=12;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0849643;STB=0.537833;TYPE=snp;VARB=0.0176489;OID=.;OPOS=20359831;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:38:37:48:49:28:20:12:26:29:20:12:25 chr16 20376755 . T C 671.82 PASS AO=172;DP=369;FAO=172;FDP=368;FR=.;FRO=196;FSAF=82;FSAR=90;FSRF=87;FSRR=109;FWDB=0.00719718;FXX=0.00270995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.892;QD=7.30242;RBI=0.0351527;REFB=0.00157285;REVB=0.034408;RO=192;SAF=82;SAR=90;SRF=86;SRR=106;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0277274;STB=0.51757;TYPE=snp;VARB=-0.000684517;OID=.;OPOS=20376755;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:369:368:192:196:172:172:90:82:86:106:90:82:87:109 chr16 20410488 . G A 317.96 PASS AO=82;DP=176;FAO=81;FDP=175;FR=.;FRO=94;FSAF=53;FSAR=28;FSRF=37;FSRR=57;FWDB=0.0673925;FXX=0.0056815;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9431;QD=7.26766;RBI=0.0756841;REFB=-0.00598504;REVB=0.0344432;RO=94;SAF=54;SAR=28;SRF=36;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.26752;STB=0.641246;TYPE=snp;VARB=0.00850343;OID=.;OPOS=20410488;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:175:94:94:82:81:28:54:36:58:28:53:37:57 chr16 20410547 . C T 192.29 PASS AO=58;DP=152;FAO=59;FDP=150;FR=.;FRO=91;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=30;FSRR=61;FWDB=0.0831765;FXX=0.0196066;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.2181;QD=5.12762;RBI=0.0880768;REFB=-0.0180852;REVB=-0.0289687;RO=90;SAF=30;SAR=28;SRF=30;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197602;STB=0.617602;TYPE=snp;VARB=0.0203351;OID=.;OPOS=20410547;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:150:90:91:58:59:28:30:30:60:28:31:30:61 chr16 20439199 . G A 376.71 PASS AO=80;DP=148;FAO=80;FDP=148;FR=.;FRO=68;FSAF=43;FSAR=37;FSRF=36;FSRR=32;FWDB=-0.0176371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.746;QD=10.1815;RBI=0.017915;REFB=0.000406235;REVB=0.00314334;RO=68;SAF=43;SAR=37;SRF=36;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00682626;STB=0.503734;TYPE=snp;VARB=-0.000352073;OID=.;OPOS=20439199;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:68:68:80:80:37:43:36:32:37:43:36:32 chr16 20441020 . G A 55.33 PASS AO=28;DP=102;FAO=27;FDP=101;FR=.;FRO=74;FSAF=3;FSAR=24;FSRF=36;FSRR=38;FWDB=-0.0438392;FXX=0.00980296;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.4508;QD=2.19146;RBI=0.0558667;REFB=-0.0170086;REVB=0.0346296;RO=74;SAF=4;SAR=24;SRF=36;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.483387;STB=0.833939;TYPE=snp;VARB=0.0470278;OID=.;OPOS=20441020;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:102:101:74:74:28:27:24:4:36:38:24:3:36:38 chr16 20476852 . T C 142.71 PASS AO=45;DP=122;FAO=46;FDP=123;FR=.;FRO=77;FSAF=38;FSAR=8;FSRF=50;FSRR=27;FWDB=-0.00867985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.601;QD=4.64089;RBI=0.0429377;REFB=-0.00542869;REVB=-0.0420512;RO=72;SAF=38;SAR=7;SRF=48;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.279686;STB=0.653808;TYPE=snp;VARB=0.00704209;OID=.;OPOS=20476852;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:123:72:77:45:46:7:38:48:24:8:38:50:27 chr16 20488696 . A G 132.04 PASS AO=25;DP=43;FAO=25;FDP=43;FR=.;FRO=18;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=3;FWDB=-0.0057815;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.472;QD=12.2826;RBI=0.030184;REFB=0.00045209;REVB=-0.0296252;RO=18;SAF=17;SAR=8;SRF=15;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141399;STB=0.57782;TYPE=snp;VARB=-0.000563228;OID=.;OPOS=20488696;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:43:43:18:18:25:25:8:17:15:3:8:17:15:3 chr16 20494408 . C T 654.14 PASS AO=161;DP=346;FAO=167;FDP=355;FR=.;FRO=188;FSAF=90;FSAR=77;FSRF=100;FSRR=88;FWDB=0.00988428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.6734;QD=7.37059;RBI=0.0101421;REFB=-0.0096175;REVB=0.00227235;RO=185;SAF=90;SAR=71;SRF=100;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0181127;STB=0.503731;TYPE=snp;VARB=0.0119702;OID=.;OPOS=20494408;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:346:355:185:188:161:167:71:90:100:85:77:90:100:88 chr16 20552075 . G T 495.51 PASS AO=127;DP=273;FAO=127;FDP=273;FR=.;FRO=146;FSAF=65;FSAR=62;FSRF=88;FSRR=58;FWDB=0.00300533;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.651;QD=7.26018;RBI=0.0317848;REFB=0.00217739;REVB=0.0316424;RO=146;SAF=65;SAR=62;SRF=88;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0884319;STB=0.54876;TYPE=snp;VARB=-0.00208649;OID=.;OPOS=20552075;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:273:273:146:146:127:127:62:65:88:58:62:65:88:58 chr16 20570661 . T C 170.86 PASS AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0276446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.632;QD=37.9686;RBI=0.0326515;REFB=0;REVB=0.0173751;RO=0;SAF=3;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.32e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.39008e-05;OID=.;OPOS=20570661;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:18:0:0:18:18:15:3:0:0:15:3:0:0 chr16 20576048 . C A 768.98 PASS AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00475301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.833;QD=37.9741;RBI=0.00476699;REFB=0;REVB=-0.00036483;RO=0;SAF=35;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.46682e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.17058e-05;OID=.;OPOS=20576048;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:81:81:0:0:81:81:46:35:0:0:46:35:0:0 chr16 20635418 . C T 327.14 PASS AO=75;DP=149;FAO=75;FDP=149;FR=.;FRO=74;FSAF=43;FSAR=32;FSRF=33;FSRR=41;FWDB=0.0172845;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0415;QD=8.78223;RBI=0.0542236;REFB=-0.0369923;REVB=0.051395;RO=74;SAF=43;SAR=32;SRF=33;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115218;STB=0.563437;TYPE=snp;VARB=0.0315118;OID=.;OPOS=20635418;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:74:74:75:75:32:43:33:41:32:43:33:41 chr16 20636814 . G A 57.54 PASS AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=-0.0134521;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.398;QD=7.93641;RBI=0.0260426;REFB=-0.0146917;REVB=0.0222993;RO=16;SAF=6;SAR=7;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.27196;STB=0.656028;TYPE=snp;VARB=0.0206953;OID=.;OPOS=20636814;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:29:29:16:16:13:13:7:6:12:4:7:6:12:4 chr16 20638576 . A T 1805.44 PASS AO=182;DP=184;FAO=191;FDP=191;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=123;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0824822;FXX=0.0103622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.655;QD=37.8103;RBI=0.09384;REFB=-0.00808066;REVB=0.0447509;RO=1;SAF=62;SAR=120;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00395132;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000296657;OID=.;OPOS=20638576;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:184:191:1:0:182:191:120:62:0:1:123:68:0:0 chr16 20648702 . G A 293.89 PASS AO=68;DP=137;FAO=68;FDP=137;FR=.;FRO=69;FSAF=31;FSAR=37;FSRF=32;FSRR=37;FWDB=-0.00590639;FXX=0.00724585;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.075;QD=8.5808;RBI=0.0101707;REFB=-0.0108913;REVB=-0.00827993;RO=66;SAF=31;SAR=37;SRF=29;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0148843;STB=0.503999;TYPE=snp;VARB=0.00923264;OID=.;OPOS=20648702;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:66:69:68:68:37:31:29:37:37:31:32:37 chr16 20673158 . AC A 88.97 PASS AO=34;DP=118;FAO=61;FDP=107;FR=.;FRO=46;FSAF=32;FSAR=29;FSRF=17;FSRR=29;FWDB=-0.0581948;FXX=0.0613981;HRUN=6;LEN=1;MLLD=7.46197;QD=3.32585;RBI=0.21487;REFB=-0.117419;REVB=0.206839;RO=43;SAF=23;SAR=11;SRF=14;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0.894737;SSSB=0.343699;STB=0.56635;TYPE=del;VARB=0.159869;OID=.;OPOS=20673159;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:34:103:61:107:46:32:29:17:29:44:43:23:11:14:29 chr16 20748331 . C A 402.4 PASS AO=97;DP=201;FAO=97;FDP=200;FR=.;FRO=103;FSAF=11;FSAR=86;FSRF=26;FSRR=77;FWDB=0.00191917;FXX=0.00497488;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.9817;QD=8.04803;RBI=0.0310599;REFB=-0.0240389;REVB=0.0310006;RO=102;SAF=11;SAR=86;SRF=26;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251878;STB=0.639564;TYPE=snp;VARB=0.0267073;OID=.;OPOS=20748331;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:200:102:103:97:97:86:11:26:76:86:11:26:77 chr16 20753123 . T C 571.35 PASS AO=60;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00919639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.881;QD=36.8611;RBI=0.0259269;REFB=0;REVB=0.0242411;RO=1;SAF=24;SAR=36;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192565;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0035077;OID=.;OPOS=20753123;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:61:62:1:0:60:62:36:24:1:0:37:25:0:0 chr16 20809283 . C A 390.32 PASS AO=99;DP=213;FAO=99;FDP=212;FR=.;FRO=113;FSAF=46;FSAR=53;FSRF=49;FSRR=64;FWDB=0.00774408;FXX=0.0139528;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.0196;QD=7.36449;RBI=0.00800779;REFB=-0.0106758;REVB=-0.00203812;RO=112;SAF=46;SAR=53;SRF=49;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0262689;STB=0.516652;TYPE=snp;VARB=0.0114418;OID=.;OPOS=20809283;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:213:212:112:113:99:99:53:46:49:63:53:46:49:64 chr16 20810067 . T C 453.27 PASS AO=108;DP=220;FAO=108;FDP=220;FR=.;FRO=112;FSAF=56;FSAR=52;FSRF=64;FSRR=48;FWDB=0.0206279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.352;QD=8.24127;RBI=0.0269304;REFB=-0.0354726;REVB=0.017313;RO=111;SAF=56;SAR=52;SRF=64;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0537331;STB=0.527022;TYPE=snp;VARB=0.0290118;OID=.;OPOS=20810067;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:220:220:111:112:108:108:52:56:64:47:52:56:64:48 chr16 20810266 . T C 353.21 PASS AO=73;DP=132;FAO=73;FDP=131;FR=.;FRO=58;FSAF=33;FSAR=40;FSRF=32;FSRR=26;FWDB=-0.0152715;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.0061;QD=10.7851;RBI=0.0206535;REFB=-0.03086;REVB=0.013905;RO=57;SAF=33;SAR=40;SRF=32;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0878028;STB=0.544149;TYPE=snp;VARB=0.0361756;OID=.;OPOS=20810266;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:131:57:58:73:73:40:33:32:25:40:33:32:26 chr16 20811681 . C T 639.88 PASS AO=49;DP=68;FAO=67;FDP=67;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=54;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105738;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.126;QD=38.2018;RBI=0.225504;REFB=0;REVB=0.225256;RO=0;SAF=44;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000582249;OID=.;OPOS=20811681;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:64:67:0:0:49:67:5:44:0:0:13:54:0:0 chr16 20855309 . A G 2256.22 PASS AO=187;DP=237;FAO=234;FDP=234;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=99;FSAR=135;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0245954;FXX=0.00847422;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.6741;QD=38.5678;RBI=0.0794803;REFB=0;REVB=0.075579;RO=0;SAF=94;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.83816e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000250445;OID=.;OPOS=20855309;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:231:234:0:0:187:234:93:94:0:0:135:99:0:0 chr16 20873767 . T G 375.7 PASS AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0238237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.814;QD=38.5338;RBI=0.0512047;REFB=0;REVB=0.045325;RO=0;SAF=14;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000474232;OID=.;OPOS=20873767;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:39:39:0:0:39:39:25:14:0:0:25:14:0:0 chr16 21051209 . G C 199.4 PASS AO=56;DP=134;FAO=56;FDP=133;FR=.;FRO=77;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=43;FSRR=34;FWDB=-0.00259741;FXX=0.00746213;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.312;QD=5.99704;RBI=0.0354411;REFB=-0.0186189;REVB=-0.0353458;RO=77;SAF=22;SAR=34;SRF=43;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171552;STB=0.596296;TYPE=snp;VARB=0.0247913;OID=.;OPOS=21051209;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:133:77:77:56:56:34:22:43:34:34:22:43:34 chr16 21073933 . G A 635.8 PASS AO=116;DP=187;FAO=117;FDP=189;FR=.;FRO=72;FSAF=62;FSAR=55;FSRF=37;FSRR=35;FWDB=0.00492039;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.836;QD=13.4561;RBI=0.00873307;REFB=-0.0254309;REVB=0.00721501;RO=71;SAF=62;SAR=54;SRF=37;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00942566;STB=0.506121;TYPE=snp;VARB=0.0209498;OID=.;OPOS=21073933;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:189:71:72:116:117:54:62:37:34:55:62:37:35 chr16 21078693 . T G 260.73 PASS AO=56;DP=113;FAO=59;FDP=116;FR=.;FRO=57;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=38;FSRR=19;FWDB=-0.0117527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.811;QD=8.99066;RBI=0.0211342;REFB=-0.0282805;REVB=-0.0175649;RO=57;SAF=26;SAR=30;SRF=38;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183302;STB=0.585807;TYPE=snp;VARB=0.0316669;OID=.;OPOS=21078693;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:116:57:57:56:59:30:26:38:19:30:29:38:19 chr16 21190853 . A C 970.8 PASS AO=109;DP=115;FAO=110;FDP=114;FR=.;FRO=4;FSAF=62;FSAR=48;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0191489;FXX=0.0086949;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.291;QD=34.0632;RBI=0.0191574;REFB=0.00922322;REVB=0.000568353;RO=5;SAF=62;SAR=47;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00264468;STB=0.506657;TYPE=snp;VARB=-0.000167396;OID=.;OPOS=21190853;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:115:114:5:4:109:110:47:62:3:2:48:62:3:1 chr16 21215672 . A G 373.29 PASS AO=88;DP=178;FAO=88;FDP=178;FR=.;FRO=90;FSAF=33;FSAR=55;FSRF=50;FSRR=40;FWDB=-0.00425651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.802;QD=8.38847;RBI=0.015115;REFB=-0.00140667;REVB=-0.0145033;RO=88;SAF=33;SAR=55;SRF=48;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157874;STB=0.592836;TYPE=snp;VARB=0.00151635;OID=.;OPOS=21215672;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:178:88:90:88:88:55:33:48:40:55:33:50:40 chr16 21217061 . G A 431.8 PASS AO=93;DP=174;FAO=93;FDP=173;FR=.;FRO=80;FSAF=42;FSAR=51;FSRF=23;FSRR=57;FWDB=-0.0107422;FXX=0.0057468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.3781;QD=9.9839;RBI=0.0143461;REFB=-0.017219;REVB=0.00950866;RO=79;SAF=42;SAR=51;SRF=23;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138585;STB=0.577745;TYPE=snp;VARB=0.0130584;OID=.;OPOS=21217061;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:173:79:80:93:93:51:42:23:56:51:42:23:57 chr16 21222672 . C A 334.11 PASS AO=86;DP=188;FAO=86;FDP=188;FR=.;FRO=102;FSAF=39;FSAR=47;FSRF=60;FSRR=42;FWDB=0.00743202;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.639;QD=7.10861;RBI=0.0108337;REFB=-0.0014469;REVB=-0.00788258;RO=102;SAF=39;SAR=47;SRF=60;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131308;STB=0.572731;TYPE=snp;VARB=0.00157391;OID=.;OPOS=21222672;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:188:102:102:86:86:47:39:60:42:47:39:60:42 chr16 21222941 . C A 195.34 PASS AO=58;DP=150;FAO=59;FDP=149;FR=.;FRO=90;FSAF=23;FSAR=36;FSRF=30;FSRR=60;FWDB=0.0179219;FXX=0.00666622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.656;QD=5.24408;RBI=0.0213647;REFB=-0.0033234;REVB=0.01163;RO=92;SAF=22;SAR=36;SRF=31;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0495035;STB=0.536431;TYPE=snp;VARB=0.00515562;OID=.;OPOS=21222941;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:149:92:90:58:59:36:22:31:61:36:23:30:60 chr16 21272591 . G C 2469.85 PASS AO=260;DP=266;FAO=264;FDP=264;FR=.;FRO=0;FSAF=135;FSAR=129;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0138992;FXX=0.0185867;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.8672;QD=37.4219;RBI=0.0430499;REFB=-0.0182683;REVB=0.0407444;RO=2;SAF=135;SAR=125;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00756596;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000458432;OID=.;OPOS=21272591;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:266:264:2:0:260:264:125:135:0:2:129:135:0:0 chr16 21531494 . T C 87.12 PASS AO=12;DP=17;FAO=13;FDP=18;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0713637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.4;QD=19.361;RBI=0.071372;REFB=-0.059782;REVB=-0.00108312;RO=5;SAF=2;SAR=10;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185934;STB=0.561697;TYPE=snp;VARB=0.0173466;OID=.;OPOS=21531494;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:17:18:5:5:12:13:10:2:2:3:10:3:2:3 chr16 21654892 . C T 280.92 PASS AO=67;DP=153;FAO=74;FDP=160;FR=.;FRO=86;FSAF=29;FSAR=45;FSRF=28;FSRR=58;FWDB=0.0155601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.858;QD=7.02292;RBI=0.0254202;REFB=-0.0273134;REVB=0.0201015;RO=85;SAF=28;SAR=39;SRF=28;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0930148;STB=0.537994;TYPE=snp;VARB=0.0282257;OID=.;OPOS=21654892;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:160:85:86:67:74:39:28:28:57:45:29:28:58 chr16 21730449 . C T 1788.46 PASS AO=185;DP=186;FAO=187;FDP=187;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0459903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.303;QD=38.2557;RBI=0.0494442;REFB=0;REVB=0.0181555;RO=0;SAF=97;SAR=88;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.31473e-05;OID=.;OPOS=21730449;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:186:187:0:0:185:187:88:97:0:0:89:98:0:0 chr16 21847732 . C CG 41.6 PASS AO=3;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=22.2877;QD=27.7363;RBI=0.388222;REFB=0;REVB=0.388222;RO=3;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.0922505;OID=.;OPOS=21847733;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:3:6:6:6:0:0:6:0:0:4:3:0:3:0:3 chr16 21983421 . AG A,AA 265.65 PASS AO=15,12;DP=38;FAO=20,13;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=10,1;FSAR=10,12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0767498,0.0498725;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=19.4564,16.2607;QD=32.2003;RBI=0.256195,0.199403;REFB=0,0;REVB=0.244428,0.193065;RO=4;SAF=9,1;SAR=6,11;SRF=0;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0.285418,0;SSSB=0.225948,0.139102;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0868317,0.00299391;OID=.,.;OPOS=21983422,21983422;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:15,12:32:20,13:33:0:10,1:10,12:0:0:31:4:9,1:6,11:0:4 chr16 22161136 . T C 523.51 PASS AO=55;DP=58;FAO=60;FDP=63;FR=.;FRO=3;FSAF=17;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0236664;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.9881;QD=33.2386;RBI=0.024151;REFB=0.0787381;REVB=-0.00481354;RO=3;SAF=12;SAR=43;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0317619;STB=0.516848;TYPE=snp;VARB=-0.00304771;OID=.;OPOS=22161136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:58:63:3:3:55:60:43:12:0:3:43:17:0:3 chr16 22237118 . A G 212.87 PASS AO=47;DP=134;FAO=57;FDP=132;FR=.,HEALED;FRO=75;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=34;FSRR=41;FWDB=0.00169182;FXX=0.0149243;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9366;QD=6.45054;RBI=0.0447014;REFB=-0.00394367;REVB=0.0446694;RO=41;SAF=29;SAR=18;SRF=32;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152836;STB=0.561382;TYPE=snp;VARB=0.00628101;OID=.;OPOS=22237118;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:132:41:75:47:57:18:29:32:9:25:32:34:41 chr16 22237273 . C G 291.85 PASS AO=62;DP=115;FAO=62;FDP=115;FR=.;FRO=53;FSAF=31;FSAR=31;FSRF=17;FSRR=36;FWDB=0.00561792;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=253.834;QD=10.1513;RBI=0.0112623;REFB=0.00305018;REVB=0.00976104;RO=53;SAF=31;SAR=31;SRF=17;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150915;STB=0.582583;TYPE=snp;VARB=-0.00232897;OID=.;OPOS=22237273;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:53:53:62:62:31:31:17:36:31:31:17:36 chr16 22262514 . C A 132.27 PASS AO=34;DP=77;FAO=34;FDP=77;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=32;FSRR=11;FWDB=0.0600664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.795;QD=6.87137;RBI=0.0625213;REFB=-0.0120569;REVB=-0.0173476;RO=43;SAF=13;SAR=21;SRF=32;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.347544;STB=0.694236;TYPE=snp;VARB=0.018635;OID=.;OPOS=22262514;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:43:43:34:34:21:13:32:11:21:13:32:11 chr16 22269867 . A G 1010.49 PASS AO=107;DP=108;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00831609;FXX=0.0092584;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.875;QD=37.7753;RBI=0.0386888;REFB=-0.0440142;REVB=-0.0377844;RO=1;SAF=50;SAR=57;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00939812;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000515469;OID=.;OPOS=22269867;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:108:107:1:0:107:107:57:50:1:0:57:50:0:0 chr16 22357850 . C CAG 2032.26 PASS AO=212;DP=236;FAO=213;FDP=213;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=150;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00417656;FXX=0.0897398;HRUN=0;LEN=2;MLLD=228.179;QD=38.1646;RBI=0.00633293;REFB=0;REVB=0.0047605;RO=18;SAF=63;SAR=149;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00345504;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=4.4763e-06;OID=.;OPOS=22357851;OREF=-;OALT=AG;OMAPALT=CAG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:212:236:213:213:0:63:150:0:0:95:18:63:149:5:13 chr16 22826339 . A G 72.59 PASS AO=26;DP=79;FAO=26;FDP=79;FR=.;FRO=53;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=31;FSRR=22;FWDB=-0.0125105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.189;QD=3.67566;RBI=0.0152961;REFB=-0.0323788;REVB=-0.00880101;RO=53;SAF=14;SAR=12;SRF=31;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0539455;STB=0.531472;TYPE=snp;VARB=0.0473378;OID=.;OPOS=22826339;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:79:79:53:53:26:26:12:14:31:22:12:14:31:22 chr16 23072833 . C T 170.71 PASS AO=59;DP=163;FAO=59;FDP=164;FR=.;FRO=105;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=53;FSRR=52;FWDB=-0.0176241;FXX=0.00606024;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.566;QD=4.16357;RBI=0.0178322;REFB=-0.00312956;REVB=0.00271615;RO=100;SAF=27;SAR=32;SRF=49;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0359612;STB=0.53023;TYPE=snp;VARB=0.00453886;OID=.;OPOS=23072833;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:164:100:105:59:59:32:27:49:51:32:27:53:52 chr16 23073531 . C G 243.38 PASS AO=63;DP=139;FAO=63;FDP=140;FR=.;FRO=77;FSAF=37;FSAR=26;FSRF=44;FSRR=33;FWDB=0.0215092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.0099;QD=6.95357;RBI=0.0291627;REFB=-0.00368674;REVB=0.0196932;RO=76;SAF=37;SAR=26;SRF=43;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0216956;STB=0.508974;TYPE=snp;VARB=0.00823424;OID=.;OPOS=23073531;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:140:76:77:63:63:26:37:43:33:26:37:44:33 chr16 23073703 . A T 122.45 PASS AO=7;DP=23;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0268402;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=26.2236;QD=23.3246;RBI=0.0289245;REFB=0.0394059;REVB=0.0107811;RO=1;SAF=1;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0674964;STB=0.5135;TYPE=snp;VARB=-0.000151707;OID=.;OPOS=23073703;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:15:21:1:1:7:20:6:1:0:1:18:2:0:1 chr16 23080634 . C A 188.37 PASS AO=41;DP=81;FAO=41;FDP=80;FR=.;FRO=39;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=25;FWDB=0.00962058;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.808;QD=9.4184;RBI=0.0143093;REFB=-0.0189986;REVB=-0.0105925;RO=37;SAF=23;SAR=18;SRF=12;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200897;STB=0.597536;TYPE=snp;VARB=0.0161688;OID=.;OPOS=23080634;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:80:37:39:41:41:18:23:12:25:18:23:14:25 chr16 23098422 . A G 414.87 PASS AO=110;DP=247;FAO=110;FDP=246;FR=.;FRO=136;FSAF=37;FSAR=73;FSRF=76;FSRR=60;FWDB=0.0130434;FXX=0.0159994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.2331;QD=6.74587;RBI=0.0157835;REFB=-0.0204783;REVB=-0.00888753;RO=135;SAF=37;SAR=73;SRF=75;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223697;STB=0.626324;TYPE=snp;VARB=0.024676;OID=.;OPOS=23098422;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:247:246:135:136:110:110:73:37:75:60:73:37:76:60 chr16 23200761 . T C 96.58 PASS AO=31;DP=86;FAO=31;FDP=85;FR=.;FRO=54;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=34;FWDB=-0.0309372;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.86;QD=4.54495;RBI=0.0334382;REFB=-0.0122074;REVB=-0.0126887;RO=53;SAF=11;SAR=20;SRF=20;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0267339;STB=0.510701;TYPE=snp;VARB=0.0185708;OID=.;OPOS=23200761;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:86:85:53:54:31:31:20:11:20:33:20:11:20:34 chr16 23200848 . T C 148.39 PASS AO=52;DP=142;FAO=51;FDP=143;FR=.;FRO=92;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=34;FSRR=58;FWDB=-0.00795438;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.7365;QD=4.15069;RBI=0.0225621;REFB=-0.00038481;REVB=-0.0211134;RO=87;SAF=22;SAR=30;SRF=31;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0764583;STB=0.528291;TYPE=snp;VARB=0.000388947;OID=.;OPOS=23200848;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:143:87:92:52:51:30:22:31:56:30:21:34:58 chr16 23360199 . T C 316.55 PASS AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0900733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=309.508;QD=37.2412;RBI=0.0906851;REFB=0;REVB=-0.0105162;RO=0;SAF=8;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00011504;OID=.;OPOS=23360199;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:34:0:0:34:34:26:8:0:0:26:8:0:0 chr16 23379279 . C T 146.29 PASS AO=44;DP=116;FAO=45;FDP=116;FR=.;FRO=71;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=44;FSRR=27;FWDB=0.000211801;FXX=0.00854628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.7994;QD=5.04464;RBI=0.0107045;REFB=-0.0184125;REVB=-0.0107024;RO=68;SAF=25;SAR=19;SRF=43;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0709154;STB=0.5401;TYPE=snp;VARB=0.0303929;OID=.;OPOS=23379279;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:68:71:44:45:19:25:43:25:20:25:44:27 chr16 23382734 . AG A 332.51 PASS AO=46;DP=58;FAO=54;FDP=56;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.213256;FXX=0.0175408;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.6227;QD=23.7506;RBI=0.287863;REFB=-0.0140259;REVB=0.193357;RO=6;SAF=18;SAR=28;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0.478659;SSSB=0.0907233;STB=0.51428;TYPE=del;VARB=0.00288808;OID=.;OPOS=23382735;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:46:57:54:56:2:20:34:0:2:20:6:18:28:0:6 chr16 23489711 . C G 689.96 PASS AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.03816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.396;QD=37.806;RBI=0.0407282;REFB=0;REVB=-0.0142337;RO=0;SAF=41;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.35085e-05;OID=.;OPOS=23489711;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:73:73:0:0:73:73:32:41:0:0:32:41:0:0 chr16 23490353 . T G 339.21 PASS AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.31;QD=37.69;RBI=0.0319579;REFB=0;REVB=-0.0287469;RO=0;SAF=22;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.61402e-05;OID=.;OPOS=23490353;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:36:36:0:0:36:36:14:22:0:0:14:22:0:0 chr16 23536531 . C T 399.22 PASS AO=105;DP=231;FAO=105;FDP=232;FR=.;FRO=127;FSAF=60;FSAR=45;FSRF=65;FSRR=62;FWDB=0.0131542;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.734;QD=6.88317;RBI=0.0208183;REFB=-0.00597233;REVB=0.0161359;RO=126;SAF=59;SAR=46;SRF=65;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0457297;STB=0.532995;TYPE=snp;VARB=0.00733461;OID=.;OPOS=23536531;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:231:232:126:127:105:105:46:59:65:61:45:60:65:62 chr16 23536684 . T C 968.58 PASS AO=101;DP=101;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0179735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.587;QD=37.9837;RBI=0.0360761;REFB=0;REVB=0.03128;RO=0;SAF=35;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.53132e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.76643e-05;OID=.;OPOS=23536684;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:101:102:0:0:101:102:66:35:0:0:67:35:0:0 chr16 23546561 . G C 481.15 PASS AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0333928;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9683;QD=37.7374;RBI=0.0596394;REFB=0;REVB=0.0494143;RO=0;SAF=29;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00107075;OID=.;OPOS=23546561;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:51:51:0:0:51:51:22:29:0:0:22:29:0:0 chr16 23563501 . C T 3761.51 PASS AO=519;DP=527;FAO=396;FDP=396;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=352;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0400729;FXX=0.00999975;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.127;QD=37.9951;RBI=0.0461416;REFB=0.0374406;REVB=0.0228737;RO=5;SAF=55;SAR=464;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0232735;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.7621e-05;OID=.;OPOS=23563501;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:527:396:5:0:519:396:464:55:3:2:352:44:0:0 chr16 23585061 . T C 985.04 PASS AO=102;DP=104;FAO=106;FDP=108;FR=.;FRO=2;FSAF=11;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0041635;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.5511;QD=36.483;RBI=0.00584623;REFB=-0.0261381;REVB=0.00410411;RO=1;SAF=11;SAR=91;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00518633;STB=0.505207;TYPE=snp;VARB=-4.95246e-06;OID=.;OPOS=23585061;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:104:108:1:2:102:106:91:11:0:1:95:11:0:2 chr16 23598595 . G A 506.74 PASS AO=122;DP=253;FAO=123;FDP=253;FR=.;FRO=130;FSAF=65;FSAR=58;FSRF=45;FSRR=85;FWDB=-0.0294284;FXX=0.00393685;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.3324;QD=8.0117;RBI=0.0315052;REFB=-0.0270266;REVB=0.0112492;RO=129;SAF=64;SAR=58;SRF=44;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170676;STB=0.592968;TYPE=snp;VARB=0.031146;OID=.;OPOS=23598595;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:253:253:129:130:122:123:58:64:44:85:58:65:45:85 chr16 23677006 . A G 485.41 PASS AO=116;DP=241;FAO=118;FDP=243;FR=.;FRO=125;FSAF=47;FSAR=71;FSRF=63;FSRR=62;FWDB=0.00971426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.798;QD=7.99022;RBI=0.0224927;REFB=-0.0159282;REVB=-0.0202868;RO=124;SAF=46;SAR=70;SRF=63;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106566;STB=0.555428;TYPE=snp;VARB=0.0151689;OID=.;OPOS=23677006;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:241:243:124:125:116:118:70:46:63:61:71:47:63:62 chr16 23701538 . A G 129.06 PASS AO=25;DP=43;FAO=25;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.0281967;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.101;QD=11.7325;RBI=0.029076;REFB=0.00385501;REVB=-0.00709641;RO=18;SAF=11;SAR=14;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0873892;STB=0.559952;TYPE=snp;VARB=-0.0017099;OID=.;OPOS=23701538;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:43:44:18:19:25:25:14:11:10:8:14:11:11:8 chr16 23711925 . C G 255.16 PASS AO=53;DP=96;FAO=53;FDP=97;FR=.;FRO=44;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=-0.0025003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.833;QD=10.5221;RBI=0.0721611;REFB=-0.0282418;REVB=-0.0721177;RO=42;SAF=32;SAR=21;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0467717;STB=0.527321;TYPE=snp;VARB=0.0107818;OID=.;OPOS=23711925;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:97:42:44:53:53:21:32:23:19:21:32:24:20 chr16 24104188 . C T 156.34 PASS AO=49;DP=125;FAO=49;FDP=128;FR=.;FRO=79;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=37;FSRR=42;FWDB=-0.0111167;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=219.188;QD=4.88549;RBI=0.0181904;REFB=-0.0153637;REVB=-0.0143983;RO=73;SAF=25;SAR=24;SRF=35;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0325651;STB=0.525802;TYPE=snp;VARB=0.0210884;OID=.;OPOS=24104188;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:128:73:79:49:49:24:25:35:38:24:25:37:42 chr16 24202458 . C T 406.09 PASS AO=98;DP=203;FAO=99;FDP=204;FR=.;FRO=105;FSAF=47;FSAR=52;FSRF=32;FSRR=73;FWDB=-0.0341214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.395;QD=7.96263;RBI=0.0403751;REFB=-0.0383608;REVB=0.0215843;RO=104;SAF=47;SAR=51;SRF=31;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171874;STB=0.588483;TYPE=snp;VARB=0.0381505;OID=.;OPOS=24202458;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:204:104:105:98:99:51:47:31:73:52:47:32:73 chr16 24788645 . T A 172.33 PASS AO=48;DP=125;FAO=51;FDP=128;FR=.;FRO=77;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=19;FSRR=58;FWDB=0.0428118;FXX=0.0153834;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.229;QD=5.38517;RBI=0.0433639;REFB=-0.00592891;REVB=0.00689777;RO=77;SAF=18;SAR=30;SRF=19;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15631;STB=0.595482;TYPE=snp;VARB=0.0103925;OID=.;OPOS=24788645;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:128:77:77:48:51:30:18:19:58:31:20:19:58 chr16 24801737 . G A 285.25 PASS AO=62;DP=118;FAO=62;FDP=118;FR=.;FRO=56;FSAF=33;FSAR=29;FSRF=24;FSRR=32;FWDB=0.0394973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.516;QD=9.66939;RBI=0.0457421;REFB=-0.0162414;REVB=-0.0230717;RO=55;SAF=33;SAR=29;SRF=24;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0819244;STB=0.549084;TYPE=snp;VARB=0.0123544;OID=.;OPOS=24801737;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:55:56:62:62:29:33:24:31:29:33:24:32 chr16 24802325 . C T 83.7 PASS AO=15;DP=25;FAO=15;FDP=25;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=-0.0108016;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.459;QD=13.3919;RBI=0.0154463;REFB=0.00696202;REVB=-0.0110414;RO=10;SAF=6;SAR=9;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.278432;STB=0.656049;TYPE=snp;VARB=-0.00228358;OID=.;OPOS=24802325;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:25:25:10:10:15:15:9:6:8:2:9:6:8:2 chr16 24836213 . C CA,A 47.81 PASS AO=13,16;DP=74;FAO=29,0;FDP=72;FR=.;FRO=43;FSAF=6,0;FSAR=23,0;FSRF=16;FSRR=27;FWDB=0.0215844,0.00925286;FXX=0.0136968;HRUN=7,1;LEN=1,1;MLLD=7.46398,169.453;QD=2.65621;RBI=0.028609,0.0115907;REFB=-0.093608,-0.00976357;REVB=0.0187774,-0.00698059;RO=44;SAF=2,5;SAR=11,11;SRF=15;SRR=29;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.307535,-0.0389015;STB=0.627695,0.5;TYPE=ins,snp;VARB=0.0897977,0;OID=.,.;OPOS=24836214,24836213;OREF=-,C;OALT=A,A;OMAPALT=CA,A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:74:72:44:43:13,16:29,0:11,11:2,5:15:29:23,0:6,0:16:27 chr16 24888646 . T C 331.61 PASS AO=64;DP=209;FAO=91;FDP=209;FR=.;FRO=118;FSAF=59;FSAR=32;FSRF=61;FSRR=57;FWDB=-0.00571679;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.453;QD=6.34667;RBI=0.0057372;REFB=-0.0205204;REVB=-0.000483482;RO=67;SAF=36;SAR=28;SRF=37;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00962886;STB=0.577587;TYPE=snp;VARB=0.0238553;OID=.;OPOS=24888646;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:209:67:118:64:91:28:36:37:30:32:59:61:57 chr16 24902194 . T C 2401.78 PASS AO=262;DP=269;FAO=262;FDP=269;FR=.;FRO=7;FSAF=113;FSAR=149;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=-0.0338489;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=118.086;QD=35.7143;RBI=0.0359749;REFB=-0.173193;REVB=0.0121841;RO=3;SAF=113;SAR=149;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00215561;STB=0.507666;TYPE=snp;VARB=0.000741599;OID=.;OPOS=24902194;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:269:269:3:7:262:262:149:113:1:2:149:113:1:6 chr16 24918048 . C T 336.32 PASS AO=81;DP=168;FAO=82;FDP=170;FR=.;FRO=88;FSAF=35;FSAR=47;FSRF=43;FSRR=45;FWDB=-0.0110235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.307;QD=7.91333;RBI=0.0178169;REFB=-0.00209367;REVB=-0.0139973;RO=87;SAF=34;SAR=47;SRF=43;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0707719;STB=0.532377;TYPE=snp;VARB=0.00220846;OID=.;OPOS=24918048;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:170:87:88:81:82:47:34:43:44:47:35:43:45 chr16 25043277 . G A 25.1 PASS AO=9;DP=33;FAO=9;FDP=33;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=-0.00934971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1473;QD=3.04266;RBI=0.0102564;REFB=-0.0103988;REVB=0.00421615;RO=24;SAF=4;SAR=5;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.303397;STB=0.685903;TYPE=snp;VARB=0.0362487;OID=.;OPOS=25043277;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:33:33:24:24:9:9:5:4:17:7:5:4:17:7 chr16 25137289 . G C 865.21 PASS AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.368;QD=38.0312;RBI=0.0147543;REFB=0;REVB=-0.00854271;RO=0;SAF=48;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.15033e-06;OID=.;OPOS=25137289;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:91:91:0:0:91:91:43:48:0:0:43:48:0:0 chr16 25137385 . G A 85.49 PASS AO=47;DP=180;FAO=47;FDP=179;FR=.;FRO=132;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=73;FSRR=59;FWDB=0.0226064;FXX=0.00555525;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.6526;QD=1.91028;RBI=0.033284;REFB=-0.00399279;REVB=-0.024429;RO=129;SAF=26;SAR=21;SRF=71;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00349878;STB=0.50012;TYPE=snp;VARB=0.0114495;OID=.;OPOS=25137385;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:180:179:129:132:47:47:21:26:71:58:21:26:73:59 chr16 25137449 . A T 110.17 PASS AO=47;DP=147;FAO=47;FDP=154;FR=.;FRO=107;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=51;FSRR=56;FWDB=-0.0141919;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=217.919;QD=2.86165;RBI=0.0302125;REFB=0.00692296;REVB=-0.0266718;RO=99;SAF=25;SAR=22;SRF=48;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0550937;STB=0.53836;TYPE=snp;VARB=-0.0122256;OID=.;OPOS=25137449;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:154:99:107:47:47:22:25:48:51:22:25:51:56 chr16 25239805 . G C 180.94 PASS AO=30;DP=64;FAO=36;FDP=63;FR=.,HEALED;FRO=27;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.13068;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.6016;QD=11.4881;RBI=0.234851;REFB=0.0145719;REVB=0.195134;RO=21;SAF=13;SAR=17;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.076945;STB=0.528286;TYPE=snp;VARB=-0.00982105;OID=.;OPOS=25239805;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:63:21:27:30:36:17:13:7:14:21:15:13:14 chr16 25255506 . C T 243.46 PASS AO=63;DP=155;FAO=72;FDP=165;FR=.;FRO=93;FSAF=34;FSAR=38;FSRF=63;FSRR=30;FWDB=-0.000785471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.174;QD=5.90196;RBI=0.00333762;REFB=-0.0187352;REVB=-0.00324387;RO=90;SAF=31;SAR=32;SRF=61;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194816;STB=0.614508;TYPE=snp;VARB=0.027687;OID=.;OPOS=25255506;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:165:90:93:63:72:32:31:61:29:38:34:63:30 chr16 25258035 . A G 165.6 PASS AO=31;DP=58;FAO=33;FDP=60;FR=.;FRO=27;FSAF=26;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=9;FWDB=0.00902005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.65;QD=11.0397;RBI=0.031982;REFB=-0.0163556;REVB=0.0306836;RO=27;SAF=25;SAR=6;SRF=18;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164914;STB=0.574537;TYPE=snp;VARB=0.00885709;OID=.;OPOS=25258035;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:60:27:27:31:33:6:25:18:9:7:26:18:9 chr16 25263278 . G A 310.03 PASS AO=80;DP=175;FAO=84;FDP=186;FR=.;FRO=102;FSAF=32;FSAR=52;FSRF=38;FSRR=64;FWDB=-0.0508834;FXX=0.0106377;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.6756;QD=6.66723;RBI=0.0782118;REFB=-0.0330529;REVB=-0.0593967;RO=90;SAF=31;SAR=49;SRF=38;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0346616;STB=0.504895;TYPE=snp;VARB=0.0343231;OID=.;OPOS=25263278;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:186:90:102:80:84:49:31:38:52:52:32:38:64 chr16 25268368 . A G 48.09 PASS AO=14;DP=37;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=18;FWDB=0.0167903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.963;QD=5.19918;RBI=0.0177308;REFB=-0.0187853;REVB=-0.00569801;RO=23;SAF=7;SAR=7;SRF=5;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.304299;STB=0.675456;TYPE=snp;VARB=0.0199281;OID=.;OPOS=25268368;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:37:37:23:23:14:14:7:7:5:18:7:7:5:18 chr16 27238110 . C T 254.77 PASS AO=49;DP=92;FAO=53;FDP=96;FR=.;FRO=43;FSAF=31;FSAR=22;FSRF=30;FSRR=13;FWDB=-0.0102742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.262;QD=10.6153;RBI=0.0129117;REFB=-0.0254213;REVB=0.0078201;RO=43;SAF=29;SAR=20;SRF=30;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0949622;STB=0.552927;TYPE=snp;VARB=0.0170166;OID=.;OPOS=27238110;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:96:43:43:49:53:20:29:30:13:22:31:30:13 chr16 27371158 . C T 760.71 PASS AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0792118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.042;QD=38.517;RBI=0.0819325;REFB=0;REVB=-0.0209388;RO=0;SAF=22;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.14853e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000390545;OID=.;OPOS=27371158;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:79:79:0:0:79:79:57:22:0:0:57:22:0:0 chr16 27472772 . C T 133.91 PASS AO=36;DP=85;FAO=36;FDP=85;FR=.;FRO=49;FSAF=33;FSAR=3;FSRF=37;FSRR=12;FWDB=0.0552081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.2192;QD=6.30184;RBI=0.0556926;REFB=-0.00451385;REVB=-0.00733022;RO=48;SAF=33;SAR=3;SRF=36;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.35293;STB=0.701986;TYPE=snp;VARB=0.00674388;OID=.;OPOS=27472772;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:48:49:36:36:3:33:36:12:3:33:37:12 chr16 27474910 . A G 327.42 PASS AO=64;DP=110;FAO=64;FDP=110;FR=.;FRO=46;FSAF=23;FSAR=41;FSRF=4;FSRR=42;FWDB=-0.00743349;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2;QD=11.9063;RBI=0.0106302;REFB=-0.00858888;REVB=-0.00759893;RO=46;SAF=23;SAR=41;SRF=4;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246553;STB=0.632922;TYPE=snp;VARB=0.00524146;OID=.;OPOS=27474910;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:46:46:64:64:41:23:4:42:41:23:4:42 chr16 27692835 . G A 109.77 PASS AO=23;DP=44;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=-0.0384936;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9268;QD=9.97888;RBI=0.0566227;REFB=0.020536;REVB=-0.0415256;RO=21;SAF=10;SAR=13;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234653;STB=0.630958;TYPE=snp;VARB=-0.0191505;OID=.;OPOS=27692835;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:44:44:21:21:23:23:13:10:15:6:13:10:15:6 chr16 27720201 . C T 300.62 PASS AO=82;DP=189;FAO=82;FDP=188;FR=.;FRO=106;FSAF=46;FSAR=36;FSRF=69;FSRR=37;FWDB=-0.0177647;FXX=0.00529073;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.893;QD=6.39619;RBI=0.0273541;REFB=-0.0174578;REVB=0.0208005;RO=105;SAF=46;SAR=36;SRF=69;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100034;STB=0.552135;TYPE=snp;VARB=0.0253081;OID=.;OPOS=27720201;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:188:105:106:82:82:36:46:69:36:36:46:69:37 chr16 27733657 . G C 217.81 PASS AO=61;DP=149;FAO=64;FDP=157;FR=.;FRO=93;FSAF=27;FSAR=37;FSRF=34;FSRR=59;FWDB=-0.0178158;FXX=0.00632871;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.154;QD=5.54919;RBI=0.0180046;REFB=0.00241354;REVB=-0.00260059;RO=80;SAF=27;SAR=34;SRF=33;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0311106;STB=0.534533;TYPE=snp;VARB=-0.00442697;OID=.;OPOS=27733657;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:157:80:93:61:64:34:27:33:47:37:27:34:59 chr16 27751382 . G A 130.91 PASS AO=28;DP=55;FAO=29;FDP=56;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.0117989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.334;QD=9.35093;RBI=0.0121098;REFB=-0.021881;REVB=0.00272655;RO=26;SAF=13;SAR=15;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0969565;STB=0.551688;TYPE=snp;VARB=0.0189102;OID=.;OPOS=27751382;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:56:26:27:28:29:15:13:15:11:16:13:15:12 chr16 27752135 . C T 139.4 PASS AO=35;DP=79;FAO=35;FDP=79;FR=.;FRO=44;FSAF=8;FSAR=27;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=0.0104775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.2562;QD=7.05825;RBI=0.076109;REFB=0.00323044;REVB=0.0753843;RO=44;SAF=8;SAR=27;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.326673;STB=0.685389;TYPE=snp;VARB=-0.00258554;OID=.;OPOS=27752135;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:44:44:35:35:27:8:23:21:27:8:23:21 chr16 27761040 . C T 124.25 PASS AO=29;DP=63;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=0.0129505;FXX=0.031741;HRUN=3;LEN=1;MLLD=192.338;QD=8.14775;RBI=0.0172264;REFB=-0.00673517;REVB=0.0113594;RO=27;SAF=18;SAR=11;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00822723;STB=0.514888;TYPE=snp;VARB=0.00709213;OID=.;OPOS=27761040;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:61:27:32:29:29:11:18:17:10:11:18:19:13 chr16 27772901 . G A 144.55 PASS AO=30;DP=56;FAO=30;FDP=56;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=24;FSRF=24;FSRR=2;FWDB=0.0232605;FXX=0.0175408;HRUN=3;LEN=1;MLLD=87.6272;QD=10.3253;RBI=0.0318305;REFB=-0.0663455;REVB=0.0217286;RO=26;SAF=6;SAR=24;SRF=24;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.581918;STB=0.821713;TYPE=snp;VARB=0.00834162;OID=.;OPOS=27772901;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:26:26:30:30:24:6:24:2:24:6:24:2 chr16 27974487 . T C 102.37 PASS AO=27;DP=65;FAO=28;FDP=68;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=-0.0259821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8257;QD=6.02162;RBI=0.0368989;REFB=-0.0139384;REVB=-0.0262004;RO=38;SAF=14;SAR=13;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0459943;STB=0.521038;TYPE=snp;VARB=0.0167245;OID=.;OPOS=27974487;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:68:38:40:27:28:13:14:18:20:13:15:20:20 chr16 28123226 . G A 513.67 PASS AO=117;DP=229;FAO=117;FDP=229;FR=.;FRO=112;FSAF=54;FSAR=63;FSRF=54;FSRR=58;FWDB=-0.0166543;FXX=0.00434764;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.5715;QD=8.9724;RBI=0.0262618;REFB=-0.0139737;REVB=-0.0203056;RO=112;SAF=54;SAR=63;SRF=54;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184684;STB=0.51012;TYPE=snp;VARB=0.0149379;OID=.;OPOS=28123226;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:229:229:112:112:117:117:63:54:54:58:63:54:54:58 chr16 28145182 . TG T 304.67 PASS AO=43;DP=58;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.191642;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.74;QD=21.3806;RBI=0.193428;REFB=0;REVB=0.0262182;RO=6;SAF=12;SAR=31;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0153092;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00948852;OID=.;OPOS=28145183;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:43:57:57:57:0:16:41:0:0:28:6:12:31:2:4 chr16 28328916 . C T 157.16 PASS AO=28;DP=50;FAO=30;FDP=52;FR=.;FRO=22;FSAF=29;FSAR=1;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=0.0466648;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.2228;QD=12.0891;RBI=0.0799342;REFB=0.00674357;REVB=-0.0648989;RO=22;SAF=27;SAR=1;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.581426;STB=0.840245;TYPE=snp;VARB=-0.00291183;OID=.;OPOS=28328916;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:50:52:22:22:28:30:1:27:15:7:1:29:15:7 chr16 28506872 . A G 45.7 PASS AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=8;FSAR=0;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.008674;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.724;QD=13.0566;RBI=0.008674;REFB=-0.00164397;REVB=0;RO=5;SAF=8;SAR=0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000553164;OID=.;OPOS=28506872;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:14:14:5:6:8:8:0:8:5:0:0:8:6:0 chr16 28508447 . A G 90.03 PASS AO=11;DP=12;FAO=11;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0153333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.452;QD=30.0097;RBI=0.034254;REFB=0.0152543;REVB=-0.0306305;RO=1;SAF=8;SAR=3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127515;STB=0.571292;TYPE=snp;VARB=-0.00356512;OID=.;OPOS=28508447;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:12:12:1:1:11:11:3:8:0:1:3:8:0:1 chr16 28508716 . T C 101.96 PASS AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00290505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2485;QD=37.0748;RBI=0.00290505;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=11;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00017128;OID=.;OPOS=28508716;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:11:11:0:11:0:0:0:11:0:0 chr16 28509299 . T C 10.38 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.0357788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.948;QD=5.93148;RBI=0.0357788;REFB=-0.0021278;REVB=0;RO=5;SAF=2;SAR=0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0133301;OID=.;OPOS=28509299;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:5:5:2:2:0:2:5:0:0:2:5:0 chr16 28510184 . G A 102.44 PASS AO=20;DP=36;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0463822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8995;QD=11.3818;RBI=0.117284;REFB=0.00123132;REVB=0.107722;RO=16;SAF=9;SAR=11;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0398524;STB=0.522324;TYPE=snp;VARB=0.00503361;OID=.;OPOS=28510184;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:36:36:16:16:20:20:11:9:8:8:11:9:8:8 chr16 28602991 . A G 134.58 PASS AO=32;DP=81;FAO=36;FDP=84;FR=.;FRO=48;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=35;FWDB=0.090728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.273;QD=6.40837;RBI=0.0910522;REFB=-0.0282157;REVB=-0.00767672;RO=47;SAF=15;SAR=17;SRF=12;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230049;STB=0.616875;TYPE=snp;VARB=0.0450815;OID=.;OPOS=28602991;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:84:47:48:32:36:17:15:12:35:19:17:13:35 chr16 28603393 . T C 90.39 PASS AO=11;DP=13;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.290768;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.3227;QD=27.8125;RBI=0.304311;REFB=-0.0294406;REVB=-0.0897704;RO=2;SAF=4;SAR=7;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0399473;STB=0.533278;TYPE=snp;VARB=0.0371318;OID=.;OPOS=28603393;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:13:13:2:1:11:12:7:4:1:1:7:5:0:1 chr16 28617485 . C T 2388.92 PASS AO=248;DP=249;FAO=249;FDP=249;FR=.;FRO=0;FSAF=107;FSAR=142;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00887116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.177;QD=38.3762;RBI=0.0790953;REFB=0;REVB=-0.0785962;RO=0;SAF=107;SAR=141;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.6799e-05;OID=.;OPOS=28617485;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:249:249:0:0:248:249:141:107:0:0:142:107:0:0 chr16 28617507 . C T 22.26 PASS AO=44;DP=284;FAO=44;FDP=283;FR=.;FRO=239;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=106;FSRR=133;FWDB=0.0024887;FXX=0.003521;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.237;QD=0.314617;RBI=0.0353534;REFB=0.00108634;REVB=-0.0352657;RO=238;SAF=17;SAR=27;SRF=106;SRR=132;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0780717;STB=0.54972;TYPE=snp;VARB=-0.0176569;OID=.;OPOS=28617507;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:284:283:238:239:44:44:27:17:106:132:27:17:106:133 chr16 28620120 . C T 85.64 PASS AO=49;DP=191;FAO=50;FDP=197;FR=.;FRO=147;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=72;FSRR=75;FWDB=-0.0103573;FXX=0.00505025;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8557;QD=1.73897;RBI=0.0680817;REFB=-0.00854216;REVB=-0.0672893;RO=135;SAF=24;SAR=25;SRF=68;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171875;STB=0.507314;TYPE=snp;VARB=0.0313008;OID=.;OPOS=28620120;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:191:197:135:147:49:50:25:24:68:67:26:24:72:75 chr16 28621311 . T C 654.38 PASS AO=71;DP=74;FAO=73;FDP=76;FR=.;FRO=3;FSAF=46;FSAR=27;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0228325;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.013;QD=34.4412;RBI=0.0232931;REFB=-0.0554718;REVB=0.00460897;RO=3;SAF=44;SAR=27;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0311534;STB=0.515785;TYPE=snp;VARB=0.00086915;OID=.;OPOS=28621311;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:74:76:3:3:71:73:27:44:3:0:27:46:3:0 chr16 28649787 . G A 107.29 PASS AO=25;DP=53;FAO=25;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=-0.0136003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.039;QD=8.09749;RBI=0.0244469;REFB=-0.0129124;REVB=-0.0203146;RO=28;SAF=6;SAR=19;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0979372;STB=0.555509;TYPE=snp;VARB=0.0117963;OID=.;OPOS=28649787;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:28:28:25:25:19:6:9:19:19:6:9:19 chr16 28842311 . A G 615.96 PASS AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00897983;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=275.272;QD=37.9049;RBI=0.0107309;REFB=0;REVB=0.00587501;RO=0;SAF=53;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.12951e-06;OID=.;OPOS=28842311;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:65:65:0:0:65:65:12:53:0:0:12:53:0:0 chr16 28883241 . A G 64.73 PASS AO=14;DP=31;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=14;FWDB=0.0922733;FXX=0.0322477;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.503;QD=8.63025;RBI=0.0923099;REFB=-0.00300359;REVB=-0.00259773;RO=15;SAF=1;SAR=13;SRF=2;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170435;STB=0.590759;TYPE=snp;VARB=0.00165347;OID=.;OPOS=28883241;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:31:30:15:16:14:14:13:1:2:13:13:1:2:14 chr16 28893137 . G A 10.8 PASS AO=4;DP=20;FAO=4;FDP=18;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.00163081;FXX=0.142789;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.92;QD=2.40073;RBI=0.0170433;REFB=-0.000535578;REVB=0.0169651;RO=16;SAF=3;SAR=1;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.46666;STB=0.555282;TYPE=snp;VARB=0.00319368;OID=.;OPOS=28893137;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:20:18:16:14:4:4:1:3:5:11:2:2:6:8 chr16 28909713 . AC A 29.15 PASS AO=14;DP=63;FAO=24;FDP=59;FR=.;FRO=35;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.164996;FXX=0.0166639;HRUN=7;LEN=1;MLLD=8.53583;QD=1.97649;RBI=0.218084;REFB=-0.0318341;REVB=0.142609;RO=27;SAF=11;SAR=3;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.333547;STB=0.672744;TYPE=del;VARB=0.00584851;OID=.;OPOS=28909714;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:14:56:24:59:35:18:6:17:18:29:27:11:3:14:13 chr16 28915527 . G A 654.64 PASS AO=69;DP=72;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.019951;FXX=0.0416609;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.016;QD=37.9503;RBI=0.0202262;REFB=0;REVB=0.00332536;RO=0;SAF=24;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.89332e-05;OID=.;OPOS=28915527;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:72:69:0:0:69:69:45:24:0:0:45:24:0:0 chr16 28944396 . C G 552.99 PASS AO=60;DP=63;FAO=62;FDP=64;FR=.;FRO=2;FSAF=19;FSAR=43;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0491532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.8026;QD=34.5616;RBI=0.0555903;REFB=-0.166328;REVB=0.0259662;RO=1;SAF=17;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0269469;STB=0.524992;TYPE=snp;VARB=0.00477598;OID=.;OPOS=28944396;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:63:64:1:2:60:62:43:17:1:0:43:19:2:0 chr16 28944700 . G T 346.39 PASS AO=79;DP=157;FAO=80;FDP=157;FR=.;FRO=77;FSAF=45;FSAR=35;FSRF=32;FSRR=45;FWDB=-0.00218107;FXX=0.00632871;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.964;QD=8.82529;RBI=0.00471857;REFB=-0.00393168;REVB=-0.00418424;RO=75;SAF=45;SAR=34;SRF=31;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138296;STB=0.571865;TYPE=snp;VARB=0.00349101;OID=.;OPOS=28944700;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:157:75:77:79:80:34:45:31:44:35:45:32:45 chr16 28995757 . C A 61.37 PASS AO=12;DP=23;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=0.00379812;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.653;QD=10.6737;RBI=0.0257165;REFB=-0.0299588;REVB=0.0254344;RO=10;SAF=9;SAR=3;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.435938;STB=0.765524;TYPE=snp;VARB=0.0228672;OID=.;OPOS=28995757;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:23:23:10:11:12:12:3:9:2:8:3:9:2:9 chr16 28997997 . G A 188.86 PASS AO=51;DP=118;FAO=51;FDP=118;FR=.;FRO=67;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=33;FSRR=34;FWDB=0.00918874;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.266;QD=6.40203;RBI=0.021678;REFB=-0.0121092;REVB=-0.0196342;RO=67;SAF=27;SAR=24;SRF=33;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0373846;STB=0.52095;TYPE=snp;VARB=0.0204459;OID=.;OPOS=28997997;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:67:67:51:51:24:27:33:34:24:27:33:34 chr16 29063626 . C A 52.34 PASS AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=15;FWDB=0.0267335;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=97.2429;QD=6.5419;RBI=0.0267461;REFB=-0.000627964;REVB=-0.000820678;RO=19;SAF=2;SAR=11;SRF=4;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100138;STB=0.559224;TYPE=snp;VARB=0.00460777;OID=.;OPOS=29063626;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:32:32:19:19:13:13:11:2:4:15:11:2:4:15 chr16 29102137 . T C 214.67 PASS AO=67;DP=170;FAO=67;FDP=172;FR=.;FRO=105;FSAF=29;FSAR=38;FSRF=51;FSRR=54;FWDB=0.0119466;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.08;QD=4.99223;RBI=0.0140712;REFB=-0.0041289;REVB=0.00743488;RO=102;SAF=29;SAR=38;SRF=49;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0514488;STB=0.532576;TYPE=snp;VARB=0.0118522;OID=.;OPOS=29102137;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:172:102:105:67:67:38:29:49:53:38:29:51:54 chr16 29124421 . T C 561.13 PASS AO=123;DP=233;FAO=123;FDP=232;FR=.;FRO=109;FSAF=57;FSAR=66;FSRF=36;FSRR=73;FWDB=-0.0133929;FXX=0.00429166;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.557;QD=9.67465;RBI=0.0306323;REFB=-0.0259623;REVB=0.0275493;RO=109;SAF=57;SAR=66;SRF=36;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116457;STB=0.563463;TYPE=snp;VARB=0.027955;OID=.;OPOS=29124421;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:233:232:109:109:123:123:66:57:36:73:66:57:36:73 chr16 29395360 . TCCG TCG,TCCA 54.71 PASS AO=2,5;DP=8;FAO=2,5;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=2,0;FSAR=0,5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0495832,-0.0368828;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=1,1;MLLD=23.7402,57.1647;QD=27.3526;RBI=0.198745,0.099461;REFB=-0.091169,-0.177857;REVB=-0.192461,0.0923696;RO=1;SAF=2,0;SAR=0,5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0.381818,0;SSSB=0.697199,0;STB=0.993266,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.0191321,0.0635373;OID=.,.;OPOS=29395361,29395363;OREF=C,G;OALT=-,A;OMAPALT=TCG,TCCA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:2,5:8:2,5:8:1:2,0:0,5:0:1:11:1:2,0:0,5:0:1 chr16 29580611 . G A 760.76 PASS AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0267295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.3986;QD=38.5194;RBI=0.0460728;REFB=0;REVB=0.0375265;RO=0;SAF=39;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33478e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.8497e-05;OID=.;OPOS=29580611;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:79:79:0:0:79:79:40:39:0:0:40:39:0:0 chr16 29677841 . T A 13.43 PASS AO=3;DP=11;FAO=3;FDP=11;FR=.;FRO=8;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7784;QD=4.88257;RBI=0.0214153;REFB=-0.0189347;REVB=-0.0214153;RO=8;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.045987;OID=.;OPOS=29677841;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:11:11:8:8:3:3:3:0:0:8:3:0:0:8 chr16 29677843 . T A 19.9 PASS AO=4;DP=11;FAO=4;FDP=11;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.0553;QD=7.2352;RBI=0.010684;REFB=-0.0212383;REVB=0.010684;RO=7;SAF=0;SAR=4;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0288837;OID=.;OPOS=29677843;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:11:11:7:7:4:4:4:0:0:7:4:0:0:7 chr16 29677845 . T A 27.78 PASS AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=11;FR=.;FRO=6;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.8306;QD=10.103;RBI=0.0126539;REFB=-0.0093025;REVB=-0.0126539;RO=6;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00902435;OID=.;OPOS=29677845;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:11:11:6:6:5:5:5:0:0:6:5:0:0:6 chr16 29679989 . A G 1059.42 PASS AO=120;DP=127;FAO=121;FDP=128;FR=.;FRO=7;FSAF=50;FSAR=71;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=0.0668853;FXX=0.0303007;HRUN=3;LEN=1;MLLD=103.117;QD=33.107;RBI=0.0824486;REFB=-0.24861;REVB=0.0482093;RO=7;SAF=50;SAR=70;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0469396;STB=0.524811;TYPE=snp;VARB=0.00653839;OID=.;OPOS=29679989;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:127:128:7:7:120:121:70:50:6:1:71:50:6:1 chr16 29680036 . T TGGGATTATAGGTGTGAGCCA 50 PASS AO=29;DP=162;LEN=20;RO=133;SAF=20;SAR=111;SRF=33;SRR=0;TYPE=ins;FR=.;OID=.;OPOS=29680037;OREF=-;OALT=GGGATTATAGGTGTGAGCCA;OMAPALT=TGGGATTATAGGTGTGAGCCA GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR 0/1:99:162:133:29:111:20:33:0 chr16 29680256 . T G 556.34 PASS AO=56;DP=56;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0290166;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.933;QD=38.3684;RBI=0.0293405;REFB=0;REVB=-0.00434774;RO=0;SAF=16;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.01924e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000104059;OID=.;OPOS=29680256;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:56:58:0:0:56:58:40:16:0:0:40:18:0:0 chr16 29680389 . A C 558.6 PASS AO=141;DP=298;FAO=141;FDP=300;FR=.;FRO=159;FSAF=114;FSAR=27;FSRF=113;FSRR=46;FWDB=-0.00215689;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.69;QD=7.44793;RBI=0.0217288;REFB=-0.00494252;REVB=-0.0216215;RO=156;SAF=114;SAR=27;SRF=111;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134614;STB=0.575866;TYPE=snp;VARB=0.00631196;OID=.;OPOS=29680389;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:298:300:156:159:141:141:27:114:111:45:27:114:113:46 chr16 29708350 . A G 183.13 PASS AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0264144;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.041;QD=38.5531;RBI=0.047183;REFB=0;REVB=-0.0390963;RO=0;SAF=18;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000212446;OID=.;OPOS=29708350;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:19:19:0:0:19:19:1:18:0:0:1:18:0:0 chr16 29790864 . G A 1485.84 PASS AO=160;DP=163;FAO=161;FDP=164;FR=.;FRO=3;FSAF=86;FSAR=75;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0180448;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.6929;QD=36.24;RBI=0.0427721;REFB=-0.0638013;REVB=0.0387793;RO=3;SAF=85;SAR=75;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00695289;STB=0.503689;TYPE=snp;VARB=0.00329939;OID=.;OPOS=29790864;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:163:164:3:3:160:161:75:85:1:2:75:86:1:2 chr16 29791561 . T G 1933.95 PASS AO=199;DP=203;FAO=204;FDP=204;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=126;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0213321;FXX=0.00487781;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9624;QD=37.9207;RBI=0.044896;REFB=-0.0118963;REVB=-0.0395043;RO=4;SAF=75;SAR=124;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0148411;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000124503;OID=.;OPOS=29791561;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:203:204:4:0:199:204:124:75:3:1:126:78:0:0 chr16 29791721 . G C 726.66 PASS AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0506036;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.8018;QD=38.2451;RBI=0.057642;REFB=0;REVB=0.0276023;RO=0;SAF=38;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000682619;OID=.;OPOS=29791721;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:77:76:0:0:76:76:38:38:0:0:38:38:0:0 chr16 29811319 . C T 124.04 PASS AO=13;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.3451;QD=35.4402;RBI=0.0755038;REFB=0;REVB=0.0737037;RO=0;SAF=9;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0303122;OID=.;OPOS=29811319;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:14:14:0:0:13:14:4:9:0:0:5:9:0:0 chr16 29814234 . G A 1325.91 PASS AO=142;DP=144;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156247;FXX=0.00694396;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.807;QD=37.0883;RBI=0.0167817;REFB=-0.109834;REVB=0.00612331;RO=1;SAF=50;SAR=92;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00941459;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000190107;OID=.;OPOS=29814234;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:144:143:1:0:142:143:92:50:1:0:93:50:0:0 chr16 29818203 . AG A 12.34 PASS AO=4;DP=9;FAO=3;FDP=9;FR=.;FRO=6;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.629;QD=5.48473;RBI=0.0221125;REFB=-0.0165371;REVB=-0.0221125;RO=5;SAF=0;SAR=4;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.165177;OID=.;OPOS=29818204;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:4:9:3:9:6:0:3:0:6:12:5:0:4:0:5 chr16 29821744 . G A 1790.82 PASS AO=186;DP=189;FAO=186;FDP=186;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0142487;FXX=0.0158722;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.083;QD=38.5123;RBI=0.0261831;REFB=0;REVB=0.0219666;RO=0;SAF=94;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.89043e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.52824e-05;OID=.;OPOS=29821744;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:189:186:0:0:186:186:92:94:0:0:92:94:0:0 chr16 29825126 . T C 336.44 PASS AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0525831;FXX=0.0512689;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.5644;QD=36.3713;RBI=0.0557401;REFB=-0.136217;REVB=-0.0184925;RO=1;SAF=13;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199188;STB=0.510632;TYPE=snp;VARB=0.00310484;OID=.;OPOS=29825126;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:37:37:1:1:36:36:23:13:0:1:23:13:0:1 chr16 29826538 . T C 82.96 PASS AO=8;DP=10;FAO=10;FDP=11;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00318995;FXX=0.0832639;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.074;QD=30.1678;RBI=0.00488683;REFB=-0.043983;REVB=0.00370207;RO=1;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.080241;STB=0.533268;TYPE=snp;VARB=0.0117543;OID=.;OPOS=29826538;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:10:11:1:1:8:10:5:3:0:1:7:3:0:1 chr16 29827075 . C A 14.18 PASS AO=3;DP=6;FAO=3;FDP=6;FR=.;FRO=3;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=33.3534;QD=9.45327;RBI=0.0768833;REFB=-0.119541;REVB=0.0768833;RO=3;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.178274;OID=.;OPOS=29827075;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:6:6:3:3:3:3:3:0:0:3:3:0:0:3 chr16 29828058 . TC T 71.35 PASS AO=9;DP=15;FAO=14;FDP=17;FR=.;FRO=3;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0782804;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=14.6268;QD=16.7874;RBI=0.360568;REFB=0.00427362;REVB=0.351968;RO=6;SAF=6;SAR=3;SRF=5;SRR=1;SSEN=0.5;SSEP=0;SSSB=-0.137772;STB=0.571332;TYPE=del;VARB=0.0320731;OID=.;OPOS=29828059;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:9:15:14:17:3:9:5:3:0:4:6:6:3:5:1 chr16 29882490 . C T 76.17 PASS AO=22;DP=57;FAO=22;FDP=57;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=26;FWDB=0.026331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.1679;QD=5.34543;RBI=0.0495109;REFB=-0.0256912;REVB=0.0419287;RO=34;SAF=12;SAR=10;SRF=8;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.323102;STB=0.672754;TYPE=snp;VARB=0.0462707;OID=.;OPOS=29882490;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:57:57:34:35:22:22:10:12:8:26:10:12:9:26 chr16 29899094 . C T 135.91 PASS AO=37;DP=89;FAO=37;FDP=88;FR=.;FRO=51;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=7;FSRR=44;FWDB=0.0123002;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.573;QD=6.17764;RBI=0.0379995;REFB=-0.0097898;REVB=-0.0359537;RO=51;SAF=15;SAR=22;SRF=7;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.309912;STB=0.671565;TYPE=snp;VARB=0.0550289;OID=.;OPOS=29899094;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:88:51:51:37:37:22:15:7:44:22:15:7:44 chr16 29908433 . C G 182.97 PASS AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0288118;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.1344;QD=38.5199;RBI=0.133081;REFB=0;REVB=-0.129924;RO=0;SAF=11;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41338e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00660684;OID=.;OPOS=29908433;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:19:19:0:0:19:19:8:11:0:0:8:11:0:0 chr16 29918034 . T C 221.68 PASS AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00747717;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.009;QD=36.947;RBI=0.0269124;REFB=0;REVB=0.0258528;RO=0;SAF=19;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000130245;OID=.;OPOS=29918034;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:25:24:0:0:24:24:5:19:0:0:5:19:0:0 chr16 30012275 . GC G 46.5 PASS AO=11;DP=30;FAO=14;FDP=26;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.19125;FXX=0.187441;HRUN=5;LEN=1;MLLD=13.2455;QD=7.15355;RBI=0.196475;REFB=-0.0292564;REVB=0.0450097;RO=11;SAF=2;SAR=9;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.300456;STB=0.529369;TYPE=del;VARB=0.0257215;OID=.;OPOS=30012276;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:11:29:14:26:12:5:9:5:7:27:11:2:9:5:6 chr16 30100077 . GC G 64.52 PASS AO=43;DP=127;FAO=49;FDP=108;FR=.;FRO=59;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=26;FSRR=33;FWDB=0.277778;FXX=0.114745;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.66766;QD=2.38979;RBI=0.277938;REFB=-0.0737133;REVB=-0.00944549;RO=47;SAF=16;SAR=27;SRF=17;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0104589;STB=0.506736;TYPE=del;VARB=0.105931;OID=.;OPOS=30100078;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:43:122:49:108:59:21:28:26:33:64:47:16:27:17:30 chr16 30100477 . G A 48.32 PASS AO=12;DP=30;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.0123632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.35;QD=6.44327;RBI=0.0226116;REFB=5.70283e-05;REVB=0.0189324;RO=16;SAF=4;SAR=8;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.284721;STB=0.636132;TYPE=snp;VARB=-1.62418e-05;OID=.;OPOS=30100477;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:30:30:16:18:12:12:8:4:10:6:8:4:10:8 chr16 30119525 . C A 664.19 PASS AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100715;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.49;QD=37.9538;RBI=0.0309747;REFB=0;REVB=-0.0292916;RO=0;SAF=25;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000227053;OID=.;OPOS=30119525;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:71:70:0:0:70:70:45:25:0:0:44:26:0:0 chr16 30198151 . A G 224.57 PASS AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0275446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.814;QD=35.9307;RBI=0.0455228;REFB=0;REVB=-0.0362439;RO=0;SAF=17;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000735383;OID=.;OPOS=30198151;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:25:25:0:0:25:25:8:17:0:0:8:17:0:0 chr16 30199584 . G A 144.18 PASS AO=33;DP=73;FAO=33;FDP=68;FR=.;FRO=35;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.031036;FXX=0.128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.9039;QD=8.48128;RBI=0.0951869;REFB=-0.034753;REVB=0.089985;RO=34;SAF=20;SAR=13;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124973;STB=0.57757;TYPE=snp;VARB=0.0357869;OID=.;OPOS=30199584;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:68:34:35:33:33:13:20:16:18:13:20:16:19 chr16 30376503 . AG A,AC 160.95 PASS AO=13,5;DP=35;FAO=26,0;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=12,0;FSAR=14,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.297796,0.0785606;FXX=0.0714031;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=13.8146,23.7023;QD=24.762;RBI=0.305744,0.18824;REFB=-0.0601589,0.0177501;REVB=0.069259,-0.171063;RO=5;SAF=7,2;SAR=6,3;SRF=3;SRR=2;SSEN=0.435374,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.030782,-0.162496;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0326461,0;OID=.,.;OPOS=30376504,30376504;OREF=G,G;OALT=-,C;OMAPALT=A,AC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:13,5:25:26,0:26:0:12,0:14,0:0:0:5:5:7,2:6,3:3:2 chr16 30380872 . C G 136.47 PASS AO=28;DP=53;FAO=28;FDP=52;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.00794994;FXX=0.0188644;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.712;QD=10.4973;RBI=0.0186187;REFB=-0.0200774;REVB=0.0168361;RO=24;SAF=10;SAR=18;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157937;STB=0.588004;TYPE=snp;VARB=0.0124343;OID=.;OPOS=30380872;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:52:24:24:28:28:18:10:13:11:18:10:13:11 chr16 30393660 . G A 1057.48 PASS AO=111;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120493;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=257.97;QD=38.1073;RBI=0.0233831;REFB=0;REVB=0.0200396;RO=0;SAF=49;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.08742e-05;OID=.;OPOS=30393660;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:111:111:0:0:111:111:62:49:0:0:62:49:0:0 chr16 30408765 . C T 832.59 PASS AO=85;DP=85;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0727801;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.4328;QD=38.2798;RBI=0.0825897;REFB=0;REVB=-0.0390398;RO=0;SAF=50;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000165935;OID=.;OPOS=30408765;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:85:87:0:0:85:87:35:50:0:0:35:52:0:0 chr16 30408961 . C T 96.45 PASS AO=25;DP=59;FAO=25;FDP=59;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=24;FWDB=0.0259757;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.527;QD=6.53878;RBI=0.0288438;REFB=-0.00970122;REVB=0.0125391;RO=34;SAF=14;SAR=11;SRF=10;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.264887;STB=0.649754;TYPE=snp;VARB=0.0121506;OID=.;OPOS=30408961;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:59:59:34:34:25:25:11:14:10:24:11:14:10:24 chr16 30518041 . G C 227.23 PASS AO=38;DP=57;FAO=38;FDP=57;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=27;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=-0.0613771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.971;QD=15.9459;RBI=0.0614006;REFB=-0.00768072;REVB=-0.0016985;RO=19;SAF=11;SAR=27;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.257858;STB=0.640872;TYPE=snp;VARB=0.00340461;OID=.;OPOS=30518041;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:57:57:19:19:38:38:27:11:13:6:27:11:13:6 chr16 30536672 . A G 54.71 PASS AO=12;DP=27;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=-0.0854654;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.609;QD=8.41719;RBI=0.0863264;REFB=-0.0276848;REVB=-0.0121617;RO=14;SAF=4;SAR=8;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.050746;STB=0.529364;TYPE=snp;VARB=0.0488159;OID=.;OPOS=30536672;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:27:26:14:14:12:12:8:4:4:10:8:4:4:10 chr16 30663206 . CG C 103.01 PASS AO=15;DP=51;FAO=37;FDP=49;FR=.;FRO=12;FSAF=11;FSAR=26;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=-0.072895;FXX=0.039208;HRUN=5;LEN=1;MLLD=8.34806;QD=8.40901;RBI=0.210896;REFB=0.149847;REVB=0.197898;RO=29;SAF=2;SAR=13;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.44446;STB=0.514011;TYPE=del;VARB=0.0590037;OID=.;OPOS=30663207;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:15:50:37:49:12:11:26:3:9:5:29:2:13:13:16 chr16 30666367 . C T 26.14 PASS AO=9;DP=32;FAO=9;FDP=32;FR=.;FRO=23;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=18;FWDB=-0.0335308;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.1361;QD=3.26754;RBI=0.0345072;REFB=-0.02173;REVB=-0.00815037;RO=23;SAF=2;SAR=7;SRF=5;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00809958;STB=0.505039;TYPE=snp;VARB=0.0953393;OID=.;OPOS=30666367;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:32:32:23:23:9:9:7:2:5:18:7:2:5:18 chr16 30667532 . GC G,AG 136.37 PASS AO=12,4;DP=25;FAO=19,4;FDP=26;FR=.;FRO=3;FSAF=5,4;FSAR=14,0;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.299096,0.115785;FXX=0;HRUN=3,1;LEN=1,2;MLLD=12.5095,15.3107;QD=20.9796;RBI=0.376607,0.135706;REFB=-0.0105762,0.00177122;REVB=-0.228855,-0.0707804;RO=6;SAF=1,4;SAR=11,0;SRF=6;SRR=0;SSEN=0.520833,0;SSEP=0.38835,0;SSSB=-0.650741,0;STB=0.615255,0.5;TYPE=del,mnp;VARB=0.0453673,-0.0877907;OID=.,.;OPOS=30667533,30667532;OREF=C,GC;OALT=-,AG;OMAPALT=G,AG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:8:26:26:6:3:12,4:19,4:11,0:1,4:6:0:14,0:5,4:3:0 chr16 30724070 . G T 2118.38 PASS AO=226;DP=226;FAO=223;FDP=223;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.104641;FXX=0.0132737;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.0431;QD=37.9979;RBI=0.116947;REFB=0.0613845;REVB=-0.0522188;RO=0;SAF=104;SAR=122;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.34041e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.973e-05;OID=.;OPOS=30724070;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:92:226:223:0:0:226:223:122:104:0:0:119:104:0:0 chr16 30733952 . C CG 16.91 PASS AO=4;DP=11;FAO=4;FDP=11;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=43.7836;QD=6.14894;RBI=0.0167209;REFB=-0.0406217;REVB=0.0167209;RO=7;SAF=0;SAR=4;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.21123;OID=.;OPOS=30733953;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:4:11:4:11:7:0:4:0:7:16:7:0:4:0:7 chr16 30734963 . C A 556.29 PASS AO=62;DP=64;FAO=62;FDP=64;FR=.;FRO=2;FSAF=1;FSAR=61;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0135849;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=286.238;QD=34.7679;RBI=0.0138962;REFB=0.00810113;REVB=-0.00292513;RO=1;SAF=1;SAR=61;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.309326;STB=0.662974;TYPE=snp;VARB=1.67306e-05;OID=.;OPOS=30734963;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:64:64:1:2:62:62:61:1:1:0:61:1:1:1 chr16 30748633 . C CG 11.63 PASS AO=2;DP=11;FAO=3;FDP=11;FR=.;FRO=8;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=39.054;QD=4.22737;RBI=0.041483;REFB=-0.0311589;REVB=0.041483;RO=9;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.179738;OID=.;OPOS=30748634;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:2:11:3:11:8:0:3:0:8:11:9:0:2:0:9 chr16 30762640 . C T 459.81 PASS AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00591951;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=158.837;QD=36.7852;RBI=0.0302525;REFB=0.000890843;REVB=0.0296677;RO=1;SAF=11;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0408602;STB=0.52173;TYPE=snp;VARB=5.35829e-05;OID=.;OPOS=30762640;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:50:50:1:1:49:49:38:11:1:0:38:11:1:0 chr16 30772004 . GAA G 122.68 PASS AO=36;DP=84;FAO=41;FDP=82;FR=.;FRO=41;FSAF=9;FSAR=32;FSRF=4;FSRR=37;FWDB=-0.0542504;FXX=0.0465062;HRUN=5;LEN=2;MLLD=32.7253;QD=5.98442;RBI=0.0737584;REFB=0.0143545;REVB=-0.049972;RO=38;SAF=8;SAR=28;SRF=4;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1747;STB=0.598801;TYPE=del;VARB=-0.0162917;OID=.;OPOS=30772005;OREF=AA;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:36:80:41:82:41:9:32:4:37:99:38:8:28:4:34 chr16 30779716 . A G 941.1 PASS AO=97;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00621435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.943;QD=38.4123;RBI=0.0256398;REFB=0;REVB=0.0248753;RO=0;SAF=18;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.25376e-05;OID=.;OPOS=30779716;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:98:98:0:0:97:98:79:18:0:0:80:18:0:0 chr16 30780828 . A G 220.87 PASS AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.573;QD=36.811;RBI=0.0157327;REFB=0;REVB=-0.00304978;RO=0;SAF=8;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000102127;OID=.;OPOS=30780828;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:24:24:0:0:24:24:16:8:0:0:16:8:0:0 chr16 30794267 . GAA GA,GAG 313.62 PASS AO=3,4;DP=53;FAO=10,35;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=6,10;FSAR=4,25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.272091,0.200655;FXX=0.0217344;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=16.4492,36.8152;QD=27.8775;RBI=0.389972,0.204842;REFB=-0.201973,-0.0906277;REVB=0.279365,0.0412063;RO=6;SAF=3,2;SAR=0,2;SRF=5;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.606014,-0.321971;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.286999,0.0280509;OID=.,.;OPOS=30794268,30794269;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=GA,GAG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:3,4:19:10,35:45:0:6,10:4,25:0:0:16:6:3,2:0,2:5:1 chr16 30886643 . T C 24.78 PASS AO=6;DP=17;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=11;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.2787;QD=5.83104;RBI=0.0213606;REFB=0.00938786;REVB=-0.0213606;RO=11;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0176321;OID=.;OPOS=30886643;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:17:17:11:11:6:6:6:0:0:11:6:0:0:11 chr16 30936081 . G A 289.45 PASS AO=82;DP=191;FAO=81;FDP=190;FR=.;FRO=109;FSAF=56;FSAR=25;FSRF=72;FSRR=37;FWDB=0.0566877;FXX=0.00523533;HRUN=5;LEN=1;MLLD=39.9771;QD=6.09376;RBI=0.0572433;REFB=-0.0342343;REVB=-0.00795654;RO=101;SAF=57;SAR=25;SRF=63;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0804532;STB=0.520379;TYPE=snp;VARB=0.060614;OID=.;OPOS=30936081;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:191:190:101:109:82:81:25:57:63:38:25:56:72:37 chr16 30937142 . C G 10.22 PASS AO=2;DP=9;FAO=2;FDP=9;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=0.0581956;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.7;QD=4.54141;RBI=0.0581956;REFB=-0.0290055;REVB=0;RO=7;SAF=2;SAR=0;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00886358;OID=.;OPOS=30937142;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:7:7:2:2:0:2:7:0:0:2:7:0 chr16 30964940 . A G 244.78 PASS AO=32;DP=37;FAO=31;FDP=36;FR=.;FRO=5;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0459139;FXX=0.0270197;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.2321;QD=27.1981;RBI=0.0680143;REFB=-0.151625;REVB=-0.0501783;RO=5;SAF=12;SAR=20;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0474858;STB=0.527707;TYPE=snp;VARB=0.0417095;OID=.;OPOS=30964940;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:37:36:5:5:32:31:20:12:1:4:19:12:1:4 chr16 30999462 . T C 124.23 PASS AO=28;DP=57;FAO=28;FDP=57;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=-0.0746589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.3098;QD=8.7176;RBI=0.0747386;REFB=-0.019628;REVB=0.00345074;RO=29;SAF=8;SAR=20;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.369104;STB=0.706922;TYPE=snp;VARB=0.0105103;OID=.;OPOS=30999462;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:29:29:28:28:20:8:20:9:20:8:20:9 chr16 31004169 . T C 19.09 PASS AO=7;DP=28;FAO=7;FDP=28;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.029893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.0343;QD=2.72651;RBI=0.054449;REFB=-0.0453059;REVB=0.0455093;RO=21;SAF=6;SAR=1;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.402521;STB=0.768344;TYPE=snp;VARB=0.0898394;OID=.;OPOS=31004169;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:28:28:21:21:7:7:1:6:12:9:1:6:12:9 chr16 31012480 . G A 84.7 PASS AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.037796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.1829;QD=7.05839;RBI=0.0503464;REFB=0.0121882;REVB=0.0332599;RO=27;SAF=8;SAR=13;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138058;STB=0.578871;TYPE=snp;VARB=-0.00862718;OID=.;OPOS=31012480;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:48:48:27:27:21:21:13:8:14:13:13:8:14:13 chr16 31075175 . G A 58.57 PASS AO=10;DP=16;FAO=10;FDP=16;FR=.;FRO=6;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0111054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.339;QD=14.6412;RBI=0.0600379;REFB=-0.0366939;REVB=0.0590019;RO=6;SAF=7;SAR=3;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144541;STB=0.583159;TYPE=snp;VARB=0.0188724;OID=.;OPOS=31075175;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:16:16:6:6:10:10:3:7:3:3:3:7:3:3 chr16 31075708 . C G 195.69 PASS AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.027;QD=39.1378;RBI=0.0254662;REFB=0;REVB=-0.0170083;RO=0;SAF=7;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.83473e-05;OID=.;OPOS=31075708;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:20:20:0:0:20:20:13:7:0:0:13:7:0:0 chr16 31088347 . G A 481.81 PASS AO=90;DP=156;FAO=93;FDP=157;FR=.;FRO=64;FSAF=45;FSAR=48;FSRF=27;FSRR=37;FWDB=0.0297581;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.764;QD=12.2753;RBI=0.0309857;REFB=-0.0196533;REVB=-0.00863539;RO=64;SAF=43;SAR=47;SRF=27;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0429395;STB=0.525334;TYPE=snp;VARB=0.0135932;OID=.;OPOS=31088347;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:157:64:64:90:93:47:43:27:37:48:45:27:37 chr16 31088625 . A G 83.19 PASS AO=15;DP=29;FAO=16;FDP=30;FR=.;FRO=14;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.00800724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.735;QD=11.0922;RBI=0.0130464;REFB=0.0015167;REVB=-0.0103002;RO=14;SAF=10;SAR=5;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208276;STB=0.627028;TYPE=snp;VARB=-0.0011159;OID=.;OPOS=31088625;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:29:30:14:14:15:16:5:10:6:8:5:11:6:8 chr16 31089341 . A G 226.96 PASS AO=43;DP=80;FAO=44;FDP=80;FR=.;FRO=36;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=11;FSRR=25;FWDB=-0.0218491;FXX=0.111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.201;QD=11.3481;RBI=0.0530924;REFB=-0.0478791;REVB=0.0483882;RO=29;SAF=20;SAR=23;SRF=7;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168208;STB=0.568415;TYPE=snp;VARB=0.0465871;OID=.;OPOS=31089341;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:29:36:43:44:23:20:7:22:24:20:11:25 chr16 31090407 . G C 229.16 PASS AO=43;DP=72;FAO=43;FDP=72;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=28;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.016147;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.959;QD=12.731;RBI=0.0165103;REFB=0.00287297;REVB=0.00344421;RO=29;SAF=15;SAR=28;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104487;STB=0.557282;TYPE=snp;VARB=-0.00153831;OID=.;OPOS=31090407;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:29:29:43:43:28:15:14:15:28:15:14:15 chr16 31092075 . G A 94.82 PASS AO=20;DP=40;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=-0.00418394;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.834;QD=9.48233;RBI=0.00705977;REFB=0.00115297;REVB=0.00568638;RO=19;SAF=16;SAR=4;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.080139;STB=0.571352;TYPE=snp;VARB=-0.000590669;OID=.;OPOS=31092075;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:40:40:19:20:20:20:4:16:14:5:4:16:14:6 chr16 31092470 . C T 34.08 PASS AO=9;DP=26;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.00726533;FXX=0.0384468;HRUN=3;LEN=1;MLLD=158.036;QD=5.45266;RBI=0.0270327;REFB=-0.0229626;REVB=0.0260381;RO=15;SAF=4;SAR=5;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0920876;STB=0.535635;TYPE=snp;VARB=0.0379395;OID=.;OPOS=31092470;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:26:25:15:16:9:9:5:4:8:7:5:4:8:8 chr16 31093892 . A G 620.11 PASS AO=63;DP=63;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.992;QD=37.5824;RBI=0.140332;REFB=0;REVB=0.139525;RO=0;SAF=40;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000568143;OID=.;OPOS=31093892;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:63:66:0:0:63:66:23:40:0:0:26:40:0:0 chr16 31093954 . C T 186.01 PASS AO=51;DP=121;FAO=51;FDP=120;FR=.;FRO=69;FSAF=33;FSAR=18;FSRF=55;FSRR=14;FWDB=-0.0335166;FXX=0.00826378;HRUN=4;LEN=1;MLLD=217.931;QD=6.20034;RBI=0.0351259;REFB=-0.0101986;REVB=-0.0105102;RO=69;SAF=33;SAR=18;SRF=55;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179946;STB=0.599964;TYPE=snp;VARB=0.0110318;OID=.;OPOS=31093954;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:120:69:69:51:51:18:33:55:14:18:33:55:14 chr16 31096164 . G C 39.46 PASS AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0399737;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.442;QD=15.7834;RBI=0.0433297;REFB=0.0621969;REVB=0.0167202;RO=4;SAF=5;SAR=1;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.297985;STB=0.681121;TYPE=snp;VARB=-0.03006;OID=.;OPOS=31096164;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:10:10:4:4:6:6:1:5:2:2:1:5:2:2 chr16 31102321 . C T 311.5 PASS AO=85;DP=203;FAO=87;FDP=200;FR=.;FRO=113;FSAF=35;FSAR=52;FSRF=51;FSRR=62;FWDB=0.00792734;FXX=0.0291248;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2123;QD=6.22998;RBI=0.0162988;REFB=-0.023151;REVB=-0.0142411;RO=101;SAF=35;SAR=50;SRF=49;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0730493;STB=0.528474;TYPE=snp;VARB=0.0352637;OID=.;OPOS=31102321;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:200:101:113:85:87:50:35:49:52:52:35:51:62 chr16 31105554 . A C 98.8 PASS AO=24;DP=69;FAO=30;FDP=74;FR=.;FRO=44;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=-0.00430061;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.274;QD=5.34048;RBI=0.00979882;REFB=-0.0105191;REVB=-0.00880464;RO=43;SAF=4;SAR=20;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.399686;STB=0.613956;TYPE=snp;VARB=0.0145649;OID=.;OPOS=31105554;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:69:74:43:44:24:30:20:4:20:23:21:9:21:23 chr16 31121793 . G A 37.17 PASS AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=-0.00062545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.986;QD=10.6203;RBI=0.00062545;REFB=-0.0286479;REVB=0;RO=7;SAF=7;SAR=0;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.022719;OID=.;OPOS=31121793;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:14:14:7:7:7:7:0:7:7:0:0:7:7:0 chr16 31141826 . A G 241.33 PASS AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0155495;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.8561;QD=37.1275;RBI=0.0765069;REFB=0;REVB=0.0749101;RO=0;SAF=11;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99383e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0021954;OID=.;OPOS=31141826;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:25:26:0:0:25:26:14:11:0:0:15:11:0:0 chr16 31141880 . A G 290.16 PASS AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0127788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.693;QD=37.4396;RBI=0.0404439;REFB=0;REVB=-0.038372;RO=0;SAF=19;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00043552;OID=.;OPOS=31141880;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:30:31:0:0:30:31:11:19:0:0:11:20:0:0 chr16 31142935 . GC G 164.77 PASS AO=20;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.221091;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.2032;QD=26.363;RBI=0.301814;REFB=-0.0418701;REVB=0.205452;RO=2;SAF=5;SAR=15;SRF=0;SRR=2;SSEN=0.315111;SSEP=0;SSSB=0.0575947;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00758257;OID=.;OPOS=31142936;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:20:25:25:25:0:7:18:0:0:13:2:5:15:0:2 chr16 31146742 . C T 134.97 PASS AO=24;DP=40;FAO=24;FDP=40;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=19;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=0.00274144;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=259.638;QD=13.4971;RBI=0.00396388;REFB=-0.0144753;REVB=-0.00286302;RO=14;SAF=5;SAR=19;SRF=2;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0694585;STB=0.51281;TYPE=snp;VARB=0.00787514;OID=.;OPOS=31146742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:40:40:14:16:24:24:19:5:2:12:19:5:3:13 chr16 31153105 . A G 773.04 PASS AO=83;DP=85;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00499551;FXX=0.0117633;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.267;QD=36.8114;RBI=0.0108407;REFB=-0.047056;REVB=0.00962116;RO=1;SAF=43;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108876;STB=0.505746;TYPE=snp;VARB=1.32233e-05;OID=.;OPOS=31153105;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:85:84:1:1:83:83:40:43:1:0:40:43:1:0 chr16 31195279 . C T 630.96 PASS AO=67;DP=68;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0142525;FXX=0.0144907;HRUN=3;LEN=1;MLLD=178.552;QD=37.1152;RBI=0.0354813;REFB=-0.0893453;REVB=0.0324929;RO=1;SAF=22;SAR=45;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0209928;STB=0.511108;TYPE=snp;VARB=0.000476477;OID=.;OPOS=31195279;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:68:68:1:1:67:67:45:22:1:0:45:22:1:0 chr16 31230463 . C T 555.85 PASS AO=57;DP=57;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0501634;FXX=0.063482;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.513;QD=37.6849;RBI=0.0597952;REFB=0;REVB=0.0325438;RO=0;SAF=35;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00122738;OID=.;OPOS=31230463;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:57:59:0:0:57:59:22:35:0:0:22:37:0:0 chr16 31277179 . A AC 37.87 PASS AO=7;DP=17;FAO=11;FDP=17;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.371338;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=12.3957;QD=8.91123;RBI=0.371353;REFB=-0.125827;REVB=0.00328722;RO=10;SAF=0;SAR=7;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.765437;STB=0.526267;TYPE=ins;VARB=0.150064;OID=.;OPOS=31277180;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:7:17:11:17:6:3:8:2:4:14:10:0:7:5:5 chr16 31308927 . C T 180.43 PASS AO=33;DP=54;FAO=33;FDP=54;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=26;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.00097009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.054;QD=13.3652;RBI=0.0056734;REFB=-0.0107316;REVB=-0.00558985;RO=21;SAF=7;SAR=26;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118062;STB=0.565175;TYPE=snp;VARB=0.00555426;OID=.;OPOS=31308927;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:54:54:21:21:33:33:26:7:7:14:26:7:7:14 chr16 31336719 . G A 193.91 PASS AO=45;DP=92;FAO=45;FDP=92;FR=.;FRO=47;FSAF=5;FSAR=40;FSRF=12;FSRR=35;FWDB=0.00416526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.1664;QD=8.43104;RBI=0.0208506;REFB=-0.00245168;REVB=-0.0204303;RO=47;SAF=5;SAR=40;SRF=12;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.255578;STB=0.644474;TYPE=snp;VARB=0.00305427;OID=.;OPOS=31336719;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:47:47:45:45:40:5:12:35:40:5:12:35 chr16 31336888 . C T 230.89 PASS AO=50;DP=95;FAO=50;FDP=95;FR=.;FRO=45;FSAF=13;FSAR=37;FSRF=13;FSRR=32;FWDB=0.0143103;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.837;QD=9.72169;RBI=0.017192;REFB=0.0165113;REVB=0.00952791;RO=45;SAF=13;SAR=37;SRF=13;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0316653;STB=0.517475;TYPE=snp;VARB=-0.0125639;OID=.;OPOS=31336888;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:45:45:50:50:37:13:13:32:37:13:13:32 chr16 31343005 . C T 74.66 PASS AO=16;DP=36;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=0.0597248;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=42.8205;QD=8.29544;RBI=0.0790965;REFB=-0.0293873;REVB=0.0518576;RO=20;SAF=7;SAR=9;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202938;STB=0.640865;TYPE=snp;VARB=0.0469473;OID=.;OPOS=31343005;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:36:36:20:19:16:17:9:7:13:7:10:7:13:6 chr16 31374535 . C G 58.48 PASS AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.00119636;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=231.927;QD=9.7474;RBI=0.00821313;REFB=-0.0195769;REVB=-0.00812553;RO=12;SAF=11;SAR=1;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.405775;STB=0.742721;TYPE=snp;VARB=0.0124123;OID=.;OPOS=31374535;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:24:24:12:12:12:12:1:11:8:4:1:11:8:4 chr16 31374609 . GGGGCC GC,GGGGC,GGGG 323.88 PASS AO=9,15,13;DP=48;FAO=0,41,10;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=0,23,7;FSAR=0,18,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0232919,-0.129561,-0.0692576;FXX=0;HRUN=4,4,4;LEN=4,1,2;MLLD=34.1742,14.1918,13.4601;QD=25.4025;RBI=0.737785,0.344516,0.189379;REFB=0,0,0;REVB=-0.737418,0.319226,0.176261;RO=2;SAF=0,15,13;SAR=9,0,0;SRF=2;SRR=0;SSEN=0.555556,0,0;SSEP=0.479638,0.468085,0.468085;SSSB=-0.819737,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=del,del,del;VARB=0,-0.0452631,0.044919;OID=.,.,.;OPOS=31374610,31374613,31374613;OREF=GGGC,C,CC;OALT=-,-,-;OMAPALT=GC,GGGGC,GGGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/3:9,15,13:46:0,41,10:51:0:0,23,7:0,18,3:0:0:8:2:0,15,13:9,0,0:2:0 chr16 31422429 . T C 385.46 PASS AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00884188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.687;QD=37.6056;RBI=0.00894217;REFB=0;REVB=0.00133549;RO=0;SAF=29;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.67744e-05;OID=.;OPOS=31422429;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:41:41:0:0:41:41:12:29:0:0:12:29:0:0 chr16 31476458 . C T 943.63 PASS AO=101;DP=103;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0533872;FXX=0.0194156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.157;QD=37.3717;RBI=0.0533936;REFB=-0.0546817;REVB=-0.000823402;RO=1;SAF=32;SAR=69;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145931;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000188317;OID=.;OPOS=31476458;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:103:101:1:0:101:101:69:32:1:0:69:32:0:0 chr16 31724836 . T C 47.15 PASS AO=6;DP=11;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0168694;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.4832;QD=17.1439;RBI=0.0169214;REFB=0.0456188;REVB=0.00132604;RO=5;SAF=4;SAR=2;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.333798;STB=0.64252;TYPE=snp;VARB=-0.0248978;OID=.;OPOS=31724836;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:11:11:5:4:6:7:2:4:5:0:2:5:4:0 chr16 31770723 . T A 312.33 PASS AO=67;DP=125;FAO=67;FDP=125;FR=.;FRO=58;FSAF=62;FSAR=5;FSRF=50;FSRR=8;FWDB=0.0125278;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.0197;QD=9.99464;RBI=0.0186228;REFB=-0.0026025;REVB=-0.0137791;RO=58;SAF=62;SAR=5;SRF=50;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162126;STB=0.590013;TYPE=snp;VARB=0.00338344;OID=.;OPOS=31770723;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:58:58:67:67:5:62:50:8:5:62:50:8 chr16 31926619 . G A 353.99 PASS AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.025227;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.34;QD=38.2691;RBI=0.0294782;REFB=0;REVB=-0.0152501;RO=0;SAF=13;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.7307e-05;OID=.;OPOS=31926619;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:38:37:0:0:37:37:24:13:0:0:24:13:0:0 chr16 33961327 . G T 24.1 PASS AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=13;FR=.;FRO=8;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.021;QD=7.41488;RBI=0.0398326;REFB=-0.0108445;REVB=-0.0398326;RO=7;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0194597;OID=.;OPOS=33961327;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:12:13:7:8:5:5:5:0:0:7:5:0:0:8 chr16 33961352 . G A 10.3 PASS AO=2;DP=8;FAO=2;FDP=8;FR=.;FRO=6;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.0941;QD=5.1483;RBI=0.0372305;REFB=0.0122661;REVB=0.0372305;RO=6;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0223037;OID=.;OPOS=33961352;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:8:6:6:2:2:2:0:0:6:2:0:0:6 chr16 33961628 . A G 57.3 PASS AO=6;DP=7;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0385557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.5324;QD=28.6494;RBI=0.0684804;REFB=-0.220423;REVB=0.0565952;RO=1;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0789211;STB=0.538356;TYPE=snp;VARB=0.0222048;OID=.;OPOS=33961628;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:7:8:1:1:6:7:5:1:0:1:6:1:0:1 chr16 33961658 . A G 17.05 PASS AO=4;DP=9;FAO=3;FDP=8;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0117896;FXX=0.110988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.965;QD=8.52685;RBI=0.0323831;REFB=-0.00303043;REVB=-0.0301608;RO=4;SAF=1;SAR=3;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.338535;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0216643;OID=.;OPOS=33961658;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:9:8:4:5:4:3:3:1:0:4:3:0:0:5 chr16 33961689 . G A 10.47 PASS AO=2;DP=6;FAO=2;FDP=6;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0514406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.098;QD=6.97886;RBI=0.057044;REFB=-0.008037;REVB=-0.0246552;RO=4;SAF=1;SAR=1;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237547;STB=0.665181;TYPE=snp;VARB=0.00656323;OID=.;OPOS=33961689;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:4:4:2:2:1:1:1:3:1:1:1:3 chr16 33961702 . C A 10.47 PASS AO=2;DP=6;FAO=2;FDP=6;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.028835;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.0633;QD=6.97935;RBI=0.0389862;REFB=-0.00550095;REVB=-0.0262387;RO=4;SAF=1;SAR=1;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237547;STB=0.665181;TYPE=snp;VARB=0.000803266;OID=.;OPOS=33961702;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:4:4:2:2:1:1:1:3:1:1:1:3 chr16 33961873 . G A 15.35 PASS AO=3;DP=9;FAO=3;FDP=9;FR=.;FRO=6;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.317;QD=6.82108;RBI=0.00956325;REFB=-0.0473052;REVB=-0.00956325;RO=6;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.105021;OID=.;OPOS=33961873;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:9:9:6:6:3:3:3:0:0:6:3:0:0:6 chr16 33961880 . C T 14.37 PASS AO=3;DP=10;FAO=3;FDP=10;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.7884;QD=5.74612;RBI=0.013559;REFB=-0.0113322;REVB=-0.013559;RO=6;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.103897;OID=.;OPOS=33961880;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:10:10:6:7:3:3:3:0:0:6:3:0:0:7 chr16 33961881 . A G 64.45 PASS AO=9;DP=10;FAO=8;FDP=10;FR=.;FRO=2;FSAF=0;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.581;QD=25.7811;RBI=0.013796;REFB=-0.0792878;REVB=-0.013796;RO=1;SAF=0;SAR=9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0161565;OID=.;OPOS=33961881;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:10:10:1:2:9:8:9:0:0:1:8:0:0:2 chr16 33961902 . C G 70.78 PASS AO=9;DP=11;FAO=9;FDP=11;FR=.;FRO=2;FSAF=0;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=47.5574;QD=25.738;RBI=0.0824574;REFB=-0.085789;REVB=0.0824574;RO=2;SAF=0;SAR=9;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0272493;OID=.;OPOS=33961902;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:11:11:2:2:9:9:9:0:0:2:9:0:0:2 chr16 33961918 . G T 19.9 PASS AO=4;DP=11;FAO=4;FDP=11;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.73;QD=7.23555;RBI=0.0154898;REFB=-0.0500445;REVB=0.0154898;RO=7;SAF=0;SAR=4;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0164143;OID=.;OPOS=33961918;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:11:11:7:7:4:4:4:0:0:7:4:0:0:7 chr16 33961938 . T C 17.49 PASS AO=5;DP=9;FAO=4;FDP=8;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0.110988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=41.7831;QD=8.74714;RBI=0.0857691;REFB=-0.15847;REVB=0.0857691;RO=4;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.299759;OID=.;OPOS=33961938;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:9:8:4:4:5:4:5:0:0:4:4:0:0:4 chr16 33961939 . G A 31.01 PASS AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.894;QD=13.7802;RBI=0.0943423;REFB=-0.0145329;REVB=0.0943423;RO=4;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0225331;OID=.;OPOS=33961939;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:9:9:4:4:5:5:5:0:0:4:5:0:0:4 chr16 33961942 . A G 68.22 PASS AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.4508;QD=30.3217;RBI=0.00691758;REFB=0.0288818;REVB=-0.00691758;RO=1;SAF=0;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00269437;OID=.;OPOS=33961942;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:9:9:1:1:8:8:8:0:0:1:8:0:0:1 chr16 33961944 . G C 59.34 PASS AO=8;DP=9;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0.110988;HRUN=3;LEN=1;MLLD=37.0165;QD=29.6699;RBI=0.0386834;REFB=-0.0989942;REVB=0.0386834;RO=1;SAF=0;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0145728;OID=.;OPOS=33961944;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:9:8:1:1:8:7:8:0:0:1:7:0:0:1 chr16 33962412 . A C 23.32 PASS AO=5;DP=8;FAO=4;FDP=7;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0153536;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.7;QD=13.3258;RBI=0.0475478;REFB=-0.0194585;REVB=0.0450007;RO=3;SAF=4;SAR=1;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23409;STB=0.666019;TYPE=snp;VARB=0.00464477;OID=.;OPOS=33962412;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:8:7:3:3:5:4:1:4:3:0:1:3:3:0 chr16 33962416 . G A 22.75 PASS AO=4;DP=9;FAO=4;FDP=8;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0154261;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=254.207;QD=11.3734;RBI=0.0936204;REFB=-0.00635519;REVB=0.0923408;RO=4;SAF=3;SAR=1;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.338535;STB=0.699286;TYPE=snp;VARB=0.00914172;OID=.;OPOS=33962416;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:9:8:4:4:4:4:1:3:4:0:1:3:4:0 chr16 33962422 . C A 22.3 PASS AO=4;DP=10;FAO=4;FDP=9;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.0180352;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=83.0679;QD=9.91256;RBI=0.0188337;REFB=-0.0330099;REVB=-0.00542575;RO=6;SAF=3;SAR=1;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113038;STB=0.538276;TYPE=snp;VARB=0.0207277;OID=.;OPOS=33962422;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:10:9:6:5:4:4:1:3:5:1:1:3:4:1 chr16 33962500 . T G 12.88 PASS AO=11;DP=59;FAO=10;FDP=58;FR=.;FRO=48;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=0.00645504;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.209;QD=0.888148;RBI=0.00660565;REFB=-0.000966918;REVB=0.00140253;RO=48;SAF=8;SAR=3;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.334325;STB=0.6996;TYPE=snp;VARB=0.00287679;OID=.;OPOS=33962500;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:59:58:48:48:11:10:3:8:22:26:3:7:22:26 chr16 33962561 . G C 336.18 PASS AO=51;DP=69;FAO=52;FDP=70;FR=.;FRO=18;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=17;FWDB=-0.00348564;FXX=0.11391;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.8543;QD=19.21;RBI=0.0285053;REFB=-0.0621287;REVB=-0.0282914;RO=18;SAF=24;SAR=27;SRF=1;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205206;STB=0.610393;TYPE=snp;VARB=0.0056465;OID=.;OPOS=33962561;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:69:70:18:18:51:52:27:24:1:17:27:25:1:17 chr16 33962562 . G A 283.74 PASS AO=50;DP=77;FAO=49;FDP=76;FR=.;FRO=27;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.0218517;FXX=0.0256377;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.8492;QD=14.9336;RBI=0.0399918;REFB=0.00619341;REVB=-0.033494;RO=27;SAF=23;SAR=27;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0585828;STB=0.528373;TYPE=snp;VARB=-0.0033049;OID=.;OPOS=33962562;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:77:76:27:27:50:49:27:23:10:17:27:22:10:17 chr16 33962570 . G A 190.21 PASS AO=41;DP=81;FAO=41;FDP=79;FR=.;FRO=38;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=12;FSRR=26;FWDB=-0.0134491;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=242.748;QD=9.63097;RBI=0.0195908;REFB=0.000816573;REVB=0.014245;RO=40;SAF=18;SAR=23;SRF=12;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128261;STB=0.56104;TYPE=snp;VARB=-0.000636173;OID=.;OPOS=33962570;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:79:40:38:41:41:23:18:12:28:23:18:12:26 chr16 33962619 . G A 161.39 PASS AO=36;DP=80;FAO=36;FDP=72;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=-0.0396114;FXX=0.0769132;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.208;QD=8.96635;RBI=0.0405768;REFB=-0.015746;REVB=0.00879873;RO=38;SAF=14;SAR=22;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0557785;STB=0.542969;TYPE=snp;VARB=0.0130616;OID=.;OPOS=33962619;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:72:38:36:36:36:22:14:17:21:22:14:17:19 chr16 33962641 . G T 129.24 PASS AO=34;DP=81;FAO=34;FDP=79;FR=.;FRO=45;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=27;FWDB=0.0312914;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.7323;QD=6.5437;RBI=0.0314577;REFB=-0.0140822;REVB=0.00323059;RO=46;SAF=14;SAR=20;SRF=17;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0447525;STB=0.50693;TYPE=snp;VARB=0.0237369;OID=.;OPOS=33962641;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:79:46:45:34:34:20:14:17:29:20:14:18:27 chr16 33962682 . T C 122.19 PASS AO=29;DP=58;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=21;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=0.045464;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.023;QD=8.88664;RBI=0.0483875;REFB=-0.0144181;REVB=0.0165642;RO=23;SAF=6;SAR=23;SRF=5;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126387;STB=0.589402;TYPE=snp;VARB=0.0148959;OID=.;OPOS=33962682;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:55:23:28:29:27:23:6:5:18:21:6:10:18 chr16 33962697 . C T 69.84 PASS AO=8;DP=40;FAO=17;FDP=38;FR=.,HEALED;FRO=21;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=16;FWDB=-0.0664118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.9512;QD=7.35129;RBI=0.0681035;REFB=-0.0129765;REVB=0.0150849;RO=17;SAF=5;SAR=3;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.351886;STB=0.538418;TYPE=snp;VARB=0.0210094;OID=.;OPOS=33962697;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:33:38:17:21:8:17:3:5:5:12:12:5:5:16 chr16 33962709 . C G 54.03 PASS AO=11;DP=36;FAO=15;FDP=40;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.0087149;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.115;QD=5.40294;RBI=0.00875733;REFB=-0.0131913;REVB=-0.000861033;RO=25;SAF=5;SAR=6;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0167309;STB=0.571331;TYPE=snp;VARB=0.0190121;OID=.;OPOS=33962709;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:36:40:25:25:11:15:6:5:11:14:10:5:11:14 chr16 33962770 . A G 10.16 PASS AO=4;DP=16;FAO=3;FDP=15;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0118894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.659;QD=2.70902;RBI=0.0121019;REFB=-0.0177129;REVB=0.00225789;RO=11;SAF=2;SAR=2;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0492666;STB=0.57094;TYPE=snp;VARB=0.0550634;OID=.;OPOS=33962770;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:16:15:11:12:4:3:2:2:6:5:1:2:7:5 chr16 33962816 . T C 19.85 PASS AO=6;DP=17;FAO=5;FDP=16;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=-0.0121031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.766;QD=4.96296;RBI=0.0419038;REFB=0.00453725;REVB=0.0401179;RO=11;SAF=4;SAR=2;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194949;STB=0.519922;TYPE=snp;VARB=-0.0074283;OID=.;OPOS=33962816;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:17:16:11:11:6:5:2:4:9:2:1:4:9:2 chr16 33962833 . A G 11.82 PASS AO=5;DP=20;FAO=4;FDP=19;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=14;FSRR=1;FWDB=0.00263658;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.027;QD=2.48873;RBI=0.0604865;REFB=-0.00648618;REVB=0.060429;RO=15;SAF=3;SAR=2;SRF=14;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.485429;STB=0.73838;TYPE=snp;VARB=0.0155175;OID=.;OPOS=33962833;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:20:19:15:15:5:4:2:3:14:1:1:3:14:1 chr16 33962867 . C T 46.58 PASS AO=12;DP=32;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=16;FSRR=4;FWDB=0.0127512;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.371;QD=5.82224;RBI=0.0377847;REFB=-0.0238606;REVB=0.0355682;RO=20;SAF=11;SAR=1;SRF=16;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.27758;STB=0.543409;TYPE=snp;VARB=0.0269039;OID=.;OPOS=33962867;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:32:32:20:20:12:12:1:11:16:4:3:9:16:4 chr16 33962891 . A T 141.21 PASS AO=26;DP=42;FAO=25;FDP=41;FR=.;FRO=16;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=1;FWDB=0.00285435;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.302;QD=13.7768;RBI=0.0303395;REFB=-0.0036327;REVB=0.0302049;RO=16;SAF=18;SAR=8;SRF=15;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219731;STB=0.62583;TYPE=snp;VARB=0.00169583;OID=.;OPOS=33962891;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:42:41:16:16:26:25:8:18:15:1:8:17:15:1 chr16 33962907 . A T 108.17 PASS AO=25;DP=54;FAO=24;FDP=49;FR=.;FRO=25;FSAF=19;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=0.00210802;FXX=0.0754575;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.118;QD=8.83046;RBI=0.0177946;REFB=-0.0106921;REVB=-0.0176693;RO=25;SAF=20;SAR=5;SRF=18;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10288;STB=0.552012;TYPE=snp;VARB=0.00257429;OID=.;OPOS=33962907;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:49:25:25:25:24:5:20:18:7:5:19:18:7 chr16 33962910 . A G 122.26 PASS AO=28;DP=54;FAO=27;FDP=52;FR=.;FRO=25;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=-0.00396765;FXX=0.0545355;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.146;QD=9.40485;RBI=0.0325148;REFB=-0.0163022;REVB=0.0322719;RO=26;SAF=20;SAR=8;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0229464;STB=0.509459;TYPE=snp;VARB=0.0158643;OID=.;OPOS=33962910;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:52:26:25:28:27:8:20:18:8:8:19:18:7 chr16 33962918 . G A 13.44 PASS AO=12;DP=72;FAO=12;FDP=71;FR=.;FRO=59;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=38;FSRR=21;FWDB=0.00349906;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=202.047;QD=0.757353;RBI=0.00850781;REFB=-0.00347047;REVB=-0.00775496;RO=60;SAF=2;SAR=10;SRF=39;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.56493;STB=0.865248;TYPE=snp;VARB=0.00871574;OID=.;OPOS=33962918;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:72:71:60:59:12:12:10:2:39:21:10:2:38:21 chr16 33962923 . G A 60.69 PASS AO=25;DP=80;FAO=24;FDP=79;FR=.;FRO=55;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=24;FSRR=31;FWDB=-0.00655145;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.674;QD=3.07297;RBI=0.0352169;REFB=0.00723289;REVB=0.0346021;RO=55;SAF=18;SAR=7;SRF=24;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.337565;STB=0.692227;TYPE=snp;VARB=-0.00613992;OID=.;OPOS=33962923;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:80:79:55:55:25:24:7:18:24:31:7:17:24:31 chr16 33962930 . G T 67.02 PASS AO=29;DP=95;FAO=28;FDP=94;FR=.;FRO=66;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=26;FSRR=40;FWDB=0.00116977;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.951;QD=2.85212;RBI=0.0243365;REFB=-0.00641445;REVB=0.0243084;RO=66;SAF=21;SAR=8;SRF=26;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.3883;STB=0.722734;TYPE=snp;VARB=0.0204923;OID=.;OPOS=33962930;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:95:94:66:66:29:28:8:21:26:40:8:20:26:40 chr16 33962996 . T C 401.03 PASS AO=93;DP=130;FAO=77;FDP=128;FR=.;FRO=51;FSAF=32;FSAR=45;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=-0.00799522;FXX=0.0375912;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.737;QD=12.5321;RBI=0.00828785;REFB=0.00435478;REVB=0.00218288;RO=37;SAF=37;SAR=56;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106374;STB=0.522382;TYPE=snp;VARB=-0.00151535;OID=.;OPOS=33962996;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:128:37:51:93:77:56:37:22:15:45:32:24:27 chr16 33963000 . T C 453.95 PASS AO=86;DP=136;FAO=83;FDP=133;FR=.;FRO=50;FSAF=32;FSAR=51;FSRF=23;FSRR=27;FWDB=0.0127379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.29;QD=13.6525;RBI=0.0127385;REFB=0.00279329;REVB=-0.000125656;RO=49;SAF=35;SAR=51;SRF=23;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0430234;STB=0.529138;TYPE=snp;VARB=-0.00150059;OID=.;OPOS=33963000;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:133:49:50:86:83:51:35:23:26:51:32:23:27 chr16 33963002 . G A 384.52 PASS AO=37;DP=132;FAO=38;FDP=103;FR=.,HEALED;FRO=34;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=0.000763872;FXX=0.225547;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.2002;QD=14.9327;RBI=0.00178382;REFB=0.019348;REVB=0.00161199;RO=58;SAF=25;SAR=12;SRF=26;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249704;STB=0.520822;TYPE=snp;VARB=-0.0238529;OID=.;OPOS=33963002;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:103:58:34:37:38:12:25:26:32:13:25:21:13 chr16 33963015 . T C 752.81 PASS AO=145;DP=240;FAO=143;FDP=237;FR=.;FRO=94;FSAF=16;FSAR=127;FSRF=48;FSRR=46;FWDB=-0.01694;FXX=0.00836785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.88;QD=12.7057;RBI=0.0198132;REFB=-0.0189303;REVB=0.0102761;RO=92;SAF=18;SAR=127;SRF=49;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.42962;STB=0.74592;TYPE=snp;VARB=0.01292;OID=.;OPOS=33963015;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:240:237:92:94:145:143:127:18:49:43:127:16:48:46 chr16 33963020 . C A 1367.6 PASS AO=199;DP=276;FAO=213;FDP=288;FR=.;FRO=75;FSAF=28;FSAR=185;FSRF=43;FSRR=32;FWDB=0.0135563;FXX=0.00689631;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.653;QD=18.9944;RBI=0.0161732;REFB=0.00684838;REVB=0.00882043;RO=77;SAF=29;SAR=170;SRF=44;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.330574;STB=0.683702;TYPE=snp;VARB=-0.000812831;OID=.;OPOS=33963020;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:276:288:77:75:199:213:170:29:44:33:185:28:43:32 chr16 33963046 . T C 2511.05 PASS AO=489;DP=583;FAO=336;FDP=398;FR=.;FRO=62;FSAF=89;FSAR=247;FSRF=27;FSRR=35;FWDB=-0.0162667;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.461;QD=25.2367;RBI=0.031463;REFB=0.00106338;REVB=0.0269317;RO=89;SAF=127;SAR=362;SRF=41;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0732839;STB=0.533058;TYPE=snp;VARB=-0.000225636;OID=.;OPOS=33963046;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:583:398:89:62:489:336:362:127:41:48:247:89:27:35 chr16 33963086 . A G 2998.59 PASS AO=659;DP=720;FAO=362;FDP=399;FR=.;FRO=37;FSAF=87;FSAR=275;FSRF=9;FSRR=28;FWDB=0.0204642;FXX=0.00249994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.4594;QD=30.061;RBI=0.0296262;REFB=0.00359762;REVB=-0.0214227;RO=60;SAF=149;SAR=510;SRF=17;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0128864;STB=0.50037;TYPE=snp;VARB=-0.00218003;OID=.;OPOS=33963086;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:720:399:60:37:659:362:510:149:17:43:275:87:9:28 chr16 33963106 . T C 3550.39 PASS AO=651;DP=673;FAO=388;FDP=399;FR=.;FRO=11;FSAF=88;FSAR=300;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.0247412;FXX=0.00249994;HRUN=3;LEN=1;MLLD=245.32;QD=35.5929;RBI=0.026191;REFB=-0.0375358;REVB=0.00859314;RO=14;SAF=151;SAR=500;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0110171;STB=0.505346;TYPE=snp;VARB=0.000374845;OID=.;OPOS=33963106;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:673:399:14:11:651:388:500:151:6:8:300:88:4:7 chr16 33963108 . A G 3319.82 PASS AO=635;DP=674;FAO=378;FDP=399;FR=.;FRO=21;FSAF=93;FSAR=285;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.0168012;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.089;QD=33.2814;RBI=0.0232399;REFB=-0.00508424;REVB=0.0160565;RO=37;SAF=144;SAR=491;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0263042;STB=0.506153;TYPE=snp;VARB=0.000549812;OID=.;OPOS=33963108;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:674:399:37:21:635:378:491:144:15:22:285:93:7:14 chr16 33963175 . C G 3649.3 PASS AO=477;DP=493;FAO=390;FDP=390;FR=.;FRO=0;FSAF=99;FSAR=291;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00802822;FXX=0.0249994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.246;QD=37.4287;RBI=0.0186473;REFB=0.0263443;REVB=-0.0168306;RO=11;SAF=117;SAR=360;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0036937;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.37314e-06;OID=.;OPOS=33963175;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:493:390:11:0:477:390:360:117:2:9:291:99:0:0 chr16 33963202 . A G 2380.95 PASS AO=258;DP=262;FAO=254;FDP=254;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=191;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0158691;FXX=0.0155033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.769;QD=37.4953;RBI=0.020838;REFB=0.00463111;REVB=-0.0135053;RO=3;SAF=63;SAR=195;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00264199;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000108175;OID=.;OPOS=33963202;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:262:254:3:0:258:254:195:63:1:2:191:63:0:0 chr16 33963210 . A G 1710.92 PASS AO=193;DP=200;FAO=190;FDP=197;FR=.;FRO=7;FSAF=53;FSAR=137;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.00617467;FXX=0.00505025;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.6745;QD=34.7395;RBI=0.0199799;REFB=-0.0812914;REVB=0.0190019;RO=7;SAF=53;SAR=140;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0110701;STB=0.506042;TYPE=snp;VARB=0.00246809;OID=.;OPOS=33963210;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:200:197:7:7:193:190:140:53:1:6:137:53:1:6 chr16 33963211 . T C 1809.46 PASS AO=196;DP=200;FAO=192;FDP=192;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=139;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190481;FXX=0.0253794;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.9122;QD=37.6971;RBI=0.0247654;REFB=-0.0167786;REVB=0.015827;RO=2;SAF=53;SAR=143;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00558134;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000619713;OID=.;OPOS=33963211;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:200:192:2:0:196:192:143:53:1:1:139:53:0:0 chr16 33963224 . T C 1383.78 PASS AO=152;DP=155;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0359133;FXX=0.0199987;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.871;QD=37.6539;RBI=0.0406911;REFB=0.0141759;REVB=0.0191311;RO=2;SAF=63;SAR=89;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00217565;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.31565e-05;OID=.;OPOS=33963224;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:155:147:2:0:152:147:89:63:1:1:86:61:0:0 chr16 33963248 . T C 876.13 PASS AO=118;DP=132;FAO=109;FDP=122;FR=.;FRO=13;FSAF=54;FSAR=55;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.00936232;FXX=0.00812942;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.388;QD=28.7254;RBI=0.0261163;REFB=-0.0377178;REVB=0.0243805;RO=13;SAF=57;SAR=61;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0329967;STB=0.520008;TYPE=snp;VARB=0.00362172;OID=.;OPOS=33963248;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:132:122:13:13:118:109:61:57:4:9:55:54:4:9 chr16 33963279 . T C 1330.16 PASS AO=181;DP=190;FAO=162;FDP=180;FR=.;FRO=18;FSAF=112;FSAR=50;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.0620844;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.0727;QD=29.559;RBI=0.106669;REFB=0.0316849;REVB=0.0867404;RO=7;SAF=122;SAR=59;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00824026;STB=0.509333;TYPE=snp;VARB=-0.0122243;OID=.;OPOS=33963279;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:190:180:7:18:181:162:59:122:4:3:50:112:11:7 chr16 33963283 . C CGG 1079.75 PASS AO=141;DP=204;FAO=148;FDP=154;FR=.;FRO=6;FSAF=104;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.062603;FXX=0.124993;HRUN=2;LEN=2;MLLD=37.5721;QD=28.0454;RBI=0.101196;REFB=-0.0259109;REVB=0.0795082;RO=33;SAF=98;SAR=43;SRF=23;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000815239;STB=0.524492;TYPE=ins;VARB=0.0009719;OID=.;OPOS=33963284;OREF=-;OALT=GG;OMAPALT=CGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:141:204:148:154:6:104:44:1:5:54:33:98:43:23:10 chr16 33963289 . A G 1961.15 PASS AO=225;DP=235;FAO=215;FDP=215;FR=.;FRO=0;FSAF=163;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000981061;FXX=0.0444425;HRUN=3;LEN=1;MLLD=156.887;QD=36.4865;RBI=0.0253275;REFB=-0.0470406;REVB=0.0253085;RO=7;SAF=167;SAR=58;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0336513;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.51882e-05;OID=.;OPOS=33963289;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:235:215:7:0:225:215:58:167:2:5:52:163:0:0 chr16 33963329 . T C 1944.15 PASS AO=248;DP=278;FAO=241;FDP=269;FR=.;FRO=28;FSAF=193;FSAR=48;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=-0.0150457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.8096;QD=28.9093;RBI=0.0547134;REFB=0.0254412;REVB=0.0526041;RO=27;SAF=197;SAR=51;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0652203;STB=0.54111;TYPE=snp;VARB=-0.00622806;OID=.;OPOS=33963329;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:278:269:27:28:248:241:51:197:15:12:48:193:15:13 chr16 33963332 . A G 2332.57 PASS AO=286;DP=307;FAO=273;FDP=293;FR=.;FRO=20;FSAF=221;FSAR=52;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.0068776;FXX=0.00340124;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.86;QD=31.844;RBI=0.00718653;REFB=0.0013756;REVB=-0.00208443;RO=20;SAF=228;SAR=58;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0369921;STB=0.522539;TYPE=snp;VARB=-0.000135101;OID=.;OPOS=33963332;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:307:293:20:20:286:273:58:228:12:8:52:221:12:8 chr16 33963395 . A T 922.38 PASS AO=159;DP=193;FAO=146;FDP=179;FR=.;FRO=33;FSAF=97;FSAR=49;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.0883095;FXX=0.118221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.428;QD=20.6119;RBI=0.117339;REFB=-0.0830626;REVB=0.0772649;RO=33;SAF=107;SAR=52;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0461322;STB=0.524188;TYPE=snp;VARB=0.0616208;OID=.;OPOS=33963395;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:193:179:33:33:159:146:52:107:18:15:49:97:18:15 chr16 33963396 . T C 1089.99 PASS AO=180;DP=227;FAO=160;FDP=202;FR=.;FRO=42;FSAF=106;FSAR=54;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=0.00939275;FXX=0.00492587;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.008;QD=21.5841;RBI=0.0121737;REFB=-0.0213891;REVB=0.00774444;RO=44;SAF=119;SAR=61;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0739418;STB=0.531576;TYPE=snp;VARB=0.00366353;OID=.;OPOS=33963396;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:227:202:44:42:180:160:61:119:21:23:54:106:22:20 chr16 33963424 . A G 1098.06 PASS AO=173;DP=223;FAO=164;FDP=214;FR=.;FRO=50;FSAF=89;FSAR=75;FSRF=28;FSRR=22;FWDB=-0.0187756;FXX=0.00465095;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.724;QD=20.5245;RBI=0.0390962;REFB=0.0114959;REVB=0.0342928;RO=49;SAF=89;SAR=84;SRF=28;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0236991;STB=0.504078;TYPE=snp;VARB=-0.001207;OID=.;OPOS=33963424;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:223:214:49:50:173:164:84:89:28:21:75:89:28:22 chr16 33963427 . T C 960.51 PASS AO=145;DP=213;FAO=152;FDP=205;FR=.;FRO=53;FSAF=90;FSAR=62;FSRF=28;FSRR=25;FWDB=-0.030586;FXX=0.0375569;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.084;QD=18.7417;RBI=0.0569287;REFB=-0.0103044;REVB=0.0480143;RO=41;SAF=91;SAR=54;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0398747;STB=0.516966;TYPE=snp;VARB=0.0015153;OID=.;OPOS=33963427;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:213:205:41:53:145:152:54:91:22:19:62:90:28:25 chr16 33963437 . T C 1535.75 PASS AO=240;DP=298;FAO=218;FDP=272;FR=.;FRO=54;FSAF=97;FSAR=121;FSRF=27;FSRR=27;FWDB=0.0552318;FXX=0.007299;HRUN=3;LEN=1;MLLD=67.7604;QD=22.5846;RBI=0.0568559;REFB=-0.0235037;REVB=0.0134924;RO=53;SAF=107;SAR=133;SRF=28;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0284131;STB=0.511034;TYPE=snp;VARB=0.0188878;OID=.;OPOS=33963437;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:298:272:53:54:240:218:133:107:28:25:121:97:27:27 chr16 33963445 . A G 1824 PASS AO=273;DP=330;FAO=250;FDP=306;FR=.;FRO=56;FSAF=100;FSAR=150;FSRF=31;FSRR=25;FWDB=-0.0510096;FXX=0.00325722;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.426;QD=23.8431;RBI=0.0514234;REFB=0.0114917;REVB=-0.00651042;RO=55;SAF=111;SAR=162;SRF=31;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0510573;STB=0.528934;TYPE=snp;VARB=-0.00319564;OID=.;OPOS=33963445;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:330:306:55:56:273:250:162:111:31:24:150:100:31:25 chr16 33963479 . T A 1089.64 PASS AO=201;DP=299;FAO=186;FDP=278;FR=.;FRO=92;FSAF=29;FSAR=157;FSRF=42;FSRR=50;FWDB=0.00164795;FXX=0.0176672;HRUN=3;LEN=1;MLLD=155.585;QD=15.6783;RBI=0.0071405;REFB=-0.0006354;REVB=0.00694773;RO=93;SAF=37;SAR=164;SRF=43;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229264;STB=0.649952;TYPE=snp;VARB=0.000822913;OID=.;OPOS=33963479;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:299:278:93:92:201:186:164:37:43:50:157:29:42:50 chr16 33963480 . T C 1385.63 PASS AO=224;DP=297;FAO=208;FDP=276;FR=.;FRO=68;FSAF=35;FSAR=173;FSRF=34;FSRR=34;FWDB=0.0192184;FXX=0.017793;HRUN=3;LEN=1;MLLD=86.4146;QD=20.0815;RBI=0.0444704;REFB=-0.0183682;REVB=0.0401033;RO=65;SAF=44;SAR=180;SRF=33;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183002;STB=0.622289;TYPE=snp;VARB=0.0153739;OID=.;OPOS=33963480;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:297:276:65:68:224:208:180:44:33:32:173:35:34:34 chr16 33963490 . T C 984.73 PASS AO=186;DP=279;FAO=172;FDP=262;FR=.;FRO=90;FSAF=32;FSAR=140;FSRF=41;FSRR=49;FWDB=-0.0205966;FXX=0.00757547;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.028;QD=15.0341;RBI=0.0572343;REFB=-0.0201443;REVB=0.0533998;RO=88;SAF=40;SAR=146;SRF=40;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187167;STB=0.628211;TYPE=snp;VARB=0.0125035;OID=.;OPOS=33963490;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:279:262:88:90:186:172:146:40:40:48:140:32:41:49 chr16 33963528 . T C 691.37 PASS AO=130;DP=204;FAO=125;FDP=198;FR=.;FRO=73;FSAF=24;FSAR=101;FSRF=48;FSRR=25;FWDB=-0.00781795;FXX=0.019801;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.5;QD=13.9671;RBI=0.0373903;REFB=-0.00508791;REVB=0.0365639;RO=72;SAF=28;SAR=102;SRF=48;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.345431;STB=0.706257;TYPE=snp;VARB=0.00492756;OID=.;OPOS=33963528;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:198:72:73:130:125:102:28:48:24:101:24:48:25 chr16 33963563 . G C 421.59 PASS AO=93;DP=164;FAO=87;FDP=157;FR=.;FRO=70;FSAF=24;FSAR=63;FSRF=49;FSRR=21;FWDB=0.00708247;FXX=0.0125778;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.889;QD=10.7411;RBI=0.0284136;REFB=-0.00154615;REVB=0.0275168;RO=69;SAF=27;SAR=66;SRF=49;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.336829;STB=0.695192;TYPE=snp;VARB=0.00144902;OID=.;OPOS=33963563;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:157:69:70:93:87:66:27:49:20:63:24:49:21 chr16 33963571 . T C 208.75 PASS AO=61;DP=127;FAO=55;FDP=123;FR=.;FRO=68;FSAF=21;FSAR=34;FSRF=49;FSRR=19;FWDB=0.0175658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.457;QD=6.78861;RBI=0.0199111;REFB=-0.00104474;REVB=0.00937537;RO=65;SAF=25;SAR=36;SRF=46;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.27234;STB=0.6813;TYPE=snp;VARB=0.00208727;OID=.;OPOS=33963571;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:123:65:68:61:55:36:25:46:19:34:21:49:19 chr16 33963591 . T C 27.58 PASS AO=24;DP=90;FAO=18;FDP=84;FR=.;FRO=66;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=52;FSRR=14;FWDB=-0.0141818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.325;QD=1.31313;RBI=0.0323808;REFB=-0.0119777;REVB=0.02911;RO=66;SAF=13;SAR=11;SRF=52;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.320465;STB=0.692563;TYPE=snp;VARB=0.0424422;OID=.;OPOS=33963591;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:90:84:66:66:24:18:11:13:52:14:8:10:52:14 chr16 33963595 . A G 48.24 PASS AO=26;DP=80;FAO=21;FDP=75;FR=.;FRO=54;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=43;FSRR=11;FWDB=0.0243034;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.5991;QD=2.57287;RBI=0.0733615;REFB=0.00301364;REVB=-0.0692189;RO=54;SAF=14;SAR=12;SRF=43;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.314327;STB=0.673331;TYPE=snp;VARB=-0.00872203;OID=.;OPOS=33963595;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:80:75:54:54:26:21:12:14:43:11:9:12:43:11 chr16 33963597 . C T 50.37 PASS AO=26;DP=78;FAO=21;FDP=73;FR=.;FRO=52;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=40;FSRR=12;FWDB=-0.0115012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.7815;QD=2.76011;RBI=0.0324657;REFB=-0.00959826;REVB=-0.0303603;RO=52;SAF=15;SAR=11;SRF=40;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23827;STB=0.619781;TYPE=snp;VARB=0.0218551;OID=.;OPOS=33963597;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:78:73:52:52:26:21:11:15:40:12:8:13:40:12 chr16 33963605 . T C 188.1 PASS AO=49;DP=96;FAO=44;FDP=91;FR=.;FRO=47;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=38;FSRR=9;FWDB=0.00212752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.489;QD=8.26818;RBI=0.00588428;REFB=-0.00447703;REVB=0.0054862;RO=47;SAF=29;SAR=20;SRF=38;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208746;STB=0.611465;TYPE=snp;VARB=0.00264821;OID=.;OPOS=33963605;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:91:47:47:49:44:20:29:38:9:17:27:38:9 chr16 33963624 . T C 135.76 PASS AO=48;DP=118;FAO=43;FDP=114;FR=.;FRO=71;FSAF=29;FSAR=14;FSRF=55;FSRR=16;FWDB=-0.00180989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.106;QD=4.76348;RBI=0.00201951;REFB=-0.00258783;REVB=-0.000895942;RO=69;SAF=30;SAR=18;SRF=54;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186925;STB=0.574748;TYPE=snp;VARB=0.0107168;OID=.;OPOS=33963624;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:114:69:71:48:43:18:30:54:15:14:29:55:16 chr16 33963636 . A G 193.63 PASS AO=57;DP=128;FAO=53;FDP=124;FR=.;FRO=71;FSAF=39;FSAR=14;FSRF=53;FSRR=18;FWDB=-0.00336561;FXX=0.0158718;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.027;QD=6.24619;RBI=0.0268447;REFB=-0.0291396;REVB=0.0266329;RO=70;SAF=41;SAR=16;SRF=52;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0292832;STB=0.507883;TYPE=snp;VARB=0.00697336;OID=.;OPOS=33963636;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:124:70:71:57:53:16:41:52:18:14:39:53:18 chr16 33963637 . A G 189.43 PASS AO=59;DP=130;FAO=53;FDP=124;FR=.;FRO=71;FSAF=39;FSAR=14;FSRF=53;FSRR=18;FWDB=0.00486755;FXX=0.0158718;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.238;QD=6.11071;RBI=0.0193152;REFB=-0.0343888;REVB=0.0186918;RO=69;SAF=42;SAR=17;SRF=52;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0506368;STB=0.507883;TYPE=snp;VARB=0.00658687;OID=.;OPOS=33963637;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:124:69:71:59:53:17:42:52:17:14:39:53:18 chr16 33963653 . GGGTTTTTA G 98.75 PASS AO=36;DP=114;FAO=38;FDP=84;FR=.;FRO=46;FSAF=35;FSAR=3;FSRF=33;FSRR=13;FWDB=-0.0127131;FXX=0.159984;HRUN=3;LEN=8;MLLD=278.987;QD=4.70222;RBI=0.0280394;REFB=0.00313647;REVB=-0.0249917;RO=34;SAF=34;SAR=2;SRF=26;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.416386;STB=0.732826;TYPE=del;VARB=-0.00332639;OID=.;OPOS=33963654;OREF=GGTTTTTA;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:36:93:38:84:46:35:3:33:13:98:34:34:2:26:8 chr16 33963678 . C T 563.76 PASS AO=88;DP=130;FAO=93;FDP=136;FR=.;FRO=43;FSAF=63;FSAR=30;FSRF=12;FSRR=31;FWDB=-0.00899391;FXX=0.00729874;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.372;QD=16.5812;RBI=0.0153247;REFB=-0.0182247;REVB=-0.012408;RO=41;SAF=63;SAR=25;SRF=12;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.268066;STB=0.630695;TYPE=snp;VARB=0.0112634;OID=.;OPOS=33963678;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:136:41:43:88:93:25:63:12:29:30:63:12:31 chr16 33963708 . G A 141.88 PASS AO=50;DP=150;FAO=53;FDP=156;FR=.;FRO=103;FSAF=48;FSAR=5;FSRF=40;FSRR=63;FWDB=0.00688203;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.87;QD=3.63787;RBI=0.0110084;REFB=-0.00695923;REVB=0.00859203;RO=100;SAF=47;SAR=3;SRF=41;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.709808;STB=0.881052;TYPE=snp;VARB=0.0332402;OID=.;OPOS=33963708;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:156:100:103:50:53:3:47:41:59:5:48:40:63 chr16 33963709 . T C 163.61 PASS AO=53;DP=149;FAO=56;FDP=155;FR=.;FRO=99;FSAF=51;FSAR=5;FSRF=38;FSRR=61;FWDB=0.0283863;FXX=0.00640985;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.3423;QD=4.22229;RBI=0.0425834;REFB=0.00271331;REVB=-0.0317422;RO=93;SAF=50;SAR=3;SRF=37;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.71994;STB=0.88308;TYPE=snp;VARB=-0.00386489;OID=.;OPOS=33963709;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:155:93:99:53:56:3:50:37:56:5:51:38:61 chr16 33963722 . C G 57.92 PASS AO=40;DP=175;FAO=40;FDP=174;FR=.;FRO=134;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=84;FSRR=50;FWDB=0.0288083;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.676;QD=1.33141;RBI=0.0415085;REFB=-0.00278511;REVB=-0.0298837;RO=135;SAF=16;SAR=24;SRF=85;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.284578;STB=0.669562;TYPE=snp;VARB=0.0156067;OID=.;OPOS=33963722;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:175:174:135:134:40:40:24:16:85:50:24:16:84:50 chr16 33963732 . A C 66.39 PASS AO=41;DP=169;FAO=41;FDP=168;FR=.;FRO=127;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=82;FSRR=45;FWDB=-0.0227882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.062;QD=1.58066;RBI=0.0228305;REFB=-0.0093987;REVB=0.0013888;RO=126;SAF=15;SAR=26;SRF=81;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.336914;STB=0.703002;TYPE=snp;VARB=0.0164773;OID=.;OPOS=33963732;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:169:168:126:127:41:41:26:15:81:45:26:15:82:45 chr16 33963737 . G A 66.62 PASS AO=39;DP=158;FAO=39;FDP=157;FR=.;FRO=118;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=73;FSRR=45;FWDB=-0.0120964;FXX=0.0125778;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.826;QD=1.69737;RBI=0.0136256;REFB=-0.000816699;REVB=-0.00627177;RO=97;SAF=15;SAR=24;SRF=63;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.31239;STB=0.671031;TYPE=snp;VARB=0.00288276;OID=.;OPOS=33963737;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:158:157:97:118:39:39:24:15:63:34:24:15:73:45 chr16 33963738 . C T 111.68 PASS AO=43;DP=137;FAO=43;FDP=132;FR=.;FRO=89;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=60;FSRR=29;FWDB=0.0160942;FXX=0.164547;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.199;QD=3.38428;RBI=0.0265958;REFB=0.00577403;REVB=-0.0211734;RO=90;SAF=16;SAR=27;SRF=61;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.34592;STB=0.695979;TYPE=snp;VARB=-0.00786379;OID=.;OPOS=33963738;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:132:90:89:43:43:27:16:61:29:27:16:60:29 chr16 33963758 . T C 67.65 PASS AO=34;DP=126;FAO=34;FDP=126;FR=.;FRO=92;FSAF=27;FSAR=7;FSRF=39;FSRR=53;FWDB=0.0182712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.575;QD=2.14775;RBI=0.0197404;REFB=0.000590137;REVB=-0.00747325;RO=91;SAF=27;SAR=7;SRF=39;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.459802;STB=0.77793;TYPE=snp;VARB=-0.00136718;OID=.;OPOS=33963758;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:126:126:91:92:34:34:7:27:39:52:7:27:39:53 chr16 33963769 . C A 280.86 PASS AO=51;DP=82;FAO=51;FDP=82;FR=.;FRO=31;FSAF=19;FSAR=32;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=-0.0157602;FXX=0.0120467;HRUN=5;LEN=1;MLLD=270.533;QD=13.7003;RBI=0.0160358;REFB=0.00170356;REVB=0.00296012;RO=31;SAF=19;SAR=32;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0344025;STB=0.518736;TYPE=snp;VARB=-0.000968213;OID=.;OPOS=33963769;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:31:31:51:51:32:19:13:18:32:19:13:18 chr16 33963775 . G C 210.68 PASS AO=25;DP=84;FAO=25;FDP=63;FR=.,HEALED;FRO=21;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.00162137;FXX=0.258793;HRUN=3;LEN=1;MLLD=21.7601;QD=13.3766;RBI=0.0995764;REFB=-0.0355143;REVB=0.0995632;RO=20;SAF=9;SAR=16;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.052929;STB=0.513297;TYPE=snp;VARB=0.0245881;OID=.;OPOS=33963775;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:60:63:20:21:25:25:16:9:6:14:16:9:7:14 chr16 33963783 . G C,T 667.49 PASS AO=25,68;DP=115;FAO=24,72;FDP=119;FR=.;FRO=23;FSAF=6,27;FSAR=18,45;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.0140269,0.0140418;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=107.437,149.512;QD=22.4366;RBI=0.0163533,0.0155725;REFB=0.0115507,0.0137238;REVB=0.00840691,-0.00673266;RO=22;SAF=6,25;SAR=19,43;SRF=8;SRR=14;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.130357,0.00196794;STB=0.559948,0.50704;TYPE=snp,snp;VARB=0.00316846,-0.00303459;OID=.,.;OPOS=33963783,33963783;OREF=G,G;OALT=C,T;OMAPALT=C,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:43:115:119:22:23:25,68:24,72:19,43:6,25:8:14:18,45:6,27:8:15 chr16 33963788 . A C 13.46 PASS AO=22;DP=143;FAO=22;FDP=146;FR=.;FRO=124;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=33;FSRR=91;FWDB=0.00358096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.594;QD=0.368705;RBI=0.0051199;REFB=-0.00165491;REVB=-0.00365925;RO=120;SAF=11;SAR=11;SRF=31;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.320267;STB=0.698478;TYPE=snp;VARB=0.00865207;OID=.;OPOS=33963788;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:143:146:120:124:22:22:11:11:31:89:11:11:33:91 chr16 33963809 . G C 947.15 PASS AO=138;DP=182;FAO=141;FDP=185;FR=.;FRO=44;FSAF=33;FSAR=108;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=0.0109485;FXX=0.0106946;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2337;QD=20.4789;RBI=0.101079;REFB=-0.0502648;REVB=0.100484;RO=41;SAF=31;SAR=107;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147746;STB=0.567847;TYPE=snp;VARB=0.0182254;OID=.;OPOS=33963809;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:182:185:41:44:138:141:107:31:20:21:108:33:20:24 chr16 33963817 . G A 559.63 PASS AO=132;DP=243;FAO=126;FDP=241;FR=.;FRO=115;FSAF=38;FSAR=88;FSRF=48;FSRR=67;FWDB=0.00238601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.027;QD=9.28839;RBI=0.0213849;REFB=-0.00535007;REVB=-0.0212513;RO=103;SAF=42;SAR=90;SRF=44;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0971654;STB=0.562332;TYPE=snp;VARB=0.00480574;OID=.;OPOS=33963817;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:243:241:103:115:132:126:90:42:44:59:88:38:48:67 chr16 33963822 . A G 928.59 PASS AO=180;DP=282;FAO=174;FDP=283;FR=.;FRO=109;FSAF=59;FSAR=115;FSRF=48;FSRR=61;FWDB=-0.00400076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.827;QD=13.1249;RBI=0.0385218;REFB=-0.00308376;REVB=-0.0383134;RO=102;SAF=63;SAR=117;SRF=46;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0727741;STB=0.542328;TYPE=snp;VARB=0.00265445;OID=.;OPOS=33963822;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:282:283:102:109:180:174:117:63:46:56:115:59:48:61 chr16 33963840 . C CCGTT 1806.28 PASS AO=291;DP=427;FAO=281;FDP=385;FR=.;FRO=104;FSAF=123;FSAR=158;FSRF=48;FSRR=56;FWDB=-0.00950522;FXX=0.0374991;HRUN=2;LEN=4;MLLD=233.291;QD=18.7665;RBI=0.021878;REFB=0.00640987;REVB=-0.0197052;RO=106;SAF=131;SAR=160;SRF=50;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108902;STB=0.506524;TYPE=ins;VARB=-0.00266965;OID=.;OPOS=33963841;OREF=-;OALT=CGTT;OMAPALT=CCGTT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:291:427:281:385:104:123:158:48:56:99:106:131:160:50:56 chr16 33963855 . T C 2544.96 PASS AO=578;DP=691;FAO=336;FDP=398;FR=.;FRO=62;FSAF=118;FSAR=218;FSRF=25;FSRR=37;FWDB=0.00738955;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.715;QD=25.5775;RBI=0.0428143;REFB=-0.0494491;REVB=0.0421718;RO=102;SAF=207;SAR=371;SRF=48;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0344067;STB=0.508846;TYPE=snp;VARB=0.0100738;OID=.;OPOS=33963855;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:691:398:102:62:578:336:371:207:48:54:218:118:25:37 chr16 33963875 . A G 3391.21 PASS AO=802;DP=829;FAO=381;FDP=392;FR=.;FRO=11;FSAF=150;FSAR=231;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=-0.0228426;FXX=0.0199995;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.65;QD=34.6042;RBI=0.0488863;REFB=0.0488621;REVB=-0.0432214;RO=24;SAF=335;SAR=467;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0117912;STB=0.509762;TYPE=snp;VARB=0.00173263;OID=.;OPOS=33963875;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:829:392:24:11:802:381:467:335:15:9:231:150:8:3 chr16 33963881 . C G 2912.58 PASS AO=835;DP=945;FAO=358;FDP=399;FR=.;FRO=41;FSAF=135;FSAR=223;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=0.00741681;FXX=0.00249994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.7371;QD=29.1988;RBI=0.0649054;REFB=0.0144915;REVB=-0.0644803;RO=105;SAF=319;SAR=516;SRF=47;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0146898;STB=0.509396;TYPE=snp;VARB=-0.00199439;OID=.;OPOS=33963881;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:945:399:105:41:835:358:516:319:47:58:223:135:19:22 chr16 33963912 . T C 3365.27 PASS AO=1092;DP=1155;FAO=380;FDP=399;FR=.;FRO=19;FSAF=156;FSAR=224;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.0173282;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.728;QD=33.7371;RBI=0.0431014;REFB=-0.0872556;REVB=0.0394647;RO=55;SAF=425;SAR=667;SRF=30;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149762;STB=0.50826;TYPE=snp;VARB=0.00345614;OID=.;OPOS=33963912;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:1155:399:55:19:1092:380:667:425:30:25:224:156:11:8 chr16 33963961 . C G 3260.71 PASS AO=1102;DP=1184;FAO=377;FDP=377;FR=.;FRO=0;FSAF=138;FSAR=239;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0178443;FXX=0.0574986;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.807;QD=34.5964;RBI=0.0204665;REFB=-0.0267244;REVB=-0.0100229;RO=63;SAF=419;SAR=683;SRF=30;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104706;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.46403e-05;OID=.;OPOS=33963961;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:1184:377:63:0:1102:377:683:419:30:33:239:138:0:0 chr16 33963975 . A G 3084.56 PASS AO=1048;DP=1152;FAO=367;FDP=400;FR=.;FRO=33;FSAF=130;FSAR=237;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=-0.0154688;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=277.448;QD=30.8456;RBI=0.0162601;REFB=-0.0150847;REVB=0.00501077;RO=102;SAF=405;SAR=643;SRF=41;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00275916;STB=0.50629;TYPE=snp;VARB=0.000846472;OID=.;OPOS=33963975;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:1152:400:102:33:1048:367:643:405:41:61:237:130:14:19 chr16 33963991 . A G 3183.95 PASS AO=951;DP=1013;FAO=372;FDP=400;FR=.;FRO=28;FSAF=155;FSAR=217;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.0206207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.03;QD=31.8395;RBI=0.0241756;REFB=-0.049069;REVB=-0.0126194;RO=62;SAF=389;SAR=562;SRF=25;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000701926;STB=0.508547;TYPE=snp;VARB=0.00347909;OID=.;OPOS=33963991;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:1013:400:62:28:951:372:562:389:25:37:217:155:15:13 chr16 33964017 . A G 832.62 PASS AO=670;DP=749;FAO=126;FDP=169;FR=.;FRO=43;FSAF=24;FSAR=102;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=0.0450372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.9821;QD=19.707;RBI=0.0455999;REFB=-0.0391;REVB=0.00714148;RO=66;SAF=271;SAR=399;SRF=36;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0248346;STB=0.613795;TYPE=snp;VARB=0.00897642;OID=.;OPOS=33964017;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:749:169:66:43:670:126:399:271:36:30:102:24:22:21 chr16 33964064 . T C 1271.49 PASS AO=263;DP=372;FAO=215;FDP=318;FR=.;FRO=103;FSAF=28;FSAR=187;FSRF=45;FSRR=58;FWDB=0.0198382;FXX=0.012422;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.5708;QD=15.9936;RBI=0.0200084;REFB=-0.0378889;REVB=0.00260444;RO=100;SAF=28;SAR=235;SRF=47;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.344534;STB=0.665527;TYPE=snp;VARB=0.0101668;OID=.;OPOS=33964064;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:372:318:100:103:263:215:235:28:47:53:187:28:45:58 chr16 33964070 . A G 668.87 PASS AO=240;DP=347;FAO=179;FDP=284;FR=.;FRO=105;FSAF=4;FSAR=175;FSRF=42;FSRR=63;FWDB=0.00594906;FXX=0.0926488;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.058;QD=9.42075;RBI=0.0554315;REFB=-0.0401658;REVB=0.0551113;RO=102;SAF=26;SAR=214;SRF=45;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.338348;STB=0.894178;TYPE=snp;VARB=0.0976568;OID=.;OPOS=33964070;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:347:284:102:105:240:179:214:26:45:57:175:4:42:63 chr16 33964071 . G C 1178.67 PASS AO=234;DP=344;FAO=205;FDP=311;FR=.;FRO=106;FSAF=27;FSAR=178;FSRF=45;FSRR=61;FWDB=-0.00311179;FXX=0.00320503;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.321;QD=15.1598;RBI=0.0289288;REFB=-0.0248161;REVB=-0.0287609;RO=107;SAF=27;SAR=207;SRF=47;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.332085;STB=0.665091;TYPE=snp;VARB=0.00328504;OID=.;OPOS=33964071;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:344:311:107:106:234:205:207:27:47:60:178:27:45:61 chr16 33964082 . T C 1130.25 PASS AO=208;DP=319;FAO=199;FDP=305;FR=.;FRO=106;FSAF=29;FSAR=170;FSRF=47;FSRR=59;FWDB=-0.0163722;FXX=0.00326787;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.508;QD=14.823;RBI=0.0240372;REFB=0.0103006;REVB=-0.0175994;RO=105;SAF=26;SAR=182;SRF=48;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.339247;STB=0.660479;TYPE=snp;VARB=-0.0101983;OID=.;OPOS=33964082;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:319:305:105:106:208:199:182:26:48:57:170:29:47:59 chr16 33964091 . T C 2067.69 PASS AO=225;DP=254;FAO=261;FDP=291;FR=.;FRO=30;FSAF=52;FSAR=209;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=0.0880284;FXX=0.00342454;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.546;QD=28.4219;RBI=0.0880842;REFB=-0.0507244;REVB=0.00313528;RO=28;SAF=14;SAR=211;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.332678;STB=0.560059;TYPE=snp;VARB=0.00351061;OID=.;OPOS=33964091;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:254:291:28:30:225:261:211:14:17:11:209:52:18:12 chr16 33964108 . G C 550.31 PASS AO=138;DP=276;FAO=134;FDP=274;FR=.;FRO=140;FSAF=29;FSAR=105;FSRF=46;FSRR=94;FWDB=-0.00191748;FXX=0.00724611;HRUN=5;LEN=1;MLLD=110.99;QD=8.03365;RBI=0.00964821;REFB=-0.0226602;REVB=0.00945575;RO=138;SAF=29;SAR=109;SRF=43;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127217;STB=0.57708;TYPE=snp;VARB=0.0152755;OID=.;OPOS=33964108;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:276:274:138:140:138:134:109:29:43:95:105:29:46:94 chr16 33964119 . A G 51.15 PASS AO=52;DP=270;FAO=52;FDP=263;FR=.;FRO=211;FSAF=17;FSAR=35;FSRF=58;FSRR=153;FWDB=-0.00104423;FXX=0.00378774;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.432;QD=0.777946;RBI=0.00214802;REFB=-0.000731705;REVB=-0.00187712;RO=216;SAF=17;SAR=35;SRF=58;SRR=158;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0897329;STB=0.549029;TYPE=snp;VARB=0.00379849;OID=.;OPOS=33964119;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:270:263:216:211:52:52:35:17:58:158:35:17:58:153 chr16 33964134 . G C 295.51 PASS AO=96;DP=231;FAO=90;FDP=224;FR=.;FRO=134;FSAF=22;FSAR=68;FSRF=45;FSRR=89;FWDB=-0.0338876;FXX=0.00444425;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.318;QD=5.27697;RBI=0.0342216;REFB=-0.000906577;REVB=0.0047697;RO=134;SAF=22;SAR=74;SRF=45;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142698;STB=0.568773;TYPE=snp;VARB=0.00174447;OID=.;OPOS=33964134;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:231:224:134:134:96:90:74:22:45:89:68:22:45:89 chr16 33964143 . T C 198.42 PASS AO=84;DP=222;FAO=74;FDP=215;FR=.;FRO=141;FSAF=17;FSAR=57;FSRF=51;FSRR=90;FWDB=-0.104089;FXX=0.00921617;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.0472;QD=3.69157;RBI=0.153461;REFB=-0.00885499;REVB=-0.112764;RO=136;SAF=21;SAR=63;SRF=46;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119399;STB=0.607969;TYPE=snp;VARB=0.0114215;OID=.;OPOS=33964143;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:215:136:141:84:74:63:21:46:90:57:17:51:90 chr16 33964153 . G T 106.74 PASS AO=55;DP=208;FAO=56;FDP=205;FR=.;FRO=149;FSAF=20;FSAR=36;FSRF=51;FSRR=98;FWDB=0.00496178;FXX=0.00485413;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.658;QD=2.08272;RBI=0.00710197;REFB=-0.0036578;REVB=-0.00508121;RO=151;SAF=19;SAR=36;SRF=50;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0197624;STB=0.511837;TYPE=snp;VARB=0.00843296;OID=.;OPOS=33964153;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:205:151:149:55:56:36:19:50:101:36:20:51:98 chr16 33964154 . C T 18.49 PASS AO=32;DP=208;FAO=32;FDP=205;FR=.;FRO=173;FSAF=7;FSAR=25;FSRF=63;FSRR=110;FWDB=0.0301275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.426;QD=0.36085;RBI=0.03103;REFB=-0.00557768;REVB=-0.00742927;RO=151;SAF=7;SAR=25;SRF=63;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.287916;STB=0.649249;TYPE=snp;VARB=0.0240938;OID=.;OPOS=33964154;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:208:205:151:173:32:32:25:7:63:88:25:7:63:110 chr16 33964168 . G A 19.47 PASS AO=28;DP=175;FAO=28;FDP=172;FR=.;FRO=144;FSAF=6;FSAR=22;FSRF=62;FSRR=82;FWDB=-0.0101621;FXX=0.0114936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.243;QD=0.452694;RBI=0.0105013;REFB=-0.00780157;REVB=0.00264769;RO=144;SAF=6;SAR=22;SRF=61;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.300308;STB=0.705501;TYPE=snp;VARB=0.0274494;OID=.;OPOS=33964168;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:175:172:144:144:28:28:22:6:61:83:22:6:62:82 chr16 33964196 . T C 118.07 PASS AO=47;DP=137;FAO=42;FDP=121;FR=.;FRO=79;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=31;FSRR=48;FWDB=-0.000495939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.856;QD=3.903;RBI=0.00427901;REFB=-0.0098462;REVB=0.00425017;RO=90;SAF=20;SAR=27;SRF=32;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0831823;STB=0.539797;TYPE=snp;VARB=0.0241392;OID=.;OPOS=33964196;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:121:90:79:47:42:27:20:32:58:23:19:31:48 chr16 33964202 . C T 211.88 PASS AO=60;DP=129;FAO=54;FDP=119;FR=.;FRO=65;FSAF=22;FSAR=32;FSRF=29;FSRR=36;FWDB=-0.00765367;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.279;QD=7.12199;RBI=0.029703;REFB=0.000505859;REVB=-0.0287;RO=69;SAF=23;SAR=37;SRF=30;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0516229;STB=0.521731;TYPE=snp;VARB=-0.000659412;OID=.;OPOS=33964202;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:119:69:65:60:54:37:23:30:39:32:22:29:36 chr16 33964204 . T G 11.77 PASS AO=21;DP=131;FAO=18;FDP=121;FR=.;FRO=103;FSAF=3;FSAR=15;FSRF=48;FSRR=55;FWDB=-0.0280163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.147;QD=0.38917;RBI=0.0334443;REFB=-0.00698736;REVB=-0.0182648;RO=110;SAF=3;SAR=18;SRF=50;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.445747;STB=0.784271;TYPE=snp;VARB=0.0441459;OID=.;OPOS=33964204;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:131:121:110:103:21:18:18:3:50:60:15:3:48:55 chr16 33964233 . C T 81.64 PASS AO=35;DP=111;FAO=34;FDP=112;FR=.;FRO=78;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=31;FSRR=47;FWDB=-0.00452952;FXX=0.00884877;HRUN=3;LEN=1;MLLD=150.575;QD=2.91574;RBI=0.00503915;REFB=0.00113137;REVB=0.00220828;RO=75;SAF=15;SAR=20;SRF=27;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0832619;STB=0.531098;TYPE=snp;VARB=-0.00190019;OID=.;OPOS=33964233;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:111:112:75:78:35:34:20:15:27:48:19:15:31:47 chr16 33964238 . T G 89.87 PASS AO=43;DP=112;FAO=35;FDP=110;FR=.;FRO=75;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=28;FSRR=47;FWDB=-0.0194928;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.798;QD=3.2681;RBI=0.0307098;REFB=-0.00162636;REVB=-0.0237302;RO=69;SAF=18;SAR=25;SRF=26;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0469794;STB=0.558107;TYPE=snp;VARB=0.0052578;OID=.;OPOS=33964238;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:112:110:69:75:43:35:25:18:26:43:19:16:28:47 chr16 33964243 . A G 62.96 PASS AO=26;DP=106;FAO=30;FDP=109;FR=.;FRO=79;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=50;FWDB=0.00342653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.8;QD=2.31034;RBI=0.0228448;REFB=-0.0110261;REVB=-0.0225863;RO=79;SAF=12;SAR=14;SRF=28;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136088;STB=0.596268;TYPE=snp;VARB=0.00711806;OID=.;OPOS=33964243;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:106:109:79:79:26:30:14:12:28:51:15:15:29:50 chr16 33964276 . A G 30.93 PASS AO=19;DP=85;FAO=19;FDP=85;FR=.;FRO=66;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=43;FWDB=0.0153213;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.521;QD=1.45542;RBI=0.0207607;REFB=-0.00641786;REVB=-0.0140095;RO=65;SAF=7;SAR=12;SRF=23;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0196405;STB=0.516761;TYPE=snp;VARB=0.0158609;OID=.;OPOS=33964276;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:85:85:65:66:19:19:12:7:23:42:12:7:23:43 chr16 33964293 . G A 27.95 PASS AO=16;DP=75;FAO=17;FDP=77;FR=.;FRO=60;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=43;FWDB=0.0226768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.4451;QD=1.45169;RBI=0.0349205;REFB=-0.00851341;REVB=-0.0265556;RO=56;SAF=5;SAR=11;SRF=16;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0395162;STB=0.561456;TYPE=snp;VARB=0.00681659;OID=.;OPOS=33964293;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:75:77:56:60:16:17:11:5:16:40:11:6:17:43 chr16 33965456 . T C 184.31 PASS AO=58;DP=147;FAO=57;FDP=146;FR=.;FRO=89;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=41;FSRR=48;FWDB=0.0133821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.4641;QD=5.04969;RBI=0.0209577;REFB=-0.0173913;REVB=0.016129;RO=89;SAF=30;SAR=28;SRF=41;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0606;STB=0.539943;TYPE=snp;VARB=0.0219342;OID=.;OPOS=33965456;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:146:89:89:58:57:28:30:41:48:27:30:41:48 chr16 33965459 . C T 62.93 PASS AO=37;DP=147;FAO=37;FDP=147;FR=.;FRO=110;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=55;FSRR=55;FWDB=-0.0118696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8234;QD=1.71227;RBI=0.0165548;REFB=0.00607858;REVB=0.0115401;RO=109;SAF=16;SAR=21;SRF=54;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0786591;STB=0.53037;TYPE=snp;VARB=-0.0195817;OID=.;OPOS=33965459;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:147:147:109:110:37:37:21:16:54:55:20:17:55:55 chr16 33965505 . C T 29.01 PASS AO=27;DP=140;FAO=26;FDP=134;FR=.;FRO=108;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=54;FSRR=54;FWDB=0.00832069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.907;QD=0.865948;RBI=0.0116716;REFB=-0.00146116;REVB=0.00818487;RO=111;SAF=8;SAR=19;SRF=54;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251094;STB=0.693858;TYPE=snp;VARB=0.0044127;OID=.;OPOS=33965505;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:140:134:111:108:27:26:19:8:54:57:19:7:54:54 chr16 33965507 . G C 69.13 PASS AO=40;DP=138;FAO=35;FDP=131;FR=.;FRO=96;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=45;FSRR=51;FWDB=-0.00355288;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.901;QD=2.11096;RBI=0.0268073;REFB=-0.00225126;REVB=-0.0265709;RO=97;SAF=14;SAR=26;SRF=46;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154834;STB=0.57344;TYPE=snp;VARB=0.00459313;OID=.;OPOS=33965507;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:138:131:97:96:40:35:26:14:46:51:22:13:45:51 chr16 33965533 . A C 88.73 PASS AO=40;DP=108;FAO=33;FDP=101;FR=.;FRO=68;FSAF=7;FSAR=26;FSRF=26;FSRR=42;FWDB=0.00339022;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.5604;QD=3.51402;RBI=0.0156284;REFB=0.00917205;REVB=-0.0152563;RO=67;SAF=9;SAR=31;SRF=25;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20108;STB=0.643083;TYPE=snp;VARB=-0.00826176;OID=.;OPOS=33965533;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:108:101:67:68:40:33:31:9:25:42:26:7:26:42 chr16 33965538 . A G 81 PASS AO=38;DP=107;FAO=31;FDP=99;FR=.;FRO=68;FSAF=8;FSAR=23;FSRF=26;FSRR=42;FWDB=0.0136358;FXX=0.0198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.216;QD=3.27293;RBI=0.0334097;REFB=-0.0151485;REVB=-0.0305004;RO=68;SAF=10;SAR=28;SRF=26;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155892;STB=0.600545;TYPE=snp;VARB=0.0246625;OID=.;OPOS=33965538;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:107:99:68:68:38:31:28:10:26:42:23:8:26:42 chr16 33965560 . T A 74.07 PASS AO=34;DP=90;FAO=27;FDP=83;FR=.;FRO=56;FSAF=6;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=41;FWDB=-0.00493335;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=248.536;QD=3.5695;RBI=0.00647678;REFB=-0.00440439;REVB=0.0041965;RO=55;SAF=8;SAR=26;SRF=15;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0541952;STB=0.542403;TYPE=snp;VARB=0.0117955;OID=.;OPOS=33965560;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:90:83:55:56:34:27:26:8:15:40:21:6:15:41 chr16 33965561 . T C 11.7 PASS AO=17;DP=90;FAO=13;FDP=83;FR=.;FRO=70;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=52;FWDB=-0.0312771;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.969;QD=0.56362;RBI=0.0313561;REFB=-0.00139192;REVB=0.00222349;RO=72;SAF=4;SAR=13;SRF=18;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0251808;STB=0.530255;TYPE=snp;VARB=0.0686585;OID=.;OPOS=33965561;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:90:83:72:70:17:13:13:4:18:54:10:3:18:52 chr16 34970274 . C G 126.24 PASS AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0922318;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.5332;QD=33.6651;RBI=0.183011;REFB=0;REVB=-0.158071;RO=0;SAF=4;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33019e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00436412;OID=.;OPOS=34970274;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:15:15:0:0:15:15:11:4:0:0:11:4:0:0 chr16 34985985 . A G 352.92 PASS AO=32;DP=33;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0263355;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=37.2056;QD=37.1496;RBI=0.132306;REFB=0;REVB=0.129659;RO=1;SAF=16;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0282865;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00498151;OID=.;OPOS=34985985;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:33:38:1:0:32:38:16:16:0:1:22:16:0:0 chr16 46565019 . T G 1464.25 PASS AO=165;DP=174;FAO=166;FDP=174;FR=.;FRO=8;FSAF=54;FSAR=112;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0221637;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=204.813;QD=33.6608;RBI=0.0224717;REFB=-0.00523609;REVB=-0.00370828;RO=6;SAF=54;SAR=111;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0130178;STB=0.515523;TYPE=snp;VARB=4.55038e-05;OID=.;OPOS=46565019;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:174:174:6:8:165:166:111:54:3:3:112:54:5:3 chr16 46590024 . T C 1264.69 PASS AO=137;DP=140;FAO=138;FDP=141;FR=.;FRO=3;FSAF=72;FSAR=66;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0236729;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=66.4376;QD=35.8777;RBI=0.0647466;REFB=-0.0189825;REVB=-0.0602637;RO=3;SAF=72;SAR=65;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00784458;STB=0.504014;TYPE=snp;VARB=-7.26783e-06;OID=.;OPOS=46590024;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:140:141:3:3:137:138:65:72:1:2:66:72:1:2 chr16 46602819 . C T 21.07 PASS AO=5;DP=15;FAO=5;FDP=15;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0607314;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.9819;QD=5.61931;RBI=0.0987086;REFB=0.0153113;REVB=0.0778144;RO=10;SAF=2;SAR=3;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11246;STB=0.571156;TYPE=snp;VARB=-0.00820542;OID=.;OPOS=46602819;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:15:15:10:10:5:5:3:2:3:7:3:2:3:7 chr16 46655210 . A G 73.84 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0298367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.684;QD=36.9199;RBI=0.0304024;REFB=0;REVB=0.0058376;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000470352;OID=.;OPOS=46655210;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:5:3:0:0:5:3:0:0 chr16 46696284 . G A 1665 PASS AO=173;DP=174;FAO=174;FDP=174;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=140;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0391873;FXX=0.00571396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.809;QD=38.2758;RBI=0.0392271;REFB=0;REVB=0.00176654;RO=0;SAF=34;SAR=139;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.47039e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.06866e-06;OID=.;OPOS=46696284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:174:174:0:0:173:174:139:34:0:0:140:34:0:0 chr16 46773999 . C A 164.82 PASS AO=43;DP=126;FAO=53;FDP=140;FR=.;FRO=87;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=23;FSRR=64;FWDB=-0.0531912;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=41.2201;QD=4.7092;RBI=0.0554733;REFB=-0.0309381;REVB=0.0157476;RO=83;SAF=14;SAR=29;SRF=23;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0650144;STB=0.599678;TYPE=snp;VARB=0.0512087;OID=.;OPOS=46773999;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:140:83:87:43:53:29:14:23:60:31:22:23:64 chr16 48122582 . G A 2426.9 PASS AO=258;DP=260;FAO=258;FDP=258;FR=.;FRO=0;FSAF=128;FSAR=130;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017753;FXX=0.0114938;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.8139;QD=37.6264;RBI=0.0213944;REFB=-0.00223652;REVB=0.0119395;RO=2;SAF=128;SAR=130;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00738991;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.196e-05;OID=.;OPOS=48122582;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:96:260:258:2:0:258:258:130:128:2:0:130:128:0:0 chr16 48164777 . T C 499.37 PASS AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00455983;FXX=0.0185151;HRUN=2;LEN=1;MLLD=266.04;QD=37.6885;RBI=0.0079743;REFB=0;REVB=0.00654197;RO=0;SAF=22;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76368e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.48052e-06;OID=.;OPOS=48164777;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:54:53:0:0:53:53:31:22:0:0:31:22:0:0 chr16 48201432 . T C 135.03 PASS AO=33;DP=72;FAO=33;FDP=72;FR=.;FRO=39;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=-0.0586499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.7796;QD=7.50151;RBI=0.0635258;REFB=-0.0588942;REVB=-0.0244074;RO=38;SAF=10;SAR=23;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125326;STB=0.565176;TYPE=snp;VARB=0.0662431;OID=.;OPOS=48201432;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:38:39:33:33:23:10:16:22:23:10:16:23 chr16 48204078 . T A 370.23 PASS AO=78;DP=146;FAO=79;FDP=146;FR=.;FRO=67;FSAF=35;FSAR=44;FSRF=25;FSRR=42;FWDB=0.00224675;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.442;QD=10.1434;RBI=0.00918416;REFB=-0.00929461;REVB=0.00890511;RO=67;SAF=34;SAR=44;SRF=25;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0543191;STB=0.532735;TYPE=snp;VARB=0.00697496;OID=.;OPOS=48204078;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:67:67:78:79:44:34:25:42:44:35:25:42 chr16 48226479 . C T 481.32 PASS AO=93;DP=157;FAO=93;FDP=157;FR=.;FRO=64;FSAF=60;FSAR=33;FSRF=35;FSRR=29;FWDB=-0.00882068;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.3256;QD=12.263;RBI=0.0352087;REFB=-0.0247221;REVB=0.0340859;RO=62;SAF=60;SAR=33;SRF=34;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0759834;STB=0.54266;TYPE=snp;VARB=0.0204944;OID=.;OPOS=48226479;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:157:62:64:93:93:33:60:34:28:33:60:35:29 chr16 48227862 . G A 122.46 PASS AO=29;DP=62;FAO=29;FDP=62;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=-0.0358829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.7706;QD=7.90038;RBI=0.0615584;REFB=-0.021775;REVB=-0.0500185;RO=33;SAF=11;SAR=18;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159513;STB=0.589768;TYPE=snp;VARB=0.024347;OID=.;OPOS=48227862;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:33:33:29:29:18:11:18:15:18:11:18:15 chr16 48242379 . G A 324.38 PASS AO=65;DP=114;FAO=65;FDP=114;FR=.;FRO=49;FSAF=21;FSAR=44;FSRF=14;FSRR=35;FWDB=-0.011149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.649;QD=11.3819;RBI=0.0114238;REFB=-0.00784544;REVB=-0.0024905;RO=49;SAF=21;SAR=44;SRF=14;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0340991;STB=0.518594;TYPE=snp;VARB=0.00377364;OID=.;OPOS=48242379;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:49:49:65:65:44:21:14:35:44:21:14:35 chr16 48248918 . T C 282.28 PASS AO=76;DP=171;FAO=76;FDP=172;FR=.;FRO=96;FSAF=41;FSAR=35;FSRF=34;FSRR=62;FWDB=0.00568276;FXX=0.0114936;HRUN=3;LEN=1;MLLD=149.896;QD=6.56463;RBI=0.00758764;REFB=-0.0126576;REVB=-0.00502777;RO=95;SAF=41;SAR=35;SRF=33;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190308;STB=0.602367;TYPE=snp;VARB=0.0152057;OID=.;OPOS=48248918;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:172:95:96:76:76:35:41:33:62:35:41:34:62 chr16 48258226 . GC G 572.19 PASS AO=83;DP=99;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.155005;FXX=0.0303;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.9509;QD=23.8413;RBI=0.277003;REFB=0;REVB=0.229574;RO=10;SAF=38;SAR=45;SRF=7;SRR=3;SSEN=0.260775;SSEP=0;SSSB=-0.0492283;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0128361;OID=.;OPOS=48258227;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:83:98:96:96:0:47:49:0:0:48:10:38:45:7:3 chr16 48394626 . C T 175.43 PASS AO=43;DP=95;FAO=44;FDP=96;FR=.;FRO=52;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=23;FSRR=29;FWDB=0.00680341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.436;QD=7.30952;RBI=0.0163703;REFB=-0.00180414;REVB=0.0148897;RO=51;SAF=15;SAR=28;SRF=22;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0854133;STB=0.558796;TYPE=snp;VARB=0.00284954;OID=.;OPOS=48394626;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:96:51:52:43:44:28:15:22:29:29:15:23:29 chr16 48396870 . T C 239.81 PASS AO=46;DP=84;FAO=47;FDP=81;FR=.;FRO=34;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=0.00527023;FXX=0.03571;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.0006;QD=11.8424;RBI=0.016811;REFB=-0.0345123;REVB=0.0159635;RO=30;SAF=20;SAR=26;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100711;STB=0.540176;TYPE=snp;VARB=0.0134613;OID=.;OPOS=48396870;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:81:30:34:46:47:26:20:9:21:26:21:12:22 chr16 48575878 . G A 323.92 PASS AO=63;DP=110;FAO=63;FDP=109;FR=.;FRO=46;FSAF=42;FSAR=21;FSRF=27;FSRR=19;FWDB=-0.0378141;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.8107;QD=11.8871;RBI=0.0438562;REFB=-0.00706311;REVB=0.022214;RO=46;SAF=42;SAR=21;SRF=27;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0675226;STB=0.536901;TYPE=snp;VARB=0.00567604;OID=.;OPOS=48575878;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:109:46:46:63:63:21:42:27:19:21:42:27:19 chr16 50059279 . C A 16.08 PASS AO=3;DP=6;FAO=3;FDP=6;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0420732;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=218.862;QD=10.7182;RBI=0.0424826;REFB=0.00948592;REVB=0.00588355;RO=3;SAF=1;SAR=2;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0104195;OID=.;OPOS=50059279;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:6:6:3:3:3:3:2:1:1:2:2:1:1:2 chr16 50069312 . C G 201.77 PASS AO=55;DP=136;FAO=55;FDP=130;FR=.;FRO=75;FSAF=22;FSAR=33;FSRF=39;FSRR=36;FWDB=-0.00140443;FXX=0.0510912;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.2723;QD=6.20821;RBI=0.0303985;REFB=-0.00347345;REVB=0.0303661;RO=66;SAF=22;SAR=33;SRF=33;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0995652;STB=0.570068;TYPE=snp;VARB=0.00390836;OID=.;OPOS=50069312;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:130:66:75:55:55:33:22:33:33:33:22:39:36 chr16 50069772 . A G 2019.09 PASS AO=210;DP=211;FAO=211;FDP=211;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=123;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144605;FXX=0.00471676;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.404;QD=38.2765;RBI=0.0302126;REFB=0;REVB=-0.0265273;RO=0;SAF=88;SAR=122;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94476e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.52921e-06;OID=.;OPOS=50069772;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:96:211:211:0:0:210:211:122:88:0:0:123:88:0:0 chr16 50071011 . C CTTTAG 456.59 PASS AO=71;DP=129;FAO=76;FDP=111;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=61;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.00961698;FXX=0.132802;HRUN=3;LEN=5;MLLD=287.15;QD=16.4538;RBI=0.0119396;REFB=-0.00465926;REVB=-0.00707593;RO=36;SAF=11;SAR=60;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.29134;STB=0.611744;TYPE=ins;VARB=0.00161002;OID=.;OPOS=50071012;OREF=-;OALT=TTTAG;OMAPALT=CTTTAG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:71:129:76:111:35:15:61:16:19:89:36:11:60:17:19 chr16 50106594 . T C 280.58 PASS AO=88;DP=220;FAO=87;FDP=220;FR=.;FRO=133;FSAF=6;FSAR=81;FSRF=22;FSRR=111;FWDB=-0.0591798;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.6222;QD=5.10136;RBI=0.103345;REFB=-0.00295071;REVB=-0.0847232;RO=131;SAF=6;SAR=82;SRF=22;SRR=109;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.289803;STB=0.663111;TYPE=snp;VARB=0.00311448;OID=.;OPOS=50106594;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:220:220:131:133:88:87:82:6:22:109:81:6:22:111 chr16 50263762 . G A 632.68 PASS AO=63;DP=63;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.296;QD=37.7717;RBI=0.0487976;REFB=0;REVB=0.0441964;RO=0;SAF=26;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000171358;OID=.;OPOS=50263762;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:63:67:0:0:63:67:37:26:0:0:38:29:0:0 chr16 50265818 . C T 982.51 PASS AO=98;DP=101;FAO=110;FDP=113;FR=.;FRO=3;FSAF=52;FSAR=58;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.108381;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.2873;QD=34.7792;RBI=0.10851;REFB=-0.00830808;REVB=-0.00528006;RO=3;SAF=41;SAR=57;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00492308;STB=0.503713;TYPE=snp;VARB=0.00338216;OID=.;OPOS=50265818;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:101:113:3:3:98:110:57:41:1:2:58:52:1:2 chr16 50326661 . A G 553.29 PASS AO=59;DP=62;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0532927;FXX=0.031741;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.999;QD=36.281;RBI=0.0619029;REFB=-0.0322332;REVB=0.0314939;RO=2;SAF=24;SAR=35;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0261996;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000758069;OID=.;OPOS=50326661;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:62:61:2:0:59:61:35:24:0:2:37:24:0:0 chr16 50342658 . C T 79.95 PASS AO=14;DP=23;FAO=14;FDP=23;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=0.0120918;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.889;QD=13.9052;RBI=0.0300849;REFB=-0.00753698;REVB=0.027548;RO=6;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226414;STB=0.666473;TYPE=snp;VARB=0.00496068;OID=.;OPOS=50342658;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:23:23:6:9:14:14:9:5:0:6:9:5:0:9 chr16 50641082 . G A 200.88 PASS AO=50;DP=120;FAO=55;FDP=124;FR=.;FRO=69;FSAF=34;FSAR=21;FSRF=38;FSRR=31;FWDB=0.00257527;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.134;QD=6.47985;RBI=0.00575343;REFB=-0.00460169;REVB=0.0051449;RO=69;SAF=32;SAR=18;SRF=38;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0966504;STB=0.53901;TYPE=snp;VARB=0.00620696;OID=.;OPOS=50641082;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:124:69:69:50:55:18:32:38:31:21:34:38:31 chr16 50642201 . G C 776.35 PASS AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0840014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.4986;QD=37.8709;RBI=0.0907693;REFB=0;REVB=0.0343922;RO=0;SAF=4;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.17267e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00113467;OID=.;OPOS=50642201;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:82:82:0:0:82:82:78:4:0:0:78:4:0:0 chr16 50733859 . C G 88.04 PASS AO=22;DP=51;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=21;FWDB=0.0436424;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=195.613;QD=6.90514;RBI=0.0438029;REFB=-0.00952079;REVB=0.00374612;RO=29;SAF=10;SAR=12;SRF=8;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18429;STB=0.604306;TYPE=snp;VARB=0.0149235;OID=.;OPOS=50733859;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:51:51:29:29:22:22:12:10:8:21:12:10:8:21 chr16 50744624 . C T 92.95 PASS AO=18;DP=33;FAO=18;FDP=33;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=15;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.000729207;FXX=0.0571265;HRUN=5;LEN=1;MLLD=177.02;QD=11.2667;RBI=0.024567;REFB=0.00171172;REVB=0.0245562;RO=14;SAF=3;SAR=15;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146726;STB=0.615241;TYPE=snp;VARB=-0.00139945;OID=.;OPOS=50744624;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:33:33:14:15:18:18:15:3:4:10:15:3:5:10 chr16 50745199 . C T 504.34 PASS AO=91;DP=141;FAO=91;FDP=144;FR=.;FRO=53;FSAF=54;FSAR=37;FSRF=32;FSRR=21;FWDB=0.00576641;FXX=0.00689608;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.455;QD=14.0095;RBI=0.0259601;REFB=-0.0347669;REVB=-0.0253115;RO=50;SAF=54;SAR=37;SRF=32;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0319434;STB=0.503959;TYPE=snp;VARB=0.0203427;OID=.;OPOS=50745199;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:144:50:53:91:91:37:54:32:18:37:54:32:21 chr16 50745583 . T G 81.93 PASS AO=17;DP=36;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0138803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=320.197;QD=8.8569;RBI=0.025036;REFB=-0.0105023;REVB=0.020836;RO=19;SAF=2;SAR=15;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.494808;STB=0.730046;TYPE=snp;VARB=0.0177043;OID=.;OPOS=50745583;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:36:37:19:19:17:18:15:2:10:9:15:3:10:9 chr16 50827518 . C T 355.77 PASS AO=84;DP=173;FAO=84;FDP=170;FR=.;FRO=86;FSAF=46;FSAR=38;FSRF=51;FSRR=35;FWDB=-0.0148632;FXX=0.01734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.743;QD=8.37099;RBI=0.0155607;REFB=-0.0158639;REVB=0.00460659;RO=86;SAF=46;SAR=38;SRF=51;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0422907;STB=0.523277;TYPE=snp;VARB=0.0171626;OID=.;OPOS=50827518;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:170:86:86:84:84:38:46:51:35:38:46:51:35 chr16 51171126 . T C 157.85 PASS AO=44;DP=105;FAO=44;FDP=105;FR=.;FRO=61;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=43;FSRR=18;FWDB=-0.00276346;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.2067;QD=6.01343;RBI=0.024012;REFB=-0.016393;REVB=0.0238525;RO=61;SAF=24;SAR=20;SRF=43;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169649;STB=0.594986;TYPE=snp;VARB=0.0195269;OID=.;OPOS=51171126;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:61:61:44:44:20:24:43:18:20:24:43:18 chr16 51171175 . C T 1049.53 PASS AO=109;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0592368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2118;QD=38.5148;RBI=0.0600452;REFB=0;REVB=-0.0098201;RO=0;SAF=61;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000285202;OID=.;OPOS=51171175;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:109:109:0:0:109:109:48:61:0:0:48:61:0:0 chr16 51172677 . G A 301.65 PASS AO=89;DP=221;FAO=90;FDP=221;FR=.;FRO=131;FSAF=49;FSAR=41;FSRF=61;FSRR=70;FWDB=0.0100165;FXX=0.0045043;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.623;QD=5.45965;RBI=0.047185;REFB=-0.015738;REVB=0.0461096;RO=131;SAF=49;SAR=40;SRF=61;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0901626;STB=0.546678;TYPE=snp;VARB=0.0240641;OID=.;OPOS=51172677;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:221:131:131:89:90:40:49:61:70:41:49:61:70 chr16 51173559 . G A 216.75 PASS AO=50;DP=125;FAO=59;FDP=136;FR=.;FRO=77;FSAF=33;FSAR=26;FSRF=57;FSRR=20;FWDB=-0.00389874;FXX=0.00729874;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.5583;QD=6.37506;RBI=0.0597535;REFB=0.00999444;REVB=0.0596262;RO=75;SAF=33;SAR=17;SRF=57;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124485;STB=0.606498;TYPE=snp;VARB=-0.00561455;OID=.;OPOS=51173559;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:136:75:77:50:59:17:33:57:18:26:33:57:20 chr16 51705448 . C T 834.54 PASS AO=86;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276816;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.917;QD=38.3698;RBI=0.0287663;REFB=0;REVB=0.0078251;RO=0;SAF=29;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000115797;OID=.;OPOS=51705448;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:87:87:0:0:86:87:57:29:0:0:58:29:0:0 chr16 52472421 . A ATTTCT 711.29 PASS AO=96;DP=156;FAO=109;FDP=146;FR=.;FRO=37;FSAF=65;FSAR=44;FSRF=31;FSRR=6;FWDB=0.0061402;FXX=0.0331104;HRUN=3;LEN=5;MLLD=232.599;QD=19.4874;RBI=0.00950706;REFB=-0.00933016;REVB=-0.00725825;RO=42;SAF=59;SAR=37;SRF=32;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.090282;STB=0.565148;TYPE=ins;VARB=0.00304465;OID=.;OPOS=52472422;OREF=-;OALT=TTTCT;OMAPALT=ATTTCT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:96:156:109:146:37:65:44:31:6:65:42:59:37:32:10 chr16 52473263 . A G 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0303109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.725;QD=33.022;RBI=0.0303109;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000752278;OID=.;OPOS=52473263;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:0:6:0:0:0:6:0:0 chr16 52478206 . C T 1370.31 PASS AO=150;DP=155;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102218;FXX=0.032256;HRUN=3;LEN=1;MLLD=238.694;QD=36.5417;RBI=0.0119239;REFB=-0.00570959;REVB=0.00613949;RO=2;SAF=95;SAR=55;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0099078;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.80999e-05;OID=.;OPOS=52478206;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:155:150:2:0:150:150:55:95:2:0:55:95:0:0 chr16 52478215 . C T 1452.23 PASS AO=155;DP=157;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0248587;FXX=0.012738;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.116;QD=37.477;RBI=0.0265812;REFB=0.00937337;REVB=-0.0094129;RO=2;SAF=98;SAR=57;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00960928;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000128576;OID=.;OPOS=52478215;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:157:155:2:0:155:155:57:98:2:0:57:98:0:0 chr16 53262964 . C T 826.15 PASS AO=287;DP=578;FAO=196;FDP=393;FR=.;FRO=197;FSAF=59;FSAR=137;FSRF=60;FSRR=137;FWDB=0.0115673;FXX=0.0174996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.8255;QD=8.40867;RBI=0.0118889;REFB=-0.0179808;REVB=0.00274649;RO=261;SAF=87;SAR=200;SRF=89;SRR=172;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0384736;STB=0.502109;TYPE=snp;VARB=0.0158006;OID=.;OPOS=53262964;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:578:393:261:197:287:196:200:87:89:172:137:59:60:137 chr16 53341748 . T G 253.14 PASS AO=63;DP=141;FAO=64;FDP=139;FR=.;FRO=75;FSAF=5;FSAR=59;FSRF=12;FSRR=63;FWDB=-0.0196377;FXX=0.0671096;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.3071;QD=7.28447;RBI=0.0220406;REFB=-0.0459894;REVB=-0.0100074;RO=70;SAF=4;SAR=59;SRF=7;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12623;STB=0.621778;TYPE=snp;VARB=0.0435656;OID=.;OPOS=53341748;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:139:70:75:63:64:59:4:7:63:59:5:12:63 chr16 53360677 . AAC A 110.05 PASS AO=53;DP=144;FAO=55;FDP=141;FR=.;FRO=86;FSAF=36;FSAR=19;FSRF=40;FSRR=46;FWDB=-0.0157084;FXX=0;HRUN=3;LEN=2;MLLD=256.061;QD=3.1219;RBI=0.015716;REFB=0.00366814;REVB=0.000489191;RO=78;SAF=35;SAR=18;SRF=35;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228083;STB=0.618349;TYPE=del;VARB=-0.00676048;OID=.;OPOS=53360678;OREF=AC;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:53:135:55:141:86:36:19:40:46:99:78:35:18:35:43 chr16 53396356 . T C 1866.82 PASS AO=196;DP=197;FAO=196;FDP=196;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0491191;FXX=0.00507588;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7128;QD=38.0983;RBI=0.0526255;REFB=0;REVB=0.018888;RO=1;SAF=100;SAR=96;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00473886;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.55032e-05;OID=.;OPOS=53396356;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:197:196:1:0:196:196:96:100:1:0:95:101:0:0 chr16 53404203 . C A 1377.63 PASS AO=147;DP=149;FAO=147;FDP=149;FR=.;FRO=2;FSAF=46;FSAR=101;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0439122;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.7658;QD=36.9833;RBI=0.103643;REFB=0.0209353;REVB=-0.0938804;RO=2;SAF=46;SAR=101;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0202245;STB=0.510637;TYPE=snp;VARB=-0.00120221;OID=.;OPOS=53404203;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:149:149:2:2:147:147:101:46:2:0:101:46:2:0 chr16 53481010 . A G 1759.22 PASS AO=186;DP=190;FAO=188;FDP=188;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0103493;FXX=0.015706;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.849;QD=37.4302;RBI=0.0128173;REFB=0.0294336;REVB=-0.00756133;RO=3;SAF=76;SAR=110;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00805453;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.36409e-05;OID=.;OPOS=53481010;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:190:188:3:0:186:188:110:76:2:1:111:77:0:0 chr16 53503934 . G A 1585.3 PASS AO=164;DP=171;FAO=170;FDP=170;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235885;FXX=0.00584761;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.4604;QD=37.3012;RBI=0.111994;REFB=-0.0386151;REVB=0.109482;RO=6;SAF=93;SAR=71;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0272473;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00131921;OID=.;OPOS=53503934;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:171:170:6:0:164:170:71:93:1:5:76:94:0:0 chr16 53503937 . TG T 879.32 PASS AO=106;DP=162;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.316027;FXX=0.00624961;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.0265;QD=22.1213;RBI=0.393954;REFB=0.0562982;REVB=-0.235215;RO=23;SAF=67;SAR=39;SRF=19;SRR=4;SSEN=0.421053;SSEP=0;SSSB=-0.0714727;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.000628943;OID=.;OPOS=53503938;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:106:152:159:159:0:87:72:0:0:70:23:67:39:19:4 chr16 53503943 . C G 1574.04 PASS AO=157;DP=159;FAO=166;FDP=166;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00355949;FXX=0.00598767;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.048;QD=37.9287;RBI=0.0425634;REFB=-0.0331297;REVB=0.0424143;RO=0;SAF=86;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.45549e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.12266e-05;OID=.;OPOS=53503943;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:159:166:0:0:157:166:71:86:0:0:78:88:0:0 chr16 53504721 . T C 1995.69 PASS AO=212;DP=216;FAO=213;FDP=213;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=131;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0090267;FXX=0.0138882;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.046;QD=37.4778;RBI=0.030111;REFB=0.0337067;REVB=-0.0287261;RO=2;SAF=81;SAR=131;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116157;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.54944e-05;OID=.;OPOS=53504721;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:216:213:2:0:212:213:131:81:2:0:131:82:0:0 chr16 53513055 . T C 830.85 PASS AO=89;DP=90;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.018835;FXX=0.0219756;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.6814;QD=37.3415;RBI=0.025642;REFB=-0.0916087;REVB=0.0173998;RO=1;SAF=20;SAR=69;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0231015;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00054091;OID=.;OPOS=53513055;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:90:89:1:0:89:89:69:20:1:0:69:20:0:0 chr16 53692776 . GT G 155.69 PASS AO=93;DP=242;FAO=102;FDP=229;FR=.;FRO=127;FSAF=12;FSAR=90;FSRF=55;FSRR=72;FWDB=0.125167;FXX=0.0213666;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.7078;QD=2.71944;RBI=0.144706;REFB=-0.100685;REVB=-0.0726146;RO=113;SAF=4;SAR=89;SRF=46;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.654562;STB=0.756147;TYPE=del;VARB=0.0995495;OID=.;OPOS=53692777;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:93:232:102:229:127:12:90:55:72:99:113:4:89:46:67 chr16 54319086 . TC CT 18.73 PASS AO=2;DP=13;FAO=4;FDP=12;FR=.,HEALED;FRO=8;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.129132;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=29.4393;QD=6.24465;RBI=0.201727;REFB=-0.0386228;REVB=0.15498;RO=5;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.749059;TYPE=mnp;VARB=0.00972479;OID=.;OPOS=54319086;OREF=TC;OALT=CT;OMAPALT=CT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:11:12:5:8:2:4:2:0:0:5:2:2:1:7 chr16 54967096 . C A 43.05 PASS AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.269;QD=14.3491;RBI=0.00409651;REFB=0.018478;REVB=0.00409651;RO=5;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0252092;OID=.;OPOS=54967096;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:12:12:5:5:7:7:7:0:0:5:7:0:0:5 chr16 54967139 . G C 10.47 PASS AO=2;DP=6;FAO=2;FDP=6;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=319.325;QD=6.97935;RBI=0.00658355;REFB=0.0080379;REVB=0.00658355;RO=4;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0161239;OID=.;OPOS=54967139;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:4:4:2:2:2:0:0:4:2:0:0:4 chr16 55325460 . T C 221.54 PASS AO=57;DP=124;FAO=57;FDP=126;FR=.;FRO=69;FSAF=20;FSAR=37;FSRF=25;FSRR=44;FWDB=-0.0282662;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.359;QD=7.03313;RBI=0.0307921;REFB=-0.00430155;REVB=-0.0122138;RO=67;SAF=20;SAR=37;SRF=23;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00811553;STB=0.506847;TYPE=snp;VARB=0.00523066;OID=.;OPOS=55325460;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:126:67:69:57:57:37:20:23:44:37:20:25:44 chr16 55360493 . G T 97.78 PASS AO=30;DP=83;FAO=31;FDP=84;FR=.;FRO=53;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=29;FWDB=-0.006276;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.585;QD=4.65608;RBI=0.00632566;REFB=-0.00523917;REVB=-0.000791129;RO=52;SAF=16;SAR=14;SRF=23;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100033;STB=0.560115;TYPE=snp;VARB=0.00742005;OID=.;OPOS=55360493;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:83:84:52:53:30:31:14:16:23:29:14:17:24:29 chr16 55519535 . G C 252.5 PASS AO=69;DP=158;FAO=69;FDP=160;FR=.;FRO=91;FSAF=50;FSAR=19;FSRF=48;FSRR=43;FWDB=-0.00438309;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=113.845;QD=6.31245;RBI=0.0177458;REFB=-0.0109111;REVB=0.017196;RO=76;SAF=50;SAR=19;SRF=38;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233987;STB=0.62471;TYPE=snp;VARB=0.0176268;OID=.;OPOS=55519535;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:160:76:91:69:69:19:50:38:38:19:50:48:43 chr16 55523705 . T C 508.5 PASS AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.922;QD=37.6664;RBI=0.0601338;REFB=0;REVB=0.0577994;RO=0;SAF=25;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000509356;OID=.;OPOS=55523705;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:54:54:0:0:54:54:29:25:0:0:29:25:0:0 chr16 55525848 . AG A 174.75 PASS AO=26;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.241609;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.1095;QD=21.8437;RBI=0.246265;REFB=0;REVB=0.0476649;RO=6;SAF=3;SAR=23;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0.25974;SSSB=-0.252305;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0158469;OID=.;OPOS=55525849;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:26:32:32:32:0:6:26:0:0:16:6:3:23:3:3 chr16 55527113 . G A 156.2 PASS AO=31;DP=59;FAO=32;FDP=60;FR=.;FRO=28;FSAF=26;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.0089472;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.487;QD=10.4134;RBI=0.0650155;REFB=-0.0303559;REVB=0.0643969;RO=27;SAF=25;SAR=6;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.270845;STB=0.649895;TYPE=snp;VARB=0.0293181;OID=.;OPOS=55527113;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:60:27:28:31:32:6:25:15:12:6:26:16:12 chr16 55536727 . C T 651.14 PASS AO=66;DP=68;FAO=74;FDP=76;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.131788;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=39.5561;QD=34.2707;RBI=0.185808;REFB=-0.0542365;REVB=0.130983;RO=2;SAF=32;SAR=34;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0269815;STB=0.51351;TYPE=snp;VARB=0.00425157;OID=.;OPOS=55536727;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:68:76:2:2:66:74:34:32:0:2:36:38:0:2 chr16 55539614 . A C 182.96 PASS AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0309009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.4068;QD=38.5183;RBI=0.0767282;REFB=0;REVB=-0.0702307;RO=0;SAF=1;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00318279;OID=.;OPOS=55539614;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:19:19:0:0:19:19:18:1:0:0:18:1:0:0 chr16 55562466 . G A 3815.76 PASS AO=525;DP=531;FAO=398;FDP=398;FR=.;FRO=0;FSAF=155;FSAR=243;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016759;FXX=0.00499988;HRUN=2;LEN=1;MLLD=247.549;QD=38.3493;RBI=0.0168873;REFB=-0.0416497;REVB=0.00207783;RO=5;SAF=202;SAR=323;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000289895;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.12123e-07;OID=.;OPOS=55562466;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:531:398:5:0:525:398:323:202:2:3:243:155:0:0 chr16 55806311 . G T 293.57 PASS AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0101984;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=253.777;QD=34.5382;RBI=0.0194909;REFB=-0.0759914;REVB=-0.0166098;RO=1;SAF=22;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0207674;STB=0.511104;TYPE=snp;VARB=0.00405098;OID=.;OPOS=55806311;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:34:34:1:1:33:33:11:22:1:0:11:22:1:0 chr16 55806409 . T C 555.43 PASS AO=57;DP=59;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00810169;FXX=0.0499917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2036;QD=38.9779;RBI=0.0258975;REFB=0;REVB=0.0245976;RO=0;SAF=29;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00154448;OID=.;OPOS=55806409;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:59:57:0:0:57:57:28:29:0:0:28:29:0:0 chr16 55862691 . G A 34.67 PASS AO=37;DP=190;FAO=36;FDP=190;FR=.;FRO=154;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=76;FSRR=78;FWDB=-0.0175358;FXX=0.00523533;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.242;QD=0.729964;RBI=0.0705606;REFB=-0.003235;REVB=-0.0683469;RO=152;SAF=17;SAR=20;SRF=76;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0520433;STB=0.517262;TYPE=snp;VARB=0.0137683;OID=.;OPOS=55862691;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:190:190:152:154:37:36:20:17:76:76:19:17:76:78 chr16 55862717 . T C 35.72 PASS AO=41;DP=222;FAO=41;FDP=222;FR=.;FRO=181;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=89;FSRR=92;FWDB=-0.00466401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.419;QD=0.643648;RBI=0.0229327;REFB=-0.000631596;REVB=0.0224534;RO=173;SAF=23;SAR=18;SRF=81;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118996;STB=0.556506;TYPE=snp;VARB=0.00291578;OID=.;OPOS=55862717;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:222:222:173:181:41:41:18:23:81:92:18:23:89:92 chr16 55862720 . T C 35.37 PASS AO=41;DP=222;FAO=41;FDP=223;FR=.;FRO=182;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=90;FSRR=92;FWDB=-0.0107878;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.609;QD=0.634509;RBI=0.0141039;REFB=-0.00200246;REVB=0.00908531;RO=181;SAF=23;SAR=18;SRF=90;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0822367;STB=0.554312;TYPE=snp;VARB=0.00715854;OID=.;OPOS=55862720;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:222:223:181:182:41:41:18:23:90:91:18:23:90:92 chr16 55862762 . C G 35.54 PASS AO=40;DP=223;FAO=42;FDP=226;FR=.;FRO=184;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=92;FSRR=92;FWDB=0.00954168;FXX=0.0173905;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.549;QD=0.629042;RBI=0.0138489;REFB=-0.00475349;REVB=-0.0100374;RO=175;SAF=20;SAR=20;SRF=84;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0257474;STB=0.538816;TYPE=snp;VARB=0.0269067;OID=.;OPOS=55862762;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:223:226:175:184:40:42:20:20:84:91:23:19:92:92 chr16 55862791 . T C 26.68 PASS AO=41;DP=244;FAO=41;FDP=245;FR=.;FRO=204;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=90;FSRR=114;FWDB=0.00237942;FXX=0.0120963;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.947;QD=0.435541;RBI=0.00621053;REFB=-0.00599196;REVB=0.00573664;RO=191;SAF=18;SAR=23;SRF=90;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.041804;STB=0.501817;TYPE=snp;VARB=0.0475458;OID=.;OPOS=55862791;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:244:245:191:204:41:41:23:18:90:101:23:18:90:114 chr16 55866894 . T TA 158.74 PASS AO=25;DP=55;FAO=29;FDP=48;FR=.;FRO=19;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.00837232;FXX=0.058812;HRUN=0;LEN=1;MLLD=225.564;QD=13.2285;RBI=0.0341509;REFB=-0.0241044;REVB=-0.0331087;RO=28;SAF=13;SAR=12;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152095;STB=0.572196;TYPE=ins;VARB=0.0130491;OID=.;OPOS=55866895;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:25:55:29:48:19:16:13:7:12:70:28:13:12:10:18 chr16 55883618 . T C 1772.94 PASS AO=180;DP=182;FAO=185;FDP=185;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0311732;FXX=0.0106946;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.8435;QD=38.3338;RBI=0.0890068;REFB=0;REVB=0.0833693;RO=0;SAF=65;SAR=115;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00023006;OID=.;OPOS=55883618;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:182:185:0:0:180:185:115:65:0:0:119:66:0:0 chr16 55905636 . A G 743.68 PASS AO=77;DP=79;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0478669;FXX=0.0253133;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.3208;QD=38.6326;RBI=0.0482539;REFB=0;REVB=-0.00609907;RO=0;SAF=53;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.08692e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000516461;OID=.;OPOS=55905636;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:79:77:0:0:77:77:24:53:0:0:24:53:0:0 chr16 55905676 . C T 125.82 PASS AO=25;DP=45;FAO=25;FDP=45;FR=.;FRO=20;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.0576082;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.8716;QD=11.1836;RBI=0.060351;REFB=-0.0260854;REVB=-0.0179872;RO=18;SAF=17;SAR=8;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0581972;STB=0.53965;TYPE=snp;VARB=0.0211849;OID=.;OPOS=55905676;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:45:45:18:20:25:25:8:17:11:7:8:17:12:8 chr16 56228066 . A G 175.76 PASS AO=50;DP=126;FAO=51;FDP=124;FR=.;FRO=73;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=35;FSRR=38;FWDB=-0.043284;FXX=0.0158718;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.268;QD=5.66981;RBI=0.0459552;REFB=-0.0042826;REVB=-0.0154393;RO=70;SAF=23;SAR=27;SRF=33;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119103;STB=0.516862;TYPE=snp;VARB=0.00637416;OID=.;OPOS=56228066;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:124:70:73:50:51:27:23:33:37:28:23:35:38 chr16 56368689 . C T 614.39 PASS AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0495049;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.63;QD=36.6798;RBI=0.0498457;REFB=-0.0729024;REVB=0.00581904;RO=1;SAF=29;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125996;STB=0.506665;TYPE=snp;VARB=0.000539791;OID=.;OPOS=56368689;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:67:67:1:1:66:66:37:29:0:1:37:29:0:1 chr16 56377748 . A G 177.5 PASS AO=33;DP=52;FAO=32;FDP=52;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.0299675;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.4935;QD=13.6539;RBI=0.0308513;REFB=-0.0224103;REVB=-0.00733154;RO=19;SAF=12;SAR=21;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.077339;STB=0.530284;TYPE=snp;VARB=0.0186122;OID=.;OPOS=56377748;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:52:52:19:20:33:32:21:12:9:10:20:12:9:11 chr16 56395610 . G A 1536.61 PASS AO=163;DP=165;FAO=164;FDP=164;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.04281;FXX=0.0120475;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.777;QD=37.4783;RBI=0.0572603;REFB=-0.0593679;REVB=0.038027;RO=2;SAF=74;SAR=89;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126853;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000746575;OID=.;OPOS=56395610;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:165:164:2:0:163:164:89:74:2:0:90:74:0:0 chr16 56396486 . C T 907.23 PASS AO=94;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189355;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.661;QD=38.1992;RBI=0.0215401;REFB=0;REVB=0.0102675;RO=0;SAF=32;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.26736e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.07014e-05;OID=.;OPOS=56396486;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:95:95:0:0:94:95:62:32:0:0:62:33:0:0 chr16 56485554 . C G 174.93 PASS AO=30;DP=47;FAO=31;FDP=50;FR=.;FRO=19;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=1;FWDB=-0.10256;FXX=0.019604;HRUN=3;LEN=1;MLLD=39.1515;QD=13.9941;RBI=0.17277;REFB=0.00583694;REVB=-0.139036;RO=17;SAF=21;SAR=9;SRF=17;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.266703;STB=0.627948;TYPE=snp;VARB=-0.0109762;OID=.;OPOS=56485554;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:47:50:17:19:30:31:9:21:17:0:10:21:18:1 chr16 56510299 . A C 935.87 PASS AO=102;DP=104;FAO=102;FDP=104;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0612248;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.5932;QD=35.9949;RBI=0.0619182;REFB=-0.0675247;REVB=0.00924033;RO=1;SAF=37;SAR=65;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00724422;STB=0.507574;TYPE=snp;VARB=0.000815133;OID=.;OPOS=56510299;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:104:104:1:2:102:102:65:37:0:1:65:37:0:2 chr16 56548501 . C T 859.37 PASS AO=91;DP=92;FAO=92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0427714;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.9;QD=36.9621;RBI=0.0852275;REFB=-0.0240465;REVB=0.0737179;RO=0;SAF=47;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.04952e-08;STB=0.505493;TYPE=snp;VARB=0.000278247;OID=.;OPOS=56548501;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:92:93:0:1:91:92:44:47:0:0:45:47:0:1 chr16 56601720 . A G 1587.25 PASS AO=166;DP=167;FAO=167;FDP=167;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.045365;FXX=0.00595203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.377;QD=38.018;RBI=0.045415;REFB=-0.0145207;REVB=0.00213063;RO=1;SAF=66;SAR=100;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00473552;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.67123e-05;OID=.;OPOS=56601720;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:167:167:1:0:166:167:100:66:0:1:101:66:0:0 chr16 56601722 . T C 1501.68 PASS AO=157;DP=158;FAO=158;FDP=158;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0596169;FXX=0.00628891;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.6276;QD=38.0173;RBI=0.0596741;REFB=-0.0116214;REVB=0.0026137;RO=1;SAF=66;SAR=91;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0051998;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.71974e-05;OID=.;OPOS=56601722;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:158:158:1:0:157:158:91:66:0:1:92:66:0:0 chr16 56667282 . C A 385.46 PASS AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.031925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.227;QD=37.6058;RBI=0.0350863;REFB=0;REVB=-0.014555;RO=0;SAF=34;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.33091e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.35454e-05;OID=.;OPOS=56667282;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:41:41:0:0:41:41:7:34:0:0:7:34:0:0 chr16 56673227 . C A 301.45 PASS AO=35;DP=37;FAO=35;FDP=37;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0501711;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8605;QD=32.5895;RBI=0.0569541;REFB=0.00678932;REVB=0.0269561;RO=2;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0583611;STB=0.531232;TYPE=snp;VARB=-0.000811506;OID=.;OPOS=56673227;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:37:37:2:2:35:35:15:20:0:2:15:20:0:2 chr16 56673249 . T C 306.42 PASS AO=32;DP=34;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0897779;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.4991;QD=37.1415;RBI=0.109813;REFB=0;REVB=0.0632355;RO=0;SAF=18;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00145555;OID=.;OPOS=56673249;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:33:0:0:32:33:14:18:0:0:14:19:0:0 chr16 56686470 . C T 103.99 PASS AO=29;DP=83;FAO=33;FDP=87;FR=.;FRO=54;FSAF=24;FSAR=9;FSRF=36;FSRR=18;FWDB=-0.012538;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.056;QD=4.78094;RBI=0.0191559;REFB=-0.01191;REVB=0.0144826;RO=54;SAF=24;SAR=5;SRF=35;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.273527;STB=0.545426;TYPE=snp;VARB=0.0624406;OID=.;OPOS=56686470;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:87:54:54:29:33:5:24:35:19:9:24:36:18 chr16 56686471 . G T 295.83 PASS AO=54;DP=89;FAO=54;FDP=88;FR=.;FRO=34;FSAF=35;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=9;FWDB=-0.0137256;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.577;QD=13.4466;RBI=0.0138026;REFB=-0.0128795;REVB=-0.00145584;RO=34;SAF=35;SAR=19;SRF=25;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0694551;STB=0.537722;TYPE=snp;VARB=0.105098;OID=.;OPOS=56686471;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:88:34:34:54:54:19:35:25:9:19:35:25:9 chr16 56855496 . C G 1300.52 PASS AO=135;DP=135;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0277036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.226;QD=38.2505;RBI=0.0683915;REFB=0;REVB=0.0625292;RO=0;SAF=49;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.99536e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000241757;OID=.;OPOS=56855496;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:135:136:0:0:135:136:86:49:0:0:87:49:0:0 chr16 56904587 . C G 431.53 PASS AO=46;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0523867;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.3691;QD=36.7262;RBI=0.0524285;REFB=0;REVB=-0.00209474;RO=1;SAF=24;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.02089;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00109774;OID=.;OPOS=56904587;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:47:47:1:0:46:47:22:24:0:1:23:24:0:0 chr16 56913513 . C T 70.44 PASS AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.00345124;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.784;QD=7.22431;RBI=0.0176641;REFB=-0.0227988;REVB=0.0173236;RO=22;SAF=8;SAR=9;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117594;STB=0.567489;TYPE=snp;VARB=0.0370433;OID=.;OPOS=56913513;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:39:39:22:22:17:17:9:8:13:9:9:8:13:9 chr16 56933519 . G A 110.71 PASS AO=28;DP=97;FAO=30;FDP=85;FR=.,HEALED;FRO=52;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=26;FWDB=-0.00089338;FXX=0.034087;HRUN=3;LEN=1;MLLD=186.815;QD=5.20991;RBI=0.00630215;REFB=-0.014094;REVB=-0.00623851;RO=36;SAF=13;SAR=15;SRF=25;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226866;STB=0.521159;TYPE=snp;VARB=0.021494;OID=.;OPOS=56933519;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:86:85:36:52:28:30:15:13:25:11:16:14:26:26 chr16 56938387 . C T 306.74 PASS AO=40;DP=111;FAO=48;FDP=92;FR=.,HEALED;FRO=29;FSAF=15;FSAR=33;FSRF=4;FSRR=25;FWDB=0.0120285;FXX=0.0515411;HRUN=3;LEN=1;MLLD=67.4897;QD=13.3364;RBI=0.0140435;REFB=-0.00706106;REVB=-0.00724825;RO=16;SAF=11;SAR=29;SRF=1;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151939;STB=0.581131;TYPE=snp;VARB=-0.00888696;OID=.;OPOS=56938387;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:89:92:16:29:40:48:29:11:1:15:33:15:4:25 chr16 57005301 . C T 185.83 PASS AO=34;DP=64;FAO=37;FDP=66;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=26;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=0.0278245;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.4148;QD=11.2624;RBI=0.0314098;REFB=-0.0301796;REVB=-0.014573;RO=29;SAF=11;SAR=23;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0827062;STB=0.558324;TYPE=snp;VARB=0.0246439;OID=.;OPOS=57005301;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:66:29:29:34:37:23:11:12:17:26:11:12:17 chr16 57015545 . C T 248.39 PASS AO=50;DP=113;FAO=62;FDP=125;FR=.;FRO=63;FSAF=35;FSAR=27;FSRF=42;FSRR=21;FWDB=0.00435257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.033;QD=7.94862;RBI=0.00994441;REFB=-0.00886092;REVB=0.00894127;RO=58;SAF=29;SAR=21;SRF=39;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0931781;STB=0.553056;TYPE=snp;VARB=0.00971134;OID=.;OPOS=57015545;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:125:58:63:50:62:21:29:39:19:27:35:42:21 chr16 57016092 . G A 273.12 PASS AO=50;DP=84;FAO=51;FDP=84;FR=.;FRO=33;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=0.00368687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.535;QD=13.0055;RBI=0.0576245;REFB=-0.0241236;REVB=0.0575065;RO=32;SAF=25;SAR=25;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.067115;STB=0.545437;TYPE=snp;VARB=0.013495;OID=.;OPOS=57016092;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:32:33:50:51:25:25:19:13:26:25:20:13 chr16 57059661 . G C 346.73 PASS AO=79;DP=155;FAO=79;FDP=155;FR=.;FRO=76;FSAF=34;FSAR=45;FSRF=50;FSRR=26;FWDB=-0.00337164;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.077;QD=8.94779;RBI=0.0164351;REFB=-0.0125532;REVB=0.0160856;RO=75;SAF=34;SAR=45;SRF=50;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207195;STB=0.610241;TYPE=snp;VARB=0.0167767;OID=.;OPOS=57059661;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:75:76:79:79:45:34:50:25:45:34:50:26 chr16 57067595 . A T 99.08 PASS AO=28;DP=79;FAO=33;FDP=93;FR=.;FRO=60;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=31;FWDB=-0.000269757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.444;QD=4.26145;RBI=0.0174934;REFB=-0.00958704;REVB=0.0174913;RO=51;SAF=18;SAR=10;SRF=29;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0873515;STB=0.540093;TYPE=snp;VARB=0.0260735;OID=.;OPOS=57067595;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:93:51:60:28:33:10:18:29:22:15:18:29:31 chr16 57070004 . C CT 23.86 PASS AO=7;DP=35;FAO=9;FDP=33;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.0311602;FXX=0.0294031;HRUN=0;LEN=1;MLLD=96.9229;QD=2.89244;RBI=0.0472776;REFB=-0.0616576;REVB=-0.0355558;RO=24;SAF=7;SAR=0;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.755903;STB=0.787451;TYPE=ins;VARB=0.131872;OID=.;OPOS=57070005;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:7:35:9:33:24:7:2:9:15:23:24:7:0:9:15 chr16 57071113 . T C 210.46 PASS AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0319337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.897;QD=36.6014;RBI=0.0763823;REFB=0;REVB=0.0693865;RO=0;SAF=13;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000936803;OID=.;OPOS=57071113;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:0:0:23:23:10:13:0:0:10:13:0:0 chr16 57071114 . A G 210.68 PASS AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00718325;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.79;QD=36.6391;RBI=0.12142;REFB=0;REVB=-0.121207;RO=0;SAF=13;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000608938;OID=.;OPOS=57071114;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:0:0:23:23:10:13:0:0:10:13:0:0 chr16 57073683 . G C 1251.15 PASS AO=96;DP=128;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00824679;FXX=0.00746213;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.725;QD=37.6287;RBI=0.0126488;REFB=-0.0654621;REVB=-0.00959079;RO=0;SAF=67;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000164219;OID=.;OPOS=57073683;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:98:133:0:0:96:133:29:67:0:0:37:96:0:0 chr16 57080528 . C A 343.11 PASS AO=73;DP=135;FAO=73;FDP=135;FR=.;FRO=62;FSAF=14;FSAR=59;FSRF=18;FSRR=44;FWDB=-0.00935831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.229;QD=10.1661;RBI=0.0139754;REFB=-0.0122352;REVB=0.0103795;RO=62;SAF=14;SAR=59;SRF=18;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121544;STB=0.566947;TYPE=snp;VARB=0.00919635;OID=.;OPOS=57080528;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:62:62:73:73:59:14:18:44:59:14:18:44 chr16 57089343 . A AT 10.17 PASS AO=2;DP=8;FAO=2;FDP=8;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.0212567;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=57.4038;QD=5.08469;RBI=0.0212567;REFB=-0.0287736;REVB=0;RO=6;SAF=2;SAR=0;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.215299;OID=.;OPOS=57089344;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:2:8:2:8:6:2:0:6:0:10:6:2:0:6:0 chr16 57089348 . G GC 10.27 PASS AO=2;DP=8;FAO=2;FDP=8;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.0145017;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=65.5;QD=5.13461;RBI=0.0145017;REFB=-0.00102322;REVB=0;RO=6;SAF=2;SAR=0;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00185549;OID=.;OPOS=57089349;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:2:8:2:8:6:2:0:6:0:10:6:2:0:6:0 chr16 57089351 . C CT 10.28 PASS AO=2;DP=8;FAO=2;FDP=8;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.00888164;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=33.433;QD=5.13754;RBI=0.00888164;REFB=-0.00156685;REVB=0;RO=6;SAF=2;SAR=0;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.000303654;OID=.;OPOS=57089352;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:2:8:2:8:6:2:0:6:0:10:6:2:0:6:0 chr16 57158352 . C A 164.89 PASS AO=49;DP=123;FAO=49;FDP=123;FR=.;FRO=74;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=25;FSRR=49;FWDB=0.00294042;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.399;QD=5.36224;RBI=0.0108707;REFB=0.000724302;REVB=-0.0104655;RO=72;SAF=22;SAR=27;SRF=25;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110123;STB=0.568487;TYPE=snp;VARB=-0.00145222;OID=.;OPOS=57158352;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:72:74:49:49:27:22:25:47:27:22:25:49 chr16 57159871 . TG T 923.61 PASS AO=129;DP=182;FAO=169;FDP=170;FR=.;FRO=1;FSAF=72;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.296999;FXX=0.0229872;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.8491;QD=21.732;RBI=0.352633;REFB=0.00897825;REVB=-0.19011;RO=20;SAF=54;SAR=75;SRF=17;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0.524887;SSSB=-0.110186;STB=0.502564;TYPE=del;VARB=0.012559;OID=.;OPOS=57159872;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:129:173:169:170:1:72:97:0:1:67:20:54:75:17:3 chr16 57286989 . G A 371.82 PASS AO=129;DP=351;FAO=130;FDP=354;FR=.;FRO=224;FSAF=50;FSAR=80;FSRF=87;FSRR=137;FWDB=-0.0631089;FXX=0.00281682;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.7542;QD=4.20136;RBI=0.0631103;REFB=-0.0100801;REVB=-0.000430765;RO=220;SAF=51;SAR=78;SRF=84;SRR=136;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0158635;STB=0.502521;TYPE=snp;VARB=0.0233721;OID=.;OPOS=57286989;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:351:354:220:224:129:130:78:51:84:136:80:50:87:137 chr16 57392733 . A C 221.1 PASS AO=21;DP=29;FAO=27;FDP=29;FR=.,HEALED;FRO=2;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0494335;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.3135;QD=30.4968;RBI=0.0931224;REFB=-0.0780451;REVB=0.0789184;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.501278;TYPE=snp;VARB=0.00835621;OID=.;OPOS=57392733;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:29:29:0:2:21:27:12:9:0:0:13:14:1:1 chr16 57496931 . G C 189.5 PASS AO=41;DP=104;FAO=48;FDP=106;FR=.,HEALED;FRO=58;FSAF=38;FSAR=10;FSRF=36;FSRR=22;FWDB=0.00529831;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.1179;QD=7.1509;RBI=0.0494962;REFB=-0.0201787;REVB=-0.0492118;RO=38;SAF=37;SAR=4;SRF=34;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0186552;STB=0.621621;TYPE=snp;VARB=0.0426245;OID=.;OPOS=57496931;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:106:38:58:41:48:4:37:34:4:10:38:36:22 chr16 57499902 . T C 1715.92 PASS AO=182;DP=184;FAO=182;FDP=182;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0286235;FXX=0.010869;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3047;QD=37.7125;RBI=0.0492574;REFB=-0.0424814;REVB=0.0400873;RO=2;SAF=69;SAR=113;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00265502;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000689935;OID=.;OPOS=57499902;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:184:182:2:0:182:182:113:69:1:1:113:69:0:0 chr16 57503213 . C T 264.75 PASS AO=75;DP=181;FAO=75;FDP=180;FR=.;FRO=105;FSAF=43;FSAR=32;FSRF=40;FSRR=65;FWDB=0.0317789;FXX=0.0769191;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.418;QD=5.88338;RBI=0.0353156;REFB=-0.0053029;REVB=0.0154043;RO=102;SAF=43;SAR=32;SRF=39;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195081;STB=0.610927;TYPE=snp;VARB=0.0102236;OID=.;OPOS=57503213;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:180:102:105:75:75:32:43:39:63:32:43:40:65 chr16 57595999 . A G 112.99 PASS AO=33;DP=86;FAO=34;FDP=86;FR=.;FRO=52;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=38;FWDB=0.0031067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.978;QD=5.25518;RBI=0.0906553;REFB=-0.00724453;REVB=-0.090602;RO=52;SAF=20;SAR=13;SRF=14;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.349741;STB=0.701725;TYPE=snp;VARB=0.00752072;OID=.;OPOS=57595999;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:52:52:33:34:13:20:14:38:13:21:14:38 chr16 57689385 . C G 236.11 PASS AO=44;DP=84;FAO=49;FDP=88;FR=.;FRO=39;FSAF=41;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=25;FWDB=0.000108148;FXX=0.0222198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.172;QD=10.7322;RBI=0.00551583;REFB=-0.0142545;REVB=0.00551477;RO=38;SAF=38;SAR=6;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.509669;STB=0.754484;TYPE=snp;VARB=0.0069551;OID=.;OPOS=57689385;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:88:38:39:44:49:6:38:14:24:8:41:14:25 chr16 57689883 . T C 204.57 PASS AO=44;DP=87;FAO=45;FDP=88;FR=.;FRO=43;FSAF=12;FSAR=33;FSRF=6;FSRR=37;FWDB=-0.0221994;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.6438;QD=9.29867;RBI=0.0222357;REFB=-0.0364741;REVB=-0.00127074;RO=42;SAF=11;SAR=33;SRF=5;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170315;STB=0.58574;TYPE=snp;VARB=0.0312356;OID=.;OPOS=57689883;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:88:42:43:44:45:33:11:5:37:33:12:6:37 chr16 57723752 . A G 70.04 PASS AO=23;DP=66;FAO=23;FDP=66;FR=.;FRO=43;FSAF=19;FSAR=4;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=0.00202043;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.5701;QD=4.24463;RBI=0.0116404;REFB=-0.00899998;REVB=-0.0114637;RO=41;SAF=19;SAR=4;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.449627;STB=0.777516;TYPE=snp;VARB=0.0163838;OID=.;OPOS=57723752;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:66:66:41:43:23:23:4:19:19:22:4:19:19:24 chr16 57771126 . G T 648.65 PASS AO=67;DP=74;FAO=72;FDP=74;FR=.;FRO=2;FSAF=46;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.015348;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.759;QD=35.0624;RBI=0.015841;REFB=-0.020778;REVB=0.00392097;RO=7;SAF=40;SAR=27;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0486604;STB=0.518513;TYPE=snp;VARB=0.00503749;OID=.;OPOS=57771126;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:74:74:7:2:67:72:27:40:6:1:26:46:0:2 chr16 57785168 . C G 330.04 PASS AO=33;DP=148;FAO=67;FDP=127;FR=.,HEALED;FRO=59;FSAF=40;FSAR=27;FSRF=25;FSRR=34;FWDB=-0.148116;FXX=0.0155027;HRUN=5;LEN=1;MLLD=56.1386;QD=10.395;RBI=0.163914;REFB=-0.101755;REVB=0.0702091;RO=31;SAF=9;SAR=24;SRF=0;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.363077;STB=0.58162;TYPE=snp;VARB=0.00417572;OID=.;OPOS=57785168;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:127:31:59:33:67:24:9:0:31:27:40:25:34 chr16 57788922 . AG A 134.9 PASS AO=25;DP=45;FAO=38;FDP=41;FR=.;FRO=3;FSAF=27;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.136572;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=9.63972;QD=13.1605;RBI=0.376166;REFB=-0.144282;REVB=0.350499;RO=14;SAF=17;SAR=8;SRF=10;SRR=4;SSEN=0.492492;SSEP=0;SSSB=-0.0259417;STB=0.503886;TYPE=del;VARB=0.063871;OID=.;OPOS=57788923;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:25:41:38:41:3:27:11:2:1:4:14:17:8:10:4 chr16 57850141 . C G 493.27 PASS AO=111;DP=220;FAO=112;FDP=219;FR=.;FRO=107;FSAF=66;FSAR=46;FSRF=46;FSRR=61;FWDB=0.0511014;FXX=0.00454525;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.4947;QD=9.00949;RBI=0.064053;REFB=0.0337023;REVB=-0.0386191;RO=105;SAF=65;SAR=46;SRF=45;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139711;STB=0.578175;TYPE=snp;VARB=-0.0321243;OID=.;OPOS=57850141;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:220:219:105:107:111:112:46:65:45:60:46:66:46:61 chr16 57937856 . G C 1214.73 PASS AO=132;DP=138;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.050739;FXX=0.00719373;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.3989;QD=35.2094;RBI=0.0527793;REFB=0.0115178;REVB=0.0145331;RO=6;SAF=66;SAR=66;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0137543;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000129402;OID=.;OPOS=57937856;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:138:138:6:0:132:138:66:66:4:2:68:70:0:0 chr16 57996932 . G A 67.1 PASS AO=10;DP=28;FAO=14;FDP=27;FR=.,HEALED;FRO=12;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=1;FWDB=-0.0387535;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.847;QD=9.94071;RBI=0.0583166;REFB=-0.0319774;REVB=0.0435774;RO=5;SAF=0;SAR=10;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.840897;STB=0.772838;TYPE=snp;VARB=0.0801885;OID=.;OPOS=57996932;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:23:27:5:12:10:14:10:0:5:0:10:4:11:1 chr16 57996960 . C T 147.37 PASS AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0632267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.33;QD=36.843;RBI=0.0657007;REFB=0;REVB=0.0178593;RO=0;SAF=3;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.78418e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000728329;OID=.;OPOS=57996960;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:16:0:0:16:16:13:3:0:0:13:3:0:0 chr16 58030634 . C T 49.59 PASS AO=11;DP=30;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.0197294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.046;QD=6.83998;RBI=0.0209332;REFB=-0.00948215;REVB=-0.00699653;RO=13;SAF=5;SAR=6;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140078;STB=0.502954;TYPE=snp;VARB=0.0171705;OID=.;OPOS=58030634;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:28:29:13:17:11:12:6:5:4:9:7:5:7:10 chr16 58032109 . G A 160.55 PASS AO=17;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.128854;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.911;QD=35.6782;RBI=0.128854;REFB=0;REVB=0;RO=1;SAF=17;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000911313;OID=.;OPOS=58032109;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:18:18:1:0:17:18:0:17:1:0:0:18:0:0 chr16 58080009 . C T 73.9 PASS AO=14;DP=25;FAO=14;FDP=25;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=10;FWDB=0.00889097;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.9311;QD=11.8233;RBI=0.0148961;REFB=0.0296278;REVB=-0.0119518;RO=11;SAF=3;SAR=11;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158579;STB=0.588673;TYPE=snp;VARB=-0.0224561;OID=.;OPOS=58080009;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:25:25:11:11:14:14:11:3:1:10:11:3:1:10 chr16 58191966 . C T 1105.13 PASS AO=114;DP=116;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00836484;FXX=0.025208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.0243;QD=38.108;RBI=0.0660834;REFB=0;REVB=0.0655519;RO=0;SAF=64;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.2792e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000495969;OID=.;OPOS=58191966;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:116:116:0:0:114:116:50:64:0:0:52:64:0:0 chr16 58314433 . T C 1208.39 PASS AO=126;DP=126;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0252317;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.629;QD=38.3617;RBI=0.025481;REFB=0;REVB=-0.00355567;RO=0;SAF=62;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.29882e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000170978;OID=.;OPOS=58314433;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:126:126:0:0:126:126:64:62:0:0:64:62:0:0 chr16 58314504 . GCC GC,GCG 466.75 PASS AO=17,20;DP=70;FAO=49,21;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=38,0;FSAR=11,21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.747028,0.100385;FXX=0.0140825;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=11.6578,127.908;QD=26.6716;RBI=0.747028,0.100708;REFB=0,0;REVB=7.04097e-05,-0.00805348;RO=27;SAF=8,0;SAR=9,20;SRF=27;SRR=0;SSEN=0.272727,0;SSEP=0.460204,0;SSSB=-0.569085,-0.889072;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.0161802,0.103966;OID=.,.;OPOS=58314505,58314506;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=GC,GCG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:17,20:69:49,21:70:0:38,0:11,21:0:0:52:27:8,0:9,20:27:0 chr16 58314598 . C T 1031.58 PASS AO=104;DP=105;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191686;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.407;QD=37.5118;RBI=0.0331236;REFB=-0.103137;REVB=0.0270137;RO=0;SAF=28;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.80081e-05;OID=.;OPOS=58314598;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:105:110:0:0:104:110:76:28:0:0:81:29:0:0 chr16 58327646 . A G 908 PASS AO=101;DP=106;FAO=102;FDP=106;FR=.;FRO=4;FSAF=59;FSAR=43;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.000139106;FXX=0.00934492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.2648;QD=34.2641;RBI=0.0229151;REFB=-0.0617183;REVB=0.0229147;RO=4;SAF=59;SAR=42;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00624593;STB=0.503031;TYPE=snp;VARB=0.00518487;OID=.;OPOS=58327646;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:106:106:4:4:101:102:42:59:2:2:43:59:2:2 chr16 58530833 . A G 164.93 PASS AO=41;DP=90;FAO=41;FDP=90;FR=.;FRO=49;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=0.00631717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.605;QD=7.33034;RBI=0.00642321;REFB=-0.0125289;REVB=-0.00116233;RO=49;SAF=16;SAR=25;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0590824;STB=0.533093;TYPE=snp;VARB=0.0133415;OID=.;OPOS=58530833;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:49:49:41:41:25:16:22:27:25:16:22:27 chr16 58538556 . G A 238.23 PASS AO=46;DP=80;FAO=46;FDP=80;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=37;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=-0.00751426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.768;QD=11.9113;RBI=0.0150592;REFB=-0.00878715;REVB=0.0130505;RO=34;SAF=9;SAR=37;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22389;STB=0.623841;TYPE=snp;VARB=0.00617649;OID=.;OPOS=58538556;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:34:34:46:46:37:9:14:20:37:9:14:20 chr16 58616984 . T C 1531.75 PASS AO=157;DP=157;FAO=161;FDP=161;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0081034;FXX=0.0122692;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.202;QD=38.0558;RBI=0.040947;REFB=0;REVB=0.0401372;RO=0;SAF=78;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000204964;OID=.;OPOS=58616984;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:157:161:0:0:157:161:79:78:0:0:82:79:0:0 chr16 58713798 . G A 334.42 PASS AO=67;DP=118;FAO=67;FDP=118;FR=.;FRO=51;FSAF=46;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=23;FWDB=0.0413546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.6416;QD=11.3361;RBI=0.0454768;REFB=-0.0419108;REVB=-0.0189192;RO=50;SAF=46;SAR=21;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126102;STB=0.565659;TYPE=snp;VARB=0.0231194;OID=.;OPOS=58713798;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:50:51:67:67:21:46:27:23:21:46:28:23 chr16 58743454 . A C 1338.24 PASS AO=137;DP=137;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0687737;FXX=0.00714235;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.072;QD=38.5104;RBI=0.0699547;REFB=0;REVB=0.0127998;RO=0;SAF=60;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.56631e-05;OID=.;OPOS=58743454;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:137:139:0:0:137:139:77:60:0:0:78:61:0:0 chr16 58750604 . G A 351.11 PASS AO=35;DP=35;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145392;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.609;QD=37.9582;RBI=0.0346469;REFB=0;REVB=0.0314487;RO=0;SAF=31;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000232958;OID=.;OPOS=58750604;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:35:37:0:0:35:37:4:31:0:0:4:33:0:0 chr16 58752466 . C T 432.92 PASS AO=102;DP=206;FAO=102;FDP=205;FR=.;FRO=103;FSAF=42;FSAR=60;FSRF=59;FSRR=44;FWDB=-0.0672637;FXX=0.00485413;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.2971;QD=8.44724;RBI=0.067639;REFB=-0.0286587;REVB=0.00711536;RO=102;SAF=42;SAR=60;SRF=58;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143196;STB=0.581112;TYPE=snp;VARB=0.0140054;OID=.;OPOS=58752466;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:206:205:102:103:102:102:60:42:58:44:60:42:59:44 chr16 58757668 . A C 1899.96 PASS AO=197;DP=198;FAO=198;FDP=198;FR=.;FRO=0;FSAF=100;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0184755;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.845;QD=38.3831;RBI=0.0279665;REFB=0;REVB=0.0209947;RO=0;SAF=99;SAR=98;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.91791e-06;OID=.;OPOS=58757668;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:89:198:198:0:0:197:198:98:99:0:0:98:100:0:0 chr16 58757683 . A G 1970.19 PASS AO=203;DP=205;FAO=205;FDP=205;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00642707;FXX=0.0144224;HRUN=1;LEN=1;MLLD=324.878;QD=38.4426;RBI=0.0142688;REFB=0;REVB=-0.0127394;RO=0;SAF=98;SAR=105;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.7079e-05;OID=.;OPOS=58757683;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:205:205:0:0:203:205:105:98:0:0:107:98:0:0 chr16 58766287 . A C 2729.19 PASS AO=286;DP=287;FAO=286;FDP=286;FR=.;FRO=0;FSAF=121;FSAR=165;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00497953;FXX=0.0034842;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.285;QD=38.1705;RBI=0.00705482;REFB=0.00757794;REVB=0.00499748;RO=1;SAF=121;SAR=165;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00288148;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.80709e-06;OID=.;OPOS=58766287;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:287:286:1:0:286:286:165:121:0:1:165:121:0:0 chr16 58768129 . C A 39.29 PASS AO=8;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=0.00578687;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.78;QD=9.24561;RBI=0.0450831;REFB=0.00283602;REVB=0.0447102;RO=9;SAF=4;SAR=4;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.355666;STB=0.705454;TYPE=snp;VARB=-0.00402426;OID=.;OPOS=58768129;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:17:17:9:9:8:8:4:4:8:1:4:4:8:1 chr16 58804449 . T C 652.27 PASS AO=65;DP=67;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0279379;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.173;QD=38.3689;RBI=0.0361155;REFB=0;REVB=-0.0228867;RO=2;SAF=38;SAR=27;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0242139;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000588254;OID=.;OPOS=58804449;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:67:68:2:0:65:68:27:38:2:0:28:40:0:0 chr16 61777269 . C A 225.7 PASS AO=62;DP=144;FAO=62;FDP=144;FR=.;FRO=82;FSAF=24;FSAR=38;FSRF=38;FSRR=44;FWDB=0.0294512;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=198.868;QD=6.26932;RBI=0.031288;REFB=-0.0206104;REVB=-0.0105626;RO=80;SAF=24;SAR=38;SRF=38;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0911388;STB=0.544851;TYPE=snp;VARB=0.028266;OID=.;OPOS=61777269;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:144:80:82:62:62:38:24:38:42:38:24:38:44 chr16 64980818 . C T 1674.41 PASS AO=175;DP=175;FAO=175;FDP=175;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0211104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.372;QD=38.2722;RBI=0.0311326;REFB=0;REVB=0.022882;RO=0;SAF=95;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.56058e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.14423e-05;OID=.;OPOS=64980818;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:175:175:0:0:175:175:80:95:0:0:80:95:0:0 chr16 65016087 . A C 2059.35 PASS AO=215;DP=215;FAO=215;FDP=215;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=146;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0738842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2674;QD=38.3135;RBI=0.0742094;REFB=0;REVB=-0.00694001;RO=0;SAF=69;SAR=146;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000226413;OID=.;OPOS=65016087;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:97:215:215:0:0:215:215:146:69:0:0:146:69:0:0 chr16 66420885 . C T 337.46 PASS AO=76;DP=150;FAO=76;FDP=149;FR=.;FRO=73;FSAF=15;FSAR=61;FSRF=12;FSRR=61;FWDB=-0.0108677;FXX=0.00666622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.4691;QD=9.05919;RBI=0.0120077;REFB=-0.025591;REVB=-0.00510669;RO=73;SAF=15;SAR=61;SRF=12;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0479993;STB=0.526309;TYPE=snp;VARB=0.0231857;OID=.;OPOS=66420885;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:149:73:73:76:76:61:15:12:61:61:15:12:61 chr16 66432423 . T C 121.15 PASS AO=33;DP=76;FAO=32;FDP=75;FR=.;FRO=43;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=27;FWDB=-0.0157054;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.08;QD=6.46147;RBI=0.0195812;REFB=-0.0278674;REVB=0.0116946;RO=43;SAF=15;SAR=18;SRF=16;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.084206;STB=0.538438;TYPE=snp;VARB=0.0447236;OID=.;OPOS=66432423;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:75:43:43:33:32:18:15:16:27:18:14:16:27 chr16 66596945 . G GT 24.1 PASS AO=20;DP=68;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=0.229978;FXX=0.0714184;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.51585;QD=1.48312;RBI=0.366023;REFB=-0.118643;REVB=-0.284751;RO=42;SAF=10;SAR=10;SRF=27;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164824;STB=0.507892;TYPE=ins;VARB=0.146106;OID=.;OPOS=66596946;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:20:68:26:65:39:15:11:23:16:24:42:10:10:27:15 chr16 66600578 . C G 10.38 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=41.2255;QD=5.93167;RBI=0.0213643;REFB=-0.0840353;REVB=-0.0213643;RO=5;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.15159;OID=.;OPOS=66600578;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:5:5:2:2:2:0:0:5:2:0:0:5 chr16 66646554 . GC G 318.81 PASS AO=44;DP=66;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.23648;FXX=0.0344768;HRUN=2;LEN=1;MLLD=12.4658;QD=22.7721;RBI=0.24;REFB=0;REVB=-0.0409521;RO=4;SAF=20;SAR=24;SRF=2;SRR=2;SSEN=0.285418;SSEP=0;SSSB=-0.00714936;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.00273483;OID=.;OPOS=66646555;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:44:58:56:56:0:26:30:0:0:28:4:20:24:2:2 chr16 66765067 . G A 423.58 PASS AO=88;DP=156;FAO=88;FDP=160;FR=.;FRO=72;FSAF=52;FSAR=36;FSRF=49;FSRR=23;FWDB=-0.0128959;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.045;QD=10.5895;RBI=0.0148858;REFB=-0.0311893;REVB=-0.00743533;RO=68;SAF=52;SAR=36;SRF=48;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0971787;STB=0.542353;TYPE=snp;VARB=0.0248311;OID=.;OPOS=66765067;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:160:68:72:88:88:36:52:48:20:36:52:49:23 chr16 66792714 . T C 71.26 PASS AO=22;DP=61;FAO=22;FDP=61;FR=.;FRO=39;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=32;FWDB=0.0882092;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.0613;QD=4.67254;RBI=0.0891572;REFB=0.00442369;REVB=0.0129665;RO=38;SAF=9;SAR=13;SRF=6;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.309091;STB=0.660561;TYPE=snp;VARB=-0.00419697;OID=.;OPOS=66792714;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:61:61:38:39:22:22:13:9:6:32:13:9:7:32 chr16 66812797 . C T 437.33 PASS AO=110;DP=242;FAO=113;FDP=245;FR=.;FRO=132;FSAF=41;FSAR=72;FSRF=69;FSRR=63;FWDB=0.0171235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.525;QD=7.14004;RBI=0.0171868;REFB=-0.00361432;REVB=-0.00147363;RO=131;SAF=40;SAR=70;SRF=68;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156823;STB=0.588613;TYPE=snp;VARB=0.00295542;OID=.;OPOS=66812797;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:242:245:131:132:110:113:70:40:68:63:72:41:69:63 chr16 67190419 . AG A 336.29 PASS AO=40;DP=49;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.259662;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=14.3432;QD=23.5993;RBI=0.26341;REFB=-0.0442858;REVB=0.0442741;RO=7;SAF=27;SAR=13;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0.310377;SSSB=0.0323341;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0200988;OID=.;OPOS=67190420;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:40:48:57:57:0:32:25:0:0:24:7:27:13:4:3 chr16 67201261 . G A 161.64 PASS AO=46;DP=112;FAO=46;FDP=112;FR=.;FRO=66;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=19;FSRR=47;FWDB=0.04225;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.8742;QD=5.77267;RBI=0.0447665;REFB=0.0162641;REVB=0.0147978;RO=64;SAF=20;SAR=26;SRF=18;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166349;STB=0.5901;TYPE=snp;VARB=-0.0207343;OID=.;OPOS=67201261;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:64:66:46:46:26:20:18:46:26:20:19:47 chr16 67201665 . AG A 74.83 PASS AO=14;DP=37;FAO=28;FDP=35;FR=.;FRO=7;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.15957;FXX=0.0277701;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.11478;QD=8.55197;RBI=0.227897;REFB=-0.000563907;REVB=-0.162709;RO=10;SAF=2;SAR=12;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.490824;STB=0.545421;TYPE=del;VARB=0.0921366;OID=.;OPOS=67201666;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:14:35:28:35:7:10:18:4:3:5:10:2:12:7:3 chr16 67201726 . GC G 82.34 PASS AO=21;DP=49;FAO=33;FDP=41;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=25;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.108409;FXX=0.0681663;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.12451;QD=8.03284;RBI=0.12634;REFB=-0.126233;REVB=0.0648803;RO=15;SAF=1;SAR=20;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.565381;STB=0.502007;TYPE=del;VARB=0.128845;OID=.;OPOS=67201727;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:21:44:33:41:8:8:25:2:6:5:15:1:20:6:9 chr16 67235672 . C T 43.11 PASS AO=13;DP=38;FAO=13;FDP=38;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=-0.00425634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.622;QD=4.53738;RBI=0.0389045;REFB=-0.024688;REVB=-0.038671;RO=25;SAF=8;SAR=5;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.317237;STB=0.687229;TYPE=snp;VARB=0.0502256;OID=.;OPOS=67235672;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:38:38:25:25:13:13:5:8:8:17:5:8:8:17 chr16 67289692 . TG T 694.27 PASS AO=87;DP=111;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.359058;FXX=0.0183469;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.4266;QD=25.9541;RBI=0.363076;REFB=0.0228542;REVB=0.0538688;RO=12;SAF=31;SAR=56;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0950896;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00842379;OID=.;OPOS=67289693;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:87:109:107:107:0:41:66:0:0:57:12:31:56:9:3 chr16 67320231 . GC G 586.02 PASS AO=76;DP=113;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.345197;FXX=0.0275204;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.4263;QD=22.1141;RBI=0.362609;REFB=-0.0123868;REVB=0.111012;RO=21;SAF=35;SAR=41;SRF=13;SRR=8;SSEN=0.487603;SSEP=0;SSSB=-0.0642758;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0155012;OID=.;OPOS=67320232;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:76:106:106:106:0:54:52:0:0:47:21:35:41:13:8 chr16 67320920 . C T 88.34 PASS AO=24;DP=59;FAO=24;FDP=59;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=0.0165984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.403;QD=5.98896;RBI=0.02416;REFB=0.00804531;REVB=0.0175557;RO=35;SAF=12;SAR=12;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.044417;STB=0.525403;TYPE=snp;VARB=-0.00751041;OID=.;OPOS=67320920;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:59:59:35:35:24:24:12:12:19:16:12:12:19:16 chr16 67576811 . C T 11.81 PASS AO=4;DP=19;FAO=4;FDP=19;FR=.;FRO=15;FSAF=0;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=15;FWDB=0;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=45.1125;QD=2.48635;RBI=0.000874955;REFB=-0.0095022;REVB=0.000874955;RO=15;SAF=0;SAR=4;SRF=0;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0435282;OID=.;OPOS=67576811;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:19:19:15:15:4:4:4:0:0:15:4:0:0:15 chr16 67691668 . A G 185.48 PASS AO=36;DP=82;FAO=43;FDP=89;FR=.;FRO=46;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=0.170241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.5;QD=8.33625;RBI=0.174081;REFB=-0.0234265;REVB=-0.0363648;RO=46;SAF=14;SAR=22;SRF=18;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00253003;STB=0.550291;TYPE=snp;VARB=0.0307008;OID=.;OPOS=67691668;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:89:46:46:36:43:22:14:18:28:22:21:18:28 chr16 67701432 . AG A,AGG 20.11 PASS AO=7,3;DP=21;FAO=9,0;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=3,0;FSAR=6,0;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=-0.0338302,0.0326081;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=11.6698,11.8847;QD=4.23454;RBI=0.136088,0.156089;REFB=-0.0317248,0.0360064;REVB=0.131816,-0.152645;RO=8;SAF=1,0;SAR=6,3;SRF=3;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0.5,0;SSSB=-0.300057,-0.630366;STB=0.583162,0.5;TYPE=del,ins;VARB=0.0725331,0;OID=.,.;OPOS=67701433,67701433;OREF=G,-;OALT=-,G;OMAPALT=A,AGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:7,3:18:9,0:19:10:3,0:6,0:2:8:20:8:1,0:6,3:3:5 chr16 67759871 . AT A 56.37 PASS AO=29;DP=184;FAO=41;FDP=105;FR=.;FRO=64;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=51;FWDB=-0.131531;FXX=0.186032;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.782;QD=2.1475;RBI=0.131948;REFB=-0.057067;REVB=0.0104739;RO=62;SAF=14;SAR=15;SRF=13;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.329782;STB=0.663249;TYPE=del;VARB=0.0871677;OID=.;OPOS=67759872;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:29:128:41:105:64:19:22:13:51:56:62:14:15:13:49 chr16 67911137 . GC G 342.2 PASS AO=38;DP=56;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.189517;FXX=0.0535619;HRUN=2;LEN=1;MLLD=14.3318;QD=25.8267;RBI=0.30574;REFB=0;REVB=0.239917;RO=14;SAF=24;SAR=14;SRF=7;SRR=7;SSEN=0.6;SSEP=0;SSSB=0.068818;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0132691;OID=.;OPOS=67911138;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:38:56:53:53:0:31:22:0:0:33:14:24:14:7:7 chr16 68025801 . G C 514.24 PASS AO=60;DP=64;FAO=60;FDP=64;FR=.;FRO=4;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0613664;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.2308;QD=32.14;RBI=0.0742967;REFB=-0.0554207;REVB=0.0418827;RO=4;SAF=25;SAR=35;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0202569;STB=0.510749;TYPE=snp;VARB=0.0113625;OID=.;OPOS=68025801;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:64:64:4:4:60:60:35:25:1:3:35:25:1:3 chr16 68057096 . T C 296.79 PASS AO=30;DP=30;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147361;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.4048;QD=37.0984;RBI=0.0967708;REFB=0;REVB=0.0956422;RO=0;SAF=10;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00140255;OID=.;OPOS=68057096;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:30:32:0:0:30:32:20:10:0:0:22:10:0:0 chr16 68100461 . C T 519.9 PASS AO=97;DP=159;FAO=97;FDP=159;FR=.;FRO=62;FSAF=31;FSAR=66;FSRF=15;FSRR=47;FWDB=0.0353924;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.134;QD=13.0793;RBI=0.0442955;REFB=-0.00941621;REVB=-0.0266358;RO=62;SAF=31;SAR=66;SRF=15;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0661008;STB=0.535702;TYPE=snp;VARB=0.00802083;OID=.;OPOS=68100461;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:159:62:62:97:97:66:31:15:47:66:31:15:47 chr16 68344696 . C T 173.08 PASS AO=34;DP=59;FAO=34;FDP=61;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=-0.0512116;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=137.213;QD=11.3495;RBI=0.0512117;REFB=-0.0119641;REVB=0.000113052;RO=25;SAF=10;SAR=24;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0592124;STB=0.557487;TYPE=snp;VARB=0.0160368;OID=.;OPOS=68344696;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:61:25:27:34:34:24:10:9:16:24:10:11:16 chr16 68373428 . C T 107.12 PASS AO=26;DP=57;FAO=26;FDP=57;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=-0.0546211;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.033;QD=7.51696;RBI=0.0549307;REFB=-0.0181347;REVB=0.00582393;RO=30;SAF=8;SAR=18;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0637113;STB=0.529389;TYPE=snp;VARB=0.0180654;OID=.;OPOS=68373428;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:30:31:26:26:18:8:11:19:18:8:11:20 chr16 68393500 . AG A 111.1 PASS AO=13;DP=25;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.150618;FXX=0.0416493;HRUN=3;LEN=1;MLLD=9.23287;QD=19.3219;RBI=0.397047;REFB=0;REVB=0.36737;RO=7;SAF=5;SAR=8;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0.647059;SSSB=0.166666;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0216527;OID=.;OPOS=68393501;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:13:24:23:23:0:7:16:0:0:10:7:5:8:1:6 chr16 68395122 . TC T 20.55 PASS AO=5;DP=23;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.0381347;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=13.4381;QD=3.7359;RBI=0.204122;REFB=-0.08035;REVB=0.200529;RO=13;SAF=5;SAR=0;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.705031;STB=0.764832;TYPE=del;VARB=0.138765;OID=.;OPOS=68395123;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:5:22:8:22:14:7:1:8:6:20:13:5:0:7:6 chr16 68398924 . C T 99.02 PASS AO=25;DP=59;FAO=25;FDP=58;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=0.00638267;FXX=0.0491723;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.378;QD=6.82926;RBI=0.015947;REFB=-0.0240324;REVB=-0.014614;RO=28;SAF=11;SAR=14;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108765;STB=0.52571;TYPE=snp;VARB=0.0296429;OID=.;OPOS=68398924;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:58:28:33:25:25:14:11:12:16:14:11:16:17 chr16 68405982 . C T 111.14 PASS AO=20;DP=33;FAO=20;FDP=33;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=0.0607322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.1987;QD=13.4716;RBI=0.0755495;REFB=-0.0218647;REVB=0.0449369;RO=13;SAF=8;SAR=12;SRF=2;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190573;STB=0.605166;TYPE=snp;VARB=0.01909;OID=.;OPOS=68405982;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:33:33:13:13:20:20:12:8:2:11:12:8:2:11 chr16 68732049 . A C 479.28 PASS AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0088011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.805;QD=37.5902;RBI=0.00887694;REFB=0;REVB=0.00115788;RO=0;SAF=28;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97956e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.38093e-05;OID=.;OPOS=68732049;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:51:51:0:0:51:51:23:28:0:0:23:28:0:0 chr16 68857441 . T C 1324.78 PASS AO=134;DP=134;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0246013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.443;QD=38.3993;RBI=0.0582915;REFB=0;REVB=0.0528458;RO=0;SAF=81;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.90283e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000137296;OID=.;OPOS=68857441;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:134:138:0:0:134:138:53:81:0:0:55:83:0:0 chr16 68862165 . C T 140.6 PASS AO=34;DP=73;FAO=34;FDP=73;FR=.;FRO=39;FSAF=30;FSAR=4;FSRF=27;FSRR=12;FWDB=0.01139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.803;QD=7.70399;RBI=0.0114119;REFB=-0.0129216;REVB=0.000707909;RO=39;SAF=30;SAR=4;SRF=27;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.310705;STB=0.67784;TYPE=snp;VARB=0.0166521;OID=.;OPOS=68862165;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:39:39:34:34:4:30:27:12:4:30:27:12 chr16 68869449 . A G 788.41 PASS AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00772972;FXX=0.0119033;HRUN=3;LEN=1;MLLD=216.242;QD=37.9954;RBI=0.0163444;REFB=0;REVB=-0.014401;RO=0;SAF=30;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000208097;OID=.;OPOS=68869449;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:83:83:0:0:83:83:53:30:0:0:53:30:0:0 chr16 69143577 . A G 195.52 PASS AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00342914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.027;QD=39.1048;RBI=0.0686013;REFB=0;REVB=0.0685155;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00108773;OID=.;OPOS=69143577;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:20:20:0:0:20:20:10:10:0:0:10:10:0:0 chr16 69358475 . CCT C 55.53 PASS AO=9;DP=42;FAO=19;FDP=31;FR=.;FRO=12;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=-0.00141312;FXX=0.162118;HRUN=7;LEN=2;MLLD=11.5272;QD=7.16575;RBI=0.225546;REFB=-0.0453369;REVB=0.225542;RO=21;SAF=8;SAR=1;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.466663;STB=0.702891;TYPE=del;VARB=0.101093;OID=.;OPOS=69358476;OREF=CT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:9:39:19:31:12:15:4:4:8:17:21:8:1:12:9 chr16 69493004 . A C 34.72 PASS AO=13;DP=43;FAO=13;FDP=45;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=-0.0150027;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=43.2838;QD=3.08615;RBI=0.0721924;REFB=-0.00194382;REVB=-0.0706163;RO=30;SAF=7;SAR=6;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196766;STB=0.636165;TYPE=snp;VARB=0.00680595;OID=.;OPOS=69493004;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:43:45:30:32:13:13:6:7:11:19:6:7:11:21 chr16 69499731 . T C 146.95 PASS AO=46;DP=121;FAO=46;FDP=121;FR=.;FRO=75;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=33;FSRR=42;FWDB=-0.0216707;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.6093;QD=4.85787;RBI=0.046954;REFB=0.00314828;REVB=-0.041654;RO=75;SAF=25;SAR=21;SRF=33;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112464;STB=0.563882;TYPE=snp;VARB=-0.00929729;OID=.;OPOS=69499731;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:75:75:46:46:21:25:33:42:21:25:33:42 chr16 69704122 . C CTG 70.19 PASS AO=20;DP=86;FAO=26;FDP=79;FR=.;FRO=53;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=30;FWDB=0.0253698;FXX=0.048187;HRUN=5;LEN=2;MLLD=214.52;QD=3.55378;RBI=0.0263551;REFB=-0.00547782;REVB=-0.00713905;RO=57;SAF=11;SAR=9;SRF=22;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198209;STB=0.51865;TYPE=ins;VARB=0.0090845;OID=.;OPOS=69704123;OREF=-;OALT=TG;OMAPALT=CTG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:20:86:26:79:53:12:14:23:30:70:57:11:9:22:35 chr16 69704204 . CT C 30.6 PASS AO=26;DP=75;FAO=29;FDP=71;FR=.;FRO=42;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=-0.00514747;FXX=0.0405351;HRUN=7;LEN=1;MLLD=8.46728;QD=1.72391;RBI=0.0613878;REFB=-0.0603013;REVB=0.0611716;RO=42;SAF=10;SAR=16;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0752342;STB=0.511803;TYPE=del;VARB=0.0666595;OID=.;OPOS=69704205;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:26:75:29:71:42:13:16:18:24:30:42:10:16:19:23 chr16 69733460 . G A 471.63 PASS AO=120;DP=256;FAO=121;FDP=258;FR=.;FRO=137;FSAF=58;FSAR=63;FSRF=79;FSRR=58;FWDB=-0.00262133;FXX=0.00386085;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4989;QD=7.3121;RBI=0.0267453;REFB=-0.0279416;REVB=0.0266166;RO=134;SAF=58;SAR=62;SRF=76;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0800774;STB=0.551528;TYPE=snp;VARB=0.0279466;OID=.;OPOS=69733460;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:256:258:134:137:120:121:62:58:76:58:63:58:79:58 chr16 69733665 . T G 322.8 PASS AO=88;DP=201;FAO=88;FDP=201;FR=.;FRO=113;FSAF=49;FSAR=39;FSRF=60;FSRR=53;FWDB=0.0124943;FXX=0.0147052;HRUN=3;LEN=1;MLLD=109.986;QD=6.42397;RBI=0.018218;REFB=-0.0028196;REVB=-0.0132584;RO=111;SAF=48;SAR=40;SRF=59;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140613;STB=0.514667;TYPE=snp;VARB=0.00391557;OID=.;OPOS=69733665;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:201:111:113:88:88:40:48:59:52:39:49:60:53 chr16 69735271 . T A 746.07 PASS AO=158;DP=303;FAO=165;FDP=309;FR=.;FRO=144;FSAF=83;FSAR=82;FSRF=73;FSRR=71;FWDB=0.0346719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.4435;QD=9.65792;RBI=0.0347039;REFB=-0.0434412;REVB=0.0014895;RO=127;SAF=78;SAR=80;SRF=68;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0342267;STB=0.501824;TYPE=snp;VARB=0.0294522;OID=.;OPOS=69735271;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:303:309:127:144:158:165:80:78:68:59:82:83:73:71 chr16 69782855 . C T 157.9 PASS AO=32;DP=59;FAO=32;FDP=59;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=7;FSRR=20;FWDB=0.00369307;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=91.916;QD=10.7051;RBI=0.0470499;REFB=-0.0363674;REVB=0.0469048;RO=26;SAF=13;SAR=19;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118246;STB=0.571547;TYPE=snp;VARB=0.0260525;OID=.;OPOS=69782855;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:26:27:32:32:19:13:7:19:19:13:7:20 chr16 69832622 . T G 342.84 PASS AO=86;DP=185;FAO=86;FDP=184;FR=.;FRO=98;FSAF=43;FSAR=43;FSRF=42;FSRR=56;FWDB=-0.00368539;FXX=0.00540511;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.078;QD=7.453;RBI=0.00828283;REFB=0.00161377;REVB=-0.00741775;RO=98;SAF=43;SAR=43;SRF=42;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0687855;STB=0.538035;TYPE=snp;VARB=-0.00164964;OID=.;OPOS=69832622;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:184:98:98:86:86:43:43:42:56:43:43:42:56 chr16 69963355 . G A 327.65 PASS AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.075;QD=37.4458;RBI=0.0249234;REFB=0;REVB=-0.0154801;RO=0;SAF=23;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.07645e-05;OID=.;OPOS=69963355;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:35:35:0:0:35:35:12:23:0:0:12:23:0:0 chr16 69963403 . G A 22.29 PASS AO=9;DP=36;FAO=9;FDP=36;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.00273682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.655;QD=2.47619;RBI=0.0621865;REFB=-0.000810205;REVB=-0.0621263;RO=27;SAF=8;SAR=1;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.419944;STB=0.778008;TYPE=snp;VARB=0.000265953;OID=.;OPOS=69963403;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:36:36:27:27:9:9:1:8:17:10:1:8:17:10 chr16 69967897 . T C 677.13 PASS AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.092;QD=38.6933;RBI=0.0378113;REFB=0;REVB=-0.028917;RO=0;SAF=23;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.79556e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.10629e-05;OID=.;OPOS=69967897;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:70:70:0:0:70:70:47:23:0:0:47:23:0:0 chr16 69970329 . A G 364.09 PASS AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0230132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.401;QD=36.4094;RBI=0.0502887;REFB=0.0259292;REVB=0.0447141;RO=1;SAF=21;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218009;STB=0.511622;TYPE=snp;VARB=0.000105661;OID=.;OPOS=69970329;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:40:40:1:1:39:39:18:21:1:0:18:21:1:0 chr16 69973825 . G A 58.2 PASS AO=9;DP=64;FAO=19;FDP=56;FR=.,HEALED;FRO=36;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=23;FSRR=13;FWDB=-0.353364;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=20.2211;QD=4.15714;RBI=0.355971;REFB=-0.0847822;REVB=-0.0430009;RO=12;SAF=3;SAR=6;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0865477;STB=0.540713;TYPE=snp;VARB=0.108136;OID=.;OPOS=69973825;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:48:56:12:36:9:19:6:3:5:7:8:11:23:13 chr16 69975631 . A T 1169.81 PASS AO=228;DP=387;FAO=229;FDP=387;FR=.;FRO=158;FSAF=121;FSAR=108;FSRF=79;FSRR=79;FWDB=-0.0138218;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.357;QD=12.0911;RBI=0.0157319;REFB=-0.0135916;REVB=-0.00751328;RO=158;SAF=121;SAR=107;SRF=79;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0233105;STB=0.51161;TYPE=snp;VARB=0.00953138;OID=.;OPOS=69975631;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:387:387:158:158:228:229:107:121:79:79:108:121:79:79 chr16 69988373 . T C 73.84 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0634382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.0877;QD=36.919;RBI=0.172642;REFB=0;REVB=0.160565;RO=0;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00828432;OID=.;OPOS=69988373;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:4:4:0:0:4:4:0:0 chr16 70010458 . G A 801.59 PASS AO=51;DP=96;FAO=94;FDP=98;FR=.;FRO=4;FSAF=45;FSAR=49;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0582118;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=35.666;QD=32.7179;RBI=0.163429;REFB=-0.101406;REVB=0.152711;RO=2;SAF=41;SAR=10;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0224201;STB=0.521272;TYPE=snp;VARB=0.0184084;OID=.;OPOS=70010458;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:65:98:2:4:51:94:10:41:2:0:49:45:4:0 chr16 70010516 . ATGT A 24.11 PASS AO=17;DP=100;FAO=18;FDP=90;FR=.;FRO=72;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=40;FSRR=32;FWDB=-0.01048;FXX=0.0217368;HRUN=1;LEN=3;MLLD=181.343;QD=1.07161;RBI=0.013852;REFB=-0.000981041;REVB=-0.00905803;RO=60;SAF=13;SAR=4;SRF=28;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.381365;STB=0.644603;TYPE=del;VARB=0.00316743;OID=.;OPOS=70010517;OREF=TGT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:17:94:18:90:72:13:5:40:32:24:60:13:4:28:32 chr16 70010589 . T C 127.9 PASS AO=53;DP=175;FAO=55;FDP=177;FR=.;FRO=122;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=51;FSRR=71;FWDB=-0.000919364;FXX=0.0111726;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.305;QD=2.89038;RBI=0.0194599;REFB=-0.00275808;REVB=0.0194381;RO=120;SAF=29;SAR=24;SRF=51;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144862;STB=0.574876;TYPE=snp;VARB=0.00502581;OID=.;OPOS=70010589;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:177:120:122:53:55:24:29:51:69:26:29:51:71 chr16 70010610 . C T 86.71 PASS AO=51;DP=204;FAO=52;FDP=206;FR=.;FRO=154;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=65;FSRR=89;FWDB=0.0569493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.826;QD=1.68371;RBI=0.0575012;REFB=-0.00947395;REVB=-0.0079477;RO=153;SAF=21;SAR=30;SRF=65;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0168261;STB=0.514071;TYPE=snp;VARB=0.0304893;OID=.;OPOS=70010610;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:204:206:153:154:51:52:30:21:65:88:31:21:65:89 chr16 70016416 . T A 590.14 PASS AO=154;DP=331;FAO=154;FDP=337;FR=.;FRO=183;FSAF=81;FSAR=73;FSRF=103;FSRR=80;FWDB=-0.0383794;FXX=0.0480212;HRUN=4;LEN=1;MLLD=120.87;QD=7.00463;RBI=0.0387043;REFB=-0.0152724;REVB=-0.00500441;RO=176;SAF=81;SAR=73;SRF=99;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0355106;STB=0.520114;TYPE=snp;VARB=0.0149171;OID=.;OPOS=70016416;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:331:337:176:183:154:154:73:81:99:77:73:81:103:80 chr16 70016573 . G A 341.2 PASS AO=106;DP=266;FAO=106;FDP=267;FR=.;FRO=161;FSAF=61;FSAR=45;FSRF=86;FSRR=75;FWDB=-0.0283018;FXX=0.0037312;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.588;QD=5.1116;RBI=0.0311289;REFB=-0.00697012;REVB=0.012962;RO=159;SAF=61;SAR=45;SRF=86;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0376193;STB=0.525291;TYPE=snp;VARB=0.0129656;OID=.;OPOS=70016573;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:266:267:159:161:106:106:45:61:86:73:45:61:86:75 chr16 70064261 . C T 76.88 PASS AO=15;DP=28;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=14;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=1;FWDB=0.00609939;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.9623;QD=10.9835;RBI=0.00643774;REFB=-0.0349785;REVB=-0.00205959;RO=13;SAF=14;SAR=1;SRF=12;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0324619;STB=0.518493;TYPE=snp;VARB=0.0283045;OID=.;OPOS=70064261;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:28:28:13:13:15:15:1:14:12:1:1:14:12:1 chr16 70161263 . T C 34.67 PASS AO=12;DP=44;FAO=13;FDP=45;FR=.;FRO=32;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=-0.0130873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.471;QD=3.08167;RBI=0.0140681;REFB=-0.00619413;REVB=-0.00516099;RO=32;SAF=6;SAR=6;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111002;STB=0.59308;TYPE=snp;VARB=0.0198975;OID=.;OPOS=70161263;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:44:45:32:32:12:13:6:6:19:13:7:6:19:13 chr16 70164334 . A G 179.41 PASS AO=120;DP=479;FAO=108;FDP=399;FR=.;FRO=291;FSAF=55;FSAR=53;FSRF=160;FSRR=131;FWDB=-0.00630181;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.859;QD=1.79858;RBI=0.017279;REFB=-0.0171595;REVB=-0.0160889;RO=358;SAF=50;SAR=70;SRF=189;SRR=169;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140301;STB=0.529625;TYPE=snp;VARB=0.0427217;OID=.;OPOS=70164334;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:479:399:358:291:120:108:70:50:189:169:53:55:160:131 chr16 70190401 . C T 99.21 PASS AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.0121307;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.29;QD=10.4434;RBI=0.0657925;REFB=-0.0266608;REVB=-0.0646645;RO=17;SAF=14;SAR=6;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103359;STB=0.576391;TYPE=snp;VARB=0.0280947;OID=.;OPOS=70190401;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:38:38:17:18:20:20:6:14:10:7:6:14:10:8 chr16 70191029 . T G 648.46 PASS AO=123;DP=205;FAO=123;FDP=203;FR=.;FRO=80;FSAF=60;FSAR=63;FSRF=48;FSRR=32;FWDB=-0.0374994;FXX=0.00975562;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.148;QD=12.7776;RBI=0.0388783;REFB=-0.0239006;REVB=-0.0102621;RO=79;SAF=60;SAR=63;SRF=47;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.077412;STB=0.544139;TYPE=snp;VARB=0.0202789;OID=.;OPOS=70191029;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:203:79:80:123:123:63:60:47:32:63:60:48:32 chr16 70191118 . A G 140.07 PASS AO=47;DP=130;FAO=47;FDP=130;FR=.;FRO=83;FSAF=33;FSAR=14;FSRF=46;FSRR=37;FWDB=-0.0180932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.346;QD=4.3098;RBI=0.0184467;REFB=-0.0139695;REVB=0.00359411;RO=83;SAF=33;SAR=14;SRF=46;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179987;STB=0.603396;TYPE=snp;VARB=0.0319003;OID=.;OPOS=70191118;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:83:83:47:47:14:33:46:37:14:33:46:37 chr16 70191161 . C T 87.36 PASS AO=49;DP=188;FAO=49;FDP=188;FR=.;FRO=139;FSAF=1;FSAR=48;FSRF=49;FSRR=90;FWDB=-0.0962237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.9889;QD=1.85866;RBI=0.096998;REFB=-0.00800397;REVB=-0.0122312;RO=139;SAF=1;SAR=48;SRF=49;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.701318;STB=0.945369;TYPE=snp;VARB=0.0116312;OID=.;OPOS=70191161;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:188:188:139:139:49:49:48:1:49:90:48:1:49:90 chr16 70191333 . T C 1767.03 PASS AO=188;DP=191;FAO=189;FDP=189;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=121;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0422242;FXX=0.0104707;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.444;QD=37.3976;RBI=0.0528594;REFB=0.0035683;REVB=0.0317999;RO=2;SAF=67;SAR=121;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.013999;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.45203e-05;OID=.;OPOS=70191333;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:191:189:2:0:188:189:121:67:2:0:121:68:0:0 chr16 70191556 . G A 130.34 PASS AO=63;DP=211;FAO=62;FDP=212;FR=.;FRO=150;FSAF=18;FSAR=44;FSRF=33;FSRR=117;FWDB=0.012599;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=32.233;QD=2.45916;RBI=0.0230972;REFB=0.00591817;REVB=0.0193584;RO=144;SAF=17;SAR=46;SRF=31;SRR=113;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0873751;STB=0.563575;TYPE=snp;VARB=-0.0131373;OID=.;OPOS=70191556;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:212:144:150:63:62:46:17:31:113:44:18:33:117 chr16 70191566 . A G 743.49 PASS AO=133;DP=209;FAO=133;FDP=208;FR=.;FRO=75;FSAF=35;FSAR=98;FSRF=6;FSRR=69;FWDB=0.00846229;FXX=0.00478446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.7668;QD=14.2979;RBI=0.013714;REFB=0.00777843;REVB=-0.0107918;RO=72;SAF=35;SAR=98;SRF=6;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165211;STB=0.592607;TYPE=snp;VARB=-0.00539884;OID=.;OPOS=70191566;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:208:72:75:133:133:98:35:6:66:98:35:6:69 chr16 70287172 . T TG 393.52 PASS AO=13;DP=75;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0899136;FXX=0.0135117;HRUN=4;LEN=1;MLLD=13.7827;QD=21.5627;RBI=0.34305;REFB=-0.00150325;REVB=-0.331057;RO=62;SAF=1;SAR=12;SRF=25;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.521586;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-0.0163263;OID=.;OPOS=70287173;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:13:75:73:73:0:24:49:0:0:33:62:1:12:25:37 chr16 70287177 . A G 690.8 PASS AO=70;DP=70;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0618501;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.2975;QD=37.3405;RBI=0.13234;REFB=0;REVB=-0.116998;RO=0;SAF=22;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00177713;OID=.;OPOS=70287177;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:70:74:0:0:70:74:48:22:0:0:49:25:0:0 chr16 70303580 . G A 363.3 PASS AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.008826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.093;QD=38.2415;RBI=0.0322278;REFB=0;REVB=0.0309957;RO=0;SAF=21;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53998e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000210325;OID=.;OPOS=70303580;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:38:38:0:0:38:38:17:21:0:0:17:21:0:0 chr16 70395387 . C T 281.97 PASS AO=75;DP=168;FAO=75;FDP=170;FR=.;FRO=95;FSAF=30;FSAR=45;FSRF=55;FSRR=40;FWDB=0.0315012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.24;QD=6.6346;RBI=0.0321657;REFB=-0.017134;REVB=-0.00650458;RO=92;SAF=30;SAR=45;SRF=53;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174642;STB=0.599973;TYPE=snp;VARB=0.0224966;OID=.;OPOS=70395387;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:170:92:95:75:75:45:30:53:39:45:30:55:40 chr16 70506907 . T C 361.86 PASS AO=21;DP=50;FAO=40;FDP=41;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0845516;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.719;QD=35.3033;RBI=0.0854597;REFB=-0.241373;REVB=0.0124255;RO=1;SAF=5;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0835989;STB=0.511106;TYPE=snp;VARB=0.00359763;OID=.;OPOS=70506907;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:40:41:1:1:21:40:16:5:1:0:18:22:1:0 chr16 70515355 . C T 586.4 PASS AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314387;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.6806;QD=37.8325;RBI=0.0321055;REFB=0;REVB=-0.00650922;RO=0;SAF=21;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.99858e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00130272;OID=.;OPOS=70515355;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:62:62:0:0:62:62:41:21:0:0:41:21:0:0 chr16 70548297 . G A 2825.21 PASS AO=294;DP=298;FAO=294;FDP=294;FR=.;FRO=0;FSAF=126;FSAR=168;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0203357;FXX=0.0199993;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.8659;QD=38.4382;RBI=0.0361094;REFB=0;REVB=0.0298387;RO=0;SAF=126;SAR=168;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=8.02747e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.94704e-05;OID=.;OPOS=70548297;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:298:294:0:0:294:294:168:126:0:0:168:126:0:0 chr16 70599348 . AC A 376.05 PASS AO=129;DP=312;FAO=173;FDP=296;FR=.;FRO=123;FSAF=136;FSAR=37;FSRF=53;FSRR=70;FWDB=-0.134978;FXX=0.0198669;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.8462;QD=5.08169;RBI=0.147214;REFB=-0.103995;REVB=0.0587608;RO=113;SAF=107;SAR=22;SRF=39;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.475318;STB=0.675401;TYPE=del;VARB=0.090399;OID=.;OPOS=70599349;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:129:292:173:296:123:136:37:53:70:99:113:107:22:39:74 chr16 70726795 . C A 718.3 PASS AO=75;DP=77;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104144;FXX=0.0259707;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.038;QD=38.3093;RBI=0.104836;REFB=0;REVB=0.104318;RO=0;SAF=29;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.89405e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00053689;OID=.;OPOS=70726795;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:77:75:0:0:75:75:46:29:0:0:46:29:0:0 chr16 70796515 . G A 429.49 PASS AO=62;DP=139;FAO=64;FDP=132;FR=.,HEALED;FRO=40;FSAF=22;FSAR=42;FSRF=14;FSRR=26;FWDB=0.00711583;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.015;QD=13.0149;RBI=0.0362651;REFB=-0.0631016;REVB=-0.0355601;RO=25;SAF=21;SAR=41;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12581;STB=0.502659;TYPE=snp;VARB=0.0213665;OID=.;OPOS=70796515;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:132:25:40:62:64:41:21:14:11:42:22:14:26 chr16 70814703 . GC G 369.71 PASS AO=40;DP=56;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.250073;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.8738;QD=26.888;RBI=0.319033;REFB=0;REVB=-0.198106;RO=3;SAF=23;SAR=17;SRF=3;SRR=0;SSEN=0.285882;SSEP=0;SSSB=-0.0573367;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00159084;OID=.;OPOS=70814704;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:40:54:55:55:0:32:23:0:0:35:3:23:17:3:0 chr16 70818759 . A G 190.57 PASS AO=49;DP=118;FAO=60;FDP=149;FR=.;FRO=89;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=46;FSRR=43;FWDB=-0.00898704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.489;QD=5.11584;RBI=0.0213904;REFB=-0.0152129;REVB=0.0194109;RO=67;SAF=27;SAR=22;SRF=44;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111494;STB=0.54;TYPE=snp;VARB=0.0181263;OID=.;OPOS=70818759;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:149:67:89:49:60:22:27:44:23:33:27:46:43 chr16 70883694 . G A 79.14 PASS AO=121;DP=521;FAO=81;FDP=400;FR=.;FRO=319;FSAF=52;FSAR=29;FSRF=168;FSRR=151;FWDB=-0.00666189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.92;QD=0.791426;RBI=0.00724262;REFB=-0.00260785;REVB=0.00284161;RO=390;SAF=74;SAR=47;SRF=206;SRR=184;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108248;STB=0.594639;TYPE=snp;VARB=0.0110734;OID=.;OPOS=70883694;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:521:400:390:319:121:81:47:74:206:184:29:52:168:151 chr16 70884524 . C G 332.31 PASS AO=118;DP=324;FAO=118;FDP=326;FR=.;FRO=208;FSAF=44;FSAR=74;FSRF=89;FSRR=119;FWDB=0.0305794;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.157;QD=4.07737;RBI=0.0462794;REFB=-0.00319422;REVB=-0.0347373;RO=206;SAF=44;SAR=74;SRF=89;SRR=117;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0695215;STB=0.536811;TYPE=snp;VARB=0.00354963;OID=.;OPOS=70884524;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:324:326:206:208:118:118:74:44:89:117:74:44:89:119 chr16 70884534 . T A 309.65 PASS AO=112;DP=313;FAO=112;FDP=314;FR=.;FRO=202;FSAF=34;FSAR=78;FSRF=83;FSRR=119;FWDB=-0.0146485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.122;QD=3.94455;RBI=0.0146837;REFB=-0.00708704;REVB=-0.00101662;RO=201;SAF=34;SAR=78;SRF=83;SRR=118;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136815;STB=0.576705;TYPE=snp;VARB=0.0117783;OID=.;OPOS=70884534;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:313:314:201:202:112:112:78:34:83:118:78:34:83:119 chr16 70886630 . C T 273.16 PASS AO=70;DP=159;FAO=72;FDP=161;FR=.;FRO=89;FSAF=39;FSAR=33;FSRF=45;FSRR=44;FWDB=0.0231266;FXX=0.00617246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.5641;QD=6.78656;RBI=0.0338089;REFB=-0.0214876;REVB=0.0246618;RO=87;SAF=37;SAR=33;SRF=45;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0113039;STB=0.519994;TYPE=snp;VARB=0.0235912;OID=.;OPOS=70886630;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:161:87:89:70:72:33:37:45:42:33:39:45:44 chr16 70886646 . T C 42.08 PASS AO=35;DP=168;FAO=35;FDP=169;FR=.;FRO=134;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=59;FSRR=75;FWDB=-0.031899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.751;QD=0.996082;RBI=0.0406623;REFB=0.0024739;REVB=-0.0252166;RO=131;SAF=24;SAR=11;SRF=57;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.31699;STB=0.693206;TYPE=snp;VARB=-0.0114383;OID=.;OPOS=70886646;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:168:169:131:134:35:35:11:24:57:74:11:24:59:75 chr16 70889147 . A G 757.3 PASS AO=167;DP=315;FAO=167;FDP=314;FR=.;FRO=147;FSAF=55;FSAR=112;FSRF=45;FSRR=102;FWDB=0.0142454;FXX=0.00632891;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.1583;QD=9.64717;RBI=0.0165622;REFB=-0.0146625;REVB=-0.00844838;RO=147;SAF=55;SAR=112;SRF=45;SRR=102;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.022775;STB=0.512406;TYPE=snp;VARB=0.0107089;OID=.;OPOS=70889147;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:315:314:147:147:167:167:112:55:45:102:112:55:45:102 chr16 70893976 . C T 87.63 PASS AO=145;DP=753;FAO=82;FDP=392;FR=.,HEALED;FRO=310;FSAF=39;FSAR=43;FSRF=169;FSRR=141;FWDB=0.0179348;FXX=0.0199995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.043;QD=0.89423;RBI=0.0179638;REFB=-0.00496115;REVB=0.00102029;RO=361;SAF=66;SAR=79;SRF=109;SRR=252;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195037;STB=0.554825;TYPE=snp;VARB=0.0204364;OID=.;OPOS=70893976;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:724:392:361:310:145:82:79:66:109:252:43:39:169:141 chr16 70894087 . T C 846.77 PASS AO=301;DP=643;FAO=200;FDP=400;FR=.;FRO=200;FSAF=88;FSAR=112;FSRF=95;FSRR=105;FWDB=-0.005066;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.063;QD=8.46774;RBI=0.0150094;REFB=-0.000351867;REVB=0.0141286;RO=340;SAF=140;SAR=161;SRF=157;SRR=183;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00325035;STB=0.517679;TYPE=snp;VARB=0.000268714;OID=.;OPOS=70894087;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:643:400:340:200:301:200:161:140:157:183:112:88:95:105 chr16 70896015 . GA G 171.59 PASS AO=83;DP=227;FAO=89;FDP=224;FR=.;FRO=135;FSAF=37;FSAR=52;FSRF=78;FSRR=57;FWDB=-0.0559653;FXX=0.00444425;HRUN=2;LEN=1;MLLD=26.7846;QD=3.06417;RBI=0.0651012;REFB=-0.00190723;REVB=-0.0332573;RO=132;SAF=33;SAR=50;SRF=76;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193527;STB=0.597202;TYPE=del;VARB=0.00158076;OID=.;OPOS=70896016;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:83:223:89:224:135:37:52:78:57:99:132:33:50:76:56 chr16 70896118 . A G 218.57 PASS AO=80;DP=229;FAO=80;FDP=229;FR=.;FRO=149;FSAF=33;FSAR=47;FSRF=62;FSRR=87;FWDB=-0.0337724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.4262;QD=3.81777;RBI=0.0441386;REFB=-0.00389415;REVB=0.028419;RO=147;SAF=33;SAR=47;SRF=62;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.010844;STB=0.502419;TYPE=snp;VARB=0.00541445;OID=.;OPOS=70896118;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:229:229:147:149:80:80:47:33:62:85:47:33:62:87 chr16 70896122 . A C 180.76 PASS AO=53;DP=198;FAO=73;FDP=222;FR=.;FRO=149;FSAF=32;FSAR=41;FSRF=61;FSRR=88;FWDB=0.00187357;FXX=0.0044841;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.5138;QD=3.2569;RBI=0.025631;REFB=-0.0452035;REVB=0.0255624;RO=144;SAF=31;SAR=22;SRF=60;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205601;STB=0.519828;TYPE=snp;VARB=0.0823159;OID=.;OPOS=70896122;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:222:144:149:53:73:22:31:60:84:41:32:61:88 chr16 70897039 . C G 282.63 PASS AO=90;DP=234;FAO=90;FDP=235;FR=.;FRO=145;FSAF=51;FSAR=39;FSRF=101;FSRR=44;FWDB=0.00498055;FXX=0.119846;HRUN=3;LEN=1;MLLD=204.898;QD=4.81067;RBI=0.00763874;REFB=-0.0109431;REVB=0.00579176;RO=141;SAF=51;SAR=39;SRF=97;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137301;STB=0.58339;TYPE=snp;VARB=0.0186329;OID=.;OPOS=70897039;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:234:235:141:145:90:90:39:51:97:44:39:51:101:44 chr16 70902559 . C T 603.39 PASS AO=344;DP=773;FAO=171;FDP=398;FR=.;FRO=227;FSAF=76;FSAR=95;FSRF=105;FSRR=122;FWDB=-0.0147804;FXX=0.00499988;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.033;QD=6.06425;RBI=0.0170514;REFB=-0.0231753;REVB=0.00850234;RO=424;SAF=147;SAR=197;SRF=177;SRR=247;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101065;STB=0.510433;TYPE=snp;VARB=0.0351641;OID=.;OPOS=70902559;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:773:398:424:227:344:171:197:147:177:247:95:76:105:122 chr16 70902568 . C T 735.24 PASS AO=329;DP=745;FAO=187;FDP=398;FR=.;FRO=211;FSAF=85;FSAR=102;FSRF=88;FSRR=123;FWDB=0.0200705;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.999;QD=7.38936;RBI=0.0214204;REFB=0.000945873;REVB=-0.007484;RO=413;SAF=142;SAR=187;SRF=179;SRR=234;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00185055;STB=0.520109;TYPE=snp;VARB=-0.00127159;OID=.;OPOS=70902568;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:745:398:413:211:329:187:187:142:179:234:102:85:88:123 chr16 70902683 . G A 126.46 PASS AO=43;DP=121;FAO=43;FDP=121;FR=.;FRO=78;FSAF=5;FSAR=38;FSRF=30;FSRR=48;FWDB=-0.0293159;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.788;QD=4.18047;RBI=0.029338;REFB=-0.00331631;REVB=-0.00113887;RO=78;SAF=5;SAR=38;SRF=30;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.433914;STB=0.755537;TYPE=snp;VARB=0.00284258;OID=.;OPOS=70902683;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:78:78:43:43:38:5:30:48:38:5:30:48 chr16 70908736 . A G 208.42 PASS AO=74;DP=214;FAO=75;FDP=213;FR=.;FRO=138;FSAF=62;FSAR=13;FSRF=100;FSRR=38;FWDB=0.00227602;FXX=0.0229347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.887;QD=3.91389;RBI=0.0241973;REFB=-0.000488209;REVB=-0.02409;RO=129;SAF=61;SAR=13;SRF=94;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160756;STB=0.600198;TYPE=snp;VARB=0.00138533;OID=.;OPOS=70908736;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:213:129:138:74:75:13:61:94:35:13:62:100:38 chr16 70913386 . G A 635.86 PASS AO=84;DP=248;FAO=135;FDP=247;FR=.;FRO=112;FSAF=71;FSAR=64;FSRF=49;FSRR=63;FWDB=0.000390313;FXX=0.0040321;HRUN=3;LEN=1;MLLD=215.497;QD=10.2973;RBI=0.0119904;REFB=-0.0187406;REVB=-0.011984;RO=74;SAF=60;SAR=24;SRF=41;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154973;STB=0.540031;TYPE=snp;VARB=0.0141427;OID=.;OPOS=70913386;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:247:74:112:84:135:24:60:41:33:64:71:49:63 chr16 70917855 . A G 266.88 PASS AO=85;DP=219;FAO=85;FDP=220;FR=.;FRO=135;FSAF=36;FSAR=49;FSRF=50;FSRR=85;FWDB=-0.021291;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.7546;QD=4.85244;RBI=0.0530779;REFB=-0.0149555;REVB=-0.0486206;RO=132;SAF=36;SAR=49;SRF=49;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0585726;STB=0.533739;TYPE=snp;VARB=0.022299;OID=.;OPOS=70917855;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:219:220:132:135:85:85:49:36:49:83:49:36:50:85 chr16 70917931 . C G 324.72 PASS AO=90;DP=234;FAO=98;FDP=241;FR=.;FRO=143;FSAF=51;FSAR=47;FSRF=59;FSRR=84;FWDB=0.0304251;FXX=0.00413206;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.744;QD=5.38961;RBI=0.0323096;REFB=-0.00575313;REVB=0.0108731;RO=144;SAF=49;SAR=41;SRF=60;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138831;STB=0.563737;TYPE=snp;VARB=0.010015;OID=.;OPOS=70917931;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:234:241:144:143:90:98:41:49:60:84:47:51:59:84 chr16 70942688 . A C 703.55 PASS AO=222;DP=530;FAO=178;FDP=377;FR=.;FRO=199;FSAF=78;FSAR=100;FSRF=92;FSRR=107;FWDB=-0.0346828;FXX=0.00527691;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.533;QD=7.46471;RBI=0.0359487;REFB=-0.0132808;REVB=0.00945588;RO=301;SAF=100;SAR=122;SRF=136;SRR=165;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00144057;STB=0.512881;TYPE=snp;VARB=0.0167341;OID=.;OPOS=70942688;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:530:377:301:199:222:178:122:100:136:165:100:78:92:107 chr16 70954513 . T C 185.48 PASS AO=59;DP=154;FAO=59;FDP=154;FR=.;FRO=95;FSAF=17;FSAR=42;FSRF=33;FSRR=62;FWDB=-0.0209793;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.5419;QD=4.81755;RBI=0.0304938;REFB=-0.00937751;REVB=-0.0221301;RO=95;SAF=17;SAR=42;SRF=33;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0755251;STB=0.542901;TYPE=snp;VARB=0.0134656;OID=.;OPOS=70954513;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:154:95:95:59:59:42:17:33:62:42:17:33:62 chr16 70954606 . C T 165.9 PASS AO=41;DP=89;FAO=42;FDP=92;FR=.;FRO=50;FSAF=7;FSAR=35;FSRF=13;FSRR=37;FWDB=0.00786524;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=215.392;QD=7.21289;RBI=0.00822075;REFB=0.0177248;REVB=0.00239138;RO=47;SAF=6;SAR=35;SRF=12;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176807;STB=0.581353;TYPE=snp;VARB=-0.016946;OID=.;OPOS=70954606;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:92:47:50:41:42:35:6:12:35:35:7:13:37 chr16 70954774 . A G 77.21 PASS AO=14;DP=25;FAO=14;FDP=24;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=-0.0157733;FXX=0.039984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.517;QD=12.8683;RBI=0.0188461;REFB=-0.0413693;REVB=-0.010314;RO=10;SAF=7;SAR=7;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222321;STB=0.624832;TYPE=snp;VARB=0.0241746;OID=.;OPOS=70954774;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:25:24:10:10:14:14:7:7:2:8:7:7:2:8 chr16 70954809 . C A 110.13 PASS AO=29;DP=68;FAO=29;FDP=68;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=28;FWDB=0.00991692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.663;QD=6.47814;RBI=0.0110947;REFB=-0.00961991;REVB=-0.00497473;RO=39;SAF=16;SAR=13;SRF=11;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.268996;STB=0.651342;TYPE=snp;VARB=0.0158257;OID=.;OPOS=70954809;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:39:39:29:29:13:16:11:28:13:16:11:28 chr16 70954915 . G T 1173.88 PASS AO=120;DP=128;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.058086;FXX=0.0633758;HRUN=4;LEN=1;MLLD=214.102;QD=35.3046;RBI=0.0581977;REFB=0.00381815;REVB=0.00360344;RO=3;SAF=11;SAR=109;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0745694;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000789791;OID=.;OPOS=70954915;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:128:133:3:0:120:133:109:11:2:1:109:24:0:0 chr16 70954945 . T A 236.21 PASS AO=67;DP=160;FAO=67;FDP=160;FR=.;FRO=93;FSAF=9;FSAR=58;FSRF=18;FSRR=75;FWDB=0.0080274;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.446;QD=5.90519;RBI=0.015424;REFB=-0.00815855;REVB=-0.0131704;RO=93;SAF=9;SAR=58;SRF=18;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118037;STB=0.566754;TYPE=snp;VARB=0.0101695;OID=.;OPOS=70954945;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:160:93:93:67:67:58:9:18:75:58:9:18:75 chr16 70972595 . T C 351.54 PASS AO=84;DP=187;FAO=88;FDP=187;FR=.;FRO=99;FSAF=56;FSAR=32;FSRF=32;FSRR=67;FWDB=-0.0305151;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.2232;QD=7.51965;RBI=0.03598;REFB=-0.0049896;REVB=0.0190627;RO=103;SAF=51;SAR=33;SRF=37;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243162;STB=0.663122;TYPE=snp;VARB=0.00824528;OID=.;OPOS=70972595;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:187:103:99:84:88:33:51:37:66:32:56:32:67 chr16 70972620 . G C 399.44 PASS AO=91;DP=187;FAO=93;FDP=186;FR=.;FRO=93;FSAF=27;FSAR=66;FSRF=53;FSRR=40;FWDB=0.0208131;FXX=0.0210515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.171;QD=8.59006;RBI=0.0216649;REFB=-0.0274304;REVB=-0.00601523;RO=96;SAF=25;SAR=66;SRF=53;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.277856;STB=0.648456;TYPE=snp;VARB=0.01743;OID=.;OPOS=70972620;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:186:96:93:91:93:66:25:53:43:66:27:53:40 chr16 70975667 . T C 207.44 PASS AO=75;DP=218;FAO=76;FDP=218;FR=.;FRO=142;FSAF=37;FSAR=39;FSRF=59;FSRR=83;FWDB=-0.0145672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.438;QD=3.80628;RBI=0.0150524;REFB=-0.0131837;REVB=-0.00379063;RO=141;SAF=36;SAR=39;SRF=59;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.070813;STB=0.546609;TYPE=snp;VARB=0.0276404;OID=.;OPOS=70975667;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:218:218:141:142:75:76:39:36:59:82:39:37:59:83 chr16 70986480 . G A 813.72 PASS AO=229;DP=479;FAO=196;FDP=399;FR=.;FRO=203;FSAF=41;FSAR=155;FSRF=36;FSRR=167;FWDB=0.038502;FXX=0.00249994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.791;QD=8.15755;RBI=0.0420158;REFB=-0.00654229;REVB=-0.0168204;RO=249;SAF=47;SAR=182;SRF=43;SRR=206;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.048957;STB=0.525199;TYPE=snp;VARB=0.00646469;OID=.;OPOS=70986480;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:479:399:249:203:229:196:182:47:43:206:155:41:36:167 chr16 70989299 . C T 654.31 PASS AO=144;DP=273;FAO=145;FDP=274;FR=.;FRO=129;FSAF=87;FSAR=58;FSRF=51;FSRR=78;FWDB=0.0200207;FXX=0.00724611;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.016;QD=9.5519;RBI=0.0272223;REFB=-0.00804712;REVB=0.0184452;RO=126;SAF=87;SAR=57;SRF=48;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190969;STB=0.596478;TYPE=snp;VARB=0.00734806;OID=.;OPOS=70989299;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:273:274:126:129:144:145:57:87:48:78:58:87:51:78 chr16 70989335 . G A 516.36 PASS AO=126;DP=249;FAO=126;FDP=259;FR=.;FRO=133;FSAF=74;FSAR=52;FSRF=60;FSRR=73;FWDB=-0.0180633;FXX=0.0152085;HRUN=3;LEN=1;MLLD=122.791;QD=7.9746;RBI=0.0372077;REFB=-0.00426304;REVB=-0.0325288;RO=121;SAF=75;SAR=51;SRF=58;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105103;STB=0.570343;TYPE=snp;VARB=0.0015807;OID=.;OPOS=70989335;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:249:259:121:133:126:126:51:75:58:63:52:74:60:73 chr16 70993566 . A G 2017.79 PASS AO=395;DP=526;FAO=302;FDP=400;FR=.;FRO=98;FSAF=170;FSAR=132;FSRF=60;FSRR=38;FWDB=-0.0244652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.4799;QD=20.1779;RBI=0.0274393;REFB=-0.0063951;REVB=0.0124244;RO=131;SAF=225;SAR=170;SRF=76;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00503863;STB=0.512318;TYPE=snp;VARB=0.00177455;OID=.;OPOS=70993566;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:526:400:131:98:395:302:170:225:76:55:132:170:60:38 chr16 71008169 . T C 430.75 PASS AO=112;DP=246;FAO=112;FDP=245;FR=.;FRO=133;FSAF=49;FSAR=63;FSRF=57;FSRR=76;FWDB=-0.00547787;FXX=0.0120963;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.378;QD=7.03263;RBI=0.00568467;REFB=-0.0103903;REVB=-0.00151933;RO=131;SAF=49;SAR=63;SRF=57;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00236338;STB=0.504929;TYPE=snp;VARB=0.0144456;OID=.;OPOS=71008169;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:246:245:131:133:112:112:63:49:57:74:63:49:57:76 chr16 71012855 . T C 378.07 PASS AO=95;DP=202;FAO=95;FDP=202;FR=.;FRO=107;FSAF=56;FSAR=39;FSRF=64;FSRR=43;FWDB=-0.00054987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.862;QD=7.4865;RBI=0.00801541;REFB=-0.0150316;REVB=0.00799652;RO=107;SAF=56;SAR=39;SRF=64;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00858845;STB=0.504744;TYPE=snp;VARB=0.0184059;OID=.;OPOS=71012855;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:202:107:107:95:95:39:56:64:43:39:56:64:43 chr16 71015329 . G T 181.08 PASS AO=187;DP=719;FAO=106;FDP=400;FR=.;FRO=294;FSAF=51;FSAR=55;FSRF=165;FSRR=129;FWDB=0.0174865;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=215.154;QD=1.8108;RBI=0.0195187;REFB=0.000951543;REVB=-0.00867197;RO=528;SAF=94;SAR=93;SRF=283;SRR=245;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0417858;STB=0.55868;TYPE=snp;VARB=-0.00269465;OID=.;OPOS=71015329;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:719:400:528:294:187:106:93:94:283:245:55:51:165:129 chr16 71025245 . C T 311.62 PASS AO=59;DP=119;FAO=66;FDP=121;FR=.;FRO=55;FSAF=40;FSAR=26;FSRF=27;FSRR=28;FWDB=0.0301322;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.657;QD=10.3015;RBI=0.0303843;REFB=-0.0154436;REVB=-0.00390589;RO=54;SAF=34;SAR=25;SRF=27;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.066997;STB=0.553546;TYPE=snp;VARB=0.00993512;OID=.;OPOS=71025245;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:121:54:55:59:66:25:34:27:27:26:40:27:28 chr16 71026076 . C G 155.75 PASS AO=38;DP=82;FAO=38;FDP=82;FR=.;FRO=44;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=29;FSRR=15;FWDB=0.0235742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.4917;QD=7.59755;RBI=0.0262634;REFB=0.000489262;REVB=-0.0115769;RO=44;SAF=25;SAR=13;SRF=29;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00127447;STB=0.500713;TYPE=snp;VARB=-0.000323641;OID=.;OPOS=71026076;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:44:44:38:38:13:25:29:15:13:25:29:15 chr16 71026098 . C T 127.03 PASS AO=28;DP=64;FAO=31;FDP=68;FR=.;FRO=37;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=13;FWDB=0.0626335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.2489;QD=7.47227;RBI=0.0629847;REFB=-0.01857;REVB=0.0066417;RO=35;SAF=13;SAR=15;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188219;STB=0.572473;TYPE=snp;VARB=0.00889038;OID=.;OPOS=71026098;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:68:35:37:28:31:15:13:23:12:15:16:24:13 chr16 71054178 . T C 149.9 PASS AO=70;DP=247;FAO=72;FDP=248;FR=.;FRO=176;FSAF=34;FSAR=38;FSRF=86;FSRR=90;FWDB=-0.0312277;FXX=0.00799968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.195;QD=2.41766;RBI=0.0329119;REFB=-0.0199071;REVB=0.0103937;RO=172;SAF=34;SAR=36;SRF=83;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00384202;STB=0.511666;TYPE=snp;VARB=0.0410475;OID=.;OPOS=71054178;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:247:248:172:176:70:72:36:34:83:89:38:34:86:90 chr16 71061495 . A G 885.59 PASS AO=184;DP=329;FAO=184;FDP=329;FR=.;FRO=145;FSAF=103;FSAR=81;FSRF=64;FSRR=81;FWDB=-0.0131975;FXX=0.00604211;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.257;QD=10.767;RBI=0.0174616;REFB=-0.0219442;REVB=-0.0114339;RO=145;SAF=103;SAR=81;SRF=64;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0962886;STB=0.552273;TYPE=snp;VARB=0.0123341;OID=.;OPOS=71061495;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:329:329:145:145:184:184:81:103:64:81:81:103:64:81 chr16 71098649 . T C 775.94 PASS AO=201;DP=416;FAO=192;FDP=399;FR=.;FRO=207;FSAF=96;FSAR=96;FSRF=95;FSRR=112;FWDB=0.00620922;FXX=0.00249994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.4087;QD=7.77886;RBI=0.00649956;REFB=-0.000659326;REVB=-0.00192091;RO=212;SAF=100;SAR=101;SRF=98;SRR=114;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0329837;STB=0.521301;TYPE=snp;VARB=0.000847067;OID=.;OPOS=71098649;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:416:399:212:207:201:192:101:100:98:114:96:96:95:112 chr16 71100830 . T C 214.86 PASS AO=67;DP=171;FAO=67;FDP=172;FR=.;FRO=105;FSAF=12;FSAR=55;FSRF=39;FSRR=66;FWDB=-0.0226275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.924;QD=4.99679;RBI=0.0250124;REFB=-0.00422272;REVB=-0.0106591;RO=104;SAF=13;SAR=54;SRF=38;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.242245;STB=0.658861;TYPE=snp;VARB=0.00468871;OID=.;OPOS=71100830;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:172:104:105:67:67:54:13:38:66:55:12:39:66 chr16 71100838 . T C 476.45 PASS AO=91;DP=152;FAO=91;FDP=152;FR=.;FRO=61;FSAF=34;FSAR=57;FSRF=12;FSRR=49;FWDB=0.0154087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.124;QD=12.5383;RBI=0.0190175;REFB=-0.00509561;REVB=-0.0111463;RO=60;SAF=34;SAR=57;SRF=12;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141845;STB=0.578847;TYPE=snp;VARB=0.00362077;OID=.;OPOS=71100838;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:152:60:61:91:91:57:34:12:48:57:34:12:49 chr16 71101200 . T C 225.5 PASS AO=59;DP=133;FAO=59;FDP=132;FR=.;FRO=73;FSAF=36;FSAR=23;FSRF=45;FSRR=28;FWDB=0.00197255;FXX=0.00751823;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.297;QD=6.83336;RBI=0.0469781;REFB=-0.00875909;REVB=-0.0469366;RO=73;SAF=36;SAR=23;SRF=45;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00654456;STB=0.503648;TYPE=snp;VARB=0.0106203;OID=.;OPOS=71101200;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:132:73:73:59:59:23:36:45:28:23:36:45:28 chr16 71101270 . C T 226.45 PASS AO=57;DP=123;FAO=57;FDP=123;FR=.;FRO=66;FSAF=38;FSAR=19;FSRF=39;FSRR=27;FWDB=0.0313104;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.69;QD=7.36427;RBI=0.0313139;REFB=0.00389992;REVB=-0.000464174;RO=65;SAF=38;SAR=19;SRF=39;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0698874;STB=0.544363;TYPE=snp;VARB=-0.00399869;OID=.;OPOS=71101270;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:65:66:57:57:19:38:39:26:19:38:39:27 chr16 71103269 . T C 439.43 PASS AO=244;DP=625;FAO=149;FDP=398;FR=.;FRO=249;FSAF=59;FSAR=90;FSRF=137;FSRR=112;FWDB=0.00238657;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.127;QD=4.41638;RBI=0.00257069;REFB=-0.00720401;REVB=0.000955378;RO=370;SAF=99;SAR=145;SRF=200;SRR=170;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146002;STB=0.59678;TYPE=snp;VARB=0.0162596;OID=.;OPOS=71103269;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:625:398:370:249:244:149:145:99:200:170:90:59:137:112 chr16 71109904 . C A 433.16 PASS AO=111;DP=241;FAO=111;FDP=240;FR=.;FRO=129;FSAF=32;FSAR=79;FSRF=24;FSRR=105;FWDB=0.0164054;FXX=0.00414921;HRUN=3;LEN=1;MLLD=246.029;QD=7.21939;RBI=0.0213704;REFB=-0.0017597;REVB=0.0136952;RO=128;SAF=32;SAR=79;SRF=23;SRR=105;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137492;STB=0.570973;TYPE=snp;VARB=0.00242779;OID=.;OPOS=71109904;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:241:240:128:129:111:111:79:32:23:105:79:32:24:105 chr16 71113780 . C T 220.43 PASS AO=64;DP=139;FAO=60;FDP=137;FR=.;FRO=77;FSAF=43;FSAR=17;FSRF=51;FSRR=26;FWDB=-0.0150014;FXX=0.0143875;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.314;QD=6.43577;RBI=0.0150032;REFB=-0.00885184;REVB=-0.000236255;RO=75;SAF=45;SAR=19;SRF=51;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0265377;STB=0.536396;TYPE=snp;VARB=0.0124719;OID=.;OPOS=71113780;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:137:75:77:64:60:19:45:51:24:17:43:51:26 chr16 71122408 . C T 257.15 PASS AO=74;DP=181;FAO=75;FDP=182;FR=.;FRO=107;FSAF=39;FSAR=36;FSRF=46;FSRR=61;FWDB=-0.0208617;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3556;QD=5.65153;RBI=0.0220689;REFB=-0.00935085;REVB=0.00719907;RO=107;SAF=39;SAR=35;SRF=46;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102063;STB=0.552814;TYPE=snp;VARB=0.0144513;OID=.;OPOS=71122408;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:182:107:107:74:75:35:39:46:61:36:39:46:61 chr16 71163579 . C T 304.86 PASS AO=93;DP=238;FAO=96;FDP=243;FR=.;FRO=147;FSAF=49;FSAR=47;FSRF=93;FSRR=54;FWDB=0.0139594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.546;QD=5.01832;RBI=0.0401076;REFB=-0.0113006;REVB=0.0375999;RO=140;SAF=46;SAR=47;SRF=91;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166595;STB=0.574191;TYPE=snp;VARB=0.0191489;OID=.;OPOS=71163579;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:238:243:140:147:93:96:47:46:91:49:47:49:93:54 chr16 71319539 . C T 792.28 PASS AO=88;DP=91;FAO=88;FDP=91;FR=.;FRO=3;FSAF=51;FSAR=37;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0500451;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=158.862;QD=34.8255;RBI=0.0511354;REFB=-0.213374;REVB=0.0105029;RO=0;SAF=51;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.502949;TYPE=snp;VARB=0.000810112;OID=.;OPOS=71319539;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:91:91:0:3:88:88:37:51:0:0:37:51:2:1 chr16 71319646 . G A 2026.14 PASS AO=202;DP=207;FAO=214;FDP=214;FR=.;FRO=0;FSAF=117;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0419264;FXX=0.00465095;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.486;QD=37.8717;RBI=0.0773029;REFB=0;REVB=0.0649455;RO=1;SAF=113;SAR=89;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0041967;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00132882;OID=.;OPOS=71319646;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:96:207:214:1:0:202:214:89:113:1:0:97:117:0:0 chr16 71418291 . T C 167.89 PASS AO=33;DP=59;FAO=33;FDP=59;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.0297856;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.691;QD=11.3825;RBI=0.030214;REFB=-0.0137369;REVB=0.00506983;RO=25;SAF=13;SAR=20;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0279473;STB=0.522245;TYPE=snp;VARB=0.0141294;OID=.;OPOS=71418291;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:25:26:33:33:20:13:9:16:20:13:9:17 chr16 71483149 . G A 496.09 PASS AO=75;DP=211;FAO=85;FDP=200;FR=.,HEALED;FRO=83;FSAF=41;FSAR=44;FSRF=67;FSRR=16;FWDB=-0.0422393;FXX=0.00497488;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.744;QD=9.92181;RBI=0.0432162;REFB=-0.0262552;REVB=0.00913674;RO=67;SAF=40;SAR=35;SRF=57;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.282702;STB=0.658868;TYPE=snp;VARB=0.0334017;OID=.;OPOS=71483149;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:200:67:83:75:85:35:40:57:10:44:41:67:16 chr16 71483497 . C G 194.82 PASS AO=59;DP=148;FAO=59;FDP=149;FR=.;FRO=90;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=54;FSRR=36;FWDB=0.00862933;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.22;QD=5.23002;RBI=0.00988193;REFB=-0.00720216;REVB=0.0048153;RO=87;SAF=30;SAR=29;SRF=51;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0824975;STB=0.555385;TYPE=snp;VARB=0.0145347;OID=.;OPOS=71483497;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:149:87:90:59:59:29:30:51:36:29:30:54:36 chr16 71487206 . T C 1043.85 PASS AO=115;DP=119;FAO=115;FDP=119;FR=.;FRO=4;FSAF=56;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.0872969;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8297;QD=35.0873;RBI=0.0931764;REFB=0.0785497;REVB=-0.0325744;RO=4;SAF=56;SAR=59;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0311068;STB=0.516391;TYPE=snp;VARB=-0.00823489;OID=.;OPOS=71487206;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:119:119:4:4:115:115:59:56:0:4:59:56:0:4 chr16 71509588 . G A 63.23 PASS AO=28;DP=87;FAO=28;FDP=98;FR=.;FRO=70;FSAF=7;FSAR=21;FSRF=27;FSRR=43;FWDB=-0.0215265;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=37.3232;QD=2.58074;RBI=0.0612846;REFB=-0.0328347;REVB=-0.0573795;RO=58;SAF=7;SAR=21;SRF=24;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217482;STB=0.61437;TYPE=snp;VARB=0.0614033;OID=.;OPOS=71509588;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:87:98:58:70:28:28:21:7:24:34:21:7:27:43 chr16 71509634 . G C 121.22 PASS AO=31;DP=86;FAO=31;FDP=70;FR=.;FRO=39;FSAF=7;FSAR=24;FSRF=13;FSRR=26;FWDB=0.0130338;FXX=0.19538;HRUN=3;LEN=1;MLLD=112.356;QD=6.92684;RBI=0.0216295;REFB=-0.0393548;REVB=-0.0172613;RO=33;SAF=7;SAR=24;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193237;STB=0.578259;TYPE=snp;VARB=0.0370885;OID=.;OPOS=71509634;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:70:33:39:31:31:24:7:13:20:24:7:13:26 chr16 71509685 . C G 680.27 PASS AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0444887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.251;QD=37.793;RBI=0.0582022;REFB=0;REVB=0.0375266;RO=0;SAF=17;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.54913e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000179679;OID=.;OPOS=71509685;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:72:72:0:0:72:72:55:17:0:0:55:17:0:0 chr16 71509796 . C G 198.63 PASS AO=41;DP=75;FAO=41;FDP=75;FR=.;FRO=34;FSAF=31;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=0.0729531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.3549;QD=10.5936;RBI=0.0773241;REFB=0.000622129;REVB=0.0256291;RO=34;SAF=31;SAR=10;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113172;STB=0.562674;TYPE=snp;VARB=0.00131374;OID=.;OPOS=71509796;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:34:34:41:41:10:31:22:12:10:31:22:12 chr16 71610276 . G A 538.38 PASS AO=116;DP=215;FAO=116;FDP=215;FR=.;FRO=99;FSAF=45;FSAR=71;FSRF=39;FSRR=60;FWDB=0.0182911;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=213.674;QD=10.0164;RBI=0.0183565;REFB=-0.0217823;REVB=0.00154803;RO=98;SAF=45;SAR=71;SRF=39;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00884379;STB=0.502909;TYPE=snp;VARB=0.0159061;OID=.;OPOS=71610276;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:215:98:99:116:116:71:45:39:59:71:45:39:60 chr16 71660315 . A C 72.09 PASS AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=15;FSAR=1;FSRF=16;FSRR=2;FWDB=-0.0189816;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.551;QD=8.48061;RBI=0.138456;REFB=-0.0367441;REVB=-0.137148;RO=18;SAF=15;SAR=1;SRF=16;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157752;STB=0.591972;TYPE=snp;VARB=0.0291953;OID=.;OPOS=71660315;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:34:34:18:18:16:16:1:15:16:2:1:15:16:2 chr16 71660404 . G A 76.7 PASS AO=14;DP=22;FAO=14;FDP=24;FR=.;FRO=10;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=-0.0609399;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=111.097;QD=12.7825;RBI=0.0668659;REFB=-0.0530161;REVB=0.0275206;RO=8;SAF=9;SAR=5;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174041;STB=0.574225;TYPE=snp;VARB=0.0107079;OID=.;OPOS=71660404;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:22:24:8:10:14:14:5:9:7:1:5:9:8:2 chr16 71679027 . G T 180.27 PASS AO=42;DP=86;FAO=42;FDP=86;FR=.;FRO=44;FSAF=11;FSAR=31;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=-0.0512695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.568;QD=8.38484;RBI=0.0530336;REFB=-0.0140157;REVB=-0.0135645;RO=44;SAF=11;SAR=31;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224148;STB=0.625409;TYPE=snp;VARB=0.0121293;OID=.;OPOS=71679027;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:44:44:42:42:31:11:21:23:31:11:21:23 chr16 71679057 . C T 689.94 PASS AO=72;DP=72;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0153786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.8576;QD=37.805;RBI=0.0494093;REFB=0;REVB=-0.046955;RO=0;SAF=22;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000300276;OID=.;OPOS=71679057;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:72:73:0:0:72:73:50:22:0:0:51:22:0:0 chr16 71682796 . T C 65.46 PASS AO=20;DP=55;FAO=20;FDP=55;FR=.;FRO=35;FSAF=1;FSAR=19;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=-0.0670914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.4377;QD=4.76106;RBI=0.0804927;REFB=-0.00249541;REVB=-0.0444726;RO=34;SAF=1;SAR=19;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.623565;STB=0.876417;TYPE=snp;VARB=0.000196079;OID=.;OPOS=71682796;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:55:55:34:35:20:20:19:1:14:20:19:1:14:21 chr16 71683718 . A G 258.88 PASS AO=66;DP=148;FAO=67;FDP=149;FR=.;FRO=82;FSAF=45;FSAR=22;FSRF=41;FSRR=41;FWDB=-0.00435406;FXX=0.00666622;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.315;QD=6.94985;RBI=0.0267711;REFB=-0.0104615;REVB=0.0264147;RO=82;SAF=45;SAR=21;SRF=41;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191456;STB=0.599715;TYPE=snp;VARB=0.0111429;OID=.;OPOS=71683718;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:149:82:82:66:67:21:45:41:41:22:45:41:41 chr16 71712786 . A G 436.15 PASS AO=102;DP=216;FAO=111;FDP=238;FR=.;FRO=127;FSAF=43;FSAR=68;FSRF=57;FSRR=70;FWDB=-0.0104402;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=150.173;QD=7.33022;RBI=0.0228981;REFB=-0.001154;REVB=-0.0203796;RO=114;SAF=42;SAR=60;SRF=50;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0263254;STB=0.533997;TYPE=snp;VARB=0.00144714;OID=.;OPOS=71712786;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:216:238:114:127:102:111:60:42:50:64:68:43:57:70 chr16 71773190 . G T 39.3 PASS AO=14;DP=45;FAO=14;FDP=46;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=24;FSRR=8;FWDB=-0.0137223;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=171.802;QD=3.41759;RBI=0.026244;REFB=0.00659707;REVB=-0.0223706;RO=31;SAF=12;SAR=2;SRF=23;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.213515;STB=0.624796;TYPE=snp;VARB=-0.0100719;OID=.;OPOS=71773190;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:45:46:31:32:14:14:2:12:23:8:2:12:24:8 chr16 71886530 . T A 555.78 PASS AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0096839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.386;QD=38.3299;RBI=0.0171944;REFB=0;REVB=-0.0142081;RO=0;SAF=20;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.38905e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.11022e-05;OID=.;OPOS=71886530;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:58:58:0:0:58:58:38:20:0:0:38:20:0:0 chr16 71887381 . A G 113.69 PASS AO=29;DP=67;FAO=29;FDP=66;FR=.;FRO=37;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=24;FSRR=13;FWDB=-0.00334508;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.181;QD=6.8901;RBI=0.0573121;REFB=-0.00492782;REVB=-0.0572144;RO=37;SAF=20;SAR=9;SRF=24;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0464335;STB=0.526297;TYPE=snp;VARB=0.00509227;OID=.;OPOS=71887381;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:66:37:37:29:29:9:20:24:13:9:20:24:13 chr16 71889173 . C T 2022.98 PASS AO=213;DP=213;FAO=219;FDP=219;FR=.;FRO=0;FSAF=100;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0387233;FXX=0.00904936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=299.692;QD=36.9495;RBI=0.0393697;REFB=-0.0958693;REVB=-0.00710502;RO=0;SAF=102;SAR=111;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000662918;OID=.;OPOS=71889173;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:213:219:0:0:213:219:111:102:0:0:119:100:0:0 chr16 71890550 . G A 229.31 PASS AO=81;DP=230;FAO=82;FDP=231;FR=.;FRO=149;FSAF=70;FSAR=12;FSRF=120;FSRR=29;FWDB=0.0248738;FXX=0.00858332;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.7604;QD=3.97071;RBI=0.0267064;REFB=-0.0189146;REVB=0.00972243;RO=147;SAF=69;SAR=12;SRF=119;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0875955;STB=0.557267;TYPE=snp;VARB=0.0306615;OID=.;OPOS=71890550;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:230:231:147:149:81:82:12:69:119:28:12:70:120:29 chr16 71950450 . C T 849.73 PASS AO=182;DP=336;FAO=182;FDP=334;FR=.;FRO=152;FSAF=80;FSAR=102;FSRF=99;FSRR=53;FWDB=-0.0446685;FXX=0.0059522;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2097;QD=10.1764;RBI=0.0457989;REFB=0.00155442;REVB=-0.0101126;RO=152;SAF=80;SAR=102;SRF=99;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175827;STB=0.595528;TYPE=snp;VARB=-0.00163202;OID=.;OPOS=71950450;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:336:334:152:152:182:182:102:80:99:53:102:80:99:53 chr16 71956511 . AATGCCC A 46.2 PASS AO=38;DP=143;FAO=38;FDP=129;FR=.;FRO=91;FSAF=6;FSAR=32;FSRF=28;FSRR=63;FWDB=-0.0412625;FXX=0.0719373;HRUN=2;LEN=6;MLLD=236.128;QD=1.43271;RBI=0.0417974;REFB=-0.00732612;REVB=0.00666529;RO=60;SAF=6;SAR=32;SRF=13;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107777;STB=0.656118;TYPE=del;VARB=0.0172933;OID=.;OPOS=71956512;OREF=ATGCCC;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:38:118:38:129:91:6:32:28:63:46:60:6:32:13:47 chr16 71958052 . A G 648.55 PASS AO=180;DP=406;FAO=177;FDP=399;FR=.;FRO=222;FSAF=113;FSAR=64;FSRF=109;FSRR=113;FWDB=-0.0121599;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.507;QD=6.50173;RBI=0.013219;REFB=-0.000742151;REVB=-0.00518454;RO=223;SAF=115;SAR=65;SRF=110;SRR=113;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150259;STB=0.584661;TYPE=snp;VARB=0.001154;OID=.;OPOS=71958052;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:406:399:223:222:180:177:65:115:110:113:64:113:109:113 chr16 71961906 . A G 99.25 PASS AO=18;DP=31;FAO=18;FDP=31;FR=.;FRO=13;FSAF=17;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=1;FWDB=-0.0609063;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.6142;QD=12.807;RBI=0.0609073;REFB=-0.0470216;REVB=-0.000345558;RO=13;SAF=17;SAR=1;SRF=12;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0702299;STB=0.539635;TYPE=snp;VARB=0.03866;OID=.;OPOS=71961906;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:31:31:13:13:18:18:1:17:12:1:1:17:12:1 chr16 71967927 . C T 291.3 PASS AO=76;DP=173;FAO=78;FDP=176;FR=.;FRO=98;FSAF=38;FSAR=40;FSRF=36;FSRR=62;FWDB=0.0124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.006;QD=6.62045;RBI=0.0296606;REFB=-0.0273652;REVB=-0.0269442;RO=97;SAF=36;SAR=40;SRF=35;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114936;STB=0.566981;TYPE=snp;VARB=0.027913;OID=.;OPOS=71967927;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:176:97:98:76:78:40:36:35:62:40:38:36:62 chr16 71981414 . C CTTTG 1385.96 PASS AO=171;DP=218;FAO=178;FDP=202;FR=.;FRO=24;FSAF=87;FSAR=91;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.0109632;FXX=0.0648118;HRUN=3;LEN=4;MLLD=223.953;QD=27.4448;RBI=0.012552;REFB=-0.0106742;REVB=0.00611242;RO=34;SAF=85;SAR=86;SRF=26;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0838004;STB=0.521125;TYPE=ins;VARB=0.00107581;OID=.;OPOS=71981415;OREF=-;OALT=TTTG;OMAPALT=CTTTG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:171:218:178:202:24:87:91:16:8:6:34:85:86:26:8 chr16 71986946 . A G 1343.99 PASS AO=141;DP=142;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00807495;FXX=0.00704176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.5251;QD=38.1273;RBI=0.0445494;REFB=0;REVB=0.0438115;RO=0;SAF=97;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.93562e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000274093;OID=.;OPOS=71986946;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:142:141:0:0:141:141:44:97:0:0:44:97:0:0 chr16 71986995 . G A 320.67 PASS AO=60;DP=104;FAO=62;FDP=106;FR=.;FRO=44;FSAF=36;FSAR=26;FSRF=25;FSRR=19;FWDB=0.0154626;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.811;QD=12.1008;RBI=0.0260375;REFB=-0.0398015;REVB=0.020949;RO=44;SAF=35;SAR=25;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0120437;STB=0.505301;TYPE=snp;VARB=0.0293015;OID=.;OPOS=71986995;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:106:44:44:60:62:25:35:25:19:26:36:25:19 chr16 71988106 . C T 1816.38 PASS AO=192;DP=195;FAO=194;FDP=194;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0428811;FXX=0.0251244;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.827;QD=37.4512;RBI=0.0430525;REFB=0.0216939;REVB=-0.00383789;RO=3;SAF=101;SAR=91;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154373;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000119073;OID=.;OPOS=71988106;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:195:194:3:0:192:194:91:101:0:3:91:103:0:0 chr16 72001110 . G A 313.64 PASS AO=81;DP=178;FAO=81;FDP=178;FR=.;FRO=97;FSAF=33;FSAR=48;FSRF=55;FSRR=42;FWDB=-0.00892421;FXX=0.00558628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.939;QD=7.04804;RBI=0.0194792;REFB=-0.0141823;REVB=0.0173147;RO=97;SAF=33;SAR=48;SRF=55;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157009;STB=0.587134;TYPE=snp;VARB=0.0153326;OID=.;OPOS=72001110;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:178:97:97:81:81:48:33:55:42:48:33:55:42 chr16 72003952 . G C 405.4 PASS AO=102;DP=216;FAO=102;FDP=217;FR=.;FRO=115;FSAF=42;FSAR=60;FSRF=47;FSRR=68;FWDB=0.00173719;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=282.32;QD=7.47278;RBI=0.00682944;REFB=-0.00977658;REVB=0.0066048;RO=110;SAF=42;SAR=60;SRF=46;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00622603;STB=0.501679;TYPE=snp;VARB=0.0101657;OID=.;OPOS=72003952;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:216:217:110:115:102:102:60:42:46:64:60:42:47:68 chr16 72007399 . C T 243.82 PASS AO=63;DP=123;FAO=63;FDP=141;FR=.;FRO=78;FSAF=23;FSAR=40;FSRF=38;FSRR=40;FWDB=-0.130378;FXX=0.00704176;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.503;QD=6.91688;RBI=0.131195;REFB=-0.0125721;REVB=-0.0146176;RO=60;SAF=23;SAR=40;SRF=22;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00151534;STB=0.570071;TYPE=snp;VARB=0.0157449;OID=.;OPOS=72007399;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:141:60:78:63:63:40:23:22:38:40:23:38:40 chr16 72011181 . G T 1822.41 PASS AO=190;DP=190;FAO=189;FDP=189;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0458093;FXX=0.00526288;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.5529;QD=38.5695;RBI=0.0468434;REFB=0;REVB=0.0097882;RO=0;SAF=84;SAR=106;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000230534;OID=.;OPOS=72011181;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:190:189:0:0:190:189:106:84:0:0:106:83:0:0 chr16 72011193 . A C 1827.43 PASS AO=186;DP=188;FAO=190;FDP=190;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107298;FXX=0.0452239;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.3995;QD=38.4722;RBI=0.0479211;REFB=0;REVB=0.0467044;RO=0;SAF=85;SAR=101;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.92632e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000500283;OID=.;OPOS=72011193;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:188:190:0:0:186:190:101:85:0:0:105:85:0:0 chr16 72011261 . A G 3205.72 PASS AO=274;DP=333;FAO=334;FDP=334;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=152;FSAR=182;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.118231;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.7781;QD=38.3919;RBI=0.136787;REFB=0;REVB=-0.0687901;RO=0;SAF=104;SAR=170;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.80288e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000139012;OID=.;OPOS=72011261;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:328:334:0:0:274:334:170:104:0:0:182:152:0:0 chr16 72013797 . G C 820.1 PASS AO=86;DP=89;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0180617;FXX=0.054939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.957;QD=38.1441;RBI=0.025797;REFB=0;REVB=0.0184191;RO=0;SAF=43;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000550597;OID=.;OPOS=72013797;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:89:86:0:0:86:86:43:43:0:0:43:43:0:0 chr16 72020134 . T C 265.08 PASS AO=79;DP=194;FAO=79;FDP=194;FR=.;FRO=115;FSAF=45;FSAR=34;FSRF=66;FSRR=49;FWDB=-0.0414532;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3116;QD=5.46562;RBI=0.0450103;REFB=0.0130116;REVB=0.0175373;RO=114;SAF=45;SAR=34;SRF=65;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000596495;STB=0.502596;TYPE=snp;VARB=-0.0209733;OID=.;OPOS=72020134;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:194:114:115:79:79:34:45:65:49:34:45:66:49 chr16 72020294 . G A 891.56 PASS AO=101;DP=107;FAO=101;FDP=106;FR=.;FRO=5;FSAF=23;FSAR=78;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0289549;FXX=0.0185168;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.051;QD=33.6436;RBI=0.0294903;REFB=-0.121373;REVB=0.00559385;RO=5;SAF=23;SAR=78;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.092636;STB=0.54901;TYPE=snp;VARB=6.33361e-06;OID=.;OPOS=72020294;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:107:106:5:5:101:101:78:23:5:0:78:23:5:0 chr16 72020323 . A G 748.28 PASS AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0355514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.167;QD=38.3736;RBI=0.0356252;REFB=0;REVB=-0.00229164;RO=0;SAF=14;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.87481e-05;OID=.;OPOS=72020323;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:78:78:0:0:78:78:64:14:0:0:64:14:0:0 chr16 72027191 . T A 324.22 PASS AO=97;DP=239;FAO=97;FDP=239;FR=.;FRO=142;FSAF=47;FSAR=50;FSRF=55;FSRR=87;FWDB=-0.019126;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=121.018;QD=5.42631;RBI=0.0264495;REFB=-0.00131094;REVB=-0.0182694;RO=142;SAF=47;SAR=50;SRF=55;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103756;STB=0.558009;TYPE=snp;VARB=0.000936925;OID=.;OPOS=72027191;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:239:239:142:142:97:97:50:47:55:87:50:47:55:87 chr16 72033801 . G T 360.72 PASS AO=98;DP=215;FAO=98;FDP=223;FR=.;FRO=125;FSAF=39;FSAR=59;FSRF=74;FSRR=51;FWDB=-0.0427738;FXX=0.0176204;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.9658;QD=6.47025;RBI=0.069854;REFB=-0.0121602;REVB=-0.0552267;RO=117;SAF=39;SAR=59;SRF=77;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252016;STB=0.608447;TYPE=snp;VARB=0.0111647;OID=.;OPOS=72033801;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:223:117:125:98:98:59:39:77:40:59:39:74:51 chr16 72042682 . A C 46.02 PASS AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.0139499;FXX=0.0312402;HRUN=3;LEN=1;MLLD=192.838;QD=5.93845;RBI=0.0433878;REFB=-0.00712603;REVB=-0.0410841;RO=18;SAF=4;SAR=8;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.523769;TYPE=snp;VARB=0.0108936;OID=.;OPOS=72042682;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:31:31:18:19:12:12:8:4:6:12:8:4:7:12 chr16 72107865 . C T 380.82 PASS AO=83;DP=157;FAO=83;FDP=157;FR=.;FRO=74;FSAF=52;FSAR=31;FSRF=30;FSRR=44;FWDB=-0.0590924;FXX=0.00632871;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.4628;QD=9.70248;RBI=0.061287;REFB=0.00408058;REVB=-0.0162536;RO=74;SAF=52;SAR=31;SRF=30;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192213;STB=0.605376;TYPE=snp;VARB=-0.00461653;OID=.;OPOS=72107865;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:157:74:74:83:83:31:52:30:44:31:52:30:44 chr16 72110948 . C G 132.72 PASS AO=35;DP=86;FAO=36;FDP=85;FR=.;FRO=49;FSAF=26;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=-0.0446888;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.229;QD=6.24574;RBI=0.0449818;REFB=-0.0151951;REVB=-0.00512576;RO=50;SAF=25;SAR=10;SRF=25;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.239248;STB=0.645305;TYPE=snp;VARB=0.0415677;OID=.;OPOS=72110948;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:85:50:49:35:36:10:25:25:25:10:26:24:25 chr16 72130203 . C G 377.5 PASS AO=79;DP=148;FAO=80;FDP=148;FR=.;FRO=68;FSAF=53;FSAR=27;FSRF=25;FSRR=43;FWDB=0.00646299;FXX=0.00671096;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.537;QD=10.2026;RBI=0.00935464;REFB=0.00157347;REVB=-0.00676307;RO=69;SAF=52;SAR=27;SRF=25;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.254886;STB=0.63786;TYPE=snp;VARB=-0.00171165;OID=.;OPOS=72130203;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:69:68:79:80:27:52:25:44:27:53:25:43 chr16 72130815 . C A 244.15 PASS AO=51;DP=185;FAO=74;FDP=175;FR=.,HEALED;FRO=101;FSAF=20;FSAR=54;FSRF=44;FSRR=57;FWDB=-0.0164701;FXX=0.0331473;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.54;QD=5.58061;RBI=0.0220942;REFB=-0.00150816;REVB=0.0147271;RO=100;SAF=20;SAR=31;SRF=43;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0451255;STB=0.608848;TYPE=snp;VARB=0.00280001;OID=.;OPOS=72130815;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:175:100:101:51:74:31:20:43:57:54:20:44:57 chr16 72135014 . T C 1481.92 PASS AO=154;DP=155;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0158134;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.787;QD=38.2432;RBI=0.0166509;REFB=0;REVB=-0.00521452;RO=0;SAF=65;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.2252e-05;OID=.;OPOS=72135014;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:155:155:0:0:154:155:89:65:0:0:89:66:0:0 chr16 72137561 . G A 177.44 PASS AO=44;DP=95;FAO=44;FDP=95;FR=.;FRO=51;FSAF=29;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=26;FWDB=0.0174996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.06;QD=7.47107;RBI=0.0331004;REFB=0.00199552;REVB=0.0280963;RO=50;SAF=29;SAR=15;SRF=24;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177555;STB=0.594753;TYPE=snp;VARB=-0.00110862;OID=.;OPOS=72137561;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:50:51:44:44:15:29:24:26:15:29:25:26 chr16 72139184 . C A 221.12 PASS AO=60;DP=135;FAO=60;FDP=139;FR=.;FRO=79;FSAF=18;FSAR=42;FSRF=23;FSRR=56;FWDB=-0.0248272;FXX=0.00714235;HRUN=3;LEN=1;MLLD=218.095;QD=6.36327;RBI=0.0393817;REFB=-0.0210572;REVB=-0.03057;RO=74;SAF=18;SAR=42;SRF=18;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0692372;STB=0.506022;TYPE=snp;VARB=0.0240238;OID=.;OPOS=72139184;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:139:74:79:60:60:42:18:18:56:42:18:23:56 chr16 72156842 . T G 481.19 PASS AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0198348;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=158.96;QD=37.7406;RBI=0.0206537;REFB=0;REVB=-0.00575822;RO=0;SAF=25;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94283e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.13073e-05;OID=.;OPOS=72156842;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:51:51:0:0:51:51:26:25:0:0:26:25:0:0 chr16 72158675 . G A 101.46 PASS AO=16;DP=23;FAO=16;FDP=23;FR=.;FRO=7;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0.0280301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.7239;QD=17.6449;RBI=0.0320707;REFB=-0.0356547;REVB=0.0155835;RO=7;SAF=9;SAR=7;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.301656;STB=0.666473;TYPE=snp;VARB=0.024475;OID=.;OPOS=72158675;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:23:23:7:7:16:16:7:9:0:7:7:9:0:7 chr16 72162966 . G T 1305.1 PASS AO=123;DP=123;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1387;QD=38.1052;RBI=0.0455352;REFB=0;REVB=0.0440091;RO=0;SAF=75;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00250926;OID=.;OPOS=72162966;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:123:137:0:0:123:137:48:75:0:0:62:75:0:0 chr16 72170408 . C A 409.54 PASS AO=102;DP=216;FAO=102;FDP=215;FR=.;FRO=113;FSAF=48;FSAR=54;FSRF=56;FSRR=57;FWDB=-0.0162078;FXX=0.00462942;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.367;QD=7.61926;RBI=0.0173124;REFB=-0.0215199;REVB=0.00608513;RO=110;SAF=48;SAR=54;SRF=54;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0191681;STB=0.513155;TYPE=snp;VARB=0.0222174;OID=.;OPOS=72170408;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:216:215:110:113:102:102:54:48:54:56:54:48:56:57 chr16 72184566 . C T 2472.68 PASS AO=259;DP=262;FAO=262;FDP=262;FR=.;FRO=0;FSAF=126;FSAR=136;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00322252;FXX=0.00757547;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4087;QD=37.7509;RBI=0.0386791;REFB=-0.0511665;REVB=-0.0385447;RO=2;SAF=124;SAR=135;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00700982;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000405392;OID=.;OPOS=72184566;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:262:262:2:0:259:262:135:124:0:2:136:126:0:0 chr16 72827758 . T C 903.97 PASS AO=92;DP=92;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00402007;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.552;QD=38.0619;RBI=0.0200039;REFB=0;REVB=0.0195958;RO=0;SAF=42;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000489143;OID=.;OPOS=72827758;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:92:95:0:0:92:95:50:42:0:0:52:43:0:0 chr16 72832135 . T A 1254.7 PASS AO=129;DP=129;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0240883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.813;QD=38.6061;RBI=0.0273282;REFB=0;REVB=0.0129069;RO=0;SAF=60;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.26367e-05;OID=.;OPOS=72832135;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:129:130:0:0:129:130:69:60:0:0:70:60:0:0 chr16 72991660 . C G 102.73 PASS AO=20;DP=35;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.0164708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.675;QD=11.4139;RBI=0.0200707;REFB=-0.0224664;REVB=-0.0114693;RO=15;SAF=4;SAR=16;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.402383;STB=0.74048;TYPE=snp;VARB=0.00634255;OID=.;OPOS=72991660;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:35:36:15:16:20:20:16:4:10:5:16:4:11:5 chr16 72992221 . G A 134.42 PASS AO=30;DP=61;FAO=30;FDP=61;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=5;FWDB=-0.0144573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.34;QD=8.81436;RBI=0.0222025;REFB=-0.0204308;REVB=0.0168505;RO=31;SAF=17;SAR=13;SRF=26;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.264719;STB=0.646157;TYPE=snp;VARB=0.0177582;OID=.;OPOS=72992221;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:31:31:30:30:13:17:26:5:13:17:26:5 chr16 72993831 . A C 16.69 PASS AO=3;DP=9;FAO=3;FDP=9;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.00880374;FXX=0.0999001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.0587;QD=7.41866;RBI=0.0263092;REFB=-0.0323902;REVB=-0.0247925;RO=5;SAF=2;SAR=1;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152533;STB=0.635588;TYPE=snp;VARB=0.0558569;OID=.;OPOS=72993831;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:9:9:5:6:3:3:1:2:4:1:1:2:5:1 chr16 73143402 . C CAGA 331.95 PASS AO=61;DP=106;FAO=63;FDP=105;FR=.;FRO=42;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=15;FSRR=27;FWDB=-0.0131794;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=182.899;QD=12.6456;RBI=0.0132527;REFB=0.00666463;REVB=-0.00139281;RO=43;SAF=34;SAR=27;SRF=16;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139911;STB=0.585339;TYPE=ins;VARB=-0.0036218;OID=.;OPOS=73143403;OREF=-;OALT=AGA;OMAPALT=CAGA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:61:106:63:105:42:36:27:15:27:99:43:34:27:16:27 chr16 73512206 . C A 202.79 PASS AO=50;DP=107;FAO=50;FDP=107;FR=.;FRO=57;FSAF=17;FSAR=33;FSRF=26;FSRR=31;FWDB=0.00910327;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.9317;QD=7.58103;RBI=0.0236794;REFB=-0.00466833;REVB=0.0218597;RO=57;SAF=17;SAR=33;SRF=26;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118257;STB=0.565988;TYPE=snp;VARB=0.00631054;OID=.;OPOS=73512206;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:57:57:50:50:33:17:26:31:33:17:26:31 chr16 74366531 . A C 135.85 PASS AO=31;DP=71;FAO=34;FDP=74;FR=.;FRO=40;FSAF=8;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=0.0175587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.597;QD=7.34338;RBI=0.0244027;REFB=-0.00891683;REVB=-0.0169465;RO=37;SAF=7;SAR=24;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.385037;STB=0.712197;TYPE=snp;VARB=0.00898902;OID=.;OPOS=74366531;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:74:37:40:31:34:24:7:22:15:26:8:24:16 chr16 74394671 . T C 37.19 PASS AO=26;DP=128;FAO=28;FDP=132;FR=.;FRO=104;FSAF=5;FSAR=23;FSRF=34;FSRR=70;FWDB=-0.049821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.977;QD=1.12711;RBI=0.0561491;REFB=-0.00727549;REVB=-0.0258956;RO=101;SAF=5;SAR=21;SRF=34;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23467;STB=0.658462;TYPE=snp;VARB=0.031162;OID=.;OPOS=74394671;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:128:132:101:104:26:28:21:5:34:67:23:5:34:70 chr16 74425299 . C T 252.44 PASS AO=57;DP=117;FAO=57;FDP=115;FR=.;FRO=58;FSAF=41;FSAR=16;FSRF=35;FSRR=23;FWDB=0.0380659;FXX=0.0416632;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0257;QD=8.78042;RBI=0.043498;REFB=-0.0358375;REVB=0.021049;RO=58;SAF=41;SAR=16;SRF=35;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122505;STB=0.568003;TYPE=snp;VARB=0.0306275;OID=.;OPOS=74425299;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:115:58:58:57:57:16:41:35:23:16:41:35:23 chr16 74425358 . G A 244.2 PASS AO=80;DP=214;FAO=81;FDP=216;FR=.;FRO=135;FSAF=53;FSAR=28;FSRF=101;FSRR=34;FWDB=-0.00112025;FXX=0.00460808;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.159;QD=4.52215;RBI=0.0265715;REFB=-0.00854665;REVB=-0.0265479;RO=133;SAF=51;SAR=29;SRF=101;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153796;STB=0.567502;TYPE=snp;VARB=0.012363;OID=.;OPOS=74425358;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:216:133:135:80:81:29:51:101:32:28:53:101:34 chr16 74425447 . C T 254.58 PASS AO=221;DP=707;FAO=120;FDP=399;FR=.;FRO=279;FSAF=81;FSAR=39;FSRF=184;FSRR=95;FWDB=0.00466327;FXX=0.00249994;HRUN=3;LEN=1;MLLD=232.414;QD=2.55217;RBI=0.00552729;REFB=-0.00953051;REVB=0.0029673;RO=473;SAF=146;SAR=75;SRF=303;SRR=170;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0262838;STB=0.512245;TYPE=snp;VARB=0.025597;OID=.;OPOS=74425447;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:707:399:473:279:221:120:75:146:303:170:39:81:184:95 chr16 74425548 . A G 1705.22 PASS AO=183;DP=186;FAO=183;FDP=186;FR=.;FRO=3;FSAF=93;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0101197;FXX=0.00534731;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.0117;QD=36.6714;RBI=0.0249154;REFB=-0.102051;REVB=0.0227678;RO=2;SAF=93;SAR=90;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0104615;STB=0.508196;TYPE=snp;VARB=0.000475507;OID=.;OPOS=74425548;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:186:186:2:3:183:183:90:93:0:2:90:93:0:3 chr16 74425569 . C T 284.27 PASS AO=80;DP=188;FAO=80;FDP=188;FR=.;FRO=108;FSAF=49;FSAR=31;FSRF=55;FSRR=53;FWDB=0.0156899;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.187;QD=6.04836;RBI=0.015759;REFB=-0.0190245;REVB=0.00147461;RO=107;SAF=49;SAR=31;SRF=54;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112957;STB=0.560748;TYPE=snp;VARB=0.02438;OID=.;OPOS=74425569;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:188:107:108:80:80:31:49:54:53:31:49:55:53 chr16 74425702 . G A 269.86 PASS AO=106;DP=306;FAO=105;FDP=304;FR=.;FRO=199;FSAF=27;FSAR=78;FSRF=49;FSRR=150;FWDB=0.00945296;FXX=0.0129866;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.054;QD=3.55081;RBI=0.0375507;REFB=-0.0118852;REVB=-0.0363414;RO=194;SAF=23;SAR=83;SRF=47;SRR=147;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0411008;STB=0.509432;TYPE=snp;VARB=0.0133225;OID=.;OPOS=74425702;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:306:304:194:199:106:105:83:23:47:147:78:27:49:150 chr16 74425703 . G A 277.66 PASS AO=118;DP=315;FAO=105;FDP=303;FR=.;FRO=198;FSAF=27;FSAR=78;FSRF=46;FSRR=152;FWDB=0.0380481;FXX=0.0098036;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.9403;QD=3.66553;RBI=0.0421662;REFB=-0.0254246;REVB=0.0181749;RO=179;SAF=26;SAR=92;SRF=38;SRR=141;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0127016;STB=0.521669;TYPE=snp;VARB=0.00386081;OID=.;OPOS=74425703;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:315:303:179:198:118:105:92:26:38:141:78:27:46:152 chr16 74425730 . AGG AG,A,AGT 1972.09 PASS AO=57,79,124;DP=300;FAO=142,0,118;FDP=283;FR=.;FRO=23;FSAF=2,0,32;FSAR=140,0,86;FSRF=19;FSRR=4;FWDB=0.14592,0.0728204,0.0395527;FXX=0.0173605;HRUN=3,3,3;LEN=1,2,1;MLLD=19.319,24.8901,192.162;QD=27.8741;RBI=0.531954,0.262687,0.126126;REFB=-0.0895161,-0.0463309,-0.0317994;REVB=-0.511548,-0.252392,-0.119764;RO=21;SAF=0,0,28;SAR=57,79,96;SRF=20;SRR=1;SSEN=0.610084,0.610084,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.898008,-0.90212,-0.242574;STB=0.910687,0.5,0.603615;TYPE=del,del,snp;VARB=-0.0613142,0.0639881,0.0469347;OID=.,.,.;OPOS=74425731,74425731,74425732;OREF=G,GG,G;OALT=-,-,T;OMAPALT=AG,A,AGT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/3:57,79,124:288:142,0,118:283:23:2,0,32:140,0,86:19:4:99:21:0,0,28:57,79,96:20:1 chr16 74425769 . C T 348.86 PASS AO=118;DP=267;FAO=105;FDP=258;FR=.;FRO=153;FSAF=26;FSAR=79;FSRF=16;FSRR=137;FWDB=0.0823118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.0336;QD=5.40868;RBI=0.0823289;REFB=-0.0305842;REVB=0.00167968;RO=148;SAF=26;SAR=92;SRF=16;SRR=132;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184882;STB=0.62859;TYPE=snp;VARB=0.0419994;OID=.;OPOS=74425769;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:267:258:148:153:118:105:92:26:16:132:79:26:16:137 chr16 74425787 . G T 221.69 PASS AO=83;DP=196;FAO=70;FDP=181;FR=.;FRO=111;FSAF=14;FSAR=56;FSRF=13;FSRR=98;FWDB=0.0149261;FXX=0.0109284;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.391;QD=4.89921;RBI=0.0149277;REFB=-0.0146503;REVB=-0.000214902;RO=109;SAF=14;SAR=69;SRF=12;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116556;STB=0.587764;TYPE=snp;VARB=0.0335262;OID=.;OPOS=74425787;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:181:109:111:83:70:69:14:12:97:56:14:13:98 chr16 74425793 . T C 205.78 PASS AO=79;DP=185;FAO=66;FDP=173;FR=.;FRO=107;FSAF=12;FSAR=54;FSRF=11;FSRR=96;FWDB=0.0079967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.011;QD=4.75791;RBI=0.0139014;REFB=-0.00446126;REVB=-0.0113711;RO=103;SAF=12;SAR=67;SRF=10;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119071;STB=0.591692;TYPE=snp;VARB=0.0083453;OID=.;OPOS=74425793;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:173:103:107:79:66:67:12:10:93:54:12:11:96 chr16 74425795 . G A 240.36 PASS AO=79;DP=167;FAO=66;FDP=153;FR=.;FRO=87;FSAF=11;FSAR=55;FSRF=11;FSRR=76;FWDB=0.0151301;FXX=0.00649309;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.4847;QD=6.28383;RBI=0.0265337;REFB=-0.0370819;REVB=-0.0217973;RO=85;SAF=11;SAR=68;SRF=10;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0438871;STB=0.543556;TYPE=snp;VARB=0.0193412;OID=.;OPOS=74425795;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:153:85:87:79:66:68:11:10:75:55:11:11:76 chr16 74425826 . G A 156.08 PASS AO=34;DP=62;FAO=32;FDP=60;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=23;FSRF=2;FSRR=26;FWDB=-0.0103891;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.556;QD=10.4056;RBI=0.0151559;REFB=0.00522355;REVB=0.0110349;RO=28;SAF=9;SAR=25;SRF=2;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230135;STB=0.635376;TYPE=snp;VARB=-0.0027399;OID=.;OPOS=74425826;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:60:28:28:34:32:25:9:2:26:23:9:2:26 chr16 74445537 . G A 19.84 PASS AO=5;DP=16;FAO=5;FDP=16;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=0;FSRF=11;FSRR=0;FWDB=0.0365122;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=135.915;QD=4.95964;RBI=0.0365122;REFB=-0.0075241;REVB=0;RO=11;SAF=5;SAR=0;SRF=11;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.014808;OID=.;OPOS=74445537;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:16:16:11:11:5:5:0:5:11:0:0:5:11:0 chr16 74452071 . G A 48.42 PASS AO=6;DP=21;FAO=8;FDP=20;FR=.,HEALED;FRO=9;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.00812475;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=116.856;QD=9.68351;RBI=0.00908133;REFB=-0.0280491;REVB=-0.00405698;RO=7;SAF=4;SAR=2;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.32987;STB=0.726689;TYPE=snp;VARB=0.0239629;OID=.;OPOS=74452071;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:18:20:7:9:6:8:2:4:2:5:2:6:3:6 chr16 74490556 . G A 267.67 PASS AO=71;DP=161;FAO=71;FDP=160;FR=.;FRO=89;FSAF=35;FSAR=36;FSRF=41;FSRR=48;FWDB=-0.017568;FXX=0.0184038;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.773;QD=6.69172;RBI=0.0304696;REFB=-0.00514926;REVB=0.024895;RO=88;SAF=35;SAR=36;SRF=40;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0382319;STB=0.517965;TYPE=snp;VARB=0.00658224;OID=.;OPOS=74490556;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:160:88:89:71:71:36:35:40:48:36:35:41:48 chr16 74499589 . G A 413.4 PASS AO=81;DP=144;FAO=82;FDP=142;FR=.;FRO=60;FSAF=45;FSAR=37;FSRF=29;FSRR=31;FWDB=-0.000396946;FXX=0.0206882;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.7995;QD=11.6452;RBI=0.0546348;REFB=-0.0219446;REVB=0.0546334;RO=57;SAF=45;SAR=36;SRF=29;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0358177;STB=0.527761;TYPE=snp;VARB=0.0173162;OID=.;OPOS=74499589;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:142:57:60:81:82:36:45:29:28:37:45:29:31 chr16 74537591 . C T 428.02 PASS AO=90;DP=167;FAO=91;FDP=168;FR=.;FRO=77;FSAF=50;FSAR=41;FSRF=36;FSRR=41;FWDB=-0.000241199;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.522;QD=10.1909;RBI=0.00213207;REFB=-0.0250503;REVB=-0.00211838;RO=75;SAF=50;SAR=40;SRF=36;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0631583;STB=0.537626;TYPE=snp;VARB=0.0169262;OID=.;OPOS=74537591;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:168:75:77:90:91:40:50:36:39:41:50:36:41 chr16 74664743 . T C 380.68 PASS AO=104;DP=236;FAO=104;FDP=237;FR=.;FRO=133;FSAF=51;FSAR=53;FSRF=65;FSRR=68;FWDB=-0.0320942;FXX=0.0042015;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.7194;QD=6.42498;RBI=0.0322085;REFB=-0.00916955;REVB=-0.00271104;RO=131;SAF=51;SAR=53;SRF=64;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00184286;STB=0.500933;TYPE=snp;VARB=0.0108905;OID=.;OPOS=74664743;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:236:237:131:133:104:104:53:51:64:67:53:51:65:68 chr16 74664810 . A T 369.15 PASS AO=96;DP=217;FAO=97;FDP=215;FR=.;FRO=118;FSAF=43;FSAR=54;FSRF=51;FSRR=67;FWDB=0.0413493;FXX=0.0227262;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.0877;QD=6.86793;RBI=0.0428185;REFB=-0.0197944;REVB=0.0111203;RO=116;SAF=43;SAR=53;SRF=50;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0168797;STB=0.506176;TYPE=snp;VARB=0.0251963;OID=.;OPOS=74664810;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:217:215:116:118:96:97:53:43:50:66:54:43:51:67 chr16 74670458 . C T 162.56 PASS AO=47;DP=121;FAO=49;FDP=124;FR=.;FRO=75;FSAF=11;FSAR=38;FSRF=13;FSRR=62;FWDB=0.0466371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.842;QD=5.24396;RBI=0.0482853;REFB=0.00648398;REVB=-0.012508;RO=74;SAF=11;SAR=36;SRF=13;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0933777;STB=0.546702;TYPE=snp;VARB=-0.0115002;OID=.;OPOS=74670458;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:124:74:75:47:49:36:11:13:61:38:11:13:62 chr16 74695079 . G T 255.35 PASS AO=70;DP=156;FAO=68;FDP=154;FR=.;FRO=86;FSAF=27;FSAR=41;FSRF=33;FSRR=53;FWDB=0.0226808;FXX=0.0128197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.92;QD=6.63243;RBI=0.0227078;REFB=-0.00386341;REVB=-0.00110752;RO=86;SAF=28;SAR=42;SRF=33;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0168689;STB=0.507801;TYPE=snp;VARB=0.00469173;OID=.;OPOS=74695079;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:154:86:86:70:68:42:28:33:53:41:27:33:53 chr16 74747024 . G C 2646.97 PASS AO=219;DP=266;FAO=276;FDP=276;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=103;FSAR=173;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.03444;FXX=0.00360998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.2583;QD=38.362;RBI=0.0459784;REFB=0;REVB=0.0304615;RO=0;SAF=78;SAR=141;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.85248e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000316659;OID=.;OPOS=74747024;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:266:276:0:0:219:276:141:78:0:0:173:103:0:0 chr16 74750405 . G A 702.01 PASS AO=73;DP=73;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01865;FXX=0.0133316;HRUN=3;LEN=1;MLLD=115.766;QD=37.9464;RBI=0.0472239;REFB=0;REVB=0.0433852;RO=0;SAF=41;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000174511;OID=.;OPOS=74750405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:73:74:0:0:73:74:32:41:0:0:33:41:0:0 chr16 74920191 . G A 135.43 PASS AO=49;DP=142;FAO=49;FDP=141;FR=.;FRO=92;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=43;FSRR=49;FWDB=-0.00500726;FXX=0.00704176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.3579;QD=3.84195;RBI=0.0112741;REFB=-0.0158702;REVB=-0.0101012;RO=86;SAF=26;SAR=23;SRF=42;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0471495;STB=0.54118;TYPE=snp;VARB=0.0277394;OID=.;OPOS=74920191;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:141:86:92:49:49:23:26:42:44:23:26:43:49 chr16 74921661 . A T 220.09 PASS AO=52;DP=107;FAO=52;FDP=107;FR=.;FRO=55;FSAF=36;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=31;FWDB=5.66585e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.497;QD=8.22764;RBI=0.0160072;REFB=0.00189096;REVB=-0.0160071;RO=42;SAF=36;SAR=16;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130183;STB=0.637954;TYPE=snp;VARB=-0.00155061;OID=.;OPOS=74921661;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:42:55:52:52:16:36:23:19:16:36:24:31 chr16 75238103 . C T 549.19 PASS AO=57;DP=59;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0585109;FXX=0.0338926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9382;QD=38.5397;RBI=0.0670926;REFB=0;REVB=0.0328312;RO=0;SAF=40;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.57065e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00106198;OID=.;OPOS=75238103;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:59:57:0:0:57:57:17:40:0:0:17:40:0:0 chr16 75258617 . C T 65.52 PASS AO=11;DP=17;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0239552;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=169.675;QD=14.5594;RBI=0.0240275;REFB=-0.0125219;REVB=0.00186315;RO=6;SAF=2;SAR=9;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140261;STB=0.63353;TYPE=snp;VARB=0.0134522;OID=.;OPOS=75258617;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:17:18:6:7:11:11:9:2:2:4:9:2:3:4 chr16 75269267 . A G 147.53 PASS AO=15;DP=15;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0878112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.319;QD=36.882;RBI=0.0881536;REFB=0;REVB=-0.0077621;RO=0;SAF=9;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00131353;OID=.;OPOS=75269267;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:16:0:0:15:16:6:9:0:0:6:10:0:0 chr16 75269534 . C T 136.28 PASS AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0543675;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.306;QD=36.3402;RBI=0.112542;REFB=0;REVB=0.0985391;RO=0;SAF=4;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33019e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00166172;OID=.;OPOS=75269534;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:15:0:0:15:15:11:4:0:0:11:4:0:0 chr16 75281964 . A C 64.62 PASS AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.00807304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.77;QD=10.339;RBI=0.013608;REFB=-0.0191531;REVB=0.0109546;RO=12;SAF=3;SAR=10;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.327611;STB=0.689341;TYPE=snp;VARB=0.0398451;OID=.;OPOS=75281964;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:25:25:12:12:13:13:10:3:7:5:10:3:7:5 chr16 75327916 . A G 326.27 PASS AO=82;DP=175;FAO=82;FDP=175;FR=.;FRO=93;FSAF=37;FSAR=45;FSRF=42;FSRR=51;FWDB=-0.0267634;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.8821;QD=7.45765;RBI=0.0283115;REFB=-0.00926393;REVB=0.00923365;RO=93;SAF=37;SAR=45;SRF=42;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000381324;STB=0.500211;TYPE=snp;VARB=0.0104383;OID=.;OPOS=75327916;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:175:93:93:82:82:45:37:42:51:45:37:42:51 chr16 75563330 . G A 210.6 PASS AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0425536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.3134;QD=36.6267;RBI=0.0592927;REFB=0;REVB=0.0412895;RO=0;SAF=14;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84921e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00234729;OID=.;OPOS=75563330;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:0:0:23:23:9:14:0:0:9:14:0:0 chr16 75564287 . T C 281.06 PASS AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00555088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.669;QD=34.0676;RBI=0.0843381;REFB=-0.0997679;REVB=0.0841553;RO=1;SAF=11;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0217181;STB=0.511621;TYPE=snp;VARB=0.0129401;OID=.;OPOS=75564287;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:33:33:1:1:32:32:21:11:0:1:21:11:0:1 chr16 75565420 . A G 673.28 PASS AO=56;DP=83;FAO=77;FDP=81;FR=.;FRO=4;FSAF=42;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0122376;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.149;QD=33.2482;RBI=0.0661542;REFB=-7.56609e-05;REVB=-0.0650125;RO=0;SAF=40;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.01924e-08;STB=0.514669;TYPE=snp;VARB=-0.00015074;OID=.;OPOS=75565420;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:61:81:0:4:56:77:16:40:0:0:35:42:1:3 chr16 75590113 . C G 263.48 PASS AO=31;DP=33;FAO=31;FDP=33;FR=.;FRO=2;FSAF=9;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0104126;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.5488;QD=31.9371;RBI=0.0169585;REFB=0.0309515;REVB=0.0133854;RO=2;SAF=9;SAR=22;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0405505;STB=0.521725;TYPE=snp;VARB=-0.00212212;OID=.;OPOS=75590113;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:33:33:2:2:31:31:22:9:0:2:22:9:0:2 chr16 75646685 . G T 1194.1 PASS AO=123;DP=129;FAO=134;FDP=137;FR=.;FRO=3;FSAF=18;FSAR=116;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0973022;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.5151;QD=34.8643;RBI=0.0976204;REFB=-0.112824;REVB=-0.00787576;RO=5;SAF=10;SAR=113;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0736767;STB=0.524172;TYPE=snp;VARB=0.0102581;OID=.;OPOS=75646685;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:129:137:5:3:123:134:113:10:2:3:116:18:2:1 chr16 76311602 . G GT 600.89 PASS AO=73;DP=81;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0363328;FXX=0.0499937;HRUN=1;LEN=1;MLLD=25.0871;QD=31.6256;RBI=0.149181;REFB=0;REVB=0.144689;RO=7;SAF=40;SAR=33;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0669759;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00134714;OID=.;OPOS=76311603;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:73:81:76:76:0:40:36:0:0:53:7:40:33:1:6 chr16 76532583 . A G 1685 PASS AO=173;DP=174;FAO=176;FDP=176;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=132;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00522949;FXX=0.0112353;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.4545;QD=38.2955;RBI=0.041348;REFB=0;REVB=-0.0410159;RO=0;SAF=41;SAR=132;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000809832;OID=.;OPOS=76532583;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:174:176:0:0:173:176:132:41:0:0:132:44:0:0 chr16 76902847 . T C 1048.2 PASS AO=112;DP=113;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121775;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.142;QD=37.4357;RBI=0.0152459;REFB=-0.0632651;REVB=-0.00917314;RO=1;SAF=57;SAR=55;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00825711;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.79014e-06;OID=.;OPOS=76902847;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:113:112:1:0:112:112:55:57:1:0:55:57:0:0 chr16 76902850 . G A 1022.83 PASS AO=107;DP=111;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00396673;FXX=0.0446389;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.287;QD=38.2365;RBI=0.00708529;REFB=0;REVB=0.0058708;RO=0;SAF=55;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000634005;OID=.;OPOS=76902850;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:111:107:0:0:107:107:52:55:0:0:52:55:0:0 chr16 77228629 . A G 158.99 PASS AO=16;DP=16;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0560725;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.2416;QD=37.4102;RBI=0.0567454;REFB=0;REVB=-0.00871294;RO=0;SAF=8;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0018475;OID=.;OPOS=77228629;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:16:17:0:0:16:17:8:8:0:0:8:9:0:0 chr16 77228866 . T C 412.46 PASS AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0802821;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.854;QD=37.4966;RBI=0.0857698;REFB=0;REVB=0.0301868;RO=0;SAF=17;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.54734e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000210874;OID=.;OPOS=77228866;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:44:44:0:0:44:44:27:17:0:0:27:17:0:0 chr16 77232746 . A C 120.37 PASS AO=34;DP=83;FAO=34;FDP=84;FR=.;FRO=50;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=30;FSRR=20;FWDB=-0.0297897;FXX=0.0117633;HRUN=3;LEN=1;MLLD=107.841;QD=5.7321;RBI=0.0299384;REFB=-0.0262999;REVB=-0.00298013;RO=49;SAF=21;SAR=13;SRF=30;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00593995;STB=0.511055;TYPE=snp;VARB=0.0403774;OID=.;OPOS=77232746;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:84:49:50:34:34:13:21:30:19:13:21:30:20 chr16 77233338 . C T 493.46 PASS AO=150;DP=372;FAO=151;FDP=370;FR=.;FRO=219;FSAF=75;FSAR=76;FSRF=117;FSRR=102;FWDB=0.000845029;FXX=0.0053762;HRUN=4;LEN=1;MLLD=177.491;QD=5.3347;RBI=0.000845081;REFB=-0.0133193;REVB=9.3938e-06;RO=218;SAF=75;SAR=75;SRF=116;SRR=102;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0340639;STB=0.522222;TYPE=snp;VARB=0.020253;OID=.;OPOS=77233338;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:372:370:218:219:150:151:75:75:116:102:76:75:117:102 chr16 77233394 . A G 3164.81 PASS AO=330;DP=330;FAO=330;FDP=330;FR=.;FRO=0;FSAF=128;FSAR=202;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0221236;FXX=0.00302106;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.487;QD=38.3613;RBI=0.0492479;REFB=0;REVB=0.0439989;RO=0;SAF=128;SAR=202;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.94135e-07;OID=.;OPOS=77233394;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:330:330:0:0:330:330:202:128:0:0:202:128:0:0 chr16 77246795 . C G 39.35 PASS AO=8;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=-0.110574;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.0318;QD=9.25913;RBI=0.118053;REFB=-0.0409828;REVB=0.0413529;RO=9;SAF=4;SAR=4;SRF=1;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.355666;STB=0.705454;TYPE=snp;VARB=0.0322949;OID=.;OPOS=77246795;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:17:17:9:9:8:8:4:4:1:8:4:4:1:8 chr16 77316150 . G T 811.52 PASS AO=247;DP=499;FAO=195;FDP=395;FR=.;FRO=200;FSAF=78;FSAR=117;FSRF=71;FSRR=129;FWDB=-0.0185058;FXX=0.0124997;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.5539;QD=8.2179;RBI=0.0186416;REFB=-0.0223074;REVB=-0.00224663;RO=247;SAF=96;SAR=151;SRF=89;SRR=158;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0274504;STB=0.523959;TYPE=snp;VARB=0.0287987;OID=.;OPOS=77316150;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:499:395:247:200:247:195:151:96:89:158:117:78:71:129 chr16 77327018 . G A 165.39 PASS AO=45;DP=105;FAO=45;FDP=105;FR=.;FRO=60;FSAF=35;FSAR=10;FSRF=42;FSRR=18;FWDB=-0.0377235;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.3507;QD=6.30066;RBI=0.0855272;REFB=-0.00716269;REVB=0.0767583;RO=60;SAF=35;SAR=10;SRF=42;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106095;STB=0.559972;TYPE=snp;VARB=0.010012;OID=.;OPOS=77327018;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:60:60:45:45:10:35:42:18:10:35:42:18 chr16 77328895 . C T 342.07 PASS AO=64;DP=109;FAO=65;FDP=110;FR=.;FRO=45;FSAF=45;FSAR=20;FSRF=33;FSRR=12;FWDB=-0.00551065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.316;QD=12.4388;RBI=0.117654;REFB=-0.00249249;REVB=0.117525;RO=45;SAF=45;SAR=19;SRF=33;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.02777;STB=0.519994;TYPE=snp;VARB=0.00202776;OID=.;OPOS=77328895;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:110:45:45:64:65:19:45:33:12:20:45:33:12 chr16 77328990 . C A 239.64 PASS AO=59;DP=125;FAO=59;FDP=125;FR=.;FRO=66;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=37;FSRR=29;FWDB=-0.0351485;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.5246;QD=7.66834;RBI=0.0353397;REFB=-0.0263333;REVB=0.00367144;RO=66;SAF=30;SAR=29;SRF=37;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0496706;STB=0.52755;TYPE=snp;VARB=0.0323458;OID=.;OPOS=77328990;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:66:66:59:59:29:30:37:29:29:30:37:29 chr16 77353973 . G T 231.05 PASS AO=53;DP=104;FAO=53;FDP=106;FR=.;FRO=53;FSAF=15;FSAR=38;FSRF=19;FSRR=34;FWDB=-0.0153807;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.146;QD=8.71903;RBI=0.0197289;REFB=-0.0131443;REVB=0.0123557;RO=51;SAF=15;SAR=38;SRF=17;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0535129;STB=0.544671;TYPE=snp;VARB=0.0131141;OID=.;OPOS=77353973;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:106:51:53:53:53:38:15:17:34:38:15:19:34 chr16 77359919 . A T 593.29 PASS AO=123;DP=221;FAO=123;FDP=221;FR=.;FRO=98;FSAF=56;FSAR=67;FSRF=40;FSRR=58;FWDB=0.00290047;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.126;QD=10.7382;RBI=0.0128046;REFB=-0.00619281;REVB=0.0124718;RO=98;SAF=56;SAR=67;SRF=40;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0388724;STB=0.52114;TYPE=snp;VARB=0.00564321;OID=.;OPOS=77359919;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:221:98:98:123:123:67:56:40:58:67:56:40:58 chr16 77389956 . A G 1397.4 PASS AO=146;DP=146;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0367078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.882;QD=38.285;RBI=0.0367197;REFB=0;REVB=0.000932893;RO=0;SAF=59;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.35721e-05;OID=.;OPOS=77389956;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:146:146:0:0:146:146:87:59:0:0:87:59:0:0 chr16 77401545 . A G 389.13 PASS AO=105;DP=241;FAO=106;FDP=241;FR=.;FRO=135;FSAF=55;FSAR=51;FSRF=90;FSRR=45;FWDB=-0.0115901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.397;QD=6.45862;RBI=0.0150085;REFB=0.0113393;REVB=-0.00953553;RO=133;SAF=55;SAR=50;SRF=88;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140474;STB=0.583417;TYPE=snp;VARB=-0.0144217;OID=.;OPOS=77401545;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:241:241:133:135:105:106:50:55:88:45:51:55:90:45 chr16 77769369 . C T 2321.25 PASS AO=251;DP=258;FAO=253;FDP=257;FR=.;FRO=4;FSAF=66;FSAR=187;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0939559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.912;QD=36.1285;RBI=0.0953895;REFB=-0.145258;REVB=0.0164758;RO=5;SAF=64;SAR=187;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00707553;STB=0.500219;TYPE=snp;VARB=0.000578123;OID=.;OPOS=77769369;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:258:257:5:4:251:253:187:64:2:3:187:66:1:3 chr16 77769834 . G A 384.67 PASS AO=97;DP=207;FAO=97;FDP=207;FR=.;FRO=110;FSAF=32;FSAR=65;FSRF=57;FSRR=53;FWDB=0.00301719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.881;QD=7.43317;RBI=0.004089;REFB=0.00619838;REVB=-0.0027598;RO=106;SAF=32;SAR=65;SRF=55;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187442;STB=0.60504;TYPE=snp;VARB=-0.00682387;OID=.;OPOS=77769834;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:207:106:110:97:97:65:32:55:51:65:32:57:53 chr16 78013123 . C T 1737.86 PASS AO=183;DP=183;FAO=182;FDP=182;FR=.;FRO=0;FSAF=113;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00333271;FXX=0.010869;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.521;QD=38.1948;RBI=0.0049011;REFB=0;REVB=-0.00359358;RO=0;SAF=112;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.40794e-05;OID=.;OPOS=78013123;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:82:183:182:0:0:183:182:71:112:0:0:69:113:0:0 chr16 78013882 . A T 2071.3 PASS AO=215;DP=215;FAO=216;FDP=216;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=161;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00404943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.039;QD=38.3574;RBI=0.00427753;REFB=0;REVB=0.00137818;RO=0;SAF=54;SAR=161;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.8725e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.65589e-06;OID=.;OPOS=78013882;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:215:216:0:0:215:216:161:54:0:0:161:55:0:0 chr16 78064351 . C G 1205.08 PASS AO=126;DP=126;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0372103;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.638;QD=38.2565;RBI=0.043364;REFB=0;REVB=0.0222672;RO=0;SAF=77;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.38853e-05;OID=.;OPOS=78064351;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:126:126:0:0:126:126:49:77:0:0:49:77:0:0 chr16 78065139 . A G 1259.82 PASS AO=146;DP=157;FAO=146;FDP=156;FR=.;FRO=10;FSAF=89;FSAR=57;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.00667628;FXX=0.00636902;HRUN=5;LEN=1;MLLD=219.569;QD=32.3032;RBI=0.0125524;REFB=-0.0642808;REVB=-0.0106296;RO=9;SAF=89;SAR=57;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00624515;STB=0.507355;TYPE=snp;VARB=-3.19585e-05;OID=.;OPOS=78065139;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:157:156:9:10:146:146:57:89:5:4:57:89:5:5 chr16 78065972 . A G 2539.63 PASS AO=266;DP=268;FAO=266;FDP=266;FR=.;FRO=0;FSAF=110;FSAR=156;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00638079;FXX=0.00746241;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.8287;QD=38.1899;RBI=0.0176937;REFB=0.00165192;REVB=0.0165031;RO=1;SAF=110;SAR=156;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00431455;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.78269e-05;OID=.;OPOS=78065972;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:268:266:1:0:266:266:156:110:1:0:156:110:0:0 chr16 78066018 . A C 2308.74 PASS AO=251;DP=257;FAO=251;FDP=257;FR=.;FRO=6;FSAF=103;FSAR=148;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.00433706;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.538;QD=35.9338;RBI=0.0183926;REFB=-0.0455146;REVB=0.0178739;RO=5;SAF=103;SAR=148;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00810155;STB=0.50589;TYPE=snp;VARB=0.00122127;OID=.;OPOS=78066018;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:257:257:5:6:251:251:148:103:1:4:148:103:1:5 chr16 78142308 . G T 986.48 PASS AO=88;DP=88;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0166455;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.344;QD=37.5802;RBI=0.0167649;REFB=0;REVB=0.00199748;RO=0;SAF=62;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.23631e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.76301e-07;OID=.;OPOS=78142308;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:88:105:0:0:88:105:26:62:0:0:27:78:0:0 chr16 78420775 . G A 1160.36 PASS AO=120;DP=120;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0539575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2052;QD=38.0445;RBI=0.0788202;REFB=0;REVB=0.0574562;RO=0;SAF=75;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.11218e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000404567;OID=.;OPOS=78420775;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:120:122:0:0:120:122:45:75:0:0:47:75:0:0 chr16 78586531 . T C 2502.62 PASS AO=268;DP=276;FAO=273;FDP=273;FR=.;FRO=0;FSAF=134;FSAR=139;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0609735;FXX=0.0108692;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9529;QD=36.6685;RBI=0.0620547;REFB=-0.139267;REVB=0.0115331;RO=5;SAF=131;SAR=137;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108654;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00257439;OID=.;OPOS=78586531;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:87:276:273:5:0:268:273:137:131:4:1:139:134:0:0 chr16 79634579 . A C 339.07 PASS AO=62;DP=113;FAO=67;FDP=116;FR=.;FRO=49;FSAF=31;FSAR=36;FSRF=27;FSRR=22;FWDB=0.0116765;FXX=0.00854628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.1448;QD=11.6921;RBI=0.0395762;REFB=-0.0290997;REVB=0.0378145;RO=48;SAF=31;SAR=31;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0332502;STB=0.537302;TYPE=snp;VARB=0.0220483;OID=.;OPOS=79634579;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:116:48:49:62:67:31:31:26:22:36:31:27:22 chr16 80583497 . C T 165.99 PASS AO=47;DP=118;FAO=48;FDP=118;FR=.;FRO=70;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=54;FWDB=0.0105777;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.5976;QD=5.62664;RBI=0.0234503;REFB=0.0251243;REVB=0.0209291;RO=69;SAF=26;SAR=21;SRF=16;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.332679;STB=0.691527;TYPE=snp;VARB=-0.0347847;OID=.;OPOS=80583497;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:69:70:47:48:21:26:16:53:21:27:16:54 chr16 80718879 . A G 1132.55 PASS AO=131;DP=142;FAO=131;FDP=139;FR=.;FRO=8;FSAF=43;FSAR=88;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=0.0109897;FXX=0.0211253;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.584;QD=32.5913;RBI=0.0305338;REFB=-0.00520772;REVB=0.0284875;RO=8;SAF=43;SAR=88;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0659851;STB=0.534819;TYPE=snp;VARB=9.98927e-05;OID=.;OPOS=80718879;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:142:139:8:8:131:131:88:43:7:1:88:43:7:1 chr16 81050965 . A T 1267.96 PASS AO=135;DP=139;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0126841;FXX=0.021427;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.301;QD=37.0208;RBI=0.0126845;REFB=-0.00322538;REVB=-9.34709e-05;RO=2;SAF=77;SAR=58;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0161071;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.9797e-05;OID=.;OPOS=81050965;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:139:137:2:0:135:137:58:77:0:2:59:78:0:0 chr16 81061827 . G A 2471.54 PASS AO=278;DP=289;FAO=275;FDP=282;FR=.;FRO=7;FSAF=129;FSAR=146;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0128271;FXX=0.0242206;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.8915;QD=35.0574;RBI=0.117635;REFB=-0.143754;REVB=0.116934;RO=10;SAF=128;SAR=150;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.010687;STB=0.504572;TYPE=snp;VARB=0.00522006;OID=.;OPOS=81061827;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:289:282:10:7:278:275:150:128:3:7:146:129:2:5 chr16 81062171 . C T 1076.51 PASS AO=103;DP=104;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.745;QD=37.7722;RBI=0.0549342;REFB=0;REVB=0.0531819;RO=0;SAF=73;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.85679e-05;OID=.;OPOS=81062171;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:104:114:0:0:103:114:30:73:0:0:40:74:0:0 chr16 81077914 . CT C,CC 580.49 PASS AO=14,44;DP=58;FAO=7,56;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=7,22;FSAR=0,34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0926343,0.108676;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=115.451,133.323;QD=36.8564;RBI=0.0942508,0.109039;REFB=0,0;REVB=0.0173813,0.00888861;RO=0;SAF=14,10;SAR=0,34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.74446e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0589418,-0.00104848;OID=.,.;OPOS=81077915,81077915;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:14,44:58:7,56:63:0:7,22:0,34:0:0:4:0:14,10:0,34:0:0 chr16 81095363 . C T 568.24 PASS AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.472;QD=38.5248;RBI=0.0140009;REFB=0;REVB=-0.0069287;RO=0;SAF=20;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.94739e-05;OID=.;OPOS=81095363;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:59:59:0:0:59:59:39:20:0:0:39:20:0:0 chr16 81145807 . C G 2980.81 PASS AO=314;DP=317;FAO=314;FDP=314;FR=.;FRO=0;FSAF=127;FSAR=187;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0231241;FXX=0.00946342;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.9782;QD=37.972;RBI=0.0297407;REFB=-0.0384875;REVB=0.0187026;RO=0;SAF=127;SAR=187;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.08329e-05;OID=.;OPOS=81145807;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:317:314:0:0:314:314:187:127:0:0:187:127:0:0 chr16 81151122 . A C 722.48 PASS AO=81;DP=82;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0118559;FXX=0.0361402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.636;QD=36.1242;RBI=0.0176705;REFB=-0.08777;REVB=0.0131029;RO=0;SAF=43;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18592e-08;STB=0.506171;TYPE=snp;VARB=0.00547173;OID=.;OPOS=81151122;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:82:80:0:1:81:79:38:43:0:0:39:40:1:0 chr16 81157324 . G A 687.4 PASS AO=78;DP=79;FAO=76;FDP=79;FR=.;FRO=3;FSAF=22;FSAR=54;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0342554;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6435;QD=34.8048;RBI=0.0901447;REFB=-0.130577;REVB=0.0833825;RO=1;SAF=23;SAR=55;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00852982;STB=0.50202;TYPE=snp;VARB=0.00689387;OID=.;OPOS=81157324;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:79:79:1:3:78:76:55:23:0:1:54:22:1:2 chr16 81173136 . T C 576.16 PASS AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00741106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.3117;QD=37.7809;RBI=0.0280649;REFB=0;REVB=0.0270687;RO=0;SAF=37;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000154819;OID=.;OPOS=81173136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:61:61:0:0:61:61:24:37:0:0:24:37:0:0 chr16 81173193 . C T 121.06 PASS AO=32;DP=74;FAO=32;FDP=75;FR=.;FRO=43;FSAF=9;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=0.00925532;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=135.52;QD=6.45658;RBI=0.0224362;REFB=-0.0218886;REVB=0.0204383;RO=39;SAF=9;SAR=23;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267781;STB=0.655286;TYPE=snp;VARB=0.0242509;OID=.;OPOS=81173193;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:75:39:43:32:32:23:9:21:18:23:9:23:20 chr16 81180988 . C G 446.59 PASS AO=104;DP=207;FAO=104;FDP=207;FR=.;FRO=103;FSAF=75;FSAR=29;FSRF=82;FSRR=21;FWDB=0.0109353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.234;QD=8.62968;RBI=0.0644791;REFB=-0.0254351;REVB=0.0635451;RO=103;SAF=75;SAR=29;SRF=82;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0884481;STB=0.548347;TYPE=snp;VARB=0.0279915;OID=.;OPOS=81180988;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:207:103:103:104:104:29:75:82:21:29:75:82:21 chr16 81181821 . T C 209.86 PASS AO=37;DP=69;FAO=41;FDP=71;FR=.;FRO=30;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.00115644;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.5888;QD=11.8232;RBI=0.0644175;REFB=-0.0085855;REVB=0.0644071;RO=29;SAF=19;SAR=18;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0793721;STB=0.508937;TYPE=snp;VARB=0.00472824;OID=.;OPOS=81181821;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:71:29:30:37:41:18:19:12:17:21:20:14:16 chr16 81185416 . A G 981.75 PASS AO=106;DP=113;FAO=111;FDP=112;FR=.;FRO=1;FSAF=73;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0500883;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.8731;QD=35.0625;RBI=0.0621037;REFB=-0.0946474;REVB=0.0367155;RO=1;SAF=73;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141628;STB=0.506492;TYPE=snp;VARB=0.00444957;OID=.;OPOS=81185416;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:113:112:1:1:106:111:33:73:0:1:38:73:0:1 chr16 81190601 . T C 679.89 PASS AO=72;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0250002;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.802;QD=37.254;RBI=0.0352474;REFB=0;REVB=0.0248468;RO=0;SAF=39;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.89537e-05;OID=.;OPOS=81190601;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:73:73:0:0:72:73:33:39:0:0:33:40:0:0 chr16 81190613 . A G 728.32 PASS AO=72;DP=73;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0646075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.9412;QD=37.8349;RBI=0.0663977;REFB=0;REVB=0.0153142;RO=0;SAF=42;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1178e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000396069;OID=.;OPOS=81190613;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:73:77:0:0:72:77:30:42:0:0:34:43:0:0 chr16 81193321 . C T 261.34 PASS AO=67;DP=148;FAO=67;FDP=147;FR=.;FRO=80;FSAF=31;FSAR=36;FSRF=33;FSRR=47;FWDB=0.0106865;FXX=0.0199987;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.421;QD=7.11133;RBI=0.0282981;REFB=-0.0095594;REVB=0.0262027;RO=68;SAF=31;SAR=36;SRF=31;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00624856;STB=0.52757;TYPE=snp;VARB=0.0114357;OID=.;OPOS=81193321;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:147:68:80:67:67:36:31:31:37:36:31:33:47 chr16 81194382 . T C 2349.32 PASS AO=241;DP=243;FAO=246;FDP=246;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=155;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107071;FXX=0.00404842;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.387;QD=38.2003;RBI=0.0291984;REFB=0;REVB=0.0271644;RO=0;SAF=89;SAR=152;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.13494e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000318478;OID=.;OPOS=81194382;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:243:246:0:0:241:246:152:89:0:0:155:91:0:0 chr16 81199520 . T C 593.88 PASS AO=61;DP=61;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.016674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.0069;QD=37.7068;RBI=0.0306841;REFB=0;REVB=0.0257584;RO=0;SAF=23;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.01386e-05;OID=.;OPOS=81199520;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:61:63:0:0:61:63:38:23:0:0:40:23:0:0 chr16 81199538 . T C 519.35 PASS AO=53;DP=53;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00908734;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8155;QD=37.7707;RBI=0.102355;REFB=0;REVB=0.101951;RO=0;SAF=18;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00130687;OID=.;OPOS=81199538;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:53:55:0:0:53:55:35:18:0:0:37:18:0:0 chr16 81199544 . G A 519.68 PASS AO=53;DP=53;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0575352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.7609;QD=37.7949;RBI=0.0714834;REFB=0;REVB=0.0424214;RO=0;SAF=18;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000694804;OID=.;OPOS=81199544;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:53:55:0:0:53:55:35:18:0:0:37:18:0:0 chr16 81199554 . C T 471.72 PASS AO=48;DP=48;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00481574;FXX=0.0740604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.979;QD=37.7378;RBI=0.0241687;REFB=0;REVB=-0.0236841;RO=0;SAF=15;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00054627;OID=.;OPOS=81199554;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:48:50:0:0:48:50:33:15:0:0:35:15:0:0 chr16 81199555 . A G 491.47 PASS AO=47;DP=51;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.118248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.3904;QD=37.0918;RBI=0.119273;REFB=0;REVB=-0.0155996;RO=0;SAF=15;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00109137;OID=.;OPOS=81199555;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:51:53:0:0:47:53:32:15:0:0:36:17:0:0 chr16 81208175 . C T 675.17 PASS AO=75;DP=79;FAO=75;FDP=78;FR=.;FRO=3;FSAF=64;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0214698;FXX=0.0126566;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.657;QD=34.6241;RBI=0.0263509;REFB=-0.0559878;REVB=0.015278;RO=1;SAF=64;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00733731;STB=0.537805;TYPE=snp;VARB=0.000316378;OID=.;OPOS=81208175;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:79:78:1:3:75:75:11:64:1:0:11:64:1:2 chr16 81208203 . G T 831.03 PASS AO=88;DP=89;FAO=88;FDP=89;FR=.;FRO=1;FSAF=73;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.028619;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=213.058;QD=37.3495;RBI=0.0289334;REFB=-0.0674933;REVB=-0.00425425;RO=1;SAF=73;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00644856;STB=0.503401;TYPE=snp;VARB=0.000148823;OID=.;OPOS=81208203;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:89:89:1:1:88:88:15:73:1:0:15:73:1:0 chr16 81208515 . G A 290.95 PASS AO=30;DP=30;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0903442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.918;QD=36.3682;RBI=0.0940757;REFB=0;REVB=0.0262328;RO=0;SAF=4;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.9955e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00085665;OID=.;OPOS=81208515;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:30:32:0:0:30:32:26:4:0:0:26:6:0:0 chr16 81209207 . T C 137.7 PASS AO=24;DP=55;FAO=32;FDP=63;FR=.;FRO=31;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.041667;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.801;QD=8.74286;RBI=0.0507197;REFB=-0.0366995;REVB=-0.0289198;RO=31;SAF=13;SAR=11;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0390688;STB=0.540167;TYPE=snp;VARB=0.0307824;OID=.;OPOS=81209207;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:63:31:31:24:32:11:13:18:13:11:21:18:13 chr16 81211496 . C A 55.54 PASS AO=20;DP=63;FAO=20;FDP=63;FR=.;FRO=43;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=-0.00150528;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=166.392;QD=3.52614;RBI=0.0115733;REFB=-0.0104391;REVB=-0.0114749;RO=43;SAF=14;SAR=6;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.254161;STB=0.651007;TYPE=snp;VARB=0.0200399;OID=.;OPOS=81211496;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:63:63:43:43:20:20:6:14:21:22:6:14:21:22 chr16 81211548 . G A 79.49 PASS AO=22;DP=55;FAO=22;FDP=55;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=-0.0252767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.4872;QD=5.78088;RBI=0.0254267;REFB=0.00518252;REVB=0.0027571;RO=33;SAF=17;SAR=5;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211938;STB=0.623096;TYPE=snp;VARB=-0.00975215;OID=.;OPOS=81211548;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:55:55:33:33:22:22:5:17:20:13:5:17:20:13 chr16 81213378 . A G 218.11 PASS AO=35;DP=52;FAO=36;FDP=53;FR=.;FRO=17;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=0.00154944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.505;QD=16.4608;RBI=0.0330536;REFB=0.00423924;REVB=0.0330172;RO=17;SAF=20;SAR=15;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0835214;STB=0.549329;TYPE=snp;VARB=-0.00160209;OID=.;OPOS=81213378;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:52:53:17:17:35:36:15:20:12:5:16:20:12:5 chr16 81219187 . C T 349.6 PASS AO=70;DP=123;FAO=71;FDP=126;FR=.;FRO=55;FSAF=9;FSAR=62;FSRF=8;FSRR=47;FWDB=0.046072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.778;QD=11.0983;RBI=0.0470861;REFB=-0.0358822;REVB=0.0097196;RO=52;SAF=9;SAR=61;SRF=8;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0424334;STB=0.517931;TYPE=snp;VARB=0.0204304;OID=.;OPOS=81219187;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:126:52:55:70:71:61:9:8:44:62:9:8:47 chr16 81232275 . G A 49.73 PASS AO=22;DP=79;FAO=22;FDP=79;FR=.;FRO=57;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=41;FSRR=16;FWDB=0.0221736;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.888;QD=2.51806;RBI=0.0258387;REFB=-0.00500769;REVB=0.0132652;RO=57;SAF=14;SAR=8;SRF=41;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112676;STB=0.566953;TYPE=snp;VARB=0.00735682;OID=.;OPOS=81232275;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:79:79:57:57:22:22:8:14:41:16:8:14:41:16 chr16 81232294 . T C 313.26 PASS AO=50;DP=78;FAO=54;FDP=82;FR=.;FRO=28;FSAF=39;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=7;FWDB=0.0166336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.932;QD=15.2808;RBI=0.0525224;REFB=-0.0247155;REVB=-0.049819;RO=26;SAF=35;SAR=15;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0233477;STB=0.511941;TYPE=snp;VARB=0.0251131;OID=.;OPOS=81232294;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:78:82:26:28:50:54:15:35:19:7:15:39:21:7 chr16 81232564 . T G 657.03 PASS AO=160;DP=330;FAO=160;FDP=329;FR=.;FRO=169;FSAF=73;FSAR=87;FSRF=74;FSRR=95;FWDB=-0.0695221;FXX=0.00303021;HRUN=3;LEN=1;MLLD=66.0646;QD=7.98821;RBI=0.0740514;REFB=-0.0134877;REVB=-0.0255008;RO=169;SAF=73;SAR=87;SRF=74;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0173528;STB=0.509529;TYPE=snp;VARB=0.011335;OID=.;OPOS=81232564;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:330:329:169:169:160:160:87:73:74:95:87:73:74:95 chr16 81241098 . C T 2208.88 PASS AO=230;DP=233;FAO=233;FDP=233;FR=.;FRO=0;FSAF=128;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00192045;FXX=0.0210075;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.105;QD=37.9208;RBI=0.00197668;REFB=-0.0309907;REVB=-0.000468086;RO=0;SAF=128;SAR=102;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.65341e-05;OID=.;OPOS=81241098;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:233:233:0:0:230:233:102:128:0:0:105:128:0:0 chr16 81241100 . G C 345.06 PASS AO=101;DP=243;FAO=101;FDP=243;FR=.;FRO=142;FSAF=44;FSAR=57;FSRF=88;FSRR=54;FWDB=-0.0140826;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=254.951;QD=5.68;RBI=0.017986;REFB=0.00298961;REVB=0.0111882;RO=142;SAF=44;SAR=57;SRF=88;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190766;STB=0.606362;TYPE=snp;VARB=-0.0043826;OID=.;OPOS=81241100;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:243:243:142:142:101:101:57:44:88:54:57:44:88:54 chr16 81242098 . TCCCG TCCG,TCCCA 341.44 PASS AO=20,20;DP=82;FAO=22,35;FDP=77;FR=.;FRO=20;FSAF=21,34;FSAR=1,1;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.417021,0.00397731;FXX=0;HRUN=3,2;LEN=1,1;MLLD=18.5679,120.349;QD=17.737;RBI=0.4518,0.0316757;REFB=-0.045672,-0.0182009;REVB=0.17383,0.031425;RO=11;SAF=20,19;SAR=0,1;SRF=2;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0.52506,0;SSSB=0.865496,0.702211;STB=0.881206,0.894404;TYPE=del,snp;VARB=0.0129873,0.04258;OID=.,.;OPOS=81242099,81242102;OREF=C,G;OALT=-,A;OMAPALT=TCCG,TCCCA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:20,20:63:22,35:77:20:21,34:1,1:10:10:76:11:20,19:0,1:2:9 chr16 81242194 . T C 654.98 PASS AO=53;DP=75;FAO=68;FDP=68;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=36;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0468324;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.504;QD=38.5281;RBI=0.0727623;REFB=0;REVB=0.0556873;RO=0;SAF=28;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000428445;OID=.;OPOS=81242194;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:68:68:0:0:53:68:25:28:0:0:32:36:0:0 chr16 81242198 . G A 169.27 PASS AO=36;DP=60;FAO=36;FDP=69;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=-0.0670802;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.505;QD=9.81253;RBI=0.0683428;REFB=-0.0510368;REVB=0.0130763;RO=24;SAF=17;SAR=19;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0202743;STB=0.563718;TYPE=snp;VARB=0.0364081;OID=.;OPOS=81242198;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:69:24:33:36:36:19:17:12:12:19:17:20:13 chr16 81248716 . C T 442.5 PASS AO=111;DP=235;FAO=111;FDP=235;FR=.;FRO=124;FSAF=65;FSAR=46;FSRF=61;FSRR=63;FWDB=0.00043722;FXX=0.00423711;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.4589;QD=7.53199;RBI=0.0204572;REFB=-0.0182666;REVB=-0.0204526;RO=122;SAF=65;SAR=46;SRF=59;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0978539;STB=0.550026;TYPE=snp;VARB=0.0175388;OID=.;OPOS=81248716;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:235:235:122:124:111:111:46:65:59:63:46:65:61:63 chr16 81249927 . C T 116.19 PASS AO=29;DP=70;FAO=30;FDP=70;FR=.;FRO=40;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=0.0655327;FXX=0.0140825;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.946;QD=6.63951;RBI=0.0686049;REFB=1.49162e-05;REVB=0.0203002;RO=40;SAF=14;SAR=15;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0430975;STB=0.533311;TYPE=snp;VARB=0.000374338;OID=.;OPOS=81249927;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:40:40:29:30:15:14:21:19:16:14:21:19 chr16 81249954 . T A 122 PASS AO=32;DP=74;FAO=32;FDP=74;FR=.;FRO=42;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=-0.0304914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.824;QD=6.5943;RBI=0.0305904;REFB=-0.0144143;REVB=0.00245899;RO=42;SAF=16;SAR=16;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0239129;STB=0.513505;TYPE=snp;VARB=0.00875152;OID=.;OPOS=81249954;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:42:42:32:32:16:16:22:20:16:16:22:20 chr16 81253759 . A G 197.05 PASS AO=57;DP=139;FAO=57;FDP=139;FR=.;FRO=82;FSAF=25;FSAR=32;FSRF=32;FSRR=50;FWDB=0.00573349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.7043;QD=5.67037;RBI=0.0342545;REFB=-0.00445617;REVB=-0.0337713;RO=82;SAF=25;SAR=32;SRF=32;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.051909;STB=0.529159;TYPE=snp;VARB=0.0127495;OID=.;OPOS=81253759;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:82:82:57:57:32:25:32:50:32:25:32:50 chr16 81253917 . A G 167.51 PASS AO=36;DP=70;FAO=36;FDP=70;FR=.;FRO=34;FSAF=8;FSAR=28;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.0207191;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.15;QD=9.5717;RBI=0.0312453;REFB=-0.00550102;REVB=-0.0233878;RO=34;SAF=8;SAR=28;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.310659;STB=0.673969;TYPE=snp;VARB=0.00678448;OID=.;OPOS=81253917;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:34:34:36:36:28:8:18:16:28:8:18:16 chr16 81279120 . T C 1012.44 PASS AO=104;DP=104;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4713;QD=38.2055;RBI=0.0173829;REFB=0;REVB=0.0130174;RO=0;SAF=41;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.05495e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.35702e-05;OID=.;OPOS=81279120;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:104:106:0:0:104:106:63:41:0:0:63:43:0:0 chr16 81301694 . A T 959.44 PASS AO=101;DP=103;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0420107;FXX=0.0194156;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.61;QD=37.9977;RBI=0.0452455;REFB=0;REVB=-0.0168005;RO=0;SAF=41;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.25502e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.90264e-05;OID=.;OPOS=81301694;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:103:101:0:0:101:101:60:41:0:0:60:41:0:0 chr16 81398635 . C T 333.07 PASS AO=86;DP=188;FAO=86;FDP=188;FR=.;FRO=102;FSAF=42;FSAR=44;FSRF=50;FSRR=52;FWDB=0.00679052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.542;QD=7.08667;RBI=0.0102075;REFB=-0.00295352;REVB=0.00762116;RO=100;SAF=42;SAR=44;SRF=48;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0081324;STB=0.50099;TYPE=snp;VARB=0.00395434;OID=.;OPOS=81398635;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:188:100:102:86:86:44:42:48:52:44:42:50:52 chr16 81412168 . G A 814.22 PASS AO=256;DP=532;FAO=196;FDP=398;FR=.;FRO=202;FSAF=107;FSAR=89;FSRF=122;FSRR=80;FWDB=-0.00931329;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.109;QD=8.18311;RBI=0.0195937;REFB=-0.0262867;REVB=0.0172387;RO=269;SAF=139;SAR=117;SRF=163;SRR=106;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0596852;STB=0.529869;TYPE=snp;VARB=0.0252945;OID=.;OPOS=81412168;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:532:398:269:202:256:196:117:139:163:106:89:107:122:80 chr16 81497952 . A G 872.41 PASS AO=89;DP=89;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0251031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.533;QD=37.9309;RBI=0.0301483;REFB=0;REVB=0.0166959;RO=0;SAF=37;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.1343e-05;OID=.;OPOS=81497952;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:89:92:0:0:89:92:52:37:0:0:52:40:0:0 chr16 81679151 . A G 606.72 PASS AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0234257;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.903;QD=37.9201;RBI=0.0310545;REFB=0;REVB=-0.0203868;RO=0;SAF=31;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.03368e-05;OID=.;OPOS=81679151;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:65:64:0:0:64:64:33:31:0:0:33:31:0:0 chr16 81726863 . C G 1997.99 PASS AO=219;DP=227;FAO=223;FDP=227;FR=.;FRO=4;FSAF=131;FSAR=92;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.00816747;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=132.865;QD=35.2068;RBI=0.0094679;REFB=-0.113395;REVB=0.00478891;RO=4;SAF=131;SAR=88;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00540154;STB=0.502958;TYPE=snp;VARB=0.00112244;OID=.;OPOS=81726863;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:227:227:4:4:219:223:88:131:3:1:92:131:3:1 chr16 81743328 . A G 910.24 PASS AO=99;DP=101;FAO=99;FDP=101;FR=.;FRO=2;FSAF=51;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0120936;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.973;QD=36.0491;RBI=0.109185;REFB=-0.0758474;REVB=-0.108513;RO=2;SAF=51;SAR=48;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000569493;STB=0.5003;TYPE=snp;VARB=0.00050024;OID=.;OPOS=81743328;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:101:101:2:2:99:99:48:51:1:1:48:51:1:1 chr16 81819768 . T C 667.85 PASS AO=61;DP=61;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0360461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.36;QD=37.6251;RBI=0.0708375;REFB=0;REVB=0.0609805;RO=0;SAF=34;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000122009;OID=.;OPOS=81819768;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:61:71:0:0:61:71:27:34:0:0:37:34:0:0 chr16 81888152 . A G 398.99 PASS AO=87;DP=163;FAO=87;FDP=162;FR=.;FRO=75;FSAF=20;FSAR=67;FSRF=21;FSRR=54;FWDB=0.0199492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.7982;QD=9.85148;RBI=0.0358774;REFB=-0.0368784;REVB=-0.0298197;RO=76;SAF=19;SAR=68;SRF=22;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0837657;STB=0.531636;TYPE=snp;VARB=0.0306102;OID=.;OPOS=81888152;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:162:76:75:87:87:68:19:22:54:67:20:21:54 chr16 81892708 . T A 154.84 PASS AO=32;DP=62;FAO=33;FDP=63;FR=.;FRO=30;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=9;FWDB=0.00755793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.898;QD=9.83137;RBI=0.0102768;REFB=-0.00768633;REVB=0.00696343;RO=30;SAF=22;SAR=10;SRF=21;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0127195;STB=0.501709;TYPE=snp;VARB=0.00703952;OID=.;OPOS=81892708;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:63:30:30:32:33:10:22:21:9:10:23:21:9 chr16 81902079 . T C 150.32 PASS AO=49;DP=150;FAO=54;FDP=155;FR=.;FRO=101;FSAF=16;FSAR=38;FSRF=32;FSRR=69;FWDB=-0.0316555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.0083;QD=3.87926;RBI=0.0320534;REFB=-0.015834;REVB=0.00503473;RO=93;SAF=11;SAR=38;SRF=24;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0529321;STB=0.515831;TYPE=snp;VARB=0.0296484;OID=.;OPOS=81902079;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:155:93:101:49:54:38:11:24:69:38:16:32:69 chr16 81902139 . G C 195.58 PASS AO=65;DP=182;FAO=67;FDP=184;FR=.;FRO=117;FSAF=14;FSAR=53;FSRF=42;FSRR=75;FWDB=0.0379298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.7765;QD=4.25181;RBI=0.0756637;REFB=-0.00172878;REVB=-0.06547;RO=117;SAF=14;SAR=51;SRF=42;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205074;STB=0.623489;TYPE=snp;VARB=0.00281431;OID=.;OPOS=81902139;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:184:117:117:65:67:51:14:42:75:53:14:42:75 chr16 81941319 . C T 569.03 PASS AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0158759;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.887;QD=36.129;RBI=0.0314282;REFB=-0.0859328;REVB=0.0271236;RO=0;SAF=35;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.46408e-08;STB=0.50704;TYPE=snp;VARB=0.000404576;OID=.;OPOS=81941319;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:63:63:0:1:62:62:27:35:0:0:27:35:1:0 chr16 81971403 . T C 54.64 PASS AO=14;DP=48;FAO=17;FDP=50;FR=.,HEALED;FRO=33;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=-0.0130462;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.2654;QD=4.37119;RBI=0.0149038;REFB=-0.0189219;REVB=-0.00720557;RO=21;SAF=6;SAR=8;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0494203;STB=0.554393;TYPE=snp;VARB=0.103256;OID=.;OPOS=81971403;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:48:50:21:33:14:17:8:6:10:11:10:7:11:22 chr16 81995553 . C T 89.99 PASS AO=19;DP=38;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=0.0312348;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.8036;QD=9.47276;RBI=0.0541392;REFB=-0.038981;REVB=-0.0442203;RO=19;SAF=13;SAR=6;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0551797;STB=0.531116;TYPE=snp;VARB=0.040333;OID=.;OPOS=81995553;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:38:38:19:19:19:19:6:13:14:5:6:13:14:5 chr16 82033612 . T C 613.6 PASS AO=181;DP=417;FAO=173;FDP=400;FR=.;FRO=227;FSAF=80;FSAR=93;FSRF=93;FSRR=134;FWDB=-0.0195932;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=72.8154;QD=6.13595;RBI=0.0596626;REFB=-0.0167174;REVB=-0.0563536;RO=235;SAF=80;SAR=101;SRF=95;SRR=140;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0391884;STB=0.530231;TYPE=snp;VARB=0.0205745;OID=.;OPOS=82033612;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:417:400:235:227:181:173:101:80:95:140:93:80:93:134 chr16 82033626 . T C 544.97 PASS AO=161;DP=385;FAO=161;FDP=386;FR=.;FRO=225;FSAF=78;FSAR=83;FSRF=92;FSRR=133;FWDB=-0.0223669;FXX=0.00258391;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.367;QD=5.64738;RBI=0.0224868;REFB=-0.0113746;REVB=0.00231941;RO=223;SAF=78;SAR=83;SRF=90;SRR=133;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0847973;STB=0.544216;TYPE=snp;VARB=0.0203168;OID=.;OPOS=82033626;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:385:386:223:225:161:161:83:78:90:133:83:78:92:133 chr16 82034435 . C G 491.72 PASS AO=96;DP=165;FAO=96;FDP=164;FR=.;FRO=68;FSAF=34;FSAR=62;FSRF=28;FSRR=40;FWDB=0.0421965;FXX=0.0120475;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5824;QD=11.9932;RBI=0.0432137;REFB=-0.012114;REVB=-0.00932057;RO=65;SAF=34;SAR=62;SRF=27;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0489839;STB=0.525706;TYPE=snp;VARB=0.00972645;OID=.;OPOS=82034435;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:164:65:68:96:96:62:34:27:38:62:34:28:40 chr16 82673047 . C T 1323.87 PASS AO=139;DP=140;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000187378;FXX=0.00714235;HRUN=3;LEN=1;MLLD=268.46;QD=38.097;RBI=0.0158227;REFB=-0.0168849;REVB=0.0158216;RO=1;SAF=49;SAR=90;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00525396;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.80106e-05;OID=.;OPOS=82673047;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:140:139:1:0:139:139:90:49:0:1:90:49:0:0 chr16 82903030 . A C 245.52 PASS AO=25;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103166;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.8731;QD=37.7723;RBI=0.0346236;REFB=0;REVB=0.0330509;RO=0;SAF=10;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000564817;OID=.;OPOS=82903030;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:26:26:0:0:25:26:15:10:0:0:16:10:0:0 chr16 83065664 . G A 2503.37 PASS AO=257;DP=258;FAO=261;FDP=261;FR=.;FRO=0;FSAF=138;FSAR=123;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173463;FXX=0.00760427;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.879;QD=38.3659;RBI=0.0255539;REFB=0;REVB=0.0187646;RO=0;SAF=136;SAR=121;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.1573e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000105595;OID=.;OPOS=83065664;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:258:261:0:0:257:261:121:136:0:0:123:138:0:0 chr16 83214480 . C A 127.9 PASS AO=34;DP=80;FAO=34;FDP=80;FR=.;FRO=46;FSAF=25;FSAR=9;FSRF=31;FSRR=15;FWDB=-0.00366413;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.18;QD=6.39496;RBI=0.0212895;REFB=0.00687979;REVB=0.0209718;RO=46;SAF=25;SAR=9;SRF=31;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0765957;STB=0.543452;TYPE=snp;VARB=-0.00957778;OID=.;OPOS=83214480;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:46:46:34:34:9:25:31:15:9:25:31:15 chr16 83817019 . A G 568.26 PASS AO=45;DP=50;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.184115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.343;QD=37.8843;RBI=0.185876;REFB=0;REVB=0.0255266;RO=0;SAF=7;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.79115e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000967371;OID=.;OPOS=83817019;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:50:60:0:0:45:60:38:7:0:0:43:17:0:0 chr16 83983071 . C T 124.27 PASS AO=32;DP=73;FAO=32;FDP=73;FR=.;FRO=41;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=0.0234367;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.285;QD=6.80931;RBI=0.0235194;REFB=-0.0313398;REVB=-0.00197126;RO=41;SAF=22;SAR=10;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137374;STB=0.577811;TYPE=snp;VARB=0.0349451;OID=.;OPOS=83983071;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:41:41:32:32:10:22:23:18:10:22:23:18 chr16 83984776 . A C 105.37 PASS AO=34;DP=90;FAO=33;FDP=89;FR=.;FRO=56;FSAF=1;FSAR=32;FSRF=5;FSRR=51;FWDB=-0.0512852;FXX=0.0111099;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.1636;QD=4.73564;RBI=0.066093;REFB=0.000678948;REVB=-0.0416907;RO=53;SAF=2;SAR=32;SRF=4;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.073669;STB=0.69802;TYPE=snp;VARB=-0.00260962;OID=.;OPOS=83984776;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:89:53:56:34:33:32:2:4:49:32:1:5:51 chr16 83984844 . A C 143.45 PASS AO=34;DP=72;FAO=34;FDP=72;FR=.;FRO=38;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=0.00216205;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.604;QD=7.9695;RBI=0.0144071;REFB=-0.0185215;REVB=-0.014244;RO=38;SAF=22;SAR=12;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216235;STB=0.62119;TYPE=snp;VARB=0.0194268;OID=.;OPOS=83984844;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:38:38:34:34:12:22:16:22:12:22:16:22 chr16 83984850 . C G 141.81 PASS AO=33;DP=69;FAO=33;FDP=69;FR=.;FRO=36;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.0180845;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.863;QD=8.22079;RBI=0.021989;REFB=-0.0238224;REVB=-0.0125087;RO=35;SAF=22;SAR=11;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225331;STB=0.619925;TYPE=snp;VARB=0.0326647;OID=.;OPOS=83984850;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:35:36:33:33:11:22:15:20:11:22:16:20 chr16 83999261 . C A 260.23 PASS AO=57;DP=112;FAO=57;FDP=108;FR=.;FRO=51;FSAF=43;FSAR=14;FSRF=29;FSRR=22;FWDB=-0.00213389;FXX=0.0357111;HRUN=4;LEN=1;MLLD=221.69;QD=9.63806;RBI=0.00596779;REFB=-0.0146661;REVB=-0.00557324;RO=51;SAF=43;SAR=14;SRF=29;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190769;STB=0.605594;TYPE=snp;VARB=0.0102186;OID=.;OPOS=83999261;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:108:51:51:57:57:14:43:29:22:14:43:29:22 chr16 84028014 . C G 184.2 PASS AO=42;DP=83;FAO=42;FDP=84;FR=.;FRO=42;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=0.00532951;FXX=0.0117633;HRUN=3;LEN=1;MLLD=193.479;QD=8.77127;RBI=0.0109102;REFB=-0.00479741;REVB=-0.00951992;RO=41;SAF=21;SAR=21;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108634;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0039546;OID=.;OPOS=84028014;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:84:41:42:42:42:21:21:20:21:21:21:21:21 chr16 84115483 . G A 289.06 PASS AO=77;DP=172;FAO=77;FDP=173;FR=.;FRO=96;FSAF=37;FSAR=40;FSRF=40;FSRR=56;FWDB=-0.00670618;FXX=0.0057468;HRUN=3;LEN=1;MLLD=201.101;QD=6.68355;RBI=0.00708772;REFB=-0.0141877;REVB=0.00229409;RO=94;SAF=37;SAR=40;SRF=39;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0652435;STB=0.535576;TYPE=snp;VARB=0.016159;OID=.;OPOS=84115483;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:173:94:96:77:77:40:37:39:55:40:37:40:56 chr16 84203612 . A G 103.95 PASS AO=27;DP=58;FAO=26;FDP=59;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=-0.0939151;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.1247;QD=7.04758;RBI=0.105624;REFB=-0.0271838;REVB=-0.0483357;RO=30;SAF=19;SAR=8;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142862;STB=0.572197;TYPE=snp;VARB=0.0305375;OID=.;OPOS=84203612;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:59:30:33:27:26:8:19:17:13:8:18:19:14 chr16 84203939 . C T 128.75 PASS AO=25;DP=44;FAO=25;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=4;FSRR=15;FWDB=-0.00421999;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.7933;QD=11.7046;RBI=0.0393987;REFB=0.00602894;REVB=0.0391721;RO=19;SAF=6;SAR=19;SRF=4;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0320237;STB=0.517753;TYPE=snp;VARB=-0.00477119;OID=.;OPOS=84203939;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:44:44:19:19:25:25:19:6:4:15:19:6:4:15 chr16 84208335 . G T 440.89 PASS AO=108;DP=219;FAO=106;FDP=218;FR=.;FRO=112;FSAF=50;FSAR=56;FSRF=49;FSRR=63;FWDB=-0.0117055;FXX=0.004566;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.6734;QD=8.08981;RBI=0.0123854;REFB=-0.0133073;REVB=-0.00404718;RO=111;SAF=52;SAR=56;SRF=48;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0453743;STB=0.517658;TYPE=snp;VARB=0.0135985;OID=.;OPOS=84208335;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:219:218:111:112:108:106:56:52:48:63:56:50:49:63 chr16 84209634 . C G 187.55 PASS AO=56;DP=144;FAO=56;FDP=141;FR=.;FRO=85;FSAF=15;FSAR=41;FSRF=29;FSRR=56;FWDB=-0.00542569;FXX=0.0723637;HRUN=4;LEN=1;MLLD=204.883;QD=5.32065;RBI=0.0115209;REFB=0.00061473;REVB=0.0101633;RO=78;SAF=15;SAR=41;SRF=23;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.034973;STB=0.553524;TYPE=snp;VARB=-0.000863659;OID=.;OPOS=84209634;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:141:78:85:56:56:41:15:23:55:41:15:29:56 chr16 84209738 . T C 97.44 PASS AO=25;DP=58;FAO=25;FDP=58;FR=.;FRO=33;FSAF=5;FSAR=20;FSRF=4;FSRR=29;FWDB=0.0236176;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.9237;QD=6.71975;RBI=0.0305175;REFB=0.00282791;REVB=-0.0193268;RO=33;SAF=5;SAR=20;SRF=4;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136189;STB=0.576416;TYPE=snp;VARB=-0.00257603;OID=.;OPOS=84209738;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:58:58:33:33:25:25:20:5:4:29:20:5:4:29 chr16 84209816 . T C 31.01 PASS AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.0335369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.58;QD=13.7805;RBI=0.0432411;REFB=-0.0528095;REVB=-0.0272959;RO=4;SAF=2;SAR=3;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.341697;STB=0.699373;TYPE=snp;VARB=0.00918941;OID=.;OPOS=84209816;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:9:9:4:4:5:5:3:2:0:4:3:2:0:4 chr16 84212571 . C A 28.68 PASS AO=10;DP=36;FAO=10;FDP=36;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=19;FSRR=7;FWDB=0.00766205;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.07;QD=3.1867;RBI=0.0128341;REFB=-0.00918035;REVB=-0.010296;RO=23;SAF=7;SAR=3;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00585383;STB=0.526974;TYPE=snp;VARB=0.0226011;OID=.;OPOS=84212571;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:36:36:23:26:10:10:3:7:16:7:3:7:19:7 chr16 84213114 . C T 15.91 PASS AO=5;DP=20;FAO=5;FDP=20;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.0218306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.987;QD=3.18298;RBI=0.0310038;REFB=-0.0080223;REVB=-0.022015;RO=15;SAF=4;SAR=1;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192305;STB=0.630998;TYPE=snp;VARB=0.0312558;OID=.;OPOS=84213114;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:20:20:15:15:5:5:1:4:10:5:1:4:10:5 chr16 84213434 . A T 105.76 PASS AO=15;DP=25;FAO=15;FDP=25;FR=.,HEALED;FRO=6;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0182008;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.37;QD=16.9216;RBI=0.0337051;REFB=-0.00425687;REVB=0.0283684;RO=6;SAF=5;SAR=10;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260162;STB=0.644965;TYPE=snp;VARB=0.0147656;OID=.;OPOS=84213434;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:25:25:6:6:15:15:10:5:5:1:10:5:5:1 chr16 84215390 . T C 205.91 PASS AO=42;DP=76;FAO=42;FDP=76;FR=.;FRO=34;FSAF=30;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=8;FWDB=-0.0329799;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.211;QD=10.8374;RBI=0.03299;REFB=-0.0308518;REVB=0.000819257;RO=33;SAF=30;SAR=12;SRF=26;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0749106;STB=0.528289;TYPE=snp;VARB=0.0288859;OID=.;OPOS=84215390;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:33:34:42:42:12:30:26:7:12:30:26:8 chr16 84217062 . C T 396.78 PASS AO=41;DP=41;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.045449;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.203;QD=36.9097;RBI=0.0487682;REFB=0;REVB=0.0176839;RO=0;SAF=12;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000651635;OID=.;OPOS=84217062;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:41:43:0:0:41:43:29:12:0:0:31:12:0:0 chr16 84229436 . G A 45.01 PASS AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=242.135;QD=25.7205;RBI=0.0248298;REFB=-0.0486495;REVB=0.0248298;RO=1;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00877744;OID=.;OPOS=84229436;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:7:7:1:1:6:6:6:0:0:1:6:0:0:1 chr16 84229559 . T C 43.19 PASS AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.0377683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.8626;QD=11.5164;RBI=0.0556321;REFB=-0.0712921;REVB=0.0408471;RO=7;SAF=4;SAR=4;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170899;STB=0.59976;TYPE=snp;VARB=0.0316157;OID=.;OPOS=84229559;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:15:15:7:7:8:8:4:4:2:5:4:4:2:5 chr16 84229580 . C T 27.69 PASS AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0332121;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.602;QD=7.3834;RBI=0.0391608;REFB=-0.0300751;REVB=-0.0207491;RO=9;SAF=3;SAR=3;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0539613;STB=0.533223;TYPE=snp;VARB=0.0164046;OID=.;OPOS=84229580;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:15:15:9:9:6:6:3:3:4:5:3:3:4:5 chr16 84256103 . C T 108.33 PASS AO=29;DP=71;FAO=30;FDP=74;FR=.;FRO=44;FSAF=7;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=-0.0140942;FXX=0.0512755;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.164;QD=5.85559;RBI=0.01485;REFB=-0.00631418;REVB=-0.00467708;RO=39;SAF=6;SAR=23;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.354826;STB=0.679097;TYPE=snp;VARB=0.0152655;OID=.;OPOS=84256103;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:74:39:44:29:30:23:6:20:19:23:7:22:22 chr16 84256422 . C T 249.84 PASS AO=50;DP=102;FAO=55;FDP=106;FR=.;FRO=51;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=20;FSRR=31;FWDB=0.0113169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.382;QD=9.42778;RBI=0.011871;REFB=-0.0301434;REVB=-0.00358475;RO=51;SAF=23;SAR=27;SRF=20;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0626399;STB=0.530424;TYPE=snp;VARB=0.0210251;OID=.;OPOS=84256422;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:106:51:51:50:55:27:23:20:31:30:25:20:31 chr16 84270381 . G A 547.21 PASS AO=63;DP=70;FAO=64;FDP=69;FR=.;FRO=5;FSAF=39;FSAR=25;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0149264;FXX=0.0142837;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5198;QD=31.7222;RBI=0.017558;REFB=-0.181297;REVB=0.00924592;RO=4;SAF=38;SAR=25;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.017326;STB=0.514596;TYPE=snp;VARB=0.00929352;OID=.;OPOS=84270381;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:70:69:4:5:63:64:25:38:3:1:25:39:4:1 chr16 84438512 . G A 925.96 PASS AO=99;DP=101;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.023497;FXX=0.0198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.0761;QD=37.4125;RBI=0.0293956;REFB=-0.0998819;REVB=0.0176634;RO=0;SAF=15;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00104979;OID=.;OPOS=84438512;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:101:99:0:0:99:99:84:15:0:0:84:15:0:0 chr16 84444349 . A C 1687 PASS AO=176;DP=177;FAO=176;FDP=176;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00176034;FXX=0.0056494;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.887;QD=38.3409;RBI=0.0122359;REFB=0;REVB=-0.0121086;RO=0;SAF=70;SAR=106;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.99063e-05;OID=.;OPOS=84444349;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:177:176:0:0:176:176:106:70:0:0:106:70:0:0 chr16 84476200 . A T 143.96 PASS AO=30;DP=56;FAO=30;FDP=57;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=4;FSRR=23;FWDB=0.00603749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.459;QD=10.1022;RBI=0.00758794;REFB=-0.0138803;REVB=-0.00459626;RO=26;SAF=9;SAR=21;SRF=3;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202505;STB=0.591873;TYPE=snp;VARB=0.012361;OID=.;OPOS=84476200;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:57:26:27:30:30:21:9:3:23:21:9:4:23 chr16 84485573 . C A 667.54 PASS AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170675;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.4043;QD=38.6978;RBI=0.0485348;REFB=0;REVB=0.0454349;RO=0;SAF=48;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000323413;OID=.;OPOS=84485573;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:70:69:0:0:69:69:21:48:0:0:21:48:0:0 chr16 84485677 . T A 142.76 PASS AO=24;DP=60;FAO=27;FDP=54;FR=.,HEALED;FRO=24;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.0278613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.192;QD=10.575;RBI=0.0278775;REFB=-0.0118079;REVB=0.000951678;RO=19;SAF=15;SAR=9;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164374;STB=0.563332;TYPE=snp;VARB=0.011522;OID=.;OPOS=84485677;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:51:54:19:24:24:27:9:15:8:11:9:18:13:11 chr16 84486903 . C T 60.7 PASS AO=17;DP=42;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=0.0875665;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.718;QD=5.9215;RBI=0.0922881;REFB=-0.00668394;REVB=-0.0291411;RO=25;SAF=6;SAR=11;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.291449;STB=0.658489;TYPE=snp;VARB=0.00486866;OID=.;OPOS=84486903;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:42:41:25:25:17:16:11:6:16:9:10:6:16:9 chr16 84493144 . C G 865.49 PASS AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00359958;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.452;QD=38.0434;RBI=0.0407627;REFB=0;REVB=0.0406035;RO=0;SAF=51;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.44907e-05;OID=.;OPOS=84493144;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:91:91:0:0:91:91:40:51:0:0:40:51:0:0 chr16 84494020 . G T 290.01 PASS AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00593616;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=150.392;QD=37.4204;RBI=0.0305448;REFB=0;REVB=0.0299625;RO=0;SAF=15;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000155355;OID=.;OPOS=84494020;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:31:31:0:0:31:31:16:15:0:0:16:15:0:0 chr16 84494168 . A T 94.27 PASS AO=14;DP=21;FAO=14;FDP=20;FR=.;FRO=6;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0241595;FXX=0.0475964;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.5687;QD=18.853;RBI=0.0285147;REFB=-0.0128508;REVB=-0.0151462;RO=6;SAF=12;SAR=2;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.463379;STB=0.763199;TYPE=snp;VARB=0.0204617;OID=.;OPOS=84494168;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:21:20:6:6:14:14:2:12:1:5:2:12:1:5 chr16 84494275 . C T 100.7 PASS AO=12;DP=51;FAO=14;FDP=50;FR=.,HEALED;FRO=23;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=21;FWDB=-0.0476377;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=79.12;QD=8.05612;RBI=0.0991294;REFB=-0.00748795;REVB=0.0869327;RO=21;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.512029;STB=0.673723;TYPE=snp;VARB=0.0320818;OID=.;OPOS=84494275;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:49:50:21:23:12:14:8:4:0:21:10:4:2:21 chr16 84494315 . C T 239.1 PASS AO=38;DP=58;FAO=39;FDP=56;FR=.;FRO=17;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.0841294;FXX=0.0344768;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.2904;QD=17.0787;RBI=0.0843834;REFB=-0.0402031;REVB=-0.00654222;RO=17;SAF=12;SAR=26;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0241955;STB=0.513507;TYPE=snp;VARB=0.0199423;OID=.;OPOS=84494315;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:58:56:17:17:38:39:26:12:6:11:26:13:5:12 chr16 84516309 . G A 999.74 PASS AO=67;DP=114;FAO=110;FDP=110;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=66;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00262587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.7816;QD=36.354;RBI=0.0375325;REFB=0;REVB=0.0374406;RO=0;SAF=23;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.11549e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000580055;OID=.;OPOS=84516309;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:110:110:0:0:67:110:44:23:0:0:44:66:0:0 chr16 84520325 . T C 153.88 PASS AO=15;DP=16;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000376936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.16;QD=36.2074;RBI=0.0573998;REFB=0;REVB=0.0573986;RO=0;SAF=12;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00028246;OID=.;OPOS=84520325;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:17:0:0:15:17:3:12:0:0:3:14:0:0 chr16 84520396 . A G 740.09 PASS AO=77;DP=80;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136013;FXX=0.0246883;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.514;QD=37.4728;RBI=0.0409631;REFB=0;REVB=-0.0386391;RO=0;SAF=33;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.58027e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000595359;OID=.;OPOS=84520396;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:80:79:0:0:77:79:44:33:0:0:46:33:0:0 chr16 84520537 . T C 1057.46 PASS AO=110;DP=110;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0128937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.423;QD=38.1067;RBI=0.0131388;REFB=0;REVB=-0.00252623;RO=0;SAF=47;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.54139e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.13668e-05;OID=.;OPOS=84520537;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:110:111:0:0:110:111:63:47:0:0:64:47:0:0 chr16 84522897 . G C 44.4 PASS AO=14;DP=42;FAO=14;FDP=42;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=24;FSRR=4;FWDB=-0.00152919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.1346;QD=4.22866;RBI=0.0255676;REFB=-0.0307985;REVB=-0.0255218;RO=28;SAF=10;SAR=4;SRF=24;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223118;STB=0.629474;TYPE=snp;VARB=0.115834;OID=.;OPOS=84522897;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:42:42:28:28:14:14:4:10:24:4:4:10:24:4 chr16 84600347 . T C 411.11 PASS AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00171703;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=208.063;QD=35.7486;RBI=0.0132509;REFB=-0.0381919;REVB=0.0131391;RO=1;SAF=40;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116084;STB=0.50617;TYPE=snp;VARB=0.000742561;OID=.;OPOS=84600347;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:46:46:1:1:45:45:5:40:1:0:5:40:1:0 chr16 84600395 . TC T 60.19 PASS AO=24;DP=60;FAO=33;FDP=53;FR=.;FRO=20;FSAF=28;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=1;FWDB=0.00520897;FXX=0.0535619;HRUN=5;LEN=1;MLLD=7.72038;QD=4.543;RBI=0.0834733;REFB=-0.115928;REVB=0.0833106;RO=18;SAF=22;SAR=2;SRF=17;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0754476;STB=0.583082;TYPE=del;VARB=0.148459;OID=.;OPOS=84600396;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:24:53:33:53:20:28:5:19:1:24:18:22:2:17:1 chr16 84690608 . C T 249.79 PASS AO=43;DP=66;FAO=43;FDP=66;FR=.;FRO=23;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=5;FWDB=0.00781387;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.534;QD=15.1387;RBI=0.0236926;REFB=-0.0358596;REVB=0.022367;RO=23;SAF=22;SAR=21;SRF=18;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174947;STB=0.594858;TYPE=snp;VARB=0.0187831;OID=.;OPOS=84690608;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:66:66:23:23:43:43:21:22:18:5:21:22:18:5 chr16 84691044 . C T 152.75 PASS AO=31;DP=57;FAO=31;FDP=57;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=25;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=0.0308568;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.1902;QD=10.7194;RBI=0.0345778;REFB=-0.045093;REVB=0.0156038;RO=25;SAF=6;SAR=25;SRF=7;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103109;STB=0.551747;TYPE=snp;VARB=0.0425543;OID=.;OPOS=84691044;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:25:26:31:31:25:6:7:18:25:6:7:19 chr16 84778685 . A G 131.16 PASS AO=26;DP=47;FAO=26;FDP=47;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=0.0224458;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.65;QD=11.1627;RBI=0.0267338;REFB=0.00759639;REVB=-0.0145217;RO=21;SAF=5;SAR=21;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.427833;STB=0.740058;TYPE=snp;VARB=-0.00154624;OID=.;OPOS=84778685;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:47:47:21:21:26:26:21:5:14:7:21:5:14:7 chr16 84778690 . C T 43.35 PASS AO=14;DP=45;FAO=15;FDP=45;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=23;FWDB=0.0305093;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=202.461;QD=3.85317;RBI=0.0373565;REFB=-0.00385609;REVB=0.0215567;RO=30;SAF=10;SAR=4;SRF=7;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.509732;STB=0.804521;TYPE=snp;VARB=0.010366;OID=.;OPOS=84778690;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:45:45:30:30:14:15:4:10:7:23:4:11:7:23 chr16 84778694 . T C 49.43 PASS AO=13;DP=36;FAO=14;FDP=39;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=19;FWDB=0.00248383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.35;QD=5.06978;RBI=0.0131117;REFB=-0.0121619;REVB=-0.0128743;RO=23;SAF=8;SAR=5;SRF=4;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.453967;STB=0.741961;TYPE=snp;VARB=0.0907698;OID=.;OPOS=84778694;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:36:39:23:25:13:14:5:8:4:19:5:9:6:19 chr16 84778697 . G C 55.19 PASS AO=15;DP=39;FAO=15;FDP=39;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=21;FWDB=0.0784257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.6027;QD=5.66077;RBI=0.0850064;REFB=0.00760532;REVB=0.032795;RO=24;SAF=11;SAR=4;SRF=3;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.580914;STB=0.830457;TYPE=snp;VARB=-0.00928563;OID=.;OPOS=84778697;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:39:39:24:24:15:15:4:11:3:21:4:11:3:21 chr16 84879464 . A G 161.14 PASS AO=45;DP=108;FAO=45;FDP=108;FR=.;FRO=63;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=39;FWDB=0.00544803;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.506;QD=5.96808;RBI=0.0207368;REFB=0.00164679;REVB=-0.0200083;RO=57;SAF=25;SAR=20;SRF=24;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133595;STB=0.600771;TYPE=snp;VARB=-0.00228332;OID=.;OPOS=84879464;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:57:63:45:45:20:25:24:33:20:25:24:39 chr16 84902483 . A T 320.95 PASS AO=67;DP=123;FAO=68;FDP=124;FR=.;FRO=56;FSAF=39;FSAR=29;FSRF=23;FSRR=33;FWDB=-0.00414345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.116;QD=10.3532;RBI=0.0185893;REFB=-0.011629;REVB=-0.0181217;RO=56;SAF=39;SAR=28;SRF=23;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142607;STB=0.573508;TYPE=snp;VARB=0.00758588;OID=.;OPOS=84902483;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:124:56:56:67:68:28:39:23:33:29:39:23:33 chr16 84906098 . C G 700.49 PASS AO=187;DP=408;FAO=183;FDP=398;FR=.;FRO=215;FSAF=76;FSAR=107;FSRF=99;FSRR=116;FWDB=-0.0108324;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.007;QD=7.0401;RBI=0.0265326;REFB=-0.00695094;REVB=-0.0242206;RO=215;SAF=79;SAR=108;SRF=99;SRR=116;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0375357;STB=0.524904;TYPE=snp;VARB=0.00677619;OID=.;OPOS=84906098;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:408:398:215:215:187:183:108:79:99:116:107:76:99:116 chr16 84922859 . C T 272.1 PASS AO=58;DP=109;FAO=58;FDP=109;FR=.;FRO=51;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=20;FSRR=31;FWDB=0.053256;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.25;QD=9.98531;RBI=0.0537626;REFB=-0.0250021;REVB=-0.00736281;RO=51;SAF=26;SAR=32;SRF=20;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0485852;STB=0.526679;TYPE=snp;VARB=0.0276968;OID=.;OPOS=84922859;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:51:51:58:58:32:26:20:31:32:26:20:31 chr16 84940172 . C A 85.05 PASS AO=18;DP=33;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.0101785;FXX=0.0277701;HRUN=3;LEN=1;MLLD=135.103;QD=9.72056;RBI=0.0857509;REFB=-0.00810135;REVB=0.0851447;RO=15;SAF=13;SAR=5;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172371;STB=0.575558;TYPE=snp;VARB=0.00371622;OID=.;OPOS=84940172;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:33:35:15:17:18:18:5:13:8:7:5:13:10:7 chr16 85009463 . T C 117.39 PASS AO=35;DP=90;FAO=35;FDP=90;FR=.;FRO=55;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=36;FSRR=19;FWDB=-0.020427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.723;QD=5.21748;RBI=0.0206026;REFB=-0.0193395;REVB=0.00268422;RO=55;SAF=20;SAR=15;SRF=36;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0926265;STB=0.552602;TYPE=snp;VARB=0.0349513;OID=.;OPOS=85009463;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:55:55:35:35:15:20:36:19:15:20:36:19 chr16 85009970 . A G 268.64 PASS AO=63;DP=130;FAO=63;FDP=129;FR=.;FRO=66;FSAF=45;FSAR=18;FSRF=54;FSRR=12;FWDB=0.00595668;FXX=0.0227256;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.712;QD=8.32992;RBI=0.0222347;REFB=0.00176839;REVB=-0.0214219;RO=65;SAF=45;SAR=18;SRF=54;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140934;STB=0.568945;TYPE=snp;VARB=-0.00229811;OID=.;OPOS=85009970;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:129:65:66:63:63:18:45:54:11:18:45:54:12 chr16 85015541 . G A 352.4 PASS AO=67;DP=115;FAO=68;FDP=117;FR=.;FRO=49;FSAF=22;FSAR=46;FSRF=19;FSRR=30;FWDB=-0.0191152;FXX=0.0249979;HRUN=3;LEN=1;MLLD=179.964;QD=12.0477;RBI=0.019116;REFB=-0.00525367;REVB=0.00017527;RO=46;SAF=21;SAR=46;SRF=17;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0477489;STB=0.530064;TYPE=snp;VARB=0.00443001;OID=.;OPOS=85015541;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:117:46:49:67:68:46:21:17:29:46:22:19:30 chr16 85112002 . T G 53.71 PASS AO=30;DP=115;FAO=29;FDP=114;FR=.;FRO=85;FSAF=3;FSAR=26;FSRF=30;FSRR=55;FWDB=-0.0584969;FXX=0.0086949;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.081;QD=1.88473;RBI=0.0595903;REFB=0.0162888;REVB=-0.011363;RO=85;SAF=4;SAR=26;SRF=29;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.360473;STB=0.779054;TYPE=snp;VARB=-0.0512801;OID=.;OPOS=85112002;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:115:114:85:85:30:29:26:4:29:56:26:3:30:55 chr16 85141292 . T C 101.8 PASS AO=32;DP=86;FAO=32;FDP=86;FR=.;FRO=54;FSAF=6;FSAR=26;FSRF=31;FSRR=23;FWDB=-0.0319717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.742;QD=4.73468;RBI=0.0328353;REFB=-0.0138514;REVB=0.00748116;RO=54;SAF=6;SAR=26;SRF=31;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.459125;STB=0.765745;TYPE=snp;VARB=0.0539064;OID=.;OPOS=85141292;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:54:54:32:32:26:6:31:23:26:6:31:23 chr16 85141556 . G A 136.33 PASS AO=32;DP=73;FAO=34;FDP=75;FR=.;FRO=41;FSAF=5;FSAR=29;FSRF=13;FSRR=28;FWDB=0.0142935;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.47;QD=7.27114;RBI=0.0351222;REFB=-0.00348083;REVB=0.0320821;RO=40;SAF=5;SAR=27;SRF=13;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.249386;STB=0.646741;TYPE=snp;VARB=0.00590339;OID=.;OPOS=85141556;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:75:40:41:32:34:27:5:13:27:29:5:13:28 chr16 85141661 . G A 26.7 PASS AO=7;DP=21;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=0.0866633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.207;QD=5.08662;RBI=0.0866634;REFB=0.00638199;REVB=0.000103462;RO=14;SAF=2;SAR=5;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0999021;STB=0.561239;TYPE=snp;VARB=-0.0120147;OID=.;OPOS=85141661;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:21:21:14:14:7:7:5:2:3:11:5:2:3:11 chr16 85145977 . T C 22.3 PASS AO=4;DP=9;FAO=4;FDP=9;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.00268202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.532;QD=9.91249;RBI=0.0107945;REFB=8.85229e-05;REVB=0.010456;RO=5;SAF=1;SAR=3;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.460738;STB=0.788117;TYPE=snp;VARB=2.97041e-05;OID=.;OPOS=85145977;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:9:9:5:5:4:4:3:1:4:1:3:1:4:1 chr16 85667644 . C T 33.2 PASS AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=0.0749719;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=128.061;QD=8.30003;RBI=0.0761784;REFB=-0.0175992;REVB=-0.0135043;RO=9;SAF=1;SAR=6;SRF=0;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.378852;STB=0.713894;TYPE=snp;VARB=0.0261727;OID=.;OPOS=85667644;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:16:16:9:9:7:7:6:1:0:9:6:1:0:9 chr16 85706047 . A C 171.06 PASS AO=50;DP=125;FAO=50;FDP=121;FR=.;FRO=71;FSAF=10;FSAR=40;FSRF=6;FSRR=65;FWDB=-0.0322239;FXX=0.0396794;HRUN=3;LEN=1;MLLD=83.2385;QD=5.65498;RBI=0.0422516;REFB=-0.0142773;REVB=-0.027328;RO=69;SAF=10;SAR=40;SRF=6;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211684;STB=0.621262;TYPE=snp;VARB=0.0121875;OID=.;OPOS=85706047;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:121:69:71:50:50:40:10:6:63:40:10:6:65 chr16 85706416 . ATTATTTC A 180.41 PASS AO=79;DP=206;FAO=80;FDP=188;FR=.;FRO=108;FSAF=39;FSAR=41;FSRF=38;FSRR=70;FWDB=-0.0106999;FXX=0.0259054;HRUN=2;LEN=7;MLLD=255.403;QD=3.83848;RBI=0.0188057;REFB=-0.003155;REVB=-0.015465;RO=97;SAF=39;SAR=40;SRF=33;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152999;STB=0.57826;TYPE=del;VARB=0.00435615;OID=.;OPOS=85706417;OREF=TTATTTC;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:79:188:80:188:108:39:41:38:70:99:97:39:40:33:64 chr16 85812955 . T A 46.3 PASS AO=20;DP=48;FAO=19;FDP=48;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=0.0612965;FXX=0.020404;HRUN=16;LEN=1;MLLD=36.7451;QD=3.85855;RBI=0.0615726;REFB=-0.0531882;REVB=0.00582501;RO=27;SAF=11;SAR=9;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178596;STB=0.536386;TYPE=snp;VARB=0.0178951;OID=.;OPOS=85812955;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:48:48:27:29:20:19:9:11:10:17:10:9:12:17 chr16 85814899 . T TAGTC 660.97 PASS AO=78;DP=84;FAO=78;FDP=84;FR=.;FRO=6;FSAF=59;FSAR=19;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0197825;FXX=0;HRUN=1;LEN=4;MLLD=237.646;QD=31.4747;RBI=0.0268079;REFB=-0.0246342;REVB=0.0180919;RO=6;SAF=59;SAR=19;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.016268;STB=0.508618;TYPE=ins;VARB=0.00146956;OID=.;OPOS=85814900;OREF=-;OALT=AGTC;OMAPALT=TAGTC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:78:84:78:84:6:59:19:4:2:7:6:59:19:4:2 chr16 85838653 . T C 1412.15 PASS AO=153;DP=158;FAO=154;FDP=158;FR=.;FRO=4;FSAF=104;FSAR=50;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0016328;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.6853;QD=35.7506;RBI=0.0208574;REFB=-0.0479185;REVB=0.0207934;RO=5;SAF=103;SAR=50;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0049937;STB=0.505042;TYPE=snp;VARB=0.00175154;OID=.;OPOS=85838653;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:158:158:5:4:153:154:50:103:3:2:50:104:2:2 chr16 86069722 . A G 820.13 PASS AO=84;DP=84;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0370123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.534;QD=38.1457;RBI=0.0563255;REFB=0;REVB=-0.0424576;RO=0;SAF=39;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.93822e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.16388e-05;OID=.;OPOS=86069722;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:84:86:0:0:84:86:45:39:0:0:45:41:0:0 chr16 86069738 . C G 227.07 PASS AO=48;DP=91;FAO=49;FDP=93;FR=.;FRO=44;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=0.0235149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.56;QD=9.76646;RBI=0.0237192;REFB=-0.00483243;REVB=-0.00310647;RO=42;SAF=25;SAR=23;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0378065;STB=0.514506;TYPE=snp;VARB=0.00486023;OID=.;OPOS=86069738;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:93:42:44:48:49:23:25:20:22:23:26:22:22 chr16 86069827 . A G 245.02 PASS AO=54;DP=104;FAO=54;FDP=104;FR=.;FRO=50;FSAF=34;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=-0.0216727;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=161.559;QD=9.42373;RBI=0.0216997;REFB=-0.00249267;REVB=-0.00108253;RO=50;SAF=34;SAR=20;SRF=24;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134299;STB=0.574128;TYPE=snp;VARB=0.00228657;OID=.;OPOS=86069827;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:50:50:54:54:20:34:24:26:20:34:24:26 chr16 86547496 . C T 166.26 PASS AO=48;DP=116;FAO=48;FDP=119;FR=.;FRO=71;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=34;FSRR=37;FWDB=-0.0150801;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.7259;QD=5.58869;RBI=0.0190423;REFB=0.0193041;REVB=0.0116275;RO=68;SAF=24;SAR=24;SRF=32;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0306065;STB=0.5126;TYPE=snp;VARB=-0.0281936;OID=.;OPOS=86547496;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:119:68:71:48:48:24:24:32:36:24:24:34:37 chr16 86565826 . C G 409.94 PASS AO=47;DP=53;FAO=51;FDP=54;FR=.;FRO=3;FSAF=48;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.090345;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=37.4113;QD=30.3662;RBI=0.121802;REFB=-0.155213;REVB=-0.081692;RO=2;SAF=44;SAR=3;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0209034;STB=0.515146;TYPE=snp;VARB=0.011955;OID=.;OPOS=86565826;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:53:54:2:3:47:51:3:44:2:0:3:48:3:0 chr16 86574818 . C G 524.29 PASS AO=60;DP=63;FAO=60;FDP=63;FR=.;FRO=3;FSAF=29;FSAR=31;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.00400592;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.305;QD=33.2882;RBI=0.0168954;REFB=-0.0389918;REVB=0.0164136;RO=3;SAF=29;SAR=31;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0463499;STB=0.524582;TYPE=snp;VARB=0.00100637;OID=.;OPOS=86574818;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:63:63:3:3:60:60:31:29:3:0:31:29:3:0 chr16 86588993 . T C 129.09 PASS AO=31;DP=70;FAO=32;FDP=71;FR=.;FRO=39;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=-0.077787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.1094;QD=7.27263;RBI=0.0799385;REFB=-0.0245413;REVB=-0.0184211;RO=35;SAF=15;SAR=16;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0287321;STB=0.503976;TYPE=snp;VARB=0.0223564;OID=.;OPOS=86588993;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:71:35:39:31:32:16:15:18:17:17:15:18:21 chr16 87417706 . G A 339.21 PASS AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188413;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.625;QD=37.69;RBI=0.0478443;REFB=0;REVB=0.0439782;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000382353;OID=.;OPOS=87417706;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:36:36:0:0:36:36:17:19:0:0:17:19:0:0 chr16 87436720 . G T 893.11 PASS AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0335066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.267;QD=38.0047;RBI=0.033939;REFB=0;REVB=-0.00540043;RO=0;SAF=52;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.46942e-05;OID=.;OPOS=87436720;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:94:94:0:0:94:94:42:52:0:0:42:52:0:0 chr16 87436764 . A G 967.35 PASS AO=103;DP=105;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0295504;FXX=0.0185168;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.875;QD=36.5038;RBI=0.029707;REFB=-0.0186459;REVB=-0.00304623;RO=1;SAF=72;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0150582;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00147911;OID=.;OPOS=87436764;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:105:106:1:0:103:106:31:72:0:1:33:73:0:0 chr16 87443734 . C T 1256.88 PASS AO=128;DP=130;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131409;FXX=0.0149243;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.233;QD=38.0872;RBI=0.019728;REFB=0;REVB=0.0147143;RO=0;SAF=69;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.60632e-05;OID=.;OPOS=87443734;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:130:132:0:0:128:132:59:69:0:0:61:71:0:0 chr16 87445363 . G A 56.15 PASS AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.000731436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.577;QD=7.48714;RBI=0.00596154;REFB=-0.0133146;REVB=-0.0059165;RO=17;SAF=7;SAR=6;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0660375;STB=0.538402;TYPE=snp;VARB=0.051721;OID=.;OPOS=87445363;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:30:30:17:17:13:13:6:7:8:9:6:7:8:9 chr16 87445839 . C T 633.63 PASS AO=70;DP=71;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00919941;FXX=0.0277739;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6705;QD=36.2074;RBI=0.0200623;REFB=-0.0687574;REVB=-0.0178289;RO=0;SAF=25;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510635;TYPE=snp;VARB=0.000235094;OID=.;OPOS=87445839;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:71:70:0:1:70:69:45:25:0:0:46:23:1:0 chr16 87446053 . G A 316.55 PASS AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00121327;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.342;QD=37.2412;RBI=0.0295729;REFB=0;REVB=0.029548;RO=0;SAF=8;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000155474;OID=.;OPOS=87446053;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:34:0:0:34:34:26:8:0:0:26:8:0:0 chr16 87678441 . C T 284.89 PASS AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0491244;FXX=0.0294031;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.9073;QD=34.5316;RBI=0.0767483;REFB=0.0864728;REVB=0.058967;RO=1;SAF=20;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0227759;STB=0.512188;TYPE=snp;VARB=-0.00164782;OID=.;OPOS=87678441;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:33:33:1:1:32:32:12:20:1:0:12:20:1:0 chr16 87723838 . T C 105.4 PASS AO=31;DP=86;FAO=34;FDP=89;FR=.;FRO=55;FSAF=27;FSAR=7;FSRF=32;FSRR=23;FWDB=-0.00183878;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.14;QD=4.73695;RBI=0.0139611;REFB=-0.017208;REVB=0.0138395;RO=49;SAF=25;SAR=6;SRF=28;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.309896;STB=0.6622;TYPE=snp;VARB=0.0204632;OID=.;OPOS=87723838;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:89:49:55:31:34:6:25:28:21:7:27:32:23 chr16 87729334 . C CA 273.79 PASS AO=24;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0382664;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=234.752;QD=37.7643;RBI=0.0592688;REFB=0;REVB=0.0452601;RO=4;SAF=16;SAR=8;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102757;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.000285899;OID=.;OPOS=87729335;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:24:29:29:29:0:20:9:0:0:13:4:16:8:4:0 chr16 87736160 . G A 204.01 PASS AO=47;DP=96;FAO=47;FDP=95;FR=.;FRO=48;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=-0.0295992;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.417;QD=8.58973;RBI=0.0327463;REFB=-0.0336288;REVB=-0.0140074;RO=47;SAF=23;SAR=24;SRF=22;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.019219;STB=0.505152;TYPE=snp;VARB=0.029625;OID=.;OPOS=87736160;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:95:47:48:47:47:24:23:22:25:24:23:23:25 chr16 87736778 . T C 192.93 PASS AO=37;DP=58;FAO=36;FDP=58;FR=.;FRO=22;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.0461336;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=50.6088;QD=13.3056;RBI=0.105907;REFB=0.0108545;REVB=-0.0953308;RO=21;SAF=24;SAR=13;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0213535;STB=0.501037;TYPE=snp;VARB=-0.0061316;OID=.;OPOS=87736778;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:58:58:21:22:37:36:13:24:13:8:13:23:14:8 chr16 87737619 . G A 91.58 PASS AO=18;DP=33;FAO=18;FDP=33;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=-0.0382296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.8675;QD=11.1005;RBI=0.0459492;REFB=-0.0798832;REVB=0.0254916;RO=15;SAF=9;SAR=9;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189201;STB=0.605948;TYPE=snp;VARB=0.0553641;OID=.;OPOS=87737619;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:33:33:15:15:18:18:9:9:11:4:9:9:11:4 chr16 87737756 . C T 57.9 PASS AO=15;DP=37;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.0796525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.319;QD=6.25897;RBI=0.0852176;REFB=-0.0283529;REVB=-0.0302905;RO=22;SAF=10;SAR=5;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0342877;STB=0.519973;TYPE=snp;VARB=0.0495772;OID=.;OPOS=87737756;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:37:37:22:22:15:15:5:10:14:8:5:10:14:8 chr16 87738694 . G A 58.86 PASS AO=9;DP=13;FAO=9;FDP=13;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.00365398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.5776;QD=18.1106;RBI=0.0396301;REFB=-0.0297873;REVB=-0.0394613;RO=4;SAF=4;SAR=5;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.29369;STB=0.666324;TYPE=snp;VARB=0.031454;OID=.;OPOS=87738694;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:13:13:4:4:9:9:5:4:4:0:5:4:4:0 chr16 87738813 . G C 24.11 PASS AO=5;DP=13;FAO=5;FDP=13;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.0304677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.1226;QD=7.41775;RBI=0.0462735;REFB=-0.0375373;REVB=0.0348275;RO=8;SAF=3;SAR=2;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0987559;STB=0.562247;TYPE=snp;VARB=0.0450028;OID=.;OPOS=87738813;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:13:13:8:8:5:5:2:3:4:4:2:3:4:4 chr16 87738853 . T C 31.62 PASS AO=7;DP=25;FAO=9;FDP=27;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.0546632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.952;QD=4.68383;RBI=0.0564048;REFB=-0.00332822;REVB=0.013908;RO=12;SAF=2;SAR=5;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0577328;STB=0.573607;TYPE=snp;VARB=0.00280466;OID=.;OPOS=87738853;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:25:27:12:18:7:9:5:2:4:8:5:4:10:8 chr16 87738858 . A G 29.12 PASS AO=7;DP=27;FAO=9;FDP=29;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.0472685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.6767;QD=4.01691;RBI=0.049699;REFB=-0.0139959;REVB=-0.0153518;RO=20;SAF=2;SAR=5;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.357767;STB=0.60583;TYPE=snp;VARB=0.0147977;OID=.;OPOS=87738858;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:27:29:20:20:7:9:5:2:12:8:5:4:12:8 chr16 87738888 . G T 80.85 PASS AO=17;DP=39;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0201747;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=144.332;QD=7.69991;RBI=0.0294075;REFB=-0.00633024;REVB=-0.0213959;RO=19;SAF=10;SAR=7;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0582958;STB=0.538218;TYPE=snp;VARB=0.00922183;OID=.;OPOS=87738888;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:39:42:19:23:17:19:7:10:10:9:7:12:13:10 chr16 87739087 . A C 292.79 PASS AO=72;DP=152;FAO=72;FDP=152;FR=.;FRO=80;FSAF=29;FSAR=43;FSRF=32;FSRR=48;FWDB=-0.0199519;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=228.649;QD=7.7051;RBI=0.0205946;REFB=-0.0149954;REVB=0.0051046;RO=80;SAF=29;SAR=43;SRF=32;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00274617;STB=0.50152;TYPE=snp;VARB=0.0166654;OID=.;OPOS=87739087;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:152:80:80:72:72:43:29:32:48:43:29:32:48 chr16 87739125 . G A 277.14 PASS AO=72;DP=155;FAO=71;FDP=155;FR=.;FRO=84;FSAF=34;FSAR=37;FSRF=35;FSRR=49;FWDB=-0.0106782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.0644;QD=7.1519;RBI=0.0179088;REFB=-0.0253961;REVB=0.0143771;RO=81;SAF=35;SAR=37;SRF=33;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0755162;STB=0.533859;TYPE=snp;VARB=0.0243174;OID=.;OPOS=87739125;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:81:84:72:71:37:35:33:48:37:34:35:49 chr16 87788864 . G A 1664.28 PASS AO=176;DP=179;FAO=178;FDP=178;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00483884;FXX=0.00558628;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.478;QD=37.3996;RBI=0.0203903;REFB=-0.0554111;REVB=0.0198079;RO=2;SAF=87;SAR=89;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0105759;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000273298;OID=.;OPOS=87788864;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:179:178:2:0:176:178:89:87:0:2:91:87:0:0 chr16 87866138 . G C 80.88 PASS AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=1;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=22;FWDB=-0.023686;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.8247;QD=7.70306;RBI=0.0315598;REFB=-0.00939677;REVB=-0.0208566;RO=23;SAF=1;SAR=18;SRF=1;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0463546;STB=0.526289;TYPE=snp;VARB=0.0145264;OID=.;OPOS=87866138;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:42:42:23:23:19:19:18:1:1:22:18:1:1:22 chr16 87921846 . T A 486.34 PASS AO=123;DP=261;FAO=123;FDP=262;FR=.;FRO=139;FSAF=50;FSAR=73;FSRF=53;FSRR=86;FWDB=0.0228466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.153;QD=7.42503;RBI=0.0230713;REFB=-0.00874486;REVB=0.00321227;RO=138;SAF=50;SAR=73;SRF=53;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0224107;STB=0.513929;TYPE=snp;VARB=0.00970548;OID=.;OPOS=87921846;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:261:262:138:139:123:123:73:50:53:85:73:50:53:86 chr16 87938398 . G A 384.64 PASS AO=78;DP=135;FAO=78;FDP=138;FR=.;FRO=60;FSAF=55;FSAR=23;FSRF=27;FSRR=33;FWDB=0.00142945;FXX=0.0547908;HRUN=4;LEN=1;MLLD=148.253;QD=11.1489;RBI=0.00567455;REFB=-0.0208802;REVB=0.00549156;RO=57;SAF=55;SAR=23;SRF=24;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235959;STB=0.620185;TYPE=snp;VARB=0.0103342;OID=.;OPOS=87938398;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:138:57:60:78:78:23:55:24:33:23:55:27:33 chr16 88017809 . C T 126.75 PASS AO=31;DP=73;FAO=33;FDP=75;FR=.;FRO=42;FSAF=3;FSAR=30;FSRF=5;FSRR=37;FWDB=0.0969793;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.3298;QD=6.76002;RBI=0.11634;REFB=-0.0259441;REVB=0.0642655;RO=42;SAF=2;SAR=29;SRF=5;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183364;STB=0.544189;TYPE=snp;VARB=0.039566;OID=.;OPOS=88017809;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:75:42:42:31:33:29:2:5:37:30:3:5:37 chr16 88052146 . C T 125.64 PASS AO=29;DP=61;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=10;FWDB=0.0304726;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.503;QD=8.23837;RBI=0.0305678;REFB=-0.0378405;REVB=0.00241155;RO=31;SAF=11;SAR=18;SRF=22;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.298245;STB=0.65843;TYPE=snp;VARB=0.0383265;OID=.;OPOS=88052146;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:31:32:29:29:18:11:22:9:18:11:22:10 chr16 88052161 . C A 615.95 PASS AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0157142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.488;QD=37.9046;RBI=0.0263341;REFB=0;REVB=-0.0211317;RO=0;SAF=38;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.04073e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000152377;OID=.;OPOS=88052161;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:65:65:0:0:65:65:27:38:0:0:27:38:0:0 chr16 88105053 . T A 114.02 PASS AO=29;DP=67;FAO=29;FDP=67;FR=.;FRO=38;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=27;FWDB=0.0244483;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.319;QD=6.80737;RBI=0.024926;REFB=-0.0092738;REVB=-0.00485644;RO=38;SAF=13;SAR=16;SRF=11;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164845;STB=0.592728;TYPE=snp;VARB=0.0132502;OID=.;OPOS=88105053;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:38:38:29:29:16:13:11:27:16:13:11:27 chr16 88105725 . G A 45.74 PASS AO=11;DP=27;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=3;FWDB=-0.0289884;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.776;QD=6.77674;RBI=0.048821;REFB=-0.0129676;REVB=-0.0392832;RO=16;SAF=5;SAR=6;SRF=13;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.355892;STB=0.705559;TYPE=snp;VARB=0.0211436;OID=.;OPOS=88105725;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:27:27:16:16:11:11:6:5:13:3:6:5:13:3 chr16 88123598 . C G 835.05 PASS AO=90;DP=91;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0525782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.5251;QD=36.7055;RBI=0.053133;REFB=-0.0563136;REVB=0.0076581;RO=0;SAF=46;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.15792e-08;STB=0.505617;TYPE=snp;VARB=0.00107307;OID=.;OPOS=88123598;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:91:91:0:1:90:90:44:46:0:0:44:46:0:1 chr16 88123697 . C A 279.43 PASS AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0189867;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6054;QD=38.5416;RBI=0.0189867;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=29;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0004386;OID=.;OPOS=88123697;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:29:29:0:0:29:29:0:29:0:0:0:29:0:0 chr16 88134285 . A G 671.26 PASS AO=69;DP=70;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.156755;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=49.089;QD=37.8172;RBI=0.187165;REFB=0;REVB=-0.102267;RO=1;SAF=44;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.010624;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00259348;OID=.;OPOS=88134285;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:70:71:1:0:69:71:25:44:1:0:25:46:0:0 chr16 88495705 . G A 116.06 PASS AO=11;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.197132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=45.2457;QD=35.7103;RBI=0.197153;REFB=0;REVB=0.00286495;RO=0;SAF=1;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0107614;OID=.;OPOS=88495705;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:13:0:0:11:13:10:1:0:0:12:1:0:0 chr16 88497400 . G A 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0323205;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.4993;QD=33.022;RBI=0.0417394;REFB=0;REVB=0.0264115;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00051148;OID=.;OPOS=88497400;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:2:4:0:0:2:4:0:0 chr16 88498221 . C T 73.84 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0425205;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.642;QD=36.9199;RBI=0.0465866;REFB=0;REVB=0.0190346;RO=0;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.58669e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000704293;OID=.;OPOS=88498221;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:6:2:0:0:6:2:0:0 chr16 88498297 . T G 147.38 PASS AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00384559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.621;QD=36.8441;RBI=0.0336176;REFB=0;REVB=-0.0333969;RO=0;SAF=2;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00027846;OID=.;OPOS=88498297;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:16:0:0:16:16:14:2:0:0:14:2:0:0 chr16 88499539 . C G 1077.35 PASS AO=121;DP=126;FAO=121;FDP=126;FR=.;FRO=5;FSAF=47;FSAR=74;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.00511835;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=270.844;QD=34.2016;RBI=0.0058087;REFB=-0.0422092;REVB=0.00274654;RO=3;SAF=47;SAR=74;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.013407;STB=0.500483;TYPE=snp;VARB=0.000301341;OID=.;OPOS=88499539;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:126:126:3:5:121:121:74:47:2:1:74:47:2:3 chr16 88500111 . G GC 17.94 PASS AO=3;DP=7;FAO=4;FDP=7;FR=.;FRO=3;FSAF=0;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=123.614;QD=10.2518;RBI=0.0374178;REFB=-0.0146538;REVB=-0.0374178;RO=4;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.13698;OID=.;OPOS=88500112;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:3:7:4:7:3:0:4:0:3:14:4:0:3:0:4 chr16 88502505 . A G 279.43 PASS AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0443522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.2517;QD=38.5418;RBI=0.0461495;REFB=0;REVB=0.0127537;RO=0;SAF=21;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.4007e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000882581;OID=.;OPOS=88502505;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:29:29:0:0:29:29:8:21:0:0:8:21:0:0 chr16 88504868 . A G 459.38 PASS AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.027925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.004;QD=38.2819;RBI=0.0442316;REFB=0;REVB=0.034302;RO=0;SAF=17;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000214522;OID=.;OPOS=88504868;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:48:48:0:0:48:48:31:17:0:0:31:17:0:0 chr16 88505387 . GC G 100.84 PASS AO=14;DP=23;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.289973;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.8177;QD=20.1677;RBI=0.30329;REFB=-0.031631;REVB=0.0888838;RO=8;SAF=4;SAR=10;SRF=4;SRR=4;SSEN=0.5;SSEP=0;SSSB=-0.15589;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0345533;OID=.;OPOS=88505388;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:14:23:20:20:0:5:15:0:0:7:8:4:10:4:4 chr16 88505635 . A G 107.81 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.138818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.6654;QD=35.9372;RBI=0.138818;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=12;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0067672;OID=.;OPOS=88505635;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:0:12:0:0:0:12:0:0 chr16 88505642 . C CG 34.41 PASS AO=6;DP=12;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.180085;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=14.2448;QD=11.4697;RBI=0.180085;REFB=-0.0647112;REVB=0;RO=6;SAF=6;SAR=0;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.0997268;OID=.;OPOS=88505643;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:6:12:7:12:5:7:0:5:0:21:6:6:0:6:0 chr16 88505734 . C T 107.81 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0308384;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.212;QD=35.9376;RBI=0.0939361;REFB=0;REVB=0.0887298;RO=0;SAF=5;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00208743;OID=.;OPOS=88505734;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:7:5:0:0:7:5:0:0 chr16 88535341 . G A 522.32 PASS AO=57;DP=60;FAO=58;FDP=60;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0108573;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=202.781;QD=34.8215;RBI=0.0234999;REFB=-0.0628762;REVB=0.0208415;RO=2;SAF=35;SAR=22;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00767061;STB=0.503596;TYPE=snp;VARB=0.00141879;OID=.;OPOS=88535341;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:60:60:2:2:57:58:22:35:1:1:23:35:1:1 chr16 88535407 . C G 505.74 PASS AO=54;DP=55;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.164205;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.7374;QD=36.1244;RBI=0.168948;REFB=0.00100132;REVB=-0.0397501;RO=1;SAF=17;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0269107;STB=0.51428;TYPE=snp;VARB=0.00159944;OID=.;OPOS=88535407;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:55:56:1:1:54:55:37:17:1:0:38:17:1:0 chr16 88552370 . A G 1167.79 PASS AO=122;DP=122;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00124115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.173;QD=37.977;RBI=0.0230988;REFB=0;REVB=0.0230654;RO=0;SAF=59;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.65337e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.6692e-05;OID=.;OPOS=88552370;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:122:123:0:0:122:123:63:59:0:0:63:60:0:0 chr16 88620195 . T G 1266.84 PASS AO=138;DP=143;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00202712;FXX=0.0349626;HRUN=3;LEN=1;MLLD=244.594;QD=36.72;RBI=0.0295444;REFB=-0.0589449;REVB=0.0294747;RO=1;SAF=67;SAR=71;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00704322;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.85846e-05;OID=.;OPOS=88620195;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:143:138:1:0:138:138:71:67:1:0:71:67:0:0 chr16 88633052 . G C 331.17 PASS AO=76;DP=167;FAO=82;FDP=173;FR=.;FRO=91;FSAF=36;FSAR=46;FSRF=28;FSRR=63;FWDB=-0.0243284;FXX=0.0057468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.983;QD=7.65709;RBI=0.036755;REFB=-0.00247556;REVB=0.0275509;RO=90;SAF=36;SAR=40;SRF=28;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161399;STB=0.571329;TYPE=snp;VARB=0.00323241;OID=.;OPOS=88633052;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:173:90:91:76:82:40:36:28:62:46:36:28:63 chr16 88644005 . A G 237.21 PASS AO=28;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0498923;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.7471;QD=30.6075;RBI=0.0525989;REFB=-0.113302;REVB=0.0166556;RO=3;SAF=25;SAR=3;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0526722;STB=0.509085;TYPE=snp;VARB=0.0162982;OID=.;OPOS=88644005;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:31:31:3:1:28:30:3:25:3:0:3:27:1:0 chr16 88705527 . C A 14.36 PASS AO=3;DP=10;FAO=3;FDP=10;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=-0.0113777;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=130.239;QD=5.74589;RBI=0.0113777;REFB=-0.0393974;REVB=0;RO=7;SAF=3;SAR=0;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0845111;OID=.;OPOS=88705527;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:10:10:7:7:3:3:0:3:7:0:0:3:7:0 chr16 88713236 . A G 339.17 PASS AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0133365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.954;QD=37.6857;RBI=0.0148873;REFB=0;REVB=-0.00661567;RO=0;SAF=22;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.58539e-05;OID=.;OPOS=88713236;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:36:36:0:0:36:36:14:22:0:0:14:22:0:0 chr16 88717386 . T C 107.82 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157929;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.084;QD=35.9383;RBI=0.0440481;REFB=0;REVB=0.0411195;RO=0;SAF=5;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000813816;OID=.;OPOS=88717386;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:7:5:0:0:7:5:0:0 chr16 88724347 . G T 115.86 PASS AO=26;DP=52;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.0111038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.038;QD=8.74408;RBI=0.0449578;REFB=-0.0296562;REVB=-0.043565;RO=26;SAF=16;SAR=10;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507686;TYPE=snp;VARB=0.0327831;OID=.;OPOS=88724347;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:53:26:27:26:26:10:16:16:10:10:16:17:10 chr16 88767769 . G C 189.47 PASS AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0530808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.122;QD=32.9509;RBI=0.0705873;REFB=-0.116427;REVB=0.0465295;RO=0;SAF=7;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.79751e-08;STB=0.533302;TYPE=snp;VARB=0.00698942;OID=.;OPOS=88767769;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:23:23:0:1:22:22:15:7:0:0:15:7:1:0 chr16 88778510 . G A 351.11 PASS AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.002474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.311;QD=37.9581;RBI=0.0393442;REFB=0;REVB=0.0392663;RO=0;SAF=24;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000188278;OID=.;OPOS=88778510;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:37:37:0:0:37:37:13:24:0:0:13:24:0:0 chr16 88779032 . G C 445.05 PASS AO=51;DP=54;FAO=52;FDP=54;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.015897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.095;QD=32.967;RBI=0.0407959;REFB=-0.174717;REVB=0.0375712;RO=3;SAF=18;SAR=33;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.040906;STB=0.51428;TYPE=snp;VARB=0.00113396;OID=.;OPOS=88779032;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:54:54:3:2:51:52:33:18:0:3:34:18:0:2 chr16 88781125 . T C 107.82 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0245237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.6341;QD=35.9384;RBI=0.0358552;REFB=0;REVB=0.0261569;RO=0;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.84847e-05;OID=.;OPOS=88781125;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:8:4:0:0:8:4:0:0 chr16 88782079 . G A 599.05 PASS AO=70;DP=75;FAO=70;FDP=75;FR=.;FRO=5;FSAF=40;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.0242476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.505;QD=31.9493;RBI=0.0350194;REFB=-0.0658309;REVB=0.0252668;RO=5;SAF=40;SAR=30;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0725321;STB=0.53845;TYPE=snp;VARB=0.00134009;OID=.;OPOS=88782079;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:75:75:5:5:70:70:30:40:0:5:30:40:0:5 chr16 88782676 . A G 677.1 PASS AO=68;DP=68;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0117045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.56;QD=38.6915;RBI=0.0170045;REFB=0;REVB=0.0123352;RO=0;SAF=45;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.18623e-07;OID=.;OPOS=88782676;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:68:70:0:0:68:70:23:45:0:0:25:45:0:0 chr16 88783449 . C G 267.04 PASS AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00946486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.8866;QD=38.1491;RBI=0.0209587;REFB=0;REVB=0.0186998;RO=0;SAF=19;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.62669e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000745949;OID=.;OPOS=88783449;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:28:28:0:0:28:28:9:19:0:0:9:19:0:0 chr16 88783521 . T C 276.84 PASS AO=27;DP=29;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00836682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.7914;QD=35.7208;RBI=0.14609;REFB=0;REVB=0.14585;RO=0;SAF=15;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00547404;OID=.;OPOS=88783521;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:29:31:0:0:27:31:12:15:0:0:15:16:0:0 chr16 88787607 . CCTT C 86.84 PASS AO=19;DP=46;FAO=23;FDP=41;FR=.;FRO=18;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.0153097;FXX=0.0681663;HRUN=2;LEN=3;MLLD=196.197;QD=8.47209;RBI=0.0340671;REFB=-0.0178217;REVB=-0.0304332;RO=17;SAF=13;SAR=6;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0354222;STB=0.542335;TYPE=del;VARB=0.0107413;OID=.;OPOS=88787608;OREF=CTT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:19:42:23:41:18:16:7:11:7:51:17:13:6:11:6 chr16 88787673 . G A 201.89 PASS AO=19;DP=60;FAO=35;FDP=56;FR=.,HEALED;FRO=21;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.0327975;FXX=0.0175408;HRUN=4;LEN=1;MLLD=84.089;QD=14.4208;RBI=0.0759206;REFB=-0.0335993;REVB=-0.0684709;RO=13;SAF=14;SAR=5;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0309072;STB=0.542833;TYPE=snp;VARB=0.0263934;OID=.;OPOS=88787673;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:41:56:13:21:19:35:5:14:10:3:19:16:12:9 chr16 88787704 . G C 474.67 PASS AO=53;DP=56;FAO=53;FDP=55;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00336401;FXX=0.017854;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.908;QD=34.5216;RBI=0.00337422;REFB=-0.0223484;REVB=-0.000262337;RO=2;SAF=22;SAR=31;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00597873;STB=0.503175;TYPE=snp;VARB=-2.85601e-05;OID=.;OPOS=88787704;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:56:55:2:2:53:53:31:22:1:1:31:22:1:1 chr16 88791458 . G A 165.67 PASS AO=35;DP=66;FAO=35;FDP=66;FR=.;FRO=31;FSAF=28;FSAR=7;FSRF=28;FSRR=3;FWDB=0.0855003;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.2873;QD=10.0405;RBI=0.140183;REFB=-0.000380196;REVB=0.11109;RO=31;SAF=28;SAR=7;SRF=28;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152059;STB=0.583291;TYPE=snp;VARB=0.00307131;OID=.;OPOS=88791458;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:31:31:35:35:7:28:28:3:7:28:28:3 chr16 88792047 . A G 363.69 PASS AO=36;DP=37;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0486828;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.8038;QD=36.3688;RBI=0.0893711;REFB=-0.0226461;REVB=-0.0749479;RO=1;SAF=21;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0301788;STB=0.513507;TYPE=snp;VARB=-0.00161792;OID=.;OPOS=88792047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:37:40:1:1:36:39:15:21:0:1:18:21:0:1 chr16 88792097 . A G 291.74 PASS AO=27;DP=27;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0310106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.325;QD=38.8988;RBI=0.0529198;REFB=0;REVB=0.0428818;RO=0;SAF=9;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000169513;OID=.;OPOS=88792097;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:27:30:0:0:27:30:18:9:0:0:20:10:0:0 chr16 88803982 . C G 97.79 PASS AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.110755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=39.9207;QD=30.0881;RBI=0.147375;REFB=-0.0736897;REVB=0.0972249;RO=0;SAF=9;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.571302;TYPE=snp;VARB=0.0213895;OID=.;OPOS=88803982;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:13:13:0:1:12:12:3:9:0:0:3:9:0:1 chr16 88804638 . GC G 25.31 PASS AO=8;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=-0.0114275;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=23.8674;QD=5.95553;RBI=0.230689;REFB=-0.0660661;REVB=-0.230405;RO=8;SAF=3;SAR=5;SRF=8;SRR=0;SSEN=0.631579;SSEP=0;SSSB=-0.499358;STB=0.785185;TYPE=del;VARB=0.0209993;OID=.;OPOS=88804639;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:8:17:9:17:8:3:6:8:0:24:8:3:5:8:0 chr16 88804734 . A G 99.26 PASS AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0319635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.0912;QD=39.7027;RBI=0.0431599;REFB=0;REVB=0.0290019;RO=0;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00214644;OID=.;OPOS=88804734;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:6:4:0:0:6:4:0:0 chr16 88808743 . A G 183.12 PASS AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0482233;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.031;QD=38.5515;RBI=0.0599783;REFB=0;REVB=0.0356638;RO=0;SAF=7;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000435325;OID=.;OPOS=88808743;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:19:19:0:0:19:19:12:7:0:0:12:7:0:0 chr16 88809368 . G T 208.55 PASS AO=23;DP=27;FAO=25;FDP=27;FR=.;FRO=2;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.108287;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.664;QD=30.8967;RBI=0.108789;REFB=-0.188148;REVB=0.010439;RO=1;SAF=11;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0402265;STB=0.501482;TYPE=snp;VARB=0.00492917;OID=.;OPOS=88809368;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:27:27:1:2:23:25:12:11:1:0:13:12:1:1 chr16 88809434 . A G 319.33 PASS AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.020041;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9514;QD=36.4953;RBI=0.0946151;REFB=-0.0423719;REVB=-0.0924682;RO=0;SAF=3;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00105792;OID=.;OPOS=88809434;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:36:35:0:0:35:35:32:3:0:0:32:3:0:0 chr16 88809480 . A G 297.34 PASS AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.5429;QD=37.1672;RBI=0.0461455;REFB=0;REVB=-0.0461455;RO=0;SAF=0;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000787967;OID=.;OPOS=88809480;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:33:32:0:0:32:32:32:0:0:0:32:0:0:0 chr16 88809686 . T C 209.83 PASS AO=25;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0364227;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4507;QD=33.5732;RBI=0.0963633;REFB=-0.000662063;REVB=-0.0892147;RO=0;SAF=15;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517227;TYPE=snp;VARB=-0.00123186;OID=.;OPOS=88809686;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:25:25:0:1:25:24:10:15:0:0:10:14:1:0 chr16 88809773 . G C 568.24 PASS AO=58;DP=58;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0708898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.212;QD=38.5246;RBI=0.0724788;REFB=0;REVB=0.0150937;RO=0;SAF=27;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07727e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000174596;OID=.;OPOS=88809773;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:58:59:0:0:58:59:31:27:0:0:31:28:0:0 chr16 88809893 . G A 210.91 PASS AO=49;DP=103;FAO=50;FDP=102;FR=.;FRO=52;FSAF=41;FSAR=9;FSRF=45;FSRR=7;FWDB=0.00763421;FXX=0.0097078;HRUN=3;LEN=1;MLLD=191.647;QD=8.2709;RBI=0.0426245;REFB=-0.00204488;REVB=0.0419353;RO=51;SAF=41;SAR=8;SRF=45;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0819554;STB=0.541243;TYPE=snp;VARB=0.00306434;OID=.;OPOS=88809893;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:102:51:52:49:50:8:41:45:6:9:41:45:7 chr16 88809894 . G C 213.37 PASS AO=50;DP=102;FAO=50;FDP=103;FR=.;FRO=53;FSAF=41;FSAR=9;FSRF=45;FSRR=8;FWDB=-0.00368225;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.715;QD=8.28607;RBI=0.0120227;REFB=-0.00275332;REVB=0.0114449;RO=50;SAF=41;SAR=9;SRF=45;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13541;STB=0.526163;TYPE=snp;VARB=0.00317592;OID=.;OPOS=88809894;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:103:50:53:50:50:9:41:45:5:9:41:45:8 chr16 88870967 . T C 172.84 PASS AO=20;DP=22;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0372394;FXX=0.0454339;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.392;QD=32.9223;RBI=0.0404357;REFB=-0.103294;REVB=0.0157567;RO=0;SAF=1;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97126e-08;STB=0.512808;TYPE=snp;VARB=0.00105422;OID=.;OPOS=88870967;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:22:21:0:1:20:20:19:1:0:0:19:1:0:1 chr16 88872145 . T C 316.54 PASS AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0125985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.5597;QD=37.2401;RBI=0.0208349;REFB=0;REVB=0.0165943;RO=0;SAF=21;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.80071e-05;OID=.;OPOS=88872145;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:34:0:0:34:34:13:21:0:0:13:21:0:0 chr16 88872229 . A G 414.52 PASS AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0370063;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.367;QD=37.6832;RBI=0.0382557;REFB=0;REVB=0.00969706;RO=0;SAF=17;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.54734e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000204986;OID=.;OPOS=88872229;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:45:44:0:0:44:44:27:17:0:0:27:17:0:0 chr16 88872511 . T C 316.55 PASS AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0316818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.16;QD=37.2411;RBI=0.0657245;REFB=0;REVB=0.0575845;RO=0;SAF=7;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.32246e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000494864;OID=.;OPOS=88872511;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:34:0:0:34:34:27:7:0:0:27:7:0:0 chr16 88874631 . TC T,TG 946.61 PASS AO=35,66;DP=106;FAO=78,25;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=43,1;FSAR=35,24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0205204,-0.44184;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=85.1593,79.0474;QD=36.7615;RBI=0.0220291,0.44201;REFB=0,0;REVB=0.00801212,-0.0122869;RO=0;SAF=0,42;SAR=35,24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,5.1333e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.00615076,-0.027662;OID=.,.;OPOS=88874632,88874632;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=T,TG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:35,66:101:78,25:103:0:43,1:35,24:0:0:42:0:0,42:35,24:0:0 chr16 88901669 . A C 454.32 PASS AO=109;DP=225;FAO=110;FDP=226;FR=.;FRO=116;FSAF=57;FSAR=53;FSRF=58;FSRR=58;FWDB=-0.025263;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.893;QD=8.04099;RBI=0.0498848;REFB=-0.0161517;REVB=-0.0430148;RO=116;SAF=56;SAR=53;SRF=58;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0128884;STB=0.509337;TYPE=snp;VARB=0.0150948;OID=.;OPOS=88901669;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:225:226:116:116:109:110:53:56:58:58:53:57:58:58 chr16 88902183 . G A 197.92 PASS AO=45;DP=93;FAO=46;FDP=93;FR=.;FRO=47;FSAF=28;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=25;FWDB=0.00966127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.985;QD=8.51266;RBI=0.0168626;REFB=-0.0450881;REVB=0.0138206;RO=45;SAF=27;SAR=18;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141439;STB=0.572212;TYPE=snp;VARB=0.036127;OID=.;OPOS=88902183;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:45:47:45:46:18:27:20:25:18:28:22:25 chr16 88921634 . C G 144.05 PASS AO=39;DP=97;FAO=40;FDP=99;FR=.;FRO=59;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=51;FSRR=8;FWDB=0.000612887;FXX=0.153833;HRUN=4;LEN=1;MLLD=158.842;QD=5.82012;RBI=0.0105028;REFB=-0.00573448;REVB=-0.0104849;RO=57;SAF=24;SAR=15;SRF=49;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.297045;STB=0.664655;TYPE=snp;VARB=0.0109509;OID=.;OPOS=88921634;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:99:57:59:39:40:15:24:49:8:15:25:51:8 chr16 88921635 . C G 13.18 PASS AO=17;DP=113;FAO=18;FDP=114;FR=.;FRO=96;FSAF=17;FSAR=1;FSRF=72;FSRR=24;FWDB=-0.00477357;FXX=0.0172399;HRUN=4;LEN=1;MLLD=129.568;QD=0.462481;RBI=0.0332949;REFB=-0.000472902;REVB=-0.0329509;RO=96;SAF=16;SAR=1;SRF=72;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.433531;STB=0.826352;TYPE=snp;VARB=0.00151099;OID=.;OPOS=88921635;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:113:114:96:96:17:18:1:16:72:24:1:17:72:24 chr16 88930024 . AG A 37.08 PASS AO=19;DP=60;FAO=23;FDP=58;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=25;FWDB=-0.0387936;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.015;QD=2.5571;RBI=0.23462;REFB=-0.0242805;REVB=0.23139;RO=29;SAF=14;SAR=5;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.438146;STB=0.737556;TYPE=del;VARB=0.0724439;OID=.;OPOS=88930025;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:19:57:23:58:35:16:7:10:25:37:29:14:5:9:20 chr16 89167094 . T C 11.13 PASS AO=4;DP=20;FAO=4;FDP=20;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.0109892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.576;QD=2.22516;RBI=0.0280863;REFB=0.00322172;REVB=-0.0258472;RO=15;SAF=2;SAR=2;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113234;STB=0.549753;TYPE=snp;VARB=-0.0219194;OID=.;OPOS=89167094;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:20:20:15:16:4:4:2:2:6:9:2:2:7:9 chr16 89167140 . G C 255.45 PASS AO=17;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0501549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.0932;QD=37.8444;RBI=0.291727;REFB=0;REVB=0.287383;RO=1;SAF=7;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0436347;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00520668;OID=.;OPOS=89167140;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:27:27:1:0:17:27:10:7:0:1:20:7:0:0 chr16 89167395 . C T 73.28 PASS AO=25;DP=75;FAO=25;FDP=74;FR=.;FRO=49;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=29;FWDB=-0.0470359;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.5006;QD=3.96086;RBI=0.0501111;REFB=-0.0366881;REVB=0.0172842;RO=48;SAF=14;SAR=11;SRF=19;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183741;STB=0.599493;TYPE=snp;VARB=0.0752053;OID=.;OPOS=89167395;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:75:74:48:49:25:25:11:14:19:29:11:14:20:29 chr16 89167404 . T C 77.22 PASS AO=28;DP=85;FAO=28;FDP=85;FR=.;FRO=57;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=28;FSRR=29;FWDB=-0.00230898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.681;QD=3.63402;RBI=0.00426041;REFB=-0.00597116;REVB=0.00358046;RO=57;SAF=17;SAR=11;SRF=28;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134751;STB=0.578667;TYPE=snp;VARB=0.0132634;OID=.;OPOS=89167404;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:85:85:57:57:28:28:11:17:28:29:11:17:28:29 chr16 89167431 . G C 84.66 PASS AO=26;DP=96;FAO=32;FDP=100;FR=.;FRO=68;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=42;FSRR=26;FWDB=0.00619988;FXX=0.0291234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.523;QD=3.3864;RBI=0.0826829;REFB=0.0096991;REVB=0.0824502;RO=69;SAF=19;SAR=7;SRF=43;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150554;STB=0.516939;TYPE=snp;VARB=-0.0166555;OID=.;OPOS=89167431;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:96:100:69:68:26:32:7:19:43:26:13:19:42:26 chr16 89167443 . T C 112.27 PASS AO=39;DP=112;FAO=39;FDP=112;FR=.;FRO=73;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=43;FSRR=30;FWDB=-0.0192943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.023;QD=4.00968;RBI=0.0192994;REFB=-0.0177366;REVB=0.000447246;RO=70;SAF=19;SAR=20;SRF=40;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.094178;STB=0.566177;TYPE=snp;VARB=0.0366887;OID=.;OPOS=89167443;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:70:73:39:39:20:19:40:30:20:19:43:30 chr16 89167458 . C A 103.56 PASS AO=34;DP=122;FAO=40;FDP=126;FR=.;FRO=86;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=50;FSRR=36;FWDB=-0.00431037;FXX=0.023254;HRUN=5;LEN=1;MLLD=144.191;QD=3.28748;RBI=0.106936;REFB=-0.0196487;REVB=-0.106849;RO=39;SAF=18;SAR=16;SRF=24;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0827809;STB=0.504469;TYPE=snp;VARB=0.0267994;OID=.;OPOS=89167458;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:126:39:86:34:40:16:18:24:15:17:23:50:36 chr16 89180883 . G A 160.06 PASS AO=28;DP=43;FAO=28;FDP=44;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=24;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.00838161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.366;QD=14.5505;RBI=0.0112638;REFB=-0.0326653;REVB=-0.00752478;RO=15;SAF=4;SAR=24;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.398474;STB=0.715415;TYPE=snp;VARB=0.0220617;OID=.;OPOS=89180883;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:43:44:15:16:28:28:24:4:9:6:24:4:9:7 chr16 89211665 . T C 41.96 PASS AO=27;DP=97;FAO=26;FDP=104;FR=.;FRO=78;FSAF=3;FSAR=23;FSRF=30;FSRR=48;FWDB=-0.0387791;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=25.437;QD=1.61402;RBI=0.0388256;REFB=-0.0826544;REVB=-0.00189853;RO=70;SAF=2;SAR=25;SRF=25;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.525317;STB=0.780604;TYPE=snp;VARB=0.0807512;OID=.;OPOS=89211665;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:97:104:70:78:27:26:25:2:25:45:23:3:30:48 chr16 89234948 . C A 69.85 PASS AO=13;DP=38;FAO=18;FDP=43;FR=.;FRO=25;FSAF=1;FSAR=17;FSRF=2;FSRR=23;FWDB=0.0346955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.75;QD=6.49794;RBI=0.0454806;REFB=-0.0403909;REVB=0.0294059;RO=24;SAF=1;SAR=12;SRF=2;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0239186;STB=0.560365;TYPE=snp;VARB=0.0652108;OID=.;OPOS=89234948;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:38:43:24:25:13:18:12:1:2:22:17:1:2:23 chr16 89246670 . T C 83.25 PASS AO=21;DP=49;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=-0.0220963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.317;QD=6.79625;RBI=0.0400829;REFB=-0.0218564;REVB=-0.0334423;RO=28;SAF=13;SAR=8;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0860282;STB=0.549248;TYPE=snp;VARB=0.0161499;OID=.;OPOS=89246670;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:49:49:28:28:21:21:8:13:15:13:8:13:15:13 chr16 89251776 . G A 74.02 PASS AO=12;DP=19;FAO=12;FDP=19;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.00735025;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.709;QD=15.5832;RBI=0.0224865;REFB=-0.0558234;REVB=0.0212512;RO=7;SAF=4;SAR=8;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.067621;STB=0.538396;TYPE=snp;VARB=0.0107584;OID=.;OPOS=89251776;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:19:19:7:7:12:12:8:4:3:4:8:4:3:4 chr16 89251798 . C T 82.48 PASS AO=12;DP=16;FAO=12;FDP=16;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.00580745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.163;QD=20.6212;RBI=0.0228889;REFB=0.0255844;REVB=-0.0221399;RO=4;SAF=3;SAR=9;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136204;STB=0.576787;TYPE=snp;VARB=-0.0165827;OID=.;OPOS=89251798;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:16:16:4:4:12:12:9:3:2:2:9:3:2:2 chr16 89251851 . A G 52.31 PASS AO=9;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.018893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.3399;QD=13.9487;RBI=0.024076;REFB=0.00154206;REVB=-0.0149234;RO=6;SAF=2;SAR=7;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.057902;STB=0.533262;TYPE=snp;VARB=-0.000790923;OID=.;OPOS=89251851;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:15:15:6:6:9:9:7:2:1:5:7:2:1:5 chr16 89259993 . A G 92.9 PASS AO=20;DP=35;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.105876;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7031;QD=10.3226;RBI=0.116832;REFB=0.0503983;REVB=-0.0493964;RO=15;SAF=3;SAR=17;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.285411;STB=0.67206;TYPE=snp;VARB=-0.0565352;OID=.;OPOS=89259993;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:35:36:15:17:20:19:17:3:6:9:16:3:7:10 chr16 89262419 . G A 16.08 PASS AO=3;DP=6;FAO=3;FDP=6;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00442601;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=167.233;QD=10.7183;RBI=0.0207105;REFB=0.0381976;REVB=0.020232;RO=3;SAF=1;SAR=2;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0328426;OID=.;OPOS=89262419;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:6:6:3:3:3:3:2:1:1:2:2:1:1:2 chr16 89262431 . G A 15.55 PASS AO=3;DP=8;FAO=3;FDP=8;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0715549;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.07;QD=7.77495;RBI=0.0797827;REFB=-0.0014253;REVB=0.0352871;RO=5;SAF=1;SAR=2;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247694;STB=0.665555;TYPE=snp;VARB=0.00773812;OID=.;OPOS=89262431;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:8:8:5:5:3:3:2:1:3:2:2:1:3:2 chr16 89262657 . G A 39.78 PASS AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.00317939;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=258.588;QD=12.2402;RBI=0.00679316;REFB=-0.0131795;REVB=-0.0060032;RO=6;SAF=1;SAR=6;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23478;STB=0.642384;TYPE=snp;VARB=0.00834407;OID=.;OPOS=89262657;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:13:13:6:6:7:7:6:1:2:4:6:1:2:4 chr16 89265087 . A G 81.07 PASS AO=25;DP=67;FAO=25;FDP=68;FR=.;FRO=43;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=-0.0432782;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.6751;QD=4.76884;RBI=0.0735791;REFB=0.0251211;REVB=-0.0595053;RO=42;SAF=12;SAR=13;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0475723;STB=0.534637;TYPE=snp;VARB=-0.0434144;OID=.;OPOS=89265087;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:67:68:42:43:25:25:13:12:22:20:13:12:23:20 chr16 89265101 . C T 80.49 PASS AO=23;DP=54;FAO=23;FDP=60;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=-0.0207056;FXX=0.0322529;HRUN=3;LEN=1;MLLD=186.81;QD=5.36622;RBI=0.0216522;REFB=-0.00745122;REVB=-0.00633213;RO=30;SAF=13;SAR=10;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.227424;STB=0.581459;TYPE=snp;VARB=0.004009;OID=.;OPOS=89265101;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:54:60:30:37:23:23:10:13:10:20:10:13:16:21 chr16 89265466 . A G 66.73 PASS AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0651949;FXX=0.0526039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.1761;QD=14.8285;RBI=0.0752836;REFB=-0.0193308;REVB=-0.0376464;RO=7;SAF=1;SAR=10;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.407764;STB=0.740184;TYPE=snp;VARB=0.00658247;OID=.;OPOS=89265466;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:19:18:7:7:11:11:10:1:3:4:10:1:3:4 chr16 89291157 . A G 411.55 PASS AO=100;DP=207;FAO=100;FDP=207;FR=.;FRO=107;FSAF=45;FSAR=55;FSRF=53;FSRR=54;FWDB=0.0125523;FXX=0.00480746;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.796;QD=7.95268;RBI=0.0262769;REFB=-0.0101126;REVB=0.023085;RO=107;SAF=45;SAR=55;SRF=53;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0427288;STB=0.52355;TYPE=snp;VARB=0.00967521;OID=.;OPOS=89291157;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:207:107:107:100:100:55:45:53:54:55:45:53:54 chr16 89291210 . G GGTGA 1485.05 PASS AO=169;DP=191;FAO=174;FDP=187;FR=.;FRO=13;FSAF=79;FSAR=95;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0281373;FXX=0.00531887;HRUN=2;LEN=4;MLLD=274.733;QD=31.7657;RBI=0.0284186;REFB=-0.0272099;REVB=0.00398806;RO=18;SAF=77;SAR=92;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00815472;STB=0.500527;TYPE=ins;VARB=0.00167727;OID=.;OPOS=89291211;OREF=-;OALT=GTGA;OMAPALT=GGTGA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:169:191:174:187:13:79:95:6:7:12:18:77:92:9:9 chr16 89291951 . C T 865.91 PASS AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0192968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.433;QD=38.485;RBI=0.0353349;REFB=0;REVB=-0.0296006;RO=0;SAF=51;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.24868e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.46955e-05;OID=.;OPOS=89291951;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:90:90:0:0:90:90:39:51:0:0:39:51:0:0 chr16 89293271 . A C 2012.76 PASS AO=223;DP=231;FAO=224;FDP=231;FR=.;FRO=7;FSAF=98;FSAR=126;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.00446717;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=217.827;QD=34.853;RBI=0.012285;REFB=-0.018047;REVB=0.0114441;RO=5;SAF=98;SAR=125;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00167305;STB=0.504678;TYPE=snp;VARB=0.000124611;OID=.;OPOS=89293271;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:231:231:5:7:223:224:125:98:2:3:126:98:2:5 chr16 89293501 . G A 336.12 PASS AO=71;DP=132;FAO=71;FDP=131;FR=.;FRO=60;FSAF=24;FSAR=47;FSRF=27;FSRR=33;FWDB=0.00813998;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.36;QD=10.2632;RBI=0.0164808;REFB=-0.0124909;REVB=-0.0143303;RO=59;SAF=24;SAR=47;SRF=26;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0918059;STB=0.555231;TYPE=snp;VARB=0.0112211;OID=.;OPOS=89293501;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:131:59:60:71:71:47:24:26:33:47:24:27:33 chr16 89293614 . A G 1932.63 PASS AO=196;DP=198;FAO=205;FDP=205;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00894476;FXX=0.00966137;HRUN=4;LEN=1;MLLD=227.285;QD=37.7099;RBI=0.0103025;REFB=-0.0279631;REVB=-0.00511205;RO=2;SAF=86;SAR=110;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00119557;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.40694e-08;OID=.;OPOS=89293614;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:198:205:2:0:196:205:110:86:1:1:119:86:0:0 chr16 89294184 . G A 1070.34 PASS AO=112;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0100484;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.489;QD=37.888;RBI=0.0144948;REFB=0;REVB=-0.0104464;RO=0;SAF=50;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.44814e-05;OID=.;OPOS=89294184;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:113:113:0:0:112:113:62:50:0:0:63:50:0:0 chr16 89294381 . T C 684.83 PASS AO=71;DP=74;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0541861;FXX=0.0399947;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.272;QD=38.0458;RBI=0.056133;REFB=0;REVB=-0.0146553;RO=0;SAF=35;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11607e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.91029e-05;OID=.;OPOS=89294381;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:74:72:0:0:71:72:36:35:0:0:36:36:0:0 chr16 89294439 . G T 519.8 PASS AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.503;QD=37.8034;RBI=0.0248864;REFB=0;REVB=0.0204138;RO=0;SAF=43;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.98168e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000129163;OID=.;OPOS=89294439;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:55:55:0:0:55:55:12:43:0:0:12:43:0:0 chr16 89294511 . C T 518.57 PASS AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-4.96307e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.83;QD=36.3907;RBI=0.00706639;REFB=0.0296878;REVB=0.00706622;RO=0;SAF=36;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.57266e-08;STB=0.506847;TYPE=snp;VARB=-0.000161975;OID=.;OPOS=89294511;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:57:57:0:1:56:56:20:36:0:0:20:36:1:0 chr16 89294697 . C T 1000.88 PASS AO=107;DP=112;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00877736;FXX=0.0446389;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1374;QD=37.416;RBI=0.0781569;REFB=-0.0325295;REVB=0.0776625;RO=0;SAF=41;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.87293e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000290139;OID=.;OPOS=89294697;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:112:107:0:0:107:107:66:41:0:0:66:41:0:0 chr16 89299200 . C A 485 PASS AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0563961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.719;QD=38.7996;RBI=0.0692293;REFB=0;REVB=0.0401519;RO=0;SAF=29;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.20481e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000390935;OID=.;OPOS=89299200;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:50:50:0:0:50:50:21:29:0:0:21:29:0:0 chr16 89299227 . C T 543.63 PASS AO=55;DP=55;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0829047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.632;QD=38.1492;RBI=0.0834825;REFB=0;REVB=0.00980523;RO=0;SAF=28;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.4002e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000423963;OID=.;OPOS=89299227;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:55:57:0:0:55:57:27:28:0:0:27:30:0:0 chr16 89299280 . T A 478.42 PASS AO=54;DP=59;FAO=56;FDP=59;FR=.;FRO=3;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.141851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.248;QD=32.435;RBI=0.154691;REFB=-0.12876;REVB=0.0617051;RO=4;SAF=24;SAR=30;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0256129;STB=0.523069;TYPE=snp;VARB=0.0123201;OID=.;OPOS=89299280;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:59:59:4:3:54:56:30:24:1:3:31:25:0:3 chr16 89299383 . G C 103.37 PASS AO=11;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.1387;QD=34.4574;RBI=0.00578969;REFB=0;REVB=0.00578969;RO=0;SAF=0;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0017923;OID=.;OPOS=89299383;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:11:12:11:0:0:0:12:0:0:0 chr16 89299442 . G A 22.46 PASS AO=3;DP=7;FAO=4;FDP=8;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0124657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=36.0223;QD=11.2302;RBI=0.202287;REFB=-0.0934234;REVB=0.201903;RO=4;SAF=2;SAR=1;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0848588;STB=0.624412;TYPE=snp;VARB=0.129195;OID=.;OPOS=89299442;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:7:8:4:4:3:4:1:2:3:1:2:2:3:1 chr16 89299890 . A G 143.29 PASS AO=16;DP=18;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0803642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2596;QD=31.8428;RBI=0.118874;REFB=-0.115884;REVB=-0.0875941;RO=2;SAF=13;SAR=3;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0653276;STB=0.517221;TYPE=snp;VARB=0.0071567;OID=.;OPOS=89299890;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:18:18:2:1:16:17:3:13:2:0:3:14:1:0 chr16 89300014 . C T 134.84 PASS AO=24;DP=40;FAO=24;FDP=40;FR=.;FRO=16;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0740342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.8905;QD=13.484;RBI=0.0746213;REFB=-0.0405788;REVB=-0.0093421;RO=16;SAF=15;SAR=9;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0935671;STB=0.551904;TYPE=snp;VARB=0.0490388;OID=.;OPOS=89300014;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:40:40:16:16:24:24:9:15:8:8:9:15:8:8 chr16 89300015 . A G 388.29 PASS AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0518813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.3559;QD=38.8292;RBI=0.058753;REFB=0;REVB=0.0275726;RO=0;SAF=23;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.4817e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000774281;OID=.;OPOS=89300015;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:40:40:0:0:40:40:17:23:0:0:17:23:0:0 chr16 89300147 . A G 180.19 PASS AO=20;DP=21;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0509015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=45.0752;QD=32.7621;RBI=0.119628;REFB=-0.120213;REVB=0.108259;RO=1;SAF=12;SAR=8;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0368683;STB=0.518501;TYPE=snp;VARB=0.0461869;OID=.;OPOS=89300147;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:21:22:1:1:20:21:8:12:1:0:8:13:1:0 chr16 89357422 . TG T 67.74 PASS AO=12;DP=20;FAO=16;FDP=19;FR=.;FRO=3;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.156739;FXX=0.049975;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.9396;QD=14.2621;RBI=0.156833;REFB=-0.150754;REVB=-0.00541011;RO=5;SAF=7;SAR=5;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0.570681;SSSB=-0.00896755;STB=0.526283;TYPE=del;VARB=0.115748;OID=.;OPOS=89357423;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:12:18:16:19:3:8:8:2:1:4:5:7:5:3:2 chr16 89590168 . T TATCTC 220.35 PASS AO=64;DP=193;FAO=71;FDP=184;FR=.;FRO=113;FSAF=24;FSAR=47;FSRF=34;FSRR=79;FWDB=-0.00500875;FXX=0.0466297;HRUN=1;LEN=5;MLLD=253.971;QD=4.79024;RBI=0.00767153;REFB=-0.00523836;REVB=0.00581075;RO=112;SAF=23;SAR=41;SRF=34;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0695206;STB=0.525906;TYPE=ins;VARB=0.00882532;OID=.;OPOS=89590169;OREF=-;OALT=ATCTC;OMAPALT=TATCTC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:64:193:71:184:113:24:47:34:79:99:112:23:41:34:78 chr16 89590243 . G A 259.8 PASS AO=80;DP=206;FAO=81;FDP=206;FR=.;FRO=125;FSAF=21;FSAR=60;FSRF=30;FSRR=95;FWDB=0.0278187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.328;QD=5.04465;RBI=0.0278549;REFB=-0.00390022;REVB=-0.001421;RO=123;SAF=21;SAR=59;SRF=29;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0380047;STB=0.515436;TYPE=snp;VARB=0.00721693;OID=.;OPOS=89590243;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:206:206:123:125:80:81:59:21:29:94:60:21:30:95 chr16 89613123 . A G 67.06 PASS AO=28;DP=95;FAO=28;FDP=94;FR=.;FRO=66;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=27;FSRR=39;FWDB=-0.0220493;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.7766;QD=2.85344;RBI=0.0423655;REFB=-0.0312535;REVB=-0.0361755;RO=66;SAF=10;SAR=18;SRF=27;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0655689;STB=0.538807;TYPE=snp;VARB=0.0387613;OID=.;OPOS=89613123;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:95:94:66:66:28:28:18:10:27:39:18:10:27:39 chr16 89615453 . A C 442.38 PASS AO=121;DP=288;FAO=124;FDP=287;FR=.;FRO=163;FSAF=67;FSAR=57;FSRF=84;FSRR=79;FWDB=-0.016543;FXX=0.0137452;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.409;QD=6.16563;RBI=0.0165444;REFB=-0.0176133;REVB=-0.00021547;RO=164;SAF=64;SAR=57;SRF=85;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0110148;STB=0.514248;TYPE=snp;VARB=0.0231048;OID=.;OPOS=89615453;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:288:287:164:163:121:124:57:64:85:79:57:67:84:79 chr16 89620328 . G A 124.28 PASS AO=23;DP=39;FAO=23;FDP=40;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=-0.00096033;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.7379;QD=12.428;RBI=0.0158061;REFB=-0.0301322;REVB=0.0157769;RO=16;SAF=7;SAR=16;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00708253;STB=0.523908;TYPE=snp;VARB=0.0259351;OID=.;OPOS=89620328;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:39:40:16:17:23:23:16:7:5:11:16:7:6:11 chr16 89652181 . T C 15.59 PASS AO=9;DP=48;FAO=9;FDP=47;FR=.;FRO=38;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=0.0181475;FXX=0.020829;HRUN=3;LEN=1;MLLD=88.2521;QD=1.32648;RBI=0.0636856;REFB=-0.0286472;REVB=-0.0610453;RO=36;SAF=7;SAR=2;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.485423;STB=0.798448;TYPE=snp;VARB=0.0377935;OID=.;OPOS=89652181;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:48:47:36:38:9:9:2:7:13:23:2:7:15:23 chr16 89652183 . A G 23.55 PASS AO=12;DP=45;FAO=11;FDP=44;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=0.0361563;FXX=0.083316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.789;QD=2.14111;RBI=0.0368693;REFB=-0.0209996;REVB=-0.00721576;RO=33;SAF=9;SAR=3;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.446569;STB=0.696872;TYPE=snp;VARB=0.107007;OID=.;OPOS=89652183;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:45:44:33:33:12:11:3:9:12:21:4:7:12:21 chr16 89653999 . TTGAG T 504.86 PASS AO=54;DP=68;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0255292;FXX=0.0454477;HRUN=3;LEN=4;MLLD=256.745;QD=32.0544;RBI=0.0290696;REFB=0;REVB=0.0139033;RO=0;SAF=14;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=4.43076e-05;OID=.;OPOS=89654000;OREF=TGAG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:54:62:63:63:0:21:42:0:0:44:0:14:40:0:0 chr16 89704365 . G C 22.3 PASS AO=4;DP=9;FAO=4;FDP=9;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0124319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.257;QD=9.91231;RBI=0.0178418;REFB=-0.0122373;REVB=0.0127976;RO=5;SAF=3;SAR=1;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.386089;STB=0.726523;TYPE=snp;VARB=0.0247517;OID=.;OPOS=89704365;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:9:9:5:5:4:4:1:3:5:0:1:3:5:0 chr16 89760652 . C T 158.7 PASS AO=39;DP=84;FAO=39;FDP=84;FR=.;FRO=45;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=30;FSRR=15;FWDB=0.0581701;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.99;QD=7.55708;RBI=0.0613056;REFB=-0.00842541;REVB=-0.019355;RO=42;SAF=25;SAR=14;SRF=27;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00185163;STB=0.515043;TYPE=snp;VARB=0.00800338;OID=.;OPOS=89760652;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:42:45:39:39:14:25:27:15:14:25:30:15 chr16 89760712 . G A 132.55 PASS AO=30;DP=59;FAO=29;FDP=58;FR=.;FRO=29;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=-0.0821711;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.5003;QD=9.14102;RBI=0.0829734;REFB=-0.049028;REVB=0.0115109;RO=28;SAF=21;SAR=9;SRF=19;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218619;STB=0.519822;TYPE=snp;VARB=0.0364471;OID=.;OPOS=89760712;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:58:28:29:30:29:9:21:19:9:9:20:19:10 chr16 89763214 . T C 35.1 PASS AO=9;DP=30;FAO=10;FDP=31;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.0117957;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.3916;QD=4.5287;RBI=0.0480984;REFB=-0.000992392;REVB=0.0466296;RO=19;SAF=5;SAR=4;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0325653;STB=0.516097;TYPE=snp;VARB=0.0116012;OID=.;OPOS=89763214;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:30:31:19:21:9:10:4:5:10:9:5:5:11:10 chr16 89763263 . T C 92.32 PASS AO=11;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.,HEALED;FRO=12;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=0.0217991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.358;QD=12.7341;RBI=0.0276574;REFB=-0.0148846;REVB=0.0170216;RO=12;SAF=4;SAR=7;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.336685;STB=0.670407;TYPE=snp;VARB=0.0423444;OID=.;OPOS=89763263;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:29:29:12:12:11:13:7:4:9:3:8:5:9:3 chr16 89764549 . G A 52.43 PASS AO=7;DP=11;FAO=8;FDP=12;FR=.;FRO=4;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.00804631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.669;QD=17.478;RBI=0.0230895;REFB=-0.0361484;REVB=-0.0216422;RO=4;SAF=7;SAR=0;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.799165;STB=0.776952;TYPE=snp;VARB=0.00707037;OID=.;OPOS=89764549;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:11:12:4:4:7:8:0:7:1:3:1:7:1:3 chr16 89777761 . C T 496.84 PASS AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000811174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.87;QD=37.4973;RBI=0.0194728;REFB=0;REVB=0.0194559;RO=0;SAF=19;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.0907e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.15541e-05;OID=.;OPOS=89777761;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:52:53:0:0:52:53:33:19:0:0:34:19:0:0 chr16 89782984 . T TG 304.37 PASS AO=12;DP=76;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0770371;FXX=0.0933209;HRUN=4;LEN=1;MLLD=11.3278;QD=17.9044;RBI=0.101002;REFB=0.00440827;REVB=0.0653193;RO=61;SAF=9;SAR=3;SRF=23;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.445163;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.02145;OID=.;OPOS=89782985;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:12:76:68:68:0:31:37:0:0:24:61:9:3:23:38 chr16 89782989 . A G 567.16 PASS AO=62;DP=67;FAO=69;FDP=75;FR=.;FRO=6;FSAF=32;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.0436919;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.2443;QD=30.2484;RBI=0.0561024;REFB=-0.0234361;REVB=0.0351924;RO=5;SAF=29;SAR=33;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00956611;STB=0.537489;TYPE=snp;VARB=0.0142224;OID=.;OPOS=89782989;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:75:5:6:62:69:33:29:2:3:37:32:0:6 chr16 89783187 . C T 387.6 PASS AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00133186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.4829;QD=38.7598;RBI=0.0513466;REFB=0;REVB=0.0513294;RO=0;SAF=16;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43889e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00060623;OID=.;OPOS=89783187;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:39:40:0:0:39:40:23:16:0:0:24:16:0:0 chr16 89784336 . C T 17.65 PASS AO=6;DP=24;FAO=6;FDP=24;FR=.;FRO=18;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=16;FWDB=-0.0793466;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=161.988;QD=2.94136;RBI=0.0794688;REFB=-0.000787363;REVB=-0.00440491;RO=15;SAF=1;SAR=5;SRF=1;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.255623;STB=0.583089;TYPE=snp;VARB=0.000562366;OID=.;OPOS=89784336;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:24:24:15:18:6:6:5:1:1:14:5:1:2:16 chr16 89789898 . T C 145.14 PASS AO=33;DP=70;FAO=33;FDP=68;FR=.;FRO=35;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=0.0339214;FXX=0.0555478;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.6789;QD=8.53758;RBI=0.0346051;REFB=-0.0122819;REVB=-0.00684514;RO=30;SAF=22;SAR=11;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151239;STB=0.597877;TYPE=snp;VARB=0.0122297;OID=.;OPOS=89789898;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:68:30:35:33:33:11:22:15:15:11:22:17:18 chr16 89799950 . C T 89.28 PASS AO=19;DP=38;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.197376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.9802;QD=9.39752;RBI=0.200939;REFB=-0.0158376;REVB=-0.0376709;RO=19;SAF=5;SAR=14;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16284;STB=0.59273;TYPE=snp;VARB=0.0451488;OID=.;OPOS=89799950;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:38:38:19:19:19:19:14:5:8:11:14:5:8:11 chr16 89805914 . T C 114.35 PASS AO=35;DP=92;FAO=35;FDP=92;FR=.;FRO=57;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=37;FWDB=-0.0809525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.683;QD=4.97177;RBI=0.0859963;REFB=-0.00553406;REVB=-0.0290182;RO=57;SAF=19;SAR=16;SRF=20;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206433;STB=0.617348;TYPE=snp;VARB=0.0142954;OID=.;OPOS=89805914;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:57:57:35:35:16:19:20:37:16:19:20:37 chr16 89806343 . C A 201.26 PASS AO=58;DP=147;FAO=60;FDP=149;FR=.;FRO=89;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=30;FSRR=59;FWDB=-0.0185937;FXX=0.0197355;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.005;QD=5.40306;RBI=0.0186564;REFB=0.00239357;REVB=-0.00152818;RO=88;SAF=26;SAR=32;SRF=29;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130689;STB=0.559444;TYPE=snp;VARB=-0.00300714;OID=.;OPOS=89806343;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:149:88:89:58:60:32:26:29:59:34:26:30:59 chr16 89806347 . A T 1459.86 PASS AO=154;DP=155;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0575115;FXX=0.00640985;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.909;QD=37.6739;RBI=0.0584133;REFB=0.00971691;REVB=0.0102244;RO=1;SAF=55;SAR=99;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00857036;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.87978e-05;OID=.;OPOS=89806347;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:155:155:1:0:154:155:99:55:1:0:99:56:0:0 chr16 89807233 . C G 232.97 PASS AO=53;DP=109;FAO=53;FDP=106;FR=.;FRO=53;FSAF=37;FSAR=16;FSRF=43;FSRR=10;FWDB=-0.0199063;FXX=0.0275204;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.0444;QD=8.79138;RBI=0.0329164;REFB=-0.0383942;REVB=0.026215;RO=52;SAF=37;SAR=16;SRF=42;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123542;STB=0.570894;TYPE=snp;VARB=0.0315406;OID=.;OPOS=89807233;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:106:52:53:53:53:16:37:42:10:16:37:43:10 chr16 89809319 . T C 41.37 PASS AO=7;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=-0.0177742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.573;QD=10.3435;RBI=0.0229886;REFB=0.0465342;REVB=0.0145792;RO=8;SAF=3;SAR=4;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.387836;STB=0.687096;TYPE=snp;VARB=-0.00461671;OID=.;OPOS=89809319;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:16:16:8:8:7:8:4:3:7:1:4:4:7:1 chr16 89825065 . G A 233.64 PASS AO=50;DP=100;FAO=53;FDP=103;FR=.;FRO=50;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=18;FSRR=32;FWDB=0.00412578;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.2785;QD=9.0735;RBI=0.0369971;REFB=-0.0284631;REVB=0.0367664;RO=50;SAF=28;SAR=22;SRF=18;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179202;STB=0.590083;TYPE=snp;VARB=0.031134;OID=.;OPOS=89825065;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:103:50:50:50:53:22:28:18:32:24:29:18:32 chr16 89828437 . A G 517.84 PASS AO=99;DP=165;FAO=99;FDP=165;FR=.;FRO=66;FSAF=39;FSAR=60;FSRF=31;FSRR=35;FWDB=0.00993516;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=184.798;QD=12.5536;RBI=0.0202375;REFB=-0.0327063;REVB=0.0176309;RO=66;SAF=39;SAR=60;SRF=31;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.057723;STB=0.531303;TYPE=snp;VARB=0.0216644;OID=.;OPOS=89828437;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:165:66:66:99:99:60:39:31:35:60:39:31:35 chr16 89836323 . C T 606.35 PASS AO=65;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.040181;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.544;QD=36.7487;RBI=0.0921724;REFB=-0.0407353;REVB=0.0829532;RO=1;SAF=31;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.013692;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000487136;OID=.;OPOS=89836323;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:66:66:1:0:65:66:34:31:0:1:35:31:0:0 chr16 89839766 . G C 106.11 PASS AO=26;DP=59;FAO=26;FDP=58;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=-0.011054;FXX=0.0169463;HRUN=3;LEN=1;MLLD=210.758;QD=7.31765;RBI=0.01491;REFB=0.00190325;REVB=-0.0100059;RO=30;SAF=9;SAR=17;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0135134;STB=0.517378;TYPE=snp;VARB=-0.00225469;OID=.;OPOS=89839766;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:58:30:32:26:26:17:9:10:20:17:9:12:20 chr16 89845194 . A G 1538.32 PASS AO=176;DP=186;FAO=176;FDP=186;FR=.;FRO=10;FSAF=89;FSAR=87;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0296192;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.277;QD=33.0822;RBI=0.0389218;REFB=-0.0044563;REVB=0.0252509;RO=10;SAF=89;SAR=87;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0198565;STB=0.51045;TYPE=snp;VARB=0.000173002;OID=.;OPOS=89845194;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:186:186:10:10:176:176:87:89:7:3:87:89:7:3 chr16 89849480 . C T 114.84 PASS AO=32;DP=79;FAO=32;FDP=79;FR=.;FRO=47;FSAF=24;FSAR=8;FSRF=44;FSRR=3;FWDB=0.00817314;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.1408;QD=5.81465;RBI=0.0192749;REFB=-0.0127873;REVB=-0.0174563;RO=46;SAF=24;SAR=8;SRF=43;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.308298;STB=0.673186;TYPE=snp;VARB=0.0172494;OID=.;OPOS=89849480;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:46:47:32:32:8:24:43:3:8:24:44:3 chr16 89857935 . G A 168.72 PASS AO=35;DP=65;FAO=35;FDP=65;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=29;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=0.0204148;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.0082;QD=10.3825;RBI=0.0296347;REFB=-0.00189853;REVB=-0.0214814;RO=29;SAF=6;SAR=29;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243171;STB=0.631158;TYPE=snp;VARB=0.00084955;OID=.;OPOS=89857935;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:29:30:35:35:29:6:11:18:29:6:11:19 chr16 89858417 . C A 101.37 PASS AO=27;DP=67;FAO=28;FDP=70;FR=.;FRO=42;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=30;FWDB=-0.00746787;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.649;QD=5.79269;RBI=0.00902452;REFB=-0.0130648;REVB=0.00506684;RO=40;SAF=15;SAR=12;SRF=12;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.263328;STB=0.647492;TYPE=snp;VARB=0.014638;OID=.;OPOS=89858417;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:70:40:42:27:28:12:15:12:28:13:15:12:30 chr16 89866043 . T C 1054.77 PASS AO=111;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0179908;FXX=0.0176975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.5031;QD=38.0099;RBI=0.0613329;REFB=0;REVB=0.058635;RO=0;SAF=51;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.42743e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.71979e-06;OID=.;OPOS=89866043;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:111:111:0:0:111:111:60:51:0:0:60:51:0:0 chr16 89920957 . A G 62.59 PASS AO=13;DP=26;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.0645422;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.3398;QD=9.62921;RBI=0.112835;REFB=0.00549105;REVB=-0.0925528;RO=11;SAF=8;SAR=5;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131312;STB=0.615207;TYPE=snp;VARB=-0.0149691;OID=.;OPOS=89920957;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:26:26:11:13:13:13:5:8:5:6:5:8:5:8 chr16 89954138 . G C 178.39 PASS AO=45;DP=105;FAO=47;FDP=107;FR=.;FRO=60;FSAF=37;FSAR=10;FSRF=44;FSRR=16;FWDB=0.0321523;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.7516;QD=6.66858;RBI=0.047159;REFB=-0.0214869;REVB=-0.0344993;RO=59;SAF=35;SAR=10;SRF=43;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0682042;STB=0.54287;TYPE=snp;VARB=0.0276957;OID=.;OPOS=89954138;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:107:59:60:45:47:10:35:43:16:10:37:44:16 chr16 89958614 . C T 32.62 PASS AO=14;DP=53;FAO=14;FDP=53;FR=.;FRO=39;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=0.0165581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.9313;QD=2.46214;RBI=0.027668;REFB=-0.00656225;REVB=0.0221664;RO=38;SAF=2;SAR=12;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.525146;STB=0.820931;TYPE=snp;VARB=0.0499033;OID=.;OPOS=89958614;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:53:53:38:39:14:14:12:2:21:17:12:2:21:18 chr16 89965055 . G A 106.9 PASS AO=22;DP=42;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.0142911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.253;QD=10.1806;RBI=0.0171222;REFB=0.0144698;REVB=-0.0094306;RO=20;SAF=12;SAR=10;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0469145;STB=0.526292;TYPE=snp;VARB=-0.00813824;OID=.;OPOS=89965055;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:42:42:20:20:22:22:10:12:12:8:10:12:12:8 chr16 89985940 . G A 165.68 PASS AO=35;DP=66;FAO=35;FDP=66;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=28;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=-0.0235042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.836;QD=10.0411;RBI=0.0280187;REFB=-0.0312192;REVB=0.0152511;RO=31;SAF=7;SAR=28;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178799;STB=0.599938;TYPE=snp;VARB=0.0344871;OID=.;OPOS=89985940;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:31:31:35:35:28:7:11:20:28:7:11:20 chr16 89986608 . A G 192.71 PASS AO=59;DP=156;FAO=61;FDP=159;FR=.;FRO=98;FSAF=34;FSAR=27;FSRF=50;FSRR=48;FWDB=0.0175991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.941;QD=4.84796;RBI=0.0196395;REFB=-0.0062093;REVB=-0.00871678;RO=96;SAF=34;SAR=25;SRF=50;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0613396;STB=0.529256;TYPE=snp;VARB=0.0103293;OID=.;OPOS=89986608;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:159:96:98:59:61:25:34:50:46:27:34:50:48 chr16 89986760 . A G 552.24 PASS AO=117;DP=216;FAO=118;FDP=217;FR=.;FRO=99;FSAF=50;FSAR=68;FSRF=44;FSRR=55;FWDB=0.00456518;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.3504;QD=10.1795;RBI=0.0492924;REFB=0.00521837;REVB=-0.0490805;RO=98;SAF=50;SAR=67;SRF=44;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.018413;STB=0.509646;TYPE=snp;VARB=-0.00490918;OID=.;OPOS=89986760;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:216:217:98:99:117:118:67:50:44:54:68:50:44:55 chr16 89987201 . A G 108.26 PASS AO=31;DP=79;FAO=31;FDP=78;FR=.;FRO=47;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=-0.0161212;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.881;QD=5.55181;RBI=0.0344106;REFB=-0.000510702;REVB=0.0304005;RO=47;SAF=15;SAR=16;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.084611;STB=0.548142;TYPE=snp;VARB=0.00138075;OID=.;OPOS=89987201;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:78:47:47:31:31:16:15:19:28:16:15:19:28 chr16 90025640 . G C 176.61 PASS AO=43;DP=92;FAO=43;FDP=92;FR=.;FRO=49;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=-0.01097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.318;QD=7.67858;RBI=0.0264629;REFB=-0.0183261;REVB=0.0240821;RO=49;SAF=17;SAR=26;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0921325;STB=0.55145;TYPE=snp;VARB=0.0245299;OID=.;OPOS=90025640;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:49:49:43:43:26:17:24:25:26:17:24:25 chr16 90030355 . T C 12.53 PASS AO=3;DP=12;FAO=3;FDP=12;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=9;FSRR=0;FWDB=-0.0221658;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.7253;QD=4.17573;RBI=0.0221658;REFB=-0.00645997;REVB=0;RO=9;SAF=3;SAR=0;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00456282;OID=.;OPOS=90030355;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:12:12:9:9:3:3:0:3:9:0:0:3:9:0 chr16 90037828 . G A 251.51 PASS AO=47;DP=78;FAO=47;FDP=78;FR=.;FRO=31;FSAF=31;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=6;FWDB=-0.0365476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.8017;QD=12.8981;RBI=0.0372517;REFB=-0.0332319;REVB=-0.00720841;RO=31;SAF=31;SAR=16;SRF=25;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124744;STB=0.56778;TYPE=snp;VARB=0.0191059;OID=.;OPOS=90037828;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:31:31:47:47:16:31:25:6:16:31:25:6 chr16 90038369 . A G 89.47 PASS AO=32;DP=95;FAO=32;FDP=95;FR=.;FRO=63;FSAF=6;FSAR=26;FSRF=28;FSRR=35;FWDB=0.0541513;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.4231;QD=3.76718;RBI=0.058497;REFB=-0.00953495;REVB=0.0221256;RO=63;SAF=6;SAR=26;SRF=28;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.351436;STB=0.707055;TYPE=snp;VARB=0.0111054;OID=.;OPOS=90038369;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:95:95:63:63:32:32:26:6:28:35:26:6:28:35 chr16 90038647 . A G 119.72 PASS AO=35;DP=89;FAO=35;FDP=90;FR=.;FRO=55;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=29;FWDB=0.000797191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.555;QD=5.32071;RBI=0.00351151;REFB=-0.0152188;REVB=0.00341982;RO=52;SAF=20;SAR=15;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0958193;STB=0.560475;TYPE=snp;VARB=0.0309137;OID=.;OPOS=90038647;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:90:52:55:35:35:15:20:25:27:15:20:26:29 chr16 90038786 . C A 856.02 PASS AO=90;DP=91;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0810198;FXX=0.0109878;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.622;QD=38.0453;RBI=0.0824599;REFB=0;REVB=0.0153438;RO=0;SAF=25;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000120918;OID=.;OPOS=90038786;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:91:90:0:0:90:90:65:25:0:0:65:25:0:0 chr16 90048327 . G A 383.6 PASS AO=104;DP=235;FAO=104;FDP=235;FR=.;FRO=131;FSAF=38;FSAR=66;FSRF=54;FSRR=77;FWDB=-0.0462672;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.476;QD=6.52941;RBI=0.0462744;REFB=-0.00828894;REVB=0.000816594;RO=122;SAF=38;SAR=66;SRF=54;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0791972;STB=0.527719;TYPE=snp;VARB=0.0124974;OID=.;OPOS=90048327;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:235:235:122:131:104:104:66:38:54:68:66:38:54:77 chr16 90075226 . C T 269.19 PASS AO=65;DP=135;FAO=65;FDP=135;FR=.;FRO=70;FSAF=35;FSAR=30;FSRF=28;FSRR=42;FWDB=0.00604543;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.033;QD=7.9761;RBI=0.0061316;REFB=-0.0280839;REVB=0.00102435;RO=69;SAF=35;SAR=30;SRF=28;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123034;STB=0.571407;TYPE=snp;VARB=0.0291568;OID=.;OPOS=90075226;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:69:70:65:65:30:35:28:41:30:35:28:42 chr16 90095561 . C T 41.43 PASS AO=10;DP=42;FAO=14;FDP=39;FR=.,HEALED;FRO=25;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=-0.010594;FXX=0.0487686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.7;QD=4.24906;RBI=0.0209122;REFB=-0.0196636;REVB=0.0180302;RO=16;SAF=1;SAR=9;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.483663;STB=0.79536;TYPE=snp;VARB=0.0740966;OID=.;OPOS=90095561;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:42:39:16:25:10:14:9:1:7:9:13:1:8:17 chr16 90095949 . C T 79.49 PASS AO=22;DP=55;FAO=22;FDP=55;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=0.0203041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.377;QD=5.78131;RBI=0.0465613;REFB=-0.0419707;REVB=-0.041901;RO=33;SAF=16;SAR=6;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179153;STB=0.603674;TYPE=snp;VARB=0.0447872;OID=.;OPOS=90095949;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:55:55:33:33:22:22:6:16:19:14:6:16:19:14 chr16 90096003 . C G 204.52 PASS AO=33;DP=50;FAO=33;FDP=49;FR=.;FRO=16;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=-0.0147901;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.9302;QD=16.6951;RBI=0.0177284;REFB=-0.0538753;REVB=0.00977495;RO=15;SAF=19;SAR=14;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0940883;STB=0.559244;TYPE=snp;VARB=0.0238636;OID=.;OPOS=90096003;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:50:49:15:16:33:33:14:19:11:4:14:19:12:4 chr16 90096067 . G A 335.65 PASS AO=65;DP=113;FAO=66;FDP=114;FR=.;FRO=48;FSAF=19;FSAR=47;FSRF=6;FSRR=42;FWDB=0.00279994;FXX=0.0172399;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.041;QD=11.7771;RBI=0.030521;REFB=-7.12748e-05;REVB=0.0303923;RO=45;SAF=19;SAR=46;SRF=6;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155539;STB=0.589996;TYPE=snp;VARB=0.000203266;OID=.;OPOS=90096067;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:114:45:48:65:66:46:19:6:39:47:19:6:42 chr16 90103087 . C T 151.22 PASS AO=41;DP=96;FAO=41;FDP=96;FR=.;FRO=55;FSAF=13;FSAR=28;FSRF=25;FSRR=30;FWDB=-0.00127758;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=215.119;QD=6.30099;RBI=0.00893646;REFB=-0.00481873;REVB=0.00884467;RO=55;SAF=13;SAR=28;SRF=25;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150807;STB=0.585215;TYPE=snp;VARB=0.00895417;OID=.;OPOS=90103087;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:55:55:41:41:28:13:25:30:28:13:25:30 chr16 90103117 . G A 193.52 PASS AO=52;DP=117;FAO=51;FDP=117;FR=.;FRO=66;FSAF=13;FSAR=38;FSRF=28;FSRR=38;FWDB=-0.00126197;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.905;QD=6.61601;RBI=0.0194139;REFB=-0.00301098;REVB=-0.0193728;RO=64;SAF=14;SAR=38;SRF=27;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173338;STB=0.611893;TYPE=snp;VARB=0.0019888;OID=.;OPOS=90103117;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:64:66:52:51:38:14:27:37:38:13:28:38 chr16 90103659 . G A 92.23 PASS AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.00322482;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.323;QD=8.38477;RBI=0.0230953;REFB=-0.0343372;REVB=-0.0228691;RO=22;SAF=16;SAR=5;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142213;STB=0.598829;TYPE=snp;VARB=0.0322334;OID=.;OPOS=90103659;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:44:44:22:23:21:21:5:16:14:8:5:16:14:9 chr16 90106746 . C T 227.24 PASS AO=53;DP=108;FAO=53;FDP=108;FR=.;FRO=55;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=42;FSRR=13;FWDB=-0.00915776;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.8;QD=8.4162;RBI=0.0201577;REFB=-0.0340026;REVB=0.0179574;RO=55;SAF=25;SAR=28;SRF=42;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.266598;STB=0.646622;TYPE=snp;VARB=0.0187456;OID=.;OPOS=90106746;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:55:55:53:53:28:25:42:13:28:25:42:13 chr16 90109711 . A G 12.86 PASS AO=8;DP=44;FAO=8;FDP=44;FR=.;FRO=36;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=-0.0243303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=45.4634;QD=1.16917;RBI=0.0593794;REFB=-0.00275843;REVB=-0.054166;RO=35;SAF=6;SAR=2;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.468161;STB=0.797189;TYPE=snp;VARB=0.00645377;OID=.;OPOS=90109711;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:44:44:35:36:8:8:2:6:12:23:2:6:13:23 chr16 90141355 . A C 953.22 PASS AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112371;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.59;QD=38.5137;RBI=0.0177033;REFB=0;REVB=0.0136797;RO=0;SAF=83;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.3184e-05;OID=.;OPOS=90141355;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:99:99:0:0:99:99:16:83:0:0:16:83:0:0 chr16 90160064 . A G 19.9 PASS AO=4;DP=11;FAO=4;FDP=11;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=0;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=-0.00271872;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=226.296;QD=7.23538;RBI=0.00271872;REFB=-0.0042548;REVB=0;RO=7;SAF=4;SAR=0;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0158131;OID=.;OPOS=90160064;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:11:11:7:7:4:4:0:4:7:0:0:4:7:0 chr16 90161753 . T C 227.64 PASS AO=67;DP=167;FAO=67;FDP=164;FR=.;FRO=97;FSAF=35;FSAR=32;FSRF=59;FSRR=38;FWDB=-0.0429567;FXX=0.0120475;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.0501;QD=5.55223;RBI=0.0486438;REFB=-0.0113967;REVB=-0.0228241;RO=98;SAF=35;SAR=32;SRF=60;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0957724;STB=0.551103;TYPE=snp;VARB=0.0165683;OID=.;OPOS=90161753;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:164:98:97:67:67:32:35:60:38:32:35:59:38 chr17 6115 . G C 627.7 PASS AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0442166;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=202.517;QD=38.0426;RBI=0.0498737;REFB=0;REVB=0.023071;RO=0;SAF=26;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000153582;OID=.;OPOS=6115;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:66:66:0:0:66:66:40:26:0:0:40:26:0:0 chr17 6157 . A G 480.97 PASS AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0101758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.902;QD=37.7234;RBI=0.014546;REFB=0;REVB=-0.0103941;RO=0;SAF=13;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.20585e-05;OID=.;OPOS=6157;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:51:51:0:0:51:51:38:13:0:0:38:13:0:0 chr17 181474 . T C 2122.16 PASS AO=222;DP=222;FAO=222;FDP=222;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=129;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0286609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.462;QD=38.2371;RBI=0.0291419;REFB=0;REVB=-0.00527294;RO=0;SAF=93;SAR=129;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.93562e-05;OID=.;OPOS=181474;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:222:222:0:0:222:222:129:93:0:0:129:93:0:0 chr17 181479 . C A 2086.89 PASS AO=227;DP=232;FAO=227;FDP=232;FR=.;FRO=5;FSAF=100;FSAR=127;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0194679;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.275;QD=35.9809;RBI=0.0231939;REFB=-0.0896903;REVB=0.0126078;RO=4;SAF=100;SAR=127;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0019894;STB=0.503483;TYPE=snp;VARB=0.000251039;OID=.;OPOS=181479;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:232:232:4:5:227:227:127:100:2:2:127:100:3:2 chr17 182990 . A C 33.52 PASS AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0586686;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.7707;QD=19.1531;RBI=0.102428;REFB=-0.0100483;REVB=-0.0839609;RO=2;SAF=4;SAR=1;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.413629;STB=0.748924;TYPE=snp;VARB=-0.01089;OID=.;OPOS=182990;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:7:7:2:2:5:5:1:4:0:2:1:4:0:2 chr17 505139 . G A 565.42 PASS AO=141;DP=287;FAO=141;FDP=298;FR=.;FRO=157;FSAF=54;FSAR=87;FSRF=47;FSRR=110;FWDB=0.0407113;FXX=0.0569602;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.3131;QD=7.58951;RBI=0.0420156;REFB=0.0096787;REVB=-0.0103875;RO=144;SAF=54;SAR=87;SRF=46;SRR=98;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0629931;STB=0.547638;TYPE=snp;VARB=-0.00881085;OID=.;OPOS=505139;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:287:298:144:157:141:141:87:54:46:98:87:54:47:110 chr17 617869 . G A 72.49 PASS AO=15;DP=27;FAO=14;FDP=26;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.062344;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.7816;QD=11.153;RBI=0.09635;REFB=-0.0591137;REVB=0.0734612;RO=12;SAF=4;SAR=11;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0168769;STB=0.523775;TYPE=snp;VARB=0.02379;OID=.;OPOS=617869;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:27:26:12:12:15:14:11:4:3:9:11:3:3:9 chr17 636320 . T TCTC 22.3 PASS AO=4;DP=9;FAO=4;FDP=9;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0327821;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=200.71;QD=9.91249;RBI=0.0337782;REFB=-0.0187763;REVB=0.00814251;RO=5;SAF=2;SAR=2;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0874326;STB=0.555281;TYPE=ins;VARB=0.0278806;OID=.;OPOS=636321;OREF=-;OALT=CTC;OMAPALT=TCTC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:4:9:4:9:5:2:2:3:2:21:5:2:2:3:2 chr17 648186 . G A 236.29 PASS AO=54;DP=107;FAO=54;FDP=108;FR=.;FRO=54;FSAF=35;FSAR=19;FSRF=33;FSRR=21;FWDB=-0.0160464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.761;QD=8.75128;RBI=0.0328892;REFB=-0.0248772;REVB=0.0287091;RO=52;SAF=35;SAR=19;SRF=33;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0131192;STB=0.520052;TYPE=snp;VARB=0.0224242;OID=.;OPOS=648186;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:108:52:54:54:54:19:35:33:19:19:35:33:21 chr17 648498 . C T 194.03 PASS AO=41;DP=77;FAO=41;FDP=77;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=0.0291593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.415;QD=10.0793;RBI=0.043868;REFB=0.00337488;REVB=0.0327741;RO=36;SAF=15;SAR=26;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208623;STB=0.511528;TYPE=snp;VARB=-0.00173604;OID=.;OPOS=648498;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:36:36:41:41:26:15:14:22:26:15:14:22 chr17 648713 . AGGGC AGGC,AGG 75.36 PASS AO=6,6;DP=24;FAO=18,0;FDP=20;FR=.;FRO=2;FSAF=10,0;FSAR=8,0;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.232421,-0.186253;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,2;MLLD=12.7115,12.0778;QD=15.0715;RBI=0.368259,0.212337;REFB=-0.0139981,0.0798022;REVB=0.285649,0.101965;RO=5;SAF=1,6;SAR=5,0;SRF=1;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0.348568,0.348568;SSSB=-0.0435573,0.795839;STB=0.555494,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.0512015,0;OID=.,.;OPOS=648714,648716;OREF=G,GC;OALT=-,-;OMAPALT=AGGC,AGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:6,6:18:18,0:20:2:10,0:8,0:0:2:4:5:1,6:5,0:1:4 chr17 649067 . A G 247.69 PASS AO=52;DP=96;FAO=52;FDP=96;FR=.;FRO=44;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=29;FSRR=15;FWDB=-0.00152364;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.0523;QD=10.3202;RBI=0.00198819;REFB=-0.0381833;REVB=0.00127727;RO=44;SAF=29;SAR=23;SRF=29;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0867742;STB=0.547601;TYPE=snp;VARB=0.0232135;OID=.;OPOS=649067;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:44:44:52:52:23:29:29:15:23:29:29:15 chr17 649547 . G C 256.18 PASS AO=41;DP=85;FAO=50;FDP=80;FR=.,HEALED;FRO=30;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.196213;FXX=0.0123442;HRUN=3;LEN=1;MLLD=36.9805;QD=12.8088;RBI=0.24931;REFB=-0.0241403;REVB=0.153805;RO=23;SAF=22;SAR=19;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123926;STB=0.512495;TYPE=snp;VARB=0.0153465;OID=.;OPOS=649547;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:23:30:41:50:19:22:8:15:25:25:14:16 chr17 649935 . G C 35.56 PASS AO=9;DP=24;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=-0.0429278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.247;QD=5.92745;RBI=0.0493736;REFB=-0.0327169;REVB=-0.0243916;RO=15;SAF=4;SAR=5;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.295642;STB=0.675319;TYPE=snp;VARB=0.0394414;OID=.;OPOS=649935;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:24:24:15:15:9:9:5:4:11:4:5:4:11:4 chr17 650518 . G A 70.7 PASS AO=17;DP=42;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.000962306;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.584;QD=6.73368;RBI=0.01312;REFB=-0.00602267;REVB=-0.0130847;RO=23;SAF=10;SAR=7;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0211591;STB=0.516111;TYPE=snp;VARB=0.0141304;OID=.;OPOS=650518;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:42:42:23:24:17:18:7:10:14:9:8:10:14:10 chr17 908502 . A G 158.46 PASS AO=39;DP=90;FAO=42;FDP=94;FR=.;FRO=52;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=-0.00369178;FXX=0.0105252;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.0679;QD=6.74293;RBI=0.0293163;REFB=-0.0111248;REVB=-0.0290829;RO=51;SAF=12;SAR=27;SRF=24;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176883;STB=0.586424;TYPE=snp;VARB=0.0139278;OID=.;OPOS=908502;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:94:51:52:39:42:27:12:24:27:28:14:25:27 chr17 908529 . A G 121.21 PASS AO=29;DP=70;FAO=32;FDP=72;FR=.;FRO=40;FSAF=8;FSAR=24;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=-0.0286056;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.9502;QD=6.73363;RBI=0.0294007;REFB=-0.0249304;REVB=0.00679162;RO=40;SAF=6;SAR=23;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247204;STB=0.599933;TYPE=snp;VARB=0.0447837;OID=.;OPOS=908529;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:72:40:40:29:32:23:6:16:24:24:8:16:24 chr17 925764 . A G 88.76 PASS AO=23;DP=57;FAO=24;FDP=59;FR=.;FRO=35;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.0421946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.827;QD=6.01751;RBI=0.0441908;REFB=0.00452085;REVB=-0.0131317;RO=34;SAF=5;SAR=18;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.245984;STB=0.623652;TYPE=snp;VARB=-0.00430373;OID=.;OPOS=925764;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:57:59:34:35:23:24:18:5:14:20:18:6:15:20 chr17 970413 . C T 272.32 PASS AO=27;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00915465;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.87;QD=38.9034;RBI=0.0273385;REFB=0;REVB=0.0257602;RO=0;SAF=6;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000541427;OID=.;OPOS=970413;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:28:28:0:0:27:28:21:6:0:0:22:6:0:0 chr17 1174750 . TG T 82.74 PASS AO=8;DP=18;FAO=15;FDP=16;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.263973;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=12.6695;QD=20.6862;RBI=0.275446;REFB=-0.0807057;REVB=-0.0786671;RO=2;SAF=3;SAR=5;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218484;STB=0.53841;TYPE=del;VARB=0.0334397;OID=.;OPOS=1174751;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:8:14:15:16:1:6:9:1:0:5:2:3:5:2:0 chr17 1183354 . T C 456.96 PASS AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0450594;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6504;QD=35.8399;RBI=0.0871617;REFB=0.0376057;REVB=-0.074611;RO=1;SAF=41;SAR=9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0113466;STB=0.506022;TYPE=snp;VARB=-0.0110651;OID=.;OPOS=1183354;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:51:51:1:1:50:50:9:41:1:0:9:41:1:0 chr17 1183464 . A G 877.47 PASS AO=90;DP=90;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.043122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.29;QD=37.7406;RBI=0.0431346;REFB=0;REVB=-0.00103973;RO=0;SAF=46;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.15792e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.37727e-05;OID=.;OPOS=1183464;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:90:93:0:0:90:93:44:46:0:0:47:46:0:0 chr17 1209700 . A G 24.72 PASS AO=11;DP=41;FAO=11;FDP=41;FR=.;FRO=30;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.0427108;FXX=0;HRUN=13;LEN=1;MLLD=121.976;QD=2.41166;RBI=0.0469427;REFB=0.0114167;REVB=0.0194783;RO=29;SAF=4;SAR=7;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220447;STB=0.647311;TYPE=snp;VARB=-0.0250819;OID=.;OPOS=1209700;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:41:41:29:30:11:11:7:4:16:13:7:4:17:13 chr17 1209747 . A G 58.95 PASS AO=19;DP=55;FAO=19;FDP=55;FR=.;FRO=36;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.0127459;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.677;QD=4.28703;RBI=0.0223983;REFB=-0.00416097;REVB=0.018418;RO=34;SAF=7;SAR=12;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115884;STB=0.570222;TYPE=snp;VARB=0.00944329;OID=.;OPOS=1209747;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:55:55:34:36:19:19:12:7:16:18:12:7:17:19 chr17 1209772 . G A 96.11 PASS AO=26;DP=63;FAO=26;FDP=63;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=0.00697817;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.829;QD=6.10245;RBI=0.0107495;REFB=-0.00569061;REVB=-0.00817656;RO=37;SAF=15;SAR=11;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121182;STB=0.569102;TYPE=snp;VARB=0.00615671;OID=.;OPOS=1209772;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:63:63:37:37:26:26:11:15:17:20:11:15:17:20 chr17 1359363 . T G 101.41 PASS AO=8;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0188424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.328;QD=36.8749;RBI=0.0478837;REFB=0;REVB=-0.0440206;RO=0;SAF=0;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000739337;OID=.;OPOS=1359363;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:8:11:8:0:0:0:9:2:0:0 chr17 1359364 . C G 13.45 PASS AO=3;DP=11;FAO=3;FDP=11;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0.0172763;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=91.9815;QD=4.89232;RBI=0.0382151;REFB=-0.0539425;REVB=-0.034087;RO=8;SAF=2;SAR=1;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.667828;STB=0.89868;TYPE=snp;VARB=0.0135424;OID=.;OPOS=1359364;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:11:11:8:8:3:3:1:2:0:8:1:2:0:8 chr17 1367555 . AG A 234.12 PASS AO=26;DP=36;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.294779;FXX=0.0789266;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.9982;QD=26.7567;RBI=0.298166;REFB=0;REVB=0.0448173;RO=2;SAF=4;SAR=22;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0.248538;SSSB=-0.183856;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0166544;OID=.;OPOS=1367556;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:26:30:35:35:0:11:24:0:0:22:2:4:22:2:0 chr17 1371123 . T C 306.43 PASS AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00303852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2957;QD=35.0203;RBI=0.109452;REFB=-0.0777019;REVB=0.10941;RO=0;SAF=20;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.48532e-08;STB=0.517231;TYPE=snp;VARB=0.00279574;OID=.;OPOS=1371123;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:35:35:0:1:34:34:14:20:0:0:14:20:0:1 chr17 1373518 . T C 392.25 PASS AO=38;DP=38;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0364749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.92;QD=37.3573;RBI=0.0504959;REFB=0;REVB=0.0349202;RO=0;SAF=14;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76123e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000247384;OID=.;OPOS=1373518;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:38:42:0:0:38:42:24:14:0:0:26:16:0:0 chr17 1373612 . C T 77.86 PASS AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.119277;FXX=0.110988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.717;QD=38.9291;RBI=0.12559;REFB=0;REVB=0.0393179;RO=0;SAF=7;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.78849e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00298204;OID=.;OPOS=1373612;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:8:0:0:8:8:1:7:0:0:1:7:0:0 chr17 1384066 . A G 538.73 PASS AO=54;DP=63;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00947927;FXX=0.119385;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.917;QD=36.5241;RBI=0.0186208;REFB=-0.0714813;REVB=-0.0160274;RO=0;SAF=32;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.64875e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00228705;OID=.;OPOS=1384066;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:63:59:0:0:54:59:22:32:0:0:26:33:0:0 chr17 1422841 . GA G 30.65 PASS AO=46;DP=154;FAO=46;FDP=144;FR=.;FRO=98;FSAF=35;FSAR=11;FSRF=50;FSRR=48;FWDB=-0.0754252;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.9491;QD=0.851279;RBI=0.0886129;REFB=-0.0950043;REVB=0.0465111;RO=93;SAF=37;SAR=9;SRF=46;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0.315789;SSSB=0.40199;STB=0.688246;TYPE=del;VARB=0.104018;OID=.;OPOS=1422842;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:46:142:46:144:98:35:11:50:48:30:93:37:9:46:47 chr17 1424948 . A G 1130.79 PASS AO=154;DP=183;FAO=151;FDP=180;FR=.;FRO=29;FSAF=70;FSAR=81;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.00431791;FXX=0.0163925;HRUN=7;LEN=1;MLLD=217.901;QD=25.1286;RBI=0.0180283;REFB=0.00466047;REVB=-0.0175035;RO=29;SAF=73;SAR=81;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0232787;STB=0.514246;TYPE=snp;VARB=-0.000450174;OID=.;OPOS=1424948;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:183:180:29:29:154:151:81:73:16:13:81:70:16:13 chr17 1489088 . C G 549.84 PASS AO=57;DP=59;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0631196;FXX=0.0338926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.057;QD=38.5856;RBI=0.0646122;REFB=0;REVB=0.0138078;RO=0;SAF=32;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000195518;OID=.;OPOS=1489088;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:59:57:0:0:57:57:25:32:0:0:25:32:0:0 chr17 1494567 . G A 129.07 PASS AO=21;DP=33;FAO=22;FDP=34;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.032921;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.0303;QD=15.1848;RBI=0.0337588;REFB=-0.0237092;REVB=0.00747426;RO=12;SAF=9;SAR=12;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101923;STB=0.545413;TYPE=snp;VARB=0.0149304;OID=.;OPOS=1494567;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:33:34:12:12:21:22:12:9:7:5:12:10:7:5 chr17 1516480 . T C 1543.43 PASS AO=160;DP=160;FAO=160;FDP=160;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.677;QD=38.5857;RBI=0.02976;REFB=0;REVB=0.0235119;RO=0;SAF=95;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.06218e-05;OID=.;OPOS=1516480;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:160:160:0:0:160:160:65:95:0:0:65:95:0:0 chr17 1538546 . C T 807.68 PASS AO=82;DP=84;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0059819;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.946;QD=38.0086;RBI=0.0100183;REFB=0;REVB=-0.00803636;RO=0;SAF=37;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.19906e-06;OID=.;OPOS=1538546;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:84:85:0:0:82:85:45:37:0:0:45:40:0:0 chr17 1538628 . C G 615.67 PASS AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00697716;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.5529;QD=37.8873;RBI=0.0266644;REFB=0;REVB=0.0257354;RO=0;SAF=31;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.90682e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000130595;OID=.;OPOS=1538628;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:65:65:0:0:65:65:34:31:0:0:34:31:0:0 chr17 1542153 . G A 83.14 PASS AO=13;DP=20;FAO=13;FDP=20;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0494791;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.176;QD=16.6288;RBI=0.0540111;REFB=-0.0204479;REVB=0.0216567;RO=6;SAF=4;SAR=9;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0167666;STB=0.509077;TYPE=snp;VARB=0.0265746;OID=.;OPOS=1542153;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:20:20:6:7:13:13:9:4:2:4:9:4:2:5 chr17 1542190 . G A 89.69 PASS AO=14;DP=21;FAO=14;FDP=21;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0631762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.152;QD=17.0835;RBI=0.0631775;REFB=-0.0300109;REVB=-0.000410543;RO=7;SAF=5;SAR=9;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0469771;STB=0.526279;TYPE=snp;VARB=0.00625571;OID=.;OPOS=1542190;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:21:21:7:7:14:14:9:5:2:5:9:5:2:5 chr17 1578939 . C T 202.96 PASS AO=45;DP=91;FAO=47;FDP=93;FR=.;FRO=46;FSAF=41;FSAR=6;FSRF=40;FSRR=6;FWDB=0.0274304;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.9052;QD=8.72963;RBI=0.0483043;REFB=0.0213772;REVB=0.0397603;RO=46;SAF=41;SAR=4;SRF=40;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104615;STB=0.503066;TYPE=snp;VARB=-0.0137374;OID=.;OPOS=1578939;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:93:46:46:45:47:4:41:40:6:6:41:40:6 chr17 1580929 . G C 76.05 PASS AO=15;DP=51;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.0604785;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.4428;QD=6.20835;RBI=0.0605803;REFB=-0.0086147;REVB=-0.00350974;RO=19;SAF=6;SAR=9;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0868987;STB=0.54044;TYPE=snp;VARB=0.0190086;OID=.;OPOS=1580929;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:45:49:19:29:15:20:9:6:6:13:13:7:12:17 chr17 1584324 . A G 544.41 PASS AO=134;DP=281;FAO=134;FDP=279;FR=.;FRO=145;FSAF=72;FSAR=62;FSRF=55;FSRR=90;FWDB=0.0241271;FXX=0.00711718;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.1271;QD=7.80515;RBI=0.0258948;REFB=-0.0095353;REVB=-0.00940341;RO=145;SAF=72;SAR=62;SRF=55;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148406;STB=0.581559;TYPE=snp;VARB=0.0141247;OID=.;OPOS=1584324;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:281:279:145:145:134:134:62:72:55:90:62:72:55:90 chr17 1585130 . A G 305.37 PASS AO=82;DP=185;FAO=82;FDP=185;FR=.;FRO=103;FSAF=40;FSAR=42;FSRF=51;FSRR=52;FWDB=-0.0271719;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.663;QD=6.60259;RBI=0.0272524;REFB=0.00128941;REVB=0.00209201;RO=103;SAF=40;SAR=42;SRF=51;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00735001;STB=0.504088;TYPE=snp;VARB=-0.00171243;OID=.;OPOS=1585130;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:185:103:103:82:82:42:40:51:52:42:40:51:52 chr17 1611250 . AC A 142.27 PASS AO=22;DP=37;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.110263;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=8.96311;QD=17.7832;RBI=0.297029;REFB=-0.028396;REVB=0.275805;RO=5;SAF=14;SAR=8;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0.516279;SSSB=0.152532;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0480799;OID=.;OPOS=1611251;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:22:32:32:32:0:19:13:0:0:12:5:14:8:1:4 chr17 1611433 . A G 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0711813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.2;QD=35.0875;RBI=0.0722163;REFB=0;REVB=-0.0121829;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00125257;OID=.;OPOS=1611433;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:4:3:0:0:4:3:0:0 chr17 1613128 . AGC A 20.07 PASS AO=5;DP=16;FAO=5;FDP=16;FR=.;FRO=11;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=11;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=144.886;QD=5.01854;RBI=0.00484417;REFB=0.00687915;REVB=0.00484417;RO=9;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.0227083;OID=.;OPOS=1613129;OREF=GC;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:5:16:5:16:11:0:5:0:11:20:9:0:5:0:9 chr17 1630208 . C T 25.4 PASS AO=12;DP=52;FAO=12;FDP=51;FR=.;FRO=39;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=25;FSRR=14;FWDB=-0.0345593;FXX=0.0192271;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.066;QD=1.99188;RBI=0.034903;REFB=-0.0159883;REVB=0.00488608;RO=39;SAF=7;SAR=5;SRF=25;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0735093;STB=0.546;TYPE=snp;VARB=0.0542571;OID=.;OPOS=1630208;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:52:51:39:39:12:12:5:7:25:14:5:7:25:14 chr17 1630395 . T C 141.87 PASS AO=29;DP=57;FAO=30;FDP=58;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=-0.0160128;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.023;QD=9.784;RBI=0.0161554;REFB=-0.0429976;REVB=0.00214174;RO=28;SAF=8;SAR=21;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0853213;STB=0.553036;TYPE=snp;VARB=0.0387458;OID=.;OPOS=1630395;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:58:28:28:29:30:21:8:10:18:22:8:10:18 chr17 1630584 . A G 191.35 PASS AO=29;DP=42;FAO=30;FDP=42;FR=.;FRO=12;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.0276132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.702;QD=18.2239;RBI=0.0283584;REFB=-0.0138581;REVB=0.00645857;RO=12;SAF=16;SAR=13;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160763;STB=0.580389;TYPE=snp;VARB=0.00417843;OID=.;OPOS=1630584;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:42:42:12:12:29:30:13:16:3:9:14:16:3:9 chr17 1636934 . A G 447.3 PASS AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0396848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.505;QD=38.0677;RBI=0.039685;REFB=0;REVB=-0.000140161;RO=0;SAF=22;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.13065e-05;OID=.;OPOS=1636934;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:47:47:0:0:47:47:25:22:0:0:25:22:0:0 chr17 1637074 . A G 296.78 PASS AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0422269;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.3182;QD=37.097;RBI=0.0726972;REFB=0;REVB=-0.0591758;RO=0;SAF=21;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000182073;OID=.;OPOS=1637074;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:32:32:0:0:32:32:11:21:0:0:11:21:0:0 chr17 1637302 . A G 664.6 PASS AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00739798;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.6503;QD=36.4163;RBI=0.0233414;REFB=-0.0574944;REVB=-0.022138;RO=1;SAF=16;SAR=56;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00837237;STB=0.504424;TYPE=snp;VARB=-7.24681e-05;OID=.;OPOS=1637302;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:73:73:1:1:72:72:56:16:0:1:56:16:0:1 chr17 1639458 . A G 282.72 PASS AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0241956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.5658;QD=36.48;RBI=0.0753677;REFB=0;REVB=-0.0713784;RO=0;SAF=16;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.56309e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000857779;OID=.;OPOS=1639458;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:30:31:0:0:30:31:14:16:0:0:14:17:0:0 chr17 1673276 . C T 549.86 PASS AO=57;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0103493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.4352;QD=37.9216;RBI=0.0405715;REFB=0;REVB=0.0392294;RO=1;SAF=17;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116468;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000363601;OID=.;OPOS=1673276;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:58:58:1:0:57:58:40:17:0:1:41:17:0:0 chr17 1703543 . G C 142.52 PASS AO=37;DP=84;FAO=37;FDP=84;FR=.;FRO=47;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=31;FWDB=0.0108259;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.965;QD=6.78645;RBI=0.0279332;REFB=-0.00662179;REVB=0.02575;RO=47;SAF=16;SAR=21;SRF=16;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0948248;STB=0.553163;TYPE=snp;VARB=0.0067646;OID=.;OPOS=1703543;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:47:47:37:37:21:16:16:31:21:16:16:31 chr17 1703982 . C T 454.39 PASS AO=126;DP=291;FAO=126;FDP=290;FR=.;FRO=164;FSAF=59;FSAR=67;FSRF=69;FSRR=95;FWDB=-0.0203095;FXX=0.00343631;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.869;QD=6.26746;RBI=0.0292401;REFB=-0.00479348;REVB=0.0210358;RO=164;SAF=59;SAR=67;SRF=69;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0487671;STB=0.527072;TYPE=snp;VARB=0.00800601;OID=.;OPOS=1703982;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:291:290:164:164:126:126:67:59:69:95:67:59:69:95 chr17 1731268 . T C 572.15 PASS AO=137;DP=280;FAO=137;FDP=279;FR=.;FRO=142;FSAF=63;FSAR=74;FSRF=48;FSRR=94;FWDB=-0.00271075;FXX=0.0035713;HRUN=2;LEN=1;MLLD=265.523;QD=8.2029;RBI=0.00362983;REFB=-0.0113778;REVB=-0.00241401;RO=142;SAF=63;SAR=74;SRF=48;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115032;STB=0.56303;TYPE=snp;VARB=0.012648;OID=.;OPOS=1731268;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:280:279:142:142:137:137:74:63:48:94:74:63:48:94 chr17 1782957 . C T 287.79 PASS AO=72;DP=157;FAO=72;FDP=154;FR=.;FRO=82;FSAF=67;FSAR=5;FSRF=58;FSRR=24;FWDB=0.0193448;FXX=0.0191071;HRUN=2;LEN=1;MLLD=248.387;QD=7.47517;RBI=0.0313679;REFB=0.00622307;REVB=-0.0246926;RO=79;SAF=67;SAR=5;SRF=58;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.414071;STB=0.756526;TYPE=snp;VARB=-0.00782068;OID=.;OPOS=1782957;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:154:79:82:72:72:5:67:58:21:5:67:58:24 chr17 1795180 . T C 249.3 PASS AO=66;DP=148;FAO=66;FDP=149;FR=.;FRO=83;FSAF=22;FSAR=44;FSRF=30;FSRR=53;FWDB=0.0031984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.626;QD=6.69251;RBI=0.0149347;REFB=-0.00605465;REVB=0.0145882;RO=82;SAF=22;SAR=44;SRF=30;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0358533;STB=0.517408;TYPE=snp;VARB=0.00957386;OID=.;OPOS=1795180;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:149:82:83:66:66:44:22:30:52:44:22:30:53 chr17 1801065 . G C 268.5 PASS AO=78;DP=189;FAO=78;FDP=188;FR=.;FRO=110;FSAF=49;FSAR=29;FSRF=84;FSRR=26;FWDB=-0.0380001;FXX=0.0259054;HRUN=3;LEN=1;MLLD=166.633;QD=5.7128;RBI=0.0387883;REFB=-0.0213603;REVB=-0.00777965;RO=105;SAF=49;SAR=29;SRF=79;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143039;STB=0.588654;TYPE=snp;VARB=0.0346138;OID=.;OPOS=1801065;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:188:105:110:78:78:29:49:79:26:29:49:84:26 chr17 1801137 . G T 390.8 PASS AO=127;DP=311;FAO=121;FDP=306;FR=.;FRO=185;FSAF=63;FSAR=58;FSRF=116;FSRR=69;FWDB=0.00626455;FXX=0.0160767;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.377;QD=5.10847;RBI=0.00654515;REFB=-0.01392;REVB=0.0018959;RO=183;SAF=66;SAR=61;SRF=115;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11591;STB=0.56475;TYPE=snp;VARB=0.0139682;OID=.;OPOS=1801137;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:311:306:183:185:127:121:61:66:115:68:58:63:116:69 chr17 1801138 . A T 414.27 PASS AO=127;DP=312;FAO=126;FDP=311;FR=.;FRO=185;FSAF=66;FSAR=60;FSRF=116;FSRR=69;FWDB=0.00678811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.87;QD=5.32826;RBI=0.0426182;REFB=-0.0480788;REVB=0.0420741;RO=184;SAF=66;SAR=61;SRF=116;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118312;STB=0.561892;TYPE=snp;VARB=0.0169;OID=.;OPOS=1801138;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:312:311:184:185:127:126:61:66:116:68:60:66:116:69 chr17 1838107 . G A 23.06 PASS AO=10;DP=43;FAO=10;FDP=41;FR=.;FRO=31;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=0.0108532;FXX=0.0465008;HRUN=3;LEN=1;MLLD=216.331;QD=2.24996;RBI=0.0180754;REFB=0.00829469;REVB=-0.0144543;RO=29;SAF=1;SAR=9;SRF=8;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.348171;STB=0.766775;TYPE=snp;VARB=-0.0210518;OID=.;OPOS=1838107;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:43:41:29:31:10:10:9:1:8:21:9:1:10:21 chr17 1839906 . A G 10.22 PASS AO=2;DP=9;FAO=2;FDP=9;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=-0.0144988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.827;QD=4.5413;RBI=0.0144988;REFB=-0.00165153;REVB=0;RO=7;SAF=2;SAR=0;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0116343;OID=.;OPOS=1839906;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:7:7:2:2:0:2:7:0:0:2:7:0 chr17 1943880 . C G 183.13 PASS AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0492026;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.418;QD=38.5546;RBI=0.0722481;REFB=0;REVB=0.0529045;RO=0;SAF=9;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33753e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000988939;OID=.;OPOS=1943880;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:19:19:0:0:19:19:10:9:0:0:10:9:0:0 chr17 1943888 . T C 151.05 PASS AO=15;DP=15;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0135179;FXX=0.0587889;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.202;QD=37.7613;RBI=0.0726173;REFB=0;REVB=0.071348;RO=0;SAF=9;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00070613;OID=.;OPOS=1943888;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:16:0:0:15:16:6:9:0:0:8:8:0:0 chr17 2091765 . C T 1574.61 PASS AO=163;DP=164;FAO=164;FDP=164;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.046996;FXX=0.017963;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.414;QD=38.4052;RBI=0.0606701;REFB=0;REVB=0.0383698;RO=0;SAF=69;SAR=94;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.25475e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.57773e-05;OID=.;OPOS=2091765;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:164:164:0:0:163:164:94:69:0:0:94:70:0:0 chr17 2186100 . C T 1493.83 PASS AO=153;DP=154;FAO=156;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.091;QD=38.3034;RBI=0.0256897;REFB=0;REVB=0.0152777;RO=0;SAF=48;SAR=105;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.25065e-05;OID=.;OPOS=2186100;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:154:156:0:0:153:156:105:48:0:0:106:50:0:0 chr17 2203348 . T C 107.82 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0494472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.011;QD=35.9383;RBI=0.0525915;REFB=0;REVB=-0.017912;RO=0;SAF=3;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000908367;OID=.;OPOS=2203348;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:9:3:0:0:9:3:0:0 chr17 2266425 . G C 36.86 PASS AO=3;DP=15;FAO=4;FDP=16;FR=.,HEALED;FRO=8;FSAF=0;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=69.7343;QD=9.21527;RBI=0.0379813;REFB=0.000339629;REVB=-0.0379813;RO=3;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0775537;OID=.;OPOS=2266425;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:14:16:3:8:3:4:3:0:0:3:4:0:0:8 chr17 2287682 . AC A 24.27 PASS AO=9;DP=24;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.217751;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=10.8384;QD=4.22055;RBI=0.271489;REFB=-0.0516897;REVB=0.162145;RO=12;SAF=8;SAR=1;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0.409557;SSSB=0.590305;STB=0.851818;TYPE=del;VARB=0.0768326;OID=.;OPOS=2287683;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:9:23:10:23:13:9:1:5:8:23:12:8:1:4:8 chr17 2289610 . TGA T,TG,TGG 238.82 PASS AO=14,4,5;DP=29;FAO=20,5,1;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=7,0,0;FSAR=13,5,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0722948,-0.182255,-0.233312;FXX=0;HRUN=1,1,1;LEN=2,1,1;MLLD=94.4188,90.6599,78.6101;QD=36.7413;RBI=0.136742,0.231489,0.265039;REFB=0,0,0;REVB=0.116068,0.142725,0.125744;RO=0;SAF=0,0,4;SAR=14,4,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=del,del,snp;VARB=-0.021134,0.0405617,-0.0839836;OID=.,.,.;OPOS=2289611,2289612,2289612;OREF=GA,A,A;OALT=-,-,G;OMAPALT=T,TG,TGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:14,4,5:23:20,5,1:26:0:7,0,0:13,5,1:0:0:16:0:0,0,4:14,4,1:0:0 chr17 2297571 . G A 37.28 PASS AO=10;DP=28;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=3;FWDB=-0.0365174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2672;QD=5.32638;RBI=0.0740635;REFB=-0.0211575;REVB=0.064435;RO=15;SAF=1;SAR=9;SRF=12;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.687184;STB=0.922333;TYPE=snp;VARB=0.0333192;OID=.;OPOS=2297571;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:28:28:15:18:10:10:9:1:12:3:9:1:15:3 chr17 2298615 . T C 15.78 PASS AO=3;DP=7;FAO=3;FDP=7;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0128752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.3578;QD=9.01795;RBI=0.0128752;REFB=0.0105712;REVB=0;RO=4;SAF=3;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0134228;OID=.;OPOS=2298615;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:7:7:4:4:3:3:0:3:4:0:0:3:4:0 chr17 2588722 . TAA T 27.84 PASS AO=18;DP=65;FAO=19;FDP=63;FR=.;FRO=44;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=29;FWDB=0.0056926;FXX=0.0307645;HRUN=2;LEN=2;MLLD=164.587;QD=1.76763;RBI=0.00940329;REFB=-0.0030964;REVB=-0.0074844;RO=43;SAF=5;SAR=13;SRF=15;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0980178;STB=0.519979;TYPE=del;VARB=0.00894143;OID=.;OPOS=2588723;OREF=AA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:18:64:19:63:44:6:13:15:29:27:43:5:13:15:28 chr17 2595964 . G A 16.08 PASS AO=3;DP=6;FAO=3;FDP=6;FR=.;FRO=3;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.0497;QD=10.7194;RBI=0.0351429;REFB=-0.122555;REVB=-0.0351429;RO=3;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0894093;OID=.;OPOS=2595964;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:6:6:3:3:3:3:3:0:0:3:3:0:0:3 chr17 2598247 . GC G 25.02 PASS AO=5;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.0951386;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.8504;QD=5.88648;RBI=0.101304;REFB=-0.0515917;REVB=-0.0348016;RO=6;SAF=5;SAR=0;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.694502;STB=0.592997;TYPE=del;VARB=0.0327436;OID=.;OPOS=2598248;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:5:17:9:17:8:7:2:5:3:20:6:5:0:5:1 chr17 2600186 . G A 474.06 PASS AO=99;DP=182;FAO=99;FDP=179;FR=.;FRO=80;FSAF=29;FSAR=70;FSRF=21;FSRR=59;FWDB=-0.0132467;FXX=0.0164826;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.269;QD=10.5936;RBI=0.0256425;REFB=-0.036055;REVB=0.0219559;RO=80;SAF=29;SAR=70;SRF=21;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0305593;STB=0.516638;TYPE=snp;VARB=0.0204312;OID=.;OPOS=2600186;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:179:80:80:99:99:70:29:21:59:70:29:21:59 chr17 2606715 . G A 487.99 PASS AO=86;DP=135;FAO=87;FDP=134;FR=.;FRO=47;FSAF=41;FSAR=46;FSRF=22;FSRR=25;FWDB=0.00265044;FXX=0.0147048;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.6477;QD=14.5668;RBI=0.0186839;REFB=-0.0196053;REVB=0.018495;RO=47;SAF=40;SAR=46;SRF=22;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00195248;STB=0.501119;TYPE=snp;VARB=0.0105965;OID=.;OPOS=2606715;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:134:47:47:86:87:46:40:22:25:46:41:22:25 chr17 2868935 . T C 735.99 PASS AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0151179;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.164;QD=38.2331;RBI=0.0177309;REFB=0;REVB=0.00926474;RO=0;SAF=38;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5078e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.25555e-05;OID=.;OPOS=2868935;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:77:77:0:0:77:77:39:38:0:0:39:38:0:0 chr17 2883588 . C A 77.49 PASS AO=26;DP=84;FAO=28;FDP=84;FR=.;FRO=56;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=34;FSRR=22;FWDB=0.0175872;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.2512;QD=3.68979;RBI=0.025;REFB=-0.0140987;REVB=0.0177678;RO=56;SAF=16;SAR=10;SRF=34;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0100924;STB=0.524458;TYPE=snp;VARB=0.0242903;OID=.;OPOS=2883588;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:84:84:56:56:26:28:10:16:34:22:12:16:34:22 chr17 2929392 . G A 73.77 PASS AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=0.00812795;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.6;QD=8.94232;RBI=0.00965729;REFB=-0.0195335;REVB=0.00521533;RO=17;SAF=10;SAR=6;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14083;STB=0.579738;TYPE=snp;VARB=0.0263843;OID=.;OPOS=2929392;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:33:33:17:17:16:16:6:10:13:4:6:10:13:4 chr17 2929674 . T C 385.46 PASS AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0101243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.961;QD=37.6057;RBI=0.0372226;REFB=0;REVB=0.0358193;RO=0;SAF=19;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.87111e-05;OID=.;OPOS=2929674;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:41:41:0:0:41:41:22:19:0:0:22:19:0:0 chr17 2930339 . G A 96.45 PASS AO=19;DP=37;FAO=20;FDP=39;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=17;FSRF=3;FSRR=16;FWDB=0.0050886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.819;QD=9.89247;RBI=0.0275368;REFB=-0.0120544;REVB=0.0270625;RO=18;SAF=3;SAR=16;SRF=2;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0810704;STB=0.507455;TYPE=snp;VARB=0.0203198;OID=.;OPOS=2930339;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:37:39:18:19:19:20:16:3:2:16:17:3:3:16 chr17 2938715 . C G 123.47 PASS AO=25;DP=46;FAO=25;FDP=46;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=3;FWDB=0.0298264;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.4856;QD=10.7364;RBI=0.0547121;REFB=-0.0138112;REVB=0.0458672;RO=21;SAF=13;SAR=12;SRF=18;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.283043;STB=0.655973;TYPE=snp;VARB=0.00960847;OID=.;OPOS=2938715;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:46:46:21:21:25:25:12:13:18:3:12:13:18:3 chr17 2940720 . C A 318.85 PASS AO=65;DP=117;FAO=65;FDP=118;FR=.;FRO=53;FSAF=20;FSAR=45;FSRF=18;FSRR=35;FWDB=-0.00499812;FXX=0.0166653;HRUN=4;LEN=1;MLLD=129.641;QD=10.8084;RBI=0.0413408;REFB=-0.00790637;REVB=0.0410376;RO=52;SAF=20;SAR=45;SRF=18;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0360643;STB=0.516611;TYPE=snp;VARB=0.00809565;OID=.;OPOS=2940720;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:118:52:53:65:65:45:20:18:34:45:20:18:35 chr17 2940759 . A G 502.34 PASS AO=108;DP=201;FAO=108;FDP=201;FR=.;FRO=93;FSAF=46;FSAR=62;FSRF=45;FSRR=48;FWDB=-0.0327204;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.081;QD=9.99673;RBI=0.0327526;REFB=-0.0152522;REVB=0.00145321;RO=91;SAF=46;SAR=62;SRF=45;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0581819;STB=0.527186;TYPE=snp;VARB=0.010906;OID=.;OPOS=2940759;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:201:91:93:108:108:62:46:45:46:62:46:45:48 chr17 2966032 . C G 18.58 PASS AO=9;DP=41;FAO=9;FDP=41;FR=.;FRO=32;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=24;FSRR=8;FWDB=-0.0234897;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.1386;QD=1.81237;RBI=0.0459389;REFB=-0.0069249;REVB=0.0394793;RO=32;SAF=4;SAR=5;SRF=24;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.367981;STB=0.728743;TYPE=snp;VARB=0.0282457;OID=.;OPOS=2966032;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:41:41:32:32:9:9:5:4:24:8:5:4:24:8 chr17 2966173 . G C 147.98 PASS AO=64;DP=214;FAO=66;FDP=217;FR=.;FRO=151;FSAF=33;FSAR=33;FSRF=121;FSRR=30;FWDB=0.00325207;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=255.576;QD=2.72775;RBI=0.00462354;REFB=-0.0108656;REVB=-0.00328651;RO=150;SAF=32;SAR=32;SRF=120;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.370327;STB=0.709625;TYPE=snp;VARB=0.0151249;OID=.;OPOS=2966173;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:217:150:151:64:66:32:32:120:30:33:33:121:30 chr17 2966191 . G A 115.89 PASS AO=55;DP=207;FAO=59;FDP=212;FR=.;FRO=153;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=125;FSRR=28;FWDB=0.0171182;FXX=0.00469462;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3784;QD=2.18652;RBI=0.0237542;REFB=-0.0180586;REVB=-0.0164691;RO=151;SAF=29;SAR=26;SRF=123;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.376967;STB=0.706562;TYPE=snp;VARB=0.0651813;OID=.;OPOS=2966191;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:212:151:153:55:59:26:29:123:28:27:32:125:28 chr17 2966273 . G A 292.91 PASS AO=54;DP=90;FAO=54;FDP=90;FR=.;FRO=36;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.00548064;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=149.523;QD=13.0181;RBI=0.00832297;REFB=-0.0417252;REVB=0.00626374;RO=36;SAF=26;SAR=28;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0135929;STB=0.507411;TYPE=snp;VARB=0.017563;OID=.;OPOS=2966273;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:36:36:54:54:28:26:18:18:28:26:18:18 chr17 2966308 . C T 264.38 PASS AO=55;DP=103;FAO=56;FDP=103;FR=.;FRO=47;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=22;FSRR=25;FWDB=-0.0242044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.893;QD=10.2672;RBI=0.0248682;REFB=-0.024279;REVB=-0.00570721;RO=47;SAF=23;SAR=32;SRF=22;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0426443;STB=0.526773;TYPE=snp;VARB=0.0166267;OID=.;OPOS=2966308;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:47:47:55:56:32:23:22:25:33:23:22:25 chr17 3101076 . G C 1590.99 PASS AO=177;DP=187;FAO=177;FDP=184;FR=.;FRO=7;FSAF=63;FSAR=114;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0.0108478;FXX=0.0160419;HRUN=4;LEN=1;MLLD=211.012;QD=34.5866;RBI=0.0219586;REFB=-0.147366;REVB=0.019092;RO=7;SAF=63;SAR=114;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0283314;STB=0.514892;TYPE=snp;VARB=0.000418886;OID=.;OPOS=3101076;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:187:184:7:7:177:177:114:63:0:7:114:63:0:7 chr17 3119008 . T C 1668.22 PASS AO=179;DP=182;FAO=180;FDP=183;FR=.;FRO=3;FSAF=116;FSAR=64;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0303232;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.2956;QD=36.4638;RBI=0.0529039;REFB=0.00426329;REVB=-0.0433511;RO=3;SAF=115;SAR=64;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000826834;STB=0.500398;TYPE=snp;VARB=-0.000577478;OID=.;OPOS=3119008;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:182:183:3:3:179:180:64:115:2:1:64:116:2:1 chr17 3119673 . A G 535.84 PASS AO=146;DP=332;FAO=147;FDP=333;FR=.;FRO=186;FSAF=93;FSAR=54;FSRF=87;FSRR=99;FWDB=0.0122913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.686;QD=6.43655;RBI=0.0228141;REFB=-0.0182433;REVB=-0.01922;RO=184;SAF=93;SAR=53;SRF=86;SRR=98;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174414;STB=0.594125;TYPE=snp;VARB=0.0246476;OID=.;OPOS=3119673;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:332:333:184:186:146:147:53:93:86:98:54:93:87:99 chr17 3119767 . C T 1815.5 PASS AO=180;DP=183;FAO=192;FDP=192;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.03668;FXX=0.00518108;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.8694;QD=37.8229;RBI=0.0391128;REFB=-0.0371734;REVB=0.013579;RO=2;SAF=88;SAR=92;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000232563;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00306408;OID=.;OPOS=3119767;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:183:192:2:0:180:192:92:88:1:1:101:91:0:0 chr17 3143983 . A G 36.61 PASS AO=12;DP=38;FAO=12;FDP=38;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.0110162;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.91;QD=3.85353;RBI=0.0410977;REFB=0.00100135;REVB=0.0395938;RO=26;SAF=8;SAR=4;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152316;STB=0.592434;TYPE=snp;VARB=-0.00230582;OID=.;OPOS=3143983;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:38:38:26:26:12:12:4:8:14:12:4:8:14:12 chr17 3324004 . C T 279.06 PASS AO=25;DP=25;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0417074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.6317;QD=38.4904;RBI=0.0417439;REFB=0;REVB=-0.00174422;RO=0;SAF=13;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94263e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000518663;OID=.;OPOS=3324004;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:25:29:0:0:25:29:12:13:0:0:14:15:0:0 chr17 3336162 . T C 766.84 PASS AO=80;DP=80;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0255395;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.158;QD=37.8688;RBI=0.0340011;REFB=0;REVB=0.0224456;RO=0;SAF=48;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000244565;OID=.;OPOS=3336162;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:80:81:0:0:80:81:32:48:0:0:33:48:0:0 chr17 3336260 . A G 1551.24 PASS AO=150;DP=152;FAO=166;FDP=166;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00848531;FXX=0.00598767;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.349;QD=37.3793;RBI=0.022275;REFB=0;REVB=0.0205955;RO=1;SAF=69;SAR=81;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00684365;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000632946;OID=.;OPOS=3336260;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:152:166:1:0:150:166:81:69:1:0:88:78:0:0 chr17 3337057 . A G 808.33 PASS AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0069356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.937;QD=38.0392;RBI=0.00889983;REFB=0;REVB=0.00557713;RO=0;SAF=67;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.2877e-05;OID=.;OPOS=3337057;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:85:85:0:0:85:85:18:67:0:0:18:67:0:0 chr17 3352309 . T C 1815.13 PASS AO=221;DP=245;FAO=222;FDP=245;FR=.;FRO=23;FSAF=117;FSAR=105;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.0222121;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=85.2896;QD=29.6348;RBI=0.0222125;REFB=-0.183701;REVB=-0.000130941;RO=7;SAF=116;SAR=105;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00272734;STB=0.51276;TYPE=snp;VARB=0.00485546;OID=.;OPOS=3352309;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:245:245:7:23:221:222:105:116:4:3:105:117:9:14 chr17 3397702 . C T 132.81 PASS AO=43;DP=119;FAO=44;FDP=121;FR=.;FRO=77;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=37;FSRR=40;FWDB=-0.00832029;FXX=0.0546832;HRUN=5;LEN=1;MLLD=96.2631;QD=4.39025;RBI=0.0086323;REFB=0.00063754;REVB=0.00229984;RO=74;SAF=16;SAR=27;SRF=34;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100247;STB=0.561389;TYPE=snp;VARB=-0.000754303;OID=.;OPOS=3397702;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:121:74:77:43:44:27:16:34:40:27:17:37:40 chr17 3416555 . C A 702.47 PASS AO=74;DP=74;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00662275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.9449;QD=37.4651;RBI=0.0206923;REFB=0;REVB=0.0196039;RO=0;SAF=25;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000474627;OID=.;OPOS=3416555;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:74:75:0:0:74:75:49:25:0:0:49:26:0:0 chr17 3422032 . G A 1589.63 PASS AO=170;DP=172;FAO=170;FDP=170;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0064983;FXX=0.0116272;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.762;QD=37.403;RBI=0.029157;REFB=-0.098617;REVB=0.0284236;RO=0;SAF=95;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000115079;OID=.;OPOS=3422032;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:172:170:0:0:170:170:75:95:0:0:75:95:0:0 chr17 3422077 . G A 391.22 PASS AO=91;DP=184;FAO=92;FDP=185;FR=.;FRO=93;FSAF=49;FSAR=43;FSRF=63;FSRR=30;FWDB=-0.0527443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.8102;QD=8.45881;RBI=0.0638789;REFB=-0.0152586;REVB=0.0360354;RO=89;SAF=48;SAR=43;SRF=59;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123451;STB=0.573796;TYPE=snp;VARB=0.0118963;OID=.;OPOS=3422077;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:185:89:93:91:92:43:48:59:30:43:49:63:30 chr17 3436080 . C T 230.6 PASS AO=40;DP=62;FAO=40;FDP=62;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=29;FSRF=6;FSRR=16;FWDB=0.0108758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.2675;QD=14.8771;RBI=0.0110859;REFB=-0.0154478;REVB=0.00214828;RO=21;SAF=11;SAR=29;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00845323;STB=0.501012;TYPE=snp;VARB=0.0198207;OID=.;OPOS=3436080;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:62:62:21:22:40:40:29:11:6:15:29:11:6:16 chr17 3445901 . T G 105.17 PASS AO=39;DP=117;FAO=39;FDP=117;FR=.;FRO=78;FSAF=8;FSAR=31;FSRF=13;FSRR=65;FWDB=-0.0405094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.467;QD=3.59549;RBI=0.0411751;REFB=-0.00737207;REVB=0.0073745;RO=77;SAF=8;SAR=31;SRF=12;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.093112;STB=0.541206;TYPE=snp;VARB=0.015535;OID=.;OPOS=3445901;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:77:78:39:39:31:8:12:65:31:8:13:65 chr17 3446885 . T C 707.05 PASS AO=67;DP=67;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0334772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.98;QD=37.7093;RBI=0.0348664;REFB=0;REVB=-0.00974363;RO=0;SAF=9;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.95869e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.53934e-05;OID=.;OPOS=3446885;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:67:75:0:0:67:75:58:9:0:0:63:12:0:0 chr17 3447914 . C T 11.93 PASS AO=9;DP=53;FAO=9;FDP=53;FR=.;FRO=44;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=30;FSRR=14;FWDB=-0.034326;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.6364;QD=0.899999;RBI=0.0369583;REFB=0.0142208;REVB=-0.0136984;RO=44;SAF=4;SAR=5;SRF=30;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.289939;STB=0.690678;TYPE=snp;VARB=-0.0792812;OID=.;OPOS=3447914;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:53:53:44:44:9:9:5:4:30:14:5:4:30:14 chr17 3458072 . T C 503.21 PASS AO=52;DP=52;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.54;QD=37.2751;RBI=0.0108125;REFB=0;REVB=-0.00305172;RO=0;SAF=32;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.00761e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000312928;OID=.;OPOS=3458072;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:52:54:0:0:52:54:20:32:0:0:20:34:0:0 chr17 3480447 . T C 39.8 PASS AO=6;DP=12;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.0314672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.947;QD=12.2458;RBI=0.071374;REFB=0.000169353;REVB=0.0640629;RO=6;SAF=1;SAR=5;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.633322;STB=0.873989;TYPE=snp;VARB=0.00104534;OID=.;OPOS=3480447;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:12:13:6:6:6:7:5:1:6:0:6:1:6:0 chr17 3486702 . G A 356.77 PASS AO=46;DP=112;FAO=68;FDP=111;FR=.,HEALED;FRO=43;FSAF=34;FSAR=34;FSRF=16;FSRR=27;FWDB=0.00177067;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.55;QD=12.8564;RBI=0.00512684;REFB=-0.0180569;REVB=0.00481136;RO=43;SAF=27;SAR=19;SRF=16;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186828;STB=0.549535;TYPE=snp;VARB=0.0108832;OID=.;OPOS=3486702;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:43:43:46:68:19:27:16:27:34:34:16:27 chr17 3486703 . T A 14.16 PASS AO=20;DP=100;FAO=19;FDP=113;FR=.;FRO=94;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=45;FSRR=49;FWDB=0.00570445;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=86.2244;QD=0.50115;RBI=0.0698954;REFB=-0.00877185;REVB=-0.0696623;RO=80;SAF=5;SAR=15;SRF=42;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.35573;STB=0.689447;TYPE=snp;VARB=0.220461;OID=.;OPOS=3486703;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:100:113:80:94:20:19:15:5:42:38:14:5:45:49 chr17 3493200 . C G 217.75 PASS AO=48;DP=93;FAO=48;FDP=93;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=13;FSRR=32;FWDB=0.0218985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.1411;QD=9.36554;RBI=0.0223984;REFB=-0.00336022;REVB=0.00470578;RO=44;SAF=18;SAR=30;SRF=13;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0752275;STB=0.545436;TYPE=snp;VARB=0.00605659;OID=.;OPOS=3493200;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:44:45:48:48:30:18:13:31:30:18:13:32 chr17 3514028 . G C 636.24 PASS AO=66;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00258866;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.3048;QD=37.9843;RBI=0.00337961;REFB=0;REVB=-0.0021727;RO=0;SAF=44;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000121362;OID=.;OPOS=3514028;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:67:67:0:0:66:67:22:44:0:0:22:45:0:0 chr17 3553526 . A G 503.54 PASS AO=59;DP=63;FAO=59;FDP=63;FR=.;FRO=4;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0405523;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.527;QD=31.971;RBI=0.0450023;REFB=-0.0078688;REVB=-0.0195122;RO=4;SAF=32;SAR=27;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0250628;STB=0.513304;TYPE=snp;VARB=0.0037432;OID=.;OPOS=3553526;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:63:63:4:4:59:59:27:32:3:1:27:32:3:1 chr17 3561396 . C T 1080.87 PASS AO=116;DP=118;FAO=116;FDP=118;FR=.;FRO=2;FSAF=50;FSAR=66;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0185558;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.674;QD=36.6397;RBI=0.0211217;REFB=-0.0844003;REVB=0.0100899;RO=2;SAF=50;SAR=66;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0186142;STB=0.509802;TYPE=snp;VARB=0.000465727;OID=.;OPOS=3561396;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:118:118:2:2:116:116:66:50:2:0:66:50:2:0 chr17 3564401 . T G 922.71 PASS AO=106;DP=112;FAO=106;FDP=112;FR=.;FRO=6;FSAF=37;FSAR=69;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.028736;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.772;QD=32.9541;RBI=0.0293329;REFB=-0.0466546;REVB=0.00588772;RO=6;SAF=37;SAR=69;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0350517;STB=0.518508;TYPE=snp;VARB=0.00235962;OID=.;OPOS=3564401;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:112:112:6:6:106:106:69:37:4:2:69:37:4:2 chr17 3568010 . GGA G,GG,GGG 684.03 PASS AO=15,40,16;DP=80;FAO=11,60,5;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=0,10,3;FSAR=11,50,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.092437,0.0214119,-0.0443121;FXX=0.0256377;HRUN=2,1,1;LEN=2,1,1;MLLD=111.863,123.675,109.906;QD=36.0014;RBI=0.0929707,0.0251924,0.0463757;REFB=0,0,0;REVB=-0.00994724,-0.0132735,-0.0136798;RO=0;SAF=0,0,12;SAR=15,40,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,-3.07465e-08;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=del,del,snp;VARB=0.029194,0.0101771,-0.0141206;OID=.,.,.;OPOS=3568011,3568012,3568012;OREF=GA,A,A;OALT=-,-,G;OMAPALT=G,GG,GGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:15,40,16:73:11,60,5:76:0:0,10,3:11,50,2:0:0:8:0:0,0,12:15,40,4:0:0 chr17 3594276 . TG T 46.1 PASS AO=24;DP=74;FAO=29;FDP=73;FR=.;FRO=44;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=27;FWDB=0.0424344;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=14.2009;QD=2.52593;RBI=0.0651182;REFB=-0.0318688;REVB=-0.0493934;RO=39;SAF=7;SAR=17;SRF=14;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0835905;STB=0.504501;TYPE=del;VARB=0.0179696;OID=.;OPOS=3594277;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:24:69:29:73:44:11:18:17:27:46:39:7:17:14:25 chr17 3627473 . C T 86.76 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.121708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.976;QD=38.5593;RBI=0.121788;REFB=0;REVB=0.00442987;RO=0;SAF=2;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00310084;OID=.;OPOS=3627473;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:7:2:0:0:7:2:0:0 chr17 3628362 . T C 711.42 PASS AO=74;DP=74;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0471546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.23;QD=37.9426;RBI=0.0485545;REFB=0;REVB=-0.0115753;RO=0;SAF=23;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000117293;OID=.;OPOS=3628362;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:74:75:0:0:74:75:51:23:0:0:51:24:0:0 chr17 3629698 . A G 2462.88 PASS AO=259;DP=261;FAO=259;FDP=259;FR=.;FRO=0;FSAF=132;FSAR=127;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00600533;FXX=0.0114499;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.422;QD=38.0367;RBI=0.0100215;REFB=-0.0406291;REVB=0.00802287;RO=0;SAF=132;SAR=127;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.02005e-05;OID=.;OPOS=3629698;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:261:259:0:0:259:259:127:132:0:0:127:132:0:0 chr17 3629848 . A G 744.14 PASS AO=80;DP=81;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0242539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.63;QD=36.7479;RBI=0.0257397;REFB=-0.0671086;REVB=-0.00861863;RO=1;SAF=52;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00901911;STB=0.504761;TYPE=snp;VARB=0.000628607;OID=.;OPOS=3629848;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:81:81:1:1:80:80:28:52:1:0:28:52:1:0 chr17 3629859 . C T 593.84 PASS AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0658477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.7447;QD=37.704;RBI=0.0897351;REFB=0;REVB=-0.0609629;RO=0;SAF=49;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76558e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.71103e-05;OID=.;OPOS=3629859;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:63:63:0:0:63:63:14:49:0:0:14:49:0:0 chr17 3631241 . A G 3000.49 PASS AO=317;DP=320;FAO=317;FDP=317;FR=.;FRO=0;FSAF=150;FSAR=167;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0426249;FXX=0.00937471;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.342;QD=37.861;RBI=0.0496618;REFB=-0.0678113;REVB=0.0254836;RO=3;SAF=150;SAR=167;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00944306;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000297887;OID=.;OPOS=3631241;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:320:317:3:0:317:317:167:150:3:0:167:150:0:0 chr17 3631473 . C G 1599.14 PASS AO=168;DP=169;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0245083;FXX=0.00591681;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.878;QD=38.0747;RBI=0.0246429;REFB=-0.0737994;REVB=-0.00257166;RO=0;SAF=61;SAR=107;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.4251e-05;OID=.;OPOS=3631473;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:169:168:0:0:168:168:107:61:0:0:107:61:0:0 chr17 3649214 . G A 916.74 PASS AO=97;DP=98;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00717094;FXX=0.0202;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6915;QD=37.8037;RBI=0.0109085;REFB=-0.0493709;REVB=0.00822027;RO=0;SAF=46;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.28761e-05;OID=.;OPOS=3649214;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:98:97:0:0:97:97:51:46:0:0:51:46:0:0 chr17 3657159 . C T 988.45 PASS AO=105;DP=107;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00638807;FXX=0.0186898;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.699;QD=37.6552;RBI=0.011736;REFB=-0.0112048;REVB=0.0098451;RO=1;SAF=49;SAR=56;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00839944;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.18752e-05;OID=.;OPOS=3657159;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:107:105:1:0:105:105:56:49:0:1:56:49:0:0 chr17 3657175 . T C 982.96 PASS AO=102;DP=104;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00538192;FXX=0.0190458;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.627;QD=38.173;RBI=0.00554528;REFB=0;REVB=-0.00133606;RO=0;SAF=45;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.08171e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.80068e-06;OID=.;OPOS=3657175;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:104:103:0:0:102:103:57:45:0:0:57:46:0:0 chr17 3775847 . CT C,CC 1268.61 PASS AO=51,79;DP=138;FAO=131,0;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=67,0;FSAR=64,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00210962,-0.0179423;FXX=0.036762;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=234.417,221.345;QD=38.7363;RBI=0.105708,0.153149;REFB=0,0;REVB=-0.105687,-0.152095;RO=0;SAF=45,22;SAR=6,57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.14853e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.00019849,0.00186205;OID=.,.;OPOS=3775848,3775848;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:51,79:136:131,0:131:0:67,0:64,0:0:0:59:0:45,22:6,57:0:0 chr17 3775916 . T C 1068.73 PASS AO=109;DP=110;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.035162;FXX=0.0887025;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.3913;QD=37.8312;RBI=0.054048;REFB=0;REVB=0.0410465;RO=0;SAF=58;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00261467;OID=.;OPOS=3775916;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:110:113:0:0:109:113:51:58:0:0:55:58:0:0 chr17 3785562 . GC G 618.26 PASS AO=82;DP=160;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.143832;FXX=0.025208;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.872;QD=21.3194;RBI=0.162986;REFB=0.0220658;REVB=0.0766595;RO=23;SAF=29;SAR=53;SRF=16;SRR=7;SSEN=0.411765;SSEP=0;SSSB=-0.146184;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0163076;OID=.;OPOS=3785563;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:82:110:116:116:0:56:60:0:0:46:23:29:53:16:7 chr17 3787726 . G A 32.12 PASS AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=27;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.00456512;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=104.363;QD=4.75856;RBI=0.0481952;REFB=-0.021209;REVB=0.0479785;RO=16;SAF=3;SAR=6;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117295;STB=0.578767;TYPE=snp;VARB=0.0553349;OID=.;OPOS=3787726;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:25:27:16:18:9:9:6:3:7:9:6:3:8:10 chr17 3818788 . G A 580.87 PASS AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0443824;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.202;QD=38.7244;RBI=0.0445046;REFB=0;REVB=0.00329451;RO=0;SAF=23;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03034e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000110298;OID=.;OPOS=3818788;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:60:60:0:0:60:60:37:23:0:0:37:23:0:0 chr17 3818830 . A G 459.5 PASS AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0101158;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.2115;QD=38.2912;RBI=0.0281544;REFB=0;REVB=-0.0262744;RO=0;SAF=14;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000413323;OID=.;OPOS=3818830;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:48:48:0:0:48:48:34:14:0:0:34:14:0:0 chr17 3819002 . T C 401.89 PASS AO=23;DP=38;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0414499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.67;QD=37.3849;RBI=0.0420041;REFB=0;REVB=-0.00680085;RO=0;SAF=14;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84921e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000239099;OID=.;OPOS=3819002;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:23:43:0:0:23:43:9:14:0:0:25:18:0:0 chr17 3828702 . T C 98.4 PASS AO=20;DP=64;FAO=31;FDP=74;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=0.0670982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.551;QD=5.31868;RBI=0.0689009;REFB=-0.0267482;REVB=0.0156575;RO=43;SAF=2;SAR=18;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.538591;STB=0.527045;TYPE=snp;VARB=0.0509919;OID=.;OPOS=3828702;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:64:74:43:43:20:31:18:2:20:23:18:13:20:23 chr17 3844787 . C G 108.15 PASS AO=21;DP=42;FAO=23;FDP=43;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.0327163;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.883;QD=10.0602;RBI=0.0363222;REFB=-0.0053777;REVB=0.0157779;RO=21;SAF=8;SAR=13;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129307;STB=0.574883;TYPE=snp;VARB=0.00404197;OID=.;OPOS=3844787;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:42:43:21:20:21:23:13:8:11:10:14:9:11:9 chr17 3845927 . A G 38.2 PASS AO=9;DP=16;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=-0.00438656;FXX=0.124922;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.136;QD=10.9131;RBI=0.00438656;REFB=-0.0543142;REVB=0;RO=7;SAF=9;SAR=0;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0296901;OID=.;OPOS=3845927;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:16:14:7:7:9:7:0:9:7:0:0:7:7:0 chr17 3846802 . A G 95.77 PASS AO=13;DP=16;FAO=13;FDP=16;FR=.;FRO=3;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0218042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.154;QD=23.9434;RBI=0.022653;REFB=-0.0377875;REVB=-0.00614276;RO=3;SAF=9;SAR=4;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133306;STB=0.574349;TYPE=snp;VARB=0.022403;OID=.;OPOS=3846802;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:16:16:3:3:13:13:4:9:1:2:4:9:1:2 chr17 3909383 . G C 366.63 PASS AO=77;DP=142;FAO=77;FDP=141;FR=.;FRO=64;FSAF=32;FSAR=45;FSRF=37;FSRR=27;FWDB=-0.00912364;FXX=0.00704176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.485;QD=10.4008;RBI=0.0285941;REFB=-0.000541867;REVB=-0.0270995;RO=64;SAF=32;SAR=45;SRF=37;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135347;STB=0.574024;TYPE=snp;VARB=0.000362605;OID=.;OPOS=3909383;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:141:64:64:77:77:45:32:37:27:45:32:37:27 chr17 3909404 . C A 372.05 PASS AO=77;DP=140;FAO=77;FDP=140;FR=.;FRO=63;FSAF=35;FSAR=42;FSRF=31;FSRR=32;FWDB=0.0291028;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.356;QD=10.63;RBI=0.029438;REFB=-0.0333842;REVB=0.00443002;RO=63;SAF=35;SAR=42;SRF=31;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0310425;STB=0.516967;TYPE=snp;VARB=0.0231269;OID=.;OPOS=3909404;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:63:63:77:77:42:35:31:32:42:35:31:32 chr17 3909564 . G A 311.53 PASS AO=67;DP=125;FAO=67;FDP=125;FR=.;FRO=58;FSAF=42;FSAR=25;FSRF=47;FSRR=11;FWDB=-0.0120985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.743;QD=9.9689;RBI=0.0455975;REFB=-0.0269247;REVB=0.0439631;RO=47;SAF=42;SAR=25;SRF=37;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135178;STB=0.595371;TYPE=snp;VARB=0.0293603;OID=.;OPOS=3909564;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:47:58:67:67:25:42:37:10:25:42:47:11 chr17 3916823 . G A 195.38 PASS AO=46;DP=97;FAO=47;FDP=98;FR=.;FRO=51;FSAF=13;FSAR=34;FSRF=20;FSRR=31;FWDB=-0.00288773;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.125;QD=7.97486;RBI=0.0119829;REFB=-0.0112085;REVB=0.0116297;RO=50;SAF=12;SAR=34;SRF=19;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133578;STB=0.57038;TYPE=snp;VARB=0.0118237;OID=.;OPOS=3916823;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:98:50:51:46:47:34:12:19:31:34:13:20:31 chr17 3947533 . G A 221.65 PASS AO=91;DP=279;FAO=91;FDP=279;FR=.;FRO=188;FSAF=36;FSAR=55;FSRF=75;FSRR=113;FWDB=-0.013924;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.255;QD=3.17776;RBI=0.0149907;REFB=-0.0072923;REVB=0.00555369;RO=187;SAF=36;SAR=55;SRF=75;SRR=112;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00668503;STB=0.502345;TYPE=snp;VARB=0.0152871;OID=.;OPOS=3947533;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:279:279:187:188:91:91:55:36:75:112:55:36:75:113 chr17 3947644 . T C 113.25 PASS AO=58;DP=208;FAO=59;FDP=211;FR=.;FRO=152;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=62;FSRR=90;FWDB=-0.0211724;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=71.0021;QD=2.14698;RBI=0.0239283;REFB=-0.0227737;REVB=-0.0111487;RO=150;SAF=27;SAR=31;SRF=61;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0730261;STB=0.548381;TYPE=snp;VARB=0.0528206;OID=.;OPOS=3947644;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:211:150:152:58:59:31:27:61:89:31:28:62:90 chr17 3953083 . T C 273.77 PASS AO=79;DP=189;FAO=78;FDP=186;FR=.;FRO=108;FSAF=35;FSAR=43;FSRF=58;FSRR=50;FWDB=-0.0160368;FXX=0.0312484;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.427;QD=5.88747;RBI=0.0236584;REFB=-0.0177251;REVB=-0.0173936;RO=107;SAF=35;SAR=44;SRF=58;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101956;STB=0.551269;TYPE=snp;VARB=0.0262988;OID=.;OPOS=3953083;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:186:107:108:79:78:44:35:58:49:43:35:58:50 chr17 3953102 . A G 297.25 PASS AO=55;DP=158;FAO=82;FDP=189;FR=.;FRO=107;FSAF=34;FSAR=48;FSRF=57;FSRR=50;FWDB=-0.000797974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.803;QD=6.29102;RBI=0.0170145;REFB=-0.0387011;REVB=-0.0169958;RO=96;SAF=26;SAR=29;SRF=50;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0536563;STB=0.567256;TYPE=snp;VARB=0.05413;OID=.;OPOS=3953102;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:189:96:107:55:82:29:26:50:46:48:34:57:50 chr17 3966064 . A G 222.5 PASS AO=68;DP=177;FAO=69;FDP=176;FR=.;FRO=107;FSAF=47;FSAR=22;FSRF=68;FSRR=39;FWDB=-0.000774194;FXX=0.0112353;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.286;QD=5.0569;RBI=0.00445433;REFB=-0.0132837;REVB=0.00438654;RO=107;SAF=47;SAR=21;SRF=68;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0683339;STB=0.531212;TYPE=snp;VARB=0.0237737;OID=.;OPOS=3966064;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:176:107:107:68:69:21:47:68:39:22:47:68:39 chr17 3979907 . G A 143.52 PASS AO=33;DP=67;FAO=33;FDP=68;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=-0.0072089;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.296;QD=8.44258;RBI=0.010943;REFB=-0.0249132;REVB=0.00823293;RO=34;SAF=16;SAR=17;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0936748;STB=0.543802;TYPE=snp;VARB=0.0169248;OID=.;OPOS=3979907;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:68:34:35:33:33:17:16:13:21:17:16:14:21 chr17 3979982 . G A 332.2 PASS AO=62;DP=104;FAO=63;FDP=105;FR=.;FRO=42;FSAF=21;FSAR=42;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=-0.0379007;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.707;QD=12.6552;RBI=0.03849;REFB=-0.0239176;REVB=0.00670981;RO=41;SAF=21;SAR=41;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134603;STB=0.581055;TYPE=snp;VARB=0.017623;OID=.;OPOS=3979982;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:105:41:42:62:63:41:21:21:20:42:21:22:20 chr17 4008021 . T C 300.29 PASS AO=82;DP=188;FAO=82;FDP=188;FR=.;FRO=106;FSAF=39;FSAR=43;FSRF=63;FSRR=43;FWDB=-0.000909052;FXX=0.00529073;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.1047;QD=6.38905;RBI=0.0219739;REFB=-0.00627653;REVB=0.0219551;RO=104;SAF=39;SAR=43;SRF=63;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130338;STB=0.566651;TYPE=snp;VARB=0.0099366;OID=.;OPOS=4008021;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:188:104:106:82:82:43:39:63:41:43:39:63:43 chr17 4088291 . C T 378.72 PASS AO=38;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0686323;FXX=0.0249938;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.457;QD=38.8434;RBI=0.0687871;REFB=0;REVB=0.0046118;RO=0;SAF=5;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00030978;OID=.;OPOS=4088291;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:39:39:0:0:38:39:33:5:0:0:34:5:0:0 chr17 4337283 . G A 240.06 PASS AO=40;DP=62;FAO=41;FDP=62;FR=.;FRO=21;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=4;FSRR=17;FWDB=0.0150977;FXX=0.0158705;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.772;QD=15.4878;RBI=0.0271901;REFB=-0.026996;REVB=0.0226133;RO=21;SAF=15;SAR=25;SRF=4;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129324;STB=0.566256;TYPE=snp;VARB=0.0124672;OID=.;OPOS=4337283;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:62:62:21:21:40:41:25:15:4:17:26:15:4:17 chr17 4337412 . C G 254.65 PASS AO=49;DP=88;FAO=50;FDP=88;FR=.;FRO=38;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=0.00556784;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.543;QD=11.5748;RBI=0.016298;REFB=-0.0280658;REVB=0.0153174;RO=36;SAF=22;SAR=27;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0181236;STB=0.503224;TYPE=snp;VARB=0.0214768;OID=.;OPOS=4337412;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:36:38:49:50:27:22:17:19:28:22:17:21 chr17 4350182 . T C 187.11 PASS AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0135969;FXX=0.0475964;HRUN=3;LEN=1;MLLD=204.048;QD=37.4211;RBI=0.0135999;REFB=0;REVB=-0.00028984;RO=0;SAF=14;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5931e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00010049;OID=.;OPOS=4350182;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:21:20:0:0:20:20:6:14:0:0:6:14:0:0 chr17 4352539 . C T 203.42 PASS AO=48;DP=102;FAO=49;FDP=102;FR=.;FRO=53;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=19;FSRR=34;FWDB=0.0356278;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.744;QD=7.9771;RBI=0.0358968;REFB=-0.00870382;REVB=0.00438699;RO=53;SAF=19;SAR=29;SRF=19;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0371802;STB=0.526965;TYPE=snp;VARB=0.0176048;OID=.;OPOS=4352539;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:53:53:48:49:29:19:19:34:29:20:19:34 chr17 4434345 . C T 26.68 PASS AO=7;DP=21;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=-0.0403411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.8353;QD=5.08219;RBI=0.0421819;REFB=-0.0473976;REVB=-0.0123252;RO=14;SAF=5;SAR=2;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.439136;STB=0.76852;TYPE=snp;VARB=0.0482824;OID=.;OPOS=4434345;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:21:21:14:14:7:7:2:5:4:10:2:5:4:10 chr17 4440907 . A G 94.54 PASS AO=22;DP=47;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=-0.00584498;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.7295;QD=8.04597;RBI=0.0677474;REFB=0.00369514;REVB=-0.0674948;RO=25;SAF=9;SAR=13;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.250368;STB=0.641242;TYPE=snp;VARB=-0.0139997;OID=.;OPOS=4440907;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:47:47:25:25:22:22:13:9:17:8:13:9:17:8 chr17 4446457 . G A 47.9 PASS AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=-0.0133093;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.097;QD=11.271;RBI=0.0187593;REFB=-0.00248304;REVB=-0.0132202;RO=8;SAF=4;SAR=5;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.341417;STB=0.695816;TYPE=snp;VARB=0.0014506;OID=.;OPOS=4446457;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:17:17:8:8:9:9:5:4:7:1:5:4:7:1 chr17 4453601 . GC G 300.14 PASS AO=43;DP=60;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.246921;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.5381;QD=21.828;RBI=0.265324;REFB=0;REVB=0.0970917;RO=10;SAF=16;SAR=27;SRF=10;SRR=0;SSEN=0.294118;SSEP=0;SSSB=-0.221496;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0168619;OID=.;OPOS=4453602;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:43:55:55:55:0:28:27:0:0:27:10:16:27:10:0 chr17 4455500 . T C 664.48 PASS AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.110984;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.709;QD=37.9703;RBI=0.111278;REFB=0;REVB=0.00807876;RO=0;SAF=23;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.79556e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000296333;OID=.;OPOS=4455500;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:71:70:0:0:70:70:47:23:0:0:47:23:0:0 chr17 4461748 . G A 57.73 PASS AO=7;DP=19;FAO=10;FDP=14;FR=.;FRO=4;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0169014;FXX=0.0666222;HRUN=4;LEN=1;MLLD=96.2808;QD=16.495;RBI=0.0229819;REFB=-0.0552221;REVB=-0.0155729;RO=2;SAF=4;SAR=3;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174483;STB=0.610916;TYPE=snp;VARB=0.0331979;OID=.;OPOS=4461748;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:9:14:2:4:7:10:3:4:2:0:3:7:4:0 chr17 4495740 . G A 78.34 PASS AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=17;FSAR=2;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=0.0228672;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=198.437;QD=7.28723;RBI=0.048041;REFB=0.00462015;REVB=-0.0422496;RO=22;SAF=17;SAR=2;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.396841;STB=0.720052;TYPE=snp;VARB=-0.0044354;OID=.;OPOS=4495740;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:43:43:22:24:19:19:2:17:14:8:2:17:16:8 chr17 4497160 . T C 430.71 PASS AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0303735;FXX=0.0425441;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.761;QD=38.2857;RBI=0.0329296;REFB=0;REVB=0.0127202;RO=0;SAF=19;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.15971e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000185769;OID=.;OPOS=4497160;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:45:45:0:0:45:45:26:19:0:0:26:19:0:0 chr17 4536241 . T C 270.29 PASS AO=58;DP=110;FAO=58;FDP=110;FR=.;FRO=52;FSAF=17;FSAR=41;FSRF=24;FSRR=28;FWDB=-0.0160755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.386;QD=9.82881;RBI=0.0160769;REFB=0.00676822;REVB=0.000214411;RO=50;SAF=17;SAR=41;SRF=22;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139346;STB=0.588966;TYPE=snp;VARB=-0.00506172;OID=.;OPOS=4536241;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:50:52:58:58:41:17:22:28:41:17:24:28 chr17 4545581 . C T 88.5 PASS AO=26;DP=75;FAO=28;FDP=77;FR=.;FRO=49;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=41;FWDB=0.145426;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.928;QD=4.59721;RBI=0.147303;REFB=-2.30673e-06;REVB=0.0234393;RO=49;SAF=10;SAR=16;SRF=8;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.289721;STB=0.681168;TYPE=snp;VARB=0.000451764;OID=.;OPOS=4545581;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:75:77:49:49:26:28:16:10:8:41:16:12:8:41 chr17 4574751 . TG T,AG 860.92 PASS AO=71,94;DP=235;FAO=69,99;FDP=227;FR=.;FRO=59;FSAF=0,47;FSAR=69,52;FSRF=45;FSRR=14;FWDB=0.131154,0.00456995;FXX=0.038134;HRUN=3,1;LEN=1,1;MLLD=17.2275,127.797;QD=15.1705;RBI=0.166067,0.0162798;REFB=-0.080905,-0.0103487;REVB=-0.101867,0.0156252;RO=53;SAF=0,47;SAR=71,47;SRF=45;SRR=8;SSEN=0.542373,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.896242,-0.234202;STB=0.999812,0.606624;TYPE=del,snp;VARB=0.0707217,0.0307506;OID=.,.;OPOS=4574752,4574751;OREF=G,T;OALT=-,A;OMAPALT=T,AG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:232:227:53:59:71,94:69,99:71,47:0,47:45:8:69,52:0,47:45:14 chr17 4575283 . A G 321.62 PASS AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00450368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.875;QD=36.757;RBI=0.00925581;REFB=0;REVB=0.00808621;RO=0;SAF=24;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.27977e-05;OID=.;OPOS=4575283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:35:35:0:0:35:35:11:24:0:0:11:24:0:0 chr17 4576620 . C T 163.15 PASS AO=29;DP=51;FAO=31;FDP=51;FR=.;FRO=20;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=0.0185194;FXX=0.105245;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.927;QD=12.7961;RBI=0.0342534;REFB=-0.0437734;REVB=0.0288154;RO=18;SAF=20;SAR=9;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0267867;STB=0.504584;TYPE=snp;VARB=0.036693;OID=.;OPOS=4576620;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:51:51:18:20:29:31:9:20:13:5:9:22:14:6 chr17 4620497 . C T 601.49 PASS AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0698255;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.99;QD=37.593;RBI=0.0760735;REFB=0;REVB=0.0301923;RO=0;SAF=42;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00126792;OID=.;OPOS=4620497;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:64:64:0:0:64:64:22:42:0:0:22:42:0:0 chr17 4637886 . G A 236.47 PASS AO=64;DP=152;FAO=66;FDP=154;FR=.;FRO=88;FSAF=40;FSAR=26;FSRF=50;FSRR=38;FWDB=0.00637579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.035;QD=6.14197;RBI=0.00661297;REFB=-0.0100118;REVB=-0.0017552;RO=88;SAF=39;SAR=25;SRF=50;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0441738;STB=0.522442;TYPE=snp;VARB=0.0124909;OID=.;OPOS=4637886;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:154:88:88:64:66:25:39:50:38:26:40:50:38 chr17 4638484 . T C 185.2 PASS AO=39;DP=73;FAO=39;FDP=73;FR=.;FRO=34;FSAF=31;FSAR=8;FSRF=27;FSRR=7;FWDB=0.00038754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.036;QD=10.148;RBI=0.00807495;REFB=-0.00543711;REVB=-0.00806565;RO=33;SAF=31;SAR=8;SRF=26;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00884198;STB=0.500538;TYPE=snp;VARB=0.00431252;OID=.;OPOS=4638484;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:33:34:39:39:8:31:26:7:8:31:27:7 chr17 4638563 . G A 107.11 PASS AO=40;DP=120;FAO=40;FDP=120;FR=.;FRO=80;FSAF=27;FSAR=13;FSRF=50;FSRR=30;FWDB=-0.0114961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.6622;QD=3.57034;RBI=0.0153773;REFB=0.000938103;REVB=-0.0102128;RO=80;SAF=27;SAR=13;SRF=50;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0637977;STB=0.536984;TYPE=snp;VARB=-0.00209468;OID=.;OPOS=4638563;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:80:80:40:40:13:27:50:30:13:27:50:30 chr17 4638737 . A G 103.38 PASS AO=31;DP=81;FAO=31;FDP=81;FR=.;FRO=50;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=33;FSRR=17;FWDB=0.00374828;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.873;QD=5.10495;RBI=0.016167;REFB=-0.00349314;REVB=-0.0157265;RO=49;SAF=12;SAR=19;SRF=32;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.279778;STB=0.664233;TYPE=snp;VARB=0.0149187;OID=.;OPOS=4638737;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:49:50:31:31:19:12:32:17:19:12:33:17 chr17 4641755 . C T 1035.64 PASS AO=115;DP=120;FAO=115;FDP=120;FR=.;FRO=5;FSAF=53;FSAR=62;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.0123108;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=248.309;QD=34.5214;RBI=0.0126764;REFB=-0.0813725;REVB=-0.0030224;RO=5;SAF=53;SAR=62;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0427132;STB=0.522519;TYPE=snp;VARB=0.000235218;OID=.;OPOS=4641755;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:120:120:5:5:115:115:62:53:5:0:62:53:5:0 chr17 4645324 . T C 188.3 PASS AO=44;DP=91;FAO=44;FDP=91;FR=.;FRO=47;FSAF=13;FSAR=31;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=-0.0211266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.586;QD=8.27692;RBI=0.023568;REFB=-0.0392508;REVB=0.0104459;RO=47;SAF=13;SAR=31;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114547;STB=0.563927;TYPE=snp;VARB=0.0240912;OID=.;OPOS=4645324;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:47:47:44:44:31:13:19:28:31:13:19:28 chr17 4684095 . G A 234.26 PASS AO=66;DP=153;FAO=66;FDP=156;FR=.;FRO=90;FSAF=43;FSAR=23;FSRF=76;FSRR=14;FWDB=-0.0133114;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=174.511;QD=6.00662;RBI=0.0305707;REFB=-0.00414638;REVB=0.0275204;RO=87;SAF=43;SAR=23;SRF=74;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.244917;STB=0.632359;TYPE=snp;VARB=0.00597597;OID=.;OPOS=4684095;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:156:87:90:66:66:23:43:74:13:23:43:76:14 chr17 4686414 . A C 451.02 PASS AO=95;DP=176;FAO=96;FDP=177;FR=.;FRO=81;FSAF=44;FSAR=52;FSRF=34;FSRR=47;FWDB=-0.00997792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.957;QD=10.1925;RBI=0.0138504;REFB=-0.0261908;REVB=0.00960595;RO=78;SAF=43;SAR=52;SRF=31;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0462656;STB=0.517828;TYPE=snp;VARB=0.0222361;OID=.;OPOS=4686414;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:177:78:81:95:96:52:43:31:47:52:44:34:47 chr17 4689572 . T C 104.35 PASS AO=21;DP=41;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.00647665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.9676;QD=9.93829;RBI=0.0409171;REFB=-0.0300926;REVB=-0.0404012;RO=20;SAF=6;SAR=15;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0658307;STB=0.517226;TYPE=snp;VARB=0.026825;OID=.;OPOS=4689572;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:41:42:20:20:21:22:15:6:7:13:15:7:7:13 chr17 4693054 . G A 70.75 PASS AO=18;DP=43;FAO=18;FDP=43;FR=.,HEALED;FRO=25;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=24;FWDB=0.021565;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.648;QD=6.58146;RBI=0.0277573;REFB=-0.0234231;REVB=-0.0174762;RO=16;SAF=4;SAR=14;SRF=1;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223438;STB=0.684537;TYPE=snp;VARB=0.0392196;OID=.;OPOS=4693054;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:43:43:16:25:18:18:14:4:1:15:14:4:1:24 chr17 4693170 . T C 101.94 PASS AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0167317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.627;QD=37.0678;RBI=0.0385439;REFB=0;REVB=0.0347229;RO=0;SAF=3;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000384047;OID=.;OPOS=4693170;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:11:11:8:3:0:0:8:3:0:0 chr17 4718776 . G A 1084.27 PASS AO=117;DP=121;FAO=119;FDP=122;FR=.;FRO=3;FSAF=59;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.00326051;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.9203;QD=35.5497;RBI=0.0412704;REFB=-0.0682424;REVB=0.0411414;RO=3;SAF=58;SAR=59;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0235336;STB=0.512193;TYPE=snp;VARB=0.00197285;OID=.;OPOS=4718776;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:121:122:3:3:117:119:59:58:0:3:60:59:0:3 chr17 4722785 . G A 624.87 PASS AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=71;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0397244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.173;QD=35.2038;RBI=0.0656111;REFB=-0.0773474;REVB=0.0522186;RO=0;SAF=38;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.501026;TYPE=snp;VARB=0.00236748;OID=.;OPOS=4722785;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:69:71:0:2:69:69:31:38:0:0:32:37:1:1 chr17 4722876 . G A 184.47 PASS AO=23;DP=26;FAO=23;FDP=26;FR=.;FRO=3;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.00260942;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=142.628;QD=28.3797;RBI=0.025352;REFB=-0.274933;REVB=0.0252173;RO=3;SAF=16;SAR=7;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0072556;STB=0.503934;TYPE=snp;VARB=0.00797697;OID=.;OPOS=4722876;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:26:26:3:3:23:23:7:16:2:1:7:16:2:1 chr17 4796274 . T C 94.19 PASS AO=25;DP=61;FAO=26;FDP=64;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=-0.0925941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.9235;QD=5.88675;RBI=0.0926766;REFB=-0.0410805;REVB=-0.00390906;RO=33;SAF=11;SAR=14;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110292;STB=0.533557;TYPE=snp;VARB=0.0657412;OID=.;OPOS=4796274;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:61:64:33:38:25:26:14:11:11:22:15:11:14:24 chr17 4796286 . C T 57.21 PASS AO=20;DP=62;FAO=20;FDP=62;FR=.;FRO=42;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=30;FWDB=0.0208174;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.057;QD=3.69097;RBI=0.022015;REFB=-0.00428936;REVB=0.00716191;RO=40;SAF=8;SAR=12;SRF=10;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187224;STB=0.583255;TYPE=snp;VARB=0.0102561;OID=.;OPOS=4796286;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:62:62:40:42:20:20:12:8:10:30:12:8:12:30 chr17 4801163 . C A 70.5 PASS AO=11;DP=16;FAO=11;FDP=16;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=180.706;QD=17.6254;RBI=0.00147602;REFB=0.00669988;REVB=0.00147602;RO=5;SAF=0;SAR=11;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0101375;OID=.;OPOS=4801163;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:16:16:5:5:11:11:11:0:0:5:11:0:0:5 chr17 4801286 . C T 216.31 PASS AO=30;DP=38;FAO=30;FDP=38;FR=.;FRO=8;FSAF=0;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=221.092;QD=22.7695;RBI=0.0194205;REFB=0.0106718;REVB=-0.0194205;RO=3;SAF=0;SAR=30;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000322462;OID=.;OPOS=4801286;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:38:38:3:8:30:30:30:0:0:3:30:0:0:8 chr17 4802329 . G A 17.4 PASS AO=4;DP=13;FAO=4;FDP=13;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.000183196;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.372;QD=5.35335;RBI=0.00130539;REFB=-0.0199152;REVB=-0.00129248;RO=9;SAF=3;SAR=1;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0398812;STB=0.526188;TYPE=snp;VARB=0.0423666;OID=.;OPOS=4802329;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:13:13:9:9:4:4:1:3:7:2:1:3:7:2 chr17 4803711 . G A 171.55 PASS AO=41;DP=86;FAO=41;FDP=86;FR=.;FRO=45;FSAF=31;FSAR=10;FSRF=36;FSRR=9;FWDB=0.0663895;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.4963;QD=7.97916;RBI=0.127384;REFB=0.00180767;REVB=0.108715;RO=45;SAF=31;SAR=10;SRF=36;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0579114;STB=0.532153;TYPE=snp;VARB=0.000700719;OID=.;OPOS=4803711;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:45:45:41:41:10:31:36:9:10:31:36:9 chr17 4836381 . C T 192.66 PASS AO=38;DP=77;FAO=44;FDP=89;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=0.0200193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.197;QD=8.65891;RBI=0.0204206;REFB=-0.0125842;REVB=-0.00402825;RO=39;SAF=14;SAR=24;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135309;STB=0.574478;TYPE=snp;VARB=0.0236499;OID=.;OPOS=4836381;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:89:39:45:38:44:24:14:20:19:26:18:25:20 chr17 4856376 . A G 593.72 PASS AO=64;DP=66;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00771541;FXX=0.0151492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.5201;QD=36.5363;RBI=0.0238762;REFB=-0.0489075;REVB=-0.0225952;RO=0;SAF=39;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30166e-08;STB=0.506327;TYPE=snp;VARB=-0.00012421;OID=.;OPOS=4856376;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:66:65:0:1:64:64:25:39:0:0:25:39:1:0 chr17 4856580 . T C 110.12 PASS AO=29;DP=68;FAO=29;FDP=68;FR=.;FRO=39;FSAF=25;FSAR=4;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=-0.0575443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8788;QD=6.4777;RBI=0.0597361;REFB=-0.0114053;REVB=-0.0160331;RO=38;SAF=25;SAR=4;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.438503;STB=0.761378;TYPE=snp;VARB=0.0184981;OID=.;OPOS=4856580;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:38:39:29:29:4:25:20:18:4:25:20:19 chr17 4863410 . A G 580.45 PASS AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00268379;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.9933;QD=38.6966;RBI=0.0689836;REFB=0;REVB=-0.0689313;RO=0;SAF=36;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.9695e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000903256;OID=.;OPOS=4863410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:60:60:0:0:60:60:24:36:0:0:24:36:0:0 chr17 4875566 . T C 40.67 PASS AO=13;DP=40;FAO=13;FDP=40;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=8;FWDB=-0.0711825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.481;QD=4.06688;RBI=0.0712087;REFB=-0.0113527;REVB=-0.00193088;RO=26;SAF=8;SAR=5;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142557;STB=0.564758;TYPE=snp;VARB=0.0217952;OID=.;OPOS=4875566;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:40:40:26:27:13:13:5:8:19:7:5:8:19:8 chr17 4875628 . A G 113.23 PASS AO=15;DP=32;FAO=25;FDP=42;FR=.;FRO=17;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=-0.00227433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.79;QD=10.7839;RBI=0.0483291;REFB=-0.0251624;REVB=0.0482756;RO=17;SAF=14;SAR=1;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.668023;STB=0.59992;TYPE=snp;VARB=0.0335909;OID=.;OPOS=4875628;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:32:42:17:17:15:25:1:14:6:11:10:15:6:11 chr17 4883818 . C G 158.92 PASS AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0199824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=315.851;QD=37.3931;RBI=0.0199824;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=17;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.83994e-05;OID=.;OPOS=4883818;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:17:17:0:0:17:17:0:17:0:0:0:17:0:0 chr17 4924097 . C G 234.03 PASS AO=39;DP=59;FAO=39;FDP=59;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.0231138;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=255.003;QD=15.8667;RBI=0.0237782;REFB=-0.00829589;REVB=0.00558174;RO=20;SAF=14;SAR=25;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0274885;STB=0.514974;TYPE=snp;VARB=0.00455604;OID=.;OPOS=4924097;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:59:59:20:20:39:39:25:14:8:12:25:14:8:12 chr17 4926882 . A G 207.53 PASS AO=41;DP=74;FAO=41;FDP=73;FR=.;FRO=32;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=10;FSRR=22;FWDB=-0.0091233;FXX=0.0519413;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.041;QD=11.3716;RBI=0.00962729;REFB=-0.039935;REVB=0.00307409;RO=31;SAF=20;SAR=21;SRF=9;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155873;STB=0.577145;TYPE=snp;VARB=0.0287829;OID=.;OPOS=4926882;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:73:31:32:41:41:21:20:9:22:21:20:10:22 chr17 4936972 . G A 161.54 PASS AO=21;DP=24;FAO=21;FDP=24;FR=.;FRO=3;FSAF=19;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0910054;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=61.8452;QD=26.9241;RBI=0.0943188;REFB=-0.0106187;REVB=0.02478;RO=3;SAF=19;SAR=2;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0675541;STB=0.536552;TYPE=snp;VARB=-0.000298379;OID=.;OPOS=4936972;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:24:24:3:3:21:21:2:19:3:0:2:19:3:0 chr17 4937575 . T C 243.17 PASS AO=24;DP=24;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0348329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7381;QD=37.4105;RBI=0.0583601;REFB=0;REVB=0.0468249;RO=0;SAF=9;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000810613;OID=.;OPOS=4937575;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:24:26:0:0:24:26:15:9:0:0:15:11:0:0 chr17 4996915 . AC A 668.4 PASS AO=71;DP=76;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0416329;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.0631;QD=37.6565;RBI=0.0559503;REFB=0;REVB=-0.0373782;RO=0;SAF=34;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.12261e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-3.61638e-05;OID=.;OPOS=4996916;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:71:73:71:71:0:34:37:0:0:32:0:34:37:0:0 chr17 4997787 . A G 810.21 PASS AO=97;DP=107;FAO=97;FDP=107;FR=.;FRO=10;FSAF=81;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=1;FWDB=-0.00766177;FXX=0.0272702;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.047;QD=30.2882;RBI=0.0109792;REFB=0.00616153;REVB=0.00786386;RO=9;SAF=81;SAR=16;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0498444;STB=0.51118;TYPE=snp;VARB=-0.000864346;OID=.;OPOS=4997787;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:107:107:9:10:97:97:16:81:9:0:16:81:9:1 chr17 4998030 . G C 655.56 PASS AO=71;DP=73;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00177454;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.9759;QD=36.42;RBI=0.042895;REFB=-0.0309613;REVB=-0.0428583;RO=0;SAF=36;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11607e-08;STB=0.506847;TYPE=snp;VARB=-8.22302e-05;OID=.;OPOS=4998030;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:73:72:0:1:71:71:35:36:0:0:35:36:1:0 chr17 4998586 . G A 604.61 PASS AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0449775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.078;QD=37.7882;RBI=0.0472327;REFB=0;REVB=0.0144204;RO=0;SAF=38;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000221196;OID=.;OPOS=4998586;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:64:64:0:0:64:64:26:38:0:0:26:38:0:0 chr17 4998852 . G C 896.82 PASS AO=94;DP=94;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.66;QD=37.761;RBI=0.0211467;REFB=0;REVB=-0.0121525;RO=0;SAF=26;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.91088e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000367337;OID=.;OPOS=4998852;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:94:95:0:0:94:95:68:26:0:0:69:26:0:0 chr17 5058808 . G A 2826.98 PASS AO=299;DP=302;FAO=299;FDP=299;FR=.;FRO=0;FSAF=139;FSAR=160;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0099239;FXX=0.00993345;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.516;QD=37.8191;RBI=0.0212715;REFB=-0.0236201;REVB=-0.0188147;RO=2;SAF=139;SAR=160;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00681228;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.21698e-06;OID=.;OPOS=5058808;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:302:299:2:0:299:299:160:139:2:0:160:139:0:0 chr17 5072316 . C T 749.65 PASS AO=53;DP=97;FAO=85;FDP=89;FR=.;FRO=4;FSAF=47;FSAR=38;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0599096;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.346;QD=33.6922;RBI=0.0599431;REFB=-0.0183658;REVB=-0.00200638;RO=0;SAF=14;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.502405;TYPE=snp;VARB=0.00389557;OID=.;OPOS=5072316;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:55:89:0:4:53:85:39:14:0:0:38:47:2:2 chr17 5084763 . G A 1652.01 PASS AO=174;DP=177;FAO=176;FDP=176;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=126;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019209;FXX=0.0434759;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.242;QD=37.5456;RBI=0.0323298;REFB=-0.0230247;REVB=0.0260044;RO=0;SAF=49;SAR=125;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.44957e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000173631;OID=.;OPOS=5084763;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:177:176:0:0:174:176:125:49:0:0:126:50:0:0 chr17 5085893 . C T 2051.92 PASS AO=232;DP=240;FAO=231;FDP=240;FR=.;FRO=9;FSAF=61;FSAR=170;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.0249987;FXX=0.00414921;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.3318;QD=34.1987;RBI=0.0255903;REFB=0.0162223;REVB=-0.00547051;RO=8;SAF=64;SAR=168;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0176456;STB=0.51907;TYPE=snp;VARB=-0.00302413;OID=.;OPOS=5085893;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:240:240:8:9:232:231:168:64:4:4:170:61:6:3 chr17 5087040 . A G 1240.6 PASS AO=131;DP=134;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00907986;FXX=0.00746213;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.1309;QD=37.3113;RBI=0.0132525;REFB=-0.0734815;REVB=0.00965327;RO=2;SAF=62;SAR=69;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000765697;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000912896;OID=.;OPOS=5087040;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:134:133:2:0:131:133:69:62:1:1:70:63:0:0 chr17 5126674 . A G 868.27 PASS AO=73;DP=77;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00405966;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.076;QD=37.7508;RBI=0.0268479;REFB=0;REVB=0.0265392;RO=0;SAF=46;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1792e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.0614e-05;OID=.;OPOS=5126674;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:77:92:0:0:73:92:27:46:0:0:40:52:0:0 chr17 5126689 . G A 856.83 PASS AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0194088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.834;QD=38.5092;RBI=0.0826645;REFB=0;REVB=0.0803537;RO=0;SAF=47;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.28712e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000253264;OID=.;OPOS=5126689;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:89:89:0:0:89:89:42:47:0:0:42:47:0:0 chr17 5425077 . T C 1077.44 PASS AO=111;DP=114;FAO=118;FDP=121;FR=.;FRO=3;FSAF=45;FSAR=73;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.00827836;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=138.432;QD=35.618;RBI=0.0277538;REFB=-0.148108;REVB=-0.0264904;RO=3;SAF=45;SAR=66;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0134921;STB=0.507468;TYPE=snp;VARB=0.000781671;OID=.;OPOS=5425077;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:114:121:3:3:111:118:66:45:2:1:73:45:2:1 chr17 5436263 . C T 412.46 PASS AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0914413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.7406;QD=37.4967;RBI=0.0914725;REFB=0;REVB=-0.00238999;RO=0;SAF=15;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02792e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00110256;OID=.;OPOS=5436263;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:43:44:0:0:43:44:28:15:0:0:29:15:0:0 chr17 5485367 . A T 555.34 PASS AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0552571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.278;QD=37.0224;RBI=0.055342;REFB=-0.0694317;REVB=0.00306288;RO=1;SAF=23;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129277;STB=0.506847;TYPE=snp;VARB=0.00207474;OID=.;OPOS=5485367;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:60:60:1:1:59:59:36:23:0:1:36:23:0:1 chr17 5991344 . C T 199.67 PASS AO=48;DP=102;FAO=48;FDP=101;FR=.;FRO=53;FSAF=30;FSAR=18;FSRF=29;FSRR=24;FWDB=-0.000142622;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.072;QD=7.90755;RBI=0.0503848;REFB=-0.0202939;REVB=-0.0503846;RO=53;SAF=30;SAR=18;SRF=29;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0765333;STB=0.542618;TYPE=snp;VARB=0.0271101;OID=.;OPOS=5991344;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:101:53:53:48:48:18:30:29:24:18:30:29:24 chr17 6014176 . A G 1374.16 PASS AO=136;DP=136;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0449265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.4392;QD=38.1711;RBI=0.0647861;REFB=0;REVB=0.0466781;RO=0;SAF=65;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56186e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000231987;OID=.;OPOS=6014176;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:136:144:0:0:136:144:71:65:0:0:79:65:0:0 chr17 6330068 . T C 167.9 PASS AO=17;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.429;QD=37.3102;RBI=0.0176536;REFB=0;REVB=0.0176536;RO=0;SAF=0;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00138426;OID=.;OPOS=6330068;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:18:0:0:17:18:17:0:0:0:18:0:0:0 chr17 6331803 . T C 393.45 PASS AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0224119;FXX=0.0454442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.1102;QD=37.4711;RBI=0.0429663;REFB=0;REVB=0.036658;RO=0;SAF=9;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.27702e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000309331;OID=.;OPOS=6331803;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:43:42:0:0:42:42:33:9:0:0:33:9:0:0 chr17 6337247 . C G 159.09 PASS AO=35;DP=71;FAO=36;FDP=72;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=27;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=-0.00892528;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.816;QD=8.83851;RBI=0.0647145;REFB=-0.00117962;REVB=0.0640961;RO=36;SAF=9;SAR=26;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.341272;STB=0.693916;TYPE=snp;VARB=0.00484302;OID=.;OPOS=6337247;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:72:36:36:35:36:26:9:22:14:27:9:22:14 chr17 6353679 . A C 758.6 PASS AO=83;DP=85;FAO=83;FDP=85;FR=.;FRO=2;FSAF=40;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0278136;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.511;QD=35.6986;RBI=0.028226;REFB=-0.13988;REVB=0.00480738;RO=1;SAF=40;SAR=43;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108876;STB=0.500426;TYPE=snp;VARB=0.000539848;OID=.;OPOS=6353679;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:85:85:1:2:83:83:43:40:0:1:43:40:1:1 chr17 6364753 . A G 709.32 PASS AO=29;DP=84;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0450969;FXX=0.038956;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.632;QD=38.3419;RBI=0.0666914;REFB=0;REVB=-0.0491327;RO=0;SAF=3;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000750358;OID=.;OPOS=6364753;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:33:74:0:0:29:74:26:3:0:0:29:45:0:0 chr17 6381939 . G A 221.18 PASS AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0272035;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.682;QD=34.028;RBI=0.028113;REFB=-0.110211;REVB=0.00709291;RO=1;SAF=9;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0487725;STB=0.526294;TYPE=snp;VARB=0.0019756;OID=.;OPOS=6381939;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:26:26:1:1:25:25:16:9:1:0:16:9:1:0 chr17 6406883 . C T 276.51 PASS AO=67;DP=139;FAO=67;FDP=139;FR=.;FRO=72;FSAF=20;FSAR=47;FSRF=20;FSRR=52;FWDB=-0.0271973;FXX=0.0279701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.788;QD=7.95703;RBI=0.0319301;REFB=-0.00332109;REVB=-0.0167282;RO=70;SAF=20;SAR=47;SRF=19;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0303395;STB=0.51295;TYPE=snp;VARB=0.00386627;OID=.;OPOS=6406883;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:70:72:67:67:47:20:19:51:47:20:20:52 chr17 6483046 . T C 257.72 PASS AO=63;DP=133;FAO=64;FDP=134;FR=.;FRO=70;FSAF=9;FSAR=55;FSRF=15;FSRR=55;FWDB=0.00358507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.4971;QD=7.69311;RBI=0.0332863;REFB=-0.014261;REVB=-0.0330927;RO=69;SAF=8;SAR=55;SRF=14;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141032;STB=0.571404;TYPE=snp;VARB=0.0192235;OID=.;OPOS=6483046;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:134:69:70:63:64:55:8:14:55:55:9:15:55 chr17 6493198 . T C 809.3 PASS AO=178;DP=348;FAO=184;FDP=351;FR=.;FRO=167;FSAF=64;FSAR=120;FSRF=91;FSRR=76;FWDB=0.0114434;FXX=0.00847434;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.1078;QD=9.22283;RBI=0.0129468;REFB=-0.0131539;REVB=-0.00605535;RO=161;SAF=61;SAR=117;SRF=87;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178854;STB=0.597215;TYPE=snp;VARB=0.0215373;OID=.;OPOS=6493198;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:348:351:161:167:178:184:117:61:87:74:120:64:91:76 chr17 6504310 . AC A 38.95 PASS AO=17;DP=38;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=1;FSRF=17;FSRR=5;FWDB=-0.0948439;FXX=0.0263089;HRUN=3;LEN=1;MLLD=19.4104;QD=4.21095;RBI=0.150476;REFB=0.0231326;REVB=-0.116823;RO=19;SAF=15;SAR=2;SRF=15;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172185;STB=0.730031;TYPE=del;VARB=-0.0490527;OID=.;OPOS=6504311;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:17:38:15:37:22:14:1:17:5:38:19:15:2:15:4 chr17 6511781 . A G 317.19 PASS AO=81;DP=175;FAO=81;FDP=175;FR=.;FRO=94;FSAF=31;FSAR=50;FSRF=30;FSRR=64;FWDB=0.0120565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.614;QD=7.25012;RBI=0.0125014;REFB=-0.00709687;REVB=0.00330522;RO=92;SAF=31;SAR=50;SRF=29;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0700219;STB=0.536747;TYPE=snp;VARB=0.0055511;OID=.;OPOS=6511781;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:175:92:94:81:81:50:31:29:63:50:31:30:64 chr17 6513329 . G A 465.22 PASS AO=116;DP=244;FAO=116;FDP=244;FR=.;FRO=128;FSAF=58;FSAR=58;FSRF=80;FSRR=48;FWDB=0.00629208;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=257.654;QD=7.62652;RBI=0.025374;REFB=-0.0124211;REVB=-0.0245815;RO=126;SAF=58;SAR=58;SRF=78;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112663;STB=0.565563;TYPE=snp;VARB=0.015179;OID=.;OPOS=6513329;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:244:126:128:116:116:58:58:78:48:58:58:80:48 chr17 6515387 . A G 181.33 PASS AO=60;DP=165;FAO=61;FDP=166;FR=.;FRO=105;FSAF=19;FSAR=42;FSRF=45;FSRR=60;FWDB=-0.0105403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.93;QD=4.36932;RBI=0.0108356;REFB=0.00145919;REVB=-0.00251251;RO=105;SAF=18;SAR=42;SRF=45;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157899;STB=0.581036;TYPE=snp;VARB=-0.0028093;OID=.;OPOS=6515387;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:166:105:105:60:61:42:18:45:60:42:19:45:60 chr17 6515454 . C T 178.34 PASS AO=22;DP=105;FAO=44;FDP=97;FR=.,HEALED;FRO=53;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=25;FSRR=28;FWDB=-0.0116443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.135;QD=7.35437;RBI=0.0265392;REFB=-0.020201;REVB=0.0238483;RO=28;SAF=17;SAR=5;SRF=25;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191084;STB=0.548069;TYPE=snp;VARB=0.0153804;OID=.;OPOS=6515454;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:97:28:53:22:44:5:17:25:3:27:17:25:28 chr17 6524298 . T A 325.71 PASS AO=75;DP=150;FAO=75;FDP=150;FR=.;FRO=75;FSAF=25;FSAR=50;FSRF=20;FSRR=55;FWDB=-0.00785816;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=260.667;QD=8.68568;RBI=0.0125201;REFB=-0.00718304;REVB=-0.00974697;RO=75;SAF=25;SAR=50;SRF=20;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0700151;STB=0.538452;TYPE=snp;VARB=0.00846555;OID=.;OPOS=6524298;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:150:75:75:75:75:50:25:20:55:50:25:20:55 chr17 6531648 . A G 881.31 PASS AO=181;DP=336;FAO=188;FDP=343;FR=.;FRO=155;FSAF=119;FSAR=69;FSRF=95;FSRR=60;FWDB=-0.0341522;FXX=0.00290689;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.653;QD=10.2777;RBI=0.0365761;REFB=-0.00129579;REVB=-0.0130934;RO=155;SAF=118;SAR=63;SRF=96;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0300864;STB=0.509711;TYPE=snp;VARB=0.00112434;OID=.;OPOS=6531648;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:336:343:155:155:181:188:63:118:96:59:69:119:95:60 chr17 6538355 . G A 444.12 PASS AO=126;DP=296;FAO=126;FDP=294;FR=.;FRO=168;FSAF=76;FSAR=50;FSRF=89;FSRR=79;FWDB=-0.0244143;FXX=0.00675653;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.4976;QD=6.04247;RBI=0.0465874;REFB=-0.0132775;REVB=0.0396778;RO=166;SAF=76;SAR=50;SRF=88;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0765744;STB=0.543031;TYPE=snp;VARB=0.0164989;OID=.;OPOS=6538355;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:296:294:166:168:126:126:50:76:88:78:50:76:89:79 chr17 6546259 . T C 274.69 PASS AO=73;DP=168;FAO=74;FDP=168;FR=.;FRO=94;FSAF=40;FSAR=34;FSRF=34;FSRR=60;FWDB=0.000651856;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=245.487;QD=6.54021;RBI=0.00763651;REFB=-0.000378781;REVB=0.00760864;RO=91;SAF=40;SAR=33;SRF=34;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172479;STB=0.599082;TYPE=snp;VARB=0.000446795;OID=.;OPOS=6546259;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:91:94:73:74:33:40:34:57:34:40:34:60 chr17 6556538 . G C 333.99 PASS AO=89;DP=201;FAO=89;FDP=200;FR=.;FRO=111;FSAF=35;FSAR=54;FSRF=70;FSRR=41;FWDB=-0.0287377;FXX=0.00497488;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.0198;QD=6.67984;RBI=0.0295801;REFB=-0.0348812;REVB=-0.00700903;RO=108;SAF=35;SAR=54;SRF=68;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231537;STB=0.630321;TYPE=snp;VARB=0.0356554;OID=.;OPOS=6556538;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:200:108:111:89:89:54:35:68:40:54:35:70:41 chr17 6556541 . A T 332.76 PASS AO=89;DP=201;FAO=89;FDP=201;FR=.;FRO=112;FSAF=41;FSAR=48;FSRF=68;FSRR=44;FWDB=0.0170808;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.763;QD=6.62218;RBI=0.0185303;REFB=-0.00899531;REVB=-0.0071846;RO=109;SAF=41;SAR=48;SRF=67;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15186;STB=0.581057;TYPE=snp;VARB=0.0141556;OID=.;OPOS=6556541;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:201:109:112:89:89:48:41:67:42:48:41:68:44 chr17 6558768 . C T 43.03 PASS AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.0565644;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.3758;QD=8.60671;RBI=0.0578696;REFB=-0.0144213;REVB=-0.0122213;RO=11;SAF=7;SAR=2;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0645154;STB=0.538373;TYPE=snp;VARB=0.0202371;OID=.;OPOS=6558768;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:20:20:11:11:9:9:2:7:8:3:2:7:8:3 chr17 6597480 . G A 222.58 PASS AO=53;DP=112;FAO=54;FDP=113;FR=.;FRO=59;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=41;FSRR=18;FWDB=-0.069451;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.082;QD=7.87906;RBI=0.0724062;REFB=-0.0132763;REVB=0.0204748;RO=59;SAF=29;SAR=24;SRF=41;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144016;STB=0.574872;TYPE=snp;VARB=0.00914672;OID=.;OPOS=6597480;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:113:59:59:53:54:24:29:41:18:24:30:41:18 chr17 6599095 . G A 85.56 PASS AO=28;DP=84;FAO=28;FDP=82;FR=.;FRO=54;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=30;FWDB=-0.0410519;FXX=0.0574647;HRUN=4;LEN=1;MLLD=80.3095;QD=4.17348;RBI=0.0792569;REFB=-0.0215777;REVB=-0.0677967;RO=38;SAF=15;SAR=13;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115851;STB=0.559853;TYPE=snp;VARB=0.0417056;OID=.;OPOS=6599095;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:76:82:38:54:28:28:13:15:16:22:13:15:24:30 chr17 6662320 . G T 105.83 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0428267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.295;QD=35.276;RBI=0.0630625;REFB=0;REVB=0.0462899;RO=0;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000754713;OID=.;OPOS=6662320;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:8:4:0:0:8:4:0:0 chr17 6663895 . C G 664.5 PASS AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.127;QD=38.5217;RBI=0.0215475;REFB=0;REVB=0.0173752;RO=0;SAF=39;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.50706e-05;OID=.;OPOS=6663895;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:69:69:0:0:69:69:30:39:0:0:30:39:0:0 chr17 6683215 . C T 137.95 PASS AO=43;DP=100;FAO=42;FDP=107;FR=.;FRO=65;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=41;FSRR=24;FWDB=-3.6321e-06;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=81.2586;QD=5.1569;RBI=0.14196;REFB=-0.0192324;REVB=-0.14196;RO=57;SAF=28;SAR=15;SRF=39;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.037398;STB=0.524126;TYPE=snp;VARB=0.0253065;OID=.;OPOS=6683215;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:107:57:65:43:42:15:28:39:18:14:28:41:24 chr17 6690161 . C T 333.45 PASS AO=79;DP=158;FAO=78;FDP=157;FR=.;FRO=79;FSAF=38;FSAR=40;FSRF=55;FSRR=24;FWDB=0.0251263;FXX=0.00632871;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.1962;QD=8.49554;RBI=0.0251264;REFB=-0.0155143;REVB=-5.14418e-05;RO=77;SAF=38;SAR=41;SRF=54;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197032;STB=0.604656;TYPE=snp;VARB=0.0213856;OID=.;OPOS=6690161;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:157:77:79:79:78:41:38:54:23:40:38:55:24 chr17 6716242 . G A 254.91 PASS AO=65;DP=141;FAO=65;FDP=140;FR=.;FRO=75;FSAF=36;FSAR=29;FSRF=20;FSRR=55;FWDB=-0.00500581;FXX=0.0070917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.029;QD=7.28307;RBI=0.00774212;REFB=-0.0477999;REVB=0.00590613;RO=70;SAF=36;SAR=29;SRF=20;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.247785;STB=0.650559;TYPE=snp;VARB=0.0477441;OID=.;OPOS=6716242;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:140:70:75:65:65:29:36:20:50:29:36:20:55 chr17 6733672 . T C 2586.03 PASS AO=273;DP=278;FAO=274;FDP=274;FR=.;FRO=0;FSAF=126;FSAR=148;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0427384;FXX=0.031801;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.7962;QD=37.7522;RBI=0.0455964;REFB=-0.0513104;REVB=0.015889;RO=0;SAF=126;SAR=147;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00045483;OID=.;OPOS=6733672;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:278:274:0:0:273:274:147:126:0:0:148:126:0:0 chr17 6902743 . G A 259.51 PASS AO=44;DP=68;FAO=44;FDP=68;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=32;FSRF=2;FSRR=22;FWDB=0.00265212;FXX=0.0285673;HRUN=4;LEN=1;MLLD=217.568;QD=15.2655;RBI=0.00481139;REFB=-0.00646404;REVB=0.00401444;RO=24;SAF=12;SAR=32;SRF=2;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169115;STB=0.591204;TYPE=snp;VARB=0.00301806;OID=.;OPOS=6902743;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:68:68:24:24:44:44:32:12:2:22:32:12:2:22 chr17 6902760 . A G 196.06 PASS AO=31;DP=53;FAO=35;FDP=57;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=2;FSRR=20;FWDB=-0.0322443;FXX=0.0499917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.696;QD=13.7589;RBI=0.0620312;REFB=-0.0536627;REVB=0.0529922;RO=22;SAF=12;SAR=19;SRF=2;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252468;STB=0.615693;TYPE=snp;VARB=0.0196218;OID=.;OPOS=6902760;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:53:57:22:22:31:35:19:12:2:20:23:12:2:20 chr17 6904934 . A G 156.87 PASS AO=40;DP=94;FAO=40;FDP=90;FR=.;FRO=50;FSAF=11;FSAR=29;FSRF=18;FSRR=32;FWDB=0.013587;FXX=0.052626;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.231;QD=6.97186;RBI=0.0179664;REFB=-0.0147411;REVB=-0.0117553;RO=33;SAF=11;SAR=29;SRF=9;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0023387;STB=0.556188;TYPE=snp;VARB=0.0176119;OID=.;OPOS=6904934;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:90:33:50:40:40:29:11:9:24:29:11:18:32 chr17 6905061 . T G 191.41 PASS AO=43;DP=85;FAO=43;FDP=85;FR=.;FRO=42;FSAF=4;FSAR=39;FSRF=6;FSRR=36;FWDB=-0.0242301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.815;QD=9.00751;RBI=0.026752;REFB=-0.0255166;REVB=0.0113389;RO=42;SAF=4;SAR=39;SRF=6;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116511;STB=0.565184;TYPE=snp;VARB=0.0286588;OID=.;OPOS=6905061;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:42:42:43:43:39:4:6:36:39:4:6:36 chr17 6913652 . G A 322.53 PASS AO=82;DP=188;FAO=85;FDP=190;FR=.;FRO=105;FSAF=49;FSAR=36;FSRF=58;FSRR=47;FWDB=-0.00678835;FXX=0.00523533;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.341;QD=6.78999;RBI=0.10544;REFB=-0.0045977;REVB=0.105221;RO=105;SAF=49;SAR=33;SRF=58;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0468442;STB=0.513572;TYPE=snp;VARB=0.00711093;OID=.;OPOS=6913652;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:190:105:105:82:85:33:49:58:47:36:49:58:47 chr17 6919093 . T C 296.78 PASS AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0096457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.6456;QD=37.0978;RBI=0.0118181;REFB=0;REVB=-0.00682845;RO=0;SAF=26;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000215049;OID=.;OPOS=6919093;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:32:32:0:0:32:32:6:26:0:0:6:26:0:0 chr17 6929924 . T C 1544.59 PASS AO=154;DP=154;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0132566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.445;QD=38.138;RBI=0.0135477;REFB=0;REVB=0.00279324;RO=0;SAF=84;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.00369e-05;OID=.;OPOS=6929924;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:154:162:0:0:154:162:70:84:0:0:76:86:0:0 chr17 6931174 . GCT G 95.82 PASS AO=23;DP=59;FAO=25;FDP=58;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=-0.0045301;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=199.491;QD=6.608;RBI=0.0149102;REFB=-0.00552109;REVB=-0.0142054;RO=33;SAF=13;SAR=10;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0430735;STB=0.526739;TYPE=del;VARB=0.00705799;OID=.;OPOS=6931175;OREF=CT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:23:57:25:58:33:14:11:20:13:95:33:13:10:20:13 chr17 6942108 . C T 154.1 PASS AO=35;DP=72;FAO=35;FDP=71;FR=.;FRO=36;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.00652265;FXX=0.013887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.178;QD=8.68165;RBI=0.0284293;REFB=-0.0100519;REVB=0.027671;RO=36;SAF=20;SAR=15;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0146964;STB=0.508192;TYPE=snp;VARB=0.0104206;OID=.;OPOS=6942108;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:71:36:36:35:35:15:20:20:16:15:20:20:16 chr17 6943266 . G A 257.75 PASS AO=65;DP=139;FAO=65;FDP=139;FR=.;FRO=74;FSAF=22;FSAR=43;FSRF=20;FSRR=54;FWDB=-0.0487047;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=166.702;QD=7.41725;RBI=0.0487601;REFB=0.00345905;REVB=-0.00232348;RO=72;SAF=22;SAR=43;SRF=19;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0815481;STB=0.541612;TYPE=snp;VARB=-0.00401232;OID=.;OPOS=6943266;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:72:74:65:65:43:22:19:53:43:22:20:54 chr17 7011144 . G A 75.98 PASS AO=13;DP=23;FAO=14;FDP=24;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.00662627;FXX=0.0768935;HRUN=2;LEN=1;MLLD=31.3815;QD=12.6632;RBI=0.109286;REFB=-0.0748685;REVB=0.109085;RO=8;SAF=8;SAR=5;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00684983;STB=0.555478;TYPE=snp;VARB=0.0528413;OID=.;OPOS=7011144;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:23:24:8:10:13:14:5:8:5:3:6:8:7:3 chr17 7099811 . G A 154.26 PASS AO=40;DP=107;FAO=45;FDP=112;FR=.;FRO=67;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=28;FSRR=39;FWDB=-0.0147728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.303;QD=5.5093;RBI=0.0774002;REFB=-0.0265783;REVB=0.0759773;RO=65;SAF=16;SAR=24;SRF=27;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.017334;STB=0.539745;TYPE=snp;VARB=0.0385267;OID=.;OPOS=7099811;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:112:65:67:40:45:24:16:27:38:29:16:28:39 chr17 7127718 . T C 426.36 PASS AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0228551;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.587;QD=37.8989;RBI=0.044999;REFB=0;REVB=0.0387628;RO=0;SAF=6;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.44635e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000150543;OID=.;OPOS=7127718;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:45:45:0:0:45:45:39:6:0:0:39:6:0:0 chr17 7129840 . T C 193.4 PASS AO=21;DP=22;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172476;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.918;QD=33.635;RBI=0.0217493;REFB=0;REVB=0.0132497;RO=1;SAF=13;SAR=8;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0341946;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00126481;OID=.;OPOS=7129840;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:22:23:1:0:21:23:8:13:1:0:8:15:0:0 chr17 7132556 . C T 882.28 PASS AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.072;QD=37.9475;RBI=0.029185;REFB=0;REVB=0.00527539;RO=0;SAF=43;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.73911e-05;OID=.;OPOS=7132556;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:93:93:0:0:93:93:50:43:0:0:50:43:0:0 chr17 7133162 . G A 1632.32 PASS AO=173;DP=176;FAO=174;FDP=174;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000386547;FXX=0.011363;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.911;QD=37.5246;RBI=0.0132754;REFB=-0.0368895;REVB=0.0132698;RO=2;SAF=100;SAR=73;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00173944;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.75579e-05;OID=.;OPOS=7133162;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:176:174:2:0:173:174:73:100:1:1:73:101:0:0 chr17 7133609 . G A 233.91 PASS AO=37;DP=71;FAO=49;FDP=83;FR=.;FRO=34;FSAF=8;FSAR=41;FSRF=9;FSRR=25;FWDB=0.0868764;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=26.0627;QD=11.2729;RBI=0.107107;REFB=-0.0831728;REVB=0.0626443;RO=34;SAF=8;SAR=29;SRF=9;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.059264;STB=0.568949;TYPE=snp;VARB=0.0773406;OID=.;OPOS=7133609;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:83:34:34:37:49:29:8:9:25:41:8:9:25 chr17 7134129 . A G 699.87 PASS AO=73;DP=73;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.014532;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5622;QD=37.8305;RBI=0.0156978;REFB=0;REVB=-0.00593655;RO=0;SAF=30;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000154163;OID=.;OPOS=7134129;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:73:74:0:0:73:74:43:30:0:0:43:31:0:0 chr17 7154534 . G A 315.33 PASS AO=32;DP=32;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0415612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.802;QD=37.0971;RBI=0.053481;REFB=0;REVB=0.0336585;RO=0;SAF=16;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000163286;OID=.;OPOS=7154534;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:32:34:0:0:32:34:16:16:0:0:18:16:0:0 chr17 7154582 . T C 88.87 PASS AO=16;DP=27;FAO=16;FDP=27;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.000252133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.4;QD=13.1664;RBI=0.020925;REFB=-0.0152897;REVB=0.0209234;RO=11;SAF=6;SAR=10;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126749;STB=0.571338;TYPE=snp;VARB=0.0111421;OID=.;OPOS=7154582;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:27:27:11:11:16:16:10:6:6:5:10:6:6:5 chr17 7155861 . G A 44.74 PASS AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.000485332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.319;QD=7.78049;RBI=0.0241766;REFB=0.010754;REVB=0.0241718;RO=13;SAF=1;SAR=9;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.583385;STB=0.851818;TYPE=snp;VARB=-0.0289259;OID=.;OPOS=7155861;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:23:23:13:13:10:10:9:1:8:5:9:1:8:5 chr17 7158203 . T G 107.82 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0496444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.4964;QD=35.9384;RBI=0.0545797;REFB=0;REVB=0.0226799;RO=0;SAF=2;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0022315;OID=.;OPOS=7158203;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:10:2:0:0:10:2:0:0 chr17 7163739 . A G 1047.99 PASS AO=112;DP=113;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300566;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.555;QD=37.4282;RBI=0.0304879;REFB=-0.0586822;REVB=-0.00511046;RO=1;SAF=61;SAR=51;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00772026;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000130401;OID=.;OPOS=7163739;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:113:112:1:0:112:112:51:61:1:0:51:61:0:0 chr17 7185788 . T C 290.06 PASS AO=27;DP=27;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.112486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.828;QD=38.6752;RBI=0.112514;REFB=0;REVB=-0.00249668;RO=0;SAF=5;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.88944e-05;OID=.;OPOS=7185788;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:27:30:0:0:27:30:22:5:0:0:24:6:0:0 chr17 7187123 . T C 479.5 PASS AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0488961;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.6633;QD=37.6081;RBI=0.0522453;REFB=0;REVB=-0.0184051;RO=0;SAF=23;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.97956e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000155098;OID=.;OPOS=7187123;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:52:51:0:0:51:51:28:23:0:0:28:23:0:0 chr17 7192091 . C T 1910.05 PASS AO=192;DP=192;FAO=199;FDP=199;FR=.;FRO=0;FSAF=115;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0198605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.212;QD=38.3929;RBI=0.0204171;REFB=0;REVB=0.00473482;RO=0;SAF=110;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.69051e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.71611e-05;OID=.;OPOS=7192091;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:192:199:0:0:192:199:82:110:0:0:84:115:0:0 chr17 7213773 . GGT G 43.03 PASS AO=19;DP=71;FAO=22;FDP=60;FR=.;FRO=38;FSAF=2;FSAR=20;FSRF=11;FSRR=27;FWDB=-0.00179893;FXX=0.0624902;HRUN=2;LEN=2;MLLD=256.063;QD=2.86854;RBI=0.00829735;REFB=0.00516168;REVB=0.0081;RO=40;SAF=2;SAR=17;SRF=12;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.367797;STB=0.734193;TYPE=del;VARB=-0.0102025;OID=.;OPOS=7213774;OREF=GT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:19:63:22:60:38:2:20:11:27:43:40:2:17:12:28 chr17 7216540 . G A 51.4 PASS AO=13;DP=45;FAO=17;FDP=47;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=0.0196251;FXX=0.040808;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.505;QD=4.37468;RBI=0.0206011;REFB=-0.0322979;REVB=0.00626571;RO=32;SAF=9;SAR=4;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126123;STB=0.647905;TYPE=snp;VARB=0.0591307;OID=.;OPOS=7216540;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:45:47:32:30:13:17:4:9:19:13:4:13:17:13 chr17 7219230 . A G 35.41 PASS AO=11;DP=34;FAO=11;FDP=34;FR=.;FRO=23;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.0467967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.877;QD=4.16615;RBI=0.0887849;REFB=-0.0199188;REVB=-0.0754509;RO=23;SAF=2;SAR=9;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.294975;STB=0.682383;TYPE=snp;VARB=0.0343386;OID=.;OPOS=7219230;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:34:34:23:23:11:11:9:2:9:14:9:2:9:14 chr17 7220881 . C T 209.74 PASS AO=51;DP=122;FAO=53;FDP=114;FR=.;FRO=61;FSAF=18;FSAR=35;FSRF=24;FSRR=37;FWDB=-0.00540341;FXX=0.11627;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.384;QD=7.3594;RBI=0.00618204;REFB=-0.000916727;REVB=0.00300346;RO=49;SAF=18;SAR=33;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12709;STB=0.531441;TYPE=snp;VARB=0.00550194;OID=.;OPOS=7220881;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:114:49:61:51:53:33:18:24:25:35:18:24:37 chr17 7221385 . G A 240.27 PASS AO=40;DP=60;FAO=41;FDP=61;FR=.;FRO=20;FSAF=28;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.0114443;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=236.077;QD=15.7551;RBI=0.020301;REFB=-0.00493031;REVB=0.0167678;RO=20;SAF=28;SAR=12;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136711;STB=0.565872;TYPE=snp;VARB=0.00365987;OID=.;OPOS=7221385;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:60:61:20:20:40:41:12:28:10:10:13:28:10:10 chr17 7226957 . G A 238.17 PASS AO=54;DP=107;FAO=54;FDP=107;FR=.;FRO=53;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=23;FSRR=30;FWDB=-0.0193961;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.989;QD=8.90341;RBI=0.0361107;REFB=-0.0103688;REVB=0.0304594;RO=53;SAF=24;SAR=30;SRF=23;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00952624;STB=0.505261;TYPE=snp;VARB=0.00822272;OID=.;OPOS=7226957;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:53:53:54:54:30:24:23:30:30:24:23:30 chr17 7249631 . C T 453.13 PASS AO=67;DP=152;FAO=89;FDP=151;FR=.;FRO=62;FSAF=40;FSAR=49;FSRF=28;FSRR=34;FWDB=-0.103366;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.3308;QD=12.0035;RBI=0.106636;REFB=-0.037388;REVB=-0.0262033;RO=27;SAF=36;SAR=31;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00980334;STB=0.500902;TYPE=snp;VARB=0.0226789;OID=.;OPOS=7249631;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:151:27:62:67:89:31:36:15:12:49:40:28:34 chr17 7286266 . C T 101.37 PASS AO=23;DP=48;FAO=23;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=0.00356444;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=195.64;QD=8.44772;RBI=0.00519267;REFB=-0.0422243;REVB=0.00377606;RO=23;SAF=10;SAR=13;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191387;STB=0.625563;TYPE=snp;VARB=0.0432717;OID=.;OPOS=7286266;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:23:25:23:23:13:10:15:8:13:10:17:8 chr17 7292107 . G A 670.48 PASS AO=75;DP=81;FAO=75;FDP=78;FR=.;FRO=3;FSAF=51;FSAR=24;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0364021;FXX=0.0370325;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.043;QD=34.3835;RBI=0.0918069;REFB=-0.153683;REVB=0.0842816;RO=2;SAF=51;SAR=24;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0181934;STB=0.514282;TYPE=snp;VARB=0.00129216;OID=.;OPOS=7292107;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:81:78:2:3:75:75:24:51:2:0:24:51:3:0 chr17 7293715 . C T 609.89 PASS AO=61;DP=62;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029841;FXX=0.0302984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.1609;QD=38.1178;RBI=0.047635;REFB=0;REVB=0.0371296;RO=1;SAF=32;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145233;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000535134;OID=.;OPOS=7293715;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:62:64:1:0:61:64:29:32:1:0:29:35:0:0 chr17 7297452 . A G 388 PASS AO=31;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=31;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.022385;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.582;QD=37.8533;RBI=0.107325;REFB=0;REVB=0.104964;RO=0;SAF=30;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000577147;OID=.;OPOS=7297452;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:40:41:0:0:31:41:1:30:0:0:10:31:0:0 chr17 7318396 . C T 199.29 PASS AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0620279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.204;QD=33.2149;RBI=0.0661828;REFB=-0.0748662;REVB=0.0230803;RO=1;SAF=12;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0370176;STB=0.519983;TYPE=snp;VARB=0.00226428;OID=.;OPOS=7318396;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:24:24:1:1:23:23:11:12:1:0:11:12:1:0 chr17 7318935 . C T 1481.88 PASS AO=155;DP=155;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000792263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.9095;QD=38.2422;RBI=0.0518487;REFB=0;REVB=0.0518426;RO=0;SAF=94;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.67899e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000129004;OID=.;OPOS=7318935;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:155:155:0:0:155:155:61:94:0:0:61:94:0:0 chr17 7322715 . C T 272.08 PASS AO=59;DP=114;FAO=59;FDP=112;FR=.;FRO=53;FSAF=54;FSAR=5;FSRF=47;FSRR=6;FWDB=0.020948;FXX=0.0175423;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.983;QD=9.71711;RBI=0.0275367;REFB=-0.000427544;REVB=-0.0178733;RO=53;SAF=54;SAR=5;SRF=47;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0731826;STB=0.540477;TYPE=snp;VARB=0.000437267;OID=.;OPOS=7322715;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:112:53:53:59:59:5:54:47:6:5:54:47:6 chr17 7329632 . T G 296.63 PASS AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0742181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.451;QD=37.0791;RBI=0.0742238;REFB=0;REVB=-0.000921819;RO=0;SAF=16;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00199125;OID=.;OPOS=7329632;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:32:32:0:0:32:32:16:16:0:0:16:16:0:0 chr17 7339215 . GC G 41.83 PASS AO=33;DP=101;FAO=37;FDP=92;FR=.;FRO=55;FSAF=7;FSAR=30;FSRF=28;FSRR=27;FWDB=0.0560204;FXX=0.0315756;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.7539;QD=1.81854;RBI=0.20693;REFB=-0.102657;REVB=-0.199202;RO=49;SAF=5;SAR=28;SRF=29;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.518743;STB=0.724503;TYPE=del;VARB=0.0661794;OID=.;OPOS=7339216;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:33:94:37:92:55:7:30:28:27:41:49:5:28:29:20 chr17 7347123 . C T 263.02 PASS AO=33;DP=38;FAO=33;FDP=38;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.00934795;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.185;QD=27.686;RBI=0.0274217;REFB=-0.0890193;REVB=0.0257792;RO=4;SAF=5;SAR=28;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0622356;STB=0.54096;TYPE=snp;VARB=0.00252685;OID=.;OPOS=7347123;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:38:38:4:5:33:33:28:5:0:4:28:5:0:5 chr17 7348625 . A G 680.28 PASS AO=70;DP=70;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00600846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.287;QD=37.7933;RBI=0.00897058;REFB=0;REVB=0.00666106;RO=0;SAF=43;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.89303e-07;OID=.;OPOS=7348625;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:70:72:0:0:70:72:27:43:0:0:28:44:0:0 chr17 7386055 . C T 489.86 PASS AO=58;DP=63;FAO=59;FDP=63;FR=.;FRO=4;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0286556;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.887;QD=31.1021;RBI=0.0510275;REFB=-0.219507;REVB=0.0422216;RO=1;SAF=29;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0159891;STB=0.515342;TYPE=snp;VARB=0.00211205;OID=.;OPOS=7386055;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:63:63:1:4:58:59:29:29:0:1:30:29:1:3 chr17 7386090 . G A 657.29 PASS AO=74;DP=79;FAO=75;FDP=79;FR=.;FRO=4;FSAF=29;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0155898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.169;QD=33.2804;RBI=0.0155927;REFB=-0.193526;REVB=-0.00029938;RO=2;SAF=29;SAR=45;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0205611;STB=0.520828;TYPE=snp;VARB=0.00276008;OID=.;OPOS=7386090;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:79:79:2:4:74:75:45:29:0:2:46:29:0:4 chr17 7386280 . G A 718.17 PASS AO=79;DP=83;FAO=81;FDP=83;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0647507;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.738;QD=34.6106;RBI=0.0663922;REFB=-0.0519349;REVB=0.0146723;RO=1;SAF=41;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122951;STB=0.500746;TYPE=snp;VARB=0.00161042;OID=.;OPOS=7386280;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:83:83:1:2:79:81:38:41:0:1:38:43:1:1 chr17 7400137 . T C 543.04 PASS AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0173123;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.3816;QD=36.8159;RBI=0.0236854;REFB=-0.0653291;REVB=0.0161643;RO=1;SAF=15;SAR=43;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108465;STB=0.505745;TYPE=snp;VARB=0.00198219;OID=.;OPOS=7400137;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:59:59:1:1:58:58:43:15:0:1:43:15:0:1 chr17 7400815 . T C 122.68 PASS AO=33;DP=78;FAO=33;FDP=78;FR=.;FRO=45;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=0.0221869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.7369;QD=6.29137;RBI=0.0278358;REFB=-0.0277267;REVB=0.01681;RO=44;SAF=11;SAR=22;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198618;STB=0.607076;TYPE=snp;VARB=0.0364488;OID=.;OPOS=7400815;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:44:45:33:33:22:11:23:21:22:11:23:22 chr17 7402600 . T C 1162.3 PASS AO=123;DP=125;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00134687;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.827;QD=37.4934;RBI=0.0478629;REFB=-0.0717625;REVB=0.0478439;RO=2;SAF=55;SAR=68;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00162404;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00020751;OID=.;OPOS=7402600;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:125:124:2:0:123:124:68:55:1:1:69:55:0:0 chr17 7404107 . T C 2031.88 PASS AO=213;DP=216;FAO=215;FDP=215;FR=.;FRO=0;FSAF=110;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104767;FXX=0.00462942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.861;QD=37.8025;RBI=0.0446208;REFB=0;REVB=0.0433734;RO=0;SAF=110;SAR=103;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.73851e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000223935;OID=.;OPOS=7404107;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:91:216:215:0:0:213:215:103:110:0:0:105:110:0:0 chr17 7404991 . T C 1753.43 PASS AO=183;DP=185;FAO=183;FDP=183;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212259;FXX=0.0161282;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.1935;QD=38.3264;RBI=0.0316238;REFB=0;REVB=-0.023442;RO=0;SAF=70;SAR=113;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.34565e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.00363e-05;OID=.;OPOS=7404991;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:185:183:0:0:183:183:113:70:0:0:113:70:0:0 chr17 7453505 . C A 265.31 PASS AO=61;DP=124;FAO=62;FDP=126;FR=.;FRO=64;FSAF=10;FSAR=52;FSRF=24;FSRR=40;FWDB=-0.00656362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.411;QD=8.42265;RBI=0.00805273;REFB=-0.00372693;REVB=-0.00466533;RO=63;SAF=10;SAR=51;SRF=24;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.282484;STB=0.65768;TYPE=snp;VARB=0.00282879;OID=.;OPOS=7453505;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:126:63:64:61:62:51:10:24:39:52:10:24:40 chr17 7460517 . G C 32.04 PASS AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=-0.00827481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.2144;QD=5.82612;RBI=0.00830449;REFB=-0.050549;REVB=-0.000701486;RO=14;SAF=2;SAR=6;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0479673;STB=0.529336;TYPE=snp;VARB=0.0480135;OID=.;OPOS=7460517;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:22:22:14:14:8:8:6:2:4:10:6:2:4:10 chr17 7460559 . T G 182.84 PASS AO=13;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0507269;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.6617;QD=38.4927;RBI=0.105495;REFB=0;REVB=0.092498;RO=0;SAF=3;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.013258;OID=.;OPOS=7460559;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:19:19:0:0:13:19:10:3:0:0:14:5:0:0 chr17 7462969 . A G 552.29 PASS AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0358167;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.3221;QD=36.2159;RBI=0.0364929;REFB=-0.0848991;REVB=-0.00699262;RO=1;SAF=43;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108509;STB=0.505745;TYPE=snp;VARB=0.000694976;OID=.;OPOS=7462969;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:61:61:1:1:60:60:17:43:1:0:17:43:1:0 chr17 7470285 . CA C 1853.76 PASS AO=227;DP=253;FAO=251;FDP=251;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=153;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0708094;FXX=0.00790483;HRUN=3;LEN=1;MLLD=23.0474;QD=29.5419;RBI=0.0744294;REFB=-0.020681;REVB=0.0229296;RO=3;SAF=94;SAR=133;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00206909;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00226119;OID=.;OPOS=7470286;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:227:251:251:251:0:98:153:0:0:99:3:94:133:1:2 chr17 7475159 . A T 163.21 PASS AO=52;DP=144;FAO=54;FDP=146;FR=.;FRO=92;FSAF=6;FSAR=48;FSRF=10;FSRR=82;FWDB=0.0542169;FXX=0.0135126;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.148;QD=4.47142;RBI=0.0542228;REFB=-0.00657969;REVB=0.000796475;RO=92;SAF=6;SAR=46;SRF=10;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0186764;STB=0.503875;TYPE=snp;VARB=0.0148892;OID=.;OPOS=7475159;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:146:92:92:52:54:46:6:10:82:48:6:10:82 chr17 7477938 . G C 777.04 PASS AO=77;DP=78;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.964;QD=37.9042;RBI=0.0943058;REFB=0;REVB=0.0930174;RO=0;SAF=23;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.18563e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000263678;OID=.;OPOS=7477938;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:78:82:0:0:77:82:54:23:0:0:59:23:0:0 chr17 7530271 . C T 165.67 PASS AO=35;DP=66;FAO=35;FDP=66;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=0.0223348;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.094;QD=10.0408;RBI=0.0224144;REFB=-0.00145951;REVB=-0.00188624;RO=30;SAF=11;SAR=24;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0799492;STB=0.538514;TYPE=snp;VARB=0.00114668;OID=.;OPOS=7530271;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:30:31:35:35:24:11:12:18:24:11:12:19 chr17 7557419 . A G 1418.91 PASS AO=118;DP=155;FAO=149;FDP=150;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=41;FSAR=108;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0882576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.789;QD=37.8375;RBI=0.0924669;REFB=0;REVB=0.027581;RO=0;SAF=35;SAR=83;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.61457e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00124099;OID=.;OPOS=7557419;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:150:150:0:0:118:149:83:35:0:0:108:41:0:0 chr17 7578115 . T C 151.51 PASS AO=35;DP=72;FAO=35;FDP=72;FR=.;FRO=37;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=-0.00893387;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.808;QD=8.41747;RBI=0.0335305;REFB=-0.00532573;REVB=0.0323185;RO=37;SAF=17;SAR=18;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000711364;STB=0.514278;TYPE=snp;VARB=0.0107121;OID=.;OPOS=7578115;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:37:37:35:35:18:17:18:19:17:18:18:19 chr17 7578210 . T C 283.27 PASS AO=55;DP=94;FAO=55;FDP=94;FR=.;FRO=39;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=-0.0750742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.5631;QD=12.0539;RBI=0.0838233;REFB=0.0215171;REVB=-0.0372855;RO=39;SAF=27;SAR=28;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0613868;STB=0.533502;TYPE=snp;VARB=-0.0199807;OID=.;OPOS=7578210;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:39:39:55:55:28:27:16:23:28:27:16:23 chr17 7578490 . ACC AC,A 48.32 PASS AO=12,7;DP=34;FAO=20,0;FDP=34;FR=.;FRO=14;FSAF=19,0;FSAR=1,0;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.310599,-0.160929;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,2;MLLD=13.4258,23.0246;QD=5.68425;RBI=0.310996,0.161187;REFB=0.00459072,0.00121596;REVB=0.0157219,0.00912079;RO=13;SAF=11,7;SAR=1,0;SRF=5;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0.782609,0.782609;SSSB=0.605986,0.777769;STB=0.871945,0.5;TYPE=del,del;VARB=-0.0523846,0.00842643;OID=.,.;OPOS=7578491,7578491;OREF=C,CC;OALT=-,-;OMAPALT=AC,A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:12,7:34:20,0:34:14:19,0:1,0:6:8:36:13:11,7:1,0:5:8 chr17 7613765 . G A 458.15 PASS AO=91;DP=158;FAO=91;FDP=158;FR=.;FRO=67;FSAF=38;FSAR=53;FSRF=33;FSRR=34;FWDB=0.0137046;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.487;QD=11.5988;RBI=0.0276905;REFB=-0.0177494;REVB=0.0240613;RO=67;SAF=38;SAR=53;SRF=33;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0593936;STB=0.532317;TYPE=snp;VARB=0.0133286;OID=.;OPOS=7613765;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:158:67:67:91:91:53:38:33:34:53:38:33:34 chr17 7637938 . A G 246.78 PASS AO=81;DP=214;FAO=81;FDP=214;FR=.;FRO=133;FSAF=35;FSAR=46;FSRF=63;FSRR=70;FWDB=-0.0376702;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.074;QD=4.61267;RBI=0.0403156;REFB=0.000149347;REVB=-0.0143632;RO=133;SAF=35;SAR=46;SRF=63;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0462403;STB=0.526137;TYPE=snp;VARB=-0.000897062;OID=.;OPOS=7637938;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:214:133:133:81:81:46:35:63:70:46:35:63:70 chr17 7664239 . C T 229.5 PASS AO=76;DP=203;FAO=77;FDP=204;FR=.;FRO=127;FSAF=50;FSAR=27;FSRF=71;FSRR=56;FWDB=0.00128094;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.171;QD=4.49997;RBI=0.00527132;REFB=-0.0076674;REVB=-0.00511332;RO=124;SAF=49;SAR=27;SRF=70;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0929064;STB=0.55951;TYPE=snp;VARB=0.012541;OID=.;OPOS=7664239;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:204:124:127:76:77:27:49:70:54:27:50:71:56 chr17 7680159 . G A 59.26 PASS AO=17;DP=46;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=23;FSRR=6;FWDB=-0.00241893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.915;QD=5.04354;RBI=0.0261203;REFB=-0.0186935;REVB=-0.0260081;RO=29;SAF=13;SAR=4;SRF=23;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0438635;STB=0.557216;TYPE=snp;VARB=0.0355517;OID=.;OPOS=7680159;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:46:47:29:29:17:18:4:13:23:6:5:13:23:6 chr17 7681412 . C G 274.67 PASS AO=64;DP=130;FAO=64;FDP=130;FR=.;FRO=66;FSAF=18;FSAR=46;FSRF=15;FSRR=51;FWDB=0.033565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.4498;QD=8.4515;RBI=0.0415701;REFB=-0.01056;REVB=0.0245246;RO=64;SAF=18;SAR=46;SRF=14;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0727606;STB=0.534916;TYPE=snp;VARB=0.00906958;OID=.;OPOS=7681412;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:64:66:64:64:46:18:14:50:46:18:15:51 chr17 7721030 . G A 175.35 PASS AO=42;DP=94;FAO=44;FDP=96;FR=.;FRO=52;FSAF=31;FSAR=13;FSRF=37;FSRR=15;FWDB=-0.0121746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.442;QD=7.30623;RBI=0.0190456;REFB=-0.0111918;REVB=0.0146463;RO=52;SAF=31;SAR=11;SRF=37;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0332335;STB=0.504564;TYPE=snp;VARB=0.0116896;OID=.;OPOS=7721030;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:96:52:52:42:44:11:31:37:15:13:31:37:15 chr17 7722365 . C T 300.07 PASS AO=60;DP=104;FAO=59;FDP=103;FR=.;FRO=44;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=-0.0151936;FXX=0.0190458;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.074;QD=11.6533;RBI=0.0416319;REFB=-0.0156213;REVB=0.0387604;RO=44;SAF=28;SAR=32;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0610319;STB=0.537537;TYPE=snp;VARB=0.0118827;OID=.;OPOS=7722365;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:103:44:44:60:59:32:28:24:20:32:27:24:20 chr17 7843053 . C T 34.49 PASS AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0342195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.56;QD=22.9962;RBI=0.0453862;REFB=-0.00969914;REVB=-0.029815;RO=1;SAF=1;SAR=4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0951258;STB=0.555346;TYPE=snp;VARB=-0.00199803;OID=.;OPOS=7843053;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:6:6:1:1:5:5:4:1:0:1:4:1:0:1 chr17 7847955 . C A 108.47 PASS AO=15;DP=27;FAO=15;FDP=20;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3233;QD=21.6934;RBI=0.0618218;REFB=0.0168563;REVB=0.0618218;RO=12;SAF=0;SAR=15;SRF=0;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00365194;OID=.;OPOS=7847955;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:27:20:12:5:15:15:15:0:0:12:15:0:0:5 chr17 7849087 . C G 371.92 PASS AO=76;DP=136;FAO=76;FDP=135;FR=.;FRO=59;FSAF=23;FSAR=53;FSRF=24;FSRR=35;FWDB=0.045962;FXX=0.0073524;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.1944;QD=11.0199;RBI=0.0631193;REFB=0.00191454;REVB=0.0432614;RO=57;SAF=23;SAR=53;SRF=22;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0749343;STB=0.551702;TYPE=snp;VARB=-0.000212213;OID=.;OPOS=7849087;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:135:57:59:76:76:53:23:22:35:53:23:24:35 chr17 7851495 . TG T 744.48 PASS AO=137;DP=216;FAO=177;FDP=207;FR=.;FRO=30;FSAF=101;FSAR=76;FSRF=28;FSRR=2;FWDB=-0.129441;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.9381;QD=14.386;RBI=0.264456;REFB=0.0063724;REVB=-0.230612;RO=35;SAF=82;SAR=55;SRF=33;SRR=2;SSEN=0.448276;SSEP=0;SSSB=-0.141629;STB=0.554456;TYPE=del;VARB=0.0234011;OID=.;OPOS=7851496;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:137:203:177:207:30:101:76:28:2:3:35:82:55:33:2 chr17 7942901 . C G 24.08 PASS AO=4;DP=6;FAO=4;FDP=6;FR=.;FRO=2;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0703522;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=222.402;QD=16.0537;RBI=0.070634;REFB=-0.0439718;REVB=0.00630278;RO=2;SAF=1;SAR=3;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210252;STB=0.624469;TYPE=snp;VARB=0.0233596;OID=.;OPOS=7942901;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:2:2:4:4:3:1:0:2:3:1:0:2 chr17 7948175 . C T 92.22 PASS AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=-0.00340173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.9455;QD=8.38402;RBI=0.0440085;REFB=-0.0157916;REVB=-0.0438768;RO=23;SAF=12;SAR=9;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119787;STB=0.567506;TYPE=snp;VARB=0.032422;OID=.;OPOS=7948175;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:44:44:23:23:21:21:9:12:16:7:9:12:16:7 chr17 7950319 . G A 643.65 PASS AO=129;DP=233;FAO=133;FDP=237;FR=.;FRO=104;FSAF=44;FSAR=89;FSRF=49;FSRR=55;FWDB=0.00288677;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.373;QD=10.8632;RBI=0.011959;REFB=0.007132;REVB=-0.0116054;RO=104;SAF=44;SAR=85;SRF=49;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113753;STB=0.566403;TYPE=snp;VARB=-0.00568458;OID=.;OPOS=7950319;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:233:237:104:104:129:133:85:44:49:55:89:44:49:55 chr17 7951819 . A G 271.61 PASS AO=46;DP=77;FAO=49;FDP=79;FR=.;FRO=30;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=20;FSRR=10;FWDB=-0.00138898;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.929;QD=13.7524;RBI=0.00492696;REFB=0.00528762;REVB=-0.00472712;RO=29;SAF=19;SAR=27;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171165;STB=0.597898;TYPE=snp;VARB=-0.00359338;OID=.;OPOS=7951819;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:79:29:30:46:49:27:19:19:10:29:20:20:10 chr17 7960625 . C T 104.17 PASS AO=40;DP=123;FAO=40;FDP=123;FR=.;FRO=83;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=55;FSRR=28;FWDB=0.0188731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.098;QD=3.38774;RBI=0.0189515;REFB=0.00670071;REVB=0.00172174;RO=81;SAF=23;SAR=17;SRF=55;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126452;STB=0.561597;TYPE=snp;VARB=-0.0191365;OID=.;OPOS=7960625;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:81:83:40:40:17:23:55:26:17:23:55:28 chr17 7960656 . A T 88.35 PASS AO=36;DP=116;FAO=36;FDP=116;FR=.;FRO=80;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=56;FSRR=24;FWDB=0.0141218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.3654;QD=3.04656;RBI=0.0143735;REFB=-0.0105896;REVB=-0.00267831;RO=77;SAF=21;SAR=15;SRF=56;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181124;STB=0.585062;TYPE=snp;VARB=0.0256016;OID=.;OPOS=7960656;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:116:116:77:80:36:36:15:21:56:21:15:21:56:24 chr17 7984157 . A C 74.91 PASS AO=11;DP=25;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.00317512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.56;QD=10.7016;RBI=0.0832898;REFB=-0.0235003;REVB=0.0832293;RO=13;SAF=9;SAR=2;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168645;STB=0.571326;TYPE=snp;VARB=0.0159036;OID=.;OPOS=7984157;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:25:28:13:13:11:15:2:9:9:4:3:12:9:4 chr17 7999957 . G A 104.99 PASS AO=22;DP=43;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=22;FSAR=0;FSRF=20;FSRR=0;FWDB=0.060256;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.5069;QD=9.99947;RBI=0.060256;REFB=0.0200428;REVB=0;RO=20;SAF=22;SAR=0;SRF=20;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0102176;OID=.;OPOS=7999957;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:43:42:20:20:22:22:0:22:20:0:0:22:20:0 chr17 8011844 . C T 234.63 PASS AO=59;DP=131;FAO=60;FDP=132;FR=.;FRO=72;FSAF=41;FSAR=19;FSRF=45;FSRR=27;FWDB=0.0167315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.06;QD=7.10986;RBI=0.0200652;REFB=-0.00446803;REVB=-0.0110757;RO=72;SAF=40;SAR=19;SRF=45;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0583036;STB=0.535783;TYPE=snp;VARB=0.00677033;OID=.;OPOS=8011844;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:132:72:72:59:60:19:40:45:27:19:41:45:27 chr17 8021608 . G C 82.08 PASS AO=21;DP=51;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=0.00773575;FXX=0.019604;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.3964;QD=6.56675;RBI=0.0204655;REFB=-0.00961787;REVB=0.0189471;RO=29;SAF=13;SAR=8;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.077632;STB=0.544289;TYPE=snp;VARB=0.0138131;OID=.;OPOS=8021608;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:51:50:29:29:21:21:8:13:20:9:8:13:20:9 chr17 8022465 . C T 363.45 PASS AO=84;DP=167;FAO=84;FDP=167;FR=.;FRO=83;FSAF=65;FSAR=19;FSRF=59;FSRR=24;FWDB=-0.0161483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.243;QD=8.70534;RBI=0.0161842;REFB=0.00320711;REVB=-0.00107658;RO=83;SAF=65;SAR=19;SRF=59;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0771809;STB=0.542603;TYPE=snp;VARB=-0.00444733;OID=.;OPOS=8022465;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:167:83:83:84:84:19:65:59:24:19:65:59:24 chr17 8023057 . A C 122.91 PASS AO=39;DP=105;FAO=40;FDP=106;FR=.;FRO=66;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=27;FSRR=39;FWDB=-0.00917911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.784;QD=4.63822;RBI=0.0175792;REFB=0.0103312;REVB=-0.0149924;RO=64;SAF=15;SAR=24;SRF=27;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0423438;STB=0.505879;TYPE=snp;VARB=-0.00799289;OID=.;OPOS=8023057;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:106:64:66:39:40:24:15:27:37:24:16:27:39 chr17 8023059 . A C 127.14 PASS AO=41;DP=112;FAO=41;FDP=110;FR=.;FRO=69;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=30;FSRR=39;FWDB=0.000152249;FXX=0.0178555;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.806;QD=4.62337;RBI=0.0129414;REFB=0.00710137;REVB=-0.0129405;RO=69;SAF=17;SAR=24;SRF=29;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00639193;STB=0.512954;TYPE=snp;VARB=-0.00809517;OID=.;OPOS=8023059;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:110:69:69:41:41:24:17:29:40:24:17:30:39 chr17 8023143 . G A 209.26 PASS AO=58;DP=136;FAO=58;FDP=136;FR=.;FRO=78;FSAF=21;FSAR=37;FSRF=34;FSRR=44;FWDB=-0.0384125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.394;QD=6.15483;RBI=0.0385816;REFB=0.0108678;REVB=0.00360816;RO=76;SAF=21;SAR=37;SRF=34;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0907801;STB=0.544685;TYPE=snp;VARB=-0.0103213;OID=.;OPOS=8023143;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:76:78:58:58:37:21:34:42:37:21:34:44 chr17 8023150 . T C 343.13 PASS AO=73;DP=135;FAO=73;FDP=135;FR=.;FRO=62;FSAF=32;FSAR=41;FSRF=22;FSRR=40;FWDB=0.0064093;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=273.095;QD=10.1669;RBI=0.00678817;REFB=-0.0104437;REVB=0.00223611;RO=61;SAF=32;SAR=41;SRF=21;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0804606;STB=0.539315;TYPE=snp;VARB=0.0100961;OID=.;OPOS=8023150;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:61:62:73:73:41:32:21:40:41:32:22:40 chr17 8024237 . T C 382.59 PASS AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0317639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.5122;QD=37.3255;RBI=0.0382835;REFB=0;REVB=0.02137;RO=0;SAF=23;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.4817e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000115645;OID=.;OPOS=8024237;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:40:41:0:0:40:41:17:23:0:0:17:24:0:0 chr17 8048169 . T C 290.01 PASS AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2554;QD=37.4201;RBI=0.0162698;REFB=0;REVB=-0.00548949;RO=0;SAF=11;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00018931;OID=.;OPOS=8048169;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:31:31:0:0:31:31:20:11:0:0:20:11:0:0 chr17 8050851 . TGG TG,T 21.51 PASS AO=7,5;DP=25;FAO=5,4;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=2,0;FSAR=3,4;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.268478,0.148873;FXX=0.0740466;HRUN=3,3;LEN=1,2;MLLD=10.9892,24.0069;QD=3.44179;RBI=0.39713,0.212097;REFB=-0.0708863,-0.0372604;REVB=-0.292629,-0.151069;RO=10;SAF=1,0;SAR=6,5;SRF=7;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.558176,-0.767621;STB=0.576614,0.997008;TYPE=del,del;VARB=-0.0322832,0.00121454;OID=.,.;OPOS=8050852,8050852;OREF=G,GG;OALT=-,-;OMAPALT=TG,T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:7,5:25:5,4:25:16:2,0:3,4:8:8:9:10:1,0:6,5:7:3 chr17 8051377 . GCC GC,G 107.53 PASS AO=9,6;DP=25;FAO=22,0;FDP=26;FR=.;FRO=4;FSAF=16,0;FSAR=6,0;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.281035,-0.151587;FXX=0.0370233;HRUN=5,5;LEN=1,2;MLLD=11.0892,11.5441;QD=16.5426;RBI=0.281442,0.151771;REFB=0.021956,0.0138774;REVB=0.0151417,0.00747924;RO=4;SAF=8,6;SAR=1,0;SRF=3;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0.305556,0.305556;SSSB=0.158958,0.742782;STB=0.504421,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.00473773,-0.0518586;OID=.,.;OPOS=8051378,8051378;OREF=C,CC;OALT=-,-;OMAPALT=GC,G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:9,6:23:22,0:26:4:16,0:6,0:3:1:4:4:8,6:1,0:3:1 chr17 8062583 . A G 995.34 PASS AO=106;DP=108;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119865;FXX=0.0092584;HRUN=4;LEN=1;MLLD=220.763;QD=37.209;RBI=0.0144052;REFB=0.0206196;REVB=0.00798953;RO=2;SAF=76;SAR=30;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00935165;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.73032e-05;OID=.;OPOS=8062583;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:108:107:2:0:106:107:30:76:1:1:31:76:0:0 chr17 8062906 . AG A 102.61 PASS AO=34;DP=85;FAO=45;FDP=72;FR=.;FRO=27;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.0138586;FXX=0.0649266;HRUN=7;LEN=1;MLLD=8.9601;QD=5.70059;RBI=0.102074;REFB=-0.126292;REVB=0.101129;RO=33;SAF=16;SAR=18;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0412839;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.149865;OID=.;OPOS=8062907;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:34:77:45:72:27:20:25:12:15:26:33:16:18:14:19 chr17 8064083 . T G 1229.86 PASS AO=96;DP=146;FAO=122;FDP=131;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=120;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156837;FXX=0.0902715;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.368;QD=37.5531;RBI=0.0787992;REFB=0;REVB=0.0772226;RO=0;SAF=94;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.47589e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00262358;OID=.;OPOS=8064083;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:141:131:0:0:96:122:2:94:0:0:2:120:0:0 chr17 8076778 . C T 1277.88 PASS AO=134;DP=134;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.418;QD=38.1456;RBI=0.019812;REFB=0;REVB=0.014103;RO=0;SAF=67;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.16143e-05;OID=.;OPOS=8076778;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:134:134:0:0:134:134:67:67:0:0:67:67:0:0 chr17 8076802 . T A 1259.72 PASS AO=134;DP=136;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00323253;FXX=0.0753373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.9519;QD=37.3252;RBI=0.0298236;REFB=-0.113468;REVB=0.0296479;RO=0;SAF=70;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00300371;OID=.;OPOS=8076802;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:136:135:0:0:134:135:64:70:0:0:65:70:0:0 chr17 8079029 . G C 459.52 PASS AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0637176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.0494;QD=38.2931;RBI=0.0904651;REFB=0;REVB=0.0642184;RO=0;SAF=23;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00187451;OID=.;OPOS=8079029;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:48:48:0:0:48:48:25:23:0:0:25:23:0:0 chr17 8090901 . C T 236.66 PASS AO=61;DP=143;FAO=65;FDP=148;FR=.;FRO=83;FSAF=47;FSAR=18;FSRF=38;FSRR=45;FWDB=0.00904359;FXX=0.00671096;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.445;QD=6.39633;RBI=0.0114543;REFB=-0.0109297;REVB=-0.00702954;RO=80;SAF=44;SAR=17;SRF=36;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.291366;STB=0.659267;TYPE=snp;VARB=0.0231972;OID=.;OPOS=8090901;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:148:80:83:61:65:17:44:36:44:18:47:38:45 chr17 8090908 . A G 1393.62 PASS AO=148;DP=150;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00184007;FXX=0.0133324;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.8305;QD=37.6655;RBI=0.0268985;REFB=-0.0254617;REVB=-0.0268355;RO=2;SAF=86;SAR=62;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0150926;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000109114;OID=.;OPOS=8090908;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:150:148:2:0:148:148:62:86:0:2:62:86:0:0 chr17 8092694 . T G 190.83 PASS AO=13;DP=22;FAO=20;FDP=20;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0880045;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.3881;QD=38.1652;RBI=0.159362;REFB=0;REVB=0.132859;RO=0;SAF=8;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60098e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.012967;OID=.;OPOS=8092694;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:19:20:0:0:13:20:5:8:0:0:8:12:0:0 chr17 8108331 . A G 266.81 PASS AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0538823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.232;QD=38.1158;RBI=0.0577154;REFB=0;REVB=0.0206826;RO=0;SAF=12;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000331058;OID=.;OPOS=8108331;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:28:28:0:0:28:28:16:12:0:0:16:12:0:0 chr17 8108339 . G A 291.97 PASS AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0110485;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.0485;QD=38.9297;RBI=0.0506345;REFB=0;REVB=0.0494144;RO=0;SAF=12;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000863939;OID=.;OPOS=8108339;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:30:30:0:0:30:30:18:12:0:0:18:12:0:0 chr17 8132763 . T C 256.95 PASS AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0230896;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.384;QD=38.0667;RBI=0.0304848;REFB=0;REVB=-0.0199046;RO=0;SAF=19;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.06954e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000158236;OID=.;OPOS=8132763;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:28:27:0:0:27:27:8:19:0:0:8:19:0:0 chr17 8135061 . T C 316.55 PASS AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00173851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.286;QD=37.2409;RBI=0.003377;REFB=0;REVB=-0.00289512;RO=0;SAF=17;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.8987e-05;OID=.;OPOS=8135061;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:34:0:0:34:34:17:17:0:0:17:17:0:0 chr17 8141707 . T C 1189.99 PASS AO=125;DP=127;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0128395;FXX=0.0078734;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.944;QD=37.7776;RBI=0.0184524;REFB=-0.0351037;REVB=-0.013253;RO=1;SAF=45;SAR=80;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104409;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000468574;OID=.;OPOS=8141707;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:127:126:1:0:125:126:80:45:1:0:81:45:0:0 chr17 8157310 . C T 1083.03 PASS AO=115;DP=119;FAO=117;FDP=119;FR=.;FRO=2;FSAF=79;FSAR=38;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0203093;FXX=0.0165276;HRUN=4;LEN=1;MLLD=246.266;QD=36.4043;RBI=0.0296169;REFB=-0.0780849;REVB=0.0215568;RO=1;SAF=77;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00612799;STB=0.506249;TYPE=snp;VARB=0.000152554;OID=.;OPOS=8157310;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:119:119:1:2:115:117:38:77:1:0:38:79:2:0 chr17 8161149 . C T 1091.21 PASS AO=136;DP=153;FAO=136;FDP=153;FR=.;FRO=17;FSAF=65;FSAR=71;FSRF=16;FSRR=1;FWDB=0.0347926;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.512;QD=28.5284;RBI=0.0350178;REFB=-0.0144771;REVB=-0.00396541;RO=17;SAF=65;SAR=71;SRF=16;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0971566;STB=0.55133;TYPE=snp;VARB=0.00250578;OID=.;OPOS=8161149;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:153:153:17:17:136:136:71:65:16:1:71:65:16:1 chr17 8167599 . CT C,CC 674.63 PASS AO=16,63;DP=83;FAO=13,60;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=4,4;FSAR=9,56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0399936,0.068028;FXX=0.0640943;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=102.33,110.316;QD=36.9661;RBI=0.0424052,0.0690214;REFB=0,0;REVB=0.0140965,0.0116685;RO=0;SAF=3,1;SAR=13,62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.78418e-08,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.027267,0.0132567;OID=.,.;OPOS=8167600,8167600;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:16,63:80:13,60:73:0:4,4:9,56:0:0:9:0:3,1:13,62:0:0 chr17 8168224 . T C 158.92 PASS AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00789993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.923;QD=37.393;RBI=0.0269848;REFB=0;REVB=-0.0258025;RO=0;SAF=6;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00042597;OID=.;OPOS=8168224;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:17:17:0:0:17:17:11:6:0:0:11:6:0:0 chr17 8172732 . A G 1082.05 PASS AO=115;DP=116;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0420176;FXX=0.00861995;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.429;QD=37.6367;RBI=0.0563741;REFB=0.0577476;REVB=-0.0375839;RO=1;SAF=52;SAR=63;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0074785;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0010659;OID=.;OPOS=8172732;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:116:115:1:0:115:115:63:52:0:1:63:52:0:0 chr17 8224276 . T C 183.08 PASS AO=38;DP=69;FAO=37;FDP=68;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=28;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=-0.0123711;FXX=0.0285673;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.8596;QD=10.7692;RBI=0.0131901;REFB=-0.0114777;REVB=-0.00457543;RO=31;SAF=10;SAR=28;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121249;STB=0.581555;TYPE=snp;VARB=0.010835;OID=.;OPOS=8224276;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:68:31:31:38:37:28:10:12:19:28:9:12:19 chr17 8232991 . A AT 131.15 PASS AO=73;DP=216;FAO=85;FDP=209;FR=.;FRO=124;FSAF=24;FSAR=61;FSRF=37;FSRR=87;FWDB=0.0384474;FXX=0.0233634;HRUN=3;LEN=1;MLLD=17.0305;QD=2.51011;RBI=0.0726378;REFB=0.002782;REVB=0.0616283;RO=123;SAF=21;SAR=52;SRF=37;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0175896;STB=0.511616;TYPE=ins;VARB=-0.0104352;OID=.;OPOS=8232992;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:73:216:85:209:124:24:61:37:87:99:123:21:52:37:86 chr17 8243469 . T C 118.06 PASS AO=23;DP=51;FAO=25;FDP=48;FR=.;FRO=23;FSAF=23;FSAR=2;FSRF=22;FSRR=1;FWDB=-0.0322742;FXX=0.0769083;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.842;QD=9.83823;RBI=0.0326596;REFB=0.0119355;REVB=-0.00500282;RO=22;SAF=21;SAR=2;SRF=21;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12891;STB=0.565991;TYPE=snp;VARB=-0.0111887;OID=.;OPOS=8243469;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:48:22:23:23:25:2:21:21:1:2:23:22:1 chr17 8243661 . G A 274.12 PASS AO=58;DP=108;FAO=58;FDP=108;FR=.;FRO=50;FSAF=36;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=30;FWDB=-0.00441336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.705;QD=10.1524;RBI=0.00442341;REFB=-0.0208486;REVB=0.000297999;RO=49;SAF=36;SAR=22;SRF=19;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195543;STB=0.603057;TYPE=snp;VARB=0.0123643;OID=.;OPOS=8243661;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:49:50:58:58:22:36:19:30:22:36:20:30 chr17 8243785 . A G 340.67 PASS AO=75;DP=146;FAO=76;FDP=146;FR=.;FRO=70;FSAF=39;FSAR=37;FSRF=35;FSRR=35;FWDB=-0.0360783;FXX=0.00680226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.372;QD=9.33346;RBI=0.0360823;REFB=-0.0266879;REVB=0.000534456;RO=70;SAF=39;SAR=36;SRF=35;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0175886;STB=0.506309;TYPE=snp;VARB=0.0267204;OID=.;OPOS=8243785;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:70:70:75:76:36:39:35:35:37:39:35:35 chr17 8339283 . C T 33.04 PASS AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0859219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.952;QD=18.8792;RBI=0.0870143;REFB=-0.0637357;REVB=0.0137449;RO=2;SAF=3;SAR=2;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.281149;STB=0.666029;TYPE=snp;VARB=0.0255391;OID=.;OPOS=8339283;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:2:2:5:5:2:3:0:2:2:3:0:2 chr17 8339307 . G A 53.72 PASS AO=6;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0313996;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3622;QD=30.6997;RBI=0.0724539;REFB=0;REVB=0.0652965;RO=1;SAF=2;SAR=4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171372;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0076014;OID=.;OPOS=8339307;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:7:7:1:0:6:7:4:2:1:0:4:3:0:0 chr17 8378932 . A G 494.2 PASS AO=114;DP=228;FAO=114;FDP=225;FR=.;FRO=111;FSAF=81;FSAR=33;FSRF=80;FSRR=31;FWDB=0.0202839;FXX=0.0131573;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.033;QD=8.78569;RBI=0.0207214;REFB=-0.00741391;REVB=-0.00423567;RO=111;SAF=81;SAR=33;SRF=80;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0112088;STB=0.506144;TYPE=snp;VARB=0.0115766;OID=.;OPOS=8378932;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:228:225:111:111:114:114:33:81:80:31:33:81:80:31 chr17 8383894 . A G 282.59 PASS AO=31;DP=31;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0338248;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1662;QD=37.6785;RBI=0.0340342;REFB=0;REVB=-0.00376946;RO=0;SAF=20;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00087934;OID=.;OPOS=8383894;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:31:30:0:0:31:30:11:20:0:0:11:19:0:0 chr17 8424270 . G A 1278.78 PASS AO=136;DP=139;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00956605;FXX=0.0285694;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.791;QD=37.6111;RBI=0.0252271;REFB=-0.0260713;REVB=0.0233431;RO=2;SAF=71;SAR=65;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0132014;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000232973;OID=.;OPOS=8424270;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:139:136:2:0:136:136:65:71:2:0:65:71:0:0 chr17 8647931 . G C 129.17 PASS AO=20;DP=29;FAO=20;FDP=29;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.0380593;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.7427;QD=17.8166;RBI=0.0505471;REFB=-0.0475847;REVB=0.0332641;RO=9;SAF=9;SAR=11;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0667753;STB=0.536806;TYPE=snp;VARB=0.0234192;OID=.;OPOS=8647931;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:29:29:9:9:20:20:11:9:3:6:11:9:3:6 chr17 8660806 . AG A 135.59 PASS AO=16;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.288892;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=15.5102;QD=28.5446;RBI=0.288986;REFB=0;REVB=0.00740661;RO=2;SAF=3;SAR=13;SRF=2;SRR=0;SSEN=0.392265;SSEP=0;SSSB=-0.225438;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0230498;OID=.;OPOS=8660807;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:16:19:19:19:0:5:14:0:0:13:2:3:13:2:0 chr17 8700675 . C T 126.05 PASS AO=27;DP=54;FAO=28;FDP=54;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=3;FSRR=23;FWDB=0.0218533;FXX=0.0181785;HRUN=3;LEN=1;MLLD=37.6195;QD=9.3368;RBI=0.0538125;REFB=-0.0774984;REVB=0.0491754;RO=27;SAF=8;SAR=19;SRF=3;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221309;STB=0.623686;TYPE=snp;VARB=0.0734111;OID=.;OPOS=8700675;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:27:26:27:28:19:8:3:24:19:9:3:23 chr17 8700982 . C T 89.7 PASS AO=18;DP=36;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=0.0585702;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.289;QD=9.96699;RBI=0.0770365;REFB=0.0161321;REVB=0.0500415;RO=15;SAF=6;SAR=12;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.319867;STB=0.656898;TYPE=snp;VARB=-0.00729205;OID=.;OPOS=8700982;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:36:36:15:17:18:19:12:6:11:4:12:7:12:5 chr17 8792003 . C T 327.61 PASS AO=10;DP=38;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00961412;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=192.382;QD=35.4168;RBI=0.0407159;REFB=-0.157285;REVB=0.0395646;RO=0;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.526301;TYPE=snp;VARB=0.000562229;OID=.;OPOS=8792003;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:12:37:0:1:10:36:6:4:0:0:27:9:1:0 chr17 8792027 . CAA CA,CAG 276.92 PASS AO=14,17;DP=36;FAO=16,15;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=2,11;FSAR=14,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0280891,-0.0816033;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=24.3853,25.6908;QD=35.7316;RBI=0.0972525,0.0966747;REFB=0,0;REVB=-0.0931077,-0.0518354;RO=0;SAF=1,12;SAR=13,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.0169465,0.0322831;OID=.,.;OPOS=8792028,8792029;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=CA,CAG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:14,17:31:16,15:31:0:2,11:14,4:0:0:59:0:1,12:13,5:0:0 chr17 8792093 . G A 214.34 PASS AO=23;DP=25;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0259539;FXX=0.079968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.349;QD=37.2757;RBI=0.0345519;REFB=0;REVB=0.0228085;RO=0;SAF=18;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000287819;OID=.;OPOS=8792093;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:25:23:0:0:23:23:5:18:0:0:5:18:0:0 chr17 8792171 . T C 392.67 PASS AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0161596;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.658;QD=37.3972;RBI=0.0290331;REFB=0;REVB=0.0241203;RO=0;SAF=8;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.67012e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.24026e-05;OID=.;OPOS=8792171;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:43:42:0:0:42:42:34:8:0:0:34:8:0:0 chr17 8792514 . G A 456.97 PASS AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0295273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.105;QD=35.8411;RBI=0.0466723;REFB=0.0163058;REVB=0.0361447;RO=0;SAF=34;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507243;TYPE=snp;VARB=-0.000269378;OID=.;OPOS=8792514;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:51:51:0:1:50:50:16:34:0:0:16:34:1:0 chr17 9086228 . C A 142.26 PASS AO=38;DP=103;FAO=44;FDP=109;FR=.;FRO=65;FSAF=14;FSAR=30;FSRF=31;FSRR=34;FWDB=0.0102506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.72;QD=5.22048;RBI=0.0116238;REFB=-0.0142962;REVB=0.00548061;RO=58;SAF=10;SAR=28;SRF=28;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.257227;STB=0.601021;TYPE=snp;VARB=0.0254845;OID=.;OPOS=9086228;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:109:58:65:38:44:28:10:28:30:30:14:31:34 chr17 9086293 . G C 154.07 PASS AO=33;DP=79;FAO=37;FDP=79;FR=.;FRO=42;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=0.0167272;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.736;QD=7.80111;RBI=0.018778;REFB=0.00635389;REVB=0.0085331;RO=45;SAF=12;SAR=21;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198147;STB=0.508936;TYPE=snp;VARB=-0.0253063;OID=.;OPOS=9086293;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:45:42:33:37:21:12:25:20:20:17:20:22 chr17 9086676 . T G 112.63 PASS AO=15;DP=32;FAO=21;FDP=35;FR=.;FRO=14;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.0344189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=40.3322;QD=12.8716;RBI=0.0959739;REFB=-0.117308;REVB=0.0895898;RO=14;SAF=9;SAR=6;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0250535;STB=0.519108;TYPE=snp;VARB=0.0740958;OID=.;OPOS=9086676;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:32:35:14:14:15:21:6:9:8:6:10:11:8:6 chr17 9086708 . T C 88.24 PASS AO=13;DP=27;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.00316021;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.644;QD=12.6063;RBI=0.031925;REFB=0.0161293;REVB=0.0317682;RO=12;SAF=5;SAR=8;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0991777;STB=0.526993;TYPE=snp;VARB=-0.0117443;OID=.;OPOS=9086708;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:27:28:12:12:13:16:8:5:6:6:9:7:6:6 chr17 9086712 . C T 43.87 PASS AO=11;DP=28;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.0227205;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.529;QD=6.26742;RBI=0.0329914;REFB=-0.00432896;REVB=-0.0239208;RO=17;SAF=6;SAR=5;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136212;STB=0.5805;TYPE=snp;VARB=0.0316474;OID=.;OPOS=9086712;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:28:28:17:17:11:11:5:6:7:10:5:6:7:10 chr17 9086743 . C T 48.91 PASS AO=10;DP=24;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0827319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.678;QD=7.52464;RBI=0.0828697;REFB=-0.0553463;REVB=-0.00477702;RO=13;SAF=4;SAR=6;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154027;STB=0.506568;TYPE=snp;VARB=0.037652;OID=.;OPOS=9086743;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:24:26:13:14:10:12:6:4:5:8:7:5:6:8 chr17 9395231 . G A 570.66 PASS AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0231656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.597;QD=36.2322;RBI=0.0293066;REFB=-0.0940049;REVB=0.0179509;RO=1;SAF=18;SAR=44;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106114;STB=0.505616;TYPE=snp;VARB=0.000385996;OID=.;OPOS=9395231;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:63:63:1:1:62:62:44:18:0:1:44:18:0:1 chr17 9471711 . T G 760.43 PASS AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0158728;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.806;QD=38.5027;RBI=0.0164164;REFB=0;REVB=0.00418975;RO=0;SAF=32;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.45895e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.14417e-06;OID=.;OPOS=9471711;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:79:79:0:0:79:79:47:32:0:0:47:32:0:0 chr17 9479098 . C A 222.83 PASS AO=30;DP=37;FAO=30;FDP=37;FR=.;FRO=7;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.02198;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=141.687;QD=24.0896;RBI=0.0235359;REFB=-0.214935;REVB=0.00841545;RO=7;SAF=14;SAR=16;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114855;STB=0.562003;TYPE=snp;VARB=0.00703901;OID=.;OPOS=9479098;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:37:37:7:7:30:30:16:14:1:6:16:14:1:6 chr17 9515777 . G A 1541.25 PASS AO=163;DP=164;FAO=163;FDP=163;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0546485;FXX=0.0121205;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.4659;QD=37.8221;RBI=0.0559314;REFB=-0.0656926;REVB=0.0119109;RO=0;SAF=53;SAR=110;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000443312;OID=.;OPOS=9515777;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:164:163:0:0:163:163:110:53:0:0:109:54:0:0 chr17 9586165 . C T 299.35 PASS AO=67;DP=131;FAO=67;FDP=131;FR=.;FRO=64;FSAF=34;FSAR=33;FSRF=34;FSRR=30;FWDB=0.0105791;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=195.513;QD=9.14053;RBI=0.0233915;REFB=-0.020031;REVB=0.0208625;RO=64;SAF=34;SAR=33;SRF=34;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0211234;STB=0.511624;TYPE=snp;VARB=0.0164392;OID=.;OPOS=9586165;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:64:64:67:67:33:34:34:30:33:34:34:30 chr17 9712255 . G A 172.26 PASS AO=30;DP=58;FAO=35;FDP=62;FR=.;FRO=27;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=19;FWDB=0.0461666;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.272;QD=11.1138;RBI=0.0467671;REFB=-0.0320818;REVB=0.00747047;RO=28;SAF=17;SAR=13;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21007;STB=0.643429;TYPE=snp;VARB=0.0218141;OID=.;OPOS=9712255;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:62:28:27:30:35:13:17:9:19:13:22:8:19 chr17 9764531 . A G 407.11 PASS AO=122;DP=302;FAO=124;FDP=305;FR=.;FRO=181;FSAF=47;FSAR=77;FSRF=66;FSRR=115;FWDB=-0.00387725;FXX=0.00326787;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.5;QD=5.33915;RBI=0.0157421;REFB=0.00588942;REVB=-0.0152572;RO=178;SAF=47;SAR=75;SRF=64;SRR=114;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0290171;STB=0.50911;TYPE=snp;VARB=-0.00985736;OID=.;OPOS=9764531;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:302:305:178:181:122:124:75:47:64:114:77:47:66:115 chr17 9792768 . G A 399.53 PASS AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0581959;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0909;QD=35.5135;RBI=0.0583737;REFB=-0.0204957;REVB=-0.0045528;RO=1;SAF=15;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.015927;STB=0.508471;TYPE=snp;VARB=0.00328796;OID=.;OPOS=9792768;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:45:45:1:1:44:44:29:15:0:1:29:15:0:1 chr17 9792872 . T C 652.01 PASS AO=67;DP=67;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00374191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.417;QD=38.3538;RBI=0.0079669;REFB=0;REVB=0.00703346;RO=0;SAF=54;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.36755e-05;OID=.;OPOS=9792872;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:67:68:0:0:67:68:13:54:0:0:13:55:0:0 chr17 10216510 . G A 247.73 PASS AO=65;DP=152;FAO=68;FDP=158;FR=.;FRO=90;FSAF=38;FSAR=30;FSRF=45;FSRR=45;FWDB=-0.0175911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.544;QD=6.27158;RBI=0.0362397;REFB=-0.0195592;REVB=0.0316838;RO=85;SAF=37;SAR=28;SRF=41;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.088566;STB=0.533698;TYPE=snp;VARB=0.0256317;OID=.;OPOS=10216510;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:158:85:90:65:68:28:37:41:44:30:38:45:45 chr17 10223714 . T C 1005.47 PASS AO=108;DP=119;FAO=114;FDP=115;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0173992;FXX=0.0495827;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.683;QD=34.9729;RBI=0.108905;REFB=-0.0301421;REVB=0.107507;RO=2;SAF=47;SAR=61;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0153071;STB=0.503703;TYPE=snp;VARB=0.00183397;OID=.;OPOS=10223714;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:119:115:2:1:108:114:61:47:0:2:67:47:0:1 chr17 10236465 . G A 940.34 PASS AO=97;DP=97;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0417217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.273;QD=38.3811;RBI=0.0430429;REFB=0;REVB=0.0105829;RO=0;SAF=27;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.53332e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.86435e-05;OID=.;OPOS=10236465;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:97:98:0:0:97:98:70:27:0:0:70:28:0:0 chr17 10243717 . G A 1509.09 PASS AO=159;DP=161;FAO=160;FDP=160;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0723577;FXX=0.0184038;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.76;QD=37.7273;RBI=0.103195;REFB=-0.0477404;REVB=-0.0735767;RO=0;SAF=64;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.47089e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.71131e-05;OID=.;OPOS=10243717;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:161:160:0:0:159:160:95:64:0:0:95:65:0:0 chr17 10296486 . G A 457.78 PASS AO=76;DP=254;FAO=114;FDP=242;FR=.;FRO=128;FSAF=58;FSAR=56;FSRF=72;FSRR=56;FWDB=0.0115733;FXX=0.0122444;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.982;QD=7.56663;RBI=0.0272499;REFB=-0.0101007;REVB=0.0246701;RO=98;SAF=29;SAR=47;SRF=49;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122481;STB=0.52845;TYPE=snp;VARB=0.0137347;OID=.;OPOS=10296486;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:199:242:98:128:76:114:47:29:49:49:56:58:72:56 chr17 10297658 . A G 212.5 PASS AO=56;DP=125;FAO=56;FDP=126;FR=.;FRO=70;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=34;FSRR=36;FWDB=-0.0214325;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.1048;QD=6.74611;RBI=0.0730184;REFB=-0.0275582;REVB=-0.0698021;RO=66;SAF=24;SAR=32;SRF=32;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0552995;STB=0.532099;TYPE=snp;VARB=0.0438387;OID=.;OPOS=10297658;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:126:66:70:56:56:32:24:32:34:32:24:34:36 chr17 10304261 . G A 220.25 PASS AO=53;DP=116;FAO=55;FDP=119;FR=.;FRO=64;FSAF=24;FSAR=31;FSRF=30;FSRR=34;FWDB=0.0321153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.1378;QD=7.40346;RBI=0.0340655;REFB=-0.0223043;REVB=-0.0113606;RO=62;SAF=23;SAR=30;SRF=30;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0487917;STB=0.517619;TYPE=snp;VARB=0.0233712;OID=.;OPOS=10304261;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:119:62:64:53:55:30:23:30:32:31:24:30:34 chr17 10318636 . A G 2480.61 PASS AO=232;DP=235;FAO=261;FDP=261;FR=.;FRO=0;FSAF=142;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023111;FXX=0.00760427;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.513;QD=38.0169;RBI=0.0234033;REFB=0;REVB=0.00368737;RO=0;SAF=115;SAR=117;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.15081e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.00212e-05;OID=.;OPOS=10318636;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:235:261:0:0:232:261:117:115:0:0:119:142:0:0 chr17 10346781 . T C 347.38 PASS AO=71;DP=127;FAO=71;FDP=127;FR=.;FRO=56;FSAF=2;FSAR=69;FSRF=6;FSRR=50;FWDB=0.0168702;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.122;QD=10.941;RBI=0.0307726;REFB=0.00483762;REVB=0.0257361;RO=55;SAF=2;SAR=69;SRF=6;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.356649;STB=0.698659;TYPE=snp;VARB=-0.00491946;OID=.;OPOS=10346781;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:55:56:71:71:69:2:6:49:69:2:6:50 chr17 10348354 . T C 126.89 PASS AO=32;DP=77;FAO=35;FDP=84;FR=.;FRO=49;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=-0.0174894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.715;QD=6.04233;RBI=0.0326785;REFB=0.00144353;REVB=-0.0276045;RO=45;SAF=11;SAR=21;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110137;STB=0.553367;TYPE=snp;VARB=-0.00243092;OID=.;OPOS=10348354;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:84:45:49:32:35:21:11:20:25:21:14:24:25 chr17 10355371 . C T 118.29 PASS AO=27;DP=60;FAO=29;FDP=64;FR=.;FRO=35;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=11;FWDB=-0.0321743;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=40.217;QD=7.39287;RBI=0.0861164;REFB=-0.0502804;REVB=0.0798802;RO=33;SAF=19;SAR=8;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0422726;STB=0.518684;TYPE=snp;VARB=0.0591026;OID=.;OPOS=10355371;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:64:33:35:27:29:8:19:22:11:10:19:24:11 chr17 10355763 . T C 554.84 PASS AO=142;DP=305;FAO=142;FDP=304;FR=.;FRO=162;FSAF=69;FSAR=73;FSRF=78;FSRR=84;FWDB=-0.0078596;FXX=0.00327858;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.979;QD=7.30045;RBI=0.00815226;REFB=-0.0131879;REVB=0.00216473;RO=162;SAF=69;SAR=73;SRF=78;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00428806;STB=0.502365;TYPE=snp;VARB=0.0205937;OID=.;OPOS=10355763;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:305:304:162:162:142:142:73:69:78:84:73:69:78:84 chr17 10363410 . A G 832.12 PASS AO=211;DP=434;FAO=198;FDP=399;FR=.;FRO=201;FSAF=63;FSAR=135;FSRF=90;FSRR=111;FWDB=-0.00252168;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.896;QD=8.34205;RBI=0.0206818;REFB=-0.0251621;REVB=0.0205275;RO=220;SAF=69;SAR=142;SRF=103;SRR=117;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140879;STB=0.571314;TYPE=snp;VARB=0.0235151;OID=.;OPOS=10363410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:434:399:220:201:211:198:142:69:103:117:135:63:90:111 chr17 10415303 . C T 522.87 PASS AO=260;DP=663;FAO=161;FDP=399;FR=.;FRO=238;FSAF=58;FSAR=103;FSRF=100;FSRR=138;FWDB=0.010524;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.126;QD=5.24176;RBI=0.0113411;REFB=0.00166467;REVB=0.00422699;RO=402;SAF=98;SAR=162;SRF=181;SRR=221;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0826643;STB=0.537943;TYPE=snp;VARB=-0.00226691;OID=.;OPOS=10415303;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:663:399:402:238:260:161:162:98:181:221:103:58:100:138 chr17 10415840 . A G 1030.68 PASS AO=109;DP=112;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162665;FXX=0.0672212;HRUN=3;LEN=1;MLLD=174.34;QD=37.1416;RBI=0.0182702;REFB=-0.100162;REVB=-0.00831863;RO=2;SAF=31;SAR=78;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00901792;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.48033e-05;OID=.;OPOS=10415840;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:112:111:2:0:109:111:78:31:1:1:78:33:0:0 chr17 10448733 . GC G 1159.49 PASS AO=122;DP=163;FAO=176;FDP=176;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=116;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.271985;FXX=0.0056494;HRUN=2;LEN=1;MLLD=17.4208;QD=26.352;RBI=0.365064;REFB=0;REVB=-0.243507;RO=21;SAF=25;SAR=97;SRF=21;SRR=0;SSEN=0.617143;SSEP=0;SSSB=-0.277386;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.000536741;OID=.;OPOS=10448734;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:122:165:176:176:0:60:116:0:0:99:21:25:97:21:0 chr17 10448769 . A T 305.16 PASS AO=82;DP=189;FAO=82;FDP=186;FR=.;FRO=104;FSAF=21;FSAR=61;FSRF=36;FSRR=68;FWDB=-0.0249644;FXX=0.0158722;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.2192;QD=6.56266;RBI=0.0409272;REFB=-0.0210962;REVB=-0.0324317;RO=102;SAF=21;SAR=61;SRF=36;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117964;STB=0.56206;TYPE=snp;VARB=0.0215674;OID=.;OPOS=10448769;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:186:102:104:82:82:61:21:36:66:61:21:36:68 chr17 10450816 . T C 604.47 PASS AO=162;DP=362;FAO=164;FDP=365;FR=.;FRO=201;FSAF=94;FSAR=70;FSRF=105;FSRR=96;FWDB=-0.00169118;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.909;QD=6.62431;RBI=0.0139407;REFB=-0.00900245;REVB=0.0138377;RO=200;SAF=94;SAR=68;SRF=104;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.061039;STB=0.528337;TYPE=snp;VARB=0.0100196;OID=.;OPOS=10450816;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:362:365:200:201:162:164:68:94:104:96:70:94:105:96 chr17 10534960 . C T 341.69 PASS AO=71;DP=130;FAO=71;FDP=130;FR=.;FRO=59;FSAF=46;FSAR=25;FSRF=24;FSRR=35;FWDB=-0.0277277;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.4766;QD=10.5135;RBI=0.0450605;REFB=-0.0320195;REVB=-0.0355193;RO=57;SAF=46;SAR=25;SRF=22;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217086;STB=0.611941;TYPE=snp;VARB=0.0174401;OID=.;OPOS=10534960;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:57:59:71:71:25:46:22:35:25:46:24:35 chr17 10536018 . G A 451.16 PASS AO=127;DP=299;FAO=128;FDP=299;FR=.;FRO=171;FSAF=39;FSAR=89;FSRF=62;FSRR=109;FWDB=-0.0215229;FXX=0.0132009;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.363;QD=6.03556;RBI=0.0490743;REFB=-0.0165268;REVB=0.0441027;RO=168;SAF=39;SAR=88;SRF=61;SRR=107;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0653494;STB=0.537903;TYPE=snp;VARB=0.0250222;OID=.;OPOS=10536018;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:299:299:168:171:127:128:88:39:61:107:89:39:62:109 chr17 10541515 . C T 543.35 PASS AO=59;DP=61;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.136714;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.0939;QD=36.2232;RBI=0.13703;REFB=-0.0407756;REVB=0.00929884;RO=1;SAF=33;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140845;STB=0.50746;TYPE=snp;VARB=0.00217906;OID=.;OPOS=10541515;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:61:60:1:1:59:59:26:33:1:0:26:33:1:0 chr17 10542471 . T G 365.77 PASS AO=92;DP=196;FAO=92;FDP=196;FR=.;FRO=104;FSAF=62;FSAR=30;FSRF=70;FSRR=34;FWDB=0.0116495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.458;QD=7.46478;RBI=0.011654;REFB=-0.02137;REVB=0.000325011;RO=104;SAF=62;SAR=30;SRF=70;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000912538;STB=0.500504;TYPE=snp;VARB=0.0233057;OID=.;OPOS=10542471;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:196:104:104:92:92:30:62:70:34:30:62:70:34 chr17 10542709 . G A 660.59 PASS AO=155;DP=312;FAO=156;FDP=312;FR=.;FRO=156;FSAF=63;FSAR=93;FSRF=82;FSRR=74;FWDB=-0.037014;FXX=0.00319479;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.886;QD=8.46908;RBI=0.0413174;REFB=-0.0291378;REVB=0.0183599;RO=151;SAF=62;SAR=93;SRF=79;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112692;STB=0.561727;TYPE=snp;VARB=0.0240493;OID=.;OPOS=10542709;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:312:312:151:156:155:156:93:62:79:72:93:63:82:74 chr17 10542765 . A G 397.05 PASS AO=91;DP=291;FAO=115;FDP=275;FR=.;FRO=160;FSAF=42;FSAR=73;FSRF=67;FSRR=93;FWDB=-0.0141881;FXX=0.010791;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.179;QD=5.77524;RBI=0.0241548;REFB=0.00203068;REVB=-0.0195488;RO=105;SAF=22;SAR=69;SRF=21;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0571137;STB=0.532984;TYPE=snp;VARB=-0.00309792;OID=.;OPOS=10542765;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:275:105:160:91:115:69:22:21:84:73:42:67:93 chr17 10542886 . T C 377.23 PASS AO=106;DP=251;FAO=108;FDP=253;FR=.;FRO=145;FSAF=40;FSAR=68;FSRF=76;FSRR=69;FWDB=-0.0445054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.0349;QD=5.96409;RBI=0.0477679;REFB=-0.0238971;REVB=0.0173508;RO=144;SAF=38;SAR=68;SRF=75;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172096;STB=0.590049;TYPE=snp;VARB=0.0416666;OID=.;OPOS=10542886;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:251:253:144:145:106:108:68:38:75:69:68:40:76:69 chr17 10543463 . T C 692.97 PASS AO=217;DP=456;FAO=183;FDP=398;FR=.;FRO=215;FSAF=85;FSAR=98;FSRF=106;FSRR=109;FWDB=0.0380066;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.721;QD=6.96453;RBI=0.0440971;REFB=-0.0148461;REVB=0.0223619;RO=233;SAF=103;SAR=114;SRF=112;SRR=121;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00570169;STB=0.515461;TYPE=snp;VARB=0.0165587;OID=.;OPOS=10543463;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:456:398:233:215:217:183:114:103:112:121:98:85:106:109 chr17 10544416 . G T 325.67 PASS AO=82;DP=177;FAO=82;FDP=176;FR=.;FRO=94;FSAF=39;FSAR=43;FSRF=43;FSRR=51;FWDB=-0.00157998;FXX=0.0056494;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2296;QD=7.40159;RBI=0.0366184;REFB=-0.0301545;REVB=0.0365843;RO=91;SAF=39;SAR=43;SRF=42;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.013429;STB=0.509731;TYPE=snp;VARB=0.0371269;OID=.;OPOS=10544416;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:176:91:94:82:82:43:39:42:49:43:39:43:51 chr17 10554899 . GC G 767.66 PASS AO=87;DP=137;FAO=126;FDP=127;FR=.;FRO=1;FSAF=69;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.337975;FXX=0.00781189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=16.4123;QD=24.1781;RBI=0.337996;REFB=-0.0674025;REVB=0.00376687;RO=23;SAF=41;SAR=46;SRF=19;SRR=4;SSEN=0.617143;SSEP=0;SSSB=-0.138481;STB=0.504347;TYPE=del;VARB=0.0165032;OID=.;OPOS=10554900;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:87:121:126:127:1:69:57:0:1:53:23:41:46:19:4 chr17 10558376 . A G 281.7 PASS AO=67;DP=138;FAO=67;FDP=138;FR=.;FRO=71;FSAF=20;FSAR=47;FSRF=33;FSRR=38;FWDB=-0.0339363;FXX=0.00719373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.686;QD=8.16534;RBI=0.0343848;REFB=-0.052072;REVB=0.00553579;RO=70;SAF=20;SAR=47;SRF=33;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17521;STB=0.594339;TYPE=snp;VARB=0.0542925;OID=.;OPOS=10558376;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:70:71:67:67:47:20:33:37:47:20:33:38 chr17 10614442 . A G 1152.77 PASS AO=124;DP=126;FAO=124;FDP=126;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=87;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0372876;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.8851;QD=36.5959;RBI=0.0564129;REFB=0.00973877;REVB=-0.0423326;RO=2;SAF=37;SAR=87;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00723666;STB=0.503809;TYPE=snp;VARB=-0.000396113;OID=.;OPOS=10614442;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:126:126:2:2:124:124:87:37:1:1:87:37:1:1 chr17 10617803 . G T 888.42 PASS AO=86;DP=90;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0112422;FXX=0.0504999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.6774;QD=37.8051;RBI=0.0195877;REFB=-0.069281;REVB=0.0160403;RO=1;SAF=39;SAR=47;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119932;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000264342;OID=.;OPOS=10617803;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:90:94:1:0:86:94:47:39:1:0:47:47:0:0 chr17 11523082 . A G 1077.3 PASS AO=118;DP=121;FAO=118;FDP=121;FR=.;FRO=3;FSAF=60;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0107494;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.12;QD=35.6132;RBI=0.0203103;REFB=-0.0987863;REVB=-0.0172324;RO=3;SAF=60;SAR=58;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239298;STB=0.512603;TYPE=snp;VARB=0.000626588;OID=.;OPOS=11523082;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:121:121:3:3:118:118:58:60:0:3:58:60:0:3 chr17 11583089 . T C 1903.34 PASS AO=198;DP=198;FAO=198;FDP=198;FR=.;FRO=0;FSAF=110;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.456;QD=38.4514;RBI=0.0291412;REFB=0;REVB=0.0102217;RO=0;SAF=110;SAR=88;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.37225e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.57818e-05;OID=.;OPOS=11583089;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:198:198:0:0:198:198:88:110:0:0:88:110:0:0 chr17 11648332 . C T 470.29 PASS AO=89;DP=154;FAO=93;FDP=157;FR=.;FRO=64;FSAF=45;FSAR=48;FSRF=22;FSRR=42;FWDB=0.0218993;FXX=0.00632871;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.3491;QD=11.9818;RBI=0.0232252;REFB=-0.043127;REVB=-0.00773489;RO=61;SAF=41;SAR=48;SRF=19;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113769;STB=0.557378;TYPE=snp;VARB=0.02572;OID=.;OPOS=11648332;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:157:61:64:89:93:48:41:19:42:48:45:22:42 chr17 11757556 . C G 1731.74 PASS AO=185;DP=185;FAO=183;FDP=183;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.049385;FXX=0.0108102;HRUN=4;LEN=1;MLLD=47.8708;QD=37.8523;RBI=0.0508329;REFB=0.0184952;REVB=-0.0120458;RO=0;SAF=97;SAR=88;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00027152;OID=.;OPOS=11757556;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:185:183:0:0:185:183:88:97:0:0:88:95:0:0 chr17 11786951 . T C 1242.03 PASS AO=129;DP=129;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0347794;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.923;QD=38.5126;RBI=0.0442839;REFB=0;REVB=-0.0274127;RO=0;SAF=76;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.142e-05;OID=.;OPOS=11786951;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:129:129:0:0:129:129:53:76:0:0:53:76:0:0 chr17 11787936 . A G 639.33 PASS AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0253809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.083;QD=38.1692;RBI=0.0441058;REFB=0;REVB=-0.0360712;RO=0;SAF=27;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.4872e-05;OID=.;OPOS=11787936;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:67:67:0:0:67:67:40:27:0:0:40:27:0:0 chr17 11865462 . G A 143.1 PASS AO=42;DP=104;FAO=42;FDP=105;FR=.;FRO=63;FSAF=7;FSAR=35;FSRF=17;FSRR=46;FWDB=0.0141117;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.123;QD=5.45154;RBI=0.0219396;REFB=-0.0254455;REVB=-0.016799;RO=61;SAF=7;SAR=35;SRF=17;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179908;STB=0.596964;TYPE=snp;VARB=0.0419999;OID=.;OPOS=11865462;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:105:61:63:42:42:35:7:17:44:35:7:17:46 chr17 12820632 . A C 1308.44 PASS AO=135;DP=135;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0426553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.587;QD=38.2026;RBI=0.0447875;REFB=0;REVB=-0.0136545;RO=0;SAF=49;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.99536e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.82854e-05;OID=.;OPOS=12820632;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:135:137:0:0:135:137:86:49:0:0:88:49:0:0 chr17 12852459 . A G 80.26 PASS AO=19;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.0276505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.149;QD=8.44808;RBI=0.0601979;REFB=-0.0345335;REVB=-0.0534718;RO=17;SAF=10;SAR=9;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193596;STB=0.60682;TYPE=snp;VARB=0.0347948;OID=.;OPOS=12852459;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:38:38:17:20:19:18:9:10:5:12:8:10:7:13 chr17 13399616 . A T 318.64 PASS AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00291816;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.479;QD=37.4875;RBI=0.00730442;REFB=0;REVB=0.00669619;RO=0;SAF=16;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.95329e-05;OID=.;OPOS=13399616;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:35:34:0:0:34:34:18:16:0:0:18:16:0:0 chr17 13446924 . G A 17.69 PASS AO=5;DP=18;FAO=5;FDP=18;FR=.;FRO=13;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.0313262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.478;QD=3.93148;RBI=0.0322931;REFB=0.00069107;REVB=0.00784316;RO=13;SAF=1;SAR=4;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157903;STB=0.605596;TYPE=snp;VARB=-0.00140085;OID=.;OPOS=13446924;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:18:18:13:13:5:5:4:1:4:9:4:1:4:9 chr17 13972955 . C T 379.39 PASS AO=109;DP=263;FAO=111;FDP=266;FR=.;FRO=155;FSAF=56;FSAR=55;FSRF=73;FSRR=82;FWDB=0.0545549;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6793;QD=5.70516;RBI=0.0590238;REFB=-0.0158678;REVB=0.0225295;RO=154;SAF=55;SAR=54;SRF=73;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.032031;STB=0.519533;TYPE=snp;VARB=0.018515;OID=.;OPOS=13972955;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:263:266:154:155:109:111:54:55:73:81:55:56:73:82 chr17 13980058 . A T 296.56 PASS AO=63;DP=116;FAO=63;FDP=116;FR=.;FRO=53;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=27;FSRR=26;FWDB=0.00933813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.323;QD=10.2262;RBI=0.0307874;REFB=-0.0289487;REVB=0.0293371;RO=52;SAF=36;SAR=27;SRF=26;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0595841;STB=0.528669;TYPE=snp;VARB=0.0288677;OID=.;OPOS=13980058;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:52:53:63:63:27:36:26:26:27:36:27:26 chr17 13980185 . C T 314.43 PASS AO=75;DP=157;FAO=76;FDP=156;FR=.;FRO=80;FSAF=10;FSAR=66;FSRF=21;FSRR=59;FWDB=0.0267808;FXX=0.00636902;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.242;QD=8.06239;RBI=0.0273972;REFB=-0.0270642;REVB=-0.00577886;RO=81;SAF=9;SAR=66;SRF=22;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.258428;STB=0.620716;TYPE=snp;VARB=0.0256184;OID=.;OPOS=13980185;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:156:81:80:75:76:66:9:22:59:66:10:21:59 chr17 13980350 . G A 122.48 PASS AO=26;DP=51;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=1;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=25;FWDB=0.0742511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.003;QD=9.60599;RBI=0.0742521;REFB=0.00384931;REVB=-0.000391915;RO=25;SAF=1;SAR=25;SRF=0;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.308219;STB=0.666577;TYPE=snp;VARB=-0.00966018;OID=.;OPOS=13980350;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:25:25:26:26:25:1:0:25:25:1:0:25 chr17 14005439 . G A 2115.29 PASS AO=220;DP=221;FAO=223;FDP=223;FR=.;FRO=0;FSAF=111;FSAR=112;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00245977;FXX=0.00446409;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.9009;QD=37.9425;RBI=0.0509555;REFB=-0.0268018;REVB=0.0508961;RO=1;SAF=111;SAR=109;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0043513;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000124363;OID=.;OPOS=14005439;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:92:221:223:1:0:220:223:109:111:0:1:112:111:0:0 chr17 14095309 . A G 277.36 PASS AO=69;DP=219;FAO=85;FDP=213;FR=.;FRO=128;FSAF=32;FSAR=53;FSRF=44;FSRR=84;FWDB=-0.0119019;FXX=0.0138882;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.508;QD=5.20866;RBI=0.0154048;REFB=0.00243218;REVB=-0.0097802;RO=88;SAF=19;SAR=50;SRF=15;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142803;STB=0.521155;TYPE=snp;VARB=-0.00274553;OID=.;OPOS=14095309;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:213:88:128:69:85:50:19:15:73:53:32:44:84 chr17 14139191 . C G 37.17 PASS AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0158573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.154;QD=10.6198;RBI=0.0179761;REFB=-0.0171099;REVB=-0.00846664;RO=7;SAF=4;SAR=3;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0223721;OID=.;OPOS=14139191;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:14:14:7:7:7:7:3:4:4:3:3:4:4:3 chr17 14139891 . A C 210.67 PASS AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0298781;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.085;QD=36.6384;RBI=0.0411442;REFB=0;REVB=0.0282868;RO=0;SAF=14;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84921e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000520558;OID=.;OPOS=14139891;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:0:0:23:23:9:14:0:0:9:14:0:0 chr17 14140080 . C T 161.9 PASS AO=39;DP=82;FAO=38;FDP=80;FR=.;FRO=42;FSAF=10;FSAR=28;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=0.0448425;FXX=0.0243873;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.737;QD=8.09482;RBI=0.0502398;REFB=-0.00362324;REVB=-0.0226538;RO=41;SAF=10;SAR=29;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218434;STB=0.614157;TYPE=snp;VARB=0.00373515;OID=.;OPOS=14140080;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:80:41:42:39:38:29:10:19:22:28:10:19:23 chr17 14140103 . A G 862.55 PASS AO=92;DP=93;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147233;FXX=0.0315756;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.099;QD=37.5019;RBI=0.0235481;REFB=-0.0724894;REVB=-0.0183776;RO=1;SAF=36;SAR=56;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129856;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000212201;OID=.;OPOS=14140103;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:93:92:1:0:92:92:56:36:1:0:56:36:0:0 chr17 14248369 . CG C 422.76 PASS AO=48;DP=65;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.386689;FXX=0.0476115;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.1773;QD=28.1843;RBI=0.386823;REFB=0;REVB=0.0101771;RO=7;SAF=8;SAR=40;SRF=6;SRR=1;SSEN=0.475207;SSEP=0;SSSB=-0.242454;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0134607;OID=.;OPOS=14248370;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:48:61:60:60:0:16:44:0:0:39:7:8:40:6:1 chr17 14248423 . T C 26.85 PASS AO=8;DP=31;FAO=10;FDP=34;FR=.;FRO=24;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=18;FWDB=0.0158879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.517;QD=3.15855;RBI=0.0189442;REFB=-0.0170323;REVB=-0.0103179;RO=23;SAF=0;SAR=8;SRF=5;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.685324;STB=0.551615;TYPE=snp;VARB=0.0338209;OID=.;OPOS=14248423;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:31:34:23:24:8:10:8:0:5:18:8:2:6:18 chr17 14683315 . TG T,TT 1185.95 PASS AO=66,109;DP=228;FAO=83,111;FDP=217;FR=.;FRO=23;FSAF=57,10;FSAR=26,101;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.0772865,0.0692753;FXX=0.0398212;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=13.6222,26.2204;QD=21.8607;RBI=0.0821696,0.0705602;REFB=-0.236704,-0.159164;REVB=-0.027904,-0.0134041;RO=37;SAF=48,8;SAR=18,101;SRF=19;SRR=18;SSEN=0.491803,0;SSEP=0,0;SSSB=0.163569,-0.442973;STB=0.570553,0.625258;TYPE=del,snp;VARB=0.121019,0.0105438;OID=.,.;OPOS=14683316,14683316;OREF=G,G;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:66,109:218:83,111:217:23:57,10:26,101:9:14:99:37:48,8:18,101:19:18 chr17 15154966 . T A 555.4 PASS AO=62;DP=65;FAO=62;FDP=64;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00940821;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.586;QD=34.7122;RBI=0.0100623;REFB=-0.00319052;REVB=-0.00356865;RO=2;SAF=22;SAR=40;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00931961;STB=0.504309;TYPE=snp;VARB=-1.0332e-05;OID=.;OPOS=15154966;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:65:64:2:2:62:62:40:22:1:1:39:23:1:1 chr17 15207364 . T G 953.6 PASS AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00732592;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.512;QD=38.1441;RBI=0.00932863;REFB=0;REVB=0.00577531;RO=0;SAF=59;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.3262e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000497974;OID=.;OPOS=15207364;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:100:100:0:0:100:100:41:59:0:0:41:59:0:0 chr17 15215660 . T C 286.31 PASS AO=69;DP=143;FAO=69;FDP=143;FR=.;FRO=74;FSAF=9;FSAR=60;FSRF=18;FSRR=56;FWDB=-0.000991215;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.347;QD=8.0086;RBI=0.00596208;REFB=0.00126587;REVB=-0.0058791;RO=74;SAF=9;SAR=60;SRF=18;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192999;STB=0.608073;TYPE=snp;VARB=-0.00144786;OID=.;OPOS=15215660;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:74:74:69:69:60:9:18:56:60:9:18:56 chr17 15217437 . C G 259.57 PASS AO=48;DP=82;FAO=49;FDP=82;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=32;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.0761451;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.273;QD=12.6618;RBI=0.076788;REFB=0.0583143;REVB=-0.0099155;RO=33;SAF=16;SAR=32;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16657;STB=0.583602;TYPE=snp;VARB=-0.0294073;OID=.;OPOS=15217437;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:33:33:48:49:32:16:18:15:32:17:18:15 chr17 15311975 . G A 606 PASS AO=46;DP=70;FAO=66;FDP=66;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=35;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.009296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.7735;QD=36.7271;RBI=0.0185074;REFB=0;REVB=0.0160034;RO=0;SAF=15;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000190305;OID=.;OPOS=15311975;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:66:66:0:0:46:66:31:15:0:0:31:35:0:0 chr17 15343524 . C CCTT 518.57 PASS AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=3;MLLD=174.094;QD=36.391;RBI=0.0145641;REFB=-0.0374193;REVB=-0.0145641;RO=1;SAF=0;SAR=56;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-4.06268e-05;OID=.;OPOS=15343525;OREF=-;OALT=CTT;OMAPALT=CCTT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:56:57:56:57:1:0:56:0:1:18:1:0:56:0:1 chr17 15406197 . A T 385.51 PASS AO=30;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.3447;QD=37.6103;RBI=0.0252984;REFB=0;REVB=-0.0103127;RO=0;SAF=18;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000133229;OID=.;OPOS=15406197;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:31:41:0:0:30:41:12:18:0:0:22:19:0:0 chr17 15441485 . AG A,AA 747.05 PASS AO=26,46;DP=76;FAO=15,64;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=4,17;FSAR=11,47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00550627,0.00796376;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=206.589,207.348;QD=37.8251;RBI=0.0194462,0.0191538;REFB=0,0;REVB=-0.0186504,-0.0174197;RO=0;SAF=9,10;SAR=17,36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.54368e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.0135839,0.00424884;OID=.,.;OPOS=15441486,15441486;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:26,46:72:15,64:79:0:4,17:11,47:0:0:20:0:9,10:17,36:0:0 chr17 15443734 . A G 786.04 PASS AO=78;DP=78;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.93;QD=37.8813;RBI=0.0141853;REFB=0;REVB=0.00799582;RO=0;SAF=55;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11101e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.5332e-05;OID=.;OPOS=15443734;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:78:83:0:0:78:83:23:55:0:0:26:57:0:0 chr17 15443742 . C G 891.57 PASS AO=95;DP=96;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0105732;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.415;QD=37.5398;RBI=0.0447916;REFB=-0.0148976;REVB=0.0435258;RO=0;SAF=65;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.36051e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000277593;OID=.;OPOS=15443742;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:96:95:0:0:95:95:30:65:0:0:30:65:0:0 chr17 15477417 . A G 529.73 PASS AO=39;DP=57;FAO=55;FDP=55;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0348756;FXX=0.0350816;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.489;QD=38.5259;RBI=0.154713;REFB=0;REVB=0.150731;RO=0;SAF=23;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43889e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000782814;OID=.;OPOS=15477417;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:57:55:0:0:39:55:16:23:0:0:26:29:0:0 chr17 15492426 . C T 122.72 PASS AO=16;DP=20;FAO=16;FDP=20;FR=.;FRO=4;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0132391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.9839;QD=24.5433;RBI=0.0969172;REFB=-0.0265852;REVB=-0.0960087;RO=4;SAF=7;SAR=9;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229225;STB=0.512642;TYPE=snp;VARB=0.00374001;OID=.;OPOS=15492426;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:20:20:4:4:16:16:9:7:2:2:9:7:2:2 chr17 15496730 . A G 1981.35 PASS AO=216;DP=222;FAO=216;FDP=221;FR=.;FRO=5;FSAF=108;FSAR=108;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.0226473;FXX=0.0045043;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.1569;QD=35.8615;RBI=0.0338462;REFB=-0.0281419;REVB=-0.0251529;RO=5;SAF=107;SAR=109;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00410926;STB=0.506787;TYPE=snp;VARB=0.00401645;OID=.;OPOS=15496730;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:222:221:5:5:216:216:109:107:2:3:108:108:1:4 chr17 15498181 . A G 296.8 PASS AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.046833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.695;QD=37.0999;RBI=0.0551059;REFB=0;REVB=0.0290401;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000207946;OID=.;OPOS=15498181;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:32:32:0:0:32:32:15:17:0:0:15:17:0:0 chr17 15510888 . G A 486.42 PASS AO=143;DP=344;FAO=143;FDP=343;FR=.;FRO=200;FSAF=87;FSAR=56;FSRF=113;FSRR=87;FWDB=-0.00893106;FXX=0.00290689;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.196;QD=5.67252;RBI=0.0194054;REFB=-0.0125832;REVB=-0.0172281;RO=200;SAF=87;SAR=56;SRF=113;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0470466;STB=0.526243;TYPE=snp;VARB=0.0177204;OID=.;OPOS=15510888;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:344:343:200:200:143:143:56:87:113:87:56:87:113:87 chr17 15510988 . T C 337.64 PASS AO=106;DP=269;FAO=106;FDP=269;FR=.;FRO=163;FSAF=59;FSAR=47;FSRF=89;FSRR=74;FWDB=-0.0603792;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.105;QD=5.02059;RBI=0.0608023;REFB=0.00946769;REVB=0.00716063;RO=155;SAF=59;SAR=47;SRF=82;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0295083;STB=0.50649;TYPE=snp;VARB=-0.00983086;OID=.;OPOS=15510988;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:269:269:155:163:106:106:47:59:82:73:47:59:89:74 chr17 15517237 . G C 101.96 PASS AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0669851;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.684;QD=37.0753;RBI=0.0697522;REFB=0;REVB=0.0194515;RO=0;SAF=5;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00154742;OID=.;OPOS=15517237;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:11:11:6:5:0:0:6:5:0:0 chr17 15532147 . G A 152.22 PASS AO=85;DP=188;FAO=44;FDP=109;FR=.;FRO=65;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=29;FSRR=36;FWDB=-0.00222807;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.143;QD=5.58606;RBI=0.0437731;REFB=-0.0121652;REVB=0.0437163;RO=102;SAF=34;SAR=51;SRF=47;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0613453;STB=0.508686;TYPE=snp;VARB=0.0160813;OID=.;OPOS=15532147;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:109:102:65:85:44:51:34:47:55:25:19:29:36 chr17 15554561 . C A 832.13 PASS AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.724;QD=38.2588;RBI=0.0311828;REFB=0;REVB=0.0256555;RO=0;SAF=49;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.33179e-05;OID=.;OPOS=15554561;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:87:87:0:0:87:87:38:49:0:0:38:49:0:0 chr17 15611495 . T C 1876.92 PASS AO=194;DP=198;FAO=198;FDP=198;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00740846;FXX=0.0149246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.485;QD=37.9176;RBI=0.025585;REFB=-0.042642;REVB=0.0244889;RO=1;SAF=89;SAR=105;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00451407;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.49723e-05;OID=.;OPOS=15611495;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:198:198:1:0:194:198:105:89:0:1:107:91:0:0 chr17 15619848 . C T 347.31 PASS AO=106;DP=259;FAO=105;FDP=259;FR=.;FRO=154;FSAF=44;FSAR=61;FSRF=67;FSRR=87;FWDB=-0.00181157;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.9636;QD=5.36391;RBI=0.015781;REFB=0.0326392;REVB=0.0156767;RO=152;SAF=45;SAR=61;SRF=66;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104186;STB=0.509747;TYPE=snp;VARB=-0.0404657;OID=.;OPOS=15619848;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:259:259:152:154:106:105:61:45:66:86:61:44:67:87 chr17 15620481 . C T 88.95 PASS AO=42;DP=140;FAO=41;FDP=142;FR=.;FRO=101;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=60;FSRR=41;FWDB=0.0107558;FXX=0.00699252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.4389;QD=2.50558;RBI=0.0824647;REFB=0.00093241;REVB=0.0817603;RO=98;SAF=22;SAR=20;SRF=59;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0944793;STB=0.5584;TYPE=snp;VARB=-0.00252555;OID=.;OPOS=15620481;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:140:142:98:101:42:41:20:22:59:39:20:21:60:41 chr17 15620647 . G A 615.22 PASS AO=68;DP=71;FAO=68;FDP=70;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00839389;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.457;QD=35.1557;RBI=0.0371635;REFB=-0.156859;REVB=0.0362031;RO=2;SAF=31;SAR=37;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00239951;STB=0.50127;TYPE=snp;VARB=0.00547555;OID=.;OPOS=15620647;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:71:70:2:2:68:68:37:31:1:1:37:31:1:1 chr17 15644506 . C T 107.39 PASS AO=26;DP=67;FAO=29;FDP=70;FR=.;FRO=41;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=0.0151979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.004;QD=6.13673;RBI=0.0213379;REFB=-0.0204968;REVB=0.0149777;RO=38;SAF=18;SAR=8;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.263111;STB=0.66304;TYPE=snp;VARB=0.0188796;OID=.;OPOS=15644506;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:70:38:41:26:29:8:18:17:21:8:21:19:22 chr17 15645289 . G A 115.89 PASS AO=22;DP=39;FAO=22;FDP=39;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.0463035;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.8998;QD=11.8857;RBI=0.0470274;REFB=0.0330567;REVB=-0.00821972;RO=17;SAF=8;SAR=14;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00904992;STB=0.505046;TYPE=snp;VARB=-0.021295;OID=.;OPOS=15645289;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:39:39:17:17:22:22:14:8:6:11:14:8:6:11 chr17 15690281 . C T 151.97 PASS AO=36;DP=86;FAO=40;FDP=90;FR=.;FRO=50;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=31;FSRR=19;FWDB=-9.30901e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.931;QD=6.75399;RBI=0.0789967;REFB=-0.0429538;REVB=0.0789967;RO=50;SAF=22;SAR=14;SRF=31;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00963901;STB=0.539573;TYPE=snp;VARB=0.0405189;OID=.;OPOS=15690281;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:90:50:50:36:40:14:22:31:19:18:22:31:19 chr17 15690294 . CCTT C 108.88 PASS AO=40;DP=100;FAO=44;FDP=101;FR=.;FRO=57;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=37;FSRR=20;FWDB=-0.00913745;FXX=0;HRUN=3;LEN=3;MLLD=151.694;QD=4.31198;RBI=0.0119015;REFB=0.00497571;REVB=0.00762573;RO=57;SAF=22;SAR=18;SRF=38;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0.385093;SSSB=-0.12471;STB=0.559607;TYPE=del;VARB=-0.0057096;OID=.;OPOS=15690295;OREF=CTT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:40:100:44:101:57:24:20:37:20:99:57:22:18:38:19 chr17 15690793 . T C 585.91 PASS AO=130;DP=246;FAO=130;FDP=247;FR=.;FRO=117;FSAF=46;FSAR=84;FSRF=50;FSRR=67;FWDB=-0.0344017;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.983;QD=9.48847;RBI=0.034466;REFB=-0.00608381;REVB=0.00210382;RO=116;SAF=46;SAR=84;SRF=50;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0711094;STB=0.537236;TYPE=snp;VARB=0.00452149;OID=.;OPOS=15690793;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:246:247:116:117:130:130:84:46:50:66:84:46:50:67 chr17 15690928 . G C 129.55 PASS AO=32;DP=71;FAO=32;FDP=71;FR=.;FRO=39;FSAF=3;FSAR=29;FSRF=11;FSRR=28;FWDB=-0.0360191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.078;QD=7.29849;RBI=0.037909;REFB=-0.0187817;REVB=-0.01182;RO=39;SAF=3;SAR=29;SRF=11;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.351976;STB=0.703481;TYPE=snp;VARB=0.0216756;OID=.;OPOS=15690928;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:39:39:32:32:29:3:11:28:29:3:11:28 chr17 16068340 . C T 40.46 PASS AO=67;DP=414;FAO=68;FDP=396;FR=.;FRO=328;FSAF=35;FSAR=33;FSRF=177;FSRR=151;FWDB=0.0050328;FXX=0.00999975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.498;QD=0.40864;RBI=0.00678002;REFB=-0.00828174;REVB=-0.00454308;RO=341;SAF=37;SAR=30;SRF=190;SRR=151;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00649131;STB=0.520685;TYPE=snp;VARB=0.0291132;OID=.;OPOS=16068340;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:414:396:341:328:67:68:30:37:190:151:33:35:177:151 chr17 16068343 . G A 54.99 PASS AO=81;DP=423;FAO=73;FDP=398;FR=.;FRO=325;FSAF=37;FSAR=36;FSRF=173;FSRR=152;FWDB=-0.0223978;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.4679;QD=0.552696;RBI=0.0241397;REFB=-0.015548;REVB=-0.00900361;RO=340;SAF=40;SAR=41;SRF=180;SRR=160;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0461114;STB=0.520799;TYPE=snp;VARB=0.0506652;OID=.;OPOS=16068343;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:423:398:340:325:81:73:41:40:180:160:36:37:173:152 chr17 16068362 . C T 109.51 PASS AO=105;DP=480;FAO=89;FDP=397;FR=.;FRO=308;FSAF=43;FSAR=46;FSRF=153;FSRR=155;FWDB=-0.00136752;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.484;QD=1.10343;RBI=0.0135185;REFB=-0.0026343;REVB=-0.0134492;RO=373;SAF=52;SAR=53;SRF=182;SRR=191;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00938397;STB=0.510559;TYPE=snp;VARB=0.00736416;OID=.;OPOS=16068362;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:480:397:373:308:105:89:53:52:182:191:46:43:153:155 chr17 16068377 . C G 126.17 PASS AO=117;DP=494;FAO=93;FDP=396;FR=.;FRO=303;FSAF=44;FSAR=49;FSRF=139;FSRR=164;FWDB=0.00672523;FXX=0.00999975;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.446;QD=1.27445;RBI=0.0127527;REFB=-0.000713045;REVB=0.0108352;RO=357;SAF=57;SAR=60;SRF=164;SRR=193;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0352264;STB=0.51104;TYPE=snp;VARB=0.00160616;OID=.;OPOS=16068377;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:494:396:357:303:117:93:60:57:164:193:49:44:139:164 chr17 16068383 . G A 168.48 PASS AO=116;DP=477;FAO=104;FDP=398;FR=.;FRO=294;FSAF=48;FSAR=56;FSRF=131;FSRR=163;FWDB=-0.0236664;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.222;QD=1.69329;RBI=0.0333753;REFB=-0.00710926;REVB=0.0235333;RO=360;SAF=60;SAR=56;SRF=158;SRR=202;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0991646;STB=0.511879;TYPE=snp;VARB=0.0165883;OID=.;OPOS=16068383;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:477:398:360:294:116:104:56:60:158:202:56:48:131:163 chr17 16068396 . G A 200.1 PASS AO=134;DP=483;FAO=109;FDP=396;FR=.;FRO=287;FSAF=50;FSAR=59;FSRF=127;FSRR=160;FWDB=0.000575061;FXX=0.00999975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.142;QD=2.02123;RBI=0.00517676;REFB=0.00377253;REVB=0.00514473;RO=334;SAF=66;SAR=68;SRF=151;SRR=183;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0496364;STB=0.511847;TYPE=snp;VARB=-0.0169852;OID=.;OPOS=16068396;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:483:396:334:287:134:109:68:66:151:183:59:50:127:160 chr17 16347325 . T C 54.42 PASS AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=-0.0162958;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.326;QD=7.02224;RBI=0.0570249;REFB=-7.98144e-05;REVB=-0.054647;RO=18;SAF=10;SAR=3;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0628588;STB=0.536854;TYPE=snp;VARB=-0.000404838;OID=.;OPOS=16347325;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:31:31:18:18:13:13:3:10:13:5:3:10:13:5 chr17 16350239 . A G 401.73 PASS AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0359362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.268;QD=37.3701;RBI=0.035963;REFB=0;REVB=0.00138757;RO=0;SAF=28;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02792e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000121034;OID=.;OPOS=16350239;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:43:43:0:0:43:43:15:28:0:0:15:28:0:0 chr17 16675944 . C A 39.28 PASS AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=-0.0182992;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.2194;QD=7.14213;RBI=0.0926897;REFB=0.034326;REVB=0.0908654;RO=13;SAF=1;SAR=8;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227484;STB=0.639632;TYPE=snp;VARB=-0.0448753;OID=.;OPOS=16675944;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:22:22:13:13:9:9:8:1:3:10:8:1:3:10 chr17 16735618 . G A 523.62 PASS AO=55;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0431929;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.751;QD=36.7455;RBI=0.0599045;REFB=0;REVB=0.0415081;RO=0;SAF=20;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.67221e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000441458;OID=.;OPOS=16735618;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:57:57:0:0:55:57:35:20:0:0:37:20:0:0 chr17 16746358 . G A 593.79 PASS AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0182344;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.0124;QD=36.5408;RBI=0.0351648;REFB=-0.117608;REVB=0.0300677;RO=1;SAF=39;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119581;STB=0.506327;TYPE=snp;VARB=0.00159726;OID=.;OPOS=16746358;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:65:65:1:1:64:64:25:39:1:0:25:39:1:0 chr17 16746365 . G A 52.86 PASS AO=20;DP=65;FAO=20;FDP=65;FR=.;FRO=45;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=-0.00797051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.596;QD=3.25266;RBI=0.0147092;REFB=-0.00791517;REVB=0.0123626;RO=45;SAF=15;SAR=5;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253386;STB=0.652011;TYPE=snp;VARB=0.0291978;OID=.;OPOS=16746365;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:65:65:45:45:20:20:5:15:25:20:5:15:25:20 chr17 16748782 . C A 16.08 PASS AO=3;DP=6;FAO=3;FDP=6;FR=.;FRO=3;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=330.667;QD=10.7183;RBI=0.0015552;REFB=0.0136409;REVB=0.0015552;RO=3;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0203974;OID=.;OPOS=16748782;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:6:6:3:3:3:3:3:0:0:3:3:0:0:3 chr17 16855878 . C T 204.68 PASS AO=18;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00118906;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=69.5373;QD=34.1133;RBI=0.0161671;REFB=-0.0849803;REVB=0.0161234;RO=0;SAF=7;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00145721;OID=.;OPOS=16855878;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:19:24:0:0:18:24:11:7:0:0:15:9:0:0 chr17 17039561 . CCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAG CCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAG,CCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGC 68.12 PASS AO=3,3;DP=19;FAO=8,0;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=5,0;FSAR=3,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.035169,-0.0523845;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=3,2;MLLD=184.258,169.952;QD=30.2767;RBI=0.0981439,0.095203;REFB=-0.128393,-0.0749197;REVB=0.0916262,0.0794951;RO=1;SAF=2,3;SAR=1,0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.163246,0;STB=0.545344,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.00418911,0.0475862;OID=.,.;OPOS=17039562,17039593;OREF=CAG,AG;OALT=-,-;OMAPALT=CCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAG,CCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:3,3:8:8,0:9:1:5,0:3,0:1:0:5:1:2,3:1,0:1:0 chr17 17046024 . C A 422.72 PASS AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0576993;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.9031;QD=35.9764;RBI=0.0668092;REFB=0.0057025;REVB=-0.0336789;RO=1;SAF=18;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0253996;STB=0.513508;TYPE=snp;VARB=-0.000343075;OID=.;OPOS=17046024;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:47:47:1:1:46:46:28:18:1:0:28:18:1:0 chr17 17062241 . C G 2259.74 PASS AO=271;DP=299;FAO=272;FDP=299;FR=.;FRO=27;FSAF=123;FSAR=149;FSRF=19;FSRR=8;FWDB=-0.00172577;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=207.587;QD=30.2306;RBI=0.0093229;REFB=-0.02396;REVB=0.00916178;RO=28;SAF=123;SAR=148;SRF=19;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0401402;STB=0.522818;TYPE=snp;VARB=0.000684231;OID=.;OPOS=17062241;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:299:299:28:27:271:272:148:123:19:9:149:123:19:8 chr17 17069105 . G A 634.44 PASS AO=65;DP=65;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.156001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.533;QD=37.877;RBI=0.156456;REFB=0;REVB=0.0119224;RO=0;SAF=23;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.35381e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000505857;OID=.;OPOS=17069105;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:65:67:0:0:65:67:42:23:0:0:42:25:0:0 chr17 17168164 . G A 1503.2 PASS AO=154;DP=154;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0476134;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.968;QD=38.2982;RBI=0.048638;REFB=0;REVB=0.00993061;RO=0;SAF=48;SAR=106;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.49869e-05;OID=.;OPOS=17168164;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:154:157:0:0:154:157:106:48:0:0:109:48:0:0 chr17 17179481 . G A 1598.14 PASS AO=171;DP=172;FAO=171;FDP=171;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0343222;FXX=0.01156;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.018;QD=37.3834;RBI=0.0348652;REFB=0.0659965;REVB=-0.00612908;RO=1;SAF=77;SAR=94;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00503679;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.65025e-05;OID=.;OPOS=17179481;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:172:171:1:0:171:171:94:77:0:1:94:77:0:0 chr17 17250159 . C T 66.95 PASS AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.0116763;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.599;QD=7.43912;RBI=0.0443822;REFB=-0.0108049;REVB=0.0428187;RO=20;SAF=10;SAR=6;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123809;STB=0.571338;TYPE=snp;VARB=0.0113607;OID=.;OPOS=17250159;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:36:36:20:20:16:16:6:10:10:10:6:10:10:10 chr17 17326604 . C T 351.39 PASS AO=91;DP=202;FAO=91;FDP=199;FR=.;FRO=108;FSAF=44;FSAR=47;FSRF=50;FSRR=58;FWDB=0.0120713;FXX=0.0245086;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.545;QD=7.06318;RBI=0.0121628;REFB=-0.0081669;REVB=0.00148922;RO=105;SAF=44;SAR=47;SRF=48;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0255844;STB=0.511173;TYPE=snp;VARB=0.0316735;OID=.;OPOS=17326604;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:199:105:108:91:91:47:44:48:57:47:44:50:58 chr17 17326605 . A G 346.11 PASS AO=90;DP=201;FAO=90;FDP=199;FR=.;FRO=109;FSAF=43;FSAR=47;FSRF=53;FSRR=56;FWDB=-0.00664534;FXX=0.0148508;HRUN=3;LEN=1;MLLD=154.41;QD=6.95697;RBI=0.0100987;REFB=-0.00682672;REVB=-0.00760416;RO=108;SAF=43;SAR=47;SRF=52;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00364948;STB=0.504641;TYPE=snp;VARB=0.0120192;OID=.;OPOS=17326605;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:199:108:109:90:90:47:43:52:56:47:43:53:56 chr17 17363784 . A C 120.09 PASS AO=33;DP=80;FAO=33;FDP=80;FR=.;FRO=47;FSAF=26;FSAR=7;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=0.0205272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.161;QD=6.00454;RBI=0.025086;REFB=-0.0103159;REVB=-0.0144201;RO=47;SAF=26;SAR=7;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.331619;STB=0.690139;TYPE=snp;VARB=0.0134095;OID=.;OPOS=17363784;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:47:47:33:33:7:26:24:23:7:26:24:23 chr17 17397818 . G C 291.89 PASS AO=75;DP=164;FAO=75;FDP=164;FR=.;FRO=89;FSAF=47;FSAR=28;FSRF=37;FSRR=52;FWDB=0.00849548;FXX=0.0120475;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.507;QD=7.11917;RBI=0.00885489;REFB=-0.0304548;REVB=0.00249718;RO=87;SAF=47;SAR=28;SRF=37;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196714;STB=0.615152;TYPE=snp;VARB=0.0288665;OID=.;OPOS=17397818;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:164:87:89:75:75:28:47:37:50:28:47:37:52 chr17 17397982 . T C 1381.62 PASS AO=178;DP=210;FAO=178;FDP=207;FR=.;FRO=29;FSAF=88;FSAR=90;FSRF=2;FSRR=27;FWDB=0.0292518;FXX=0.0189564;HRUN=4;LEN=1;MLLD=90.2732;QD=26.698;RBI=0.0297247;REFB=-0.0483906;REVB=0.00528123;RO=27;SAF=88;SAR=90;SRF=1;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114247;STB=0.55968;TYPE=snp;VARB=0.00175874;OID=.;OPOS=17397982;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:210:207:27:29:178:178:90:88:1:26:90:88:2:27 chr17 17409560 . C T 58.49 PASS AO=8;DP=11;FAO=8;FDP=11;FR=.;FRO=3;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.020912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.4709;QD=21.2685;RBI=0.0275227;REFB=-0.0384558;REVB=-0.0178937;RO=3;SAF=5;SAR=3;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0212058;STB=0.512165;TYPE=snp;VARB=0.0118765;OID=.;OPOS=17409560;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:11:11:3:3:8:8:3:5:2:1:3:5:2:1 chr17 17415893 . C T 26.19 PASS AO=7;DP=21;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.0622256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.787;QD=4.98875;RBI=0.0636341;REFB=-0.0103228;REVB=0.0133149;RO=14;SAF=4;SAR=3;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.301111;STB=0.68373;TYPE=snp;VARB=0.0529475;OID=.;OPOS=17415893;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:21:21:14:14:7:7:3:4:4:10:3:4:4:10 chr17 17425631 . C T 76.88 PASS AO=19;DP=47;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.0650391;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.99;QD=6.54327;RBI=0.0756405;REFB=-0.0273337;REVB=-0.0386187;RO=24;SAF=13;SAR=6;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190258;STB=0.620268;TYPE=snp;VARB=0.041212;OID=.;OPOS=17425631;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:47:47:24:27:19:20:6:13:12:12:7:13:12:15 chr17 17682484 . G A 375.77 PASS AO=38;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0470802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.015;QD=38.5404;RBI=0.0519675;REFB=0;REVB=0.0220016;RO=0;SAF=14;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76123e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.47778e-05;OID=.;OPOS=17682484;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:38:39:0:0:38:39:24:14:0:0:25:14:0:0 chr17 17696531 . G C 13.63 PASS AO=5;DP=22;FAO=5;FDP=22;FR=.;FRO=17;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=-0.0543117;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.3967;QD=2.47793;RBI=0.104751;REFB=-0.0116148;REVB=0.0895711;RO=17;SAF=1;SAR=4;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.585687;STB=0.873807;TYPE=snp;VARB=0.0438873;OID=.;OPOS=17696531;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:22:22:17:17:5:5:4:1:13:4:4:1:13:4 chr17 17696755 . C A 77.33 PASS AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=2;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=21;FWDB=0.0140249;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=74.9698;QD=7.73327;RBI=0.0192809;REFB=-0.0032491;REVB=-0.0132309;RO=22;SAF=2;SAR=16;SRF=1;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190505;STB=0.60646;TYPE=snp;VARB=0.00306435;OID=.;OPOS=17696755;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:40:40:22:22:18:18:16:2:1:21:16:2:1:21 chr17 17698254 . G A 137.8 PASS AO=29;DP=56;FAO=29;FDP=56;FR=.;FRO=27;FSAF=22;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.00171487;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.998;QD=9.84307;RBI=0.0125208;REFB=-0.0164319;REVB=-0.0124028;RO=26;SAF=22;SAR=7;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186415;STB=0.617343;TYPE=snp;VARB=0.0172588;OID=.;OPOS=17698254;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:26:27:29:29:7:22:15:11:7:22:15:12 chr17 17707105 . T C 155.61 PASS AO=34;DP=69;FAO=34;FDP=67;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.0592149;FXX=0.0289813;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.448;QD=9.28993;RBI=0.0649472;REFB=-0.0257301;REVB=-0.0266786;RO=33;SAF=13;SAR=21;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146722;STB=0.567017;TYPE=snp;VARB=0.00866615;OID=.;OPOS=17707105;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:67:33:33:34:34:21:13:18:15:21:13:17:16 chr17 17715101 . G A 47.21 PASS AO=18;DP=56;FAO=17;FDP=55;FR=.;FRO=38;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=-0.0147032;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.9759;QD=3.43327;RBI=0.0247426;REFB=-0.0174664;REVB=-0.0199001;RO=38;SAF=6;SAR=12;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138127;STB=0.568457;TYPE=snp;VARB=0.033731;OID=.;OPOS=17715101;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:56:55:38:38:18:17:12:6:17:21:11:6:17:21 chr17 17715317 . C G 70.75 PASS AO=19;DP=52;FAO=20;FDP=53;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=28;FSRR=5;FWDB=-0.00117317;FXX=0.036357;HRUN=3;LEN=1;MLLD=176.914;QD=5.33995;RBI=0.00916327;REFB=0.00273578;REVB=-0.00908786;RO=33;SAF=15;SAR=4;SRF=28;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1045;STB=0.588962;TYPE=snp;VARB=-0.00221844;OID=.;OPOS=17715317;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:52:53:33:33:19:20:4:15:28:5:5:15:28:5 chr17 17772619 . A G 29.12 PASS AO=5;DP=22;FAO=7;FDP=23;FR=.,HEALED;FRO=14;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.0331452;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=23.6893;QD=5.06466;RBI=0.110226;REFB=-0.00131827;REVB=-0.105124;RO=9;SAF=0;SAR=5;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.739778;STB=0.749167;TYPE=snp;VARB=-0.0426138;OID=.;OPOS=17772619;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:19:23:9:14:5:7:5:0:5:4:6:1:6:8 chr17 17896089 . TC T 179.31 PASS AO=49;DP=132;FAO=63;FDP=129;FR=.;FRO=66;FSAF=61;FSAR=2;FSRF=61;FSRR=5;FWDB=-0.0479281;FXX=0.0373106;HRUN=2;LEN=1;MLLD=23.4848;QD=5.56007;RBI=0.118509;REFB=0.0339082;REVB=0.108385;RO=67;SAF=49;SAR=0;SRF=62;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.807937;STB=0.63631;TYPE=del;VARB=-0.0317575;OID=.;OPOS=17896090;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:49:131:63:129:66:61:2:61:5:99:67:49:0:62:5 chr17 17896205 . C T 536.03 PASS AO=135;DP=288;FAO=135;FDP=286;FR=.;FRO=151;FSAF=38;FSAR=97;FSRF=48;FSRR=103;FWDB=0.0412136;FXX=0.0069442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.78;QD=7.49689;RBI=0.0501471;REFB=-0.0224262;REVB=0.0285687;RO=148;SAF=38;SAR=97;SRF=46;SRR=102;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0338207;STB=0.523268;TYPE=snp;VARB=0.0257237;OID=.;OPOS=17896205;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:288:286:148:151:135:135:97:38:46:102:97:38:48:103 chr17 17948475 . G A 392 PASS AO=95;DP=197;FAO=96;FDP=198;FR=.;FRO=102;FSAF=42;FSAR=54;FSRF=36;FSRR=66;FWDB=0.0715294;FXX=0.00502487;HRUN=4;LEN=1;MLLD=41.2855;QD=7.91909;RBI=0.100986;REFB=-0.0403586;REVB=0.0712861;RO=97;SAF=41;SAR=54;SRF=35;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0669636;STB=0.544738;TYPE=snp;VARB=0.0456324;OID=.;OPOS=17948475;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:198:97:102:95:96:54:41:35:62:54:42:36:66 chr17 17997209 . G A 338.98 PASS AO=79;DP=159;FAO=79;FDP=159;FR=.;FRO=80;FSAF=41;FSAR=38;FSRF=33;FSRR=47;FWDB=0.00640592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.414;QD=8.52787;RBI=0.0262175;REFB=0.00378468;REVB=0.0254229;RO=80;SAF=41;SAR=38;SRF=33;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0970654;STB=0.553425;TYPE=snp;VARB=-0.00364562;OID=.;OPOS=17997209;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:159:80:80:79:79:38:41:33:47:38:41:33:47 chr17 18003671 . T G 793.98 PASS AO=85;DP=86;FAO=85;FDP=86;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0291273;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.521;QD=36.9292;RBI=0.0305485;REFB=-0.0949416;REVB=0.00920944;RO=1;SAF=48;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00976784;STB=0.505153;TYPE=snp;VARB=0.00109043;OID=.;OPOS=18003671;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:86:86:1:1:85:85:37:48:1:0:37:48:1:0 chr17 18027809 . C T 100.2 PASS AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=3;FWDB=0.00531369;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.6287;QD=10.8327;RBI=0.0206956;REFB=-0.00991387;REVB=0.0200018;RO=18;SAF=6;SAR=14;SRF=15;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.43314;STB=0.73276;TYPE=snp;VARB=0.0117954;OID=.;OPOS=18027809;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:38:37:18:17:20:20:14:6:15:3:14:6:14:3 chr17 18046898 . T C 55.51 PASS AO=11;DP=22;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=1;FWDB=-0.0452545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.1851;QD=10.0933;RBI=0.0464185;REFB=-0.0555431;REVB=-0.01033;RO=11;SAF=9;SAR=2;SRF=10;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148371;STB=0.58448;TYPE=snp;VARB=0.0578942;OID=.;OPOS=18046898;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:22:22:11:11:11:11:2:9:10:1:2:9:10:1 chr17 18052867 . T C 412 PASS AO=46;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0326157;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=65.089;QD=34.3334;RBI=0.0337318;REFB=-0.184599;REVB=0.00860503;RO=2;SAF=36;SAR=10;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.025408;STB=0.506664;TYPE=snp;VARB=0.00564363;OID=.;OPOS=18052867;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:48:48:2:1:46:47:10:36:2:0:10:37:1:0 chr17 18055229 . G A 42.4 PASS AO=11;DP=37;FAO=13;FDP=39;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=-0.0401982;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=102.79;QD=4.34899;RBI=0.0522146;REFB=-0.00983273;REVB=-0.0333237;RO=25;SAF=7;SAR=4;SRF=7;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.38972;STB=0.76347;TYPE=snp;VARB=0.0178;OID=.;OPOS=18055229;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:37:39:25:26:11:13:4:7:7:18:4:9:7:19 chr17 18064730 . C T 37.12 PASS AO=13;DP=43;FAO=13;FDP=43;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=23;FWDB=0.012554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.187;QD=3.45315;RBI=0.02748;REFB=-0.00788338;REVB=0.0244448;RO=30;SAF=7;SAR=6;SRF=7;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.351153;STB=0.707044;TYPE=snp;VARB=0.0443378;OID=.;OPOS=18064730;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:43:43:30:30:13:13:6:7:7:23:6:7:7:23 chr17 18077175 . T C 161.68 PASS AO=40;DP=87;FAO=40;FDP=87;FR=.;FRO=47;FSAF=12;FSAR=28;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=-0.041955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.052;QD=7.43343;RBI=0.0423955;REFB=-0.00478816;REVB=-0.0060957;RO=47;SAF=12;SAR=28;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156182;STB=0.58774;TYPE=snp;VARB=0.00908893;OID=.;OPOS=18077175;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:47:47:40:40:28:12:21:26:28:12:21:26 chr17 18088094 . C T 94.79 PASS AO=30;DP=82;FAO=30;FDP=82;FR=.;FRO=52;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=28;FSRR=24;FWDB=0.0317245;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.4404;QD=4.62408;RBI=0.0351398;REFB=-0.0197544;REVB=0.0151117;RO=52;SAF=20;SAR=10;SRF=28;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149193;STB=0.586148;TYPE=snp;VARB=0.0382321;OID=.;OPOS=18088094;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:82:82:52:52:30:30:10:20:28:24:10:20:28:24 chr17 18111793 . C T 50.98 PASS AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.0181884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.633;QD=7.28274;RBI=0.0192401;REFB=0.00330297;REVB=-0.00627407;RO=16;SAF=10;SAR=2;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209717;STB=0.624765;TYPE=snp;VARB=-0.00536332;OID=.;OPOS=18111793;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:28:28:16:16:12:12:2:10:11:5:2:10:11:5 chr17 18111868 . G A 219.85 PASS AO=51;DP=97;FAO=51;FDP=104;FR=.;FRO=53;FSAF=44;FSAR=7;FSRF=44;FSRR=9;FWDB=0.0139881;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.8898;QD=8.45591;RBI=0.0571532;REFB=-0.0371635;REVB=-0.0554149;RO=46;SAF=44;SAR=7;SRF=43;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147903;STB=0.53332;TYPE=snp;VARB=0.0350443;OID=.;OPOS=18111868;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:104:46:53:51:51:7:44:43:3:7:44:44:9 chr17 18137141 . A G 251.16 PASS AO=54;DP=103;FAO=55;FDP=105;FR=.;FRO=50;FSAF=21;FSAR=34;FSRF=18;FSRR=32;FWDB=0.0313768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.846;QD=9.56787;RBI=0.033212;REFB=-0.0314736;REVB=-0.0108873;RO=49;SAF=20;SAR=34;SRF=18;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0028016;STB=0.511058;TYPE=snp;VARB=0.0260752;OID=.;OPOS=18137141;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:105:49:50:54:55:34:20:18:31:34:21:18:32 chr17 18148049 . C G 126.58 PASS AO=12;DP=13;FAO=15;FDP=16;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00650541;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.167;QD=31.645;RBI=0.0230841;REFB=0.0147977;REVB=0.0221484;RO=1;SAF=11;SAR=1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0393232;STB=0.517219;TYPE=snp;VARB=-0.00105241;OID=.;OPOS=18148049;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:13:16:1:1:12:15:1:11:1:0:1:14:1:0 chr17 18148050 . A G 160.92 PASS AO=14;DP=15;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00407355;FXX=0.0555247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.443;QD=37.8627;RBI=0.00407355;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=14;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.00977e-06;OID=.;OPOS=18148050;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:15:17:0:0:14:17:0:14:0:0:0:17:0:0 chr17 18148485 . G A 43.02 PASS AO=6;DP=8;FAO=6;FDP=8;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0110597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.061;QD=21.5082;RBI=0.0112407;REFB=0.00288567;REVB=0.00200911;RO=2;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.418591;STB=0.749058;TYPE=snp;VARB=-0.00154447;OID=.;OPOS=18148485;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:8:2:2:6:6:1:5:0:2:1:5:0:2 chr17 18167143 . GC G 468.49 PASS AO=61;DP=95;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.177526;FXX=0.0109878;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.2072;QD=20.8217;RBI=0.339739;REFB=-0.00483022;REVB=0.289667;RO=23;SAF=27;SAR=34;SRF=5;SRR=18;SSEN=0.570681;SSEP=0;SSSB=0.118117;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0192407;OID=.;OPOS=18167144;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:61:91:90:90:0:33:57:0:0:40:23:27:34:5:18 chr17 18167505 . T C 24.49 PASS AO=8;DP=29;FAO=8;FDP=28;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.00543664;FXX=0.0344709;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.1612;QD=3.4979;RBI=0.0222799;REFB=-0.0198365;REVB=-0.0216065;RO=21;SAF=6;SAR=2;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116649;STB=0.586726;TYPE=snp;VARB=0.0495635;OID=.;OPOS=18167505;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:29:28:21:20:8:8:2:6:14:7:2:6:13:7 chr17 18219835 . T C 125.99 PASS AO=33;DP=76;FAO=33;FDP=76;FR=.;FRO=43;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=26;FWDB=-0.0590802;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.972;QD=6.63129;RBI=0.0592909;REFB=-0.00694006;REVB=-0.00499512;RO=43;SAF=14;SAR=19;SRF=17;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0298084;STB=0.516807;TYPE=snp;VARB=0.0119356;OID=.;OPOS=18219835;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:43:43:33:33:19:14:17:26:19:14:17:26 chr17 18220770 . G A 164.34 PASS AO=39;DP=82;FAO=39;FDP=82;FR=.;FRO=43;FSAF=26;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=0.00503003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9292;QD=8.01635;RBI=0.066839;REFB=-0.0112823;REVB=-0.0666494;RO=41;SAF=26;SAR=13;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172728;STB=0.610111;TYPE=snp;VARB=0.0113091;OID=.;OPOS=18220770;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:41:43:39:39:13:26:20:21:13:26:20:23 chr17 18221010 . A G 80.87 PASS AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=0.0105918;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.103;QD=7.70217;RBI=0.0106695;REFB=-0.00551343;REVB=0.00128502;RO=17;SAF=5;SAR=14;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.337803;STB=0.736593;TYPE=snp;VARB=0.00215134;OID=.;OPOS=18221010;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:42:42:17:23:19:19:14:5:11:6:14:5:16:7 chr17 18230380 . T G 283.04 PASS AO=76;DP=197;FAO=85;FDP=205;FR=.;FRO=120;FSAF=34;FSAR=51;FSRF=40;FSRR=80;FWDB=-0.0402092;FXX=0.00966137;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.996;QD=5.52275;RBI=0.0498985;REFB=-0.0120804;REVB=0.029548;RO=110;SAF=32;SAR=44;SRF=40;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0628732;STB=0.541313;TYPE=snp;VARB=0.0110969;OID=.;OPOS=18230380;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:205:110:120:76:85:44:32:40:70:51:34:40:80 chr17 18236339 . G A 34.32 PASS AO=10;DP=30;FAO=10;FDP=30;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=-0.0204061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.258;QD=4.57634;RBI=0.0205235;REFB=-0.00941357;REVB=-0.00219191;RO=20;SAF=9;SAR=1;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.366969;STB=0.731977;TYPE=snp;VARB=0.0181389;OID=.;OPOS=18236339;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:30:30:20:20:10:10:1:9:14:6:1:9:14:6 chr17 18284262 . G A 97.92 PASS AO=21;DP=42;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=17;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.00807837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.018;QD=9.32596;RBI=0.00873553;REFB=-0.0164864;REVB=-0.00332406;RO=21;SAF=17;SAR=4;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.314666;STB=0.679808;TYPE=snp;VARB=0.0172354;OID=.;OPOS=18284262;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:42:42:21:21:21:21:4:17:11:10:4:17:11:10 chr17 18291544 . A G 144.37 PASS AO=78;DP=284;FAO=78;FDP=284;FR=.;FRO=206;FSAF=19;FSAR=59;FSRF=76;FSRR=130;FWDB=-0.00300002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.1;QD=2.03339;RBI=0.0157024;REFB=0.00160598;REVB=0.0154132;RO=204;SAF=19;SAR=59;SRF=75;SRR=129;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182314;STB=0.609474;TYPE=snp;VARB=-0.00506837;OID=.;OPOS=18291544;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:284:284:204:206:78:78:59:19:75:129:59:19:76:130 chr17 18333915 . C T 73.84 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00321337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.094;QD=36.9199;RBI=0.00483602;REFB=0;REVB=0.00361406;RO=0;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000154094;OID=.;OPOS=18333915;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:4:4:0:0:4:4:0:0 chr17 18380154 . A G 219.82 PASS AO=41;DP=69;FAO=41;FDP=69;FR=.;FRO=28;FSAF=29;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=9;FWDB=-0.00308708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.581;QD=12.7433;RBI=0.024682;REFB=-0.00620293;REVB=-0.0244882;RO=28;SAF=29;SAR=12;SRF=19;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0253814;STB=0.513917;TYPE=snp;VARB=0.00372177;OID=.;OPOS=18380154;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:28:28:41:41:12:29:19:9:12:29:19:9 chr17 18528623 . A G 95.68 PASS AO=33;DP=95;FAO=33;FDP=95;FR=.;FRO=62;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=43;FSRR=19;FWDB=0.0119281;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9191;QD=4.02866;RBI=0.0340472;REFB=0.00770497;REVB=-0.0318894;RO=62;SAF=14;SAR=19;SRF=43;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.298017;STB=0.670492;TYPE=snp;VARB=-0.0231613;OID=.;OPOS=18528623;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:95:95:62:62:33:33:19:14:43:19:19:14:43:19 chr17 18542519 . T G 42.05 PASS AO=11;DP=29;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.0693835;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.3953;QD=5.80006;RBI=0.0693961;REFB=-0.0372162;REVB=0.00132427;RO=18;SAF=9;SAR=2;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.278876;STB=0.669074;TYPE=snp;VARB=0.0820078;OID=.;OPOS=18542519;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:29:29:18:18:11:11:2:9:11:7:2:9:11:7 chr17 18565350 . G C 2088.88 PASS AO=271;DP=320;FAO=271;FDP=317;FR=.;FRO=46;FSAF=167;FSAR=104;FSRF=16;FSRR=30;FWDB=0.00524607;FXX=0.00937471;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.507;QD=26.3581;RBI=0.0157371;REFB=-0.00707565;REVB=-0.014837;RO=45;SAF=167;SAR=104;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0790379;STB=0.540398;TYPE=snp;VARB=0.000739723;OID=.;OPOS=18565350;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:320:317:45:46:271:271:104:167:15:30:104:167:16:30 chr17 18565423 . G A 1723.93 PASS AO=193;DP=211;FAO=200;FDP=210;FR=.;FRO=10;FSAF=102;FSAR=98;FSRF=10;FSRR=0;FWDB=-0.0159526;FXX=0.0232547;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.318;QD=32.8367;RBI=0.0196033;REFB=-0.00703166;REVB=0.0113931;RO=6;SAF=97;SAR=96;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0285427;STB=0.523362;TYPE=snp;VARB=0.000172387;OID=.;OPOS=18565423;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:211:210:6:10:193:200:96:97:6:0:98:102:10:0 chr17 18610134 . T G 1384.35 PASS AO=163;DP=172;FAO=160;FDP=170;FR=.;FRO=10;FSAF=56;FSAR=104;FSRF=9;FSRR=1;FWDB=0.00190497;FXX=0.0116272;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.6186;QD=32.5729;RBI=0.0402262;REFB=-0.213121;REVB=-0.0401811;RO=3;SAF=58;SAR=105;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116129;STB=0.534806;TYPE=snp;VARB=0.00954531;OID=.;OPOS=18610134;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:172:170:3:10:163:160:105:58:2:1:104:56:9:1 chr17 18630995 . G A 1020.82 PASS AO=132;DP=159;FAO=136;FDP=162;FR=.;FRO=26;FSAF=76;FSAR=60;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=-0.0151501;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.7279;QD=25.2054;RBI=0.0434586;REFB=-0.0284783;REVB=0.0407324;RO=26;SAF=76;SAR=56;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0839617;STB=0.540475;TYPE=snp;VARB=0.00914829;OID=.;OPOS=18630995;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:159:162:26:26:132:136:56:76:8:18:60:76:8:18 chr17 18647625 . T A 504.49 PASS AO=48;DP=49;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00304978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.266;QD=37.3698;RBI=0.00977222;REFB=0;REVB=-0.00928413;RO=0;SAF=21;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.05217e-05;OID=.;OPOS=18647625;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:49:54:0:0:48:54:27:21:0:0:30:24:0:0 chr17 18653070 . G A 1038.01 PASS AO=137;DP=169;FAO=142;FDP=173;FR=.;FRO=31;FSAF=111;FSAR=31;FSRF=29;FSRR=2;FWDB=0.0464418;FXX=0.0057468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.9969;QD=24.0003;RBI=0.0646874;REFB=-0.0394442;REVB=0.0450291;RO=30;SAF=109;SAR=28;SRF=28;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0752672;STB=0.542291;TYPE=snp;VARB=0.00534194;OID=.;OPOS=18653070;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:169:173:30:31:137:142:28:109:28:2:31:111:29:2 chr17 18653403 . G A 217.12 PASS AO=46;DP=86;FAO=46;FDP=86;FR=.;FRO=40;FSAF=28;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=15;FWDB=0.0981166;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2431;QD=10.0984;RBI=0.0981172;REFB=-0.0237916;REVB=0.000368613;RO=39;SAF=28;SAR=18;SRF=25;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0284806;STB=0.507984;TYPE=snp;VARB=0.0215545;OID=.;OPOS=18653403;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:39:40:46:46:18:28:25:14:18:28:25:15 chr17 18684642 . G T 68.37 PASS AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0989025;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=67.4661;QD=30.3877;RBI=0.103518;REFB=-0.0907903;REVB=0.0305667;RO=0;SAF=6;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.58669e-08;STB=0.538369;TYPE=snp;VARB=0.0160839;OID=.;OPOS=18684642;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:9:9:0:1:8:8:2:6:0:0:2:6:1:0 chr17 18694277 . G A 1065.4 PASS AO=121;DP=128;FAO=122;FDP=128;FR=.;FRO=6;FSAF=56;FSAR=66;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.022451;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.659;QD=33.2937;RBI=0.0224625;REFB=-0.0110264;REVB=-0.000716591;RO=6;SAF=56;SAR=65;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116782;STB=0.505936;TYPE=snp;VARB=0.000174828;OID=.;OPOS=18694277;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:128:128:6:6:121:122:65:56:2:4:66:56:2:4 chr17 18702220 . T C 3420.93 PASS AO=376;DP=393;FAO=384;FDP=397;FR=.;FRO=13;FSAF=160;FSAR=224;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=0.0577691;FXX=0.00501241;HRUN=4;LEN=1;MLLD=43.8027;QD=34.4678;RBI=0.059608;REFB=-0.187135;REVB=0.0146917;RO=15;SAF=153;SAR=223;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106449;STB=0.506274;TYPE=snp;VARB=0.00578185;OID=.;OPOS=18702220;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:393:397:15:13:376:384:223:153:4:11:224:160:3:10 chr17 18709578 . A G 256.23 PASS AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0403052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.5127;QD=36.6045;RBI=0.111771;REFB=0;REVB=0.104251;RO=0;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39874e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0029654;OID=.;OPOS=18709578;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:27:28:0:0:27:28:14:13:0:0:15:13:0:0 chr17 18775900 . A G 1800.15 PASS AO=194;DP=202;FAO=197;FDP=197;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0187641;FXX=0.0295552;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.011;QD=36.5512;RBI=0.0274806;REFB=-0.0269918;REVB=0.0200771;RO=4;SAF=77;SAR=117;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0041368;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000586628;OID=.;OPOS=18775900;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:202:197:4:0:194:197:117:77:2:2:119:78:0:0 chr17 18855611 . T C 86.76 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0088863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.967;QD=38.5591;RBI=0.046078;REFB=0;REVB=0.045213;RO=0;SAF=8;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00123986;OID=.;OPOS=18855611;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:8:0:0:1:8:0:0 chr17 18874720 . C G 49.33 PASS AO=17;DP=53;FAO=17;FDP=53;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=24;FSRR=12;FWDB=-0.0487603;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.6585;QD=3.72304;RBI=0.0495121;REFB=0.00872776;REVB=-0.00859567;RO=35;SAF=13;SAR=4;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151639;STB=0.584164;TYPE=snp;VARB=-0.0209356;OID=.;OPOS=18874720;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:53:53:35:36:17:17:4:13:23:12:4:13:24:12 chr17 19216917 . T C 262.96 PASS AO=22;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=4;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.293849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=44.4227;QD=37.5653;RBI=0.298515;REFB=0;REVB=-0.0525713;RO=0;SAF=0;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0108376;OID=.;OPOS=19216917;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:28:28:0:0:22:27:22:0:0:0:23:4:0:0 chr17 19232078 . T C 595.12 PASS AO=60;DP=61;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0274151;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.5091;QD=37.7851;RBI=0.0810928;REFB=0;REVB=-0.0763181;RO=0;SAF=22;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000731826;OID=.;OPOS=19232078;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:61:63:0:0:60:63:38:22:0:0:41:22:0:0 chr17 19247075 . G A 85.32 PASS AO=22;DP=52;FAO=24;FDP=61;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=24;FSRR=13;FWDB=-0.00433047;FXX=0.031741;HRUN=5;LEN=1;MLLD=202.269;QD=5.59497;RBI=0.0310191;REFB=-0.00128842;REVB=-0.0307153;RO=30;SAF=13;SAR=9;SRF=20;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0806116;STB=0.515406;TYPE=snp;VARB=0.00263713;OID=.;OPOS=19247075;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:52:61:30:37:22:24:9:13:20:10:9:15:24:13 chr17 19265952 . C T 132.1 PASS AO=20;DP=28;FAO=20;FDP=28;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=-0.0606728;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.1682;QD=18.871;RBI=0.0875485;REFB=-0.0415307;REVB=-0.0631154;RO=7;SAF=3;SAR=17;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157096;STB=0.514272;TYPE=snp;VARB=0.0194095;OID=.;OPOS=19265952;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:28:28:7:8:20:20:17:3:0:7:17:3:1:7 chr17 19285450 . C A 18.66 PASS AO=3;DP=11;FAO=4;FDP=12;FR=.;FRO=8;FSAF=0;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=111.098;QD=6.21944;RBI=0.0453192;REFB=-0.0334598;REVB=0.0453192;RO=8;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00606952;OID=.;OPOS=19285450;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:11:12:8:8:3:4:3:0:0:8:4:0:0:8 chr17 19319015 . C T 256.46 PASS AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0527688;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.076;QD=35.3737;RBI=0.0585436;REFB=-0.124375;REVB=0.0253536;RO=1;SAF=16;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0372036;STB=0.519986;TYPE=snp;VARB=0.00247396;OID=.;OPOS=19319015;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:29:29:1:1:28:28:12:16:0:1:12:16:0:1 chr17 19578873 . A T 1447.19 PASS AO=178;DP=178;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.782;QD=38.5916;RBI=0.0244128;REFB=0;REVB=-0.0197934;RO=0;SAF=59;SAR=119;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.1817e-05;OID=.;OPOS=19578873;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:178:150:0:0:178:150:119:59:0:0:102:48:0:0 chr17 19608773 . G A 882.28 PASS AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0666943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.723;QD=37.9474;RBI=0.104677;REFB=0;REVB=0.0806792;RO=0;SAF=33;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000320575;OID=.;OPOS=19608773;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:93:93:0:0:93:93:60:33:0:0:60:33:0:0 chr17 19617236 . G T 288.96 PASS AO=31;DP=33;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101866;FXX=0.0882094;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.535;QD=37.2851;RBI=0.0674749;REFB=0;REVB=0.0667015;RO=0;SAF=13;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.33668e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000275421;OID=.;OPOS=19617236;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:33:31:0:0:31:31:18:13:0:0:18:13:0:0 chr17 19642952 . G C 258.37 PASS AO=32;DP=36;FAO=32;FDP=36;FR=.;FRO=4;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.000988406;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=208.768;QD=28.708;RBI=0.00583581;REFB=-0.183295;REVB=0.00575149;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.558787;TYPE=snp;VARB=0.00201142;OID=.;OPOS=19642952;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:36:36:0:4:32:32:15:17:0:0:15:17:0:4 chr17 19645938 . A C 658.07 PASS AO=67;DP=67;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0296514;FXX=0.0285673;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.449;QD=38.7097;RBI=0.0329866;REFB=0;REVB=-0.0144536;RO=0;SAF=24;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.31755e-05;OID=.;OPOS=19645938;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:67:68:0:0:67:68:43:24:0:0:44:24:0:0 chr17 19678475 . G A 937.5 PASS AO=94;DP=94;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0369919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.494;QD=38.2654;RBI=0.0551308;REFB=0;REVB=0.0408779;RO=0;SAF=43;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000342743;OID=.;OPOS=19678475;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:94:98:0:0:94:98:51:43:0:0:53:45:0:0 chr17 19713740 . C T 3446.59 PASS AO=365;DP=367;FAO=368;FDP=368;FR=.;FRO=0;FSAF=174;FSAR=194;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0694508;FXX=0.0107524;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.0743;QD=37.4629;RBI=0.0696121;REFB=-0.0640321;REVB=0.00473637;RO=1;SAF=173;SAR=192;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00275031;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00132219;OID=.;OPOS=19713740;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:367:368:1:0:365:368:192:173:1:0:194:174:0:0 chr17 19729495 . T C 2150.9 PASS AO=226;DP=235;FAO=228;FDP=228;FR=.;FRO=0;FSAF=132;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.018592;FXX=0.0338969;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.126;QD=37.735;RBI=0.0259809;REFB=-0.0261279;REVB=0.0181479;RO=2;SAF=131;SAR=95;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00721896;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.68741e-05;OID=.;OPOS=19729495;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:235:228:2:0:226:228:95:131:2:0:96:132:0:0 chr17 20107773 . T C 293.09 PASS AO=75;DP=158;FAO=75;FDP=161;FR=.;FRO=86;FSAF=41;FSAR=34;FSRF=47;FSRR=39;FWDB=-0.0462434;FXX=0.0122692;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.3453;QD=7.28163;RBI=0.0492113;REFB=-0.00410852;REVB=0.0168313;RO=83;SAF=41;SAR=34;SRF=44;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0158187;STB=0.500084;TYPE=snp;VARB=0.0043989;OID=.;OPOS=20107773;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:161:83:86:75:75:34:41:44:39:34:41:47:39 chr17 20108239 . A T 273.68 PASS AO=57;DP=104;FAO=57;FDP=104;FR=.;FRO=47;FSAF=19;FSAR=38;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=-0.00999303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.492;QD=10.526;RBI=0.0139032;REFB=-0.00596716;REVB=-0.00966636;RO=47;SAF=19;SAR=38;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136986;STB=0.575315;TYPE=snp;VARB=0.0048824;OID=.;OPOS=20108239;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:47:47:57:57:38:19:23:24:38:19:23:24 chr17 20109189 . C T 192.63 PASS AO=56;DP=138;FAO=56;FDP=137;FR=.;FRO=81;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=41;FSRR=40;FWDB=-0.0144389;FXX=0.00724585;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.1297;QD=5.62412;RBI=0.0148348;REFB=-0.00742188;REVB=0.00340429;RO=77;SAF=25;SAR=31;SRF=41;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0888152;STB=0.535449;TYPE=snp;VARB=0.0166952;OID=.;OPOS=20109189;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:137:77:81:56:56:31:25:41:36:31:25:41:40 chr17 20163529 . A G 185.8 PASS AO=41;DP=107;FAO=51;FDP=117;FR=.;FRO=66;FSAF=16;FSAR=35;FSRF=25;FSRR=41;FWDB=0.0812912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.16;QD=6.35221;RBI=0.0814857;REFB=-0.018204;REVB=-0.00562637;RO=65;SAF=6;SAR=35;SRF=25;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.35634;STB=0.541289;TYPE=snp;VARB=0.0202944;OID=.;OPOS=20163529;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:117:65:66:41:51:35:6:25:40:35:16:25:41 chr17 20244264 . G C 109.77 PASS AO=23;DP=44;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.0286857;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.103;QD=9.97943;RBI=0.0363374;REFB=-0.0261468;REVB=0.0223056;RO=21;SAF=12;SAR=11;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0424814;STB=0.523789;TYPE=snp;VARB=0.0262342;OID=.;OPOS=20244264;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:44:44:21:21:23:23:11:12:12:9:11:12:12:9 chr17 20268754 . A G 220.87 PASS AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0401902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.697;QD=36.8113;RBI=0.0401994;REFB=0;REVB=0.000860752;RO=0;SAF=4;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.83186e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00044958;OID=.;OPOS=20268754;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:24:24:0:0:24:24:20:4:0:0:20:4:0:0 chr17 20354836 . A G 13.8 PASS AO=6;DP=29;FAO=6;FDP=29;FR=.;FRO=23;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.00291319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.3287;QD=1.90372;RBI=0.0783658;REFB=-0.0316115;REVB=-0.0783117;RO=22;SAF=3;SAR=3;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0533155;STB=0.517184;TYPE=snp;VARB=0.0539197;OID=.;OPOS=20354836;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:29:29:22:23:6:6:3:3:12:10:3:3:12:11 chr17 20769862 . T A 105.09 PASS AO=23;DP=46;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=18;FWDB=0.00980036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.227;QD=9.13797;RBI=0.0302587;REFB=0.00420721;REVB=0.0286276;RO=22;SAF=13;SAR=10;SRF=4;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.326556;STB=0.668981;TYPE=snp;VARB=-0.0071523;OID=.;OPOS=20769862;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:22:23:23:23:10:13:4:18:10:13:5:18 chr17 20769866 . G A 112.09 PASS AO=21;DP=47;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=19;FWDB=-0.0842644;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.2055;QD=9.53973;RBI=0.0848665;REFB=-0.00521241;REVB=0.0100918;RO=26;SAF=12;SAR=9;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.287769;STB=0.710498;TYPE=snp;VARB=0.00424181;OID=.;OPOS=20769866;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:26:23:21:24:9:12:7:19:9:15:4:19 chr17 20769896 . G T 90.81 PASS AO=33;DP=64;FAO=25;FDP=62;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=27;FWDB=0.00810241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.213;QD=5.859;RBI=0.00843142;REFB=-0.00732846;REVB=-0.00233235;RO=30;SAF=18;SAR=15;SRF=4;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.347825;STB=0.6474;TYPE=snp;VARB=0.00684881;OID=.;OPOS=20769896;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:64:62:30:37:33:25:15:18:4:26:12:13:10:27 chr17 20769899 . G T 149.02 PASS AO=34;DP=64;FAO=32;FDP=62;FR=.;FRO=30;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=26;FWDB=0.0484119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.46;QD=9.61439;RBI=0.0487064;REFB=-0.0166983;REVB=0.00534747;RO=30;SAF=19;SAR=15;SRF=4;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.35187;STB=0.712382;TYPE=snp;VARB=0.00984735;OID=.;OPOS=20769899;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:62:30:30:34:32:15:19:4:26:13:19:4:26 chr17 20769904 . G A 149.02 PASS AO=34;DP=64;FAO=32;FDP=62;FR=.;FRO=30;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=26;FWDB=-0.0170959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.7753;QD=9.61427;RBI=0.017347;REFB=-0.00174573;REVB=-0.00294106;RO=29;SAF=19;SAR=15;SRF=4;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.342382;STB=0.712382;TYPE=snp;VARB=0.00108256;OID=.;OPOS=20769904;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:62:29:30:34:32:15:19:4:25:13:19:4:26 chr17 20769954 . T G 103.96 PASS AO=28;DP=61;FAO=26;FDP=59;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=25;FWDB=-0.0230026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.971;QD=7.04838;RBI=0.0253621;REFB=-0.0276756;REVB=-0.0106824;RO=33;SAF=12;SAR=16;SRF=8;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189402;STB=0.62558;TYPE=snp;VARB=0.0234602;OID=.;OPOS=20769954;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:59:33:33:28:26:16:12:8:25:14:12:8:25 chr17 20769964 . C A 65.46 PASS AO=21;DP=53;FAO=19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=26;FWDB=0.0114909;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.5755;QD=5.1345;RBI=0.0210479;REFB=0.0148427;REVB=-0.0176344;RO=32;SAF=8;SAR=13;SRF=6;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232101;STB=0.657635;TYPE=snp;VARB=-0.0285697;OID=.;OPOS=20769964;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:53:51:32:32:21:19:13:8:6:26:11:8:6:26 chr17 20769968 . G A 61 PASS AO=20;DP=51;FAO=18;FDP=49;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=24;FWDB=-0.0168008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.658;QD=4.97987;RBI=0.0171484;REFB=-0.00390316;REVB=0.00343503;RO=31;SAF=8;SAR=12;SRF=7;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202251;STB=0.644407;TYPE=snp;VARB=0.017318;OID=.;OPOS=20769968;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:51:49:31:31:20:18:12:8:7:24:10:8:7:24 chr17 20769995 . C T 87.34 PASS AO=21;DP=41;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=0.0359882;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4645;QD=8.95809;RBI=0.0688496;REFB=-0.0101988;REVB=0.0586951;RO=20;SAF=5;SAR=16;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0705105;STB=0.523784;TYPE=snp;VARB=0.0182818;OID=.;OPOS=20769995;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:41:39:20:20:21:19:16:5:6:14:14:5:6:14 chr17 20770002 . C A 82.01 PASS AO=20;DP=39;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=-0.023292;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.061;QD=8.86608;RBI=0.0361841;REFB=-0.0164956;REVB=0.0276906;RO=19;SAF=4;SAR=16;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.080139;STB=0.529378;TYPE=snp;VARB=0.0198794;OID=.;OPOS=20770002;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:39:37:19:19:20:18:16:4:5:14:14:4:5:14 chr17 20770003 . C G 90.69 PASS AO=21;DP=39;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=14;FWDB=-0.0144037;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.2753;QD=9.80397;RBI=0.0372108;REFB=-0.00946064;REVB=0.03431;RO=18;SAF=5;SAR=16;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0182105;STB=0.526289;TYPE=snp;VARB=0.0322043;OID=.;OPOS=20770003;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:39:37:18:18:21:19:16:5:4:14:14:5:4:14 chr17 20799119 . A G 34.01 PASS AO=9;DP=60;FAO=17;FDP=64;FR=.;FRO=47;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=34;FSRR=13;FWDB=-0.00412592;FXX=0.0588149;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.855;QD=2.12535;RBI=0.00649247;REFB=-0.026494;REVB=0.00501288;RO=51;SAF=6;SAR=3;SRF=36;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0557375;STB=0.563603;TYPE=snp;VARB=0.0825903;OID=.;OPOS=20799119;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:60:64:51:47:9:17:3:6:36:15:6:11:34:13 chr17 20799194 . A G 73.86 PASS AO=22;DP=59;FAO=22;FDP=59;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=0.0109251;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3528;QD=5.0076;RBI=0.011277;REFB=0.0115011;REVB=-0.00279511;RO=37;SAF=13;SAR=9;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00413111;STB=0.50239;TYPE=snp;VARB=-0.036092;OID=.;OPOS=20799194;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:59:59:37:37:22:22:9:13:22:15:9:13:22:15 chr17 20903068 . C A 178.93 PASS AO=45;DP=108;FAO=48;FDP=111;FR=.;FRO=63;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=21;FSRR=42;FWDB=0.0299942;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3967;QD=6.44791;RBI=0.032278;REFB=-0.0121293;REVB=-0.0119253;RO=62;SAF=24;SAR=21;SRF=21;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198973;STB=0.594557;TYPE=snp;VARB=0.0114961;OID=.;OPOS=20903068;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:111:62:63:45:48:21:24:21:41:24:24:21:42 chr17 20911204 . G T 223.71 PASS AO=63;DP=149;FAO=63;FDP=150;FR=.;FRO=87;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=54;FSRR=33;FWDB=-0.014908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.783;QD=5.96548;RBI=0.0225298;REFB=-0.0229083;REVB=0.016892;RO=85;SAF=33;SAR=30;SRF=54;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115608;STB=0.556604;TYPE=snp;VARB=0.0244069;OID=.;OPOS=20911204;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:150:85:87:63:63:30:33:54:31:30:33:54:33 chr17 20924523 . G A 979.92 PASS AO=100;DP=101;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0524382;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.923;QD=38.0553;RBI=0.0572204;REFB=0;REVB=0.0229;RO=0;SAF=41;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.3262e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.95834e-05;OID=.;OPOS=20924523;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:101:103:0:0:100:103:59:41:0:0:62:41:0:0 chr17 21087739 . C T 253.83 PASS AO=59;DP=120;FAO=59;FDP=120;FR=.;FRO=61;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=27;FSRR=34;FWDB=0.000810618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.902;QD=8.46094;RBI=0.0199151;REFB=-0.0158783;REVB=0.0198986;RO=61;SAF=29;SAR=30;SRF=27;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0450076;STB=0.524878;TYPE=snp;VARB=0.0190637;OID=.;OPOS=21087739;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:61:61:59:59:30:29:27:34:30:29:27:34 chr17 21117589 . C A 52.31 PASS AO=9;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=0;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.0708;QD=13.9487;RBI=0.0573426;REFB=0.031787;REVB=0.0573426;RO=6;SAF=0;SAR=9;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0128001;OID=.;OPOS=21117589;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:15:15:6:6:9:9:9:0:0:6:9:0:0:6 chr17 21132915 . C T 296.98 PASS AO=31;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0591244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.1349;QD=37.1219;RBI=0.0652581;REFB=0;REVB=0.0276212;RO=0;SAF=9;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.15349e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00142743;OID=.;OPOS=21132915;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:31:32:0:0:31:32:22:9:0:0:22:10:0:0 chr17 21144074 . G A 430.56 PASS AO=87;DP=153;FAO=87;FDP=153;FR=.;FRO=66;FSAF=44;FSAR=43;FSRF=34;FSRR=32;FWDB=0.00570465;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.462;QD=11.2565;RBI=0.0159017;REFB=-0.00108543;REVB=0.0148432;RO=63;SAF=44;SAR=43;SRF=33;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0139531;STB=0.504057;TYPE=snp;VARB=0.00097313;OID=.;OPOS=21144074;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:153:63:66:87:87:43:44:33:30:43:44:34:32 chr17 21144155 . C G 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.425;QD=35.083;RBI=0.0433529;REFB=0;REVB=0.0433529;RO=0;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000644264;OID=.;OPOS=21144155;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:7:0:0:0:7:0:0:0 chr17 21144352 . G A 288.42 PASS AO=32;DP=33;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0265224;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=122.483;QD=33.9316;RBI=0.0393974;REFB=-0.0725996;REVB=-0.0291327;RO=1;SAF=16;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0282865;STB=0.515142;TYPE=snp;VARB=0.000473326;OID=.;OPOS=21144352;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:33:34:1:1:32:33:16:16:1:0:17:16:1:0 chr17 21194769 . C T 36.15 PASS AO=14;DP=48;FAO=14;FDP=49;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.0321892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.8702;QD=2.95064;RBI=0.0328573;REFB=0.000881502;REVB=0.0065922;RO=34;SAF=12;SAR=2;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.547833;STB=0.829685;TYPE=snp;VARB=-0.00313926;OID=.;OPOS=21194769;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:48:49:34:35:14:14:2:12:14:20:2:12:15:20 chr17 21194785 . T C 32.95 PASS AO=14;DP=48;FAO=13;FDP=47;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=-0.0255537;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.107;QD=2.80406;RBI=0.0319042;REFB=-0.00986088;REVB=-0.0191019;RO=33;SAF=11;SAR=3;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.45954;STB=0.761183;TYPE=snp;VARB=0.036005;OID=.;OPOS=21194785;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:48:47:33:34:14:13:3:11:13:20:3:10:14:20 chr17 21194820 . G A 42.95 PASS AO=15;DP=45;FAO=15;FDP=48;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=-0.0495689;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.272;QD=3.5793;RBI=0.0512489;REFB=-0.00333611;REVB=-0.0130144;RO=30;SAF=11;SAR=4;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.377012;STB=0.748993;TYPE=snp;VARB=0.009613;OID=.;OPOS=21194820;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:45:48:30:33:15:15:4:11:12:18:4:11:12:21 chr17 21194843 . T C 70.58 PASS AO=19;DP=44;FAO=19;FDP=47;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=23;FWDB=-0.0443566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.076;QD=6.00679;RBI=0.0500366;REFB=-0.00543068;REVB=-0.0231551;RO=24;SAF=11;SAR=8;SRF=4;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.390307;STB=0.726874;TYPE=snp;VARB=0.0307416;OID=.;OPOS=21194843;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:44:47:24:28:19:19:8:11:4:20:8:11:5:23 chr17 21194852 . G A 93.55 PASS AO=23;DP=49;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=23;FWDB=0.0194251;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.397;QD=7.19596;RBI=0.0198607;REFB=-0.016829;REVB=0.0041368;RO=26;SAF=15;SAR=8;SRF=6;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.381483;STB=0.734411;TYPE=snp;VARB=0.0192523;OID=.;OPOS=21194852;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:49:52:26:29:23:23:8:15:6:20:8:15:6:23 chr17 21194859 . G A 119.09 PASS AO=25;DP=48;FAO=26;FDP=52;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=20;FWDB=0.0155939;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2453;QD=9.16072;RBI=0.0624482;REFB=-0.00417199;REVB=0.0604699;RO=23;SAF=14;SAR=11;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252388;STB=0.651055;TYPE=snp;VARB=0.00512091;OID=.;OPOS=21194859;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:52:23:26:25:26:11:14:6:17:12:14:6:20 chr17 21199022 . A T 24.28 PASS AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=13;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.0111423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.7797;QD=7.47032;RBI=0.0234617;REFB=-0.00402177;REVB=0.0206471;RO=7;SAF=4;SAR=1;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.478981;STB=0.822299;TYPE=snp;VARB=0.0372215;OID=.;OPOS=21199022;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:12:13:7:8:5:5:1:4:2:5:1:4:2:6 chr17 21199037 . G A 53.79 PASS AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0108261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.431;QD=23.9071;RBI=0.0495977;REFB=-0.00416457;REVB=-0.0484017;RO=2;SAF=6;SAR=1;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.422723;STB=0.749163;TYPE=snp;VARB=-0.00214352;OID=.;OPOS=21199037;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:2:2:7:7:1:6:0:2:1:6:0:2 chr17 21199390 . C T 71.28 PASS AO=38;DP=133;FAO=36;FDP=133;FR=.;FRO=97;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=57;FSRR=40;FWDB=-0.0736352;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.8154;QD=2.14365;RBI=0.0751947;REFB=0.0027901;REVB=0.0152349;RO=95;SAF=20;SAR=18;SRF=57;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.090143;STB=0.523796;TYPE=snp;VARB=-0.0327192;OID=.;OPOS=21199390;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:133:133:95:97:38:36:18:20:57:38:16:20:57:40 chr17 21199403 . C T 86.79 PASS AO=41;DP=136;FAO=40;FDP=138;FR=.;FRO=98;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=59;FSRR=39;FWDB=0.00738819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.559;QD=2.51562;RBI=0.0640949;REFB=-0.00661444;REVB=-0.0636676;RO=95;SAF=19;SAR=22;SRF=59;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186994;STB=0.589589;TYPE=snp;VARB=0.0207643;OID=.;OPOS=21199403;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:136:138:95:98:41:40:22:19:59:36:21:19:59:39 chr17 21201719 . T C 216.05 PASS AO=49;DP=105;FAO=52;FDP=109;FR=.;FRO=57;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=21;FSRR=36;FWDB=0.01277;FXX=0.00909008;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.5191;QD=7.92846;RBI=0.0372567;REFB=-0.027462;REVB=-0.0349998;RO=55;SAF=21;SAR=28;SRF=19;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0818499;STB=0.539501;TYPE=snp;VARB=0.0391673;OID=.;OPOS=21201719;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:109:55:57:49:52:28:21:19:36:29:23:21:36 chr17 21202191 . C A 200.99 PASS AO=43;DP=83;FAO=45;FDP=90;FR=.;FRO=45;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=28;FWDB=0.0363503;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=33.9363;QD=8.93278;RBI=0.0536952;REFB=-0.0587606;REVB=0.03952;RO=40;SAF=24;SAR=19;SRF=15;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158575;STB=0.577286;TYPE=snp;VARB=0.0528109;OID=.;OPOS=21202191;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:90:40:45:43:45:19:24:15:25:21:24:17:28 chr17 21202237 . G C 229 PASS AO=43;DP=72;FAO=43;FDP=72;FR=.;FRO=29;FSAF=27;FSAR=16;FSRF=5;FSRR=24;FWDB=0.0536146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.977;QD=12.7222;RBI=0.0570656;REFB=-0.0272852;REVB=0.0195439;RO=29;SAF=27;SAR=16;SRF=5;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.326996;STB=0.678312;TYPE=snp;VARB=0.0328168;OID=.;OPOS=21202237;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:29:29:43:43:16:27:5:24:16:27:5:24 chr17 21203893 . T C 224.34 PASS AO=26;DP=78;FAO=39;FDP=75;FR=.,HEALED;FRO=31;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=7;FSRR=24;FWDB=0.0888544;FXX=0.0259707;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.878;QD=11.9648;RBI=0.0891848;REFB=0.00229815;REVB=-0.00766908;RO=30;SAF=2;SAR=24;SRF=6;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.287522;STB=0.576886;TYPE=snp;VARB=0.0062882;OID=.;OPOS=21203893;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:75:30:31:26:39:24:2:6:24:24:15:7:24 chr17 21203907 . T C 49.28 PASS AO=21;DP=73;FAO=21;FDP=74;FR=.;FRO=53;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=31;FWDB=-0.0167396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.121;QD=2.66405;RBI=0.0302149;REFB=-0.00798607;REVB=-0.0251541;RO=51;SAF=8;SAR=13;SRF=21;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0382703;STB=0.525582;TYPE=snp;VARB=0.0112234;OID=.;OPOS=21203907;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:73:74:51:53:21:21:13:8:21:30:13:8:22:31 chr17 21203934 . G A 180.89 PASS AO=35;DP=62;FAO=35;FDP=61;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=5;FSRR=21;FWDB=0.011947;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.728;QD=11.8613;RBI=0.0190916;REFB=0.00243196;REVB=0.0148916;RO=26;SAF=15;SAR=20;SRF=5;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193498;STB=0.605855;TYPE=snp;VARB=-0.00241007;OID=.;OPOS=21203934;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:61:26:26:35:35:20:15:5:21:20:15:5:21 chr17 21203941 . G A 79.9 PASS AO=21;DP=52;FAO=21;FDP=51;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=21;FWDB=0.0236973;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.723;QD=6.26672;RBI=0.0244342;REFB=-0.00923418;REVB=0.00595567;RO=30;SAF=7;SAR=14;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0390746;STB=0.522367;TYPE=snp;VARB=0.0262276;OID=.;OPOS=21203941;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:52:51:30:30:21:21:14:7:9:21:14:7:9:21 chr17 21203949 . C T 182.08 PASS AO=20;DP=50;FAO=33;FDP=49;FR=.,HEALED;FRO=16;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=-0.0334526;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.45;QD=14.8635;RBI=0.0541595;REFB=-0.0304368;REVB=-0.0425932;RO=15;SAF=11;SAR=9;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.264532;STB=0.555523;TYPE=snp;VARB=0.0240357;OID=.;OPOS=21203949;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:49:49:15:16:20:33:9:11:3:12:22:11:3:13 chr17 21204187 . G T 101.8 PASS AO=25;DP=55;FAO=25;FDP=55;FR=.;FRO=30;FSAF=19;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=-0.0130429;FXX=0.017854;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.141;QD=7.40339;RBI=0.0139738;REFB=-0.0226094;REVB=0.00501502;RO=30;SAF=19;SAR=6;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186358;STB=0.606292;TYPE=snp;VARB=0.0246956;OID=.;OPOS=21204187;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:30:30:25:25:6:19:18:12:6:19:18:12 chr17 21204192 . C T 31.56 PASS AO=15;DP=58;FAO=15;FDP=60;FR=.;FRO=45;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=29;FSRR=16;FWDB=0.00578976;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.798;QD=2.10368;RBI=0.0205902;REFB=-0.00955594;REVB=-0.0197594;RO=30;SAF=11;SAR=4;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171153;STB=0.578837;TYPE=snp;VARB=0.0189348;OID=.;OPOS=21204192;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:48:60:30:45:15:15:4:11:18:12:4:11:29:16 chr17 21204210 . C T 82.46 PASS AO=27;DP=75;FAO=27;FDP=76;FR=.;FRO=49;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=30;FSRR=19;FWDB=0.0488245;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.1506;QD=4.33974;RBI=0.0636186;REFB=0.00243416;REVB=0.040786;RO=47;SAF=20;SAR=7;SRF=29;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160029;STB=0.597624;TYPE=snp;VARB=-0.00226543;OID=.;OPOS=21204210;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:75:76:47:49:27:27:7:20:29:18:7:20:30:19 chr17 21204257 . G A 81.78 PASS AO=32;DP=103;FAO=32;FDP=102;FR=.;FRO=70;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=37;FSRR=33;FWDB=0.0263985;FXX=0.0192289;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.764;QD=3.20689;RBI=0.0279739;REFB=-0.00659482;REVB=0.00925516;RO=70;SAF=22;SAR=10;SRF=37;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197009;STB=0.61581;TYPE=snp;VARB=0.0135414;OID=.;OPOS=21204257;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:103:102:70:70:32:32:10:22:37:33:10:22:37:33 chr17 21204266 . T C 931.33 PASS AO=98;DP=99;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000453435;FXX=0.019998;HRUN=3;LEN=1;MLLD=220.468;QD=38.0133;RBI=0.0264382;REFB=0.0362525;REVB=0.0264344;RO=1;SAF=57;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114277;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.91324e-05;OID=.;OPOS=21204266;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:99:98:1:0:98:98:41:57:0:1:41:57:0:0 chr17 21204308 . G T 58.76 PASS AO=29;DP=108;FAO=29;FDP=108;FR=.;FRO=79;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=34;FSRR=45;FWDB=0.00709183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.223;QD=2.1764;RBI=0.00970487;REFB=-0.0030769;REVB=-0.006625;RO=79;SAF=19;SAR=10;SRF=34;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.273373;STB=0.66338;TYPE=snp;VARB=0.0124163;OID=.;OPOS=21204308;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:108:108:79:79:29:29:10:19:34:45:10:19:34:45 chr17 21205460 . C T 36.7 PASS AO=10;DP=28;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=14;FSRR=4;FWDB=0.0274775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.951;QD=5.24354;RBI=0.0297176;REFB=-0.0199221;REVB=-0.0113191;RO=16;SAF=9;SAR=1;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.293452;STB=0.661373;TYPE=snp;VARB=0.0349253;OID=.;OPOS=21205460;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:28:28:16:18:10:10:1:9:12:4:1:9:14:4 chr17 21206556 . C T 375.66 PASS AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00406457;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=117.928;QD=38.5296;RBI=0.055454;REFB=0;REVB=0.0553048;RO=0;SAF=13;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00029454;OID=.;OPOS=21206556;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:39:39:0:0:39:39:26:13:0:0:26:13:0:0 chr17 21207834 . C T 22.05 PASS AO=26;DP=156;FAO=27;FDP=157;FR=.;FRO=130;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=44;FSRR=86;FWDB=0.0305181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.818;QD=0.561906;RBI=0.0311775;REFB=-0.00130995;REVB=-0.00637805;RO=128;SAF=15;SAR=11;SRF=43;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.303415;STB=0.674813;TYPE=snp;VARB=0.013848;OID=.;OPOS=21207834;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:156:157:128:130:26:27:11:15:43:85:12:15:44:86 chr17 21207844 . C T 42.81 PASS AO=31;DP=141;FAO=31;FDP=142;FR=.;FRO=111;FSAF=6;FSAR=25;FSRF=44;FSRR=67;FWDB=-0.0440937;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.399;QD=1.20602;RBI=0.0563427;REFB=-0.00998616;REVB=-0.0350748;RO=107;SAF=6;SAR=25;SRF=42;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.302226;STB=0.693535;TYPE=snp;VARB=0.0421355;OID=.;OPOS=21207844;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:141:142:107:111:31:31:25:6:42:65:25:6:44:67 chr17 21208413 . C T 88.09 PASS AO=29;DP=82;FAO=29;FDP=82;FR=.;FRO=53;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=29;FSRR=24;FWDB=-0.00343852;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.667;QD=4.29685;RBI=0.0150108;REFB=-0.0165777;REVB=-0.0146116;RO=51;SAF=17;SAR=12;SRF=27;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0638297;STB=0.525755;TYPE=snp;VARB=0.0244379;OID=.;OPOS=21208413;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:82:82:51:53:29:29:12:17:27:24:12:17:29:24 chr17 21208449 . G T 46.8 PASS AO=18;DP=59;FAO=18;FDP=59;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=-0.00309144;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=213.151;QD=3.17272;RBI=0.0108399;REFB=0.000220253;REVB=0.0103898;RO=41;SAF=10;SAR=8;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0790218;STB=0.547117;TYPE=snp;VARB=-0.000404475;OID=.;OPOS=21208449;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:59:59:41:41:18:18:8:10:20:21:8:10:20:21 chr17 21215483 . C T 194.35 PASS AO=49;DP=107;FAO=49;FDP=107;FR=.;FRO=58;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=20;FSRR=38;FWDB=0.00622417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.227;QD=7.26542;RBI=0.00844991;REFB=-0.00779704;REVB=0.00571496;RO=58;SAF=21;SAR=28;SRF=20;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0843642;STB=0.546943;TYPE=snp;VARB=0.0101198;OID=.;OPOS=21215483;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:58:58:49:49:28:21:20:38:28:21:20:38 chr17 21215537 . C A 147.05 PASS AO=43;DP=107;FAO=43;FDP=107;FR=.;FRO=64;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=22;FSRR=42;FWDB=0.0198376;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=205.561;QD=5.49705;RBI=0.0236829;REFB=0.00173481;REVB=0.0129364;RO=64;SAF=19;SAR=24;SRF=22;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106926;STB=0.560294;TYPE=snp;VARB=-0.00229567;OID=.;OPOS=21215537;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:64:64:43:43:24:19:22:42:24:19:22:42 chr17 21215552 . C T 214.43 PASS AO=52;DP=108;FAO=52;FDP=108;FR=.;FRO=56;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=20;FSRR=36;FWDB=-0.00783479;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.034;QD=7.94169;RBI=0.00807202;REFB=-0.0074587;REVB=-0.00194256;RO=56;SAF=21;SAR=31;SRF=20;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0458055;STB=0.525382;TYPE=snp;VARB=0.0073285;OID=.;OPOS=21215552;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:56:56:52:52:31:21:20:36:31:21:20:36 chr17 21215557 . G A 230.8 PASS AO=53;DP=110;FAO=54;FDP=110;FR=.;FRO=56;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=19;FSRR=37;FWDB=-0.00476463;FXX=0.0178555;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.622;QD=8.39256;RBI=0.0156956;REFB=-0.00935762;REVB=0.0149549;RO=54;SAF=24;SAR=29;SRF=18;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111486;STB=0.563887;TYPE=snp;VARB=0.00830356;OID=.;OPOS=21215557;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:54:56:53:54:29:24:18:36:29:25:19:37 chr17 21216788 . C T 41.69 PASS AO=13;DP=39;FAO=13;FDP=39;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=0.0141162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.253;QD=4.2763;RBI=0.0561599;REFB=0.00390071;REVB=0.0543568;RO=26;SAF=7;SAR=6;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17041;STB=0.60141;TYPE=snp;VARB=-0.00506346;OID=.;OPOS=21216788;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:39:39:26:26:13:13:6:7:10:16:6:7:10:16 chr17 21216846 . G C 24.14 PASS AO=8;DP=29;FAO=8;FDP=29;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.0613744;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.657;QD=3.32982;RBI=0.0624029;REFB=-0.0190245;REVB=0.0112829;RO=21;SAF=6;SAR=2;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.417917;STB=0.762067;TYPE=snp;VARB=0.0495901;OID=.;OPOS=21216846;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:29:29:21:21:8:8:2:6:8:13:2:6:8:13 chr17 21217513 . G A 195.4 PASS AO=53;DP=120;FAO=52;FDP=119;FR=.;FRO=67;FSAF=12;FSAR=40;FSRF=32;FSRR=35;FWDB=0.000515892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.6458;QD=6.56795;RBI=0.0193762;REFB=0.00516647;REVB=0.0193693;RO=67;SAF=12;SAR=41;SRF=32;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.290992;STB=0.661587;TYPE=snp;VARB=-0.0082281;OID=.;OPOS=21217513;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:119:67:67:53:52:41:12:32:35:40:12:32:35 chr17 21217547 . T C 177.56 PASS AO=48;DP=112;FAO=48;FDP=112;FR=.;FRO=64;FSAF=13;FSAR=35;FSRF=33;FSRR=31;FWDB=-0.00529759;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.665;QD=6.34132;RBI=0.0193879;REFB=-0.00358122;REVB=0.0186501;RO=58;SAF=13;SAR=35;SRF=33;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.30933;STB=0.652283;TYPE=snp;VARB=0.0119694;OID=.;OPOS=21217547;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:58:64:48:48:35:13:33:25:35:13:33:31 chr17 21217586 . G T 182.55 PASS AO=45;DP=96;FAO=44;FDP=94;FR=.;FRO=50;FSAF=11;FSAR=33;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=0.00982207;FXX=0.0408122;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.049;QD=7.76788;RBI=0.00991001;REFB=-0.00278969;REVB=0.0013173;RO=43;SAF=11;SAR=34;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.288102;STB=0.650529;TYPE=snp;VARB=0.00388858;OID=.;OPOS=21217586;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:94:43:50:45:44:34:11:23:20:33:11:25:25 chr17 21217596 . C G 207.05 PASS AO=21;DP=70;FAO=33;FDP=73;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=16;FSAF=8;FSAR=25;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.0126507;FXX=0.0266631;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.71;QD=11.3453;RBI=0.0126638;REFB=-0.0312833;REVB=-0.000576463;RO=13;SAF=1;SAR=20;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.624684;STB=0.644605;TYPE=snp;VARB=0.0463562;OID=.;OPOS=21217596;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:62:73:13:16:21:33:20:1:7:6:25:8:10:6 chr17 21217660 . C T 94.06 PASS AO=26;DP=64;FAO=26;FDP=64;FR=.;FRO=38;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=0.011656;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.096;QD=5.87891;RBI=0.0116946;REFB=-0.000517072;REVB=0.000949868;RO=38;SAF=8;SAR=18;SRF=24;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.336556;STB=0.69216;TYPE=snp;VARB=0.00112272;OID=.;OPOS=21217660;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:64:64:38:38:26:26:18:8:24:14:18:8:24:14 chr17 21217690 . C T 50.51 PASS AO=18;DP=57;FAO=18;FDP=57;FR=.;FRO=39;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=0.0530883;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.8619;QD=3.54452;RBI=0.0554171;REFB=-0.0191563;REVB=0.0158961;RO=39;SAF=4;SAR=14;SRF=24;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.456472;STB=0.771349;TYPE=snp;VARB=0.0458559;OID=.;OPOS=21217690;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:57:57:39:39:18:18:14:4:24:15:14:4:24:15 chr17 21217727 . TG T,CG 115.57 PASS AO=9,10;DP=39;FAO=10,11;FDP=29;FR=.;FRO=8;FSAF=10,1;FSAR=0,10;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.00985947,-0.0306072;FXX=0.17138;HRUN=4,2;LEN=1,1;MLLD=17.0358,98.6846;QD=15.9412;RBI=0.105546,0.0568487;REFB=0.0302607,-0.0179919;REVB=-0.105085,0.0479059;RO=8;SAF=9,0;SAR=0,10;SRF=3;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0.571429,0;SSSB=0.80753,-0.79271;STB=0.998553,0.726749;TYPE=del,snp;VARB=0.0687969,0.0172477;OID=.,.;OPOS=21217728,21217727;OREF=G,T;OALT=-,C;OMAPALT=T,CG GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:45:34:29:8:8:9,10:10,11:0,10:9,0:3:5:0,10:10,1:3:5 chr17 21217749 . G C 92.95 PASS AO=17;DP=30;FAO=17;FDP=30;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.033469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.5913;QD=12.393;RBI=0.0379813;REFB=0.00316466;REVB=0.0179557;RO=13;SAF=2;SAR=15;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.545397;STB=0.812378;TYPE=snp;VARB=-0.00153587;OID=.;OPOS=21217749;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:30:30:13:13:17:17:15:2:9:4:15:2:9:4 chr17 21318663 . G A 39.36 PASS AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0391406;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.902;QD=7.15675;RBI=0.0526611;REFB=-0.0185205;REVB=-0.0352307;RO=11;SAF=3;SAR=6;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119999;STB=0.580461;TYPE=snp;VARB=0.018769;OID=.;OPOS=21318663;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:21:22:11:13:9:9:6:3:5:6:6:3:6:7 chr17 21318698 . C T 40.25 PASS AO=12;DP=35;FAO=12;FDP=35;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.0070924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.0757;QD=4.60015;RBI=0.151283;REFB=0.00110116;REVB=0.151116;RO=22;SAF=5;SAR=7;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0418302;STB=0.540994;TYPE=snp;VARB=0.006039;OID=.;OPOS=21318698;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:35:35:22:23:12:12:7:5:10:12:7:5:11:12 chr17 21318770 . G A 18.68 PASS AO=14;DP=75;FAO=14;FDP=74;FR=.,HEALED;FRO=60;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=31;FSRR=29;FWDB=-0.00528883;FXX=0.0133316;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.601;QD=1.00955;RBI=0.133159;REFB=-0.031421;REVB=-0.133054;RO=43;SAF=10;SAR=4;SRF=31;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00994847;STB=0.667768;TYPE=snp;VARB=0.0795848;OID=.;OPOS=21318770;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:74:74:43:60:14:14:4:10:31:12:4:10:31:29 chr17 21318773 . G A 14.44 PASS AO=14;DP=82;FAO=14;FDP=83;FR=.;FRO=69;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=34;FSRR=35;FWDB=0.00968745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.058;QD=0.695869;RBI=0.022903;REFB=-0.0110371;REVB=0.0207533;RO=66;SAF=10;SAR=4;SRF=33;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275467;STB=0.68877;TYPE=snp;VARB=0.0263748;OID=.;OPOS=21318773;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:82:83:66:69:14:14:4:10:33:33:4:10:34:35 chr17 21318782 . G A 78.65 PASS AO=29;DP=88;FAO=29;FDP=89;FR=.;FRO=60;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=26;FSRR=34;FWDB=-0.0119081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.1898;QD=3.53491;RBI=0.0745449;REFB=-0.0121137;REVB=-0.0735877;RO=59;SAF=21;SAR=8;SRF=26;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.335027;STB=0.700971;TYPE=snp;VARB=0.0240158;OID=.;OPOS=21318782;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:88:89:59:60:29:29:8:21:26:33:8:21:26:34 chr17 21318867 . G A 87.37 PASS AO=36;DP=117;FAO=36;FDP=117;FR=.;FRO=81;FSAF=29;FSAR=7;FSRF=33;FSRR=48;FWDB=0.036559;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.5205;QD=2.98686;RBI=0.0422952;REFB=0.0103424;REVB=0.021268;RO=79;SAF=29;SAR=7;SRF=32;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.486947;STB=0.785937;TYPE=snp;VARB=-0.0281856;OID=.;OPOS=21318867;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:117:117:79:81:36:36:7:29:32:47:7:29:33:48 chr17 21318897 . G C 42.09 PASS AO=28;DP=123;FAO=28;FDP=125;FR=.;FRO=97;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=49;FSRR=48;FWDB=0.00715547;FXX=0.00793588;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.8543;QD=1.34683;RBI=0.0531904;REFB=-0.0116788;REVB=-0.0527069;RO=95;SAF=11;SAR=17;SRF=49;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15522;STB=0.587833;TYPE=snp;VARB=0.0621342;OID=.;OPOS=21318897;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:123:125:95:97:28:28:17:11:49:46:17:11:49:48 chr17 21318912 . C A 15.23 PASS AO=20;DP=125;FAO=20;FDP=125;FR=.;FRO=105;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=48;FSRR=57;FWDB=-0.0189355;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.2897;QD=0.487474;RBI=0.0192333;REFB=-0.00891225;REVB=0.00337112;RO=102;SAF=14;SAR=6;SRF=47;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.303493;STB=0.703147;TYPE=snp;VARB=0.0452875;OID=.;OPOS=21318912;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:125:125:102:105:20:20:6:14:47:55:6:14:48:57 chr17 21318918 . G A 129.7 PASS AO=44;DP=122;FAO=44;FDP=123;FR=.;FRO=79;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=32;FSRR=47;FWDB=-0.00477318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.8854;QD=4.21774;RBI=0.059746;REFB=-0.0323545;REVB=0.059555;RO=77;SAF=28;SAR=16;SRF=31;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.258673;STB=0.64751;TYPE=snp;VARB=0.0562197;OID=.;OPOS=21318918;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:123:77:79:44:44:16:28:31:46:16:28:32:47 chr17 21318948 . C T 68.36 PASS AO=29;DP=98;FAO=29;FDP=98;FR=.;FRO=69;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=43;FWDB=0.0508353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.5533;QD=2.79037;RBI=0.0508395;REFB=-0.0172561;REVB=0.000654328;RO=69;SAF=16;SAR=13;SRF=26;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206518;STB=0.621278;TYPE=snp;VARB=0.0604641;OID=.;OPOS=21318948;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:98:98:69:69:29:29:13:16:26:43:13:16:26:43 chr17 21318951 . C T 69.37 PASS AO=29;DP=97;FAO=29;FDP=97;FR=.;FRO=68;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=43;FWDB=0.00853012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.442;QD=2.86045;RBI=0.00964318;REFB=-0.0183615;REVB=-0.00449754;RO=67;SAF=16;SAR=13;SRF=24;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226849;STB=0.626928;TYPE=snp;VARB=0.0217363;OID=.;OPOS=21318951;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:97:97:67:68:29:29:13:16:24:43:13:16:25:43 chr17 21318952 . A G 247.69 PASS AO=52;DP=95;FAO=52;FDP=96;FR=.;FRO=44;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=17;FSRR=27;FWDB=-0.00444192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.164;QD=10.3202;RBI=0.00491229;REFB=-0.0401167;REVB=-0.00209759;RO=42;SAF=23;SAR=29;SRF=16;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0509893;STB=0.526134;TYPE=snp;VARB=0.0191724;OID=.;OPOS=21318952;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:96:42:44:52:52:29:23:16:26:29:23:17:27 chr17 21318969 . C T 75.03 PASS AO=30;DP=97;FAO=30;FDP=97;FR=.;FRO=67;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=42;FWDB=-0.0560689;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.0693;QD=3.09413;RBI=0.0579503;REFB=-0.00682274;REVB=-0.0146465;RO=67;SAF=16;SAR=14;SRF=25;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187522;STB=0.609453;TYPE=snp;VARB=0.0104656;OID=.;OPOS=21318969;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:97:97:67:67:30:30:14:16:25:42:14:16:25:42 chr17 21318981 . C T 88.1 PASS AO=29;DP=82;FAO=29;FDP=82;FR=.;FRO=53;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=29;FWDB=-0.0143843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.1474;QD=4.29739;RBI=0.0313574;REFB=-0.0158065;REVB=-0.0278636;RO=51;SAF=15;SAR=14;SRF=23;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0731707;STB=0.541533;TYPE=snp;VARB=0.0320382;OID=.;OPOS=21318981;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:82:82:51:53:29:29:14:15:23:28:14:15:24:29 chr17 21319007 . G A 37.68 PASS AO=18;DP=70;FAO=18;FDP=70;FR=.;FRO=52;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=29;FWDB=-0.0452557;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=98.0481;QD=2.15311;RBI=0.0471654;REFB=-0.00793728;REVB=-0.0132852;RO=51;SAF=7;SAR=11;SRF=22;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0533129;STB=0.540938;TYPE=snp;VARB=0.0809964;OID=.;OPOS=21319007;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:70:70:51:52:18:18:11:7:22:29:11:7:23:29 chr17 21319008 . G C 204.75 PASS AO=41;DP=73;FAO=41;FDP=73;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=-0.0379898;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=193.142;QD=11.2191;RBI=0.0392023;REFB=-0.0284152;REVB=-0.00967434;RO=32;SAF=18;SAR=23;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0521813;STB=0.528675;TYPE=snp;VARB=0.0230559;OID=.;OPOS=21319008;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:32:32:41:41:23:18:12:20:23:18:12:20 chr17 21319069 . G A 94.57 PASS AO=35;DP=110;FAO=36;FDP=111;FR=.;FRO=75;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=27;FSRR=48;FWDB=0.0564647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.5184;QD=3.4079;RBI=0.0595676;REFB=0.00257494;REVB=0.0189746;RO=75;SAF=17;SAR=18;SRF=27;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148587;STB=0.576668;TYPE=snp;VARB=-0.00455108;OID=.;OPOS=21319069;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:110:111:75:75:35:36:18:17:27:48:19:17:27:48 chr17 21319079 . C A 82.47 PASS AO=35;DP=113;FAO=35;FDP=115;FR=.;FRO=80;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=31;FSRR=49;FWDB=0.0118293;FXX=0.0170926;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.9593;QD=2.86858;RBI=0.0260368;REFB=-0.019642;REVB=-0.0231945;RO=77;SAF=17;SAR=18;SRF=31;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0984232;STB=0.568609;TYPE=snp;VARB=0.0471296;OID=.;OPOS=21319079;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:113:115:77:80:35:35:18:17:31:46:18:17:31:49 chr17 21319087 . G A 66.62 PASS AO=32;DP=116;FAO=32;FDP=116;FR=.;FRO=84;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=35;FSRR=49;FWDB=0.0145303;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.003;QD=2.29718;RBI=0.039244;REFB=-0.00446726;REVB=0.036455;RO=84;SAF=15;SAR=17;SRF=35;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0640352;STB=0.53802;TYPE=snp;VARB=0.00966403;OID=.;OPOS=21319087;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:116:116:84:84:32:32:17:15:35:49:17:15:35:49 chr17 21319110 . G A 85 PASS AO=35;DP=114;FAO=35;FDP=114;FR=.;FRO=79;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=32;FSRR=47;FWDB=0.0196117;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.7077;QD=2.98262;RBI=0.0217447;REFB=-0.00552086;REVB=-0.00939209;RO=79;SAF=18;SAR=17;SRF=32;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129138;STB=0.575382;TYPE=snp;VARB=0.00684412;OID=.;OPOS=21319110;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:114:114:79:79:35:35:17:18:32:47:17:18:32:47 chr17 21319121 . C T 69.07 PASS AO=30;DP=106;FAO=30;FDP=103;FR=.;FRO=73;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=30;FSRR=43;FWDB=-0.0267668;FXX=0.0282992;HRUN=3;LEN=1;MLLD=100.701;QD=2.68216;RBI=0.0494469;REFB=-0.00672273;REVB=-0.0415756;RO=71;SAF=17;SAR=13;SRF=28;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203144;STB=0.609014;TYPE=snp;VARB=0.0195475;OID=.;OPOS=21319121;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:106:103:71:73:30:30:13:17:28:43:13:17:30:43 chr17 21319171 . G A 117.75 PASS AO=40;DP=113;FAO=40;FDP=113;FR=.;FRO=73;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=36;FSRR=37;FWDB=-0.000521447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.1058;QD=4.16811;RBI=0.0790126;REFB=-0.0302236;REVB=0.0790108;RO=71;SAF=24;SAR=16;SRF=35;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120833;STB=0.569857;TYPE=snp;VARB=0.0558;OID=.;OPOS=21319171;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:71:73:40:40:16:24:35:36:16:24:36:37 chr17 21319208 . C T 94.49 PASS AO=28;DP=76;FAO=29;FDP=77;FR=.;FRO=48;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=0.0373176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.894;QD=4.90849;RBI=0.0374117;REFB=-0.0172467;REVB=-0.00265165;RO=48;SAF=16;SAR=12;SRF=20;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168626;STB=0.60491;TYPE=snp;VARB=0.031002;OID=.;OPOS=21319208;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:76:77:48:48:28:29:12:16:20:28:12:17:20:28 chr17 21319230 . G C 70.04 PASS AO=23;DP=66;FAO=23;FDP=66;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=26;FWDB=0.0418998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.576;QD=4.24484;RBI=0.0495549;REFB=-0.0244791;REVB=-0.0264592;RO=43;SAF=16;SAR=7;SRF=17;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.335767;STB=0.695482;TYPE=snp;VARB=0.0548619;OID=.;OPOS=21319230;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:66:66:43:43:23:23:7:16:17:26:7:16:17:26 chr17 21319251 . C T 58.87 PASS AO=19;DP=55;FAO=19;FDP=55;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=-0.0181314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.505;QD=4.28141;RBI=0.0641812;REFB=-0.0117089;REVB=-0.0615669;RO=36;SAF=11;SAR=8;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0578512;STB=0.533945;TYPE=snp;VARB=0.0202407;OID=.;OPOS=21319251;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:55:55:36:36:19:19:8:11:19:17:8:11:19:17 chr17 21319272 . C T 50.91 PASS AO=19;DP=62;FAO=19;FDP=62;FR=.;FRO=43;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=26;FSRR=17;FWDB=0.00541059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.457;QD=3.28483;RBI=0.0391443;REFB=-0.0143274;REVB=-0.0387686;RO=41;SAF=12;SAR=7;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0267667;STB=0.519835;TYPE=snp;VARB=0.0560529;OID=.;OPOS=21319272;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:62:62:41:43:19:19:7:12:25:16:7:12:26:17 chr17 21319285 . C T 43.43 PASS AO=19;DP=69;FAO=19;FDP=69;FR=.;FRO=50;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=32;FSRR=18;FWDB=0.0625594;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.3993;QD=2.51765;RBI=0.0626668;REFB=-0.0041412;REVB=-0.00366708;RO=50;SAF=11;SAR=8;SRF=32;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0765443;STB=0.545984;TYPE=snp;VARB=0.0139528;OID=.;OPOS=21319285;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:69:69:50:50:19:19:8:11:32:18:8:11:32:18 chr17 21319302 . T C 223.5 PASS AO=41;DP=68;FAO=41;FDP=68;FR=.;FRO=27;FSAF=28;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.00428089;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.277;QD=13.147;RBI=0.00989188;REFB=-0.0208453;REVB=0.00891759;RO=26;SAF=28;SAR=13;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140946;STB=0.571393;TYPE=snp;VARB=0.01107;OID=.;OPOS=21319302;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:68:68:26:27:41:41:13:28:13:13:13:28:14:13 chr17 21319311 . C T 48.04 PASS AO=20;DP=74;FAO=21;FDP=73;FR=.;FRO=52;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=33;FSRR=19;FWDB=0.036756;FXX=0.0266631;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.113;QD=2.63247;RBI=0.03714;REFB=-0.0122166;REVB=-0.00532703;RO=51;SAF=13;SAR=7;SRF=33;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00385781;STB=0.511811;TYPE=snp;VARB=0.0385189;OID=.;OPOS=21319311;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:74:73:51:52:20:21:7:13:33:18:8:13:33:19 chr17 21319369 . G A 35.29 PASS AO=22;DP=99;FAO=22;FDP=98;FR=.;FRO=76;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=50;FSRR=26;FWDB=-0.0132552;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.441;QD=1.44034;RBI=0.0189202;REFB=-0.0080614;REVB=0.0135009;RO=76;SAF=10;SAR=12;SRF=50;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252783;STB=0.654415;TYPE=snp;VARB=0.036507;OID=.;OPOS=21319369;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:99:98:76:76:22:22:12:10:50:26:12:10:50:26 chr17 21319392 . G A 30.37 PASS AO=23;DP=112;FAO=23;FDP=112;FR=.;FRO=89;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=59;FSRR=30;FWDB=-0.0189665;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.801;QD=1.08469;RBI=0.0380912;REFB=-0.00559237;REVB=0.0330335;RO=88;SAF=9;SAR=14;SRF=58;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.329445;STB=0.706068;TYPE=snp;VARB=0.0301347;OID=.;OPOS=21319392;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:112:112:88:89:23:23:14:9:58:30:14:9:59:30 chr17 21319407 . C T 36.25 PASS AO=24;DP=108;FAO=24;FDP=108;FR=.;FRO=84;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=55;FSRR=29;FWDB=0.0143451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.4265;QD=1.34271;RBI=0.0143889;REFB=0.0113096;REVB=0.00112082;RO=84;SAF=10;SAR=14;SRF=55;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.29337;STB=0.678966;TYPE=snp;VARB=-0.019116;OID=.;OPOS=21319407;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:108:108:84:84:24:24:14:10:55:29:14:10:55:29 chr17 21319436 . G A 33.19 PASS AO=21;DP=95;FAO=21;FDP=94;FR=.;FRO=73;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=45;FSRR=28;FWDB=-0.0242072;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.524;QD=1.41242;RBI=0.0242373;REFB=-0.00578423;REVB=0.00120801;RO=73;SAF=8;SAR=13;SRF=45;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.288332;STB=0.677321;TYPE=snp;VARB=0.0158518;OID=.;OPOS=21319436;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:95:94:73:73:21:21:13:8:45:28:13:8:45:28 chr17 21319439 . T G 27.82 PASS AO=19;DP=89;FAO=19;FDP=90;FR=.;FRO=71;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=43;FSRR=28;FWDB=-0.0242864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.38;QD=1.23629;RBI=0.0321204;REFB=-0.0055336;REVB=-0.0210211;RO=68;SAF=8;SAR=11;SRF=42;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.242225;STB=0.642467;TYPE=snp;VARB=0.0134299;OID=.;OPOS=21319439;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:89:90:68:71:19:19:11:8:42:26:11:8:43:28 chr17 21319452 . G A 13.66 PASS AO=14;DP=85;FAO=14;FDP=85;FR=.;FRO=71;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=43;FSRR=28;FWDB=-0.0271257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8059;QD=0.642769;RBI=0.0394766;REFB=0.00451968;REVB=0.028681;RO=68;SAF=5;SAR=9;SRF=40;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.284165;STB=0.699891;TYPE=snp;VARB=-0.0212216;OID=.;OPOS=21319452;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:85:85:68:71:14:14:9:5:40:28:9:5:43:28 chr17 21319465 . T C 12.7 PASS AO=14;DP=84;FAO=14;FDP=87;FR=.;FRO=73;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=44;FSRR=29;FWDB=-0.0461189;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2562;QD=0.583682;RBI=0.0465941;REFB=-0.000557033;REVB=-0.00663786;RO=70;SAF=5;SAR=9;SRF=41;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.281203;STB=0.698621;TYPE=snp;VARB=0.00111554;OID=.;OPOS=21319465;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:84:87:70:73:14:14:9:5:41:29:9:5:44:29 chr17 21319470 . T C 18.77 PASS AO=16;DP=87;FAO=16;FDP=87;FR=.;FRO=71;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=42;FSRR=29;FWDB=-0.0410332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.1259;QD=0.86306;RBI=0.044198;REFB=-0.0227129;REVB=-0.0164238;RO=70;SAF=6;SAR=10;SRF=41;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260734;STB=0.672061;TYPE=snp;VARB=0.0614882;OID=.;OPOS=21319470;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:87:87:70:71:16:16:10:6:41:29:10:6:42:29 chr17 21319473 . G A 40.45 PASS AO=21;DP=84;FAO=21;FDP=84;FR=.;FRO=63;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=40;FSRR=23;FWDB=0.010708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.242;QD=1.92632;RBI=0.0114409;REFB=-0.00849751;REVB=0.00402889;RO=63;SAF=7;SAR=14;SRF=40;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.359918;STB=0.717361;TYPE=snp;VARB=0.0268441;OID=.;OPOS=21319473;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:84:84:63:63:21:21:14:7:40:23:14:7:40:23 chr17 21319488 . C T 20.8 PASS AO=16;DP=83;FAO=16;FDP=83;FR=.;FRO=67;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=39;FSRR=28;FWDB=0.0105877;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=143.738;QD=1.00227;RBI=0.0128226;REFB=-0.00411689;REVB=-0.0072331;RO=67;SAF=8;SAR=8;SRF=39;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103433;STB=0.566184;TYPE=snp;VARB=0.0199361;OID=.;OPOS=21319488;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:83:83:67:67:16:16:8:8:39:28:8:8:39:28 chr17 21319519 . G C 29.68 PASS AO=19;DP=87;FAO=19;FDP=87;FR=.;FRO=68;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=32;FSRR=36;FWDB=-0.0333079;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.461;QD=1.36442;RBI=0.0368287;REFB=-0.00822608;REVB=-0.0157143;RO=66;SAF=5;SAR=14;SRF=32;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.291628;STB=0.674286;TYPE=snp;VARB=0.0354913;OID=.;OPOS=21319519;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:87:87:66:68:19:19:14:5:32:34:14:5:32:36 chr17 21319523 . C T 43.9 PASS AO=23;DP=90;FAO=23;FDP=90;FR=.;FRO=67;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=31;FSRR=36;FWDB=0.0130805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.051;QD=1.95114;RBI=0.0181173;REFB=-0.00401834;REVB=-0.0125355;RO=64;SAF=8;SAR=15;SRF=30;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152668;STB=0.589045;TYPE=snp;VARB=0.0409658;OID=.;OPOS=21319523;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:90:90:64:67:23:23:15:8:30:34:15:8:31:36 chr17 21319527 . C T 54.33 PASS AO=26;DP=96;FAO=26;FDP=96;FR=.;FRO=70;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=34;FSRR=36;FWDB=-0.00118407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.572;QD=2.26388;RBI=0.0106434;REFB=0.0013629;REVB=-0.0105773;RO=69;SAF=9;SAR=17;SRF=33;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165576;STB=0.60505;TYPE=snp;VARB=-0.00475452;OID=.;OPOS=21319527;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:96:96:69:70:26:26:17:9:33:36:17:9:34:36 chr17 21319543 . G A 66.74 PASS AO=30;DP=107;FAO=30;FDP=105;FR=.;FRO=75;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=38;FSRR=37;FWDB=0.00183906;FXX=0.0186898;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.631;QD=2.54229;RBI=0.0212759;REFB=-0.0178562;REVB=-0.0211963;RO=75;SAF=12;SAR=18;SRF=38;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129551;STB=0.576871;TYPE=snp;VARB=0.0390519;OID=.;OPOS=21319543;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:107:105:75:75:30:30:18:12:38:37:18:12:38:37 chr17 21319560 . G T 68.89 PASS AO=33;DP=120;FAO=33;FDP=119;FR=.;FRO=86;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=40;FSRR=46;FWDB=-0.00838081;FXX=0.00833264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.822;QD=2.3155;RBI=0.0109729;REFB=0.00687916;REVB=0.00708284;RO=87;SAF=13;SAR=20;SRF=41;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.096089;STB=0.552627;TYPE=snp;VARB=-0.0315276;OID=.;OPOS=21319560;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:120:119:87:86:33:33:20:13:41:46:20:13:40:46 chr17 21319650 . CGAG C 115.28 PASS AO=56;DP=218;FAO=59;FDP=212;FR=.;FRO=153;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=73;FSRR=80;FWDB=0.0022287;FXX=0.0185177;HRUN=1;LEN=3;MLLD=185.068;QD=2.17504;RBI=0.0259473;REFB=-0.011997;REVB=-0.0258514;RO=142;SAF=28;SAR=28;SRF=69;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171893;STB=0.510396;TYPE=del;VARB=0.0273801;OID=.;OPOS=21319651;OREF=GAG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:56:209:59:212:153:29:30:73:80:99:142:28:28:69:73 chr17 21319682 . C T 124.65 PASS AO=62;DP=221;FAO=63;FDP=224;FR=.;FRO=161;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=78;FSRR=83;FWDB=-0.00441741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.5744;QD=2.22597;RBI=0.0163413;REFB=-0.00346335;REVB=-0.0157329;RO=159;SAF=30;SAR=32;SRF=76;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00721334;STB=0.505961;TYPE=snp;VARB=0.00556342;OID=.;OPOS=21319682;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:224:159:161:62:63:32:30:76:83:33:30:78:83 chr17 21319716 . G A 57.47 PASS AO=42;DP=195;FAO=42;FDP=189;FR=.;FRO=147;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=65;FSRR=82;FWDB=-0.0286431;FXX=0.0454523;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.7444;QD=1.21636;RBI=0.0322175;REFB=-0.00623462;REVB=0.0147493;RO=135;SAF=21;SAR=21;SRF=58;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.088817;STB=0.544952;TYPE=snp;VARB=0.010249;OID=.;OPOS=21319716;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:195:189:135:147:42:42:21:21:58:77:21:21:65:82 chr17 21319728 . T C 103.48 PASS AO=54;DP=198;FAO=54;FDP=198;FR=.;FRO=144;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=65;FSRR=79;FWDB=-0.0441081;FXX=0.00502487;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.224;QD=2.09053;RBI=0.0534365;REFB=-0.0116698;REVB=-0.0301652;RO=141;SAF=29;SAR=25;SRF=62;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118925;STB=0.562035;TYPE=snp;VARB=0.0318406;OID=.;OPOS=21319728;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:198:141:144:54:54:25:29:62:79:25:29:65:79 chr17 21319743 . A G 86.14 PASS AO=47;DP=177;FAO=47;FDP=178;FR=.;FRO=131;FSAF=29;FSAR=18;FSRF=60;FSRR=71;FWDB=-0.0202595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.749;QD=1.93573;RBI=0.0512596;REFB=-0.0127337;REVB=-0.0470861;RO=129;SAF=29;SAR=18;SRF=59;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197069;STB=0.616971;TYPE=snp;VARB=0.017219;OID=.;OPOS=21319743;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:177:178:129:131:47:47:18:29:59:70:18:29:60:71 chr17 21319767 . C T 232.81 PASS AO=55;DP=156;FAO=55;FDP=114;FR=.;FRO=59;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=25;FSRR=34;FWDB=-0.0135119;FXX=0.287482;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.448;QD=8.1688;RBI=0.0185873;REFB=0.00624431;REVB=-0.0127638;RO=58;SAF=27;SAR=28;SRF=25;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0555713;STB=0.534812;TYPE=snp;VARB=-0.0066956;OID=.;OPOS=21319767;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:114:58:59:55:55:28:27:25:33:28:27:25:34 chr17 21319785 . C T 131.25 PASS AO=48;DP=146;FAO=50;FDP=149;FR=.;FRO=99;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=50;FSRR=49;FWDB=0.00543505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.969;QD=3.52342;RBI=0.0113521;REFB=-0.00853356;REVB=0.00996651;RO=98;SAF=22;SAR=26;SRF=49;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0485193;STB=0.516642;TYPE=snp;VARB=0.016098;OID=.;OPOS=21319785;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:149:98:99:48:50:26:22:49:49:26:24:50:49 chr17 21319786 . G A 85.23 PASS AO=42;DP=148;FAO=41;FDP=147;FR=.;FRO=106;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=47;FSRR=59;FWDB=0.0441263;FXX=0.0067563;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.148;QD=2.31918;RBI=0.0454559;REFB=0.00160667;REVB=0.0109137;RO=106;SAF=26;SAR=16;SRF=47;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212724;STB=0.619367;TYPE=snp;VARB=-0.00525643;OID=.;OPOS=21319786;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:148:147:106:106:42:41:16:26:47:59:16:25:47:59 chr17 21319845 . C T 92.33 PASS AO=26;DP=65;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=-0.0476799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.9342;QD=5.68167;RBI=0.0553168;REFB=-0.0248087;REVB=0.028046;RO=39;SAF=18;SAR=8;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226134;STB=0.629896;TYPE=snp;VARB=0.0544206;OID=.;OPOS=21319845;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:65:65:39:39:26:26:8:18:19:20:8:18:19:20 chr17 21319860 . C A,T 229.88 PASS AO=17,13;DP=39;FAO=18,16;FDP=43;FR=.;FRO=9;FSAF=13,6;FSAR=5,10;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.00856558,0.000313029;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=233.337,71.2407;QD=21.384;RBI=0.0121047,0.00643711;REFB=-0.026483,-0.0144504;REVB=0.00855309,0.0064295;RO=9;SAF=13,6;SAR=4,7;SRF=4;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.235576,0.0124041;STB=0.604528,0.526282;TYPE=snp,snp;VARB=0.0193892,-0.00263917;OID=.,.;OPOS=21319860,21319860;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:72:39:43:9:9:17,13:18,16:4,7:13,6:4:5:5,10:13,6:4:5 chr17 21319868 . G T 77.99 PASS AO=17;DP=39;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.0043535;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.127;QD=7.79863;RBI=0.00796041;REFB=-0.00602955;REVB=-0.00666447;RO=18;SAF=11;SAR=6;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23473;STB=0.666481;TYPE=snp;VARB=0.00483734;OID=.;OPOS=21319868;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:39:40:18:22:17:18:6:11:7:11:6:12:8:14 chr17 21319908 . C T 77.13 PASS AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=17;FWDB=0.0940225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.363;QD=7.71267;RBI=0.0940408;REFB=-0.00942697;REVB=-0.00185468;RO=22;SAF=12;SAR=6;SRF=5;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.405594;STB=0.729921;TYPE=snp;VARB=0.023094;OID=.;OPOS=21319908;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:40:40:22:22:18:18:6:12:5:17:6:12:5:17 chr17 21319943 . A G 28.81 PASS AO=7;DP=30;FAO=10;FDP=33;FR=.;FRO=23;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.0443275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.004;QD=3.49153;RBI=0.0464525;REFB=-0.00303649;REVB=-0.0138889;RO=22;SAF=0;SAR=7;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.707717;STB=0.695219;TYPE=snp;VARB=0.00620953;OID=.;OPOS=21319943;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:30:33:22:23:7:10:7:0:9:13:8:2:10:13 chr17 21319955 . G A 11.43 PASS AO=5;DP=26;FAO=5;FDP=26;FR=.;FRO=21;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=17;FWDB=-0.0973617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.435;QD=1.75882;RBI=0.102017;REFB=-0.00416125;REVB=0.0304662;RO=21;SAF=1;SAR=4;SRF=4;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0176102;STB=0.512147;TYPE=snp;VARB=0.0092841;OID=.;OPOS=21319955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:26:26:21:21:5:5:4:1:4:17:4:1:4:17 chr17 21320197 . G C 23.43 PASS AO=10;DP=31;FAO=8;FDP=29;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.000246937;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=211.4;QD=3.23172;RBI=0.0239086;REFB=-0.0136184;REVB=-0.0239074;RO=21;SAF=6;SAR=4;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0790598;STB=0.53263;TYPE=snp;VARB=0.030007;OID=.;OPOS=21320197;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:31:29:21:21:10:8:4:6:14:7:3:5:14:7 chr17 21320210 . C T 20.13 PASS AO=9;DP=34;FAO=7;FDP=28;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=-0.0332002;FXX=0.124961;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.579;QD=2.8751;RBI=0.0349107;REFB=0.00628589;REVB=-0.0107937;RO=20;SAF=6;SAR=3;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0428515;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0101534;OID=.;OPOS=21320210;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:34:28:20:21:9:7:3:6:14:6:2:5:15:6 chr17 21320212 . A G 89.51 PASS AO=18;DP=32;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=2;FWDB=-0.00879236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.15;QD=11.5503;RBI=0.038762;REFB=0.00295341;REVB=0.0377516;RO=13;SAF=12;SAR=6;SRF=11;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161541;STB=0.610503;TYPE=snp;VARB=-0.00259863;OID=.;OPOS=21320212;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:32:31:13:14:18:17:6:12:11:2:6:11:12:2 chr17 21320252 . G T 23.35 PASS AO=15;DP=62;FAO=13;FDP=59;FR=.;FRO=46;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=29;FSRR=17;FWDB=0.00169581;FXX=0.0166639;HRUN=4;LEN=1;MLLD=239.186;QD=1.58328;RBI=0.0164397;REFB=-0.00757153;REVB=-0.016352;RO=45;SAF=11;SAR=4;SRF=30;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0968475;STB=0.630697;TYPE=snp;VARB=0.0251185;OID=.;OPOS=21320252;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:62:59:45:46:15:13:4:11:30:15:3:10:29:17 chr17 21320263 . T C 66.53 PASS AO=28;DP=89;FAO=26;FDP=84;FR=.;FRO=58;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=45;FSRR=13;FWDB=0.0241672;FXX=0.0232531;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.463;QD=3.16797;RBI=0.0487159;REFB=-0.0170139;REVB=-0.0422988;RO=61;SAF=18;SAR=10;SRF=48;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198446;STB=0.623637;TYPE=snp;VARB=0.0405294;OID=.;OPOS=21320263;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:89:84:61:58:28:26:10:18:48:13:10:16:45:13 chr17 21320279 . C T 14.86 PASS AO=17;DP=93;FAO=15;FDP=89;FR=.;FRO=74;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=58;FSRR=16;FWDB=0.0508308;FXX=0.0111099;HRUN=3;LEN=1;MLLD=71.5106;QD=0.667658;RBI=0.0686631;REFB=0.00702546;REVB=-0.0461611;RO=75;SAF=11;SAR=6;SRF=60;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.238149;STB=0.618044;TYPE=snp;VARB=-0.0375834;OID=.;OPOS=21320279;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:93:89:75:74:17:15:6:11:60:15:5:10:58:16 chr17 21320350 . G A 17.22 PASS AO=17;DP=94;FAO=16;FDP=91;FR=.;FRO=75;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=51;FSRR=24;FWDB=0.002496;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=205.642;QD=0.756749;RBI=0.00265459;REFB=0.00406898;REVB=0.00090378;RO=76;SAF=9;SAR=8;SRF=52;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202535;STB=0.648183;TYPE=snp;VARB=-0.0207265;OID=.;OPOS=21320350;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:94:91:76:75:17:16:8:9:52:24:8:8:51:24 chr17 21320365 . T C 105.58 PASS AO=36;DP=96;FAO=34;FDP=93;FR=.;FRO=59;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=38;FSRR=21;FWDB=-0.0575551;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.1066;QD=4.54122;RBI=0.0576183;REFB=-0.000375962;REVB=0.00269743;RO=60;SAF=21;SAR=15;SRF=39;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0762363;STB=0.555524;TYPE=snp;VARB=-0.000131704;OID=.;OPOS=21320365;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:93:60:59:36:34:15:21:39:21:15:19:38:21 chr17 21320405 . T A 46.36 PASS AO=10;DP=57;FAO=22;FDP=68;FR=.;FRO=46;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=0.0210994;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7943;QD=2.72694;RBI=0.0215682;REFB=-0.0352429;REVB=-0.00447274;RO=47;SAF=5;SAR=5;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0393288;STB=0.590826;TYPE=snp;VARB=0.00117639;OID=.;OPOS=21320405;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:57:68:47:46:10:22:5:5:25:22:13:9:25:21 chr17 21320406 . T A 17.4 PASS AO=11;DP=69;FAO=13;FDP=68;FR=.;FRO=55;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=27;FSRR=28;FWDB=0.0622443;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.929;QD=1.02336;RBI=0.0640647;REFB=0.00191546;REVB=0.0151638;RO=58;SAF=5;SAR=6;SRF=29;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0563153;STB=0.538402;TYPE=snp;VARB=-0.0017902;OID=.;OPOS=21320406;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:69:68:58:55:11:13:6:5:29:29:6:7:27:28 chr17 21320711 . C G 21.48 PASS AO=11;DP=39;FAO=9;FDP=37;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=23;FSRR=5;FWDB=0.00645771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.89;QD=2.32164;RBI=0.0326162;REFB=0.00196678;REVB=-0.0319706;RO=23;SAF=10;SAR=1;SRF=18;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.28822;STB=0.607321;TYPE=snp;VARB=-0.00791974;OID=.;OPOS=21320711;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:39:37:23:28:11:9:1:10:18:5:1:8:23:5 chr17 21320787 . G A 323.74 PASS AO=122;DP=353;FAO=122;FDP=351;FR=.;FRO=229;FSAF=20;FSAR=102;FSRF=29;FSRR=200;FWDB=-0.00874733;FXX=0.00284083;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.843;QD=3.6894;RBI=0.0130067;REFB=-0.00321;REVB=-0.00962593;RO=230;SAF=20;SAR=102;SRF=30;SRR=200;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0747024;STB=0.547193;TYPE=snp;VARB=0.0055328;OID=.;OPOS=21320787;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:353:351:230:229:122:122:102:20:30:200:102:20:29:200 chr17 21320796 . C T 964.13 PASS AO=199;DP=353;FAO=199;FDP=353;FR=.;FRO=154;FSAF=17;FSAR=182;FSRF=25;FSRR=129;FWDB=-0.0269598;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=235.691;QD=10.925;RBI=0.0269631;REFB=-0.00573287;REVB=0.00041664;RO=154;SAF=17;SAR=182;SRF=25;SRR=129;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166228;STB=0.591127;TYPE=snp;VARB=0.00494884;OID=.;OPOS=21320796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:353:353:154:154:199:199:182:17:25:129:182:17:25:129 chr17 21320798 . G C 574.84 PASS AO=201;DP=346;FAO=180;FDP=325;FR=.;FRO=145;FSAF=9;FSAR=171;FSRF=24;FSRR=121;FWDB=0.0398277;FXX=0.0714265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.262;QD=7.07501;RBI=0.0458265;REFB=-0.0310608;REVB=0.0226678;RO=141;SAF=17;SAR=184;SRF=24;SRR=117;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175333;STB=0.682237;TYPE=snp;VARB=0.108713;OID=.;OPOS=21320798;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:346:325:141:145:201:180:184:17:24:117:171:9:24:121 chr17 21320980 . C G 546.41 PASS AO=86;DP=120;FAO=85;FDP=118;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=68;FSRF=8;FSRR=25;FWDB=-0.000596305;FXX=0.00840265;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.457;QD=18.5225;RBI=0.00287005;REFB=-0.0359428;REVB=-0.00280742;RO=33;SAF=17;SAR=69;SRF=8;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0355863;STB=0.51813;TYPE=snp;VARB=0.0140895;OID=.;OPOS=21320980;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:120:118:33:33:86:85:69:17:8:25:68:17:8:25 chr17 21320991 . C T 67.75 PASS AO=31;DP=105;FAO=30;FDP=104;FR=.;FRO=74;FSAF=7;FSAR=23;FSRF=11;FSRR=63;FWDB=0.0173828;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.835;QD=2.6059;RBI=0.017441;REFB=-0.00471201;REVB=-0.00142318;RO=74;SAF=7;SAR=24;SRF=11;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146572;STB=0.592465;TYPE=snp;VARB=0.0108171;OID=.;OPOS=21320991;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:105:104:74:74:31:30:24:7:11:63:23:7:11:63 chr17 21320993 . G T 381.05 PASS AO=66;DP=100;FAO=65;FDP=99;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=54;FSRF=6;FSRR=28;FWDB=0.0393484;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=176.936;QD=15.3959;RBI=0.0394465;REFB=-0.00850989;REVB=0.00278019;RO=33;SAF=11;SAR=55;SRF=6;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0166114;STB=0.504394;TYPE=snp;VARB=0.00508207;OID=.;OPOS=21320993;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:100:99:33:34:66:65:55:11:6:27:54:11:6:28 chr17 21321005 . C A 47.35 PASS AO=24;DP=90;FAO=23;FDP=88;FR=.;FRO=65;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=7;FSRR=58;FWDB=-0.00927399;FXX=0.0329634;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.0258;QD=2.15215;RBI=0.0202365;REFB=-0.00199555;REVB=0.0179864;RO=61;SAF=5;SAR=19;SRF=7;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198748;STB=0.637488;TYPE=snp;VARB=0.00548788;OID=.;OPOS=21321005;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:90:88:61:65:24:23:19:5:7:54:18:5:7:58 chr17 21321016 . T C 267.77 PASS AO=46;DP=68;FAO=45;FDP=67;FR=.;FRO=22;FSAF=3;FSAR=42;FSRF=2;FSRR=20;FWDB=-0.0412667;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.158;QD=15.9861;RBI=0.0427922;REFB=0.0027196;REVB=0.0113241;RO=21;SAF=3;SAR=43;SRF=2;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0664181;STB=0.530289;TYPE=snp;VARB=-0.00147576;OID=.;OPOS=21321016;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:68:67:21:22:46:45:43:3:2:19:42:3:2:20 chr17 21321029 . C G 255.38 PASS AO=41;DP=55;FAO=40;FDP=56;FR=.;FRO=16;FSAF=0;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=16;FWDB=0;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=221.253;QD=18.2415;RBI=0.00414631;REFB=-0.0102566;REVB=-0.00414631;RO=14;SAF=0;SAR=41;SRF=0;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00511615;OID=.;OPOS=21321029;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:55:56:14:16:41:40:41:0:0:14:40:0:0:16 chr17 21322972 . G C 66.03 PASS AO=14;DP=29;FAO=14;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=13;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.0225292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.877;QD=9.10814;RBI=0.0225352;REFB=-0.0118903;REVB=0.000519353;RO=15;SAF=13;SAR=1;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.555987;STB=0.831384;TYPE=snp;VARB=0.00295236;OID=.;OPOS=21322972;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:29:29:15:15:14:14:1:13:8:7:1:13:8:7 chr17 21322973 . T C 66.03 PASS AO=14;DP=29;FAO=14;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=13;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.0122053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.448;QD=9.10764;RBI=0.0275713;REFB=-0.051001;REVB=-0.0247226;RO=14;SAF=13;SAR=1;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.524293;STB=0.831384;TYPE=snp;VARB=0.00708339;OID=.;OPOS=21322973;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:29:29:14:15:14:14:1:13:8:6:1:13:8:7 chr17 21323001 . C T 99.42 PASS AO=19;DP=36;FAO=19;FDP=34;FR=.;FRO=15;FSAF=18;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.00602142;FXX=0.0555401;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.425;QD=11.6962;RBI=0.0108046;REFB=0.00237062;REVB=-0.00897115;RO=10;SAF=18;SAR=1;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.563109;STB=0.846558;TYPE=snp;VARB=-0.0079859;OID=.;OPOS=21323001;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:36:34:10:15:19:19:1:18:5:5:1:18:8:7 chr17 21323049 . C T 84.33 PASS AO=28;DP=80;FAO=28;FDP=80;FR=.;FRO=52;FSAF=24;FSAR=4;FSRF=22;FSRR=30;FWDB=-0.00647964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.391;QD=4.21637;RBI=0.00837557;REFB=-0.00359587;REVB=-0.00530702;RO=51;SAF=24;SAR=4;SRF=22;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.530983;STB=0.815753;TYPE=snp;VARB=0.0184052;OID=.;OPOS=21323049;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:80:80:51:52:28:28:4:24:22:29:4:24:22:30 chr17 21323096 . G A 145.26 PASS AO=37;DP=93;FAO=40;FDP=95;FR=.;FRO=55;FSAF=28;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=33;FWDB=0.000717344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.374;QD=6.11631;RBI=0.0184053;REFB=-0.0165026;REVB=-0.0183913;RO=43;SAF=26;SAR=11;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.241722;STB=0.677329;TYPE=snp;VARB=0.0109318;OID=.;OPOS=21323096;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:95:43:55:37:40:11:26:20:23:12:28:22:33 chr17 21323107 . A G 78.76 PASS AO=30;DP=97;FAO=30;FDP=95;FR=.;FRO=65;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=27;FSRR=38;FWDB=0.0335813;FXX=0.0404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.059;QD=3.31642;RBI=0.0464982;REFB=-0.0112428;REVB=-0.0321618;RO=60;SAF=20;SAR=10;SRF=27;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.251595;STB=0.671215;TYPE=snp;VARB=0.0225299;OID=.;OPOS=21323107;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:97:95:60:65:30:30:10:20:27:33:10:20:27:38 chr17 21730703 . G A 125.56 PASS AO=45;DP=130;FAO=45;FDP=131;FR=.;FRO=86;FSAF=40;FSAR=5;FSRF=56;FSRR=30;FWDB=0.0308383;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.039;QD=3.83374;RBI=0.0343184;REFB=0.0012284;REVB=-0.0150583;RO=85;SAF=40;SAR=5;SRF=56;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.404104;STB=0.744547;TYPE=snp;VARB=-0.00428351;OID=.;OPOS=21730703;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:131:85:86:45:45:5:40:56:29:5:40:56:30 chr17 21731041 . G A 193.87 PASS AO=16;DP=64;FAO=32;FDP=58;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.0390902;FXX=0.0491723;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.2462;QD=13.3705;RBI=0.0392626;REFB=0.045035;REVB=0.00367468;RO=10;SAF=1;SAR=15;SRF=1;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0980127;STB=0.505316;TYPE=snp;VARB=-0.0209428;OID=.;OPOS=21731041;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:44:58:10:18:16:32:15:1:1:9:20:12:7:11 chr17 25628820 . T C 226.61 PASS AO=71;DP=183;FAO=71;FDP=182;FR=.;FRO=111;FSAF=43;FSAR=28;FSRF=51;FSRR=60;FWDB=0.0066107;FXX=0.00546418;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.627;QD=4.98051;RBI=0.00835268;REFB=-0.00422641;REVB=0.00510548;RO=111;SAF=43;SAR=28;SRF=51;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159064;STB=0.58975;TYPE=snp;VARB=0.00667382;OID=.;OPOS=25628820;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:182:111:111:71:71:28:43:51:60:28:43:51:60 chr17 25639610 . TCTAA T 154.83 PASS AO=38;DP=103;FAO=42;FDP=99;FR=.;FRO=57;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=26;FSRR=31;FWDB=-0.0137431;FXX=0.0294089;HRUN=1;LEN=4;MLLD=219.121;QD=6.25559;RBI=0.015326;REFB=-0.0273077;REVB=-0.0067833;RO=44;SAF=19;SAR=19;SRF=15;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153001;STB=0.552594;TYPE=del;VARB=0.0306572;OID=.;OPOS=25639611;OREF=CTAA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:38:96:42:99:57:23:19:26:31:99:44:19:19:15:29 chr17 25909850 . G T 256.4 PASS AO=23;DP=23;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.939;QD=37.9848;RBI=0.0248174;REFB=0;REVB=0.0248174;RO=0;SAF=0;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00412027;OID=.;OPOS=25909850;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:23:27:0:0:23:27:23:0:0:0:27:0:0:0 chr17 25970642 . A T 774.89 PASS AO=90;DP=99;FAO=92;FDP=100;FR=.;FRO=8;FSAF=12;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0.0189979;FXX=0.0476145;HRUN=5;LEN=1;MLLD=103.726;QD=30.9955;RBI=0.0268736;REFB=-0.157907;REVB=-0.0190072;RO=8;SAF=12;SAR=78;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.046178;STB=0.523804;TYPE=snp;VARB=0.00269227;OID=.;OPOS=25970642;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:99:100:8:8:90:92:78:12:0:8:80:12:0:8 chr17 26574820 . G A 22.51 PASS AO=5;DP=16;FAO=5;FDP=14;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=-0.0339419;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.679;QD=6.43102;RBI=0.0422887;REFB=0.00594635;REVB=0.0252246;RO=11;SAF=1;SAR=4;SRF=0;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.505609;STB=0.764115;TYPE=snp;VARB=-0.00986079;OID=.;OPOS=26574820;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:16:14:11:9:5:5:4:1:0:11:4:1:0:9 chr17 26633155 . A T 332.54 PASS AO=87;DP=198;FAO=89;FDP=200;FR=.;FRO=111;FSAF=45;FSAR=44;FSRF=57;FSRR=54;FWDB=0.0555675;FXX=0.0099005;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.395;QD=6.65084;RBI=0.0567172;REFB=-0.0094339;REVB=0.0113615;RO=110;SAF=41;SAR=46;SRF=57;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0471161;STB=0.504382;TYPE=snp;VARB=0.011914;OID=.;OPOS=26633155;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:200:110:111:87:89:46:41:57:53:44:45:57:54 chr17 26646267 . TG T 65.23 PASS AO=16;DP=35;FAO=20;FDP=34;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=-0.00640581;FXX=0.0555401;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.3068;QD=7.6747;RBI=0.0281069;REFB=-0.114634;REVB=-0.0273672;RO=13;SAF=9;SAR=7;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0.478673;SSSB=-0.171681;STB=0.58815;TYPE=del;VARB=0.102671;OID=.;OPOS=26646268;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:16:34:20:34:14:10:10:10:4:25:13:9:7:10:3 chr17 26672360 . G GC 324.26 PASS AO=39;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.143069;FXX=0.0454442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=23.0626;QD=30.8814;RBI=0.146937;REFB=0;REVB=-0.0334935;RO=1;SAF=10;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0158949;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-0.00918266;OID=.;OPOS=26672361;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:39:42:42:42:0:10:32:0:0:29:1:10:29:0:1 chr17 26691321 . A G 47.15 PASS AO=7;DP=11;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0165927;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.6692;QD=17.1439;RBI=0.104386;REFB=-0.0294823;REVB=-0.103059;RO=4;SAF=4;SAR=3;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.290716;STB=0.66626;TYPE=snp;VARB=0.00978936;OID=.;OPOS=26691321;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:11:11:4:4:7:7:3:4:4:0:3:4:4:0 chr17 26708300 . T C 839.43 PASS AO=90;DP=91;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.076211;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.593;QD=36.8978;RBI=0.0779355;REFB=-0.0893582;REVB=0.0163044;RO=1;SAF=20;SAR=70;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00672401;STB=0.503545;TYPE=snp;VARB=0.000600401;OID=.;OPOS=26708300;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:91:91:1:1:90:90:70:20:0:1:70:20:0:1 chr17 26708302 . G T 839.38 PASS AO=90;DP=91;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=71;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0282553;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.184;QD=36.8957;RBI=0.0329527;REFB=-0.0181721;REVB=0.0169564;RO=0;SAF=19;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.73879e-08;STB=0.512818;TYPE=snp;VARB=0.000101519;OID=.;OPOS=26708302;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:91:91:0:1:90:90:71:19:0:0:71:19:1:0 chr17 26708547 . CTTTC CTTCG 289.49 PASS AO=13;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.387051;FXX=0;HRUN=3;LEN=2;MLLD=38.8128;QD=37.3535;RBI=0.391983;REFB=0;REVB=-0.0619838;RO=1;SAF=3;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128507;STB=0.5;TYPE=mnp;VARB=0.0081677;OID=.;OPOS=26708550;OREF=TC;OALT=CG;OMAPALT=CTTCG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:13:28:31:31:0:20:11:0:0:14:1:3:10:1:0 chr17 26727721 . GA G 1724.75 PASS AO=209;DP=226;FAO=218;FDP=218;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=133;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0286311;FXX=0.0090905;HRUN=2;LEN=1;MLLD=28.2174;QD=31.6467;RBI=0.0479387;REFB=0;REVB=-0.0384498;RO=13;SAF=79;SAR=130;SRF=12;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0634241;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.000402679;OID=.;OPOS=26727722;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:209:227:218:218:0:85:133:0:0:99:13:79:130:12:1 chr17 26824219 . TG T 213.26 PASS AO=30;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.265081;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.9186;QD=23.6953;RBI=0.30671;REFB=0;REVB=-0.154284;RO=3;SAF=14;SAR=16;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0.207547;SSSB=-0.0899482;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00672874;OID=.;OPOS=26824220;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:30:36:36:36:0:17:19:0:0:20:3:14:16:3:0 chr17 26874314 . G A 499.09 PASS AO=54;DP=56;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0139828;FXX=0.017854;HRUN=4;LEN=1;MLLD=129.336;QD=36.2971;RBI=0.0140226;REFB=-0.087731;REVB=-0.00105554;RO=0;SAF=35;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.86274e-08;STB=0.50704;TYPE=snp;VARB=0.000224069;OID=.;OPOS=26874314;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:56:55:0:1:54:54:19:35:0:0:19:35:1:0 chr17 27009749 . C T 1020.37 PASS AO=112;DP=115;FAO=112;FDP=115;FR=.;FRO=3;FSAF=41;FSAR=71;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=5.88651e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=255.592;QD=35.4911;RBI=0.0119638;REFB=-0.00175397;REVB=0.0119637;RO=2;SAF=41;SAR=71;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00479839;STB=0.508408;TYPE=snp;VARB=7.19522e-06;OID=.;OPOS=27009749;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:115:115:2:3:112:112:71:41:1:1:71:41:2:1 chr17 27185827 . C T 1217.21 PASS AO=127;DP=127;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00844113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.9977;QD=38.3373;RBI=0.0194035;REFB=0;REVB=0.0174712;RO=0;SAF=48;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.54552e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.24234e-05;OID=.;OPOS=27185827;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:127:127:0:0:127:127:79:48:0:0:79:48:0:0 chr17 27207453 . G A 735.93 PASS AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.581;QD=38.23;RBI=0.0600388;REFB=0;REVB=0.0582796;RO=0;SAF=29;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000410455;OID=.;OPOS=27207453;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:77:77:0:0:77:77:48:29:0:0:48:29:0:0 chr17 27209636 . AG A 27.25 PASS AO=17;DP=68;FAO=20;FDP=63;FR=.;FRO=43;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=26;FWDB=-0.138208;FXX=0.0156226;HRUN=4;LEN=1;MLLD=12.231;QD=1.73042;RBI=0.199177;REFB=-0.0641247;REVB=0.143422;RO=37;SAF=14;SAR=3;SRF=13;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0.665025;SSSB=0.5431;STB=0.706419;TYPE=del;VARB=0.0877662;OID=.;OPOS=27209637;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:17:63:20:63:43:14:6:17:26:27:37:14:3:13:24 chr17 27370248 . CG C 241.2 PASS AO=7;DP=43;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.200152;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=15.152;QD=22.9714;RBI=0.363208;REFB=-0.0794289;REVB=0.303083;RO=5;SAF=0;SAR=7;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0.43026;SSSB=-0.751346;STB=0.509429;TYPE=del;VARB=0.0372747;OID=.;OPOS=27370249;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:7:15:41:42:1:26:15:1:0:15:5:0:7:1:4 chr17 27422053 . C T 44.63 PASS AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=12;FWDB=-0.0249714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.576;QD=7.7626;RBI=0.0253121;REFB=-0.0397742;REVB=-0.0041387;RO=13;SAF=1;SAR=9;SRF=1;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.065766;STB=0.538389;TYPE=snp;VARB=0.0574945;OID=.;OPOS=27422053;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:23:23:13:13:10:10:9:1:1:12:9:1:1:12 chr17 27424316 . G A 143.51 PASS AO=20;DP=25;FAO=20;FDP=25;FR=.;FRO=5;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0111763;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=246.863;QD=22.9621;RBI=0.0133124;REFB=-0.0628186;REVB=-0.00723262;RO=5;SAF=7;SAR=13;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0199229;STB=0.510906;TYPE=snp;VARB=0.0115936;OID=.;OPOS=27424316;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:25:25:5:5:20:20:13:7:2:3:13:7:2:3 chr17 27438469 . G A 61.27 PASS AO=17;DP=42;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=25;FSRR=0;FWDB=0.000988336;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=84.0438;QD=5.83512;RBI=0.00377309;REFB=-0.0226431;REVB=-0.00364134;RO=21;SAF=14;SAR=3;SRF=21;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.391535;STB=0.735683;TYPE=snp;VARB=0.0209569;OID=.;OPOS=27438469;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:42:42:21:25:17:17:3:14:21:0:3:14:25:0 chr17 27441077 . C G 30.52 PASS AO=7;DP=21;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=0.0195488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.028;QD=5.54832;RBI=0.0247106;REFB=-0.0206841;REVB=-0.0151149;RO=10;SAF=2;SAR=5;SRF=1;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.257384;STB=0.615126;TYPE=snp;VARB=0.0466402;OID=.;OPOS=27441077;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:21:22:10:14:7:8:5:2:1:9:5:3:3:11 chr17 27448593 . CG C 131.15 PASS AO=18;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.170698;FXX=0.0526177;HRUN=5;LEN=1;MLLD=8.00288;QD=14.5721;RBI=0.353345;REFB=-0.134002;REVB=0.309378;RO=15;SAF=13;SAR=5;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.325719;STB=0.515143;TYPE=del;VARB=0.0994623;OID=.;OPOS=27448594;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:18:37:35:36:1:19:16:0:1:9:15:13:5:5:10 chr17 27588806 . C A 114.8 PASS AO=39;DP=107;FAO=39;FDP=114;FR=.;FRO=75;FSAF=11;FSAR=28;FSRF=37;FSRR=38;FWDB=-0.0687447;FXX=0.0420133;HRUN=5;LEN=1;MLLD=46.3567;QD=4.02811;RBI=0.0753007;REFB=-0.0519153;REVB=0.0307304;RO=68;SAF=12;SAR=27;SRF=33;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208868;STB=0.649195;TYPE=snp;VARB=0.056786;OID=.;OPOS=27588806;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:114:68:75:39:39:27:12:33:35:28:11:37:38 chr17 27588980 . CAG C 40.2 PASS AO=11;DP=47;FAO=13;FDP=40;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.00679202;FXX=0.0476077;HRUN=1;LEN=2;MLLD=179.876;QD=4.01953;RBI=0.0196541;REFB=-0.00653734;REVB=0.0184433;RO=24;SAF=5;SAR=6;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190887;STB=0.51161;TYPE=del;VARB=0.0115919;OID=.;OPOS=27588981;OREF=AG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:11:42:13:40:27:7:6:15:12:40:24:5:6:15:9 chr17 27835138 . C T 435.34 PASS AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0622431;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=263.333;QD=37.8553;RBI=0.0734477;REFB=0;REVB=0.0389918;RO=0;SAF=11;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31358e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000263467;OID=.;OPOS=27835138;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:46:46:0:0:46:46:35:11:0:0:35:11:0:0 chr17 27869968 . G A 204.18 PASS AO=39;DP=68;FAO=39;FDP=67;FR=.;FRO=28;FSAF=29;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=5;FWDB=0.00103103;FXX=0.0147037;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.475;QD=12.1896;RBI=0.0121717;REFB=-0.012959;REVB=0.012128;RO=28;SAF=29;SAR=10;SRF=23;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0813674;STB=0.544481;TYPE=snp;VARB=0.00871066;OID=.;OPOS=27869968;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:67:28:28:39:39:10:29:23:5:10:29:23:5 chr17 27871025 . A G 565.42 PASS AO=163;DP=390;FAO=164;FDP=389;FR=.;FRO=225;FSAF=67;FSAR=97;FSRF=103;FSRR=122;FWDB=-0.00430436;FXX=0.00511496;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.457;QD=5.81405;RBI=0.00918031;REFB=-0.00361798;REVB=0.00810867;RO=224;SAF=66;SAR=97;SRF=102;SRR=122;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0537792;STB=0.52915;TYPE=snp;VARB=0.00292551;OID=.;OPOS=27871025;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:390:389:224:225:163:164:97:66:102:122:97:67:103:122 chr17 27889578 . T C 390.54 PASS AO=103;DP=228;FAO=103;FDP=228;FR=.;FRO=125;FSAF=56;FSAR=47;FSRF=53;FSRR=72;FWDB=0.0121528;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=199.458;QD=6.85151;RBI=0.0122457;REFB=-0.0117799;REVB=0.00150563;RO=125;SAF=56;SAR=47;SRF=53;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117999;STB=0.565356;TYPE=snp;VARB=0.0133547;OID=.;OPOS=27889578;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:228:228:125:125:103:103:47:56:53:72:47:56:53:72 chr17 27889986 . T C 560.75 PASS AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000678239;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.165;QD=38.6722;RBI=0.102667;REFB=0;REVB=0.102665;RO=0;SAF=35;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000338758;OID=.;OPOS=27889986;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:58:58:0:0:58:58:23:35:0:0:23:35:0:0 chr17 27901146 . G A 39 PASS AO=4;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.,HEALED;FRO=6;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.00162976;FXX=0.133244;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.537;QD=11.999;RBI=0.00162976;REFB=-0.00367484;REVB=0;RO=2;SAF=4;SAR=0;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00417371;OID=.;OPOS=27901146;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:11:13:2:6:4:6:0:4:2:0:0:6:6:0 chr17 27901537 . C CA,A 39.85 PASS AO=4,5;DP=20;FAO=5,4;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=4,3;FSAR=1,1;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.00486501,0.0145491;FXX=0;HRUN=1,7;LEN=1,1;MLLD=26.6454,33.3864;QD=8.38976;RBI=0.13663,0.0820855;REFB=0.0267826,-0.00316483;REVB=-0.136544,-0.0807858;RO=11;SAF=3,4;SAR=1,1;SRF=4;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.408699,0.463715;STB=0.819285,0.798629;TYPE=ins,snp;VARB=-0.0191735,0.0563252;OID=.,.;OPOS=27901538,27901537;OREF=-,C;OALT=A,A;OMAPALT=CA,A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:20:19:11:10:4,5:5,4:1,1:3,4:4:7:1,1:4,3:3:7 chr17 27901975 . A G 627.69 PASS AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00804716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.998;QD=38.0418;RBI=0.110336;REFB=0;REVB=-0.110042;RO=0;SAF=56;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.61997e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000303945;OID=.;OPOS=27901975;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:66:66:0:0:66:66:10:56:0:0:10:56:0:0 chr17 27941511 . C T 43.95 PASS AO=9;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=-0.0305119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.7872;QD=7.64271;RBI=0.0307339;REFB=-0.0114196;REVB=-0.00368682;RO=12;SAF=1;SAR=8;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11806;STB=0.574302;TYPE=snp;VARB=0.0488331;OID=.;OPOS=27941511;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:23:23:12:13:9:10:8:1:2:10:9:1:2:11 chr17 27945979 . A G 63.39 PASS AO=20;DP=57;FAO=20;FDP=57;FR=.;FRO=37;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=26;FWDB=0.0204711;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.9607;QD=4.44855;RBI=0.0211028;REFB=-0.0129467;REVB=0.00512467;RO=35;SAF=7;SAR=13;SRF=10;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0797137;STB=0.538424;TYPE=snp;VARB=0.0156414;OID=.;OPOS=27945979;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:57:57:35:37:20:20:13:7:10:25:13:7:11:26 chr17 27957939 . C T 210.41 PASS AO=54;DP=120;FAO=54;FDP=120;FR=.;FRO=66;FSAF=18;FSAR=36;FSRF=26;FSRR=40;FWDB=-0.0248133;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.632;QD=7.0138;RBI=0.0251527;REFB=-0.0242529;REVB=0.00411802;RO=66;SAF=18;SAR=36;SRF=26;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0654273;STB=0.536572;TYPE=snp;VARB=0.0248614;OID=.;OPOS=27957939;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:66:66:54:54:36:18:26:40:36:18:26:40 chr17 28088244 . AG A 93.2 PASS AO=27;DP=51;FAO=27;FDP=49;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=22;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.0933267;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=24.1298;QD=7.60817;RBI=0.0937626;REFB=-0.0710164;REVB=-0.00903018;RO=22;SAF=5;SAR=22;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.244717;STB=0.637567;TYPE=del;VARB=0.0549547;OID=.;OPOS=28088245;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:27:49:27:49:22:5:22:9:13:58:22:5:22:9:13 chr17 28268800 . A C 844.57 PASS AO=89;DP=92;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0250194;FXX=0.0108684;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2778;QD=37.1241;RBI=0.025085;REFB=0.066651;REVB=-0.00181282;RO=3;SAF=46;SAR=43;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.029905;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00408792;OID=.;OPOS=28268800;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:92:91:3:0:89:91:43:46:3:0:43:48:0:0 chr17 28268817 . G A 104.16 PASS AO=32;DP=89;FAO=34;FDP=93;FR=.;FRO=59;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=37;FSRR=22;FWDB=-0.0105391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.51;QD=4.48002;RBI=0.027623;REFB=-0.0122651;REVB=0.0255335;RO=55;SAF=16;SAR=16;SRF=34;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130439;STB=0.598438;TYPE=snp;VARB=0.0217671;OID=.;OPOS=28268817;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:93:55:59:32:34:16:16:34:21:18:16:37:22 chr17 28295351 . C T 486.42 PASS AO=107;DP=222;FAO=115;FDP=230;FR=.;FRO=115;FSAF=57;FSAR=58;FSRF=69;FSRR=46;FWDB=0.00835581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.004;QD=8.45938;RBI=0.0117175;REFB=-0.00359616;REVB=0.00821469;RO=113;SAF=55;SAR=52;SRF=67;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0738962;STB=0.552122;TYPE=snp;VARB=0.00354359;OID=.;OPOS=28295351;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:230:113:115:107:115:52:55:67:46:58:57:69:46 chr17 28296327 . T G 724.46 PASS AO=66;DP=67;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0928167;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.5213;QD=37.6343;RBI=0.101032;REFB=0;REVB=0.0399068;RO=1;SAF=37;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0160134;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00344676;OID=.;OPOS=28296327;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:67:77:1:0:66:77:29:37:0:1:39:38:0:0 chr17 28320248 . T A 1346.03 PASS AO=140;DP=140;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00604441;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.177;QD=38.1853;RBI=0.0297966;REFB=0;REVB=0.029177;RO=0;SAF=94;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.92535e-05;OID=.;OPOS=28320248;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:140:141:0:0:140:141:46:94:0:0:47:94:0:0 chr17 28381141 . C G 292.98 PASS AO=60;DP=110;FAO=60;FDP=109;FR=.;FRO=49;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=23;FSRR=26;FWDB=-0.00299519;FXX=0.00909008;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.779;QD=10.7514;RBI=0.0174652;REFB=0.00529833;REVB=0.0172065;RO=49;SAF=25;SAR=35;SRF=23;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0440986;STB=0.524173;TYPE=snp;VARB=-0.0056087;OID=.;OPOS=28381141;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:109:49:49:60:60:35:25:23:26:35:25:23:26 chr17 28407876 . T G 554.42 PASS AO=126;DP=289;FAO=145;FDP=310;FR=.;FRO=165;FSAF=69;FSAR=76;FSRF=82;FSRR=83;FWDB=-0.0390967;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.2346;QD=7.1538;RBI=0.0482838;REFB=-0.00154914;REVB=0.0283332;RO=162;SAF=66;SAR=60;SRF=82;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0178911;STB=0.511247;TYPE=snp;VARB=0.00235892;OID=.;OPOS=28407876;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:289:310:162:165:126:145:60:66:82:80:76:69:82:83 chr17 28444183 . A C 736.14 PASS AO=85;DP=87;FAO=83;FDP=87;FR=.;FRO=4;FSAF=51;FSAR=32;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0249719;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.4272;QD=33.8457;RBI=0.0531781;REFB=-0.0203169;REVB=-0.0469501;RO=2;SAF=53;SAR=32;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0175403;STB=0.518863;TYPE=snp;VARB=0.00567779;OID=.;OPOS=28444183;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:87:87:2:4:85:83:32:53:2:0:32:51:4:0 chr17 28511978 . G A 75.38 PASS AO=17;DP=40;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=4;FWDB=-0.0165314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.751;QD=7.35369;RBI=0.0338567;REFB=-0.0221135;REVB=0.0295464;RO=23;SAF=7;SAR=10;SRF=19;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.399527;STB=0.731232;TYPE=snp;VARB=0.0335974;OID=.;OPOS=28511978;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:40:41:23:23:17:18:10:7:19:4:11:7:19:4 chr17 28576076 . T C 227.56 PASS AO=66;DP=163;FAO=67;FDP=164;FR=.;FRO=97;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=45;FSRR=52;FWDB=-0.0681733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.515;QD=5.55031;RBI=0.0684365;REFB=-0.0354161;REVB=-0.0059972;RO=97;SAF=32;SAR=34;SRF=45;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0221913;STB=0.516935;TYPE=snp;VARB=0.036511;OID=.;OPOS=28576076;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:164:97:97:66:67:34:32:45:52:34:33:45:52 chr17 28612448 . G C 371.89 PASS AO=103;DP=235;FAO=103;FDP=237;FR=.;FRO=134;FSAF=73;FSAR=30;FSRF=65;FSRR=69;FWDB=-0.033523;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.4629;QD=6.27658;RBI=0.0407762;REFB=0.00566935;REVB=-0.0232143;RO=132;SAF=73;SAR=30;SRF=64;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242005;STB=0.63576;TYPE=snp;VARB=-0.00751598;OID=.;OPOS=28612448;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:235:237:132:134:103:103:30:73:64:68:30:73:65:69 chr17 28794020 . A G 741.69 PASS AO=164;DP=312;FAO=165;FDP=313;FR=.;FRO=148;FSAF=91;FSAR=74;FSRF=99;FSRR=49;FWDB=0.0245568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2293;QD=9.47848;RBI=0.0278145;REFB=-0.0135501;REVB=0.0130618;RO=144;SAF=90;SAR=74;SRF=98;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11576;STB=0.556759;TYPE=snp;VARB=0.0129927;OID=.;OPOS=28794020;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:312:313:144:148:164:165:74:90:98:46:74:91:99:49 chr17 28853530 . A C 116.4 PASS AO=34;DP=94;FAO=36;FDP=96;FR=.;FRO=60;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=31;FSRR=29;FWDB=-0.00542461;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.699;QD=4.8499;RBI=0.00732279;REFB=-0.0158767;REVB=-0.00491903;RO=60;SAF=14;SAR=20;SRF=31;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117293;STB=0.545218;TYPE=snp;VARB=0.0341872;OID=.;OPOS=28853530;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:96:60:60:34:36:20:14:31:29:20:16:31:29 chr17 28900708 . G T 304.46 PASS AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00603672;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=209.935;QD=34.7949;RBI=0.019457;REFB=0.0258395;REVB=0.0184968;RO=1;SAF=25;SAR=9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0183382;STB=0.509798;TYPE=snp;VARB=-5.01588e-05;OID=.;OPOS=28900708;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:35:35:1:1:34:34:9:25:1:0:9:25:1:0 chr17 29161503 . A G 119.77 PASS AO=29;DP=62;FAO=29;FDP=63;FR=.;FRO=34;FSAF=5;FSAR=24;FSRF=11;FSRR=23;FWDB=-0.00130207;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.3541;QD=7.60416;RBI=0.0537013;REFB=0.035282;REVB=-0.0536855;RO=33;SAF=5;SAR=24;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220009;STB=0.620263;TYPE=snp;VARB=-0.0399331;OID=.;OPOS=29161503;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:63:33:34:29:29:24:5:11:22:24:5:11:23 chr17 29206522 . G C 316.82 PASS AO=76;DP=157;FAO=78;FDP=160;FR=.;FRO=82;FSAF=25;FSAR=53;FSRF=25;FSRR=57;FWDB=0.0105017;FXX=0.00621079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.1057;QD=7.92054;RBI=0.029671;REFB=-0.0319948;REVB=-0.0277503;RO=78;SAF=25;SAR=51;SRF=25;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0088061;STB=0.509257;TYPE=snp;VARB=0.0337501;OID=.;OPOS=29206522;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:160:78:82:76:78:51:25:25:53:53:25:25:57 chr17 29486152 . G A 254.97 PASS AO=80;DP=200;FAO=79;FDP=198;FR=.;FRO=119;FSAF=41;FSAR=38;FSRF=73;FSRR=46;FWDB=0.0302054;FXX=0.0246293;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.1032;QD=5.15089;RBI=0.0302815;REFB=-0.034754;REVB=0.00214577;RO=118;SAF=42;SAR=38;SRF=72;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0912624;STB=0.557085;TYPE=snp;VARB=0.0385583;OID=.;OPOS=29486152;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:200:198:118:119:80:79:38:42:72:46:38:41:73:46 chr17 29496819 . C T 314.28 PASS AO=64;DP=114;FAO=64;FDP=114;FR=.;FRO=50;FSAF=51;FSAR=13;FSRF=33;FSRR=17;FWDB=0.0189047;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3598;QD=11.0272;RBI=0.0788185;REFB=0.0174547;REVB=-0.0765178;RO=50;SAF=51;SAR=13;SRF=33;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151712;STB=0.583496;TYPE=snp;VARB=-0.0215835;OID=.;OPOS=29496819;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:50:50:64:64:13:51:33:17:13:51:33:17 chr17 29508775 . G A 236.58 PASS AO=71;DP=176;FAO=71;FDP=176;FR=.;FRO=105;FSAF=30;FSAR=41;FSRF=45;FSRR=60;FWDB=-0.0110616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.165;QD=5.37689;RBI=0.0122142;REFB=-0.0080069;REVB=0.0051796;RO=104;SAF=30;SAR=41;SRF=45;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0109859;STB=0.503684;TYPE=snp;VARB=0.0126187;OID=.;OPOS=29508775;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:176:104:105:71:71:41:30:45:59:41:30:45:60 chr17 29553485 . G A 215.01 PASS AO=41;DP=132;FAO=58;FDP=135;FR=.;FRO=77;FSAF=18;FSAR=40;FSRF=27;FSRR=50;FWDB=0.0197432;FXX=0.0425502;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.3549;QD=6.37063;RBI=0.0649403;REFB=-0.0237972;REVB=-0.0618664;RO=41;SAF=12;SAR=29;SRF=12;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.526307;TYPE=snp;VARB=0.0384324;OID=.;OPOS=29553485;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:135:41:77:41:58:29:12:12:29:40:18:27:50 chr17 29646032 . G A 383.43 PASS AO=99;DP=217;FAO=99;FDP=217;FR=.;FRO=118;FSAF=31;FSAR=68;FSRF=37;FSRR=81;FWDB=-0.0295684;FXX=0.0269046;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.587;QD=7.06786;RBI=0.0295792;REFB=0.0119355;REVB=-0.00079754;RO=114;SAF=31;SAR=68;SRF=37;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0127834;STB=0.50027;TYPE=snp;VARB=-0.0171744;OID=.;OPOS=29646032;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:217:217:114:118:99:99:68:31:37:77:68:31:37:81 chr17 29705947 . T C 305.66 PASS AO=66;DP=124;FAO=66;FDP=124;FR=.;FRO=58;FSAF=20;FSAR=46;FSRF=8;FSRR=50;FWDB=0.0269918;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.984;QD=9.86005;RBI=0.0313627;REFB=-0.00555195;REVB=-0.0159706;RO=57;SAF=20;SAR=46;SRF=8;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176621;STB=0.598477;TYPE=snp;VARB=0.00491054;OID=.;OPOS=29705947;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:57:58:66:66:46:20:8:49:46:20:8:50 chr17 29857460 . G A 206.23 PASS AO=48;DP=101;FAO=50;FDP=103;FR=.;FRO=53;FSAF=13;FSAR=37;FSRF=9;FSRR=44;FWDB=0.0179049;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.572;QD=8.00881;RBI=0.0316163;REFB=-0.0275566;REVB=0.0260577;RO=53;SAF=13;SAR=35;SRF=9;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129606;STB=0.563983;TYPE=snp;VARB=0.0266245;OID=.;OPOS=29857460;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:103:53:53:48:50:35:13:9:44:37:13:9:44 chr17 29864246 . GC G 373.58 PASS AO=53;DP=79;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0489766;FXX=0.0147037;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.1952;QD=22.303;RBI=0.274147;REFB=-0.0184817;REVB=0.269737;RO=9;SAF=23;SAR=30;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0.331522;SSSB=0.0590972;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0206537;OID=.;OPOS=29864247;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:53:68:67:67:0:28:39:0:0:30:9:23:30:2:7 chr17 29890808 . C T 259.25 PASS AO=54;DP=100;FAO=54;FDP=100;FR=.;FRO=46;FSAF=32;FSAR=22;FSRF=27;FSRR=19;FWDB=-0.0105398;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.705;QD=10.3699;RBI=0.0212855;REFB=-0.00611922;REVB=-0.0184929;RO=45;SAF=32;SAR=22;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126619;STB=0.502681;TYPE=snp;VARB=0.00596422;OID=.;OPOS=29890808;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:45:46:54:54:22:32:26:19:22:32:27:19 chr17 30040819 . T G 197.04 PASS AO=55;DP=133;FAO=55;FDP=130;FR=.;FRO=75;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=42;FSRR=33;FWDB=-0.00266797;FXX=0.0298485;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.923;QD=6.06264;RBI=0.00498902;REFB=-0.0118779;REVB=0.00421572;RO=73;SAF=25;SAR=30;SRF=41;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108748;STB=0.560647;TYPE=snp;VARB=0.0162978;OID=.;OPOS=30040819;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:130:73:75:55:55:30:25:41:32:30:25:42:33 chr17 30183857 . T C 943.03 PASS AO=99;DP=101;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0358158;FXX=0.0198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.437;QD=38.1024;RBI=0.035867;REFB=0;REVB=-0.00191598;RO=0;SAF=36;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.61321e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000216275;OID=.;OPOS=30183857;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:101:99:0:0:99:99:63:36:0:0:63:36:0:0 chr17 30222002 . T C 926.81 PASS AO=94;DP=95;FAO=98;FDP=99;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=57;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0533979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.445;QD=37.447;RBI=0.0536401;REFB=-0.0448093;REVB=-0.00509179;RO=0;SAF=38;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506023;TYPE=snp;VARB=0.000446253;OID=.;OPOS=30222002;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:95:99:0:1:94:98:56:38:0:0:57:41:1:0 chr17 30611803 . TG T 852.09 PASS AO=110;DP=145;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.331221;FXX=0.0141834;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.7703;QD=24.5207;RBI=0.349836;REFB=0;REVB=0.112598;RO=19;SAF=35;SAR=75;SRF=14;SRR=5;SSEN=0.475207;SSEP=0;SSSB=-0.127164;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00654747;OID=.;OPOS=30611804;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:110:136:139:139:0:50:89:0:0:77:19:35:75:14:5 chr17 30816470 . AG A 612.41 PASS AO=83;DP=102;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00101877;FXX=0.00980296;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.9571;QD=24.2538;RBI=0.0665038;REFB=0;REVB=-0.066496;RO=3;SAF=48;SAR=35;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0.361111;SSSB=-0.00598555;STB=0.5;TYPE=del;VARB=9.32336e-05;OID=.;OPOS=30816471;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:83:98:101:101:0:62:39:0:0:54:3:48:35:2:1 chr17 30816798 . C T 74.48 PASS AO=16;DP=61;FAO=16;FDP=48;FR=.,HEALED;FRO=27;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=-0.05114;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=191.345;QD=6.207;RBI=0.0540714;REFB=-0.00073425;REVB=-0.0175618;RO=21;SAF=7;SAR=9;SRF=3;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.314243;STB=0.567486;TYPE=snp;VARB=-0.0011791;OID=.;OPOS=30816798;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:48:48:21:27:16:16:9:7:3:18:9:7:9:18 chr17 32583269 . T C 205.56 PASS AO=64;DP=163;FAO=64;FDP=164;FR=.;FRO=100;FSAF=19;FSAR=45;FSRF=44;FSRR=56;FWDB=-0.0183185;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.01;QD=5.01366;RBI=0.0183186;REFB=-0.0152968;REVB=-6.00015e-05;RO=99;SAF=19;SAR=45;SRF=43;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163076;STB=0.596308;TYPE=snp;VARB=0.0228799;OID=.;OPOS=32583269;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:164:99:100:64:64:45:19:43:56:45:19:44:56 chr17 32583911 . C T 282.87 PASS AO=83;DP=192;FAO=81;FDP=191;FR=.;FRO=110;FSAF=38;FSAR=43;FSRF=27;FSRR=83;FWDB=-0.00727842;FXX=0.00520806;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.8629;QD=5.9239;RBI=0.0410679;REFB=0.0102025;REVB=0.0404178;RO=105;SAF=40;SAR=43;SRF=25;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249664;STB=0.631383;TYPE=snp;VARB=-0.0126666;OID=.;OPOS=32583911;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:191:105:110:83:81:43:40:25:80:43:38:27:83 chr17 32904586 . C T 1178.25 PASS AO=125;DP=126;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204121;FXX=0.00793588;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.681;QD=37.7041;RBI=0.0235354;REFB=-0.0355493;REVB=-0.0117159;RO=1;SAF=65;SAR=60;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00725408;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000397444;OID=.;OPOS=32904586;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:126:125:1:0:125:125:60:65:1:0:60:65:0:0 chr17 32906038 . G C 88.04 PASS AO=22;DP=51;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.00785256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.727;QD=6.90542;RBI=0.0513319;REFB=-0.0328139;REVB=-0.0507277;RO=29;SAF=15;SAR=7;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.272211;STB=0.655594;TYPE=snp;VARB=0.0235477;OID=.;OPOS=32906038;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:51:51:29:29:22:22:7:15:12:17:7:15:12:17 chr17 32962064 . C A 127.98 PASS AO=31;DP=67;FAO=31;FDP=67;FR=.;FRO=36;FSAF=4;FSAR=27;FSRF=11;FSRR=25;FWDB=-0.0100767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.911;QD=7.64033;RBI=0.0221453;REFB=-0.00161667;REVB=0.0197199;RO=36;SAF=4;SAR=27;SRF=11;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.28037;STB=0.660563;TYPE=snp;VARB=0.00241236;OID=.;OPOS=32962064;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:36:36:31:31:27:4:11:25:27:4:11:25 chr17 33288882 . T G 1067.55 PASS AO=113;DP=115;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0507033;FXX=0.0341851;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.151;QD=37.7895;RBI=0.0519305;REFB=-0.0326884;REVB=0.0112229;RO=1;SAF=36;SAR=77;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0130053;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000676112;OID=.;OPOS=33288882;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:115:113:1:0:113:113:77:36:1:0:77:36:0:0 chr17 33348773 . AAT A 35.43 PASS AO=22;DP=123;FAO=31;FDP=104;FR=.;FRO=73;FSAF=8;FSAR=23;FSRF=41;FSRR=32;FWDB=-0.0427944;FXX=0.0188661;HRUN=5;LEN=2;MLLD=21.913;QD=1.36287;RBI=0.0792615;REFB=-0.0753304;REVB=-0.066716;RO=63;SAF=7;SAR=15;SRF=36;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.308553;STB=0.719064;TYPE=del;VARB=0.142116;OID=.;OPOS=33348774;OREF=AT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:22:119:31:104:73:8:23:41:32:35:63:7:15:36:27 chr17 33448818 . T C 1253.61 PASS AO=141;DP=154;FAO=145;FDP=154;FR=.;FRO=9;FSAF=54;FSAR=91;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=-0.0252086;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.7101;QD=32.5612;RBI=0.0450872;REFB=0.0339331;REVB=-0.0373815;RO=13;SAF=52;SAR=89;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0547002;STB=0.525013;TYPE=snp;VARB=-0.00198753;OID=.;OPOS=33448818;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:154:154:13:9:141:145:89:52:9:4:91:54:7:2 chr17 33454415 . C A 393.12 PASS AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0246641;FXX=0.0232504;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.435;QD=37.4402;RBI=0.0376137;REFB=0;REVB=0.0283984;RO=0;SAF=14;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000106482;OID=.;OPOS=33454415;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:43:42:0:0:42:42:28:14:0:0:28:14:0:0 chr17 33464864 . C T 1249.75 PASS AO=129;DP=129;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.016978;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5594;QD=38.1604;RBI=0.0519573;REFB=0;REVB=0.0491051;RO=0;SAF=49;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.3659e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000188314;OID=.;OPOS=33464864;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:129:131:0:0:129:131:80:49:0:0:80:51:0:0 chr17 33477130 . TG T 44.24 PASS AO=39;DP=112;FAO=36;FDP=105;FR=.;FRO=69;FSAF=31;FSAR=5;FSRF=28;FSRR=41;FWDB=-0.167972;FXX=0.00943307;HRUN=4;LEN=1;MLLD=14.8711;QD=1.68514;RBI=0.169602;REFB=-0.0359607;REVB=0.0234551;RO=62;SAF=35;SAR=4;SRF=21;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0.5;SSSB=0.653098;STB=0.828391;TYPE=del;VARB=0.0486792;OID=.;OPOS=33477131;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:39:105:36:105:69:31:5:28:41:44:62:35:4:21:41 chr17 33477242 . G A 101.64 PASS AO=29;DP=69;FAO=29;FDP=73;FR=.;FRO=44;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=33;FSRR=11;FWDB=-0.0493359;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.9918;QD=5.56922;RBI=0.0494063;REFB=-0.0411027;REVB=0.0026378;RO=40;SAF=19;SAR=10;SRF=29;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0814755;STB=0.56579;TYPE=snp;VARB=0.0436975;OID=.;OPOS=33477242;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:73:40:44:29:29:10:19:29:11:10:19:33:11 chr17 33592591 . C T 425.55 PASS AO=100;DP=202;FAO=100;FDP=201;FR=.;FRO=101;FSAF=60;FSAR=40;FSRF=59;FSRR=42;FWDB=0.0191938;FXX=0.00495025;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.7;QD=8.46868;RBI=0.0197391;REFB=-0.0199293;REVB=0.00460758;RO=101;SAF=60;SAR=40;SRF=59;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0150283;STB=0.508263;TYPE=snp;VARB=0.0223712;OID=.;OPOS=33592591;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:201:101:101:100:100:40:60:59:42:40:60:59:42 chr17 33680807 . G A 555.11 PASS AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0225033;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.1923;QD=37.0073;RBI=0.0231343;REFB=-0.00863878;REVB=0.00536638;RO=1;SAF=29;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159925;STB=0.508472;TYPE=snp;VARB=0.000430593;OID=.;OPOS=33680807;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:60:60:1:1:59:59:30:29:1:0:30:29:1:0 chr17 33680840 . T C 839.45 PASS AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0126691;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.7233;QD=38.1568;RBI=0.0136894;REFB=0;REVB=-0.00518605;RO=0;SAF=48;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.43431e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000150425;OID=.;OPOS=33680840;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:88:88:0:0:88:88:40:48:0:0:40:48:0:0 chr17 33689926 . T C 2887.35 PASS AO=323;DP=328;FAO=310;FDP=310;FR=.;FRO=0;FSAF=205;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0729859;FXX=0.0548764;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9346;QD=37.2561;RBI=0.0730575;REFB=-0.0253295;REVB=-0.00323437;RO=5;SAF=219;SAR=104;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00259481;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00551956;OID=.;OPOS=33689926;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:328:310:5:0:323:310:104:219:3:2:105:205:0:0 chr17 33690466 . C A 388.32 PASS AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0083816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.209;QD=38.832;RBI=0.0208875;REFB=0;REVB=0.0191321;RO=0;SAF=12;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.65546e-05;OID=.;OPOS=33690466;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:40:40:0:0:40:40:28:12:0:0:28:12:0:0 chr17 33749546 . A G 473.25 PASS AO=94;DP=183;FAO=104;FDP=195;FR=.;FRO=91;FSAF=27;FSAR=77;FSRF=51;FSRR=40;FWDB=0.0191801;FXX=0.00510178;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.478;QD=9.70761;RBI=0.0271548;REFB=-0.0196356;REVB=-0.0192225;RO=68;SAF=25;SAR=69;SRF=50;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.374578;STB=0.655287;TYPE=snp;VARB=0.0153763;OID=.;OPOS=33749546;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:195:68:91:94:104:69:25:50:18:77:27:51:40 chr17 33749919 . A C 151.44 PASS AO=33;DP=70;FAO=34;FDP=69;FR=.;FRO=35;FSAF=7;FSAR=27;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=0.00473854;FXX=0.028165;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.11;QD=8.77894;RBI=0.0279162;REFB=-0.0140153;REVB=-0.0275111;RO=37;SAF=7;SAR=26;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.417812;STB=0.724689;TYPE=snp;VARB=0.0135119;OID=.;OPOS=33749919;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:69:37:35:33:34:26:7:23:14:27:7:21:14 chr17 33768199 . G A 426.21 PASS AO=105;DP=227;FAO=109;FDP=233;FR=.;FRO=124;FSAF=70;FSAR=39;FSRF=92;FSRR=32;FWDB=-0.00881109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.039;QD=7.31697;RBI=0.0113263;REFB=-0.0125884;REVB=0.00711692;RO=118;SAF=67;SAR=38;SRF=88;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116185;STB=0.559699;TYPE=snp;VARB=0.015027;OID=.;OPOS=33768199;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:227:233:118:124:105:109:38:67:88:30:39:70:92:32 chr17 33768354 . C T 193.39 PASS AO=59;DP=145;FAO=59;FDP=148;FR=.;FRO=89;FSAF=19;FSAR=40;FSRF=41;FSRR=48;FWDB=-0.00211691;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.4246;QD=5.22685;RBI=0.0475156;REFB=-0.0230209;REVB=0.0474684;RO=86;SAF=19;SAR=40;SRF=40;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16089;STB=0.58936;TYPE=snp;VARB=0.00947699;OID=.;OPOS=33768354;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:148:86:89:59:59:40:19:40:46:40:19:41:48 chr17 33769034 . G A 52.14 PASS AO=35;DP=152;FAO=35;FDP=152;FR=.;FRO=117;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=63;FSRR=54;FWDB=-0.0180896;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.3969;QD=1.37212;RBI=0.0191518;REFB=-0.011198;REVB=-0.00628943;RO=117;SAF=23;SAR=12;SRF=63;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155421;STB=0.595238;TYPE=snp;VARB=0.0265327;OID=.;OPOS=33769034;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:152:152:117:117:35:35:12:23:63:54:12:23:63:54 chr17 33772658 . G T 612.68 PASS AO=140;DP=278;FAO=141;FDP=276;FR=.;FRO=135;FSAF=66;FSAR=75;FSRF=64;FSRR=71;FWDB=0.0095377;FXX=0.00719399;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.8994;QD=8.87936;RBI=0.0119203;REFB=0.00511938;REVB=0.00715026;RO=137;SAF=66;SAR=74;SRF=65;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00273819;STB=0.50294;TYPE=snp;VARB=-0.00564723;OID=.;OPOS=33772658;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:278:276:137:135:140:141:74:66:65:72:75:66:64:71 chr17 33805150 . T C 312 PASS AO=85;DP=197;FAO=86;FDP=196;FR=.;FRO=110;FSAF=25;FSAR=61;FSRF=32;FSRR=78;FWDB=-0.0149541;FXX=0.0150746;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2405;QD=6.3673;RBI=0.021347;REFB=-0.00280211;REVB=0.0152339;RO=108;SAF=24;SAR=61;SRF=32;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171431;STB=0.500144;TYPE=snp;VARB=0.00198742;OID=.;OPOS=33805150;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:196:108:110:85:86:61:24:32:76:61:25:32:78 chr17 33814758 . T C 111.07 PASS AO=30;DP=72;FAO=30;FDP=72;FR=.;FRO=42;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=-0.00876332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.776;QD=6.17068;RBI=0.019702;REFB=-0.00477557;REVB=-0.0176458;RO=42;SAF=12;SAR=18;SRF=17;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00508783;STB=0.502888;TYPE=snp;VARB=0.00662853;OID=.;OPOS=33814758;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:42:42:30:30:18:12:17:25:18:12:17:25 chr17 33875262 . T A 335.63 PASS AO=68;DP=121;FAO=69;FDP=123;FR=.;FRO=54;FSAF=41;FSAR=28;FSRF=27;FSRR=27;FWDB=0.000982583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.982;QD=10.9149;RBI=0.00241107;REFB=-0.00584964;REVB=0.00220177;RO=53;SAF=41;SAR=27;SRF=27;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0768504;STB=0.542185;TYPE=snp;VARB=0.00409245;OID=.;OPOS=33875262;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:123:53:54:68:69:27:41:27:26:28:41:27:27 chr17 33881631 . T C 506.63 PASS AO=126;DP=264;FAO=126;FDP=264;FR=.;FRO=138;FSAF=66;FSAR=60;FSRF=79;FSRR=59;FWDB=-0.0139955;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=151.257;QD=7.67622;RBI=0.0169562;REFB=-0.00390929;REVB=-0.00957282;RO=138;SAF=66;SAR=60;SRF=79;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0464072;STB=0.525549;TYPE=snp;VARB=0.00414987;OID=.;OPOS=33881631;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:264:264:138:138:126:126:60:66:79:59:60:66:79:59 chr17 33881718 . G A 401.93 PASS AO=102;DP=219;FAO=102;FDP=219;FR=.;FRO=117;FSAF=51;FSAR=51;FSRF=66;FSRR=51;FWDB=0.104937;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.4247;QD=7.34126;RBI=0.105778;REFB=-0.00623063;REVB=0.0133157;RO=114;SAF=51;SAR=51;SRF=65;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0671131;STB=0.53424;TYPE=snp;VARB=0.00854228;OID=.;OPOS=33881718;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:219:219:114:117:102:102:51:51:65:49:51:51:66:51 chr17 33901917 . TTAAG T 135.05 PASS AO=46;DP=103;FAO=47;FDP=97;FR=.;FRO=50;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=15;FSRR=35;FWDB=0.00293278;FXX=0.0396;HRUN=2;LEN=4;MLLD=273.062;QD=5.5692;RBI=0.00730166;REFB=-0.0120538;REVB=0.00668679;RO=50;SAF=23;SAR=23;SRF=15;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188092;STB=0.608082;TYPE=del;VARB=0.0117906;OID=.;OPOS=33901918;OREF=TAAG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:46:98:47:97:50:24:23:15:35:99:50:23:23:15:35 chr17 33901965 . C G 154.52 PASS AO=40;DP=90;FAO=40;FDP=90;FR=.;FRO=50;FSAF=11;FSAR=29;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=-0.0062575;FXX=0.0425487;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.972;QD=6.86743;RBI=0.0259098;REFB=-0.00524561;REVB=-0.0251428;RO=48;SAF=11;SAR=29;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.259251;STB=0.65822;TYPE=snp;VARB=0.0119453;OID=.;OPOS=33901965;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:48:50:40:40:29:11:25:23:29:11:27:23 chr17 33904313 . C A 206.03 PASS AO=49;DP=102;FAO=49;FDP=102;FR=.;FRO=53;FSAF=17;FSAR=32;FSRF=34;FSRR=19;FWDB=-0.00384826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.721;QD=8.07965;RBI=0.0161558;REFB=0.00707532;REVB=-0.0156908;RO=53;SAF=17;SAR=32;SRF=34;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.27549;STB=0.652999;TYPE=snp;VARB=-0.00764886;OID=.;OPOS=33904313;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:53:53:49:49:32:17:34:19:32:17:34:19 chr17 33998802 . G C 117.81 PASS AO=28;DP=65;FAO=30;FDP=67;FR=.;FRO=37;FSAF=22;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=-0.00376913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.487;QD=7.03336;RBI=0.0340236;REFB=-0.0452844;REVB=-0.0338142;RO=21;SAF=20;SAR=8;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.273521;STB=0.620682;TYPE=snp;VARB=0.0708871;OID=.;OPOS=33998802;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:67:21:37:28:30:8:20:8:13:8:22:20:17 chr17 34050934 . C T 580.42 PASS AO=143;DP=311;FAO=148;FDP=316;FR=.;FRO=168;FSAF=65;FSAR=83;FSRF=84;FSRR=84;FWDB=0.0177951;FXX=0.00315447;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.5704;QD=7.34711;RBI=0.0243073;REFB=-0.00957714;REVB=0.0165582;RO=167;SAF=65;SAR=78;SRF=84;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0474278;STB=0.532551;TYPE=snp;VARB=0.0113661;OID=.;OPOS=34050934;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:311:316:167:168:143:148:78:65:84:83:83:65:84:84 chr17 34051124 . T G 156.03 PASS AO=49;DP=125;FAO=50;FDP=131;FR=.;FRO=81;FSAF=13;FSAR=37;FSRF=19;FSRR=62;FWDB=-0.0810959;FXX=0.00757518;HRUN=4;LEN=1;MLLD=39.6051;QD=4.76422;RBI=0.0952091;REFB=-0.0234277;REVB=-0.0498821;RO=76;SAF=12;SAR=37;SRF=15;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.072244;STB=0.520834;TYPE=snp;VARB=0.0252972;OID=.;OPOS=34051124;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:131:76:81:49:50:37:12:15:61:37:13:19:62 chr17 34072555 . G A 245.48 PASS AO=77;DP=197;FAO=77;FDP=197;FR=.;FRO=120;FSAF=34;FSAR=43;FSRF=40;FSRR=80;FWDB=0.00704747;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.684;QD=4.98427;RBI=0.00912753;REFB=0.0103048;REVB=-0.00580043;RO=119;SAF=34;SAR=43;SRF=40;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11743;STB=0.567881;TYPE=snp;VARB=-0.0169867;OID=.;OPOS=34072555;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:197:119:120:77:77:43:34:40:79:43:34:40:80 chr17 34100350 . G GC 279.43 PASS AO=29;DP=31;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0056698;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=225.108;QD=38.5422;RBI=0.0357525;REFB=0;REVB=0.0353001;RO=2;SAF=17;SAR=12;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106369;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00018371;OID=.;OPOS=34100351;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:29:31:29:29:0:17:12:0:0:13:2:17:12:1:1 chr17 34328461 . A G 651.95 PASS AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0158072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.738;QD=38.3502;RBI=0.0183135;REFB=0;REVB=-0.00924757;RO=0;SAF=31;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.68135e-05;OID=.;OPOS=34328461;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:68:68:0:0:68:68:37:31:0:0:37:31:0:0 chr17 34340284 . C T 2012.11 PASS AO=209;DP=209;FAO=209;FDP=209;FR=.;FRO=0;FSAF=99;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.439;QD=38.5092;RBI=0.0126869;REFB=0;REVB=-0.00516136;RO=0;SAF=99;SAR=110;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.27813e-06;OID=.;OPOS=34340284;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:209:209:0:0:209:209:110:99:0:0:110:99:0:0 chr17 34431287 . G T 1280.6 PASS AO=129;DP=130;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201916;FXX=0.0289834;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.102;QD=38.2268;RBI=0.0735605;REFB=0;REVB=0.070735;RO=0;SAF=60;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000295546;OID=.;OPOS=34431287;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:130:134:0:0:129:134:69:60:0:0:71:63:0:0 chr17 34431961 . T C 210.68 PASS AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.113559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.799;QD=36.6391;RBI=0.113926;REFB=0;REVB=-0.00913835;RO=0;SAF=5;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000408925;OID=.;OPOS=34431961;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:0:0:23:23:18:5:0:0:18:5:0:0 chr17 34854280 . G A 317.11 PASS AO=48;DP=90;FAO=61;FDP=103;FR=.;FRO=42;FSAF=17;FSAR=44;FSRF=26;FSRR=16;FWDB=-0.0289407;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.9102;QD=12.3148;RBI=0.0573084;REFB=-0.0182656;REVB=0.049464;RO=42;SAF=13;SAR=35;SRF=28;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.348349;STB=0.649674;TYPE=snp;VARB=0.0110777;OID=.;OPOS=34854280;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:103:42:42:48:61:35:13:28:14:44:17:26:16 chr17 34942595 . G A 63.63 PASS AO=18;DP=47;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=20;FWDB=0.00454158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.544;QD=5.41542;RBI=0.00597408;REFB=-0.0187924;REVB=0.00388119;RO=27;SAF=11;SAR=7;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.282363;STB=0.679445;TYPE=snp;VARB=0.032042;OID=.;OPOS=34942595;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:47:47:27:29:18:18:7:11:9:18:7:11:9:20 chr17 34956585 . CCA C 213.35 PASS AO=72;DP=155;FAO=73;FDP=147;FR=.;FRO=74;FSAF=41;FSAR=32;FSRF=37;FSRR=37;FWDB=0.0013011;FXX=0.0264883;HRUN=2;LEN=2;MLLD=232.913;QD=5.80541;RBI=0.00162288;REFB=-0.000839468;REVB=-0.000969989;RO=71;SAF=41;SAR=31;SRF=36;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0.303681;SSSB=0.0568323;STB=0.531259;TYPE=del;VARB=0.00101069;OID=.;OPOS=34956586;OREF=CA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:72:143:73:147:74:41:32:37:37:99:71:41:31:36:35 chr17 35346641 . T C 1177.02 PASS AO=126;DP=128;FAO=126;FDP=128;FR=.;FRO=2;FSAF=95;FSAR=31;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0179239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.6;QD=36.7818;RBI=0.0179243;REFB=-0.0788156;REVB=-0.000122546;RO=0;SAF=95;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505207;TYPE=snp;VARB=0.000284026;OID=.;OPOS=35346641;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:128:128:0:2:126:126:31:95:0:0:31:95:2:0 chr17 35478362 . T C 820.13 PASS AO=85;DP=85;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00193399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.706;QD=38.1456;RBI=0.0286228;REFB=0;REVB=0.0285574;RO=0;SAF=31;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.11373e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.37761e-05;OID=.;OPOS=35478362;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:85:86:0:0:85:86:54:31:0:0:55:31:0:0 chr17 35696804 . G A 659.22 PASS AO=67;DP=67;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0125712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.839;QD=38.2156;RBI=0.0126493;REFB=0;REVB=0.00140364;RO=0;SAF=16;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17211e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.2316e-05;OID=.;OPOS=35696804;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:67:69:0:0:67:69:51:16:0:0:52:17:0:0 chr17 35696820 . AAAAG A,AAGAG 409.17 PASS AO=33,9;DP=58;FAO=34,14;FDP=50;FR=.;FRO=2;FSAF=3,7;FSAR=31,7;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00305596,-0.0488412;FXX=0.0384541;HRUN=5,5;LEN=4,1;MLLD=150.591,55.2944;QD=32.7333;RBI=0.0204814,0.0494608;REFB=-0.100105,-0.146114;REVB=0.0202521,0.00780379;RO=1;SAF=3,1;SAR=30,8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0153259,0.0524171;STB=0.563595,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.00112927,0.00856981;OID=.,.;OPOS=35696821,35696822;OREF=AAAG,A;OALT=-,G;OMAPALT=A,AAGAG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:33,9:45:34,14:50:2:3,7:31,7:1:1:37:1:3,1:30,8:0:1 chr17 35771468 . C T 719.24 PASS AO=78;DP=81;FAO=79;FDP=81;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=61;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0236741;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.109;QD=35.5182;RBI=0.0343805;REFB=-0.0802505;REVB=0.024931;RO=3;SAF=17;SAR=61;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0448028;STB=0.509448;TYPE=snp;VARB=0.0019269;OID=.;OPOS=35771468;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:81:81:3:2:78:79:61:17:2:1:61:18:1:1 chr17 35873399 . TA T 2160.2 PASS AO=258;DP=279;FAO=278;FDP=278;FR=.;FRO=0;FSAF=131;FSAR=147;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00924115;FXX=0.0106758;HRUN=2;LEN=1;MLLD=27.3181;QD=31.0819;RBI=0.0267544;REFB=0;REVB=-0.0251077;RO=1;SAF=128;SAR=130;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00371002;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.000154772;OID=.;OPOS=35873400;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:258:276:278:278:0:131:147:0:0:99:1:128:130:1:0 chr17 35896123 . T C 2489.23 PASS AO=231;DP=233;FAO=260;FDP=260;FR=.;FRO=0;FSAF=120;FSAR=140;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0293547;FXX=0.0076333;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.51;QD=38.2959;RBI=0.0390368;REFB=0;REVB=-0.0257326;RO=0;SAF=120;SAR=111;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18261e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.33281e-05;OID=.;OPOS=35896123;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:233:260:0:0:231:260:111:120:0:0:140:120:0:0 chr17 35902225 . C G 393 PASS AO=85;DP=182;FAO=95;FDP=192;FR=.;FRO=97;FSAF=39;FSAR=56;FSRF=47;FSRR=50;FWDB=0.0535775;FXX=0.0204071;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.8943;QD=8.18757;RBI=0.0535973;REFB=-0.024271;REVB=-0.00145656;RO=93;SAF=34;SAR=51;SRF=45;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0810722;STB=0.538092;TYPE=snp;VARB=0.0272178;OID=.;OPOS=35902225;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:192:93:97:85:95:51:34:45:48:56:39:47:50 chr17 35937637 . T C 436.05 PASS AO=100;DP=198;FAO=100;FDP=198;FR=.;FRO=98;FSAF=35;FSAR=65;FSRF=42;FSRR=56;FWDB=-0.015582;FXX=0.00502487;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.766;QD=8.80917;RBI=0.0321423;REFB=0.00247301;REVB=-0.0281128;RO=98;SAF=35;SAR=65;SRF=42;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0757571;STB=0.541658;TYPE=snp;VARB=-0.00268653;OID=.;OPOS=35937637;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:198:98:98:100:100:65:35:42:56:65:35:42:56 chr17 35956391 . G C 191.41 PASS AO=43;DP=85;FAO=43;FDP=85;FR=.;FRO=42;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=32;FSRR=10;FWDB=0.00505424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.37;QD=9.00765;RBI=0.0057166;REFB=-0.0171174;REVB=-0.00267097;RO=42;SAF=23;SAR=20;SRF=32;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207972;STB=0.614475;TYPE=snp;VARB=0.0238962;OID=.;OPOS=35956391;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:42:42:43:43:20:23:32:10:20:23:32:10 chr17 35984410 . T C 353.02 PASS AO=71;DP=126;FAO=71;FDP=125;FR=.;FRO=54;FSAF=6;FSAR=65;FSRF=13;FSRR=41;FWDB=0.00533726;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.879;QD=11.2967;RBI=0.00564031;REFB=-0.0341524;REVB=0.00182394;RO=51;SAF=6;SAR=65;SRF=12;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.274486;STB=0.66002;TYPE=snp;VARB=0.0213496;OID=.;OPOS=35984410;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:125:51:54:71:71:65:6:12:39:65:6:13:41 chr17 35988672 . C T 217.56 PASS AO=61;DP=147;FAO=62;FDP=149;FR=.;FRO=87;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=35;FSRR=52;FWDB=0.00602232;FXX=0.00666622;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.3408;QD=5.84057;RBI=0.0385329;REFB=0.0119695;REVB=-0.0380593;RO=86;SAF=33;SAR=28;SRF=36;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127002;STB=0.584668;TYPE=snp;VARB=-0.0163221;OID=.;OPOS=35988672;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:149:86:87:61:62:28:33:36:50:28:34:35:52 chr17 35995638 . T A 29.5 PASS AO=156;DP=344;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0300065;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.666;QD=11.8011;RBI=0.0378556;REFB=-0.0204083;REVB=-0.0230793;RO=188;SAF=81;SAR=75;SRF=100;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125671;STB=0.798798;TYPE=snp;VARB=0.0255366;OID=.;OPOS=35995638;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:344:10:188:5:156:5:75:81:100:88:1:4:1:4 chr17 36003359 . A G 96.39 PASS AO=22;DP=46;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.0372626;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.036;QD=8.38178;RBI=0.0441755;REFB=-0.00896334;REVB=-0.023727;RO=24;SAF=10;SAR=12;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0420867;STB=0.523788;TYPE=snp;VARB=0.0159746;OID=.;OPOS=36003359;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:46:46:24:24:22:22:12:10:12:12:12:10:12:12 chr17 36358847 . T A 1312.85 PASS AO=335;DP=540;FAO=245;FDP=397;FR=.;FRO=152;FSAF=166;FSAR=79;FSRF=94;FSRR=58;FWDB=-0.00812403;FXX=0.00749981;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.3512;QD=13.2277;RBI=0.0401583;REFB=0.00766556;REVB=0.0393279;RO=205;SAF=227;SAR=108;SRF=124;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0573846;STB=0.525436;TYPE=snp;VARB=-0.00281322;OID=.;OPOS=36358847;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:540:397:205:152:335:245:108:227:124:81:79:166:94:58 chr17 36617210 . A G 255.1 PASS AO=65;DP=140;FAO=65;FDP=142;FR=.;FRO=77;FSAF=43;FSAR=22;FSRF=55;FSRR=22;FWDB=-0.03381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.968;QD=7.18586;RBI=0.063967;REFB=-0.00962667;REVB=-0.0543016;RO=74;SAF=43;SAR=22;SRF=53;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.059981;STB=0.532599;TYPE=snp;VARB=0.00916695;OID=.;OPOS=36617210;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:142:74:77:65:65:22:43:53:21:22:43:55:22 chr17 36622482 . G C 128.16 PASS AO=26;DP=50;FAO=26;FDP=49;FR=.;FRO=23;FSAF=2;FSAR=24;FSRF=5;FSRR=18;FWDB=-0.000142274;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.358;QD=10.462;RBI=0.0150943;REFB=0.0128003;REVB=-0.0150936;RO=22;SAF=2;SAR=24;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.35931;STB=0.666508;TYPE=snp;VARB=-0.00752396;OID=.;OPOS=36622482;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:49:22:23:26:26:24:2:6:16:24:2:5:18 chr17 36622819 . C T 52.85 PASS AO=8;DP=12;FAO=8;FDP=12;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.015892;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.195;QD=17.615;RBI=0.0226893;REFB=0.00401114;REVB=-0.016194;RO=4;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.292303;STB=0.666295;TYPE=snp;VARB=-0.00173933;OID=.;OPOS=36622819;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:12:12:4:4:8:8:4:4:0:4:4:4:0:4 chr17 36635721 . C T 363.27 PASS AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0297404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.8735;QD=38.239;RBI=0.0629992;REFB=0;REVB=0.0555375;RO=0;SAF=24;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00122507;OID=.;OPOS=36635721;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:37:38:0:0:37:38:13:24:0:0:14:24:0:0 chr17 36646386 . A G 1770.57 PASS AO=185;DP=185;FAO=185;FDP=185;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=121;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.813;QD=38.2826;RBI=0.0457701;REFB=0;REVB=0.0436026;RO=0;SAF=64;SAR=121;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.48787e-05;OID=.;OPOS=36646386;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:185:185:0:0:185:185:121:64:0:0:121:64:0:0 chr17 36654005 . C T 14.26 PASS AO=4;DP=16;FAO=4;FDP=16;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=-0.100442;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.6601;QD=3.56562;RBI=0.135485;REFB=-0.0198583;REVB=0.0909274;RO=10;SAF=1;SAR=3;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.067076;STB=0.576517;TYPE=snp;VARB=0.0424547;OID=.;OPOS=36654005;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:16:16:10:12:4:4:3:1:3:7:3:1:4:8 chr17 36760751 . AGG AG,AGT 385.05 PASS AO=28,38;DP=95;FAO=36,42;FDP=94;FR=.;FRO=16;FSAF=0,2;FSAR=36,40;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.0396984,-0.0179179;FXX=0.0208312;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=11.6336,210.988;QD=16.3851;RBI=0.0511675,0.0179179;REFB=-0.210285,-0.0164689;REVB=-0.0322823,2.73045e-05;RO=15;SAF=0,2;SAR=28,36;SRF=6;SRR=9;SSEN=0.503425,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.855528,-0.469658;STB=0.999507,0.761732;TYPE=del,snp;VARB=0.218207,-0.00552305;OID=.,.;OPOS=36760752,36760753;OREF=G,G;OALT=-,T;OMAPALT=AG,AGT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:28,38:88:36,42:94:16:0,2:36,40:6:10:99:15:0,2:28,36:6:9 chr17 36909061 . A G 113.41 PASS AO=31;DP=92;FAO=38;FDP=99;FR=.;FRO=61;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=44;FWDB=0.0902276;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.043;QD=4.58241;RBI=0.0902989;REFB=-0.0193705;REVB=-0.0035866;RO=59;SAF=24;SAR=7;SRF=16;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.54187;STB=0.722874;TYPE=snp;VARB=0.0797538;OID=.;OPOS=36909061;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:99:59:61:31:38:7:24:16:43:13:25:17:44 chr17 36922196 . A G 402.6 PASS AO=76;DP=125;FAO=76;FDP=126;FR=.;FRO=50;FSAF=30;FSAR=46;FSRF=29;FSRR=21;FWDB=0.0147144;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.987;QD=12.7809;RBI=0.0150135;REFB=-0.00294651;REVB=-0.0029823;RO=45;SAF=30;SAR=46;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112501;STB=0.574493;TYPE=snp;VARB=0.000968955;OID=.;OPOS=36922196;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:126:45:50:76:76:46:30:25:20:46:30:29:21 chr17 36922839 . C G 305.73 PASS AO=60;DP=106;FAO=61;FDP=107;FR=.;FRO=46;FSAF=24;FSAR=37;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=0.00385413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.502;QD=11.4292;RBI=0.0178225;REFB=0.00511964;REVB=0.0174007;RO=45;SAF=24;SAR=36;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0359978;STB=0.528059;TYPE=snp;VARB=-0.00576902;OID=.;OPOS=36922839;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:107:45:46:60:61:36:24:20:25:37:24:21:25 chr17 36926731 . T G 234.39 PASS AO=56;DP=115;FAO=56;FDP=115;FR=.;FRO=59;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=33;FSRR=26;FWDB=-0.0175007;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.8242;QD=8.15259;RBI=0.019641;REFB=-0.0144612;REVB=0.00891588;RO=58;SAF=32;SAR=24;SRF=32;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184301;STB=0.506327;TYPE=snp;VARB=0.0147816;OID=.;OPOS=36926731;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:58:59:56:56:24:32:32:26:24:32:33:26 chr17 36926767 . G A 245.52 PASS AO=51;DP=101;FAO=55;FDP=105;FR=.;FRO=50;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=34;FSRR=16;FWDB=0.061424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.1781;QD=9.35309;RBI=0.0628934;REFB=-0.00644809;REVB=0.0135152;RO=49;SAF=29;SAR=22;SRF=33;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0963792;STB=0.565348;TYPE=snp;VARB=0.00793831;OID=.;OPOS=36926767;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:105:49:50:51:55:22:29:33:16:25:30:34:16 chr17 37017969 . T G 403.32 PASS AO=94;DP=185;FAO=95;FDP=191;FR=.;FRO=96;FSAF=44;FSAR=51;FSRF=56;FSRR=40;FWDB=0.0215474;FXX=0.0103622;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.7718;QD=8.44647;RBI=0.0228911;REFB=-0.00114057;REVB=0.00772733;RO=90;SAF=43;SAR=51;SRF=48;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0676883;STB=0.560181;TYPE=snp;VARB=0.0017668;OID=.;OPOS=37017969;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:191:90:96:94:95:51:43:48:42:51:44:56:40 chr17 37023896 . G A 128.4 PASS AO=28;DP=85;FAO=38;FDP=96;FR=.;FRO=58;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=31;FSRR=27;FWDB=-0.00413176;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.617;QD=5.3499;RBI=0.00827719;REFB=-0.00399986;REVB=0.0071722;RO=57;SAF=14;SAR=14;SRF=31;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0504356;STB=0.568721;TYPE=snp;VARB=0.00619064;OID=.;OPOS=37023896;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:96:57:58:28:38:14:14:31:26:22:16:31:27 chr17 37055024 . GC G 73.17 PASS AO=38;DP=102;FAO=44;FDP=96;FR=.;FRO=52;FSAF=30;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=39;FWDB=-0.174185;FXX=0.0495;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.1989;QD=3.04895;RBI=0.229892;REFB=-0.0916873;REVB=0.150034;RO=42;SAF=26;SAR=12;SRF=11;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0.650794;SSSB=0.387628;STB=0.725267;TYPE=del;VARB=0.104311;OID=.;OPOS=37055025;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:38:100:44:96:52:30:14:13:39:73:42:26:12:11:31 chr17 37055077 . G A 323.79 PASS AO=53;DP=84;FAO=57;FDP=88;FR=.;FRO=31;FSAF=21;FSAR=36;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.00203573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.363;QD=14.7175;RBI=0.00647431;REFB=-0.0178543;REVB=0.00614594;RO=31;SAF=19;SAR=34;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0898273;STB=0.542698;TYPE=snp;VARB=0.0125856;OID=.;OPOS=37055077;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:84:88:31:31:53:57:34:19:15:16:36:21:15:16 chr17 37070658 . A G 459.52 PASS AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0059352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.8487;QD=38.2929;RBI=0.0262345;REFB=0;REVB=-0.0255543;RO=0;SAF=11;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.14038e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000273966;OID=.;OPOS=37070658;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:48:48:0:0:48:48:37:11:0:0:37:11:0:0 chr17 37076331 . G A 25.56 PASS AO=14;DP=62;FAO=14;FDP=62;FR=.;FRO=48;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=0.00592708;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.21;QD=1.64907;RBI=0.0457596;REFB=-0.00944017;REVB=-0.0453741;RO=47;SAF=8;SAR=6;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0490276;STB=0.523331;TYPE=snp;VARB=0.0395626;OID=.;OPOS=37076331;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:62:62:47:48:14:14:6:8:25:22:6:8:26:22 chr17 37101380 . T C 1746.96 PASS AO=209;DP=232;FAO=212;FDP=231;FR=.;FRO=19;FSAF=80;FSAR=132;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=0.064892;FXX=0.00431016;HRUN=5;LEN=1;MLLD=151.907;QD=30.2505;RBI=0.0723116;REFB=-0.0702941;REVB=0.0319059;RO=20;SAF=80;SAR=129;SRF=4;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0323311;STB=0.505402;TYPE=snp;VARB=0.000552826;OID=.;OPOS=37101380;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:232:231:20:19:209:212:129:80:4:16:132:80:6:13 chr17 37213317 . C A 296.8 PASS AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0298526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.023;QD=37.0998;RBI=0.0929567;REFB=0;REVB=0.0880328;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000970005;OID=.;OPOS=37213317;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:32:32:0:0:32:32:15:17:0:0:15:17:0:0 chr17 37228765 . A G 769.12 PASS AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0275438;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.443;QD=37.9811;RBI=0.0534661;REFB=0;REVB=-0.0458254;RO=0;SAF=50;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.35858e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000115262;OID=.;OPOS=37228765;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:81:81:0:0:81:81:31:50:0:0:31:50:0:0 chr17 37243927 . A G 99.38 PASS AO=33;DP=92;FAO=33;FDP=92;FR=.;FRO=59;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=32;FSRR=27;FWDB=0.0239872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.842;QD=4.32071;RBI=0.0313097;REFB=-0.017217;REVB=-0.0201224;RO=59;SAF=13;SAR=20;SRF=32;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166041;STB=0.595574;TYPE=snp;VARB=0.0203876;OID=.;OPOS=37243927;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:59:59:33:33:20:13:32:27:20:13:32:27 chr17 37264441 . G A 226.81 PASS AO=49;DP=94;FAO=49;FDP=93;FR=.;FRO=44;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=26;FSRR=18;FWDB=-0.00201887;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.883;QD=9.75537;RBI=0.0151139;REFB=-0.0167035;REVB=0.0149785;RO=40;SAF=26;SAR=23;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0572207;STB=0.528724;TYPE=snp;VARB=0.0223597;OID=.;OPOS=37264441;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:93:40:44:49:49:23:26:24:16:23:26:26:18 chr17 37296025 . C T 89.75 PASS AO=28;DP=80;FAO=29;FDP=81;FR=.;FRO=52;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=29;FSRR=23;FWDB=0.00693393;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.108;QD=4.43227;RBI=0.00845399;REFB=-0.00925128;REVB=-0.00483639;RO=50;SAF=10;SAR=18;SRF=29;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247272;STB=0.61478;TYPE=snp;VARB=0.0271715;OID=.;OPOS=37296025;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:80:81:50:52:28:29:18:10:29:21:18:11:29:23 chr17 37341119 . TG T 32.08 PASS AO=16;DP=46;FAO=22;FDP=39;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.316244;FXX=0.0487686;HRUN=8;LEN=1;MLLD=6.0619;QD=3.29026;RBI=0.354343;REFB=-0.0717921;REVB=-0.159838;RO=14;SAF=3;SAR=13;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260868;STB=0.571796;TYPE=del;VARB=0.100479;OID=.;OPOS=37341120;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:16:39:22:39:17:5:17:6:11:21:14:3:13:6:8 chr17 37349709 . AC A,AG 1284.74 PASS AO=47,95;DP=150;FAO=19,122;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=1,13;FSAR=18,109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0653868,0.0704944;FXX=0.013985;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=132.49,144.529;QD=36.4465;RBI=0.0694627,0.0884454;REFB=0.0464284,0.107655;REVB=0.0234441,0.0534147;RO=1;SAF=1,12;SAR=46,83;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0101181,0.00568003;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0438614,-0.00250944;OID=.,.;OPOS=37349710,37349710;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=A,AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:47,95:144:19,122:141:0:1,13:18,109:0:0:12:1:1,12:46,83:0:1 chr17 37410892 . C G 2315.4 PASS AO=239;DP=241;FAO=242;FDP=242;FR=.;FRO=0;FSAF=124;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146103;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.826;QD=38.2711;RBI=0.017965;REFB=0;REVB=0.0104537;RO=0;SAF=121;SAR=118;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.12812e-06;OID=.;OPOS=37410892;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:241:242:0:0:239:242:118:121:0:0:118:124:0:0 chr17 37814080 . G A 201.94 PASS AO=24;DP=26;FAO=24;FDP=26;FR=.;FRO=2;FSAF=19;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0315682;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.252;QD=31.0676;RBI=0.0550264;REFB=-0.165126;REVB=0.0450706;RO=2;SAF=19;SAR=5;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153229;STB=0.583258;TYPE=snp;VARB=0.0048256;OID=.;OPOS=37814080;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:26:26:2:2:24:24:5:19:0:2:5:19:0:2 chr17 37821644 . CGGA C 24.08 PASS AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.035451;FXX=0.130378;HRUN=2;LEN=3;MLLD=196.153;QD=4.81576;RBI=0.0388656;REFB=-0.0248302;REVB=0.0159299;RO=10;SAF=5;SAR=3;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20901;STB=0.576728;TYPE=del;VARB=0.0283234;OID=.;OPOS=37821645;OREF=GGA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:8:20:8:20:12:5:3:6:6:24:10:5:3:4:6 chr17 37822311 . A C 215.31 PASS AO=16;DP=25;FAO=23;FDP=24;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.110139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.466;QD=35.8848;RBI=0.110296;REFB=0;REVB=0.00588039;RO=0;SAF=9;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000319773;OID=.;OPOS=37822311;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:23:24:0:0:16:23:7:9:0:0:7:16:0:0 chr17 37828496 . T C 423.53 PASS AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00184318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.343;QD=37.6474;RBI=0.00748943;REFB=0;REVB=-0.00725908;RO=0;SAF=16;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.49331e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.62961e-05;OID=.;OPOS=37828496;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:45:45:0:0:45:45:29:16:0:0:29:16:0:0 chr17 37828745 . A G 101.95 PASS AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00833352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.4485;QD=37.0728;RBI=0.055516;REFB=0;REVB=-0.054887;RO=0;SAF=6;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000677801;OID=.;OPOS=37828745;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:11:11:5:6:0:0:5:6:0:0 chr17 37828787 . G A 209.2 PASS AO=22;DP=22;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0200904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.508;QD=36.3826;RBI=0.0283438;REFB=0;REVB=0.0199936;RO=0;SAF=13;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2029e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000561412;OID=.;OPOS=37828787;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:22:23:0:0:22:23:9:13:0:0:10:13:0:0 chr17 37829129 . A G 308.37 PASS AO=36;DP=39;FAO=37;FDP=40;FR=.;FRO=3;FSAF=12;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0223515;FXX=0.0243843;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.912;QD=30.8374;RBI=0.0260463;REFB=-0.0197051;REVB=-0.0133724;RO=3;SAF=12;SAR=24;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50077;TYPE=snp;VARB=0.00076628;OID=.;OPOS=37829129;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:40:3:3:36:37:24:12:1:2:25:12:1:2 chr17 37830900 . A G 514.87 PASS AO=59;DP=62;FAO=59;FDP=62;FR=.;FRO=3;FSAF=38;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.00500366;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=196.813;QD=33.2174;RBI=0.0289067;REFB=-0.0839936;REVB=0.0284703;RO=3;SAF=38;SAR=21;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0627569;STB=0.533322;TYPE=snp;VARB=0.000734404;OID=.;OPOS=37830900;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:62:62:3:3:59:59:21:38:0:3:21:38:0:3 chr17 37871547 . C A 400.53 PASS AO=84;DP=147;FAO=84;FDP=152;FR=.;FRO=68;FSAF=50;FSAR=34;FSRF=29;FSRR=39;FWDB=0.00804226;FXX=0.00653552;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.646;QD=10.5402;RBI=0.00864361;REFB=-0.0177277;REVB=0.00316768;RO=63;SAF=50;SAR=34;SRF=29;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107627;STB=0.576055;TYPE=snp;VARB=0.0118924;OID=.;OPOS=37871547;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:152:63:68:84:84:34:50:29:34:34:50:29:39 chr17 37884037 . C G 554.34 PASS AO=58;DP=61;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.164724;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=35.6453;QD=34.1129;RBI=0.165117;REFB=-0.11594;REVB=0.0113814;RO=3;SAF=22;SAR=36;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0600835;STB=0.510201;TYPE=snp;VARB=0.00841406;OID=.;OPOS=37884037;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:61:65:3:1:58:64:36:22:3:0:40:24:1:0 chr17 37898543 . T C 279.43 PASS AO=28;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0459149;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.2379;QD=38.5419;RBI=0.0827995;REFB=0;REVB=0.0689027;RO=0;SAF=22;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00019609;OID=.;OPOS=37898543;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:28:29:0:0:28:29:6:22:0:0:6:23:0:0 chr17 37922259 . G A 2373.77 PASS AO=257;DP=265;FAO=258;FDP=264;FR=.;FRO=6;FSAF=186;FSAR=72;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.00723055;FXX=0.00751851;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.622;QD=35.9663;RBI=0.0435684;REFB=-0.0214442;REVB=0.0429642;RO=6;SAF=185;SAR=72;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.015207;STB=0.507936;TYPE=snp;VARB=8.60853e-05;OID=.;OPOS=37922259;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:265:264:6:6:257:258:72:185:6:0:72:186:6:0 chr17 38020419 . T C 73.45 PASS AO=7;DP=7;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0866795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.977;QD=36.7263;RBI=0.0930579;REFB=0;REVB=0.0338592;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00230785;OID=.;OPOS=38020419;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:8:0:0:7:8:3:4:0:0:3:5:0:0 chr17 38024626 . C T 712.77 PASS AO=77;DP=78;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.075581;FXX=0.0128189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.2344;QD=37.0268;RBI=0.077914;REFB=-0.0233422;REVB=0.0189236;RO=1;SAF=42;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111359;STB=0.506023;TYPE=snp;VARB=0.00155087;OID=.;OPOS=38024626;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:78:77:1:1:77:76:35:42:1:0:35:41:1:0 chr17 38028634 . G T 1432.72 PASS AO=147;DP=147;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00404045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.688;QD=38.4623;RBI=0.0147677;REFB=0;REVB=0.0142042;RO=0;SAF=43;SAR=104;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.71351e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.91486e-05;OID=.;OPOS=38028634;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:147:149:0:0:147:149:104:43:0:0:106:43:0:0 chr17 38031674 . C T 1100.76 PASS AO=115;DP=120;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0840278;FXX=0.0333306;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.9;QD=37.9573;RBI=0.084647;REFB=-0.0253034;REVB=0.0102195;RO=1;SAF=61;SAR=54;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00871291;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000523336;OID=.;OPOS=38031674;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:120:116:1:0:115:116:54:61:0:1:55:61:0:0 chr17 38033277 . A C 786.05 PASS AO=45;DP=92;FAO=89;FDP=93;FR=.;FRO=4;FSAF=41;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.00414129;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.763;QD=33.8084;RBI=0.0168502;REFB=-0.0460121;REVB=0.0163333;RO=0;SAF=39;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.44635e-08;STB=0.519996;TYPE=snp;VARB=0.00260724;OID=.;OPOS=38033277;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:49:93:0:4:45:89:6:39:0:0:48:41:0:4 chr17 38062196 . G A 1260.56 PASS AO=135;DP=137;FAO=135;FDP=137;FR=.;FRO=2;FSAF=80;FSAR=55;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0168715;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=179.182;QD=36.8047;RBI=0.0246624;REFB=-0.0805454;REVB=-0.0179885;RO=1;SAF=80;SAR=55;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00590545;STB=0.506172;TYPE=snp;VARB=0.000165538;OID=.;OPOS=38062196;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:137:137:1:2:135:135:55:80:1:0:55:80:2:0 chr17 38062217 . C T 1206.44 PASS AO=138;DP=145;FAO=138;FDP=145;FR=.;FRO=7;FSAF=86;FSAR=52;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0219274;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=116.934;QD=33.281;RBI=0.0235664;REFB=-0.115075;REVB=0.0086351;RO=3;SAF=86;SAR=52;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0266343;STB=0.517195;TYPE=snp;VARB=0.00109181;OID=.;OPOS=38062217;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:145:145:3:7:138:138:52:86:0:3:52:86:2:5 chr17 38064405 . C T 907.73 PASS AO=95;DP=98;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0236291;FXX=0.0594001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.162;QD=38.2202;RBI=0.0396793;REFB=0;REVB=0.0318765;RO=0;SAF=50;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000243127;OID=.;OPOS=38064405;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:98:95:0:0:95:95:45:50:0:0:45:50:0:0 chr17 38064469 . T C 992.27 PASS AO=98;DP=99;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154044;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.742;QD=38.1641;RBI=0.042816;REFB=0;REVB=0.0399489;RO=0;SAF=44;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40252e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.26431e-05;OID=.;OPOS=38064469;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:99:104:0:0:98:104:54:44:0:0:54:50:0:0 chr17 38122680 . G T 511.26 PASS AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0200131;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.886;QD=37.8708;RBI=0.0389282;REFB=0;REVB=0.0333897;RO=0;SAF=16;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.22487e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000189551;OID=.;OPOS=38122680;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:54:54:0:0:54:54:38:16:0:0:39:15:0:0 chr17 38122686 . G A 434.6 PASS AO=48;DP=50;FAO=49;FDP=51;FR=.;FRO=2;FSAF=14;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0977216;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5276;QD=34.086;RBI=0.110495;REFB=-0.133235;REVB=0.0515722;RO=2;SAF=14;SAR=34;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0187886;STB=0.5102;TYPE=snp;VARB=0.0227888;OID=.;OPOS=38122686;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:50:51:2:2:48:49:34:14:1:1:35:14:1:1 chr17 38137364 . G A 90.91 PASS AO=10;DP=11;FAO=11;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0172728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=39.6913;QD=30.3018;RBI=0.0232024;REFB=-0.0702761;REVB=0.0154921;RO=0;SAF=9;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.8593e-08;STB=0.526269;TYPE=snp;VARB=0.0112122;OID=.;OPOS=38137364;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:11:12:0:1:10:11:1:9:0:0:2:9:1:0 chr17 38173143 . G A 280.15 PASS AO=29;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000876548;FXX=0.0302939;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.492;QD=35.0184;RBI=0.00247269;REFB=0;REVB=-0.00231211;RO=0;SAF=4;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.10829e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.16603e-05;OID=.;OPOS=38173143;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:32:32:0:0:29:32:25:4:0:0:28:4:0:0 chr17 38176256 . A T 239.38 PASS AO=25;DP=27;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00788999;FXX=0.0740466;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.5869;QD=38.3011;RBI=0.0267137;REFB=0;REVB=0.025522;RO=0;SAF=18;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000674693;OID=.;OPOS=38176256;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:27:25:0:0:25:25:7:18:0:0:7:18:0:0 chr17 38179492 . A G 886.67 PASS AO=98;DP=101;FAO=98;FDP=101;FR=.;FRO=3;FSAF=61;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0118539;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=244.098;QD=35.1157;RBI=0.0134147;REFB=-0.0751315;REVB=0.00628017;RO=3;SAF=61;SAR=37;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0172354;STB=0.509093;TYPE=snp;VARB=6.9496e-06;OID=.;OPOS=38179492;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:101:101:3:3:98:98:37:61:1:2:37:61:1:2 chr17 38246286 . A G 150.35 PASS AO=35;DP=76;FAO=37;FDP=81;FR=.;FRO=44;FSAF=8;FSAR=29;FSRF=9;FSRR=35;FWDB=0.0285973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.021;QD=7.42468;RBI=0.0288657;REFB=-0.0159776;REVB=0.00392745;RO=41;SAF=8;SAR=27;SRF=9;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0124582;STB=0.509448;TYPE=snp;VARB=0.0122909;OID=.;OPOS=38246286;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:81:41:44:35:37:27:8:9:32:29:8:9:35 chr17 38350583 . G A 154.6 PASS AO=29;DP=50;FAO=29;FDP=50;FR=.;FRO=21;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=0.00628988;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.74;QD=12.3677;RBI=0.0466405;REFB=-0.00155219;REVB=0.0462144;RO=20;SAF=18;SAR=11;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104723;STB=0.542572;TYPE=snp;VARB=0.00173696;OID=.;OPOS=38350583;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:50:50:20:21:29:29:11:18:15:5:11:18:15:6 chr17 38457151 . G A 288.65 PASS AO=72;DP=186;FAO=85;FDP=198;FR=.;FRO=113;FSAF=42;FSAR=43;FSRF=47;FSRR=66;FWDB=0.00561989;FXX=0.0149246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.817;QD=5.83121;RBI=0.00604169;REFB=-0.0305738;REVB=0.00221783;RO=112;SAF=30;SAR=42;SRF=46;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00661959;STB=0.544665;TYPE=snp;VARB=0.0514579;OID=.;OPOS=38457151;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:198:112:113:72:85:42:30:46:66:43:42:47:66 chr17 38513803 . GGGCC G 213.37 PASS AO=19;DP=36;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0285544;FXX=0.0644953;HRUN=4;LEN=4;MLLD=48.5331;QD=29.4305;RBI=0.386721;REFB=0;REVB=0.385665;RO=1;SAF=19;SAR=0;SRF=0;SRR=1;SSEN=0.445946;SSEP=0;SSSB=0.85711;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.013484;OID=.;OPOS=38513804;OREF=GGCC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:19:29:29:29:0:24:5:0:0:19:1:19:0:0:1 chr17 38640744 . C T 283.62 PASS AO=56;DP=95;FAO=55;FDP=94;FR=.;FRO=39;FSAF=23;FSAR=32;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=0.0364187;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.6642;QD=12.069;RBI=0.0371418;REFB=-0.027838;REVB=0.00729333;RO=39;SAF=23;SAR=33;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000355744;STB=0.503381;TYPE=snp;VARB=0.0212424;OID=.;OPOS=38640744;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:94:39:39:56:55:33:23:16:23:32:23:16:23 chr17 38645125 . A G 169.92 PASS AO=40;DP=81;FAO=39;FDP=80;FR=.;FRO=41;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=0.0280307;FXX=0.0123442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.8633;QD=8.4959;RBI=0.0937699;REFB=-0.00875194;REVB=-0.0894823;RO=40;SAF=23;SAR=17;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0229226;STB=0.511105;TYPE=snp;VARB=0.0108269;OID=.;OPOS=38645125;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:80:40:41:40:39:17:23:22:18:17:22:24:17 chr17 38855772 . T C 204.65 PASS AO=46;DP=97;FAO=48;FDP=99;FR=.;FRO=51;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=35;FWDB=-0.0212743;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.9618;QD=8.26883;RBI=0.0212959;REFB=-0.0144781;REVB=0.000960386;RO=51;SAF=26;SAR=20;SRF=16;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234253;STB=0.636308;TYPE=snp;VARB=0.0246374;OID=.;OPOS=38855772;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:99:51:51:46:48:20:26:16:35:20:28:16:35 chr17 38857446 . C A 233.38 PASS AO=67;DP=158;FAO=66;FDP=157;FR=.;FRO=91;FSAF=28;FSAR=38;FSRF=30;FSRR=61;FWDB=-0.00698064;FXX=0.00632871;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.813;QD=5.94591;RBI=0.0479416;REFB=-0.0121591;REVB=0.0474306;RO=90;SAF=28;SAR=39;SRF=30;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0908158;STB=0.557057;TYPE=snp;VARB=0.0149308;OID=.;OPOS=38857446;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:157:90:91:67:66:39:28:30:60:38:28:30:61 chr17 38858134 . CA C 356.56 PASS AO=82;DP=173;FAO=86;FDP=175;FR=.;FRO=89;FSAF=20;FSAR=66;FSRF=20;FSRR=69;FWDB=0.0102578;FXX=0.0112988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.571;QD=8.15004;RBI=0.0127499;REFB=-0.00194823;REVB=-0.00757223;RO=89;SAF=18;SAR=64;SRF=20;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00712441;STB=0.505617;TYPE=del;VARB=0.0017025;OID=.;OPOS=38858135;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:82:173:86:175:89:20:66:20:69:99:89:18:64:20:69 chr17 38911212 . G A 189.09 PASS AO=51;DP=122;FAO=52;FDP=122;FR=.;FRO=70;FSAF=18;FSAR=34;FSRF=30;FSRR=40;FWDB=-0.037306;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.95;QD=6.19951;RBI=0.0494536;REFB=-0.00691061;REVB=-0.0324642;RO=70;SAF=18;SAR=33;SRF=30;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0827281;STB=0.550587;TYPE=snp;VARB=0.00895499;OID=.;OPOS=38911212;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:70:70:51:52:33:18:30:40:34:18:30:40 chr17 38911363 . G A 159.29 PASS AO=46;DP=113;FAO=46;FDP=113;FR=.;FRO=67;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=32;FSRR=35;FWDB=-0.00486799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.7688;QD=5.6387;RBI=0.0413752;REFB=0.000589624;REVB=0.0410878;RO=67;SAF=23;SAR=23;SRF=32;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.02351;STB=0.513269;TYPE=snp;VARB=-0.00104934;OID=.;OPOS=38911363;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:67:67:46:46:23:23:32:35:23:23:32:35 chr17 38935812 . A G 185.39 PASS AO=39;DP=72;FAO=39;FDP=73;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=27;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=-0.037954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.073;QD=10.1586;RBI=0.0402135;REFB=-0.0167133;REVB=-0.0132897;RO=33;SAF=12;SAR=27;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0531553;STB=0.539548;TYPE=snp;VARB=0.0111857;OID=.;OPOS=38935812;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:73:33:34:39:39:27:12:12:21:27:12:13:21 chr17 38936659 . C T 367.66 PASS AO=95;DP=207;FAO=95;FDP=207;FR=.;FRO=112;FSAF=41;FSAR=54;FSRF=39;FSRR=73;FWDB=0.0216325;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.982;QD=7.10455;RBI=0.0217973;REFB=0.0066624;REVB=0.0026757;RO=111;SAF=41;SAR=54;SRF=39;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0807056;STB=0.546542;TYPE=snp;VARB=-0.00907926;OID=.;OPOS=38936659;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:207:111:112:95:95:54:41:39:72:54:41:39:73 chr17 38938557 . G A 107.97 PASS AO=26;DP=59;FAO=28;FDP=64;FR=.;FRO=36;FSAF=5;FSAR=23;FSRF=11;FSRR=25;FWDB=0.00788264;FXX=0.0447694;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.825;QD=6.74826;RBI=0.0177201;REFB=0.00216132;REVB=-0.0158703;RO=30;SAF=3;SAR=23;SRF=5;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106984;STB=0.60518;TYPE=snp;VARB=-0.00432201;OID=.;OPOS=38938557;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:64:30:36:26:28:23:3:5:25:23:5:11:25 chr17 38938558 . C A 10.11 PASS AO=10;DP=66;FAO=10;FDP=65;FR=.;FRO=55;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=47;FWDB=-0.00724681;FXX=0.0151492;HRUN=3;LEN=1;MLLD=61.0161;QD=0.622373;RBI=0.0429869;REFB=0.0744424;REVB=0.0423716;RO=55;SAF=7;SAR=3;SRF=8;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.633127;STB=0.885625;TYPE=snp;VARB=-0.0198734;OID=.;OPOS=38938558;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:66:65:55:55:10:10:3:7:8:47:3:7:8:47 chr17 38938591 . C G 134.43 PASS AO=29;DP=56;FAO=30;FDP=59;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=8;FSRR=21;FWDB=-0.00452956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.854;QD=9.11374;RBI=0.0186036;REFB=-0.0271666;REVB=0.0180437;RO=27;SAF=11;SAR=18;SRF=8;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0780305;STB=0.549282;TYPE=snp;VARB=0.0184249;OID=.;OPOS=38938591;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:59:27:29:29:30:18:11:8:19:19:11:8:21 chr17 38950272 . T C 194.22 PASS AO=41;DP=91;FAO=48;FDP=103;FR=.;FRO=55;FSAF=16;FSAR=32;FSRF=28;FSRR=27;FWDB=-0.0311264;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.559;QD=7.54241;RBI=0.0330967;REFB=-0.0179126;REVB=-0.0112489;RO=50;SAF=16;SAR=25;SRF=29;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186477;STB=0.598597;TYPE=snp;VARB=0.0142793;OID=.;OPOS=38950272;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:103:50:55:41:48:25:16:29:21:32:16:28:27 chr17 38955961 . G A 180.84 PASS AO=35;DP=62;FAO=35;FDP=61;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=27;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.0230269;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.818;QD=11.8585;RBI=0.028162;REFB=0.02148;REVB=0.016213;RO=27;SAF=8;SAR=27;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20942;STB=0.604176;TYPE=snp;VARB=-0.0165947;OID=.;OPOS=38955961;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:61:27:26:35:35:27:8:12:15:27:8:11:15 chr17 38978536 . A C 497.66 PASS AO=54;DP=56;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.000744075;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.977;QD=36.1932;RBI=0.00507461;REFB=-0.097234;REVB=-0.00501976;RO=1;SAF=16;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0285388;STB=0.515146;TYPE=snp;VARB=0.000203991;OID=.;OPOS=38978536;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:56:55:1:1:54:54:38:16:1:0:38:16:1:0 chr17 38990833 . TGC TC,T,TCC 1650.44 PASS AO=39,49,79;DP=173;FAO=168,0,3;FDP=171;FR=.;FRO=0;FSAF=86,0,3;FSAR=82,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.102189,0.0971127,0.0969572;FXX=0.01156;HRUN=1,1,1;LEN=1,2,1;MLLD=216.799,202.791,206.171;QD=38.6067;RBI=0.103269,0.164612,0.155357;REFB=0,0,0;REVB=0.0149026,0.132914,-0.121389;RO=0;SAF=36,49,3;SAR=3,0,76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=del,del,snp;VARB=0.00217123,0,-0.070051;OID=.,.,.;OPOS=38990834,38990834,38990834;OREF=G,GC,G;OALT=-,-,C;OMAPALT=TC,T,TCC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:39,49,79:169:168,0,3:171:0:86,0,3:82,0,0:0:0:34:0:36,49,3:3,0,76:0:0 chr17 38991003 . T C 608.16 PASS AO=200;DP=454;FAO=172;FDP=400;FR=.;FRO=228;FSAF=72;FSAR=100;FSRF=108;FSRR=120;FWDB=-0.0195543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.817;QD=6.08162;RBI=0.0258399;REFB=-0.0139906;REVB=0.0168916;RO=251;SAF=88;SAR=112;SRF=122;SRR=129;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0466942;STB=0.531911;TYPE=snp;VARB=0.019667;OID=.;OPOS=38991003;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:454:400:251:228:200:172:112:88:122:129:100:72:108:120 chr17 38991032 . T A 729.99 PASS AO=216;DP=466;FAO=187;FDP=400;FR=.;FRO=213;FSAF=78;FSAR=109;FSRF=99;FSRR=114;FWDB=0.0358712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.7004;QD=7.29988;RBI=0.0414592;REFB=-0.0250126;REVB=0.0207875;RO=247;SAF=89;SAR=127;SRF=117;SRR=130;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0608666;STB=0.525878;TYPE=snp;VARB=0.0378197;OID=.;OPOS=38991032;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:466:400:247:213:216:187:127:89:117:130:109:78:99:114 chr17 39081713 . A G 585.19 PASS AO=135;DP=265;FAO=135;FDP=265;FR=.;FRO=130;FSAF=68;FSAR=67;FSRF=63;FSRR=67;FWDB=-0.0258196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.883;QD=8.833;RBI=0.0258226;REFB=-0.0200733;REVB=-0.00039309;RO=130;SAF=68;SAR=67;SRF=63;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0170975;STB=0.509362;TYPE=snp;VARB=0.018736;OID=.;OPOS=39081713;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:265:265:130:130:135:135:67:68:63:67:67:68:63:67 chr17 39084504 . T C 190.51 PASS AO=52;DP=125;FAO=53;FDP=125;FR=.;FRO=72;FSAF=14;FSAR=39;FSRF=22;FSRR=50;FWDB=-0.0208462;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.849;QD=6.09641;RBI=0.0266392;REFB=-0.0131912;REVB=0.0165856;RO=73;SAF=14;SAR=38;SRF=22;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0413975;STB=0.5298;TYPE=snp;VARB=0.0180761;OID=.;OPOS=39084504;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:73:72:52:53:38:14:22:51:39:14:22:50 chr17 39135205 . A G 92.32 PASS AO=30;DP=86;FAO=31;FDP=88;FR=.;FRO=57;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=32;FSRR=25;FWDB=-0.00494087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.673;QD=4.1962;RBI=0.0425943;REFB=-0.0290194;REVB=-0.0423068;RO=54;SAF=11;SAR=19;SRF=31;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231033;STB=0.61283;TYPE=snp;VARB=0.0437759;OID=.;OPOS=39135205;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:86:88:54:57:30:31:19:11:31:23:19:12:32:25 chr17 39135207 . A G 86.01 PASS AO=30;DP=88;FAO=30;FDP=88;FR=.;FRO=58;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=33;FSRR=25;FWDB=0.0130027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.633;QD=3.90936;RBI=0.0303298;REFB=-0.0284493;REVB=-0.0274012;RO=58;SAF=11;SAR=19;SRF=33;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229821;STB=0.633244;TYPE=snp;VARB=0.0309793;OID=.;OPOS=39135207;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:88:88:58:58:30:30:19:11:33:25:19:11:33:25 chr17 39137297 . C T 44.02 PASS AO=12;DP=36;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=0.00216673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.546;QD=4.75903;RBI=0.0439298;REFB=-0.0150418;REVB=0.0438764;RO=24;SAF=4;SAR=8;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.399401;STB=0.746681;TYPE=snp;VARB=0.00703341;OID=.;OPOS=39137297;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:36:37:24:24:12:13:8:4:17:7:9:4:17:7 chr17 39150167 . G A 85.75 PASS AO=17;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=0;FWDB=0.00718596;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.311;QD=10.7186;RBI=0.0367125;REFB=-0.0154345;REVB=0.0360024;RO=15;SAF=14;SAR=3;SRF=15;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.318782;STB=0.674271;TYPE=snp;VARB=0.0242923;OID=.;OPOS=39150167;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:32:32:15:15:17:17:3:14:15:0:3:14:15:0 chr17 39150284 . A G 46.36 PASS AO=13;DP=35;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.0399812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.631;QD=5.29826;RBI=0.0873652;REFB=-0.00211986;REVB=-0.0776799;RO=21;SAF=11;SAR=2;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.414735;STB=0.741145;TYPE=snp;VARB=0.00170329;OID=.;OPOS=39150284;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:35:35:21:22:13:13:2:11:11:10:2:11:12:10 chr17 39150357 . A G 152.86 PASS AO=30;DP=59;FAO=32;FDP=61;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.0335967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.402;QD=10.0239;RBI=0.0375869;REFB=-0.0231155;REVB=-0.0168534;RO=29;SAF=10;SAR=20;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0772522;STB=0.519468;TYPE=snp;VARB=0.0192528;OID=.;OPOS=39150357;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:61:29:29:30:32:20:10:12:17:20:12:12:17 chr17 39156027 . G A 76.08 PASS AO=20;DP=47;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=21;FWDB=0.00879339;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.008;QD=6.21072;RBI=0.0147134;REFB=-0.0311126;REVB=-0.0117966;RO=27;SAF=4;SAR=16;SRF=8;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135275;STB=0.564637;TYPE=snp;VARB=0.0462844;OID=.;OPOS=39156027;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:47:49:27:29:20:20:16:4:8:19:16:4:8:21 chr17 39186031 . C T 109.24 PASS AO=23;DP=47;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=17;FWDB=0.0230915;FXX=0.059988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.3498;QD=9.29693;RBI=0.0237044;REFB=-0.0326198;REVB=-0.00535573;RO=22;SAF=9;SAR=14;SRF=5;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15667;STB=0.561355;TYPE=snp;VARB=0.0395416;OID=.;OPOS=39186031;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:22:23:23:24:14:9:5:17:15:9:6:17 chr17 39186168 . A C 105.96 PASS AO=21;DP=39;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.0163165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.1342;QD=10.8679;RBI=0.0323994;REFB=-0.0134312;REVB=-0.027991;RO=18;SAF=7;SAR=14;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190413;STB=0.607038;TYPE=snp;VARB=0.0134253;OID=.;OPOS=39186168;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:39:39:18:18:21:21:14:7:10:8:14:7:10:8 chr17 39186220 . G A 118.84 PASS AO=23;DP=44;FAO=24;FDP=44;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.0171901;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.065;QD=10.804;RBI=0.0205651;REFB=-0.00869222;REVB=0.0112882;RO=20;SAF=5;SAR=18;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.28037;STB=0.662641;TYPE=snp;VARB=0.0131155;OID=.;OPOS=39186220;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:44:44:20:20:23:24:18:5:10:10:19:5:10:10 chr17 39197499 . G A 10.84 PASS AO=3;DP=13;FAO=3;FDP=14;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.0774201;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.167;QD=3.09826;RBI=0.0782665;REFB=-0.0176231;REVB=-0.0114793;RO=10;SAF=2;SAR=1;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181792;STB=0.599316;TYPE=snp;VARB=0.0634041;OID=.;OPOS=39197499;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:13:14:10:11:3:3:1:2:5:5:1:2:6:5 chr17 39203490 . G C 90.03 PASS AO=9;DP=10;FAO=11;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0282975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0442;QD=30.0096;RBI=0.032659;REFB=0.052827;REVB=0.0163053;RO=1;SAF=3;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0684198;STB=0.52936;TYPE=snp;VARB=-0.00201438;OID=.;OPOS=39203490;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:10:12:1:1:9:11:6:3:0:1:8:3:0:1 chr17 39203521 . GTGGTGTCTGAGGC G 93.33 PASS AO=12;DP=16;FAO=12;FDP=15;FR=.;FRO=3;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0128914;FXX=0.210416;HRUN=1;LEN=13;MLLD=276.831;QD=24.8871;RBI=0.0138707;REFB=-0.0479837;REVB=-0.00511921;RO=3;SAF=8;SAR=4;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127365;STB=0.571306;TYPE=del;VARB=0.00984;OID=.;OPOS=39203522;OREF=TGGTGTCTGAGGC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:12:18:12:15:3:8:4:1:2:10:3:8:4:1:2 chr17 39240504 . A G 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5854;QD=35.0874;RBI=0.025705;REFB=0;REVB=0.025705;RO=0;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00240734;OID=.;OPOS=39240504;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:7:0:0:0:7:0:0:0 chr17 39240511 . A T 73.38 PASS AO=7;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0673662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0979;QD=36.6882;RBI=0.0797995;REFB=0;REVB=0.0427756;RO=0;SAF=1;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00406247;OID=.;OPOS=39240511;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:7:8:6:1:0:0:7:1:0:0 chr17 39240795 . A T 34.36 PASS AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0169096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.626;QD=22.9052;RBI=0.177285;REFB=-0.046536;REVB=0.176477;RO=0;SAF=2;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.599598;TYPE=snp;VARB=0.0576553;OID=.;OPOS=39240795;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:6:6:0:1:5:5:3:2:0:0:3:2:1:0 chr17 39253815 . G A 127.39 PASS AO=11;DP=15;FAO=15;FDP=16;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0265621;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=68.346;QD=31.8482;RBI=0.0673283;REFB=-0.106864;REVB=0.0618672;RO=0;SAF=6;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.526281;TYPE=snp;VARB=0.00756171;OID=.;OPOS=39253815;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:12:16:0:1:11:15:5:6:0:0:6:9:1:0 chr17 39253835 . C T 147.59 PASS AO=14;DP=14;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0768548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.2297;QD=36.8972;RBI=0.0810647;REFB=0;REVB=0.0257842;RO=0;SAF=8;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00172233;OID=.;OPOS=39253835;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:14:16:0:0:14:16:6:8:0:0:6:10:0:0 chr17 39254335 . A AT 2071.58 PASS AO=263;DP=280;FAO=269;FDP=269;FR=.;FRO=0;FSAF=126;FSAR=143;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0626091;FXX=0.0323729;HRUN=1;LEN=1;MLLD=24.2511;QD=30.8042;RBI=0.0627288;REFB=0;REVB=0.00387406;RO=5;SAF=123;SAR=140;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0118555;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.000414309;OID=.;OPOS=39254336;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:263:280:269:269:0:126:143:0:0:99:5:123:140:4:1 chr17 39274518 . C T 1204.36 PASS AO=125;DP=125;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0255754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.404;QD=38.2336;RBI=0.0256364;REFB=0;REVB=-0.00176738;RO=0;SAF=77;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.68797e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.64407e-05;OID=.;OPOS=39274518;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:125:126:0:0:125:126:48:77:0:0:48:78:0:0 chr17 39296434 . G T 10.76 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=6;FR=.,HEALED;FRO=4;FSAF=1;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0945062;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=31.1122;QD=7.17052;RBI=0.209029;REFB=-0.0976863;REVB=-0.186445;RO=1;SAF=1;SAR=1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.25849;STB=0.665181;TYPE=snp;VARB=0.12522;OID=.;OPOS=39296434;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:6:6:1:4:2:2:1:1:1:0:1:1:1:3 chr17 39305956 . G A 273.37 PASS AO=32;DP=34;FAO=32;FDP=34;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0110641;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.996;QD=32.1615;RBI=0.0225703;REFB=-0.119914;REVB=0.0196724;RO=0;SAF=23;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02243e-08;STB=0.549968;TYPE=snp;VARB=0.00222787;OID=.;OPOS=39305956;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:34:34:0:2:32:32:9:23:0:0:9:23:0:2 chr17 39334456 . G A 713.25 PASS AO=77;DP=80;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0545789;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.1783;QD=35.2223;RBI=0.124765;REFB=-0.0676368;REVB=0.112194;RO=3;SAF=32;SAR=45;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0305085;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0122373;OID=.;OPOS=39334456;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:80:81:3:0:77:81:45:32:0:3:49:32:0:0 chr17 39340707 . C T 342.37 PASS AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0806495;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.909;QD=38.0413;RBI=0.0857572;REFB=0;REVB=-0.029154;RO=0;SAF=24;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000296868;OID=.;OPOS=39340707;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:36:36:0:0:36:36:12:24:0:0:12:24:0:0 chr17 39340812 . T C 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0474298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.835;QD=35.0875;RBI=0.0492758;REFB=0;REVB=-0.0133611;RO=0;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.27427e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00137326;OID=.;OPOS=39340812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:5:2:0:0:5:2:0:0 chr17 39341158 . G A 1062.28 PASS AO=108;DP=108;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.041987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.4394;QD=38.6283;RBI=0.0473214;REFB=0;REVB=-0.0218267;RO=0;SAF=49;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.62579e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000156607;OID=.;OPOS=39341158;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:108:110:0:0:108:110:59:49:0:0:60:50:0:0 chr17 39341266 . A G 705.34 PASS AO=80;DP=85;FAO=80;FDP=84;FR=.;FRO=4;FSAF=44;FSAR=36;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0101185;FXX=0.0117633;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.895;QD=33.5874;RBI=0.0153458;REFB=-0.0199293;REVB=-0.0115373;RO=4;SAF=44;SAR=36;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0182254;STB=0.509636;TYPE=snp;VARB=0.000436112;OID=.;OPOS=39341266;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:85:84:4:4:80:80:36:44:3:1:36:44:3:1 chr17 39341294 . T A 755.11 PASS AO=73;DP=74;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019781;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.712;QD=37.7556;RBI=0.0197826;REFB=0;REVB=0.00025067;RO=0;SAF=40;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.93225e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.51824e-05;OID=.;OPOS=39341294;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:74:80:0:0:73:80:33:40:0:0:37:43:0:0 chr17 39346139 . A G 67.19 PASS AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=0;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=20;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.7257;QD=7.46503;RBI=0.0313973;REFB=-0.000458593;REVB=0.0313973;RO=20;SAF=0;SAR=16;SRF=0;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00154406;OID=.;OPOS=39346139;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:36:36:20:20:16:16:16:0:0:20:16:0:0:20 chr17 39346518 . T C 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0310025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.422;QD=35.0875;RBI=0.0312747;REFB=0;REVB=-0.00411743;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000871016;OID=.;OPOS=39346518;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:3:4:0:0:3:4:0:0 chr17 39382942 . C A 110.76 PASS AO=18;DP=27;FAO=18;FDP=27;FR=.;FRO=9;FSAF=0;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.2047;QD=16.4091;RBI=0.0165099;REFB=-0.0263728;REVB=0.0165099;RO=9;SAF=0;SAR=18;SRF=0;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00431308;OID=.;OPOS=39382942;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:27:27:9:9:18:18:18:0:0:9:18:0:0:9 chr17 39383012 . C T 29.49 PASS AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=242.837;QD=11.7975;RBI=0.0227324;REFB=0.00297098;REVB=0.0227324;RO=5;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00188379;OID=.;OPOS=39383012;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:10:10:5:5:5:5:5:0:0:5:5:0:0:5 chr17 39383027 . G T 21.11 PASS AO=4;DP=10;FAO=4;FDP=10;FR=.;FRO=6;FSAF=0;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.0507;QD=8.44511;RBI=0.0113825;REFB=-0.0397277;REVB=-0.0113825;RO=5;SAF=0;SAR=4;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0535815;OID=.;OPOS=39383027;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:10:10:5:6:4:4:4:0:0:5:4:0:0:6 chr17 39383041 . C T 29.49 PASS AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=265.831;QD=11.7975;RBI=0.00238064;REFB=-0.0109958;REVB=-0.00238064;RO=5;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0157159;OID=.;OPOS=39383041;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:10:10:5:5:5:5:5:0:0:5:5:0:0:5 chr17 39383073 . G C 110.58 PASS AO=14;DP=16;FAO=14;FDP=16;FR=.;FRO=2;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00420832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.035;QD=27.6436;RBI=0.0586032;REFB=-0.00725289;REVB=0.0584519;RO=2;SAF=12;SAR=2;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.296967;STB=0.666388;TYPE=snp;VARB=0.00061892;OID=.;OPOS=39383073;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:16:16:2:2:14:14:2:12:0:2:2:12:0:2 chr17 39383335 . C G 174.54 PASS AO=19;DP=20;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.111107;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.7557;QD=33.2452;RBI=0.12342;REFB=-0.0877008;REVB=-0.0537371;RO=1;SAF=16;SAR=3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0279067;STB=0.514272;TYPE=snp;VARB=0.0119661;OID=.;OPOS=39383335;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:21:1:1:19:20:3:16:1:0:3:17:1:0 chr17 39388852 . T C 99.27 PASS AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7314;QD=39.7064;RBI=0.0182724;REFB=0;REVB=0.0182724;RO=0;SAF=0;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00120446;OID=.;OPOS=39388852;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:10:0:0:0:10:0:0:0 chr17 39394674 . A G 316.55 PASS AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0534106;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.839;QD=37.2412;RBI=0.0585557;REFB=0;REVB=0.0240014;RO=0;SAF=26;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000538914;OID=.;OPOS=39394674;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:34:0:0:34:34:8:26:0:0:8:26:0:0 chr17 39394729 . C A 73.83 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0788266;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0812;QD=36.9152;RBI=0.108956;REFB=0;REVB=-0.0752189;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000307118;OID=.;OPOS=39394729;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:5:3:0:0:5:3:0:0 chr17 39406291 . T C 39.09 PASS AO=21;DP=91;FAO=22;FDP=91;FR=.;FRO=69;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=36;FSRR=33;FWDB=-0.0043333;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.502;QD=1.7184;RBI=0.0324686;REFB=-0.00565413;REVB=0.0321781;RO=68;SAF=6;SAR=15;SRF=36;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.30868;STB=0.695469;TYPE=snp;VARB=0.0213697;OID=.;OPOS=39406291;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:91:91:68:69:21:22:15:6:36:32:16:6:36:33 chr17 39406299 . A G 47.84 PASS AO=25;DP=98;FAO=25;FDP=98;FR=.;FRO=73;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=36;FSRR=37;FWDB=-0.0132075;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.504;QD=1.95271;RBI=0.0207396;REFB=-0.00179114;REVB=0.0159905;RO=73;SAF=9;SAR=16;SRF=36;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167204;STB=0.601421;TYPE=snp;VARB=0.0103703;OID=.;OPOS=39406299;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:98:98:73:73:25:25:16:9:36:37:16:9:36:37 chr17 39406343 . A G 90.85 PASS AO=43;DP=151;FAO=43;FDP=151;FR=.;FRO=108;FSAF=14;FSAR=29;FSRF=52;FSRR=56;FWDB=-0.00816778;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.826;QD=2.40674;RBI=0.00939021;REFB=-0.00497383;REVB=0.00463284;RO=108;SAF=14;SAR=29;SRF=52;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197024;STB=0.616568;TYPE=snp;VARB=0.0109586;OID=.;OPOS=39406343;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:151:151:108:108:43:43:29:14:52:56:29:14:52:56 chr17 39406409 . C A 2169.91 PASS AO=240;DP=251;FAO=243;FDP=253;FR=.;FRO=10;FSAF=107;FSAR=136;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0134494;FXX=0.00393685;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.3633;QD=34.3069;RBI=0.0849673;REFB=-0.0958787;REVB=0.0838961;RO=9;SAF=106;SAR=134;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000193796;STB=0.502391;TYPE=snp;VARB=0.00401568;OID=.;OPOS=39406409;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:251:253:9:10:240:243:134:106:4:5:136:107:5:5 chr17 39406419 . T C 42.71 PASS AO=51;DP=274;FAO=51;FDP=275;FR=.;FRO=224;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=105;FSRR=119;FWDB=-0.019955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.418;QD=0.62121;RBI=0.0203465;REFB=0.000944191;REVB=0.00397256;RO=221;SAF=18;SAR=33;SRF=102;SRR=119;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144608;STB=0.597312;TYPE=snp;VARB=-0.0174861;OID=.;OPOS=39406419;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:274:275:221:224:51:51:33:18:102:119:33:18:105:119 chr17 39406427 . T C 28.81 PASS AO=48;DP=291;FAO=48;FDP=291;FR=.;FRO=243;FSAF=16;FSAR=32;FSRF=115;FSRR=128;FWDB=0.00644404;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=260.007;QD=0.395951;RBI=0.0101382;REFB=-0.00240724;REVB=-0.00782671;RO=242;SAF=16;SAR=32;SRF=115;SRR=127;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188396;STB=0.620802;TYPE=snp;VARB=0.0139672;OID=.;OPOS=39406427;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:291:291:242:243:48:48:32:16:115:127:32:16:115:128 chr17 39406447 . A G 1682.74 PASS AO=236;DP=295;FAO=236;FDP=294;FR=.;FRO=58;FSAF=119;FSAR=117;FSRF=20;FSRR=38;FWDB=0.0238035;FXX=0.00338972;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.222;QD=22.8944;RBI=0.0332077;REFB=-0.00735959;REVB=-0.0231548;RO=58;SAF=119;SAR=117;SRF=20;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0593144;STB=0.531431;TYPE=snp;VARB=0.0016638;OID=.;OPOS=39406447;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:295:294:58:58:236:236:117:119:20:38:117:119:20:38 chr17 39406461 . C A 17.79 PASS AO=42;DP=279;FAO=42;FDP=285;FR=.;FRO=243;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=129;FSRR=114;FWDB=-0.0550064;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.149;QD=0.24973;RBI=0.065129;REFB=-0.00268046;REVB=0.0348722;RO=237;SAF=14;SAR=28;SRF=123;SRR=114;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.239781;STB=0.668144;TYPE=snp;VARB=0.017999;OID=.;OPOS=39406461;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:279:285:237:243:42:42:28:14:123:114:28:14:129:114 chr17 39406567 . C A 2336.56 PASS AO=244;DP=244;FAO=244;FDP=244;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=161;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0278428;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.553;QD=38.3043;RBI=0.0385602;REFB=0;REVB=0.0266772;RO=0;SAF=83;SAR=161;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.34804e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.8015e-05;OID=.;OPOS=39406567;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:244:244:0:0:244:244:161:83:0:0:161:83:0:0 chr17 39406589 . A G 2492.65 PASS AO=253;DP=259;FAO=263;FDP=263;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=178;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00271171;FXX=0.0149807;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.508;QD=37.9111;RBI=0.0124506;REFB=-0.0843638;REVB=-0.0121517;RO=2;SAF=85;SAR=168;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0110823;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.18918e-05;OID=.;OPOS=39406589;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:259:263:2:0:253:263:168:85:2:0:178:85:0:0 chr17 39412372 . G C 1817.96 PASS AO=187;DP=187;FAO=189;FDP=189;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=134;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0277916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.4832;QD=38.4754;RBI=0.0281581;REFB=0;REVB=-0.00452833;RO=0;SAF=55;SAR=132;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.82578e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.43344e-05;OID=.;OPOS=39412372;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:187:189:0:0:187:189:132:55:0:0:134:55:0:0 chr17 39421781 . A G 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.984;QD=33.022;RBI=0.0465699;REFB=0;REVB=-0.0465699;RO=0;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00184407;OID=.;OPOS=39421781;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:6:0:0:0:6:0:0:0 chr17 39432562 . A T 1056.07 PASS AO=111;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00311499;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=176.595;QD=38.0567;RBI=0.00730725;REFB=0;REVB=-0.00661005;RO=0;SAF=50;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.91616e-06;OID=.;OPOS=39432562;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:111:111:0:0:111:111:61:50:0:0:61:50:0:0 chr17 39458765 . A G 497.84 PASS AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0365172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.31;QD=37.573;RBI=0.0368578;REFB=0;REVB=0.00499913;RO=0;SAF=35;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000205795;OID=.;OPOS=39458765;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:53:53:0:0:53:53:18:35:0:0:18:35:0:0 chr17 39535859 . A G 349.64 PASS AO=99;DP=234;FAO=99;FDP=233;FR=.;FRO=134;FSAF=57;FSAR=42;FSRF=77;FSRR=57;FWDB=0.00225621;FXX=0.00427332;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.689;QD=6.00238;RBI=0.0062644;REFB=-0.000963583;REVB=0.00584399;RO=132;SAF=57;SAR=42;SRF=75;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00794049;STB=0.500665;TYPE=snp;VARB=0.00116407;OID=.;OPOS=39535859;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:234:233:132:134:99:99:42:57:75:57:42:57:77:57 chr17 39580559 . T A 239.55 PASS AO=43;DP=70;FAO=43;FDP=70;FR=.;FRO=27;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=0.00512436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.899;QD=13.6886;RBI=0.0077879;REFB=-0.00537342;REVB=0.00586449;RO=27;SAF=16;SAR=27;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00130184;STB=0.500711;TYPE=snp;VARB=0.00235049;OID=.;OPOS=39580559;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:70:70:27:27:43:43:27:16:10:17:27:16:10:17 chr17 39580562 . T C 149.01 PASS AO=33;DP=66;FAO=33;FDP=66;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=9;FSRR=24;FWDB=0.00983937;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.058;QD=9.03081;RBI=0.0194184;REFB=-0.00321142;REVB=0.0167409;RO=29;SAF=16;SAR=17;SRF=6;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.238182;STB=0.606784;TYPE=snp;VARB=0.00453873;OID=.;OPOS=39580562;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:29:33:33:33:17:16:6:23:17:16:9:24 chr17 39580660 . T C 79.92 PASS AO=20;DP=46;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=0.0147262;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.478;QD=6.9492;RBI=0.0149755;REFB=-0.00267723;REVB=-0.002721;RO=26;SAF=14;SAR=6;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00900469;STB=0.505149;TYPE=snp;VARB=0.00413506;OID=.;OPOS=39580660;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:46:46:26:26:20:20:6:14:18:8:6:14:18:8 chr17 39580739 . C A 114.27 PASS AO=31;DP=72;FAO=31;FDP=74;FR=.;FRO=43;FSAF=29;FSAR=2;FSRF=41;FSRR=2;FWDB=0.00340081;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.673;QD=6.17694;RBI=0.0205953;REFB=-0.00718427;REVB=0.0203125;RO=41;SAF=29;SAR=2;SRF=39;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0707167;STB=0.546847;TYPE=snp;VARB=0.00949235;OID=.;OPOS=39580739;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:74:41:43:31:31:2:29:39:2:2:29:41:2 chr17 39593768 . A G 445.21 PASS AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00235242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.598;QD=37.8901;RBI=0.0619894;REFB=0;REVB=0.0619448;RO=0;SAF=26;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00103589;OID=.;OPOS=39593768;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:46:47:0:0:46:47:20:26:0:0:20:27:0:0 chr17 39594809 . C T 196.18 PASS AO=49;DP=106;FAO=49;FDP=106;FR=.;FRO=57;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=22;FSRR=35;FWDB=-0.0225248;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.095;QD=7.40298;RBI=0.0268529;REFB=-0.0427384;REVB=0.0146189;RO=56;SAF=22;SAR=27;SRF=22;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0546966;STB=0.534469;TYPE=snp;VARB=0.0504444;OID=.;OPOS=39594809;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:56:57:49:49:27:22:22:34:27:22:22:35 chr17 39616430 . G T 298.29 PASS AO=35;DP=38;FAO=35;FDP=38;FR=.;FRO=3;FSAF=31;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0988062;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=53.6949;QD=31.3984;RBI=0.138632;REFB=0.0286869;REVB=0.0972428;RO=2;SAF=31;SAR=4;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185169;STB=0.592297;TYPE=snp;VARB=0.00181936;OID=.;OPOS=39616430;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:38:38:2:3:35:35:4:31:0:2:4:31:1:2 chr17 39619093 . G A 19.11 PASS AO=7;DP=28;FAO=7;FDP=28;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0164855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.381;QD=2.72982;RBI=0.0380128;REFB=-0.000137637;REVB=0.034252;RO=21;SAF=3;SAR=4;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110511;STB=0.571225;TYPE=snp;VARB=0.00646618;OID=.;OPOS=39619093;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:28:28:21:21:7:7:4:3:11:10:4:3:11:10 chr17 39619094 . T C 19.11 PASS AO=7;DP=28;FAO=7;FDP=28;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.0333904;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.185;QD=2.72983;RBI=0.0437082;REFB=-0.00557441;REVB=0.0282044;RO=21;SAF=3;SAR=4;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110511;STB=0.571225;TYPE=snp;VARB=0.0258192;OID=.;OPOS=39619094;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:28:28:21:21:7:7:4:3:11:10:4:3:11:10 chr17 39619115 . G A 29.1 PASS AO=11;DP=39;FAO=11;FDP=40;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.0314977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.963;QD=2.90978;RBI=0.0359547;REFB=-0.00718858;REVB=0.0173388;RO=28;SAF=6;SAR=5;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114211;STB=0.520511;TYPE=snp;VARB=0.0130478;OID=.;OPOS=39619115;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:39:40:28:29:11:11:5:6:15:13:5:6:15:14 chr17 39619219 . G A 145.27 PASS AO=41;DP=99;FAO=41;FDP=100;FR=.;FRO=59;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=36;FWDB=-0.040252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.221;QD=5.81082;RBI=0.0420138;REFB=-0.0185529;REVB=-0.0120391;RO=58;SAF=17;SAR=24;SRF=23;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0194023;STB=0.515144;TYPE=snp;VARB=0.0233222;OID=.;OPOS=39619219;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:100:58:59:41:41:24:17:23:35:24:17:23:36 chr17 39620399 . C T 207.32 PASS AO=54;DP=136;FAO=59;FDP=140;FR=.;FRO=81;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=36;FSRR=45;FWDB=0.0278266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7952;QD=5.92336;RBI=0.0334971;REFB=-0.0123109;REVB=0.0186476;RO=81;SAF=30;SAR=24;SRF=36;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117875;STB=0.576245;TYPE=snp;VARB=0.0138976;OID=.;OPOS=39620399;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:140:81:81:54:59:24:30:36:45:25:34:36:45 chr17 39620565 . C T 86.87 PASS AO=25;DP=65;FAO=25;FDP=65;FR=.;FRO=40;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=0.0494591;FXX=0.0298463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.986;QD=5.34583;RBI=0.0555654;REFB=-0.00357362;REVB=-0.0253241;RO=40;SAF=8;SAR=17;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149208;STB=0.586136;TYPE=snp;VARB=0.00417926;OID=.;OPOS=39620565;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:65:65:40:40:25:25:17:8:18:22:17:8:18:22 chr17 39622068 . G T 279.06 PASS AO=63;DP=127;FAO=64;FDP=127;FR=.;FRO=63;FSAF=27;FSAR=37;FSRF=21;FSRR=42;FWDB=-0.0066738;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=98.341;QD=8.78931;RBI=0.0100804;REFB=0.0077708;REVB=0.00755485;RO=63;SAF=27;SAR=36;SRF=21;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0895145;STB=0.54565;TYPE=snp;VARB=-0.00838666;OID=.;OPOS=39622068;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:63:63:63:64:36:27:21:42:37:27:21:42 chr17 39623363 . T C 97.3 PASS AO=20;DP=39;FAO=20;FDP=39;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0207514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.874;QD=9.97975;RBI=0.0314776;REFB=-0.0343496;REVB=0.023669;RO=18;SAF=12;SAR=8;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0858625;STB=0.562437;TYPE=snp;VARB=0.0299446;OID=.;OPOS=39623363;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:39:39:18:19:20:20:8:12:9:9:8:12:9:10 chr17 39624240 . G C 184.45 PASS AO=53;DP=129;FAO=53;FDP=129;FR=.;FRO=76;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=38;FSRR=38;FWDB=0.00281357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.104;QD=5.71949;RBI=0.0640714;REFB=-0.00648337;REVB=-0.0640096;RO=75;SAF=24;SAR=29;SRF=38;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0562255;STB=0.527881;TYPE=snp;VARB=0.00795007;OID=.;OPOS=39624240;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:75:76:53:53:29:24:38:37:29:24:38:38 chr17 39624326 . G C 180.71 PASS AO=54;DP=136;FAO=54;FDP=135;FR=.;FRO=81;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=33;FSRR=48;FWDB=0.00553063;FXX=0.0073524;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.177;QD=5.35439;RBI=0.0118456;REFB=-0.012907;REVB=-0.0104753;RO=81;SAF=28;SAR=26;SRF=33;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117878;STB=0.566405;TYPE=snp;VARB=0.0178329;OID=.;OPOS=39624326;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:135:81:81:54:54:26:28:33:48:26:28:33:48 chr17 39633349 . G C 41.14 PASS AO=11;DP=31;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=0.0227117;FXX=0.0322477;HRUN=5;LEN=1;MLLD=146.831;QD=5.48598;RBI=0.0326834;REFB=-0.0132636;REVB=-0.0235029;RO=19;SAF=3;SAR=8;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.469569;STB=0.776676;TYPE=snp;VARB=0.023957;OID=.;OPOS=39633349;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:31:30:19:19:11:11:8:3:14:5:8:3:14:5 chr17 39634625 . A G 32.15 PASS AO=7;DP=26;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.00975266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.088;QD=4.43488;RBI=0.0417622;REFB=-0.044626;REVB=-0.0406075;RO=14;SAF=2;SAR=5;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0885977;STB=0.517207;TYPE=snp;VARB=0.0746737;OID=.;OPOS=39634625;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:26:29:14:19:7:10:5:2:5:9:5:5:10:9 chr17 39637244 . A G 109.17 PASS AO=25;DP=54;FAO=26;FDP=55;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.00809362;FXX=0.0350816;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.766;QD=7.93983;RBI=0.0151192;REFB=-0.0341313;REVB=0.0127704;RO=29;SAF=17;SAR=8;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228641;STB=0.611423;TYPE=snp;VARB=0.0515424;OID=.;OPOS=39637244;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:55:29:29:25:26:8:17:13:16:9:17:13:16 chr17 39643646 . G A 51.09 PASS AO=7;DP=10;FAO=7;FDP=10;FR=.;FRO=3;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.00579829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.443;QD=20.4378;RBI=0.0740383;REFB=-0.043842;REVB=0.073811;RO=2;SAF=6;SAR=1;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125389;STB=0.599755;TYPE=snp;VARB=0.0136863;OID=.;OPOS=39643646;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:10:10:2:3:7:7:1:6:2:0:1:6:3:0 chr17 39646021 . A G 145.17 PASS AO=28;DP=50;FAO=28;FDP=50;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.0108809;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.628;QD=11.6138;RBI=0.0121384;REFB=-0.0258777;REVB=-0.00538015;RO=20;SAF=14;SAR=14;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113153;STB=0.559958;TYPE=snp;VARB=0.0162251;OID=.;OPOS=39646021;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:50:50:20:22:28:28:14:14:7:13:14:14:8:14 chr17 39659194 . T C 331.72 PASS AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0390071;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.419;QD=37.9108;RBI=0.0433535;REFB=0;REVB=0.0189203;RO=0;SAF=22;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.39865e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.19812e-05;OID=.;OPOS=39659194;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:36:35:0:0:35:35:13:22:0:0:13:22:0:0 chr17 39659913 . G A 1728.69 PASS AO=181;DP=182;FAO=181;FDP=181;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0119543;FXX=0.0054942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4427;QD=38.2031;RBI=0.0156413;REFB=0;REVB=0.0100869;RO=0;SAF=95;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.70949e-06;OID=.;OPOS=39659913;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:82:182:181:0:0:181:181:86:95:0:0:86:95:0:0 chr17 39661689 . G A 135.59 PASS AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0311387;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.517;QD=36.157;RBI=0.0318622;REFB=0;REVB=-0.00675133;RO=0;SAF=1;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.28053e-05;OID=.;OPOS=39661689;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:15:0:0:15:15:14:1:0:0:14:1:0:0 chr17 39670912 . G C 914.57 PASS AO=102;DP=104;FAO=101;FDP=104;FR=.;FRO=3;FSAF=17;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.124786;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.651;QD=35.1756;RBI=0.125214;REFB=-0.0731217;REVB=-0.0103449;RO=1;SAF=17;SAR=85;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0055502;STB=0.50877;TYPE=snp;VARB=0.00644692;OID=.;OPOS=39670912;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:104:104:1:3:102:101:85:17:0:1:84:17:0:3 chr17 39671724 . T C 102.86 PASS AO=22;DP=46;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.0343007;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.428;QD=8.75374;RBI=0.0476584;REFB=-0.00148055;REVB=0.0330875;RO=24;SAF=11;SAR=11;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115537;STB=0.574522;TYPE=snp;VARB=0.000898119;OID=.;OPOS=39671724;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:47:24:24:22:23:11:11:9:15:11:12:9:15 chr17 39674641 . T C 256.18 PASS AO=84;DP=220;FAO=84;FDP=221;FR=.;FRO=137;FSAF=42;FSAR=42;FSRF=70;FSRR=67;FWDB=0.00284837;FXX=0.00896821;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.216;QD=4.6367;RBI=0.0212;REFB=0.0028956;REVB=0.0210078;RO=132;SAF=42;SAR=42;SRF=65;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00821852;STB=0.506786;TYPE=snp;VARB=-0.00437924;OID=.;OPOS=39674641;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:220:221:132:137:84:84:42:42:65:67:42:42:70:67 chr17 39681475 . A G 169.43 PASS AO=38;DP=77;FAO=38;FDP=76;FR=.;FRO=38;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=0.0841515;FXX=0.0256377;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.025;QD=8.91726;RBI=0.0982969;REFB=-0.0368851;REVB=0.0508015;RO=38;SAF=13;SAR=25;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195354;STB=0.608824;TYPE=snp;VARB=0.0199257;OID=.;OPOS=39681475;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:76:38:38:38:38:25:13:21:17:25:13:21:17 chr17 39723990 . T A 519.79 PASS AO=54;DP=54;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0426886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.9032;QD=37.8031;RBI=0.0603015;REFB=0;REVB=-0.0425905;RO=0;SAF=4;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.4218e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.27813e-06;OID=.;OPOS=39723990;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:54:55:0:0:54:55:50:4:0:0:51:4:0:0 chr17 39727816 . T G 752.94 PASS AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.063079;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.9469;QD=38.6123;RBI=0.0657043;REFB=0;REVB=0.0183872;RO=0;SAF=30;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000545389;OID=.;OPOS=39727816;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:78:78:0:0:78:78:48:30:0:0:48:30:0:0 chr17 39728050 . G A 366.48 PASS AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.751;QD=38.5766;RBI=0.0402685;REFB=0;REVB=0.0402685;RO=0;SAF=0;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0011821;OID=.;OPOS=39728050;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:39:38:0:0:38:38:38:0:0:0:38:0:0:0 chr17 39742718 . A G 776.91 PASS AO=81;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0575999;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.942;QD=37.8982;RBI=0.0576337;REFB=0;REVB=-0.00197383;RO=0;SAF=17;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.10482e-05;OID=.;OPOS=39742718;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:82:82:0:0:81:82:64:17:0:0:65:17:0:0 chr17 39742893 . AG A,AA 64.99 PASS AO=3,4;DP=8;FAO=1,7;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=0,3;FSAR=1,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0252761,0.0231729;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=203.77,218.997;QD=32.4971;RBI=0.0258429,0.023891;REFB=0,0;REVB=0.00538261,0.00581377;RO=0;SAF=3,0;SAR=0,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.0160576,0.00104126;OID=.,.;OPOS=39742894,39742894;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:3,4:8:1,7:8:0:0,3:1,4:0:0:4:0:3,0:0,4:0:0 chr17 39742898 . G A 73.84 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0132786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.143;QD=36.9185;RBI=0.0472792;REFB=0;REVB=0.0453762;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000642055;OID=.;OPOS=39742898;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:5:3:0:0:5:3:0:0 chr17 39742899 . C T 71.47 PASS AO=7;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0278313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=40.6891;QD=35.7333;RBI=0.14317;REFB=0;REVB=0.140439;RO=1;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0971198;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0134201;OID=.;OPOS=39742899;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:1:0:7:8:4:3:0:1:5:3:0:0 chr17 39743081 . G A 195.71 PASS AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000776472;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.293;QD=39.1418;RBI=0.0184209;REFB=0;REVB=0.0184045;RO=0;SAF=14;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5931e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000158652;OID=.;OPOS=39743081;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:20:20:0:0:20:20:6:14:0:0:6:14:0:0 chr17 39766504 . A G 73.81 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.190725;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=39.6304;QD=36.9037;RBI=0.190725;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=8;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0149162;OID=.;OPOS=39766504;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:0:8:0:0:0:8:0:0 chr17 39767744 . A G 201.64 PASS AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.7159;QD=36.6616;RBI=0.0235348;REFB=0;REVB=0.0150768;RO=0;SAF=8;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0005892;OID=.;OPOS=39767744;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:22:22:0:0:22:22:14:8:0:0:14:8:0:0 chr17 39777114 . GC G 54.56 PASS AO=31;DP=58;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=22;FSAR=4;FSRF=19;FSRR=8;FWDB=-0.0771217;FXX=0.036357;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.4734;QD=4.11744;RBI=0.14628;REFB=-0.182428;REVB=-0.124299;RO=20;SAF=24;SAR=7;SRF=15;SRR=5;SSEN=0.335196;SSEP=0;SSSB=0.0242643;STB=0.616721;TYPE=del;VARB=0.160858;OID=.;OPOS=39777115;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:31:55:26:53:27:22:4:19:8:53:20:24:7:15:5 chr17 39795650 . A G 129.8 PASS AO=30;DP=64;FAO=31;FDP=66;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=-0.00121931;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.92;QD=7.86644;RBI=0.0078771;REFB=-0.0138475;REVB=-0.00778216;RO=34;SAF=14;SAR=16;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0806824;STB=0.544623;TYPE=snp;VARB=0.0154036;OID=.;OPOS=39795650;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:66:34:35:30:31:16:14:13:21:16:15:14:21 chr17 39871700 . G A 229.3 PASS AO=51;DP=103;FAO=52;FDP=103;FR=.;FRO=51;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=0.0205755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.6786;QD=8.90485;RBI=0.037782;REFB=-0.0228119;REVB=0.031688;RO=51;SAF=21;SAR=30;SRF=24;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0542357;STB=0.523909;TYPE=snp;VARB=0.0200708;OID=.;OPOS=39871700;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:51:51:51:52:30:21:24:27:30:22:24:27 chr17 39874267 . T A 362.39 PASS AO=98;DP=221;FAO=98;FDP=222;FR=.;FRO=124;FSAF=51;FSAR=47;FSRF=53;FSRR=71;FWDB=-0.020372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.84;QD=6.52961;RBI=0.0208587;REFB=0.00100536;REVB=0.00447965;RO=122;SAF=51;SAR=47;SRF=51;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102035;STB=0.551796;TYPE=snp;VARB=-0.0013745;OID=.;OPOS=39874267;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:222:122:124:98:98:47:51:51:71:47:51:53:71 chr17 39874283 . T A 366.92 PASS AO=99;DP=220;FAO=98;FDP=220;FR=.;FRO=122;FSAF=52;FSAR=46;FSRF=44;FSRR=78;FWDB=0.0286059;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5904;QD=6.67134;RBI=0.0558935;REFB=0.00341147;REVB=0.0480186;RO=121;SAF=53;SAR=46;SRF=43;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177319;STB=0.593501;TYPE=snp;VARB=-0.00514726;OID=.;OPOS=39874283;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:220:220:121:122:99:98:46:53:43:78:46:52:44:78 chr17 39879729 . CAGA C 18.73 PASS AO=7;DP=43;FAO=9;FDP=40;FR=.;FRO=31;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=23;FSRR=8;FWDB=-0.0199937;FXX=0.0476077;HRUN=1;LEN=3;MLLD=251.43;QD=1.87293;RBI=0.0371655;REFB=0.000567523;REVB=-0.0313292;RO=30;SAF=4;SAR=3;SRF=23;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.261075;STB=0.650867;TYPE=del;VARB=-0.00411645;OID=.;OPOS=39879730;OREF=AGA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:7:40:9:40:31:5:4:23:8:18:30:4:3:23:7 chr17 39880340 . A C 58.08 PASS AO=18;DP=52;FAO=18;FDP=52;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=25;FSRR=9;FWDB=-0.00962958;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=248.867;QD=4.46804;RBI=0.0137944;REFB=-0.00835462;REVB=-0.00987707;RO=34;SAF=12;SAR=6;SRF=25;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0894567;STB=0.552183;TYPE=snp;VARB=0.0175113;OID=.;OPOS=39880340;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:52:52:34:34:18:18:6:12:25:9:6:12:25:9 chr17 39880545 . C T 219.19 PASS AO=34;DP=47;FAO=34;FDP=48;FR=.;FRO=14;FSAF=1;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=13;FWDB=0.023558;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=112.658;QD=18.2658;RBI=0.0235638;REFB=-0.0408391;REVB=0.000522711;RO=13;SAF=1;SAR=33;SRF=1;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171807;STB=0.589224;TYPE=snp;VARB=0.0187255;OID=.;OPOS=39880545;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:47:48:13:14:34:34:33:1:1:12:33:1:1:13 chr17 39880573 . G A 175.2 PASS AO=29;DP=43;FAO=29;FDP=43;FR=.;FRO=14;FSAF=0;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=14;FWDB=0.0598862;FXX=0.0652032;HRUN=3;LEN=1;MLLD=201.261;QD=16.2972;RBI=0.0599752;REFB=-0.027836;REVB=0.00326611;RO=13;SAF=0;SAR=29;SRF=0;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0108681;OID=.;OPOS=39880573;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:43:43:13:14:29:29:29:0:0:13:29:0:0:14 chr17 39881289 . G C 210.25 PASS AO=38;DP=68;FAO=41;FDP=70;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=33;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=0.011639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5813;QD=12.0145;RBI=0.0311287;REFB=-0.0273702;REVB=-0.0288709;RO=27;SAF=7;SAR=31;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199505;STB=0.60574;TYPE=snp;VARB=0.0300975;OID=.;OPOS=39881289;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:70:27:29:38:41:31:7:10:17:33:8:11:18 chr17 39883595 . T C 48.53 PASS AO=12;DP=43;FAO=14;FDP=43;FR=.,HEALED;FRO=28;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=21;FWDB=-0.0264254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.433;QD=4.514;RBI=0.0382051;REFB=-0.022669;REVB=-0.0275921;RO=20;SAF=4;SAR=8;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0402508;STB=0.581287;TYPE=snp;VARB=0.0274268;OID=.;OPOS=39883595;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:43:43:20:28:12:14:8:4:6:14:9:5:7:21 chr17 39883672 . G A 65.53 PASS AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.0192603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.399;QD=7.94302;RBI=0.0206505;REFB=-0.0176302;REVB=-0.00744866;RO=17;SAF=6;SAR=9;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121036;STB=0.585251;TYPE=snp;VARB=0.0256217;OID=.;OPOS=39883672;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:33:33:17:18:15:15:9:6:9:8:9:6:10:8 chr17 39888648 . TG T 27.75 PASS AO=13;DP=39;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.0764123;FXX=0.103413;HRUN=7;LEN=1;MLLD=6.03143;QD=4.26852;RBI=0.147692;REFB=-0.157418;REVB=0.126389;RO=10;SAF=11;SAR=2;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.355333;STB=0.709302;TYPE=del;VARB=0.168355;OID=.;OPOS=39888649;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:13:29:13:26:13:11:2:7:6:13:10:11:2:5:5 chr17 39912145 . T A 71.08 PASS AO=14;DP=31;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.0318205;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.0789;QD=9.17127;RBI=0.0369477;REFB=-0.0209492;REVB=-0.0187773;RO=16;SAF=7;SAR=7;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233471;STB=0.580682;TYPE=snp;VARB=0.0151946;OID=.;OPOS=39912145;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:31:31:16:16:14:15:7:7:12:4:7:8:11:5 chr17 39925925 . A G 51.09 PASS AO=14;DP=41;FAO=15;FDP=43;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=0.0594368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.4766;QD=4.75221;RBI=0.061716;REFB=-0.0191528;REVB=-0.0166171;RO=26;SAF=9;SAR=5;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160666;STB=0.565949;TYPE=snp;VARB=0.0464347;OID=.;OPOS=39925925;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:41:43:26:28:14:15:5:9:13:13:6:9:14:14 chr17 39959189 . C G 486.34 PASS AO=40;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=30;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00875751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.071;QD=38.9068;RBI=0.012128;REFB=0;REVB=0.00839009;RO=0;SAF=22;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19993e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000411801;OID=.;OPOS=39959189;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:50:50:0:0:40:50:18:22:0:0:20:30:0:0 chr17 39967442 . T C 410.93 PASS AO=42;DP=42;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000192574;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.883;QD=37.3577;RBI=0.0125479;REFB=0;REVB=0.0125464;RO=0;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000162828;OID=.;OPOS=39967442;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:42:44:0:0:42:44:21:21:0:0:23:21:0:0 chr17 39977232 . CG C,TC 115.36 PASS AO=11,3;DP=19;FAO=15,3;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=9,3;FSAR=6,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.359912,0.267889;FXX=0;HRUN=4,1;LEN=1,2;MLLD=12.7463,18.6521;QD=25.636;RBI=0.388889,0.304535;REFB=-0.0376826,-0.0283582;REVB=0.147303,0.144833;RO=4;SAF=5,3;SAR=6,0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0.451613,0;SSSB=-0.254731,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,mnp;VARB=0.0871492,-0.0155901;OID=.,.;OPOS=39977233,39977232;OREF=G,CG;OALT=-,TC;OMAPALT=C,TC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:6:18:18:4:0:11,3:15,3:6,0:5,3:4:0:6,0:9,3:0:0 chr17 39983808 . G C 423.7 PASS AO=103;DP=237;FAO=111;FDP=245;FR=.;FRO=134;FSAF=57;FSAR=54;FSRF=65;FSRR=69;FWDB=0.0247367;FXX=0.0120963;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1793;QD=6.91762;RBI=0.0428063;REFB=-0.00327734;REVB=-0.0349353;RO=131;SAF=53;SAR=50;SRF=65;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0185236;STB=0.51555;TYPE=snp;VARB=0.00334457;OID=.;OPOS=39983808;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:237:245:131:134:103:111:50:53:65:66:54:57:65:69 chr17 39983820 . G A 399.28 PASS AO=100;DP=231;FAO=107;FDP=239;FR=.;FRO=132;FSAF=51;FSAR=56;FSRF=61;FSRR=71;FWDB=0.0226804;FXX=0.00416649;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.982;QD=6.68251;RBI=0.0228096;REFB=-0.0116965;REVB=-0.00242437;RO=129;SAF=49;SAR=51;SRF=61;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0173677;STB=0.508038;TYPE=snp;VARB=0.0168213;OID=.;OPOS=39983820;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:231:239:129:132:100:107:51:49:61:68:56:51:61:71 chr17 39983849 . G C 319.3 PASS AO=79;DP=183;FAO=86;FDP=196;FR=.;FRO=110;FSAF=35;FSAR=51;FSRF=54;FSRR=56;FWDB=-0.0353793;FXX=0.0101005;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.605;QD=6.51624;RBI=0.0393499;REFB=-0.0189086;REVB=-0.0172254;RO=102;SAF=31;SAR=48;SRF=48;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0811919;STB=0.547912;TYPE=snp;VARB=0.0217892;OID=.;OPOS=39983849;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:196:102:110:79:86:48:31:48:54:51:35:54:56 chr17 39987130 . T C 1378.35 PASS AO=144;DP=146;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.109742;FXX=0.0136977;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.1981;QD=38.2876;RBI=0.112454;REFB=0;REVB=0.0245486;RO=0;SAF=59;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.20183e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000284843;OID=.;OPOS=39987130;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:146:144:0:0:144:144:85:59:0:0:85:59:0:0 chr17 39991867 . A ATATC 208.82 PASS AO=54;DP=158;FAO=57;FDP=134;FR=.;FRO=77;FSAF=22;FSAR=35;FSRF=43;FSRR=34;FWDB=0.00175581;FXX=0.124175;HRUN=0;LEN=4;MLLD=250.078;QD=6.23357;RBI=0.00175866;REFB=-0.0105518;REVB=-0.000100031;RO=82;SAF=20;SAR=34;SRF=48;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229518;STB=0.599754;TYPE=ins;VARB=0.0120443;OID=.;OPOS=39991868;OREF=-;OALT=TATC;OMAPALT=ATATC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:54:158:57:134:77:22:35:43:34:99:82:20:34:48:34 chr17 39998141 . C T 445.56 PASS AO=94;DP=172;FAO=94;FDP=172;FR=.;FRO=78;FSAF=30;FSAR=64;FSRF=32;FSRR=46;FWDB=0.0325647;FXX=0.00578001;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.763;QD=10.3618;RBI=0.0345187;REFB=-0.00635699;REVB=0.0114491;RO=75;SAF=30;SAR=64;SRF=31;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0850556;STB=0.545945;TYPE=snp;VARB=0.00569692;OID=.;OPOS=39998141;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:172:75:78:94:94:64:30:31:44:64:30:32:46 chr17 40001659 . T C 583.75 PASS AO=129;DP=244;FAO=129;FDP=244;FR=.;FRO=115;FSAF=79;FSAR=50;FSRF=54;FSRR=61;FWDB=-0.0492404;FXX=0.00408147;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.6661;QD=9.56971;RBI=0.0502196;REFB=0.00211478;REVB=-0.00986863;RO=115;SAF=80;SAR=49;SRF=54;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132936;STB=0.568703;TYPE=snp;VARB=-0.00176321;OID=.;OPOS=40001659;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:244:115:115:129:129:49:80:54:61:50:79:54:61 chr17 40010979 . G A 255.07 PASS AO=59;DP=144;FAO=69;FDP=154;FR=.;FRO=85;FSAF=36;FSAR=33;FSRF=43;FSRR=42;FWDB=-0.00213265;FXX=0.0128197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.311;QD=6.62529;RBI=0.0106051;REFB=-0.0141244;REVB=0.0103884;RO=80;SAF=31;SAR=28;SRF=41;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0132951;STB=0.508759;TYPE=snp;VARB=0.0203834;OID=.;OPOS=40010979;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:154:80:85:59:69:28:31:41:39:33:36:43:42 chr17 40048613 . A G 1789.21 PASS AO=182;DP=182;FAO=187;FDP=187;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0152165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.967;QD=38.2718;RBI=0.0156756;REFB=0;REVB=0.00376601;RO=0;SAF=68;SAR=114;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.43078e-05;OID=.;OPOS=40048613;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:182:187:0:0:182:187:114:68:0:0:119:68:0:0 chr17 40052842 . G A 77.25 PASS AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=17;FSAR=1;FSRF=16;FSRR=6;FWDB=0.00748161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.377;QD=7.72462;RBI=0.0346127;REFB=-0.00269612;REVB=-0.0337944;RO=22;SAF=17;SAR=1;SRF=16;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.472187;STB=0.782464;TYPE=snp;VARB=0.00198945;OID=.;OPOS=40052842;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:40:40:22:22:18:18:1:17:16:6:1:17:16:6 chr17 40065774 . T G 209.4 PASS AO=47;DP=95;FAO=48;FDP=95;FR=.;FRO=47;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=0.0252886;FXX=0.0104156;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.9987;QD=8.81665;RBI=0.0317938;REFB=-0.00261249;REVB=0.0192699;RO=47;SAF=29;SAR=18;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0794716;STB=0.536779;TYPE=snp;VARB=0.0015171;OID=.;OPOS=40065774;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:47:47:47:48:18:29:25:22:19:29:25:22 chr17 40094835 . C T 379.55 PASS AO=72;DP=124;FAO=73;FDP=123;FR=.;FRO=50;FSAF=45;FSAR=28;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=0.0216431;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.807;QD=12.3431;RBI=0.0241411;REFB=-0.00249454;REVB=0.0106944;RO=48;SAF=45;SAR=27;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110881;STB=0.557068;TYPE=snp;VARB=0.00150062;OID=.;OPOS=40094835;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:123:48:50:72:73:27:45:23:25:28:45:24:26 chr17 40120771 . T G 14.27 PASS AO=4;DP=24;FAO=6;FDP=26;FR=.;FRO=20;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.00322892;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.4294;QD=2.19596;RBI=0.0751894;REFB=-0.00421426;REVB=0.07512;RO=20;SAF=2;SAR=2;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.631132;TYPE=snp;VARB=0.0609972;OID=.;OPOS=40120771;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:24:26:20:20:4:6:2:2:10:10:4:2:10:10 chr17 40146970 . G A 960.72 PASS AO=104;DP=106;FAO=104;FDP=106;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=70;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0327875;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.309;QD=36.2535;RBI=0.0366781;REFB=0.00302961;REVB=0.0164397;RO=2;SAF=34;SAR=70;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0270912;STB=0.514283;TYPE=snp;VARB=-0.000424157;OID=.;OPOS=40146970;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:106:106:2:2:104:104:70:34:2:0:70:34:2:0 chr17 40173851 . A C 991.42 PASS AO=105;DP=105;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00897811;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.214;QD=38.1315;RBI=0.017259;REFB=0;REVB=0.01474;RO=0;SAF=43;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.24969e-05;OID=.;OPOS=40173851;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:105:104:0:0:105:104:62:43:0:0:61:43:0:0 chr17 40646803 . G A 484.82 PASS AO=97;DP=168;FAO=97;FDP=170;FR=.;FRO=73;FSAF=27;FSAR=70;FSRF=34;FSRR=39;FWDB=-0.0388694;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.732;QD=11.4076;RBI=0.0389359;REFB=-0.0260124;REVB=-0.00227544;RO=70;SAF=27;SAR=70;SRF=31;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146211;STB=0.591967;TYPE=snp;VARB=0.0125756;OID=.;OPOS=40646803;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:170:70:73:97:97:70:27:31:39:70:27:34:39 chr17 40689455 . T C 496.83 PASS AO=51;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0698671;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.1957;QD=37.4966;RBI=0.0703834;REFB=0;REVB=0.00851009;RO=1;SAF=33;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140577;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000729661;OID=.;OPOS=40689455;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:52:53:1:0:51:53:18:33:1:0:19:34:0:0 chr17 40696233 . C G 552.9 PASS AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.185542;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=37.7007;QD=35.6708;RBI=0.185837;REFB=-0.106132;REVB=0.0104617;RO=0;SAF=18;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505745;TYPE=snp;VARB=0.00572;OID=.;OPOS=40696233;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:62:62:0:1:61:61:43:18:0:0:43:18:0:1 chr17 40699291 . G A 300.99 PASS AO=33;DP=33;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00595309;FXX=0.0588062;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.727;QD=37.6241;RBI=0.142225;REFB=0;REVB=0.142101;RO=0;SAF=33;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00155785;OID=.;OPOS=40699291;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:33:32:0:0:33:32:0:33:0:0:1:31:0:0 chr17 40699332 . T C 465.89 PASS AO=48;DP=50;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00679184;FXX=0.039992;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.207;QD=38.8245;RBI=0.0135652;REFB=0;REVB=-0.0117425;RO=0;SAF=41;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.90087e-05;OID=.;OPOS=40699332;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:50:48:0:0:48:48:7:41:0:0:7:41:0:0 chr17 40705100 . C T 51 PASS AO=15;DP=42;FAO=15;FDP=42;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.0288103;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.227;QD=4.85713;RBI=0.0336104;REFB=-0.0145181;REVB=-0.0173097;RO=27;SAF=8;SAR=7;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0966188;STB=0.556886;TYPE=snp;VARB=0.0330869;OID=.;OPOS=40705100;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:42:42:27:27:15:15:7:8:12:15:7:8:12:15 chr17 40714804 . C A 27.79 PASS AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=11;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.0495761;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9523;QD=10.106;RBI=0.0967406;REFB=0.0152945;REVB=0.083072;RO=6;SAF=2;SAR=3;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0621951;STB=0.538311;TYPE=snp;VARB=-0.0132131;OID=.;OPOS=40714804;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:11:11:6:6:5:5:3:2:2:4:3:2:2:4 chr17 40716520 . A G 352.02 PASS AO=87;DP=183;FAO=87;FDP=183;FR=.;FRO=96;FSAF=12;FSAR=75;FSRF=19;FSRR=77;FWDB=-0.00885607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.303;QD=7.69449;RBI=0.0441987;REFB=-0.00965585;REVB=-0.0433024;RO=95;SAF=12;SAR=75;SRF=19;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111409;STB=0.560361;TYPE=snp;VARB=0.0110846;OID=.;OPOS=40716520;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:183:95:96:87:87:75:12:19:76:75:12:19:77 chr17 40722162 . G A 476.58 PASS AO=104;DP=216;FAO=113;FDP=228;FR=.;FRO=115;FSAF=46;FSAR=67;FSRF=43;FSRR=72;FWDB=-0.0144406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1549;QD=8.36103;RBI=0.026459;REFB=-0.0231433;REVB=0.0221709;RO=112;SAF=46;SAR=58;SRF=43;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.056118;STB=0.517436;TYPE=snp;VARB=0.0276079;OID=.;OPOS=40722162;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:216:228:112:115:104:113:58:46:43:69:67:46:43:72 chr17 40818451 . G A 49.76 PASS AO=8;DP=14;FAO=9;FDP=14;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0350301;FXX=0.0666222;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.8216;QD=14.2173;RBI=0.0396476;REFB=-0.0972912;REVB=0.0185694;RO=4;SAF=1;SAR=7;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141787;STB=0.571252;TYPE=snp;VARB=0.0387207;OID=.;OPOS=40818451;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:14:14:4:5:8:9:7:1:1:3:8:1:1:4 chr17 40818699 . A G 341.13 PASS AO=92;DP=208;FAO=92;FDP=208;FR=.;FRO=116;FSAF=35;FSAR=57;FSRF=47;FSRR=69;FWDB=0.00572305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.133;QD=6.56023;RBI=0.0303873;REFB=-0.000866089;REVB=-0.0298436;RO=116;SAF=35;SAR=57;SRF=47;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0261265;STB=0.514528;TYPE=snp;VARB=0.00110081;OID=.;OPOS=40818699;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:208:116:116:92:92:57:35:47:69:57:35:47:69 chr17 40820143 . G GT,T 365.98 PASS AO=9,23;DP=43;FAO=4,35;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0;FSAR=4,35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0,0;FXX=0;HRUN=0,2;LEN=1,1;MLLD=28.261,43.4143;QD=37.5368;RBI=0.408045,0.390606;REFB=0,0;REVB=0.408045,0.390606;RO=11;SAF=0,0;SAR=9,23;SRF=0;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=ins,snp;VARB=0.265386,-0.00857963;OID=.,.;OPOS=40820144,40820143;OREF=-,G;OALT=T,T;OMAPALT=GT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:5:43:39:11:0:9,23:4,35:9,23:0,0:0:11:4,35:0,0:0:0 chr17 40835922 . A C 303.39 PASS AO=74;DP=156;FAO=74;FDP=155;FR=.;FRO=81;FSAF=26;FSAR=48;FSRF=47;FSRR=34;FWDB=-0.00112292;FXX=0.00640985;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5301;QD=7.82947;RBI=0.0629303;REFB=-0.0655318;REVB=-0.0629203;RO=78;SAF=26;SAR=48;SRF=44;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202123;STB=0.621684;TYPE=snp;VARB=0.0380866;OID=.;OPOS=40835922;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:155:78:81:74:74:48:26:44:34:48:26:47:34 chr17 40854534 . G GT 72.6 PASS AO=36;DP=121;FAO=42;FDP=116;FR=.;FRO=74;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=29;FSRR=45;FWDB=0.0399175;FXX=0.025208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=28.0887;QD=2.50349;RBI=0.0403939;REFB=0.00637691;REVB=0.0061855;RO=82;SAF=23;SAR=13;SRF=35;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.250563;STB=0.674203;TYPE=ins;VARB=-0.00980638;OID=.;OPOS=40854535;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:36:121:42:116:74:28:14:29:45:72:82:23:13:35:47 chr17 41116234 . G A 645.55 PASS AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0148771;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.8501;QD=36.3691;RBI=0.0255498;REFB=0.0234845;REVB=-0.0207717;RO=1;SAF=15;SAR=55;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0085206;STB=0.504503;TYPE=snp;VARB=-6.56017e-05;OID=.;OPOS=41116234;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:71:71:1:1:70:70:55:15:0:1:55:15:0:1 chr17 41121207 . GGGGC G,GG,GGG 386.13 PASS AO=20,16,8;DP=49;FAO=43,3,4;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=7,2,0;FSAR=36,1,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00426597,-0.00704387,-0.00934544;FXX=0;HRUN=5,5,5;LEN=4,3,2;MLLD=171.502,168.852,163.002;QD=30.8904;RBI=0.034824,0.0193296,0.0101928;REFB=0,0,0;REVB=0.0345617,0.0180005,0.00406894;RO=0;SAF=5,3,1;SAR=15,13,7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,3.78418e-08,-4.78849e-08;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=del,del,del;VARB=-0.0112302,-0.00910231,-0.0153492;OID=.,.,.;OPOS=41121208,41121209,41121210;OREF=GGGC,GGC,GC;OALT=-,-,-;OMAPALT=G,GG,GGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:20,16,8:49:43,3,4:50:0:7,2,0:36,1,4:0:0:7:0:5,3,1:15,13,7:0:0 chr17 41121217 . G A 261.03 PASS AO=38;DP=53;FAO=40;FDP=54;FR=.;FRO=14;FSAF=1;FSAR=39;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.0453762;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=115.736;QD=19.3352;RBI=0.0479079;REFB=-0.000786106;REVB=-0.0153676;RO=15;SAF=1;SAR=37;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.680094;STB=0.88607;TYPE=snp;VARB=5.44043e-05;OID=.;OPOS=41121217;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:53:54:15:14:38:40:37:1:8:7:39:1:8:6 chr17 41133071 . T C 225.34 PASS AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0344293;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.78;QD=37.5566;RBI=0.0402634;REFB=0;REVB=-0.0208749;RO=0;SAF=21;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.86584e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000209657;OID=.;OPOS=41133071;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:25:24:0:0:24:24:3:21:0:0:3:21:0:0 chr17 41165493 . A G 805.01 PASS AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=87;FR=.;FRO=1;FSAF=72;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0258083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.401;QD=37.0119;RBI=0.0365648;REFB=0.0486133;REVB=-0.0259022;RO=0;SAF=72;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.17255e-08;STB=0.503447;TYPE=snp;VARB=-0.000700639;OID=.;OPOS=41165493;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:86:87:0:1:86:86:14:72:0:0:14:72:1:0 chr17 41165878 . C T 339.3 PASS AO=38;DP=40;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.12322;FXX=0.0681663;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.0818;QD=33.1025;RBI=0.134879;REFB=-0.0401311;REVB=0.0548547;RO=2;SAF=14;SAR=24;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0131768;STB=0.509799;TYPE=snp;VARB=0.0108974;OID=.;OPOS=41165878;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:40:41:2:1:38:40:24:14:1:1:25:15:0:1 chr17 41174025 . A C 29.46 PASS AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0419096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.4209;QD=11.785;RBI=0.0419381;REFB=-0.0818766;REVB=0.00154616;RO=5;SAF=4;SAR=1;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20967;STB=0.630995;TYPE=snp;VARB=0.0519922;OID=.;OPOS=41174025;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:10:10:5:5:5:5:1:4:3:2:1:4:3:2 chr17 41196408 . G A 147.66 PASS AO=37;DP=94;FAO=37;FDP=83;FR=.;FRO=46;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=-0.00155771;FXX=0.1782;HRUN=7;LEN=1;MLLD=108.86;QD=7.11591;RBI=0.0280776;REFB=-0.0120314;REVB=-0.0280344;RO=41;SAF=24;SAR=13;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0395546;STB=0.54921;TYPE=snp;VARB=0.0332304;OID=.;OPOS=41196408;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:83:41:46:37:37:13:24:25:16:13:24:26:20 chr17 41223094 . T C 557.18 PASS AO=109;DP=235;FAO=132;FDP=258;FR=.;FRO=126;FSAF=44;FSAR=88;FSRF=43;FSRR=83;FWDB=0.0193709;FXX=0.00769201;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.99;QD=8.63841;RBI=0.0380158;REFB=-0.0361687;REVB=0.0327104;RO=123;SAF=26;SAR=83;SRF=42;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125447;STB=0.504347;TYPE=snp;VARB=0.0337918;OID=.;OPOS=41223094;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:235:258:123:126:109:132:83:26:42:81:88:44:43:83 chr17 41234470 . A G 557.23 PASS AO=136;DP=281;FAO=138;FDP=288;FR=.;FRO=150;FSAF=95;FSAR=43;FSRF=86;FSRR=64;FWDB=0.0270399;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3774;QD=7.73936;RBI=0.0351767;REFB=0.0118987;REVB=-0.0224999;RO=143;SAF=95;SAR=41;SRF=83;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123275;STB=0.566348;TYPE=snp;VARB=-0.0139184;OID=.;OPOS=41234470;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:281:288:143:150:136:138:41:95:83:60:43:95:86:64 chr17 41244000 . T C 287.89 PASS AO=70;DP=146;FAO=70;FDP=146;FR=.;FRO=76;FSAF=27;FSAR=43;FSRF=39;FSRR=37;FWDB=-0.0151622;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=234.047;QD=7.88749;RBI=0.0334952;REFB=-0.00160296;REVB=0.029867;RO=76;SAF=27;SAR=43;SRF=39;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122448;STB=0.567807;TYPE=snp;VARB=0.00206503;OID=.;OPOS=41244000;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:76:76:70:70:43:27:39:37:43:27:39:37 chr17 41244435 . T C 419.01 PASS AO=81;DP=141;FAO=82;FDP=141;FR=.;FRO=59;FSAF=20;FSAR=62;FSRF=21;FSRR=38;FWDB=0.0174538;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3884;QD=11.8867;RBI=0.0186621;REFB=0.0239331;REVB=0.00660595;RO=60;SAF=19;SAR=62;SRF=22;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13204;STB=0.55965;TYPE=snp;VARB=-0.0188274;OID=.;OPOS=41244435;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:60:59:81:82:62:19:22:38:62:20:21:38 chr17 41244936 . G A 271.16 PASS AO=67;DP=149;FAO=70;FDP=154;FR=.;FRO=84;FSAF=33;FSAR=37;FSRF=42;FSRR=42;FWDB=-0.00166635;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.403;QD=7.04319;RBI=0.00500615;REFB=-0.00666211;REVB=0.00472068;RO=82;SAF=33;SAR=34;SRF=42;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0194336;STB=0.515603;TYPE=snp;VARB=0.00627528;OID=.;OPOS=41244936;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:154:82:84:67:70:34:33:42:40:37:33:42:42 chr17 41245237 . A G 396.85 PASS AO=77;DP=132;FAO=77;FDP=131;FR=.;FRO=54;FSAF=37;FSAR=40;FSRF=18;FSRR=36;FWDB=-0.00433251;FXX=0.00757518;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.2263;QD=12.1177;RBI=0.0415884;REFB=-0.00757256;REVB=0.0413621;RO=53;SAF=37;SAR=40;SRF=17;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120818;STB=0.561038;TYPE=snp;VARB=0.00777855;OID=.;OPOS=41245237;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:131:53:54:77:77:40:37:17:36:40:37:18:36 chr17 41245466 . G A 503.37 PASS AO=111;DP=212;FAO=111;FDP=211;FR=.;FRO=100;FSAF=63;FSAR=48;FSRF=64;FSRR=36;FWDB=0.00434068;FXX=0.00938923;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.9029;QD=9.54259;RBI=0.0297735;REFB=-0.00710329;REVB=-0.0294554;RO=98;SAF=63;SAR=48;SRF=64;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.075669;STB=0.535294;TYPE=snp;VARB=0.00637401;OID=.;OPOS=41245466;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:211:98:100:111:111:48:63:64:34:48:63:64:36 chr17 41277187 . G C 19.66 PASS AO=3;DP=10;FAO=4;FDP=11;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0144822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.864;QD=7.14987;RBI=0.0151033;REFB=-0.0085956;REVB=0.00428672;RO=5;SAF=1;SAR=2;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152533;STB=0.59956;TYPE=snp;VARB=0.0451628;OID=.;OPOS=41277187;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:10:11:5:7:3:4:2:1:1:4:3:1:1:6 chr17 41291953 . C G 212.64 PASS AO=64;DP=163;FAO=64;FDP=161;FR=.;FRO=97;FSAF=26;FSAR=38;FSRF=50;FSRR=47;FWDB=0.00447879;FXX=0.0473345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0778;QD=5.28295;RBI=0.00486897;REFB=0.000708026;REVB=0.0019098;RO=96;SAF=26;SAR=38;SRF=50;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123129;STB=0.566476;TYPE=snp;VARB=-0.00111395;OID=.;OPOS=41291953;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:161:96:97:64:64:38:26:50:46:38:26:50:47 chr17 41330024 . T C 660.33 PASS AO=142;DP=262;FAO=142;FDP=262;FR=.;FRO=120;FSAF=86;FSAR=56;FSRF=64;FSRR=56;FWDB=-0.0153972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3871;QD=10.0814;RBI=0.0191531;REFB=-0.0275888;REVB=0.0113914;RO=120;SAF=86;SAR=56;SRF=64;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0626509;STB=0.534157;TYPE=snp;VARB=0.0235354;OID=.;OPOS=41330024;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:262:262:120:120:142:142:56:86:64:56:56:86:64:56 chr17 41331460 . G A 159.39 PASS AO=38;DP=82;FAO=39;FDP=82;FR=.;FRO=43;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=-0.0534538;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.764;QD=7.77508;RBI=0.053454;REFB=-0.0184059;REVB=0.00013412;RO=43;SAF=14;SAR=24;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0503735;STB=0.533316;TYPE=snp;VARB=0.016709;OID=.;OPOS=41331460;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:43:43:38:39:24:14:18:25:25:14:18:25 chr17 41332804 . T C 632.37 PASS AO=76;DP=82;FAO=75;FDP=81;FR=.;FRO=6;FSAF=38;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=-0.0718821;FXX=0.0121936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.438;QD=31.2281;RBI=0.0760241;REFB=0.0304142;REVB=-0.0247513;RO=6;SAF=37;SAR=39;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0212281;STB=0.525166;TYPE=snp;VARB=-0.0356709;OID=.;OPOS=41332804;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:82:81:6:6:76:75:39:37:2:4:37:38:1:5 chr17 41361960 . A G 538.15 PASS AO=104;DP=182;FAO=107;FDP=185;FR=.;FRO=78;FSAF=51;FSAR=56;FSRF=35;FSRR=43;FWDB=-0.00369589;FXX=0.0106946;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.4;QD=11.6357;RBI=0.011812;REFB=-0.0127213;REVB=0.0112189;RO=78;SAF=51;SAR=53;SRF=35;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0328833;STB=0.511807;TYPE=snp;VARB=0.00704789;OID=.;OPOS=41361960;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:185:78:78:104:107:53:51:35:43:56:51:35:43 chr17 41362272 . C G 571.33 PASS AO=135;DP=275;FAO=135;FDP=271;FR=.;FRO=136;FSAF=29;FSAR=106;FSRF=45;FSRR=91;FWDB=-0.00641641;FXX=0.0145449;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.773;QD=8.43286;RBI=0.00676034;REFB=0.00536084;REVB=-0.00212883;RO=135;SAF=29;SAR=106;SRF=45;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144629;STB=0.578582;TYPE=snp;VARB=-0.00646362;OID=.;OPOS=41362272;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:275:271:135:136:135:135:106:29:45:90:106:29:45:91 chr17 41445410 . A T 105.98 PASS AO=21;DP=39;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.0268343;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=221.686;QD=10.8695;RBI=0.0286293;REFB=-0.00204726;REVB=0.00997767;RO=18;SAF=5;SAR=16;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154231;STB=0.587067;TYPE=snp;VARB=0.00444502;OID=.;OPOS=41445410;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:39:39:18:18:21:21:16:5:7:11:16:5:7:11 chr17 41464774 . A C 27.57 PASS AO=19;DP=84;FAO=18;FDP=84;FR=.;FRO=66;FSAF=2;FSAR=16;FSRF=38;FSRR=28;FWDB=-0.00535282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.392;QD=1.31281;RBI=0.00559212;REFB=4.84991e-05;REVB=-0.00161839;RO=65;SAF=2;SAR=17;SRF=38;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.615449;STB=0.878685;TYPE=snp;VARB=-0.000922027;OID=.;OPOS=41464774;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:84:84:65:66:19:18:17:2:38:27:16:2:38:28 chr17 41464782 . A C 35.3 PASS AO=19;DP=73;FAO=18;FDP=73;FR=.;FRO=55;FSAF=2;FSAR=16;FSRF=30;FSRR=25;FWDB=-0.0247261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.382;QD=1.93408;RBI=0.0266312;REFB=-0.00861554;REVB=-0.00989124;RO=54;SAF=2;SAR=17;SRF=30;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.5967;STB=0.861515;TYPE=snp;VARB=0.0178484;OID=.;OPOS=41464782;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:73:73:54:55:19:18:17:2:30:24:16:2:30:25 chr17 41478008 . AAT A 74.1 PASS AO=22;DP=113;FAO=37;FDP=82;FR=.;FRO=45;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=-0.104258;FXX=0.0574647;HRUN=5;LEN=2;MLLD=22.0207;QD=3.61479;RBI=0.110686;REFB=-0.0116971;REVB=0.0371726;RO=54;SAF=18;SAR=4;SRF=32;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.329321;STB=0.558727;TYPE=del;VARB=0.0538589;OID=.;OPOS=41478009;OREF=AT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:22:96:37:82:45:25:12:26:19:74:54:18:4:32:22 chr17 41522213 . T A 348.81 PASS AO=83;DP=171;FAO=83;FDP=170;FR=.;FRO=87;FSAF=43;FSAR=40;FSRF=46;FSRR=41;FWDB=0.0298689;FXX=0.00584761;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.9239;QD=8.20726;RBI=0.0548156;REFB=0.00414888;REVB=0.045963;RO=88;SAF=43;SAR=40;SRF=47;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149703;STB=0.505465;TYPE=snp;VARB=-0.00388609;OID=.;OPOS=41522213;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:170:88:87:83:83:40:43:47:41:40:43:46:41 chr17 41603882 . T C 236.02 PASS AO=41;DP=81;FAO=50;FDP=90;FR=.;FRO=40;FSAF=14;FSAR=36;FSRF=13;FSRR=27;FWDB=0.0017635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.74;QD=10.4896;RBI=0.0124099;REFB=-0.000458967;REVB=-0.0122839;RO=40;SAF=6;SAR=35;SRF=13;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.250942;STB=0.524262;TYPE=snp;VARB=0.00148274;OID=.;OPOS=41603882;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:90:40:40:41:50:35:6:13:27:36:14:13:27 chr17 41843979 . C G 1306.66 PASS AO=134;DP=134;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0521127;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.8049;QD=38.1508;RBI=0.0980023;REFB=0;REVB=-0.0829983;RO=0;SAF=53;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.90283e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000173497;OID=.;OPOS=41843979;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:134:137:0:0:134:137:81:53:0:0:82:55:0:0 chr17 41846508 . A G 886.63 PASS AO=80;DP=84;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.238;QD=36.9428;RBI=0.243125;REFB=-0.0649239;REVB=0.242483;RO=0;SAF=68;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000691142;OID=.;OPOS=41846508;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:84:96:0:0:80:96:12:68:0:0:27:69:0:0 chr17 41901366 . G T 589.05 PASS AO=139;DP=281;FAO=140;FDP=282;FR=.;FRO=142;FSAF=55;FSAR=85;FSRF=65;FSRR=77;FWDB=-0.0103271;FXX=0.00353344;HRUN=3;LEN=1;MLLD=143.991;QD=8.35531;RBI=0.0103297;REFB=-0.00244519;REVB=-0.000230273;RO=141;SAF=55;SAR=84;SRF=65;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0617222;STB=0.533747;TYPE=snp;VARB=0.00218167;OID=.;OPOS=41901366;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:281:282:141:142:139:140:84:55:65:76:85:55:65:77 chr17 41926219 . GGCC GC,G,GG 521.94 PASS AO=9,12,15;DP=87;FAO=81,0,0;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=37,0,0;FSAR=44,0,0;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0585376,-0.16269,-0.373282;FXX=0;HRUN=4,4,4;LEN=2,3,2;MLLD=20.964,15.0156,9.06371;QD=25.4606;RBI=0.0971481,0.195542,0.422851;REFB=-0.14648,-0.122528,-0.114276;REVB=0.0775312,0.108483,0.198656;RO=8;SAF=2,12,15;SAR=7,0,0;SRF=1;SRR=7;SSEN=0.514563,0.514563,0.479638;SSEP=0,0,0.441379;SSSB=0.123876,0.847052,0.856151;STB=0.505617,0.5,0.5;TYPE=del,del,del;VARB=0.0112841,0,0;OID=.,.,.;OPOS=41926220,41926220,41926221;OREF=GC,GCC,CC;OALT=-,-,-;OMAPALT=GC,G,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:9,12,15:50:81,0,0:82:1:37,0,0:44,0,0:0:1:34:8:2,12,15:7,0,0:1:7 chr17 41935181 . C A 31.4 PASS AO=8;DP=23;FAO=8;FDP=23;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=0;FSRF=15;FSRR=0;FWDB=0.0126263;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4177;QD=5.4611;RBI=0.0126263;REFB=-0.177422;REVB=0;RO=15;SAF=8;SAR=0;SRF=15;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0969553;OID=.;OPOS=41935181;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:23:23:15:15:8:8:0:8:15:0:0:8:15:0 chr17 41959808 . T C 2032.2 PASS AO=218;DP=222;FAO=218;FDP=218;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=160;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00225729;FXX=0.0180172;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.098;QD=37.288;RBI=0.0372424;REFB=-0.0721028;REVB=-0.0371739;RO=3;SAF=58;SAR=160;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0131739;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.5767e-05;OID=.;OPOS=41959808;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:222:218:3:0:218:218:160:58:2:1:160:58:0:0 chr17 41960343 . T C 423.68 PASS AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0118873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.602;QD=37.6609;RBI=0.0385427;REFB=0;REVB=0.0366638;RO=0;SAF=9;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000134129;OID=.;OPOS=41960343;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:45:45:0:0:45:45:36:9:0:0:36:9:0:0 chr17 41960633 . C G 488.74 PASS AO=59;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.242557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.6;QD=31.5317;RBI=0.307985;REFB=-0.176785;REVB=0.189792;RO=3;SAF=26;SAR=33;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0513809;STB=0.508769;TYPE=snp;VARB=0.00707293;OID=.;OPOS=41960633;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:62:62:3:1:59:61:33:26:3:0:33:28:1:0 chr17 41961451 . T C 647.6 PASS AO=69;DP=71;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0110465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.857;QD=35.9777;RBI=0.0197801;REFB=0.000691477;REVB=0.0164082;RO=1;SAF=35;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.013701;STB=0.50704;TYPE=snp;VARB=3.94653e-05;OID=.;OPOS=41961451;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:71:72:1:1:69:71:34:35:0:1:35:36:0:1 chr17 41975710 . TGGGGAG TGGGAG,TGGGGA 376.79 PASS AO=14,23;DP=75;FAO=0,73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=0,21;FSAR=0,52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.149722,0.117435;FXX=0.0135117;HRUN=4,3;LEN=1,1;MLLD=10.9645,9.79375;QD=20.6459;RBI=0.603691,0.383007;REFB=0,0;REVB=-0.58483,0.364559;RO=13;SAF=0,15;SAR=14,8;SRF=2;SRR=11;SSEN=0.333333,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.790645,0.320788;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=0,0.0121787;OID=.,.;OPOS=41975711,41975716;OREF=G,G;OALT=-,-;OMAPALT=TGGGAG,TGGGGA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:14,23:55:0,73:73:0:0,21:0,52:0:0:37:13:0,15:14,8:2:11 chr17 41994794 . C T 442.1 PASS AO=50;DP=53;FAO=50;FDP=52;FR=.;FRO=2;FSAF=16;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0655055;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4492;QD=34.0075;RBI=0.0681605;REFB=-0.139984;REVB=0.0188381;RO=2;SAF=16;SAR=34;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0268895;STB=0.51428;TYPE=snp;VARB=0.00261076;OID=.;OPOS=41994794;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:53:52:2:2:50:50:34:16:0:2:34:16:0:2 chr17 42030531 . G C 16.74 PASS AO=6;DP=25;FAO=6;FDP=25;FR=.;FRO=19;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=15;FWDB=-0.0273542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.229;QD=2.67861;RBI=0.0274817;REFB=-0.00667787;REVB=0.00264364;RO=19;SAF=1;SAR=5;SRF=4;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0829805;STB=0.555358;TYPE=snp;VARB=0.0178445;OID=.;OPOS=42030531;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:25:25:19:19:6:6:5:1:4:15:5:1:4:15 chr17 42030743 . G C 293.08 PASS AO=31;DP=32;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0632416;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=49.0491;QD=34.4798;RBI=0.154435;REFB=-0.0732786;REVB=0.140893;RO=1;SAF=22;SAR=9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0490246;STB=0.526299;TYPE=snp;VARB=0.00753717;OID=.;OPOS=42030743;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:32:34:1:1:31:33:9:22:0:1:9:24:0:1 chr17 42085972 . C T 734.74 PASS AO=78;DP=79;FAO=78;FDP=79;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=50;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.082397;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.2796;QD=37.202;RBI=0.0898416;REFB=-0.0238767;REVB=0.0358084;RO=1;SAF=28;SAR=50;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0166031;STB=0.50877;TYPE=snp;VARB=0.00154361;OID=.;OPOS=42085972;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:79:79:1:1:78:78:50:28:1:0:50:28:1:0 chr17 42154470 . A G 577.88 PASS AO=54;DP=54;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00470674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.036;QD=38.525;RBI=0.0299241;REFB=0;REVB=0.0295516;RO=0;SAF=51;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.19725e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00145225;OID=.;OPOS=42154470;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:54:60:0:0:54:60:3:51:0:0:6:54:0:0 chr17 42155408 . G A 509.45 PASS AO=61;DP=67;FAO=60;FDP=65;FR=.;FRO=5;FSAF=20;FSAR=40;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0321442;FXX=0.0298463;HRUN=6;LEN=1;MLLD=258.758;QD=31.3508;RBI=0.033094;REFB=-0.00542604;REVB=-0.00787188;RO=2;SAF=20;SAR=41;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116429;STB=0.52272;TYPE=snp;VARB=0.000225302;OID=.;OPOS=42155408;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:67:65:2:5:61:60:41:20:1:1:40:20:3:2 chr17 42164885 . G C 481.18 PASS AO=50;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0906184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.883;QD=37.7394;RBI=0.0906235;REFB=0;REVB=-0.000960791;RO=0;SAF=3;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.54029e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000527614;OID=.;OPOS=42164885;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:50:51:0:0:50:51:47:3:0:0:48:3:0:0 chr17 42226391 . A G 13.43 PASS AO=3;DP=11;FAO=3;FDP=11;FR=.;FRO=8;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.1331;QD=4.88263;RBI=0.00458971;REFB=0.0012095;REVB=0.00458971;RO=8;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00174622;OID=.;OPOS=42226391;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:11:11:8:8:3:3:3:0:0:8:3:0:0:8 chr17 42248346 . A T 220.87 PASS AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0285161;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.6721;QD=36.8112;RBI=0.0464259;REFB=0;REVB=-0.036636;RO=0;SAF=8;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000142584;OID=.;OPOS=42248346;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:24:24:0:0:24:24:16:8:0:0:16:8:0:0 chr17 42327850 . G A 47.9 PASS AO=15;DP=44;FAO=15;FDP=44;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=2;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=0.0169317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.174;QD=4.3544;RBI=0.0467895;REFB=0.00318231;REVB=0.0436185;RO=27;SAF=13;SAR=2;SRF=18;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.325479;STB=0.68392;TYPE=snp;VARB=-0.00812642;OID=.;OPOS=42327850;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:44:44:27:29:15:15:2:13:18:9:2:13:20:9 chr17 42330551 . GCCCCT GCCCT,GCCC 29.18 PASS AO=34,17;DP=101;FAO=46,0;FDP=100;FR=.;FRO=54;FSAF=5,0;FSAR=41,0;FSRF=40;FSRR=14;FWDB=0.0387033,-0.00980236;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,2;MLLD=9.39544,83.4289;QD=1.16735;RBI=0.107176,0.0302243;REFB=-0.199787,-0.0259019;REVB=-0.0999441,-0.0285906;RO=41;SAF=3,3;SAR=31,14;SRF=34;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.727941,-0.675969;STB=0.87011,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.149245,0;OID=.,.;OPOS=42330552,42330555;OREF=C,CT;OALT=-,-;OMAPALT=GCCCT,GCCC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:34,17:99:46,0:100:54:5,0:41,0:40:14:29:41:3,3:31,14:34:7 chr17 42335135 . C T 47.93 PASS AO=13;DP=50;FAO=18;FDP=56;FR=.;FRO=38;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=0.0129185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.2178;QD=3.4238;RBI=0.130699;REFB=-0.0254224;REVB=0.130059;RO=37;SAF=6;SAR=7;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0299526;STB=0.599886;TYPE=snp;VARB=0.080681;OID=.;OPOS=42335135;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:50:56:37:38:13:18:7:6:18:19:12:6:18:20 chr17 42384528 . G A 14.12 PASS AO=7;DP=35;FAO=7;FDP=35;FR=.;FRO=28;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.0292177;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.6206;QD=1.61322;RBI=0.0296179;REFB=0.00216533;REVB=0.00485221;RO=28;SAF=1;SAR=6;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.519942;STB=0.848981;TYPE=snp;VARB=-0.00951411;OID=.;OPOS=42384528;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:35:35:28:28:7:7:6:1:16:12:6:1:16:12 chr17 42392622 . T C 87.25 PASS AO=23;DP=59;FAO=25;FDP=62;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=26;FWDB=-0.0587143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.145;QD=5.62877;RBI=0.0597251;REFB=-0.0371676;REVB=-0.0109418;RO=36;SAF=9;SAR=14;SRF=10;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131331;STB=0.588168;TYPE=snp;VARB=0.0577843;OID=.;OPOS=42392622;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:59:62:36:37:23:25:14:9:10:26:14:11:11:26 chr17 42392955 . A C 10.47 PASS AO=2;DP=6;FAO=2;FDP=6;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.5195;QD=6.97897;RBI=0.00848477;REFB=-0.0860804;REVB=0.00848477;RO=4;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.15268;OID=.;OPOS=42392955;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:4:4:2:2:2:0:0:4:2:0:0:4 chr17 42398052 . A G 64.45 PASS AO=8;DP=10;FAO=8;FDP=10;FR=.;FRO=2;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00188774;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=263.184;QD=25.781;RBI=0.0054446;REFB=-0.0250338;REVB=0.00510687;RO=0;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.78849e-08;STB=0.562356;TYPE=snp;VARB=0.00671441;OID=.;OPOS=42398052;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:8:10:0:2:8:8:7:1:0:0:7:1:0:2 chr17 42398757 . C A 138.84 PASS AO=15;DP=16;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019335;FXX=0.062461;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.619;QD=37.0232;RBI=0.0599871;REFB=0;REVB=0.0567856;RO=0;SAF=10;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000464006;OID=.;OPOS=42398757;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:15:0:0:15:15:5:10:0:0:5:10:0:0 chr17 42437000 . G A 91.8 PASS AO=13;DP=17;FAO=13;FDP=17;FR=.;FRO=4;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.00927954;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.592;QD=21.5994;RBI=0.0248197;REFB=0.0129679;REVB=0.0230198;RO=3;SAF=5;SAR=8;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.097715;STB=0.528258;TYPE=snp;VARB=-0.00447062;OID=.;OPOS=42437000;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:17:17:3:4:13:13:8:5:2:1:8:5:2:2 chr17 42437441 . AGGC AGC,AG 62.6 PASS AO=3,2;DP=18;FAO=13,0;FDP=16;FR=.;FRO=3;FSAF=10,0;FSAR=3,0;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0399655,-0.302126;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,2;MLLD=13.0514,11.6424;QD=15.6489;RBI=0.332943,0.404214;REFB=-0.0928653,-0.0256388;REVB=0.330536,0.268531;RO=4;SAF=2,2;SAR=1,0;SRF=0;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0.239411,0.239411;SSSB=0.541115,0.767801;STB=0.666388,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.0691146,0;OID=.,.;OPOS=42437442,42437443;OREF=G,GC;OALT=-,-;OMAPALT=AGC,AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:3,2:10:13,0:16:3:10,0:3,0:0:3:5:4:2,2:1,0:0:4 chr17 42449789 . G A 824.58 PASS AO=88;DP=91;FAO=92;FDP=95;FR=.;FRO=3;FSAF=46;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.00226461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.002;QD=34.7192;RBI=0.00236806;REFB=-0.0938469;REVB=0.000692268;RO=1;SAF=44;SAR=44;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106485;STB=0.515786;TYPE=snp;VARB=0.000250369;OID=.;OPOS=42449789;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:91:95:1:3:88:92:44:44:0:1:46:46:0:3 chr17 42453065 . A C 412.31 PASS AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0147876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.221;QD=37.4824;RBI=0.0340375;REFB=0;REVB=0.0306574;RO=0;SAF=28;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.80116e-05;OID=.;OPOS=42453065;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:44:44:0:0:44:44:16:28:0:0:16:28:0:0 chr17 42454463 . G C 559.37 PASS AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0231477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8444;QD=36.0884;RBI=0.0418387;REFB=0.00201937;REVB=-0.034852;RO=1;SAF=15;SAR=46;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101533;STB=0.505375;TYPE=snp;VARB=-0.000575426;OID=.;OPOS=42454463;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:62:62:1:1:61:61:46:15:0:1:46:15:0:1 chr17 42475903 . GGC G 214.38 PASS AO=29;DP=127;FAO=85;FDP=127;FR=.;FRO=42;FSAF=49;FSAR=36;FSRF=39;FSRR=3;FWDB=-0.125231;FXX=0.00781189;HRUN=5;LEN=2;MLLD=13.7848;QD=6.75212;RBI=0.220566;REFB=-0.100536;REVB=0.181566;RO=59;SAF=25;SAR=4;SRF=27;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.527185;STB=0.623719;TYPE=del;VARB=0.107823;OID=.;OPOS=42475904;OREF=GC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:29:126:85:127:42:49:36:39:3:54:59:25:4:27:32 chr17 42786213 . G C 61.63 PASS AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.00562688;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.797;QD=9.13066;RBI=0.0103874;REFB=-0.0217618;REVB=-0.00873135;RO=14;SAF=5;SAR=8;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0412168;STB=0.523773;TYPE=snp;VARB=0.0119742;OID=.;OPOS=42786213;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:27:27:14:14:13:13:8:5:6:8:8:5:6:8 chr17 42848950 . AG A 20 PASS AO=5;DP=21;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=-0.137778;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=13.8333;QD=5.33403;RBI=0.177862;REFB=-0.0741915;REVB=0.112481;RO=8;SAF=4;SAR=1;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0.461538;SSSB=0.598683;STB=0.881272;TYPE=del;VARB=0.0938663;OID=.;OPOS=42848951;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:5:14:6:15:9:5:1:1:8:19:8:4:1:1:7 chr17 42851729 . C T 201.62 PASS AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0721037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.374;QD=36.6589;RBI=0.0747564;REFB=0;REVB=0.019738;RO=0;SAF=9;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2029e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00059284;OID=.;OPOS=42851729;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:22:22:0:0:22:22:13:9:0:0:13:9:0:0 chr17 42852604 . G T 343.88 PASS AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019069;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.5643;QD=38.2086;RBI=0.048103;REFB=0;REVB=0.0441619;RO=0;SAF=13;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21415e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00609447;OID=.;OPOS=42852604;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:37:36:0:0:36:36:23:13:0:0:23:13:0:0 chr17 42852610 . T C 354.1 PASS AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0161455;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.305;QD=38.2811;RBI=0.0165198;REFB=0;REVB=-0.0034968;RO=0;SAF=12;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000631156;OID=.;OPOS=42852610;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:38:37:0:0:37:37:25:12:0:0:25:12:0:0 chr17 42854610 . T C 572.69 PASS AO=60;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0294949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.568;QD=37.5536;RBI=0.0300532;REFB=0;REVB=-0.00576552;RO=0;SAF=42;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41114e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000431961;OID=.;OPOS=42854610;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:61:61:0:0:60:61:18:42:0:0:19:42:0:0 chr17 42855554 . T C 776.85 PASS AO=82;DP=83;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000962444;FXX=0.0120467;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.832;QD=37.8952;RBI=0.0296319;REFB=0;REVB=0.0296162;RO=0;SAF=45;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000103977;OID=.;OPOS=42855554;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:83:82:0:0:82:82:37:45:0:0:37:45:0:0 chr17 42857430 . G A 962.43 PASS AO=106;DP=114;FAO=107;FDP=111;FR=.;FRO=4;FSAF=57;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.027739;FXX=0.0347796;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.3296;QD=34.682;RBI=0.103584;REFB=-0.151731;REVB=0.0998006;RO=3;SAF=57;SAR=49;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0281683;STB=0.519227;TYPE=snp;VARB=0.00283543;OID=.;OPOS=42857430;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:114:111:3:4:106:107:49:57:0:3:50:57:0:4 chr17 42857517 . C T 391.09 PASS AO=42;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0581295;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.1;QD=35.5533;RBI=0.058651;REFB=-0.110606;REVB=0.00780375;RO=0;SAF=23;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000962901;OID=.;OPOS=42857517;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:43:44:0:0:42:44:19:23:0:0:21:23:0:0 chr17 42876111 . C G 391.81 PASS AO=86;DP=164;FAO=86;FDP=163;FR=.;FRO=77;FSAF=30;FSAR=56;FSRF=35;FSRR=42;FWDB=0.0213155;FXX=0.00609719;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.8225;QD=9.61493;RBI=0.0236208;REFB=-0.00940044;REVB=-0.010178;RO=77;SAF=30;SAR=56;SRF=35;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.096913;STB=0.553179;TYPE=snp;VARB=0.0084768;OID=.;OPOS=42876111;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:163:77:77:86:86:56:30:35:42:56:30:35:42 chr17 42880753 . C T 353.86 PASS AO=80;DP=156;FAO=80;FDP=156;FR=.;FRO=76;FSAF=46;FSAR=34;FSRF=28;FSRR=48;FWDB=0.0297204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.1411;QD=9.07323;RBI=0.029822;REFB=0.00649425;REVB=0.00245966;RO=75;SAF=46;SAR=34;SRF=28;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17664;STB=0.599848;TYPE=snp;VARB=-0.00544123;OID=.;OPOS=42880753;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:156:75:76:80:80:34:46:28:47:34:46:28:48 chr17 42925559 . C T 268.04 PASS AO=52;DP=90;FAO=52;FDP=90;FR=.;FRO=38;FSAF=18;FSAR=34;FSRF=25;FSRR=13;FWDB=0.00750029;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.481;QD=11.9129;RBI=0.00762729;REFB=-0.017953;REVB=-0.00138606;RO=38;SAF=18;SAR=34;SRF=25;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24366;STB=0.633397;TYPE=snp;VARB=0.0139167;OID=.;OPOS=42925559;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:38:38:52:52:34:18:25:13:34:18:25:13 chr17 42927721 . G A 86 PASS AO=30;DP=88;FAO=30;FDP=88;FR=.;FRO=58;FSAF=23;FSAR=7;FSRF=33;FSRR=25;FWDB=-0.0126906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.513;QD=3.90903;RBI=0.0958413;REFB=0.00508433;REVB=-0.0949974;RO=58;SAF=23;SAR=7;SRF=33;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.259841;STB=0.652372;TYPE=snp;VARB=-0.00816566;OID=.;OPOS=42927721;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:88:88:58:58:30:30:7:23:33:25:7:23:33:25 chr17 42961009 . C T 266.99 PASS AO=58;DP=111;FAO=58;FDP=111;FR=.;FRO=53;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=37;FSRR=16;FWDB=-0.00716812;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.851;QD=9.62135;RBI=0.0305461;REFB=-0.00517242;REVB=-0.0296931;RO=53;SAF=30;SAR=28;SRF=37;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158531;STB=0.586955;TYPE=snp;VARB=0.00485314;OID=.;OPOS=42961009;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:53:53:58:58:28:30:37:16:28:30:37:16 chr17 42983052 . GC G 462.66 PASS AO=56;DP=83;FAO=75;FDP=77;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.290093;FXX=0.0128189;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.8353;QD=24.034;RBI=0.351283;REFB=-0.0644333;REVB=0.198106;RO=14;SAF=24;SAR=32;SRF=8;SRR=6;SSEN=0.299652;SSEP=0;SSSB=-0.0539881;STB=0.500173;TYPE=del;VARB=0.0279279;OID=.;OPOS=42983053;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:56:78:75:77:2:37:38:1:1:30:14:24:32:8:6 chr17 42983095 . G A 33.64 PASS AO=12;DP=41;FAO=12;FDP=41;FR=.;FRO=29;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=0.12748;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1851;QD=3.28242;RBI=0.135512;REFB=0.0206801;REVB=0.0459596;RO=29;SAF=2;SAR=10;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.353973;STB=0.721228;TYPE=snp;VARB=-0.0370273;OID=.;OPOS=42983095;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:41:41:29:29:12:12:10:2:12:17:10:2:12:17 chr17 43111688 . G A 163.16 PASS AO=32;DP=57;FAO=32;FDP=57;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=26;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=0.0130443;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.278;QD=11.4499;RBI=0.013651;REFB=-0.0322552;REVB=0.00402429;RO=23;SAF=6;SAR=26;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.409247;STB=0.731298;TYPE=snp;VARB=0.0162897;OID=.;OPOS=43111688;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:23:25:32:32:26:6:15:8:26:6:16:9 chr17 43175906 . C T 295.57 PASS AO=77;DP=175;FAO=78;FDP=172;FR=.;FRO=94;FSAF=19;FSAR=59;FSRF=33;FSRR=61;FWDB=-0.00490697;FXX=0.0171419;HRUN=3;LEN=1;MLLD=76.172;QD=6.87371;RBI=0.00522681;REFB=-0.00286844;REVB=-0.00180032;RO=94;SAF=18;SAR=59;SRF=33;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146787;STB=0.573652;TYPE=snp;VARB=0.0034526;OID=.;OPOS=43175906;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:172:94:94:77:78:59:18:33:61:59:19:33:61 chr17 43181287 . A G 648.37 PASS AO=66;DP=66;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0158186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.971;QD=38.1392;RBI=0.0174539;REFB=0;REVB=0.00737626;RO=0;SAF=41;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.04816e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.25017e-05;OID=.;OPOS=43181287;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:66:68:0:0:66:68:25:41:0:0:25:43:0:0 chr17 43183028 . G A 139.34 PASS AO=68;DP=236;FAO=68;FDP=236;FR=.;FRO=168;FSAF=18;FSAR=50;FSRF=71;FSRR=97;FWDB=-0.0128822;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.042;QD=2.36175;RBI=0.0176132;REFB=-0.00500923;REVB=0.0120114;RO=168;SAF=18;SAR=50;SRF=71;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21537;STB=0.627074;TYPE=snp;VARB=0.0208461;OID=.;OPOS=43183028;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:236:236:168:168:68:68:50:18:71:97:50:18:71:97 chr17 43190846 . G A 34.29 PASS AO=17;DP=63;FAO=17;FDP=70;FR=.;FRO=53;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=36;FSRR=17;FWDB=0.00988476;FXX=0.0410903;HRUN=4;LEN=1;MLLD=138.269;QD=1.95951;RBI=0.0361815;REFB=-0.00422337;REVB=-0.0348051;RO=46;SAF=10;SAR=7;SRF=33;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168022;STB=0.572872;TYPE=snp;VARB=0.00565557;OID=.;OPOS=43190846;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:63:70:46:53:17:17:7:10:33:13:7:10:36:17 chr17 43216472 . A G 49.9 PASS AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.047582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.981;QD=12.474;RBI=0.0556739;REFB=-0.00991218;REVB=-0.0289057;RO=7;SAF=8;SAR=1;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249071;STB=0.648255;TYPE=snp;VARB=0.00980206;OID=.;OPOS=43216472;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:16:16:7:7:9:9:1:8:5:2:1:8:5:2 chr17 43227766 . T TTTGG 790.71 PASS AO=87;DP=110;FAO=94;FDP=102;FR=.;FRO=8;FSAF=56;FSAR=38;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=0.00841673;FXX=0.0642143;HRUN=3;LEN=4;MLLD=250.595;QD=31.0082;RBI=0.0183802;REFB=-0.0650066;REVB=-0.0163399;RO=14;SAF=54;SAR=33;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0463203;STB=0.522931;TYPE=ins;VARB=-0.000334067;OID=.;OPOS=43227767;OREF=-;OALT=TTGG;OMAPALT=TTTGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:87:110:94:102:8:56:38:7:1:6:14:54:33:11:3 chr17 43228491 . C T 318.87 PASS AO=70;DP=137;FAO=71;FDP=135;FR=.;FRO=64;FSAF=24;FSAR=47;FSRF=36;FSRR=28;FWDB=0.0124801;FXX=0.0145975;HRUN=6;LEN=1;MLLD=150.566;QD=9.44789;RBI=0.0174976;REFB=-0.00541122;REVB=0.0122644;RO=60;SAF=23;SAR=47;SRF=32;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18156;STB=0.610358;TYPE=snp;VARB=0.00371874;OID=.;OPOS=43228491;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:135:60:64:70:71:47:23:32:28:47:24:36:28 chr17 43318774 . TGGGGC TGGGCG 231.43 PASS AO=15;DP=29;FAO=28;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=22;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00699945;FXX=0;HRUN=4;LEN=2;MLLD=168.137;QD=33.0613;RBI=0.0716996;REFB=0;REVB=0.0713572;RO=0;SAF=12;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=mnp;VARB=0.00299485;OID=.;OPOS=43318778;OREF=GC;OALT=CG;OMAPALT=TGGGCG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:15:23:28:28:0:22:6:0:0:12:0:12:3:0:0 chr17 43318780 . C G 34.4 PASS AO=10;DP=30;FAO=10;FDP=30;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=-0.0152022;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=82.7104;QD=4.58704;RBI=0.0372673;REFB=-0.0518098;REVB=0.0340256;RO=20;SAF=9;SAR=1;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.366969;STB=0.731977;TYPE=snp;VARB=0.019361;OID=.;OPOS=43318780;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:30:30:20:20:10:10:1:9:14:6:1:9:14:6 chr17 43319770 . C T 735.98 PASS AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0507494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.656;QD=38.2328;RBI=0.050817;REFB=0;REVB=-0.00262014;RO=0;SAF=30;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000105124;OID=.;OPOS=43319770;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:77:77:0:0:77:77:47:30:0:0:47:30:0:0 chr17 43333125 . C T 106.95 PASS AO=35;DP=96;FAO=35;FDP=96;FR=.;FRO=61;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=31;FSRR=30;FWDB=-0.0170839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.589;QD=4.45629;RBI=0.0222294;REFB=-0.0198846;REVB=-0.0142229;RO=61;SAF=18;SAR=17;SRF=31;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00674526;STB=0.503869;TYPE=snp;VARB=0.0217733;OID=.;OPOS=43333125;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:61:61:35:35:17:18:31:30:17:18:31:30 chr17 43333785 . AAGAC A,AAGA 516.72 PASS AO=41,11;DP=77;FAO=44,13;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=19,4;FSAR=25,9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0149333,0.00676385;FXX=0.0338926;HRUN=2,1;LEN=4,1;MLLD=153.864,110.991;QD=36.2612;RBI=0.0315596,0.0132572;REFB=0,0;REVB=0.027803,0.0114019;RO=0;SAF=17,2;SAR=24,9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=6.2194e-08,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=-0.00334682,-0.000877792;OID=.,.;OPOS=43333786,43333789;OREF=AGAC,C;OALT=-,-;OMAPALT=A,AAGA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:41,11:57:44,13:57:0:19,4:25,9:0:0:23:0:17,2:24,9:0:0 chr17 43340936 . G A 620.86 PASS AO=60;DP=64;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.131593;FXX=0.0441112;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.61;QD=38.2066;RBI=0.141158;REFB=0;REVB=0.0510761;RO=0;SAF=2;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.55779e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000900856;OID=.;OPOS=43340936;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:64:65:0:0:60:65:58:2:0:0:61:4:0:0 chr17 43342141 . G C 712.22 PASS AO=73;DP=74;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00166932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.393;QD=37.9853;RBI=0.0308364;REFB=0;REVB=0.0307912;RO=1;SAF=47;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00995914;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000108706;OID=.;OPOS=43342141;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:74:75:1:0:73:75:26:47:1:0:26:49:0:0 chr17 43345001 . GC G 208.93 PASS AO=16;DP=46;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0462417;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=10.1078;QD=19.8976;RBI=0.364595;REFB=0;REVB=0.36165;RO=11;SAF=3;SAR=13;SRF=0;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.271212;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0388841;OID=.;OPOS=43345002;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:16:29:42:42:0:10:32:0:0:20:11:3:13:0:11 chr17 43364293 . C CG 332.07 PASS AO=39;DP=47;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0257299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=21.0671;QD=29.5176;RBI=0.137927;REFB=0;REVB=-0.135505;RO=5;SAF=22;SAR=17;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0512576;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-0.00413894;OID=.;OPOS=43364294;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:39:47:45:45:0:26:19:0:0:30:5:22:17:4:1 chr17 43514589 . G C 17.4 PASS AO=4;DP=13;FAO=4;FDP=13;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.00818495;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.56;QD=5.35324;RBI=0.0286003;REFB=0.00462112;REVB=0.0274041;RO=9;SAF=3;SAR=1;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.32832;STB=0.718863;TYPE=snp;VARB=-0.0107365;OID=.;OPOS=43514589;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:13:13:9:9:4:4:1:3:4:5:1:3:4:5 chr17 43585711 . G A 580.01 PASS AO=143;DP=297;FAO=143;FDP=297;FR=.;FRO=154;FSAF=60;FSAR=83;FSRF=72;FSRR=82;FWDB=0.000119403;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.791;QD=7.81164;RBI=0.00936963;REFB=-0.0152787;REVB=0.00936887;RO=152;SAF=60;SAR=83;SRF=70;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0391046;STB=0.525313;TYPE=snp;VARB=0.0161174;OID=.;OPOS=43585711;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:297:297:152:154:143:143:83:60:70:82:83:60:72:82 chr17 43923180 . G A 73.46 PASS AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.00272058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.358;QD=9.79411;RBI=0.0135313;REFB=-0.0119783;REVB=0.0132549;RO=14;SAF=9;SAR=6;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0863963;STB=0.567477;TYPE=snp;VARB=0.00832133;OID=.;OPOS=43923180;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:29:30:14:15:15:15:6:9:7:7:6:9:7:8 chr17 43923898 . A G 306.11 PASS AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.064933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.668;QD=37.1041;RBI=0.0656539;REFB=0;REVB=-0.00970285;RO=0;SAF=18;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.64315e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000335342;OID=.;OPOS=43923898;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:33:33:0:0:33:33:15:18:0:0:15:18:0:0 chr17 43924412 . T C 1262.43 PASS AO=130;DP=133;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130479;FXX=0.0222206;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.522;QD=38.2555;RBI=0.021923;REFB=0;REVB=0.0176173;RO=0;SAF=75;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.67811e-05;OID=.;OPOS=43924412;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:133:132:0:0:130:132:55:75:0:0:56:76:0:0 chr17 44077044 . T C 181.97 PASS AO=18;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153679;FXX=0.049975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.123;QD=38.3103;RBI=0.0549284;REFB=0;REVB=0.0527348;RO=0;SAF=5;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000892085;OID=.;OPOS=44077044;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:19:19:0:0:18:19:13:5:0:0:14:5:0:0 chr17 44107321 . C CT,T 187.55 PASS AO=15,31;DP=91;FAO=65,19;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=40,8;FSAR=25,11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.137425,-0.00583606;FXX=0.034087;HRUN=12,1;LEN=1,1;MLLD=5.40218,205.875;QD=8.82582;RBI=0.207118,0.0215243;REFB=0.0580293,-0.000785133;REVB=0.154958,0.020718;RO=32;SAF=12,13;SAR=3,18;SRF=21;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.212541,-0.212905;STB=0.506171,0.529381;TYPE=ins,snp;VARB=-0.0263631,-0.00505007;OID=.,.;OPOS=44107322,44107321;OREF=-,C;OALT=T,T;OMAPALT=CT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:37:91:85:32:1:15,31:65,19:3,18:12,13:21:11:25,11:40,8:1:0 chr17 44109474 . G A 76.82 PASS AO=17;DP=37;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.017999;FXX=0.0238039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.357;QD=7.49423;RBI=0.0357598;REFB=-0.0110561;REVB=0.0308998;RO=19;SAF=12;SAR=5;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0238079;STB=0.509081;TYPE=snp;VARB=0.0162603;OID=.;OPOS=44109474;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:37:41:19:23:17:18:5:12:13:6:6:12:15:8 chr17 44144993 . C G 754.13 PASS AO=76;DP=76;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.868;QD=38.1836;RBI=0.0617572;REFB=0;REVB=0.0597645;RO=0;SAF=39;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000150901;OID=.;OPOS=44144993;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:76:79:0:0:76:79:37:39:0:0:39:40:0:0 chr17 44388580 . G A 13.61 PASS AO=5;DP=23;FAO=5;FDP=23;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=0.0118936;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.6357;QD=2.36655;RBI=0.042959;REFB=-0.0110919;REVB=-0.0412797;RO=17;SAF=3;SAR=2;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132679;STB=0.555341;TYPE=snp;VARB=0.034297;OID=.;OPOS=44388580;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:23:23:17:18:5:5:2:3:12:5:2:3:12:6 chr17 44626660 . C G 65.53 PASS AO=7;DP=8;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0369376;FXX=0.124844;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.4232;QD=37.4479;RBI=0.0374499;REFB=0;REVB=0.0061732;RO=0;SAF=1;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00389158;OID=.;OPOS=44626660;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:8:7:0:0:7:7:6:1:0:0:6:1:0:0 chr17 44998563 . G A 2229.3 PASS AO=234;DP=236;FAO=234;FDP=234;FR=.;FRO=0;FSAF=113;FSAR=121;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107764;FXX=0.00847422;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.1591;QD=38.1077;RBI=0.0242592;REFB=-0.0441776;REVB=0.0217343;RO=0;SAF=113;SAR=121;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.10083e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000865684;OID=.;OPOS=44998563;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:236:234:0:0:234:234:121:113:0:0:121:113:0:0 chr17 45000547 . G C 365.14 PASS AO=44;DP=48;FAO=44;FDP=49;FR=.;FRO=5;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.0263111;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=58.5082;QD=29.8077;RBI=0.0346275;REFB=-0.1856;REVB=0.022512;RO=4;SAF=21;SAR=23;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0356196;STB=0.528412;TYPE=snp;VARB=0.0132101;OID=.;OPOS=45000547;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:48:49:4:5:44:44:23:21:1:3:23:21:1:4 chr17 45214523 . A C 26.86 PASS AO=16;DP=56;FAO=13;FDP=54;FR=.;FRO=41;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=-0.0250478;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.1327;QD=1.98978;RBI=0.0253015;REFB=0.000646924;REVB=0.00357432;RO=40;SAF=9;SAR=7;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103381;STB=0.519969;TYPE=snp;VARB=-0.00278915;OID=.;OPOS=45214523;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:56:54:40:41:16:13:7:9:19:21:7:6:20:21 chr17 45214527 . T C 76.36 PASS AO=23;DP=58;FAO=22;FDP=57;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.0127418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.345;QD=5.35859;RBI=0.0132214;REFB=-0.0227772;REVB=0.0035287;RO=34;SAF=14;SAR=9;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174751;STB=0.599274;TYPE=snp;VARB=0.0394981;OID=.;OPOS=45214527;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:58:57:34:35:23:22:9:14:15:19:9:13:15:20 chr17 45214544 . T C 29.65 PASS AO=11;DP=55;FAO=14;FDP=58;FR=.;FRO=44;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=0.0227583;FXX=0.0333278;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.68;QD=2.04463;RBI=0.0387111;REFB=-0.017374;REVB=-0.0313147;RO=44;SAF=4;SAR=7;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115401;STB=0.534434;TYPE=snp;VARB=0.053076;OID=.;OPOS=45214544;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:55:58:44:44:11:14:7:4:20:24:7:7:20:24 chr17 45214582 . A G 18.46 PASS AO=14;DP=74;FAO=14;FDP=74;FR=.;FRO=60;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=30;FSRR=30;FWDB=-0.0173198;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=262.759;QD=0.997911;RBI=0.0174745;REFB=-4.98682e-05;REVB=0.00231958;RO=58;SAF=10;SAR=4;SRF=30;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.25599;STB=0.679735;TYPE=snp;VARB=0.000306067;OID=.;OPOS=45214582;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:74:74:58:60:14:14:4:10:30:28:4:10:30:30 chr17 45214592 . T G 10.29 PASS AO=11;DP=72;FAO=11;FDP=72;FR=.;FRO=61;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=31;FSRR=30;FWDB=0.0049614;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.425;QD=0.571813;RBI=0.0085117;REFB=0.000825511;REVB=0.00691618;RO=61;SAF=7;SAR=4;SRF=31;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160333;STB=0.610054;TYPE=snp;VARB=-0.0115051;OID=.;OPOS=45214592;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:72:72:61:61:11:11:4:7:31:30:4:7:31:30 chr17 45214631 . G A 20.25 PASS AO=13;DP=64;FAO=13;FDP=64;FR=.;FRO=51;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=-0.0044893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.478;QD=1.26543;RBI=0.0171707;REFB=-0.0038104;REVB=-0.0165734;RO=49;SAF=8;SAR=5;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204579;STB=0.615207;TYPE=snp;VARB=0.0181208;OID=.;OPOS=45214631;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:64:64:49:51:13:13:5:8:22:27:5:8:24:27 chr17 45214643 . A C 13.38 PASS AO=11;DP=67;FAO=11;FDP=64;FR=.;FRO=53;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=23;FSRR=30;FWDB=0.0298247;FXX=0.0447694;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3608;QD=0.836057;RBI=0.0426845;REFB=9.28682e-05;REVB=0.0305361;RO=53;SAF=9;SAR=2;SRF=23;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.475778;STB=0.817604;TYPE=snp;VARB=0.00382654;OID=.;OPOS=45214643;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:67:64:53:53:11:11:2:9:23:30:2:9:23:30 chr17 45214682 . A G 31.01 PASS AO=14;DP=58;FAO=15;FDP=59;FR=.;FRO=44;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=31;FWDB=0.0115695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.528;QD=2.10204;RBI=0.0181012;REFB=-0.00472302;REVB=-0.0139213;RO=44;SAF=9;SAR=5;SRF=13;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.405391;STB=0.75759;TYPE=snp;VARB=0.00700993;OID=.;OPOS=45214682;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:58:59:44:44:14:15:5:9:13:31:5:10:13:31 chr17 45216168 . T C 24.95 PASS AO=17;DP=82;FAO=17;FDP=82;FR=.;FRO=65;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=32;FSRR=33;FWDB=0.00871801;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=202.935;QD=1.21699;RBI=0.0186428;REFB=0.00110231;REVB=-0.0164788;RO=64;SAF=14;SAR=3;SRF=31;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.450767;STB=0.784688;TYPE=snp;VARB=-0.0321838;OID=.;OPOS=45216168;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:82:82:64:65:17:17:3:14:31:33:3:14:32:33 chr17 45216169 . T G 30.2 PASS AO=19;DP=81;FAO=18;FDP=80;FR=.;FRO=62;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=29;FSRR=33;FWDB=0.00827395;FXX=0.0123442;HRUN=5;LEN=1;MLLD=69.3176;QD=1.51019;RBI=0.0119223;REFB=0.00417506;REVB=0.00858391;RO=62;SAF=16;SAR=3;SRF=29;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.495169;STB=0.803214;TYPE=snp;VARB=-0.00299781;OID=.;OPOS=45216169;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:81:80:62:62:19:18:3:16:29:33:3:15:29:33 chr17 45216172 . A G 33.04 PASS AO=20;DP=82;FAO=19;FDP=82;FR=.;FRO=63;FSAF=16;FSAR=3;FSRF=31;FSRR=32;FWDB=0.00128199;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.1936;QD=1.61155;RBI=0.0192099;REFB=-0.00837465;REVB=0.0191671;RO=62;SAF=17;SAR=3;SRF=30;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.494561;STB=0.798517;TYPE=snp;VARB=0.0243345;OID=.;OPOS=45216172;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:82:82:62:63:20:19:3:17:30:32:3:16:31:32 chr17 45216210 . A G 58.9 PASS AO=21;DP=65;FAO=21;FDP=65;FR=.;FRO=44;FSAF=20;FSAR=1;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=0.0202995;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.441;QD=3.62453;RBI=0.0306843;REFB=-0.00868196;REVB=0.0230099;RO=44;SAF=20;SAR=1;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.69156;STB=0.920815;TYPE=snp;VARB=0.017833;OID=.;OPOS=45216210;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:65:65:44:44:21:21:1:20:21:23:1:20:21:23 chr17 45216216 . A G 58.89 PASS AO=21;DP=65;FAO=21;FDP=65;FR=.;FRO=44;FSAF=20;FSAR=1;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=-0.0138635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.518;QD=3.62429;RBI=0.029826;REFB=0.00700015;REVB=-0.0264082;RO=44;SAF=20;SAR=1;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.69156;STB=0.920815;TYPE=snp;VARB=-0.0469361;OID=.;OPOS=45216216;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:65:65:44:44:21:21:1:20:21:23:1:20:21:23 chr17 45234298 . G C 169.89 PASS AO=32;DP=54;FAO=32;FDP=54;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=26;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.0312374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.2876;QD=12.5843;RBI=0.0319106;REFB=-0.0411879;REVB=0.00652001;RO=21;SAF=6;SAR=26;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235806;STB=0.645861;TYPE=snp;VARB=0.041091;OID=.;OPOS=45234298;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:54:54:21:22:32:32:26:6:9:12:26:6:10:12 chr17 45234331 . T G 10.29 PASS AO=11;DP=72;FAO=11;FDP=72;FR=.;FRO=61;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=40;FWDB=-0.0281939;FXX=0.0136968;HRUN=5;LEN=1;MLLD=45.7881;QD=0.571679;RBI=0.0397752;REFB=0.0145887;REVB=-0.0280565;RO=60;SAF=2;SAR=9;SRF=21;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.259089;STB=0.678322;TYPE=snp;VARB=-0.0888947;OID=.;OPOS=45234331;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:72:72:60:61:11:11:9:2:21:39:9:2:21:40 chr17 45234343 . T G 189.05 PASS AO=40;DP=75;FAO=40;FDP=75;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=31;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=-0.0204708;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=253.981;QD=10.0826;RBI=0.0217858;REFB=-0.00932673;REVB=-0.00745439;RO=34;SAF=9;SAR=31;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167326;STB=0.60367;TYPE=snp;VARB=0.00635084;OID=.;OPOS=45234343;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:34:35:40:40:31:9:13:21:31:9:14:21 chr17 45234360 . A C 199.71 PASS AO=46;DP=92;FAO=46;FDP=93;FR=.;FRO=47;FSAF=15;FSAR=31;FSRF=22;FSRR=25;FWDB=-0.0129311;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.6029;QD=8.58976;RBI=0.0155709;REFB=-0.010153;REVB=-0.00867399;RO=46;SAF=15;SAR=31;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126909;STB=0.577217;TYPE=snp;VARB=0.00825475;OID=.;OPOS=45234360;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:93:46:47:46:46:31:15:21:25:31:15:22:25 chr17 45234403 . T G 81.48 PASS AO=28;DP=82;FAO=28;FDP=82;FR=.;FRO=54;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=0.00173436;FXX=0.0120467;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.215;QD=3.97476;RBI=0.00539167;REFB=-0.0372339;REVB=-0.00510511;RO=53;SAF=10;SAR=18;SRF=25;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134017;STB=0.572674;TYPE=snp;VARB=0.0101312;OID=.;OPOS=45234403;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:82:82:53:54:28:28:18:10:25:28:18:10:25:29 chr17 45234404 . T G 87.87 PASS AO=29;DP=83;FAO=29;FDP=82;FR=.;FRO=53;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=24;FSRR=29;FWDB=-0.0071501;FXX=0.0120467;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.172;QD=4.28633;RBI=0.00790388;REFB=-0.0100292;REVB=0.00336859;RO=53;SAF=11;SAR=18;SRF=24;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0850273;STB=0.549224;TYPE=snp;VARB=0.0225374;OID=.;OPOS=45234404;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:83:82:53:53:29:29:18:11:24:29:18:11:24:29 chr17 45234406 . CA C 32.14 PASS AO=18;DP=81;FAO=18;FDP=77;FR=.;FRO=59;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=33;FWDB=-0.025989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.782;QD=1.66968;RBI=0.0333117;REFB=-0.00795054;REVB=-0.0208385;RO=58;SAF=7;SAR=11;SRF=26;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0753212;STB=0.540938;TYPE=del;VARB=0.0157075;OID=.;OPOS=45234407;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:18:77:18:77:59:7:11:26:33:32:58:7:11:26:32 chr17 45234416 . A G 33.67 PASS AO=17;DP=69;FAO=17;FDP=69;FR=.;FRO=52;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=24;FSRR=28;FWDB=-0.0138639;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.998;QD=1.95187;RBI=0.025603;REFB=0.0049483;REVB=-0.0215246;RO=51;SAF=8;SAR=9;SRF=23;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240647;STB=0.506841;TYPE=snp;VARB=-0.0304614;OID=.;OPOS=45234416;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:69:69:51:52:17:17:9:8:23:28:9:8:24:28 chr17 45234417 . A G 34.44 PASS AO=17;DP=68;FAO=17;FDP=68;FR=.;FRO=51;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=0.00491886;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.8235;QD=2.02561;RBI=0.0274496;REFB=-0.00974315;REVB=-0.0270053;RO=51;SAF=7;SAR=10;SRF=24;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0728127;STB=0.544762;TYPE=snp;VARB=0.0382089;OID=.;OPOS=45234417;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:68:68:51:51:17:17:10:7:24:27:10:7:24:27 chr17 45234420 . T G 125.29 PASS AO=29;DP=63;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.00436872;FXX=0.0468677;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.6769;QD=8.2155;RBI=0.017648;REFB=-0.0146922;REVB=-0.0170988;RO=31;SAF=12;SAR=17;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.065637;STB=0.54584;TYPE=snp;VARB=0.0142247;OID=.;OPOS=45234420;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:61:31:32:29:29:17:12:15:16:17:12:16:16 chr17 45266522 . T C 10.3 PASS AO=2;DP=8;FAO=2;FDP=8;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=-0.110395;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.32;QD=5.14758;RBI=0.17085;REFB=-0.0271008;REVB=-0.130394;RO=6;SAF=1;SAR=1;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.359974;STB=0.748118;TYPE=snp;VARB=0.00295874;OID=.;OPOS=45266522;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:8:6:6:2:2:1:1:1:5:1:1:1:5 chr17 45266535 . T C 58.39 PASS AO=8;DP=11;FAO=8;FDP=11;FR=.;FRO=3;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.00127925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.1398;QD=21.2325;RBI=0.00686937;REFB=-0.0245118;REVB=0.00674921;RO=3;SAF=6;SAR=2;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.370397;STB=0.713728;TYPE=snp;VARB=0.00393195;OID=.;OPOS=45266535;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:11:11:3:3:8:8:2:6:0:3:2:6:0:3 chr17 45266571 . T A 16.26 PASS AO=4;DP=14;FAO=4;FDP=14;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0443659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.8437;QD=4.64564;RBI=0.0445484;REFB=-0.0144176;REVB=-0.00402855;RO=10;SAF=2;SAR=2;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0380345;OID=.;OPOS=45266571;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:14:14:10:10:4:4:2:2:5:5:2:2:5:5 chr17 45368337 . A C 487.14 PASS AO=122;DP=259;FAO=122;FDP=258;FR=.;FRO=136;FSAF=38;FSAR=84;FSRF=37;FSRR=99;FWDB=-0.00602304;FXX=0.00386085;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.682;QD=7.5525;RBI=0.0110528;REFB=-0.00327971;REVB=-0.0092675;RO=135;SAF=38;SAR=84;SRF=36;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0509402;STB=0.524668;TYPE=snp;VARB=0.00301099;OID=.;OPOS=45368337;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:259:258:135:136:122:122:84:38:36:99:84:38:37:99 chr17 45369777 . A G 203.39 PASS AO=37;DP=61;FAO=37;FDP=61;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=23;FWDB=-0.0060083;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.524;QD=13.3371;RBI=0.0213041;REFB=-0.00392927;REVB=-0.0204393;RO=22;SAF=6;SAR=31;SRF=0;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243744;STB=0.598845;TYPE=snp;VARB=0.0051043;OID=.;OPOS=45369777;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:61:61:22:24:37:37:31:6:0:22:31:6:1:23 chr17 45369789 . G A 179.72 PASS AO=33;DP=54;FAO=33;FDP=54;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=20;FWDB=0.0204736;FXX=0.0181785;HRUN=3;LEN=1;MLLD=229.788;QD=13.3126;RBI=0.0205847;REFB=-0.0193153;REVB=0.00213554;RO=21;SAF=3;SAR=30;SRF=1;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102004;STB=0.555525;TYPE=snp;VARB=0.0105537;OID=.;OPOS=45369789;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:54:54:21:21:33:33:30:3:1:20:30:3:1:20 chr17 45388586 . T A 222.91 PASS AO=90;DP=275;FAO=90;FDP=274;FR=.;FRO=184;FSAF=69;FSAR=21;FSRF=74;FSRR=110;FWDB=0.00108501;FXX=0.0108299;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.2683;QD=3.25421;RBI=0.00961403;REFB=-0.0159438;REVB=-0.00955261;RO=183;SAF=69;SAR=21;SRF=74;SRR=109;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.433182;STB=0.750566;TYPE=snp;VARB=0.0293582;OID=.;OPOS=45388586;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:275:274:183:184:90:90:21:69:74:109:21:69:74:110 chr17 45438886 . CAGTG C 119.06 PASS AO=42;DP=147;FAO=44;FDP=131;FR=.;FRO=87;FSAF=14;FSAR=30;FSRF=30;FSRR=57;FWDB=-0.021305;FXX=0.0575498;HRUN=1;LEN=4;MLLD=228.127;QD=3.63551;RBI=0.0213055;REFB=-0.010676;REVB=0.000148202;RO=88;SAF=13;SAR=29;SRF=32;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0712837;STB=0.520085;TYPE=del;VARB=0.0213362;OID=.;OPOS=45438887;OREF=AGTG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:42:140:44:131:87:14:30:30:57:99:88:13:29:32:56 chr17 45451894 . G A 467.17 PASS AO=133;DP=313;FAO=133;FDP=311;FR=.;FRO=178;FSAF=65;FSAR=68;FSRF=89;FSRR=89;FWDB=-0.0522843;FXX=0.00638957;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.7531;QD=6.00855;RBI=0.0523122;REFB=-0.00310538;REVB=-0.00170912;RO=177;SAF=65;SAR=68;SRF=88;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00868234;STB=0.506455;TYPE=snp;VARB=0.00429317;OID=.;OPOS=45451894;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:313:311:177:178:133:133:68:65:88:89:68:65:89:89 chr17 45567593 . ATC A 183.93 PASS AO=27;DP=100;FAO=44;FDP=94;FR=.;FRO=50;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=14;FSRR=36;FWDB=0.0241692;FXX=0.0408122;HRUN=1;LEN=2;MLLD=196.08;QD=7.82673;RBI=0.0255591;REFB=-0.029311;REVB=-0.00831383;RO=30;SAF=7;SAR=20;SRF=5;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121111;STB=0.572864;TYPE=del;VARB=0.0311664;OID=.;OPOS=45567594;OREF=TC;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:27:66:44:94:50:18:26:14:36:99:30:7:20:5:25 chr17 45569814 . GAGG GGG,GA,GGGG 532.34 PASS AO=19,31,15;DP=99;FAO=26,41,10;FDP=94;FR=.;FRO=17;FSAF=20,41,1;FSAR=6,0,9;FSRF=0;FSRR=17;FWDB=0.0516679,0.146288,0.0363446;FXX=0.0504999;HRUN=1,3,1;LEN=1,2,1;MLLD=164.221,32.5502,166.391;QD=22.6529;RBI=0.0581432,0.22272,0.0536323;REFB=-0.00021517,-0.0454721,0.00429886;REVB=-0.0266655,0.167941,-0.0394397;RO=15;SAF=18,31,1;SAR=1,0,14;SRF=0;SRR=15;SSEN=0,0.460204,0;SSEP=0,0.485036,0;SSSB=0.781537,0.888512,0.318176;STB=0.792887,0.999655,0.742584;TYPE=del,del,snp;VARB=-0.0232922,0.0682249,0.0180531;OID=.,.,.;OPOS=45569815,45569816,45569815;OREF=A,GG,A;OALT=-,-,G;OMAPALT=GGG,GA,GGGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:19,31,15:93:26,41,10:94:17:20,41,1:6,0,9:0:17:88:15:18,31,1:1,0,14:0:15 chr17 45700384 . C CCTA 360.57 PASS AO=99;DP=239;FAO=102;FDP=238;FR=.;FRO=136;FSAF=61;FSAR=41;FSRF=87;FSRR=49;FWDB=-0.00652009;FXX=0.00418393;HRUN=2;LEN=3;MLLD=207.671;QD=6.06004;RBI=0.00852951;REFB=-0.0212715;REVB=-0.00549918;RO=136;SAF=59;SAR=40;SRF=87;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0476423;STB=0.524999;TYPE=ins;VARB=0.0302216;OID=.;OPOS=45700385;OREF=-;OALT=CTA;OMAPALT=CCTA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:99:239:102:238:136:61:41:87:49:99:136:59:40:87:49 chr17 45759767 . C T 467.85 PASS AO=97;DP=215;FAO=119;FDP=238;FR=.;FRO=119;FSAF=67;FSAR=52;FSRF=41;FSRR=78;FWDB=0.0555067;FXX=0.00833299;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.3756;QD=7.86307;RBI=0.0639645;REFB=-0.0310754;REVB=0.0317878;RO=118;SAF=56;SAR=41;SRF=41;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.224626;STB=0.607968;TYPE=snp;VARB=0.0406914;OID=.;OPOS=45759767;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:238:118:119:97:119:41:56:41:77:52:67:41:78 chr17 45760349 . T C 1170.08 PASS AO=122;DP=126;FAO=127;FDP=129;FR=.;FRO=2;FSAF=90;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.032919;FXX=0.00769172;HRUN=4;LEN=1;MLLD=280.261;QD=36.2817;RBI=0.0330638;REFB=-0.202499;REVB=-0.00309013;RO=0;SAF=90;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503904;TYPE=snp;VARB=0.000403615;OID=.;OPOS=45760349;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:126:129:0:2:122:127:32:90:0:0:37:90:1:1 chr17 45760429 . T C 592.75 PASS AO=66;DP=69;FAO=66;FDP=69;FR=.;FRO=3;FSAF=44;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0406444;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=165.449;QD=34.3621;RBI=0.0424904;REFB=-0.103255;REVB=-0.0123882;RO=1;SAF=44;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106189;STB=0.516124;TYPE=snp;VARB=0.000696585;OID=.;OPOS=45760429;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:69:69:1:3:66:66:22:44:1:0:22:44:1:2 chr17 45760433 . T C 592.61 PASS AO=66;DP=69;FAO=66;FDP=69;FR=.;FRO=3;FSAF=42;FSAR=24;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.00656443;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=268.361;QD=34.3542;RBI=0.0203672;REFB=-0.0506457;REVB=0.0192804;RO=3;SAF=42;SAR=24;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0325587;STB=0.517236;TYPE=snp;VARB=0.00183254;OID=.;OPOS=45760433;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:69:69:3:3:66:66:24:42:3:0:24:42:3:0 chr17 45760958 . TA T 93.87 PASS AO=38;DP=95;FAO=41;FDP=96;FR=.;FRO=55;FSAF=13;FSAR=28;FSRF=19;FSRR=36;FWDB=-0.0377891;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=21.5318;QD=3.91113;RBI=0.042485;REFB=-0.0178921;REVB=0.0194154;RO=55;SAF=13;SAR=25;SRF=19;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00387924;STB=0.518509;TYPE=del;VARB=0.029067;OID=.;OPOS=45760959;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:38:95:41:96:55:13:28:19:36:93:55:13:25:19:36 chr17 45885687 . A G 462.47 PASS AO=20;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0373983;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.144;QD=38.5391;RBI=0.0524587;REFB=0;REVB=-0.0367869;RO=0;SAF=0;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.3362e-06;OID=.;OPOS=45885687;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:21:48:0:0:20:48:20:0:0:0:24:24:0:0 chr17 45885756 . C T 117.09 PASS AO=28;DP=61;FAO=28;FDP=61;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=0.0403721;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.9;QD=7.67794;RBI=0.0403779;REFB=-0.0119715;REVB=-0.000680857;RO=32;SAF=12;SAR=16;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0523077;STB=0.519217;TYPE=snp;VARB=0.0113428;OID=.;OPOS=45885756;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:32:33:28:28:16:12:12:20:16:12:13:20 chr17 45886758 . TCC TC,T 145.11 PASS AO=8,23;DP=56;FAO=0,33;FDP=50;FR=.;FRO=17;FSAF=0,28;FSAR=0,5;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=0.210321,0.114039;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,2;MLLD=14.5219,27.3455;QD=11.6088;RBI=0.275701,0.150401;REFB=-0.059146,-0.033515;REVB=0.178259,0.0980595;RO=16;SAF=6,21;SAR=2,2;SRF=4;SRR=12;SSEN=0,0;SSEP=0.347826,0.347826;SSSB=0.509185,0.625654;STB=0.5,0.758856;TYPE=del,del;VARB=0,0.0279195;OID=.,.;OPOS=45886759,45886759;OREF=C,CC;OALT=-,-;OMAPALT=TC,T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:8,23:50:0,33:50:17:0,28:0,5:4:13:31:16:6,21:2,2:4:12 chr17 45887951 . G T 75.7 PASS AO=15;DP=28;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.0052941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.283;QD=10.0928;RBI=0.0355149;REFB=-0.0211326;REVB=0.0351181;RO=11;SAF=12;SAR=3;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.244687;STB=0.631385;TYPE=snp;VARB=0.0196221;OID=.;OPOS=45887951;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:28:30:11:15:15:15:3:12:6:5:3:12:9:6 chr17 45890703 . AGGGC AGGC,AGGGT 310.28 PASS AO=20,17;DP=47;FAO=29,17;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=21,12;FSAR=8,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.204102,-0.0038265;FXX=0.0212721;HRUN=3,1;LEN=1,1;MLLD=17.9361,210.042;QD=26.9809;RBI=0.325802,0.0267916;REFB=-0.0696736,-0.00489141;REVB=0.253948,0.0265169;RO=8;SAF=17,12;SAR=3,5;SRF=3;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0.22249,0;SSSB=0.346375,0.206534;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.171153,0.00155183;OID=.,.;OPOS=45890704,45890707;OREF=G,C;OALT=-,T;OMAPALT=AGGC,AGGGT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:20,17:47:29,17:46:0:21,12:8,5:0:0:60:8:17,12:3,5:3:5 chr17 45904420 . C T 107.04 PASS AO=25;DP=52;FAO=25;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=7;FWDB=0.00655698;FXX=0.0185151;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.256;QD=8.07871;RBI=0.103048;REFB=-0.0115383;REVB=-0.10284;RO=26;SAF=15;SAR=10;SRF=21;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207376;STB=0.585302;TYPE=snp;VARB=0.0123399;OID=.;OPOS=45904420;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:53:26:28:25:25:10:15:21:5:10:15:21:7 chr17 45912696 . C T 206.97 PASS AO=68;DP=188;FAO=70;FDP=191;FR=.;FRO=121;FSAF=32;FSAR=38;FSRF=43;FSRR=78;FWDB=-0.00739882;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=217.467;QD=4.33441;RBI=0.0123667;REFB=-0.0117724;REVB=-0.00990917;RO=120;SAF=32;SAR=36;SRF=42;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137577;STB=0.565663;TYPE=snp;VARB=0.019185;OID=.;OPOS=45912696;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:191:120:121:68:70:36:32:42:78:38:32:43:78 chr17 45915788 . T C 743.92 PASS AO=67;DP=70;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0379035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.842;QD=37.6669;RBI=0.0456963;REFB=0;REVB=0.0255241;RO=0;SAF=17;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00113378;OID=.;OPOS=45915788;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:70:79:0:0:67:79:50:17:0:0:61:18:0:0 chr17 45994044 . C T 173.75 PASS AO=43;DP=93;FAO=43;FDP=93;FR=.;FRO=50;FSAF=34;FSAR=9;FSRF=38;FSRR=12;FWDB=0.00745992;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.2966;QD=7.47323;RBI=0.0818982;REFB=0.00155874;REVB=0.0815578;RO=49;SAF=34;SAR=9;SRF=37;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.049511;STB=0.524217;TYPE=snp;VARB=-0.000745941;OID=.;OPOS=45994044;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:49:50:43:43:9:34:37:12:9:34:38:12 chr17 45994094 . T C 231.54 PASS AO=64;DP=150;FAO=64;FDP=150;FR=.;FRO=86;FSAF=56;FSAR=8;FSRF=70;FSRR=16;FWDB=-0.00854686;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.9385;QD=6.17448;RBI=0.013884;REFB=0.00884895;REVB=0.0109415;RO=86;SAF=56;SAR=8;SRF=70;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126324;STB=0.571404;TYPE=snp;VARB=-0.0125747;OID=.;OPOS=45994094;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:150:86:86:64:64:8:56:70:16:8:56:70:16 chr17 45994154 . G A 22.28 PASS AO=9;DP=36;FAO=9;FDP=36;FR=.;FRO=27;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.101403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.3924;QD=2.47505;RBI=0.103462;REFB=-0.0100475;REVB=-0.0205389;RO=25;SAF=2;SAR=7;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.405392;STB=0.736288;TYPE=snp;VARB=0.0463952;OID=.;OPOS=45994154;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:36:36:25:27:9:9:7:2:14:11:7:2:14:13 chr17 46002744 . G T 174.27 PASS AO=42;DP=92;FAO=43;FDP=93;FR=.;FRO=50;FSAF=15;FSAR=28;FSRF=16;FSRR=34;FWDB=0.00258493;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.804;QD=7.49527;RBI=0.00847633;REFB=-0.00197968;REVB=0.00807257;RO=50;SAF=15;SAR=27;SRF=16;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0398523;STB=0.517233;TYPE=snp;VARB=0.00291735;OID=.;OPOS=46002744;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:93:50:50:42:43:27:15:16:34:28:15:16:34 chr17 46005792 . A ACT 197.52 PASS AO=62;DP=170;FAO=64;FDP=170;FR=.;FRO=106;FSAF=29;FSAR=35;FSRF=36;FSRR=70;FWDB=-0.0102118;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=217.166;QD=4.6476;RBI=0.0111389;REFB=-0.00142671;REVB=0.00444895;RO=105;SAF=29;SAR=33;SRF=36;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140886;STB=0.572347;TYPE=ins;VARB=0.00211317;OID=.;OPOS=46005793;OREF=-;OALT=CT;OMAPALT=ACT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:62:170:64:170:106:29:35:36:70:99:105:29:33:36:69 chr17 46026156 . A G 180.51 PASS AO=36;DP=64;FAO=36;FDP=64;FR=.;FRO=28;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.00210361;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.911;QD=11.2819;RBI=0.00210566;REFB=-0.00371068;REVB=-9.30094e-05;RO=28;SAF=20;SAR=16;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0443619;STB=0.524462;TYPE=snp;VARB=0.00265067;OID=.;OPOS=46026156;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:28:28:36:36:16:20:14:14:16:20:14:14 chr17 46030551 . T A 295.88 PASS AO=77;DP=174;FAO=79;FDP=178;FR=.;FRO=99;FSAF=21;FSAR=58;FSRF=33;FSRR=66;FWDB=-0.00264329;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=298.273;QD=6.64889;RBI=0.0101849;REFB=0.00210401;REVB=0.00983592;RO=97;SAF=21;SAR=56;SRF=33;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0813689;STB=0.546013;TYPE=snp;VARB=-0.00227685;OID=.;OPOS=46030551;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:178:97:99:77:79:56:21:33:64:58:21:33:66 chr17 46132424 . C G 79.04 PASS AO=26;DP=74;FAO=26;FDP=74;FR=.;FRO=48;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=0.0175399;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.1948;QD=4.27216;RBI=0.0194864;REFB=0.0148595;REVB=-0.00848965;RO=47;SAF=13;SAR=13;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0828657;STB=0.554013;TYPE=snp;VARB=-0.0440594;OID=.;OPOS=46132424;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:74:74:47:48:26:26:13:13:20:27:13:13:20:28 chr17 46136133 . G C 93.63 PASS AO=27;DP=68;FAO=27;FDP=69;FR=.;FRO=42;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=-0.0436104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.132;QD=5.42768;RBI=0.0436687;REFB=0.00810356;REVB=-0.0022574;RO=39;SAF=7;SAR=20;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235316;STB=0.647366;TYPE=snp;VARB=-0.0134127;OID=.;OPOS=46136133;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:68:69:39:42:27:27:20:7:18:21:20:7:20:22 chr17 46136309 . TG T 180.16 PASS AO=25;DP=37;FAO=30;FDP=32;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.201846;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.6302;QD=22.5201;RBI=0.210695;REFB=-0.0524544;REVB=0.0604189;RO=4;SAF=22;SAR=3;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0.52;SSSB=0.190623;STB=0.624902;TYPE=del;VARB=0.0234137;OID=.;OPOS=46136310;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:25:30:30:32:2:27:3:0:2:8:4:22:3:2:2 chr17 46137055 . GCTGGAC G 69.62 PASS AO=18;DP=66;FAO=25;FDP=72;FR=.;FRO=47;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=-0.0070325;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=6;MLLD=263.187;QD=3.86788;RBI=0.0129147;REFB=-0.0224392;REVB=0.010832;RO=37;SAF=9;SAR=9;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0153657;STB=0.600601;TYPE=del;VARB=0.0402295;OID=.;OPOS=46137056;OREF=CTGGAC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:18:58:25:72:47:9:16:24:23:69:37:9:9:18:19 chr17 46166073 . G A 605.83 PASS AO=218;DP=511;FAO=172;FDP=400;FR=.;FRO=228;FSAF=82;FSAR=90;FSRF=106;FSRR=122;FWDB=-0.00468759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.533;QD=6.05833;RBI=0.00475729;REFB=-0.00915742;REVB=0.000811337;RO=289;SAF=101;SAR=117;SRF=133;SRR=156;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00319848;STB=0.506762;TYPE=snp;VARB=0.0144049;OID=.;OPOS=46166073;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:511:400:289:228:218:172:117:101:133:156:90:82:106:122 chr17 46262171 . C T 301.19 PASS AO=79;DP=175;FAO=79;FDP=175;FR=.;FRO=96;FSAF=29;FSAR=50;FSRF=45;FSRR=51;FWDB=0.00614588;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.265;QD=6.88439;RBI=0.0163131;REFB=0.00736236;REVB=0.0151111;RO=96;SAF=29;SAR=50;SRF=45;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104495;STB=0.558139;TYPE=snp;VARB=-0.00808717;OID=.;OPOS=46262171;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:175:96:96:79:79:50:29:45:51:50:29:45:51 chr17 46507417 . G A 130.02 PASS AO=41;DP=109;FAO=41;FDP=109;FR=.;FRO=68;FSAF=9;FSAR=32;FSRF=23;FSRR=45;FWDB=-0.00304833;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=235.467;QD=4.77128;RBI=0.0032322;REFB=-0.0115605;REVB=0.0010746;RO=68;SAF=9;SAR=32;SRF=23;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167362;STB=0.596338;TYPE=snp;VARB=0.0186579;OID=.;OPOS=46507417;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:68:68:41:41:32:9:23:45:32:9:23:45 chr17 46607021 . T C 1627.7 PASS AO=173;DP=174;FAO=173;FDP=173;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.051726;FXX=0.0057468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.5119;QD=37.6347;RBI=0.0697724;REFB=-0.00774167;REVB=-0.0468252;RO=0;SAF=68;SAR=105;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000443877;OID=.;OPOS=46607021;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:174:173:0:0:173:173:105:68:0:0:105:68:0:0 chr17 46621101 . C T 47.93 PASS AO=7;DP=11;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=121.616;QD=17.4308;RBI=0.140037;REFB=-0.230501;REVB=0.140037;RO=4;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0299116;OID=.;OPOS=46621101;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:11:11:4:4:7:7:7:0:0:4:7:0:0:4 chr17 46626811 . G GGACA 279.42 PASS AO=34;DP=45;FAO=37;FDP=44;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0.0103661;FXX=0.0222173;HRUN=3;LEN=4;MLLD=287.328;QD=25.402;RBI=0.011081;REFB=0.00841164;REVB=-0.00391554;RO=8;SAF=4;SAR=30;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109757;STB=0.547921;TYPE=ins;VARB=-0.00137328;OID=.;OPOS=46626812;OREF=-;OALT=GACA;OMAPALT=GGACA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:34:45:37:44:7:4:33:0:7:9:8:4:30:0:8 chr17 46628084 . G T 144.25 PASS AO=22;DP=31;FAO=22;FDP=31;FR=.;FRO=9;FSAF=22;FSAR=0;FSRF=9;FSRR=0;FWDB=-0.0324849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=308.485;QD=18.6128;RBI=0.0324849;REFB=0.00138848;REVB=0;RO=9;SAF=22;SAR=0;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000456597;OID=.;OPOS=46628084;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:31:31:9:9:22:22:0:22:9:0:0:22:9:0 chr17 46629593 . G C,T 241.88 PASS AO=7,25;DP=38;FAO=7,26;FDP=38;FR=.;FRO=5;FSAF=2,11;FSAR=5,15;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0283996,0.0336218;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=30.0359,85.9958;QD=25.4615;RBI=0.0570135,0.0446175;REFB=-0.0417204,-0.17978;REVB=0.0494368,0.0293307;RO=2;SAF=2,11;SAR=5,14;SRF=1;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0955799,-0.00834051;STB=0.640603,0.528945;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00458898,0.0060545;OID=.,.;OPOS=46629593,46629593;OREF=G,G;OALT=C,T;OMAPALT=C,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:15:38:38:2:5:7,25:7,26:5,14:2,11:1:1:5,15:2,11:3:2 chr17 46653037 . AT A 747.1 PASS AO=116;DP=394;FAO=193;FDP=389;FR=.;FRO=196;FSAF=87;FSAR=106;FSRF=76;FSRR=120;FWDB=-0.00801983;FXX=0.0274993;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.444;QD=7.68228;RBI=0.00846474;REFB=0.0124618;REVB=-0.00270816;RO=209;SAF=46;SAR=70;SRF=81;SRR=128;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106804;STB=0.532265;TYPE=del;VARB=-0.0149151;OID=.;OPOS=46653038;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:116:386:193:389:196:87:106:76:120:99:209:46:70:81:128 chr17 46670520 . T C 244.25 PASS AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0140364;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=176.981;QD=34.8929;RBI=0.0434004;REFB=-0.0334818;REVB=0.0410679;RO=1;SAF=24;SAR=3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0189901;STB=0.510197;TYPE=snp;VARB=0.00143247;OID=.;OPOS=46670520;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:28:28:1:1:27:27:3:24:1:0:3:24:1:0 chr17 46684929 . A G 396.38 PASS AO=81;DP=147;FAO=82;FDP=147;FR=.;FRO=65;FSAF=35;FSAR=47;FSRF=25;FSRR=40;FWDB=0.0324157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.961;QD=10.7859;RBI=0.0509033;REFB=0.0147386;REVB=-0.0392475;RO=65;SAF=34;SAR=47;SRF=26;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0165848;STB=0.519177;TYPE=snp;VARB=-0.0132614;OID=.;OPOS=46684929;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:147:65:65:81:82:47:34:26:39:47:35:25:40 chr17 46688135 . G A 43.04 PASS AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0146312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.324;QD=14.3483;RBI=0.0225072;REFB=-0.0170959;REVB=0.0171027;RO=5;SAF=2;SAR=5;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0935942;STB=0.55539;TYPE=snp;VARB=0.0218191;OID=.;OPOS=46688135;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:12:12:5:5:7:7:5:2:2:3:5:2:2:3 chr17 46688256 . T C 481.18 PASS AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.018503;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.0537;QD=37.74;RBI=0.022993;REFB=0;REVB=0.0136498;RO=0;SAF=27;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.29351e-05;OID=.;OPOS=46688256;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:51:51:0:0:51:51:24:27:0:0:24:27:0:0 chr17 46689680 . C A 11.94 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.00821961;FXX=0.124844;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.229;QD=6.824;RBI=0.00821961;REFB=-0.00735047;REVB=0;RO=4;SAF=2;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0342902;OID=.;OPOS=46689680;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:7:7:4:5:2:2:0:2:4:0:0:2:5:0 chr17 46805443 . A G 327.37 PASS AO=73;DP=143;FAO=73;FDP=141;FR=.;FRO=68;FSAF=46;FSAR=27;FSRF=30;FSRR=38;FWDB=0.0842364;FXX=0.013985;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2157;QD=9.28709;RBI=0.0850447;REFB=-0.00669695;REVB=-0.0116979;RO=70;SAF=45;SAR=28;SRF=31;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156602;STB=0.592993;TYPE=snp;VARB=0.0105092;OID=.;OPOS=46805443;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:141:70:68:73:73:28:45:31:39:27:46:30:38 chr17 46842983 . T C 1127.71 PASS AO=123;DP=126;FAO=123;FDP=126;FR=.;FRO=3;FSAF=57;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.017572;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.63;QD=35.8002;RBI=0.0224734;REFB=0.0541111;REVB=-0.0140099;RO=3;SAF=57;SAR=66;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0211022;STB=0.511109;TYPE=snp;VARB=-0.00340316;OID=.;OPOS=46842983;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:126:126:3:3:123:123:66:57:0:3:66:57:0:3 chr17 46881748 . T C 1205.08 PASS AO=125;DP=125;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000309312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.559;QD=38.2565;RBI=0.0187463;REFB=0;REVB=0.0187438;RO=0;SAF=70;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.44616e-05;OID=.;OPOS=46881748;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:125:126:0:0:125:126:55:70:0:0:56:70:0:0 chr17 46923384 . G A 169.53 PASS AO=104;DP=232;FAO=64;FDP=193;FR=.;FRO=129;FSAF=26;FSAR=38;FSRF=62;FSRR=67;FWDB=0.0147724;FXX=0.175206;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.679;QD=3.51363;RBI=0.0185588;REFB=0.00357197;REVB=-0.0112341;RO=122;SAF=67;SAR=37;SRF=56;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185103;STB=0.550527;TYPE=snp;VARB=-0.0099582;OID=.;OPOS=46923384;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:193:122:129:104:64:37:67:56:66:38:26:62:67 chr17 46926615 . G A 324.26 PASS AO=80;DP=162;FAO=78;FDP=161;FR=.;FRO=83;FSAF=54;FSAR=24;FSRF=62;FSRR=21;FWDB=0.0148952;FXX=0.00617246;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.0117;QD=8.05614;RBI=0.0581914;REFB=0.0106273;REVB=0.0562527;RO=80;SAF=55;SAR=25;SRF=60;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0681046;STB=0.533939;TYPE=snp;VARB=-0.0122195;OID=.;OPOS=46926615;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:161:80:83:80:78:25:55:60:20:24:54:62:21 chr17 46934001 . GCATTCA GCA,GCATTCC 545.46 PASS AO=31,30;DP=98;FAO=38,47;FDP=98;FR=.;FRO=13;FSAF=15,17;FSAR=23,30;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.00894022,0.0220529;FXX=0.019998;HRUN=2,1;LEN=4,1;MLLD=100.914,119.114;QD=22.2639;RBI=0.011928,0.0323938;REFB=-0.0682754,0.00905077;REVB=0.00789615,-0.0237282;RO=0;SAF=9,9;SAR=22,21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.15349e-08,0;STB=0.537706,0.540523;TYPE=del,snp;VARB=0.0690029,0.022247;OID=.,.;OPOS=46934002,46934007;OREF=CATT,A;OALT=-,C;OMAPALT=GCA,GCATTCC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:31,30:63:38,47:98:13:15,17:23,30:7:6:99:0:9,9:22,21:0:0 chr17 46970836 . A G 2182.55 PASS AO=209;DP=210;FAO=230;FDP=230;FR=.;FRO=0;FSAF=121;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00115469;FXX=0.00432882;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.746;QD=37.9574;RBI=0.0600845;REFB=-0.0254167;REVB=0.0600734;RO=0;SAF=121;SAR=88;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.97716e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.11802e-05;OID=.;OPOS=46970836;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:210:230:0:0:209:230:88:121:0:0:109:121:0:0 chr17 46971140 . G A 1791.92 PASS AO=186;DP=191;FAO=195;FDP=198;FR=.;FRO=3;FSAF=73;FSAR=122;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0410112;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6216;QD=36.2004;RBI=0.0424726;REFB=-0.00827322;REVB=0.0110453;RO=5;SAF=67;SAR=119;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129053;STB=0.500664;TYPE=snp;VARB=0.000725121;OID=.;OPOS=46971140;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:191:198:5:3:186:195:119:67:3:2:122:73:1:2 chr17 46972479 . ATCTC A 926.85 PASS AO=95;DP=111;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0462061;FXX=0.0202;HRUN=1;LEN=4;MLLD=249.782;QD=38.2208;RBI=0.046455;REFB=0;REVB=0.00480247;RO=0;SAF=7;SAR=88;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.24229e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.000952256;OID=.;OPOS=46972480;OREF=TCTC;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:95:97:97:97:0:7:90:0:0:44:0:7:88:0:0 chr17 47000251 . C T 2732.24 PASS AO=286;DP=288;FAO=286;FDP=286;FR=.;FRO=0;FSAF=150;FSAR=136;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0555349;FXX=0.0069442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.044;QD=38.2131;RBI=0.0555508;REFB=-0.0274416;REVB=-0.00133194;RO=0;SAF=150;SAR=136;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.82554e-05;OID=.;OPOS=47000251;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:288:286:0:0:286:286:136:150:0:0:136:150:0:0 chr17 47014675 . C T 578.62 PASS AO=59;DP=59;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.019917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.5516;QD=37.3302;RBI=0.0748277;REFB=0;REVB=0.0721283;RO=0;SAF=23;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000525391;OID=.;OPOS=47014675;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:59:62:0:0:59:62:36:23:0:0:38:24:0:0 chr17 47026836 . G C 715.62 PASS AO=80;DP=84;FAO=80;FDP=83;FR=.;FRO=3;FSAF=26;FSAR=54;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.00791466;FXX=0.0119033;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.565;QD=34.4878;RBI=0.0626762;REFB=-0.0408191;REVB=0.0621745;RO=3;SAF=26;SAR=54;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.051545;STB=0.527266;TYPE=snp;VARB=0.00907567;OID=.;OPOS=47026836;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:84:83:3:3:80:80:54:26:3:0:54:26:3:0 chr17 47039132 . T C 423.66 PASS AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.902;QD=37.6583;RBI=0.016812;REFB=0;REVB=0.00240827;RO=0;SAF=16;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.29867e-05;OID=.;OPOS=47039132;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:44:45:0:0:44:45:28:16:0:0:28:17:0:0 chr17 47128247 . C T 451.42 PASS AO=95;DP=174;FAO=95;FDP=173;FR=.;FRO=78;FSAF=57;FSAR=38;FSRF=28;FSRR=50;FWDB=0.013696;FXX=0.0057468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.7933;QD=10.4374;RBI=0.0646963;REFB=-0.0185569;REVB=-0.06323;RO=78;SAF=57;SAR=38;SRF=28;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198517;STB=0.608272;TYPE=snp;VARB=0.0135539;OID=.;OPOS=47128247;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:173:78:78:95:95:38:57:28:50:38:57:28:50 chr17 47131627 . G A 10.42 PASS AO=5;DP=20;FAO=4;FDP=19;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=3;FWDB=0.0138078;FXX=0.049975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.801;QD=2.19413;RBI=0.0411725;REFB=-0.00537856;REVB=0.0387882;RO=11;SAF=4;SAR=1;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108645;STB=0.555295;TYPE=snp;VARB=0.0190591;OID=.;OPOS=47131627;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:20:19:11:15:5:4:1:4:8:3:1:3:12:3 chr17 47210429 . A G 72.05 PASS AO=18;DP=41;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=-0.0161556;FXX=0.0238039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.593;QD=7.02971;RBI=0.0710757;REFB=-0.00439904;REVB=-0.0692152;RO=23;SAF=10;SAR=8;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201114;STB=0.614849;TYPE=snp;VARB=0.0103882;OID=.;OPOS=47210429;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:41:41:23:23:18:18:8:10:8:15:8:10:8:15 chr17 47210506 . C A 148.06 PASS AO=29;DP=53;FAO=30;FDP=53;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=4;FSRR=19;FWDB=0.0167327;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.1696;QD=11.1739;RBI=0.018198;REFB=0.000522855;REVB=0.00715435;RO=23;SAF=12;SAR=17;SRF=4;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206704;STB=0.606492;TYPE=snp;VARB=-0.00016944;OID=.;OPOS=47210506;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:53:53:23:23:29:30:17:12:4:19:18:12:4:19 chr17 47241604 . T C 1965.67 PASS AO=206;DP=206;FAO=205;FDP=205;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=155;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0274979;FXX=0.00485413;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.345;QD=38.3546;RBI=0.0358798;REFB=0;REVB=0.0230483;RO=0;SAF=51;SAR=155;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.79468e-05;OID=.;OPOS=47241604;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:206:205:0:0:206:205:155:51:0:0:155:50:0:0 chr17 47246163 . T C 1404.02 PASS AO=143;DP=143;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.060172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.802;QD=38.2046;RBI=0.0601914;REFB=0;REVB=0.00152617;RO=0;SAF=46;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.72207e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000178227;OID=.;OPOS=47246163;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:143:147:0:0:143:147:97:46:0:0:97:50:0:0 chr17 47246979 . A G 1623.16 PASS AO=167;DP=169;FAO=170;FDP=170;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212002;FXX=0.0116272;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.314;QD=38.192;RBI=0.0241473;REFB=0;REVB=0.0115603;RO=0;SAF=79;SAR=88;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.80027e-05;OID=.;OPOS=47246979;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:169:170:0:0:167:170:88:79:0:0:91:79:0:0 chr17 47297297 . T C 342.47 PASS AO=37;DP=39;FAO=38;FDP=40;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00691237;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=209.936;QD=34.2466;RBI=0.00820067;REFB=-0.086171;REVB=0.00441251;RO=2;SAF=12;SAR=25;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0360049;STB=0.519221;TYPE=snp;VARB=-7.70003e-05;OID=.;OPOS=47297297;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:39:40:2:2:37:38:25:12:0:2:25:13:0:2 chr17 47300823 . G A 41.05 PASS AO=11;DP=30;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=18;FSRR=1;FWDB=0.00832912;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=194.785;QD=5.47338;RBI=0.0447053;REFB=-0.00083489;REVB=0.0439226;RO=19;SAF=9;SAR=2;SRF=18;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.291664;STB=0.666443;TYPE=snp;VARB=0.00126844;OID=.;OPOS=47300823;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:30:30:19:19:11:11:2:9:18:1:2:9:18:1 chr17 47304007 . AC A 636.3 PASS AO=97;DP=132;FAO=123;FDP=131;FR=.;FRO=8;FSAF=60;FSAR=63;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.242821;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.4219;QD=19.4289;RBI=0.270589;REFB=-0.126418;REVB=0.119399;RO=30;SAF=46;SAR=51;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114248;STB=0.514539;TYPE=del;VARB=0.0412529;OID=.;OPOS=47304008;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:97:129:123:131:8:60:63:2:6:18:30:46:51:15:15 chr17 47373417 . T C 232.45 PASS AO=55;DP=113;FAO=55;FDP=113;FR=.;FRO=58;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=35;FSRR=23;FWDB=-0.0165349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.234;QD=8.22835;RBI=0.09084;REFB=-0.0127088;REVB=0.0893224;RO=58;SAF=25;SAR=30;SRF=35;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137288;STB=0.575973;TYPE=snp;VARB=0.0142088;OID=.;OPOS=47373417;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:58:58:55:55:30:25:35:23:30:25:35:23 chr17 47572518 . C T 67.74 PASS AO=11;DP=17;FAO=11;FDP=17;FR=.;FRO=6;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.00771417;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.366;QD=15.9378;RBI=0.0268908;REFB=0.0485549;REVB=0.0257606;RO=6;SAF=8;SAR=3;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161641;STB=0.592415;TYPE=snp;VARB=-0.0156252;OID=.;OPOS=47572518;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:17:17:6:6:11:11:3:8:3:3:3:8:3:3 chr17 47677191 . T C 130.22 PASS AO=38;DP=95;FAO=38;FDP=95;FR=.;FRO=57;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=32;FSRR=25;FWDB=0.00668257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.2951;QD=5.48278;RBI=0.0107266;REFB=0.00126938;REVB=-0.00839073;RO=57;SAF=16;SAR=22;SRF=32;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148177;STB=0.584027;TYPE=snp;VARB=-0.00261812;OID=.;OPOS=47677191;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:57:57:38:38:22:16:32:25:22:16:32:25 chr17 47788613 . AC A 25.36 PASS AO=5;DP=16;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.0290561;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=21.6541;QD=6.76398;RBI=0.0437939;REFB=-0.0572041;REVB=-0.0327666;RO=7;SAF=4;SAR=1;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0.460204;SSSB=0.478981;STB=0.822615;TYPE=del;VARB=0.0524203;OID=.;OPOS=47788614;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:5:14:8:15:7:7:1:2:5:22:7:4:1:2:5 chr17 47888852 . A G 759.31 PASS AO=76;DP=76;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00089875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.879;QD=37.4965;RBI=0.0597208;REFB=0;REVB=0.059714;RO=0;SAF=55;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00114683;OID=.;OPOS=47888852;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:76:81:0:0:76:81:21:55:0:0:26:55:0:0 chr17 47903381 . C T 298.57 PASS AO=70;DP=148;FAO=72;FDP=150;FR=.;FRO=78;FSAF=30;FSAR=42;FSRF=32;FSRR=46;FWDB=-0.000929746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.546;QD=7.96186;RBI=0.00110185;REFB=0.00461737;REVB=0.000591316;RO=78;SAF=28;SAR=42;SRF=32;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101408;STB=0.503432;TYPE=snp;VARB=-0.00452713;OID=.;OPOS=47903381;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:150:78:78:70:72:42:28:32:46:42:30:32:46 chr17 48067439 . G A 79.73 PASS AO=24;DP=64;FAO=24;FDP=64;FR=.;FRO=40;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=29;FWDB=-0.0285174;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=91.8623;QD=4.98292;RBI=0.0285449;REFB=-0.0204932;REVB=-0.001253;RO=40;SAF=7;SAR=17;SRF=11;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0220974;STB=0.512728;TYPE=snp;VARB=0.0468253;OID=.;OPOS=48067439;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:64:64:40:40:24:24:17:7:11:29:17:7:11:29 chr17 48067953 . T C 252.03 PASS AO=79;DP=203;FAO=79;FDP=203;FR=.;FRO=124;FSAF=51;FSAR=28;FSRF=72;FSRR=52;FWDB=-0.00692369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.715;QD=4.96618;RBI=0.0105346;REFB=-0.00730819;REVB=0.00793982;RO=117;SAF=51;SAR=28;SRF=71;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0442732;STB=0.542254;TYPE=snp;VARB=0.00863272;OID=.;OPOS=48067953;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:203:117:124:79:79:28:51:71:46:28:51:72:52 chr17 48070878 . C T 53.82 PASS AO=14;DP=35;FAO=14;FDP=35;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0203777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.499;QD=6.15137;RBI=0.0211625;REFB=0.0101962;REVB=-0.00570963;RO=21;SAF=7;SAR=7;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.024428;STB=0.514265;TYPE=snp;VARB=-0.0153109;OID=.;OPOS=48070878;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:35:35:21:21:14:14:7:7:11:10:7:7:11:10 chr17 48184157 . GC G 87.91 PASS AO=16;DP=22;FAO=17;FDP=22;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=16;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.0204687;FXX=0.0434594;HRUN=3;LEN=1;MLLD=20.7844;QD=15.9835;RBI=0.0221775;REFB=0.00229098;REVB=0.00853654;RO=4;SAF=1;SAR=15;SRF=4;SRR=0;SSEN=0.519481;SSEP=0;SSSB=-0.585361;STB=0.856585;TYPE=del;VARB=0.00414146;OID=.;OPOS=48184158;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:16:22:17:22:5:1:16:5:0:8:4:1:15:4:0 chr17 48248906 . C G 393.89 PASS AO=87;DP=162;FAO=87;FDP=168;FR=.;FRO=81;FSAF=27;FSAR=60;FSRF=39;FSRR=42;FWDB=-0.00907969;FXX=0.0232545;HRUN=5;LEN=1;MLLD=168.985;QD=9.37827;RBI=0.0313698;REFB=-0.0201705;REVB=-0.0300271;RO=75;SAF=27;SAR=60;SRF=34;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13311;STB=0.589791;TYPE=snp;VARB=0.017849;OID=.;OPOS=48248906;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:168:75:81:87:87:60:27:34:41:60:27:39:42 chr17 48248998 . C T 328.35 PASS AO=77;DP=160;FAO=78;FDP=160;FR=.;FRO=82;FSAF=40;FSAR=38;FSRF=43;FSRR=39;FWDB=0.0254702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.857;QD=8.20885;RBI=0.0366288;REFB=-0.00784804;REVB=0.0263238;RO=81;SAF=40;SAR=37;SRF=42;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000894876;STB=0.505934;TYPE=snp;VARB=0.00897988;OID=.;OPOS=48248998;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:160:81:82:77:78:37:40:42:39:38:40:43:39 chr17 48258140 . T C 182.35 PASS AO=22;DP=24;FAO=22;FDP=24;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0217078;FXX=0.039984;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.895;QD=30.3916;RBI=0.0308318;REFB=-0.0167714;REVB=0.0218945;RO=2;SAF=15;SAR=7;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0317672;STB=0.517226;TYPE=snp;VARB=0.000990186;OID=.;OPOS=48258140;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:24:24:2:2:22:22:7:15:1:1:7:15:1:1 chr17 48258321 . C T 101.06 PASS AO=28;DP=69;FAO=28;FDP=69;FR=.;FRO=41;FSAF=26;FSAR=2;FSRF=40;FSRR=1;FWDB=0.00471547;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.96;QD=5.85834;RBI=0.0226623;REFB=-0.0135322;REVB=0.0221663;RO=41;SAF=26;SAR=2;SRF=40;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232136;STB=0.628501;TYPE=snp;VARB=0.0150002;OID=.;OPOS=48258321;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:41:41:28:28:2:26:40:1:2:26:40:1 chr17 48265495 . T C 248.23 PASS AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00601222;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.512;QD=38.1896;RBI=0.0984661;REFB=0;REVB=0.0982824;RO=0;SAF=19;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.63811e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000134927;OID=.;OPOS=48265495;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:27:26:0:0:26:26:7:19:0:0:7:19:0:0 chr17 48268223 . A G 306.04 PASS AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0349204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.631;QD=37.0952;RBI=0.0446899;REFB=0;REVB=0.0278881;RO=0;SAF=14;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.71297e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000351945;OID=.;OPOS=48268223;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:33:33:0:0:33:33:19:14:0:0:19:14:0:0 chr17 48356260 . G C 324.16 PASS AO=24;DP=36;FAO=35;FDP=35;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=26;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.071959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.5045;QD=37.0466;RBI=0.0766295;REFB=0;REVB=0.0263438;RO=0;SAF=16;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0101877;OID=.;OPOS=48356260;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:35:0:0:24:35:8:16:0:0:9:26:0:0 chr17 48437456 . C G 129.92 PASS AO=19;DP=25;FAO=19;FDP=25;FR=.;FRO=6;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0235768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.619;QD=20.7872;RBI=0.035844;REFB=-0.00951876;REVB=-0.0269987;RO=6;SAF=13;SAR=6;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164689;STB=0.59081;TYPE=snp;VARB=0.00290745;OID=.;OPOS=48437456;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:25:25:6:6:19:19:6:13:2:4:6:13:2:4 chr17 48452776 . A C 223.79 PASS AO=44;DP=77;FAO=44;FDP=77;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=36;FSRF=8;FSRR=25;FWDB=-0.0223068;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=223.472;QD=11.6256;RBI=0.0273802;REFB=-0.0223623;REVB=-0.0158771;RO=33;SAF=8;SAR=36;SRF=8;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0750088;STB=0.541334;TYPE=snp;VARB=0.0140863;OID=.;OPOS=48452776;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:33:33:44:44:36:8:8:25:36:8:8:25 chr17 48472270 . C T 103.48 PASS AO=24;DP=52;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=4;FSAR=20;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.0125907;FXX=0.0727141;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.047;QD=8.11568;RBI=0.0181113;REFB=-0.00330653;REVB=-0.013019;RO=27;SAF=4;SAR=20;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.340629;STB=0.695465;TYPE=snp;VARB=0.00485087;OID=.;OPOS=48472270;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:51:27:27:24:24:20:4:12:15:20:4:12:15 chr17 48539035 . T C 30.54 PASS AO=8;DP=23;FAO=8;FDP=23;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.00995378;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.576;QD=5.31172;RBI=0.0234347;REFB=0.00244003;REVB=-0.0212157;RO=15;SAF=2;SAR=6;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10912;STB=0.56739;TYPE=snp;VARB=-0.00899992;OID=.;OPOS=48539035;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:23:23:15:15:8:8:6:2:5:10:6:2:5:10 chr17 48545596 . G A 34.26 PASS AO=15;DP=56;FAO=15;FDP=57;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=-0.0403882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.762;QD=2.40411;RBI=0.0486163;REFB=-0.0121942;REVB=0.0270619;RO=39;SAF=11;SAR=4;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.250633;STB=0.650173;TYPE=snp;VARB=0.0249719;OID=.;OPOS=48545596;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:56:57:39:42:15:15:4:11:21:18:4:11:23:19 chr17 48549791 . C G 107.12 PASS AO=26;DP=57;FAO=26;FDP=57;FR=.;FRO=31;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.00239972;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=220.949;QD=7.51708;RBI=0.0063941;REFB=-0.01324;REVB=-0.00592671;RO=31;SAF=18;SAR=8;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119052;STB=0.567514;TYPE=snp;VARB=0.0150151;OID=.;OPOS=48549791;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:31:31:26:26:8:18:18:13:8:18:18:13 chr17 48557326 . G A 195.71 PASS AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0437606;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.9646;QD=39.1418;RBI=0.0697491;REFB=0;REVB=0.0543134;RO=0;SAF=3;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000213705;OID=.;OPOS=48557326;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:20:20:0:0:20:20:17:3:0:0:17:3:0:0 chr17 48557348 . T C 189.44 PASS AO=19;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0232163;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.331;QD=37.8887;RBI=0.0353826;REFB=0;REVB=0.0267008;RO=0;SAF=4;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.00629e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000153238;OID=.;OPOS=48557348;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:20:20:0:0:19:20:15:4:0:0:16:4:0:0 chr17 48598785 . G A 2015.66 PASS AO=209;DP=210;FAO=211;FDP=211;FR=.;FRO=0;FSAF=108;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0848905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.657;QD=38.2116;RBI=0.084915;REFB=0;REVB=-0.00204074;RO=0;SAF=107;SAR=102;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.88022e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.98613e-05;OID=.;OPOS=48598785;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:210:211:0:0:209:211:102:107:0:0:103:108:0:0 chr17 48599450 . A T 604.94 PASS AO=65;DP=67;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0200813;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.747;QD=36.6629;RBI=0.0215837;REFB=-0.0117036;REVB=-0.00791189;RO=0;SAF=22;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505745;TYPE=snp;VARB=0.000248348;OID=.;OPOS=48599450;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:67:66:0:1:65:65:43:22:0:0:43:22:0:1 chr17 48603503 . C T 467.01 PASS AO=46;DP=46;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107524;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.44;QD=34.593;RBI=0.0209283;REFB=0;REVB=0.017955;RO=0;SAF=16;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.31553e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00281131;OID=.;OPOS=48603503;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:46:54:0:0:46:54:30:16:0:0:38:16:0:0 chr17 48606537 . C G 949.94 PASS AO=101;DP=101;FAO=102;FDP=103;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0332774;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3735;QD=36.8908;RBI=0.0499734;REFB=-0.166825;REVB=-0.0372822;RO=0;SAF=46;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.13729e-08;STB=0.504424;TYPE=snp;VARB=0.00247059;OID=.;OPOS=48606537;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:101:103:0:1:101:102:55:46:0:0:56:46:0:1 chr17 48607614 . G A 183.14 PASS AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0944186;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=238.503;QD=38.5549;RBI=0.0967932;REFB=0;REVB=0.0213086;RO=0;SAF=2;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.41729e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000346341;OID=.;OPOS=48607614;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:19:19:0:0:19:19:17:2:0:0:17:2:0:0 chr17 48608717 . T C 1353.4 PASS AO=142;DP=142;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0246547;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.573;QD=38.1239;RBI=0.0246628;REFB=0;REVB=-0.000631044;RO=0;SAF=62;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.24749e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.88273e-05;OID=.;OPOS=48608717;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:142:142:0:0:142:142:80:62:0:0:80:62:0:0 chr17 48610272 . G C 135.89 PASS AO=13;DP=13;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0304263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.936;QD=36.2382;RBI=0.0304855;REFB=0;REVB=0.00189858;RO=0;SAF=10;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000238657;OID=.;OPOS=48610272;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:13:15:0:0:13:15:3:10:0:0:5:10:0:0 chr17 48613837 . A G 686.55 PASS AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0109904;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.668;QD=36.6157;RBI=0.0141032;REFB=0.019789;REVB=-0.00883799;RO=1;SAF=28;SAR=46;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165947;STB=0.50877;TYPE=snp;VARB=-0.000109027;OID=.;OPOS=48613837;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:75:75:1:1:74:74:46:28:1:0:46:28:1:0 chr17 48614222 . C T 168.24 PASS AO=38;DP=76;FAO=38;FDP=76;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=27;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.0067225;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=247.2;QD=8.85467;RBI=0.0384243;REFB=-0.0167097;REVB=0.0378317;RO=38;SAF=11;SAR=27;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206695;STB=0.615438;TYPE=snp;VARB=0.0186008;OID=.;OPOS=48614222;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:38:38:38:38:27:11:19:19:27:11:19:19 chr17 48616333 . G C 15.4 PASS AO=4;DP=15;FAO=4;FDP=15;FR=.;FRO=11;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=-0.060546;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=37.2484;QD=4.10621;RBI=0.0633327;REFB=-0.0228085;REVB=-0.0185801;RO=11;SAF=1;SAR=3;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107868;STB=0.571101;TYPE=snp;VARB=0.0344;OID=.;OPOS=48616333;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:15:15:11:11:4:4:3:1:2:9:3:1:2:9 chr17 48627449 . CG C 27.64 PASS AO=18;DP=53;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=22;FWDB=-0.0114042;FXX=0.0222173;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.9664;QD=2.51238;RBI=0.0481426;REFB=-0.115405;REVB=-0.0467724;RO=24;SAF=4;SAR=14;SRF=5;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0202563;STB=0.586115;TYPE=del;VARB=0.153911;OID=.;OPOS=48627450;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:18:42:17:44:27:5:12:5:22:27:24:4:14:5:19 chr17 48629458 . A G 212.63 PASS AO=26;DP=27;FAO=25;FDP=27;FR=.;FRO=2;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00351242;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.2347;QD=31.5;RBI=0.0646069;REFB=-0.0146746;REVB=-0.0645114;RO=1;SAF=13;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0343929;STB=0.538431;TYPE=snp;VARB=0.00646384;OID=.;OPOS=48629458;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:27:27:1:2:26:25:13:13:1:0:13:12:2:0 chr17 48653354 . C A 212.29 PASS AO=30;DP=39;FAO=30;FDP=39;FR=.;FRO=9;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=0.0447582;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.875;QD=21.7734;RBI=0.048846;REFB=-0.00739775;REVB=0.0195611;RO=8;SAF=10;SAR=20;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154715;STB=0.591781;TYPE=snp;VARB=0.0052706;OID=.;OPOS=48653354;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:39:39:8:9:30:30:20:10:0:8:20:10:0:9 chr17 48712705 . G A 305.23 PASS AO=33;DP=34;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0264286;FXX=0.0277701;HRUN=3;LEN=1;MLLD=97.7398;QD=34.8829;RBI=0.0279599;REFB=-0.101771;REVB=0.00912588;RO=1;SAF=14;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239571;STB=0.512188;TYPE=snp;VARB=8.18109e-05;OID=.;OPOS=48712705;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:34:35:1:1:33:34:19:14:0:1:20:14:0:1 chr17 48712711 . C G 342.95 PASS AO=37;DP=39;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00252525;FXX=0.0256345;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.669;QD=36.1001;RBI=0.0486823;REFB=-0.0842188;REVB=0.0486168;RO=0;SAF=14;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.91909e-08;STB=0.510633;TYPE=snp;VARB=0.00121479;OID=.;OPOS=48712711;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:39:38:0:1:37:37:23:14:0:0:23:14:0:1 chr17 48834023 . A G 69.32 PASS AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=2;FWDB=-0.00898038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.905;QD=10.2693;RBI=0.00937654;REFB=-0.0168982;REVB=0.00269672;RO=13;SAF=12;SAR=2;SRF=11;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0185802;STB=0.510623;TYPE=snp;VARB=0.028953;OID=.;OPOS=48834023;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:27:27:13:13:14:14:2:12:11:2:2:12:11:2 chr17 48834032 . G A 56.3 PASS AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=12;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=-0.0475435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=39.0052;QD=8.34055;RBI=0.048092;REFB=-0.0201747;REVB=0.00724229;RO=14;SAF=12;SAR=1;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.295364;STB=0.675717;TYPE=snp;VARB=0.0497259;OID=.;OPOS=48834032;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:27:27:14:14:13:13:1:12:11:3:1:12:11:3 chr17 48834080 . A G 65.63 PASS AO=14;DP=29;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=-0.0516785;FXX=0;HRUN=27;LEN=1;MLLD=24.9239;QD=8.75104;RBI=0.244394;REFB=-0.0331048;REVB=0.238868;RO=15;SAF=10;SAR=4;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.44616;STB=0.740408;TYPE=snp;VARB=0.0706875;OID=.;OPOS=48834080;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:29:30:15:16:14:14:4:10:3:12:4:10:4:12 chr17 48917333 . C T 502.16 PASS AO=52;DP=52;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00562223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.192;QD=37.1969;RBI=0.0313959;REFB=0;REVB=0.0308884;RO=0;SAF=28;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00116842;OID=.;OPOS=48917333;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:52:54:0:0:52:54:24:28:0:0:25:29:0:0 chr17 48940422 . T C 1216.03 PASS AO=132;DP=135;FAO=133;FDP=135;FR=.;FRO=2;FSAF=64;FSAR=69;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0079125;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=131.445;QD=36.0305;RBI=0.0462414;REFB=-0.0896075;REVB=0.0455594;RO=2;SAF=63;SAR=69;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0148478;STB=0.507691;TYPE=snp;VARB=0.000384984;OID=.;OPOS=48940422;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:135:135:2:2:132:133:69:63:2:0:69:64:2:0 chr17 49043640 . T C 283.8 PASS AO=81;DP=193;FAO=82;FDP=195;FR=.;FRO=113;FSAF=32;FSAR=50;FSRF=33;FSRR=80;FWDB=-0.0435808;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.2695;QD=5.82163;RBI=0.044919;REFB=-0.0316413;REVB=-0.0108824;RO=112;SAF=32;SAR=49;SRF=32;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122703;STB=0.561389;TYPE=snp;VARB=0.0411203;OID=.;OPOS=49043640;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:195:112:113:81:82:49:32:32:80:50:32:33:80 chr17 49085175 . C A 117.37 PASS AO=25;DP=55;FAO=28;FDP=58;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.121036;FXX=0.0169463;HRUN=4;LEN=1;MLLD=38.1399;QD=8.09436;RBI=0.123558;REFB=-0.0529521;REVB=0.0248401;RO=30;SAF=9;SAR=16;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139576;STB=0.537287;TYPE=snp;VARB=0.0723531;OID=.;OPOS=49085175;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:58:30:30:25:28:16:9:15:15:16:12:15:15 chr17 49197883 . C T 35.65 PASS AO=16;DP=61;FAO=16;FDP=61;FR=.;FRO=45;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=29;FWDB=0.086717;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.0405;QD=2.33802;RBI=0.0868954;REFB=0.00571615;REVB=0.00556519;RO=45;SAF=6;SAR=10;SRF=16;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0252445;STB=0.515399;TYPE=snp;VARB=-0.010696;OID=.;OPOS=49197883;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:61:61:45:45:16:16:10:6:16:29:10:6:16:29 chr17 49257946 . T C 128.43 PASS AO=41;DP=110;FAO=41;FDP=110;FR=.;FRO=69;FSAF=13;FSAR=28;FSRF=16;FSRR=53;FWDB=-0.0336547;FXX=0.0090082;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.4237;QD=4.67013;RBI=0.053118;REFB=0.0200951;REVB=-0.041096;RO=69;SAF=13;SAR=28;SRF=16;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114041;STB=0.564582;TYPE=snp;VARB=-0.038018;OID=.;OPOS=49257946;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:69:69:41:41:28:13:16:53:28:13:16:53 chr17 49713300 . G A 469.21 PASS AO=126;DP=284;FAO=126;FDP=282;FR=.;FRO=156;FSAF=42;FSAR=84;FSRF=71;FSRR=85;FWDB=-0.0322527;FXX=0.00704201;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.451;QD=6.65549;RBI=0.0368119;REFB=-0.0197194;REVB=0.0177449;RO=153;SAF=42;SAR=84;SRF=69;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124718;STB=0.57214;TYPE=snp;VARB=0.0242841;OID=.;OPOS=49713300;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:284:282:153:156:126:126:84:42:69:84:84:42:71:85 chr17 51900836 . C T 96.74 PASS AO=22;DP=52;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.0787364;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.2128;QD=7.16609;RBI=0.0793034;REFB=-0.00666439;REVB=-0.00946569;RO=30;SAF=12;SAR=10;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0123128;STB=0.518503;TYPE=snp;VARB=0.00856468;OID=.;OPOS=51900836;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:52:54:30:30:22:24:10:12:16:14:12:12:16:14 chr17 51901084 . A G 113.83 PASS AO=27;DP=58;FAO=27;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=7;FSRR=24;FWDB=-0.0131636;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=215.487;QD=7.85041;RBI=0.015854;REFB=0.0129362;REVB=0.00883567;RO=31;SAF=10;SAR=17;SRF=7;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154806;STB=0.586493;TYPE=snp;VARB=-0.0139796;OID=.;OPOS=51901084;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:31:31:27:27:17:10:7:24:17:10:7:24 chr17 51901643 . C T 198.5 PASS AO=56;DP=137;FAO=57;FDP=138;FR=.;FRO=81;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=39;FSRR=42;FWDB=0.0175084;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.345;QD=5.75371;RBI=0.0202797;REFB=0.0120503;REVB=-0.0102333;RO=81;SAF=31;SAR=25;SRF=39;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.075884;STB=0.536647;TYPE=snp;VARB=-0.013592;OID=.;OPOS=51901643;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:138:81:81:56:57:25:31:39:42:26:31:39:42 chr17 51901703 . C G 109.89 PASS AO=33;DP=89;FAO=34;FDP=90;FR=.;FRO=56;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=31;FWDB=-0.00998319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.775;QD=4.88413;RBI=0.0353765;REFB=0.0201857;REVB=-0.0339386;RO=54;SAF=18;SAR=15;SRF=25;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0894046;STB=0.569711;TYPE=snp;VARB=-0.0240369;OID=.;OPOS=51901703;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:90:54:56:33:34:15:18:25:29:15:19:25:31 chr17 51901816 . T C 69.28 PASS AO=25;DP=81;FAO=26;FDP=82;FR=.;FRO=56;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=33;FSRR=23;FWDB=-0.0213686;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.596;QD=3.37943;RBI=0.0221735;REFB=-0.016252;REVB=-0.00591987;RO=56;SAF=15;SAR=10;SRF=33;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0130365;STB=0.508664;TYPE=snp;VARB=0.0348788;OID=.;OPOS=51901816;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:81:82:56:56:25:26:10:15:33:23:11:15:33:23 chr17 51902252 . C T 437.37 PASS AO=101;DP=206;FAO=105;FDP=211;FR=.;FRO=106;FSAF=46;FSAR=59;FSRF=51;FSRR=55;FWDB=-0.00484919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.335;QD=8.29128;RBI=0.0122758;REFB=-0.0228329;REVB=-0.0112775;RO=101;SAF=46;SAR=55;SRF=51;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0451962;STB=0.521834;TYPE=snp;VARB=0.0268328;OID=.;OPOS=51902252;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:206:211:101:106:101:105:55:46:51:50:59:46:51:55 chr17 51902492 . A AAAT 81.97 PASS AO=17;DP=44;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=2;FSAR=16;FSRF=4;FSRR=16;FWDB=0.0465392;FXX=0.0731529;HRUN=3;LEN=3;MLLD=223.205;QD=8.62886;RBI=0.0468394;REFB=0.0110225;REVB=0.00529461;RO=24;SAF=2;SAR=15;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.348999;STB=0.599873;TYPE=ins;VARB=-0.0114001;OID=.;OPOS=51902493;OREF=-;OALT=AAT;OMAPALT=AAAT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:17:44:18:38:20:2:16:4:16:81:24:2:15:8:16 chr17 53038654 . A C 242.13 PASS AO=48;DP=84;FAO=48;FDP=84;FR=.;FRO=36;FSAF=16;FSAR=32;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=-0.0495004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.0601;QD=11.53;RBI=0.0570834;REFB=-0.00024566;REVB=0.0284293;RO=36;SAF=16;SAR=32;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116651;STB=0.564075;TYPE=snp;VARB=-0.00013;OID=.;OPOS=53038654;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:36:36:48:48:32:16:17:19:32:16:17:19 chr17 53238728 . G A 2451.63 PASS AO=284;DP=302;FAO=286;FDP=302;FR=.;FRO=16;FSAF=146;FSAR=140;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.0833939;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=42.6658;QD=32.4719;RBI=0.127459;REFB=-0.215624;REVB=0.0963907;RO=3;SAF=146;SAR=138;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.010252;STB=0.510489;TYPE=snp;VARB=0.0136682;OID=.;OPOS=53238728;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:302:302:3:16:284:286:138:146:0:3:140:146:5:11 chr17 53400110 . T C 633.89 PASS AO=153;DP=312;FAO=153;FDP=312;FR=.;FRO=159;FSAF=105;FSAR=48;FSRF=98;FSRR=61;FWDB=-0.00364108;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.221;QD=8.12683;RBI=0.0409117;REFB=-0.0132354;REVB=0.0407494;RO=159;SAF=105;SAR=48;SRF=98;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0729508;STB=0.540133;TYPE=snp;VARB=0.0112807;OID=.;OPOS=53400110;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:312:312:159:159:153:153:48:105:98:61:48:105:98:61 chr17 53400918 . GT G 186.02 PASS AO=70;DP=130;FAO=76;FDP=132;FR=.;FRO=56;FSAF=36;FSAR=40;FSRF=28;FSRR=28;FWDB=-0.00340029;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.9326;QD=5.63684;RBI=0.0037243;REFB=-0.128901;REVB=-0.00151937;RO=54;SAF=33;SAR=37;SRF=28;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0375857;STB=0.511179;TYPE=del;VARB=0.129928;OID=.;OPOS=53400919;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:70:128:76:132:56:36:40:28:28:99:54:33:37:28:26 chr17 53471105 . T G 389.52 PASS AO=115;DP=276;FAO=114;FDP=274;FR=.;FRO=160;FSAF=55;FSAR=59;FSRF=66;FSRR=94;FWDB=-0.00111159;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.299;QD=5.68639;RBI=0.00696429;REFB=0.00168141;REVB=0.006875;RO=158;SAF=55;SAR=60;SRF=63;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0831524;STB=0.541011;TYPE=snp;VARB=-0.00234357;OID=.;OPOS=53471105;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:276:274:158:160:115:114:60:55:63:95:59:55:66:94 chr17 53485186 . C T 195.13 PASS AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0369064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.8602;QD=37.1671;RBI=0.0372465;REFB=0;REVB=0.00502164;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00120278;OID=.;OPOS=53485186;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:21:21:0:0:21:21:10:11:0:0:10:11:0:0 chr17 53498999 . G C 93.18 PASS AO=28;DP=75;FAO=29;FDP=76;FR=.;FRO=47;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=25;FWDB=0.0324376;FXX=0.0256377;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.7538;QD=4.90415;RBI=0.111165;REFB=-0.0170079;REVB=-0.106327;RO=45;SAF=14;SAR=14;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119401;STB=0.530351;TYPE=snp;VARB=0.029831;OID=.;OPOS=53498999;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:75:76:45:47:28:29:14:14:22:23:14:15:22:25 chr17 53851228 . C T 1007.35 PASS AO=84;DP=86;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0213628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.2941;QD=38.0133;RBI=0.0282805;REFB=0;REVB=0.0185315;RO=0;SAF=57;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.38583e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000358886;OID=.;OPOS=53851228;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:86:106:0:0:84:106:27:57:0:0:44:62:0:0 chr17 54450038 . C A 209.11 PASS AO=33;DP=65;FAO=42;FDP=73;FR=.;FRO=31;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=24;FSRR=7;FWDB=0.0152884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.716;QD=11.4581;RBI=0.0308294;REFB=-0.0143741;REVB=0.0267716;RO=31;SAF=18;SAR=15;SRF=24;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206494;STB=0.590123;TYPE=snp;VARB=0.0160385;OID=.;OPOS=54450038;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:73:31:31:33:42:15:18:24:7:18:24:24:7 chr17 54450134 . G A 261.48 PASS AO=51;DP=90;FAO=52;FDP=90;FR=.;FRO=38;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=-0.0234963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.362;QD=11.6214;RBI=0.0297815;REFB=0.00627054;REVB=0.0182992;RO=38;SAF=20;SAR=31;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0234881;STB=0.507519;TYPE=snp;VARB=-0.00486254;OID=.;OPOS=54450134;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:38:38:51:52:31:20:16:22:31:21:16:22 chr17 54534634 . G A 155.99 PASS AO=45;DP=111;FAO=45;FDP=111;FR=.;FRO=66;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=41;FSRR=25;FWDB=-0.0200099;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.105;QD=5.62116;RBI=0.0382099;REFB=-0.00271037;REVB=-0.0325515;RO=65;SAF=22;SAR=23;SRF=41;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148429;STB=0.578409;TYPE=snp;VARB=0.00344188;OID=.;OPOS=54534634;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:65:66:45:45:23:22:41:24:23:22:41:25 chr17 54672335 . GC G 41.19 PASS AO=24;DP=61;FAO=23;FDP=53;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.0906916;FXX=0.036357;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.8209;QD=3.10875;RBI=0.0949926;REFB=-0.0537233;REVB=0.0282602;RO=25;SAF=7;SAR=17;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.257361;STB=0.608012;TYPE=del;VARB=0.0716298;OID=.;OPOS=54672336;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:24:54:23:53:30:8:15:16:14:41:25:7:17:14:11 chr17 54872439 . T C 103.92 PASS AO=19;DP=56;FAO=31;FDP=69;FR=.;FRO=38;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=0.0401885;FXX=0.028165;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.019;QD=6.02449;RBI=0.0432539;REFB=-0.0451163;REVB=-0.0159932;RO=36;SAF=1;SAR=18;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.714926;STB=0.615453;TYPE=snp;VARB=0.0584649;OID=.;OPOS=54872439;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:69:36:38:19:31:18:1:22:14:18:13:24:14 chr17 54912339 . G A 86.71 PASS AO=15;DP=24;FAO=15;FDP=24;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=-0.00713116;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=128.865;QD=14.4519;RBI=0.02719;REFB=-0.0202821;REVB=0.0262381;RO=9;SAF=3;SAR=12;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.424626;STB=0.740394;TYPE=snp;VARB=0.00841461;OID=.;OPOS=54912339;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:24:24:9:9:15:15:12:3:7:2:12:3:7:2 chr17 54921494 . A C 251.05 PASS AO=60;DP=122;FAO=59;FDP=121;FR=.;FRO=62;FSAF=20;FSAR=39;FSRF=26;FSRR=36;FWDB=0.0107748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.195;QD=8.2993;RBI=0.0107965;REFB=-0.0175591;REVB=-0.00068459;RO=61;SAF=20;SAR=40;SRF=25;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0761503;STB=0.544611;TYPE=snp;VARB=0.0219895;OID=.;OPOS=54921494;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:121:61:62:60:59:40:20:25:36:39:20:26:36 chr17 54978794 . G A 246.25 PASS AO=49;DP=90;FAO=50;FDP=90;FR=.;FRO=40;FSAF=45;FSAR=5;FSRF=35;FSRR=5;FWDB=-0.00276613;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=260.135;QD=10.9442;RBI=0.0327467;REFB=-0.0327192;REVB=0.0326297;RO=40;SAF=45;SAR=4;SRF=35;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105779;STB=0.529399;TYPE=snp;VARB=0.0241943;OID=.;OPOS=54978794;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:40:40:49:50:4:45:35:5:5:45:35:5 chr17 55027850 . T C 1420.26 PASS AO=149;DP=150;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314079;FXX=0.00666622;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.977;QD=38.1278;RBI=0.0516863;REFB=-0.0283346;REVB=0.0410489;RO=1;SAF=91;SAR=58;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00519845;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000140236;OID=.;OPOS=55027850;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:150:149:1:0:149:149:58:91:1:0:58:91:0:0 chr17 55163827 . C T 284.93 PASS AO=67;DP=140;FAO=68;FDP=140;FR=.;FRO=72;FSAF=32;FSAR=36;FSRF=50;FSRR=22;FWDB=0.000397959;FXX=0.0070917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.235;QD=8.14084;RBI=0.0332965;REFB=-0.00622122;REVB=0.0332941;RO=72;SAF=31;SAR=36;SRF=49;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202369;STB=0.613945;TYPE=snp;VARB=0.00846612;OID=.;OPOS=55163827;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:72:72:67:68:36:31:49:23:36:32:50:22 chr17 55182811 . CT C 96.9 PASS AO=37;DP=77;FAO=36;FDP=76;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=0.0877137;FXX=0.0129853;HRUN=2;LEN=1;MLLD=24.2015;QD=5.0999;RBI=0.0878872;REFB=-0.00271765;REVB=-0.00551938;RO=39;SAF=15;SAR=22;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0289111;STB=0.504502;TYPE=del;VARB=0.00662451;OID=.;OPOS=55182812;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:37:77:36:76:40:15:21:17:23:96:39:15:22:17:22 chr17 55182878 . C T 263.59 PASS AO=60;DP=116;FAO=59;FDP=115;FR=.;FRO=56;FSAF=33;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=32;FWDB=-0.00920979;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.5719;QD=9.16843;RBI=0.0399288;REFB=-0.0323349;REVB=-0.0388521;RO=55;SAF=33;SAR=27;SRF=23;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11429;STB=0.563583;TYPE=snp;VARB=0.0278229;OID=.;OPOS=55182878;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:115:55:56:60:59:27:33:23:32:26:33:24:32 chr17 55183203 . T C 179.19 PASS AO=42;DP=90;FAO=43;FDP=91;FR=.;FRO=48;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=-0.022561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.796;QD=7.87639;RBI=0.0226822;REFB=-0.0318079;REVB=-0.00234179;RO=48;SAF=26;SAR=16;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0766506;STB=0.53423;TYPE=snp;VARB=0.0362456;OID=.;OPOS=55183203;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:91:48:48:42:43:16:26:26:22:17:26:26:22 chr17 55183716 . T C 1024.56 PASS AO=106;DP=106;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.882;QD=38.3013;RBI=0.0248438;REFB=0;REVB=0.0161971;RO=0;SAF=73;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.6885e-05;OID=.;OPOS=55183716;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:106:107:0:0:106:107:33:73:0:0:34:73:0:0 chr17 55183792 . G A 34.98 PASS AO=21;DP=90;FAO=21;FDP=92;FR=.;FRO=71;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=45;FSRR=26;FWDB=0.012693;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=123.265;QD=1.52105;RBI=0.0293384;REFB=-0.0328805;REVB=-0.0264505;RO=65;SAF=11;SAR=10;SRF=40;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114587;STB=0.585695;TYPE=snp;VARB=0.0710155;OID=.;OPOS=55183792;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:90:92:65:71:21:21:10:11:40:25:10:11:45:26 chr17 55198420 . C T 218.42 PASS AO=55;DP=110;FAO=53;FDP=111;FR=.;FRO=58;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=26;FSRR=32;FWDB=-0.000681962;FXX=0.0176975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.925;QD=7.871;RBI=0.00382073;REFB=-0.0143909;REVB=0.00375937;RO=54;SAF=25;SAR=30;SRF=26;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0242937;STB=0.51229;TYPE=snp;VARB=0.014945;OID=.;OPOS=55198420;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:111:54:58:55:53:30:25:26:28:28:25:26:32 chr17 55296482 . C T 322.51 PASS AO=83;DP=183;FAO=83;FDP=181;FR=.;FRO=98;FSAF=59;FSAR=24;FSRF=50;FSRR=48;FWDB=0.00330424;FXX=0.0109284;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.704;QD=7.12721;RBI=0.00337831;REFB=-0.012836;REVB=-0.000703548;RO=98;SAF=59;SAR=24;SRF=50;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.213378;STB=0.618851;TYPE=snp;VARB=0.0179511;OID=.;OPOS=55296482;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:181:98:98:83:83:24:59:50:48:24:59:50:48 chr17 55822171 . T C 117.71 PASS AO=32;DP=78;FAO=32;FDP=77;FR=.;FRO=45;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=-0.0144628;FXX=0.0128189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.352;QD=6.11465;RBI=0.0185731;REFB=-0.0133854;REVB=0.0116529;RO=45;SAF=13;SAR=19;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0403981;STB=0.522921;TYPE=snp;VARB=0.0206684;OID=.;OPOS=55822171;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:77:45:45:32:32:19:13:20:25:19:13:20:25 chr17 55822214 . T A 124.68 PASS AO=29;DP=61;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.00344351;FXX=0.128553;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.3635;QD=8.1758;RBI=0.00387651;REFB=-0.0476078;REVB=-0.00178033;RO=23;SAF=7;SAR=22;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186587;STB=0.670776;TYPE=snp;VARB=0.00990006;OID=.;OPOS=55822214;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:23:32:29:29:22:7:10:13:22:7:17:15 chr17 55822467 . G A 275.3 PASS AO=67;DP=142;FAO=68;FDP=142;FR=.;FRO=74;FSAF=53;FSAR=15;FSRF=41;FSRR=33;FWDB=0.00414278;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.2687;QD=7.75493;RBI=0.0210798;REFB=-0.00722942;REVB=0.0206687;RO=72;SAF=53;SAR=14;SRF=41;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.258512;STB=0.643353;TYPE=snp;VARB=0.0131007;OID=.;OPOS=55822467;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:72:74:67:68:14:53:41:31:15:53:41:33 chr17 55950064 . C T 193.11 PASS AO=43;DP=88;FAO=44;FDP=89;FR=.;FRO=45;FSAF=33;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=30;FWDB=0.0180721;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.456;QD=8.67897;RBI=0.0228727;REFB=-0.00644773;REVB=0.01402;RO=45;SAF=32;SAR=11;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.389774;STB=0.719195;TYPE=snp;VARB=0.00450799;OID=.;OPOS=55950064;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:89:45:45:43:44:11:32:15:30:11:33:15:30 chr17 55951037 . C T 255.85 PASS AO=67;DP=150;FAO=67;FDP=150;FR=.;FRO=83;FSAF=25;FSAR=42;FSRF=26;FSRR=57;FWDB=0.0232528;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.073;QD=6.82262;RBI=0.0232813;REFB=0.00213602;REVB=-0.00115156;RO=83;SAF=25;SAR=42;SRF=26;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0649;STB=0.536052;TYPE=snp;VARB=-0.00183856;OID=.;OPOS=55951037;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:150:83:83:67:67:42:25:26:57:42:25:26:57 chr17 56233034 . C A 456.55 PASS AO=104;DP=202;FAO=104;FDP=203;FR=.;FRO=99;FSAF=79;FSAR=25;FSRF=72;FSRR=27;FWDB=0.0155076;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.625;QD=8.99606;RBI=0.0186779;REFB=-0.0141924;REVB=-0.0104104;RO=97;SAF=79;SAR=25;SRF=71;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.032682;STB=0.521117;TYPE=snp;VARB=0.010119;OID=.;OPOS=56233034;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:203:97:99:104:104:25:79:71:26:25:79:72:27 chr17 56233499 . C T 52.63 PASS AO=14;DP=37;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=18;FWDB=0.0161683;FXX=0.0270197;HRUN=3;LEN=1;MLLD=222.564;QD=5.84726;RBI=0.0206743;REFB=-0.00787393;REVB=0.0128847;RO=22;SAF=4;SAR=10;SRF=4;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144044;STB=0.583225;TYPE=snp;VARB=0.0129564;OID=.;OPOS=56233499;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:37:36:22:22:14:14:10:4:4:18:10:4:4:18 chr17 56247101 . C A 2313.34 PASS AO=240;DP=240;FAO=240;FDP=240;FR=.;FRO=0;FSAF=143;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.036361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.333;QD=38.5556;RBI=0.084557;REFB=0;REVB=0.0763398;RO=0;SAF=143;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000147629;OID=.;OPOS=56247101;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:240:240:0:0:240:240:97:143:0:0:97:143:0:0 chr17 56270442 . A G 224.8 PASS AO=55;DP=121;FAO=57;FDP=124;FR=.;FRO=67;FSAF=46;FSAR=11;FSRF=43;FSRR=24;FWDB=-0.0053287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.906;QD=7.25151;RBI=0.0188023;REFB=-0.049056;REVB=-0.0180313;RO=66;SAF=45;SAR=10;SRF=43;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226755;STB=0.621814;TYPE=snp;VARB=0.0473664;OID=.;OPOS=56270442;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:124:66:67:55:57:10:45:43:23:11:46:43:24 chr17 56271094 . G C 65.36 PASS AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=-0.00134133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.085;QD=14.5244;RBI=0.00823162;REFB=-0.00769725;REVB=0.0081216;RO=7;SAF=1;SAR=10;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233612;STB=0.629444;TYPE=snp;VARB=0.00147157;OID=.;OPOS=56271094;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:18:18:7:7:11:11:10:1:0:7:10:1:0:7 chr17 56326521 . G C 112.09 PASS AO=24;DP=47;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.0342105;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=65.7714;QD=9.53919;RBI=0.0345186;REFB=0.0277251;REVB=-0.00460154;RO=23;SAF=7;SAR=17;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253196;STB=0.642598;TYPE=snp;VARB=-0.0205473;OID=.;OPOS=56326521;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:23:23:24:24:17:7:13:10:17:7:13:10 chr17 56327999 . A G 122.63 PASS AO=32;DP=83;FAO=35;FDP=86;FR=.;FRO=51;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=30;FWDB=0.00389189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.089;QD=5.70364;RBI=0.00814645;REFB=-0.0370147;REVB=-0.00715666;RO=51;SAF=10;SAR=22;SRF=21;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117395;STB=0.54406;TYPE=snp;VARB=0.0620403;OID=.;OPOS=56327999;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:86:51:51:32:35:22:10:21:30:23:12:21:30 chr17 56332327 . G A 82.53 PASS AO=27;DP=76;FAO=27;FDP=76;FR=.;FRO=49;FSAF=4;FSAR=23;FSRF=13;FSRR=36;FWDB=-0.0574968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.287;QD=4.34376;RBI=0.0583156;REFB=-0.0104259;REVB=0.00973757;RO=49;SAF=4;SAR=23;SRF=13;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.209605;STB=0.6235;TYPE=snp;VARB=0.0178267;OID=.;OPOS=56332327;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:76:76:49:49:27:27:23:4:13:36:23:4:13:36 chr17 56379131 . C T 64.75 PASS AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=-0.0182894;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.97;QD=10.3596;RBI=0.12242;REFB=-0.0550168;REVB=0.121046;RO=12;SAF=6;SAR=7;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182354;STB=0.603623;TYPE=snp;VARB=0.0327571;OID=.;OPOS=56379131;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:25:25:12:12:13:13:7:6:3:9:7:6:3:9 chr17 56381729 . A G 71.8 PASS AO=24;DP=72;FAO=24;FDP=70;FR=.;FRO=46;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=0.0227326;FXX=0.0277739;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.3844;QD=4.10285;RBI=0.0322519;REFB=-0.00610977;REVB=-0.0228783;RO=43;SAF=14;SAR=10;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0544918;STB=0.555242;TYPE=snp;VARB=0.00982417;OID=.;OPOS=56381729;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:72:70:43:46:24:24:10:14:23:20:10:14:23:23 chr17 56382308 . G T 263.96 PASS AO=56;DP=104;FAO=56;FDP=104;FR=.;FRO=48;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=-0.0176873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.993;QD=10.1524;RBI=0.0185238;REFB=-0.0126787;REVB=-0.00550352;RO=48;SAF=26;SAR=30;SRF=21;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0226601;STB=0.512444;TYPE=snp;VARB=0.00882662;OID=.;OPOS=56382308;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:48:48:56:56:30:26:21:27:30:26:21:27 chr17 56383187 . C T 17.28 PASS AO=3;DP=13;FAO=4;FDP=13;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=0.0147189;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.965;QD=5.31756;RBI=0.0214143;REFB=-0.0164309;REVB=0.015554;RO=9;SAF=0;SAR=3;SRF=1;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.564269;STB=0.646469;TYPE=snp;VARB=0.046402;OID=.;OPOS=56383187;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:13:13:9:9:3:4:3:0:1:8:3:1:1:8 chr17 56383690 . G A 99.47 PASS AO=29;DP=74;FAO=29;FDP=74;FR=.;FRO=45;FSAF=7;FSAR=22;FSRF=31;FSRR=14;FWDB=0.00545184;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=196.378;QD=5.37698;RBI=0.0054995;REFB=-0.0126451;REVB=0.000722444;RO=45;SAF=7;SAR=22;SRF=31;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.470138;STB=0.7682;TYPE=snp;VARB=0.0219509;OID=.;OPOS=56383690;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:45:45:29:29:22:7:31:14:22:7:31:14 chr17 56385247 . TGGGGGC TGGGC,TGGC,TGGGG 365.25 PASS AO=15,13,8;DP=57;FAO=46,0,0;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=13,0,0;FSAR=33,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.367366,0.253871,-0.0416671;FXX=0;HRUN=5,5,5;LEN=2,3,2;MLLD=30.2527,20.5584,6.31466;QD=31.7608;RBI=0.389148,0.268465,0.19579;REFB=0,0,0;REVB=-0.128369,-0.0873083,-0.191304;RO=1;SAF=0,0,8;SAR=15,13,0;SRF=0;SRR=1;SSEN=0.305556,0.305556,0.305556;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0.803989;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=del,del,del;VARB=-6.47123e-05,0,0;OID=.,.,.;OPOS=56385248,56385248,56385252;OREF=GG,GGG,GC;OALT=-,-,-;OMAPALT=TGGGC,TGGC,TGGGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:15,13,8:45:46,0,0:46:0:13,0,0:33,0,0:0:0:32:1:0,0,8:15,13,0:0:1 chr17 56386118 . A G 110.86 PASS AO=32;DP=80;FAO=32;FDP=81;FR=.;FRO=49;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=-0.0305549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.387;QD=5.47438;RBI=0.0306378;REFB=-0.0252324;REVB=-0.002253;RO=48;SAF=19;SAR=13;SRF=21;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164634;STB=0.587725;TYPE=snp;VARB=0.0401963;OID=.;OPOS=56386118;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:81:48:49:32:32:13:19:21:27:13:19:22:27 chr17 56386358 . T A 88.72 PASS AO=35;DP=112;FAO=35;FDP=111;FR=.;FRO=76;FSAF=33;FSAR=2;FSRF=70;FSRR=6;FWDB=-0.00662543;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.419;QD=3.1971;RBI=0.0819788;REFB=-0.00810778;REVB=0.0817107;RO=75;SAF=33;SAR=2;SRF=69;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108255;STB=0.561663;TYPE=snp;VARB=0.0183776;OID=.;OPOS=56386358;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:112:111:75:76:35:35:2:33:69:6:2:33:70:6 chr17 56386732 . C T 43.1 PASS AO=8;DP=19;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=0;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=11;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.177;QD=8.61948;RBI=0.00319429;REFB=-0.0184826;REVB=0.00319429;RO=10;SAF=0;SAR=8;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.015167;OID=.;OPOS=56386732;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:19:20:10:11:8:9:8:0:0:10:9:0:0:11 chr17 56388238 . C G 96.55 PASS AO=21;DP=45;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.0799926;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9508;QD=8.39601;RBI=0.10099;REFB=-0.00488029;REVB=-0.0616447;RO=23;SAF=11;SAR=10;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161807;STB=0.565159;TYPE=snp;VARB=0.00674094;OID=.;OPOS=56388238;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:45:46:23:24:21:22:10:11:8:15:11:11:9:15 chr17 56405046 . C T 72.77 PASS AO=16;DP=36;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=15;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.0617655;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.8839;QD=7.86755;RBI=0.0760524;REFB=0.00103699;REVB=0.0443734;RO=20;SAF=14;SAR=2;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.387664;STB=0.734957;TYPE=snp;VARB=0.00425408;OID=.;OPOS=56405046;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:36:37:20:20:16:17:2:14:12:8:2:15:12:8 chr17 56435080 . G C 288.09 PASS AO=52;DP=83;FAO=52;FDP=83;FR=.;FRO=31;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.00834394;FXX=0.0119033;HRUN=5;LEN=1;MLLD=287.073;QD=13.8838;RBI=0.0122939;REFB=-0.00174737;REVB=-0.00902881;RO=31;SAF=23;SAR=29;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0288075;STB=0.51567;TYPE=snp;VARB=0.000876105;OID=.;OPOS=56435080;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:31:31:52:52:29:23:15:16:29:23:15:16 chr17 56435160 . AC A 40.53 PASS AO=12;DP=37;FAO=15;FDP=27;FR=.;FRO=12;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0243657;FXX=0.128991;HRUN=7;LEN=1;MLLD=9.16346;QD=6.00415;RBI=0.0578716;REFB=-0.0429999;REVB=0.0524923;RO=22;SAF=12;SAR=0;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.799185;STB=0.666419;TYPE=del;VARB=0.0686137;OID=.;OPOS=56435161;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:12:37:15:27:12:12:3:6:6:17:22:12:0:10:12 chr17 56438301 . G A 91.34 PASS AO=16;DP=26;FAO=16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=-0.0152905;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.091;QD=14.0518;RBI=0.0156949;REFB=-0.0061648;REVB=0.00353995;RO=10;SAF=4;SAR=12;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.390667;STB=0.719715;TYPE=snp;VARB=0.00232341;OID=.;OPOS=56438301;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:26:26:10:10:16:16:12:4:8:2:12:4:8:2 chr17 56544280 . T G 1101.78 PASS AO=123;DP=129;FAO=123;FDP=128;FR=.;FRO=5;FSAF=73;FSAR=50;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0171031;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.1862;QD=34.4305;RBI=0.0309352;REFB=-0.0474646;REVB=0.0257773;RO=4;SAF=72;SAR=51;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00525204;STB=0.500263;TYPE=snp;VARB=-7.79881e-05;OID=.;OPOS=56544280;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:129:128:4:5:123:123:51:72:2:2:50:73:3:2 chr17 56584508 . T C 163.81 PASS AO=45;DP=106;FAO=45;FDP=106;FR=.;FRO=61;FSAF=38;FSAR=7;FSRF=37;FSRR=24;FWDB=-0.0140545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.837;QD=6.18142;RBI=0.0173937;REFB=-0.00439294;REVB=-0.0102474;RO=60;SAF=38;SAR=7;SRF=37;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.322943;STB=0.691622;TYPE=snp;VARB=0.00400555;OID=.;OPOS=56584508;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:60:61:45:45:7:38:37:23:7:38:37:24 chr17 56598991 . T A 478 PASS AO=138;DP=325;FAO=138;FDP=325;FR=.;FRO=187;FSAF=69;FSAR=69;FSRF=90;FSRR=97;FWDB=-0.0128427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.812;QD=5.88308;RBI=0.0249973;REFB=-0.0207649;REVB=0.0214459;RO=186;SAF=69;SAR=69;SRF=90;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0166438;STB=0.510768;TYPE=snp;VARB=0.028464;OID=.;OPOS=56598991;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:325:325:186:187:138:138:69:69:90:96:69:69:90:97 chr17 56618030 . C T 96.48 PASS AO=24;DP=54;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=0.0421013;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.6514;QD=7.14675;RBI=0.0421055;REFB=-0.0250051;REVB=-0.000597624;RO=30;SAF=11;SAR=13;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125083;STB=0.570698;TYPE=snp;VARB=0.0352612;OID=.;OPOS=56618030;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:54:54:30:30:24:24:13:11:10:20:13:11:10:20 chr17 56619177 . TA T 351.68 PASS AO=72;DP=154;FAO=78;FDP=150;FR=.;FRO=72;FSAF=40;FSAR=38;FSRF=28;FSRR=44;FWDB=0.0080673;FXX=0.0384591;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.751;QD=9.37801;RBI=0.0106717;REFB=-0.0168445;REVB=-0.00698592;RO=73;SAF=36;SAR=36;SRF=28;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106442;STB=0.55933;TYPE=del;VARB=0.0148464;OID=.;OPOS=56619178;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:72:153:78:150:72:40:38:28:44:99:73:36:36:28:45 chr17 56621286 . G T 199.99 PASS AO=60;DP=155;FAO=62;FDP=156;FR=.;FRO=94;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=76;FSRR=18;FWDB=0.034917;FXX=0.00636902;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.3124;QD=5.12783;RBI=0.0356754;REFB=-0.0165753;REVB=-0.00731675;RO=93;SAF=24;SAR=36;SRF=75;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.419761;STB=0.723342;TYPE=snp;VARB=0.0215102;OID=.;OPOS=56621286;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:156:93:94:60:62:36:24:75:18:36:26:76:18 chr17 56621359 . T C 409.85 PASS AO=97;DP=231;FAO=108;FDP=237;FR=.;FRO=129;FSAF=73;FSAR=35;FSRF=107;FSRR=22;FWDB=-0.00953198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.884;QD=6.91727;RBI=0.0586135;REFB=-0.00867237;REVB=0.0578333;RO=123;SAF=68;SAR=29;SRF=102;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16692;STB=0.60222;TYPE=snp;VARB=0.00951328;OID=.;OPOS=56621359;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:231:237:123:129:97:108:29:68:102:21:35:73:107:22 chr17 56636854 . T C 272.22 PASS AO=61;DP=120;FAO=61;FDP=120;FR=.;FRO=59;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=36;FSRR=23;FWDB=-0.000652992;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=230.638;QD=9.07393;RBI=0.0230691;REFB=-0.00847135;REVB=0.0230598;RO=59;SAF=33;SAR=28;SRF=36;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0625211;STB=0.534429;TYPE=snp;VARB=0.00820009;OID=.;OPOS=56636854;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:59:59:61:61:28:33:36:23:28:33:36:23 chr17 56636908 . T C 194.23 PASS AO=51;DP=113;FAO=52;FDP=116;FR=.;FRO=64;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=30;FSRR=34;FWDB=-0.0285863;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.5581;QD=6.69757;RBI=0.0415132;REFB=-0.0396309;REVB=-0.0301027;RO=62;SAF=22;SAR=29;SRF=28;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0202039;STB=0.51473;TYPE=snp;VARB=0.0414133;OID=.;OPOS=56636908;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:116:62:64:51:52:29:22:28:34:29:23:30:34 chr17 56659018 . C T 2068.08 PASS AO=217;DP=218;FAO=217;FDP=217;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=131;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0043133;FXX=0.00458695;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.276;QD=38.1213;RBI=0.00653765;REFB=-0.0437183;REVB=0.00491288;RO=1;SAF=86;SAR=131;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00362325;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.36799e-05;OID=.;OPOS=56659018;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:89:218:217:1:0:217:217:131:86:0:1:131:86:0:0 chr17 56676368 . T C 684.98 PASS AO=162;DP=324;FAO=162;FDP=324;FR=.;FRO=162;FSAF=56;FSAR=106;FSRF=66;FSRR=96;FWDB=0.0100757;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=258.842;QD=8.4566;RBI=0.0104187;REFB=-0.00834187;REVB=0.00265161;RO=160;SAF=56;SAR=106;SRF=66;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0654209;STB=0.533406;TYPE=snp;VARB=0.00890225;OID=.;OPOS=56676368;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:324:324:160:162:162:162:106:56:66:94:106:56:66:96 chr17 56709034 . G A 471.97 PASS AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00560641;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.235;QD=38.5281;RBI=0.0434025;REFB=0;REVB=-0.0430389;RO=0;SAF=43;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00021611;OID=.;OPOS=56709034;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:49:49:0:0:49:49:6:43:0:0:6:43:0:0 chr17 56709058 . G C 543.6 PASS AO=56;DP=60;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00709318;FXX=0.0666556;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.751;QD=38.8287;RBI=0.00711362;REFB=0;REVB=-0.000538854;RO=0;SAF=44;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000220525;OID=.;OPOS=56709058;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:60:56:0:0:56:56:12:44:0:0:12:44:0:0 chr17 56709077 . A G 626.88 PASS AO=67;DP=72;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00327284;FXX=0.0416609;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.175;QD=36.3409;RBI=0.0860678;REFB=-0.0440862;REVB=0.0860055;RO=2;SAF=48;SAR=19;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0471706;STB=0.512191;TYPE=snp;VARB=0.00109739;OID=.;OPOS=56709077;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:72:69:2:1:67:68:19:48:0:2:20:48:0:1 chr17 56709086 . C T 642.23 PASS AO=73;DP=77;FAO=73;FDP=77;FR=.;FRO=4;FSAF=51;FSAR=22;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0274027;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=144.802;QD=33.3627;RBI=0.0606484;REFB=-0.110183;REVB=0.0541047;RO=4;SAF=51;SAR=22;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.022904;STB=0.51213;TYPE=snp;VARB=0.0026966;OID=.;OPOS=56709086;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:77:77:4:4:73:73:22:51:2:2:22:51:2:2 chr17 56736598 . G C 178.91 PASS AO=19;DP=21;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00943424;FXX=0.0951928;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.0827;QD=37.6656;RBI=0.0461358;REFB=0;REVB=0.0451609;RO=0;SAF=2;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.41729e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0011658;OID=.;OPOS=56736598;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:21:19:0:0:19:19:17:2:0:0:17:2:0:0 chr17 56755092 . TA T 1122.32 PASS AO=136;DP=149;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0503156;FXX=0.0206882;HRUN=3;LEN=1;MLLD=28.9634;QD=31.6146;RBI=0.0507214;REFB=0;REVB=-0.00640253;RO=0;SAF=81;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.000756232;OID=.;OPOS=56755093;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:136:144:142:142:0:83:59:0:0:99:0:81:55:0:0 chr17 56756977 . A G 1252.64 PASS AO=133;DP=135;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0800681;FXX=0.0148137;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.4095;QD=37.6734;RBI=0.0811212;REFB=-0.0496849;REVB=0.0130289;RO=1;SAF=65;SAR=68;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00725672;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000420276;OID=.;OPOS=56756977;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:135:133:1:0:133:133:68:65:1:0:68:65:0:0 chr17 56770232 . GC G 292.42 PASS AO=35;DP=48;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.17854;FXX=0.0227221;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.3095;QD=27.2019;RBI=0.268271;REFB=0;REVB=0.200231;RO=6;SAF=14;SAR=21;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0.440455;SSSB=0.116512;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0177557;OID=.;OPOS=56770233;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:35:44:43:43:0:15:28:0:0:27:6:14:21:0:6 chr17 56833490 . G A 45.33 PASS AO=12;DP=28;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.0415331;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.022;QD=6.71534;RBI=0.041696;REFB=-0.0255666;REVB=0.00368284;RO=14;SAF=2;SAR=10;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.250011;STB=0.691913;TYPE=snp;VARB=0.0196832;OID=.;OPOS=56833490;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:28:27:14:16:12:11:10:2:5:9:9:2:7:9 chr17 56833491 . T C 47.53 PASS AO=12;DP=27;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.00334688;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.1336;QD=7.04191;RBI=0.0172862;REFB=-0.0235945;REVB=-0.0169591;RO=14;SAF=2;SAR=10;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.250011;STB=0.691913;TYPE=snp;VARB=0.0258664;OID=.;OPOS=56833491;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:27:27:14:16:12:11:10:2:5:9:9:2:7:9 chr17 57059119 . GAAA GAA,GAAT 1759.84 PASS AO=150,35;DP=198;FAO=194,0;FDP=194;FR=.;FRO=0;FSAF=105,0;FSAR=89,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.072225,-0.0257231;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=22.6693,10.3487;QD=36.2853;RBI=0.0770916,0.137816;REFB=0,0;REVB=0.0269567,-0.135394;RO=0;SAF=101,1;SAR=49,34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.000303652,0;OID=.,.;OPOS=57059120,57059122;OREF=A,A;OALT=-,T;OMAPALT=GAA,GAAT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:150,35:193:194,0:194:0:105,0:89,0:0:0:86:0:101,1:49,34:0:0 chr17 57287454 . A G 1133.3 PASS AO=118;DP=118;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00866787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.756;QD=38.4169;RBI=0.024509;REFB=0;REVB=0.0229251;RO=0;SAF=73;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.50679e-05;OID=.;OPOS=57287454;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:118:118:0:0:118:118:45:73:0:0:45:73:0:0 chr17 57477235 . T G 81.05 PASS AO=31;DP=99;FAO=32;FDP=100;FR=.;FRO=68;FSAF=24;FSAR=8;FSRF=54;FSRR=14;FWDB=-0.0327399;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.5;QD=3.24214;RBI=0.0339491;REFB=0.00277976;REVB=0.00898001;RO=68;SAF=23;SAR=8;SRF=54;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0843704;STB=0.541642;TYPE=snp;VARB=-0.00785485;OID=.;OPOS=57477235;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:99:100:68:68:31:32:8:23:54:14:8:24:54:14 chr17 57477616 . G A 427.59 PASS AO=89;DP=175;FAO=96;FDP=181;FR=.;FRO=85;FSAF=36;FSAR=60;FSRF=39;FSRR=46;FWDB=0.0130235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.488;QD=9.44944;RBI=0.019581;REFB=-0.0248525;REVB=0.014622;RO=82;SAF=34;SAR=55;SRF=37;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0629805;STB=0.541117;TYPE=snp;VARB=0.0216165;OID=.;OPOS=57477616;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:181:82:85:89:96:55:34:37:45:60:36:39:46 chr17 57478253 . A C 437.39 PASS AO=161;DP=446;FAO=150;FDP=400;FR=.;FRO=250;FSAF=65;FSAR=85;FSRF=111;FSRR=139;FWDB=0.0238413;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.847;QD=4.37385;RBI=0.0238824;REFB=0.00374331;REVB=-0.00139959;RO=283;SAF=72;SAR=89;SRF=130;SRR=153;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0138406;STB=0.506774;TYPE=snp;VARB=-0.00572324;OID=.;OPOS=57478253;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:446:400:283:250:161:150:89:72:130:153:85:65:111:139 chr17 57963537 . A G 247.38 PASS AO=66;DP=157;FAO=67;FDP=155;FR=.;FRO=88;FSAF=28;FSAR=39;FSRF=26;FSRR=62;FWDB=0.0236611;FXX=0.031248;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4488;QD=6.38389;RBI=0.0238457;REFB=-0.0175985;REVB=-0.00296079;RO=87;SAF=28;SAR=38;SRF=25;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14685;STB=0.573145;TYPE=snp;VARB=0.0256938;OID=.;OPOS=57963537;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:155:87:88:66:67:38:28:25:62:39:28:26:62 chr17 58031412 . A G 94.95 PASS AO=27;DP=68;FAO=27;FDP=68;FR=.;FRO=41;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=26;FWDB=-0.00349488;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=254.777;QD=5.58536;RBI=0.0250333;REFB=-0.000601723;REVB=0.0247881;RO=41;SAF=7;SAR=20;SRF=15;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134403;STB=0.577367;TYPE=snp;VARB=0.00080682;OID=.;OPOS=58031412;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:68:68:41:41:27:27:20:7:15:26:20:7:15:26 chr17 58121453 . G A 43.48 PASS AO=11;DP=28;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.0100078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.156;QD=6.21195;RBI=0.0119637;REFB=0.00938448;REVB=-0.00655541;RO=17;SAF=4;SAR=7;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172666;STB=0.60246;TYPE=snp;VARB=-0.0175132;OID=.;OPOS=58121453;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:28:28:17:17:11:11:7:4:9:8:7:4:9:8 chr17 58303482 . G A 23.49 PASS AO=39;DP=160;FAO=33;FDP=160;FR=.;FRO=127;FSAF=32;FSAR=1;FSRF=92;FSRR=35;FWDB=-0.101499;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.252;QD=0.587317;RBI=0.112699;REFB=-0.0527126;REVB=0.048978;RO=121;SAF=38;SAR=1;SRF=86;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.64011;STB=0.902469;TYPE=snp;VARB=0.337462;OID=.;OPOS=58303482;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:160:160:121:127:39:33:1:38:86:35:1:32:92:35 chr17 58786625 . A G 2155.97 PASS AO=234;DP=241;FAO=234;FDP=239;FR=.;FRO=5;FSAF=126;FSAR=108;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.045344;FXX=0.00829841;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3518;QD=36.0832;RBI=0.0664209;REFB=-0.11093;REVB=0.0485351;RO=5;SAF=126;SAR=108;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00246754;STB=0.501295;TYPE=snp;VARB=0.00403667;OID=.;OPOS=58786625;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:241:239:5:5:234:234:108:126:3:2:108:126:3:2 chr17 58824567 . T C 1041.01 PASS AO=109;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0578203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.2277;QD=37.5139;RBI=0.0937338;REFB=0;REVB=0.0737756;RO=0;SAF=47;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.59784e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00109859;OID=.;OPOS=58824567;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:111:111:0:0:109:111:62:47:0:0:62:49:0:0 chr17 59482062 . C T 10.3 PASS AO=2;DP=8;FAO=2;FDP=8;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0141065;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=134.028;QD=5.14878;RBI=0.0184867;REFB=-0.00467596;REVB=0.0119483;RO=6;SAF=1;SAR=1;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168213;STB=0.623829;TYPE=snp;VARB=0.00893985;OID=.;OPOS=59482062;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:8:6:6:2:2:1:1:2:4:1:1:2:4 chr17 59482169 . C G 154.7 PASS AO=15;DP=15;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.102896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.862;QD=36.3993;RBI=0.241373;REFB=0;REVB=0.218342;RO=0;SAF=14;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00242892;OID=.;OPOS=59482169;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:15:17:0:0:15:17:1:14:0:0:1:16:0:0 chr17 59482173 . G A 76.47 PASS AO=12;DP=16;FAO=12;FDP=18;FR=.;FRO=6;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.0126399;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=155.75;QD=16.9926;RBI=0.0127799;REFB=0.0161309;REVB=0.00188643;RO=2;SAF=11;SAR=1;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0753549;STB=0.606995;TYPE=snp;VARB=-0.000626485;OID=.;OPOS=59482173;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:16:18:2:6:12:12:1:11:2:0:1:11:6:0 chr17 59485555 . C T 86.75 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0313061;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=192.376;QD=38.5574;RBI=0.0562099;REFB=0;REVB=0.0466849;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000633063;OID=.;OPOS=59485555;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:5:4:0:0:5:4:0:0 chr17 59486437 . G GA,A 44.18 PASS AO=4,9;DP=26;FAO=10,7;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=10,7;FSAR=0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0491709,0.0148999;FXX=0.227169;HRUN=12,4;LEN=1,1;MLLD=2.45892,59.9242;QD=10.3948;RBI=0.0587398,0.0340657;REFB=0.0388904,0.00263773;REVB=0.0321338,0.0306344;RO=11;SAF=4,9;SAR=0,0;SRF=9;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.619207,0.749973;STB=0.5,0.5;TYPE=ins,snp;VARB=0.362865,-0.00209189;OID=.,.;OPOS=59486438,59486437;OREF=-,G;OALT=A,A;OMAPALT=GA,A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:24:26:17:11:0:4,9:10,7:0,0:4,9:9:2:0,0:10,7:0:0 chr17 59667953 . G A 1828.33 PASS AO=195;DP=200;FAO=195;FDP=198;FR=.;FRO=3;FSAF=105;FSAR=90;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0160633;FXX=0.0099995;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.221;QD=36.9359;RBI=0.019045;REFB=-0.0492242;REVB=0.0102315;RO=2;SAF=105;SAR=90;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00898406;STB=0.507042;TYPE=snp;VARB=0.000370558;OID=.;OPOS=59667953;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:200:198:2:3:195:195:90:105:2:0:90:105:3:0 chr17 59668021 . G C 1615.24 PASS AO=166;DP=170;FAO=171;FDP=171;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0205546;FXX=0.0446902;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.65;QD=37.7835;RBI=0.021872;REFB=0.0436249;REVB=0.00747602;RO=1;SAF=79;SAR=87;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00543889;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00453159;OID=.;OPOS=59668021;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:170:171:1:0:166:171:87:79:0:1:88:83:0:0 chr17 59668352 . C T 2551.75 PASS AO=262;DP=270;FAO=274;FDP=274;FR=.;FRO=0;FSAF=136;FSAR=138;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0387431;FXX=0.00363623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.3096;QD=37.2519;RBI=0.0398877;REFB=0;REVB=0.00948676;RO=2;SAF=125;SAR=137;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00756616;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00100504;OID=.;OPOS=59668352;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:270:274:2:0:262:274:137:125:2:0:138:136:0:0 chr17 59760174 . G A 149.19 PASS AO=31;DP=69;FAO=35;FDP=73;FR=.;FRO=38;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=29;FWDB=0.0152296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.586;QD=8.17473;RBI=0.0270699;REFB=-0.0248308;REVB=0.0223795;RO=38;SAF=20;SAR=11;SRF=9;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.38433;STB=0.7255;TYPE=snp;VARB=0.0153371;OID=.;OPOS=59760174;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:73:38:38:31:35:11:20:9:29:11:24:9:29 chr17 59760996 . A G 144.85 PASS AO=38;DP=87;FAO=38;FDP=87;FR=.;FRO=49;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=23;FSRR=26;FWDB=0.00455036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.706;QD=6.65979;RBI=0.0268512;REFB=-0.0167027;REVB=0.0264628;RO=48;SAF=13;SAR=25;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14306;STB=0.575775;TYPE=snp;VARB=0.0170756;OID=.;OPOS=59760996;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:48:49:38:38:25:13:23:25:25:13:23:26 chr17 59763114 . A T 179.89 PASS AO=45;DP=97;FAO=45;FDP=98;FR=.;FRO=53;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=0.00426022;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.0792;QD=7.34252;RBI=0.00647424;REFB=-0.0294578;REVB=0.00487507;RO=52;SAF=25;SAR=20;SRF=26;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0536632;STB=0.535292;TYPE=snp;VARB=0.0323628;OID=.;OPOS=59763114;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:98:52:53:45:45:20:25:26:26:20:25:26:27 chr17 59763347 . A G 360.29 PASS AO=85;DP=181;FAO=87;FDP=180;FR=.;FRO=93;FSAF=40;FSAR=47;FSRF=44;FSRR=49;FWDB=-0.000551377;FXX=0.0374312;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.515;QD=8.00656;RBI=0.00798544;REFB=-0.00670023;REVB=-0.00796638;RO=94;SAF=38;SAR=47;SRF=47;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0505593;STB=0.506932;TYPE=snp;VARB=0.00734346;OID=.;OPOS=59763347;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:180:94:93:85:87:47:38:47:47:47:40:44:49 chr17 59763465 . T C 1137.41 PASS AO=125;DP=130;FAO=125;FDP=129;FR=.;FRO=4;FSAF=55;FSAR=70;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.00789216;FXX=0.00769172;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.185;QD=35.2686;RBI=0.0484305;REFB=-0.102157;REVB=0.0477831;RO=4;SAF=55;SAR=70;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.033303;STB=0.517541;TYPE=snp;VARB=0.000853978;OID=.;OPOS=59763465;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:130:129:4:4:125:125:70:55:4:0:70:55:4:0 chr17 59955426 . T G 1788.01 PASS AO=188;DP=191;FAO=189;FDP=189;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0011901;FXX=0.0156242;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.97;QD=37.8414;RBI=0.00146953;REFB=0.0314721;REVB=0.000862079;RO=1;SAF=85;SAR=103;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00460077;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.37791e-06;OID=.;OPOS=59955426;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:191:189:1:0:188:189:103:85:0:1:104:85:0:0 chr17 59969000 . T C 252.02 PASS AO=52;DP=96;FAO=52;FDP=95;FR=.;FRO=43;FSAF=35;FSAR=17;FSRF=28;FSRR=15;FWDB=-0.00929376;FXX=0.0206164;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.069;QD=10.6112;RBI=0.0194222;REFB=0.00129262;REVB=0.0170542;RO=43;SAF=35;SAR=17;SRF=28;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.020343;STB=0.511178;TYPE=snp;VARB=0.00154001;OID=.;OPOS=59969000;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:95:43:43:52:52:17:35:28:15:17:35:28:15 chr17 60020137 . AAAG A 103.41 PASS AO=26;DP=81;FAO=38;FDP=81;FR=.;FRO=43;FSAF=11;FSAR=27;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=-0.0329996;FXX=0.0470533;HRUN=5;LEN=3;MLLD=172.976;QD=5.10666;RBI=0.0422719;REFB=0.0151931;REVB=-0.0264186;RO=44;SAF=7;SAR=19;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.293906;STB=0.627836;TYPE=del;VARB=-0.0142245;OID=.;OPOS=60020138;OREF=AAG;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:26:79:38:81:43:11:27:22:21:99:44:7:19:23:21 chr17 60043884 . G A 1944.37 PASS AO=203;DP=205;FAO=203;FDP=203;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0234135;FXX=0.00975562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.537;QD=38.3127;RBI=0.0351309;REFB=0;REVB=0.0261914;RO=0;SAF=84;SAR=119;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.96701e-06;OID=.;OPOS=60043884;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:92:205:203:0:0:203:203:119:84:0:0:119:84:0:0 chr17 60348325 . G A 267.1 PASS AO=68;DP=147;FAO=68;FDP=148;FR=.;FRO=80;FSAF=12;FSAR=56;FSRF=22;FSRR=58;FWDB=-0.0104877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3007;QD=7.21901;RBI=0.0431196;REFB=0.000419967;REVB=0.0418247;RO=79;SAF=12;SAR=56;SRF=22;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150057;STB=0.581881;TYPE=snp;VARB=-0.000174897;OID=.;OPOS=60348325;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:148:79:80:68:68:56:12:22:57:56:12:22:58 chr17 60351457 . G A 685.63 PASS AO=154;DP=297;FAO=154;FDP=296;FR=.;FRO=142;FSAF=49;FSAR=105;FSRF=61;FSRR=81;FWDB=-0.0229219;FXX=0.00671118;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.81;QD=9.26528;RBI=0.0329236;REFB=-0.00866189;REVB=-0.0236337;RO=138;SAF=49;SAR=105;SRF=61;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117497;STB=0.558935;TYPE=snp;VARB=0.00880518;OID=.;OPOS=60351457;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:297:296:138:142:154:154:105:49:61:77:105:49:61:81 chr17 60493386 . A G 190.71 PASS AO=38;DP=68;FAO=38;FDP=68;FR=.;FRO=30;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=27;FSRR=3;FWDB=0.00191974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.565;QD=11.2184;RBI=0.0313413;REFB=0.00501002;REVB=-0.0312825;RO=30;SAF=19;SAR=19;SRF=27;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.323873;STB=0.676389;TYPE=snp;VARB=-0.00474725;OID=.;OPOS=60493386;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:30:30:38:38:19:19:27:3:19:19:27:3 chr17 60503892 . A G 174.59 PASS AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0399602;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=114.607;QD=33.2562;RBI=0.0460289;REFB=-0.105932;REVB=0.0228438;RO=1;SAF=14;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0317962;STB=0.517224;TYPE=snp;VARB=0.00290138;OID=.;OPOS=60503892;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:21:21:1:1:20:20:6:14:1:0:6:14:1:0 chr17 60683503 . A G 2179.21 PASS AO=226;DP=226;FAO=227;FDP=227;FR=.;FRO=0;FSAF=117;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.402;QD=38.4001;RBI=0.0199995;REFB=0;REVB=-0.0167804;RO=0;SAF=117;SAR=109;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.43654e-06;OID=.;OPOS=60683503;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:226:227:0:0:226:227:109:117:0:0:110:117:0:0 chr17 60758273 . G C 304.43 PASS AO=33;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0182872;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2206;QD=34.7919;RBI=0.0865429;REFB=0.0154436;REVB=-0.0845887;RO=1;SAF=19;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0239571;STB=0.512188;TYPE=snp;VARB=-0.00194785;OID=.;OPOS=60758273;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:35:35:1:1:33:34:14:19:1:0:14:20:1:0 chr17 60766224 . A G 680.28 PASS AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0294039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.7085;QD=37.7933;RBI=0.032895;REFB=0;REVB=-0.0147476;RO=0;SAF=42;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1178e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000261425;OID=.;OPOS=60766224;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:72:72:0:0:72:72:30:42:0:0:30:42:0:0 chr17 60767015 . G A 374.73 PASS AO=38;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0406787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.791;QD=38.4337;RBI=0.135928;REFB=0;REVB=0.129698;RO=1;SAF=11;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0170418;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00106534;OID=.;OPOS=60767015;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:39:39:1:0:38:39:27:11:0:1:28:11:0:0 chr17 60813627 . G A 161.12 PASS AO=47;DP=116;FAO=47;FDP=116;FR=.;FRO=69;FSAF=29;FSAR=18;FSRF=50;FSRR=19;FWDB=-0.0117718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.3203;QD=5.5557;RBI=0.039925;REFB=-0.00985744;REVB=-0.0381501;RO=66;SAF=29;SAR=18;SRF=48;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125647;STB=0.569912;TYPE=snp;VARB=0.0255341;OID=.;OPOS=60813627;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:66:69:47:47:18:29:48:18:18:29:50:19 chr17 60814273 . A G 1631.81 PASS AO=173;DP=177;FAO=175;FDP=175;FR=.;FRO=0;FSAF=102;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0175877;FXX=0.016853;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.686;QD=37.2985;RBI=0.0177658;REFB=-0.0384887;REVB=0.00250914;RO=3;SAF=102;SAR=71;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0196831;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.52262e-05;OID=.;OPOS=60814273;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:177:175:3:0:173:175:71:102:0:3:73:102:0:0 chr17 60824224 . A G 209.67 PASS AO=51;DP=108;FAO=51;FDP=108;FR=.;FRO=57;FSAF=36;FSAR=15;FSRF=36;FSRR=21;FWDB=-0.0428571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1553;QD=7.7654;RBI=0.0430597;REFB=-0.021599;REVB=-0.00417203;RO=57;SAF=36;SAR=15;SRF=36;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0814895;STB=0.545436;TYPE=snp;VARB=0.0210824;OID=.;OPOS=60824224;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:57:57:51:51:15:36:36:21:15:36:36:21 chr17 61315272 . G A 276.39 PASS AO=81;DP=202;FAO=85;FDP=209;FR=.;FRO=124;FSAF=33;FSAR=52;FSRF=42;FSRR=82;FWDB=-0.0284683;FXX=0.00476168;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.9309;QD=5.28967;RBI=0.0590856;REFB=-0.0592664;REVB=-0.0517751;RO=119;SAF=30;SAR=51;SRF=39;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0492525;STB=0.531355;TYPE=snp;VARB=0.0742456;OID=.;OPOS=61315272;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:209:119:124:81:85:51:30:39:80:52:33:42:82 chr17 61559923 . C T 135.03 PASS AO=27;DP=50;FAO=27;FDP=50;FR=.;FRO=23;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=17;FWDB=-0.0220708;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=156.26;QD=10.8023;RBI=0.0312071;REFB=-0.00623007;REVB=0.0220628;RO=23;SAF=16;SAR=11;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.269052;STB=0.649169;TYPE=snp;VARB=0.00765363;OID=.;OPOS=61559923;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:50:50:23:23:27:27:11:16:6:17:11:16:6:17 chr17 61562309 . C T 46.05 PASS AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.0740656;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=182.18;QD=10.2331;RBI=0.0741498;REFB=-0.0427523;REVB=-0.00353303;RO=9;SAF=2;SAR=7;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.400241;STB=0.736288;TYPE=snp;VARB=0.0183488;OID=.;OPOS=61562309;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:18:18:9:9:9:9:7:2:6:3:7:2:6:3 chr17 61562418 . C A 24.17 PASS AO=5;DP=13;FAO=5;FDP=13;FR=.;FRO=8;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=134.737;QD=7.43699;RBI=0.0175057;REFB=0.0181908;REVB=0.0175057;RO=8;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00313763;OID=.;OPOS=61562418;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:13:13:8:8:5:5:5:0:0:8:5:0:0:8 chr17 61562774 . T C 298.72 PASS AO=48;DP=70;FAO=48;FDP=70;FR=.;FRO=22;FSAF=16;FSAR=32;FSRF=2;FSRR=20;FWDB=0.000600461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.3339;QD=17.0698;RBI=0.00965934;REFB=0.0097031;REVB=-0.00964066;RO=22;SAF=16;SAR=32;SRF=2;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169018;STB=0.590875;TYPE=snp;VARB=-0.00512498;OID=.;OPOS=61562774;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:70:70:22:22:48:48:32:16:2:20:32:16:2:20 chr17 61564052 . A G 135.91 PASS AO=35;DP=80;FAO=35;FDP=80;FR=.;FRO=45;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=0.0021109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.832;QD=6.79564;RBI=0.00324993;REFB=-0.0200782;REVB=0.00247106;RO=45;SAF=17;SAR=18;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0413019;STB=0.523251;TYPE=snp;VARB=0.0260778;OID=.;OPOS=61564052;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:45:45:35:35:18:17:20:25:18:17:20:25 chr17 61566031 . G A 355.73 PASS AO=84;DP=174;FAO=85;FDP=174;FR=.;FRO=89;FSAF=42;FSAR=43;FSRF=46;FSRR=43;FWDB=-0.00675874;FXX=0.00571396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.864;QD=8.17767;RBI=0.0530432;REFB=-0.0183433;REVB=0.0526108;RO=89;SAF=42;SAR=42;SRF=46;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0157172;STB=0.511625;TYPE=snp;VARB=0.0429307;OID=.;OPOS=61566031;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:174:89:89:84:85:42:42:46:43:43:42:46:43 chr17 61573761 . T C 66.07 PASS AO=10;DP=14;FAO=10;FDP=14;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0105923;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.6106;QD=18.8778;RBI=0.0434393;REFB=-0.0697455;REVB=-0.0421281;RO=4;SAF=3;SAR=7;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113004;STB=0.564382;TYPE=snp;VARB=0.0132489;OID=.;OPOS=61573761;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:14:14:4:4:10:10:7:3:2:2:7:3:2:2 chr17 61607708 . T C 87.04 PASS AO=24;DP=60;FAO=24;FDP=60;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=30;FWDB=-0.00327441;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.109;QD=5.80294;RBI=0.0430142;REFB=-0.0306576;REVB=-0.0428894;RO=33;SAF=9;SAR=15;SRF=5;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.264714;STB=0.642755;TYPE=snp;VARB=0.0535168;OID=.;OPOS=61607708;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:60:60:33:36:24:24:15:9:5:28:15:9:6:30 chr17 61611423 . T C 152.4 PASS AO=34;DP=68;FAO=34;FDP=68;FR=.;FRO=34;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=-0.0312496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.343;QD=8.96487;RBI=0.060224;REFB=-0.026558;REVB=-0.0514819;RO=34;SAF=20;SAR=14;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183877;STB=0.60235;TYPE=snp;VARB=0.0340273;OID=.;OPOS=61611423;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:34:34:34:34:14:20:13:21:14:20:13:21 chr17 61621409 . AG A 409.93 PASS AO=51;DP=60;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.161498;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.9407;QD=26.447;RBI=0.166161;REFB=0;REVB=0.039086;RO=3;SAF=7;SAR=44;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0.320329;SSSB=-0.0417622;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00481986;OID=.;OPOS=61621410;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:51:58:62:62:0:11:51:0:0:39:3:7:44:1:2 chr17 61666714 . A T 25.27 PASS AO=11;DP=19;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=14;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.5583;QD=4.81399;RBI=0.207953;REFB=-0.0855988;REVB=-0.207953;RO=7;SAF=0;SAR=11;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.28678;OID=.;OPOS=61666714;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:19:21:7:14:11:7:11:0:0:7:7:0:0:14 chr17 61805747 . G A 78.79 PASS AO=25;DP=70;FAO=25;FDP=70;FR=.;FRO=45;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=-0.0190377;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.11;QD=4.50216;RBI=0.0203074;REFB=-0.00629768;REVB=0.00706785;RO=45;SAF=8;SAR=17;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147995;STB=0.586136;TYPE=snp;VARB=0.0105837;OID=.;OPOS=61805747;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:70:70:45:45:25:25:17:8:20:25:17:8:20:25 chr17 61838259 . G A 155.31 PASS AO=40;DP=88;FAO=40;FDP=91;FR=.;FRO=51;FSAF=27;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=32;FWDB=-0.0160059;FXX=0.0108684;HRUN=3;LEN=1;MLLD=72.0865;QD=6.82691;RBI=0.0387685;REFB=-0.0126259;REVB=-0.0353102;RO=47;SAF=27;SAR=13;SRF=18;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.285048;STB=0.670075;TYPE=snp;VARB=0.00792849;OID=.;OPOS=61838259;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:91:47:51:40:40:13:27:18:29:13:27:19:32 chr17 61901197 . T A 75 PASS AO=26;DP=78;FAO=26;FDP=77;FR=.;FRO=51;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=30;FWDB=0.0077685;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.751;QD=3.89592;RBI=0.00879257;REFB=-0.0139526;REVB=0.00411821;RO=51;SAF=6;SAR=20;SRF=21;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24217;STB=0.642738;TYPE=snp;VARB=0.0307215;OID=.;OPOS=61901197;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:78:77:51:51:26:26:20:6:21:30:20:6:21:30 chr17 61903445 . G C 590.64 PASS AO=140;DP=285;FAO=141;FDP=285;FR=.;FRO=144;FSAF=65;FSAR=76;FSRF=75;FSRR=69;FWDB=-0.0166385;FXX=0.00349638;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.646;QD=8.28966;RBI=0.0692797;REFB=0.0020241;REVB=0.0672521;RO=144;SAF=65;SAR=75;SRF=74;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.045874;STB=0.530272;TYPE=snp;VARB=-0.00213488;OID=.;OPOS=61903445;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:285:285:144:144:140:141:75:65:74:70:76:65:75:69 chr17 61906846 . T C 167.03 PASS AO=44;DP=100;FAO=44;FDP=101;FR=.;FRO=57;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=37;FSRR=20;FWDB=-0.0446435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.195;QD=6.61484;RBI=0.0446526;REFB=-0.0151881;REVB=0.000900585;RO=56;SAF=18;SAR=26;SRF=36;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230571;STB=0.633245;TYPE=snp;VARB=0.012119;OID=.;OPOS=61906846;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:101:56:57:44:44:26:18:36:20:26:18:37:20 chr17 61908271 . C T 535.7 PASS AO=120;DP=231;FAO=120;FDP=231;FR=.;FRO=111;FSAF=59;FSAR=61;FSRF=61;FSRR=50;FWDB=-0.0123089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.256;QD=9.27626;RBI=0.0147439;REFB=-0.0021899;REVB=0.0081163;RO=109;SAF=59;SAR=61;SRF=59;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0431759;STB=0.527791;TYPE=snp;VARB=0.00190413;OID=.;OPOS=61908271;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:231:231:109:111:120:120:61:59:59:50:61:59:61:50 chr17 61910167 . G A 259.31 PASS AO=54;DP=103;FAO=56;FDP=105;FR=.;FRO=49;FSAF=35;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=0.0254995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.948;QD=9.87857;RBI=0.0260563;REFB=-0.01035;REVB=0.00535795;RO=49;SAF=35;SAR=19;SRF=26;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107156;STB=0.545889;TYPE=snp;VARB=0.010335;OID=.;OPOS=61910167;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:105:49:49:54:56:19:35:26:23:21:35:26:23 chr17 61986988 . A G 179.65 PASS AO=52;DP=127;FAO=52;FDP=127;FR=.;FRO=75;FSAF=15;FSAR=37;FSRF=23;FSRR=52;FWDB=-0.0070373;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2904;QD=5.65811;RBI=0.0108023;REFB=0.0137681;REVB=0.00819543;RO=75;SAF=15;SAR=37;SRF=23;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229636;STB=0.512946;TYPE=snp;VARB=-0.0212611;OID=.;OPOS=61986988;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:75:75:52:52:37:15:23:52:37:15:23:52 chr17 61987405 . A T 289.54 PASS AO=71;DP=153;FAO=72;FDP=153;FR=.;FRO=81;FSAF=20;FSAR=52;FSRF=34;FSRR=47;FWDB=0.0119981;FXX=0.00649309;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.971;QD=7.56957;RBI=0.0146335;REFB=-0.00241089;REVB=-0.00837752;RO=80;SAF=20;SAR=51;SRF=34;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155735;STB=0.586441;TYPE=snp;VARB=0.00306639;OID=.;OPOS=61987405;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:153:80:81:71:72:51:20:34:46:52:20:34:47 chr17 61987570 . G T 204.49 PASS AO=60;DP=148;FAO=61;FDP=152;FR=.;FRO=91;FSAF=25;FSAR=36;FSRF=25;FSRR=66;FWDB=-0.0281086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.756;QD=5.38142;RBI=0.0290226;REFB=-0.00758606;REVB=0.00722625;RO=88;SAF=24;SAR=36;SRF=25;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132053;STB=0.58618;TYPE=snp;VARB=0.00803811;OID=.;OPOS=61987570;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:152:88:91:60:61:36:24:25:63:36:25:25:66 chr17 61987576 . G A 211.75 PASS AO=62;DP=149;FAO=62;FDP=152;FR=.;FRO=90;FSAF=25;FSAR=37;FSRF=25;FSRR=65;FWDB=-0.0213713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.2851;QD=5.57244;RBI=0.0357209;REFB=-0.00242074;REVB=0.0286225;RO=87;SAF=25;SAR=37;SRF=25;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12942;STB=0.579521;TYPE=snp;VARB=0.00381861;OID=.;OPOS=61987576;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:152:87:90:62:62:37:25:25:62:37:25:25:65 chr17 61988014 . G A 194.58 PASS AO=56;DP=137;FAO=56;FDP=136;FR=.;FRO=80;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=17;FSRR=63;FWDB=0.000999335;FXX=0.0144917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.9554;QD=5.72279;RBI=0.0187759;REFB=-0.00180917;REVB=0.0187493;RO=79;SAF=23;SAR=33;SRF=17;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222002;STB=0.62581;TYPE=snp;VARB=0.00162243;OID=.;OPOS=61988014;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:136:79:80:56:56:33:23:17:62:33:23:17:63 chr17 62007498 . A G 607.61 PASS AO=63;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0178291;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.691;QD=37.9759;RBI=0.0184026;REFB=0;REVB=-0.00455846;RO=0;SAF=42;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00107689;OID=.;OPOS=62007498;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:64:64:0:0:63:64:21:42:0:0:21:43:0:0 chr17 62018773 . T C 1963.16 PASS AO=205;DP=205;FAO=205;FDP=205;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=117;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0298318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.842;QD=38.3055;RBI=0.0302301;REFB=0;REVB=0.00489061;RO=0;SAF=88;SAR=117;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11226e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.76686e-05;OID=.;OPOS=62018773;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:205:205:0:0:205:205:117:88:0:0:117:88:0:0 chr17 62020348 . T C 1366 PASS AO=160;DP=173;FAO=161;FDP=173;FR=.;FRO=12;FSAF=62;FSAR=99;FSRF=12;FSRR=0;FWDB=0.0371387;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.801;QD=31.5838;RBI=0.0378883;REFB=-0.0798703;REVB=0.00749946;RO=13;SAF=62;SAR=98;SRF=12;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0788658;STB=0.544112;TYPE=snp;VARB=0.0036114;OID=.;OPOS=62020348;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:173:173:13:12:160:161:98:62:12:1:99:62:12:0 chr17 62041068 . T C 1184.42 PASS AO=121;DP=122;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0610394;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.287;QD=38.207;RBI=0.111687;REFB=0;REVB=0.093532;RO=0;SAF=37;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000396903;OID=.;OPOS=62041068;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:122:124:0:0:121:124:84:37:0:0:87:37:0:0 chr17 62049204 . G C 175.83 PASS AO=35;DP=65;FAO=36;FDP=66;FR=.;FRO=30;FSAF=25;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=10;FWDB=0.0301548;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.903;QD=10.6565;RBI=0.0327481;REFB=-0.0077978;REVB=0.0127722;RO=30;SAF=24;SAR=11;SRF=20;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0182672;STB=0.514698;TYPE=snp;VARB=0.00705435;OID=.;OPOS=62049204;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:66:30:30:35:36:11:24:20:10:11:25:20:10 chr17 62079286 . G A 135.4 PASS AO=29;DP=64;FAO=30;FDP=61;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=-0.00386088;FXX=0.061529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.729;QD=8.87881;RBI=0.0124188;REFB=-0.00645413;REVB=-0.0118034;RO=26;SAF=9;SAR=20;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0349324;STB=0.568218;TYPE=snp;VARB=0.0126397;OID=.;OPOS=62079286;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:61:26:31:29:30:20:9:9:17:21:9:13:18 chr17 62082674 . TG T,TT 830.22 PASS AO=67,17;DP=106;FAO=88,16;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=34,15;FSAR=54,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0233223,0.0312994;FXX=0.0095229;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=18.0399,12.8044;QD=31.9315;RBI=0.0536513,0.093183;REFB=0,0;REVB=0.0483171,0.0877691;RO=5;SAF=25,16;SAR=42,1;SRF=1;SRR=4;SSEN=0.602941,0;SSEP=0.286624,0;SSSB=0.0243953,0.569482;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.0012978,0.00234866;OID=.,.;OPOS=62082675,62082675;OREF=G,G;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:67,17:100:88,16:104:0:34,15:54,1:0:0:10:5:25,16:42,1:1:4 chr17 62121480 . T C 81.88 PASS AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=5;FWDB=-0.00736259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.397;QD=7.27798;RBI=0.015693;REFB=-0.0143952;REVB=0.0138587;RO=25;SAF=15;SAR=5;SRF=20;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0677184;STB=0.538425;TYPE=snp;VARB=0.0230245;OID=.;OPOS=62121480;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:45:45:25:25:20:20:5:15:20:5:5:15:20:5 chr17 62125272 . A G 1796.79 PASS AO=190;DP=193;FAO=193;FDP=193;FR=.;FRO=0;FSAF=117;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00129876;FXX=0.0153053;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.194;QD=37.2392;RBI=0.0583918;REFB=-0.117624;REVB=0.0583774;RO=2;SAF=115;SAR=75;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125269;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000300956;OID=.;OPOS=62125272;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:193:193:2:0:190:193:75:115:0:2:76:117:0:0 chr17 62133189 . C T 97.07 PASS AO=17;DP=28;FAO=17;FDP=28;FR=.;FRO=11;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.0254745;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.8484;QD=13.8678;RBI=0.0256463;REFB=-0.00600464;REVB=0.0029634;RO=11;SAF=14;SAR=3;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106309;STB=0.559924;TYPE=snp;VARB=0.0051847;OID=.;OPOS=62133189;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:28:28:11:11:17:17:3:14:8:3:3:14:8:3 chr17 62141455 . A G 667.53 PASS AO=42;DP=74;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.012519;FXX=0.0142837;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.8596;QD=38.6976;RBI=0.0128771;REFB=0;REVB=-0.00301566;RO=0;SAF=6;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.68983e-05;OID=.;OPOS=62141455;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:43:69:0:0:42:69:36:6:0:0:39:30:0:0 chr17 62152578 . C T 230.04 PASS AO=36;DP=51;FAO=36;FDP=51;FR=.;FRO=15;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.00267666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.107;QD=18.0422;RBI=0.0311093;REFB=-0.00610143;REVB=0.0309939;RO=15;SAF=23;SAR=13;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0978959;STB=0.553234;TYPE=snp;VARB=0.00418496;OID=.;OPOS=62152578;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:51:51:15:15:36:36:13:23:7:8:13:23:7:8 chr17 62270941 . C T 437.25 PASS AO=100;DP=196;FAO=100;FDP=196;FR=.;FRO=96;FSAF=55;FSAR=45;FSRF=50;FSRR=46;FWDB=0.0112497;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.967;QD=8.92339;RBI=0.0117426;REFB=-0.0178839;REVB=-0.00336642;RO=96;SAF=55;SAR=45;SRF=50;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.026221;STB=0.514386;TYPE=snp;VARB=0.0155375;OID=.;OPOS=62270941;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:196:96:96:100:100:45:55:50:46:45:55:50:46 chr17 62492630 . G C 212.65 PASS AO=52;DP=111;FAO=52;FDP=111;FR=.;FRO=59;FSAF=19;FSAR=33;FSRF=24;FSRR=35;FWDB=-0.00251163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.102;QD=7.66291;RBI=0.0254324;REFB=-0.0110164;REVB=0.025308;RO=59;SAF=19;SAR=33;SRF=24;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0420577;STB=0.523414;TYPE=snp;VARB=0.0220944;OID=.;OPOS=62492630;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:59:59:52:52:33:19:24:35:33:19:24:35 chr17 62541852 . G A 56.4 PASS AO=17;DP=39;FAO=22;FDP=43;FR=.;FRO=21;FSAF=19;FSAR=3;FSRF=21;FSRR=0;FWDB=-0.00722301;FXX=0.0652032;HRUN=13;LEN=1;MLLD=52.4362;QD=5.24638;RBI=0.333344;REFB=-0.00344636;REVB=0.333266;RO=22;SAF=14;SAR=3;SRF=22;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.401967;STB=0.677853;TYPE=snp;VARB=0.0205013;OID=.;OPOS=62541852;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:39:43:22:21:17:22:3:14:22:0:3:19:21:0 chr17 62541853 . G A 10.81 PASS AO=7;DP=41;FAO=8;FDP=46;FR=.;FRO=38;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=35;FSRR=3;FWDB=-0.00465099;FXX=0;HRUN=13;LEN=1;MLLD=130.236;QD=0.939638;RBI=0.00506718;REFB=-0.00153618;REVB=0.00201113;RO=34;SAF=4;SAR=3;SRF=34;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.724611;STB=0.799582;TYPE=snp;VARB=0.00198271;OID=.;OPOS=62541853;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:41:46:34:38:7:8:3:4:34:0:3:5:35:3 chr17 62782689 . T C 587.06 PASS AO=68;DP=73;FAO=69;FDP=74;FR=.;FRO=5;FSAF=23;FSAR=46;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.0442025;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.1942;QD=31.7331;RBI=0.0445394;REFB=-0.00411401;REVB=0.00546777;RO=5;SAF=23;SAR=45;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0923121;STB=0.549005;TYPE=snp;VARB=0.00229508;OID=.;OPOS=62782689;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:73:74:5:5:68:69:45:23:5:0:46:23:5:0 chr17 62796759 . A C 25.41 PASS AO=8;DP=27;FAO=8;FDP=27;FR=.;FRO=19;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=-0.0545431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.848;QD=3.76401;RBI=0.0587004;REFB=-0.0178195;REVB=-0.0216976;RO=18;SAF=1;SAR=7;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.635832;STB=0.881953;TYPE=snp;VARB=0.0253066;OID=.;OPOS=62796759;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:27:27:18:19:8:8:7:1:13:5:7:1:13:6 chr17 62818216 . GCCC GCC,GCCCA 181.38 PASS AO=14,30;DP=91;FAO=0,54;FDP=94;FR=.;FRO=40;FSAF=0,12;FSAR=0,42;FSRF=13;FSRR=27;FWDB=0.126739,0.0379354;FXX=0;HRUN=3,1;LEN=1,1;MLLD=17.009,21.9275;QD=7.71841;RBI=0.342125,0.116528;REFB=-0.171661,-0.000825026;REVB=-0.317785,0.11018;RO=10;SAF=0,4;SAR=14,26;SRF=2;SRR=8;SSEN=0.32126,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.804187,-0.0627728;STB=0.5,0.559082;TYPE=del,ins;VARB=0.0670846,0.00541343;OID=.,.;OPOS=62818217,62818220;OREF=C,-;OALT=-,A;OMAPALT=GCC,GCCCA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:14,30:70:0,54:94:40:0,12:0,42:13:27:85:10:0,4:14,26:2:8 chr17 62820746 . G T 1402.82 PASS AO=162;DP=173;FAO=162;FDP=172;FR=.;FRO=10;FSAF=84;FSAR=78;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0193417;FXX=0.00578001;HRUN=5;LEN=1;MLLD=224.757;QD=32.6236;RBI=0.0526899;REFB=-0.0841729;REVB=0.0490115;RO=9;SAF=84;SAR=78;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0296246;STB=0.512708;TYPE=snp;VARB=0.00198726;OID=.;OPOS=62820746;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:173:172:9:10:162:162:78:84:2:7:78:84:3:7 chr17 63533768 . G A 127.04 PASS AO=16;DP=21;FAO=17;FDP=21;FR=.;FRO=4;FSAF=15;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0139627;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=216.357;QD=24.1986;RBI=0.0229183;REFB=0.0126875;REVB=0.0181739;RO=0;SAF=14;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.555485;TYPE=snp;VARB=-0.00134886;OID=.;OPOS=63533768;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:16:21:0:4:16:17:2:14:0:0:2:15:3:1 chr17 63533789 . T C 222.14 PASS AO=23;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00456664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.414;QD=35.5418;RBI=0.108991;REFB=0;REVB=0.108896;RO=0;SAF=20;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00656971;OID=.;OPOS=63533789;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:25:25:0:0:23:25:3:20:0:0:5:20:0:0 chr17 63533904 . GC G 108.62 PASS AO=12;DP=26;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.242929;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.4457;QD=20.6892;RBI=0.35452;REFB=-0.0271003;REVB=0.258206;RO=7;SAF=4;SAR=8;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162618;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.046708;OID=.;OPOS=63533905;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:12:21:21:21:0:9:12:0:0:9:7:4:8:4:3 chr17 63534250 . T C 407.17 PASS AO=43;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00599126;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.712;QD=37.0156;RBI=0.0573724;REFB=0;REVB=0.0570587;RO=0;SAF=35;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.54187e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000343325;OID=.;OPOS=63534250;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:44:44:0:0:43:44:8:35:0:0:8:36:0:0 chr17 63554591 . G A 232.46 PASS AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0155782;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.887;QD=34.4387;RBI=0.0623327;REFB=-0.0596262;REVB=0.0603547;RO=1;SAF=10;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0281527;STB=0.51514;TYPE=snp;VARB=0.00511514;OID=.;OPOS=63554591;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:27:27:1:1:26:26:16:10:0:1:16:10:0:1 chr17 64023642 . A G 640.6 PASS AO=156;DP=326;FAO=156;FDP=320;FR=.;FRO=164;FSAF=81;FSAR=75;FSRF=79;FSRR=85;FWDB=0.007437;FXX=0.0184043;HRUN=3;LEN=1;MLLD=213.364;QD=8.00748;RBI=0.0135926;REFB=-0.018783;REVB=-0.0113775;RO=163;SAF=81;SAR=75;SRF=78;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0378722;STB=0.519228;TYPE=snp;VARB=0.0211933;OID=.;OPOS=64023642;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:326:320:163:164:156:156:75:81:78:85:75:81:79:85 chr17 64210757 . C A 95.19 PASS AO=39;DP=135;FAO=41;FDP=136;FR=.;FRO=95;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=39;FSRR=56;FWDB=-0.00463694;FXX=0.00729874;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.0708;QD=2.79977;RBI=0.0217576;REFB=-0.00607509;REVB=0.0212577;RO=91;SAF=17;SAR=22;SRF=36;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0493585;STB=0.520298;TYPE=snp;VARB=0.0129395;OID=.;OPOS=64210757;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:135:136:91:95:39:41:22:17:36:55:23:18:39:56 chr17 64222164 . C T 221.01 PASS AO=65;DP=155;FAO=64;FDP=154;FR=.;FRO=90;FSAF=37;FSAR=27;FSRF=42;FSRR=48;FWDB=-0.0173172;FXX=0.0064512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7158;QD=5.74055;RBI=0.0278289;REFB=0.0026563;REVB=-0.0217844;RO=90;SAF=37;SAR=28;SRF=42;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106513;STB=0.565383;TYPE=snp;VARB=-0.00303464;OID=.;OPOS=64222164;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:154:90:90:65:64:28:37:42:48:27:37:42:48 chr17 64783081 . G A 2589.17 PASS AO=269;DP=269;FAO=269;FDP=269;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=172;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0071532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.7221;QD=38.5007;RBI=0.0118727;REFB=0;REVB=0.00947588;RO=0;SAF=97;SAR=172;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.63457e-06;OID=.;OPOS=64783081;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:269:269:0:0:269:269:172:97:0:0:172:97:0:0 chr17 64801021 . A G 718.27 PASS AO=74;DP=79;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0459507;FXX=0.0506265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.68;QD=38.3077;RBI=0.048485;REFB=0;REVB=0.0154702;RO=0;SAF=26;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.16077e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000907833;OID=.;OPOS=64801021;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:79:75:0:0:74:75:48:26:0:0:49:26:0:0 chr17 65066879 . A G 262.26 PASS AO=65;DP=140;FAO=65;FDP=139;FR=.;FRO=74;FSAF=31;FSAR=34;FSRF=43;FSRR=31;FWDB=0.00750664;FXX=0.0211253;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.871;QD=7.54708;RBI=0.00766611;REFB=0.00748543;REVB=0.0015555;RO=68;SAF=31;SAR=34;SRF=38;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0756436;STB=0.555269;TYPE=snp;VARB=-0.00915472;OID=.;OPOS=65066879;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:139:68:74:65:65:34:31:38:30:34:31:43:31 chr17 65104666 . T G 242.25 PASS AO=49;DP=127;FAO=58;FDP=122;FR=.,HEALED;FRO=64;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=40;FSRR=24;FWDB=0.00708816;FXX=0.0161277;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.561;QD=7.94277;RBI=0.0148437;REFB=-0.0186673;REVB=-0.013042;RO=42;SAF=24;SAR=25;SRF=33;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.2484;STB=0.600806;TYPE=snp;VARB=0.0262885;OID=.;OPOS=65104666;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:122:42:64:49:58:25:24:33:9:33:25:40:24 chr17 65104743 . G A 1346.77 PASS AO=130;DP=130;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.168;QD=37.9371;RBI=0.0332489;REFB=0;REVB=0.0298819;RO=0;SAF=69;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000563727;OID=.;OPOS=65104743;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:130:142:0:0:130:142:61:69:0:0:72:70:0:0 chr17 65110436 . A G 239.94 PASS AO=74;DP=190;FAO=74;FDP=188;FR=.;FRO=114;FSAF=33;FSAR=41;FSRF=42;FSRR=72;FWDB=-0.00235844;FXX=0.0105258;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.424;QD=5.10518;RBI=0.00622196;REFB=-0.0120115;REVB=-0.00575766;RO=113;SAF=33;SAR=41;SRF=42;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0816228;STB=0.548047;TYPE=snp;VARB=0.0222382;OID=.;OPOS=65110436;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:188:113:114:74:74:41:33:42:71:41:33:42:72 chr17 65212042 . C T 89.1 PASS AO=23;DP=55;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=0.000331359;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.94;QD=6.60035;RBI=0.0555938;REFB=-0.00609894;REVB=-0.0555929;RO=31;SAF=8;SAR=15;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.266625;STB=0.652042;TYPE=snp;VARB=0.00710555;OID=.;OPOS=65212042;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:55:54:31:31:23:23:15:8:19:12:15:8:19:12 chr17 65341976 . A G 349.96 PASS AO=74;DP=135;FAO=74;FDP=135;FR=.;FRO=61;FSAF=30;FSAR=44;FSRF=35;FSRR=26;FWDB=-0.0203314;FXX=0.0073524;HRUN=4;LEN=1;MLLD=115.492;QD=10.3691;RBI=0.0203744;REFB=-0.0215612;REVB=-0.00132365;RO=61;SAF=30;SAR=44;SRF=35;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139999;STB=0.576592;TYPE=snp;VARB=0.0143293;OID=.;OPOS=65341976;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:61:61:74:74:44:30:35:26:44:30:35:26 chr17 65362548 . CGGGT CGT,CGGGA 253.35 PASS AO=12,10;DP=50;FAO=12,28;FDP=46;FR=.;FRO=6;FSAF=0,10;FSAR=12,18;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.0024605,0.0253429;FXX=0.079984;HRUN=3,1;LEN=2,1;MLLD=20.913,101.103;QD=22.0308;RBI=0.102244,0.164814;REFB=-0.0552996,-0.0665556;REVB=-0.102215,0.162854;RO=6;SAF=0,10;SAR=12,0;SRF=6;SRR=0;SSEN=0.380952,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.851554,0;STB=0.998887,0.615301;TYPE=del,snp;VARB=0.107997,0.0275552;OID=.,.;OPOS=65362549,65362552;OREF=GG,T;OALT=-,A;OMAPALT=CGT,CGGGA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:12,10:31:12,28:46:6:0,10:12,18:6:0:30:6:0,10:12,0:6:0 chr17 65404916 . AAG A 419.49 PASS AO=49;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114399;FXX=0.0185151;HRUN=3;LEN=2;MLLD=41.657;QD=31.6596;RBI=0.0204702;REFB=0;REVB=0.0169752;RO=2;SAF=29;SAR=20;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0313537;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.000320433;OID=.;OPOS=65404917;OREF=AG;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:49:53:53:53:0:31:22:0:0:37:2:29:20:2:0 chr17 65574283 . A G 298.61 PASS AO=76;DP=169;FAO=76;FDP=166;FR=.;FRO=90;FSAF=35;FSAR=41;FSRF=36;FSRR=54;FWDB=-0.0242665;FXX=0.0177504;HRUN=4;LEN=1;MLLD=104.312;QD=7.19536;RBI=0.0243637;REFB=-0.0237964;REVB=-0.00217452;RO=83;SAF=35;SAR=41;SRF=32;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0717676;STB=0.533186;TYPE=snp;VARB=0.0305021;OID=.;OPOS=65574283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:166:83:90:76:76:41:35:32:51:41:35:36:54 chr17 65739627 . A G 1142.18 PASS AO=129;DP=135;FAO=129;FDP=135;FR=.;FRO=6;FSAF=65;FSAR=64;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0301944;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=156.621;QD=33.8425;RBI=0.0380528;REFB=-0.00504662;REVB=-0.0231583;RO=6;SAF=65;SAR=64;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000326943;STB=0.500172;TYPE=snp;VARB=7.13209e-05;OID=.;OPOS=65739627;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:135:135:6:6:129:129:64:65:3:3:64:65:3:3 chr17 65978851 . T G 1380.61 PASS AO=149;DP=151;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0283446;FXX=0.0261421;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.2076;QD=37.0634;RBI=0.0349608;REFB=0.0255954;REVB=-0.0204657;RO=2;SAF=80;SAR=69;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0135849;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000140643;OID=.;OPOS=65978851;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:151:149:2:0:149:149:69:80:0:2:69:80:0:0 chr17 65988049 . T C 433.65 PASS AO=105;DP=216;FAO=106;FDP=218;FR=.;FRO=112;FSAF=57;FSAR=49;FSRF=65;FSRR=47;FWDB=-0.0266943;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.1127;QD=7.9568;RBI=0.0282951;REFB=-0.0174438;REVB=0.00938214;RO=111;SAF=56;SAR=49;SRF=64;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0406757;STB=0.522092;TYPE=snp;VARB=0.0165447;OID=.;OPOS=65988049;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:216:218:111:112:105:106:49:56:64:47:49:57:65:47 chr17 65989048 . T C 627.32 PASS AO=90;DP=97;FAO=83;FDP=97;FR=.;FRO=14;FSAF=55;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=14;FWDB=-0.0422897;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=37.0988;QD=25.8688;RBI=0.0438755;REFB=-0.17642;REVB=0.0116895;RO=7;SAF=55;SAR=35;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0858677;STB=0.599975;TYPE=snp;VARB=0.0273372;OID=.;OPOS=65989048;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:97:97:7:14:90:83:35:55:0:7:28:55:0:14 chr17 66016006 . T C 149.44 PASS AO=52;DP=137;FAO=50;FDP=135;FR=.;FRO=85;FSAF=30;FSAR=20;FSRF=39;FSRR=46;FWDB=-0.0389044;FXX=0.0287749;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.837;QD=4.4279;RBI=0.0534029;REFB=-0.00350419;REVB=-0.036583;RO=85;SAF=33;SAR=19;SRF=39;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194533;STB=0.58925;TYPE=snp;VARB=0.0069643;OID=.;OPOS=66016006;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:135:85:85:52:50:19:33:39:46:20:30:39:46 chr17 66016096 . C T 143.65 PASS AO=34;DP=79;FAO=37;FDP=81;FR=.;FRO=44;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=8;FSRR=36;FWDB=0.0817819;FXX=0.0121936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.1996;QD=7.0938;RBI=0.0951368;REFB=-0.0560502;REVB=0.048608;RO=45;SAF=14;SAR=20;SRF=8;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.259863;STB=0.632204;TYPE=snp;VARB=0.0708176;OID=.;OPOS=66016096;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:81:45:44:34:37:20:14:8:37:22:15:8:36 chr17 66039350 . A G 712.17 PASS AO=162;DP=316;FAO=162;FDP=314;FR=.;FRO=152;FSAF=80;FSAR=82;FSRF=83;FSRR=69;FWDB=0.00599172;FXX=0.00946342;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.246;QD=9.07225;RBI=0.00762053;REFB=0.00890861;REVB=-0.0047087;RO=149;SAF=80;SAR=82;SRF=81;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0436693;STB=0.525266;TYPE=snp;VARB=-0.00743205;OID=.;OPOS=66039350;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:316:314:149:152:162:162:82:80:81:68:82:80:83:69 chr17 66042639 . T A 502.65 PASS AO=113;DP=218;FAO=113;FDP=218;FR=.;FRO=105;FSAF=70;FSAR=43;FSRF=63;FSRR=42;FWDB=-0.00571119;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.797;QD=9.22299;RBI=0.0080642;REFB=-0.00353451;REVB=-0.00569329;RO=105;SAF=70;SAR=43;SRF=63;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0180727;STB=0.509896;TYPE=snp;VARB=0.0028246;OID=.;OPOS=66042639;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:218:218:105:105:113:113:43:70:63:42:43:70:63:42 chr17 66246416 . A G 1174.11 PASS AO=128;DP=131;FAO=128;FDP=131;FR=.;FRO=3;FSAF=75;FSAR=53;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0216462;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=198.884;QD=35.8506;RBI=0.0233683;REFB=-0.0910399;REVB=0.00880446;RO=2;SAF=75;SAR=53;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0175918;STB=0.505948;TYPE=snp;VARB=0.000128094;OID=.;OPOS=66246416;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:131:131:2:3:128:128:53:75:0:2:53:75:1:2 chr17 66253095 . T A 204.68 PASS AO=50;DP=106;FAO=50;FDP=106;FR=.;FRO=56;FSAF=16;FSAR=34;FSRF=21;FSRR=35;FWDB=-0.0244218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.853;QD=7.72387;RBI=0.0252778;REFB=-0.0204605;REVB=-0.00652263;RO=56;SAF=16;SAR=34;SRF=21;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0584833;STB=0.532586;TYPE=snp;VARB=0.0190049;OID=.;OPOS=66253095;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:56:56:50:50:34:16:21:35:34:16:21:35 chr17 66264567 . TTA T 553.11 PASS AO=215;DP=567;FAO=188;FDP=358;FR=.;FRO=170;FSAF=64;FSAR=124;FSRF=78;FSRR=92;FWDB=-0.0462267;FXX=0.104997;HRUN=2;LEN=2;MLLD=115.504;QD=6.18002;RBI=0.0530843;REFB=-0.0506604;REVB=0.0260967;RO=0;SAF=87;SAR=128;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.80401e-08;STB=0.560187;TYPE=del;VARB=0.106529;OID=.;OPOS=66264568;OREF=TA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:215:297:188:358:170:64:124:78:92:99:0:87:128:0:0 chr17 66267650 . T G 505.84 PASS AO=99;DP=170;FAO=99;FDP=170;FR=.;FRO=71;FSAF=51;FSAR=48;FSRF=41;FSRR=30;FWDB=-0.0167169;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=208.826;QD=11.9022;RBI=0.0167625;REFB=-0.0147098;REVB=-0.00123533;RO=70;SAF=51;SAR=48;SRF=41;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.054;STB=0.526085;TYPE=snp;VARB=0.0106216;OID=.;OPOS=66267650;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:170:70:71:99:99:48:51:41:29:48:51:41:30 chr17 66267691 . A T 230.99 PASS AO=72;DP=186;FAO=72;FDP=185;FR=.;FRO=113;FSAF=44;FSAR=28;FSRF=54;FSRR=59;FWDB=-0.0447757;FXX=0.00537606;HRUN=3;LEN=1;MLLD=87.2737;QD=4.99445;RBI=0.0449934;REFB=-0.00278863;REVB=-0.00442079;RO=112;SAF=44;SAR=28;SRF=53;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15055;STB=0.582448;TYPE=snp;VARB=0.00397864;OID=.;OPOS=66267691;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:185:112:113:72:72:28:44:53:59:28:44:54:59 chr17 66270082 . A G 210.98 PASS AO=56;DP=127;FAO=56;FDP=127;FR=.;FRO=71;FSAF=37;FSAR=19;FSRF=45;FSRR=26;FWDB=-0.0109013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.187;QD=6.64511;RBI=0.0173854;REFB=-0.0126538;REVB=-0.0135431;RO=71;SAF=37;SAR=19;SRF=45;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0296744;STB=0.516593;TYPE=snp;VARB=0.0167156;OID=.;OPOS=66270082;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:71:71:56:56:19:37:45:26:19:37:45:26 chr17 66303721 . G A 218.22 PASS AO=67;DP=166;FAO=67;FDP=168;FR=.;FRO=101;FSAF=37;FSAR=30;FSRF=60;FSRR=41;FWDB=0.096254;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=36.9163;QD=5.19566;RBI=0.115642;REFB=-0.010246;REVB=0.0640955;RO=88;SAF=36;SAR=31;SRF=51;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0433407;STB=0.525548;TYPE=snp;VARB=0.0164619;OID=.;OPOS=66303721;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:168:88:101:67:67:31:36:51:37:30:37:60:41 chr17 66416357 . C T 220.74 PASS AO=66;DP=170;FAO=66;FDP=165;FR=.;FRO=99;FSAF=52;FSAR=14;FSRF=68;FSRR=31;FWDB=0.00031779;FXX=0.0517212;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5419;QD=5.35128;RBI=0.0231637;REFB=-0.00795333;REVB=-0.0231615;RO=91;SAF=52;SAR=14;SRF=63;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134007;STB=0.582063;TYPE=snp;VARB=0.00723072;OID=.;OPOS=66416357;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:165:91:99:66:66:14:52:63:28:14:52:68:31 chr17 66449122 . G A 334.2 PASS AO=91;DP=222;FAO=96;FDP=228;FR=.;FRO=132;FSAF=58;FSAR=38;FSRF=62;FSRR=70;FWDB=0.00712723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.464;QD=5.86311;RBI=0.00742547;REFB=-0.0015572;REVB=-0.0020833;RO=131;SAF=55;SAR=36;SRF=62;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139622;STB=0.578697;TYPE=snp;VARB=0.00150277;OID=.;OPOS=66449122;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:228:131:132:91:96:36:55:62:69:38:58:62:70 chr17 66533655 . A G 543.34 PASS AO=59;DP=61;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0192018;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.706;QD=36.2227;RBI=0.0575967;REFB=-0.0194024;REVB=-0.0543016;RO=1;SAF=30;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0159925;STB=0.508472;TYPE=snp;VARB=-1.94454e-05;OID=.;OPOS=66533655;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:61:60:1:1:59:59:29:30:0:1:29:30:0:1 chr17 66538239 . G T 1216.39 PASS AO=130;DP=136;FAO=133;FDP=135;FR=.;FRO=2;FSAF=65;FSAR=68;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.111103;FXX=0.0073524;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.2476;QD=36.0411;RBI=0.126027;REFB=-0.166578;REVB=0.059489;RO=6;SAF=62;SAR=68;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159081;STB=0.500167;TYPE=snp;VARB=0.00767999;OID=.;OPOS=66538239;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:136:135:6:2:130:133:68:62:4:2:68:65:1:1 chr17 66539847 . C T 308.4 PASS AO=70;DP=124;FAO=66;FDP=123;FR=.;FRO=57;FSAF=30;FSAR=36;FSRF=30;FSRR=27;FWDB=-0.0072601;FXX=0.00806387;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.7256;QD=10.0293;RBI=0.0418586;REFB=0.00424686;REVB=0.0412242;RO=54;SAF=33;SAR=37;SRF=27;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0228256;STB=0.533323;TYPE=snp;VARB=-0.00338134;OID=.;OPOS=66539847;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:123:54:57:70:66:37:33:27:27:36:30:30:27 chr17 66872802 . G C 263.53 PASS AO=75;DP=179;FAO=75;FDP=179;FR=.;FRO=104;FSAF=38;FSAR=37;FSRF=64;FSRR=40;FWDB=0.0140762;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.7821;QD=5.88897;RBI=0.0255467;REFB=0.0119666;REVB=0.0213189;RO=104;SAF=38;SAR=37;SRF=64;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113281;STB=0.563267;TYPE=snp;VARB=-0.0124866;OID=.;OPOS=66872802;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:179:104:104:75:75:37:38:64:40:37:38:64:40 chr17 66899613 . G A 179.13 PASS AO=55;DP=141;FAO=55;FDP=141;FR=.;FRO=86;FSAF=16;FSAR=39;FSRF=37;FSRR=49;FWDB=-0.0522346;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.7497;QD=5.08175;RBI=0.0544035;REFB=-0.0122235;REVB=-0.015208;RO=85;SAF=16;SAR=39;SRF=37;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171672;STB=0.594784;TYPE=snp;VARB=0.0185988;OID=.;OPOS=66899613;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:85:86:55:55:39:16:37:48:39:16:37:49 chr17 66985992 . T G 120.68 PASS AO=41;DP=115;FAO=41;FDP=115;FR=.;FRO=74;FSAF=12;FSAR=29;FSRF=44;FSRR=30;FWDB=-0.011244;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=233.86;QD=4.19767;RBI=0.015384;REFB=-0.00206858;REVB=-0.0104995;RO=72;SAF=12;SAR=29;SRF=43;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.342225;STB=0.696301;TYPE=snp;VARB=0.00436228;OID=.;OPOS=66985992;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:72:74:41:41:29:12:43:29:29:12:44:30 chr17 67017930 . T C 88.67 PASS AO=23;DP=53;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.0171782;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.0647;QD=6.56799;RBI=0.0679794;REFB=-0.0209616;REVB=-0.0657731;RO=30;SAF=14;SAR=9;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00904492;STB=0.502536;TYPE=snp;VARB=0.0252749;OID=.;OPOS=67017930;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:53:54:30:31:23:23:9:14:18:12:9:14:19:12 chr17 67028260 . T C 501.04 PASS AO=107;DP=197;FAO=108;FDP=201;FR=.;FRO=93;FSAF=54;FSAR=54;FSRF=40;FSRR=53;FWDB=-0.0471008;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.0642;QD=9.97098;RBI=0.0716075;REFB=-0.00698176;REVB=0.0539364;RO=90;SAF=54;SAR=53;SRF=38;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0690165;STB=0.532332;TYPE=snp;VARB=0.00582958;OID=.;OPOS=67028260;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:201:90:93:107:108:53:54:38:52:54:54:40:53 chr17 67031457 . C T 1710.18 PASS AO=178;DP=178;FAO=178;FDP=178;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.0165;QD=38.431;RBI=0.0191283;REFB=0;REVB=-0.00738861;RO=0;SAF=77;SAR=101;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.43519e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.79627e-05;OID=.;OPOS=67031457;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:178:178:0:0:178:178:101:77:0:0:101:77:0:0 chr17 67081830 . T C 376.43 PASS AO=84;DP=162;FAO=84;FDP=162;FR=.;FRO=78;FSAF=33;FSAR=51;FSRF=38;FSRR=40;FWDB=-0.00395737;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.983;QD=9.29461;RBI=0.0138745;REFB=0.00509105;REVB=0.0132982;RO=77;SAF=33;SAR=51;SRF=38;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0899572;STB=0.546637;TYPE=snp;VARB=-0.00520345;OID=.;OPOS=67081830;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:162:77:78:84:84:51:33:38:39:51:33:38:40 chr17 67101718 . C T 1562.85 PASS AO=162;DP=163;FAO=165;FDP=165;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0748788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.382;QD=37.8872;RBI=0.077525;REFB=0;REVB=0.0200821;RO=0;SAF=76;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.22958e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000310574;OID=.;OPOS=67101718;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:163:165:0:0:162:165:86:76:0:0:89:76:0:0 chr17 67125840 . C T 199.96 PASS AO=32;DP=46;FAO=32;FDP=46;FR=.;FRO=14;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0080484;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.684;QD=17.3875;RBI=0.0111671;REFB=0.0014513;REVB=0.00774128;RO=14;SAF=11;SAR=21;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0515003;STB=0.528089;TYPE=snp;VARB=-0.000285154;OID=.;OPOS=67125840;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:46:46:14:14:32:32:21:11:6:8:21:11:6:8 chr17 67178316 . A G 2095.3 PASS AO=222;DP=230;FAO=226;FDP=226;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=133;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137471;FXX=0.0464115;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.337;QD=37.0849;RBI=0.0209489;REFB=-0.110834;REVB=0.0158074;RO=3;SAF=89;SAR=133;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0157866;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000595467;OID=.;OPOS=67178316;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:230:226:3:0:222:226:133:89:3:0:133:93:0:0 chr17 67210992 . T C 52.9 PASS AO=16;DP=45;FAO=16;FDP=45;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=0.0297595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.008;QD=4.70252;RBI=0.0305064;REFB=-0.00530954;REVB=0.00670899;RO=28;SAF=5;SAR=11;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0965433;STB=0.571772;TYPE=snp;VARB=0.0101889;OID=.;OPOS=67210992;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:45:45:28:29:16:16:11:5:11:17:11:5:12:17 chr17 67212031 . A G 1094.48 PASS AO=119;DP=124;FAO=123;FDP=127;FR=.;FRO=4;FSAF=66;FSAR=57;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0816352;FXX=0.00781189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.5186;QD=34.4717;RBI=0.0971584;REFB=-0.202518;REVB=0.0526826;RO=5;SAF=63;SAR=56;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0362121;STB=0.514704;TYPE=snp;VARB=0.00590675;OID=.;OPOS=67212031;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:124:127:5:4:119:123:56:63:5:0:57:66:4:0 chr17 67212423 . G A 1248.41 PASS AO=134;DP=136;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00732653;FXX=0.0147048;HRUN=3;LEN=1;MLLD=291.018;QD=37.2661;RBI=0.015416;REFB=0.00749848;REVB=0.0135638;RO=2;SAF=61;SAR=73;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0153277;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.24929e-05;OID=.;OPOS=67212423;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:136:134:2:0:134:134:73:61:2:0:73:61:0:0 chr17 67215712 . C T 1405.91 PASS AO=145;DP=145;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00294876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.176;QD=38.2562;RBI=0.0186096;REFB=0;REVB=-0.0183745;RO=0;SAF=55;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.69298e-05;OID=.;OPOS=67215712;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:145:147:0:0:145:147:90:55:0:0:91:56:0:0 chr17 67267317 . T C 778.69 PASS AO=82;DP=83;FAO=84;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=61;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0616455;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.3667;QD=36.6444;RBI=0.0650399;REFB=-0.0356624;REVB=0.0207369;RO=0;SAF=60;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94507e-08;STB=0.510636;TYPE=snp;VARB=0.000922351;OID=.;OPOS=67267317;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:83:85:0:1:82:84:22:60:0:0:23:61:0:1 chr17 67267347 . C A 86.04 PASS AO=33;DP=103;FAO=33;FDP=103;FR=.;FRO=70;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=51;FSRR=19;FWDB=-0.00103808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.357;QD=3.34133;RBI=0.0134055;REFB=0.00200023;REVB=0.0133652;RO=69;SAF=20;SAR=13;SRF=51;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170403;STB=0.59048;TYPE=snp;VARB=-0.00464241;OID=.;OPOS=67267347;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:103:103:69:70:33:33:13:20:51:18:13:20:51:19 chr17 67273882 . C A 2079.79 PASS AO=210;DP=212;FAO=217;FDP=217;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0359171;FXX=0.009132;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.792;QD=38.3372;RBI=0.0360316;REFB=0;REVB=-0.00287003;RO=0;SAF=97;SAR=113;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.86378e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000233532;OID=.;OPOS=67273882;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:212:217:0:0:210:217:113:97:0:0:113:104:0:0 chr17 67513003 . C A 417.96 PASS AO=104;DP=220;FAO=104;FDP=220;FR=.;FRO=116;FSAF=47;FSAR=57;FSRF=62;FSRR=54;FWDB=-0.00554791;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.669;QD=7.59933;RBI=0.0109183;REFB=-0.00813608;REVB=0.00940376;RO=116;SAF=47;SAR=57;SRF=62;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0789219;STB=0.543561;TYPE=snp;VARB=0.00859669;OID=.;OPOS=67513003;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:220:220:116:116:104:104:57:47:62:54:57:47:62:54 chr17 67513055 . A G 343.72 PASS AO=92;DP=208;FAO=92;FDP=207;FR=.;FRO=115;FSAF=42;FSAR=50;FSRF=49;FSRR=66;FWDB=0.0135186;FXX=0.00480746;HRUN=6;LEN=1;MLLD=179.343;QD=6.64188;RBI=0.0141427;REFB=-0.00134887;REVB=-0.00415486;RO=109;SAF=42;SAR=50;SRF=48;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0159581;STB=0.517084;TYPE=snp;VARB=0.00109007;OID=.;OPOS=67513055;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:207:109:115:92:92:50:42:48:61:50:42:49:66 chr17 67982157 . C T 1229.53 PASS AO=126;DP=127;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0304963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.366;QD=38.4227;RBI=0.0309551;REFB=0;REVB=0.00530997;RO=1;SAF=63;SAR=63;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00748277;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.47848e-05;OID=.;OPOS=67982157;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:127:128:1:0:126:128:63:63:1:0:64:64:0:0 chr17 68128417 . C T 499.82 PASS AO=120;DP=244;FAO=120;FDP=244;FR=.;FRO=124;FSAF=49;FSAR=71;FSRF=41;FSRR=83;FWDB=-0.0335697;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.9354;QD=8.19382;RBI=0.0644188;REFB=-0.0336473;REVB=-0.0549805;RO=123;SAF=49;SAR=71;SRF=41;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.072677;STB=0.541469;TYPE=snp;VARB=0.0240956;OID=.;OPOS=68128417;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:244:123:124:120:120:71:49:41:82:71:49:41:83 chr17 68173731 . A G 184.95 PASS AO=46;DP=100;FAO=46;FDP=100;FR=.;FRO=54;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=19;FSRR=35;FWDB=0.00981196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.22;QD=7.39806;RBI=0.0181617;REFB=-0.0174073;REVB=0.0152831;RO=54;SAF=23;SAR=23;SRF=19;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143694;STB=0.579966;TYPE=snp;VARB=0.0154478;OID=.;OPOS=68173731;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:54:54:46:46:23:23:19:35:23:23:19:35 chr17 68174060 . A C 422.11 PASS AO=77;DP=128;FAO=78;FDP=127;FR=.;FRO=49;FSAF=35;FSAR=43;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=-0.0157264;FXX=0.00781189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.865;QD=13.2949;RBI=0.0189226;REFB=-0.00114297;REVB=0.0105235;RO=50;SAF=34;SAR=43;SRF=24;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0281627;STB=0.515961;TYPE=snp;VARB=0.000703259;OID=.;OPOS=68174060;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:127:50:49:77:78:43:34:24:26:43:35:24:25 chr17 70660158 . T C 262.81 PASS AO=70;DP=155;FAO=70;FDP=158;FR=.;FRO=88;FSAF=23;FSAR=47;FSRF=49;FSRR=39;FWDB=-0.0537611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.5249;QD=6.65332;RBI=0.0584077;REFB=-0.0329498;REVB=0.0228299;RO=84;SAF=23;SAR=47;SRF=48;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.244343;STB=0.631069;TYPE=snp;VARB=0.0402803;OID=.;OPOS=70660158;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:158:84:88:70:70:47:23:48:36:47:23:49:39 chr17 70815064 . A T 281.37 PASS AO=79;DP=185;FAO=79;FDP=185;FR=.;FRO=106;FSAF=36;FSAR=43;FSRF=46;FSRR=60;FWDB=-0.00298167;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=239.222;QD=6.08368;RBI=0.00666248;REFB=-0.00391548;REVB=-0.00595804;RO=106;SAF=36;SAR=43;SRF=46;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0225344;STB=0.512576;TYPE=snp;VARB=0.00750121;OID=.;OPOS=70815064;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:185:106:106:79:79:43:36:46:60:43:36:46:60 chr17 70943990 . T C 788.2 PASS AO=67;DP=87;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.123134;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.2816;QD=37.5333;RBI=0.129411;REFB=0;REVB=0.0398146;RO=0;SAF=16;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17211e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0027408;OID=.;OPOS=70943990;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:68:84:0:0:67:84:51:16:0:0:56:28:0:0 chr17 71192663 . G A 40.6 PASS AO=12;DP=36;FAO=12;FDP=35;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0357155;FXX=0.0277701;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.1103;QD=4.63979;RBI=0.095818;REFB=0.0184999;REVB=0.0889128;RO=23;SAF=8;SAR=4;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118681;STB=0.571306;TYPE=snp;VARB=-0.0649685;OID=.;OPOS=71192663;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:36:35:23:23:12:12:4:8:13:10:4:8:13:10 chr17 71192873 . A G 52.99 PASS AO=19;DP=63;FAO=20;FDP=65;FR=.;FRO=45;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=0.0141952;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.162;QD=3.26098;RBI=0.0309887;REFB=-0.009256;REVB=-0.0275463;RO=43;SAF=12;SAR=7;SRF=26;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0333065;STB=0.553137;TYPE=snp;VARB=0.0147615;OID=.;OPOS=71192873;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:63:65:43:45:19:20:7:12:26:17:7:13:26:19 chr17 71196809 . A G 605.11 PASS AO=145;DP=303;FAO=148;FDP=306;FR=.;FRO=158;FSAF=60;FSAR=88;FSRF=81;FSRR=77;FWDB=-0.00474184;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.9755;QD=7.90997;RBI=0.0373509;REFB=-0.0124546;REVB=-0.0370487;RO=158;SAF=59;SAR=86;SRF=81;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101571;STB=0.556205;TYPE=snp;VARB=0.010259;OID=.;OPOS=71196809;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:303:306:158:158:145:148:86:59:81:77:88:60:81:77 chr17 71197748 . G A 37.64 PASS AO=13;DP=40;FAO=13;FDP=40;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=22;FSRR=5;FWDB=-0.0235724;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.8793;QD=3.76356;RBI=0.0235827;REFB=0.00350465;REVB=0.000696258;RO=27;SAF=10;SAR=3;SRF=22;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0764116;STB=0.545388;TYPE=snp;VARB=-0.0158374;OID=.;OPOS=71197748;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:40:40:27:27:13:13:3:10:22:5:3:10:22:5 chr17 71205854 . A G 21.07 PASS AO=4;DP=12;FAO=5;FDP=13;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0329983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.193;QD=6.48299;RBI=0.0675688;REFB=-0.0046677;REVB=-0.0589632;RO=8;SAF=4;SAR=0;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.703678;STB=0.713343;TYPE=snp;VARB=0.00901675;OID=.;OPOS=71205854;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:12:13:8:8:4:5:0:4:4:4:1:4:4:4 chr17 71232456 . AT A 26.91 PASS AO=5;DP=25;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=-0.181415;FXX=0.049975;HRUN=4;LEN=1;MLLD=9.18441;QD=5.66605;RBI=0.295586;REFB=-0.140282;REVB=0.233366;RO=10;SAF=5;SAR=0;SRF=4;SRR=6;SSEN=0.327619;SSEP=0;SSSB=0.745952;STB=0.553098;TYPE=del;VARB=0.156104;OID=.;OPOS=71232457;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:5:18:11:19:8:7:4:6:2:18:10:5:0:4:6 chr17 71232687 . T C 144.07 PASS AO=39;DP=92;FAO=39;FDP=92;FR=.;FRO=53;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=28;FWDB=0.0219213;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.031;QD=6.26381;RBI=0.0247574;REFB=-0.00187858;REVB=0.011506;RO=52;SAF=16;SAR=23;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0727413;STB=0.536081;TYPE=snp;VARB=0.00276336;OID=.;OPOS=71232687;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:52:53:39:39:23:16:25:27:23:16:25:28 chr17 71232804 . C A 1311.36 PASS AO=137;DP=138;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0178892;FXX=0.00719373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.4925;QD=38.0105;RBI=0.0180715;REFB=-0.0459997;REVB=-0.0025601;RO=1;SAF=54;SAR=83;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00872215;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000539428;OID=.;OPOS=71232804;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:138:138:1:0:137:138:83:54:1:0:84:54:0:0 chr17 71232807 . T C 180.4 PASS AO=56;DP=144;FAO=56;FDP=144;FR=.;FRO=88;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=34;FSRR=54;FWDB=0.00411488;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.833;QD=5.01114;RBI=0.0289826;REFB=-0.000415235;REVB=-0.028689;RO=87;SAF=25;SAR=31;SRF=33;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0738574;STB=0.537417;TYPE=snp;VARB=0.000260948;OID=.;OPOS=71232807;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:144:87:88:56:56:31:25:33:54:31:25:34:54 chr17 71232881 . G C 121.29 PASS AO=48;DP=150;FAO=48;FDP=149;FR=.;FRO=101;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=39;FSRR=62;FWDB=-0.0743726;FXX=0.00666622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.9715;QD=3.2562;RBI=0.0798143;REFB=-0.00641574;REVB=0.0289661;RO=99;SAF=20;SAR=28;SRF=38;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0396885;STB=0.521428;TYPE=snp;VARB=0.0123337;OID=.;OPOS=71232881;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:149:99:101:48:48:28:20:38:61:28:20:39:62 chr17 71233130 . A G 83.52 PASS AO=30;DP=90;FAO=30;FDP=90;FR=.;FRO=60;FSAF=4;FSAR=26;FSRF=5;FSRR=55;FWDB=0.00721973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.475;QD=3.71188;RBI=0.0282506;REFB=-0.0197306;REVB=0.0273125;RO=60;SAF=4;SAR=26;SRF=5;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141199;STB=0.580598;TYPE=snp;VARB=0.0309689;OID=.;OPOS=71233130;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:90:90:60:60:30:30:26:4:5:55:26:4:5:55 chr17 71238433 . G A 524.33 PASS AO=144;DP=330;FAO=145;FDP=330;FR=.;FRO=185;FSAF=80;FSAR=65;FSRF=105;FSRR=80;FWDB=-0.0185224;FXX=0.00602391;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.2399;QD=6.35556;RBI=0.0185565;REFB=-0.0278491;REVB=0.00112488;RO=183;SAF=79;SAR=65;SRF=103;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145254;STB=0.508993;TYPE=snp;VARB=0.0316886;OID=.;OPOS=71238433;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:330:330:183:185:144:145:65:79:103:80:65:80:105:80 chr17 71239087 . G T 658.71 PASS AO=161;DP=333;FAO=161;FDP=331;FR=.;FRO=170;FSAF=91;FSAR=70;FSRF=99;FSRR=71;FWDB=0.00316509;FXX=0.00301196;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.491;QD=7.9602;RBI=0.0270397;REFB=-0.00332758;REVB=0.0268539;RO=167;SAF=91;SAR=70;SRF=98;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0204585;STB=0.508973;TYPE=snp;VARB=0.00459669;OID=.;OPOS=71239087;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:333:331:167:170:161:161:70:91:98:69:70:91:99:71 chr17 71239215 . A T 283.41 PASS AO=57;DP=108;FAO=59;FDP=107;FR=.;FRO=48;FSAF=36;FSAR=23;FSRF=41;FSRR=7;FWDB=0.022832;FXX=0.0183469;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.621;QD=10.5946;RBI=0.022843;REFB=-0.00754161;REVB=0.000707677;RO=48;SAF=33;SAR=24;SRF=41;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24745;STB=0.621149;TYPE=snp;VARB=0.00128805;OID=.;OPOS=71239215;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:107:48:48:57:59:24:33:41:7:23:36:41:7 chr17 71239216 . A T 292.41 PASS AO=57;DP=105;FAO=60;FDP=105;FR=.;FRO=45;FSAF=40;FSAR=20;FSRF=38;FSRR=7;FWDB=0.0596982;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.089;QD=11.1394;RBI=0.0792641;REFB=-0.0737551;REVB=0.0521433;RO=38;SAF=36;SAR=21;SRF=31;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152431;STB=0.590881;TYPE=snp;VARB=0.0244911;OID=.;OPOS=71239216;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:105:105:38:45:57:60:21:36:31:7:20:40:38:7 chr17 71239234 . T G 35.77 PASS AO=19;DP=82;FAO=19;FDP=81;FR=.;FRO=62;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=42;FSRR=20;FWDB=0.00707453;FXX=0;HRUN=24;LEN=1;MLLD=92.2101;QD=1.76625;RBI=0.0174413;REFB=0.00596373;REVB=0.015942;RO=63;SAF=11;SAR=8;SRF=42;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115001;STB=0.579156;TYPE=snp;VARB=-0.0102622;OID=.;OPOS=71239234;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:82:81:63:62:19:19:8:11:42:21:8:11:42:20 chr17 71244630 . C T 1681.25 PASS AO=175;DP=178;FAO=175;FDP=175;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00770817;FXX=0.016853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.301;QD=38.4285;RBI=0.0144163;REFB=0;REVB=0.0121826;RO=0;SAF=87;SAR=88;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.23298e-05;OID=.;OPOS=71244630;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:178:175:0:0:175:175:88:87:0:0:88:87:0:0 chr17 71244702 . G T 281.98 PASS AO=75;DP=169;FAO=75;FDP=169;FR=.;FRO=94;FSAF=25;FSAR=50;FSRF=50;FSRR=44;FWDB=0.0284478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.055;QD=6.67411;RBI=0.0288544;REFB=-0.00571003;REVB=0.00482684;RO=94;SAF=25;SAR=50;SRF=50;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205606;STB=0.614723;TYPE=snp;VARB=0.00592258;OID=.;OPOS=71244702;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:169:94:94:75:75:50:25:50:44:50:25:50:44 chr17 71281760 . CG C 20.47 PASS AO=4;DP=16;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.0185313;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=12.7565;QD=5.45805;RBI=0.0325562;REFB=-0.124881;REVB=-0.0267675;RO=8;SAF=0;SAR=4;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.67854;STB=0.529329;TYPE=del;VARB=0.146528;OID=.;OPOS=71281761;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:4:14:7:15:8:3:4:3:5:19:8:0:4:3:5 chr17 71334955 . GC G 635.54 PASS AO=78;DP=99;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.199594;FXX=0.010203;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.8507;QD=26.2077;RBI=0.349362;REFB=0;REVB=0.286733;RO=17;SAF=40;SAR=38;SRF=6;SRR=11;SSEN=0.243808;SSEP=0;SSSB=0.053652;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.010056;OID=.;OPOS=71334956;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:78:97:97:97:0:48:49:0:0:54:17:40:38:6:11 chr17 71365314 . A G 650.53 PASS AO=139;DP=254;FAO=139;FDP=255;FR=.;FRO=116;FSAF=44;FSAR=95;FSRF=50;FSRR=66;FWDB=-0.0120244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.483;QD=10.2044;RBI=0.0123495;REFB=-0.0167748;REVB=-0.00281498;RO=111;SAF=44;SAR=95;SRF=49;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112255;STB=0.557629;TYPE=snp;VARB=0.0132964;OID=.;OPOS=71365314;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:254:255:111:116:139:139:95:44:49:62:95:44:50:66 chr17 71386577 . G T 209.73 PASS AO=44;DP=82;FAO=44;FDP=82;FR=.;FRO=38;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=13;FSRR=25;FWDB=0.00452926;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.247;QD=10.2306;RBI=0.021701;REFB=-0.0211452;REVB=-0.0212231;RO=38;SAF=16;SAR=28;SRF=13;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0196717;STB=0.510838;TYPE=snp;VARB=0.0225056;OID=.;OPOS=71386577;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:38:38:44:44:28:16:13:25:28:16:13:25 chr17 71390366 . C A 83.37 PASS AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=24;FR=.,HEALED;FRO=9;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=-0.0180265;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=138.384;QD=13.8949;RBI=0.019857;REFB=-0.0100717;REVB=-0.00832749;RO=9;SAF=7;SAR=4;SRF=0;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.469562;STB=0.7643;TYPE=snp;VARB=0.0144527;OID=.;OPOS=71390366;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:24:24:9:9:11:11:4:7:0:9:4:7:0:9 chr17 71398170 . G C 250.42 PASS AO=50;DP=89;FAO=50;FDP=89;FR=.;FRO=39;FSAF=37;FSAR=13;FSRF=33;FSRR=6;FWDB=-0.00407303;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.7797;QD=11.2549;RBI=0.105338;REFB=0.0288428;REVB=0.105259;RO=39;SAF=37;SAR=13;SRF=33;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11774;STB=0.564142;TYPE=snp;VARB=-0.0189386;OID=.;OPOS=71398170;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:39:39:50:50:13:37:33:6:13:37:33:6 chr17 71410891 . C T 151.08 PASS AO=34;DP=69;FAO=34;FDP=69;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=-0.00582907;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.928;QD=8.75825;RBI=0.00683457;REFB=0.000270162;REVB=-0.00356838;RO=34;SAF=10;SAR=24;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0910231;STB=0.561366;TYPE=snp;VARB=-0.000629755;OID=.;OPOS=71410891;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:34:35:34:34:24:10:13:21:24:10:14:21 chr17 71426656 . G T 79.95 PASS AO=14;DP=23;FAO=14;FDP=23;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.113809;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.408;QD=13.9047;RBI=0.132234;REFB=-0.0397179;REVB=0.067331;RO=8;SAF=3;SAR=11;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139114;STB=0.564005;TYPE=snp;VARB=0.0229802;OID=.;OPOS=71426656;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:23:23:8:9:14:14:11:3:3:5:11:3:3:6 chr17 71426670 . G A 76.66 PASS AO=14;DP=24;FAO=14;FDP=24;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.0231897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.45;QD=12.7767;RBI=0.0330693;REFB=-0.003131;REVB=0.0235757;RO=9;SAF=1;SAR=13;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.483655;STB=0.811913;TYPE=snp;VARB=0.0077832;OID=.;OPOS=71426670;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:24:24:9:10:14:14:13:1:4:5:13:1:5:5 chr17 71503636 . T C 1212.76 PASS AO=127;DP=128;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0402593;FXX=0.030532;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.402;QD=38.1972;RBI=0.0469;REFB=0;REVB=0.0240583;RO=0;SAF=73;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.33451e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000194401;OID=.;OPOS=71503636;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:128:127:0:0:127:127:54:73:0:0:54:73:0:0 chr17 71752500 . C CT 1481.22 PASS AO=147;DP=174;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=118;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029995;FXX=0.0647021;HRUN=0;LEN=1;MLLD=190.68;QD=37.2634;RBI=0.0442442;REFB=-0.0547465;REVB=0.0325246;RO=14;SAF=114;SAR=33;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0469125;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00057178;OID=.;OPOS=71752501;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:147:174:159:159:0:118:41:0:0:55:14:114:33:8:6 chr17 72209858 . A G 254.95 PASS AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0901389;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.9616;QD=37.7712;RBI=0.0901503;REFB=0;REVB=-0.00143342;RO=0;SAF=2;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.18567e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00148918;OID=.;OPOS=72209858;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:27:27:0:0:27:27:25:2:0:0:25:2:0:0 chr17 72233485 . G A 319.21 PASS AO=64;DP=115;FAO=65;FDP=116;FR=.;FRO=51;FSAF=28;FSAR=37;FSRF=12;FSRR=39;FWDB=0.000653681;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.957;QD=11.0074;RBI=0.00702027;REFB=-0.00115327;REVB=-0.00698977;RO=51;SAF=28;SAR=36;SRF=12;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171198;STB=0.589774;TYPE=snp;VARB=0.000979509;OID=.;OPOS=72233485;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:116:51:51:64:65:36:28:12:39:37:28:12:39 chr17 72233559 . G A 1088.3 PASS AO=112;DP=113;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0313212;FXX=0.0256388;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.8429;QD=38.186;RBI=0.036575;REFB=0;REVB=-0.0188869;RO=0;SAF=40;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.64229e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.2724e-05;OID=.;OPOS=72233559;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:113:114:0:0:112:114:72:40:0:0:73:41:0:0 chr17 72240177 . T G 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.557;QD=35.0875;RBI=0.0130509;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=7;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000359222;OID=.;OPOS=72240177;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:0:7:0:0:0:7:0:0 chr17 72246101 . T C 34.49 PASS AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00772883;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.6676;QD=22.9962;RBI=0.0435458;REFB=-0.00944376;REVB=0.0428545;RO=1;SAF=2;SAR=3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121807;STB=0.571154;TYPE=snp;VARB=0.00953913;OID=.;OPOS=72246101;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:6:6:1:1:5:5:3:2:0:1:3:2:0:1 chr17 72246466 . C T 92.96 PASS AO=25;DP=61;FAO=25;FDP=61;FR=.;FRO=36;FSAF=20;FSAR=5;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=0.0143075;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.111;QD=6.09577;RBI=0.0515512;REFB=-0.0240378;REVB=-0.049526;RO=36;SAF=20;SAR=5;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.278126;STB=0.661014;TYPE=snp;VARB=0.0280728;OID=.;OPOS=72246466;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:61:61:36:36:25:25:5:20:21:15:5:20:21:15 chr17 72248483 . A G 102.45 PASS AO=22;DP=47;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.0104196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.172;QD=8.19566;RBI=0.0405799;REFB=-0.0190201;REVB=-0.0392193;RO=24;SAF=11;SAR=11;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0384446;STB=0.541632;TYPE=snp;VARB=0.0167343;OID=.;OPOS=72248483;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:50:24:26:22:24:11:11:13:11:13:11:14:12 chr17 72249229 . C A 166.26 PASS AO=38;DP=77;FAO=38;FDP=77;FR=.;FRO=39;FSAF=11;FSAR=27;FSRF=11;FSRR=28;FWDB=-0.00817019;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.6858;QD=8.63708;RBI=0.0187842;REFB=-0.0204537;REVB=-0.0169143;RO=39;SAF=11;SAR=27;SRF=11;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00824358;STB=0.504585;TYPE=snp;VARB=0.0192813;OID=.;OPOS=72249229;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:39:39:38:38:27:11:11:28:27:11:11:28 chr17 72257932 . T C 414.69 PASS AO=97;DP=197;FAO=98;FDP=198;FR=.;FRO=100;FSAF=40;FSAR=58;FSRF=42;FSRR=58;FWDB=-0.00617203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.889;QD=8.37768;RBI=0.00797755;REFB=-0.0148736;REVB=-0.00505444;RO=100;SAF=39;SAR=58;SRF=42;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171356;STB=0.506172;TYPE=snp;VARB=0.0154811;OID=.;OPOS=72257932;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:198:100:100:97:98:58:39:42:58:58:40:42:58 chr17 72308319 . G A 246.26 PASS AO=58;DP=119;FAO=58;FDP=119;FR=.;FRO=61;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=30;FSRR=31;FWDB=0.0205332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.0661;QD=8.27749;RBI=0.0480857;REFB=-0.0289059;REVB=0.0434812;RO=61;SAF=29;SAR=29;SRF=30;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00758917;STB=0.5042;TYPE=snp;VARB=0.0428097;OID=.;OPOS=72308319;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:61:61:58:58:29:29:30:31:29:29:30:31 chr17 72324649 . G GC 42.35 PASS AO=17;DP=53;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.0656167;FXX=0.0961354;HRUN=1;LEN=1;MLLD=25.9761;QD=3.60383;RBI=0.0726465;REFB=-0.00443592;REVB=0.0311764;RO=36;SAF=7;SAR=10;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.038202;STB=0.580246;TYPE=ins;VARB=0.0123224;OID=.;OPOS=72324650;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:17:53:18:47:29:7:11:15:14:42:36:7:10:16:20 chr17 72338765 . G A 467.55 PASS AO=51;DP=54;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0593007;FXX=0.0370302;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.6343;QD=35.9657;RBI=0.0854956;REFB=0.0201643;REVB=0.0615867;RO=1;SAF=26;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184631;STB=0.5098;TYPE=snp;VARB=0.00138812;OID=.;OPOS=72338765;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:54:52:1:1:51:51:25:26:0:1:25:26:0:1 chr17 72346855 . T C 220.97 PASS AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0275017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.546;QD=33.9957;RBI=0.0350774;REFB=-0.0765997;REVB=0.0217734;RO=1;SAF=15;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0299354;STB=0.516116;TYPE=snp;VARB=0.00178247;OID=.;OPOS=72346855;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:26:26:1:1:25:25:10:15:1:0:10:15:1:0 chr17 72346868 . C T 52.69 PASS AO=11;DP=23;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.0209773;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.8493;QD=9.1628;RBI=0.0211023;REFB=-0.0205015;REVB=0.00229307;RO=12;SAF=8;SAR=3;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0657668;STB=0.538389;TYPE=snp;VARB=0.021739;OID=.;OPOS=72346868;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:23:23:12:12:11:11:3:8:8:4:3:8:8:4 chr17 72350362 . G A 443.35 PASS AO=46;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.141842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.4762;QD=37.7316;RBI=0.1438;REFB=0;REVB=0.0236438;RO=0;SAF=4;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.5936e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00234374;OID=.;OPOS=72350362;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:47:47:0:0:46:47:42:4:0:0:42:5:0:0 chr17 72351406 . C T 883.59 PASS AO=97;DP=105;FAO=100;FDP=105;FR=.;FRO=5;FSAF=39;FSAR=61;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0615239;FXX=0.0186898;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.4118;QD=33.6607;RBI=0.0655299;REFB=-0.0733497;REVB=0.0225605;RO=2;SAF=37;SAR=60;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0155457;STB=0.510458;TYPE=snp;VARB=0.00264017;OID=.;OPOS=72351406;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:105:105:2:5:97:100:60:37:0:2:61:39:3:2 chr17 72351761 . A G 478.23 PASS AO=46;DP=46;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.981;QD=37.5079;RBI=0.028934;REFB=0;REVB=0.0218512;RO=0;SAF=28;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.06241e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.45994e-05;OID=.;OPOS=72351761;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:46:51:0:0:46:51:18:28:0:0:22:29:0:0 chr17 72353369 . C T 10.38 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.773;QD=5.93254;RBI=0.000876007;REFB=-0.0710467;REVB=-0.000876007;RO=5;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0219806;OID=.;OPOS=72353369;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:5:5:2:2:2:0:0:5:2:0:0:5 chr17 72366695 . C A 391.92 PASS AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0904305;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=47.5024;QD=37.3253;RBI=0.0980801;REFB=0;REVB=0.0379739;RO=0;SAF=25;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.98888e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00212717;OID=.;OPOS=72366695;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:42:42:0:0:42:42:17:25:0:0:17:25:0:0 chr17 72368550 . T C 652 PASS AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0318857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.6046;QD=38.353;RBI=0.039539;REFB=0;REVB=-0.0233803;RO=0;SAF=14;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.42547e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.00027e-05;OID=.;OPOS=72368550;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:68:68:0:0:68:68:54:14:0:0:54:14:0:0 chr17 72439700 . T G 42.21 PASS AO=11;DP=29;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=0;FSRF=18;FSRR=0;FWDB=-0.0112954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.828;QD=5.822;RBI=0.0112954;REFB=0.00364235;REVB=0;RO=17;SAF=11;SAR=0;SRF=17;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00605091;OID=.;OPOS=72439700;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:29:29:17:18:11:11:0:11:17:0:0:11:18:0 chr17 72439808 . TG T 316.22 PASS AO=95;DP=180;FAO=97;FDP=176;FR=.;FRO=79;FSAF=57;FSAR=40;FSRF=49;FSRR=30;FWDB=-0.244624;FXX=0.0276228;HRUN=2;LEN=1;MLLD=23.8873;QD=7.18673;RBI=0.245789;REFB=0.00859521;REVB=0.0239018;RO=76;SAF=55;SAR=40;SRF=46;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0220922;STB=0.515185;TYPE=del;VARB=-0.0112879;OID=.;OPOS=72439809;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:95:181:97:176:79:57:40:49:30:99:76:55:40:46:30 chr17 72469958 . A G 541.96 PASS AO=151;DP=346;FAO=151;FDP=346;FR=.;FRO=195;FSAF=61;FSAR=90;FSRF=81;FSRR=114;FWDB=-0.0319439;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.0711;QD=6.26548;RBI=0.0468206;REFB=-0.0187022;REVB=-0.0342309;RO=195;SAF=61;SAR=90;SRF=81;SRR=114;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0120021;STB=0.506659;TYPE=snp;VARB=0.0219344;OID=.;OPOS=72469958;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:346:346:195:195:151:151:90:61:81:114:90:61:81:114 chr17 72519798 . C T 177.95 PASS AO=46;DP=103;FAO=46;FDP=103;FR=.;FRO=57;FSAF=9;FSAR=37;FSRF=29;FSRR=28;FWDB=-0.0204025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.157;QD=6.91048;RBI=0.0207181;REFB=-0.0121976;REVB=0.00360272;RO=56;SAF=9;SAR=37;SRF=28;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.354602;STB=0.706078;TYPE=snp;VARB=0.0107196;OID=.;OPOS=72519798;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:56:57:46:46:37:9:28:28:37:9:29:28 chr17 72521897 . G A 216.11 PASS AO=62;DP=150;FAO=62;FDP=150;FR=.;FRO=88;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=57;FSRR=31;FWDB=-0.00738924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.504;QD=5.76283;RBI=0.0335807;REFB=-0.0143311;REVB=-0.0327576;RO=87;SAF=26;SAR=36;SRF=56;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230315;STB=0.631671;TYPE=snp;VARB=0.0245414;OID=.;OPOS=72521897;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:150:87:88:62:62:36:26:56:31:36:26:57:31 chr17 72588326 . A C 1136.81 PASS AO=107;DP=107;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0095242;FXX=0.00840265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.898;QD=38.5361;RBI=0.0537414;REFB=0;REVB=0.0528907;RO=0;SAF=60;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71637e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.51424e-05;OID=.;OPOS=72588326;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:107:118:0:0:107:118:47:60:0:0:57:61:0:0 chr17 72589196 . T C 925.21 PASS AO=101;DP=104;FAO=102;FDP=105;FR=.;FRO=3;FSAF=13;FSAR=89;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0677873;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=181.791;QD=35.2461;RBI=0.0682832;REFB=-0.0554822;REVB=0.00821394;RO=3;SAF=13;SAR=88;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0622323;STB=0.532927;TYPE=snp;VARB=0.000485594;OID=.;OPOS=72589196;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:104:105:3:3:101:102:88:13:2:1:89:13:2:1 chr17 72589264 . G T 739.17 PASS AO=76;DP=77;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0244668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.436;QD=36.5022;RBI=0.0346759;REFB=-0.0287478;REVB=0.0245723;RO=1;SAF=39;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119796;STB=0.506171;TYPE=snp;VARB=0.000489587;OID=.;OPOS=72589264;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:77:81:1:1:76:80:37:39:1:0:40:40:1:0 chr17 72590267 . T C 760.72 PASS AO=77;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.11077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.074;QD=38.5172;RBI=0.112008;REFB=0;REVB=0.0166084;RO=0;SAF=10;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.87952e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000154029;OID=.;OPOS=72590267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:79:79:0:0:77:79:67:10:0:0:69:10:0:0 chr17 72608834 . G A 767.48 PASS AO=70;DP=70;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.071142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.869;QD=37.4382;RBI=0.0857767;REFB=0;REVB=0.0479214;RO=0;SAF=27;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000199191;OID=.;OPOS=72608834;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:70:82:0:0:70:82:43:27:0:0:52:30:0:0 chr17 72610089 . C T 709.46 PASS AO=91;DP=104;FAO=92;FDP=104;FR=.;FRO=12;FSAF=54;FSAR=38;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.0161678;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=171.9;QD=27.2868;RBI=0.0237894;REFB=-0.0666649;REVB=0.017451;RO=8;SAF=54;SAR=37;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0921355;STB=0.539532;TYPE=snp;VARB=0.0010802;OID=.;OPOS=72610089;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:104:104:8:12:91:92:37:54:0:8:38:54:3:9 chr17 72691928 . T C 1223.02 PASS AO=130;DP=131;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0032249;FXX=0.00763301;HRUN=4;LEN=1;MLLD=66.6315;QD=37.6313;RBI=0.0172759;REFB=-0.0521798;REVB=0.0169722;RO=0;SAF=71;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.28473e-05;OID=.;OPOS=72691928;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:131:130:0:0:130:130:59:71:0:0:59:71:0:0 chr17 72700943 . A G 677.11 PASS AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0257001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1875;QD=38.6917;RBI=0.0397828;REFB=0;REVB=-0.0303673;RO=0;SAF=32;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00060068;OID=.;OPOS=72700943;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:70:70:0:0:70:70:38:32:0:0:38:32:0:0 chr17 72773794 . C A 568.24 PASS AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00411422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.928;QD=38.5245;RBI=0.0216913;REFB=0;REVB=0.0212976;RO=0;SAF=24;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.23102e-05;OID=.;OPOS=72773794;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:59:59:0:0:59:59:35:24:0:0:35:24:0:0 chr17 72784932 . G A 210.68 PASS AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0568152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.01;QD=36.6391;RBI=0.0585475;REFB=0;REVB=0.0141364;RO=0;SAF=8;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000781016;OID=.;OPOS=72784932;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:0:0:23:23:15:8:0:0:15:8:0:0 chr17 72838649 . C A 1560.97 PASS AO=176;DP=184;FAO=176;FDP=184;FR=.;FRO=8;FSAF=55;FSAR=121;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0477416;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=217.486;QD=33.9342;RBI=0.0514946;REFB=-0.144688;REVB=0.0192986;RO=0;SAF=55;SAR=121;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503169;TYPE=snp;VARB=0.000607281;OID=.;OPOS=72838649;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:184:184:0:8:176:176:121:55:0:0:121:55:2:6 chr17 72851133 . A G 99.27 PASS AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0635343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.372;QD=39.7067;RBI=0.065859;REFB=0;REVB=-0.0173438;RO=0;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000664994;OID=.;OPOS=72851133;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:6:4:0:0:6:4:0:0 chr17 72860253 . A G 482.44 PASS AO=49;DP=49;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00539639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.036;QD=36.4107;RBI=0.0160432;REFB=0;REVB=0.0151084;RO=0;SAF=31;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58521e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00090179;OID=.;OPOS=72860253;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:49:53:0:0:49:53:18:31:0:0:20:33:0:0 chr17 72862593 . C T 688.55 PASS AO=83;DP=92;FAO=83;FDP=91;FR=.;FRO=8;FSAF=54;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.0257664;FXX=0.0108684;HRUN=3;LEN=1;MLLD=116.321;QD=30.266;RBI=0.0616274;REFB=-0.122615;REVB=0.0559824;RO=1;SAF=54;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00869117;STB=0.549296;TYPE=snp;VARB=0.00457123;OID=.;OPOS=72862593;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:92:91:1:8:83:83:29:54:1:0:29:54:1:7 chr17 72863030 . T C 187.08 PASS AO=14;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00987851;FXX=0.049975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.668;QD=39.3851;RBI=0.0335978;REFB=0;REVB=0.0321127;RO=0;SAF=3;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00217169;OID=.;OPOS=72863030;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:14:19:0:0:14:19:11:3:0:0:13:6:0:0 chr17 72889685 . G A 19.34 PASS AO=8;DP=31;FAO=8;FDP=34;FR=.;FRO=26;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=0.123142;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.4457;QD=2.27475;RBI=0.123174;REFB=-0.0138924;REVB=0.00277941;RO=20;SAF=4;SAR=4;SRF=4;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.354465;STB=0.676084;TYPE=snp;VARB=0.0358526;OID=.;OPOS=72889685;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:31:34:20:26:8:8:4:4:4:16:4:4:7:19 chr17 72889696 . A G 25.32 PASS AO=8;DP=24;FAO=8;FDP=27;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=19;FWDB=-0.0931513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.1984;QD=3.75099;RBI=0.115074;REFB=-0.0566785;REVB=-0.0675632;RO=16;SAF=6;SAR=2;SRF=0;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.702097;STB=0.912483;TYPE=snp;VARB=0.0373864;OID=.;OPOS=72889696;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:24:27:16:19:8:8:2:6:0:16:2:6:0:19 chr17 72926997 . G A 209.14 PASS AO=33;DP=47;FAO=33;FDP=47;FR=.;FRO=14;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.0427531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.4422;QD=17.799;RBI=0.0474482;REFB=0.0213444;REVB=0.0205793;RO=14;SAF=13;SAR=20;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0598747;STB=0.532603;TYPE=snp;VARB=-0.00655789;OID=.;OPOS=72926997;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:47:47:14:14:33:33:20:13:7:7:20:13:7:7 chr17 72937605 . G A 85.69 PASS AO=17;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.000489334;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.355;QD=10.7116;RBI=0.0191187;REFB=0.00878255;REVB=0.0191125;RO=15;SAF=9;SAR=8;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115311;STB=0.564981;TYPE=snp;VARB=-0.00921667;OID=.;OPOS=72937605;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:32:32:15:15:17:17:8:9:10:5:8:9:10:5 chr17 72937851 . G A 78.46 PASS AO=17;DP=38;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.0275831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.8337;QD=8.04725;RBI=0.0417978;REFB=-0.00213634;REVB=-0.0314042;RO=20;SAF=6;SAR=11;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0477634;STB=0.52223;TYPE=snp;VARB=0.000117124;OID=.;OPOS=72937851;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:38:39:20:21:17:18:11:6:8:12:11:7:9:12 chr17 72938100 . T C 162.02 PASS AO=29;DP=47;FAO=29;FDP=47;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.0200796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.11;QD=13.7886;RBI=0.0253326;REFB=-0.0158009;REVB=-0.0154451;RO=18;SAF=10;SAR=19;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0334968;STB=0.518446;TYPE=snp;VARB=0.00854861;OID=.;OPOS=72938100;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:47:47:18:18:29:29:19:10:7:11:19:10:7:11 chr17 72943126 . G A 86.45 PASS AO=20;DP=40;FAO=20;FDP=43;FR=.;FRO=23;FSAF=18;FSAR=2;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=0.0136356;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=128.753;QD=8.04164;RBI=0.0280566;REFB=-0.0238402;REVB=-0.0245202;RO=20;SAF=18;SAR=2;SRF=17;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109393;STB=0.672686;TYPE=snp;VARB=0.0193853;OID=.;OPOS=72943126;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:40:43:20:23:20:20:2:18:17:3:2:18:17:6 chr17 72948369 . A G 210.68 PASS AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0315466;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.942;QD=36.6391;RBI=0.0329546;REFB=0;REVB=-0.00952971;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000334663;OID=.;OPOS=72948369;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:0:0:23:23:12:11:0:0:12:11:0:0 chr17 72949146 . C T 82.48 PASS AO=12;DP=16;FAO=12;FDP=16;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0124535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.32;QD=20.6206;RBI=0.0222842;REFB=-0.0110659;REVB=0.0184795;RO=4;SAF=1;SAR=11;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19444;STB=0.610893;TYPE=snp;VARB=0.00558305;OID=.;OPOS=72949146;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:16:16:4:4:12:12:11:1:1:3:11:1:1:3 chr17 72952017 . A G 956.48 PASS AO=96;DP=97;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0307721;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.965;QD=38.6458;RBI=0.0310035;REFB=0;REVB=0.00378035;RO=0;SAF=38;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.8879e-05;OID=.;OPOS=72952017;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:97:99:0:0:96:99:58:38:0:0:59:40:0:0 chr17 72999773 . C T 15.78 PASS AO=3;DP=7;FAO=3;FDP=7;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0016892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.134;QD=9.01804;RBI=0.0016892;REFB=-0.0134225;REVB=0;RO=4;SAF=3;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0375948;OID=.;OPOS=72999773;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:7:7:4:4:3:3:0:3:4:0:0:3:4:0 chr17 73000061 . A G 218.18 PASS AO=49;DP=100;FAO=49;FDP=98;FR=.;FRO=49;FSAF=19;FSAR=30;FSRF=17;FSRR=32;FWDB=0.0127598;FXX=0.019998;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.186;QD=8.9052;RBI=0.0131547;REFB=-0.0105813;REVB=0.00319898;RO=46;SAF=19;SAR=30;SRF=16;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0372399;STB=0.521692;TYPE=snp;VARB=0.0101591;OID=.;OPOS=73000061;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:98:46:49:49:49:30:19:16:30:30:19:17:32 chr17 73016621 . C T 157.42 PASS AO=40;DP=97;FAO=42;FDP=97;FR=.;FRO=55;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=31;FSRR=24;FWDB=-0.00174895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.292;QD=6.49145;RBI=0.00235952;REFB=-0.00648396;REVB=-0.00158383;RO=55;SAF=14;SAR=26;SRF=31;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222437;STB=0.604302;TYPE=snp;VARB=0.00889759;OID=.;OPOS=73016621;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:55:55:40:42:26:14:31:24:26:16:31:24 chr17 73037868 . C G 73.61 PASS AO=15;DP=32;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.00457447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.984;QD=8.92246;RBI=0.0517405;REFB=-0.0241822;REVB=0.0515379;RO=17;SAF=6;SAR=9;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0668581;STB=0.551116;TYPE=snp;VARB=0.0329977;OID=.;OPOS=73037868;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:32:33:17:17:15:16:9:6:8:9:10:6:8:9 chr17 73089524 . G A 132.14 PASS AO=23;DP=38;FAO=23;FDP=37;FR=.;FRO=14;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=1;FWDB=-0.00424545;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.9325;QD=14.285;RBI=0.0627502;REFB=-0.0195165;REVB=0.0626064;RO=12;SAF=16;SAR=7;SRF=11;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17613;STB=0.613207;TYPE=snp;VARB=0.0349622;OID=.;OPOS=73089524;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:38:37:12:14:23:23:7:16:11:1:7:16:13:1 chr17 73089706 . G A 59.03 PASS AO=14;DP=28;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.00605664;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2029;QD=8.43316;RBI=0.110458;REFB=-0.0225957;REVB=0.110292;RO=14;SAF=7;SAR=7;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.538402;TYPE=snp;VARB=0.0354998;OID=.;OPOS=73089706;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:28:28:14:15:14:13:7:7:7:7:6:7:7:8 chr17 73089852 . T C 73.78 PASS AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.0133756;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.6239;QD=8.94263;RBI=0.0204442;REFB=-0.0353377;REVB=-0.0154616;RO=17;SAF=8;SAR=8;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132974;STB=0.575665;TYPE=snp;VARB=0.0161915;OID=.;OPOS=73089852;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:33:33:17:17:16:16:8:8:11:6:8:8:11:6 chr17 73100208 . GC G 662.66 PASS AO=80;DP=97;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0240777;FXX=0.0108684;HRUN=3;LEN=1;MLLD=17.7063;QD=29.1278;RBI=0.171182;REFB=0;REVB=-0.169481;RO=0;SAF=20;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.201342;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.00365933;OID=.;OPOS=73100209;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:80:90:91:91:0:25:66:0:0:61:0:20:60:0:0 chr17 73110279 . C T 387.76 PASS AO=80;DP=151;FAO=81;FDP=147;FR=.;FRO=66;FSAF=20;FSAR=61;FSRF=13;FSRR=53;FWDB=0.0370683;FXX=0.0264883;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.56;QD=10.5512;RBI=0.039707;REFB=-0.0162997;REVB=0.0142333;RO=62;SAF=20;SAR=60;SRF=13;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0441663;STB=0.53109;TYPE=snp;VARB=0.0119986;OID=.;OPOS=73110279;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:147:62:66:80:81:60:20:13:49:61:20:13:53 chr17 73127217 . G C 24.78 PASS AO=6;DP=17;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.0250135;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.0344;QD=5.83083;RBI=0.032473;REFB=0.0452454;REVB=0.020708;RO=11;SAF=2;SAR=4;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0346033;STB=0.521666;TYPE=snp;VARB=-0.0597657;OID=.;OPOS=73127217;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:17:17:11:11:6:6:4:2:4:7:4:2:4:7 chr17 73221439 . C T 1153.82 PASS AO=132;DP=155;FAO=134;FDP=141;FR=.;FRO=7;FSAF=58;FSAR=76;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0322317;FXX=0.0903168;HRUN=3;LEN=1;MLLD=112.606;QD=32.7326;RBI=0.0340541;REFB=-0.0506147;REVB=0.010991;RO=2;SAF=57;SAR=75;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012505;STB=0.506993;TYPE=snp;VARB=0.000689724;OID=.;OPOS=73221439;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:155:141:2:7:132:134:75:57:0:2:76:58:4:3 chr17 73222847 . C T 1431.2 PASS AO=146;DP=147;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0460665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.339;QD=38.4216;RBI=0.0461851;REFB=0;REVB=0.00330837;RO=0;SAF=67;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.98198e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.79118e-05;OID=.;OPOS=73222847;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:147:149:0:0:146:149:79:67:0:0:81:68:0:0 chr17 73222865 . G A 1129.65 PASS AO=122;DP=124;FAO=122;FDP=124;FR=.;FRO=2;FSAF=49;FSAR=73;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0238056;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=186.532;QD=36.4403;RBI=0.0384291;REFB=-0.0369181;REVB=0.0301677;RO=2;SAF=49;SAR=73;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00313281;STB=0.501649;TYPE=snp;VARB=9.63255e-05;OID=.;OPOS=73222865;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:124:124:2:2:122:122:73:49:1:1:73:49:1:1 chr17 73230856 . C T 2631.35 PASS AO=278;DP=284;FAO=282;FDP=282;FR=.;FRO=0;FSAF=120;FSAR=162;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0319886;FXX=0.0139855;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.411;QD=37.3241;RBI=0.0339919;REFB=-0.0400385;REVB=0.0114969;RO=4;SAF=119;SAR=159;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00198597;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00016591;OID=.;OPOS=73230856;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:284:282:4:0:278:282:159:119:2:2:162:120:0:0 chr17 73238508 . T C 452.33 PASS AO=77;DP=129;FAO=84;FDP=134;FR=.;FRO=50;FSAF=32;FSAR=52;FSRF=19;FSRR=31;FWDB=0.00902154;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.265;QD=13.5024;RBI=0.00951741;REFB=-0.0106326;REVB=0.00303198;RO=52;SAF=29;SAR=48;SRF=21;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0213726;STB=0.500377;TYPE=snp;VARB=0.00650434;OID=.;OPOS=73238508;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:134:52:50:77:84:48:29:21:31:52:32:19:31 chr17 73258479 . C T 743.7 PASS AO=80;DP=81;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00929452;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=199.221;QD=36.7258;RBI=0.0479877;REFB=0.0119394;REVB=0.047079;RO=1;SAF=40;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116896;STB=0.506171;TYPE=snp;VARB=-5.5236e-06;OID=.;OPOS=73258479;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:81:81:1:1:80:80:40:40:1:0:40:40:1:0 chr17 73269530 . A G 392.92 PASS AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0480043;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.0907;QD=37.4207;RBI=0.0480758;REFB=0;REVB=0.00262174;RO=0;SAF=24;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000622926;OID=.;OPOS=73269530;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:43:42:0:0:42:42:18:24:0:0:18:24:0:0 chr17 73269676 . C T 840.52 PASS AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0842134;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.781;QD=38.2054;RBI=0.0898267;REFB=0;REVB=0.031256;RO=0;SAF=41;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000125099;OID=.;OPOS=73269676;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:88:88:0:0:88:88:47:41:0:0:47:41:0:0 chr17 73279624 . A G 688.05 PASS AO=72;DP=72;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0481118;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.332;QD=37.7014;RBI=0.0486682;REFB=0;REVB=-0.00733767;RO=0;SAF=38;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00022592;OID=.;OPOS=73279624;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:72:73:0:0:72:73:34:38:0:0:35:38:0:0 chr17 73315368 . C T 1004.35 PASS AO=113;DP=121;FAO=117;FDP=125;FR=.;FRO=8;FSAF=74;FSAR=43;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.0215214;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.063;QD=32.1391;RBI=0.0298941;REFB=-0.0445441;REVB=0.0207482;RO=8;SAF=70;SAR=43;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0174171;STB=0.508123;TYPE=snp;VARB=0.0095117;OID=.;OPOS=73315368;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:121:125:8:8:113:117:43:70:6:2:43:74:6:2 chr17 73402246 . C A 180.71 PASS AO=20;DP=21;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0577823;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9734;QD=32.8565;RBI=0.119342;REFB=-0.10063;REVB=-0.104421;RO=1;SAF=14;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0707039;STB=0.538424;TYPE=snp;VARB=0.00598317;OID=.;OPOS=73402246;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:21:22:1:1:20:21:6:14:0:1:6:15:0:1 chr17 73488794 . C T 39.28 PASS AO=7;DP=19;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.115097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.244;QD=7.14213;RBI=0.115129;REFB=-0.014263;REVB=0.00268495;RO=12;SAF=1;SAR=6;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.439197;STB=0.787955;TYPE=snp;VARB=0.017432;OID=.;OPOS=73488794;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:19:22:12:13:7:9:6:1:6:6:8:1:6:7 chr17 73493874 . G C 86.77 PASS AO=28;DP=79;FAO=30;FDP=83;FR=.;FRO=53;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=32;FWDB=-0.000171326;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=102.373;QD=4.18154;RBI=0.0182865;REFB=-0.00547876;REVB=0.0182857;RO=51;SAF=6;SAR=22;SRF=19;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22063;STB=0.596194;TYPE=snp;VARB=0.00653516;OID=.;OPOS=73493874;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:79:83:51:53:28:30:22:6:19:32:22:8:21:32 chr17 73494683 . AC A 21.63 PASS AO=14;DP=51;FAO=18;FDP=46;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.0050848;FXX=0.061212;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.6654;QD=1.88068;RBI=0.0329663;REFB=-0.106447;REVB=-0.0325718;RO=26;SAF=9;SAR=5;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.279725;STB=0.631434;TYPE=del;VARB=0.168242;OID=.;OPOS=73494684;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:14:45:18:46:28:11:7:11:17:21:26:9:5:10:16 chr17 73495692 . C G 56.64 PASS AO=20;DP=79;FAO=28;FDP=92;FR=.;FRO=64;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=27;FSRR=37;FWDB=0.0121309;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=25.1674;QD=2.46255;RBI=0.0183957;REFB=-0.0311177;REVB=-0.013829;RO=58;SAF=1;SAR=19;SRF=21;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.591974;STB=0.575702;TYPE=snp;VARB=0.0950695;OID=.;OPOS=73495692;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:79:92:58:64:20:28:19:1:21:37:19:9:27:37 chr17 73498483 . T C 52.85 PASS AO=8;DP=12;FAO=8;FDP=12;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0569231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.292;QD=17.6151;RBI=0.0583801;REFB=0.0038821;REVB=-0.0129613;RO=4;SAF=1;SAR=7;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141787;STB=0.5831;TYPE=snp;VARB=-0.000152191;OID=.;OPOS=73498483;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:12:12:4:4:8:8:7:1:1:3:7:1:1:3 chr17 73518203 . G C 33.19 PASS AO=9;DP=30;FAO=10;FDP=31;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=-0.00610061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.176;QD=4.28284;RBI=0.0332185;REFB=-0.0238154;REVB=-0.0326535;RO=21;SAF=2;SAR=7;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0958897;STB=0.581641;TYPE=snp;VARB=0.0486234;OID=.;OPOS=73518203;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:30:31:21:21:9:10:7:2:6:15:8:2:6:15 chr17 73519413 . C T 218.69 PASS AO=56;DP=121;FAO=56;FDP=123;FR=.;FRO=67;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=22;FSRR=45;FWDB=0.0267717;FXX=0.00806387;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.8336;QD=7.11181;RBI=0.0647756;REFB=-0.0353614;REVB=0.0589843;RO=65;SAF=22;SAR=34;SRF=20;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0882615;STB=0.537402;TYPE=snp;VARB=0.0394079;OID=.;OPOS=73519413;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:123:65:67:56:56:34:22:20:45:34:22:22:45 chr17 73552185 . G A 23.32 PASS AO=4;DP=7;FAO=4;FDP=7;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0244178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.8854;QD=13.3252;RBI=0.024452;REFB=-0.1159;REVB=-0.00129326;RO=2;SAF=2;SAR=2;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.277405;STB=0.571077;TYPE=snp;VARB=0.0595701;OID=.;OPOS=73552185;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:7:7:2:3:4:4:2:2:2:0:2:2:2:1 chr17 73565171 . T C 121.77 PASS AO=21;DP=35;FAO=22;FDP=36;FR=.;FRO=14;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=2;FWDB=-0.0118803;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.7497;QD=13.5304;RBI=0.0139954;REFB=-0.0291522;REVB=-0.00739794;RO=14;SAF=10;SAR=11;SRF=12;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.272612;STB=0.638772;TYPE=snp;VARB=0.0158732;OID=.;OPOS=73565171;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:35:36:14:14:21:22:11:10:12:2:11:11:12:2 chr17 73567846 . C T 191.86 PASS AO=36;DP=63;FAO=38;FDP=67;FR=.;FRO=29;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.0549779;FXX=0.0147037;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.46;QD=11.4543;RBI=0.0551795;REFB=-0.051749;REVB=-0.00471211;RO=27;SAF=18;SAR=18;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.014406;STB=0.503935;TYPE=snp;VARB=0.042375;OID=.;OPOS=73567846;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:67:27:29:36:38:18:18:13:14:20:18:14:15 chr17 73568055 . C T 132.71 PASS AO=22;DP=33;FAO=22;FDP=33;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.00515722;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=104.032;QD=16.0864;RBI=0.0359457;REFB=-0.0303739;REVB=0.0355738;RO=11;SAF=8;SAR=14;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.221305;STB=0.62211;TYPE=snp;VARB=0.0125309;OID=.;OPOS=73568055;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:33:33:11:11:22:22:14:8:8:3:14:8:8:3 chr17 73570718 . C G 48.82 PASS AO=8;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.00734961;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.5856;QD=15.0219;RBI=0.0160039;REFB=-0.0428355;REVB=-0.0142164;RO=5;SAF=4;SAR=4;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199671;STB=0.615111;TYPE=snp;VARB=0.0226099;OID=.;OPOS=73570718;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:13:13:5:5:8:8:4:4:4:1:4:4:4:1 chr17 73571030 . A G 32.58 PASS AO=9;DP=26;FAO=9;FDP=26;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0090314;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.531;QD=5.01234;RBI=0.0153446;REFB=-0.00110837;REVB=0.0124053;RO=17;SAF=5;SAR=4;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0912882;STB=0.555432;TYPE=snp;VARB=0.00164829;OID=.;OPOS=73571030;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:26:26:17:17:9:9:4:5:8:9:4:5:8:9 chr17 73587268 . C T 79.98 PASS AO=14;DP=23;FAO=14;FDP=23;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=-0.0550242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.7596;QD=13.9088;RBI=0.0592043;REFB=-0.00569786;REVB=0.0218516;RO=9;SAF=4;SAR=10;SRF=1;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161555;STB=0.590048;TYPE=snp;VARB=0.00521393;OID=.;OPOS=73587268;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:23:23:9:9:14:14:10:4:1:8:10:4:1:8 chr17 73587784 . A G 832.23 PASS AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00120669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.753;QD=38.2633;RBI=0.00929129;REFB=0;REVB=-0.0092126;RO=0;SAF=56;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.00429e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.00895e-05;OID=.;OPOS=73587784;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:87:87:0:0:87:87:31:56:0:0:31:56:0:0 chr17 73588058 . G T 103.16 PASS AO=33;DP=90;FAO=33;FDP=90;FR=.;FRO=57;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=38;FSRR=19;FWDB=-0.0690765;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.1469;QD=4.5847;RBI=0.129729;REFB=0.00212429;REVB=-0.10981;RO=57;SAF=23;SAR=10;SRF=38;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0387843;STB=0.522304;TYPE=snp;VARB=-0.00799014;OID=.;OPOS=73588058;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:57:57:33:33:10:23:38:19:10:23:38:19 chr17 73588067 . A G 847.64 PASS AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0654966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.5169;QD=38.0962;RBI=0.0698171;REFB=0;REVB=-0.0241789;RO=0;SAF=60;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.99908e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00071179;OID=.;OPOS=73588067;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:89:89:0:0:89:89:29:60:0:0:29:60:0:0 chr17 73590817 . C T 83.62 PASS AO=23;DP=57;FAO=23;FDP=57;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.00725999;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=160.956;QD=5.86807;RBI=0.0323036;REFB=-0.0143171;REVB=0.0314772;RO=34;SAF=15;SAR=8;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133657;STB=0.576855;TYPE=snp;VARB=0.028718;OID=.;OPOS=73590817;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:57:57:34:34:23:23:8:15:18:16:8:15:18:16 chr17 73590830 . T G 498.94 PASS AO=55;DP=57;FAO=55;FDP=57;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=22;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0270452;FXX=0.0172384;HRUN=3;LEN=1;MLLD=232.476;QD=35.013;RBI=0.0280036;REFB=-0.19533;REVB=-0.00726332;RO=0;SAF=33;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.514701;TYPE=snp;VARB=0.00080482;OID=.;OPOS=73590830;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:57:57:0:2:55:55:22:33:0:0:22:33:2:0 chr17 73597544 . A G 135.9 PASS AO=39;DP=96;FAO=39;FDP=96;FR=.;FRO=57;FSAF=9;FSAR=30;FSRF=20;FSRR=37;FWDB=0.0083539;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.602;QD=5.66234;RBI=0.0177562;REFB=0.00473626;REVB=-0.0156683;RO=57;SAF=9;SAR=30;SRF=20;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158695;STB=0.590582;TYPE=snp;VARB=-0.00931104;OID=.;OPOS=73597544;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:57:57:39:39:30:9:20:37:30:9:20:37 chr17 73602081 . G A 170.86 PASS AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0690194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.9452;QD=37.9683;RBI=0.0910901;REFB=0;REVB=0.0594452;RO=0;SAF=8;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00435419;OID=.;OPOS=73602081;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:18:0:0:18:18:10:8:0:0:10:8:0:0 chr17 73606310 . G A 168.77 PASS AO=30;DP=64;FAO=36;FDP=66;FR=.;FRO=30;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=9;FWDB=0.116254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.6665;QD=10.2282;RBI=0.116855;REFB=-0.0177663;REVB=0.0118426;RO=24;SAF=14;SAR=16;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192492;STB=0.567438;TYPE=snp;VARB=0.0318275;OID=.;OPOS=73606310;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:66:24:30:30:36:16:14:17:7:16:20:21:9 chr17 73609112 . G A 304.17 PASS AO=32;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0415688;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4586;QD=36.8696;RBI=0.181534;REFB=0;REVB=0.176711;RO=0;SAF=20;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00309533;OID=.;OPOS=73609112;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:33:33:0:0:32:33:12:20:0:0:13:20:0:0 chr17 73611823 . T C 86.44 PASS AO=26;DP=69;FAO=26;FDP=69;FR=.;FRO=43;FSAF=2;FSAR=24;FSRF=13;FSRR=30;FWDB=-0.100684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.56;QD=5.01126;RBI=0.100704;REFB=-0.0180975;REVB=-0.00200156;RO=40;SAF=2;SAR=24;SRF=12;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.442811;STB=0.76896;TYPE=snp;VARB=0.0313265;OID=.;OPOS=73611823;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:69:69:40:43:26:26:24:2:12:28:24:2:13:30 chr17 73613975 . G A 276.32 PASS AO=64;DP=129;FAO=64;FDP=129;FR=.;FRO=65;FSAF=34;FSAR=30;FSRF=39;FSRR=26;FWDB=0.00317241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.595;QD=8.56794;RBI=0.0309278;REFB=-0.0160024;REVB=0.0307646;RO=49;SAF=34;SAR=30;SRF=38;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198196;STB=0.534918;TYPE=snp;VARB=0.0148417;OID=.;OPOS=73613975;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:49:65:64:64:30:34:38:11:30:34:39:26 chr17 73615962 . T C 35.36 PASS AO=11;DP=34;FAO=11;FDP=34;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.00939978;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.2492;QD=4.15985;RBI=0.110862;REFB=-0.0157182;REVB=-0.110463;RO=23;SAF=10;SAR=1;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.652955;STB=0.898117;TYPE=snp;VARB=0.0199657;OID=.;OPOS=73615962;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:34:34:23:23:11:11:1:10:8:15:1:10:8:15 chr17 73615983 . G A 31.96 PASS AO=9;DP=32;FAO=10;FDP=32;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.026099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.5317;QD=3.99461;RBI=0.0338623;REFB=-0.00705601;REVB=-0.0215753;RO=22;SAF=8;SAR=1;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.584169;STB=0.87418;TYPE=snp;VARB=0.0201202;OID=.;OPOS=73615983;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:32:32:22:22:9:10:1:8:9:13:1:9:9:13 chr17 73616088 . T C 29.16 PASS AO=11;DP=39;FAO=11;FDP=40;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=22;FWDB=-0.0275796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.721;QD=2.91649;RBI=0.0326932;REFB=-0.0126579;REVB=-0.0175559;RO=27;SAF=7;SAR=4;SRF=6;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.455493;STB=0.764301;TYPE=snp;VARB=0.0251721;OID=.;OPOS=73616088;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:39:40:27:29:11:11:4:7:6:21:4:7:7:22 chr17 73616864 . C A 44.24 PASS AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=-0.0128513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.495;QD=9.31461;RBI=0.0443071;REFB=-0.0127151;REVB=-0.0424024;RO=10;SAF=8;SAR=1;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166059;STB=0.599746;TYPE=snp;VARB=0.0158227;OID=.;OPOS=73616864;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:19:19:10:10:9:9:1:8:8:2:1:8:8:2 chr17 73616920 . A G 72.52 PASS AO=14;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=3;FWDB=-9.67781e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.711;QD=9.66994;RBI=0.0234297;REFB=-0.0362089;REVB=0.0234295;RO=14;SAF=10;SAR=4;SRF=12;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167346;STB=0.544322;TYPE=snp;VARB=0.0329949;OID=.;OPOS=73616920;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:30:30:14:15:14:15:4:10:12:2:4:11:12:3 chr17 73617104 . A C 34.11 PASS AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=-0.0282607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.2815;QD=11.3698;RBI=0.0524636;REFB=-0.0179671;REVB=-0.0442013;RO=6;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.327571;STB=0.687061;TYPE=snp;VARB=0.0331236;OID=.;OPOS=73617104;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:12:12:6:6:6:6:5:1:0:6:5:1:0:6 chr17 73619920 . G A 58.5 PASS AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=-0.000543337;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=195.328;QD=9.74976;RBI=0.0181387;REFB=-0.0228063;REVB=0.0181306;RO=12;SAF=7;SAR=5;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.351049;STB=0.6997;TYPE=snp;VARB=0.0141963;OID=.;OPOS=73619920;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:24:24:12:12:12:12:5:7:2:10:5:7:2:10 chr17 73625286 . G A 178.12 PASS AO=40;DP=79;FAO=39;FDP=77;FR=.;FRO=38;FSAF=33;FSAR=6;FSRF=28;FSRR=10;FWDB=0.0279783;FXX=0.0253133;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.176;QD=9.25309;RBI=0.0304578;REFB=-0.0354581;REVB=0.0120371;RO=37;SAF=34;SAR=6;SRF=27;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174648;STB=0.590553;TYPE=snp;VARB=0.0321597;OID=.;OPOS=73625286;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:77:37:38:40:39:6:34:27:10:6:33:28:10 chr17 73625430 . G A 107.27 PASS AO=25;DP=53;FAO=25;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=0.0509138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.6145;QD=8.09553;RBI=0.0690126;REFB=-0.0482505;REVB=0.0465889;RO=28;SAF=13;SAR=12;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152095;STB=0.585519;TYPE=snp;VARB=0.0534191;OID=.;OPOS=73625430;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:28:28:25:25:12:13:10:18:12:13:10:18 chr17 73625478 . T C 822.91 PASS AO=86;DP=87;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207737;FXX=0.0114929;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.34;QD=38.2751;RBI=0.0209269;REFB=0;REVB=0.00252758;RO=0;SAF=47;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.13595e-05;OID=.;OPOS=73625478;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:87:86:0:0:86:86:39:47:0:0:39:47:0:0 chr17 73626923 . G T 27.71 PASS AO=8;DP=25;FAO=8;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=0;FSRF=17;FSRR=0;FWDB=0.000676886;FXX=0;HRUN=12;LEN=1;MLLD=229.044;QD=4.43437;RBI=0.000676886;REFB=-0.00471556;REVB=0;RO=17;SAF=8;SAR=0;SRF=17;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00586973;OID=.;OPOS=73626923;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:25:25:17:17:8:8:0:8:17:0:0:8:17:0 chr17 73626924 . G T 16.74 PASS AO=6;DP=25;FAO=6;FDP=25;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=19;FSRR=0;FWDB=-0.00128775;FXX=0;HRUN=12;LEN=1;MLLD=184.402;QD=2.67899;RBI=0.00128775;REFB=-0.000970938;REVB=0;RO=18;SAF=6;SAR=0;SRF=18;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00201221;OID=.;OPOS=73626924;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:25:25:18:19:6:6:0:6:18:0:0:6:19:0 chr17 73627565 . A G 339.21 PASS AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.113418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.888;QD=37.6897;RBI=0.114747;REFB=0;REVB=-0.0174093;RO=0;SAF=7;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00118547;OID=.;OPOS=73627565;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:36:36:0:0:36:36:29:7:0:0:29:7:0:0 chr17 73687495 . G A 186.05 PASS AO=48;DP=107;FAO=48;FDP=107;FR=.;FRO=59;FSAF=47;FSAR=1;FSRF=37;FSRR=22;FWDB=-0.0307502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.469;QD=6.95528;RBI=0.0475419;REFB=1.75858e-05;REVB=-0.0362582;RO=56;SAF=47;SAR=1;SRF=37;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.711572;STB=0.927632;TYPE=snp;VARB=-0.000580868;OID=.;OPOS=73687495;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:56:59:48:48:1:47:37:19:1:47:37:22 chr17 73689581 . TGG TG,T 203.36 PASS AO=22,13;DP=55;FAO=55,0;FDP=58;FR=.;FRO=3;FSAF=8,0;FSAR=47,0;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.316929,0.176383;FXX=0.0333278;HRUN=5,5;LEN=1,2;MLLD=10.3614,12.9401;QD=14.025;RBI=0.398085,0.215732;REFB=0.0644259,0.0411161;REVB=-0.24089,-0.124216;RO=15;SAF=4,0;SAR=18,13;SRF=4;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0.423729,0.423729;SSSB=-0.0962297,-0.787287;STB=0.515458,0.5;TYPE=del,del;VARB=-0.0211906,-0.0137855;OID=.,.;OPOS=73689582,73689582;OREF=G,GG;OALT=-,-;OMAPALT=TG,T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:22,13:55:55,0:58:3:8,0:47,0:0:3:6:15:4,0:18,13:4:11 chr17 73698557 . C T 738.81 PASS AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214558;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.3096;QD=38.3795;RBI=0.0356436;REFB=0;REVB=0.0284625;RO=0;SAF=33;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.58027e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00016276;OID=.;OPOS=73698557;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:78:77:0:0:77:77:44:33:0:0:44:33:0:0 chr17 73733622 . GC G 166.24 PASS AO=20;DP=28;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0270982;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=17.1695;QD=24.6274;RBI=0.214053;REFB=-0.0527393;REVB=0.21233;RO=4;SAF=4;SAR=16;SRF=0;SRR=4;SSEN=0.325771;SSEP=0;SSSB=0.102305;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0296771;OID=.;OPOS=73733623;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:20:25:27:27:0:5:22:0:0:12:4:4:16:0:4 chr17 73748559 . GC G 54.61 PASS AO=38;DP=88;FAO=39;FDP=86;FR=.;FRO=47;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=-0.0434013;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.5847;QD=2.53977;RBI=0.0436267;REFB=-0.116654;REVB=0.0044294;RO=44;SAF=25;SAR=13;SRF=21;SRR=23;SSEN=0.308;SSEP=0;SSSB=0.179633;STB=0.574139;TYPE=del;VARB=0.11065;OID=.;OPOS=73748560;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:38:86:39:86:47:25:14:24:23:54:44:25:13:21:23 chr17 73750859 . C G 44.7 PASS AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=12;FWDB=-0.000755141;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=82.8176;QD=7.77455;RBI=0.000840601;REFB=0.00684032;REVB=0.000369284;RO=13;SAF=3;SAR=7;SRF=1;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.299057;STB=0.670322;TYPE=snp;VARB=-0.00465242;OID=.;OPOS=73750859;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:23:23:13:13:10:10:7:3:1:12:7:3:1:12 chr17 73753503 . T C 350.6 PASS AO=34;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0072261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.432;QD=37.9023;RBI=0.0239543;REFB=0;REVB=0.0228384;RO=0;SAF=15;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40663e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000104755;OID=.;OPOS=73753503;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:37:37:0:0:34:37:19:15:0:0:19:18:0:0 chr17 73812908 . CA C,CG 1725.74 PASS AO=104,82;DP=193;FAO=104,84;FDP=188;FR=.;FRO=0;FSAF=4,52;FSAR=100,32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0305259,0.0201541;FXX=0.0105258;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=63.5918,63.323;QD=36.7178;RBI=0.0314145,0.0228191;REFB=0,0;REVB=-0.00741896,0.0107016;RO=0;SAF=3,51;SAR=101,31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.2938e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.0255472,0.0117976;OID=.,.;OPOS=73812909,73812909;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:104,82:187:104,84:188:0:4,52:100,32:0:0:99:0:3,51:101,31:0:0 chr17 73816140 . T C 34.06 PASS AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.218529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.265;QD=11.3543;RBI=0.218826;REFB=-0.0417734;REVB=0.0113988;RO=5;SAF=1;SAR=5;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0435573;STB=0.624529;TYPE=snp;VARB=0.0294658;OID=.;OPOS=73816140;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:11:12:5:6:6:6:5:1:1:4:5:1:2:4 chr17 73836162 . C G 19.37 PASS AO=6;DP=22;FAO=6;FDP=23;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.00888379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6109;QD=3.3692;RBI=0.0519581;REFB=-0.00812836;REVB=-0.051193;RO=15;SAF=5;SAR=1;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.493865;STB=0.819797;TYPE=snp;VARB=0.0313004;OID=.;OPOS=73836162;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:22:23:15:17:6:6:1:5:6:9:1:5:7:10 chr17 73949540 . G C 1174.39 PASS AO=125;DP=127;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00112524;FXX=0.0157468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.6082;QD=37.5806;RBI=0.00163881;REFB=-0.020631;REVB=0.00119145;RO=1;SAF=63;SAR=62;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0074824;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000448184;OID=.;OPOS=73949540;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:127:125:1:0:125:125:62:63:1:0:62:63:0:0 chr17 73997474 . G A 106.57 PASS AO=16;DP=22;FAO=16;FDP=22;FR=.;FRO=6;FSAF=14;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.00684847;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.712;QD=19.3766;RBI=0.0242877;REFB=-0.010618;REVB=-0.0233022;RO=6;SAF=14;SAR=2;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.306053;STB=0.672819;TYPE=snp;VARB=0.00793585;OID=.;OPOS=73997474;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:22:22:6:6:16:16:2:14:3:3:2:14:3:3 chr17 74014628 . G A 187.73 PASS AO=31;DP=46;FAO=31;FDP=46;FR=.;FRO=15;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.0212718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.219;QD=16.324;RBI=0.0244331;REFB=-0.0662365;REVB=-0.0120201;RO=15;SAF=15;SAR=16;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0295107;STB=0.516119;TYPE=snp;VARB=0.0270845;OID=.;OPOS=74014628;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:46:46:15:15:31:31:16:15:8:7:16:15:8:7 chr17 74014668 . T C 198.02 PASS AO=23;DP=36;FAO=27;FDP=35;FR=.,HEALED;FRO=7;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.0144805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.8567;QD=22.631;RBI=0.0170634;REFB=-0.0556842;REVB=0.00902631;RO=7;SAF=9;SAR=14;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139785;STB=0.547791;TYPE=snp;VARB=0.0199715;OID=.;OPOS=74014668;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:36:35:7:7:23:27:14:9:5:2:14:13:5:2 chr17 74017554 . G T 11.82 PASS AO=4;DP=19;FAO=4;FDP=19;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=3;FWDB=0.0111529;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.002;QD=2.48868;RBI=0.0251342;REFB=-0.000631151;REVB=0.0225243;RO=15;SAF=3;SAR=1;SRF=12;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0806035;STB=0.555295;TYPE=snp;VARB=0.00374163;OID=.;OPOS=74017554;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:19:19:15:15:4:4:1:3:12:3:1:3:12:3 chr17 74017573 . C G 11.13 PASS AO=4;DP=20;FAO=4;FDP=20;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=-0.000831565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.299;QD=2.22534;RBI=0.0195351;REFB=-0.00621964;REVB=0.0195174;RO=16;SAF=3;SAR=1;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.84668e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0418562;OID=.;OPOS=74017573;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:20:20:16:16:4:4:1:3:12:4:1:3:12:4 chr17 74056413 . C T 194.61 PASS AO=45;DP=88;FAO=44;FDP=88;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=-0.000886806;FXX=0.0112347;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.3517;QD=8.84576;RBI=0.0228319;REFB=0.00650304;REVB=-0.0228146;RO=42;SAF=17;SAR=28;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130619;STB=0.582052;TYPE=snp;VARB=-0.0170003;OID=.;OPOS=74056413;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:42:44:45:44:28:17:22:20:28:16:23:21 chr17 74066447 . T A 137.49 PASS AO=54;DP=168;FAO=55;FDP=169;FR=.;FRO=114;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=55;FSRR=59;FWDB=0.00243235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.673;QD=3.25413;RBI=0.00265572;REFB=-0.0109931;REVB=-0.00106608;RO=111;SAF=28;SAR=26;SRF=53;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.047823;STB=0.530211;TYPE=snp;VARB=0.0202368;OID=.;OPOS=74066447;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:169:111:114:54:55:26:28:53:58:26:29:55:59 chr17 74076415 . G A 11.82 PASS AO=4;DP=19;FAO=4;FDP=19;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=0.0203098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.3431;QD=2.48867;RBI=0.025243;REFB=-0.0151574;REVB=0.0149908;RO=15;SAF=3;SAR=1;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0244365;STB=0.517154;TYPE=snp;VARB=0.0673649;OID=.;OPOS=74076415;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:19:19:15:15:4:4:1:3:11:4:1:3:11:4 chr17 74076642 . G A 76.64 PASS AO=14;DP=24;FAO=14;FDP=24;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0176454;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.3334;QD=12.7737;RBI=0.0925867;REFB=-0.0312576;REVB=0.0908897;RO=10;SAF=3;SAR=11;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.3915;STB=0.723341;TYPE=snp;VARB=0.0290364;OID=.;OPOS=74076642;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:24:24:10:10:14:14:11:3:7:3:11:3:7:3 chr17 74077797 . C T 47.13 PASS AO=14;DP=40;FAO=14;FDP=40;FR=.;FRO=26;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=21;FWDB=0.0196572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.445;QD=4.71285;RBI=0.0196652;REFB=-0.0127182;REVB=0.000560662;RO=26;SAF=3;SAR=11;SRF=5;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0367999;STB=0.521709;TYPE=snp;VARB=0.0148677;OID=.;OPOS=74077797;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:40:40:26:26:14:14:11:3:5:21:11:3:5:21 chr17 74080443 . C T 216.2 PASS AO=55;DP=120;FAO=55;FDP=121;FR=.;FRO=66;FSAF=14;FSAR=41;FSRF=18;FSRR=48;FWDB=-0.0110506;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.9784;QD=7.14722;RBI=0.0278723;REFB=-0.0358071;REVB=-0.025588;RO=65;SAF=14;SAR=41;SRF=17;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00891185;STB=0.512896;TYPE=snp;VARB=0.0159913;OID=.;OPOS=74080443;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:121:65:66:55:55:41:14:17:48:41:14:18:48 chr17 74133619 . GC G,GG 59.85 PASS AO=6,6;DP=30;FAO=8,7;FDP=25;FR=.;FRO=10;FSAF=4,1;FSAR=4,6;FSRF=9;FSRR=1;FWDB=0.166551,0.119747;FXX=0.0384468;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=10.6754,21.3168;QD=9.57545;RBI=0.191647,0.153045;REFB=-0.0397769,-0.0315319;REVB=0.0948129,0.0953073;RO=9;SAF=3,1;SAR=3,5;SRF=8;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.39381,-0.637077;STB=0.721775,0.894549;TYPE=del,snp;VARB=0.0346089,0.0692767;OID=.,.;OPOS=74133620,74133620;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:6,6:24:8,7:25:10:4,1:4,6:9:1:26:9:3,1:3,5:8:1 chr17 74152366 . A G 77.13 PASS AO=25;DP=71;FAO=25;FDP=71;FR=.;FRO=46;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=32;FWDB=-0.0309221;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7817;QD=4.34524;RBI=0.0321514;REFB=0.0113149;REVB=0.00880554;RO=46;SAF=18;SAR=7;SRF=14;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.447656;STB=0.757903;TYPE=snp;VARB=-0.0254443;OID=.;OPOS=74152366;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:71:71:46:46:25:25:7:18:14:32:7:18:14:32 chr17 74286082 . C T 72.38 PASS AO=27;DP=91;FAO=28;FDP=91;FR=.;FRO=63;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=42;FWDB=0.00419886;FXX=0.0215031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.518;QD=3.18169;RBI=0.00723312;REFB=-0.00868234;REVB=0.00588962;RO=64;SAF=10;SAR=17;SRF=22;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0343473;STB=0.543976;TYPE=snp;VARB=0.0177941;OID=.;OPOS=74286082;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:91:91:64:63:27:28:17:10:22:42:17:11:21:42 chr17 74286106 . C T 90.04 PASS AO=32;DP=99;FAO=33;FDP=99;FR=.;FRO=66;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=47;FWDB=0.0163253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1295;QD=3.63794;RBI=0.0164631;REFB=-0.0185248;REVB=0.00212553;RO=66;SAF=12;SAR=20;SRF=19;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111704;STB=0.556205;TYPE=snp;VARB=0.0219893;OID=.;OPOS=74286106;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:99:99:66:66:32:33:20:12:19:47:21:12:19:47 chr17 74287204 . C G 202.46 PASS AO=59;DP=144;FAO=59;FDP=144;FR=.;FRO=85;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=52;FSRR=33;FWDB=0.0262587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1685;QD=5.62382;RBI=0.0268506;REFB=-0.00545136;REVB=0.00560697;RO=85;SAF=34;SAR=25;SRF=52;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0384283;STB=0.521584;TYPE=snp;VARB=0.00904388;OID=.;OPOS=74287204;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:144:85:85:59:59:25:34:52:33:25:34:52:33 chr17 74287389 . T C 250.69 PASS AO=60;DP=125;FAO=60;FDP=124;FR=.;FRO=64;FSAF=29;FSAR=31;FSRF=18;FSRR=46;FWDB=-0.00788756;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.814;QD=8.08661;RBI=0.0106851;REFB=-0.0205868;REVB=0.00720822;RO=64;SAF=29;SAR=31;SRF=18;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190825;STB=0.605116;TYPE=snp;VARB=0.0235164;OID=.;OPOS=74287389;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:124:64:64:60:60:31:29:18:46:31:29:18:46 chr17 74287594 . G A 474.46 PASS AO=96;DP=170;FAO=96;FDP=170;FR=.;FRO=74;FSAF=49;FSAR=47;FSRF=38;FSRR=36;FWDB=0.00796697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.4601;QD=11.1638;RBI=0.0234464;REFB=-0.0231551;REVB=-0.0220513;RO=74;SAF=49;SAR=47;SRF=38;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00247697;STB=0.501348;TYPE=snp;VARB=0.00998815;OID=.;OPOS=74287594;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:170:74:74:96:96:47:49:38:36:47:49:38:36 chr17 74288262 . T C 27.53 PASS AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=11;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.110287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.3834;QD=10.0127;RBI=0.112543;REFB=-0.040362;REVB=-0.0224241;RO=6;SAF=1;SAR=4;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.308675;STB=0.694785;TYPE=snp;VARB=0.124075;OID=.;OPOS=74288262;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:11:11:6:6:5:5:4:1:3:3:4:1:3:3 chr17 74289500 . G A 440.45 PASS AO=67;DP=96;FAO=70;FDP=99;FR=.;FRO=29;FSAF=24;FSAR=46;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=-0.00463603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.069;QD=17.7958;RBI=0.0299232;REFB=-0.0215968;REVB=0.0295619;RO=28;SAF=24;SAR=43;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000634959;STB=0.50064;TYPE=snp;VARB=0.00826646;OID=.;OPOS=74289500;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:96:99:28:29:67:70:43:24:10:18:46:24:10:19 chr17 74289705 . A G 17.63 PASS AO=8;DP=35;FAO=8;FDP=36;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=19;FSRR=9;FWDB=0.0236931;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.598;QD=1.95868;RBI=0.0237116;REFB=0.0105225;REVB=0.000937484;RO=27;SAF=5;SAR=3;SRF=19;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104389;STB=0.545344;TYPE=snp;VARB=-0.0268779;OID=.;OPOS=74289705;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:35:36:27:28:8:8:3:5:19:8:3:5:19:9 chr17 74289839 . G A 178.18 PASS AO=49;DP=115;FAO=49;FDP=115;FR=.;FRO=66;FSAF=38;FSAR=11;FSRF=49;FSRR=17;FWDB=-0.000964381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.935;QD=6.19755;RBI=0.0346699;REFB=0.00655485;REVB=0.0346565;RO=64;SAF=38;SAR=11;SRF=47;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0573429;STB=0.526461;TYPE=snp;VARB=-0.0091126;OID=.;OPOS=74289839;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:64:66:49:49:11:38:47:17:11:38:49:17 chr17 74289875 . C T 295.96 PASS AO=75;DP=164;FAO=76;FDP=165;FR=.;FRO=89;FSAF=53;FSAR=23;FSRF=64;FSRR=25;FWDB=0.0881927;FXX=0.00602373;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.507;QD=7.17471;RBI=0.0925409;REFB=0.000664958;REVB=0.0280335;RO=89;SAF=52;SAR=23;SRF=64;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0300401;STB=0.514036;TYPE=snp;VARB=-0.00078339;OID=.;OPOS=74289875;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:165:89:89:75:76:23:52:64:25:23:53:64:25 chr17 74289908 . A G 309.82 PASS AO=83;DP=186;FAO=83;FDP=187;FR=.;FRO=104;FSAF=52;FSAR=31;FSRF=69;FSRR=35;FWDB=0.000169396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.4202;QD=6.62716;RBI=0.0490901;REFB=-0.00663039;REVB=-0.0490898;RO=103;SAF=52;SAR=31;SRF=69;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0468717;STB=0.5222;TYPE=snp;VARB=0.011557;OID=.;OPOS=74289908;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:187:103:104:83:83:31:52:69:34:31:52:69:35 chr17 74290097 . T A 132.98 PASS AO=39;DP=98;FAO=39;FDP=98;FR=.;FRO=59;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=35;FSRR=24;FWDB=0.0142961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.26;QD=5.42758;RBI=0.0143738;REFB=-0.00904852;REVB=0.00149266;RO=59;SAF=14;SAR=25;SRF=35;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.248498;STB=0.640953;TYPE=snp;VARB=0.0127647;OID=.;OPOS=74290097;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:59:59:39:39:25:14:35:24:25:14:35:24 chr17 74307737 . T C 131.19 PASS AO=41;DP=108;FAO=41;FDP=108;FR=.;FRO=67;FSAF=12;FSAR=29;FSRF=22;FSRR=45;FWDB=0.011551;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.589;QD=4.8588;RBI=0.0143384;REFB=-0.00418265;REVB=0.00849497;RO=67;SAF=12;SAR=29;SRF=22;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0457816;STB=0.526134;TYPE=snp;VARB=0.00324695;OID=.;OPOS=74307737;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:67:67:41:41:29:12:22:45:29:12:22:45 chr17 74379952 . CGGGGGC CGGGGC,CGGGC,CGGGG 268.14 PASS AO=10,8,12;DP=51;FAO=0,0,37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=0,0,14;FSAR=0,0,23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.353383,0.185334,0.0207643;FXX=0.0256345;HRUN=5,5,5;LEN=1,2,2;MLLD=11.4895,10.5325,22.8688;QD=28.2252;RBI=0.537901,0.284408,0.106287;REFB=-0.047147,-0.0523958,0.00531109;REVB=-0.405534,-0.21573,0.104239;RO=0;SAF=0,0,11;SAR=10,8,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.416667,0.416667,0.416667;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,3.23983e-08;STB=0.5,0.5,0.510633;TYPE=del,del,del;VARB=0,0,0.00658118;OID=.,.,.;OPOS=74379953,74379953,74379957;OREF=G,GG,GC;OALT=-,-,-;OMAPALT=CGGGGC,CGGGC,CGGGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 3/3:10,8,12:38:0,0,37:38:1:0,0,14:0,0,23:0:1:20:0:0,0,11:10,8,1:0:0 chr17 74387284 . C T 199.02 PASS AO=35;DP=55;FAO=35;FDP=55;FR=.;FRO=20;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.0126758;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=223.333;QD=14.4738;RBI=0.0213009;REFB=-0.0252991;REVB=0.0171187;RO=19;SAF=18;SAR=17;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.026141;STB=0.523351;TYPE=snp;VARB=0.0142486;OID=.;OPOS=74387284;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:55:55:19:20:35:35:17:18:9:10:17:18:9:11 chr17 74475024 . G A 101.96 PASS AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000621095;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=59.3876;QD=37.0751;RBI=0.000621095;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=11;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.18242e-05;OID=.;OPOS=74475024;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:11:11:0:11:0:0:0:11:0:0 chr17 74475975 . C A 135.69 PASS AO=31;DP=67;FAO=33;FDP=70;FR=.;FRO=37;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=0.00827411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.223;QD=7.75347;RBI=0.0153218;REFB=-0.0339369;REVB=0.0128957;RO=34;SAF=19;SAR=12;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0803059;STB=0.533313;TYPE=snp;VARB=0.0399983;OID=.;OPOS=74475975;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:70:34:37:31:33:12:19:18:16:14:19:19:18 chr17 74540917 . A C 149.51 PASS AO=23;DP=32;FAO=23;FDP=32;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=-0.000192089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.111;QD=18.6889;RBI=0.0239592;REFB=-0.0480969;REVB=-0.0239584;RO=9;SAF=7;SAR=16;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0509079;STB=0.527845;TYPE=snp;VARB=0.0162742;OID=.;OPOS=74540917;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:32:32:9:9:23:23:16:7:2:7:16:7:2:7 chr17 74541129 . A G 79.86 PASS AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0105054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.801;QD=31.9432;RBI=0.0105054;REFB=-0.0146591;REVB=0;RO=1;SAF=9;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000145602;OID=.;OPOS=74541129;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:10:10:1:1:9:9:0:9:1:0:0:9:1:0 chr17 74652491 . T C 336.29 PASS AO=80;DP=164;FAO=80;FDP=163;FR=.;FRO=83;FSAF=43;FSAR=37;FSRF=37;FSRR=46;FWDB=-0.0119026;FXX=0.00609719;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.177;QD=8.25259;RBI=0.0235435;REFB=-0.0322752;REVB=0.0203132;RO=82;SAF=43;SAR=37;SRF=37;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0791768;STB=0.546626;TYPE=snp;VARB=0.0081018;OID=.;OPOS=74652491;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:163:82:83:80:80:37:43:37:45:37:43:37:46 chr17 74652502 . T A 12.34 PASS AO=74;DP=148;FAO=13;FDP=120;FR=.;FRO=107;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=63;FSRR=44;FWDB=-0.0105762;FXX=0.220765;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.376;QD=0.411224;RBI=0.0105905;REFB=-1.2079e-05;REVB=-0.000550882;RO=74;SAF=38;SAR=36;SRF=34;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0490243;STB=0.773226;TYPE=snp;VARB=0.0571283;OID=.;OPOS=74652502;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:148:120:74:107:74:13:36:38:34:40:2:11:63:44 chr17 74732507 . A G 363.29 PASS AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00166683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.106;QD=38.2409;RBI=0.0207595;REFB=0;REVB=0.0206925;RO=0;SAF=15;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000169538;OID=.;OPOS=74732507;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:38:38:0:0:38:38:23:15:0:0:23:15:0:0 chr17 74733099 . G A 1642.47 PASS AO=173;DP=177;FAO=173;FDP=173;FR=.;FRO=0;FSAF=100;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.035484;FXX=0.0225976;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.991;QD=37.9762;RBI=0.106933;REFB=-0.019424;REVB=0.100873;RO=1;SAF=100;SAR=73;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00473637;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000139516;OID=.;OPOS=74733099;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:177:173:1:0:173:173:73:100:1:0:73:100:0:0 chr17 74921072 . G C 119.45 PASS AO=36;DP=93;FAO=36;FDP=93;FR=.;FRO=57;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=7;FSRR=50;FWDB=0.00530336;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=203.414;QD=5.13778;RBI=0.00538124;REFB=0.000861024;REVB=0.000912192;RO=57;SAF=11;SAR=25;SRF=7;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.26385;STB=0.646992;TYPE=snp;VARB=-0.00118125;OID=.;OPOS=74921072;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:57:57:36:36:25:11:7:50:25:11:7:50 chr17 74944151 . C T 137.1 PASS AO=24;DP=39;FAO=24;FDP=39;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=14;FWDB=0.0144706;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.9822;QD=14.0617;RBI=0.0629308;REFB=-0.0384841;REVB=0.0612445;RO=15;SAF=2;SAR=22;SRF=1;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0394238;STB=0.521722;TYPE=snp;VARB=0.0299043;OID=.;OPOS=74944151;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:39:39:15:15:24:24:22:2:1:14:22:2:1:14 chr17 74944934 . G A 47.44 PASS AO=16;DP=52;FAO=16;FDP=50;FR=.;FRO=34;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=0.00462487;FXX=0.0565931;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.143;QD=3.79504;RBI=0.070151;REFB=-0.000356748;REVB=0.0699984;RO=32;SAF=3;SAR=13;SRF=11;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233191;STB=0.670728;TYPE=snp;VARB=0.00301452;OID=.;OPOS=74944934;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:52:50:32:34:16:16:13:3:11:21:13:3:13:21 chr17 74945978 . C T 187.27 PASS AO=35;DP=59;FAO=35;FDP=60;FR=.;FRO=25;FSAF=1;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=25;FWDB=0.0848718;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=219.304;QD=12.485;RBI=0.0848923;REFB=-0.00368809;REVB=0.00186629;RO=23;SAF=1;SAR=34;SRF=0;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235276;STB=0.63435;TYPE=snp;VARB=0.00241575;OID=.;OPOS=74945978;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:59:60:23:25:35:35:34:1:0:23:34:1:0:25 chr17 74946060 . G A 90.9 PASS AO=23;DP=51;FAO=22;FDP=50;FR=.;FRO=28;FSAF=0;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=28;FWDB=0.0472919;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7009;QD=7.27183;RBI=0.0474551;REFB=-0.00837641;REVB=-0.00393228;RO=28;SAF=1;SAR=22;SRF=0;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.358464;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0162463;OID=.;OPOS=74946060;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:51:50:28:28:23:22:22:1:0:28:22:0:0:28 chr17 75085434 . G A 705.5 PASS AO=175;DP=344;FAO=175;FDP=365;FR=.;FRO=190;FSAF=87;FSAR=88;FSRF=114;FSRR=76;FWDB=-0.00151002;FXX=0.00544944;HRUN=3;LEN=1;MLLD=191.149;QD=7.73151;RBI=0.0117698;REFB=-0.0197135;REVB=-0.0116726;RO=168;SAF=87;SAR=88;SRF=114;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162753;STB=0.553505;TYPE=snp;VARB=0.0213199;OID=.;OPOS=75085434;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:344:365:168:190:175:175:88:87:114:54:88:87:114:76 chr17 75158213 . T G 130.22 PASS AO=40;DP=104;FAO=40;FDP=104;FR=.;FRO=64;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=40;FSRR=24;FWDB=0.0243604;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=223.75;QD=5.00839;RBI=0.028234;REFB=-0.00651998;REVB=-0.0142734;RO=64;SAF=22;SAR=18;SRF=40;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0828514;STB=0.547036;TYPE=snp;VARB=0.0111797;OID=.;OPOS=75158213;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:64:64:40:40:18:22:40:24:18:22:40:24 chr17 75158261 . C G 87.84 PASS AO=29;DP=83;FAO=29;FDP=82;FR=.;FRO=53;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=32;FSRR=21;FWDB=-0.0465458;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.2872;QD=4.28487;RBI=0.0548296;REFB=-0.0147378;REVB=-0.0289788;RO=51;SAF=19;SAR=10;SRF=31;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0566037;STB=0.535917;TYPE=snp;VARB=0.0158752;OID=.;OPOS=75158261;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:83:82:51:53:29:29:10:19:31:20:10:19:32:21 chr17 75190846 . A C 637.08 PASS AO=65;DP=65;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0333296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.617;QD=38.0348;RBI=0.0727646;REFB=0;REVB=0.0646825;RO=0;SAF=32;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000363905;OID=.;OPOS=75190846;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:65:67:0:0:65:67:33:32:0:0:35:32:0:0 chr17 75190962 . C T 89.7 PASS AO=16;DP=31;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0358111;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.925;QD=11.5738;RBI=0.0451867;REFB=-0.0303232;REVB=0.0275573;RO=15;SAF=5;SAR=11;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142741;STB=0.536542;TYPE=snp;VARB=0.0162129;OID=.;OPOS=75190962;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:31:31:15:14:16:17:11:5:7:8:11:6:6:8 chr17 75202452 . GC G 164.69 PASS AO=23;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.230891;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=10.3809;QD=19.3749;RBI=0.350436;REFB=-0.018094;REVB=0.263619;RO=7;SAF=4;SAR=19;SRF=2;SRR=5;SSEN=0.216769;SSEP=0;SSSB=-0.0780666;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0313575;OID=.;OPOS=75202453;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:23:34:34:34:0:7:27:0:0:13:7:4:19:2:5 chr17 75303298 . T C 184.17 PASS AO=34;DP=64;FAO=37;FDP=67;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.027492;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.982;QD=10.995;RBI=0.0323777;REFB=-0.029595;REVB=0.0171029;RO=30;SAF=15;SAR=19;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.078158;STB=0.5331;TYPE=snp;VARB=0.0216368;OID=.;OPOS=75303298;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:67:30:30:34:37:19:15:16:14:20:17:16:14 chr17 75369578 . T C 73.84 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.5113;QD=36.9196;RBI=0.0458649;REFB=0;REVB=-0.0429903;RO=0;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00124422;OID=.;OPOS=75369578;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:4:4:0:0:4:4:0:0 chr17 75398514 . G A 213.37 PASS AO=41;DP=71;FAO=41;FDP=71;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=0.0109607;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.789;QD=12.0209;RBI=0.0601539;REFB=-0.0213963;REVB=0.0591469;RO=30;SAF=17;SAR=24;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1679;STB=0.592142;TYPE=snp;VARB=0.017643;OID=.;OPOS=75398514;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:30:30:41:41:24:17:19:11:24:17:19:11 chr17 75401190 . G A 284.27 PASS AO=70;DP=148;FAO=70;FDP=148;FR=.;FRO=78;FSAF=41;FSAR=29;FSRF=43;FSRR=35;FWDB=0.00331323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.723;QD=7.68283;RBI=0.110229;REFB=-0.0215662;REVB=0.110179;RO=75;SAF=41;SAR=29;SRF=43;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119037;STB=0.518572;TYPE=snp;VARB=0.0161815;OID=.;OPOS=75401190;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:75:78:70:70:29:41:43:32:29:41:43:35 chr17 75478481 . C T 191.95 PASS AO=41;DP=78;FAO=41;FDP=78;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=29;FSRF=13;FSRR=24;FWDB=-0.0177325;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=187.9;QD=9.84343;RBI=0.0228262;REFB=0.00216674;REVB=-0.0143733;RO=37;SAF=12;SAR=29;SRF=13;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0589836;STB=0.53268;TYPE=snp;VARB=-0.00203359;OID=.;OPOS=75478481;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:37:37:41:41:29:12:13:24:29:12:13:24 chr17 75494705 . A G 158.92 PASS AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0105346;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.3325;QD=37.3922;RBI=0.0795742;REFB=0;REVB=0.0788739;RO=0;SAF=9;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.126e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00231673;OID=.;OPOS=75494705;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:17:17:0:0:17:17:8:9:0:0:8:9:0:0 chr17 75495065 . T C 254.96 PASS AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0416825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.846;QD=37.7722;RBI=0.0468685;REFB=0;REVB=0.0214296;RO=0;SAF=6;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00029076;OID=.;OPOS=75495065;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:27:27:0:0:27:27:21:6:0:0:21:6:0:0 chr17 75495397 . T C 147.37 PASS AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0369267;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.471;QD=36.8434;RBI=0.0398019;REFB=0;REVB=0.0148529;RO=0;SAF=8;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000258471;OID=.;OPOS=75495397;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:16:0:0:16:16:8:8:0:0:8:8:0:0 chr17 75496342 . T C 161.46 PASS AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.060088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.8442;QD=33.9919;RBI=0.0762893;REFB=-0.0617079;REVB=0.0470051;RO=0;SAF=1;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.51427;TYPE=snp;VARB=0.00400423;OID=.;OPOS=75496342;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:0:1:18:18:17:1:0:0:17:1:0:1 chr17 75496361 . A G 147.38 PASS AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0360492;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.9209;QD=36.8439;RBI=0.0364251;REFB=0;REVB=0.00521945;RO=0;SAF=2;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00123378;OID=.;OPOS=75496361;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:16:0:0:16:16:14:2:0:0:14:2:0:0 chr17 75558676 . A T 186.98 PASS AO=18;DP=28;FAO=23;FDP=27;FR=.,HEALED;FRO=3;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.274968;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.2368;QD=27.7001;RBI=0.30622;REFB=-0.188485;REVB=0.134771;RO=4;SAF=8;SAR=10;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0185841;STB=0.511935;TYPE=snp;VARB=0.0125499;OID=.;OPOS=75558676;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:28:27:4:3:18:23:10:8:2:2:10:13:2:1 chr17 75559019 . C T 718.98 PASS AO=79;DP=83;FAO=79;FDP=81;FR=.;FRO=2;FSAF=51;FSAR=28;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0164238;FXX=0.0240935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.238;QD=35.5053;RBI=0.0283904;REFB=-0.151118;REVB=-0.0231576;RO=2;SAF=51;SAR=28;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0182024;STB=0.509613;TYPE=snp;VARB=0.000279472;OID=.;OPOS=75559019;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:83:81:2:2:79:79:28:51:2:0:28:51:2:0 chr17 75916303 . TG T 33.01 PASS AO=20;DP=72;FAO=24;FDP=58;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=29;FSRR=5;FWDB=0.283253;FXX=0.0169463;HRUN=5;LEN=1;MLLD=7.86116;QD=2.27637;RBI=0.377372;REFB=-0.0951013;REVB=-0.249355;RO=29;SAF=10;SAR=10;SRF=26;SRR=3;SSEN=0.320144;SSEP=0;SSSB=-0.419886;STB=0.706754;TYPE=del;VARB=0.116857;OID=.;OPOS=75916304;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:20:58:24:58:34:12:12:29:5:32:29:10:10:26:3 chr17 76130575 . A T 282.97 PASS AO=42;DP=57;FAO=42;FDP=56;FR=.;FRO=14;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=0.0066356;FXX=0.0175408;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.763;QD=20.2123;RBI=0.0462141;REFB=-0.0184648;REVB=0.0457352;RO=14;SAF=19;SAR=23;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12092;STB=0.565223;TYPE=snp;VARB=0.00474104;OID=.;OPOS=76130575;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:57:56:14:14:42:42:23:19:10:4:23:19:10:4 chr17 76131070 . G A 180.8 PASS AO=44;DP=94;FAO=45;FDP=95;FR=.;FRO=50;FSAF=13;FSAR=32;FSRF=21;FSRR=29;FWDB=0.00340234;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.4299;QD=7.61275;RBI=0.0548673;REFB=-0.0375119;REVB=0.0547617;RO=50;SAF=13;SAR=31;SRF=21;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133356;STB=0.578379;TYPE=snp;VARB=0.0547996;OID=.;OPOS=76131070;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:95:50:50:44:45:31:13:21:29:32:13:21:29 chr17 76134828 . C A 71.24 PASS AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=14;FWDB=0.00346147;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.091;QD=8.38115;RBI=0.0195013;REFB=-0.0233747;REVB=-0.0191917;RO=16;SAF=3;SAR=13;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.529032;TYPE=snp;VARB=0.0266272;OID=.;OPOS=76134828;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:34:34:16:18:16:16:13:3:3:13:13:3:4:14 chr17 76135148 . G T 28.14 PASS AO=12;DP=46;FAO=12;FDP=47;FR=.;FRO=35;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=0.0164523;FXX=0.059988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.129;QD=2.3948;RBI=0.0165298;REFB=-0.0017125;REVB=0.00159933;RO=34;SAF=4;SAR=8;SRF=12;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0259548;STB=0.531197;TYPE=snp;VARB=0.00282498;OID=.;OPOS=76135148;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:46:47:34:35:12:12:8:4:12:22:8:4:13:22 chr17 76157266 . T C 147.79 PASS AO=30;DP=56;FAO=30;FDP=55;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=-0.0191441;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.029;QD=10.7481;RBI=0.0201477;REFB=-0.00326183;REVB=-0.00627947;RO=21;SAF=9;SAR=21;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.056497;STB=0.510722;TYPE=snp;VARB=0.00204777;OID=.;OPOS=76157266;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:55:21:25:30:30:21:9:5:16:21:9:8:17 chr17 76178748 . T C 41.01 PASS AO=15;DP=50;FAO=15;FDP=50;FR=.;FRO=35;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.0304895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.791;QD=3.281;RBI=0.0309084;REFB=-0.0128419;REVB=-0.00507147;RO=35;SAF=3;SAR=12;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.424879;STB=0.758255;TYPE=snp;VARB=0.0164358;OID=.;OPOS=76178748;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:50:50:35:35:15:15:12:3:19:16:12:3:19:16 chr17 76210506 . CGGG CGG,CGGC 186.93 PASS AO=20,5;DP=36;FAO=31,0;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=19,0;FSAR=12,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0337604,-0.173454;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=11.4074,15.8696;QD=24.1195;RBI=0.0927784,0.175252;REFB=0,0;REVB=0.086418,-0.0250399;RO=3;SAF=9,5;SAR=11,0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.13106,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.00748698,-0.00237664;OID=.,.;OPOS=76210507,76210509;OREF=G,G;OALT=-,C;OMAPALT=CGG,CGGC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:20,5:31:31,0:31:0:19,0:12,0:0:0:9:3:9,5:11,0:3:0 chr17 76219591 . G A 498.04 PASS AO=56;DP=56;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0623878;FXX=0.017854;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.6595;QD=36.2208;RBI=0.0869452;REFB=0.0384727;REVB=0.0605577;RO=0;SAF=36;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.57266e-08;STB=0.507244;TYPE=snp;VARB=-0.00677774;OID=.;OPOS=76219591;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:56:55:0:1:56:54:20:36:0:0:20:34:1:0 chr17 76230025 . G A 117.07 PASS AO=28;DP=60;FAO=28;FDP=61;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.0162655;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.6674;QD=7.67683;RBI=0.0457211;REFB=0.0068176;REVB=0.04273;RO=32;SAF=14;SAR=14;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0296056;STB=0.508191;TYPE=snp;VARB=-0.00525592;OID=.;OPOS=76230025;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:61:32:33:28:28:14:14:17:15:14:14:17:16 chr17 76230729 . T C 672.83 PASS AO=74;DP=76;FAO=74;FDP=76;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=43;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0175112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.8832;QD=35.4122;RBI=0.0299746;REFB=-0.110107;REVB=0.0243277;RO=2;SAF=31;SAR=43;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0295417;STB=0.515621;TYPE=snp;VARB=0.00231712;OID=.;OPOS=76230729;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:76:76:2:2:74:74:43:31:2:0:43:31:2:0 chr17 76235972 . C T 278.61 PASS AO=72;DP=160;FAO=73;FDP=163;FR=.;FRO=90;FSAF=35;FSAR=38;FSRF=38;FSRR=52;FWDB=0.00174178;FXX=0.00609719;HRUN=4;LEN=1;MLLD=197.574;QD=6.83716;RBI=0.00552541;REFB=-0.0102265;REVB=0.00524369;RO=87;SAF=35;SAR=37;SRF=37;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0600678;STB=0.531727;TYPE=snp;VARB=0.0115224;OID=.;OPOS=76235972;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:163:87:90:72:73:37:35:37:50:38:35:38:52 chr17 76267779 . A C 47.8 PASS AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=9;FSAR=0;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=-0.00589318;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=270.878;QD=11.2464;RBI=0.00589318;REFB=-0.0435876;REVB=0;RO=6;SAF=9;SAR=0;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0327791;OID=.;OPOS=76267779;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:16:17:6:8:9:9:0:9:6:0:0:9:8:0 chr17 76395430 . C T 796.77 PASS AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00669299;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.8299;QD=37.9416;RBI=0.00847409;REFB=0;REVB=-0.0051975;RO=0;SAF=52;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.65395e-06;OID=.;OPOS=76395430;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:84:84:0:0:84:84:32:52:0:0:32:52:0:0 chr17 76433898 . T C 447.29 PASS AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00622046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.756;QD=38.0673;RBI=0.0651344;REFB=0;REVB=0.0648367;RO=0;SAF=20;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000392063;OID=.;OPOS=76433898;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:47:47:0:0:47:47:27:20:0:0:27:20:0:0 chr17 76451921 . A G 1390.31 PASS AO=147;DP=149;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=117;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0362017;FXX=0.0389585;HRUN=3;LEN=1;MLLD=119.788;QD=37.5759;RBI=0.0362036;REFB=-0.0402914;REVB=0.000368131;RO=0;SAF=30;SAR=117;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000206722;OID=.;OPOS=76451921;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:149:148:0:0:147:148:117:30:0:0:117:31:0:0 chr17 76456017 . C G 1157.22 PASS AO=100;DP=101;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.222304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.8397;QD=37.633;RBI=0.222531;REFB=0;REVB=-0.0100547;RO=0;SAF=8;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.55471e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00252236;OID=.;OPOS=76456017;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:101:123:0:0:100:123:92:8:0:0:92:31:0:0 chr17 76462770 . G A 1133.07 PASS AO=118;DP=118;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0319924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.065;QD=38.4092;RBI=0.0320725;REFB=0;REVB=-0.00226606;RO=0;SAF=66;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.05954e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.84534e-05;OID=.;OPOS=76462770;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:118:118:0:0:118:118:52:66:0:0:52:66:0:0 chr17 76464915 . CG C,CA 232.03 PASS AO=25,23;DP=84;FAO=25,23;FDP=83;FR=.;FRO=35;FSAF=1,19;FSAR=24,4;FSRF=7;FSRR=28;FWDB=-0.00263038,-0.00116209;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=235.748,246.388;QD=11.1821;RBI=0.00298579,0.00916672;REFB=-0.00582512,-0.00485991;REVB=0.00141282,0.00909276;RO=35;SAF=1,19;SAR=24,4;SRF=7;SRR=28;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.47791,0.621741;STB=0.786559,0.853647;TYPE=del,snp;VARB=0.0082298,0.00231782;OID=.,.;OPOS=76464916,76464916;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=C,CA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:25,23:83:25,23:83:35:1,19:24,4:7:28:89:35:1,19:24,4:7:28 chr17 76472768 . G A 370.27 PASS AO=81;DP=156;FAO=82;FDP=157;FR=.;FRO=75;FSAF=41;FSAR=41;FSRF=26;FSRR=49;FWDB=-0.0276221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.9695;QD=9.43358;RBI=0.028253;REFB=-0.00482044;REVB=-0.00593721;RO=74;SAF=41;SAR=40;SRF=25;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146552;STB=0.573231;TYPE=snp;VARB=0.00520902;OID=.;OPOS=76472768;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:157:74:75:81:82:40:41:25:49:41:41:26:49 chr17 76482432 . A G 170.08 PASS AO=37;DP=72;FAO=37;FDP=72;FR=.;FRO=35;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.0437426;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.2067;QD=9.44862;RBI=0.0672611;REFB=0.00508866;REVB=0.0510944;RO=35;SAF=22;SAR=15;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146087;STB=0.581088;TYPE=snp;VARB=-0.00458959;OID=.;OPOS=76482432;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:35:35:37:37:15:22:15:20:15:22:15:20 chr17 76491127 . T C 1085.52 PASS AO=115;DP=115;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0239535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.416;QD=38.0884;RBI=0.025451;REFB=0;REVB=-0.00860134;RO=0;SAF=48;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.17188e-05;OID=.;OPOS=76491127;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:115:114:0:0:115:114:67:48:0:0:67:47:0:0 chr17 76491128 . G C 1085.49 PASS AO=115;DP=115;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.955;QD=38.0874;RBI=0.0216433;REFB=0;REVB=-0.0126914;RO=0;SAF=48;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.36332e-06;OID=.;OPOS=76491128;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:115:114:0:0:115:114:67:48:0:0:67:47:0:0 chr17 76496492 . A G 1171.87 PASS AO=116;DP=116;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0480382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.604;QD=37.8024;RBI=0.0601025;REFB=0;REVB=0.0361199;RO=0;SAF=13;SAR=103;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.91969e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000141328;OID=.;OPOS=76496492;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:116:124:0:0:116:124:103:13:0:0:109:15:0:0 chr17 76497920 . C A 137.31 PASS AO=37;DP=86;FAO=37;FDP=86;FR=.;FRO=49;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=30;FWDB=0.101728;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=41.9074;QD=6.38632;RBI=0.103074;REFB=-0.0263139;REVB=-0.0166028;RO=49;SAF=15;SAR=22;SRF=19;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.018583;STB=0.510466;TYPE=snp;VARB=0.0366954;OID=.;OPOS=76497920;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:49:49:37:37:22:15:19:30:22:15:19:30 chr17 76498346 . CCTT C 269.84 PASS AO=68;DP=140;FAO=76;FDP=134;FR=.;FRO=58;FSAF=10;FSAR=66;FSRF=22;FSRR=36;FWDB=-0.0551662;FXX=0.0289834;HRUN=2;LEN=3;MLLD=240.491;QD=8.05477;RBI=0.0557333;REFB=0.00568141;REVB=0.00793038;RO=49;SAF=8;SAR=60;SRF=17;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.308427;STB=0.674275;TYPE=del;VARB=-0.00437359;OID=.;OPOS=76498347;OREF=CTT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:68:136:76:134:58:10:66:22:36:99:49:8:60:17:32 chr17 76498393 . A G 82.99 PASS AO=26;DP=117;FAO=26;FDP=84;FR=.;FRO=58;FSAF=1;FSAR=25;FSRF=20;FSRR=38;FWDB=0.00847719;FXX=0.338556;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.785;QD=3.95209;RBI=0.00893858;REFB=-0.00312919;REVB=-0.00283471;RO=26;SAF=1;SAR=25;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.630979;STB=0.892436;TYPE=snp;VARB=0.0295778;OID=.;OPOS=76498393;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:117:84:26:58:26:26:25:1:10:16:25:1:20:38 chr17 76498406 . A G 253.09 PASS AO=62;DP=127;FAO=61;FDP=127;FR=.;FRO=66;FSAF=1;FSAR=60;FSRF=17;FSRR=49;FWDB=0.0347407;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.134;QD=7.97137;RBI=0.0352068;REFB=-0.00223844;REVB=0.00570992;RO=62;SAF=1;SAR=61;SRF=16;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.697538;STB=0.908114;TYPE=snp;VARB=0.010574;OID=.;OPOS=76498406;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:62:66:62:61:61:1:16:46:60:1:17:49 chr17 76498692 . C T 910.98 PASS AO=89;DP=89;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0549554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.197;QD=37.9574;RBI=0.0550349;REFB=0;REVB=0.00295833;RO=0;SAF=38;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000625397;OID=.;OPOS=76498692;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:89:96:0:0:89:96:51:38:0:0:52:44:0:0 chr17 76503593 . T C 229.69 PASS AO=67;DP=163;FAO=67;FDP=163;FR=.;FRO=96;FSAF=28;FSAR=39;FSRF=39;FSRR=57;FWDB=-0.009656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.528;QD=5.63655;RBI=0.0117163;REFB=-0.00486352;REVB=-0.00663583;RO=94;SAF=28;SAR=39;SRF=37;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0261377;STB=0.507072;TYPE=snp;VARB=0.00738223;OID=.;OPOS=76503593;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:163:94:96:67:67:39:28:37:57:39:28:39:57 chr17 76503624 . C T 424.91 PASS AO=90;DP=169;FAO=92;FDP=172;FR=.;FRO=80;FSAF=40;FSAR=52;FSRF=34;FSRR=46;FWDB=0.0149024;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.619;QD=9.88156;RBI=0.0165783;REFB=-0.0245075;REVB=0.00726365;RO=78;SAF=40;SAR=50;SRF=32;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0294998;STB=0.504633;TYPE=snp;VARB=0.0189013;OID=.;OPOS=76503624;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:172:78:80:90:92:50:40:32:46:52:40:34:46 chr17 76503678 . C A 448.04 PASS AO=88;DP=152;FAO=88;FDP=151;FR=.;FRO=63;FSAF=38;FSAR=50;FSRF=27;FSRR=36;FWDB=0.0141365;FXX=0.00657851;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.318;QD=11.8686;RBI=0.0204216;REFB=-0.0381436;REVB=0.0147377;RO=63;SAF=38;SAR=50;SRF=27;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00253999;STB=0.50138;TYPE=snp;VARB=0.0213953;OID=.;OPOS=76503678;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:151:63:63:88:88:50:38:27:36:50:38:27:36 chr17 76521121 . T C 85.2 PASS AO=24;DP=62;FAO=24;FDP=61;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=26;FWDB=-0.027827;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.718;QD=5.58656;RBI=0.0305886;REFB=-0.0119112;REVB=0.0127011;RO=37;SAF=10;SAR=14;SRF=11;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13376;STB=0.576308;TYPE=snp;VARB=0.0187454;OID=.;OPOS=76521121;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:62:61:37:37:24:24:14:10:11:26:14:10:11:26 chr17 76522785 . C T 157.89 PASS AO=32;DP=59;FAO=32;FDP=59;FR=.;FRO=27;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.0422137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.357;QD=10.7042;RBI=0.0436715;REFB=-0.0549154;REVB=-0.0111894;RO=27;SAF=16;SAR=16;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0152856;STB=0.508469;TYPE=snp;VARB=0.0184359;OID=.;OPOS=76522785;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:27:27:32:32:16:16:13:14:16:16:13:14 chr17 76525565 . A G 415.63 PASS AO=48;DP=50;FAO=47;FDP=50;FR=.;FRO=3;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0232925;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.8769;QD=33.2503;RBI=0.0762214;REFB=-0.112245;REVB=-0.0725752;RO=2;SAF=22;SAR=26;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0408602;STB=0.533319;TYPE=snp;VARB=0.0167332;OID=.;OPOS=76525565;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:50:50:2:3:48:47:26:22:2:0:26:21:3:0 chr17 76528591 . C T 357.42 PASS AO=45;DP=52;FAO=45;FDP=51;FR=.;FRO=6;FSAF=33;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.0293096;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.053;QD=28.0329;RBI=0.0489111;REFB=-0.026371;REVB=0.0391567;RO=6;SAF=33;SAR=12;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0781596;STB=0.541649;TYPE=snp;VARB=0.00103587;OID=.;OPOS=76528591;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:52:51:6:6:45:45:12:33:6:0:12:33:6:0 chr17 76528790 . A G 2418.9 PASS AO=254;DP=256;FAO=254;FDP=254;FR=.;FRO=0;FSAF=145;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120383;FXX=0.00781219;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.346;QD=38.0929;RBI=0.0173019;REFB=0.0141476;REVB=0.0124273;RO=1;SAF=145;SAR=109;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00435341;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.60904e-05;OID=.;OPOS=76528790;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:256:254:1:0:254:254:109:145:0:1:109:145:0:0 chr17 76529053 . A G 327.65 PASS AO=32;DP=32;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.02091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.406;QD=37.4458;RBI=0.0225162;REFB=0;REVB=0.00835169;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.8713e-05;OID=.;OPOS=76529053;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:32:35:0:0:32:35:15:17:0:0:17:18:0:0 chr17 76535948 . T C 748.14 PASS AO=77;DP=77;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.9908;QD=38.3662;RBI=0.0220352;REFB=0;REVB=0.0127027;RO=0;SAF=22;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.29633e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000174436;OID=.;OPOS=76535948;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:77:78:0:0:77:78:55:22:0:0:56:22:0:0 chr17 76557862 . T C 929.3 PASS AO=98;DP=100;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000240911;FXX=0.019998;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.719;QD=37.9305;RBI=0.01883;REFB=0.0114664;REVB=0.0188284;RO=1;SAF=41;SAR=57;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00824921;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.17191e-05;OID=.;OPOS=76557862;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:100:98:1:0:98:98:57:41:0:1:57:41:0:0 chr17 76567707 . T C 170.85 PASS AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0831652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.642;QD=37.9671;RBI=0.0965931;REFB=0;REVB=0.0491303;RO=0;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000510317;OID=.;OPOS=76567707;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:18:0:0:18:18:9:9:0:0:9:9:0:0 chr17 76568810 . AG A 188.18 PASS AO=43;DP=59;FAO=45;FDP=58;FR=.;FRO=13;FSAF=43;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.32234;FXX=0.0169463;HRUN=2;LEN=1;MLLD=14.4586;QD=12.9777;RBI=0.32601;REFB=-0.052727;REVB=-0.048782;RO=16;SAF=41;SAR=2;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0.455837;SSSB=0.582587;STB=0.834005;TYPE=del;VARB=0.0100103;OID=.;OPOS=76568811;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:43:59:45:58:13:43:2:4:9:12:16:41:2:7:9 chr17 76672002 . T C 102.36 PASS AO=17;DP=29;FAO=18;FDP=29;FR=.;FRO=11;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.00263165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.126;QD=14.1181;RBI=0.0136584;REFB=-0.0103441;REVB=0.0134025;RO=11;SAF=12;SAR=5;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0570112;STB=0.539126;TYPE=snp;VARB=0.00538936;OID=.;OPOS=76672002;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:29:29:11:11:17:18:5:12:7:4:5:13:7:4 chr17 76799795 . G A 1110.13 PASS AO=117;DP=118;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0412843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.449;QD=37.6316;RBI=0.060439;REFB=-0.0420894;REVB=0.0441415;RO=1;SAF=48;SAR=69;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00979137;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000255283;OID=.;OPOS=76799795;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:118:118:1:0:117:118:69:48:1:0:69:49:0:0 chr17 76799860 . T C 900.04 PASS AO=82;DP=87;FAO=99;FDP=101;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.000468829;FXX=0.0194156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.485;QD=35.6453;RBI=0.00715219;REFB=-0.0161762;REVB=0.00713681;RO=0;SAF=20;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506755;TYPE=snp;VARB=0.000241424;OID=.;OPOS=76799860;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:87:101:0:2:82:99:62:20:0:0:73:26:0:2 chr17 76799861 . G C 11.95 PASS AO=16;DP=105;FAO=16;FDP=106;FR=.;FRO=90;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=69;FWDB=-0.0288363;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=45.8381;QD=0.450846;RBI=0.0292406;REFB=-0.00900112;REVB=-0.00484598;RO=89;SAF=5;SAR=11;SRF=20;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140803;STB=0.582995;TYPE=snp;VARB=0.100916;OID=.;OPOS=76799861;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:105:106:89:90:16:16:11:5:20:69:11:5:21:69 chr17 76799898 . A G 911.8 PASS AO=92;DP=92;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0273282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.593;QD=37.9915;RBI=0.0336145;REFB=0;REVB=-0.0195731;RO=0;SAF=14;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.78257e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.62452e-05;OID=.;OPOS=76799898;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:92:96:0:0:92:96:78:14:0:0:80:16:0:0 chr17 76814782 . G A 446.29 PASS AO=99;DP=230;FAO=115;FDP=249;FR=.;FRO=134;FSAF=38;FSAR=77;FSRF=43;FSRR=91;FWDB=0.031323;FXX=0.00399984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9145;QD=7.16931;RBI=0.0320675;REFB=-0.0246465;REVB=0.00686986;RO=130;SAF=32;SAR=67;SRF=43;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00875;STB=0.505823;TYPE=snp;VARB=0.0248883;OID=.;OPOS=76814782;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:230:249:130:134:99:115:67:32:43:87:77:38:43:91 chr17 76817090 . C T 24.11 PASS AO=9;DP=34;FAO=9;FDP=34;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.00433042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.203;QD=2.83701;RBI=0.0469094;REFB=-0.00463931;REVB=-0.0467091;RO=25;SAF=7;SAR=2;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.28753;STB=0.683766;TYPE=snp;VARB=0.00590786;OID=.;OPOS=76817090;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:34:34:25:25:9:9:2:7:14:11:2:7:14:11 chr17 76867017 . C T 100.58 PASS AO=33;DP=92;FAO=33;FDP=92;FR=.;FRO=59;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=35;FSRR=24;FWDB=0.0420914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.3743;QD=4.37314;RBI=0.0503694;REFB=0.00975229;REVB=0.0276655;RO=59;SAF=16;SAR=17;SRF=35;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120576;STB=0.56923;TYPE=snp;VARB=-0.0108822;OID=.;OPOS=76867017;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:59:59:33:33:17:16:35:24:17:16:35:24 chr17 76970879 . A G 587.59 PASS AO=62;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.612;QD=37.3075;RBI=0.0290205;REFB=0;REVB=-0.0242648;RO=0;SAF=32;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000789629;OID=.;OPOS=76970879;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:63:63:0:0:62:63:30:32:0:0:30:33:0:0 chr17 76972231 . G A 55.87 PASS AO=11;DP=22;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=0.0321889;FXX=0.119952;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.276;QD=10.1579;RBI=0.0482384;REFB=0.00494213;REVB=0.035928;RO=11;SAF=7;SAR=4;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.307182;STB=0.677107;TYPE=snp;VARB=-0.0024656;OID=.;OPOS=76972231;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:22:22:11:11:11:11:4:7:3:8:4:7:3:8 chr17 77039835 . G A 376.52 PASS AO=81;DP=154;FAO=81;FDP=151;FR=.;FRO=70;FSAF=30;FSAR=51;FSRF=20;FSRR=50;FWDB=0.0180162;FXX=0.0194793;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3093;QD=9.97401;RBI=0.0929854;REFB=-0.0313686;REVB=0.0912234;RO=70;SAF=30;SAR=51;SRF=20;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0787697;STB=0.543;TYPE=snp;VARB=0.0274952;OID=.;OPOS=77039835;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:151:70:70:81:81:51:30:20:50:51:30:20:50 chr17 77039852 . G A 494.26 PASS AO=104;DP=192;FAO=105;FDP=192;FR=.;FRO=87;FSAF=51;FSAR=54;FSRF=27;FSRR=60;FWDB=0.0279002;FXX=0.00518108;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.797;QD=10.2971;RBI=0.0339447;REFB=-0.032559;REVB=0.0193345;RO=86;SAF=51;SAR=53;SRF=26;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15705;STB=0.579878;TYPE=snp;VARB=0.0283591;OID=.;OPOS=77039852;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:192:86:87:104:105:53:51:26:60:54:51:27:60 chr17 77040185 . G C 91.29 PASS AO=11;DP=13;FAO=12;FDP=14;FR=.;FRO=2;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0156185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.201;QD=26.0817;RBI=0.0694109;REFB=-0.03766;REVB=0.0676309;RO=2;SAF=1;SAR=10;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0818657;STB=0.541601;TYPE=snp;VARB=0.00893593;OID=.;OPOS=77040185;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:13:14:2:2:11:12:10:1:0:2:11:1:0:2 chr17 77704912 . T C 280.38 PASS AO=47;DP=74;FAO=49;FDP=73;FR=.;FRO=24;FSAF=17;FSAR=32;FSRF=21;FSRR=3;FWDB=0.00957046;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.758;QD=15.3631;RBI=0.00965147;REFB=-0.0149741;REVB=-0.00124782;RO=24;SAF=17;SAR=30;SRF=21;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.314082;STB=0.671383;TYPE=snp;VARB=0.00925831;OID=.;OPOS=77704912;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:74:73:24:24:47:49:30:17:21:3:32:17:21:3 chr17 77705045 . T C 144.23 PASS AO=35;DP=75;FAO=35;FDP=75;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=31;FSRR=9;FWDB=-0.0343274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.706;QD=7.6922;RBI=0.0348149;REFB=-0.0103733;REVB=-0.00580572;RO=40;SAF=15;SAR=20;SRF=31;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.322264;STB=0.678873;TYPE=snp;VARB=0.00655223;OID=.;OPOS=77705045;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:40:40:35:35:20:15:31:9:20:15:31:9 chr17 77709339 . C G 236.68 PASS AO=41;DP=72;FAO=42;FDP=71;FR=.,HEALED;FRO=26;FSAF=8;FSAR=34;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.0102827;FXX=0.013887;HRUN=3;LEN=1;MLLD=244.624;QD=13.334;RBI=0.0146284;REFB=-0.0422512;REVB=-0.0104045;RO=16;SAF=7;SAR=34;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206211;STB=0.586162;TYPE=snp;VARB=0.0165446;OID=.;OPOS=77709339;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:70:71:16:26:41:42:34:7:7:9:34:8:9:17 chr17 77758484 . G A 548.51 PASS AO=57;DP=59;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0292741;FXX=0.0338926;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.422;QD=38.4921;RBI=0.0511666;REFB=0;REVB=0.0419648;RO=0;SAF=30;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00019227;OID=.;OPOS=77758484;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:59:57:0:0:57:57:27:30:0:0:27:30:0:0 chr17 78013724 . G C 1378.81 PASS AO=144;DP=144;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000556461;FXX=0.0136977;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.038;QD=38.3004;RBI=0.0121821;REFB=0;REVB=0.0121694;RO=0;SAF=94;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.48344e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000145649;OID=.;OPOS=78013724;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:144:144:0:0:144:144:50:94:0:0:50:94:0:0 chr17 78022378 . C G 372.56 PASS AO=28;DP=45;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159514;FXX=0.0232504;HRUN=6;LEN=1;MLLD=236.865;QD=35.482;RBI=0.0184275;REFB=0.0085063;REVB=-0.0092263;RO=0;SAF=13;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.73458e-05;OID=.;OPOS=78022378;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:28:42:0:0:28:42:15:13:0:0:16:26:0:0 chr17 78071052 . T C 151.9 PASS AO=33;DP=64;FAO=33;FDP=64;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.0302166;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.2833;QD=9.49394;RBI=0.0305085;REFB=-0.0383398;REVB=-0.00420993;RO=31;SAF=11;SAR=22;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139413;STB=0.577729;TYPE=snp;VARB=0.026526;OID=.;OPOS=78071052;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:31:31:33:33:22:11:15:16:22:11:15:16 chr17 78073355 . A G 99.11 PASS AO=30;DP=79;FAO=30;FDP=79;FR=.;FRO=49;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=28;FSRR=21;FWDB=-0.0494728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.645;QD=5.01802;RBI=0.0936431;REFB=-0.0244339;REVB=-0.0795077;RO=49;SAF=10;SAR=20;SRF=28;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260513;STB=0.649472;TYPE=snp;VARB=0.0370363;OID=.;OPOS=78073355;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:49:49:30:30:20:10:28:21:20:10:28:21 chr17 78073562 . A G 75.98 PASS AO=12;DP=34;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0607254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.185;QD=7.79282;RBI=0.0620913;REFB=-0.0222947;REVB=-0.0129524;RO=19;SAF=6;SAR=6;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0819582;STB=0.52223;TYPE=snp;VARB=0.0172744;OID=.;OPOS=78073562;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:34:39:19:21:12:18:6:6:8:11:11:7:9:12 chr17 78078709 . T C 125.74 PASS AO=38;DP=98;FAO=38;FDP=98;FR=.;FRO=60;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=33;FSRR=27;FWDB=-0.0217297;FXX=0.0101;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.141;QD=5.13214;RBI=0.0505288;REFB=-0.0265499;REVB=-0.0456177;RO=60;SAF=15;SAR=23;SRF=33;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16762;STB=0.595419;TYPE=snp;VARB=0.0376753;OID=.;OPOS=78078709;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:60:60:38:38:23:15:33:27:23:15:33:27 chr17 78079597 . A G 37.23 PASS AO=14;DP=48;FAO=14;FDP=48;FR=.;FRO=34;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.0134163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1541;QD=3.10236;RBI=0.0186463;REFB=-0.00718095;REVB=-0.0129495;RO=31;SAF=7;SAR=7;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129853;STB=0.541608;TYPE=snp;VARB=0.0332542;OID=.;OPOS=78079597;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:48:48:31:34:14:14:7:7:12:19:7:7:15:19 chr17 78079669 . G A 47.11 PASS AO=6;DP=14;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.00710769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.084;QD=8.56608;RBI=0.0216076;REFB=-0.0213743;REVB=0.0204051;RO=8;SAF=2;SAR=4;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0912889;STB=0.555443;TYPE=snp;VARB=0.0432447;OID=.;OPOS=78079669;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:14:22:8:12:6:10:4:2:2:6:4:6:6:6 chr17 78081661 . A T 79.2 PASS AO=12;DP=17;FAO=12;FDP=17;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.00261194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.0468;QD=18.6363;RBI=0.0251184;REFB=-0.012993;REVB=0.0249822;RO=5;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214373;STB=0.618873;TYPE=snp;VARB=0.00736244;OID=.;OPOS=78081661;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:17:17:5:5:12:12:8:4:0:5:8:4:0:5 chr17 78082504 . G A 238.34 PASS AO=46;DP=81;FAO=47;FDP=82;FR=.;FRO=35;FSAF=29;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=10;FWDB=0.0140695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.001;QD=11.6265;RBI=0.0166354;REFB=-0.0275868;REVB=0.00887609;RO=35;SAF=29;SAR=17;SRF=25;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0724775;STB=0.544824;TYPE=snp;VARB=0.0156665;OID=.;OPOS=78082504;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:82:35:35:46:47:17:29:25:10:18:29:25:10 chr17 78083791 . C T 149.63 PASS AO=31;DP=58;FAO=31;FDP=58;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.0156202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.72;QD=10.3195;RBI=0.0204925;REFB=-0.020108;REVB=0.0132646;RO=27;SAF=12;SAR=19;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0178491;STB=0.509912;TYPE=snp;VARB=0.0183369;OID=.;OPOS=78083791;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:27:27:31:31:19:12:11:16:19:12:11:16 chr17 78091405 . G A 82.85 PASS AO=20;DP=54;FAO=23;FDP=57;FR=.;FRO=34;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.0116498;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.27;QD=5.81411;RBI=0.0267169;REFB=-0.043036;REVB=0.0240432;RO=34;SAF=6;SAR=14;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228982;STB=0.656998;TYPE=snp;VARB=0.0372092;OID=.;OPOS=78091405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:54:57:34:34:20:23:14:6:17:17:17:6:17:17 chr17 78092063 . G A 51.83 PASS AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0188783;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=268.252;QD=10.3667;RBI=0.0366251;REFB=-0.00229996;REVB=-0.0313849;RO=10;SAF=8;SAR=2;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.308745;STB=0.68252;TYPE=snp;VARB=0.00185981;OID=.;OPOS=78092063;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:20:20:10:10:10:10:2:8:5:5:2:8:5:5 chr17 78157995 . G A 96.35 PASS AO=19;DP=38;FAO=20;FDP=39;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=-0.00295759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.816;QD=9.88195;RBI=0.00407855;REFB=-0.00862593;REVB=0.00280842;RO=19;SAF=4;SAR=15;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127057;STB=0.579624;TYPE=snp;VARB=0.0067653;OID=.;OPOS=78157995;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:38:39:19:19:19:20:15:4:6:13:16:4:6:13 chr17 78178881 . T C 10.38 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.354;QD=5.93125;RBI=0.0373748;REFB=0.00908384;REVB=-0.0373748;RO=5;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0217187;OID=.;OPOS=78178881;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:5:5:2:2:2:0:0:5:2:0:0:5 chr17 78178893 . C T 45.01 PASS AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.2202;QD=25.7205;RBI=0.0539789;REFB=-0.0517914;REVB=0.0539789;RO=1;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0157251;OID=.;OPOS=78178893;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:7:7:1:1:6:6:6:0:0:1:6:0:0:1 chr17 78184393 . C T 459.88 PASS AO=81;DP=134;FAO=84;FDP=136;FR=.;FRO=52;FSAF=48;FSAR=36;FSRF=36;FSRR=16;FWDB=0.0364735;FXX=0.0285694;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.5384;QD=13.526;RBI=0.0430838;REFB=-0.00864791;REVB=-0.0229324;RO=50;SAF=48;SAR=33;SRF=36;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.094922;STB=0.547815;TYPE=snp;VARB=0.00683456;OID=.;OPOS=78184393;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:136:50:52:81:84:33:48:36:14:36:48:36:16 chr17 78187954 . A G 65.43 PASS AO=11;DP=27;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=-0.0613996;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.487;QD=8.72379;RBI=0.066649;REFB=-0.0313793;REVB=0.0259264;RO=15;SAF=9;SAR=2;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124955;STB=0.571338;TYPE=snp;VARB=0.057862;OID=.;OPOS=78187954;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:27:30:15:15:11:15:2:9:11:4:6:9:11:4 chr17 78215566 . T G 83.26 PASS AO=21;DP=49;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=-0.00348988;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=184.937;QD=6.79637;RBI=0.00705296;REFB=-0.00844537;REVB=-0.00612903;RO=28;SAF=5;SAR=16;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187176;STB=0.607965;TYPE=snp;VARB=0.00817897;OID=.;OPOS=78215566;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:49:49:28:28:21:21:16:5:11:17:16:5:11:17 chr17 78219065 . C A 209.68 PASS AO=42;DP=80;FAO=44;FDP=82;FR=.;FRO=38;FSAF=9;FSAR=35;FSRF=10;FSRR=28;FWDB=0.00776548;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.577;QD=10.2281;RBI=0.0211975;REFB=-0.0176254;REVB=0.0197239;RO=37;SAF=9;SAR=33;SRF=10;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0672358;STB=0.539754;TYPE=snp;VARB=0.0196903;OID=.;OPOS=78219065;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:82:37:38:42:44:33:9:10:27:35:9:10:28 chr17 78272230 . C G 247.45 PASS AO=52;DP=107;FAO=56;FDP=110;FR=.;FRO=54;FSAF=31;FSAR=25;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=0.0110864;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.073;QD=8.99832;RBI=0.025518;REFB=-0.0165068;REVB=0.022984;RO=55;SAF=30;SAR=22;SRF=26;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0972262;STB=0.544551;TYPE=snp;VARB=0.0208862;OID=.;OPOS=78272230;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:110:55:54:52:56:22:30:26:29:25:31:25:29 chr17 78293189 . A T 284.32 PASS AO=78;DP=182;FAO=78;FDP=180;FR=.;FRO=102;FSAF=35;FSAR=43;FSRF=42;FSRR=60;FWDB=-0.0231713;FXX=0.0109884;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.212;QD=6.31812;RBI=0.0278137;REFB=-0.0147179;REVB=-0.0153848;RO=100;SAF=35;SAR=43;SRF=42;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.029379;STB=0.52125;TYPE=snp;VARB=0.0246767;OID=.;OPOS=78293189;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:180:100:102:78:78:43:35:42:58:43:35:42:60 chr17 78298938 . A G 2012.19 PASS AO=208;DP=209;FAO=209;FDP=209;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=166;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.031925;FXX=0.00476168;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.6884;QD=38.5109;RBI=0.0441559;REFB=0;REVB=-0.0305047;RO=0;SAF=43;SAR=165;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.63091e-05;OID=.;OPOS=78298938;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:94:209:209:0:0:208:209:165:43:0:0:166:43:0:0 chr17 78302157 . C A 457.83 PASS AO=95;DP=224;FAO=118;FDP=245;FR=.;FRO=127;FSAF=59;FSAR=59;FSRF=64;FSRR=63;FWDB=0.040461;FXX=0.0120963;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.972;QD=7.47482;RBI=0.040817;REFB=-0.0174642;REVB=-0.00537927;RO=124;SAF=43;SAR=52;SRF=63;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0565389;STB=0.50204;TYPE=snp;VARB=0.0208662;OID=.;OPOS=78302157;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:224:245:124:127:95:118:52:43:63:61:59:59:64:63 chr17 78306280 . A G 88.32 PASS AO=19;DP=52;FAO=24;FDP=59;FR=.;FRO=35;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=0.0205367;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1135;QD=5.98771;RBI=0.021911;REFB=-0.0258377;REVB=-0.00763795;RO=29;SAF=4;SAR=15;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140499;STB=0.57297;TYPE=snp;VARB=0.035693;OID=.;OPOS=78306280;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:52:59:29:35:19:24:15:4:9:20:17:7:14:21 chr17 78311508 . G A 32.78 PASS AO=15;DP=58;FAO=15;FDP=58;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=36;FWDB=0.0118755;FXX=0.0645057;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.582;QD=2.26082;RBI=0.0122832;REFB=-0.0116383;REVB=-0.00313824;RO=42;SAF=10;SAR=5;SRF=6;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.580912;STB=0.827964;TYPE=snp;VARB=0.00640053;OID=.;OPOS=78311508;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:58:58:42:43:15:15:5:10:6:36:5:10:7:36 chr17 78313735 . GC G 153.81 PASS AO=30;DP=42;FAO=36;FDP=41;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=31;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.390933;FXX=0.0238039;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.8779;QD=15.0053;RBI=0.397707;REFB=-0.0926346;REVB=-0.0730919;RO=10;SAF=3;SAR=27;SRF=3;SRR=7;SSEN=0.247283;SSEP=0;SSSB=-0.206463;STB=0.560687;TYPE=del;VARB=0.06035;OID=.;OPOS=78313736;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:30:42:36:41:5:5:31:2:3:3:10:3:27:3:7 chr17 78318568 . GC G 1226.5 PASS AO=163;DP=208;FAO=204;FDP=204;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=117;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.36571;FXX=0.00970827;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.9962;QD=24.049;RBI=0.379963;REFB=0;REVB=0.10309;RO=41;SAF=54;SAR=109;SRF=37;SRR=4;SSEN=0.286966;SSEP=0;SSSB=-0.224023;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00912648;OID=.;OPOS=78318569;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:163:206:204:204:0:87:117:0:0:99:41:54:109:37:4 chr17 78319114 . A G 94.5 PASS AO=22;DP=46;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.00659429;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.242;QD=8.04283;RBI=0.012409;REFB=-0.0290232;REVB=-0.0105119;RO=24;SAF=13;SAR=9;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0851252;STB=0.559632;TYPE=snp;VARB=0.0718494;OID=.;OPOS=78319114;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:46:47:24:25:22:22:9:13:12:12:9:13:12:13 chr17 78319115 . A G 112.18 PASS AO=24;DP=46;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.0530908;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.944;QD=9.54691;RBI=0.0559697;REFB=0.0144869;REVB=0.0177195;RO=22;SAF=12;SAR=12;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0776856;STB=0.531888;TYPE=snp;VARB=-0.0033014;OID=.;OPOS=78319115;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:47:22:23:24:24:12:12:13:9:12:12:13:10 chr17 78321157 . T C 36.79 PASS AO=11;DP=33;FAO=11;FDP=33;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.037913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.114;QD=4.459;RBI=0.0415138;REFB=-0.00398147;REVB=-0.0169116;RO=21;SAF=7;SAR=4;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0202481;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00809967;OID=.;OPOS=78321157;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:33:33:21:22:11:11:4:7:13:8:4:7:14:8 chr17 78354661 . C T 123.13 PASS AO=33;DP=75;FAO=33;FDP=75;FR=.;FRO=42;FSAF=24;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=0.00293243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.633;QD=6.5669;RBI=0.0525341;REFB=-0.0156422;REVB=-0.0524522;RO=42;SAF=24;SAR=9;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223814;STB=0.626946;TYPE=snp;VARB=0.0214676;OID=.;OPOS=78354661;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:42:42:33:33:9:24:22:20:9:24:22:20 chr17 78401588 . G T 33.62 PASS AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=12;FWDB=0.077482;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.6717;QD=6.40461;RBI=0.0871038;REFB=-0.0276036;REVB=-0.0397945;RO=12;SAF=2;SAR=6;SRF=1;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.264459;STB=0.666347;TYPE=snp;VARB=0.043809;OID=.;OPOS=78401588;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:20:21:12:13:8:8:6:2:1:11:6:2:1:12 chr17 78411073 . C T 136.33 PASS AO=28;DP=54;FAO=31;FDP=60;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.0356546;FXX=0.0322529;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.291;QD=9.08862;RBI=0.0427426;REFB=-0.0173405;REVB=-0.0235728;RO=25;SAF=14;SAR=14;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0169289;STB=0.501628;TYPE=snp;VARB=0.0106155;OID=.;OPOS=78411073;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:60:25:29:28:31:14:14:13:12:14:17:16:13 chr17 78444658 . T G 270.84 PASS AO=27;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00612772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.6878;QD=37.3577;RBI=0.0148517;REFB=0;REVB=-0.0135286;RO=0;SAF=19;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.06954e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000288994;OID=.;OPOS=78444658;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:29:29:0:0:27:29:8:19:0:0:8:21:0:0 chr17 78445702 . A G 759.83 PASS AO=77;DP=77;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0066992;FXX=0.0121936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.693;QD=37.5223;RBI=0.0202342;REFB=0;REVB=-0.019093;RO=0;SAF=31;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.64555e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.40777e-05;OID=.;OPOS=78445702;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:77:81:0:0:77:81:46:31:0:0:50:31:0:0 chr17 78820329 . C T 155.02 PASS AO=36;DP=74;FAO=36;FDP=74;FR=.;FRO=38;FSAF=10;FSAR=26;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.0330298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.414;QD=8.37949;RBI=0.0330447;REFB=-0.00551256;REVB=-0.000990911;RO=38;SAF=10;SAR=26;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.248397;STB=0.639263;TYPE=snp;VARB=0.00410802;OID=.;OPOS=78820329;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:38:38:36:36:26:10:20:18:26:10:20:18 chr17 78854223 . A G 417.08 PASS AO=47;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0230696;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.5218;QD=35.4959;RBI=0.0232139;REFB=-0.0348997;REVB=0.00258473;RO=0;SAF=18;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.514279;TYPE=snp;VARB=0.00484742;OID=.;OPOS=78854223;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:47:47:0:1:47:46:29:18:0:0:29:17:1:0 chr17 78919558 . C T 1566.65 PASS AO=164;DP=164;FAO=164;FDP=164;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=121;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0286055;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.178;QD=38.2111;RBI=0.0725435;REFB=0;REVB=0.0666655;RO=0;SAF=43;SAR=121;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.05767e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000138561;OID=.;OPOS=78919558;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:164:164:0:0:164:164:121:43:0:0:121:43:0:0 chr17 78935197 . C T 423.66 PASS AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0256045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.636;QD=37.6584;RBI=0.0287253;REFB=0;REVB=0.0130213;RO=0;SAF=25;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.09779e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000294937;OID=.;OPOS=78935197;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:45:45:0:0:45:45:20:25:0:0:20:25:0:0 chr17 78978654 . A G 96.34 PASS AO=30;DP=82;FAO=30;FDP=81;FR=.;FRO=51;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=7;FSRR=44;FWDB=-0.00379239;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.366;QD=4.75731;RBI=0.00389095;REFB=-0.0175016;REVB=-0.000870225;RO=50;SAF=10;SAR=20;SRF=7;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.266299;STB=0.652977;TYPE=snp;VARB=0.0254048;OID=.;OPOS=78978654;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:82:81:50:51:30:30:20:10:7:43:20:10:7:44 chr17 79009061 . C T 31.68 PASS AO=6;DP=15;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=0.0187632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.766;QD=7.91971;RBI=0.0645216;REFB=-0.0244902;REVB=0.0617331;RO=8;SAF=1;SAR=5;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.613938;STB=0.88425;TYPE=snp;VARB=0.0137041;OID=.;OPOS=79009061;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:15:16:8:9:6:7:5:1:7:1:6:1:8:1 chr17 79059332 . GCC GC,GGC,GCG 324.25 PASS AO=16,6,9;DP=52;FAO=34,5,16;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=31,5,0;FSAR=3,0,16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.131392,0.0612426,-0.0761668;FXX=0.017854;HRUN=4,4,4;LEN=1,1,1;MLLD=9.46132,6.89616,147.58;QD=23.5821;RBI=0.403817,0.162469,0.0842443;REFB=-0.462954,-0.462954,-0.654793;REVB=-0.381844,-0.150484,-0.035996;RO=1;SAF=16,6,0;SAR=0,0,9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0.341463,0,0;SSEP=0.509542,0,0;SSSB=0,0,-0.81244;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=del,snp,snp;VARB=-0.10088,-0.0186134,0.0487212;OID=.,.,.;OPOS=79059333,79059333,79059334;OREF=C,C,C;OALT=-,G,G;OMAPALT=GC,GGC,GCG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/3:16,6,9:40:34,5,16:55:0:31,5,0:3,0,16:0:0:40:1:16,6,0:0,0,9:1:0 chr17 79091103 . G T 265.75 PASS AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.147;QD=37.9648;RBI=0.0108589;REFB=0;REVB=-0.0034099;RO=0;SAF=6;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.20763e-05;OID=.;OPOS=79091103;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:27:28:0:0:27:28:21:6:0:0:22:6:0:0 chr17 79095144 . G A 274.28 PASS AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0316207;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.642;QD=34.2852;RBI=0.0674015;REFB=0.00691247;REVB=0.0595239;RO=1;SAF=13;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0252169;STB=0.513505;TYPE=snp;VARB=0.000788116;OID=.;OPOS=79095144;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:32:32:1:1:31:31:18:13:0:1:18:13:0:1 chr17 79102330 . T C 107.55 PASS AO=27;DP=65;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=27;FWDB=-0.00481138;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.071;QD=6.61856;RBI=0.0164291;REFB=-0.0175461;REVB=-0.0157088;RO=37;SAF=12;SAR=15;SRF=10;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184869;STB=0.630682;TYPE=snp;VARB=0.012807;OID=.;OPOS=79102330;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:37:37:27:28:15:12:10:27:14:14:10:27 chr17 79140505 . C G 128.74 PASS AO=13;DP=51;FAO=18;FDP=45;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=17;FSAR=1;FSRF=15;FSRR=5;FWDB=0.0165142;FXX=0.13459;HRUN=7;LEN=1;MLLD=123.449;QD=11.4439;RBI=0.0466335;REFB=0.00390751;REVB=0.0436116;RO=24;SAF=12;SAR=1;SRF=18;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.380191;STB=0.760799;TYPE=snp;VARB=0.0102511;OID=.;OPOS=79140505;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:51:45:24:20:13:18:1:12:18:6:1:17:15:5 chr17 79152798 . G A 100.73 PASS AO=26;DP=61;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=5;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.0312144;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.533;QD=6.60547;RBI=0.0328728;REFB=-0.0173065;REVB=0.0103094;RO=34;SAF=5;SAR=21;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.335903;STB=0.703022;TYPE=snp;VARB=0.0158645;OID=.;OPOS=79152798;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:34:35:26:26:21:5:16:18:21:5:17:18 chr17 79163649 . G A 147.97 PASS AO=34;DP=82;FAO=40;FDP=89;FR=.;FRO=49;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=31;FWDB=0.0383105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.5857;QD=6.6505;RBI=0.0411677;REFB=-0.0131431;REVB=0.0150693;RO=46;SAF=19;SAR=15;SRF=17;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190722;STB=0.599506;TYPE=snp;VARB=0.0289051;OID=.;OPOS=79163649;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:89:46:49:34:40:15:19:17:29:18:22:18:31 chr17 79164488 . C T 112.7 PASS AO=23;DP=43;FAO=23;FDP=43;FR=.;FRO=20;FSAF=21;FSAR=2;FSRF=16;FSRR=4;FWDB=0.0783728;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.1444;QD=10.4837;RBI=0.0862798;REFB=-0.0130759;REVB=0.0360819;RO=20;SAF=21;SAR=2;SRF=16;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.227701;STB=0.629865;TYPE=snp;VARB=0.0103246;OID=.;OPOS=79164488;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:43:43:20:20:23:23:2:21:16:4:2:21:16:4 chr17 79170576 . C T 14.31 PASS AO=5;DP=22;FAO=5;FDP=22;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.0298181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.5062;QD=2.60179;RBI=0.0575576;REFB=-0.026135;REVB=-0.0492316;RO=17;SAF=4;SAR=1;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.443561;STB=0.798801;TYPE=snp;VARB=0.0612222;OID=.;OPOS=79170576;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:22:22:17:17:5:5:1:4:7:10:1:4:7:10 chr17 79171967 . A G 231.5 PASS AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0238066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.799;QD=37.0404;RBI=0.0468175;REFB=0;REVB=0.0403128;RO=0;SAF=16;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000527052;OID=.;OPOS=79171967;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:25:25:0:0:25:25:9:16:0:0:9:16:0:0 chr17 79173184 . T C 195.15 PASS AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00537473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.5419;QD=37.1712;RBI=0.0180501;REFB=0;REVB=0.0172313;RO=0;SAF=15;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000450306;OID=.;OPOS=79173184;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:21:21:0:0:21:21:6:15:0:0:6:15:0:0 chr17 79173224 . T C 203.96 PASS AO=22;DP=24;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.016996;FXX=0.0832986;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.5028;QD=37.0844;RBI=0.0176272;REFB=0;REVB=0.00467489;RO=0;SAF=14;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00129166;OID=.;OPOS=79173224;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:24:22:0:0:22:22:8:14:0:0:8:14:0:0 chr17 79174221 . T C 447.31 PASS AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00582497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.798;QD=38.0688;RBI=0.0115125;REFB=0;REVB=0.00993007;RO=0;SAF=16;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.39445e-05;OID=.;OPOS=79174221;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:47:47:0:0:47:47:31:16:0:0:31:16:0:0 chr17 79182778 . T C 88.04 PASS AO=21;DP=46;FAO=21;FDP=46;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=-0.0680909;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2573;QD=7.65562;RBI=0.0692049;REFB=0.0278288;REVB=-0.0123673;RO=24;SAF=10;SAR=11;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0959819;STB=0.563615;TYPE=snp;VARB=-0.0387285;OID=.;OPOS=79182778;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:46:46:24:25:21:21:11:10:9:15:11:10:9:16 chr17 79202955 . CT C,CC 176.6 PASS AO=5,12;DP=18;FAO=7,12;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0;FSAR=7,12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0,0;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=207.91,210.182;QD=37.1779;RBI=0.00131727,0.00348509;REFB=0,0;REVB=0.00131727,0.00348509;RO=0;SAF=0,0;SAR=5,12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0240196,-0.0060389;OID=.,.;OPOS=79202956,79202956;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:5,12:18:7,12:19:0:0,0:7,12:0:0:26:0:0,0:5,12:0:0 chr17 79219500 . AATG A 105.27 PASS AO=30;DP=74;FAO=35;FDP=70;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.00377154;FXX=0.0140825;HRUN=2;LEN=3;MLLD=251.28;QD=6.01554;RBI=0.00386424;REFB=-0.0106965;REVB=-0.000841318;RO=17;SAF=12;SAR=18;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0740099;STB=0.572213;TYPE=del;VARB=0.00925019;OID=.;OPOS=79219501;OREF=ATG;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:30:60:35:70:35:14:21:19:16:99:17:12:18:5:12 chr17 79220224 . G C 74.8 PASS AO=10;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.,HEALED;FRO=15;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=-0.0157332;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1802;QD=9.97335;RBI=0.247145;REFB=-0.0330748;REVB=0.246644;RO=14;SAF=7;SAR=3;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.396837;STB=0.601681;TYPE=snp;VARB=0.0448912;OID=.;OPOS=79220224;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:30:30:14:15:10:15:3:7:4:10:8:7:4:11 chr17 79414307 . A G 18.62 PASS AO=4;DP=12;FAO=4;FDP=12;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0.133943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.116;QD=6.20777;RBI=0.135028;REFB=-0.00964243;REVB=0.0170873;RO=8;SAF=2;SAR=2;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.567148;STB=0.832399;TYPE=snp;VARB=0.00515473;OID=.;OPOS=79414307;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:12:12:8:8:4:4:2:2:0:8:2:2:0:8 chr17 79424516 . A G 78.12 PASS AO=14;DP=22;FAO=14;FDP=22;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.0351409;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.8748;QD=14.2031;RBI=0.0415448;REFB=-0.000331826;REVB=0.0221605;RO=8;SAF=8;SAR=6;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0355542;STB=0.519972;TYPE=snp;VARB=0.0188548;OID=.;OPOS=79424516;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:22:22:8:8:14:14:6:8:5:3:6:8:5:3 chr17 79428601 . C T 92.97 PASS AO=17;DP=30;FAO=17;FDP=30;FR=.;FRO=13;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.00308669;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.816;QD=12.3954;RBI=0.00664986;REFB=-0.0247805;REVB=-0.00589007;RO=12;SAF=11;SAR=6;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159068;STB=0.514876;TYPE=snp;VARB=0.0202749;OID=.;OPOS=79428601;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:30:30:12:13:17:17:6:11:8:4:6:11:8:5 chr17 79478019 . G A 840.7 PASS AO=91;DP=94;FAO=92;FDP=94;FR=.;FRO=2;FSAF=48;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00975562;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=159.429;QD=35.7745;RBI=0.0277259;REFB=-0.168567;REVB=0.0259529;RO=3;SAF=48;SAR=43;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0319233;STB=0.511109;TYPE=snp;VARB=0.000660428;OID=.;OPOS=79478019;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:94:94:3:2:91:92:43:48:0:3:44:48:0:2 chr17 79507170 . T C 49.53 PASS AO=5;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0375305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.819;QD=33.022;RBI=0.0631739;REFB=0;REVB=0.0508173;RO=0;SAF=3;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000205828;OID=.;OPOS=79507170;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:5:6:2:3:0:0:2:4:0:0 chr17 79507272 . G A 54.12 PASS AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.00616418;FXX=0.11107;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.0232;QD=9.02054;RBI=0.136019;REFB=-0.0237067;REVB=0.135879;RO=8;SAF=2;SAR=9;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200183;STB=0.5998;TYPE=snp;VARB=0.0273817;OID=.;OPOS=79507272;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:24:24:8:13:11:11:9:2:3:5:9:2:4:9 chr17 79508400 . T C 296.43 PASS AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00976382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.214;QD=37.0531;RBI=0.0153237;REFB=0;REVB=0.0118103;RO=0;SAF=19;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.17118e-05;OID=.;OPOS=79508400;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:32:32:0:0:32:32:13:19:0:0:13:19:0:0 chr17 79511135 . A G 45.08 PASS AO=10;DP=30;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.0108974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.375;QD=5.63453;RBI=0.0348302;REFB=-0.00535559;REVB=-0.0330816;RO=20;SAF=9;SAR=1;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.573767;STB=0.867694;TYPE=snp;VARB=0.00569653;OID=.;OPOS=79511135;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:30:32:20:20:10:12:1:9:9:11:1:11:9:11 chr17 79514129 . G A 12.4 PASS AO=3;DP=12;FAO=3;FDP=13;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=10;FSRR=0;FWDB=-0.047477;FXX=0.0713776;HRUN=4;LEN=1;MLLD=57.5615;QD=3.81427;RBI=0.0881301;REFB=-0.0234606;REVB=0.0742486;RO=9;SAF=2;SAR=1;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.587597;STB=0.856181;TYPE=snp;VARB=0.033234;OID=.;OPOS=79514129;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:12:13:9:10:3:3:1:2:9:0:1:2:10:0 chr17 79514832 . G A 71.21 PASS AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=0.00371119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.669;QD=8.37707;RBI=0.0686769;REFB=-0.0183047;REVB=0.0685766;RO=18;SAF=3;SAR=13;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.474126;STB=0.773445;TYPE=snp;VARB=0.0540209;OID=.;OPOS=79514832;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:34:34:18:18:16:16:13:3:12:6:13:3:12:6 chr17 79518110 . T C 269.89 PASS AO=55;DP=123;FAO=64;FDP=131;FR=.;FRO=67;FSAF=38;FSAR=26;FSRF=27;FSRR=40;FWDB=-0.00471226;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.369;QD=8.24093;RBI=0.0149387;REFB=-0.0503416;REVB=-0.014176;RO=65;SAF=32;SAR=23;SRF=25;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190428;STB=0.597397;TYPE=snp;VARB=0.0263602;OID=.;OPOS=79518110;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:131:65:67:55:64:23:32:25:40:26:38:27:40 chr17 79525118 . T G 46.83 PASS AO=12;DP=30;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=-0.0867853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.231;QD=6.04251;RBI=0.087982;REFB=-0.0269364;REVB=0.014462;RO=17;SAF=1;SAR=11;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.321757;STB=0.724795;TYPE=snp;VARB=0.0253884;OID=.;OPOS=79525118;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:30:31:17:19:12:12:11:1:4:13:11:1:5:14 chr17 79540598 . T C 155.67 PASS AO=46;DP=124;FAO=61;FDP=150;FR=.;FRO=89;FSAF=25;FSAR=36;FSRF=32;FSRR=57;FWDB=-0.0795671;FXX=0.00662208;HRUN=3;LEN=1;MLLD=25.5298;QD=4.15126;RBI=0.0942209;REFB=-0.0601555;REVB=-0.0504645;RO=77;SAF=10;SAR=36;SRF=23;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120134;STB=0.531176;TYPE=snp;VARB=0.116483;OID=.;OPOS=79540598;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:150:77:89:46:61:36:10:23:54:36:25:32:57 chr17 79589242 . G A 610.25 PASS AO=162;DP=356;FAO=162;FDP=357;FR=.;FRO=195;FSAF=64;FSAR=98;FSRF=77;FSRR=118;FWDB=-0.00272045;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=255.502;QD=6.83749;RBI=0.0135776;REFB=-0.00492528;REVB=0.0133023;RO=192;SAF=64;SAR=98;SRF=74;SRR=118;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00993502;STB=0.500109;TYPE=snp;VARB=0.00572118;OID=.;OPOS=79589242;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:356:357:192:195:162:162:98:64:74:118:98:64:77:118 chr17 79596811 . C T 305.85 PASS AO=83;DP=194;FAO=83;FDP=189;FR=.;FRO=106;FSAF=40;FSAR=43;FSRF=49;FSRR=57;FWDB=0.00799907;FXX=0.0257719;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.72;QD=6.47299;RBI=0.0080793;REFB=-0.00592716;REVB=0.00113578;RO=102;SAF=40;SAR=43;SRF=46;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.030797;STB=0.511049;TYPE=snp;VARB=0.00628468;OID=.;OPOS=79596811;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:189:102:106:83:83:43:40:46:56:43:40:49:57 chr17 79609410 . G T 125.75 PASS AO=21;DP=34;FAO=22;FDP=35;FR=.;FRO=13;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=12;FWDB=0.0436525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.862;QD=14.3718;RBI=0.0620131;REFB=0.00974815;REVB=0.0440463;RO=13;SAF=15;SAR=6;SRF=1;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.429128;STB=0.738248;TYPE=snp;VARB=-0.00482007;OID=.;OPOS=79609410;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:34:35:13:13:21:22:6:15:1:12:6:16:1:12 chr17 79612161 . C T 122.98 PASS AO=33;DP=78;FAO=33;FDP=78;FR=.;FRO=45;FSAF=25;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=30;FWDB=-0.000583936;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=211.816;QD=6.30672;RBI=0.0385666;REFB=-0.00962759;REVB=0.0385622;RO=45;SAF=25;SAR=8;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.437604;STB=0.747879;TYPE=snp;VARB=0.00831193;OID=.;OPOS=79612161;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:45:45:33:33:8:25:15:30:8:25:15:30 chr17 79612333 . G A 16.19 PASS AO=3;DP=10;FAO=4;FDP=14;FR=.,HEALED;FRO=10;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=-0.0177572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.586;QD=4.62452;RBI=0.0237037;REFB=0.00483213;REVB=0.0157018;RO=5;SAF=0;SAR=3;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.698233;STB=0.842368;TYPE=snp;VARB=-0.0436266;OID=.;OPOS=79612333;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:13:14:5:10:3:4:3:0:3:2:3:1:8:2 chr17 79612382 . T C 13.56 PASS AO=4;DP=22;FAO=5;FDP=23;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=14;FSRR=4;FWDB=-0.0872829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.311;QD=2.35874;RBI=0.0892007;REFB=0.0046138;REVB=-0.0183975;RO=18;SAF=4;SAR=0;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.580913;STB=0.526207;TYPE=snp;VARB=-0.026709;OID=.;OPOS=79612382;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:22:23:18:18:4:5:0:4:14:4:1:4:14:4 chr17 79612397 . A G 246.21 PASS AO=25;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00205629;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.591;QD=37.8791;RBI=0.0109039;REFB=0;REVB=0.0107083;RO=0;SAF=20;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00133722;OID=.;OPOS=79612397;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:26:26:0:0:25:26:5:20:0:0:6:20:0:0 chr17 79612413 . T C 28.42 PASS AO=10;DP=35;FAO=10;FDP=35;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=5;FWDB=-0.0295135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.89;QD=3.24829;RBI=0.0322978;REFB=-0.0117956;REVB=0.0131186;RO=24;SAF=5;SAR=5;SRF=19;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.345007;STB=0.713936;TYPE=snp;VARB=0.0275165;OID=.;OPOS=79612413;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:35:35:24:25:10:10:5:5:19:5:5:5:20:5 chr17 79612443 . T C 104.02 PASS AO=13;DP=42;FAO=18;FDP=39;FR=.,HEALED;FRO=16;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.00757253;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.269;QD=10.6689;RBI=0.00813177;REFB=-0.0224225;REVB=0.00296352;RO=14;SAF=6;SAR=7;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225385;STB=0.666481;TYPE=snp;VARB=0.0164244;OID=.;OPOS=79612443;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:36:39:14:16:13:18:7:6:10:4:12:6:11:5 chr17 79614481 . A G 88.32 PASS AO=15;DP=27;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=0.0114572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.409;QD=11.3967;RBI=0.0301564;REFB=-0.0177316;REVB=-0.0278951;RO=11;SAF=11;SAR=4;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.466435;STB=0.752593;TYPE=snp;VARB=0.0105445;OID=.;OPOS=79614481;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:27:31:11:14:15:17:4:11:1:10:4:13:3:11 chr17 79614932 . TTAAC T 264.26 PASS AO=30;DP=34;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000863542;FXX=0.0294031;HRUN=3;LEN=4;MLLD=265.99;QD=32.031;RBI=0.0437307;REFB=0;REVB=-0.0437222;RO=0;SAF=6;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.000307527;OID=.;OPOS=79614933;OREF=TAAC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:30:32:33:33:0:6:27:0:0:23:0:6:24:0:0 chr17 79637349 . T C 1503.3 PASS AO=161;DP=162;FAO=161;FDP=161;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0417587;FXX=0.0122692;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.291;QD=37.3491;RBI=0.0418084;REFB=0.00787303;REVB=0.00203771;RO=0;SAF=46;SAR=115;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.98992e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.09269e-05;OID=.;OPOS=79637349;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:162:161:0:0:161:161:115:46:0:0:115:46:0:0 chr17 79657194 . A G 34.55 PASS AO=14;DP=51;FAO=14;FDP=51;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=35;FSRR=2;FWDB=-0.0451826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.8665;QD=2.71001;RBI=0.0651565;REFB=0.0108579;REVB=0.0469458;RO=36;SAF=10;SAR=4;SRF=34;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.432155;STB=0.749779;TYPE=snp;VARB=-0.028973;OID=.;OPOS=79657194;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:51:51:36:37:14:14:4:10:34:2:4:10:35:2 chr17 79671332 . T C 112.11 PASS AO=29;DP=68;FAO=29;FDP=67;FR=.;FRO=38;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=-0.104846;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.5382;QD=6.69289;RBI=0.104898;REFB=-0.0149723;REVB=0.00330808;RO=38;SAF=8;SAR=21;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.317017;STB=0.680216;TYPE=snp;VARB=0.0253715;OID=.;OPOS=79671332;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:67:38:38:29:29:21:8:22:16:21:8:22:16 chr17 79784105 . A G 95.18 PASS AO=18;DP=32;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.031823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.6777;QD=11.8974;RBI=0.031871;REFB=-0.0266141;REVB=0.0017481;RO=14;SAF=4;SAR=14;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200963;STB=0.613897;TYPE=snp;VARB=0.0316408;OID=.;OPOS=79784105;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:32:32:14:14:18:18:14:4:6:8:14:4:6:8 chr17 79803101 . A G 285.32 PASS AO=51;DP=82;FAO=51;FDP=81;FR=.;FRO=30;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=9;FSRR=21;FWDB=0.0173217;FXX=0.0121936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.5465;QD=14.0897;RBI=0.0249247;REFB=0.0115207;REVB=-0.017922;RO=31;SAF=20;SAR=31;SRF=9;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.075621;STB=0.536345;TYPE=snp;VARB=-0.00452519;OID=.;OPOS=79803101;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:82:81:31:30:51:51:31:20:9:22:31:20:9:21 chr17 79805134 . G A 60.58 PASS AO=19;DP=51;FAO=18;FDP=50;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=0.0037615;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.273;QD=4.84646;RBI=0.0146835;REFB=-0.0137914;REVB=0.0141935;RO=32;SAF=12;SAR=7;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111933;STB=0.552452;TYPE=snp;VARB=0.0546494;OID=.;OPOS=79805134;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:51:50:32:32:19:18:7:12:17:15:7:11:17:15 chr17 79825897 . A G 240.97 PASS AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0027332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.413;QD=37.0722;RBI=0.072269;REFB=0;REVB=0.0722173;RO=0;SAF=24;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.21284e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000269366;OID=.;OPOS=79825897;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:26:26:0:0:26:26:2:24:0:0:2:24:0:0 chr17 79872241 . A G 201.65 PASS AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02865;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=218.21;QD=36.6633;RBI=0.0330658;REFB=0;REVB=0.0165084;RO=0;SAF=7;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.79751e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000175596;OID=.;OPOS=79872241;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:22:22:0:0:22:22:15:7:0:0:15:7:0:0 chr17 79891147 . T C 664.14 PASS AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00919691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.53;QD=38.501;RBI=0.0130852;REFB=0;REVB=0.00930799;RO=0;SAF=35;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.66702e-05;OID=.;OPOS=79891147;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:69:69:0:0:69:69:34:35:0:0:34:35:0:0 chr17 79899272 . A G 296.3 PASS AO=24;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=23;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.10883;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=34.5864;QD=37.037;RBI=0.133391;REFB=0;REVB=0.0771316;RO=0;SAF=18;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00628199;OID=.;OPOS=79899272;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:32:32:0:0:24:32:6:18:0:0:9:23:0:0 chr17 79899283 . C T 65.51 PASS AO=16;DP=37;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=14;FSAR=2;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=0.00201781;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.61;QD=7.08187;RBI=0.0136138;REFB=-0.0106088;REVB=-0.0134635;RO=21;SAF=14;SAR=2;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.324615;STB=0.692019;TYPE=snp;VARB=0.0136233;OID=.;OPOS=79899283;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:37:37:21:21:16:16:2:14:14:7:2:14:14:7 chr17 79899495 . G A 378.17 PASS AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0291059;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=210.65;QD=35.1784;RBI=0.0298619;REFB=0.0535802;REVB=0.00667685;RO=1;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218287;STB=0.511622;TYPE=snp;VARB=-0.000134416;OID=.;OPOS=79899495;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:43:43:1:1:42:42:21:21:0:1:21:21:0:1 chr17 79899698 . G A 201.65 PASS AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00217594;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.39;QD=36.6635;RBI=0.0491951;REFB=0;REVB=0.0491469;RO=0;SAF=5;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.58081e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000578656;OID=.;OPOS=79899698;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:22:22:0:0:22:22:17:5:0:0:17:5:0:0 chr17 79954544 . T A 696.65 PASS AO=49;DP=70;FAO=72;FDP=76;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=15;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00522249;FXX=0.0379699;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.9228;QD=36.6659;RBI=0.0228426;REFB=0;REVB=0.0222376;RO=0;SAF=10;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000169359;OID=.;OPOS=79954544;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:70:76:0:0:49:72:39:10:0:0:57:15:0:0 chr17 79954545 . G A 10.77 PASS AO=12;DP=79;FAO=12;FDP=78;FR=.;FRO=66;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=52;FWDB=0.0107431;FXX=0.0126566;HRUN=6;LEN=1;MLLD=85.9928;QD=0.55211;RBI=0.011058;REFB=-0.00764351;REVB=0.00261999;RO=65;SAF=6;SAR=6;SRF=14;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.376562;STB=0.74328;TYPE=snp;VARB=0.205765;OID=.;OPOS=79954545;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:79:78:65:66:12:12:6:6:14:51:6:6:14:52 chr17 79974731 . T C 192.66 PASS AO=19;DP=19;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0353912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.015;QD=38.5312;RBI=0.0548528;REFB=0;REVB=0.0419081;RO=0;SAF=4;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.00629e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00122073;OID=.;OPOS=79974731;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:19:20:0:0:19:20:15:4:0:0:15:5:0:0 chr17 79976582 . G A 235.97 PASS AO=64;DP=147;FAO=64;FDP=147;FR=.;FRO=83;FSAF=38;FSAR=26;FSRF=48;FSRR=35;FWDB=0.0540661;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.4392;QD=6.42088;RBI=0.129887;REFB=0.0234307;REVB=0.118099;RO=80;SAF=38;SAR=26;SRF=47;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00644542;STB=0.509;TYPE=snp;VARB=-0.0280026;OID=.;OPOS=79976582;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:147:80:83:64:64:26:38:47:33:26:38:48:35 chr17 80006957 . A C 306.1 PASS AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0430798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.1582;QD=37.1026;RBI=0.0496944;REFB=0;REVB=-0.0247722;RO=0;SAF=24;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000392615;OID=.;OPOS=80006957;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:33:33:0:0:33:33:9:24:0:0:9:24:0:0 chr17 80007887 . A G 1067.7 PASS AO=114;DP=116;FAO=115;FDP=117;FR=.;FRO=2;FSAF=54;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0389492;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.2687;QD=36.5025;RBI=0.0504293;REFB=-0.101345;REVB=0.0320324;RO=2;SAF=53;SAR=61;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0153126;STB=0.508063;TYPE=snp;VARB=0.00476976;OID=.;OPOS=80007887;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:116:117:2:2:114:115:61:53:0:2:61:54:0:2 chr17 80008392 . G T 855.69 PASS AO=79;DP=81;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.118013;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.151;QD=38.0304;RBI=0.120706;REFB=0;REVB=-0.0253566;RO=2;SAF=26;SAR=53;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0350236;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00113813;OID=.;OPOS=80008392;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:81:90:2:0:79:90:53:26:2:0:59:31:0:0 chr17 80012970 . TG T 28.9 PASS AO=18;DP=52;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=0.0825463;FXX=0.0384541;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.5004;QD=2.31202;RBI=0.176268;REFB=-0.0726688;REVB=-0.155745;RO=24;SAF=5;SAR=13;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.386449;STB=0.687294;TYPE=del;VARB=0.0765535;OID=.;OPOS=80012971;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:18:52:19:50:31:5:14:17:14:28:24:5:13:16:8 chr17 80013235 . A G 555.77 PASS AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00470084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.87;QD=38.3288;RBI=0.0113046;REFB=0;REVB=-0.0102809;RO=0;SAF=23;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.42361e-05;OID=.;OPOS=80013235;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:58:58:0:0:58:58:35:23:0:0:35:23:0:0 chr17 80039481 . G A 368.46 PASS AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0497756;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.6925;QD=35.0917;RBI=0.087632;REFB=0.0847836;REVB=0.0721232;RO=0;SAF=16;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.1719e-08;STB=0.509799;TYPE=snp;VARB=-0.00936713;OID=.;OPOS=80039481;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:42:42:0:1:41:41:25:16:0:0:25:16:0:1 chr17 80041466 . G A 39.24 PASS AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=-0.00161812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.9338;QD=6.03768;RBI=0.0752135;REFB=-0.00631934;REVB=0.0751961;RO=16;SAF=9;SAR=1;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.293452;STB=0.681372;TYPE=snp;VARB=0.0249243;OID=.;OPOS=80041466;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:26:26:16:16:10:10:1:9:12:4:1:9:12:4 chr17 80044211 . G A 258.59 PASS AO=37;DP=48;FAO=37;FDP=48;FR=.;FRO=11;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0485412;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.5386;QD=21.5488;RBI=0.0688923;REFB=-0.0372963;REVB=0.0488866;RO=11;SAF=23;SAR=14;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0340146;STB=0.518377;TYPE=snp;VARB=0.0184692;OID=.;OPOS=80044211;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:48:48:11:11:37:37:14:23:6:5:14:23:6:5 chr17 80048407 . GC G 299.33 PASS AO=36;DP=69;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.216713;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=9.71557;QD=17.8703;RBI=0.355102;REFB=0.0341519;REVB=0.281306;RO=17;SAF=28;SAR=8;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0.434783;SSSB=0.146279;STB=0.511108;TYPE=del;VARB=0.0229674;OID=.;OPOS=80048408;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:36:65:66:67:1:44:22:0:1:20:17:28:8:10:7 chr17 80051183 . A G 664.37 PASS AO=68;DP=68;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0461133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.098;QD=38.5144;RBI=0.0538822;REFB=0;REVB=-0.0278721;RO=0;SAF=31;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000196333;OID=.;OPOS=80051183;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:68:69:0:0:68:69:37:31:0:0:37:32:0:0 chr17 80059596 . T C 382.55 PASS AO=38;DP=38;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.268;QD=36.4329;RBI=0.0906314;REFB=0;REVB=0.0885919;RO=0;SAF=36;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000330224;OID=.;OPOS=80059596;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:38:42:0:0:38:42:2:36:0:0:2:40:0:0 chr17 80071244 . T C 960.96 PASS AO=95;DP=96;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0319366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.3482;QD=38.4383;RBI=0.0372158;REFB=0;REVB=-0.0191069;RO=0;SAF=51;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.2359e-05;OID=.;OPOS=80071244;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:96:100:0:0:95:100:44:51:0:0:47:53:0:0 chr17 80071450 . G A 131.42 PASS AO=33;DP=73;FAO=33;FDP=73;FR=.;FRO=40;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=25;FWDB=-0.0108189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.065;QD=7.20121;RBI=0.0108754;REFB=0.00829071;REVB=-0.00110709;RO=40;SAF=17;SAR=16;SRF=15;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136304;STB=0.576464;TYPE=snp;VARB=-0.0119178;OID=.;OPOS=80071450;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:40:40:33:33:16:17:15:25:16:17:15:25 chr17 80085633 . A G 568.24 PASS AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0120395;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.774;QD=38.5244;RBI=0.105198;REFB=0;REVB=-0.104507;RO=0;SAF=57;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.6519e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000343255;OID=.;OPOS=80085633;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:59:59:0:0:59:59:2:57:0:0:2:57:0:0 chr17 80085703 . G T 447.73 PASS AO=52;DP=56;FAO=52;FDP=56;FR=.;FRO=4;FSAF=48;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0852234;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=38.1226;QD=31.981;RBI=0.0855388;REFB=-0.214424;REVB=-0.00733906;RO=4;SAF=48;SAR=4;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0376598;STB=0.519993;TYPE=snp;VARB=0.0191046;OID=.;OPOS=80085703;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:56:56:4:4:52:52:4:48:4:0:4:48:4:0 chr17 80086386 . C T 604.61 PASS AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0303908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.668;QD=37.7879;RBI=0.0412665;REFB=0;REVB=0.0279164;RO=0;SAF=41;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000196784;OID=.;OPOS=80086386;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:64:64:0:0:64:64:23:41:0:0:23:41:0:0 chr17 80086389 . C T 627.61 PASS AO=63;DP=63;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.21;QD=38.0368;RBI=0.0552214;REFB=0;REVB=0.0539401;RO=0;SAF=43;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.00371e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000174453;OID=.;OPOS=80086389;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:63:66:0:0:63:66:20:43:0:0:23:43:0:0 chr17 80086395 . T C 734.51 PASS AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00583257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.724;QD=38.1561;RBI=0.0534465;REFB=0;REVB=0.0531273;RO=0;SAF=49;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0002071;OID=.;OPOS=80086395;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:77:77:0:0:77:77:28:49:0:0:28:49:0:0 chr17 80159566 . T C 88.08 PASS AO=19;DP=38;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=18;FWDB=-0.124426;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.9358;QD=9.27114;RBI=0.12443;REFB=-0.0240033;REVB=0.000956552;RO=19;SAF=9;SAR=10;SRF=1;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.390667;STB=0.715728;TYPE=snp;VARB=0.0206653;OID=.;OPOS=80159566;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:38:38:19:19:19:19:10:9:1:18:10:9:1:18 chr17 80159665 . G A 73.77 PASS AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=0;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=17;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.6411;QD=8.94184;RBI=0.0166791;REFB=-0.0113245;REVB=0.0166791;RO=17;SAF=0;SAR=16;SRF=0;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00809866;OID=.;OPOS=80159665;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:33:33:17:17:16:16:16:0:0:17:16:0:0:17 chr17 80195130 . GC G 115.72 PASS AO=13;DP=22;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.217592;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.6415;QD=23.143;RBI=0.382578;REFB=0;REVB=0.314674;RO=5;SAF=4;SAR=9;SRF=2;SRR=3;SSEN=0.286966;SSEP=0;SSSB=-0.0523783;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.049209;OID=.;OPOS=80195131;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:13:19:20:20:0:7:13:0:0:11:5:4:9:2:3 chr17 80195582 . T C 279.43 PASS AO=24;DP=30;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000695241;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.606;QD=38.5422;RBI=0.0261036;REFB=0;REVB=0.0260943;RO=0;SAF=15;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000148588;OID=.;OPOS=80195582;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:24:29:0:0:24:29:9:15:0:0:14:15:0:0 chr17 80280865 . G A 96.1 PASS AO=17;DP=29;FAO=17;FDP=29;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=1;FWDB=-0.0110499;FXX=0.0644953;HRUN=5;LEN=1;MLLD=111.915;QD=13.2558;RBI=0.0367298;REFB=-0.0250362;REVB=-0.0350283;RO=12;SAF=10;SAR=7;SRF=11;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.266631;STB=0.647426;TYPE=snp;VARB=0.0252891;OID=.;OPOS=80280865;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:29:29:12:12:17:17:7:10:11:1:7:10:11:1 chr17 80320561 . G A 196.2 PASS AO=49;DP=106;FAO=49;FDP=106;FR=.;FRO=57;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=7;FSRR=50;FWDB=0.0180198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.2706;QD=7.40367;RBI=0.0181479;REFB=-0.000166085;REVB=0.00215294;RO=56;SAF=20;SAR=29;SRF=6;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.323603;STB=0.668584;TYPE=snp;VARB=0.000346945;OID=.;OPOS=80320561;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:56:57:49:49:29:20:6:50:29:20:7:50 chr17 80350331 . G A 223.57 PASS AO=72;DP=192;FAO=74;FDP=197;FR=.;FRO=123;FSAF=34;FSAR=40;FSRF=72;FSRR=51;FWDB=-0.0280819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.4191;QD=4.53953;RBI=0.0375617;REFB=-0.0189572;REVB=0.0249457;RO=120;SAF=32;SAR=40;SRF=69;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143403;STB=0.578108;TYPE=snp;VARB=0.0237993;OID=.;OPOS=80350331;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:197:120:123:72:74:40:32:69:51:40:34:72:51 chr17 80373452 . C T 85.67 PASS AO=17;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=3;FWDB=0.0368158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2631;QD=10.7086;RBI=0.0368696;REFB=-0.0262847;REVB=0.00199003;RO=15;SAF=8;SAR=9;SRF=12;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.271362;STB=0.652008;TYPE=snp;VARB=0.0187344;OID=.;OPOS=80373452;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:32:32:15:15:17:17:9:8:12:3:9:8:12:3 chr17 80397644 . AG A 90.02 PASS AO=11;DP=23;FAO=18;FDP=22;FR=.;FRO=4;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.208696;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.2266;QD=16.3681;RBI=0.289122;REFB=0.159262;REVB=-0.200093;RO=5;SAF=9;SAR=2;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0.325771;SSSB=0.3999;STB=0.610987;TYPE=del;VARB=-0.0162899;OID=.;OPOS=80397645;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:11:21:18:22:4:11:7:0:4:3:5:9:2:1:4 chr17 80481088 . T C 243.34 PASS AO=60;DP=129;FAO=60;FDP=128;FR=.;FRO=68;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=24;FSRR=44;FWDB=0.0175211;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.483;QD=7.60434;RBI=0.0188974;REFB=-0.00227852;REVB=-0.00707973;RO=68;SAF=30;SAR=30;SRF=24;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141039;STB=0.5781;TYPE=snp;VARB=0.00294482;OID=.;OPOS=80481088;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:128:68:68:60:60:30:30:24:44:30:30:24:44 chr17 80585094 . C T 250.14 PASS AO=51;DP=91;FAO=51;FDP=92;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=34;FSRF=12;FSRR=29;FWDB=0.041883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.38;QD=10.8755;RBI=0.0601381;REFB=-0.0153347;REVB=-0.0431557;RO=40;SAF=16;SAR=35;SRF=12;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0128453;STB=0.520653;TYPE=snp;VARB=0.0110031;OID=.;OPOS=80585094;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:92:40:41:51:51:35:16:12:28:34:17:12:29 chr17 80614933 . T C 153.7 PASS AO=45;DP=112;FAO=45;FDP=112;FR=.;FRO=67;FSAF=34;FSAR=11;FSRF=33;FSRR=34;FWDB=0.0261855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.2268;QD=5.4894;RBI=0.0386754;REFB=0.00147146;REVB=0.0284624;RO=65;SAF=34;SAR=11;SRF=33;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.289595;STB=0.674818;TYPE=snp;VARB=-0.00180681;OID=.;OPOS=80614933;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:65:67:45:45:11:34:33:32:11:34:33:34 chr17 80615040 . A C 2095.97 PASS AO=219;DP=222;FAO=219;FDP=219;FR=.;FRO=0;FSAF=112;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00522271;FXX=0.0135129;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.092;QD=38.2826;RBI=0.00964448;REFB=0;REVB=-0.00810798;RO=0;SAF=111;SAR=108;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.53434e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000158516;OID=.;OPOS=80615040;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:222:219:0:0:219:219:108:111:0:0:107:112:0:0 chr17 80674643 . C G 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177947;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.829;QD=33.022;RBI=0.0177947;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000484889;OID=.;OPOS=80674643;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:0:6:0:0:0:6:0:0 chr17 80678227 . G A 14.2 PASS AO=7;DP=34;FAO=7;FDP=35;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=-0.0278001;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.523;QD=1.6234;RBI=0.0300189;REFB=-0.00690954;REVB=-0.0113264;RO=27;SAF=5;SAR=2;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202188;STB=0.651721;TYPE=snp;VARB=0.0429478;OID=.;OPOS=80678227;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:34:35:27:28:7:7:2:5:15:12:2:5:15:13 chr17 80684784 . G A 423.64 PASS AO=110;DP=246;FAO=112;FDP=248;FR=.;FRO=136;FSAF=70;FSAR=42;FSRF=82;FSRR=54;FWDB=0.0138469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.844;QD=6.83295;RBI=0.0392286;REFB=-0.0058276;REVB=0.0367035;RO=136;SAF=69;SAR=41;SRF=82;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0257321;STB=0.512818;TYPE=snp;VARB=0.00688362;OID=.;OPOS=80684784;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:246:248:136:136:110:112:41:69:82:54:42:70:82:54 chr17 80696410 . A C 327.65 PASS AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00648168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.865;QD=37.4451;RBI=0.0227067;REFB=0;REVB=0.021762;RO=0;SAF=18;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11116e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000195842;OID=.;OPOS=80696410;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:35:35:0:0:35:35:17:18:0:0:17:18:0:0 chr17 80700592 . T C 1768.53 PASS AO=188;DP=188;FAO=188;FDP=188;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106099;FXX=0.0105258;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.992;QD=37.6282;RBI=0.0205228;REFB=0.0406579;REVB=-0.0175674;RO=0;SAF=70;SAR=118;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000181138;OID=.;OPOS=80700592;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:188:188:0:0:188:188:118:70:0:0:118:70:0:0 chr17 80708607 . C T 37.33 PASS AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0214788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.146;QD=6.49216;RBI=0.0228575;REFB=0.000347151;REVB=-0.0078185;RO=14;SAF=3;SAR=6;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0268092;STB=0.516093;TYPE=snp;VARB=-0.00074134;OID=.;OPOS=80708607;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:23:23:14:14:9:9:6:3:5:9:6:3:5:9 chr17 80788465 . T C 415.59 PASS AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0259177;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.465;QD=37.7809;RBI=0.0270414;REFB=0;REVB=-0.00771412;RO=0;SAF=19;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000129162;OID=.;OPOS=80788465;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:44:44:0:0:44:44:25:19:0:0:25:19:0:0 chr17 80788492 . A G 481.05 PASS AO=50;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00074205;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.509;QD=37.7293;RBI=0.00775311;REFB=0;REVB=-0.00771752;RO=0;SAF=26;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.10374e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.74083e-05;OID=.;OPOS=80788492;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:50:51:0:0:50:51:24:26:0:0:25:26:0:0 chr17 80789972 . CG C 36.83 PASS AO=15;DP=46;FAO=19;FDP=44;FR=.;FRO=25;FSAF=17;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=-0.114121;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.6802;QD=3.34795;RBI=0.123593;REFB=-0.0750321;REVB=-0.04745;RO=24;SAF=12;SAR=3;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0.338462;SSSB=0.465511;STB=0.854327;TYPE=del;VARB=0.0720797;OID=.;OPOS=80789973;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:15:44:19:44:25:17:2:9:16:36:24:12:3:9:15 chr17 80863857 . T C 523.47 PASS AO=61;DP=67;FAO=62;FDP=68;FR=.;FRO=6;FSAF=31;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.00843641;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.165;QD=30.7925;RBI=0.0181602;REFB=-0.101091;REVB=0.0160817;RO=6;SAF=30;SAR=31;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0830423;STB=0.544104;TYPE=snp;VARB=0.0132103;OID=.;OPOS=80863857;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:67:68:6:6:61:62:31:30:0:6:31:31:0:6 chr17 80882895 . GC G 505.95 PASS AO=85;DP=119;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0944897;FXX=0.0181802;HRUN=3;LEN=1;MLLD=10.3547;QD=18.7389;RBI=0.0999297;REFB=0.00289983;REVB=0.0325216;RO=16;SAF=45;SAR=40;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0474131;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00668795;OID=.;OPOS=80882896;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:85:110:108:108:0:62:46:0:0:38:16:45:40:11:5 chr17 80885779 . AG A 176.74 PASS AO=22;DP=30;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.379018;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.9237;QD=24.3778;RBI=0.393625;REFB=0.022876;REVB=-0.106234;RO=6;SAF=12;SAR=10;SRF=5;SRR=1;SSEN=0.482014;SSEP=0;SSSB=-0.115373;STB=0.521723;TYPE=del;VARB=0.0198492;OID=.;OPOS=80885780;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:22:29:28:29:1:17:11:0:1:13:6:12:10:5:1 chr17 80887244 . T C 30.72 PASS AO=10;DP=33;FAO=10;FDP=33;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.0414792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.181;QD=3.72354;RBI=0.0447616;REFB=-0.0129389;REVB=-0.0168248;RO=23;SAF=7;SAR=3;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.34695;STB=0.712155;TYPE=snp;VARB=0.0397624;OID=.;OPOS=80887244;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:33:33:23:23:10:10:3:7:9:14:3:7:9:14 chr17 80887451 . A G 146.68 PASS AO=35;DP=74;FAO=35;FDP=74;FR=.;FRO=39;FSAF=30;FSAR=5;FSRF=26;FSRR=13;FWDB=0.00746398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.533;QD=7.92851;RBI=0.0425389;REFB=-0.0209569;REVB=-0.041879;RO=38;SAF=30;SAR=5;SRF=25;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.285908;STB=0.658431;TYPE=snp;VARB=0.0225213;OID=.;OPOS=80887451;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:38:39:35:35:5:30:25:13:5:30:26:13 chr17 80895745 . T C 332.3 PASS AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00345117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.348;QD=36.9226;RBI=0.0358548;REFB=0;REVB=0.0356883;RO=0;SAF=28;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00101311;OID=.;OPOS=80895745;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:35:36:0:0:35:36:7:28:0:0:7:29:0:0 chr17 80895769 . A G 244.28 PASS AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00946708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.6292;QD=34.8976;RBI=0.0375495;REFB=-0.0762543;REVB=-0.0363365;RO=1;SAF=19;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0545937;STB=0.52939;TYPE=snp;VARB=0.00316492;OID=.;OPOS=80895769;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:28:28:1:1:27:27:8:19:0:1:8:19:0:1 chr17 80895931 . CGA C,CG,CGG 235.34 PASS AO=10,7,8;DP=27;FAO=0,25,0;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=0,8,0;FSAR=0,17,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00124703,-0.0897532,-0.13613;FXX=0;HRUN=1,1,1;LEN=2,1,1;MLLD=188.892,211.812,197.513;QD=37.6551;RBI=0.0876852,0.177617,0.211228;REFB=0,0,0;REVB=0.0876763,0.153272,0.161512;RO=0;SAF=0,0,8;SAR=10,7,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=del,del,snp;VARB=0,0.000280772,0.0437252;OID=.,.,.;OPOS=80895932,80895933,80895933;OREF=GA,A,A;OALT=-,-,G;OMAPALT=C,CG,CGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:10,7,8:25:0,25,0:25:0:0,8,0:0,17,0:0:0:11:0:0,0,8:10,7,0:0:0 chr17 80899281 . G A 43.04 PASS AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.0231086;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.894;QD=8.60864;RBI=0.0464778;REFB=-0.0233403;REVB=0.0403259;RO=11;SAF=5;SAR=4;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166393;STB=0.597497;TYPE=snp;VARB=0.0324807;OID=.;OPOS=80899281;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:20:20:11:11:9:9:4:5:8:3:4:5:8:3 chr17 80899353 . GC G 59.91 PASS AO=10;DP=21;FAO=14;FDP=18;FR=.;FRO=4;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.239364;FXX=0.0526039;HRUN=4;LEN=1;MLLD=14.4639;QD=13.3137;RBI=0.304204;REFB=-0.165081;REVB=0.187736;RO=7;SAF=4;SAR=6;SRF=4;SRR=3;SSEN=0.333333;SSEP=0;SSSB=-0.123877;STB=0.571326;TYPE=del;VARB=0.123861;OID=.;OPOS=80899354;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:10:18:14:18:4:6:8:3:1:6:7:4:6:4:3 chr17 80904844 . C T 218.89 PASS AO=54;DP=115;FAO=54;FDP=115;FR=.;FRO=61;FSAF=13;FSAR=41;FSRF=14;FSRR=47;FWDB=-0.0355412;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.579;QD=7.61343;RBI=0.036866;REFB=0.00272697;REVB=-0.00979414;RO=61;SAF=13;SAR=41;SRF=14;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0147964;STB=0.508216;TYPE=snp;VARB=-0.00328651;OID=.;OPOS=80904844;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:61:61:54:54:41:13:14:47:41:13:14:47 chr17 80992932 . A C 469.99 PASS AO=96;DP=171;FAO=96;FDP=171;FR=.;FRO=75;FSAF=44;FSAR=52;FSRF=42;FSRR=33;FWDB=0.0121121;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.536;QD=10.9938;RBI=0.0231544;REFB=0.00152981;REVB=-0.0197338;RO=74;SAF=44;SAR=52;SRF=42;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0872476;STB=0.54456;TYPE=snp;VARB=-0.00158988;OID=.;OPOS=80992932;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:171:74:75:96:96:52:44:42:32:52:44:42:33 chr17 81006629 . C T 523.16 PASS AO=103;DP=178;FAO=103;FDP=177;FR=.;FRO=74;FSAF=48;FSAR=55;FSRF=30;FSRR=44;FWDB=-0.0585031;FXX=0.00561766;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.229;QD=11.8228;RBI=0.0609205;REFB=-0.00928939;REVB=-0.016991;RO=72;SAF=48;SAR=55;SRF=30;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0377143;STB=0.525542;TYPE=snp;VARB=0.00809142;OID=.;OPOS=81006629;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:177:72:74:103:103:55:48:30:42:55:48:30:44 chr17 81043039 . A G 34.49 PASS AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0310917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.39;QD=22.9962;RBI=0.049481;REFB=-0.0447836;REVB=-0.0384925;RO=1;SAF=1;SAR=4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.277405;STB=0.66592;TYPE=snp;VARB=0.00391475;OID=.;OPOS=81043039;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:6:6:1:1:5:5:4:1:1:0:4:1:1:0 chr17 81050982 . G C 484.6 PASS AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.316;QD=38.7677;RBI=0.0314951;REFB=0;REVB=0.00122196;RO=0;SAF=9;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000166609;OID=.;OPOS=81050982;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:50:50:0:0:50:50:41:9:0:0:41:9:0:0 chr18 213592 . A G 194.23 PASS AO=48;DP=103;FAO=48;FDP=103;FR=.;FRO=55;FSAF=30;FSAR=18;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=0.00309696;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.4715;QD=7.54288;RBI=0.00904051;REFB=-0.00448486;REVB=-0.0084935;RO=55;SAF=30;SAR=18;SRF=29;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0970312;STB=0.554133;TYPE=snp;VARB=0.00562658;OID=.;OPOS=213592;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:55:55:48:48:18:30:29:26:18:30:29:26 chr18 225081 . A T 605.73 PASS AO=149;DP=311;FAO=150;FDP=311;FR=.;FRO=161;FSAF=64;FSAR=86;FSRF=66;FSRR=95;FWDB=-0.0239056;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=98.3429;QD=7.79079;RBI=0.0239056;REFB=0.00029375;REVB=3.66147e-05;RO=149;SAF=64;SAR=85;SRF=64;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508872;TYPE=snp;VARB=-0.000858628;OID=.;OPOS=225081;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:311:311:149:161:149:150:85:64:64:85:86:64:66:95 chr18 252559 . G A 889.55 PASS AO=96;DP=98;FAO=96;FDP=98;FR=.;FRO=2;FSAF=49;FSAR=47;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0298968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.584;QD=36.3081;RBI=0.0304177;REFB=-0.0640466;REVB=0.00560497;RO=0;SAF=49;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.53995e-08;STB=0.509998;TYPE=snp;VARB=6.40003e-05;OID=.;OPOS=252559;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:98:98:0:2:96:96:47:49:0:0:47:49:2:0 chr18 319935 . T C 595.78 PASS AO=180;DP=410;FAO=169;FDP=396;FR=.;FRO=227;FSAF=90;FSAR=79;FSRF=113;FSRR=114;FWDB=-0.00198333;FXX=0.00999975;HRUN=4;LEN=1;MLLD=116.593;QD=6.01793;RBI=0.0180941;REFB=-0.00858967;REVB=-0.0179851;RO=229;SAF=95;SAR=85;SRF=112;SRR=117;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0391367;STB=0.519949;TYPE=snp;VARB=0.0124509;OID=.;OPOS=319935;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:410:396:229:227:180:169:85:95:112:117:79:90:113:114 chr18 334742 . C T 64.26 PASS AO=29;DP=103;FAO=29;FDP=102;FR=.;FRO=73;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=48;FWDB=0.0336935;FXX=0.0097078;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.443;QD=2.51994;RBI=0.0452485;REFB=-0.00769139;REVB=0.0302022;RO=73;SAF=10;SAR=19;SRF=25;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00315349;STB=0.501871;TYPE=snp;VARB=0.0142082;OID=.;OPOS=334742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:103:102:73:73:29:29:19:10:25:48:19:10:25:48 chr18 334758 . T C 70.72 PASS AO=25;DP=87;FAO=28;FDP=91;FR=.;FRO=63;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=38;FWDB=-0.00721319;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.024;QD=3.10839;RBI=0.00737917;REFB=-0.00855549;REVB=0.00155628;RO=56;SAF=8;SAR=17;SRF=23;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115576;STB=0.557335;TYPE=snp;VARB=0.0196559;OID=.;OPOS=334758;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:87:91:56:63:25:28:17:8:23:33:19:9:25:38 chr18 334994 . A G 47.58 PASS AO=16;DP=54;FAO=17;FDP=55;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=27;FSRR=11;FWDB=-0.019681;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.172;QD=3.46062;RBI=0.0199104;REFB=-0.0231145;REVB=0.00301358;RO=38;SAF=11;SAR=5;SRF=27;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0318705;STB=0.503871;TYPE=snp;VARB=0.040935;OID=.;OPOS=334994;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:54:55:38:38:16:17:5:11:27:11:5:12:27:11 chr18 581123 . T C 625.08 PASS AO=175;DP=413;FAO=174;FDP=399;FR=.;FRO=225;FSAF=86;FSAR=88;FSRF=96;FSRR=129;FWDB=0.00937637;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.72;QD=6.26646;RBI=0.110052;REFB=-0.0130437;REVB=0.109652;RO=232;SAF=88;SAR=87;SRF=101;SRR=131;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0693236;STB=0.538147;TYPE=snp;VARB=0.0147941;OID=.;OPOS=581123;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:413:399:232:225:175:174:87:88:101:131:88:86:96:129 chr18 581201 . T A 547.86 PASS AO=167;DP=406;FAO=163;FDP=394;FR=.;FRO=231;FSAF=72;FSAR=91;FSRF=101;FSRR=130;FWDB=0.0703731;FXX=0.0149996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1623;QD=5.56204;RBI=0.0727608;REFB=-0.0150808;REVB=0.0184868;RO=232;SAF=77;SAR=90;SRF=101;SRR=131;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0271105;STB=0.502669;TYPE=snp;VARB=0.0175013;OID=.;OPOS=581201;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:406:394:232:231:167:163:90:77:101:131:91:72:101:130 chr18 581204 . T A 583.95 PASS AO=171;DP=407;FAO=169;FDP=399;FR=.;FRO=230;FSAF=76;FSAR=93;FSRF=100;FSRR=130;FWDB=-0.000543565;FXX=0.00249994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.135;QD=5.85409;RBI=0.00667543;REFB=-0.00611539;REVB=0.00665326;RO=234;SAF=80;SAR=91;SRF=102;SRR=132;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0334061;STB=0.508704;TYPE=snp;VARB=0.0277866;OID=.;OPOS=581204;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:407:399:234:230:171:169:91:80:102:132:93:76:100:130 chr18 586700 . T C 351.14 PASS AO=80;DP=156;FAO=80;FDP=157;FR=.;FRO=77;FSAF=27;FSAR=53;FSRF=41;FSRR=36;FWDB=-0.0468867;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7565;QD=8.94614;RBI=0.0518442;REFB=0.0252474;REVB=-0.0221236;RO=76;SAF=27;SAR=53;SRF=40;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175039;STB=0.599941;TYPE=snp;VARB=-0.0228407;OID=.;OPOS=586700;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:157:76:77:80:80:53:27:40:36:53:27:41:36 chr18 586714 . A G 310.46 PASS AO=75;DP=158;FAO=75;FDP=156;FR=.;FRO=81;FSAF=26;FSAR=49;FSRF=40;FSRR=41;FWDB=-0.00975349;FXX=0.0126574;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.664;QD=7.96051;RBI=0.0239421;REFB=-0.0129797;REVB=0.0218654;RO=81;SAF=26;SAR=49;SRF=40;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144749;STB=0.580172;TYPE=snp;VARB=0.0180608;OID=.;OPOS=586714;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:156:81:81:75:75:49:26:40:41:49:26:40:41 chr18 586736 . C T 301.32 PASS AO=71;DP=144;FAO=71;FDP=144;FR=.;FRO=73;FSAF=28;FSAR=43;FSRF=39;FSRR=34;FWDB=0.0201094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.198;QD=8.3701;RBI=0.0216457;REFB=-0.000500728;REVB=-0.00800933;RO=72;SAF=28;SAR=43;SRF=39;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136166;STB=0.571947;TYPE=snp;VARB=0.000611686;OID=.;OPOS=586736;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:144:72:73:71:71:43:28:39:33:43:28:39:34 chr18 724612 . A G 901.96 PASS AO=94;DP=95;FAO=96;FDP=97;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0292977;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.6448;QD=37.1943;RBI=0.0385415;REFB=-0.0672447;REVB=0.0250419;RO=0;SAF=46;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.73299e-08;STB=0.504949;TYPE=snp;VARB=0.000857325;OID=.;OPOS=724612;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:95:97:0:1:94:96:48:46:0:0:50:46:0:1 chr18 904766 . G C 125.84 PASS AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0397095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.368;QD=35.9535;RBI=0.0456183;REFB=0;REVB=-0.022454;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000133359;OID=.;OPOS=904766;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:14:14:0:0:14:14:8:6:0:0:8:6:0:0 chr18 907675 . G A 450 PASS AO=48;DP=48;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0597864;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.5957;QD=38.2977;RBI=0.0765846;REFB=0;REVB=0.0478622;RO=0;SAF=3;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.73383e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00172172;OID=.;OPOS=907675;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:48:47:0:0:48:47:45:3:0:0:44:3:0:0 chr18 907742 . G C 10.22 PASS AO=2;DP=9;FAO=2;FDP=9;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.021;QD=4.5413;RBI=0.0161125;REFB=-0.00548331;REVB=0.0161125;RO=7;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0126517;OID=.;OPOS=907742;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:7:7:2:2:2:0:0:7:2:0:0:7 chr18 2539016 . C G 1338.3 PASS AO=139;DP=139;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.04218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.1255;QD=38.5123;RBI=0.059925;REFB=0;REVB=0.0425659;RO=0;SAF=85;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.58833e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.99289e-06;OID=.;OPOS=2539016;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:139:139:0:0:139:139:54:85:0:0:54:85:0:0 chr18 2547500 . G T 1522.57 PASS AO=158;DP=158;FAO=158;FDP=158;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00692607;FXX=0.00628891;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.002;QD=38.546;RBI=0.0371423;REFB=0;REVB=0.0364909;RO=0;SAF=83;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.38974e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.10291e-05;OID=.;OPOS=2547500;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:158:158:0:0:158:158:75:83:0:0:76:82:0:0 chr18 2616457 . G C 665.68 PASS AO=191;DP=413;FAO=178;FDP=394;FR=.;FRO=216;FSAF=54;FSAR=124;FSRF=61;FSRR=155;FWDB=0.0021909;FXX=0.0149996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.047;QD=6.75818;RBI=0.00483421;REFB=-0.0154775;REVB=0.00430924;RO=217;SAF=61;SAR=130;SRF=61;SRR=156;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0433112;STB=0.513741;TYPE=snp;VARB=0.0170327;OID=.;OPOS=2616457;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:413:394:217:216:191:178:130:61:61:156:124:54:61:155 chr18 2705700 . A G 698.13 PASS AO=74;DP=75;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0171499;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.223;QD=36.7439;RBI=0.0496295;REFB=-0.127722;REVB=0.0465722;RO=1;SAF=43;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108759;STB=0.505746;TYPE=snp;VARB=0.00133561;OID=.;OPOS=2705700;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:75:76:1:1:74:75:31:43:1:0:32:43:1:0 chr18 2706359 . C T 75.12 PASS AO=18;DP=37;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=-0.00370576;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.959;QD=8.34675;RBI=0.0595289;REFB=-0.0125322;REVB=-0.0594134;RO=18;SAF=14;SAR=4;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.571338;TYPE=snp;VARB=0.013278;OID=.;OPOS=2706359;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:37:36:18:19:18:17:4:14:14:4:3:14:14:5 chr18 2707619 . G A 2270.65 PASS AO=237;DP=243;FAO=237;FDP=237;FR=.;FRO=0;FSAF=107;FSAR=130;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.051725;FXX=0.0246903;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.087;QD=38.3232;RBI=0.0519158;REFB=0;REVB=0.00444703;RO=0;SAF=107;SAR=130;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.04837e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.07915e-05;OID=.;OPOS=2707619;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:243:237:0:0:237:237:130:107:0:0:130:107:0:0 chr18 2724930 . A T 1260.45 PASS AO=135;DP=137;FAO=135;FDP=137;FR=.;FRO=2;FSAF=76;FSAR=59;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00985352;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=183.465;QD=36.8014;RBI=0.0130991;REFB=-0.0416078;REVB=0.00863102;RO=1;SAF=76;SAR=59;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00621409;STB=0.506493;TYPE=snp;VARB=0.000129933;OID=.;OPOS=2724930;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:137:137:1:2:135:135:59:76:1:0:59:76:2:0 chr18 2763697 . C T 2938.85 PASS AO=299;DP=301;FAO=308;FDP=308;FR=.;FRO=0;FSAF=165;FSAR=143;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00242496;FXX=0.00964599;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.969;QD=38.1669;RBI=0.00704216;REFB=0;REVB=0.00661147;RO=1;SAF=167;SAR=132;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00284743;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00034445;OID=.;OPOS=2763697;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:301:308:1:0:299:308:132:167:1:0:143:165:0:0 chr18 2778979 . G T 1104.02 PASS AO=113;DP=116;FAO=118;FDP=120;FR=.;FRO=2;FSAF=51;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0428953;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.4093;QD=36.8007;RBI=0.0734742;REFB=0.0510604;REVB=0.0596528;RO=3;SAF=50;SAR=63;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00543247;STB=0.507352;TYPE=snp;VARB=-0.00192154;OID=.;OPOS=2778979;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:116:120:3:2:113:118:63:50:1:2:67:51:0:2 chr18 2891478 . T C 281.05 PASS AO=52;DP=85;FAO=52;FDP=85;FR=.;FRO=33;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=-0.0307734;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.9062;QD=13.2256;RBI=0.0611636;REFB=-0.0165976;REVB=0.0528582;RO=33;SAF=26;SAR=26;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0539888;STB=0.5294;TYPE=snp;VARB=0.0119423;OID=.;OPOS=2891478;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:33:33:52:52:26:26:14:19:26:26:14:19 chr18 2892474 . G A 132.64 PASS AO=18;DP=26;FAO=19;FDP=25;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=-0.0144732;FXX=0.0740466;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.273;QD=21.222;RBI=0.0203473;REFB=-0.0298224;REVB=0.0143018;RO=6;SAF=6;SAR=12;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.54267;TYPE=snp;VARB=0.00183927;OID=.;OPOS=2892474;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:26:25:6:6:18:19:12:6:2:4:13:6:1:5 chr18 2909700 . C T 604.49 PASS AO=120;DP=206;FAO=121;FDP=209;FR=.;FRO=88;FSAF=68;FSAR=53;FSRF=35;FSRR=53;FWDB=0.00856763;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.9884;QD=11.5692;RBI=0.014877;REFB=-0.016325;REVB=0.0121623;RO=86;SAF=67;SAR=53;SRF=35;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11637;STB=0.569026;TYPE=snp;VARB=0.0105185;OID=.;OPOS=2909700;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:206:209:86:88:120:121:53:67:35:51:53:68:35:53 chr18 2920288 . G A 78.83 PASS AO=20;DP=47;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.00266492;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.061;QD=6.70871;RBI=0.0162744;REFB=-0.020827;REVB=-0.0160547;RO=27;SAF=15;SAR=5;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260347;STB=0.650441;TYPE=snp;VARB=0.0249187;OID=.;OPOS=2920288;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:47:47:27:27:20:20:5:15:14:13:5:15:14:13 chr18 2946291 . C T 3646.14 PASS AO=486;DP=496;FAO=392;FDP=392;FR=.;FRO=0;FSAF=158;FSAR=234;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0390038;FXX=0.0199995;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1721;QD=37.2055;RBI=0.0467257;REFB=0.0670898;REVB=-0.0257293;RO=9;SAF=183;SAR=303;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00250733;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00366293;OID=.;OPOS=2946291;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:496:392:9:0:486:392:303:183:4:5:234:158:0:0 chr18 3025464 . A G 500.94 PASS AO=129;DP=287;FAO=130;FDP=281;FR=.;FRO=151;FSAF=63;FSAR=67;FSRF=83;FSRR=68;FWDB=0.0623062;FXX=0.0209052;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.771;QD=7.1308;RBI=0.0653864;REFB=0.0120859;REVB=-0.0198323;RO=145;SAF=62;SAR=67;SRF=77;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0483556;STB=0.53491;TYPE=snp;VARB=-0.0113072;OID=.;OPOS=3025464;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:287:281:145:151:129:130:67:62:77:68:67:63:83:68 chr18 3067278 . A G 141.83 PASS AO=33;DP=69;FAO=33;FDP=69;FR=.;FRO=36;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=-0.000289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.81;QD=8.22178;RBI=0.0360331;REFB=-0.0124909;REVB=-0.036032;RO=36;SAF=21;SAR=12;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0524755;STB=0.529394;TYPE=snp;VARB=0.0135494;OID=.;OPOS=3067278;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:36:36:33:33:12:21:21:15:12:21:21:15 chr18 3075503 . C CAAA 1476.9 PASS AO=144;DP=185;FAO=156;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159017;FXX=0.156748;HRUN=0;LEN=3;MLLD=161.707;QD=37.8692;RBI=0.0188013;REFB=0;REVB=-0.0100312;RO=23;SAF=52;SAR=92;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0800752;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-1.04221e-06;OID=.;OPOS=3075504;OREF=-;OALT=AAA;OMAPALT=CAAA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:144:185:156:156:0:55:101:0:0:70:23:52:92:15:8 chr18 3075712 . C A 419.4 PASS AO=107;DP=243;FAO=110;FDP=242;FR=.;FRO=132;FSAF=47;FSAR=63;FSRF=55;FSRR=77;FWDB=-0.0510048;FXX=0.00411506;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.1529;QD=6.93219;RBI=0.0600673;REFB=-0.00382944;REVB=-0.0317269;RO=134;SAF=44;SAR=63;SRF=58;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0222582;STB=0.505919;TYPE=snp;VARB=0.00463218;OID=.;OPOS=3075712;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:243:242:134:132:107:110:63:44:58:76:63:47:55:77 chr18 3089522 . G T 467.76 PASS AO=103;DP=195;FAO=103;FDP=195;FR=.;FRO=92;FSAF=45;FSAR=58;FSRF=38;FSRR=54;FWDB=-0.025568;FXX=0.00510178;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.514;QD=9.59504;RBI=0.0274559;REFB=-0.00102914;REVB=0.0100051;RO=92;SAF=45;SAR=58;SRF=38;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0209703;STB=0.511465;TYPE=snp;VARB=0.00081224;OID=.;OPOS=3089522;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:195:92:92:103:103:58:45:38:54:58:45:38:54 chr18 3571217 . T C 1487.03 PASS AO=155;DP=159;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0406813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3936;QD=37.4095;RBI=0.167328;REFB=0;REVB=0.162308;RO=0;SAF=89;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.59131e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000990261;OID=.;OPOS=3571217;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:159:159:0:0:155:159:66:89:0:0:70:89:0:0 chr18 3597154 . CTCTG C 121.29 PASS AO=29;DP=71;FAO=31;FDP=70;FR=.;FRO=39;FSAF=28;FSAR=3;FSRF=34;FSRR=5;FWDB=0.00346373;FXX=0.0666578;HRUN=1;LEN=4;MLLD=242.462;QD=6.93082;RBI=0.0228202;REFB=-0.0126843;REVB=-0.0225558;RO=28;SAF=26;SAR=3;SRF=26;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0820335;STB=0.546309;TYPE=del;VARB=0.0140991;OID=.;OPOS=3597155;OREF=TCTG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:29:62:31:70:39:28:3:34:5:99:28:26:3:26:2 chr18 3597525 . G A 187.16 PASS AO=52;DP=123;FAO=52;FDP=123;FR=.;FRO=71;FSAF=20;FSAR=32;FSRF=20;FSRR=51;FWDB=-0.0163841;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.1749;QD=6.08662;RBI=0.0332387;REFB=-0.00742591;REVB=-0.0289201;RO=71;SAF=20;SAR=32;SRF=20;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11565;STB=0.564602;TYPE=snp;VARB=0.0109271;OID=.;OPOS=3597525;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:71:71:52:52:32:20:20:51:32:20:20:51 chr18 3597838 . C T 362.85 PASS AO=104;DP=248;FAO=104;FDP=246;FR=.;FRO=142;FSAF=61;FSAR=43;FSRF=67;FSRR=75;FWDB=0.0285469;FXX=0.00806419;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.0714;QD=5.90001;RBI=0.0287498;REFB=-0.00431573;REVB=-0.00340976;RO=142;SAF=61;SAR=43;SRF=67;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119499;STB=0.56667;TYPE=snp;VARB=0.00539212;OID=.;OPOS=3597838;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:248:246:142:142:104:104:43:61:67:75:43:61:67:75 chr18 3598067 . G A 125.64 PASS AO=29;DP=61;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=0.0121526;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=246.173;QD=8.23857;RBI=0.0182688;REFB=-0.0155208;REVB=-0.0136405;RO=32;SAF=11;SAR=18;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172978;STB=0.597186;TYPE=snp;VARB=0.0183647;OID=.;OPOS=3598067;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:32:32:29:29:18:11:18:14:18:11:18:14 chr18 3729175 . C T 496.15 PASS AO=52;DP=54;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0140023;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.432;QD=37.4451;RBI=0.0267553;REFB=0;REVB=0.0227988;RO=0;SAF=31;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.93989e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000108864;OID=.;OPOS=3729175;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:54:53:0:0:52:53:21:31:0:0:21:32:0:0 chr18 5233105 . C G 113.44 PASS AO=39;DP=114;FAO=41;FDP=120;FR=.;FRO=79;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=26;FSRR=53;FWDB=0.0672502;FXX=0.0163921;HRUN=3;LEN=1;MLLD=40.8929;QD=3.78143;RBI=0.144156;REFB=-0.00183924;REVB=-0.127508;RO=75;SAF=16;SAR=23;SRF=26;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0763526;STB=0.574755;TYPE=snp;VARB=0.0016122;OID=.;OPOS=5233105;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:120:75:79:39:41:23:16:26:49:23:18:26:53 chr18 5237478 . T C 173.26 PASS AO=49;DP=118;FAO=49;FDP=118;FR=.;FRO=69;FSAF=15;FSAR=34;FSRF=27;FSRR=42;FWDB=-0.00369347;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=191.215;QD=5.8733;RBI=0.00486629;REFB=-0.0094655;REVB=0.00316844;RO=69;SAF=15;SAR=34;SRF=27;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0992345;STB=0.556051;TYPE=snp;VARB=0.0117083;OID=.;OPOS=5237478;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:69:69:49:49:34:15:27:42:34:15:27:42 chr18 5237575 . G T 279.39 PASS AO=47;DP=71;FAO=47;FDP=71;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=35;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.00645934;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.6053;QD=15.7405;RBI=0.0230466;REFB=-0.00833676;REVB=-0.0221229;RO=24;SAF=12;SAR=35;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122934;STB=0.56698;TYPE=snp;VARB=0.0116869;OID=.;OPOS=5237575;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:71:71:24:24:47:47:35:12:10:14:35:12:10:14 chr18 5237612 . G A 250.64 PASS AO=40;DP=59;FAO=40;FDP=58;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=35;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.0301491;FXX=0.0169463;HRUN=3;LEN=1;MLLD=236.116;QD=17.2856;RBI=0.0323862;REFB=-0.0221278;REVB=0.0118278;RO=18;SAF=5;SAR=35;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265572;STB=0.646068;TYPE=snp;VARB=0.00812643;OID=.;OPOS=5237612;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:59:58:18:18:40:40:35:5:7:11:35:5:7:11 chr18 5292030 . A G 770.13 PASS AO=249;DP=253;FAO=85;FDP=88;FR=.;FRO=3;FSAF=54;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0112072;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.91;QD=35.0059;RBI=0.0280565;REFB=-0.0153886;REVB=0.0257209;RO=4;SAF=130;SAR=119;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000666792;STB=0.511038;TYPE=snp;VARB=0.000707551;OID=.;OPOS=5292030;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:253:88:4:3:249:85:119:130:2:2:31:54:1:2 chr18 5410574 . A G 953.27 PASS AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00902799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.684;QD=38.5161;RBI=0.0301003;REFB=0;REVB=-0.0287145;RO=0;SAF=43;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.45789e-05;OID=.;OPOS=5410574;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:99:99:0:0:99:99:56:43:0:0:56:43:0:0 chr18 5630531 . G A 57.76 PASS AO=8;DP=25;FAO=10;FDP=26;FR=.,HEALED;FRO=12;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=2;FWDB=-0.0187586;FXX=0.0370233;HRUN=4;LEN=1;MLLD=187.479;QD=8.88642;RBI=0.0425074;REFB=-0.0424702;REVB=-0.0381444;RO=10;SAF=7;SAR=1;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136846;STB=0.529355;TYPE=snp;VARB=0.0431795;OID=.;OPOS=5630531;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:26:26:10:12:8:10:1:7:8:2:2:8:10:2 chr18 5891637 . C A 241.93 PASS AO=56;DP=145;FAO=67;FDP=153;FR=.;FRO=86;FSAF=15;FSAR=52;FSRF=31;FSRR=55;FWDB=0.00680451;FXX=0.0192295;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.597;QD=6.32495;RBI=0.0180255;REFB=-0.00880988;REVB=0.0166919;RO=80;SAF=14;SAR=42;SRF=32;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185737;STB=0.598417;TYPE=snp;VARB=0.0145187;OID=.;OPOS=5891637;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:153:80:86:56:67:42:14:32:48:52:15:31:55 chr18 5955911 . C T 166.84 PASS AO=50;DP=130;FAO=51;FDP=131;FR=.;FRO=80;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=36;FSRR=44;FWDB=-0.00900302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.482;QD=5.09437;RBI=0.0095328;REFB=-0.02752;REVB=0.00313368;RO=79;SAF=21;SAR=29;SRF=35;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0254169;STB=0.511553;TYPE=snp;VARB=0.02855;OID=.;OPOS=5955911;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:131:79:80:50:51:29:21:35:44:29:22:36:44 chr18 5955932 . G A 101.4 PASS AO=37;DP=114;FAO=38;FDP=115;FR=.;FRO=77;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=33;FSRR=44;FWDB=0.0198207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.9946;QD=3.52694;RBI=0.0348794;REFB=-0.00895351;REVB=0.0287004;RO=76;SAF=18;SAR=19;SRF=33;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0607947;STB=0.547801;TYPE=snp;VARB=0.0143595;OID=.;OPOS=5955932;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:115:76:77:37:38:19:18:33:43:19:19:33:44 chr18 5956145 . T C 196.78 PASS AO=61;DP=156;FAO=61;FDP=156;FR=.;FRO=95;FSAF=46;FSAR=15;FSRF=73;FSRR=22;FWDB=0.00867495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.952;QD=5.04551;RBI=0.00922853;REFB=-0.00950568;REVB=-0.00314816;RO=95;SAF=46;SAR=15;SRF=73;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0211014;STB=0.511898;TYPE=snp;VARB=0.016509;OID=.;OPOS=5956145;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:156:95:95:61:61:15:46:73:22:15:46:73:22 chr18 5956238 . C T 356.66 PASS AO=87;DP=173;FAO=88;FDP=186;FR=.;FRO=98;FSAF=68;FSAR=20;FSRF=75;FSRR=23;FWDB=0.0116694;FXX=0.0106377;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.6989;QD=7.67005;RBI=0.0516797;REFB=-0.0304441;REVB=-0.050345;RO=84;SAF=67;SAR=20;SRF=75;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172608;STB=0.505531;TYPE=snp;VARB=0.0223519;OID=.;OPOS=5956238;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:186:84:98:87:88:20:67:75:9:20:68:75:23 chr18 5960165 . G A 436.88 PASS AO=113;DP=242;FAO=113;FDP=245;FR=.;FRO=132;FSAF=47;FSAR=66;FSRF=63;FSRR=69;FWDB=-0.0136829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.785;QD=7.13281;RBI=0.0154663;REFB=-0.0291019;REVB=-0.00721003;RO=127;SAF=47;SAR=66;SRF=62;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0703208;STB=0.533621;TYPE=snp;VARB=0.0296743;OID=.;OPOS=5960165;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:242:245:127:132:113:113:66:47:62:65:66:47:63:69 chr18 6046717 . T C 2091.89 PASS AO=225;DP=237;FAO=227;FDP=227;FR=.;FRO=0;FSAF=145;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156889;FXX=0.0462165;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.4408;QD=36.8616;RBI=0.0766973;REFB=-0.0851817;REVB=0.0750755;RO=4;SAF=144;SAR=81;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00397636;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00087834;OID=.;OPOS=6046717;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:237:227:4:0:225:227:81:144:3:1:82:145:0:0 chr18 6455000 . C T 1624.87 PASS AO=164;DP=165;FAO=170;FDP=170;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0256736;FXX=0.00584761;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.245;QD=38.2323;RBI=0.0286707;REFB=0;REVB=-0.0127622;RO=0;SAF=79;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.14401e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.46192e-05;OID=.;OPOS=6455000;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:165:170:0:0:164:170:85:79:0:0:89:81:0:0 chr18 6455037 . T C 1494.17 PASS AO=156;DP=158;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157851;FXX=0.0125778;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.165;QD=38.0681;RBI=0.0394862;REFB=-0.034224;REVB=0.0361938;RO=1;SAF=73;SAR=83;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00647266;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.87085e-05;OID=.;OPOS=6455037;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:158:157:1:0:156:157:83:73:1:0:84:73:0:0 chr18 6889973 . A G 366.22 PASS AO=94;DP=202;FAO=95;FDP=208;FR=.;FRO=113;FSAF=59;FSAR=36;FSRF=54;FSRR=59;FWDB=-0.010113;FXX=0.0234731;HRUN=3;LEN=1;MLLD=127.606;QD=7.04263;RBI=0.023034;REFB=-0.016935;REVB=-0.0206952;RO=108;SAF=59;SAR=35;SRF=51;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153501;STB=0.579431;TYPE=snp;VARB=0.016128;OID=.;OPOS=6889973;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:208:108:113:94:95:35:59:51:57:36:59:54:59 chr18 6890434 . A G 243.88 PASS AO=67;DP=155;FAO=67;FDP=155;FR=.;FRO=88;FSAF=29;FSAR=38;FSRF=45;FSRR=43;FWDB=-0.00248381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.04;QD=6.29366;RBI=0.0162694;REFB=-0.000714717;REVB=0.0160787;RO=88;SAF=29;SAR=38;SRF=45;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0802553;STB=0.544842;TYPE=snp;VARB=0.000901886;OID=.;OPOS=6890434;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:88:88:67:67:38:29:45:43:38:29:45:43 chr18 6912143 . A C 908.92 PASS AO=91;DP=93;FAO=97;FDP=98;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0450679;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.1844;QD=37.0986;RBI=0.0460331;REFB=-0.105782;REVB=-0.00937706;RO=2;SAF=28;SAR=63;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00916212;STB=0.503875;TYPE=snp;VARB=0.00176226;OID=.;OPOS=6912143;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:93:98:2:1:91:97:63:28:1:1:64:33:0:1 chr18 6928138 . A G 73.78 PASS AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.0065101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.885;QD=8.94262;RBI=0.0070815;REFB=-0.00511678;REVB=-0.00278681;RO=17;SAF=3;SAR=13;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140316;STB=0.580896;TYPE=snp;VARB=0.00407476;OID=.;OPOS=6928138;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:33:33:17:17:16:16:13:3:5:12:13:3:5:12 chr18 6928180 . G T 75.33 PASS AO=17;DP=36;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=0.0360017;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.5615;QD=8.36998;RBI=0.0730678;REFB=0.00811097;REVB=0.0635829;RO=19;SAF=3;SAR=14;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123809;STB=0.571338;TYPE=snp;VARB=-0.00828013;OID=.;OPOS=6928180;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:36:36:19:19:17:17:14:3:5:14:14:3:5:14 chr18 6956504 . ACAGCTCCAGCTC A 70.37 PASS AO=22;DP=83;FAO=24;FDP=71;FR=.;FRO=47;FSAF=20;FSAR=4;FSRF=33;FSRR=14;FWDB=0.0121904;FXX=0.0405351;HRUN=1;LEN=12;MLLD=303.787;QD=3.96469;RBI=0.0158371;REFB=-0.0125225;REVB=0.0101098;RO=27;SAF=18;SAR=4;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.355184;STB=0.629249;TYPE=del;VARB=0.0294927;OID=.;OPOS=6956505;OREF=CAGCTCCAGCTC;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:22:54:24:71:47:20:4:33:14:70:27:18:4:14:13 chr18 6980523 . T C 1420.73 PASS AO=154;DP=158;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0251785;FXX=0.0189861;HRUN=3;LEN=1;MLLD=227.362;QD=36.6639;RBI=0.0279483;REFB=-0.131464;REVB=0.0121306;RO=3;SAF=79;SAR=75;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0186448;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.38516e-05;OID=.;OPOS=6980523;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:158:155:3:0:154:155:75:79:0:3:76:79:0:0 chr18 6985270 . C T 1939.33 PASS AO=203;DP=206;FAO=203;FDP=203;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0238154;FXX=0.0287068;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.176;QD=38.2134;RBI=0.0341466;REFB=-0.0199435;REVB=-0.0244708;RO=0;SAF=98;SAR=105;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000456117;OID=.;OPOS=6985270;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:206:203:0:0:203:203:105:98:0:0:105:98:0:0 chr18 6986259 . G A 2440.79 PASS AO=254;DP=257;FAO=254;FDP=254;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=165;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0183109;FXX=0.0116727;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.628;QD=38.4377;RBI=0.0185331;REFB=0;REVB=0.00286147;RO=0;SAF=89;SAR=165;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.51141e-08;OID=.;OPOS=6986259;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:257:254:0:0:254:254:165:89:0:0:165:89:0:0 chr18 6993673 . T C 2499.3 PASS AO=261;DP=261;FAO=261;FDP=261;FR=.;FRO=0;FSAF=102;FSAR=159;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102579;FXX=0.0113632;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.323;QD=38.3034;RBI=0.0479748;REFB=0;REVB=0.0468654;RO=0;SAF=102;SAR=159;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.88632e-05;OID=.;OPOS=6993673;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:261:261:0:0:261:261:159:102:0:0:159:102:0:0 chr18 6997818 . A C 1921.79 PASS AO=201;DP=203;FAO=203;FDP=203;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126103;FXX=0.00490172;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.584;QD=37.8678;RBI=0.0170921;REFB=0;REVB=0.0115377;RO=2;SAF=92;SAR=109;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00865854;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.94157e-05;OID=.;OPOS=6997818;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:203:203:2:0:201:203:109:92:0:2:111:92:0:0 chr18 6999628 . T C 750 PASS AO=81;DP=82;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00178409;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.3461;QD=36.5854;RBI=0.00737988;REFB=-0.0599752;REVB=-0.00716098;RO=1;SAF=31;SAR=50;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00937721;STB=0.504949;TYPE=snp;VARB=0.00390954;OID=.;OPOS=6999628;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:82:82:1:1:81:81:50:31:0:1:50:31:0:1 chr18 7008591 . T C 148.32 PASS AO=45;DP=115;FAO=45;FDP=115;FR=.;FRO=70;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=40;FSRR=30;FWDB=0.00462423;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.5171;QD=5.15902;RBI=0.0176089;REFB=-0.00741334;REVB=-0.0169909;RO=70;SAF=20;SAR=25;SRF=40;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135745;STB=0.576889;TYPE=snp;VARB=0.0132104;OID=.;OPOS=7008591;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:70:70:45:45:25:20:40:30:25:20:40:30 chr18 7011413 . G A 119.64 PASS AO=28;DP=60;FAO=28;FDP=60;FR=.;FRO=32;FSAF=21;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=0.00877939;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=242.059;QD=7.97576;RBI=0.0158227;REFB=-0.00158037;REVB=0.0131636;RO=31;SAF=21;SAR=7;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154797;STB=0.599924;TYPE=snp;VARB=0.00152918;OID=.;OPOS=7011413;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:31:32:28:28:7:21:19:12:7:21:19:13 chr18 7012123 . A G 42.95 PASS AO=15;DP=48;FAO=15;FDP=48;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=23;FWDB=-0.000297774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.486;QD=3.57918;RBI=0.0232967;REFB=-0.00112007;REVB=-0.0232948;RO=33;SAF=10;SAR=5;SRF=10;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.400454;STB=0.736551;TYPE=snp;VARB=0.00145492;OID=.;OPOS=7012123;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:48:48:33:33:15:15:5:10:10:23:5:10:10:23 chr18 7017322 . A G 1253.98 PASS AO=135;DP=139;FAO=137;FDP=140;FR=.;FRO=3;FSAF=84;FSAR=53;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0247219;FXX=0.0070917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.758;QD=35.8279;RBI=0.0787447;REFB=-0.0732171;REVB=0.0747633;RO=3;SAF=84;SAR=51;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0166725;STB=0.508771;TYPE=snp;VARB=0.000608723;OID=.;OPOS=7017322;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:139:140:3:3:135:137:51:84:3:0:53:84:3:0 chr18 7023371 . A G 563.91 PASS AO=61;DP=63;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.179832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.5594;QD=35.2444;RBI=0.180203;REFB=-0.076519;REVB=-0.0115631;RO=2;SAF=23;SAR=38;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0392848;STB=0.510201;TYPE=snp;VARB=0.0040858;OID=.;OPOS=7023371;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:63:64:2:1:61:63:38:23:2:0:39:24:1:0 chr18 7033037 . G A 829.78 PASS AO=92;DP=95;FAO=92;FDP=95;FR=.;FRO=3;FSAF=19;FSAR=73;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.079763;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.007;QD=34.9383;RBI=0.0800661;REFB=-0.0321614;REVB=0.00696036;RO=3;SAF=19;SAR=73;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114869;STB=0.506065;TYPE=snp;VARB=0.000714238;OID=.;OPOS=7033037;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:95:95:3:3:92:92:73:19:1:2:73:19:1:2 chr18 7034508 . T G 1181.1 PASS AO=123;DP=124;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0328277;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5545;QD=38.1;RBI=0.0392395;REFB=0;REVB=0.0214961;RO=0;SAF=66;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00040151;OID=.;OPOS=7034508;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:124:124:0:0:123:124:57:66:0:0:57:67:0:0 chr18 8069868 . C T 104.87 PASS AO=32;DP=80;FAO=31;FDP=80;FR=.;FRO=49;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=32;FWDB=0.0188346;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.2898;QD=5.24328;RBI=0.0210108;REFB=-0.00398707;REVB=0.009312;RO=45;SAF=10;SAR=22;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0246823;STB=0.516853;TYPE=snp;VARB=0.00349199;OID=.;OPOS=8069868;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:45:49:32:31:22:10:15:30:21:10:17:32 chr18 8387195 . G A 2263.83 PASS AO=241;DP=242;FAO=240;FDP=240;FR=.;FRO=0;FSAF=108;FSAR=132;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0310174;FXX=0.0123452;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.92;QD=37.7305;RBI=0.0391233;REFB=0.0133708;REVB=0.0238444;RO=1;SAF=108;SAR=133;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00357029;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000122983;OID=.;OPOS=8387195;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:91:242:240:1:0:241:240:133:108:0:1:132:108:0:0 chr18 8387219 . G C 2063.64 PASS AO=214;DP=217;FAO=215;FDP=215;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=117;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0240985;FXX=0.00921617;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.9482;QD=38.3934;RBI=0.0315693;REFB=0;REVB=-0.0203932;RO=1;SAF=97;SAR=117;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00488628;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.33015e-05;OID=.;OPOS=8387219;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:97:217:215:1:0:214:215:117:97:1:0:117:98:0:0 chr18 8471976 . A G 948.63 PASS AO=100;DP=101;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104942;FXX=0.0097078;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.4354;QD=37.201;RBI=0.0247937;REFB=0.0631538;REVB=-0.0224633;RO=1;SAF=34;SAR=66;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0137468;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000975419;OID=.;OPOS=8471976;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:101:102:1:0:100:102:66:34:1:0:68:34:0:0 chr18 8545736 . A G 221.25 PASS AO=55;DP=117;FAO=55;FDP=117;FR=.;FRO=62;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=30;FSRR=32;FWDB=-0.0140444;FXX=0.00847386;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.663;QD=7.56394;RBI=0.0140673;REFB=-0.0390697;REVB=-0.0008024;RO=62;SAF=28;SAR=27;SRF=30;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240445;STB=0.513357;TYPE=snp;VARB=0.0527476;OID=.;OPOS=8545736;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:62:62:55:55:27:28:30:32:27:28:30:32 chr18 8545785 . A G 196.83 PASS AO=46;DP=94;FAO=46;FDP=94;FR=.;FRO=48;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=-0.0655092;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9218;QD=8.37589;RBI=0.0755385;REFB=-0.019481;REVB=-0.0376113;RO=47;SAF=19;SAR=27;SRF=27;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147305;STB=0.576568;TYPE=snp;VARB=0.0221906;OID=.;OPOS=8545785;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:47:48:46:46:27:19:27:20:27:19:27:21 chr18 8545823 . T C 168.28 PASS AO=42;DP=92;FAO=42;FDP=92;FR=.;FRO=50;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=-0.0600226;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.2263;QD=7.31638;RBI=0.069098;REFB=-0.0429403;REVB=-0.0342317;RO=49;SAF=18;SAR=24;SRF=26;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0987386;STB=0.560719;TYPE=snp;VARB=0.0473054;OID=.;OPOS=8545823;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:49:50:42:42:24:18:26:23:24:18:27:23 chr18 8545859 . A G 128.5 PASS AO=38;DP=96;FAO=38;FDP=96;FR=.;FRO=58;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=34;FSRR=24;FWDB=0.0301973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.5243;QD=5.35432;RBI=0.0388501;REFB=-0.0070643;REVB=-0.0244428;RO=57;SAF=15;SAR=23;SRF=33;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194387;STB=0.615114;TYPE=snp;VARB=0.0193428;OID=.;OPOS=8545859;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:57:58:38:38:23:15:33:24:23:15:34:24 chr18 8783835 . T C 363.29 PASS AO=9;DP=56;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0341939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.8642;QD=38.2412;RBI=0.0365433;REFB=0;REVB=-0.0128915;RO=0;SAF=6;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000498267;OID=.;OPOS=8783835;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:9:38:0:0:9:38:3:6:0:0:23:15:0:0 chr18 8784370 . A G 639.75 PASS AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0148603;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=242.945;QD=38.1942;RBI=0.029009;REFB=0;REVB=-0.0249137;RO=0;SAF=53;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.42201e-05;OID=.;OPOS=8784370;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:67:67:0:0:67:67:14:53:0:0:14:53:0:0 chr18 8786117 . C A 56.3 PASS AO=7;DP=8;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00257725;FXX=0;HRUN=11;LEN=1;MLLD=276.008;QD=28.1499;RBI=0.00257725;REFB=-0.0305743;REVB=0;RO=1;SAF=7;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00447973;OID=.;OPOS=8786117;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:8:8:1:1:7:7:0:7:1:0:0:7:1:0 chr18 8826083 . G C 267.06 PASS AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.298;QD=38.152;RBI=0.0277097;REFB=0;REVB=0.0234966;RO=0;SAF=16;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000163625;OID=.;OPOS=8826083;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:28:28:0:0:28:28:12:16:0:0:12:16:0:0 chr18 9117867 . T C 2056.16 PASS AO=217;DP=219;FAO=218;FDP=218;FR=.;FRO=0;FSAF=110;FSAR=108;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195384;FXX=0.004566;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.602;QD=37.7277;RBI=0.042157;REFB=-0.0599752;REVB=0.037356;RO=2;SAF=109;SAR=108;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.01037e-05;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000186531;OID=.;OPOS=9117867;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:219:218:2:0:217:218:108:109:1:1:108:110:0:0 chr18 9255982 . A G 894.23 PASS AO=71;DP=114;FAO=105;FDP=113;FR=.;FRO=8;FSAF=40;FSAR=65;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.0041644;FXX=0.0173898;HRUN=4;LEN=1;MLLD=37.6181;QD=31.6542;RBI=0.0563604;REFB=-0.157925;REVB=0.0562063;RO=0;SAF=39;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.500447;TYPE=snp;VARB=0.0121831;OID=.;OPOS=9255982;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:78:113:0:8:71:105:32:39:0:0:65:40:3:5 chr18 9256229 . C T 39.78 PASS AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.00219867;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.933;QD=12.2402;RBI=0.00795077;REFB=-0.00268609;REVB=0.00764072;RO=6;SAF=5;SAR=2;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0441607;STB=0.526239;TYPE=snp;VARB=0.00239928;OID=.;OPOS=9256229;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:13:13:6:6:7:7:2:5:4:2:2:5:4:2 chr18 9518126 . G A 565.47 PASS AO=180;DP=431;FAO=166;FDP=397;FR=.;FRO=231;FSAF=79;FSAR=87;FSRF=92;FSRR=139;FWDB=-0.0249987;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4342;QD=5.69739;RBI=0.0274402;REFB=-0.0193266;REVB=0.0113151;RO=249;SAF=88;SAR=92;SRF=100;SRR=149;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0914089;STB=0.545471;TYPE=snp;VARB=0.0198378;OID=.;OPOS=9518126;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:431:397:249:231:180:166:92:88:100:149:87:79:92:139 chr18 9562042 . C T 298.98 PASS AO=69;DP=134;FAO=68;FDP=134;FR=.;FRO=66;FSAF=28;FSAR=40;FSRF=27;FSRR=39;FWDB=-0.0290884;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.504;QD=8.92473;RBI=0.0305165;REFB=-0.0051478;REVB=-0.00922625;RO=64;SAF=29;SAR=40;SRF=26;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126412;STB=0.50136;TYPE=snp;VARB=0.00499826;OID=.;OPOS=9562042;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:64:66:69:68:40:29:26:38:40:28:27:39 chr18 9617988 . T G 70.62 PASS AO=24;DP=71;FAO=24;FDP=71;FR=.;FRO=47;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=27;FWDB=-0.00317011;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=291.588;QD=3.97872;RBI=0.00993844;REFB=-0.00120231;REVB=0.00941929;RO=47;SAF=12;SAR=12;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0845254;STB=0.549255;TYPE=snp;VARB=0.00343641;OID=.;OPOS=9617988;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:71:71:47:47:24:24:12:12:20:27:12:12:20:27 chr18 9618005 . A G 677.96 PASS AO=71;DP=75;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0468791;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.1365;QD=36.158;RBI=0.060993;REFB=0.00171372;REVB=0.0390191;RO=1;SAF=35;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129547;STB=0.506327;TYPE=snp;VARB=0.00165174;OID=.;OPOS=9618005;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:75:75:1:1:71:74:36:35:0:1:39:35:0:1 chr18 9618049 . C T 760.76 PASS AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.305;QD=38.5196;RBI=0.0202351;REFB=0;REVB=0.00498858;RO=0;SAF=38;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.47685e-05;OID=.;OPOS=9618049;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:79:79:0:0:79:79:41:38:0:0:41:38:0:0 chr18 9859341 . C T 207.26 PASS AO=42;DP=75;FAO=42;FDP=75;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=0.00856994;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.6179;QD=11.054;RBI=0.0109104;REFB=-0.0401684;REVB=-0.00675222;RO=30;SAF=14;SAR=28;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0557211;STB=0.529398;TYPE=snp;VARB=0.042183;OID=.;OPOS=9859341;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:30:33:42:42:28:14:12:18:28:14:13:20 chr18 9887149 . G C 86.09 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.454;QD=38.2609;RBI=0.0795748;REFB=0;REVB=0.0795748;RO=0;SAF=0;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00131731;OID=.;OPOS=9887149;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:9:0:0:0:9:0:0:0 chr18 9887497 . G A 241.74 PASS AO=27;DP=31;FAO=28;FDP=30;FR=.;FRO=2;FSAF=7;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0867507;FXX=0.0322477;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.8569;QD=32.2321;RBI=0.125523;REFB=-0.151375;REVB=0.0907218;RO=4;SAF=6;SAR=21;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0095318;STB=0.522711;TYPE=snp;VARB=0.015655;OID=.;OPOS=9887497;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:31:30:4:2:27:28:21:6:1:3:21:7:0:2 chr18 9888027 . C T 2372.93 PASS AO=248;DP=250;FAO=248;FDP=248;FR=.;FRO=0;FSAF=121;FSAR=127;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0935756;FXX=0.00799968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.4418;QD=38.2731;RBI=0.0944674;REFB=-0.0249279;REVB=0.0129496;RO=1;SAF=121;SAR=127;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00392325;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000261839;OID=.;OPOS=9888027;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:250:248:1:0:248:248:127:121:1:0:127:121:0:0 chr18 9923941 . C T 1825.73 PASS AO=190;DP=196;FAO=191;FDP=191;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0280967;FXX=0.0255089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.349;QD=38.2352;RBI=0.0281205;REFB=0;REVB=0.00115442;RO=0;SAF=80;SAR=110;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.80718e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.89358e-05;OID=.;OPOS=9923941;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:196:191:0:0:190:191:110:80:0:0:111:80:0:0 chr18 9955897 . CT C,CC 1384.92 PASS AO=98,37;DP=157;FAO=133,18;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=0,1;FSAR=133,17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0718383,0.0648288;FXX=0.0320492;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=248.955,242.138;QD=36.6866;RBI=0.0723159,0.0651856;REFB=0,0;REVB=-0.00829773,-0.00681107;RO=20;SAF=0,1;SAR=98,36;SRF=13;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.899132,-0.745176;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.00210132,0.00261523;OID=.,.;OPOS=9955898,9955898;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:98,37:155:133,18:151:0:0,1:133,17:0:0:6:20:0,1:98,36:13:7 chr18 9955960 . A G 1438.92 PASS AO=161;DP=168;FAO=161;FDP=168;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=157;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=-0.00599888;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=158.119;QD=34.26;RBI=0.0111762;REFB=-0.0230352;REVB=-0.00942984;RO=7;SAF=4;SAR=157;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0875562;STB=0.546271;TYPE=snp;VARB=0.000386833;OID=.;OPOS=9955960;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:168:168:7:7:161:161:157:4:1:6:157:4:1:6 chr18 10487784 . C A 121.36 PASS AO=31;DP=82;FAO=29;FDP=69;FR=.,HEALED;FRO=38;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=29;FWDB=-0.0119087;FXX=0.137483;HRUN=3;LEN=1;MLLD=133.458;QD=7.03522;RBI=0.01284;REFB=-0.019144;REVB=0.00480085;RO=35;SAF=12;SAR=19;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0956469;STB=0.624254;TYPE=snp;VARB=0.0130224;OID=.;OPOS=10487784;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:69:35:38:31:29:19:12:17:18:16:13:9:29 chr18 10691357 . G A 109.36 PASS AO=51;DP=175;FAO=51;FDP=175;FR=.;FRO=124;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=55;FSRR=69;FWDB=0.0149783;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=197.583;QD=2.49957;RBI=0.052887;REFB=-0.0110324;REVB=-0.0507216;RO=124;SAF=26;SAR=25;SRF=55;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0800786;STB=0.54686;TYPE=snp;VARB=0.0257498;OID=.;OPOS=10691357;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:175:124:124:51:51:25:26:55:69:25:26:55:69 chr18 10696227 . C T 353.25 PASS AO=101;DP=245;FAO=103;FDP=244;FR=.;FRO=141;FSAF=48;FSAR=55;FSRF=75;FSRR=66;FWDB=-0.0223229;FXX=0.0161284;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.83;QD=5.79103;RBI=0.0236724;REFB=-0.00623466;REVB=-0.00787846;RO=132;SAF=48;SAR=53;SRF=72;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.071384;STB=0.53805;TYPE=snp;VARB=0.00830971;OID=.;OPOS=10696227;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:245:244:132:141:101:103:53:48:72:60:55:48:75:66 chr18 10731428 . C T 114 PASS AO=25;DP=48;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=18;FWDB=0.0324093;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.1022;QD=9.70199;RBI=0.0364908;REFB=-0.0148416;REVB=-0.0167696;RO=23;SAF=17;SAR=8;SRF=5;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.386079;STB=0.71216;TYPE=snp;VARB=0.00965798;OID=.;OPOS=10731428;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:47:23:23:25:24:8:17:5:18:8:16:5:18 chr18 10741011 . G A 343.83 PASS AO=96;DP=222;FAO=96;FDP=223;FR=.;FRO=127;FSAF=50;FSAR=46;FSRF=84;FSRR=43;FWDB=0.000749809;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=233.114;QD=6.16739;RBI=0.00747678;REFB=0.015673;REVB=-0.00743909;RO=125;SAF=50;SAR=46;SRF=83;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14723;STB=0.580726;TYPE=snp;VARB=-0.0234586;OID=.;OPOS=10741011;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:223:125:127:96:96:46:50:83:42:46:50:84:43 chr18 10748603 . A T 208.16 PASS AO=48;DP=97;FAO=48;FDP=97;FR=.;FRO=49;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=30;FSRR=19;FWDB=-0.00516073;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.407;QD=8.58376;RBI=0.0076514;REFB=-0.00885337;REVB=0.00564896;RO=48;SAF=22;SAR=26;SRF=29;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131075;STB=0.577253;TYPE=snp;VARB=0.00517896;OID=.;OPOS=10748603;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:48:49:48:48:26:22:29:19:26:22:30:19 chr18 10750150 . G C 84.7 PASS AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=26;FWDB=0.0422475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2644;QD=7.05835;RBI=0.0482498;REFB=-0.00673679;REVB=-0.0233065;RO=27;SAF=5;SAR=16;SRF=1;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.338007;STB=0.686146;TYPE=snp;VARB=0.0059437;OID=.;OPOS=10750150;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:48:48:27:27:21:21:16:5:1:26:16:5:1:26 chr18 10758023 . G A 507.36 PASS AO=116;DP=227;FAO=116;FDP=226;FR=.;FRO=110;FSAF=73;FSAR=43;FSRF=63;FSRR=47;FWDB=-0.011551;FXX=0.00440509;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.452;QD=8.97986;RBI=0.0158896;REFB=-0.0128599;REVB=0.0109112;RO=108;SAF=73;SAR=43;SRF=61;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0597782;STB=0.529066;TYPE=snp;VARB=0.0124116;OID=.;OPOS=10758023;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:227:226:108:110:116:116:43:73:61:47:43:73:63:47 chr18 10759840 . C A 212.81 PASS AO=54;DP=121;FAO=55;FDP=122;FR=.;FRO=67;FSAF=20;FSAR=35;FSRF=26;FSRR=41;FWDB=-0.0118437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.028;QD=6.97736;RBI=0.0155636;REFB=-0.0154636;REVB=-0.0100972;RO=67;SAF=20;SAR=34;SRF=26;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0186912;STB=0.514372;TYPE=snp;VARB=0.0171516;OID=.;OPOS=10759840;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:122:67:67:54:55:34:20:26:41:35:20:26:41 chr18 10762962 . G A 372.61 PASS AO=90;DP=181;FAO=88;FDP=179;FR=.;FRO=91;FSAF=42;FSAR=46;FSRF=38;FSRR=53;FWDB=-0.0167927;FXX=0.0110491;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8469;QD=8.32657;RBI=0.0190617;REFB=0.0130505;REVB=0.00901948;RO=91;SAF=44;SAR=46;SRF=37;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0754286;STB=0.530486;TYPE=snp;VARB=-0.0160254;OID=.;OPOS=10762962;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:179:91:91:90:88:46:44:37:54:46:42:38:53 chr18 10763007 . T C 447.02 PASS AO=98;DP=185;FAO=98;FDP=185;FR=.;FRO=87;FSAF=46;FSAR=52;FSRF=34;FSRR=53;FWDB=-0.0104986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.35;QD=9.66524;RBI=0.0199351;REFB=0.00365934;REVB=-0.0169467;RO=86;SAF=46;SAR=52;SRF=33;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0739309;STB=0.537256;TYPE=snp;VARB=-0.00310185;OID=.;OPOS=10763007;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:185:86:87:98:98:52:46:33:53:52:46:34:53 chr18 10787047 . G A 969.49 PASS AO=102;DP=103;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162863;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.118;QD=38.0194;RBI=0.0263089;REFB=0;REVB=0.020662;RO=0;SAF=54;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.03919e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.7757e-05;OID=.;OPOS=10787047;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:103:102:0:0:102:102:48:54:0:0:48:54:0:0 chr18 11609903 . C G 1378.11 PASS AO=147;DP=147;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272198;FXX=0.0135126;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.606;QD=37.7566;RBI=0.034314;REFB=-0.063679;REVB=-0.0208934;RO=0;SAF=57;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.38161e-05;OID=.;OPOS=11609903;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:147:146:0:0:147:146:90:57:0:0:90:56:0:0 chr18 11609904 . A G 1422.06 PASS AO=149;DP=149;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.781;QD=38.4342;RBI=0.0249971;REFB=0;REVB=-0.0179819;RO=0;SAF=58;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.03408e-07;OID=.;OPOS=11609904;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:149:148:0:0:149:148:91:58:0:0:91:57:0:0 chr18 11610163 . G C 965.62 PASS AO=110;DP=116;FAO=111;FDP=118;FR=.;FRO=7;FSAF=32;FSAR=79;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=0.0163847;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9494;QD=32.7329;RBI=0.0334063;REFB=-0.0314316;REVB=-0.0291122;RO=6;SAF=31;SAR=79;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0834694;STB=0.549287;TYPE=snp;VARB=0.0173208;OID=.;OPOS=11610163;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:116:118:6:7:110:111:79:31:6:0:79:32:7:0 chr18 11610332 . G T 478.28 PASS AO=90;DP=190;FAO=107;FDP=204;FR=.;FRO=97;FSAF=60;FSAR=47;FSRF=46;FSRR=51;FWDB=-0.00150836;FXX=0.0144921;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.634;QD=9.37802;RBI=0.0180038;REFB=-0.0256898;REVB=0.0179405;RO=70;SAF=49;SAR=41;SRF=34;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0473008;STB=0.541329;TYPE=snp;VARB=0.025869;OID=.;OPOS=11610332;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:204:70:97:90:107:41:49:34:36:47:60:46:51 chr18 11610349 . G A 318.35 PASS AO=78;DP=183;FAO=85;FDP=189;FR=.;FRO=104;FSAF=37;FSAR=48;FSRF=58;FSRR=46;FWDB=0.0416634;FXX=0.0104707;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.1395;QD=6.73759;RBI=0.0743512;REFB=-0.0190659;REVB=0.0615814;RO=99;SAF=30;SAR=48;SRF=55;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173156;STB=0.567289;TYPE=snp;VARB=0.0225687;OID=.;OPOS=11610349;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:189:99:104:78:85:48:30:55:44:48:37:58:46 chr18 11610382 . C A 268.55 PASS AO=67;DP=157;FAO=71;FDP=160;FR=.;FRO=89;FSAF=27;FSAR=44;FSRF=40;FSRR=49;FWDB=-0.00619223;FXX=0.00621079;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.6191;QD=6.71381;RBI=0.0102657;REFB=0.0175898;REVB=-0.0081879;RO=87;SAF=23;SAR=44;SRF=38;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100946;STB=0.540014;TYPE=snp;VARB=-0.0206266;OID=.;OPOS=11610382;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:160:87:89:67:71:44:23:38:49:44:27:40:49 chr18 11619541 . G C 20.75 PASS AO=13;DP=63;FAO=13;FDP=63;FR=.;FRO=50;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=18;FSRR=32;FWDB=-0.00225949;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.6109;QD=1.31772;RBI=0.0356894;REFB=-0.00538762;REVB=-0.0356178;RO=50;SAF=10;SAR=3;SRF=18;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.485329;STB=0.806012;TYPE=snp;VARB=0.0517419;OID=.;OPOS=11619541;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:63:63:50:50:13:13:3:10:18:32:3:10:18:32 chr18 11619552 . C T 590.86 PASS AO=45;DP=65;FAO=63;FDP=63;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=22;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00177509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.557;QD=37.5147;RBI=0.0711355;REFB=0;REVB=0.0711133;RO=0;SAF=21;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00110416;OID=.;OPOS=11619552;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:63:63:0:0:45:63:24:21:0:0:41:22:0:0 chr18 11619799 . ATGT A 739.1 PASS AO=71;DP=111;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00876848;FXX=0.0238067;HRUN=1;LEN=3;MLLD=160.402;QD=36.0539;RBI=0.0309732;REFB=0.0259505;REVB=0.0297061;RO=1;SAF=29;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0160259;STB=0.506848;TYPE=del;VARB=-0.000105121;OID=.;OPOS=11619800;OREF=TGT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:71:78:81:82:1:36:45:1:0:29:1:29:42:1:0 chr18 11619908 . A G 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.030636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.907;QD=35.0875;RBI=0.0421762;REFB=0;REVB=-0.0289874;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.82985e-05;OID=.;OPOS=11619908;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:4:3:0:0:4:3:0:0 chr18 11621447 . A G 259.6 PASS AO=27;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.121223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.4059;QD=37.0863;RBI=0.13167;REFB=0;REVB=-0.0514007;RO=0;SAF=22;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00266698;OID=.;OPOS=11621447;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:28:28:0:0:27:28:5:22:0:0:5:23:0:0 chr18 11621458 . A G 186.79 PASS AO=20;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0424583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.924;QD=35.5791;RBI=0.0743339;REFB=0;REVB=0.0610149;RO=0;SAF=15;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000998819;OID=.;OPOS=11621458;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:21:21:0:0:20:21:5:15:0:0:5:16:0:0 chr18 11625886 . T C 1154.36 PASS AO=129;DP=132;FAO=129;FDP=131;FR=.;FRO=2;FSAF=83;FSAR=46;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0425812;FXX=0.00757518;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.665;QD=35.2476;RBI=0.0502223;REFB=-0.0743482;REVB=-0.0266293;RO=2;SAF=83;SAR=46;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0113132;STB=0.505951;TYPE=snp;VARB=0.00153394;OID=.;OPOS=11625886;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:132:131:2:2:129:129:46:83:2:0:46:83:2:0 chr18 11639356 . G C 2028.43 PASS AO=219;DP=219;FAO=218;FDP=218;FR=.;FRO=0;FSAF=144;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00322198;FXX=0.0180172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.576;QD=37.2189;RBI=0.0293952;REFB=-0.109477;REVB=0.0292181;RO=0;SAF=144;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000107362;OID=.;OPOS=11639356;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:219:218:0:0:219:218:75:144:0:0:74:144:0:0 chr18 11853053 . A G 1903.06 PASS AO=201;DP=202;FAO=199;FDP=199;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=146;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00986035;FXX=0.0148508;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.807;QD=38.2524;RBI=0.01059;REFB=0;REVB=-0.00386275;RO=0;SAF=54;SAR=147;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.33265e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.12027e-05;OID=.;OPOS=11853053;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:202:199:0:0:201:199:147:54:0:0:146:53:0:0 chr18 11853731 . A G 1350.72 PASS AO=138;DP=138;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0429573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.905;QD=38.5921;RBI=0.0439304;REFB=0;REVB=0.0091948;RO=0;SAF=64;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.14677e-05;OID=.;OPOS=11853731;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:138:140:0:0:138:140:74:64:0:0:75:65:0:0 chr18 11886563 . C G 2549.24 PASS AO=266;DP=267;FAO=267;FDP=267;FR=.;FRO=0;FSAF=137;FSAR=130;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0645135;FXX=0.0037312;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.862;QD=38.1909;RBI=0.0650062;REFB=-0.0782153;REVB=-0.00798769;RO=1;SAF=136;SAR=130;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00349282;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000184535;OID=.;OPOS=11886563;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:267:267:1:0:266:267:130:136:1:0:130:137:0:0 chr18 12057389 . C G 33.58 PASS AO=7;DP=20;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.0100455;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.614;QD=6.39651;RBI=0.0161966;REFB=-0.0266562;REVB=-0.0127051;RO=13;SAF=6;SAR=1;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260866;STB=0.545336;TYPE=snp;VARB=0.0329954;OID=.;OPOS=12057389;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:20:21:13:13:7:8:1:6:9:4:2:6:9:4 chr18 12057403 . A G 42.71 PASS AO=8;DP=22;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.0166382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.525;QD=7.11851;RBI=0.0188791;REFB=-0.0261842;REVB=-0.00892144;RO=14;SAF=5;SAR=3;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.020009;STB=0.526264;TYPE=snp;VARB=0.0319636;OID=.;OPOS=12057403;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:22:24:14:14:8:10:3:5:9:5:4:6:9:5 chr18 12057809 . G C 41.72 PASS AO=6;DP=9;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0824856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.565;QD=18.5406;RBI=0.0833479;REFB=-0.0339744;REVB=0.0119587;RO=3;SAF=5;SAR=1;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.354507;STB=0.713466;TYPE=snp;VARB=0.0273946;OID=.;OPOS=12057809;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:9:9:3:3:6:6:1:5:1:2:1:5:1:2 chr18 12094031 . G T 158.93 PASS AO=40;DP=88;FAO=40;FDP=87;FR=.;FRO=47;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=0.0595169;FXX=0.0113623;HRUN=5;LEN=1;MLLD=37.6297;QD=7.30707;RBI=0.0706135;REFB=-0.00901927;REVB=0.038;RO=46;SAF=24;SAR=16;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.097399;STB=0.549271;TYPE=snp;VARB=0.0111714;OID=.;OPOS=12094031;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:87:46:47:40:40:16:24:23:23:16:24:24:23 chr18 12096249 . G T 390.34 PASS AO=101;DP=223;FAO=101;FDP=220;FR=.;FRO=119;FSAF=45;FSAR=56;FSRF=56;FSRR=63;FWDB=0.00666565;FXX=0.0134523;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0498;QD=7.09717;RBI=0.00766092;REFB=-0.0170552;REVB=-0.00377608;RO=119;SAF=45;SAR=56;SRF=56;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0246859;STB=0.513665;TYPE=snp;VARB=0.0264897;OID=.;OPOS=12096249;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:220:119:119:101:101:56:45:56:63:56:45:56:63 chr18 12099654 . T C 281.36 PASS AO=79;DP=185;FAO=79;FDP=185;FR=.;FRO=106;FSAF=41;FSAR=38;FSRF=50;FSRR=56;FWDB=0.00688354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.48;QD=6.08335;RBI=0.00759327;REFB=-0.00471101;REVB=0.00320541;RO=106;SAF=41;SAR=38;SRF=50;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0484978;STB=0.527072;TYPE=snp;VARB=0.00703092;OID=.;OPOS=12099654;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:185:106:106:79:79:38:41:50:56:38:41:50:56 chr18 12115509 . G A 195.33 PASS AO=41;DP=76;FAO=41;FDP=76;FR=.;FRO=35;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=0.0122364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.037;QD=10.2805;RBI=0.0140751;REFB=-0.00203638;REVB=0.00695554;RO=34;SAF=23;SAR=18;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0746513;STB=0.534867;TYPE=snp;VARB=0.00230125;OID=.;OPOS=12115509;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:34:35:41:41:18:23:16:18:18:23:17:18 chr18 12125657 . G A 176.57 PASS AO=41;DP=93;FAO=44;FDP=95;FR=.;FRO=51;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=-0.00556918;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.649;QD=7.43438;RBI=0.0101815;REFB=-0.0116289;REVB=0.00852332;RO=51;SAF=24;SAR=17;SRF=24;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11422;STB=0.578066;TYPE=snp;VARB=0.0135497;OID=.;OPOS=12125657;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:95:51:51:41:44:17:24:24:27:17:27:24:27 chr18 12254956 . G A 80.18 PASS AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.000379433;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.9876;QD=8.43994;RBI=0.0462288;REFB=-0.0382859;REVB=0.0462272;RO=19;SAF=10;SAR=8;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0266391;STB=0.502955;TYPE=snp;VARB=0.0318273;OID=.;OPOS=12254956;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:38:38:19:20:18:18:8:10:10:9:8:10:11:9 chr18 12274104 . G T 748.26 PASS AO=68;DP=68;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.101124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.3382;QD=38.3724;RBI=0.107647;REFB=0;REVB=0.0369031;RO=0;SAF=42;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00090963;OID=.;OPOS=12274104;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:68:78:0:0:68:78:26:42:0:0:27:51:0:0 chr18 12308793 . G C 141.91 PASS AO=36;DP=81;FAO=36;FDP=81;FR=.;FRO=45;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=32;FWDB=-0.0134704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.956;QD=7.00801;RBI=0.0151721;REFB=-0.00411133;REVB=0.00698159;RO=45;SAF=14;SAR=22;SRF=13;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107168;STB=0.559968;TYPE=snp;VARB=0.00391037;OID=.;OPOS=12308793;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:45:45:36:36:22:14:13:32:22:14:13:32 chr18 12348285 . T C 146.04 PASS AO=52;DP=147;FAO=52;FDP=149;FR=.;FRO=97;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=41;FSRR=56;FWDB=-0.0181456;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.611;QD=3.92064;RBI=0.0200793;REFB=0.00835577;REVB=-0.00859724;RO=95;SAF=21;SAR=31;SRF=40;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200842;STB=0.512665;TYPE=snp;VARB=-0.0106016;OID=.;OPOS=12348285;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:149:95:97:52:52:31:21:40:55:31:21:41:56 chr18 12351342 . C T 515.17 PASS AO=128;DP=270;FAO=128;FDP=269;FR=.;FRO=141;FSAF=64;FSAR=64;FSRF=56;FSRR=85;FWDB=0.0148477;FXX=0.00370357;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.138;QD=7.66054;RBI=0.016204;REFB=-0.0181417;REVB=0.0064898;RO=141;SAF=64;SAR=64;SRF=56;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0979389;STB=0.553895;TYPE=snp;VARB=0.0220038;OID=.;OPOS=12351342;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:270:269:141:141:128:128:64:64:56:85:64:64:56:85 chr18 12427118 . A G 1206 PASS AO=127;DP=129;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124133;FXX=0.0155027;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.5752;QD=37.9844;RBI=0.0376218;REFB=-0.103031;REVB=0.0355149;RO=0;SAF=64;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.21543e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000432064;OID=.;OPOS=12427118;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:129:127:0:0:127:127:63:64:0:0:63:64:0:0 chr18 12635038 . A C 124.42 PASS AO=32;DP=72;FAO=32;FDP=73;FR=.;FRO=41;FSAF=8;FSAR=24;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=0.0040267;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=222.796;QD=6.81753;RBI=0.0102421;REFB=-0.00777716;REVB=-0.00941739;RO=40;SAF=8;SAR=24;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.363334;STB=0.712092;TYPE=snp;VARB=0.0202305;OID=.;OPOS=12635038;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:73:40:41:32:32:24:8:24:16:24:8:25:16 chr18 12658600 . A G 96.69 PASS AO=24;DP=55;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.0132579;FXX=0.0181785;HRUN=4;LEN=1;MLLD=204.392;QD=7.16189;RBI=0.0150515;REFB=-0.0129176;REVB=-0.00712573;RO=30;SAF=13;SAR=11;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.024699;STB=0.514007;TYPE=snp;VARB=0.0166678;OID=.;OPOS=12658600;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:55:54:30:30:24:24:11:13:17:13:11:13:17:13 chr18 12662148 . G A 277.09 PASS AO=69;DP=147;FAO=69;FDP=147;FR=.;FRO=78;FSAF=33;FSAR=36;FSRF=28;FSRR=50;FWDB=-0.0187214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.699;QD=7.53972;RBI=0.0217669;REFB=-0.00934189;REVB=-0.0111044;RO=78;SAF=33;SAR=36;SRF=28;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115277;STB=0.563748;TYPE=snp;VARB=0.0161216;OID=.;OPOS=12662148;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:147:78:78:69:69:36:33:28:50:36:33:28:50 chr18 12718593 . A G 414.45 PASS AO=104;DP=222;FAO=105;FDP=224;FR=.;FRO=119;FSAF=48;FSAR=57;FSRF=30;FSRR=89;FWDB=-0.010149;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3783;QD=7.40084;RBI=0.0105326;REFB=0.0118559;REVB=0.00281661;RO=117;SAF=48;SAR=56;SRF=29;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211137;STB=0.611819;TYPE=snp;VARB=-0.0149144;OID=.;OPOS=12718593;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:224:117:119:104:105:56:48:29:88:57:48:30:89 chr18 12760740 . T A 915.67 PASS AO=101;DP=104;FAO=101;FDP=104;FR=.;FRO=3;FSAF=48;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0328535;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.1619;QD=35.2182;RBI=0.0452757;REFB=-0.14862;REVB=0.0311535;RO=0;SAF=48;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11453e-08;STB=0.513759;TYPE=snp;VARB=0.00419654;OID=.;OPOS=12760740;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:104:104:0:3:101:101:53:48:0:0:53:48:0:3 chr18 12819218 . G A 373.3 PASS AO=95;DP=195;FAO=94;FDP=197;FR=.;FRO=103;FSAF=29;FSAR=65;FSRF=39;FSRR=64;FWDB=-0.0363238;FXX=0.00505025;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.485;QD=7.57971;RBI=0.0744818;REFB=-0.0260439;REVB=-0.065024;RO=99;SAF=30;SAR=65;SRF=37;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0604858;STB=0.541591;TYPE=snp;VARB=0.0331932;OID=.;OPOS=12819218;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:197:99:103:95:94:65:30:37:62:65:29:39:64 chr18 12984144 . C A 172.37 PASS AO=41;DP=82;FAO=40;FDP=82;FR=.;FRO=42;FSAF=6;FSAR=34;FSRF=14;FSRR=28;FWDB=-0.0239292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.583;QD=8.40831;RBI=0.0240901;REFB=-0.0184334;REVB=-0.00277964;RO=41;SAF=6;SAR=35;SRF=14;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.271258;STB=0.646304;TYPE=snp;VARB=0.0129296;OID=.;OPOS=12984144;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:41:42:41:40:35:6:14:27:34:6:14:28 chr18 13068132 . T C 485.74 PASS AO=97;DP=211;FAO=115;FDP=228;FR=.;FRO=113;FSAF=55;FSAR=60;FSRF=48;FSRR=65;FWDB=0.0648997;FXX=0.0172406;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.432;QD=8.52178;RBI=0.0652164;REFB=-0.0150756;REVB=0.00641977;RO=111;SAF=36;SAR=61;SRF=48;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0621646;STB=0.526614;TYPE=snp;VARB=0.0168998;OID=.;OPOS=13068132;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:228:111:113:97:115:61:36:48:63:60:55:48:65 chr18 13069782 . C T 265.42 PASS AO=47;DP=97;FAO=47;FDP=93;FR=.,HEALED;FRO=38;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=29;FSRR=9;FWDB=0.0169079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.1666;QD=11.416;RBI=0.0220578;REFB=-0.0375115;REVB=0.0141658;RO=27;SAF=26;SAR=21;SRF=19;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103462;STB=0.588509;TYPE=snp;VARB=0.0142385;OID=.;OPOS=13069782;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:93:27:38:47:47:21:26:19:8:20:27:29:9 chr18 13095609 . T C 432.48 PASS AO=99;DP=199;FAO=100;FDP=199;FR=.;FRO=99;FSAF=40;FSAR=60;FSRF=46;FSRR=53;FWDB=-0.053519;FXX=0.00499975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.044;QD=8.69297;RBI=0.053673;REFB=0.00123596;REVB=-0.00406289;RO=95;SAF=39;SAR=60;SRF=45;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0731851;STB=0.533051;TYPE=snp;VARB=-0.00132527;OID=.;OPOS=13095609;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:199:199:95:99:99:100:60:39:45:50:60:40:46:53 chr18 13116432 . G T 735.26 PASS AO=220;DP=515;FAO=185;FDP=391;FR=.;FRO=206;FSAF=81;FSAR=104;FSRF=95;FSRR=111;FWDB=0.0381665;FXX=0.0224994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.708;QD=7.52187;RBI=0.0383334;REFB=0.000380029;REVB=-0.00357319;RO=286;SAF=99;SAR=121;SRF=128;SRR=158;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00252243;STB=0.512443;TYPE=snp;VARB=-0.00040735;OID=.;OPOS=13116432;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:515:391:286:206:220:185:121:99:128:158:104:81:95:111 chr18 13650245 . T TTGC 216.63 PASS AO=56;DP=168;FAO=61;FDP=145;FR=.;FRO=84;FSAF=13;FSAR=48;FSRF=37;FSRR=47;FWDB=-0.0189996;FXX=0.0584378;HRUN=3;LEN=3;MLLD=164.573;QD=5.97602;RBI=0.0279014;REFB=-0.0416971;REVB=0.0204329;RO=105;SAF=12;SAR=44;SRF=47;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.309833;STB=0.66019;TYPE=ins;VARB=0.0613698;OID=.;OPOS=13650246;OREF=-;OALT=TGC;OMAPALT=TTGC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:56:168:61:145:84:13:48:37:47:99:105:12:44:47:58 chr18 13715334 . A G 372.07 PASS AO=75;DP=155;FAO=86;FDP=166;FR=.;FRO=80;FSAF=52;FSAR=34;FSRF=41;FSRR=39;FWDB=0.120331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.241;QD=8.96547;RBI=0.120363;REFB=-0.0138398;REVB=-0.0027405;RO=78;SAF=41;SAR=34;SRF=42;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00764064;STB=0.545548;TYPE=snp;VARB=0.0129361;OID=.;OPOS=13715334;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:166:78:80:75:86:34:41:42:36:34:52:41:39 chr18 13760290 . T C 536.62 PASS AO=142;DP=314;FAO=143;FDP=313;FR=.;FRO=170;FSAF=82;FSAR=61;FSRF=84;FSRR=86;FWDB=0.0347613;FXX=0.00318461;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.5953;QD=6.85778;RBI=0.0732173;REFB=-0.0352419;REVB=-0.0644393;RO=171;SAF=81;SAR=61;SRF=84;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0788075;STB=0.543456;TYPE=snp;VARB=0.0415514;OID=.;OPOS=13760290;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:314:313:171:170:142:143:61:81:84:87:61:82:84:86 chr18 13826088 . C T 322.37 PASS AO=59;DP=99;FAO=61;FDP=101;FR=.;FRO=40;FSAF=23;FSAR=38;FSRF=12;FSRR=28;FWDB=0.0188781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.943;QD=12.7672;RBI=0.0342474;REFB=-0.020188;REVB=-0.0285746;RO=40;SAF=23;SAR=36;SRF=12;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0713237;STB=0.532995;TYPE=snp;VARB=0.011829;OID=.;OPOS=13826088;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:101:40:40:59:61:36:23:12:28:38:23:12:28 chr18 13826391 . C G 10.89 PASS AO=3;DP=14;FAO=3;FDP=14;FR=.;FRO=11;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.0382249;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.427;QD=3.11202;RBI=0.0520979;REFB=-0.00491913;REVB=-0.0353984;RO=11;SAF=1;SAR=2;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.318673;STB=0.725859;TYPE=snp;VARB=0.0198175;OID=.;OPOS=13826391;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:14:14:11:11:3:3:2:1:7:4:2:1:7:4 chr18 13826508 . C T 209.67 PASS AO=51;DP=108;FAO=51;FDP=108;FR=.;FRO=57;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=34;FSRR=23;FWDB=0.00201493;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.055;QD=7.76568;RBI=0.0233227;REFB=-0.00960134;REVB=0.0232355;RO=56;SAF=20;SAR=31;SRF=34;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20213;STB=0.607801;TYPE=snp;VARB=0.00938558;OID=.;OPOS=13826508;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:56:57:51:51:31:20:34:22:31:20:34:23 chr18 13826837 . A C 104.56 PASS AO=24;DP=60;FAO=27;FDP=62;FR=.;FRO=35;FSAF=4;FSAR=23;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.0123375;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.018;QD=6.74559;RBI=0.0319593;REFB=0.00596347;REVB=0.0294819;RO=31;SAF=2;SAR=22;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.564907;STB=0.732283;TYPE=snp;VARB=-0.00779627;OID=.;OPOS=13826837;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:62:31:35:24:27:22:2:15:16:23:4:16:19 chr18 14105098 . C T 10.72 PASS AO=6;DP=31;FAO=6;FDP=33;FR=.;FRO=27;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.0921874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.5632;QD=1.29955;RBI=0.0934723;REFB=-0.0221892;REVB=-0.0154451;RO=24;SAF=5;SAR=1;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.457624;STB=0.82364;TYPE=snp;VARB=0.326953;OID=.;OPOS=14105098;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:31:33:24:27:6:6:1:5:11:13:1:5:12:15 chr18 14105923 . T C 1023.44 PASS AO=124;DP=140;FAO=125;FDP=140;FR=.;FRO=15;FSAF=64;FSAR=61;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.00576599;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=183.461;QD=29.2412;RBI=0.00638258;REFB=-0.149432;REVB=-0.00273691;RO=3;SAF=64;SAR=60;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0217469;STB=0.509437;TYPE=snp;VARB=0.000933125;OID=.;OPOS=14105923;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:140:140:3:15:124:125:60:64:3:0:61:64:9:6 chr18 14124364 . T G 325.38 PASS AO=69;DP=128;FAO=69;FDP=128;FR=.;FRO=59;FSAF=26;FSAR=43;FSRF=34;FSRR=25;FWDB=-0.00544905;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=174.37;QD=10.1682;RBI=0.01479;REFB=-0.00484832;REVB=0.0137496;RO=59;SAF=26;SAR=43;SRF=34;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1702;STB=0.593349;TYPE=snp;VARB=0.00379408;OID=.;OPOS=14124364;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:59:59:69:69:43:26:34:25:43:26:34:25 chr18 14183720 . C T 2693.21 PASS AO=283;DP=284;FAO=283;FDP=283;FR=.;FRO=0;FSAF=133;FSAR=150;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.031799;FXX=0.003521;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.4864;QD=38.0665;RBI=0.0334203;REFB=0.0199039;REVB=-0.0102828;RO=1;SAF=133;SAR=150;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00316863;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.98753e-05;OID=.;OPOS=14183720;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:284:283:1:0:283:283:150:133:0:1:150:133:0:0 chr18 14183979 . G A 12.43 PASS AO=10;DP=60;FAO=10;FDP=59;FR=.;FRO=49;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=-0.0269599;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.332;QD=0.842535;RBI=0.0380941;REFB=-0.00308063;REVB=-0.0269134;RO=48;SAF=2;SAR=8;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.427556;STB=0.782635;TYPE=snp;VARB=0.0576332;OID=.;OPOS=14183979;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:60:59:48:49:10:10:8:2:26:22:8:2:26:23 chr18 14186497 . G C 677.1 PASS AO=69;DP=69;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00338713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.704;QD=38.6914;RBI=0.0234309;REFB=0;REVB=0.0231848;RO=0;SAF=26;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.41541e-05;OID=.;OPOS=14186497;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:69:70:0:0:69:70:43:26:0:0:44:26:0:0 chr18 14187273 . C G 36.92 PASS AO=18;DP=71;FAO=18;FDP=71;FR=.;FRO=53;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=30;FWDB=-0.009332;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.064;QD=2.07996;RBI=0.00976263;REFB=-0.00702458;REVB=0.00286751;RO=53;SAF=6;SAR=12;SRF=23;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130015;STB=0.579908;TYPE=snp;VARB=0.0311731;OID=.;OPOS=14187273;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:71:71:53:53:18:18:12:6:23:30:12:6:23:30 chr18 14187304 . G A 45.44 PASS AO=21;DP=78;FAO=21;FDP=78;FR=.;FRO=57;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=26;FSRR=31;FWDB=-0.0336431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.637;QD=2.33032;RBI=0.0336442;REFB=-0.00184954;REVB=0.000270102;RO=57;SAF=7;SAR=14;SRF=26;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155926;STB=0.594502;TYPE=snp;VARB=0.0065727;OID=.;OPOS=14187304;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:78:78:57:57:21:21:14:7:26:31:14:7:26:31 chr18 14533105 . G C 1449.61 PASS AO=152;DP=152;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.888;QD=38.1476;RBI=0.0244511;REFB=0;REVB=0.0145844;RO=0;SAF=104;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.11685e-05;OID=.;OPOS=14533105;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:152:152:0:0:152:152:48:104:0:0:48:104:0:0 chr18 14542890 . G C 171.32 PASS AO=20;DP=22;FAO=21;FDP=23;FR=.;FRO=2;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0373334;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.807;QD=29.7943;RBI=0.045081;REFB=-0.0213214;REVB=-0.0252688;RO=2;SAF=7;SAR=13;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0657793;STB=0.535681;TYPE=snp;VARB=0.00407228;OID=.;OPOS=14542890;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:22:23:2:2:20:21:13:7:0:2:13:8:0:2 chr18 14543139 . T C 880.3 PASS AO=62;DP=89;FAO=92;FDP=92;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=44;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.259156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.1416;QD=38.2738;RBI=0.262704;REFB=0;REVB=0.0430276;RO=0;SAF=14;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.84193e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00226779;OID=.;OPOS=14543139;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:92:92:0:0:62:92:48:14:0:0:48:44:0:0 chr18 14752957 . G A 1491.85 PASS AO=155;DP=157;FAO=156;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0205611;FXX=0.00636902;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.167;QD=38.2525;RBI=0.0323756;REFB=0;REVB=0.0250084;RO=0;SAF=53;SAR=102;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.90221e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.11119e-05;OID=.;OPOS=14752957;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:157:156:0:0:155:156:102:53:0:0:103:53:0:0 chr18 14759244 . G C 1554.06 PASS AO=173;DP=181;FAO=174;FDP=181;FR=.;FRO=7;FSAF=82;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0.000367882;FXX=0.0054942;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.674;QD=34.3439;RBI=0.0177014;REFB=-0.00957068;REVB=0.0176975;RO=7;SAF=82;SAR=91;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0352112;STB=0.518323;TYPE=snp;VARB=1.98815e-05;OID=.;OPOS=14759244;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:181:181:7:7:173:174:91:82:0:7:92:82:0:7 chr18 14848820 . C T 1258.88 PASS AO=137;DP=141;FAO=137;FDP=140;FR=.;FRO=3;FSAF=71;FSAR=66;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.024867;FXX=0.0070917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.302;QD=35.9679;RBI=0.0588453;REFB=0.02727;REVB=-0.0533329;RO=3;SAF=71;SAR=66;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00753808;STB=0.503966;TYPE=snp;VARB=-0.00103421;OID=.;OPOS=14848820;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:141:140:3:3:137:137:66:71:1:2:66:71:1:2 chr18 14852335 . C A 98.04 PASS AO=9;DP=9;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0493767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.349;QD=39.2166;RBI=0.0633026;REFB=0;REVB=0.0396126;RO=0;SAF=0;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000882133;OID=.;OPOS=14852335;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:10:0:0:9:10:9:0:0:0:9:1:0:0 chr18 19034556 . T C 547.98 PASS AO=148;DP=345;FAO=154;FDP=351;FR=.;FRO=197;FSAF=53;FSAR=101;FSRF=81;FSRR=116;FWDB=0.000649185;FXX=0.00284083;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.944;QD=6.24473;RBI=0.0203079;REFB=-0.00256106;REVB=-0.0202975;RO=194;SAF=48;SAR=100;SRF=80;SRR=114;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0983892;STB=0.540598;TYPE=snp;VARB=0.00312109;OID=.;OPOS=19034556;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:345:351:194:197:148:154:100:48:80:114:101:53:81:116 chr18 19079853 . A G 902.19 PASS AO=96;DP=97;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00382523;FXX=0.0103082;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.226;QD=37.5911;RBI=0.00488907;REFB=-0.0462921;REVB=-0.00304477;RO=1;SAF=24;SAR=72;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00654201;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.14545e-06;OID=.;OPOS=19079853;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:97:96:1:0:96:96:72:24:0:1:72:24:0:0 chr18 19100758 . A ATCT 416.44 PASS AO=73;DP=134;FAO=77;FDP=124;FR=.;FRO=47;FSAF=12;FSAR=65;FSRF=42;FSRR=5;FWDB=-0.0230431;FXX=0.0387567;HRUN=1;LEN=3;MLLD=171.576;QD=13.4336;RBI=0.039324;REFB=-0.0114037;REVB=-0.0318652;RO=56;SAF=12;SAR=61;SRF=49;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.584919;STB=0.80681;TYPE=ins;VARB=0.00975518;OID=.;OPOS=19100759;OREF=-;OALT=TCT;OMAPALT=ATCT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:73:134:77:124:47:12:65:42:5:99:56:12:61:49:7 chr18 19119974 . GAT G 278.8 PASS AO=55;DP=272;FAO=77;FDP=172;FR=.;FRO=95;FSAF=25;FSAR=52;FSRF=39;FSRR=56;FWDB=0.0579889;FXX=0.139993;HRUN=1;LEN=2;MLLD=66.2214;QD=6.48364;RBI=0.0579926;REFB=-0.0696933;REVB=0.000649105;RO=80;SAF=18;SAR=37;SRF=28;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.026841;STB=0.552076;TYPE=del;VARB=0.0845673;OID=.;OPOS=19119975;OREF=AT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:55:187:77:172:95:25:52:39:56:99:80:18:37:28:52 chr18 19153494 . C T 771.75 PASS AO=169;DP=319;FAO=169;FDP=317;FR=.;FRO=148;FSAF=66;FSAR=103;FSRF=83;FSRR=65;FWDB=-0.0286343;FXX=0.00937471;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.0048;QD=9.73819;RBI=0.0299952;REFB=-0.00444053;REVB=-0.00893247;RO=147;SAF=66;SAR=103;SRF=83;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15038;STB=0.580546;TYPE=snp;VARB=0.00322294;OID=.;OPOS=19153494;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:319:317:147:148:169:169:103:66:83:64:103:66:83:65 chr18 19154143 . G A 904.54 PASS AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.915;QD=38.0859;RBI=0.0367925;REFB=0;REVB=-0.0344614;RO=0;SAF=42;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.69587e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.0776e-05;OID=.;OPOS=19154143;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:95:95:0:0:95:95:53:42:0:0:53:42:0:0 chr18 19373962 . T TATG 719.08 PASS AO=76;DP=82;FAO=78;FDP=79;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0128931;FXX=0.0246883;HRUN=0;LEN=3;MLLD=219.672;QD=36.4089;RBI=0.0130497;REFB=-0.0999791;REVB=0.00201554;RO=3;SAF=33;SAR=43;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.016941;STB=0.505746;TYPE=ins;VARB=2.59708e-05;OID=.;OPOS=19373963;OREF=-;OALT=ATG;OMAPALT=TATG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:76:82:78:79:1:35:43:0:1:27:3:33:43:2:1 chr18 19450386 . T C 697.5 PASS AO=74;DP=76;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0176422;FXX=0.0384566;HRUN=4;LEN=1;MLLD=94.3607;QD=37.1998;RBI=0.0177739;REFB=-0.0907557;REVB=-0.00215987;RO=1;SAF=37;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126148;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00120716;OID=.;OPOS=19450386;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:76:75:1:0:74:75:37:37:0:1:38:37:0:0 chr18 19508949 . G A 856.28 PASS AO=93;DP=94;FAO=92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0158223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.295;QD=36.8292;RBI=0.0176218;REFB=-0.0721441;REVB=-0.0077577;RO=1;SAF=46;SAR=47;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101954;STB=0.505493;TYPE=snp;VARB=0.000432272;OID=.;OPOS=19508949;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:94:93:1:1:93:92:47:46:1:0:47:45:1:0 chr18 19840623 . A G 1442.45 PASS AO=148;DP=149;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.142712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.6196;QD=38.4653;RBI=0.142813;REFB=0;REVB=-0.00538277;RO=1;SAF=48;SAR=100;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00980479;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000511767;OID=.;OPOS=19840623;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:149:150:1:0:148:150:100:48:1:0:100:50:0:0 chr18 19995753 . T C 141.29 PASS AO=46;DP=123;FAO=46;FDP=124;FR=.;FRO=78;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=35;FSRR=43;FWDB=0.0156614;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.118;QD=4.55761;RBI=0.0175692;REFB=-0.00110226;REVB=-0.00796228;RO=76;SAF=23;SAR=23;SRF=35;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0432195;STB=0.532244;TYPE=snp;VARB=0.00192403;OID=.;OPOS=19995753;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:124:76:78:46:46:23:23:35:41:23:23:35:43 chr18 20577669 . G A 107.12 PASS AO=26;DP=57;FAO=26;FDP=57;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=0.00954673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.384;QD=7.51706;RBI=0.00968017;REFB=-0.00119305;REVB=0.00160178;RO=31;SAF=14;SAR=12;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00961627;STB=0.505431;TYPE=snp;VARB=0.00167063;OID=.;OPOS=20577669;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:31:31:26:26:12:14:17:14:12:14:17:14 chr18 20838286 . G T 593.76 PASS AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0522577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0971;QD=37.6992;RBI=0.0537959;REFB=0;REVB=0.0127723;RO=0;SAF=23;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75648e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000833996;OID=.;OPOS=20838286;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:62:63:0:0:62:63:39:23:0:0:39:24:0:0 chr18 20953720 . G A 85.03 PASS AO=26;DP=65;FAO=25;FDP=65;FR=.;FRO=40;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=0.015261;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.901;QD=5.2327;RBI=0.0532693;REFB=0.00495717;REVB=0.0510365;RO=39;SAF=11;SAR=15;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147556;STB=0.567514;TYPE=snp;VARB=-0.00591495;OID=.;OPOS=20953720;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:65:65:39:40:26:25:15:11:22:17:14:11:22:18 chr18 21017836 . T C 84.08 PASS AO=24;DP=28;FAO=19;FDP=28;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=18;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.0107713;FXX=0.0666445;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.83;QD=12.0114;RBI=0.0296539;REFB=-0.0755846;REVB=0.0276284;RO=4;SAF=5;SAR=19;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0881717;STB=0.830288;TYPE=snp;VARB=0.0163796;OID=.;OPOS=21017836;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:28:28:4:9:24:19:19:5:0:4:18:1:5:4 chr18 21100240 . C T 797.65 PASS AO=179;DP=343;FAO=179;FDP=342;FR=.;FRO=163;FSAF=52;FSAR=127;FSRF=52;FSRR=111;FWDB=0.00440531;FXX=0.00291537;HRUN=3;LEN=1;MLLD=117.436;QD=9.32918;RBI=0.0192654;REFB=-0.0234853;REVB=0.018755;RO=161;SAF=52;SAR=127;SRF=51;SRR=110;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0272869;STB=0.516258;TYPE=snp;VARB=0.0182336;OID=.;OPOS=21100240;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:343:342:161:163:179:179:127:52:51:110:127:52:52:111 chr18 21109250 . T C 131.1 PASS AO=30;DP=62;FAO=30;FDP=62;FR=.;FRO=32;FSAF=24;FSAR=6;FSRF=22;FSRR=10;FWDB=0.0173477;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=99.4514;QD=8.45788;RBI=0.0252449;REFB=-0.00434484;REVB=-0.0183402;RO=32;SAF=24;SAR=6;SRF=22;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144777;STB=0.581759;TYPE=snp;VARB=0.00501003;OID=.;OPOS=21109250;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:32:32:30:30:6:24:22:10:6:24:22:10 chr18 21111680 . GT G 120.76 PASS AO=115;DP=415;FAO=151;FDP=349;FR=.;FRO=198;FSAF=83;FSAR=68;FSRF=62;FSRR=136;FWDB=-0.127643;FXX=0.116453;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.28867;QD=1.3841;RBI=0.271615;REFB=-0.107388;REVB=0.239753;RO=173;SAF=73;SAR=42;SRF=48;SRR=125;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.369774;STB=0.631963;TYPE=del;VARB=0.116763;OID=.;OPOS=21111681;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:115:363:151:349:198:83:68:62:136:99:173:73:42:48:125 chr18 21111691 . TA T 23.02 PASS AO=80;DP=373;FAO=81;FDP=330;FR=.;FRO=249;FSAF=38;FSAR=43;FSRF=87;FSRR=162;FWDB=-0.098489;FXX=0.043477;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.7881;QD=0.279018;RBI=0.112916;REFB=-0.0739593;REVB=0.0552265;RO=216;SAF=38;SAR=42;SRF=74;SRR=142;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167205;STB=0.591699;TYPE=del;VARB=0.0940428;OID=.;OPOS=21111692;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:80:335:81:330:249:38:43:87:162:23:216:38:42:74:142 chr18 21119777 . G A 346.45 PASS AO=92;DP=205;FAO=92;FDP=205;FR=.;FRO=113;FSAF=43;FSAR=49;FSRF=46;FSRR=67;FWDB=-0.023946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.038;QD=6.76003;RBI=0.0240748;REFB=-0.00392321;REVB=0.00248745;RO=113;SAF=43;SAR=49;SRF=46;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0604626;STB=0.533526;TYPE=snp;VARB=0.00457844;OID=.;OPOS=21119777;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:205:113:113:92:92:49:43:46:67:49:43:46:67 chr18 21120444 . T C 139.89 PASS AO=31;DP=62;FAO=31;FDP=62;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.00353154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.391;QD=9.02539;RBI=0.0469521;REFB=-0.0232587;REVB=0.0468191;RO=30;SAF=14;SAR=17;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133803;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.028426;OID=.;OPOS=21120444;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:30:31:31:31:17:14:14:16:17:14:14:17 chr18 21124945 . C G 208.59 PASS AO=55;DP=125;FAO=55;FDP=124;FR=.;FRO=69;FSAF=18;FSAR=37;FSRF=33;FSRR=36;FWDB=0.0380059;FXX=0.0158718;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.6714;QD=6.72876;RBI=0.0390399;REFB=-0.00141111;REVB=0.00892548;RO=69;SAF=18;SAR=37;SRF=33;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159683;STB=0.58947;TYPE=snp;VARB=0.00249413;OID=.;OPOS=21124945;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:124:69:69:55:55:37:18:33:36:37:18:33:36 chr18 21140432 . T C 85.97 PASS AO=19;DP=41;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=17;FWDB=-0.026469;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.8755;QD=8.59699;RBI=0.0269069;REFB=0.00852065;REVB=-0.00483436;RO=21;SAF=9;SAR=10;SRF=4;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.269829;STB=0.651332;TYPE=snp;VARB=-0.00413285;OID=.;OPOS=21140432;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:41:40:21:21:19:19:10:9:4:17:10:9:4:17 chr18 21413869 . T C 1325.05 PASS AO=113;DP=192;FAO=138;FDP=139;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=66;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0158577;FXX=0.0141834;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.199;QD=38.1309;RBI=0.150458;REFB=0;REVB=0.14962;RO=0;SAF=94;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000600821;OID=.;OPOS=21413869;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:192:139:0:0:113:138:19:94:0:0:72:66:0:0 chr18 21424991 . C A 451.09 PASS AO=97;DP=180;FAO=97;FDP=181;FR=.;FRO=84;FSAF=45;FSAR=52;FSRF=35;FSRR=49;FWDB=-0.0322205;FXX=0.0054942;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.601;QD=9.96877;RBI=0.0472402;REFB=-0.00228368;REVB=-0.0345467;RO=83;SAF=45;SAR=52;SRF=35;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0359408;STB=0.522109;TYPE=snp;VARB=0.00204498;OID=.;OPOS=21424991;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:181:83:84:97:97:52:45:35:48:52:45:35:49 chr18 21427606 . G A 23.72 PASS AO=8;DP=32;FAO=9;FDP=33;FR=.;FRO=24;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=0.00186675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.041;QD=2.87463;RBI=0.00981603;REFB=-0.0109405;REVB=-0.00963689;RO=24;SAF=2;SAR=6;SRF=7;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0620461;STB=0.567408;TYPE=snp;VARB=0.034225;OID=.;OPOS=21427606;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:32:33:24:24:8:9:6:2:7:17:7:2:7:17 chr18 21437931 . G C 276.24 PASS AO=88;DP=228;FAO=88;FDP=227;FR=.;FRO=139;FSAF=41;FSAR=47;FSRF=57;FSRR=82;FWDB=0.000550403;FXX=0.00438577;HRUN=3;LEN=1;MLLD=229.005;QD=4.86764;RBI=0.00614896;REFB=-0.00120685;REVB=0.00612428;RO=138;SAF=41;SAR=47;SRF=56;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0659063;STB=0.534505;TYPE=snp;VARB=0.00192052;OID=.;OPOS=21437931;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:228:227:138:139:88:88:47:41:56:82:47:41:57:82 chr18 21441717 . C T 76.08 PASS AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=44;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.00739465;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=99.681;QD=6.91635;RBI=0.025208;REFB=-0.00960562;REVB=-0.024099;RO=24;SAF=4;SAR=15;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20557;STB=0.636206;TYPE=snp;VARB=0.016532;OID=.;OPOS=21441717;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:43:44:24:25:19:19:15:4:9:15:15:4:10:15 chr18 21511089 . A G 2245.98 PASS AO=236;DP=240;FAO=241;FDP=241;FR=.;FRO=0;FSAF=138;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0338015;FXX=0.0122946;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.518;QD=37.2777;RBI=0.036199;REFB=-0.0445155;REVB=0.012955;RO=1;SAF=135;SAR=101;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00351732;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0012195;OID=.;OPOS=21511089;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:240:241:1:0:236:241:101:135:1:0:103:138:0:0 chr18 21710321 . C T 2915.91 PASS AO=303;DP=303;FAO=304;FDP=304;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=258;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00598908;FXX=0.00327858;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.252;QD=38.3672;RBI=0.010812;REFB=0;REVB=0.00900168;RO=0;SAF=47;SAR=256;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.80404e-05;OID=.;OPOS=21710321;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:303:304:0:0:303:304:256:47:0:0:258:46:0:0 chr18 21736933 . T G 362.72 PASS AO=101;DP=237;FAO=102;FDP=238;FR=.;FRO=136;FSAF=54;FSAR=48;FSRF=67;FSRR=69;FWDB=0.00495423;FXX=0.00418393;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.128;QD=6.0962;RBI=0.00532604;REFB=0.00147093;REVB=-0.00195507;RO=134;SAF=53;SAR=48;SRF=65;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0406311;STB=0.521025;TYPE=snp;VARB=-0.00212253;OID=.;OPOS=21736933;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:237:238:134:136:101:102:48:53:65:69:48:54:67:69 chr18 21739725 . T C 240.76 PASS AO=62;DP=142;FAO=63;FDP=141;FR=.;FRO=78;FSAF=27;FSAR=36;FSRF=24;FSRR=54;FWDB=-0.0170707;FXX=0.00704176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.786;QD=6.83016;RBI=0.0170808;REFB=0.00553948;REVB=-0.000587572;RO=77;SAF=27;SAR=35;SRF=23;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141655;STB=0.569599;TYPE=snp;VARB=-0.00735333;OID=.;OPOS=21739725;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:141:77:78:62:63:35:27:23:54:36:27:24:54 chr18 21759055 . G C 1089.41 PASS AO=109;DP=110;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0197828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.547;QD=37.8924;RBI=0.0205698;REFB=0;REVB=0.00563543;RO=0;SAF=78;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000311502;OID=.;OPOS=21759055;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:110:115:0:0:109:115:31:78:0:0:35:80:0:0 chr18 21759190 . G C 99.62 PASS AO=15;DP=46;FAO=21;FDP=39;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=18;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.207922;FXX=0.0487686;HRUN=3;LEN=1;MLLD=29.4357;QD=10.2172;RBI=0.303483;REFB=-0.0982036;REVB=-0.221067;RO=4;SAF=12;SAR=3;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0290643;STB=0.673963;TYPE=snp;VARB=0.070113;OID=.;OPOS=21759190;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:35:39:4:18:15:21:3:12:3:1:3:18:11:7 chr18 22020467 . T A 252.39 PASS AO=61;DP=131;FAO=62;FDP=131;FR=.;FRO=69;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=25;FSRR=44;FWDB=0.00817251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.8701;QD=7.70645;RBI=0.0539189;REFB=-0.00527442;REVB=0.0532959;RO=69;SAF=26;SAR=35;SRF=25;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.063208;STB=0.531144;TYPE=snp;VARB=0.00432124;OID=.;OPOS=22020467;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:69:69:61:62:35:26:25:44:36:26:25:44 chr18 22020543 . C G 180.9 PASS AO=55;DP=140;FAO=55;FDP=140;FR=.;FRO=85;FSAF=17;FSAR=38;FSRF=32;FSRR=53;FWDB=-0.0205113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.946;QD=5.16873;RBI=0.0207958;REFB=-0.00375619;REVB=0.00342797;RO=83;SAF=17;SAR=38;SRF=32;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0912893;STB=0.546184;TYPE=snp;VARB=0.00568327;OID=.;OPOS=22020543;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:83:85:55:55:38:17:32:51:38:17:32:53 chr18 22775185 . C T 269.98 PASS AO=45;DP=68;FAO=46;FDP=69;FR=.;FRO=23;FSAF=38;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=-0.00410185;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.801;QD=15.651;RBI=0.0679728;REFB=-0.0407113;REVB=-0.0678489;RO=22;SAF=38;SAR=7;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.386671;STB=0.703603;TYPE=snp;VARB=0.0150892;OID=.;OPOS=22775185;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:68:69:22:23:45:46:7:38:8:14:8:38:8:15 chr18 23597811 . T C 887.79 PASS AO=95;DP=98;FAO=96;FDP=97;FR=.;FRO=1;FSAF=86;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0104876;FXX=0.010203;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.068;QD=36.61;RBI=0.0701806;REFB=-0.122121;REVB=0.0693925;RO=2;SAF=86;SAR=9;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0944109;STB=0.523804;TYPE=snp;VARB=0.00140216;OID=.;OPOS=23597811;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:98:97:2:1:95:96:9:86:0:2:10:86:0:1 chr18 23865851 . C T 246.74 PASS AO=68;DP=158;FAO=68;FDP=158;FR=.;FRO=90;FSAF=30;FSAR=38;FSRF=31;FSRR=59;FWDB=-0.0095073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.3267;QD=6.24663;RBI=0.0188697;REFB=-0.00654823;REVB=0.0162996;RO=88;SAF=30;SAR=38;SRF=29;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116534;STB=0.556602;TYPE=snp;VARB=0.00832664;OID=.;OPOS=23865851;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:158:88:90:68:68:38:30:29:59:38:30:31:59 chr18 23872235 . A G 278.47 PASS AO=62;DP=121;FAO=62;FDP=121;FR=.;FRO=59;FSAF=23;FSAR=39;FSRF=14;FSRR=45;FWDB=0.00449737;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.751;QD=9.20549;RBI=0.0132049;REFB=-0.0144915;REVB=-0.0124154;RO=58;SAF=23;SAR=39;SRF=14;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126877;STB=0.572422;TYPE=snp;VARB=0.0191048;OID=.;OPOS=23872235;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:58:59:62:62:39:23:14:44:39:23:14:45 chr18 23873463 . T C 970.11 PASS AO=308;DP=594;FAO=213;FDP=400;FR=.;FRO=187;FSAF=100;FSAR=113;FSRF=82;FSRR=105;FWDB=0.0103321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.5;QD=9.7011;RBI=0.0229363;REFB=-0.0199271;REVB=0.0204773;RO=282;SAF=142;SAR=166;SRF=133;SRR=149;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0093404;STB=0.514562;TYPE=snp;VARB=0.0229905;OID=.;OPOS=23873463;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:594:400:282:187:308:213:166:142:133:149:113:100:82:105 chr18 23879134 . T C 85.7 PASS AO=26;DP=70;FAO=26;FDP=70;FR=.;FRO=44;FSAF=4;FSAR=22;FSRF=6;FSRR=38;FWDB=0.0123198;FXX=0;HRUN=10;LEN=1;MLLD=214.204;QD=4.89725;RBI=0.0174105;REFB=0.0232989;REVB=0.0123024;RO=35;SAF=4;SAR=22;SRF=5;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0216985;STB=0.521723;TYPE=snp;VARB=-0.0288326;OID=.;OPOS=23879134;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:70:70:35:44:26:26:22:4:5:30:22:4:6:38 chr18 23879142 . T A 189.25 PASS AO=21;DP=77;FAO=39;FDP=74;FR=.,HEALED;FRO=33;FSAF=8;FSAR=31;FSRF=5;FSRR=28;FWDB=-0.0854117;FXX=0.038956;HRUN=6;LEN=1;MLLD=26.666;QD=10.2295;RBI=0.17959;REFB=-0.118322;REVB=0.157979;RO=36;SAF=8;SAR=13;SRF=5;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.310657;STB=0.539409;TYPE=snp;VARB=0.10165;OID=.;OPOS=23879142;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:74:36:33:21:39:13:8:5:31:31:8:5:28 chr18 24035399 . A G 647.76 PASS AO=66;DP=70;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00822566;FXX=0.0135117;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.2644;QD=35.4935;RBI=0.00850387;REFB=0.0730311;REVB=0.00215741;RO=2;SAF=21;SAR=45;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0115832;STB=0.505375;TYPE=snp;VARB=-0.00720797;OID=.;OPOS=24035399;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:70:73:2:1:66:72:45:21:1:1:46:26:0:1 chr18 24269386 . G A 1653.5 PASS AO=172;DP=176;FAO=175;FDP=175;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=162;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00856012;FXX=0.0223451;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.4069;QD=37.7943;RBI=0.0124608;REFB=-0.06873;REVB=-0.00905522;RO=2;SAF=11;SAR=161;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0383729;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000922314;OID=.;OPOS=24269386;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:176:175:2:0:172:175:161:11:1:1:162:13:0:0 chr18 24445692 . C T 316.57 PASS AO=79;DP=171;FAO=80;FDP=173;FR=.;FRO=93;FSAF=23;FSAR=57;FSRF=22;FSRR=71;FWDB=-0.0525774;FXX=0.0057468;HRUN=4;LEN=1;MLLD=220.037;QD=7.31949;RBI=0.0531885;REFB=-0.0171515;REVB=0.00803989;RO=90;SAF=23;SAR=56;SRF=21;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.069753;STB=0.53439;TYPE=snp;VARB=0.0198842;OID=.;OPOS=24445692;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:173:90:93:79:80:56:23:21:69:57:23:22:71 chr18 25543387 . G A 1407.41 PASS AO=148;DP=149;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101521;FXX=0.00671096;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.431;QD=38.0381;RBI=0.0226785;REFB=-0.107572;REVB=0.0202793;RO=0;SAF=81;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000470433;OID=.;OPOS=25543387;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:149:148:0:0:148:148:67:81:0:0:67:81:0:0 chr18 25565082 . A G 1637.42 PASS AO=173;DP=174;FAO=173;FDP=173;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276342;FXX=0.0114279;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.0562;QD=37.8593;RBI=0.0284686;REFB=-0.0284989;REVB=0.00684192;RO=1;SAF=81;SAR=92;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00584025;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.49256e-05;OID=.;OPOS=25565082;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:174:173:1:0:173:173:92:81:1:0:92:81:0:0 chr18 25570228 . G C 2584.51 PASS AO=299;DP=321;FAO=302;FDP=324;FR=.;FRO=22;FSAF=194;FSAR=108;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.000116252;FXX=0.00307683;HRUN=6;LEN=1;MLLD=231.735;QD=31.9075;RBI=0.0156385;REFB=-0.0657676;REVB=0.015638;RO=19;SAF=194;SAR=105;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00441984;STB=0.500445;TYPE=snp;VARB=0.000331942;OID=.;OPOS=25570228;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:321:324:19:22:299:302:105:194:13:6:108:194:14:8 chr18 28586964 . A G 553.24 PASS AO=119;DP=245;FAO=130;FDP=257;FR=.;FRO=127;FSAF=59;FSAR=71;FSRF=61;FSRR=66;FWDB=-0.00766401;FXX=0.00772171;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.681;QD=8.61074;RBI=0.00937074;REFB=-0.0251064;REVB=0.00539201;RO=119;SAF=59;SAR=60;SRF=59;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.513158;TYPE=snp;VARB=0.0222473;OID=.;OPOS=28586964;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:245:257:119:127:119:130:60:59:59:60:71:59:61:66 chr18 28610988 . C T 221.38 PASS AO=73;DP=191;FAO=72;FDP=191;FR=.;FRO=119;FSAF=49;FSAR=23;FSRF=76;FSRR=43;FWDB=0.0232351;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.4573;QD=4.63621;RBI=0.0776288;REFB=0.00318468;REVB=0.07407;RO=103;SAF=49;SAR=24;SRF=71;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0215963;STB=0.529375;TYPE=snp;VARB=-0.007916;OID=.;OPOS=28610988;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:191:191:103:119:73:72:24:49:71:32:23:49:76:43 chr18 28611061 . A T 354.94 PASS AO=94;DP=220;FAO=96;FDP=217;FR=.;FRO=121;FSAF=40;FSAR=56;FSRF=74;FSRR=47;FWDB=0.00856773;FXX=0.035554;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.1791;QD=6.54261;RBI=0.0177514;REFB=-0.0175483;REVB=0.0155469;RO=111;SAF=40;SAR=54;SRF=71;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207122;STB=0.607746;TYPE=snp;VARB=0.0312665;OID=.;OPOS=28611061;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:220:217:111:121:94:96:54:40:71:40:56:40:74:47 chr18 28611139 . A C 1835.47 PASS AO=200;DP=207;FAO=201;FDP=207;FR=.;FRO=6;FSAF=79;FSAR=122;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.00950435;FXX=0.00480746;HRUN=3;LEN=1;MLLD=106.254;QD=35.4681;RBI=0.0307139;REFB=-0.168019;REVB=0.0292064;RO=2;SAF=79;SAR=121;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00207057;STB=0.501815;TYPE=snp;VARB=0.00130529;OID=.;OPOS=28611139;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:207:207:2:6:200:201:121:79:1:1:122:79:2:4 chr18 28722133 . T C 356.99 PASS AO=88;DP=185;FAO=89;FDP=189;FR=.;FRO=100;FSAF=26;FSAR=63;FSRF=37;FSRR=63;FWDB=-0.0122036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.894;QD=7.55539;RBI=0.014424;REFB=0.00173656;REVB=-0.00768911;RO=97;SAF=25;SAR=63;SRF=36;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0965241;STB=0.547815;TYPE=snp;VARB=-0.00214604;OID=.;OPOS=28722133;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:189:97:100:88:89:63:25:36:61:63:26:37:63 chr18 28734749 . A G 426.77 PASS AO=105;DP=225;FAO=107;FDP=227;FR=.;FRO=120;FSAF=48;FSAR=59;FSRF=68;FSRR=52;FWDB=0.0361017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.634;QD=7.52009;RBI=0.0363978;REFB=-0.0192043;REVB=-0.0046329;RO=120;SAF=47;SAR=58;SRF=68;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11466;STB=0.562262;TYPE=snp;VARB=0.0182677;OID=.;OPOS=28734749;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:225:227:120:120:105:107:58:47:68:52:59:48:68:52 chr18 28898294 . A G 2461.33 PASS AO=259;DP=262;FAO=259;FDP=259;FR=.;FRO=0;FSAF=113;FSAR=146;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0227266;FXX=0.0114499;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.651;QD=38.0128;RBI=0.0299469;REFB=-0.00561843;REVB=0.0195018;RO=1;SAF=113;SAR=146;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00420018;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.68878e-05;OID=.;OPOS=28898294;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:262:259:1:0:259:259:146:113:1:0:146:113:0:0 chr18 28913597 . GGC G,GG,GGT 1928.69 PASS AO=44,50,104;DP=207;FAO=0,44,158;FDP=202;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0,101;FSAR=0,44,57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00960223,-0.00729976,0.096742;FXX=0;HRUN=2,1,1;LEN=2,1,1;MLLD=164.104,169.31,58.1557;QD=38.192;RBI=0.117897,0.15875,0.109844;REFB=0,0,0;REVB=0.117505,0.158582,0.0520253;RO=0;SAF=0,2,97;SAR=44,48,7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=del,del,snp;VARB=0,0.0375038,-0.000252495;OID=.,.,.;OPOS=28913598,28913599,28913599;OREF=GC,C,C;OALT=-,-,T;OMAPALT=G,GG,GGT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/3:44,50,104:199:0,44,158:202:0:0,0,101:0,44,57:0:0:66:0:0,2,97:44,48,7:0:0 chr18 28986333 . A C 1160.06 PASS AO=121;DP=122;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0318049;FXX=0.0396794;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.09;QD=38.3491;RBI=0.0322744;REFB=0;REVB=0.00548484;RO=0;SAF=55;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.82645e-05;OID=.;OPOS=28986333;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:122:121:0:0:121:121:66:55:0:0:66:55:0:0 chr18 28993501 . C A 55.13 PASS AO=16;DP=41;FAO=15;FDP=40;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.0326705;FXX=0.0243843;HRUN=5;LEN=1;MLLD=42.6321;QD=5.51311;RBI=0.0329304;REFB=0.00796211;REVB=0.00412916;RO=24;SAF=9;SAR=7;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0648571;STB=0.533289;TYPE=snp;VARB=-0.0164005;OID=.;OPOS=28993501;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:41:40:24:25:16:15:7:9:12:12:7:8:12:13 chr18 29055957 . A G 2204.1 PASS AO=232;DP=239;FAO=235;FDP=235;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=137;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123256;FXX=0.0248952;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.1812;QD=37.5166;RBI=0.0891228;REFB=0;REVB=0.0882664;RO=0;SAF=96;SAR=136;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.22898e-05;OID=.;OPOS=29055957;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:239:235:0:0:232:235:136:96:0:0:137:98:0:0 chr18 29104698 . C T 372.71 PASS AO=73;DP=132;FAO=76;FDP=135;FR=.;FRO=59;FSAF=33;FSAR=43;FSRF=21;FSRR=38;FWDB=-0.0155751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.323;QD=11.0433;RBI=0.0206141;REFB=-0.00317953;REVB=-0.013504;RO=59;SAF=33;SAR=40;SRF=21;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0800939;STB=0.535126;TYPE=snp;VARB=0.00293374;OID=.;OPOS=29104698;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:135:59:59:73:76:40:33:21:38:43:33:21:38 chr18 29126592 . C T 432.94 PASS AO=109;DP=229;FAO=109;FDP=232;FR=.;FRO=123;FSAF=38;FSAR=71;FSRF=59;FSRR=64;FWDB=0.0704204;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.9433;QD=7.46445;RBI=0.0780003;REFB=0.0196613;REVB=0.0335413;RO=120;SAF=37;SAR=72;SRF=57;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136306;STB=0.573091;TYPE=snp;VARB=-0.0189082;OID=.;OPOS=29126592;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:229:232:120:123:109:109:72:37:57:63:71:38:59:64 chr18 29126670 . T C 244.26 PASS AO=62;DP=135;FAO=62;FDP=135;FR=.;FRO=73;FSAF=20;FSAR=42;FSRF=33;FSRR=40;FWDB=0.00821958;FXX=0.0073524;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.41;QD=7.23735;RBI=0.0153309;REFB=-0.00852842;REVB=0.0129412;RO=72;SAF=20;SAR=42;SRF=32;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127594;STB=0.575764;TYPE=snp;VARB=0.0120597;OID=.;OPOS=29126670;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:72:73:62:62:42:20:32:40:42:20:33:40 chr18 29178513 . G C 340.75 PASS AO=86;DP=184;FAO=86;FDP=184;FR=.;FRO=98;FSAF=36;FSAR=50;FSRF=48;FSRR=50;FWDB=-0.0149803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.821;QD=7.40752;RBI=0.0150006;REFB=-0.0106126;REVB=-0.000781089;RO=97;SAF=36;SAR=50;SRF=48;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0740019;STB=0.538453;TYPE=snp;VARB=0.0149781;OID=.;OPOS=29178513;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:184:97:98:86:86:50:36:48:49:50:36:48:50 chr18 29205591 . T C 192 PASS AO=48;DP=104;FAO=48;FDP=104;FR=.;FRO=56;FSAF=14;FSAR=34;FSRF=29;FSRR=27;FWDB=-0.00426174;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.893;QD=7.38466;RBI=0.021221;REFB=-0.00698007;REVB=-0.0207887;RO=56;SAF=14;SAR=34;SRF=29;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234258;STB=0.631204;TYPE=snp;VARB=0.00822771;OID=.;OPOS=29205591;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:56:56:48:48:34:14:29:27:34:14:29:27 chr18 29339910 . G T 172.84 PASS AO=22;DP=25;FAO=22;FDP=25;FR=.;FRO=3;FSAF=19;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0286193;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.209;QD=27.6542;RBI=0.0365133;REFB=-0.0163893;REVB=-0.022675;RO=3;SAF=19;SAR=3;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0676343;STB=0.536554;TYPE=snp;VARB=0.00199391;OID=.;OPOS=29339910;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:25:25:3:3:22:22:3:19:3:0:3:19:3:0 chr18 29432624 . T C 228.55 PASS AO=48;DP=90;FAO=48;FDP=90;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=37;FSRF=14;FSRR=28;FWDB=-0.00853347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.1298;QD=10.1579;RBI=0.0164245;REFB=-0.0085429;REVB=0.0140337;RO=41;SAF=11;SAR=37;SRF=14;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122534;STB=0.563996;TYPE=snp;VARB=0.00965925;OID=.;OPOS=29432624;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:41:42:48:48:37:11:14:27:37:11:14:28 chr18 29497573 . A G 1733.65 PASS AO=187;DP=192;FAO=187;FDP=187;FR=.;FRO=0;FSAF=120;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114262;FXX=0.0260403;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.101;QD=37.0834;RBI=0.0159493;REFB=-0.0500401;REVB=-0.0111275;RO=3;SAF=120;SAR=67;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000815928;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.04562e-05;OID=.;OPOS=29497573;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:192:187:3:0:187:187:67:120:2:1:67:120:0:0 chr18 29710880 . A AAG 334.36 PASS AO=109;DP=334;FAO=116;FDP=312;FR=.;FRO=196;FSAF=66;FSAR=50;FSRF=113;FSRR=83;FWDB=0.0162924;FXX=0.0516702;HRUN=2;LEN=2;MLLD=316.697;QD=4.28672;RBI=0.0188128;REFB=0.0004685;REVB=0.00940643;RO=204;SAF=61;SAR=48;SRF=116;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104675;STB=0.50485;TYPE=ins;VARB=-0.000952317;OID=.;OPOS=29710881;OREF=-;OALT=AG;OMAPALT=AAG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:109:334:116:312:196:66:50:113:83:99:204:61:48:116:88 chr18 29795076 . T C 2025.39 PASS AO=206;DP=213;FAO=212;FDP=212;FR=.;FRO=0;FSAF=139;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00238833;FXX=0.0185177;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.691;QD=38.2148;RBI=0.0302543;REFB=0;REVB=0.0301599;RO=0;SAF=135;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=8.83508e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.80517e-05;OID=.;OPOS=29795076;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:96:213:212:0:0:206:212:71:135:0:0:73:139:0:0 chr18 29795101 . T C 2159.45 PASS AO=219;DP=219;FAO=225;FDP=225;FR=.;FRO=0;FSAF=140;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00974717;FXX=0.00442458;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.457;QD=38.3902;RBI=0.045863;REFB=0;REVB=0.0448153;RO=0;SAF=140;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.83089e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.53323e-05;OID=.;OPOS=29795101;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:219:225:0:0:219:225:79:140:0:0:85:140:0:0 chr18 30253010 . T TC,C 1460.2 PASS AO=110,29;DP=168;FAO=147,16;FDP=163;FR=.;FRO=0;FSAF=95,14;FSAR=52,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166399,-0.00229672;FXX=0.0180712;HRUN=0,4;LEN=1,1;MLLD=66.1627,61.1559;QD=35.8332;RBI=0.0424872,0.0145544;REFB=0,0;REVB=0.0390932,0.014372;RO=16;SAF=73,19;SAR=37,10;SRF=7;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0594018,0.147801;STB=0.5,0.5;TYPE=ins,snp;VARB=0.00422085,0.0163596;OID=.,.;OPOS=30253011,30253010;OREF=-,T;OALT=C,C;OMAPALT=TC,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:5:168:163:16:0:110,29:147,16:37,10:73,19:7:9:52,2:95,14:0:0 chr18 30804756 . C T 1229.25 PASS AO=129;DP=130;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0301167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.1037;QD=37.8232;RBI=0.0324218;REFB=-0.0654887;REVB=-0.0120066;RO=1;SAF=82;SAR=47;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0100034;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00103595;OID=.;OPOS=30804756;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:130:130:1:0:129:130:47:82:0:1:48:82:0:0 chr18 30846895 . A T 1819.38 PASS AO=175;DP=176;FAO=194;FDP=194;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0439088;FXX=0.00512794;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.819;QD=37.513;RBI=0.0612961;REFB=0;REVB=0.0427696;RO=0;SAF=85;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.0478e-05;OID=.;OPOS=30846895;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:176:194:0:0:175:194:90:85:0:0:97:97:0:0 chr18 30908047 . A T 169.68 PASS AO=14;DP=17;FAO=21;FDP=23;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00455758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.561;QD=29.5094;RBI=0.0206545;REFB=-0.167807;REVB=0.0201454;RO=2;SAF=10;SAR=4;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180146;STB=0.599895;TYPE=snp;VARB=8.29089e-05;OID=.;OPOS=30908047;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:17:23:2:2:14:21:4:10:0:2:4:17:0:2 chr18 31431529 . G T 51.28 PASS AO=17;DP=48;FAO=16;FDP=46;FR=.;FRO=30;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=0.0251859;FXX=0.041658;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.699;QD=4.45928;RBI=0.0257709;REFB=0.000603873;REVB=0.00545973;RO=30;SAF=4;SAR=13;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134538;STB=0.567479;TYPE=snp;VARB=-0.00170505;OID=.;OPOS=31431529;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:48:46:30:30:17:16:13:4:10:20:12:4:10:20 chr18 32470291 . G A 272.59 PASS AO=80;DP=198;FAO=81;FDP=199;FR=.;FRO=118;FSAF=75;FSAR=6;FSRF=107;FSRR=11;FWDB=-0.00560407;FXX=0.00499975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.016;QD=5.47912;RBI=0.0104647;REFB=0.00300008;REVB=-0.00883769;RO=117;SAF=74;SAR=6;SRF=106;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0673828;STB=0.538646;TYPE=snp;VARB=-0.00526261;OID=.;OPOS=32470291;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:199:117:118:80:81:6:74:106:11:6:75:107:11 chr18 32826088 . A G 583.16 PASS AO=63;DP=67;FAO=68;FDP=71;FR=.;FRO=3;FSAF=18;FSAR=50;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0402141;FXX=0.013887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.8124;QD=32.854;RBI=0.040374;REFB=-0.0441757;REVB=-0.00358976;RO=2;SAF=17;SAR=46;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0168132;STB=0.50371;TYPE=snp;VARB=0.00736343;OID=.;OPOS=32826088;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:67:71:2:3:63:68:46:17:1:1:50:18:1:2 chr18 32888546 . C A 465.73 PASS AO=87;DP=150;FAO=90;FDP=152;FR=.;FRO=62;FSAF=41;FSAR=49;FSRF=19;FSRR=43;FWDB=-0.00525705;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.2224;QD=12.256;RBI=0.0559513;REFB=-0.00759674;REVB=-0.0557038;RO=62;SAF=38;SAR=49;SRF=20;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0900892;STB=0.561965;TYPE=snp;VARB=0.00473457;OID=.;OPOS=32888546;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:152:62:62:87:90:49:38:20:42:49:41:19:43 chr18 32917644 . T C 959.62 PASS AO=100;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00452605;FXX=0.00980296;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.308;QD=38.0046;RBI=0.0278822;REFB=0;REVB=0.0275124;RO=0;SAF=92;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.55471e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000119772;OID=.;OPOS=32917644;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:101:101:0:0:100:101:8:92:0:0:9:92:0:0 chr18 32947616 . A ATTTTAT 718.27 PASS AO=80;DP=127;FAO=96;FDP=114;FR=.;FRO=18;FSAF=28;FSAR=68;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.0095711;FXX=0.0338954;HRUN=4;LEN=6;MLLD=209.639;QD=25.2025;RBI=0.00969007;REFB=-0.00309336;REVB=0.00151375;RO=28;SAF=20;SAR=60;SRF=19;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.239692;STB=0.548377;TYPE=ins;VARB=0.000547413;OID=.;OPOS=32947617;OREF=-;OALT=TTTTAT;OMAPALT=ATTTTAT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:80:127:96:114:18:28:68:10:8:12:28:20:60:19:9 chr18 33647254 . A C 405.77 PASS AO=27;DP=44;FAO=43;FDP=44;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0782646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.327;QD=36.8882;RBI=0.0917901;REFB=0;REVB=-0.0479591;RO=0;SAF=17;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00169221;OID=.;OPOS=33647254;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:33:44:0:0:27:43:10:17:0:0:21:22:0:0 chr18 33694120 . G A 2395.79 PASS AO=248;DP=249;FAO=250;FDP=250;FR=.;FRO=0;FSAF=218;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00548104;FXX=0.00398391;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.378;QD=38.3326;RBI=0.013099;REFB=0;REVB=0.0118972;RO=1;SAF=216;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00220186;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.3341e-05;OID=.;OPOS=33694120;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:249:250:1:0:248:250:32:216:1:0:32:218:0:0 chr18 33706614 . C G 1916.26 PASS AO=201;DP=203;FAO=204;FDP=204;FR=.;FRO=0;FSAF=141;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00831359;FXX=0.0144921;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.556;QD=37.5738;RBI=0.0691431;REFB=-0.0276044;REVB=0.0686415;RO=0;SAF=141;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000123694;OID=.;OPOS=33706614;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:203:204:0:0:201:204:60:141:0:0:63:141:0:0 chr18 33713287 . T A 1674.8 PASS AO=185;DP=191;FAO=185;FDP=191;FR=.;FRO=6;FSAF=82;FSAR=103;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0382778;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9216;QD=35.0744;RBI=0.0442757;REFB=0.0186164;REVB=0.0222518;RO=6;SAF=82;SAR=103;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.016779;STB=0.508818;TYPE=snp;VARB=-0.00172296;OID=.;OPOS=33713287;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:191:191:6:6:185:185:103:82:1:5:103:82:1:5 chr18 33718326 . A C 1566.64 PASS AO=159;DP=159;FAO=164;FDP=164;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0247105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.851;QD=38.2107;RBI=0.0256862;REFB=0;REVB=-0.00701237;RO=0;SAF=72;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.95007e-05;OID=.;OPOS=33718326;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:159:164:0:0:159:164:87:72:0:0:88:76:0:0 chr18 33719434 . C T 1377.48 PASS AO=152;DP=155;FAO=151;FDP=155;FR=.;FRO=4;FSAF=83;FSAR=68;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0332638;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.555;QD=35.5478;RBI=0.0350612;REFB=-0.0156739;REVB=0.0110817;RO=3;SAF=84;SAR=68;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0205194;STB=0.507797;TYPE=snp;VARB=0.00140848;OID=.;OPOS=33719434;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:155:155:3:4:152:151:68:84:0:3:68:83:1:3 chr18 33725931 . G A 2074.03 PASS AO=216;DP=217;FAO=216;FDP=216;FR=.;FRO=0;FSAF=112;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0152041;FXX=0.00460808;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.258;QD=38.408;RBI=0.0479488;REFB=0;REVB=-0.0454745;RO=0;SAF=112;SAR=104;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000183816;OID=.;OPOS=33725931;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:217:216:0:0:216:216:104:112:0:0:104:112:0:0 chr18 33750046 . C T 1968.41 PASS AO=216;DP=227;FAO=222;FDP=227;FR=.;FRO=5;FSAF=145;FSAR=77;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0868487;FXX=0.00873324;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.2896;QD=34.6856;RBI=0.104012;REFB=-0.129171;REVB=-0.0572353;RO=9;SAF=141;SAR=75;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0105304;STB=0.501291;TYPE=snp;VARB=0.00607161;OID=.;OPOS=33750046;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:227:227:9:5:216:222:75:141:7:2:77:145:3:2 chr18 33779821 . C A 2197.88 PASS AO=228;DP=228;FAO=228;FDP=228;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=142;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00870894;FXX=0.00869527;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.8822;QD=38.5594;RBI=0.026193;REFB=0;REVB=0.0247028;RO=0;SAF=86;SAR=142;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000124484;OID=.;OPOS=33779821;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:228:228:0:0:228:228:142:86:0:0:142:86:0:0 chr18 33779855 . C T 1507.59 PASS AO=170;DP=180;FAO=172;FDP=181;FR=.;FRO=9;FSAF=66;FSAR=106;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0292037;FXX=0.0372321;HRUN=4;LEN=1;MLLD=84.7715;QD=33.317;RBI=0.0630336;REFB=-0.11606;REVB=0.0558603;RO=10;SAF=65;SAR=105;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0130976;STB=0.508994;TYPE=snp;VARB=0.00183056;OID=.;OPOS=33779855;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:180:181:10:9:170:172:105:65:5:5:106:66:5:4 chr18 33779896 . A G 1449.74 PASS AO=151;DP=151;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220835;FXX=0.00653552;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.61;QD=38.1511;RBI=0.0236395;REFB=0;REVB=-0.00843466;RO=0;SAF=62;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.88648e-05;OID=.;OPOS=33779896;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:151:152:0:0:151:152:89:62:0:0:90:62:0:0 chr18 33780018 . GCA G,GC,GCG 795.05 PASS AO=15,16,55;DP=96;FAO=14,1,77;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=14,1,23;FSAR=0,0,54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0696677,-0.0534772,0.0714385;FXX=0;HRUN=1,1,1;LEN=2,1,1;MLLD=74.6387,79.4114,77.0875;QD=34.5675;RBI=0.0723327,0.054123,0.0722129;REFB=0,0,0;REVB=-0.0194534,-0.00833602,0.010547;RO=0;SAF=15,14,6;SAR=0,2,49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=del,del,snp;VARB=0.0823974,0.104428,0.00609909;OID=.,.,.;OPOS=33780019,33780020,33780020;OREF=CA,A,A;OALT=-,-,G;OMAPALT=G,GC,GCG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/3:15,16,55:89:14,1,77:92:0:14,1,23:0,0,54:0:0:13:0:15,14,6:0,2,49:0:0 chr18 33780021 . C G 24.16 PASS AO=18;DP=92;FAO=18;FDP=90;FR=.;FRO=72;FSAF=16;FSAR=2;FSRF=19;FSRR=53;FWDB=0.0182818;FXX=0.0322546;HRUN=3;LEN=1;MLLD=82.0124;QD=1.07383;RBI=0.0195544;REFB=-0.0108953;REVB=0.00693888;RO=71;SAF=16;SAR=2;SRF=18;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.70484;STB=0.925932;TYPE=snp;VARB=0.0080522;OID=.;OPOS=33780021;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:92:90:71:72:18:18:2:16:18:53:2:16:19:53 chr18 33785093 . G A 1693.74 PASS AO=176;DP=178;FAO=176;FDP=176;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=122;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00973902;FXX=0.0112353;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.44;QD=38.4942;RBI=0.0126213;REFB=0;REVB=0.00802794;RO=0;SAF=54;SAR=122;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.62553e-05;OID=.;OPOS=33785093;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:178:176:0:0:176:176:122:54:0:0:122:54:0:0 chr18 33785185 . A G 1466.63 PASS AO=154;DP=155;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00704171;FXX=0.00640985;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.395;QD=37.8486;RBI=0.0114569;REFB=-0.0598381;REVB=-0.00903745;RO=1;SAF=62;SAR=92;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00514309;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.35414e-05;OID=.;OPOS=33785185;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:155:155:1:0:154:155:92:62:0:1:93:62:0:0 chr18 33831189 . C A 688.06 PASS AO=135;DP=271;FAO=152;FDP=288;FR=.;FRO=136;FSAF=55;FSAR=97;FSRF=55;FSRR=81;FWDB=-0.0046272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.1292;QD=9.55638;RBI=0.00847318;REFB=-0.0213025;REVB=0.00709815;RO=134;SAF=55;SAR=80;SRF=55;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00285833;STB=0.521502;TYPE=snp;VARB=0.0191804;OID=.;OPOS=33831189;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:271:288:134:136:135:152:80:55:55:79:97:55:55:81 chr18 34273279 . C G 68.51 PASS AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=0.0180096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.901;QD=8.56433;RBI=0.0343334;REFB=-0.00947019;REVB=-0.0292307;RO=16;SAF=7;SAR=8;SRF=13;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.309608;STB=0.655546;TYPE=snp;VARB=0.0104179;OID=.;OPOS=34273279;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:32:32:16:17:15:15:8:7:13:3:8:7:13:4 chr18 34289364 . G A 156.78 PASS AO=31;DP=55;FAO=31;FDP=55;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=0.0774776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.198;QD=11.4021;RBI=0.0798029;REFB=-0.0082314;REVB=0.0191242;RO=20;SAF=10;SAR=21;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.022146;STB=0.515594;TYPE=snp;VARB=0.00670516;OID=.;OPOS=34289364;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:55:55:20:24:31:31:21:10:7:13:21:10:7:17 chr18 34310668 . C T 172.33 PASS AO=57;DP=151;FAO=56;FDP=151;FR=.;FRO=95;FSAF=20;FSAR=36;FSRF=37;FSRR=58;FWDB=-0.00662544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.364;QD=4.56518;RBI=0.0403039;REFB=-0.00424869;REVB=-0.0397556;RO=91;SAF=20;SAR=37;SRF=37;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0648306;STB=0.521864;TYPE=snp;VARB=0.00508926;OID=.;OPOS=34310668;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:151:91:95:57:56:37:20:37:54:36:20:37:58 chr18 34324091 . G A 157.42 PASS AO=42;DP=97;FAO=42;FDP=97;FR=.;FRO=55;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=39;FSRR=16;FWDB=-0.0268092;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.3297;QD=6.49168;RBI=0.0288358;REFB=-0.0200139;REVB=0.0106192;RO=55;SAF=28;SAR=14;SRF=39;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0491389;STB=0.527546;TYPE=snp;VARB=0.034306;OID=.;OPOS=34324091;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:55:55:42:42:14:28:39:16:14:28:39:16 chr18 34398914 . C T 989.16 PASS AO=103;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0774502;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0763;QD=38.0444;RBI=0.0819572;REFB=0;REVB=0.0268038;RO=0;SAF=42;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.08734e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000390867;OID=.;OPOS=34398914;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:104:104:0:0:103:104:61:42:0:0:61:43:0:0 chr18 34824546 . G T 13.23 PASS AO=37;DP=121;FAO=18;FDP=115;FR=.;FRO=97;FSAF=16;FSAR=2;FSRF=76;FSRR=21;FWDB=0.0223279;FXX=0.0799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.947;QD=0.460111;RBI=0.0284732;REFB=-0.00561149;REVB=0.0176689;RO=57;SAF=32;SAR=5;SRF=42;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230754;STB=0.666444;TYPE=snp;VARB=0.0155016;OID=.;OPOS=34824546;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:121:115:57:97:37:18:5:32:42:15:2:16:76:21 chr18 39761310 . A G 253.73 PASS AO=61;DP=127;FAO=61;FDP=127;FR=.;FRO=66;FSAF=24;FSAR=37;FSRF=32;FSRR=34;FWDB=-0.0204208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.6489;QD=7.9916;RBI=0.0260615;REFB=0.000175059;REVB=-0.0161924;RO=66;SAF=24;SAR=37;SRF=32;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0878602;STB=0.548713;TYPE=snp;VARB=-0.000724418;OID=.;OPOS=39761310;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:66:66:61:61:37:24:32:34:37:24:32:34 chr18 40323497 . G T 45.35 PASS AO=13;DP=36;FAO=13;FDP=36;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=20;FSRR=3;FWDB=0.00763156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.405;QD=5.03937;RBI=0.0117615;REFB=-0.00153835;REVB=-0.00894949;RO=21;SAF=10;SAR=3;SRF=18;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14369;STB=0.599866;TYPE=snp;VARB=0.00268034;OID=.;OPOS=40323497;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:36:36:21:23:13:13:3:10:18:3:3:10:20:3 chr18 40554120 . A G 319.14 PASS AO=87;DP=198;FAO=87;FDP=199;FR=.;FRO=112;FSAF=36;FSAR=51;FSRF=45;FSRR=67;FWDB=-0.0488188;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=183.713;QD=6.41478;RBI=0.0489246;REFB=-0.00526695;REVB=0.00321548;RO=109;SAF=36;SAR=51;SRF=44;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0104607;STB=0.50698;TYPE=snp;VARB=0.00805958;OID=.;OPOS=40554120;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:199:109:112:87:87:51:36:44:65:51:36:45:67 chr18 42456653 . G A 740.05 PASS AO=74;DP=79;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.132419;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.404;QD=36.5459;RBI=0.13257;REFB=0;REVB=0.00633707;RO=0;SAF=4;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.63628e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00180971;OID=.;OPOS=42456653;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:79:81:0:0:74:81:70:4:0:0:74:7:0:0 chr18 42456670 . C CTCTT,T 783.74 PASS AO=63,21;DP=98;FAO=67,20;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=5,4;FSAR=62,16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0300912,0.113224;FXX=0.1212;HRUN=0,1;LEN=4,1;MLLD=158.662,55.3972;QD=36.0339;RBI=0.033071,0.114815;REFB=0,0;REVB=0.0137191,0.0190462;RO=7;SAF=4,3;SAR=59,18;SRF=1;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.059119,0;STB=0.5,0.5;TYPE=ins,snp;VARB=0.00253046,0.048031;OID=.,.;OPOS=42456671,42456670;OREF=-,C;OALT=TCTT,T;OMAPALT=CTCTT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:33:98:87:7:0:63,21:67,20:59,18:4,3:1:6:62,16:5,4:0:0 chr18 42533130 . A G 258.58 PASS AO=64;DP=134;FAO=64;FDP=136;FR=.;FRO=72;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=44;FSRR=28;FWDB=-0.0329944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.981;QD=7.60517;RBI=0.0460951;REFB=-0.0196312;REVB=-0.0321889;RO=70;SAF=32;SAR=32;SRF=44;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121458;STB=0.558805;TYPE=snp;VARB=0.0266701;OID=.;OPOS=42533130;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:136:70:72:64:64:32:32:44:26:32:32:44:28 chr18 42643541 . C A 10.38 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0701349;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.3417;QD=5.93054;RBI=0.0701349;REFB=-0.0477611;REVB=0;RO=5;SAF=2;SAR=0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.107742;OID=.;OPOS=42643541;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:5:5:2:2:0:2:5:0:0:2:5:0 chr18 43206985 . A G 2500.49 PASS AO=260;DP=260;FAO=261;FDP=261;FR=.;FRO=0;FSAF=119;FSAR=142;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.835;QD=38.3217;RBI=0.0260097;REFB=0;REVB=-0.0169816;RO=0;SAF=119;SAR=141;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.98751e-06;OID=.;OPOS=43206985;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:260:261:0:0:260:261:141:119:0:0:142:119:0:0 chr18 43246156 . G A 322.33 PASS AO=84;DP=184;FAO=84;FDP=184;FR=.;FRO=100;FSAF=45;FSAR=39;FSRF=53;FSRR=47;FWDB=-0.0154525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.614;QD=7.00719;RBI=0.016915;REFB=0.00310029;REVB=0.0068803;RO=100;SAF=45;SAR=39;SRF=53;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00562511;STB=0.503119;TYPE=snp;VARB=-0.00400798;OID=.;OPOS=43246156;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:184:100:100:84:84:39:45:53:47:39:45:53:47 chr18 43247001 . C G 116.56 PASS AO=34;DP=90;FAO=35;FDP=91;FR=.;FRO=56;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=30;FWDB=0.00936175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.3262;QD=5.12371;RBI=0.0342578;REFB=-0.0083182;REVB=0.0329539;RO=56;SAF=21;SAR=13;SRF=26;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168386;STB=0.602489;TYPE=snp;VARB=0.012096;OID=.;OPOS=43247001;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:91:56:56:34:35:13:21:26:30:13:22:26:30 chr18 43262359 . G A 110.16 PASS AO=41;DP=124;FAO=41;FDP=123;FR=.;FRO=82;FSAF=2;FSAR=39;FSRF=22;FSRR=60;FWDB=-0.0677979;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.7099;QD=3.58245;RBI=0.0919555;REFB=-0.00680129;REVB=0.062123;RO=81;SAF=2;SAR=39;SRF=21;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.524618;STB=0.825175;TYPE=snp;VARB=0.0188226;OID=.;OPOS=43262359;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:123:81:82:41:41:39:2:21:60:39:2:22:60 chr18 43307246 . C T 82.14 PASS AO=26;DP=72;FAO=26;FDP=72;FR=.;FRO=46;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=-0.00823459;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.21;QD=4.56348;RBI=0.0123326;REFB=-0.0227997;REVB=-0.00918063;RO=45;SAF=14;SAR=12;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0787145;STB=0.538432;TYPE=snp;VARB=0.0295747;OID=.;OPOS=43307246;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:72:72:45:46:26:26:12:14:21:24:12:14:22:24 chr18 43307338 . C A 61.93 PASS AO=21;DP=74;FAO=24;FDP=77;FR=.;FRO=53;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=36;FWDB=-0.0169351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.917;QD=3.21729;RBI=0.0206039;REFB=-0.0184329;REVB=0.0117355;RO=52;SAF=5;SAR=16;SRF=17;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132191;STB=0.560922;TYPE=snp;VARB=0.0486534;OID=.;OPOS=43307338;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:74:77:52:53:21:24:16:5:17:35:18:6:17:36 chr18 43311094 . AC A 937.47 PASS AO=125;DP=197;FAO=189;FDP=189;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.191002;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=10.5125;QD=19.8407;RBI=0.38461;REFB=0.0505929;REVB=0.333831;RO=42;SAF=68;SAR=57;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0.389671;SSSB=0.00958072;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00679627;OID=.;OPOS=43311095;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:125:185:189:189:0:105:84:0:0:79:42:68:57:22:20 chr18 43316538 . A G 235.26 PASS AO=61;DP=135;FAO=61;FDP=135;FR=.;FRO=74;FSAF=10;FSAR=51;FSRF=14;FSRR=60;FWDB=0.0224238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.433;QD=6.97079;RBI=0.0228767;REFB=-0.000924405;REVB=0.00452964;RO=74;SAF=10;SAR=51;SRF=14;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0437055;STB=0.524413;TYPE=snp;VARB=0.00105309;OID=.;OPOS=43316538;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:74:74:61:61:51:10:14:60:51:10:14:60 chr18 43319274 . G A 192.19 PASS AO=46;DP=97;FAO=47;FDP=100;FR=.;FRO=53;FSAF=16;FSAR=31;FSRF=32;FSRR=21;FWDB=-0.075974;FXX=0.00990001;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.805;QD=7.6876;RBI=0.0783682;REFB=-0.0252691;REVB=-0.0192228;RO=51;SAF=15;SAR=31;SRF=30;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253413;STB=0.641318;TYPE=snp;VARB=0.0231102;OID=.;OPOS=43319274;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:100:51:53:46:47:31:15:30:21:31:16:32:21 chr18 43319519 . G A 247.75 PASS AO=57;DP=114;FAO=57;FDP=114;FR=.;FRO=57;FSAF=33;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=34;FWDB=0.0218445;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4409;QD=8.69288;RBI=0.0219354;REFB=0.00487754;REVB=-0.00199524;RO=57;SAF=33;SAR=24;SRF=23;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15835;STB=0.587446;TYPE=snp;VARB=-0.00690434;OID=.;OPOS=43319519;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:57:57:57:57:24:33:23:34:24:33:23:34 chr18 43497710 . A G 186.22 PASS AO=29;DP=102;FAO=30;FDP=78;FR=.,HEALED;FRO=35;FSAF=4;FSAR=26;FSRF=11;FSRR=24;FWDB=-0.0240273;FXX=0.2277;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.047;QD=9.54947;RBI=0.0251561;REFB=-0.0191788;REVB=0.00745131;RO=31;SAF=4;SAR=25;SRF=8;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192938;STB=0.660891;TYPE=snp;VARB=0.0113566;OID=.;OPOS=43497710;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:31:35:29:30:25:4:8:23:26:4:11:24 chr18 43569827 . C T 233.32 PASS AO=51;DP=98;FAO=51;FDP=98;FR=.;FRO=47;FSAF=38;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=0.00353015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.4095;QD=9.52333;RBI=0.0104317;REFB=-0.0063722;REVB=0.00981622;RO=46;SAF=38;SAR=13;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.239846;STB=0.639323;TYPE=snp;VARB=0.00650112;OID=.;OPOS=43569827;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:46:47:51:51:13:38:23:23:13:38:23:24 chr18 43701587 . G A 245.24 PASS AO=57;DP=116;FAO=57;FDP=115;FR=.;FRO=58;FSAF=39;FSAR=18;FSRF=39;FSRR=19;FWDB=-0.0137987;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.704;QD=8.53007;RBI=0.014082;REFB=-0.00379629;REVB=0.00281065;RO=58;SAF=39;SAR=18;SRF=39;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0123801;STB=0.506847;TYPE=snp;VARB=0.00442534;OID=.;OPOS=43701587;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:115:58:58:57:57:18:39:39:19:18:39:39:19 chr18 43833701 . T TCTG 1308.92 PASS AO=163;DP=190;FAO=165;FDP=188;FR=.;FRO=23;FSAF=61;FSAR=104;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.0295293;FXX=0.0105258;HRUN=1;LEN=3;MLLD=198.179;QD=27.8493;RBI=0.0314641;REFB=-0.0599901;REVB=0.0108632;RO=24;SAF=60;SAR=103;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0761966;STB=0.536369;TYPE=ins;VARB=0.00705251;OID=.;OPOS=43833702;OREF=-;OALT=CTG;OMAPALT=TCTG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:163:190:165:188:23:61:104:15:8:6:24:60:103:16:8 chr18 43843736 . T G 518.54 PASS AO=60;DP=60;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0197784;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.8195;QD=36.3889;RBI=0.0233707;REFB=-0.0658593;REVB=-0.0124501;RO=0;SAF=20;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506664;TYPE=snp;VARB=0.00118085;OID=.;OPOS=43843736;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:60:57:0:1:60:56:40:20:0:0:37:19:0:1 chr18 44037098 . C T 418.08 PASS AO=119;DP=280;FAO=119;FDP=280;FR=.;FRO=161;FSAF=54;FSAR=65;FSRF=88;FSRR=73;FWDB=-0.0149137;FXX=0.00355859;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.264;QD=5.97254;RBI=0.0149245;REFB=-0.00386095;REVB=-0.000567176;RO=160;SAF=54;SAR=65;SRF=87;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0925924;STB=0.553282;TYPE=snp;VARB=0.00441789;OID=.;OPOS=44037098;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:280:280:160:161:119:119:65:54:87:73:65:54:88:73 chr18 44040660 . T C 235.36 PASS AO=65;DP=147;FAO=64;FDP=146;FR=.;FRO=82;FSAF=34;FSAR=30;FSRF=40;FSRR=42;FWDB=-0.000231767;FXX=0.00680226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4985;QD=6.44811;RBI=0.00438209;REFB=0.00155287;REVB=0.00437596;RO=82;SAF=35;SAR=30;SRF=39;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0628979;STB=0.524414;TYPE=snp;VARB=-0.00377876;OID=.;OPOS=44040660;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:146:82:82:65:64:30:35:39:43:30:34:40:42 chr18 44063598 . G A 2589.05 PASS AO=297;DP=320;FAO=298;FDP=316;FR=.;FRO=18;FSAF=120;FSAR=178;FSRF=3;FSRR=15;FWDB=0.0265385;FXX=0.0124996;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.115;QD=32.7728;RBI=0.0687688;REFB=-0.14251;REVB=0.0634417;RO=16;SAF=120;SAR=177;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0219786;STB=0.514049;TYPE=snp;VARB=0.0176257;OID=.;OPOS=44063598;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:320:316:16:18:297:298:177:120:3:13:178:120:3:15 chr18 44126909 . T C 948.96 PASS AO=94;DP=94;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0508339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.065;QD=37.5826;RBI=0.0655396;REFB=0;REVB=0.0413685;RO=0;SAF=63;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000105526;OID=.;OPOS=44126909;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:94:101:0:0:94:101:31:63:0:0:33:68:0:0 chr18 44135143 . T C 326.39 PASS AO=83;DP=188;FAO=84;FDP=185;FR=.;FRO=101;FSAF=19;FSAR=65;FSRF=36;FSRR=65;FWDB=-0.00826582;FXX=0.0263144;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.295;QD=7.05715;RBI=0.0107364;REFB=0.0100393;REVB=0.00685179;RO=90;SAF=19;SAR=64;SRF=35;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187836;STB=0.591375;TYPE=snp;VARB=-0.0122206;OID=.;OPOS=44135143;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:185:90:101:83:84:64:19:35:55:65:19:36:65 chr18 44259718 . GC G 378.61 PASS AO=52;DP=78;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.140162;FXX=0.0441112;HRUN=4;LEN=1;MLLD=12.2311;QD=23.2992;RBI=0.198625;REFB=0;REVB=0.140736;RO=9;SAF=12;SAR=40;SRF=1;SRR=8;SSEN=0.665025;SSEP=0;SSSB=0.0478982;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00531419;OID=.;OPOS=44259719;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:52:65:65:65:0:13:52:0:0:34:9:12:40:1:8 chr18 44407993 . G A 413.45 PASS AO=101;DP=212;FAO=101;FDP=210;FR=.;FRO=109;FSAF=54;FSAR=47;FSRF=53;FSRR=56;FWDB=0.00399414;FXX=0.00943352;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.906;QD=7.87523;RBI=0.00441786;REFB=-0.0010263;REVB=0.00188794;RO=109;SAF=54;SAR=47;SRF=53;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0456378;STB=0.525158;TYPE=snp;VARB=0.00118741;OID=.;OPOS=44407993;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:210:109:109:101:101:47:54:53:56:47:54:53:56 chr18 44560429 . C A 1242.55 PASS AO=127;DP=127;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00557855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.594;QD=38.5286;RBI=0.0535673;REFB=0;REVB=0.053276;RO=0;SAF=101;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.00393e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.41098e-05;OID=.;OPOS=44560429;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:127:129:0:0:127:129:26:101:0:0:28:101:0:0 chr18 44560875 . C A 108.26 PASS AO=32;DP=78;FAO=31;FDP=77;FR=.;FRO=46;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=27;FSRR=19;FWDB=0.0298823;FXX=0.0253133;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.101;QD=5.6241;RBI=0.037709;REFB=-0.0142482;REVB=0.0230003;RO=45;SAF=20;SAR=12;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0510686;STB=0.503873;TYPE=snp;VARB=0.0174471;OID=.;OPOS=44560875;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:77:45:46:32:31:12:20:26:19:13:18:27:19 chr18 44561100 . C G 160.46 PASS AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0196218;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.2037;QD=33.781;RBI=0.0312944;REFB=-0.059519;REVB=0.0243787;RO=1;SAF=12;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0704612;STB=0.538418;TYPE=snp;VARB=0.0232188;OID=.;OPOS=44561100;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:1:1:18:18:6:12:0:1:6:12:0:1 chr18 44561619 . G C 70.5 PASS AO=11;DP=16;FAO=11;FDP=16;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.00863851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2484;QD=17.6252;RBI=0.0871125;REFB=-0.034912;REVB=-0.0866831;RO=5;SAF=2;SAR=9;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195527;STB=0.608529;TYPE=snp;VARB=0.00687893;OID=.;OPOS=44561619;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:16:16:5:5:11:11:9:2:0:5:9:2:0:5 chr18 44561630 . C T 79.2 PASS AO=12;DP=17;FAO=12;FDP=17;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0622835;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.39;QD=18.6358;RBI=0.0624629;REFB=-0.0161284;REVB=0.00473058;RO=5;SAF=2;SAR=10;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180625;STB=0.599857;TYPE=snp;VARB=0.00914795;OID=.;OPOS=44561630;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:17:17:5:5:12:12:10:2:0:5:10:2:0:5 chr18 44561795 . C T 184.24 PASS AO=23;DP=26;FAO=23;FDP=26;FR=.;FRO=3;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0207522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.459;QD=28.3441;RBI=0.0207903;REFB=0.0194421;REVB=-0.00125765;RO=3;SAF=18;SAR=5;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128634;STB=0.570071;TYPE=snp;VARB=-0.00139283;OID=.;OPOS=44561795;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:26:26:3:3:23:23:5:18:1:2:5:18:1:2 chr18 44585955 . G A 127.69 PASS AO=32;DP=80;FAO=35;FDP=82;FR=.;FRO=47;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=0.0558069;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.832;QD=6.22878;RBI=0.0561692;REFB=-0.00199679;REVB=0.00636933;RO=46;SAF=16;SAR=16;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0225724;STB=0.530709;TYPE=snp;VARB=0.00371571;OID=.;OPOS=44585955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:82:46:47:32:35:16:16:22:24:16:19:23:24 chr18 44610718 . T C 260.18 PASS AO=80;DP=202;FAO=80;FDP=202;FR=.;FRO=122;FSAF=40;FSAR=40;FSRF=70;FSRR=52;FWDB=0.00509135;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=246.468;QD=5.15209;RBI=0.0120759;REFB=0.00104482;REVB=0.0109502;RO=121;SAF=40;SAR=40;SRF=70;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0841492;STB=0.544543;TYPE=snp;VARB=-0.00180188;OID=.;OPOS=44610718;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:202:121:122:80:80:40:40:70:51:40:40:70:52 chr18 44634291 . C T 243.8 PASS AO=70;DP=179;FAO=73;FDP=181;FR=.;FRO=108;FSAF=33;FSAR=40;FSRF=38;FSRR=70;FWDB=0.000965614;FXX=0.0109284;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.439;QD=5.38786;RBI=0.0138635;REFB=-0.0101345;REVB=0.0138298;RO=108;SAF=33;SAR=37;SRF=38;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130665;STB=0.561035;TYPE=snp;VARB=0.014662;OID=.;OPOS=44634291;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:181:108:108:70:73:37:33:38:70:40:33:38:70 chr18 45555829 . T C 15.55 PASS AO=3;DP=8;FAO=3;FDP=8;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.101027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.4539;QD=7.77568;RBI=0.123908;REFB=-0.00990535;REVB=-0.0717411;RO=5;SAF=1;SAR=2;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0671606;STB=0.545144;TYPE=snp;VARB=-0.022901;OID=.;OPOS=45555829;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:8:8:5:5:3:3:2:1:2:3:2:1:2:3 chr18 45696158 . G A 54.36 PASS AO=21;DP=77;FAO=23;FDP=80;FR=.;FRO=57;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=33;FSRR=24;FWDB=0.0158379;FXX=0.0243873;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.666;QD=2.71801;RBI=0.0160365;REFB=-0.00645884;REVB=-0.00251608;RO=56;SAF=15;SAR=6;SRF=32;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188817;STB=0.591097;TYPE=snp;VARB=0.0334934;OID=.;OPOS=45696158;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:77:80:56:57:21:23:6:15:32:24:7:16:33:24 chr18 45696204 . T C 90.75 PASS AO=27;DP=74;FAO=28;FDP=75;FR=.;FRO=47;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=-0.0150636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.741;QD=4.83987;RBI=0.016693;REFB=-0.0117246;REVB=-0.00719333;RO=47;SAF=14;SAR=13;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0147717;STB=0.502391;TYPE=snp;VARB=0.0212146;OID=.;OPOS=45696204;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:74:75:47:47:27:28:13:14:25:22:13:15:25:22 chr18 45696256 . A G 116.76 PASS AO=29;DP=64;FAO=29;FDP=64;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=0.011288;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.474;QD=7.29752;RBI=0.0185651;REFB=-0.00919461;REVB=0.0147393;RO=35;SAF=14;SAR=15;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0582233;STB=0.532808;TYPE=snp;VARB=0.010293;OID=.;OPOS=45696256;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:35:35:29:29:15:14:19:16:15:14:19:16 chr18 46001932 . A G 1145.78 PASS AO=119;DP=119;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=111;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00112627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=325.059;QD=38.5137;RBI=0.0241274;REFB=0;REVB=0.0241011;RO=0;SAF=111;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.91328e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.33576e-05;OID=.;OPOS=46001932;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:119:119:0:0:119:119:8:111:0:0:8:111:0:0 chr18 46163042 . GC G 506.53 PASS AO=80;DP=148;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146783;FXX=0.0143875;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.63279;QD=14.7893;RBI=0.288476;REFB=0.0365302;REVB=0.288102;RO=35;SAF=18;SAR=62;SRF=7;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0205496;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0053892;OID=.;OPOS=46163043;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:80:136:137:137:0:31:106:0:0:42:35:18:62:7:28 chr18 46284587 . T C 375.69 PASS AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0430122;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.2584;QD=38.532;RBI=0.0875113;REFB=0;REVB=0.0762113;RO=0;SAF=33;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000369593;OID=.;OPOS=46284587;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:39:39:0:0:39:39:6:33:0:0:6:33:0:0 chr18 46385948 . A G 193.8 PASS AO=19;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0213206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.359;QD=38.7606;RBI=0.0213803;REFB=0;REVB=0.00159666;RO=0;SAF=3;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000329986;OID=.;OPOS=46385948;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:20:20:0:0:19:20:16:3:0:0:17:3:0:0 chr18 46468946 . G A 640.08 PASS AO=66;DP=67;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0375418;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.424;QD=35.5599;RBI=0.0396248;REFB=-0.11083;REVB=0.012678;RO=1;SAF=22;SAR=44;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106189;STB=0.505049;TYPE=snp;VARB=0.00072745;OID=.;OPOS=46468946;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:67:72:1:1:66:71:44:22:0:1:49:22:0:1 chr18 46545924 . A G 2004.86 PASS AO=213;DP=215;FAO=213;FDP=213;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=143;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0413678;FXX=0.00930189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.941;QD=37.6499;RBI=0.0456053;REFB=-0.0727988;REVB=-0.0191976;RO=2;SAF=70;SAR=143;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00343678;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.27888e-05;OID=.;OPOS=46545924;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:215:213:2:0:213:213:143:70:1:1:143:70:0:0 chr18 46545979 . A C 410.44 PASS AO=103;DP=216;FAO=103;FDP=219;FR=.;FRO=116;FSAF=23;FSAR=80;FSRF=34;FSRR=82;FWDB=-0.0488392;FXX=0.00454525;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.487;QD=7.49659;RBI=0.0488502;REFB=-0.0414902;REVB=-0.00104001;RO=112;SAF=23;SAR=80;SRF=33;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.091299;STB=0.550316;TYPE=snp;VARB=0.0508582;OID=.;OPOS=46545979;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:216:219:112:116:103:103:80:23:33:79:80:23:34:82 chr18 46623854 . T C 310.64 PASS AO=67;DP=129;FAO=68;FDP=130;FR=.;FRO=62;FSAF=34;FSAR=34;FSRF=40;FSRR=22;FWDB=-0.0190943;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.764;QD=9.55828;RBI=0.0193976;REFB=-0.0179945;REVB=-0.00341691;RO=61;SAF=34;SAR=33;SRF=39;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1148;STB=0.569211;TYPE=snp;VARB=0.0178401;OID=.;OPOS=46623854;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:130:61:62:67:68:33:34:39:22:34:34:40:22 chr18 47352677 . A C 18.96 PASS AO=26;DP=172;FAO=28;FDP=172;FR=.;FRO=144;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=65;FSRR=79;FWDB=-0.0060769;FXX=0.00578001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.823;QD=0.441006;RBI=0.0139492;REFB=0.00265379;REVB=0.0125559;RO=143;SAF=9;SAR=17;SRF=65;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142902;STB=0.581837;TYPE=snp;VARB=-0.0506252;OID=.;OPOS=47352677;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:172:172:143:144:26:28:17:9:65:78:18:10:65:79 chr18 47397996 . T C 187.64 PASS AO=49;DP=111;FAO=49;FDP=111;FR=.;FRO=62;FSAF=17;FSAR=32;FSRF=29;FSRR=33;FWDB=-0.0262471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.596;QD=6.76183;RBI=0.0468234;REFB=-0.018809;REVB=-0.0387753;RO=62;SAF=17;SAR=32;SRF=29;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126874;STB=0.571177;TYPE=snp;VARB=0.0240314;OID=.;OPOS=47397996;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:62:62:49:49:32:17:29:33:32:17:29:33 chr18 47398549 . G A 464.13 PASS AO=106;DP=209;FAO=106;FDP=208;FR=.;FRO=102;FSAF=38;FSAR=68;FSRF=47;FSRR=55;FWDB=-0.0380675;FXX=0.00478446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.604;QD=8.92559;RBI=0.0439461;REFB=-0.0210168;REVB=0.0219574;RO=101;SAF=38;SAR=68;SRF=46;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0909963;STB=0.552888;TYPE=snp;VARB=0.0221682;OID=.;OPOS=47398549;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:208:101:102:106:106:68:38:46:55:68:38:47:55 chr18 47405425 . T TGAG 261.62 PASS AO=88;DP=259;FAO=91;FDP=251;FR=.;FRO=160;FSAF=38;FSAR=53;FSRF=50;FSRR=110;FWDB=0.0138568;FXX=0.00790483;HRUN=1;LEN=3;MLLD=228.562;QD=4.16925;RBI=0.0151562;REFB=-0.0127154;REVB=-0.00614006;RO=165;SAF=38;SAR=50;SRF=52;SRR=113;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139737;STB=0.57044;TYPE=ins;VARB=0.0260535;OID=.;OPOS=47405426;OREF=-;OALT=GAG;OMAPALT=TGAG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:88:259:91:251:160:38:53:50:110:99:165:38:50:52:113 chr18 47429022 . C T 441.56 PASS AO=104;DP=210;FAO=104;FDP=210;FR=.;FRO=106;FSAF=80;FSAR=24;FSRF=64;FSRR=42;FWDB=0.0111833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.342;QD=8.4106;RBI=0.0113036;REFB=-0.0168813;REVB=-0.00164467;RO=105;SAF=80;SAR=24;SRF=64;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18204;STB=0.604374;TYPE=snp;VARB=0.0217954;OID=.;OPOS=47429022;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:210:210:105:106:104:104:24:80:64:41:24:80:64:42 chr18 47455923 . C T 18.31 PASS AO=7;DP=29;FAO=7;FDP=29;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=19;FSRR=3;FWDB=-0.0176882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.182;QD=2.5249;RBI=0.0575144;REFB=0.000823419;REVB=-0.0547269;RO=22;SAF=4;SAR=3;SRF=19;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.398414;STB=0.741439;TYPE=snp;VARB=-0.00276007;OID=.;OPOS=47455923;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:29:29:22:22:7:7:3:4:19:3:3:4:19:3 chr18 47563299 . T C 1110.72 PASS AO=116;DP=117;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00726712;FXX=0.0168053;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.5582;QD=37.9733;RBI=0.0500938;REFB=-0.0711658;REVB=0.0495638;RO=0;SAF=50;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18089e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00109789;OID=.;OPOS=47563299;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:117:117:0:0:116:117:66:50:0:0:67:50:0:0 chr18 47777244 . C T 632.83 PASS AO=144;DP=347;FAO=172;FDP=376;FR=.;FRO=204;FSAF=93;FSAR=79;FSRF=118;FSRR=86;FWDB=0.0427781;FXX=0.00265245;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.182;QD=6.73221;RBI=0.0432097;REFB=-0.027277;REVB=0.00609174;RO=200;SAF=64;SAR=80;SRF=115;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13571;STB=0.520676;TYPE=snp;VARB=0.02857;OID=.;OPOS=47777244;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:347:376:200:204:144:172:80:64:115:85:79:93:118:86 chr18 47795629 . C A 1422.45 PASS AO=198;DP=206;FAO=180;FDP=205;FR=.;FRO=25;FSAF=94;FSAR=86;FSRF=6;FSRR=19;FWDB=0.0531898;FXX=0.00485413;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.7216;QD=27.7551;RBI=0.0538008;REFB=-0.0583084;REVB=-0.00808494;RO=8;SAF=97;SAR=101;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000746472;STB=0.534376;TYPE=snp;VARB=0.0222428;OID=.;OPOS=47795629;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:206:205:8:25:198:180:101:97:4:4:86:94:6:19 chr18 47799207 . GC G 416.88 PASS AO=58;DP=82;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.353667;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=11.6698;QD=20.0907;RBI=0.383898;REFB=0;REVB=0.149321;RO=21;SAF=18;SAR=40;SRF=11;SRR=10;SSEN=0.300429;SSEP=0;SSSB=-0.117039;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0142177;OID=.;OPOS=47799208;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:58:82:83:83:0:31:52:0:0:34:21:18:40:11:10 chr18 47800179 . G C 152.88 PASS AO=32;DP=60;FAO=32;FDP=61;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.0139889;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=167.264;QD=10.0247;RBI=0.0420549;REFB=-0.00866537;REVB=0.0396601;RO=28;SAF=14;SAR=18;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0227958;STB=0.505194;TYPE=snp;VARB=0.0063717;OID=.;OPOS=47800179;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:61:28:29:32:32:18:14:13:15:18:14:13:16 chr18 47809871 . G T 123.9 PASS AO=27;DP=53;FAO=27;FDP=53;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=26;FWDB=0.0361354;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.7864;QD=9.35095;RBI=0.0498858;REFB=-0.0231015;REVB=-0.0343922;RO=26;SAF=7;SAR=20;SRF=0;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.363286;STB=0.696866;TYPE=snp;VARB=0.0125987;OID=.;OPOS=47809871;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:26:26:27:27:20:7:0:26:20:7:0:26 chr18 47810351 . A G 151.36 PASS AO=37;DP=84;FAO=39;FDP=86;FR=.;FRO=47;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=25;FWDB=-0.00602128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.153;QD=7.04009;RBI=0.0125148;REFB=-0.0111392;REVB=0.010971;RO=47;SAF=18;SAR=19;SRF=22;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0183287;STB=0.503595;TYPE=snp;VARB=0.0121785;OID=.;OPOS=47810351;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:86:47:47:37:39:19:18:22:25:21:18:22:25 chr18 47908556 . G A 478.1 PASS AO=92;DP=159;FAO=92;FDP=156;FR=.;FRO=64;FSAF=22;FSAR=70;FSRF=32;FSRR=32;FWDB=-0.0123948;FXX=0.0188667;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.912;QD=12.259;RBI=0.0157163;REFB=-0.0111988;REVB=0.00966293;RO=64;SAF=22;SAR=70;SRF=32;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233349;STB=0.62746;TYPE=snp;VARB=0.00444861;OID=.;OPOS=47908556;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:156:64:64:92:92:70:22:32:32:70:22:32:32 chr18 48331524 . G A 304.41 PASS AO=74;DP=154;FAO=74;FDP=154;FR=.;FRO=80;FSAF=37;FSAR=37;FSRF=32;FSRR=48;FWDB=0.00128345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.8048;QD=7.90683;RBI=0.0187606;REFB=-0.0262385;REVB=0.0187166;RO=80;SAF=37;SAR=37;SRF=32;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0940669;STB=0.551934;TYPE=snp;VARB=0.0232355;OID=.;OPOS=48331524;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:154:80:80:74:74:37:37:32:48:37:37:32:48 chr18 48331553 . T C 371.69 PASS AO=88;DP=179;FAO=88;FDP=179;FR=.;FRO=91;FSAF=47;FSAR=41;FSRF=42;FSRR=49;FWDB=0.00588647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.6298;QD=8.30586;RBI=0.0178239;REFB=-0.0286945;REVB=-0.0168238;RO=91;SAF=47;SAR=41;SRF=42;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0669324;STB=0.536862;TYPE=snp;VARB=0.0301111;OID=.;OPOS=48331553;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:179:91:91:88:88:41:47:42:49:41:47:42:49 chr18 48333203 . C G 1258.74 PASS AO=131;DP=134;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00983892;FXX=0.0073524;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.646;QD=37.2961;RBI=0.01709;REFB=-0.051124;REVB=0.0139737;RO=2;SAF=76;SAR=55;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0169664;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.72767e-05;OID=.;OPOS=48333203;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:134:135:2:0:131:135:55:76:0:2:56:79:0:0 chr18 48335773 . A G 247.21 PASS AO=62;DP=137;FAO=65;FDP=143;FR=.;FRO=78;FSAF=18;FSAR=47;FSRF=24;FSRR=54;FWDB=-0.141195;FXX=0.00694396;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.8068;QD=6.9151;RBI=0.142515;REFB=0.0196162;REVB=0.0193577;RO=75;SAF=18;SAR=44;SRF=23;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0193056;STB=0.520563;TYPE=snp;VARB=-0.0249449;OID=.;OPOS=48335773;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:143:75:78:62:65:44:18:23:52:47:18:24:54 chr18 48577782 . G C 143.92 PASS AO=40;DP=161;FAO=47;FDP=161;FR=.,HEALED;FRO=105;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=38;FSRR=67;FWDB=-0.0162364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.298;QD=3.57567;RBI=0.0440882;REFB=-0.0396121;REVB=-0.0409896;RO=86;SAF=18;SAR=22;SRF=38;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00965833;STB=0.530713;TYPE=snp;VARB=0.0813024;OID=.;OPOS=48577782;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:160:161:86:105:40:47:22:18:38:48:28:19:38:67 chr18 48609920 . G A 110.73 PASS AO=32;DP=81;FAO=32;FDP=81;FR=.;FRO=49;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=6;FSRR=43;FWDB=-0.00275394;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.253;QD=5.46828;RBI=0.0034336;REFB=-0.00782762;REVB=0.0020507;RO=47;SAF=11;SAR=21;SRF=6;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.281051;STB=0.663442;TYPE=snp;VARB=0.0114342;OID=.;OPOS=48609920;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:47:49:32:32:21:11:6:41:21:11:6:43 chr18 48633216 . G T 293.32 PASS AO=66;DP=129;FAO=66;FDP=130;FR=.;FRO=64;FSAF=38;FSAR=28;FSRF=32;FSRR=32;FWDB=0.00053905;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.096;QD=9.02523;RBI=0.00177401;REFB=-0.0229379;REVB=-0.00169013;RO=62;SAF=38;SAR=28;SRF=31;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.067451;STB=0.537724;TYPE=snp;VARB=0.0204364;OID=.;OPOS=48633216;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:130:62:64:66:66:28:38:31:31:28:38:32:32 chr18 48723217 . C T 164.61 PASS AO=17;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149175;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=218.869;QD=36.5803;RBI=0.0467936;REFB=0;REVB=0.0443521;RO=1;SAF=16;SAR=1;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.298625;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000361678;OID=.;OPOS=48723217;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:18:1:0:17:18:1:16:0:1:2:16:0:0 chr18 49072801 . C T 1403.32 PASS AO=146;DP=148;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000947715;FXX=0.0135126;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.858;QD=38.447;RBI=0.0188067;REFB=0;REVB=-0.0187828;RO=0;SAF=65;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.00316e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.31568e-05;OID=.;OPOS=49072801;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:148:146:0:0:146:146:81:65:0:0:81:65:0:0 chr18 49867224 . T C 2799.62 PASS AO=299;DP=305;FAO=302;FDP=308;FR=.;FRO=6;FSAF=121;FSAR=181;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0265392;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.014;QD=36.3587;RBI=0.0268543;REFB=-0.0471406;REVB=0.00410194;RO=6;SAF=121;SAR=178;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0166238;STB=0.508744;TYPE=snp;VARB=0.000948671;OID=.;OPOS=49867224;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:305:308:6:6:299:302:178:121:5:1:181:121:5:1 chr18 50278686 . G A 308.59 PASS AO=78;DP=168;FAO=78;FDP=168;FR=.;FRO=90;FSAF=43;FSAR=35;FSRF=61;FSRR=29;FWDB=0.0482102;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3111;QD=7.34745;RBI=0.0547727;REFB=-0.0170219;REVB=0.0259967;RO=89;SAF=43;SAR=35;SRF=60;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121496;STB=0.569445;TYPE=snp;VARB=0.0221051;OID=.;OPOS=50278686;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:89:90:78:78:35:43:60:29:35:43:61:29 chr18 50432602 . C G 1342.03 PASS AO=144;DP=146;FAO=144;FDP=146;FR=.;FRO=2;FSAF=42;FSAR=102;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0478558;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.6443;QD=36.7679;RBI=0.0661902;REFB=0.0202372;REVB=0.0457271;RO=1;SAF=42;SAR=102;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111866;STB=0.503443;TYPE=snp;VARB=-0.000722348;OID=.;OPOS=50432602;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:146:146:1:2:144:144:102:42:1:0:102:42:1:1 chr18 51681244 . T C 1767.85 PASS AO=182;DP=183;FAO=186;FDP=186;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00386449;FXX=0.00534731;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.243;QD=38.0182;RBI=0.0871596;REFB=-0.0482529;REVB=0.0870739;RO=0;SAF=86;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000197149;OID=.;OPOS=51681244;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:183:186:0:0:182:186:96:86:0:0:100:86:0:0 chr18 51795957 . GCGA G,GCGG 295.89 PASS AO=19,11;DP=41;FAO=21,12;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=7,5;FSAR=14,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167043,0.0382654;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=3,1;MLLD=143.232,78.9862;QD=35.8648;RBI=0.0202982,0.0404001;REFB=0,0;REVB=-0.0115318,0.0129586;RO=0;SAF=6,4;SAR=13,7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.851e-08,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.00642422,0.0439739;OID=.,.;OPOS=51795958,51795960;OREF=CGA,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GCGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:19,11:30:21,12:33:0:7,5:14,7:0:0:43:0:6,4:13,7:0:0 chr18 51820805 . G A 604.61 PASS AO=63;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00724554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.762;QD=37.7883;RBI=0.0221858;REFB=0;REVB=0.0209693;RO=0;SAF=28;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.88631e-05;OID=.;OPOS=51820805;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:64:64:0:0:63:64:35:28:0:0:35:29:0:0 chr18 51858197 . A G 1695.79 PASS AO=194;DP=207;FAO=195;FDP=207;FR=.;FRO=12;FSAF=74;FSAR=121;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.0897776;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=167.872;QD=32.769;RBI=0.090894;REFB=-0.186014;REVB=-0.0142016;RO=3;SAF=74;SAR=120;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00874311;STB=0.50739;TYPE=snp;VARB=0.00127365;OID=.;OPOS=51858197;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:207:207:3:12:194:195:120:74:2:1:121:74:6:6 chr18 52258548 . T C 1560.22 PASS AO=165;DP=166;FAO=165;FDP=165;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0302437;FXX=0.0119753;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.029;QD=37.8234;RBI=0.038633;REFB=-6.56949e-05;REVB=0.024038;RO=0;SAF=90;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.12797e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.0781e-05;OID=.;OPOS=52258548;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:166:165:0:0:165:165:75:90:0:0:75:90:0:0 chr18 52570281 . G A 627.68 PASS AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.203;QD=38.0409;RBI=0.0628697;REFB=0;REVB=0.0594967;RO=0;SAF=44;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000105799;OID=.;OPOS=52570281;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:66:66:0:0:66:66:22:44:0:0:22:44:0:0 chr18 52570345 . C A 187.58 PASS AO=38;DP=74;FAO=40;FDP=76;FR=.;FRO=36;FSAF=27;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.0139655;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.205;QD=9.8727;RBI=0.0154068;REFB=-0.00930127;REVB=-0.00650644;RO=36;SAF=27;SAR=11;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177661;STB=0.575245;TYPE=snp;VARB=0.0090538;OID=.;OPOS=52570345;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:76:36:36:38:40:11:27:19:17:13:27:19:17 chr18 52605188 . C T 161.41 PASS AO=39;DP=83;FAO=39;FDP=83;FR=.;FRO=44;FSAF=31;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=0.0113235;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.4823;QD=7.77897;RBI=0.0254908;REFB=-0.00249405;REVB=-0.0228377;RO=43;SAF=31;SAR=8;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.338474;STB=0.697782;TYPE=snp;VARB=0.00200059;OID=.;OPOS=52605188;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:43:44:39:39:8:31:21:22:8:31:21:23 chr18 52889967 . T C 1147.5 PASS AO=128;DP=135;FAO=128;FDP=133;FR=.;FRO=5;FSAF=74;FSAR=54;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0138712;FXX=0.0148137;HRUN=4;LEN=1;MLLD=141.396;QD=34.5113;RBI=0.0154534;REFB=-0.093957;REVB=0.00681163;RO=3;SAF=74;SAR=54;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00395074;STB=0.500843;TYPE=snp;VARB=0.000407593;OID=.;OPOS=52889967;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:135:133:3:5:128:128:54:74:2:1:54:74:3:2 chr18 52895531 . T C 173.26 PASS AO=49;DP=118;FAO=49;FDP=118;FR=.;FRO=69;FSAF=12;FSAR=37;FSRF=25;FSRR=44;FWDB=-0.00639295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.865;QD=5.8732;RBI=0.0114174;REFB=0.00527804;REVB=0.00945983;RO=69;SAF=12;SAR=37;SRF=25;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14954;STB=0.584756;TYPE=snp;VARB=-0.00501702;OID=.;OPOS=52895531;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:69:69:49:49:37:12:25:44:37:12:25:44 chr18 53070914 . G A 227.08 PASS AO=60;DP=136;FAO=60;FDP=135;FR=.;FRO=75;FSAF=34;FSAR=26;FSRF=47;FSRR=28;FWDB=0.0155364;FXX=0.0073524;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.381;QD=6.7284;RBI=0.0173128;REFB=0.00462704;REVB=0.00763889;RO=75;SAF=34;SAR=26;SRF=47;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0614687;STB=0.534235;TYPE=snp;VARB=-0.00494832;OID=.;OPOS=53070914;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:135:75:75:60:60:26:34:47:28:26:34:47:28 chr18 53303101 . C G 2226.25 PASS AO=131;DP=239;FAO=229;FDP=229;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=131;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124564;FXX=0.0255308;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.201;QD=38.8865;RBI=0.2398;REFB=0;REVB=0.239476;RO=0;SAF=130;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000188814;OID=.;OPOS=53303101;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:233:229:0:0:131:229:1:130:0:0:98:131:0:0 chr18 54339818 . C G 1860.14 PASS AO=217;DP=234;FAO=219;FDP=236;FR=.;FRO=17;FSAF=45;FSAR=174;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.0205803;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.7545;QD=31.5277;RBI=0.0472762;REFB=-0.0076017;REVB=-0.0425616;RO=16;SAF=44;SAR=173;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0807057;STB=0.540216;TYPE=snp;VARB=0.0026763;OID=.;OPOS=54339818;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:234:236:16:17:217:219:173:44:10:6:174:45:10:7 chr18 54448778 . G A 526.12 PASS AO=104;DP=180;FAO=104;FDP=180;FR=.;FRO=76;FSAF=52;FSAR=52;FSRF=55;FSRR=21;FWDB=-0.00661617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.305;QD=11.6916;RBI=0.0225226;REFB=0.00318091;REVB=-0.0215289;RO=75;SAF=52;SAR=52;SRF=55;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180577;STB=0.594427;TYPE=snp;VARB=-0.00235003;OID=.;OPOS=54448778;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:180:75:76:104:104:52:52:55:20:52:52:55:21 chr18 54814730 . G A 116.43 PASS AO=31;DP=73;FAO=31;FDP=73;FR=.;FRO=42;FSAF=1;FSAR=30;FSRF=7;FSRR=35;FWDB=0.00578779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.563;QD=6.37987;RBI=0.00615178;REFB=-0.02224;REVB=0.0020847;RO=42;SAF=1;SAR=30;SRF=7;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.481084;STB=0.786617;TYPE=snp;VARB=0.0276915;OID=.;OPOS=54814730;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:42:42:31:31:30:1:7:35:30:1:7:35 chr18 54814771 . G A 253.75 PASS AO=63;DP=136;FAO=63;FDP=135;FR=.;FRO=72;FSAF=12;FSAR=51;FSRF=17;FSRR=55;FWDB=-0.00575843;FXX=0.0145975;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.087;QD=7.51861;RBI=0.0503308;REFB=-0.00551715;REVB=0.0500003;RO=71;SAF=12;SAR=51;SRF=16;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0518973;STB=0.53761;TYPE=snp;VARB=0.00785431;OID=.;OPOS=54814771;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:135:71:72:63:63:51:12:16:55:51:12:17:55 chr18 54815025 . G T 254.34 PASS AO=52;DP=137;FAO=61;FDP=127;FR=.,HEALED;FRO=66;FSAF=17;FSAR=44;FSRF=34;FSRR=32;FWDB=-0.034833;FXX=0.0155027;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.5053;QD=8.01065;RBI=0.0475045;REFB=-0.0100093;REVB=0.0323008;RO=40;SAF=15;SAR=37;SRF=10;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0378827;STB=0.634569;TYPE=snp;VARB=0.00792869;OID=.;OPOS=54815025;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:127:40:66:52:61:37:15:10:30:44:17:34:32 chr18 54951861 . G A 52.59 PASS AO=21;DP=71;FAO=21;FDP=71;FR=.;FRO=50;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=30;FWDB=-0.00346938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.2733;QD=2.96308;RBI=0.00778047;REFB=-0.00735758;REVB=0.00696413;RO=50;SAF=15;SAR=6;SRF=20;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.36948;STB=0.719792;TYPE=snp;VARB=0.0182053;OID=.;OPOS=54951861;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:71:71:50:50:21:21:6:15:20:30:6:15:20:30 chr18 55021725 . A C 216.97 PASS AO=47;DP=92;FAO=47;FDP=90;FR=.;FRO=43;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=31;FSRR=12;FWDB=0.000545365;FXX=0.0217368;HRUN=3;LEN=1;MLLD=254.574;QD=9.64289;RBI=0.0171084;REFB=-0.00555178;REVB=0.0170997;RO=43;SAF=25;SAR=22;SRF=31;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166858;STB=0.591701;TYPE=snp;VARB=0.00454183;OID=.;OPOS=55021725;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:90:43:43:47:47:22:25:31:12:22:25:31:12 chr18 55027334 . G T 157.94 PASS AO=48;DP=117;FAO=46;FDP=115;FR=.;FRO=69;FSAF=40;FSAR=6;FSRF=34;FSRR=35;FWDB=-0.0131918;FXX=0.0336106;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.6883;QD=5.49369;RBI=0.0661125;REFB=-0.0160078;REVB=0.064783;RO=68;SAF=41;SAR=7;SRF=33;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.469185;STB=0.786803;TYPE=snp;VARB=0.0266542;OID=.;OPOS=55027334;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:115:68:69:48:46:7:41:33:35:6:40:34:35 chr18 55035072 . C T 181.14 PASS AO=15;DP=63;FAO=36;FDP=59;FR=.,HEALED;FRO=23;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.016388;FXX=0.0922935;HRUN=3;LEN=1;MLLD=26.3456;QD=12.281;RBI=0.103468;REFB=-0.0887354;REVB=-0.102162;RO=11;SAF=15;SAR=0;SRF=11;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503815;TYPE=snp;VARB=-0.0282115;OID=.;OPOS=55035072;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:40:59:11:23:15:36:0:15:11:0:16:20:13:10 chr18 55145377 . G A 65.45 PASS AO=19;DP=50;FAO=19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=-0.047914;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.153;QD=5.13321;RBI=0.0503626;REFB=-0.029368;REVB=-0.0155126;RO=31;SAF=8;SAR=11;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00185945;STB=0.510537;TYPE=snp;VARB=0.0363774;OID=.;OPOS=55145377;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:50:51:31:32:19:19:11:8:13:18:11:8:14:18 chr18 55145547 . G T 145.09 PASS AO=45;DP=117;FAO=45;FDP=117;FR=.;FRO=72;FSAF=30;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=43;FWDB=0.0266625;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=46.8822;QD=4.96026;RBI=0.0818068;REFB=-0.00852138;REVB=0.07734;RO=70;SAF=30;SAR=15;SRF=29;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.272998;STB=0.662785;TYPE=snp;VARB=0.0145261;OID=.;OPOS=55145547;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:70:72:45:45:15:30:29:41:15:30:29:43 chr18 55145575 . C G 1158.28 PASS AO=120;DP=120;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0172875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.3744;QD=38.6095;RBI=0.0182388;REFB=0;REVB=0.00581357;RO=0;SAF=59;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.65501e-05;OID=.;OPOS=55145575;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:120:120:0:0:120:120:61:59:0:0:61:59:0:0 chr18 55145765 . G C 155.81 PASS AO=38;DP=82;FAO=38;FDP=82;FR=.;FRO=44;FSAF=11;FSAR=27;FSRF=16;FSRR=28;FWDB=0.00340331;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=174.462;QD=7.60033;RBI=0.00341548;REFB=0.0073522;REVB=0.000287961;RO=44;SAF=11;SAR=27;SRF=16;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0827613;STB=0.546452;TYPE=snp;VARB=-0.00902076;OID=.;OPOS=55145765;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:44:44:38:38:27:11:16:28:27:11:16:28 chr18 55145906 . C T 825.52 PASS AO=86;DP=88;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0235619;FXX=0.0227247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.5832;QD=38.3962;RBI=0.0242871;REFB=0;REVB=0.00589049;RO=0;SAF=36;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000120907;OID=.;OPOS=55145906;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:88:86:0:0:86:86:50:36:0:0:50:36:0:0 chr18 55146453 . T C 1593.16 PASS AO=166;DP=166;FAO=166;FDP=166;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0231202;FXX=0.00598767;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.31;QD=38.3894;RBI=0.0473913;REFB=0;REVB=0.0413689;RO=0;SAF=90;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.08707e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.49882e-05;OID=.;OPOS=55146453;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:166:166:0:0:166:166:76:90:0:0:77:89:0:0 chr18 55150557 . G T 1415.26 PASS AO=159;DP=163;FAO=158;FDP=163;FR=.;FRO=5;FSAF=61;FSAR=97;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0605633;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.8343;QD=34.7304;RBI=0.0688158;REFB=-0.0377675;REVB=0.0326757;RO=3;SAF=62;SAR=97;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00209642;STB=0.50045;TYPE=snp;VARB=0.00468213;OID=.;OPOS=55150557;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:163:163:3:5:159:158:97:62:1:2:97:61:2:3 chr18 55151440 . G GA,A 69.14 PASS AO=10,27;DP=63;FAO=50,6;FDP=60;FR=.;FRO=4;FSAF=21,5;FSAR=29,1;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0880109,0.0139259;FXX=0;HRUN=10,1;LEN=1,1;MLLD=3.84843,179.987;QD=4.60951;RBI=0.113406,0.0142037;REFB=-0.100135,-0.00251201;REVB=0.0715187,-0.00279549;RO=19;SAF=4,15;SAR=6,12;SRF=10;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.13765,0.0220304;STB=0.512972,0.768234;TYPE=ins,snp;VARB=0.0180597,-0.0126193;OID=.,.;OPOS=55151441,55151440;OREF=-,G;OALT=A,A;OMAPALT=GA,A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:5:63:60:19:4:10,27:50,6:6,12:4,15:10:9:29,1:21,5:1:3 chr18 55154066 . A G 2162.4 PASS AO=223;DP=236;FAO=229;FDP=229;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=135;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0158081;FXX=0.0614729;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.977;QD=37.7712;RBI=0.0373292;REFB=-0.0508314;REVB=0.0338167;RO=2;SAF=93;SAR=130;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00144468;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000596082;OID=.;OPOS=55154066;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:87:236:229:2:0:223:229:130:93:1:1:135:94:0:0 chr18 55155489 . A G 1996.42 PASS AO=207;DP=210;FAO=207;FDP=207;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=124;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243473;FXX=0.014285;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.581;QD=38.5782;RBI=0.0244611;REFB=0;REVB=0.0023566;RO=0;SAF=83;SAR=124;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.32972e-05;OID=.;OPOS=55155489;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:94:210:207:0:0:207:207:124:83:0:0:124:83:0:0 chr18 55158489 . A AATTCTGC 500.49 PASS AO=81;DP=124;FAO=83;FDP=121;FR=.;FRO=38;FSAF=20;FSAR=63;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=-0.0303513;FXX=0.0241916;HRUN=3;LEN=7;MLLD=263.292;QD=16.545;RBI=0.0305967;REFB=-0.0344844;REVB=-0.00386766;RO=41;SAF=20;SAR=61;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213195;STB=0.617469;TYPE=ins;VARB=0.0166522;OID=.;OPOS=55158490;OREF=-;OALT=ATTCTGC;OMAPALT=AATTCTGC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:81:124:83:121:38:20:63:21:17:93:41:20:61:22:19 chr18 55221648 . T C 683.54 PASS AO=167;DP=344;FAO=167;FDP=343;FR=.;FRO=176;FSAF=78;FSAR=89;FSRF=82;FSRR=94;FWDB=0.000571058;FXX=0.00290689;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.101;QD=7.97128;RBI=0.00250531;REFB=-0.0034573;REVB=-0.00243936;RO=174;SAF=78;SAR=89;SRF=82;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00391902;STB=0.500596;TYPE=snp;VARB=0.00475957;OID=.;OPOS=55221648;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:344:343:174:176:167:167:89:78:82:92:89:78:82:94 chr18 55226383 . G C 292.93 PASS AO=63;DP=119;FAO=63;FDP=119;FR=.;FRO=56;FSAF=35;FSAR=28;FSRF=34;FSRR=22;FWDB=-0.0211443;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=69.0794;QD=9.84649;RBI=0.0233121;REFB=-0.00658592;REVB=0.00981696;RO=56;SAF=35;SAR=28;SRF=34;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0450179;STB=0.524707;TYPE=snp;VARB=0.0046011;OID=.;OPOS=55226383;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:56:56:63:63:28:35:34:22:28:35:34:22 chr18 55313704 . AT A 760.7 PASS AO=129;DP=177;FAO=171;FDP=171;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.159476;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=9.64564;QD=17.7941;RBI=0.164767;REFB=-0.0322204;REVB=0.0414193;RO=22;SAF=59;SAR=70;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0514096;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0210991;OID=.;OPOS=55313705;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:129:168:171:171:0:80:91:0:0:50:22:59:70:6:16 chr18 55313997 . C T 882.25 PASS AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0397493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.2043;QD=37.9462;RBI=0.0555179;REFB=0;REVB=0.0387586;RO=0;SAF=48;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000389182;OID=.;OPOS=55313997;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:93:93:0:0:93:93:45:48:0:0:45:48:0:0 chr18 55314820 . C A 1521.05 PASS AO=158;DP=159;FAO=158;FDP=158;FR=.;FRO=0;FSAF=99;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247335;FXX=0.00628891;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.475;QD=38.5077;RBI=0.0336304;REFB=0;REVB=0.0227872;RO=0;SAF=99;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.61259e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.24068e-05;OID=.;OPOS=55314820;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:159:158:0:0:158:158:59:99:0:0:59:99:0:0 chr18 55317676 . C T 628.83 PASS AO=68;DP=69;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00720472;FXX=0.0277739;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.225;QD=35.9331;RBI=0.0556303;REFB=-0.0466323;REVB=-0.0551618;RO=0;SAF=19;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504949;TYPE=snp;VARB=0.000458025;OID=.;OPOS=55317676;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:69:70:0:1:68:69:49:19:0:0:50:19:0:1 chr18 55322502 . C T 1732.19 PASS AO=178;DP=178;FAO=182;FDP=182;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00855731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.561;QD=38.0701;RBI=0.0113018;REFB=0;REVB=0.00738262;RO=0;SAF=93;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000106417;OID=.;OPOS=55322502;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:82:178:182:0:0:178:182:85:93:0:0:89:93:0:0 chr18 55335240 . A G 615.54 PASS AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00791981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.388;QD=37.8795;RBI=0.0128237;REFB=0;REVB=0.0100859;RO=0;SAF=31;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.90682e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.91999e-06;OID=.;OPOS=55335240;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:65:65:0:0:65:65:34:31:0:0:34:31:0:0 chr18 55346232 . A G 497.84 PASS AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0326762;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.5578;QD=37.5732;RBI=0.0343288;REFB=0;REVB=0.0105228;RO=0;SAF=21;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.81969e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00032999;OID=.;OPOS=55346232;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:53:53:0:0:53:53:32:21:0:0:32:21:0:0 chr18 55362532 . T G 2039.63 PASS AO=209;DP=209;FAO=215;FDP=215;FR=.;FRO=0;FSAF=108;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0366691;FXX=0.00462942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.473;QD=37.9465;RBI=0.0453735;REFB=-0.0529153;REVB=0.0267232;RO=0;SAF=103;SAR=106;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000123248;OID=.;OPOS=55362532;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:209:215:0:0:209:215:106:103:0:0:107:108:0:0 chr18 55364852 . A G 1431.46 PASS AO=150;DP=153;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189399;FXX=0.0196066;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.19;QD=38.1723;RBI=0.0189515;REFB=0;REVB=0.000663414;RO=0;SAF=76;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.74915e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.85501e-05;OID=.;OPOS=55364852;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:153:150:0:0:150:150:74:76:0:0:74:76:0:0 chr18 56148781 . G C 133.33 PASS AO=26;DP=46;FAO=26;FDP=46;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=21;FSRF=4;FSRR=16;FWDB=0.0108478;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.162;QD=11.5941;RBI=0.0216522;REFB=0.00930402;REVB=0.0187389;RO=20;SAF=5;SAR=21;SRF=4;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00962039;STB=0.505343;TYPE=snp;VARB=-0.012758;OID=.;OPOS=56148781;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:46:46:20:20:26:26:21:5:4:16:21:5:4:16 chr18 56148796 . A G 339.48 PASS AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0961638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.352;QD=35.7349;RBI=0.0963925;REFB=-0.00228925;REVB=-0.00663717;RO=1;SAF=6;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0148726;STB=0.507932;TYPE=snp;VARB=0.000372411;OID=.;OPOS=56148796;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:38:38:1:1:37:37:31:6:0:1:31:6:0:1 chr18 56149099 . T C 1622.73 PASS AO=173;DP=175;FAO=174;FDP=174;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=152;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0293167;FXX=0.00571396;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.162;QD=37.3041;RBI=0.0420766;REFB=-0.0700038;REVB=0.0301823;RO=1;SAF=22;SAR=151;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0211385;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000150863;OID=.;OPOS=56149099;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:175:174:1:0:173:174:151:22:1:0:152:22:0:0 chr18 56196451 . C T 918.63 PASS AO=64;DP=99;FAO=91;FDP=97;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=21;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0517957;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.008;QD=37.8815;RBI=0.0620491;REFB=0;REVB=0.0341657;RO=0;SAF=5;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.38061e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0114917;OID=.;OPOS=56196451;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:93:97:0:0:64:91:59:5:0:0:70:21:0:0 chr18 56202418 . T C 580.83 PASS AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00202396;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=141.78;QD=38.7221;RBI=0.0186221;REFB=0;REVB=-0.0185118;RO=0;SAF=25;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.89445e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.46013e-05;OID=.;OPOS=56202418;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:60:60:0:0:60:60:35:25:0:0:35:25:0:0 chr18 56202768 . C A 2173.36 PASS AO=229;DP=230;FAO=229;FDP=229;FR=.;FRO=0;FSAF=162;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0563205;FXX=0.0171666;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2761;QD=37.9626;RBI=0.056372;REFB=-0.0466978;REVB=0.00240788;RO=0;SAF=162;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.90535e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.41755e-06;OID=.;OPOS=56202768;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:230:229:0:0:229:229:67:162:0:0:67:162:0:0 chr18 56202982 . A T 1940.51 PASS AO=203;DP=203;FAO=203;FDP=203;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=132;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0359485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.105;QD=38.2367;RBI=0.0369202;REFB=0;REVB=-0.00841474;RO=0;SAF=71;SAR=132;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.49231e-05;OID=.;OPOS=56202982;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:92:203:203:0:0:203:203:132:71:0:0:132:71:0:0 chr18 56203074 . G A 2152.11 PASS AO=226;DP=227;FAO=226;FDP=226;FR=.;FRO=0;FSAF=124;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129854;FXX=0.00440509;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.128;QD=38.0904;RBI=0.0301201;REFB=-0.0619282;REVB=0.0271771;RO=0;SAF=124;SAR=102;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.20716e-05;OID=.;OPOS=56203074;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:227:226:0:0:226:226:102:124:0:0:102:124:0:0 chr18 56203120 . C T 2369.5 PASS AO=248;DP=249;FAO=248;FDP=248;FR=.;FRO=0;FSAF=138;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00813738;FXX=0.0040159;HRUN=5;LEN=1;MLLD=212.491;QD=38.2178;RBI=0.0163335;REFB=-0.0378491;REVB=0.0141622;RO=1;SAF=138;SAR=110;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00431365;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.90784e-06;OID=.;OPOS=56203120;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:249:248:1:0:248:248:110:138:0:1:110:138:0:0 chr18 56203411 . G C 680.15 PASS AO=71;DP=71;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0643062;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=145.312;QD=37.7859;RBI=0.0780786;REFB=0;REVB=0.0442829;RO=0;SAF=32;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.6531e-05;OID=.;OPOS=56203411;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:71:72:0:0:71:72:39:32:0:0:40:32:0:0 chr18 56203447 . A G 902.36 PASS AO=92;DP=93;FAO=96;FDP=97;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=53;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0361153;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.443;QD=37.2108;RBI=0.0362364;REFB=-0.105937;REVB=0.002961;RO=0;SAF=43;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505746;TYPE=snp;VARB=0.00052548;OID=.;OPOS=56203447;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:93:97:0:1:92:96:49:43:0:0:53:43:1:0 chr18 56203891 . G T 514.94 PASS AO=59;DP=62;FAO=59;FDP=62;FR=.;FRO=3;FSAF=35;FSAR=24;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00824876;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=172.229;QD=33.2222;RBI=0.0299771;REFB=0.0125963;REVB=0.0288199;RO=2;SAF=35;SAR=24;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0261996;STB=0.503686;TYPE=snp;VARB=-0.0103799;OID=.;OPOS=56203891;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:62:62:2:3:59:59:24:35:2:0:24:35:2:1 chr18 56203898 . T G 525.62 PASS AO=39;DP=61;FAO=55;FDP=55;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=36;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0308186;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=317.452;QD=38.2265;RBI=0.0309144;REFB=0;REVB=0.00243142;RO=0;SAF=19;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3303e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0010165;OID=.;OPOS=56203898;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:57:55:0:0:39:55:20:19:0:0:19:36:0:0 chr18 56204250 . A C 1263.11 PASS AO=134;DP=135;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00136916;FXX=0.00740686;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.6195;QD=37.7047;RBI=0.0527927;REFB=-0.0745777;REVB=-0.0527749;RO=0;SAF=64;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000435698;OID=.;OPOS=56204250;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:135:134:0:0:134:134:70:64:0:0:70:64:0:0 chr18 56204387 . ACAGTTGATGTGTCCT A 885.21 PASS AO=91;DP=139;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0409514;FXX=0.097078;HRUN=1;LEN=15;MLLD=412.939;QD=38.0736;RBI=0.0461969;REFB=0;REVB=0.0213806;RO=0;SAF=44;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.04952e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=4.11058e-05;OID=.;OPOS=56204388;OREF=CAGTTGATGTGTCCT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:91:95:93:93:0:45:48:0:0:42:0:44:47:0:0 chr18 56204410 . C T 1226.62 PASS AO=126;DP=126;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0264883;FXX=0.00775134;HRUN=3;LEN=1;MLLD=134.644;QD=38.332;RBI=0.0289769;REFB=0;REVB=0.0117488;RO=0;SAF=53;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.43441e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000179531;OID=.;OPOS=56204410;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:126:128:0:0:126:128:73:53:0:0:75:53:0:0 chr18 56204671 . A T 1545.85 PASS AO=168;DP=170;FAO=167;FDP=170;FR=.;FRO=3;FSAF=84;FSAR=83;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0041678;FXX=0.00584761;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.9539;QD=36.3729;RBI=0.0366024;REFB=-0.0476306;REVB=-0.0363644;RO=1;SAF=85;SAR=83;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00556631;STB=0.508771;TYPE=snp;VARB=0.00130608;OID=.;OPOS=56204671;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:170:170:1:3:168:167:83:85:1:0:83:84:3:0 chr18 56204747 . G A 2730.62 PASS AO=283;DP=286;FAO=287;FDP=287;FR=.;FRO=0;FSAF=120;FSAR=167;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00816699;FXX=0.00692018;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.325;QD=38.0574;RBI=0.0193577;REFB=0;REVB=0.0175505;RO=1;SAF=120;SAR=163;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00291667;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.17344e-05;OID=.;OPOS=56204747;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:286:287:1:0:283:287:163:120:0:1:167:120:0:0 chr18 56204932 . T G 1159.58 PASS AO=132;DP=140;FAO=133;FDP=140;FR=.;FRO=7;FSAF=57;FSAR=76;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=0.022953;FXX=0.0070917;HRUN=3;LEN=1;MLLD=141.235;QD=33.1307;RBI=0.0290378;REFB=-0.145552;REVB=-0.0177863;RO=7;SAF=56;SAR=76;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0557916;STB=0.528921;TYPE=snp;VARB=0.00150924;OID=.;OPOS=56204932;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:140:140:7:7:132:133:76:56:7:0:76:57:7:0 chr18 56204945 . C G 1301.18 PASS AO=136;DP=136;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0204405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.6139;QD=38.27;RBI=0.0219621;REFB=0;REVB=-0.00803244;RO=0;SAF=64;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.46256e-05;OID=.;OPOS=56204945;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:136:136:0:0:136:136:72:64:0:0:72:64:0:0 chr18 56204977 . C T 1145.75 PASS AO=119;DP=119;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00721513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.395;QD=38.5128;RBI=0.0182871;REFB=0;REVB=0.0168036;RO=0;SAF=58;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.93668e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.61471e-05;OID=.;OPOS=56204977;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:119:119:0:0:119:119:61:58:0:0:61:58:0:0 chr18 56204991 . C T 1085.52 PASS AO=114;DP=114;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.042297;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.573;QD=38.0884;RBI=0.0432275;REFB=0;REVB=0.00892048;RO=0;SAF=57;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000110445;OID=.;OPOS=56204991;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:114:114:0:0:114:114:57:57:0:0:57:57:0:0 chr18 56205262 . A C 689.85 PASS AO=69;DP=71;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0370659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.313;QD=37.8001;RBI=0.0370953;REFB=0;REVB=0.00147802;RO=0;SAF=55;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.90286e-05;OID=.;OPOS=56205262;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:71:73:0:0:69:73:14:55:0:0:14:59:0:0 chr18 56246442 . T C 131.04 PASS AO=42;DP=122;FAO=49;FDP=124;FR=.;FRO=75;FSAF=15;FSAR=34;FSRF=20;FSRR=55;FWDB=0.0639697;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=29.7455;QD=4.22713;RBI=0.111217;REFB=-0.0667455;REVB=-0.0909784;RO=53;SAF=2;SAR=40;SRF=4;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130344;STB=0.528701;TYPE=snp;VARB=0.0961413;OID=.;OPOS=56246442;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:124:53:75:42:49:40:2:4:49:34:15:20:55 chr18 56247180 . T C 329.44 PASS AO=73;DP=141;FAO=73;FDP=141;FR=.;FRO=68;FSAF=38;FSAR=35;FSRF=14;FSRR=54;FWDB=0.00897749;FXX=0.013985;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.608;QD=9.34589;RBI=0.0117795;REFB=-0.0294933;REVB=-0.00762642;RO=66;SAF=38;SAR=35;SRF=13;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.278907;STB=0.650097;TYPE=snp;VARB=0.0388521;OID=.;OPOS=56247180;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:66:68:73:73:35:38:13:53:35:38:14:54 chr18 56247567 . A G 224.84 PASS AO=42;DP=68;FAO=43;FDP=73;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=31;FSRF=7;FSRR=23;FWDB=0.0143864;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.877;QD=12.3198;RBI=0.0190717;REFB=0.00675935;REVB=-0.0125204;RO=25;SAF=12;SAR=30;SRF=7;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00479688;STB=0.523837;TYPE=snp;VARB=-0.00483384;OID=.;OPOS=56247567;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:73:25:30:42:43:30:12:7:18:31:12:7:23 chr18 56247600 . C A 140.87 PASS AO=29;DP=61;FAO=32;FDP=63;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=23;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=-0.0345545;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=180.412;QD=8.94409;RBI=0.0351303;REFB=-0.00358379;REVB=0.00633411;RO=30;SAF=8;SAR=21;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163244;STB=0.578234;TYPE=snp;VARB=0.00355309;OID=.;OPOS=56247600;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:63:30:31:29:32:21:8:13:17:23:9:13:18 chr18 56279025 . T G 819.82 PASS AO=87;DP=88;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0134439;FXX=0.0113623;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.778;QD=37.6927;RBI=0.0197116;REFB=-0.0970355;REVB=-0.0144156;RO=1;SAF=21;SAR=66;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0220241;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.6634e-05;OID=.;OPOS=56279025;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:88:87:1:0:87:87:66:21:1:0:66:21:0:0 chr18 56593521 . T G 80.92 PASS AO=26;DP=78;FAO=26;FDP=77;FR=.;FRO=51;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=29;FWDB=0.00608493;FXX=0.134816;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1565;QD=4.20368;RBI=0.0575799;REFB=0.00588219;REVB=0.0572575;RO=44;SAF=14;SAR=12;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.091303;STB=0.570523;TYPE=snp;VARB=-0.00859735;OID=.;OPOS=56593521;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:78:77:44:51:26:26:12:14:20:24:12:14:22:29 chr18 56648756 . C T 416.11 PASS AO=86;DP=158;FAO=87;FDP=157;FR=.;FRO=70;FSAF=53;FSAR=34;FSRF=34;FSRR=36;FWDB=-0.00380691;FXX=0.00632871;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.711;QD=10.6016;RBI=0.0287362;REFB=-0.0221955;REVB=-0.0284829;RO=70;SAF=53;SAR=33;SRF=34;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110136;STB=0.556376;TYPE=snp;VARB=0.0222985;OID=.;OPOS=56648756;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:157:70:70:86:87:33:53:34:36:34:53:34:36 chr18 56652999 . C T 10.06 PASS AO=2;DP=10;FAO=2;FDP=10;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=0.0267845;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=24.6284;QD=4.02221;RBI=0.0267845;REFB=0.0698015;REVB=0;RO=3;SAF=2;SAR=0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00181185;OID=.;OPOS=56652999;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:10:10:3:8:2:2:0:2:3:0:0:2:8:0 chr18 57000469 . T A 323.12 PASS AO=74;DP=147;FAO=74;FDP=147;FR=.;FRO=73;FSAF=28;FSAR=46;FSRF=18;FSRR=55;FWDB=-0.0432372;FXX=0.0067563;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.804;QD=8.79242;RBI=0.0434833;REFB=0.000414653;REVB=0.00461986;RO=71;SAF=27;SAR=47;SRF=18;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110906;STB=0.571988;TYPE=snp;VARB=-0.000470814;OID=.;OPOS=57000469;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:147:71:73:74:74:47:27:18:53:46:28:18:55 chr18 57640352 . C CAA 167.17 PASS AO=48;DP=117;FAO=57;FDP=113;FR=.;FRO=56;FSAF=19;FSAR=38;FSRF=21;FSRR=35;FWDB=0.0406963;FXX=0.0173898;HRUN=4;LEN=2;MLLD=26.7126;QD=5.91762;RBI=0.0427022;REFB=0.0433025;REVB=0.0129338;RO=56;SAF=17;SAR=31;SRF=21;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218138;STB=0.522868;TYPE=ins;VARB=-0.0501253;OID=.;OPOS=57640353;OREF=-;OALT=AA;OMAPALT=CAA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:48:117:57:113:56:19:38:21:35:99:56:17:31:21:35 chr18 59166541 . C T 1250.71 PASS AO=138;DP=142;FAO=138;FDP=142;FR=.;FRO=4;FSAF=70;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0155721;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.2052;QD=35.2314;RBI=0.0156438;REFB=-0.0559961;REVB=0.00149548;RO=4;SAF=70;SAR=68;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0271421;STB=0.514284;TYPE=snp;VARB=4.97685e-05;OID=.;OPOS=59166541;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:142:142:4:4:138:138:68:70:0:4:68:70:0:4 chr18 59170304 . C G 1277.93 PASS AO=134;DP=134;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00144671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.088;QD=38.1472;RBI=0.00527293;REFB=0;REVB=-0.00507059;RO=0;SAF=60;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.74051e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.09761e-05;OID=.;OPOS=59170304;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:134:134:0:0:134:134:74:60:0:0:74:60:0:0 chr18 59482283 . A G 347.01 PASS AO=69;DP=121;FAO=69;FDP=121;FR=.;FRO=52;FSAF=35;FSAR=34;FSRF=27;FSRR=25;FWDB=0.0232322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.6998;QD=11.4713;RBI=0.112299;REFB=-0.0439269;REVB=0.109869;RO=50;SAF=35;SAR=34;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0252648;STB=0.505151;TYPE=snp;VARB=0.0319701;OID=.;OPOS=59482283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:50:52:69:69:34:35:27:23:34:35:27:25 chr18 59483514 . A G 110.81 PASS AO=19;DP=32;FAO=20;FDP=33;FR=.;FRO=13;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.00819038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.921;QD=13.431;RBI=0.0120827;REFB=-0.0255123;REVB=0.00888313;RO=8;SAF=13;SAR=6;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108862;STB=0.514836;TYPE=snp;VARB=0.0132069;OID=.;OPOS=59483514;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:32:33:8:13:19:20:6:13:4:4:7:13:8:5 chr18 59768375 . A G 444.21 PASS AO=94;DP=176;FAO=95;FDP=176;FR=.;FRO=81;FSAF=51;FSAR=44;FSRF=47;FSRR=34;FWDB=-0.00237551;FXX=0.0112353;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.834;QD=10.0956;RBI=0.0280836;REFB=-0.00628149;REVB=0.0279829;RO=82;SAF=52;SAR=42;SRF=47;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0172533;STB=0.520141;TYPE=snp;VARB=0.00515288;OID=.;OPOS=59768375;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:176:82:81:94:95:42:52:47:35:44:51:47:34 chr18 59770033 . C T 217.54 PASS AO=57;DP=128;FAO=57;FDP=128;FR=.;FRO=71;FSAF=25;FSAR=32;FSRF=46;FSRR=25;FWDB=0.00200901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.909;QD=6.79807;RBI=0.0322831;REFB=-0.00461373;REVB=-0.0322205;RO=70;SAF=25;SAR=32;SRF=46;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213491;STB=0.614513;TYPE=snp;VARB=0.00597253;OID=.;OPOS=59770033;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:70:71:57:57:32:25:46:24:32:25:46:25 chr18 59774037 . C T 219.31 PASS AO=49;DP=96;FAO=49;FDP=96;FR=.;FRO=47;FSAF=35;FSAR=14;FSRF=36;FSRR=11;FWDB=-0.00456367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.949;QD=9.13805;RBI=0.0337365;REFB=-0.00665712;REVB=-0.0334264;RO=47;SAF=35;SAR=14;SRF=36;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.057757;STB=0.531823;TYPE=snp;VARB=0.00862923;OID=.;OPOS=59774037;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:47:47:49:49:14:35:36:11:14:35:36:11 chr18 59780424 . A G 456.7 PASS AO=103;DP=197;FAO=102;FDP=196;FR=.;FRO=94;FSAF=43;FSAR=59;FSRF=43;FSRR=51;FWDB=-0.0253599;FXX=0.00507588;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.6923;QD=9.3205;RBI=0.0259423;REFB=-0.0190304;REVB=-0.00546596;RO=92;SAF=43;SAR=60;SRF=42;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0343914;STB=0.51754;TYPE=snp;VARB=0.0161519;OID=.;OPOS=59780424;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:196:92:94:103:102:60:43:42:50:59:43:43:51 chr18 59781800 . A G 31.39 PASS AO=16;DP=66;FAO=16;FDP=66;FR=.;FRO=50;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=32;FWDB=-0.00613899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.609;QD=1.90215;RBI=0.00925325;REFB=-0.00193199;REVB=-0.00692354;RO=50;SAF=6;SAR=10;SRF=18;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0197302;STB=0.51218;TYPE=snp;VARB=0.00673;OID=.;OPOS=59781800;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:66:66:50:50:16:16:10:6:18:32:10:6:18:32 chr18 59805532 . T C 1294.5 PASS AO=141;DP=145;FAO=142;FDP=146;FR=.;FRO=4;FSAF=47;FSAR=95;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.00374702;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1864;QD=35.4656;RBI=0.0729969;REFB=-0.0680869;REVB=0.0729006;RO=3;SAF=47;SAR=94;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149315;STB=0.502509;TYPE=snp;VARB=0.00779969;OID=.;OPOS=59805532;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:145:146:3:4:141:142:94:47:0:3:95:47:1:3 chr18 59810563 . A G 432.41 PASS AO=107;DP=224;FAO=107;FDP=224;FR=.;FRO=117;FSAF=45;FSAR=62;FSRF=43;FSRR=74;FWDB=0.00640336;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.995;QD=7.72161;RBI=0.00819924;REFB=-0.00561517;REVB=0.00512098;RO=115;SAF=45;SAR=62;SRF=42;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0539472;STB=0.528675;TYPE=snp;VARB=0.00808706;OID=.;OPOS=59810563;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:224:224:115:117:107:107:62:45:42:73:62:45:43:74 chr18 59814268 . G A 163.92 PASS AO=57;DP=160;FAO=57;FDP=160;FR=.;FRO=103;FSAF=34;FSAR=23;FSRF=50;FSRR=53;FWDB=-0.000474094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.949;QD=4.09789;RBI=0.00625842;REFB=-0.0132602;REVB=-0.00624044;RO=103;SAF=34;SAR=23;SRF=50;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126318;STB=0.572162;TYPE=snp;VARB=0.022523;OID=.;OPOS=59814268;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:160:103:103:57:57:23:34:50:53:23:34:50:53 chr18 59814324 . G C 199.08 PASS AO=64;DP=169;FAO=64;FDP=169;FR=.;FRO=105;FSAF=33;FSAR=31;FSRF=33;FSRR=72;FWDB=-0.00387043;FXX=0.00588201;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.54;QD=4.71194;RBI=0.00398908;REFB=-0.00729981;REVB=-0.000965671;RO=105;SAF=33;SAR=31;SRF=33;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220762;STB=0.624206;TYPE=snp;VARB=0.0146835;OID=.;OPOS=59814324;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:169:105:105:64:64:31:33:33:72:31:33:33:72 chr18 59936142 . C T 631.59 PASS AO=236;DP=514;FAO=175;FDP=399;FR=.;FRO=224;FSAF=96;FSAR=79;FSRF=84;FSRR=140;FWDB=0.00303433;FXX=0.00249994;HRUN=4;LEN=1;MLLD=43.2748;QD=6.33175;RBI=0.0609224;REFB=-0.0117838;REVB=0.0608468;RO=278;SAF=125;SAR=111;SRF=113;SRR=165;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120447;STB=0.596516;TYPE=snp;VARB=0.0149391;OID=.;OPOS=59936142;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:514:399:278:224:236:175:111:125:113:165:79:96:84:140 chr18 60021761 . C T 31 PASS AO=4;DP=8;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.021704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.88;QD=13.7789;RBI=0.0252807;REFB=-0.0458215;REVB=-0.0129634;RO=4;SAF=2;SAR=2;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.418587;STB=0.699373;TYPE=snp;VARB=0.0232179;OID=.;OPOS=60021761;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:8:9:4:4:4:5:2:2:0:4:3:2:0:4 chr18 60027241 . C T 1614.3 PASS AO=168;DP=168;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=117;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.385;QD=38.4358;RBI=0.0199593;REFB=0;REVB=0.00714182;RO=0;SAF=51;SAR=117;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53929e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.96557e-05;OID=.;OPOS=60027241;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:168:168:0:0:168:168:117:51:0:0:117:51:0:0 chr18 60036083 . A G 746.62 PASS AO=82;DP=84;FAO=82;FDP=84;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.022124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.2206;QD=35.5534;RBI=0.0288265;REFB=-0.0593201;REVB=0.0184797;RO=2;SAF=37;SAR=45;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0022194;STB=0.501172;TYPE=snp;VARB=0.000879287;OID=.;OPOS=60036083;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:84:84:2:2:82:82:45:37:1:1:45:37:1:1 chr18 60111457 . T G 484.6 PASS AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.855;QD=38.7676;RBI=0.0246267;REFB=0;REVB=0.0246267;RO=0;SAF=0;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000118318;OID=.;OPOS=60111457;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:50:50:0:0:50:50:50:0:0:0:50:0:0:0 chr18 60231851 . A G 310.33 PASS AO=72;DP=146;FAO=73;FDP=147;FR=.;FRO=74;FSAF=26;FSAR=47;FSRF=25;FSRR=49;FWDB=-0.0634828;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.693;QD=8.44423;RBI=0.0848045;REFB=0.0200676;REVB=-0.0562293;RO=74;SAF=26;SAR=46;SRF=25;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0233494;STB=0.510114;TYPE=snp;VARB=-0.0214681;OID=.;OPOS=60231851;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:147:74:74:72:73:46:26:25:49:47:26:25:49 chr18 60244856 . A G 980.77 PASS AO=235;DP=441;FAO=214;FDP=399;FR=.;FRO=185;FSAF=115;FSAR=99;FSRF=102;FSRR=83;FWDB=-0.0187684;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.694;QD=9.83229;RBI=0.0473786;REFB=-0.0138753;REVB=-0.0435026;RO=202;SAF=125;SAR=110;SRF=114;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0277376;STB=0.506519;TYPE=snp;VARB=0.013185;OID=.;OPOS=60244856;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:441:399:202:185:235:214:110:125:114:88:99:115:102:83 chr18 60562298 . A T 307.54 PASS AO=80;DP=184;FAO=81;FDP=178;FR=.;FRO=97;FSAF=27;FSAR=54;FSRF=33;FSRR=64;FWDB=0.056465;FXX=0.0326069;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.5682;QD=6.91093;RBI=0.0592935;REFB=-0.0173749;REVB=-0.0180946;RO=97;SAF=26;SAR=54;SRF=34;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0283461;STB=0.504201;TYPE=snp;VARB=0.0298623;OID=.;OPOS=60562298;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:178:97:97:80:81:54:26:34:63:54:27:33:64 chr18 60985879 . T C 23.32 PASS AO=4;DP=7;FAO=4;FDP=7;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0800389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.169;QD=13.3256;RBI=0.080537;REFB=0.00172523;REVB=0.00894271;RO=3;SAF=2;SAR=2;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.357477;STB=0.713404;TYPE=snp;VARB=-0.00313847;OID=.;OPOS=60985879;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:7:7:3:3:4:4:2:2:0:3:2:2:0:3 chr18 61022791 . C T 388.23 PASS AO=68;DP=105;FAO=68;FDP=105;FR=.;FRO=37;FSAF=30;FSAR=38;FSRF=26;FSRR=11;FWDB=0.00209437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.112;QD=14.7898;RBI=0.0152356;REFB=-0.000918311;REVB=-0.015091;RO=37;SAF=30;SAR=38;SRF=26;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169155;STB=0.591413;TYPE=snp;VARB=0.000792955;OID=.;OPOS=61022791;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:37:37:68:68:38:30:26:11:38:30:26:11 chr18 61156606 . G C 218.68 PASS AO=68;DP=181;FAO=70;FDP=183;FR=.;FRO=113;FSAF=41;FSAR=29;FSRF=50;FSRR=63;FWDB=-0.0396652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.0723;QD=4.77988;RBI=0.0492981;REFB=-0.00909125;REVB=0.0292742;RO=111;SAF=39;SAR=29;SRF=48;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154084;STB=0.588339;TYPE=snp;VARB=0.0109696;OID=.;OPOS=61156606;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:183:111:113:68:70:29:39:48:63:29:41:50:63 chr18 61160287 . T C 358.77 PASS AO=94;DP=199;FAO=92;FDP=199;FR=.;FRO=107;FSAF=61;FSAR=31;FSRF=51;FSRR=56;FWDB=-0.0126905;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.1494;QD=7.21144;RBI=0.0768294;REFB=0.00262295;REVB=-0.0757741;RO=104;SAF=63;SAR=31;SRF=48;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206482;STB=0.604487;TYPE=snp;VARB=-0.00420018;OID=.;OPOS=61160287;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:199:199:104:107:94:92:31:63:48:56:31:61:51:56 chr18 61160385 . T C 256.72 PASS AO=62;DP=131;FAO=62;FDP=130;FR=.;FRO=68;FSAF=41;FSAR=21;FSRF=27;FSRR=41;FWDB=-0.0132277;FXX=0.00763301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.102;QD=7.89895;RBI=0.0133827;REFB=-0.0159004;REVB=0.00203068;RO=66;SAF=41;SAR=21;SRF=27;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.239395;STB=0.640256;TYPE=snp;VARB=0.0117431;OID=.;OPOS=61160385;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:130:66:68:62:62:21:41:27:39:21:41:27:41 chr18 61170721 . T C 188.06 PASS AO=55;DP=135;FAO=55;FDP=135;FR=.;FRO=80;FSAF=37;FSAR=18;FSRF=36;FSRR=44;FWDB=0.0206682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.8139;QD=5.57228;RBI=0.0233975;REFB=0.00153686;REVB=-0.0109668;RO=79;SAF=37;SAR=18;SRF=36;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233994;STB=0.635759;TYPE=snp;VARB=-0.00213162;OID=.;OPOS=61170721;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:79:80:55:55:18:37:36:43:18:37:36:44 chr18 61170782 . A G 243.55 PASS AO=65;DP=149;FAO=65;FDP=149;FR=.;FRO=84;FSAF=34;FSAR=31;FSRF=41;FSRR=43;FWDB=-0.0132549;FXX=0.00666622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.123;QD=6.53826;RBI=0.0167859;REFB=-0.0109856;REVB=-0.0102993;RO=84;SAF=34;SAR=31;SRF=41;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0353287;STB=0.519721;TYPE=snp;VARB=0.0130695;OID=.;OPOS=61170782;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:84:84:65:65:31:34:41:43:31:34:41:43 chr18 61170925 . T C 1950.95 PASS AO=204;DP=208;FAO=206;FDP=206;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=134;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104217;FXX=0.0190467;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.378;QD=37.8826;RBI=0.0151376;REFB=0.0482185;REVB=-0.0109788;RO=1;SAF=72;SAR=132;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00359514;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.43223e-05;OID=.;OPOS=61170925;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:208:206:1:0:204:206:132:72:0:1:134:72:0:0 chr18 61264298 . G A 2533.17 PASS AO=270;DP=276;FAO=272;FDP=272;FR=.;FRO=0;FSAF=148;FSAR=124;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122907;FXX=0.0144922;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.223;QD=37.2524;RBI=0.041052;REFB=-0.085153;REVB=0.0391689;RO=4;SAF=147;SAR=123;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00124651;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000341675;OID=.;OPOS=61264298;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:92:276:272:4:0:270:272:123:147:2:2:124:148:0:0 chr18 61264468 . C T 1214.51 PASS AO=132;DP=136;FAO=132;FDP=135;FR=.;FRO=3;FSAF=65;FSAR=67;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0373873;FXX=0.0073524;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.952;QD=35.9856;RBI=0.0480188;REFB=-0.0813325;REVB=0.0301329;RO=0;SAF=65;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.83182e-08;STB=0.511276;TYPE=snp;VARB=0.00169929;OID=.;OPOS=61264468;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:136:135:0:3:132:132:67:65:0:0:67:65:3:0 chr18 61305209 . T C 457.09 PASS AO=110;DP=230;FAO=112;FDP=233;FR=.;FRO=121;FSAF=45;FSAR=67;FSRF=65;FSRR=56;FWDB=0.0209729;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.736;QD=7.84695;RBI=0.0211018;REFB=-0.0138507;REVB=0.00232845;RO=119;SAF=45;SAR=65;SRF=64;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122387;STB=0.571084;TYPE=snp;VARB=0.0178138;OID=.;OPOS=61305209;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:230:233:119:121:110:112:65:45:64:55:67:45:65:56 chr18 61326597 . A C 1184.01 PASS AO=125;DP=125;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=108;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0512071;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.465;QD=38.1937;RBI=0.0525961;REFB=0;REVB=0.0120075;RO=0;SAF=109;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.00506e-05;OID=.;OPOS=61326597;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:125:124:0:0:125:124:16:109:0:0:16:108:0:0 chr18 61326602 . A G 1127.52 PASS AO=124;DP=127;FAO=123;FDP=126;FR=.;FRO=3;FSAF=110;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0124554;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=174.063;QD=35.7942;RBI=0.0125203;REFB=0.0624225;REVB=0.00127406;RO=3;SAF=111;SAR=13;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0266699;STB=0.514016;TYPE=snp;VARB=-0.000310803;OID=.;OPOS=61326602;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:127:126:3:3:124:123:13:111:2:1:13:110:2:1 chr18 61326609 . T G 1288.48 PASS AO=134;DP=136;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=125;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0305111;FXX=0.0416638;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.856;QD=37.3473;RBI=0.105632;REFB=-0.0655113;REVB=0.101129;RO=0;SAF=131;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.6946e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000355493;OID=.;OPOS=61326609;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:136:138:0:0:134:138:3:131:0:0:13:125:0:0 chr18 61326628 . A AT 850.55 PASS AO=99;DP=153;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=120;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.103088;FXX=0.0724585;HRUN=2;LEN=1;MLLD=14.7374;QD=26.5798;RBI=0.393204;REFB=0.0200491;REVB=0.379449;RO=34;SAF=98;SAR=1;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.753512;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.0114429;OID=.;OPOS=61326629;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:99:153:128:128:0:120:8:0:0:73:34:98:1:21:13 chr18 61377579 . A C 277.55 PASS AO=67;DP=143;FAO=68;FDP=143;FR=.;FRO=75;FSAF=39;FSAR=29;FSRF=46;FSRR=29;FWDB=0.00309585;FXX=0.00694396;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.967;QD=7.76371;RBI=0.0106175;REFB=-0.0219159;REVB=-0.0101561;RO=72;SAF=39;SAR=28;SRF=45;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0416396;STB=0.521466;TYPE=snp;VARB=0.0254376;OID=.;OPOS=61377579;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:72:75:67:68:28:39:45:27:29:39:46:29 chr18 61390316 . C A 1098.04 PASS AO=122;DP=127;FAO=122;FDP=127;FR=.;FRO=5;FSAF=52;FSAR=70;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0259178;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=186.453;QD=34.5838;RBI=0.0275396;REFB=-0.13515;REVB=0.00931122;RO=1;SAF=52;SAR=70;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00904818;STB=0.514974;TYPE=snp;VARB=0.000458338;OID=.;OPOS=61390316;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:127:127:1:5:122:122:70:52:1:0:70:52:4:1 chr18 61390332 . C T 1243.35 PASS AO=131;DP=131;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0092477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.967;QD=37.965;RBI=0.0145628;REFB=0;REVB=0.0112497;RO=0;SAF=59;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.95289e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000187518;OID=.;OPOS=61390332;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:131:131:0:0:131:131:72:59:0:0:72:59:0:0 chr18 61390361 . T C 1324.39 PASS AO=140;DP=140;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00532274;FXX=0.0279701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.101;QD=38.1119;RBI=0.00782755;REFB=0;REVB=-0.00573925;RO=0;SAF=63;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000892133;OID=.;OPOS=61390361;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:140:139:0:0:140:139:77:63:0:0:80:59:0:0 chr18 61390570 . T G 473.37 PASS AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00560213;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=247.659;QD=35.7259;RBI=0.00561668;REFB=-0.0135245;REVB=0.000404044;RO=1;SAF=14;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0324507;STB=0.517235;TYPE=snp;VARB=7.49306e-05;OID=.;OPOS=61390570;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:53:53:1:1:52:52:38:14:1:0:38:14:1:0 chr18 61647069 . G A 287.66 PASS AO=74;DP=166;FAO=75;FDP=166;FR=.;FRO=91;FSAF=43;FSAR=32;FSRF=50;FSRR=41;FWDB=0.0059143;FXX=0.0119041;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.998;QD=6.93167;RBI=0.0220443;REFB=-0.0157565;REVB=-0.0212361;RO=91;SAF=43;SAR=31;SRF=50;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0320105;STB=0.513324;TYPE=snp;VARB=0.0145095;OID=.;OPOS=61647069;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:166:91:91:74:75:31:43:50:41:32:43:50:41 chr18 61654297 . A G 1831.69 PASS AO=194;DP=198;FAO=196;FDP=196;FR=.;FRO=0;FSAF=108;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0157084;FXX=0.0150746;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.502;QD=37.3814;RBI=0.0436423;REFB=-0.0722252;REVB=0.0407172;RO=2;SAF=108;SAR=86;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0087367;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000391852;OID=.;OPOS=61654297;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:198:196:2:0:194:196:86:108:2:0:88:108:0:0 chr18 61654463 . A G 101.92 PASS AO=34;DP=94;FAO=34;FDP=94;FR=.;FRO=60;FSAF=8;FSAR=26;FSRF=32;FSRR=28;FWDB=-0.00458477;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.7031;QD=4.33712;RBI=0.0458725;REFB=-0.0487293;REVB=-0.0456428;RO=60;SAF=8;SAR=26;SRF=32;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.356467;STB=0.706393;TYPE=snp;VARB=0.0730026;OID=.;OPOS=61654463;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:60:60:34:34:26:8:32:28:26:8:32:28 chr18 62036875 . G A 1351.23 PASS AO=139;DP=139;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0125846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.428;QD=38.6066;RBI=0.0131272;REFB=0;REVB=0.00373518;RO=0;SAF=72;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.36576e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.46068e-05;OID=.;OPOS=62036875;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:139:140:0:0:139:140:67:72:0:0:68:72:0:0 chr18 63477050 . C A 200.64 PASS AO=60;DP=150;FAO=60;FDP=150;FR=.;FRO=90;FSAF=37;FSAR=23;FSRF=43;FSRR=47;FWDB=-0.0325874;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.4277;QD=5.35047;RBI=0.0412196;REFB=-0.010344;REVB=0.0252411;RO=89;SAF=37;SAR=23;SRF=43;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143886;STB=0.584622;TYPE=snp;VARB=0.0166078;OID=.;OPOS=63477050;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:150:89:90:60:60:23:37:43:46:23:37:43:47 chr18 63489378 . C T 2002.07 PASS AO=203;DP=206;FAO=210;FDP=210;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=130;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017031;FXX=0.00943352;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0042;QD=38.1347;RBI=0.0225158;REFB=0;REVB=0.0147277;RO=0;SAF=79;SAR=124;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.1157e-05;OID=.;OPOS=63489378;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:206:210:0:0:203:210:124:79:0:0:130:80:0:0 chr18 63530016 . A G 1195.46 PASS AO=125;DP=126;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0199848;FXX=0.00793588;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.336;QD=38.2549;RBI=0.0321368;REFB=0;REVB=0.0251671;RO=0;SAF=53;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.24737e-05;OID=.;OPOS=63530016;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:126:125:0:0:125:125:72:53:0:0:72:53:0:0 chr18 64176365 . G T 631.93 PASS AO=145;DP=284;FAO=145;FDP=283;FR=.;FRO=138;FSAF=63;FSAR=82;FSRF=36;FSRR=102;FWDB=0.0110004;FXX=0.003521;HRUN=3;LEN=1;MLLD=253.623;QD=8.93191;RBI=0.0117487;REFB=0.00168404;REVB=0.00412582;RO=138;SAF=63;SAR=82;SRF=36;SRR=102;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161794;STB=0.588116;TYPE=snp;VARB=-0.00167421;OID=.;OPOS=64176365;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:284:283:138:138:145:145:82:63:36:102:82:63:36:102 chr18 65178103 . G GCA 66.17 PASS AO=24;DP=107;FAO=24;FDP=78;FR=.;FRO=54;FSAF=4;FSAR=20;FSRF=39;FSRR=15;FWDB=-0.0451733;FXX=0.142841;HRUN=1;LEN=2;MLLD=93.5715;QD=3.39316;RBI=0.070336;REFB=-0.0275421;REVB=0.0539122;RO=73;SAF=4;SAR=20;SRF=46;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.563519;STB=0.859722;TYPE=ins;VARB=0.0917109;OID=.;OPOS=65178104;OREF=-;OALT=CA;OMAPALT=GCA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:24:107:24:78:54:4:20:39:15:66:73:4:20:46:27 chr18 65179829 . G A 360.73 PASS AO=88;DP=183;FAO=88;FDP=183;FR=.;FRO=95;FSAF=45;FSAR=43;FSRF=48;FSRR=47;FWDB=-0.00262658;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=156.475;QD=7.88485;RBI=0.00349984;REFB=-0.0137715;REVB=0.00231299;RO=90;SAF=45;SAR=43;SRF=47;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00997913;STB=0.503167;TYPE=snp;VARB=0.0161424;OID=.;OPOS=65179829;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:183:90:95:88:88:43:45:47:43:43:45:48:47 chr18 66504093 . A C 1773.73 PASS AO=164;DP=164;FAO=189;FDP=189;FR=.;FRO=0;FSAF=102;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0369977;FXX=0.00526288;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.334;QD=37.5393;RBI=0.0407763;REFB=0;REVB=0.0171427;RO=0;SAF=85;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.14401e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00250838;OID=.;OPOS=66504093;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:164:189:0:0:164:189:79:85:0:0:87:102:0:0 chr18 66504351 . G A 362.66 PASS AO=86;DP=159;FAO=86;FDP=178;FR=.;FRO=92;FSAF=29;FSAR=57;FSRF=57;FSRR=35;FWDB=0.0165451;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=171.777;QD=8.14975;RBI=0.0226021;REFB=-0.0148238;REVB=-0.0153985;RO=73;SAF=29;SAR=57;SRF=57;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.36385;STB=0.647521;TYPE=snp;VARB=0.0109715;OID=.;OPOS=66504351;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:178:73:92:86:86:57:29:57:16:57:29:57:35 chr18 66504459 . A T 1021.43 PASS AO=113;DP=117;FAO=113;FDP=117;FR=.;FRO=4;FSAF=48;FSAR=65;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.00966002;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=127.982;QD=34.9207;RBI=0.0465601;REFB=-0.133922;REVB=0.045547;RO=0;SAF=48;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.502629;TYPE=snp;VARB=0.00102231;OID=.;OPOS=66504459;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:117:117:0:4:113:113:65:48:0:0:65:48:2:2 chr18 66513615 . A G 261.08 PASS AO=58;DP=116;FAO=59;FDP=116;FR=.;FRO=57;FSAF=18;FSAR=41;FSRF=20;FSRR=37;FWDB=0.0491013;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6001;QD=9.00277;RBI=0.0491049;REFB=0.00499185;REVB=-0.000596743;RO=58;SAF=17;SAR=41;SRF=21;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0726126;STB=0.525987;TYPE=snp;VARB=-0.0041118;OID=.;OPOS=66513615;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:58:57:58:59:41:17:21:37:41:18:20:37 chr18 66513662 . T C 156.26 PASS AO=42;DP=103;FAO=43;FDP=104;FR=.;FRO=61;FSAF=11;FSAR=32;FSRF=18;FSRR=43;FWDB=-0.0101406;FXX=0.0956439;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.206;QD=6.01002;RBI=0.0109375;REFB=0.00192301;REVB=-0.00409846;RO=42;SAF=11;SAR=31;SRF=12;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0272981;STB=0.529364;TYPE=snp;VARB=-0.00253913;OID=.;OPOS=66513662;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:104:42:61:42:43:31:11:12:30:32:11:18:43 chr18 66526176 . T C 555.77 PASS AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0197085;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.882;QD=38.3292;RBI=0.0453078;REFB=0;REVB=0.0407967;RO=0;SAF=23;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000121632;OID=.;OPOS=66526176;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:58:58:0:0:58:58:35:23:0:0:35:23:0:0 chr18 67345034 . T C 1417.57 PASS AO=154;DP=158;FAO=155;FDP=158;FR=.;FRO=3;FSAF=59;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0229666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.5888;QD=35.8879;RBI=0.0286465;REFB=-0.0540298;REVB=0.0171218;RO=2;SAF=59;SAR=95;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00990911;STB=0.507691;TYPE=snp;VARB=0.00289697;OID=.;OPOS=67345034;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:158:158:2:3:154:155:95:59:0:2:96:59:0:3 chr18 67531642 . T C 209.61 PASS AO=67;DP=182;FAO=69;FDP=184;FR=.;FRO=115;FSAF=26;FSAR=43;FSRF=40;FSRR=75;FWDB=0.0162077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.713;QD=4.55677;RBI=0.0206117;REFB=-0.0156126;REVB=0.0127339;RO=113;SAF=25;SAR=42;SRF=40;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0228257;STB=0.519466;TYPE=snp;VARB=0.0254116;OID=.;OPOS=67531642;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:184:113:115:67:69:42:25:40:73:43:26:40:75 chr18 67687860 . T C 305.89 PASS AO=84;DP=193;FAO=84;FDP=193;FR=.;FRO=109;FSAF=61;FSAR=23;FSRF=69;FSRR=40;FWDB=-0.00580805;FXX=0.00515437;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.605;QD=6.33968;RBI=0.00726853;REFB=-0.0142542;REVB=0.00437015;RO=107;SAF=61;SAR=23;SRF=68;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108024;STB=0.562402;TYPE=snp;VARB=0.0230476;OID=.;OPOS=67687860;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:193:107:109:84:84:23:61:68:39:23:61:69:40 chr18 67718688 . A G 1640.71 PASS AO=180;DP=185;FAO=180;FDP=180;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0166638;FXX=0.0270256;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.9;QD=36.4603;RBI=0.0172062;REFB=0.0189918;REVB=-0.00428595;RO=5;SAF=65;SAR=115;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00216539;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.74947e-05;OID=.;OPOS=67718688;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:185:180:5:0:180:180:115:65:2:3:115:65:0:0 chr18 67863850 . T TCTC 396.02 PASS AO=58;DP=85;FAO=59;FDP=79;FR=.;FRO=20;FSAF=18;FSAR=41;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=0.0229138;FXX=0.0246883;HRUN=1;LEN=3;MLLD=177.571;QD=20.0517;RBI=0.0537398;REFB=-0.0481911;REVB=0.0486099;RO=25;SAF=17;SAR=41;SRF=19;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.275003;STB=0.607932;TYPE=ins;VARB=0.0190711;OID=.;OPOS=67863851;OREF=-;OALT=CTC;OMAPALT=TCTC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:58:85:59:79:20:18:41:14:6:38:25:17:41:19:6 chr18 67871343 . A C 1687.71 PASS AO=175;DP=176;FAO=176;FDP=176;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0166716;FXX=0.0112353;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.88;QD=38.357;RBI=0.0373895;REFB=0;REVB=0.0334668;RO=0;SAF=83;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.79516e-05;OID=.;OPOS=67871343;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:176:176:0:0:175:176:92:83:0:0:93:83:0:0 chr18 67996410 . C T 130.58 PASS AO=31;DP=68;FAO=31;FDP=67;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=-0.00399303;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.406;QD=7.7957;RBI=0.00401338;REFB=-0.00232325;REVB=0.000403632;RO=37;SAF=10;SAR=21;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.268041;STB=0.657431;TYPE=snp;VARB=0.0034526;OID=.;OPOS=67996410;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:67:37:36:31:31:21:10:22:15:21:10:22:14 chr18 70417396 . C T 1353.6 PASS AO=141;DP=141;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.032175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.834;QD=38.1296;RBI=0.0333731;REFB=0;REVB=0.00886186;RO=0;SAF=86;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.47144e-05;OID=.;OPOS=70417396;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:141:142:0:0:141:142:55:86:0:0:56:86:0:0 chr18 70532840 . T G 375.68 PASS AO=114;DP=278;FAO=113;FDP=277;FR=.;FRO=164;FSAF=53;FSAR=60;FSRF=70;FSRR=94;FWDB=-0.0145868;FXX=0.00359699;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.472;QD=5.42492;RBI=0.0388261;REFB=0.0023774;REVB=-0.0359818;RO=164;SAF=54;SAR=60;SRF=70;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0497592;STB=0.525153;TYPE=snp;VARB=-0.00355647;OID=.;OPOS=70532840;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:278:277:164:164:114:113:60:54:70:94:60:53:70:94 chr18 71412428 . C T 355.64 PASS AO=68;DP=117;FAO=69;FDP=118;FR=.;FRO=49;FSAF=31;FSAR=38;FSRF=19;FSRR=30;FWDB=-0.038284;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.462;QD=12.0554;RBI=0.0390219;REFB=-0.00356565;REVB=-0.00755293;RO=49;SAF=30;SAR=38;SRF=19;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0418699;STB=0.525941;TYPE=snp;VARB=0.00319158;OID=.;OPOS=71412428;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:118:49:49:68:69:38:30:19:30:38:31:19:30 chr18 72021717 . T C 317.28 PASS AO=33;DP=40;FAO=37;FDP=39;FR=.;FRO=2;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0923552;FXX=0.0249938;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2435;QD=32.5411;RBI=0.092897;REFB=-0.0615593;REVB=-0.0100182;RO=2;SAF=12;SAR=21;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0156293;STB=0.503524;TYPE=snp;VARB=0.014134;OID=.;OPOS=72021717;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:40:39:2:2:33:37:21:12:1:1:21:16:1:1 chr18 72114454 . TC T,TT 224.51 PASS AO=5,17;DP=24;FAO=24,0;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=9,0;FSAR=15,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0337876,-0.0851477;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=182.694,166.096;QD=37.4179;RBI=0.0836232,0.144962;REFB=0,0;REVB=-0.0764934,-0.117319;RO=0;SAF=1,8;SAR=4,9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.126e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.000846818,0;OID=.,.;OPOS=72114455,72114455;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:5,17:23:24,0:24:0:9,0:15,0:0:0:11:0:1,8:4,9:0:0 chr18 72186183 . GT G 22.11 PASS AO=15;DP=66;FAO=20;FDP=59;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=0.0359995;FXX=0.0922935;HRUN=5;LEN=1;MLLD=13.039;QD=1.49867;RBI=0.0604328;REFB=-0.0893228;REVB=-0.0485403;RO=36;SAF=9;SAR=6;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21236;STB=0.608;TYPE=del;VARB=0.126382;OID=.;OPOS=72186184;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:15:65:20:59:39:12:8:17:22:22:36:9:6:15:21 chr18 72223591 . G GTGC 299 PASS AO=36;DP=50;FAO=40;FDP=48;FR=.;FRO=8;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=0.0364098;FXX=0.039992;HRUN=1;LEN=3;MLLD=189.767;QD=24.9167;RBI=0.0482893;REFB=-0.0749461;REVB=0.0317203;RO=12;SAF=13;SAR=23;SRF=10;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220457;STB=0.60521;TYPE=ins;VARB=0.0149056;OID=.;OPOS=72223592;OREF=-;OALT=TGC;OMAPALT=GTGC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:36:50:40:48:8:15:25:8:0:11:12:13:23:10:2 chr18 72228124 . A G 1268.88 PASS AO=133;DP=134;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00773792;FXX=0.00746213;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.8951;QD=38.1619;RBI=0.0233482;REFB=0;REVB=-0.0220287;RO=0;SAF=78;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000220962;OID=.;OPOS=72228124;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:134:133:0:0:133:133:55:78:0:0:55:78:0:0 chr18 72234635 . C T 1294.89 PASS AO=130;DP=135;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=112;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00807236;FXX=0.0349626;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.7214;QD=37.5331;RBI=0.0385944;REFB=0;REVB=-0.0377408;RO=0;SAF=24;SAR=106;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.25554e-05;OID=.;OPOS=72234635;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:135:138:0:0:130:138:106:24:0:0:112:26:0:0 chr18 72343008 . T C 690.19 PASS AO=72;DP=72;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.689;QD=37.8184;RBI=0.0342881;REFB=0;REVB=0.0320819;RO=0;SAF=37;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000141789;OID=.;OPOS=72343008;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:72:73:0:0:72:73:35:37:0:0:36:37:0:0 chr18 72347482 . T C 309.57 PASS AO=75;DP=166;FAO=78;FDP=168;FR=.;FRO=90;FSAF=29;FSAR=49;FSRF=46;FSRR=44;FWDB=-0.00317698;FXX=0.011764;HRUN=5;LEN=1;MLLD=215.493;QD=7.37069;RBI=0.00774449;REFB=-0.00781046;REVB=-0.00706286;RO=86;SAF=29;SAR=46;SRF=46;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14494;STB=0.576722;TYPE=snp;VARB=0.0078295;OID=.;OPOS=72347482;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:168:86:90:75:78:46:29:46:40:49:29:46:44 chr18 72776121 . G A 553.51 PASS AO=60;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00367809;FXX=0.0158705;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.128;QD=35.7105;RBI=0.0584269;REFB=-0.111716;REVB=0.058311;RO=0;SAF=27;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.7886e-08;STB=0.507244;TYPE=snp;VARB=0.00143689;OID=.;OPOS=72776121;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:62:62:0:1:60:61:33:27:0:0:34:27:0:1 chr18 72997677 . C T 302.67 PASS AO=64;DP=119;FAO=64;FDP=119;FR=.;FRO=55;FSAF=20;FSAR=44;FSRF=13;FSRR=42;FWDB=0.0242796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.294;QD=10.1737;RBI=0.0265652;REFB=-0.0322817;REVB=0.0107801;RO=54;SAF=20;SAR=44;SRF=12;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.091331;STB=0.542232;TYPE=snp;VARB=0.0219727;OID=.;OPOS=72997677;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:54:55:64:64:44:20:12:42:44:20:13:42 chr18 72998004 . T C 35.56 PASS AO=11;DP=36;FAO=12;FDP=37;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=19;FSRR=6;FWDB=-0.0221093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.364;QD=3.84436;RBI=0.0356045;REFB=-0.0145581;REVB=-0.027908;RO=24;SAF=6;SAR=5;SRF=18;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243405;STB=0.675419;TYPE=snp;VARB=0.0307728;OID=.;OPOS=72998004;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:36:37:24:25:11:12:5:6:18:6:6:6:19:6 chr18 72998268 . T C 92.97 PASS AO=23;DP=59;FAO=25;FDP=61;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=-0.107446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.2526;QD=6.0965;RBI=0.108266;REFB=-0.037088;REVB=0.0133006;RO=36;SAF=8;SAR=15;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195275;STB=0.627802;TYPE=snp;VARB=0.040377;OID=.;OPOS=72998268;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:59:61:36:36:23:25:15:8:19:17:17:8:19:17 chr18 72998886 . T C 319.81 PASS AO=82;DP=184;FAO=84;FDP=186;FR=.;FRO=102;FSAF=28;FSAR=56;FSRF=58;FSRR=44;FWDB=-0.0324444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.853;QD=6.87758;RBI=0.0326925;REFB=-0.00838623;REVB=-0.00401996;RO=101;SAF=27;SAR=55;SRF=58;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.248872;STB=0.632321;TYPE=snp;VARB=0.00998235;OID=.;OPOS=72998886;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:186:101:102:82:84:55:27:58:43:56:28:58:44 chr18 72999359 . T C 170.87 PASS AO=38;DP=75;FAO=38;FDP=75;FR=.;FRO=37;FSAF=34;FSAR=4;FSRF=34;FSRR=3;FWDB=-0.0050449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.891;QD=9.11313;RBI=0.00511952;REFB=-0.0347741;REVB=-0.000870958;RO=28;SAF=34;SAR=4;SRF=25;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00383426;STB=0.533317;TYPE=snp;VARB=0.020363;OID=.;OPOS=72999359;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:28:37:38:38:4:34:25:3:4:34:34:3 chr18 72999453 . C T 64.18 PASS AO=7;DP=20;FAO=13;FDP=19;FR=.;FRO=6;FSAF=13;FSAR=0;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.202883;FXX=0.049975;HRUN=2;LEN=1;MLLD=31.9731;QD=13.5114;RBI=0.202883;REFB=-0.17984;REVB=0;RO=5;SAF=7;SAR=0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0858873;OID=.;OPOS=72999453;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:13:19:5:6:7:13:0:7:5:0:0:13:6:0 chr18 74090957 . CG C 99.42 PASS AO=15;DP=40;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.183079;FXX=0.0434594;HRUN=7;LEN=1;MLLD=8.73822;QD=18.0768;RBI=0.219497;REFB=0;REVB=-0.121082;RO=3;SAF=8;SAR=7;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14342;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00270944;OID=.;OPOS=74090958;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:15:21:22:22:0:12:10:0:0:10:3:8:7:3:0 chr18 74208524 . G T 10.3 PASS AO=2;DP=8;FAO=2;FDP=8;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.00386002;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.352;QD=5.14841;RBI=0.00386002;REFB=0.0143974;REVB=0;RO=6;SAF=2;SAR=0;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0033935;OID=.;OPOS=74208524;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:8:6:6:2:2:0:2:6:0:0:2:6:0 chr18 74208573 . G A 268.59 PASS AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00245828;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.8294;QD=35.8124;RBI=0.0628317;REFB=-0.037745;REVB=0.0627836;RO=1;SAF=25;SAR=4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102941;STB=0.555514;TYPE=snp;VARB=0.00167035;OID=.;OPOS=74208573;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:30:30:1:1:29:29:4:25:0:1:4:25:0:1 chr18 74611127 . A G 1497.21 PASS AO=158;DP=160;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0320113;FXX=0.00624961;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.491;QD=37.6657;RBI=0.0355707;REFB=-0.0442399;REVB=0.0155097;RO=2;SAF=58;SAR=100;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00339792;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.57903e-05;OID=.;OPOS=74611127;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:160:159:2:0:158:159:100:58:1:1:101:58:0:0 chr18 74671768 . T C 2289.03 PASS AO=239;DP=241;FAO=239;FDP=239;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=152;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00349878;FXX=0.00829841;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.155;QD=38.3101;RBI=0.0268104;REFB=0;REVB=-0.0265811;RO=0;SAF=87;SAR=152;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.3109e-06;OID=.;OPOS=74671768;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:241:239:0:0:239:239:152:87:0:0:152:87:0:0 chr18 74680208 . C T 120.94 PASS AO=22;DP=38;FAO=22;FDP=38;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=20;FSRF=2;FSRR=14;FWDB=0.0425635;FXX=0.0499875;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.579;QD=12.7304;RBI=0.0426877;REFB=-0.0132404;REVB=-0.00325362;RO=13;SAF=2;SAR=20;SRF=2;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113321;STB=0.540501;TYPE=snp;VARB=0.00776481;OID=.;OPOS=74680208;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:38:38:13:16:22:22:20:2:2:11:20:2:2:14 chr18 74680259 . C T 316.55 PASS AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00154704;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.6528;QD=37.2411;RBI=0.00423206;REFB=0;REVB=0.00393916;RO=0;SAF=3;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.35389e-05;OID=.;OPOS=74680259;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:34:0:0:34:34:31:3:0:0:31:3:0:0 chr18 74682214 . C T 512.14 PASS AO=148;DP=351;FAO=148;FDP=350;FR=.;FRO=202;FSAF=66;FSAR=82;FSRF=117;FSRR=85;FWDB=-0.0317289;FXX=0.00284892;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.6786;QD=5.85298;RBI=0.0751339;REFB=-0.0284729;REVB=-0.0681057;RO=200;SAF=66;SAR=82;SRF=116;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137925;STB=0.576523;TYPE=snp;VARB=0.0287379;OID=.;OPOS=74682214;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:351:350:200:202:148:148:82:66:116:84:82:66:117:85 chr18 74701984 . G A 576 PASS AO=124;DP=239;FAO=128;FDP=243;FR=.;FRO=115;FSAF=47;FSAR=81;FSRF=48;FSRR=67;FWDB=-0.00416655;FXX=0.00816293;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.5901;QD=9.48147;RBI=0.0312532;REFB=-0.0281774;REVB=0.0309742;RO=113;SAF=47;SAR=77;SRF=47;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0338483;STB=0.525216;TYPE=snp;VARB=0.0322113;OID=.;OPOS=74701984;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:239:243:113:115:124:128:77:47:47:66:81:47:48:67 chr18 74702864 . G A 204.19 PASS AO=41;DP=76;FAO=42;FDP=77;FR=.;FRO=35;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=10;FWDB=0.012329;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.3141;QD=10.6073;RBI=0.0323655;REFB=0.00417244;REVB=0.0299253;RO=35;SAF=26;SAR=15;SRF=25;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.073813;STB=0.546895;TYPE=snp;VARB=-0.00237898;OID=.;OPOS=74702864;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:77:35:35:41:42:15:26:25:10:16:26:25:10 chr18 74962645 . T C 317.46 PASS AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0453376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.8028;QD=35.2732;RBI=0.0453621;REFB=-0.141742;REVB=-0.00148929;RO=0;SAF=27;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.529394;TYPE=snp;VARB=0.00267124;OID=.;OPOS=74962645;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:36:36:0:1:35:35:8:27:0:0:8:27:0:1 chr18 74980809 . G A 993.01 PASS AO=98;DP=100;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00939786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.234;QD=37.829;RBI=0.0630091;REFB=0;REVB=0.0623043;RO=1;SAF=32;SAR=66;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00713328;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000287417;OID=.;OPOS=74980809;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:100:105:1:0:98:105:66:32:0:1:72:33:0:0 chr18 75796785 . G A 13.52 PASS AO=5;DP=24;FAO=5;FDP=24;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.0133852;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.173;QD=2.25414;RBI=0.0987846;REFB=0.0361707;REVB=0.0978735;RO=19;SAF=2;SAR=3;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145789;STB=0.599601;TYPE=snp;VARB=-0.0867051;OID=.;OPOS=75796785;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:24:24:19:19:5:5:3:2:10:9:3:2:10:9 chr18 76754466 . C T 127.29 PASS AO=15;DP=16;FAO=15;FDP=16;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.115478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.0444;QD=31.8217;RBI=0.13053;REFB=-0.0416151;REVB=0.0608511;RO=1;SAF=1;SAR=14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0314901;STB=0.517219;TYPE=snp;VARB=0.00823857;OID=.;OPOS=76754466;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:16:16:1:1:15:15:14:1:0:1:14:1:0:1 chr18 76755278 . C T 10.38 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.2541;QD=5.93115;RBI=0.0196949;REFB=0.0279968;REVB=0.0196949;RO=5;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.104291;OID=.;OPOS=76755278;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:5:5:2:2:2:0:0:5:2:0:0:5 chr18 76856627 . G C 529.11 PASS AO=144;DP=325;FAO=144;FDP=324;FR=.;FRO=180;FSAF=52;FSAR=92;FSRF=85;FSRR=95;FWDB=-0.00873788;FXX=0.00307683;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.825;QD=6.53225;RBI=0.0159633;REFB=-0.0219789;REVB=0.0133595;RO=180;SAF=52;SAR=92;SRF=85;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11619;STB=0.564484;TYPE=snp;VARB=0.0270176;OID=.;OPOS=76856627;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:325:324:180:180:144:144:92:52:85:95:92:52:85:95 chr18 76933689 . G A 448.57 PASS AO=122;DP=275;FAO=122;FDP=273;FR=.;FRO=151;FSAF=44;FSAR=78;FSRF=69;FSRR=82;FWDB=-0.00384534;FXX=0.00727246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.6868;QD=6.57247;RBI=0.0122299;REFB=-0.00639364;REVB=-0.0116096;RO=149;SAF=44;SAR=78;SRF=67;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.092881;STB=0.555939;TYPE=snp;VARB=0.0072189;OID=.;OPOS=76933689;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:275:273:149:151:122:122:78:44:67:82:78:44:69:82 chr18 77067000 . T G 253.55 PASS AO=58;DP=124;FAO=62;FDP=130;FR=.;FRO=68;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=29;FSRR=39;FWDB=6.56102e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.6903;QD=7.80166;RBI=0.00119957;REFB=-0.0396459;REVB=-0.00119777;RO=63;SAF=33;SAR=25;SRF=24;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175357;STB=0.563562;TYPE=snp;VARB=0.0378882;OID=.;OPOS=77067000;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:130:63:68:58:62:25:33:24:39:28:34:29:39 chr18 77246406 . T G 96.45 PASS AO=16;DP=35;FAO=20;FDP=39;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=0.000486615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.462;QD=9.89253;RBI=0.00216732;REFB=-0.00401599;REVB=0.00211198;RO=18;SAF=7;SAR=9;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154267;STB=0.54778;TYPE=snp;VARB=0.00332113;OID=.;OPOS=77246406;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:35:39:18:19:16:20:9:7:5:13:13:7:5:14 chr18 77288425 . C T 124.53 PASS AO=33;DP=81;FAO=34;FDP=82;FR=.;FRO=48;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=0.0206668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.169;QD=6.07466;RBI=0.0220583;REFB=-0.00664283;REVB=0.00771071;RO=47;SAF=17;SAR=16;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.070698;STB=0.541523;TYPE=snp;VARB=0.00601898;OID=.;OPOS=77288425;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:82:47:48:33:34:16:17:21:26:16:18:22:26 chr18 77420703 . C G 541.64 PASS AO=63;DP=68;FAO=64;FDP=69;FR=.;FRO=5;FSAF=21;FSAR=43;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.0324089;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.8985;QD=31.3992;RBI=0.0378459;REFB=-0.056768;REVB=0.0195441;RO=5;SAF=21;SAR=42;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0409157;STB=0.537757;TYPE=snp;VARB=0.00527979;OID=.;OPOS=77420703;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:68:69:5:5:63:64:42:21:3:2:43:21:4:1 chr18 77439532 . T C 12.53 PASS AO=3;DP=12;FAO=3;FDP=12;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.0188973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.312;QD=4.17566;RBI=0.0227064;REFB=-0.0125576;REVB=-0.0125886;RO=9;SAF=2;SAR=1;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.341307;STB=0.735389;TYPE=snp;VARB=0.0572521;OID=.;OPOS=77439532;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:12:12:9:9:3:3:1:2:3:6:1:2:3:6 chr18 77473086 . G A 212.43 PASS AO=59;DP=135;FAO=59;FDP=139;FR=.;FRO=80;FSAF=16;FSAR=43;FSRF=11;FSRR=69;FWDB=0.000569743;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=152.946;QD=6.11312;RBI=0.0086836;REFB=-0.0128078;REVB=0.00866489;RO=76;SAF=16;SAR=43;SRF=11;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177781;STB=0.606809;TYPE=snp;VARB=0.0217612;OID=.;OPOS=77473086;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:139:76:80:59:59:43:16:11:65:43:16:11:69 chr18 77473127 . C T 387.22 PASS AO=75;DP=125;FAO=75;FDP=126;FR=.;FRO=51;FSAF=2;FSAR=73;FSRF=4;FSRR=47;FWDB=-0.0015634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3234;QD=12.2928;RBI=0.0407724;REFB=-0.0506028;REVB=-0.0407424;RO=50;SAF=2;SAR=73;SRF=4;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.26659;STB=0.645968;TYPE=snp;VARB=0.0447099;OID=.;OPOS=77473127;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:126:50:51:75:75:73:2:4:46:73:2:4:47 chr18 77474921 . G A 157.32 PASS AO=24;DP=38;FAO=26;FDP=39;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.0242351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.4333;QD=16.135;RBI=0.0347239;REFB=0.0130546;REVB=0.0248679;RO=13;SAF=6;SAR=18;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263289;STB=0.629034;TYPE=snp;VARB=-0.0046852;OID=.;OPOS=77474921;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:38:39:13:13:24:26:18:6:8:5:19:7:8:5 chr18 77477581 . G A 60.29 PASS AO=19;DP=53;FAO=19;FDP=54;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=3;FSRF=31;FSRR=4;FWDB=0.00380159;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.498;QD=4.46599;RBI=0.0173279;REFB=-0.0215181;REVB=0.0169057;RO=34;SAF=16;SAR=3;SRF=31;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165966;STB=0.557257;TYPE=snp;VARB=0.0590068;OID=.;OPOS=77477581;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:53:54:34:35:19:19:3:16:31:3:3:16:31:4 chr18 77513721 . T C 988.82 PASS AO=103;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000972608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.199;QD=38.0316;RBI=0.0154438;REFB=0;REVB=0.0154132;RO=0;SAF=49;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.95759e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.8183e-05;OID=.;OPOS=77513721;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:104:104:0:0:103:104:54:49:0:0:54:50:0:0 chr18 77659553 . C T 43.34 PASS AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.148441;FXX=0.0999001;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3028;QD=19.2601;RBI=0.149134;REFB=-0.0127047;REVB=-0.0143584;RO=4;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.559127;STB=0.79893;TYPE=snp;VARB=0.0318814;OID=.;OPOS=77659553;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:10:9:4:3:6:6:1:5:0:4:1:5:0:3 chr18 77728135 . G T 217.41 PASS AO=54;DP=116;FAO=54;FDP=116;FR=.;FRO=62;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=39;FWDB=-0.00716331;FXX=0.00854628;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.938;QD=7.49704;RBI=0.0109749;REFB=-0.0156197;REVB=-0.00831472;RO=61;SAF=30;SAR=24;SRF=23;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169101;STB=0.597687;TYPE=snp;VARB=0.0160042;OID=.;OPOS=77728135;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:61:62:54:54:24:30:23:38:24:30:23:39 chr18 77736735 . T C 332.11 PASS AO=62;DP=106;FAO=65;FDP=112;FR=.;FRO=47;FSAF=34;FSAR=31;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=-0.0288145;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.8212;QD=11.8611;RBI=0.10849;REFB=-0.056693;REVB=-0.104594;RO=44;SAF=33;SAR=29;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00727991;STB=0.514156;TYPE=snp;VARB=0.0373064;OID=.;OPOS=77736735;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:112:44:47:62:65:29:33:23:21:31:34:23:24 chr18 77773006 . A G 18.23 PASS AO=11;DP=53;FAO=11;FDP=55;FR=.;FRO=44;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=0.0303285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.003;QD=1.32616;RBI=0.0557546;REFB=-0.00404366;REVB=-0.0467841;RO=42;SAF=9;SAR=2;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.482592;STB=0.822948;TYPE=snp;VARB=0.0276822;OID=.;OPOS=77773006;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:53:55:42:44:11:11:2:9:18:24:2:9:18:26 chr18 77773035 . G A 23.95 PASS AO=12;DP=52;FAO=12;FDP=52;FR=.;FRO=40;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=0.011627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.196;QD=1.84193;RBI=0.0229077;REFB=-0.00708054;REVB=0.0197376;RO=40;SAF=9;SAR=3;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.395721;STB=0.749584;TYPE=snp;VARB=0.0126736;OID=.;OPOS=77773035;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:52:52:40:40:12:12:3:9:17:23:3:9:17:23 chr18 77805949 . A C 123.19 PASS AO=28;DP=56;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.0121124;FXX=0.0327815;HRUN=5;LEN=1;MLLD=163.301;QD=8.35201;RBI=0.0199139;REFB=-0.00287156;REVB=-0.0158068;RO=26;SAF=8;SAR=20;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203251;STB=0.663144;TYPE=snp;VARB=0.00181977;OID=.;OPOS=77805949;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:59:26:31:28:28:20:8:13:13:20:8:18:13 chr18 77894844 . G A 34.58 PASS AO=10;DP=31;FAO=10;FDP=30;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.0383994;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.671;QD=4.61042;RBI=0.0501428;REFB=0.0163895;REVB=0.0322457;RO=20;SAF=4;SAR=6;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111111;STB=0.567431;TYPE=snp;VARB=-0.0203527;OID=.;OPOS=77894844;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:31:30:20:20:10:10:6:4:10:10:6:4:10:10 chr18 77897478 . C G 386.23 PASS AO=115;DP=280;FAO=115;FDP=280;FR=.;FRO=165;FSAF=58;FSAR=57;FSRF=60;FSRR=105;FWDB=-0.024792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.745;QD=5.51756;RBI=0.0252659;REFB=-0.0122154;REVB=0.00487051;RO=161;SAF=58;SAR=57;SRF=57;SRR=104;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157353;STB=0.582792;TYPE=snp;VARB=0.0160826;OID=.;OPOS=77897478;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:280:280:161:165:115:115:57:58:57:104:57:58:60:105 chr18 77915383 . C T 128.41 PASS AO=36;DP=95;FAO=38;FDP=96;FR=.;FRO=58;FSAF=10;FSAR=28;FSRF=17;FSRR=41;FWDB=-0.0117393;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2295;QD=5.35045;RBI=0.0184188;REFB=-0.0225921;REVB=-0.014193;RO=58;SAF=8;SAR=28;SRF=17;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10288;STB=0.522809;TYPE=snp;VARB=0.0380775;OID=.;OPOS=77915383;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:96:58:58:36:38:28:8:17:41:28:10:17:41 chr19 288062 . G A 462.64 PASS AO=15;DP=149;FAO=65;FDP=140;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=51;FSAF=50;FSAR=15;FSRF=34;FSRR=17;FWDB=0.0115627;FXX=0.0140835;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.045;QD=13.2184;RBI=0.0116554;REFB=-0.0151654;REVB=-0.00146659;RO=15;SAF=0;SAR=15;SRF=0;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.559421;TYPE=snp;VARB=0.0212861;OID=.;OPOS=288062;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:140:15:51:15:65:15:0:0:15:15:50:34:17 chr19 327182 . C T 196.07 PASS AO=50;DP=114;FAO=51;FDP=113;FR=.;FRO=62;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=41;FSRR=21;FWDB=0.0151775;FXX=0.0504159;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.635;QD=6.94054;RBI=0.0152081;REFB=-0.00435293;REVB=0.000964286;RO=59;SAF=25;SAR=25;SRF=39;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156777;STB=0.593531;TYPE=snp;VARB=0.00744099;OID=.;OPOS=327182;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:113:59:62:50:51:25:25:39:20:26:25:41:21 chr19 334474 . T G 423.5 PASS AO=48;DP=137;FAO=73;FDP=127;FR=.,HEALED;FRO=41;FSAF=48;FSAR=25;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=0.0057981;FXX=0.0451094;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.725;QD=13.3385;RBI=0.0676132;REFB=0.00207555;REVB=-0.0673642;RO=30;SAF=32;SAR=16;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218625;STB=0.564977;TYPE=snp;VARB=0.00622495;OID=.;OPOS=334474;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:127:30:41:48:73:16:32:11:19:25:48:20:21 chr19 372689 . G A 32.77 PASS AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=26;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=-0.0496237;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.7582;QD=5.04172;RBI=0.04963;REFB=-0.0104387;REVB=-0.000791235;RO=16;SAF=2;SAR=7;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0553985;STB=0.512168;TYPE=snp;VARB=0.0115024;OID=.;OPOS=372689;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:25:26:16:17:9:9:7:2:3:13:7:2:4:13 chr19 407358 . C T 71.25 PASS AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=15;FWDB=0.0290919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.6631;QD=8.38275;RBI=0.029293;REFB=-0.0567016;REVB=0.00342621;RO=17;SAF=6;SAR=10;SRF=2;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.271658;STB=0.624862;TYPE=snp;VARB=0.0262705;OID=.;OPOS=407358;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:34:34:17:18:16:16:10:6:2:15:10:6:3:15 chr19 453160 . A G 98.38 PASS AO=26;DP=62;FAO=26;FDP=62;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=0.0256904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.736;QD=6.3474;RBI=0.0284679;REFB=-0.0030086;REVB=-0.0122647;RO=36;SAF=11;SAR=15;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162666;STB=0.592522;TYPE=snp;VARB=0.00372528;OID=.;OPOS=453160;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:62:62:36:36:26:26:15:11:21:15:15:11:21:15 chr19 464080 . C T 49.89 PASS AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.02352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.427;QD=12.4736;RBI=0.0279907;REFB=-0.0222502;REVB=-0.0151753;RO=7;SAF=3;SAR=6;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174375;STB=0.599799;TYPE=snp;VARB=0.023798;OID=.;OPOS=464080;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:16:16:7:7:9:9:6:3:1:6:6:3:1:6 chr19 467740 . C T 115.86 PASS AO=22;DP=39;FAO=22;FDP=39;FR=.;FRO=17;FSAF=19;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=0.0150841;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=117.359;QD=11.8832;RBI=0.0154395;REFB=0.000129118;REVB=-0.00329367;RO=17;SAF=19;SAR=3;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143169;STB=0.580705;TYPE=snp;VARB=2.25172e-05;OID=.;OPOS=467740;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:39:39:17:17:22:22:3:19:13:4:3:19:13:4 chr19 498524 . A G 54.03 PASS AO=15;DP=40;FAO=15;FDP=40;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.0217813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.716;QD=5.40299;RBI=0.0303022;REFB=-0.00479488;REVB=-0.0210666;RO=24;SAF=7;SAR=8;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00880615;STB=0.516756;TYPE=snp;VARB=0.0148278;OID=.;OPOS=498524;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:40:40:24:25:15:15:8:7:11:13:8:7:11:14 chr19 501743 . T C 11.66 PASS AO=3;DP=12;FAO=3;FDP=13;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=9;FWDB=-0.185456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.4766;QD=3.58766;RBI=0.186941;REFB=-0.0103976;REVB=-0.0235169;RO=9;SAF=1;SAR=2;SRF=0;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.587597;STB=0.732273;TYPE=snp;VARB=0.0619424;OID=.;OPOS=501743;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:12:13:9:10:3:3:2:1:0:9:2:1:1:9 chr19 544140 . G A 562.82 PASS AO=64;DP=70;FAO=65;FDP=70;FR=.;FRO=5;FSAF=58;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0891709;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.0103;QD=32.1614;RBI=0.126987;REFB=-0.153313;REVB=0.090411;RO=4;SAF=57;SAR=7;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0320027;STB=0.516698;TYPE=snp;VARB=0.00667459;OID=.;OPOS=544140;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:70:70:4:5:64:65:7:57:4:0:7:58:4:1 chr19 549080 . A G 44.93 PASS AO=18;DP=58;FAO=17;FDP=57;FR=.;FRO=40;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=30;FWDB=-0.0312287;FXX=0.0172384;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.7315;QD=3.15277;RBI=0.0556575;REFB=-0.00844363;REVB=-0.0460708;RO=40;SAF=7;SAR=11;SRF=9;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214678;STB=0.582848;TYPE=snp;VARB=0.0123927;OID=.;OPOS=549080;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:58:57:40:40:18:17:11:7:9:31:11:6:10:30 chr19 549678 . A G 102.87 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.617;QD=34.2912;RBI=0.0282722;REFB=0;REVB=-0.025418;RO=0;SAF=5;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00129506;OID=.;OPOS=549678;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:7:5:0:0:7:5:0:0 chr19 579010 . G A 195.71 PASS AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0134057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0598;QD=39.1413;RBI=0.0363795;REFB=0;REVB=-0.0338194;RO=0;SAF=19;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.97126e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00176181;OID=.;OPOS=579010;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:20:20:0:0:20:20:1:19:0:0:1:19:0:0 chr19 579035 . C T 78.73 PASS AO=13;DP=21;FAO=13;FDP=21;FR=.;FRO=8;FSAF=12;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=0.00237866;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.189;QD=14.9959;RBI=0.00477875;REFB=-0.0369148;REVB=0.00414468;RO=8;SAF=12;SAR=1;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226836;STB=0.624848;TYPE=snp;VARB=0.0176296;OID=.;OPOS=579035;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:21:21:8:8:13:13:1:12:8:0:1:12:8:0 chr19 579432 . G C 38.67 PASS AO=14;DP=45;FAO=14;FDP=47;FR=.;FRO=33;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=-0.0463272;FXX=0.020829;HRUN=5;LEN=1;MLLD=131.493;QD=3.29072;RBI=0.0472191;REFB=-0.0300821;REVB=-0.00913428;RO=30;SAF=6;SAR=8;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154622;STB=0.569525;TYPE=snp;VARB=0.0550508;OID=.;OPOS=579432;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:45:47:30:33:14:14:8:6:9:21:8:6:11:22 chr19 580665 . T C 97.42 PASS AO=24;DP=58;FAO=25;FDP=58;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=23;FSRR=10;FWDB=-0.0128882;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.628;QD=6.7183;RBI=0.0158117;REFB=-0.0345767;REVB=0.00916;RO=33;SAF=17;SAR=7;SRF=23;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0138477;STB=0.516007;TYPE=snp;VARB=0.0436877;OID=.;OPOS=580665;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:58:58:33:33:24:25:7:17:23:10:7:18:23:10 chr19 582505 . G A 10.38 PASS AO=2;DP=8;FAO=2;FDP=8;FR=.;FRO=6;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=37.6397;QD=5.18979;RBI=0.0119069;REFB=-0.00500164;REVB=0.0119069;RO=6;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0150805;OID=.;OPOS=582505;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:8:6:6:2:2:2:0:0:6:2:0:0:6 chr19 582775 . A G 292.03 PASS AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0388461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.6023;QD=38.9371;RBI=0.0690355;REFB=0;REVB=-0.0570691;RO=0;SAF=23;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00041485;OID=.;OPOS=582775;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:30:30:0:0:30:30:7:23:0:0:7:23:0:0 chr19 582927 . T A 144.23 PASS AO=37;DP=83;FAO=37;FDP=85;FR=.;FRO=48;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=-0.0091588;FXX=0.0555494;HRUN=7;LEN=1;MLLD=197.612;QD=6.78733;RBI=0.0160357;REFB=-0.0234221;REVB=-0.0131628;RO=27;SAF=20;SAR=17;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101862;STB=0.534672;TYPE=snp;VARB=0.0247336;OID=.;OPOS=582927;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:85:27:48:37:37:17:20:11:16:17:20:23:25 chr19 605171 . T C 719.49 PASS AO=59;DP=78;FAO=76;FDP=76;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=32;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.139197;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.663;QD=37.8677;RBI=0.139386;REFB=0;REVB=-0.00725601;RO=0;SAF=16;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.74604e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000652015;OID=.;OPOS=605171;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:75:76:0:0:59:76:43:16:0:0:44:32:0:0 chr19 607984 . G C 142.2 PASS AO=27;DP=48;FAO=27;FDP=47;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.00850094;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.706;QD=12.1017;RBI=0.0393709;REFB=-0.00694846;REVB=0.0384422;RO=19;SAF=14;SAR=13;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0452637;STB=0.513418;TYPE=snp;VARB=0.00480054;OID=.;OPOS=607984;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:48:47:19:20:27:27:13:14:11:8:13:14:11:9 chr19 613898 . T C 186.33 PASS AO=20;DP=20;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00345226;FXX=0.049975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9627;QD=39.2267;RBI=0.0393333;REFB=0;REVB=0.0391815;RO=0;SAF=18;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.19193e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000246864;OID=.;OPOS=613898;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:20:19:0:0:20:19:2:18:0:0:2:17:0:0 chr19 617614 . G A 67.66 PASS AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=0.0298739;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6562;QD=9.66616;RBI=0.0298817;REFB=0.0138702;REVB=0.000683258;RO=14;SAF=7;SAR=7;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188032;STB=0.606997;TYPE=snp;VARB=-0.0131838;OID=.;OPOS=617614;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:28:28:14:14:14:14:7:7:10:4:7:7:10:4 chr19 619020 . AG A,AC 120.23 PASS AO=6,8;DP=24;FAO=9,9;FDP=21;FR=.;FRO=3;FSAF=9,8;FSAR=0,1;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0221888,-0.0166287;FXX=0.0454339;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=14.1292,200.041;QD=22.9013;RBI=0.35357,0.23076;REFB=0.0199755,-0.0202667;REVB=0.352873,0.23016;RO=2;SAF=6,7;SAR=0,1;SRF=2;SRR=0;SSEN=0.328125,0;SSEP=0.227976,0;SSSB=0,-0.110633;STB=0.997923,0.615086;TYPE=del,snp;VARB=0.0935953,-0.0105291;OID=.,.;OPOS=619021,619021;OREF=G,G;OALT=-,C;OMAPALT=A,AC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:6,8:17:9,9:21:3:9,8:0,1:2:1:41:2:6,7:0,1:2:0 chr19 621070 . G A 36.66 PASS AO=8;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.0176142;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.223;QD=6.66589;RBI=0.0176142;REFB=-0.0258221;REVB=-4.29522e-05;RO=13;SAF=6;SAR=2;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0743475;STB=0.517204;TYPE=snp;VARB=0.0419389;OID=.;OPOS=621070;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:22:22:13:13:8:9:2:6:9:4:3:6:9:4 chr19 621076 . G A 68.12 PASS AO=13;DP=22;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=-0.00110427;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.968;QD=11.3536;RBI=0.028992;REFB=-0.0200818;REVB=0.028971;RO=9;SAF=9;SAR=4;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181636;STB=0.519055;TYPE=snp;VARB=0.0231071;OID=.;OPOS=621076;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:22:24:9:11:13:13:4:9:8:1:4:9:8:3 chr19 625198 . A G 62.49 PASS AO=21;DP=65;FAO=22;FDP=66;FR=.;FRO=44;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=30;FSRR=14;FWDB=-0.0264319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.867;QD=3.78757;RBI=0.0268993;REFB=-0.0100851;REVB=0.00499251;RO=43;SAF=11;SAR=10;SRF=29;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175397;STB=0.621108;TYPE=snp;VARB=0.0184417;OID=.;OPOS=625198;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:65:66:43:44:21:22:10:11:29:14:11:11:30:14 chr19 629846 . G A 106.57 PASS AO=16;DP=22;FAO=16;FDP=22;FR=.;FRO=6;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.0230954;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.967;QD=19.3766;RBI=0.131825;REFB=-0.0314056;REVB=0.129786;RO=6;SAF=13;SAR=3;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171203;STB=0.593648;TYPE=snp;VARB=0.0136561;OID=.;OPOS=629846;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:22:22:6:6:16:16:3:13:6:0:3:13:6:0 chr19 641215 . T C 46.67 PASS AO=7;DP=31;FAO=15;FDP=42;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.0057023;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.623;QD=4.44496;RBI=0.0481827;REFB=-0.0118441;REVB=-0.0478441;RO=22;SAF=1;SAR=6;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.533416;STB=0.514358;TYPE=snp;VARB=0.0271227;OID=.;OPOS=641215;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:31:42:22:27:7:15:6:1:13:9:7:8:15:12 chr19 652238 . A G 92.93 PASS AO=19;DP=36;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=0.010094;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.498;QD=10.3255;RBI=0.0143142;REFB=0.001617;REVB=0.0101493;RO=17;SAF=13;SAR=6;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0212108;STB=0.511933;TYPE=snp;VARB=-0.00155339;OID=.;OPOS=652238;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:36:36:17:17:19:19:6:13:12:5:6:13:12:5 chr19 685833 . G T 30.97 PASS AO=9;DP=27;FAO=9;FDP=29;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0140744;FXX=0.0333222;HRUN=5;LEN=1;MLLD=136.37;QD=4.27127;RBI=0.0666413;REFB=-0.00585942;REVB=-0.0651381;RO=14;SAF=8;SAR=1;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.44622;STB=0.807265;TYPE=snp;VARB=0.00661814;OID=.;OPOS=685833;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:27:29:14:20:9:9:1:8:8:6:1:8:11:9 chr19 691909 . T C 580.86 PASS AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.599;QD=38.7241;RBI=0.0348643;REFB=0;REVB=0.029542;RO=0;SAF=29;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.73709e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000193466;OID=.;OPOS=691909;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:60:60:0:0:60:60:31:29:0:0:31:29:0:0 chr19 726130 . TC T 115.14 PASS AO=42;DP=111;FAO=52;FDP=92;FR=.;FRO=40;FSAF=37;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=14;FWDB=0.0170846;FXX=0.0706999;HRUN=3;LEN=1;MLLD=10.7143;QD=5.00586;RBI=0.0215941;REFB=-0.147837;REVB=0.0132068;RO=54;SAF=32;SAR=10;SRF=27;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.295619;STB=0.531702;TYPE=del;VARB=0.161854;OID=.;OPOS=726131;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:42:109:52:92:40:37:15:26:14:56:54:32:10:27:27 chr19 759915 . CG C 825.38 PASS AO=104;DP=156;FAO=152;FDP=153;FR=.;FRO=1;FSAF=88;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.319035;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.4461;QD=21.5786;RBI=0.323611;REFB=0.107514;REVB=-0.05423;RO=35;SAF=51;SAR=53;SRF=32;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0.369369;SSSB=-0.199558;STB=0.503875;TYPE=del;VARB=0.00727228;OID=.;OPOS=759916;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:104:151:152:153:1:88:64:0:1:58:35:51:53:32:3 chr19 763541 . TGGCAGAGCGCTGGGAATCCCGCATCTACGCCAGTGAGGAGGATGACTGAGCCTCG TGCAGAGCGCTGGGAATCCCGCATCTACGCCAGTGAGGAGGATGACTGAGCCTCG,TGGCAGAGCGCTGGGAATCCCGCATCTACGCCAGTGAGGAGGATGACTGAGCCTC 34.91 PASS AO=3,5;DP=89;FAO=0,16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=0,1;FSAR=0,15;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.583415,0.295976;FXX=0.190431;HRUN=2,3;LEN=1,1;MLLD=15.1332,11.4903;QD=4.10661;RBI=0.591487,0.388651;REFB=-0.0206917,0.0148243;REVB=-0.0973863,-0.251887;RO=1;SAF=3,0;SAR=0,5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0.310377,0;SSSB=0,-0.767767;STB=0.5,0.890487;TYPE=del,del;VARB=0,0.0207297;OID=.,.;OPOS=763542,763596;OREF=G,G;OALT=-,-;OMAPALT=TGCAGAGCGCTGGGAATCCCGCATCTACGCCAGTGAGGAGGATGACTGAGCCTCG,TGGCAGAGCGCTGGGAATCCCGCATCTACGCCAGTGAGGAGGATGACTGAGCCTC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:3,5:11:0,16:34:18:0,1:0,15:11:7:33:1:3,0:0,5:1:0 chr19 804184 . C T 43.73 PASS AO=25;DP=88;FAO=23;FDP=86;FR=.;FRO=63;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=25;FSRR=38;FWDB=0.104259;FXX=0.0227247;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.6663;QD=2.03406;RBI=0.108475;REFB=-0.00632779;REVB=-0.029948;RO=63;SAF=16;SAR=9;SRF=25;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.287614;STB=0.652002;TYPE=snp;VARB=0.0242849;OID=.;OPOS=804184;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:88:86:63:63:25:23:9:16:25:38:9:14:25:38 chr19 871222 . G A 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.792;QD=33.021;RBI=0.0784043;REFB=0;REVB=0.0784043;RO=0;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00348772;OID=.;OPOS=871222;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:6:0:0:0:6:0:0:0 chr19 872089 . A G 749.54 PASS AO=76;DP=79;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.103884;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.5298;QD=36.5628;RBI=0.13843;REFB=-0.00603983;REVB=-0.0914921;RO=3;SAF=39;SAR=37;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0110323;STB=0.506328;TYPE=snp;VARB=-0.00169238;OID=.;OPOS=872089;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:79:82:3:1:76:81:37:39:2:1:39:42:0:1 chr19 885818 . A G 313.81 PASS AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.123977;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.011;QD=36.9185;RBI=0.127317;REFB=0;REVB=0.0289728;RO=0;SAF=15;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40663e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0017715;OID=.;OPOS=885818;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:34:0:0:34:34:19:15:0:0:19:15:0:0 chr19 965043 . T C 392.42 PASS AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0328227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.189;QD=37.373;RBI=0.0340288;REFB=0;REVB=-0.00897923;RO=0;SAF=14;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000138622;OID=.;OPOS=965043;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:42:42:0:0:42:42:28:14:0:0:28:14:0:0 chr19 966693 . C T 437.39 PASS AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0321743;FXX=0.0212721;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.322;QD=38.0335;RBI=0.0382824;REFB=0;REVB=0.0207451;RO=0;SAF=13;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.94744e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000344093;OID=.;OPOS=966693;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:47:46:0:0:46:46:33:13:0:0:33:13:0:0 chr19 971933 . A G 61.59 PASS AO=6;DP=6;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.203286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.985;QD=35.1958;RBI=0.203346;REFB=0;REVB=-0.00491995;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00181116;OID=.;OPOS=971933;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:7:0:0:6:7:5:1:0:0:6:1:0:0 chr19 971949 . G A 79.67 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.130032;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.121;QD=31.867;RBI=0.140976;REFB=-0.178355;REVB=0.0544588;RO=0;SAF=1;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.666218;TYPE=snp;VARB=0.0209847;OID=.;OPOS=971949;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:9:10:0:1:9:9:8:1:0:0:8:1:1:0 chr19 984533 . T C 22.68 PASS AO=5;DP=14;FAO=5;FDP=14;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.00109237;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.997;QD=6.48136;RBI=0.0239608;REFB=-0.0203502;REVB=-0.0239359;RO=8;SAF=2;SAR=3;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.33255;STB=0.666031;TYPE=snp;VARB=0.0516609;OID=.;OPOS=984533;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:14:14:8:9:5:5:3:2:6:2:3:2:6:3 chr19 984537 . A G 43.03 PASS AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0432882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.6652;QD=14.3433;RBI=0.0589212;REFB=0.00308021;REVB=-0.0399731;RO=5;SAF=5;SAR=2;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237226;STB=0.640603;TYPE=snp;VARB=-0.0156909;OID=.;OPOS=984537;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:12:12:5:5:7:7:2:5:2:3:2:5:2:3 chr19 990238 . C T 79.24 PASS AO=12;DP=15;FAO=12;FDP=17;FR=.;FRO=5;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0128153;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=121.97;QD=18.6438;RBI=0.0744005;REFB=-0.00430502;REVB=-0.0732885;RO=3;SAF=11;SAR=1;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.405314;STB=0.820218;TYPE=snp;VARB=0.000832396;OID=.;OPOS=990238;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:15:17:3:5:12:12:1:11:1:2:1:11:1:4 chr19 990281 . G A 282.68 PASS AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00556378;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.705;QD=38.9898;RBI=0.0493957;REFB=0;REVB=0.0490814;RO=0;SAF=18;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000168535;OID=.;OPOS=990281;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:30:29:0:0:29:29:11:18:0:0:11:18:0:0 chr19 1004710 . C T 25.53 PASS AO=10;DP=38;FAO=10;FDP=38;FR=.;FRO=28;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.0025251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.958;QD=2.68758;RBI=0.0144431;REFB=-0.00748971;REVB=-0.0142206;RO=28;SAF=4;SAR=6;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118809;STB=0.574318;TYPE=snp;VARB=0.033532;OID=.;OPOS=1004710;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:38:38:28:28:10:10:6:4:14:14:6:4:14:14 chr19 1004740 . T C 68.87 PASS AO=20;DP=53;FAO=20;FDP=53;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.0138076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.093;QD=5.19748;RBI=0.0216416;REFB=0.00366108;REVB=0.0166646;RO=31;SAF=9;SAR=11;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103314;STB=0.540602;TYPE=snp;VARB=-0.00645271;OID=.;OPOS=1004740;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:53:53:31:33:20:20:11:9:17:14:11:9:17:16 chr19 1009585 . C G 56.7 PASS AO=18;DP=50;FAO=18;FDP=51;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=9;FWDB=-0.0248432;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.5393;QD=4.44703;RBI=0.0594445;REFB=-0.00497694;REVB=-0.0540043;RO=30;SAF=7;SAR=11;SRF=21;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.324644;STB=0.708728;TYPE=snp;VARB=0.0269886;OID=.;OPOS=1009585;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:50:51:30:33:18:18:11:7:21:9:11:7:24:9 chr19 1010406 . G A 27.79 PASS AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=11;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.0746771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.258;QD=10.1059;RBI=0.158089;REFB=0.0211549;REVB=0.13934;RO=6;SAF=4;SAR=1;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.370384;STB=0.713717;TYPE=snp;VARB=-0.00732489;OID=.;OPOS=1010406;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:11:11:6:6:5:5:1:4:6:0:1:4:6:0 chr19 1014377 . A G 78.05 PASS AO=24;DP=65;FAO=24;FDP=65;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=0.00214078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.1006;QD=4.80286;RBI=0.0402033;REFB=-0.0278976;REVB=-0.0401463;RO=41;SAF=15;SAR=9;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0176337;STB=0.510196;TYPE=snp;VARB=0.0337451;OID=.;OPOS=1014377;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:65:65:41:41:24:24:9:15:25:16:9:15:25:16 chr19 1014398 . A G 54.06 PASS AO=19;DP=59;FAO=19;FDP=59;FR=.;FRO=40;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=-0.0147069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0492;QD=3.66525;RBI=0.0304592;REFB=-0.0207855;REVB=-0.0266734;RO=39;SAF=13;SAR=6;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147247;STB=0.580495;TYPE=snp;VARB=0.0497988;OID=.;OPOS=1014398;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:59:59:39:40:19:19:6:13:22:17:6:13:23:17 chr19 1036552 . T C 643.09 PASS AO=67;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00612341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.941;QD=37.8286;RBI=0.00624465;REFB=0;REVB=-0.00122454;RO=0;SAF=25;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.93036e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.20621e-05;OID=.;OPOS=1036552;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:68:68:0:0:67:68:42:25:0:0:42:26:0:0 chr19 1038995 . A C 2580.72 PASS AO=124;DP=272;FAO=276;FDP=276;FR=.;FRO=0;FSAF=159;FSAR=117;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0565157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.323;QD=37.4017;RBI=0.0579839;REFB=0;REVB=-0.012966;RO=0;SAF=101;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000823437;OID=.;OPOS=1038995;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:150:276:0:0:124:276:23:101:0:0:117:159:0:0 chr19 1042809 . A G 42.16 PASS AO=9;DP=23;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=-0.00554672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.125;QD=7.02612;RBI=0.0121639;REFB=-0.0148724;REVB=0.0108257;RO=13;SAF=3;SAR=6;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120736;STB=0.562383;TYPE=snp;VARB=0.0276932;OID=.;OPOS=1042809;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:23:24:13:14:9:10:6:3:3:10:7:3:3:11 chr19 1047002 . A G 39.58 PASS AO=8;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=-0.042514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.6576;QD=9.31353;RBI=0.0507422;REFB=-0.058779;REVB=0.0277007;RO=9;SAF=3;SAR=5;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153362;STB=0.589955;TYPE=snp;VARB=0.0403693;OID=.;OPOS=1047002;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:17:17:9:9:8:8:5:3:2:7:5:3:2:7 chr19 1047161 . A G 57.9 PASS AO=11;DP=34;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=-0.0334055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.213;QD=5.93795;RBI=0.033857;REFB=-0.0189866;REVB=-0.00551081;RO=22;SAF=7;SAR=4;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.554389;TYPE=snp;VARB=0.0356486;OID=.;OPOS=1047161;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:34:39:22:23:11:16:4:7:14:8:7:9:15:8 chr19 1048982 . C T 169.48 PASS AO=23;DP=29;FAO=23;FDP=29;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.0429089;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=176.967;QD=23.3768;RBI=0.0437019;REFB=0.00827578;REVB=-0.00828751;RO=6;SAF=1;SAR=22;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111012;STB=0.559953;TYPE=snp;VARB=-0.000798107;OID=.;OPOS=1048982;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:29:29:6:6:23:23:22:1:0:6:22:1:0:6 chr19 1049305 . C A 329.09 PASS AO=68;DP=123;FAO=68;FDP=123;FR=.;FRO=55;FSAF=36;FSAR=32;FSRF=15;FSRR=40;FWDB=0.0296409;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.2792;QD=10.7021;RBI=0.0783166;REFB=-0.0151998;REVB=0.0724908;RO=55;SAF=36;SAR=32;SRF=15;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208404;STB=0.613604;TYPE=snp;VARB=0.0141808;OID=.;OPOS=1049305;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:55:55:68:68:32:36:15:40:32:36:15:40 chr19 1052005 . C T 274.23 PASS AO=31;DP=33;FAO=32;FDP=34;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0217644;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.849;QD=32.2617;RBI=0.0577623;REFB=-0.167004;REVB=0.0535051;RO=1;SAF=24;SAR=7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0190495;STB=0.519219;TYPE=snp;VARB=0.00307346;OID=.;OPOS=1052005;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:33:34:1:2:31:32:7:24:1:0:7:25:2:0 chr19 1053524 . C G 21.5 PASS AO=6;DP=20;FAO=6;FDP=20;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=1;FWDB=-0.0158602;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.6;QD=4.29945;RBI=0.0239535;REFB=-0.0110156;REVB=-0.0179506;RO=14;SAF=3;SAR=3;SRF=13;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.509428;STB=0.799358;TYPE=snp;VARB=0.034029;OID=.;OPOS=1053524;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:20:20:14:14:6:6:3:3:13:1:3:3:13:1 chr19 1054060 . A G 431.39 PASS AO=51;DP=55;FAO=51;FDP=55;FR=.;FRO=4;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0224736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.65;QD=31.374;RBI=0.0330168;REFB=-0.0406453;REVB=0.0241877;RO=4;SAF=25;SAR=26;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0695893;STB=0.537023;TYPE=snp;VARB=0.00130515;OID=.;OPOS=1054060;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:55:55:4:4:51:51:26:25:4:0:26:25:4:0 chr19 1055191 . G A 136.31 PASS AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0352327;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.742;QD=36.3481;RBI=0.0445531;REFB=0;REVB=0.0272696;RO=0;SAF=11;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33019e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00118479;OID=.;OPOS=1055191;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:15:0:0:15:15:4:11:0:0:4:11:0:0 chr19 1056065 . A G 136.31 PASS AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.118645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.848;QD=36.3484;RBI=0.128873;REFB=0;REVB=0.0503168;RO=0;SAF=2;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000528997;OID=.;OPOS=1056065;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:15:0:0:15:15:13:2:0:0:13:2:0:0 chr19 1056492 . G C 79.87 PASS AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0282096;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.6575;QD=31.9495;RBI=0.075735;REFB=-0.118979;REVB=-0.0702852;RO=0;SAF=1;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.529348;TYPE=snp;VARB=0.0103283;OID=.;OPOS=1056492;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:10:10:0:1:9:9:8:1:0:0:8:1:0:1 chr19 1059004 . A G 339.02 PASS AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0193822;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.9763;QD=37.669;RBI=0.109511;REFB=0;REVB=-0.107782;RO=0;SAF=29;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00249011;OID=.;OPOS=1059004;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:36:36:0:0:36:36:7:29:0:0:7:29:0:0 chr19 1064193 . G A 590.76 PASS AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00767995;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.433;QD=36.3544;RBI=0.0499371;REFB=-0.0804194;REVB=0.049343;RO=0;SAF=32;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50769;TYPE=snp;VARB=0.00200816;OID=.;OPOS=1064193;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:65:65:0:1:64:64:32:32:0:0:32:32:0:1 chr19 1068734 . T C 236.57 PASS AO=27;DP=29;FAO=27;FDP=29;FR=.;FRO=2;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00622548;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.924;QD=32.6309;RBI=0.0356111;REFB=-0.0783532;REVB=-0.0350627;RO=2;SAF=19;SAR=8;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0308107;STB=0.516604;TYPE=snp;VARB=0.00123231;OID=.;OPOS=1068734;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:2:2:27:27:8:19:1:1:8:19:1:1 chr19 1068738 . G A 236.61 PASS AO=27;DP=29;FAO=27;FDP=29;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0674296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.101;QD=32.6353;RBI=0.104561;REFB=-0.196196;REVB=0.0799146;RO=0;SAF=18;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.526297;TYPE=snp;VARB=0.00499891;OID=.;OPOS=1068738;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:29:29:0:2:27:27:9:18:0:0:9:18:2:0 chr19 1074000 . A T 738.8 PASS AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0488869;FXX=0.0128189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.163;QD=38.3792;RBI=0.0498914;REFB=0;REVB=0.00996112;RO=0;SAF=35;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000117;OID=.;OPOS=1074000;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:78:77:0:0:77:77:42:35:0:0:42:35:0:0 chr19 1074413 . G C 13.7 PASS AO=3;DP=9;FAO=3;FDP=10;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0911633;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=34.3547;QD=5.47906;RBI=0.0961255;REFB=0.0102167;REVB=0.0304852;RO=6;SAF=0;SAR=3;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.606014;STB=0.665772;TYPE=snp;VARB=0.00114085;OID=.;OPOS=1074413;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:9:10:6:7:3:3:3:0:1:5:2:1:1:6 chr19 1077985 . A G 107.81 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.115612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.897;QD=35.9378;RBI=0.126237;REFB=0;REVB=0.0506915;RO=0;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00374908;OID=.;OPOS=1077985;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:8:4:0:0:8:4:0:0 chr19 1085966 . A G 25.08 PASS AO=9;DP=33;FAO=9;FDP=33;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=18;FWDB=-0.0176553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.9448;QD=3.04039;RBI=0.0731959;REFB=-0.00639725;REVB=-0.0710347;RO=24;SAF=6;SAR=3;SRF=6;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.457148;STB=0.777254;TYPE=snp;VARB=0.0241746;OID=.;OPOS=1085966;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:33:33:24:24:9:9:3:6:6:18:3:6:6:18 chr19 1094004 . G A 764.65 PASS AO=75;DP=75;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0642821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.668;QD=38.2325;RBI=0.0678422;REFB=0;REVB=0.0216881;RO=0;SAF=39;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6999e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000160919;OID=.;OPOS=1094004;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:75:80:0:0:75:80:36:39:0:0:38:42:0:0 chr19 1106615 . T C 74 PASS AO=12;DP=19;FAO=12;FDP=19;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.866;QD=15.5785;RBI=0.0227185;REFB=-0.00624796;REVB=0.0227185;RO=7;SAF=0;SAR=12;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00180622;OID=.;OPOS=1106615;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:19:19:7:7:12:12:12:0:0:7:12:0:0:7 chr19 1109213 . A G 24.12 PASS AO=4;DP=12;FAO=5;FDP=13;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0037641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.314;QD=7.42168;RBI=0.045516;REFB=-0.0145688;REVB=0.04536;RO=8;SAF=2;SAR=2;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127513;STB=0.635829;TYPE=snp;VARB=0.0254297;OID=.;OPOS=1109213;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:12:13:8:8:4:5:2:2:5:3:3:2:5:3 chr19 1110829 . G A 74 PASS AO=12;DP=19;FAO=12;FDP=19;FR=.;FRO=7;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0107608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.359;QD=15.5784;RBI=0.0148274;REFB=-0.0264715;REVB=0.0102009;RO=7;SAF=8;SAR=4;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.067621;STB=0.538396;TYPE=snp;VARB=0.004951;OID=.;OPOS=1110829;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:19:19:7:7:12:12:4:8:4:3:4:8:4:3 chr19 1113697 . AGGGG AGG,AGGGA 148.27 PASS AO=3,5;DP=24;FAO=3,17;FDP=22;FR=.;FRO=2;FSAF=0,3;FSAR=3,14;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.12266,0.144476;FXX=0.119952;HRUN=4,4;LEN=2,1;MLLD=13.7721,115.459;QD=26.9578;RBI=0.130063,0.150168;REFB=0.0786294,-0.0385658;REVB=-0.0432541,0.0409522;RO=1;SAF=0,2;SAR=3,3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0.555556,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.727144,-0.169284;STB=0.995982,0.624835;TYPE=del,snp;VARB=0.0830043,0.0251271;OID=.,.;OPOS=1113698,1113701;OREF=GG,G;OALT=-,A;OMAPALT=AGG,AGGGA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:3,5:14:3,17:22:2:0,3:3,14:2:0:7:1:0,2:3,3:1:0 chr19 1119019 . C T 55.25 PASS AO=10;DP=18;FAO=10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=-0.00627801;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.401;QD=12.2782;RBI=0.00913427;REFB=-0.0325766;REVB=-0.00663487;RO=8;SAF=6;SAR=4;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124286;STB=0.571292;TYPE=snp;VARB=0.0348309;OID=.;OPOS=1119019;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:18:18:8:8:10:10:4:6:6:2:4:6:6:2 chr19 1119963 . A G 69.08 PASS AO=16;DP=35;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=1;FWDB=-0.0332715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.592;QD=7.8951;RBI=0.0577276;REFB=-0.00941505;REVB=-0.0471751;RO=19;SAF=5;SAR=11;SRF=18;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.55067;STB=0.807996;TYPE=snp;VARB=0.0124012;OID=.;OPOS=1119963;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:35:35:19:19:16:16:11:5:18:1:11:5:18:1 chr19 1122147 . G A 96.42 PASS AO=20;DP=39;FAO=20;FDP=39;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=3;FWDB=-0.0270166;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.101;QD=9.88943;RBI=0.0845033;REFB=-0.0105208;REVB=0.0800682;RO=18;SAF=12;SAR=8;SRF=16;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.27291;STB=0.629099;TYPE=snp;VARB=0.0187179;OID=.;OPOS=1122147;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:39:39:18:19:20:20:8:12:16:2:8:12:16:3 chr19 1124053 . A G 31.54 PASS AO=3;DP=7;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0296319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.276;QD=15.7685;RBI=0.0434945;REFB=-0.062048;REVB=0.031839;RO=3;SAF=2;SAR=1;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.599599;TYPE=snp;VARB=0.0260635;OID=.;OPOS=1124053;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:7:8:3:3:3:5:1:2:2:1:3:2:2:1 chr19 1231064 . G A 10.47 PASS AO=2;DP=6;FAO=2;FDP=6;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0155398;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.485;QD=6.98005;RBI=0.0155398;REFB=0.0674309;REVB=0;RO=4;SAF=2;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00866715;OID=.;OPOS=1231064;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:4:4:2:2:0:2:4:0:0:2:4:0 chr19 1231142 . T C 31.59 PASS AO=6;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=0.0139028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.334;QD=9.71863;RBI=0.062695;REFB=0.00158528;REVB=0.061134;RO=7;SAF=4;SAR=2;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.406329;STB=0.732802;TYPE=snp;VARB=0.000696995;OID=.;OPOS=1231142;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:13:13:7:7:6:6:2:4:7:0:2:4:7:0 chr19 1235487 . G A 59.57 PASS AO=15;DP=35;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=5;FWDB=-0.018254;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.4147;QD=6.61934;RBI=0.0607676;REFB=-0.0502236;REVB=0.0579612;RO=20;SAF=7;SAR=8;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.277923;STB=0.668886;TYPE=snp;VARB=0.0868429;OID=.;OPOS=1235487;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:35:36:20:21:15:15:8:7:15:5:8:7:16:5 chr19 1256998 . C T 93.14 PASS AO=27;DP=69;FAO=27;FDP=70;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=-0.000373523;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.745;QD=5.32237;RBI=0.00929979;REFB=-0.0172866;REVB=-0.00929228;RO=41;SAF=10;SAR=17;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127373;STB=0.574644;TYPE=snp;VARB=0.0254422;OID=.;OPOS=1256998;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:69:70:41:43:27:27:17:10:20:21:17:10:21:22 chr19 1258425 . GC G 150.65 PASS AO=13;DP=32;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0393545;FXX=0.0312402;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.8798;QD=19.4388;RBI=0.387245;REFB=-0.0154845;REVB=0.38524;RO=14;SAF=5;SAR=8;SRF=1;SRR=13;SSEN=0.311688;SSEP=0;SSSB=0.332009;STB=0.526298;TYPE=del;VARB=0.0365513;OID=.;OPOS=1258426;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:13:32:30:31:1:9:21:1:0:9:14:5:8:1:13 chr19 1258999 . A G 92.86 PASS AO=22;DP=48;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=5;FSRR=21;FWDB=-0.00628107;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=235.493;QD=7.73795;RBI=0.0131679;REFB=-0.0018128;REVB=-0.0115733;RO=25;SAF=6;SAR=16;SRF=5;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.090619;STB=0.55774;TYPE=snp;VARB=0.00203326;OID=.;OPOS=1258999;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:48:48:25:26:22:22:16:6:5:20:16:6:5:21 chr19 1272040 . T C 1183.83 PASS AO=124;DP=125;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115498;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.615;QD=38.188;RBI=0.0378864;REFB=0;REVB=0.036083;RO=0;SAF=57;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.09096e-05;OID=.;OPOS=1272040;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:125:124:0:0:124:124:67:57:0:0:67:57:0:0 chr19 1277275 . G C 178.34 PASS AO=20;DP=21;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00608609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.6662;QD=32.425;RBI=0.0337936;REFB=0.0745327;REVB=0.033241;RO=1;SAF=11;SAR=9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0400637;STB=0.519981;TYPE=snp;VARB=-0.00315348;OID=.;OPOS=1277275;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:21:22:1:1:20:21:9:11:1:0:9:12:1:0 chr19 1357082 . T C 3756.06 PASS AO=388;DP=388;FAO=392;FDP=392;FR=.;FRO=0;FSAF=180;FSAR=212;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0065373;FXX=0.00254446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.437;QD=38.3272;RBI=0.0103504;REFB=0;REVB=0.00802459;RO=0;SAF=178;SAR=210;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.55441e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.31109e-05;OID=.;OPOS=1357082;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:388:392:0:0:388:392:210:178:0:0:212:180:0:0 chr19 1358726 . C T 1642.05 PASS AO=106;DP=176;FAO=172;FDP=172;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=112;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00885444;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=218.317;QD=38.1871;RBI=0.0158785;REFB=0;REVB=0.0131805;RO=0;SAF=3;SAR=103;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.7793e-06;OID=.;OPOS=1358726;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:106:172:0:0:106:172:103:3:0:0:112:60:0:0 chr19 1360575 . G A 1180.3 PASS AO=126;DP=127;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0193813;FXX=0.0157468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2488;QD=37.7696;RBI=0.0436943;REFB=-0.056806;REVB=0.0391607;RO=1;SAF=53;SAR=73;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00646507;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000516635;OID=.;OPOS=1360575;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:127:125:1:0:126:125:73:53:0:1:73:52:0:0 chr19 1370675 . C G 37.12 PASS AO=13;DP=43;FAO=13;FDP=43;FR=.;FRO=30;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.00920495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.093;QD=3.45257;RBI=0.0174476;REFB=-0.00869527;REVB=0.0148219;RO=30;SAF=4;SAR=9;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156308;STB=0.595178;TYPE=snp;VARB=0.01106;OID=.;OPOS=1370675;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:43:43:30:30:13:13:9:4:13:17:9:4:13:17 chr19 1389064 . G T 76.75 PASS AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.00135621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.122;QD=9.59376;RBI=0.0143618;REFB=-0.0455776;REVB=0.0142976;RO=16;SAF=5;SAR=11;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229204;STB=0.630978;TYPE=snp;VARB=0.0367778;OID=.;OPOS=1389064;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:32:32:16:16:16:16:11:5:9:7:11:5:9:7 chr19 1389517 . C A 169.07 PASS AO=34;DP=84;FAO=35;FDP=84;FR=.,HEALED;FRO=40;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=-0.00793417;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=201.855;QD=8.05089;RBI=0.0142187;REFB=-0.0589393;REVB=0.0117991;RO=34;SAF=15;SAR=19;SRF=10;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136746;STB=0.515616;TYPE=snp;VARB=0.0312956;OID=.;OPOS=1389517;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:84:34:40:34:35:19:15:10:24:20:15:16:24 chr19 1460193 . C T 216.99 PASS AO=44;DP=81;FAO=44;FDP=80;FR=.;FRO=36;FSAF=34;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=10;FWDB=0.0390533;FXX=0.0123442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.592;QD=10.8495;RBI=0.0484723;REFB=-0.0058027;REVB=-0.0287124;RO=36;SAF=34;SAR=10;SRF=26;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0566037;STB=0.531235;TYPE=snp;VARB=0.00426103;OID=.;OPOS=1460193;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:80:36:36:44:44:10:34:26:10:10:34:26:10 chr19 1472435 . G C 11.66 PASS AO=10;DP=64;FAO=7;FDP=61;FR=.,HEALED;FRO=49;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=-0.188802;FXX=0.0161264;HRUN=3;LEN=1;MLLD=77.847;QD=0.764399;RBI=0.188868;REFB=-0.00543656;REVB=0.00499133;RO=34;SAF=1;SAR=9;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.506794;STB=0.806046;TYPE=snp;VARB=0.154679;OID=.;OPOS=1472435;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:62:61:34:49:10:7:9:1:15:19:6:1:22:27 chr19 1495634 . G A 258.29 PASS AO=47;DP=78;FAO=47;FDP=77;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=34;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.00670187;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.848;QD=13.4177;RBI=0.0133688;REFB=-0.0435007;REVB=0.0115676;RO=30;SAF=13;SAR=34;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155901;STB=0.585421;TYPE=snp;VARB=0.0167252;OID=.;OPOS=1495634;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:78:77:30:30:47:47:34:13:14:16:34:13:14:16 chr19 1497543 . A G 42.18 PASS AO=10;DP=28;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=18;FWDB=0.0411033;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.84;QD=5.81831;RBI=0.0568467;REFB=-0.0202052;REVB=-0.0392691;RO=17;SAF=1;SAR=9;SRF=0;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.437516;STB=0.736596;TYPE=snp;VARB=0.0597501;OID=.;OPOS=1497543;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:28:29:17:18:10:11:9:1:0:17:10:1:0:18 chr19 1535179 . G A 860.51 PASS AO=99;DP=105;FAO=99;FDP=105;FR=.;FRO=6;FSAF=34;FSAR=65;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.0183273;FXX=0.00943307;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.442;QD=32.7811;RBI=0.0472303;REFB=-0.101556;REVB=0.0435294;RO=5;SAF=34;SAR=65;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0256716;STB=0.509856;TYPE=snp;VARB=0.00269097;OID=.;OPOS=1535179;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:105:105:5:6:99:99:65:34:3:2:65:34:3:3 chr19 1609267 . A G 570.37 PASS AO=66;DP=73;FAO=68;FDP=74;FR=.;FRO=6;FSAF=28;FSAR=40;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.0163379;FXX=0.0133316;HRUN=5;LEN=1;MLLD=205.903;QD=30.8307;RBI=0.0227384;REFB=-0.0699646;REVB=0.0158149;RO=6;SAF=27;SAR=39;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0147134;STB=0.507363;TYPE=snp;VARB=0.00200293;OID=.;OPOS=1609267;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:73:74:6:6:66:68:39:27:3:3:40:28:3:3 chr19 1611709 . C T 173.32 PASS AO=32;DP=53;FAO=32;FDP=53;FR=.;FRO=21;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.0223185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.0705;QD=13.0809;RBI=0.0435817;REFB=0.00686694;REVB=-0.0374332;RO=21;SAF=15;SAR=17;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0738769;STB=0.540611;TYPE=snp;VARB=-0.00589746;OID=.;OPOS=1611709;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:53:53:21:21:32:32:17:15:12:9:17:15:12:9 chr19 1782798 . A G 132.71 PASS AO=37;DP=94;FAO=38;FDP=93;FR=.;FRO=55;FSAF=4;FSAR=34;FSRF=4;FSRR=51;FWDB=0.086033;FXX=0.0106372;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.5896;QD=5.70811;RBI=0.0863916;REFB=0.00164772;REVB=-0.00786328;RO=56;SAF=3;SAR=34;SRF=5;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0283016;STB=0.555529;TYPE=snp;VARB=-0.00131176;OID=.;OPOS=1782798;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:93:56:55:37:38:34:3:5:51:34:4:4:51 chr19 1783261 . C T 111.03 PASS AO=30;DP=72;FAO=30;FDP=72;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=27;FWDB=4.73833e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.6891;QD=6.16851;RBI=0.0363652;REFB=-0.0236164;REVB=0.0363652;RO=40;SAF=11;SAR=19;SRF=14;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0182122;STB=0.505996;TYPE=snp;VARB=0.0354395;OID=.;OPOS=1783261;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:40:42:30:30:19:11:14:26:19:11:15:27 chr19 1784890 . A G 88.84 PASS AO=23;DP=54;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=4;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=-0.159394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.007;QD=6.5808;RBI=0.160089;REFB=-0.0200359;REVB=-0.0149021;RO=31;SAF=4;SAR=19;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252197;STB=0.646115;TYPE=snp;VARB=0.0255033;OID=.;OPOS=1784890;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:54:54:31:31:23:23:19:4:11:20:19:4:11:20 chr19 1784944 . A G 64.67 PASS AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=17;FWDB=0.00429814;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.336;QD=6.80775;RBI=0.0259937;REFB=-0.0096996;REVB=-0.0256359;RO=20;SAF=2;SAR=14;SRF=3;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0523333;STB=0.612339;TYPE=snp;VARB=0.0148527;OID=.;OPOS=1784944;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:38:38:20:22:16:16:14:2:3:17:14:2:5:17 chr19 1787157 . A T 103.18 PASS AO=21;DP=40;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.0180182;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=170.694;QD=10.3179;RBI=0.0233475;REFB=-0.00754443;REVB=0.0148476;RO=19;SAF=6;SAR=15;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0819299;STB=0.546173;TYPE=snp;VARB=0.00679372;OID=.;OPOS=1787157;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:40:40:19:19:21:21:15:6:7:12:15:6:7:12 chr19 1787192 . CG C 24.59 PASS AO=15;DP=37;FAO=12;FDP=35;FR=.;FRO=23;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=-0.0195479;FXX=0.0277701;HRUN=5;LEN=1;MLLD=14.9776;QD=2.8098;RBI=0.0981036;REFB=-0.0405005;REVB=-0.0961364;RO=20;SAF=2;SAR=13;SRF=7;SRR=13;SSEN=0.338235;SSEP=0;SSSB=-0.32374;STB=0.791375;TYPE=del;VARB=0.066866;OID=.;OPOS=1787193;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:15:36:12:35:23:1:11:8:15:24:20:2:13:7:13 chr19 1789556 . C T 91.06 PASS AO=23;DP=53;FAO=23;FDP=53;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.0365879;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.1334;QD=6.87234;RBI=0.0430857;REFB=-0.00318052;REVB=-0.0227531;RO=30;SAF=11;SAR=12;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0546774;STB=0.53112;TYPE=snp;VARB=0.00738222;OID=.;OPOS=1789556;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:53:53:30:30:23:23:12:11:16:14:12:11:16:14 chr19 1796943 . C T 47.12 PASS AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.00276866;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=248.03;QD=8.56652;RBI=0.00278218;REFB=-0.0209273;REVB=-0.000273919;RO=11;SAF=5;SAR=5;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122307;STB=0.545364;TYPE=snp;VARB=0.0213587;OID=.;OPOS=1796943;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:22:22:11:12:10:10:5:5:7:4:5:5:7:5 chr19 1808275 . G A 114.76 PASS AO=34;DP=88;FAO=34;FDP=87;FR=.;FRO=53;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=-0.0146705;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.0886;QD=5.27608;RBI=0.0406495;REFB=-0.022059;REVB=0.0379099;RO=52;SAF=20;SAR=14;SRF=26;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0947806;STB=0.560074;TYPE=snp;VARB=0.0427657;OID=.;OPOS=1808275;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:87:52:53:34:34:14:20:26:26:14:20:26:27 chr19 1810605 . T C 195.7 PASS AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0706289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.161;QD=39.1407;RBI=0.0717936;REFB=0;REVB=0.0128794;RO=0;SAF=5;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000272102;OID=.;OPOS=1810605;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:20:20:0:0:20:20:15:5:0:0:15:5:0:0 chr19 1811547 . A G 320.16 PASS AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217133;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.935;QD=37.6659;RBI=0.0419354;REFB=0;REVB=0.0358763;RO=0;SAF=13;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.82173e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00151463;OID=.;OPOS=1811547;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:33:34:0:0:33:34:20:13:0:0:21:13:0:0 chr19 1821637 . A G 73.83 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0622226;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.096;QD=36.9154;RBI=0.0740765;REFB=0;REVB=0.0401955;RO=0;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.58669e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000783846;OID=.;OPOS=1821637;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:6:2:0:0:6:2:0:0 chr19 1880950 . T C 220.87 PASS AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00102178;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.188;QD=36.8111;RBI=0.0386859;REFB=0;REVB=0.0386724;RO=0;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000491698;OID=.;OPOS=1880950;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:24:24:0:0:24:24:11:13:0:0:11:13:0:0 chr19 1923155 . C T 83.29 PASS AO=19;DP=49;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.0257335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.571;QD=6.28641;RBI=0.0267963;REFB=-0.0192255;REVB=0.0074719;RO=27;SAF=6;SAR=13;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102876;STB=0.553907;TYPE=snp;VARB=0.0263546;OID=.;OPOS=1923155;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:49:53:27:31:19:22:13:6:11:16:14:8:14:17 chr19 1925942 . C T 145.29 PASS AO=17;DP=19;FAO=17;FDP=19;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0550589;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=193.165;QD=30.5872;RBI=0.0647668;REFB=-0.187382;REVB=0.0341065;RO=2;SAF=6;SAR=11;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0762947;STB=0.541619;TYPE=snp;VARB=0.00302625;OID=.;OPOS=1925942;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:19:19:2:2:17:17:11:6:0:2:11:6:0:2 chr19 2099250 . G A 351.11 PASS AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.01757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.5423;QD=37.9581;RBI=0.0871847;REFB=0;REVB=0.0853959;RO=0;SAF=18;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.68991e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000933154;OID=.;OPOS=2099250;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:37:37:0:0:37:37:19:18:0:0:19:18:0:0 chr19 2138654 . T G 175.37 PASS AO=33;DP=57;FAO=33;FDP=56;FR=.;FRO=23;FSAF=29;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=0.0153182;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.7435;QD=12.5264;RBI=0.0382902;REFB=0.00286608;REVB=-0.0350926;RO=23;SAF=29;SAR=4;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249036;STB=0.63918;TYPE=snp;VARB=-0.00310075;OID=.;OPOS=2138654;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:57:56:23:23:33:33:4:29:16:7:4:29:16:7 chr19 2249477 . G T 479.54 PASS AO=52;DP=53;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00375724;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.831;QD=35.5217;RBI=0.0276668;REFB=-0.0730193;REVB=0.0274104;RO=0;SAF=28;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5102;TYPE=snp;VARB=6.14545e-05;OID=.;OPOS=2249477;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:53:54:0:1:52:53:24:28:0:0:24:29:0:1 chr19 2251817 . T C 116.19 PASS AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.5254;QD=35.7493;RBI=0.00311948;REFB=0;REVB=-0.00311948;RO=0;SAF=0;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000156844;OID=.;OPOS=2251817;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:13:0:0:13:13:13:0:0:0:13:0:0:0 chr19 2255311 . C G 73.45 PASS AO=15;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=0.0359175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.6331;QD=9.79362;RBI=0.0460918;REFB=-0.0381437;REVB=0.0288858;RO=15;SAF=4;SAR=11;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0781246;STB=0.544322;TYPE=snp;VARB=0.0712422;OID=.;OPOS=2255311;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:30:30:15:15:15:15:11:4:3:12:11:4:3:12 chr19 2278755 . C T 15.78 PASS AO=3;DP=7;FAO=3;FDP=7;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.545;QD=9.01664;RBI=0.0446593;REFB=-0.00923199;REVB=-0.0446593;RO=4;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0165603;OID=.;OPOS=2278755;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:7:7:4:4:3:3:3:0:0:4:3:0:0:4 chr19 2339856 . C T 85.85 PASS AO=19;DP=40;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.0297286;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=130.761;QD=8.58502;RBI=0.0303199;REFB=-0.039773;REVB=0.00595833;RO=21;SAF=5;SAR=14;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.221404;STB=0.626724;TYPE=snp;VARB=0.0315873;OID=.;OPOS=2339856;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:40:40:21:21:19:19:14:5:10:11:14:5:10:11 chr19 2339949 . T C 210.65 PASS AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00463721;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=116.131;QD=36.6353;RBI=0.0440169;REFB=0;REVB=-0.0437719;RO=0;SAF=5;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000651438;OID=.;OPOS=2339949;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:0:0:23:23:18:5:0:0:18:5:0:0 chr19 2339958 . T C 136.32 PASS AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0328222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.256;QD=36.3521;RBI=0.0403613;REFB=0;REVB=0.0234891;RO=0;SAF=4;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33019e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000841577;OID=.;OPOS=2339958;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:15:0:0:15:15:11:4:0:0:11:4:0:0 chr19 2341047 . C T 107.78 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00142427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.2612;QD=35.9273;RBI=0.00159771;REFB=0;REVB=-0.000723976;RO=0;SAF=10;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000113918;OID=.;OPOS=2341047;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:2:10:0:0:2:10:0:0 chr19 2341060 . T C 136.3 PASS AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00760434;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.28;QD=36.347;RBI=0.0479559;REFB=0;REVB=0.0473491;RO=0;SAF=11;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33019e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000518733;OID=.;OPOS=2341060;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:15:0:0:15:15:4:11:0:0:4:11:0:0 chr19 2341192 . TG T 66.32 PASS AO=34;DP=87;FAO=35;FDP=84;FR=.;FRO=49;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=27;FSRR=22;FWDB=-0.0629794;FXX=0.0232531;HRUN=4;LEN=1;MLLD=11.7367;QD=3.15818;RBI=0.0667982;REFB=-0.0277305;REVB=0.0222622;RO=39;SAF=14;SAR=20;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145479;STB=0.538022;TYPE=del;VARB=0.0471145;OID=.;OPOS=2341193;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:34:83:35:84:49:17:18:27:22:66:39:14:20:22:17 chr19 2341365 . C T 205.45 PASS AO=46;DP=92;FAO=46;FDP=91;FR=.;FRO=45;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=0.00552271;FXX=0.0108684;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.473;QD=9.03058;RBI=0.0332426;REFB=-0.0364214;REVB=0.0327806;RO=44;SAF=23;SAR=23;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0401727;STB=0.527461;TYPE=snp;VARB=0.0359886;OID=.;OPOS=2341365;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:91:44:45:46:46:23:23:20:24:23:23:20:25 chr19 2341405 . G A 153.3 PASS AO=40;DP=94;FAO=41;FDP=95;FR=.;FRO=54;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=20;FSRR=34;FWDB=-0.00441693;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.562;QD=6.45482;RBI=0.019239;REFB=-0.0154744;REVB=0.0187251;RO=53;SAF=18;SAR=22;SRF=20;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0750329;STB=0.539981;TYPE=snp;VARB=0.0214181;OID=.;OPOS=2341405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:95:53:54:40:41:22:18:20:33:23:18:20:34 chr19 2389872 . G C 117.48 PASS AO=26;DP=55;FAO=27;FDP=56;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.0149771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.368;QD=8.39124;RBI=0.0179099;REFB=-0.00617749;REVB=0.00982091;RO=29;SAF=8;SAR=18;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176678;STB=0.605715;TYPE=snp;VARB=0.00607915;OID=.;OPOS=2389872;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:56:29:29:26:27:18:8:14:15:19:8:14:15 chr19 2398849 . A G 723.98 PASS AO=172;DP=346;FAO=172;FDP=345;FR=.;FRO=173;FSAF=52;FSAR=120;FSRF=70;FSRR=103;FWDB=0.0215663;FXX=0.00576352;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.734;QD=8.39391;RBI=0.0223565;REFB=-0.00476332;REVB=0.00589157;RO=171;SAF=52;SAR=120;SRF=70;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109639;STB=0.558005;TYPE=snp;VARB=0.00363565;OID=.;OPOS=2398849;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:346:345:171:173:172:172:120:52:70:101:120:52:70:103 chr19 2410332 . T C 147.04 PASS AO=30;DP=55;FAO=30;FDP=55;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.0343311;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.6187;QD=10.6934;RBI=0.0495105;REFB=0.00184427;REVB=-0.0356744;RO=25;SAF=12;SAR=18;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0338478;STB=0.518784;TYPE=snp;VARB=-0.00330009;OID=.;OPOS=2410332;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:25:25:30:30:18:12:11:14:18:12:11:14 chr19 2413911 . G A 48.03 PASS AO=16;DP=49;FAO=16;FDP=49;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=-0.0133659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.396;QD=3.92119;RBI=0.0140421;REFB=0.00227192;REVB=-0.00430491;RO=31;SAF=7;SAR=9;SRF=22;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.298587;STB=0.650695;TYPE=snp;VARB=-0.00690213;OID=.;OPOS=2413911;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:49:49:31:33:16:16:9:7:22:9:9:7:22:11 chr19 2413961 . G C 43.59 PASS AO=17;DP=57;FAO=17;FDP=58;FR=.;FRO=41;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=0.00665699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4237;QD=3.0064;RBI=0.0538166;REFB=-0.0102169;REVB=-0.0534033;RO=40;SAF=5;SAR=12;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252157;STB=0.660821;TYPE=snp;VARB=0.0324073;OID=.;OPOS=2413961;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:57:58:40:41:17:17:12:5:20:20:12:5:21:20 chr19 2416796 . A G 92.92 PASS AO=19;DP=36;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=17;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=-0.0409792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.33;QD=10.3239;RBI=0.0510778;REFB=0.022958;REVB=-0.0304901;RO=16;SAF=2;SAR=17;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.239612;STB=0.629469;TYPE=snp;VARB=-0.0177518;OID=.;OPOS=2416796;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:36:36:16:17:19:19:17:2:4:12:17:2:4:13 chr19 2428253 . A G 198.7 PASS AO=36;DP=65;FAO=38;FDP=66;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=31;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=0.0255357;FXX=0.0294074;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.066;QD=12.0421;RBI=0.0368848;REFB=0.0305541;REVB=-0.0266161;RO=27;SAF=7;SAR=29;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222272;STB=0.641529;TYPE=snp;VARB=-0.0108944;OID=.;OPOS=2428253;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:66:27:28:36:38:29:7:11:16:31:7:12:16 chr19 2433890 . A G 18.1 PASS AO=10;DP=48;FAO=10;FDP=48;FR=.;FRO=38;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=33;FWDB=-0.0345605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.368;QD=1.50858;RBI=0.0695932;REFB=-0.00499812;REVB=-0.0604051;RO=37;SAF=3;SAR=7;SRF=5;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.287833;STB=0.681542;TYPE=snp;VARB=0.034291;OID=.;OPOS=2433890;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:48:48:37:38:10:10:7:3:5:32:7:3:5:33 chr19 2512038 . A G 69.95 PASS AO=22;DP=65;FAO=23;FDP=66;FR=.;FRO=43;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=-0.0185973;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2241;QD=4.23917;RBI=0.0602394;REFB=0.01426;REVB=-0.0572968;RO=43;SAF=7;SAR=15;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176027;STB=0.612664;TYPE=snp;VARB=-0.0231194;OID=.;OPOS=2512038;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:65:66:43:43:22:23:15:7:20:23:16:7:20:23 chr19 2714614 . G T 208.45 PASS AO=37;DP=60;FAO=37;FDP=60;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=30;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.0272429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.239;QD=13.8968;RBI=0.0273451;REFB=-0.0444856;REVB=0.00236175;RO=22;SAF=7;SAR=30;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207598;STB=0.628776;TYPE=snp;VARB=0.0355683;OID=.;OPOS=2714614;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:60:60:22:23:37:37:30:7:9:13:30:7:10:13 chr19 2714771 . T C 235.86 PASS AO=21;DP=21;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0353823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.5598;QD=36.2855;RBI=0.0356069;REFB=0;REVB=-0.00399301;RO=0;SAF=6;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00333781;OID=.;OPOS=2714771;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:21:26:0:0:21:26:15:6:0:0:20:6:0:0 chr19 2834808 . T C 86.13 PASS AO=22;DP=53;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=2;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=29;FWDB=-0.0811343;FXX=0.0370302;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.0695;QD=6.62552;RBI=0.0820933;REFB=0.0103991;REVB=-0.0125115;RO=28;SAF=2;SAR=20;SRF=1;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198463;STB=0.620166;TYPE=snp;VARB=-0.0144041;OID=.;OPOS=2834808;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:53:52:28:30:22:22:20:2:1:27:20:2:1:29 chr19 2853566 . A G 160.94 PASS AO=40;DP=87;FAO=40;FDP=87;FR=.;FRO=47;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=30;FWDB=0.022897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.2942;QD=7.39929;RBI=0.0859099;REFB=0.0057238;REVB=-0.0828024;RO=47;SAF=23;SAR=17;SRF=17;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203874;STB=0.6138;TYPE=snp;VARB=-0.00487982;OID=.;OPOS=2853566;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:47:47:40:40:17:23:17:30:17:23:17:30 chr19 2877365 . C T 343.45 PASS AO=85;DP=180;FAO=85;FDP=180;FR=.;FRO=95;FSAF=36;FSAR=49;FSRF=44;FSRR=51;FWDB=-0.00344099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.596;QD=7.63226;RBI=0.00845676;REFB=-0.0210753;REVB=-0.00772505;RO=95;SAF=36;SAR=49;SRF=44;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0384615;STB=0.521272;TYPE=snp;VARB=0.0217539;OID=.;OPOS=2877365;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:180:95:95:85:85:49:36:44:51:49:36:44:51 chr19 2896818 . C T 2144.01 PASS AO=223;DP=224;FAO=224;FDP=224;FR=.;FRO=0;FSAF=136;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00965717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.8312;QD=38.286;RBI=0.0277899;REFB=0;REVB=0.026058;RO=0;SAF=136;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5816e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.93218e-05;OID=.;OPOS=2896818;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:224:224:0:0:223:224:87:136:0:0:88:136:0:0 chr19 2896948 . T C 3706.82 PASS AO=420;DP=428;FAO=392;FDP=392;FR=.;FRO=0;FSAF=164;FSAR=228;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0638812;FXX=0.0199995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.57;QD=37.8246;RBI=0.0677823;REFB=-0.0489337;REVB=0.0226634;RO=3;SAF=178;SAR=242;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00797535;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000403703;OID=.;OPOS=2896948;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:428:392:3:0:420:392:242:178:3:0:228:164:0:0 chr19 2896953 . A G 3837.1 PASS AO=414;DP=414;FAO=398;FDP=398;FR=.;FRO=0;FSAF=173;FSAR=225;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182227;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.796;QD=38.5638;RBI=0.0215524;REFB=0;REVB=-0.0115081;RO=0;SAF=177;SAR=237;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.2846e-05;OID=.;OPOS=2896953;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:414:398:0:0:414:398:237:177:0:0:225:173:0:0 chr19 2915738 . T A 2660.6 PASS AO=277;DP=277;FAO=277;FDP=277;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=202;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0340195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.6306;QD=38.4202;RBI=0.0442185;REFB=0;REVB=0.028248;RO=0;SAF=75;SAR=202;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.60545e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.73554e-05;OID=.;OPOS=2915738;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:277:277:0:0:277:277:202:75:0:0:202:75:0:0 chr19 2917186 . T C 1869.49 PASS AO=194;DP=195;FAO=195;FDP=195;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00332633;FXX=0.00510178;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.579;QD=38.3486;RBI=0.010504;REFB=0;REVB=-0.00996337;RO=0;SAF=93;SAR=101;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.76489e-05;OID=.;OPOS=2917186;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:195:195:0:0:194:195:101:93:0:0:101:94:0:0 chr19 2917287 . C A 1512.01 PASS AO=142;DP=144;FAO=167;FDP=167;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0503544;FXX=0.0118336;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.5827;QD=36.2157;RBI=0.073599;REFB=0.0136956;REVB=0.0536773;RO=2;SAF=51;SAR=91;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00403506;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00554975;OID=.;OPOS=2917287;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:144:167:2:0:142:167:91:51:1:1:103:64:0:0 chr19 2917612 . T C 1542.02 PASS AO=147;DP=155;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=106;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00827665;FXX=0.00613459;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.982;QD=38.0745;RBI=0.0486513;REFB=0;REVB=0.0479421;RO=0;SAF=98;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00010466;OID=.;OPOS=2917612;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:155:162:0:0:147:162:49:98:0:0:56:106:0:0 chr19 2934282 . T C 425.29 PASS AO=101;DP=208;FAO=102;FDP=209;FR=.;FRO=107;FSAF=46;FSAR=56;FSRF=58;FSRR=49;FWDB=-0.0169151;FXX=0.00476168;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.649;QD=8.1395;RBI=0.03547;REFB=-0.0157128;REVB=0.031177;RO=107;SAF=46;SAR=55;SRF=58;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0808816;STB=0.54664;TYPE=snp;VARB=0.013253;OID=.;OPOS=2934282;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:209:107:107:101:102:55:46:58:49:56:46:58:49 chr19 2936623 . C T 361.13 PASS AO=78;DP=149;FAO=79;FDP=150;FR=.;FRO=71;FSAF=30;FSAR=49;FSRF=24;FSRR=47;FWDB=0.00685735;FXX=0.00662208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.88;QD=9.63015;RBI=0.0069175;REFB=-0.0173391;REVB=-0.000910246;RO=71;SAF=29;SAR=49;SRF=24;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0316987;STB=0.521167;TYPE=snp;VARB=0.0154895;OID=.;OPOS=2936623;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:150:71:71:78:79:49:29:24:47:49:30:24:47 chr19 2994903 . T C 234.09 PASS AO=65;DP=161;FAO=69;FDP=164;FR=.;FRO=95;FSAF=31;FSAR=38;FSRF=28;FSRR=67;FWDB=0.00903111;FXX=0.0120475;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.03;QD=5.70957;RBI=0.00915639;REFB=-0.0193246;REVB=0.00150946;RO=89;SAF=28;SAR=37;SRF=26;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150013;STB=0.592116;TYPE=snp;VARB=0.0271879;OID=.;OPOS=2994903;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:164:89:95:65:69:37:28:26:63:38:31:28:67 chr19 2994921 . G A 227.43 PASS AO=74;DP=194;FAO=74;FDP=194;FR=.;FRO=120;FSAF=27;FSAR=47;FSRF=33;FSRR=87;FWDB=-0.0483008;FXX=0.00512794;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.557;QD=4.68922;RBI=0.0577518;REFB=-0.0236983;REVB=0.0316591;RO=119;SAF=27;SAR=47;SRF=32;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11774;STB=0.56196;TYPE=snp;VARB=0.0416738;OID=.;OPOS=2994921;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:194:119:120:74:74:47:27:32:87:47:27:33:87 chr19 2997897 . G A 111.47 PASS AO=35;DP=97;FAO=36;FDP=98;FR=.;FRO=62;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=27;FSRR=35;FWDB=0.0159724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.534;QD=4.54986;RBI=0.0242869;REFB=-0.0128566;REVB=0.0182959;RO=62;SAF=20;SAR=15;SRF=27;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150668;STB=0.593169;TYPE=snp;VARB=0.0210045;OID=.;OPOS=2997897;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:98:62:62:35:36:15:20:27:35:15:21:27:35 chr19 3014639 . A G 64.17 PASS AO=20;DP=51;FAO=18;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=20;FWDB=-0.00877321;FXX=0.0425441;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.345;QD=5.70383;RBI=0.0502237;REFB=0.00197432;REVB=0.0494515;RO=29;SAF=10;SAR=10;SRF=7;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.269228;STB=0.672901;TYPE=snp;VARB=-0.00140697;OID=.;OPOS=3014639;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:51:45:29:27:20:18:10:10:7:22:8:10:7:20 chr19 3028871 . G C 69.39 PASS AO=13;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=0.00499937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.677;QD=10.2803;RBI=0.0295589;REFB=0.00298922;REVB=-0.029133;RO=13;SAF=6;SAR=7;SRF=2;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.2801;STB=0.666455;TYPE=snp;VARB=-0.00346296;OID=.;OPOS=3028871;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:27:27:13:13:13:14:7:6:2:11:7:7:2:11 chr19 3062857 . T C 101.99 PASS AO=32;DP=87;FAO=32;FDP=86;FR=.;FRO=54;FSAF=6;FSAR=26;FSRF=31;FSRR=23;FWDB=0.00411202;FXX=0.0114929;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.71;QD=4.74373;RBI=0.0339332;REFB=-0.0235112;REVB=0.0336831;RO=54;SAF=6;SAR=26;SRF=31;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.459125;STB=0.765745;TYPE=snp;VARB=0.0287214;OID=.;OPOS=3062857;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:86:54:54:32:32:26:6:31:23:26:6:31:23 chr19 3119239 . C T 304.18 PASS AO=35;DP=39;FAO=36;FDP=39;FR=.;FRO=3;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0580413;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.124;QD=31.1975;RBI=0.0605505;REFB=-0.223954;REVB=0.0172503;RO=4;SAF=13;SAR=22;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0777959;STB=0.530596;TYPE=snp;VARB=0.00259535;OID=.;OPOS=3119239;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:39:39:4:3:35:36:22:13:0:4:23:13:0:3 chr19 3150238 . A G 288.24 PASS AO=29;DP=29;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.053697;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.324;QD=37.1925;RBI=0.0574462;REFB=0;REVB=-0.0204132;RO=0;SAF=2;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.75607e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000219329;OID=.;OPOS=3150238;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:29:31:0:0:29:31:27:2:0:0:29:2:0:0 chr19 3155902 . G A 230.84 PASS AO=55;DP=119;FAO=59;FDP=123;FR=.;FRO=64;FSAF=22;FSAR=37;FSRF=29;FSRR=35;FWDB=-0.043165;FXX=0.053842;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.932;QD=7.50712;RBI=0.0443253;REFB=-0.0211161;REVB=-0.0100757;RO=62;SAF=18;SAR=37;SRF=27;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111797;STB=0.543632;TYPE=snp;VARB=0.0356408;OID=.;OPOS=3155902;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:123:62:64:55:59:37:18:27:35:37:22:29:35 chr19 3179525 . G A 10.48 PASS AO=2;DP=6;FAO=2;FDP=6;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.128395;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.5654;QD=6.98652;RBI=0.128395;REFB=-0.0585764;REVB=0;RO=4;SAF=2;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.114842;OID=.;OPOS=3179525;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:4:4:2:2:0:2:4:0:0:2:4:0 chr19 3207422 . T C 22.51 PASS AO=5;DP=14;FAO=5;FDP=14;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.0629138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.245;QD=6.43097;RBI=0.0676214;REFB=-0.00380968;REVB=0.0247892;RO=9;SAF=1;SAR=4;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.386659;STB=0.748928;TYPE=snp;VARB=0.0131827;OID=.;OPOS=3207422;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:14:14:9:9:5:5:4:1:5:4:4:1:5:4 chr19 3208990 . GC G 74.8 PASS AO=27;DP=43;FAO=27;FDP=43;FR=.;FRO=16;FSAF=0;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=16;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=32.0102;QD=6.95811;RBI=0.0207335;REFB=-0.0924423;REVB=0.0207335;RO=11;SAF=0;SAR=27;SRF=0;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.229728;OID=.;OPOS=3208991;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:27:41:27:43:16:0:27:0:16:47:11:0:27:0:11 chr19 3543397 . C T 53.81 PASS AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0239697;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=189.846;QD=23.916;RBI=0.0244357;REFB=-0.0422976;REVB=-0.00474944;RO=2;SAF=1;SAR=6;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223089;STB=0.631145;TYPE=snp;VARB=0.00900817;OID=.;OPOS=3543397;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:2:2:7:7:6:1:1:1:6:1:1:1 chr19 3591590 . T C 41.73 PASS AO=12;DP=34;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=18;FWDB=-0.0622731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.623;QD=4.90954;RBI=0.0623967;REFB=0.00393524;REVB=-0.00392498;RO=22;SAF=2;SAR=10;SRF=4;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0287716;STB=0.517212;TYPE=snp;VARB=-0.0070438;OID=.;OPOS=3591590;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:34:34:22:22:12:12:10:2:4:18:10:2:4:18 chr19 3592171 . T C 133.43 PASS AO=27;DP=53;FAO=29;FDP=57;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=7;FWDB=0.0196129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.124;QD=9.36336;RBI=0.026492;REFB=-0.032375;REVB=-0.017809;RO=26;SAF=12;SAR=15;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24767;STB=0.64522;TYPE=snp;VARB=0.0314936;OID=.;OPOS=3592171;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:57:26:28:27:29:15:12:19:7:16:13:21:7 chr19 3592730 . C T 55.94 PASS AO=18;DP=53;FAO=18;FDP=53;FR=.;FRO=35;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=29;FWDB=0.0614004;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.724;QD=4.22224;RBI=0.0615917;REFB=-0.00474652;REVB=0.0048501;RO=34;SAF=4;SAR=14;SRF=6;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0779766;STB=0.551229;TYPE=snp;VARB=0.00573563;OID=.;OPOS=3592730;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:53:53:34:35:18:18:14:4:6:28:14:4:6:29 chr19 3592731 . C T 70.71 PASS AO=20;DP=52;FAO=20;FDP=52;FR=.;FRO=32;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=6;FSRR=26;FWDB=0.0176364;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.403;QD=5.43893;RBI=0.0179348;REFB=-0.0075476;REVB=-0.00325773;RO=32;SAF=4;SAR=16;SRF=6;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0211036;STB=0.512183;TYPE=snp;VARB=0.0058746;OID=.;OPOS=3592731;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:52:52:32:32:20:20:16:4:6:26:16:4:6:26 chr19 3611765 . A G 20.98 PASS AO=3;DP=14;FAO=5;FDP=15;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0126041;FXX=0.062461;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.877;QD=5.59532;RBI=0.0309055;REFB=-0.0061917;REVB=0.0282185;RO=11;SAF=1;SAR=2;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0774686;STB=0.59219;TYPE=snp;VARB=0.022725;OID=.;OPOS=3611765;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:14:15:11:10:3:5:2:1:3:8:4:1:3:7 chr19 3611972 . G A 226.7 PASS AO=52;DP=104;FAO=52;FDP=104;FR=.;FRO=52;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=27;FSRR=25;FWDB=0.030704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.598;QD=8.71931;RBI=0.0307513;REFB=-0.0049466;REVB=0.00170439;RO=52;SAF=30;SAR=22;SRF=27;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0528922;STB=0.529268;TYPE=snp;VARB=0.003929;OID=.;OPOS=3611972;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:52:52:52:52:22:30:27:25:22:30:27:25 chr19 3614403 . T C 183.13 PASS AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0363645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.367;QD=38.5543;RBI=0.0364164;REFB=0;REVB=-0.00194342;RO=0;SAF=7;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00026026;OID=.;OPOS=3614403;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:19:19:0:0:19:19:12:7:0:0:12:7:0:0 chr19 3644173 . G A 104.01 PASS AO=16;DP=28;FAO=18;FDP=30;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.0360375;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0797;QD=13.8685;RBI=0.118167;REFB=-0.033116;REVB=0.112537;RO=12;SAF=7;SAR=9;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0815107;STB=0.523596;TYPE=snp;VARB=0.0283411;OID=.;OPOS=3644173;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:28:30:12:12:16:18:9:7:4:8:11:7:4:8 chr19 3653525 . C T 137.98 PASS AO=35;DP=80;FAO=35;FDP=79;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=27;FWDB=0.0167855;FXX=0.0124984;HRUN=6;LEN=1;MLLD=222.201;QD=6.98623;RBI=0.0189774;REFB=-0.00576359;REVB=0.00885374;RO=42;SAF=16;SAR=19;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0990204;STB=0.539963;TYPE=snp;VARB=0.00911431;OID=.;OPOS=3653525;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:79:42:44:35:35:19:16:15:27:19:16:17:27 chr19 3730041 . C T 457.06 PASS AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.035422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.4699;QD=35.8481;RBI=0.0417144;REFB=-0.0916997;REVB=0.0220313;RO=1;SAF=24;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177622;STB=0.50943;TYPE=snp;VARB=0.0010594;OID=.;OPOS=3730041;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:51:51:1:1:50:50:26:24:0:1:26:24:0:1 chr19 3738649 . A C 459.52 PASS AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0410254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.6653;QD=38.2934;RBI=0.0532821;REFB=0;REVB=-0.0339985;RO=0;SAF=25;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00111373;OID=.;OPOS=3738649;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:48:48:0:0:48:48:23:25:0:0:23:25:0:0 chr19 3738971 . A G 480.43 PASS AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.030724;FXX=0.0377287;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.71;QD=37.6808;RBI=0.0312823;REFB=0;REVB=0.00588342;RO=0;SAF=20;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.13361e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.33361e-05;OID=.;OPOS=3738971;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:52:51:0:0:51:51:31:20:0:0:31:20:0:0 chr19 3746087 . G A 1197.92 PASS AO=128;DP=131;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0319001;FXX=0.0225547;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.852;QD=36.8592;RBI=0.0319751;REFB=-0.0953906;REVB=0.00218967;RO=2;SAF=57;SAR=71;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0131968;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.12603e-05;OID=.;OPOS=3746087;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:131:130:2:0:128:130:71:57:0:2:72:58:0:0 chr19 3750205 . T TGG,TGGG 533.58 PASS AO=52,17;DP=90;FAO=82,0;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=19,0;FSAR=63,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0821409,0.0580794;FXX=0.03529;HRUN=4,4;LEN=2,3;MLLD=17.2746,11.1014;QD=26.0284;RBI=0.152652,0.105569;REFB=0,0;REVB=-0.128668,-0.0881571;RO=10;SAF=12,1;SAR=40,16;SRF=6;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.143229,-0.60226;STB=0.5,0.5;TYPE=ins,ins;VARB=0.00191489,0;OID=.,.;OPOS=3750206,3750206;OREF=-,-;OALT=GG,GGG;OMAPALT=TGG,TGGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:52,17:90:82,0:82:0:19,0:63,0:0:0:47:10:12,1:40,16:6:4 chr19 3750615 . T C 865.21 PASS AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.537;QD=38.0311;RBI=0.0217114;REFB=0;REVB=-0.000947162;RO=0;SAF=24;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.97226e-06;OID=.;OPOS=3750615;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:91:91:0:0:91:91:67:24:0:0:67:24:0:0 chr19 3750622 . A C 846.9 PASS AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0265992;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.9233;QD=38.0628;RBI=0.0379893;REFB=0;REVB=-0.0271232;RO=0;SAF=24;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34512e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00166512;OID=.;OPOS=3750622;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:89:89:0:0:89:89:65:24:0:0:65:24:0:0 chr19 3752874 . A G 172.99 PASS AO=17;DP=17;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0200535;FXX=0.0526039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.253;QD=38.442;RBI=0.0685574;REFB=0;REVB=0.0655589;RO=0;SAF=12;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000730015;OID=.;OPOS=3752874;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:17:18:0:0:17:18:5:12:0:0:7:11:0:0 chr19 3753769 . C T 664.5 PASS AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0587511;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.769;QD=38.5219;RBI=0.0594843;REFB=0;REVB=0.00931089;RO=0;SAF=42;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.56939e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000211438;OID=.;OPOS=3753769;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:69:69:0:0:69:69:27:42:0:0:27:42:0:0 chr19 3753874 . G A 368.15 PASS AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.018003;FXX=0.0487686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.7;QD=37.7585;RBI=0.0918985;REFB=0;REVB=0.0901179;RO=0;SAF=30;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.68708e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000190526;OID=.;OPOS=3753874;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:40:39:0:0:39:39:9:30:0:0:9:30:0:0 chr19 3760125 . G A 220.97 PASS AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0825859;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.94;QD=33.9955;RBI=0.0825859;REFB=-0.0555128;REVB=0;RO=1;SAF=25;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00735245;OID=.;OPOS=3760125;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:26:26:1:1:25:25:0:25:1:0:0:25:1:0 chr19 3762698 . C T 681.14 PASS AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0605728;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.061;QD=37.8409;RBI=0.0605804;REFB=0;REVB=-0.000957303;RO=0;SAF=46;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000305233;OID=.;OPOS=3762698;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:73:72:0:0:72:72:26:46:0:0:26:46:0:0 chr19 3767265 . C T 267.05 PASS AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.102171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.239;QD=38.1504;RBI=0.116871;REFB=0;REVB=0.0567446;RO=0;SAF=14;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00105883;OID=.;OPOS=3767265;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:28:28:0:0:28:28:14:14:0:0:14:14:0:0 chr19 3820191 . C T 79.92 PASS AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104124;FXX=0.110988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.852;QD=39.9604;RBI=0.0488307;REFB=0;REVB=0.0477077;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00366606;OID=.;OPOS=3820191;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:8:0:0:8:8:5:3:0:0:5:3:0:0 chr19 3831525 . C A 286.32 PASS AO=27;DP=28;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0805527;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.0411;QD=38.1753;RBI=0.101727;REFB=0;REVB=0.0621253;RO=1;SAF=21;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0216358;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00417156;OID=.;OPOS=3831525;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:28:30:1:0:27:30:6:21:1:0:6:24:0:0 chr19 3831765 . G A 684.22 PASS AO=74;DP=76;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00710971;FXX=0.0263123;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.954;QD=36.9848;RBI=0.023656;REFB=0;REVB=0.0225624;RO=0;SAF=36;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.79579e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000125731;OID=.;OPOS=3831765;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:76:74:0:0:74:74:38:36:0:0:38:36:0:0 chr19 3920750 . T C 345.86 PASS AO=102;DP=250;FAO=103;FDP=250;FR=.;FRO=147;FSAF=7;FSAR=96;FSRF=10;FSRR=137;FWDB=0.0276319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.316;QD=5.53372;RBI=0.0281539;REFB=0.00577272;REVB=0.00539644;RO=145;SAF=7;SAR=95;SRF=9;SRR=136;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0277337;STB=0.500153;TYPE=snp;VARB=-0.0076709;OID=.;OPOS=3920750;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:250:250:145:147:102:103:95:7:9:136:96:7:10:137 chr19 3961465 . AGG AG,A 73.57 PASS AO=10,8;DP=33;FAO=10,8;FDP=29;FR=.;FRO=11;FSAF=1,0;FSAR=9,8;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=-0.134992,-0.0784112;FXX=0.19439;HRUN=4,4;LEN=1,2;MLLD=19.0795,24.8668;QD=10.148;RBI=0.143271,0.0832982;REFB=-0.0581219,-0.0329223;REVB=-0.0479956,-0.0281117;RO=9;SAF=1,0;SAR=9,8;SRF=7;SRR=2;SSEN=0.534591,0.534591;SSEP=0,0;SSSB=-0.622527,-0.817364;STB=0.870147,0.998552;TYPE=del,del;VARB=-0.0300122,0.0329863;OID=.,.;OPOS=3961466,3961466;OREF=G,GG;OALT=-,-;OMAPALT=AG,A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:10,8:34:10,8:29:11:1,0:9,8:8:3:30:9:1,0:9,8:7:2 chr19 3977486 . A G 35.27 PASS AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.00659991;FXX=0.062461;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.541;QD=9.40497;RBI=0.0266848;REFB=-0.0199392;REVB=0.0258558;RO=7;SAF=4;SAR=3;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235769;STB=0.666221;TYPE=snp;VARB=0.0336105;OID=.;OPOS=3977486;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:16:15:7:8:7:7:3:4:2:5:3:4:2:6 chr19 3979408 . A G 71.25 PASS AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0709384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.131;QD=8.38237;RBI=0.0710458;REFB=-0.0388684;REVB=0.00390503;RO=18;SAF=6;SAR=10;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0670294;STB=0.538413;TYPE=snp;VARB=0.0363908;OID=.;OPOS=3979408;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:34:34:18:18:16:16:10:6:8:10:10:6:8:10 chr19 4028212 . A C 10.22 PASS AO=2;DP=9;FAO=2;FDP=9;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.395;QD=4.5417;RBI=0.0203171;REFB=-0.0299774;REVB=0.0203171;RO=7;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0229637;OID=.;OPOS=4028212;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:7:7:2:2:2:0:0:7:2:0:0:7 chr19 4028783 . C T 41.31 PASS AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=0.064287;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=92.8312;QD=7.86928;RBI=0.0650384;REFB=-0.0140271;REVB=-0.00985721;RO=12;SAF=2;SAR=7;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0820699;STB=0.548286;TYPE=snp;VARB=0.0153969;OID=.;OPOS=4028783;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:21:21:12:12:9:9:7:2:2:10:7:2:2:10 chr19 4033462 . T C 748.23 PASS AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0515093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.801;QD=38.371;RBI=0.0568494;REFB=0;REVB=0.024055;RO=0;SAF=44;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.47622e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000106235;OID=.;OPOS=4033462;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:78:78:0:0:78:78:34:44:0:0:34:44:0:0 chr19 4042808 . G C 47.84 PASS AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.0219259;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.833;QD=11.2563;RBI=0.0243674;REFB=-0.00321617;REVB=-0.0106314;RO=8;SAF=7;SAR=2;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157762;STB=0.592997;TYPE=snp;VARB=0.00126252;OID=.;OPOS=4042808;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:17:17:8:8:9:9:2:7:5:3:2:7:5:3 chr19 4042858 . G A 313.24 PASS AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00845036;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.247;QD=36.8513;RBI=0.0298681;REFB=0;REVB=0.0286477;RO=0;SAF=27;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.86929e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000500004;OID=.;OPOS=4042858;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:33:34:0:0:33:34:6:27:0:0:6:28:0:0 chr19 4042923 . A G 386.65 PASS AO=40;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.052053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.0972;QD=36.8234;RBI=0.0801726;REFB=0;REVB=-0.0609764;RO=1;SAF=34;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0719083;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00155622;OID=.;OPOS=4042923;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:41:42:1:0:40:42:6:34:0:1:7:35:0:0 chr19 4043024 . T C 316.55 PASS AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0283418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.903;QD=37.2412;RBI=0.0346609;REFB=0;REVB=-0.019953;RO=0;SAF=13;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.88945e-05;OID=.;OPOS=4043024;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:34:0:0:34:34:21:13:0:0:21:13:0:0 chr19 4043090 . AG A 87.37 PASS AO=19;DP=29;FAO=22;FDP=29;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=21;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.293474;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.1668;QD=12.0506;RBI=0.390681;REFB=-0.0532601;REVB=-0.257884;RO=5;SAF=0;SAR=19;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0.282258;SSSB=-0.859775;STB=0.813549;TYPE=del;VARB=0.0413729;OID=.;OPOS=4043091;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:19:27:22:29:7:1:21:4:3:7:5:0:19:4:1 chr19 4047790 . CCG C,CC 20.53 PASS AO=4,5;DP=27;FAO=1,10;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=0,5;FSAR=1,5;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=-0.300897,-0.0608038;FXX=0.0384468;HRUN=4,4;LEN=2,1;MLLD=19.732,13.6724;QD=3.28535;RBI=0.31177,0.114313;REFB=-0.0276776,-0.096612;REVB=-0.081616,-0.0968002;RO=15;SAF=2,0;SAR=2,5;SRF=12;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0.362319;SSSB=-0.360561,-0.789465;STB=0.994692,0.66637;TYPE=del,del;VARB=0.060227,0.106315;OID=.,.;OPOS=4047791,4047792;OREF=CG,G;OALT=-,-;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:4,5:25:1,10:25:14:0,5:1,5:11:3:17:15:2,0:2,5:12:3 chr19 4101062 . G T 76.6 PASS AO=14;DP=23;FAO=14;FDP=24;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=9;FWDB=0.0454661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.774;QD=12.7661;RBI=0.0509278;REFB=-0.0361132;REVB=-0.022945;RO=9;SAF=5;SAR=9;SRF=1;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199914;STB=0.624843;TYPE=snp;VARB=0.0333508;OID=.;OPOS=4101062;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:23:24:9:10:14:14:9:5:1:8:9:5:1:9 chr19 4180836 . C T 555.74 PASS AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.249;QD=38.3266;RBI=0.0272571;REFB=0;REVB=0.0248698;RO=0;SAF=42;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.83285e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.71186e-05;OID=.;OPOS=4180836;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:58:58:0:0:58:58:16:42:0:0:16:42:0:0 chr19 4207569 . AG A 24.66 PASS AO=23;DP=78;FAO=25;FDP=74;FR=.;FRO=49;FSAF=2;FSAR=23;FSRF=9;FSRR=40;FWDB=-0.177452;FXX=0.0263123;HRUN=4;LEN=1;MLLD=12.1167;QD=1.33313;RBI=0.19295;REFB=-0.042117;REVB=0.0757651;RO=45;SAF=2;SAR=21;SRF=8;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.239515;STB=0.66738;TYPE=del;VARB=0.038333;OID=.;OPOS=4207570;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:23:75:25:74:49:2:23:9:40:24:45:2:21:8:37 chr19 4216906 . A C 12.51 PASS AO=3;DP=12;FAO=3;FDP=12;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=9;FSRR=0;FWDB=0.014427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.5153;QD=4.16977;RBI=0.014427;REFB=-0.0383302;REVB=0;RO=9;SAF=3;SAR=0;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.133962;OID=.;OPOS=4216906;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:12:12:9:9:3:3:0:3:9:0:0:3:9:0 chr19 4217207 . T G 103.21 PASS AO=25;DP=56;FAO=26;FDP=56;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=0.00270327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.479;QD=7.37189;RBI=0.0127183;REFB=-0.00456499;REVB=0.0124277;RO=31;SAF=12;SAR=13;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0278056;STB=0.50276;TYPE=snp;VARB=0.00731841;OID=.;OPOS=4217207;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:31:30:25:26:13:12:14:17:14:12:14:16 chr19 4280207 . G C 77.78 PASS AO=22;DP=56;FAO=22;FDP=56;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=11;FWDB=0.0419672;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.4383;QD=5.55559;RBI=0.0420917;REFB=-0.00261016;REVB=0.00323554;RO=34;SAF=12;SAR=10;SRF=23;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142064;STB=0.581324;TYPE=snp;VARB=0.00584125;OID=.;OPOS=4280207;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:56:56:34:34:22:22:10:12:23:11:10:12:23:11 chr19 4280344 . GC G 26.96 PASS AO=9;DP=26;FAO=14;FDP=24;FR=.;FRO=10;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.256711;FXX=0.039984;HRUN=4;LEN=1;MLLD=7.20709;QD=4.49365;RBI=0.355339;REFB=-0.1292;REVB=0.245693;RO=9;SAF=7;SAR=2;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.473086;STB=0.603508;TYPE=del;VARB=0.188402;OID=.;OPOS=4280345;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:9:25:14:24:10:9:5:4:6:16:9:7:2:2:7 chr19 4283059 . G A 235.47 PASS AO=54;DP=110;FAO=54;FDP=109;FR=.;FRO=55;FSAF=19;FSAR=35;FSRF=31;FSRR=24;FWDB=-0.00349529;FXX=0.00909008;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.357;QD=8.64094;RBI=0.00359029;REFB=0.000177936;REVB=0.000820441;RO=55;SAF=19;SAR=35;SRF=31;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197601;STB=0.609502;TYPE=snp;VARB=-0.00013451;OID=.;OPOS=4283059;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:109:55:55:54:54:35:19:31:24:35:19:31:24 chr19 4288332 . A G 185.44 PASS AO=37;DP=67;FAO=37;FDP=66;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=0.000146076;FXX=0.0149231;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.131;QD=11.2385;RBI=0.0101102;REFB=0.00799422;REVB=-0.0101091;RO=28;SAF=17;SAR=20;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0812476;STB=0.551095;TYPE=snp;VARB=-0.00510383;OID=.;OPOS=4288332;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:66:28:29:37:37:20:17:10:18:20:17:10:19 chr19 4292597 . C T 594.06 PASS AO=61;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.7397;QD=37.7182;RBI=0.0355474;REFB=0;REVB=0.0331199;RO=0;SAF=24;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000500918;OID=.;OPOS=4292597;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:62:63:0:0:61:63:37:24:0:0:38:25:0:0 chr19 4294623 . C A 65.02 PASS AO=23;DP=67;FAO=22;FDP=66;FR=.;FRO=44;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=0.00845278;FXX=0.0149231;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.1125;QD=3.94041;RBI=0.0145071;REFB=-0.0226098;REVB=-0.0117901;RO=42;SAF=7;SAR=16;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150821;STB=0.603674;TYPE=snp;VARB=0.0727195;OID=.;OPOS=4294623;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:67:66:42:44:23:22:16:7:18:24:16:6:18:26 chr19 4306311 . T C 81.98 PASS AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.0630341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.6031;QD=8.86293;RBI=0.0630798;REFB=-0.00804492;REVB=0.00239923;RO=19;SAF=7;SAR=11;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218046;STB=0.623744;TYPE=snp;VARB=0.00907462;OID=.;OPOS=4306311;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:37:37:19:19:18:18:11:7:12:7:11:7:12:7 chr19 4323878 . C T 86.32 PASS AO=27;DP=75;FAO=27;FDP=74;FR=.;FRO=47;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=25;FWDB=-0.0263187;FXX=0.0512755;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.927;QD=4.66585;RBI=0.0305571;REFB=0.005666;REVB=-0.0155262;RO=44;SAF=8;SAR=19;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185627;STB=0.61813;TYPE=snp;VARB=-0.0141111;OID=.;OPOS=4323878;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:75:74:44:47:27:27:19:8:20:24:19:8:22:25 chr19 4325433 . G A 181.17 PASS AO=38;DP=68;FAO=38;FDP=71;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=30;FSRF=6;FSRR=27;FWDB=0.0065232;FXX=0.0405351;HRUN=5;LEN=1;MLLD=231.994;QD=10.2067;RBI=0.0121098;REFB=-0.0247049;REVB=0.0102027;RO=29;SAF=8;SAR=30;SRF=6;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00430443;STB=0.520537;TYPE=snp;VARB=0.0194366;OID=.;OPOS=4325433;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:71:29:33:38:38:30:8:6:23:30:8:6:27 chr19 4333711 . C T 2296.28 PASS AO=243;DP=248;FAO=247;FDP=247;FR=.;FRO=0;FSAF=136;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0329981;FXX=0.0159356;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.2857;QD=37.1868;RBI=0.0871902;REFB=-0.0469663;REVB=0.0807048;RO=5;SAF=134;SAR=109;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136227;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000698367;OID=.;OPOS=4333711;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:248:247:5:0:243:247:109:134:1:4:111:136:0:0 chr19 4352959 . A G 155.3 PASS AO=10;DP=17;FAO=16;FDP=17;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0189304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.9949;QD=36.5418;RBI=0.177238;REFB=0;REVB=0.176224;RO=0;SAF=8;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0084085;OID=.;OPOS=4352959;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:17:0:0:10:16:2:8:0:0:7:9:0:0 chr19 4357374 . AG A 289.98 PASS AO=43;DP=57;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.204414;FXX=0.0175408;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.2424;QD=20.7129;RBI=0.233929;REFB=-0.00746232;REVB=-0.113745;RO=8;SAF=25;SAR=18;SRF=6;SRR=2;SSEN=0.342294;SSEP=0;SSSB=-0.0511569;STB=0.507934;TYPE=del;VARB=0.0100072;OID=.;OPOS=4357375;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:43:57:55:56:1:31:24:1:0:19:8:25:18:6:2 chr19 4357555 . A G 465.54 PASS AO=47;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.105175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.748;QD=36.5126;RBI=0.112698;REFB=0;REVB=0.0404871;RO=0;SAF=31;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00628304;OID=.;OPOS=4357555;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:51:51:0:0:47:51:16:31:0:0:19:32:0:0 chr19 4362691 . G C 182.89 PASS AO=47;DP=86;FAO=48;FDP=111;FR=.;FRO=63;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=36;FSRR=27;FWDB=0.013043;FXX=0.00892777;HRUN=3;LEN=1;MLLD=140.718;QD=6.59062;RBI=0.0265184;REFB=-0.0210744;REVB=-0.0230891;RO=39;SAF=28;SAR=19;SRF=36;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.302039;STB=0.506931;TYPE=snp;VARB=0.0230915;OID=.;OPOS=4362691;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:111:39:63:47:48:19:28:36:3:20:28:36:27 chr19 4409756 . A G 39.78 PASS AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.663;QD=12.2402;RBI=0.00278259;REFB=-0.0236238;REVB=-0.00278259;RO=6;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0188987;OID=.;OPOS=4409756;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:13:13:6:6:7:7:7:0:0:6:7:0:0:6 chr19 4442336 . C T 1121.93 PASS AO=116;DP=118;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0847189;FXX=0.0333306;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.672;QD=38.6874;RBI=0.0967103;REFB=0;REVB=0.0466432;RO=0;SAF=60;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000529365;OID=.;OPOS=4442336;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:118:116:0:0:116:116:56:60:0:0:56:60:0:0 chr19 4442999 . T G 796.88 PASS AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00687982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.297;QD=37.9467;RBI=0.0257483;REFB=0;REVB=-0.0248122;RO=0;SAF=60;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6186e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.8401e-05;OID=.;OPOS=4442999;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:84:84:0:0:84:84:24:60:0:0:24:60:0:0 chr19 4443046 . T C 480.08 PASS AO=104;DP=194;FAO=104;FDP=194;FR=.;FRO=90;FSAF=60;FSAR=44;FSRF=49;FSRR=41;FWDB=-0.0170583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.361;QD=9.89852;RBI=0.0275958;REFB=-0.00603972;REVB=-0.021692;RO=89;SAF=60;SAR=44;SRF=48;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0323287;STB=0.515357;TYPE=snp;VARB=0.00424835;OID=.;OPOS=4443046;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:194:89:90:104:104:44:60:48:41:44:60:49:41 chr19 4454083 . C T 39.24 PASS AO=9;DP=25;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0695418;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.3369;QD=6.0375;RBI=0.0698014;REFB=-0.0147689;REVB=0.00601417;RO=16;SAF=3;SAR=6;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.244812;STB=0.666325;TYPE=snp;VARB=0.015094;OID=.;OPOS=4454083;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:25:26:16:16:9:10:6:3:9:7:7:3:9:7 chr19 4493708 . A G 414.97 PASS AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0146993;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.193;QD=37.7246;RBI=0.0150277;REFB=0;REVB=0.00312416;RO=0;SAF=29;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.70539e-05;OID=.;OPOS=4493708;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:45:44:0:0:44:44:15:29:0:0:15:29:0:0 chr19 4508945 . A G 359.86 PASS AO=24;DP=39;FAO=37;FDP=39;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.43;QD=36.9089;RBI=0.0952615;REFB=0;REVB=0.0943226;RO=0;SAF=19;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00067486;OID=.;OPOS=4508945;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:38:39:0:0:24:37:5:19:0:0:16:21:0:0 chr19 4510530 . G A 129.55 PASS AO=32;DP=71;FAO=32;FDP=71;FR=.;FRO=39;FSAF=4;FSAR=28;FSRF=2;FSRR=37;FWDB=-0.00556627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.808;QD=7.29835;RBI=0.0195183;REFB=-0.0346579;REVB=0.0187078;RO=39;SAF=4;SAR=28;SRF=2;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194788;STB=0.607421;TYPE=snp;VARB=0.0336042;OID=.;OPOS=4510530;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:39:39:32:32:28:4:2:37:28:4:2:37 chr19 4511140 . C G 53.45 PASS AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.0105073;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.989;QD=11.2523;RBI=0.011841;REFB=-0.0148568;REVB=0.00545941;RO=9;SAF=3;SAR=7;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.304629;STB=0.677057;TYPE=snp;VARB=0.0218084;OID=.;OPOS=4511140;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:19:19:9:9:10:10:7:3:6:3:7:3:6:3 chr19 4511281 . G A 196.1 PASS AO=38;DP=67;FAO=38;FDP=66;FR=.;FRO=28;FSAF=3;FSAR=35;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.00821762;FXX=0.0149231;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.469;QD=11.8845;RBI=0.0428618;REFB=-0.062963;REVB=0.0420666;RO=28;SAF=3;SAR=35;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.576491;STB=0.824844;TYPE=snp;VARB=0.01854;OID=.;OPOS=4511281;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:66:28:28:38:38:35:3:16:12:35:3:16:12 chr19 4511350 . T A 352.44 PASS AO=46;DP=55;FAO=46;FDP=54;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=40;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.00793438;FXX=0.0181785;HRUN=3;LEN=1;MLLD=95.2073;QD=26.1068;RBI=0.00883358;REFB=-0.00686008;REVB=0.00388301;RO=8;SAF=6;SAR=40;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132585;STB=0.571395;TYPE=snp;VARB=0.000922357;OID=.;OPOS=4511350;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:55:54:8:8:46:46:40:6:3:5:40:6:3:5 chr19 4511365 . C G 41.91 PASS AO=17;DP=61;FAO=17;FDP=60;FR=.;FRO=43;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=32;FWDB=-0.046091;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.999;QD=2.7938;RBI=0.0463342;REFB=0.000589899;REVB=0.00474129;RO=43;SAF=3;SAR=14;SRF=11;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141544;STB=0.586715;TYPE=snp;VARB=-0.00183194;OID=.;OPOS=4511365;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:61:60:43:43:17:17:14:3:11:32:14:3:11:32 chr19 4511453 . G A 83.39 PASS AO=19;DP=41;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=19;FWDB=-0.0240017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.6577;QD=8.13591;RBI=0.0927582;REFB=-0.0733325;REVB=0.0895991;RO=22;SAF=11;SAR=8;SRF=3;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.403969;STB=0.725957;TYPE=snp;VARB=0.0914995;OID=.;OPOS=4511453;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:41:41:22:22:19:19:8:11:3:19:8:11:3:19 chr19 4511479 . A T 11.42 PASS AO=6;DP=33;FAO=6;FDP=33;FR=.;FRO=27;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=20;FWDB=-0.00878917;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.498;QD=1.38379;RBI=0.00879004;REFB=-0.00847351;REVB=0.000123982;RO=27;SAF=3;SAR=3;SRF=7;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.2981;STB=0.696415;TYPE=snp;VARB=0.0231692;OID=.;OPOS=4511479;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:33:33:27:27:6:6:3:3:7:20:3:3:7:20 chr19 4511491 . A G 24.13 PASS AO=8;DP=34;FAO=9;FDP=34;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0425384;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.679;QD=2.83898;RBI=0.0440465;REFB=0.000771825;REVB=-0.0114271;RO=25;SAF=5;SAR=3;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126229;STB=0.526257;TYPE=snp;VARB=-0.00292417;OID=.;OPOS=4511491;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:34:34:25:25:8:9:3:5:13:12:4:5:13:12 chr19 4511494 . G A 16.28 PASS AO=8;DP=38;FAO=8;FDP=38;FR=.;FRO=30;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=0.00907095;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.918;QD=1.71407;RBI=0.00916379;REFB=-0.0104991;REVB=-0.00130114;RO=30;SAF=5;SAR=3;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0726847;STB=0.547824;TYPE=snp;VARB=0.0482271;OID=.;OPOS=4511494;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:38:38:30:30:8:8:3:5:17:13:3:5:17:13 chr19 4511525 . A G 296.14 PASS AO=42;DP=53;FAO=42;FDP=53;FR=.;FRO=11;FSAF=34;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.0186948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.822;QD=22.3505;RBI=0.0208661;REFB=-0.0444236;REVB=-0.0092681;RO=11;SAF=34;SAR=8;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233294;STB=0.626469;TYPE=snp;VARB=0.00610711;OID=.;OPOS=4511525;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:53:53:11:11:42:42:8:34:4:7:8:34:4:7 chr19 4511647 . C G 86.46 PASS AO=24;DP=63;FAO=25;FDP=64;FR=.;FRO=39;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=27;FWDB=0.00208604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.4189;QD=5.40386;RBI=0.00398316;REFB=-0.0167655;REVB=-0.00339323;RO=39;SAF=8;SAR=16;SRF=12;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.031409;STB=0.508664;TYPE=snp;VARB=0.0491356;OID=.;OPOS=4511647;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:63:64:39:39:24:25:16:8:12:27:17:8:12:27 chr19 4511677 . A G 21.58 PASS AO=18;DP=75;FAO=15;FDP=75;FR=.;FRO=60;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=25;FSRR=35;FWDB=-0.0266581;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.23;QD=1.1509;RBI=0.0332729;REFB=-0.00633788;REVB=-0.0199105;RO=57;SAF=7;SAR=11;SRF=25;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0631423;STB=0.540342;TYPE=snp;VARB=0.0197363;OID=.;OPOS=4511677;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:75:75:57:60:18:15:11:7:25:32:8:7:25:35 chr19 4511725 . T C 146.71 PASS AO=35;DP=76;FAO=36;FDP=77;FR=.;FRO=41;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=14;FSRR=27;FWDB=0.0022594;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.8949;QD=7.62118;RBI=0.00830459;REFB=4.72694e-05;REVB=0.00799132;RO=41;SAF=12;SAR=23;SRF=14;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00148833;STB=0.504852;TYPE=snp;VARB=0.000278335;OID=.;OPOS=4511725;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:77:41:41:35:36:23:12:14:27:24:12:14:27 chr19 4511730 . T C 172.98 PASS AO=38;DP=74;FAO=38;FDP=74;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=26;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=0.0155564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.078;QD=9.35047;RBI=0.0159128;REFB=-0.0187443;REVB=-0.00334909;RO=35;SAF=12;SAR=26;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0543477;STB=0.539915;TYPE=snp;VARB=0.0128905;OID=.;OPOS=4511730;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:35:36:38:38:26:12:13:22:26:12:14:22 chr19 4511920 . T C 141.17 PASS AO=32;DP=89;FAO=40;FDP=98;FR=.;FRO=58;FSAF=11;FSAR=29;FSRF=37;FSRR=21;FWDB=-0.00423218;FXX=0.048539;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.577;QD=5.76201;RBI=0.00972206;REFB=-0.0114795;REVB=-0.00875254;RO=56;SAF=6;SAR=26;SRF=36;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.51672;STB=0.716677;TYPE=snp;VARB=0.0190429;OID=.;OPOS=4511920;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:98:56:58:32:40:26:6:36:20:29:11:37:21 chr19 4511955 . T C 1121.79 PASS AO=120;DP=123;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0428882;FXX=0.0161277;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.3685;QD=36.7801;RBI=0.0496939;REFB=-0.122898;REVB=0.0251015;RO=1;SAF=61;SAR=59;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0079833;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000586712;OID=.;OPOS=4511955;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:123:122:1:0:120:122:59:61:0:1:60:62:0:0 chr19 4512409 . T C 48.05 PASS AO=14;DP=39;FAO=14;FDP=39;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=-0.0510967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.983;QD=4.92798;RBI=0.0513271;REFB=-0.00677075;REVB=-0.00485789;RO=25;SAF=4;SAR=10;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.416075;STB=0.744344;TYPE=snp;VARB=0.0122421;OID=.;OPOS=4512409;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:39:39:25:25:14:14:10:4:17:8:10:4:17:8 chr19 4512514 . G C 71.47 PASS AO=17;DP=51;FAO=21;FDP=54;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=-0.00582836;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.423;QD=5.29423;RBI=0.0315775;REFB=-0.0237808;REVB=0.031035;RO=32;SAF=10;SAR=7;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166646;STB=0.531885;TYPE=snp;VARB=0.0294295;OID=.;OPOS=4512514;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:51:54:32:33:17:21:7:10:14:18:11:10:14:19 chr19 4512613 . T G 26.51 PASS AO=16;DP=77;FAO=17;FDP=78;FR=.;FRO=61;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=36;FWDB=-0.0118814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.951;QD=1.35956;RBI=0.0308786;REFB=-0.00757658;REVB=-0.0285012;RO=60;SAF=1;SAR=15;SRF=25;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.580408;STB=0.7984;TYPE=snp;VARB=0.0175555;OID=.;OPOS=4512613;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:77:78:60:61:16:17:15:1:25:35:15:2:25:36 chr19 4512629 . C T 10.29 PASS AO=11;DP=72;FAO=11;FDP=72;FR=.;FRO=61;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=25;FSRR=36;FWDB=-0.0482464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.235;QD=0.571827;RBI=0.0482998;REFB=-0.00351747;REVB=-0.00227018;RO=61;SAF=1;SAR=10;SRF=25;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.484702;STB=0.848915;TYPE=snp;VARB=0.0145525;OID=.;OPOS=4512629;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:72:72:61:61:11:11:10:1:25:36:10:1:25:36 chr19 4513143 . C T 155.81 PASS AO=20;DP=23;FAO=20;FDP=23;FR=.;FRO=3;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.00582421;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.996;QD=27.0971;RBI=0.0398835;REFB=-0.0654283;REVB=0.0394559;RO=2;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0918973;STB=0.571357;TYPE=snp;VARB=0.00307532;OID=.;OPOS=4513143;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:23:23:2:3:20:20:9:11:0:2:9:11:0:3 chr19 4513144 . A G 182.58 PASS AO=23;DP=25;FAO=22;FDP=24;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00305919;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.438;QD=30.4299;RBI=0.0241958;REFB=-0.0428401;REVB=-0.0240016;RO=2;SAF=13;SAR=10;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0839258;STB=0.549954;TYPE=snp;VARB=0.00241176;OID=.;OPOS=4513144;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:25:24:2:2:23:22:10:13:0:2:9:13:0:2 chr19 4513559 . A G 288.86 PASS AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00265638;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3592;QD=37.2717;RBI=0.043137;REFB=0;REVB=-0.0430551;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000383333;OID=.;OPOS=4513559;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:32:31:0:0:31:31:17:14:0:0:17:14:0:0 chr19 4534014 . G A 144.85 PASS AO=37;DP=83;FAO=37;FDP=83;FR=.;FRO=46;FSAF=31;FSAR=6;FSRF=39;FSRR=7;FWDB=-0.000615147;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=168.519;QD=6.98091;RBI=0.00533056;REFB=-0.0221518;REVB=0.00529495;RO=46;SAF=31;SAR=6;SRF=39;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.018409;STB=0.510323;TYPE=snp;VARB=0.0202827;OID=.;OPOS=4534014;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:46:46:37:37:6:31:39:7:6:31:39:7 chr19 4652822 . C G 1096.56 PASS AO=90;DP=102;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00686294;FXX=0.0166653;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.162;QD=37.1717;RBI=0.107352;REFB=-0.161626;REVB=0.107132;RO=0;SAF=42;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000613129;OID=.;OPOS=4652822;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:102:118:0:0:90:118:48:42:0:0:63:55:0:0 chr19 4653370 . C G 1365.18 PASS AO=143;DP=143;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00469294;FXX=0.00694396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.0936;QD=38.187;RBI=0.0544069;REFB=0;REVB=-0.0542041;RO=0;SAF=60;SAR=83;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.2309e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000291792;OID=.;OPOS=4653370;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:143:143:0:0:143:143:83:60:0:0:83:60:0:0 chr19 4653420 . A G 965.9 PASS AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0142785;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.773;QD=38.636;RBI=0.0407866;REFB=0;REVB=-0.0382056;RO=0;SAF=37;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000390078;OID=.;OPOS=4653420;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:100:100:0:0:100:100:63:37:0:0:63:37:0:0 chr19 4655166 . A G 195.06 PASS AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0462046;FXX=0.0869187;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.098;QD=37.1537;RBI=0.0539762;REFB=0;REVB=-0.0279028;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000474746;OID=.;OPOS=4655166;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:22:21:0:0:21:21:9:12:0:0:9:12:0:0 chr19 4685276 . A C 829.51 PASS AO=96;DP=97;FAO=93;FDP=97;FR=.;FRO=4;FSAF=64;FSAR=29;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0193465;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2818;QD=34.2065;RBI=0.039751;REFB=0.0178744;REVB=-0.0347255;RO=0;SAF=66;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.502976;TYPE=snp;VARB=-0.00377552;OID=.;OPOS=4685276;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:97:97:0:4:96:93:30:66:0:0:29:64:3:1 chr19 4688782 . C CG 11.73 PASS AO=2;DP=7;FAO=3;FDP=7;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0872619;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=17.9054;QD=6.70262;RBI=0.128305;REFB=-0.0314647;REVB=0.0940618;RO=5;SAF=1;SAR=1;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.306614;STB=0.555201;TYPE=ins;VARB=0.151718;OID=.;OPOS=4688783;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:2:7:3:7:4:2:1:3:1:11:5:1:1:4:1 chr19 4724069 . G A 615.95 PASS AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0302864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.524;QD=37.9048;RBI=0.0302887;REFB=0;REVB=0.000380104;RO=0;SAF=53;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000159258;OID=.;OPOS=4724069;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:65:65:0:0:65:65:12:53:0:0:12:53:0:0 chr19 4724157 . G A 898.64 PASS AO=94;DP=94;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00190234;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.302;QD=37.8373;RBI=0.0158931;REFB=0;REVB=-0.0157788;RO=0;SAF=35;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.06074e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.5227e-05;OID=.;OPOS=4724157;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:94:95:0:0:94:95:59:35:0:0:59:36:0:0 chr19 4724732 . G T 1238.88 PASS AO=130;DP=133;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0361951;FXX=0.0298485;HRUN=3;LEN=1;MLLD=161.614;QD=38.1195;RBI=0.0362021;REFB=0;REVB=0.000713709;RO=0;SAF=10;SAR=120;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.88302e-05;OID=.;OPOS=4724732;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:133:130:0:0:130:130:120:10:0:0:120:10:0:0 chr19 4772202 . A C 133.17 PASS AO=46;DP=127;FAO=46;FDP=128;FR=.;FRO=82;FSAF=6;FSAR=40;FSRF=30;FSRR=52;FWDB=-0.0566801;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.0976;QD=4.16158;RBI=0.0833134;REFB=-0.00276326;REVB=-0.0610614;RO=80;SAF=6;SAR=40;SRF=29;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.375099;STB=0.722776;TYPE=snp;VARB=0.00485707;OID=.;OPOS=4772202;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:128:80:82:46:46:40:6:29:51:40:6:30:52 chr19 4793880 . GC G 234.95 PASS AO=29;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0993844;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.5361;QD=24.0969;RBI=0.359703;REFB=0;REVB=0.345701;RO=8;SAF=27;SAR=2;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0.360656;SSSB=0.322201;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0192805;OID=.;OPOS=4793881;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:29:39:39:39:0:32:7:0:0:20:8:27:2:5:3 chr19 4794257 . T G 239.98 PASS AO=56;DP=116;FAO=57;FDP=117;FR=.;FRO=60;FSAF=33;FSAR=24;FSRF=24;FSRR=36;FWDB=0.0182812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.44;QD=8.20442;RBI=0.0268402;REFB=0.000918263;REVB=-0.0196518;RO=59;SAF=32;SAR=24;SRF=23;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167285;STB=0.591366;TYPE=snp;VARB=-0.000980315;OID=.;OPOS=4794257;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:117:59:60:56:57:24:32:23:36:24:33:24:36 chr19 4794948 . A AAACCTCAC 148.93 PASS AO=34;DP=77;FAO=35;FDP=73;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=-0.0174244;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=8;MLLD=282.836;QD=8.16052;RBI=0.0179655;REFB=-0.023481;REVB=0.00437567;RO=41;SAF=15;SAR=19;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139695;STB=0.564669;TYPE=ins;VARB=0.0268361;OID=.;OPOS=4794949;OREF=-;OALT=AACCTCAC;OMAPALT=AAACCTCAC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:34:77:35:73:38:15:20:21:17:99:41:15:19:24:17 chr19 4795289 . G A 279.82 PASS AO=61;DP=116;FAO=61;FDP=116;FR=.;FRO=55;FSAF=40;FSAR=21;FSRF=31;FSRR=24;FWDB=0.0114121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.063;QD=9.64907;RBI=0.0151788;REFB=-0.0110263;REVB=-0.010008;RO=55;SAF=40;SAR=21;SRF=31;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0852113;STB=0.54693;TYPE=snp;VARB=0.00910298;OID=.;OPOS=4795289;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:55:55:61:61:21:40:31:24:21:40:31:24 chr19 4795342 . G A 309.09 PASS AO=71;DP=143;FAO=71;FDP=141;FR=.;FRO=70;FSAF=42;FSAR=29;FSRF=39;FSRR=31;FWDB=0.0221381;FXX=0.013985;HRUN=5;LEN=1;MLLD=191.954;QD=8.76857;RBI=0.0221662;REFB=0.00321439;REVB=-0.00111612;RO=67;SAF=42;SAR=29;SRF=37;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0356338;STB=0.517555;TYPE=snp;VARB=-0.00398911;OID=.;OPOS=4795342;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:141:67:70:71:71:29:42:37:30:29:42:39:31 chr19 4816719 . G A 41.92 PASS AO=15;DP=49;FAO=15;FDP=49;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=25;FSRR=9;FWDB=0.0215773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.108;QD=3.42207;RBI=0.0349919;REFB=-0.00945251;REVB=0.0275473;RO=33;SAF=10;SAR=5;SRF=24;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0812861;STB=0.555485;TYPE=snp;VARB=0.0236311;OID=.;OPOS=4816719;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:49:49:33:34:15:15:5:10:24:9:5:10:25:9 chr19 4818378 . T C 575.51 PASS AO=46;DP=61;FAO=60;FDP=60;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=23;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0599191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.003;QD=38.3676;RBI=0.0604098;REFB=0;REVB=-0.00768389;RO=0;SAF=9;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.83101e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000766413;OID=.;OPOS=4818378;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:61:60:0:0:46:60:37:9:0:0:37:23:0:0 chr19 4818487 . C A 35.39 PASS AO=10;DP=29;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=16;FWDB=-0.026919;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=211.506;QD=4.88091;RBI=0.0279349;REFB=-0.00371705;REVB=-0.00746494;RO=18;SAF=1;SAR=9;SRF=2;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0317579;STB=0.589959;TYPE=snp;VARB=0.0130631;OID=.;OPOS=4818487;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:29:29:18:19:10:10:9:1:2:16:9:1:3:16 chr19 4818488 . C G 34.84 PASS AO=10;DP=28;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=15;FWDB=-0.255093;FXX=0.0344709;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.972;QD=4.97708;RBI=0.255663;REFB=-0.00931682;REVB=-0.0170624;RO=16;SAF=1;SAR=9;SRF=1;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12191;STB=0.599771;TYPE=snp;VARB=0.0180186;OID=.;OPOS=4818488;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:28:28:16:18:10:10:9:1:1:15:9:1:3:15 chr19 4847713 . A G 575.06 PASS AO=50;DP=51;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.715;QD=38.3371;RBI=0.038433;REFB=0;REVB=0.0239273;RO=0;SAF=25;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000162555;OID=.;OPOS=4847713;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:51:60:0:0:50:60:25:25:0:0:28:32:0:0 chr19 4847868 . G A 130.5 PASS AO=35;DP=85;FAO=36;FDP=86;FR=.;FRO=50;FSAF=10;FSAR=26;FSRF=21;FSRR=29;FWDB=-0.0366324;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.6951;QD=6.06983;RBI=0.0567805;REFB=0.00508229;REVB=0.0433832;RO=46;SAF=10;SAR=25;SRF=20;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167876;STB=0.59434;TYPE=snp;VARB=-0.0121835;OID=.;OPOS=4847868;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:86:46:50:35:36:25:10:20:26:26:10:21:29 chr19 4847874 . A G 690.52 PASS AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0213735;FXX=0.0632831;HRUN=3;LEN=1;MLLD=123.61;QD=37.3253;RBI=0.0216392;REFB=0.0218674;REVB=-0.00338076;RO=1;SAF=27;SAR=46;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101732;STB=0.505375;TYPE=snp;VARB=0.00038245;OID=.;OPOS=4847874;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:74:74:1:1:73:73:46:27:0:1:46:27:0:1 chr19 4852106 . A G 767.28 PASS AO=81;DP=82;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.032195;FXX=0.0121936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.971;QD=37.8902;RBI=0.032425;REFB=0;REVB=-0.00385557;RO=0;SAF=52;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.45212e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.10257e-05;OID=.;OPOS=4852106;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:82:81:0:0:81:81:29:52:0:0:29:52:0:0 chr19 4852137 . C T 367.34 PASS AO=56;DP=79;FAO=57;FDP=80;FR=.;FRO=23;FSAF=38;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.0222946;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.828;QD=18.3668;RBI=0.0282411;REFB=-0.0235619;REVB=0.0173352;RO=23;SAF=37;SAR=19;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129651;STB=0.571403;TYPE=snp;VARB=0.0140758;OID=.;OPOS=4852137;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:79:80:23:23:56:57:19:37:10:13:19:38:10:13 chr19 4859937 . T C 31.96 PASS AO=10;DP=32;FAO=10;FDP=32;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=-0.0216789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.918;QD=3.99463;RBI=0.0225282;REFB=-0.0181441;REVB=-0.00612713;RO=22;SAF=4;SAR=6;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0431152;STB=0.526264;TYPE=snp;VARB=0.0291088;OID=.;OPOS=4859937;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:32:32:22:22:10:10:6:4:8:14:6:4:8:14 chr19 4902754 . G A 624.05 PASS AO=121;DP=237;FAO=138;FDP=254;FR=.;FRO=116;FSAF=67;FSAR=71;FSRF=51;FSRR=65;FWDB=0.0374323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.467;QD=9.82756;RBI=0.0398087;REFB=-0.0117823;REVB=0.0135482;RO=116;SAF=58;SAR=63;SRF=51;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0355776;STB=0.52098;TYPE=snp;VARB=0.0108693;OID=.;OPOS=4902754;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:237:254:116:116:121:138:63:58:51:65:71:67:51:65 chr19 4910889 . G T 250.07 PASS AO=44;DP=68;FAO=44;FDP=68;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=34;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.024901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.852;QD=14.71;RBI=0.0250278;REFB=-0.0122325;REVB=-0.00251683;RO=23;SAF=10;SAR=34;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.255547;STB=0.634674;TYPE=snp;VARB=0.00501554;OID=.;OPOS=4910889;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:68:68:23:24:44:44:34:10:13:10:34:10:13:11 chr19 4910924 . C T 164.67 PASS AO=36;DP=71;FAO=36;FDP=71;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=27;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=-0.00184377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.951;QD=9.27711;RBI=0.0198724;REFB=-0.0236969;REVB=0.0197867;RO=33;SAF=9;SAR=27;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121167;STB=0.57387;TYPE=snp;VARB=0.0190874;OID=.;OPOS=4910924;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:33:35:36:36:27:9:12:21:27:9:13:22 chr19 4929413 . T C 27.87 PASS AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=2;FWDB=-0.0461925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.0737;QD=5.57495;RBI=0.055869;REFB=-0.0161013;REVB=-0.031426;RO=13;SAF=5;SAR=2;SRF=11;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191487;STB=0.6151;TYPE=snp;VARB=0.0220838;OID=.;OPOS=4929413;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:20:20:13:13:7:7:2:5:11:2:2:5:11:2 chr19 4929473 . A G 39.78 PASS AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.0484104;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.956;QD=12.2402;RBI=0.052493;REFB=-0.0363888;REVB=0.0202965;RO=6;SAF=3;SAR=4;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0767769;STB=0.545327;TYPE=snp;VARB=0.0180228;OID=.;OPOS=4929473;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:13:13:6:6:7:7:4:3:2:4:4:3:2:4 chr19 4945914 . A C 375.7 PASS AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00657354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.691;QD=38.5338;RBI=0.00778397;REFB=0;REVB=-0.0041688;RO=0;SAF=5;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.44716e-05;OID=.;OPOS=4945914;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:39:39:0:0:39:39:34:5:0:0:34:5:0:0 chr19 4945917 . C T 62.61 PASS AO=16;DP=39;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=3;FSRR=20;FWDB=0.0276867;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.4249;QD=6.42194;RBI=0.0282314;REFB=-0.0143994;REVB=0.00551903;RO=23;SAF=2;SAR=14;SRF=3;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0124736;STB=0.507237;TYPE=snp;VARB=0.0270248;OID=.;OPOS=4945917;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:39:39:23:23:16:16:14:2:3:20:14:2:3:20 chr19 4945973 . AT A,AC 139.68 PASS AO=5,11;DP=17;FAO=4,12;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=0,5;FSAR=4,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.101985,0.067342;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=37.6799,106.235;QD=34.9208;RBI=0.110541,0.0673695;REFB=0,0;REVB=0.0426431,0.00192162;RO=0;SAF=0,5;SAR=5,6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.031911,0.0201455;OID=.,.;OPOS=4945974,4945974;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=A,AC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:5,11:16:4,12:16:0:0,5:4,7:0:0:11:0:0,5:5,6:0:0 chr19 4950770 . C T 349.17 PASS AO=67;DP=118;FAO=67;FDP=114;FR=.;FRO=47;FSAF=42;FSAR=25;FSRF=34;FSRR=13;FWDB=0.0123889;FXX=0.0338954;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.865;QD=12.2516;RBI=0.0152114;REFB=-0.0244343;REVB=-0.00882617;RO=47;SAF=42;SAR=25;SRF=34;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.080005;STB=0.543466;TYPE=snp;VARB=0.0169067;OID=.;OPOS=4950770;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:114:47:47:67:67:25:42:34:13:25:42:34:13 chr19 4954454 . C T 210.37 PASS AO=36;DP=59;FAO=37;FDP=59;FR=.;FRO=22;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.0173046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.753;QD=14.2621;RBI=0.0221347;REFB=-0.00579157;REVB=-0.013802;RO=22;SAF=17;SAR=19;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122891;STB=0.501844;TYPE=snp;VARB=0.0024767;OID=.;OPOS=4954454;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:59:59:22:22:36:37:19:17:10:12:20:17:10:12 chr19 4960865 . C T 85.74 PASS AO=17;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.000927912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.644;QD=10.7177;RBI=0.0179286;REFB=-0.0180892;REVB=-0.0179046;RO=15;SAF=7;SAR=10;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155953;STB=0.588131;TYPE=snp;VARB=0.00917692;OID=.;OPOS=4960865;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:32:32:15:15:17:17:10:7:9:6:10:7:9:6 chr19 4961398 . TC T 31.72 PASS AO=9;DP=20;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.188259;FXX=0.049975;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.381;QD=6.67816;RBI=0.267269;REFB=-0.077101;REVB=0.189714;RO=9;SAF=6;SAR=3;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0.393939;SSSB=0.36755;STB=0.624753;TYPE=del;VARB=0.125487;OID=.;OPOS=4961399;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:9:20:10:19:9:6:4:3:6:22:9:6:3:2:7 chr19 4961997 . C T 41.73 PASS AO=12;DP=34;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.0249846;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.0661;QD=4.90973;RBI=0.0367459;REFB=0.0272809;REVB=-0.0269449;RO=20;SAF=8;SAR=4;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.328087;STB=0.666389;TYPE=snp;VARB=-0.0692508;OID=.;OPOS=4961997;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:34:34:20:22:12:12:4:8:7:13:4:8:9:13 chr19 5041178 . T C 1235.39 PASS AO=135;DP=138;FAO=134;FDP=136;FR=.;FRO=2;FSAF=93;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0236991;FXX=0.0144917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.5512;QD=36.3349;RBI=0.0696905;REFB=-0.0572375;REVB=0.0655372;RO=1;SAF=93;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00508463;STB=0.50335;TYPE=snp;VARB=0.0015864;OID=.;OPOS=5041178;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:138:136:1:2:135:134:42:93:1:0:41:93:1:1 chr19 5110794 . A G 231.77 PASS AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0060792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.717;QD=37.0834;RBI=0.0127988;REFB=0;REVB=0.0112629;RO=0;SAF=8;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000266579;OID=.;OPOS=5110794;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:25:25:0:0:25:25:17:8:0:0:17:8:0:0 chr19 5114116 . T G 136.71 PASS AO=35;DP=82;FAO=36;FDP=83;FR=.;FRO=47;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=16;FSRR=31;FWDB=-0.0223069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.542;QD=6.58865;RBI=0.0223163;REFB=-0.00724232;REVB=-0.00064999;RO=47;SAF=14;SAR=21;SRF=16;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.064028;STB=0.529228;TYPE=snp;VARB=0.00877379;OID=.;OPOS=5114116;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:83:47:47:35:36:21:14:16:31:22:14:16:31 chr19 5135392 . A G 421.13 PASS AO=49;DP=52;FAO=49;FDP=52;FR=.;FRO=3;FSAF=45;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.00136282;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=200.993;QD=32.3945;RBI=0.0180517;REFB=0.00757657;REVB=-0.0180002;RO=3;SAF=45;SAR=4;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176385;STB=0.594669;TYPE=snp;VARB=-0.000340426;OID=.;OPOS=5135392;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:52:52:3:3:49:49:4:45:1:2:4:45:1:2 chr19 5206775 . A G 389.9 PASS AO=30;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0442384;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=36.4834;QD=37.1331;RBI=0.259628;REFB=0;REVB=0.255831;RO=0;SAF=24;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00561454;OID=.;OPOS=5206775;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:42:42:0:0:30:42:6:24:0:0:14:28:0:0 chr19 5210762 . G A 19.85 PASS AO=10;DP=45;FAO=10;FDP=45;FR=.;FRO=35;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=30;FWDB=0.0359368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2313;QD=1.76468;RBI=0.0670875;REFB=-0.0126961;REVB=0.0566506;RO=35;SAF=5;SAR=5;SRF=5;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.464381;STB=0.777393;TYPE=snp;VARB=0.0646982;OID=.;OPOS=5210762;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:45:45:35:35:10:10:5:5:5:30:5:5:5:30 chr19 5210782 . G A 17.91 PASS AO=9;DP=42;FAO=9;FDP=42;FR=.;FRO=33;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=29;FWDB=0.0418491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.391;QD=1.7054;RBI=0.0422802;REFB=-0.000503607;REVB=-0.00602227;RO=33;SAF=4;SAR=5;SRF=4;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.455001;STB=0.772325;TYPE=snp;VARB=0.00291373;OID=.;OPOS=5210782;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:42:42:33:33:9:9:5:4:4:29:5:4:4:29 chr19 5212380 . C T 461.12 PASS AO=47;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155991;FXX=0.039992;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.488;QD=38.4269;RBI=0.0200087;REFB=0;REVB=0.0125305;RO=0;SAF=34;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000291133;OID=.;OPOS=5212380;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:48:48:0:0:47:48:13:34:0:0:14:34:0:0 chr19 5214697 . A G 763.62 PASS AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00047456;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.958;QD=38.6644;RBI=0.0237818;REFB=0;REVB=0.0237771;RO=0;SAF=41;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.39446e-05;OID=.;OPOS=5214697;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:80:79:0:0:79:79:38:41:0:0:38:41:0:0 chr19 5218836 . G A 104.25 PASS AO=17;DP=33;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=18;FWDB=0.00853828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.596;QD=10.6922;RBI=0.022692;REFB=-0.0253423;REVB=0.0210243;RO=16;SAF=5;SAR=12;SRF=0;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.364674;STB=0.687367;TYPE=snp;VARB=0.0186086;OID=.;OPOS=5218836;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:33:39:16:18:17:21:12:5:0:16:15:6:0:18 chr19 5273571 . T G 125.09 PASS AO=27;DP=53;FAO=28;FDP=54;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=23;FSRF=6;FSRR=20;FWDB=-0.0276699;FXX=0.0357079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.526;QD=9.26611;RBI=0.0294858;REFB=-0.0124871;REVB=-0.0101877;RO=23;SAF=4;SAR=23;SRF=5;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103287;STB=0.540568;TYPE=snp;VARB=0.01556;OID=.;OPOS=5273571;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:54:23:26:27:28:23:4:5:18:23:5:6:20 chr19 5455611 . C T 40.21 PASS AO=8;DP=27;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=0.134972;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=36.2874;QD=5.54585;RBI=0.16732;REFB=-0.0339993;REVB=0.0988868;RO=18;SAF=6;SAR=2;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0425351;STB=0.565919;TYPE=snp;VARB=0.05503;OID=.;OPOS=5455611;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:27:29:18:17:8:12:2:6:14:4:2:10:13:4 chr19 5455796 . A G 50.28 PASS AO=12;DP=32;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.000852948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.52;QD=6.09488;RBI=0.00873214;REFB=-0.0275585;REVB=-0.00869039;RO=20;SAF=8;SAR=4;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130519;STB=0.540999;TYPE=snp;VARB=0.037257;OID=.;OPOS=5455796;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:32:33:20:20:12:13:4:8:11:9:5:8:11:9 chr19 5455971 . G T 125.44 PASS AO=30;DP=68;FAO=31;FDP=69;FR=.;FRO=38;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=27;FSRR=11;FWDB=0.0238106;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.5226;QD=7.27164;RBI=0.0266679;REFB=-0.0233734;REVB=0.0120097;RO=35;SAF=21;SAR=9;SRF=26;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0500647;STB=0.521159;TYPE=snp;VARB=0.0227303;OID=.;OPOS=5455971;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:69:35:38:30:31:9:21:26:9:10:21:27:11 chr19 5455976 . C T 140.31 PASS AO=31;DP=68;FAO=33;FDP=70;FR=.;FRO=37;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=11;FWDB=0.0382453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.2769;QD=8.01773;RBI=0.0468152;REFB=0.00853302;REVB=0.0269993;RO=37;SAF=22;SAR=9;SRF=26;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00814665;STB=0.521726;TYPE=snp;VARB=-0.00608601;OID=.;OPOS=5455976;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:70:37:37:31:33:9:22:26:11:11:22:26:11 chr19 5455978 . T C 152.09 PASS AO=33;DP=70;FAO=35;FDP=72;FR=.;FRO=37;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=11;FWDB=-0.0520358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.131;QD=8.44919;RBI=0.0554088;REFB=-0.0331544;REVB=-0.0190372;RO=37;SAF=24;SAR=9;SRF=26;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0287377;STB=0.510198;TYPE=snp;VARB=0.0275568;OID=.;OPOS=5455978;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:72:37:37:33:35:9:24:26:11:11:24:26:11 chr19 5456450 . T C 691.35 PASS AO=71;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0247713;FXX=0.0266631;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.379;QD=37.8823;RBI=0.0318971;REFB=0;REVB=0.0200948;RO=0;SAF=25;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.50978e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.30981e-05;OID=.;OPOS=5456450;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:73:73:0:0:71:73:46:25:0:0:48:25:0:0 chr19 5591735 . G A 264.02 PASS AO=48;DP=78;FAO=48;FDP=78;FR=.;FRO=30;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=20;FSRR=10;FWDB=0.0104373;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=107.184;QD=13.5396;RBI=0.0768263;REFB=-0.0297022;REVB=0.076114;RO=30;SAF=23;SAR=25;SRF=20;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131837;STB=0.571779;TYPE=snp;VARB=0.0145727;OID=.;OPOS=5591735;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:30:30:48:48:25:23:20:10:25:23:20:10 chr19 5696146 . G A 80.64 PASS AO=17;DP=41;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.00992394;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.1686;QD=7.68002;RBI=0.0337659;REFB=-0.00674554;REVB=0.0322746;RO=22;SAF=10;SAR=7;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00270738;STB=0.545407;TYPE=snp;VARB=0.0108647;OID=.;OPOS=5696146;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:41:42:22:23:17:19:7:10:13:9:9:10:14:9 chr19 5766090 . T C 119.68 PASS AO=34;DP=84;FAO=34;FDP=84;FR=.;FRO=50;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=30;FSRR=20;FWDB=-0.0198824;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.88;QD=5.69917;RBI=0.0431767;REFB=-0.00246286;REVB=-0.0383265;RO=49;SAF=22;SAR=12;SRF=29;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0614904;STB=0.530102;TYPE=snp;VARB=0.00293498;OID=.;OPOS=5766090;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:49:50:34:34:12:22:29:20:12:22:30:20 chr19 5784667 . T C 17.4 PASS AO=4;DP=13;FAO=4;FDP=13;FR=.;FRO=9;FSAF=0;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7477;QD=5.35325;RBI=0.00564361;REFB=-0.0306002;REVB=0.00564361;RO=8;SAF=0;SAR=4;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0657926;OID=.;OPOS=5784667;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:13:13:8:9:4:4:4:0:0:8:4:0:0:9 chr19 5831634 . G T 70.68 PASS AO=18;DP=43;FAO=18;FDP=43;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=0.0977864;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0337;QD=6.57443;RBI=0.122852;REFB=-0.00988804;REVB=0.0743675;RO=23;SAF=11;SAR=7;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0024826;STB=0.506768;TYPE=snp;VARB=0.0204028;OID=.;OPOS=5831634;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:43:43:23:25:18:18:7:11:14:9:7:11:15:10 chr19 5831724 . T C 73.84 PASS AO=7;DP=7;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0294153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.885;QD=36.9199;RBI=0.0594036;REFB=0;REVB=-0.0516093;RO=0;SAF=5;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.27427e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000604699;OID=.;OPOS=5831724;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:8:0:0:7:8:2:5:0:0:2:6:0:0 chr19 5831840 . C T 137.37 PASS AO=29;DP=58;FAO=30;FDP=60;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.00270589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.36;QD=9.15782;RBI=0.00511293;REFB=-0.00196618;REVB=-0.00433823;RO=29;SAF=14;SAR=15;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0308283;STB=0.516693;TYPE=snp;VARB=0.00244872;OID=.;OPOS=5831840;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:60:29:30:29:30:15:14:15:14:16:14:15:15 chr19 5832209 . G A 686.61 PASS AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.048041;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=234.261;QD=36.6193;RBI=0.0520219;REFB=-0.0854908;REVB=0.0199586;RO=1;SAF=41;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0113997;STB=0.506023;TYPE=snp;VARB=0.000239565;OID=.;OPOS=5832209;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:75:75:1:1:74:74:33:41:1:0:33:41:1:0 chr19 5843784 . A T 102.12 PASS AO=23;DP=49;FAO=23;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.019092;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.656;QD=8.50988;RBI=0.0193005;REFB=-0.0393207;REVB=0.00282887;RO=26;SAF=13;SAR=10;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0254242;STB=0.50276;TYPE=snp;VARB=0.0383517;OID=.;OPOS=5843784;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:48:26:25:23:23:10:13:14:12:10:13:14:11 chr19 5844537 . A G 72.61 PASS AO=22;DP=59;FAO=22;FDP=60;FR=.;FRO=38;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=-0.0162514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.005;QD=4.84075;RBI=0.0244704;REFB=-0.0100925;REVB=-0.0182947;RO=37;SAF=10;SAR=12;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0929941;STB=0.545413;TYPE=snp;VARB=0.0294662;OID=.;OPOS=5844537;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:59:60:37:38:22:22:12:10:20:17:12:10:20:18 chr19 5844649 . G A 10.48 PASS AO=4;DP=21;FAO=4;FDP=21;FR=.;FRO=17;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.0345199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.42;QD=1.99588;RBI=0.0355687;REFB=-0.00699227;REVB=-0.00857378;RO=17;SAF=1;SAR=3;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.26482;STB=0.691296;TYPE=snp;VARB=0.0158196;OID=.;OPOS=5844649;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:21:21:17:17:4:4:3:1:8:9:3:1:8:9 chr19 5844792 . A C 18.62 PASS AO=6;DP=18;FAO=5;FDP=17;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.0302978;FXX=0.0555247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2753;QD=4.38015;RBI=0.0613985;REFB=-0.0240574;REVB=-0.0534024;RO=12;SAF=5;SAR=1;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.329965;STB=0.684891;TYPE=snp;VARB=0.0767842;OID=.;OPOS=5844792;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:18:17:12:12:6:5:1:5:7:5:1:4:7:5 chr19 5866654 . A G 48.06 PASS AO=13;DP=38;FAO=14;FDP=39;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.0228782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.219;QD=4.92931;RBI=0.0228818;REFB=-0.0159373;REVB=-0.000403609;RO=25;SAF=6;SAR=7;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0204309;STB=0.533285;TYPE=snp;VARB=0.0228496;OID=.;OPOS=5866654;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:38:39:25:25:13:14:7:6:12:13:8:6:12:13 chr19 5867191 . G A 132.45 PASS AO=18;DP=22;FAO=18;FDP=22;FR=.;FRO=4;FSAF=17;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0172627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.156;QD=24.0812;RBI=0.0260921;REFB=-0.00865178;REVB=-0.0195651;RO=4;SAF=17;SAR=1;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.404356;STB=0.728231;TYPE=snp;VARB=0.00228859;OID=.;OPOS=5867191;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:22:22:4:4:18:18:1:17:2:2:1:17:2:2 chr19 5867748 . G T 27.69 PASS AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=-0.0255046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.16;QD=7.38339;RBI=0.0288657;REFB=-0.012914;REVB=0.0135183;RO=9;SAF=3;SAR=3;SRF=1;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.39381;STB=0.732723;TYPE=snp;VARB=0.0168453;OID=.;OPOS=5867748;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:15:15:9:9:6:6:3:3:1:8:3:3:1:8 chr19 5908969 . G A 21.49 PASS AO=5;DP=18;FAO=6;FDP=20;FR=.;FRO=14;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=14;FWDB=-0.0465605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.7518;QD=4.29811;RBI=0.0475853;REFB=-0.0253824;REVB=0.00982207;RO=13;SAF=1;SAR=4;SRF=0;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.542477;STB=0.791194;TYPE=snp;VARB=0.0369221;OID=.;OPOS=5908969;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:18:20:13:14:5:6:4:1:0:13:5:1:0:14 chr19 6156483 . T C 164.02 PASS AO=46;DP=116;FAO=49;FDP=122;FR=.;FRO=73;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=15;FSRR=58;FWDB=-0.0166673;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=84.3701;QD=5.37769;RBI=0.0172451;REFB=-0.0522431;REVB=-0.00442651;RO=70;SAF=20;SAR=26;SRF=13;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.285874;STB=0.631531;TYPE=snp;VARB=0.0390656;OID=.;OPOS=6156483;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:122:70:73:46:49:26:20:13:57:29:20:15:58 chr19 6156510 . A G 361.95 PASS AO=74;DP=133;FAO=74;FDP=132;FR=.;FRO=58;FSAF=11;FSAR=63;FSRF=27;FSRR=31;FWDB=-0.0134354;FXX=0.00751823;HRUN=3;LEN=1;MLLD=222.767;QD=10.9683;RBI=0.0211654;REFB=-0.0108066;REVB=0.0163543;RO=58;SAF=11;SAR=63;SRF=27;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.358192;STB=0.698304;TYPE=snp;VARB=0.00852894;OID=.;OPOS=6156510;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:132:58:58:74:74:63:11:27:31:63:11:27:31 chr19 6222428 . G C 10.17 PASS AO=2;DP=8;FAO=2;FDP=8;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.00129048;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=29.968;QD=5.08625;RBI=0.00129048;REFB=-0.0402888;REVB=0;RO=6;SAF=2;SAR=0;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.111431;OID=.;OPOS=6222428;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:8:6:6:2:2:0:2:6:0:0:2:6:0 chr19 6333476 . G A 1033.71 PASS AO=112;DP=114;FAO=112;FDP=114;FR=.;FRO=2;FSAF=45;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0180481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.164;QD=36.2706;RBI=0.0246433;REFB=-0.0352376;REVB=0.0167798;RO=2;SAF=45;SAR=67;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0139609;STB=0.507352;TYPE=snp;VARB=0.00109261;OID=.;OPOS=6333476;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:114:114:2:2:112:112:67:45:0:2:67:45:0:2 chr19 6375914 . TG T 165.06 PASS AO=21;DP=30;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0451777;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.1362;QD=22.7668;RBI=0.299402;REFB=0;REVB=0.295974;RO=7;SAF=12;SAR=9;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0.29899;SSSB=0.193526;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0201094;OID=.;OPOS=6375915;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:21:29:29:29:0:13:16:0:0:15:7:12:9:1:6 chr19 6417052 . TGGGGGCC TGGCC,TGGGG,TGGGGG,TGCTGGCC 113.15 PASS AO=3,4,2,2;DP=15;FAO=0,5,2,6;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=0,5,2,0;FSAR=0,0,0,6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0356539,-0.0551594,-0.0948627,-0.0199855;FXX=0;HRUN=5,5,4,5;LEN=3,3,2,2;MLLD=38.4681,36.2472,36.3421,201.952;QD=34.8143;RBI=0.0438205,0.103033,0.132035,0.103336;REFB=0,0,0,0;REVB=-0.0254762,-0.087024,-0.0918382,0.101385;RO=0;SAF=0,4,2,0;SAR=3,0,0,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.305263,0.305263,0,0;SSEP=0,0,0.472222,0;SSSB=0,0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;TYPE=del,del,del,mnp;VARB=0,0.00675435,-0.0178884,0.00216146;OID=.,.,.,.;OPOS=6417053,6417057,6417058,6417054;OREF=GGG,GCC,CC,GG;OALT=-,-,-,CT;OMAPALT=TGGCC,TGGGG,TGGGGG,TGCTGGCC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/4:3,4,2,2:12:0,5,2,6:13:0:0,5,2,0:0,0,0,6:0:0:26:0:0,4,2,0:3,0,0,2:0:0 chr19 6430106 . C T 55.64 PASS AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=-0.00935557;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.331;QD=6.54578;RBI=0.00938076;REFB=-0.0177249;REVB=-0.000687077;RO=20;SAF=7;SAR=7;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.255303;STB=0.646867;TYPE=snp;VARB=0.0326514;OID=.;OPOS=6430106;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:34:34:20:20:14:14:7:7:5:15:7:7:5:15 chr19 6432112 . G A 343.78 PASS AO=63;DP=112;FAO=64;FDP=107;FR=.;FRO=43;FSAF=27;FSAR=37;FSRF=13;FSRR=30;FWDB=0.0235386;FXX=0.115693;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.695;QD=12.8516;RBI=0.0237553;REFB=-0.015792;REVB=0.00320167;RO=38;SAF=26;SAR=37;SRF=13;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0510006;STB=0.55;TYPE=snp;VARB=0.00977497;OID=.;OPOS=6432112;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:107:38:43:63:64:37:26:13:25:37:27:13:30 chr19 6456019 . T C 116.45 PASS AO=24;DP=45;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.0168883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.6391;QD=10.3509;RBI=0.0603072;REFB=0.00185592;REVB=0.0578942;RO=21;SAF=18;SAR=6;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177586;STB=0.599911;TYPE=snp;VARB=-0.000839576;OID=.;OPOS=6456019;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:45:45:21:21:24:24:6:18:12:9:6:18:12:9 chr19 6456021 . C A 116.45 PASS AO=24;DP=45;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.0273294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.0757;QD=10.3507;RBI=0.0343608;REFB=-0.0162507;REVB=0.0208271;RO=21;SAF=18;SAR=6;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177586;STB=0.599911;TYPE=snp;VARB=0.0191632;OID=.;OPOS=6456021;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:45:45:21:21:24:24:6:18:12:9:6:18:12:9 chr19 6458240 . G C 360.09 PASS AO=77;DP=143;FAO=77;FDP=143;FR=.;FRO=66;FSAF=12;FSAR=65;FSRF=6;FSRR=60;FWDB=0.0213539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.452;QD=10.0723;RBI=0.0219345;REFB=-0.0309183;REVB=0.00501361;RO=65;SAF=12;SAR=65;SRF=6;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110166;STB=0.561783;TYPE=snp;VARB=0.0287559;OID=.;OPOS=6458240;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:65:66:77:77:65:12:6:59:65:12:6:60 chr19 6466482 . A G 1266.91 PASS AO=123;DP=124;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00619817;FXX=0.0147048;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.747;QD=37.8182;RBI=0.010579;REFB=-0.0204241;REVB=-0.00857311;RO=0;SAF=49;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.79611e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.45734e-05;OID=.;OPOS=6466482;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:124:134:0:0:123:134:74:49:0:0:81:53:0:0 chr19 6468331 . T C 61.51 PASS AO=16;DP=39;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0213187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.7664;QD=6.30827;RBI=0.049647;REFB=-0.00876693;REVB=0.0448368;RO=22;SAF=6;SAR=10;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172576;STB=0.612761;TYPE=snp;VARB=0.00487856;OID=.;OPOS=6468331;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:39:39:22:23:16:16:10:6:12:10:10:6:13:10 chr19 6477256 . G T 88.16 PASS AO=22;DP=51;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=19;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=3.51354e-05;FXX=0;HRUN=9;LEN=1;MLLD=242.284;QD=6.91436;RBI=0.00900748;REFB=-0.00217073;REVB=-0.00900741;RO=29;SAF=19;SAR=3;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.473141;STB=0.775219;TYPE=snp;VARB=0.00214638;OID=.;OPOS=6477256;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:51:51:29:29:22:22:3:19:14:15:3:19:14:15 chr19 6495736 . A G 61.6 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0511812;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3727;QD=35.1976;RBI=0.071624;REFB=0;REVB=-0.0501048;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00935608;OID=.;OPOS=6495736;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:3:4:0:0:3:4:0:0 chr19 6535080 . T C 1954.68 PASS AO=203;DP=204;FAO=206;FDP=206;FR=.;FRO=0;FSAF=160;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00352911;FXX=0.00483068;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.532;QD=37.9549;RBI=0.0559886;REFB=0.0341961;REVB=-0.0558773;RO=0;SAF=158;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000102129;OID=.;OPOS=6535080;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:204:206:0:0:203:206:45:158:0:0:46:160:0:0 chr19 6665020 . T C 554.98 PASS AO=60;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0403569;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.5891;QD=36.9988;RBI=0.0551305;REFB=0.0452317;REVB=0.0375591;RO=0;SAF=33;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.7886e-08;STB=0.50769;TYPE=snp;VARB=-0.012699;OID=.;OPOS=6665020;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:60:60:0:1:60:59:27:33:0:0:27:32:1:0 chr19 6677989 . G A 346.62 PASS AO=72;DP=130;FAO=72;FDP=131;FR=.;FRO=59;FSAF=29;FSAR=43;FSRF=29;FSRR=30;FWDB=0.0131573;FXX=0.0223864;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.376;QD=10.5839;RBI=0.0247873;REFB=-0.00679636;REVB=0.021007;RO=58;SAF=29;SAR=43;SRF=28;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0668207;STB=0.540869;TYPE=snp;VARB=0.00644504;OID=.;OPOS=6677989;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:131:58:59:72:72:43:29:28:30:43:29:29:30 chr19 6679511 . C T 154.61 PASS AO=12;DP=101;FAO=41;FDP=98;FR=.,HEALED;FRO=57;FSAF=10;FSAR=31;FSRF=11;FSRR=46;FWDB=0.0765043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.43;QD=6.31051;RBI=0.0788343;REFB=-0.0494275;REVB=-0.0190246;RO=20;SAF=9;SAR=3;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.238155;STB=0.541852;TYPE=snp;VARB=0.0643191;OID=.;OPOS=6679511;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:98:20:57:12:41:3:9:11:9:31:10:11:46 chr19 6696597 . G A 288.16 PASS AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0362416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.1818;QD=37.1822;RBI=0.0397218;REFB=0;REVB=-0.0162593;RO=0;SAF=3;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.84607e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0002098;OID=.;OPOS=6696597;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:30:31:0:0:30:31:27:3:0:0:28:3:0:0 chr19 6697406 . A G 1870.46 PASS AO=193;DP=195;FAO=195;FDP=195;FR=.;FRO=0;FSAF=120;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174844;FXX=0.0151508;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.844;QD=38.3684;RBI=0.0177987;REFB=0;REVB=0.00332961;RO=0;SAF=119;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000133182;OID=.;OPOS=6697406;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:195:195:0:0:193:195:74:119:0:0:75:120:0:0 chr19 6702157 . C G 1199.8 PASS AO=136;DP=146;FAO=138;FDP=145;FR=.;FRO=7;FSAF=50;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0.00650366;FXX=0.0136045;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.336;QD=33.098;RBI=0.142162;REFB=-0.178338;REVB=0.142013;RO=1;SAF=50;SAR=86;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00549615;STB=0.519123;TYPE=snp;VARB=0.00396337;OID=.;OPOS=6702157;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:146:145:1:7:136:138:86:50:0:1:88:50:0:7 chr19 6709704 . C T 86.69 PASS AO=16;DP=28;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.0060127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.079;QD=12.3837;RBI=0.048649;REFB=0.01329;REVB=0.048276;RO=12;SAF=11;SAR=5;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0883617;STB=0.549936;TYPE=snp;VARB=-0.00460412;OID=.;OPOS=6709704;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:28:28:12:12:16:16:5:11:7:5:5:11:7:5 chr19 6710782 . G T 235.36 PASS AO=47;DP=83;FAO=47;FDP=83;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=30;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.00842436;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=225.057;QD=11.3424;RBI=0.0153203;REFB=-0.0204204;REVB=-0.0127961;RO=36;SAF=17;SAR=30;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.069233;STB=0.538027;TYPE=snp;VARB=0.016008;OID=.;OPOS=6710782;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:36:36:47:47:30:17:16:20:30:17:16:20 chr19 6713262 . G A 93.24 PASS AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=33;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0077126;FXX=0.0294031;HRUN=5;LEN=1;MLLD=229.512;QD=11.302;RBI=0.0271829;REFB=-0.00292118;REVB=-0.0260658;RO=14;SAF=7;SAR=11;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.088825;STB=0.536544;TYPE=snp;VARB=0.00245592;OID=.;OPOS=6713262;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:34:33:14:15:18:18:11:7:7:7:11:7:7:8 chr19 6713291 . C T 28.21 PASS AO=11;DP=41;FAO=11;FDP=41;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=0.0742263;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.1297;QD=2.75253;RBI=0.0754396;REFB=-0.00150532;REVB=0.0134753;RO=30;SAF=8;SAR=3;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.414437;STB=0.754918;TYPE=snp;VARB=0.00812221;OID=.;OPOS=6713291;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:41:41:30:30:11:11:3:8:11:19:3:8:11:19 chr19 6718387 . G C 342.41 PASS AO=31;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016399;FXX=0.0714116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.599;QD=35.1185;RBI=0.0236219;REFB=0.0864164;REVB=0.0170019;RO=0;SAF=18;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.33668e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00207049;OID=.;OPOS=6718387;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:39:39:0:0:31:38:13:18:0:0:17:21:0:0 chr19 6731057 . T C 29.74 PASS AO=8;DP=20;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=-0.0382025;FXX=0.049975;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.6228;QD=6.2603;RBI=0.134642;REFB=-0.023513;REVB=-0.129108;RO=12;SAF=3;SAR=5;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0448594;STB=0.535609;TYPE=snp;VARB=-0.00656376;OID=.;OPOS=6731057;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:20:19:12:12:8:7:5:3:4:8:5:2:4:8 chr19 6735990 . G A 101.2 PASS AO=10;DP=13;FAO=15;FDP=16;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=21.9545;QD=25.2995;RBI=0.127031;REFB=-0.197307;REVB=0.127031;RO=3;SAF=0;SAR=10;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0190454;OID=.;OPOS=6735990;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:13:16:3:1:10:15:10:0:0:3:15:0:0:1 chr19 6737481 . T C 22.74 PASS AO=4;DP=8;FAO=4;FDP=8;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0305258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.409;QD=11.3685;RBI=0.0412495;REFB=-0.0282939;REVB=-0.0277433;RO=4;SAF=2;SAR=2;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201109;STB=0.624412;TYPE=snp;VARB=0.0319449;OID=.;OPOS=6737481;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:8:8:4:4:4:4:2:2:1:3:2:2:1:3 chr19 6737509 . G A 18.62 PASS AO=4;DP=12;FAO=4;FDP=12;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.0569322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.148;QD=6.20763;RBI=0.0626056;REFB=-0.0159907;REVB=0.026042;RO=8;SAF=1;SAR=3;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.272394;STB=0.680854;TYPE=snp;VARB=0.047973;OID=.;OPOS=6737509;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:12:12:8:8:4:4:3:1:4:4:3:1:4:4 chr19 6833777 . A G 417.02 PASS AO=123;DP=300;FAO=124;FDP=301;FR=.;FRO=177;FSAF=53;FSAR=71;FSRF=103;FSRR=74;FWDB=-0.0162213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.634;QD=5.54178;RBI=0.01794;REFB=-0.00687275;REVB=-0.0076624;RO=177;SAF=52;SAR=71;SRF=103;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1673;STB=0.590359;TYPE=snp;VARB=0.00861872;OID=.;OPOS=6833777;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:300:301:177:177:123:124:71:52:103:74:71:53:103:74 chr19 6833989 . G T 59.79 PASS AO=18;DP=55;FAO=21;FDP=63;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=32;FSRR=10;FWDB=0.0223945;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=31.5275;QD=3.79646;RBI=0.0657494;REFB=-0.0360584;REVB=-0.0618181;RO=37;SAF=10;SAR=8;SRF=32;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.387567;STB=0.661403;TYPE=snp;VARB=0.0505113;OID=.;OPOS=6833989;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:55:63:37:42:18:21:8:10:32:5:10:11:32:10 chr19 6896483 . G A 1144.07 PASS AO=122;DP=123;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00347411;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.5524;QD=37.5105;RBI=0.0485677;REFB=-0.0508264;REVB=0.0484433;RO=0;SAF=55;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000641071;OID=.;OPOS=6896483;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:123:122:0:0:122:122:67:55:0:0:67:55:0:0 chr19 6897464 . C G 1850.79 PASS AO=180;DP=180;FAO=194;FDP=194;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=108;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.031;QD=38.1606;RBI=0.0278202;REFB=0;REVB=0.0211984;RO=0;SAF=77;SAR=103;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.3304e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000139417;OID=.;OPOS=6897464;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:180:194:0:0:180:194:103:77:0:0:108:86:0:0 chr19 6901891 . G A 1514.19 PASS AO=162;DP=165;FAO=164;FDP=164;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0758909;FXX=0.00606024;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9859;QD=36.9316;RBI=0.0814551;REFB=-0.0591614;REVB=0.0295888;RO=2;SAF=90;SAR=72;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0013051;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00129166;OID=.;OPOS=6901891;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:165:164:2:0:162:164:72:90:1:1:73:91:0:0 chr19 6903920 . A G 2256.31 PASS AO=236;DP=240;FAO=236;FDP=236;FR=.;FRO=0;FSAF=126;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00698848;FXX=0.016666;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.2945;QD=38.2426;RBI=0.00969847;REFB=-0.0352889;REVB=-0.00672468;RO=1;SAF=126;SAR=110;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00376762;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.43168e-05;OID=.;OPOS=6903920;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:240:236:1:0:236:236:110:126:1:0:110:126:0:0 chr19 6904137 . C T 1229.55 PASS AO=118;DP=118;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0741303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.236;QD=38.4235;RBI=0.0802351;REFB=0;REVB=0.030698;RO=0;SAF=57;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.03988e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00018119;OID=.;OPOS=6904137;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:118:128:0:0:118:128:61:57:0:0:70:58:0:0 chr19 6913707 . C T 1415.27 PASS AO=146;DP=148;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0521179;FXX=0.0134219;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.587;QD=38.5107;RBI=0.0522001;REFB=0;REVB=0.00292839;RO=0;SAF=60;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000180324;OID=.;OPOS=6913707;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:148:147:0:0:146:147:86:60:0:0:86:61:0:0 chr19 6913811 . A G 1640.11 PASS AO=171;DP=171;FAO=172;FDP=172;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00979188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.3255;QD=38.1422;RBI=0.0100363;REFB=0;REVB=-0.00220124;RO=0;SAF=58;SAR=113;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.22305e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.7375e-05;OID=.;OPOS=6913811;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:171:172:0:0:171:172:113:58:0:0:113:59:0:0 chr19 6919624 . A C 1612.74 PASS AO=176;DP=180;FAO=177;FDP=181;FR=.;FRO=4;FSAF=108;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.0179277;FXX=0.0054942;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.2717;QD=35.6407;RBI=0.0429648;REFB=-0.0265108;REVB=-0.0390457;RO=3;SAF=109;SAR=67;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0208329;STB=0.514083;TYPE=snp;VARB=3.16879e-05;OID=.;OPOS=6919624;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:180:181:3:4:176:177:67:109:0:3:69:108:0:4 chr19 6919753 . A G 1312.39 PASS AO=137;DP=140;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=117;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0495818;FXX=0.0212751;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.147;QD=38.0404;RBI=0.0574326;REFB=0;REVB=-0.0289854;RO=0;SAF=21;SAR=116;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.32174e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000172276;OID=.;OPOS=6919753;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:140:138:0:0:137:138:116:21:0:0:117:21:0:0 chr19 6926378 . T C 1690.09 PASS AO=173;DP=180;FAO=181;FDP=181;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0303808;FXX=0.0523533;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.2;QD=37.35;RBI=0.0392642;REFB=0;REVB=0.0248734;RO=0;SAF=83;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00209102;OID=.;OPOS=6926378;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:180:181:0:0:173:181:90:83:0:0:93:88:0:0 chr19 6974564 . C T 998.13 PASS AO=106;DP=108;FAO=107;FDP=109;FR=.;FRO=2;FSAF=52;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0320052;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.321;QD=36.6287;RBI=0.0327972;REFB=-0.167758;REVB=0.00716411;RO=1;SAF=52;SAR=54;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00870811;STB=0.500257;TYPE=snp;VARB=0.00099715;OID=.;OPOS=6974564;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:108:109:1:2:106:107:54:52:0:1:55:52:1:1 chr19 7005905 . T A 334.9 PASS AO=23;DP=46;FAO=37;FDP=37;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118429;FXX=0.0512689;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.3204;QD=36.2055;RBI=0.0156276;REFB=0;REVB=-0.0101965;RO=0;SAF=6;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.9951e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.72006e-05;OID=.;OPOS=7005905;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:39:37:0:0:23:37:17:6:0:0:17:20:0:0 chr19 7012026 . A G 55.87 PASS AO=21;DP=136;FAO=38;FDP=154;FR=.;FRO=116;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=66;FSRR=50;FWDB=0.0338349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.422;QD=1.45111;RBI=0.0343592;REFB=-0.010322;REVB=0.00597904;RO=114;SAF=16;SAR=5;SRF=66;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.256802;STB=0.571028;TYPE=snp;VARB=0.0302703;OID=.;OPOS=7012026;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:136:154:114:116:21:38:5:16:66:48:13:25:66:50 chr19 7116136 . C T 14.26 PASS AO=7;DP=21;FAO=5;FDP=21;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.0162945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.317;QD=2.71685;RBI=0.0163177;REFB=-0.0127794;REVB=0.000869538;RO=9;SAF=3;SAR=4;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0150213;STB=0.666032;TYPE=snp;VARB=0.0341943;OID=.;OPOS=7116136;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:21:21:9:16:7:5:4:3:4:5:2:3:6:10 chr19 7184518 . G A 129 PASS AO=24;DP=46;FAO=26;FDP=48;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.0137957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.285;QD=10.7498;RBI=0.0299941;REFB=-0.0178932;REVB=0.0266331;RO=22;SAF=10;SAR=14;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0470398;STB=0.510196;TYPE=snp;VARB=0.0150628;OID=.;OPOS=7184518;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:46:48:22:22:24:26:14:10:8:14:16:10:8:14 chr19 7504982 . C T 425.85 PASS AO=43;DP=45;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0637253;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.715;QD=36.2429;RBI=0.0670385;REFB=-0.0487977;REVB=0.0208145;RO=1;SAF=17;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0268199;STB=0.51219;TYPE=snp;VARB=0.000350118;OID=.;OPOS=7504982;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:45:47:1:1:43:46:26:17:1:0:26:20:1:0 chr19 7518588 . AG A 323.77 PASS AO=42;DP=67;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0718021;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.2739;QD=19.6222;RBI=0.345066;REFB=0;REVB=0.337513;RO=18;SAF=23;SAR=19;SRF=0;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0.588235;SSSB=0.298245;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00900553;OID=.;OPOS=7518589;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:42:65:66:66:0:25:41:0:0:28:18:23:19:0:18 chr19 7528734 . A G 101.96 PASS AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0861127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.658;QD=37.075;RBI=0.0871385;REFB=0;REVB=-0.0133307;RO=0;SAF=6;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00261492;OID=.;OPOS=7528734;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:11:11:5:6:0:0:5:6:0:0 chr19 7533767 . T G 116.42 PASS AO=12;DP=12;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0596109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.795;QD=35.82;RBI=0.068211;REFB=0;REVB=0.0331553;RO=0;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000216;OID=.;OPOS=7533767;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:12:13:0:0:12:13:8:4:0:0:9:4:0:0 chr19 7533850 . A G 127.22 PASS AO=15;DP=16;FAO=15;FDP=16;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00982333;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.441;QD=31.804;RBI=0.0195946;REFB=-0.0317688;REVB=-0.0169544;RO=1;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0434393;STB=0.523778;TYPE=snp;VARB=0.00765803;OID=.;OPOS=7533850;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:16:16:1:1:15:15:10:5:0:1:10:5:0:1 chr19 7538039 . A G 2771.61 PASS AO=287;DP=287;FAO=288;FDP=288;FR=.;FRO=0;FSAF=176;FSAR=112;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0290904;FXX=0.00346009;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.838;QD=38.4946;RBI=0.0327057;REFB=0;REVB=0.014947;RO=0;SAF=176;SAR=111;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.34822e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.07241e-06;OID=.;OPOS=7538039;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:287:288:0:0:287:288:111:176:0:0:112:176:0:0 chr19 7538117 . A G 454.13 PASS AO=102;DP=201;FAO=105;FDP=208;FR=.;FRO=103;FSAF=36;FSAR=69;FSRF=38;FSRR=65;FWDB=-0.0137374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.9101;QD=8.73326;RBI=0.0137805;REFB=-0.021983;REVB=-0.00108906;RO=97;SAF=36;SAR=66;SRF=38;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0372778;STB=0.514197;TYPE=snp;VARB=0.00957363;OID=.;OPOS=7538117;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:208:97:103:102:105:66:36:38:59:69:36:38:65 chr19 7547074 . A C 85.07 PASS AO=16;DP=33;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.0177942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.34;QD=9.7228;RBI=0.0179734;REFB=-0.00951551;REVB=0.00253168;RO=17;SAF=1;SAR=15;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.648558;STB=0.746817;TYPE=snp;VARB=0.0109565;OID=.;OPOS=7547074;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:33:35:17:17:16:18:15:1:10:7:15:3:10:7 chr19 7550844 . G A 170.33 PASS AO=41;DP=90;FAO=42;FDP=89;FR=.;FRO=47;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=-0.0157315;FXX=0.0111099;HRUN=2;LEN=1;MLLD=271.108;QD=7.65518;RBI=0.0161575;REFB=-0.00822032;REVB=-0.0036857;RO=47;SAF=15;SAR=26;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0390564;STB=0.526665;TYPE=snp;VARB=0.0101548;OID=.;OPOS=7550844;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:89:47:47:41:42:26:15:19:28:27:15:19:28 chr19 7570978 . T C 164.25 PASS AO=13;DP=48;FAO=29;FDP=47;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=1;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=17;FWDB=-0.0451343;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.1387;QD=13.979;RBI=0.178496;REFB=-0.1055;REVB=0.172696;RO=18;SAF=1;SAR=12;SRF=1;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0817064;STB=0.554414;TYPE=snp;VARB=0.0680407;OID=.;OPOS=7570978;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:47:47:18:18:13:29:12:1:1:17:28:1:1:17 chr19 7584223 . A G 291.06 PASS AO=78;DP=176;FAO=78;FDP=176;FR=.;FRO=98;FSAF=56;FSAR=22;FSRF=52;FSRR=46;FWDB=-0.00366659;FXX=0.0056494;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.982;QD=6.61507;RBI=0.0112512;REFB=0.00146179;REVB=0.010637;RO=97;SAF=56;SAR=22;SRF=51;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210985;STB=0.615751;TYPE=snp;VARB=-0.0018191;OID=.;OPOS=7584223;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:176:97:98:78:78:22:56:51:46:22:56:52:46 chr19 7593589 . C T 295.69 PASS AO=73;DP=155;FAO=73;FDP=154;FR=.;FRO=81;FSAF=13;FSAR=60;FSRF=18;FSRR=63;FWDB=0.0354783;FXX=0.0064512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.249;QD=7.68027;RBI=0.0355979;REFB=-0.00228267;REVB=0.00291541;RO=81;SAF=13;SAR=60;SRF=18;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0678612;STB=0.537717;TYPE=snp;VARB=0.00243163;OID=.;OPOS=7593589;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:154:81:81:73:73:60:13:18:63:60:13:18:63 chr19 7606908 . G C 85.47 PASS AO=31;DP=99;FAO=33;FDP=101;FR=.;FRO=68;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=47;FWDB=-0.0083976;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.193;QD=3.38502;RBI=0.0135267;REFB=0.00143483;REVB=-0.0106043;RO=53;SAF=15;SAR=16;SRF=18;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160307;STB=0.637802;TYPE=snp;VARB=-0.00739653;OID=.;OPOS=7606908;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:99:101:53:68:31:33:16:15:18:35:16:17:21:47 chr19 7690845 . AG A 51.68 PASS AO=10;DP=31;FAO=18;FDP=30;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.135923;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=12.9341;QD=6.89068;RBI=0.19116;REFB=-0.0514589;REVB=-0.134414;RO=11;SAF=0;SAR=10;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.824837;STB=0.87876;TYPE=del;VARB=0.0422385;OID=.;OPOS=7690846;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:10:30:18:30:12:1:17:8:4:26:11:0:10:8:3 chr19 7705340 . A AG 30.61 PASS AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=0.00806817;FXX=0.0713776;HRUN=0;LEN=1;MLLD=22.4682;QD=9.4194;RBI=0.00806817;REFB=-0.0967153;REVB=0;RO=7;SAF=6;SAR=0;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.113932;OID=.;OPOS=7705341;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:6:14:6:13:7:6:0:7:0:29:7:6:0:7:0 chr19 7705552 . GGC G,GG 198.04 PASS AO=5,18;DP=33;FAO=0,30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=0,14;FSAR=0,16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0257776,0.380831;FXX=0.0322477;HRUN=2,2;LEN=2,1;MLLD=9.06457,17.2177;QD=26.4054;RBI=0.0591734,0.380849;REFB=0,0;REVB=-0.0532635,-0.00366878;RO=5;SAF=5,3;SAR=0,15;SRF=4;SRR=1;SSEN=0,0.361213;SSEP=0.349427,0;SSSB=0.706441,-0.334033;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=0,0.0200804;OID=.,.;OPOS=7705553,7705554;OREF=GC,C;OALT=-,-;OMAPALT=G,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:5,18:30:0,30:30:0:0,14:0,16:0:0:18:5:5,3:0,15:4:1 chr19 7743879 . C T 105.04 PASS AO=19;DP=32;FAO=19;FDP=32;FR=.;FRO=13;FSAF=18;FSAR=1;FSRF=13;FSRR=0;FWDB=0.0325164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.1692;QD=13.1302;RBI=0.0995881;REFB=0.0129251;REVB=0.0941301;RO=13;SAF=18;SAR=1;SRF=13;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243746;STB=0.632546;TYPE=snp;VARB=-0.0024139;OID=.;OPOS=7743879;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:32:32:13:13:19:19:1:18:13:0:1:18:13:0 chr19 7810698 . A G 16.29 PASS AO=2;DP=7;FAO=3;FDP=7;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.00442661;FXX=0.124844;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.028;QD=9.30974;RBI=0.0844148;REFB=-0.0410106;REVB=0.0842986;RO=4;SAF=1;SAR=1;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.532453;STB=0.748908;TYPE=snp;VARB=0.109268;OID=.;OPOS=7810698;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:7:7:4:4:2:3:1:1:4:0:1:2:4:0 chr19 7831628 . G A 423.93 PASS AO=53;DP=100;FAO=90;FDP=165;FR=.;FRO=75;FSAF=52;FSAR=38;FSRF=38;FSRR=37;FWDB=-0.00727833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.937;QD=10.2771;RBI=0.0291583;REFB=-0.0250093;REVB=0.0282353;RO=45;SAF=33;SAR=20;SRF=30;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0395932;STB=0.53278;TYPE=snp;VARB=0.0246858;OID=.;OPOS=7831628;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:165:45:75:53:90:20:33:30:15:38:52:38:37 chr19 7913974 . T C 665.58 PASS AO=72;DP=73;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=49;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00593822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.282;QD=35.9774;RBI=0.0110979;REFB=-0.0221594;REVB=-0.00937552;RO=1;SAF=24;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192957;STB=0.510201;TYPE=snp;VARB=-4.52492e-06;OID=.;OPOS=7913974;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:73:74:1:1:72:73:48:24:1:0:49:24:1:0 chr19 7916620 . A G 326.1 PASS AO=33;DP=33;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0353229;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.813;QD=37.2687;RBI=0.0353519;REFB=0;REVB=-0.00143224;RO=0;SAF=14;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.71297e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000158753;OID=.;OPOS=7916620;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:33:35:0:0:33:35:19:14:0:0:20:15:0:0 chr19 7928462 . T C 74.28 PASS AO=6;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.1317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.585;QD=37.1384;RBI=0.145798;REFB=0;REVB=0.0625477;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00665428;OID=.;OPOS=7928462;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:6:8:5:1:0:0:5:3:0:0 chr19 7928788 . A C 195.16 PASS AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0309143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.422;QD=37.1724;RBI=0.0327593;REFB=0;REVB=-0.0108387;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000616948;OID=.;OPOS=7928788;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:21:21:0:0:21:21:9:12:0:0:9:12:0:0 chr19 7929690 . C T 212.84 PASS AO=47;DP=92;FAO=48;FDP=95;FR=.;FRO=47;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=28;FSRR=19;FWDB=-0.00366594;FXX=0.0104156;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.084;QD=8.96152;RBI=0.0146399;REFB=-0.0169292;REVB=0.0141735;RO=44;SAF=24;SAR=23;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0504506;STB=0.537226;TYPE=snp;VARB=0.0162156;OID=.;OPOS=7929690;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:95:44:47:47:48:23:24:25:19:23:25:28:19 chr19 7934941 . C G 14.3 PASS AO=3;DP=10;FAO=3;FDP=10;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=0.0224128;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.2126;QD=5.72013;RBI=0.0224128;REFB=-0.0758899;REVB=0;RO=7;SAF=3;SAR=0;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.134765;OID=.;OPOS=7934941;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:10:10:7:7:3:3:0:3:7:0:0:3:7:0 chr19 7934942 . T TC 11.33 PASS AO=2;DP=10;FAO=3;FDP=10;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=-0.0374316;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=61.4623;QD=4.53236;RBI=0.0374316;REFB=-0.0222306;REVB=0;RO=7;SAF=2;SAR=0;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.229258;OID=.;OPOS=7934943;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:2:10:3:10:7:3:0:7:0:11:7:2:0:7:0 chr19 7935116 . T G 21.85 PASS AO=4;DP=8;FAO=4;FDP=8;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0233717;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.222;QD=10.9236;RBI=0.0393214;REFB=-0.0227764;REVB=-0.0316217;RO=4;SAF=1;SAR=3;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.338535;STB=0.699286;TYPE=snp;VARB=0.0437557;OID=.;OPOS=7935116;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:8:8:4:4:4:4:3:1:0:4:3:1:0:4 chr19 7944348 . TC T 349.3 PASS AO=42;DP=50;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.046203;FXX=0.0217344;HRUN=2;LEN=1;MLLD=27.0217;QD=31.0493;RBI=0.109405;REFB=0;REVB=0.0991705;RO=0;SAF=34;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.67012e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00554768;OID=.;OPOS=7944349;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:42:46:45:45:0:35:10:0:0:31:0:34:8:0:0 chr19 7951933 . G C 194.67 PASS AO=50;DP=111;FAO=50;FDP=111;FR=.;FRO=61;FSAF=36;FSAR=14;FSRF=34;FSRR=27;FWDB=-0.0135833;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.7;QD=7.01499;RBI=0.0250582;REFB=-0.0237343;REVB=0.0210572;RO=61;SAF=36;SAR=14;SRF=34;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179778;STB=0.600935;TYPE=snp;VARB=0.0300073;OID=.;OPOS=7951933;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:61:61:50:50:14:36:34:27:14:36:34:27 chr19 7963914 . A C 618.74 PASS AO=64;DP=65;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00960944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.461;QD=37.4996;RBI=0.0303772;REFB=0;REVB=0.0288172;RO=0;SAF=11;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.43321e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.92619e-05;OID=.;OPOS=7963914;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:65:66:0:0:64:66:53:11:0:0:54:12:0:0 chr19 7963976 . T C 117.97 PASS AO=22;DP=38;FAO=22;FDP=38;FR=.;FRO=16;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0492613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.291;QD=12.4183;RBI=0.0576021;REFB=-0.022075;REVB=0.0298551;RO=16;SAF=16;SAR=6;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193942;STB=0.608591;TYPE=snp;VARB=0.0343066;OID=.;OPOS=7963976;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:38:38:16:16:22:22:6:16:8:8:6:16:8:8 chr19 7964616 . G C 123.5 PASS AO=23;DP=48;FAO=26;FDP=50;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=0.0464303;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.71;QD=9.87976;RBI=0.0549332;REFB=-0.0166095;REVB=0.0293579;RO=24;SAF=5;SAR=18;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139389;STB=0.509084;TYPE=snp;VARB=0.0167545;OID=.;OPOS=7964616;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:50:24:24:23:26:18:5:8:16:18:8:7:17 chr19 7966567 . GC G 142.35 PASS AO=29;DP=39;FAO=29;FDP=40;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=27;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=0.0382456;FXX=0.0243843;HRUN=2;LEN=1;MLLD=25.8691;QD=14.2354;RBI=0.0658475;REFB=-0.0322513;REVB=0.0536019;RO=11;SAF=2;SAR=27;SRF=9;SRR=2;SSEN=0.552795;SSEP=0;SSSB=-0.602608;STB=0.836317;TYPE=del;VARB=0.0194294;OID=.;OPOS=7966568;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:29:41:29:40:11:2:27:9:2:15:11:2:27:9:2 chr19 7966993 . G A 109.35 PASS AO=28;DP=64;FAO=28;FDP=64;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=-0.00878753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.9592;QD=6.83431;RBI=0.0394381;REFB=-0.0226566;REVB=0.0384466;RO=36;SAF=10;SAR=18;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.062951;STB=0.535688;TYPE=snp;VARB=0.049524;OID=.;OPOS=7966993;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:36:36:28:28:18:10:15:21:18:10:15:21 chr19 7967812 . G T 196.97 PASS AO=44;DP=85;FAO=44;FDP=87;FR=.;FRO=43;FSAF=9;FSAR=35;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=-0.00472229;FXX=0.0113623;HRUN=3;LEN=1;MLLD=136.279;QD=9.05634;RBI=0.0289886;REFB=-0.00477015;REVB=0.0286014;RO=40;SAF=9;SAR=35;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.28731;STB=0.648502;TYPE=snp;VARB=0.00570405;OID=.;OPOS=7967812;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:87:40:43:44:44:35:9:19:21:35:9:19:24 chr19 7986638 . C G 121.4 PASS AO=24;DP=46;FAO=25;FDP=47;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=-0.0104416;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=232.402;QD=10.3319;RBI=0.012906;REFB=-0.0497193;REVB=0.00758537;RO=22;SAF=12;SAR=12;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155751;STB=0.593836;TYPE=snp;VARB=0.0322873;OID=.;OPOS=7986638;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:46:47:22:22:24:25:12:12:15:7:13:12:15:7 chr19 7987518 . AC A 22.95 PASS AO=7;DP=22;FAO=10;FDP=17;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.194334;FXX=0.0555247;HRUN=7;LEN=1;MLLD=9.14012;QD=5.40095;RBI=0.291993;REFB=-0.0740502;REVB=0.217931;RO=6;SAF=3;SAR=4;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0767769;STB=0.588064;TYPE=del;VARB=0.0751498;OID=.;OPOS=7987519;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:7:17:10:17:7:5:5:2:5:16:6:3:4:2:4 chr19 8027055 . G T 285.23 PASS AO=67;DP=137;FAO=67;FDP=136;FR=.;FRO=69;FSAF=30;FSAR=37;FSRF=23;FSRR=46;FWDB=-0.00952398;FXX=0.00729874;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.158;QD=8.38906;RBI=0.0222959;REFB=-0.00438407;REVB=-0.0201594;RO=67;SAF=30;SAR=37;SRF=22;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111122;STB=0.559408;TYPE=snp;VARB=0.00359071;OID=.;OPOS=8027055;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:136:67:69:67:67:37:30:22:45:37:30:23:46 chr19 8028544 . A G 357.84 PASS AO=98;DP=225;FAO=98;FDP=223;FR=.;FRO=125;FSAF=39;FSAR=59;FSRF=39;FSRR=86;FWDB=-0.0194422;FXX=0.00888849;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.7238;QD=6.41873;RBI=0.0197452;REFB=-0.0147785;REVB=0.00344574;RO=114;SAF=39;SAR=59;SRF=39;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.057464;STB=0.551321;TYPE=snp;VARB=0.0178546;OID=.;OPOS=8028544;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:225:223:114:125:98:98:59:39:39:75:59:39:39:86 chr19 8038679 . C T 337.55 PASS AO=78;DP=159;FAO=79;FDP=159;FR=.;FRO=80;FSAF=40;FSAR=39;FSRF=34;FSRR=46;FWDB=0.0707089;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.0478;QD=8.49172;RBI=0.0750124;REFB=-0.0138148;REVB=0.0250422;RO=78;SAF=39;SAR=39;SRF=33;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0698804;STB=0.540874;TYPE=snp;VARB=0.0189863;OID=.;OPOS=8038679;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:159:78:80:78:79:39:39:33:45:39:40:34:46 chr19 8122737 . G A 272.24 PASS AO=61;DP=121;FAO=61;FDP=120;FR=.;FRO=59;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=33;FSRR=26;FWDB=-0.0113785;FXX=0.00826378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.4326;QD=9.07448;RBI=0.0287207;REFB=-0.00031587;REVB=-0.0263706;RO=56;SAF=28;SAR=33;SRF=30;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0667568;STB=0.549234;TYPE=snp;VARB=-0.00181658;OID=.;OPOS=8122737;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:120:56:59:61:61:33:28:30:26:33:28:33:26 chr19 8122767 . T C 1291.78 PASS AO=135;DP=135;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00136819;FXX=0.0073524;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.288;QD=38.2749;RBI=0.0304537;REFB=0;REVB=-0.030423;RO=0;SAF=65;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.62647e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.46117e-05;OID=.;OPOS=8122767;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:135:135:0:0:135:135:70:65:0:0:70:65:0:0 chr19 8127075 . C G 244.09 PASS AO=57;DP=117;FAO=57;FDP=116;FR=.;FRO=59;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=26;FSRR=33;FWDB=0.0566841;FXX=0.00854628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.686;QD=8.41681;RBI=0.0567034;REFB=-0.00959686;REVB=0.00147759;RO=56;SAF=31;SAR=26;SRF=25;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0873808;STB=0.552383;TYPE=snp;VARB=0.00989146;OID=.;OPOS=8127075;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:116:56:59:57:57:26:31:25:31:26:31:26:33 chr19 8138054 . C A 65.51 PASS AO=15;DP=35;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.00818414;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.555;QD=7.0825;RBI=0.0143034;REFB=-0.00802614;REVB=-0.0117306;RO=20;SAF=10;SAR=5;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122839;STB=0.559365;TYPE=snp;VARB=0.0068926;OID=.;OPOS=8138054;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:35:37:20:21:15:16:5:10:11:9:6:10:11:10 chr19 8145921 . C T 22.49 PASS AO=6;DP=19;FAO=6;FDP=19;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.0457624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.743;QD=4.73397;RBI=0.0547749;REFB=-0.00243869;REVB=-0.0301015;RO=12;SAF=4;SAR=2;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.264239;STB=0.689036;TYPE=snp;VARB=0.0064692;OID=.;OPOS=8145921;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:19:19:12:13:6:6:2:4:5:7:2:4:5:8 chr19 8152725 . A G 723.8 PASS AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00605254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.4015;QD=38.0945;RBI=0.0202181;REFB=0;REVB=-0.0192909;RO=0;SAF=51;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.21421e-05;OID=.;OPOS=8152725;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:76:76:0:0:76:76:25:51:0:0:25:51:0:0 chr19 8154990 . C T 391.3 PASS AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0106047;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.1532;QD=37.2665;RBI=0.0164182;REFB=0;REVB=0.0125338;RO=0;SAF=28;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.98442e-05;OID=.;OPOS=8154990;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:42:42:0:0:42:42:14:28:0:0:14:28:0:0 chr19 8168545 . C T 825.6 PASS AO=86;DP=88;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0278931;FXX=0.0113623;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.797;QD=37.9587;RBI=0.0317442;REFB=0;REVB=0.0151549;RO=0;SAF=50;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000335908;OID=.;OPOS=8168545;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:88:87:0:0:86:87:36:50:0:0:36:51:0:0 chr19 8191238 . C T 494.84 PASS AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00511983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.2822;QD=37.3467;RBI=0.0335883;REFB=0;REVB=0.0331958;RO=0;SAF=21;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.93989e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000489751;OID=.;OPOS=8191238;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:52:53:0:0:52:53:31:21:0:0:32:21:0:0 chr19 8191248 . A G 423.67 PASS AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0413895;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.013;QD=37.6596;RBI=0.046077;REFB=0;REVB=-0.0202483;RO=0;SAF=16;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.49331e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.9282e-05;OID=.;OPOS=8191248;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:45:45:0:0:45:45:29:16:0:0:29:16:0:0 chr19 8191401 . G A 147.79 PASS AO=19;DP=22;FAO=19;FDP=22;FR=.;FRO=3;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.00456829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.6647;QD=26.8706;RBI=0.0772261;REFB=-0.0804105;REVB=0.0770909;RO=1;SAF=7;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0368096;STB=0.555499;TYPE=snp;VARB=0.00800566;OID=.;OPOS=8191401;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:22:22:1:3:19:19:12:7:0:1:12:7:0:3 chr19 8196443 . TC T,TT 437.82 PASS AO=8,36;DP=46;FAO=6,41;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=6,32;FSAR=0,9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00967294,0.010208;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=218.868,229.662;QD=37.2614;RBI=0.0548834,0.0617885;REFB=0,0;REVB=0.0540243,0.0609394;RO=0;SAF=7,28;SAR=1,8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.78849e-08,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.00273909,0.00269668;OID=.,.;OPOS=8196444,8196444;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:8,36:44:6,41:47:0:6,32:0,9:0:0:5:0:7,28:1,8:0:0 chr19 8196508 . G C 614.83 PASS AO=65;DP=66;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0671391;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0862;QD=36.7062;RBI=0.0749537;REFB=-0.0837016;REVB=-0.0333227;RO=1;SAF=34;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.013692;STB=0.50704;TYPE=snp;VARB=0.000886966;OID=.;OPOS=8196508;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:66:67:1:1:65:66:31:34:1:0:31:35:1:0 chr19 8197865 . C T 231.77 PASS AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.628;QD=37.0834;RBI=0.0340619;REFB=0;REVB=0.0301105;RO=0;SAF=16;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000196318;OID=.;OPOS=8197865;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:25:25:0:0:25:25:9:16:0:0:9:16:0:0 chr19 8212263 . G A 64.62 PASS AO=10;DP=18;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0519691;FXX=0.049975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.6554;QD=13.6036;RBI=0.0545206;REFB=-0.0366425;REVB=-0.0164837;RO=8;SAF=6;SAR=4;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0784731;STB=0.519196;TYPE=snp;VARB=0.0372236;OID=.;OPOS=8212263;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:18:19:8:8:10:11:4:6:4:4:5:6:4:4 chr19 8321182 . A T 220.99 PASS AO=55;DP=121;FAO=55;FDP=119;FR=.;FRO=64;FSAF=40;FSAR=15;FSRF=30;FSRR=34;FWDB=0.00294031;FXX=0.0165276;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.9901;QD=7.42821;RBI=0.0196112;REFB=-0.00117372;REVB=-0.0193895;RO=63;SAF=40;SAR=15;SRF=30;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.261906;STB=0.651105;TYPE=snp;VARB=0.00118201;OID=.;OPOS=8321182;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:119:63:64:55:55:15:40:30:33:15:40:30:34 chr19 8321946 . T C 155.3 PASS AO=34;DP=73;FAO=37;FDP=77;FR=.;FRO=40;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=30;FWDB=0.0386343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.622;QD=8.06763;RBI=0.0409079;REFB=-0.0362316;REVB=-0.0134479;RO=39;SAF=18;SAR=16;SRF=10;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.258501;STB=0.648201;TYPE=snp;VARB=0.0537346;OID=.;OPOS=8321946;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:77:39:40:34:37:16:18:10:29:17:20:10:30 chr19 8326904 . G A 236.65 PASS AO=26;DP=28;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0328907;FXX=0.0357015;HRUN=4;LEN=1;MLLD=113.888;QD=35.0592;RBI=0.0561753;REFB=0.0019852;REVB=0.0455398;RO=1;SAF=10;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0441872;STB=0.523791;TYPE=snp;VARB=0.000841019;OID=.;OPOS=8326904;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:28:27:1:1:26:26:16:10:1:0:16:10:1:0 chr19 8367033 . T C 366.46 PASS AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0641717;FXX=0.0256345;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.447;QD=38.5743;RBI=0.0768229;REFB=0;REVB=0.0422345;RO=0;SAF=28;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000574231;OID=.;OPOS=8367033;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:39:38:0:0:38:38:10:28:0:0:10:28:0:0 chr19 8387207 . G A 323.22 PASS AO=81;DP=179;FAO=83;FDP=181;FR=.;FRO=98;FSAF=72;FSAR=11;FSRF=82;FSRR=16;FWDB=0.00748658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.043;QD=7.14296;RBI=0.0510459;REFB=-0.014285;REVB=0.0504939;RO=96;SAF=70;SAR=11;SRF=80;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.060827;STB=0.534351;TYPE=snp;VARB=0.0134689;OID=.;OPOS=8387207;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:181:96:98:81:83:11:70:80:16:11:72:82:16 chr19 8389520 . C T 58.83 PASS AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=0.0438514;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.527;QD=5.8827;RBI=0.0438779;REFB=-0.0199184;REVB=0.00152522;RO=24;SAF=4;SAR=12;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154947;STB=0.590788;TYPE=snp;VARB=0.0521804;OID=.;OPOS=8389520;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:40:40:24:24:16:16:12:4:9:15:12:4:9:15 chr19 8398714 . A G 25.06 PASS AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.024512;FXX=0.0555247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.934;QD=5.89528;RBI=0.0251138;REFB=-0.0177402;REVB=0.00546496;RO=12;SAF=5;SAR=1;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137104;STB=0.605667;TYPE=snp;VARB=0.031969;OID=.;OPOS=8398714;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:18:17:12:11:6:6:1:5:9:3:1:5:8:3 chr19 8398975 . C T 76.89 PASS AO=15;DP=28;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=13;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=0.0434135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.8081;QD=10.9838;RBI=0.048943;REFB=-0.00832474;REVB=-0.0225984;RO=13;SAF=13;SAR=2;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148635;STB=0.585459;TYPE=snp;VARB=0.00933628;OID=.;OPOS=8398975;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:28:28:13:13:15:15:2:13:10:3:2:13:10:3 chr19 8454236 . A G 369.04 PASS AO=83;DP=168;FAO=86;FDP=171;FR=.;FRO=85;FSAF=40;FSAR=46;FSRF=29;FSRR=56;FWDB=-0.0021573;FXX=0.01156;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.9344;QD=8.63254;RBI=0.0142329;REFB=-0.0126651;REVB=-0.0140685;RO=84;SAF=38;SAR=45;SRF=28;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116054;STB=0.562434;TYPE=snp;VARB=0.0136996;OID=.;OPOS=8454236;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:171:84:85:83:86:45:38:28:56:46:40:29:56 chr19 8468337 . C T 59.03 PASS AO=13;DP=28;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=0.116842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.525;QD=8.43355;RBI=0.117952;REFB=-0.0368864;REVB=-0.0161472;RO=14;SAF=7;SAR=6;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225385;STB=0.643036;TYPE=snp;VARB=0.0769621;OID=.;OPOS=8468337;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:28:28:14:15:13:13:6:7:4:10:6:7:4:11 chr19 8486884 . G A 307.6 PASS AO=63;DP=113;FAO=63;FDP=113;FR=.;FRO=50;FSAF=32;FSAR=31;FSRF=37;FSRR=13;FWDB=-0.0152756;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.783;QD=10.8885;RBI=0.0162455;REFB=-0.0197611;REVB=0.00552925;RO=41;SAF=32;SAR=31;SRF=32;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199055;STB=0.603014;TYPE=snp;VARB=0.0164413;OID=.;OPOS=8486884;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:41:50:63:63:31:32:32:9:31:32:37:13 chr19 8553630 . C T 1813.22 PASS AO=188;DP=190;FAO=188;FDP=188;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0274278;FXX=0.0105258;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.253;QD=38.5792;RBI=0.0275283;REFB=0;REVB=0.00234974;RO=0;SAF=104;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84179e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.00278e-05;OID=.;OPOS=8553630;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:190:188:0:0:188:188:84:104:0:0:84:104:0:0 chr19 8555964 . AC A 21.15 PASS AO=6;DP=27;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.136148;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.8743;QD=2.82009;RBI=0.162294;REFB=-0.047378;REVB=-0.0883351;RO=14;SAF=1;SAR=5;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0.309524;SSSB=-0.41176;STB=0.528454;TYPE=del;VARB=0.0603235;OID=.;OPOS=8555965;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:6:25:13:30:17:7:6:10:7:21:14:1:5:7:7 chr19 8601223 . GC G 117.37 PASS AO=17;DP=22;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.321681;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.937;QD=23.4741;RBI=0.321919;REFB=-0.0727467;REVB=0.0123866;RO=3;SAF=10;SAR=7;SRF=3;SRR=0;SSEN=0.220994;SSEP=0;SSSB=-0.119205;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0594034;OID=.;OPOS=8601224;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:17:20:20:20:0:13:7:0:0:9:3:10:7:3:0 chr19 8645786 . A C 196.23 PASS AO=20;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.235;QD=35.6787;RBI=0.0331102;REFB=0;REVB=0.0232574;RO=0;SAF=7;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000489726;OID=.;OPOS=8645786;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:21:22:0:0:20:22:13:7:0:0:15:7:0:0 chr19 8669931 . G C 281.83 PASS AO=60;DP=112;FAO=60;FDP=112;FR=.;FRO=52;FSAF=14;FSAR=46;FSRF=18;FSRR=34;FWDB=0.0102468;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.56;QD=10.0652;RBI=0.0112436;REFB=-0.0280892;REVB=-0.00462831;RO=52;SAF=14;SAR=46;SRF=18;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122995;STB=0.567877;TYPE=snp;VARB=0.0227021;OID=.;OPOS=8669931;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:52:52:60:60:46:14:18:34:46:14:18:34 chr19 8841558 . T C 218.46 PASS AO=67;DP=168;FAO=67;FDP=170;FR=.;FRO=103;FSAF=16;FSAR=51;FSRF=40;FSRR=63;FWDB=0.019544;FXX=0.00584761;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.821;QD=5.14024;RBI=0.0195451;REFB=0.00773959;REVB=-0.000205815;RO=101;SAF=16;SAR=51;SRF=38;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17893;STB=0.610221;TYPE=snp;VARB=-0.0125726;OID=.;OPOS=8841558;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:170:101:103:67:67:51:16:38:63:51:16:40:63 chr19 8953801 . T C 1520.37 PASS AO=159;DP=161;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00730276;FXX=0.0124216;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.9221;QD=38.2482;RBI=0.0174825;REFB=0;REVB=-0.0158841;RO=0;SAF=70;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.38732e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000569281;OID=.;OPOS=8953801;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:161:159:0:0:159:159:89:70:0:0:89:70:0:0 chr19 8953922 . C T 865.82 PASS AO=95;DP=98;FAO=95;FDP=98;FR=.;FRO=3;FSAF=25;FSAR=70;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0150121;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.6192;QD=35.3396;RBI=0.0150829;REFB=-0.0380293;REVB=-0.00145964;RO=2;SAF=25;SAR=70;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0364259;STB=0.515686;TYPE=snp;VARB=0.00222084;OID=.;OPOS=8953922;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:98:98:2:3:95:95:70:25:2:0:70:25:2:1 chr19 8961981 . C G 2152.73 PASS AO=225;DP=227;FAO=227;FDP=227;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=152;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0446518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.1302;QD=37.9336;RBI=0.0938717;REFB=0;REVB=0.0825719;RO=2;SAF=75;SAR=150;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00631077;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000708354;OID=.;OPOS=8961981;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:227:227:2:0:225:227:150:75:0:2:152:75:0:0 chr19 8999438 . A T 52.74 PASS AO=38;DP=156;FAO=35;FDP=151;FR=.;FRO=116;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=43;FSRR=73;FWDB=-0.0314844;FXX=0.00657851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.442;QD=1.39713;RBI=0.0342072;REFB=0.000841004;REVB=0.0133741;RO=117;SAF=13;SAR=25;SRF=43;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0347753;STB=0.548427;TYPE=snp;VARB=-0.0017645;OID=.;OPOS=8999438;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:156:151:117:116:38:35:25:13:43:74:24:11:43:73 chr19 8999449 . G T 52.39 PASS AO=40;DP=150;FAO=35;FDP=152;FR=.;FRO=117;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=46;FSRR=71;FWDB=0.023731;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.8734;QD=1.37868;RBI=0.038588;REFB=-0.00294228;REVB=-0.0304282;RO=110;SAF=13;SAR=27;SRF=45;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111945;STB=0.56689;TYPE=snp;VARB=0.00921085;OID=.;OPOS=8999449;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:150:152:110:117:40:35:27:13:45:65:24:11:46:71 chr19 8999453 . C T 474.5 PASS AO=92;DP=158;FAO=91;FDP=152;FR=.;FRO=61;FSAF=38;FSAR=53;FSRF=18;FSRR=43;FWDB=0.00892442;FXX=0.00653552;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.06;QD=12.4868;RBI=0.0110166;REFB=-0.010023;REVB=0.00645919;RO=66;SAF=39;SAR=53;SRF=20;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0968413;STB=0.55138;TYPE=snp;VARB=0.00827968;OID=.;OPOS=8999453;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:152:66:61:92:91:53:39:20:46:53:38:18:43 chr19 8999478 . T C 23.22 PASS AO=29;DP=147;FAO=26;FDP=144;FR=.;FRO=118;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=51;FSRR=67;FWDB=-0.0374607;FXX=0.00689608;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.598;QD=0.644899;RBI=0.037469;REFB=-0.0109576;REVB=-0.000788723;RO=117;SAF=11;SAR=18;SRF=50;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0636137;STB=0.540389;TYPE=snp;VARB=0.0470865;OID=.;OPOS=8999478;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:147:144:117:118:29:26:18:11:50:67:16:10:51:67 chr19 9001822 . A G 555.63 PASS AO=57;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0315644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.423;QD=38.3196;RBI=0.0541784;REFB=0;REVB=0.0440339;RO=0;SAF=41;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.92381e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000256853;OID=.;OPOS=9001822;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:57:58:0:0:57:58:16:41:0:0:17:41:0:0 chr19 9001833 . A G 580.87 PASS AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00900421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.181;QD=38.7245;RBI=0.0386429;REFB=0;REVB=0.0375792;RO=0;SAF=41;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31043e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.44438e-05;OID=.;OPOS=9001833;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:60:60:0:0:60:60:19:41:0:0:19:41:0:0 chr19 9001835 . G A 506.31 PASS AO=57;DP=60;FAO=57;FDP=60;FR=.;FRO=3;FSAF=40;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.00458277;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=153.129;QD=33.7538;RBI=0.0284066;REFB=-0.164728;REVB=0.0280345;RO=3;SAF=40;SAR=17;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0406807;STB=0.521612;TYPE=snp;VARB=0.00210923;OID=.;OPOS=9001835;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:60:60:3:3:57:57:17:40:1:2:17:40:1:2 chr19 9002504 . T C 11.65 PASS AO=21;DP=139;FAO=20;FDP=137;FR=.;FRO=117;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=64;FSRR=53;FWDB=-0.0305822;FXX=0.00724585;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.251;QD=0.340043;RBI=0.0434244;REFB=-0.00773795;REVB=-0.0308287;RO=117;SAF=14;SAR=7;SRF=64;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15749;STB=0.591264;TYPE=snp;VARB=0.0313366;OID=.;OPOS=9002504;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:139:137:117:117:21:20:7:14:64:53:7:13:64:53 chr19 9003618 . C T 3160.59 PASS AO=334;DP=338;FAO=334;FDP=334;FR=.;FRO=0;FSAF=161;FSAR=173;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=4.84392e-05;FXX=0.0147488;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.344;QD=37.8514;RBI=0.0204514;REFB=0.022699;REVB=-0.0204513;RO=3;SAF=161;SAR=173;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00819989;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000111242;OID=.;OPOS=9003618;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:338:334:3:0:334:334:173:161:0:3:173:161:0:0 chr19 9005674 . G A 354.86 PASS AO=46;DP=54;FAO=47;FDP=54;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0.176283;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=202.828;QD=26.2861;RBI=0.178749;REFB=-0.124903;REVB=0.0295845;RO=8;SAF=6;SAR=40;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0853014;STB=0.53931;TYPE=snp;VARB=0.000811557;OID=.;OPOS=9005674;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:54:54:8:7:46:47:40:6:0:8:41:6:0:7 chr19 9005719 . A G 481.07 PASS AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.281;QD=37.7313;RBI=0.0111513;REFB=0;REVB=-0.00492628;RO=0;SAF=10;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.12541e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.60855e-05;OID=.;OPOS=9005719;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:51:51:0:0:51:51:41:10:0:0:41:10:0:0 chr19 9006370 . A G 149.8 PASS AO=58;DP=167;FAO=56;FDP=165;FR=.;FRO=109;FSAF=14;FSAR=42;FSRF=72;FSRR=37;FWDB=-0.0360535;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.152;QD=3.63156;RBI=0.0375032;REFB=-0.0107386;REVB=-0.0103265;RO=109;SAF=14;SAR=44;SRF=72;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.471574;STB=0.765486;TYPE=snp;VARB=0.0226111;OID=.;OPOS=9006370;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:165:109:109:58:56:44:14:72:37:42:14:72:37 chr19 9006415 . T C 41.34 PASS AO=30;DP=128;FAO=28;FDP=125;FR=.;FRO=97;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=54;FSRR=43;FWDB=0.0126645;FXX=0.0157468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162;QD=1.32273;RBI=0.0306701;REFB=-0.00119639;REVB=-0.0279333;RO=95;SAF=12;SAR=18;SRF=53;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196046;STB=0.59857;TYPE=snp;VARB=0.0130781;OID=.;OPOS=9006415;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:128:125:95:97:30:28:18:12:53:42:16:12:54:43 chr19 9006416 . T A 160.41 PASS AO=51;DP=129;FAO=49;FDP=126;FR=.;FRO=77;FSAF=18;FSAR=31;FSRF=47;FSRR=30;FWDB=-0.00890261;FXX=0.0078734;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.3862;QD=5.09224;RBI=0.0222358;REFB=-0.032306;REVB=-0.0203759;RO=62;SAF=18;SAR=33;SRF=40;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.285192;STB=0.647226;TYPE=snp;VARB=0.0305296;OID=.;OPOS=9006416;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:126:62:77:51:49:33:18:40:22:31:18:47:30 chr19 9006418 . G A 131.57 PASS AO=47;DP=128;FAO=45;FDP=126;FR=.;FRO=81;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=49;FSRR=32;FWDB=0.000550825;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=217.365;QD=4.17666;RBI=0.0153036;REFB=-0.0103792;REVB=-0.0152937;RO=81;SAF=17;SAR=30;SRF=49;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267777;STB=0.644288;TYPE=snp;VARB=0.0186538;OID=.;OPOS=9006418;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:126:81:81:47:45:30:17:49:32:28:17:49:32 chr19 9011412 . C T 176.88 PASS AO=53;DP=136;FAO=54;FDP=137;FR=.;FRO=83;FSAF=37;FSAR=17;FSRF=37;FSRR=46;FWDB=0.00095814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.351;QD=5.16422;RBI=0.0338115;REFB=-0.0118278;REVB=-0.0337979;RO=83;SAF=36;SAR=17;SRF=37;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.257894;STB=0.649428;TYPE=snp;VARB=0.020651;OID=.;OPOS=9011412;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:137:83:83:53:54:17:36:37:46:17:37:37:46 chr19 9014551 . T C 1392.05 PASS AO=148;DP=150;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000523578;FXX=0.0133324;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.9408;QD=37.6231;RBI=0.00816232;REFB=-0.0564443;REVB=-0.00814551;RO=2;SAF=60;SAR=88;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0155871;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.95788e-05;OID=.;OPOS=9014551;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:150:148:2:0:148:148:88:60:2:0:88:60:0:0 chr19 9014569 . A G 1247.96 PASS AO=103;DP=142;FAO=134;FDP=134;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=49;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0665417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.063;QD=37.2526;RBI=0.0665461;REFB=0;REVB=-0.000765105;RO=0;SAF=24;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00115408;OID=.;OPOS=9014569;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:135:134:0:0:103:134:79:24:0:0:85:49:0:0 chr19 9019605 . C G 3792.4 PASS AO=387;DP=388;FAO=396;FDP=396;FR=.;FRO=0;FSAF=219;FSAR=177;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0274412;FXX=0.00251883;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.935;QD=38.3071;RBI=0.0454647;REFB=0;REVB=0.0362494;RO=0;SAF=212;SAR=175;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.58872e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.61303e-05;OID=.;OPOS=9019605;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:388:396:0:0:387:396:175:212:0:0:177:219:0:0 chr19 9024871 . C T 220.84 PASS AO=44;DP=103;FAO=55;FDP=114;FR=.;FRO=59;FSAF=37;FSAR=18;FSRF=29;FSRR=30;FWDB=0.0104395;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.073;QD=7.74874;RBI=0.0141185;REFB=-0.0103522;REVB=-0.00950523;RO=59;SAF=31;SAR=13;SRF=29;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.231552;STB=0.599153;TYPE=snp;VARB=0.011791;OID=.;OPOS=9024871;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:114:59:59:44:55:13:31:29:30:18:37:29:30 chr19 9026257 . G A 635.76 PASS AO=197;DP=454;FAO=175;FDP=397;FR=.;FRO=222;FSAF=79;FSAR=96;FSRF=95;FSRR=127;FWDB=-0.0110146;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.807;QD=6.40562;RBI=0.0343372;REFB=-0.00985365;REVB=0.0325227;RO=249;SAF=85;SAR=112;SRF=105;SRR=144;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0100753;STB=0.513299;TYPE=snp;VARB=0.0119356;OID=.;OPOS=9026257;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:454:397:249:222:197:175:112:85:105:144:96:79:95:127 chr19 9026318 . A G 569.36 PASS AO=152;DP=336;FAO=152;FDP=337;FR=.;FRO=185;FSAF=49;FSAR=103;FSRF=58;FSRR=127;FWDB=0.00485662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.604;QD=6.758;RBI=0.0056545;REFB=-0.0134966;REVB=-0.00289597;RO=184;SAF=49;SAR=103;SRF=57;SRR=127;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0143535;STB=0.505584;TYPE=snp;VARB=0.0144421;OID=.;OPOS=9026318;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:336:337:184:185:152:152:103:49:57:127:103:49:58:127 chr19 9046876 . G T 573.19 PASS AO=141;DP=296;FAO=142;FDP=296;FR=.;FRO=154;FSAF=67;FSAR=75;FSRF=65;FSRR=89;FWDB=0.00182587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.026;QD=7.74576;RBI=0.00351089;REFB=-0.00492041;REVB=0.00299876;RO=153;SAF=66;SAR=75;SRF=64;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0474564;STB=0.52604;TYPE=snp;VARB=0.00408974;OID=.;OPOS=9046876;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:296:296:153:154:141:142:75:66:64:89:75:67:65:89 chr19 9048320 . C T 137.53 PASS AO=29;DP=55;FAO=29;FDP=55;FR=.;FRO=26;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=0.0147806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.166;QD=10.0024;RBI=0.0241253;REFB=-0.0152866;REVB=0.0190673;RO=26;SAF=17;SAR=12;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0256673;STB=0.514276;TYPE=snp;VARB=0.0357754;OID=.;OPOS=9048320;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:55:26:26:29:29:12:17:16:10:12:17:16:10 chr19 9048342 . C T 56.57 PASS AO=15;DP=48;FAO=18;FDP=51;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=0.0445831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.6306;QD=4.43713;RBI=0.074592;REFB=-0.0341116;REVB=-0.0598023;RO=33;SAF=7;SAR=8;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0556231;STB=0.526286;TYPE=snp;VARB=0.0517882;OID=.;OPOS=9048342;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:48:51:33:33:15:18:8:7:17:16:8:10:17:16 chr19 9048421 . T C 61.32 PASS AO=23;DP=74;FAO=23;FDP=74;FR=.;FRO=51;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=32;FWDB=0.0243219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.49;QD=3.3147;RBI=0.0312914;REFB=-0.0239484;REVB=0.0196876;RO=51;SAF=7;SAR=16;SRF=19;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0896195;STB=0.553144;TYPE=snp;VARB=0.0455294;OID=.;OPOS=9048421;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:74:74:51:51:23:23:16:7:19:32:16:7:19:32 chr19 9048602 . G A 20.96 PASS AO=18;DP=97;FAO=19;FDP=98;FR=.;FRO=79;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=40;FSRR=39;FWDB=-0.0399009;FXX=0.0101;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.2583;QD=0.855691;RBI=0.045024;REFB=-0.0274022;REVB=0.0208587;RO=79;SAF=9;SAR=9;SRF=41;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0239798;STB=0.516112;TYPE=snp;VARB=0.12004;OID=.;OPOS=9048602;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:97:98:79:79:18:19:9:9:41:38:9:10:40:39 chr19 9048672 . T C 10.4 PASS AO=15;DP=70;FAO=12;FDP=73;FR=.;FRO=61;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=33;FSRR=28;FWDB=-0.065686;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.0962;QD=0.569747;RBI=0.0822325;REFB=-0.0234653;REVB=-0.0494725;RO=55;SAF=10;SAR=5;SRF=28;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200453;STB=0.609336;TYPE=snp;VARB=0.24532;OID=.;OPOS=9048672;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:70:73:55:61:15:12:5:10:28:27:4:8:33:28 chr19 9049339 . C G 526.21 PASS AO=157;DP=377;FAO=157;FDP=378;FR=.;FRO=221;FSAF=64;FSAR=93;FSRF=121;FSRR=100;FWDB=0.00323542;FXX=0.00526302;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.628;QD=5.56837;RBI=0.0088462;REFB=-0.0103582;REVB=-0.00823331;RO=219;SAF=64;SAR=93;SRF=119;SRR=100;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142563;STB=0.582085;TYPE=snp;VARB=0.0121733;OID=.;OPOS=9049339;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:377:378:219:221:157:157:93:64:119:100:93:64:121:100 chr19 9049726 . G A 557.18 PASS AO=130;DP=264;FAO=132;FDP=263;FR=.;FRO=131;FSAF=43;FSAR=89;FSRF=58;FSRR=73;FWDB=0.0305517;FXX=0.00378774;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.331;QD=8.47417;RBI=0.0318736;REFB=-0.031541;REVB=0.0090841;RO=131;SAF=42;SAR=88;SRF=58;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118994;STB=0.563387;TYPE=snp;VARB=0.0231883;OID=.;OPOS=9049726;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:264:263:131:131:130:132:88:42:58:73:89:43:58:73 chr19 9049910 . C T 388.59 PASS AO=121;DP=304;FAO=121;FDP=304;FR=.;FRO=183;FSAF=56;FSAR=65;FSRF=91;FSRR=92;FWDB=0.000644764;FXX=0.00653573;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.853;QD=5.113;RBI=0.0117258;REFB=-0.00517795;REVB=-0.0117081;RO=179;SAF=56;SAR=65;SRF=88;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0307978;STB=0.52079;TYPE=snp;VARB=0.00905996;OID=.;OPOS=9049910;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:304:304:179:183:121:121:65:56:88:91:65:56:91:92 chr19 9056982 . G A 466 PASS AO=95;DP=169;FAO=95;FDP=169;FR=.;FRO=74;FSAF=51;FSAR=44;FSRF=17;FSRR=57;FWDB=0.00624086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.584;QD=11.0296;RBI=0.0502228;REFB=-0.00653397;REVB=-0.0498336;RO=74;SAF=51;SAR=44;SRF=17;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.244402;STB=0.632541;TYPE=snp;VARB=0.00492086;OID=.;OPOS=9056982;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:169:74:74:95:95:44:51:17:57:44:51:17:57 chr19 9056989 . C G 233.49 PASS AO=68;DP=166;FAO=68;FDP=165;FR=.;FRO=97;FSAF=12;FSAR=56;FSRF=51;FSRR=46;FWDB=-0.0248405;FXX=0.0119753;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8957;QD=5.66027;RBI=0.0415927;REFB=-0.00118351;REVB=-0.0333603;RO=90;SAF=12;SAR=56;SRF=46;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.406732;STB=0.742345;TYPE=snp;VARB=0.00178931;OID=.;OPOS=9056989;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:165:90:97:68:68:56:12:46:44:56:12:51:46 chr19 9057408 . A G 1935.61 PASS AO=204;DP=205;FAO=204;FDP=204;FR=.;FRO=0;FSAF=136;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00821305;FXX=0.00487781;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.996;QD=37.9532;RBI=0.00822031;REFB=-0.0517898;REVB=0.000345566;RO=1;SAF=136;SAR=68;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00348977;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.22628e-05;OID=.;OPOS=9057408;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:205:204:1:0:204:204:68:136:1:0:68:136:0:0 chr19 9057687 . A G 1861.64 PASS AO=196;DP=206;FAO=202;FDP=202;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=124;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.104525;FXX=0.0288448;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.833;QD=36.8641;RBI=0.104977;REFB=-0.0540843;REVB=-0.00973287;RO=5;SAF=74;SAR=122;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0310895;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000699286;OID=.;OPOS=9057687;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:206:202:5:0:196:202:122:74:5:0:124:78:0:0 chr19 9057721 . C T 1439.21 PASS AO=148;DP=148;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0338413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.9041;QD=37.8739;RBI=0.054436;REFB=0;REVB=0.0426386;RO=0;SAF=60;SAR=88;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00145541;OID=.;OPOS=9057721;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:148:152:0:0:148:152:88:60:0:0:91:61:0:0 chr19 9058624 . G A 393.1 PASS AO=123;DP=309;FAO=123;FDP=309;FR=.;FRO=186;FSAF=47;FSAR=76;FSRF=65;FSRR=121;FWDB=-0.00944553;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.7992;QD=5.08864;RBI=0.0582413;REFB=-0.027696;REVB=0.0574702;RO=183;SAF=47;SAR=76;SRF=65;SRR=118;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0307272;STB=0.521014;TYPE=snp;VARB=0.0460337;OID=.;OPOS=9058624;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:309:309:183:186:123:123:76:47:65:118:76:47:65:121 chr19 9058907 . G C 254.89 PASS AO=57;DP=109;FAO=55;FDP=104;FR=.;FRO=49;FSAF=33;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=0.0302489;FXX=0.0630574;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.473;QD=9.80344;RBI=0.0304878;REFB=-0.0378141;REVB=0.00380943;RO=49;SAF=35;SAR=22;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0899721;STB=0.543291;TYPE=snp;VARB=0.0173868;OID=.;OPOS=9058907;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:104:49:49:57:55:22:35:25:24:22:33:25:24 chr19 9058942 . C T 1240.27 PASS AO=130;DP=134;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0462026;FXX=0.0441144;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.89;QD=38.1622;RBI=0.0483924;REFB=0;REVB=0.0143926;RO=0;SAF=67;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000166996;OID=.;OPOS=9058942;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:134:130:0:0:130:130:63:67:0:0:63:67:0:0 chr19 9059808 . A G 2744.03 PASS AO=302;DP=304;FAO=297;FDP=303;FR=.;FRO=6;FSAF=152;FSAR=145;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.0138148;FXX=0.00328937;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.586;QD=36.2248;RBI=0.01624;REFB=-0.00101561;REVB=0.00853761;RO=2;SAF=152;SAR=150;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00623379;STB=0.503535;TYPE=snp;VARB=1.7684e-05;OID=.;OPOS=9059808;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:304:303:2:6:302:297:150:152:2:0:145:152:2:4 chr19 9060085 . C T 831.87 PASS AO=184;DP=350;FAO=186;FDP=354;FR=.;FRO=168;FSAF=107;FSAR=79;FSRF=89;FSRR=79;FWDB=0.0179707;FXX=0.00281682;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.538;QD=9.39964;RBI=0.0273304;REFB=-0.0187558;REVB=-0.0205913;RO=162;SAF=107;SAR=77;SRF=89;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0282142;STB=0.521949;TYPE=snp;VARB=0.0178228;OID=.;OPOS=9060085;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:350:354:162:168:184:186:77:107:89:73:79:107:89:79 chr19 9060541 . C T 158.04 PASS AO=57;DP=137;FAO=49;FDP=127;FR=.;FRO=78;FSAF=19;FSAR=30;FSRF=21;FSRR=57;FWDB=-0.0193888;FXX=0.00781189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.171;QD=4.97775;RBI=0.0269513;REFB=-0.0106248;REVB=-0.0187203;RO=78;SAF=19;SAR=38;SRF=19;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108819;STB=0.57936;TYPE=snp;VARB=0.0222369;OID=.;OPOS=9060541;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:127:78:78:57:49:38:19:19:59:30:19:21:57 chr19 9060572 . G A 174.2 PASS AO=51;DP=137;FAO=51;FDP=127;FR=.,HEALED;FRO=76;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=55;FWDB=0.000327596;FXX=0.0378759;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.797;QD=5.48649;RBI=0.0330636;REFB=-0.0133944;REVB=-0.033062;RO=28;SAF=28;SAR=23;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110399;STB=0.659561;TYPE=snp;VARB=0.0304891;OID=.;OPOS=9060572;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:127:28:76:51:51:23:28:20:8:23:28:21:55 chr19 9060605 . G A 1681.24 PASS AO=175;DP=176;FAO=175;FDP=175;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0277128;FXX=0.016853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.661;QD=38.4284;RBI=0.0426571;REFB=0;REVB=0.0324288;RO=0;SAF=64;SAR=111;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.94882e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.68532e-05;OID=.;OPOS=9060605;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:176:175:0:0:175:175:111:64:0:0:111:64:0:0 chr19 9060656 . C T 236.47 PASS AO=88;DP=246;FAO=86;FDP=244;FR=.;FRO=158;FSAF=15;FSAR=71;FSRF=58;FSRR=100;FWDB=-0.00889665;FXX=0.00812975;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2173;QD=3.87647;RBI=0.0959842;REFB=-0.00453792;REVB=-0.095571;RO=156;SAF=17;SAR=71;SRF=55;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236666;STB=0.668902;TYPE=snp;VARB=0.00840593;OID=.;OPOS=9060656;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:246:244:156:158:88:86:71:17:55:101:71:15:58:100 chr19 9060812 . T C 931.26 PASS AO=102;DP=107;FAO=102;FDP=105;FR=.;FRO=3;FSAF=25;FSAR=77;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0437773;FXX=0.0186898;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.781;QD=35.4764;RBI=0.0439452;REFB=-0.185646;REVB=-0.00383791;RO=0;SAF=25;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.528296;TYPE=snp;VARB=0.00101635;OID=.;OPOS=9060812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:107:105:0:3:102:102:77:25:0:0:77:25:3:0 chr19 9061559 . C G 272.68 PASS AO=63;DP=126;FAO=63;FDP=126;FR=.;FRO=63;FSAF=45;FSAR=18;FSRF=46;FSRR=17;FWDB=-0.00827055;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.834;QD=8.65663;RBI=0.00842581;REFB=-0.0212103;REVB=-0.00161003;RO=59;SAF=45;SAR=18;SRF=42;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00260232;STB=0.509801;TYPE=snp;VARB=0.0163072;OID=.;OPOS=9061559;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:59:63:63:63:18:45:42:17:18:45:46:17 chr19 9062415 . T G 210.23 PASS AO=67;DP=174;FAO=67;FDP=174;FR=.;FRO=107;FSAF=24;FSAR=43;FSRF=48;FSRR=59;FWDB=-0.0612268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.463;QD=4.83286;RBI=0.0633517;REFB=-0.00511138;REVB=-0.0162699;RO=107;SAF=24;SAR=43;SRF=48;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103174;STB=0.558424;TYPE=snp;VARB=0.011847;OID=.;OPOS=9062415;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:174:107:107:67:67:43:24:48:59:43:24:48:59 chr19 9062544 . T G 944.53 PASS AO=92;DP=94;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.039638;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.4214;QD=37.0402;RBI=0.0482664;REFB=0;REVB=0.0275405;RO=2;SAF=51;SAR=41;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00221718;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00319436;OID=.;OPOS=9062544;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:94:102:2:0:92:102:41:51:1:1:47:55:0:0 chr19 9063678 . T G 482.93 PASS AO=115;DP=263;FAO=126;FDP=275;FR=.;FRO=149;FSAF=60;FSAR=66;FSRF=100;FSRR=49;FWDB=0.00277944;FXX=0.00362306;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.279;QD=7.02441;RBI=0.0159398;REFB=-0.00240577;REVB=-0.0156956;RO=141;SAF=59;SAR=56;SRF=95;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161156;STB=0.604795;TYPE=snp;VARB=0.00461632;OID=.;OPOS=9063678;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:263:275:141:149:115:126:56:59:95:46:66:60:100:49 chr19 9063935 . G A 327.72 PASS AO=44;DP=139;FAO=72;FDP=138;FR=.;FRO=66;FSAF=33;FSAR=39;FSRF=23;FSRR=43;FWDB=0.0104187;FXX=0.00719373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.533;QD=9.49905;RBI=0.0229511;REFB=-0.03127;REVB=-0.02045;RO=57;SAF=5;SAR=39;SRF=16;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.299556;STB=0.55336;TYPE=snp;VARB=0.032502;OID=.;OPOS=9063935;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:138:57:66:44:72:39:5:16:41:39:33:23:43 chr19 9065632 . T C 419.96 PASS AO=84;DP=151;FAO=86;FDP=153;FR=.;FRO=67;FSAF=57;FSAR=29;FSRF=41;FSRR=26;FWDB=0.0420729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.6538;QD=10.9794;RBI=0.0455744;REFB=-0.0319321;REVB=0.0175185;RO=66;SAF=55;SAR=29;SRF=41;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0296098;STB=0.524505;TYPE=snp;VARB=0.0243278;OID=.;OPOS=9065632;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:153:66:67:84:86:29:55:41:25:29:57:41:26 chr19 9066874 . G T 832.48 PASS AO=192;DP=374;FAO=192;FDP=375;FR=.;FRO=183;FSAF=108;FSAR=84;FSRF=95;FSRR=88;FWDB=0.00175194;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.511;QD=8.87981;RBI=0.0401565;REFB=-0.0137794;REVB=-0.0401182;RO=182;SAF=108;SAR=84;SRF=95;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0364681;STB=0.521385;TYPE=snp;VARB=0.0144219;OID=.;OPOS=9066874;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:374:375:182:183:192:192:84:108:95:87:84:108:95:88 chr19 9069792 . G A 419.25 PASS AO=92;DP=318;FAO=126;FDP=305;FR=.;FRO=179;FSAF=79;FSAR=47;FSRF=97;FSRR=82;FWDB=0.102448;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.7946;QD=5.49832;RBI=0.113218;REFB=-0.0242423;REVB=0.0481944;RO=89;SAF=48;SAR=44;SRF=21;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.254779;STB=0.55196;TYPE=snp;VARB=0.0374094;OID=.;OPOS=9069792;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:231:305:89:179:92:126:44:48:21:68:47:79:97:82 chr19 9069892 . A C 587.44 PASS AO=149;DP=318;FAO=149;FDP=317;FR=.;FRO=168;FSAF=77;FSAR=72;FSRF=85;FSRR=83;FWDB=-0.00340847;FXX=0.00314456;HRUN=4;LEN=1;MLLD=231.371;QD=7.4125;RBI=0.011478;REFB=-0.00689194;REVB=-0.0109602;RO=163;SAF=77;SAR=72;SRF=85;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00446164;STB=0.505741;TYPE=snp;VARB=0.00716683;OID=.;OPOS=9069892;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:318:317:163:168:149:149:72:77:85:78:72:77:85:83 chr19 9070194 . A G 1639.51 PASS AO=165;DP=166;FAO=175;FDP=175;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00099817;FXX=0.0112988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.813;QD=37.4744;RBI=0.115323;REFB=-0.0148353;REVB=0.115319;RO=1;SAF=81;SAR=84;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0056318;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000209426;OID=.;OPOS=9070194;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:166:175:1:0:165:175:84:81:0:1:93:82:0:0 chr19 9070225 . G C 2441.6 PASS AO=257;DP=260;FAO=257;FDP=257;FR=.;FRO=0;FSAF=120;FSAR=137;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201613;FXX=0.011538;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.8903;QD=38.0015;RBI=0.0531843;REFB=-0.0627959;REVB=0.0492148;RO=1;SAF=120;SAR=137;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00395612;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.80946e-05;OID=.;OPOS=9070225;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:260:257:1:0:257:257:137:120:1:0:137:120:0:0 chr19 9070837 . G A 2148.27 PASS AO=239;DP=251;FAO=240;FDP=248;FR=.;FRO=8;FSAF=125;FSAR=115;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=-0.0530523;FXX=0.0119517;HRUN=3;LEN=1;MLLD=109.931;QD=34.6496;RBI=0.0531047;REFB=-0.0037574;REVB=0.0023598;RO=7;SAF=125;SAR=114;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.020623;STB=0.512776;TYPE=snp;VARB=-0.000104402;OID=.;OPOS=9070837;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:251:248:7:8:239:240:114:125:1:6:115:125:1:7 chr19 9071763 . T A 1948.54 PASS AO=207;DP=215;FAO=208;FDP=208;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=165;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00438926;FXX=0.0325566;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.893;QD=37.472;RBI=0.0104803;REFB=-0.0637439;REVB=0.00951689;RO=2;SAF=43;SAR=164;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00805168;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000240144;OID=.;OPOS=9071763;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:215:208:2:0:207:208:164:43:1:1:165:43:0:0 chr19 9071834 . G C 424.15 PASS AO=95;DP=183;FAO=95;FDP=183;FR=.;FRO=88;FSAF=17;FSAR=78;FSRF=14;FSRR=74;FWDB=0.0157036;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=107.299;QD=9.27105;RBI=0.018841;REFB=-0.00918049;REVB=0.0104106;RO=88;SAF=17;SAR=78;SRF=14;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0303334;STB=0.51659;TYPE=snp;VARB=0.0076949;OID=.;OPOS=9071834;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:183:88:88:95:95:78:17:14:74:78:17:14:74 chr19 9072221 . G A 96.1 PASS AO=30;DP=84;FAO=30;FDP=82;FR=.;FRO=52;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=29;FSRR=23;FWDB=-0.0155712;FXX=0.0238067;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.6473;QD=4.6877;RBI=0.0335425;REFB=-0.0225737;REVB=0.0297092;RO=47;SAF=18;SAR=12;SRF=29;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0190211;STB=0.52762;TYPE=snp;VARB=0.0723517;OID=.;OPOS=9072221;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:84:82:47:52:30:30:12:18:29:18:12:18:29:23 chr19 9072313 . A G 169.85 PASS AO=43;DP=99;FAO=44;FDP=100;FR=.;FRO=56;FSAF=34;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=30;FWDB=0.00330328;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.3664;QD=6.79408;RBI=0.0311809;REFB=-0.0630437;REVB=-0.0310054;RO=55;SAF=34;SAR=9;SRF=26;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.362056;STB=0.693783;TYPE=snp;VARB=0.00607597;OID=.;OPOS=9072313;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:100:55:56:43:44:9:34:26:29:10:34:26:30 chr19 9072742 . T C 319.69 PASS AO=84;DP=186;FAO=84;FDP=186;FR=.;FRO=102;FSAF=35;FSAR=49;FSRF=39;FSRR=63;FWDB=0.0303275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3823;QD=6.87508;RBI=0.0362171;REFB=-0.0148724;REVB=0.019797;RO=102;SAF=35;SAR=49;SRF=39;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0351154;STB=0.519476;TYPE=snp;VARB=0.0133911;OID=.;OPOS=9072742;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:186:102:102:84:84:49:35:39:63:49:35:39:63 chr19 9072875 . G A 351.67 PASS AO=86;DP=198;FAO=93;FDP=205;FR=.;FRO=112;FSAF=23;FSAR=70;FSRF=42;FSRR=70;FWDB=0.0165074;FXX=0.0144224;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.777;QD=6.86191;RBI=0.023734;REFB=-0.0227627;REVB=0.0170531;RO=106;SAF=22;SAR=64;SRF=42;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165662;STB=0.585566;TYPE=snp;VARB=0.030077;OID=.;OPOS=9072875;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:205:106:112:86:93:64:22:42:64:70:23:42:70 chr19 9072975 . G A 385.69 PASS AO=100;DP=220;FAO=100;FDP=219;FR=.;FRO=119;FSAF=42;FSAR=58;FSRF=58;FSRR=61;FWDB=0.00361678;FXX=0.00904936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.502;QD=7.04449;RBI=0.033892;REFB=-0.00697591;REVB=0.0336985;RO=118;SAF=42;SAR=58;SRF=57;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0625232;STB=0.537129;TYPE=snp;VARB=0.00940138;OID=.;OPOS=9072975;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:220:219:118:119:100:100:58:42:57:61:58:42:58:61 chr19 9074073 . G A 401.79 PASS AO=85;DP=166;FAO=90;FDP=172;FR=.;FRO=82;FSAF=40;FSAR=50;FSRF=31;FSRR=51;FWDB=0.0441274;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.6664;QD=9.3439;RBI=0.0556548;REFB=-0.0168999;REVB=0.033915;RO=81;SAF=37;SAR=48;SRF=30;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0592262;STB=0.532272;TYPE=snp;VARB=0.0130672;OID=.;OPOS=9074073;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:172:81:82:85:90:48:37:30:51:50:40:31:51 chr19 9074950 . G T 150.35 PASS AO=58;DP=174;FAO=59;FDP=176;FR=.;FRO=117;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=53;FSRR=64;FWDB=0.0255975;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.328;QD=3.41706;RBI=0.0354252;REFB=0.00694985;REVB=-0.0244891;RO=116;SAF=30;SAR=28;SRF=53;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0698597;STB=0.536836;TYPE=snp;VARB=-0.0143114;OID=.;OPOS=9074950;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:176:116:117:58:59:28:30:53:63:29:30:53:64 chr19 9075217 . T A 399.16 PASS AO=90;DP=183;FAO=95;FDP=192;FR=.;FRO=97;FSAF=39;FSAR=56;FSRF=39;FSRR=58;FWDB=-0.000876802;FXX=0.00518108;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.0519;QD=8.31588;RBI=0.00300671;REFB=-0.0270988;REVB=0.00287603;RO=91;SAF=39;SAR=51;SRF=38;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0146868;STB=0.504424;TYPE=snp;VARB=0.0189395;OID=.;OPOS=9075217;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:192:91:97:90:95:51:39:38:53:56:39:39:58 chr19 9075346 . T A 591.54 PASS AO=125;DP=280;FAO=147;FDP=302;FR=.;FRO=155;FSAF=82;FSAR=65;FSRF=71;FSRR=84;FWDB=0.0244374;FXX=0.00657873;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.186;QD=7.83492;RBI=0.0356795;REFB=-0.0113073;REVB=0.0259969;RO=155;SAF=75;SAR=50;SRF=71;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142907;STB=0.551272;TYPE=snp;VARB=0.0153287;OID=.;OPOS=9075346;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:280:302:155:155:125:147:50:75:71:84:65:82:71:84 chr19 9075584 . T A 738.16 PASS AO=173;DP=344;FAO=173;FDP=343;FR=.;FRO=170;FSAF=75;FSAR=98;FSRF=63;FSRR=107;FWDB=0.0299707;FXX=0.00290689;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.6469;QD=8.60831;RBI=0.0356869;REFB=-0.024888;REVB=0.0193729;RO=169;SAF=75;SAR=98;SRF=63;SRR=106;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0563476;STB=0.532022;TYPE=snp;VARB=0.0286773;OID=.;OPOS=9075584;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:344:343:169:170:173:173:98:75:63:106:98:75:63:107 chr19 9075635 . G A 576.81 PASS AO=132;DP=257;FAO=132;FDP=258;FR=.;FRO=126;FSAF=60;FSAR=72;FSRF=51;FSRR=75;FWDB=0.0253236;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.089;QD=8.94282;RBI=0.0298558;REFB=-0.00497423;REVB=0.015814;RO=125;SAF=60;SAR=72;SRF=51;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0419013;STB=0.524622;TYPE=snp;VARB=0.00467898;OID=.;OPOS=9075635;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:257:258:125:126:132:132:72:60:51:74:72:60:51:75 chr19 9075737 . T C 160.84 PASS AO=42;DP=95;FAO=42;FDP=95;FR=.;FRO=53;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=20;FSRR=33;FWDB=0.0108341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.9155;QD=6.77239;RBI=0.0369004;REFB=0.00116515;REVB=0.0352741;RO=53;SAF=16;SAR=26;SRF=20;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0037926;STB=0.502127;TYPE=snp;VARB=-0.000653764;OID=.;OPOS=9075737;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:53:53:42:42:26:16:20:33:26:16:20:33 chr19 9075969 . C T 481.04 PASS AO=54;DP=136;FAO=58;FDP=128;FR=.,HEALED;FRO=38;FSAF=33;FSAR=25;FSRF=6;FSRR=32;FWDB=-0.0412949;FXX=0.0303007;HRUN=3;LEN=1;MLLD=78.9187;QD=15.0326;RBI=0.0799146;REFB=-0.0400992;REVB=-0.0684183;RO=29;SAF=32;SAR=22;SRF=2;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.32801;STB=0.658562;TYPE=snp;VARB=-0.035461;OID=.;OPOS=9075969;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:29:38:54:58:22:32:2:27:25:33:6:32 chr19 9076083 . G A 328.62 PASS AO=85;DP=186;FAO=85;FDP=186;FR=.;FRO=101;FSAF=62;FSAR=23;FSRF=73;FSRR=28;FWDB=0.00458763;FXX=0.00534731;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.5796;QD=7.06712;RBI=0.00988832;REFB=-0.00672467;REVB=-0.00875972;RO=101;SAF=62;SAR=23;SRF=73;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00819733;STB=0.504547;TYPE=snp;VARB=0.00654966;OID=.;OPOS=9076083;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:186:101:101:85:85:23:62:73:28:23:62:73:28 chr19 9076163 . C T 443.44 PASS AO=119;DP=275;FAO=121;FDP=274;FR=.;FRO=153;FSAF=87;FSAR=34;FSRF=92;FSRR=61;FWDB=-0.0162045;FXX=0.00724611;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1776;QD=6.47359;RBI=0.0596664;REFB=0.0184249;REVB=-0.0574238;RO=154;SAF=85;SAR=34;SRF=92;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135356;STB=0.575905;TYPE=snp;VARB=-0.0287332;OID=.;OPOS=9076163;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:275:274:154:153:119:121:34:85:92:62:34:87:92:61 chr19 9076278 . G A 146.95 PASS AO=35;DP=81;FAO=37;FDP=82;FR=.;FRO=45;FSAF=7;FSAR=30;FSRF=13;FSRR=32;FWDB=-0.0243223;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.485;QD=7.1681;RBI=0.0284075;REFB=-0.0153258;REVB=0.0146769;RO=45;SAF=7;SAR=28;SRF=13;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125748;STB=0.580224;TYPE=snp;VARB=0.0267514;OID=.;OPOS=9076278;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:82:45:45:35:37:28:7:13:32:30:7:13:32 chr19 9076728 . C T 131.68 PASS AO=31;DP=68;FAO=32;FDP=70;FR=.;FRO=38;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=0.0196894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5689;QD=7.52471;RBI=0.0809556;REFB=-0.00820277;REVB=-0.0785248;RO=37;SAF=22;SAR=9;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.231814;STB=0.622562;TYPE=snp;VARB=0.0101338;OID=.;OPOS=9076728;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:70:37:38:31:32:9:22:18:19:10:22:18:20 chr19 9076858 . C T 250.84 PASS AO=53;DP=102;FAO=54;FDP=102;FR=.;FRO=48;FSAF=52;FSAR=2;FSRF=43;FSRR=5;FWDB=0.00333253;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.834;QD=9.83675;RBI=0.0429542;REFB=0.00407726;REVB=-0.0428247;RO=48;SAF=51;SAR=2;SRF=43;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.27462;STB=0.656966;TYPE=snp;VARB=-0.00415403;OID=.;OPOS=9076858;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:48:48:53:54:2:51:43:5:2:52:43:5 chr19 9076929 . T G 314 PASS AO=71;DP=140;FAO=71;FDP=140;FR=.;FRO=69;FSAF=55;FSAR=16;FSRF=57;FSRR=12;FWDB=-0.0125297;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=256.059;QD=8.97142;RBI=0.0366851;REFB=-0.0207781;REVB=-0.0344791;RO=66;SAF=55;SAR=16;SRF=54;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0567014;STB=0.537805;TYPE=snp;VARB=0.0222137;OID=.;OPOS=9076929;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:66:69:71:71:16:55:54:12:16:55:57:12 chr19 9076950 . C A 314.54 PASS AO=75;DP=150;FAO=72;FDP=142;FR=.;FRO=70;FSAF=53;FSAR=19;FSRF=56;FSRR=14;FWDB=-0.0200904;FXX=0.0206882;HRUN=3;LEN=1;MLLD=109.022;QD=8.86037;RBI=0.0201289;REFB=-0.0178941;REVB=-0.00124559;RO=72;SAF=56;SAR=19;SRF=58;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0723091;STB=0.542135;TYPE=snp;VARB=0.0317604;OID=.;OPOS=9076950;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:142:72:70:75:72:19:56:58:14:19:53:56:14 chr19 9076991 . C T 240.04 PASS AO=63;DP=141;FAO=63;FDP=141;FR=.;FRO=78;FSAF=46;FSAR=17;FSRF=61;FSRR=17;FWDB=-0.030938;FXX=0.00704176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.798;QD=6.80968;RBI=0.0531659;REFB=-0.0200095;REVB=-0.0432372;RO=77;SAF=46;SAR=17;SRF=60;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0637106;STB=0.537677;TYPE=snp;VARB=0.0194546;OID=.;OPOS=9076991;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:77:78:63:63:17:46:60:17:17:46:61:17 chr19 9077060 . C T 363.62 PASS AO=82;DP=155;FAO=81;FDP=156;FR=.;FRO=75;FSAF=52;FSAR=29;FSRF=37;FSRR=38;FWDB=-0.0458093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.471;QD=9.32369;RBI=0.0464458;REFB=-0.027634;REVB=0.00766264;RO=73;SAF=53;SAR=29;SRF=36;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13738;STB=0.574425;TYPE=snp;VARB=0.0140339;OID=.;OPOS=9077060;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:156:73:75:82:81:29:53:36:37:29:52:37:38 chr19 9077264 . T G 439.76 PASS AO=99;DP=192;FAO=99;FDP=192;FR=.;FRO=93;FSAF=35;FSAR=64;FSRF=39;FSRR=54;FWDB=-0.0114212;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.729;QD=9.16167;RBI=0.0418361;REFB=-0.0300906;REVB=-0.0402469;RO=93;SAF=35;SAR=64;SRF=39;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0622542;STB=0.534168;TYPE=snp;VARB=0.0301019;OID=.;OPOS=9077264;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:192:93:93:99:99:64:35:39:54:64:35:39:54 chr19 9077436 . G A 292.9 PASS AO=79;DP=186;FAO=81;FDP=188;FR=.;FRO=107;FSAF=31;FSAR=50;FSRF=67;FSRR=40;FWDB=-0.00711789;FXX=0.00529073;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.28;QD=6.23185;RBI=0.0187631;REFB=-0.0141178;REVB=0.0173606;RO=106;SAF=31;SAR=48;SRF=66;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234108;STB=0.637158;TYPE=snp;VARB=0.0211423;OID=.;OPOS=9077436;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:188:106:107:79:81:48:31:66:40:50:31:67:40 chr19 9077581 . G T 434.5 PASS AO=108;DP=230;FAO=109;FDP=230;FR=.;FRO=121;FSAF=92;FSAR=17;FSRF=89;FSRR=32;FWDB=0.00688161;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=275.779;QD=7.55645;RBI=0.048408;REFB=0.0216727;REVB=-0.0479163;RO=121;SAF=91;SAR=17;SRF=89;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166866;STB=0.594312;TYPE=snp;VARB=-0.0217364;OID=.;OPOS=9077581;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:230:230:121:121:108:109:17:91:89:32:17:92:89:32 chr19 9077803 . T C 124.79 PASS AO=33;DP=92;FAO=38;FDP=96;FR=.;FRO=58;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=38;FSRR=20;FWDB=-0.00220609;FXX=0.0204061;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.144;QD=5.19944;RBI=0.060182;REFB=-0.00593861;REVB=0.0601415;RO=53;SAF=24;SAR=9;SRF=35;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0864232;STB=0.53196;TYPE=snp;VARB=0.00891794;OID=.;OPOS=9077803;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:96:53:58:33:38:9:24:35:18:15:23:38:20 chr19 9080462 . C G 2738.9 PASS AO=289;DP=292;FAO=293;FDP=293;FR=.;FRO=0;FSAF=121;FSAR=172;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0142794;FXX=0.016778;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.781;QD=37.3911;RBI=0.0213248;REFB=0.000289305;REVB=0.0158381;RO=2;SAF=122;SAR=167;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00775274;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.11652e-06;OID=.;OPOS=9080462;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:97:292:293:2:0:289:293:167:122:2:0:172:121:0:0 chr19 9083124 . G A 182.19 PASS AO=45;DP=93;FAO=44;FDP=93;FR=.;FRO=49;FSAF=9;FSAR=35;FSRF=28;FSRR=21;FWDB=0.00152638;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.1781;QD=7.83614;RBI=0.0595154;REFB=0.00364924;REVB=0.0594958;RO=48;SAF=10;SAR=35;SRF=27;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.353453;STB=0.719735;TYPE=snp;VARB=-0.00276284;OID=.;OPOS=9083124;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:48:49:45:44:35:10:27:21:35:9:28:21 chr19 9083427 . A G 463.19 PASS AO=77;DP=161;FAO=99;FDP=183;FR=.;FRO=84;FSAF=66;FSAR=33;FSRF=39;FSRR=45;FWDB=-0.00388149;FXX=0.00543449;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.805;QD=10.1244;RBI=0.0448903;REFB=-0.00242428;REVB=-0.0447222;RO=81;SAF=44;SAR=33;SRF=36;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118142;STB=0.597681;TYPE=snp;VARB=0.00289378;OID=.;OPOS=9083427;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:183:81:84:77:99:33:44:36:45:33:66:39:45 chr19 9083457 . C T 566.22 PASS AO=108;DP=184;FAO=110;FDP=186;FR=.;FRO=76;FSAF=64;FSAR=46;FSRF=36;FSRR=40;FWDB=0.0261874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.142;QD=12.1767;RBI=0.0278827;REFB=-0.0310281;REVB=0.00957433;RO=76;SAF=62;SAR=46;SRF=36;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0771452;STB=0.544727;TYPE=snp;VARB=0.0231391;OID=.;OPOS=9083457;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:186:76:76:108:110:46:62:36:40:46:64:36:40 chr19 9084183 . G A 1059.94 PASS AO=202;DP=333;FAO=202;FDP=333;FR=.;FRO=131;FSAF=53;FSAR=149;FSRF=49;FSRR=82;FWDB=0.0183236;FXX=0.00299392;HRUN=4;LEN=1;MLLD=194.202;QD=12.732;RBI=0.0185302;REFB=-0.0215171;REVB=-0.0027593;RO=126;SAF=53;SAR=149;SRF=49;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109572;STB=0.553837;TYPE=snp;VARB=0.0148227;OID=.;OPOS=9084183;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:333:333:126:131:202:202:149:53:49:77:149:53:49:82 chr19 9084299 . T C 158.46 PASS AO=49;DP=127;FAO=49;FDP=128;FR=.;FRO=79;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=28;FSRR=51;FWDB=-0.043551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.9078;QD=4.95181;RBI=0.04521;REFB=-0.0284385;REVB=-0.0121347;RO=78;SAF=20;SAR=29;SRF=28;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0558629;STB=0.534745;TYPE=snp;VARB=0.0466923;OID=.;OPOS=9084299;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:128:78:79:49:49:29:20:28:50:29:20:28:51 chr19 9085004 . T C 213.57 PASS AO=54;DP=123;FAO=56;FDP=126;FR=.;FRO=70;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=36;FSRR=34;FWDB=0.00524198;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.664;QD=6.77995;RBI=0.0296363;REFB=-0.0121117;REVB=0.029169;RO=67;SAF=25;SAR=29;SRF=34;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0441971;STB=0.537813;TYPE=snp;VARB=0.0140076;OID=.;OPOS=9085004;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:126:67:70:54:56:29:25:34:33:31:25:36:34 chr19 9085643 . A G 243.84 PASS AO=59;DP=136;FAO=70;FDP=168;FR=.;FRO=98;FSAF=25;FSAR=45;FSRF=45;FSRR=53;FWDB=0.00688143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.778;QD=5.80566;RBI=0.00970677;REFB=-0.00832346;REVB=0.00684597;RO=76;SAF=25;SAR=34;SRF=44;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155878;STB=0.562482;TYPE=snp;VARB=0.00878011;OID=.;OPOS=9085643;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:168:76:98:59:70:34:25:44:32:45:25:45:53 chr19 9086318 . G A 203.16 PASS AO=40;DP=67;FAO=39;FDP=67;FR=.;FRO=28;FSAF=36;FSAR=3;FSRF=27;FSRR=1;FWDB=0.000604828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.396;QD=12.1289;RBI=0.0195408;REFB=-0.0350596;REVB=0.0195314;RO=27;SAF=37;SAR=3;SRF=26;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112033;STB=0.567537;TYPE=snp;VARB=0.0207177;OID=.;OPOS=9086318;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:27:28:40:39:3:37:26:1:3:36:27:1 chr19 9086819 . G A 152.96 PASS AO=37;DP=84;FAO=39;FDP=87;FR=.;FRO=48;FSAF=11;FSAR=28;FSRF=17;FSRR=31;FWDB=0.00138982;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.611;QD=7.03263;RBI=0.0238552;REFB=-0.0483993;REVB=0.0238147;RO=38;SAF=10;SAR=27;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158774;STB=0.547079;TYPE=snp;VARB=0.0484599;OID=.;OPOS=9086819;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:87:38:48:37:39:27:10:16:22:28:11:17:31 chr19 9087615 . T A 1944.68 PASS AO=202;DP=206;FAO=211;FDP=211;FR=.;FRO=0;FSAF=138;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.092265;FXX=0.0186038;HRUN=4;LEN=1;MLLD=40.8813;QD=36.866;RBI=0.0932765;REFB=0.0745868;REVB=-0.0136998;RO=4;SAF=134;SAR=68;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00359036;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.71413e-05;OID=.;OPOS=9087615;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:206:211:4:0:202:211:68:134:3:1:73:138:0:0 chr19 9087758 . G A 654.03 PASS AO=231;DP=507;FAO=177;FDP=397;FR=.;FRO=220;FSAF=110;FSAR=67;FSRF=110;FSRR=110;FWDB=-0.00915303;FXX=0.00749981;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.881;QD=6.58971;RBI=0.0190967;REFB=-0.0138175;REVB=-0.0167602;RO=270;SAF=147;SAR=84;SRF=134;SRR=136;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141434;STB=0.569124;TYPE=snp;VARB=0.0145714;OID=.;OPOS=9087758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:507:397:270:220:231:177:84:147:134:136:67:110:110:110 chr19 9088017 . T G 269.42 PASS AO=68;DP=176;FAO=86;FDP=200;FR=.;FRO=114;FSAF=35;FSAR=51;FSRF=52;FSRR=62;FWDB=-0.00264321;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=37.0623;QD=5.38841;RBI=0.0067157;REFB=-0.0698434;REVB=-0.00617366;RO=108;SAF=35;SAR=33;SRF=52;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0360846;STB=0.528711;TYPE=snp;VARB=0.0848932;OID=.;OPOS=9088017;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:200:108:114:68:86:33:35:52:56:51:35:52:62 chr19 9088330 . G A 559.24 PASS AO=126;DP=247;FAO=128;FDP=250;FR=.;FRO=122;FSAF=52;FSAR=76;FSRF=54;FSRR=68;FWDB=0.0350417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.2499;QD=8.94788;RBI=0.0388257;REFB=-0.0109883;REVB=0.0167187;RO=119;SAF=53;SAR=73;SRF=51;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00721375;STB=0.518268;TYPE=snp;VARB=0.0152958;OID=.;OPOS=9088330;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:247:250:119:122:126:128:73:53:51:68:76:52:54:68 chr19 9088772 . T C 695.04 PASS AO=163;DP=335;FAO=168;FDP=342;FR=.;FRO=174;FSAF=75;FSAR=93;FSRF=84;FSRR=90;FWDB=-0.000292378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.457;QD=8.1291;RBI=0.00312283;REFB=-0.00981876;REVB=0.00310911;RO=172;SAF=75;SAR=88;SRF=84;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.026512;STB=0.518622;TYPE=snp;VARB=0.00885355;OID=.;OPOS=9088772;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:335:342:172:174:163:168:88:75:84:88:93:75:84:90 chr19 9089843 . T C 14.77 PASS AO=10;DP=53;FAO=10;FDP=54;FR=.;FRO=44;FSAF=0;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=44;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.618;QD=1.09407;RBI=0.00889965;REFB=0.00375617;REVB=-0.00889965;RO=43;SAF=0;SAR=10;SRF=0;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0222515;OID=.;OPOS=9089843;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:53:54:43:44:10:10:10:0:0:43:10:0:0:44 chr19 9204307 . A G 797.3 PASS AO=58;DP=95;FAO=88;FDP=90;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0500324;FXX=0.0425487;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.866;QD=35.4354;RBI=0.050087;REFB=-0.0966897;REVB=-0.00233742;RO=0;SAF=17;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510867;TYPE=snp;VARB=0.00113877;OID=.;OPOS=9204307;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:61:90:0:2:58:88:41:17:0:0:45:43:0:2 chr19 9213026 . T C 299.74 PASS AO=73;DP=152;FAO=75;FDP=155;FR=.;FRO=80;FSAF=26;FSAR=49;FSRF=22;FSRR=58;FWDB=-0.0849442;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.2059;QD=7.7351;RBI=0.107743;REFB=-0.031317;REVB=-0.0662808;RO=78;SAF=24;SAR=49;SRF=21;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.064766;STB=0.541867;TYPE=snp;VARB=0.0333148;OID=.;OPOS=9213026;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:155:78:80:73:75:49:24:21:57:49:26:22:58 chr19 9213079 . A C 288.04 PASS AO=73;DP=158;FAO=73;FDP=158;FR=.;FRO=85;FSAF=40;FSAR=33;FSRF=29;FSRR=56;FWDB=-0.0298313;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0211;QD=7.29224;RBI=0.0304907;REFB=0.00584138;REVB=0.00630709;RO=85;SAF=40;SAR=33;SRF=29;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198644;STB=0.609873;TYPE=snp;VARB=-0.0067029;OID=.;OPOS=9213079;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:158:85:85:73:73:33:40:29:56:33:40:29:56 chr19 9213132 . A G 237.37 PASS AO=61;DP=135;FAO=61;FDP=134;FR=.;FRO=73;FSAF=34;FSAR=27;FSRF=27;FSRR=46;FWDB=0.0340924;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.2337;QD=7.08576;RBI=0.0344244;REFB=-0.0148928;REVB=0.00476905;RO=71;SAF=34;SAR=27;SRF=25;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196692;STB=0.601082;TYPE=snp;VARB=0.0177133;OID=.;OPOS=9213132;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:134:71:73:61:61:27:34:25:46:27:34:27:46 chr19 9236698 . G GATGGT 148.27 PASS AO=51;DP=159;FAO=51;FDP=143;FR=.;FRO=92;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=32;FSRR=60;FWDB=0.00751212;FXX=0.100623;HRUN=1;LEN=5;MLLD=213.538;QD=4.14738;RBI=0.0121363;REFB=-0.0110794;REVB=0.00953191;RO=92;SAF=21;SAR=30;SRF=33;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0625508;STB=0.543087;TYPE=ins;VARB=0.0200805;OID=.;OPOS=9236699;OREF=-;OALT=ATGGT;OMAPALT=GATGGT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:51:159:51:143:92:21:30:32:60:99:92:21:30:33:59 chr19 9236886 . A G 325.06 PASS AO=72;DP=138;FAO=72;FDP=139;FR=.;FRO=67;FSAF=28;FSAR=44;FSRF=39;FSRR=28;FWDB=-0.00539498;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.568;QD=9.35428;RBI=0.013831;REFB=-0.00244078;REVB=-0.0127354;RO=66;SAF=28;SAR=44;SRF=38;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164196;STB=0.59385;TYPE=snp;VARB=0.00273759;OID=.;OPOS=9236886;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:139:66:67:72:72:44:28:38:28:44:28:39:28 chr19 9237435 . A G 152.07 PASS AO=35;DP=75;FAO=36;FDP=75;FR=.;FRO=39;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=25;FWDB=-0.00544243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.042;QD=8.11028;RBI=0.00544478;REFB=-0.000450068;REVB=0.000159921;RO=39;SAF=24;SAR=11;SRF=14;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.310544;STB=0.660625;TYPE=snp;VARB=0.000433026;OID=.;OPOS=9237435;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:39:39:35:36:11:24:14:25:12:24:14:25 chr19 9237542 . T C 104.88 PASS AO=20;DP=35;FAO=20;FDP=35;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=14;FWDB=0.0232527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.983;QD=11.9857;RBI=0.0272317;REFB=-0.0348471;REVB=-0.0141731;RO=15;SAF=11;SAR=9;SRF=1;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.363881;STB=0.700655;TYPE=snp;VARB=0.0272113;OID=.;OPOS=9237542;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:35:35:15:15:20:20:9:11:1:14:9:11:1:14 chr19 9296664 . T C 156.63 PASS AO=40;DP=90;FAO=40;FDP=90;FR=.;FRO=50;FSAF=12;FSAR=28;FSRF=13;FSRR=37;FWDB=-0.0203698;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=255.412;QD=6.96116;RBI=0.0203721;REFB=-0.00900549;REVB=-0.00030254;RO=50;SAF=12;SAR=28;SRF=13;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0482806;STB=0.527014;TYPE=snp;VARB=0.011852;OID=.;OPOS=9296664;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:50:50:40:40:28:12:13:37:28:12:13:37 chr19 9297606 . C T 385.12 PASS AO=27;DP=36;FAO=40;FDP=40;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.066703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.13;QD=38.5123;RBI=0.0668906;REFB=0;REVB=-0.00500693;RO=0;SAF=14;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39874e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00191519;OID=.;OPOS=9297606;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:36:40:0:0:27:40:13:14:0:0:17:23:0:0 chr19 9297874 . G A 614.26 PASS AO=55;DP=73;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00339067;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.2293;QD=33.6582;RBI=0.0453689;REFB=-0.0958106;REVB=0.045242;RO=0;SAF=20;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.67221e-08;STB=0.506327;TYPE=snp;VARB=0.00333234;OID=.;OPOS=9297874;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:56:73:0:1:55:72:35:20:0:0:39:33:0:1 chr19 9298174 . T A 39.43 PASS AO=17;DP=43;FAO=17;FDP=49;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=25;FWDB=-0.010818;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=29.4822;QD=3.21868;RBI=0.150623;REFB=-0.0212809;REVB=-0.150234;RO=20;SAF=11;SAR=6;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.321187;STB=0.790911;TYPE=snp;VARB=0.0155005;OID=.;OPOS=9298174;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:43:49:20:32:17:17:6:11:6:14:5:12:7:25 chr19 9298200 . GT G 109.76 PASS AO=25;DP=44;FAO=28;FDP=42;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=21;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.00493975;FXX=0.0454442;HRUN=5;LEN=1;MLLD=15.9288;QD=10.453;RBI=0.150944;REFB=0.13469;REVB=-0.150863;RO=14;SAF=6;SAR=19;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152575;STB=0.573474;TYPE=del;VARB=-0.0758714;OID=.;OPOS=9298201;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:25:43:28:42:14:7:21:6:8:24:14:6:19:6:8 chr19 9298364 . C T 495.38 PASS AO=55;DP=57;FAO=55;FDP=57;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00785404;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.5662;QD=34.7633;RBI=0.100606;REFB=0.0622269;REVB=0.100299;RO=2;SAF=6;SAR=49;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0188555;STB=0.509996;TYPE=snp;VARB=-0.00139676;OID=.;OPOS=9298364;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:57:57:2:2:55:55:49:6:0:2:49:6:0:2 chr19 9324863 . G A 130.65 PASS AO=36;DP=85;FAO=36;FDP=86;FR=.;FRO=50;FSAF=32;FSAR=4;FSRF=42;FSRR=8;FWDB=-0.00669358;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.675;QD=6.07676;RBI=0.00673947;REFB=-0.00196454;REVB=0.000785163;RO=49;SAF=32;SAR=4;SRF=42;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0759324;STB=0.564667;TYPE=snp;VARB=0.00251971;OID=.;OPOS=9324863;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:86:49:50:36:36:4:32:42:7:4:32:42:8 chr19 9325116 . G A 264.94 PASS AO=84;DP=215;FAO=84;FDP=216;FR=.;FRO=132;FSAF=38;FSAR=46;FSRF=66;FSRR=66;FWDB=-0.00679552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.674;QD=4.90634;RBI=0.00818918;REFB=-0.00912361;REVB=-0.00456985;RO=131;SAF=38;SAR=46;SRF=65;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0475783;STB=0.529197;TYPE=snp;VARB=0.0129614;OID=.;OPOS=9325116;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:216:131:132:84:84:46:38:65:66:46:38:66:66 chr19 9325252 . G A 301.97 PASS AO=76;DP=163;FAO=76;FDP=163;FR=.;FRO=87;FSAF=37;FSAR=39;FSRF=48;FSRR=39;FWDB=-0.0181697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.441;QD=7.41033;RBI=0.0310959;REFB=-0.00371563;REVB=-0.0252352;RO=87;SAF=37;SAR=39;SRF=48;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0624434;STB=0.534582;TYPE=snp;VARB=0.00379253;OID=.;OPOS=9325252;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:163:87:87:76:76:39:37:48:39:39:37:48:39 chr19 9346319 . CCTT C 269.09 PASS AO=96;DP=221;FAO=97;FDP=199;FR=.;FRO=102;FSAF=46;FSAR=51;FSRF=55;FSRR=47;FWDB=-0.0453104;FXX=0.0245086;HRUN=2;LEN=3;MLLD=226.96;QD=5.40891;RBI=0.0479028;REFB=-0.00641515;REVB=0.0155447;RO=101;SAF=45;SAR=51;SRF=53;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0521331;STB=0.533278;TYPE=del;VARB=0.00617136;OID=.;OPOS=9346320;OREF=CTT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:96:206:97:199:102:46:51:55:47:99:101:45:51:53:48 chr19 9346427 . T C 222.24 PASS AO=55;DP=118;FAO=55;FDP=119;FR=.;FRO=64;FSAF=11;FSAR=44;FSRF=16;FSRR=48;FWDB=0.0267479;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.559;QD=7.47038;RBI=0.0301298;REFB=-0.0237431;REVB=0.0138692;RO=58;SAF=11;SAR=44;SRF=13;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0340718;STB=0.539985;TYPE=snp;VARB=0.0330928;OID=.;OPOS=9346427;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:119:58:64:55:55:44:11:13:45:44:11:16:48 chr19 9346762 . T G 227.56 PASS AO=46;DP=87;FAO=48;FDP=88;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=33;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=0.0539662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.242;QD=10.3435;RBI=0.0672439;REFB=0.00656065;REVB=-0.0401172;RO=40;SAF=14;SAR=32;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113899;STB=0.556938;TYPE=snp;VARB=-0.00961071;OID=.;OPOS=9346762;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:88:40:40:46:48:32:14:17:23:33:15:17:23 chr19 9362343 . C T 796.91 PASS AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.027789;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.977;QD=37.9482;RBI=0.0278252;REFB=0;REVB=-0.00142001;RO=0;SAF=41;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.70535e-05;OID=.;OPOS=9362343;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:84:84:0:0:84:84:43:41:0:0:43:41:0:0 chr19 9362443 . C T 811.16 PASS AO=86;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201441;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=247.367;QD=37.2948;RBI=0.022243;REFB=-0.0326805;REVB=0.00943224;RO=0;SAF=74;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.71471e-05;OID=.;OPOS=9362443;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:87:87:0:0:86:87:12:74:0:0:12:75:0:0 chr19 9434872 . C T 85.66 PASS AO=22;DP=52;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.00883699;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.51;QD=6.58889;RBI=0.00896324;REFB=-0.0207101;REVB=0.00149912;RO=30;SAF=16;SAR=6;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217009;STB=0.62488;TYPE=snp;VARB=0.0342034;OID=.;OPOS=9434872;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:52:52:30:30:22:22:6:16:16:14:6:16:16:14 chr19 9452026 . ACT A 139.94 PASS AO=45;DP=145;FAO=49;FDP=140;FR=.;FRO=91;FSAF=17;FSAR=32;FSRF=49;FSRR=42;FWDB=-0.0107243;FXX=0.0140835;HRUN=1;LEN=2;MLLD=197.829;QD=3.99832;RBI=0.0110134;REFB=-0.00539843;REVB=-0.00250696;RO=79;SAF=13;SAR=32;SRF=41;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.269852;STB=0.626654;TYPE=del;VARB=0.0102167;OID=.;OPOS=9452027;OREF=CT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:45:134:49:140:91:17:32:49:42:99:79:13:32:41:38 chr19 9490814 . C T 253.02 PASS AO=56;DP=109;FAO=56;FDP=109;FR=.;FRO=53;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=20;FSRR=33;FWDB=-0.0144943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.831;QD=9.28523;RBI=0.0150837;REFB=7.82723e-05;REVB=0.0041754;RO=53;SAF=30;SAR=26;SRF=20;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138964;STB=0.57652;TYPE=snp;VARB=-9.2596e-05;OID=.;OPOS=9490814;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:53:53:56:56:26:30:20:33:26:30:20:33 chr19 9492141 . C T 258.11 PASS AO=75;DP=179;FAO=75;FDP=181;FR=.;FRO=106;FSAF=36;FSAR=39;FSRF=44;FSRR=62;FWDB=0.0173887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.422;QD=5.70402;RBI=0.0178725;REFB=-0.00957501;REVB=-0.00413044;RO=103;SAF=37;SAR=38;SRF=42;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.08875;STB=0.538178;TYPE=snp;VARB=0.0151778;OID=.;OPOS=9492141;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:181:103:106:75:75:38:37:42:61:39:36:44:62 chr19 9492370 . A T 189.84 PASS AO=32;DP=58;FAO=36;FDP=61;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=0.039308;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.812;QD=12.4484;RBI=0.0629517;REFB=-0.0205087;REVB=0.0491711;RO=26;SAF=9;SAR=23;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0981915;STB=0.500493;TYPE=snp;VARB=0.0144598;OID=.;OPOS=9492370;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:58:61:26:25:32:36:23:9:10:16:23:13:9:16 chr19 9524185 . A G 510.43 PASS AO=117;DP=391;FAO=161;FDP=382;FR=.,HEALED;FRO=221;FSAF=94;FSAR=67;FSRF=127;FSRR=94;FWDB=0.00449028;FXX=0.0154635;HRUN=4;LEN=1;MLLD=31.0254;QD=5.34483;RBI=0.0092585;REFB=-0.113368;REVB=0.00809673;RO=172;SAF=53;SAR=64;SRF=88;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0624878;STB=0.50546;TYPE=snp;VARB=0.156992;OID=.;OPOS=9524185;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:385:382:172:221:117:161:64:53:88:84:67:94:127:94 chr19 9964946 . G A 327.02 PASS AO=59;DP=94;FAO=59;FDP=94;FR=.;FRO=35;FSAF=41;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.0146616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.09;QD=13.9158;RBI=0.0554023;REFB=0.0151823;REVB=0.0534271;RO=35;SAF=41;SAR=18;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157329;STB=0.585684;TYPE=snp;VARB=-0.00538854;OID=.;OPOS=9964946;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:35:35:59:59:18:41:17:18:18:41:17:18 chr19 9967947 . TG T 69.04 PASS AO=14;DP=25;FAO=16;FDP=22;FR=.;FRO=6;FSAF=14;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0268952;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.7398;QD=12.553;RBI=0.0689114;REFB=-0.135527;REVB=-0.0634462;RO=7;SAF=13;SAR=1;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0.260775;SSSB=0.436908;STB=0.672819;TYPE=del;VARB=0.061138;OID=.;OPOS=9967948;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:14:22:16:22:6:14:2:3:3:11:7:13:1:4:3 chr19 10070500 . G A 55.23 PASS AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=39;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.00901125;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=207.878;QD=5.66469;RBI=0.0220588;REFB=-0.0164761;REVB=-0.0201343;RO=23;SAF=11;SAR=4;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15033;STB=0.606149;TYPE=snp;VARB=0.0290757;OID=.;OPOS=10070500;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:38:39:23:24:15:15:4:11:14:9:4:11:14:10 chr19 10071063 . T C 12.55 PASS AO=3;DP=12;FAO=3;FDP=12;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=0.0108409;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.72;QD=4.18249;RBI=0.0139957;REFB=0.00575354;REVB=-0.00885184;RO=9;SAF=1;SAR=2;SRF=1;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.329465;STB=0.713258;TYPE=snp;VARB=-0.0105778;OID=.;OPOS=10071063;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:12:12:9:9:3:3:2:1:1:8:2:1:1:8 chr19 10071347 . C T 60.72 PASS AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0275207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.846;QD=8.99552;RBI=0.0277081;REFB=-0.00619506;REVB=-0.00321731;RO=14;SAF=8;SAR=5;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230409;STB=0.632566;TYPE=snp;VARB=0.0125655;OID=.;OPOS=10071347;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:27:27:14:14:13:13:5:8:5:9:5:8:5:9 chr19 10078589 . T C 377.46 PASS AO=57;DP=153;FAO=69;FDP=154;FR=.,HEALED;FRO=66;FSAF=29;FSAR=40;FSRF=34;FSRR=32;FWDB=-0.0195195;FXX=0.0128197;HRUN=4;LEN=1;MLLD=27.2624;QD=9.80404;RBI=0.0414841;REFB=-0.03156;REVB=0.0366049;RO=56;SAF=21;SAR=36;SRF=31;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169485;STB=0.546861;TYPE=snp;VARB=0.0611941;OID=.;OPOS=10078589;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:154:56:66:57:69:36:21:31:25:40:29:34:32 chr19 10081276 . C G 73.46 PASS AO=15;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=14;FSAR=1;FSRF=14;FSRR=1;FWDB=0.0127222;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=142.869;QD=9.79516;RBI=0.103671;REFB=-0.0182407;REVB=-0.102888;RO=15;SAF=14;SAR=1;SRF=14;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0216451;OID=.;OPOS=10081276;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:30:30:15:15:15:15:1:14:14:1:1:14:14:1 chr19 10084292 . C G 80.87 PASS AO=20;DP=42;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.0646311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.543;QD=7.70193;RBI=0.0651594;REFB=-0.0150925;REVB=-0.00828102;RO=22;SAF=9;SAR=11;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.046355;STB=0.50251;TYPE=snp;VARB=0.0220517;OID=.;OPOS=10084292;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:42:42:22:23:20:19:11:9:11:11:10:9:11:12 chr19 10089262 . G A 161.21 PASS AO=40;DP=90;FAO=40;FDP=88;FR=.;FRO=48;FSAF=9;FSAR=31;FSRF=17;FSRR=31;FWDB=-0.00771898;FXX=0.0329634;HRUN=3;LEN=1;MLLD=79.2453;QD=7.32784;RBI=0.0529811;REFB=0.0074246;REVB=-0.0524158;RO=47;SAF=9;SAR=31;SRF=17;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168117;STB=0.59086;TYPE=snp;VARB=-0.00432449;OID=.;OPOS=10089262;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:88:47:48:40:40:31:9:17:30:31:9:17:31 chr19 10100061 . C A 573.54 PASS AO=94;DP=139;FAO=95;FDP=140;FR=.;FRO=45;FSAF=44;FSAR=51;FSRF=5;FSRR=40;FWDB=0.0121961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.5528;QD=16.3867;RBI=0.0209556;REFB=0.0197555;REVB=0.0170409;RO=44;SAF=44;SAR=50;SRF=5;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215145;STB=0.615693;TYPE=snp;VARB=-0.00651786;OID=.;OPOS=10100061;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:140:44:45:94:95:50:44:5:39:51:44:5:40 chr19 10102676 . A G 138.9 PASS AO=19;DP=28;FAO=21;FDP=30;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0197866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.564;QD=18.5199;RBI=0.0228238;REFB=-0.0179525;REVB=0.0113761;RO=9;SAF=7;SAR=12;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112637;STB=0.571359;TYPE=snp;VARB=0.0112309;OID=.;OPOS=10102676;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:28:30:9:9:19:21:12:7:5:4:14:7:5:4 chr19 10103755 . C T 123.85 PASS AO=45;DP=132;FAO=45;FDP=132;FR=.;FRO=87;FSAF=14;FSAR=31;FSRF=41;FSRR=46;FWDB=0.0170048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2238;QD=3.75294;RBI=0.0170103;REFB=-0.0109386;REVB=-0.000433869;RO=87;SAF=14;SAR=31;SRF=41;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194702;STB=0.612596;TYPE=snp;VARB=0.0228793;OID=.;OPOS=10103755;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:87:87:45:45:31:14:41:46:31:14:41:46 chr19 10106811 . A AG 56.98 PASS AO=36;DP=121;FAO=35;FDP=118;FR=.;FRO=83;FSAF=1;FSAR=34;FSRF=39;FSRR=44;FWDB=0.00296467;FXX=0.0327842;HRUN=0;LEN=1;MLLD=59.8092;QD=1.93161;RBI=0.0621313;REFB=-0.0362924;REVB=-0.0620605;RO=78;SAF=1;SAR=35;SRF=39;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.742718;STB=0.94543;TYPE=ins;VARB=0.220073;OID=.;OPOS=10106812;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:36:121:35:118:83:1:34:39:44:56:78:1:35:39:39 chr19 10106936 . G C 230.87 PASS AO=50;DP=94;FAO=50;FDP=95;FR=.;FRO=45;FSAF=8;FSAR=42;FSRF=17;FSRR=28;FWDB=-0.0294094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.9745;QD=9.72098;RBI=0.0304945;REFB=-0.0321092;REVB=-0.00806239;RO=44;SAF=8;SAR=42;SRF=17;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.278434;STB=0.652104;TYPE=snp;VARB=0.022214;OID=.;OPOS=10106936;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:95:44:45:50:50:42:8:17:27:42:8:17:28 chr19 10108714 . G A 379.09 PASS AO=81;DP=172;FAO=90;FDP=181;FR=.;FRO=91;FSAF=30;FSAR=60;FSRF=52;FSRR=39;FWDB=0.0178667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.8283;QD=8.3776;RBI=0.0359902;REFB=-0.0476202;REVB=0.0312423;RO=90;SAF=29;SAR=52;SRF=51;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20198;STB=0.623546;TYPE=snp;VARB=0.0317204;OID=.;OPOS=10108714;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:181:90:91:81:90:52:29:51:39:60:30:52:39 chr19 10108850 . A G 45.46 PASS AO=10;DP=24;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=13;FWDB=-0.0383617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.038;QD=6.99428;RBI=0.0392188;REFB=-0.0113688;REVB=0.00815416;RO=14;SAF=3;SAR=7;SRF=2;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206149;STB=0.611475;TYPE=snp;VARB=0.0185748;OID=.;OPOS=10108850;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:24:26:14:15:10:11:7:3:2:12:8:3:2:13 chr19 10112346 . T C 1629.76 PASS AO=159;DP=159;FAO=170;FDP=170;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.218;QD=38.3473;RBI=0.0129858;REFB=0;REVB=-0.0077274;RO=0;SAF=66;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43809e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000279213;OID=.;OPOS=10112346;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:159:170:0:0:159:170:93:66:0:0:93:77:0:0 chr19 10114792 . TG T 369.16 PASS AO=47;DP=70;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0688597;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.8796;QD=22.3735;RBI=0.347035;REFB=0;REVB=0.340135;RO=12;SAF=24;SAR=23;SRF=1;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0.48834;SSSB=0.161596;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0182037;OID=.;OPOS=10114793;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:47:63:66:66:0:29:37:0:0:32:12:24:23:1:11 chr19 10116375 . G T 100.22 PASS AO=20;DP=37;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=18;FSRF=3;FSRR=14;FWDB=0.0310226;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.3849;QD=10.835;RBI=0.0882929;REFB=-0.0478308;REVB=0.0826633;RO=17;SAF=2;SAR=18;SRF=3;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148267;STB=0.58432;TYPE=snp;VARB=0.0326438;OID=.;OPOS=10116375;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:37:37:17:17:20:20:18:2:3:14:18:2:3:14 chr19 10172516 . T C 197.47 PASS AO=52;DP=123;FAO=54;FDP=124;FR=.;FRO=70;FSAF=32;FSAR=22;FSRF=50;FSRR=20;FWDB=-0.00913833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.824;QD=6.37006;RBI=0.0286346;REFB=-0.000157852;REVB=0.0271373;RO=70;SAF=31;SAR=21;SRF=50;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129587;STB=0.573036;TYPE=snp;VARB=0.000235303;OID=.;OPOS=10172516;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:124:70:70:52:54:21:31:50:20:22:32:50:20 chr19 10218524 . C G 1183.91 PASS AO=124;DP=125;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272836;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.5099;QD=37.5844;RBI=0.0293514;REFB=-0.0444671;REVB=0.0108219;RO=0;SAF=87;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.26495e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000436574;OID=.;OPOS=10218524;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:125:126:0:0:124:126:37:87:0:0:38:88:0:0 chr19 10225776 . C T 45.92 PASS AO=12;DP=38;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.0456055;FXX=0.0512689;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.5994;QD=4.96436;RBI=0.0695432;REFB=-0.0311945;REVB=-0.0525014;RO=24;SAF=9;SAR=3;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.339974;STB=0.656405;TYPE=snp;VARB=0.0746962;OID=.;OPOS=10225776;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:38:37:24:24:12:13:3:9:11:13:4:9:11:13 chr19 10225777 . A G 312.49 PASS AO=37;DP=38;FAO=36;FDP=38;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0186925;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.624;QD=32.8941;RBI=0.0434112;REFB=-0.0962467;REVB=0.0391807;RO=1;SAF=21;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0283678;STB=0.502957;TYPE=snp;VARB=0.00429366;OID=.;OPOS=10225777;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:38:38:1:2:37:36:16:21:0:1:16:20:1:1 chr19 10226256 . A G 116.19 PASS AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029982;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=236.671;QD=35.75;RBI=0.106864;REFB=0;REVB=-0.102572;RO=0;SAF=10;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000316681;OID=.;OPOS=10226256;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:13:0:0:13:13:3:10:0:0:3:10:0:0 chr19 10229297 . C A 844.51 PASS AO=86;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.617;QD=38.3869;RBI=0.0158301;REFB=0;REVB=-0.00474474;RO=0;SAF=40;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.08082e-05;OID=.;OPOS=10229297;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:88:88:0:0:86:88:46:40:0:0:46:42:0:0 chr19 10230032 . C T 71.27 PASS AO=13;DP=27;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.0313044;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=40.7032;QD=9.83095;RBI=0.0822803;REFB=-0.0222959;REVB=0.0760926;RO=14;SAF=11;SAR=2;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.268587;STB=0.552999;TYPE=snp;VARB=0.0267315;OID=.;OPOS=10230032;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:27:29:14:14:13:15:2:11:9:5:4:11:9:5 chr19 10265312 . T C 447.27 PASS AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0275379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.614;QD=38.0656;RBI=0.0294934;REFB=0;REVB=0.0105604;RO=0;SAF=27;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00023328;OID=.;OPOS=10265312;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:47:47:0:0:47:47:20:27:0:0:20:27:0:0 chr19 10334663 . T G 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0806782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.026;QD=33.0217;RBI=0.0810458;REFB=0;REVB=-0.00771084;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00397685;OID=.;OPOS=10334663;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:5:0:0:1:5:0:0 chr19 10334959 . AG A 46.29 PASS AO=6;DP=15;FAO=11;FDP=15;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.275428;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.2664;QD=12.3452;RBI=0.365919;REFB=0.10698;REVB=0.240907;RO=6;SAF=3;SAR=3;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138347;STB=0.533274;TYPE=del;VARB=0.0307517;OID=.;OPOS=10334960;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:6:15:11:15:4:4:7:1:3:9:6:3:3:2:4 chr19 10363281 . GC G 21.81 PASS AO=10;DP=27;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.0196245;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.8166;QD=3.96613;RBI=0.121618;REFB=-0.0910228;REVB=0.120024;RO=12;SAF=5;SAR=5;SRF=7;SRR=5;SSEN=0.320329;SSEP=0;SSSB=-0.0773769;STB=0.599782;TYPE=del;VARB=0.131509;OID=.;OPOS=10363282;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:10:22:9:22:13:4:5:8:5:21:12:5:5:7:5 chr19 10395683 . A G 116.19 PASS AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0372201;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.544;QD=35.7501;RBI=0.0413325;REFB=0;REVB=0.0179734;RO=0;SAF=7;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000750873;OID=.;OPOS=10395683;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:13:0:0:13:13:6:7:0:0:6:7:0:0 chr19 10397808 . GC G 33.67 PASS AO=8;DP=16;FAO=10;FDP=16;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.0454065;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.7887;QD=8.41713;RBI=0.292342;REFB=-0.0905125;REVB=0.288794;RO=8;SAF=6;SAR=2;SRF=4;SRR=4;SSEN=0.28169;SSEP=0;SSSB=0.23873;STB=0.624765;TYPE=del;VARB=0.0831889;OID=.;OPOS=10397809;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:8:16:10:16:6:5:5:5:1:17:8:6:2:4:4 chr19 10402938 . G A 304.5 PASS AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.118297;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.61;QD=34.7997;RBI=0.135017;REFB=-0.0881869;REVB=0.0650804;RO=1;SAF=7;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.017006;STB=0.509086;TYPE=snp;VARB=0.00328672;OID=.;OPOS=10402938;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:35:35:1:1:34:34:27:7:0:1:27:7:0:1 chr19 10403368 . G A 254.67 PASS AO=33;DP=39;FAO=34;FDP=41;FR=.;FRO=7;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0270917;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=83.2237;QD=24.8457;RBI=0.0350387;REFB=-0.0887039;REVB=0.0222206;RO=4;SAF=10;SAR=23;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10161;STB=0.554422;TYPE=snp;VARB=0.00516984;OID=.;OPOS=10403368;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:39:41:4:7:33:34:23:10:3:1:24:10:4:3 chr19 10404519 . G A 239.06 PASS AO=19;DP=27;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122676;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=38.921;QD=36.7783;RBI=0.0438013;REFB=0;REVB=0.0420483;RO=0;SAF=8;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41338e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00169322;OID=.;OPOS=10404519;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:21:26:0:0:19:26:11:8:0:0:18:8:0:0 chr19 10428380 . T C 15.78 PASS AO=3;DP=7;FAO=3;FDP=7;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0324041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.752;QD=9.01795;RBI=0.0324041;REFB=-0.024846;REVB=0;RO=4;SAF=3;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0238388;OID=.;OPOS=10428380;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:7:7:4:4:3:3:0:3:4:0:0:3:4:0 chr19 10428384 . A G 15.71 PASS AO=3;DP=7;FAO=3;FDP=7;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.00107042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=43.7022;QD=8.97937;RBI=0.00107042;REFB=-0.066643;REVB=0;RO=4;SAF=3;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0974961;OID=.;OPOS=10428384;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:7:7:4:4:3:3:0:3:4:0:0:3:4:0 chr19 10446568 . T C 220.87 PASS AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0309064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.46;QD=36.8111;RBI=0.0366111;REFB=0;REVB=-0.0196257;RO=0;SAF=11;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.16155e-05;OID=.;OPOS=10446568;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:24:24:0:0:24:24:13:11:0:0:13:11:0:0 chr19 10449358 . T C 508.51 PASS AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.288;QD=37.6675;RBI=0.0198764;REFB=0;REVB=0.0101696;RO=0;SAF=47;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.61958e-05;OID=.;OPOS=10449358;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:54:54:0:0:54:54:7:47:0:0:7:47:0:0 chr19 10449392 . A G 665.15 PASS AO=65;DP=65;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0503866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.136;QD=38.5595;RBI=0.0669011;REFB=0;REVB=0.0440107;RO=0;SAF=56;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.13074e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000128365;OID=.;OPOS=10449392;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:65:69:0:0:65:69:9:56:0:0:9:60:0:0 chr19 10468190 . G C 96.14 PASS AO=21;DP=42;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.0301011;FXX=0.0227221;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.959;QD=8.94364;RBI=0.0333288;REFB=-0.017442;REVB=0.0143086;RO=21;SAF=9;SAR=12;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0427514;STB=0.536877;TYPE=snp;VARB=0.0195391;OID=.;OPOS=10468190;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:42:43:21:22:21:21:12:9:10:11:12:9:11:11 chr19 10577843 . C A 249.55 PASS AO=48;DP=82;FAO=48;FDP=82;FR=.;FRO=34;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.0662724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.744;QD=12.1734;RBI=0.0664659;REFB=-0.0600507;REVB=-0.00506905;RO=34;SAF=24;SAR=24;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0222856;STB=0.51219;TYPE=snp;VARB=0.0316051;OID=.;OPOS=10577843;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:34:34:48:48:24:24:18:16:24:24:18:16 chr19 10578585 . G A 12.41 PASS AO=3;DP=23;FAO=3;FDP=21;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=18;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.00449889;FXX=0.0869187;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.258;QD=2.3647;RBI=0.00450238;REFB=0.000767102;REVB=0.000177223;RO=5;SAF=2;SAR=1;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0671606;STB=0.686277;TYPE=snp;VARB=-0.00935159;OID=.;OPOS=10578585;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:20:21:5:18:3:3:1:2:3:2:1:2:8:10 chr19 10579474 . T G 188.58 PASS AO=35;DP=71;FAO=40;FDP=75;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=27;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=0.0187708;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.4802;QD=10.0575;RBI=0.0306501;REFB=-0.094714;REVB=0.0242299;RO=34;SAF=13;SAR=22;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0648357;STB=0.553009;TYPE=snp;VARB=0.0746324;OID=.;OPOS=10579474;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:75:34:35:35:40:22:13:15:19:27:13:15:20 chr19 10600442 . G C 698.52 PASS AO=73;DP=74;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0348383;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.626;QD=36.7641;RBI=0.0424941;REFB=-0.11278;REVB=0.024332;RO=0;SAF=19;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504424;TYPE=snp;VARB=0.000235476;OID=.;OPOS=10600442;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:74:76:0:1:73:75:54:19:0:0:56:19:0:1 chr19 10610236 . A G 100.75 PASS AO=27;DP=68;FAO=28;FDP=69;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=0.0229044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.183;QD=5.84052;RBI=0.0254877;REFB=-0.00100933;REVB=0.0111808;RO=40;SAF=13;SAR=14;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0975601;STB=0.557235;TYPE=snp;VARB=0.00133763;OID=.;OPOS=10610236;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:69:40:41:27:28:14:13:23:17:15:13:23:18 chr19 10668452 . A G 45.03 PASS AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0738989;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.3503;QD=25.7323;RBI=0.0796804;REFB=-0.0551506;REVB=-0.029798;RO=1;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0789211;STB=0.54531;TYPE=snp;VARB=0.012006;OID=.;OPOS=10668452;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:7:7:1:1:6:6:5:1:0:1:5:1:0:1 chr19 10668673 . A G 550.69 PASS AO=53;DP=53;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.669;QD=37.9787;RBI=0.0621834;REFB=0;REVB=0.0613581;RO=0;SAF=27;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000295229;OID=.;OPOS=10668673;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:53:58:0:0:53:58:26:27:0:0:31:27:0:0 chr19 10670184 . C G 806.45 PASS AO=84;DP=84;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0510297;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.792;QD=37.9507;RBI=0.053188;REFB=0;REVB=0.0149977;RO=0;SAF=44;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00070469;OID=.;OPOS=10670184;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:84:85:0:0:84:85:40:44:0:0:40:45:0:0 chr19 10683477 . A G 916.6 PASS AO=91;DP=91;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00927761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.287;QD=37.7978;RBI=0.0220817;REFB=0;REVB=0.0200382;RO=0;SAF=55;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000212922;OID=.;OPOS=10683477;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:91:97:0:0:91:97:36:55:0:0:39:58:0:0 chr19 10692000 . T C 1012.65 PASS AO=104;DP=104;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.589;QD=38.2131;RBI=0.025467;REFB=0;REVB=-0.0140243;RO=0;SAF=46;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.75848e-06;OID=.;OPOS=10692000;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:104:106:0:0:104:106:58:46:0:0:59:47:0:0 chr19 10738639 . C T 663.85 PASS AO=68;DP=69;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00687916;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.1806;QD=37.9344;RBI=0.0131889;REFB=0;REVB=0.0112527;RO=0;SAF=12;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.83383e-05;OID=.;OPOS=10738639;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:69:70:0:0:68:70:56:12:0:0:58:12:0:0 chr19 10742170 . A G 618.59 PASS AO=66;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00787742;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.0713;QD=36.9306;RBI=0.0343386;REFB=-0.0816237;REVB=-0.0334228;RO=1;SAF=25;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.011386;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00140123;OID=.;OPOS=10742170;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:67:67:1:0:66:67:41:25:0:1:42:25:0:0 chr19 10794630 . G T 1617.64 PASS AO=177;DP=183;FAO=179;FDP=184;FR=.;FRO=5;FSAF=93;FSAR=86;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0585858;FXX=0.00540511;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.926;QD=35.1662;RBI=0.0599969;REFB=-0.173353;REVB=0.012936;RO=6;SAF=92;SAR=85;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00917763;STB=0.50219;TYPE=snp;VARB=0.000822863;OID=.;OPOS=10794630;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:183:184:6:5:177:179:85:92:4:2:86:93:3:2 chr19 10798066 . G A 97.76 PASS AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00906993;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.693;QD=30.0813;RBI=0.0380258;REFB=-0.00695886;REVB=0.0369283;RO=1;SAF=10;SAR=2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0430526;STB=0.523771;TYPE=snp;VARB=0.00107916;OID=.;OPOS=10798066;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:13:13:1:1:12:12:2:10:1:0:2:10:1:0 chr19 10961024 . C G 105.68 PASS AO=18;DP=29;FAO=18;FDP=29;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.00888366;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=223.427;QD=14.5768;RBI=0.00949161;REFB=-0.0267016;REVB=-0.00334232;RO=11;SAF=5;SAR=13;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138634;STB=0.577687;TYPE=snp;VARB=0.0132981;OID=.;OPOS=10961024;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:29:29:11:11:18:18:13:5:5:6:13:5:5:6 chr19 11096046 . GGC GG,G 685.26 PASS AO=19,29;DP=164;FAO=0,131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=0,54;FSAR=0,77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.430029,0.0242314;FXX=0.050721;HRUN=5,4;LEN=1,2;MLLD=8.83113,15.8497;QD=20.924;RBI=0.910973,0.104208;REFB=-0.0323741,-0.134365;REVB=0.803086,0.101352;RO=8;SAF=19,28;SAR=0,1;SRF=5;SRR=3;SSEN=0,0.395939;SSEP=0,0;SSSB=0.842249,0.485791;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.0774341,-0.0272266;OID=.,.;OPOS=11096048,11096047;OREF=C,GC;OALT=-,-;OMAPALT=GG,G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:19,29:83:0,131:131:0:0,54:0,77:0:0:45:8:19,28:0,1:5:3 chr19 11122451 . G T 204.49 PASS AO=48;DP=106;FAO=50;FDP=106;FR=.;FRO=56;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=39;FSRR=17;FWDB=0.0114252;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.178;QD=7.71647;RBI=0.0280968;REFB=-0.00435108;REVB=-0.0256689;RO=48;SAF=25;SAR=23;SRF=33;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152284;STB=0.603734;TYPE=snp;VARB=0.00704347;OID=.;OPOS=11122451;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:48:56:48:50:23:25:33:15:25:25:39:17 chr19 11224265 . A G 140.1 PASS AO=33;DP=83;FAO=38;FDP=88;FR=.;FRO=50;FSAF=28;FSAR=10;FSRF=30;FSRR=20;FWDB=0.00442082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.614;QD=6.36831;RBI=0.0251757;REFB=-0.00569908;REVB=0.0247845;RO=48;SAF=25;SAR=8;SRF=28;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214198;STB=0.591498;TYPE=snp;VARB=0.00800559;OID=.;OPOS=11224265;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:88:48:50:33:38:8:25:28:20:10:28:30:20 chr19 11227554 . C T 355.96 PASS AO=72;DP=132;FAO=74;FDP=134;FR=.;FRO=60;FSAF=21;FSAR=53;FSRF=37;FSRR=23;FWDB=0.00804387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.797;QD=10.6256;RBI=0.0341004;REFB=-0.00381466;REVB=0.0331381;RO=58;SAF=21;SAR=51;SRF=37;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.294982;STB=0.6582;TYPE=snp;VARB=0.00383535;OID=.;OPOS=11227554;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:134:58:60:72:74:51:21:37:21:53:21:37:23 chr19 11227602 . C T 319.75 PASS AO=60;DP=173;FAO=82;FDP=190;FR=.,HEALED;FRO=103;FSAF=47;FSAR=35;FSRF=33;FSRR=70;FWDB=-0.00903969;FXX=0.0155432;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.368;QD=6.73151;RBI=0.0365128;REFB=-0.0118449;REVB=-0.0353761;RO=69;SAF=41;SAR=19;SRF=31;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234628;STB=0.637977;TYPE=snp;VARB=0.0197358;OID=.;OPOS=11227602;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:190:69:103:60:82:19:41:31:38:35:47:33:70 chr19 11230881 . T C 553.06 PASS AO=130;DP=246;FAO=125;FDP=242;FR=.;FRO=117;FSAF=68;FSAR=57;FSRF=53;FSRR=64;FWDB=-0.0234778;FXX=0.0162595;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0594;QD=9.14147;RBI=0.0246244;REFB=0.0406018;REVB=-0.00742641;RO=115;SAF=73;SAR=57;SRF=51;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101638;STB=0.543993;TYPE=snp;VARB=-0.0446118;OID=.;OPOS=11230881;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:246:242:115:117:130:125:57:73:51:64:57:68:53:64 chr19 11233941 . A G 54.05 PASS AO=14;DP=41;FAO=15;FDP=41;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.000487395;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.083;QD=5.27305;RBI=0.00641001;REFB=-0.0138358;REVB=-0.00639145;RO=25;SAF=6;SAR=8;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142004;STB=0.569487;TYPE=snp;VARB=0.0206554;OID=.;OPOS=11233941;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:41:41:25:26:14:15:8:6:14:11:8:7:15:11 chr19 11242774 . AC A 68.01 PASS AO=32;DP=64;FAO=32;FDP=65;FR=.;FRO=33;FSAF=2;FSAR=30;FSRF=6;FSRR=27;FWDB=-0.124922;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=13.3175;QD=4.18533;RBI=0.156307;REFB=-0.106034;REVB=-0.093949;RO=27;SAF=1;SAR=31;SRF=6;SRR=21;SSEN=0.387755;SSEP=0;SSSB=-0.528873;STB=0.677825;TYPE=del;VARB=0.103019;OID=.;OPOS=11242775;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:32:64:32:65:33:2:30:6:27:67:27:1:31:6:21 chr19 11244187 . TTATATATATATATAT TTATATATATATAT,TTATATATATATATAC 1370.43 PASS AO=83,44;DP=208;FAO=104,47;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=58,27;FSAR=46,20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276156,0.149376;FXX=0.0736151;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=103.137,51.4066;QD=36.3029;RBI=0.0367372,0.152082;REFB=0,0;REVB=0.0242281,0.0285605;RO=0;SAF=47,24;SAR=36,20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,5.30465e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0125038,-0.00468187;OID=.,.;OPOS=11244188,11244202;OREF=TA,T;OALT=-,C;OMAPALT=TTATATATATATAT,TTATATATATATATAC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:83,44:147:104,47:151:0:58,27:46,20:0:0:99:0:47,24:36,20:0:0 chr19 11277232 . G A 232 PASS AO=53;DP=112;FAO=55;FDP=113;FR=.;FRO=58;FSAF=40;FSAR=15;FSRF=36;FSRR=22;FWDB=-0.0279685;FXX=0.00877116;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.1506;QD=8.21228;RBI=0.0997272;REFB=-0.0316151;REVB=0.095725;RO=58;SAF=40;SAR=13;SRF=36;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154377;STB=0.564861;TYPE=snp;VARB=0.0307258;OID=.;OPOS=11277232;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:113:58:58:53:55:13:40:36:22:15:40:36:22 chr19 11280809 . AG A 120.29 PASS AO=15;DP=21;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0604581;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.0333;QD=24.0586;RBI=0.386764;REFB=0;REVB=0.382009;RO=4;SAF=8;SAR=7;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0.43662;SSSB=0.201273;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0389048;OID=.;OPOS=11280810;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:15:20:20:20:0:9:11:0:0:11:4:8:7:0:4 chr19 11303943 . A G 57.54 PASS AO=13;DP=28;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=-0.0262657;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8505;QD=7.93604;RBI=0.0580796;REFB=-0.00383735;REVB=0.0518011;RO=15;SAF=10;SAR=3;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0453036;STB=0.514683;TYPE=snp;VARB=0.00584672;OID=.;OPOS=11303943;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:28:29:15:16:13:13:3:10:11:4:3:10:12:4 chr19 11319491 . G A 53.25 PASS AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=0.0662606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.3254;QD=11.2104;RBI=0.0662793;REFB=-0.0302972;REVB=-0.00157121;RO=7;SAF=2;SAR=8;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.272569;STB=0.67974;TYPE=snp;VARB=0.0529442;OID=.;OPOS=11319491;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:19:19:7:9:10:10:8:2:0:7:8:2:0:9 chr19 11319709 . C T 284.95 PASS AO=55;DP=95;FAO=56;FDP=95;FR=.;FRO=39;FSAF=41;FSAR=15;FSRF=27;FSRR=12;FWDB=0.0575072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.731;QD=11.9977;RBI=0.071131;REFB=-0.0310608;REVB=0.0418634;RO=40;SAF=40;SAR=15;SRF=28;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0261068;STB=0.520444;TYPE=snp;VARB=0.0214474;OID=.;OPOS=11319709;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:40:39:55:56:15:40:28:12:15:41:27:12 chr19 11326119 . A G 121.62 PASS AO=31;DP=71;FAO=31;FDP=71;FR=.;FRO=40;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=32;FSRR=8;FWDB=0.000241267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.584;QD=6.85168;RBI=0.0239524;REFB=-0.0103287;REVB=-0.0239512;RO=39;SAF=21;SAR=10;SRF=31;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141345;STB=0.583651;TYPE=snp;VARB=0.0130209;OID=.;OPOS=11326119;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:39:40:31:31:10:21:31:8:10:21:32:8 chr19 11326125 . C T 111.65 PASS AO=28;DP=63;FAO=28;FDP=63;FR=.;FRO=35;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=27;FSRR=8;FWDB=0.0565355;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.315;QD=7.08877;RBI=0.0572833;REFB=-0.00819228;REVB=0.00922534;RO=35;SAF=19;SAR=9;SRF=27;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109899;STB=0.561695;TYPE=snp;VARB=0.00762937;OID=.;OPOS=11326125;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:35:35:28:28:9:19:27:8:9:19:27:8 chr19 11327608 . T C 86.79 PASS AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=-0.0359386;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.45;QD=7.38672;RBI=0.0702062;REFB=-0.0234633;REVB=-0.0603103;RO=27;SAF=10;SAR=11;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150686;STB=0.576541;TYPE=snp;VARB=0.0388846;OID=.;OPOS=11327608;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:48:47:27:26:21:21:11:10:17:10:11:10:16:10 chr19 11327626 . A G 137.14 PASS AO=30;DP=60;FAO=30;FDP=60;FR=.;FRO=30;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.0282369;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=135.653;QD=9.14232;RBI=0.0330331;REFB=0.000133978;REVB=-0.0171425;RO=30;SAF=18;SAR=12;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0308343;STB=0.51723;TYPE=snp;VARB=-0.000794668;OID=.;OPOS=11327626;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:30:30:30:30:12:18:17:13:12:18:17:13 chr19 11332570 . T A 284.34 PASS AO=40;DP=70;FAO=50;FDP=79;FR=.;FRO=29;FSAF=18;FSAR=32;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.0249047;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.145;QD=14.3968;RBI=0.049691;REFB=-0.0416888;REVB=0.0429995;RO=30;SAF=15;SAR=25;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126858;STB=0.573205;TYPE=snp;VARB=0.0236817;OID=.;OPOS=11332570;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:70:79:30:29:40:50:25:15:16:14:32:18:16:13 chr19 11347493 . T C 29.05 PASS AO=11;DP=40;FAO=11;FDP=40;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.00431506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.819;QD=2.90528;RBI=0.00543814;REFB=-0.00393241;REVB=-0.00330964;RO=29;SAF=6;SAR=5;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153479;STB=0.594426;TYPE=snp;VARB=0.00911632;OID=.;OPOS=11347493;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:40:40:29:29:11:11:5:6:12:17:5:6:12:17 chr19 11350340 . C G 103.14 PASS AO=23;DP=47;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=3;FSAR=20;FSRF=6;FSRR=18;FWDB=-0.000989362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.642;QD=8.77816;RBI=0.0122405;REFB=-0.0111403;REVB=0.0122004;RO=24;SAF=3;SAR=20;SRF=6;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196037;STB=0.612134;TYPE=snp;VARB=0.0131189;OID=.;OPOS=11350340;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:24:24:23:23:20:3:6:18:20:3:6:18 chr19 11350488 . C T 161.53 PASS AO=31;DP=59;FAO=33;FDP=61;FR=.;FRO=28;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=0.00135335;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.36;QD=10.5922;RBI=0.00135684;REFB=-0.0357957;REVB=-9.72033e-05;RO=27;SAF=19;SAR=12;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0148323;STB=0.503224;TYPE=snp;VARB=0.0236407;OID=.;OPOS=11350488;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:61:27:28:31:33:12:19:17:10:12:21:18:10 chr19 11358799 . G A 55.61 PASS AO=8;DP=47;FAO=9;FDP=35;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=15;FWDB=-0.0438286;FXX=0.146306;HRUN=3;LEN=1;MLLD=88.6623;QD=6.35505;RBI=0.0907165;REFB=-0.0166373;REVB=0.0794263;RO=17;SAF=2;SAR=6;SRF=2;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228385;STB=0.636106;TYPE=snp;VARB=0.0206238;OID=.;OPOS=11358799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:36:35:17:18:8:9:6:2:2:15:6:3:3:15 chr19 11363146 . A T 275.99 PASS AO=50;DP=81;FAO=50;FDP=81;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=41;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=-0.0374188;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.6868;QD=13.629;RBI=0.0487134;REFB=0.0173749;REVB=-0.0311903;RO=29;SAF=9;SAR=41;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194953;STB=0.629391;TYPE=snp;VARB=-0.0269108;OID=.;OPOS=11363146;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:29:31:50:50:41:9:11:18:41:9:13:18 chr19 11411868 . C A 588.93 PASS AO=163;DP=370;FAO=162;FDP=368;FR=.;FRO=206;FSAF=79;FSAR=83;FSRF=90;FSRR=116;FWDB=-0.0199227;FXX=0.00540526;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.2694;QD=6.40145;RBI=0.0371986;REFB=-0.0122489;REVB=-0.0314137;RO=205;SAF=80;SAR=83;SRF=90;SRR=115;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0521706;STB=0.528469;TYPE=snp;VARB=0.0166459;OID=.;OPOS=11411868;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:370:368:205:206:163:162:83:80:90:115:83:79:90:116 chr19 11459665 . G GA 78.11 PASS AO=25;DP=67;FAO=30;FDP=64;FR=.;FRO=34;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.00816785;FXX=0.0447694;HRUN=1;LEN=1;MLLD=21.0792;QD=4.8821;RBI=0.139824;REFB=-0.041198;REVB=0.139585;RO=40;SAF=18;SAR=7;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252684;STB=0.599246;TYPE=ins;VARB=0.0549363;OID=.;OPOS=11459666;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:25:67:30:64:34:21:9:18:16:78:40:18:7:20:20 chr19 11459669 . G A 150.82 PASS AO=34;DP=69;FAO=34;FDP=69;FR=.;FRO=35;FSAF=27;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.0143717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.426;QD=8.74318;RBI=0.0151004;REFB=-0.0185559;REVB=0.00463424;RO=34;SAF=27;SAR=7;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.290159;STB=0.658433;TYPE=snp;VARB=0.0258524;OID=.;OPOS=11459669;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:34:35:34:34:7:27:18:16:7:27:19:16 chr19 11465316 . G C 26.1 PASS AO=12;DP=48;FAO=12;FDP=49;FR=.;FRO=37;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=31;FWDB=-0.0346179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.4441;QD=2.13094;RBI=0.0372534;REFB=-0.00925046;REVB=-0.0137628;RO=36;SAF=1;SAR=11;SRF=6;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234354;STB=0.646762;TYPE=snp;VARB=0.0308888;OID=.;OPOS=11465316;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:48:49:36:37:12:12:11:1:6:30:11:1:6:31 chr19 11465610 . A C 100.02 PASS AO=36;DP=109;FAO=37;FDP=110;FR=.;FRO=73;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=50;FWDB=0.0108452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.069;QD=3.63716;RBI=0.0197034;REFB=-0.00659158;REVB=0.0164502;RO=71;SAF=15;SAR=21;SRF=22;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129889;STB=0.581032;TYPE=snp;VARB=0.0102432;OID=.;OPOS=11465610;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:110:71:73:36:37:21:15:22:49:21:16:23:50 chr19 11473217 . AGG AG,A 364.81 PASS AO=37,18;DP=63;FAO=64,2;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=20,0;FSAR=44,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0469581,0.0238492;FXX=0.0294074;HRUN=3,3;LEN=1,2;MLLD=12.0811,11.2444;QD=22.1094;RBI=0.365711,0.182775;REFB=0,0;REVB=-0.362684,-0.181212;RO=2;SAF=13,0;SAR=24,18;SRF=1;SRR=1;SSEN=0.365741,0.365741;SSEP=0,0;SSSB=-0.0155589,-0.850359;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=-0.0203911,-0.0534166;OID=.,.;OPOS=11473218,11473218;OREF=G,GG;OALT=-,-;OMAPALT=AG,A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:37,18:60:64,2:66:0:20,0:44,2:0:0:16:2:13,0:24,18:1:1 chr19 11473358 . C G 88.88 PASS AO=19;DP=35;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=17;FWDB=0.0467345;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.044;QD=9.35527;RBI=0.0475306;REFB=-0.011861;REVB=-0.00866302;RO=16;SAF=8;SAR=11;SRF=1;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.321744;STB=0.670508;TYPE=snp;VARB=0.0155523;OID=.;OPOS=11473358;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:35:38:16:19:19:19:11:8:1:15:11:8:2:17 chr19 11476225 . TG T 136.5 PASS AO=81;DP=182;FAO=108;FDP=171;FR=.;FRO=63;FSAF=42;FSAR=66;FSRF=25;FSRR=38;FWDB=-0.211765;FXX=0.0172404;HRUN=6;LEN=1;MLLD=5.96716;QD=3.19298;RBI=0.218165;REFB=-0.0811948;REVB=-0.0524559;RO=49;SAF=34;SAR=47;SRF=19;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0.490196;SSSB=0.0229608;STB=0.503071;TYPE=del;VARB=0.0726115;OID=.;OPOS=11476226;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:81:171:108:171:63:42:66:25:38:40:49:34:47:19:30 chr19 11508177 . G A 113.34 PASS AO=25;DP=51;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=0.017011;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=176.275;QD=8.88957;RBI=0.0236199;REFB=0.00758635;REVB=0.0163868;RO=26;SAF=14;SAR=11;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.051356;STB=0.528823;TYPE=snp;VARB=-0.00656561;OID=.;OPOS=11508177;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:26:26:25:25:11:14:16:10:11:14:16:10 chr19 11526745 . C T 140.45 PASS AO=37;DP=85;FAO=37;FDP=85;FR=.;FRO=48;FSAF=9;FSAR=28;FSRF=9;FSRR=39;FWDB=0.0163445;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.189;QD=6.60955;RBI=0.0254205;REFB=-0.0131313;REVB=0.0194695;RO=47;SAF=9;SAR=28;SRF=8;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105439;STB=0.544693;TYPE=snp;VARB=0.0156029;OID=.;OPOS=11526745;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:47:48:37:37:28:9:8:39:28:9:9:39 chr19 11526759 . G A 618.14 PASS AO=74;DP=82;FAO=75;FDP=81;FR=.;FRO=6;FSAF=17;FSAR=58;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0108045;FXX=0.0121936;HRUN=3;LEN=1;MLLD=78.5574;QD=30.5252;RBI=0.0631264;REFB=-0.17422;REVB=0.0621949;RO=7;SAF=17;SAR=57;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0202454;STB=0.506381;TYPE=snp;VARB=0.00394261;OID=.;OPOS=11526759;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:82:81:7:6:74:75:57:17:1:6:58:17:1:5 chr19 11529958 . C T 89.74 PASS AO=22;DP=51;FAO=22;FDP=50;FR=.;FRO=28;FSAF=3;FSAR=19;FSRF=2;FSRR=26;FWDB=0.00890071;FXX=0.019604;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.0468;QD=7.17896;RBI=0.0119424;REFB=-0.0153728;REVB=0.00796228;RO=23;SAF=3;SAR=19;SRF=2;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104061;STB=0.586888;TYPE=snp;VARB=0.0170997;OID=.;OPOS=11529958;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:51:50:23:28:22:22:19:3:2:21:19:3:2:26 chr19 11598657 . A G 22.3 PASS AO=4;DP=9;FAO=4;FDP=9;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.016828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.004;QD=9.91249;RBI=0.0191543;REFB=-0.0352243;REVB=-0.00914908;RO=5;SAF=1;SAR=3;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.386089;STB=0.726523;TYPE=snp;VARB=0.0261727;OID=.;OPOS=11598657;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:9:9:5:5:4:4:3:1:0:5:3:1:0:5 chr19 11708464 . G C 123.25 PASS AO=25;DP=46;FAO=25;FDP=46;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.0291753;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2468;QD=10.717;RBI=0.0386701;REFB=-0.0334495;REVB=0.0253807;RO=20;SAF=7;SAR=18;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235052;STB=0.643947;TYPE=snp;VARB=0.0255481;OID=.;OPOS=11708464;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:46:46:20:21:25:25:18:7:11:9:18:7:12:9 chr19 11725413 . G A 398.37 PASS AO=94;DP=232;FAO=111;FDP=249;FR=.;FRO=138;FSAF=57;FSAR=54;FSRF=63;FSRR=75;FWDB=0.01269;FXX=0.0119043;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.016;QD=6.39955;RBI=0.0130488;REFB=-0.00995211;REVB=0.00303913;RO=131;SAF=55;SAR=39;SRF=61;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125079;STB=0.531549;TYPE=snp;VARB=0.0128089;OID=.;OPOS=11725413;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:249:131:138:94:111:39:55:61:70:54:57:63:75 chr19 11833654 . TA T 26.49 PASS AO=20;DP=105;FAO=31;FDP=99;FR=.;FRO=68;FSAF=6;FSAR=25;FSRF=29;FSRR=39;FWDB=-0.0401303;FXX=0.0480723;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.7209;QD=1.07037;RBI=0.0567066;REFB=-0.0158481;REVB=-0.0400649;RO=58;SAF=2;SAR=18;SRF=26;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.531394;STB=0.694856;TYPE=del;VARB=-0.0196349;OID=.;OPOS=11833655;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:20:98:31:99:68:6:25:29:39:26:58:2:18:26:32 chr19 11891003 . G A 1174.89 PASS AO=121;DP=123;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0198843;FXX=0.0676641;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.239;QD=37.8996;RBI=0.0332834;REFB=0;REVB=0.0266909;RO=0;SAF=53;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.82975e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000370464;OID=.;OPOS=11891003;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:123:124:0:0:121:124:68:53:0:0:71:53:0:0 chr19 11892935 . G C 366.85 PASS AO=79;DP=151;FAO=79;FDP=148;FR=.;FRO=69;FSAF=50;FSAR=29;FSRF=40;FSRR=29;FWDB=-0.0185806;FXX=0.0198662;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.6815;QD=9.91481;RBI=0.0206719;REFB=-0.00804475;REVB=-0.00906036;RO=65;SAF=50;SAR=29;SRF=37;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0556119;STB=0.526309;TYPE=snp;VARB=0.00890001;OID=.;OPOS=11892935;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:148:65:69:79:79:29:50:37:28:29:50:40:29 chr19 11918093 . AT A 138.19 PASS AO=41;DP=107;FAO=60;FDP=94;FR=.;FRO=34;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=0.00324784;FXX=0.059994;HRUN=6;LEN=1;MLLD=9.60674;QD=5.88061;RBI=0.0360296;REFB=0.0010126;REVB=0.0358829;RO=38;SAF=20;SAR=21;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0351944;STB=0.513664;TYPE=del;VARB=0.0402417;OID=.;OPOS=11918094;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:41:96:60:94:34:26:34:16:18:34:38:20:21:17:21 chr19 11918878 . C A 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0307088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.855;QD=35.0874;RBI=0.0310922;REFB=0;REVB=0.00486812;RO=0;SAF=1;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000252471;OID=.;OPOS=11918878;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:6:1:0:0:6:1:0:0 chr19 11941221 . T A 621.63 PASS AO=234;DP=529;FAO=174;FDP=400;FR=.;FRO=226;FSAF=83;FSAR=91;FSRF=99;FSRR=127;FWDB=-0.00627261;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=247.975;QD=6.21628;RBI=0.0265953;REFB=-0.0256885;REVB=-0.025845;RO=294;SAF=106;SAR=128;SRF=125;SRR=169;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0283551;STB=0.5221;TYPE=snp;VARB=0.0311616;OID=.;OPOS=11941221;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:529:400:294:226:234:174:128:106:125:169:91:83:99:127 chr19 11942362 . A G 463.32 PASS AO=112;DP=236;FAO=114;FDP=238;FR=.;FRO=124;FSAF=56;FSAR=58;FSRF=57;FSRR=67;FWDB=0.00492619;FXX=0.00418393;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.207;QD=7.78692;RBI=0.0106467;REFB=-0.010314;REVB=-0.0094385;RO=123;SAF=56;SAR=56;SRF=57;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0347359;STB=0.51645;TYPE=snp;VARB=0.010407;OID=.;OPOS=11942362;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:236:238:123:124:112:114:56:56:57:66:58:56:57:67 chr19 11942615 . A C 109.89 PASS AO=28;DP=70;FAO=30;FDP=72;FR=.;FRO=42;FSAF=7;FSAR=23;FSRF=11;FSRR=31;FWDB=0.0383629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5508;QD=6.10522;RBI=0.0538;REFB=-0.0260342;REVB=0.037719;RO=40;SAF=7;SAR=21;SRF=10;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.522712;TYPE=snp;VARB=0.0299656;OID=.;OPOS=11942615;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:72:40:42:28:30:21:7:10:30:23:7:11:31 chr19 11942771 . G A 124.85 PASS AO=34;DP=82;FAO=34;FDP=81;FR=.;FRO=47;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=0.000616779;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.7497;QD=6.16517;RBI=0.036548;REFB=-0.00686238;REVB=0.0365428;RO=47;SAF=22;SAR=12;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123559;STB=0.57008;TYPE=snp;VARB=0.00912469;OID=.;OPOS=11942771;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:81:47:47:34:34:12:22:25:22:12:22:25:22 chr19 11943697 . G A 689.09 PASS AO=65;DP=66;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00221714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.403;QD=37.7581;RBI=0.0155418;REFB=0;REVB=0.0153829;RO=0;SAF=27;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.04073e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.84632e-05;OID=.;OPOS=11943697;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:66:73:0:0:65:73:38:27:0:0:39:34:0:0 chr19 11943713 . G A 41.79 PASS AO=17;DP=59;FAO=17;FDP=60;FR=.;FRO=43;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=0.0485592;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.1312;QD=2.78605;RBI=0.0551491;REFB=0.000290736;REVB=0.0261424;RO=41;SAF=6;SAR=11;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.244646;STB=0.631527;TYPE=snp;VARB=0.00170618;OID=.;OPOS=11943713;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:59:60:41:43:17:17:11:6:23:18:11:6:23:20 chr19 11979164 . T C 15.16 PASS AO=6;DP=27;FAO=6;FDP=27;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.0309131;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.724;QD=2.24533;RBI=0.0403964;REFB=-0.0120665;REVB=-0.0260047;RO=21;SAF=4;SAR=2;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0604803;STB=0.540403;TYPE=snp;VARB=0.0741612;OID=.;OPOS=11979164;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:27:27:21:21:6:6:2:4:13:8:2:4:13:8 chr19 11979636 . T C 157.3 PASS AO=36;DP=78;FAO=37;FDP=78;FR=.;FRO=41;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=28;FSRR=13;FWDB=-0.00948286;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.117;QD=8.06669;RBI=0.0106898;REFB=-0.0192616;REVB=0.00493422;RO=41;SAF=24;SAR=12;SRF=28;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0175253;STB=0.504359;TYPE=snp;VARB=0.0172031;OID=.;OPOS=11979636;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:41:41:36:37:12:24:28:13:12:25:28:13 chr19 12187151 . C G 101.4 PASS AO=23;DP=48;FAO=23;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.0177113;FXX=0.020404;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.033;QD=8.45037;RBI=0.0189668;REFB=-0.0123707;REVB=-0.00678594;RO=23;SAF=13;SAR=10;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0390575;STB=0.50276;TYPE=snp;VARB=0.0123305;OID=.;OPOS=12187151;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:23:25:23:23:10:13:12:11:10:13:14:11 chr19 12222381 . C G 289.23 PASS AO=58;DP=104;FAO=59;FDP=105;FR=.;FRO=46;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=-0.0130829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.595;QD=11.0182;RBI=0.017234;REFB=-0.0102689;REVB=0.0112182;RO=45;SAF=27;SAR=31;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0541631;STB=0.520665;TYPE=snp;VARB=0.00721151;OID=.;OPOS=12222381;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:105:45:46:58:59:31:27:24:21:31:28:24:22 chr19 12250983 . C G 57.61 PASS AO=19;DP=56;FAO=19;FDP=56;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=0.0138262;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=205.244;QD=4.11512;RBI=0.0165108;REFB=0.00442481;REVB=0.00902454;RO=36;SAF=13;SAR=6;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122627;STB=0.583582;TYPE=snp;VARB=-0.00761726;OID=.;OPOS=12250983;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:56:56:36:37:19:19:6:13:21:15:6:13:21:16 chr19 12405552 . T C 66.37 PASS AO=28;DP=104;FAO=32;FDP=110;FR=.;FRO=78;FSAF=9;FSAR=23;FSRF=24;FSRR=54;FWDB=-0.0421066;FXX=0.0178555;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.0393;QD=2.4134;RBI=0.0860393;REFB=-0.0236769;REVB=-0.075032;RO=75;SAF=10;SAR=18;SRF=23;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.068812;STB=0.522713;TYPE=snp;VARB=0.0359928;OID=.;OPOS=12405552;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:104:110:75:78:28:32:18:10:23:52:23:9:24:54 chr19 12491302 . TTTC T 1345.14 PASS AO=189;DP=217;FAO=197;FDP=212;FR=.;FRO=15;FSAF=87;FSAR=110;FSRF=12;FSRR=3;FWDB=-0.0215254;FXX=0.0185177;HRUN=3;LEN=3;MLLD=200.941;QD=25.38;RBI=0.0532451;REFB=0.00494493;REVB=-0.0487001;RO=0;SAF=81;SAR=108;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.525551;TYPE=del;VARB=-0.000355128;OID=.;OPOS=12491303;OREF=TTC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:189:196:197:212:15:87:110:12:3:36:0:81:108:0:0 chr19 12491498 . C T 3443.46 PASS AO=354;DP=354;FAO=358;FDP=358;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=264;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0186548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.669;QD=38.4744;RBI=0.0225599;REFB=0;REVB=0.0126865;RO=0;SAF=94;SAR=260;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.40524e-06;OID=.;OPOS=12491498;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:354:358:0:0:354:358:260:94:0:0:264:94:0:0 chr19 12491639 . A G 1529.13 PASS AO=154;DP=155;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0425676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.989;QD=38.4687;RBI=0.0505696;REFB=0;REVB=-0.0272999;RO=0;SAF=37;SAR=117;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.5709e-05;OID=.;OPOS=12491639;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:155:159:0:0:154:159:117:37:0:0:119:40:0:0 chr19 12491654 . C T 1580.73 PASS AO=165;DP=166;FAO=165;FDP=165;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=127;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0293494;FXX=0.00602373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.7072;QD=38.3208;RBI=0.0338002;REFB=0;REVB=0.016765;RO=0;SAF=38;SAR=127;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.37501e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.62645e-05;OID=.;OPOS=12491654;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:166:165:0:0:165:165:127:38:0:0:127:38:0:0 chr19 12491779 . T C 2108.81 PASS AO=220;DP=237;FAO=230;FDP=230;FR=.;FRO=0;FSAF=102;FSAR=128;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00417495;FXX=0.0295346;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.3111;QD=36.675;RBI=0.0416042;REFB=-0.00214235;REVB=0.0413942;RO=1;SAF=102;SAR=118;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0046484;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.05223e-05;OID=.;OPOS=12491779;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:237:230:1:0:220:230:118:102:1:0:128:102:0:0 chr19 12491949 . T C 1228.01 PASS AO=142;DP=152;FAO=142;FDP=151;FR=.;FRO=9;FSAF=70;FSAR=72;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.016755;FXX=0.0194793;HRUN=4;LEN=1;MLLD=100.467;QD=32.5301;RBI=0.0320337;REFB=-0.00406538;REVB=-0.0273025;RO=9;SAF=70;SAR=72;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0180607;STB=0.509517;TYPE=snp;VARB=0.000660185;OID=.;OPOS=12491949;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:152:151:9:9:142:142:72:70:3:6:72:70:3:6 chr19 12491955 . A C 1220.56 PASS AO=138;DP=144;FAO=140;FDP=145;FR=.;FRO=5;FSAF=68;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.13351;FXX=0.00684885;HRUN=4;LEN=1;MLLD=39.9772;QD=33.6708;RBI=0.140728;REFB=-0.105367;REVB=-0.0444903;RO=6;SAF=67;SAR=71;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0384929;STB=0.516776;TYPE=snp;VARB=0.00236986;OID=.;OPOS=12491955;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:144:145:6:5:138:140:71:67:0:6:72:68:0:5 chr19 12492036 . A T 769.72 PASS AO=84;DP=86;FAO=84;FDP=86;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=57;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00848144;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=221.468;QD=35.8008;RBI=0.0267599;REFB=-0.0124914;REVB=0.0253803;RO=1;SAF=27;SAR=57;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0172181;STB=0.517853;TYPE=snp;VARB=9.18247e-05;OID=.;OPOS=12492036;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:86:86:1:2:84:84:57:27:1:0:57:27:2:0 chr19 12492039 . G T 784.07 PASS AO=81;DP=81;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0470132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.045;QD=37.7867;RBI=0.0489921;REFB=0;REVB=0.0137835;RO=0;SAF=28;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.50795e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000108603;OID=.;OPOS=12492039;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:81:83:0:0:81:83:53:28:0:0:54:29:0:0 chr19 12502457 . A G 1345.92 PASS AO=137;DP=137;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.73;QD=38.1822;RBI=0.0313358;REFB=0;REVB=-0.00904923;RO=0;SAF=78;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.5753e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.29944e-05;OID=.;OPOS=12502457;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:137:141:0:0:137:141:59:78:0:0:59:82:0:0 chr19 12502786 . C T 717.52 PASS AO=216;DP=450;FAO=185;FDP=398;FR=.;FRO=213;FSAF=96;FSAR=89;FSRF=83;FSRR=130;FWDB=0.023455;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.4834;QD=7.21125;RBI=0.027562;REFB=-0.0157165;REVB=-0.0144751;RO=228;SAF=115;SAR=101;SRF=89;SRR=139;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132409;STB=0.568901;TYPE=snp;VARB=0.0222609;OID=.;OPOS=12502786;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:450:398:228:213:216:185:101:115:89:139:89:96:83:130 chr19 12540971 . T A 105.09 PASS AO=24;DP=46;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=4;FWDB=-0.00571026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.228;QD=9.13825;RBI=0.00619801;REFB=-0.00210498;REVB=0.00241003;RO=22;SAF=19;SAR=5;SRF=18;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.035195;STB=0.533114;TYPE=snp;VARB=0.00162455;OID=.;OPOS=12540971;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:22:23:24:23:5:19:18:4:5:18:19:4 chr19 12541214 . G T 195.22 PASS AO=71;DP=205;FAO=71;FDP=203;FR=.;FRO=132;FSAF=29;FSAR=42;FSRF=40;FSRR=92;FWDB=0.0157493;FXX=0.00975562;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9303;QD=3.8467;RBI=0.0157796;REFB=-0.000626179;REVB=-0.000977364;RO=132;SAF=29;SAR=42;SRF=40;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128326;STB=0.572799;TYPE=snp;VARB=0.00134135;OID=.;OPOS=12541214;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:203:132:132:71:71:42:29:40:92:42:29:40:92 chr19 12541532 . C A 1447.22 PASS AO=140;DP=140;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00580098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.772;QD=38.5926;RBI=0.0148648;REFB=0;REVB=-0.0136862;RO=0;SAF=61;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.91616e-06;OID=.;OPOS=12541532;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:140:150:0:0:140:150:79:61:0:0:79:71:0:0 chr19 12541542 . C T 184.28 PASS AO=56;DP=143;FAO=56;FDP=142;FR=.;FRO=86;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=37;FSRR=49;FWDB=0.0525005;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=142.988;QD=5.1909;RBI=0.0527754;REFB=-0.00354708;REVB=0.00537958;RO=85;SAF=32;SAR=24;SRF=36;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157258;STB=0.58514;TYPE=snp;VARB=0.00604235;OID=.;OPOS=12541542;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:142:85:86:56:56:24:32:36:49:24:32:37:49 chr19 12541544 . A C 188.53 PASS AO=55;DP=141;FAO=56;FDP=140;FR=.;FRO=84;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=36;FSRR=48;FWDB=0.0124818;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.206;QD=5.38649;RBI=0.0136793;REFB=-0.00553504;REVB=0.00559708;RO=85;SAF=32;SAR=23;SRF=37;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157057;STB=0.585335;TYPE=snp;VARB=0.00220744;OID=.;OPOS=12541544;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:140:85:84:55:56:23:32:37:48:24:32:36:48 chr19 12541547 . T G 398.65 PASS AO=83;DP=148;FAO=82;FDP=147;FR=.;FRO=65;FSAF=36;FSAR=46;FSRF=34;FSRR=31;FWDB=0.00878961;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.327;QD=10.8476;RBI=0.0149973;REFB=-0.00598351;REVB=-0.0121517;RO=65;SAF=37;SAR=46;SRF=34;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.062497;STB=0.537374;TYPE=snp;VARB=0.00306652;OID=.;OPOS=12541547;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:147:65:65:83:82:46:37:34:31:46:36:34:31 chr19 12541795 . C A 209.65 PASS AO=63;DP=153;FAO=62;FDP=153;FR=.;FRO=91;FSAF=35;FSAR=27;FSRF=33;FSRR=58;FWDB=0.000654739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.835;QD=5.48111;RBI=0.0395723;REFB=-0.0107143;REVB=-0.0395669;RO=89;SAF=35;SAR=28;SRF=32;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202397;STB=0.618337;TYPE=snp;VARB=0.0186008;OID=.;OPOS=12541795;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:153:89:91:63:62:28:35:32:57:27:35:33:58 chr19 12542355 . A G 275.34 PASS AO=74;DP=168;FAO=74;FDP=168;FR=.;FRO=94;FSAF=39;FSAR=35;FSRF=42;FSRR=52;FWDB=0.00251951;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=228.27;QD=6.5556;RBI=0.0132723;REFB=-0.0014957;REVB=0.013031;RO=94;SAF=39;SAR=35;SRF=42;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0804356;STB=0.544786;TYPE=snp;VARB=0.00166312;OID=.;OPOS=12542355;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:168:94:94:74:74:35:39:42:52:35:39:42:52 chr19 12542653 . T G 437.03 PASS AO=111;DP=243;FAO=114;FDP=250;FR=.;FRO=136;FSAF=48;FSAR=66;FSRF=64;FSRR=72;FWDB=0.0354478;FXX=0.0157474;HRUN=5;LEN=1;MLLD=174.924;QD=6.99254;RBI=0.0357638;REFB=-0.010349;REVB=-0.00474385;RO=131;SAF=48;SAR=63;SRF=64;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.055441;STB=0.527392;TYPE=snp;VARB=0.0106016;OID=.;OPOS=12542653;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:243:250:131:136:111:114:63:48:64:67:66:48:64:72 chr19 12542654 . T A 435.52 PASS AO=111;DP=247;FAO=114;FDP=250;FR=.;FRO=136;FSAF=48;FSAR=66;FSRF=65;FSRR=71;FWDB=0.0177099;FXX=0.0118572;HRUN=5;LEN=1;MLLD=196.802;QD=6.96839;RBI=0.0181617;REFB=0.00257019;REVB=-0.00402582;RO=133;SAF=48;SAR=63;SRF=65;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0559511;STB=0.531418;TYPE=snp;VARB=-0.00640142;OID=.;OPOS=12542654;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:247:250:133:136:111:114:63:48:65:68:66:48:65:71 chr19 12542772 . C T 94.76 PASS AO=20;DP=46;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=-0.0456983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.953;QD=7.5804;RBI=0.0457813;REFB=-0.00917759;REVB=0.0027557;RO=25;SAF=10;SAR=10;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176008;STB=0.556505;TYPE=snp;VARB=0.0160054;OID=.;OPOS=12542772;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:46:50:25:27:20:23:10:10:8:17:13:10:9:18 chr19 12551715 . A C 290 PASS AO=27;DP=27;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0429518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.405;QD=37.4195;RBI=0.0607237;REFB=0;REVB=0.0429245;RO=0;SAF=6;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.23693e-07;OID=.;OPOS=12551715;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:27:31:0:0:27:31:21:6:0:0:25:6:0:0 chr19 12576049 . G A 66.57 PASS AO=18;DP=45;FAO=18;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=-0.0204385;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.925;QD=5.91703;RBI=0.0205231;REFB=-0.0237334;REVB=-0.00186175;RO=27;SAF=8;SAR=10;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190232;STB=0.609637;TYPE=snp;VARB=0.0365366;OID=.;OPOS=12576049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:45:45:27:27:18:18:10:8:17:10:10:8:17:10 chr19 12692001 . G A 392.12 PASS AO=98;DP=209;FAO=98;FDP=208;FR=.;FRO=110;FSAF=58;FSAR=40;FSRF=63;FSRR=47;FWDB=-0.00512751;FXX=0.00478446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.053;QD=7.54076;RBI=0.00825066;REFB=0.00601487;REVB=-0.0064639;RO=110;SAF=58;SAR=40;SRF=63;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0188543;STB=0.510417;TYPE=snp;VARB=-0.00599756;OID=.;OPOS=12692001;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:208:110:110:98:98:40:58:63:47:40:58:63:47 chr19 12707978 . G A 140.51 PASS AO=32;DP=65;FAO=32;FDP=65;FR=.;FRO=33;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.0225989;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.69;QD=8.64694;RBI=0.0448825;REFB=-0.0202023;REVB=0.0387779;RO=33;SAF=22;SAR=10;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168633;STB=0.594533;TYPE=snp;VARB=0.0238521;OID=.;OPOS=12707978;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:33:33:32:32:10:22:17:16:10:22:17:16 chr19 12772090 . C T 832.93 PASS AO=92;DP=96;FAO=92;FDP=95;FR=.;FRO=3;FSAF=69;FSAR=23;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0203109;FXX=0.0104156;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.094;QD=35.0706;RBI=0.0323886;REFB=-0.0292515;REVB=0.0252288;RO=3;SAF=69;SAR=23;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00662253;STB=0.503496;TYPE=snp;VARB=0.000326878;OID=.;OPOS=12772090;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:96:95:3:3:92:92:23:69:2:1:23:69:2:1 chr19 12772165 . G A 760.75 PASS AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0812486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.5434;QD=38.519;RBI=0.101804;REFB=0;REVB=0.0613417;RO=0;SAF=64;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.41902e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000723345;OID=.;OPOS=12772165;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:79:79:0:0:79:79:15:64:0:0:15:64:0:0 chr19 12774208 . G C 460.91 PASS AO=98;DP=187;FAO=101;FDP=191;FR=.;FRO=90;FSAF=50;FSAR=51;FSRF=55;FSRR=35;FWDB=0.0302299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.2849;QD=9.65259;RBI=0.0316408;REFB=0.000675008;REVB=0.00934311;RO=89;SAF=49;SAR=49;SRF=55;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102661;STB=0.554624;TYPE=snp;VARB=-0.000238915;OID=.;OPOS=12774208;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:191:89:90:98:101:49:49:55:34:51:50:55:35 chr19 12779170 . G A 341.05 PASS AO=52;DP=72;FAO=53;FDP=73;FR=.;FRO=20;FSAF=37;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=3;FWDB=-0.006088;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.138;QD=18.6877;RBI=0.0632188;REFB=0.00714103;REVB=0.0629249;RO=20;SAF=36;SAR=16;SRF=17;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0996298;STB=0.551354;TYPE=snp;VARB=-0.00814927;OID=.;OPOS=12779170;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:72:73:20:20:52:53:16:36:17:3:16:37:17:3 chr19 12800090 . GC G 98.43 PASS AO=16;DP=36;FAO=25;FDP=31;FR=.;FRO=6;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.149312;FXX=0.0312402;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.4566;QD=12.7006;RBI=0.244152;REFB=-0.084241;REVB=0.193174;RO=9;SAF=7;SAR=9;SRF=6;SRR=3;SSEN=0.303743;SSEP=0;SSSB=-0.146799;STB=0.636252;TYPE=del;VARB=0.0501437;OID=.;OPOS=12800091;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:16:30:25:31:6:8:17:6:0:8:9:7:9:6:3 chr19 12800170 . T C 52.53 PASS AO=11;DP=38;FAO=13;FDP=34;FR=.,HEALED;FRO=21;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.00129879;FXX=0.128172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.355;QD=6.17965;RBI=0.0235435;REFB=-0.00166292;REVB=-0.0235077;RO=10;SAF=8;SAR=3;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208353;STB=0.642641;TYPE=snp;VARB=0.000626607;OID=.;OPOS=12800170;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:36:34:10:21:11:13:3:8:5:5:5:8:8:13 chr19 12805431 . T C 206.67 PASS AO=49;DP=103;FAO=49;FDP=102;FR=.;FRO=53;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=31;FWDB=-0.0237637;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.837;QD=8.1047;RBI=0.0324823;REFB=-0.0154332;REVB=0.0221447;RO=53;SAF=26;SAR=23;SRF=22;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107724;STB=0.559784;TYPE=snp;VARB=0.0143269;OID=.;OPOS=12805431;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:102:53:53:49:49:23:26:22:31:23:26:22:31 chr19 12805525 . G C 160.98 PASS AO=36;DP=72;FAO=36;FDP=72;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=11;FSRR=25;FWDB=-0.00391483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.609;QD=8.94309;RBI=0.022775;REFB=-0.0110231;REVB=-0.022436;RO=36;SAF=11;SAR=25;SRF=11;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0112081;OID=.;OPOS=12805525;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:36:36:36:36:25:11:11:25:25:11:11:25 chr19 12812169 . A G 33.68 PASS AO=13;DP=46;FAO=13;FDP=46;FR=.;FRO=33;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=-0.00531198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.498;QD=2.9289;RBI=0.114175;REFB=-0.0178671;REVB=-0.114051;RO=33;SAF=5;SAR=8;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.084448;STB=0.551644;TYPE=snp;VARB=0.0628701;OID=.;OPOS=12812169;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:46:46:33:33:13:13:8:5:15:18:8:5:15:18 chr19 12813683 . T C 159.85 PASS AO=35;DP=69;FAO=35;FDP=69;FR=.;FRO=34;FSAF=5;FSAR=30;FSRF=7;FSRR=27;FWDB=-0.00444382;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=255.852;QD=9.26642;RBI=0.0184063;REFB=-0.0119041;REVB=-0.0178618;RO=34;SAF=5;SAR=30;SRF=7;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103713;STB=0.558104;TYPE=snp;VARB=0.013749;OID=.;OPOS=12813683;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:34:34:35:35:30:5:7:27:30:5:7:27 chr19 12816559 . G T 77.25 PASS AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.0173625;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=217.812;QD=7.72461;RBI=0.017465;REFB=0.000386104;REVB=-0.00188897;RO=22;SAF=9;SAR=9;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131387;STB=0.574919;TYPE=snp;VARB=-0.000331124;OID=.;OPOS=12816559;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:40:40:22:22:18:18:9:9:14:8:9:9:14:8 chr19 12856217 . G A 41.09 PASS AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.0382687;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.377;QD=10.2726;RBI=0.0468798;REFB=-0.0298556;REVB=0.027078;RO=8;SAF=2;SAR=6;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128818;STB=0.576719;TYPE=snp;VARB=0.0449958;OID=.;OPOS=12856217;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:16:16:8:8:8:8:6:2:3:5:6:2:3:5 chr19 12875807 . A C 250.89 PASS AO=47;DP=79;FAO=47;FDP=79;FR=.;FRO=32;FSAF=6;FSAR=41;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=0.00150842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.03;QD=12.7032;RBI=0.0235838;REFB=-0.0530207;REVB=-0.0235355;RO=31;SAF=6;SAR=41;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.411483;STB=0.737174;TYPE=snp;VARB=0.0178043;OID=.;OPOS=12875807;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:31:32:47:47:41:6:16:15:41:6:17:15 chr19 12876753 . GCC GC,G,TGC 179.02 PASS AO=7,6,5;DP=38;FAO=26,0,6;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=14,0,0;FSAR=12,0,6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.594717,0.323272,0.323022;FXX=0;HRUN=6,6,1;LEN=1,2,2;MLLD=9.16835,8.85941,12.3869;QD=22.3772;RBI=0.626085,0.339541,0.323041;REFB=0.00513872,0.00964823,0.00985368;REVB=-0.195686,-0.103845,-0.00345615;RO=11;SAF=2,0,0;SAR=5,6,5;SRF=10;SRR=1;SSEN=0.479769,0.479769,0;SSEP=0.636364,0.636364,0;SSSB=-0.567703,-0.827439,-0.819387;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=del,del,mnp;VARB=-0.0300929,0.0280259,0.0955369;OID=.,.,.;OPOS=12876754,12876754,12876753;OREF=C,CC,GC;OALT=-,-,TG;OMAPALT=GC,G,TGC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/3:11:31:32:11:0:7,6,5:26,0,6:5,6,5:2,0,0:10:1:12,0,6:14,0,0:0:0 chr19 12882201 . AG A 207.4 PASS AO=22;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.336094;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=8.88956;QD=20.7398;RBI=0.377552;REFB=0;REVB=0.172006;RO=6;SAF=6;SAR=16;SRF=3;SRR=3;SSEN=0.45679;SSEP=0;SSSB=-0.105998;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0238378;OID=.;OPOS=12882202;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:22:38:40:40:0:17:23:0:0:21:6:6:16:3:3 chr19 12882997 . C A 281.92 PASS AO=64;DP=126;FAO=64;FDP=126;FR=.;FRO=62;FSAF=38;FSAR=26;FSRF=30;FSRR=32;FWDB=-0.0092176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.7562;QD=8.94987;RBI=0.0482011;REFB=-0.0168778;REVB=-0.0473115;RO=62;SAF=38;SAR=26;SRF=30;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0995081;STB=0.554867;TYPE=snp;VARB=0.0177069;OID=.;OPOS=12882997;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:62:62:64:64:26:38:30:32:26:38:30:32 chr19 12883020 . C T 333.1 PASS AO=74;DP=146;FAO=76;FDP=151;FR=.;FRO=75;FSAF=38;FSAR=38;FSRF=45;FSRR=30;FWDB=0.0184215;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.1041;QD=8.82391;RBI=0.0195022;REFB=-0.0271209;REVB=0.0064018;RO=71;SAF=38;SAR=36;SRF=45;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107671;STB=0.549656;TYPE=snp;VARB=0.0307543;OID=.;OPOS=12883020;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:151:71:75:74:76:36:38:45:26:38:38:45:30 chr19 12920935 . G A 429.86 PASS AO=93;DP=184;FAO=96;FDP=184;FR=.;FRO=88;FSAF=49;FSAR=47;FSRF=45;FSRR=43;FWDB=-0.0202145;FXX=0.0160419;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.549;QD=9.34477;RBI=0.0410852;REFB=-0.00247535;REVB=0.0357683;RO=89;SAF=48;SAR=45;SRF=47;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106719;STB=0.500453;TYPE=snp;VARB=0.00223438;OID=.;OPOS=12920935;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:184:89:88:93:96:45:48:47:42:47:49:45:43 chr19 12921186 . T C 130.88 PASS AO=28;DP=54;FAO=28;FDP=54;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=0.0138607;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.7392;QD=9.69504;RBI=0.0734739;REFB=0.0169146;REVB=-0.0721547;RO=26;SAF=10;SAR=18;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0255769;STB=0.514275;TYPE=snp;VARB=-0.018499;OID=.;OPOS=12921186;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:26:26:28:28:18:10:10:16:18:10:10:16 chr19 12936617 . C G 178.07 PASS AO=35;DP=65;FAO=36;FDP=65;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.0530806;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.8132;QD=10.9578;RBI=0.0544946;REFB=-0.00415466;REVB=-0.0123334;RO=30;SAF=15;SAR=20;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.087867;STB=0.532628;TYPE=snp;VARB=0.00390632;OID=.;OPOS=12936617;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:30:29:35:36:20:15:16:14:20:16:15:14 chr19 12958420 . C T 523.98 PASS AO=71;DP=130;FAO=74;FDP=122;FR=.,HEALED;FRO=31;FSAF=28;FSAR=46;FSRF=9;FSRR=22;FWDB=-0.0146233;FXX=0.0161277;HRUN=4;LEN=1;MLLD=184.946;QD=17.1797;RBI=0.0339981;REFB=-0.0166888;REVB=0.0306925;RO=23;SAF=27;SAR=44;SRF=5;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0806895;STB=0.528001;TYPE=snp;VARB=0.00718742;OID=.;OPOS=12958420;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:120:122:23:31:71:74:44:27:5:18:46:28:9:22 chr19 12958697 . T C 26.7 PASS AO=7;DP=21;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.00348792;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.7413;QD=5.08611;RBI=0.0851137;REFB=0.0422554;REVB=0.0850422;RO=14;SAF=6;SAR=1;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.448782;STB=0.785954;TYPE=snp;VARB=-0.0641248;OID=.;OPOS=12958697;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:21:21:14:14:7:7:1:6:7:7:1:6:7:7 chr19 12963143 . T C 50.31 PASS AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=39;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=22;FWDB=-0.0409424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.9872;QD=5.15962;RBI=0.0413114;REFB=-0.0216914;REVB=-0.00550927;RO=22;SAF=7;SAR=8;SRF=1;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.466489;STB=0.74444;TYPE=snp;VARB=0.0836188;OID=.;OPOS=12963143;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:38:39:22:24:15:15:8:7:1:21:8:7:2:22 chr19 12985576 . A G 30.14 PASS AO=9;DP=28;FAO=9;FDP=28;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=15;FWDB=-0.0282744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.48;QD=4.30514;RBI=0.0282746;REFB=-0.0181173;REVB=0.000107068;RO=18;SAF=2;SAR=7;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511602;TYPE=snp;VARB=0.0272945;OID=.;OPOS=12985576;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:28:28:18:19:9:9:7:2:4:14:7:2:4:15 chr19 13008600 . TGGGGGGG TGGGGGG,TGGGGGGT 931.26 PASS AO=40,93;DP=274;FAO=53,131;FDP=237;FR=.;FRO=53;FSAF=12,18;FSAR=41,113;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=-0.121602,0.00180167;FXX=0.0632386;HRUN=7,7;LEN=1,1;MLLD=6.91464,256.911;QD=15.7175;RBI=0.147134,0.00717071;REFB=-0.135383,-0.0159942;REVB=0.0828346,0.00694068;RO=54;SAF=11,15;SAR=29,78;SRF=23;SRR=31;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.174645,-0.264659;STB=0.656212,0.663612;TYPE=del,snp;VARB=0.127473,-0.00200374;OID=.,.;OPOS=13008601,13008607;OREF=G,G;OALT=-,T;OMAPALT=TGGGGGG,TGGGGGGT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:40,93:228:53,131:237:53:12,18:41,113:26:27:89:54:11,15:29,78:23:31 chr19 13010520 . A G 959.69 PASS AO=99;DP=100;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0179968;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.496;QD=38.0075;RBI=0.0319408;REFB=0;REVB=-0.0263881;RO=0;SAF=19;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000133801;OID=.;OPOS=13010520;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:100:101:0:0:99:101:80:19:0:0:82:19:0:0 chr19 13035006 . G A 254.38 PASS AO=62;DP=131;FAO=62;FDP=131;FR=.;FRO=69;FSAF=23;FSAR=39;FSRF=30;FSRR=39;FWDB=-0.000741659;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=205.904;QD=7.76737;RBI=0.0239317;REFB=-0.0081544;REVB=0.0239202;RO=69;SAF=23;SAR=39;SRF=30;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0636621;STB=0.535342;TYPE=snp;VARB=0.00708694;OID=.;OPOS=13035006;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:69:69:62:62:39:23:30:39:39:23:30:39 chr19 13058826 . G C 58.45 PASS AO=15;DP=37;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=1;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.0657155;FXX=0.0263089;HRUN=3;LEN=1;MLLD=118.401;QD=6.31901;RBI=0.0665716;REFB=-0.00939643;REVB=-0.0106417;RO=22;SAF=14;SAR=1;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.556532;STB=0.837732;TYPE=snp;VARB=0.043164;OID=.;OPOS=13058826;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:37:37:22:22:15:15:1:14:13:9:1:14:13:9 chr19 13251019 . TG T 59.66 PASS AO=21;DP=42;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=21;FSRF=4;FSRR=15;FWDB=-0.0188246;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.2861;QD=5.68222;RBI=0.0860596;REFB=-0.15826;REVB=-0.0839756;RO=20;SAF=1;SAR=20;SRF=4;SRR=16;SSEN=0.378378;SSEP=0;SSSB=-0.401725;STB=0.636222;TYPE=del;VARB=0.110259;OID=.;OPOS=13251020;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:21:42:23:42:19:2:21:4:15:39:20:1:20:4:16 chr19 13317457 . T C 134.98 PASS AO=34;DP=73;FAO=34;FDP=74;FR=.;FRO=40;FSAF=25;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=-0.0107326;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.818;QD=7.29645;RBI=0.0230037;REFB=-0.00923386;REVB=0.0203465;RO=39;SAF=25;SAR=9;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187435;STB=0.600677;TYPE=snp;VARB=0.0108442;OID=.;OPOS=13317457;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:74:39:40:34:34:9:25:22:17:9:25:23:17 chr19 13317490 . GTTA G 21.93 PASS AO=18;DP=76;FAO=19;FDP=71;FR=.;FRO=52;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=32;FSRR=20;FWDB=0.0101142;FXX=0.0273935;HRUN=2;LEN=3;MLLD=272.615;QD=1.2353;RBI=0.0138557;REFB=-0.0011831;REVB=0.00947016;RO=29;SAF=12;SAR=6;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0277849;STB=0.55586;TYPE=del;VARB=0.00300685;OID=.;OPOS=13317491;OREF=TTA;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:18:63:19:71:52:13:6:32:20:21:29:12:6:20:9 chr19 13319691 . GGAT G,GGGT 111.86 PASS AO=4,7;DP=13;FAO=5,8;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=5,8;FSAR=0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.104672,-0.0930879;FXX=0;HRUN=5,1;LEN=3,1;MLLD=64.7504,34.7263;QD=34.4189;RBI=0.104672,0.0930879;REFB=0,0;REVB=0,0;RO=0;SAF=4,7;SAR=0,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.411765,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.0329208,0.071775;OID=.,.;OPOS=13319692,13319693;OREF=GAT,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GGGT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:4,7:13:5,8:13:0:5,8:0,0:0:0:23:0:4,7:0,0:0:0 chr19 13387904 . A G 39.75 PASS AO=17;DP=62;FAO=17;FDP=62;FR=.;FRO=45;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=28;FSRR=17;FWDB=-0.00843704;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=137.242;QD=2.56457;RBI=0.0277285;REFB=0.00207088;REVB=0.0264137;RO=45;SAF=9;SAR=8;SRF=28;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112869;STB=0.56806;TYPE=snp;VARB=-0.00771409;OID=.;OPOS=13387904;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:62:62:45:45:17:17:8:9:28:17:8:9:28:17 chr19 13423525 . C T 434.64 PASS AO=100;DP=197;FAO=100;FDP=197;FR=.;FRO=97;FSAF=54;FSAR=46;FSRF=55;FSRR=42;FWDB=0.0233369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.657;QD=8.82526;RBI=0.0256292;REFB=0.000908233;REVB=-0.0105946;RO=97;SAF=54;SAR=46;SRF=55;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0244455;STB=0.513411;TYPE=snp;VARB=-0.000871477;OID=.;OPOS=13423525;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:197:97:97:100:100:46:54:55:42:46:54:55:42 chr19 13868669 . G A 773.4 PASS AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0305397;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.288;QD=38.6698;RBI=0.0449064;REFB=0;REVB=0.0329229;RO=0;SAF=37;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.04562e-06;OID=.;OPOS=13868669;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:80:80:0:0:80:80:43:37:0:0:43:37:0:0 chr19 13885309 . C T 123.54 PASS AO=25;DP=46;FAO=25;FDP=46;FR=.;FRO=21;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.019332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.191;QD=10.743;RBI=0.0785679;REFB=-0.0057854;REVB=0.0761524;RO=21;SAF=16;SAR=9;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138878;STB=0.577554;TYPE=snp;VARB=0.00446394;OID=.;OPOS=13885309;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:46:46:21:21:25:25:9:16:10:11:9:16:10:11 chr19 13885484 . A G 63.96 PASS AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=18;FWDB=0.00893805;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.4868;QD=6.73264;RBI=0.0419182;REFB=0.0130583;REVB=0.0409542;RO=22;SAF=8;SAR=8;SRF=4;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.324341;STB=0.684011;TYPE=snp;VARB=-0.0171095;OID=.;OPOS=13885484;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:38:38:22:22:16:16:8:8:4:18:8:8:4:18 chr19 13900059 . A G 271.5 PASS AO=60;DP=128;FAO=65;FDP=133;FR=.;FRO=68;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=39;FSRR=29;FWDB=-0.00573373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.975;QD=8.16529;RBI=0.0099408;REFB=-0.0189124;REVB=-0.00812059;RO=67;SAF=30;SAR=30;SRF=39;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0781034;STB=0.533694;TYPE=snp;VARB=0.0207603;OID=.;OPOS=13900059;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:133:67:68:60:65:30:30:39:28:32:33:39:29 chr19 14029729 . GC G 54.93 PASS AO=11;DP=18;FAO=13;FDP=18;FR=.;FRO=5;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.106753;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.6697;QD=12.2078;RBI=0.206745;REFB=-0.0583495;REVB=-0.177052;RO=5;SAF=4;SAR=7;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0.349206;SSSB=-0.0215005;STB=0.573803;TYPE=del;VARB=0.0104325;OID=.;OPOS=14029730;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:11:18:13:18:5:6:7:1:4:9:5:4:7:2:3 chr19 14038791 . C T 141.26 PASS AO=27;DP=50;FAO=29;FDP=53;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0335744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.4502;QD=10.6615;RBI=0.0370287;REFB=-0.0154641;REVB=-0.0156168;RO=23;SAF=9;SAR=18;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0908653;STB=0.535187;TYPE=snp;VARB=0.0146989;OID=.;OPOS=14038791;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:50:53:23:24:27:29:18:9:10:13:19:10:10:14 chr19 14040450 . A G 18.3 PASS AO=5;DP=16;FAO=5;FDP=16;FR=.;FRO=11;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.0529706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3645;QD=4.57487;RBI=0.0718234;REFB=-0.0902825;REVB=0.0485048;RO=9;SAF=1;SAR=4;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.291052;STB=0.644517;TYPE=snp;VARB=0.306147;OID=.;OPOS=14040450;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:16:16:9:11:5:5:4:1:4:5:4:1:4:7 chr19 14065341 . T C 125.37 PASS AO=26;DP=50;FAO=26;FDP=50;FR=.;FRO=24;FSAF=23;FSAR=3;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=-0.00676296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.1701;QD=10.03;RBI=0.0446085;REFB=-0.0230357;REVB=0.0440929;RO=24;SAF=23;SAR=3;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275604;STB=0.656999;TYPE=snp;VARB=0.0464265;OID=.;OPOS=14065341;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:24:24:26:26:3:23:17:7:3:23:17:7 chr19 14153293 . T C 162.73 PASS AO=21;DP=70;FAO=28;FDP=69;FR=.,HEALED;FRO=33;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=-0.00278095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.586;QD=9.43364;RBI=0.00280807;REFB=-0.000930158;REVB=-0.000389313;RO=33;SAF=4;SAR=17;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.444309;STB=0.641633;TYPE=snp;VARB=0.00531606;OID=.;OPOS=14153293;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:69:33:33:21:28:17:4:19:14:19:9:19:14 chr19 14164527 . G C 53.45 PASS AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.019542;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=216.993;QD=11.253;RBI=0.0240152;REFB=-0.0252544;REVB=-0.0139584;RO=9;SAF=2;SAR=8;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252049;STB=0.648318;TYPE=snp;VARB=0.0107738;OID=.;OPOS=14164527;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:19:19:9:9:10:10:8:2:4:5:8:2:4:5 chr19 14185226 . T C 18.62 PASS AO=4;DP=12;FAO=4;FDP=12;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=-0.0692791;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.7196;QD=6.20778;RBI=0.0701067;REFB=0.00160135;REVB=-0.0107406;RO=8;SAF=3;SAR=1;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197909;STB=0.624475;TYPE=snp;VARB=-0.0214333;OID=.;OPOS=14185226;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:12:12:8:8:4:4:1:3:7:1:1:3:7:1 chr19 14200109 . T C 39.24 PASS AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=-0.0991533;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.1488;QD=6.03737;RBI=0.0995541;REFB=-0.00338644;REVB=-0.00892416;RO=16;SAF=1;SAR=9;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196547;STB=0.620407;TYPE=snp;VARB=-0.00254817;OID=.;OPOS=14200109;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:26:26:16:16:10:10:9:1:3:13:9:1:3:13 chr19 14231325 . C G 244.01 PASS AO=49;DP=78;FAO=51;FDP=88;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=40;FSRF=9;FSRR=28;FWDB=0.0728431;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=31.5921;QD=11.0915;RBI=0.0976156;REFB=-0.101124;REVB=-0.0649822;RO=29;SAF=8;SAR=41;SRF=8;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12671;STB=0.516789;TYPE=snp;VARB=0.0742956;OID=.;OPOS=14231325;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:88:29:37:49:51:41:8:8:21:40:11:9:28 chr19 14231330 . A G 210.57 PASS AO=34;DP=83;FAO=49;FDP=87;FR=.,HEALED;FRO=37;FSAF=12;FSAR=37;FSRF=6;FSRR=31;FWDB=-0.0308377;FXX=0.0113623;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.8407;QD=9.68129;RBI=0.0392556;REFB=-0.0926467;REVB=0.0242907;RO=14;SAF=11;SAR=23;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0204203;STB=0.550588;TYPE=snp;VARB=0.0783213;OID=.;OPOS=14231330;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:87:14:37:34:49:23:11:5:9:37:12:6:31 chr19 14266286 . GC G 270.81 PASS AO=28;DP=35;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.22453;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=17.9715;QD=27.0812;RBI=0.330692;REFB=0;REVB=-0.242784;RO=5;SAF=9;SAR=19;SRF=5;SRR=0;SSEN=0.513158;SSEP=0;SSSB=-0.200502;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.000153152;OID=.;OPOS=14266287;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:28:34:40:40:0:15:25:0:0:25:5:9:19:5:0 chr19 14302015 . C T 46.28 PASS AO=17;DP=46;FAO=16;FDP=47;FR=.;FRO=31;FSAF=0;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=31;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.101;QD=3.93859;RBI=0.00125116;REFB=-0.178127;REVB=-0.00125116;RO=29;SAF=0;SAR=17;SRF=0;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.1173;OID=.;OPOS=14302015;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:46:47:29:31:17:16:17:0:0:29:16:0:0:31 chr19 14561722 . A G 99.27 PASS AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.688;QD=39.7067;RBI=0.00520358;REFB=0;REVB=0.00520358;RO=0;SAF=0;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.82052e-05;OID=.;OPOS=14561722;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:10:0:0:0:10:0:0:0 chr19 14590236 . C T 108.61 PASS AO=22;DP=41;FAO=22;FDP=41;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0416839;FXX=0.0465008;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.4966;QD=10.5962;RBI=0.0418645;REFB=-0.0237931;REVB=-0.00388396;RO=17;SAF=11;SAR=11;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0689408;STB=0.560921;TYPE=snp;VARB=0.0332137;OID=.;OPOS=14590236;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:41:41:17:19:22:22:11:11:10:7:11:11:12:7 chr19 14744032 . G A 286.71 PASS AO=61;DP=128;FAO=67;FDP=135;FR=.;FRO=68;FSAF=32;FSAR=35;FSRF=31;FSRR=37;FWDB=0.0489689;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.231;QD=8.49499;RBI=0.0504759;REFB=-0.0286287;REVB=0.0122421;RO=64;SAF=31;SAR=30;SRF=31;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0220431;STB=0.510975;TYPE=snp;VARB=0.0269043;OID=.;OPOS=14744032;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:135:64:68:61:67:30:31:31:33:35:32:31:37 chr19 14752325 . C T 964.24 PASS AO=101;DP=106;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000295539;FXX=0.0377323;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.498;QD=37.8133;RBI=0.0224946;REFB=0;REVB=0.0224926;RO=1;SAF=70;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00673016;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.47543e-05;OID=.;OPOS=14752325;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:106:102:1:0:101:102:31:70:1:0:31:71:0:0 chr19 14758168 . G A 178.86 PASS AO=40;DP=81;FAO=40;FDP=80;FR=.;FRO=40;FSAF=10;FSAR=30;FSRF=12;FSRR=28;FWDB=0.0278989;FXX=0.0123442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.7716;QD=8.94292;RBI=0.0281163;REFB=-0.00464356;REVB=-0.00348987;RO=40;SAF=10;SAR=30;SRF=12;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0578964;STB=0.532241;TYPE=snp;VARB=0.00270433;OID=.;OPOS=14758168;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:80:40:40:40:40:30:10:12:28:30:10:12:28 chr19 14769339 . C G 3817.72 PASS AO=573;DP=575;FAO=399;FDP=399;FR=.;FRO=0;FSAF=366;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111152;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8244;QD=38.2729;RBI=0.0522036;REFB=0.00544605;REVB=-0.0510065;RO=0;SAF=526;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.44971e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.32007e-05;OID=.;OPOS=14769339;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:575:399:0:0:573:399:47:526:0:0:33:366:0:0 chr19 14815918 . A C 120.05 PASS AO=26;DP=52;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.0342074;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.652;QD=9.41577;RBI=0.0396753;REFB=0.00817494;REVB=-0.0200995;RO=25;SAF=16;SAR=10;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189334;STB=0.605979;TYPE=snp;VARB=-0.00643834;OID=.;OPOS=14815918;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:51:25:25:26:26:10:16:10:15:10:16:10:15 chr19 14817548 . T A 680.26 PASS AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00747867;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.2843;QD=37.7923;RBI=0.0181735;REFB=0;REVB=0.0165634;RO=0;SAF=25;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000243429;OID=.;OPOS=14817548;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:72:72:0:0:72:72:47:25:0:0:47:25:0:0 chr19 14829749 . C T 270.07 PASS AO=76;DP=184;FAO=77;FDP=183;FR=.;FRO=106;FSAF=43;FSAR=34;FSRF=53;FSRR=53;FWDB=0.00133804;FXX=0.0108102;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.35;QD=5.90314;RBI=0.0710172;REFB=-0.0416249;REVB=-0.0710046;RO=100;SAF=43;SAR=33;SRF=49;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0776031;STB=0.534038;TYPE=snp;VARB=0.0691297;OID=.;OPOS=14829749;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:183:100:106:76:77:33:43:49:51:34:43:53:53 chr19 14862430 . C G 1143.52 PASS AO=119;DP=120;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00137899;FXX=0.0243883;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.855;QD=38.1173;RBI=0.0348745;REFB=0;REVB=0.0348472;RO=0;SAF=76;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.21358e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.50351e-05;OID=.;OPOS=14862430;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:120:120:0:0:119:120:43:76:0:0:44:76:0:0 chr19 14910438 . C T 1190.89 PASS AO=99;DP=128;FAO=125;FDP=125;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=61;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.106397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.553;QD=38.1085;RBI=0.121012;REFB=0;REVB=0.0576507;RO=0;SAF=55;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000681242;OID=.;OPOS=14910438;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:126:125:0:0:99:125:44:55:0:0:64:61:0:0 chr19 14910573 . C T 173.44 PASS AO=39;DP=78;FAO=39;FDP=78;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=27;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=0.0150491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.55;QD=8.89423;RBI=0.0164234;REFB=-0.00800946;REVB=-0.00657679;RO=39;SAF=12;SAR=27;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263354;STB=0.64674;TYPE=snp;VARB=0.0109081;OID=.;OPOS=14910573;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:39:39:39:39:27:12:23:16:27:12:23:16 chr19 14938616 . T C 232.14 PASS AO=50;DP=101;FAO=52;FDP=102;FR=.;FRO=50;FSAF=33;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=-0.0392261;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.049;QD=9.1035;RBI=0.049805;REFB=-0.0110477;REVB=0.0306896;RO=49;SAF=32;SAR=18;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121056;STB=0.568493;TYPE=snp;VARB=0.00850327;OID=.;OPOS=14938616;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:102:49:50:50:52:18:32:25:24:19:33:25:25 chr19 14991643 . G A 189.8 PASS AO=48;DP=105;FAO=48;FDP=105;FR=.;FRO=57;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=41;FSRR=16;FWDB=-5.76428e-05;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=211.395;QD=7.23047;RBI=0.0152668;REFB=0.00221881;REVB=-0.0152667;RO=57;SAF=28;SAR=20;SRF=41;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140258;STB=0.577859;TYPE=snp;VARB=-0.00236454;OID=.;OPOS=14991643;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:57:57:48:48:20:28:41:16:20:28:41:16 chr19 15052983 . T TATC 635.16 PASS AO=81;DP=100;FAO=83;FDP=97;FR=.;FRO=14;FSAF=13;FSAR=70;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0120642;FXX=0.0202;HRUN=1;LEN=3;MLLD=223.135;QD=26.192;RBI=0.0130823;REFB=-0.0150464;REVB=-0.00505963;RO=16;SAF=12;SAR=69;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212019;STB=0.598021;TYPE=ins;VARB=0.00196246;OID=.;OPOS=15052984;OREF=-;OALT=ATC;OMAPALT=TATC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:81:100:83:97:14:13:70:8:6:9:16:12:69:9:7 chr19 15133762 . G C 860.06 PASS AO=89;DP=90;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00935294;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.515;QD=38.6543;RBI=0.0172021;REFB=0;REVB=0.0144373;RO=0;SAF=20;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.78144e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000172104;OID=.;OPOS=15133762;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:90:89:0:0:89:89:69:20:0:0:69:20:0:0 chr19 15133787 . C A 235.63 PASS AO=43;DP=70;FAO=43;FDP=71;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=34;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=0.0153839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.875;QD=13.275;RBI=0.0171131;REFB=-0.00835766;REVB=0.00749626;RO=26;SAF=9;SAR=34;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130115;STB=0.561953;TYPE=snp;VARB=0.00603954;OID=.;OPOS=15133787;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:70:71:26:28:43:43:34:9:9:17:34:9:9:19 chr19 15198263 . A G 519.8 PASS AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.9;QD=37.8036;RBI=0.0304229;REFB=0;REVB=-0.025294;RO=0;SAF=24;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.03322e-05;OID=.;OPOS=15198263;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:55:55:0:0:55:55:31:24:0:0:31:24:0:0 chr19 15198292 . C G 564.09 PASS AO=58;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209249;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=165.359;QD=38.2433;RBI=0.0252047;REFB=0;REVB=0.0140508;RO=1;SAF=33;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184944;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.07231e-05;OID=.;OPOS=15198292;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:59:59:1:0:58:59:25:33:0:1:26:33:0:0 chr19 15198507 . T C 834.88 PASS AO=87;DP=88;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0292319;FXX=0.0113623;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.1706;QD=38.3854;RBI=0.0798168;REFB=0;REVB=-0.0742713;RO=0;SAF=48;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.57206e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000188379;OID=.;OPOS=15198507;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:88:87:0:0:87:87:39:48:0:0:39:48:0:0 chr19 15198631 . A C 1693.89 PASS AO=175;DP=175;FAO=176;FDP=176;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0234232;FXX=0.022221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.936;QD=38.4974;RBI=0.0243093;REFB=0;REVB=0.00650334;RO=0;SAF=79;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.57231e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000206353;OID=.;OPOS=15198631;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:175:176:0:0:175:176:96:79:0:0:96:80:0:0 chr19 15198764 . T C 2172.08 PASS AO=224;DP=225;FAO=226;FDP=226;FR=.;FRO=0;FSAF=99;FSAR=127;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00676119;FXX=0.00440509;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.4493;QD=38.4439;RBI=0.025538;REFB=0;REVB=-0.0246268;RO=0;SAF=99;SAR=125;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.84919e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0022858;OID=.;OPOS=15198764;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:225:226:0:0:224:226:125:99:0:0:127:99:0:0 chr19 15225348 . T C 668.31 PASS AO=79;DP=83;FAO=78;FDP=83;FR=.;FRO=5;FSAF=10;FSAR=68;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.00555746;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.4651;QD=32.2077;RBI=0.118465;REFB=0.0647642;REVB=-0.118335;RO=4;SAF=10;SAR=69;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0723013;STB=0.534722;TYPE=snp;VARB=-0.005054;OID=.;OPOS=15225348;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:83:83:4:5:79:78:69:10:2:2:68:10:2:3 chr19 15225358 . T A 640.87 PASS AO=63;DP=70;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0427713;FXX=0.105249;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.705;QD=37.6982;RBI=0.0428085;REFB=0;REVB=0.00178373;RO=0;SAF=3;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.58776e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000534991;OID=.;OPOS=15225358;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:70:68:0:0:63:68:60:3:0:0:60:8:0:0 chr19 15226970 . G A 399.83 PASS AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0357218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.41;QD=35.5401;RBI=0.0457159;REFB=-0.121338;REVB=0.0285288;RO=0;SAF=11;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.521729;TYPE=snp;VARB=0.00205891;OID=.;OPOS=15226970;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:45:45:0:1:44:44:33:11:0:0:33:11:1:0 chr19 15227030 . G A 237.71 PASS AO=26;DP=29;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0214376;FXX=0.096743;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.7526;QD=33.9588;RBI=0.0950839;REFB=-0.105784;REVB=0.0926357;RO=0;SAF=4;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.50493e-08;STB=0.510631;TYPE=snp;VARB=0.0136337;OID=.;OPOS=15227030;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:29:28:0:1:26:27:22:4:0:0:23:4:0:1 chr19 15233581 . C A 161.97 PASS AO=32;DP=62;FAO=34;FDP=64;FR=.;FRO=30;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=0.0193225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.825;QD=10.1229;RBI=0.0199547;REFB=-0.0241282;REVB=-0.00498307;RO=30;SAF=13;SAR=19;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0537841;STB=0.512075;TYPE=snp;VARB=0.0200492;OID=.;OPOS=15233581;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:64:30:30:32:34:19:13:14:16:19:15:14:16 chr19 15270805 . C A 127.27 PASS AO=15;DP=16;FAO=15;FDP=16;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0436253;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.1315;QD=31.8167;RBI=0.113306;REFB=-0.158896;REVB=-0.104571;RO=0;SAF=13;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.518494;TYPE=snp;VARB=0.015609;OID=.;OPOS=15270805;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:16:16:0:1:15:15:2:13:0:0:2:13:1:0 chr19 15271135 . T G 274.93 PASS AO=28;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0787975;FXX=0.0624805;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.376;QD=36.6574;RBI=0.0789012;REFB=0;REVB=0.00404406;RO=0;SAF=11;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31638e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.51504e-06;OID=.;OPOS=15271135;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:29:30:0:0:28:30:17:11:0:0:18:12:0:0 chr19 15271696 . G T 15.76 PASS AO=3;DP=7;FAO=3;FDP=7;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0052009;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=113.838;QD=9.00304;RBI=0.0052009;REFB=-0.0146871;REVB=0;RO=4;SAF=3;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.201875;OID=.;OPOS=15271696;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:7:7:4:4:3:3:0:3:4:0:0:3:4:0 chr19 15278057 . A G 760.76 PASS AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00790085;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.7259;QD=38.5194;RBI=0.0128772;REFB=0;REVB=-0.0101685;RO=0;SAF=46;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.22981e-05;OID=.;OPOS=15278057;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:79:79:0:0:79:79:33:46:0:0:33:46:0:0 chr19 15285052 . T C 210.68 PASS AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0496383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.657;QD=36.6392;RBI=0.055489;REFB=0;REVB=0.0248006;RO=0;SAF=12;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000196135;OID=.;OPOS=15285052;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:0:0:23:23:11:12:0:0:11:12:0:0 chr19 15289635 . TG T 1026.42 PASS AO=136;DP=151;FAO=145;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=125;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0662415;FXX=0.0202689;HRUN=3;LEN=1;MLLD=20.4922;QD=28.315;RBI=0.106255;REFB=-0.0167403;REVB=0.0830789;RO=9;SAF=117;SAR=19;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0.401631;SSSB=-0.0351737;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0033132;OID=.;OPOS=15289636;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:136:147:145:145:0:125:20:0:0:79:9:117:19:9:0 chr19 15292437 . T C 419.45 PASS AO=40;DP=41;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.068508;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.034;QD=37.2849;RBI=0.0814686;REFB=0;REVB=0.0440885;RO=0;SAF=10;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000463588;OID=.;OPOS=15292437;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:41:45:0:0:40:45:30:10:0:0:30:15:0:0 chr19 15295134 . G A 1277.36 PASS AO=133;DP=136;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0479586;FXX=0.0147048;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.6466;QD=38.1302;RBI=0.0505633;REFB=0;REVB=0.0160192;RO=1;SAF=71;SAR=62;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00664795;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.31688e-06;OID=.;OPOS=15295134;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:136:134:1:0:133:134:62:71:1:0:62:72:0:0 chr19 15302844 . T C 100.55 PASS AO=12;DP=12;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0327955;FXX=0.0832639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6129;QD=36.5646;RBI=0.0495201;REFB=0;REVB=0.0371038;RO=0;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000500728;OID=.;OPOS=15302844;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:11:0:0:12:11:8:4:0:0:8:3:0:0 chr19 15376261 . C G 10.38 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.00682221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.912;QD=5.93124;RBI=0.00682221;REFB=-0.0143854;REVB=0;RO=4;SAF=2;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0363561;OID=.;OPOS=15376261;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:4:5:2:2:0:2:4:0:0:2:5:0 chr19 15484618 . TC T 28.99 PASS AO=14;DP=44;FAO=17;FDP=40;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=19;FWDB=0.0093601;FXX=0.0697512;HRUN=4;LEN=1;MLLD=11.0995;QD=2.89937;RBI=0.0260401;REFB=-0.0722127;REVB=0.0242997;RO=20;SAF=7;SAR=7;SRF=4;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.308058;STB=0.700085;TYPE=del;VARB=0.142008;OID=.;OPOS=15484619;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:14:37:17:40:23:9:8:4:19:28:20:7:7:4:16 chr19 15508362 . G C 2297.02 PASS AO=247;DP=251;FAO=247;FDP=247;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=146;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.010556;FXX=0.0159356;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.644;QD=37.1987;RBI=0.0548108;REFB=-0.0325241;REVB=0.0537847;RO=3;SAF=101;SAR=146;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00178844;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000171729;OID=.;OPOS=15508362;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:251:247:3:0:247:247:146:101:1:2:146:101:0:0 chr19 15533821 . A G 401.89 PASS AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193781;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.36;QD=37.3848;RBI=0.0193975;REFB=0;REVB=-0.000868354;RO=0;SAF=25;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.65211e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.77399e-05;OID=.;OPOS=15533821;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:43:43:0:0:43:43:18:25:0:0:18:25:0:0 chr19 15549939 . C T 466.99 PASS AO=53;DP=57;FAO=54;FDP=57;FR=.;FRO=3;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0590584;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.6613;QD=32.7713;RBI=0.0850685;REFB=-0.0846282;REVB=0.0612271;RO=2;SAF=24;SAR=29;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0376506;STB=0.511807;TYPE=snp;VARB=0.0128347;OID=.;OPOS=15549939;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:57:57:2:3:53:54:29:24:2:0:30:24:2:1 chr19 15558918 . G T 238.66 PASS AO=53;DP=103;FAO=53;FDP=103;FR=.;FRO=50;FSAF=19;FSAR=34;FSRF=23;FSRR=27;FWDB=0.0228256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.1563;QD=9.26817;RBI=0.0375946;REFB=-0.0401067;REVB=-0.0298722;RO=50;SAF=19;SAR=34;SRF=23;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0940457;STB=0.551971;TYPE=snp;VARB=0.0346709;OID=.;OPOS=15558918;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:50:50:53:53:34:19:23:27:34:19:23:27 chr19 15559023 . AC A 422.54 PASS AO=57;DP=77;FAO=78;FDP=83;FR=.;FRO=5;FSAF=21;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.306232;FXX=0.0119033;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.2435;QD=20.3633;RBI=0.379101;REFB=0.156629;REVB=-0.223471;RO=19;SAF=4;SAR=53;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.454317;STB=0.521003;TYPE=del;VARB=-0.0106095;OID=.;OPOS=15559024;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:57:77:78:83:5:21:57:0:5:16:19:4:53:10:9 chr19 15574858 . C T 91.05 PASS AO=23;DP=53;FAO=23;FDP=53;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=0.00853284;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=248.905;QD=6.87202;RBI=0.0162007;REFB=0.00143699;REVB=0.0137714;RO=29;SAF=16;SAR=7;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0832732;STB=0.560831;TYPE=snp;VARB=-0.00166019;OID=.;OPOS=15574858;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:53:53:29:30:23:23:7:16:18:11:7:16:18:12 chr19 15586672 . A T 142.05 PASS AO=24;DP=37;FAO=24;FDP=37;FR=.;FRO=13;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.00835244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.223;QD=15.3572;RBI=0.0136149;REFB=-0.0204154;REVB=0.0107519;RO=13;SAF=15;SAR=9;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20343;STB=0.612151;TYPE=snp;VARB=0.0159634;OID=.;OPOS=15586672;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:37:37:13:13:24:24:9:15:4:9:9:15:4:9 chr19 15587185 . C T 155.81 PASS AO=38;DP=82;FAO=38;FDP=82;FR=.;FRO=44;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=12;FSRR=32;FWDB=0.0488022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.095;QD=7.6007;RBI=0.049455;REFB=0.000472918;REVB=0.00800873;RO=42;SAF=18;SAR=20;SRF=12;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18;STB=0.609321;TYPE=snp;VARB=-0.000433145;OID=.;OPOS=15587185;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:42:44:38:38:20:18:12:30:20:18:12:32 chr19 15587345 . T C 197.61 PASS AO=27;DP=71;FAO=31;FDP=70;FR=.,HEALED;FRO=30;FSAF=6;FSAR=25;FSRF=6;FSRR=24;FWDB=0.00723432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.948;QD=11.2922;RBI=0.00740596;REFB=1.76088e-05;REVB=-0.00158522;RO=30;SAF=6;SAR=21;SRF=6;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0307027;STB=0.505047;TYPE=snp;VARB=0.0114126;OID=.;OPOS=15587345;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:30:30:27:31:21:6:6:24:25:6:6:24 chr19 15726487 . G T 36.92 PASS AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0660962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.922;QD=13.4271;RBI=0.0674591;REFB=-0.0496717;REVB=0.0134916;RO=5;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.391876;STB=0.726669;TYPE=snp;VARB=0.0420086;OID=.;OPOS=15726487;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:11:11:5:5:6:6:3:3:0:5:3:3:0:5 chr19 15726589 . C A 41.09 PASS AO=7;DP=15;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.00860432;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=262.988;QD=10.2735;RBI=0.0149879;REFB=-0.00925393;REVB=0.0122721;RO=8;SAF=4;SAR=3;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.387836;STB=0.687096;TYPE=snp;VARB=0.00934276;OID=.;OPOS=15726589;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:15:16:8:8:7:8:3:4:1:7:4:4:1:7 chr19 15729056 . C G 299.19 PASS AO=67;DP=134;FAO=68;FDP=133;FR=.;FRO=65;FSAF=0;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=65;FWDB=0;FXX=0.00746213;HRUN=4;LEN=1;MLLD=93.3588;QD=8.99826;RBI=0.0310207;REFB=-0.00177362;REVB=0.0310207;RO=64;SAF=0;SAR=67;SRF=0;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00162955;OID=.;OPOS=15729056;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:133:64:65:67:68:67:0:0:64:68:0:0:65 chr19 15730498 . G GC 1383.9 PASS AO=140;DP=160;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.100284;FXX=0.0580608;HRUN=0;LEN=1;MLLD=125.009;QD=37.915;RBI=0.109309;REFB=0;REVB=0.0434941;RO=14;SAF=55;SAR=85;SRF=12;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0821913;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.000242569;OID=.;OPOS=15730499;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:140:160:146:146:0:57:89:0:0:66:14:55:85:12:2 chr19 15730502 . C T 385.69 PASS AO=82;DP=159;FAO=84;FDP=158;FR=.;FRO=74;FSAF=32;FSAR=52;FSRF=35;FSRR=39;FWDB=0.0248026;FXX=0.0124992;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.706;QD=9.76428;RBI=0.0248739;REFB=-0.01609;REVB=0.0018816;RO=73;SAF=31;SAR=51;SRF=34;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.078376;STB=0.544705;TYPE=snp;VARB=0.0147525;OID=.;OPOS=15730502;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:158:73:74:82:84:51:31:34:39:52:32:35:39 chr19 15739597 . A C 506.54 PASS AO=47;DP=60;FAO=52;FDP=53;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0324469;FXX=0.0701631;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.114;QD=38.2291;RBI=0.0324782;REFB=0;REVB=0.00142695;RO=0;SAF=17;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.50138e-05;OID=.;OPOS=15739597;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:59:53:0:0:47:52:30:17:0:0:27:25:0:0 chr19 15757927 . T C 1116.97 PASS AO=119;DP=121;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00640621;FXX=0.0165276;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.423;QD=37.5454;RBI=0.0216175;REFB=0.0144865;REVB=-0.0206465;RO=1;SAF=78;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00605125;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.16829e-05;OID=.;OPOS=15757927;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:121:119:1:0:119:119:41:78:1:0:41:78:0:0 chr19 15760053 . G A 295.58 PASS AO=61;DP=112;FAO=61;FDP=111;FR=.;FRO=50;FSAF=24;FSAR=37;FSRF=18;FSRR=32;FWDB=0.00584602;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.481;QD=10.6515;RBI=0.0408919;REFB=0.00187917;REVB=0.0404718;RO=50;SAF=24;SAR=37;SRF=18;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.029011;STB=0.515883;TYPE=snp;VARB=-0.00153819;OID=.;OPOS=15760053;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:111:50:50:61:61:37:24:18:32:37:24:18:32 chr19 15763691 . G A 238.21 PASS AO=53;DP=105;FAO=54;FDP=107;FR=.;FRO=53;FSAF=22;FSAR=32;FSRF=20;FSRR=33;FWDB=0.00259963;FXX=0.0092584;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.398;QD=8.90487;RBI=0.0239797;REFB=0.0152688;REVB=0.0238383;RO=52;SAF=22;SAR=31;SRF=19;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0463128;STB=0.515495;TYPE=snp;VARB=-0.0156355;OID=.;OPOS=15763691;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:107:52:53:53:54:31:22:19:33:32:22:20:33 chr19 15763721 . G A 162.18 PASS AO=45;DP=106;FAO=45;FDP=107;FR=.;FRO=62;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=25;FSRR=37;FWDB=-0.00650074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.929;QD=6.06281;RBI=0.0108377;REFB=-0.0202389;REVB=-0.0086716;RO=61;SAF=18;SAR=27;SRF=25;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104538;STB=0.501945;TYPE=snp;VARB=0.0237888;OID=.;OPOS=15763721;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:107:61:62:45:45:27:18:25:36:27:18:25:37 chr19 15769379 . G C 55.35 PASS AO=16;DP=56;FAO=20;FDP=59;FR=.;FRO=39;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=-0.00931711;FXX=0.0327815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.148;QD=3.75235;RBI=0.00980774;REFB=-0.0148891;REVB=0.00306319;RO=39;SAF=3;SAR=13;SRF=15;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.289466;STB=0.563153;TYPE=snp;VARB=0.0200556;OID=.;OPOS=15769379;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:56:59:39:39:16:20:13:3:15:24:14:6:15:24 chr19 15769529 . G T 152.93 PASS AO=39;DP=87;FAO=39;FDP=87;FR=.;FRO=48;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=33;FWDB=0.0151304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.403;QD=7.03103;RBI=0.015507;REFB=-0.00799177;REVB=0.00339692;RO=41;SAF=20;SAR=19;SRF=15;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135057;STB=0.609917;TYPE=snp;VARB=0.0115315;OID=.;OPOS=15769529;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:41:48:39:39:19:20:15:26:19:20:15:33 chr19 15769530 . C T 153.17 PASS AO=39;DP=80;FAO=39;FDP=87;FR=.;FRO=48;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=33;FWDB=-0.0242431;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.388;QD=7.04238;RBI=0.0421734;REFB=-0.00478885;REVB=-0.034509;RO=41;SAF=20;SAR=19;SRF=15;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135057;STB=0.609917;TYPE=snp;VARB=0.0156406;OID=.;OPOS=15769530;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:87:41:48:39:39:19:20:15:26:19:20:15:33 chr19 15769625 . A G 508.5 PASS AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00550622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.414;QD=37.6666;RBI=0.0254827;REFB=0;REVB=-0.0248807;RO=0;SAF=12;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.59206e-05;OID=.;OPOS=15769625;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:54:54:0:0:54:54:42:12:0:0:42:12:0:0 chr19 15784061 . C A 699.6 PASS AO=67;DP=69;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.166361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.0178;QD=37.312;RBI=0.166411;REFB=0;REVB=0.00408073;RO=1;SAF=32;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145389;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00155855;OID=.;OPOS=15784061;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:69:75:1:0:67:75:35:32:1:0:36:39:0:0 chr19 15784377 . C T 26.1 PASS AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=11;FWDB=0.0410368;FXX=0.0555247;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3087;QD=6.14097;RBI=0.0416568;REFB=-0.0518901;REVB=0.00715989;RO=9;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.46249;STB=0.788931;TYPE=snp;VARB=0.0299815;OID=.;OPOS=15784377;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:18:17:9:11:6:6:4:2:0:9:4:2:0:11 chr19 15784386 . C T 201.63 PASS AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0357199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.1951;QD=36.6604;RBI=0.0396731;REFB=0;REVB=0.0172638;RO=0;SAF=5;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.58081e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000307913;OID=.;OPOS=15784386;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:22:22:0:0:22:22:17:5:0:0:17:5:0:0 chr19 15789098 . A G 875.94 PASS AO=66;DP=94;FAO=90;FDP=90;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=54;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.235846;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.8329;QD=38.9305;RBI=0.245098;REFB=0;REVB=-0.0667029;RO=5;SAF=30;SAR=36;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0724887;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00168103;OID=.;OPOS=15789098;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:93:90:5:0:66:90:36:30:5:0:36:54:0:0 chr19 15789140 . A G 936.97 PASS AO=94;DP=94;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.604;QD=38.2436;RBI=0.0492161;REFB=0;REVB=0.0432365;RO=0;SAF=46;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.73299e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000115578;OID=.;OPOS=15789140;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:94:98:0:0:94:98:48:46:0:0:52:46:0:0 chr19 15791180 . C T 716.31 PASS AO=73;DP=76;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0100979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.544;QD=36.7336;RBI=0.0270375;REFB=0.0309885;REVB=0.025081;RO=1;SAF=29;SAR=44;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106301;STB=0.505153;TYPE=snp;VARB=-6.71385e-05;OID=.;OPOS=15791180;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:76:78:1:1:73:77:44:29:0:1:48:29:0:1 chr19 15793235 . T C 136.31 PASS AO=41;DP=106;FAO=41;FDP=105;FR=.;FRO=64;FSAF=12;FSAR=29;FSRF=25;FSRR=39;FWDB=0.00407086;FXX=0.00943307;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.736;QD=5.19291;RBI=0.0236956;REFB=-0.0137469;REVB=0.0233433;RO=64;SAF=12;SAR=29;SRF=25;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119166;STB=0.567991;TYPE=snp;VARB=0.0170097;OID=.;OPOS=15793235;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:105:64:64:41:41:29:12:25:39:29:12:25:39 chr19 15807305 . T C 248.74 PASS AO=50;DP=97;FAO=54;FDP=102;FR=.;FRO=48;FSAF=40;FSAR=14;FSRF=34;FSRR=14;FWDB=-0.0363548;FXX=0.0285687;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.6626;QD=9.75436;RBI=0.0822901;REFB=-0.033583;REVB=-0.073824;RO=45;SAF=36;SAR=14;SRF=31;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0325798;STB=0.519473;TYPE=snp;VARB=0.0329629;OID=.;OPOS=15807305;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:102:45:48:50:54:14:36:31:14:14:40:34:14 chr19 15807830 . T C 116.48 PASS AO=25;DP=56;FAO=25;FDP=52;FR=.,HEALED;FRO=25;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=24;FWDB=-0.0257147;FXX=0.0188644;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.205;QD=8.96013;RBI=0.0338274;REFB=-0.0225498;REVB=-0.0219783;RO=19;SAF=13;SAR=12;SRF=1;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.36314;STB=0.735699;TYPE=snp;VARB=0.0502389;OID=.;OPOS=15807830;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:52:19:25:25:25:12:13:1:18:12:13:1:24 chr19 15807884 . A G 139.28 PASS AO=19;DP=52;FAO=28;FDP=52;FR=.,HEALED;FRO=24;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=23;FWDB=0.192055;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.3172;QD=10.7135;RBI=0.201707;REFB=-0.00903969;REVB=-0.0616497;RO=23;SAF=3;SAR=16;SRF=1;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253097;STB=0.692197;TYPE=snp;VARB=0.0120388;OID=.;OPOS=15807884;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:23:24:19:28:16:3:1:22:16:12:1:23 chr19 15838869 . C T 399.88 PASS AO=86;DP=161;FAO=86;FDP=161;FR=.;FRO=75;FSAF=35;FSAR=51;FSRF=29;FSRR=46;FWDB=0.00678191;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.342;QD=9.935;RBI=0.0236233;REFB=-0.0048491;REVB=0.0226289;RO=74;SAF=35;SAR=51;SRF=29;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.01325;STB=0.509834;TYPE=snp;VARB=0.00379987;OID=.;OPOS=15838869;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:161:74:75:86:86:51:35:29:45:51:35:29:46 chr19 15838972 . T A 247.35 PASS AO=53;DP=105;FAO=54;FDP=104;FR=.;FRO=50;FSAF=7;FSAR=47;FSRF=10;FSRR=40;FWDB=0.0165428;FXX=0.0458673;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.042;QD=9.51329;RBI=0.0176982;REFB=-0.0290556;REVB=0.00628984;RO=41;SAF=7;SAR=46;SRF=7;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0633895;STB=0.567444;TYPE=snp;VARB=0.0254244;OID=.;OPOS=15838972;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:104:41:50:53:54:46:7:7:34:47:7:10:40 chr19 15839081 . C T 211.45 PASS AO=39;DP=64;FAO=39;FDP=64;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=29;FSRF=4;FSRR=21;FWDB=0.0126526;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=268.405;QD=13.2157;RBI=0.0247279;REFB=-0.0458589;REVB=0.0212457;RO=25;SAF=10;SAR=29;SRF=4;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0952172;STB=0.551851;TYPE=snp;VARB=0.0302844;OID=.;OPOS=15839081;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:64:64:25:25:39:39:29:10:4:21:29:10:4:21 chr19 15852223 . A C 226.19 PASS AO=44;DP=76;FAO=44;FDP=76;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=34;FSRF=9;FSRR=23;FWDB=-0.00774576;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.5633;QD=11.9047;RBI=0.0463915;REFB=0.0119859;REVB=-0.0457403;RO=32;SAF=10;SAR=34;SRF=9;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0568242;STB=0.531235;TYPE=snp;VARB=-0.0190827;OID=.;OPOS=15852223;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:32:32:44:44:34:10:9:23:34:10:9:23 chr19 15852363 . G A 417.71 PASS AO=80;DP=138;FAO=81;FDP=138;FR=.;FRO=57;FSAF=34;FSAR=47;FSRF=23;FSRR=34;FWDB=-0.00337522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.006;QD=12.1075;RBI=0.0196123;REFB=-0.0179254;REVB=0.0193197;RO=49;SAF=34;SAR=46;SRF=23;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0316654;STB=0.506901;TYPE=snp;VARB=0.0198412;OID=.;OPOS=15852363;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:49:57:80:81:46:34:23:26:47:34:23:34 chr19 15852544 . C T 181.3 PASS AO=41;DP=84;FAO=43;FDP=87;FR=.;FRO=44;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=0.0704732;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.4382;QD=8.33569;RBI=0.0737524;REFB=-0.043299;REVB=0.0217474;RO=42;SAF=23;SAR=18;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0774995;STB=0.553132;TYPE=snp;VARB=0.0617347;OID=.;OPOS=15852544;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:87:42:44:41:43:18:23:20:22:18:25:21:23 chr19 15853150 . C T 346.36 PASS AO=72;DP=129;FAO=71;FDP=128;FR=.;FRO=57;FSAF=11;FSAR=60;FSRF=31;FSRR=26;FWDB=-0.0548903;FXX=0.00775134;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0063;QD=10.8237;RBI=0.0656937;REFB=-0.0156604;REVB=0.0360931;RO=57;SAF=12;SAR=60;SRF=31;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.387493;STB=0.726989;TYPE=snp;VARB=0.0121453;OID=.;OPOS=15853150;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:128:57:57:72:71:60:12:31:26:60:11:31:26 chr19 15881953 . A G 122.5 PASS AO=34;DP=84;FAO=34;FDP=83;FR=.;FRO=49;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=28;FSRR=21;FWDB=0.020831;FXX=0.0348797;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.754;QD=5.90347;RBI=0.0213951;REFB=-0.0101246;REVB=0.00488059;RO=47;SAF=16;SAR=18;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0845286;STB=0.559287;TYPE=snp;VARB=0.0157537;OID=.;OPOS=15881953;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:83:47:49:34:34:18:16:26:21:18:16:28:21 chr19 15905002 . T C 257.01 PASS AO=56;DP=116;FAO=59;FDP=118;FR=.;FRO=59;FSAF=12;FSAR=47;FSRF=23;FSRR=36;FWDB=0.00835658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.661;QD=8.71228;RBI=0.0178224;REFB=-0.0250414;REVB=-0.0157419;RO=59;SAF=11;SAR=45;SRF=23;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235765;STB=0.622824;TYPE=snp;VARB=0.0194173;OID=.;OPOS=15905002;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:118:59:59:56:59:45:11:23:36:47:12:23:36 chr19 15905289 . G T 185.53 PASS AO=42;DP=82;FAO=42;FDP=84;FR=.;FRO=42;FSAF=33;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=0.0137952;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=151.263;QD=8.83466;RBI=0.069644;REFB=-0.0267957;REVB=-0.0682641;RO=39;SAF=33;SAR=9;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.285527;STB=0.681905;TYPE=snp;VARB=0.0191293;OID=.;OPOS=15905289;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:84:39:42:42:42:9:33:20:19:9:33:20:22 chr19 15905431 . T C 240.38 PASS AO=66;DP=153;FAO=66;FDP=153;FR=.;FRO=87;FSAF=46;FSAR=20;FSRF=45;FSRR=42;FWDB=0.0235922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.995;QD=6.28439;RBI=0.0266171;REFB=-0.0187964;REVB=0.0123239;RO=87;SAF=46;SAR=20;SRF=45;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196753;STB=0.61041;TYPE=snp;VARB=0.0223161;OID=.;OPOS=15905431;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:153:87:87:66:66:20:46:45:42:20:46:45:42 chr19 15905468 . T G 125.85 PASS AO=41;DP=122;FAO=43;FDP=121;FR=.;FRO=78;FSAF=27;FSAR=16;FSRF=39;FSRR=39;FWDB=-0.0575403;FXX=0.0162588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.565;QD=4.1604;RBI=0.060936;REFB=-0.00178278;REVB=-0.0200574;RO=81;SAF=26;SAR=15;SRF=41;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150752;STB=0.584376;TYPE=snp;VARB=0.00244691;OID=.;OPOS=15905468;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:121:81:78:41:43:15:26:41:40:16:27:39:39 chr19 15905505 . T C 50 PASS AO=14;DP=89;FAO=27;FDP=100;FR=.;FRO=73;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=33;FSRR=40;FWDB=0.0358113;FXX=0.0196059;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.32;QD=1.99988;RBI=0.0365527;REFB=-0.023085;REVB=0.00732429;RO=75;SAF=4;SAR=10;SRF=33;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205603;STB=0.521529;TYPE=snp;VARB=0.0631891;OID=.;OPOS=15905505;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:89:100:75:73:14:27:10:4:33:42:14:13:33:40 chr19 15905529 . C A 67.19 PASS AO=26;DP=86;FAO=27;FDP=89;FR=.;FRO=62;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=27;FSRR=35;FWDB=0.0146733;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.837;QD=3.01957;RBI=0.0362909;REFB=-0.0101776;REVB=-0.0331922;RO=60;SAF=14;SAR=12;SRF=27;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104194;STB=0.583066;TYPE=snp;VARB=0.0251986;OID=.;OPOS=15905529;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:86:89:60:62:26:27:12:14:27:33:12:15:27:35 chr19 15905661 . C A 411.89 PASS AO=88;DP=164;FAO=89;FDP=166;FR=.;FRO=77;FSAF=53;FSAR=36;FSRF=40;FSRR=37;FWDB=0.118658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7638;QD=9.92501;RBI=0.122679;REFB=-0.00240609;REVB=0.0311525;RO=76;SAF=53;SAR=35;SRF=40;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0661106;STB=0.536087;TYPE=snp;VARB=0.00203927;OID=.;OPOS=15905661;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:166:76:77:88:89:35:53:40:36:36:53:40:37 chr19 15918380 . C T 837.58 PASS AO=93;DP=98;FAO=96;FDP=101;FR=.;FRO=5;FSAF=44;FSAR=52;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.209935;FXX=0.00980296;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.1353;QD=33.1713;RBI=0.247065;REFB=-0.246157;REVB=0.130263;RO=5;SAF=40;SAR=53;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00296689;STB=0.502909;TYPE=snp;VARB=0.0134811;OID=.;OPOS=15918380;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:98:101:5:5:93:96:53:40:2:3:52:44:2:3 chr19 15918500 . G A 145.17 PASS AO=21;DP=28;FAO=21;FDP=28;FR=.;FRO=7;FSAF=17;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=0.0118665;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=283.84;QD=20.7382;RBI=0.0400281;REFB=-0.0537865;REVB=0.0382287;RO=7;SAF=17;SAR=4;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0361141;STB=0.519756;TYPE=snp;VARB=0.0160812;OID=.;OPOS=15918500;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:28:28:7:7:21:21:4:17:6:1:4:17:6:1 chr19 15989589 . G T 94.63 PASS AO=8;DP=19;FAO=13;FDP=17;FR=.,HEALED;FRO=3;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0372099;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=244.205;QD=22.2653;RBI=0.0443741;REFB=-0.0557754;REVB=-0.0241761;RO=4;SAF=4;SAR=4;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144485;STB=0.505609;TYPE=snp;VARB=0.0133496;OID=.;OPOS=15989589;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:18:17:4:3:8:13:4:4:3:1:4:9:2:1 chr19 15989730 . T C 18.76 PASS AO=13;DP=69;FAO=14;FDP=71;FR=.;FRO=57;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=41;FSRR=16;FWDB=-0.0310295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.2342;QD=1.0571;RBI=0.0406699;REFB=-0.0097304;REVB=0.026291;RO=55;SAF=9;SAR=4;SRF=40;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0527784;STB=0.569382;TYPE=snp;VARB=0.0312973;OID=.;OPOS=15989730;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:69:71:55:57:13:14:4:9:40:15:5:9:41:16 chr19 15996820 . G A 213.74 PASS AO=46;DP=89;FAO=46;FDP=88;FR=.;FRO=42;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=-0.0257577;FXX=0.0112347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.804;QD=9.7153;RBI=0.0271459;REFB=0.00172064;REVB=0.00856977;RO=41;SAF=23;SAR=23;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0520938;STB=0.522717;TYPE=snp;VARB=-0.00188219;OID=.;OPOS=15996820;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:88:41:42:46:46:23:23:18:23:23:23:19:23 chr19 16024662 . G C 241.73 PASS AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00515259;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.352;QD=37.1896;RBI=0.0169619;REFB=0;REVB=-0.0161604;RO=0;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.48064e-05;OID=.;OPOS=16024662;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:26:26:0:0:26:26:12:14:0:0:12:14:0:0 chr19 16025176 . C T 64.66 PASS AO=22;DP=70;FAO=23;FDP=71;FR=.;FRO=48;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=32;FWDB=0.0828376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.8525;QD=3.64307;RBI=0.084434;REFB=0.00283545;REVB=0.016341;RO=48;SAF=4;SAR=18;SRF=16;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237415;STB=0.601815;TYPE=snp;VARB=-0.00361114;OID=.;OPOS=16025176;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:70:71:48:48:22:23:18:4:16:32:18:5:16:32 chr19 16034714 . A G 760.67 PASS AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0381848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.359;QD=38.5148;RBI=0.0403277;REFB=0;REVB=-0.0129709;RO=0;SAF=46;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.21962e-05;OID=.;OPOS=16034714;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:79:79:0:0:79:79:33:46:0:0:33:46:0:0 chr19 16040292 . A G 224.99 PASS AO=57;DP=123;FAO=57;FDP=124;FR=.;FRO=67;FSAF=50;FSAR=7;FSRF=53;FSRR=14;FWDB=-0.0546602;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.73;QD=7.2576;RBI=0.0596985;REFB=0.00104226;REVB=0.0240038;RO=66;SAF=50;SAR=7;SRF=53;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144145;STB=0.592849;TYPE=snp;VARB=-0.00286421;OID=.;OPOS=16040292;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:124:66:67:57:57:7:50:53:13:7:50:53:14 chr19 16045140 . CT C,CC 190.17 PASS AO=4,15;DP=21;FAO=5,16;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=2,7;FSAR=3,9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105203,0.0158779;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=189.39,197.405;QD=36.2237;RBI=0.0111616,0.0160338;REFB=0,0;REVB=-0.0037287,0.00223067;RO=0;SAF=2,6;SAR=2,9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.00521481,0.0041371;OID=.,.;OPOS=16045141,16045141;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:4,15:19:5,16:21:0:2,7:3,9:0:0:7:0:2,6:2,9:0:0 chr19 16060021 . C T 256.13 PASS AO=62;DP=131;FAO=62;FDP=131;FR=.;FRO=69;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=36;FSRR=33;FWDB=-0.00347853;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.792;QD=7.82086;RBI=0.00880232;REFB=-0.0239651;REVB=0.00808583;RO=65;SAF=34;SAR=28;SRF=34;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0235772;STB=0.514125;TYPE=snp;VARB=0.0262483;OID=.;OPOS=16060021;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:65:69:62:62:28:34:34:31:28:34:36:33 chr19 16060117 . C A 83.24 PASS AO=24;DP=65;FAO=25;FDP=65;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=30;FSRR=10;FWDB=0.0186031;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.1367;QD=5.12257;RBI=0.0666837;REFB=-0.0446465;REVB=0.0640363;RO=40;SAF=17;SAR=7;SRF=30;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0562823;STB=0.523346;TYPE=snp;VARB=0.0608386;OID=.;OPOS=16060117;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:65:65:40:40:24:25:7:17:30:10:7:18:30:10 chr19 16060248 . A G 123.28 PASS AO=39;DP=107;FAO=39;FDP=104;FR=.;FRO=65;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=43;FSRR=22;FWDB=-0.0420959;FXX=0.0280348;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4508;QD=4.74167;RBI=0.0897318;REFB=-0.0285782;REVB=-0.0792447;RO=63;SAF=24;SAR=15;SRF=43;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0787394;STB=0.530888;TYPE=snp;VARB=0.0517762;OID=.;OPOS=16060248;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:104:63:65:39:39:15:24:43:20:15:24:43:22 chr19 16060658 . A G 410.43 PASS AO=107;DP=234;FAO=107;FDP=234;FR=.;FRO=127;FSAF=45;FSAR=62;FSRF=44;FSRR=83;FWDB=0.00376974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.685;QD=7.01582;RBI=0.00602521;REFB=-0.00672052;REVB=0.00470023;RO=126;SAF=45;SAR=62;SRF=43;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0807962;STB=0.541801;TYPE=snp;VARB=0.00707028;OID=.;OPOS=16060658;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:234:234:126:127:107:107:62:45:43:83:62:45:44:83 chr19 16136528 . G GCAGCACCTGGC 33.33 PASS AO=27;DP=165;FAO=31;FDP=154;FR=.;FRO=123;FSAF=1;FSAR=30;FSRF=36;FSRR=87;FWDB=-0.0432238;FXX=0.0493797;HRUN=1;LEN=11;MLLD=329.656;QD=0.865768;RBI=0.0442723;REFB=-0.00975863;REVB=-0.0095778;RO=129;SAF=1;SAR=26;SRF=41;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.578212;STB=0.904275;TYPE=ins;VARB=0.0359451;OID=.;OPOS=16136529;OREF=-;OALT=CAGCACCTGGC;OMAPALT=GCAGCACCTGGC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:27:165:31:154:123:1:30:36:87:33:129:1:26:41:88 chr19 16136923 . T C 162.22 PASS AO=15;DP=44;FAO=29;FDP=44;FR=.,HEALED;FRO=15;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.0155743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.942;QD=14.747;RBI=0.018244;REFB=-0.0160128;REVB=-0.00950194;RO=15;SAF=9;SAR=6;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.576869;TYPE=snp;VARB=0.0107833;OID=.;OPOS=16136923;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:43:44:15:15:15:29:6:9:9:6:18:11:9:6 chr19 16178443 . C T 10.38 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.000744596;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=289.541;QD=5.93126;RBI=0.000744596;REFB=-0.00603926;REVB=0;RO=5;SAF=2;SAR=0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0147835;OID=.;OPOS=16178443;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:5:5:2:2:0:2:5:0:0:2:5:0 chr19 16238279 . C T 46.83 PASS AO=11;DP=30;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.00585634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.907;QD=6.04256;RBI=0.0511588;REFB=0.000803679;REVB=-0.0508225;RO=18;SAF=5;SAR=6;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162248;STB=0.629419;TYPE=snp;VARB=-0.0102747;OID=.;OPOS=16238279;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:30:31:18:19:11:12:6:5:11:7:7:5:12:7 chr19 16263947 . GC G 113.93 PASS AO=23;DP=39;FAO=29;FDP=39;FR=.;FRO=10;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.15294;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.4971;QD=11.6856;RBI=0.178824;REFB=-0.0872717;REVB=-0.0926683;RO=12;SAF=8;SAR=15;SRF=9;SRR=3;SSEN=0.352273;SSEP=0;SSSB=-0.251954;STB=0.594776;TYPE=del;VARB=0.0696347;OID=.;OPOS=16263948;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:23:39:29:39:10:10:19:7:3:10:12:8:15:9:3 chr19 16268207 . TA T 417.68 PASS AO=56;DP=76;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.275199;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=12.668;QD=23.2044;RBI=0.27696;REFB=0;REVB=0.0311789;RO=2;SAF=12;SAR=44;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0209528;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.00655925;OID=.;OPOS=16268208;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:56:72:72:72:0:20:52:0:0:37:2:12:44:0:2 chr19 16275655 . C T 994.53 PASS AO=155;DP=216;FAO=156;FDP=216;FR=.;FRO=60;FSAF=36;FSAR=120;FSRF=22;FSRR=38;FWDB=0.00252807;FXX=0.00460808;HRUN=8;LEN=1;MLLD=136;QD=18.4172;RBI=0.0297418;REFB=0.0138396;REVB=0.0296342;RO=59;SAF=35;SAR=120;SRF=21;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0906865;STB=0.550278;TYPE=snp;VARB=-0.00307108;OID=.;OPOS=16275655;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:216:216:59:60:155:156:120:35:21:38:120:36:22:38 chr19 16301312 . A G 501.2 PASS AO=53;DP=55;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0250166;FXX=0.036357;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.282;QD=37.8266;RBI=0.0539631;REFB=0;REVB=0.0478141;RO=0;SAF=38;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.94565e-05;OID=.;OPOS=16301312;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:55:53:0:0:53:53:15:38:0:0:15:38:0:0 chr19 16339715 . C T 915.24 PASS AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0253638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.4403;QD=38.1351;RBI=0.040554;REFB=0;REVB=0.0316434;RO=0;SAF=42;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000267164;OID=.;OPOS=16339715;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:96:96:0:0:96:96:54:42:0:0:54:42:0:0 chr19 16633950 . T C 13.43 PASS AO=3;DP=11;FAO=3;FDP=11;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.0149827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.571;QD=4.88264;RBI=0.0316891;REFB=-0.0131533;REVB=-0.0279235;RO=7;SAF=1;SAR=2;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.371415;STB=0.776206;TYPE=snp;VARB=0.0361041;OID=.;OPOS=16633950;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:11:11:7:8:3:3:2:1:5:2:2:1:6:2 chr19 16638975 . GCCCCG GCCCG,GCCC 161.1 PASS AO=8,5;DP=23;FAO=28,0;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=17,0;FSAR=11,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.206803,-0.266668;FXX=0.0344709;HRUN=4,4;LEN=1,2;MLLD=11.7012,6.19426;QD=23.0137;RBI=0.355004,0.287411;REFB=0,0;REVB=0.288548,-0.107206;RO=2;SAF=8,5;SAR=0,0;SRF=0;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.812466,0.78221;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=-0.00651059,0;OID=.,.;OPOS=16638976,16638979;OREF=C,CG;OALT=-,-;OMAPALT=GCCCG,GCCC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:8,5:20:28,0:28:0:17,0:11,0:0:0:15:2:8,5:0,0:0:2 chr19 16790859 . C T 226.99 PASS AO=47;DP=113;FAO=58;FDP=126;FR=.;FRO=68;FSAF=33;FSAR=25;FSRF=32;FSRR=36;FWDB=0.00958311;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.072;QD=7.20603;RBI=0.147041;REFB=-0.00979531;REVB=0.146728;RO=56;SAF=32;SAR=15;SRF=33;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0981872;STB=0.553308;TYPE=snp;VARB=0.0226823;OID=.;OPOS=16790859;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:126:56:68:47:58:15:32:33:23:25:33:32:36 chr19 16842052 . G T 978.45 PASS AO=99;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0668345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.357;QD=37.998;RBI=0.0698653;REFB=0;REVB=0.0203545;RO=0;SAF=39;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.47126e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000102903;OID=.;OPOS=16842052;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:103:103:0:0:99:103:60:39:0:0:60:43:0:0 chr19 16860105 . G A 639.75 PASS AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0354115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.461;QD=38.1939;RBI=0.0566303;REFB=0;REVB=0.044193;RO=0;SAF=24;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000197655;OID=.;OPOS=16860105;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:67:67:0:0:67:67:43:24:0:0:43:24:0:0 chr19 16860862 . CG C 28.87 PASS AO=13;DP=47;FAO=18;FDP=44;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.10701;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=8.84429;QD=2.62474;RBI=0.216724;REFB=-0.0525187;REVB=-0.188463;RO=21;SAF=4;SAR=9;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0.386364;SSSB=-0.188234;STB=0.544221;TYPE=del;VARB=0.0842389;OID=.;OPOS=16860863;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:13:42:18:44:26:7:11:12:14:28:21:4:9:10:11 chr19 16899838 . A T 3573.96 PASS AO=381;DP=386;FAO=382;FDP=382;FR=.;FRO=0;FSAF=196;FSAR=186;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0395298;FXX=0.0103624;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.763;QD=37.4237;RBI=0.0484904;REFB=-0.0030441;REVB=-0.0280839;RO=2;SAF=195;SAR=186;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00486906;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000208149;OID=.;OPOS=16899838;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:386:382:2:0:381:382:186:195:2:0:186:196:0:0 chr19 16926067 . A T 236.54 PASS AO=55;DP=114;FAO=56;FDP=115;FR=.;FRO=59;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=23;FSRR=36;FWDB=0.0215669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.937;QD=8.22735;RBI=0.0230451;REFB=0.00368115;REVB=-0.00812056;RO=58;SAF=21;SAR=34;SRF=22;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00246231;STB=0.501628;TYPE=snp;VARB=-0.00455513;OID=.;OPOS=16926067;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:115:58:59:55:56:34:21:22:36:34:22:23:36 chr19 16976286 . A G 1059.21 PASS AO=111;DP=111;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00637343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.8026;QD=37.8289;RBI=0.0124246;REFB=0;REVB=-0.0106653;RO=0;SAF=41;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.65433e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000988495;OID=.;OPOS=16976286;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:111:112:0:0:111:112:70:41:0:0:71:41:0:0 chr19 17004049 . T C 447.3 PASS AO=44;DP=45;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.737;QD=38.0683;RBI=0.0146746;REFB=0;REVB=0.00759705;RO=0;SAF=22;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.77019e-05;OID=.;OPOS=17004049;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:45:47:0:0:44:47:22:22:0:0:22:25:0:0 chr19 17006697 . C A 1235.22 PASS AO=135;DP=139;FAO=136;FDP=140;FR=.;FRO=4;FSAF=47;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0431713;FXX=0.0070917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.596;QD=35.2919;RBI=0.0456353;REFB=-0.0958387;REVB=0.0147926;RO=4;SAF=47;SAR=88;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0211145;STB=0.510987;TYPE=snp;VARB=0.00100659;OID=.;OPOS=17006697;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:139:140:4:4:135:136:88:47:0:4:89:47:0:4 chr19 17006700 . G T 1177.2 PASS AO=123;DP=124;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0600072;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.143;QD=37.6704;RBI=0.0791949;REFB=-0.0458488;REVB=0.0516814;RO=1;SAF=46;SAR=77;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00613062;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00054302;OID=.;OPOS=17006700;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:124:125:1:0:123:125:77:46:0:1:78:47:0:0 chr19 17006738 . A G 29.4 PASS AO=13;DP=63;FAO=13;FDP=51;FR=.;FRO=38;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=26;FSRR=12;FWDB=-0.0219214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6833;QD=2.30613;RBI=0.0340713;REFB=-0.00680068;REVB=-0.0260827;RO=50;SAF=5;SAR=8;SRF=37;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.424887;STB=0.712347;TYPE=snp;VARB=0.0141423;OID=.;OPOS=17006738;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:63:51:50:38:13:13:8:5:37:13:8:5:26:12 chr19 17006740 . G A 33.59 PASS AO=16;DP=55;FAO=14;FDP=52;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=-0.0622351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3959;QD=2.58398;RBI=0.0673081;REFB=-0.0371978;REVB=-0.0256352;RO=39;SAF=13;SAR=3;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.396085;STB=0.728566;TYPE=snp;VARB=0.120734;OID=.;OPOS=17006740;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:55:52:39:38:16:14:3:13:20:19:3:11:19:19 chr19 17006747 . T C 136.59 PASS AO=31;DP=56;FAO=29;FDP=55;FR=.;FRO=26;FSAF=24;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=-0.0592493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.0361;QD=9.93369;RBI=0.0600709;REFB=-0.0247577;REVB=0.00990111;RO=23;SAF=25;SAR=6;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.43297;STB=0.787748;TYPE=snp;VARB=0.0268921;OID=.;OPOS=17006747;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:55:23:26:31:29:6:25:7:16:5:24:7:19 chr19 17006752 . C G 47.93 PASS AO=16;DP=49;FAO=16;FDP=49;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=26;FWDB=-0.0798801;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=86.3417;QD=3.91262;RBI=0.0804201;REFB=0.0128711;REVB=-0.00930394;RO=33;SAF=13;SAR=3;SRF=7;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.623288;STB=0.862307;TYPE=snp;VARB=-0.0344987;OID=.;OPOS=17006752;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:49:49:33:33:16:16:3:13:7:26:3:13:7:26 chr19 17006787 . G A 329.79 PASS AO=34;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.226445;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=123.306;QD=35.6533;RBI=0.226749;REFB=0;REVB=0.011727;RO=2;SAF=4;SAR=30;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0881756;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00125245;OID=.;OPOS=17006787;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:37:37:2:0:34:37:30:4:1:1:31:6:0:0 chr19 17025292 . G A 127.11 PASS AO=26;DP=49;FAO=26;FDP=49;FR=.;FRO=23;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.00255855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.963;QD=10.3763;RBI=0.018481;REFB=-0.00708973;REVB=-0.0183031;RO=22;SAF=16;SAR=10;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171175;STB=0.58592;TYPE=snp;VARB=0.00543488;OID=.;OPOS=17025292;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:22:23:26:26:10:16:9:13:10:16:10:13 chr19 17088299 . T C 423.63 PASS AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0114169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.724;QD=37.6559;RBI=0.0115934;REFB=0;REVB=0.00201522;RO=0;SAF=23;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.62593e-05;OID=.;OPOS=17088299;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:45:45:0:0:45:45:22:23:0:0:22:23:0:0 chr19 17088319 . G T 74.27 PASS AO=19;DP=48;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=0.028916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.5964;QD=6.06254;RBI=0.0526102;REFB=-0.0373557;REVB=0.0439511;RO=29;SAF=12;SAR=7;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.227499;STB=0.640516;TYPE=snp;VARB=0.0344127;OID=.;OPOS=17088319;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:48:49:29:29:19:20:7:12:12:17:7:13:12:17 chr19 17091356 . C T 90.97 PASS AO=27;DP=71;FAO=27;FDP=71;FR=.;FRO=44;FSAF=3;FSAR=24;FSRF=5;FSRR=39;FWDB=0.027369;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.975;QD=5.12521;RBI=0.0495859;REFB=-0.00652006;REVB=-0.0413486;RO=44;SAF=3;SAR=24;SRF=5;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00684526;STB=0.503934;TYPE=snp;VARB=0.00976061;OID=.;OPOS=17091356;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:71:71:44:44:27:27:24:3:5:39:24:3:5:39 chr19 17091368 . T G 181.48 PASS AO=40;DP=80;FAO=40;FDP=79;FR=.;FRO=39;FSAF=5;FSAR=35;FSRF=5;FSRR=34;FWDB=0.00514738;FXX=0.0124984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.301;QD=9.18864;RBI=0.00595016;REFB=-0.023994;REVB=0.00298479;RO=39;SAF=5;SAR=35;SRF=5;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00647801;STB=0.503595;TYPE=snp;VARB=0.0180868;OID=.;OPOS=17091368;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:79:39:39:40:40:35:5:5:34:35:5:5:34 chr19 17091381 . G A 184.95 PASS AO=42;DP=85;FAO=42;FDP=84;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=31;FSRF=7;FSRR=35;FWDB=0.0123197;FXX=0.0117633;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.644;QD=8.80737;RBI=0.0211464;REFB=-0.018983;REVB=-0.0171871;RO=42;SAF=11;SAR=31;SRF=7;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118738;STB=0.565392;TYPE=snp;VARB=0.0124388;OID=.;OPOS=17091381;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:84:42:42:42:42:31:11:7:35:31:11:7:35 chr19 17100552 . A G 388.32 PASS AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00138434;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.149;QD=38.832;RBI=0.0195076;REFB=0;REVB=0.0194584;RO=0;SAF=29;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97233e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.88789e-05;OID=.;OPOS=17100552;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:40:40:0:0:40:40:11:29:0:0:11:29:0:0 chr19 17108052 . C T 80.22 PASS AO=21;DP=50;FAO=21;FDP=51;FR=.;FRO=30;FSAF=4;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=0.029401;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.275;QD=6.29202;RBI=0.0496103;REFB=-0.00862335;REVB=0.0399595;RO=29;SAF=4;SAR=17;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.352658;STB=0.698419;TYPE=snp;VARB=0.0100605;OID=.;OPOS=17108052;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:50:51:29:30:21:21:17:4:14:15:17:4:14:16 chr19 17108094 . C T 110.24 PASS AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-8.71943e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.798;QD=9.18662;RBI=0.00858485;REFB=-0.0145881;REVB=-0.00858441;RO=24;SAF=6;SAR=18;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0931919;STB=0.552586;TYPE=snp;VARB=0.0131398;OID=.;OPOS=17108094;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:24:24:24:24:18:6:8:16:18:6:8:16 chr19 17108098 . C T 91.34 PASS AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=4;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=0.00887252;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.1187;QD=7.45654;RBI=0.0183613;REFB=-0.0140352;REVB=-0.0160753;RO=26;SAF=4;SAR=18;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218371;STB=0.642711;TYPE=snp;VARB=0.0152982;OID=.;OPOS=17108098;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:49:49:26:27:22:22:18:4:9:17:18:4:10:17 chr19 17108135 . C T 170.89 PASS AO=34;DP=62;FAO=34;FDP=61;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=8;FSRR=19;FWDB=0.00270894;FXX=0.0161264;HRUN=3;LEN=1;MLLD=258.633;QD=11.2056;RBI=0.00272406;REFB=-0.0169453;REVB=0.000286612;RO=24;SAF=11;SAR=23;SRF=7;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0276787;STB=0.513896;TYPE=snp;VARB=0.013069;OID=.;OPOS=17108135;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:61:24:27:34:34:23:11:7:17:23:11:8:19 chr19 17111297 . A G 1120.38 PASS AO=126;DP=133;FAO=127;FDP=133;FR=.;FRO=6;FSAF=50;FSAR=77;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.0777293;FXX=0.0148137;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7805;QD=33.6955;RBI=0.0797984;REFB=-0.0208581;REVB=-0.0180539;RO=6;SAF=49;SAR=77;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0547049;STB=0.528297;TYPE=snp;VARB=0.000707931;OID=.;OPOS=17111297;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:133:133:6:6:126:127:77:49:6:0:77:50:6:0 chr19 17163661 . C T 183.03 PASS AO=48;DP=109;FAO=48;FDP=109;FR=.;FRO=61;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=32;FSRR=29;FWDB=0.0608004;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.0123;QD=6.71666;RBI=0.0611569;REFB=0.000579574;REVB=0.00659455;RO=60;SAF=26;SAR=22;SRF=31;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0249305;STB=0.509604;TYPE=snp;VARB=-0.00048214;OID=.;OPOS=17163661;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:60:61:48:48:22:26:31:29:22:26:32:29 chr19 17170885 . C T 211.31 PASS AO=36;DP=65;FAO=42;FDP=74;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=9;FWDB=-0.0142425;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.909;QD=11.4222;RBI=0.0178229;REFB=-0.0228177;REVB=-0.0107148;RO=29;SAF=13;SAR=23;SRF=21;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.290001;STB=0.61367;TYPE=snp;VARB=0.0325771;OID=.;OPOS=17170885;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:74:29:32:36:42:23:13:21:8:23:19:23:9 chr19 17273893 . G T 1203.4 PASS AO=121;DP=122;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0188734;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.069;QD=38.203;RBI=0.0756388;REFB=0;REVB=0.0732463;RO=0;SAF=20;SAR=101;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2006e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.96229e-05;OID=.;OPOS=17273893;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:122:126:0:0:121:126:101:20:0:0:106:20:0:0 chr19 17306031 . T C 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0702522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.64;QD=33.022;RBI=0.0702522;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00132019;OID=.;OPOS=17306031;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:0:6:0:0:0:6:0:0 chr19 17312992 . C T 191.04 PASS AO=44;DP=89;FAO=44;FDP=90;FR=.;FRO=46;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=26;FWDB=-0.00120017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.1581;QD=8.49069;RBI=0.00335596;REFB=0.00612815;REVB=0.00313401;RO=45;SAF=22;SAR=22;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0506123;STB=0.533318;TYPE=snp;VARB=-0.0059228;OID=.;OPOS=17312992;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:90:45:46:44:44:22:22:20:25:22:22:20:26 chr19 17317955 . A G 153.56 PASS AO=39;DP=90;FAO=40;FDP=89;FR=.;FRO=49;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=31;FWDB=0.00311574;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.8218;QD=6.90152;RBI=0.0426587;REFB=-0.0308835;REVB=-0.0425447;RO=48;SAF=16;SAR=23;SRF=17;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0577506;STB=0.532775;TYPE=snp;VARB=0.0927866;OID=.;OPOS=17317955;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:89:48:49:39:40:23:16:17:31:23:17:18:31 chr19 17323426 . A C 328.59 PASS AO=89;DP=197;FAO=89;FDP=198;FR=.;FRO=109;FSAF=28;FSAR=61;FSRF=46;FSRR=63;FWDB=-0.0234791;FXX=0.0099995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5928;QD=6.63819;RBI=0.0378696;REFB=-0.0126527;REVB=-0.0297127;RO=107;SAF=29;SAR=60;SRF=46;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111225;STB=0.565224;TYPE=snp;VARB=0.0244716;OID=.;OPOS=17323426;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:198:107:109:89:89:60:29:46:61:61:28:46:63 chr19 17330060 . T C 1343.48 PASS AO=139;DP=140;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0527567;FXX=0.00704176;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.3229;QD=38.1128;RBI=0.0596653;REFB=0;REVB=-0.027869;RO=0;SAF=44;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000426195;OID=.;OPOS=17330060;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:140:141:0:0:139:141:95:44:0:0:97:44:0:0 chr19 17355790 . GA G 39.33 PASS AO=8;DP=23;FAO=15;FDP=23;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.0558293;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.9504;QD=6.84029;RBI=0.0664521;REFB=-0.128216;REVB=0.0360413;RO=8;SAF=4;SAR=4;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105859;STB=0.516107;TYPE=del;VARB=0.142919;OID=.;OPOS=17355791;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:8:22:15:23:8:5:10:3:5:18:8:4:4:3:5 chr19 17361116 . G A 163.86 PASS AO=32;DP=56;FAO=32;FDP=57;FR=.;FRO=25;FSAF=29;FSAR=3;FSRF=19;FSRR=6;FWDB=-0.00673528;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.203;QD=11.4992;RBI=0.00932824;REFB=-0.0531398;REVB=0.00645384;RO=24;SAF=29;SAR=3;SRF=19;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208586;STB=0.644336;TYPE=snp;VARB=0.0405875;OID=.;OPOS=17361116;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:56:57:24:25:32:32:3:29:19:5:3:29:19:6 chr19 17366278 . T C 24.38 PASS AO=9;DP=34;FAO=9;FDP=34;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=-0.00621633;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.803;QD=2.86856;RBI=0.0125829;REFB=-0.0175354;REVB=-0.0109402;RO=25;SAF=5;SAR=4;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226365;STB=0.640728;TYPE=snp;VARB=0.0322485;OID=.;OPOS=17366278;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:34:34:25:25:9:9:4:5:9:16:4:5:9:16 chr19 17367435 . T C 93.66 PASS AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.0284345;FXX=0.020404;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.1387;QD=7.80539;RBI=0.0291022;REFB=-0.0149902;REVB=0.00619816;RO=26;SAF=13;SAR=9;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0511632;STB=0.529043;TYPE=snp;VARB=0.0378571;OID=.;OPOS=17367435;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:49:48:26:26:22:22:9:13:14:12:9:13:14:12 chr19 17394124 . T G 222.34 PASS AO=89;DP=258;FAO=86;FDP=255;FR=.;FRO=169;FSAF=44;FSAR=42;FSRF=76;FSRR=93;FWDB=-0.0392129;FXX=0.0116275;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1183;QD=3.48769;RBI=0.0432847;REFB=0.0125533;REVB=-0.018328;RO=165;SAF=44;SAR=45;SRF=73;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0593601;STB=0.540974;TYPE=snp;VARB=-0.0301567;OID=.;OPOS=17394124;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:258:255:165:169:89:86:45:44:73:92:42:44:76:93 chr19 17394504 . A C 24.63 PASS AO=11;DP=39;FAO=10;FDP=39;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=0.0240901;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0008;QD=2.52593;RBI=0.0297221;REFB=0.00433201;REVB=-0.017409;RO=22;SAF=6;SAR=5;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0833e-08;STB=0.58957;TYPE=snp;VARB=-0.0529945;OID=.;OPOS=17394504;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:39:39:22:29:11:10:5:6:12:10:5:5:18:11 chr19 17395003 . A G 195.41 PASS AO=33;DP=128;FAO=40;FDP=128;FR=.,HEALED;FRO=72;FSAF=31;FSAR=9;FSRF=41;FSRR=31;FWDB=0.0334501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.655;QD=6.10659;RBI=0.0347011;REFB=-0.0168607;REVB=-0.00923331;RO=67;SAF=25;SAR=8;SRF=41;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198958;STB=0.656694;TYPE=snp;VARB=0.0566366;OID=.;OPOS=17395003;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:127:128:67:72:33:40:8:25:41:26:9:31:41:31 chr19 17395055 . C G 258.08 PASS AO=66;DP=144;FAO=66;FDP=144;FR=.;FRO=78;FSAF=34;FSAR=32;FSRF=47;FSRR=31;FWDB=-0.0116205;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.428;QD=7.16887;RBI=0.0152768;REFB=-0.0223484;REVB=-0.00991678;RO=78;SAF=34;SAR=32;SRF=47;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0856205;STB=0.547514;TYPE=snp;VARB=0.022262;OID=.;OPOS=17395055;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:144:78:78:66:66:32:34:47:31:32:34:47:31 chr19 17396549 . T C 245.22 PASS AO=70;DP=166;FAO=70;FDP=167;FR=.;FRO=97;FSAF=27;FSAR=43;FSRF=42;FSRR=55;FWDB=0.0363884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9309;QD=5.87362;RBI=0.0451884;REFB=-0.0181386;REVB=-0.0267932;RO=95;SAF=27;SAR=43;SRF=41;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0491302;STB=0.528586;TYPE=snp;VARB=0.020342;OID=.;OPOS=17396549;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:167:95:97:70:70:43:27:41:54:43:27:42:55 chr19 17397499 . GTT GT,GTG 151.95 PASS AO=8,7;DP=19;FAO=9,8;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=1,1;FSAR=8,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0709799,-0.0560395;FXX=0.105208;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=21.1083,32.7107;QD=35.7522;RBI=0.0889054,0.0616006;REFB=0,0;REVB=0.0535353,0.0255776;RO=0;SAF=1,1;SAR=7,6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.78849e-08,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0482947,-0.00867653;OID=.,.;OPOS=17397500,17397501;OREF=T,T;OALT=-,G;OMAPALT=GT,GTG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:8,7:18:9,8:17:0:1,1:8,7:0:0:40:0:1,1:7,6:0:0 chr19 17405311 . GC G,GG 380.43 PASS AO=14,20;DP=48;FAO=34,20;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=15,0;FSAR=19,20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.599535,0.315802;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=15.8825,18.9157;QD=28.1797;RBI=0.656353,0.329656;REFB=-0.0214554,-0.019214;REVB=0.267128,0.0945637;RO=13;SAF=6,0;SAR=8,20;SRF=7;SRR=6;SSEN=0.348568,0;SSEP=0.278689,0;SSSB=-0.0930297,-0.847528;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.121639,-0.0198134;OID=.,.;OPOS=17405312,17405312;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:14,20:53:34,20:54:0:15,0:19,20:0:0:65:13:6,0:8,20:7:6 chr19 17534825 . GGT G,GGG 45.95 PASS AO=5,3;DP=22;FAO=9,0;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=1,0;FSAR=8,0;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=0.0242092,-0.0510802;FXX=0.111049;HRUN=4,2;LEN=2,1;MLLD=32.4998,19.2542;QD=11.4877;RBI=0.0466232,0.0747083;REFB=-0.0113663,-0.00763448;REVB=0.0398452,-0.0545173;RO=10;SAF=0,0;SAR=5,3;SRF=7;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.767621,-0.71177;STB=0.888023,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0227066,0;OID=.,.;OPOS=17534826,17534827;OREF=GT,T;OALT=-,G;OMAPALT=G,GGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:5,3:20:9,0:16:7:1,0:8,0:7:0:34:10:0,0:5,3:7:3 chr19 17547292 . A G 766.18 PASS AO=80;DP=86;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0278773;FXX=0.0804505;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.055;QD=38.3091;RBI=0.0281216;REFB=0;REVB=0.00369823;RO=0;SAF=19;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.49012e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.76992e-05;OID=.;OPOS=17547292;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:86:80:0:0:80:80:61:19:0:0:61:19:0:0 chr19 17556054 . A G 567.25 PASS AO=62;DP=66;FAO=63;FDP=65;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=45;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0235416;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.5728;QD=34.9076;RBI=0.0867607;REFB=-0.166665;REVB=0.0835057;RO=1;SAF=18;SAR=44;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106114;STB=0.526307;TYPE=snp;VARB=0.0032912;OID=.;OPOS=17556054;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:66:65:1:2:62:63:44:18:0:1:45:18:2:0 chr19 17611490 . T G 78.12 PASS AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.111405;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.473;QD=7.2669;RBI=0.112623;REFB=0.00916436;REVB=-0.0165178;RO=22;SAF=9;SAR=10;SRF=16;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237772;STB=0.606688;TYPE=snp;VARB=-0.0111403;OID=.;OPOS=17611490;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:43:43:22:24:19:19:10:9:16:6:10:9:16:8 chr19 17616171 . G A 813.54 PASS AO=82;DP=82;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.279526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.9259;QD=37.839;RBI=0.282847;REFB=0;REVB=0.0432177;RO=0;SAF=19;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.35046e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00771921;OID=.;OPOS=17616171;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:82:86:0:0:82:86:63:19:0:0:64:22:0:0 chr19 17628587 . A G 1094.18 PASS AO=115;DP=116;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2367;QD=37.7303;RBI=0.0166107;REFB=0;REVB=-0.0126253;RO=1;SAF=52;SAR=63;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0074785;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.04863e-05;OID=.;OPOS=17628587;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:116:116:1:0:115:116:63:52:0:1:64:52:0:0 chr19 17648350 . T C 210.68 PASS AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0231239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.352;QD=36.6392;RBI=0.030355;REFB=0;REVB=0.019665;RO=0;SAF=3;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.90062e-06;OID=.;OPOS=17648350;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:0:0:23:23:20:3:0:0:20:3:0:0 chr19 17651370 . A G 87.29 PASS AO=7;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=0;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.411;QD=38.797;RBI=0.0506444;REFB=0;REVB=0.0506444;RO=0;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000764872;OID=.;OPOS=17651370;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:7:9:7:0:0:0:9:0:0:0 chr19 17660300 . G A 894.6 PASS AO=93;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00445452;FXX=0.0105252;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.3742;QD=38.0681;RBI=0.0666472;REFB=0;REVB=0.0664982;RO=0;SAF=73;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.57802e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000325834;OID=.;OPOS=17660300;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:94:94:0:0:93:94:20:73:0:0:20:74:0:0 chr19 17679316 . AG A 420.05 PASS AO=48;DP=66;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.363623;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.9983;QD=25.8494;RBI=0.39799;REFB=0;REVB=0.161784;RO=13;SAF=31;SAR=17;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0.257732;SSSB=-0.0544893;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0136075;OID=.;OPOS=17679317;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:48:63:65:65:0:43:22:0:0:38:13:31:17:10:3 chr19 17692324 . T G 296.86 PASS AO=16;DP=33;FAO=31;FDP=33;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0560899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.467;QD=35.9835;RBI=0.117863;REFB=0;REVB=0.103661;RO=0;SAF=11;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.36667e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00317219;OID=.;OPOS=17692324;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:33:33:0:0:16:31:5:11:0:0:15:16:0:0 chr19 17741047 . A G 138.11 PASS AO=34;DP=74;FAO=34;FDP=74;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=-0.00839354;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=167.631;QD=7.46527;RBI=0.00995814;REFB=0.000264902;REVB=0.00535846;RO=40;SAF=18;SAR=16;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0442068;STB=0.524785;TYPE=snp;VARB=-0.0002845;OID=.;OPOS=17741047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:40:40:34:34:16:18:23:17:16:18:23:17 chr19 17746947 . A G 2700.85 PASS AO=178;DP=289;FAO=278;FDP=280;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=111;FSAR=167;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0725711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.473;QD=38.5836;RBI=0.0726383;REFB=0;REVB=-0.00312343;RO=6;SAF=17;SAR=161;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141859;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00165739;OID=.;OPOS=17746947;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:271:280:6:0:178:278:161:17:6:0:167:111:0:0 chr19 17766900 . C T 236.98 PASS AO=26;DP=59;FAO=38;FDP=57;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.0384331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.922;QD=16.6299;RBI=0.0511475;REFB=-0.0804595;REVB=0.0337485;RO=10;SAF=12;SAR=14;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0703652;STB=0.544355;TYPE=snp;VARB=0.0328039;OID=.;OPOS=17766900;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:46:57:10:18:26:38:14:12:6:4:24:14:9:9 chr19 17777508 . C G 603.97 PASS AO=62;DP=62;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00918208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.4478;QD=37.748;RBI=0.0396786;REFB=0;REVB=-0.0386015;RO=0;SAF=44;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.25982e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000253062;OID=.;OPOS=17777508;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:62:64:0:0:62:64:18:44:0:0:18:46:0:0 chr19 17885270 . A G 292.03 PASS AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.857;QD=38.9374;RBI=0.0569647;REFB=0;REVB=0.0535774;RO=0;SAF=14;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.56309e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000216303;OID=.;OPOS=17885270;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:30:30:0:0:30:30:16:14:0:0:16:14:0:0 chr19 17886940 . G A 210.45 PASS AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0322943;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=129.904;QD=33.6716;RBI=0.0333389;REFB=-0.165998;REVB=0.00828032;RO=1;SAF=15;SAR=9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0487199;STB=0.526294;TYPE=snp;VARB=0.00172324;OID=.;OPOS=17886940;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:25:25:1:1:24:24:9:15:0:1:9:15:0:1 chr19 17887024 . T C 591.63 PASS AO=65;DP=68;FAO=66;FDP=69;FR=.;FRO=3;FSAF=15;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0313529;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.28;QD=34.2975;RBI=0.0707719;REFB=-0.00223937;REVB=0.0634481;RO=3;SAF=15;SAR=50;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0275045;STB=0.514281;TYPE=snp;VARB=0.000339827;OID=.;OPOS=17887024;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:68:69:3:3:65:66:50:15:0:3:51:15:0:3 chr19 17892122 . C T 13.38 PASS AO=4;DP=17;FAO=4;FDP=17;FR=.;FRO=13;FSAF=0;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=13;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0852;QD=3.14788;RBI=0.0388383;REFB=-0.0038397;REVB=0.0388383;RO=13;SAF=0;SAR=4;SRF=0;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0150958;OID=.;OPOS=17892122;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:17:17:13:13:4:4:4:0:0:13:4:0:0:13 chr19 17892591 . A G 254.94 PASS AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000553073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.651;QD=37.7683;RBI=0.00355145;REFB=0;REVB=-0.00350812;RO=0;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39874e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.06621e-05;OID=.;OPOS=17892591;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:27:27:0:0:27:27:14:13:0:0:14:13:0:0 chr19 17919024 . A T 158.33 PASS AO=25;DP=40;FAO=27;FDP=42;FR=.;FRO=15;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=0.000142591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.234;QD=15.0794;RBI=0.060536;REFB=-0.0182006;REVB=0.0605359;RO=15;SAF=20;SAR=5;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0673143;STB=0.50343;TYPE=snp;VARB=0.00492249;OID=.;OPOS=17919024;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:40:42:15:15:25:27:5:20:11:4:7:20:11:4 chr19 17922795 . G A 608.62 PASS AO=64;DP=66;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0687163;FXX=0.0302984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.861;QD=38.0386;RBI=0.0973092;REFB=0;REVB=0.0688996;RO=0;SAF=36;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000742985;OID=.;OPOS=17922795;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:66:64:0:0:64:64:28:36:0:0:28:36:0:0 chr19 17999239 . C T 66.89 PASS AO=19;DP=50;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=0.146817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.1638;QD=5.35148;RBI=0.146943;REFB=-0.0199065;REVB=-0.00607979;RO=29;SAF=8;SAR=11;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00778986;STB=0.521716;TYPE=snp;VARB=0.0466511;OID=.;OPOS=17999239;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:50:50:29:31:19:19:11:8:12:17:11:8:12:19 chr19 18047283 . T G 660.54 PASS AO=68;DP=68;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.619;QD=38.2921;RBI=0.0150007;REFB=0;REVB=0.00658263;RO=0;SAF=62;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.74668e-05;OID=.;OPOS=18047283;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:68:69:0:0:68:69:6:62:0:0:6:63:0:0 chr19 18123738 . T C 207.79 PASS AO=24;DP=70;FAO=40;FDP=70;FR=.,HEALED;FRO=30;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=0.0143314;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.623;QD=11.8739;RBI=0.0165897;REFB=-0.0123232;REVB=-0.00835647;RO=27;SAF=8;SAR=16;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0756739;STB=0.569817;TYPE=snp;VARB=0.00922995;OID=.;OPOS=18123738;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:70:27:30:24:40:16:8:11:16:15:25:14:16 chr19 18170384 . G A 250.21 PASS AO=67;DP=161;FAO=74;FDP=180;FR=.;FRO=106;FSAF=26;FSAR=48;FSRF=74;FSRR=32;FWDB=0.0148345;FXX=0.0163925;HRUN=3;LEN=1;MLLD=117.614;QD=5.56032;RBI=0.0414076;REFB=-0.035863;REVB=0.0386591;RO=92;SAF=24;SAR=43;SRF=61;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.309684;STB=0.697623;TYPE=snp;VARB=0.0447754;OID=.;OPOS=18170384;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:180:92:106:67:74:43:24:61:31:48:26:74:32 chr19 18180413 . C G 178.36 PASS AO=37;DP=68;FAO=37;FDP=67;FR=.;FRO=30;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=0.0186247;FXX=0.0147037;HRUN=5;LEN=1;MLLD=52.002;QD=10.6481;RBI=0.0420254;REFB=-0.0191074;REVB=0.037673;RO=29;SAF=22;SAR=15;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144838;STB=0.560194;TYPE=snp;VARB=0.0329218;OID=.;OPOS=18180413;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:67:29:30:37:37:15:22:12:17:16:21:13:17 chr19 18180451 . A G 225.39 PASS AO=46;DP=83;FAO=46;FDP=83;FR=.;FRO=37;FSAF=28;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=23;FWDB=0.0177275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.9654;QD=10.862;RBI=0.0177839;REFB=-0.0316471;REVB=0.00141489;RO=37;SAF=28;SAR=18;SRF=14;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187192;STB=0.602896;TYPE=snp;VARB=0.0292906;OID=.;OPOS=18180451;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:37:37:46:46:18:28:14:23:18:28:14:23 chr19 18186575 . G A 106.89 PASS AO=27;DP=93;FAO=31;FDP=79;FR=.;FRO=48;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=35;FWDB=-0.0165043;FXX=0.141289;HRUN=4;LEN=1;MLLD=108.048;QD=5.41209;RBI=0.0166213;REFB=-0.0164082;REVB=0.00196843;RO=37;SAF=9;SAR=18;SRF=11;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0419532;STB=0.576979;TYPE=snp;VARB=0.0263491;OID=.;OPOS=18186575;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:79:37:48:27:31:18:9:11:26:19:12:13:35 chr19 18186618 . T C 189.46 PASS AO=40;DP=74;FAO=40;FDP=75;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=8;FSRR=27;FWDB=0.054046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.7204;QD=10.1046;RBI=0.061566;REFB=-0.0357435;REVB=0.0294856;RO=34;SAF=16;SAR=24;SRF=7;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175975;STB=0.586166;TYPE=snp;VARB=0.0243173;OID=.;OPOS=18186618;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:75:34:35:40:40:24:16:7:27:24:16:8:27 chr19 18188408 . C T 255.2 PASS AO=70;DP=169;FAO=72;FDP=171;FR=.;FRO=99;FSAF=38;FSAR=34;FSRF=40;FSRR=59;FWDB=0.00802586;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.932;QD=5.9697;RBI=0.00888054;REFB=-0.0230233;REVB=-0.00380127;RO=98;SAF=37;SAR=33;SRF=40;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124902;STB=0.57127;TYPE=snp;VARB=0.0249762;OID=.;OPOS=18188408;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:171:98:99:70:72:33:37:40:58:34:38:40:59 chr19 18197635 . G A 98.19 PASS AO=28;DP=71;FAO=28;FDP=71;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=0.00146494;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.343;QD=5.53157;RBI=0.0159781;REFB=-0.0064078;REVB=0.0159108;RO=43;SAF=16;SAR=12;SRF=19;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136945;STB=0.578257;TYPE=snp;VARB=0.00895924;OID=.;OPOS=18197635;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:71:71:43:43:28:28:12:16:19:24:12:16:19:24 chr19 18197744 . T A 28.34 PASS AO=8;DP=28;FAO=9;FDP=29;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=0.00361617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.936;QD=3.90873;RBI=0.00465621;REFB=0.00826965;REVB=-0.00293319;RO=20;SAF=4;SAR=4;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.291917;STB=0.639722;TYPE=snp;VARB=-0.0065161;OID=.;OPOS=18197744;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:28:29:20:20:8:9:4:4:5:15:5:4:5:15 chr19 18232492 . CA C 24.83 PASS AO=10;DP=50;FAO=12;FDP=49;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=28;FWDB=0.00915178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.4542;QD=2.02678;RBI=0.00948142;REFB=-0.00873177;REVB=-0.00247835;RO=37;SAF=9;SAR=1;SRF=9;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.70613;STB=0.940387;TYPE=del;VARB=0.089635;OID=.;OPOS=18232493;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:10:50:12:49:37:11:1:9:28:24:37:9:1:9:28 chr19 18239244 . GCCCC GCCC,GCC,G 189.53 PASS AO=20,15,16;DP=104;FAO=23,18,20;FDP=94;FR=.;FRO=33;FSAF=9,18,20;FSAR=14,0,0;FSRF=2;FSRR=31;FWDB=-0.133735,-0.0703607,-0.0365073;FXX=0.0504999;HRUN=5,5,5;LEN=1,2,4;MLLD=12.6048,22.4694,41.6194;QD=8.06502;RBI=0.136054,0.0715434,0.0370785;REFB=-0.0720524,-0.036136,-0.0187948;REVB=0.0250167,0.0129549,0.00648326;RO=31;SAF=5,15,16;SAR=15,0,0;SRF=1;SRR=30;SSEN=0.341772,0.341772,0.341772;SSEP=0,0,0;SSSB=0.387936,0.881957,0.88295;STB=0.724366,0.999564,0.999585;TYPE=del,del,del;VARB=0.0128458,-0.119374,0.0475728;OID=.,.,.;OPOS=18239245,18239245,18239245;OREF=C,CC,CCCC;OALT=-,-,-;OMAPALT=GCCC,GCC,G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:20,15,16:95:23,18,20:94:33:9,18,20:14,0,0:2:31:36:31:5,15,16:15,0,0:1:30 chr19 18248146 . T C 158.92 PASS AO=16;DP=16;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.13;QD=37.3931;RBI=0.0364056;REFB=0;REVB=0.0339515;RO=0;SAF=3;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.78418e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000550319;OID=.;OPOS=18248146;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:16:17:0:0:16:17:13:3:0:0:14:3:0:0 chr19 18273047 . T C 292.09 PASS AO=27;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000252094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.144;QD=36.5114;RBI=0.0291471;REFB=0;REVB=0.029146;RO=0;SAF=15;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00573627;OID=.;OPOS=18273047;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:32:32:0:0:27:31:12:15:0:0:15:16:0:0 chr19 18273888 . C T 236.81 PASS AO=55;DP=118;FAO=56;FDP=116;FR=.;FRO=60;FSAF=15;FSAR=41;FSRF=16;FSRR=44;FWDB=0.00347595;FXX=0.025208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.9483;QD=8.16571;RBI=0.030096;REFB=-0.0138223;REVB=0.0298946;RO=60;SAF=14;SAR=41;SRF=16;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0148815;STB=0.500785;TYPE=snp;VARB=0.0194715;OID=.;OPOS=18273888;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:116:60:60:55:56:41:14:16:44:41:15:16:44 chr19 18279638 . T C 479.21 PASS AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0290083;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.4428;QD=37.585;RBI=0.032152;REFB=0;REVB=0.0138661;RO=0;SAF=37;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000331869;OID=.;OPOS=18279638;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:51:51:0:0:51:51:14:37:0:0:14:37:0:0 chr19 18285944 . G A 114.45 PASS AO=33;DP=86;FAO=34;FDP=87;FR=.;FRO=53;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=36;FWDB=-0.0176059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.739;QD=5.26186;RBI=0.0182536;REFB=-0.00117669;REVB=0.00481914;RO=53;SAF=16;SAR=17;SRF=17;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179272;STB=0.592541;TYPE=snp;VARB=0.00210717;OID=.;OPOS=18285944;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:87:53:53:33:34:17:16:17:36:18:16:17:36 chr19 18288069 . A G 856.95 PASS AO=88;DP=88;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0219254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.522;QD=38.5147;RBI=0.0296944;REFB=0;REVB=-0.0200259;RO=0;SAF=56;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.82247e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000126761;OID=.;OPOS=18288069;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:88:89:0:0:88:89:32:56:0:0:33:56:0:0 chr19 18288898 . T C 241.9 PASS AO=73;DP=183;FAO=73;FDP=183;FR=.;FRO=110;FSAF=32;FSAR=41;FSRF=44;FSRR=66;FWDB=-0.00720795;FXX=0.00543449;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.9167;QD=5.28738;RBI=0.018732;REFB=-0.00544557;REVB=0.0172897;RO=105;SAF=32;SAR=41;SRF=42;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0412205;STB=0.523541;TYPE=snp;VARB=0.00922036;OID=.;OPOS=18288898;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:183:105:110:73:73:41:32:42:63:41:32:44:66 chr19 18288947 . A C 262.77 PASS AO=69;DP=156;FAO=70;FDP=159;FR=.;FRO=89;FSAF=28;FSAR=42;FSRF=27;FSRR=62;FWDB=0.0117831;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.59;QD=6.61057;RBI=0.0440638;REFB=9.37515e-05;REVB=-0.0424591;RO=86;SAF=27;SAR=42;SRF=25;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108381;STB=0.557625;TYPE=snp;VARB=-0.000172734;OID=.;OPOS=18288947;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:156:159:86:89:69:70:42:27:25:61:42:28:27:62 chr19 18304700 . A G 236.47 PASS AO=60;DP=131;FAO=60;FDP=131;FR=.;FRO=71;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=46;FSRR=25;FWDB=-0.00478388;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.7899;QD=7.22048;RBI=0.0111933;REFB=-0.0394017;REVB=-0.0101195;RO=70;SAF=32;SAR=28;SRF=46;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121849;STB=0.562866;TYPE=snp;VARB=0.030615;OID=.;OPOS=18304700;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:70:71:60:60:28:32:46:24:28:32:46:25 chr19 18305578 . G C 388.58 PASS AO=38;DP=38;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.187235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.0812;QD=38.8577;RBI=0.19087;REFB=0;REVB=0.0370751;RO=0;SAF=4;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0044837;OID=.;OPOS=18305578;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:38:40:0:0:38:40:34:4:0:0:36:4:0:0 chr19 18305824 . C T 198.79 PASS AO=30;DP=72;FAO=34;FDP=67;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=29;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.0211744;FXX=0.0821805;HRUN=7;LEN=1;MLLD=155.115;QD=11.8678;RBI=0.0211841;REFB=-0.0232876;REVB=-0.00063921;RO=16;SAF=25;SAR=5;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.373929;STB=0.709336;TYPE=snp;VARB=0.0224536;OID=.;OPOS=18305824;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:68:67:16:20:30:34:5:25:6:10:5:29:9:11 chr19 18306990 . G C 133.12 PASS AO=38;DP=97;FAO=39;FDP=98;FR=.;FRO=59;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=40;FSRR=19;FWDB=-0.0364145;FXX=0.0297;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.1712;QD=5.43335;RBI=0.0472139;REFB=0.00329125;REVB=0.0300521;RO=59;SAF=19;SAR=19;SRF=41;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.209899;STB=0.599951;TYPE=snp;VARB=-0.00304797;OID=.;OPOS=18306990;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:98:59:59:38:39:19:19:41:18:19:20:40:19 chr19 18307108 . C T 68.9 PASS AO=19;DP=50;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=3;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=0.0805969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.2294;QD=5.51182;RBI=0.0835896;REFB=-0.0215593;REVB=0.0221668;RO=31;SAF=3;SAR=16;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.256565;STB=0.651854;TYPE=snp;VARB=0.0421055;OID=.;OPOS=18307108;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:50:50:31:31:19:19:16:3:10:21:16:3:10:21 chr19 18311199 . A G 432.84 PASS AO=83;DP=177;FAO=102;FDP=190;FR=.;FRO=88;FSAF=43;FSAR=59;FSRF=52;FSRR=36;FWDB=-0.0155237;FXX=0.0206175;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.5927;QD=9.1124;RBI=0.0627374;REFB=-8.71168e-05;REVB=0.0607865;RO=91;SAF=43;SAR=40;SRF=52;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0506929;STB=0.578416;TYPE=snp;VARB=0.00254689;OID=.;OPOS=18311199;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:190:91:88:83:102:40:43:52:39:59:43:52:36 chr19 18329240 . T C 441.14 PASS AO=45;DP=47;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0222628;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.9966;QD=36.0117;RBI=0.107682;REFB=0.0248289;REVB=0.105356;RO=1;SAF=34;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136255;STB=0.507039;TYPE=snp;VARB=0.000658922;OID=.;OPOS=18329240;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:47:49:1:1:45:48:11:34:1:0:13:35:1:0 chr19 18329784 . C T 249.81 PASS AO=81;DP=212;FAO=81;FDP=212;FR=.;FRO=131;FSAF=49;FSAR=32;FSRF=57;FSRR=74;FWDB=-0.0038107;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.233;QD=4.71347;RBI=0.0153708;REFB=-0.00124933;REVB=-0.0148909;RO=130;SAF=49;SAR=32;SRF=57;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181936;STB=0.604912;TYPE=snp;VARB=0.0018051;OID=.;OPOS=18329784;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:212:130:131:81:81:32:49:57:73:32:49:57:74 chr19 18368810 . G T 100.99 PASS AO=28;DP=68;FAO=28;FDP=69;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=-0.0273062;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.261;QD=5.85469;RBI=0.0371027;REFB=-0.0132188;REVB=0.0251193;RO=40;SAF=10;SAR=18;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0473781;STB=0.536397;TYPE=snp;VARB=0.0130542;OID=.;OPOS=18368810;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:69:40:41:28:28:18:10:16:24:18:10:17:24 chr19 18368969 . G A 356.8 PASS AO=111;DP=277;FAO=111;FDP=277;FR=.;FRO=166;FSAF=45;FSAR=66;FSRF=93;FSRR=73;FWDB=0.0350521;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=135.659;QD=5.15235;RBI=0.0350713;REFB=-0.0100322;REVB=-0.00116122;RO=164;SAF=45;SAR=66;SRF=91;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159473;STB=0.592836;TYPE=snp;VARB=0.0158396;OID=.;OPOS=18368969;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:277:277:164:166:111:111:66:45:91:73:66:45:93:73 chr19 18368988 . G A 472.13 PASS AO=123;DP=272;FAO=124;FDP=271;FR=.;FRO=147;FSAF=55;FSAR=69;FSRF=81;FSRR=66;FWDB=0.000287813;FXX=0.00367634;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.064;QD=6.96865;RBI=0.0060251;REFB=-0.0342168;REVB=0.00601822;RO=146;SAF=55;SAR=68;SRF=80;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0988804;STB=0.558263;TYPE=snp;VARB=0.0351294;OID=.;OPOS=18368988;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:272:271:146:147:123:124:68:55:80:66:69:55:81:66 chr19 18369120 . G A 183.74 PASS AO=54;DP=136;FAO=54;FDP=134;FR=.;FRO=80;FSAF=20;FSAR=34;FSRF=39;FSRR=41;FWDB=0.0142063;FXX=0.0218962;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.349;QD=5.48475;RBI=0.0316587;REFB=-0.0103106;REVB=0.0282923;RO=78;SAF=20;SAR=34;SRF=38;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126309;STB=0.572135;TYPE=snp;VARB=0.0138688;OID=.;OPOS=18369120;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:134:78:80:54:54:34:20:38:40:34:20:39:41 chr19 18369211 . T G 178.78 PASS AO=46;DP=99;FAO=45;FDP=99;FR=.;FRO=54;FSAF=14;FSAR=31;FSRF=23;FSRR=31;FWDB=-0.0329143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.6778;QD=7.22324;RBI=0.0368923;REFB=0.0127848;REVB=0.016664;RO=53;SAF=15;SAR=31;SRF=22;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0934074;STB=0.569199;TYPE=snp;VARB=-0.0186629;OID=.;OPOS=18369211;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:53:54:46:45:31:15:22:31:31:14:23:31 chr19 18369246 . G T 248.54 PASS AO=50;DP=88;FAO=50;FDP=90;FR=.;FRO=40;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=13;FSRR=27;FWDB=0.00247793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.245;QD=11.046;RBI=0.0130916;REFB=-0.0139225;REVB=0.0128549;RO=36;SAF=21;SAR=29;SRF=10;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11423;STB=0.543924;TYPE=snp;VARB=0.00643854;OID=.;OPOS=18369246;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:90:36:40:50:50:29:21:10:26:29:21:13:27 chr19 18369270 . C T 191.87 PASS AO=40;DP=75;FAO=40;FDP=74;FR=.;FRO=34;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=0.0121682;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.079;QD=10.3714;RBI=0.0121773;REFB=-0.0175051;REVB=-0.000470565;RO=34;SAF=20;SAR=20;SRF=12;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122588;STB=0.567534;TYPE=snp;VARB=0.0106838;OID=.;OPOS=18369270;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:74:34:34:40:40:20:20:12:22:20:20:12:22 chr19 18369581 . G T 85.39 PASS AO=21;DP=49;FAO=24;FDP=56;FR=.;FRO=32;FSAF=21;FSAR=3;FSRF=26;FSRR=6;FWDB=0.0751728;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=34.2564;QD=6.0991;RBI=0.1637;REFB=-0.00583191;REVB=-0.14542;RO=28;SAF=18;SAR=3;SRF=26;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168569;STB=0.572661;TYPE=snp;VARB=0.00313251;OID=.;OPOS=18369581;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:49:56:28:32:21:24:3:18:26:2:3:21:26:6 chr19 18369596 . G A 115.53 PASS AO=28;DP=57;FAO=27;FDP=57;FR=.;FRO=30;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=27;FSRR=3;FWDB=-0.00325848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.7858;QD=8.10704;RBI=0.0131915;REFB=-0.00857122;REVB=-0.0127827;RO=29;SAF=20;SAR=8;SRF=27;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.278509;STB=0.621852;TYPE=snp;VARB=0.0173653;OID=.;OPOS=18369596;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:29:30:28:27:8:20:27:2:7:20:27:3 chr19 18369597 . T C 123.99 PASS AO=28;DP=57;FAO=28;FDP=57;FR=.;FRO=29;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=27;FSRR=2;FWDB=0.0521957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.0854;QD=8.70136;RBI=0.0995449;REFB=0.0169346;REVB=0.0847631;RO=29;SAF=20;SAR=8;SRF=27;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.278509;STB=0.65269;TYPE=snp;VARB=-0.0122821;OID=.;OPOS=18369597;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:29:29:28:28:8:20:27:2:8:20:27:2 chr19 18370063 . A AG 242.05 PASS AO=33;DP=45;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0210704;FXX=0.0243843;HRUN=2;LEN=1;MLLD=12.9076;QD=24.2053;RBI=0.179105;REFB=-0.0288932;REVB=0.177862;RO=11;SAF=17;SAR=16;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11154;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.0103306;OID=.;OPOS=18370064;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:33:45:40:40:0:20:20:0:0:21:11:17:16:3:8 chr19 18370160 . A AG 183.84 PASS AO=28;DP=43;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.229416;FXX=0.0476077;HRUN=5;LEN=1;MLLD=9.74537;QD=18.3836;RBI=0.234655;REFB=0.000641285;REVB=0.0493058;RO=7;SAF=16;SAR=12;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105749;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-0.00234963;OID=.;OPOS=18370161;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:28:43:40:40:0:22:18:0:0:15:7:16:12:2:5 chr19 18370566 . TGGGGT TGGGT,TGGGGC 160.6 PASS AO=4,13;DP=23;FAO=5,16;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=0,1;FSAR=5,15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.118528,0.0141077;FXX=0.0434594;HRUN=4,1;LEN=1,1;MLLD=10.8833,188.238;QD=29.1998;RBI=0.151984,0.0152406;REFB=-0.09299,-0.0251536;REVB=-0.0951326,-0.00576605;RO=1;SAF=0,1;SAR=4,12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0.340909,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0.0363094;STB=0.5,0.516109;TYPE=del,snp;VARB=0.0148446,0.00464967;OID=.,.;OPOS=18370567,18370571;OREF=G,T;OALT=-,C;OMAPALT=TGGGT,TGGGGC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:4,13:20:5,16:22:1:0,1:5,15:0:1:17:1:0,1:4,12:0:1 chr19 18370790 . A C 86.68 PASS AO=16;DP=28;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=2;FWDB=0.0161094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.8173;QD=12.3824;RBI=0.0494156;REFB=-0.0101123;REVB=0.0467161;RO=12;SAF=10;SAR=6;SRF=10;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179039;STB=0.599886;TYPE=snp;VARB=0.0270383;OID=.;OPOS=18370790;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:28:28:12:12:16:16:6:10:10:2:6:10:10:2 chr19 18371439 . T A 14.37 PASS AO=3;DP=11;FAO=3;FDP=10;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.0515173;FXX=0.0908265;HRUN=3;LEN=1;MLLD=147;QD=5.7463;RBI=0.0519796;REFB=-0.0223853;REVB=-0.00691729;RO=7;SAF=1;SAR=2;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.240731;STB=0.665556;TYPE=snp;VARB=0.0314949;OID=.;OPOS=18371439;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:11:10:7:7:3:3:2:1:4:3:2:1:4:3 chr19 18375563 . G A 96.68 PASS AO=24;DP=54;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=21;FSAR=3;FSRF=26;FSRR=4;FWDB=0.0082305;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=194.707;QD=7.16179;RBI=0.0232083;REFB=-0.0226469;REVB=-0.0216998;RO=30;SAF=21;SAR=3;SRF=26;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0183121;STB=0.510408;TYPE=snp;VARB=0.0262385;OID=.;OPOS=18375563;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:54:54:30:30:24:24:3:21:26:4:3:21:26:4 chr19 18375659 . C T 113.92 PASS AO=32;DP=79;FAO=32;FDP=80;FR=.;FRO=48;FSAF=28;FSAR=4;FSRF=30;FSRR=18;FWDB=0.054438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.4093;QD=5.69581;RBI=0.0735768;REFB=-0.0121958;REVB=-0.049498;RO=45;SAF=28;SAR=4;SRF=30;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.338107;STB=0.726245;TYPE=snp;VARB=0.0189297;OID=.;OPOS=18375659;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:80:45:48:32:32:4:28:30:15:4:28:30:18 chr19 18376407 . T A 71.08 PASS AO=14;DP=30;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=0.0355836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.721;QD=9.17166;RBI=0.0434396;REFB=-0.0165332;REVB=-0.024916;RO=15;SAF=11;SAR=3;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0665616;STB=0.511096;TYPE=snp;VARB=0.0137338;OID=.;OPOS=18376407;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:30:31:15:16:14:15:3:11:11:4:4:11:12:4 chr19 18376522 . T G 192.58 PASS AO=41;DP=93;FAO=47;FDP=99;FR=.;FRO=52;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=0.00828199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.629;QD=7.78091;RBI=0.0094102;REFB=0.00430878;REVB=-0.00446773;RO=52;SAF=13;SAR=28;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174027;STB=0.541045;TYPE=snp;VARB=-0.00344702;OID=.;OPOS=18376522;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:99:52:52:41:47:28:13:25:27:28:19:25:27 chr19 18377274 . A G 114.8 PASS AO=37;DP=101;FAO=37;FDP=101;FR=.;FRO=64;FSAF=34;FSAR=3;FSRF=52;FSRR=12;FWDB=-0.0132335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.6628;QD=4.54637;RBI=0.072151;REFB=-0.0087615;REVB=-0.070927;RO=64;SAF=34;SAR=3;SRF=52;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.278142;STB=0.663953;TYPE=snp;VARB=0.0216558;OID=.;OPOS=18377274;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:64:64:37:37:3:34:52:12:3:34:52:12 chr19 18377496 . C G 361.06 PASS AO=89;DP=188;FAO=89;FDP=187;FR=.;FRO=98;FSAF=29;FSAR=60;FSRF=41;FSRR=57;FWDB=-0.0475607;FXX=0.00531887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.2601;QD=7.72321;RBI=0.0543074;REFB=-0.0053625;REVB=-0.0262159;RO=97;SAF=29;SAR=60;SRF=40;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0895903;STB=0.553129;TYPE=snp;VARB=0.00394178;OID=.;OPOS=18377496;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:187:97:98:89:89:60:29:40:57:60:29:41:57 chr19 18377647 . G C 126.83 PASS AO=10;DP=27;FAO=18;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=8;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.00170707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.153;QD=18.1193;RBI=0.00884989;REFB=0.0262004;REVB=-0.00868369;RO=8;SAF=5;SAR=5;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.535358;TYPE=snp;VARB=0.0034176;OID=.;OPOS=18377647;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:24:28:8:8:10:18:5:5:4:4:7:11:4:4 chr19 18378219 . A G 81.88 PASS AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=-0.028299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.857;QD=7.27847;RBI=0.032684;REFB=-0.014862;REVB=0.0163526;RO=25;SAF=8;SAR=12;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267631;STB=0.652027;TYPE=snp;VARB=0.018748;OID=.;OPOS=18378219;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:45:45:25:25:20:20:12:8:17:8:12:8:17:8 chr19 18444360 . T G 339.36 PASS AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0460922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.285;QD=37.7061;RBI=0.0597287;REFB=0;REVB=-0.0379871;RO=0;SAF=6;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.61498e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.52937e-05;OID=.;OPOS=18444360;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:35:36:0:0:35:36:29:6:0:0:29:7:0:0 chr19 18480034 . TG T 106.8 PASS AO=19;DP=55;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.162397;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=6.44725;QD=12.2054;RBI=0.24927;REFB=0.0047976;REVB=-0.189111;RO=7;SAF=12;SAR=7;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123129;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00291503;OID=.;OPOS=18480035;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:19:34:35:35:0:25:10:0:0:9:7:12:7:6:1 chr19 18497024 . G C 157.16 PASS AO=19;DP=21;FAO=19;FDP=21;FR=.;FRO=2;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0190303;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.571;QD=29.9347;RBI=0.0198454;REFB=-0.171476;REVB=-0.00562937;RO=0;SAF=14;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.528271;TYPE=snp;VARB=0.00493072;OID=.;OPOS=18497024;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:21:21:0:2:19:19:5:14:0:0:5:14:1:1 chr19 18497141 . T A 243.15 PASS AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0337533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.6038;QD=37.4081;RBI=0.0644382;REFB=0;REVB=0.0548907;RO=0;SAF=8;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.28381e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0016099;OID=.;OPOS=18497141;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:26:26:0:0:26:26:18:8:0:0:18:8:0:0 chr19 18499238 . G T 90.2 PASS AO=11;DP=12;FAO=11;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0378635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=45.3235;QD=30.0666;RBI=0.0407547;REFB=-0.170665;REVB=-0.0150764;RO=0;SAF=3;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.52936;TYPE=snp;VARB=0.0246191;OID=.;OPOS=18499238;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:12:12:0:1:11:11:8:3:0:0:8:3:0:1 chr19 18502835 . G A 815.42 PASS AO=101;DP=113;FAO=101;FDP=113;FR=.;FRO=12;FSAF=55;FSAR=46;FSRF=12;FSRR=0;FWDB=0.0353559;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=177.744;QD=28.8646;RBI=0.0375432;REFB=4.99987e-05;REVB=-0.0126273;RO=12;SAF=55;SAR=46;SRF=12;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0929833;STB=0.549171;TYPE=snp;VARB=1.73959e-05;OID=.;OPOS=18502835;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:113:113:12:12:101:101:46:55:12:0:46:55:12:0 chr19 18538742 . A C 12.16 PASS AO=5;DP=24;FAO=5;FDP=25;FR=.;FRO=20;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.0571659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.794;QD=1.94608;RBI=0.0664654;REFB=-0.00407471;REVB=-0.0339073;RO=19;SAF=2;SAR=3;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0385029;STB=0.542208;TYPE=snp;VARB=0.0229921;OID=.;OPOS=18538742;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:24:25:19:20:5:5:3:2:7:12:3:2:7:13 chr19 18545786 . G T 89.9 PASS AO=30;DP=84;FAO=30;FDP=85;FR=.;FRO=55;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=41;FWDB=0.0480764;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.438;QD=4.23079;RBI=0.070739;REFB=-0.0194452;REVB=-0.051891;RO=54;SAF=19;SAR=11;SRF=14;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.399363;STB=0.731172;TYPE=snp;VARB=0.0363042;OID=.;OPOS=18545786;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:84:85:54:55:30:30:11:19:14:40:11:19:14:41 chr19 18546678 . T C 76.87 PASS AO=20;DP=48;FAO=20;FDP=48;FR=.;FRO=28;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=-0.0330083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.818;QD=6.40584;RBI=0.0362678;REFB=-0.00698148;REVB=-0.0150267;RO=28;SAF=4;SAR=16;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.470607;STB=0.771645;TYPE=snp;VARB=0.017496;OID=.;OPOS=18546678;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:48:48:28:28:20:20:16:4:18:10:16:4:18:10 chr19 18547305 . T A 175.69 PASS AO=35;DP=69;FAO=37;FDP=71;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=-0.0148918;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.045;QD=9.89784;RBI=0.0192732;REFB=-0.0360121;REVB=-0.0122347;RO=33;SAF=13;SAR=22;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102778;STB=0.560353;TYPE=snp;VARB=0.0320845;OID=.;OPOS=18547305;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:71:33:34:35:37:22:13:16:17:24:13:16:18 chr19 18553580 . CAGAT C 57.67 PASS AO=24;DP=86;FAO=24;FDP=82;FR=.;FRO=58;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=27;FSRR=31;FWDB=-0.000789606;FXX=0.0238067;HRUN=1;LEN=4;MLLD=291.291;QD=2.81334;RBI=0.00125356;REFB=-0.0117694;REVB=0.000973626;RO=55;SAF=13;SAR=11;SRF=26;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0810528;STB=0.553708;TYPE=del;VARB=0.0250862;OID=.;OPOS=18553581;OREF=AGAT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:24:81:24:82:58:13:11:27:31:57:55:13:11:26:29 chr19 18554631 . AGAC A 38.7 PASS AO=12;DP=42;FAO=12;FDP=37;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=23;FWDB=0.0151467;FXX=0.0512689;HRUN=1;LEN=3;MLLD=192.725;QD=4.18415;RBI=0.0295209;REFB=8.36647e-05;REVB=-0.0253388;RO=21;SAF=6;SAR=6;SRF=2;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.451973;STB=0.783463;TYPE=del;VARB=-0.00026855;OID=.;OPOS=18554632;OREF=GAC;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:12:39:12:37:25:6:6:2:23:38:21:6:6:2:19 chr19 18679379 . C G 201.52 PASS AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109972;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.0443;QD=36.6398;RBI=0.0157077;REFB=0;REVB=-0.0112158;RO=0;SAF=6;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17051e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.77199e-06;OID=.;OPOS=18679379;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:22:22:0:0:22:22:16:6:0:0:16:6:0:0 chr19 18684563 . C T 209.87 PASS AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00276574;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.329;QD=33.5799;RBI=0.0356971;REFB=0.0168799;REVB=0.0355898;RO=1;SAF=7;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0264929;STB=0.514274;TYPE=snp;VARB=2.0891e-05;OID=.;OPOS=18684563;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:25:25:1:1:24:24:17:7:0:1:17:7:0:1 chr19 18700047 . A G 263.3 PASS AO=31;DP=33;FAO=31;FDP=33;FR=.;FRO=2;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00621508;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=176.504;QD=31.9146;RBI=0.0427087;REFB=-0.0344438;REVB=-0.042254;RO=2;SAF=16;SAR=15;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00182271;STB=0.500978;TYPE=snp;VARB=0.000226548;OID=.;OPOS=18700047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:33:33:2:2:31:31:15:16:1:1:15:16:1:1 chr19 18710535 . G A 76.89 PASS AO=15;DP=28;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.00467353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8562;QD=10.9841;RBI=0.0384516;REFB=-0.0495075;REVB=0.0381665;RO=13;SAF=7;SAR=8;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0677684;STB=0.538411;TYPE=snp;VARB=0.0177779;OID=.;OPOS=18710535;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:28:28:13:13:15:15:8:7:5:8:8:7:5:8 chr19 18726856 . T C 365.99 PASS AO=95;DP=207;FAO=95;FDP=208;FR=.;FRO=113;FSAF=34;FSAR=61;FSRF=87;FSRR=26;FWDB=-0.0171749;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.877;QD=7.03816;RBI=0.0182801;REFB=-0.0200749;REVB=0.00625968;RO=112;SAF=34;SAR=61;SRF=86;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.385686;STB=0.713857;TYPE=snp;VARB=0.0371301;OID=.;OPOS=18726856;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:208:112:113:95:95:61:34:86:26:61:34:87:26 chr19 18775077 . C T 340.94 PASS AO=85;DP=181;FAO=85;FDP=181;FR=.;FRO=96;FSAF=47;FSAR=38;FSRF=40;FSRR=56;FWDB=0.0607023;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.7779;QD=7.53454;RBI=0.0637035;REFB=-0.0278468;REVB=-0.0193228;RO=94;SAF=47;SAR=38;SRF=39;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1307;STB=0.571967;TYPE=snp;VARB=0.0323053;OID=.;OPOS=18775077;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:181:94:96:85:85:38:47:39:55:38:47:40:56 chr19 18977937 . G C 1386.23 PASS AO=144;DP=149;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00554672;FXX=0.0335548;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.526;QD=38.5064;RBI=0.0322521;REFB=0;REVB=0.0317716;RO=0;SAF=53;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.3691e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.78615e-05;OID=.;OPOS=18977937;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:149:144:0:0:144:144:91:53:0:0:91:53:0:0 chr19 19011244 . T C 145.25 PASS AO=28;DP=58;FAO=31;FDP=59;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=25;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=-0.0156359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.426;QD=9.84748;RBI=0.0462253;REFB=-0.00508512;REVB=-0.0435005;RO=22;SAF=5;SAR=23;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.424485;STB=0.740571;TYPE=snp;VARB=0.00605937;OID=.;OPOS=19011244;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:59:22:28:28:31:23:5:14:8:25:6:18:10 chr19 19023853 . T C 41.05 PASS AO=11;DP=30;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0312799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0961;QD=5.47293;RBI=0.0665764;REFB=-0.00786887;REVB=-0.0587706;RO=19;SAF=9;SAR=2;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.454614;STB=0.774298;TYPE=snp;VARB=0.00780911;OID=.;OPOS=19023853;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:30:30:19:19:11:11:2:9:8:11:2:9:8:11 chr19 19042905 . GA G 24.57 PASS AO=15;DP=35;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.00397467;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.1795;QD=2.8911;RBI=0.0850667;REFB=-0.0771829;REVB=0.0849738;RO=19;SAF=8;SAR=7;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00681493;STB=0.52937;TYPE=del;VARB=0.120748;OID=.;OPOS=19042906;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:15:34:14:34:20:7:7:11:9:24:19:8:7:10:9 chr19 19049198 . G A 224.82 PASS AO=55;DP=123;FAO=58;FDP=128;FR=.;FRO=70;FSAF=24;FSAR=34;FSRF=39;FSRR=31;FWDB=-0.0146894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.48;QD=7.02575;RBI=0.0166538;REFB=-0.00670748;REVB=0.0078468;RO=68;SAF=24;SAR=31;SRF=39;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135474;STB=0.578579;TYPE=snp;VARB=0.00692074;OID=.;OPOS=19049198;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:128:68:70:55:58:31:24:39:29:34:24:39:31 chr19 19136541 . C T 1405.56 PASS AO=153;DP=159;FAO=154;FDP=159;FR=.;FRO=5;FSAF=72;FSAR=82;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.036373;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.815;QD=35.3601;RBI=0.0552713;REFB=-0.180989;REVB=0.0416164;RO=0;SAF=71;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6227e-08;STB=0.508457;TYPE=snp;VARB=0.00138768;OID=.;OPOS=19136541;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:159:159:0:5:153:154:82:71:0:0:82:72:1:4 chr19 19230868 . A G 840.66 PASS AO=81;DP=83;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.649;QD=36.9522;RBI=0.0460958;REFB=0;REVB=0.0420788;RO=2;SAF=53;SAR=28;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0326201;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000151274;OID=.;OPOS=19230868;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:83:91:2:0:81:91:28:53:0:2:38:53:0:0 chr19 19446936 . G A 1470.39 PASS AO=154;DP=154;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0125579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.8742;QD=38.1918;RBI=0.0455796;REFB=0;REVB=0.0438155;RO=0;SAF=73;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000271074;OID=.;OPOS=19446936;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:154:154:0:0:154:154:81:73:0:0:81:73:0:0 chr19 19449686 . G T 1618.79 PASS AO=178;DP=185;FAO=180;FDP=185;FR=.;FRO=5;FSAF=86;FSAR=94;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.00794564;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.693;QD=35.0008;RBI=0.0164443;REFB=-0.0679648;REVB=0.0143973;RO=5;SAF=84;SAR=94;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170893;STB=0.508718;TYPE=snp;VARB=0.000500513;OID=.;OPOS=19449686;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:185:185:5:5:178:180:94:84:4:1:94:86:4:1 chr19 19467085 . G C 552.94 PASS AO=50;DP=51;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0795894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.778;QD=37.4871;RBI=0.0811559;REFB=0;REVB=-0.0158687;RO=1;SAF=18;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0254311;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000251076;OID=.;OPOS=19467085;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:51:59:1:0:50:59:32:18:1:0:32:27:0:0 chr19 19467937 . T C 224.38 PASS AO=28;DP=43;FAO=32;FDP=41;FR=.;FRO=9;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=-0.00306855;FXX=0.0238039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.368;QD=21.8908;RBI=0.0275449;REFB=0.0288211;REVB=0.0273734;RO=0;SAF=13;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.568841;TYPE=snp;VARB=-0.0178895;OID=.;OPOS=19467937;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:28:41:0:9:28:32:15:13:0:0:19:13:1:8 chr19 19468260 . C T 327.3 PASS AO=55;DP=82;FAO=55;FDP=82;FR=.;FRO=27;FSAF=38;FSAR=17;FSRF=3;FSRR=24;FWDB=0.0143784;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=198.785;QD=15.9656;RBI=0.021414;REFB=-0.00311733;REVB=0.0158689;RO=27;SAF=38;SAR=17;SRF=3;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.352729;STB=0.69084;TYPE=snp;VARB=0.00210412;OID=.;OPOS=19468260;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:82:82:27:27:55:55:17:38:3:24:17:38:3:24 chr19 19468709 . GC G,GG 1292.27 PASS AO=48,89;DP=138;FAO=18,119;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=0,42;FSAR=18,77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0348841,0.0797622;FXX=0.00724585;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=174.048,191.925;QD=37.7304;RBI=0.0414567,0.0830851;REFB=0,0;REVB=0.0224,0.0232618;RO=0;SAF=25,17;SAR=23,72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.26339e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.0165052,0.00391659;OID=.,.;OPOS=19468710,19468710;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:48,89:138:18,119:137:0:0,42:18,77:0:0:5:0:25,17:23,72:0:0 chr19 19468734 . G A 1145.01 PASS AO=119;DP=120;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226774;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.549;QD=37.8514;RBI=0.0428331;REFB=0;REVB=0.0363374;RO=0;SAF=34;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.51092e-05;OID=.;OPOS=19468734;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:120:121:0:0:119:121:85:34:0:0:87:34:0:0 chr19 19617023 . ACCCCCG ACCCCG,ACCCC 27.19 PASS AO=5,4;DP=28;FAO=11,0;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=7,0;FSAR=4,0;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=0.208711,-0.0602522;FXX=0.11107;HRUN=5,5;LEN=1,2;MLLD=12.3703,196.09;QD=4.53142;RBI=0.226722,0.0652995;REFB=0.0169815,-0.0101393;REVB=0.0885583,0.0251733;RO=11;SAF=3,2;SAR=2,2;SRF=1;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.530131,0.488976;STB=0.74429,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.103526,0;OID=.,.;OPOS=19617024,19617028;OREF=C,CG;OALT=-,-;OMAPALT=ACCCCG,ACCCC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:5,4:25:11,0:24:13:7,0:4,0:2:11:27:11:3,2:2,2:1:10 chr19 19654517 . G A 57.97 PASS AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=16;FWDB=0.0217036;FXX=0.0644953;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.9126;QD=7.99586;RBI=0.0317823;REFB=0.011369;REVB=0.0232177;RO=16;SAF=4;SAR=9;SRF=0;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.425376;STB=0.735054;TYPE=snp;VARB=-0.0224693;OID=.;OPOS=19654517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:30:29:16:16:13:13:9:4:0:16:9:4:0:16 chr19 19735257 . G T 471.98 PASS AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0270878;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=247.4;QD=38.5287;RBI=0.0299797;REFB=0;REVB=0.0128464;RO=0;SAF=20;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.46659e-05;OID=.;OPOS=19735257;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:49:49:0:0:49:49:29:20:0:0:29:20:0:0 chr19 19741292 . C G 143.21 PASS AO=42;DP=107;FAO=42;FDP=106;FR=.;FRO=64;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=19;FSRR=45;FWDB=-0.00423388;FXX=0.00934492;HRUN=5;LEN=1;MLLD=90.9231;QD=5.404;RBI=0.0161186;REFB=-0.00754651;REVB=-0.0155526;RO=51;SAF=15;SAR=27;SRF=18;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00448763;STB=0.540522;TYPE=snp;VARB=0.0135338;OID=.;OPOS=19741292;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:106:51:64:42:42:27:15:18:33:27:15:19:45 chr19 19753400 . C A 178.3 PASS AO=51;DP=128;FAO=52;FDP=127;FR=.;FRO=75;FSAF=7;FSAR=45;FSRF=30;FSRR=45;FWDB=-0.0120054;FXX=0.0230751;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.482;QD=5.6157;RBI=0.012125;REFB=-0.015013;REVB=0.00169917;RO=73;SAF=6;SAR=45;SRF=29;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.427848;STB=0.725387;TYPE=snp;VARB=0.0236117;OID=.;OPOS=19753400;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:127:73:75:51:52:45:6:29:44:45:7:30:45 chr19 19823270 . T A 196.28 PASS AO=44;DP=87;FAO=44;FDP=87;FR=.;FRO=43;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=0.0124147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.65;QD=9.02441;RBI=0.0168251;REFB=0.00361849;REVB=0.011356;RO=43;SAF=20;SAR=24;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.051064;STB=0.528289;TYPE=snp;VARB=-0.00264352;OID=.;OPOS=19823270;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:43:43:44:44:24:20:22:21:24:20:22:21 chr19 19855654 . C T 67.7 PASS AO=19;DP=50;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=0.00844751;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.154;QD=5.41573;RBI=0.0238911;REFB=-0.0305634;REVB=-0.0223478;RO=31;SAF=9;SAR=10;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0584315;STB=0.533863;TYPE=snp;VARB=0.033071;OID=.;OPOS=19855654;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:50:50:31:31:19:19:10:9:13:18:10:9:13:18 chr19 20150175 . G C 60.67 PASS AO=5;DP=6;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0137742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.642;QD=34.6712;RBI=0.122919;REFB=0;REVB=0.122145;RO=0;SAF=4;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00268879;OID=.;OPOS=20150175;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:7:0:0:5:7:1:4:0:0:3:4:0:0 chr19 20308149 . C G 137.09 PASS AO=22;DP=33;FAO=22;FDP=32;FR=.;FRO=10;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0412646;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.971;QD=17.136;RBI=0.0661944;REFB=-0.0361992;REVB=0.0517584;RO=10;SAF=13;SAR=9;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.064944;STB=0.535682;TYPE=snp;VARB=0.0158559;OID=.;OPOS=20308149;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:33:32:10:10:22:22:9:13:7:3:9:13:7:3 chr19 20308488 . G T 197.4 PASS AO=34;DP=56;FAO=36;FDP=58;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=31;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.0562712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.931;QD=13.614;RBI=0.0592931;REFB=-0.00957563;REVB=0.0186874;RO=22;SAF=5;SAR=29;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.356526;STB=0.702416;TYPE=snp;VARB=0.00575722;OID=.;OPOS=20308488;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:56:58:22:22:34:36:29:5:11:11:31:5:11:11 chr19 20728217 . C T 11.71 PASS AO=11;DP=55;FAO=9;FDP=54;FR=.;FRO=45;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=10;FSRR=35;FWDB=0.0196227;FXX=0.0181785;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.721;QD=0.867221;RBI=0.0986655;REFB=-0.0135922;REVB=-0.0966946;RO=43;SAF=9;SAR=2;SRF=9;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.657386;STB=0.940485;TYPE=snp;VARB=0.0606733;OID=.;OPOS=20728217;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:55:54:43:45:11:9:2:9:9:34:1:8:10:35 chr19 20807352 . C T 43.02 PASS AO=6;DP=8;FAO=6;FDP=8;FR=.;FRO=2;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0186805;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.9377;QD=21.5081;RBI=0.0208068;REFB=0.0432361;REVB=0.00916311;RO=2;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144764;STB=0.583085;TYPE=snp;VARB=-0.0639462;OID=.;OPOS=20807352;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:8:2:2:6:6:5:1:0:2:5:1:0:2 chr19 20808143 . T G 585.78 PASS AO=117;DP=204;FAO=117;FDP=203;FR=.;FRO=86;FSAF=61;FSAR=56;FSRF=35;FSRR=51;FWDB=0.011316;FXX=0.00975562;HRUN=3;LEN=1;MLLD=118.511;QD=11.5424;RBI=0.0158119;REFB=-0.0266445;REVB=0.0110437;RO=83;SAF=61;SAR=56;SRF=35;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0761641;STB=0.548341;TYPE=snp;VARB=0.0184443;OID=.;OPOS=20808143;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:203:83:86:117:117:56:61:35:48:56:61:35:51 chr19 20808149 . A G 1831.89 PASS AO=193;DP=203;FAO=194;FDP=194;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00732326;FXX=0.0443328;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.585;QD=37.7708;RBI=0.0513284;REFB=-0.0660855;REVB=0.0508033;RO=0;SAF=89;SAR=104;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.57119e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000332571;OID=.;OPOS=20808149;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:203:194:0:0:193:194:104:89:0:0:105:89:0:0 chr19 20808374 . A G 113.67 PASS AO=19;DP=35;FAO=20;FDP=33;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=0.0521412;FXX=0.0833102;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.429;QD=13.778;RBI=0.052143;REFB=-0.00303135;REVB=0.000427612;RO=13;SAF=4;SAR=15;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.02179;STB=0.510194;TYPE=snp;VARB=0.000641371;OID=.;OPOS=20808374;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:35:33:13:13:19:20:15:4:3:10:15:5:3:10 chr19 21112948 . A G 17.25 PASS AO=5;DP=11;FAO=4;FDP=11;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.0453259;FXX=0;HRUN=22;LEN=1;MLLD=37.3133;QD=6.27096;RBI=0.12202;REFB=-0.000388172;REVB=0.113289;RO=6;SAF=3;SAR=2;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0621951;STB=0.635732;TYPE=snp;VARB=0.0250635;OID=.;OPOS=21112948;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:11:11:6:7:5:4:2:3:4:2:2:2:5:2 chr19 21112949 . G GGA 25.02 PASS AO=2;DP=11;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.154191;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=23.8572;QD=10.0085;RBI=0.161833;REFB=-0.160562;REVB=0.0491437;RO=8;SAF=2;SAR=0;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.590874;STB=0.726279;TYPE=ins;VARB=0.185447;OID=.;OPOS=21112950;OREF=-;OALT=GA;OMAPALT=GGA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:2:11:5:10:5:4:1:2:3:22:8:2:0:4:4 chr19 21115243 . T C 254.66 PASS AO=72;DP=171;FAO=72;FDP=171;FR=.;FRO=99;FSAF=40;FSAR=32;FSRF=44;FSRR=55;FWDB=-0.0112192;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=251.52;QD=5.95702;RBI=0.0202511;REFB=0.00606556;REVB=0.0168594;RO=97;SAF=40;SAR=32;SRF=43;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115058;STB=0.564185;TYPE=snp;VARB=-0.00715245;OID=.;OPOS=21115243;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:171:97:99:72:72:32:40:43:54:32:40:44:55 chr19 21115247 . T C 286.93 PASS AO=77;DP=174;FAO=77;FDP=174;FR=.;FRO=97;FSAF=43;FSAR=34;FSRF=44;FSRR=53;FWDB=0.0024592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.648;QD=6.59603;RBI=0.00393468;REFB=0.00363599;REVB=0.00307149;RO=97;SAF=43;SAR=34;SRF=44;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104984;STB=0.558426;TYPE=snp;VARB=-0.0140893;OID=.;OPOS=21115247;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:174:97:97:77:77:34:43:44:53:34:43:44:53 chr19 21131571 . A G 94.78 PASS AO=19;DP=40;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=4;FWDB=0.0129587;FXX=0.0243843;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.934;QD=9.4781;RBI=0.0293625;REFB=-0.00592441;REVB=0.0263482;RO=20;SAF=9;SAR=10;SRF=16;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.293844;STB=0.649863;TYPE=snp;VARB=0.018848;OID=.;OPOS=21131571;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:40:40:20:20:19:20:10:9:16:4:10:10:16:4 chr19 21131664 . G T 152.93 PASS AO=48;DP=130;FAO=48;FDP=126;FR=.;FRO=78;FSAF=16;FSAR=32;FSRF=42;FSRR=36;FWDB=0.00240908;FXX=0.0526276;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.332;QD=4.85504;RBI=0.00291898;REFB=-0.000273529;REVB=-0.00164826;RO=67;SAF=16;SAR=32;SRF=35;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20274;STB=0.630379;TYPE=snp;VARB=0.000303471;OID=.;OPOS=21131664;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:126:67:78:48:48:32:16:35:32:32:16:42:36 chr19 21131850 . C G 122.06 PASS AO=30;DP=67;FAO=30;FDP=66;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=12;FSRR=24;FWDB=0.00559581;FXX=0.0294074;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.147;QD=7.39756;RBI=0.0312049;REFB=-0.017114;REVB=0.0306991;RO=36;SAF=8;SAR=22;SRF=12;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0787695;STB=0.544524;TYPE=snp;VARB=0.0202719;OID=.;OPOS=21131850;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:66:36:36:30:30:22:8:12:24:22:8:12:24 chr19 21131870 . G C 41.74 PASS AO=14;DP=44;FAO=14;FDP=44;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=-0.0133978;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.158;QD=3.79446;RBI=0.0143183;REFB=-0.0169444;REVB=-0.00505111;RO=30;SAF=6;SAR=8;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11335;STB=0.567475;TYPE=snp;VARB=0.0196616;OID=.;OPOS=21131870;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:44:44:30:30:14:14:8:6:10:20:8:6:10:20 chr19 21132129 . T C 16.68 PASS AO=7;DP=25;FAO=6;FDP=25;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=19;FSRR=0;FWDB=-0.0282953;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.1129;QD=2.66856;RBI=0.0282953;REFB=-0.0302363;REVB=0;RO=18;SAF=7;SAR=0;SRF=18;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.135369;OID=.;OPOS=21132129;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:25:25:18:19:7:6:0:7:18:0:0:6:19:0 chr19 21132211 . A T 37.87 PASS AO=15;DP=53;FAO=15;FDP=53;FR=.;FRO=38;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=0.018972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.345;QD=2.85782;RBI=0.0193033;REFB=-0.00102521;REVB=0.00356086;RO=37;SAF=5;SAR=10;SRF=14;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.05797;STB=0.52774;TYPE=snp;VARB=0.00346043;OID=.;OPOS=21132211;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:53:53:37:38:15:15:10:5:14:23:10:5:14:24 chr19 21132394 . C T 69.5 PASS AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.0406911;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.682;QD=10.2969;RBI=0.0420327;REFB=-0.0117413;REVB=0.0105349;RO=13;SAF=2;SAR=12;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.370519;STB=0.716054;TYPE=snp;VARB=0.0118809;OID=.;OPOS=21132394;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:27:27:13:13:14:14:12:2:6:7:12:2:6:7 chr19 21133129 . T C 36.03 PASS AO=21;DP=83;FAO=20;FDP=84;FR=.;FRO=64;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=32;FSRR=32;FWDB=-0.00853651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.434;QD=1.7159;RBI=0.00853879;REFB=0.00307609;REVB=0.000197379;RO=62;SAF=10;SAR=11;SRF=32;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0489594;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00777066;OID=.;OPOS=21133129;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:83:84:62:64:21:20:11:10:32:30:10:10:32:32 chr19 21133225 . TATAAAA T 56.91 PASS AO=34;DP=155;FAO=35;FDP=146;FR=.;FRO=111;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=74;FSRR=37;FWDB=-0.0110648;FXX=0.0266649;HRUN=1;LEN=6;MLLD=265.412;QD=1.55905;RBI=0.0115782;REFB=0.000340029;REVB=-0.00340951;RO=102;SAF=19;SAR=15;SRF=67;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126748;STB=0.575469;TYPE=del;VARB=-0.000144062;OID=.;OPOS=21133226;OREF=ATAAAA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:34:148:35:146:111:20:15:74:37:56:102:19:15:67:35 chr19 21133243 . G A 55.05 PASS AO=37;DP=160;FAO=37;FDP=160;FR=.;FRO=123;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=84;FSRR=39;FWDB=-0.00970741;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.65;QD=1.37636;RBI=0.018012;REFB=-0.00275014;REVB=0.0151723;RO=123;SAF=21;SAR=16;SRF=84;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153554;STB=0.592546;TYPE=snp;VARB=0.0154237;OID=.;OPOS=21133243;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:160:160:123:123:37:37:16:21:84:39:16:21:84:39 chr19 21133269 . C A 60.68 PASS AO=41;DP=174;FAO=41;FDP=176;FR=.;FRO=135;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=88;FSRR=47;FWDB=-0.00761733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.059;QD=1.37919;RBI=0.0131779;REFB=-0.0022743;REVB=-0.0107533;RO=133;SAF=22;SAR=19;SRF=86;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142213;STB=0.59002;TYPE=snp;VARB=0.00517034;OID=.;OPOS=21133269;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:174:176:133:135:41:41:19:22:86:47:19:22:88:47 chr19 21133309 . G A 88.94 PASS AO=45;DP=176;FAO=47;FDP=175;FR=.;FRO=128;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=71;FSRR=57;FWDB=-0.00139721;FXX=0.016853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.771;QD=2.03299;RBI=0.0226933;REFB=-0.00659366;REVB=0.0226502;RO=130;SAF=22;SAR=23;SRF=71;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0711621;STB=0.563064;TYPE=snp;VARB=0.0158601;OID=.;OPOS=21133309;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:176:175:130:128:45:47:23:22:71:59:25:22:71:57 chr19 21133340 . A G 62.57 PASS AO=42;DP=177;FAO=42;FDP=180;FR=.;FRO=138;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=75;FSRR=63;FWDB=-0.017531;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=142.462;QD=1.39043;RBI=0.0220891;REFB=-0.00884334;REVB=0.0134385;RO=132;SAF=16;SAR=26;SRF=71;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197134;STB=0.624215;TYPE=snp;VARB=0.0305933;OID=.;OPOS=21133340;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:177:180:132:138:42:42:26:16:71:61:26:16:75:63 chr19 21133378 . C T 93.69 PASS AO=49;DP=179;FAO=49;FDP=181;FR=.;FRO=132;FSAF=19;FSAR=30;FSRF=70;FSRR=62;FWDB=-0.0121284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.7673;QD=2.07049;RBI=0.0137439;REFB=-0.0152838;REVB=-0.00646493;RO=130;SAF=19;SAR=30;SRF=70;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185278;STB=0.604303;TYPE=snp;VARB=0.0288529;OID=.;OPOS=21133378;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:179:181:130:132:49:49:30:19:70:60:30:19:70:62 chr19 21133439 . C T 75.83 PASS AO=38;DP=142;FAO=38;FDP=140;FR=.;FRO=102;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=43;FSRR=59;FWDB=0.0126475;FXX=0.0140835;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.05;QD=2.16655;RBI=0.0161601;REFB=-0.00849467;REVB=-0.0100593;RO=101;SAF=15;SAR=23;SRF=43;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0392579;STB=0.52027;TYPE=snp;VARB=0.0219732;OID=.;OPOS=21133439;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:142:140:101:102:38:38:23:15:43:58:23:15:43:59 chr19 21299774 . T TATA 252.77 PASS AO=35;DP=49;FAO=36;FDP=46;FR=.;FRO=10;FSAF=27;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=1;FWDB=0.00848819;FXX=0.041658;HRUN=1;LEN=3;MLLD=195.756;QD=21.9798;RBI=0.0254926;REFB=-0.0255705;REVB=-0.0240379;RO=11;SAF=27;SAR=8;SRF=10;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.091256;STB=0.545431;TYPE=ins;VARB=0.00272065;OID=.;OPOS=21299775;OREF=-;OALT=ATA;OMAPALT=TATA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:35:49:36:46:10:27:9:9:1:19:11:27:8:10:1 chr19 21300462 . A G 497.26 PASS AO=60;DP=66;FAO=60;FDP=66;FR=.;FRO=6;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.0190876;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=189.317;QD=30.1372;RBI=0.0208032;REFB=0.0240014;REVB=0.0082725;RO=5;SAF=27;SAR=33;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0797439;STB=0.534943;TYPE=snp;VARB=-0.00271658;OID=.;OPOS=21300462;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:66:66:5:6:60:60:33:27:5:0:33:27:5:1 chr19 21366498 . T C 16.06 PASS AO=3;DP=6;FAO=3;FDP=6;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.100346;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=21.3615;QD=10.7094;RBI=0.100346;REFB=-0.153772;REVB=0;RO=3;SAF=3;SAR=0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.178311;OID=.;OPOS=21366498;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:6:6:3:3:3:3:0:3:3:0:0:3:3:0 chr19 21477379 . C T 299.38 PASS AO=71;DP=146;FAO=71;FDP=145;FR=.;FRO=74;FSAF=17;FSAR=54;FSRF=20;FSRR=54;FWDB=-0.00379408;FXX=0.00684885;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.1325;QD=8.25862;RBI=0.0192771;REFB=-0.00894964;REVB=-0.0189;RO=74;SAF=17;SAR=54;SRF=20;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0381872;STB=0.521121;TYPE=snp;VARB=0.0108438;OID=.;OPOS=21477379;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:145:74:74:71:71:54:17:20:54:54:17:20:54 chr19 21477431 . T C 294.31 PASS AO=72;DP=152;FAO=72;FDP=150;FR=.;FRO=78;FSAF=9;FSAR=63;FSRF=14;FSRR=64;FWDB=-0.0211061;FXX=0.013157;HRUN=4;LEN=1;MLLD=178.795;QD=7.84834;RBI=0.0247945;REFB=-0.0143292;REVB=0.0130115;RO=75;SAF=9;SAR=63;SRF=14;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116599;STB=0.55901;TYPE=snp;VARB=0.0137527;OID=.;OPOS=21477431;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:150:75:78:72:72:63:9:14:61:63:9:14:64 chr19 21492062 . G A 957.87 PASS AO=100;DP=101;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.050105;FXX=0.0190458;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.77;QD=37.1988;RBI=0.0689805;REFB=-0.0130497;REVB=0.047411;RO=0;SAF=52;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.19274e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000510251;OID=.;OPOS=21492062;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:101:103:0:0:100:103:48:52:0:0:51:52:0:0 chr19 21544571 . G A 244.98 PASS AO=65;DP=160;FAO=69;FDP=163;FR=.;FRO=94;FSAF=50;FSAR=19;FSRF=67;FSRR=27;FWDB=-0.00132333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.997;QD=6.01179;RBI=0.00623351;REFB=-0.00130048;REVB=-0.00609143;RO=94;SAF=47;SAR=18;SRF=67;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.013444;STB=0.50851;TYPE=snp;VARB=0.00205152;OID=.;OPOS=21544571;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:163:94:94:65:69:18:47:67:27:19:50:67:27 chr19 21580012 . T G 98.58 PASS AO=32;DP=89;FAO=32;FDP=89;FR=.;FRO=57;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=28;FSRR=29;FWDB=-9.78663e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.585;QD=4.43063;RBI=0.0335397;REFB=-0.0208086;REVB=-0.0335396;RO=55;SAF=18;SAR=14;SRF=26;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0989225;STB=0.54581;TYPE=snp;VARB=0.039859;OID=.;OPOS=21580012;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:89:89:55:57:32:32:14:18:26:29:14:18:28:29 chr19 21606429 . G T 96.7 PASS AO=24;DP=54;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=0.0328179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.542;QD=7.16276;RBI=0.0358816;REFB=-0.0147366;REVB=0.0145077;RO=29;SAF=13;SAR=11;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188567;STB=0.596252;TYPE=snp;VARB=0.0129307;OID=.;OPOS=21606429;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:54:54:29:30:24:24:11:13:10:19:11:13:11:19 chr19 21607878 . ATAAT A 76.75 PASS AO=25;DP=88;FAO=26;FDP=75;FR=.;FRO=49;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=32;FWDB=0.0255215;FXX=0.0506265;HRUN=1;LEN=4;MLLD=201.937;QD=4.09349;RBI=0.0279996;REFB=-0.0036542;REVB=-0.0115164;RO=34;SAF=14;SAR=11;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11999;STB=0.646833;TYPE=del;VARB=0.00668721;OID=.;OPOS=21607879;OREF=TAAT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:25:65:26:75:49:15:11:17:32:76:34:14:11:15:19 chr19 21608110 . C T 173.37 PASS AO=53;DP=136;FAO=53;FDP=135;FR=.;FRO=82;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=35;FSRR=47;FWDB=0.000903102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.542;QD=5.13673;RBI=0.00588671;REFB=-0.00343924;REVB=-0.00581703;RO=78;SAF=27;SAR=26;SRF=33;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0911345;STB=0.561381;TYPE=snp;VARB=0.00597194;OID=.;OPOS=21608110;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:135:78:82:53:53:26:27:33:45:25:28:35:47 chr19 21608153 . C T 237.28 PASS AO=72;DP=165;FAO=68;FDP=163;FR=.;FRO=95;FSAF=26;FSAR=42;FSRF=42;FSRR=53;FWDB=0.0103243;FXX=0.00609719;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.0582;QD=5.82283;RBI=0.0105445;REFB=0.0283472;REVB=-0.00214371;RO=92;SAF=29;SAR=43;SRF=39;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.02199;STB=0.536227;TYPE=snp;VARB=-0.0400262;OID=.;OPOS=21608153;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:163:92:95:72:68:43:29:39:53:42:26:42:53 chr19 21608263 . CT C 35.01 PASS AO=24;DP=98;FAO=31;FDP=89;FR=.;FRO=58;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=34;FWDB=0.0184381;FXX=0.0531858;HRUN=4;LEN=1;MLLD=14.1261;QD=1.57354;RBI=0.156835;REFB=-0.0592007;REVB=-0.155747;RO=61;SAF=1;SAR=23;SRF=24;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.643812;STB=0.56483;TYPE=del;VARB=0.121816;OID=.;OPOS=21608264;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:24:94:31:89:58:10:21:24:34:35:61:1:23:24:37 chr19 21608269 . A G 79.9 PASS AO=30;DP=91;FAO=29;FDP=88;FR=.;FRO=59;FSAF=7;FSAR=22;FSRF=26;FSRR=33;FWDB=-0.0306631;FXX=0.0112347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.462;QD=3.63173;RBI=0.0316761;REFB=-0.0105865;REVB=-0.00794698;RO=58;SAF=7;SAR=23;SRF=26;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.278605;STB=0.653351;TYPE=snp;VARB=0.0293278;OID=.;OPOS=21608269;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:91:88:58:59:30:29:23:7:26:32:22:7:26:33 chr19 21608270 . C T 93.89 PASS AO=32;DP=90;FAO=31;FDP=87;FR=.;FRO=56;FSAF=8;FSAR=23;FSRF=24;FSRR=32;FWDB=-0.00280976;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.652;QD=4.31686;RBI=0.00829904;REFB=-0.011062;REVB=-0.00780892;RO=52;SAF=8;SAR=24;SRF=24;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.257437;STB=0.625764;TYPE=snp;VARB=0.0281998;OID=.;OPOS=21608270;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:90:87:52:56:32:31:24:8:24:28:23:8:24:32 chr19 21608272 . A T 87.53 PASS AO=32;DP=89;FAO=30;FDP=87;FR=.;FRO=57;FSAF=7;FSAR=23;FSRF=24;FSRR=33;FWDB=-0.0193404;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=247.929;QD=4.02445;RBI=0.0239914;REFB=-0.0138846;REVB=-0.0141963;RO=57;SAF=7;SAR=25;SRF=24;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267939;STB=0.645144;TYPE=snp;VARB=0.0281962;OID=.;OPOS=21608272;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:89:87:57:57:32:30:25:7:24:33:23:7:24:33 chr19 21608275 . C T 88.49 PASS AO=32;DP=89;FAO=30;FDP=86;FR=.;FRO=56;FSAF=7;FSAR=23;FSRF=24;FSRR=32;FWDB=-0.0107782;FXX=0.0114929;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.7799;QD=4.11563;RBI=0.0175539;REFB=-0.0274087;REVB=-0.0138553;RO=56;SAF=7;SAR=25;SRF=24;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.275024;STB=0.649255;TYPE=snp;VARB=0.05223;OID=.;OPOS=21608275;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:89:86:56:56:32:30:25:7:24:32:23:7:24:32 chr19 21608280 . T A 100.89 PASS AO=35;DP=91;FAO=32;FDP=87;FR=.;FRO=55;FSAF=9;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=32;FWDB=0.0157761;FXX=0.0224694;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.033;QD=4.63856;RBI=0.0331374;REFB=-0.00448668;REVB=-0.0291411;RO=55;SAF=9;SAR=26;SRF=23;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199211;STB=0.597824;TYPE=snp;VARB=0.00891933;OID=.;OPOS=21608280;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:87:55:55:35:32:26:9:23:32:23:9:23:32 chr19 21608283 . A C 96.35 PASS AO=33;DP=88;FAO=31;FDP=85;FR=.;FRO=54;FSAF=9;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=31;FWDB=0.0373092;FXX=0.0229859;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.615;QD=4.53405;RBI=0.0378783;REFB=-0.00102942;REVB=-0.0065413;RO=52;SAF=8;SAR=25;SRF=22;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226044;STB=0.59604;TYPE=snp;VARB=0.000659867;OID=.;OPOS=21608283;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:88:85:52:54:33:31:25:8:22:30:22:9:23:31 chr19 21608287 . G C 119.36 PASS AO=36;DP=85;FAO=34;FDP=84;FR=.;FRO=50;FSAF=9;FSAR=25;FSRF=21;FSRR=29;FWDB=-0.011118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.06;QD=5.68378;RBI=0.0187625;REFB=-0.0104173;REVB=-0.0151137;RO=47;SAF=9;SAR=27;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205981;STB=0.606729;TYPE=snp;VARB=0.0415528;OID=.;OPOS=21608287;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:84:47:50:36:34:27:9:20:27:25:9:21:29 chr19 21608311 . G A 61.59 PASS AO=22;DP=64;FAO=21;FDP=63;FR=.;FRO=42;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=-0.00538871;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.7679;QD=3.91074;RBI=0.0651759;REFB=-0.000246541;REVB=0.0649527;RO=41;SAF=8;SAR=14;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.060163;STB=0.516677;TYPE=snp;VARB=0.00281591;OID=.;OPOS=21608311;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:64:63:41:42:22:21:14:8:17:24:13:8:17:25 chr19 21608319 . A C 65.52 PASS AO=22;DP=61;FAO=21;FDP=60;FR=.;FRO=39;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=-0.0924121;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=37.5082;QD=4.36771;RBI=0.0980889;REFB=0.0122296;REVB=-0.0328851;RO=39;SAF=7;SAR=15;SRF=15;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0810146;STB=0.53655;TYPE=snp;VARB=-0.0299826;OID=.;OPOS=21608319;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:61:60:39:39:22:21:15:7:15:24:14:7:15:24 chr19 21609556 . T A 52.77 PASS AO=27;DP=61;FAO=22;FDP=67;FR=.;FRO=45;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=33;FWDB=-0.0563183;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=34.1632;QD=3.15066;RBI=0.0630423;REFB=-0.00584753;REVB=-0.0283298;RO=34;SAF=7;SAR=20;SRF=10;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0434971;STB=0.541027;TYPE=snp;VARB=0.0154896;OID=.;OPOS=21609556;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:61:67:34:45:27:22:20:7:10:24:15:7:12:33 chr19 21609743 . G A 532.16 PASS AO=58;DP=60;FAO=58;FDP=60;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00738573;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.1;QD=35.4773;RBI=0.0394322;REFB=0.0079877;REVB=0.0387344;RO=1;SAF=23;SAR=35;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0132888;STB=0.513884;TYPE=snp;VARB=-7.51154e-05;OID=.;OPOS=21609743;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:60:60:1:2:58:58:35:23:0:1:35:23:0:2 chr19 21609755 . GT G 31.7 PASS AO=20;DP=60;FAO=20;FDP=58;FR=.;FRO=38;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=0.0488474;FXX=0.0333278;HRUN=3;LEN=1;MLLD=20.8673;QD=2.18649;RBI=0.0791942;REFB=-0.0342008;REVB=-0.0623349;RO=37;SAF=7;SAR=13;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0968151;STB=0.567204;TYPE=del;VARB=0.075916;OID=.;OPOS=21609756;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:20:59:20:58:38:7:13:17:21:31:37:7:13:16:21 chr19 21688602 . C G 571.5 PASS AO=47;DP=69;FAO=65;FDP=67;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0771041;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=136.233;QD=34.1192;RBI=0.0775115;REFB=-0.0966124;REVB=0.00793647;RO=0;SAF=5;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509801;TYPE=snp;VARB=0.000373419;OID=.;OPOS=21688602;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:51:67:0:2:47:65:42:5:0:0:50:15:0:2 chr19 21719401 . T C 94.63 PASS AO=24;DP=55;FAO=24;FDP=55;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.0148832;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=176.656;QD=6.88186;RBI=0.0160224;REFB=-0.00969103;REVB=-0.00593364;RO=30;SAF=9;SAR=15;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0597569;STB=0.544986;TYPE=snp;VARB=0.0134423;OID=.;OPOS=21719401;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:55:55:30:31:24:24:15:9:13:17:15:9:14:17 chr19 21720803 . C T 159.8 PASS AO=29;DP=48;FAO=29;FDP=48;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0335933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.725;QD=13.3169;RBI=0.0547388;REFB=-0.00984267;REVB=0.0432184;RO=19;SAF=9;SAR=20;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129123;STB=0.571378;TYPE=snp;VARB=0.00782457;OID=.;OPOS=21720803;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:48:48:19:19:29:29:20:9:9:10:20:9:9:10 chr19 21909948 . G A 511.74 PASS AO=64;DP=65;FAO=57;FDP=59;FR=.;FRO=2;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.043816;FXX=0.0922935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.6744;QD=34.6945;RBI=0.0510198;REFB=-0.171351;REVB=0.0261376;RO=1;SAF=39;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119581;STB=0.515146;TYPE=snp;VARB=0.0064961;OID=.;OPOS=21909948;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:65:59:1:2:64:57:25:39:1:0:25:32:2:0 chr19 22115982 . A G 40.15 PASS AO=40;DP=211;FAO=41;FDP=212;FR=.;FRO=171;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=86;FSRR=85;FWDB=0.0196375;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.7142;QD=0.757619;RBI=0.019899;REFB=-0.010603;REVB=0.00321527;RO=169;SAF=21;SAR=19;SRF=84;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0359497;STB=0.527176;TYPE=snp;VARB=0.0588663;OID=.;OPOS=22115982;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:211:212:169:171:40:41:19:21:84:85:19:22:86:85 chr19 22115990 . G A 34.9 PASS AO=38;DP=202;FAO=38;FDP=204;FR=.;FRO=166;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=85;FSRR=81;FWDB=-0.0482064;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.941;QD=0.684219;RBI=0.048933;REFB=-0.00577845;REVB=-0.00840114;RO=164;SAF=21;SAR=17;SRF=84;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0521684;STB=0.533143;TYPE=snp;VARB=0.031233;OID=.;OPOS=22115990;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:202:204:164:166:38:38:17:21:84:80:17:21:85:81 chr19 22155807 . A C 10.38 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0131962;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.324;QD=5.931;RBI=0.14586;REFB=0.00216964;REVB=0.145262;RO=5;SAF=1;SAR=1;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0967026;STB=0.57073;TYPE=snp;VARB=0.0186615;OID=.;OPOS=22155807;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:5:5:2:2:1:1:3:2:1:1:3:2 chr19 22271486 . G A 16.13 PASS AO=3;DP=6;FAO=3;FDP=6;FR=.;FRO=3;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.2241;QD=10.7543;RBI=0.0987889;REFB=-0.156031;REVB=0.0987889;RO=3;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.168668;OID=.;OPOS=22271486;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:6:6:3:3:3:3:3:0:0:3:3:0:0:3 chr19 22363189 . C T 16.08 PASS AO=3;DP=6;FAO=3;FDP=6;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.291528;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.7603;QD=10.7182;RBI=0.299995;REFB=-0.0103139;REVB=0.0707682;RO=3;SAF=2;SAR=1;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.483116;STB=0.798389;TYPE=snp;VARB=0.060184;OID=.;OPOS=22363189;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:6:6:3:3:3:3:1:2:0:3:1:2:0:3 chr19 22363493 . G A 28.42 PASS AO=10;DP=35;FAO=10;FDP=35;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=-0.0120529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9526;QD=3.24786;RBI=0.0203435;REFB=-0.0447855;REVB=-0.0163886;RO=25;SAF=7;SAR=3;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.420835;STB=0.756281;TYPE=snp;VARB=0.0891254;OID=.;OPOS=22363493;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:35:35:25:25:10:10:3:7:8:17:3:7:8:17 chr19 22363508 . G A 24.54 PASS AO=9;DP=32;FAO=9;FDP=32;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.0926868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.639;QD=3.06735;RBI=0.0942732;REFB=-0.0242902;REVB=0.0172216;RO=23;SAF=6;SAR=3;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.312079;STB=0.693457;TYPE=snp;VARB=0.185531;OID=.;OPOS=22363508;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:32:32:23:23:9:9:3:6:9:14:3:6:9:14 chr19 22363826 . G C 37.32 PASS AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.000531973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.722;QD=6.49056;RBI=0.00382315;REFB=-0.0148271;REVB=0.00378596;RO=14;SAF=1;SAR=8;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.590428;STB=0.859339;TYPE=snp;VARB=0.0415975;OID=.;OPOS=22363826;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:23:23:14:14:9:9:8:1:9:5:8:1:9:5 chr19 22575488 . C T 260.24 PASS AO=62;DP=128;FAO=62;FDP=128;FR=.;FRO=66;FSAF=49;FSAR=13;FSRF=28;FSRR=38;FWDB=-0.00653254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.096;QD=8.13243;RBI=0.0119862;REFB=-0.01446;REVB=0.0100496;RO=64;SAF=49;SAR=13;SRF=27;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.381465;STB=0.713925;TYPE=snp;VARB=0.0223191;OID=.;OPOS=22575488;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:64:66:62:62:13:49:27:37:13:49:28:38 chr19 22586192 . A G 15.21 PASS AO=13;DP=74;FAO=13;FDP=74;FR=.;FRO=61;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=26;FSRR=35;FWDB=-0.0168007;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=141.533;QD=0.821953;RBI=0.0300809;REFB=-0.00654791;REVB=0.0249519;RO=61;SAF=6;SAR=7;SRF=26;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0446227;STB=0.529367;TYPE=snp;VARB=0.0231333;OID=.;OPOS=22586192;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:74:74:61:61:13:13:7:6:26:35:7:6:26:35 chr19 22940178 . C T 16.96 PASS AO=7;DP=28;FAO=7;FDP=28;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=17;FWDB=-0.0149286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.163;QD=2.42353;RBI=0.101657;REFB=-0.0219694;REVB=-0.100555;RO=21;SAF=5;SAR=2;SRF=4;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.557869;STB=0.839971;TYPE=snp;VARB=0.115243;OID=.;OPOS=22940178;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:28:28:21:21:7:7:2:5:4:17:2:5:4:17 chr19 23328940 . G A 357.59 PASS AO=46;DP=53;FAO=46;FDP=53;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0.0214265;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=226.215;QD=26.9878;RBI=0.0291167;REFB=-0.021669;REVB=0.019715;RO=7;SAF=2;SAR=44;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0691874;STB=0.536827;TYPE=snp;VARB=0.00352944;OID=.;OPOS=23328940;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:53:53:7:7:46:46:44:2:0:7:44:2:0:7 chr19 23405457 . T G 70.52 PASS AO=11;DP=16;FAO=11;FDP=16;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0383689;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.1808;QD=17.6288;RBI=0.11767;REFB=-0.0666349;REVB=0.111239;RO=5;SAF=4;SAR=7;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134614;STB=0.576329;TYPE=snp;VARB=0.0189513;OID=.;OPOS=23405457;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:16:16:5:5:11:11:7:4:3:2:7:4:3:2 chr19 23405580 . T C 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.4299;QD=35.0861;RBI=0.0610822;REFB=0;REVB=0.0591627;RO=0;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.27427e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00511366;OID=.;OPOS=23405580;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:5:2:0:0:5:2:0:0 chr19 23406165 . T C 575.14 PASS AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00927533;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.515;QD=37.7143;RBI=0.0415423;REFB=0;REVB=0.0404936;RO=0;SAF=26;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000126706;OID=.;OPOS=23406165;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:62:61:0:0:61:61:35:26:0:0:35:26:0:0 chr19 23406801 . G C 497.85 PASS AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0583052;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=279.827;QD=37.5735;RBI=0.0594976;REFB=0;REVB=0.0118519;RO=0;SAF=6;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.55111e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000116833;OID=.;OPOS=23406801;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:53:53:0:0:53:53:47:6:0:0:47:6:0:0 chr19 23542697 . G C 50.96 PASS AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=-0.00793414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.419;QD=7.28032;RBI=0.0372892;REFB=-0.00598577;REVB=0.0364354;RO=15;SAF=6;SAR=6;SRF=12;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.290292;STB=0.642638;TYPE=snp;VARB=0.00745802;OID=.;OPOS=23542697;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:28:28:15:16:12:12:6:6:12:3:6:6:12:4 chr19 23545250 . A G 740.62 PASS AO=153;DP=274;FAO=154;FDP=275;FR=.;FRO=121;FSAF=85;FSAR=69;FSRF=55;FSRR=66;FWDB=0.00377331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.297;QD=10.7726;RBI=0.00472729;REFB=-0.0025327;REVB=-0.00284769;RO=117;SAF=85;SAR=68;SRF=55;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0685017;STB=0.542933;TYPE=snp;VARB=0.00191137;OID=.;OPOS=23545250;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:274:275:117:121:153:154:68:85:55:62:69:85:55:66 chr19 23836454 . T C 12.06 PASS AO=7;DP=30;FAO=7;FDP=30;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.00160347;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.0028;QD=1.60791;RBI=0.0677458;REFB=-0.0554199;REVB=0.0677268;RO=23;SAF=5;SAR=2;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189188;STB=0.624625;TYPE=snp;VARB=0.243007;OID=.;OPOS=23836454;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:30:30:23:23:7:7:2:5:13:10:2:5:13:10 chr19 23837365 . A C 700.3 PASS AO=73;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163995;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.9163;QD=37.8538;RBI=0.0451563;REFB=0;REVB=-0.0420731;RO=1;SAF=29;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0160305;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000265849;OID=.;OPOS=23837365;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:74:74:1:0:73:74:44:29:1:0:44:30:0:0 chr19 23869823 . T G 31.67 PASS AO=15;DP=55;FAO=14;FDP=54;FR=.;FRO=40;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=27;FWDB=-0.0683589;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.8331;QD=2.34609;RBI=0.0832278;REFB=0.0134391;REVB=-0.0474756;RO=38;SAF=10;SAR=5;SRF=12;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.397959;STB=0.723325;TYPE=snp;VARB=-0.0388901;OID=.;OPOS=23869823;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:55:54:38:40:15:14:5:10:12:26:5:9:13:27 chr19 23926708 . A G,T 71.91 PASS AO=6,2;DP=8;FAO=6,2;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=2,0;FSAR=4,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112636,-0.0101957;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=237.631,212.839;QD=35.9526;RBI=0.0124308,0.0195532;REFB=0,0;REVB=0.00525883,0.0166846;RO=0;SAF=2,0;SAR=4,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=snp,snp;VARB=0.00869929,-0.0216122;OID=.,.;OPOS=23926708,23926708;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:10:8:8:0:0:6,2:6,2:4,2:2,0:0:0:4,2:2,0:0:0 chr19 23926807 . G A 11.24 PASS AO=2;DP=9;FAO=2;FDP=8;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.00235159;FXX=0.110988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.787;QD=5.61952;RBI=0.00711854;REFB=-0.0121623;REVB=-0.0067189;RO=6;SAF=1;SAR=1;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168213;STB=0.623829;TYPE=snp;VARB=0.0396658;OID=.;OPOS=23926807;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:9:8:6:6:2:2:1:1:4:2:1:1:4:2 chr19 23927468 . A G 604.61 PASS AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000246426;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.317;QD=37.7883;RBI=0.0104084;REFB=0;REVB=0.0104054;RO=0;SAF=39;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30166e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.28949e-05;OID=.;OPOS=23927468;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:64:64:0:0:64:64:25:39:0:0:25:39:0:0 chr19 23928102 . C G 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.080096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0922;QD=33.0218;RBI=0.0888482;REFB=0;REVB=0.038453;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0148318;OID=.;OPOS=23928102;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:2:4:0:0:2:4:0:0 chr19 24115772 . G GA,A 43.24 PASS AO=5,3;DP=17;FAO=9,0;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=7,0;FSAR=2,0;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.197114,-0.0154006;FXX=0;HRUN=0,1;LEN=1,1;MLLD=21.9323,56.458;QD=10.1741;RBI=0.215748,0.0268077;REFB=-0.132996,0.00909324;REVB=0.0877129,-0.0219426;RO=9;SAF=4,2;SAR=1,1;SRF=6;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.177426,0;STB=0.592997,0.5;TYPE=ins,snp;VARB=0.152396,0;OID=.,.;OPOS=24115773,24115772;OREF=-,G;OALT=A,A;OMAPALT=GA,A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:17:17:9:8:5,3:9,0:1,1:4,2:6:3:2,0:7,0:5:3 chr19 24115891 . T C 11.65 PASS AO=4;DP=13;FAO=3;FDP=13;FR=.,HEALED;FRO=10;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.173663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.889;QD=3.58465;RBI=0.174258;REFB=-0.00821881;REVB=0.0143889;RO=7;SAF=2;SAR=2;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0699385;STB=0.69871;TYPE=snp;VARB=0.013178;OID=.;OPOS=24115891;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:13:13:7:10:4:3:2:2:3:4:2:1:6:4 chr19 24184261 . C T 330.54 PASS AO=87;DP=192;FAO=87;FDP=193;FR=.;FRO=106;FSAF=38;FSAR=49;FSRF=48;FSRR=58;FWDB=0.0238125;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.173;QD=6.85059;RBI=0.0332592;REFB=-0.0118257;REVB=0.0232193;RO=104;SAF=38;SAR=49;SRF=47;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0150726;STB=0.508935;TYPE=snp;VARB=0.0175774;OID=.;OPOS=24184261;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:193:104:106:87:87:49:38:47:57:49:38:48:58 chr19 29724209 . A G 1827 PASS AO=191;DP=191;FAO=191;FDP=191;FR=.;FRO=0;FSAF=102;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0158758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9;QD=38.2617;RBI=0.0269199;REFB=0;REVB=-0.0217403;RO=0;SAF=102;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000111596;OID=.;OPOS=29724209;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:191:191:0:0:191:191:89:102:0:0:89:102:0:0 chr19 30166185 . AG A 176.46 PASS AO=26;DP=43;FAO=44;FDP=49;FR=.;FRO=5;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.378588;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=9.6622;QD=14.405;RBI=0.387261;REFB=0.000535744;REVB=-0.0814993;RO=17;SAF=2;SAR=24;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0.221264;SSSB=-0.597385;STB=0.54384;TYPE=del;VARB=0.0359236;OID=.;OPOS=30166186;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:26:43:44:49:5:18:26:0:5:5:17:2:24:11:6 chr19 30193721 . G A 565.36 PASS AO=100;DP=155;FAO=100;FDP=155;FR=.;FRO=55;FSAF=51;FSAR=49;FSRF=23;FSRR=32;FWDB=0.0294218;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.272;QD=14.5899;RBI=0.0311361;REFB=-0.0478308;REVB=0.0101889;RO=55;SAF=51;SAR=49;SRF=23;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.06037;STB=0.532545;TYPE=snp;VARB=0.0304907;OID=.;OPOS=30193721;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:55:55:100:100:49:51:23:32:49:51:23:32 chr19 30314666 . C T 802.56 PASS AO=83;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0866082;FXX=0.0444395;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.067;QD=37.3284;RBI=0.089242;REFB=0;REVB=0.0215209;RO=0;SAF=35;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.10069e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00155826;OID=.;OPOS=30314666;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:86:86:0:0:83:86:48:35:0:0:50:36:0:0 chr19 30414572 . C G 325.11 PASS AO=85;DP=189;FAO=85;FDP=189;FR=.;FRO=104;FSAF=49;FSAR=36;FSRF=65;FSRR=39;FWDB=0.0221543;FXX=0.00526288;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.753;QD=6.88064;RBI=0.0241418;REFB=-0.023679;REVB=-0.00959246;RO=103;SAF=49;SAR=36;SRF=65;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0557735;STB=0.527568;TYPE=snp;VARB=0.0240029;OID=.;OPOS=30414572;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:189:103:104:85:85:36:49:65:38:36:49:65:39 chr19 30414587 . G T 367.27 PASS AO=95;DP=204;FAO=94;FDP=203;FR=.;FRO=109;FSAF=53;FSAR=41;FSRF=66;FSRR=43;FWDB=-0.022029;FXX=0.00490172;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0726;QD=7.23682;RBI=0.0220574;REFB=-0.0145792;REVB=-0.00111821;RO=107;SAF=53;SAR=42;SRF=65;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0485106;STB=0.522876;TYPE=snp;VARB=0.0162207;OID=.;OPOS=30414587;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:203:107:109:95:94:42:53:65:42:41:53:66:43 chr19 30500118 . GTGA G 487.55 PASS AO=93;DP=286;FAO=122;FDP=251;FR=.;FRO=129;FSAF=61;FSAR=61;FSRF=57;FSRR=72;FWDB=-0.0467686;FXX=0.0599228;HRUN=1;LEN=3;MLLD=107.126;QD=7.76976;RBI=0.0564974;REFB=-0.0384361;REVB=-0.0316963;RO=106;SAF=45;SAR=48;SRF=43;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0756817;STB=0.529876;TYPE=del;VARB=0.0441826;OID=.;OPOS=30500119;OREF=TGA;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:93:251:122:251:129:61:61:57:72:99:106:45:48:43:63 chr19 31038995 . T C 101.73 PASS AO=24;DP=52;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=24;FWDB=-0.028987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.115;QD=7.82518;RBI=0.0605379;REFB=-0.023709;REVB=-0.0531468;RO=27;SAF=15;SAR=9;SRF=4;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.42603;STB=0.743067;TYPE=snp;VARB=0.0357811;OID=.;OPOS=31038995;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:27:28:24:24:9:15:4:23:9:15:4:24 chr19 31769763 . G A 303.2 PASS AO=62;DP=108;FAO=60;FDP=105;FR=.;FRO=45;FSAF=50;FSAR=10;FSRF=39;FSRR=6;FWDB=-0.00724524;FXX=0.0277752;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.02;QD=11.5506;RBI=0.0283747;REFB=0.00927409;REVB=0.0274341;RO=46;SAF=52;SAR=10;SRF=39;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0132794;STB=0.526619;TYPE=snp;VARB=-0.0064319;OID=.;OPOS=31769763;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:105:46:45:62:60:10:52:39:7:10:50:39:6 chr19 31770009 . C T 155.47 PASS AO=31;DP=57;FAO=31;FDP=56;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.0290333;FXX=0.0175408;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.381;QD=11.1047;RBI=0.0348071;REFB=-0.0321542;REVB=-0.019199;RO=25;SAF=16;SAR=15;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0612944;STB=0.533925;TYPE=snp;VARB=0.0241813;OID=.;OPOS=31770009;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:57:56:25:25:31:31:15:16:11:14:15:16:11:14 chr19 32083696 . T C 1313.44 PASS AO=137;DP=137;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.015833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.038;QD=38.3486;RBI=0.0211232;REFB=0;REVB=0.0139823;RO=0;SAF=66;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.49328e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.01018e-05;OID=.;OPOS=32083696;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:137:137:0:0:137:137:71:66:0:0:71:66:0:0 chr19 32844471 . C T 503.38 PASS AO=112;DP=216;FAO=112;FDP=214;FR=.;FRO=102;FSAF=56;FSAR=56;FSRF=42;FSRR=60;FWDB=-0.00176139;FXX=0.00925883;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.806;QD=9.40892;RBI=0.00176487;REFB=-0.0105294;REVB=0.000110778;RO=101;SAF=56;SAR=56;SRF=42;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0730103;STB=0.542049;TYPE=snp;VARB=0.0113302;OID=.;OPOS=32844471;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:216:214:101:102:112:112:56:56:42:59:56:56:42:60 chr19 32873698 . A G 1151.44 PASS AO=107;DP=108;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162016;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.571;QD=38.0642;RBI=0.0351347;REFB=0;REVB=0.0311762;RO=0;SAF=61;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.73491e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.58353e-05;OID=.;OPOS=32873698;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:108:121:0:0:107:121:46:61:0:0:54:67:0:0 chr19 32930069 . G A 1150.5 PASS AO=122;DP=124;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00709584;FXX=0.0159987;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.281;QD=37.4146;RBI=0.00913039;REFB=-0.0904016;REVB=-0.0057457;RO=1;SAF=76;SAR=46;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0102151;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000443658;OID=.;OPOS=32930069;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:124:123:1:0:122:123:46:76:0:1:46:77:0:0 chr19 33096786 . G A 128.06 PASS AO=29;DP=60;FAO=29;FDP=60;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.00494479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.687;QD=8.53713;RBI=0.0264579;REFB=-0.0160184;REVB=0.0259917;RO=30;SAF=15;SAR=14;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0156619;STB=0.517229;TYPE=snp;VARB=0.0138465;OID=.;OPOS=33096786;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:30:31:29:29:14:15:15:15:14:15:15:16 chr19 33096816 . C T 170.48 PASS AO=38;DP=75;FAO=38;FDP=75;FR=.;FRO=37;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=0.00315809;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5962;QD=9.09221;RBI=0.0192709;REFB=0.0134177;REVB=0.0190103;RO=33;SAF=16;SAR=22;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0544298;STB=0.519303;TYPE=snp;VARB=-0.0132616;OID=.;OPOS=33096816;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:33:37:38:38:22:16:16:17:22:16:17:20 chr19 33098632 . G C 36.32 PASS AO=8;DP=19;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.0540389;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=211.091;QD=7.64589;RBI=0.0667873;REFB=-0.00718778;REVB=-0.0392472;RO=11;SAF=2;SAR=6;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224141;STB=0.635998;TYPE=snp;VARB=0.0077114;OID=.;OPOS=33098632;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:19:19:11:11:8:8:6:2:5:6:6:2:5:6 chr19 33099277 . T C 537.17 PASS AO=56;DP=58;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153766;FXX=0.0344768;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.7259;QD=38.3692;RBI=0.0273359;REFB=0;REVB=0.0226011;RO=0;SAF=32;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000865793;OID=.;OPOS=33099277;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:58:56:0:0:56:56:24:32:0:0:24:32:0:0 chr19 33099305 . T C 673.17 PASS AO=71;DP=73;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000759238;FXX=0.0273935;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.877;QD=37.9253;RBI=0.0119784;REFB=0;REVB=0.0119543;RO=0;SAF=34;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.12261e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.07541e-05;OID=.;OPOS=33099305;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:73:71:0:0:71:71:37:34:0:0:37:34:0:0 chr19 33099336 . A G 837.78 PASS AO=87;DP=89;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00508153;FXX=0.0224694;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.983;QD=38.5184;RBI=0.0654694;REFB=0;REVB=-0.0652719;RO=0;SAF=40;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000248842;OID=.;OPOS=33099336;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:89:87:0:0:87:87:47:40:0:0:47:40:0:0 chr19 33106621 . C T 524.78 PASS AO=61;DP=65;FAO=61;FDP=65;FR=.;FRO=4;FSAF=43;FSAR=18;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.048552;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.58;QD=32.2939;RBI=0.0487847;REFB=-0.0696347;REVB=0.00475924;RO=4;SAF=43;SAR=18;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0419131;STB=0.522215;TYPE=snp;VARB=0.00565501;OID=.;OPOS=33106621;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:65:65:4:4:61:61:18:43:4:0:18:43:4:0 chr19 33110204 . T C 23.92 PASS AO=10;DP=40;FAO=10;FDP=40;FR=.;FRO=30;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.0382098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.2994;QD=2.39153;RBI=0.0387533;REFB=-0.0170421;REVB=0.00646758;RO=26;SAF=5;SAR=5;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0896548;STB=0.52495;TYPE=snp;VARB=0.0677111;OID=.;OPOS=33110204;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:40:40:26:30:10:10:5:5:15:11:5:5:16:14 chr19 33117666 . T C 823.43 PASS AO=59;DP=91;FAO=85;FDP=86;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=41;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0209579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.78;QD=38.2991;RBI=0.104832;REFB=0;REVB=0.102715;RO=0;SAF=39;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000918636;OID=.;OPOS=33117666;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:85:86:0:0:59:85:20:39:0:0:44:41:0:0 chr19 33146154 . G C 60.72 PASS AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=-0.0136602;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.824;QD=8.99556;RBI=0.0163005;REFB=-0.043199;REVB=-0.00889424;RO=14;SAF=10;SAR=3;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0211741;STB=0.512177;TYPE=snp;VARB=0.0465946;OID=.;OPOS=33146154;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:27:27:14:14:13:13:3:10:11:3:3:10:11:3 chr19 33167879 . G A 384.98 PASS AO=42;DP=43;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0144641;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.193;QD=34.9977;RBI=0.0902394;REFB=-0.0508497;REVB=0.0890727;RO=0;SAF=37;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43317e-08;STB=0.538443;TYPE=snp;VARB=0.000602093;OID=.;OPOS=33167879;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:43:44:0:1:42:43:5:37:0:0:6:37:0:1 chr19 33168036 . G GT 56.7 PASS AO=40;DP=127;FAO=43;FDP=121;FR=.;FRO=78;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=52;FSRR=26;FWDB=0.101009;FXX=0.0396794;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.3343;QD=1.8743;RBI=0.191341;REFB=-0.0469485;REVB=0.162507;RO=78;SAF=19;SAR=21;SRF=51;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204111;STB=0.614333;TYPE=ins;VARB=0.09327;OID=.;OPOS=33168037;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:40:127:43:121:78:21:22:52:26:56:78:19:21:51:27 chr19 33168059 . G A 189 PASS AO=54;DP=130;FAO=54;FDP=131;FR=.;FRO=77;FSAF=31;FSAR=23;FSRF=44;FSRR=33;FWDB=0.0133534;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.3774;QD=5.771;RBI=0.054913;REFB=0.00951392;REVB=0.0532647;RO=76;SAF=31;SAR=23;SRF=44;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00518578;STB=0.501589;TYPE=snp;VARB=-0.0138319;OID=.;OPOS=33168059;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:131:76:77:54:54:23:31:44:32:23:31:44:33 chr19 33168412 . C T 1883.91 PASS AO=195;DP=198;FAO=198;FDP=198;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=117;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0558248;FXX=0.0099995;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.167;QD=38.0588;RBI=0.0566922;REFB=-0.0286532;REVB=0.0098787;RO=1;SAF=79;SAR=116;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00599013;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.414e-05;OID=.;OPOS=33168412;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:198:198:1:0:195:198:116:79:1:0:117:81:0:0 chr19 33168605 . G A 249.57 PASS AO=65;DP=149;FAO=67;FDP=152;FR=.;FRO=85;FSAF=30;FSAR=37;FSRF=48;FSRR=37;FWDB=-0.0380391;FXX=0.00653552;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.446;QD=6.56761;RBI=0.0390758;REFB=-0.012073;REVB=0.00894123;RO=84;SAF=31;SAR=34;SRF=48;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0952147;STB=0.565198;TYPE=snp;VARB=0.0203293;OID=.;OPOS=33168605;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:152:84:85:65:67:34:31:48:36:37:30:48:37 chr19 33168627 . G A 256.83 PASS AO=60;DP=129;FAO=63;FDP=133;FR=.;FRO=70;FSAF=29;FSAR=34;FSRF=38;FSRR=32;FWDB=-0.0157185;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.396;QD=7.72425;RBI=0.0187002;REFB=-0.0198957;REVB=-0.0101304;RO=67;SAF=29;SAR=31;SRF=37;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0654435;STB=0.543402;TYPE=snp;VARB=0.0241656;OID=.;OPOS=33168627;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:133:67:70:60:63:31:29:37:30:34:29:38:32 chr19 33168829 . T C 244.14 PASS AO=64;DP=144;FAO=64;FDP=143;FR=.;FRO=79;FSAF=44;FSAR=20;FSRF=58;FSRR=21;FWDB=0.02499;FXX=0.00694396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.1962;QD=6.82899;RBI=0.025792;REFB=-0.0216727;REVB=0.00638177;RO=77;SAF=44;SAR=20;SRF=57;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0619929;STB=0.530688;TYPE=snp;VARB=0.0292867;OID=.;OPOS=33168829;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:143:77:79:64:64:20:44:57:20:20:44:58:21 chr19 33169003 . A C 680.03 PASS AO=71;DP=71;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.046;QD=37.7792;RBI=0.0515476;REFB=0;REVB=0.0480703;RO=0;SAF=58;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.49716e-05;OID=.;OPOS=33169003;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:71:72:0:0:71:72:13:58:0:0:14:58:0:0 chr19 33169097 . G T 327.46 PASS AO=87;DP=192;FAO=87;FDP=194;FR=.;FRO=107;FSAF=46;FSAR=41;FSRF=44;FSRR=63;FWDB=0.00405288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.152;QD=6.75184;RBI=0.00678886;REFB=-0.0320276;REVB=0.00544635;RO=105;SAF=46;SAR=41;SRF=44;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107802;STB=0.564536;TYPE=snp;VARB=0.0248332;OID=.;OPOS=33169097;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:194:105:107:87:87:41:46:44:61:41:46:44:63 chr19 33169103 . C T 350.73 PASS AO=91;DP=200;FAO=91;FDP=200;FR=.;FRO=109;FSAF=49;FSAR=42;FSRF=46;FSRR=63;FWDB=0.00134708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1958;QD=7.01461;RBI=0.0271906;REFB=-0.03337;REVB=-0.0271572;RO=107;SAF=49;SAR=42;SRF=46;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105621;STB=0.563205;TYPE=snp;VARB=0.0258844;OID=.;OPOS=33169103;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:200:200:107:109:91:91:42:49:46:61:42:49:46:63 chr19 33239450 . C G 100.42 PASS AO=30;DP=78;FAO=30;FDP=78;FR=.;FRO=48;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=4;FSRR=44;FWDB=-0.0174276;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.825;QD=5.14973;RBI=0.0380826;REFB=-0.020033;REVB=-0.033861;RO=47;SAF=10;SAR=20;SRF=4;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.346988;STB=0.695554;TYPE=snp;VARB=0.0324513;OID=.;OPOS=33239450;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:47:48:30:30:20:10:4:43:20:10:4:44 chr19 33281924 . A G 364.35 PASS AO=87;DP=178;FAO=87;FDP=178;FR=.;FRO=91;FSAF=57;FSAR=30;FSRF=45;FSRR=46;FWDB=-0.00323304;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9889;QD=8.18773;RBI=0.021402;REFB=0.00742856;REVB=0.0211564;RO=90;SAF=57;SAR=30;SRF=44;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160132;STB=0.586019;TYPE=snp;VARB=-0.00853684;OID=.;OPOS=33281924;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:178:90:91:87:87:30:57:44:46:30:57:45:46 chr19 33372814 . G A 262.17 PASS AO=54;DP=104;FAO=56;FDP=104;FR=.;FRO=48;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=15;FSRR=33;FWDB=0.0422345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.939;QD=10.0836;RBI=0.0427173;REFB=-0.0182394;REVB=0.00640436;RO=50;SAF=25;SAR=29;SRF=15;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145084;STB=0.563358;TYPE=snp;VARB=0.00898353;OID=.;OPOS=33372814;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:50:48:54:56:29:25:15:35:31:25:15:33 chr19 33372885 . TC T 398.41 PASS AO=62;DP=98;FAO=85;FDP=91;FR=.;FRO=6;FSAF=22;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.178593;FXX=0.0215031;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.3466;QD=17.5125;RBI=0.214623;REFB=-0.00157871;REVB=-0.119028;RO=13;SAF=11;SAR=51;SRF=6;SRR=7;SSEN=0.303571;SSEP=0;SSSB=-0.141721;STB=0.522722;TYPE=del;VARB=0.0255035;OID=.;OPOS=33372886;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:62:90:85:91:6:22:63:0:6:15:13:11:51:6:7 chr19 33390796 . G A 2324.35 PASS AO=238;DP=242;FAO=242;FDP=242;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=138;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0109943;FXX=0.0656345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9048;QD=38.419;RBI=0.033307;REFB=0;REVB=-0.0314402;RO=0;SAF=103;SAR=135;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.04959e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00692295;OID=.;OPOS=33390796;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:242:242:0:0:238:242:135:103:0:0:138:104:0:0 chr19 33414420 . A G 295.85 PASS AO=75;DP=175;FAO=79;FDP=178;FR=.;FRO=99;FSAF=37;FSAR=42;FSRF=42;FSRR=57;FWDB=0.0525422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.536;QD=6.64839;RBI=0.0533558;REFB=-0.00405215;REVB=-0.00928257;RO=99;SAF=34;SAR=41;SRF=42;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0300204;STB=0.524704;TYPE=snp;VARB=0.005434;OID=.;OPOS=33414420;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:178:99:99:75:79:41:34:42:57:42:37:42:57 chr19 33430816 . T G 924.66 PASS AO=203;DP=397;FAO=205;FDP=387;FR=.;FRO=182;FSAF=50;FSAR=155;FSRF=56;FSRR=126;FWDB=-0.0153439;FXX=0.0276375;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.5995;QD=9.55718;RBI=0.0153524;REFB=-0.0232406;REVB=-0.000509889;RO=174;SAF=48;SAR=155;SRF=53;SRR=121;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0762703;STB=0.539038;TYPE=snp;VARB=0.021377;OID=.;OPOS=33430816;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:397:387:174:182:203:205:155:48:53:121:155:50:56:126 chr19 33444707 . C T 209.48 PASS AO=50;DP=106;FAO=50;FDP=106;FR=.,HEALED;FRO=56;FSAF=19;FSAR=31;FSRF=9;FSRR=47;FWDB=-0.0324014;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.715;QD=7.90485;RBI=0.0366276;REFB=-0.0326992;REVB=-0.0170801;RO=30;SAF=19;SAR=31;SRF=7;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110664;STB=0.630592;TYPE=snp;VARB=0.0277665;OID=.;OPOS=33444707;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:106:30:56:50:50:31:19:7:23:31:19:9:47 chr19 33467357 . G A 284.25 PASS AO=83;DP=226;FAO=91;FDP=234;FR=.;FRO=143;FSAF=43;FSAR=48;FSRF=72;FSRR=71;FWDB=0.00745466;FXX=0.00425514;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.313;QD=4.85892;RBI=0.0239372;REFB=0.00416592;REVB=0.0227468;RO=134;SAF=36;SAR=47;SRF=65;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.056666;STB=0.518939;TYPE=snp;VARB=-0.00639069;OID=.;OPOS=33467357;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:226:234:134:143:83:91:47:36:65:69:48:43:72:71 chr19 33470806 . G C 305.9 PASS AO=72;DP=146;FAO=72;FDP=146;FR=.;FRO=74;FSAF=53;FSAR=19;FSRF=43;FSRR=31;FWDB=-0.00507253;FXX=0.00680226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.177;QD=8.38074;RBI=0.00953419;REFB=-0.0248218;REVB=0.0080728;RO=72;SAF=53;SAR=19;SRF=42;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162363;STB=0.592284;TYPE=snp;VARB=0.0239433;OID=.;OPOS=33470806;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:72:74:72:72:19:53:42:30:19:53:43:31 chr19 33470874 . A G 333.25 PASS AO=83;DP=193;FAO=89;FDP=199;FR=.;FRO=110;FSAF=68;FSAR=21;FSRF=76;FSRR=34;FWDB=0.00594253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.613;QD=6.69839;RBI=0.00904207;REFB=-0.0134423;REVB=-0.00681509;RO=95;SAF=64;SAR=19;SRF=61;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158161;STB=0.552915;TYPE=snp;VARB=0.0154081;OID=.;OPOS=33470874;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:199:95:110:83:89:19:64:61:34:21:68:76:34 chr19 33498978 . A G 168.24 PASS AO=38;DP=76;FAO=38;FDP=76;FR=.;FRO=38;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=-0.00739574;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.545;QD=8.85473;RBI=0.011929;REFB=-0.00663595;REVB=-0.00935974;RO=37;SAF=20;SAR=18;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0368319;STB=0.513206;TYPE=snp;VARB=0.00761692;OID=.;OPOS=33498978;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:37:38:38:38:18:20:21:16:18:20:21:17 chr19 33517515 . C T 322.26 PASS AO=66;DP=118;FAO=66;FDP=119;FR=.;FRO=53;FSAF=24;FSAR=42;FSRF=14;FSRR=39;FWDB=-0.0214602;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=157.095;QD=10.8324;RBI=0.0242322;REFB=0.00214691;REVB=0.0112543;RO=52;SAF=24;SAR=42;SRF=14;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0845004;STB=0.549138;TYPE=snp;VARB=-0.00143918;OID=.;OPOS=33517515;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:119:52:53:66:66:42:24:14:38:42:24:14:39 chr19 33579128 . T C 1644.91 PASS AO=175;DP=177;FAO=175;FDP=175;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00625079;FXX=0.0112988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.4292;QD=37.5978;RBI=0.0501271;REFB=-0.0906653;REVB=0.0497358;RO=0;SAF=74;SAR=101;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00114708;OID=.;OPOS=33579128;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:177:175:0:0:175:175:101:74:0:0:101:74:0:0 chr19 33586739 . G C 1158.38 PASS AO=120;DP=120;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0131835;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.8223;QD=38.6128;RBI=0.0133712;REFB=0;REVB=-0.00223226;RO=0;SAF=40;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000103256;OID=.;OPOS=33586739;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:120:120:0:0:120:120:80:40:0:0:80:40:0:0 chr19 33600764 . T C 886.67 PASS AO=88;DP=89;FAO=95;FDP=96;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0335386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.409;QD=36.9445;RBI=0.0391277;REFB=-0.0606719;REVB=0.020153;RO=1;SAF=50;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0123069;STB=0.506328;TYPE=snp;VARB=0.000441049;OID=.;OPOS=33600764;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:89:96:1:1:88:95:38:50:0:1:39:56:0:1 chr19 33602757 . C T 368.98 PASS AO=76;DP=142;FAO=79;FDP=147;FR=.;FRO=68;FSAF=36;FSAR=43;FSRF=28;FSRR=40;FWDB=0.0569693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.747;QD=10.0403;RBI=0.0617823;REFB=-0.0303749;REVB=-0.0239073;RO=66;SAF=33;SAR=43;SRF=26;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0349634;STB=0.520552;TYPE=snp;VARB=0.0274488;OID=.;OPOS=33602757;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:147:66:68:76:79:43:33:26:40:43:36:28:40 chr19 33605300 . A G 658.92 PASS AO=71;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.103868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.99;QD=36.6065;RBI=0.104008;REFB=-0.0483962;REVB=0.00540064;RO=1;SAF=39;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119714;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00181576;OID=.;OPOS=33605300;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:72:72:1:0:71:72:32:39:1:0:32:40:0:0 chr19 33605312 . T C 615.95 PASS AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0451756;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.625;QD=37.9047;RBI=0.0620486;REFB=0;REVB=-0.0425345;RO=0;SAF=38;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.04073e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000561347;OID=.;OPOS=33605312;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:65:65:0:0:65:65:27:38:0:0:27:38:0:0 chr19 33608733 . C A 122.47 PASS AO=45;DP=134;FAO=45;FDP=133;FR=.;FRO=88;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=34;FSRR=54;FWDB=0.00550627;FXX=0.00746213;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.712;QD=3.68331;RBI=0.00565975;REFB=-0.0100856;REVB=-0.0013091;RO=86;SAF=22;SAR=23;SRF=33;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120807;STB=0.568046;TYPE=snp;VARB=0.0236184;OID=.;OPOS=33608733;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:133:86:88:45:45:23:22:33:53:23:22:34:54 chr19 33617583 . C T 215.82 PASS AO=44;DP=81;FAO=44;FDP=80;FR=.;FRO=36;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=29;FSRR=7;FWDB=0.00821608;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.1189;QD=10.7908;RBI=0.0257682;REFB=0.000931326;REVB=-0.0244233;RO=36;SAF=26;SAR=18;SRF=29;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18965;STB=0.603615;TYPE=snp;VARB=-0.00246544;OID=.;OPOS=33617583;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:80:36:36:44:44:18:26:29:7:18:26:29:7 chr19 33635761 . C T 122.2 PASS AO=46;DP=140;FAO=46;FDP=140;FR=.;FRO=94;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=32;FSRR=62;FWDB=0.00197647;FXX=0.0070917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.161;QD=3.49128;RBI=0.0126941;REFB=-0.00706451;REVB=-0.0125392;RO=90;SAF=20;SAR=26;SRF=32;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0942128;STB=0.565525;TYPE=snp;VARB=0.0174874;OID=.;OPOS=33635761;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:90:94:46:46:26:20:32:58:26:20:32:62 chr19 33638539 . T A 84.74 PASS AO=28;DP=81;FAO=28;FDP=80;FR=.;FRO=52;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=-0.0311657;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.327;QD=4.23689;RBI=0.0393482;REFB=-0.000954232;REVB=-0.0240204;RO=52;SAF=12;SAR=16;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0591542;STB=0.534271;TYPE=snp;VARB=0.000311554;OID=.;OPOS=33638539;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:81:80:52:52:28:28:16:12:25:27:16:12:25:27 chr19 33647379 . T C 115.2 PASS AO=35;DP=97;FAO=37;FDP=98;FR=.;FRO=61;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=20;FSRR=41;FWDB=0.0257418;FXX=0.019998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.094;QD=4.70186;RBI=0.0317419;REFB=-0.00985368;REVB=0.0185717;RO=59;SAF=11;SAR=24;SRF=18;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0117656;STB=0.51618;TYPE=snp;VARB=0.0176346;OID=.;OPOS=33647379;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:98:59:61:35:37:24:11:18:41:24:13:20:41 chr19 33668046 . G A 213.99 PASS AO=44;DP=81;FAO=44;FDP=81;FR=.;FRO=37;FSAF=14;FSAR=30;FSRF=8;FSRR=29;FWDB=0.0360666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.324;QD=10.5673;RBI=0.0377099;REFB=-0.00492523;REVB=0.0110106;RO=37;SAF=14;SAR=30;SRF=8;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101846;STB=0.555831;TYPE=snp;VARB=0.00492542;OID=.;OPOS=33668046;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:37:37:44:44:30:14:8:29:30:14:8:29 chr19 33696708 . T C 16.08 PASS AO=3;DP=6;FAO=3;FDP=6;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0334664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.015;QD=10.7183;RBI=0.0334664;REFB=-0.0567013;REVB=0;RO=3;SAF=3;SAR=0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0174284;OID=.;OPOS=33696708;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:6:6:3:3:3:3:0:3:3:0:0:3:3:0 chr19 33696897 . C T 80.4 PASS AO=14;DP=31;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=0.0927589;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.6798;QD=9.45833;RBI=0.115829;REFB=-0.0409829;REVB=-0.0693701;RO=17;SAF=2;SAR=12;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.601854;STB=0.729467;TYPE=snp;VARB=0.0397906;OID=.;OPOS=33696897;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:31:34:17:17:14:17:12:2:13:4:12:5:13:4 chr19 33698291 . T C 65.73 PASS AO=10;DP=15;FAO=10;FDP=14;FR=.;FRO=4;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0369113;FXX=0.0666222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.978;QD=18.7808;RBI=0.055935;REFB=0.0122197;REVB=-0.0420272;RO=4;SAF=6;SAR=4;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0516928;STB=0.529352;TYPE=snp;VARB=-0.00699041;OID=.;OPOS=33698291;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:15:14:4:4:10:10:4:6:2:2:4:6:2:2 chr19 33702245 . A G 78.35 PASS AO=20;DP=46;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=21;FWDB=0.0358927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.5716;QD=6.66851;RBI=0.0454656;REFB=-0.0151051;REVB=-0.0279076;RO=26;SAF=5;SAR=15;SRF=6;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0257527;STB=0.521718;TYPE=snp;VARB=0.0201866;OID=.;OPOS=33702245;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:46:47:26:27:20:20:15:5:6:20:15:5:6:21 chr19 33791127 . G A 26.7 PASS AO=7;DP=21;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=14;FWDB=0.0647477;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.23;QD=5.08659;RBI=0.0669942;REFB=-0.00550556;REVB=0.0172034;RO=14;SAF=1;SAR=6;SRF=0;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.478341;STB=0.768827;TYPE=snp;VARB=0.00988368;OID=.;OPOS=33791127;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:21:21:14:14:7:7:6:1:0:14:6:1:0:14 chr19 33870906 . T C 221.88 PASS AO=57;DP=129;FAO=57;FDP=127;FR=.;FRO=70;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=39;FSRR=31;FWDB=-0.0458097;FXX=0.0230751;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.3385;QD=6.98835;RBI=0.0478005;REFB=0.00266253;REVB=0.0136512;RO=70;SAF=30;SAR=27;SRF=40;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0448439;STB=0.517063;TYPE=snp;VARB=-0.00158276;OID=.;OPOS=33870906;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:127:70:70:57:57:27:30:40:30:27:30:39:31 chr19 33872125 . T G 221.02 PASS AO=61;DP=142;FAO=61;FDP=142;FR=.;FRO=81;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=26;FSRR=55;FWDB=0.0147365;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=249.299;QD=6.226;RBI=0.0148882;REFB=-0.00374246;REVB=-0.00212008;RO=76;SAF=29;SAR=32;SRF=26;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134298;STB=0.589045;TYPE=snp;VARB=0.00524955;OID=.;OPOS=33872125;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:76:81:61:61:32:29:26:50:32:29:26:55 chr19 33872150 . G C 274.82 PASS AO=70;DP=155;FAO=71;FDP=156;FR=.;FRO=85;FSAF=31;FSAR=40;FSRF=27;FSRR=58;FWDB=0.0185473;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.9261;QD=7.04672;RBI=0.0185476;REFB=-0.0122108;REVB=9.91754e-05;RO=85;SAF=31;SAR=39;SRF=27;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127574;STB=0.566984;TYPE=snp;VARB=0.0179566;OID=.;OPOS=33872150;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:156:85:85:70:71:39:31:27:58:40:31:27:58 chr19 33873435 . T G 625.9 PASS AO=148;DP=306;FAO=151;FDP=308;FR=.;FRO=157;FSAF=78;FSAR=73;FSRF=67;FSRR=90;FWDB=0.0664828;FXX=0.00323614;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.4494;QD=8.12855;RBI=0.0693194;REFB=-0.0332172;REVB=-0.0196269;RO=154;SAF=75;SAR=73;SRF=65;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0785984;STB=0.545683;TYPE=snp;VARB=0.0327253;OID=.;OPOS=33873435;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:306:308:154:157:148:151:73:75:65:89:73:78:67:90 chr19 34264354 . G A 256.58 PASS AO=50;DP=85;FAO=50;FDP=86;FR=.;FRO=36;FSAF=31;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=24;FWDB=-0.00713815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.512;QD=11.9338;RBI=0.0164064;REFB=-0.0216213;REVB=0.0147722;RO=33;SAF=31;SAR=19;SRF=10;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230285;STB=0.619952;TYPE=snp;VARB=0.0136715;OID=.;OPOS=34264354;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:86:33:36:50:50:19:31:10:23:19:31:12:24 chr19 34583700 . C T 377.35 PASS AO=100;DP=226;FAO=102;FDP=228;FR=.;FRO=126;FSAF=42;FSAR=60;FSRF=61;FSRR=65;FWDB=0.0246995;FXX=0.0129865;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.818;QD=6.62013;RBI=0.0266722;REFB=-0.0139875;REVB=0.0100667;RO=124;SAF=43;SAR=57;SRF=59;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0462452;STB=0.540674;TYPE=snp;VARB=0.0115428;OID=.;OPOS=34583700;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:226:228:124:126:100:102:57:43:59:65:60:42:61:65 chr19 34583716 . T G 394.73 PASS AO=97;DP=225;FAO=104;FDP=226;FR=.;FRO=122;FSAF=43;FSAR=61;FSRF=61;FSRR=61;FWDB=0.123847;FXX=0.0173905;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6504;QD=6.98641;RBI=0.124167;REFB=-0.00439963;REVB=-0.00890546;RO=122;SAF=34;SAR=63;SRF=62;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163801;STB=0.547359;TYPE=snp;VARB=0.00618624;OID=.;OPOS=34583716;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:225:226:122:122:97:104:63:34:62:60:61:43:61:61 chr19 34842488 . T C 121.49 PASS AO=43;DP=124;FAO=43;FDP=124;FR=.;FRO=81;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=26;FSRR=55;FWDB=-0.0232936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.129;QD=3.91906;RBI=0.0409324;REFB=0.00300655;REVB=-0.0336581;RO=81;SAF=24;SAR=19;SRF=26;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.265512;STB=0.651438;TYPE=snp;VARB=-0.00362192;OID=.;OPOS=34842488;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:81:81:43:43:19:24:26:55:19:24:26:55 chr19 34843761 . C A 16.08 PASS AO=3;DP=6;FAO=3;FDP=6;FR=.;FRO=3;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=177.915;QD=10.7182;RBI=0.0308076;REFB=0.0172826;REVB=0.0308076;RO=3;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0154063;OID=.;OPOS=34843761;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:6:6:3:3:3:3:3:0:0:3:3:0:0:3 chr19 34872382 . G A 347.42 PASS AO=68;DP=118;FAO=68;FDP=118;FR=.;FRO=50;FSAF=42;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=-0.00767697;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.8149;QD=11.7769;RBI=0.038903;REFB=-0.00499224;REVB=0.038138;RO=50;SAF=42;SAR=26;SRF=24;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109876;STB=0.559982;TYPE=snp;VARB=0.00305147;OID=.;OPOS=34872382;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:50:50:68:68:26:42:24:26:26:42:24:26 chr19 34959979 . A G 134.51 PASS AO=31;DP=64;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=0.00595468;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.514;QD=8.40696;RBI=0.00650214;REFB=-0.0251793;REVB=0.00261142;RO=33;SAF=12;SAR=19;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201655;STB=0.61283;TYPE=snp;VARB=0.0257118;OID=.;OPOS=34959979;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:33:33:31:31:19:12:20:13:19:12:20:13 chr19 34972146 . G C 34.18 PASS AO=5;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0786622;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=31.6151;QD=12.428;RBI=0.0851156;REFB=-0.077492;REVB=-0.0325103;RO=6;SAF=3;SAR=2;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0892949;STB=0.624573;TYPE=snp;VARB=0.0864519;OID=.;OPOS=34972146;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:11:11:6:5:5:6:2:3:3:3:2:4:2:3 chr19 35175208 . A G 132.05 PASS AO=25;DP=43;FAO=25;FDP=43;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=0.0314269;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.4544;QD=12.2838;RBI=0.0694375;REFB=-0.0194804;REVB=0.0619186;RO=18;SAF=10;SAR=15;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0984477;STB=0.554413;TYPE=snp;VARB=0.00932072;OID=.;OPOS=35175208;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:43:43:18:18:25:25:15:10:5:13:15:10:5:13 chr19 35175592 . G A 272.09 PASS AO=86;DP=207;FAO=82;FDP=204;FR=.;FRO=122;FSAF=38;FSAR=44;FSRF=65;FSRR=57;FWDB=-0.0113583;FXX=0.0192298;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.235;QD=5.33518;RBI=0.0260309;REFB=-0.00991028;REVB=-0.0234221;RO=118;SAF=38;SAR=48;SRF=62;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0866989;STB=0.541447;TYPE=snp;VARB=0.0122509;OID=.;OPOS=35175592;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:204:118:122:86:82:48:38:62:56:44:38:65:57 chr19 35175749 . C G 289.04 PASS AO=84;DP=210;FAO=87;FDP=212;FR=.;FRO=125;FSAF=36;FSAR=51;FSRF=67;FSRR=58;FWDB=-0.00657783;FXX=0.00934536;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.708;QD=5.45357;RBI=0.0329609;REFB=-0.0023596;REVB=-0.0322979;RO=126;SAF=36;SAR=48;SRF=69;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127166;STB=0.572393;TYPE=snp;VARB=0.0040414;OID=.;OPOS=35175749;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:210:212:126:125:84:87:48:36:69:57:51:36:67:58 chr19 35175775 . C T 635.99 PASS AO=127;DP=227;FAO=130;FDP=230;FR=.;FRO=100;FSAF=71;FSAR=59;FSRF=45;FSRR=55;FWDB=-0.0140177;FXX=0.00432882;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.722;QD=11.0606;RBI=0.0159391;REFB=-0.0306719;REVB=0.00758677;RO=99;SAF=72;SAR=55;SRF=45;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0909565;STB=0.541833;TYPE=snp;VARB=0.0166437;OID=.;OPOS=35175775;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:227:230:99:100:127:130:55:72:45:54:59:71:45:55 chr19 35270362 . G C 791.31 PASS AO=175;DP=332;FAO=175;FDP=330;FR=.;FRO=155;FSAF=113;FSAR=62;FSRF=85;FSRR=70;FWDB=0.0581277;FXX=0.00900874;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0562;QD=9.59165;RBI=0.0621009;REFB=-0.00482664;REVB=-0.0218562;RO=153;SAF=113;SAR=62;SRF=84;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0877853;STB=0.548538;TYPE=snp;VARB=0.00352822;OID=.;OPOS=35270362;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:332:330:153:155:175:175:62:113:84:69:62:113:85:70 chr19 35434238 . A G 413.44 PASS AO=86;DP=164;FAO=90;FDP=168;FR=.;FRO=78;FSAF=35;FSAR=55;FSRF=23;FSRR=55;FWDB=1.73987e-06;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.722;QD=9.8438;RBI=0.0329755;REFB=-0.0206157;REVB=-0.0329755;RO=78;SAF=34;SAR=52;SRF=23;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0933874;STB=0.546865;TYPE=snp;VARB=0.015575;OID=.;OPOS=35434238;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:168:78:78:86:90:52:34:23:55:55:35:23:55 chr19 35434512 . T C 461.42 PASS AO=101;DP=192;FAO=101;FDP=191;FR=.;FRO=90;FSAF=56;FSAR=45;FSRF=45;FSRR=45;FWDB=-0.0103285;FXX=0.00520806;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.561;QD=9.66335;RBI=0.0147848;REFB=-0.0180822;REVB=0.0105788;RO=87;SAF=56;SAR=45;SRF=45;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0317712;STB=0.525817;TYPE=snp;VARB=0.0174104;OID=.;OPOS=35434512;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:191:87:90:101:101:45:56:45:42:45:56:45:45 chr19 35435001 . C T 90.31 PASS AO=14;DP=82;FAO=33;FDP=82;FR=.,HEALED;FRO=49;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=-0.0162684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.9036;QD=4.40528;RBI=0.0365433;REFB=-0.0183156;REVB=-0.0327223;RO=45;SAF=11;SAR=3;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.406038;STB=0.553455;TYPE=snp;VARB=0.0271307;OID=.;OPOS=35435001;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:82:82:45:49:14:33:3:11:21:24:21:12:22:27 chr19 35435002 . G T 32.33 PASS AO=19;DP=82;FAO=19;FDP=83;FR=.;FRO=64;FSAF=1;FSAR=18;FSRF=33;FSRR=31;FWDB=-0.00139653;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=112.486;QD=1.55814;RBI=0.00998584;REFB=-0.00984989;REVB=0.00988771;RO=63;SAF=1;SAR=18;SRF=32;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.663107;STB=0.925353;TYPE=snp;VARB=0.01949;OID=.;OPOS=35435002;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:82:83:63:64:19:19:18:1:32:31:18:1:33:31 chr19 35435006 . G A 256.61 PASS AO=48;DP=81;FAO=49;FDP=82;FR=.;FRO=33;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=0.0118542;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.336;QD=12.5175;RBI=0.0119099;REFB=-0.0141108;REVB=0.00115018;RO=33;SAF=22;SAR=26;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0715934;STB=0.526871;TYPE=snp;VARB=0.00909214;OID=.;OPOS=35435006;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:82:33:33:48:49:26:22:12:21:28:21:12:21 chr19 35435069 . A G 195.48 PASS AO=37;DP=68;FAO=39;FDP=70;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.0266138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.747;QD=11.1703;RBI=0.0315848;REFB=-0.0449113;REVB=0.017009;RO=31;SAF=13;SAR=24;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115122;STB=0.571391;TYPE=snp;VARB=0.0302026;OID=.;OPOS=35435069;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:70:31:31:37:39:24:13:15:16:26:13:15:16 chr19 35435589 . C T 121.99 PASS AO=29;DP=63;FAO=29;FDP=62;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=0.0248975;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.2846;QD=7.87041;RBI=0.0370541;REFB=-0.000881947;REVB=-0.0274431;RO=31;SAF=14;SAR=15;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00102591;STB=0.51504;TYPE=snp;VARB=0.000947117;OID=.;OPOS=35435589;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:62:31:33:29:29:15:14:15:16:15:14:15:18 chr19 35449082 . G A 442.79 PASS AO=109;DP=228;FAO=109;FDP=228;FR=.;FRO=119;FSAF=37;FSAR=72;FSRF=53;FSRR=66;FWDB=-0.0102332;FXX=0.00436662;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.06;QD=7.76816;RBI=0.0184349;REFB=0.00047828;REVB=0.0153339;RO=115;SAF=37;SAR=72;SRF=51;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103957;STB=0.559285;TYPE=snp;VARB=-0.000538165;OID=.;OPOS=35449082;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:228:228:115:119:109:109:72:37:51:64:72:37:53:66 chr19 35450229 . C T 252.51 PASS AO=63;DP=133;FAO=62;FDP=132;FR=.;FRO=70;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=28;FSRR=42;FWDB=-0.00773609;FXX=0.00751823;HRUN=2;LEN=1;MLLD=276.25;QD=7.65193;RBI=0.0225364;REFB=-0.0165992;REVB=-0.021167;RO=64;SAF=27;SAR=36;SRF=27;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00624426;STB=0.510571;TYPE=snp;VARB=0.0168043;OID=.;OPOS=35450229;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:132:64:70:63:62:36:27:27:37:36:26:28:42 chr19 35505161 . G A 102 PASS AO=23;DP=47;FAO=23;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.00923953;FXX=0.020404;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.687;QD=8.50031;RBI=0.0390686;REFB=-0.00124452;REVB=-0.0379603;RO=22;SAF=14;SAR=9;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0254509;STB=0.526293;TYPE=snp;VARB=0.00116747;OID=.;OPOS=35505161;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:48:22:25:23:23:9:14:14:8:9:14:14:11 chr19 35506729 . G A 250.43 PASS AO=50;DP=89;FAO=50;FDP=89;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=36;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=0.0233604;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.89;QD=11.2553;RBI=0.0329808;REFB=-0.0182729;REVB=0.0232815;RO=38;SAF=14;SAR=36;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.27439;STB=0.64654;TYPE=snp;VARB=0.00743523;OID=.;OPOS=35506729;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:38:39:50:50:36:14:23:15:36:14:23:16 chr19 35510102 . G C 447.5 PASS AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00415159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.112;QD=38.0848;RBI=0.0202519;REFB=0;REVB=-0.0198218;RO=0;SAF=26;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.60707e-05;OID=.;OPOS=35510102;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:46:47:0:0:46:47:20:26:0:0:20:27:0:0 chr19 35524824 . T C 339.38 PASS AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.749;QD=37.7087;RBI=0.0251336;REFB=0;REVB=0.0215621;RO=0;SAF=26;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.98196e-05;OID=.;OPOS=35524824;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:36:36:0:0:36:36:10:26:0:0:10:26:0:0 chr19 35577870 . G A 276.21 PASS AO=75;DP=177;FAO=77;FDP=179;FR=.;FRO=102;FSAF=40;FSAR=37;FSRF=29;FSRR=73;FWDB=-0.000112283;FXX=0.00555525;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.407;QD=6.17219;RBI=0.00585859;REFB=-0.0123143;REVB=-0.00585751;RO=102;SAF=39;SAR=36;SRF=29;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242295;STB=0.632788;TYPE=snp;VARB=0.00928107;OID=.;OPOS=35577870;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:179:102:102:75:77:36:39:29:73:37:40:29:73 chr19 35590180 . T A 1099.56 PASS AO=113;DP=114;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0397928;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.362;QD=38.2456;RBI=0.0424138;REFB=0;REVB=0.0146787;RO=0;SAF=30;SAR=83;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21351e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.25109e-05;OID=.;OPOS=35590180;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:114:115:0:0:113:115:83:30:0:0:85:30:0:0 chr19 35597352 . T C 85.21 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0338925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.885;QD=37.8713;RBI=0.0485877;REFB=0;REVB=0.0348148;RO=0;SAF=2;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.49526e-05;OID=.;OPOS=35597352;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:7:2:0:0:7:2:0:0 chr19 35597462 . A G 162.99 PASS AO=30;DP=58;FAO=33;FDP=60;FR=.;FRO=27;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.00133483;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.414;QD=10.8657;RBI=0.0112955;REFB=-0.00906298;REVB=0.0112164;RO=26;SAF=18;SAR=12;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179932;STB=0.559355;TYPE=snp;VARB=0.00951126;OID=.;OPOS=35597462;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:60:26:27:30:33:12:18:10:16:14:19:12:15 chr19 35597620 . C T 263.12 PASS AO=63;DP=131;FAO=63;FDP=131;FR=.;FRO=68;FSAF=24;FSAR=39;FSRF=34;FSRR=34;FWDB=-0.0140704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.488;QD=8.0343;RBI=0.017612;REFB=-0.0153587;REVB=0.0105927;RO=68;SAF=24;SAR=39;SRF=34;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114566;STB=0.563507;TYPE=snp;VARB=0.0140978;OID=.;OPOS=35597620;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:68:68:63:63:39:24:34:34:39:24:34:34 chr19 35597729 . C T 265.52 PASS AO=60;DP=120;FAO=60;FDP=119;FR=.;FRO=59;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=33;FSRR=26;FWDB=-0.0247785;FXX=0.00833264;HRUN=4;LEN=1;MLLD=86.6559;QD=8.92488;RBI=0.0279739;REFB=-0.000794373;REVB=-0.0129832;RO=59;SAF=33;SAR=27;SRF=33;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00846835;STB=0.504671;TYPE=snp;VARB=0.000981779;OID=.;OPOS=35597729;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:119:59:59:60:60:27:33:33:26:27:33:33:26 chr19 35610245 . A G 39.24 PASS AO=9;DP=25;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.0222374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.7486;QD=6.03632;RBI=0.0228759;REFB=-0.00740919;REVB=-0.00536697;RO=16;SAF=4;SAR=5;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00743536;STB=0.538385;TYPE=snp;VARB=0.00725471;OID=.;OPOS=35610245;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:25:26:16:16:9:10:5:4:7:9:5:5:7:9 chr19 35622695 . A G 500.8 PASS AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0455757;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.9393;QD=37.796;RBI=0.113782;REFB=0;REVB=0.104256;RO=0;SAF=29;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00133645;OID=.;OPOS=35622695;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:53:53:0:0:53:53:24:29:0:0:24:29:0:0 chr19 35633601 . C T 99.78 PASS AO=23;DP=49;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=-0.0127949;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=242.823;QD=8.14531;RBI=0.0127955;REFB=-0.00969524;REVB=-0.00012306;RO=26;SAF=7;SAR=16;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00369721;STB=0.50209;TYPE=snp;VARB=0.0110383;OID=.;OPOS=35633601;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:26:26:23:23:16:7:8:18:16:7:8:18 chr19 35642297 . T C 101.12 PASS AO=26;DP=63;FAO=27;FDP=64;FR=.;FRO=37;FSAF=5;FSAR=22;FSRF=12;FSRR=25;FWDB=0.016471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.34;QD=6.31966;RBI=0.0164784;REFB=-0.00297534;REVB=0.000496844;RO=36;SAF=4;SAR=22;SRF=11;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236528;STB=0.614028;TYPE=snp;VARB=0.00488043;OID=.;OPOS=35642297;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:64:36:37:26:27:22:4:11:25:22:5:12:25 chr19 35648365 . T G 1807.41 PASS AO=191;DP=193;FAO=191;FDP=191;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.036647;FXX=0.0103622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.998;QD=37.8514;RBI=0.0369335;REFB=-0.0283564;REVB=0.00459146;RO=1;SAF=82;SAR=109;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00577191;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.30188e-05;OID=.;OPOS=35648365;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:193:191:1:0:191:191:109:82:1:0:109:82:0:0 chr19 35649324 . C G 706.07 PASS AO=72;DP=72;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.945;QD=37.657;RBI=0.0126885;REFB=0;REVB=0.00470747;RO=0;SAF=17;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.54913e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.39396e-05;OID=.;OPOS=35649324;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:72:75:0:0:72:75:55:17:0:0:58:17:0:0 chr19 35655151 . T C 279.43 PASS AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0163254;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.607;QD=38.5418;RBI=0.0307428;REFB=0;REVB=0.02605;RO=0;SAF=2;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.75607e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.75793e-05;OID=.;OPOS=35655151;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:29:29:0:0:29:29:27:2:0:0:27:2:0:0 chr19 35660508 . G A 522.18 PASS AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0461578;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3228;QD=37.9765;RBI=0.0494734;REFB=0;REVB=0.0178066;RO=0;SAF=17;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.97918e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000593232;OID=.;OPOS=35660508;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:56:55:0:0:55:55:38:17:0:0:38:17:0:0 chr19 35718938 . C T 218.52 PASS AO=67;DP=170;FAO=67;FDP=170;FR=.;FRO=103;FSAF=20;FSAR=47;FSRF=43;FSRR=60;FWDB=-0.0111373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.566;QD=5.14173;RBI=0.0199425;REFB=0.00318591;REVB=-0.0165427;RO=103;SAF=20;SAR=47;SRF=43;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142074;STB=0.580449;TYPE=snp;VARB=-0.00457675;OID=.;OPOS=35718938;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:170:103:103:67:67:47:20:43:60:47:20:43:60 chr19 35719020 . C T 208.45 PASS AO=50;DP=104;FAO=50;FDP=104;FR=.;FRO=54;FSAF=15;FSAR=35;FSRF=24;FSRR=30;FWDB=0.016009;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.656;QD=8.01746;RBI=0.0384992;REFB=-0.0147821;REVB=-0.0350128;RO=54;SAF=15;SAR=35;SRF=24;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149422;STB=0.583299;TYPE=snp;VARB=0.0128261;OID=.;OPOS=35719020;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:54:54:50:50:35:15:24:30:35:15:24:30 chr19 35719106 . A G 135.87 PASS AO=34;DP=75;FAO=34;FDP=75;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=0.0167495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.2136;QD=7.24637;RBI=0.0185691;REFB=-0.0145756;REVB=-0.00801663;RO=41;SAF=17;SAR=17;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0593411;STB=0.533314;TYPE=snp;VARB=0.0203046;OID=.;OPOS=35719106;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:41:41:34:34:17:17:18:23:17:17:18:23 chr19 35719257 . G A 276.62 PASS AO=58;DP=120;FAO=64;FDP=127;FR=.;FRO=63;FSAF=50;FSAR=14;FSRF=32;FSRR=31;FWDB=0.133094;FXX=0.00781189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.8304;QD=8.71232;RBI=0.133452;REFB=-0.0180338;REVB=0.00977692;RO=61;SAF=49;SAR=9;SRF=32;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.388956;STB=0.662099;TYPE=snp;VARB=0.037056;OID=.;OPOS=35719257;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:127:61:63:58:64:9:49:32:29:14:50:32:31 chr19 35741375 . C T 243.55 PASS AO=52;DP=98;FAO=52;FDP=98;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=35;FSRF=16;FSRR=30;FWDB=0.0178952;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.992;QD=9.94063;RBI=0.0319597;REFB=-0.00672411;REVB=0.0264799;RO=41;SAF=17;SAR=35;SRF=15;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0350435;STB=0.511058;TYPE=snp;VARB=0.00443872;OID=.;OPOS=35741375;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:41:46:52:52:35:17:15:26:35:17:16:30 chr19 35741456 . T C 1100.65 PASS AO=117;DP=120;FAO=119;FDP=121;FR=.;FRO=2;FSAF=40;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.059233;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9181;QD=36.3852;RBI=0.11925;REFB=0.0558779;REVB=-0.103499;RO=2;SAF=40;SAR=77;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0121756;STB=0.506249;TYPE=snp;VARB=-0.00149829;OID=.;OPOS=35741456;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:120:121:2:2:117:119:77:40:0:2:79:40:0:2 chr19 35758275 . G GGGA 64.91 PASS AO=13;DP=48;FAO=18;FDP=48;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=23;FSRR=7;FWDB=0.00478469;FXX=0.039992;HRUN=3;LEN=3;MLLD=209.834;QD=5.40909;RBI=0.0446997;REFB=-0.00839453;REVB=0.0444429;RO=28;SAF=12;SAR=1;SRF=24;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201152;STB=0.573694;TYPE=ins;VARB=0.0134365;OID=.;OPOS=35758276;OREF=-;OALT=GGA;OMAPALT=GGGA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:13:48:18:48:30:12:6:23:7:64:28:12:1:24:4 chr19 35770056 . G A 59.82 PASS AO=16;DP=41;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.0206527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.957;QD=5.83605;RBI=0.0210726;REFB=-0.0122205;REVB=0.00418581;RO=25;SAF=6;SAR=10;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113019;STB=0.565954;TYPE=snp;VARB=0.0178955;OID=.;OPOS=35770056;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:41:41:25:25:16:16:10:6:12:13:10:6:12:13 chr19 35770064 . C T 81.98 PASS AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=0.0347909;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.945;QD=8.86322;RBI=0.0348948;REFB=0.0010482;REVB=0.00269006;RO=19;SAF=8;SAR=10;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119896;STB=0.567828;TYPE=snp;VARB=-0.000375771;OID=.;OPOS=35770064;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:37:37:19:19:18:18:10:8:6:13:10:8:6:13 chr19 35770471 . C T 221.49 PASS AO=41;DP=70;FAO=41;FDP=69;FR=.;FRO=28;FSAF=34;FSAR=7;FSRF=22;FSRR=6;FWDB=-0.00388699;FXX=0.0142837;HRUN=3;LEN=1;MLLD=98.5177;QD=12.8399;RBI=0.0504791;REFB=-0.00801003;REVB=0.0503292;RO=28;SAF=34;SAR=7;SRF=22;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0545153;STB=0.529961;TYPE=snp;VARB=0.00459032;OID=.;OPOS=35770471;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:69:28:28:41:41:7:34:22:6:7:34:22:6 chr19 35790503 . G A 158.85 PASS AO=16;DP=16;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0518373;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.8898;QD=37.376;RBI=0.120049;REFB=0;REVB=0.108281;RO=0;SAF=12;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07465e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00754784;OID=.;OPOS=35790503;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:16:17:0:0:16:17:4:12:0:0:5:12:0:0 chr19 35820813 . A G 46.89 PASS AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.131123;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=200.942;QD=6.05013;RBI=0.134379;REFB=0.00224239;REVB=-0.0294014;RO=16;SAF=2;SAR=10;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.27891;STB=0.671314;TYPE=snp;VARB=-0.00659359;OID=.;OPOS=35820813;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:28:31:16:19:12:12:10:2:6:10:10:2:7:12 chr19 35823739 . G A 194.04 PASS AO=15;DP=81;FAO=41;FDP=77;FR=.;FRO=36;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=26;FWDB=-0.010654;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.903;QD=10.0797;RBI=0.01108;REFB=-0.00935592;REVB=-0.00304282;RO=24;SAF=0;SAR=15;SRF=0;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.652102;TYPE=snp;VARB=0.00720416;OID=.;OPOS=35823739;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:45:77:24:36:15:41:15:0:0:24:16:25:10:26 chr19 35843086 . G A 210.53 PASS AO=22;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.2516;QD=36.6145;RBI=0.132592;REFB=0;REVB=0.129683;RO=0;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00418384;OID=.;OPOS=35843086;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:0:0:22:23:12:10:0:0:13:10:0:0 chr19 35849883 . C G 52.12 PASS AO=30;DP=123;FAO=30;FDP=122;FR=.;FRO=92;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=73;FWDB=-0.0294265;FXX=0.00812942;HRUN=5;LEN=1;MLLD=222.939;QD=1.70898;RBI=0.030702;REFB=-0.00130003;REVB=0.00875758;RO=91;SAF=8;SAR=22;SRF=19;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0980827;STB=0.561262;TYPE=snp;VARB=0.00357669;OID=.;OPOS=35849883;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:123:122:91:92:30:30:22:8:19:72:22:8:19:73 chr19 35849926 . G A 267.6 PASS AO=65;DP=137;FAO=65;FDP=136;FR=.;FRO=71;FSAF=19;FSAR=46;FSRF=18;FSRR=53;FWDB=0.0010695;FXX=0.00729874;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.6236;QD=7.87066;RBI=0.00370214;REFB=-0.0380837;REVB=0.0035443;RO=67;SAF=19;SAR=46;SRF=16;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0612582;STB=0.524972;TYPE=snp;VARB=0.0382037;OID=.;OPOS=35849926;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:136:67:71:65:65:46:19:16:51:46:19:18:53 chr19 35850672 . T C 11.82 PASS AO=4;DP=19;FAO=4;FDP=19;FR=.;FRO=15;FSAF=0;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=15;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.939;QD=2.48873;RBI=0.00672085;REFB=-0.00871153;REVB=0.00672085;RO=15;SAF=0;SAR=4;SRF=0;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0348968;OID=.;OPOS=35850672;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:19:19:15:15:4:4:4:0:0:15:4:0:0:15 chr19 35863383 . C T 11.75 PASS AO=6;DP=32;FAO=6;FDP=32;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=19;FSRR=7;FWDB=0.0708765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.9722;QD=1.46884;RBI=0.0903598;REFB=-0.00658589;REVB=-0.0560483;RO=26;SAF=5;SAR=1;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176135;STB=0.624532;TYPE=snp;VARB=0.0617665;OID=.;OPOS=35863383;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:32:32:26:26:6:6:1:5:19:7:1:5:19:7 chr19 35863707 . G A 95.14 PASS AO=16;DP=27;FAO=16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0203249;FXX=0.103413;HRUN=5;LEN=1;MLLD=119.6;QD=14.6369;RBI=0.0234845;REFB=-0.047371;REVB=0.0117652;RO=10;SAF=2;SAR=14;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219118;STB=0.624819;TYPE=snp;VARB=0.0365339;OID=.;OPOS=35863707;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:27:26:10:10:16:16:14:2:3:7:14:2:3:7 chr19 35863809 . T A 89.63 PASS AO=17;DP=31;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=1;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.0651249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.647;QD=11.5655;RBI=0.065752;REFB=-0.00423894;REVB=-0.00905953;RO=14;SAF=1;SAR=16;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.628953;STB=0.866904;TYPE=snp;VARB=0.00134177;OID=.;OPOS=35863809;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:31:31:14:14:17:17:16:1:8:6:16:1:8:6 chr19 35899431 . GAGA G 107.93 PASS AO=23;DP=62;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=20;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=-0.0133249;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=3;MLLD=179.812;QD=8.63436;RBI=0.0405315;REFB=-0.00153265;REVB=-0.0382786;RO=33;SAF=19;SAR=4;SRF=24;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154385;STB=0.637125;TYPE=del;VARB=-0.000742205;OID=.;OPOS=35899432;OREF=AGA;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:23:60:24:50:26:20:4:17:9:99:33:19:4:24:9 chr19 35979747 . A T 279.66 PASS AO=71;DP=151;FAO=71;FDP=153;FR=.;FRO=82;FSAF=23;FSAR=48;FSRF=38;FSRR=44;FWDB=-0.0203302;FXX=0.0254761;HRUN=4;LEN=1;MLLD=192.095;QD=7.31146;RBI=0.0293801;REFB=-0.0177314;REVB=-0.0212102;RO=80;SAF=23;SAR=48;SRF=36;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130178;STB=0.580468;TYPE=snp;VARB=0.0227486;OID=.;OPOS=35979747;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:153:80:82:71:71:48:23:36:44:48:23:38:44 chr19 35991373 . C T 581.3 PASS AO=63;DP=67;FAO=67;FDP=71;FR=.;FRO=4;FSAF=34;FSAR=33;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0106912;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.702;QD=32.7495;RBI=0.014037;REFB=-0.125993;REVB=0.00909588;RO=3;SAF=34;SAR=29;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0109664;STB=0.513669;TYPE=snp;VARB=0.00299801;OID=.;OPOS=35991373;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:67:71:3:4:63:67:29:34:2:1:33:34:3:1 chr19 35991442 . T G 593.86 PASS AO=58;DP=58;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.062434;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.265;QD=37.7056;RBI=0.0637051;REFB=0;REVB=-0.0126623;RO=0;SAF=20;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.38905e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000170089;OID=.;OPOS=35991442;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:58:63:0:0:58:63:38:20:0:0:42:21:0:0 chr19 35998362 . T G 488.25 PASS AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0449051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.4823;QD=37.5579;RBI=0.057796;REFB=0;REVB=-0.0363856;RO=0;SAF=18;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.19096e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.58747e-05;OID=.;OPOS=35998362;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:52:52:0:0:52:52:34:18:0:0:34:18:0:0 chr19 36002381 . C T 201.65 PASS AO=23;DP=23;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.027343;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.843;QD=36.6634;RBI=0.0275323;REFB=0;REVB=-0.00322292;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00019778;OID=.;OPOS=36002381;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:22:0:0:23:22:12:11:0:0:11:11:0:0 chr19 36002393 . C T 108.51 PASS AO=13;DP=14;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00275775;FXX=0.076864;HRUN=2;LEN=1;MLLD=294.756;QD=36.1701;RBI=0.0417339;REFB=0;REVB=0.0416427;RO=0;SAF=2;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.00908e-05;OID=.;OPOS=36002393;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:14:12:0:0:13:12:11:2:0:0:10:2:0:0 chr19 36002399 . T C 37.61 PASS AO=7;DP=9;FAO=6;FDP=8;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0187843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.046;QD=18.8035;RBI=0.100873;REFB=-0.0580179;REVB=0.0991083;RO=2;SAF=3;SAR=4;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0278747;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0410737;OID=.;OPOS=36002399;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:8:2:2:7:6:4:3:1:1:3:3:1:1 chr19 36002400 . G A 43.02 PASS AO=7;DP=9;FAO=6;FDP=8;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00166006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.091;QD=21.5082;RBI=0.0821444;REFB=-0.0112012;REVB=0.0821276;RO=1;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0971198;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00653046;OID=.;OPOS=36002400;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:8:1:2:7:6:4:3:0:1:3:3:1:1 chr19 36002409 . ACTGCTGCTG ACTGCTG,ACTGCTGC 50.32 PASS AO=4,2;DP=8;FAO=0,6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=0,6;FSAR=0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0466324,0.073826;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=3,2;MLLD=272.407,297.773;QD=33.5472;RBI=0.0466324,0.073826;REFB=0,0;REVB=0,0;RO=0;SAF=4,2;SAR=0,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=0,0.00117069;OID=.,.;OPOS=36002410,36002417;OREF=CTG,TG;OALT=-,-;OMAPALT=ACTGCTG,ACTGCTGC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:4,2:6:0,6:6:0:0,6:0,0:0:0:4:0:4,2:0,0:0:0 chr19 36002710 . C A 1024.67 PASS AO=107;DP=107;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0341522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.232;QD=38.3053;RBI=0.0376502;REFB=0;REVB=0.0158481;RO=0;SAF=59;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.65773e-05;OID=.;OPOS=36002710;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:107:107:0:0:107:107:48:59:0:0:48:59:0:0 chr19 36004106 . A G 345.81 PASS AO=37;DP=40;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0345775;FXX=0.0499875;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.4193;QD=36.4011;RBI=0.0383755;REFB=-0.0669251;REVB=-0.0166457;RO=1;SAF=13;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0346573;STB=0.518508;TYPE=snp;VARB=0.00175488;OID=.;OPOS=36004106;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:40:38:1:1:37:37:24:13:1:0:24:13:1:0 chr19 36004171 . C A 290.01 PASS AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0799258;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.139;QD=37.4203;RBI=0.0862223;REFB=0;REVB=0.0323442;RO=0;SAF=2;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.56306e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000282475;OID=.;OPOS=36004171;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:30:31:0:0:30:31:28:2:0:0:29:2:0:0 chr19 36017615 . G A 199.55 PASS AO=50;DP=109;FAO=50;FDP=109;FR=.;FRO=59;FSAF=46;FSAR=4;FSRF=43;FSRR=16;FWDB=-0.0223575;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.54;QD=7.32293;RBI=0.0227732;REFB=-0.0409086;REVB=-0.00433123;RO=59;SAF=46;SAR=4;SRF=43;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.385149;STB=0.72089;TYPE=snp;VARB=0.0366223;OID=.;OPOS=36017615;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:59:59:50:50:4:46:43:16:4:46:43:16 chr19 36017928 . G C 368.91 PASS AO=29;DP=45;FAO=40;FDP=40;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.138687;FXX=0.0476077;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.819;QD=36.8913;RBI=0.140265;REFB=0;REVB=0.0209764;RO=0;SAF=5;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000168751;OID=.;OPOS=36017928;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:38:40:0:0:29:40:24:5:0:0:31:9:0:0 chr19 36033460 . C T 1313.06 PASS AO=135;DP=137;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0204463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.524;QD=38.3375;RBI=0.0211886;REFB=0;REVB=0.0055594;RO=0;SAF=76;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.17043e-05;OID=.;OPOS=36033460;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:137:137:0:0:135:137:59:76:0:0:59:78:0:0 chr19 36066570 . A G 1188 PASS AO=181;DP=246;FAO=182;FDP=246;FR=.;FRO=64;FSAF=15;FSAR=167;FSRF=29;FSRR=35;FWDB=-0.00536183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.854;QD=19.317;RBI=0.00757225;REFB=-0.0279547;REVB=0.00534694;RO=64;SAF=15;SAR=166;SRF=29;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.383555;STB=0.708007;TYPE=snp;VARB=0.00743463;OID=.;OPOS=36066570;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:246:246:64:64:181:182:166:15:29:35:167:15:29:35 chr19 36066577 . A G 1092.98 PASS AO=172;DP=240;FAO=171;FDP=237;FR=.;FRO=66;FSAF=13;FSAR=158;FSRF=28;FSRR=38;FWDB=-0.00196843;FXX=0.00836785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.4387;QD=18.447;RBI=0.0190165;REFB=-0.000940033;REVB=-0.0189143;RO=66;SAF=13;SAR=159;SRF=28;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.401015;STB=0.717672;TYPE=snp;VARB=0.000685046;OID=.;OPOS=36066577;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:240:237:66:66:172:171:159:13:28:38:158:13:28:38 chr19 36066634 . A G 500.87 PASS AO=111;DP=206;FAO=109;FDP=204;FR=.;FRO=95;FSAF=13;FSAR=96;FSRF=43;FSRR=52;FWDB=-0.0138007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.6029;QD=9.82094;RBI=0.0140434;REFB=-0.0142622;REVB=0.00259958;RO=94;SAF=13;SAR=98;SRF=42;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.421779;STB=0.736386;TYPE=snp;VARB=0.0167016;OID=.;OPOS=36066634;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:206:204:94:95:111:109:98:13:42:52:96:13:43:52 chr19 36066642 . A G 363.94 PASS AO=94;DP=200;FAO=92;FDP=197;FR=.;FRO=105;FSAF=8;FSAR=84;FSRF=50;FSRR=55;FWDB=-0.0413134;FXX=0.00505025;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.061;QD=7.38973;RBI=0.0413201;REFB=-0.0215668;REVB=-0.000744289;RO=104;SAF=8;SAR=86;SRF=50;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.559497;STB=0.814085;TYPE=snp;VARB=0.0224863;OID=.;OPOS=36066642;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:200:197:104:105:94:92:86:8:50:54:84:8:50:55 chr19 36066645 . A G 315.15 PASS AO=84;DP=194;FAO=84;FDP=189;FR=.;FRO=105;FSAF=7;FSAR=77;FSRF=50;FSRR=55;FWDB=-0.0165945;FXX=0.0307677;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.597;QD=6.66988;RBI=0.016895;REFB=-0.00672238;REVB=0.00317217;RO=79;SAF=7;SAR=77;SRF=23;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.378457;STB=0.825989;TYPE=snp;VARB=0.0184185;OID=.;OPOS=36066645;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:189:79:105:84:84:77:7:23:56:77:7:50:55 chr19 36066661 . A G 99.83 PASS AO=50;DP=176;FAO=49;FDP=174;FR=.;FRO=125;FSAF=5;FSAR=44;FSRF=60;FSRR=65;FWDB=-0.0143775;FXX=0.011363;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.312;QD=2.29496;RBI=0.0146676;REFB=-1.53196e-05;REVB=-0.00290266;RO=122;SAF=5;SAR=45;SRF=58;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.562712;STB=0.839779;TYPE=snp;VARB=-2.78594e-05;OID=.;OPOS=36066661;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:174:122:125:50:49:45:5:58:64:44:5:60:65 chr19 36066667 . A G 35.73 PASS AO=34;DP=164;FAO=32;FDP=161;FR=.;FRO=129;FSAF=4;FSAR=28;FSRF=61;FSRR=68;FWDB=-0.0219412;FXX=0.00617246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.728;QD=0.887712;RBI=0.0229759;REFB=-0.0212631;REVB=-0.00681728;RO=128;SAF=4;SAR=30;SRF=61;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.525078;STB=0.825542;TYPE=snp;VARB=0.0660467;OID=.;OPOS=36066667;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:164:161:128:129:34:32:30:4:61:67:28:4:61:68 chr19 36168914 . T C 52.89 PASS AO=16;DP=45;FAO=16;FDP=45;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=23;FSRR=6;FWDB=0.00127041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.7071;QD=4.7009;RBI=0.0108374;REFB=-0.00369701;REVB=-0.0107627;RO=29;SAF=8;SAR=8;SRF=23;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.327887;STB=0.688686;TYPE=snp;VARB=0.0060676;OID=.;OPOS=36168914;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:45:45:29:29:16:16:8:8:23:6:8:8:23:6 chr19 36214632 . A AG 1562.87 PASS AO=185;DP=217;FAO=209;FDP=209;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=167;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.170149;FXX=0.0279057;HRUN=1;LEN=1;MLLD=22.8974;QD=29.9113;RBI=0.201902;REFB=0;REVB=-0.108691;RO=24;SAF=36;SAR=149;SRF=3;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0245517;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.000321626;OID=.;OPOS=36214633;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:185:217:209:209:0:42:167:0:0:99:24:36:149:3:21 chr19 36218478 . C T 111.98 PASS AO=15;DP=19;FAO=15;FDP=19;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0743547;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=294.497;QD=23.5751;RBI=0.0744375;REFB=-0.0169106;REVB=0.00351014;RO=4;SAF=2;SAR=13;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.352642;STB=0.698609;TYPE=snp;VARB=0.00154228;OID=.;OPOS=36218478;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:19:19:4:4:15:15:13:2:3:1:13:2:3:1 chr19 36233470 . G A 361.71 PASS AO=80;DP=153;FAO=80;FDP=153;FR=.;FRO=73;FSAF=31;FSAR=49;FSRF=35;FSRR=38;FWDB=-0.0338892;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.859;QD=9.45644;RBI=0.033949;REFB=-0.0138935;REVB=0.00201346;RO=73;SAF=31;SAR=49;SRF=35;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.082434;STB=0.545259;TYPE=snp;VARB=0.00754615;OID=.;OPOS=36233470;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:153:73:73:80:80:49:31:35:38:49:31:35:38 chr19 36243089 . T C 306.11 PASS AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0574358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.4522;QD=37.1038;RBI=0.0869851;REFB=0;REVB=-0.0653264;RO=0;SAF=18;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.64315e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00265315;OID=.;OPOS=36243089;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:33:33:0:0:33:33:15:18:0:0:15:18:0:0 chr19 36243813 . G A 1062.95 PASS AO=112;DP=112;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00776777;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.684;QD=37.9625;RBI=0.0140953;REFB=0;REVB=0.0117618;RO=0;SAF=61;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.57684e-05;OID=.;OPOS=36243813;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:112:112:0:0:112:112:51:61:0:0:51:61:0:0 chr19 36258937 . AG A 343.32 PASS AO=38;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.253413;FXX=0.0217344;HRUN=3;LEN=1;MLLD=19.3388;QD=30.5172;RBI=0.278989;REFB=0;REVB=-0.116691;RO=0;SAF=33;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.0120267;OID=.;OPOS=36258938;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:38:42:45:45:0:39:6:0:0:31:0:33:5:0:0 chr19 36270052 . A G 60.48 PASS AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=3;FWDB=-0.00401457;FXX=0.0666445;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.442;QD=8.64039;RBI=0.00402584;REFB=-0.00732754;REVB=0.000300994;RO=16;SAF=11;SAR=2;SRF=13;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0581656;STB=0.544482;TYPE=snp;VARB=0.0159673;OID=.;OPOS=36270052;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:29:28:16:15:13:13:2:11:13:3:2:11:12:3 chr19 36322270 . C T 189 PASS AO=45;DP=94;FAO=45;FDP=94;FR=.;FRO=49;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=0.00209423;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.172;QD=8.04237;RBI=0.00252414;REFB=-0.0130411;REVB=-0.00140907;RO=49;SAF=20;SAR=25;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0427725;STB=0.523799;TYPE=snp;VARB=0.0118231;OID=.;OPOS=36322270;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:49:49:45:45:25:20:24:25:25:20:24:25 chr19 36322580 . AC A 25.33 PASS AO=34;DP=115;FAO=36;FDP=100;FR=.;FRO=64;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=27;FSRR=37;FWDB=-0.071119;FXX=0.0476145;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.92971;QD=1.01303;RBI=0.104444;REFB=-0.112003;REVB=0.0764891;RO=55;SAF=28;SAR=6;SRF=19;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.534247;STB=0.65763;TYPE=del;VARB=0.0705194;OID=.;OPOS=36322581;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:34:105:36:100:64:24:12:27:37:25:55:28:6:19:36 chr19 36330456 . C G 166.86 PASS AO=37;DP=80;FAO=39;FDP=81;FR=.;FRO=42;FSAF=26;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=0.0324997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.5518;QD=8.23995;RBI=0.0608976;REFB=-0.00147604;REVB=-0.0515003;RO=42;SAF=24;SAR=13;SRF=17;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234167;STB=0.638583;TYPE=snp;VARB=0.00104855;OID=.;OPOS=36330456;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:81:42:42:37:39:13:24:17:25:13:26:17:25 chr19 36334419 . G A 283.05 PASS AO=56;DP=98;FAO=56;FDP=98;FR=.;FRO=42;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=0.0168315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.813;QD=11.5529;RBI=0.0286809;REFB=-0.0148929;REVB=0.0232227;RO=41;SAF=29;SAR=27;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0609029;STB=0.538196;TYPE=snp;VARB=0.00881346;OID=.;OPOS=36334419;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:41:42:56:56:27:29:18:23:27:29:18:24 chr19 36339063 . G A 178.93 PASS AO=45;DP=96;FAO=45;FDP=99;FR=.;FRO=54;FSAF=35;FSAR=10;FSRF=30;FSRR=24;FWDB=0.0100485;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=120.474;QD=7.2293;RBI=0.0221421;REFB=-0.014921;REVB=-0.0197307;RO=51;SAF=35;SAR=10;SRF=30;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222822;STB=0.646668;TYPE=snp;VARB=0.0168295;OID=.;OPOS=36339063;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:99:51:54:45:45:10:35:30:21:10:35:30:24 chr19 36355595 . A G 965.72 PASS AO=96;DP=99;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0056177;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.3115;QD=38.6288;RBI=0.0526648;REFB=0;REVB=-0.0523643;RO=3;SAF=40;SAR=56;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0342411;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000451176;OID=.;OPOS=36355595;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:99:100:3:0:96:100:56:40:3:0:57:43:0:0 chr19 36399057 . GC G 66.33 PASS AO=10;DP=15;FAO=12;FDP=15;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.166522;FXX=0.062461;HRUN=4;LEN=1;MLLD=21.3497;QD=17.688;RBI=0.16741;REFB=-0.00732875;REVB=-0.0172171;RO=4;SAF=3;SAR=7;SRF=3;SRR=1;SSEN=0.370656;SSEP=0;SSSB=-0.23879;STB=0.571306;TYPE=del;VARB=0.03362;OID=.;OPOS=36399058;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:10:15:12:15:3:4:8:2:1:5:4:3:7:3:1 chr19 36435564 . G A 73.8 PASS AO=11;DP=15;FAO=11;FDP=15;FR=.;FRO=4;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.00107754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.879;QD=19.6802;RBI=0.0217203;REFB=-0.0875894;REVB=-0.0216935;RO=4;SAF=10;SAR=1;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150097;STB=0.583201;TYPE=snp;VARB=0.00572443;OID=.;OPOS=36435564;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:15:15:4:4:11:11:1:10:4:0:1:10:4:0 chr19 36486445 . G C 73.36 PASS AO=7;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.068957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.343;QD=36.6823;RBI=0.0704883;REFB=0;REVB=0.0146125;RO=0;SAF=5;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.27427e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00124165;OID=.;OPOS=36486445;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:7:8:2:5:0:0:2:6:0:0 chr19 36497358 . C G 758.25 PASS AO=84;DP=87;FAO=84;FDP=87;FR=.;FRO=3;FSAF=35;FSAR=49;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0545808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.2896;QD=34.862;RBI=0.0657986;REFB=-0.00233606;REVB=-0.0367476;RO=3;SAF=35;SAR=49;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0388794;STB=0.520543;TYPE=snp;VARB=2.53393e-05;OID=.;OPOS=36497358;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:87:87:3:3:84:84:49:35:3:0:49:35:3:0 chr19 36530332 . G A 86.75 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.039917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.708;QD=38.5568;RBI=0.108445;REFB=0;REVB=0.100832;RO=0;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0022673;OID=.;OPOS=36530332;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:4:5:0:0:4:5:0:0 chr19 36530343 . C T 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134424;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.387;QD=35.0876;RBI=0.0134641;REFB=0;REVB=0.00076299;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000453632;OID=.;OPOS=36530343;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:3:4:0:0:3:4:0:0 chr19 36530875 . AG A 223.89 PASS AO=28;DP=45;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.344719;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.0864;QD=20.3532;RBI=0.35393;REFB=-0.0258342;REVB=0.0802203;RO=9;SAF=12;SAR=16;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0.335196;SSSB=-0.0574107;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.023061;OID=.;OPOS=36530876;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:28:44:44:44:0:19:25:0:0:17:9:12:16:5:4 chr19 36590329 . T C 290.01 PASS AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00872987;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.993;QD=37.4204;RBI=0.0100854;REFB=0;REVB=-0.00505031;RO=0;SAF=10;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.58987e-05;OID=.;OPOS=36590329;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:31:31:0:0:31:31:21:10:0:0:21:10:0:0 chr19 36594659 . A T 195.16 PASS AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0245189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.999;QD=37.1733;RBI=0.0308478;REFB=0;REVB=0.0187193;RO=0;SAF=14;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0002681;OID=.;OPOS=36594659;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:21:21:0:0:21:21:7:14:0:0:7:14:0:0 chr19 36594676 . C G 33.93 PASS AO=9;DP=24;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.00308051;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=128.733;QD=5.42872;RBI=0.0288271;REFB=-0.0443074;REVB=0.028662;RO=12;SAF=7;SAR=2;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225785;STB=0.576289;TYPE=snp;VARB=0.0288979;OID=.;OPOS=36594676;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:24:25:12:16:9:9:2:7:7:5:2:7:11:5 chr19 36595436 . A C 735.98 PASS AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00265199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.313;QD=38.2329;RBI=0.0149846;REFB=0;REVB=-0.014748;RO=0;SAF=41;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52206e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.13412e-05;OID=.;OPOS=36595436;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:77:77:0:0:77:77:36:41:0:0:36:41:0:0 chr19 36602729 . G C 1176.85 PASS AO=139;DP=143;FAO=136;FDP=143;FR=.;FRO=7;FSAF=59;FSAR=77;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=-0.0206847;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.1869;QD=32.9188;RBI=0.118129;REFB=-0.0997692;REVB=0.116304;RO=1;SAF=58;SAR=81;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00583396;STB=0.514551;TYPE=snp;VARB=0.0122097;OID=.;OPOS=36602729;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:143:143:1:7:139:136:81:58:0:1:77:59:1:6 chr19 36603703 . T A 394.39 PASS AO=40;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0278607;FXX=0.0444346;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.922;QD=36.6873;RBI=0.0312521;REFB=0;REVB=0.014159;RO=0;SAF=14;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000483714;OID=.;OPOS=36603703;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:43:43:0:0:40:43:26:14:0:0:29:14:0:0 chr19 36673706 . C T 162.43 PASS AO=43;DP=99;FAO=43;FDP=99;FR=.;FRO=56;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=34;FSRR=22;FWDB=0.0202488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.363;QD=6.56287;RBI=0.0209249;REFB=-0.0022333;REVB=-0.00527626;RO=56;SAF=18;SAR=25;SRF=34;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188519;STB=0.60573;TYPE=snp;VARB=0.000778446;OID=.;OPOS=36673706;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:56:56:43:43:25:18:34:22:25:18:34:22 chr19 36674305 . A G 788.85 PASS AO=89;DP=95;FAO=91;FDP=97;FR=.;FRO=6;FSAF=64;FSAR=27;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0247033;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.655;QD=32.5301;RBI=0.0272635;REFB=-0.00949392;REVB=-0.0115345;RO=4;SAF=64;SAR=25;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218422;STB=0.51488;TYPE=snp;VARB=0.000598057;OID=.;OPOS=36674305;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:95:97:4:6:89:91:25:64:2:2:27:64:3:3 chr19 36831372 . A G 132.28 PASS AO=43;DP=120;FAO=42;FDP=112;FR=.;FRO=70;FSAF=30;FSAR=12;FSRF=30;FSRR=40;FWDB=0.024722;FXX=0.0175423;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.203;QD=4.72442;RBI=0.0255798;REFB=-0.0085425;REVB=0.00656863;RO=76;SAF=29;SAR=14;SRF=31;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.29816;STB=0.68412;TYPE=snp;VARB=0.0141574;OID=.;OPOS=36831372;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:112:76:70:43:42:14:29:31:45:12:30:30:40 chr19 36885067 . A T 52.2 PASS AO=14;DP=36;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.000646019;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.843;QD=5.80053;RBI=0.0133742;REFB=0.00483572;REVB=0.0133586;RO=22;SAF=8;SAR=6;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168078;STB=0.598286;TYPE=snp;VARB=-0.00668719;OID=.;OPOS=36885067;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:36:36:22:22:14:14:6:8:9:13:6:8:9:13 chr19 36940760 . G T 110.78 PASS AO=27;DP=61;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=21;FSAR=6;FSRF=28;FSRR=5;FWDB=-0.0394638;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.335;QD=7.38524;RBI=0.044728;REFB=-0.0125203;REVB=0.0210525;RO=32;SAF=21;SAR=6;SRF=27;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0980476;STB=0.559959;TYPE=snp;VARB=0.014263;OID=.;OPOS=36940760;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:60:32:33:27:27:6:21:27:5:6:21:28:5 chr19 37004938 . T C 317.64 PASS AO=71;DP=138;FAO=71;FDP=138;FR=.;FRO=67;FSAF=50;FSAR=21;FSRF=49;FSRR=18;FWDB=-0.0278331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.0217;QD=9.20708;RBI=0.0567473;REFB=-0.0395177;REVB=0.0494527;RO=66;SAF=50;SAR=21;SRF=48;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0245401;STB=0.516005;TYPE=snp;VARB=0.0313481;OID=.;OPOS=37004938;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:66:67:71:71:21:50:48:18:21:50:49:18 chr19 37038092 . T C 342.08 PASS AO=68;DP=119;FAO=68;FDP=119;FR=.;FRO=51;FSAF=41;FSAR=27;FSRF=28;FSRR=23;FWDB=-0.0704229;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.8093;QD=11.4984;RBI=0.0709587;REFB=-0.000581148;REVB=0.00870382;RO=51;SAF=41;SAR=27;SRF=28;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0437546;STB=0.523888;TYPE=snp;VARB=-0.00015594;OID=.;OPOS=37038092;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:51:51:68:68:27:41:28:23:27:41:28:23 chr19 37038416 . T C 276.35 PASS AO=64;DP=129;FAO=64;FDP=129;FR=.;FRO=65;FSAF=39;FSAR=25;FSRF=37;FSRR=28;FWDB=0.0264329;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8395;QD=8.56884;RBI=0.0312846;REFB=0.000521323;REVB=-0.0167341;RO=65;SAF=39;SAR=25;SRF=37;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0380924;STB=0.521042;TYPE=snp;VARB=-0.000440309;OID=.;OPOS=37038416;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:65:65:64:64:25:39:37:28:25:39:37:28 chr19 37038418 . TAAAAAC TAAAAC,TAAAA 58.43 PASS AO=18,18;DP=133;FAO=44,1;FDP=114;FR=.;FRO=69;FSAF=38,1;FSAR=6,0;FSRF=30;FSRR=39;FWDB=-0.139226,-0.281495;FXX=0.0086949;HRUN=5,5;LEN=1,2;MLLD=13.3197,21.481;QD=2.05027;RBI=0.181368,0.310232;REFB=-0.0399781,0.013619;REVB=-0.116235,-0.130401;RO=59;SAF=13,16;SAR=5,2;SRF=24;SRR=35;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.384799,0.611282;STB=0.807208,0.991287;TYPE=del,del;VARB=0.0481527,0.0594535;OID=.,.;OPOS=37038419,37038423;OREF=A,AC;OALT=-,-;OMAPALT=TAAAAC,TAAAA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:18,18:104:44,1:114:69:38,1:6,0:30:39:54:59:13,16:5,2:24:35 chr19 37039069 . A C 1586.94 PASS AO=167;DP=168;FAO=167;FDP=167;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0342704;FXX=0.00595203;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.0203;QD=38.0105;RBI=0.0368308;REFB=-0.0306827;REVB=0.0134925;RO=1;SAF=69;SAR=98;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0068472;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000119617;OID=.;OPOS=37039069;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:168:167:1:0:167:167:98:69:1:0:98:69:0:0 chr19 37065732 . A C 1431.95 PASS AO=148;DP=153;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00214505;FXX=0.0196066;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.076;QD=38.1853;RBI=0.0120858;REFB=0;REVB=-0.0118939;RO=0;SAF=69;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.86736e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.2975e-05;OID=.;OPOS=37065732;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:153:150:0:0:148:150:79:69:0:0:79:71:0:0 chr19 37068081 . G C 684.47 PASS AO=72;DP=72;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00597841;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.551;QD=37.5054;RBI=0.0304252;REFB=0;REVB=0.0298321;RO=0;SAF=43;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.16073e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00028256;OID=.;OPOS=37068081;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:72:73:0:0:72:73:29:43:0:0:29:44:0:0 chr19 37117302 . A G 1732.32 PASS AO=138;DP=185;FAO=183;FDP=184;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=89;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0561304;FXX=0.0264536;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.653;QD=37.6592;RBI=0.0630199;REFB=-0.0980344;REVB=0.0286511;RO=1;SAF=59;SAR=79;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00798987;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00118554;OID=.;OPOS=37117302;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:188:184:1:0:138:183:79:59:1:0:94:89:0:0 chr19 37118439 . C T 121.37 PASS AO=33;DP=78;FAO=33;FDP=79;FR=.;FRO=46;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=30;FWDB=0.0301694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.695;QD=6.14505;RBI=0.0411169;REFB=0.0166976;REVB=-0.0279358;RO=45;SAF=12;SAR=21;SRF=16;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00892682;STB=0.509994;TYPE=snp;VARB=-0.0182987;OID=.;OPOS=37118439;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:79:45:46:33:33:21:12:16:29:21:12:16:30 chr19 37134737 . T C 575.82 PASS AO=205;DP=492;FAO=168;FDP=399;FR=.;FRO=231;FSAF=79;FSAR=89;FSRF=103;FSRR=128;FWDB=-0.00171116;FXX=0.00249994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.7182;QD=5.77267;RBI=0.0209372;REFB=-0.0113898;REVB=-0.0208672;RO=287;SAF=99;SAR=106;SRF=128;SRR=159;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0388264;STB=0.51417;TYPE=snp;VARB=0.0176367;OID=.;OPOS=37134737;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:492:399:287:231:205:168:106:99:128:159:89:79:103:128 chr19 37210529 . A G 784.97 PASS AO=87;DP=90;FAO=89;FDP=93;FR=.;FRO=4;FSAF=42;FSAR=47;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.130699;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.022;QD=33.7622;RBI=0.130898;REFB=-0.0848082;REVB=-0.00722203;RO=3;SAF=40;SAR=47;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0342141;STB=0.51198;TYPE=snp;VARB=0.0102037;OID=.;OPOS=37210529;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:90:93:3:4:87:89:47:40:3:0:47:42:3:1 chr19 37210805 . C T 1353.24 PASS AO=142;DP=142;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.8242;QD=38.1195;RBI=0.0177213;REFB=0;REVB=-0.000863819;RO=0;SAF=81;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.26383e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.51116e-05;OID=.;OPOS=37210805;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:142:142:0:0:142:142:61:81:0:0:61:81:0:0 chr19 37239497 . G A 19.17 PASS AO=24;DP=97;FAO=20;FDP=97;FR=.;FRO=77;FSAF=1;FSAR=19;FSRF=30;FSRR=47;FWDB=-0.236361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.9512;QD=0.790663;RBI=0.239027;REFB=-0.0365132;REVB=-0.0356007;RO=64;SAF=3;SAR=21;SRF=21;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.361151;STB=0.898722;TYPE=snp;VARB=0.261214;OID=.;OPOS=37239497;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:97:97:64:77:24:20:21:3:21:43:19:1:30:47 chr19 37241141 . A G 1137.42 PASS AO=118;DP=118;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174439;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.156;QD=38.2326;RBI=0.0204039;REFB=0;REVB=0.0105844;RO=0;SAF=48;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.2502e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.37055e-05;OID=.;OPOS=37241141;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:118:119:0:0:118:119:70:48:0:0:71:48:0:0 chr19 37369924 . G A 187.91 PASS AO=25;DP=31;FAO=26;FDP=32;FR=.;FRO=6;FSAF=25;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0210366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=331.683;QD=23.489;RBI=0.0710395;REFB=-0.00325457;REVB=-0.0678533;RO=6;SAF=24;SAR=1;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223018;STB=0.624882;TYPE=snp;VARB=0.000318622;OID=.;OPOS=37369924;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:31:32:6:6:25:26:1:24:5:1:1:25:5:1 chr19 37441111 . C T 142.51 PASS AO=45;DP=118;FAO=45;FDP=119;FR=.;FRO=74;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=37;FSRR=37;FWDB=0.0137561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.623;QD=4.79024;RBI=0.0404054;REFB=-0.0218277;REVB=-0.0379916;RO=73;SAF=25;SAR=20;SRF=37;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0532706;STB=0.534694;TYPE=snp;VARB=0.023727;OID=.;OPOS=37441111;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:119:73:74:45:45:20:25:37:36:20:25:37:37 chr19 37441462 . T C 81.06 PASS AO=15;DP=27;FAO=15;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=-0.0186956;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.17;QD=12.4708;RBI=0.03147;REFB=-0.0202856;REVB=0.0253146;RO=11;SAF=3;SAR=12;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0216161;STB=0.512179;TYPE=snp;VARB=0.003599;OID=.;OPOS=37441462;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:27:26:11:11:15:15:12:3:2:9:12:3:2:9 chr19 37441980 . A G 384.08 PASS AO=78;DP=139;FAO=78;FDP=139;FR=.;FRO=61;FSAF=32;FSAR=46;FSRF=22;FSRR=39;FWDB=0.00891221;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.3276;QD=11.0526;RBI=0.0131828;REFB=0.0015568;REVB=0.0097138;RO=61;SAF=32;SAR=46;SRF=22;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0415848;STB=0.522669;TYPE=snp;VARB=-0.000800654;OID=.;OPOS=37441980;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:61:61:78:78:46:32:22:39:46:32:22:39 chr19 37482151 . A G 490.65 PASS AO=108;DP=247;FAO=126;FDP=263;FR=.;FRO=137;FSAF=58;FSAR=68;FSRF=63;FSRR=74;FWDB=0.0397441;FXX=0.00378774;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.241;QD=7.46241;RBI=0.0462181;REFB=-0.0274315;REVB=0.0235906;RO=131;SAF=51;SAR=57;SRF=59;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.021705;STB=0.500243;TYPE=snp;VARB=0.029439;OID=.;OPOS=37482151;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:247:263:131:137:108:126:57:51:59:72:68:58:63:74 chr19 37487632 . G A 214.37 PASS AO=44;DP=87;FAO=47;FDP=90;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=31;FSRF=16;FSRR=27;FWDB=-0.0263804;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.2793;QD=9.52771;RBI=0.0467798;REFB=-0.0270945;REVB=0.0386318;RO=42;SAF=15;SAR=29;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0158366;STB=0.516659;TYPE=snp;VARB=0.0206563;OID=.;OPOS=37487632;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:90:42:43:44:47:29:15:15:27:31:16:16:27 chr19 37487723 . G A 244.36 PASS AO=62;DP=135;FAO=62;FDP=136;FR=.;FRO=74;FSAF=23;FSAR=39;FSRF=29;FSRR=45;FWDB=0.00044347;FXX=0.0144917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.968;QD=7.18698;RBI=0.014704;REFB=-0.00370325;REVB=0.0146973;RO=70;SAF=23;SAR=39;SRF=27;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0150257;STB=0.512117;TYPE=snp;VARB=0.00522426;OID=.;OPOS=37487723;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:136:70:74:62:62:39:23:27:43:39:23:29:45 chr19 37487866 . A T 260.64 PASS AO=64;DP=135;FAO=64;FDP=135;FR=.;FRO=71;FSAF=31;FSAR=33;FSRF=29;FSRR=42;FWDB=0.00189672;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=173.105;QD=7.72254;RBI=0.0153962;REFB=-0.0136301;REVB=-0.0152789;RO=70;SAF=31;SAR=33;SRF=28;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0799471;STB=0.540057;TYPE=snp;VARB=0.0133851;OID=.;OPOS=37487866;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:70:71:64:64:33:31:28:42:33:31:29:42 chr19 37487873 . C A 304 PASS AO=68;DP=133;FAO=68;FDP=132;FR=.;FRO=64;FSAF=35;FSAR=33;FSRF=25;FSRR=39;FWDB=-0.00808969;FXX=0.0149243;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.167;QD=9.21203;RBI=0.016493;REFB=-0.00901029;REVB=0.0143728;RO=64;SAF=35;SAR=33;SRF=25;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109177;STB=0.559983;TYPE=snp;VARB=0.00836665;OID=.;OPOS=37487873;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:132:64:64:68:68:33:35:25:39:33:35:25:39 chr19 37488055 . T G 224.01 PASS AO=52;DP=109;FAO=53;FDP=110;FR=.;FRO=57;FSAF=31;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=37;FWDB=0.0147423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.39;QD=8.14562;RBI=0.015401;REFB=-0.000846242;REVB=-0.00445586;RO=57;SAF=30;SAR=22;SRF=20;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210547;STB=0.619745;TYPE=snp;VARB=0.000763989;OID=.;OPOS=37488055;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:110:57:57:52:53:22:30:20:37:22:31:20:37 chr19 37488197 . G A 144.88 PASS AO=53;DP=159;FAO=54;FDP=159;FR=.;FRO=105;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=48;FSRR=57;FWDB=-0.0447161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.075;QD=3.64489;RBI=0.077455;REFB=-0.0332818;REVB=0.0632436;RO=102;SAF=27;SAR=26;SRF=44;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0894249;STB=0.528291;TYPE=snp;VARB=0.0563989;OID=.;OPOS=37488197;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:159:102:105:53:54:26:27:44:58:27:27:48:57 chr19 37488299 . A G 138.78 PASS AO=43;DP=139;FAO=53;FDP=151;FR=.;FRO=98;FSAF=17;FSAR=36;FSRF=29;FSRR=69;FWDB=-0.0961996;FXX=0.013071;HRUN=4;LEN=1;MLLD=34.6196;QD=3.67632;RBI=0.105089;REFB=-0.0710461;REVB=0.0423012;RO=96;SAF=17;SAR=26;SRF=28;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133658;STB=0.518738;TYPE=snp;VARB=0.149785;OID=.;OPOS=37488299;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:151:96:98:43:53:26:17:28:68:36:17:29:69 chr19 37488472 . C G 43.53 PASS AO=10;DP=29;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.182294;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.9467;QD=5.61694;RBI=0.183193;REFB=-0.0185137;REVB=0.0181301;RO=19;SAF=5;SAR=5;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0856821;STB=0.629419;TYPE=snp;VARB=0.0540041;OID=.;OPOS=37488472;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:29:31:19:19:10:12:5:5:8:11:5:7:7:12 chr19 37488481 . G C 55.52 PASS AO=11;DP=22;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.0431545;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.1122;QD=10.0939;RBI=0.0560138;REFB=0.0314692;REVB=0.0357105;RO=11;SAF=4;SAR=7;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0955866;OID=.;OPOS=37488481;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:22:22:11:11:11:11:7:4:4:7:7:4:4:7 chr19 37488499 . T C 61.44 PASS AO=11;DP=20;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0289151;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=281.519;QD=12.2875;RBI=0.0354587;REFB=0.0283587;REVB=-0.020524;RO=8;SAF=4;SAR=7;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00898424;STB=0.53839;TYPE=snp;VARB=-0.0152098;OID=.;OPOS=37488499;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:20:20:8:9:11:11:7:4:3:5:7:4:4:5 chr19 37642968 . A AG 15.01 PASS AO=6;DP=21;FAO=5;FDP=21;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=0;FSRF=16;FSRR=0;FWDB=-0.162059;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=17.3268;QD=2.85973;RBI=0.162059;REFB=-0.0378394;REVB=0;RO=14;SAF=6;SAR=0;SRF=14;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.0346007;OID=.;OPOS=37642969;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:6:21:5:21:16:5:0:16:0:15:14:6:0:14:0 chr19 37690375 . C T 78.13 PASS AO=24;DP=64;FAO=24;FDP=65;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=26;FSRR=15;FWDB=0.0310314;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.558;QD=4.80822;RBI=0.0533474;REFB=-0.0144861;REVB=-0.0433935;RO=40;SAF=16;SAR=8;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0201206;STB=0.522708;TYPE=snp;VARB=0.0352583;OID=.;OPOS=37690375;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:64:65:40:41:24:24:8:16:26:14:8:16:26:15 chr19 37690420 . C T 569.91 PASS AO=65;DP=70;FAO=66;FDP=70;FR=.;FRO=4;FSAF=30;FSAR=36;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0289017;FXX=0.0140825;HRUN=4;LEN=1;MLLD=81.4241;QD=32.5664;RBI=0.0832963;REFB=-0.18056;REVB=0.0781214;RO=1;SAF=30;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154862;STB=0.531241;TYPE=snp;VARB=0.00283509;OID=.;OPOS=37690420;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:70:70:1:4:65:66:35:30:1:0:36:30:4:0 chr19 37825633 . A T 64.25 PASS AO=26;DP=86;FAO=26;FDP=86;FR=.;FRO=60;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=39;FWDB=0.0393283;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.8296;QD=2.98819;RBI=0.0454257;REFB=-0.0264481;REVB=-0.0227327;RO=60;SAF=15;SAR=11;SRF=21;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.263488;STB=0.654337;TYPE=snp;VARB=0.0553765;OID=.;OPOS=37825633;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:86:86:60:60:26:26:11:15:21:39:11:15:21:39 chr19 37854235 . G T 65.54 PASS AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=1;FSRF=17;FSRR=1;FWDB=0.0079993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.42;QD=7.94426;RBI=0.0299197;REFB=-0.0514191;REVB=0.0288305;RO=18;SAF=14;SAR=1;SRF=17;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0443915;STB=0.525391;TYPE=snp;VARB=0.0311099;OID=.;OPOS=37854235;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:33:33:18:18:15:15:1:14:17:1:1:14:17:1 chr19 37879589 . A G 102.62 PASS AO=26;DP=60;FAO=26;FDP=60;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.0137962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.646;QD=6.84098;RBI=0.0284861;REFB=-0.0115137;REVB=0.0249224;RO=33;SAF=11;SAR=15;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121005;STB=0.56052;TYPE=snp;VARB=0.0126415;OID=.;OPOS=37879589;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:33:34:26:26:15:11:18:15:15:11:18:16 chr19 37879853 . C T 59.43 PASS AO=22;DP=70;FAO=22;FDP=70;FR=.;FRO=48;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=29;FSRR=19;FWDB=-0.00728141;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.253;QD=3.39591;RBI=0.00746606;REFB=-0.00383099;REVB=-0.00165021;RO=47;SAF=14;SAR=8;SRF=29;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239312;STB=0.523524;TYPE=snp;VARB=0.0229292;OID=.;OPOS=37879853;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:70:70:47:48:22:22:8:14:29:18:8:14:29:19 chr19 37879854 . A G 59.37 PASS AO=22;DP=70;FAO=22;FDP=70;FR=.;FRO=48;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=29;FSRR=19;FWDB=-0.0811823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.9499;QD=3.39236;RBI=0.0832333;REFB=0.00287385;REVB=-0.0183634;RO=42;SAF=14;SAR=8;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10381;STB=0.523524;TYPE=snp;VARB=-0.0183257;OID=.;OPOS=37879854;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:70:70:42:48:22:22:8:14:23:19:8:14:29:19 chr19 37879855 . T TGCA 74.84 PASS AO=21;DP=64;FAO=22;FDP=59;FR=.;FRO=37;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=-0.0436067;FXX=0.15712;HRUN=0;LEN=3;MLLD=201.525;QD=5.07366;RBI=0.0489704;REFB=-0.0137113;REVB=-0.0222836;RO=37;SAF=13;SAR=8;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147518;STB=0.596126;TYPE=ins;VARB=0.0132784;OID=.;OPOS=37879856;OREF=-;OALT=GCA;OMAPALT=TGCA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:21:64:22:59:37:14:8:18:19:74:37:13:8:18:19 chr19 37905073 . C G 234.15 PASS AO=66;DP=162;FAO=68;FDP=165;FR=.;FRO=97;FSAF=34;FSAR=34;FSRF=38;FSRR=59;FWDB=0.0139514;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.463;QD=5.67633;RBI=0.0492481;REFB=-0.0196583;REVB=-0.0472306;RO=96;SAF=33;SAR=33;SRF=38;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110027;STB=0.563618;TYPE=snp;VARB=0.0282434;OID=.;OPOS=37905073;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:165:96:97:66:68:33:33:38:58:34:34:38:59 chr19 38027957 . A G 353.76 PASS AO=86;DP=179;FAO=86;FDP=179;FR=.;FRO=93;FSAF=54;FSAR=32;FSRF=65;FSRR=28;FWDB=0.0117325;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.836;QD=7.90532;RBI=0.0259809;REFB=-0.00450251;REVB=0.0231809;RO=91;SAF=54;SAR=32;SRF=63;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0655647;STB=0.540286;TYPE=snp;VARB=0.00468876;OID=.;OPOS=38027957;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:179:91:93:86:86:32:54:63:28:32:54:65:28 chr19 38030265 . G A 1144.69 PASS AO=120;DP=121;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164179;FXX=0.00826378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.293;QD=38.1562;RBI=0.0176757;REFB=0;REVB=0.00654838;RO=0;SAF=65;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.24966e-05;OID=.;OPOS=38030265;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:121:120:0:0:120:120:55:65:0:0:55:65:0:0 chr19 38033251 . C T 787.4 PASS AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0059075;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.9468;QD=37.9471;RBI=0.0212351;REFB=0;REVB=-0.0203968;RO=0;SAF=50;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.15707e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.60251e-05;OID=.;OPOS=38033251;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:84:83:0:0:83:83:33:50:0:0:33:50:0:0 chr19 38046967 . G A 1473.43 PASS AO=150;DP=152;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00491945;FXX=0.00632871;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.194;QD=37.5395;RBI=0.0374898;REFB=0;REVB=0.0371656;RO=1;SAF=81;SAR=69;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00684365;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.53233e-05;OID=.;OPOS=38046967;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:152:157:1:0:150:157:69:81:0:1:74:83:0:0 chr19 38055612 . A T 1723.83 PASS AO=183;DP=187;FAO=184;FDP=184;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00934824;FXX=0.0160419;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.542;QD=37.4746;RBI=0.0391865;REFB=-0.136699;REVB=0.0380551;RO=2;SAF=73;SAR=110;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00857728;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000133913;OID=.;OPOS=38055612;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:187:184:2:0:183:184:110:73:0:2:111:73:0:0 chr19 38056574 . T A 1206.27 PASS AO=130;DP=132;FAO=130;FDP=132;FR=.;FRO=2;FSAF=59;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0282692;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7375;QD=36.5536;RBI=0.0357708;REFB=-0.0603855;REVB=-0.021918;RO=2;SAF=59;SAR=71;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.013198;STB=0.506943;TYPE=snp;VARB=0.00204842;OID=.;OPOS=38056574;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:132:132:2:2:130:130:71:59:0:2:71:59:0:2 chr19 38063125 . C CT 1333.2 PASS AO=158;DP=184;FAO=177;FDP=177;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0265279;FXX=0.0111726;HRUN=1;LEN=1;MLLD=24.3773;QD=30.1287;RBI=0.295466;REFB=-0.0167131;REVB=0.294272;RO=23;SAF=74;SAR=84;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0186207;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00302772;OID=.;OPOS=38063126;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:158:184:177:177:0:79:98:0:0:99:23:74:84:9:14 chr19 38091932 . A T 519.71 PASS AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.502;QD=37.7969;RBI=0.0146521;REFB=0;REVB=0.000867896;RO=0;SAF=18;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.85968e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.22669e-05;OID=.;OPOS=38091932;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:55:55:0:0:55:55:37:18:0:0:37:18:0:0 chr19 38202516 . A C 841.68 PASS AO=89;DP=89;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023347;FXX=0.0322546;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.959;QD=37.408;RBI=0.143885;REFB=0;REVB=0.141978;RO=0;SAF=42;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.28712e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0020333;OID=.;OPOS=38202516;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:89:90:0:0:89:90:47:42:0:0:51:39:0:0 chr19 38314767 . A G 1326.5 PASS AO=151;DP=160;FAO=151;FDP=160;FR=.;FRO=9;FSAF=89;FSAR=62;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.00978931;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=252.379;QD=33.1625;RBI=0.00998591;REFB=-0.0639444;REVB=-0.00197174;RO=7;SAF=89;SAR=62;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108793;STB=0.501965;TYPE=snp;VARB=0.000712503;OID=.;OPOS=38314767;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:160:160:7:9:151:151:62:89:5:2:62:89:5:4 chr19 38376485 . T A 1841.51 PASS AO=196;DP=199;FAO=197;FDP=197;FR=.;FRO=0;FSAF=117;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0163399;FXX=0.0149993;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.716;QD=37.391;RBI=0.0456772;REFB=-0.0500055;REVB=0.0426546;RO=3;SAF=117;SAR=79;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177378;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000111667;OID=.;OPOS=38376485;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:199:197:3:0:196:197:79:117:0:3:80:117:0:0 chr19 38377409 . A T 73.83 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.8458;QD=36.9158;RBI=0.0155193;REFB=0;REVB=0.0155193;RO=0;SAF=0;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00161407;OID=.;OPOS=38377409;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:8:0:0:0:8:0:0:0 chr19 38377564 . T C 945.02 PASS AO=103;DP=106;FAO=105;FDP=107;FR=.;FRO=2;FSAF=53;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0330595;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=52.3045;QD=35.3277;RBI=0.0472543;REFB=-0.111269;REVB=-0.0337644;RO=2;SAF=51;SAR=52;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000175443;STB=0.509432;TYPE=snp;VARB=-0.000427968;OID=.;OPOS=38377564;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:106:107:2:2:103:105:52:51:1:1:52:53:0:2 chr19 38377773 . G A 1437.97 PASS AO=147;DP=147;FAO=151;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0617631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.9928;QD=38.092;RBI=0.0623606;REFB=0;REVB=-0.00861202;RO=0;SAF=68;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.92383e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000159064;OID=.;OPOS=38377773;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:147:151:0:0:147:151:79:68:0:0:79:72:0:0 chr19 38378107 . G A 1627.09 PASS AO=169;DP=169;FAO=169;FDP=169;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=128;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0478113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.6196;QD=38.5109;RBI=0.0478663;REFB=0;REVB=0.00229551;RO=0;SAF=41;SAR=128;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.0245e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000196943;OID=.;OPOS=38378107;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:169:169:0:0:169:169:128:41:0:0:128:41:0:0 chr19 38378539 . G C 1815.71 PASS AO=188;DP=189;FAO=188;FDP=188;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00977144;FXX=0.0105258;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.692;QD=38.6321;RBI=0.0199972;REFB=0;REVB=0.0174473;RO=0;SAF=95;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.91535e-05;OID=.;OPOS=38378539;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:189:188:0:0:188:188:93:95:0:0:93:95:0:0 chr19 38379446 . C T 1170.82 PASS AO=122;DP=122;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.891;QD=38.0753;RBI=0.0181709;REFB=0;REVB=0.00824796;RO=0;SAF=32;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.42706e-06;OID=.;OPOS=38379446;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:122:123:0:0:122:123:90:32:0:0:91:32:0:0 chr19 38382328 . C T 2897.92 PASS AO=306;DP=311;FAO=306;FDP=306;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=202;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00646294;FXX=0.0160767;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.9257;QD=37.8814;RBI=0.018326;REFB=-0.0125023;REVB=-0.0171486;RO=0;SAF=104;SAR=202;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.88227e-05;OID=.;OPOS=38382328;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:311:306:0:0:306:306:202:104:0:0:202:104:0:0 chr19 38384421 . C G 365.7 PASS AO=40;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0806388;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.4006;QD=34.8281;RBI=0.0893237;REFB=0.0691867;REVB=-0.03842;RO=0;SAF=16;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509799;TYPE=snp;VARB=-0.00829605;OID=.;OPOS=38384421;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:42:42:0:1:40:41:24:16:0:0:25:16:0:1 chr19 38573149 . G C 48.76 PASS AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.00138568;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=200.671;QD=7.80153;RBI=0.00313845;REFB=-0.00982041;REVB=-0.00281598;RO=13;SAF=5;SAR=6;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140078;STB=0.596848;TYPE=snp;VARB=0.00457639;OID=.;OPOS=38573149;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:24:25:13:14:11:11:6:5:4:9:6:5:4:10 chr19 38610504 . G A 188.63 PASS AO=51;DP=126;FAO=53;FDP=126;FR=.;FRO=73;FSAF=35;FSAR=18;FSRF=54;FSRR=19;FWDB=0.00854346;FXX=0.0156238;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.422;QD=5.98814;RBI=0.0192041;REFB=-0.0198037;REVB=0.017199;RO=74;SAF=34;SAR=17;SRF=54;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0769619;STB=0.552967;TYPE=snp;VARB=0.0271191;OID=.;OPOS=38610504;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:74:73:51:53:17:34:54:20:18:35:54:19 chr19 38652993 . C T 82.28 PASS AO=16;DP=32;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.00523884;FXX=0.0294031;HRUN=5;LEN=1;MLLD=226.702;QD=9.97314;RBI=0.00566672;REFB=-0.0146245;REVB=0.00216016;RO=16;SAF=5;SAR=11;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120505;STB=0.578217;TYPE=snp;VARB=0.00876179;OID=.;OPOS=38652993;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:32:33:16:16:16:17:11:5:7:9:12:5:7:9 chr19 38698997 . G T 292.02 PASS AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123191;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.194;QD=38.9356;RBI=0.0643767;REFB=0;REVB=-0.063187;RO=0;SAF=14;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.56309e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00021654;OID=.;OPOS=38698997;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:30:30:0:0:30:30:16:14:0:0:16:14:0:0 chr19 38709568 . C T 364.35 PASS AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0714665;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=74.8341;QD=36.4353;RBI=0.0744774;REFB=-0.160589;REVB=0.0209625;RO=1;SAF=26;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0346908;STB=0.518509;TYPE=snp;VARB=0.00446023;OID=.;OPOS=38709568;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:40:40:1:1:39:39:13:26:0:1:13:26:0:1 chr19 38861333 . G A 844.29 PASS AO=89;DP=92;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0049954;FXX=0.0326052;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.433;QD=37.9459;RBI=0.0860604;REFB=0;REVB=0.0859153;RO=0;SAF=56;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.72195e-05;OID=.;OPOS=38861333;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:92:89:0:0:89:89:33:56:0:0:33:56:0:0 chr19 38893856 . G C 46.47 PASS AO=11;DP=26;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.0181112;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=126.796;QD=7.1498;RBI=0.021886;REFB=-0.0259765;REVB=0.0122875;RO=15;SAF=2;SAR=9;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.496106;STB=0.793558;TYPE=snp;VARB=0.0489969;OID=.;OPOS=38893856;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:26:26:15:15:11:11:9:2:10:5:9:2:10:5 chr19 38903399 . G A 134.94 PASS AO=41;DP=110;FAO=42;FDP=111;FR=.;FRO=69;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=32;FSRR=37;FWDB=0.0197053;FXX=0.0176975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.27;QD=4.86266;RBI=0.0202748;REFB=-0.0156469;REVB=-0.00477176;RO=69;SAF=23;SAR=18;SRF=32;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106808;STB=0.552054;TYPE=snp;VARB=0.0277378;OID=.;OPOS=38903399;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:111:69:69:41:42:18:23:32:37:19:23:32:37 chr19 38907788 . A AG 10.03 PASS AO=5;DP=27;FAO=6;FDP=27;FR=.;FRO=21;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.199744;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=91.7887;QD=1.48579;RBI=0.200121;REFB=-0.00357881;REVB=0.0122677;RO=22;SAF=0;SAR=5;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.651987;STB=0.71347;TYPE=ins;VARB=0.163482;OID=.;OPOS=38907789;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:5:27:6:27:21:1:5:8:13:10:22:0:5:9:13 chr19 38912764 . A G 188.73 PASS AO=40;DP=77;FAO=40;FDP=77;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.0112311;FXX=0.0493766;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2834;QD=9.80438;RBI=0.0461042;REFB=-0.0307735;REVB=-0.0447153;RO=32;SAF=15;SAR=25;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.052935;STB=0.542351;TYPE=snp;VARB=0.0380545;OID=.;OPOS=38912764;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:32:37:40:40:25:15:14:18:25:15:17:20 chr19 38935280 . A G 283.17 PASS AO=77;DP=178;FAO=77;FDP=177;FR=.;FRO=100;FSAF=40;FSAR=37;FSRF=29;FSRR=71;FWDB=-0.0185122;FXX=0.00561766;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.5268;QD=6.39933;RBI=0.0438325;REFB=-0.0230911;REVB=-0.0397314;RO=100;SAF=40;SAR=37;SRF=29;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23191;STB=0.628515;TYPE=snp;VARB=0.0338644;OID=.;OPOS=38935280;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:177:100:100:77:77:37:40:29:71:37:40:29:71 chr19 38939408 . T C 447.88 PASS AO=45;DP=45;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00201717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.336;QD=38.1171;RBI=0.111733;REFB=0;REVB=0.111715;RO=0;SAF=18;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000893624;OID=.;OPOS=38939408;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:45:47:0:0:45:47:27:18:0:0:29:18:0:0 chr19 38946182 . G A 1177.76 PASS AO=133;DP=140;FAO=134;FDP=141;FR=.;FRO=7;FSAF=59;FSAR=75;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=0.0434958;FXX=0.00704176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.672;QD=33.4116;RBI=0.0671632;REFB=-0.178958;REVB=0.0511763;RO=3;SAF=59;SAR=74;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0235516;STB=0.527996;TYPE=snp;VARB=0.00315878;OID=.;OPOS=38946182;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:140:141:3:7:133:134:74:59:3:0:75:59:7:0 chr19 38949904 . C T 89.2 PASS AO=20;DP=42;FAO=20;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=0.0239046;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=90.8811;QD=8.49529;RBI=0.0301668;REFB=-0.0178233;REVB=-0.0184013;RO=22;SAF=5;SAR=15;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0797219;STB=0.545407;TYPE=snp;VARB=0.0110249;OID=.;OPOS=38949904;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:42:42:22:22:20:20:15:5:7:15:15:5:7:15 chr19 38956803 . G A 349.31 PASS AO=74;DP=147;FAO=78;FDP=151;FR=.;FRO=73;FSAF=26;FSAR=52;FSRF=37;FSRR=36;FWDB=-0.000966473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.587;QD=9.25336;RBI=0.0313309;REFB=-0.0220483;REVB=0.031316;RO=72;SAF=26;SAR=48;SRF=37;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151509;STB=0.588762;TYPE=snp;VARB=0.0174891;OID=.;OPOS=38956803;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:151:72:73:74:78:48:26:37:35:52:26:37:36 chr19 38959680 . C T 155.01 PASS AO=39;DP=88;FAO=40;FDP=89;FR=.;FRO=49;FSAF=5;FSAR=35;FSRF=13;FSRR=36;FWDB=-0.0141124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.1066;QD=6.96684;RBI=0.0334829;REFB=-0.0117609;REVB=0.0303635;RO=49;SAF=5;SAR=34;SRF=13;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.238239;STB=0.639512;TYPE=snp;VARB=0.0205802;OID=.;OPOS=38959680;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:89:49:49:39:40:34:5:13:36:35:5:13:36 chr19 38981284 . A G 202.67 PASS AO=55;DP=127;FAO=55;FDP=127;FR=.;FRO=72;FSAF=34;FSAR=21;FSRF=50;FSRR=22;FWDB=0.00271833;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.4478;QD=6.38342;RBI=0.0623977;REFB=-0.0249301;REVB=0.0623384;RO=72;SAF=34;SAR=21;SRF=50;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0838723;STB=0.546791;TYPE=snp;VARB=0.037032;OID=.;OPOS=38981284;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:72:72:55:55:21:34:50:22:21:34:50:22 chr19 38983178 . TGG TG,TGT 492.7 PASS AO=30,45;DP=111;FAO=40,47;FDP=105;FR=.;FRO=18;FSAF=6,26;FSAR=34,21;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=0.173433,0.0133525;FXX=0.0277752;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=16.3171,185.653;QD=18.7694;RBI=0.193388,0.0138382;REFB=-0.105612,-0.000323772;REVB=0.0855577,-0.00363406;RO=22;SAF=3,24;SAR=27,21;SRF=14;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0.328947,0;SSSB=-0.556284,-0.0629376;STB=0.718183,0.531987;TYPE=del,snp;VARB=0.170257,-0.00532598;OID=.,.;OPOS=38983179,38983180;OREF=G,G;OALT=-,T;OMAPALT=TG,TGT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:30,45:103:40,47:105:18:6,26:34,21:12:6:99:22:3,24:27,21:14:8 chr19 38991516 . G A 30.13 PASS AO=11;DP=38;FAO=11;FDP=38;FR=.;FRO=27;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=-0.00188781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.181;QD=3.17179;RBI=0.00382309;REFB=-0.0171675;REVB=0.00332448;RO=26;SAF=5;SAR=6;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0819496;STB=0.533919;TYPE=snp;VARB=0.0330755;OID=.;OPOS=38991516;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:38:38:26:27:11:11:6:5:10:16:6:5:11:16 chr19 38991543 . G A 43.34 PASS AO=12;DP=33;FAO=12;FDP=33;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0271753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.881;QD=5.25339;RBI=0.0314125;REFB=-0.0217476;REVB=0.0157559;RO=21;SAF=7;SAR=5;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.064554;STB=0.538397;TYPE=snp;VARB=0.0308218;OID=.;OPOS=38991543;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:33:33:21:21:12:12:5:7:11:10:5:7:11:10 chr19 38993547 . C T 303.51 PASS AO=78;DP=171;FAO=78;FDP=171;FR=.;FRO=93;FSAF=54;FSAR=24;FSRF=66;FSRR=27;FWDB=0.001603;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.071;QD=7.09964;RBI=0.0355951;REFB=-0.0157217;REVB=0.035559;RO=93;SAF=54;SAR=24;SRF=66;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0201636;STB=0.511179;TYPE=snp;VARB=0.0183976;OID=.;OPOS=38993547;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:171:93:93:78:78:24:54:66:27:24:54:66:27 chr19 38994910 . G A 342.11 PASS AO=64;DP=98;FAO=64;FDP=106;FR=.;FRO=42;FSAF=29;FSAR=35;FSRF=10;FSRR=32;FWDB=0.0192099;FXX=0.0275204;HRUN=3;LEN=1;MLLD=203.913;QD=12.9097;RBI=0.0351191;REFB=-0.0301159;REVB=-0.0293996;RO=32;SAF=29;SAR=35;SRF=10;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0884071;STB=0.587338;TYPE=snp;VARB=0.0147479;OID=.;OPOS=38994910;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:106:32:42:64:64:35:29:10:22:35:29:10:32 chr19 38995438 . T C 135.8 PASS AO=42;DP=110;FAO=42;FDP=110;FR=.;FRO=68;FSAF=12;FSAR=30;FSRF=24;FSRR=44;FWDB=-0.000436332;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.032;QD=4.93819;RBI=0.0288484;REFB=-0.0225146;REVB=0.0288451;RO=68;SAF=12;SAR=30;SRF=24;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0853499;STB=0.548756;TYPE=snp;VARB=0.0406306;OID=.;OPOS=38995438;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:68:68:42:42:30:12:24:44:30:12:24:44 chr19 38995510 . T C 185.11 PASS AO=37;DP=66;FAO=37;FDP=66;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=-0.0152407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.748;QD=11.2188;RBI=0.0202489;REFB=-0.0319739;REVB=0.0133318;RO=29;SAF=13;SAR=24;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218265;STB=0.620451;TYPE=snp;VARB=0.0389678;OID=.;OPOS=38995510;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:29:29:37:37:24:13:18:11:24:13:18:11 chr19 38995975 . G A 130.4 PASS AO=32;DP=89;FAO=38;FDP=95;FR=.;FRO=57;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=34;FSRR=23;FWDB=0.00916728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.723;QD=5.4907;RBI=0.0137083;REFB=-0.026319;REVB=0.010192;RO=56;SAF=15;SAR=17;SRF=34;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152438;STB=0.588739;TYPE=snp;VARB=0.0371774;OID=.;OPOS=38995975;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:95:56:57:32:38:17:15:34:22:21:17:34:23 chr19 38996990 . T C 110.82 PASS AO=27;DP=60;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=9;FSRR=24;FWDB=0.021912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.174;QD=7.38818;RBI=0.0225169;REFB=-0.00918692;REVB=-0.0051842;RO=33;SAF=7;SAR=20;SRF=9;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0168818;STB=0.509547;TYPE=snp;VARB=0.0185995;OID=.;OPOS=38996990;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:33:33:27:27:20:7:9:24:20:7:9:24 chr19 39002725 . A G 207.12 PASS AO=39;DP=61;FAO=39;FDP=60;FR=.;FRO=21;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.0488865;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.542;QD=13.8078;RBI=0.0488904;REFB=-0.00871075;REVB=-0.000615228;RO=21;SAF=24;SAR=15;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122613;STB=0.58329;TYPE=snp;VARB=0.0164565;OID=.;OPOS=39002725;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:61:60:21:21:39:39:15:24:9:12:15:24:8:13 chr19 39010053 . C T 136.85 PASS AO=27;DP=49;FAO=27;FDP=49;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.000668342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.941;QD=11.1716;RBI=0.0524783;REFB=-0.00895577;REVB=0.0524741;RO=22;SAF=14;SAR=13;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0516261;STB=0.52868;TYPE=snp;VARB=0.0117803;OID=.;OPOS=39010053;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:49:49:22:22:27:27:13:14:10:12:13:14:10:12 chr19 39101870 . T C 184.76 PASS AO=50;DP=117;FAO=50;FDP=116;FR=.;FRO=66;FSAF=11;FSAR=39;FSRF=8;FSRR=58;FWDB=0.0170666;FXX=0.00854628;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.2404;QD=6.37115;RBI=0.0485605;REFB=-0.00464211;REVB=-0.0454626;RO=65;SAF=11;SAR=39;SRF=8;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158401;STB=0.590123;TYPE=snp;VARB=0.00624909;OID=.;OPOS=39101870;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:116:65:66:50:50:39:11:8:57:39:11:8:58 chr19 39109975 . C T 181.84 PASS AO=52;DP=116;FAO=52;FDP=127;FR=.;FRO=75;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=47;FSRR=28;FWDB=-0.0312459;FXX=0.0155027;HRUN=3;LEN=1;MLLD=96.329;QD=5.72733;RBI=0.03147;REFB=-0.0220862;REVB=0.00374893;RO=63;SAF=24;SAR=28;SRF=37;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122983;STB=0.596602;TYPE=snp;VARB=0.0292496;OID=.;OPOS=39109975;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:127:63:75:52:52:28:24:37:26:28:24:47:28 chr19 39196745 . C T 157.91 PASS AO=37;DP=76;FAO=37;FDP=77;FR=.;FRO=40;FSAF=10;FSAR=27;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=0.0298397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.019;QD=8.20298;RBI=0.0388785;REFB=-0.00753429;REVB=-0.0249226;RO=39;SAF=10;SAR=27;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199029;STB=0.619884;TYPE=snp;VARB=0.0135032;OID=.;OPOS=39196745;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:77:39:40:37:37:27:10:18:21:27:10:19:21 chr19 39224413 . A G 350.95 PASS AO=40;DP=42;FAO=40;FDP=42;FR=.;FRO=2;FSAF=9;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.000542777;FXX=0.0454442;HRUN=3;LEN=1;MLLD=134.531;QD=33.4239;RBI=0.0197955;REFB=0.162926;REVB=-0.0197881;RO=2;SAF=9;SAR=31;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0293063;STB=0.515617;TYPE=snp;VARB=-0.00249873;OID=.;OPOS=39224413;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:42:42:2:2:40:40:31:9:0:2:31:9:0:2 chr19 39229089 . A G 29.68 PASS AO=4;DP=12;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=-0.00793032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.207;QD=8.48108;RBI=0.0939235;REFB=-0.00433371;REVB=0.0935881;RO=7;SAF=3;SAR=1;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158242;STB=0.642419;TYPE=snp;VARB=0.0095731;OID=.;OPOS=39229089;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:12:14:7:8:4:6:1:3:6:1:3:3:6:2 chr19 39230748 . C G 82.48 PASS AO=12;DP=16;FAO=12;FDP=16;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.135386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.802;QD=20.6212;RBI=0.135766;REFB=-0.0307834;REVB=0.0101461;RO=4;SAF=1;SAR=11;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139102;STB=0.57681;TYPE=snp;VARB=0.01008;OID=.;OPOS=39230748;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:16:16:4:4:12:12:11:1:0:4:11:1:0:4 chr19 39233146 . A G 1095.07 PASS AO=115;DP=117;FAO=118;FDP=119;FR=.;FRO=1;FSAF=62;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.031022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.929;QD=36.8089;RBI=0.143311;REFB=-0.129114;REVB=0.139913;RO=0;SAF=62;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19391e-08;STB=0.504424;TYPE=snp;VARB=0.00162786;OID=.;OPOS=39233146;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:117:119:0:1:115:118:53:62:0:0:56:62:0:1 chr19 39308190 . C T 221.12 PASS AO=50;DP=100;FAO=50;FDP=100;FR=.;FRO=50;FSAF=19;FSAR=31;FSRF=12;FSRR=38;FWDB=0.0218367;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.925;QD=8.84486;RBI=0.0554586;REFB=0.000897318;REVB=0.0509786;RO=50;SAF=19;SAR=31;SRF=12;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139934;STB=0.576996;TYPE=snp;VARB=-0.000457859;OID=.;OPOS=39308190;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:50:50:50:50:31:19:12:38:31:19:12:38 chr19 39322087 . T G 239.18 PASS AO=62;DP=140;FAO=63;FDP=140;FR=.;FRO=77;FSAF=29;FSAR=34;FSRF=47;FSRR=30;FWDB=-0.0183299;FXX=0.0209776;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.659;QD=6.83381;RBI=0.0183342;REFB=-0.0178488;REVB=-0.000400561;RO=76;SAF=29;SAR=33;SRF=46;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135355;STB=0.581956;TYPE=snp;VARB=0.0223123;OID=.;OPOS=39322087;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:76:77:62:63:33:29:46:30:34:29:47:30 chr19 39362305 . GC G 399.83 PASS AO=44;DP=68;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.232988;FXX=0.0140825;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.6708;QD=22.8475;RBI=0.335213;REFB=0.0157202;REVB=0.241007;RO=7;SAF=28;SAR=16;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167421;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00947238;OID=.;OPOS=39362306;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:44:63:70:70:0:40:30:0:0:30:7:28:16:0:7 chr19 39364584 . C T 281.79 PASS AO=75;DP=171;FAO=75;FDP=170;FR=.;FRO=95;FSAF=43;FSAR=32;FSRF=58;FSRR=37;FWDB=0.0116733;FXX=0.00584761;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.6463;QD=6.63033;RBI=0.0407916;REFB=0.00164414;REVB=-0.0390856;RO=94;SAF=43;SAR=32;SRF=57;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0339599;STB=0.521369;TYPE=snp;VARB=-0.000836181;OID=.;OPOS=39364584;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:170:94:95:75:75:32:43:57:37:32:43:58:37 chr19 39385532 . T C 97.91 PASS AO=12;DP=35;FAO=13;FDP=33;FR=.,HEALED;FRO=14;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0648657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.967;QD=11.8677;RBI=0.066739;REFB=-0.0248146;REVB=0.0157012;RO=14;SAF=1;SAR=11;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.442137;STB=0.657839;TYPE=snp;VARB=0.0344945;OID=.;OPOS=39385532;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:33:33:14:14:12:13:11:1:5:9:11:2:5:9 chr19 39432783 . T C 263.03 PASS AO=70;DP=157;FAO=70;FDP=158;FR=.;FRO=88;FSAF=38;FSAR=32;FSRF=46;FSRR=42;FWDB=-0.00934452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.923;QD=6.65909;RBI=0.0134321;REFB=-0.0242589;REVB=-0.00964888;RO=87;SAF=38;SAR=32;SRF=46;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141371;STB=0.51127;TYPE=snp;VARB=0.0295854;OID=.;OPOS=39432783;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:158:87:88:70:70:32:38:46:41:32:38:46:42 chr19 39433299 . A G 110.37 PASS AO=32;DP=84;FAO=33;FDP=85;FR=.;FRO=52;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=34;FWDB=0.00526063;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.701;QD=5.19393;RBI=0.00721547;REFB=0.000488068;REVB=0.0049385;RO=51;SAF=20;SAR=12;SRF=18;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.28742;STB=0.655418;TYPE=snp;VARB=-0.000898249;OID=.;OPOS=39433299;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:85:51:52:32:33:12:20:18:33:13:20:18:34 chr19 39521881 . GGCC GC,G 598.6 PASS AO=21,18;DP=102;FAO=80,9;FDP=92;FR=.;FRO=3;FSAF=35,9;FSAR=45,0;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.208794,-0.136079;FXX=0.079992;HRUN=4,4;LEN=2,3;MLLD=24.3394,21.0069;QD=26.0259;RBI=0.305265,0.31128;REFB=-0.0532514,-0.0189798;REVB=0.222692,0.27996;RO=52;SAF=20,18;SAR=1,0;SRF=5;SRR=47;SSEN=0.466357,0.466357;SSEP=0,0;SSSB=0.834373,0.872927;STB=0.508395,0.997923;TYPE=del,del;VARB=0.00189508,0.00773549;OID=.,.;OPOS=39521882,39521882;OREF=GC,GCC;OALT=-,-;OMAPALT=GC,G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:21,18:100:80,9:92:3:35,9:45,0:2:1:6:52:20,18:1,0:5:47 chr19 39589189 . C T 496.4 PASS AO=77;DP=159;FAO=85;FDP=153;FR=.,HEALED;FRO=50;FSAF=52;FSAR=33;FSRF=19;FSRR=31;FWDB=-0.0110452;FXX=0.0377335;HRUN=4;LEN=1;MLLD=228.936;QD=12.9777;RBI=0.02311;REFB=-0.0383257;REVB=-0.0202997;RO=35;SAF=50;SAR=27;SRF=11;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199558;STB=0.586825;TYPE=snp;VARB=0.0188965;OID=.;OPOS=39589189;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:153:35:50:77:85:27:50:11:24:33:52:19:31 chr19 39590955 . G A 140.17 PASS AO=28;DP=47;FAO=29;FDP=54;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=6;FWDB=0.0032744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.559;QD=10.3828;RBI=0.0101109;REFB=-0.032324;REVB=-0.009566;RO=19;SAF=6;SAR=22;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.383214;STB=0.74462;TYPE=snp;VARB=0.0123698;OID=.;OPOS=39590955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:54:19:25:28:29:22:6:13:6:22:7:19:6 chr19 39664347 . C T 10.38 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.982;QD=5.93112;RBI=0.0134391;REFB=-0.00554865;REVB=-0.0134391;RO=5;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0808281;OID=.;OPOS=39664347;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:5:5:2:2:2:0:0:5:2:0:0:5 chr19 39688901 . G T 163.89 PASS AO=37;DP=74;FAO=37;FDP=74;FR=.;FRO=37;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=13;FSRR=24;FWDB=0.0615299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.728;QD=8.85903;RBI=0.0693551;REFB=-0.05617;REVB=0.0320032;RO=35;SAF=14;SAR=23;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0333937;STB=0.514457;TYPE=snp;VARB=0.0693788;OID=.;OPOS=39688901;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:35:37:37:37:23:14:12:23:23:14:13:24 chr19 39735106 . T C 107.81 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0359127;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.7544;QD=35.9352;RBI=0.0452858;REFB=0;REVB=-0.0275878;RO=0;SAF=10;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00382786;OID=.;OPOS=39735106;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:2:10:0:0:2:10:0:0 chr19 39735607 . T C 101.58 PASS AO=27;DP=64;FAO=27;FDP=64;FR=.;FRO=37;FSAF=23;FSAR=4;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=-0.00561401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.754;QD=6.34877;RBI=0.0067418;REFB=-7.17614e-05;REVB=-0.00373293;RO=37;SAF=23;SAR=4;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.432665;STB=0.750527;TYPE=snp;VARB=0.000235748;OID=.;OPOS=39735607;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:64:37:37:27:27:4:23:19:18:4:23:19:18 chr19 39760191 . A G 170.83 PASS AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0440518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.282;QD=37.9621;RBI=0.0442584;REFB=0;REVB=0.00427145;RO=0;SAF=5;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000645367;OID=.;OPOS=39760191;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:18:0:0:18:18:13:5:0:0:13:5:0:0 chr19 39888449 . C T 450.8 PASS AO=48;DP=50;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0744539;FXX=0.019996;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.348;QD=36.7996;RBI=0.0815275;REFB=-0.108852;REVB=0.0332169;RO=1;SAF=25;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.020015;STB=0.510634;TYPE=snp;VARB=0.00578507;OID=.;OPOS=39888449;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:50:49:1:1:48:48:23:25:0:1:23:25:0:1 chr19 39899916 . CTT C 2916.18 PASS AO=427;DP=579;FAO=390;FDP=390;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=305;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0567499;FXX=0.0249994;HRUN=7;LEN=2;MLLD=25.6442;QD=29.9095;RBI=0.071451;REFB=0;REVB=-0.0434132;RO=0;SAF=90;SAR=337;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.000866387;OID=.;OPOS=39899917;OREF=TT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:427:504:390:390:0:85:305:0:0:99:0:90:337:0:0 chr19 39905903 . A G 104 PASS AO=26;DP=59;FAO=26;FDP=59;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=9;FWDB=0.00835246;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.85;QD=7.05058;RBI=0.0156643;REFB=-0.0116136;REVB=-0.0132516;RO=33;SAF=11;SAR=15;SRF=24;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.293855;STB=0.66528;TYPE=snp;VARB=0.0125098;OID=.;OPOS=39905903;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:33:33:26:26:15:11:24:9:15:11:24:9 chr19 39906985 . T C 62.48 PASS AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=14;FWDB=-0.0568734;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.075;QD=8.06145;RBI=0.0575718;REFB=-0.00646128;REVB=0.00893985;RO=16;SAF=3;SAR=11;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0378376;STB=0.531871;TYPE=snp;VARB=0.0123956;OID=.;OPOS=39906985;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:30:31:16:17:14:14:11:3:3:13:11:3:3:14 chr19 39907036 . C T 50.29 PASS AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.0257738;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.472;QD=8.38234;RBI=0.0269108;REFB=0.00334889;REVB=0.00773957;RO=13;SAF=8;SAR=3;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.328516;STB=0.692551;TYPE=snp;VARB=-0.00491847;OID=.;OPOS=39907036;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:24:24:13:13:11:11:3:8:5:8:3:8:5:8 chr19 39908574 . C T 43.05 PASS AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.0172923;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.296;QD=8.60964;RBI=0.0200927;REFB=-0.0175209;REVB=-0.0102319;RO=10;SAF=4;SAR=5;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138165;STB=0.604168;TYPE=snp;VARB=0.0187713;OID=.;OPOS=39908574;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:20:20:10:11:9:9:5:4:6:4:5:4:7:4 chr19 39913558 . A G 97.3 PASS AO=20;DP=42;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0218002;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.4278;QD=9.26633;RBI=0.0409665;REFB=0.0135852;REVB=0.0346843;RO=21;SAF=6;SAR=14;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216171;STB=0.6295;TYPE=snp;VARB=-0.00633435;OID=.;OPOS=39913558;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:42:42:21:21:20:21:14:6:11:10:15:6:11:10 chr19 39914236 . CG C,CC 25.12 PASS AO=7,3;DP=16;FAO=8,0;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=1,0;FSAR=7,0;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.203185,0.167258;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=17.1023,26.1971;QD=5.91096;RBI=0.300908,0.255389;REFB=-0.0261063,-0.00638986;REVB=-0.22195,-0.192998;RO=7;SAF=1,0;SAR=6,3;SRF=4;SRR=3;SSEN=0.375,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.439386,-0.684179;STB=0.743945,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0539391,0.0366613;OID=.,.;OPOS=39914237,39914237;OREF=G,G;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:7,3:17:8,0:17:9:1,0:7,0:4:5:25:7:1,0:6,3:4:3 chr19 39914644 . G A 133.3 PASS AO=31;DP=78;FAO=35;FDP=80;FR=.;FRO=45;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=0.00293393;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.534;QD=6.66473;RBI=0.0144713;REFB=-0.010567;REVB=0.0141707;RO=45;SAF=16;SAR=15;SRF=19;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0976202;STB=0.567529;TYPE=snp;VARB=0.0104907;OID=.;OPOS=39914644;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:80:45:45:31:35:15:16:19:26:16:19:19:26 chr19 39916110 . GGGA G 154.85 PASS AO=53;DP=120;FAO=56;FDP=118;FR=.;FRO=62;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=20;FSRR=42;FWDB=-0.0108283;FXX=0.0483832;HRUN=3;LEN=3;MLLD=156.137;QD=5.24924;RBI=0.0116698;REFB=-0.0023734;REVB=0.00435093;RO=54;SAF=25;SAR=28;SRF=19;SRR=35;SSEN=0.318824;SSEP=0;SSSB=0.110606;STB=0.584422;TYPE=del;VARB=0.00241167;OID=.;OPOS=39916111;OREF=GGA;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:53:116:56:118:62:27:29:20:42:99:54:25:28:19:35 chr19 39923952 . G A 464.11 PASS AO=123;DP=275;FAO=124;FDP=273;FR=.;FRO=149;FSAF=51;FSAR=73;FSRF=39;FSRR=110;FWDB=0.00872275;FXX=0.0108692;HRUN=3;LEN=1;MLLD=159.234;QD=6.80017;RBI=0.0153276;REFB=0.00167504;REVB=0.0126035;RO=148;SAF=51;SAR=72;SRF=38;SRR=110;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166506;STB=0.586857;TYPE=snp;VARB=-0.00170263;OID=.;OPOS=39923952;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:275:273:148:149:123:124:72:51:38:110:73:51:39:110 chr19 39926509 . A C 79.48 PASS AO=22;DP=55;FAO=22;FDP=55;FR=.;FRO=33;FSAF=3;FSAR=19;FSRF=4;FSRR=29;FWDB=-0.0137093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.784;QD=5.78067;RBI=0.0266189;REFB=-0.017261;REVB=-0.0228171;RO=32;SAF=3;SAR=19;SRF=4;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.025506;STB=0.519838;TYPE=snp;VARB=0.0254976;OID=.;OPOS=39926509;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:55:55:32:33:22:22:19:3:4:28:19:3:4:29 chr19 39926521 . G A 52.03 PASS AO=17;DP=52;FAO=17;FDP=51;FR=.;FRO=34;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=3;FSRR=31;FWDB=-0.0161497;FXX=0.0192271;HRUN=3;LEN=1;MLLD=121.712;QD=4.08079;RBI=0.0329392;REFB=-0.00880254;REVB=-0.0287085;RO=32;SAF=2;SAR=15;SRF=3;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0683647;STB=0.550843;TYPE=snp;VARB=0.018133;OID=.;OPOS=39926521;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:52:51:32:34:17:17:15:2:3:29:15:2:3:31 chr19 39930268 . C G 340.16 PASS AO=46;DP=110;FAO=50;FDP=106;FR=.,HEALED;FRO=34;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=0.00885104;FXX=0.00934492;HRUN=5;LEN=1;MLLD=44.5618;QD=12.8363;RBI=0.0223847;REFB=-0.0319446;REVB=0.0205605;RO=28;SAF=18;SAR=28;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00113052;STB=0.504948;TYPE=snp;VARB=0.0274692;OID=.;OPOS=39930268;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:106:28:34:46:50:28:18:11:17:30:20:14:20 chr19 39932066 . T C 251.29 PASS AO=61;DP=134;FAO=63;FDP=135;FR=.;FRO=72;FSAF=18;FSAR=45;FSRF=14;FSRR=58;FWDB=0.0175524;FXX=0.0217376;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.091;QD=7.44572;RBI=0.0213552;REFB=-0.0157467;REVB=0.0121637;RO=73;SAF=18;SAR=43;SRF=15;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111435;STB=0.562823;TYPE=snp;VARB=0.0152217;OID=.;OPOS=39932066;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:135:73:72:61:63:43:18:15:58:45:18:14:58 chr19 39944082 . C T 286.24 PASS AO=60;DP=111;FAO=60;FDP=111;FR=.;FRO=51;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=20;FSRR=31;FWDB=0.00336802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.487;QD=10.3151;RBI=0.00519478;REFB=0.019858;REVB=-0.00395502;RO=51;SAF=25;SAR=35;SRF=20;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0211953;STB=0.511624;TYPE=snp;VARB=-0.0184272;OID=.;OPOS=39944082;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:51:51:60:60:35:25:20:31:35:25:20:31 chr19 39949897 . G A 255.23 PASS AO=39;DP=53;FAO=39;FDP=53;FR=.;FRO=14;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=0;FWDB=0.0111167;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=267.037;QD=19.2626;RBI=0.0111168;REFB=-0.00570556;REVB=-3.47184e-05;RO=13;SAF=25;SAR=14;SRF=13;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192246;STB=0.609325;TYPE=snp;VARB=0.00164983;OID=.;OPOS=39949897;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:53:53:13:14:39:39:14:25:13:0:14:25:14:0 chr19 39967318 . T C 118.71 PASS AO=23;DP=41;FAO=23;FDP=41;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=4;FSRR=14;FWDB=-0.0174493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.6742;QD=11.5818;RBI=0.0175793;REFB=-0.0332167;REVB=0.00213446;RO=18;SAF=7;SAR=16;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0793022;STB=0.544005;TYPE=snp;VARB=0.0700779;OID=.;OPOS=39967318;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:41:41:18:18:23:23:16:7:4:14:16:7:4:14 chr19 39967320 . T C 128.67 PASS AO=23;DP=39;FAO=23;FDP=38;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=0.0251138;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.6646;QD=13.5441;RBI=0.0253186;REFB=-0.0868117;REVB=0.00321371;RO=15;SAF=7;SAR=16;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.032152;STB=0.517793;TYPE=snp;VARB=0.045549;OID=.;OPOS=39967320;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:39:38:15:15:23:23:16:7:4:11:16:7:4:11 chr19 39994711 . T C 126.03 PASS AO=33;DP=76;FAO=33;FDP=76;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=29;FWDB=-0.0171624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.979;QD=6.63306;RBI=0.0291607;REFB=0.00412466;REVB=-0.0235754;RO=43;SAF=15;SAR=18;SRF=14;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132622;STB=0.574529;TYPE=snp;VARB=-0.00659065;OID=.;OPOS=39994711;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:76:43:43:33:33:18:15:14:29:18:15:14:29 chr19 40149297 . T A 1710.81 PASS AO=179;DP=183;FAO=183;FDP=183;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=127;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0222652;FXX=0.0108102;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.9987;QD=37.3948;RBI=0.0454506;REFB=-0.0966221;REVB=0.0396235;RO=4;SAF=55;SAR=124;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0028007;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000713358;OID=.;OPOS=40149297;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:183:183:4:0:179:183:124:55:1:3:127:56:0:0 chr19 40170053 . G A 16.64 PASS AO=5;DP=21;FAO=5;FDP=21;FR=.;FRO=16;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=2;FWDB=-0.0144496;FXX=0.0454339;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.109;QD=3.17016;RBI=0.0209518;REFB=-0.0145807;REVB=-0.0151719;RO=15;SAF=1;SAR=4;SRF=13;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.657887;STB=0.908027;TYPE=snp;VARB=0.0316895;OID=.;OPOS=40170053;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:21:21:15:16:5:5:4:1:13:2:4:1:14:2 chr19 40174236 . G A 1471.8 PASS AO=150;DP=152;FAO=156;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017524;FXX=0.0188667;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.1163;QD=37.7385;RBI=0.0330644;REFB=-0.092234;REVB=0.0280387;RO=1;SAF=56;SAR=94;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0050336;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0011414;OID=.;OPOS=40174236;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:152:156:1:0:150:156:94:56:0:1:100:56:0:0 chr19 40196611 . C T 248.54 PASS AO=61;DP=131;FAO=61;FDP=130;FR=.;FRO=69;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=34;FSRR=35;FWDB=-0.00052615;FXX=0.00763301;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.36;QD=7.64749;RBI=0.0213;REFB=-0.00901014;REVB=0.0212935;RO=68;SAF=31;SAR=30;SRF=33;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0217603;STB=0.508194;TYPE=snp;VARB=0.00707478;OID=.;OPOS=40196611;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:130:68:69:61:61:30:31:33:35:30:31:34:35 chr19 40197924 . T C 3065.14 PASS AO=331;DP=338;FAO=332;FDP=338;FR=.;FRO=6;FSAF=169;FSAR=163;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0354546;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6737;QD=36.2738;RBI=0.0362343;REFB=-0.134807;REVB=0.00747643;RO=3;SAF=169;SAR=162;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00267613;STB=0.503119;TYPE=snp;VARB=0.00188997;OID=.;OPOS=40197924;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:94:338:338:3:6:331:332:162:169:2:1:163:169:2:4 chr19 40199914 . C G 1289.33 PASS AO=135;DP=135;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0205598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.059;QD=38.2024;RBI=0.0206287;REFB=0;REVB=-0.00168516;RO=0;SAF=64;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=9.26516e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.47947e-05;OID=.;OPOS=40199914;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:135:135:0:0:135:135:71:64:0:0:71:64:0:0 chr19 40224986 . A G 1340.18 PASS AO=140;DP=140;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0327982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.2395;QD=38.0193;RBI=0.0586974;REFB=0;REVB=0.0486792;RO=0;SAF=100;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.62661e-05;OID=.;OPOS=40224986;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:140:141:0:0:140:141:40:100:0:0:40:101:0:0 chr19 40225646 . G A 884.04 PASS AO=92;DP=94;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101353;FXX=0.0106372;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.266;QD=38.0231;RBI=0.0457349;REFB=0;REVB=0.0445977;RO=0;SAF=40;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.0217e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000109557;OID=.;OPOS=40225646;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:94:93:0:0:92:93:52:40:0:0:52:41:0:0 chr19 40366142 . C T 22.43 PASS AO=6;DP=19;FAO=6;FDP=19;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.0340285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.5388;QD=4.72249;RBI=0.0551533;REFB=-0.0550867;REVB=0.0434045;RO=13;SAF=4;SAR=2;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0316032;STB=0.519934;TYPE=snp;VARB=0.0503713;OID=.;OPOS=40366142;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:19:19:13:13:6:6:2:4:9:4:2:4:9:4 chr19 40366362 . G C 101.46 PASS AO=15;DP=22;FAO=16;FDP=23;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.0268615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.599;QD=17.6452;RBI=0.0319357;REFB=-0.0099806;REVB=0.0172727;RO=7;SAF=4;SAR=11;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.276867;STB=0.658324;TYPE=snp;VARB=0.0021246;OID=.;OPOS=40366362;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:22:23:7:7:15:16:11:4:5:2:12:4:5:2 chr19 40368395 . C T 189.07 PASS AO=38;DP=71;FAO=39;FDP=72;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=29;FSRF=27;FSRR=6;FWDB=-0.0145897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.92;QD=10.5037;RBI=0.0197036;REFB=-0.00915196;REVB=0.0132428;RO=32;SAF=10;SAR=28;SRF=26;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.449093;STB=0.753912;TYPE=snp;VARB=0.0153935;OID=.;OPOS=40368395;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:72:32:33:38:39:28:10:26:6:29:10:27:6 chr19 40368498 . A C 392.12 PASS AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.106942;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.8553;QD=37.3443;RBI=0.108291;REFB=0;REVB=0.0170433;RO=0;SAF=12;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.52854e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00203926;OID=.;OPOS=40368498;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:42:42:0:0:42:42:30:12:0:0:30:12:0:0 chr19 40368499 . A C 361.96 PASS AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0752564;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.1749;QD=35.313;RBI=0.0776793;REFB=-0.017958;REVB=0.0192496;RO=0;SAF=12;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508768;TYPE=snp;VARB=0.000614974;OID=.;OPOS=40368499;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:41:41:0:1:40:40:28:12:0:0:28:12:0:1 chr19 40368520 . G C 156.62 PASS AO=24;DP=35;FAO=25;FDP=36;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=23;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0919771;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.5525;QD=17.402;RBI=0.10438;REFB=-0.0397896;REVB=0.0493499;RO=7;SAF=2;SAR=22;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.321567;STB=0.76639;TYPE=snp;VARB=0.0236225;OID=.;OPOS=40368520;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:35:36:7:11:24:25:22:2:3:4:23:2:6:5 chr19 40392482 . A G 305.77 PASS AO=31;DP=32;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0070294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0875;QD=37.0628;RBI=0.0260655;REFB=0;REVB=-0.0250998;RO=1;SAF=8;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.019859;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000746259;OID=.;OPOS=40392482;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:32:33:1:0:31:33:23:8:0:1:25:8:0:0 chr19 40392585 . T G 30.72 PASS AO=10;DP=33;FAO=10;FDP=33;FR=.;FRO=23;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.0014555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.808;QD=3.72379;RBI=0.00981916;REFB=-0.00743772;REVB=0.00971069;RO=23;SAF=3;SAR=7;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165793;STB=0.602435;TYPE=snp;VARB=0.00728735;OID=.;OPOS=40392585;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:33:33:23:23:10:10:7:3:10:13:7:3:10:13 chr19 40392631 . G A 67.74 PASS AO=11;DP=17;FAO=11;FDP=17;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.0193009;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=151.426;QD=15.938;RBI=0.148915;REFB=-0.00201009;REVB=0.147659;RO=5;SAF=4;SAR=7;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0215005;STB=0.550468;TYPE=snp;VARB=0.00494236;OID=.;OPOS=40392631;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:17:17:5:6:11:11:7:4:2:3:7:4:3:3 chr19 40392719 . G A 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0729529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3043;QD=33.0219;RBI=0.0730338;REFB=0;REVB=0.00343693;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00920911;OID=.;OPOS=40392719;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:2:4:0:0:2:4:0:0 chr19 40406019 . G A 229.25 PASS AO=46;DP=82;FAO=46;FDP=82;FR=.;FRO=36;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=0.0532707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.455;QD=11.1827;RBI=0.0540185;REFB=-0.0420133;REVB=-0.00895746;RO=34;SAF=23;SAR=23;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.068426;STB=0.548759;TYPE=snp;VARB=0.0387222;OID=.;OPOS=40406019;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:34:36:46:46:23:23:14:20:23:23:14:22 chr19 40408128 . C T 27.28 PASS AO=8;DP=34;FAO=10;FDP=36;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=21;FWDB=0.00410335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1317;QD=3.03068;RBI=0.0212146;REFB=-0.024134;REVB=0.020814;RO=22;SAF=6;SAR=2;SRF=5;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.554691;STB=0.772765;TYPE=snp;VARB=0.0208816;OID=.;OPOS=40408128;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:34:36:22:26:8:10:2:6:5:17:4:6:5:21 chr19 40408821 . C G 121.75 PASS AO=23;DP=47;FAO=26;FDP=50;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=0.0797254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.1508;QD=9.74018;RBI=0.079793;REFB=-0.00429044;REVB=-0.00328418;RO=22;SAF=9;SAR=14;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0254509;STB=0.544695;TYPE=snp;VARB=0.00727205;OID=.;OPOS=40408821;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:50:22:24:23:26:14:9:8:14:15:11:8:16 chr19 40420087 . G A 221.54 PASS AO=49;DP=95;FAO=49;FDP=95;FR=.;FRO=46;FSAF=34;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=0.0189897;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.376;QD=9.32806;RBI=0.0371703;REFB=-0.0378032;REVB=0.0319534;RO=46;SAF=34;SAR=15;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183545;STB=0.601727;TYPE=snp;VARB=0.0260043;OID=.;OPOS=40420087;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:46:46:49:49:15:34:23:23:15:34:23:23 chr19 40900517 . G C 10.21 PASS AO=2;DP=9;FAO=2;FDP=9;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=33.4909;QD=4.53875;RBI=0.0268517;REFB=-0.0111184;REVB=0.0268517;RO=7;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0407378;OID=.;OPOS=40900517;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:7:7:2:2:2:0:0:7:2:0:0:7 chr19 40900519 . A T 17.99 PASS AO=3;DP=9;FAO=4;FDP=9;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.874;QD=7.99618;RBI=0.00282743;REFB=-0.024188;REVB=0.00282743;RO=6;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0674567;OID=.;OPOS=40900519;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:9:9:6:5:3:4:3:0:0:6:4:0:0:5 chr19 40900522 . T G 15.36 PASS AO=3;DP=9;FAO=3;FDP=9;FR=.;FRO=6;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.668;QD=6.82576;RBI=0.0319;REFB=0.00549661;REVB=-0.0319;RO=6;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.04115;OID=.;OPOS=40900522;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:9:9:6:6:3:3:3:0:0:6:3:0:0:6 chr19 40900527 . C T 17.31 PASS AO=4;DP=13;FAO=4;FDP=13;FR=.;FRO=9;FSAF=0;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8575;QD=5.32744;RBI=0.0014714;REFB=-0.112692;REVB=-0.0014714;RO=8;SAF=0;SAR=4;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.176601;OID=.;OPOS=40900527;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:13:13:8:9:4:4:4:0:0:8:4:0:0:9 chr19 40900865 . C T 457.19 PASS AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0167522;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.236;QD=35.8578;RBI=0.0536304;REFB=-0.0555556;REVB=0.0509469;RO=1;SAF=24;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177622;STB=0.50943;TYPE=snp;VARB=0.000476921;OID=.;OPOS=40900865;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:51:51:1:1:50:50:26:24:0:1:26:24:0:1 chr19 41008049 . A G 257.15 PASS AO=59;DP=118;FAO=59;FDP=118;FR=.;FRO=59;FSAF=38;FSAR=21;FSRF=34;FSRR=25;FWDB=-0.0287129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8911;QD=8.71682;RBI=0.0288702;REFB=0.000756674;REVB=-0.0030094;RO=59;SAF=38;SAR=21;SRF=34;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0654323;STB=0.536184;TYPE=snp;VARB=-0.00125138;OID=.;OPOS=41008049;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:59:59:59:59:21:38:34:25:21:38:34:25 chr19 41012190 . C T 90.78 PASS AO=25;DP=60;FAO=25;FDP=62;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=0.0377842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.6313;QD=5.85691;RBI=0.0482708;REFB=-0.0187677;REVB=-0.0300403;RO=35;SAF=10;SAR=15;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203307;STB=0.59992;TYPE=snp;VARB=0.0241872;OID=.;OPOS=41012190;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:60:62:35:37:25:25:15:10:21:14:15:10:21:16 chr19 41038574 . G A 34.71 PASS AO=8;DP=24;FAO=8;FDP=22;FR=.,HEALED;FRO=13;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=2;FWDB=-0.0525606;FXX=0.0832986;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.676;QD=6.31075;RBI=0.0538075;REFB=-0.0159661;REVB=-0.0115163;RO=10;SAF=2;SAR=6;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.489183;STB=0.829092;TYPE=snp;VARB=0.0356357;OID=.;OPOS=41038574;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:24:22:10:13:8:8:6:2:8:2:6:2:11:2 chr19 41060616 . A G 34.34 PASS AO=5;DP=11;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0241279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.748;QD=11.448;RBI=0.0255762;REFB=-0.0157426;REVB=0.0084847;RO=6;SAF=5;SAR=0;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.716421;STB=0.624529;TYPE=snp;VARB=0.0234782;OID=.;OPOS=41060616;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:11:12:6:6:5:6:0:5:4:2:1:5:4:2 chr19 41078220 . G C 512.56 PASS AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000645567;FXX=0.0526223;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.8832;QD=37.9677;RBI=0.0146626;REFB=0;REVB=0.0146483;RO=0;SAF=28;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.52846e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000187564;OID=.;OPOS=41078220;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:54:54:0:0:54:54:26:28:0:0:26:28:0:0 chr19 41096189 . A G 45.07 PASS AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=-0.0149499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.907;QD=5.6338;RBI=0.0312688;REFB=-0.0184177;REVB=-0.0274634;RO=18;SAF=6;SAR=6;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170731;STB=0.624805;TYPE=snp;VARB=0.0331666;OID=.;OPOS=41096189;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:31:32:18:20:12:12:6:6:6:12:6:6:6:14 chr19 41097276 . C G 59.17 PASS AO=24;DP=79;FAO=24;FDP=81;FR=.;FRO=57;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=30;FSRR=27;FWDB=0.00777924;FXX=0.0470533;HRUN=3;LEN=1;MLLD=143.674;QD=2.92201;RBI=0.0431519;REFB=-0.0100587;REVB=-0.0424449;RO=55;SAF=13;SAR=11;SRF=30;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00449076;STB=0.510849;TYPE=snp;VARB=0.019733;OID=.;OPOS=41097276;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:79:81:55:57:24:24:11:13:30:25:11:13:30:27 chr19 41111069 . G A 61.86 PASS AO=17;DP=44;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=1;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=26;FWDB=0.100904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3238;QD=5.62387;RBI=0.105691;REFB=-0.00971094;REVB=-0.0314477;RO=26;SAF=1;SAR=16;SRF=1;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107811;STB=0.567497;TYPE=snp;VARB=0.0112764;OID=.;OPOS=41111069;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:44:44:26:27:17:17:16:1:1:25:16:1:1:26 chr19 41117869 . A G 49.48 PASS AO=14;DP=38;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.00433152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.5152;QD=5.20829;RBI=0.0758922;REFB=-0.00907076;REVB=-0.0757684;RO=24;SAF=2;SAR=12;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.34616;STB=0.709325;TYPE=snp;VARB=0.0132355;OID=.;OPOS=41117869;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:38:38:24:24:14:14:12:2:9:15:12:2:9:15 chr19 41123093 . A AG 224.74 PASS AO=30;DP=37;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0811783;FXX=0.0285633;HRUN=2;LEN=1;MLLD=17.0294;QD=26.4399;RBI=0.167597;REFB=0;REVB=-0.146625;RO=4;SAF=20;SAR=10;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0403077;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-0.00885276;OID=.;OPOS=41123094;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:30:37:34:34:0:21:13:0:0:21:4:20:10:2:2 chr19 41129842 . C T 39.75 PASS AO=11;DP=31;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=0.003184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.47;QD=5.12907;RBI=0.00632099;REFB=0.00108531;REVB=0.0054605;RO=20;SAF=7;SAR=4;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159505;STB=0.509537;TYPE=snp;VARB=-0.00135092;OID=.;OPOS=41129842;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:31:31:20:20:11:11:4:7:13:7:4:7:13:7 chr19 41172806 . GC G 90.25 PASS AO=23;DP=32;FAO=23;FDP=32;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=20;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.144905;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.8968;QD=11.2808;RBI=0.153733;REFB=-0.127346;REVB=-0.051344;RO=8;SAF=2;SAR=21;SRF=5;SRR=3;SSEN=0.478673;SSEP=0;SSSB=-0.452603;STB=0.689459;TYPE=del;VARB=0.0749214;OID=.;OPOS=41172807;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:23:32:23:32:9:3:20:5:4:10:8:2:21:5:3 chr19 41186879 . A G 36.81 PASS AO=15;DP=54;FAO=15;FDP=54;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=-0.0156684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.236;QD=2.72693;RBI=0.0731342;REFB=0.00425928;REVB=-0.071436;RO=39;SAF=12;SAR=3;SRF=24;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.268591;STB=0.66642;TYPE=snp;VARB=-0.00853221;OID=.;OPOS=41186879;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:54:54:39:39:15:15:3:12:24:15:3:12:24:15 chr19 41192872 . A G 10.38 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.548;QD=5.93124;RBI=0.0280433;REFB=-0.0261152;REVB=-0.0280433;RO=5;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0454293;OID=.;OPOS=41192872;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:5:5:2:2:2:0:0:5:2:0:0:5 chr19 41211056 . T C 28.16 PASS AO=9;DP=30;FAO=9;FDP=30;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=-0.0368776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.6092;QD=3.75477;RBI=0.0656948;REFB=-0.0169152;REVB=-0.0543677;RO=20;SAF=6;SAR=3;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0428515;STB=0.538379;TYPE=snp;VARB=0.0632689;OID=.;OPOS=41211056;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:30:30:20:21:9:9:3:6:14:6:3:6:15:6 chr19 41235120 . A G 149.5 PASS AO=31;DP=58;FAO=31;FDP=58;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.0185608;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.078;QD=10.3104;RBI=0.0188199;REFB=-0.0268691;REVB=-0.0031124;RO=27;SAF=15;SAR=16;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.09098;STB=0.550467;TYPE=snp;VARB=0.0142433;OID=.;OPOS=41235120;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:27:27:31:31:16:15:16:11:16:15:16:11 chr19 41255500 . C G 310.76 PASS AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0274436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.0984;QD=36.5605;RBI=0.115147;REFB=0;REVB=0.111829;RO=0;SAF=16;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.60901e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00121303;OID=.;OPOS=41255500;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:33:34:0:0:33:34:17:16:0:0:16:18:0:0 chr19 41255603 . G A 61.42 PASS AO=11;DP=20;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=11;FSAR=0;FSRF=9;FSRR=0;FWDB=0.0557703;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=49.497;QD=12.2841;RBI=0.0557703;REFB=-0.0277225;REVB=0;RO=9;SAF=11;SAR=0;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0290127;OID=.;OPOS=41255603;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:20:20:9:9:11:11:0:11:9:0:0:11:9:0 chr19 41257396 . C T 165.61 PASS AO=44;DP=105;FAO=45;FDP=105;FR=.;FRO=60;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=12;FSRR=48;FWDB=-0.0120922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.9395;QD=6.30885;RBI=0.0239023;REFB=0.0035114;REVB=0.020618;RO=55;SAF=17;SAR=27;SRF=10;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228997;STB=0.62495;TYPE=snp;VARB=-0.00487874;OID=.;OPOS=41257396;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:55:60:44:45:27:17:10:45:27:18:12:48 chr19 41263403 . A G 21.04 PASS AO=8;DP=33;FAO=8;FDP=32;FR=.;FRO=24;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.0543433;FXX=0.0588062;HRUN=3;LEN=1;MLLD=145.487;QD=2.62948;RBI=0.0587354;REFB=-0.00738686;REVB=-0.0222857;RO=22;SAF=2;SAR=6;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155554;STB=0.642475;TYPE=snp;VARB=0.0229931;OID=.;OPOS=41263403;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:33:32:22:24:8:8:6:2:8:14:6:2:10:14 chr19 41281700 . C T 140.43 PASS AO=38;DP=90;FAO=38;FDP=90;FR=.;FRO=52;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=30;FWDB=0.0142466;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=194.32;QD=6.24147;RBI=0.0142682;REFB=-0.00328844;REVB=0.000785711;RO=52;SAF=22;SAR=16;SRF=22;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159055;STB=0.589697;TYPE=snp;VARB=0.00412266;OID=.;OPOS=41281700;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:52:52:38:38:16:22:22:30:16:22:22:30 chr19 41307170 . G A 141.8 PASS AO=22;DP=31;FAO=22;FDP=31;FR=.;FRO=9;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0151247;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.187;QD=18.2968;RBI=0.0213532;REFB=-0.0958401;REVB=0.0150732;RO=8;SAF=15;SAR=7;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0976033;STB=0.540945;TYPE=snp;VARB=0.0210895;OID=.;OPOS=41307170;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:31:31:8:9:22:22:7:15:4:4:7:15:5:4 chr19 41350594 . G A 263.55 PASS AO=66;DP=168;FAO=75;FDP=175;FR=.;FRO=100;FSAF=37;FSAR=38;FSRF=54;FSRR=46;FWDB=0.0335101;FXX=0.0056815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9547;QD=6.02394;RBI=0.0409305;REFB=-0.0213048;REVB=0.0235028;RO=100;SAF=30;SAR=36;SRF=55;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10188;STB=0.526645;TYPE=snp;VARB=0.0224023;OID=.;OPOS=41350594;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:175:100:100:66:75:36:30:55:45:38:37:54:46 chr19 41350664 . A T 1193.95 PASS AO=127;DP=129;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.112712;FXX=0.0227256;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.354;QD=37.0217;RBI=0.113061;REFB=-0.0637249;REVB=-0.00887739;RO=2;SAF=45;SAR=82;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0206469;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00028913;OID=.;OPOS=41350664;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:129:129:2:0:127:129:82:45:2:0:82:47:0:0 chr19 41352840 . G A 610.07 PASS AO=156;DP=337;FAO=157;FDP=338;FR=.;FRO=181;FSAF=64;FSAR=93;FSRF=70;FSRR=111;FWDB=0.034323;FXX=0.00294977;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.5532;QD=7.2198;RBI=0.0363634;REFB=-0.028368;REVB=0.0120096;RO=181;SAF=63;SAR=93;SRF=70;SRR=111;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0173617;STB=0.511637;TYPE=snp;VARB=0.0306041;OID=.;OPOS=41352840;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:337:338:181:181:156:157:93:63:70:111:93:64:70:111 chr19 41356188 . C T 156.45 PASS AO=46;DP=117;FAO=47;FDP=119;FR=.;FRO=72;FSAF=30;FSAR=17;FSRF=54;FSRR=18;FWDB=-0.00453035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.447;QD=5.25884;RBI=0.0191986;REFB=-0.0133618;REVB=-0.0186564;RO=70;SAF=29;SAR=17;SRF=53;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152662;STB=0.576241;TYPE=snp;VARB=0.0214783;OID=.;OPOS=41356188;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:119:70:72:46:47:17:29:53:17:17:30:54:18 chr19 41356281 . T C 1337.44 PASS AO=139;DP=139;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0157484;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.6212;QD=38.4875;RBI=0.0409819;REFB=0;REVB=-0.0378353;RO=0;SAF=98;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000247283;OID=.;OPOS=41356281;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:139:139:0:0:139:139:41:98:0:0:41:98:0:0 chr19 41381646 . GA G,GC 475.78 PASS AO=15,36;DP=55;FAO=8,44;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=0,37;FSAR=8,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.100941,0.0714807;FXX=0.0188644;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=67.2403,76.213;QD=36.5986;RBI=0.132766,0.115851;REFB=0,0;REVB=-0.0862419,0.0911696;RO=1;SAF=2,34;SAR=13,2;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0338159,0.185168;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0425404,0.0234263;OID=.,.;OPOS=41381647,41381647;OREF=A,A;OALT=-,C;OMAPALT=G,GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:15,36:52:8,44:52:0:0,37:8,7:0:0:5:1:2,34:13,2:0:1 chr19 41382476 . T A 467.79 PASS AO=127;DP=288;FAO=128;FDP=290;FR=.;FRO=162;FSAF=79;FSAR=49;FSRF=93;FSRR=69;FWDB=0.0189054;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.649;QD=6.45232;RBI=0.0249594;REFB=-0.00688894;REVB=-0.0162959;RO=160;SAF=79;SAR=48;SRF=93;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0430596;STB=0.525179;TYPE=snp;VARB=0.0113234;OID=.;OPOS=41382476;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:288:290:160:162:127:128:48:79:93:67:49:79:93:69 chr19 41383217 . T C 668.79 PASS AO=58;DP=69;FAO=68;FDP=70;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=28;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0807451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.76;QD=38.2165;RBI=0.0809382;REFB=0;REVB=-0.00558809;RO=0;SAF=18;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0013286;OID=.;OPOS=41383217;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:69:70:0:0:58:68:40:18:0:0:40:28:0:0 chr19 41384675 . T C 830.15 PASS AO=89;DP=91;FAO=89;FDP=90;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0261085;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.8467;QD=36.8957;RBI=0.0372257;REFB=-0.0447636;REVB=-0.0265349;RO=1;SAF=38;SAR=51;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00920269;STB=0.504853;TYPE=snp;VARB=0.000559962;OID=.;OPOS=41384675;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:91:90:1:1:89:89:51:38:0:1:51:38:0:1 chr19 41384702 . T C 779.98 PASS AO=81;DP=81;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0083554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.479;QD=37.5892;RBI=0.0272824;REFB=0;REVB=0.0259715;RO=0;SAF=32;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.32002e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.52484e-05;OID=.;OPOS=41384702;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:81:83:0:0:81:83:49:32:0:0:51:32:0:0 chr19 41386033 . T C 472.38 PASS AO=110;DP=222;FAO=110;FDP=219;FR=.;FRO=109;FSAF=66;FSAR=44;FSRF=83;FSRR=26;FWDB=0.0135678;FXX=0.0135129;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.223;QD=8.62792;RBI=0.0171652;REFB=-0.0209421;REVB=0.0105147;RO=109;SAF=66;SAR=44;SRF=83;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158659;STB=0.586599;TYPE=snp;VARB=0.0196324;OID=.;OPOS=41386033;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:219:109:109:110:110:44:66:83:26:44:66:83:26 chr19 41416750 . T C 33.68 PASS AO=8;DP=21;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=13;FWDB=-0.0840136;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=34.8092;QD=6.41444;RBI=0.125697;REFB=0.0200134;REVB=-0.0934959;RO=12;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.411416;STB=0.740393;TYPE=snp;VARB=-0.0455605;OID=.;OPOS=41416750;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:21:21:12:13:8:8:7:1:0:12:7:1:0:13 chr19 41515255 . C A 118.38 PASS AO=31;DP=73;FAO=31;FDP=72;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=29;FSRR=12;FWDB=-0.0971128;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.759;QD=6.5764;RBI=0.0981501;REFB=-0.0107371;REVB=-0.0142318;RO=41;SAF=10;SAR=21;SRF=29;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.377659;STB=0.712661;TYPE=snp;VARB=0.00323901;OID=.;OPOS=41515255;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:72:41:41:31:31:21:10:29:12:21:10:29:12 chr19 41522715 . C T 70.59 PASS AO=18;DP=43;FAO=18;FDP=43;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=20;FWDB=0.02213;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.699;QD=6.56683;RBI=0.0227885;REFB=-0.000887401;REVB=0.00543874;RO=25;SAF=5;SAR=13;SRF=5;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103805;STB=0.55926;TYPE=snp;VARB=0.000791245;OID=.;OPOS=41522715;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:43:43:25:25:18:18:13:5:5:20:13:5:5:20 chr19 41531522 . G T 513.92 PASS AO=105;DP=183;FAO=104;FDP=182;FR=.;FRO=78;FSAF=44;FSAR=60;FSRF=57;FSRR=21;FWDB=-0.0190198;FXX=0.00546418;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.4553;QD=11.295;RBI=0.0614168;REFB=0.00663819;REVB=0.0583976;RO=77;SAF=44;SAR=61;SRF=57;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246341;STB=0.629652;TYPE=snp;VARB=-0.00557419;OID=.;OPOS=41531522;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:182:77:78:105:104:61:44:57:20:60:44:57:21 chr19 41531597 . C G 322.36 PASS AO=98;DP=243;FAO=98;FDP=243;FR=.;FRO=145;FSAF=71;FSAR=27;FSRF=80;FSRR=65;FWDB=-0.00923376;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=218.68;QD=5.30639;RBI=0.00949858;REFB=-0.00201361;REVB=-0.00222727;RO=145;SAF=71;SAR=27;SRF=80;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20517;STB=0.615679;TYPE=snp;VARB=0.00301901;OID=.;OPOS=41531597;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:243:243:145:145:98:98:27:71:80:65:27:71:80:65 chr19 41531656 . A C 679.52 PASS AO=138;DP=243;FAO=138;FDP=242;FR=.;FRO=104;FSAF=72;FSAR=66;FSRF=76;FSRR=28;FWDB=-0.0122418;FXX=0.00411506;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.369;QD=11.2317;RBI=0.0165905;REFB=-0.0216007;REVB=-0.0111975;RO=103;SAF=72;SAR=66;SRF=75;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164644;STB=0.590699;TYPE=snp;VARB=0.0158007;OID=.;OPOS=41531656;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:243:242:103:104:138:138:66:72:75:28:66:72:76:28 chr19 41531705 . G A 388.36 PASS AO=77;DP=133;FAO=77;FDP=133;FR=.;FRO=56;FSAF=47;FSAR=30;FSRF=49;FSRR=7;FWDB=-0.0240296;FXX=0.00746213;HRUN=3;LEN=1;MLLD=155.43;QD=11.6801;RBI=0.0283605;REFB=0.032641;REVB=0.015063;RO=55;SAF=47;SAR=30;SRF=48;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224356;STB=0.623483;TYPE=snp;VARB=-0.00355578;OID=.;OPOS=41531705;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:133:55:56:77:77:30:47:48:7:30:47:49:7 chr19 41533049 . G A 22.3 PASS AO=4;DP=9;FAO=4;FDP=9;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0310546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.7376;QD=9.9125;RBI=0.0433554;REFB=0.0329716;REVB=0.030254;RO=5;SAF=3;SAR=1;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15474;STB=0.599465;TYPE=snp;VARB=-0.0333848;OID=.;OPOS=41533049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:9:9:5:5:4:4:1:3:3:2:1:3:3:2 chr19 41533087 . T C 14.24 PASS AO=4;DP=16;FAO=4;FDP=16;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.107444;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.3085;QD=3.56001;RBI=0.119108;REFB=-0.0211764;REVB=-0.051405;RO=12;SAF=3;SAR=1;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205016;STB=0.642093;TYPE=snp;VARB=0.0312314;OID=.;OPOS=41533087;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:16:16:12:12:4:4:1:3:7:5:1:3:7:5 chr19 41700492 . CG C,CC 635.81 PASS AO=21,46;DP=69;FAO=16,54;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=15,17;FSAR=1,37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0265603,0.119651;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=200.449,215.262;QD=36.3317;RBI=0.0267675,0.119709;REFB=0,0;REVB=-0.00332412,-0.00372715;RO=0;SAF=21,9;SAR=0,37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.83101e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.0154809,0.00186414;OID=.,.;OPOS=41700493,41700493;OREF=G,G;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:21,46:68:16,54:70:0:15,17:1,37:0:0:19:0:21,9:0,37:0:0 chr19 41743861 . A G 426.64 PASS AO=51;DP=57;FAO=51;FDP=56;FR=.;FRO=5;FSAF=33;FSAR=18;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0140161;FXX=0.0175408;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.393;QD=30.4739;RBI=0.0194628;REFB=-0.0784199;REVB=0.0135037;RO=5;SAF=33;SAR=18;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00860804;STB=0.504585;TYPE=snp;VARB=0.0032345;OID=.;OPOS=41743861;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:57:56:5:5:51:51:18:33:3:2:18:33:3:2 chr19 41748153 . A G 378.79 PASS AO=40;DP=40;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0738489;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.543;QD=38.8498;RBI=0.0786279;REFB=0;REVB=-0.0269942;RO=0;SAF=15;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.0028e-05;OID=.;OPOS=41748153;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:40:39:0:0:40:39:25:15:0:0:24:15:0:0 chr19 41808432 . A T 252.22 PASS AO=65;DP=143;FAO=65;FDP=143;FR=.;FRO=78;FSAF=30;FSAR=35;FSRF=31;FSRR=47;FWDB=0.024066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.166;QD=7.05517;RBI=0.0382066;REFB=-0.0132288;REVB=-0.0296744;RO=78;SAF=30;SAR=35;SRF=31;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0636404;STB=0.535354;TYPE=snp;VARB=0.0135737;OID=.;OPOS=41808432;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:78:78:65:65:35:30:31:47:35:30:31:47 chr19 41809995 . A G 112.1 PASS AO=24;DP=47;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.00485451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.746;QD=9.54021;RBI=0.0185286;REFB=-0.00737217;REVB=0.0178813;RO=23;SAF=12;SAR=12;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0949181;STB=0.553148;TYPE=snp;VARB=0.00421274;OID=.;OPOS=41809995;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:23:23:24:24:12:12:9:14:12:12:9:14 chr19 41811730 . T C 61.29 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.1784;QD=35.0243;RBI=0.119213;REFB=0;REVB=0.119213;RO=0;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00412281;OID=.;OPOS=41811730;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:7:0:0:0:7:0:0:0 chr19 41829581 . T A 17.73 PASS AO=6;DP=25;FAO=6;FDP=24;FR=.;FRO=18;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=15;FWDB=-0.0363524;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.0212;QD=2.95525;RBI=0.0367263;REFB=-0.0134018;REVB=-0.00522733;RO=18;SAF=1;SAR=5;SRF=3;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0383241;OID=.;OPOS=41829581;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:25:24:18:18:6:6:5:1:3:15:5:1:3:15 chr19 41829606 . G A 15.42 PASS AO=7;DP=33;FAO=7;FDP=33;FR=.;FRO=26;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=23;FWDB=-0.0296028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.5276;QD=1.86893;RBI=0.0297183;REFB=-0.00266315;REVB=-0.00261857;RO=24;SAF=1;SAR=6;SRF=3;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0452772;STB=0.547044;TYPE=snp;VARB=0.0111928;OID=.;OPOS=41829606;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:33:33:24:26:7:7:6:1:3:21:6:1:3:23 chr19 41869392 . T C 365.86 PASS AO=50;DP=159;FAO=58;FDP=156;FR=.,HEALED;FRO=73;FSAF=33;FSAR=25;FSRF=49;FSRR=24;FWDB=0.00331093;FXX=0.0126574;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.849;QD=9.38112;RBI=0.00439347;REFB=-0.0021878;REVB=0.00288796;RO=73;SAF=32;SAR=18;SRF=49;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.036118;STB=0.55902;TYPE=snp;VARB=0.0234011;OID=.;OPOS=41869392;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:156:73:73:50:58:18:32:49:24:25:33:49:24 chr19 41889748 . T C 78.06 PASS AO=21;DP=52;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=4;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=0.0311392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.8059;QD=6.00428;RBI=0.045581;REFB=-0.0345678;REVB=-0.0332862;RO=31;SAF=17;SAR=4;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.263345;STB=0.653682;TYPE=snp;VARB=0.0584439;OID=.;OPOS=41889748;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:52:52:31:31:21:21:4:17:19:12:4:17:19:12 chr19 41903220 . G A 62.6 PASS AO=12;DP=25;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=13;FWDB=0.0240927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.243;QD=9.63113;RBI=0.027024;REFB=-0.0368795;REVB=0.0122409;RO=13;SAF=3;SAR=9;SRF=0;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.378389;STB=0.709447;TYPE=snp;VARB=0.0306478;OID=.;OPOS=41903220;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:25:26:13:13:12:13:9:3:0:13:9:4:0:13 chr19 41916549 . C A 186.66 PASS AO=35;DP=60;FAO=35;FDP=60;FR=.;FRO=25;FSAF=25;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.0349292;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=166.399;QD=12.4441;RBI=0.0355241;REFB=-0.0202031;REVB=0.00647401;RO=21;SAF=25;SAR=10;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246058;STB=0.624925;TYPE=snp;VARB=0.0167773;OID=.;OPOS=41916549;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:60:60:21:25:35:35:10:25:8:13:10:25:11:14 chr19 41928652 . C T 42.71 PASS AO=12;DP=31;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=0.0370279;FXX=0.0322477;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.0984;QD=5.69417;RBI=0.0372399;REFB=-0.0221291;REVB=0.00396794;RO=19;SAF=3;SAR=9;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0179646;STB=0.577828;TYPE=snp;VARB=0.0459177;OID=.;OPOS=41928652;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:31:30:19:19:12:11:9:3:5:14:9:2:5:14 chr19 41932063 . A G 16.74 PASS AO=6;DP=25;FAO=6;FDP=25;FR=.;FRO=19;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.00313337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.4369;QD=2.6786;RBI=0.00327556;REFB=0.016218;REVB=0.000954615;RO=19;SAF=1;SAR=5;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.44328;STB=0.796042;TYPE=snp;VARB=-0.0584259;OID=.;OPOS=41932063;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:25:25:19:19:6:6:5:1:10:9:5:1:10:9 chr19 41932275 . T C 22.51 PASS AO=5;DP=14;FAO=5;FDP=14;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=0;FSRF=9;FSRR=0;FWDB=0.0125165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.67;QD=6.4317;RBI=0.0125165;REFB=-0.027705;REVB=0;RO=9;SAF=5;SAR=0;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0442722;OID=.;OPOS=41932275;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:14:14:9:9:5:5:0:5:9:0:0:5:9:0 chr19 41937095 . G A 276.8 PASS AO=58;DP=110;FAO=59;FDP=111;FR=.;FRO=52;FSAF=26;FSAR=33;FSRF=16;FSRR=36;FWDB=-0.00693446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.998;QD=9.97493;RBI=0.013251;REFB=-0.0403876;REVB=-0.0112917;RO=52;SAF=26;SAR=32;SRF=16;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1242;STB=0.56413;TYPE=snp;VARB=0.0253878;OID=.;OPOS=41937095;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:111:52:52:58:59:32:26:16:36:33:26:16:36 chr19 41939297 . C G 23.17 PASS AO=5;DP=17;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.0153685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.778;QD=5.14951;RBI=0.0357226;REFB=-0.0542064;REVB=0.0322477;RO=12;SAF=1;SAR=4;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187242;STB=0.657294;TYPE=snp;VARB=0.060502;OID=.;OPOS=41939297;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:17:18:12:12:5:6:4:1:4:8:5:1:4:8 chr19 41944237 . T C 55.99 PASS AO=22;DP=72;FAO=22;FDP=73;FR=.;FRO=51;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=30;FSRR=21;FWDB=0.0191893;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.915;QD=3.06797;RBI=0.023463;REFB=0.000982511;REVB=-0.0135013;RO=50;SAF=12;SAR=10;SRF=30;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0650223;STB=0.530276;TYPE=snp;VARB=-0.00720077;OID=.;OPOS=41944237;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:72:73:50:51:22:22:10:12:30:20:10:12:30:21 chr19 41945837 . T A 371.22 PASS AO=82;DP=158;FAO=82;FDP=157;FR=.;FRO=75;FSAF=30;FSAR=52;FSRF=47;FSRR=28;FWDB=-0.016836;FXX=0.00632871;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.958;QD=9.45775;RBI=0.0298839;REFB=0.00878989;REVB=-0.02469;RO=75;SAF=30;SAR=52;SRF=47;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228226;STB=0.625204;TYPE=snp;VARB=-0.00489827;OID=.;OPOS=41945837;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:157:75:75:82:82:52:30:47:28:52:30:47:28 chr19 42070360 . C T 761.88 PASS AO=81;DP=83;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=61;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.051389;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.5237;QD=36.7171;RBI=0.102347;REFB=-0.0357966;REVB=0.0885101;RO=1;SAF=61;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00770064;STB=0.504064;TYPE=snp;VARB=0.000994718;OID=.;OPOS=42070360;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:83:83:1:1:81:82:20:61:1:0:21:61:1:0 chr19 42070528 . G C 831.1 PASS AO=89;DP=91;FAO=89;FDP=90;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00992784;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.623;QD=36.9376;RBI=0.0150483;REFB=-0.0095427;REVB=0.0113088;RO=1;SAF=48;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114189;STB=0.506023;TYPE=snp;VARB=8.84635e-05;OID=.;OPOS=42070528;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:91:90:1:1:89:89:41:48:0:1:41:48:0:1 chr19 42070701 . A ATTATTTATTTATTTAT,AT,T 110.75 PASS AO=5,6,6;DP=22;FAO=5,9,3;FDP=22;FR=.;FRO=5;FSAF=4,5,3;FSAR=1,4,0;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.026348,0.0263907,0.0183576;FXX=0;HRUN=2,2,1;LEN=16,1,1;MLLD=87.2388,26.7032,200.204;QD=20.1356;RBI=0.0358446,0.0289345,0.0215187;REFB=-0.0186659,-0.0143835,-0.0226134;REVB=-0.0243026,0.0118632,0.0112274;RO=5;SAF=4,2,6;SAR=1,4,0;SRF=3;SRR=2;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.20967,-0.207272,0.751961;STB=0.630995,0.516093,0.994993;TYPE=ins,ins,snp;VARB=0.0025754,0.0106359,-0.00277557;OID=.,.,.;OPOS=42070702,42070702,42070701;OREF=-,-,A;OALT=TTATTTATTTATTTAT,T,T;OMAPALT=ATTATTTATTTATTTAT,AT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:25:22:22:5:5:5,6,6:5,9,3:1,4,0:4,2,6:3:2:1,4,0:4,5,3:3:2 chr19 42071289 . T C 1076.11 PASS AO=113;DP=114;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0666746;FXX=0.00877116;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.5168;QD=38.0924;RBI=0.0678755;REFB=0;REVB=0.012711;RO=0;SAF=69;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.91148e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000405453;OID=.;OPOS=42071289;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:114:113:0:0:113:113:44:69:0:0:44:69:0:0 chr19 42083849 . C A 1309.01 PASS AO=130;DP=134;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.159427;FXX=0.0140835;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.156;QD=37.4003;RBI=0.159534;REFB=-0.0692479;REVB=-0.00583193;RO=3;SAF=54;SAR=76;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0110623;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00141976;OID=.;OPOS=42083849;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:134:140:3:0:130:140:76:54:2:1:79:61:0:0 chr19 42085873 . A G 873.32 PASS AO=92;DP=93;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0369117;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.587;QD=37.9704;RBI=0.0467979;REFB=0;REVB=0.0287675;RO=0;SAF=19;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76537e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.64475e-05;OID=.;OPOS=42085873;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:93:92:0:0:92:92:73:19:0:0:73:19:0:0 chr19 42190859 . A T 328.25 PASS AO=89;DP=194;FAO=87;FDP=194;FR=.;FRO=107;FSAF=43;FSAR=44;FSRF=48;FSRR=59;FWDB=-0.0147734;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.0868;QD=6.76812;RBI=0.0175512;REFB=-0.0143071;REVB=-0.00947577;RO=104;SAF=45;SAR=44;SRF=46;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0615768;STB=0.525193;TYPE=snp;VARB=0.0296966;OID=.;OPOS=42190859;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:194:104:107:89:87:44:45:46:58:44:43:48:59 chr19 42219306 . C A 19.18 PASS AO=8;DP=34;FAO=8;FDP=34;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.00919599;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=205.422;QD=2.25628;RBI=0.0117804;REFB=-0.00423217;REVB=-0.00736292;RO=26;SAF=5;SAR=3;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193611;STB=0.624688;TYPE=snp;VARB=0.0108039;OID=.;OPOS=42219306;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:34:34:26:26:8:8:3:5:12:14:3:5:12:14 chr19 42221607 . A G 385.86 PASS AO=78;DP=137;FAO=78;FDP=138;FR=.;FRO=60;FSAF=25;FSAR=53;FSRF=25;FSRR=35;FWDB=-0.0438329;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=136.123;QD=11.1844;RBI=0.043853;REFB=-0.00510773;REVB=0.00132588;RO=59;SAF=25;SAR=53;SRF=24;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0757584;STB=0.54638;TYPE=snp;VARB=0.00270533;OID=.;OPOS=42221607;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:138:59:60:78:78:53:25:24:35:53:25:25:35 chr19 42265889 . G T 1153.47 PASS AO=129;DP=139;FAO=132;FDP=139;FR=.;FRO=7;FSAF=59;FSAR=73;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0366387;FXX=0.0141834;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.7304;QD=33.1934;RBI=0.0413547;REFB=-0.00327122;REVB=0.0191787;RO=6;SAF=58;SAR=71;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00429142;STB=0.50633;TYPE=snp;VARB=0.00121479;OID=.;OPOS=42265889;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:139:139:6:7:129:132:71:58:3:3:73:59:4:3 chr19 42315281 . G T 604.61 PASS AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0199431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.238;QD=37.788;RBI=0.0223609;REFB=0;REVB=0.0101135;RO=0;SAF=34;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.72981e-05;OID=.;OPOS=42315281;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:64:64:0:0:64:64:30:34:0:0:30:34:0:0 chr19 42342319 . A G 370.44 PASS AO=40;DP=43;FAO=43;FDP=46;FR=.;FRO=3;FSAF=11;FSAR=32;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0235631;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.07;QD=32.212;RBI=0.0255879;REFB=-0.0860075;REVB=-0.00997585;RO=0;SAF=11;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.97233e-08;STB=0.559971;TYPE=snp;VARB=0.00214869;OID=.;OPOS=42342319;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:43:46:0:3:40:43:29:11:0:0:32:11:3:0 chr19 42354629 . T C 734.41 PASS AO=46;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=27;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0450896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.347;QD=38.1512;RBI=0.0552699;REFB=0;REVB=0.0319639;RO=0;SAF=20;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000413934;OID=.;OPOS=42354629;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:73:77:0:0:46:77:26:20:0:0:50:27:0:0 chr19 42463447 . C T 170.86 PASS AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0252245;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.357;QD=37.9687;RBI=0.0407162;REFB=0;REVB=0.0319614;RO=0;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000369631;OID=.;OPOS=42463447;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:18:0:0:18:18:9:9:0:0:9:9:0:0 chr19 42471050 . G C 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00581518;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=292.177;QD=35.0875;RBI=0.00581518;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=7;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.38028e-05;OID=.;OPOS=42471050;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:0:7:0:0:0:7:0:0 chr19 42489516 . A C 1222.51 PASS AO=129;DP=135;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0439626;FXX=0.0370343;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.491;QD=37.6158;RBI=0.059618;REFB=0;REVB=0.040269;RO=0;SAF=86;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000100985;OID=.;OPOS=42489516;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:135:130:0:0:129:130:43:86:0:0:43:87:0:0 chr19 42620945 . AC A 26.31 PASS AO=10;DP=32;FAO=15;FDP=27;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=-0.0384965;FXX=0.0357015;HRUN=8;LEN=1;MLLD=6.81333;QD=3.89716;RBI=0.187869;REFB=-0.0244927;REVB=0.183883;RO=10;SAF=5;SAR=5;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.26049;STB=0.659998;TYPE=del;VARB=0.092027;OID=.;OPOS=42620946;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:10:28:15:27:12:8:7:2:10:18:10:5:5:2:8 chr19 42736267 . A G 1264.89 PASS AO=134;DP=136;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00770831;FXX=0.0147048;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.118;QD=37.758;RBI=0.0113572;REFB=0.0666488;REVB=0.0083407;RO=1;SAF=52;SAR=82;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00576214;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.79575e-08;OID=.;OPOS=42736267;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:136:134:1:0:134:134:82:52:0:1:82:52:0:0 chr19 42795268 . AGGGGGC AGGGC,AGGGG 43.36 PASS AO=4,6;DP=33;FAO=0,15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=0,9;FSAR=0,6;FSRF=13;FSRR=0;FWDB=0.100859,0.112191;FXX=0.0344709;HRUN=5,5;LEN=2,2;MLLD=18.4348,20.1279;QD=6.19474;RBI=0.456295,0.12294;REFB=-0.0283766,-0.0985729;REVB=-0.445008,-0.0502745;RO=11;SAF=0,6;SAR=4,0;SRF=11;SRR=0;SSEN=0.30137,0.30137;SSEP=0,0;SSSB=-0.840896,0;STB=0.5,0.709464;TYPE=del,del;VARB=0,0.125443;OID=.,.;OPOS=42795269,42795273;OREF=GG,GC;OALT=-,-;OMAPALT=AGGGC,AGGGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:4,6:26:0,15:28:13:0,9:0,6:13:0:40:11:0,6:4,0:11:0 chr19 42798427 . AG A 28.63 PASS AO=10;DP=21;FAO=13;FDP=20;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.118689;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=7.89457;QD=5.72623;RBI=0.232389;REFB=0.0499529;REVB=-0.199794;RO=8;SAF=1;SAR=9;SRF=4;SRR=4;SSEN=0.414179;SSEP=0;SSSB=-0.461553;STB=0.526274;TYPE=del;VARB=-0.0246208;OID=.;OPOS=42798428;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:10:21:13:20:7:3:10:2:5:13:8:1:9:4:4 chr19 42840272 . GC G 261.66 PASS AO=12;DP=61;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.316954;FXX=0.020404;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.7327;QD=21.8053;RBI=0.320168;REFB=-0.0787721;REVB=-0.04525;RO=0;SAF=1;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.408163;SSEP=0;SSSB=-3.23983e-08;STB=0.507689;TYPE=del;VARB=0.0323096;OID=.;OPOS=42840273;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:12:12:47:48:1:15:32:0:1:18:0:1:11:0:0 chr19 42855434 . C G 13.43 PASS AO=3;DP=11;FAO=3;FDP=11;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=0.0287724;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.313;QD=4.8837;RBI=0.0287724;REFB=-0.00686545;REVB=0;RO=7;SAF=3;SAR=0;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00270862;OID=.;OPOS=42855434;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:11:11:7:8:3:3:0:3:7:0:0:3:8:0 chr19 42880841 . G T 15.62 PASS AO=5;DP=20;FAO=5;FDP=21;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=0;FSRF=16;FSRR=0;FWDB=0.00120269;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=114.856;QD=2.97518;RBI=0.00120269;REFB=0.0109585;REVB=0;RO=15;SAF=5;SAR=0;SRF=15;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00181054;OID=.;OPOS=42880841;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:20:21:15:16:5:5:0:5:15:0:0:5:16:0 chr19 42882829 . TA T 580.28 PASS AO=58;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.052063;FXX=0.0302984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.718;QD=36.2675;RBI=0.0530302;REFB=-0.0286074;REVB=0.0100821;RO=1;SAF=1;SAR=57;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.309005;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00186586;OID=.;OPOS=42882830;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:58:62:64:64:0:3:61:0:0:25:1:1:57:1:0 chr19 42882853 . T C 155.05 PASS AO=30;DP=54;FAO=31;FDP=56;FR=.;FRO=25;FSAF=1;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=24;FWDB=-0.0758038;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.844;QD=11.0751;RBI=0.0759407;REFB=-0.0360319;REVB=0.00455823;RO=23;SAF=1;SAR=29;SRF=1;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0576848;STB=0.526298;TYPE=snp;VARB=0.0261436;OID=.;OPOS=42882853;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:56:23:25:30:31:29:1:1:22:30:1:1:24 chr19 42905853 . G C 12.6 PASS AO=3;DP=11;FAO=3;FDP=11;FR=.;FRO=8;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=328.373;QD=4.58362;RBI=0.00577596;REFB=-0.0195134;REVB=0.00577596;RO=8;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0478263;OID=.;OPOS=42905853;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:11:11:8:8:3:3:3:0:0:8:3:0:0:8 chr19 42911617 . T C 18.62 PASS AO=4;DP=12;FAO=4;FDP=12;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.0177821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.313;QD=6.20765;RBI=0.0178434;REFB=-0.0149891;REVB=-0.00147862;RO=8;SAF=1;SAR=3;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.37999;STB=0.74875;TYPE=snp;VARB=0.0667906;OID=.;OPOS=42911617;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:12:12:8:8:4:4:3:1:5:3:3:1:5:3 chr19 43013363 . A G 138.56 PASS AO=43;DP=116;FAO=44;FDP=115;FR=.;FRO=71;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=56;FSRR=15;FWDB=-0.0147628;FXX=0.00861995;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.1443;QD=4.81942;RBI=0.0157892;REFB=0.00369949;REVB=-0.0055998;RO=72;SAF=27;SAR=16;SRF=56;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187776;STB=0.620171;TYPE=snp;VARB=-0.0113682;OID=.;OPOS=43013363;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:115:72:71:43:44:16:27:56:16:17:27:56:15 chr19 43032561 . G A 253.32 PASS AO=41;DP=71;FAO=47;FDP=74;FR=.;FRO=27;FSAF=30;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.0450514;FXX=0.0133316;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.2834;QD=13.6928;RBI=0.0541321;REFB=-0.0252333;REVB=0.0300108;RO=28;SAF=26;SAR=15;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00696538;STB=0.503417;TYPE=snp;VARB=0.0244754;OID=.;OPOS=43032561;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:71:74:28:27:41:47:15:26:18:10:17:30:17:10 chr19 43087484 . A C 187.77 PASS AO=36;DP=62;FAO=36;FDP=62;FR=.;FRO=26;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=0.0069711;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=134.06;QD=12.1139;RBI=0.0270167;REFB=-0.0199242;REVB=0.0261018;RO=26;SAF=24;SAR=12;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0221787;STB=0.512188;TYPE=snp;VARB=0.0173786;OID=.;OPOS=43087484;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:62:62:26:26:36:36:12:24:18:8:12:24:18:8 chr19 43233304 . C A 480.88 PASS AO=171;DP=422;FAO=143;FDP=354;FR=.;FRO=211;FSAF=111;FSAR=32;FSRF=110;FSRR=101;FWDB=0.00154053;FXX=0.114997;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.647;QD=5.43371;RBI=0.0157503;REFB=-0.00922733;REVB=-0.0156748;RO=221;SAF=130;SAR=41;SRF=122;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246744;STB=0.676089;TYPE=snp;VARB=0.0123638;OID=.;OPOS=43233304;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:422:354:221:211:171:143:41:130:122:99:32:111:110:101 chr19 43234049 . A T 632.19 PASS AO=172;DP=398;FAO=175;FDP=398;FR=.;FRO=223;FSAF=135;FSAR=40;FSRF=162;FSRR=61;FWDB=-0.009902;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.5298;QD=6.35362;RBI=0.0204631;REFB=0.00603457;REVB=-0.0179078;RO=225;SAF=133;SAR=39;SRF=164;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0619719;STB=0.534387;TYPE=snp;VARB=-0.00911605;OID=.;OPOS=43234049;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:398:398:225:223:172:175:39:133:164:61:40:135:162:61 chr19 43243217 . A G 3801.65 PASS AO=440;DP=442;FAO=396;FDP=396;FR=.;FRO=0;FSAF=145;FSAR=251;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00880429;FXX=0.00999975;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.057;QD=38.4005;RBI=0.0352487;REFB=0;REVB=0.0341314;RO=0;SAF=163;SAR=277;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.77317e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000206664;OID=.;OPOS=43243217;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:442:396:0:0:440:396:277:163:0:0:251:145:0:0 chr19 43243218 . A G 3741.8 PASS AO=463;DP=463;FAO=391;FDP=391;FR=.;FRO=0;FSAF=141;FSAR=250;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00700924;FXX=0.0224994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.006;QD=38.2793;RBI=0.054126;REFB=0;REVB=0.0536703;RO=0;SAF=166;SAR=297;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000133727;OID=.;OPOS=43243218;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:463:391:0:0:463:391:297:166:0:0:250:141:0:0 chr19 43243238 . A G 3744.47 PASS AO=397;DP=401;FAO=397;FDP=397;FR=.;FRO=0;FSAF=136;FSAR=261;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0521336;FXX=0.00749981;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.661;QD=37.7277;RBI=0.0557477;REFB=0.0269678;REVB=-0.0197457;RO=3;SAF=135;SAR=262;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00519896;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000201569;OID=.;OPOS=43243238;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:401:397:3:0:397:397:262:135:2:1:261:136:0:0 chr19 43244485 . G C 110.82 PASS AO=27;DP=60;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=-0.0042143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.69;QD=7.38825;RBI=0.0215212;REFB=-0.0188076;REVB=0.0211046;RO=29;SAF=12;SAR=15;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.094273;STB=0.51127;TYPE=snp;VARB=0.0201674;OID=.;OPOS=43244485;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:29:33:27:27:15:12:10:19:15:12:14:19 chr19 43259184 . T G 224.31 PASS AO=97;DP=307;FAO=97;FDP=307;FR=.;FRO=210;FSAF=77;FSAR=20;FSRF=158;FSRR=52;FWDB=0.0184645;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2542;QD=2.92263;RBI=0.0196781;REFB=-0.00273901;REVB=-0.00680366;RO=209;SAF=76;SAR=21;SRF=158;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0464686;STB=0.541186;TYPE=snp;VARB=0.00841801;OID=.;OPOS=43259184;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:307:307:209:210:97:97:21:76:158:51:20:77:158:52 chr19 43268069 . A G 476.56 PASS AO=105;DP=196;FAO=104;FDP=196;FR=.;FRO=92;FSAF=83;FSAR=21;FSRF=61;FSRR=31;FWDB=0.0119095;FXX=0.00507588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.346;QD=9.72564;RBI=0.0119912;REFB=-0.0108828;REVB=0.00139703;RO=90;SAF=83;SAR=22;SRF=61;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130991;STB=0.587993;TYPE=snp;VARB=0.00870406;OID=.;OPOS=43268069;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:196:90:92:105:104:22:83:61:29:21:83:61:31 chr19 43268140 . AG A 459.66 PASS AO=153;DP=311;FAO=161;FDP=303;FR=.;FRO=142;FSAF=100;FSAR=61;FSRF=94;FSRR=48;FWDB=-0.0210734;FXX=0.0162332;HRUN=2;LEN=1;MLLD=23.7522;QD=6.06806;RBI=0.102932;REFB=-0.0135758;REVB=-0.100752;RO=136;SAF=97;SAR=56;SRF=93;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0470084;STB=0.520539;TYPE=del;VARB=0.00462331;OID=.;OPOS=43268141;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:153:305:161:303:142:100:61:94:48:99:136:97:56:93:43 chr19 43268216 . T G 874.51 PASS AO=128;DP=385;FAO=155;FDP=369;FR=.,HEALED;FRO=168;FSAF=56;FSAR=99;FSRF=94;FSRR=74;FWDB=0.0229167;FXX=0.00270263;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.3273;QD=9.4798;RBI=0.0246287;REFB=-0.0138613;REVB=0.00902215;RO=169;SAF=29;SAR=99;SRF=95;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.374913;STB=0.60517;TYPE=snp;VARB=0.0304405;OID=.;OPOS=43268216;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:371:369:169:168:128:155:99:29:95:74:99:56:94:74 chr19 43268235 . A C 879.64 PASS AO=194;DP=370;FAO=194;FDP=367;FR=.;FRO=173;FSAF=95;FSAR=99;FSRF=103;FSRR=70;FWDB=0.00528576;FXX=0.0239355;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.694;QD=9.58739;RBI=0.0117194;REFB=0.00377645;REVB=-0.0104597;RO=168;SAF=95;SAR=99;SRF=100;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0898679;STB=0.549733;TYPE=snp;VARB=-0.00331311;OID=.;OPOS=43268235;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:370:367:168:173:194:194:99:95:100:68:99:95:103:70 chr19 43269699 . C T 1508.75 PASS AO=157;DP=158;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00429805;FXX=0.00632871;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.917;QD=38.4395;RBI=0.0195313;REFB=0;REVB=0.0190525;RO=0;SAF=64;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5449e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.69492e-05;OID=.;OPOS=43269699;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:158:157:0:0:157:157:93:64:0:0:93:64:0:0 chr19 43269704 . T C 1460.97 PASS AO=153;DP=154;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018515;FXX=0.00649309;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.284;QD=38.1953;RBI=0.0342888;REFB=0;REVB=0.0288603;RO=0;SAF=63;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71982e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.57318e-05;OID=.;OPOS=43269704;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:154:153:0:0:153:153:90:63:0:0:90:63:0:0 chr19 43269705 . G A 1441.31 PASS AO=152;DP=154;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0325093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.34;QD=37.4366;RBI=0.0500742;REFB=0;REVB=0.0380863;RO=1;SAF=63;SAR=89;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00531508;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000264445;OID=.;OPOS=43269705;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:154:154:1:0:152:154:89:63:0:1:91:63:0:0 chr19 43373034 . G A 219.14 PASS AO=57;DP=127;FAO=57;FDP=127;FR=.;FRO=70;FSAF=38;FSAR=19;FSRF=54;FSRR=16;FWDB=0.000724786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.802;QD=6.90203;RBI=0.0126162;REFB=-0.00708384;REVB=-0.0125954;RO=70;SAF=38;SAR=19;SRF=54;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122507;STB=0.567879;TYPE=snp;VARB=0.00582793;OID=.;OPOS=43373034;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:70:70:57:57:19:38:54:16:19:38:54:16 chr19 43383746 . T C 222.46 PASS AO=74;DP=209;FAO=77;FDP=212;FR=.;FRO=135;FSAF=31;FSAR=46;FSRF=58;FSRR=77;FWDB=0.0896119;FXX=0.00469462;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2096;QD=4.19739;RBI=0.101858;REFB=-0.0279452;REVB=-0.0484237;RO=135;SAF=28;SAR=46;SRF=59;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.069217;STB=0.517764;TYPE=snp;VARB=0.0532887;OID=.;OPOS=43383746;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:212:135:135:74:77:46:28:59:76:46:31:58:77 chr19 43439793 . G A 2528.45 PASS AO=271;DP=276;FAO=275;FDP=280;FR=.;FRO=5;FSAF=192;FSAR=83;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0156779;FXX=0.0243894;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.1308;QD=36.1207;RBI=0.0285828;REFB=-0.00136751;REVB=0.0238993;RO=5;SAF=188;SAR=83;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125096;STB=0.506426;TYPE=snp;VARB=0.000461953;OID=.;OPOS=43439793;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:276:280:5:5:271:275:83:188:5:0:83:192:5:0 chr19 43519362 . C T 3642.13 PASS AO=370;DP=370;FAO=381;FDP=381;FR=.;FRO=0;FSAF=185;FSAR=196;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00858202;FXX=0.0052218;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.388;QD=38.2376;RBI=0.0247256;REFB=0;REVB=0.0231885;RO=0;SAF=182;SAR=188;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000391298;OID=.;OPOS=43519362;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:370:381:0:0:370:381:188:182:0:0:196:185:0:0 chr19 43519442 . T C 2929.33 PASS AO=318;DP=326;FAO=319;FDP=327;FR=.;FRO=8;FSAF=139;FSAR=180;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=0.013743;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=183.754;QD=35.8328;RBI=0.0427081;REFB=-0.0556079;REVB=0.0404366;RO=6;SAF=139;SAR=179;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0201399;STB=0.510896;TYPE=snp;VARB=0.00037711;OID=.;OPOS=43519442;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:326:327:6:8:318:319:179:139:6:0:180:139:7:1 chr19 43529026 . C T 3226.82 PASS AO=336;DP=339;FAO=336;FDP=336;FR=.;FRO=0;FSAF=160;FSAR=176;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0282545;FXX=0.0088493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.792;QD=38.4145;RBI=0.0286529;REFB=0;REVB=-0.00476167;RO=0;SAF=160;SAR=176;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02006e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.73993e-06;OID=.;OPOS=43529026;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:339:336:0:0:336:336:176:160:0:0:176:160:0:0 chr19 43529027 . A G 3198.69 PASS AO=335;DP=336;FAO=335;FDP=335;FR=.;FRO=0;FSAF=163;FSAR=172;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00312491;FXX=0.0029761;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.722;QD=38.1933;RBI=0.00446153;REFB=-0.0298933;REVB=0.00318436;RO=1;SAF=163;SAR=172;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00291788;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.73773e-05;OID=.;OPOS=43529027;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:336:335:1:0:335:335:172:163:1:0:172:163:0:0 chr19 43575874 . T C 624.09 PASS AO=177;DP=410;FAO=174;FDP=399;FR=.;FRO=225;FSAF=110;FSAR=64;FSRF=160;FSRR=65;FWDB=-0.0206078;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143;QD=6.25649;RBI=0.0291498;REFB=-0.00194787;REVB=0.0206163;RO=229;SAF=112;SAR=65;SRF=162;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0839889;STB=0.549089;TYPE=snp;VARB=0.00253951;OID=.;OPOS=43575874;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:410:399:229:225:177:174:65:112:162:67:64:110:160:65 chr19 43579642 . A G 361.29 PASS AO=73;DP=130;FAO=73;FDP=130;FR=.;FRO=57;FSAF=32;FSAR=41;FSRF=17;FSRR=40;FWDB=0.0133957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3292;QD=11.1167;RBI=0.0542887;REFB=-0.00601047;REVB=-0.0526101;RO=57;SAF=32;SAR=41;SRF=17;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11633;STB=0.563339;TYPE=snp;VARB=0.00731759;OID=.;OPOS=43579642;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:57:57:73:73:41:32:17:40:41:32:17:40 chr19 43586664 . C G 157.39 PASS AO=41;DP=93;FAO=41;FDP=93;FR=.;FRO=52;FSAF=14;FSAR=27;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=0.0226133;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.851;QD=6.7693;RBI=0.030726;REFB=-0.000258782;REVB=0.0208022;RO=52;SAF=14;SAR=27;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145791;STB=0.582048;TYPE=snp;VARB=0.000434216;OID=.;OPOS=43586664;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:52:52:41:41:27:14:25:27:27:14:25:27 chr19 43679410 . A G 3385.91 PASS AO=320;DP=328;FAO=362;FDP=362;FR=.;FRO=0;FSAF=222;FSAR=140;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103469;FXX=0.0163039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.348;QD=37.4134;RBI=0.0826222;REFB=-0.0916521;REVB=0.0819717;RO=3;SAF=214;SAR=106;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0133059;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000244502;OID=.;OPOS=43679410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:328:362:3:0:320:362:106:214:0:3:140:222:0:0 chr19 43680051 . C T 2921.02 PASS AO=306;DP=309;FAO=308;FDP=308;FR=.;FRO=0;FSAF=251;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0520816;FXX=0.00323614;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.3965;QD=37.9353;RBI=0.0667834;REFB=-0.0104594;REVB=0.0418035;RO=3;SAF=249;SAR=57;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00571155;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000116837;OID=.;OPOS=43680051;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:309:308:3:0:306:308:57:249:3:0:57:251:0:0 chr19 43680147 . C T 748.7 PASS AO=160;DP=296;FAO=160;FDP=293;FR=.;FRO=133;FSAF=127;FSAR=33;FSRF=89;FSRR=44;FWDB=0.00250687;FXX=0.0101348;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.528;QD=10.2211;RBI=0.0149007;REFB=-0.0146567;REVB=0.0146884;RO=133;SAF=128;SAR=32;SRF=90;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144541;STB=0.578389;TYPE=snp;VARB=0.0180312;OID=.;OPOS=43680147;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:296:293:133:133:160:160:32:128:90:43:33:127:89:44 chr19 43687589 . G A 117.63 PASS AO=25;DP=49;FAO=25;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=21;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=0.0468462;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.0767;QD=9.60254;RBI=0.0468534;REFB=0.00546608;REVB=0.000816557;RO=24;SAF=21;SAR=4;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228669;STB=0.629882;TYPE=snp;VARB=-0.00334637;OID=.;OPOS=43687589;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:49:24:24:25:25:4:21:16:8:4:21:16:8 chr19 43687613 . T C 96.68 PASS AO=23;DP=55;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=21;FSAR=3;FSRF=22;FSRR=8;FWDB=-0.0101861;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.89;QD=7.16128;RBI=0.0133007;REFB=-0.00153922;REVB=0.00855296;RO=29;SAF=20;SAR=3;SRF=22;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196244;STB=0.641529;TYPE=snp;VARB=0.00199249;OID=.;OPOS=43687613;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:55:54:29:30:23:24:3:20:22:7:3:21:22:8 chr19 43689004 . G A 229.87 PASS AO=95;DP=295;FAO=95;FDP=293;FR=.;FRO=198;FSAF=48;FSAR=47;FSRF=71;FSRR=127;FWDB=0.0119258;FXX=0.00677943;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.23;QD=3.13815;RBI=0.0119452;REFB=-0.00409287;REVB=-0.000679497;RO=197;SAF=48;SAR=47;SRF=70;SRR=127;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1767;STB=0.598904;TYPE=snp;VARB=0.00829037;OID=.;OPOS=43689004;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:295:293:197:198:95:95:47:48:70:127:47:48:71:127 chr19 43690506 . G C 477.57 PASS AO=50;DP=51;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00175507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.188;QD=35.3757;RBI=0.0319586;REFB=0.0648353;REVB=0.0319104;RO=0;SAF=29;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.20481e-08;STB=0.511107;TYPE=snp;VARB=0.000293801;OID=.;OPOS=43690506;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:51:54:0:1:50:53:21:29:0:0:22:31:0:1 chr19 43699336 . T C 2488.33 PASS AO=264;DP=270;FAO=265;FDP=265;FR=.;FRO=0;FSAF=155;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0232779;FXX=0.0185178;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.918;QD=37.5598;RBI=0.0380618;REFB=-0.117032;REVB=0.0301138;RO=1;SAF=154;SAR=110;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00431449;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000159835;OID=.;OPOS=43699336;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:92:270:265:1:0:264:265:110:154:0:1:110:155:0:0 chr19 43699417 . A G 2921.25 PASS AO=289;DP=300;FAO=309;FDP=309;FR=.;FRO=0;FSAF=140;FSAR=169;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0269815;FXX=0.0159231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.8018;QD=37.8155;RBI=0.0491304;REFB=-0.0316169;REVB=0.0410585;RO=1;SAF=140;SAR=149;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00339422;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000730856;OID=.;OPOS=43699417;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:300:309:1:0:289:309:149:140:1:0:169:140:0:0 chr19 43702342 . C T 1970.99 PASS AO=201;DP=206;FAO=209;FDP=209;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=126;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0469097;FXX=0.0187785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.526;QD=37.7222;RBI=0.0534524;REFB=-0.029788;REVB=0.0256248;RO=0;SAF=76;SAR=125;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.45585e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.60031e-05;OID=.;OPOS=43702342;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:206:209:0:0:201:209:125:76:0:0:126:83:0:0 chr19 43708926 . G T 116.19 PASS AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0322363;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.972;QD=35.75;RBI=0.0333104;REFB=0;REVB=0.0083908;RO=0;SAF=10;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000424586;OID=.;OPOS=43708926;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:13:0:0:13:13:3:10:0:0:3:10:0:0 chr19 43708968 . T C 195.71 PASS AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0193793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.175;QD=39.1419;RBI=0.0206773;REFB=0;REVB=-0.00721062;RO=0;SAF=17;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.61326e-05;OID=.;OPOS=43708968;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:20:20:0:0:20:20:3:17:0:0:3:17:0:0 chr19 43708977 . TTC T,TT,TTT 170.22 PASS AO=4,8,7;DP=19;FAO=4,14,0;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=3,10,0;FSAR=1,4,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0246598,-0.0244089,-0.024173;FXX=0.0526039;HRUN=3,1,1;LEN=2,1,1;MLLD=242.524,247.574,240.961;QD=37.8268;RBI=0.0288523,0.0345284,0.0398426;REFB=0,0,0;REVB=-0.0149784,-0.0244217,-0.0316717;RO=0;SAF=3,6,5;SAR=1,2,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=4.86674e-08,5.58669e-08,3.27427e-08;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=del,del,snp;VARB=-0.00270424,-0.00284011,0;OID=.,.,.;OPOS=43708978,43708979,43708979;OREF=TC,C,C;OALT=-,-,T;OMAPALT=T,TT,TTT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:4,8,7:19:4,14,0:18:0:3,10,0:1,4,0:0:0:10:0:3,6,5:1,2,2:0:0 chr19 43709619 . C T 398.87 PASS AO=51;DP=60;FAO=51;FDP=60;FR=.;FRO=9;FSAF=35;FSAR=16;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0578396;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.529;QD=26.5913;RBI=0.0600231;REFB=0.0469869;REVB=0.0160422;RO=9;SAF=35;SAR=16;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0418376;STB=0.522379;TYPE=snp;VARB=-0.00739942;OID=.;OPOS=43709619;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:60:60:9:9:51:51:16:35:5:4:16:35:5:4 chr19 43709647 . G A 447.98 PASS AO=59;DP=71;FAO=59;FDP=70;FR=.;FRO=11;FSAF=43;FSAR=16;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0313821;FXX=0.0140825;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.917;QD=25.5986;RBI=0.0839736;REFB=-6.17378e-05;REVB=0.0778892;RO=11;SAF=43;SAR=16;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0659562;STB=0.535257;TYPE=snp;VARB=0.00122317;OID=.;OPOS=43709647;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:71:70:11:11:59:59:16:43:6:5:16:43:6:5 chr19 43709654 . C A 448.01 PASS AO=59;DP=71;FAO=59;FDP=70;FR=.;FRO=11;FSAF=43;FSAR=16;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.0100272;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.975;QD=25.6006;RBI=0.0781729;REFB=-0.0568788;REVB=0.0775272;RO=11;SAF=43;SAR=16;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0659562;STB=0.535257;TYPE=snp;VARB=0.00265792;OID=.;OPOS=43709654;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:71:70:11:11:59:59:16:43:6:5:16:43:6:5 chr19 43709656 . C G 462.51 PASS AO=61;DP=72;FAO=61;FDP=72;FR=.;FRO=11;FSAF=44;FSAR=17;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.0165318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.05;QD=25.695;RBI=0.0304939;REFB=-0.027809;REVB=0.0256237;RO=11;SAF=44;SAR=17;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0607423;STB=0.532442;TYPE=snp;VARB=0.00142025;OID=.;OPOS=43709656;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:72:72:11:11:61:61:17:44:6:5:17:44:6:5 chr19 43763144 . C T 1247.7 PASS AO=130;DP=173;FAO=154;FDP=172;FR=.;FRO=18;FSAF=116;FSAR=38;FSRF=15;FSRR=3;FWDB=0.00960549;FXX=0.00578001;HRUN=4;LEN=1;MLLD=213.876;QD=29.0162;RBI=0.00962263;REFB=0.0381924;REVB=0.000574194;RO=0;SAF=99;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.42736e-08;STB=0.511402;TYPE=snp;VARB=-0.000409621;OID=.;OPOS=43763144;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:131:172:0:18:130:154:31:99:0:0:38:116:15:3 chr19 43772270 . G T 550.56 PASS AO=130;DP=280;FAO=140;FDP=293;FR=.;FRO=153;FSAF=51;FSAR=89;FSRF=100;FSRR=53;FWDB=-0.0108333;FXX=0.00677943;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.6279;QD=7.51611;RBI=0.069514;REFB=-0.0106068;REVB=0.0686647;RO=150;SAF=51;SAR=79;SRF=100;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.262344;STB=0.649802;TYPE=snp;VARB=0.0128419;OID=.;OPOS=43772270;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:280:293:150:153:130:140:79:51:100:50:89:51:100:53 chr19 43772302 . C T 532.15 PASS AO=130;DP=288;FAO=142;FDP=313;FR=.;FRO=171;FSAF=31;FSAR=111;FSRF=83;FSRR=88;FWDB=-0.00981456;FXX=0.006349;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.521;QD=6.80066;RBI=0.0151763;REFB=-0.00673218;REVB=0.0115756;RO=153;SAF=30;SAR=100;SRF=80;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.322233;STB=0.672236;TYPE=snp;VARB=0.0108352;OID=.;OPOS=43772302;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:288:313:153:171:130:142:100:30:80:73:111:31:83:88 chr19 43773532 . G C 73.67 PASS AO=15;DP=73;FAO=31;FDP=89;FR=.;FRO=58;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=36;FWDB=0.0307654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.531;QD=3.31089;RBI=0.0343239;REFB=-0.0475404;REVB=0.0152192;RO=51;SAF=0;SAR=15;SRF=15;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.718411;STB=0.56847;TYPE=snp;VARB=0.122573;OID=.;OPOS=43773532;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:73:89:51:58:15:31:15:0:15:36:16:15:22:36 chr19 43773572 . G A 102.04 PASS AO=34;DP=95;FAO=34;FDP=95;FR=.;FRO=61;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=30;FSRR=31;FWDB=0.121679;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.3967;QD=4.29621;RBI=0.124783;REFB=-0.0288284;REVB=0.0276561;RO=61;SAF=15;SAR=19;SRF=31;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0750382;STB=0.51364;TYPE=snp;VARB=0.0664667;OID=.;OPOS=43773572;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:61:61:34:34:19:15:31:30:18:16:30:31 chr19 43773599 . T C 211.1 PASS AO=51;DP=104;FAO=51;FDP=106;FR=.;FRO=55;FSAF=15;FSAR=36;FSRF=25;FSRR=30;FWDB=-0.0873353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.0036;QD=7.96608;RBI=0.0880383;REFB=-0.0157331;REVB=-0.0111037;RO=52;SAF=15;SAR=36;SRF=24;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168804;STB=0.592555;TYPE=snp;VARB=0.0217766;OID=.;OPOS=43773599;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:106:52:55:51:51:36:15:24:28:36:15:25:30 chr19 43857870 . AGCG AG,AGC,AGCC 892.21 PASS AO=28,35,28;DP=107;FAO=2,92,0;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=2,62,0;FSAR=0,30,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0943629,0.123104,0.124521;FXX=0.0408122;HRUN=1,1,1;LEN=2,1,1;MLLD=174.466,191.462,178.324;QD=37.9666;RBI=0.107268,0.126227,0.148944;REFB=0,0,0;REVB=0.0510114,-0.0279024,-0.0817246;RO=0;SAF=28,33,1;SAR=0,2,27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=del,del,snp;VARB=0.057197,0.00188483,0.00372329;OID=.,.,.;OPOS=43857871,43857873,43857873;OREF=GC,G,G;OALT=-,-,C;OMAPALT=AG,AGC,AGCC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:28,35,28:97:2,92,0:94:0:2,62,0:0,30,0:0:0:20:0:28,33,1:0,2,27:0:0 chr19 43864548 . C A 130.53 PASS AO=49;DP=145;FAO=49;FDP=146;FR=.;FRO=97;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=41;FSRR=56;FWDB=-0.0286088;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.717;QD=3.57604;RBI=0.0337264;REFB=-0.0292176;REVB=-0.0178607;RO=96;SAF=24;SAR=25;SRF=41;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0723701;STB=0.544672;TYPE=snp;VARB=0.0426928;OID=.;OPOS=43864548;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:146:96:97:49:49:25:24:41:55:25:24:41:56 chr19 43910649 . G T 98.24 PASS AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.0157462;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.058;QD=10.3413;RBI=0.0461674;REFB=0.00879247;REVB=0.0433991;RO=17;SAF=11;SAR=9;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0317187;STB=0.502657;TYPE=snp;VARB=-0.00870745;OID=.;OPOS=43910649;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:38:38:17:18:20:20:9:11:10:7:9:11:10:8 chr19 43910764 . A G 383.25 PASS AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00997322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.63;QD=38.3253;RBI=0.0151951;REFB=0;REVB=0.0114641;RO=0;SAF=27;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00027511;OID=.;OPOS=43910764;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:39:40:0:0:39:40:12:27:0:0:12:28:0:0 chr19 43912146 . GC G 446.74 PASS AO=106;DP=170;FAO=128;FDP=159;FR=.;FRO=31;FSAF=57;FSAR=71;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.0330477;FXX=0.00624961;HRUN=3;LEN=1;MLLD=10.284;QD=11.2386;RBI=0.20356;REFB=-0.05581;REVB=-0.20086;RO=33;SAF=44;SAR=62;SRF=19;SRR=14;SSEN=0.491228;SSEP=0;SSSB=-0.072596;STB=0.520246;TYPE=del;VARB=0.048609;OID=.;OPOS=43912147;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:106:160:128:159:31:57:71:17:14:4:33:44:62:19:14 chr19 43922061 . A G 304.72 PASS AO=76;DP=162;FAO=76;FDP=162;FR=.;FRO=86;FSAF=30;FSAR=46;FSRF=29;FSRR=57;FWDB=-0.0284744;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.4626;QD=7.52404;RBI=0.029448;REFB=-0.00164175;REVB=0.00750951;RO=86;SAF=30;SAR=46;SRF=29;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0585873;STB=0.532383;TYPE=snp;VARB=0.00360223;OID=.;OPOS=43922061;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:162:86:86:76:76:46:30:29:57:46:30:29:57 chr19 43967692 . T C 39.75 PASS AO=11;DP=31;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.0194096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.678;QD=5.12902;RBI=0.037082;REFB=-0.0145653;REVB=-0.0315966;RO=19;SAF=10;SAR=1;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.405169;STB=0.776061;TYPE=snp;VARB=0.018065;OID=.;OPOS=43967692;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:31:31:19:20:11:11:1:10:13:6:1:10:13:7 chr19 43979589 . G T 160.95 PASS AO=26;DP=39;FAO=26;FDP=39;FR=.;FRO=13;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.00493689;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.987;QD=16.5077;RBI=0.0454173;REFB=-0.05477;REVB=0.0451482;RO=13;SAF=18;SAR=8;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104419;STB=0.557476;TYPE=snp;VARB=0.0231889;OID=.;OPOS=43979589;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:39:39:13:13:26:26:8:18:7:6:8:18:7:6 chr19 44001345 . C T 228.66 PASS AO=47;DP=86;FAO=48;FDP=87;FR=.;FRO=39;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=0.032479;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.5042;QD=10.5129;RBI=0.0824242;REFB=-0.00485359;REVB=0.0757553;RO=39;SAF=28;SAR=19;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0910281;STB=0.553575;TYPE=snp;VARB=0.00661181;OID=.;OPOS=44001345;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:87:39:39:47:48:19:28:19:20:19:29:19:20 chr19 44039823 . AG A 33.83 PASS AO=17;DP=48;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=3;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.258805;FXX=0.0222173;HRUN=5;LEN=1;MLLD=8.01119;QD=3.07585;RBI=0.271099;REFB=-0.129139;REVB=-0.0807135;RO=19;SAF=0;SAR=17;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.823855;STB=0.736578;TYPE=del;VARB=0.121606;OID=.;OPOS=44039824;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:17:43:21:44:23:3:18:11:12:32:19:0:17:9:10 chr19 44047550 . T C 107.15 PASS AO=34;DP=76;FAO=35;FDP=79;FR=.;FRO=44;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=31;FWDB=0.0398832;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.2613;QD=5.42515;RBI=0.047492;REFB=-0.0311537;REVB=-0.0257842;RO=42;SAF=20;SAR=14;SRF=12;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.290731;STB=0.664935;TYPE=snp;VARB=0.0475389;OID=.;OPOS=44047550;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:79:42:44:34:35:14:20:12:30:14:21:13:31 chr19 44047826 . T A 775.64 PASS AO=82;DP=85;FAO=84;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0628503;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.007;QD=36.5006;RBI=0.0640068;REFB=-0.0198018;REVB=0.0121122;RO=0;SAF=22;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94507e-08;STB=0.503999;TYPE=snp;VARB=0.000220844;OID=.;OPOS=44047826;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:85:85:0:1:82:84:60:22:0:0:62:22:0:1 chr19 44050195 . C T 47.07 PASS AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=0;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=12;FWDB=0;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=71.0162;QD=8.55847;RBI=0.0556985;REFB=0.00954489;REVB=0.0556985;RO=10;SAF=0;SAR=10;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00854996;OID=.;OPOS=44050195;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:22:22:10:12:10:10:10:0:0:10:10:0:0:12 chr19 44050966 . T C 79.98 PASS AO=14;DP=23;FAO=14;FDP=23;FR=.;FRO=9;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.00909321;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=174.036;QD=13.9088;RBI=0.0268005;REFB=0.00160152;REVB=-0.0252107;RO=9;SAF=11;SAR=3;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00811842;STB=0.504581;TYPE=snp;VARB=-0.0016287;OID=.;OPOS=44050966;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:23:23:9:9:14:14:3:11:7:2:3:11:7:2 chr19 44055726 . T C 58.48 PASS AO=13;DP=36;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=-0.0314785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.234;QD=5.99791;RBI=0.0319814;REFB=-0.023788;REVB=-0.00564905;RO=23;SAF=6;SAR=7;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174558;STB=0.581298;TYPE=snp;VARB=0.0278551;OID=.;OPOS=44055726;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:36:39:23:23:13:16:7:6:7:16:9:7:7:16 chr19 44057227 . T C 149.23 PASS AO=26;DP=43;FAO=27;FDP=44;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=25;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.013987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.831;QD=13.5666;RBI=0.0160741;REFB=-0.0139094;REVB=0.00792076;RO=16;SAF=2;SAR=24;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.546147;STB=0.806155;TYPE=snp;VARB=0.00872394;OID=.;OPOS=44057227;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:43:44:16:17:26:27:24:2:9:7:25:2:9:8 chr19 44081288 . A G 778.42 PASS AO=73;DP=76;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00388779;FXX=0.0666593;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.5093;QD=37.0678;RBI=0.0199897;REFB=0;REVB=0.019608;RO=0;SAF=50;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.51353e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0101134;OID=.;OPOS=44081288;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:76:84:0:0:73:84:23:50:0:0:29:55:0:0 chr19 44081289 . C G 12.22 PASS AO=14;DP=90;FAO=14;FDP=90;FR=.;FRO=76;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=53;FSRR=23;FWDB=-0.0244212;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=71.664;QD=0.543139;RBI=0.0545921;REFB=-0.00363947;REVB=0.0488252;RO=76;SAF=8;SAR=6;SRF=53;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169478;STB=0.611893;TYPE=snp;VARB=0.00290264;OID=.;OPOS=44081289;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:90:90:76:76:14:14:6:8:53:23:6:8:53:23 chr19 44082791 . T C 71.46 PASS AO=23;DP=65;FAO=23;FDP=65;FR=.;FRO=42;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=-0.008579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.471;QD=4.39739;RBI=0.00883398;REFB=-0.0123048;REVB=0.00210714;RO=42;SAF=9;SAR=14;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174139;STB=0.601254;TYPE=snp;VARB=0.0472653;OID=.;OPOS=44082791;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:65:65:42:42:23:23:14:9:23:19:14:9:23:19 chr19 44082945 . T C 548.4 PASS AO=55;DP=56;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184209;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.945;QD=38.4843;RBI=0.0251693;REFB=0;REVB=0.0171512;RO=0;SAF=19;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.75811e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.12875e-05;OID=.;OPOS=44082945;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:56:57:0:0:55:57:36:19:0:0:38:19:0:0 chr19 44085827 . C T 179.55 PASS AO=50;DP=119;FAO=50;FDP=119;FR=.;FRO=69;FSAF=44;FSAR=6;FSRF=46;FSRR=23;FWDB=0.0659371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.3814;QD=6.03514;RBI=0.0660067;REFB=-0.0158499;REVB=-0.00303039;RO=66;SAF=44;SAR=6;SRF=44;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.348762;STB=0.702545;TYPE=snp;VARB=0.0387699;OID=.;OPOS=44085827;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:66:69:50:50:6:44:44:22:6:44:46:23 chr19 44096205 . C CG 67.53 PASS AO=3;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=7.8343;QD=20.7795;RBI=0.309349;REFB=0;REVB=0.309349;RO=10;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.0429954;OID=.;OPOS=44096206;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:3:13:13:13:0:0:13:0:0:4:10:0:3:0:10 chr19 44098963 . C G 423.69 PASS AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00810231;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.701;QD=37.661;RBI=0.0226365;REFB=0;REVB=0.0211368;RO=0;SAF=16;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.49331e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000134303;OID=.;OPOS=44098963;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:45:45:0:0:45:45:29:16:0:0:29:16:0:0 chr19 44102993 . GGC G 368.85 PASS AO=27;DP=97;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.207617;FXX=0;HRUN=5;LEN=2;MLLD=10.6615;QD=17.7758;RBI=0.291152;REFB=0;REVB=-0.204119;RO=54;SAF=27;SAR=0;SRF=18;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.844039;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00368282;OID=.;OPOS=44102994;OREF=GC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:27:93:83:83:0:59:24:0:0:32:54:27:0:18:36 chr19 44117610 . C CA 29.94 PASS AO=7;DP=32;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0850875;FXX=0.079968;HRUN=0;LEN=1;MLLD=103.46;QD=5.20756;RBI=0.0932559;REFB=-0.00702207;REVB=-0.0381677;RO=24;SAF=4;SAR=3;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.277371;STB=0.618791;TYPE=ins;VARB=0.118011;OID=.;OPOS=44117611;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:7:32:9:23:14:5:4:5:9:29:24:4:3:8:16 chr19 44156472 . T C 165.9 PASS AO=46;DP=106;FAO=45;FDP=105;FR=.;FRO=60;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=7;FSRR=53;FWDB=-0.00140334;FXX=0.00943307;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.4281;QD=6.3201;RBI=0.00140395;REFB=-0.0164839;REVB=-4.13277e-05;RO=60;SAF=23;SAR=23;SRF=7;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.394743;STB=0.72319;TYPE=snp;VARB=0.0170308;OID=.;OPOS=44156472;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:105:60:60:46:45:23:23:7:53:22:23:7:53 chr19 44302624 . T C 72.69 PASS AO=20;DP=51;FAO=20;FDP=51;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=-0.0540443;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.42;QD=5.70087;RBI=0.0572911;REFB=-0.0215212;REVB=0.0190128;RO=31;SAF=7;SAR=13;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0320977;STB=0.5185;TYPE=snp;VARB=0.0228286;OID=.;OPOS=44302624;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:51:51:31:31:20:20:13:7:10:21:13:7:10:21 chr19 44306482 . C T 336.82 PASS AO=65;DP=111;FAO=65;FDP=111;FR=.;FRO=46;FSAF=49;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=-0.0114695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.365;QD=12.1378;RBI=0.0300227;REFB=-0.00285182;REVB=0.0277455;RO=45;SAF=49;SAR=16;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23206;STB=0.633031;TYPE=snp;VARB=0.00100646;OID=.;OPOS=44306482;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:45:46:65:65:16:49:22:23:16:49:22:24 chr19 44351107 . G A 117.53 PASS AO=21;DP=34;FAO=21;FDP=34;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0180516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.2158;QD=13.8274;RBI=0.0238689;REFB=-0.00306929;REVB=-0.0156161;RO=12;SAF=5;SAR=16;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.313972;STB=0.664368;TYPE=snp;VARB=0.00104952;OID=.;OPOS=44351107;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:34:34:12:13:21:21:16:5:8:4:16:5:8:5 chr19 44351166 . GGGAGAT G 110.81 PASS AO=29;DP=52;FAO=32;FDP=61;FR=.;FRO=29;FSAF=4;FSAR=28;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=0.0192657;FXX=0;HRUN=3;LEN=6;MLLD=280.094;QD=7.2661;RBI=0.0192707;REFB=-0.029062;REVB=-0.000442392;RO=21;SAF=3;SAR=26;SRF=10;SRR=11;SSEN=0.621918;SSEP=0;SSSB=-0.446788;STB=0.675731;TYPE=del;VARB=0.0145219;OID=.;OPOS=44351167;OREF=GGAGAT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:29:51:32:61:29:4:28:10:19:74:21:3:26:10:11 chr19 44351694 . C T 307.8 PASS AO=34;DP=34;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121932;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.706;QD=37.3094;RBI=0.0273587;REFB=0;REVB=-0.0244914;RO=0;SAF=19;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.40663e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.80942e-05;OID=.;OPOS=44351694;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:33:0:0:34:33:15:19:0:0:15:18:0:0 chr19 44351836 . G A 940.78 PASS AO=97;DP=97;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0444914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.15;QD=38.3991;RBI=0.0500116;REFB=0;REVB=0.0228402;RO=0;SAF=34;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=9.76468e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000153555;OID=.;OPOS=44351836;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:97:98:0:0:97:98:63:34:0:0:63:35:0:0 chr19 44352665 . T C 949.22 PASS AO=103;DP=105;FAO=103;FDP=105;FR=.;FRO=2;FSAF=45;FSAR=58;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00354064;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.919;QD=36.1607;RBI=0.0133631;REFB=-0.0029539;REVB=0.0128856;RO=1;SAF=45;SAR=58;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104275;STB=0.510867;TYPE=snp;VARB=8.59508e-05;OID=.;OPOS=44352665;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:105:105:1:2:103:103:58:45:1:0:58:45:2:0 chr19 44352666 . G A 224.26 PASS AO=52;DP=105;FAO=52;FDP=105;FR=.;FRO=53;FSAF=17;FSAR=35;FSRF=30;FSRR=23;FWDB=-0.0176736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.894;QD=8.54336;RBI=0.028729;REFB=-0.0110184;REVB=-0.0226494;RO=52;SAF=17;SAR=35;SRF=30;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233152;STB=0.625188;TYPE=snp;VARB=0.0251781;OID=.;OPOS=44352666;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:52:53:52:52:35:17:30:22:35:17:30:23 chr19 44352688 . G A 210.67 PASS AO=48;DP=97;FAO=48;FDP=96;FR=.;FRO=48;FSAF=16;FSAR=32;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=0.0109346;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.645;QD=8.77791;RBI=0.0187565;REFB=-0.00771947;REVB=0.0152394;RO=49;SAF=16;SAR=32;SRF=26;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187654;STB=0.598498;TYPE=snp;VARB=0.0078492;OID=.;OPOS=44352688;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:96:49:48:48:48:32:16:26:23:32:16:25:23 chr19 44352769 . A G 39.28 PASS AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.0253553;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=244.809;QD=7.14218;RBI=0.0376155;REFB=-0.013322;REVB=-0.0277855;RO=13;SAF=4;SAR=5;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140406;STB=0.583156;TYPE=snp;VARB=0.0233586;OID=.;OPOS=44352769;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:22:22:13:13:9:9:5:4:4:9:5:4:4:9 chr19 44377357 . C T 791.97 PASS AO=88;DP=95;FAO=89;FDP=93;FR=.;FRO=4;FSAF=38;FSAR=51;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0209571;FXX=0.0312467;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.985;QD=34.063;RBI=0.0264169;REFB=-0.0825138;REVB=0.0160827;RO=4;SAF=37;SAR=51;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0485145;STB=0.524994;TYPE=snp;VARB=0.000260263;OID=.;OPOS=44377357;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:95:93:4:4:88:89:51:37:4:0:51:38:4:0 chr19 44377669 . G A 280.41 PASS AO=70;DP=151;FAO=70;FDP=151;FR=.;FRO=81;FSAF=33;FSAR=37;FSRF=45;FSRR=36;FWDB=-0.0121753;FXX=0.00657851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.2189;QD=7.42794;RBI=0.0170017;REFB=-0.0182301;REVB=0.0118667;RO=78;SAF=33;SAR=37;SRF=43;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0758812;STB=0.54503;TYPE=snp;VARB=0.0198118;OID=.;OPOS=44377669;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:151:78:81:70:70:37:33:43:35:37:33:45:36 chr19 44417575 . A G 306.49 PASS AO=76;DP=173;FAO=82;FDP=179;FR=.;FRO=97;FSAF=45;FSAR=37;FSRF=64;FSRR=33;FWDB=0.0145488;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=35.6186;QD=6.84883;RBI=0.0502866;REFB=-0.0151662;REVB=-0.048136;RO=97;SAF=39;SAR=37;SRF=64;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148803;STB=0.56145;TYPE=snp;VARB=0.0248923;OID=.;OPOS=44417575;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:179:97:97:76:82:37:39:64:33:37:45:64:33 chr19 44418077 . C T 262.2 PASS AO=74;DP=177;FAO=75;FDP=177;FR=.;FRO=102;FSAF=39;FSAR=36;FSRF=39;FSRR=63;FWDB=0.0180836;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.055;QD=5.92538;RBI=0.0190773;REFB=-0.0245898;REVB=0.00607672;RO=102;SAF=38;SAR=36;SRF=39;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135656;STB=0.578927;TYPE=snp;VARB=0.0315978;OID=.;OPOS=44418077;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:177:102:102:74:75:36:38:39:63:36:39:39:63 chr19 44418343 . C T 175.55 PASS AO=51;DP=125;FAO=51;FDP=125;FR=.;FRO=74;FSAF=40;FSAR=11;FSRF=42;FSRR=32;FWDB=0.00651092;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.336;QD=5.61751;RBI=0.0447522;REFB=-0.0188688;REVB=-0.044276;RO=71;SAF=40;SAR=11;SRF=42;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.245432;STB=0.655921;TYPE=snp;VARB=0.0226308;OID=.;OPOS=44418343;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:71:74:51:51:11:40:42:29:11:40:42:32 chr19 44418544 . A G 291.06 PASS AO=78;DP=176;FAO=78;FDP=176;FR=.;FRO=98;FSAF=30;FSAR=48;FSRF=24;FSRR=74;FWDB=0.0168764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9972;QD=6.61505;RBI=0.0429656;REFB=0.000440584;REVB=-0.0395124;RO=97;SAF=30;SAR=48;SRF=24;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150936;STB=0.585392;TYPE=snp;VARB=-0.000749488;OID=.;OPOS=44418544;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:176:97:98:78:78:48:30:24:73:48:30:24:74 chr19 44418680 . G C 145.59 PASS AO=47;DP=126;FAO=47;FDP=126;FR=.;FRO=79;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=20;FSRR=59;FWDB=-0.0209296;FXX=0.0078734;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.889;QD=4.62195;RBI=0.0217503;REFB=-0.0138834;REVB=0.00591832;RO=79;SAF=22;SAR=25;SRF=20;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.244459;STB=0.637628;TYPE=snp;VARB=0.0390956;OID=.;OPOS=44418680;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:79:79:47:47:25:22:20:59:25:22:20:59 chr19 44418693 . T C 166.32 PASS AO=49;DP=122;FAO=49;FDP=122;FR=.;FRO=73;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=50;FWDB=0.000878054;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.401;QD=5.45296;RBI=0.00311012;REFB=-0.00992204;REVB=0.0029836;RO=73;SAF=25;SAR=24;SRF=23;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206979;STB=0.616211;TYPE=snp;VARB=0.0186401;OID=.;OPOS=44418693;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:73:73:49:49:24:25:23:50:24:25:23:50 chr19 44418824 . C T 379.18 PASS AO=90;DP=205;FAO=96;FDP=205;FR=.;FRO=109;FSAF=46;FSAR=50;FSRF=50;FSRR=59;FWDB=-0.0258949;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.781;QD=7.39856;RBI=0.0663345;REFB=0.00455792;REVB=-0.0610714;RO=114;SAF=40;SAR=50;SRF=55;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0384823;STB=0.510901;TYPE=snp;VARB=-0.00755572;OID=.;OPOS=44418824;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:205:114:109:90:96:50:40:55:59:50:46:50:59 chr19 44419030 . A G 2038.28 PASS AO=213;DP=214;FAO=213;FDP=213;FR=.;FRO=0;FSAF=138;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.036836;FXX=0.00467268;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.032;QD=38.2776;RBI=0.0371235;REFB=0;REVB=-0.00461087;RO=0;SAF=138;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.95191e-05;OID=.;OPOS=44419030;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:96:214:213:0:0:213:213:75:138:0:0:75:138:0:0 chr19 44470189 . T A 1394.88 PASS AO=147;DP=148;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000755885;FXX=0.0067563;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.77;QD=37.9559;RBI=0.00131332;REFB=-0.0860075;REVB=0.00107399;RO=1;SAF=78;SAR=69;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00605862;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000199386;OID=.;OPOS=44470189;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:148:147:1:0:147:147:69:78:1:0:69:78:0:0 chr19 44470420 . T C 1242.02 PASS AO=129;DP=129;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150233;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.315;QD=38.5122;RBI=0.0246775;REFB=0;REVB=0.0195775;RO=0;SAF=32;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.38826e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.7079e-05;OID=.;OPOS=44470420;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:129:129:0:0:129:129:97:32:0:0:97:32:0:0 chr19 44470548 . A G 961.59 PASS AO=114;DP=122;FAO=115;FDP=124;FR=.;FRO=9;FSAF=52;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=-0.0415283;FXX=0.00799936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5787;QD=31.019;RBI=0.0614033;REFB=-0.101042;REVB=-0.0452301;RO=8;SAF=52;SAR=62;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0574308;STB=0.533328;TYPE=snp;VARB=0.0264181;OID=.;OPOS=44470548;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:122:124:8:9:114:115:62:52:0:8:63:52:0:9 chr19 44470663 . G C 1575.83 PASS AO=165;DP=165;FAO=164;FDP=164;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00887195;FXX=0.029584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.543;QD=38.435;RBI=0.0114804;REFB=0;REVB=-0.00728608;RO=0;SAF=90;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.12797e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.65681e-05;OID=.;OPOS=44470663;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:165:164:0:0:165:164:75:90:0:0:77:87:0:0 chr19 44471209 . T A 1801.04 PASS AO=192;DP=194;FAO=192;FDP=192;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00134523;FXX=0.0103087;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.5507;QD=37.5217;RBI=0.0282073;REFB=-0.0808568;REVB=0.0281752;RO=1;SAF=81;SAR=111;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00427114;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00133595;OID=.;OPOS=44471209;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:194:192:1:0:192:192:111:81:0:1:111:81:0:0 chr19 44471323 . G A 1491.64 PASS AO=134;DP=169;FAO=157;FDP=157;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=90;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142675;FXX=0.0248432;HRUN=5;LEN=1;MLLD=121.508;QD=38.0035;RBI=0.0144475;REFB=0;REVB=-0.00227304;RO=0;SAF=87;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.14743e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.81416e-05;OID=.;OPOS=44471323;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:165:157:0:0:134:157:47:87:0:0:67:90:0:0 chr19 44471324 . G A 15.39 PASS AO=26;DP=170;FAO=26;FDP=170;FR=.;FRO=144;FSAF=2;FSAR=24;FSRF=92;FSRR=52;FWDB=0.00762526;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=75.3333;QD=0.362073;RBI=0.0349321;REFB=-0.031606;REVB=0.0340897;RO=144;SAF=2;SAR=24;SRF=92;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.673026;STB=0.936572;TYPE=snp;VARB=0.0485241;OID=.;OPOS=44471324;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:170:170:144:144:26:26:24:2:92:52:24:2:92:52 chr19 44500478 . A T 1574.16 PASS AO=130;DP=169;FAO=165;FDP=165;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=136;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0116929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.435;QD=38.1614;RBI=0.0554853;REFB=0;REVB=0.0542392;RO=0;SAF=26;SAR=104;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.33734e-05;OID=.;OPOS=44500478;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:132:165:0:0:130:165:104:26:0:0:136:29:0:0 chr19 44500761 . G A 1205.08 PASS AO=126;DP=126;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00380542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.883;QD=38.2564;RBI=0.00988397;REFB=0;REVB=0.00912205;RO=0;SAF=64;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.29882e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.27284e-06;OID=.;OPOS=44500761;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:126:126:0:0:126:126:62:64:0:0:62:64:0:0 chr19 44501116 . A G 972.94 PASS AO=105;DP=107;FAO=105;FDP=107;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=84;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00351399;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=266.935;QD=36.3716;RBI=0.0123042;REFB=-0.0420033;REVB=-0.0117917;RO=2;SAF=21;SAR=84;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0164431;STB=0.508669;TYPE=snp;VARB=0.000405889;OID=.;OPOS=44501116;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:107:107:2:2:105:105:84:21:1:1:84:21:1:1 chr19 44501227 . A G 1314.47 PASS AO=144;DP=150;FAO=148;FDP=153;FR=.;FRO=5;FSAF=84;FSAR=64;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0316005;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.4409;QD=34.3653;RBI=0.0505104;REFB=0.0110615;REVB=-0.0394044;RO=6;SAF=84;SAR=60;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0194659;STB=0.505569;TYPE=snp;VARB=4.00146e-05;OID=.;OPOS=44501227;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:150:153:6:5:144:148:60:84:2:4:64:84:2:3 chr19 44501627 . T C 1809.27 PASS AO=195;DP=199;FAO=195;FDP=199;FR=.;FRO=4;FSAF=66;FSAR=129;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0460011;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.958;QD=36.3672;RBI=0.0505273;REFB=-0.0530244;REVB=0.0209023;RO=4;SAF=66;SAR=129;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0068848;STB=0.503617;TYPE=snp;VARB=0.000521216;OID=.;OPOS=44501627;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:199:199:4:4:195:195:129:66:2:2:129:66:2:2 chr19 44511202 . A T 926.89 PASS AO=98;DP=99;FAO=98;FDP=99;FR=.;FRO=1;FSAF=70;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0432137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.792;QD=37.4502;RBI=0.0604539;REFB=-0.0412424;REVB=0.0422759;RO=1;SAF=70;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00672866;STB=0.503545;TYPE=snp;VARB=0.000333969;OID=.;OPOS=44511202;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:99:99:1:1:98:98:28:70:1:0:28:70:1:0 chr19 44511223 . T G 977.35 PASS AO=106;DP=109;FAO=107;FDP=110;FR=.;FRO=3;FSAF=73;FSAR=34;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0155169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.6097;QD=35.5401;RBI=0.0405548;REFB=-0.0929217;REVB=0.0374688;RO=3;SAF=72;SAR=34;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000753291;STB=0.50049;TYPE=snp;VARB=0.000684176;OID=.;OPOS=44511223;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:109:110:3:3:106:107:34:72:2:1:34:73:2:1 chr19 44535999 . G T 575.35 PASS AO=51;DP=51;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.051886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.1;QD=38.3568;RBI=0.0666001;REFB=0;REVB=0.0417543;RO=0;SAF=27;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00297676;OID=.;OPOS=44535999;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:51:60:0:0:51:60:24:27:0:0:26:34:0:0 chr19 44564981 . G A 2104.59 PASS AO=227;DP=231;FAO=227;FDP=227;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=124;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000568888;FXX=0.0173153;HRUN=3;LEN=1;MLLD=249.727;QD=37.0853;RBI=0.0078453;REFB=0.0908125;REVB=-0.00782465;RO=4;SAF=103;SAR=124;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0151203;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.54856e-06;OID=.;OPOS=44564981;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:231:227:4:0:227:227:124:103:0:4:124:103:0:0 chr19 44570393 . C A 2018.01 PASS AO=208;DP=209;FAO=211;FDP=211;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=125;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00776566;FXX=0.00471676;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.516;QD=38.2561;RBI=0.0100193;REFB=0;REVB=0.00633088;RO=0;SAF=86;SAR=122;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.03608e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.50051e-07;OID=.;OPOS=44570393;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:209:211:0:0:208:211:122:86:0:0:125:86:0:0 chr19 44570551 . G A 1100.8 PASS AO=115;DP=116;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0355204;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.294;QD=38.2885;RBI=0.0382403;REFB=0;REVB=-0.0141641;RO=0;SAF=52;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.20366e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.62812e-05;OID=.;OPOS=44570551;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:116:115:0:0:115:115:63:52:0:0:63:52:0:0 chr19 44571154 . T C 701.59 PASS AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0646373;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.1631;QD=37.9239;RBI=0.0665024;REFB=0;REVB=0.0156394;RO=0;SAF=36;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.79579e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000894048;OID=.;OPOS=44571154;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:75:74:0:0:74:74:38:36:0:0:38:36:0:0 chr19 44589999 . TCTC T 1174.89 PASS AO=123;DP=127;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0154712;FXX=0.0159987;HRUN=1;LEN=3;MLLD=236.241;QD=38.2079;RBI=0.0177233;REFB=0;REVB=-0.00864624;RO=0;SAF=54;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-3.84677e-05;OID=.;OPOS=44590000;OREF=CTC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:123:123:123:123:0:55:68:0:0:56:0:54:69:0:0 chr19 44590558 . C T 447.3 PASS AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00156711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.2617;QD=38.0682;RBI=0.0461873;REFB=0;REVB=0.0461607;RO=0;SAF=21;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000603269;OID=.;OPOS=44590558;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:47:47:0:0:47:47:26:21:0:0:26:21:0:0 chr19 44591360 . G A 1601.99 PASS AO=166;DP=167;FAO=167;FDP=167;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0114955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.639;QD=38.3709;RBI=0.0220696;REFB=0;REVB=0.0188394;RO=1;SAF=72;SAR=94;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00503604;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.54099e-06;OID=.;OPOS=44591360;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:167:167:1:0:166:167:94:72:0:1:95:72:0:0 chr19 44610665 . A G 1277.95 PASS AO=133;DP=133;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00899117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.785;QD=38.1477;RBI=0.0316305;REFB=0;REVB=0.0303256;RO=0;SAF=46;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.97442e-05;OID=.;OPOS=44610665;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:133:134:0:0:133:134:87:46:0:0:88:46:0:0 chr19 44610798 . A T 2234.19 PASS AO=235;DP=238;FAO=236;FDP=236;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=138;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0262017;FXX=0.0125518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.7348;QD=37.8676;RBI=0.0534436;REFB=-0.0414681;REVB=0.0465799;RO=1;SAF=97;SAR=138;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00488783;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000260581;OID=.;OPOS=44610798;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:238:236:1:0:235:236:138:97:1:0:138:98:0:0 chr19 44611066 . T C 1175.97 PASS AO=126;DP=129;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00656852;FXX=0.030532;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.3848;QD=37.0385;RBI=0.0127028;REFB=0.0127104;REVB=0.0108727;RO=2;SAF=73;SAR=53;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0128392;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000479276;OID=.;OPOS=44611066;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:129:127:2:0:126:127:53:73:2:0:54:73:0:0 chr19 44611420 . A G 1000.76 PASS AO=105;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00227933;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=279.801;QD=38.1243;RBI=0.00650188;REFB=0;REVB=-0.00608926;RO=0;SAF=48;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.53057e-06;OID=.;OPOS=44611420;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:105:105:0:0:105:105:57:48:0:0:57:48:0:0 chr19 44611957 . T C 108.38 PASS AO=30;DP=73;FAO=30;FDP=73;FR=.;FRO=43;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=32;FSRR=11;FWDB=0.00181824;FXX=0.0135117;HRUN=4;LEN=1;MLLD=173.739;QD=5.93875;RBI=0.00377926;REFB=-0.00346458;REVB=-0.00331313;RO=42;SAF=20;SAR=10;SRF=32;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115625;STB=0.553158;TYPE=snp;VARB=0.00670129;OID=.;OPOS=44611957;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:42:43:30:30:10:20:32:10:10:20:32:11 chr19 44612005 . A G 1037.35 PASS AO=97;DP=97;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.826;QD=37.7217;RBI=0.0224175;REFB=0;REVB=0.0168107;RO=0;SAF=62;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.81934e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.42212e-05;OID=.;OPOS=44612005;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:97:110:0:0:97:110:35:62:0:0:37:73:0:0 chr19 44612014 . A T 1151.05 PASS AO=117;DP=120;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.639;QD=38.0512;RBI=0.0152381;REFB=0;REVB=0.00148807;RO=0;SAF=76;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.49896e-05;OID=.;OPOS=44612014;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:120:121:0:0:117:121:41:76:0:0:42:79:0:0 chr19 44612231 . A G 797.44 PASS AO=91;DP=96;FAO=91;FDP=96;FR=.;FRO=5;FSAF=36;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.011197;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=76.7017;QD=33.2267;RBI=0.0476914;REFB=-0.116731;REVB=0.0463584;RO=5;SAF=36;SAR=55;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.041163;STB=0.521734;TYPE=snp;VARB=0.00269574;OID=.;OPOS=44612231;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:96:96:5:5:91:91:55:36:0:5:55:36:0:5 chr19 44721699 . C T 2006.18 PASS AO=205;DP=205;FAO=209;FDP=209;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00228685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.049;QD=38.3958;RBI=0.0127854;REFB=0;REVB=-0.0125792;RO=0;SAF=88;SAR=117;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11226e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.60779e-05;OID=.;OPOS=44721699;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:94:205:209:0:0:205:209:117:88:0:0:119:90:0:0 chr19 44739303 . T C 395.01 PASS AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0327483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.804;QD=36.745;RBI=0.0339728;REFB=0;REVB=0.00903888;RO=0;SAF=13;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.36943e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00042295;OID=.;OPOS=44739303;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:42:43:0:0:42:43:29:13:0:0:30:13:0:0 chr19 44739399 . T C 423.68 PASS AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00904551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.689;QD=37.6604;RBI=0.0105553;REFB=0;REVB=-0.00543995;RO=0;SAF=20;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.09779e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.20643e-06;OID=.;OPOS=44739399;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:45:45:0:0:45:45:25:20:0:0:25:20:0:0 chr19 44764064 . A G 998.46 PASS AO=110;DP=113;FAO=110;FDP=113;FR=.;FRO=3;FSAF=33;FSAR=77;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0346179;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.4006;QD=35.3437;RBI=0.0819679;REFB=-0.0127053;REVB=-0.0742989;RO=3;SAF=33;SAR=77;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00199712;STB=0.501052;TYPE=snp;VARB=0.000156233;OID=.;OPOS=44764064;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:113:113:3:3:110:110:77:33:1:2:77:33:1:2 chr19 44778405 . A C 543.52 PASS AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247398;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=229.073;QD=38.1421;RBI=0.0343104;REFB=0;REVB=0.0237729;RO=0;SAF=18;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.88184e-05;OID=.;OPOS=44778405;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:57:57:0:0:57:57:39:18:0:0:39:18:0:0 chr19 44778636 . A T 284.46 PASS AO=69;DP=147;FAO=70;FDP=148;FR=.;FRO=78;FSAF=25;FSAR=45;FSRF=39;FSRR=39;FWDB=0.0144214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.205;QD=7.68803;RBI=0.0144215;REFB=-0.00475823;REVB=-4.241e-05;RO=78;SAF=25;SAR=44;SRF=39;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136391;STB=0.57829;TYPE=snp;VARB=0.00597315;OID=.;OPOS=44778636;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:148:78:78:69:70:44:25:39:39:45:25:39:39 chr19 44792701 . T G 1545.52 PASS AO=158;DP=158;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0592083;FXX=0.0121944;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.4702;QD=38.1609;RBI=0.0600385;REFB=0;REVB=0.00994952;RO=0;SAF=85;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40066e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000210086;OID=.;OPOS=44792701;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:158:162:0:0:158:162:73:85:0:0:74:88:0:0 chr19 44792969 . G A 576.99 PASS AO=59;DP=59;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00507074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.8577;QD=37.8357;RBI=0.0522774;REFB=0;REVB=0.0520309;RO=0;SAF=41;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.49224e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000158136;OID=.;OPOS=44792969;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:59:61:0:0:59:61:18:41:0:0:18:43:0:0 chr19 44832684 . T G 2140.31 PASS AO=223;DP=227;FAO=224;FDP=224;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=159;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113892;FXX=0.0132153;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.813;QD=38.2198;RBI=0.0212282;REFB=0;REVB=-0.0179143;RO=1;SAF=64;SAR=159;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00738634;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.47185e-06;OID=.;OPOS=44832684;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:227:224:1:0:223:224:159:64:1:0:159:65:0:0 chr19 44832875 . A G 1698.47 PASS AO=177;DP=177;FAO=177;FDP=177;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00948463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.031;QD=38.3835;RBI=0.00948907;REFB=0;REVB=-0.000290252;RO=0;SAF=66;SAR=111;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.76938e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.05354e-05;OID=.;OPOS=44832875;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:177:177:0:0:177:177:111:66:0:0:111:66:0:0 chr19 44832992 . C G 1710.27 PASS AO=181;DP=183;FAO=181;FDP=181;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0291038;FXX=0.0109284;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.2408;QD=37.796;RBI=0.0341062;REFB=-0.060887;REVB=0.0177822;RO=0;SAF=85;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000520297;OID=.;OPOS=44832992;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:183:181:0:0:181:181:96:85:0:0:96:85:0:0 chr19 44833506 . C T 1897.75 PASS AO=204;DP=207;FAO=203;FDP=203;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=108;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00841275;FXX=0.0193227;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1641;QD=37.394;RBI=0.0305992;REFB=-0.00608887;REVB=-0.02942;RO=3;SAF=95;SAR=109;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00557125;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.94189e-05;OID=.;OPOS=44833506;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:207:203:3:0:204:203:109:95:2:1:108:95:0:0 chr19 44833851 . G C 1776.6 PASS AO=185;DP=185;FAO=185;FDP=185;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107373;FXX=0.031412;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.726;QD=38.4131;RBI=0.0294735;REFB=0;REVB=0.0274481;RO=0;SAF=101;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000182543;OID=.;OPOS=44833851;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:185:185:0:0:185:185:84:101:0:0:84:101:0:0 chr19 44840789 . T C 1528.14 PASS AO=95;DP=174;FAO=161;FDP=161;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=82;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0642683;FXX=0.0182916;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.943;QD=37.9663;RBI=0.0678074;REFB=0;REVB=-0.0216201;RO=1;SAF=14;SAR=81;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00581945;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00126397;OID=.;OPOS=44840789;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:165:161:1:0:95:161:81:14:0:1:79:82:0:0 chr19 44871287 . T C 123.08 PASS AO=38;DP=102;FAO=38;FDP=100;FR=.;FRO=62;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=31;FSRR=31;FWDB=-0.0514863;FXX=0.0196059;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.5966;QD=4.92328;RBI=0.0529484;REFB=-0.00129467;REVB=-0.0123572;RO=62;SAF=25;SAR=13;SRF=31;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17782;STB=0.601696;TYPE=snp;VARB=0.00184492;OID=.;OPOS=44871287;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:100:62:62:38:38:13:25:31:31:13:25:31:31 chr19 44871293 . T C 123.82 PASS AO=38;DP=102;FAO=39;FDP=102;FR=.;FRO=63;FSAF=26;FSAR=13;FSRF=31;FSRR=32;FWDB=0.0109228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8523;QD=4.85561;RBI=0.0602357;REFB=-0.00205752;REVB=-0.059237;RO=61;SAF=25;SAR=13;SRF=30;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185571;STB=0.612186;TYPE=snp;VARB=0.00323121;OID=.;OPOS=44871293;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:61:63:38:39:13:25:30:31:13:26:31:32 chr19 44890697 . A G 153.03 PASS AO=44;DP=108;FAO=44;FDP=108;FR=.;FRO=64;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=40;FSRR=24;FWDB=0.00868609;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.81;QD=5.66778;RBI=0.00938162;REFB=0.00258152;REVB=0.00354494;RO=63;SAF=22;SAR=22;SRF=40;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141131;STB=0.574041;TYPE=snp;VARB=-0.00373802;OID=.;OPOS=44890697;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:63:64:44:44:22:22:40:23:22:22:40:24 chr19 44890801 . T C 268.55 PASS AO=74;DP=171;FAO=75;FDP=173;FR=.;FRO=98;FSAF=40;FSAR=35;FSRF=54;FSRR=44;FWDB=-0.0247676;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.665;QD=6.20916;RBI=0.0306946;REFB=0.00111146;REVB=-0.0181308;RO=97;SAF=40;SAR=34;SRF=53;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00599074;STB=0.510075;TYPE=snp;VARB=-0.00232414;OID=.;OPOS=44890801;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:173:97:98:74:75:34:40:53:44:35:40:54:44 chr19 44891784 . T C 272.31 PASS AO=60;DP=119;FAO=61;FDP=120;FR=.;FRO=59;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=35;FSRR=24;FWDB=-0.0127299;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.147;QD=9.07684;RBI=0.0136671;REFB=0.00273219;REVB=0.00497395;RO=58;SAF=31;SAR=29;SRF=35;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.077728;STB=0.541858;TYPE=snp;VARB=-0.0031002;OID=.;OPOS=44891784;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:120:58:59:60:61:29:31:35:23:30:31:35:24 chr19 44898662 . C T 85.21 PASS AO=21;DP=52;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=8;FWDB=0.019692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.4524;QD=6.55443;RBI=0.0198709;REFB=-0.0253063;REVB=0.00266021;RO=30;SAF=14;SAR=7;SRF=22;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0795469;STB=0.562446;TYPE=snp;VARB=0.0482596;OID=.;OPOS=44898662;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:52:52:30:30:21:22:7:14:22:8:8:14:22:8 chr19 44930880 . G A 3809.98 PASS AO=462;DP=467;FAO=395;FDP=395;FR=.;FRO=0;FSAF=208;FSAR=187;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0257293;FXX=0.0124997;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.5059;QD=38.5821;RBI=0.026745;REFB=0;REVB=0.00730068;RO=1;SAF=247;SAR=215;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00192893;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000637284;OID=.;OPOS=44930880;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:467:395:1:0:462:395:215:247:1:0:187:208:0:0 chr19 44932972 . C T 189.47 PASS AO=48;DP=111;FAO=50;FDP=113;FR=.;FRO=63;FSAF=12;FSAR=38;FSRF=17;FSRR=46;FWDB=0.00154546;FXX=0.00877116;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.312;QD=6.70693;RBI=0.0124503;REFB=-0.0088411;REVB=-0.0123541;RO=62;SAF=12;SAR=36;SRF=16;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0107398;STB=0.522266;TYPE=snp;VARB=0.00970248;OID=.;OPOS=44932972;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:113:62:63:48:50:36:12:16:46:38:12:17:46 chr19 44933504 . G A 169.91 PASS AO=50;DP=124;FAO=50;FDP=124;FR=.;FRO=74;FSAF=39;FSAR=11;FSRF=59;FSRR=15;FWDB=-0.00729395;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.82;QD=5.48084;RBI=0.0204947;REFB=-0.0125906;REVB=0.0191528;RO=74;SAF=39;SAR=11;SRF=59;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0271519;STB=0.51529;TYPE=snp;VARB=0.0173253;OID=.;OPOS=44933504;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:124:74:74:50:50:11:39:59:15:11:39:59:15 chr19 44933706 . C T 366.16 PASS AO=78;DP=144;FAO=78;FDP=143;FR=.;FRO=65;FSAF=36;FSAR=42;FSRF=28;FSRR=37;FWDB=0.00224653;FXX=0.0137922;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3007;QD=10.2423;RBI=0.0266385;REFB=-0.0356703;REVB=0.0265436;RO=62;SAF=37;SAR=41;SRF=28;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0185185;STB=0.514096;TYPE=snp;VARB=0.0219176;OID=.;OPOS=44933706;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:143:62:65:78:78:41:37:28:34:42:36:28:37 chr19 44933947 . G A 548.35 PASS AO=119;DP=221;FAO=119;FDP=222;FR=.;FRO=103;FSAF=60;FSAR=59;FSRF=58;FSRR=45;FWDB=-0.0192488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.2134;QD=9.88022;RBI=0.0338216;REFB=-0.013289;REVB=0.0278098;RO=102;SAF=60;SAR=59;SRF=57;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0462361;STB=0.52734;TYPE=snp;VARB=0.0105486;OID=.;OPOS=44933947;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:222:102:103:119:119:59:60:57:45:59:60:58:45 chr19 44934489 . G A 1791.17 PASS AO=206;DP=220;FAO=211;FDP=220;FR=.;FRO=9;FSAF=89;FSAR=122;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=0.0693845;FXX=0.00452468;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.8552;QD=32.5667;RBI=0.152657;REFB=-0.109987;REVB=0.135977;RO=9;SAF=85;SAR=121;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0117135;STB=0.513081;TYPE=snp;VARB=0.0058357;OID=.;OPOS=44934489;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:220:220:9:9:206:211:121:85:5:4:122:89:1:8 chr19 44934653 . T C 119.45 PASS AO=24;DP=47;FAO=25;FDP=48;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.101601;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.1385;QD=9.95404;RBI=0.106697;REFB=0.00979745;REVB=-0.0325819;RO=23;SAF=6;SAR=18;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106374;STB=0.53889;TYPE=snp;VARB=-0.0074061;OID=.;OPOS=44934653;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:48:23:23:24:25:18:6:8:15:18:7:8:15 chr19 44947050 . T C 84.65 PASS AO=31;DP=94;FAO=31;FDP=94;FR=.;FRO=63;FSAF=6;FSAR=25;FSRF=20;FSRR=43;FWDB=-0.0327565;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=224.964;QD=3.60201;RBI=0.0328699;REFB=-0.0122683;REVB=-0.00272826;RO=63;SAF=6;SAR=25;SRF=20;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19372;STB=0.614285;TYPE=snp;VARB=0.0200475;OID=.;OPOS=44947050;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:94:94:63:63:31:31:25:6:20:43:25:6:20:43 chr19 44981375 . T C 458.96 PASS AO=47;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0107903;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.275;QD=38.2467;RBI=0.0126715;REFB=0;REVB=-0.0066436;RO=0;SAF=24;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.12089e-05;OID=.;OPOS=44981375;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:47:48:0:0:47:48:23:24:0:0:24:24:0:0 chr19 44981883 . C G 1249.82 PASS AO=131;DP=131;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.911;QD=38.1623;RBI=0.0303171;REFB=0;REVB=0.00697414;RO=0;SAF=63;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.60286e-05;OID=.;OPOS=44981883;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:131:131:0:0:131:131:68:63:0:0:68:63:0:0 chr19 44983567 . C G 2519.16 PASS AO=266;DP=271;FAO=270;FDP=270;FR=.;FRO=0;FSAF=102;FSAR=168;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126339;FXX=0.0181812;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.533;QD=37.3209;RBI=0.0149446;REFB=-0.0271572;REVB=0.00798298;RO=4;SAF=102;SAR=164;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00347706;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.67086e-06;OID=.;OPOS=44983567;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:271:270:4:0:266:270:164:102:2:2:168:102:0:0 chr19 45001346 . G A 143.03 PASS AO=36;DP=79;FAO=36;FDP=80;FR=.;FRO=44;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=13;FWDB=-0.047576;FXX=0.0243873;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.7801;QD=7.15144;RBI=0.0506437;REFB=0.00199578;REVB=0.0173585;RO=41;SAF=20;SAR=16;SRF=28;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125022;STB=0.584482;TYPE=snp;VARB=-0.00634395;OID=.;OPOS=45001346;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:80:41:44:36:36:16:20:28:13:16:20:31:13 chr19 45004305 . G C 176.31 PASS AO=29;DP=44;FAO=30;FDP=44;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=13;FWDB=0.0058015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.242;QD=16.028;RBI=0.00990068;REFB=-0.00671414;REVB=-0.00802285;RO=15;SAF=2;SAR=27;SRF=2;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13441;STB=0.526299;TYPE=snp;VARB=0.00447563;OID=.;OPOS=45004305;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:44:44:15:14:29:30:27:2:2:13:27:3:1:13 chr19 45016116 . A G 116.25 PASS AO=35;DP=91;FAO=35;FDP=91;FR=.;FRO=56;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=35;FWDB=0.00968566;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.699;QD=5.10985;RBI=0.0312235;REFB=-0.00581591;REVB=0.0296833;RO=56;SAF=18;SAR=17;SRF=21;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150043;STB=0.585318;TYPE=snp;VARB=0.00848465;OID=.;OPOS=45016116;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:56:56:35:35:17:18:21:35:17:18:21:35 chr19 45016990 . CT C 1487.5 PASS AO=184;DP=209;FAO=194;FDP=194;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=138;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00365959;FXX=0.0443328;HRUN=2;LEN=1;MLLD=24.3225;QD=30.6701;RBI=0.0793553;REFB=-0.0126743;REVB=0.0792709;RO=2;SAF=53;SAR=131;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00721339;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00148275;OID=.;OPOS=45016991;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:184:201:194:194:0:56:138:0:0:99:2:53:131:0:2 chr19 45017249 . T C 53.68 PASS AO=9;DP=15;FAO=10;FDP=16;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0463616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.9467;QD=13.4195;RBI=0.0731282;REFB=-0.0499593;REVB=0.0565539;RO=6;SAF=6;SAR=3;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.526264;TYPE=snp;VARB=0.0324188;OID=.;OPOS=45017249;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:15:16:6:6:9:10:3:6:4:2:4:6:4:2 chr19 45021137 . G A 393.53 PASS AO=77;DP=132;FAO=77;FDP=132;FR=.;FRO=55;FSAF=20;FSAR=57;FSRF=18;FSRR=37;FWDB=0.0396054;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.216;QD=11.9253;RBI=0.0396291;REFB=-0.000789339;REVB=0.00136881;RO=55;SAF=20;SAR=57;SRF=18;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0647814;STB=0.535334;TYPE=snp;VARB=0.00062212;OID=.;OPOS=45021137;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:55:55:77:77:57:20:18:37:57:20:18:37 chr19 45024581 . C G 896.7 PASS AO=99;DP=100;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0549793;FXX=0.009999;HRUN=4;LEN=1;MLLD=70.6864;QD=36.2302;RBI=0.0632188;REFB=-0.0728336;REVB=-0.0312072;RO=1;SAF=64;SAR=35;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0133588;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0022148;OID=.;OPOS=45024581;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:100:99:1:0:99:99:35:64:0:1:36:63:0:0 chr19 45028169 . C T 2357.13 PASS AO=246;DP=251;FAO=246;FDP=246;FR=.;FRO=0;FSAF=128;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0265756;FXX=0.0199195;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.5943;QD=38.3272;RBI=0.0271888;REFB=0;REVB=-0.00574165;RO=0;SAF=128;SAR=118;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.46008e-05;OID=.;OPOS=45028169;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:251:246:0:0:246:246:118:128:0:0:118:128:0:0 chr19 45162038 . A G 2036.84 PASS AO=213;DP=213;FAO=213;FDP=213;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0611533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3573;QD=38.2504;RBI=0.0657565;REFB=0;REVB=0.0241701;RO=0;SAF=93;SAR=120;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00011683;OID=.;OPOS=45162038;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:96:213:213:0:0:213:213:120:93:0:0:120:93:0:0 chr19 45162189 . C A 408.94 PASS AO=112;DP=257;FAO=112;FDP=255;FR=.;FRO=143;FSAF=44;FSAR=68;FSRF=59;FSRR=84;FWDB=0.0255731;FXX=0.0077818;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.632;QD=6.41472;RBI=0.0451331;REFB=-0.0114898;REVB=-0.0371888;RO=139;SAF=44;SAR=68;SRF=56;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104589;STB=0.511537;TYPE=snp;VARB=0.0146937;OID=.;OPOS=45162189;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:257:255:139:143:112:112:68:44:56:83:68:44:59:84 chr19 45211407 . C T 33.74 PASS AO=13;DP=46;FAO=13;FDP=46;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=28;FSRR=5;FWDB=0.00338518;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.493;QD=2.93421;RBI=0.0126735;REFB=-0.00438202;REVB=-0.012213;RO=33;SAF=10;SAR=3;SRF=28;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14646;STB=0.587509;TYPE=snp;VARB=0.0100145;OID=.;OPOS=45211407;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:46:46:33:33:13:13:3:10:28:5:3:10:28:5 chr19 45260971 . G T 115.6 PASS AO=25;DP=52;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=6;FSRR=21;FWDB=0.0141572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.822;QD=8.72484;RBI=0.0189587;REFB=-0.00102104;REVB=0.0126097;RO=27;SAF=7;SAR=18;SRF=6;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0685819;STB=0.531286;TYPE=snp;VARB=0.000954934;OID=.;OPOS=45260971;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:53:27:27:25:26:18:7:6:21:19:7:6:21 chr19 45296806 . C T 145.78 PASS AO=34;DP=72;FAO=34;FDP=71;FR=.;FRO=37;FSAF=7;FSAR=27;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=-0.0158258;FXX=0.013887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.442;QD=8.21297;RBI=0.0160017;REFB=-0.00744411;REVB=0.00236619;RO=37;SAF=7;SAR=27;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263298;STB=0.648806;TYPE=snp;VARB=0.00814445;OID=.;OPOS=45296806;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:71:37:37:34:34:27:7:16:21:27:7:16:21 chr19 45322744 . A G 260.83 PASS AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.03844;FXX=0.0689417;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.365;QD=38.6411;RBI=0.0384774;REFB=0;REVB=0.0016964;RO=0;SAF=11;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5146e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000358891;OID=.;OPOS=45322744;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:28:27:0:0:27:27:16:11:0:0:16:11:0:0 chr19 45389224 . A G 97.77 PASS AO=21;DP=42;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=1;FSAR=20;FSRF=3;FSRR=18;FWDB=-0.0391295;FXX=0.0232504;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.4522;QD=9.31181;RBI=0.0819347;REFB=-0.0153066;REVB=-0.0719874;RO=20;SAF=1;SAR=20;SRF=3;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.315785;STB=0.677747;TYPE=snp;VARB=0.0261647;OID=.;OPOS=45389224;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:42:42:20:21:21:21:20:1:3:17:20:1:3:18 chr19 45404574 . G A 91.44 PASS AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.00387621;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.579;QD=7.46474;RBI=0.0368184;REFB=0.0131748;REVB=0.0366138;RO=25;SAF=10;SAR=12;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0905328;STB=0.526292;TYPE=snp;VARB=-0.0132065;OID=.;OPOS=45404574;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:49:49:25:27:22:22:12:10:9:16:12:10:11:16 chr19 45448036 . T C 593.74 PASS AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00707846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.311;QD=37.6976;RBI=0.0165126;REFB=0;REVB=-0.0149184;RO=0;SAF=32;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.83229e-05;OID=.;OPOS=45448036;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:63:63:0:0:63:63:31:32:0:0:31:32:0:0 chr19 45448465 . T G 401.89 PASS AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0357935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.972;QD=37.3847;RBI=0.0428042;REFB=0;REVB=0.023474;RO=0;SAF=21;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00021531;OID=.;OPOS=45448465;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:43:43:0:0:43:43:22:21:0:0:22:21:0:0 chr19 45452694 . G GT 1142.16 PASS AO=86;DP=127;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00310587;FXX=0.0158718;HRUN=0;LEN=1;MLLD=243.496;QD=36.844;RBI=0.0250876;REFB=0;REVB=0.0248946;RO=33;SAF=60;SAR=26;SRF=2;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.334714;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=3.53519e-05;OID=.;OPOS=45452695;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:86:127:124:124:0:65:59:0:0:55:33:60:26:2:31 chr19 45476422 . T C 504.75 PASS AO=50;DP=50;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0526285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.941;QD=37.3891;RBI=0.0526311;REFB=0;REVB=0.00052856;RO=0;SAF=30;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000215074;OID=.;OPOS=45476422;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:50:54:0:0:50:54:20:30:0:0:21:33:0:0 chr19 45488567 . T C 261.68 PASS AO=12;DP=29;FAO=31;FDP=31;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=0;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00539583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.7426;QD=33.7655;RBI=0.0572648;REFB=0;REVB=-0.05701;RO=0;SAF=11;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.23983e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.85128e-05;OID=.;OPOS=45488567;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:24:31:0:0:12:31:1:11:0:0:20:11:0:0 chr19 45490570 . A G 663.93 PASS AO=44;DP=74;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00184837;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.5119;QD=37.9391;RBI=0.0255131;REFB=0;REVB=-0.025446;RO=0;SAF=15;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000208108;OID=.;OPOS=45490570;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:45:70:0:0:44:70:29:15:0:0:34:36:0:0 chr19 45490858 . GC G 80.96 PASS AO=15;DP=19;FAO=16;FDP=19;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0493658;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.9784;QD=17.0444;RBI=0.153381;REFB=-0.0940042;REVB=-0.14522;RO=3;SAF=4;SAR=11;SRF=1;SRR=2;SSEN=0.227976;SSEP=0;SSSB=-0.0253526;STB=0.517219;TYPE=del;VARB=0.0374917;OID=.;OPOS=45490859;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:15:19:16:19:3:4:12:1:2:3:3:4:11:1:2 chr19 45561063 . A G 1024.85 PASS AO=106;DP=106;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00306918;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.1301;QD=38.3122;RBI=0.0145033;REFB=0;REVB=0.0141749;RO=0;SAF=56;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.81344e-05;OID=.;OPOS=45561063;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:106:107:0:0:106:107:50:56:0:0:50:57:0:0 chr19 45655333 . T C 10.22 PASS AO=2;DP=9;FAO=2;FDP=9;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.0438386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.898;QD=4.54131;RBI=0.0450986;REFB=-0.00139985;REVB=0.0105857;RO=7;SAF=1;SAR=1;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.224092;STB=0.665187;TYPE=snp;VARB=0.0272808;OID=.;OPOS=45655333;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:7:7:2:2:1:1:2:5:1:1:2:5 chr19 45818835 . A G 62.64 PASS AO=16;DP=39;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=-0.00853654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.936;QD=6.42435;RBI=0.00984704;REFB=-0.0125519;REVB=0.00490834;RO=23;SAF=9;SAR=7;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0942034;STB=0.554389;TYPE=snp;VARB=0.0209177;OID=.;OPOS=45818835;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:39:39:23:23:16:16:7:9:15:8:7:9:15:8 chr19 45862112 . G C 222.95 PASS AO=66;DP=152;FAO=66;FDP=165;FR=.;FRO=99;FSAF=49;FSAR=17;FSRF=66;FSRR=33;FWDB=-0.0481089;FXX=0.0624964;HRUN=6;LEN=1;MLLD=101.396;QD=5.40488;RBI=0.0492265;REFB=-0.0310439;REVB=-0.0104296;RO=86;SAF=49;SAR=17;SRF=54;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139334;STB=0.556168;TYPE=snp;VARB=0.0291491;OID=.;OPOS=45862112;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:165:86:99:66:66:17:49:54:32:17:49:66:33 chr19 45865002 . C A 24.29 PASS AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.0375663;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.479;QD=6.07373;RBI=0.070283;REFB=-0.0135312;REVB=-0.0594009;RO=10;SAF=2;SAR=4;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267756;STB=0.666111;TYPE=snp;VARB=0.0454752;OID=.;OPOS=45865002;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:16:16:10:10:6:6:4:2:6:4:4:2:6:4 chr19 45868309 . T G 169.37 PASS AO=21;DP=33;FAO=26;FDP=36;FR=.;FRO=10;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.027121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.734;QD=18.8183;RBI=0.0388252;REFB=-0.0408551;REVB=0.0277821;RO=6;SAF=6;SAR=15;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173157;STB=0.561356;TYPE=snp;VARB=0.00618744;OID=.;OPOS=45868309;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:28:36:6:10:21:26:15:6:4:2:16:10:6:4 chr19 45882962 . T A 146.74 PASS AO=42;DP=103;FAO=42;FDP=103;FR=.;FRO=61;FSAF=12;FSAR=30;FSRF=19;FSRR=42;FWDB=-0.00852288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.8189;QD=5.69868;RBI=0.00864606;REFB=-0.0242037;REVB=-0.00145425;RO=61;SAF=12;SAR=30;SRF=19;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0324786;STB=0.518386;TYPE=snp;VARB=0.0212039;OID=.;OPOS=45882962;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:61:61:42:42:30:12:19:42:30:12:19:42 chr19 45885800 . C T 169.27 PASS AO=12;DP=104;FAO=44;FDP=96;FR=.,HEALED;FRO=52;FSAF=3;FSAR=41;FSRF=3;FSRR=49;FWDB=0.0530258;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.0565;QD=7.05278;RBI=0.0600687;REFB=-0.0203317;REVB=-0.0282226;RO=26;SAF=2;SAR=10;SRF=3;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116068;STB=0.523246;TYPE=snp;VARB=0.0328287;OID=.;OPOS=45885800;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:96:26:52:12:44:10:2:3:23:41:3:3:49 chr19 45909934 . G A 103.6 PASS AO=22;DP=43;FAO=22;FDP=43;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.0226601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.257;QD=9.63736;RBI=0.0231308;REFB=-0.0252175;REVB=0.00464248;RO=20;SAF=9;SAR=13;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243248;STB=0.624106;TYPE=snp;VARB=0.0163392;OID=.;OPOS=45909934;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:43:43:20:21:22:22:13:9:14:6:13:9:14:7 chr19 45910003 . G T 110.48 PASS AO=22;DP=41;FAO=22;FDP=41;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=0.0174962;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0097;QD=10.7784;RBI=0.0296508;REFB=-0.0130697;REVB=0.0239385;RO=19;SAF=9;SAR=13;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.266217;STB=0.64846;TYPE=snp;VARB=0.016149;OID=.;OPOS=45910003;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:41:41:19:19:22:22:13:9:14:5:13:9:14:5 chr19 45912002 . A C 79.98 PASS AO=14;DP=23;FAO=14;FDP=23;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.00254685;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=271.942;QD=13.9088;RBI=0.0107063;REFB=-0.0151921;REVB=0.0103989;RO=9;SAF=5;SAR=9;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216917;STB=0.622464;TYPE=snp;VARB=0.010235;OID=.;OPOS=45912002;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:23:23:9:9:14:14:9:5:6:3:9:5:6:3 chr19 45912343 . A G 76.08 PASS AO=26;DP=76;FAO=26;FDP=76;FR=.;FRO=50;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=0.0720605;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.1585;QD=4.00443;RBI=0.0733517;REFB=0.00343664;REVB=-0.0137026;RO=50;SAF=8;SAR=18;SRF=25;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227865;STB=0.633156;TYPE=snp;VARB=-0.00516613;OID=.;OPOS=45912343;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:76:76:50:50:26:26:18:8:25:25:18:8:25:25 chr19 45912406 . G A 113.92 PASS AO=22;DP=54;FAO=28;FDP=60;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=0.0142738;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.326;QD=7.59451;RBI=0.0417735;REFB=-0.0375439;REVB=0.0392592;RO=31;SAF=10;SAR=12;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0629699;STB=0.574825;TYPE=snp;VARB=0.0338163;OID=.;OPOS=45912406;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:60:31:32:22:28:12:10:16:15:17:11:17:15 chr19 45923653 . A G 199.97 PASS AO=54;DP=124;FAO=55;FDP=129;FR=.;FRO=74;FSAF=18;FSAR=37;FSRF=32;FSRR=42;FWDB=0.0108158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.5;QD=6.20056;RBI=0.0159081;REFB=-0.0165319;REVB=0.0116655;RO=68;SAF=18;SAR=36;SRF=30;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115441;STB=0.565379;TYPE=snp;VARB=0.0238084;OID=.;OPOS=45923653;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:129:68:74:54:55:36:18:30:38:37:18:32:42 chr19 45971961 . C G 43.12 PASS AO=20;DP=71;FAO=20;FDP=75;FR=.;FRO=55;FSAF=19;FSAR=1;FSRF=22;FSRR=33;FWDB=0.0583058;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.5892;QD=2.29979;RBI=0.0583159;REFB=-0.00590648;REVB=-0.0010881;RO=51;SAF=19;SAR=1;SRF=22;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.704639;STB=0.939844;TYPE=snp;VARB=0.0305436;OID=.;OPOS=45971961;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:71:75:51:55:20:20:1:19:22:29:1:19:22:33 chr19 45974192 . AC A,AG 29.82 PASS AO=4,3;DP=16;FAO=9,0;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=1,0;FSAR=8,0;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.0966631,-0.00471975;FXX=0.0587889;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=12.2449,97.5973;QD=7.45534;RBI=0.276596,0.00600685;REFB=-0.192384,-0.0209245;REVB=0.259155,-0.00371567;RO=8;SAF=0,0;SAR=4,3;SRF=6;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.75998,-0.73181;STB=0.826738,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.122485,0;OID=.,.;OPOS=45974193,45974193;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=A,AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:4,3:17:9,0:16:7:1,0:8,0:5:2:27:8:0,0:4,3:6:2 chr19 45978375 . A G 258.45 PASS AO=71;DP=163;FAO=71;FDP=164;FR=.;FRO=93;FSAF=24;FSAR=47;FSRF=27;FSRR=66;FWDB=0.0306393;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.1257;QD=6.30364;RBI=0.0487992;REFB=-0.00449041;REVB=-0.0379815;RO=91;SAF=24;SAR=47;SRF=27;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0474013;STB=0.530819;TYPE=snp;VARB=0.00576063;OID=.;OPOS=45978375;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:164:91:93:71:71:47:24:27:64:47:24:27:66 chr19 46029981 . T C 362.56 PASS AO=122;DP=324;FAO=122;FDP=323;FR=.;FRO=201;FSAF=27;FSAR=95;FSRF=39;FSRR=162;FWDB=0.0573155;FXX=0.00308632;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.0884;QD=4.48988;RBI=0.0831579;REFB=-0.0114091;REVB=0.0602509;RO=199;SAF=28;SAR=94;SRF=39;SRR=160;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0541072;STB=0.52532;TYPE=snp;VARB=0.0220993;OID=.;OPOS=46029981;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:324:323:199:201:122:122:94:28:39:160:95:27:39:162 chr19 46057081 . A G 195.16 PASS AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.53;QD=37.1733;RBI=0.0356883;REFB=0;REVB=-0.0277034;RO=0;SAF=13;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.45426e-05;OID=.;OPOS=46057081;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:21:21:0:0:21:21:8:13:0:0:8:13:0:0 chr19 46154806 . T C 637.21 PASS AO=66;DP=68;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.050464;FXX=0.0294074;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.37;QD=38.6186;RBI=0.082204;REFB=0;REVB=0.0648913;RO=0;SAF=42;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.1333e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000525992;OID=.;OPOS=46154806;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:68:66:0:0:66:66:24:42:0:0:24:42:0:0 chr19 46154820 . G A 698.62 PASS AO=75;DP=76;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0230918;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=86.7877;QD=36.7696;RBI=0.0253037;REFB=-0.0486774;REVB=-0.0103464;RO=0;SAF=44;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505616;TYPE=snp;VARB=-0.000297989;OID=.;OPOS=46154820;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:76:76:0:1:75:75:31:44:0:0:31:44:1:0 chr19 46154902 . G GC 688.09 PASS AO=83;DP=95;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0277787;FXX=0.0215031;HRUN=0;LEN=1;MLLD=177.951;QD=30.2457;RBI=0.0277787;REFB=0.055526;REVB=-3.17193e-05;RO=4;SAF=43;SAR=40;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00157359;STB=0.506023;TYPE=ins;VARB=-0.000467241;OID=.;OPOS=46154903;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:83:95:90:91:1:49:41:0:1:53:4:43:40:2:2 chr19 46154906 . C CT 709.47 PASS AO=82;DP=92;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00529111;FXX=0.0217368;HRUN=2;LEN=1;MLLD=267.817;QD=31.5321;RBI=0.0099356;REFB=0;REVB=0.00840954;RO=7;SAF=40;SAR=42;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0759812;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=4.30302e-05;OID=.;OPOS=46154907;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:82:92:90:90:0:48:42:0:0:62:7:40:42:7:0 chr19 46155049 . G A 399.85 PASS AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0532099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.2221;QD=37.1953;RBI=0.0571166;REFB=0;REVB=-0.0207608;RO=0;SAF=17;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75441e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000425654;OID=.;OPOS=46155049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:43:43:0:0:43:43:26:17:0:0:26:17:0:0 chr19 46206262 . G A 254.24 PASS AO=62;DP=134;FAO=63;FDP=134;FR=.;FRO=71;FSAF=23;FSAR=40;FSRF=30;FSRR=41;FWDB=-0.000415298;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.529;QD=7.58936;RBI=0.0273735;REFB=-0.0056701;REVB=0.0273704;RO=71;SAF=22;SAR=40;SRF=30;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.069358;STB=0.532252;TYPE=snp;VARB=0.0052424;OID=.;OPOS=46206262;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:71:71:62:63:40:22:30:41:40:23:30:41 chr19 46268902 . C T 77.85 PASS AO=22;DP=56;FAO=22;FDP=56;FR=.;FRO=34;FSAF=1;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=33;FWDB=0.0819544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.778;QD=5.5607;RBI=0.0844949;REFB=-0.0151329;REVB=0.0205637;RO=33;SAF=1;SAR=21;SRF=1;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102116;STB=0.562449;TYPE=snp;VARB=0.0285805;OID=.;OPOS=46268902;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:56:56:33:34:22:22:21:1:1:32:21:1:1:33 chr19 46269076 . G A 52.59 PASS AO=9;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.0586515;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=139.559;QD=14.0232;RBI=0.0586656;REFB=-0.0585717;REVB=0.00128477;RO=5;SAF=2;SAR=7;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143326;STB=0.636032;TYPE=snp;VARB=0.0160618;OID=.;OPOS=46269076;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:15:15:5:6:9:9:7:2:2:3:7:2:3:3 chr19 46269313 . G C 56.99 PASS AO=4;DP=8;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.139599;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=158.932;QD=28.4974;RBI=0.140927;REFB=-0.0508846;REVB=0.0193007;RO=0;SAF=2;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5554;TYPE=snp;VARB=0.00472566;OID=.;OPOS=46269313;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:5:8:0:1:4:7:2:2:0:0:4:3:0:1 chr19 46287200 . C G 48.24 PASS AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=0.00268676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.158;QD=7.71799;RBI=0.0323253;REFB=-0.000819141;REVB=0.0322134;RO=14;SAF=6;SAR=5;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.240656;STB=0.63887;TYPE=snp;VARB=0.00359667;OID=.;OPOS=46287200;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:25:25:14:14:11:11:5:6:11:3:5:6:11:3 chr19 46289392 . G C 66.06 PASS AO=10;DP=14;FAO=10;FDP=14;FR=.;FRO=4;FSAF=10;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0101299;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=167.413;QD=18.8748;RBI=0.0101299;REFB=-0.153757;REVB=0;RO=3;SAF=10;SAR=0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00484668;OID=.;OPOS=46289392;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:14:14:3:4:10:10:0:10:3:0:0:10:4:0 chr19 46289503 . C T 48.81 PASS AO=5;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.,HEALED;FRO=4;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0131327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=35.7595;QD=16.2703;RBI=0.0203709;REFB=-0.0572868;REVB=0.0155726;RO=5;SAF=4;SAR=1;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.331615;STB=0.642482;TYPE=snp;VARB=0.074352;OID=.;OPOS=46289503;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:12:12:5:4:5:6:1:4:5:0:1:5:4:0 chr19 46307987 . GC G 22.17 PASS AO=12;DP=33;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.00644277;FXX=0.0322477;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.1562;QD=2.95611;RBI=0.0175939;REFB=-0.133902;REVB=-0.0163718;RO=18;SAF=4;SAR=8;SRF=12;SRR=6;SSEN=0.243808;SSEP=0;SSSB=-0.333332;STB=0.66637;TYPE=del;VARB=0.165662;OID=.;OPOS=46307988;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:12:31:11:30:19:4:7:12:7:22:18:4:8:12:6 chr19 46319415 . G C 77.83 PASS AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162836;FXX=0.110988;HRUN=4;LEN=1;MLLD=251.409;QD=38.9158;RBI=0.0396872;REFB=0;REVB=0.0361928;RO=0;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.58669e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000386842;OID=.;OPOS=46319415;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:8:0:0:8:8:6:2:0:0:6:2:0:0 chr19 46333432 . AAT A 168 PASS AO=18;DP=48;FAO=31;FDP=39;FR=.;FRO=8;FSAF=24;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=-0.169584;FXX=0.0249938;HRUN=4;LEN=2;MLLD=29.4151;QD=17.2307;RBI=0.178086;REFB=-0.069867;REVB=-0.054366;RO=14;SAF=14;SAR=4;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0.354582;SSSB=0.312556;STB=0.657423;TYPE=del;VARB=0.0169332;OID=.;OPOS=46333433;OREF=AT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:18:40:31:39:8:24:7:1:7:5:14:14:4:6:8 chr19 46386919 . T G 10.04 PASS AO=3;DP=9;FAO=2;FDP=9;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=0.026714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.559;QD=4.46195;RBI=0.026714;REFB=-0.0144653;REVB=0;RO=6;SAF=3;SAR=0;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0414007;OID=.;OPOS=46386919;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:6:7:3:2:0:3:6:0:0:2:7:0 chr19 46386920 . G T 12.96 PASS AO=3;DP=12;FAO=3;FDP=12;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=9;FSRR=0;FWDB=-0.0194919;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=166.023;QD=4.31851;RBI=0.0194919;REFB=-0.0190724;REVB=0;RO=9;SAF=3;SAR=0;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0149063;OID=.;OPOS=46386920;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:12:12:9:9:3:3:0:3:9:0:0:3:9:0 chr19 46387503 . T C 29.45 PASS AO=6;DP=13;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.0780928;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.489;QD=8.41358;RBI=0.0825394;REFB=-0.0205812;REVB=0.0267257;RO=7;SAF=4;SAR=2;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215036;STB=0.599657;TYPE=snp;VARB=0.0205856;OID=.;OPOS=46387503;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:13:14:7:8:6:6:2:4:3:4:2:4:4:4 chr19 46388379 . C G 473.43 PASS AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0686624;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=281.797;QD=35.7304;RBI=0.0691454;REFB=-0.0874501;REVB=0.0081585;RO=1;SAF=15;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125628;STB=0.506664;TYPE=snp;VARB=0.000480824;OID=.;OPOS=46388379;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:53:53:1:1:52:52:37:15:0:1:37:15:0:1 chr19 46404579 . A G 290.23 PASS AO=27;DP=27;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0671007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.67;QD=38.6975;RBI=0.0842728;REFB=0;REVB=0.0509843;RO=0;SAF=5;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000384266;OID=.;OPOS=46404579;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:27:30:0:0:27:30:22:5:0:0:25:5:0:0 chr19 46443374 . A ACT 18.67 PASS AO=4;DP=10;FAO=4;FDP=10;FR=.;FRO=6;FSAF=0;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=76.8826;QD=7.46961;RBI=0.000200862;REFB=-0.035524;REVB=0.000200862;RO=6;SAF=0;SAR=4;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.21291;OID=.;OPOS=46443375;OREF=-;OALT=CT;OMAPALT=ACT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:4:10:4:10:6:0:4:0:6:18:6:0:4:0:6 chr19 46443389 . C G 154.04 PASS AO=22;DP=29;FAO=22;FDP=29;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=33.8131;QD=21.2471;RBI=0.0696972;REFB=-0.251897;REVB=0.0696972;RO=7;SAF=0;SAR=22;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.112243;OID=.;OPOS=46443389;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:29:29:7:7:22:22:22:0:0:7:22:0:0:7 chr19 46443886 . C A 30.66 PASS AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0515988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.358;QD=20.4426;RBI=0.0515988;REFB=-0.0361303;REVB=0;RO=1;SAF=5;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0162175;OID=.;OPOS=46443886;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:6:6:1:1:5:5:0:5:1:0:0:5:1:0 chr19 46444177 . C T 104.99 PASS AO=32;DP=84;FAO=32;FDP=84;FR=.;FRO=52;FSAF=25;FSAR=7;FSRF=22;FSRR=30;FWDB=-0.0314623;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.199;QD=4.99964;RBI=0.0323523;REFB=-0.00422568;REVB=0.00753616;RO=51;SAF=25;SAR=7;SRF=21;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.42024;STB=0.737483;TYPE=snp;VARB=0.0103992;OID=.;OPOS=46444177;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:51:52:32:32:7:25:21:30:7:25:22:30 chr19 46476530 . G A 10.22 PASS AO=2;DP=9;FAO=2;FDP=9;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.8634;QD=4.5413;RBI=0.0459637;REFB=0.00769034;REVB=0.0459637;RO=7;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0511199;OID=.;OPOS=46476530;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:7:7:2:2:2:0:0:7:2:0:0:7 chr19 46498353 . C G 58.17 PASS AO=20;DP=62;FAO=20;FDP=61;FR=.;FRO=41;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=31;FWDB=-0.0118981;FXX=0.0161264;HRUN=3;LEN=1;MLLD=177.836;QD=3.81415;RBI=0.0152612;REFB=-0.00170931;REVB=0.00955717;RO=41;SAF=8;SAR=12;SRF=10;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196702;STB=0.614182;TYPE=snp;VARB=0.00358989;OID=.;OPOS=46498353;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:62:61:41:41:20:20:12:8:10:31:12:8:10:31 chr19 46498407 . AG A 133.21 PASS AO=35;DP=76;FAO=48;FDP=74;FR=.;FRO=26;FSAF=3;FSAR=45;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=-0.0420935;FXX=0.0512755;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.1059;QD=7.20054;RBI=0.232;REFB=-0.0637748;REVB=-0.228149;RO=26;SAF=1;SAR=34;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.752449;STB=0.838048;TYPE=del;VARB=0.0223168;OID=.;OPOS=46498408;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:35:76:48:74:26:3:45:16:10:39:26:1:34:16:10 chr19 46511548 . T C 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.129379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.0928;QD=35.0875;RBI=0.131899;REFB=0;REVB=0.0256605;RO=0;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.27427e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0139624;OID=.;OPOS=46511548;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:5:2:0:0:5:2:0:0 chr19 46520025 . CA C,CG 487.74 PASS AO=12,40;DP=55;FAO=13,41;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=2,6;FSAR=11,35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00177307,0.00449135;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=196.971,215.021;QD=36.1292;RBI=0.0380284,0.0416977;REFB=0,0;REVB=-0.0379871,-0.0414551;RO=0;SAF=1,5;SAR=11,35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.23983e-08,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0357524,-0.0106034;OID=.,.;OPOS=46520026,46520026;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:12,40:52:13,41:54:0:2,6:11,35:0:0:24:0:1,5:11,35:0:0 chr19 46627592 . G A 374.17 PASS AO=83;DP=159;FAO=83;FDP=159;FR=.;FRO=76;FSAF=42;FSAR=41;FSRF=36;FSRR=40;FWDB=-0.0866073;FXX=0.00624961;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.6331;QD=9.41317;RBI=0.0892828;REFB=-0.0123199;REVB=-0.021693;RO=66;SAF=42;SAR=41;SRF=30;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0417731;STB=0.515451;TYPE=snp;VARB=0.0252003;OID=.;OPOS=46627592;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:159:66:76:83:83:41:42:30:36:41:42:36:40 chr19 46808371 . C T 581.21 PASS AO=120;DP=211;FAO=120;FDP=214;FR=.;FRO=94;FSAF=52;FSAR=68;FSRF=45;FSRR=49;FWDB=0.0056712;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=187.91;QD=10.8638;RBI=0.00577555;REFB=-0.00566317;REVB=-0.00109288;RO=91;SAF=52;SAR=68;SRF=42;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0227118;STB=0.520186;TYPE=snp;VARB=0.00377435;OID=.;OPOS=46808371;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:214:91:94:120:120:68:52:42:49:68:52:45:49 chr19 46811984 . A G 86.76 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0457674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.046;QD=38.5593;RBI=0.0462292;REFB=0;REVB=0.00651822;RO=0;SAF=3;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000832865;OID=.;OPOS=46811984;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:6:3:0:0:6:3:0:0 chr19 46815310 . G A 295.39 PASS AO=69;DP=138;FAO=69;FDP=140;FR=.;FRO=71;FSAF=45;FSAR=24;FSRF=28;FSRR=43;FWDB=-0.00361784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.285;QD=8.43964;RBI=0.0491441;REFB=-0.0364793;REVB=0.0490107;RO=68;SAF=45;SAR=24;SRF=27;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233143;STB=0.632434;TYPE=snp;VARB=0.0320232;OID=.;OPOS=46815310;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:140:68:71:69:69:24:45:27:41:24:45:28:43 chr19 46815499 . T C 435.03 PASS AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00635671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.2032;QD=36.2524;RBI=0.0171483;REFB=-0.138124;REVB=-0.0159266;RO=0;SAF=13;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.94744e-08;STB=0.507243;TYPE=snp;VARB=0.00210068;OID=.;OPOS=46815499;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:46:48:0:1:46:47:33:13:0:0:34:13:0:1 chr19 46815705 . A C 193.64 PASS AO=20;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0237608;FXX=0.0454339;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.3915;QD=36.8846;RBI=0.0370343;REFB=0;REVB=0.0284071;RO=0;SAF=12;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00116331;OID=.;OPOS=46815705;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:21:21:0:0:20:21:8:12:0:0:8:13:0:0 chr19 46823701 . CA C 139.01 PASS AO=31;DP=80;FAO=33;FDP=71;FR=.;FRO=38;FSAF=3;FSAR=30;FSRF=6;FSRR=32;FWDB=-0.107705;FXX=0.112486;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.8295;QD=7.8315;RBI=0.107861;REFB=-0.0190146;REVB=0.00580101;RO=38;SAF=1;SAR=30;SRF=6;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.46022;STB=0.592042;TYPE=del;VARB=0.0173709;OID=.;OPOS=46823702;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:31:80:33:71:38:3:30:6:32:99:38:1:30:6:32 chr19 46823751 . C T 146.6 PASS AO=34;DP=71;FAO=34;FDP=71;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=3;FSRR=34;FWDB=0.026555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.193;QD=8.25934;RBI=0.0267616;REFB=-0.0144682;REVB=0.00331909;RO=37;SAF=10;SAR=24;SRF=3;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.274124;STB=0.650153;TYPE=snp;VARB=0.0119584;OID=.;OPOS=46823751;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:37:37:34:34:24:10:3:34:24:10:3:34 chr19 46823776 . GC G 52.2 PASS AO=20;DP=57;FAO=25;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=20;FSRF=3;FSRR=21;FWDB=0.0469605;FXX=0.0754575;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.031;QD=4.26143;RBI=0.059441;REFB=-0.0439222;REVB=0.0364409;RO=22;SAF=1;SAR=19;SRF=4;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0.414179;SSSB=-0.372278;STB=0.561599;TYPE=del;VARB=0.095637;OID=.;OPOS=46823777;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:20:52:25:49:24:5:20:3:21:45:22:1:19:4:18 chr19 46914921 . G A 75.91 PASS AO=15;DP=30;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=0.0169609;FXX=0.0333222;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.071;QD=10.4703;RBI=0.0193173;REFB=-0.0192369;REVB=0.00924587;RO=14;SAF=7;SAR=8;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220407;STB=0.62426;TYPE=snp;VARB=0.0150458;OID=.;OPOS=46914921;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:30:29:14:14:15:15:8:7:3:11:8:7:3:11 chr19 46973981 . G A 148.46 PASS AO=37;DP=83;FAO=38;FDP=85;FR=.;FRO=47;FSAF=11;FSAR=27;FSRF=33;FSRR=14;FWDB=0.0126996;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.261;QD=6.98625;RBI=0.0127006;REFB=-0.00735809;REVB=0.000163357;RO=46;SAF=10;SAR=27;SRF=32;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.417507;STB=0.724716;TYPE=snp;VARB=0.00432945;OID=.;OPOS=46973981;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:85:46:47:37:38:27:10:32:14:27:11:33:14 chr19 46974233 . G A 235.83 PASS AO=61;DP=135;FAO=61;FDP=135;FR=.;FRO=74;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=32;FSRR=42;FWDB=0.00822166;FXX=0.0073524;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.545;QD=6.98745;RBI=0.0209328;REFB=-0.0196616;REVB=0.0192506;RO=74;SAF=28;SAR=33;SRF=32;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0264116;STB=0.514701;TYPE=snp;VARB=0.0276061;OID=.;OPOS=46974233;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:74:74:61:61:33:28:32:42:33:28:32:42 chr19 46999691 . C G 110.2 PASS AO=25;DP=52;FAO=25;FDP=52;FR=.;FRO=27;FSAF=2;FSAR=23;FSRF=3;FSRR=24;FWDB=0.0347083;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=227.612;QD=8.47653;RBI=0.0453981;REFB=-0.0285155;REVB=-0.0292631;RO=27;SAF=2;SAR=23;SRF=3;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0883905;STB=0.550196;TYPE=snp;VARB=0.0192238;OID=.;OPOS=46999691;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:27:27:25:25:23:2:3:24:23:2:3:24 chr19 47124714 . T G 136.4 PASS AO=20;DP=54;FAO=27;FDP=52;FR=.,HEALED;FRO=24;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=5;FWDB=-0.0174753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.867;QD=10.4925;RBI=0.0191082;REFB=-0.0124186;REVB=-0.00772894;RO=8;SAF=9;SAR=11;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0394609;STB=0.600555;TYPE=snp;VARB=0.00718797;OID=.;OPOS=47124714;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:52:8:24:20:27:11:9:3:5:11:16:19:5 chr19 47137459 . C T 72.47 PASS AO=19;DP=51;FAO=20;FDP=51;FR=.;FRO=31;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=3;FSRR=28;FWDB=0.0116226;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.1559;QD=5.68377;RBI=0.011879;REFB=0.00299738;REVB=0.00245466;RO=31;SAF=3;SAR=16;SRF=3;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138237;STB=0.611018;TYPE=snp;VARB=-0.00398193;OID=.;OPOS=47137459;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:51:51:31:31:19:20:16:3:3:28:16:4:3:28 chr19 47177913 . A G 612.76 PASS AO=64;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0585783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.0886;QD=37.7083;RBI=0.0610822;REFB=0;REVB=0.0173097;RO=0;SAF=28;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000495157;OID=.;OPOS=47177913;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:65:65:0:0:64:65:36:28:0:0:36:29:0:0 chr19 47212593 . A G 124.19 PASS AO=26;DP=55;FAO=28;FDP=57;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=21;FSRF=7;FSRR=22;FWDB=-0.103524;FXX=0.0172384;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.2438;QD=8.715;RBI=0.109435;REFB=-0.0378013;REVB=0.0354795;RO=29;SAF=7;SAR=19;SRF=7;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0337685;STB=0.505878;TYPE=snp;VARB=0.0358423;OID=.;OPOS=47212593;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:57:29:29:26:28:19:7:7:22:21:7:7:22 chr19 47219450 . A G 92.87 PASS AO=22;DP=48;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.0103605;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.744;QD=7.73941;RBI=0.0109085;REFB=-0.0047536;REVB=-0.00341389;RO=26;SAF=10;SAR=12;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0435255;STB=0.524692;TYPE=snp;VARB=0.00689117;OID=.;OPOS=47219450;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:48:48:26:26:22:22:12:10:13:13:12:10:13:13 chr19 47223543 . T C 1046.6 PASS AO=110;DP=112;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00216679;FXX=0.0178555;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.188;QD=38.0583;RBI=0.0212153;REFB=0;REVB=0.0211043;RO=0;SAF=87;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2404e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.42566e-05;OID=.;OPOS=47223543;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:112:110:0:0:110:110:23:87:0:0:23:87:0:0 chr19 47223949 . G A 101.35 PASS AO=21;DP=41;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=0.00222823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.567;QD=9.88793;RBI=0.00292684;REFB=-0.0221485;REVB=-0.00189773;RO=20;SAF=13;SAR=8;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.312111;STB=0.674784;TYPE=snp;VARB=0.0201613;OID=.;OPOS=47223949;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:41:41:20:20:21:21:8:13:5:15:8:13:5:15 chr19 47258842 . C T 24.78 PASS AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=-0.0286282;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.802;QD=5.83135;RBI=0.0286758;REFB=-0.0219212;REVB=0.00165129;RO=9;SAF=3;SAR=3;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162993;STB=0.646611;TYPE=snp;VARB=0.0378649;OID=.;OPOS=47258842;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:15:17:9:11:6:6:3:3:3:6:3:3:3:8 chr19 47258974 . G C 10.3 PASS AO=2;DP=8;FAO=2;FDP=8;FR=.;FRO=6;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=344.627;QD=5.14829;RBI=0.0092913;REFB=-0.0135897;REVB=0.0092913;RO=6;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0237277;OID=.;OPOS=47258974;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:8:6:6:2:2:2:0:0:6:2:0:0:6 chr19 47278859 . C G 74.8 PASS AO=25;DP=76;FAO=26;FDP=77;FR=.;FRO=51;FSAF=2;FSAR=24;FSRF=21;FSRR=30;FWDB=0.0152849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.6416;QD=3.88578;RBI=0.0159788;REFB=-0.0099322;REVB=-0.00465753;RO=51;SAF=2;SAR=23;SRF=21;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.548133;STB=0.836035;TYPE=snp;VARB=0.045317;OID=.;OPOS=47278859;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:76:77:51:51:25:26:23:2:21:30:24:2:21:30 chr19 47287405 . T C 263.36 PASS AO=79;DP=194;FAO=79;FDP=195;FR=.;FRO=116;FSAF=32;FSAR=47;FSRF=46;FSRR=70;FWDB=-0.0101462;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.42;QD=5.40216;RBI=0.0267574;REFB=-0.000560972;REVB=-0.0247591;RO=115;SAF=32;SAR=47;SRF=46;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00555765;STB=0.505262;TYPE=snp;VARB=0.00081274;OID=.;OPOS=47287405;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:195:115:116:79:79:47:32:46:69:47:32:46:70 chr19 47543774 . G A 196.05 PASS AO=57;DP=137;FAO=57;FDP=139;FR=.;FRO=82;FSAF=17;FSAR=40;FSRF=21;FSRR=61;FWDB=0.0697978;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.4793;QD=5.64179;RBI=0.0839635;REFB=0.0160971;REVB=0.0466706;RO=79;SAF=16;SAR=41;SRF=21;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192643;STB=0.530419;TYPE=snp;VARB=-0.0183388;OID=.;OPOS=47543774;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:139:79:82:57:57:41:16:21:58:40:17:21:61 chr19 47575243 . T A 18.6 PASS AO=7;DP=28;FAO=7;FDP=30;FR=.;FRO=23;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=-0.0433168;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.6974;QD=2.47972;RBI=0.0472646;REFB=-0.02397;REVB=-0.0189102;RO=21;SAF=3;SAR=4;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116335;STB=0.599733;TYPE=snp;VARB=0.0792534;OID=.;OPOS=47575243;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:28:30:21:23:7:7:4:3:7:14:4:3:7:16 chr19 47575245 . C G 17.3 PASS AO=6;DP=27;FAO=7;FDP=31;FR=.;FRO=24;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=-0.0102776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.208;QD=2.23277;RBI=0.0167084;REFB=-0.0122513;REVB=-0.0131735;RO=20;SAF=3;SAR=3;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176379;STB=0.611357;TYPE=snp;VARB=0.0511851;OID=.;OPOS=47575245;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:27:31:20:24:6:7:3:3:7:13:4:3:7:17 chr19 47575255 . A C 18.3 PASS AO=7;DP=26;FAO=7;FDP=29;FR=.;FRO=22;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=-0.0284168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.582;QD=2.5247;RBI=0.0306387;REFB=-0.00749935;REVB=-0.0114549;RO=19;SAF=3;SAR=4;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0713947;STB=0.587392;TYPE=snp;VARB=0.0214515;OID=.;OPOS=47575255;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:26:29:19:22:7:7:4:3:7:12:4:3:7:15 chr19 47575267 . C G 10.82 PASS AO=5;DP=24;FAO=5;FDP=25;FR=.;FRO=20;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=0.000569377;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.4597;QD=1.73132;RBI=0.000572201;REFB=-0.00862269;REVB=-5.67734e-05;RO=18;SAF=2;SAR=3;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0823023;STB=0.585884;TYPE=snp;VARB=0.0282128;OID=.;OPOS=47575267;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:24:25:18:20:5:5:3:2:6:12:3:2:6:14 chr19 47585517 . G C 222.04 PASS AO=67;DP=174;FAO=68;FDP=169;FR=.;FRO=101;FSAF=37;FSAR=31;FSRF=47;FSRR=54;FWDB=0.0221284;FXX=0.028734;HRUN=3;LEN=1;MLLD=123.311;QD=5.25532;RBI=0.0265205;REFB=0.00877983;REVB=0.0146176;RO=101;SAF=36;SAR=31;SRF=48;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0662656;STB=0.547038;TYPE=snp;VARB=-0.0200152;OID=.;OPOS=47585517;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:169:101:101:67:68:31:36:48:53:31:37:47:54 chr19 47761646 . G C 447.31 PASS AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0340899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.259;QD=38.0688;RBI=0.0387342;REFB=0;REVB=0.0183908;RO=0;SAF=20;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00012813;OID=.;OPOS=47761646;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:47:47:0:0:47:47:27:20:0:0:27:20:0:0 chr19 47768128 . G C 119.98 PASS AO=13;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.171128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.7497;QD=34.2807;RBI=0.175362;REFB=0;REVB=0.0383026;RO=1;SAF=9;SAR=4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.047723;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00695073;OID=.;OPOS=47768128;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:14:14:1:0:13:14:4:9:1:0:4:10:0:0 chr19 47770015 . A C 183.13 PASS AO=13;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0166149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.6128;QD=38.5534;RBI=0.0543088;REFB=0;REVB=0.0517048;RO=0;SAF=11;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00139424;OID=.;OPOS=47770015;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:13:19:0:0:13:19:2:11:0:0:7:12:0:0 chr19 47770032 . C T 49.57 PASS AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=0.0279645;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.907;QD=6.83779;RBI=0.0337761;REFB=-0.0471719;REVB=-0.0189424;RO=15;SAF=7;SAR=5;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.295191;STB=0.695836;TYPE=snp;VARB=0.0659127;OID=.;OPOS=47770032;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:29:29:15:17:12:12:5:7:4:11:5:7:4:13 chr19 47773647 . C T 164.32 PASS AO=48;DP=119;FAO=48;FDP=119;FR=.;FRO=71;FSAF=14;FSAR=34;FSRF=30;FSRR=41;FWDB=-0.0037508;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=241.653;QD=5.52319;RBI=0.0123508;REFB=-0.00747579;REVB=0.0117675;RO=71;SAF=14;SAR=34;SRF=30;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154264;STB=0.58755;TYPE=snp;VARB=0.0100973;OID=.;OPOS=47773647;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:71:71:48:48:34:14:30:41:34:14:30:41 chr19 47774572 . C T 296.8 PASS AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0351687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.258;QD=37.0997;RBI=0.0686899;REFB=0;REVB=0.0590039;RO=0;SAF=21;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000663014;OID=.;OPOS=47774572;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:32:32:0:0:32:32:11:21:0:0:11:21:0:0 chr19 47774772 . T C 210.68 PASS AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00619298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.404;QD=36.6392;RBI=0.00709372;REFB=0;REVB=0.00345946;RO=0;SAF=4;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.79426e-05;OID=.;OPOS=47774772;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:0:0:23:23:19:4:0:0:19:4:0:0 chr19 47778857 . C G 121.66 PASS AO=27;DP=54;FAO=27;FDP=54;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.000854068;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.956;QD=9.01211;RBI=0.0137849;REFB=-0.0374274;REVB=0.0137584;RO=27;SAF=7;SAR=20;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.318508;STB=0.679328;TYPE=snp;VARB=0.0229064;OID=.;OPOS=47778857;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:27:27:27:27:20:7:16:11:20:7:16:11 chr19 47823038 . G A 388.53 PASS AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0114401;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9278;QD=35.3209;RBI=0.0231358;REFB=0.0472861;REVB=-0.0201095;RO=1;SAF=27;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170778;STB=0.509087;TYPE=snp;VARB=-0.00390151;OID=.;OPOS=47823038;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:44:44:1:1:43:43:16:27:1:0:16:27:1:0 chr19 47823484 . T C 662.6 PASS AO=71;DP=72;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00893958;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.389;QD=36.3069;RBI=0.0260946;REFB=0;REVB=0.0245155;RO=1;SAF=19;SAR=52;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.024233;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00245526;OID=.;OPOS=47823484;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:72:73:1:0:71:73:52:19:1:0:54:19:0:0 chr19 47823871 . G T 1280.25 PASS AO=134;DP=134;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0332362;FXX=0.0073524;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.3337;QD=37.9333;RBI=0.0332592;REFB=0;REVB=0.00123585;RO=0;SAF=69;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00140596;OID=.;OPOS=47823871;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:134:135:0:0:134:135:65:69:0:0:66:69:0:0 chr19 47844811 . TG CT 10.91 PASS AO=2;DP=12;FAO=2;FDP=12;FR=.,HEALED;FRO=9;FSAF=1;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=0;FWDB=-0.0811814;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=52.9618;QD=3.63829;RBI=0.0913201;REFB=-0.0783174;REVB=0.0418202;RO=7;SAF=1;SAR=1;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.639247;STB=0.907711;TYPE=mnp;VARB=-0.00351286;OID=.;OPOS=47844811;OREF=TG;OALT=CT;OMAPALT=CT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:12:12:7:9:2:2:1:1:7:0:1:1:9:0 chr19 47858489 . C G 358.76 PASS AO=80;DP=154;FAO=80;FDP=154;FR=.;FRO=74;FSAF=19;FSAR=61;FSRF=27;FSRR=47;FWDB=0.031776;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=243.257;QD=9.31837;RBI=0.0368289;REFB=-0.0227902;REVB=0.0186187;RO=72;SAF=19;SAR=61;SRF=25;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121094;STB=0.577583;TYPE=snp;VARB=0.0184053;OID=.;OPOS=47858489;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:154:72:74:80:80:61:19:25:47:61:19:27:47 chr19 47858540 . C T 266.39 PASS AO=62;DP=134;FAO=65;FDP=135;FR=.;FRO=70;FSAF=19;FSAR=46;FSRF=21;FSRR=49;FWDB=0.105459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.39;QD=7.8929;RBI=0.105508;REFB=-0.00661413;REVB=0.0031955;RO=69;SAF=19;SAR=43;SRF=21;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00235281;STB=0.5048;TYPE=snp;VARB=0.00812876;OID=.;OPOS=47858540;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:135:69:70:62:65:43:19:21:48:46:19:21:49 chr19 47935352 . T C 190.3 PASS AO=18;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0379825;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=74.2159;QD=38.0595;RBI=0.15871;REFB=0;REVB=0.154098;RO=0;SAF=16;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.002177;OID=.;OPOS=47935352;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:20:20:0:0:18:20:2:16:0:0:4:16:0:0 chr19 47980153 . G A 167.03 PASS AO=44;DP=101;FAO=44;FDP=101;FR=.;FRO=57;FSAF=29;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=32;FWDB=0.015035;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=152.114;QD=6.61492;RBI=0.0325239;REFB=-0.0171017;REVB=0.0288401;RO=57;SAF=29;SAR=15;SRF=25;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226219;STB=0.627185;TYPE=snp;VARB=0.0175516;OID=.;OPOS=47980153;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:57:57:44:44:15:29:25:32:15:29:25:32 chr19 48036156 . C T 200.29 PASS AO=45;DP=86;FAO=45;FDP=90;FR=.;FRO=45;FSAF=31;FSAR=14;FSRF=27;FSRR=18;FWDB=0.000721036;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=140.606;QD=8.90182;RBI=0.010142;REFB=-0.00530202;REVB=-0.0101163;RO=41;SAF=31;SAR=14;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121799;STB=0.549866;TYPE=snp;VARB=0.00639134;OID=.;OPOS=48036156;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:90:41:45:45:45:14:31:23:18:14:31:27:18 chr19 48182787 . C T 49.68 PASS AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.00192185;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.1422;QD=9.46318;RBI=0.0476859;REFB=0.00616446;REVB=0.0476472;RO=11;SAF=5;SAR=5;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0406606;STB=0.523762;TYPE=snp;VARB=-0.00316311;OID=.;OPOS=48182787;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:21:21:11:11:10:10:5:5:6:5:5:5:6:5 chr19 48198675 . AC A,GC 242.62 PASS AO=16,12;DP=50;FAO=20,22;FDP=49;FR=.;FRO=7;FSAF=20,21;FSAR=0,1;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=-0.26338,-0.00893199;FXX=0.019996;HRUN=3,1;LEN=1,1;MLLD=14.364,74.0626;QD=19.8059;RBI=0.28082,0.0593378;REFB=-0.0612259,-0.0540177;REVB=0.0974203,-0.0586617;RO=6;SAF=16,11;SAR=0,1;SRF=0;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.861835,0.650741;STB=0.999258,0.888411;TYPE=del,snp;VARB=0.0700699,0.0395168;OID=.,.;OPOS=48198676,48198675;OREF=C,A;OALT=-,G;OMAPALT=A,GC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:75:39:49:6:7:16,12:20,22:0,1:16,11:0:6:0,1:20,21:0:7 chr19 48244194 . A G 211.28 PASS AO=34;DP=50;FAO=35;FDP=52;FR=.;FRO=17;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.0158227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.782;QD=16.2522;RBI=0.0634724;REFB=-0.0409812;REVB=-0.0614686;RO=16;SAF=18;SAR=16;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0565432;STB=0.514975;TYPE=snp;VARB=0.0207609;OID=.;OPOS=48244194;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:50:52:16:17:34:35:16:18:10:6:16:19:10:7 chr19 48244401 . G A 145.65 PASS AO=32;DP=63;FAO=32;FDP=63;FR=.;FRO=31;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.00575895;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.5262;QD=9.24757;RBI=0.0447691;REFB=-0.0395811;REVB=0.0443972;RO=31;SAF=18;SAR=14;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126345;STB=0.507038;TYPE=snp;VARB=0.0371182;OID=.;OPOS=48244401;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:63:31:31:32:32:14:18:17:14:14:18:17:14 chr19 48244569 . G A 21.08 PASS AO=5;DP=15;FAO=5;FDP=15;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.0383668;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.0645;QD=5.62049;RBI=0.067623;REFB=0.00601808;REVB=0.0556854;RO=10;SAF=1;SAR=4;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.429227;STB=0.776626;TYPE=snp;VARB=-0.00669653;OID=.;OPOS=48244569;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:15:15:10:10:5:5:4:1:6:4:4:1:6:4 chr19 48255804 . A G 51.86 PASS AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0609454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.5324;QD=10.3713;RBI=0.0825003;REFB=0.013494;REVB=-0.0556054;RO=10;SAF=2;SAR=8;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121211;STB=0.571275;TYPE=snp;VARB=-0.011957;OID=.;OPOS=48255804;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:20:20:10:10:10:10:8:2:3:7:8:2:3:7 chr19 48259789 . AG A 188.48 PASS AO=24;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.13778;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=20.6068;QD=30.1574;RBI=0.204194;REFB=0;REVB=0.150704;RO=1;SAF=19;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0.243808;SSSB=-0.0237806;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0168727;OID=.;OPOS=48259790;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:24:25:25:25:0:20:5:0:0:17:1:19:5:1:0 chr19 48305447 . T G 18.76 PASS AO=4;DP=6;FAO=4;FDP=6;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=0;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0897965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.1895;QD=12.5052;RBI=0.0897965;REFB=-0.126823;REVB=0;RO=1;SAF=4;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.144856;OID=.;OPOS=48305447;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:1:2:4:4:0:4:1:0:0:4:2:0 chr19 48364130 . TG T 147.41 PASS AO=17;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0124022;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=22.0391;QD=29.4815;RBI=0.202118;REFB=0;REVB=0.201737;RO=0;SAF=6;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.341962;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0173453;OID=.;OPOS=48364131;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:17:20:20:20:0:8:12:0:0:13:0:6:11:0:0 chr19 48389425 . A G 3418.41 PASS AO=365;DP=371;FAO=367;FDP=367;FR=.;FRO=0;FSAF=188;FSAR=179;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0278518;FXX=0.0213328;HRUN=3;LEN=1;MLLD=157.928;QD=37.2578;RBI=0.0318688;REFB=-0.132445;REVB=0.0154887;RO=6;SAF=188;SAR=177;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0107543;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000219492;OID=.;OPOS=48389425;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:371:367:6:0:365:367:177:188:1:5:179:188:0:0 chr19 48484150 . G A 1000.7 PASS AO=105;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00712988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.502;QD=38.122;RBI=0.00799459;REFB=0;REVB=0.00361639;RO=0;SAF=69;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21741e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.75551e-05;OID=.;OPOS=48484150;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:105:105:0:0:105:105:36:69:0:0:36:69:0:0 chr19 48495304 . G A 83.63 PASS AO=26;DP=74;FAO=27;FDP=75;FR=.;FRO=48;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=29;FWDB=-0.0282062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.098;QD=4.46002;RBI=0.0531239;REFB=-0.026406;REVB=0.0450173;RO=44;SAF=12;SAR=14;SRF=15;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134468;STB=0.531699;TYPE=snp;VARB=0.0517304;OID=.;OPOS=48495304;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:74:75:44:48:26:27:14:12:15:29:15:12:19:29 chr19 48517538 . G A 495.67 PASS AO=129;DP=273;FAO=130;FDP=283;FR=.;FRO=153;FSAF=32;FSAR=98;FSRF=47;FSRR=106;FWDB=-0.0113099;FXX=0.0139368;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.493;QD=7.0059;RBI=0.0113188;REFB=-0.0173826;REVB=-0.000448751;RO=144;SAF=32;SAR=97;SRF=46;SRR=98;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0867789;STB=0.54253;TYPE=snp;VARB=0.0189756;OID=.;OPOS=48517538;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:273:283:144:153:129:130:97:32:46:98:98:32:47:106 chr19 48519158 . C T 122.69 PASS AO=53;DP=173;FAO=53;FDP=173;FR=.;FRO=120;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=78;FSRR=42;FWDB=-0.0514571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5949;QD=2.8368;RBI=0.0527413;REFB=-0.0271608;REVB=-0.0115674;RO=118;SAF=28;SAR=25;SRF=76;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139874;STB=0.585475;TYPE=snp;VARB=0.064461;OID=.;OPOS=48519158;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:173:118:120:53:53:25:28:76:42:25:28:78:42 chr19 48519205 . C T 79.07 PASS AO=42;DP=161;FAO=42;FDP=159;FR=.;FRO=117;FSAF=29;FSAR=13;FSRF=85;FSRR=32;FWDB=0.00160986;FXX=0.0124216;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.322;QD=1.98914;RBI=0.0086363;REFB=-0.0056835;REVB=0.00848493;RO=116;SAF=29;SAR=13;SRF=84;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0498652;STB=0.53174;TYPE=snp;VARB=0.0189895;OID=.;OPOS=48519205;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:161:159:116:117:42:42:13:29:84:32:13:29:85:32 chr19 48519244 . A G 63.97 PASS AO=35;DP=136;FAO=35;FDP=136;FR=.;FRO=101;FSAF=25;FSAR=10;FSRF=77;FSRR=24;FWDB=-0.00286203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.372;QD=1.88137;RBI=0.00308283;REFB=-0.00113962;REVB=0.0011457;RO=97;SAF=25;SAR=10;SRF=74;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0766603;STB=0.54543;TYPE=snp;VARB=0.00367133;OID=.;OPOS=48519244;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:136:136:97:101:35:35:10:25:74:23:10:25:77:24 chr19 48533856 . A G 181.14 PASS AO=46;DP=99;FAO=45;FDP=98;FR=.;FRO=53;FSAF=13;FSAR=32;FSRF=21;FSRR=32;FWDB=0.0133553;FXX=0.0101;HRUN=11;LEN=1;MLLD=208.047;QD=7.39334;RBI=0.0149173;REFB=0.0142581;REVB=0.00664532;RO=46;SAF=13;SAR=33;SRF=19;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135005;STB=0.566636;TYPE=snp;VARB=-0.0135297;OID=.;OPOS=48533856;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:98:46:53:46:45:33:13:19:27:32:13:21:32 chr19 48537585 . A G 103.21 PASS AO=25;DP=60;FAO=26;FDP=60;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=3;FSRR=31;FWDB=0.00342564;FXX=0.0624902;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.1101;QD=6.88055;RBI=0.0313118;REFB=-0.0410254;REVB=-0.0311239;RO=34;SAF=10;SAR=15;SRF=3;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.365207;STB=0.693099;TYPE=snp;VARB=0.0273069;OID=.;OPOS=48537585;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:34:34:25:26:15:10:3:31:16:10:3:31 chr19 48543862 . G A 1039.99 PASS AO=108;DP=109;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0029813;FXX=0.00917347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.621;QD=38.5181;RBI=0.045124;REFB=0;REVB=0.0450254;RO=0;SAF=52;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.59964e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.41713e-05;OID=.;OPOS=48543862;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:109:108:0:0:108:108:56:52:0:0:56:52:0:0 chr19 48543923 . C A 219.27 PASS AO=66;DP=169;FAO=66;FDP=165;FR=.;FRO=99;FSAF=23;FSAR=43;FSRF=47;FSRR=52;FWDB=-0.00416776;FXX=0.0236672;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.6283;QD=5.31573;RBI=0.0117433;REFB=0.00657204;REVB=0.0109788;RO=98;SAF=23;SAR=43;SRF=46;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13452;STB=0.579379;TYPE=snp;VARB=-0.00917433;OID=.;OPOS=48543923;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:165:98:99:66:66:43:23:46:52:43:23:47:52 chr19 48558286 . G A 100.4 PASS AO=35;DP=104;FAO=36;FDP=106;FR=.;FRO=70;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=23;FSRR=47;FWDB=-0.0249737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.782;QD=3.78866;RBI=0.0257406;REFB=-0.0241442;REVB=-0.00623645;RO=69;SAF=11;SAR=24;SRF=22;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00603533;STB=0.517651;TYPE=snp;VARB=0.0604824;OID=.;OPOS=48558286;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:106:69:70:35:36:24:11:22:47:25:11:23:47 chr19 48571072 . T G 150.11 PASS AO=39;DP=93;FAO=41;FDP=95;FR=.;FRO=54;FSAF=32;FSAR=9;FSRF=39;FSRR=15;FWDB=0.00215285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=320.339;QD=6.3206;RBI=0.0189536;REFB=-0.0022255;REVB=0.0188309;RO=54;SAF=32;SAR=7;SRF=39;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15107;STB=0.545819;TYPE=snp;VARB=0.00387182;OID=.;OPOS=48571072;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:95:54:54:39:41:7:32:39:15:9:32:39:15 chr19 48598823 . A G 125.18 PASS AO=36;DP=90;FAO=36;FDP=90;FR=.;FRO=54;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=31;FWDB=-0.0074523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.471;QD=5.56333;RBI=0.0154623;REFB=-0.00298652;REVB=0.0135479;RO=54;SAF=12;SAR=24;SRF=23;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105284;STB=0.559966;TYPE=snp;VARB=0.00544031;OID=.;OPOS=48598823;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:54:54:36:36:24:12:23:31:24:12:23:31 chr19 48601454 . T C 199.58 PASS AO=51;DP=181;FAO=55;FDP=151;FR=.,HEALED;FRO=88;FSAF=35;FSAR=20;FSRF=41;FSRR=47;FWDB=-0.008444;FXX=0.146884;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.6382;QD=5.28684;RBI=0.0357148;REFB=-0.00749396;REVB=-0.0347023;RO=54;SAF=35;SAR=16;SRF=37;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.001172;STB=0.606688;TYPE=snp;VARB=0.0211786;OID=.;OPOS=48601454;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:151:54:88:51:55:16:35:37:17:20:35:41:47 chr19 48621036 . C G 133.89 PASS AO=20;DP=33;FAO=23;FDP=36;FR=.;FRO=13;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=2;FWDB=-0.022436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.411;QD=14.8767;RBI=0.0301606;REFB=-0.059822;REVB=0.0201566;RO=13;SAF=14;SAR=6;SRF=11;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131181;STB=0.552588;TYPE=snp;VARB=0.0350696;OID=.;OPOS=48621036;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:33:36:13:13:20:23:6:14:11:2:6:17:11:2 chr19 48622427 . A G 272.32 PASS AO=82;DP=205;FAO=83;FDP=207;FR=.;FRO=124;FSAF=17;FSAR=66;FSRF=58;FSRR=66;FWDB=0.00718454;FXX=0.0189564;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.371;QD=5.26227;RBI=0.0276115;REFB=-0.01503;REVB=-0.0266604;RO=120;SAF=15;SAR=67;SRF=56;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.365303;STB=0.688023;TYPE=snp;VARB=0.0343933;OID=.;OPOS=48622427;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:207:120:124:82:83:67:15:56:64:66:17:58:66 chr19 48654553 . G T 315.35 PASS AO=79;DP=164;FAO=79;FDP=169;FR=.;FRO=90;FSAF=32;FSAR=47;FSRF=50;FSRR=40;FWDB=-0.0825823;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.9437;QD=7.4638;RBI=0.0887168;REFB=0.0166465;REVB=0.0324165;RO=85;SAF=32;SAR=47;SRF=46;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128829;STB=0.580576;TYPE=snp;VARB=-0.0200415;OID=.;OPOS=48654553;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:169:85:90:79:79:47:32:46:39:47:32:50:40 chr19 48668795 . G A 151.6 PASS AO=53;DP=171;FAO=58;FDP=170;FR=.,HEALED;FRO=112;FSAF=47;FSAR=11;FSRF=50;FSRR=62;FWDB=0.0278465;FXX=0.00584761;HRUN=3;LEN=1;MLLD=37.3039;QD=3.56699;RBI=0.241972;REFB=-0.017124;REVB=-0.240364;RO=53;SAF=42;SAR=11;SRF=48;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175208;STB=0.762686;TYPE=snp;VARB=0.0332183;OID=.;OPOS=48668795;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:170:53:112:53:58:11:42:48:5:11:47:50:62 chr19 48697961 . C T 136.79 PASS AO=32;DP=67;FAO=32;FDP=67;FR=.;FRO=35;FSAF=6;FSAR=26;FSRF=11;FSRR=24;FWDB=0.024624;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.6851;QD=8.16645;RBI=0.030207;REFB=-0.00557174;REVB=0.0174963;RO=33;SAF=6;SAR=26;SRF=9;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11587;STB=0.595622;TYPE=snp;VARB=0.00553654;OID=.;OPOS=48697961;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:33:35:32:32:26:6:9:24:26:6:11:24 chr19 48715153 . T C 167.62 PASS AO=43;DP=95;FAO=43;FDP=95;FR=.;FRO=52;FSAF=2;FSAR=41;FSRF=3;FSRR=49;FWDB=-0.023185;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.7719;QD=7.0577;RBI=0.0236445;REFB=-0.00159038;REVB=0.00463901;RO=52;SAF=2;SAR=41;SRF=3;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0576579;STB=0.532451;TYPE=snp;VARB=0.00204029;OID=.;OPOS=48715153;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:52:52:43:43:41:2:3:49:41:2:3:49 chr19 48737706 . A T 412.82 PASS AO=91;DP=172;FAO=91;FDP=173;FR=.;FRO=82;FSAF=26;FSAR=65;FSRF=23;FSRR=59;FWDB=-0.0161017;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.171;QD=9.54506;RBI=0.016777;REFB=-0.00442663;REVB=-0.00471175;RO=81;SAF=26;SAR=65;SRF=23;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0018603;STB=0.503042;TYPE=snp;VARB=0.00364383;OID=.;OPOS=48737706;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:173:81:82:91:91:65:26:23:58:65:26:23:59 chr19 48800338 . A G 231.38 PASS AO=63;DP=147;FAO=63;FDP=146;FR=.;FRO=83;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=40;FSRR=43;FWDB=-0.0369183;FXX=0.00680226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.068;QD=6.33926;RBI=0.042436;REFB=-0.0119949;REVB=-0.0209251;RO=81;SAF=30;SAR=33;SRF=39;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00534005;STB=0.503267;TYPE=snp;VARB=0.0155851;OID=.;OPOS=48800338;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:146:81:83:63:63:33:30:39:42:33:30:40:43 chr19 48800914 . G A 22.62 PASS AO=8;DP=29;FAO=8;FDP=30;FR=.;FRO=22;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=17;FWDB=-0.0122435;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=121.797;QD=3.01551;RBI=0.0124293;REFB=-0.00882772;REVB=0.00214065;RO=21;SAF=2;SAR=6;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184739;STB=0.522672;TYPE=snp;VARB=0.0438572;OID=.;OPOS=48800914;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:29:30:21:22:8:8:6:2:5:16:6:2:5:17 chr19 48823545 . G A 202.69 PASS AO=50;DP=110;FAO=51;FDP=111;FR=.;FRO=60;FSAF=34;FSAR=17;FSRF=36;FSRR=24;FWDB=0.019178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.852;QD=7.30415;RBI=0.020051;REFB=-0.00222794;REVB=0.00585203;RO=59;SAF=34;SAR=16;SRF=35;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0928857;STB=0.539458;TYPE=snp;VARB=0.00310218;OID=.;OPOS=48823545;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:111:59:60:50:51:16:34:35:24:17:34:36:24 chr19 48836579 . G C 86.69 PASS AO=16;DP=28;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.00644839;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=222.748;QD=12.3837;RBI=0.0371461;REFB=-0.0124358;REVB=-0.0365821;RO=12;SAF=8;SAR=8;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0633569;STB=0.53567;TYPE=snp;VARB=0.0108813;OID=.;OPOS=48836579;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:28:28:12:12:16:16:8:8:7:5:8:8:7:5 chr19 48836673 . G T 78.73 PASS AO=12;DP=20;FAO=13;FDP=21;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0253829;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.124;QD=14.9959;RBI=0.0271673;REFB=0.00946743;REVB=0.0096834;RO=8;SAF=5;SAR=7;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0594792;STB=0.545384;TYPE=snp;VARB=-0.00380585;OID=.;OPOS=48836673;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:20:21:8:8:12:13:7:5:4:4:8:5:4:4 chr19 48863386 . C T 647.87 PASS AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0176285;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.466;QD=36.4997;RBI=0.0301703;REFB=-0.074473;REVB=0.0244844;RO=1;SAF=37;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141118;STB=0.507461;TYPE=snp;VARB=0.00054783;OID=.;OPOS=48863386;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:71:71:1:1:70:70:33:37:0:1:33:37:0:1 chr19 48949286 . G T 296.75 PASS AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0437789;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.1876;QD=37.0934;RBI=0.0503657;REFB=0;REVB=0.024902;RO=0;SAF=23;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02243e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00107923;OID=.;OPOS=48949286;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:32:32:0:0:32:32:9:23:0:0:9:23:0:0 chr19 48954421 . G A 213.27 PASS AO=52;DP=110;FAO=52;FDP=111;FR=.;FRO=59;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=25;FSRR=34;FWDB=0.045987;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=100.555;QD=7.68556;RBI=0.0462495;REFB=-0.00737196;REVB=0.00492078;RO=58;SAF=22;SAR=30;SRF=25;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00771962;STB=0.500355;TYPE=snp;VARB=0.0058823;OID=.;OPOS=48954421;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:111:58:59:52:52:30:22:25:33:30:22:25:34 chr19 48985178 . TA T 2462.66 PASS AO=303;DP=317;FAO=313;FDP=313;FR=.;FRO=0;FSAF=123;FSAR=190;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.066354;FXX=0.0126179;HRUN=2;LEN=1;MLLD=27.9333;QD=31.4717;RBI=0.145043;REFB=0;REVB=-0.128975;RO=0;SAF=119;SAR=184;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.000274127;OID=.;OPOS=48985179;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:303:315:313:313:0:123:190:0:0:99:0:119:184:0:0 chr19 48994757 . CG C,CGG 49.72 PASS AO=6,5;DP=34;FAO=24,7;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=15,7;FSAR=9,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.123673,-0.123592;FXX=0.0312402;HRUN=8,8;LEN=1,1;MLLD=6.44436,7.60941;QD=6.41595;RBI=0.205242,0.20519;REFB=-0.0183066,0.0183066;REVB=0.163796,-0.163792;RO=9;SAF=1,5;SAR=5,0;SRF=6;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.503774,0.69933;STB=0.5,0.5;TYPE=del,ins;VARB=0.146099,0.0992656;OID=.,.;OPOS=48994758,48994758;OREF=G,-;OALT=-,G;OMAPALT=C,CGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:6,5:31:24,7:31:0:15,7:9,0:0:0:5:9:1,5:5,0:6:3 chr19 49102399 . C T 1954.78 PASS AO=212;DP=222;FAO=213;FDP=213;FR=.;FRO=0;FSAF=116;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148186;FXX=0.0405387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.092;QD=36.7096;RBI=0.0148728;REFB=-0.052151;REVB=-0.00126886;RO=5;SAF=116;SAR=96;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0153436;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000149599;OID=.;OPOS=49102399;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:222:213:5:0:212:213:96:116:1:4:97:116:0:0 chr19 49116555 . A G 50.82 PASS AO=14;DP=36;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.0230141;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.2096;QD=5.49379;RBI=0.0645985;REFB=-0.0113094;REVB=-0.06036;RO=22;SAF=7;SAR=7;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.513494;TYPE=snp;VARB=0.0113727;OID=.;OPOS=49116555;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:36:37:22:23:14:14:7:7:11:11:7:7:12:11 chr19 49141406 . AAGAC A 248.13 PASS AO=31;DP=41;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00296268;FXX=0.0312402;HRUN=2;LEN=4;MLLD=305.571;QD=32.0171;RBI=0.0261661;REFB=0;REVB=0.0259978;RO=0;SAF=7;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71661e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=9.91628e-05;OID=.;OPOS=49141407;OREF=AGAC;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:31:32:31:31:0:7:24:0:0:22:0:7:24:0:0 chr19 49183705 . G A 483.6 PASS AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0116546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.4328;QD=35.8222;RBI=0.0139089;REFB=-0.0323098;REVB=0.00759128;RO=0;SAF=29;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5102;TYPE=snp;VARB=0.000896675;OID=.;OPOS=49183705;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:54:54:0:1:53:53:24:29:0:0:24:29:0:1 chr19 49206417 . A G 457.01 PASS AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0349588;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.7361;QD=35.844;RBI=0.0529963;REFB=-0.0810458;REVB=-0.0398308;RO=1;SAF=13;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125559;STB=0.506664;TYPE=snp;VARB=0.00179304;OID=.;OPOS=49206417;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:51:51:1:1:50:50:37:13:0:1:37:13:0:1 chr19 49206462 . C T 422.61 PASS AO=48;DP=51;FAO=49;FDP=51;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0383249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.999;QD=33.1457;RBI=0.0598282;REFB=-0.12234;REVB=0.0459414;RO=1;SAF=16;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0144774;STB=0.506594;TYPE=snp;VARB=0.00168307;OID=.;OPOS=49206462;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:51:51:1:2:48:49:32:16:0:1:32:17:1:1 chr19 49206674 . G A 723.91 PASS AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0190879;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.673;QD=38.1006;RBI=0.0214837;REFB=0;REVB=-0.00985906;RO=0;SAF=26;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99741e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.92635e-05;OID=.;OPOS=49206674;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:76:76:0:0:76:76:50:26:0:0:50:26:0:0 chr19 49206985 . G A 1439.7 PASS AO=151;DP=152;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00919501;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.98;QD=37.6392;RBI=0.0351523;REFB=0;REVB=0.0339284;RO=1;SAF=88;SAR=63;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00749028;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.18919e-05;OID=.;OPOS=49206985;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:152:153:1:0:151:153:63:88:0:1:65:88:0:0 chr19 49207206 . A G 703.08 PASS AO=73;DP=73;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0248085;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.213;QD=38.0043;RBI=0.0263891;REFB=0;REVB=-0.00899592;RO=0;SAF=16;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.69141e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000476407;OID=.;OPOS=49207206;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:73:74:0:0:73:74:57:16:0:0:57:17:0:0 chr19 49207255 . A G 534.04 PASS AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208248;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.889;QD=38.1457;RBI=0.0209365;REFB=0;REVB=0.00216004;RO=0;SAF=14;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.30503e-05;OID=.;OPOS=49207255;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:56:56:0:0:56:56:42:14:0:0:42:14:0:0 chr19 49207257 . T C 411.92 PASS AO=52;DP=55;FAO=50;FDP=55;FR=.;FRO=5;FSAF=13;FSAR=37;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0312371;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.5455;QD=29.9577;RBI=0.03474;REFB=-0.0571894;REVB=-0.0152024;RO=2;SAF=14;SAR=38;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0202275;STB=0.516272;TYPE=snp;VARB=0.0136936;OID=.;OPOS=49207257;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:55:55:2:5:52:50:38:14:1:1:37:13:2:3 chr19 49207438 . T G 107.82 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.048;QD=35.9384;RBI=0.020462;REFB=0;REVB=0.020462;RO=0;SAF=0;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000125939;OID=.;OPOS=49207438;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:12:0:0:0:12:0:0:0 chr19 49207651 . T C 73.84 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.106239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3388;QD=36.9196;RBI=0.106239;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=8;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00858353;OID=.;OPOS=49207651;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:0:8:0:0:0:8:0:0 chr19 49207718 . T C 341.9 PASS AO=34;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00452724;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.455;QD=37.9886;RBI=0.0702324;REFB=0;REVB=0.0700863;RO=0;SAF=29;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000295541;OID=.;OPOS=49207718;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:35:36:0:0:34:36:5:29:0:0:5:31:0:0 chr19 49207792 . G A 1088.32 PASS AO=113;DP=114;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105377;FXX=0.0254216;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.35;QD=37.8546;RBI=0.0132619;REFB=-0.0717621;REVB=0.00805193;RO=1;SAF=77;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0130053;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.52322e-05;OID=.;OPOS=49207792;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:114:115:1:0:113:115:36:77:0:1:36:79:0:0 chr19 49207881 . AG A,AA 1309.59 PASS AO=51,45;DP=162;FAO=134,46;FDP=180;FR=.;FRO=0;FSAF=56,44;FSAR=78,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.490402,0.296184;FXX=0.0109884;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=15.2008,13.6786;QD=29.1019;RBI=0.577004,0.391667;REFB=0,0;REVB=0.304038,0.256277;RO=70;SAF=7,44;SAR=44,1;SRF=45;SRR=25;SSEN=0,0;SSEP=0.325926,0;SSSB=-0.573841,0.714718;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0617671,-0.0641427;OID=.,.;OPOS=49207882,49207882;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:51,45:170:134,46:180:0:56,44:78,2:0:0:59:70:7,44:44,1:45:25 chr19 49208344 . AC A 618.29 PASS AO=68;DP=81;FAO=68;FDP=70;FR=.;FRO=2;FSAF=30;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0543438;FXX=0.078937;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.84;QD=35.3309;RBI=0.0589211;REFB=0.0650005;REVB=0.0227694;RO=2;SAF=30;SAR=38;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0242257;STB=0.512817;TYPE=del;VARB=6.37082e-05;OID=.;OPOS=49208345;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:68:79:68:70:2:30:38:0:2:18:2:30:38:0:2 chr19 49208368 . C T 115 PASS AO=19;DP=21;FAO=17;FDP=22;FR=.;FRO=5;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0104233;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.638;QD=20.9089;RBI=0.0427663;REFB=-0.0478112;REVB=0.0414766;RO=2;SAF=9;SAR=10;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0834716;STB=0.618913;TYPE=snp;VARB=0.00609042;OID=.;OPOS=49208368;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:21:22:2:5:19:17:10:9:0:2:8:9:0:5 chr19 49208543 . T C 136.31 PASS AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0145045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.43;QD=36.3484;RBI=0.0145103;REFB=0;REVB=0.000409968;RO=0;SAF=9;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000298365;OID=.;OPOS=49208543;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:15:0:0:15:15:6:9:0:0:6:9:0:0 chr19 49208564 . C T 254.87 PASS AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00932102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.752;QD=37.759;RBI=0.116175;REFB=0;REVB=0.1158;RO=0;SAF=13;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00155047;OID=.;OPOS=49208564;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:26:27:0:0:26:27:13:13:0:0:14:13:0:0 chr19 49208629 . G C 593.88 PASS AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00155748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.995;QD=37.7067;RBI=0.0313094;REFB=0;REVB=-0.0312706;RO=0;SAF=40;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000356632;OID=.;OPOS=49208629;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:63:63:0:0:63:63:23:40:0:0:23:40:0:0 chr19 49208865 . G A 916.34 PASS AO=95;DP=95;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00817988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.055;QD=38.1807;RBI=0.0100996;REFB=0;REVB=0.00592385;RO=0;SAF=44;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.32885e-05;OID=.;OPOS=49208865;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:95:96:0:0:95:96:51:44:0:0:51:45:0:0 chr19 49208978 . A G 602.79 PASS AO=66;DP=68;FAO=66;FDP=68;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0234382;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=201.311;QD=35.4583;RBI=0.0237828;REFB=-0.0111482;REVB=-0.00403393;RO=1;SAF=29;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0160134;STB=0.501808;TYPE=snp;VARB=5.13752e-05;OID=.;OPOS=49208978;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:68:68:1:2:66:66:37:29:1:0:37:29:1:1 chr19 49209010 . T C 734.85 PASS AO=78;DP=83;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0324672;FXX=0.0240935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.8626;QD=36.2888;RBI=0.122683;REFB=0;REVB=0.118309;RO=0;SAF=30;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00430706;OID=.;OPOS=49209010;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:83:81:0:0:78:81:48:30:0:0:51:30:0:0 chr19 49217261 . A G 195.16 PASS AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0617392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.579;QD=37.1733;RBI=0.0804277;REFB=0;REVB=-0.051545;RO=0;SAF=13;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00014757;OID=.;OPOS=49217261;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:21:21:0:0:21:21:8:13:0:0:8:13:0:0 chr19 49218060 . C T 255.63 PASS AO=27;DP=29;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00309655;FXX=0.0689417;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.729;QD=37.8705;RBI=0.017547;REFB=0;REVB=-0.0172716;RO=0;SAF=24;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000329413;OID=.;OPOS=49218060;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:29:27:0:0:27:27:3:24:0:0:3:24:0:0 chr19 49218111 . G T 181.15 PASS AO=22;DP=24;FAO=22;FDP=24;FR=.;FRO=2;FSAF=19;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0411795;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=165.165;QD=30.1919;RBI=0.0412689;REFB=-0.114642;REVB=0.00271434;RO=1;SAF=19;SAR=3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0237245;STB=0.524978;TYPE=snp;VARB=0.00100432;OID=.;OPOS=49218111;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:24:24:1:2:22:22:3:19:1:0:3:19:2:0 chr19 49218602 . C T 422.92 PASS AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0144083;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.057;QD=35.9931;RBI=0.0175857;REFB=0.00219337;REVB=-0.0100824;RO=1;SAF=26;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0229252;STB=0.51219;TYPE=snp;VARB=-0.000178666;OID=.;OPOS=49218602;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:47:47:1:1:46:46:20:26:0:1:20:26:0:1 chr19 49299533 . A G 421.43 PASS AO=106;DP=225;FAO=106;FDP=225;FR=.;FRO=119;FSAF=57;FSAR=49;FSRF=64;FSRR=55;FWDB=-0.00573802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.746;QD=7.49215;RBI=0.0058903;REFB=-0.00682531;REVB=-0.0013307;RO=119;SAF=57;SAR=49;SRF=64;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.63748e-05;STB=0.500042;TYPE=snp;VARB=0.00872481;OID=.;OPOS=49299533;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:225:225:119:119:106:106:49:57:64:55:49:57:64:55 chr19 49300282 . AG A 207.27 PASS AO=34;DP=44;FAO=40;FDP=43;FR=.;FRO=3;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0832914;FXX=0.0227221;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.0717;QD=19.2813;RBI=0.108021;REFB=-0.051956;REVB=-0.0687834;RO=6;SAF=11;SAR=23;SRF=3;SRR=3;SSEN=0.677966;SSEP=0;SSSB=-0.0549217;STB=0.527259;TYPE=del;VARB=0.0401676;OID=.;OPOS=49300283;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:34:44:40:43:3:14:26:0:3:9:6:11:23:3:3 chr19 49303070 . G C 56.46 PASS AO=12;DP=31;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=15;FWDB=-0.0104578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.948;QD=6.84351;RBI=0.0271914;REFB=-0.0349513;REVB=0.0250999;RO=19;SAF=0;SAR=12;SRF=4;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.758791;STB=0.698561;TYPE=snp;VARB=0.061256;OID=.;OPOS=49303070;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:31:33:19:19:12:14:12:0:4:15:13:1:4:15 chr19 49334991 . C T 90.96 PASS AO=19;DP=39;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.0170109;FXX=0.0499875;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.814;QD=9.57523;RBI=0.0212341;REFB=-0.0296578;REVB=0.012709;RO=20;SAF=7;SAR=12;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0303562;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0393394;OID=.;OPOS=49334991;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:39:38:20:19:19:19:12:7:8:12:12:7:7:12 chr19 49339098 . T C 128.5 PASS AO=40;DP=105;FAO=40;FDP=105;FR=.;FRO=65;FSAF=35;FSAR=5;FSRF=38;FSRR=27;FWDB=-0.0623276;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.171;QD=4.89536;RBI=0.0625992;REFB=0.0315285;REVB=0.00582524;RO=65;SAF=35;SAR=5;SRF=38;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.435532;STB=0.754056;TYPE=snp;VARB=-0.0542241;OID=.;OPOS=49339098;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:65:65:40:40:5:35:38:27:5:35:38:27 chr19 49340782 . G C 43.19 PASS AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.0311392;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.034;QD=11.5176;RBI=0.0318171;REFB=-0.0374227;REVB=-0.00653287;RO=7;SAF=5;SAR=3;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0775671;STB=0.545344;TYPE=snp;VARB=0.041227;OID=.;OPOS=49340782;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:15:15:7:7:8:8:3:5:5:2:3:5:5:2 chr19 49368843 . T C 190.58 PASS AO=57;DP=144;FAO=58;FDP=146;FR=.;FRO=88;FSAF=21;FSAR=37;FSRF=37;FSRR=51;FWDB=-0.056853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.217;QD=5.22135;RBI=0.0569283;REFB=-0.0032609;REVB=0.00292678;RO=85;SAF=21;SAR=36;SRF=35;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0486655;STB=0.537293;TYPE=snp;VARB=0.00548599;OID=.;OPOS=49368843;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:146:85:88:57:58:36:21:35:50:37:21:37:51 chr19 49376584 . G A 170.62 PASS AO=40;DP=84;FAO=40;FDP=82;FR=.;FRO=42;FSAF=13;FSAR=27;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=0.00865373;FXX=0.0238067;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.646;QD=8.32277;RBI=0.0197148;REFB=-0.00877282;REVB=-0.0177141;RO=42;SAF=13;SAR=27;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148809;STB=0.583072;TYPE=snp;VARB=0.009382;OID=.;OPOS=49376584;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:82:42:42:40:40:27:13:20:22:27:13:20:22 chr19 49416456 . G A 156.86 PASS AO=30;DP=52;FAO=30;FDP=52;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.00858566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.537;QD=12.0662;RBI=0.0141419;REFB=-0.00318235;REVB=0.0112375;RO=22;SAF=12;SAR=18;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0430482;STB=0.523794;TYPE=snp;VARB=0.00309917;OID=.;OPOS=49416456;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:52:52:22:22:30:30:18:12:10:12:18:12:10:12 chr19 49421966 . T C 1267.06 PASS AO=131;DP=132;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00840532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.796;QD=38.107;RBI=0.00840656;REFB=0;REVB=-0.000144656;RO=1;SAF=76;SAR=55;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00856295;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.03792e-06;OID=.;OPOS=49421966;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:132:133:1:0:131:133:55:76:0:1:56:77:0:0 chr19 49438363 . G A 54.11 PASS AO=17;DP=55;FAO=18;FDP=54;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=25;FWDB=0.00672857;FXX=0.0357079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.166;QD=4.00842;RBI=0.00723192;REFB=-0.0123008;REVB=0.00265085;RO=38;SAF=9;SAR=8;SRF=13;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216025;STB=0.629495;TYPE=snp;VARB=0.0201641;OID=.;OPOS=49438363;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:55:54:38:36:17:18:8:9:13:25:9:9:11:25 chr19 49442933 . T C 348.69 PASS AO=90;DP=200;FAO=91;FDP=200;FR=.;FRO=109;FSAF=30;FSAR=61;FSRF=44;FSRR=65;FWDB=-0.0226843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.933;QD=6.97378;RBI=0.0240709;REFB=0.000699067;REVB=-0.00805181;RO=108;SAF=30;SAR=60;SRF=44;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0793818;STB=0.544239;TYPE=snp;VARB=-0.000840188;OID=.;OPOS=49442933;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:200:200:108:109:90:91:60:30:44:64:61:30:44:65 chr19 49445817 . T C 233.16 PASS AO=47;DP=88;FAO=48;FDP=89;FR=.;FRO=41;FSAF=5;FSAR=43;FSRF=12;FSRR=29;FWDB=-0.0434151;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.037;QD=10.479;RBI=0.0435423;REFB=-0.0281546;REVB=0.00332679;RO=40;SAF=5;SAR=42;SRF=11;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.275314;STB=0.669942;TYPE=snp;VARB=0.0293086;OID=.;OPOS=49445817;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:89:40:41:47:48:42:5:11:29:43:5:12:29 chr19 49469087 . T C 367.3 PASS AO=41;DP=43;FAO=42;FDP=44;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0161225;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.9261;QD=33.3907;RBI=0.0275037;REFB=-0.0520039;REVB=0.0222827;RO=2;SAF=25;SAR=16;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.055096;STB=0.527764;TYPE=snp;VARB=0.00153277;OID=.;OPOS=49469087;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:43:44:2:2:41:42:16:25:0:2:17:25:0:2 chr19 49485548 . G A 304.63 PASS AO=69;DP=132;FAO=68;FDP=132;FR=.;FRO=64;FSAF=29;FSAR=39;FSRF=29;FSRR=35;FWDB=0.00188233;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.8132;QD=9.23108;RBI=0.061573;REFB=0.0063817;REVB=0.0615442;RO=63;SAF=29;SAR=40;SRF=29;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0354437;STB=0.513154;TYPE=snp;VARB=-0.00651126;OID=.;OPOS=49485548;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:63:64:69:68:40:29:29:34:39:29:29:35 chr19 49513349 . C G 92.11 PASS AO=16;DP=26;FAO=16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.00549247;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=152.064;QD=14.1708;RBI=0.00830453;REFB=-0.0224354;REVB=-0.00622881;RO=10;SAF=5;SAR=11;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140152;STB=0.578845;TYPE=snp;VARB=0.00704659;OID=.;OPOS=49513349;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:26:26:10:10:16:16:11:5:5:5:11:5:5:5 chr19 49519058 . T C 487.2 PASS AO=130;DP=281;FAO=131;FDP=287;FR=.;FRO=156;FSAF=72;FSAR=59;FSRF=80;FSRR=76;FWDB=-0.0457411;FXX=0.0034721;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.2417;QD=6.7903;RBI=0.0689331;REFB=-0.008346;REVB=-0.0515706;RO=150;SAF=73;SAR=57;SRF=76;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0536477;STB=0.520117;TYPE=snp;VARB=0.0115091;OID=.;OPOS=49519058;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:281:287:150:156:130:131:57:73:76:74:59:72:80:76 chr19 49519466 . A G 28.39 PASS AO=9;DP=19;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=0.0202019;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.603;QD=5.97714;RBI=0.247929;REFB=-0.0309842;REVB=-0.247104;RO=10;SAF=3;SAR=6;SRF=9;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.475274;STB=0.69515;TYPE=snp;VARB=0.0665187;OID=.;OPOS=49519466;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:19:19:10:12:9:7:6:3:9:1:4:3:9:3 chr19 49520315 . T C 326.13 PASS AO=60;DP=98;FAO=60;FDP=98;FR=.;FRO=38;FSAF=39;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=12;FWDB=0.00396215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.622;QD=13.3114;RBI=0.022178;REFB=-0.0173531;REVB=0.0218212;RO=36;SAF=39;SAR=21;SRF=24;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0127023;STB=0.514701;TYPE=snp;VARB=0.00849638;OID=.;OPOS=49520315;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:36:38:60:60:21:39:24:12:21:39:26:12 chr19 49520372 . A T 275.11 PASS AO=50;DP=97;FAO=58;FDP=105;FR=.;FRO=47;FSAF=32;FSAR=26;FSRF=30;FSRR=17;FWDB=0.0206065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.088;QD=10.4802;RBI=0.0311207;REFB=-0.0377606;REVB=0.023321;RO=42;SAF=26;SAR=24;SRF=25;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0627749;STB=0.539478;TYPE=snp;VARB=0.0255017;OID=.;OPOS=49520372;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:105:42:47:50:58:24:26:25:17:26:32:30:17 chr19 49526191 . G A 128.07 PASS AO=25;DP=44;FAO=25;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0137469;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=75.0453;QD=11.6429;RBI=0.0296698;REFB=-0.0284593;REVB=0.026293;RO=19;SAF=5;SAR=20;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.309852;STB=0.674002;TYPE=snp;VARB=0.0495886;OID=.;OPOS=49526191;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:44:44:19:19:25:25:20:5:10:9:20:5:10:9 chr19 49526203 . G C 105.96 PASS AO=3;DP=34;FAO=17;FDP=29;FR=.,HEALED;FRO=12;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.000940282;FXX=0.0333222;HRUN=6;LEN=1;MLLD=146.475;QD=14.6152;RBI=0.0919172;REFB=-0.0214221;REVB=-0.0919124;RO=6;SAF=3;SAR=0;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.628663;TYPE=snp;VARB=-0.00642218;OID=.;OPOS=49526203;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:17:29:6:12:3:17:0:3:6:0:12:5:7:5 chr19 49547446 . G C 101.62 PASS AO=34;DP=98;FAO=35;FDP=99;FR=.;FRO=64;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=39;FSRR=25;FWDB=0.00907498;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.115;QD=4.10601;RBI=0.0177255;REFB=-0.0162791;REVB=0.0152263;RO=64;SAF=23;SAR=11;SRF=39;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0834348;STB=0.533523;TYPE=snp;VARB=0.0162147;OID=.;OPOS=49547446;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:99:64:64:34:35:11:23:39:25:12:23:39:25 chr19 49557572 . T C 15.06 PASS AO=8;DP=40;FAO=8;FDP=40;FR=.;FRO=32;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=24;FSRR=8;FWDB=-0.0102849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.049;QD=1.50575;RBI=0.0179079;REFB=-0.00403998;REVB=-0.01466;RO=32;SAF=5;SAR=3;SRF=24;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174283;STB=0.612423;TYPE=snp;VARB=0.0166684;OID=.;OPOS=49557572;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:40:40:32:32:8:8:3:5:24:8:3:5:24:8 chr19 49558667 . T C 79.87 PASS AO=31;DP=98;FAO=31;FDP=98;FR=.;FRO=67;FSAF=7;FSAR=24;FSRF=25;FSRR=42;FWDB=-0.0646322;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=106.652;QD=3.25989;RBI=0.0673475;REFB=-0.0471101;REVB=-0.0189305;RO=66;SAF=7;SAR=24;SRF=25;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216327;STB=0.624303;TYPE=snp;VARB=0.0747082;OID=.;OPOS=49558667;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:98:98:66:67:31:31:24:7:25:41:24:7:25:42 chr19 49559518 . C G 65.74 PASS AO=10;DP=14;FAO=10;FDP=14;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0834349;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.0249;QD=18.7832;RBI=0.123511;REFB=-0.0253197;REVB=-0.0910691;RO=4;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222789;STB=0.624776;TYPE=snp;VARB=0.0117545;OID=.;OPOS=49559518;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:14:14:4:4:10:10:6:4:0:4:6:4:0:4 chr19 49560461 . G A 163.77 PASS AO=20;DP=25;FAO=23;FDP=28;FR=.;FRO=5;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0896628;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.166;QD=23.3954;RBI=0.174549;REFB=0.0597812;REVB=0.149759;RO=5;SAF=6;SAR=14;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122967;STB=0.572967;TYPE=snp;VARB=-0.00530731;OID=.;OPOS=49560461;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:25:28:5:5:20:23:14:6:3:2:17:6:3:2 chr19 49573438 . A G 375.71 PASS AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0219047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.3602;QD=38.534;RBI=0.0571379;REFB=0;REVB=0.0527724;RO=0;SAF=8;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000822569;OID=.;OPOS=49573438;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:39:39:0:0:39:39:31:8:0:0:31:8:0:0 chr19 49574125 . G C 723.7 PASS AO=78;DP=80;FAO=78;FDP=80;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0999075;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.0843;QD=36.1849;RBI=0.10242;REFB=-0.160041;REVB=0.022546;RO=2;SAF=35;SAR=43;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00245095;STB=0.501295;TYPE=snp;VARB=0.00415242;OID=.;OPOS=49574125;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:80:80:2:2:78:78:43:35:1:1:43:35:1:1 chr19 49611684 . AGG AG,A 65.95 PASS AO=6,15;DP=65;FAO=21,0;FDP=37;FR=.;FRO=16;FSAF=19,0;FSAR=2,0;FSRF=0;FSRR=16;FWDB=-0.255627,-0.110499;FXX=0.0263089;HRUN=2,2;LEN=1,2;MLLD=16.3769,46.877;QD=7.13019;RBI=0.264129,0.112442;REFB=-0.0608475,-0.0197761;REVB=-0.0664754,-0.0208125;RO=15;SAF=3,15;SAR=3,0;SRF=0;SRR=15;SSEN=0,0;SSEP=0.429066,0.429066;SSSB=0.626553,0.874997;STB=0.899611,0.5;TYPE=del,del;VARB=-0.33434,0.205005;OID=.,.;OPOS=49611685,49611685;OREF=G,GG;OALT=-,-;OMAPALT=AG,A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:6,15:37:21,0:37:16:19,0:2,0:0:16:43:15:3,15:3,0:0:15 chr19 49621964 . T C 193.86 PASS AO=22;DP=23;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132558;FXX=0.0869187;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.03;QD=36.9259;RBI=0.0156348;REFB=0;REVB=0.00829039;RO=0;SAF=15;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.79751e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000149756;OID=.;OPOS=49621964;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:23:21:0:0:22:21:7:15:0:0:6:15:0:0 chr19 49640002 . G T 112.9 PASS AO=23;DP=49;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=20;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=0.00896954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.304;QD=8.85518;RBI=0.0244599;REFB=-0.0207157;REVB=-0.0227559;RO=26;SAF=19;SAR=4;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229517;STB=0.602061;TYPE=snp;VARB=0.023073;OID=.;OPOS=49640002;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:51:26:26:23:25:4:19:17:9:5:20:17:9 chr19 49657423 . A G 216.4 PASS AO=47;DP=142;FAO=66;FDP=161;FR=.;FRO=95;FSAF=33;FSAR=33;FSRF=49;FSRR=46;FWDB=-0.0044446;FXX=0.00617246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.075;QD=5.3764;RBI=0.0136219;REFB=-0.022441;REVB=0.0128764;RO=92;SAF=31;SAR=16;SRF=48;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165072;STB=0.509314;TYPE=snp;VARB=0.0311921;OID=.;OPOS=49657423;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:161:92:95:47:66:16:31:48:44:33:33:49:46 chr19 49658209 . A C 1518.62 PASS AO=157;DP=160;FAO=158;FDP=158;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00117987;FXX=0.0124992;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.314;QD=38.4461;RBI=0.0158714;REFB=0;REVB=0.0158275;RO=0;SAF=77;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.49368e-05;OID=.;OPOS=49658209;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:160:158:0:0:157:158:80:77:0:0:81:77:0:0 chr19 49658367 . C T 488.22 PASS AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00778332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.261;QD=37.5551;RBI=0.06697;REFB=0;REVB=0.0665162;RO=0;SAF=21;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.93989e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000274667;OID=.;OPOS=49658367;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:52:52:0:0:52:52:31:21:0:0:31:21:0:0 chr19 49658390 . T C 79.93 PASS AO=15;DP=33;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.00303946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.965;QD=9.40325;RBI=0.00313615;REFB=-0.0276511;REVB=0.000772753;RO=17;SAF=7;SAR=8;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0512395;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0308702;OID=.;OPOS=49658390;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:33:34:17:17:15:17:8:7:7:10:10:7:7:10 chr19 49671207 . G A 142.11 PASS AO=24;DP=37;FAO=24;FDP=37;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=0.081171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.498;QD=15.3636;RBI=0.0822871;REFB=0.0114514;REVB=0.0135072;RO=13;SAF=8;SAR=16;SRF=2;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135908;STB=0.57441;TYPE=snp;VARB=-0.000994171;OID=.;OPOS=49671207;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:37:37:13:13:24:24:16:8:2:11:16:8:2:11 chr19 49671212 . T G 142.11 PASS AO=24;DP=37;FAO=24;FDP=37;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=0.00683869;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=245.43;QD=15.3637;RBI=0.0210885;REFB=-0.034276;REVB=0.0199488;RO=13;SAF=8;SAR=16;SRF=2;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135908;STB=0.57441;TYPE=snp;VARB=0.016338;OID=.;OPOS=49671212;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:37:37:13:13:24:24:16:8:2:11:16:8:2:11 chr19 49671980 . G A 177.67 PASS AO=33;DP=55;FAO=33;FDP=55;FR=.;FRO=22;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0143083;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.894;QD=12.9215;RBI=0.0143273;REFB=-0.0173198;REVB=-0.00073744;RO=22;SAF=15;SAR=18;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0332166;STB=0.512134;TYPE=snp;VARB=0.0117838;OID=.;OPOS=49671980;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:55:55:22:22:33:33:18:15:11:11:17:16:10:12 chr19 49839015 . T C 12.52 PASS AO=3;DP=12;FAO=3;FDP=12;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.0219876;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.555;QD=4.1736;RBI=0.025229;REFB=-0.0135223;REVB=-0.0123711;RO=9;SAF=1;SAR=2;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145032;STB=0.599399;TYPE=snp;VARB=0.0373956;OID=.;OPOS=49839015;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:12:12:9:9:3:3:2:1:2:7:2:1:2:7 chr19 49850472 . TG T 77.55 PASS AO=37;DP=94;FAO=57;FDP=90;FR=.;FRO=33;FSAF=36;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=0.0332652;FXX=0.0217368;HRUN=8;LEN=1;MLLD=5.67839;QD=3.44673;RBI=0.0857939;REFB=-0.0238402;REVB=0.0790824;RO=30;SAF=25;SAR=12;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179358;STB=0.544769;TYPE=del;VARB=0.0603983;OID=.;OPOS=49850473;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:37:90:57:90:33:36:21:17:16:20:30:25:12:14:16 chr19 49867913 . G A 1414.62 PASS AO=146;DP=156;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0558309;FXX=0.0509522;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.5611;QD=37.9765;RBI=0.0633651;REFB=0;REVB=0.0299675;RO=0;SAF=84;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.04697e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000937478;OID=.;OPOS=49867913;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:156:149:0:0:146:149:62:84:0:0:63:86:0:0 chr19 49869051 . T G 197.06 PASS AO=51;DP=110;FAO=49;FDP=108;FR=.;FRO=59;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=21;FSRR=38;FWDB=0.0129516;FXX=0.0270246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.124;QD=7.29847;RBI=0.0410322;REFB=-0.00843423;REVB=-0.0389345;RO=59;SAF=24;SAR=27;SRF=21;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111862;STB=0.55189;TYPE=snp;VARB=0.013006;OID=.;OPOS=49869051;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:108:59:59:51:49:27:24:21:38:27:22:21:38 chr19 49878115 . G A 268.43 PASS AO=62;DP=125;FAO=62;FDP=124;FR=.;FRO=62;FSAF=36;FSAR=26;FSRF=31;FSRR=31;FWDB=-0.0417832;FXX=0.00799936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.474;QD=8.65909;RBI=0.0493817;REFB=-0.0155355;REVB=0.0263195;RO=62;SAF=36;SAR=26;SRF=31;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0739617;STB=0.540841;TYPE=snp;VARB=0.0201773;OID=.;OPOS=49878115;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:124:62:62:62:62:26:36:31:31:26:36:31:31 chr19 49878196 . G A 129.49 PASS AO=28;DP=72;FAO=34;FDP=78;FR=.;FRO=44;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=27;FSRR=17;FWDB=0.000294555;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.942;QD=6.64024;RBI=0.0617801;REFB=-0.0126942;REVB=0.0617794;RO=44;SAF=17;SAR=11;SRF=27;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00727548;STB=0.564065;TYPE=snp;VARB=0.0188798;OID=.;OPOS=49878196;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:78:44:44:28:34:11:17:27:17:17:17:27:17 chr19 49894152 . C T 770.44 PASS AO=87;DP=96;FAO=88;FDP=92;FR=.;FRO=4;FSAF=27;FSAR=61;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0325545;FXX=0.0416623;HRUN=3;LEN=1;MLLD=111.776;QD=33.4976;RBI=0.0416732;REFB=-0.129679;REVB=0.0260166;RO=3;SAF=26;SAR=61;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0515832;STB=0.522255;TYPE=snp;VARB=0.00104637;OID=.;OPOS=49894152;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:96:92:3:4:87:88:61:26:3:0:61:27:3:1 chr19 49899076 . G A 356.77 PASS AO=41;DP=43;FAO=41;FDP=43;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0613921;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.305;QD=33.1882;RBI=0.0654342;REFB=0.0100723;REVB=0.0226417;RO=2;SAF=15;SAR=26;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0347354;STB=0.51851;TYPE=snp;VARB=-0.000451895;OID=.;OPOS=49899076;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:43:43:2:2:41:41:26:15:0:2:26:15:0:2 chr19 49901318 . T C 514.85 PASS AO=56;DP=58;FAO=59;FDP=62;FR=.;FRO=3;FSAF=14;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0522629;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.782;QD=33.2158;RBI=0.0527093;REFB=-0.159946;REVB=0.00684563;RO=2;SAF=14;SAR=42;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0213992;STB=0.506374;TYPE=snp;VARB=0.00606086;OID=.;OPOS=49901318;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:58:62:2:3:56:59:42:14:1:1:45:14:1:2 chr19 49901346 . AG A 53.42 PASS AO=23;DP=55;FAO=27;FDP=49;FR=.;FRO=22;FSAF=2;FSAR=25;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.0233712;FXX=0.019996;HRUN=4;LEN=1;MLLD=13.3729;QD=4.36069;RBI=0.0636119;REFB=-0.0212564;REVB=0.059163;RO=22;SAF=2;SAR=21;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.50546;STB=0.818333;TYPE=del;VARB=0.0460856;OID=.;OPOS=49901347;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:23:50:27:49:22:2:25:11:11:52:22:2:21:10:12 chr19 49930721 . T C 961.95 PASS AO=99;DP=99;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0306011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.227;QD=37.7234;RBI=0.0306101;REFB=0;REVB=0.000740127;RO=0;SAF=30;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00104021;OID=.;OPOS=49930721;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:99:102:0:0:99:102:69:30:0:0:70:32:0:0 chr19 49930786 . C A 215.08 PASS AO=39;DP=63;FAO=39;FDP=63;FR=.;FRO=24;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=6;FSRR=18;FWDB=0.00150532;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=266.679;QD=13.656;RBI=0.0120692;REFB=-0.0259311;REVB=-0.0119749;RO=23;SAF=17;SAR=22;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123255;STB=0.57332;TYPE=snp;VARB=0.0162874;OID=.;OPOS=49930786;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:63:63:23:24:39:39:22:17:6:17:22:17:6:18 chr19 49932762 . G T 738.19 PASS AO=78;DP=80;FAO=78;FDP=79;FR=.;FRO=1;FSAF=62;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0313854;FXX=0.0124984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.1392;QD=37.3766;RBI=0.0332746;REFB=0.0324802;REVB=0.0110522;RO=1;SAF=62;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00757489;STB=0.503999;TYPE=snp;VARB=-0.000161363;OID=.;OPOS=49932762;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:80:79:1:1:78:78:16:62:1:0:16:62:1:0 chr19 49950298 . C T 948.32 PASS AO=102;DP=103;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0205603;FXX=0.0194156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.2743;QD=37.5572;RBI=0.0782177;REFB=0;REVB=0.0754671;RO=0;SAF=63;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000511117;OID=.;OPOS=49950298;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:103:101:0:0:102:101:39:63:0:0:39:62:0:0 chr19 49950355 . GC G,GG 807.65 PASS AO=49,30;DP=94;FAO=90,2;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=42,0;FSAR=48,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0837245,-0.219048;FXX=0.0107515;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=19.6664,8.77897;QD=35.1153;RBI=0.0915049,0.220101;REFB=0,0;REVB=0.0369236,-0.0215086;RO=0;SAF=8,26;SAR=41,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.276944,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.90022e-08,2.9955e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.00137422,0.0124795;OID=.,.;OPOS=49950356,49950356;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:49,30:89:90,2:92:0:42,0:48,2:0:0:20:0:8,26:41,4:0:0 chr19 49954803 . C T 532.85 PASS AO=58;DP=60;FAO=58;FDP=60;FR=.;FRO=2;FSAF=9;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.059597;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=206.838;QD=35.5235;RBI=0.0660045;REFB=-0.101419;REVB=0.0283688;RO=2;SAF=9;SAR=49;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0188679;STB=0.509997;TYPE=snp;VARB=0.000728087;OID=.;OPOS=49954803;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:60:60:2:2:58:58:49:9:0:2:49:9:0:2 chr19 49954807 . T G 578.5 PASS AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0445217;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.729;QD=36.1562;RBI=0.0476354;REFB=-0.0686212;REVB=0.0169395;RO=1;SAF=9;SAR=54;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0086669;STB=0.504586;TYPE=snp;VARB=0.00104685;OID=.;OPOS=49954807;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:64:64:1:1:63:63:54:9:0:1:54:9:0:1 chr19 49964977 . C G 243.17 PASS AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0891445;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.634;QD=37.411;RBI=0.0993666;REFB=0;REVB=0.0438975;RO=0;SAF=16;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000986693;OID=.;OPOS=49964977;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:25:26:0:0:25:26:9:16:0:0:10:16:0:0 chr19 49965173 . A T 35.02 PASS AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0236097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.309;QD=9.33876;RBI=0.0257007;REFB=-0.0244968;REVB=0.0101542;RO=8;SAF=6;SAR=1;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.561098;STB=0.838983;TYPE=snp;VARB=0.0200676;OID=.;OPOS=49965173;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:15:15:8:8:7:7:1:6:2:6:1:6:2:6 chr19 49967680 . G A 89.49 PASS AO=21;DP=49;FAO=22;FDP=50;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=-0.0656527;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.2149;QD=7.1588;RBI=0.0676971;REFB=-0.00101167;REVB=-0.016511;RO=26;SAF=8;SAR=13;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.261577;STB=0.63624;TYPE=snp;VARB=-0.0013669;OID=.;OPOS=49967680;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:49:50:26:28:21:22:13:8:17:9:14:8:17:11 chr19 49967981 . T G 13.89 PASS AO=7;DP=43;FAO=8;FDP=42;FR=.;FRO=34;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=26;FWDB=-0.0121106;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=288.162;QD=1.32293;RBI=0.0126451;REFB=-0.00166531;REVB=-0.00363755;RO=17;SAF=4;SAR=3;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112877;STB=0.787481;TYPE=snp;VARB=0.0124416;OID=.;OPOS=49967981;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:24:42:17:34:7:8:3:4:8:9:3:5:8:26 chr19 49969085 . C T 196.15 PASS AO=36;DP=61;FAO=36;FDP=60;FR=.;FRO=24;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.00665136;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.949;QD=13.0768;RBI=0.0113236;REFB=-0.0457797;REVB=-0.00916424;RO=24;SAF=21;SAR=15;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0314233;STB=0.517232;TYPE=snp;VARB=0.0260077;OID=.;OPOS=49969085;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:61:60:24:24:36:36:15:21:15:9:15:21:15:9 chr19 49993535 . C G 225.78 PASS AO=57;DP=127;FAO=58;FDP=128;FR=.;FRO=70;FSAF=40;FSAR=18;FSRF=41;FSRR=29;FWDB=0.0131815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.737;QD=7.05549;RBI=0.0231319;REFB=-0.0075811;REVB=-0.0190088;RO=70;SAF=39;SAR=18;SRF=41;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107287;STB=0.563189;TYPE=snp;VARB=0.0086466;OID=.;OPOS=49993535;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:128:70:70:57:58:18:39:41:29:18:40:41:29 chr19 50028163 . A G 223.92 PASS AO=56;DP=127;FAO=58;FDP=128;FR=.;FRO=70;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=40;FSRR=30;FWDB=-0.00509705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2579;QD=6.99742;RBI=0.0762171;REFB=-0.0231299;REVB=-0.0760465;RO=69;SAF=30;SAR=26;SRF=40;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0439256;STB=0.52972;TYPE=snp;VARB=0.0332062;OID=.;OPOS=50028163;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:128:69:70:56:58:26:30:40:29:28:30:40:30 chr19 50038017 . C T 88.2 PASS AO=17;DP=56;FAO=28;FDP=74;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=32;FWDB=0.0593679;FXX=0.0263123;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.438;QD=4.76768;RBI=0.0605139;REFB=-0.028765;REVB=0.0117209;RO=36;SAF=5;SAR=12;SRF=7;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149304;STB=0.681781;TYPE=snp;VARB=0.0446228;OID=.;OPOS=50038017;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:56:74:36:46:17:28:12:5:7:29:11:17:14:32 chr19 50101090 . G C 10.53 PASS AO=2;DP=6;FAO=2;FDP=6;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=31.6157;QD=7.02238;RBI=0.0508549;REFB=0.026688;REVB=-0.0508549;RO=3;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0594871;OID=.;OPOS=50101090;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:3:4:2:2:2:0:0:3:2:0:0:4 chr19 50156701 . G A 10.28 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=8;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.0217475;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.3357;QD=5.13901;RBI=0.0217475;REFB=-0.0198106;REVB=0;RO=5;SAF=2;SAR=0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.154228;OID=.;OPOS=50156701;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:8:5:6:2:2:0:2:5:0:0:2:6:0 chr19 50156896 . T C 195.16 PASS AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00107766;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.689;QD=37.1732;RBI=0.0317941;REFB=0;REVB=-0.0317758;RO=0;SAF=7;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00032393;OID=.;OPOS=50156896;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:21:21:0:0:21:21:14:7:0:0:14:7:0:0 chr19 50204843 . G A 110.78 PASS AO=23;DP=49;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=2;FSAR=22;FSRF=4;FSRR=20;FWDB=0.0204644;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=45.5373;QD=9.23135;RBI=0.123421;REFB=-0.0623998;REVB=0.121713;RO=23;SAF=2;SAR=21;SRF=4;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19482;STB=0.611003;TYPE=snp;VARB=0.0553656;OID=.;OPOS=50204843;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:49:48:23:24:23:24:21:2:4:19:22:2:4:20 chr19 50310012 . C CG 10.09 PASS AO=2;DP=8;FAO=3;FDP=7;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0285536;FXX=0.124844;HRUN=0;LEN=1;MLLD=36.5773;QD=5.76724;RBI=0.0285546;REFB=-0.0144497;REVB=-0.000241917;RO=4;SAF=2;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.151051;OID=.;OPOS=50310013;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:2:8:3:7:4:3:0:4:0:9:4:2:0:4:0 chr19 50354211 . C T 80.25 PASS AO=17;DP=39;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=1;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=22;FWDB=0.023938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.5721;QD=7.64272;RBI=0.0294552;REFB=-0.0224865;REVB=0.0171634;RO=22;SAF=1;SAR=16;SRF=1;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0635125;STB=0.526289;TYPE=snp;VARB=0.0235724;OID=.;OPOS=50354211;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:39:42:22:23:17:19:16:1:1:21:18:1:1:22 chr19 50360989 . A G 69.37 PASS AO=18;DP=47;FAO=19;FDP=48;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.00508212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.4931;QD=5.78074;RBI=0.0414886;REFB=0.0111452;REVB=-0.0411761;RO=27;SAF=9;SAR=9;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134803;STB=0.567615;TYPE=snp;VARB=-0.026556;OID=.;OPOS=50360989;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:47:48:27:29:18:19:9:9:17:10:10:9:17:12 chr19 50365683 . T C 14.26 PASS AO=4;DP=16;FAO=4;FDP=16;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=0;FSRF=12;FSRR=0;FWDB=-0.0646736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.282;QD=3.56425;RBI=0.0646736;REFB=0.00671893;REVB=0;RO=12;SAF=4;SAR=0;SRF=12;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0442179;OID=.;OPOS=50365683;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:16:16:12:12:4:4:0:4:12:0:0:4:12:0 chr19 50383591 . A G 1237.83 PASS AO=129;DP=129;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0352987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.194;QD=38.0871;RBI=0.0495565;REFB=0;REVB=-0.0347828;RO=0;SAF=35;SAR=94;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.51174e-05;OID=.;OPOS=50383591;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:129:130:0:0:129:130:94:35:0:0:94:36:0:0 chr19 50404939 . T G 186.15 PASS AO=47;DP=103;FAO=47;FDP=103;FR=.;FRO=56;FSAF=5;FSAR=42;FSRF=5;FSRR=51;FWDB=0.0424186;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=86.8347;QD=7.22926;RBI=0.052116;REFB=-0.0041019;REVB=-0.0302777;RO=56;SAF=5;SAR=42;SRF=5;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0457219;STB=0.525413;TYPE=snp;VARB=0.00433559;OID=.;OPOS=50404939;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:56:56:47:47:42:5:5:51:42:5:5:51 chr19 50411742 . A G 919.02 PASS AO=96;DP=97;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00278548;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.226;QD=38.2924;RBI=0.0102275;REFB=0;REVB=0.0098409;RO=0;SAF=37;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.78952e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.9696e-05;OID=.;OPOS=50411742;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:97:96:0:0:96:96:59:37:0:0:59:37:0:0 chr19 50412217 . C G 86.76 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00662154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.185;QD=38.5593;RBI=0.00662154;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=9;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000112253;OID=.;OPOS=50412217;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:0:9:0:0:0:9:0:0 chr19 50412417 . G A 353.25 PASS AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.047675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.2437;QD=36.2303;RBI=0.1129;REFB=-0.128464;REVB=0.10234;RO=1;SAF=12;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0176841;STB=0.509429;TYPE=snp;VARB=0.00628419;OID=.;OPOS=50412417;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:39:39:1:1:38:38:26:12:0:1:26:12:0:1 chr19 50435747 . T C 64.71 PASS AO=11;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=0;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=12;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.8904;QD=10.3543;RBI=0.0204693;REFB=-0.011346;REVB=-0.0204693;RO=14;SAF=0;SAR=11;SRF=0;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00458489;OID=.;OPOS=50435747;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:25:25:14:12:11:13:11:0:0:14:13:0:0:12 chr19 50453317 . C T 148.92 PASS AO=42;DP=102;FAO=42;FDP=102;FR=.;FRO=60;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=17;FSRR=43;FWDB=-0.0184449;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.129;QD=5.84009;RBI=0.0200816;REFB=-0.0337398;REVB=0.00794086;RO=60;SAF=15;SAR=27;SRF=17;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0863791;STB=0.548567;TYPE=snp;VARB=0.0399018;OID=.;OPOS=50453317;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:60:60:42:42:27:15:17:43:27:15:17:43 chr19 50462298 . G C 75.58 PASS AO=23;DP=63;FAO=23;FDP=63;FR=.;FRO=40;FSAF=4;FSAR=19;FSRF=2;FSRR=38;FWDB=0.015046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.877;QD=4.79855;RBI=0.0172383;REFB=-0.00923634;REVB=-0.00841295;RO=38;SAF=4;SAR=19;SRF=2;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.284423;STB=0.66656;TYPE=snp;VARB=0.0196426;OID=.;OPOS=50462298;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:63:63:38:40:23:23:19:4:2:36:19:4:2:38 chr19 50463982 . T G 155.82 PASS AO=35;DP=71;FAO=35;FDP=71;FR=.;FRO=36;FSAF=25;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.0110492;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=226.109;QD=8.77878;RBI=0.0116894;REFB=-0.00405921;REVB=-0.00381535;RO=35;SAF=25;SAR=10;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198017;STB=0.619397;TYPE=snp;VARB=0.00384691;OID=.;OPOS=50463982;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:35:36:35:35:10:25:18:17:10:25:18:18 chr19 50475114 . G C 91.87 PASS AO=20;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.0316696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.7924;QD=8.35192;RBI=0.0382625;REFB=0.0030675;REVB=-0.0214722;RO=24;SAF=8;SAR=12;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165484;STB=0.519981;TYPE=snp;VARB=-0.00410947;OID=.;OPOS=50475114;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:44:44:24:23:20:21:12:8:10:14:12:9:9:14 chr19 50475208 . C T 22.51 PASS AO=4;DP=19;FAO=4;FDP=18;FR=.,HEALED;FRO=12;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0121205;FXX=0.0526039;HRUN=3;LEN=1;MLLD=115.903;QD=5.00199;RBI=0.0771397;REFB=-0.00553927;REVB=0.0761815;RO=7;SAF=2;SAR=2;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0699385;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00758011;OID=.;OPOS=50475208;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:19:18:7:12:4:4:2:2:3:4:2:2:6:6 chr19 50475259 . G C 29.18 PASS AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.00176724;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.1;QD=7.78102;RBI=0.00392921;REFB=-0.0160005;REVB=0.00350935;RO=8;SAF=3;SAR=3;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116777;STB=0.533223;TYPE=snp;VARB=0.0279132;OID=.;OPOS=50475259;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:15:15:8:9:6:6:3:3:5:3:3:3:5:4 chr19 50479999 . A G 499.19 PASS AO=96;DP=165;FAO=97;FDP=166;FR=.;FRO=69;FSAF=37;FSAR=60;FSRF=27;FSRR=42;FWDB=-0.029042;FXX=0.0292381;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.677;QD=12.0288;RBI=0.0314358;REFB=-0.0171519;REVB=-0.0120322;RO=67;SAF=36;SAR=60;SRF=26;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0105156;STB=0.504333;TYPE=snp;VARB=0.0142795;OID=.;OPOS=50479999;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:166:67:69:96:97:60:36:26:41:60:37:27:42 chr19 50562372 . T C 173.11 PASS AO=47;DP=110;FAO=47;FDP=110;FR=.;FRO=63;FSAF=37;FSAR=10;FSRF=28;FSRR=35;FWDB=0.00436189;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.54;QD=6.29487;RBI=0.00468333;REFB=0.00270103;REVB=-0.00170514;RO=63;SAF=37;SAR=10;SRF=28;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.386792;STB=0.719122;TYPE=snp;VARB=-0.00495462;OID=.;OPOS=50562372;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:63:63:47:47:10:37:28:35:10:37:28:35 chr19 50562459 . T G 72.88 PASS AO=34;DP=116;FAO=33;FDP=116;FR=.;FRO=83;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=49;FSRR=34;FWDB=-0.0404969;FXX=0.00854628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.1573;QD=2.51313;RBI=0.0420033;REFB=-0.0157112;REVB=0.011148;RO=82;SAF=20;SAR=14;SRF=48;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00354842;STB=0.510723;TYPE=snp;VARB=0.0389136;OID=.;OPOS=50562459;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:116:116:82:83:34:33:14:20:48:34:14:19:49:34 chr19 50665984 . C G 112.36 PASS AO=31;DP=75;FAO=31;FDP=75;FR=.;FRO=44;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=19;FWDB=-0.027868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.933;QD=5.99231;RBI=0.0478017;REFB=-0.0269301;REVB=0.0388378;RO=44;SAF=18;SAR=13;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0131813;STB=0.507484;TYPE=snp;VARB=0.0207686;OID=.;OPOS=50665984;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:44:44:31:31:13:18:25:19:13:18:25:19 chr19 50666389 . G A 68.23 PASS AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.031128;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.027;QD=30.326;RBI=0.031128;REFB=-0.0380242;REVB=0;RO=1;SAF=8;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00101914;OID=.;OPOS=50666389;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:9:9:1:1:8:8:0:8:1:0:0:8:1:0 chr19 50726319 . C G 183.92 PASS AO=59;DP=157;FAO=59;FDP=156;FR=.;FRO=97;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=48;FSRR=49;FWDB=-0.00318385;FXX=0.0188667;HRUN=5;LEN=1;MLLD=183.195;QD=4.71595;RBI=0.010762;REFB=-0.00575071;REVB=-0.0102802;RO=96;SAF=28;SAR=31;SRF=48;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0278148;STB=0.512615;TYPE=snp;VARB=0.0107379;OID=.;OPOS=50726319;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:156:96:97:59:59:31:28:48:48:31:28:48:49 chr19 50726570 . G A 175.87 PASS AO=40;DP=80;FAO=40;FDP=81;FR=.;FRO=41;FSAF=11;FSAR=29;FSRF=5;FSRR=36;FWDB=0.0104611;FXX=0.0240935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.1655;QD=8.68488;RBI=0.0299645;REFB=-0.0181379;REVB=0.0280791;RO=40;SAF=11;SAR=29;SRF=5;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18724;STB=0.6064;TYPE=snp;VARB=0.0199602;OID=.;OPOS=50726570;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:81:40:41:40:40:29:11:5:35:29:11:5:36 chr19 50760716 . C G 35.26 PASS AO=11;DP=34;FAO=11;FDP=34;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=0.00829724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.5392;QD=4.148;RBI=0.0690788;REFB=-0.0245656;REVB=-0.0685787;RO=22;SAF=6;SAR=5;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155754;STB=0.604217;TYPE=snp;VARB=0.0326024;OID=.;OPOS=50760716;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:34:34:22:23:11:11:5:6:15:7:5:6:16:7 chr19 50762418 . A G 158.9 PASS AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.23;QD=37.3891;RBI=0.0365967;REFB=0;REVB=0.0307079;RO=0;SAF=12;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000752378;OID=.;OPOS=50762418;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:17:17:0:0:17:17:5:12:0:0:5:12:0:0 chr19 50763889 . C T 154.29 PASS AO=34;DP=67;FAO=34;FDP=67;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=0.012146;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=247.794;QD=9.21103;RBI=0.0143597;REFB=-0.00717325;REVB=0.00766012;RO=33;SAF=12;SAR=22;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0191253;STB=0.510632;TYPE=snp;VARB=0.00572979;OID=.;OPOS=50763889;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:33:33:34:34:22:12:11:22:22:12:11:22 chr19 50771609 . G A 173.85 PASS AO=32;DP=55;FAO=32;FDP=53;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.0147535;FXX=0.036357;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.892;QD=13.1207;RBI=0.0755099;REFB=-0.0378499;REVB=0.0740546;RO=21;SAF=10;SAR=22;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198502;STB=0.609501;TYPE=snp;VARB=0.0195435;OID=.;OPOS=50771609;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:55:53:21:21:32:32:22:10:12:9:22:10:12:9 chr19 50796905 . G A 533.85 PASS AO=62;DP=67;FAO=62;FDP=67;FR=.;FRO=5;FSAF=33;FSAR=29;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0535274;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.866;QD=31.8715;RBI=0.0622004;REFB=-0.202655;REVB=0.0316814;RO=2;SAF=33;SAR=29;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0277544;STB=0.5352;TYPE=snp;VARB=0.0031683;OID=.;OPOS=50796905;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:67:67:2:5:62:62:29:33:2:0:29:33:5:0 chr19 50818206 . T C 16.26 PASS AO=4;DP=14;FAO=4;FDP=14;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=0;FSRF=10;FSRR=0;FWDB=-0.013429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=316.455;QD=4.64557;RBI=0.013429;REFB=0.00492699;REVB=0;RO=10;SAF=4;SAR=0;SRF=10;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0615032;OID=.;OPOS=50818206;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:14:14:10:10:4:4:0:4:10:0:0:4:10:0 chr19 50818228 . G A 86.76 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.136233;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.81;QD=38.5593;RBI=0.136233;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=9;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00175403;OID=.;OPOS=50818228;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:0:9:0:0:0:9:0:0 chr19 50918703 . AG A 289.76 PASS AO=40;DP=49;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.039373;FXX=0.020404;HRUN=3;LEN=1;MLLD=17.7211;QD=24.1468;RBI=0.208828;REFB=0;REVB=0.205083;RO=6;SAF=27;SAR=13;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0.327103;SSSB=0.174499;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0071325;OID=.;OPOS=50918704;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:40:49:48:48:0:27:21:0:0:25:6:27:13:0:6 chr19 50926264 . T C 574.72 PASS AO=55;DP=56;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0336524;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.229;QD=35.9201;RBI=0.064708;REFB=-0.159103;REVB=0.0552688;RO=0;SAF=45;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.71233e-08;STB=0.50476;TYPE=snp;VARB=0.000494286;OID=.;OPOS=50926264;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:56:64:0:1:55:63:10:45:0:0:11:52:1:0 chr19 50926265 . G C 145.69 PASS AO=33;DP=67;FAO=34;FDP=67;FR=.;FRO=33;FSAF=27;FSAR=7;FSRF=29;FSRR=4;FWDB=0.0382384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.926;QD=8.69812;RBI=0.0625016;REFB=-0.0240268;REVB=0.0494396;RO=32;SAF=26;SAR=7;SRF=29;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176403;STB=0.568904;TYPE=snp;VARB=0.0240796;OID=.;OPOS=50926265;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:32:33:33:34:7:26:29:3:7:27:29:4 chr19 50936265 . G C 218.77 PASS AO=47;DP=87;FAO=46;FDP=85;FR=.;FRO=39;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=27;FSRR=12;FWDB=0.0147249;FXX=0.0229859;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.5979;QD=10.2952;RBI=0.0400546;REFB=0.0105994;REVB=0.0372498;RO=37;SAF=20;SAR=27;SRF=25;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19878;STB=0.62627;TYPE=snp;VARB=-0.00677575;OID=.;OPOS=50936265;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:85:37:39:47:46:27:20:25:12:27:19:27:12 chr19 50951640 . G A 237.57 PASS AO=61;DP=136;FAO=61;FDP=134;FR=.;FRO=73;FSAF=15;FSAR=46;FSRF=23;FSRR=50;FWDB=0.0100504;FXX=0.0147048;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.825;QD=7.09165;RBI=0.0120271;REFB=-0.0195711;REVB=0.00660607;RO=73;SAF=15;SAR=46;SRF=23;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.086419;STB=0.54829;TYPE=snp;VARB=0.0218695;OID=.;OPOS=50951640;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:134:73:73:61:61:46:15:23:50:46:15:23:50 chr19 50963328 . G A 187.65 PASS AO=39;DP=82;FAO=43;FDP=86;FR=.;FRO=43;FSAF=35;FSAR=8;FSRF=34;FSRR=9;FWDB=-0.00511305;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.62;QD=8.72768;RBI=0.0267464;REFB=-0.0111826;REVB=0.0262531;RO=41;SAF=32;SAR=7;SRF=33;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239616;STB=0.518736;TYPE=snp;VARB=0.0150119;OID=.;OPOS=50963328;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:86:41:43:39:43:7:32:33:8:8:35:34:9 chr19 50965272 . T C 677.64 PASS AO=71;DP=71;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00287562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7872;QD=37.6469;RBI=0.0310454;REFB=0;REVB=0.0309119;RO=0;SAF=30;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21646e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00027585;OID=.;OPOS=50965272;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:71:72:0:0:71:72:41:30:0:0:42:30:0:0 chr19 50983377 . GC G 60.58 PASS AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=3;FWDB=-0.0145267;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=21.2109;QD=5.50772;RBI=0.0941273;REFB=-0.0251124;REVB=-0.0929996;RO=23;SAF=6;SAR=15;SRF=20;SRR=3;SSEN=0.315111;SSEP=0;SSSB=-0.505894;STB=0.78289;TYPE=del;VARB=0.0176673;OID=.;OPOS=50983378;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:21:44:21:44:23:6:15:20:3:60:23:6:15:20:3 chr19 51009431 . C T 53.81 PASS AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.000178808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.111;QD=23.9158;RBI=0.0430539;REFB=-0.0250461;REVB=0.0430535;RO=2;SAF=6;SAR=1;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125389;STB=0.571243;TYPE=snp;VARB=0.0153323;OID=.;OPOS=51009431;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:2:2:7:7:1:6:2:0:1:6:2:0 chr19 51009643 . G A 40.84 PASS AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.0308292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.314;QD=6.53516;RBI=0.0332895;REFB=0.00376092;REVB=0.0125597;RO=15;SAF=8;SAR=2;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.480118;STB=0.786298;TYPE=snp;VARB=-0.00293557;OID=.;OPOS=51009643;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:25:25:15:15:10:10:2:8:5:10:2:8:5:10 chr19 51128661 . T C 243.17 PASS AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0274022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.194;QD=37.4112;RBI=0.0577171;REFB=0;REVB=0.0507975;RO=0;SAF=22;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.50493e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000851497;OID=.;OPOS=51128661;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:26:26:0:0:26:26:4:22:0:0:4:22:0:0 chr19 51133356 . C G 84.1 PASS AO=10;DP=11;FAO=10;FDP=11;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0478212;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.0703;QD=30.5811;RBI=0.0775497;REFB=-0.0376961;REVB=0.0610499;RO=1;SAF=6;SAR=4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0687795;STB=0.538386;TYPE=snp;VARB=0.0445639;OID=.;OPOS=51133356;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:11:11:1:1:10:10:4:6:1:0:4:6:1:0 chr19 51140603 . C T 27.21 PASS AO=11;DP=41;FAO=11;FDP=42;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=22;FSRR=9;FWDB=-0.00832812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.0461;QD=2.59125;RBI=0.0321816;REFB=-0.0152511;REVB=-0.0310853;RO=30;SAF=7;SAR=4;SRF=22;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130574;STB=0.560282;TYPE=snp;VARB=0.0423771;OID=.;OPOS=51140603;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:41:42:30:31:11:11:4:7:22:8:4:7:22:9 chr19 51159571 . T G 417.57 PASS AO=55;DP=65;FAO=55;FDP=65;FR=.;FRO=10;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=9;FSRR=1;FWDB=0.0144065;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.499;QD=25.6968;RBI=0.018597;REFB=-0.0381929;REVB=-0.0117602;RO=10;SAF=25;SAR=30;SRF=9;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127811;STB=0.56822;TYPE=snp;VARB=0.00501496;OID=.;OPOS=51159571;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:65:65:10:10:55:55:30:25:9:1:30:25:9:1 chr19 51207700 . G A 44.54 PASS AO=15;DP=50;FAO=16;FDP=53;FR=.;FRO=37;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=30;FWDB=0.0373618;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=26.902;QD=3.36142;RBI=0.0375139;REFB=-0.0303054;REVB=-0.00337514;RO=35;SAF=3;SAR=12;SRF=5;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113954;STB=0.501928;TYPE=snp;VARB=0.0584989;OID=.;OPOS=51207700;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:50:53:35:37:15:16:12:3:5:30:13:3:7:30 chr19 51207775 . C T 51.7 PASS AO=18;DP=58;FAO=18;FDP=56;FR=.;FRO=38;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=33;FWDB=0.0672548;FXX=0.0344768;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.6699;QD=3.69317;RBI=0.0792832;REFB=0.00683834;REVB=-0.0419835;RO=38;SAF=4;SAR=14;SRF=5;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170074;STB=0.598631;TYPE=snp;VARB=-0.0135874;OID=.;OPOS=51207775;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:58:56:38:38:18:18:14:4:5:33:14:4:5:33 chr19 51217550 . G A 488.5 PASS AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0335132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.086;QD=37.5768;RBI=0.0598104;REFB=0;REVB=0.0495394;RO=0;SAF=9;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000238976;OID=.;OPOS=51217550;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:51:52:0:0:51:52:42:9:0:0:43:9:0:0 chr19 51323232 . T C 185.65 PASS AO=37;DP=68;FAO=37;FDP=67;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=0.00491012;FXX=0.0147037;HRUN=6;LEN=1;MLLD=115.567;QD=11.0834;RBI=0.00494531;REFB=-0.00855897;REVB=-0.000588877;RO=29;SAF=17;SAR=20;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00897864;STB=0.511792;TYPE=snp;VARB=0.00626718;OID=.;OPOS=51323232;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:67:29:30:37:37:20:17:13:16:20:17:13:17 chr19 51323473 . C G 110.22 PASS AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.00550332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.27;QD=9.18464;RBI=0.00562963;REFB=-0.00418464;REVB=-0.00118584;RO=24;SAF=16;SAR=8;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.262766;STB=0.647763;TYPE=snp;VARB=0.00898287;OID=.;OPOS=51323473;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:24:24:24:24:8:16:9:15:8:16:9:15 chr19 51323501 . A G 145.91 PASS AO=33;DP=68;FAO=33;FDP=67;FR=.;FRO=34;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=-0.0110666;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.111;QD=8.71081;RBI=0.0379533;REFB=-0.0255589;REVB=-0.036304;RO=34;SAF=20;SAR=13;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202755;STB=0.613097;TYPE=snp;VARB=0.0323826;OID=.;OPOS=51323501;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:67:34:34:33:33:13:20:13:21:13:20:13:21 chr19 51330932 . G T 48.48 PASS AO=13;DP=34;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=4;FWDB=-0.00307031;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=241.324;QD=5.70341;RBI=0.0286393;REFB=-0.020499;REVB=-0.0284742;RO=21;SAF=7;SAR=6;SRF=17;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.299723;STB=0.672669;TYPE=snp;VARB=0.0374851;OID=.;OPOS=51330932;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:34:34:21:21:13:13:6:7:17:4:6:7:17:4 chr19 51379893 . C T 1491.43 PASS AO=159;DP=161;FAO=160;FDP=160;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=131;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00304037;FXX=0.0123449;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6249;QD=37.2857;RBI=0.073371;REFB=-0.0357137;REVB=0.0733079;RO=2;SAF=29;SAR=130;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00726372;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00111676;OID=.;OPOS=51379893;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:161:160:2:0:159:160:130:29:0:2:131:29:0:0 chr19 51381777 . C T 328.12 PASS AO=76;DP=152;FAO=76;FDP=152;FR=.;FRO=76;FSAF=33;FSAR=43;FSRF=29;FSRR=47;FWDB=0.00773675;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.849;QD=8.63477;RBI=0.011662;REFB=-0.00694977;REVB=0.00872611;RO=75;SAF=33;SAR=43;SRF=28;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0564093;STB=0.526962;TYPE=snp;VARB=0.0062244;OID=.;OPOS=51381777;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:152:75:76:76:76:43:33:28:47:43:33:29:47 chr19 51411636 . G T 722.09 PASS AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0393709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.057;QD=38.0049;RBI=0.0401254;REFB=0;REVB=0.00774466;RO=0;SAF=30;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000128955;OID=.;OPOS=51411636;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:76:76:0:0:76:76:46:30:0:0:46:30:0:0 chr19 51412666 . C A 75.09 PASS AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=14;FWDB=0.0458577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.2402;QD=10.3571;RBI=0.0513944;REFB=-0.0122894;REVB=0.0232046;RO=14;SAF=3;SAR=12;SRF=0;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.335262;STB=0.684035;TYPE=snp;VARB=0.0111368;OID=.;OPOS=51412666;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:29:29:14:14:15:15:12:3:0:14:12:3:0:14 chr19 51452250 . T C 1529.49 PASS AO=162;DP=164;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0193933;FXX=0.0121944;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.687;QD=37.7651;RBI=0.0308752;REFB=-0.0652902;REVB=0.0240245;RO=1;SAF=87;SAR=75;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00543825;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00011906;OID=.;OPOS=51452250;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:164:162:1:0:162:162:75:87:1:0:75:87:0:0 chr19 51485622 . A G 2241.16 PASS AO=254;DP=262;FAO=253;FDP=264;FR=.;FRO=11;FSAF=129;FSAR=124;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=-0.036075;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8713;QD=33.9569;RBI=0.06157;REFB=-0.0036888;REVB=-0.0498945;RO=8;SAF=130;SAR=124;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00658721;STB=0.509064;TYPE=snp;VARB=0.000288937;OID=.;OPOS=51485622;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:262:264:8:11:254:253:124:130:5:3:124:129:8:3 chr19 51487175 . T G 181.27 PASS AO=15;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0684603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.392;QD=36.2532;RBI=0.0744257;REFB=0;REVB=-0.0291953;RO=0;SAF=0;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000820572;OID=.;OPOS=51487175;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:20:20:0:0:15:20:15:0:0:0:16:4:0:0 chr19 51487176 . C G 15.91 PASS AO=5;DP=20;FAO=5;FDP=20;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=15;FWDB=0.0180891;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.3924;QD=3.18289;RBI=0.0339779;REFB=-0.0173515;REVB=0.0287625;RO=15;SAF=4;SAR=1;SRF=0;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.762704;STB=0.940343;TYPE=snp;VARB=0.0592571;OID=.;OPOS=51487176;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:20:20:15:15:5:5:1:4:0:15:1:4:0:15 chr19 51507020 . T G 162.89 PASS AO=56;DP=158;FAO=58;FDP=165;FR=.;FRO=107;FSAF=32;FSAR=26;FSRF=48;FSRR=59;FWDB=-0.0139006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.7587;QD=3.94893;RBI=0.030455;REFB=-0.00958262;REVB=-0.0270976;RO=101;SAF=31;SAR=25;SRF=43;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143302;STB=0.566644;TYPE=snp;VARB=0.0290506;OID=.;OPOS=51507020;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:165:101:107:56:58:25:31:43:58:26:32:48:59 chr19 51517731 . A G 248.47 PASS AO=64;DP=154;FAO=69;FDP=159;FR=.;FRO=90;FSAF=56;FSAR=13;FSRF=62;FSRR=28;FWDB=-0.0125411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.272;QD=6.25088;RBI=0.0221348;REFB=-0.012353;REVB=-0.0182392;RO=87;SAF=55;SAR=9;SRF=61;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260496;STB=0.599446;TYPE=snp;VARB=0.0151696;OID=.;OPOS=51517731;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:159:87:90:64:69:9:55:61:26:13:56:62:28 chr19 51519236 . A G 39.29 PASS AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=0.0137996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.149;QD=9.24564;RBI=0.0258159;REFB=-0.00224417;REVB=-0.0218182;RO=8;SAF=1;SAR=7;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517199;TYPE=snp;VARB=0.00281547;OID=.;OPOS=51519236;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:16:17:8:9:8:8:7:1:1:7:7:1:1:8 chr19 51519259 . C T 67.3 PASS AO=13;DP=24;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=10;FWDB=0.0416025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.095;QD=11.2163;RBI=0.042277;REFB=-0.0252258;REVB=-0.00752145;RO=11;SAF=6;SAR=7;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.3128;STB=0.675266;TYPE=snp;VARB=0.0228723;OID=.;OPOS=51519259;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:24:24:11:11:13:13:7:6:1:10:7:6:1:10 chr19 51519346 . G C 62.84 PASS AO=12;DP=28;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=0.0443607;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.012;QD=8.10775;RBI=0.0486597;REFB=-0.029625;REVB=0.0199973;RO=16;SAF=2;SAR=10;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129746;STB=0.516754;TYPE=snp;VARB=0.0288794;OID=.;OPOS=51519346;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:28:31:16:17:12:14:10:2:4:12:11:3:4:13 chr19 51519364 . T G 74.08 PASS AO=9;DP=22;FAO=12;FDP=23;FR=.,HEALED;FRO=9;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=-0.0670159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.041;QD=12.8841;RBI=0.119271;REFB=-0.0190855;REVB=-0.0986638;RO=9;SAF=4;SAR=5;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198782;STB=0.555467;TYPE=snp;VARB=-0.00591073;OID=.;OPOS=51519364;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:23:23:9:9:9:12:5:4:2:7:8:4:2:7 chr19 51520487 . A C 44.04 PASS AO=15;DP=47;FAO=15;FDP=47;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=26;FSRR=6;FWDB=-0.0160225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.2271;QD=3.74773;RBI=0.0172251;REFB=-0.0421817;REVB=0.00632333;RO=32;SAF=7;SAR=8;SRF=26;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.395574;STB=0.729033;TYPE=snp;VARB=0.0266825;OID=.;OPOS=51520487;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:47:47:32:32:15:15:8:7:26:6:8:7:26:6 chr19 51530693 . G A 822.69 PASS AO=86;DP=87;FAO=87;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=61;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0395039;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.063;QD=37.3951;RBI=0.0520943;REFB=-0.00279938;REVB=0.0339596;RO=0;SAF=26;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509432;TYPE=snp;VARB=0.000243098;OID=.;OPOS=51530693;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:87:88:0:1:86:87:60:26:0:0:61:26:1:0 chr19 51535130 . A G 53.81 PASS AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.022557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.68;QD=23.916;RBI=0.0470916;REFB=-0.0534015;REVB=-0.0413377;RO=2;SAF=3;SAR=4;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0278747;STB=0.516083;TYPE=snp;VARB=0.0178114;OID=.;OPOS=51535130;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:2:2:7:7:4:3:1:1:4:3:1:1 chr19 51566943 . G A 512.79 PASS AO=97;DP=161;FAO=97;FDP=161;FR=.;FRO=64;FSAF=47;FSAR=50;FSRF=35;FSRR=29;FWDB=0.0225082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.2353;QD=12.7402;RBI=0.0302559;REFB=0.0195629;REVB=-0.0202189;RO=60;SAF=47;SAR=50;SRF=31;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0227016;STB=0.524761;TYPE=snp;VARB=-0.00892684;OID=.;OPOS=51566943;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:161:60:64:97:97:50:47:31:29:50:47:35:29 chr19 51584916 . G A 96.17 PASS AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=51;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=0.0140771;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.965;QD=7.54303;RBI=0.062698;REFB=-0.00220932;REVB=0.0610972;RO=28;SAF=13;SAR=10;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131848;STB=0.574765;TYPE=snp;VARB=0.00281296;OID=.;OPOS=51584916;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:51:51:28:28:23:23:10:13:12:16:10:13:12:16 chr19 51584951 . T C 107.12 PASS AO=26;DP=57;FAO=26;FDP=57;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.00540894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.8227;QD=7.517;RBI=0.0297289;REFB=-0.00155981;REVB=-0.0292327;RO=31;SAF=14;SAR=12;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0834687;STB=0.547134;TYPE=snp;VARB=0.000679321;OID=.;OPOS=51584951;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:31:31:26:26:12:14:14:17:12:14:14:17 chr19 51628529 . A G 231.52 PASS AO=59;DP=131;FAO=60;FDP=133;FR=.;FRO=73;FSAF=35;FSAR=25;FSRF=31;FSRR=42;FWDB=0.0208294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.79;QD=6.96303;RBI=0.0208296;REFB=-0.00590262;REVB=0.000106727;RO=72;SAF=35;SAR=24;SRF=31;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160608;STB=0.586955;TYPE=snp;VARB=0.00380639;OID=.;OPOS=51628529;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:133:72:73:59:60:24:35:31:41:25:35:31:42 chr19 51630482 . C A 94.18 PASS AO=22;DP=54;FAO=24;FDP=55;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.0473711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.955;QD=6.8497;RBI=0.0483557;REFB=-0.0342986;REVB=0.00970849;RO=31;SAF=15;SAR=7;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112948;STB=0.552587;TYPE=snp;VARB=0.0487563;OID=.;OPOS=51630482;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:54:55:31:31:22:24:7:15:18:13:8:16:18:13 chr19 51656454 . A T 147.22 PASS AO=36;DP=120;FAO=43;FDP=107;FR=.,HEALED;FRO=64;FSAF=6;FSAR=37;FSRF=22;FSRR=42;FWDB=-0.00948355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.056;QD=5.50349;RBI=0.0121124;REFB=-0.0128756;REVB=-0.00753477;RO=48;SAF=0;SAR=36;SRF=6;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.807295;STB=0.685991;TYPE=snp;VARB=0.0202744;OID=.;OPOS=51656454;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:107:48:64:36:43:36:0:6:42:37:6:22:42 chr19 51671842 . C A 138.72 PASS AO=40;DP=101;FAO=40;FDP=100;FR=.;FRO=60;FSAF=7;FSAR=33;FSRF=8;FSRR=52;FWDB=-0.0134371;FXX=0.00990001;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.709;QD=5.54884;RBI=0.0137079;REFB=-0.00384304;REVB=0.00271138;RO=59;SAF=7;SAR=33;SRF=8;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0763419;STB=0.54585;TYPE=snp;VARB=0.00689462;OID=.;OPOS=51671842;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:100:59:60:40:40:33:7:8:51:33:7:8:52 chr19 51728641 . A G 191.98 PASS AO=54;DP=131;FAO=55;FDP=132;FR=.;FRO=77;FSAF=16;FSAR=39;FSRF=31;FSRR=46;FWDB=0.00363238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.772;QD=5.81748;RBI=0.0130066;REFB=0.000219521;REVB=-0.012489;RO=74;SAF=16;SAR=38;SRF=29;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11153;STB=0.57404;TYPE=snp;VARB=-0.000288056;OID=.;OPOS=51728641;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:132:74:77:54:55:38:16:29:45:39:16:31:46 chr19 51835892 . T TG 498.59 PASS AO=43;DP=75;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.058089;FXX=0.0273935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=16.503;QD=28.0893;RBI=0.0640809;REFB=0;REVB=-0.027056;RO=30;SAF=27;SAR=16;SRF=6;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.314143;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-0.00131855;OID=.;OPOS=51835893;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:43:75:71:71:0:31:40:0:0:47:30:27:16:6:24 chr19 51837171 . A G 346.82 PASS AO=105;DP=260;FAO=105;FDP=259;FR=.;FRO=154;FSAF=48;FSAR=57;FSRF=65;FSRR=89;FWDB=-0.0224204;FXX=0.00384601;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.7517;QD=5.35621;RBI=0.072477;REFB=0.00438055;REVB=-0.068922;RO=150;SAF=48;SAR=57;SRF=64;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0324169;STB=0.521076;TYPE=snp;VARB=-0.00608048;OID=.;OPOS=51837171;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:260:259:150:154:105:105:57:48:64:86:57:48:65:89 chr19 51841417 . C T 84.09 PASS AO=18;DP=40;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.0134691;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.237;QD=8.40935;RBI=0.0217852;REFB=0.00324462;REVB=0.0171224;RO=22;SAF=7;SAR=11;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0257126;STB=0.507035;TYPE=snp;VARB=-0.00405716;OID=.;OPOS=51841417;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:40:40:22:21:18:19:11:7:8:14:12:7:8:13 chr19 51844978 . G T 355.53 PASS AO=86;DP=178;FAO=86;FDP=178;FR=.;FRO=92;FSAF=40;FSAR=46;FSRF=45;FSRR=47;FWDB=0.0146814;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=192.183;QD=7.98944;RBI=0.0216576;REFB=-0.0150344;REVB=-0.015922;RO=91;SAF=40;SAR=46;SRF=44;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0172117;STB=0.512448;TYPE=snp;VARB=0.009742;OID=.;OPOS=51844978;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:178:91:92:86:86:46:40:44:47:46:40:45:47 chr19 51845371 . T G 180.05 PASS AO=39;DP=76;FAO=39;FDP=75;FR=.;FRO=36;FSAF=27;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=12;FWDB=-0.0367172;FXX=0.0131562;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0539;QD=9.60261;RBI=0.0368927;REFB=0.0329395;REVB=0.00359442;RO=37;SAF=27;SAR=12;SRF=24;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0440562;STB=0.514278;TYPE=snp;VARB=-0.0614854;OID=.;OPOS=51845371;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:75:37:36:39:39:12:27:24:13:12:27:24:12 chr19 51850290 . G A 211.32 PASS AO=43;DP=81;FAO=44;FDP=80;FR=.;FRO=36;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=0.0117826;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.135;QD=10.5662;RBI=0.0150832;REFB=-0.0225455;REVB=0.00941672;RO=36;SAF=16;SAR=27;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0627983;STB=0.538444;TYPE=snp;VARB=0.0209724;OID=.;OPOS=51850290;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:80:36:36:43:44:27:16:16:20:28:16:16:20 chr19 51919240 . C T 38.23 PASS AO=14;DP=47;FAO=14;FDP=47;FR=.;FRO=33;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=0.00749292;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=277.592;QD=3.25371;RBI=0.0138239;REFB=-0.014446;REVB=-0.0116171;RO=33;SAF=6;SAR=8;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0414103;STB=0.524965;TYPE=snp;VARB=0.029964;OID=.;OPOS=51919240;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:47:47:33:33:14:14:8:6:13:20:8:6:13:20 chr19 51919321 . T C 10.37 PASS AO=6;DP=35;FAO=6;FDP=35;FR=.;FRO=29;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.035131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.777;QD=1.18475;RBI=0.0475443;REFB=-0.00810283;REVB=-0.0320355;RO=28;SAF=3;SAR=3;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172145;STB=0.59968;TYPE=snp;VARB=0.0531327;OID=.;OPOS=51919321;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:35:35:28:29:6:6:3:3:10:18:3:3:11:18 chr19 51919507 . T C 280.77 PASS AO=59;DP=121;FAO=65;FDP=127;FR=.;FRO=62;FSAF=42;FSAR=23;FSRF=42;FSRR=20;FWDB=0.000536883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.908;QD=8.84321;RBI=0.00203331;REFB=-0.00878097;REVB=0.00196115;RO=62;SAF=38;SAR=21;SRF=42;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0340751;STB=0.516849;TYPE=snp;VARB=0.00822507;OID=.;OPOS=51919507;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:127:62:62:59:65:21:38:42:20:23:42:42:20 chr19 51919949 . G A 373.54 PASS AO=78;DP=142;FAO=78;FDP=142;FR=.;FRO=64;FSAF=42;FSAR=36;FSRF=50;FSRR=14;FWDB=-9.62659e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.835;QD=10.5223;RBI=0.0119905;REFB=-0.0190807;REVB=-0.0119901;RO=63;SAF=42;SAR=36;SRF=49;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201291;STB=0.611947;TYPE=snp;VARB=0.0121828;OID=.;OPOS=51919949;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:63:64:78:78:36:42:49:14:36:42:50:14 chr19 51920196 . G T 83.11 PASS AO=35;DP=137;FAO=40;FDP=142;FR=.;FRO=102;FSAF=12;FSAR=28;FSRF=64;FSRR=38;FWDB=0.00656472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.179;QD=2.34106;RBI=0.0286493;REFB=-0.00325995;REVB=0.027887;RO=102;SAF=12;SAR=23;SRF=64;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.343632;STB=0.728657;TYPE=snp;VARB=0.00839589;OID=.;OPOS=51920196;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:137:142:102:102:35:40:23:12:64:38:28:12:64:38 chr19 51920613 . C T 460.36 PASS AO=58;DP=59;FAO=54;FDP=59;FR=.;FRO=5;FSAF=10;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0551085;FXX=0.0166639;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7045;QD=31.2105;RBI=0.0582357;REFB=-0.0512689;REVB=0.0188268;RO=0;SAF=11;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.526872;TYPE=snp;VARB=0.0058725;OID=.;OPOS=51920613;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:59:59:0:5:58:54:47:11:0:0:44:10:0:5 chr19 51984725 . T A 781.28 PASS AO=181;DP=359;FAO=182;FDP=358;FR=.;FRO=176;FSAF=94;FSAR=88;FSRF=78;FSRR=98;FWDB=-0.0116895;FXX=0.00278544;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.947;QD=8.72933;RBI=0.0296947;REFB=-0.0155499;REVB=0.0272971;RO=175;SAF=93;SAR=88;SRF=78;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0611481;STB=0.535986;TYPE=snp;VARB=0.0138922;OID=.;OPOS=51984725;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:359:358:175:176:181:182:88:93:78:97:88:94:78:98 chr19 52000624 . T G 992.05 PASS AO=104;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00960706;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.582;QD=38.1556;RBI=0.0308629;REFB=0;REVB=-0.0293295;RO=0;SAF=64;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.62314e-05;OID=.;OPOS=52000624;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:104:104:0:0:104:104:40:64:0:0:40:64:0:0 chr19 52000672 . G A 1183.98 PASS AO=124;DP=125;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207599;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.519;QD=38.1928;RBI=0.0254264;REFB=0;REVB=0.0146809;RO=0;SAF=63;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.49245e-05;OID=.;OPOS=52000672;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:125:124:0:0:124:124:61:63:0:0:61:63:0:0 chr19 52001485 . G A 83.2 PASS AO=15;DP=28;FAO=15;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.0285915;FXX=0.0714031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.835;QD=12.8004;RBI=0.0289834;REFB=0.0119152;REVB=-0.0047498;RO=11;SAF=4;SAR=11;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232261;STB=0.631997;TYPE=snp;VARB=-0.0106092;OID=.;OPOS=52001485;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:28:26:11:11:15:15:11:4:6:5:11:4:6:5 chr19 52002488 . C A 1086.97 PASS AO=112;DP=113;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0102056;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.018;QD=38.1394;RBI=0.050999;REFB=0;REVB=0.0499674;RO=0;SAF=51;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.77659e-05;OID=.;OPOS=52002488;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:113:114:0:0:112:114:61:51:0:0:63:51:0:0 chr19 52002729 . G A 514.69 PASS AO=55;DP=57;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0142426;FXX=0.0344768;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.869;QD=36.7637;RBI=0.047328;REFB=-0.107954;REVB=0.0451341;RO=0;SAF=36;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.75811e-08;STB=0.512816;TYPE=snp;VARB=0.000366277;OID=.;OPOS=52002729;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:57:56:0:1:55:55:19:36:0:0:19:36:0:1 chr19 52003329 . CCG C,CC,CCC 2608.21 PASS AO=71,59,166;DP=316;FAO=62,68,165;FDP=295;FR=.;FRO=0;FSAF=62,67,9;FSAR=0,1,156;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000403237,0.0170024,0.0273713;FXX=0.0100668;HRUN=2,1,1;LEN=2,1,1;MLLD=85.8737,101.046,107.685;QD=35.3656;RBI=0.000747896,0.0191118,0.0296639;REFB=0,0,0;REVB=-0.00062988,-0.00872825,-0.0114348;RO=1;SAF=71,58,7;SAR=0,1,159;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,-0.00806833,-0.0632687;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=del,del,snp;VARB=0.111835,-0.00434261,-0.00500511;OID=.,.,.;OPOS=52003330,52003331,52003331;OREF=CG,G,G;OALT=-,-,C;OMAPALT=C,CC,CCC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/3:71,59,166:298:62,68,165:295:0:62,67,9:0,1,156:0:0:99:1:71,58,7:0,1,159:1:0 chr19 52004743 . G A 1193.8 PASS AO=120;DP=120;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130077;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.402;QD=38.2017;RBI=0.0251323;REFB=0;REVB=0.0215043;RO=0;SAF=72;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000346046;OID=.;OPOS=52004743;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:120:125:0:0:120:125:48:72:0:0:47:78:0:0 chr19 52004795 . G T 954.47 PASS AO=103;DP=107;FAO=103;FDP=105;FR=.;FRO=2;FSAF=70;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.019162;FXX=0.0186898;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.567;QD=36.3609;RBI=0.0198723;REFB=-0.0849922;REVB=0.00526558;RO=2;SAF=70;SAR=33;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00742998;STB=0.503916;TYPE=snp;VARB=9.30721e-05;OID=.;OPOS=52004795;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:107:105:2:2:103:103:33:70:1:1:33:70:1:1 chr19 52032964 . C G 421.57 PASS AO=37;DP=70;FAO=63;FDP=67;FR=.;FRO=4;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0247018;FXX=0.0563301;HRUN=6;LEN=1;MLLD=135.746;QD=25.1685;RBI=0.0268156;REFB=-0.162847;REVB=0.0104355;RO=0;SAF=11;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.53124;TYPE=snp;VARB=0.00630324;OID=.;OPOS=52032964;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:42:67:0:4:37:63:26:11:0:0:30:33:0:4 chr19 52033158 . C T 77.79 PASS AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=-0.104595;FXX=0.0302939;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.318;QD=9.72335;RBI=0.104598;REFB=-0.0420144;REVB=0.000755852;RO=16;SAF=6;SAR=10;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186817;STB=0.605143;TYPE=snp;VARB=0.0189305;OID=.;OPOS=52033158;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:33:32:16:16:16:16:10:6:3:13:10:6:3:13 chr19 52033742 . G A 691.56 PASS AO=79;DP=83;FAO=79;FDP=83;FR=.;FRO=4;FSAF=49;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0167619;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=240.945;QD=33.3282;RBI=0.0209736;REFB=-0.0888941;REVB=0.0126068;RO=4;SAF=49;SAR=30;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0590375;STB=0.531242;TYPE=snp;VARB=0.000455303;OID=.;OPOS=52033742;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:83:83:4:4:79:79:30:49:0:4:30:49:0:4 chr19 52034678 . TG T 629.52 PASS AO=81;DP=90;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.355881;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.1848;QD=24.6872;RBI=0.396499;REFB=-0.0159645;REVB=0.174814;RO=15;SAF=28;SAR=53;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0.301518;SSSB=-0.0596724;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0145671;OID=.;OPOS=52034679;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:81:102:102:102:0:37:65:0:0:52:15:28:53:8:7 chr19 52085095 . G A 262.39 PASS AO=40;DP=159;FAO=67;FDP=150;FR=.,HEALED;FRO=83;FSAF=29;FSAR=38;FSRF=36;FSRR=47;FWDB=-0.0434581;FXX=0.00662208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.3573;QD=6.99701;RBI=0.0440476;REFB=-0.0101311;REVB=-0.00718204;RO=55;SAF=2;SAR=38;SRF=9;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.364551;STB=0.500506;TYPE=snp;VARB=0.0128271;OID=.;OPOS=52085095;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:150:55:83:40:67:38:2:9:46:38:29:36:47 chr19 52090014 . C T 141.42 PASS AO=42;DP=107;FAO=42;FDP=106;FR=.;FRO=64;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=34;FSRR=30;FWDB=-0.0123657;FXX=0.00934492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.036;QD=5.33642;RBI=0.0357622;REFB=-0.0284989;REVB=-0.0335563;RO=64;SAF=19;SAR=23;SRF=34;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0839794;STB=0.547596;TYPE=snp;VARB=0.0374801;OID=.;OPOS=52090014;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:106:64:64:42:42:23:19:34:30:23:19:34:30 chr19 52090100 . T C 32.7 PASS AO=14;DP=53;FAO=14;FDP=53;FR=.;FRO=39;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=-0.000255147;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.498;QD=2.46759;RBI=0.00475369;REFB=-0.019282;REVB=0.00474684;RO=39;SAF=6;SAR=8;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0706802;STB=0.543416;TYPE=snp;VARB=0.0248097;OID=.;OPOS=52090100;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:53:53:39:39:14:14:8:6:19:20:8:6:19:20 chr19 52148804 . A C 56.54 PASS AO=13;DP=26;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.00836438;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.149;QD=9.04699;RBI=0.0133268;REFB=0.000791687;REVB=0.010375;RO=13;SAF=7;SAR=6;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136804;STB=0.517213;TYPE=snp;VARB=-0.000668347;OID=.;OPOS=52148804;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:26:25:13:13:13:12:6:7:9:4:5:7:8:5 chr19 52172672 . C T 536.62 PASS AO=129;DP=269;FAO=132;FDP=273;FR=.;FRO=141;FSAF=58;FSAR=74;FSRF=86;FSRR=55;FWDB=0.0151882;FXX=0.0036495;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.403;QD=7.86256;RBI=0.0152748;REFB=-0.012452;REVB=0.001624;RO=133;SAF=55;SAR=74;SRF=86;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20158;STB=0.587483;TYPE=snp;VARB=0.0122253;OID=.;OPOS=52172672;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:269:273:133:141:129:132:74:55:86:47:74:58:86:55 chr19 52222552 . G A 612.15 PASS AO=64;DP=67;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0892236;FXX=0.0447694;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.855;QD=38.2594;RBI=0.0927278;REFB=0;REVB=0.0252507;RO=0;SAF=10;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.78622e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000423289;OID=.;OPOS=52222552;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:67:64:0:0:64:64:54:10:0:0:54:10:0:0 chr19 52223121 . A G 155.64 PASS AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0399758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.631;QD=36.6208;RBI=0.0402386;REFB=0;REVB=0.00459145;RO=0;SAF=15;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.95117e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000309881;OID=.;OPOS=52223121;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:17:17:0:0:17:17:2:15:0:0:2:15:0:0 chr19 52249702 . G T 84.59 PASS AO=13;DP=19;FAO=13;FDP=20;FR=.;FRO=7;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=-0.00783768;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=165.619;QD=16.9178;RBI=0.0467664;REFB=-0.00929961;REVB=-0.0461049;RO=6;SAF=10;SAR=3;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208876;STB=0.545388;TYPE=snp;VARB=0.00405812;OID=.;OPOS=52249702;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:19:20:6:7:13:13:3:10:6:0:3:10:6:1 chr19 52250216 . A G 560.35 PASS AO=136;DP=281;FAO=137;FDP=282;FR=.;FRO=145;FSAF=52;FSAR=85;FSRF=63;FSRR=82;FWDB=0.0352646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.5787;QD=7.94816;RBI=0.0409583;REFB=-0.0134316;REVB=-0.0208325;RO=143;SAF=51;SAR=85;SRF=63;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0639877;STB=0.529548;TYPE=snp;VARB=0.0133857;OID=.;OPOS=52250216;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:281:282:143:145:136:137:85:51:63:80:85:52:63:82 chr19 52659991 . A G 161.93 PASS AO=49;DP=126;FAO=49;FDP=125;FR=.;FRO=76;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=23;FSRR=53;FWDB=0.00085351;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.8336;QD=5.18161;RBI=0.0100012;REFB=-0.0215364;REVB=-0.00996472;RO=76;SAF=21;SAR=28;SRF=23;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141973;STB=0.579921;TYPE=snp;VARB=0.0405721;OID=.;OPOS=52659991;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:125:76:76:49:49:28:21:23:53:28:21:23:53 chr19 52660279 . C T 202.27 PASS AO=66;DP=172;FAO=66;FDP=175;FR=.;FRO=109;FSAF=44;FSAR=22;FSRF=55;FSRR=54;FWDB=-0.0356074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.4439;QD=4.6233;RBI=0.037824;REFB=-0.00859136;REVB=-0.012758;RO=105;SAF=44;SAR=22;SRF=51;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203591;STB=0.605545;TYPE=snp;VARB=0.0124938;OID=.;OPOS=52660279;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:175:105:109:66:66:22:44:51:54:22:44:55:54 chr19 52660783 . A G 79.1 PASS AO=29;DP=88;FAO=29;FDP=89;FR=.;FRO=60;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=9;FSRR=51;FWDB=-0.0263012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.049;QD=3.5551;RBI=0.0320354;REFB=-0.0084383;REVB=-0.0182898;RO=58;SAF=9;SAR=20;SRF=9;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233657;STB=0.639559;TYPE=snp;VARB=0.0195805;OID=.;OPOS=52660783;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:88:89:58:60:29:29:20:9:9:49:20:9:9:51 chr19 52762384 . C A 137.9 PASS AO=34;DP=72;FAO=33;FDP=71;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=0.00222728;FXX=0.013887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.122;QD=7.76899;RBI=0.00663157;REFB=0.00461528;REVB=0.00624636;RO=36;SAF=12;SAR=22;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0357627;STB=0.532589;TYPE=snp;VARB=-0.00530264;OID=.;OPOS=52762384;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:71:36:38:34:33:22:12:14:22:21:12:16:22 chr19 52803669 . CTG C 1485.03 PASS AO=147;DP=160;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=99;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0012869;FXX=0.031248;HRUN=1;LEN=2;MLLD=157.85;QD=38.3234;RBI=0.0651429;REFB=0;REVB=0.0651302;RO=0;SAF=96;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=6.0973e-05;OID=.;OPOS=52803670;OREF=TG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:147:152:155:155:0:99:56:0:0:70:0:96:51:0:0 chr19 52825235 . A G 664.61 PASS AO=68;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0309853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.204;QD=38.5279;RBI=0.0329538;REFB=0;REVB=-0.0112188;RO=0;SAF=47;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000149076;OID=.;OPOS=52825235;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:69:69:0:0:68:69:21:47:0:0:21:48:0:0 chr19 52869022 . G T 1464.28 PASS AO=161;DP=167;FAO=161;FDP=166;FR=.;FRO=5;FSAF=80;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0198765;FXX=0.00598767;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.8087;QD=35.284;RBI=0.0211214;REFB=-0.0212697;REVB=-0.00714424;RO=5;SAF=80;SAR=81;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0284632;STB=0.514968;TYPE=snp;VARB=-0.000234699;OID=.;OPOS=52869022;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:167:166:5:5:161:161:81:80:0:5:81:80:0:5 chr19 52869278 . G C 979.27 PASS AO=101;DP=101;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0295911;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.953;QD=38.0298;RBI=0.0392588;REFB=0;REVB=0.0257996;RO=0;SAF=51;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.10484e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.21959e-07;OID=.;OPOS=52869278;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:101:103:0:0:101:103:50:51:0:0:52:51:0:0 chr19 52869312 . T C 969.59 PASS AO=96;DP=97;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00113478;FXX=0.0192289;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.009;QD=38.0231;RBI=0.0972937;REFB=0;REVB=0.0972871;RO=0;SAF=56;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000398464;OID=.;OPOS=52869312;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:97:102:0:0:96:102:40:56:0:0:47:55:0:0 chr19 52869534 . G A 496.27 PASS AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0255798;FXX=0.0185151;HRUN=3;LEN=1;MLLD=197.51;QD=37.4546;RBI=0.0260499;REFB=0;REVB=-0.00492665;RO=0;SAF=26;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.28894e-05;OID=.;OPOS=52869534;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:52:53:0:0:52:53:26:26:0:0:27:26:0:0 chr19 52876385 . G A 474.28 PASS AO=119;DP=252;FAO=119;FDP=252;FR=.;FRO=133;FSAF=58;FSAR=61;FSRF=56;FSRR=77;FWDB=-0.0167751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.475;QD=7.52834;RBI=0.0167897;REFB=-0.00361878;REVB=-0.000701929;RO=133;SAF=58;SAR=61;SRF=56;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0636725;STB=0.535092;TYPE=snp;VARB=0.00440371;OID=.;OPOS=52876385;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:252:252:133:133:119:119:61:58:56:77:61:58:56:77 chr19 52887145 . TA T 167.64 PASS AO=54;DP=133;FAO=65;FDP=129;FR=.;FRO=64;FSAF=21;FSAR=44;FSRF=31;FSRR=33;FWDB=0.113283;FXX=0.00769172;HRUN=5;LEN=1;MLLD=16.043;QD=5.19818;RBI=0.204992;REFB=0.0621986;REVB=-0.170847;RO=61;SAF=17;SAR=37;SRF=28;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0.3125;SSSB=-0.149093;STB=0.585888;TYPE=del;VARB=-0.0511523;OID=.;OPOS=52887146;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:54:130:65:129:64:21:44:31:33:99:61:17:37:28:33 chr19 52887246 . T TCAA 198.48 PASS AO=54;DP=141;FAO=57;FDP=138;FR=.;FRO=81;FSAF=19;FSAR=38;FSRF=42;FSRR=39;FWDB=-0.0179438;FXX=0.028167;HRUN=1;LEN=3;MLLD=251.98;QD=5.75314;RBI=0.019125;REFB=-0.00481777;REVB=0.00661727;RO=84;SAF=17;SAR=37;SRF=45;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246187;STB=0.613025;TYPE=ins;VARB=0.0048471;OID=.;OPOS=52887247;OREF=-;OALT=CAA;OMAPALT=TCAA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:54:141:57:138:81:19:38:42:39:99:84:17:37:45:39 chr19 52887282 . A G 228.89 PASS AO=56;DP=118;FAO=56;FDP=119;FR=.;FRO=63;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=22;FSRR=41;FWDB=0.0142825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.178;QD=7.69368;RBI=0.0189852;REFB=0.00725657;REVB=0.0125078;RO=61;SAF=27;SAR=29;SRF=22;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115078;STB=0.5708;TYPE=snp;VARB=-0.00907444;OID=.;OPOS=52887282;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:119:61:63:56:56:29:27:22:39:29:27:22:41 chr19 52887427 . A C 337.95 PASS AO=65;DP=113;FAO=66;FDP=113;FR=.;FRO=47;FSAF=20;FSAR=46;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=0.00630745;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.293;QD=11.9629;RBI=0.0103897;REFB=-0.0032175;REVB=0.00825604;RO=47;SAF=20;SAR=45;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152985;STB=0.585527;TYPE=snp;VARB=0.00246862;OID=.;OPOS=52887427;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:47:47:65:66:45:20:23:24:46:20:23:24 chr19 52887437 . A C 289.91 PASS AO=60;DP=111;FAO=61;FDP=112;FR=.;FRO=51;FSAF=18;FSAR=43;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=-0.0292212;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0297;QD=10.3538;RBI=0.0688673;REFB=-0.0105934;REVB=0.0623605;RO=51;SAF=18;SAR=42;SRF=24;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157613;STB=0.589011;TYPE=snp;VARB=0.0116493;OID=.;OPOS=52887437;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:112:51:51:60:61:42:18:24:27:43:18:24:27 chr19 52887904 . T C 43.86 PASS AO=18;DP=63;FAO=18;FDP=63;FR=.;FRO=45;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=31;FSRR=14;FWDB=-0.0574712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.82;QD=2.785;RBI=0.0663466;REFB=-0.0203553;REVB=0.0331502;RO=39;SAF=6;SAR=12;SRF=26;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.371895;STB=0.739756;TYPE=snp;VARB=0.0485442;OID=.;OPOS=52887904;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:63:63:39:45:18:18:12:6:26:13:12:6:31:14 chr19 52888048 . G A 199.94 PASS AO=33;DP=46;FAO=32;FDP=46;FR=.;FRO=14;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=-0.0585129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.5304;QD=17.3863;RBI=0.0627203;REFB=-0.0188567;REVB=-0.022585;RO=12;SAF=16;SAR=17;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129933;STB=0.595629;TYPE=snp;VARB=0.0286756;OID=.;OPOS=52888048;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:46:46:12:14:33:32:17:16:9:3:17:15:11:3 chr19 52888210 . T C 131.23 PASS AO=30;DP=62;FAO=30;FDP=62;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=8;FSRR=24;FWDB=-0.00628874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.809;QD=8.46638;RBI=0.0120068;REFB=0.0061502;REVB=0.0102282;RO=32;SAF=12;SAR=18;SRF=8;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149669;STB=0.583281;TYPE=snp;VARB=-0.00363663;OID=.;OPOS=52888210;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:32:32:30:30:18:12:8:24:18:12:8:24 chr19 52888245 . A G 149.58 PASS AO=33;DP=65;FAO=33;FDP=65;FR=.;FRO=32;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=-0.00467869;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.7842;QD=9.20493;RBI=0.026208;REFB=-0.00215275;REVB=0.025787;RO=31;SAF=22;SAR=11;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.24819;STB=0.645744;TYPE=snp;VARB=0.000720298;OID=.;OPOS=52888245;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:31:32:33:33:11:22:12:19:11:22:12:20 chr19 52917590 . G A 1340.77 PASS AO=141;DP=142;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.099691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.1088;QD=37.7682;RBI=0.128325;REFB=0;REVB=0.0808019;RO=1;SAF=74;SAR=67;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00704406;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00278294;OID=.;OPOS=52917590;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:142:142:1:0:141:142:67:74:0:1:68:74:0:0 chr19 52937339 . G A 156.17 PASS AO=44;DP=106;FAO=44;FDP=106;FR=.;FRO=62;FSAF=12;FSAR=32;FSRF=19;FSRR=43;FWDB=-0.0890547;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.2875;QD=5.89308;RBI=0.0928136;REFB=-0.0236698;REVB=0.0261462;RO=62;SAF=12;SAR=32;SRF=19;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0430106;STB=0.524302;TYPE=snp;VARB=0.0252932;OID=.;OPOS=52937339;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:62:62:44:44:32:12:19:43:32:12:19:43 chr19 52938361 . C A 2673.15 PASS AO=280;DP=285;FAO=284;FDP=284;FR=.;FRO=0;FSAF=158;FSAR=126;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00160011;FXX=0.0138884;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3033;QD=37.6499;RBI=0.0980654;REFB=0.0495969;REVB=-0.0980524;RO=5;SAF=157;SAR=123;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00813083;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000533841;OID=.;OPOS=52938361;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:285:284:5:0:280:284:123:157:4:1:126:158:0:0 chr19 52938417 . A G 2154.49 PASS AO=227;DP=231;FAO=230;FDP=230;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=129;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00272759;FXX=0.012875;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.4022;QD=37.4694;RBI=0.00360406;REFB=-0.0275838;REVB=-0.00235575;RO=3;SAF=100;SAR=127;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.014078;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.37766e-05;OID=.;OPOS=52938417;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:231:230:3:0:227:230:127:100:3:0:129:101:0:0 chr19 52938459 . A G 1822.42 PASS AO=187;DP=188;FAO=189;FDP=189;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0661847;FXX=0.00526288;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.3708;QD=38.5697;RBI=0.0673191;REFB=0;REVB=0.0123064;RO=0;SAF=83;SAR=104;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000181836;OID=.;OPOS=52938459;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:188:189:0:0:187:189:104:83:0:0:106:83:0:0 chr19 52941171 . T C 1202.52 PASS AO=150;DP=164;FAO=150;FDP=163;FR=.;FRO=13;FSAF=66;FSAR=84;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.0012066;FXX=0.00609719;HRUN=6;LEN=1;MLLD=38.6136;QD=29.5096;RBI=0.0126309;REFB=-0.132947;REVB=-0.0125732;RO=2;SAF=67;SAR=83;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0113224;STB=0.504486;TYPE=snp;VARB=0.0162152;OID=.;OPOS=52941171;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:164:163:2:13:150:150:83:67:0:2:84:66:5:8 chr19 52941540 . G A 304.46 PASS AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0151719;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=234.855;QD=34.7949;RBI=0.0180844;REFB=0.0126211;REVB=0.0098416;RO=0;SAF=15;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40663e-08;STB=0.512813;TYPE=snp;VARB=8.02602e-05;OID=.;OPOS=52941540;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:35:35:0:1:34:34:19:15:0:0:19:15:0:1 chr19 52941618 . A C 256.71 PASS AO=27;DP=28;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00420661;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.615;QD=35.4088;RBI=0.0331798;REFB=-0.0859268;REVB=0.032912;RO=0;SAF=16;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5146e-08;STB=0.521723;TYPE=snp;VARB=0.00191501;OID=.;OPOS=52941618;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:28:29:0:1:27:28:11:16:0:0:11:17:0:1 chr19 52941847 . A T 951.66 PASS AO=99;DP=99;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104396;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.562;QD=38.0662;RBI=0.0400909;REFB=0;REVB=0.0387078;RO=0;SAF=37;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000103837;OID=.;OPOS=52941847;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:99:100:0:0:99:100:62:37:0:0:63:37:0:0 chr19 52942159 . A G 244.27 PASS AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.034006;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.509;QD=34.8951;RBI=0.0416524;REFB=-0.0408043;REVB=0.0240524;RO=1;SAF=7;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0226895;STB=0.512186;TYPE=snp;VARB=0.000474756;OID=.;OPOS=52942159;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:28:28:1:1:27:27:20:7:0:1:20:7:0:1 chr19 52942445 . C T 147.38 PASS AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0410968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.523;QD=36.8439;RBI=0.0433721;REFB=0;REVB=-0.0138631;RO=0;SAF=4;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07465e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000132914;OID=.;OPOS=52942445;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:16:0:0:16:16:12:4:0:0:12:4:0:0 chr19 52942495 . G A 258.55 PASS AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0800175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.807;QD=35.6622;RBI=0.0871037;REFB=-0.0329628;REVB=0.0344128;RO=1;SAF=10;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0442673;STB=0.523792;TYPE=snp;VARB=0.00243225;OID=.;OPOS=52942495;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:29:29:1:1:28:28:18:10:1:0:18:10:1:0 chr19 52954507 . T C 1002.71 PASS AO=102;DP=104;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010648;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.588;QD=38.1986;RBI=0.0115488;REFB=0;REVB=0.00447151;RO=0;SAF=44;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.38163e-05;OID=.;OPOS=52954507;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:104:105:0:0:102:105:58:44:0:0:60:45:0:0 chr19 53075519 . G T 77.86 PASS AO=22;DP=56;FAO=22;FDP=56;FR=.;FRO=34;FSAF=20;FSAR=2;FSRF=32;FSRR=2;FWDB=-0.0112938;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.205;QD=5.56139;RBI=0.0137009;REFB=-0.00829772;REVB=-0.0077567;RO=33;SAF=20;SAR=2;SRF=31;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106547;STB=0.565164;TYPE=snp;VARB=0.00922345;OID=.;OPOS=53075519;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:56:56:33:34:22:22:2:20:31:2:2:20:32:2 chr19 53077411 . T C 455.07 PASS AO=114;DP=246;FAO=116;FDP=248;FR=.;FRO=132;FSAF=62;FSAR=54;FSRF=78;FSRR=54;FWDB=0.00956571;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0971;QD=7.33982;RBI=0.0434066;REFB=0.00443835;REVB=0.0423395;RO=132;SAF=62;SAR=52;SRF=78;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0462743;STB=0.530298;TYPE=snp;VARB=-0.00473996;OID=.;OPOS=53077411;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:246:248:132:132:114:116:52:62:78:54:54:62:78:54 chr19 53085659 . C T 128.4 PASS AO=37;DP=92;FAO=37;FDP=92;FR=.;FRO=55;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=30;FSRR=25;FWDB=-0.0163432;FXX=0.0107515;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.831;QD=5.58248;RBI=0.0168253;REFB=-0.00291569;REVB=0.0039987;RO=54;SAF=15;SAR=22;SRF=29;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138579;STB=0.584025;TYPE=snp;VARB=0.00430495;OID=.;OPOS=53085659;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:54:55:37:37:22:15:29:25:22:15:30:25 chr19 53085813 . T C 199.74 PASS AO=41;DP=76;FAO=42;FDP=78;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=31;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.00206907;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.364;QD=10.2429;RBI=0.00251851;REFB=-0.0168775;REVB=-0.00143591;RO=35;SAF=12;SAR=29;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225015;STB=0.63779;TYPE=snp;VARB=0.0112238;OID=.;OPOS=53085813;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:78:35:36:41:42:29:12:19:16:31:11:19:17 chr19 53086124 . C A 91.69 PASS AO=36;DP=118;FAO=37;FDP=118;FR=.;FRO=81;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=42;FSRR=39;FWDB=-0.00722493;FXX=0.00840265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.062;QD=3.10807;RBI=0.0562991;REFB=-0.00770486;REVB=-0.0558336;RO=80;SAF=14;SAR=22;SRF=41;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147347;STB=0.597349;TYPE=snp;VARB=0.0165647;OID=.;OPOS=53086124;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:118:118:80:81:36:37:22:14:41:39:23:14:42:39 chr19 53116643 . T C 78.07 PASS AO=25;DP=70;FAO=25;FDP=70;FR=.;FRO=45;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=30;FWDB=0.0368224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.251;QD=4.46111;RBI=0.0381122;REFB=-0.00481673;REVB=0.00983137;RO=45;SAF=15;SAR=10;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.289377;STB=0.66654;TYPE=snp;VARB=0.0103742;OID=.;OPOS=53116643;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:70:70:45:45:25:25:10:15:15:30:10:15:15:30 chr19 53117531 . C T 230.41 PASS AO=48;DP=89;FAO=48;FDP=89;FR=.;FRO=41;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=-0.0176042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.787;QD=10.3554;RBI=0.0176043;REFB=-0.0171494;REVB=-7.45325e-05;RO=41;SAF=25;SAR=23;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0542537;STB=0.529842;TYPE=snp;VARB=0.0185947;OID=.;OPOS=53117531;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:41:41:48:48:23:25:24:17:23:25:24:17 chr19 53117809 . C A 428.09 PASS AO=78;DP=118;FAO=83;FDP=143;FR=.;FRO=60;FSAF=48;FSAR=35;FSRF=35;FSRR=25;FWDB=-0.010492;FXX=0.0337815;HRUN=3;LEN=1;MLLD=86.1841;QD=11.9745;RBI=0.0393559;REFB=-0.0412747;REVB=0.0379316;RO=40;SAF=44;SAR=34;SRF=14;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134234;STB=0.50216;TYPE=snp;VARB=0.0302741;OID=.;OPOS=53117809;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:143:40:60:78:83:34:44:14:26:35:48:35:25 chr19 53270384 . A G 168.81 PASS AO=57;DP=155;FAO=57;FDP=156;FR=.;FRO=99;FSAF=24;FSAR=33;FSRF=51;FSRR=48;FWDB=0.00871426;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.94;QD=4.32857;RBI=0.0383037;REFB=-0.010063;REVB=-0.0372993;RO=98;SAF=24;SAR=33;SRF=50;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.099718;STB=0.56006;TYPE=snp;VARB=0.0143719;OID=.;OPOS=53270384;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:156:98:99:57:57:33:24:50:48:33:24:51:48 chr19 53303527 . A G 584.5 PASS AO=61;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.006;QD=37.7094;RBI=0.0559392;REFB=0;REVB=0.0541097;RO=0;SAF=37;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000324162;OID=.;OPOS=53303527;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:61:62:0:0:61:62:24:37:0:0:25:37:0:0 chr19 53303705 . T G 1082.09 PASS AO=117;DP=121;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171206;FXX=0.0165276;HRUN=3;LEN=1;MLLD=138.026;QD=36.3727;RBI=0.0208527;REFB=-0.0484911;REVB=0.0119045;RO=3;SAF=44;SAR=73;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0191155;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000396616;OID=.;OPOS=53303705;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:121:119:3:0:117:119:73:44:0:3:75:44:0:0 chr19 53321171 . G A 1405.92 PASS AO=150;DP=152;FAO=151;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00425577;FXX=0.013071;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.318;QD=37.2429;RBI=0.0239243;REFB=-0.0947881;REVB=0.0235428;RO=0;SAF=93;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.97759e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00039693;OID=.;OPOS=53321171;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:152:151:0:0:150:151:57:93:0:0:57:94:0:0 chr19 53384185 . C T 1065.21 PASS AO=112;DP=113;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00591415;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.403;QD=38.0433;RBI=0.0149248;REFB=0;REVB=0.013703;RO=0;SAF=60;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.31461e-05;OID=.;OPOS=53384185;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:113:112:0:0:112:112:52:60:0:0:52:60:0:0 chr19 53384691 . CT C 45.52 PASS AO=36;DP=118;FAO=43;FDP=98;FR=.;FRO=55;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=37;FSRR=18;FWDB=-0.0473863;FXX=0.0101;HRUN=5;LEN=1;MLLD=8.2668;QD=1.85788;RBI=0.146461;REFB=-0.0629439;REVB=-0.138583;RO=47;SAF=19;SAR=17;SRF=32;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15648;STB=0.578557;TYPE=del;VARB=0.0133437;OID=.;OPOS=53384692;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:36:97:43:98:55:23:20:37:18:45:47:19:17:32:15 chr19 53391453 . T C 199.47 PASS AO=49;DP=106;FAO=50;FDP=109;FR=.;FRO=59;FSAF=49;FSAR=1;FSRF=57;FSRR=2;FWDB=0.0289899;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.8161;QD=7.31995;RBI=0.0377015;REFB=-0.028913;REVB=0.0241036;RO=57;SAF=48;SAR=1;SRF=55;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146518;STB=0.58099;TYPE=snp;VARB=0.0284772;OID=.;OPOS=53391453;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:109:57:59:49:50:1:48:55:2:1:49:57:2 chr19 53391486 . A G 422.84 PASS AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0107244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.5897;QD=35.9862;RBI=0.0449323;REFB=-0.0663482;REVB=-0.0436337;RO=1;SAF=45;SAR=1;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.307735;STB=0.666571;TYPE=snp;VARB=0.012667;OID=.;OPOS=53391486;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:47:47:1:1:46:46:1:45:0:1:1:45:0:1 chr19 53391500 . G A 116.69 PASS AO=14;DP=15;FAO=14;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0449409;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.4897;QD=31.1168;RBI=0.0999369;REFB=-0.0268053;REVB=-0.089262;RO=1;SAF=13;SAR=1;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.295994;STB=0.666367;TYPE=snp;VARB=0.0224057;OID=.;OPOS=53391500;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:15:15:1:1:14:14:1:13:0:1:1:13:0:1 chr19 53453777 . C T 859.83 PASS AO=80;DP=80;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0423465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.57;QD=37.7948;RBI=0.065367;REFB=0;REVB=0.0497957;RO=0;SAF=28;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000811768;OID=.;OPOS=53453777;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:80:91:0:0:80:91:52:28:0:0:57:34:0:0 chr19 53454475 . C CACT 1388.43 PASS AO=139;DP=172;FAO=145;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0064486;FXX=0.142003;HRUN=0;LEN=3;MLLD=206.807;QD=38.3016;RBI=0.00946084;REFB=0;REVB=0.00692265;RO=7;SAF=66;SAR=73;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00422084;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=8.52741e-05;OID=.;OPOS=53454476;OREF=-;OALT=ACT;OMAPALT=CACT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:139:172:145:145:0:71:74:0:0:65:7:66:73:3:4 chr19 53454789 . A T 1938.85 PASS AO=211;DP=216;FAO=211;FDP=216;FR=.;FRO=5;FSAF=100;FSAR=111;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0283163;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.5039;QD=35.9047;RBI=0.0283782;REFB=-0.0582992;REVB=-0.00187246;RO=5;SAF=100;SAR=111;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0121148;STB=0.506362;TYPE=snp;VARB=0.00581085;OID=.;OPOS=53454789;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:216:216:5:5:211:211:111:100:1:4:111:100:1:4 chr19 53513447 . C T 176.62 PASS AO=43;DP=92;FAO=43;FDP=92;FR=.;FRO=49;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=33;FWDB=-0.0106188;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=127.584;QD=7.67929;RBI=0.040267;REFB=-0.0411749;REVB=0.0388416;RO=45;SAF=24;SAR=19;SRF=13;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.244226;STB=0.621459;TYPE=snp;VARB=0.0272554;OID=.;OPOS=53513447;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:45:49:43:43:19:24:13:32:19:24:16:33 chr19 53572059 . T C 872.5 PASS AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0246747;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=240.184;QD=37.9348;RBI=0.0268574;REFB=0;REVB=-0.0106055;RO=0;SAF=57;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.05585e-05;OID=.;OPOS=53572059;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:92:92:0:0:92:92:35:57:0:0:35:57:0:0 chr19 53572494 . G T 1602.74 PASS AO=167;DP=168;FAO=172;FDP=174;FR=.;FRO=2;FSAF=71;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00418032;FXX=0.00571396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.884;QD=36.8447;RBI=0.0516532;REFB=-0.167349;REVB=0.0514838;RO=1;SAF=69;SAR=98;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00483177;STB=0.504901;TYPE=snp;VARB=0.000428247;OID=.;OPOS=53572494;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:168:174:1:2:167:172:98:69:0:1:101:71:0:2 chr19 53572917 . G A 2205.24 PASS AO=238;DP=245;FAO=240;FDP=240;FR=.;FRO=0;FSAF=145;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126778;FXX=0.0204073;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.753;QD=36.754;RBI=0.0892141;REFB=-0.0478914;REVB=0.0883088;RO=1;SAF=145;SAR=93;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00509701;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000884339;OID=.;OPOS=53572917;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:245:240:1:0:238:240:93:145:0:1:95:145:0:0 chr19 53576589 . C G 320.85 PASS AO=79;DP=169;FAO=79;FDP=168;FR=.;FRO=89;FSAF=32;FSAR=47;FSRF=49;FSRR=40;FWDB=-0.0201721;FXX=0.0175428;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.6099;QD=7.63935;RBI=0.0301287;REFB=-0.0176533;REVB=-0.0223791;RO=88;SAF=32;SAR=47;SRF=49;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145307;STB=0.577586;TYPE=snp;VARB=0.0199162;OID=.;OPOS=53576589;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:168:88:89:79:79:47:32:49:39:47:32:49:40 chr19 53577419 . G C 2199.04 PASS AO=226;DP=234;FAO=232;FDP=232;FR=.;FRO=0;FSAF=106;FSAR=126;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0753952;FXX=0.00854664;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.4128;QD=37.9145;RBI=0.0889192;REFB=0.046426;REVB=-0.0471401;RO=8;SAF=100;SAR=126;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0284233;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00183878;OID=.;OPOS=53577419;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:96:234:232:8:0:226:232:126:100:7:1:126:106:0:0 chr19 53612311 . T C 273.41 PASS AO=52;DP=87;FAO=52;FDP=88;FR=.;FRO=36;FSAF=39;FSAR=13;FSRF=32;FSRR=4;FWDB=-0.013302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.885;QD=12.4278;RBI=0.0580016;REFB=-0.0176946;REVB=0.0564556;RO=35;SAF=39;SAR=13;SRF=31;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14501;STB=0.581939;TYPE=snp;VARB=0.0199227;OID=.;OPOS=53612311;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:88:35:36:52:52:13:39:31:4:13:39:32:4 chr19 53612720 . T C 220.09 PASS AO=62;DP=149;FAO=62;FDP=148;FR=.;FRO=86;FSAF=43;FSAR=19;FSRF=53;FSRR=33;FWDB=0.0112493;FXX=0.0133324;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.302;QD=5.9484;RBI=0.0442256;REFB=0.00584555;REVB=0.042771;RO=86;SAF=43;SAR=19;SRF=53;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.090175;STB=0.550722;TYPE=snp;VARB=-0.00630531;OID=.;OPOS=53612720;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:148:86:86:62:62:19:43:53:33:19:43:53:33 chr19 53612745 . T C 231.62 PASS AO=61;DP=138;FAO=61;FDP=138;FR=.;FRO=77;FSAF=39;FSAR=22;FSRF=46;FSRR=31;FWDB=-0.0103649;FXX=0.0212751;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.06;QD=6.71348;RBI=0.0125088;REFB=-0.0162056;REVB=-0.00700276;RO=75;SAF=39;SAR=22;SRF=46;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0276417;STB=0.525011;TYPE=snp;VARB=0.0129964;OID=.;OPOS=53612745;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:75:77:61:61:22:39:46:29:22:39:46:31 chr19 53612757 . T G 236.68 PASS AO=64;DP=149;FAO=65;FDP=150;FR=.;FRO=85;FSAF=45;FSAR=20;FSRF=58;FSRR=27;FWDB=0.00835386;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.708;QD=6.31143;RBI=0.00854366;REFB=-0.00440999;REVB=-0.00179088;RO=85;SAF=45;SAR=19;SRF=58;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0250574;STB=0.506585;TYPE=snp;VARB=0.022517;OID=.;OPOS=53612757;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:150:85:85:64:65:19:45:58:27:20:45:58:27 chr19 53612989 . A G 328.68 PASS AO=91;DP=212;FAO=92;FDP=214;FR=.;FRO=122;FSAF=42;FSAR=50;FSRF=51;FSRR=71;FWDB=0.0109231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.7512;QD=6.14349;RBI=0.0172713;REFB=-0.0080141;REVB=-0.0133784;RO=120;SAF=41;SAR=50;SRF=51;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0264222;STB=0.52219;TYPE=snp;VARB=0.0152909;OID=.;OPOS=53612989;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:214:120:122:91:92:50:41:51:69:50:42:51:71 chr19 53645291 . T C 177.91 PASS AO=47;DP=107;FAO=47;FDP=107;FR=.;FRO=60;FSAF=29;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=34;FWDB=0.0252119;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.9272;QD=6.65093;RBI=0.0268491;REFB=-0.0177916;REVB=0.00923214;RO=57;SAF=29;SAR=18;SRF=26;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159742;STB=0.603639;TYPE=snp;VARB=0.038286;OID=.;OPOS=53645291;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:57:60:47:47:18:29:26:31:18:29:26:34 chr19 53668549 . T G 170.76 PASS AO=46;DP=107;FAO=46;FDP=107;FR=.;FRO=61;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=41;FSRR=20;FWDB=-0.0073274;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3538;QD=6.38342;RBI=0.0404335;REFB=-0.00179928;REVB=-0.039764;RO=61;SAF=18;SAR=28;SRF=41;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.279783;STB=0.656532;TYPE=snp;VARB=0.00476458;OID=.;OPOS=53668549;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:61:61:46:46:28:18:41:20:28:18:41:20 chr19 53669273 . T C 950.96 PASS AO=100;DP=105;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141609;FXX=0.0560695;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.416;QD=37.6616;RBI=0.0172845;REFB=-0.0820789;REVB=0.00991079;RO=2;SAF=35;SAR=65;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0263322;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.93307e-05;OID=.;OPOS=53669273;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:105:101:2:0:100:101:65:35:2:0:65:36:0:0 chr19 53740822 . T C 94.54 PASS AO=22;DP=47;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.00413069;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=301.845;QD=8.04599;RBI=0.0172425;REFB=-0.00951971;REVB=0.0167404;RO=25;SAF=4;SAR=18;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.310119;STB=0.678209;TYPE=snp;VARB=0.0130286;OID=.;OPOS=53740822;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:47:47:25:25:22:22:18:4:11:14:18:4:11:14 chr19 53741068 . C T 297.06 PASS AO=82;DP=184;FAO=81;FDP=184;FR=.;FRO=103;FSAF=46;FSAR=35;FSRF=49;FSRR=54;FWDB=-0.01587;FXX=0.00540511;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.9201;QD=6.45786;RBI=0.0361747;REFB=-0.01382;REVB=0.0325077;RO=102;SAF=47;SAR=35;SRF=48;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102732;STB=0.551814;TYPE=snp;VARB=0.0275698;OID=.;OPOS=53741068;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:184:102:103:82:81:35:47:48:54:35:46:49:54 chr19 53741188 . C T 295.19 PASS AO=89;DP=222;FAO=90;FDP=223;FR=.;FRO=133;FSAF=35;FSAR=55;FSRF=54;FSRR=79;FWDB=-0.0154175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.485;QD=5.29481;RBI=0.0174347;REFB=-0.00833033;REVB=0.00814062;RO=129;SAF=35;SAR=54;SRF=51;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00231184;STB=0.510691;TYPE=snp;VARB=0.00938275;OID=.;OPOS=53741188;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:223:129:133:89:90:54:35:51:78:55:35:54:79 chr19 53761740 . T C 156.31 PASS AO=53;DP=144;FAO=53;FDP=144;FR=.;FRO=91;FSAF=21;FSAR=32;FSRF=37;FSRR=54;FWDB=-0.0666061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.419;QD=4.34194;RBI=0.0891558;REFB=-0.0490009;REVB=-0.0592653;RO=91;SAF=21;SAR=32;SRF=37;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119847;STB=0.506824;TYPE=snp;VARB=0.0770427;OID=.;OPOS=53761740;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:144:91:91:53:53:32:21:37:54:32:21:37:54 chr19 53762537 . C T 360.46 PASS AO=91;DP=200;FAO=93;FDP=202;FR=.;FRO=109;FSAF=41;FSAR=52;FSRF=53;FSRR=56;FWDB=-0.00339211;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.385;QD=7.13788;RBI=0.00343173;REFB=0.00609132;REVB=-0.000519981;RO=109;SAF=39;SAR=52;SRF=53;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0573109;STB=0.524683;TYPE=snp;VARB=-0.00745299;OID=.;OPOS=53762537;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:200:202:109:109:91:93:52:39:53:56:52:41:53:56 chr19 53770261 . T C 32.97 PASS AO=17;DP=70;FAO=17;FDP=70;FR=.;FRO=53;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=30;FSRR=23;FWDB=-0.057564;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.437;QD=1.88426;RBI=0.0591242;REFB=-0.001523;REVB=0.0134927;RO=52;SAF=10;SAR=7;SRF=29;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0382073;STB=0.517221;TYPE=snp;VARB=0.0129576;OID=.;OPOS=53770261;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:70:70:52:53:17:17:7:10:29:23:7:10:30:23 chr19 53787375 . C T 123.54 PASS AO=25;DP=46;FAO=25;FDP=46;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.0168267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4166;QD=10.7427;RBI=0.0289864;REFB=0.00451352;REVB=0.0236025;RO=21;SAF=6;SAR=19;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0982299;STB=0.55501;TYPE=snp;VARB=-0.001376;OID=.;OPOS=53787375;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:46:46:21:21:25:25:19:6:7:14:19:6:7:14 chr19 53793042 . G A 234.71 PASS AO=52;DP=102;FAO=53;FDP=103;FR=.;FRO=50;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=-0.0253649;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.877;QD=9.11487;RBI=0.0365483;REFB=0.00869998;REVB=0.0263135;RO=49;SAF=32;SAR=20;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11309;STB=0.571079;TYPE=snp;VARB=-0.00795509;OID=.;OPOS=53793042;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:103:49:50:52:53:20:32:24:25:20:33:24:26 chr19 53793574 . A G 421.48 PASS AO=118;DP=273;FAO=118;FDP=273;FR=.;FRO=155;FSAF=52;FSAR=66;FSRF=59;FSRR=96;FWDB=0.00132902;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.464;QD=6.17551;RBI=0.0144875;REFB=-0.0157222;REVB=-0.0144265;RO=155;SAF=52;SAR=66;SRF=59;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0627684;STB=0.534851;TYPE=snp;VARB=0.017094;OID=.;OPOS=53793574;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:273:273:155:155:118:118:66:52:59:96:66:52:59:96 chr19 53855329 . C T 37.96 PASS AO=7;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0180599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5961;QD=10.1233;RBI=0.192889;REFB=-0.0778085;REVB=0.192042;RO=6;SAF=1;SAR=6;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23478;STB=0.776953;TYPE=snp;VARB=0.200985;OID=.;OPOS=53855329;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:15:15:6:7:7:8:6:1:2:4:7:1:4:3 chr19 53856349 . A T 738.96 PASS AO=85;DP=88;FAO=82;FDP=85;FR=.;FRO=3;FSAF=55;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0129434;FXX=0.034087;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2459;QD=34.7746;RBI=0.0300605;REFB=-0.0123141;REVB=0.0271312;RO=2;SAF=58;SAR=27;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00912319;STB=0.513354;TYPE=snp;VARB=0.000151105;OID=.;OPOS=53856349;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:88:85:2:3:85:82:27:58:1:1:27:55:1:2 chr19 53875494 . A T 149.15 PASS AO=45;DP=112;FAO=45;FDP=114;FR=.;FRO=69;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=30;FSRR=39;FWDB=-0.096856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.6946;QD=5.23333;RBI=0.104205;REFB=-0.00292342;REVB=-0.0384401;RO=67;SAF=25;SAR=20;SRF=29;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129361;STB=0.559414;TYPE=snp;VARB=0.00169954;OID=.;OPOS=53875494;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:114:67:69:45:45:20:25:29:38:21:24:30:39 chr19 53875523 . G A 146.07 PASS AO=40;DP=109;FAO=44;FDP=111;FR=.;FRO=67;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=25;FSRR=42;FWDB=0.00627067;FXX=0.0176975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.705;QD=5.26388;RBI=0.0281078;REFB=-0.0132761;REVB=0.0273994;RO=68;SAF=17;SAR=23;SRF=25;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0654988;STB=0.536435;TYPE=snp;VARB=0.0221851;OID=.;OPOS=53875523;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:111:68:67:40:44:23:17:25:43:25:19:25:42 chr19 53875569 . G A 128.51 PASS AO=40;DP=105;FAO=40;FDP=105;FR=.;FRO=65;FSAF=10;FSAR=30;FSRF=23;FSRR=42;FWDB=-0.00761072;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.51;QD=4.89546;RBI=0.0286509;REFB=-0.00864914;REVB=0.0276215;RO=65;SAF=10;SAR=30;SRF=23;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137561;STB=0.578906;TYPE=snp;VARB=0.0142848;OID=.;OPOS=53875569;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:65:65:40:40:30:10:23:42:30:10:23:42 chr19 53879561 . GACA G 470.02 PASS AO=119;DP=292;FAO=126;FDP=281;FR=.;FRO=155;FSAF=54;FSAR=72;FSRF=79;FSRR=76;FWDB=0.000640539;FXX=0.0243047;HRUN=1;LEN=3;MLLD=258.689;QD=6.69071;RBI=0.0338557;REFB=0.00667427;REVB=-0.0338496;RO=148;SAF=52;SAR=67;SRF=76;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.076893;STB=0.545075;TYPE=del;VARB=-0.00786313;OID=.;OPOS=53879562;OREF=ACA;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:119:278:126:281:155:54:72:79:76:99:148:52:67:76:72 chr19 53884412 . G A 161.41 PASS AO=46;DP=112;FAO=46;FDP=112;FR=.;FRO=66;FSAF=17;FSAR=29;FSRF=29;FSRR=37;FWDB=-0.0144193;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=43.6562;QD=5.7648;RBI=0.017146;REFB=0.020411;REVB=0.00927749;RO=66;SAF=17;SAR=29;SRF=29;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0763664;STB=0.543141;TYPE=snp;VARB=-0.02777;OID=.;OPOS=53884412;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:66:66:46:46:29:17:29:37:29:17:29:37 chr19 53911510 . G A 1112.25 PASS AO=105;DP=106;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00301427;FXX=0.00854628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.84;QD=38.3535;RBI=0.0126959;REFB=0;REVB=0.0123329;RO=0;SAF=54;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.72595e-05;OID=.;OPOS=53911510;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:106:116:0:0:105:116:51:54:0:0:61:55:0:0 chr19 53911973 . A G 254.93 PASS AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.809;QD=37.7678;RBI=0.0126906;REFB=0;REVB=-0.0041025;RO=0;SAF=21;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.10883e-05;OID=.;OPOS=53911973;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:27:27:0:0:27:27:6:21:0:0:6:21:0:0 chr19 53912242 . G A 273.89 PASS AO=28;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0395199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.7139;QD=37.7785;RBI=0.0582878;REFB=0;REVB=0.0428444;RO=0;SAF=12;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00190014;OID=.;OPOS=53912242;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:28:29:0:0:28:29:16:12:0:0:16:13:0:0 chr19 53952885 . TC T 898.41 PASS AO=104;DP=143;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.117262;FXX=0.0428541;HRUN=4;LEN=1;MLLD=16.1993;QD=26.8181;RBI=0.11916;REFB=0;REVB=-0.0211827;RO=8;SAF=55;SAR=49;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0.423503;SSSB=-0.0300556;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.00212424;OID=.;OPOS=53952886;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:104:140:134:134:0:72:62:0:0:80:8:55:49:6:2 chr19 53958126 . T G 199 PASS AO=55;DP=132;FAO=56;FDP=133;FR=.;FRO=77;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=26;FSRR=51;FWDB=0.0110506;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.369;QD=5.98489;RBI=0.0239758;REFB=-0.0212954;REVB=-0.0212773;RO=76;SAF=24;SAR=31;SRF=26;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100701;STB=0.554547;TYPE=snp;VARB=0.0323469;OID=.;OPOS=53958126;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:133:76:77:55:56:31:24:26:50:32:24:26:51 chr19 53958263 . G A 200.42 PASS AO=49;DP=104;FAO=49;FDP=104;FR=.;FRO=55;FSAF=35;FSAR=14;FSRF=31;FSRR=24;FWDB=-0.0982896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.787;QD=7.70837;RBI=0.0983116;REFB=-0.0222895;REVB=-0.00208233;RO=55;SAF=35;SAR=14;SRF=31;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161036;STB=0.590024;TYPE=snp;VARB=0.0300702;OID=.;OPOS=53958263;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:55:55:49:49:14:35:31:24:14:35:31:24 chr19 53959343 . G A 114.76 PASS AO=18;DP=29;FAO=19;FDP=30;FR=.;FRO=11;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.00118579;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.304;QD=15.3008;RBI=0.0316846;REFB=-0.0804746;REVB=0.0316624;RO=11;SAF=9;SAR=9;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0927626;STB=0.540594;TYPE=snp;VARB=0.0467202;OID=.;OPOS=53959343;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:29:30:11:11:18:19:9:9:4:7:10:9:4:7 chr19 53959568 . G C 73.77 PASS AO=11;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.022411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.345;QD=8.94227;RBI=0.0293242;REFB=-0.0571753;REVB=0.0189119;RO=14;SAF=7;SAR=4;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134192;STB=0.513497;TYPE=snp;VARB=0.0145314;OID=.;OPOS=53959568;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:29:33:14:17:11:16:4:7:7:7:9:7:7:10 chr19 53989945 . G A 515.59 PASS AO=176;DP=460;FAO=160;FDP=399;FR=.;FRO=239;FSAF=81;FSAR=79;FSRF=100;FSRR=139;FWDB=0.00729589;FXX=0.00249994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=265.441;QD=5.16883;RBI=0.0151455;REFB=-0.0050491;REVB=0.0132723;RO=282;SAF=89;SAR=87;SRF=114;SRR=168;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111254;STB=0.552548;TYPE=snp;VARB=0.00676614;OID=.;OPOS=53989945;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:460:399:282:239:176:160:87:89:114:168:79:81:100:139 chr19 53990002 . G A 371.99 PASS AO=193;DP=536;FAO=140;FDP=400;FR=.;FRO=260;FSAF=68;FSAR=72;FSRF=118;FSRR=142;FWDB=0.01475;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.9;QD=3.71994;RBI=0.0202012;REFB=0.00456105;REVB=0.013803;RO=342;SAF=94;SAR=99;SRF=149;SRR=193;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0582906;STB=0.520753;TYPE=snp;VARB=-0.00886451;OID=.;OPOS=53990002;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:536:400:342:260:193:140:99:94:149:193:72:68:118:142 chr19 53993923 . C T 139.43 PASS AO=65;DP=216;FAO=65;FDP=220;FR=.;FRO=155;FSAF=41;FSAR=24;FSRF=68;FSRR=87;FWDB=-0.00914457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.87;QD=2.53512;RBI=0.0201346;REFB=-0.00362359;REVB=-0.0179382;RO=151;SAF=41;SAR=24;SRF=67;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.224756;STB=0.634952;TYPE=snp;VARB=0.0107585;OID=.;OPOS=53993923;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:216:220:151:155:65:65:24:41:67:84:24:41:68:87 chr19 53995004 . G A 92.94 PASS AO=19;DP=36;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.00660004;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.4765;QD=10.3263;RBI=0.0661987;REFB=0.000422182;REVB=0.0658688;RO=13;SAF=10;SAR=9;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00885881;STB=0.501465;TYPE=snp;VARB=0.00175469;OID=.;OPOS=53995004;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:36:36:13:17:19:19:9:10:7:6:9:10:9:8 chr19 54080144 . A G 284.68 PASS AO=67;DP=154;FAO=72;FDP=156;FR=.;FRO=84;FSAF=26;FSAR=46;FSRF=45;FSRR=39;FWDB=0.0104577;FXX=0.0249984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.087;QD=7.29936;RBI=0.013917;REFB=-0.0139782;REVB=0.00918246;RO=78;SAF=25;SAR=42;SRF=45;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199014;STB=0.596394;TYPE=snp;VARB=0.0147909;OID=.;OPOS=54080144;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:156:78:84:67:72:42:25:45:33:46:26:45:39 chr19 54132976 . A G 543.52 PASS AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.045;QD=38.142;RBI=0.0335134;REFB=0;REVB=0.0158059;RO=0;SAF=38;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.37614e-05;OID=.;OPOS=54132976;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:57:57:0:0:57:57:19:38:0:0:19:38:0:0 chr19 54222321 . A T 913.56 PASS AO=233;DP=439;FAO=207;FDP=398;FR=.;FRO=191;FSAF=145;FSAR=62;FSRF=124;FSRR=67;FWDB=-0.00269716;FXX=0.00499988;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.6161;QD=9.18152;RBI=0.00831331;REFB=-0.0272798;REVB=0.00786361;RO=205;SAF=161;SAR=72;SRF=139;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129459;STB=0.528641;TYPE=snp;VARB=0.0245962;OID=.;OPOS=54222321;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:439:398:205:191:233:207:72:161:139:66:62:145:124:67 chr19 54261549 . C G 557.47 PASS AO=128;DP=250;FAO=127;FDP=248;FR=.;FRO=121;FSAF=75;FSAR=52;FSRF=64;FSRR=57;FWDB=0.0247113;FXX=0.0040159;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.862;QD=8.99138;RBI=0.0247616;REFB=0.000833476;REVB=0.00157777;RO=113;SAF=76;SAR=52;SRF=61;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0475023;STB=0.530736;TYPE=snp;VARB=-0.00069081;OID=.;OPOS=54261549;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:250:248:113:121:128:127:52:76:61:52:52:75:64:57 chr19 54301646 . GC G 223.86 PASS AO=30;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.171482;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.7212;QD=22.3856;RBI=0.351681;REFB=0;REVB=0.30704;RO=9;SAF=13;SAR=17;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0.23296;SSSB=-0.00480659;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0271767;OID=.;OPOS=54301647;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:30:40:40:40:0:18:22:0:0:20:9:13:17:4:5 chr19 54307322 . G A,T 1164.31 PASS AO=72,58;DP=130;FAO=74,56;FDP=132;FR=.;FRO=2;FSAF=25,14;FSAR=49,42;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0148425,0.0166964;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=75.5769,109.559;QD=35.2822;RBI=0.0177681,0.0189731;REFB=-0.115896,-0.0712011;REVB=0.00976762,0.00901148;RO=0;SAF=24,16;SAR=48,42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.83285e-08;STB=0.519226,0.533321;TYPE=snp,snp;VARB=-0.011736,0.0203677;OID=.,.;OPOS=54307322,54307322;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:130:132:0:2:72,58:74,56:48,42:24,16:0:0:49,42:25,14:2:0 chr19 54308554 . C T 337.45 PASS AO=31;DP=32;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0396993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.602;QD=35.5213;RBI=0.0555743;REFB=-0.0931087;REVB=0.0388905;RO=1;SAF=21;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0443701;STB=0.523796;TYPE=snp;VARB=0.00122502;OID=.;OPOS=54308554;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:32:38:1:1:31:37:10:21:0:1:10:27:0:1 chr19 54313707 . G C 40.82 PASS AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=14;FWDB=-0.0100953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.778;QD=6.53148;RBI=0.022331;REFB=-0.00990985;REVB=-0.0199188;RO=15;SAF=5;SAR=5;SRF=1;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.45649;STB=0.75962;TYPE=snp;VARB=0.00911592;OID=.;OPOS=54313707;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:25:25:15:15:10:10:5:5:1:14:5:5:1:14 chr19 54327313 . C A 222.6 PASS AO=51;DP=106;FAO=52;FDP=109;FR=.;FRO=57;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=18;FSRR=39;FWDB=-0.00571656;FXX=0.00909008;HRUN=3;LEN=1;MLLD=149.663;QD=8.16878;RBI=0.012379;REFB=-0.00924858;REVB=0.0109801;RO=53;SAF=25;SAR=26;SRF=17;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156881;STB=0.586948;TYPE=snp;VARB=0.0108784;OID=.;OPOS=54327313;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:109:53:57:51:52:26:25:17:36:27:25:18:39 chr19 54378082 . T C 107.82 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.113883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.581;QD=35.9383;RBI=0.114283;REFB=0;REVB=0.00955702;RO=0;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00288304;OID=.;OPOS=54378082;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:8:4:0:0:8:4:0:0 chr19 54378627 . T A 2459.62 PASS AO=267;DP=276;FAO=267;FDP=267;FR=.;FRO=0;FSAF=224;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00917187;FXX=0.0326075;HRUN=3;LEN=1;MLLD=141.11;QD=36.8483;RBI=0.0153043;REFB=-0.0732352;REVB=-0.0122515;RO=6;SAF=224;SAR=43;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125973;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000127519;OID=.;OPOS=54378627;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:276:267:6:0:267:267:43:224:6:0:43:224:0:0 chr19 54378789 . C G 2853.58 PASS AO=282;DP=309;FAO=302;FDP=302;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=225;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0583938;FXX=0.0412685;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.4558;QD=37.7958;RBI=0.0637114;REFB=0;REVB=0.0254813;RO=0;SAF=65;SAR=217;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.01081e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0012057;OID=.;OPOS=54378789;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:309:302:0:0:282:302:217:65:0:0:225:77:0:0 chr19 54379573 . C T 566.43 PASS AO=61;DP=64;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0682208;FXX=0.0156226;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.8413;QD=35.9639;RBI=0.115927;REFB=-0.118217;REVB=0.0937289;RO=2;SAF=48;SAR=13;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0252006;STB=0.505153;TYPE=snp;VARB=0.00211077;OID=.;OPOS=54379573;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:64:63:2:1:61:62:13:48:1:1:14:48:1:0 chr19 54385820 . C T 1807.59 PASS AO=195;DP=201;FAO=199;FDP=205;FR=.;FRO=6;FSAF=72;FSAR=127;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0216853;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=245.172;QD=35.27;RBI=0.0245433;REFB=-0.030585;REVB=0.0114944;RO=5;SAF=72;SAR=123;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00157088;STB=0.500903;TYPE=snp;VARB=0.00010326;OID=.;OPOS=54385820;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:201:205:5:6:195:199:123:72:2:3:127:72:2:4 chr19 54394965 . T C 643.4 PASS AO=131;DP=240;FAO=133;FDP=238;FR=.;FRO=105;FSAF=41;FSAR=92;FSRF=33;FSRR=72;FWDB=-0.00239029;FXX=0.0205753;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.637;QD=10.8134;RBI=0.00322625;REFB=0.00903589;REVB=0.00216685;RO=104;SAF=41;SAR=90;SRF=33;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00408948;STB=0.503103;TYPE=snp;VARB=-0.00579805;OID=.;OPOS=54394965;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:240:238:104:105:131:133:90:41:33:71:92:41:33:72 chr19 54545186 . C T 174.78 PASS AO=40;DP=83;FAO=40;FDP=81;FR=.;FRO=41;FSAF=9;FSAR=31;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=0.0129125;FXX=0.0240935;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.073;QD=8.63096;RBI=0.0163258;REFB=-0.0066589;REVB=-0.00998989;RO=41;SAF=9;SAR=31;SRF=16;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188954;STB=0.605885;TYPE=snp;VARB=0.00825492;OID=.;OPOS=54545186;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:81:41:41:40:40:31:9:16:25:31:9:16:25 chr19 54545390 . A AC 302.31 PASS AO=52;DP=102;FAO=60;FDP=100;FR=.;FRO=40;FSAF=44;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=9;FWDB=0.00581659;FXX=0.0196059;HRUN=0;LEN=1;MLLD=85.7867;QD=12.0923;RBI=0.0771069;REFB=0.00168741;REVB=0.0768872;RO=42;SAF=39;SAR=13;SRF=31;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0128224;STB=0.521732;TYPE=ins;VARB=-0.000966351;OID=.;OPOS=54545391;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:52:102:60:100:40:44:16:31:9:99:42:39:13:31:11 chr19 54545531 . T C 641.82 PASS AO=140;DP=269;FAO=143;FDP=271;FR=.;FRO=128;FSAF=85;FSAR=58;FSRF=59;FSRR=69;FWDB=-0.034522;FXX=0.00367634;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.056;QD=9.47339;RBI=0.0404235;REFB=-0.0241443;REVB=-0.0210306;RO=127;SAF=84;SAR=56;SRF=59;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119533;STB=0.563787;TYPE=snp;VARB=0.0166509;OID=.;OPOS=54545531;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:269:271:127:128:140:143:56:84:59:68:58:85:59:69 chr19 54561792 . G A 376.08 PASS AO=83;DP=158;FAO=83;FDP=159;FR=.;FRO=76;FSAF=46;FSAR=37;FSRF=44;FSRR=32;FWDB=0.00197776;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.707;QD=9.46111;RBI=0.0280209;REFB=-0.0252694;REVB=0.027951;RO=75;SAF=46;SAR=37;SRF=43;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0167871;STB=0.51199;TYPE=snp;VARB=0.0208809;OID=.;OPOS=54561792;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:159:75:76:83:83:37:46:43:32:37:46:44:32 chr19 54600232 . A C 1807.18 PASS AO=193;DP=196;FAO=194;FDP=194;FR=.;FRO=0;FSAF=109;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0137518;FXX=0.0102036;HRUN=3;LEN=1;MLLD=99.6373;QD=37.2614;RBI=0.0138112;REFB=-0.0151373;REVB=-0.00127941;RO=2;SAF=108;SAR=85;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0110718;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.06656e-05;OID=.;OPOS=54600232;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:196:194:2:0:193:194:85:108:0:2:85:109:0:0 chr19 54606209 . T G 101.96 PASS AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0187857;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.566;QD=37.0753;RBI=0.0355264;REFB=0;REVB=-0.0301533;RO=0;SAF=10;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000585748;OID=.;OPOS=54606209;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:11:11:1:10:0:0:1:10:0:0 chr19 54613420 . G A 32.04 PASS AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=0.000468608;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.718;QD=5.8252;RBI=0.0196675;REFB=0.0042304;REVB=0.0196619;RO=14;SAF=7;SAR=1;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.274278;STB=0.672562;TYPE=snp;VARB=-0.00496742;OID=.;OPOS=54613420;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:22:22:14:14:8:8:1:7:10:4:1:7:10:4 chr19 54649670 . CT C,CC 168.06 PASS AO=4,10;DP=19;FAO=12,6;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=6,1;FSAR=6,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.165161,0.155851;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=208.445,207.104;QD=37.3457;RBI=0.171206,0.161251;REFB=0,0;REVB=-0.0450926,-0.0413798;RO=0;SAF=2,1;SAR=2,9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.8593e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.0423852,0.0193782;OID=.,.;OPOS=54649671,54649671;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:4,10:14:12,6:18:0:6,1:6,5:0:0:15:0:2,1:2,9:0:0 chr19 54664209 . G C 121.42 PASS AO=36;DP=93;FAO=36;FDP=92;FR=.;FRO=56;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=30;FWDB=-0.0516814;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.1399;QD=5.27926;RBI=0.0899047;REFB=-0.0581737;REVB=0.0735655;RO=54;SAF=15;SAR=21;SRF=24;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0299896;STB=0.529504;TYPE=snp;VARB=0.0688618;OID=.;OPOS=54664209;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:92:54:56:36:36:21:15:24:30:21:15:26:30 chr19 54664752 . A C 328.49 PASS AO=61;DP=101;FAO=61;FDP=101;FR=.;FRO=40;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=0.00133786;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=239.107;QD=13.0094;RBI=0.00222177;REFB=-0.0102839;REVB=-0.00177381;RO=39;SAF=31;SAR=30;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0401341;STB=0.526478;TYPE=snp;VARB=0.00689349;OID=.;OPOS=54664752;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:101:39:40:61:61:30:31:22:17:30:31:23:17 chr19 54674742 . C T 765.94 PASS AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0297444;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.65;QD=38.782;RBI=0.0301467;REFB=0;REVB=-0.00490874;RO=0;SAF=45;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40017e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.76021e-05;OID=.;OPOS=54674742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:80:79:0:0:79:79:34:45:0:0:34:45:0:0 chr19 54675643 . G A 170.85 PASS AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0306756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.7795;QD=37.9668;RBI=0.0306974;REFB=0;REVB=-0.00115681;RO=0;SAF=12;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000611524;OID=.;OPOS=54675643;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:18:0:0:18:18:6:12:0:0:6:12:0:0 chr19 54676763 . C T 752.77 PASS AO=81;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0096863;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=218.337;QD=36.7207;RBI=0.0151056;REFB=-0.0850994;REVB=0.0115912;RO=1;SAF=27;SAR=54;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00868924;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000187541;OID=.;OPOS=54676763;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:82:82:1:0:81:82:54:27:0:1:55:27:0:0 chr19 54676814 . G GC 497.92 PASS AO=61;DP=79;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.279539;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.736;QD=26.2062;RBI=0.283458;REFB=0;REVB=0.0469666;RO=15;SAF=19;SAR=42;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0649056;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00617108;OID=.;OPOS=54676815;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:61:79:76:76:0:26:50:0:0:45:15:19:42:7:8 chr19 54677167 . G T 423.54 PASS AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0270997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.32;QD=36.0459;RBI=0.048324;REFB=-0.114374;REVB=0.0400102;RO=0;SAF=38;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.19647e-08;STB=0.529399;TYPE=snp;VARB=0.00169347;OID=.;OPOS=54677167;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:47:47:0:1:46:46:8:38:0:0:8:38:0:1 chr19 54677189 . C T 400.42 PASS AO=42;DP=45;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0997856;FXX=0.0444346;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.2829;QD=37.2483;RBI=0.103946;REFB=0;REVB=0.0291135;RO=0;SAF=34;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.67012e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00251257;OID=.;OPOS=54677189;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:45:43:0:0:42:43:8:34:0:0:9:34:0:0 chr19 54677759 . T C 497.76 PASS AO=51;DP=51;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0116973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.634;QD=37.5665;RBI=0.0117336;REFB=0;REVB=-0.000922014;RO=0;SAF=33;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-8.62909e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.30455e-05;OID=.;OPOS=54677759;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:51:53:0:0:51:53:18:33:0:0:18:35:0:0 chr19 54677897 . G A 316.55 PASS AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175056;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.162;QD=37.2411;RBI=0.0468049;REFB=0;REVB=0.0434079;RO=0;SAF=12;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.75716e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000260587;OID=.;OPOS=54677897;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:34:0:0:34:34:22:12:0:0:22:12:0:0 chr19 54697079 . C T 1176.96 PASS AO=126;DP=128;FAO=126;FDP=128;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=97;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0104379;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=216.075;QD=36.78;RBI=0.0105938;REFB=-0.0777383;REVB=-0.00181069;RO=0;SAF=29;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50591;TYPE=snp;VARB=4.81609e-05;OID=.;OPOS=54697079;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:128:128:0:2:126:126:97:29:0:0:97:29:1:1 chr19 54711329 . C T 104.06 PASS AO=26;DP=62;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=0.085758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.3872;QD=6.60674;RBI=0.0862007;REFB=0.0101027;REVB=-0.00872504;RO=36;SAF=15;SAR=11;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00670139;STB=0.505464;TYPE=snp;VARB=-0.0203106;OID=.;OPOS=54711329;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:63:36:36:26:27:11:15:21:15:11:16:21:15 chr19 54722275 . G A 233.75 PASS AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0536008;FXX=0.0384468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.308;QD=37.4001;RBI=0.0550735;REFB=0;REVB=0.012651;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000728705;OID=.;OPOS=54722275;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:26:25:0:0:25:25:13:12:0:0:13:12:0:0 chr19 54723738 . G C 195.14 PASS AO=19;DP=20;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00100112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.203;QD=37.1703;RBI=0.0143965;REFB=0;REVB=0.0143616;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000169838;OID=.;OPOS=54723738;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:20:21:0:0:19:21:9:10:0:0:9:12:0:0 chr19 54723898 . T C 99.34 PASS AO=10;DP=15;FAO=14;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.378288;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.4834;QD=26.4901;RBI=0.393556;REFB=-0.0553565;REVB=0.108556;RO=5;SAF=1;SAR=9;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194936;STB=0.518492;TYPE=snp;VARB=0.0442626;OID=.;OPOS=54723898;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:15:15:5:1:10:14:9:1:0:5:13:1:0:1 chr19 54724006 . C A 158.91 PASS AO=16;DP=16;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.100273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.827;QD=37.3904;RBI=0.100986;REFB=0;REVB=-0.0119761;RO=0;SAF=1;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000510956;OID=.;OPOS=54724006;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:16:17:0:0:16:17:15:1:0:0:16:1:0:0 chr19 54744104 . T G 30.25 PASS AO=7;DP=18;FAO=7;FDP=18;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.030745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1003;QD=6.72282;RBI=0.0939663;REFB=-0.0309797;REVB=-0.0887942;RO=11;SAF=6;SAR=1;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.312896;STB=0.69701;TYPE=snp;VARB=0.0330633;OID=.;OPOS=54744104;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:18:18:11:11:7:7:1:6:7:4:1:6:7:4 chr19 54744209 . T C 308.26 PASS AO=70;DP=138;FAO=70;FDP=138;FR=.;FRO=68;FSAF=33;FSAR=37;FSRF=40;FSRR=28;FWDB=-0.0449665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.112;QD=8.93512;RBI=0.0554228;REFB=-0.0229911;REVB=0.0323991;RO=68;SAF=33;SAR=37;SRF=40;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104248;STB=0.557351;TYPE=snp;VARB=0.0134963;OID=.;OPOS=54744209;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:68:68:70:70:37:33:40:28:37:33:40:28 chr19 54744210 . A G 307.53 PASS AO=70;DP=138;FAO=70;FDP=138;FR=.;FRO=68;FSAF=33;FSAR=37;FSRF=40;FSRR=28;FWDB=-0.00975133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.231;QD=8.91399;RBI=0.027428;REFB=-0.00339447;REVB=-0.0256361;RO=68;SAF=33;SAR=37;SRF=40;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104248;STB=0.557351;TYPE=snp;VARB=0.00372256;OID=.;OPOS=54744210;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:68:68:70:70:37:33:40:28:37:33:40:28 chr19 54744361 . A C 275.39 PASS AO=115;DP=347;FAO=116;FDP=355;FR=.;FRO=239;FSAF=37;FSAR=79;FSRF=125;FSRR=114;FWDB=0.0132787;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.5859;QD=3.10296;RBI=0.0736427;REFB=0.00135626;REVB=-0.0724357;RO=202;SAF=36;SAR=79;SRF=95;SRR=107;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188431;STB=0.641833;TYPE=snp;VARB=-0.00610506;OID=.;OPOS=54744361;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:347:355:202:239:115:116:79:36:95:107:79:37:125:114 chr19 54744387 . C T 234.83 PASS AO=89;DP=265;FAO=91;FDP=270;FR=.;FRO=179;FSAF=32;FSAR=59;FSRF=94;FSRR=85;FWDB=-0.0429671;FXX=0.0036899;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.3517;QD=3.4789;RBI=0.0502386;REFB=-0.0176638;REVB=0.0260335;RO=173;SAF=32;SAR=57;SRF=89;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182522;STB=0.617313;TYPE=snp;VARB=0.0286047;OID=.;OPOS=54744387;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:265:270:173:179:89:91:57:32:89:84:59:32:94:85 chr19 54744794 . G A 87.21 PASS AO=23;DP=60;FAO=24;FDP=60;FR=.;FRO=36;FSAF=19;FSAR=5;FSRF=30;FSRR=6;FWDB=-0.00390412;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.936;QD=5.81373;RBI=0.0136572;REFB=-0.0117305;REVB=0.0130872;RO=35;SAF=19;SAR=4;SRF=30;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0596264;STB=0.539616;TYPE=snp;VARB=0.0340936;OID=.;OPOS=54744794;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:60:60:35:36:23:24:4:19:30:5:5:19:30:6 chr19 54744799 . G C 85.45 PASS AO=24;DP=61;FAO=24;FDP=61;FR=.;FRO=37;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=31;FSRR=6;FWDB=-0.0116902;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=229.209;QD=5.60345;RBI=0.0394761;REFB=-0.0085451;REVB=-0.0377054;RO=37;SAF=18;SAR=6;SRF=31;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134732;STB=0.576413;TYPE=snp;VARB=0.0208806;OID=.;OPOS=54744799;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:61:61:37:37:24:24:6:18:31:6:6:18:31:6 chr19 54745907 . A G 125.11 PASS AO=94;DP=399;FAO=93;FDP=399;FR=.;FRO=306;FSAF=55;FSAR=38;FSRF=178;FSRR=128;FWDB=-0.0395045;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9282;QD=1.25422;RBI=0.127806;REFB=-0.010106;REVB=-0.121548;RO=300;SAF=55;SAR=39;SRF=177;SRR=123;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00640918;STB=0.507672;TYPE=snp;VARB=0.0342131;OID=.;OPOS=54745907;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:399:399:300:306:94:93:39:55:177:123:38:55:178:128 chr19 54746051 . A C 1659.91 PASS AO=388;DP=557;FAO=275;FDP=399;FR=.;FRO=124;FSAF=144;FSAR=131;FSRF=64;FSRR=60;FWDB=-0.035063;FXX=0.00249994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.5842;QD=16.6407;RBI=0.0384124;REFB=0.00470387;REVB=-0.0156874;RO=163;SAF=196;SAR=192;SRF=83;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00224551;STB=0.502338;TYPE=snp;VARB=-0.00269949;OID=.;OPOS=54746051;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:557:399:163:124:388:275:192:196:83:80:131:144:64:60 chr19 54746107 . C T 57.67 PASS AO=73;DP=367;FAO=68;FDP=365;FR=.;FRO=297;FSAF=32;FSAR=36;FSRF=142;FSRR=155;FWDB=0.0692168;FXX=0.0108398;HRUN=4;LEN=1;MLLD=41.5114;QD=0.63202;RBI=0.0727202;REFB=-0.00162665;REVB=0.0222994;RO=288;SAF=36;SAR=37;SRF=134;SRR=154;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0360267;STB=0.506139;TYPE=snp;VARB=0.00836222;OID=.;OPOS=54746107;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:367:365:288:297:73:68:37:36:134:154:36:32:142:155 chr19 54754752 . T C 385.45 PASS AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0942624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.318;QD=37.6052;RBI=0.097441;REFB=0;REVB=0.024685;RO=0;SAF=25;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.1719e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000624198;OID=.;OPOS=54754752;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:41:41:0:0:41:41:16:25:0:0:16:25:0:0 chr19 54754820 . T G 121.04 PASS AO=14;DP=16;FAO=15;FDP=17;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0125019;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.3995;QD=28.4802;RBI=0.0710146;REFB=-0.0202557;REVB=-0.0699055;RO=2;SAF=12;SAR=2;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144584;STB=0.581968;TYPE=snp;VARB=0.011981;OID=.;OPOS=54754820;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:16:17:2:2:14:15:2:12:1:1:2:13:1:1 chr19 54755021 . G A 26.54 PASS AO=16;DP=72;FAO=16;FDP=73;FR=.;FRO=57;FSAF=1;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=33;FWDB=-0.0255313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.2767;QD=1.45407;RBI=0.0341162;REFB=0.00374927;REVB=0.022629;RO=55;SAF=1;SAR=15;SRF=22;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.57289;STB=0.885924;TYPE=snp;VARB=-0.0132698;OID=.;OPOS=54755021;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:72:73:55:57:16:16:15:1:22:33:15:1:24:33 chr19 54755911 . C T 38.96 PASS AO=15;DP=52;FAO=15;FDP=52;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=33;FSRR=4;FWDB=0.0419406;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.8332;QD=2.9966;RBI=0.0481743;REFB=0.000342588;REVB=-0.0237013;RO=37;SAF=12;SAR=3;SRF=33;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198203;STB=0.616309;TYPE=snp;VARB=-0.00030062;OID=.;OPOS=54755911;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:52:52:37:37:15:15:3:12:33:4:3:12:33:4 chr19 54755922 . C T 53.53 PASS AO=17;DP=50;FAO=17;FDP=50;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=29;FSRR=4;FWDB=0.00608049;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.93;QD=4.28206;RBI=0.00701195;REFB=0.00161314;REVB=-0.00349215;RO=32;SAF=14;SAR=3;SRF=29;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183788;STB=0.568209;TYPE=snp;VARB=-0.00727176;OID=.;OPOS=54755922;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:50:50:32:33:17:17:3:14:29:3:3:14:29:4 chr19 54755923 . A G 54.68 PASS AO=17;DP=49;FAO=17;FDP=49;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=28;FSRR=4;FWDB=-0.0188682;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.326;QD=4.46337;RBI=0.115711;REFB=0.00622591;REVB=-0.114163;RO=31;SAF=14;SAR=3;SRF=28;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174078;STB=0.562433;TYPE=snp;VARB=-0.0181278;OID=.;OPOS=54755923;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:49:49:31:32:17:17:3:14:28:3:3:14:28:4 chr19 54759361 . T C 141.49 PASS AO=28;DP=51;FAO=28;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.046407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.848;QD=11.0972;RBI=0.0469365;REFB=-0.0299648;REVB=-0.0070302;RO=23;SAF=8;SAR=20;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174574;STB=0.597411;TYPE=snp;VARB=0.0232471;OID=.;OPOS=54759361;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:51:51:23:23:28:28:20:8:11:12:20:8:11:12 chr19 54767879 . T C 411.89 PASS AO=132;DP=327;FAO=129;FDP=326;FR=.;FRO=197;FSAF=57;FSAR=72;FSRF=105;FSRR=92;FWDB=-0.00415425;FXX=0.00911826;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.265;QD=5.05383;RBI=0.00472489;REFB=-0.00740188;REVB=-0.00225096;RO=192;SAF=59;SAR=73;SRF=104;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100348;STB=0.555103;TYPE=snp;VARB=0.0117737;OID=.;OPOS=54767879;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:327:326:192:197:132:129:73:59:104:88:72:57:105:92 chr19 54782407 . C T 133.33 PASS AO=26;DP=46;FAO=26;FDP=46;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.0122134;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.727;QD=11.594;RBI=0.0122535;REFB=-0.0218461;REVB=-0.000989933;RO=20;SAF=14;SAR=12;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00909265;STB=0.505047;TYPE=snp;VARB=0.016782;OID=.;OPOS=54782407;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:46:46:20:20:26:26:12:14:11:9:12:14:11:9 chr19 54782704 . G C 76.85 PASS AO=16;DP=30;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.033175;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.246;QD=10.6005;RBI=0.0343591;REFB=-0.0133148;REVB=0.0089426;RO=13;SAF=12;SAR=4;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0587417;STB=0.603622;TYPE=snp;VARB=0.00502415;OID=.;OPOS=54782704;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:30:29:13:14:16:15:4:12:9:4:3:12:9:5 chr19 54782710 . A G 100.79 PASS AO=19;DP=35;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.0318044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.651;QD=11.1987;RBI=0.0330762;REFB=-0.0141545;REVB=-0.00908356;RO=16;SAF=16;SAR=3;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260069;STB=0.605944;TYPE=snp;VARB=0.00930035;OID=.;OPOS=54782710;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:35:36:16:16:19:20:3:16:10:6:4:16:10:6 chr19 54782724 . G A 126.31 PASS AO=23;DP=39;FAO=23;FDP=39;FR=.;FRO=16;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=0.00633196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.745;QD=12.955;RBI=0.0242987;REFB=0.00287827;REVB=-0.0234592;RO=15;SAF=18;SAR=5;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0497712;STB=0.519214;TYPE=snp;VARB=-0.00166053;OID=.;OPOS=54782724;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:39:39:15:16:23:23:5:18:11:4:5:18:12:4 chr19 54783375 . T A 279.15 PASS AO=63;DP=126;FAO=64;FDP=127;FR=.;FRO=63;FSAF=48;FSAR=16;FSRF=39;FSRR=24;FWDB=-0.0150151;FXX=0.00781189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.9306;QD=8.79212;RBI=0.0380499;REFB=0.00420351;REVB=-0.0349621;RO=63;SAF=47;SAR=16;SRF=39;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139488;STB=0.579684;TYPE=snp;VARB=-0.00470741;OID=.;OPOS=54783375;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:127:63:63:63:64:16:47:39:24:16:48:39:24 chr19 54783923 . A G 333.76 PASS AO=34;DP=36;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0164021;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.6745;QD=35.1329;RBI=0.0459768;REFB=-0.0635071;REVB=0.0429516;RO=1;SAF=29;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0158543;STB=0.508192;TYPE=snp;VARB=0.00275761;OID=.;OPOS=54783923;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:36:38:1:1:34:37:5:29:1:0:7:30:1:0 chr19 54848722 . C G 84.8 PASS AO=15;DP=27;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.0344004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.3004;QD=12.1136;RBI=0.0425985;REFB=-0.0154105;REVB=-0.0251245;RO=12;SAF=12;SAR=3;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145668;STB=0.545395;TYPE=snp;VARB=0.0306626;OID=.;OPOS=54848722;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:27:28:12:12:15:16:3:12:8:4:4:12:8:4 chr19 54848741 . T C 77.36 PASS AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=4;FWDB=-0.0273005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.909;QD=8.8414;RBI=0.035629;REFB=-0.00564114;REVB=-0.0228935;RO=17;SAF=13;SAR=4;SRF=14;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0755876;STB=0.509423;TYPE=snp;VARB=0.00623524;OID=.;OPOS=54848741;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:34:35:17:18:17:17:4:13:14:3:4:13:14:4 chr19 54881850 . G T 298.13 PASS AO=39;DP=46;FAO=39;FDP=46;FR=.;FRO=7;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.0433734;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=228.514;QD=25.9241;RBI=0.0436309;REFB=-0.00382798;REVB=-0.00473309;RO=7;SAF=19;SAR=20;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0238743;STB=0.512814;TYPE=snp;VARB=0.000348593;OID=.;OPOS=54881850;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:46:46:7:7:39:39:20:19:4:3:20:19:4:3 chr19 54962579 . C T 940.63 PASS AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00566616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.2117;QD=38.3931;RBI=0.0303734;REFB=0;REVB=0.0298402;RO=0;SAF=46;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000154266;OID=.;OPOS=54962579;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:98:98:0:0:98:98:52:46:0:0:52:46:0:0 chr19 54965860 . G A 279.43 PASS AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105889;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.247;QD=38.5423;RBI=0.0177779;REFB=0;REVB=0.0142804;RO=0;SAF=11;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.76454e-05;OID=.;OPOS=54965860;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:29:29:0:0:29:29:18:11:0:0:18:11:0:0 chr19 54966579 . C G 678.38 PASS AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0611609;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.5431;QD=37.688;RBI=0.119288;REFB=0;REVB=-0.102416;RO=0;SAF=27;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.27032e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00185783;OID=.;OPOS=54966579;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:72:72:0:0:72:72:45:27:0:0:45:27:0:0 chr19 54972719 . A T 88.99 PASS AO=19;DP=38;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=3;FSRR=16;FWDB=-0.130849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.467;QD=9.36773;RBI=0.136449;REFB=-0.0342886;REVB=0.0386891;RO=19;SAF=4;SAR=15;SRF=3;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0737189;STB=0.541443;TYPE=snp;VARB=0.0349709;OID=.;OPOS=54972719;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:38:38:19:19:19:19:15:4:3:16:15:4:3:16 chr19 54973280 . C G 658.51 PASS AO=67;DP=67;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0361383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.113;QD=38.1743;RBI=0.0373951;REFB=0;REVB=0.00961342;RO=0;SAF=20;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.05209e-05;OID=.;OPOS=54973280;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:67:69:0:0:67:69:47:20:0:0:48:21:0:0 chr19 55009496 . CA C 55.41 PASS AO=25;DP=134;FAO=27;FDP=110;FR=.;FRO=83;FSAF=25;FSAR=2;FSRF=32;FSRR=51;FWDB=0.00281109;FXX=0.133848;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.939;QD=2.0148;RBI=0.0147193;REFB=0.0020844;REVB=0.0144484;RO=84;SAF=25;SAR=0;SRF=33;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.802882;STB=0.920457;TYPE=del;VARB=-0.00276709;OID=.;OPOS=55009497;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:25:128:27:110:83:25:2:32:51:55:84:25:0:33:51 chr19 55014172 . A T 85.82 PASS AO=19;DP=40;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=0.0351459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.2159;QD=8.58155;RBI=0.0392479;REFB=-0.00196572;REVB=-0.0174689;RO=20;SAF=5;SAR=14;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.399102;STB=0.736593;TYPE=snp;VARB=0.00106537;OID=.;OPOS=55014172;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:40:40:20:21:19:19:14:5:14:6:14:5:15:6 chr19 55019402 . A G 556.23 PASS AO=62;DP=64;FAO=62;FDP=64;FR=.;FRO=2;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0459764;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.334;QD=34.7645;RBI=0.0459879;REFB=-0.0175237;REVB=0.00102791;RO=2;SAF=30;SAR=32;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.028594;STB=0.515147;TYPE=snp;VARB=-0.000127385;OID=.;OPOS=55019402;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:64:64:2:2:62:62:32:30:0:2:32:30:0:2 chr19 55020233 . C T 140.59 PASS AO=34;DP=73;FAO=34;FDP=73;FR=.;FRO=39;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=-0.011809;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=207.916;QD=7.70372;RBI=0.0146121;REFB=-0.00620176;REVB=0.00860583;RO=39;SAF=17;SAR=17;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0856015;STB=0.547917;TYPE=snp;VARB=0.00627012;OID=.;OPOS=55020233;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:39:39:34:34:17:17:23:16:17:17:23:16 chr19 55045042 . G A 322.54 PASS AO=89;DP=204;FAO=89;FDP=205;FR=.;FRO=116;FSAF=40;FSAR=49;FSRF=57;FSRR=59;FWDB=0.00313304;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.922;QD=6.29351;RBI=0.00328113;REFB=-0.00888258;REVB=-0.000974611;RO=110;SAF=40;SAR=49;SRF=53;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0324319;STB=0.523857;TYPE=snp;VARB=0.0116224;OID=.;OPOS=55045042;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:205:110:116:89:89:49:40:53:57:49:40:57:59 chr19 55086775 . C T 927.93 PASS AO=112;DP=124;FAO=112;FDP=123;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=107;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=0.0161353;FXX=0.00806387;HRUN=5;LEN=1;MLLD=184.335;QD=30.1766;RBI=0.0175396;REFB=-0.0328604;REVB=0.00687669;RO=10;SAF=5;SAR=107;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123586;STB=0.563569;TYPE=snp;VARB=0.000134064;OID=.;OPOS=55086775;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:124:123:10:11:112:112:107:5:2:8:107:5:2:9 chr19 55142699 . C T 228.34 PASS AO=50;DP=101;FAO=51;FDP=100;FR=.;FRO=49;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=28;FWDB=0.015654;FXX=0.00990001;HRUN=3;LEN=1;MLLD=162.981;QD=9.13346;RBI=0.0157931;REFB=-0.0104306;REVB=0.00209217;RO=48;SAF=29;SAR=21;SRF=21;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12667;STB=0.578481;TYPE=snp;VARB=0.00978976;OID=.;OPOS=55142699;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:100:48:49:50:51:21:29:21:27:21:30:21:28 chr19 55144186 . C T 167.37 PASS AO=20;DP=23;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00438602;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=41.6964;QD=30.4316;RBI=0.0647212;REFB=-0.0284679;REVB=0.0645725;RO=2;SAF=6;SAR=14;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0614156;STB=0.516114;TYPE=snp;VARB=0.00530838;OID=.;OPOS=55144186;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:23:22:2:1:20:21:14:6:0:2:15:6:0:1 chr19 55175009 . G T 68.04 PASS AO=19;DP=48;FAO=19;FDP=49;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=21;FSRR=9;FWDB=-0.0238696;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.856;QD=5.55428;RBI=0.0270095;REFB=-0.0172114;REVB=-0.0126395;RO=29;SAF=12;SAR=7;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0667315;STB=0.546052;TYPE=snp;VARB=0.0308585;OID=.;OPOS=55175009;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:48:49:29:30:19:19:7:12:20:9:7:12:21:9 chr19 55175740 . C T 254.76 PASS AO=50;DP=95;FAO=54;FDP=99;FR=.;FRO=45;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=16;FSRR=29;FWDB=0.0748174;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.9196;QD=10.2932;RBI=0.0905393;REFB=-0.0119394;REVB=0.0509875;RO=45;SAF=28;SAR=22;SRF=16;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174354;STB=0.58191;TYPE=snp;VARB=0.014256;OID=.;OPOS=55175740;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:99:45:45:50:54:22:28:16:29:25:29:16:29 chr19 55176262 . A G 236.38 PASS AO=16;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=1;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0513048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=294.831;QD=36.3666;RBI=0.0601774;REFB=0;REVB=0.0314505;RO=0;SAF=1;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.34843e-05;OID=.;OPOS=55176262;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:26:26:0:0:16:25:15:1:0:0:24:1:0:0 chr19 55176535 . C T 124.26 PASS AO=17;DP=25;FAO=18;FDP=23;FR=.;FRO=5;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.0179621;FXX=0.11534;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.635;QD=21.611;RBI=0.0733568;REFB=0.0639336;REVB=0.0711237;RO=4;SAF=15;SAR=2;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107805;STB=0.512806;TYPE=snp;VARB=-0.00841454;OID=.;OPOS=55176535;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:25:23:4:5:17:18:2:15:4:0:3:15:4:1 chr19 55178162 . A C,G 510.14 PASS AO=21,37;DP=59;FAO=20,39;FDP=61;FR=.;FRO=2;FSAF=5,9;FSAR=15,30;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0531148,-4.47647e-05;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=91.0406,37.8581;QD=33.4518;RBI=0.0542902,0.184556;REFB=0.00643676,0.01533;REVB=-0.0112361,-0.184556;RO=1;SAF=5,9;SAR=16,28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0279913,0.0164365;STB=0.53122,0.516121;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00176565,0.0234206;OID=.,.;OPOS=55178162,55178162;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:60:59:61:1:2:21,37:20,39:16,28:5,9:0:1:15,30:5,9:0:2 chr19 55239223 . G A 1558.63 PASS AO=162;DP=163;FAO=163;FDP=163;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00186154;FXX=0.00609719;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.395;QD=38.2487;RBI=0.0474991;REFB=0;REVB=0.0474626;RO=0;SAF=82;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000154293;OID=.;OPOS=55239223;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:163:163:0:0:162:163:80:82:0:0:81:82:0:0 chr19 55246731 . C T 1809.59 PASS AO=188;DP=189;FAO=188;FDP=188;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=116;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00164437;FXX=0.00529073;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.5863;QD=38.5019;RBI=0.0408586;REFB=0;REVB=-0.0408255;RO=0;SAF=72;SAR=116;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.0644e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000106421;OID=.;OPOS=55246731;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:189:188:0:0:188:188:116:72:0:0:116:72:0:0 chr19 55246741 . T C 1881.71 PASS AO=198;DP=200;FAO=199;FDP=199;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=129;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00740271;FXX=0.00499975;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.418;QD=37.8233;RBI=0.0268134;REFB=0.00500953;REVB=0.0257712;RO=1;SAF=70;SAR=128;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00370658;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000143873;OID=.;OPOS=55246741;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:200:199:1:0:198:199:128:70:0:1:129:70:0:0 chr19 55247353 . C A 1286.5 PASS AO=135;DP=136;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0205905;FXX=0.00729874;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.092;QD=37.8384;RBI=0.0587339;REFB=0.076418;REVB=0.0550064;RO=1;SAF=70;SAR=65;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00674279;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000181865;OID=.;OPOS=55247353;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:136:136:1:0:135:136:65:70:1:0:66:70:0:0 chr19 55250036 . T C 800.49 PASS AO=86;DP=92;FAO=86;FDP=87;FR=.;FRO=1;FSAF=70;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0364726;FXX=0.0543419;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.4317;QD=36.8042;RBI=0.046281;REFB=-0.0167002;REVB=0.02849;RO=1;SAF=70;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00672152;STB=0.503545;TYPE=snp;VARB=0.00020712;OID=.;OPOS=55250036;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:92:87:1:1:86:86:16:70:1:0:16:70:1:0 chr19 55250061 . C A 806.2 PASS AO=81;DP=82;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0614911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.806;QD=37.9387;RBI=0.0656465;REFB=0;REVB=0.0229852;RO=0;SAF=66;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.25838e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000221245;OID=.;OPOS=55250061;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:82:85:0:0:81:85:15:66:0:0:15:70:0:0 chr19 55250928 . G C 51.67 PASS AO=177;DP=1107;FAO=72;FDP=400;FR=.;FRO=328;FSAF=42;FSAR=30;FSRF=154;FSRR=174;FWDB=-0.0145547;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.343;QD=0.516727;RBI=0.0154025;REFB=-0.00599169;REVB=-0.00503979;RO=929;SAF=111;SAR=66;SRF=441;SRR=488;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198616;STB=0.592997;TYPE=snp;VARB=0.029789;OID=.;OPOS=55250928;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:1107:400:929:328:177:72:66:111:441:488:30:42:154:174 chr19 55250979 . C A 297.26 PASS AO=405;DP=1176;FAO=128;FDP=400;FR=.;FRO=272;FSAF=47;FSAR=81;FSRF=121;FSRR=151;FWDB=0.0149759;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.4529;QD=2.97259;RBI=0.0359726;REFB=-0.0432531;REVB=-0.032707;RO=767;SAF=151;SAR=254;SRF=382;SRR=385;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147706;STB=0.555148;TYPE=snp;VARB=0.0938414;OID=.;OPOS=55250979;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:1176:400:767:272:405:128:254:151:382:385:81:47:121:151 chr19 55251013 . G T 156.76 PASS AO=319;DP=1167;FAO=100;FDP=396;FR=.;FRO=296;FSAF=43;FSAR=57;FSRF=107;FSRR=189;FWDB=0.0484871;FXX=0.00999975;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.8777;QD=1.58347;RBI=0.0746209;REFB=-0.00351326;REVB=0.056721;RO=836;SAF=140;SAR=179;SRF=333;SRR=503;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0515067;STB=0.553001;TYPE=snp;VARB=0.0101041;OID=.;OPOS=55251013;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:1167:396:836:296:319:100:179:140:333:503:57:43:107:189 chr19 55253465 . C G 732.44 PASS AO=127;DP=196;FAO=128;FDP=195;FR=.;FRO=67;FSAF=43;FSAR=85;FSRF=42;FSRR=25;FWDB=-0.00201124;FXX=0.00510178;HRUN=4;LEN=1;MLLD=196.331;QD=15.0244;RBI=0.00885388;REFB=-0.0171392;REVB=0.00862242;RO=67;SAF=43;SAR=84;SRF=42;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19243;STB=0.604333;TYPE=snp;VARB=0.00876004;OID=.;OPOS=55253465;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:195:67:67:127:128:84:43:42:25:85:43:42:25 chr19 55253521 . C G 3796.37 PASS AO=403;DP=413;FAO=395;FDP=395;FR=.;FRO=0;FSAF=151;FSAR=244;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110092;FXX=0.0124997;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.978;QD=38.4442;RBI=0.0376032;REFB=0;REVB=0.0359555;RO=0;SAF=155;SAR=248;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.36495e-05;OID=.;OPOS=55253521;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:413:395:0:0:403:395:248:155:0:0:244:151:0:0 chr19 55253544 . A G 702.25 PASS AO=217;DP=480;FAO=184;FDP=400;FR=.;FRO=216;FSAF=79;FSAR=105;FSRF=76;FSRR=140;FWDB=0.00362131;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.2725;QD=7.02254;RBI=0.0487716;REFB=-0.0268026;REVB=-0.048637;RO=251;SAF=90;SAR=127;SRF=96;SRR=155;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0325828;STB=0.543217;TYPE=snp;VARB=0.0271349;OID=.;OPOS=55253544;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:480:400:251:216:217:184:127:90:96:155:105:79:76:140 chr19 55253552 . T A 681.37 PASS AO=229;DP=497;FAO=181;FDP=399;FR=.;FRO=218;FSAF=78;FSAR=103;FSRF=76;FSRR=142;FWDB=0.0185268;FXX=0.00249994;HRUN=3;LEN=1;MLLD=315.356;QD=6.83077;RBI=0.0213368;REFB=0.00654907;REVB=0.0105838;RO=267;SAF=97;SAR=132;SRF=98;SRR=169;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0571709;STB=0.546432;TYPE=snp;VARB=-0.00674038;OID=.;OPOS=55253552;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:497:399:267:218:229:181:132:97:98:169:103:78:76:142 chr19 55253601 . G A 859.25 PASS AO=236;DP=477;FAO=202;FDP=399;FR=.;FRO=197;FSAF=66;FSAR=136;FSRF=85;FSRR=112;FWDB=-0.0125276;FXX=0.00249994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.4935;QD=8.61402;RBI=0.0335335;REFB=-0.0245773;REVB=0.0311056;RO=241;SAF=75;SAR=161;SRF=103;SRR=138;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111095;STB=0.556465;TYPE=snp;VARB=0.0314869;OID=.;OPOS=55253601;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:477:399:241:197:236:202:161:75:103:138:136:66:85:112 chr19 55255377 . C T 736.71 PASS AO=122;DP=180;FAO=123;FDP=181;FR=.;FRO=58;FSAF=55;FSAR=68;FSRF=32;FSRR=26;FWDB=0.030122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.212;QD=16.2808;RBI=0.0301713;REFB=-0.0136468;REVB=0.0017242;RO=56;SAF=54;SAR=68;SRF=32;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0758098;STB=0.533641;TYPE=snp;VARB=0.00687277;OID=.;OPOS=55255377;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:181:56:58:122:123:68:54:32:24:68:55:32:26 chr19 55255490 . A C 183.31 PASS AO=107;DP=374;FAO=102;FDP=374;FR=.;FRO=272;FSAF=44;FSAR=58;FSRF=102;FSRR=170;FWDB=-0.0110711;FXX=0.0026666;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.707;QD=1.96051;RBI=0.0205148;REFB=-0.00845665;REVB=-0.017271;RO=264;SAF=47;SAR=60;SRF=98;SRR=166;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0856263;STB=0.542262;TYPE=snp;VARB=0.0205121;OID=.;OPOS=55255490;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:374:374:264:272:107:102:60:47:98:166:58:44:102:170 chr19 55255493 . C T 206.28 PASS AO=108;DP=383;FAO=108;FDP=383;FR=.;FRO=275;FSAF=47;FSAR=61;FSRF=102;FSRR=173;FWDB=0.0111146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.114;QD=2.15433;RBI=0.0119125;REFB=-0.00846994;REVB=-0.0042864;RO=272;SAF=47;SAR=61;SRF=102;SRR=170;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0761281;STB=0.54751;TYPE=snp;VARB=0.0142053;OID=.;OPOS=55255493;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:383:383:272:275:108:108:61:47:102:170:61:47:102:173 chr19 55255534 . C T 1357.4 PASS AO=242;DP=376;FAO=242;FDP=375;FR=.;FRO=133;FSAF=78;FSAR=164;FSRF=51;FSRR=82;FWDB=0.005371;FXX=0.0053049;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4664;QD=14.4789;RBI=0.0122794;REFB=-0.0240937;REVB=0.0110425;RO=133;SAF=78;SAR=164;SRF=51;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.045379;STB=0.524388;TYPE=snp;VARB=0.0111779;OID=.;OPOS=55255534;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:376:375:133:133:242:242:164:78:51:82:164:78:51:82 chr19 55258778 . G A 1625.57 PASS AO=257;DP=367;FAO=259;FDP=362;FR=.;FRO=103;FSAF=118;FSAR=141;FSRF=68;FSRR=35;FWDB=-0.0112862;FXX=0.0189697;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.944;QD=17.9621;RBI=0.0292826;REFB=-0.0341127;REVB=-0.0270202;RO=101;SAF=118;SAR=139;SRF=66;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102592;STB=0.558067;TYPE=snp;VARB=0.0188504;OID=.;OPOS=55258778;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:367:362:101:103:257:259:139:118:66:35:141:118:68:35 chr19 55258830 . C T 1515.53 PASS AO=321;DP=499;FAO=263;FDP=399;FR=.;FRO=136;FSAF=124;FSAR=139;FSRF=83;FSRR=53;FWDB=-0.00953765;FXX=0.00249994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.497;QD=15.1933;RBI=0.0196538;REFB=-0.0106925;REVB=-0.0171845;RO=175;SAF=147;SAR=174;SRF=112;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11935;STB=0.547209;TYPE=snp;VARB=0.0127931;OID=.;OPOS=55258830;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:499:399:175:136:321:263:174:147:112:63:139:124:83:53 chr19 55258831 . G A 1563.2 PASS AO=324;DP=501;FAO=262;FDP=385;FR=.;FRO=123;FSAF=126;FSAR=136;FSRF=81;FSRR=42;FWDB=0.0215722;FXX=0.0374991;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.404;QD=16.2411;RBI=0.027606;REFB=0.00424237;REVB=0.0172258;RO=159;SAF=150;SAR=174;SRF=108;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132458;STB=0.556579;TYPE=snp;VARB=-0.000742735;OID=.;OPOS=55258831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:501:385:159:123:324:262:174:150:108:51:136:126:81:42 chr19 55263657 . G A 56.3 PASS AO=7;DP=8;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0271485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.662;QD=28.1499;RBI=0.0372749;REFB=0.0168932;REVB=0.0255417;RO=1;SAF=5;SAR=2;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173072;STB=0.599698;TYPE=snp;VARB=-0.00207197;OID=.;OPOS=55263657;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:8:8:1:1:7:7:2:5:0:1:2:5:0:1 chr19 55263672 . T A 56.3 PASS AO=7;DP=8;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0235926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.702;QD=28.1499;RBI=0.0766379;REFB=-0.0621147;REVB=-0.0729161;RO=1;SAF=5;SAR=2;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173072;STB=0.599698;TYPE=snp;VARB=0.00447543;OID=.;OPOS=55263672;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:8:8:1:1:7:7:2:5:0:1:2:5:0:1 chr19 55263674 . T C 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00680317;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.901;QD=35.0875;RBI=0.140238;REFB=0;REVB=0.140073;RO=0;SAF=5;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.27427e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00207766;OID=.;OPOS=55263674;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:2:5:0:0:2:5:0:0 chr19 55263689 . A G 79.57 PASS AO=8;DP=9;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00619841;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.083;QD=31.8266;RBI=0.00720624;REFB=0.0209625;REVB=0.00367554;RO=1;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125393;STB=0.555432;TYPE=snp;VARB=-0.00110473;OID=.;OPOS=55263689;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:9:10:1:1:8:9:3:5:0:1:4:5:0:1 chr19 55263696 . A G 84.58 PASS AO=10;DP=11;FAO=10;FDP=11;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00853146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.825;QD=30.7578;RBI=0.0255648;REFB=-0.0232929;REVB=-0.0240992;RO=1;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0811734;STB=0.545364;TYPE=snp;VARB=0.00117242;OID=.;OPOS=55263696;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:11:11:1:1:10:10:5:5:0:1:5:5:0:1 chr19 55263830 . A T 97.76 PASS AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.089553;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.2071;QD=30.081;RBI=0.0922065;REFB=-0.00715452;REVB=0.021961;RO=1;SAF=2;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0430526;STB=0.523771;TYPE=snp;VARB=0.00576762;OID=.;OPOS=55263830;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:13:13:1:1:12:12:10:2:0:1:10:2:0:1 chr19 55263864 . A G 84.57 PASS AO=10;DP=11;FAO=10;FDP=11;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0242679;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.5019;QD=30.7545;RBI=0.0441429;REFB=-0.100912;REVB=-0.0368736;RO=1;SAF=1;SAR=9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.290714;STB=0.666259;TYPE=snp;VARB=0.00955992;OID=.;OPOS=55263864;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:11:11:1:1:10:10:9:1:1:0:9:1:1:0 chr19 55263886 . G C 82.78 PASS AO=8;DP=8;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00843251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.455;QD=36.7929;RBI=0.0334809;REFB=0;REVB=0.0324015;RO=0;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.58669e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00338858;OID=.;OPOS=55263886;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:9:0:0:8:9:6:2:0:0:7:2:0:0 chr19 55266447 . A G 363.29 PASS AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00386841;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.335;QD=38.2413;RBI=0.0898628;REFB=0;REVB=-0.0897795;RO=0;SAF=29;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000543895;OID=.;OPOS=55266447;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:38:38:0:0:38:38:9:29:0:0:9:29:0:0 chr19 55267541 . C G 380.56 PASS AO=69;DP=111;FAO=69;FDP=111;FR=.;FRO=42;FSAF=46;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=0.00844992;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.883;QD=13.7138;RBI=0.00888628;REFB=-0.0200901;REVB=0.00275043;RO=40;SAF=46;SAR=23;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172277;STB=0.594908;TYPE=snp;VARB=0.0145328;OID=.;OPOS=55267541;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:40:42:69:69:23:46:17:23:23:46:18:24 chr19 55267623 . A C 1179.8 PASS AO=103;DP=168;FAO=142;FDP=156;FR=.;FRO=14;FSAF=74;FSAR=68;FSRF=2;FSRR=12;FWDB=-0.00887279;FXX=0.0370348;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.517;QD=30.2513;RBI=0.00959669;REFB=-0.0219229;REVB=0.0036565;RO=14;SAF=36;SAR=67;SRF=2;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0522379;STB=0.533906;TYPE=snp;VARB=0.00401915;OID=.;OPOS=55267623;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:121:156:14:14:103:142:67:36:2:12:68:74:2:12 chr19 55275334 . A G 87.74 PASS AO=185;DP=847;FAO=83;FDP=398;FR=.;FRO=315;FSAF=45;FSAR=38;FSRF=182;FSRR=133;FWDB=0.0183473;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.491;QD=0.881852;RBI=0.0189831;REFB=-0.00495837;REVB=0.00487182;RO=659;SAF=92;SAR=93;SRF=380;SRR=279;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10243;STB=0.528515;TYPE=snp;VARB=0.0146967;OID=.;OPOS=55275334;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:847:398:659:315:185:83:93:92:380:279:38:45:182:133 chr19 55275336 . G A 342.08 PASS AO=299;DP=847;FAO=135;FDP=400;FR=.;FRO=265;FSAF=70;FSAR=65;FSRF=142;FSRR=123;FWDB=-0.0252091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.994;QD=3.42077;RBI=0.0257303;REFB=-0.0138156;REVB=0.00515267;RO=545;SAF=165;SAR=134;SRF=302;SRR=243;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00264292;STB=0.511505;TYPE=snp;VARB=0.0218708;OID=.;OPOS=55275336;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:847:400:545:265:299:135:134:165:302:243:65:70:142:123 chr19 55275387 . A G 356.08 PASS AO=319;DP=931;FAO=137;FDP=399;FR=.;FRO=262;FSAF=76;FSAR=61;FSRF=158;FSRR=104;FWDB=-0.0372756;FXX=0.00249994;HRUN=4;LEN=1;MLLD=78.9586;QD=3.56976;RBI=0.0671389;REFB=-0.00678772;REVB=-0.0558405;RO=611;SAF=179;SAR=140;SRF=363;SRR=248;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0389994;STB=0.532329;TYPE=snp;VARB=0.0132702;OID=.;OPOS=55275387;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:931:399:611:262:319:137:140:179:363:248:61:76:158:104 chr19 55281368 . T C 123.13 PASS AO=25;DP=49;FAO=25;FDP=47;FR=.;FRO=22;FSAF=22;FSAR=3;FSRF=20;FSRR=2;FWDB=-0.0396219;FXX=0.040808;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.5345;QD=10.4787;RBI=0.0429745;REFB=-0.0186348;REVB=-0.0166406;RO=18;SAF=22;SAR=3;SRF=16;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0161108;STB=0.533873;TYPE=snp;VARB=0.0132465;OID=.;OPOS=55281368;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:49:47:18:22:25:25:3:22:16:2:3:22:20:2 chr19 55282351 . C A 2881.81 PASS AO=586;DP=653;FAO=361;FDP=400;FR=.;FRO=39;FSAF=136;FSAR=225;FSRF=28;FSRR=11;FWDB=0.128926;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.1556;QD=28.8181;RBI=0.133404;REFB=-0.235731;REVB=0.0342774;RO=58;SAF=212;SAR=374;SRF=49;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0872586;STB=0.534812;TYPE=snp;VARB=0.0296023;OID=.;OPOS=55282351;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:653:400:58:39:586:361:374:212:49:9:225:136:28:11 chr19 55284858 . G A 3375.06 PASS AO=354;DP=356;FAO=355;FDP=355;FR=.;FRO=0;FSAF=192;FSAR=163;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0116619;FXX=0.00560208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.121;QD=38.0289;RBI=0.011683;REFB=0.0142959;REVB=-0.00070198;RO=2;SAF=191;SAR=163;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0049697;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.53884e-05;OID=.;OPOS=55284858;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:356:355:2:0:354:355:163:191:2:0:163:192:0:0 chr19 55284986 . C A 568.87 PASS AO=202;DP=502;FAO=160;FDP=370;FR=.;FRO=210;FSAF=57;FSAR=103;FSRF=77;FSRR=133;FWDB=0.0148807;FXX=0.0749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.008;QD=6.14999;RBI=0.0233808;REFB=-0.00678468;REVB=0.0180341;RO=265;SAF=70;SAR=132;SRF=102;SRR=163;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0426622;STB=0.50642;TYPE=snp;VARB=0.00759681;OID=.;OPOS=55284986;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:502:370:265:210:202:160:132:70:102:163:103:57:77:133 chr19 55285045 . G T 530.35 PASS AO=140;DP=310;FAO=140;FDP=308;FR=.;FRO=168;FSAF=30;FSAR=110;FSRF=58;FSRR=110;FWDB=-0.0464962;FXX=0.0064514;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.654;QD=6.88772;RBI=0.05367;REFB=-0.0261448;REVB=0.0268062;RO=167;SAF=29;SAR=111;SRF=58;SRR=109;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183283;STB=0.59458;TYPE=snp;VARB=0.0322484;OID=.;OPOS=55285045;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:310:308:167:168:140:140:111:29:58:109:110:30:58:110 chr19 55286650 . T C 1835.34 PASS AO=183;DP=187;FAO=192;FDP=192;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=108;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208071;FXX=0.0253794;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.025;QD=38.2362;RBI=0.0245286;REFB=0;REVB=0.012989;RO=0;SAF=81;SAR=102;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000119238;OID=.;OPOS=55286650;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:87:187:192:0:0:183:192:102:81:0:0:108:84:0:0 chr19 55286769 . C A 2457.74 PASS AO=225;DP=393;FAO=332;FDP=398;FR=.;FRO=66;FSAF=146;FSAR=186;FSRF=28;FSRR=38;FWDB=0.0185881;FXX=0.00499988;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.597;QD=24.7009;RBI=0.0506216;REFB=-0.0218853;REVB=0.0470853;RO=23;SAF=140;SAR=85;SRF=21;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0552678;STB=0.502613;TYPE=snp;VARB=0.00286291;OID=.;OPOS=55286769;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:293:398:23:66:225:332:85:140:21:2:186:146:28:38 chr19 55286795 . T C 3509.2 PASS AO=409;DP=421;FAO=372;FDP=372;FR=.;FRO=0;FSAF=160;FSAR=212;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0118232;FXX=0.0699982;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.511;QD=37.7334;RBI=0.0147942;REFB=-0.0151384;REVB=-0.00889274;RO=4;SAF=177;SAR=232;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00126555;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000145486;OID=.;OPOS=55286795;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:421:372:4:0:409:372:232:177:2:2:212:160:0:0 chr19 55286796 . G A 2167.56 PASS AO=356;DP=446;FAO=308;FDP=388;FR=.;FRO=80;FSAF=122;FSAR=186;FSRF=42;FSRR=38;FWDB=0.00948467;FXX=0.0299992;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.593;QD=22.3459;RBI=0.0310686;REFB=-0.0174511;REVB=-0.0295854;RO=88;SAF=141;SAR=215;SRF=48;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0576709;STB=0.527457;TYPE=snp;VARB=0.00450713;OID=.;OPOS=55286796;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:446:388:88:80:356:308:215:141:48:40:186:122:42:38 chr19 55286822 . C T 2017.46 PASS AO=387;DP=543;FAO=284;FDP=356;FR=.;FRO=72;FSAF=103;FSAR=181;FSRF=30;FSRR=42;FWDB=0.00641339;FXX=0.109997;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.494;QD=22.6681;RBI=0.00656237;REFB=-0.00548456;REVB=0.00139039;RO=89;SAF=158;SAR=229;SRF=36;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00138087;STB=0.511733;TYPE=snp;VARB=0.00125202;OID=.;OPOS=55286822;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:543:356:89:72:387:284:229:158:36:53:181:103:30:42 chr19 55286854 . A G 2377.52 PASS AO=470;DP=591;FAO=325;FDP=396;FR=.;FRO=71;FSAF=148;FSAR=177;FSRF=46;FSRR=25;FWDB=-0.00407541;FXX=0.00999975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.961;QD=24.0154;RBI=0.00993624;REFB=0.000191824;REVB=0.00906201;RO=116;SAF=208;SAR=262;SRF=70;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.060528;STB=0.534575;TYPE=snp;VARB=-5.93492e-05;OID=.;OPOS=55286854;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:591:396:116:71:470:325:262:208:70:46:177:148:46:25 chr19 55286864 . A C 82.84 PASS AO=110;DP=595;FAO=83;FDP=399;FR=.;FRO=316;FSAF=48;FSAR=35;FSRF=128;FSRR=188;FWDB=-0.000175276;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.043;QD=0.830448;RBI=0.0245871;REFB=-0.00524802;REVB=-0.0245865;RO=481;SAF=60;SAR=50;SRF=213;SRR=268;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132879;STB=0.634693;TYPE=snp;VARB=0.0218511;OID=.;OPOS=55286864;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:595:399:481:316:110:83:50:60:213:268:35:48:128:188 chr19 55290108 . A G 1654.77 PASS AO=187;DP=200;FAO=190;FDP=201;FR=.;FRO=11;FSAF=87;FSAR=103;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=-0.0100447;FXX=0.0289841;HRUN=4;LEN=1;MLLD=83.7585;QD=32.9307;RBI=0.0261346;REFB=-0.0030029;REVB=-0.0241272;RO=11;SAF=87;SAR=100;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0277385;STB=0.514809;TYPE=snp;VARB=0.000132538;OID=.;OPOS=55290108;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:200:201:11:11:187:190:100:87:8:3:103:87:8:3 chr19 55294454 . C T 750.45 PASS AO=223;DP=480;FAO=189;FDP=399;FR=.;FRO=210;FSAF=102;FSAR=87;FSRF=89;FSRR=121;FWDB=0.0622079;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.702;QD=7.52331;RBI=0.062364;REFB=-0.0149061;REVB=-0.00440988;RO=253;SAF=119;SAR=104;SRF=110;SRR=143;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0952573;STB=0.560774;TYPE=snp;VARB=0.0199112;OID=.;OPOS=55294454;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:480:399:253:210:223:189:104:119:110:143:87:102:89:121 chr19 55294927 . A G 3430.64 PASS AO=433;DP=451;FAO=381;FDP=381;FR=.;FRO=0;FSAF=170;FSAR=211;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0201635;FXX=0.0474988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.124;QD=36.0172;RBI=0.0274143;REFB=0.0401106;REVB=0.0185736;RO=17;SAF=192;SAR=241;SRF=14;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0276353;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000620437;OID=.;OPOS=55294927;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:74:451:381:17:0:433:381:241:192:14:3:211:170:0:0 chr19 55294931 . T C 648.99 PASS AO=216;DP=477;FAO=177;FDP=397;FR=.;FRO=220;FSAF=77;FSAR=100;FSRF=104;FSRR=116;FWDB=-0.0674873;FXX=0.00749981;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.4188;QD=6.53894;RBI=0.0767702;REFB=0.0035162;REVB=0.0365941;RO=257;SAF=98;SAR=118;SRF=119;SRR=138;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0092603;STB=0.521131;TYPE=snp;VARB=-0.00424955;OID=.;OPOS=55294931;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:477:397:257:220:216:177:118:98:119:138:100:77:104:116 chr19 55294969 . A G 814.69 PASS AO=240;DP=494;FAO=198;FDP=400;FR=.;FRO=202;FSAF=97;FSAR=101;FSRF=95;FSRR=107;FWDB=-0.0696412;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.7464;QD=8.14687;RBI=0.0953822;REFB=-0.0362285;REVB=-0.0651757;RO=254;SAF=117;SAR=123;SRF=114;SRR=140;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0363275;STB=0.509906;TYPE=snp;VARB=0.0355196;OID=.;OPOS=55294969;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:494:400:254:202:240:198:123:117:114:140:101:97:95:107 chr19 55295215 . A G 298.58 PASS AO=71;DP=145;FAO=71;FDP=145;FR=.;FRO=74;FSAF=18;FSAR=53;FSRF=15;FSRR=59;FWDB=0.00945297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.5901;QD=8.2367;RBI=0.0192318;REFB=-0.0241283;REVB=0.0167483;RO=69;SAF=18;SAR=53;SRF=14;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0620859;STB=0.535449;TYPE=snp;VARB=0.0243561;OID=.;OPOS=55295215;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:69:74:71:71:53:18:14:55:53:18:15:59 chr19 55297784 . C T 83.67 PASS AO=25;DP=67;FAO=25;FDP=66;FR=.;FRO=41;FSAF=23;FSAR=2;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=-0.0133445;FXX=0.0149231;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.7915;QD=5.07101;RBI=0.0189817;REFB=-0.0135417;REVB=-0.0134993;RO=40;SAF=23;SAR=2;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.655518;STB=0.888057;TYPE=snp;VARB=0.022483;OID=.;OPOS=55297784;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:67:66:40:41:25:25:2:23:16:24:2:23:16:25 chr19 55297955 . T C 1510.89 PASS AO=146;DP=150;FAO=158;FDP=158;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0568;FXX=0.00628891;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.313;QD=38.2504;RBI=0.0630276;REFB=0;REVB=0.0273172;RO=0;SAF=66;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99178e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000135763;OID=.;OPOS=55297955;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:150:158:0:0:146:158:80:66:0:0:86:72:0:0 chr19 55315140 . T C 155.76 PASS AO=44;DP=116;FAO=47;FDP=120;FR=.;FRO=73;FSAF=32;FSAR=15;FSRF=45;FSRR=28;FWDB=-0.00931883;FXX=0.00826378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.124;QD=5.19183;RBI=0.00952838;REFB=-0.0197684;REVB=-0.00198731;RO=71;SAF=29;SAR=15;SRF=43;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0629651;STB=0.54364;TYPE=snp;VARB=0.0291525;OID=.;OPOS=55315140;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:120:71:73:44:47:15:29:43:28:15:32:45:28 chr19 55315326 . A C 1338.4 PASS AO=137;DP=138;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0160563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.043;QD=37.9687;RBI=0.043368;REFB=0;REVB=0.0402862;RO=0;SAF=57;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000144088;OID=.;OPOS=55315326;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:138:141:0:0:137:141:80:57:0:0:84:57:0:0 chr19 55316329 . A G 1291.34 PASS AO=133;DP=135;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0157959;FXX=0.0428541;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.807;QD=38.5476;RBI=0.0274264;REFB=0;REVB=-0.022421;RO=0;SAF=73;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.80485e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000332186;OID=.;OPOS=55316329;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:135:134:0:0:133:134:60:73:0:0:61:73:0:0 chr19 55320279 . G A 2257.36 PASS AO=264;DP=286;FAO=266;FDP=286;FR=.;FRO=20;FSAF=111;FSAR=155;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.0157877;FXX=0.0034842;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.6992;QD=31.5715;RBI=0.0163874;REFB=-0.0148265;REVB=-0.00439284;RO=21;SAF=110;SAR=154;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0153916;STB=0.509511;TYPE=snp;VARB=0.000158135;OID=.;OPOS=55320279;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:286:286:21:20:264:266:154:110:11:10:155:111:11:9 chr19 55324635 . T C 1052.08 PASS AO=108;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0118522;FXX=0.00909008;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.14;QD=38.6084;RBI=0.0219603;REFB=0;REVB=0.0184873;RO=0;SAF=38;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.33527e-05;OID=.;OPOS=55324635;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:109:109:0:0:108:109:70:38:0:0:71:38:0:0 chr19 55325123 . T C 698.93 PASS AO=77;DP=81;FAO=77;FDP=79;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0534348;FXX=0.0246883;HRUN=4;LEN=1;MLLD=47.1062;QD=35.3888;RBI=0.0551684;REFB=0.0307441;REVB=0.0137214;RO=2;SAF=27;SAR=50;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0185544;STB=0.509801;TYPE=snp;VARB=-0.00125226;OID=.;OPOS=55325123;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:81:79:2:2:77:77:50:27:0:2:50:27:0:2 chr19 55327960 . C T 158.92 PASS AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0211526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.299;QD=37.393;RBI=0.0433759;REFB=0;REVB=0.0378687;RO=0;SAF=11;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000218223;OID=.;OPOS=55327960;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:17:17:0:0:17:17:6:11:0:0:6:11:0:0 chr19 55328959 . G T 1046.21 PASS AO=113;DP=115;FAO=113;FDP=115;FR=.;FRO=2;FSAF=59;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.000476555;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=159.7;QD=36.39;RBI=0.0331952;REFB=-0.119124;REVB=-0.0331917;RO=2;SAF=59;SAR=54;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0172588;STB=0.509089;TYPE=snp;VARB=0.000403804;OID=.;OPOS=55328959;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:115:115:2:2:113:113:54:59:0:2:54:59:0:2 chr19 55329783 . A G 267.7 PASS AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0147471;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.219;QD=34.542;RBI=0.0149759;REFB=0.111895;REVB=0.0026082;RO=1;SAF=26;SAR=4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103025;STB=0.555516;TYPE=snp;VARB=-0.0011275;OID=.;OPOS=55329783;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:31:31:1:1:30:30:4:26:0:1:4:26:0:1 chr19 55329789 . C G 10.35 PASS AO=6;DP=34;FAO=6;FDP=35;FR=.;FRO=29;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=24;FSRR=5;FWDB=-0.0402337;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.886;QD=1.18314;RBI=0.0468628;REFB=-0.0187219;REVB=-0.0240286;RO=28;SAF=4;SAR=2;SRF=24;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.3106;STB=0.666222;TYPE=snp;VARB=0.0598664;OID=.;OPOS=55329789;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:34:35:28:29:6:6:2:4:24:4:2:4:24:5 chr19 55329822 . A C 276.28 PASS AO=36;DP=43;FAO=36;FDP=42;FR=.;FRO=6;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.000393136;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.572;QD=26.3126;RBI=0.00637999;REFB=0.0283471;REVB=-0.00636787;RO=6;SAF=23;SAR=13;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00802036;STB=0.504308;TYPE=snp;VARB=-0.00912925;OID=.;OPOS=55329822;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:43:42:6:6:36:36:13:23:4:2:13:23:4:2 chr19 55329901 . A G 477.59 PASS AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0209503;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.769;QD=37.4581;RBI=0.0315262;REFB=0;REVB=0.0235581;RO=0;SAF=23;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.97956e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000110178;OID=.;OPOS=55329901;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:51:51:0:0:51:51:28:23:0:0:28:23:0:0 chr19 55329934 . A G 408.61 PASS AO=36;DP=47;FAO=43;FDP=43;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.057318;FXX=0.0652032;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.633;QD=38.0098;RBI=0.057856;REFB=0;REVB=-0.00787154;RO=1;SAF=12;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0191068;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000539554;OID=.;OPOS=55329934;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:48:43:1:0:36:43:24:12:0:1:23:20:0:0 chr19 55330036 . G A 186.46 PASS AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.04;QD=37.2915;RBI=0.00946376;REFB=0;REVB=0.00946376;RO=0;SAF=0;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.95701e-05;OID=.;OPOS=55330036;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:20:20:0:0:20:20:20:0:0:0:20:0:0:0 chr19 55331287 . G T 1676.46 PASS AO=185;DP=192;FAO=186;FDP=191;FR=.;FRO=5;FSAF=68;FSAR=118;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0152623;FXX=0.00520806;HRUN=4;LEN=1;MLLD=211.828;QD=35.1092;RBI=0.0334825;REFB=-0.109285;REVB=0.0298017;RO=6;SAF=68;SAR=117;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00220154;STB=0.50097;TYPE=snp;VARB=0.000343012;OID=.;OPOS=55331287;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:192:191:6:5:185:186:117:68:2:4:118:68:2:3 chr19 55331362 . C T 1980.78 PASS AO=150;DP=209;FAO=206;FDP=207;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=85;FSAR=121;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.037094;FXX=0.00480746;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.5323;QD=38.2759;RBI=0.227496;REFB=-0.0765749;REVB=0.224452;RO=1;SAF=83;SAR=67;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0056965;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00125703;OID=.;OPOS=55331362;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:206:207:1:0:150:206:67:83:1:0:121:85:0:0 chr19 55331372 . T G 1935.82 PASS AO=202;DP=203;FAO=204;FDP=204;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00523796;FXX=0.00487781;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.2528;QD=37.9573;RBI=0.0175962;REFB=-0.0596582;REVB=-0.0167985;RO=1;SAF=86;SAR=116;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0055063;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000774047;OID=.;OPOS=55331372;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:203:204:1:0:202:204:116:86:1:0:118:86:0:0 chr19 55333023 . C T 339.2 PASS AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217782;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.579;QD=37.6885;RBI=0.0301558;REFB=0;REVB=0.0208587;RO=0;SAF=20;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.9376e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000144283;OID=.;OPOS=55333023;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:36:36:0:0:36:36:16:20:0:0:16:20:0:0 chr19 55340822 . C T 45.01 PASS AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.000170067;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=209.466;QD=25.7205;RBI=0.0138841;REFB=-0.0560259;REVB=-0.013883;RO=1;SAF=4;SAR=2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0962265;STB=0.555378;TYPE=snp;VARB=0.00948223;OID=.;OPOS=55340822;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:7:7:1:1:6:6:2:4:1:0:2:4:1:0 chr19 55341621 . G C 73.71 PASS AO=6;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0680018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6721;QD=36.8541;RBI=0.0701004;REFB=0;REVB=-0.0170242;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00642445;OID=.;OPOS=55341621;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:6:8:2:4:0:0:3:5:0:0 chr19 55341633 . G C 59.74 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.187681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.59;QD=34.1367;RBI=0.197903;REFB=0;REVB=0.0627807;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00365663;OID=.;OPOS=55341633;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:3:4:0:0:3:4:0:0 chr19 55341658 . C T 73.84 PASS AO=9;DP=9;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0176195;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=197.534;QD=36.9199;RBI=0.0555944;REFB=0;REVB=-0.0527284;RO=0;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000786928;OID=.;OPOS=55341658;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:8:0:0:9:8:4:5:0:0:3:5:0:0 chr19 55341661 . T A 73.84 PASS AO=9;DP=9;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.767;QD=36.9199;RBI=0.045751;REFB=0;REVB=0.0402128;RO=0;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00107006;OID=.;OPOS=55341661;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:8:0:0:9:8:4:5:0:0:3:5:0:0 chr19 55341672 . T C 73.84 PASS AO=9;DP=9;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0399376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.6849;QD=36.9198;RBI=0.0847202;REFB=0;REVB=0.0747162;RO=0;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00212237;OID=.;OPOS=55341672;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:8:0:0:9:8:4:5:0:0:3:5:0:0 chr19 55341674 . T A 73.84 PASS AO=9;DP=9;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0613603;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.951;QD=36.9199;RBI=0.0740664;REFB=0;REVB=0.0414819;RO=0;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000421599;OID=.;OPOS=55341674;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:8:0:0:9:8:4:5:0:0:3:5:0:0 chr19 55341681 . C T 98.91 PASS AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0666247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.6748;QD=39.5632;RBI=0.136231;REFB=0;REVB=0.118827;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.012236;OID=.;OPOS=55341681;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:4:6:0:0:4:6:0:0 chr19 55341703 . C A 79.85 PASS AO=10;DP=11;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00366522;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.8857;QD=31.9381;RBI=0.0198804;REFB=-0.0447682;REVB=0.0195396;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.571265;TYPE=snp;VARB=0.00919687;OID=.;OPOS=55341703;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:11:10:0:1:10:9:4:6:0:0:3:6:0:1 chr19 55344191 . C T 373.78 PASS AO=49;DP=60;FAO=49;FDP=59;FR=.;FRO=10;FSAF=32;FSAR=17;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.0292332;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.041;QD=25.341;RBI=0.0323545;REFB=-0.0276686;REVB=0.0138647;RO=10;SAF=32;SAR=17;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184106;STB=0.509859;TYPE=snp;VARB=0.00601831;OID=.;OPOS=55344191;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:60:59:10:10:49:49:17:32:6:4:17:32:6:4 chr19 55344208 . A T 210.46 PASS AO=40;DP=69;FAO=40;FDP=69;FR=.;FRO=29;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=8;FWDB=0.00425681;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.597;QD=12.2004;RBI=0.0284366;REFB=-0.03299;REVB=0.0281162;RO=29;SAF=25;SAR=15;SRF=21;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.08298;STB=0.545433;TYPE=snp;VARB=0.0199553;OID=.;OPOS=55344208;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:29:29:40:40:15:25:21:8:15:25:21:8 chr19 55344215 . G C 250.57 PASS AO=47;DP=79;FAO=47;FDP=79;FR=.;FRO=32;FSAF=31;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=8;FWDB=0.0424086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.182;QD=12.687;RBI=0.0460133;REFB=-0.0212152;REVB=-0.0178533;RO=32;SAF=31;SAR=16;SRF=24;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0767929;STB=0.541855;TYPE=snp;VARB=0.0095673;OID=.;OPOS=55344215;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:32:32:47:47:16:31:24:8:16:31:24:8 chr19 55344239 . T G 872.96 PASS AO=92;DP=93;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0116523;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.084;QD=37.9549;RBI=0.0116773;REFB=0;REVB=0.000764092;RO=0;SAF=66;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.04346e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.03581e-05;OID=.;OPOS=55344239;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:93:92:0:0:92:92:26:66:0:0:26:66:0:0 chr19 55344246 . G A 326.13 PASS AO=60;DP=98;FAO=60;FDP=98;FR=.;FRO=38;FSAF=42;FSAR=18;FSRF=30;FSRR=8;FWDB=0.0178501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.767;QD=13.3115;RBI=0.0956294;REFB=-0.0204424;REVB=0.0939487;RO=37;SAF=42;SAR=18;SRF=29;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0724103;STB=0.5427;TYPE=snp;VARB=0.00924628;OID=.;OPOS=55344246;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:37:38:60:60:18:42:29:8:18:42:30:8 chr19 55346520 . A G 108.5 PASS AO=15;DP=20;FAO=15;FDP=20;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.03604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.1192;QD=21.6989;RBI=0.0375956;REFB=-0.0451851;REVB=-0.0107025;RO=5;SAF=5;SAR=10;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.069444;STB=0.538412;TYPE=snp;VARB=0.00557434;OID=.;OPOS=55346520;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:20:20:5:5:15:15:10:5:1:4:10:5:1:4 chr19 55346534 . G C 32.6 PASS AO=12;DP=42;FAO=12;FDP=42;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=23;FWDB=-0.00853405;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.301;QD=3.10438;RBI=0.0196743;REFB=-0.011445;REVB=-0.017727;RO=30;SAF=8;SAR=4;SRF=7;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.47547;STB=0.782214;TYPE=snp;VARB=0.0183598;OID=.;OPOS=55346534;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:42:42:30:30:12:12:4:8:7:23:4:8:7:23 chr19 55346543 . T G 189.46 PASS AO=32;DP=47;FAO=31;FDP=46;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=22;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.0242244;FXX=0.0212721;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.8858;QD=16.4749;RBI=0.0372068;REFB=-0.00471622;REVB=-0.0282404;RO=15;SAF=10;SAR=22;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180539;STB=0.611036;TYPE=snp;VARB=0.0027126;OID=.;OPOS=55346543;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:47:46:15:15:32:31:22:10:9:6:22:9:9:6 chr19 55346565 . G T 605 PASS AO=63;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00962454;FXX=0.0153822;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.683;QD=37.8122;RBI=0.00996936;REFB=0;REVB=-0.0025993;RO=0;SAF=27;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.31521e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.42462e-05;OID=.;OPOS=55346565;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:64:64:0:0:63:64:36:27:0:0:37:27:0:0 chr19 55346592 . G A 771.72 PASS AO=77;DP=78;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.055486;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.9286;QD=38.5861;RBI=0.0682298;REFB=0;REVB=-0.0397064;RO=0;SAF=30;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00014739;OID=.;OPOS=55346592;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:78:80:0:0:77:80:47:30:0:0:49:31:0:0 chr19 55349273 . C A 10.16 PASS AO=3;DP=15;FAO=3;FDP=15;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=0.00603856;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.464;QD=2.70912;RBI=0.0274012;REFB=0.00543677;REVB=0.0267276;RO=12;SAF=1;SAR=2;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.241822;STB=0.665776;TYPE=snp;VARB=-0.00366624;OID=.;OPOS=55349273;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:15:15:12:12:3:3:2:1:2:10:2:1:2:10 chr19 55349293 . G T 123.7 PASS AO=14;DP=18;FAO=16;FDP=20;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0592772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.291;QD=24.7403;RBI=0.0610791;REFB=-0.0698561;REVB=0.0147268;RO=4;SAF=1;SAR=13;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210178;STB=0.552561;TYPE=snp;VARB=0.00839986;OID=.;OPOS=55349293;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:18:20:4:4:14:16:13:1:1:3:14:2:1:3 chr19 55349299 . T G 31.35 PASS AO=5;DP=21;FAO=5;FDP=20;FR=.,HEALED;FRO=12;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=0.0259755;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.889;QD=6.26942;RBI=0.0426097;REFB=0.00583267;REVB=-0.0337767;RO=12;SAF=2;SAR=3;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.296011;STB=0.683616;TYPE=snp;VARB=0.00147666;OID=.;OPOS=55349299;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:21:20:12:12:5:5:3:2:2:10:3:2:2:10 chr19 55349320 . G C 195.16 PASS AO=19;DP=19;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0306437;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.535;QD=37.1733;RBI=0.0490165;REFB=0;REVB=0.0382568;RO=0;SAF=4;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.00629e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00010392;OID=.;OPOS=55349320;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:19:21:0:0:19:21:15:4:0:0:17:4:0:0 chr19 55349328 . T C 195.16 PASS AO=19;DP=19;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0488961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2947;QD=37.1732;RBI=0.0517407;REFB=0;REVB=-0.0169197;RO=0;SAF=4;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.00629e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00132242;OID=.;OPOS=55349328;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:19:21:0:0:19:21:15:4:0:0:17:4:0:0 chr19 55358655 . A G 717.47 PASS AO=411;DP=977;FAO=185;FDP=398;FR=.;FRO=213;FSAF=85;FSAR=100;FSRF=120;FSRR=93;FWDB=-0.0206781;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.441;QD=7.21071;RBI=0.0206952;REFB=-0.0154724;REVB=0.000840735;RO=557;SAF=205;SAR=206;SRF=309;SRR=248;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.058096;STB=0.555474;TYPE=snp;VARB=0.0243681;OID=.;OPOS=55358655;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:977:398:557:213:411:185:206:205:309:248:100:85:120:93 chr19 55358658 . T C 726.63 PASS AO=468;DP=968;FAO=186;FDP=398;FR=.;FRO=212;FSAF=103;FSAR=83;FSRF=103;FSRR=109;FWDB=0.00717611;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.659;QD=7.30277;RBI=0.0112455;REFB=-0.0143644;REVB=-0.00865819;RO=498;SAF=252;SAR=216;SRF=257;SRR=241;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0211634;STB=0.536309;TYPE=snp;VARB=0.0133612;OID=.;OPOS=55358658;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:968:398:498:212:468:186:216:252:257:241:83:103:103:109 chr19 55358659 . G A 40.19 PASS AO=155;DP=969;FAO=67;FDP=397;FR=.;FRO=330;FSAF=39;FSAR=28;FSRF=179;FSRR=151;FWDB=-0.0377473;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.703;QD=0.404977;RBI=0.0378086;REFB=-0.00163673;REVB=0.00215268;RO=787;SAF=75;SAR=80;SRF=424;SRR=363;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0715063;STB=0.533502;TYPE=snp;VARB=0.0121385;OID=.;OPOS=55358659;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:969:397:787:330:155:67:80:75:424:363:28:39:179:151 chr19 55358686 . A C 355.61 PASS AO=301;DP=957;FAO=137;FDP=399;FR=.;FRO=262;FSAF=69;FSAR=68;FSRF=118;FSRR=144;FWDB=-0.00920409;FXX=0.00249994;HRUN=4;LEN=1;MLLD=187.437;QD=3.56501;RBI=0.00927159;REFB=-0.00487973;REVB=0.00111678;RO=648;SAF=156;SAR=145;SRF=298;SRR=350;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.069506;STB=0.534957;TYPE=snp;VARB=0.0123763;OID=.;OPOS=55358686;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:957:399:648:262:301:137:145:156:298:350:68:69:118:144 chr19 55358734 . G A 1072.47 PASS AO=408;DP=749;FAO=224;FDP=400;FR=.;FRO=176;FSAF=91;FSAR=133;FSRF=62;FSRR=114;FWDB=0.0174044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.3803;QD=10.7247;RBI=0.058511;REFB=-0.00758966;REVB=0.0558625;RO=314;SAF=152;SAR=256;SRF=112;SRR=202;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136864;STB=0.524843;TYPE=snp;VARB=0.00292291;OID=.;OPOS=55358734;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:749:400:314:176:408:224:256:152:112:202:133:91:62:114 chr19 55359234 . A G 18.4 PASS AO=126;DP=776;FAO=56;FDP=394;FR=.;FRO=338;FSAF=35;FSAR=21;FSRF=218;FSRR=120;FWDB=-0.0134535;FXX=0.0149996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.919;QD=0.186762;RBI=0.0543548;REFB=-0.00478926;REVB=-0.0526635;RO=622;SAF=69;SAR=57;SRF=397;SRR=225;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121944;STB=0.518436;TYPE=snp;VARB=0.0333736;OID=.;OPOS=55359234;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:776:394:622:338:126:56:57:69:397:225:21:35:218:120 chr19 55359243 . AAC A 26.78 PASS AO=143;DP=782;FAO=83;FDP=393;FR=.;FRO=310;FSAF=55;FSAR=28;FSRF=189;FSRR=121;FWDB=0.0144167;FXX=0.0174996;HRUN=2;LEN=2;MLLD=153.566;QD=0.2726;RBI=0.0160825;REFB=-0.00279807;REVB=-0.00712767;RO=625;SAF=101;SAR=42;SRF=371;SRR=254;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160584;STB=0.545341;TYPE=del;VARB=0.0105754;OID=.;OPOS=55359244;OREF=AC;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:143:775:83:393:310:55:28:189:121:26:625:101:42:371:254 chr19 55359255 . C G 66.55 PASS AO=140;DP=783;FAO=77;FDP=397;FR=.;FRO=320;FSAF=35;FSAR=42;FSRF=181;FSRR=139;FWDB=-0.0177225;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.868;QD=0.670482;RBI=0.0347118;REFB=-0.0122329;REVB=-0.0298467;RO=638;SAF=73;SAR=67;SRF=388;SRR=250;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114547;STB=0.588801;TYPE=snp;VARB=0.0591772;OID=.;OPOS=55359255;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:783:397:638:320:140:77:67:73:388:250:42:35:181:139 chr19 55359272 . C G 3658.76 PASS AO=785;DP=807;FAO=394;FDP=394;FR=.;FRO=0;FSAF=209;FSAR=185;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0436084;FXX=0.0149996;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3777;QD=37.1448;RBI=0.0473094;REFB=-0.0551777;REVB=-0.0183435;RO=17;SAF=403;SAR=382;SRF=15;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149507;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00169013;OID=.;OPOS=55359272;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:807:394:17:0:785:394:382:403:15:2:185:209:0:0 chr19 55359371 . A G 228.69 PASS AO=182;DP=585;FAO=115;FDP=398;FR=.;FRO=283;FSAF=35;FSAR=80;FSRF=124;FSRR=159;FWDB=0.0608952;FXX=0.00499988;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9629;QD=2.29841;RBI=0.060896;REFB=0.000964169;REVB=0.000311563;RO=400;SAF=55;SAR=127;SRF=155;SRR=245;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114043;STB=0.603254;TYPE=snp;VARB=-0.00160927;OID=.;OPOS=55359371;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:585:398:400:283:182:115:127:55:155:245:80:35:124:159 chr19 55359404 . T A 50.06 PASS AO=85;DP=455;FAO=71;FDP=397;FR=.;FRO=326;FSAF=27;FSAR=44;FSRF=120;FSRR=206;FWDB=0.00556103;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.68;QD=0.504425;RBI=0.0200521;REFB=-0.00170938;REVB=-0.0192655;RO=369;SAF=31;SAR=54;SRF=124;SRR=245;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0408261;STB=0.510664;TYPE=snp;VARB=0.00903483;OID=.;OPOS=55359404;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:455:397:369:326:85:71:54:31:124:245:44:27:120:206 chr19 55359426 . A G 80.16 PASS AO=77;DP=379;FAO=80;FDP=387;FR=.;FRO=307;FSAF=23;FSAR=57;FSRF=88;FSRR=219;FWDB=0.00711918;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=193.866;QD=0.82856;RBI=0.0257117;REFB=-0.00471244;REVB=-0.0247065;RO=301;SAF=22;SAR=55;SRF=87;SRR=214;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00523584;STB=0.500828;TYPE=snp;VARB=0.0169132;OID=.;OPOS=55359426;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:379:387:301:307:77:80:55:22:87:214:57:23:88:219 chr19 55361942 . G T 401.9 PASS AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0320577;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.372;QD=37.3859;RBI=0.0897515;REFB=0;REVB=0.083831;RO=0;SAF=36;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000542457;OID=.;OPOS=55361942;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:43:43:0:0:43:43:7:36:0:0:7:36:0:0 chr19 55362719 . G T 2099.64 PASS AO=218;DP=218;FAO=218;FDP=218;FR=.;FRO=0;FSAF=125;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0414796;FXX=0.0090905;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.521;QD=38.5255;RBI=0.0564002;REFB=0;REVB=0.0382155;RO=0;SAF=126;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6549e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.91586e-05;OID=.;OPOS=55362719;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:218:218:0:0:218:218:92:126:0:0:93:125:0:0 chr19 55363704 . G A 327.65 PASS AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0036936;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.0856;QD=37.4456;RBI=0.0243994;REFB=0;REVB=0.0241182;RO=0;SAF=4;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000174055;OID=.;OPOS=55363704;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:35:35:0:0:35:35:31:4:0:0:31:4:0:0 chr19 55378008 . C T 652 PASS AO=105;DP=106;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0627589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.966;QD=38.3527;RBI=0.100529;REFB=0;REVB=0.0785324;RO=1;SAF=41;SAR=64;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00735807;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000687926;OID=.;OPOS=55378008;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:106:68:1:0:105:68:64:41:0:1:37:31:0:0 chr19 55396900 . A G 1334.11 PASS AO=128;DP=128;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121319;FXX=0.0070917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.694;QD=38.1174;RBI=0.0481153;REFB=0;REVB=0.0465607;RO=0;SAF=51;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.10441e-05;OID=.;OPOS=55396900;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:128:140:0:0:128:140:77:51:0:0:89:51:0:0 chr19 55396913 . G A 1054.44 PASS AO=108;DP=109;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0223928;FXX=0.0176975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.368;QD=37.9978;RBI=0.024364;REFB=0;REVB=-0.00960051;RO=0;SAF=42;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000175231;OID=.;OPOS=55396913;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:109:111:0:0:108:111:66:42:0:0:66:45:0:0 chr19 55441902 . T C 691.58 PASS AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00549702;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.637;QD=37.8949;RBI=0.0331245;REFB=0;REVB=0.0326652;RO=0;SAF=39;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.35789e-05;OID=.;OPOS=55441902;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:74:73:0:0:73:73:34:39:0:0:34:39:0:0 chr19 55441995 . A G 969 PASS AO=99;DP=99;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0548466;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.666;QD=38;RBI=0.0549332;REFB=0;REVB=-0.00308298;RO=0;SAF=42;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.37041e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000723429;OID=.;OPOS=55441995;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:99:102:0:0:99:102:57:42:0:0:58:44:0:0 chr19 55485899 . G A 318.43 PASS AO=67;DP=130;FAO=69;FDP=131;FR=.;FRO=62;FSAF=38;FSAR=31;FSRF=31;FSRR=31;FWDB=0.0437413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.543;QD=9.72296;RBI=0.044255;REFB=-0.00774454;REVB=0.00672329;RO=61;SAF=37;SAR=30;SRF=30;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0526587;STB=0.524131;TYPE=snp;VARB=0.00715094;OID=.;OPOS=55485899;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:131:61:62:67:69:30:37:30:31:31:38:31:31 chr19 55493633 . C T 519.83 PASS AO=92;DP=149;FAO=94;FDP=150;FR=.;FRO=56;FSAF=49;FSAR=45;FSRF=33;FSRR=23;FWDB=0.0658113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.3823;QD=13.8621;RBI=0.0679909;REFB=-0.02058;REVB=-0.0170772;RO=56;SAF=47;SAR=45;SRF=34;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0675084;STB=0.525486;TYPE=snp;VARB=0.0175974;OID=.;OPOS=55493633;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:150:56:56:92:94:45:47:34:22:45:49:33:23 chr19 55501579 . A C 690.56 PASS AO=150;DP=281;FAO=152;FDP=285;FR=.;FRO=133;FSAF=65;FSAR=87;FSRF=54;FSRR=79;FWDB=-0.0527203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.866;QD=9.69207;RBI=0.0644467;REFB=-0.0108741;REVB=-0.0370668;RO=131;SAF=63;SAR=87;SRF=53;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0135638;STB=0.510333;TYPE=snp;VARB=0.00927392;OID=.;OPOS=55501579;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:281:285:131:133:150:152:87:63:53:78:87:65:54:79 chr19 55512137 . C A 940.79 PASS AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0238015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.256;QD=38.3996;RBI=0.0239414;REFB=0;REVB=0.00258398;RO=0;SAF=45;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.94383e-05;OID=.;OPOS=55512137;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:98:98:0:0:98:98:53:45:0:0:53:45:0:0 chr19 55512228 . TGGGC TGGC,TGGGA 339.42 PASS AO=25,27;DP=70;FAO=29,28;FDP=72;FR=.;FRO=15;FSAF=18,17;FSAR=11,11;FSRF=1;FSRR=14;FWDB=0.0593083,0.00861309;FXX=0.0399947;HRUN=3,1;LEN=1,1;MLLD=16.737,164.923;QD=18.8565;RBI=0.194383,0.0190248;REFB=-0.182174,-0.0188307;REVB=-0.185115,-0.0169634;RO=11;SAF=13,17;SAR=12,10;SRF=1;SRR=10;SSEN=0.341962,0;SSEP=0,0;SSSB=0.238161,0.281853;STB=0.682733,0.68206;TYPE=del,snp;VARB=0.0679846,0.0261426;OID=.,.;OPOS=55512229,55512232;OREF=G,C;OALT=-,A;OMAPALT=TGGC,TGGGA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:25,27:67:29,28:72:15:18,17:11,11:1:14:99:11:13,17:12,10:1:10 chr19 55525596 . T C 275.26 PASS AO=21;DP=30;FAO=28;FDP=29;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0718868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.284;QD=37.9674;RBI=0.0718916;REFB=0;REVB=0.000831838;RO=0;SAF=13;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00211839;OID=.;OPOS=55525596;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:29:0:0:21:28:8:13:0:0:9:19:0:0 chr19 55525894 . G A 817.12 PASS AO=87;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0268424;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=71.2024;QD=36.7246;RBI=0.065856;REFB=-0.0469312;REVB=0.0601373;RO=1;SAF=84;SAR=3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00560874;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000759456;OID=.;OPOS=55525894;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:89:89:1:0:87:89:3:84:1:0:3:86:0:0 chr19 55526345 . T G 158.91 PASS AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00185899;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=261.764;QD=37.3905;RBI=0.00551247;REFB=0;REVB=-0.00518955;RO=0;SAF=9;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.126e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.61149e-06;OID=.;OPOS=55526345;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:17:17:0:0:17:17:8:9:0:0:8:9:0:0 chr19 55526359 . A T 125.84 PASS AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0884362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.533;QD=35.9535;RBI=0.0891056;REFB=0;REVB=-0.0109019;RO=0;SAF=9;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000833734;OID=.;OPOS=55526359;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:14:14:0:0:14:14:5:9:0:0:5:9:0:0 chr19 55526373 . G C 47.84 PASS AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=0.0142594;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=139.017;QD=11.256;RBI=0.0473596;REFB=0.00103153;REVB=0.045162;RO=8;SAF=6;SAR=3;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.355513;STB=0.699669;TYPE=snp;VARB=-0.00297195;OID=.;OPOS=55526373;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:17:17:8:8:9:9:3:6:8:0:3:6:8:0 chr19 55527081 . C T 1674.34 PASS AO=176;DP=178;FAO=176;FDP=176;FR=.;FRO=0;FSAF=107;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.076317;FXX=0.0112353;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.516;QD=38.0532;RBI=0.0771979;REFB=-0.0189896;REVB=0.0116288;RO=1;SAF=107;SAR=69;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00442835;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000135669;OID=.;OPOS=55527081;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:178:176:1:0:176:176:69:107:1:0:69:107:0:0 chr19 55530035 . C T 1229.95 PASS AO=129;DP=129;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0220757;FXX=0.0151504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.8957;QD=37.8445;RBI=0.0398322;REFB=0;REVB=0.0331552;RO=0;SAF=64;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.05633e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000996456;OID=.;OPOS=55530035;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:129:130:0:0:129:130:65:64:0:0:66:64:0:0 chr19 55536595 . G A 1154.35 PASS AO=131;DP=140;FAO=133;FDP=141;FR=.;FRO=8;FSAF=50;FSAR=83;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.00512753;FXX=0.00704176;HRUN=4;LEN=1;MLLD=220.928;QD=32.7475;RBI=0.0228758;REFB=0.0020831;REVB=-0.0222937;RO=7;SAF=48;SAR=83;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0083843;STB=0.500057;TYPE=snp;VARB=-6.29516e-05;OID=.;OPOS=55536595;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:140:141:7:8:131:133:83:48:2:5:83:50:3:5 chr19 55538980 . T C 879.7 PASS AO=93;DP=97;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.014666;FXX=0.0706999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.417;QD=38.2477;RBI=0.0767247;REFB=0;REVB=0.0753099;RO=0;SAF=80;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00153829;OID=.;OPOS=55538980;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:97:92:0:0:93:92:13:80:0:0:15:77:0:0 chr19 55539061 . A G 1618.28 PASS AO=166;DP=172;FAO=179;FDP=182;FR=.;FRO=3;FSAF=120;FSAR=59;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0858636;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=41.8609;QD=35.5666;RBI=0.0860183;REFB=-0.014015;REVB=-0.00515732;RO=6;SAF=110;SAR=56;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000297898;STB=0.500069;TYPE=snp;VARB=0.00105523;OID=.;OPOS=55539061;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:172:182:6:3:166:179:56:110:4:2:59:120:2:1 chr19 55539072 . T G 1670.44 PASS AO=182;DP=182;FAO=178;FDP=178;FR=.;FRO=0;FSAF=118;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0253503;FXX=0.0219768;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.104;QD=37.5381;RBI=0.02732;REFB=0;REVB=-0.0101854;RO=0;SAF=122;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.77612e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00414354;OID=.;OPOS=55539072;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:182:178:0:0:182:178:60:122:0:0:60:118:0:0 chr19 55559715 . G A 266.41 PASS AO=50;DP=83;FAO=50;FDP=83;FR=.;FRO=33;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=0.0189223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.335;QD=12.839;RBI=0.0210085;REFB=-0.003862;REVB=-0.00912692;RO=33;SAF=28;SAR=22;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0797768;STB=0.543461;TYPE=snp;VARB=0.00272155;OID=.;OPOS=55559715;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:33:33:50:50:22:28:22:11:22:28:22:11 chr19 55570574 . A G 646.96 PASS AO=66;DP=67;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00895091;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.2357;QD=36.9693;RBI=0.0606477;REFB=0;REVB=0.0599835;RO=0;SAF=20;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0021846;OID=.;OPOS=55570574;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:67:70:0:0:66:70:46:20:0:0:47:23:0:0 chr19 55597880 . G T 24.11 PASS AO=5;DP=13;FAO=5;FDP=13;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.0121795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.403;QD=7.41784;RBI=0.0373926;REFB=-0.0032221;REVB=-0.0353535;RO=8;SAF=1;SAR=4;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.332419;STB=0.713343;TYPE=snp;VARB=0.00314573;OID=.;OPOS=55597880;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:13:13:8:8:5:5:4:1:4:4:4:1:4:4 chr19 55598724 . A G 31.88 PASS AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0436655;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5511;QD=15.9402;RBI=0.0506191;REFB=0.046828;REVB=0.0256051;RO=3;SAF=4;SAR=1;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116878;STB=0.57112;TYPE=snp;VARB=-0.0313676;OID=.;OPOS=55598724;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:8:8:3:3:5:5:1:4:2:1:1:4:2:1 chr19 55606052 . TG T 23.17 PASS AO=13;DP=40;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.101771;FXX=0.0263089;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.7591;QD=2.50476;RBI=0.130864;REFB=-0.00407537;REVB=0.0822678;RO=19;SAF=3;SAR=10;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.418346;STB=0.612104;TYPE=del;VARB=0.0267608;OID=.;OPOS=55606053;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:13:38:16:37:21:6:10:12:9:23:19:3:10:12:7 chr19 55614923 . T C 102.1 PASS AO=10;DP=10;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.160782;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9698;QD=37.1265;RBI=0.187505;REFB=0;REVB=0.0964728;RO=0;SAF=1;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.8593e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0167339;OID=.;OPOS=55614923;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:10:11:0:0:10:11:9:1:0:0:9:2:0:0 chr19 55624113 . G A 46.72 PASS AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.0134552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.571;QD=6.02808;RBI=0.0621614;REFB=-0.0045343;REVB=0.0606877;RO=18;SAF=4;SAR=8;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230768;STB=0.651918;TYPE=snp;VARB=0.0119353;OID=.;OPOS=55624113;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:31:31:18:19:12:12:8:4:10:8:8:4:11:8 chr19 55644325 . A C 171.25 PASS AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.198833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.154;QD=38.0558;RBI=0.205739;REFB=0;REVB=0.0528614;RO=0;SAF=4;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00217831;OID=.;OPOS=55644325;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:18:0:0:18:18:14:4:0:0:14:4:0:0 chr19 55671337 . C T 100.31 PASS AO=11;DP=12;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.151253;FXX=0.0832639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.724;QD=36.4765;RBI=0.151518;REFB=0;REVB=0.0089615;RO=0;SAF=1;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00224312;OID=.;OPOS=55671337;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:11:0:0:11:11:10:1:0:0:10:1:0:0 chr19 55698889 . A AG 11.24 PASS AO=9;DP=48;FAO=8;FDP=48;FR=.;FRO=40;FSAF=8;FSAR=0;FSRF=40;FSRR=0;FWDB=-0.0125221;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=110.002;QD=0.936539;RBI=0.0125221;REFB=-0.010604;REVB=0;RO=39;SAF=9;SAR=0;SRF=39;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.182979;OID=.;OPOS=55698890;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:9:48:8:48:40:8:0:40:0:11:39:9:0:39:0 chr19 55699454 . T C 1064.8 PASS AO=112;DP=112;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0158163;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.511;QD=38.0286;RBI=0.0546349;REFB=0;REVB=-0.0522954;RO=0;SAF=67;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00012502;OID=.;OPOS=55699454;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:112:112:0:0:112:112:45:67:0:0:45:67:0:0 chr19 55738634 . T C 201.43 PASS AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0473525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.9413;QD=36.6239;RBI=0.0504191;REFB=0;REVB=-0.0173154;RO=0;SAF=6;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17051e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000632703;OID=.;OPOS=55738634;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:22:22:0:0:22:22:16:6:0:0:16:6:0:0 chr19 55739689 . G A 295.5 PASS AO=57;DP=88;FAO=59;FDP=105;FR=.;FRO=46;FSAF=40;FSAR=19;FSRF=31;FSRR=15;FWDB=-0.014478;FXX=0.0186898;HRUN=3;LEN=1;MLLD=89.6666;QD=11.2572;RBI=0.0403277;REFB=-0.082366;REVB=-0.0376392;RO=31;SAF=40;SAR=17;SRF=29;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198911;STB=0.50203;TYPE=snp;VARB=0.047996;OID=.;OPOS=55739689;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:105:31:46:57:59:17:40:29:2:19:40:31:15 chr19 55752671 . AG A 339.26 PASS AO=44;DP=56;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.114818;FXX=0.0185151;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.127;QD=25.6048;RBI=0.217324;REFB=0;REVB=0.184517;RO=5;SAF=20;SAR=24;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0.286966;SSSB=0.0105141;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0108937;OID=.;OPOS=55752672;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:44:54:53:53:0:25:28:0:0:31:5:20:24:2:3 chr19 55791091 . C T 92.65 PASS AO=23;DP=55;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=0.00740254;FXX=0.0545355;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.694;QD=7.12722;RBI=0.0153565;REFB=-0.00616857;REVB=0.0134546;RO=30;SAF=12;SAR=11;SRF=20;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14591;STB=0.555508;TYPE=snp;VARB=0.00715791;OID=.;OPOS=55791091;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:55:52:30:29:23:23:11:12:20:10:11:12:18:11 chr19 55856083 . T C 18.74 PASS AO=10;DP=48;FAO=10;FDP=47;FR=.;FRO=37;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=-0.0423118;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.539;QD=1.59495;RBI=0.0481372;REFB=-0.00678256;REVB=-0.0229543;RO=37;SAF=6;SAR=4;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106446;STB=0.568826;TYPE=snp;VARB=0.0307467;OID=.;OPOS=55856083;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:48:47:37:37:10:10:4:6:19:18:4:6:19:18 chr19 55856211 . C T 116.44 PASS AO=31;DP=73;FAO=31;FDP=73;FR=.;FRO=42;FSAF=3;FSAR=28;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=-0.00995386;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=112.977;QD=6.38002;RBI=0.0132737;REFB=0.000513035;REVB=-0.00878136;RO=42;SAF=3;SAR=28;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.498041;STB=0.790089;TYPE=snp;VARB=-0.000965089;OID=.;OPOS=55856211;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:42:42:31:31:28:3:18:24:28:3:18:24 chr19 55859439 . C A 92.63 PASS AO=33;DP=100;FAO=33;FDP=98;FR=.;FRO=65;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=44;FWDB=-0.0020908;FXX=0.019998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.665;QD=3.781;RBI=0.00539568;REFB=-0.00818497;REVB=-0.00497412;RO=62;SAF=10;SAR=23;SRF=20;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0257971;STB=0.515536;TYPE=snp;VARB=0.0148501;OID=.;OPOS=55859439;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:100:98:62:65:33:33:23:10:20:42:23:10:21:44 chr19 55870018 . AG A 225.83 PASS AO=12;DP=31;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.206941;FXX=0.0833102;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.551;QD=27.3728;RBI=0.386275;REFB=0;REVB=0.326166;RO=9;SAF=10;SAR=2;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0.281852;SSSB=0.439064;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0260944;OID=.;OPOS=55870019;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:12:22:33:33:0:16:17:0:0:21:9:10:2:3:6 chr19 55870104 . G C 1045.47 PASS AO=113;DP=115;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00724998;FXX=0.0173898;HRUN=3;LEN=1;MLLD=230.399;QD=37.0077;RBI=0.0130218;REFB=-0.0968698;REVB=-0.0108169;RO=1;SAF=63;SAR=50;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0094016;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.62971e-06;OID=.;OPOS=55870104;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:115:113:1:0:113:113:50:63:0:1:50:63:0:0 chr19 55870289 . C T 488.53 PASS AO=51;DP=51;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0728962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.5588;QD=36.8699;RBI=0.123789;REFB=0;REVB=0.100049;RO=0;SAF=20;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.13361e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00215544;OID=.;OPOS=55870289;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:51:53:0:0:51:53:31:20:0:0:33:20:0:0 chr19 55870351 . T C 339.21 PASS AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.087029;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.81;QD=37.6899;RBI=0.088234;REFB=0;REVB=-0.0145326;RO=0;SAF=13;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21415e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000302729;OID=.;OPOS=55870351;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:36:36:0:0:36:36:23:13:0:0:23:13:0:0 chr19 55870599 . TCG T,TGG 603.49 PASS AO=11,36;DP=63;FAO=17,49;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=0,42;FSAR=17,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0867937,-0.0982762;FXX=0.0294074;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=68.9987,84.5294;QD=36.575;RBI=0.12952,0.163437;REFB=0,0;REVB=0.0961371,0.130588;RO=0;SAF=0,35;SAR=11,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-9.00013e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0346725,-0.00947165;OID=.,.;OPOS=55870600,55870600;OREF=CG,C;OALT=-,G;OMAPALT=T,TGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:11,36:55:17,49:66:0:0,42:17,7:0:0:31:0:0,35:11,1:0:0 chr19 55871019 . A G 56.23 PASS AO=7;DP=8;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0427512;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=37.8763;QD=28.1155;RBI=0.0455446;REFB=-0.125619;REVB=0.0157048;RO=1;SAF=6;SAR=1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0674964;STB=0.538356;TYPE=snp;VARB=0.0361395;OID=.;OPOS=55871019;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:8:8:1:1:7:7:1:6:1:0:1:6:1:0 chr19 55872397 . A G 201.9 PASS AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.104278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.58;QD=36.7089;RBI=0.109683;REFB=0;REVB=-0.0340087;RO=0;SAF=6;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000779005;OID=.;OPOS=55872397;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:21:22:0:0:21:22:15:6:0:0:15:7:0:0 chr19 55872566 . A G 170.85 PASS AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0562741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.58;QD=37.9671;RBI=0.0579783;REFB=0;REVB=-0.0139535;RO=0;SAF=1;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00067294;OID=.;OPOS=55872566;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:18:0:0:18:18:17:1:0:0:17:1:0:0 chr19 55873642 . C T 345.84 PASS AO=35;DP=37;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142859;FXX=0.0526177;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.812;QD=38.4264;RBI=0.0580501;REFB=0;REVB=0.0562648;RO=0;SAF=22;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.39865e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000621053;OID=.;OPOS=55873642;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:37:36:0:0:35:36:13:22:0:0:14:22:0:0 chr19 55877231 . C T 58.14 PASS AO=19;DP=79;FAO=22;FDP=72;FR=.;FRO=50;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=-0.0062384;FXX=0.0769132;HRUN=6;LEN=1;MLLD=92.6699;QD=3.23025;RBI=0.0258425;REFB=-0.0143739;REVB=-0.0250782;RO=33;SAF=9;SAR=10;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0451219;STB=0.522001;TYPE=snp;VARB=0.0256478;OID=.;OPOS=55877231;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:64:72:33:50:19:22:10:9:17:16:13:9:22:28 chr19 55879872 . C T 74.92 PASS AO=18;DP=42;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.0365507;FXX=0.0238039;HRUN=5;LEN=1;MLLD=134;QD=7.30882;RBI=0.0436838;REFB=-0.0304883;REVB=0.0239232;RO=22;SAF=8;SAR=10;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0970462;STB=0.54343;TYPE=snp;VARB=0.0359636;OID=.;OPOS=55879872;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:42:41:22:23:18:18:10:8:12:10:10:8:12:11 chr19 55913038 . C T 67.5 PASS AO=12;DP=22;FAO=12;FDP=21;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.00567772;FXX=0.0454339;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.111;QD=12.8569;RBI=0.0101904;REFB=-0.0370064;REVB=-0.00846211;RO=9;SAF=5;SAR=7;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186247;STB=0.606124;TYPE=snp;VARB=0.0338904;OID=.;OPOS=55913038;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:22:21:9:9:12:12:7:5:6:3:7:5:6:3 chr19 55914444 . T C 240.5 PASS AO=57;DP=123;FAO=57;FDP=117;FR=.;FRO=60;FSAF=14;FSAR=43;FSRF=10;FSRR=50;FWDB=-0.118761;FXX=0.0564471;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.625;QD=8.22217;RBI=0.119246;REFB=-0.0252462;REVB=-0.010743;RO=58;SAF=14;SAR=43;SRF=10;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0954466;STB=0.557822;TYPE=snp;VARB=0.0291713;OID=.;OPOS=55914444;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:117:58:60:57:57:43:14:10:48:43:14:10:50 chr19 55999993 . A G 665.95 PASS AO=72;DP=77;FAO=73;FDP=75;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00755404;FXX=0.0384566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.369;QD=35.5175;RBI=0.0130566;REFB=-0.14899;REVB=0.0106495;RO=2;SAF=36;SAR=36;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0255483;STB=0.51351;TYPE=snp;VARB=0.00120802;OID=.;OPOS=55999993;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:77:75:2:2:72:73:36:36:0:2:36:37:0:2 chr19 56011460 . C T 418.16 PASS AO=48;DP=58;FAO=56;FDP=66;FR=.;FRO=10;FSAF=21;FSAR=35;FSRF=9;FSRR=1;FWDB=0.123287;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=33.2045;QD=25.3431;RBI=0.13887;REFB=-0.234962;REVB=0.0639143;RO=8;SAF=16;SAR=32;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0848594;STB=0.581366;TYPE=snp;VARB=0.0452339;OID=.;OPOS=56011460;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:58:66:8:10:48:56:32:16:5:3:35:21:9:1 chr19 56012106 . GC G 264.08 PASS AO=33;DP=50;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.174256;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=15.6263;QD=26.408;RBI=0.346463;REFB=0;REVB=0.299452;RO=6;SAF=20;SAR=13;SRF=2;SRR=4;SSEN=0.44;SSEP=0;SSSB=0.0799828;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0218502;OID=.;OPOS=56012107;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:33:40:40:40:0:22:18:0:0:23:6:20:13:2:4 chr19 56024519 . T C 447.31 PASS AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.6;QD=38.0687;RBI=0.0425388;REFB=0;REVB=0.0404022;RO=0;SAF=33;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000124416;OID=.;OPOS=56024519;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:47:47:0:0:47:47:14:33:0:0:14:33:0:0 chr19 56041254 . GC G,GG 106.21 PASS AO=3,8;DP=11;FAO=4,8;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=0,5;FSAR=4,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00239848,-0.000146065;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=181.643,184.843;QD=35.4017;RBI=0.086869,0.069517;REFB=0,0;REVB=0.0868359,0.0695169;RO=0;SAF=0,5;SAR=3,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,4.46938e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.00837322,-0.00153089;OID=.,.;OPOS=56041255,56041255;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:3,8:11:4,8:12:0:0,5:4,3:0:0:19:0:0,5:3,3:0:0 chr19 56047448 . A G 481.17 PASS AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029567;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.832;QD=37.7391;RBI=0.0304264;REFB=0;REVB=0.00718078;RO=0;SAF=29;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.19274e-05;OID=.;OPOS=56047448;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:51:51:0:0:51:51:22:29:0:0:22:29:0:0 chr19 56052770 . C T 228.5 PASS AO=29;DP=34;FAO=29;FDP=33;FR=.;FRO=4;FSAF=24;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0317643;FXX=0.0294031;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.85;QD=27.697;RBI=0.0321411;REFB=0.0445253;REVB=0.00490736;RO=4;SAF=24;SAR=5;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.262373;STB=0.642746;TYPE=snp;VARB=-0.00102909;OID=.;OPOS=56052770;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:34:33:4:4:29:29:5:24:0:4:5:24:0:4 chr19 56056184 . A G 654.65 PASS AO=76;DP=81;FAO=76;FDP=81;FR=.;FRO=5;FSAF=44;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.0439088;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.0801;QD=32.3283;RBI=0.0590189;REFB=0.0423089;REVB=-0.0394365;RO=5;SAF=44;SAR=32;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0683975;STB=0.536222;TYPE=snp;VARB=-0.0112138;OID=.;OPOS=56056184;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:81:81:5:5:76:76:32:44:0:5:32:44:0:5 chr19 56089353 . C T 181.82 PASS AO=30;DP=44;FAO=30;FDP=44;FR=.;FRO=14;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.0554728;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.6475;QD=16.5289;RBI=0.0736831;REFB=-0.0573259;REVB=0.0484971;RO=14;SAF=20;SAR=10;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154982;STB=0.508469;TYPE=snp;VARB=0.0824016;OID=.;OPOS=56089353;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:44:44:14:14:30:30:10:20:9:5:10:20:9:5 chr19 56114045 . C T 15.52 PASS AO=3;DP=8;FAO=3;FDP=9;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.00298551;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.108;QD=6.8998;RBI=0.00298551;REFB=-0.0169903;REVB=0;RO=5;SAF=3;SAR=0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0542275;OID=.;OPOS=56114045;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:8:9:5:6:3:3:0:3:5:0:0:3:6:0 chr19 56114237 . G A 327.89 PASS AO=34;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.071681;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.1069;QD=37.4727;RBI=0.163934;REFB=0;REVB=0.147432;RO=1;SAF=23;SAR=11;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0406014;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00498355;OID=.;OPOS=56114237;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:35:35:1:0:34:35:11:23:0:1:12:23:0:0 chr19 56154518 . GTTT G 435.34 PASS AO=50;DP=57;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0198724;FXX=0.017854;HRUN=3;LEN=3;MLLD=69.0979;QD=31.6608;RBI=0.0199398;REFB=0;REVB=-0.00163829;RO=0;SAF=7;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.2537e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=4.2755e-05;OID=.;OPOS=56154519;OREF=TTT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:50:53:55:55:0:9:46:0:0:39:0:7:43:0:0 chr19 56160399 . T C 297.4 PASS AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120155;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3631;QD=37.175;RBI=0.0375438;REFB=0;REVB=0.0355692;RO=0;SAF=21;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000454191;OID=.;OPOS=56160399;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:33:32:0:0:32:32:11:21:0:0:11:21:0:0 chr19 56162776 . C T 195.7 PASS AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0934633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.9429;QD=39.1398;RBI=0.0944402;REFB=0;REVB=-0.0135487;RO=0;SAF=6;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5931e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0020499;OID=.;OPOS=56162776;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:20:20:0:0:20:20:14:6:0:0:14:6:0:0 chr19 56180968 . C T 909.7 PASS AO=95;DP=96;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0575506;FXX=0.0206164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.308;QD=38.3033;RBI=0.0642676;REFB=0;REVB=0.0286053;RO=0;SAF=33;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.10899e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000147548;OID=.;OPOS=56180968;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:96:95:0:0:95:95:62:33:0:0:62:33:0:0 chr19 56241265 . A G 1850.15 PASS AO=197;DP=201;FAO=197;FDP=197;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=108;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0254183;FXX=0.0198995;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.404;QD=37.5665;RBI=0.0350603;REFB=-0.00666733;REVB=0.0241483;RO=2;SAF=89;SAR=108;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00873726;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.07033e-05;OID=.;OPOS=56241265;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:201:197:2:0:197:197:108:89:0:2:108:89:0:0 chr19 56283289 . A G 59.48 PASS AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.00346444;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2788;QD=6.60843;RBI=0.0536121;REFB=0.00309135;REVB=-0.0535;RO=20;SAF=3;SAR=12;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.299422;STB=0.66642;TYPE=snp;VARB=-0.00583753;OID=.;OPOS=56283289;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:36:36:20:21:15:15:12:3:9:11:12:3:9:12 chr19 56283297 . G A 58.61 PASS AO=15;DP=32;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=0.0189621;FXX=0.0624805;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.2473;QD=7.81519;RBI=0.0223104;REFB=-0.00278464;REVB=0.0117555;RO=17;SAF=3;SAR=12;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0490561;STB=0.705478;TYPE=snp;VARB=0.0101465;OID=.;OPOS=56283297;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:32:30:17:17:15:13:12:3:4:13:12:1:4:13 chr19 56284090 . G A 787.66 PASS AO=48;DP=88;FAO=87;FDP=88;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=54;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0721872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.887;QD=35.8028;RBI=0.142165;REFB=0.0122483;REVB=0.122474;RO=1;SAF=15;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140455;STB=0.507461;TYPE=snp;VARB=0.00665493;OID=.;OPOS=56284090;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:88:88:1:1:48:87:33:15:0:1:33:54:0:1 chr19 56307583 . A G 1395.33 PASS AO=147;DP=150;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.108459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.257;QD=37.2088;RBI=0.10948;REFB=0;REVB=0.0149133;RO=2;SAF=59;SAR=88;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0158461;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000469015;OID=.;OPOS=56307583;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:150:150:2:0:147:150:88:59:2:0:89:61:0:0 chr19 56320663 . G A 841.12 PASS AO=86;DP=88;FAO=92;FDP=94;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00825602;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.95;QD=35.7924;RBI=0.0518199;REFB=-0.0345613;REVB=0.051158;RO=1;SAF=33;SAR=53;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00885627;STB=0.508331;TYPE=snp;VARB=0.000396665;OID=.;OPOS=56320663;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:88:94:1:2:86:92:53:33:0:1:59:33:0:2 chr19 56321414 . C A 1263.11 PASS AO=120;DP=122;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0382653;FXX=0.0147048;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.088;QD=37.7048;RBI=0.130082;REFB=-0.0768469;REVB=0.124326;RO=1;SAF=73;SAR=47;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00999902;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000952395;OID=.;OPOS=56321414;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:122:134:1:0:120:134:47:73:0:1:60:74:0:0 chr19 56369189 . G A 1124.88 PASS AO=112;DP=114;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.006;QD=38.1317;RBI=0.0154014;REFB=0;REVB=0.00196831;RO=0;SAF=83;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.35804e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000391595;OID=.;OPOS=56369189;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:114:118:0:0:112:118:29:83:0:0:33:85:0:0 chr19 56369215 . C T 965.14 PASS AO=97;DP=99;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.8485;QD=38.6057;RBI=0.0957898;REFB=0;REVB=0.0932605;RO=0;SAF=70;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.53332e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000528516;OID=.;OPOS=56369215;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:99:100:0:0:97:100:27:70:0:0:28:72:0:0 chr19 56369593 . T C 542.85 PASS AO=55;DP=55;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0313245;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.788;QD=38.0947;RBI=0.0403175;REFB=0;REVB=0.0253825;RO=0;SAF=16;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11947e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000138623;OID=.;OPOS=56369593;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:55:57:0:0:55:57:39:16:0:0:39:18:0:0 chr19 56392920 . C T 239.52 PASS AO=67;DP=158;FAO=67;FDP=158;FR=.;FRO=91;FSAF=46;FSAR=21;FSRF=55;FSRR=36;FWDB=0.00498849;FXX=0.00628891;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.624;QD=6.06371;RBI=0.0244601;REFB=-0.00459396;REVB=-0.023946;RO=89;SAF=46;SAR=21;SRF=54;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0907748;STB=0.552798;TYPE=snp;VARB=0.00566476;OID=.;OPOS=56392920;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:158:89:91:67:67:21:46:54:35:21:46:55:36 chr19 56413532 . G A 198.85 PASS AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0664171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.27;QD=36.1536;RBI=0.0667979;REFB=0;REVB=-0.00712289;RO=0;SAF=17;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.45803e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000780343;OID=.;OPOS=56413532;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:21:22:0:0:21:22:4:17:0:0:4:18:0:0 chr19 56459342 . C T 976.88 PASS AO=104;DP=106;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0322005;FXX=0.0188661;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.294;QD=37.5722;RBI=0.0805475;REFB=-0.118128;REVB=0.073831;RO=1;SAF=37;SAR=67;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126514;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00068767;OID=.;OPOS=56459342;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:106:104:1:0:104:104:67:37:1:0:67:37:0:0 chr19 56459614 . G C 996.84 PASS AO=105;DP=108;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0414668;FXX=0.0185168;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.8777;QD=37.6166;RBI=0.0629133;REFB=0;REVB=0.0473137;RO=1;SAF=58;SAR=47;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00811238;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000493047;OID=.;OPOS=56459614;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:108:106:1:0:105:106:47:58:1:0:47:59:0:0 chr19 56477687 . A G 541.37 PASS AO=64;DP=67;FAO=63;FDP=68;FR=.;FRO=5;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0500798;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.4129;QD=31.8452;RBI=0.108532;REFB=-0.199514;REVB=0.0962869;RO=3;SAF=37;SAR=27;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0211174;STB=0.512816;TYPE=snp;VARB=0.0138554;OID=.;OPOS=56477687;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:67:68:3:5:64:63:27:37:1:2:27:36:2:3 chr19 56477710 . T C 401.53 PASS AO=30;DP=57;FAO=49;FDP=55;FR=.;FRO=6;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.0246515;FXX=0.0350816;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.5606;QD=29.2022;RBI=0.0406367;REFB=-0.216768;REVB=0.0323055;RO=0;SAF=27;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.84607e-08;STB=0.568154;TYPE=snp;VARB=0.00726936;OID=.;OPOS=56477710;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:38:55:0:6:30:49:3:27:0:0:19:30:0:6 chr19 56477727 . T C 34.56 PASS AO=7;DP=40;FAO=7;FDP=40;FR=.,HEALED;FRO=27;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.086421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.464;QD=3.45557;RBI=0.0865118;REFB=-0.00136364;REVB=0.00396432;RO=27;SAF=3;SAR=4;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150496;STB=0.599718;TYPE=snp;VARB=0.054029;OID=.;OPOS=56477727;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:40:40:27:27:7:7:4:3:15:12:4:3:15:12 chr19 56490778 . C T 1107.22 PASS AO=109;DP=110;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0256766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.952;QD=38.1799;RBI=0.0295836;REFB=0;REVB=0.0146937;RO=0;SAF=92;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3517e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000147274;OID=.;OPOS=56490778;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:110:116:0:0:109:116:17:92:0:0:18:98:0:0 chr19 56499279 . G C 1078.89 PASS AO=113;DP=115;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0398561;FXX=0.0173898;HRUN=2;LEN=1;MLLD=269.603;QD=38.1907;RBI=0.0410477;REFB=0;REVB=0.00981862;RO=0;SAF=3;SAR=110;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.38505e-05;OID=.;OPOS=56499279;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:115:113:0:0:113:113:110:3:0:0:110:3:0:0 chr19 56511082 . C G 1175.67 PASS AO=117;DP=117;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0444172;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.332;QD=37.9249;RBI=0.0446524;REFB=0;REVB=0.00457711;RO=0;SAF=75;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000682332;OID=.;OPOS=56511082;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:117:124:0:0:117:124:42:75:0:0:41:83:0:0 chr19 56520150 . C G 1328.22 PASS AO=142;DP=145;FAO=143;FDP=145;FR=.;FRO=2;FSAF=85;FSAR=58;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0072379;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.459;QD=36.6406;RBI=0.0076968;REFB=-0.101671;REVB=-0.00261793;RO=2;SAF=85;SAR=57;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0110561;STB=0.505813;TYPE=snp;VARB=0.000193038;OID=.;OPOS=56520150;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:145:145:2:2:142:143:57:85:2:0:58:85:2:0 chr19 56539240 . C T 2323.19 PASS AO=243;DP=247;FAO=243;FDP=243;FR=.;FRO=0;FSAF=113;FSAR=130;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023953;FXX=0.0201605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.969;QD=38.2417;RBI=0.0396313;REFB=-0.0679326;REVB=0.0315736;RO=1;SAF=113;SAR=130;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0036524;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.79021e-05;OID=.;OPOS=56539240;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:247:243:1:0:243:243:130:113:0:1:130:113:0:0 chr19 56565126 . C T 182.2 PASS AO=36;DP=64;FAO=36;FDP=63;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=28;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.0221661;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.38;QD=11.5684;RBI=0.0225897;REFB=-0.0240521;REVB=0.00435418;RO=27;SAF=8;SAR=28;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215115;STB=0.619397;TYPE=snp;VARB=0.0170036;OID=.;OPOS=56565126;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:63:27:27:36:36:28:8:12:15:28:8:12:15 chr19 56565164 . G A 224.83 PASS AO=26;DP=28;FAO=26;FDP=28;FR=.;FRO=2;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.089032;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.8929;QD=32.118;RBI=0.104234;REFB=-0.163524;REVB=0.0542032;RO=0;SAF=12;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50276;TYPE=snp;VARB=0.0124472;OID=.;OPOS=56565164;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:28:28:0:2:26:26:14:12:0:0:14:12:1:1 chr19 56663058 . C G 19.08 PASS AO=6;DP=26;FAO=7;FDP=26;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=-0.00701036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.364;QD=2.93605;RBI=0.052751;REFB=-0.0160498;REVB=-0.0522831;RO=18;SAF=4;SAR=2;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156386;STB=0.52049;TYPE=snp;VARB=0.0986047;OID=.;OPOS=56663058;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:26:26:18:19:6:7:2:4:14:4:2:5:14:5 chr19 56688570 . G A 31.31 PASS AO=9;DP=27;FAO=9;FDP=27;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.0152557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.048;QD=4.63886;RBI=0.0989445;REFB=-0.0217112;REVB=0.0977613;RO=18;SAF=6;SAR=3;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0660765;STB=0.540449;TYPE=snp;VARB=0.0428023;OID=.;OPOS=56688570;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:27:27:18:18:9:9:3:6:11:7:3:6:11:7 chr19 56693551 . TC T 41.08 PASS AO=20;DP=75;FAO=30;FDP=74;FR=.;FRO=44;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=0.0580304;FXX=0.0263123;HRUN=4;LEN=1;MLLD=10.5739;QD=2.22068;RBI=0.0642828;REFB=-0.0634078;REVB=0.027654;RO=33;SAF=9;SAR=11;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0.414013;SSSB=-0.00492397;STB=0.505614;TYPE=del;VARB=0.0994722;OID=.;OPOS=56693552;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:20:70:30:74:44:12:18:18:26:41:33:9:11:15:18 chr19 56694505 . C T 259.89 PASS AO=97;DP=289;FAO=99;FDP=290;FR=.;FRO=191;FSAF=48;FSAR=51;FSRF=96;FSRR=95;FWDB=0.0176898;FXX=0.0365436;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.893;QD=3.58471;RBI=0.0194478;REFB=-0.01095;REVB=-0.00808021;RO=149;SAF=47;SAR=50;SRF=90;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128591;STB=0.511703;TYPE=snp;VARB=0.011904;OID=.;OPOS=56694505;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:289:290:149:191:97:99:50:47:90:59:51:48:96:95 chr19 56702323 . C T 192.09 PASS AO=57;DP=148;FAO=59;FDP=151;FR=.;FRO=92;FSAF=14;FSAR=45;FSRF=25;FSRR=67;FWDB=0.00955376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.883;QD=5.0884;RBI=0.00971694;REFB=-0.00914776;REVB=-0.00177333;RO=88;SAF=14;SAR=43;SRF=25;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0538601;STB=0.528127;TYPE=snp;VARB=0.0143955;OID=.;OPOS=56702323;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:151:88:92:57:59:43:14:25:63:45:14:25:67 chr19 56703248 . G A 107.13 PASS AO=28;DP=66;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=27;FSRR=10;FWDB=-0.101283;FXX=0.0151492;HRUN=3;LEN=1;MLLD=140.432;QD=6.59251;RBI=0.103077;REFB=-0.0112834;REVB=0.0191494;RO=36;SAF=19;SAR=9;SRF=26;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0508553;STB=0.53417;TYPE=snp;VARB=0.0131997;OID=.;OPOS=56703248;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:65:36:37:28:28:9:19:26:10:9:19:27:10 chr19 56703271 . G A 193.98 PASS AO=41;DP=77;FAO=41;FDP=77;FR=.;FRO=36;FSAF=33;FSAR=8;FSRF=29;FSRR=7;FWDB=-0.0210331;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.256;QD=10.077;RBI=0.0217067;REFB=-0.0156658;REVB=0.00536568;RO=36;SAF=33;SAR=8;SRF=29;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000913199;STB=0.500504;TYPE=snp;VARB=0.0260402;OID=.;OPOS=56703271;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:36:36:41:41:8:33:29:7:8:33:29:7 chr19 56704101 . G A 211 PASS AO=49;DP=103;FAO=50;FDP=103;FR=.;FRO=53;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=30;FWDB=0.0368039;FXX=0.0282992;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.706;QD=8.1942;RBI=0.0484021;REFB=-0.0179271;REVB=0.0314362;RO=52;SAF=25;SAR=24;SRF=23;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0629281;STB=0.544168;TYPE=snp;VARB=0.0205357;OID=.;OPOS=56704101;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:52:53:49:50:24:25:23:29:24:26:23:30 chr19 56718585 . A G 138.82 PASS AO=35;DP=78;FAO=35;FDP=78;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=8;FSRR=35;FWDB=-0.025137;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.2301;QD=7.1187;RBI=0.0320676;REFB=0.000621373;REVB=-0.0199113;RO=43;SAF=15;SAR=20;SRF=8;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.255925;STB=0.641952;TYPE=snp;VARB=-0.00114956;OID=.;OPOS=56718585;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:43:43:35:35:20:15:8:35:20:15:8:35 chr19 56719822 . G T 110.23 PASS AO=38;DP=109;FAO=38;FDP=109;FR=.;FRO=71;FSAF=27;FSAR=11;FSRF=57;FSRR=14;FWDB=-0.00345854;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=210.723;QD=4.04519;RBI=0.0178336;REFB=-0.000691835;REVB=-0.017495;RO=70;SAF=27;SAR=11;SRF=56;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131647;STB=0.577824;TYPE=snp;VARB=0.00130013;OID=.;OPOS=56719822;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:70:71:38:38:11:27:56:14:11:27:57:14 chr19 56719853 . C A 60.2 PASS AO=35;DP=118;FAO=34;FDP=118;FR=.;FRO=84;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=56;FSRR=28;FWDB=-0.0168993;FXX=0.00840265;HRUN=4;LEN=1;MLLD=42.6217;QD=2.04059;RBI=0.0353031;REFB=-0.0102495;REVB=-0.0309955;RO=64;SAF=22;SAR=13;SRF=43;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0530014;STB=0.537572;TYPE=snp;VARB=0.0939011;OID=.;OPOS=56719853;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:118:118:64:84:35:34:13:22:43:21:13:21:56:28 chr19 56827938 . C A 227.44 PASS AO=50;DP=110;FAO=55;FDP=115;FR=.;FRO=60;FSAF=19;FSAR=36;FSRF=22;FSRR=38;FWDB=-0.046721;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.2421;QD=7.91105;RBI=0.0487187;REFB=0.0146824;REVB=-0.0138079;RO=60;SAF=19;SAR=31;SRF=22;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0138841;STB=0.51214;TYPE=snp;VARB=-0.0180825;OID=.;OPOS=56827938;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:115:60:60:50:55:31:19:22:38:36:19:22:38 chr19 56935527 . A G 96.33 PASS AO=17;DP=30;FAO=17;FDP=29;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.018184;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.551;QD=13.2864;RBI=0.0252233;REFB=-0.0265436;REVB=-0.0174801;RO=12;SAF=10;SAR=7;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186812;STB=0.604716;TYPE=snp;VARB=0.0109504;OID=.;OPOS=56935527;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:30:29:12:12:17:17:7:10:4:8:7:10:4:8 chr19 56953585 . T C 50.92 PASS AO=19;DP=62;FAO=19;FDP=62;FR=.;FRO=43;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=-0.0060639;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=242.233;QD=3.2852;RBI=0.00725216;REFB=-0.00542082;REVB=-0.00397781;RO=43;SAF=8;SAR=11;SRF=19;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0247314;STB=0.514716;TYPE=snp;VARB=0.0120635;OID=.;OPOS=56953585;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:62:62:43:43:19:19:11:8:19:24:11:8:19:24 chr19 56953863 . T C 2339.86 PASS AO=243;DP=243;FAO=245;FDP=245;FR=.;FRO=0;FSAF=125;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0188396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0475;QD=38.2017;RBI=0.033249;REFB=0;REVB=-0.0273964;RO=0;SAF=125;SAR=118;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75089e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000105578;OID=.;OPOS=56953863;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:243:245:0:0:243:245:118:125:0:0:120:125:0:0 chr19 56953963 . G A 611.5 PASS AO=150;DP=325;FAO=154;FDP=325;FR=.;FRO=171;FSAF=71;FSAR=83;FSRF=72;FSRR=99;FWDB=0.0185954;FXX=0.00306739;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0495;QD=7.5262;RBI=0.0349633;REFB=0.00393938;REVB=0.0296082;RO=174;SAF=67;SAR=83;SRF=75;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154192;STB=0.521235;TYPE=snp;VARB=-0.00418394;OID=.;OPOS=56953963;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:325:325:174:171:150:154:83:67:75:99:83:71:72:99 chr19 57006415 . A G 150.16 PASS AO=54;DP=154;FAO=54;FDP=154;FR=.;FRO=100;FSAF=16;FSAR=38;FSRF=55;FSRR=45;FWDB=-0.0131819;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.5685;QD=3.90023;RBI=0.0179334;REFB=-0.00321918;REVB=-0.0121592;RO=94;SAF=16;SAR=38;SRF=49;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.262651;STB=0.670079;TYPE=snp;VARB=0.00893466;OID=.;OPOS=57006415;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:154:94:100:54:54:38:16:49:45:38:16:55:45 chr19 57036653 . G A 209 PASS AO=44;DP=83;FAO=44;FDP=82;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=13;FSRR=25;FWDB=-0.00371074;FXX=0.0120467;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.7457;QD=10.1952;RBI=0.0155204;REFB=-0.0217165;REVB=0.0150703;RO=36;SAF=17;SAR=27;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218978;STB=0.521832;TYPE=snp;VARB=0.0218568;OID=.;OPOS=57036653;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:82:36:38:44:44:27:17:13:23:27:17:13:25 chr19 57036678 . G A 188.78 PASS AO=34;DP=54;FAO=34;FDP=56;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=5;FSRR=17;FWDB=-0.00227726;FXX=0.0344768;HRUN=3;LEN=1;MLLD=112.627;QD=13.4839;RBI=0.0555115;REFB=-0.0198968;REVB=-0.0554648;RO=19;SAF=10;SAR=24;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0247217;STB=0.532449;TYPE=snp;VARB=0.0119588;OID=.;OPOS=57036678;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:54:56:19:22:34:34:24:10:5:14:24:10:5:17 chr19 57036725 . C G 183.58 PASS AO=34;DP=58;FAO=35;FDP=58;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=5;FSRR=18;FWDB=-0.00119332;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.226;QD=12.6606;RBI=0.0028222;REFB=-0.0130926;REVB=0.0025575;RO=23;SAF=11;SAR=23;SRF=5;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0925233;STB=0.55716;TYPE=snp;VARB=0.00738517;OID=.;OPOS=57036725;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:58:58:23:23:34:35:23:11:5:18:23:12:5:18 chr19 57058998 . C G 74.41 PASS AO=30;DP=102;FAO=31;FDP=103;FR=.;FRO=72;FSAF=9;FSAR=22;FSRF=29;FSRR=43;FWDB=-0.0399709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.1799;QD=2.88971;RBI=0.0481872;REFB=-0.0198057;REVB=-0.0269134;RO=72;SAF=9;SAR=21;SRF=29;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135879;STB=0.588259;TYPE=snp;VARB=0.0328847;OID=.;OPOS=57058998;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:102:103:72:72:30:31:21:9:29:43:22:9:29:43 chr19 57062073 . T C 327.3 PASS AO=89;DP=203;FAO=89;FDP=203;FR=.;FRO=114;FSAF=44;FSAR=45;FSRF=44;FSRR=70;FWDB=0.000226881;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=119.524;QD=6.44922;RBI=0.000777777;REFB=-0.00992814;REVB=0.00074395;RO=112;SAF=44;SAR=45;SRF=43;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111061;STB=0.560962;TYPE=snp;VARB=0.00813587;OID=.;OPOS=57062073;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:203:112:114:89:89:45:44:43:69:45:44:44:70 chr19 57088850 . T C 1123.7 PASS AO=121;DP=124;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0604558;FXX=0.00806387;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.855;QD=36.5429;RBI=0.0609309;REFB=-0.108902;REVB=0.00759383;RO=1;SAF=57;SAR=64;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00826123;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000295204;OID=.;OPOS=57088850;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:124:123:1:0:121:123:64:57:1:0:65:58:0:0 chr19 57089050 . C T 1470.53 PASS AO=153;DP=153;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.198;QD=38.1957;RBI=0.0227296;REFB=0;REVB=0.0148028;RO=0;SAF=67;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.76445e-05;OID=.;OPOS=57089050;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:153:154:0:0:153:154:86:67:0:0:86:68:0:0 chr19 57133954 . C T 33.04 PASS AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0934139;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.852;QD=18.8816;RBI=0.10009;REFB=-0.0111858;REVB=0.0359425;RO=2;SAF=2;SAR=3;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212944;STB=0.62455;TYPE=snp;VARB=0.00773231;OID=.;OPOS=57133954;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:2:2:5:5:3:2:0:2:3:2:0:2 chr19 57134257 . G T 155.08 PASS AO=17;DP=18;FAO=18;FDP=20;FR=.;FRO=2;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0013382;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=195.652;QD=31.0164;RBI=0.0219845;REFB=-0.0800422;REVB=-0.0219438;RO=1;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0482085;STB=0.505612;TYPE=snp;VARB=0.00769787;OID=.;OPOS=57134257;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:18:20:1:2:17:18:9:8:0:1:10:8:1:1 chr19 57135195 . G A 3476.24 PASS AO=368;DP=374;FAO=370;FDP=370;FR=.;FRO=0;FSAF=193;FSAR=177;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0153398;FXX=0.013333;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.022;QD=37.581;RBI=0.0379093;REFB=-0.0294082;REVB=0.0346671;RO=4;SAF=192;SAR=176;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00558426;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000108111;OID=.;OPOS=57135195;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:374:370:4:0:368:370:176:192:1:3:177:193:0:0 chr19 57176198 . T G 122.45 PASS AO=27;DP=57;FAO=28;FDP=58;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=22;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=0.00401821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.072;QD=8.4451;RBI=0.0393813;REFB=-0.00712176;REVB=0.0391757;RO=30;SAF=6;SAR=21;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.384298;STB=0.721141;TYPE=snp;VARB=0.0110434;OID=.;OPOS=57176198;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:58:30:30:27:28:21:6:18:12:22:6:18:12 chr19 57176304 . T G 113.69 PASS AO=23;DP=43;FAO=23;FDP=43;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=19;FSRF=4;FSRR=16;FWDB=-0.0163078;FXX=0.0444346;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.778;QD=10.5756;RBI=0.0173358;REFB=-0.0147808;REVB=-0.00588094;RO=17;SAF=4;SAR=19;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0765814;STB=0.52053;TYPE=snp;VARB=0.0154207;OID=.;OPOS=57176304;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:43:43:17:20:23:23:19:4:4:13:19:4:4:16 chr19 57176482 . C T 267.54 PASS AO=62;DP=153;FAO=74;FDP=167;FR=.;FRO=93;FSAF=38;FSAR=36;FSRF=52;FSRR=41;FWDB=0.149656;FXX=0.0118336;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.2922;QD=6.40822;RBI=0.155176;REFB=-0.0182421;REVB=0.0410196;RO=91;SAF=30;SAR=32;SRF=52;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0924154;STB=0.525455;TYPE=snp;VARB=0.0397423;OID=.;OPOS=57176482;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:167:91:93:62:74:32:30:52:39:36:38:52:41 chr19 57176820 . C A 231.74 PASS AO=65;DP=154;FAO=65;FDP=154;FR=.;FRO=89;FSAF=24;FSAR=41;FSRF=48;FSRR=41;FWDB=-0.0021769;FXX=0.0064512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.28;QD=6.01917;RBI=0.0117796;REFB=-0.000120853;REVB=0.0115767;RO=88;SAF=24;SAR=41;SRF=48;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183658;STB=0.599969;TYPE=snp;VARB=0.000418551;OID=.;OPOS=57176820;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:154:88:89:65:65:41:24:48:40:41:24:48:41 chr19 57176838 . C G 150.57 PASS AO=48;DP=127;FAO=48;FDP=127;FR=.;FRO=79;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=44;FSRR=35;FWDB=-0.0178735;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=174.24;QD=4.74248;RBI=0.0181954;REFB=0.0177786;REVB=-0.0034075;RO=76;SAF=18;SAR=30;SRF=42;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193344;STB=0.613814;TYPE=snp;VARB=-0.0190142;OID=.;OPOS=57176838;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:76:79:48:48:30:18:42:34:30:18:44:35 chr19 57286761 . A G 761.03 PASS AO=173;DP=336;FAO=174;FDP=337;FR=.;FRO=163;FSAF=93;FSAR=81;FSRF=82;FSRR=81;FWDB=-0.019223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.311;QD=9.033;RBI=0.0210265;REFB=-0.00870196;REVB=-0.00852013;RO=161;SAF=92;SAR=81;SRF=82;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0198844;STB=0.515234;TYPE=snp;VARB=0.00739291;OID=.;OPOS=57286761;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:336:337:161:163:173:174:81:92:82:79:81:93:82:81 chr19 57293394 . A G 1787.88 PASS AO=146;DP=201;FAO=199;FDP=199;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=117;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0294496;FXX=0.0197035;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.892;QD=35.9374;RBI=0.0372879;REFB=-0.0590152;REVB=0.0228716;RO=0;SAF=69;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.96699e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00168916;OID=.;OPOS=57293394;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:153:199:0:0:146:199:77:69:0:0:117:82:0:0 chr19 57293831 . G A 347.08 PASS AO=65;DP=104;FAO=65;FDP=109;FR=.;FRO=44;FSAF=10;FSAR=55;FSRF=12;FSRR=32;FWDB=0.0254886;FXX=0.00909008;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.6316;QD=12.737;RBI=0.0702119;REFB=-0.0122167;REVB=-0.065422;RO=39;SAF=10;SAR=55;SRF=12;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175503;STB=0.581703;TYPE=snp;VARB=0.00806343;OID=.;OPOS=57293831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:109:39:44:65:65:55:10:12:27:55:10:12:32 chr19 57325083 . C T 168.41 PASS AO=30;DP=49;FAO=30;FDP=49;FR=.;FRO=19;FSAF=22;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.0243465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.404;QD=13.7479;RBI=0.0687145;REFB=-0.0230414;REVB=0.0642568;RO=19;SAF=22;SAR=8;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0872243;STB=0.548139;TYPE=snp;VARB=0.00750207;OID=.;OPOS=57325083;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:49:49:19:19:30:30:8:22:12:7:8:22:12:7 chr19 57433619 . C T 325.18 PASS AO=68;DP=128;FAO=69;FDP=128;FR=.;FRO=59;FSAF=24;FSAR=45;FSRF=24;FSRR=35;FWDB=0.0140158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.906;QD=10.1619;RBI=0.0141652;REFB=-0.00256374;REVB=0.0020519;RO=59;SAF=24;SAR=44;SRF=24;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0490755;STB=0.529403;TYPE=snp;VARB=0.00192087;OID=.;OPOS=57433619;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:59:59:68:69:44:24:24:35:45:24:24:35 chr19 57641001 . TG T 267.01 PASS AO=31;DP=69;FAO=58;FDP=61;FR=.;FRO=3;FSAF=22;FSAR=36;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.149201;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=10.6351;QD=17.5089;RBI=0.354045;REFB=-0.0617479;REVB=0.321072;RO=17;SAF=13;SAR=18;SRF=7;SRR=10;SSEN=0.363636;SSEP=0;SSSB=0.00504101;STB=0.531904;TYPE=del;VARB=0.0304849;OID=.;OPOS=57641002;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:31:61:58:61:3:22:36:3:0:14:17:13:18:7:10 chr19 57641146 . A G 212.73 PASS AO=53;DP=112;FAO=53;FDP=114;FR=.;FRO=61;FSAF=34;FSAR=19;FSRF=30;FSRR=31;FWDB=-0.00772149;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.315;QD=7.46427;RBI=0.0135632;REFB=-0.00140214;REVB=-0.0111508;RO=59;SAF=34;SAR=19;SRF=30;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131152;STB=0.582958;TYPE=snp;VARB=0.00153002;OID=.;OPOS=57641146;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:114:59:61:53:53:19:34:30:29:19:34:30:31 chr19 57642098 . G A 113.99 PASS AO=35;DP=89;FAO=34;FDP=88;FR=.;FRO=54;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=38;FSRR=16;FWDB=-0.0136797;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.88;QD=5.18146;RBI=0.0189645;REFB=-0.0282242;REVB=0.0131347;RO=51;SAF=18;SAR=17;SRF=35;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181988;STB=0.624931;TYPE=snp;VARB=0.0234588;OID=.;OPOS=57642098;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:88:51:54:35:34:17:18:35:16:17:17:38:16 chr19 57642782 . C A 74.15 PASS AO=35;DP=115;FAO=33;FDP=114;FR=.;FRO=81;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=31;FSRR=50;FWDB=0.0188739;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.998;QD=2.60174;RBI=0.0198246;REFB=-0.00307861;REVB=0.00606551;RO=79;SAF=14;SAR=21;SRF=30;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0251351;STB=0.508375;TYPE=snp;VARB=0.0138736;OID=.;OPOS=57642782;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:115:114:79:81:35:33:21:14:30:49:20:13:31:50 chr19 57643051 . G A 367.37 PASS AO=111;DP=270;FAO=111;FDP=273;FR=.;FRO=162;FSAF=63;FSAR=48;FSRF=42;FSRR=120;FWDB=-0.0836866;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.093;QD=5.38273;RBI=0.0836911;REFB=-0.0102029;REVB=0.00086587;RO=159;SAF=63;SAR=48;SRF=39;SRR=120;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.331816;STB=0.67739;TYPE=snp;VARB=0.0211774;OID=.;OPOS=57643051;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:270:273:159:162:111:111:48:63:39:120:48:63:42:120 chr19 57643099 . G A 306.22 PASS AO=89;DP=210;FAO=88;FDP=210;FR=.;FRO=122;FSAF=44;FSAR=44;FSRF=29;FSRR=93;FWDB=-0.00496114;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.9084;QD=5.83273;RBI=0.0372333;REFB=0.0221628;REVB=0.0369013;RO=120;SAF=45;SAR=44;SRF=28;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.281991;STB=0.652349;TYPE=snp;VARB=-0.0329754;OID=.;OPOS=57643099;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:210:210:120:122:89:88:44:45:28:92:44:44:29:93 chr19 57646570 . T C 247.5 PASS AO=69;DP=162;FAO=69;FDP=162;FR=.;FRO=93;FSAF=26;FSAR=43;FSRF=26;FSRR=67;FWDB=0.0073897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.246;QD=6.111;RBI=0.010408;REFB=-0.000467626;REVB=0.00732926;RO=91;SAF=26;SAR=43;SRF=24;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127556;STB=0.561208;TYPE=snp;VARB=0.000473589;OID=.;OPOS=57646570;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:162:91:93:69:69:43:26:24:67:43:26:26:67 chr19 57647015 . A G 331.72 PASS AO=85;DP=190;FAO=85;FDP=186;FR=.;FRO=101;FSAF=40;FSAR=45;FSRF=45;FSRR=56;FWDB=0.00257912;FXX=0.0210515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.0258;QD=7.13376;RBI=0.00561328;REFB=-0.0270543;REVB=-0.00498568;RO=99;SAF=40;SAR=45;SRF=45;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0156524;STB=0.513665;TYPE=snp;VARB=0.0485689;OID=.;OPOS=57647015;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:186:99:101:85:85:45:40:45:54:45:40:45:56 chr19 57647236 . T C 360.58 PASS AO=100;DP=232;FAO=100;FDP=231;FR=.;FRO=131;FSAF=44;FSAR=56;FSRF=47;FSRR=84;FWDB=-0.0323205;FXX=0.00431016;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.864;QD=6.24372;RBI=0.0334616;REFB=-0.00612505;REVB=-0.00866374;RO=127;SAF=44;SAR=56;SRF=45;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0887347;STB=0.547254;TYPE=snp;VARB=0.00774658;OID=.;OPOS=57647236;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:231:127:131:100:100:56:44:45:82:56:44:47:84 chr19 57648277 . A T 253.54 PASS AO=85;DP=227;FAO=85;FDP=228;FR=.;FRO=143;FSAF=48;FSAR=37;FSRF=90;FSRR=53;FWDB=-0.0140838;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.088;QD=4.44812;RBI=0.0261321;REFB=-0.0192864;REVB=0.0220122;RO=136;SAF=48;SAR=37;SRF=83;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0510348;STB=0.541684;TYPE=snp;VARB=0.0335909;OID=.;OPOS=57648277;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:227:228:136:143:85:85:37:48:83:53:37:48:90:53 chr19 57742472 . G C 351.11 PASS AO=36;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0576032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7345;QD=37.9575;RBI=0.0832787;REFB=0;REVB=0.0601432;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00195929;OID=.;OPOS=57742472;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:36:37:0:0:36:37:17:19:0:0:18:19:0:0 chr19 57742489 . C T 282.73 PASS AO=28;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0392248;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.9558;QD=38.9972;RBI=0.0925537;REFB=0;REVB=0.0838308;RO=0;SAF=15;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000913056;OID=.;OPOS=57742489;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:29:29:0:0:28:29:13:15:0:0:14:15:0:0 chr19 57742493 . AGGACGAGCAGGATT A 120.4 PASS AO=15;DP=28;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00396369;FXX=0.166574;HRUN=2;LEN=14;MLLD=371.427;QD=32.1072;RBI=0.0381839;REFB=0;REVB=0.0379776;RO=0;SAF=7;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.000128682;OID=.;OPOS=57742494;OREF=GGACGAGCAGGATT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:15:15:15:15:0:7:8:0:0:11:0:7:8:0:0 chr19 57766301 . G A 1147.03 PASS AO=117;DP=117;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186486;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.89;QD=38.5556;RBI=0.0195041;REFB=0;REVB=0.00571298;RO=0;SAF=49;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.15086e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.02916e-05;OID=.;OPOS=57766301;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:117:119:0:0:117:119:68:49:0:0:68:51:0:0 chr19 57767129 . T C 1990.05 PASS AO=217;DP=227;FAO=221;FDP=225;FR=.;FRO=4;FSAF=126;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0442564;FXX=0.00881018;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.2617;QD=35.3786;RBI=0.0477126;REFB=-0.0729478;REVB=0.0178288;RO=4;SAF=125;SAR=92;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0202594;STB=0.510308;TYPE=snp;VARB=0.00285547;OID=.;OPOS=57767129;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:227:225:4:4:217:221:92:125:0:4:95:126:0:4 chr19 57769819 . G T 64.24 PASS AO=15;DP=35;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=1;FSRF=16;FSRR=2;FWDB=0.0132627;FXX=0.0571265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.122;QD=7.78639;RBI=0.0133377;REFB=0.0013415;REVB=-0.00141268;RO=17;SAF=14;SAR=1;SRF=14;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280964;STB=0.583206;TYPE=snp;VARB=-0.00277812;OID=.;OPOS=57769819;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:35:33:17:18:15:15:1:14:14:3:1:14:16:2 chr19 57769896 . A AT,T 479.37 PASS AO=49,16;DP=91;FAO=87,0;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=51,0;FSAR=36,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139789,-0.0184018;FXX=0.0113623;HRUN=6,2;LEN=1,1;MLLD=9.95192,15.2959;QD=22.0401;RBI=0.014602,0.050121;REFB=0.0104353,0.0107463;REVB=-0.00422008,-0.0466207;RO=13;SAF=33,3;SAR=16,13;SRF=10;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0432491,-0.489748;STB=0.5,0.5;TYPE=ins,snp;VARB=0.00229247,0;OID=.,.;OPOS=57769897,57769896;OREF=-,A;OALT=T,T;OMAPALT=AT,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:91:87:13:0:49,16:87,0:16,13:33,3:10:3:36,0:51,0:0:0 chr19 57770237 . T G 2035.97 PASS AO=211;DP=211;FAO=213;FDP=213;FR=.;FRO=0;FSAF=100;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.872;QD=38.2343;RBI=0.0205986;REFB=0;REVB=-0.00435533;RO=0;SAF=99;SAR=112;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.54589e-06;OID=.;OPOS=57770237;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:96:211:213:0:0:211:213:112:99:0:0:113:100:0:0 chr19 57771266 . T C 1320.84 PASS AO=137;DP=140;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00661526;FXX=0.021427;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.513;QD=38.5648;RBI=0.0199621;REFB=0;REVB=-0.0188341;RO=0;SAF=84;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.44705e-05;OID=.;OPOS=57771266;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:140:137:0:0:137:137:53:84:0:0:53:84:0:0 chr19 57802806 . C T 160.8 PASS AO=51;DP=135;FAO=51;FDP=134;FR=.;FRO=83;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=46;FSRR=37;FWDB=0.0228274;FXX=0.0147048;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.351;QD=4.80002;RBI=0.0236785;REFB=-0.00242138;REVB=0.00629137;RO=83;SAF=22;SAR=29;SRF=46;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133792;STB=0.575905;TYPE=snp;VARB=0.00473544;OID=.;OPOS=57802806;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:134:83:83:51:51:29:22:46:37:29:22:46:37 chr19 57802824 . G A 158.24 PASS AO=47;DP=132;FAO=52;FDP=136;FR=.;FRO=84;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=43;FSRR=41;FWDB=-0.00811973;FXX=0.0144917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.071;QD=4.65421;RBI=0.00863762;REFB=0.00112932;REVB=0.00294591;RO=83;SAF=20;SAR=27;SRF=42;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0904863;STB=0.519223;TYPE=snp;VARB=-0.001342;OID=.;OPOS=57802824;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:136:83:84:47:52:27:20:42:41:27:25:43:41 chr19 57832257 . T C 375.3 PASS AO=40;DP=42;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00424631;FXX=0.0476077;HRUN=4;LEN=1;MLLD=250.022;QD=37.5299;RBI=0.0136257;REFB=0;REVB=0.0129471;RO=0;SAF=7;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.48559e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.38834e-05;OID=.;OPOS=57832257;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:42:40:0:0:40:40:33:7:0:0:33:7:0:0 chr19 57838018 . C G 614.36 PASS AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.000636017;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.546;QD=36.6782;RBI=0.0133221;REFB=-0.0991883;REVB=0.0133069;RO=1;SAF=29;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125996;STB=0.506665;TYPE=snp;VARB=0.00108393;OID=.;OPOS=57838018;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:67:67:1:1:66:66:37:29:0:1:37:29:0:1 chr19 57839150 . A G 528.1 PASS AO=59;DP=61;FAO=59;FDP=61;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0276943;FXX=0.0161264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=260.765;QD=34.6296;RBI=0.0539185;REFB=-0.0437704;REVB=0.0462626;RO=2;SAF=43;SAR=16;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.021442;STB=0.51136;TYPE=snp;VARB=0.000942406;OID=.;OPOS=57839150;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:61:61:2:2:59:59:16:43:2:0:16:43:2:0 chr19 57839567 . T A 1550.91 PASS AO=164;DP=165;FAO=164;FDP=164;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0392666;FXX=0.00606024;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.1803;QD=37.827;RBI=0.04451;REFB=-0.0226691;REVB=0.0209589;RO=1;SAF=82;SAR=82;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00576809;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000214654;OID=.;OPOS=57839567;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:165:164:1:0:164:164:82:82:1:0:82:82:0:0 chr19 57845171 . AT A 32 PASS AO=4;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.221665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=32.242;QD=10.6669;RBI=0.221698;REFB=-0.0456355;REVB=0.00380456;RO=8;SAF=0;SAR=4;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.730747;STB=0.587932;TYPE=del;VARB=0.155224;OID=.;OPOS=57845172;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:4:12:6:12:6:2:4:3:3:20:8:0:4:5:3 chr19 57868336 . A G 557.37 PASS AO=63;DP=66;FAO=63;FDP=66;FR=.;FRO=3;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.014606;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=191.264;QD=33.7801;RBI=0.014629;REFB=-0.179663;REVB=-0.000820516;RO=3;SAF=36;SAR=27;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0207689;STB=0.51101;TYPE=snp;VARB=0.000940771;OID=.;OPOS=57868336;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:66:66:3:3:63:63:27:36:1:2:27:36:1:2 chr19 57909872 . G A 1589.62 PASS AO=163;DP=165;FAO=166;FDP=166;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0191843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.107;QD=38.3042;RBI=0.0198833;REFB=0;REVB=0.00522575;RO=0;SAF=70;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.99811e-05;OID=.;OPOS=57909872;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:165:166:0:0:163:166:93:70:0:0:93:73:0:0 chr19 57931303 . C A 455.35 PASS AO=92;DP=170;FAO=96;FDP=173;FR=.;FRO=77;FSAF=24;FSAR=72;FSRF=29;FSRR=48;FWDB=0.0184903;FXX=0.0114279;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.661;QD=10.5282;RBI=0.0187721;REFB=-0.021222;REVB=0.00324043;RO=74;SAF=20;SAR=72;SRF=26;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145497;STB=0.569877;TYPE=snp;VARB=0.015379;OID=.;OPOS=57931303;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:173:74:77:92:96:72:20:26:48:72:24:29:48 chr19 57932027 . C T 84.29 PASS AO=24;DP=60;FAO=24;FDP=60;FR=.;FRO=36;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=25;FSRR=11;FWDB=-0.0066127;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.318;QD=5.6193;RBI=0.0299615;REFB=-0.00962314;REVB=0.0292227;RO=35;SAF=16;SAR=8;SRF=25;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.056887;STB=0.518972;TYPE=snp;VARB=0.011541;OID=.;OPOS=57932027;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:60:60:35:36:24:24:8:16:25:10:8:16:25:11 chr19 57985460 . T A 442.49 PASS AO=100;DP=196;FAO=101;FDP=198;FR=.;FRO=97;FSAF=56;FSAR=45;FSRF=61;FSRR=36;FWDB=-0.0420461;FXX=0.00502487;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.3498;QD=8.93922;RBI=0.0433778;REFB=0.00752149;REVB=-0.0106661;RO=96;SAF=57;SAR=43;SRF=60;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.050519;STB=0.537183;TYPE=snp;VARB=-0.00803214;OID=.;OPOS=57985460;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:198:96:97:100:101:43:57:60:36:45:56:61:36 chr19 57985566 . G C 555.96 PASS AO=132;DP=267;FAO=132;FDP=266;FR=.;FRO=134;FSAF=75;FSAR=57;FSRF=74;FSRR=60;FWDB=-0.00852309;FXX=0.00374518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.536;QD=8.36032;RBI=0.010455;REFB=6.49086e-05;REVB=-0.00605504;RO=132;SAF=75;SAR=57;SRF=73;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.01404;STB=0.508164;TYPE=snp;VARB=-8.5054e-05;OID=.;OPOS=57985566;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:267:266:132:134:132:132:57:75:73:59:57:75:74:60 chr19 57987895 . C T 511.3 PASS AO=119;DP=236;FAO=119;FDP=236;FR=.;FRO=117;FSAF=67;FSAR=52;FSRF=68;FSRR=49;FWDB=-0.00755017;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=206.897;QD=8.66601;RBI=0.0081568;REFB=-0.00905919;REVB=-0.00308679;RO=117;SAF=67;SAR=52;SRF=68;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0167313;STB=0.509174;TYPE=snp;VARB=0.00890246;OID=.;OPOS=57987895;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:236:236:117:117:119:119:52:67:68:49:52:67:68:49 chr19 58002964 . G C 466.64 PASS AO=131;DP=302;FAO=131;FDP=303;FR=.;FRO=172;FSAF=59;FSAR=72;FSRF=52;FSRR=120;FWDB=-0.0104826;FXX=0.00328937;HRUN=3;LEN=1;MLLD=76.2702;QD=6.1603;RBI=0.0117338;REFB=0.00413619;REVB=-0.00527234;RO=171;SAF=59;SAR=72;SRF=51;SRR=120;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160129;STB=0.586323;TYPE=snp;VARB=-0.00583689;OID=.;OPOS=58002964;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:302:303:171:172:131:131:72:59:51:120:72:59:52:120 chr19 58003580 . A G 537.79 PASS AO=163;DP=400;FAO=163;FDP=399;FR=.;FRO=236;FSAF=57;FSAR=106;FSRF=119;FSRR=117;FWDB=0.0136037;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.5;QD=5.39133;RBI=0.014895;REFB=-0.012986;REVB=-0.00606624;RO=235;SAF=56;SAR=107;SRF=118;SRR=117;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174208;STB=0.594753;TYPE=snp;VARB=0.0119254;OID=.;OPOS=58003580;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:400:399:235:236:163:163:107:56:118:117:106:57:119:117 chr19 58003613 . C T 529.07 PASS AO=155;DP=366;FAO=154;FDP=365;FR=.;FRO=211;FSAF=40;FSAR=114;FSRF=97;FSRR=114;FWDB=0.00506964;FXX=0.00544944;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.6669;QD=5.79804;RBI=0.00639835;REFB=-0.0148936;REVB=0.00390354;RO=210;SAF=41;SAR=114;SRF=96;SRR=114;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224358;STB=0.631318;TYPE=snp;VARB=0.0180235;OID=.;OPOS=58003613;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:366:365:210:211:155:154:114:41:96:114:114:40:97:114 chr19 58004346 . G C 200.3 PASS AO=63;DP=163;FAO=63;FDP=163;FR=.;FRO=100;FSAF=27;FSAR=36;FSRF=59;FSRR=41;FWDB=0.0259352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.382;QD=4.91528;RBI=0.0356949;REFB=0.00216563;REVB=-0.0245254;RO=100;SAF=27;SAR=36;SRF=59;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174042;STB=0.59823;TYPE=snp;VARB=-0.00324054;OID=.;OPOS=58004346;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:163:100:100:63:63:36:27:59:41:36:27:59:41 chr19 58004931 . A G 20.85 PASS AO=8;DP=32;FAO=8;FDP=32;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.0318156;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.899;QD=2.60656;RBI=0.0329474;REFB=-0.00103022;REVB=0.00856148;RO=23;SAF=4;SAR=4;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0761304;STB=0.531172;TYPE=snp;VARB=0.00188469;OID=.;OPOS=58004931;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:32:32:23:24:8:8:4:4:13:10:4:4:13:11 chr19 58005026 . A C 232.42 PASS AO=54;DP=110;FAO=54;FDP=110;FR=.;FRO=56;FSAF=33;FSAR=21;FSRF=46;FSRR=10;FWDB=0.0127127;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.076;QD=8.45173;RBI=0.0217727;REFB=-0.000867868;REVB=-0.017676;RO=56;SAF=33;SAR=21;SRF=46;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216265;STB=0.618529;TYPE=snp;VARB=0.000857194;OID=.;OPOS=58005026;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:56:56:54:54:21:33:46:10:21:33:46:10 chr19 58038964 . T A 470.99 PASS AO=47;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157506;FXX=0.019604;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.5177;QD=37.6793;RBI=0.0701454;REFB=0;REVB=0.0683542;RO=0;SAF=32;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00153283;OID=.;OPOS=58038964;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:49:50:0:0:47:50:15:32:0:0:17:33:0:0 chr19 58058536 . A G 326.5 PASS AO=71;DP=134;FAO=71;FDP=134;FR=.;FRO=63;FSAF=42;FSAR=29;FSRF=32;FSRR=31;FWDB=-0.0235046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.8772;QD=9.74613;RBI=0.0819052;REFB=-0.00605924;REVB=-0.0784601;RO=63;SAF=42;SAR=29;SRF=32;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0729945;STB=0.540066;TYPE=snp;VARB=0.00569573;OID=.;OPOS=58058536;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:134:63:63:71:71:29:42:32:31:29:42:32:31 chr19 58058739 . T C 232.95 PASS AO=52;DP=104;FAO=53;FDP=105;FR=.;FRO=52;FSAF=37;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=26;FWDB=0.0107983;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.826;QD=8.87434;RBI=0.0135438;REFB=-0.00874749;REVB=-0.00817506;RO=52;SAF=36;SAR=16;SRF=26;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186956;STB=0.606515;TYPE=snp;VARB=0.00551578;OID=.;OPOS=58058739;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:105:52:52:52:53:16:36:26:26:16:37:26:26 chr19 58117223 . T A 763.19 PASS AO=79;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.31;QD=37.6883;RBI=0.0183722;REFB=0;REVB=0.0115077;RO=0;SAF=23;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.03902e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000723351;OID=.;OPOS=58117223;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:81:81:0:0:79:81:56:23:0:0:57:24:0:0 chr19 58125644 . A G 45.09 PASS AO=12;DP=32;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.00885798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.284;QD=5.63614;RBI=0.0181214;REFB=-0.0234308;REVB=-0.0158089;RO=19;SAF=7;SAR=5;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0600117;STB=0.552543;TYPE=snp;VARB=0.029912;OID=.;OPOS=58125644;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:32:32:19:20:12:12:5:7:10:9:5:7:10:10 chr19 58151338 . TG T 1523.18 PASS AO=152;DP=167;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0349627;FXX=0.0479013;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.818;QD=38.3191;RBI=0.0351463;REFB=0;REVB=0.00358768;RO=0;SAF=59;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.84351e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-1.06618e-06;OID=.;OPOS=58151339;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:152:165:159:159:0:60:99:0:0:72:0:59:93:0:0 chr19 58200099 . T C 180.53 PASS AO=52;DP=136;FAO=55;FDP=140;FR=.;FRO=85;FSAF=35;FSAR=20;FSRF=53;FSRR=32;FWDB=-5.28796e-05;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=39.6542;QD=5.15786;RBI=0.010134;REFB=-0.0136552;REVB=-0.0101339;RO=84;SAF=32;SAR=20;SRF=52;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00421778;STB=0.508377;TYPE=snp;VARB=0.0204682;OID=.;OPOS=58200099;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:140:84:85:52:55:20:32:52:32:20:35:53:32 chr19 58200628 . G T 374.54 PASS AO=80;DP=150;FAO=80;FDP=150;FR=.;FRO=70;FSAF=29;FSAR=51;FSRF=33;FSRR=37;FWDB=0.0259485;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.5525;QD=9.98764;RBI=0.0458261;REFB=-0.0380371;REVB=-0.0377719;RO=70;SAF=29;SAR=51;SRF=33;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.097298;STB=0.553364;TYPE=snp;VARB=0.0195152;OID=.;OPOS=58200628;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:150:70:70:80:80:51:29:33:37:51:29:33:37 chr19 58201360 . C T 245.91 PASS AO=59;DP=124;FAO=60;FDP=125;FR=.;FRO=65;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=21;FSRR=44;FWDB=0.00409694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.6016;QD=7.86925;RBI=0.0425654;REFB=-0.0255481;REVB=0.0423678;RO=63;SAF=26;SAR=33;SRF=20;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118699;STB=0.567546;TYPE=snp;VARB=0.0310311;OID=.;OPOS=58201360;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:125:63:65:59:60:33:26:20:43:33:27:21:44 chr19 58201740 . TACACACAC T 34.79 PASS AO=12;DP=62;FAO=12;FDP=41;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=0;FSRF=29;FSRR=0;FWDB=0.0046677;FXX=0.163232;HRUN=1;LEN=8;MLLD=142.59;QD=3.39408;RBI=0.0046677;REFB=-0.0242367;REVB=0;RO=7;SAF=12;SAR=0;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0476322;OID=.;OPOS=58201741;OREF=ACACACAC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:12:25:12:41:29:12:0:29:0:34:7:12:0:7:0 chr19 58201817 . A G 45.3 PASS AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0424104;FXX=0.049975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.6194;QD=9.53692;RBI=0.0667294;REFB=-0.070539;REVB=-0.0515187;RO=10;SAF=5;SAR=4;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0498364;STB=0.529346;TYPE=snp;VARB=0.103746;OID=.;OPOS=58201817;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:19:19:10:10:9:9:4:5:5:5:4:5:5:5 chr19 58201825 . GTGTATA G,GTG 62 PASS AO=3,3;DP=19;FAO=3,6;FDP=13;FR=.;FRO=4;FSAF=1,1;FSAR=2,5;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0461311,-0.0055781;FXX=0.187383;HRUN=1,1;LEN=6,4;MLLD=116.747,91.3569;QD=19.0765;RBI=0.111813,0.134068;REFB=-0.0113079,-0.0150291;REVB=0.101853,0.133952;RO=5;SAF=1,1;SAR=2,2;SRF=4;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.414454,-0.414454;STB=0.831735,0.832219;TYPE=del,del;VARB=0.0394517,-0.00925359;OID=.,.;OPOS=58201826,58201828;OREF=TGTATA,TATA;OALT=-,-;OMAPALT=G,GTG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:3,3:14:3,6:13:4:1,1:2,5:4:0:20:5:1,1:2,2:4:1 chr19 58202016 . ATTCAT A 142.62 PASS AO=44;DP=90;FAO=45;FDP=88;FR=.;FRO=43;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=16;FSRR=27;FWDB=-0.040313;FXX=0.0112347;HRUN=2;LEN=5;MLLD=209.35;QD=6.48277;RBI=0.0478121;REFB=-0.0152669;REVB=0.0257073;RO=38;SAF=16;SAR=28;SRF=12;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0440705;STB=0.502957;TYPE=del;VARB=0.0135588;OID=.;OPOS=58202017;OREF=TTCAT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:44:87:45:88:43:17:28:16:27:99:38:16:28:12:26 chr19 58352522 . G A 343.92 PASS AO=109;DP=276;FAO=109;FDP=278;FR=.;FRO=169;FSAF=45;FSAR=64;FSRF=57;FSRR=112;FWDB=0.0312713;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.91;QD=4.94852;RBI=0.0312725;REFB=-0.00713514;REVB=0.000273194;RO=166;SAF=45;SAR=64;SRF=56;SRR=110;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0853933;STB=0.548164;TYPE=snp;VARB=0.0118348;OID=.;OPOS=58352522;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:276:278:166:169:109:109:64:45:56:110:64:45:57:112 chr19 58352806 . T C 325.98 PASS AO=66;DP=117;FAO=66;FDP=117;FR=.;FRO=51;FSAF=37;FSAR=29;FSRF=28;FSRR=23;FWDB=-0.00442508;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=244.319;QD=11.1445;RBI=0.00537234;REFB=-0.011882;REVB=0.00304643;RO=51;SAF=37;SAR=29;SRF=28;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00936762;STB=0.505118;TYPE=snp;VARB=0.00972021;OID=.;OPOS=58352806;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:51:51:66:66:29:37:28:23:29:37:28:23 chr19 58353003 . G A 191.02 PASS AO=52;DP=123;FAO=53;FDP=123;FR=.;FRO=70;FSAF=34;FSAR=19;FSRF=38;FSRR=32;FWDB=-0.0201944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.763;QD=6.21216;RBI=0.0217611;REFB=-0.00475356;REVB=-0.00810733;RO=71;SAF=33;SAR=19;SRF=39;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0917446;STB=0.558971;TYPE=snp;VARB=0.00546771;OID=.;OPOS=58353003;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:71:70:52:53:19:33:39:32:19:34:38:32 chr19 58385707 . G T 14.3 PASS AO=27;DP=129;FAO=17;FDP=125;FR=.;FRO=108;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=54;FSRR=54;FWDB=0.00682022;FXX=0.125865;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.347;QD=0.457544;RBI=0.0329948;REFB=-0.00497391;REVB=0.0322823;RO=72;SAF=19;SAR=8;SRF=44;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125754;STB=0.73748;TYPE=snp;VARB=0.0473819;OID=.;OPOS=58385707;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:129:125:72:108:27:17:8:19:44:28:4:13:54:54 chr19 58385748 . G A 130.42 PASS AO=17;DP=31;FAO=23;FDP=34;FR=.;FRO=11;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=0.213522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.974;QD=15.3437;RBI=0.214314;REFB=-0.0880774;REVB=-0.018405;RO=14;SAF=11;SAR=6;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233972;STB=0.670006;TYPE=snp;VARB=0.044887;OID=.;OPOS=58385748;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:31:34:14:11:17:23:6:11:5:9:7:16:2:9 chr19 58385872 . G A 29.5 PASS AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=-0.0178019;FXX=0.049975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.7823;QD=6.20984;RBI=0.0244632;REFB=0.00230964;REVB=-0.0167791;RO=10;SAF=1;SAR=6;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237604;STB=0.61501;TYPE=snp;VARB=-0.0401848;OID=.;OPOS=58385872;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:20:19:10:12:7:7:6:1:3:7:6:1:3:9 chr19 58420152 . C A 189.59 PASS AO=68;DP=192;FAO=68;FDP=194;FR=.;FRO=126;FSAF=34;FSAR=34;FSRF=61;FSRR=65;FWDB=0.0114215;FXX=0.0102036;HRUN=3;LEN=1;MLLD=191.631;QD=3.90914;RBI=0.0137619;REFB=0.00715916;REVB=0.00767718;RO=121;SAF=34;SAR=34;SRF=61;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00464788;STB=0.510306;TYPE=snp;VARB=-0.012395;OID=.;OPOS=58420152;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:194:121:126:68:68:34:34:61:60:34:34:61:65 chr19 58420162 . T C 245.52 PASS AO=79;DP=203;FAO=79;FDP=206;FR=.;FRO=127;FSAF=43;FSAR=36;FSRF=63;FSRR=64;FWDB=-0.0272337;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.173;QD=4.76731;RBI=0.0331013;REFB=-0.013565;REVB=0.0188154;RO=124;SAF=43;SAR=36;SRF=62;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0481554;STB=0.52981;TYPE=snp;VARB=0.0255763;OID=.;OPOS=58420162;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:206:124:127:79:79:36:43:62:62:36:43:63:64 chr19 58420167 . T C 256.37 PASS AO=83;DP=212;FAO=83;FDP=217;FR=.;FRO=134;FSAF=43;FSAR=40;FSRF=64;FSRR=70;FWDB=-0.00886349;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.426;QD=4.72564;RBI=0.015909;REFB=-0.0124934;REVB=-0.0132112;RO=129;SAF=43;SAR=40;SRF=60;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0571894;STB=0.524966;TYPE=snp;VARB=0.0125329;OID=.;OPOS=58420167;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:217:129:134:83:83:40:43:60:69:40:43:64:70 chr19 58420699 . C A 318.04 PASS AO=57;DP=231;FAO=92;FDP=224;FR=.,HEALED;FRO=132;FSAF=60;FSAR=32;FSRF=64;FSRR=68;FWDB=0.0318899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.979;QD=5.67927;RBI=0.0372779;REFB=-0.0242986;REVB=0.0193048;RO=138;SAF=26;SAR=31;SRF=65;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0180979;STB=0.601904;TYPE=snp;VARB=0.0256279;OID=.;OPOS=58420699;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:230:224:138:132:57:92:31:26:65:73:32:60:64:68 chr19 58421128 . C T 82.18 PASS AO=16;DP=30;FAO=16;FDP=30;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0302263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.965;QD=10.9575;RBI=0.0406651;REFB=0.0252904;REVB=-0.0272034;RO=14;SAF=9;SAR=7;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167883;STB=0.594924;TYPE=snp;VARB=-0.0223115;OID=.;OPOS=58421128;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:30:30:14:14:16:16:7:9:5:9:7:9:5:9 chr19 58438709 . G A 11.7 PASS AO=6;DP=22;FAO=6;FDP=22;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.0304085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.3737;QD=2.12636;RBI=0.0735405;REFB=-0.0193351;REVB=-0.0669592;RO=16;SAF=2;SAR=4;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123829;STB=0.580369;TYPE=snp;VARB=0.0968205;OID=.;OPOS=58438709;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:22:22:16:16:6:6:4:2:7:9:4:2:7:9 chr19 58453342 . T C 503.75 PASS AO=110;DP=210;FAO=111;FDP=211;FR=.;FRO=100;FSAF=59;FSAR=52;FSRF=55;FSRR=45;FWDB=-0.0134401;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=209.855;QD=9.54973;RBI=0.0305426;REFB=-0.0196711;REVB=-0.0274265;RO=98;SAF=58;SAR=52;SRF=54;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0205554;STB=0.508796;TYPE=snp;VARB=0.0193816;OID=.;OPOS=58453342;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:210:211:98:100:110:111:52:58:54:44:52:59:55:45 chr19 58455381 . C T 1494.22 PASS AO=104;DP=143;FAO=155;FDP=155;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=96;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0870179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.643;QD=38.5604;RBI=0.0875364;REFB=0;REVB=0.00951304;RO=0;SAF=46;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000287807;OID=.;OPOS=58455381;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:139:155:0:0:104:155:58:46:0:0:59:96:0:0 chr19 58572979 . G A 2016.43 PASS AO=218;DP=223;FAO=218;FDP=218;FR=.;FRO=0;FSAF=109;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.026014;FXX=0.0267845;HRUN=3;LEN=1;MLLD=85.0527;QD=36.9987;RBI=0.0388988;REFB=-0.0332767;REVB=0.0289204;RO=2;SAF=109;SAR=109;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00866107;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.27337e-05;OID=.;OPOS=58572979;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:223:218:2:0:218:218:109:109:0:2:109:109:0:0 chr19 58578578 . C T 306.11 PASS AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0113884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.421;QD=37.1042;RBI=0.0132612;REFB=0;REVB=0.00679432;RO=0;SAF=8;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.90425e-05;OID=.;OPOS=58578578;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:33:33:0:0:33:33:25:8:0:0:25:8:0:0 chr19 58581572 . G A 471.98 PASS AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0483541;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.023;QD=38.5287;RBI=0.0623767;REFB=0;REVB=0.0394046;RO=0;SAF=30;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48867e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000224061;OID=.;OPOS=58581572;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:49:49:0:0:49:49:19:30:0:0:19:30:0:0 chr19 58581904 . A G 231.77 PASS AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00548125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.065;QD=37.0834;RBI=0.00848129;REFB=0;REVB=-0.00647211;RO=0;SAF=16;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.21696e-06;OID=.;OPOS=58581904;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:25:25:0:0:25:25:9:16:0:0:9:16:0:0 chr19 58596449 . C T 63.24 PASS AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=-0.00266325;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.786;QD=7.43982;RBI=0.0147552;REFB=-0.0267012;REVB=0.0145128;RO=19;SAF=6;SAR=9;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.269944;STB=0.654973;TYPE=snp;VARB=0.0373409;OID=.;OPOS=58596449;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:34:34:19:19:15:15:9:6:13:6:9:6:13:6 chr19 58718360 . A AG 337.95 PASS AO=41;DP=54;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.151465;FXX=0.0769083;HRUN=1;LEN=1;MLLD=20.6088;QD=28.1622;RBI=0.172422;REFB=0;REVB=-0.0823868;RO=11;SAF=22;SAR=19;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112372;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00256649;OID=.;OPOS=58718361;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:41:54:48:48:0:29:19:0:0:30:11:22:19:9:2 chr19 58864479 . T C 450.44 PASS AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0321761;FXX=0.0769083;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.661;QD=37.5368;RBI=0.033811;REFB=0;REVB=0.0103869;RO=0;SAF=14;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00159388;OID=.;OPOS=58864479;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:49:48:0:0:48:48:34:14:0:0:34:14:0:0 chr19 58868480 . G T 34.49 PASS AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0466717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.1351;QD=22.9947;RBI=0.0496377;REFB=-0.0560938;REVB=0.0169013;RO=1;SAF=3;SAR=2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121807;STB=0.571154;TYPE=snp;VARB=0.0244663;OID=.;OPOS=58868480;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:6:6:1:1:5:5:2:3:1:0:2:3:1:0 chr19 58870087 . TG T 72.49 PASS AO=11;DP=17;FAO=14;FDP=17;FR=.;FRO=3;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0673421;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=24.5906;QD=17.0576;RBI=0.101886;REFB=-0.0509494;REVB=0.0764584;RO=5;SAF=6;SAR=5;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0.445813;SSSB=0.0801957;STB=0.542312;TYPE=del;VARB=0.0197266;OID=.;OPOS=58870088;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:11:17:14:17:3:6:8:2:1:6:5:6:5:2:3 chr19 58870892 . G C 12.22 PASS AO=2;DP=9;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0.221976;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.236;QD=6.98393;RBI=0.0302936;REFB=-0.0141966;REVB=0.0302936;RO=7;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0209766;OID=.;OPOS=58870892;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:9:7:7:5:2:2:2:0:0:7:2:0:0:5 chr19 58928302 . T C 266.67 PASS AO=45;DP=180;FAO=66;FDP=176;FR=.,HEALED;FRO=92;FSAF=52;FSAR=14;FSRF=33;FSRR=59;FWDB=0.017266;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=33.4747;QD=6.06057;RBI=0.152835;REFB=-0.0910619;REVB=-0.151857;RO=66;SAF=43;SAR=2;SRF=31;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.71153;STB=0.761249;TYPE=snp;VARB=0.111686;OID=.;OPOS=58928302;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:176:66:92:45:66:2:43:31:35:14:52:33:59 chr19 58928786 . A G 337.12 PASS AO=91;DP=207;FAO=91;FDP=206;FR=.;FRO=115;FSAF=53;FSAR=38;FSRF=39;FSRR=76;FWDB=0.0176673;FXX=0.00483068;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.173;QD=6.54598;RBI=0.0235687;REFB=-0.0115478;REVB=-0.0155997;RO=112;SAF=53;SAR=38;SRF=39;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229745;STB=0.633438;TYPE=snp;VARB=0.0192359;OID=.;OPOS=58928786;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:206:112:115:91:91:38:53:39:73:38:53:39:76 chr19 58929052 . G A 162.84 PASS AO=48;DP=120;FAO=49;FDP=124;FR=.;FRO=75;FSAF=18;FSAR=31;FSRF=24;FSRR=51;FWDB=-0.0597092;FXX=0.00799936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3781;QD=5.25281;RBI=0.0597534;REFB=-0.0160264;REVB=-0.00229856;RO=72;SAF=17;SAR=31;SRF=23;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0408952;STB=0.531305;TYPE=snp;VARB=0.0456577;OID=.;OPOS=58929052;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:124:72:75:48:49:31:17:23:49:31:18:24:51 chr19 58929136 . G A 71.92 PASS AO=24;DP=67;FAO=24;FDP=67;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=0.000647085;FXX=0.0147037;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.5723;QD=4.29377;RBI=0.0220512;REFB=-0.0223988;REVB=-0.0220417;RO=43;SAF=10;SAR=14;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105749;STB=0.54656;TYPE=snp;VARB=0.0736946;OID=.;OPOS=58929136;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:67:67:43:43:24:24:14:10:22:21:14:10:21:22 chr19 58945962 . C T 834.46 PASS AO=81;DP=82;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0299187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.752;QD=37.9301;RBI=0.0333184;REFB=0;REVB=-0.0146625;RO=0;SAF=31;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.35858e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.02061e-05;OID=.;OPOS=58945962;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:82:88:0:0:81:88:50:31:0:0:52:36:0:0 chr19 58946056 . G A 104.21 PASS AO=21;DP=40;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.00335181;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=196.118;QD=10.4214;RBI=0.0393591;REFB=-0.00503065;REVB=-0.0392161;RO=19;SAF=8;SAR=13;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125635;STB=0.570663;TYPE=snp;VARB=0.00424712;OID=.;OPOS=58946056;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:40:40:19:19:21:21:13:8:10:9:13:8:10:9 chr19 58951123 . T C 243.11 PASS AO=51;DP=94;FAO=51;FDP=94;FR=.;FRO=43;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=15;FSRR=28;FWDB=-0.00526075;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.662;QD=10.3451;RBI=0.011891;REFB=0.0016721;REVB=0.010664;RO=43;SAF=21;SAR=30;SRF=15;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0546786;STB=0.530015;TYPE=snp;VARB=-0.00122785;OID=.;OPOS=58951123;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:94:43:43:51:51:30:21:15:28:30:21:15:28 chr19 58966644 . A T 178.25 PASS AO=52;DP=128;FAO=52;FDP=128;FR=.;FRO=76;FSAF=7;FSAR=45;FSRF=21;FSRR=55;FWDB=0.0186927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.239;QD=5.57044;RBI=0.0207955;REFB=-0.00741621;REVB=0.00911235;RO=76;SAF=7;SAR=45;SRF=21;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.248867;STB=0.642793;TYPE=snp;VARB=0.0132643;OID=.;OPOS=58966644;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:128:76:76:52:52:45:7:21:55:45:7:21:55 chr19 58968875 . A C 105.73 PASS AO=18;DP=29;FAO=18;FDP=29;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=11;FWDB=-0.0262051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.683;QD=14.5833;RBI=0.0264555;REFB=-0.0358841;REVB=0.00363138;RO=11;SAF=3;SAR=15;SRF=0;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.245764;STB=0.634028;TYPE=snp;VARB=0.00875332;OID=.;OPOS=58968875;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:29:29:11:11:18:18:15:3:0:11:15:3:0:11 chr19 58969179 . C A 129.53 PASS AO=35;DP=92;FAO=38;FDP=94;FR=.;FRO=56;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=39;FWDB=-0.0145706;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.381;QD=5.51199;RBI=0.0414604;REFB=-0.0136532;REVB=0.0388157;RO=52;SAF=14;SAR=21;SRF=17;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0818398;STB=0.542414;TYPE=snp;VARB=0.0221896;OID=.;OPOS=58969179;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:94:52:56:35:38:21:14:17:35:24:14:17:39 chr19 58982384 . A G 290.2 PASS AO=26;DP=27;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.255;QD=37.4446;RBI=0.0100929;REFB=0;REVB=0.00101477;RO=1;SAF=7;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0617811;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.52025e-05;OID=.;OPOS=58982384;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:27:31:1:0:26:31:19:7:1:0:20:11:0:0 chr19 58989495 . A C 166.29 PASS AO=26;DP=72;FAO=37;FDP=73;FR=.;FRO=36;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=-0.0407925;FXX=0.0135117;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.744;QD=9.11156;RBI=0.0418038;REFB=-0.0183986;REVB=0.00913919;RO=32;SAF=15;SAR=11;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0168526;STB=0.50847;TYPE=snp;VARB=0.0166501;OID=.;OPOS=58989495;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:73:32:36:26:37:11:15:19:13:15:22:22:14 chr19 58991900 . G A 199.32 PASS AO=63;DP=165;FAO=63;FDP=164;FR=.;FRO=101;FSAF=28;FSAR=35;FSRF=39;FSRR=62;FWDB=-0.0114293;FXX=0.017963;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.0385;QD=4.86147;RBI=0.0373035;REFB=-0.0315992;REVB=-0.0355095;RO=95;SAF=28;SAR=35;SRF=36;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0715181;STB=0.536641;TYPE=snp;VARB=0.0467505;OID=.;OPOS=58991900;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:164:95:101:63:63:35:28:36:59:35:28:39:62 chr19 58992029 . G A 14.85 PASS AO=9;DP=47;FAO=9;FDP=47;FR=.;FRO=38;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=28;FWDB=-0.0170942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.2021;QD=1.26392;RBI=0.0174072;REFB=-0.00260236;REVB=0.00328651;RO=38;SAF=2;SAR=7;SRF=10;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0678284;STB=0.545349;TYPE=snp;VARB=0.0148583;OID=.;OPOS=58992029;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:47:47:38:38:9:9:7:2:10:28:7:2:10:28 chr19 59028162 . G C 101.08 PASS AO=27;DP=71;FAO=29;FDP=73;FR=.;FRO=44;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=31;FWDB=0.0244845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.3441;QD=5.53843;RBI=0.0457269;REFB=-0.0250711;REVB=0.0386194;RO=44;SAF=12;SAR=15;SRF=13;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167352;STB=0.594875;TYPE=snp;VARB=0.0373232;OID=.;OPOS=59028162;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:73:44:44:27:29:15:12:13:31:16:13:13:31 chr19 59028635 . G A 10.38 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.0121996;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=114.538;QD=5.9322;RBI=0.0121996;REFB=0.0166196;REVB=0;RO=5;SAF=2;SAR=0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00283381;OID=.;OPOS=59028635;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:5:5:2:2:0:2:5:0:0:2:5:0 chr19 59061102 . AG A 149.16 PASS AO=29;DP=60;FAO=42;FDP=52;FR=.;FRO=10;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=0.134602;FXX=0.0714158;HRUN=3;LEN=1;MLLD=10.1015;QD=11.4734;RBI=0.135776;REFB=0.130087;REVB=0.0178116;RO=14;SAF=10;SAR=19;SRF=6;SRR=8;SSEN=0.416749;SSEP=0;SSSB=-0.0540364;STB=0.545433;TYPE=del;VARB=0.0317684;OID=.;OPOS=59061103;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:29:53:42:52:10:18:24:2:8:5:14:10:19:6:8 chr19 59082605 . C T 111.89 PASS AO=24;DP=47;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=20;FSAR=4;FSRF=21;FSRR=2;FWDB=0.0859257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.0789;QD=9.52242;RBI=0.0860758;REFB=-0.00260176;REVB=-0.00508024;RO=23;SAF=20;SAR=4;SRF=21;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139819;STB=0.577407;TYPE=snp;VARB=0.00323385;OID=.;OPOS=59082605;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:23:23:24:24:4:20:21:2:4:20:21:2 chr20 126310 . ACC A 252.94 PASS AO=95;DP=241;FAO=97;FDP=210;FR=.;FRO=113;FSAF=22;FSAR=75;FSRF=48;FSRR=65;FWDB=-0.0799757;FXX=0.00943352;HRUN=5;LEN=2;MLLD=30.8174;QD=4.81782;RBI=0.108607;REFB=-0.00189155;REVB=0.073481;RO=90;SAF=21;SAR=74;SRF=37;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211209;STB=0.630223;TYPE=del;VARB=0.000475538;OID=.;OPOS=126311;OREF=CC;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:95:203:97:210:113:22:75:48:65:99:90:21:74:37:53 chr20 138178 . GC G 202.16 PASS AO=68;DP=152;FAO=74;FDP=153;FR=.;FRO=79;FSAF=38;FSAR=36;FSRF=39;FSRR=40;FWDB=-0.0229505;FXX=0.0254761;HRUN=2;LEN=1;MLLD=27.6188;QD=5.28533;RBI=0.0231919;REFB=-0.0118284;REVB=-0.00333788;RO=77;SAF=33;SAR=35;SRF=37;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0045776;STB=0.510245;TYPE=del;VARB=0.0124528;OID=.;OPOS=138179;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:68:152:74:153:79:38:36:39:40:99:77:33:35:37:40 chr20 139456 . G A 378.17 PASS AO=76;DP=136;FAO=77;FDP=137;FR=.;FRO=60;FSAF=29;FSAR=48;FSRF=38;FSRR=22;FWDB=0.00376605;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.5556;QD=11.0415;RBI=0.0404629;REFB=-0.0174711;REVB=0.0402872;RO=60;SAF=29;SAR=47;SRF=38;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204063;STB=0.613009;TYPE=snp;VARB=0.0137737;OID=.;OPOS=139456;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:137:60:60:76:77:47:29:38:22:48:29:38:22 chr20 139576 . C A 470.75 PASS AO=71;DP=152;FAO=103;FDP=184;FR=.;FRO=81;FSAF=37;FSAR=66;FSRF=41;FSRR=40;FWDB=0.107593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.213;QD=10.2337;RBI=0.108027;REFB=-0.064207;REVB=0.00966591;RO=61;SAF=5;SAR=66;SRF=22;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.483509;STB=0.567572;TYPE=snp;VARB=0.0311052;OID=.;OPOS=139576;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:184:61:81:71:103:66:5:22:39:66:37:41:40 chr20 210061 . G A 443.55 PASS AO=108;DP=223;FAO=108;FDP=223;FR=.;FRO=115;FSAF=29;FSAR=79;FSRF=36;FSRR=79;FWDB=-0.00562002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.0878;QD=7.95596;RBI=0.00565489;REFB=-0.0185537;REVB=-0.000627005;RO=110;SAF=29;SAR=79;SRF=35;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0562328;STB=0.52845;TYPE=snp;VARB=0.0186859;OID=.;OPOS=210061;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:223:110:115:108:108:79:29:35:75:79:29:36:79 chr20 238435 . CTGGTCT C 125.91 PASS AO=33;DP=94;FAO=34;FDP=81;FR=.;FRO=47;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=2;FSRR=45;FWDB=0.00489123;FXX=0.0898775;HRUN=1;LEN=6;MLLD=233.554;QD=6.21754;RBI=0.0148416;REFB=-0.00560183;REVB=0.0140125;RO=47;SAF=10;SAR=23;SRF=1;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.425373;STB=0.705435;TYPE=del;VARB=0.00654152;OID=.;OPOS=238436;OREF=TGGTCT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:33:82:34:81:47:10:24:2:45:99:47:10:23:1:46 chr20 256727 . T A 1161.03 PASS AO=120;DP=121;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00356219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.415;QD=38.0665;RBI=0.0867454;REFB=0;REVB=0.0866722;RO=0;SAF=105;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000925026;OID=.;OPOS=256727;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:121:122:0:0:120:122:15:105:0:0:17:105:0:0 chr20 257733 . A G 493.63 PASS AO=54;DP=54;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00824852;FXX=0.0545355;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.502;QD=37.9718;RBI=0.0231764;REFB=0;REVB=0.0216589;RO=0;SAF=28;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.52846e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.85638e-05;OID=.;OPOS=257733;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:54:52:0:0:54:52:26:28:0:0:26:26:0:0 chr20 259818 . G A 132.98 PASS AO=35;DP=81;FAO=35;FDP=81;FR=.;FRO=46;FSAF=34;FSAR=1;FSRF=45;FSRR=1;FWDB=0.0442357;FXX=0.0121936;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.2652;QD=6.56712;RBI=0.150038;REFB=0.0330537;REVB=0.143369;RO=46;SAF=34;SAR=1;SRF=44;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116537;STB=0.537395;TYPE=snp;VARB=-0.0392431;OID=.;OPOS=259818;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:46:46:35:35:1:34:44:2:1:34:45:1 chr20 278806 . C T 210.54 PASS AO=35;DP=53;FAO=35;FDP=52;FR=.;FRO=17;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=0.0300653;FXX=0.0188644;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.976;QD=16.1953;RBI=0.0354024;REFB=-0.035064;REVB=0.0186924;RO=17;SAF=15;SAR=20;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165481;STB=0.590113;TYPE=snp;VARB=0.0177103;OID=.;OPOS=278806;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:53:52:17:17:35:35:20:15:12:5:20:15:12:5 chr20 279483 . T C 48.1 PASS AO=13;DP=37;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.0396433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.923;QD=5.06359;RBI=0.0558419;REFB=-0.00650355;REVB=-0.0393284;RO=24;SAF=9;SAR=4;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.262225;STB=0.669041;TYPE=snp;VARB=0.0185968;OID=.;OPOS=279483;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:37:38:24:24:13:14:4:9:11:13:4:10:11:13 chr20 368783 . GCCCCCCT GCCCCCTC 30.63 PASS AO=7;DP=44;FAO=13;FDP=41;FR=.,HEALED;FRO=26;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=22;FWDB=-0.0975832;FXX=0.0465008;HRUN=6;LEN=2;MLLD=43.2421;QD=2.98877;RBI=0.0977653;REFB=-0.0362026;REVB=0.00596324;RO=17;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.651371;STB=0.817796;TYPE=mnp;VARB=0.172728;OID=.;OPOS=368789;OREF=CT;OALT=TC;OMAPALT=GCCCCCTC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:7:39:13:41:26:9:4:4:22:26:17:4:3:0:17 chr20 391170 . C T 680.09 PASS AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.7328;QD=37.7826;RBI=0.0185576;REFB=0;REVB=0.00782988;RO=0;SAF=34;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000162164;OID=.;OPOS=391170;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:72:72:0:0:72:72:38:34:0:0:38:34:0:0 chr20 397928 . C T 1362.23 PASS AO=147;DP=148;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0049514;FXX=0.0270252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.572;QD=37.8398;RBI=0.00496797;REFB=0.00855436;REVB=-0.000405495;RO=1;SAF=87;SAR=60;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00543562;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00126179;OID=.;OPOS=397928;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:148:144:1:0:147:144:60:87:1:0:60:84:0:0 chr20 418022 . C T 337.98 PASS AO=105;DP=271;FAO=107;FDP=272;FR=.;FRO=165;FSAF=58;FSAR=49;FSRF=73;FSRR=92;FWDB=0.0162349;FXX=0.00366287;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.279;QD=4.97035;RBI=0.0169387;REFB=-0.013003;REVB=0.00483194;RO=162;SAF=56;SAR=49;SRF=72;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0958002;STB=0.560241;TYPE=snp;VARB=0.0229815;OID=.;OPOS=418022;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:271:272:162:165:105:107:49:56:72:90:49:58:73:92 chr20 418199 . T A 1913.62 PASS AO=199;DP=201;FAO=202;FDP=202;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000506374;FXX=0.00980344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.682;QD=37.8935;RBI=0.041494;REFB=-0.0371905;REVB=0.0414909;RO=1;SAF=95;SAR=104;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0045578;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.79526e-05;OID=.;OPOS=418199;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:82:201:202:1:0:199:202:104:95:0:1:107:95:0:0 chr20 741847 . A G 82.93 PASS AO=16;DP=30;FAO=16;FDP=30;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.0185238;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.649;QD=11.0575;RBI=0.0185297;REFB=0.0175818;REVB=-0.000468544;RO=14;SAF=9;SAR=7;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0679609;STB=0.538414;TYPE=snp;VARB=-0.0228026;OID=.;OPOS=741847;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:30:30:14:14:16:16:7:9:9:5:7:9:9:5 chr20 825678 . T C 101.96 PASS AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0309987;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=81.7822;QD=37.0753;RBI=0.0332326;REFB=0;REVB=0.0119784;RO=0;SAF=9;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00275321;OID=.;OPOS=825678;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:11:11:2:9:0:0:2:9:0:0 chr20 826492 . G C 241.72 PASS AO=64;DP=144;FAO=64;FDP=144;FR=.;FRO=80;FSAF=47;FSAR=17;FSRF=44;FSRR=36;FWDB=-0.00280544;FXX=0.00689608;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.059;QD=6.71448;RBI=0.0170287;REFB=-0.0110963;REVB=0.0167961;RO=80;SAF=47;SAR=17;SRF=44;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208337;STB=0.616851;TYPE=snp;VARB=0.0166122;OID=.;OPOS=826492;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:144:80:80:64:64:17:47:44:36:17:47:44:36 chr20 826513 . C G 319.64 PASS AO=71;DP=136;FAO=71;FDP=137;FR=.;FRO=66;FSAF=41;FSAR=30;FSRF=45;FSRR=21;FWDB=0.0313221;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.2789;QD=9.33247;RBI=0.0355803;REFB=-0.0162587;REVB=-0.0168784;RO=63;SAF=41;SAR=30;SRF=44;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108453;STB=0.55233;TYPE=snp;VARB=0.00998942;OID=.;OPOS=826513;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:137:63:66:71:71:30:41:44:19:30:41:45:21 chr20 826710 . C T 103.5 PASS AO=22;DP=43;FAO=22;FDP=43;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0340939;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2728;QD=9.62795;RBI=0.0725655;REFB=-0.0213071;REVB=0.0640575;RO=20;SAF=7;SAR=15;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0772372;STB=0.559385;TYPE=snp;VARB=0.0386888;OID=.;OPOS=826710;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:43:43:20:21:22:22:15:7:8:12:15:7:9:12 chr20 854940 . T C 122.72 PASS AO=21;DP=35;FAO=22;FDP=36;FR=.;FRO=14;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.0556588;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0968;QD=13.6352;RBI=0.107309;REFB=-0.025435;REVB=0.0917462;RO=14;SAF=13;SAR=8;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0359042;STB=0.507805;TYPE=snp;VARB=0.0152863;OID=.;OPOS=854940;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:35:36:14:14:21:22:8:13:8:6:9:13:8:6 chr20 939130 . T A 127.54 PASS AO=39;DP=93;FAO=38;FDP=94;FR=.;FRO=56;FSAF=11;FSAR=27;FSRF=27;FSRR=29;FWDB=-0.0861649;FXX=0.0105252;HRUN=4;LEN=1;MLLD=33.7004;QD=5.42714;RBI=0.0874128;REFB=-0.00762038;REVB=-0.0147178;RO=42;SAF=11;SAR=28;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.26425;STB=0.624779;TYPE=snp;VARB=0.0150821;OID=.;OPOS=939130;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:94:42:56:39:38:28:11:23:19:27:11:27:29 chr20 939161 . A G 193.81 PASS AO=45;DP=92;FAO=45;FDP=92;FR=.;FRO=47;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=0.0389041;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.4705;QD=8.42657;RBI=0.0391939;REFB=-0.00164109;REVB=0.00475727;RO=47;SAF=16;SAR=29;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0887825;STB=0.549389;TYPE=snp;VARB=0.00220433;OID=.;OPOS=939161;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:92:47:47:45:45:29:16:21:26:29:16:21:26 chr20 1099523 . T G 85.02 PASS AO=22;DP=53;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=21;FWDB=-0.0161065;FXX=0.0188644;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.415;QD=6.54017;RBI=0.017039;REFB=-0.0144934;REVB=-0.00555963;RO=30;SAF=8;SAR=14;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0711423;STB=0.540505;TYPE=snp;VARB=0.0220418;OID=.;OPOS=1099523;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:53:52:30:30:22:22:14:8:9:21:14:8:9:21 chr20 1115919 . A G 23.17 PASS AO=8;DP=34;FAO=9;FDP=35;FR=.;FRO=26;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.0206944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.063;QD=2.64825;RBI=0.0396055;REFB=0.00502272;REVB=-0.0337689;RO=26;SAF=3;SAR=5;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0593907;STB=0.516093;TYPE=snp;VARB=-0.0171775;OID=.;OPOS=1115919;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:34:35:26:26:8:9:5:3:11:15:5:4:11:15 chr20 1285933 . G A 141.09 PASS AO=27;DP=47;FAO=27;FDP=47;FR=.;FRO=20;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.0216798;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=217.227;QD=12.008;RBI=0.0221497;REFB=-0.0242575;REVB=0.00453838;RO=19;SAF=18;SAR=9;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0291155;STB=0.531226;TYPE=snp;VARB=0.0178109;OID=.;OPOS=1285933;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:47:47:19:20:27:27:9:18:12:7:9:18:12:8 chr20 1293247 . C T 599.12 PASS AO=63;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0424515;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.3066;QD=37.4452;RBI=0.0429472;REFB=0;REVB=-0.00650637;RO=0;SAF=38;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.2299e-05;OID=.;OPOS=1293247;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:64:64:0:0:63:64:25:38:0:0:25:39:0:0 chr20 1294002 . C T 73.84 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=259.275;QD=36.9199;RBI=0.129473;REFB=0;REVB=0.129473;RO=0;SAF=0;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00217091;OID=.;OPOS=1294002;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:8:0:0:0:8:0:0:0 chr20 1298698 . A G 59.72 PASS AO=16;DP=41;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=2;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=0.0205976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.776;QD=5.82654;RBI=0.0349314;REFB=-0.0322836;REVB=-0.0282125;RO=25;SAF=14;SAR=2;SRF=18;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.272767;STB=0.662916;TYPE=snp;VARB=0.057614;OID=.;OPOS=1298698;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:41:41:25:25:16:16:2:14:18:7:2:14:18:7 chr20 1298794 . G A 769.12 PASS AO=79;DP=79;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.022453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.1285;QD=37.9811;RBI=0.0353264;REFB=0;REVB=0.027273;RO=0;SAF=47;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.45895e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00028517;OID=.;OPOS=1298794;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:79:81:0:0:79:81:32:47:0:0:32:49:0:0 chr20 1298954 . A G 747.99 PASS AO=72;DP=76;FAO=84;FDP=88;FR=.;FRO=4;FSAF=38;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0138934;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=65.245;QD=33.9997;RBI=0.0347841;REFB=-0.122802;REVB=0.031889;RO=1;SAF=38;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0137071;STB=0.509298;TYPE=snp;VARB=0.00444337;OID=.;OPOS=1298954;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:76:88:1:4:72:84:34:38:0:1:46:38:1:3 chr20 1317279 . G A 497.91 PASS AO=91;DP=143;FAO=91;FDP=146;FR=.;FRO=55;FSAF=36;FSAR=55;FSRF=35;FSRR=20;FWDB=0.00733865;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.567;QD=13.6413;RBI=0.0222283;REFB=-0.0273187;REVB=0.0209819;RO=52;SAF=36;SAR=55;SRF=33;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162;STB=0.591199;TYPE=snp;VARB=0.0183808;OID=.;OPOS=1317279;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:146:52:55:91:91:55:36:33:19:55:36:35:20 chr20 1350672 . T C 270.18 PASS AO=54;DP=102;FAO=59;FDP=113;FR=.;FRO=54;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=28;FSRR=26;FWDB=-0.0276956;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.624;QD=9.5638;RBI=0.0465371;REFB=-0.0149646;REVB=0.0373986;RO=48;SAF=27;SAR=27;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0356266;STB=0.529154;TYPE=snp;VARB=0.0152158;OID=.;OPOS=1350672;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:113:48:54:54:59:27:27:26:22:32:27:28:26 chr20 1424303 . G A 176.02 PASS AO=31;DP=51;FAO=31;FDP=50;FR=.;FRO=19;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0422883;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.7082;QD=14.0817;RBI=0.0455181;REFB=-0.0122273;REVB=-0.0168404;RO=19;SAF=19;SAR=12;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0620596;STB=0.534114;TYPE=snp;VARB=0.00528402;OID=.;OPOS=1424303;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:51:50:19:19:31:31:12:19:10:9:12:19:10:9 chr20 1426393 . C T 475.1 PASS AO=141;DP=336;FAO=140;FDP=336;FR=.;FRO=196;FSAF=77;FSAR=63;FSRF=108;FSRR=88;FWDB=-0.0286359;FXX=0.00296727;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.72;QD=5.65589;RBI=0.0302561;REFB=0.00328597;REVB=-0.00976802;RO=193;SAF=78;SAR=63;SRF=106;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00416394;STB=0.500601;TYPE=snp;VARB=-0.00427297;OID=.;OPOS=1426393;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:336:336:193:196:141:140:63:78:106:87:63:77:108:88 chr20 1457910 . C A 491.81 PASS AO=104;DP=200;FAO=108;FDP=204;FR=.;FRO=96;FSAF=37;FSAR=71;FSRF=42;FSRR=54;FWDB=-0.0710045;FXX=0.00970827;HRUN=3;LEN=1;MLLD=127.402;QD=9.64329;RBI=0.0710359;REFB=-0.00078522;REVB=0.0021107;RO=94;SAF=37;SAR=67;SRF=41;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0741906;STB=0.548066;TYPE=snp;VARB=0.000367403;OID=.;OPOS=1457910;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:200:204:94:96:104:108:67:37:41:53:71:37:42:54 chr20 1459060 . T G 867.21 PASS AO=91;DP=92;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00871292;FXX=0.0319115;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.1488;QD=38.1189;RBI=0.0728088;REFB=0;REVB=0.0722856;RO=0;SAF=33;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.45581e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000714725;OID=.;OPOS=1459060;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:92:91:0:0:91:91:58:33:0:0:58:33:0:0 chr20 1532595 . T C 2728.59 PASS AO=290;DP=305;FAO=292;FDP=292;FR=.;FRO=0;FSAF=109;FSAR=183;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0423669;FXX=0.0457501;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.832;QD=37.378;RBI=0.0487025;REFB=0.0539552;REVB=0.0240205;RO=3;SAF=109;SAR=181;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00604123;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000263225;OID=.;OPOS=1532595;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:96:305:292:3:0:290:292:181:109:2:1:183:109:0:0 chr20 1538266 . G A 157.77 PASS AO=27;DP=43;FAO=28;FDP=44;FR=.;FRO=16;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.00991394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.036;QD=14.3426;RBI=0.0508921;REFB=-0.0454756;REVB=0.0499172;RO=16;SAF=15;SAR=12;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0478084;STB=0.532764;TYPE=snp;VARB=0.0249544;OID=.;OPOS=1538266;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:43:44:16:16:27:28:12:15:10:6:13:15:10:6 chr20 1546911 . C G 107.27 PASS AO=22;DP=43;FAO=23;FDP=45;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.0166189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.855;QD=9.5354;RBI=0.0296699;REFB=-0.0175706;REVB=0.0245787;RO=21;SAF=12;SAR=10;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107592;STB=0.535684;TYPE=snp;VARB=0.0190816;OID=.;OPOS=1546911;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:43:45:21:22:22:23:10:12:14:7:10:13:14:8 chr20 1551485 . C T 221.82 PASS AO=47;DP=90;FAO=47;FDP=89;FR=.;FRO=42;FSAF=37;FSAR=10;FSRF=34;FSRR=8;FWDB=0.0530674;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1286;QD=9.96938;RBI=0.0876679;REFB=-0.0139402;REVB=-0.0697818;RO=42;SAF=37;SAR=10;SRF=34;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0290344;STB=0.515982;TYPE=snp;VARB=0.0119034;OID=.;OPOS=1551485;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:89:42:42:47:47:10:37:34:8:10:37:34:8 chr20 1552430 . T C 553.56 PASS AO=147;DP=303;FAO=141;FDP=299;FR=.;FRO=158;FSAF=73;FSAR=68;FSRF=82;FSRR=76;FWDB=-0.0614332;FXX=0.0228751;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.824;QD=7.40547;RBI=0.0620241;REFB=-0.0278686;REVB=-0.00854082;RO=156;SAF=80;SAR=67;SRF=80;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0295517;STB=0.500665;TYPE=snp;VARB=0.0339183;OID=.;OPOS=1552430;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:303:299:156:158:147:141:67:80:80:76:68:73:82:76 chr20 1559101 . T G 782.21 PASS AO=306;DP=636;FAO=192;FDP=396;FR=.;FRO=204;FSAF=91;FSAR=101;FSRF=104;FSRR=100;FWDB=-0.00278287;FXX=0.00999975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.831;QD=7.90108;RBI=0.00780375;REFB=-0.0204066;REVB=-0.00729069;RO=327;SAF=138;SAR=168;SRF=154;SRR=173;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0189518;STB=0.518479;TYPE=snp;VARB=0.0246725;OID=.;OPOS=1559101;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:636:396:327:204:306:192:168:138:154:173:101:91:104:100 chr20 1592265 . A G 32.82 PASS AO=39;DP=194;FAO=36;FDP=194;FR=.;FRO=158;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=44;FSRR=114;FWDB=-0.0421784;FXX=0.00512794;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.0139;QD=0.676613;RBI=0.0590262;REFB=-0.00393569;REVB=-0.0412925;RO=154;SAF=16;SAR=23;SRF=40;SRR=114;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21308;STB=0.575963;TYPE=snp;VARB=0.0310305;OID=.;OPOS=1592265;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:194:194:154:158:39:36:23:16:40:114:23:13:44:114 chr20 1592284 . G A 37.63 PASS AO=33;DP=156;FAO=32;FDP=157;FR=.;FRO=125;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=34;FSRR=91;FWDB=0.0395658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.9391;QD=0.958836;RBI=0.0398059;REFB=-0.017477;REVB=-0.00436586;RO=123;SAF=14;SAR=19;SRF=33;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215425;STB=0.615518;TYPE=snp;VARB=0.0493011;OID=.;OPOS=1592284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:156:157:123:125:33:32:19:14:33:90:19:13:34:91 chr20 1592312 . T C 23.39 PASS AO=20;DP=98;FAO=19;FDP=98;FR=.;FRO=79;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=30;FSRR=49;FWDB=-0.00758116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.552;QD=0.954834;RBI=0.0152955;REFB=-0.0134648;REVB=-0.0132845;RO=66;SAF=11;SAR=9;SRF=19;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.323259;STB=0.616903;TYPE=snp;VARB=0.0382844;OID=.;OPOS=1592312;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:98:98:66:79:20:19:9:11:19:47:9:10:30:49 chr20 1592343 . T C 11.89 PASS AO=9;DP=54;FAO=9;FDP=53;FR=.;FRO=44;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=35;FWDB=-0.0278867;FXX=0.0185151;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.6189;QD=0.89772;RBI=0.034789;REFB=-0.00680666;REVB=0.0207993;RO=45;SAF=7;SAR=2;SRF=10;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.610072;STB=0.889436;TYPE=snp;VARB=0.0439179;OID=.;OPOS=1592343;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:54:53:45:44:9:9:2:7:10:35:2:7:9:35 chr20 1592355 . T C 10.87 PASS AO=6;DP=34;FAO=6;FDP=34;FR=.;FRO=28;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=23;FWDB=-0.0410565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.312;QD=1.27879;RBI=0.0497824;REFB=-0.00484926;REVB=-0.0281541;RO=28;SAF=4;SAR=2;SRF=5;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.550933;STB=0.846678;TYPE=snp;VARB=0.0544033;OID=.;OPOS=1592355;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:34:34:28:28:6:6:2:4:5:23:2:4:5:23 chr20 1592358 . C T 10.87 PASS AO=6;DP=34;FAO=6;FDP=34;FR=.;FRO=28;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=23;FWDB=-0.0109116;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=236.117;QD=1.2788;RBI=0.012086;REFB=0.00621699;REVB=-0.00519692;RO=28;SAF=4;SAR=2;SRF=5;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.550933;STB=0.846678;TYPE=snp;VARB=-0.0248027;OID=.;OPOS=1592358;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:34:34:28:28:6:6:2:4:5:23:2:4:5:23 chr20 1610894 . G A 161.59 PASS AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0116044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.077;QD=34.0183;RBI=0.0116062;REFB=0.0410439;REVB=0.000200932;RO=1;SAF=16;SAR=2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0278586;STB=0.515135;TYPE=snp;VARB=-0.000753579;OID=.;OPOS=1610894;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:19:19:1:1:18:18:2:16:1:0:2:16:1:0 chr20 1610939 . G A 155.54 PASS AO=18;DP=20;FAO=18;FDP=20;FR=.;FRO=2;FSAF=16;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0250579;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=145.379;QD=31.108;RBI=0.0327534;REFB=-0.0282037;REVB=-0.0210923;RO=1;SAF=16;SAR=2;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181456;STB=0.585259;TYPE=snp;VARB=0.00148298;OID=.;OPOS=1610939;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:20:20:1:2:18:18:2:16:0:1:2:16:1:1 chr20 1615959 . T C 2019.36 PASS AO=211;DP=211;FAO=211;FDP=211;FR=.;FRO=0;FSAF=113;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00367909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.3958;QD=38.2817;RBI=0.0411361;REFB=0;REVB=0.0409712;RO=0;SAF=113;SAR=98;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.82455e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.79082e-05;OID=.;OPOS=1615959;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:211:211:0:0:211:211:98:113:0:0:98:113:0:0 chr20 1616137 . G A 2938.49 PASS AO=287;DP=287;FAO=306;FDP=306;FR=.;FRO=0;FSAF=168;FSAR=138;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0837892;FXX=0.0064933;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.8287;QD=38.4117;RBI=0.0941068;REFB=0;REVB=-0.0428422;RO=0;SAF=163;SAR=124;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.20279e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.29064e-05;OID=.;OPOS=1616137;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:287:306:0:0:287:306:124:163:0:0:138:168:0:0 chr20 1616206 . A G 1944 PASS AO=181;DP=191;FAO=218;FDP=218;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=126;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00208248;FXX=0.0438577;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.138;QD=35.6696;RBI=0.0156464;REFB=0;REVB=0.0155072;RO=0;SAF=92;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00177923;OID=.;OPOS=1616206;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:191:218:0:0:181:218:89:92:0:0:126:92:0:0 chr20 1616207 . C G 47.37 PASS AO=45;DP=226;FAO=45;FDP=226;FR=.;FRO=181;FSAF=4;FSAR=41;FSRF=92;FSRR=89;FWDB=-0.00169312;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=66.7528;QD=0.838424;RBI=0.0325152;REFB=-0.0851453;REVB=0.0324711;RO=181;SAF=4;SAR=41;SRF=92;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.601293;STB=0.883114;TYPE=snp;VARB=0.0224354;OID=.;OPOS=1616207;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:226:226:181:181:45:45:41:4:92:89:41:4:92:89 chr20 1616892 . A G 2135.45 PASS AO=223;DP=226;FAO=225;FDP=225;FR=.;FRO=0;FSAF=143;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193085;FXX=0.00442458;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.922;QD=37.9636;RBI=0.0221179;REFB=0;REVB=0.0107881;RO=1;SAF=141;SAR=82;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00336758;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000150304;OID=.;OPOS=1616892;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:226:225:1:0:223:225:82:141:1:0:82:143:0:0 chr20 1895984 . C A 53.49 PASS AO=72;DP=389;FAO=71;FDP=388;FR=.;FRO=317;FSAF=40;FSAR=31;FSRF=152;FSRR=165;FWDB=-0.00210214;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.884;QD=0.551476;RBI=0.0026231;REFB=-0.00994154;REVB=0.00156897;RO=316;SAF=40;SAR=32;SRF=151;SRR=165;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100614;STB=0.568426;TYPE=snp;VARB=0.0355638;OID=.;OPOS=1895984;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:389:388:316:317:72:71:32:40:151:165:31:40:152:165 chr20 1895990 . G A 64 PASS AO=76;DP=393;FAO=75;FDP=392;FR=.;FRO=317;FSAF=41;FSAR=34;FSRF=157;FSRR=160;FWDB=-0.00778823;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.076;QD=0.65303;RBI=0.0163988;REFB=-0.0042421;REVB=-0.0144313;RO=315;SAF=41;SAR=35;SRF=155;SRR=160;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0613833;STB=0.541593;TYPE=snp;VARB=0.0141148;OID=.;OPOS=1895990;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:393:392:315:317:76:75:35:41:155:160:34:41:157:160 chr20 1896051 . CCGA C 54.77 PASS AO=68;DP=293;FAO=73;FDP=281;FR=.;FRO=208;FSAF=41;FSAR=32;FSRF=93;FSRR=115;FWDB=0.0107275;FXX=0.0174819;HRUN=4;LEN=3;MLLD=222.901;QD=0.779679;RBI=0.0220242;REFB=-0.00617855;REVB=-0.019235;RO=205;SAF=40;SAR=28;SRF=89;SRR=116;SSEN=0.576471;SSEP=0;SSSB=0.192259;STB=0.584272;TYPE=del;VARB=0.0199194;OID=.;OPOS=1896052;OREF=CGA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:68:282:73:281:208:41:32:93:115:54:205:40:28:89:116 chr20 1896059 . G A 131.8 PASS AO=70;DP=271;FAO=74;FDP=275;FR=.;FRO=201;FSAF=41;FSAR=33;FSRF=93;FSRR=108;FWDB=-0.0152838;FXX=0.00721996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.186;QD=1.91711;RBI=0.0158992;REFB=-0.00275355;REVB=0.0043807;RO=199;SAF=40;SAR=30;SRF=93;SRR=106;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129641;STB=0.56658;TYPE=snp;VARB=0.0106417;OID=.;OPOS=1896059;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:271:275:199:201:70:74:30:40:93:106:33:41:93:108 chr20 1896060 . T C 131.01 PASS AO=70;DP=271;FAO=73;FDP=273;FR=.;FRO=200;FSAF=41;FSAR=32;FSRF=92;FSRR=108;FWDB=0.0052037;FXX=0.0108692;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.477;QD=1.91951;RBI=0.0053999;REFB=-0.00885075;REVB=0.00144238;RO=198;SAF=40;SAR=30;SRF=90;SRR=108;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145151;STB=0.574209;TYPE=snp;VARB=0.0150943;OID=.;OPOS=1896060;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:271:273:198:200:70:73:30:40:90:108:32:41:92:108 chr20 1896100 . C T 235.28 PASS AO=80;DP=223;FAO=81;FDP=223;FR=.;FRO=142;FSAF=41;FSAR=40;FSRF=70;FSRR=72;FWDB=-0.0841931;FXX=0.00888849;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.721;QD=4.22025;RBI=0.0855873;REFB=-0.0349515;REVB=-0.0153856;RO=140;SAF=40;SAR=40;SRF=69;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00800794;STB=0.508412;TYPE=snp;VARB=0.058737;OID=.;OPOS=1896100;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:223:140:142:80:81:40:40:69:71:40:41:70:72 chr20 2290333 . C A 99.53 PASS AO=32;DP=95;FAO=34;FDP=97;FR=.;FRO=63;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=33;FSRR=30;FWDB=-0.00732612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.274;QD=4.10423;RBI=0.00779036;REFB=-0.0210123;REVB=-0.00264907;RO=63;SAF=13;SAR=19;SRF=33;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13509;STB=0.553702;TYPE=snp;VARB=0.0332736;OID=.;OPOS=2290333;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:97:63:63:32:34:19:13:33:30:19:15:33:30 chr20 2321105 . G C 131.54 PASS AO=26;DP=82;FAO=33;FDP=77;FR=.,HEALED;FRO=43;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=26;FWDB=-0.0254161;FXX=0.0253133;HRUN=4;LEN=1;MLLD=213.002;QD=6.83344;RBI=0.0535235;REFB=-0.0138803;REVB=-0.047104;RO=23;SAF=15;SAR=11;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.065659;STB=0.55081;TYPE=snp;VARB=0.00522356;OID=.;OPOS=2321105;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:77:23:43:26:33:11:15:15:8:17:16:17:26 chr20 2375262 . A G 989.29 PASS AO=102;DP=102;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00918;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.137;QD=38.0495;RBI=0.0161469;REFB=0;REVB=-0.0132835;RO=0;SAF=45;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.08171e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.45699e-06;OID=.;OPOS=2375262;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:102:104:0:0:102:104:57:45:0:0:58:46:0:0 chr20 2377204 . C T 112.78 PASS AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0245429;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.6;QD=9.59812;RBI=0.0254262;REFB=-0.0215077;REVB=-0.00664371;RO=23;SAF=12;SAR=12;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.056906;STB=0.531888;TYPE=snp;VARB=0.0231845;OID=.;OPOS=2377204;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:47:23:23:24:24:12:12:13:10:12:12:13:10 chr20 2398017 . G A 385.31 PASS AO=83;DP=178;FAO=95;FDP=193;FR=.;FRO=98;FSAF=55;FSAR=40;FSRF=49;FSRR=49;FWDB=0.0198976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.154;QD=7.98574;RBI=0.0218125;REFB=-0.0302668;REVB=0.00893693;RO=87;SAF=47;SAR=36;SRF=40;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0991117;STB=0.540577;TYPE=snp;VARB=0.0288553;OID=.;OPOS=2398017;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:193:87:98:83:95:36:47:40:47:40:55:49:49 chr20 2464353 . A G 25.21 PASS AO=12;DP=52;FAO=12;FDP=52;FR=.;FRO=40;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=0.0190479;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=95.6531;QD=1.93893;RBI=0.0273801;REFB=-0.0140141;REVB=-0.0196684;RO=40;SAF=6;SAR=6;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0304495;STB=0.519199;TYPE=snp;VARB=0.0273924;OID=.;OPOS=2464353;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:52:52:40:40:12:12:6:6:19:21:6:6:19:21 chr20 2539387 . G A 424.76 PASS AO=42;DP=44;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0482221;FXX=0.020829;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.7394;QD=36.15;RBI=0.135448;REFB=-0.0137609;REVB=0.126573;RO=1;SAF=22;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208598;STB=0.5102;TYPE=snp;VARB=0.00409322;OID=.;OPOS=2539387;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:44:47:1:1:42:46:20:22:1:0:22:24:1:0 chr20 2591232 . C T 1321.58 PASS AO=139;DP=142;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0743886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.397;QD=37.2276;RBI=0.0800626;REFB=-0.0473369;REVB=0.0296035;RO=2;SAF=38;SAR=101;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0243608;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000262579;OID=.;OPOS=2591232;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:142:142:2:0:139:142:101:38:2:0:101:41:0:0 chr20 2593863 . T C 2087.13 PASS AO=216;DP=216;FAO=217;FDP=217;FR=.;FRO=0;FSAF=168;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00021212;FXX=0.00458695;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.693;QD=38.4724;RBI=0.087872;REFB=0;REVB=0.0878717;RO=0;SAF=169;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.73979e-05;OID=.;OPOS=2593863;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:216:217:0:0:216:217:47:169:0:0:49:168:0:0 chr20 2618140 . T C 1235.93 PASS AO=134;DP=134;FAO=133;FDP=135;FR=.;FRO=2;FSAF=70;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00713031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.602;QD=36.6203;RBI=0.0078119;REFB=-0.0689229;REVB=-0.00319132;RO=0;SAF=69;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507811;TYPE=snp;VARB=0.000132874;OID=.;OPOS=2618140;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:134:135:0:2:134:133:65:69:0:0:63:70:0:2 chr20 2633936 . T C 984.18 PASS AO=105;DP=105;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000898901;FXX=0.0190458;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.631;QD=38.2204;RBI=0.031373;REFB=0;REVB=-0.0313601;RO=0;SAF=60;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.03574e-05;OID=.;OPOS=2633936;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:105:103:0:0:105:103:45:60:0:0:45:58:0:0 chr20 2635212 . A G 461.18 PASS AO=103;DP=198;FAO=103;FDP=198;FR=.;FRO=95;FSAF=70;FSAR=33;FSRF=37;FSRR=58;FWDB=-0.0142306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.585;QD=9.31685;RBI=0.0810837;REFB=0.0063751;REVB=0.0798252;RO=95;SAF=70;SAR=33;SRF=37;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.261256;STB=0.643341;TYPE=snp;VARB=-0.00423649;OID=.;OPOS=2635212;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:198:95:95:103:103:33:70:37:58:33:70:37:58 chr20 2637071 . T C 55.69 PASS AO=16;DP=47;FAO=17;FDP=48;FR=.;FRO=31;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=23;FWDB=0.016984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.557;QD=4.64111;RBI=0.017291;REFB=-0.00297571;REVB=0.00324389;RO=30;SAF=5;SAR=11;SRF=8;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0608021;STB=0.528668;TYPE=snp;VARB=0.0055646;OID=.;OPOS=2637071;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:47:48:30:31:16:17:11:5:8:22:12:5:8:23 chr20 2638579 . T C 353.51 PASS AO=124;DP=340;FAO=124;FDP=340;FR=.;FRO=216;FSAF=58;FSAR=66;FSRF=96;FSRR=120;FWDB=-0.0519814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.443;QD=4.15888;RBI=0.0527307;REFB=-0.00667042;REVB=0.00885778;RO=214;SAF=58;SAR=66;SRF=95;SRR=119;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0268492;STB=0.514889;TYPE=snp;VARB=0.0147461;OID=.;OPOS=2638579;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:340:340:214:216:124:124:66:58:95:119:66:58:96:120 chr20 2638882 . T C 209.67 PASS AO=44;DP=81;FAO=44;FDP=82;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=30;FSRF=13;FSRR=25;FWDB=-0.0305125;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.606;QD=10.2279;RBI=0.0344698;REFB=-0.0329938;REVB=-0.0160361;RO=37;SAF=14;SAR=30;SRF=12;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00585297;STB=0.512652;TYPE=snp;VARB=0.0308574;OID=.;OPOS=2638882;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:82:37:38:44:44:30:14:12:25:30:14:13:25 chr20 2644407 . C G 115.17 PASS AO=26;DP=63;FAO=29;FDP=65;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=11;FSRR=25;FWDB=0.0436483;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.2909;QD=7.08743;RBI=0.0604711;REFB=-0.0356276;REVB=-0.0418519;RO=36;SAF=6;SAR=20;SRF=11;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100092;STB=0.503103;TYPE=snp;VARB=0.0395646;OID=.;OPOS=2644407;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:65:36:36:26:29:20:6:11:25:20:9:11:25 chr20 2796193 . T C 36.55 PASS AO=10;DP=28;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.0468051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.306;QD=5.22081;RBI=0.0548499;REFB=0.00167839;REVB=-0.0285971;RO=18;SAF=1;SAR=9;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.604871;STB=0.870147;TYPE=snp;VARB=-0.00676562;OID=.;OPOS=2796193;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:28:28:18:18:10:10:9:1:11:7:9:1:11:7 chr20 2797015 . G A 107.81 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0236125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.077;QD=35.9367;RBI=0.0876815;REFB=0;REVB=0.0844423;RO=0;SAF=5;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00144285;OID=.;OPOS=2797015;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:7:5:0:0:7:5:0:0 chr20 3090516 . G T 74.13 PASS AO=19;DP=45;FAO=19;FDP=45;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=7;FWDB=0.00333877;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=230.101;QD=6.58927;RBI=0.0624971;REFB=0.00175974;REVB=0.0624079;RO=26;SAF=11;SAR=8;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162409;STB=0.592501;TYPE=snp;VARB=-0.00235226;OID=.;OPOS=3090516;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:45:45:26:26:19:19:8:11:19:7:8:11:19:7 chr20 3147468 . G A 117.83 PASS AO=30;DP=67;FAO=30;FDP=69;FR=.;FRO=39;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=6;FSRR=33;FWDB=0.0102446;FXX=0.028165;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.7356;QD=6.83073;RBI=0.0412207;REFB=-0.00965229;REVB=0.0399274;RO=37;SAF=10;SAR=20;SRF=6;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205676;STB=0.623458;TYPE=snp;VARB=0.0174425;OID=.;OPOS=3147468;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:69:37:39:30:30:20:10:6:31:20:10:6:33 chr20 3171337 . C T 526.96 PASS AO=55;DP=59;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00503675;FXX=0.0499917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.076;QD=36.9798;RBI=0.065369;REFB=-0.0381331;REVB=0.0651747;RO=1;SAF=36;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129164;STB=0.506847;TYPE=snp;VARB=0.00142914;OID=.;OPOS=3171337;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:59:57:1:1:55:56:19:36:1:0:20:36:1:0 chr20 3211235 . C T 45.27 PASS AO=14;DP=42;FAO=14;FDP=42;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=23;FWDB=0.0573505;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=120.648;QD=4.31163;RBI=0.0574566;REFB=-0.0156635;REVB=0.00349076;RO=28;SAF=5;SAR=9;SRF=5;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240415;STB=0.639829;TYPE=snp;VARB=0.0275939;OID=.;OPOS=3211235;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:42:42:28:28:14:14:9:5:5:23:9:5:5:23 chr20 3214819 . T G 114.23 PASS AO=27;DP=58;FAO=29;FDP=65;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.000685118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.769;QD=7.02969;RBI=0.00615572;REFB=-0.0150816;REVB=-0.00611748;RO=30;SAF=14;SAR=13;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0766364;STB=0.509548;TYPE=snp;VARB=0.0168907;OID=.;OPOS=3214819;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:65:30:36:27:29:13:14:18:12:15:14:18:18 chr20 3218563 . T C 15.77 PASS AO=6;DP=24;FAO=6;FDP=24;FR=.;FRO=18;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.000729987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.45;QD=2.62802;RBI=0.0284661;REFB=-0.0084302;REVB=-0.0284567;RO=18;SAF=1;SAR=5;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.255546;STB=0.672417;TYPE=snp;VARB=0.0278301;OID=.;OPOS=3218563;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:24:24:18:18:6:6:5:1:6:12:5:1:6:12 chr20 3218634 . G C 338.88 PASS AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0252607;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.7503;QD=37.6535;RBI=0.0403162;REFB=0;REVB=-0.0314212;RO=0;SAF=7;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0011642;OID=.;OPOS=3218634;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:35:36:0:0:35:36:28:7:0:0:29:7:0:0 chr20 3231134 . C T 253.39 PASS AO=69;DP=159;FAO=69;FDP=159;FR=.;FRO=90;FSAF=42;FSAR=27;FSRF=50;FSRR=40;FWDB=0.000439762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.553;QD=6.37453;RBI=0.010047;REFB=-0.00576918;REVB=0.0100373;RO=89;SAF=42;SAR=27;SRF=49;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0606284;STB=0.531135;TYPE=snp;VARB=0.0119207;OID=.;OPOS=3231134;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:159:89:90:69:69:27:42:49:40:27:42:50:40 chr20 3232031 . C T 145.47 PASS AO=33;DP=66;FAO=33;FDP=67;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=11;FSRR=23;FWDB=-0.0558142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.1386;QD=8.68456;RBI=0.0558145;REFB=-0.0404193;REVB=-0.00018544;RO=33;SAF=10;SAR=23;SRF=10;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512188;TYPE=snp;VARB=0.0216023;OID=.;OPOS=3232031;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:67:33:34:33:33:23:10:10:23:23:10:11:23 chr20 3285126 . A T 187.25 PASS AO=43;DP=87;FAO=43;FDP=87;FR=.;FRO=44;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=-0.0148946;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=243.871;QD=8.609;RBI=0.0186216;REFB=-0.00136633;REVB=-0.0111765;RO=42;SAF=24;SAR=19;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115352;STB=0.563772;TYPE=snp;VARB=0.00127879;OID=.;OPOS=3285126;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:42:44:43:43:19:24:18:24:19:24:19:25 chr20 3285140 . T C 810.3 PASS AO=85;DP=86;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0326071;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.202;QD=38.1319;RBI=0.0552896;REFB=0;REVB=0.044651;RO=0;SAF=43;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000394408;OID=.;OPOS=3285140;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:86:85:0:0:85:85:42:43:0:0:42:43:0:0 chr20 3515924 . G A 503.99 PASS AO=222;DP=533;FAO=158;FDP=397;FR=.;FRO=239;FSAF=90;FSAR=68;FSRF=121;FSRR=118;FWDB=-0.0185463;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.6;QD=5.07794;RBI=0.0238952;REFB=0.00955819;REVB=0.015067;RO=309;SAF=128;SAR=94;SRF=155;SRR=154;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0791758;STB=0.538467;TYPE=snp;VARB=-0.0119675;OID=.;OPOS=3515924;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:533:397:309:239:222:158:94:128:155:154:68:90:121:118 chr20 3515951 . C T 517.94 PASS AO=210;DP=564;FAO=156;FDP=381;FR=.;FRO=225;FSAF=84;FSAR=72;FSRF=110;FSRR=115;FWDB=0.00718365;FXX=0.0474988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.538;QD=5.4377;RBI=0.0075164;REFB=-0.00228021;REVB=0.00221166;RO=313;SAF=109;SAR=101;SRF=141;SRR=172;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0733723;STB=0.529313;TYPE=snp;VARB=0.00307027;OID=.;OPOS=3515951;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:564:381:313:225:210:156:101:109:141:172:72:84:110:115 chr20 3564672 . C T 302.95 PASS AO=76;DP=163;FAO=76;FDP=163;FR=.;FRO=87;FSAF=28;FSAR=48;FSRF=21;FSRR=66;FWDB=-0.0250826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.201;QD=7.43447;RBI=0.0280466;REFB=-0.0209515;REVB=-0.0125488;RO=87;SAF=28;SAR=48;SRF=21;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137528;STB=0.575739;TYPE=snp;VARB=0.0249601;OID=.;OPOS=3564672;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:163:87:87:76:76:48:28:21:66:48:28:21:66 chr20 3624830 . G A 395.57 PASS AO=90;DP=176;FAO=90;FDP=176;FR=.;FRO=86;FSAF=40;FSAR=50;FSRF=37;FSRR=49;FWDB=-0.00421153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.0786;QD=8.99014;RBI=0.0062607;REFB=0.00511033;REVB=-0.00463243;RO=85;SAF=40;SAR=50;SRF=37;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00820967;STB=0.507041;TYPE=snp;VARB=-0.00715151;OID=.;OPOS=3624830;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:176:85:86:90:90:50:40:37:48:50:40:37:49 chr20 3627840 . C CA 24.15 PASS AO=46;DP=190;FAO=49;FDP=180;FR=.;FRO=131;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=65;FSRR=66;FWDB=0.226023;FXX=0.0322563;HRUN=6;LEN=1;MLLD=8.80618;QD=0.53677;RBI=0.249845;REFB=-0.0573731;REVB=0.106472;RO=121;SAF=23;SAR=23;SRF=54;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0658757;STB=0.5495;TYPE=ins;VARB=0.0189418;OID=.;OPOS=3627841;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:46:190:49:180:131:21:28:65:66:24:121:23:23:54:67 chr20 3628918 . T C 946.89 PASS AO=98;DP=100;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00604064;FXX=0.019998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.276;QD=38.6484;RBI=0.00668639;REFB=0;REVB=-0.0028668;RO=0;SAF=63;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.76182e-06;OID=.;OPOS=3628918;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:100:98:0:0:98:98:35:63:0:0:35:63:0:0 chr20 3630107 . G A 249.71 PASS AO=67;DP=143;FAO=64;FDP=140;FR=.;FRO=76;FSAF=35;FSAR=29;FSRF=27;FSRR=49;FWDB=0.00982113;FXX=0.0277759;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.364;QD=7.13444;RBI=0.0163944;REFB=-0.0157414;REVB=-0.0131271;RO=76;SAF=37;SAR=30;SRF=27;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187115;STB=0.602884;TYPE=snp;VARB=0.0244183;OID=.;OPOS=3630107;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:140:76:76:67:64:30:37:27:49:29:35:27:49 chr20 3641254 . AG A 133.18 PASS AO=21;DP=35;FAO=29;FDP=31;FR=.;FRO=2;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.24827;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=10.2703;QD=17.1839;RBI=0.351411;REFB=-0.035489;REVB=0.2487;RO=9;SAF=7;SAR=14;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0.348568;SSSB=0.0699998;STB=0.517796;TYPE=del;VARB=0.0588385;OID=.;OPOS=3641255;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:21:31:29:31:2:8:21:1:1:7:9:7:14:2:7 chr20 3651742 . C G 41.73 PASS AO=11;DP=31;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=19;FWDB=0.0150609;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=190.854;QD=4.90968;RBI=0.0433195;REFB=-0.00195384;REVB=-0.0406171;RO=20;SAF=4;SAR=7;SRF=3;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.278543;STB=0.658321;TYPE=snp;VARB=0.00235919;OID=.;OPOS=3651742;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:31:34:20:22:11:12:7:4:3:17:8:4:3:19 chr20 3673770 . G A 10.38 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=162.152;QD=5.93156;RBI=0.046361;REFB=-0.0347296;REVB=-0.046361;RO=5;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0536723;OID=.;OPOS=3673770;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:5:5:2:2:2:0:0:5:2:0:0:5 chr20 3677357 . T C 588.78 PASS AO=64;DP=67;FAO=65;FDP=67;FR=.;FRO=2;FSAF=47;FSAR=18;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0909721;FXX=0.0147037;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.4153;QD=35.1511;RBI=0.0952851;REFB=-0.0872637;REVB=-0.0283432;RO=2;SAF=46;SAR=18;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200938;STB=0.510413;TYPE=snp;VARB=0.00451977;OID=.;OPOS=3677357;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:67:67:2:2:64:65:18:46:2:0:18:47:2:0 chr20 3677736 . T G 39.28 PASS AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.012855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.58;QD=7.14218;RBI=0.0812314;REFB=-0.0214119;REVB=-0.0802078;RO=13;SAF=7;SAR=2;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.274631;STB=0.666262;TYPE=snp;VARB=0.0276638;OID=.;OPOS=3677736;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:22:22:13:13:9:9:2:7:7:6:2:7:7:6 chr20 3679928 . G A 75.32 PASS AO=17;DP=36;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=16;FSAR=1;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.0551981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.459;QD=8.36911;RBI=0.0578021;REFB=-0.0114535;REVB=-0.0171538;RO=18;SAF=16;SAR=1;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.584799;STB=0.859655;TYPE=snp;VARB=0.0146958;OID=.;OPOS=3679928;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:36:36:18:19:17:17:1:16:10:8:1:16:10:9 chr20 3682242 . C T 113.42 PASS AO=25;DP=51;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=4;FSAR=21;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=0.0161723;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=127.641;QD=8.89598;RBI=0.016502;REFB=-0.00592841;REVB=0.00328214;RO=26;SAF=4;SAR=21;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.249295;STB=0.642223;TYPE=snp;VARB=0.00635242;OID=.;OPOS=3682242;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:51:51:26:26:25:25:21:4:9:17:21:4:9:17 chr20 3684022 . A G 69.08 PASS AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=1;FSAR=15;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=0.00954668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.564;QD=7.89541;RBI=0.0121181;REFB=-0.0107281;REVB=-0.00746387;RO=18;SAF=1;SAR=15;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.439634;STB=0.755873;TYPE=snp;VARB=0.0106319;OID=.;OPOS=3684022;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:34:35:18:19:16:16:15:1:5:13:15:1:5:14 chr20 3684729 . T C 80.92 PASS AO=18;DP=42;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.0261805;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.9962;QD=7.70714;RBI=0.03024;REFB=-0.012942;REVB=0.015134;RO=22;SAF=4;SAR=14;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.264764;STB=0.608574;TYPE=snp;VARB=0.0129655;OID=.;OPOS=3684729;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:42:42:22:23:18:19:14:4:10:12:14:5:10:13 chr20 3784110 . C T 114.4 PASS AO=24;DP=50;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.0264775;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.144;QD=8.97226;RBI=0.0351797;REFB=-0.0215548;REVB=-0.0231635;RO=26;SAF=13;SAR=11;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109043;STB=0.569584;TYPE=snp;VARB=0.0257978;OID=.;OPOS=3784110;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:51:26:26:24:25:11:13:11:15:11:14:11:15 chr20 3786273 . TTACCCACTCGGTCCCAGTTTTG T 110.91 PASS AO=66;DP=248;FAO=71;FDP=204;FR=.;FRO=133;FSAF=1;FSAR=70;FSRF=4;FSRR=129;FWDB=0.015096;FXX=0.00970827;HRUN=2;LEN=22;MLLD=656.503;QD=2.17465;RBI=0.0172419;REFB=0.00390054;REVB=0.0083304;RO=119;SAF=1;SAR=65;SRF=1;SRR=118;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15164;STB=0.637474;TYPE=del;VARB=-0.0060534;OID=.;OPOS=3786274;OREF=TACCCACTCGGTCCCAGTTTTG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:66:199:71:204:133:1:70:4:129:99:119:1:65:1:118 chr20 3838441 . C G 198.16 PASS AO=44;DP=84;FAO=44;FDP=87;FR=.;FRO=43;FSAF=14;FSAR=30;FSRF=16;FSRR=27;FWDB=-0.0589079;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.1463;QD=9.11063;RBI=0.0644385;REFB=-0.0587832;REVB=0.0261187;RO=39;SAF=14;SAR=30;SRF=13;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.014765;STB=0.530021;TYPE=snp;VARB=0.0715183;OID=.;OPOS=3838441;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:87:39:43:44:44:30:14:13:26:30:14:16:27 chr20 4053254 . A G 2353.42 PASS AO=247;DP=248;FAO=247;FDP=247;FR=.;FRO=0;FSAF=107;FSAR=140;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0199781;FXX=0.0040321;HRUN=3;LEN=1;MLLD=232.218;QD=38.112;RBI=0.0227506;REFB=-0.0138586;REVB=0.0108841;RO=1;SAF=107;SAR=140;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00443397;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.45284e-06;OID=.;OPOS=4053254;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:248:247:1:0:247:247:140:107:1:0:140:107:0:0 chr20 4124037 . TACAC T,TAC 386.62 PASS AO=17,12;DP=83;FAO=25,18;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=14,11;FSAR=11,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00862555,0.0384125;FXX=0.203666;HRUN=1,1;LEN=4,2;MLLD=116.304,79.5413;QD=35.9644;RBI=0.0118251,0.0821851;REFB=0,0;REVB=0.00808902,0.0726558;RO=0;SAF=8,7;SAR=9,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.126e-08,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.0158714,-0.00708168;OID=.,.;OPOS=4124038,4124038;OREF=ACAC,AC;OALT=-,-;OMAPALT=T,TAC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:17,12:41:25,18:43:0:14,11:11,7:0:0:73:0:8,7:9,5:0:0 chr20 4163302 . A G 508.48 PASS AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0406924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.645;QD=37.6655;RBI=0.0458317;REFB=0;REVB=0.0210872;RO=0;SAF=36;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00019356;OID=.;OPOS=4163302;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:54:54:0:0:54:54:18:36:0:0:18:36:0:0 chr20 4164283 . A G 673.07 PASS AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0582564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.444;QD=37.9192;RBI=0.0588013;REFB=0;REVB=-0.00798704;RO=0;SAF=23;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000279855;OID=.;OPOS=4164283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:71:71:0:0:71:71:48:23:0:0:48:23:0:0 chr20 4705718 . C T 39.26 PASS AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=0.0097875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.118;QD=6.03951;RBI=0.0285364;REFB=-0.023766;REVB=-0.0268055;RO=16;SAF=2;SAR=8;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.020453;STB=0.512171;TYPE=snp;VARB=0.0206093;OID=.;OPOS=4705718;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:26:26:16:16:10:10:8:2:3:13:8:2:3:13 chr20 4705756 . T C 52.15 PASS AO=14;DP=36;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.0243161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.683;QD=5.79437;RBI=0.0252815;REFB=-0.020751;REVB=-0.00691974;RO=22;SAF=8;SAR=6;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168078;STB=0.598286;TYPE=snp;VARB=0.0510911;OID=.;OPOS=4705756;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:36:36:22:22:14:14:6:8:9:13:6:8:9:13 chr20 4705865 . T C 190.37 PASS AO=26;DP=90;FAO=43;FDP=86;FR=.,HEALED;FRO=43;FSAF=39;FSAR=4;FSRF=34;FSRR=9;FWDB=0.0322513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.803;QD=8.85421;RBI=0.0361318;REFB=-0.039998;REVB=-0.0162898;RO=45;SAF=22;SAR=4;SRF=36;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0894542;STB=0.634469;TYPE=snp;VARB=0.0501455;OID=.;OPOS=4705865;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:86:45:43:26:43:4:22:36:9:4:39:34:9 chr20 4706310 . T C 311.9 PASS AO=88;DP=210;FAO=89;FDP=210;FR=.;FRO=121;FSAF=46;FSAR=43;FSRF=59;FSRR=62;FWDB=0.03005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.5653;QD=5.94103;RBI=0.0486659;REFB=-0.00267245;REVB=0.0382801;RO=119;SAF=45;SAR=43;SRF=59;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0160345;STB=0.51685;TYPE=snp;VARB=0.00267647;OID=.;OPOS=4706310;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:210:210:119:121:88:89:43:45:59:60:43:46:59:62 chr20 4707388 . G T 1000.76 PASS AO=105;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.486;QD=38.1243;RBI=0.037655;REFB=0;REVB=0.0346372;RO=0;SAF=47;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.43771e-05;OID=.;OPOS=4707388;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:105:105:0:0:105:105:58:47:0:0:58:47:0:0 chr20 4708130 . T C 742.67 PASS AO=80;DP=81;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0822311;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.6587;QD=36.6752;RBI=0.0834778;REFB=-0.0279648;REVB=0.0143733;RO=1;SAF=46;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0137211;STB=0.507245;TYPE=snp;VARB=-0.000255282;OID=.;OPOS=4708130;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:81:81:1:1:80:80:34:46:0:1:34:46:0:1 chr20 4708778 . T C 19.69 PASS AO=7;DP=30;FAO=8;FDP=31;FR=.;FRO=23;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=20;FWDB=-0.0105305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.659;QD=2.5408;RBI=0.0109154;REFB=-0.0119285;REVB=0.00287332;RO=21;SAF=1;SAR=6;SRF=2;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129686;STB=0.509068;TYPE=snp;VARB=0.0284656;OID=.;OPOS=4708778;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:30:31:21:23:7:8:6:1:2:19:7:1:3:20 chr20 4708979 . T C 244.8 PASS AO=58;DP=120;FAO=58;FDP=120;FR=.;FRO=62;FSAF=35;FSAR=23;FSRF=33;FSRR=29;FWDB=-0.0202586;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=100.654;QD=8.16013;RBI=0.0778213;REFB=-0.0175834;REVB=-0.0751381;RO=60;SAF=35;SAR=23;SRF=31;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0816802;STB=0.537812;TYPE=snp;VARB=0.0149612;OID=.;OPOS=4708979;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:60:62:58:58:23:35:31:29:23:35:33:29 chr20 4713176 . A G 336.2 PASS AO=72;DP=135;FAO=72;FDP=134;FR=.;FRO=62;FSAF=39;FSAR=33;FSRF=41;FSRR=21;FWDB=0.00395218;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.464;QD=10.0357;RBI=0.0146635;REFB=-0.0191808;REVB=0.0141209;RO=62;SAF=39;SAR=33;SRF=41;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102864;STB=0.556243;TYPE=snp;VARB=0.0135547;OID=.;OPOS=4713176;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:134:62:62:72:72:33:39:41:21:33:39:41:21 chr20 4762577 . C G 321.12 PASS AO=97;DP=241;FAO=97;FDP=240;FR=.;FRO=143;FSAF=54;FSAR=43;FSRF=71;FSRR=72;FWDB=-0.00964986;FXX=0.00414921;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.382;QD=5.35205;RBI=0.00965116;REFB=-0.00957256;REVB=0.000158034;RO=141;SAF=54;SAR=43;SRF=69;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0714929;STB=0.536031;TYPE=snp;VARB=0.0164051;OID=.;OPOS=4762577;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:241:240:141:143:97:97:43:54:69:72:43:54:71:72 chr20 4762869 . G A 2360.36 PASS AO=242;DP=248;FAO=247;FDP=247;FR=.;FRO=0;FSAF=132;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157947;FXX=0.00803181;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.538;QD=38.2245;RBI=0.0256356;REFB=-0.00248466;REVB=0.0201918;RO=1;SAF=127;SAR=115;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0037383;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.70841e-05;OID=.;OPOS=4762869;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:248:247:1:0:242:247:115:127:1:0:115:132:0:0 chr20 4764681 . GT G,GC 1051.03 PASS AO=61,46;DP=124;FAO=115,1;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=35,0;FSAR=80,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0907109,-0.0442495;FXX=0.0333306;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=159.24,147.931;QD=36.2424;RBI=0.0909074,0.0446527;REFB=0,0;REVB=0.0059742,-0.00598716;RO=0;SAF=24,6;SAR=37,40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.00013429,0.0173295;OID=.,.;OPOS=4764682,4764682;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=G,GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:61,46:118:115,1:116:0:35,0:80,1:0:0:28:0:24,6:37,40:0:0 chr20 4834338 . C T 786.11 PASS AO=79;DP=79;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0040265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.213;QD=37.8847;RBI=0.00455083;REFB=0;REVB=-0.0021207;RO=0;SAF=40;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33478e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.02477e-05;OID=.;OPOS=4834338;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:79:83:0:0:79:83:39:40:0:0:43:40:0:0 chr20 4836440 . C T 357.32 PASS AO=82;DP=163;FAO=82;FDP=162;FR=.;FRO=80;FSAF=50;FSAR=32;FSRF=30;FSRR=50;FWDB=0.00232255;FXX=0.00613459;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.544;QD=8.82279;RBI=0.00850328;REFB=-0.0126636;REVB=-0.00817995;RO=78;SAF=50;SAR=32;SRF=30;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1998;STB=0.615587;TYPE=snp;VARB=0.0101703;OID=.;OPOS=4836440;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:162:78:80:82:82:32:50:30:48:32:50:30:50 chr20 4850548 . G A 177.27 PASS AO=33;DP=55;FAO=33;FDP=55;FR=.;FRO=22;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=4;FWDB=-0.00602653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.998;QD=12.8927;RBI=0.00624041;REFB=0.00607265;REVB=-0.00161978;RO=22;SAF=22;SAR=11;SRF=18;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130641;STB=0.571388;TYPE=snp;VARB=-0.00346381;OID=.;OPOS=4850548;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:55:55:22:22:33:33:11:22:18:4:11:22:18:4 chr20 4854682 . A G 296.04 PASS AO=65;DP=126;FAO=66;FDP=127;FR=.;FRO=61;FSAF=29;FSAR=37;FSRF=17;FSRR=44;FWDB=-0.00672665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.926;QD=9.32397;RBI=0.0123867;REFB=-0.00811146;REVB=-0.0104011;RO=61;SAF=28;SAR=37;SRF=17;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139858;STB=0.579834;TYPE=snp;VARB=0.00789224;OID=.;OPOS=4854682;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:127:61:61:65:66:37:28:17:44:37:29:17:44 chr20 5283256 . C G 894.85 PASS AO=99;DP=103;FAO=99;FDP=102;FR=.;FRO=3;FSAF=40;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0150382;FXX=0.0097078;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4897;QD=35.0922;RBI=0.0150428;REFB=-0.115966;REVB=0.000370718;RO=4;SAF=39;SAR=60;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111202;STB=0.512394;TYPE=snp;VARB=0.00898534;OID=.;OPOS=5283256;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:103:102:4:3:99:99:60:39:1:3:59:40:0:3 chr20 5283323 . A C 104.76 PASS AO=36;DP=103;FAO=36;FDP=103;FR=.;FRO=67;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=35;FSRR=32;FWDB=0.0203419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.851;QD=4.06847;RBI=0.0362463;REFB=0.00225962;REVB=-0.03;RO=66;SAF=11;SAR=25;SRF=34;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.245802;STB=0.647074;TYPE=snp;VARB=-0.00524333;OID=.;OPOS=5283323;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:66:67:36:36:25:11:34:32:25:11:35:32 chr20 5283376 . G A 690.3 PASS AO=72;DP=72;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0403365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.01;QD=37.8246;RBI=0.0471553;REFB=0;REVB=0.0244251;RO=0;SAF=35;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.89855e-05;OID=.;OPOS=5283376;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:72:73:0:0:72:73:37:35:0:0:38:35:0:0 chr20 5296798 . T C 1923.36 PASS AO=183;DP=185;FAO=206;FDP=206;FR=.;FRO=0;FSAF=112;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.047376;FXX=0.00961492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.1146;QD=37.3467;RBI=0.109967;REFB=-0.0432773;REVB=0.0992385;RO=2;SAF=98;SAR=85;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000734834;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00166417;OID=.;OPOS=5296798;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:185:206:2:0:183:206:85:98:1:1:94:112:0:0 chr20 5454400 . A T 33.03 PASS AO=16;DP=64;FAO=16;FDP=64;FR=.;FRO=48;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=-0.0181356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.9755;QD=2.06406;RBI=0.0447861;REFB=0.00241953;REVB=0.0409499;RO=48;SAF=4;SAR=12;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.364617;STB=0.725516;TYPE=snp;VARB=-0.00875255;OID=.;OPOS=5454400;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:64:64:48:48:16:16:12:4:26:22:12:4:26:22 chr20 5527176 . T A 147.06 PASS AO=28;DP=49;FAO=28;FDP=49;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.0125545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.421;QD=12.0046;RBI=0.0210352;REFB=-0.0322168;REVB=0.0168779;RO=21;SAF=13;SAR=15;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00924929;STB=0.505121;TYPE=snp;VARB=0.017994;OID=.;OPOS=5527176;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:49:49:21:21:28:28:15:13:10:11:15:13:10:11 chr20 5527291 . A G 590.77 PASS AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.020117;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=240.913;QD=36.3552;RBI=0.0203321;REFB=0.0495175;REVB=-0.0029494;RO=1;SAF=37;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125954;STB=0.506665;TYPE=snp;VARB=-3.19429e-05;OID=.;OPOS=5527291;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:65:65:1:1:64:64:27:37:1:0:27:37:1:0 chr20 5903067 . T A 181.37 PASS AO=42;DP=88;FAO=42;FDP=86;FR=.;FRO=44;FSAF=29;FSAR=13;FSRF=28;FSRR=16;FWDB=-0.026293;FXX=0.0227247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.2604;QD=8.43595;RBI=0.0288017;REFB=-0.0232518;REVB=-0.0117565;RO=43;SAF=29;SAR=13;SRF=27;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0646618;STB=0.53159;TYPE=snp;VARB=0.0278921;OID=.;OPOS=5903067;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:86:43:44:42:42:13:29:27:16:13:29:28:16 chr20 5903323 . G A 34.33 PASS AO=9;DP=29;FAO=10;FDP=30;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=-0.0442236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.229;QD=4.57688;RBI=0.0444088;REFB=-0.000340996;REVB=0.0040508;RO=17;SAF=5;SAR=4;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.340276;STB=0.633085;TYPE=snp;VARB=0.000151112;OID=.;OPOS=5903323;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:29:30:17:20:9:10:4:5:4:13:5:5:6:14 chr20 5903517 . A G 783.75 PASS AO=31;DP=96;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00415945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.698;QD=37.7708;RBI=0.0579638;REFB=0;REVB=0.0578143;RO=0;SAF=0;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00014591;OID=.;OPOS=5903517;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:31:83:0:0:31:83:31:0:0:0:80:3:0:0 chr20 5903848 . C G 113.29 PASS AO=23;DP=58;FAO=29;FDP=65;FR=.;FRO=36;FSAF=24;FSAR=5;FSRF=26;FSRR=10;FWDB=-0.0555649;FXX=0.0151492;HRUN=4;LEN=1;MLLD=33.5034;QD=6.97142;RBI=0.103434;REFB=-0.0185776;REVB=-0.0872412;RO=34;SAF=21;SAR=2;SRF=26;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.322279;STB=0.590096;TYPE=snp;VARB=0.0127601;OID=.;OPOS=5903848;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:65:34:36:23:29:2:21:26:8:5:24:26:10 chr20 5903894 . A G 173.06 PASS AO=36;DP=67;FAO=36;FDP=67;FR=.;FRO=31;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.0444747;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6368;QD=10.3317;RBI=0.056797;REFB=0.00587645;REVB=-0.0353256;RO=30;SAF=24;SAR=12;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0304565;STB=0.527457;TYPE=snp;VARB=-0.00696601;OID=.;OPOS=5903894;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:30:31:36:36:12:24:19:11:12:24:19:12 chr20 5904040 . G A 188.11 PASS AO=36;DP=62;FAO=37;FDP=63;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.0398948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.0634;QD=11.9436;RBI=0.0589768;REFB=-0.0724187;REVB=0.0434358;RO=25;SAF=14;SAR=22;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159025;STB=0.583506;TYPE=snp;VARB=0.0540773;OID=.;OPOS=5904040;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:62:63:25:26:36:37:22:14:15:10:23:14:15:11 chr20 5923203 . T C 330.26 PASS AO=122;DP=356;FAO=124;FDP=356;FR=.;FRO=232;FSAF=42;FSAR=82;FSRF=88;FSRR=144;FWDB=-0.0343647;FXX=0.00558644;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.322;QD=3.71076;RBI=0.0362827;REFB=-0.0128519;REVB=-0.0116405;RO=232;SAF=42;SAR=80;SRF=88;SRR=144;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0439121;STB=0.528975;TYPE=snp;VARB=0.0219972;OID=.;OPOS=5923203;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:356:356:232:232:122:124:80:42:88:144:82:42:88:144 chr20 5923204 . T C 339.92 PASS AO=127;DP=358;FAO=126;FDP=358;FR=.;FRO=232;FSAF=44;FSAR=82;FSRF=87;FSRR=145;FWDB=0.0450306;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.08;QD=3.79794;RBI=0.0464058;REFB=-0.0350076;REVB=-0.0112136;RO=229;SAF=44;SAR=83;SRF=87;SRR=142;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0412486;STB=0.518183;TYPE=snp;VARB=0.013597;OID=.;OPOS=5923204;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:358:358:229:232:127:126:83:44:87:142:82:44:87:145 chr20 6090969 . A G 295.99 PASS AO=72;DP=151;FAO=72;FDP=151;FR=.;FRO=79;FSAF=34;FSAR=38;FSRF=54;FSRR=25;FWDB=-0.0239744;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.989;QD=7.84084;RBI=0.0267832;REFB=-0.0179515;REVB=0.0119402;RO=79;SAF=34;SAR=38;SRF=54;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198679;STB=0.609522;TYPE=snp;VARB=0.0261883;OID=.;OPOS=6090969;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:151:151:79:79:72:72:38:34:54:25:38:34:54:25 chr20 6100088 . A G 239.94 PASS AO=75;DP=192;FAO=75;FDP=192;FR=.;FRO=117;FSAF=44;FSAR=31;FSRF=48;FSRR=69;FWDB=0.00409901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.229;QD=4.99876;RBI=0.0201808;REFB=-0.00688586;REVB=-0.0197601;RO=117;SAF=44;SAR=31;SRF=48;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189547;STB=0.606701;TYPE=snp;VARB=0.00985034;OID=.;OPOS=6100088;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:192:117:117:75:75:31:44:48:69:31:44:48:69 chr20 6750771 . AC A 21.86 PASS AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=0.123508;FXX=0.049975;HRUN=2;LEN=1;MLLD=18.5482;QD=4.603;RBI=0.16205;REFB=0.0285924;REVB=-0.104909;RO=11;SAF=1;SAR=7;SRF=9;SRR=2;SSEN=0.277207;SSEP=0;SSSB=-0.646677;STB=0.885149;TYPE=del;VARB=-0.0364074;OID=.;OPOS=6750772;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:8:20:8:19:11:1:7:9:2:21:11:1:7:9:2 chr20 6751034 . A G 260.3 PASS AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186495;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.383;QD=38.5635;RBI=0.028318;REFB=0;REVB=0.0213098;RO=0;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39874e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000356953;OID=.;OPOS=6751034;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:27:27:0:0:27:27:14:13:0:0:14:13:0:0 chr20 6759115 . A T 1861.58 PASS AO=194;DP=195;FAO=196;FDP=196;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=127;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0338885;FXX=0.00507588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.8662;QD=37.9915;RBI=0.0466036;REFB=0.0373484;REVB=0.0319916;RO=1;SAF=68;SAR=126;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00376489;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.30736e-06;OID=.;OPOS=6759115;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:195:196:1:0:194:196:126:68:0:1:127:69:0:0 chr20 7614374 . G A 1451.62 PASS AO=153;DP=153;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00912329;FXX=0.00653552;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.907;QD=38.2005;RBI=0.035002;REFB=0;REVB=0.0337921;RO=0;SAF=68;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.64903e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000184556;OID=.;OPOS=7614374;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:153:152:0:0:153:152:85:68:0:0:85:67:0:0 chr20 7864284 . T C 302.62 PASS AO=86;DP=203;FAO=86;FDP=203;FR=.;FRO=117;FSAF=28;FSAR=58;FSRF=47;FSRR=70;FWDB=0.0373232;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.303;QD=5.96291;RBI=0.0374893;REFB=-0.00390355;REVB=0.00352585;RO=117;SAF=28;SAR=58;SRF=47;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0862205;STB=0.548262;TYPE=snp;VARB=0.00436609;OID=.;OPOS=7864284;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:203:203:117:117:86:86:58:28:47:70:58:28:47:70 chr20 7967980 . G C 175.84 PASS AO=38;DP=73;FAO=38;FDP=73;FR=.;FRO=35;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=-0.00166609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.4272;QD=9.63491;RBI=0.0111811;REFB=0.00429409;REVB=0.0110563;RO=35;SAF=21;SAR=17;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0416631;STB=0.523065;TYPE=snp;VARB=-0.00285053;OID=.;OPOS=7967980;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:35:35:38:38:17:21:21:14:17:21:21:14 chr20 7980390 . C T 1310.76 PASS AO=156;DP=176;FAO=157;FDP=171;FR=.;FRO=14;FSAF=103;FSAR=54;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.00529798;FXX=0.0284075;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.138;QD=30.6611;RBI=0.033637;REFB=-0.0381783;REVB=0.0332171;RO=14;SAF=103;SAR=53;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.051787;STB=0.526658;TYPE=snp;VARB=0.00162745;OID=.;OPOS=7980390;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:176:171:14:14:156:157:53:103:5:9:54:103:5:9 chr20 7999642 . G A 419.3 PASS AO=98;DP=196;FAO=98;FDP=196;FR=.;FRO=98;FSAF=58;FSAR=40;FSRF=58;FSRR=40;FWDB=0.00908681;FXX=0.00507588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.5798;QD=8.55705;RBI=0.0205795;REFB=-0.0138343;REVB=-0.0184647;RO=98;SAF=58;SAR=40;SRF=58;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0153003;OID=.;OPOS=7999642;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:196:98:98:98:98:40:58:58:40:40:58:58:40 chr20 8130943 . C T 416.49 PASS AO=89;DP=168;FAO=90;FDP=169;FR=.;FRO=79;FSAF=48;FSAR=42;FSRF=33;FSRR=46;FWDB=-0.00770773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.353;QD=9.85771;RBI=0.0263084;REFB=-0.014464;REVB=-0.025154;RO=77;SAF=47;SAR=42;SRF=31;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106126;STB=0.553883;TYPE=snp;VARB=0.00816203;OID=.;OPOS=8130943;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:169:77:79:89:90:42:47:31:46:42:48:33:46 chr20 8737734 . G A 1133.3 PASS AO=119;DP=119;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00702064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.941;QD=38.4169;RBI=0.0120571;REFB=0;REVB=0.0098023;RO=0;SAF=60;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.85627e-06;OID=.;OPOS=8737734;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:119:118:0:0:119:118:59:60:0:0:59:59:0:0 chr20 8755243 . T C 1915.06 PASS AO=126;DP=206;FAO=200;FDP=200;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=121;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0122648;FXX=0.00497488;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.79;QD=38.3012;RBI=0.168579;REFB=0;REVB=0.168132;RO=0;SAF=109;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.67342e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00157296;OID=.;OPOS=8755243;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:202:200:0:0:126:200:17:109:0:0:79:121:0:0 chr20 8769180 . C T 624.34 PASS AO=74;DP=80;FAO=75;FDP=80;FR=.;FRO=5;FSAF=32;FSAR=43;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0317129;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=35.9177;QD=31.2172;RBI=0.105788;REFB=-0.112097;REVB=-0.100922;RO=5;SAF=31;SAR=43;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0704136;STB=0.536222;TYPE=snp;VARB=0.00727419;OID=.;OPOS=8769180;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:80:80:5:5:74:75:43:31:5:0:43:32:5:0 chr20 8770822 . C T 1313.44 PASS AO=136;DP=136;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0210375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.215;QD=38.3487;RBI=0.0780426;REFB=0;REVB=0.0751536;RO=0;SAF=69;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.55397e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000118948;OID=.;OPOS=8770822;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:136:137:0:0:136:137:67:69:0:0:68:69:0:0 chr20 8865006 . C T 3278.11 PASS AO=342;DP=342;FAO=342;FDP=342;FR=.;FRO=0;FSAF=183;FSAR=159;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0504686;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.881;QD=38.3404;RBI=0.0537547;REFB=0;REVB=-0.0185064;RO=0;SAF=183;SAR=159;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.72892e-05;OID=.;OPOS=8865006;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:342:342:0:0:342:342:159:183:0:0:159:183:0:0 chr20 9424810 . A C 99.85 PASS AO=27;DP=66;FAO=27;FDP=65;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=0.0761619;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.615;QD=6.14491;RBI=0.0767482;REFB=-0.000376906;REVB=0.00946795;RO=34;SAF=11;SAR=16;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00443704;STB=0.507687;TYPE=snp;VARB=0.0012672;OID=.;OPOS=9424810;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:65:34:38:27:27:16:11:14:20:16:11:15:23 chr20 9424868 . C A 99 PASS AO=25;DP=57;FAO=25;FDP=57;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=23;FWDB=-0.019923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.1966;QD=6.94702;RBI=0.031992;REFB=-0.020188;REVB=0.0250311;RO=32;SAF=7;SAR=18;SRF=9;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00153124;STB=0.500869;TYPE=snp;VARB=0.0127533;OID=.;OPOS=9424868;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:57:57:32:32:25:25:18:7:9:23:18:7:9:23 chr20 9424904 . C A 50.2 PASS AO=16;DP=47;FAO=16;FDP=47;FR=.;FRO=31;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=22;FWDB=-0.0557075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.923;QD=4.27274;RBI=0.0621822;REFB=-0.00331582;REVB=-0.0276279;RO=31;SAF=5;SAR=11;SRF=9;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0292053;STB=0.51722;TYPE=snp;VARB=0.00576021;OID=.;OPOS=9424904;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:47:47:31:31:16:16:11:5:9:22:11:5:9:22 chr20 9460659 . A C 233.68 PASS AO=51;DP=98;FAO=51;FDP=98;FR=.;FRO=47;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=-0.00993346;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.654;QD=9.53793;RBI=0.04139;REFB=-0.028713;REVB=0.0401804;RO=46;SAF=30;SAR=21;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0771235;STB=0.537882;TYPE=snp;VARB=0.0216211;OID=.;OPOS=9460659;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:46:47:51:51:21:30:23:23:21:30:24:23 chr20 10006682 . T A 181.25 PASS AO=48;DP=110;FAO=48;FDP=110;FR=.;FRO=62;FSAF=33;FSAR=15;FSRF=30;FSRR=32;FWDB=-0.0154483;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.5237;QD=6.59084;RBI=0.0205224;REFB=-0.00182925;REVB=-0.0135099;RO=62;SAF=33;SAR=15;SRF=30;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215739;STB=0.621342;TYPE=snp;VARB=0.00213671;OID=.;OPOS=10006682;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:62:62:48:48:15:33:30:32:15:33:30:32 chr20 10620275 . G A 421.55 PASS AO=110;DP=244;FAO=112;FDP=244;FR=.;FRO=132;FSAF=50;FSAR=62;FSRF=60;FSRR=72;FWDB=0.00573828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.9494;QD=6.9107;RBI=0.0637332;REFB=-0.0233296;REVB=0.0634743;RO=132;SAF=50;SAR=60;SRF=59;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00753105;STB=0.504437;TYPE=snp;VARB=0.0379252;OID=.;OPOS=10620275;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:244:132:132:110:112:60:50:59:73:62:50:60:72 chr20 10620386 . A G 1814.36 PASS AO=190;DP=193;FAO=190;FDP=190;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0350614;FXX=0.0155432;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.16;QD=38.197;RBI=0.038484;REFB=0;REVB=-0.0158657;RO=0;SAF=88;SAR=102;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.71292e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000198647;OID=.;OPOS=10620386;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:193:190:0:0:190:190:102:88:0:0:102:88:0:0 chr20 10633237 . G A 109.38 PASS AO=25;DP=50;FAO=26;FDP=56;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=-0.00566176;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.413;QD=7.81248;RBI=0.0194488;REFB=-0.0170337;REVB=0.0186065;RO=24;SAF=8;SAR=17;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167808;STB=0.555511;TYPE=snp;VARB=0.0213478;OID=.;OPOS=10633237;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:56:24:30:25:26:17:8:12:12:18:8:12:18 chr20 11790885 . C CTT 164.28 PASS AO=55;DP=123;FAO=58;FDP=120;FR=.;FRO=62;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=28;FSRR=34;FWDB=0.0315009;FXX=0.00826378;HRUN=2;LEN=2;MLLD=44.3549;QD=5.47613;RBI=0.0746363;REFB=-0.0167701;REVB=0.0676629;RO=65;SAF=24;SAR=31;SRF=31;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0398515;STB=0.501742;TYPE=ins;VARB=0.0194012;OID=.;OPOS=11790886;OREF=-;OALT=TT;OMAPALT=CTT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:55:123:58:120:62:26:32:28:34:99:65:24:31:31:34 chr20 11791008 . C T 227.46 PASS AO=67;DP=166;FAO=68;FDP=167;FR=.;FRO=99;FSAF=25;FSAR=43;FSRF=51;FSRR=48;FWDB=-0.0138955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.5273;QD=5.4481;RBI=0.0189371;REFB=-0.0179312;REVB=-0.0128658;RO=98;SAF=25;SAR=42;SRF=50;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148014;STB=0.589546;TYPE=snp;VARB=0.0231076;OID=.;OPOS=11791008;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:167:98:99:67:68:42:25:50:48:43:25:51:48 chr20 11799583 . G C 254.18 PASS AO=58;DP=115;FAO=58;FDP=115;FR=.;FRO=57;FSAF=18;FSAR=40;FSRF=13;FSRR=44;FWDB=-0.0196964;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=256.574;QD=8.84102;RBI=0.0217886;REFB=-0.0175949;REVB=0.00931632;RO=57;SAF=18;SAR=40;SRF=13;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0899003;STB=0.549402;TYPE=snp;VARB=0.0165199;OID=.;OPOS=11799583;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:57:57:58:58:40:18:13:44:40:18:13:44 chr20 11907058 . C T 416.43 PASS AO=90;DP=166;FAO=90;FDP=169;FR=.;FRO=79;FSAF=28;FSAR=62;FSRF=22;FSRR=57;FWDB=-0.0128506;FXX=0.00588201;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.482;QD=9.85636;RBI=0.0463311;REFB=-0.0233228;REVB=-0.0445133;RO=76;SAF=28;SAR=62;SRF=19;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0613844;STB=0.518031;TYPE=snp;VARB=0.0152148;OID=.;OPOS=11907058;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:169:76:79:90:90:62:28:19:57:62:28:22:57 chr20 13029764 . A C 1722.21 PASS AO=182;DP=184;FAO=182;FDP=182;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=151;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0258874;FXX=0.010869;HRUN=3;LEN=1;MLLD=209.778;QD=37.8507;RBI=0.0306568;REFB=-0.00890287;REVB=-0.016422;RO=0;SAF=31;SAR=151;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.64648e-06;OID=.;OPOS=13029764;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:184:182:0:0:182:182:151:31:0:0:151:31:0:0 chr20 13029790 . C T 376.1 PASS AO=93;DP=196;FAO=93;FDP=196;FR=.;FRO=103;FSAF=30;FSAR=63;FSRF=17;FSRR=86;FWDB=0.011853;FXX=0.0101005;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.905;QD=7.67554;RBI=0.0197881;REFB=-0.000414805;REVB=-0.0158453;RO=103;SAF=30;SAR=63;SRF=17;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185697;STB=0.601515;TYPE=snp;VARB=0.000494772;OID=.;OPOS=13029790;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:196:103:103:93:93:63:30:17:86:63:30:17:86 chr20 13029862 . C T 1805.41 PASS AO=189;DP=191;FAO=193;FDP=193;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00799571;FXX=0.0102559;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1404;QD=37.4178;RBI=0.0180839;REFB=0.0486884;REVB=0.0162202;RO=2;SAF=102;SAR=87;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108193;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000190104;OID=.;OPOS=13029862;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:191:193:2:0:189:193:87:102:0:2:90:103:0:0 chr20 13029920 . C G 1620.29 PASS AO=178;DP=190;FAO=181;FDP=188;FR=.;FRO=7;FSAF=115;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0.00417206;FXX=0.0105258;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.872;QD=34.4743;RBI=0.00538943;REFB=-0.0319233;REVB=-0.00341174;RO=7;SAF=115;SAR=63;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0500061;STB=0.525177;TYPE=snp;VARB=1.99993e-05;OID=.;OPOS=13029920;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:190:188:7:7:178:181:63:115:0:7:66:115:0:7 chr20 13053018 . T G 334.02 PASS AO=80;DP=164;FAO=80;FDP=164;FR=.;FRO=84;FSAF=40;FSAR=40;FSRF=46;FSRR=38;FWDB=-0.00950615;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=203.472;QD=8.14691;RBI=0.0261191;REFB=-0.0281514;REVB=-0.0243278;RO=84;SAF=40;SAR=40;SRF=46;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0442191;STB=0.524384;TYPE=snp;VARB=0.0293973;OID=.;OPOS=13053018;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:164:84:84:80:80:40:40:46:38:40:40:46:38 chr20 13053035 . A G 316.05 PASS AO=77;DP=160;FAO=77;FDP=160;FR=.;FRO=83;FSAF=39;FSAR=38;FSRF=44;FSRR=39;FWDB=-0.0155466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.586;QD=7.90118;RBI=0.0342935;REFB=-0.020922;REVB=-0.0305671;RO=82;SAF=39;SAR=38;SRF=44;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.028122;STB=0.512259;TYPE=snp;VARB=0.0190315;OID=.;OPOS=13053035;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:160:82:83:77:77:38:39:44:38:38:39:44:39 chr20 13134768 . T C 416.57 PASS AO=115;DP=264;FAO=115;FDP=263;FR=.;FRO=148;FSAF=49;FSAR=66;FSRF=84;FSRR=64;FWDB=0.0218446;FXX=0.00378774;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1216;QD=6.3356;RBI=0.0220017;REFB=-0.0208533;REVB=-0.0026245;RO=148;SAF=49;SAR=66;SRF=84;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143097;STB=0.579469;TYPE=snp;VARB=0.0194787;OID=.;OPOS=13134768;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:264:263:148:148:115:115:66:49:84:64:66:49:84:64 chr20 13251316 . T C 313.59 PASS AO=65;DP=136;FAO=72;FDP=143;FR=.;FRO=71;FSAF=26;FSAR=46;FSRF=31;FSRR=40;FWDB=0.0270723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.045;QD=8.77184;RBI=0.0399571;REFB=-0.00778141;REVB=-0.0293881;RO=71;SAF=19;SAR=46;SRF=31;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152177;STB=0.539717;TYPE=snp;VARB=0.00636019;OID=.;OPOS=13251316;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:143:71:71:65:72:46:19:31:40:46:26:31:40 chr20 13747441 . A G 285.72 PASS AO=88;DP=222;FAO=88;FDP=222;FR=.;FRO=134;FSAF=51;FSAR=37;FSRF=72;FSRR=62;FWDB=-0.00809735;FXX=0.0044841;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.771;QD=5.14812;RBI=0.00843579;REFB=-0.0075986;REVB=-0.00236548;RO=134;SAF=51;SAR=37;SRF=72;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0461243;STB=0.525932;TYPE=snp;VARB=0.0100797;OID=.;OPOS=13747441;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:222:222:134:134:88:88:37:51:72:62:37:51:72:62 chr20 13847420 . A G 363.15 PASS AO=70;DP=126;FAO=73;FDP=129;FR=.;FRO=56;FSAF=48;FSAR=25;FSRF=26;FSRR=30;FWDB=0.00128719;FXX=0.00769172;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.855;QD=11.2604;RBI=0.0373735;REFB=-0.0142243;REVB=0.0373514;RO=54;SAF=48;SAR=22;SRF=26;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174939;STB=0.587949;TYPE=snp;VARB=0.00819787;OID=.;OPOS=13847420;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:129:54:56:70:73:22:48:26:28:25:48:26:30 chr20 14203735 . T C 1484.26 PASS AO=155;DP=157;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00234525;FXX=0.00632871;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.0286;QD=37.8156;RBI=0.211195;REFB=-0.0391702;REVB=0.211182;RO=1;SAF=70;SAR=85;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00556424;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000626415;OID=.;OPOS=14203735;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:157:157:1:0:155:157:85:70:0:1:87:70:0:0 chr20 14203776 . G A 235.35 PASS AO=78;DP=208;FAO=78;FDP=208;FR=.;FRO=130;FSAF=19;FSAR=59;FSRF=56;FSRR=74;FWDB=0.0165248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.389;QD=4.52592;RBI=0.0239625;REFB=-0.0037887;REVB=-0.0173531;RO=130;SAF=19;SAR=59;SRF=56;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.239121;STB=0.63647;TYPE=snp;VARB=0.00530413;OID=.;OPOS=14203776;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:208:130:130:78:78:59:19:56:74:59:19:56:74 chr20 14306896 . G A 962.03 PASS AO=177;DP=293;FAO=180;FDP=291;FR=.;FRO=111;FSAF=130;FSAR=50;FSRF=70;FSRR=41;FWDB=-0.0180441;FXX=0.0168913;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4061;QD=13.2238;RBI=0.0276582;REFB=-0.0153681;REVB=-0.0209615;RO=115;SAF=128;SAR=49;SRF=74;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0699952;STB=0.54191;TYPE=snp;VARB=0.0112403;OID=.;OPOS=14306896;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:293:291:115:111:177:180:49:128:74:41:50:130:70:41 chr20 16033818 . ATTTG A 1304.45 PASS AO=145;DP=177;FAO=164;FDP=164;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000725405;FXX=0.0120475;HRUN=3;LEN=4;MLLD=192.454;QD=31.8159;RBI=0.0105549;REFB=0;REVB=0.01053;RO=0;SAF=61;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11288e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-4.05005e-05;OID=.;OPOS=16033819;OREF=TTTG;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:145:148:164:164:0:71:93:0:0:99:0:61:84:0:0 chr20 16240407 . C A 24.08 PASS AO=4;DP=6;FAO=4;FDP=6;FR=.;FRO=2;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0776713;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.478;QD=16.0538;RBI=0.0874438;REFB=0.0498565;REVB=-0.0401696;RO=2;SAF=1;SAR=3;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.407562;STB=0.748744;TYPE=snp;VARB=-0.0217794;OID=.;OPOS=16240407;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:2:2:4:4:3:1:2:0:3:1:2:0 chr20 16354949 . C A 335.5 PASS AO=73;DP=146;FAO=76;FDP=149;FR=.;FRO=73;FSAF=28;FSAR=48;FSRF=39;FSRR=34;FWDB=-0.00187316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.132;QD=9.00659;RBI=0.00223861;REFB=-0.0185326;REVB=-0.00122584;RO=72;SAF=27;SAR=46;SRF=39;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158374;STB=0.583432;TYPE=snp;VARB=0.0237226;OID=.;OPOS=16354949;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:149:72:73:73:76:46:27:39:33:48:28:39:34 chr20 16359567 . A G 56.13 PASS AO=16;DP=43;FAO=16;FDP=43;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.022836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.8581;QD=5.22119;RBI=0.0269405;REFB=-0.0367908;REVB=-0.0142936;RO=27;SAF=10;SAR=6;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156256;STB=0.5916;TYPE=snp;VARB=0.0199276;OID=.;OPOS=16359567;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:43:43:27:27:16:16:6:10:13:14:6:10:13:14 chr20 16359650 . C T 153.57 PASS AO=38;DP=82;FAO=38;FDP=82;FR=.;FRO=44;FSAF=27;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=-2.46055e-05;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.629;QD=7.49138;RBI=0.0571332;REFB=-0.0241362;REVB=0.0571332;RO=44;SAF=26;SAR=12;SRF=18;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.270433;STB=0.668583;TYPE=snp;VARB=0.015806;OID=.;OPOS=16359650;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:44:44:38:38:12:26:18:26:11:27:18:26 chr20 16360177 . G T 266.35 PASS AO=57;DP=107;FAO=57;FDP=107;FR=.;FRO=50;FSAF=35;FSAR=22;FSRF=32;FSRR=18;FWDB=0.00697094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.641;QD=9.95696;RBI=0.0104226;REFB=-0.00333126;REVB=-0.00774829;RO=50;SAF=35;SAR=22;SRF=32;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.02343;STB=0.51287;TYPE=snp;VARB=0.0023475;OID=.;OPOS=16360177;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:107:50:50:57:57:22:35:32:18:22:35:32:18 chr20 16360219 . C T 229.78 PASS AO=45;DP=79;FAO=45;FDP=79;FR=.;FRO=34;FSAF=30;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=0.0183923;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.917;QD=11.6346;RBI=0.0202277;REFB=-0.0203006;REVB=0.00841919;RO=34;SAF=30;SAR=15;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171787;STB=0.50943;TYPE=snp;VARB=0.0150373;OID=.;OPOS=16360219;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:34:34:45:45:15:30:22:12:15:30:22:12 chr20 16362804 . A G 12.69 PASS AO=14;DP=92;FAO=15;FDP=94;FR=.;FRO=79;FSAF=1;FSAR=14;FSRF=31;FSRR=48;FWDB=-0.0218106;FXX=0.0105252;HRUN=3;LEN=1;MLLD=64.162;QD=0.540041;RBI=0.0769081;REFB=-0.0125219;REVB=0.0737507;RO=76;SAF=1;SAR=13;SRF=30;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.520267;STB=0.877805;TYPE=snp;VARB=0.0513457;OID=.;OPOS=16362804;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:92:94:76:79:14:15:13:1:30:46:14:1:31:48 chr20 16712401 . TA T 22.47 PASS AO=21;DP=113;FAO=33;FDP=108;FR=.;FRO=75;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=41;FSRR=34;FWDB=-0.125581;FXX=0.00917347;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.6954;QD=0.832233;RBI=0.168722;REFB=-0.0872608;REVB=-0.11268;RO=48;SAF=19;SAR=2;SRF=32;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.437253;STB=0.521922;TYPE=del;VARB=0.132598;OID=.;OPOS=16712402;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:21:104:33:108:75:17:16:41:34:22:48:19:2:32:16 chr20 16729654 . A AAGATG 50 PASS AO=62;DP=96;LEN=5;RO=34;SAF=40;SAR=32;SRF=18;SRR=6;TYPE=ins;FR=.;OID=.;OPOS=16729655;OREF=-;OALT=AGATG;OMAPALT=AAGATG GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR 0/1:99:96:34:62:32:40:18:6 chr20 16730640 . G A 425.46 PASS AO=103;DP=211;FAO=103;FDP=212;FR=.;FRO=109;FSAF=33;FSAR=70;FSRF=45;FSRR=64;FWDB=-0.0360685;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.673;QD=8.02762;RBI=0.0539826;REFB=-0.0370225;REVB=0.0401645;RO=108;SAF=34;SAR=69;SRF=44;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0786993;STB=0.552509;TYPE=snp;VARB=0.0405239;OID=.;OPOS=16730640;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:211:212:108:109:103:103:69:34:44:64:70:33:45:64 chr20 16963522 . G C 1049.32 PASS AO=107;DP=108;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0103948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5137;QD=38.507;RBI=0.0505871;REFB=0;REVB=-0.0495076;RO=0;SAF=53;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.66183e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000275547;OID=.;OPOS=16963522;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:108:109:0:0:107:109:54:53:0:0:55:54:0:0 chr20 16963542 . A G 232.19 PASS AO=54;DP=115;FAO=56;FDP=117;FR=.;FRO=61;FSAF=33;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=36;FWDB=0.00943324;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.405;QD=7.93827;RBI=0.00944716;REFB=-0.0218208;REVB=0.000512743;RO=61;SAF=32;SAR=22;SRF=25;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174123;STB=0.593383;TYPE=snp;VARB=0.0177051;OID=.;OPOS=16963542;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:117:61:61:54:56:22:32:25:36:23:33:25:36 chr20 17470035 . C G 167.09 PASS AO=35;DP=68;FAO=35;FDP=66;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=9;FSRR=22;FWDB=0.0296246;FXX=0.0294074;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.293;QD=10.1264;RBI=0.0297957;REFB=-0.017613;REVB=0.00318889;RO=33;SAF=14;SAR=21;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0615912;STB=0.554808;TYPE=snp;VARB=0.0173601;OID=.;OPOS=17470035;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:66:33:31:35:35:21:14:11:22:21:14:9:22 chr20 17474968 . T C 281.6 PASS AO=67;DP=140;FAO=69;FDP=145;FR=.;FRO=76;FSAF=21;FSAR=48;FSRF=22;FSRR=54;FWDB=-0.0150804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.953;QD=7.76823;RBI=0.0185191;REFB=-0.00773018;REVB=-0.0107489;RO=72;SAF=21;SAR=46;SRF=21;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239334;STB=0.50927;TYPE=snp;VARB=0.00896189;OID=.;OPOS=17474968;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:145:72:76:67:69:46:21:21:51:48:21:22:54 chr20 17475217 . C T 388.32 PASS AO=80;DP=144;FAO=81;FDP=148;FR=.;FRO=67;FSAF=25;FSAR=56;FSRF=33;FSRR=34;FWDB=0.00691929;FXX=0.00671096;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.526;QD=10.4951;RBI=0.0231905;REFB=-0.00534102;REVB=0.0221341;RO=61;SAF=24;SAR=56;SRF=28;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140521;STB=0.590737;TYPE=snp;VARB=0.00520575;OID=.;OPOS=17475217;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:148:61:67:80:81:56:24:28:33:56:25:33:34 chr20 17477592 . C T 172 PASS AO=44;DP=98;FAO=44;FDP=98;FR=.;FRO=54;FSAF=43;FSAR=1;FSRF=53;FSRR=1;FWDB=0.00867278;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.654;QD=7.02045;RBI=0.00895724;REFB=0.00746302;REVB=0.00223945;RO=54;SAF=43;SAR=1;SRF=53;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0493499;STB=0.527461;TYPE=snp;VARB=-0.0109316;OID=.;OPOS=17477592;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:54:54:44:44:1:43:53:1:1:43:53:1 chr20 17594714 . GC G 3031.94 PASS AO=312;DP=323;FAO=317;FDP=317;FR=.;FRO=0;FSAF=141;FSAR=176;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00473499;FXX=0.0185753;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.7828;QD=38.258;RBI=0.00855376;REFB=0;REVB=0.00712366;RO=0;SAF=138;SAR=174;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=3.42448e-05;OID=.;OPOS=17594715;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:312:319:317:317:0:141:176:0:0:99:0:138:174:0:0 chr20 17600357 . G A 643.86 PASS AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00342743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.811;QD=36.274;RBI=0.0124047;REFB=-0.099144;REVB=0.0119218;RO=1;SAF=27;SAR=43;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108697;STB=0.505745;TYPE=snp;VARB=0.000237341;OID=.;OPOS=17600357;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:71:71:1:1:70:70:43:27:0:1:43:27:0:1 chr20 17605240 . A T 639.48 PASS AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0136053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.696;QD=38.1778;RBI=0.0150795;REFB=0;REVB=0.0065029;RO=0;SAF=36;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.98599e-05;OID=.;OPOS=17605240;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:67:67:0:0:67:67:31:36:0:0:31:36:0:0 chr20 17623692 . C T 45.08 PASS AO=12;DP=32;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.0087398;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.354;QD=5.6345;RBI=0.00937496;REFB=-0.013522;REVB=-0.003392;RO=20;SAF=7;SAR=5;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140483;STB=0.583194;TYPE=snp;VARB=0.024504;OID=.;OPOS=17623692;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:32:32:20:20:12:12:5:7:9:11:5:7:9:11 chr20 17623770 . G A 26.19 PASS AO=9;DP=29;FAO=9;FDP=32;FR=.;FRO=23;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.135868;FXX=0.0302939;HRUN=5;LEN=1;MLLD=173.151;QD=3.27358;RBI=0.135893;REFB=-0.00392516;REVB=-0.00263602;RO=15;SAF=1;SAR=8;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186349;STB=0.826739;TYPE=snp;VARB=0.0096945;OID=.;OPOS=17623770;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:29:32:15:23:9:9:8:1:3:12:8:1:11:12 chr20 17705677 . A G 1453.13 PASS AO=159;DP=165;FAO=162;FDP=168;FR=.;FRO=6;FSAF=106;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.000266937;FXX=0.0175428;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.024;QD=34.5983;RBI=0.095409;REFB=-0.0123663;REVB=-0.0954086;RO=6;SAF=103;SAR=56;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0482895;STB=0.525421;TYPE=snp;VARB=5.75497e-05;OID=.;OPOS=17705677;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:165:168:6:6:159:162:56:103:0:6:56:106:0:6 chr20 17950545 . A T 273.94 PASS AO=66;DP=137;FAO=66;FDP=137;FR=.;FRO=71;FSAF=42;FSAR=24;FSRF=26;FSRR=45;FWDB=-0.0183023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.019;QD=7.99828;RBI=0.0234963;REFB=-0.00559775;REVB=0.0147344;RO=70;SAF=42;SAR=24;SRF=26;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246584;STB=0.639693;TYPE=snp;VARB=0.00977027;OID=.;OPOS=17950545;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:137:70:71:66:66:24:42:26:44:24:42:26:45 chr20 18142564 . A G 290.76 PASS AO=59;DP=105;FAO=59;FDP=105;FR=.;FRO=46;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=27;FSRR=19;FWDB=0.00894139;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=258.267;QD=11.0764;RBI=0.0134292;REFB=-0.0206987;REVB=-0.0100197;RO=46;SAF=29;SAR=30;SRF=27;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0763356;STB=0.541747;TYPE=snp;VARB=0.0178281;OID=.;OPOS=18142564;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:105:105:46:46:59:59:30:29:27:19:30:29:27:19 chr20 18143117 . T G 269.24 PASS AO=42;DP=68;FAO=48;FDP=75;FR=.;FRO=27;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.0819748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=36.9046;QD=14.3597;RBI=0.109691;REFB=-0.0646231;REVB=0.072885;RO=26;SAF=20;SAR=22;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0435769;STB=0.550541;TYPE=snp;VARB=0.0358923;OID=.;OPOS=18143117;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:68:75:26:27:42:48:22:20:14:12:28:20:15:12 chr20 18167977 . T C 290 PASS AO=72;DP=160;FAO=75;FDP=163;FR=.;FRO=88;FSAF=8;FSAR=67;FSRF=13;FSRR=75;FWDB=-0.00320221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.978;QD=7.11645;RBI=0.00669918;REFB=-0.00439293;REVB=0.00588429;RO=87;SAF=8;SAR=64;SRF=13;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0875516;STB=0.553268;TYPE=snp;VARB=0.00568989;OID=.;OPOS=18167977;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:163:87:88:72:75:64:8:13:74:67:8:13:75 chr20 18290979 . A G 69.1 PASS AO=27;DP=93;FAO=28;FDP=92;FR=.;FRO=64;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=57;FWDB=0.0300621;FXX=0.0212743;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.97;QD=3.0045;RBI=0.0301439;REFB=-0.0049444;REVB=-0.00221924;RO=62;SAF=13;SAR=14;SRF=7;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.464758;STB=0.757151;TYPE=snp;VARB=0.0172498;OID=.;OPOS=18290979;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:93:92:62:64:27:28:14:13:7:55:15:13:7:57 chr20 18295861 . G A 152.98 PASS AO=50;DP=132;FAO=51;FDP=141;FR=.;FRO=90;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=38;FSRR=52;FWDB=-0.0130127;FXX=0.00704176;HRUN=3;LEN=1;MLLD=195.359;QD=4.33991;RBI=0.013034;REFB=-0.00483892;REVB=-0.000745245;RO=81;SAF=21;SAR=29;SRF=36;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0271758;STB=0.50596;TYPE=snp;VARB=0.00710778;OID=.;OPOS=18295861;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:141:81:90:50:51:29:21:36:45:29:22:38:52 chr20 18296072 . T A 481.48 PASS AO=49;DP=49;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0042073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.018;QD=37.763;RBI=0.0268339;REFB=0;REVB=0.026502;RO=0;SAF=11;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000182934;OID=.;OPOS=18296072;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:49:51:0:0:49:51:38:11:0:0:40:11:0:0 chr20 18296473 . C T 102.4 PASS AO=20;DP=36;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.0205955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.19;QD=11.3777;RBI=0.0222244;REFB=-0.0228528;REVB=-0.00835159;RO=16;SAF=14;SAR=6;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221985;STB=0.62487;TYPE=snp;VARB=0.0258799;OID=.;OPOS=18296473;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:36:36:16:16:20:20:6:14:7:9:6:14:7:9 chr20 18296987 . G T 16.26 PASS AO=4;DP=14;FAO=4;FDP=14;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=0.00297647;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=183.276;QD=4.64579;RBI=0.00675738;REFB=0.00339796;REVB=-0.00606653;RO=10;SAF=3;SAR=1;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.539296;STB=0.842368;TYPE=snp;VARB=-0.0112188;OID=.;OPOS=18296987;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:14:14:10:10:4:4:1:3:2:8:1:3:2:8 chr20 18297193 . T C 275.78 PASS AO=61;DP=117;FAO=61;FDP=118;FR=.;FRO=57;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=20;FSRR=37;FWDB=-0.0347643;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.153;QD=9.34854;RBI=0.0556011;REFB=-0.00363366;REVB=-0.0433926;RO=56;SAF=33;SAR=28;SRF=20;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158925;STB=0.591043;TYPE=snp;VARB=0.0017154;OID=.;OPOS=18297193;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:118:56:57:61:61:28:33:20:36:28:33:20:37 chr20 18309650 . GT G 749.51 PASS AO=93;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0756539;FXX=0.00980296;HRUN=3;LEN=1;MLLD=20.0464;QD=29.6834;RBI=0.098574;REFB=0;REVB=0.0631927;RO=3;SAF=40;SAR=53;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0142533;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00263926;OID=.;OPOS=18309651;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:93:100:101:101:0:45:56:0:0:68:3:40:53:2:1 chr20 18375322 . T G 245.48 PASS AO=54;DP=107;FAO=55;FDP=108;FR=.;FRO=53;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=30;FSRR=23;FWDB=-0.00594298;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=138.324;QD=9.09172;RBI=0.0160297;REFB=-0.0319307;REVB=-0.0148873;RO=52;SAF=27;SAR=27;SRF=29;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0512744;STB=0.527974;TYPE=snp;VARB=0.0235838;OID=.;OPOS=18375322;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:108:52:53:54:55:27:27:29:23:27:28:30:23 chr20 18375324 . G T 301.62 PASS AO=62;DP=114;FAO=63;FDP=115;FR=.;FRO=52;FSAF=35;FSAR=28;FSRF=31;FSRR=21;FWDB=-0.0322131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.7559;QD=10.4911;RBI=0.0393848;REFB=-0.0475786;REVB=-0.02266;RO=52;SAF=34;SAR=28;SRF=31;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0403036;STB=0.518658;TYPE=snp;VARB=0.0305334;OID=.;OPOS=18375324;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:115:52:52:62:63:28:34:31:21:28:35:31:21 chr20 18393312 . C G 1897.03 PASS AO=197;DP=197;FAO=198;FDP=198;FR=.;FRO=0;FSAF=116;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166616;FXX=0.0149246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.6499;QD=38.3239;RBI=0.063647;REFB=0;REVB=-0.0614275;RO=0;SAF=116;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.94044e-05;OID=.;OPOS=18393312;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:197:198:0:0:197:198:81:116:0:0:82:116:0:0 chr20 18393499 . C T 676.58 PASS AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0243244;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.921;QD=36.5716;RBI=0.0303677;REFB=-0.131828;REVB=0.0181802;RO=0;SAF=15;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504272;TYPE=snp;VARB=0.000251311;OID=.;OPOS=18393499;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:74:74:0:1:73:73:58:15:0:0:58:15:0:1 chr20 18414356 . A G 1216.92 PASS AO=127;DP=133;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.121848;FXX=0.0150365;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.268;QD=37.158;RBI=0.123107;REFB=0;REVB=0.0175612;RO=3;SAF=66;SAR=61;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0211063;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000478654;OID=.;OPOS=18414356;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:133:131:3:0:127:131:61:66:3:0:62:69:0:0 chr20 18462421 . A G 1062.31 PASS AO=101;DP=101;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0384212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.743;QD=38.6295;RBI=0.0424561;REFB=0;REVB=-0.0180647;RO=0;SAF=31;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.82367e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.83463e-05;OID=.;OPOS=18462421;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:101:110:0:0:101:110:70:31:0:0:71:39:0:0 chr20 18794714 . C T 195.85 PASS AO=70;DP=198;FAO=70;FDP=198;FR=.;FRO=128;FSAF=21;FSAR=49;FSRF=65;FSRR=63;FWDB=0.0156579;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.072;QD=3.95652;RBI=0.0168988;REFB=-0.014302;REVB=0.00635588;RO=127;SAF=21;SAR=49;SRF=64;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.242977;STB=0.641749;TYPE=snp;VARB=0.0228954;OID=.;OPOS=18794714;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:198:127:128:70:70:49:21:64:63:49:21:65:63 chr20 18794754 . C T 239.86 PASS AO=76;DP=191;FAO=76;FDP=196;FR=.;FRO=120;FSAF=28;FSAR=48;FSRF=64;FSRR=56;FWDB=-0.00541832;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.305;QD=4.89519;RBI=0.0362583;REFB=-0.0111465;REVB=-0.0358512;RO=115;SAF=28;SAR=48;SRF=63;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194221;STB=0.602593;TYPE=snp;VARB=0.0133617;OID=.;OPOS=18794754;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:191:196:115:120:76:76:48:28:63:52:48:28:64:56 chr20 18810705 . C T 1383.33 PASS AO=146;DP=147;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0239218;FXX=0.00680226;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.791;QD=37.8994;RBI=0.029305;REFB=-0.0809476;REVB=0.0169272;RO=1;SAF=75;SAR=71;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00629909;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000145066;OID=.;OPOS=18810705;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:147:146:1:0:146:146:71:75:1:0:71:75:0:0 chr20 19261623 . G A 512.03 PASS AO=112;DP=212;FAO=113;FDP=214;FR=.;FRO=101;FSAF=52;FSAR=61;FSRF=53;FSRR=48;FWDB=0.00510099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.3438;QD=9.57056;RBI=0.0426743;REFB=-0.0125549;REVB=0.0423683;RO=100;SAF=52;SAR=60;SRF=53;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0567367;STB=0.530517;TYPE=snp;VARB=0.0175033;OID=.;OPOS=19261623;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:214:100:101:112:113:60:52:53:47:61:52:53:48 chr20 19560664 . G A 182.78 PASS AO=64;DP=180;FAO=64;FDP=179;FR=.;FRO=115;FSAF=25;FSAR=39;FSRF=35;FSRR=80;FWDB=-0.0228258;FXX=0.00555525;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.7361;QD=4.08437;RBI=0.0311451;REFB=-0.00999192;REVB=0.0211896;RO=115;SAF=25;SAR=39;SRF=35;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105318;STB=0.559719;TYPE=snp;VARB=0.0199144;OID=.;OPOS=19560664;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:179:115:115:64:64:39:25:35:80:39:25:35:80 chr20 19565693 . G A 146.47 PASS AO=31;DP=60;FAO=31;FDP=60;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=24;FSRF=7;FSRR=22;FWDB=0.00526611;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.456;QD=9.76461;RBI=0.0160374;REFB=-0.0143138;REVB=0.0151482;RO=29;SAF=7;SAR=24;SRF=7;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0190796;STB=0.510631;TYPE=snp;VARB=0.0149429;OID=.;OPOS=19565693;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:60:29:29:31:31:24:7:7:22:24:7:7:22 chr20 19634732 . G A 418.31 PASS AO=116;DP=268;FAO=116;FDP=267;FR=.;FRO=151;FSAF=43;FSAR=73;FSRF=64;FSRR=87;FWDB=-0.0118563;FXX=0.00743467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.761;QD=6.26688;RBI=0.0131766;REFB=-0.00685705;REVB=0.00574896;RO=149;SAF=43;SAR=73;SRF=64;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0625975;STB=0.531681;TYPE=snp;VARB=0.0084303;OID=.;OPOS=19634732;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:268:267:149:151:116:116:73:43:64:85:73:43:64:87 chr20 19634747 . T C 431.97 PASS AO=120;DP=276;FAO=120;FDP=276;FR=.;FRO=156;FSAF=44;FSAR=76;FSRF=63;FSRR=93;FWDB=-0.00280578;FXX=0.00360998;HRUN=3;LEN=1;MLLD=174.05;QD=6.26046;RBI=0.0185225;REFB=-0.0135784;REVB=-0.0183088;RO=155;SAF=44;SAR=76;SRF=63;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.04286;STB=0.52235;TYPE=snp;VARB=0.0176999;OID=.;OPOS=19634747;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:276:276:155:156:120:120:76:44:63:92:76:44:63:93 chr20 19701688 . G A 139.38 PASS AO=36;DP=82;FAO=36;FDP=82;FR=.;FRO=46;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=30;FSRR=16;FWDB=0.0047678;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=192.944;QD=6.79915;RBI=0.00918166;REFB=-0.018962;REVB=0.00784671;RO=46;SAF=18;SAR=18;SRF=30;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152124;STB=0.58532;TYPE=snp;VARB=0.0227027;OID=.;OPOS=19701688;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:46:46:36:36:18:18:30:16:18:18:30:16 chr20 19702049 . G A 302.73 PASS AO=67;DP=129;FAO=66;FDP=126;FR=.;FRO=60;FSAF=49;FSAR=17;FSRF=36;FSRR=24;FWDB=0.0314968;FXX=0.038165;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.094;QD=9.61059;RBI=0.0319717;REFB=-0.0089217;REVB=0.00549059;RO=61;SAF=53;SAR=14;SRF=36;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223539;STB=0.581618;TYPE=snp;VARB=0.0143624;OID=.;OPOS=19702049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:126:61:60:67:66:14:53:36:25:17:49:36:24 chr20 19951534 . T A 557.21 PASS AO=125;DP=239;FAO=125;FDP=239;FR=.;FRO=114;FSAF=52;FSAR=73;FSRF=30;FSRR=84;FWDB=8.66652e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5324;QD=9.32561;RBI=0.0151346;REFB=-0.0170433;REVB=-0.0151343;RO=114;SAF=52;SAR=73;SRF=30;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141348;STB=0.576949;TYPE=snp;VARB=0.0123344;OID=.;OPOS=19951534;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:239:239:114:114:125:125:73:52:30:84:73:52:30:84 chr20 19983022 . AT A 60.11 PASS AO=39;DP=104;FAO=43;FDP=99;FR=.;FRO=56;FSAF=6;FSAR=37;FSRF=11;FSRR=45;FWDB=-0.186749;FXX=0.009999;HRUN=6;LEN=1;MLLD=9.94881;QD=2.42887;RBI=0.209947;REFB=-0.0216938;REVB=0.0959284;RO=45;SAF=6;SAR=33;SRF=9;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0.4;SSSB=-0.0791768;STB=0.561075;TYPE=del;VARB=0.0263004;OID=.;OPOS=19983023;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:39:98:43:99:56:6:37:11:45:60:45:6:33:9:36 chr20 20032998 . T C 49.05 PASS AO=12;DP=34;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=-0.0830462;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.9617;QD=5.77104;RBI=0.0850075;REFB=-0.020064;REVB=-0.0181549;RO=19;SAF=8;SAR=4;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0851185;STB=0.516105;TYPE=snp;VARB=0.0256806;OID=.;OPOS=20032998;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:34:34:19:21:12:13:4:8:14:5:4:9:15:6 chr20 20033137 . T A 251.49 PASS AO=50;DP=90;FAO=50;FDP=89;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=32;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=-0.0376343;FXX=0.0111099;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.653;QD=11.303;RBI=0.0459441;REFB=-0.00515386;REVB=-0.0263537;RO=39;SAF=18;SAR=32;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106441;STB=0.558467;TYPE=snp;VARB=0.00391339;OID=.;OPOS=20033137;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:89:39:39:50:50:32:18:19:20:32:18:19:20 chr20 20033242 . A T 159.75 PASS AO=27;DP=42;FAO=28;FDP=44;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.0192738;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9176;QD=14.5226;RBI=0.0201971;REFB=0.0109975;REVB=-0.00603712;RO=15;SAF=10;SAR=17;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0656931;STB=0.531227;TYPE=snp;VARB=-0.00512535;OID=.;OPOS=20033242;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:42:44:15:16:27:28:17:10:7:8:18:10:7:9 chr20 20033319 . A G 56.21 PASS AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0335435;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.082;QD=8.99306;RBI=0.0409881;REFB=-0.00600433;REVB=-0.0235553;RO=13;SAF=6;SAR=6;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103751;STB=0.559901;TYPE=snp;VARB=0.00564111;OID=.;OPOS=20033319;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:25:25:13:13:12:12:6:6:8:5:6:6:8:5 chr20 20033367 . C G 54.62 PASS AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=15;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.0463607;FXX=0.0344709;HRUN=3;LEN=1;MLLD=159.888;QD=7.80349;RBI=0.050473;REFB=-0.0335094;REVB=-0.0199551;RO=9;SAF=6;SAR=6;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0416756;STB=0.518488;TYPE=snp;VARB=0.0406176;OID=.;OPOS=20033367;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:29:28:9:15:12:12:6:6:5:4:6:6:8:7 chr20 20033380 . A G 46.44 PASS AO=11;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0411377;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.9779;QD=5.99209;RBI=0.0436882;REFB=-0.0257624;REVB=-0.014709;RO=20;SAF=5;SAR=6;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102486;STB=0.516102;TYPE=snp;VARB=0.0414468;OID=.;OPOS=20033380;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:31:31:20:19:11:12:6:5:11:9:6:6:10:9 chr20 20050397 . G A 1726.4 PASS AO=179;DP=179;FAO=179;FDP=179;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151339;FXX=0.00555525;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.989;QD=38.5789;RBI=0.0257774;REFB=0;REVB=0.0208672;RO=0;SAF=70;SAR=109;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.5403e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.95332e-06;OID=.;OPOS=20050397;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:179:179:0:0:179:179:109:70:0:0:109:70:0:0 chr20 20079360 . A G 371.07 PASS AO=108;DP=282;FAO=119;FDP=306;FR=.;FRO=187;FSAF=40;FSAR=79;FSRF=76;FSRR=111;FWDB=0.00158384;FXX=0.00970842;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.397;QD=4.85058;RBI=0.0282441;REFB=-0.00875665;REVB=-0.0281996;RO=170;SAF=40;SAR=68;SRF=76;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0869814;STB=0.54664;TYPE=snp;VARB=0.0126181;OID=.;OPOS=20079360;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:282:306:170:187:108:119:68:40:76:94:79:40:76:111 chr20 20144772 . G A 1692.23 PASS AO=174;DP=176;FAO=176;FDP=176;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00870739;FXX=0.0112353;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.442;QD=38.4598;RBI=0.0408518;REFB=0;REVB=0.0399131;RO=0;SAF=98;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.13812e-05;OID=.;OPOS=20144772;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:176:176:0:0:174:176:76:98:0:0:78:98:0:0 chr20 20150027 . C T 296.97 PASS AO=81;DP=185;FAO=81;FDP=185;FR=.;FRO=104;FSAF=32;FSAR=49;FSRF=47;FSRR=57;FWDB=0.0159558;FXX=0.00537606;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.181;QD=6.42105;RBI=0.0271032;REFB=-0.0241773;REVB=0.0219087;RO=101;SAF=31;SAR=50;SRF=45;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0651391;STB=0.532967;TYPE=snp;VARB=0.0387658;OID=.;OPOS=20150027;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:185:101:104:81:81:50:31:45:56:49:32:47:57 chr20 20152462 . A C 171.94 PASS AO=50;DP=123;FAO=50;FDP=123;FR=.;FRO=73;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=25;FSRR=48;FWDB=-0.0211455;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.4173;QD=5.59161;RBI=0.0211803;REFB=0.00161493;REVB=0.00121435;RO=72;SAF=26;SAR=24;SRF=24;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194933;STB=0.604611;TYPE=snp;VARB=-0.00269956;OID=.;OPOS=20152462;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:72:73:50:50:24:26:24:48:24:26:25:48 chr20 20341333 . G C 2480.43 PASS AO=261;DP=262;FAO=261;FDP=261;FR=.;FRO=0;FSAF=121;FSAR=140;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012949;FXX=0.00381665;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.962;QD=38.0142;RBI=0.0130389;REFB=-0.0461785;REVB=0.00152854;RO=0;SAF=121;SAR=140;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.01063e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.09125e-05;OID=.;OPOS=20341333;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:262:261:0:0:261:261:140:121:0:0:140:121:0:0 chr20 20350516 . T G 130.41 PASS AO=12;DP=15;FAO=14;FDP=15;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0178017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.161;QD=34.7757;RBI=0.0561362;REFB=0;REVB=0.0532389;RO=0;SAF=10;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00047134;OID=.;OPOS=20350516;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:15:15:0:0:12:14:2:10:0:0:3:11:0:0 chr20 20377421 . A AC 219.13 PASS AO=33;DP=54;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.165999;FXX=0.019996;HRUN=5;LEN=1;MLLD=9.94211;QD=17.8883;RBI=0.204714;REFB=-0.0186247;REVB=0.119801;RO=17;SAF=17;SAR=16;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156655;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.0113726;OID=.;OPOS=20377422;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:33:54:49:49:0:28:21:0:0:16:17:17:16:13:4 chr20 20493222 . G A 177.96 PASS AO=46;DP=103;FAO=46;FDP=103;FR=.;FRO=57;FSAF=40;FSAR=6;FSRF=29;FSRR=28;FWDB=0.00999658;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=257.263;QD=6.91095;RBI=0.0188415;REFB=-0.0139986;REVB=-0.0159709;RO=57;SAF=40;SAR=6;SRF=29;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.467329;STB=0.766492;TYPE=snp;VARB=0.0121583;OID=.;OPOS=20493222;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:57:57:46:46:6:40:29:28:6:40:29:28 chr20 21142523 . C G 253.67 PASS AO=61;DP=130;FAO=62;FDP=131;FR=.;FRO=69;FSAF=44;FSAR=18;FSRF=41;FSRR=28;FWDB=-0.00810292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.672;QD=7.74549;RBI=0.0456838;REFB=-0.0122408;REVB=0.0449594;RO=69;SAF=44;SAR=17;SRF=41;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140027;STB=0.569476;TYPE=snp;VARB=0.0108972;OID=.;OPOS=21142523;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:131:69:69:61:62:17:44:41:28:18:44:41:28 chr20 21142813 . T C 909.89 PASS AO=99;DP=102;FAO=99;FDP=101;FR=.;FRO=2;FSAF=47;FSAR=52;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0178055;FXX=0.0194156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7674;QD=36.0351;RBI=0.0732817;REFB=-0.176404;REVB=0.0710857;RO=1;SAF=47;SAR=52;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00903516;STB=0.500501;TYPE=snp;VARB=0.00158504;OID=.;OPOS=21142813;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:102:101:1:2:99:99:52:47:0:1:52:47:1:1 chr20 21186161 . A AG 850.31 PASS AO=104;DP=141;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.288436;FXX=0.00724585;HRUN=2;LEN=1;MLLD=16.0768;QD=24.8264;RBI=0.325582;REFB=0.050211;REVB=0.151026;RO=35;SAF=48;SAR=56;SRF=28;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158528;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00673245;OID=.;OPOS=21186162;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:104:141:137:137:0:74:63:0:0:63:35:48:56:28:7 chr20 21362703 . TA T 1911.36 PASS AO=239;DP=286;FAO=265;FDP=265;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=171;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0529286;FXX=0.0148693;HRUN=4;LEN=1;MLLD=20.2678;QD=28.8507;RBI=0.0642474;REFB=0;REVB=-0.0364182;RO=9;SAF=77;SAR=162;SRF=7;SRR=2;SSEN=0.333333;SSEP=0;SSSB=-0.0355336;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.000652464;OID=.;OPOS=21362704;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:239:263:265:265:0:94:171:0:0:99:9:77:162:7:2 chr20 22562674 . T C 577.01 PASS AO=43;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00956101;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.375;QD=37.8367;RBI=0.0256374;REFB=0;REVB=0.0237879;RO=0;SAF=20;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.08135e-05;OID=.;OPOS=22562674;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:43:61:0:0:43:61:23:20:0:0:40:21:0:0 chr20 22758594 . T C 326.64 PASS AO=76;DP=152;FAO=76;FDP=152;FR=.;FRO=76;FSAF=38;FSAR=38;FSRF=30;FSRR=46;FWDB=-0.0174671;FXX=0.00653552;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.913;QD=8.59566;RBI=0.0255797;REFB=0.00612592;REVB=0.0186875;RO=74;SAF=38;SAR=38;SRF=30;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0848807;STB=0.552618;TYPE=snp;VARB=-0.00462826;OID=.;OPOS=22758594;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:152:74:76:76:76:38:38:30:44:38:38:30:46 chr20 23065879 . G A 25.85 PASS AO=10;DP=37;FAO=10;FDP=37;FR=.;FRO=27;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=-0.0440512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7003;QD=2.79478;RBI=0.0513658;REFB=-0.0163118;REVB=0.0264184;RO=26;SAF=4;SAR=6;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0277258;STB=0.505607;TYPE=snp;VARB=0.0631144;OID=.;OPOS=23065879;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:37:37:26:27:10:10:6:4:11:15:6:4:11:16 chr20 23066338 . G C 22.68 PASS AO=4;DP=20;FAO=6;FDP=19;FR=.,HEALED;FRO=13;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=-0.0107769;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=209.576;QD=4.77543;RBI=0.0502658;REFB=-0.00953823;REVB=-0.049097;RO=8;SAF=4;SAR=0;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.75998;STB=0.894477;TYPE=snp;VARB=0.0145091;OID=.;OPOS=23066338;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:17:19:8:13:4:6:0:4:2:6:1:5:2:11 chr20 23141550 . C G 80.12 PASS AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.0355819;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=133.667;QD=10.3378;RBI=0.0382361;REFB=-0.0170948;REVB=0.0139973;RO=15;SAF=11;SAR=5;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142741;STB=0.581392;TYPE=snp;VARB=0.0261691;OID=.;OPOS=23141550;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:31:31:15:15:16:16:5:11:8:7:5:11:8:7 chr20 23334781 . C T 426.6 PASS AO=111;DP=244;FAO=112;FDP=246;FR=.;FRO=134;FSAF=44;FSAR=68;FSRF=68;FSRR=66;FWDB=-0.0110796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3042;QD=6.93655;RBI=0.0354736;REFB=0.00463091;REVB=0.0336989;RO=129;SAF=43;SAR=68;SRF=66;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123194;STB=0.563636;TYPE=snp;VARB=-0.00787806;OID=.;OPOS=23334781;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:246:129:134:111:112:68:43:66:63:68:44:68:66 chr20 23335120 . CTT C 49.31 PASS AO=15;DP=43;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.100282;FXX=0.0731529;HRUN=3;LEN=2;MLLD=41.5931;QD=5.19065;RBI=0.101114;REFB=0.0302038;REVB=0.012944;RO=20;SAF=4;SAR=11;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0988718;STB=0.569634;TYPE=del;VARB=-0.0269906;OID=.;OPOS=23335121;OREF=TT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:15:40:17:38:21:4:13:7:14:49:20:4:11:7:13 chr20 23345844 . A C 206.06 PASS AO=44;DP=84;FAO=44;FDP=83;FR=.;FRO=39;FSAF=30;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=-0.0331925;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.8234;QD=9.93064;RBI=0.0500772;REFB=-0.009668;REVB=0.0374964;RO=38;SAF=30;SAR=14;SRF=24;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0476387;STB=0.535039;TYPE=snp;VARB=0.00857841;OID=.;OPOS=23345844;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:83:38:39:44:44:14:30:24:14:14:30:24:15 chr20 23352480 . A G 266.1 PASS AO=67;DP=144;FAO=67;FDP=144;FR=.;FRO=77;FSAF=35;FSAR=32;FSRF=38;FSRR=39;FWDB=0.0098946;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.9666;QD=7.39165;RBI=0.029714;REFB=0.0164151;REVB=-0.0280182;RO=77;SAF=35;SAR=32;SRF=38;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0278456;STB=0.515449;TYPE=snp;VARB=-0.0185202;OID=.;OPOS=23352480;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:144:77:77:67:67:32:35:38:39:32:35:38:39 chr20 23355423 . C T 81.92 PASS AO=19;DP=48;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=-0.00381586;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.936;QD=6.5538;RBI=0.00650449;REFB=0.00247102;REVB=-0.0052676;RO=28;SAF=13;SAR=6;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0482577;STB=0.501009;TYPE=snp;VARB=-0.00380157;OID=.;OPOS=23355423;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:48:50:28:29:19:21:6:13:18:10:8:13:18:11 chr20 23421101 . G A 633.39 PASS AO=131;DP=234;FAO=132;FDP=238;FR=.;FRO=106;FSAF=42;FSAR=90;FSRF=33;FSRR=73;FWDB=-0.0715776;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.799;QD=10.6452;RBI=0.0751454;REFB=-0.0334485;REVB=-0.0228797;RO=103;SAF=42;SAR=89;SRF=32;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00926352;STB=0.50353;TYPE=snp;VARB=0.0267098;OID=.;OPOS=23421101;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:234:238:103:106:131:132:89:42:32:71:90:42:33:73 chr20 23424613 . T C 302.14 PASS AO=67;DP=147;FAO=74;FDP=155;FR=.;FRO=81;FSAF=29;FSAR=45;FSRF=29;FSRR=52;FWDB=-0.0117885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.291;QD=7.79708;RBI=0.0119028;REFB=-0.022918;REVB=-0.00164561;RO=77;SAF=26;SAR=41;SRF=28;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.024946;STB=0.518712;TYPE=snp;VARB=0.0236784;OID=.;OPOS=23424613;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:155:77:81:67:74:41:26:28:49:45:29:29:52 chr20 23424638 . C T 277.81 PASS AO=66;DP=144;FAO=70;FDP=151;FR=.;FRO=81;FSAF=26;FSAR=44;FSRF=30;FSRR=51;FWDB=-0.0116079;FXX=0.013071;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.333;QD=7.35911;RBI=0.0189551;REFB=-0.0178806;REVB=-0.0149851;RO=73;SAF=26;SAR=40;SRF=27;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240471;STB=0.500608;TYPE=snp;VARB=0.0237919;OID=.;OPOS=23424638;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:151:73:81:66:70:40:26:27:46:44:26:30:51 chr20 23432528 . A G 239.24 PASS AO=57;DP=118;FAO=57;FDP=118;FR=.;FRO=61;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=21;FSRR=40;FWDB=-0.0097785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.685;QD=8.10992;RBI=0.00981731;REFB=-0.00173578;REVB=0.000872074;RO=61;SAF=32;SAR=25;SRF=21;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200494;STB=0.610828;TYPE=snp;VARB=0.00218535;OID=.;OPOS=23432528;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:61:61:57:57:25:32:21:40:25:32:21:40 chr20 23472391 . A G 2601.24 PASS AO=254;DP=258;FAO=284;FDP=284;FR=.;FRO=0;FSAF=142;FSAR=142;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0250419;FXX=0.0173004;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.594;QD=36.6371;RBI=0.0259428;REFB=-0.11299;REVB=0.00677738;RO=1;SAF=138;SAR=116;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00409183;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000621054;OID=.;OPOS=23472391;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:258:284:1:0:254:284:116:138:0:1:142:142:0:0 chr20 23531276 . G A 115.59 PASS AO=23;DP=43;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.0016649;FXX=0.0232504;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.94;QD=11.0085;RBI=0.00344208;REFB=-0.0045776;REVB=0.00301264;RO=19;SAF=15;SAR=8;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107913;STB=0.560386;TYPE=snp;VARB=0.00607788;OID=.;OPOS=23531276;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:43:42:19:19:23:23:8:15:10:9:8:15:10:9 chr20 23546639 . T G 642.62 PASS AO=144;DP=297;FAO=152;FDP=304;FR=.;FRO=152;FSAF=61;FSAR=91;FSRF=62;FSRR=90;FWDB=0.00547449;FXX=0.00327858;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.914;QD=8.45557;RBI=0.0104727;REFB=-0.0115157;REVB=0.00892785;RO=152;SAF=54;SAR=90;SRF=62;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0324703;STB=0.503418;TYPE=snp;VARB=0.0124331;OID=.;OPOS=23546639;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:297:304:152:152:144:152:90:54:62:90:91:61:62:90 chr20 23586360 . G A 270.33 PASS AO=82;DP=207;FAO=83;FDP=209;FR=.;FRO=126;FSAF=33;FSAR=50;FSRF=40;FSRR=86;FWDB=-0.0841201;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.203;QD=5.17368;RBI=0.0848035;REFB=-0.0146503;REVB=-0.010745;RO=125;SAF=33;SAR=49;SRF=40;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.094248;STB=0.551475;TYPE=snp;VARB=0.0221522;OID=.;OPOS=23586360;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:209:125:126:82:83:49:33:40:85:50:33:40:86 chr20 23618395 . T C 116.19 PASS AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00690055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.669;QD=35.7501;RBI=0.00710181;REFB=0;REVB=0.00167874;RO=0;SAF=6;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.27446e-05;OID=.;OPOS=23618395;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:13:13:0:0:13:13:7:6:0:0:7:6:0:0 chr20 23729722 . G T 3346.65 PASS AO=354;DP=357;FAO=354;FDP=354;FR=.;FRO=0;FSAF=184;FSAR=170;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0443913;FXX=0.00840313;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.5327;QD=37.8153;RBI=0.0567304;REFB=0.00539506;REVB=-0.0353236;RO=3;SAF=184;SAR=170;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00299375;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000117611;OID=.;OPOS=23729722;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:357:354:3:0:354:354:170:184:1:2:170:184:0:0 chr20 23731426 . C T 470.07 PASS AO=89;DP=154;FAO=91;FDP=153;FR=.;FRO=62;FSAF=36;FSAR=55;FSRF=32;FSRR=30;FWDB=0.0694017;FXX=0.00649309;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.7345;QD=12.2893;RBI=0.0705513;REFB=-0.040622;REVB=0.0126842;RO=63;SAF=34;SAR=55;SRF=33;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111128;STB=0.549989;TYPE=snp;VARB=0.0391362;OID=.;OPOS=23731426;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:153:63:62:89:91:55:34:33:30:55:36:32:30 chr20 23731494 . A G 751.09 PASS AO=78;DP=79;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0839332;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.947;QD=38.5176;RBI=0.0840768;REFB=0;REVB=0.00491285;RO=0;SAF=37;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.4281e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000638746;OID=.;OPOS=23731494;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:79:78:0:0:78:78:41:37:0:0:41:37:0:0 chr20 23860178 . A G 156.81 PASS AO=30;DP=52;FAO=30;FDP=52;FR=.;FRO=22;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.00722279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.078;QD=12.062;RBI=0.0488892;REFB=-0.0338415;REVB=-0.0483528;RO=22;SAF=20;SAR=10;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0635924;STB=0.535187;TYPE=snp;VARB=0.0224812;OID=.;OPOS=23860178;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:52:52:22:22:30:30:10:20:13:9:10:20:13:9 chr20 24939590 . G C 146.43 PASS AO=35;DP=74;FAO=35;FDP=74;FR=.;FRO=39;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=26;FSRR=13;FWDB=-0.0549874;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.249;QD=7.91528;RBI=0.0613871;REFB=-0.0147054;REVB=-0.0272902;RO=39;SAF=21;SAR=14;SRF=26;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.066519;STB=0.537122;TYPE=snp;VARB=0.0200347;OID=.;OPOS=24939590;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:39:39:35:35:14:21:26:13:14:21:26:13 chr20 24954887 . A T 43.08 PASS AO=14;DP=43;FAO=14;FDP=43;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=0.0113257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.985;QD=4.00734;RBI=0.0124978;REFB=-0.0283962;REVB=0.00528435;RO=29;SAF=6;SAR=8;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.098492;STB=0.558539;TYPE=snp;VARB=0.0530119;OID=.;OPOS=24954887;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:43:43:29:29:14:14:8:6:10:19:8:6:10:19 chr20 25058330 . AG A 31.19 PASS AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.117867;FXX=0.0951928;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.1733;QD=6.56697;RBI=0.117868;REFB=-0.0347158;REVB=-0.000275405;RO=7;SAF=4;SAR=6;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0.201149;SSSB=-0.222514;STB=0.673141;TYPE=del;VARB=0.0483739;OID=.;OPOS=25058331;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:10:20:10:19:9:4:6:7:2:26:7:4:6:5:2 chr20 25059381 . A T 2956.86 PASS AO=344;DP=371;FAO=344;FDP=368;FR=.;FRO=24;FSAF=121;FSAR=223;FSRF=1;FSRR=23;FWDB=-0.00928885;FXX=0.00808604;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.098;QD=32.1398;RBI=0.010702;REFB=-0.0689864;REVB=-0.00531501;RO=24;SAF=121;SAR=223;SRF=1;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0427847;STB=0.522466;TYPE=snp;VARB=0.00247164;OID=.;OPOS=25059381;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:371:368:24:24:344:344:223:121:1:23:223:121:1:23 chr20 25059546 . T C 2061.26 PASS AO=215;DP=216;FAO=215;FDP=215;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=142;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110597;FXX=0.00462942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.029;QD=38.349;RBI=0.0115001;REFB=0;REVB=0.00315207;RO=0;SAF=73;SAR=142;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.86097e-05;OID=.;OPOS=25059546;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:97:216:215:0:0:215:215:142:73:0:0:142:73:0:0 chr20 25195509 . A G 2285.16 PASS AO=249;DP=259;FAO=249;FDP=256;FR=.;FRO=7;FSAF=111;FSAR=138;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.0112548;FXX=0.015384;HRUN=6;LEN=1;MLLD=233.732;QD=35.7056;RBI=0.0113089;REFB=-0.0794102;REVB=0.00110502;RO=3;SAF=111;SAR=138;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0102482;STB=0.504433;TYPE=snp;VARB=6.16536e-05;OID=.;OPOS=25195509;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:259:256:3:7:249:249:138:111:0:3:138:111:2:5 chr20 25202100 . GC G 378.81 PASS AO=46;DP=69;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0364707;FXX=0.0454477;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.3192;QD=24.0516;RBI=0.353831;REFB=0;REVB=0.351946;RO=11;SAF=37;SAR=9;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0.637239;SSSB=0.251419;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0105194;OID=.;OPOS=25202101;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:46:66:63:63:0:45:18:0:0:31:11:37:9:3:8 chr20 25288632 . G A 3527.53 PASS AO=369;DP=372;FAO=370;FDP=370;FR=.;FRO=0;FSAF=304;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114289;FXX=0.0053762;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.556;QD=38.1355;RBI=0.022229;REFB=-0.0170888;REVB=-0.0190659;RO=1;SAF=303;SAR=66;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00157231;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.81657e-05;OID=.;OPOS=25288632;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:372:370:1:0:369:370:66:303:1:0:66:304:0:0 chr20 25398790 . G A 434.82 PASS AO=110;DP=236;FAO=110;FDP=235;FR=.;FRO=125;FSAF=46;FSAR=64;FSRF=59;FSRR=66;FWDB=0.00282223;FXX=0.00423711;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.913;QD=7.40117;RBI=0.0193364;REFB=-0.0118143;REVB=-0.0191294;RO=124;SAF=46;SAR=64;SRF=59;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.056222;STB=0.529129;TYPE=snp;VARB=0.0152422;OID=.;OPOS=25398790;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:236:235:124:125:110:110:64:46:59:65:64:46:59:66 chr20 25520665 . GT G 65.51 PASS AO=20;DP=37;FAO=21;FDP=37;FR=.;FRO=16;FSAF=1;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.0611567;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=17.7837;QD=7.08175;RBI=0.0741288;REFB=-0.0533579;REVB=0.041892;RO=16;SAF=1;SAR=19;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.678916;STB=0.893813;TYPE=del;VARB=0.0636836;OID=.;OPOS=25520666;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:20:37:21:37:16:1:20:10:6:44:16:1:19:10:6 chr20 25591864 . A T 668.06 PASS AO=71;DP=76;FAO=78;FDP=82;FR=.;FRO=4;FSAF=16;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.277456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.369;QD=32.5882;RBI=0.278892;REFB=-0.022531;REVB=0.0282644;RO=5;SAF=15;SAR=56;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00210122;STB=0.515621;TYPE=snp;VARB=0.000865576;OID=.;OPOS=25591864;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:76:82:5:4:71:78:56:15:1:4:62:16:0:4 chr20 26061803 . C A 31.04 PASS AO=13;DP=49;FAO=13;FDP=49;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=29;FSRR=7;FWDB=-0.00651794;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.4879;QD=2.53415;RBI=0.0132527;REFB=-0.016329;REVB=0.0115391;RO=32;SAF=11;SAR=2;SRF=27;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00535981;STB=0.552985;TYPE=snp;VARB=0.0445534;OID=.;OPOS=26061803;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:49:49:32:36:13:13:2:11:27:5:2:11:29:7 chr20 26063560 . G A 353.41 PASS AO=91;DP=214;FAO=93;FDP=205;FR=.;FRO=112;FSAF=45;FSAR=48;FSRF=55;FSRR=57;FWDB=-0.0236363;FXX=0.0509236;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.258;QD=6.89588;RBI=0.0264058;REFB=0.0167525;REVB=0.0117725;RO=107;SAF=43;SAR=48;SRF=52;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0131533;STB=0.503936;TYPE=snp;VARB=-0.0161335;OID=.;OPOS=26063560;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:205:107:112:91:93:48:43:52:55:48:45:55:57 chr20 26094564 . T G 650.06 PASS AO=455;DP=1036;FAO=175;FDP=390;FR=.;FRO=215;FSAF=80;FSAR=95;FSRF=115;FSRR=100;FWDB=0.0174606;FXX=0.0249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5462;QD=6.66726;RBI=0.0215949;REFB=-0.0173684;REVB=-0.0127069;RO=533;SAF=220;SAR=235;SRF=291;SRR=242;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0611695;STB=0.542852;TYPE=snp;VARB=0.0272329;OID=.;OPOS=26094564;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:1036:390:533:215:455:175:235:220:291:242:95:80:115:100 chr20 26094567 . T C 910.5 PASS AO=537;DP=1029;FAO=207;FDP=399;FR=.;FRO=192;FSAF=99;FSAR=108;FSRF=103;FSRR=89;FWDB=0.00459996;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.016;QD=9.12779;RBI=0.00671069;REFB=0.00159821;REVB=0.00488607;RO=481;SAF=246;SAR=291;SRF=271;SRR=210;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0913828;STB=0.527987;TYPE=snp;VARB=-0.00161044;OID=.;OPOS=26094567;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:1029:399:481:192:537:207:291:246:271:210:108:99:103:89 chr20 26094605 . G A 575.57 PASS AO=354;DP=826;FAO=168;FDP=399;FR=.;FRO=231;FSAF=75;FSAR=93;FSRF=107;FSRR=124;FWDB=-0.00471569;FXX=0.00249994;HRUN=3;LEN=1;MLLD=195.449;QD=5.77008;RBI=0.0334033;REFB=-0.0292109;REVB=-0.0330687;RO=465;SAF=151;SAR=203;SRF=212;SRR=253;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0306029;STB=0.509803;TYPE=snp;VARB=0.0314852;OID=.;OPOS=26094605;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:826:399:465:231:354:168:203:151:212:253:93:75:107:124 chr20 26094609 . C A 607.71 PASS AO=326;DP=800;FAO=172;FDP=399;FR=.;FRO=227;FSAF=80;FSAR=92;FSRF=100;FSRR=127;FWDB=-0.0175623;FXX=0.00249994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.9856;QD=6.09232;RBI=0.0465399;REFB=-0.00139765;REVB=-0.043099;RO=471;SAF=141;SAR=185;SRF=218;SRR=253;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0326136;STB=0.514083;TYPE=snp;VARB=0.00144504;OID=.;OPOS=26094609;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:800:399:471:227:326:172:185:141:218:253:92:80:100:127 chr20 29543700 . G C 109.11 PASS AO=36;DP=101;FAO=36;FDP=100;FR=.;FRO=64;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=40;FWDB=-0.0390957;FXX=0.00990001;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.95;QD=4.36429;RBI=0.0392159;REFB=-0.0166738;REVB=-0.00306814;RO=62;SAF=20;SAR=16;SRF=23;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201747;STB=0.613973;TYPE=snp;VARB=0.0248299;OID=.;OPOS=29543700;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:100:62:64:36:36:16:20:23:39:16:20:24:40 chr20 29543730 . G A 210.69 PASS AO=57;DP=139;FAO=60;FDP=142;FR=.;FRO=82;FSAF=20;FSAR=40;FSRF=23;FSRR=59;FWDB=-0.0111501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.803;QD=5.93488;RBI=0.0133309;REFB=-0.00859244;REVB=-0.00730679;RO=81;SAF=18;SAR=39;SRF=23;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0391628;STB=0.535124;TYPE=snp;VARB=0.0139551;OID=.;OPOS=29543730;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:142:81:82:57:60:39:18:23:58:40:20:23:59 chr20 29623223 . T C 214.88 PASS AO=92;DP=290;FAO=92;FDP=291;FR=.;FRO=199;FSAF=47;FSAR=45;FSRF=110;FSRR=89;FWDB=-0.0294549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.32;QD=2.95362;RBI=0.0294811;REFB=-0.00564752;REVB=-0.0012414;RO=196;SAF=47;SAR=45;SRF=109;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0536368;STB=0.528692;TYPE=snp;VARB=0.00967662;OID=.;OPOS=29623223;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:290:291:196:199:92:92:45:47:109:87:45:47:110:89 chr20 29623248 . AAAG A 110.17 PASS AO=78;DP=271;FAO=79;FDP=235;FR=.;FRO=156;FSAF=39;FSAR=40;FSRF=72;FSRR=84;FWDB=0.0131717;FXX=0.113203;HRUN=3;LEN=3;MLLD=192.952;QD=1.87521;RBI=0.0136704;REFB=0.0173768;REVB=0.00365877;RO=128;SAF=38;SAR=40;SRF=60;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0202859;STB=0.52134;TYPE=del;VARB=-0.0349073;OID=.;OPOS=29623249;OREF=AAG;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:78:255:79:235:156:39:40:72:84:99:128:38:40:60:68 chr20 29624020 . G GT 54.39 PASS AO=61;DP=143;FAO=59;FDP=137;FR=.;FRO=78;FSAF=43;FSAR=16;FSRF=51;FSRR=27;FWDB=0.0693541;FXX=0.0352088;HRUN=6;LEN=1;MLLD=8.15975;QD=1.58809;RBI=0.0897834;REFB=-0.0653389;REVB=-0.057018;RO=67;SAF=39;SAR=22;SRF=48;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0811293;STB=0.551428;TYPE=ins;VARB=0.034333;OID=.;OPOS=29624021;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:61:143:59:137:78:43:16:51:27:54:67:39:22:48:19 chr20 29624070 . G A 401.86 PASS AO=105;DP=232;FAO=105;FDP=231;FR=.;FRO=126;FSAF=65;FSAR=40;FSRF=80;FSRR=46;FWDB=-0.0116999;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.382;QD=6.95861;RBI=0.0152841;REFB=-0.0146378;REVB=0.00983449;RO=124;SAF=65;SAR=40;SRF=80;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0272994;STB=0.509217;TYPE=snp;VARB=0.0110752;OID=.;OPOS=29624070;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:231:124:126:105:105:40:65:80:44:40:65:80:46 chr20 29625876 . C T 80.34 PASS AO=69;DP=304;FAO=66;FDP=302;FR=.;FRO=236;FSAF=42;FSAR=24;FSRF=140;FSRR=96;FWDB=-0.00817051;FXX=0.00330022;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.775;QD=1.06408;RBI=0.0332828;REFB=-0.00597567;REVB=-0.0322643;RO=229;SAF=44;SAR=25;SRF=137;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.05318;STB=0.535703;TYPE=snp;VARB=0.0255969;OID=.;OPOS=29625876;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:304:302:229:236:69:66:25:44:137:92:24:42:140:96 chr20 29625877 . G A 68.76 PASS AO=63;DP=303;FAO=63;FDP=302;FR=.;FRO=239;FSAF=39;FSAR=24;FSRF=143;FSRR=96;FWDB=0.0108046;FXX=0.00330022;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.738;QD=0.910757;RBI=0.0333668;REFB=0.00228253;REVB=-0.031569;RO=227;SAF=39;SAR=24;SRF=133;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0443403;STB=0.517236;TYPE=snp;VARB=-0.0107693;OID=.;OPOS=29625877;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:303:302:227:239:63:63:24:39:133:94:24:39:143:96 chr20 29625925 . C CTTG 48.99 PASS AO=50;DP=281;FAO=53;FDP=273;FR=.;FRO=220;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=123;FSRR=97;FWDB=0.0113663;FXX=0.0319138;HRUN=2;LEN=3;MLLD=227.4;QD=0.717781;RBI=0.0241696;REFB=0.00254524;REVB=-0.0213302;RO=221;SAF=28;SAR=22;SRF=127;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192823;STB=0.509707;TYPE=ins;VARB=-0.0106287;OID=.;OPOS=29625926;OREF=-;OALT=TTG;OMAPALT=CTTG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:50:281:53:273:220:29:24:123:97:48:221:28:22:127:94 chr20 29625935 . A G 58.4 PASS AO=55;DP=268;FAO=55;FDP=268;FR=.;FRO=213;FSAF=22;FSAR=33;FSRF=111;FSRR=102;FWDB=0.0184281;FXX=0.00371733;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.893;QD=0.871645;RBI=0.0255819;REFB=-0.0106784;REVB=-0.0177436;RO=207;SAF=22;SAR=33;SRF=107;SRR=100;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150392;STB=0.596377;TYPE=snp;VARB=0.0395396;OID=.;OPOS=29625935;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:268:268:207:213:55:55:33:22:107:100:33:22:111:102 chr20 29628271 . C T 1104.45 PASS AO=219;DP=390;FAO=226;FDP=395;FR=.;FRO=169;FSAF=105;FSAR=121;FSRF=53;FSRR=116;FWDB=0.0189114;FXX=0.0075375;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.8984;QD=11.1843;RBI=0.0300033;REFB=-0.0432299;REVB=-0.0232929;RO=168;SAF=98;SAR=121;SRF=52;SRR=116;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113408;STB=0.565524;TYPE=snp;VARB=0.0256776;OID=.;OPOS=29628271;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:390:395:168:169:219:226:121:98:52:116:121:105:53:116 chr20 29628361 . A C 410.26 PASS AO=92;DP=177;FAO=92;FDP=178;FR=.;FRO=86;FSAF=28;FSAR=64;FSRF=25;FSRR=61;FWDB=-0.00118293;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.717;QD=9.21929;RBI=0.0014898;REFB=-0.0274157;REVB=-0.000905648;RO=85;SAF=28;SAR=64;SRF=25;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106352;STB=0.507833;TYPE=snp;VARB=0.0273242;OID=.;OPOS=29628361;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:178:85:86:92:92:64:28:25:60:64:28:25:61 chr20 29628431 . C T 514 PASS AO=77;DP=109;FAO=81;FDP=112;FR=.;FRO=31;FSAF=21;FSAR=60;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=0.00698887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.5413;QD=18.3571;RBI=0.00865358;REFB=-0.0322062;REVB=-0.00510296;RO=31;SAF=18;SAR=59;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.063676;STB=0.52232;TYPE=snp;VARB=0.0107116;OID=.;OPOS=29628431;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:109:112:31:31:77:81:59:18:10:21:60:21:10:21 chr20 29628439 . A G 12.26 PASS AO=16;DP=104;FAO=16;FDP=104;FR=.;FRO=88;FSAF=1;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=62;FWDB=0.0141566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.35;QD=0.47164;RBI=0.0170382;REFB=0.000822634;REVB=0.00948109;RO=87;SAF=1;SAR=15;SRF=26;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.470064;STB=0.839685;TYPE=snp;VARB=-0.00289811;OID=.;OPOS=29628439;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:104:104:87:88:16:16:15:1:26:61:15:1:26:62 chr20 29630666 . T C 63.85 PASS AO=64;DP=311;FAO=64;FDP=319;FR=.;FRO=255;FSAF=29;FSAR=35;FSRF=136;FSRR=119;FWDB=-0.0216339;FXX=0.0031249;HRUN=3;LEN=1;MLLD=67.7844;QD=0.800588;RBI=0.0267163;REFB=-0.0153331;REVB=-0.015676;RO=245;SAF=29;SAR=35;SRF=131;SRR=114;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104707;STB=0.56389;TYPE=snp;VARB=0.0288377;OID=.;OPOS=29630666;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:311:319:245:255:64:64:35:29:131:114:35:29:136:119 chr20 29630674 . A T 151.47 PASS AO=83;DP=305;FAO=83;FDP=305;FR=.;FRO=222;FSAF=36;FSAR=47;FSRF=122;FSRR=100;FWDB=0.00558915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.742;QD=1.98648;RBI=0.0193718;REFB=-0.00676658;REVB=0.018548;RO=221;SAF=36;SAR=47;SRF=122;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145601;STB=0.583877;TYPE=snp;VARB=0.0191351;OID=.;OPOS=29630674;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:305:305:221:222:83:83:47:36:122:99:47:36:122:100 chr20 29630681 . G A 121.24 PASS AO=76;DP=305;FAO=76;FDP=301;FR=.;FRO=225;FSAF=38;FSAR=38;FSRF=119;FSRR=106;FWDB=0.00718472;FXX=0.0131143;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.216;QD=1.61119;RBI=0.00724916;REFB=-0.00392123;REVB=-0.000964412;RO=218;SAF=38;SAR=38;SRF=116;SRR=102;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0401435;STB=0.521589;TYPE=snp;VARB=0.0116134;OID=.;OPOS=29630681;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:305:301:218:225:76:76:38:38:116:102:38:38:119:106 chr20 29630695 . C A 63.81 PASS AO=61;DP=310;FAO=64;FDP=314;FR=.;FRO=250;FSAF=35;FSAR=29;FSRF=112;FSRR=138;FWDB=-0.00285244;FXX=0.0031745;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.82;QD=0.812891;RBI=0.0210863;REFB=-0.0164162;REVB=-0.0208925;RO=246;SAF=32;SAR=29;SRF=109;SRR=137;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104942;STB=0.578231;TYPE=snp;VARB=0.0470257;OID=.;OPOS=29630695;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:310:314:246:250:61:64:29:32:109:137:29:35:112:138 chr20 29630697 . A G 221.51 PASS AO=98;DP=315;FAO=98;FDP=315;FR=.;FRO=217;FSAF=37;FSAR=61;FSRF=110;FSRR=107;FWDB=0.0290722;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.5645;QD=2.81278;RBI=0.0291519;REFB=-0.0178085;REVB=0.00215502;RO=214;SAF=37;SAR=61;SRF=109;SRR=105;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159043;STB=0.590576;TYPE=snp;VARB=0.0419784;OID=.;OPOS=29630697;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:315:315:214:217:98:98:61:37:109:105:61:37:110:107 chr20 29630725 . T C 271.48 PASS AO=108;DP=331;FAO=110;FDP=334;FR=.;FRO=224;FSAF=40;FSAR=70;FSRF=119;FSRR=105;FWDB=-0.027158;FXX=0.00298499;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.387;QD=3.2513;RBI=0.0395694;REFB=-0.00570322;REVB=-0.0287781;RO=223;SAF=38;SAR=70;SRF=119;SRR=104;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216506;STB=0.613879;TYPE=snp;VARB=0.0138152;OID=.;OPOS=29630725;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:331:334:223:224:108:110:70:38:119:104:70:40:119:105 chr20 29632638 . C A 73.12 PASS AO=54;DP=239;FAO=54;FDP=238;FR=.;FRO=184;FSAF=22;FSAR=32;FSRF=80;FSRR=104;FWDB=0.00475074;FXX=0.0124476;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.872;QD=1.22896;RBI=0.0061131;REFB=-0.000622485;REVB=0.00384714;RO=176;SAF=23;SAR=31;SRF=80;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0367744;STB=0.521731;TYPE=snp;VARB=0.00206628;OID=.;OPOS=29632638;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:239:238:176:184:54:54:31:23:80:96:32:22:80:104 chr20 29632662 . G C 197.12 PASS AO=80;DP=280;FAO=80;FDP=246;FR=.;FRO=166;FSAF=34;FSAR=46;FSRF=65;FSRR=101;FWDB=-0.0239415;FXX=0.121424;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.453;QD=3.20514;RBI=0.0329324;REFB=-0.00884982;REVB=-0.022613;RO=164;SAF=34;SAR=46;SRF=63;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0493912;STB=0.523235;TYPE=snp;VARB=0.0151239;OID=.;OPOS=29632662;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:280:246:164:166:80:80:46:34:63:101:46:34:65:101 chr20 29632674 . T TA 41.01 PASS AO=68;DP=306;FAO=83;FDP=300;FR=.;FRO=217;FSAF=27;FSAR=56;FSRF=89;FSRR=128;FWDB=-0.180885;FXX=0.0066223;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.6553;QD=0.546812;RBI=0.198032;REFB=-0.0379078;REVB=0.0806064;RO=208;SAF=27;SAR=41;SRF=79;SRR=129;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0228435;STB=0.566627;TYPE=ins;VARB=-0.0159296;OID=.;OPOS=29632675;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:68:306:83:300:217:27:56:89:128:41:208:27:41:79:129 chr20 29632709 . C T 23.64 PASS AO=50;DP=329;FAO=51;FDP=332;FR=.;FRO=281;FSAF=19;FSAR=32;FSRF=98;FSRR=183;FWDB=-0.0408355;FXX=0.00300291;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.1054;QD=0.284828;RBI=0.0441224;REFB=-0.00729829;REVB=-0.0167107;RO=278;SAF=19;SAR=31;SRF=98;SRR=180;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0381848;STB=0.52177;TYPE=snp;VARB=0.0205242;OID=.;OPOS=29632709;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:329:332:278:281:50:51:31:19:98:180:32:19:98:183 chr20 29633916 . G T 436.15 PASS AO=133;DP=422;FAO=126;FDP=299;FR=.;FRO=173;FSAF=69;FSAR=57;FSRF=75;FSRR=98;FWDB=-0.0321575;FXX=0.252494;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.117;QD=5.83474;RBI=0.0375225;REFB=-0.0104333;REVB=-0.0193348;RO=183;SAF=71;SAR=62;SRF=80;SRR=103;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100249;STB=0.565773;TYPE=snp;VARB=0.0243872;OID=.;OPOS=29633916;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:422:299:183:173:133:126:62:71:80:103:57:69:75:98 chr20 29633929 . A G 293.45 PASS AO=131;DP=414;FAO=127;FDP=400;FR=.;FRO=273;FSAF=68;FSAR=59;FSRF=109;FSRR=164;FWDB=-0.0188273;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=174.41;QD=2.93449;RBI=0.0249373;REFB=-0.00485909;REVB=0.0163524;RO=279;SAF=69;SAR=62;SRF=111;SRR=168;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152133;STB=0.592168;TYPE=snp;VARB=0.00586568;OID=.;OPOS=29633929;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:414:400:279:273:131:127:62:69:111:168:59:68:109:164 chr20 29633938 . A G 107.88 PASS AO=88;DP=405;FAO=89;FDP=400;FR=.;FRO=311;FSAF=33;FSAR=56;FSRF=143;FSRR=168;FWDB=-0.0623432;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.8944;QD=1.07881;RBI=0.0624028;REFB=0.00926812;REVB=0.00272466;RO=317;SAF=31;SAR=57;SRF=147;SRR=170;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147904;STB=0.571412;TYPE=snp;VARB=-0.0513186;OID=.;OPOS=29633938;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:405:400:317:311:88:89:57:31:147:170:56:33:143:168 chr20 29633952 . C T 240.15 PASS AO=115;DP=383;FAO=115;FDP=386;FR=.;FRO=271;FSAF=63;FSAR=52;FSRF=99;FSRR=172;FWDB=-0.0111107;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.525;QD=2.48857;RBI=0.0121041;REFB=-0.00890926;REVB=-0.00480216;RO=268;SAF=63;SAR=52;SRF=98;SRR=170;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217928;STB=0.626177;TYPE=snp;VARB=0.0135006;OID=.;OPOS=29633952;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:383:386:268:271:115:115:52:63:98:170:52:63:99:172 chr20 29652165 . C T 23.88 PASS AO=45;DP=280;FAO=44;FDP=277;FR=.;FRO=233;FSAF=6;FSAR=38;FSRF=26;FSRR=207;FWDB=-0.00752389;FXX=0.00359699;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.8639;QD=0.344891;RBI=0.0819836;REFB=-0.00381762;REVB=-0.0816376;RO=233;SAF=6;SAR=39;SRF=26;SRR=207;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0654019;STB=0.547262;TYPE=snp;VARB=0.031241;OID=.;OPOS=29652165;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:280:277:233:233:45:44:39:6:26:207:38:6:26:207 chr20 29652172 . T C 1893.51 PASS AO=242;DP=281;FAO=242;FDP=278;FR=.;FRO=36;FSAF=22;FSAR=220;FSRF=9;FSRR=27;FWDB=-0.00394249;FXX=0.0071426;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.1;QD=27.2448;RBI=0.00977475;REFB=0.021019;REVB=-0.00894441;RO=34;SAF=22;SAR=220;SRF=9;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110462;STB=0.556548;TYPE=snp;VARB=-0.00166359;OID=.;OPOS=29652172;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:281:278:34:36:242:242:220:22:9:25:220:22:9:27 chr20 29652173 . G A 332.23 PASS AO=110;DP=285;FAO=109;FDP=283;FR=.;FRO=174;FSAF=12;FSAR=97;FSRF=20;FSRR=154;FWDB=-0.0112589;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.222;QD=4.69585;RBI=0.0161559;REFB=0.00582196;REVB=0.0115867;RO=175;SAF=12;SAR=98;SRF=20;SRR=155;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0143789;STB=0.50752;TYPE=snp;VARB=-0.00798415;OID=.;OPOS=29652173;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:285:283:175:174:110:109:98:12:20:155:97:12:20:154 chr20 29652183 . G A 27.16 PASS AO=53;DP=334;FAO=53;FDP=334;FR=.;FRO=281;FSAF=5;FSAR=48;FSRF=25;FSRR=256;FWDB=-0.0228829;FXX=0.00298499;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.025;QD=0.325242;RBI=0.0292284;REFB=-0.00895584;REVB=0.0181843;RO=280;SAF=5;SAR=48;SRF=22;SRR=258;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0646788;STB=0.513508;TYPE=snp;VARB=0.0433266;OID=.;OPOS=29652183;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:334:334:280:281:53:53:48:5:22:258:48:5:25:256 chr20 29652191 . C T 1769.26 PASS AO=269;DP=354;FAO=267;FDP=353;FR=.;FRO=86;FSAF=22;FSAR=245;FSRF=11;FSRR=75;FWDB=0.0493097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9003;QD=20.0482;RBI=0.0499067;REFB=-0.0259083;REVB=0.00769619;RO=85;SAF=22;SAR=247;SRF=11;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0671178;STB=0.534543;TYPE=snp;VARB=0.0119756;OID=.;OPOS=29652191;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:354:353:85:86:269:267:247:22:11:74:245:22:11:75 chr20 29652194 . C T 38.13 PASS AO=64;DP=380;FAO=64;FDP=379;FR=.;FRO=315;FSAF=8;FSAR=56;FSRF=26;FSRR=289;FWDB=0.0237054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.25;QD=0.40239;RBI=0.0246346;REFB=-0.00495179;REVB=0.00670188;RO=315;SAF=8;SAR=56;SRF=26;SRR=289;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148064;STB=0.591742;TYPE=snp;VARB=0.0322201;OID=.;OPOS=29652194;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:380:379:315:315:64:64:56:8:26:289:56:8:26:289 chr20 29652196 . T C 41.43 PASS AO=66;DP=386;FAO=66;FDP=385;FR=.;FRO=319;FSAF=6;FSAR=60;FSRF=29;FSRR=290;FWDB=-0.0158908;FXX=0.00259061;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.1913;QD=0.430461;RBI=0.022454;REFB=-0.0097578;REVB=-0.015864;RO=319;SAF=6;SAR=60;SRF=29;SRR=290;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.15436e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0441338;OID=.;OPOS=29652196;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:386:385:319:319:66:66:60:6:29:290:60:6:29:290 chr20 29652236 . G C 1344.16 PASS AO=228;DP=306;FAO=221;FDP=317;FR=.;FRO=96;FSAF=17;FSAR=204;FSRF=15;FSRR=81;FWDB=-0.0205712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.17;QD=16.961;RBI=0.0235848;REFB=-0.0253413;REVB=0.0115356;RO=71;SAF=13;SAR=215;SRF=12;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188906;STB=0.573984;TYPE=snp;VARB=0.0105626;OID=.;OPOS=29652236;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:306:317:71:96:228:221:215:13:12:59:204:17:15:81 chr20 29652254 . G A 88.65 PASS AO=64;DP=276;FAO=64;FDP=275;FR=.;FRO=211;FSAF=7;FSAR=57;FSRF=26;FSRR=185;FWDB=-0.0190748;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.884;QD=1.2895;RBI=0.0285328;REFB=0.00290075;REVB=0.0212196;RO=212;SAF=7;SAR=57;SRF=26;SRR=186;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0412966;STB=0.526145;TYPE=snp;VARB=-0.00861086;OID=.;OPOS=29652254;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:276:275:212:211:64:64:57:7:26:186:57:7:26:185 chr20 29965014 . T C 298.66 PASS AO=85;DP=202;FAO=85;FDP=201;FR=.;FRO=116;FSAF=46;FSAR=39;FSRF=35;FSRR=81;FWDB=-0.0382942;FXX=0.00495025;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.6683;QD=5.94338;RBI=0.0393666;REFB=-0.0265545;REVB=0.00912589;RO=116;SAF=46;SAR=39;SRF=35;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.24487;STB=0.635988;TYPE=snp;VARB=0.0378177;OID=.;OPOS=29965014;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:201:116:116:85:85:39:46:35:81:39:46:35:81 chr20 29978216 . T C 244.97 PASS AO=60;DP=128;FAO=60;FDP=127;FR=.;FRO=67;FSAF=41;FSAR=19;FSRF=37;FSRR=30;FWDB=0.00562923;FXX=0.00781189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.209;QD=7.71562;RBI=0.00566099;REFB=3.92892e-05;REVB=-0.000598767;RO=67;SAF=41;SAR=19;SRF=37;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135563;STB=0.575454;TYPE=snp;VARB=-4.17641e-05;OID=.;OPOS=29978216;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:127:67:67:60:60:19:41:37:30:19:41:37:30 chr20 30193538 . A G 59.08 PASS AO=18;DP=53;FAO=19;FDP=55;FR=.;FRO=36;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=28;FWDB=-0.0271338;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.1442;QD=4.29676;RBI=0.0315449;REFB=0.00803049;REVB=-0.0160883;RO=33;SAF=6;SAR=12;SRF=8;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119126;STB=0.574693;TYPE=snp;VARB=-0.0222288;OID=.;OPOS=30193538;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:53:55:33:36:18:19:12:6:8:25:13:6:8:28 chr20 30193544 . CG C,CC 106.2 PASS AO=11,9;DP=49;FAO=24,8;FDP=49;FR=.;FRO=17;FSAF=3,1;FSAR=21,7;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.00226607,0.115822;FXX=0.019996;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=10.4185,13.3382;QD=8.66924;RBI=0.0240339,0.133822;REFB=-0.0900734,-0.115496;REVB=-0.0239269,0.067033;RO=17;SAF=0,1;SAR=11,8;SRF=6;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.773577,-0.389497;STB=0.662997,0.730647;TYPE=del,snp;VARB=0.0940821,-0.0254942;OID=.,.;OPOS=30193545,30193545;OREF=G,G;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:11,9:41:24,8:49:17:3,1:21,7:6:11:38:17:0,1:11,8:6:11 chr20 30194248 . A G 342.02 PASS AO=84;DP=176;FAO=84;FDP=176;FR=.;FRO=92;FSAF=33;FSAR=51;FSRF=43;FSRR=49;FWDB=-0.00854077;FXX=0.0056494;HRUN=4;LEN=1;MLLD=161.588;QD=7.7732;RBI=0.00868939;REFB=-0.0198813;REVB=-0.00160024;RO=91;SAF=33;SAR=51;SRF=42;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0666503;STB=0.540124;TYPE=snp;VARB=0.0159453;OID=.;OPOS=30194248;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:176:91:92:84:84:51:33:42:49:51:33:43:49 chr20 30354417 . G A 139.39 PASS AO=36;DP=82;FAO=36;FDP=82;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=26;FWDB=0.0103299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.3248;QD=6.7994;RBI=0.0257147;REFB=0.0165748;REVB=0.0235487;RO=46;SAF=17;SAR=19;SRF=20;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0375258;STB=0.521105;TYPE=snp;VARB=-0.0119235;OID=.;OPOS=30354417;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:46:46:36:36:19:17:20:26:19:17:20:26 chr20 30381758 . G C 391.16 PASS AO=105;DP=238;FAO=106;FDP=240;FR=.;FRO=134;FSAF=34;FSAR=72;FSRF=24;FSRR=110;FWDB=0.0204184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.361;QD=6.51925;RBI=0.0207695;REFB=-0.0191871;REVB=0.00380313;RO=131;SAF=32;SAR=73;SRF=24;SRR=107;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154323;STB=0.59705;TYPE=snp;VARB=0.0206504;OID=.;OPOS=30381758;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:238:240:131:134:105:106:73:32:24:107:72:34:24:110 chr20 30382315 . A G 278.16 PASS AO=69;DP=145;FAO=69;FDP=147;FR=.;FRO=78;FSAF=20;FSAR=49;FSRF=37;FSRR=41;FWDB=0.0162374;FXX=0.0067563;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0071;QD=7.56884;RBI=0.0891592;REFB=0.0122813;REVB=-0.0876682;RO=75;SAF=20;SAR=49;SRF=36;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196491;STB=0.608066;TYPE=snp;VARB=-0.0153918;OID=.;OPOS=30382315;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:147:75:78:69:69:49:20:36:39:49:20:37:41 chr20 30412101 . C T 285.62 PASS AO=56;DP=97;FAO=56;FDP=97;FR=.;FRO=41;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=0.00370293;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.2;QD=11.7781;RBI=0.0133783;REFB=-0.0279471;REVB=0.0128556;RO=41;SAF=26;SAR=30;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0182524;STB=0.509974;TYPE=snp;VARB=0.0192734;OID=.;OPOS=30412101;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:41:41:56:56:30:26:20:21:30:26:20:21 chr20 30433352 . C T 29.49 PASS AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0454669;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.36;QD=11.7975;RBI=0.0668286;REFB=-0.0446467;REVB=-0.0489777;RO=4;SAF=1;SAR=4;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0543107;STB=0.630995;TYPE=snp;VARB=0.0528025;OID=.;OPOS=30433352;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:10:10:4:5:5:5:4:1:1:3:4:1:2:3 chr20 30489095 . G A 374.19 PASS AO=98;DP=242;FAO=105;FDP=244;FR=.;FRO=139;FSAF=44;FSAR=61;FSRF=87;FSRR=52;FWDB=0.0023368;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.7473;QD=6.1342;RBI=0.0632797;REFB=-0.00871037;REVB=0.0632365;RO=142;SAF=41;SAR=57;SRF=90;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224878;STB=0.616425;TYPE=snp;VARB=0.0200764;OID=.;OPOS=30489095;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:242:244:142:139:98:105:57:41:90:52:61:44:87:52 chr20 30513735 . C T 248.62 PASS AO=63;DP=138;FAO=63;FDP=137;FR=.;FRO=74;FSAF=25;FSAR=38;FSRF=23;FSRR=51;FWDB=0.00601915;FXX=0.00724585;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.978;QD=7.2589;RBI=0.0549714;REFB=-0.0325354;REVB=0.0546408;RO=74;SAF=25;SAR=38;SRF=22;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103782;STB=0.549503;TYPE=snp;VARB=0.0258383;OID=.;OPOS=30513735;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:137:74:74:63:63:38:25:22:52:38:25:23:51 chr20 30527065 . T C 43.67 PASS AO=30;DP=132;FAO=30;FDP=134;FR=.;FRO=104;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=55;FSRR=49;FWDB=0.0101653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.093;QD=1.3035;RBI=0.0120444;REFB=-0.00620181;REVB=0.00646021;RO=102;SAF=12;SAR=18;SRF=55;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174898;STB=0.599933;TYPE=snp;VARB=0.0242957;OID=.;OPOS=30527065;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:132:134:102:104:30:30:18:12:55:47:18:12:55:49 chr20 30533344 . C T 131.73 PASS AO=32;DP=71;FAO=32;FDP=70;FR=.;FRO=38;FSAF=7;FSAR=25;FSRF=9;FSRR=29;FWDB=0.0197937;FXX=0.0140825;HRUN=4;LEN=1;MLLD=148.551;QD=7.52753;RBI=0.022163;REFB=-0.0174798;REVB=0.00997026;RO=36;SAF=7;SAR=25;SRF=7;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0343716;STB=0.51413;TYPE=snp;VARB=0.0186179;OID=.;OPOS=30533344;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:70:36:38:32:32:25:7:7:29:25:7:9:29 chr20 30746248 . T C 2043.62 PASS AO=213;DP=216;FAO=213;FDP=213;FR=.;FRO=0;FSAF=114;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0307208;FXX=0.0184323;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9623;QD=38.3778;RBI=0.0583194;REFB=0;REVB=0.0495721;RO=0;SAF=114;SAR=99;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000185061;OID=.;OPOS=30746248;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:96:216:213:0:0:213:213:99:114:0:0:99:114:0:0 chr20 30777800 . T C 220.66 PASS AO=21;DP=22;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0432197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.968;QD=36.776;RBI=0.0745329;REFB=0;REVB=0.0607225;RO=0;SAF=4;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.45803e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000733561;OID=.;OPOS=30777800;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:22:24:0:0:21:24:17:4:0:0:19:5:0:0 chr20 30777860 . A G 146.62 PASS AO=15;DP=15;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0621124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.1473;QD=36.6539;RBI=0.0797904;REFB=0;REVB=0.0500855;RO=0;SAF=2;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000247298;OID=.;OPOS=30777860;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:16:0:0:15:16:13:2:0:0:14:2:0:0 chr20 30783710 . G A 373.91 PASS AO=105;DP=245;FAO=105;FDP=244;FR=.;FRO=139;FSAF=73;FSAR=32;FSRF=102;FSRR=37;FWDB=0.0187654;FXX=0.00408147;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.366;QD=6.12961;RBI=0.0194806;REFB=-0.00867468;REVB=0.00522999;RO=139;SAF=73;SAR=32;SRF=102;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0476476;STB=0.526459;TYPE=snp;VARB=0.0117689;OID=.;OPOS=30783710;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:245:244:139:139:105:105:32:73:102:37:32:73:102:37 chr20 30795818 . CT C,CC 547.42 PASS AO=21,37;DP=69;FAO=6,52;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=6,51;FSAR=0,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0508685,0.0667118;FXX=0.0169463;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=162.606,175.255;QD=37.753;RBI=0.0543972,0.0809233;REFB=0,0;REVB=0.0192731,0.0458052;RO=0;SAF=20,36;SAR=1,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.78928e-08,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0456898,0.00022441;OID=.,.;OPOS=30795819,30795819;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:21,37:58:6,52:58:0:6,51:0,1:0:0:4:0:20,36:1,1:0:0 chr20 30922398 . C T 965.64 PASS AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0213637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.133;QD=38.6255;RBI=0.0251185;REFB=0;REVB=0.013211;RO=0;SAF=62;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.37511e-05;OID=.;OPOS=30922398;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:100:100:0:0:100:100:38:62:0:0:38:62:0:0 chr20 31022959 . T C 1465.86 PASS AO=148;DP=149;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0182759;FXX=0.0128197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.776;QD=38.0742;RBI=0.0328295;REFB=0;REVB=0.0272721;RO=0;SAF=77;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.64319e-05;OID=.;OPOS=31022959;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:149:154:0:0:148:154:71:77:0:0:78:76:0:0 chr20 31024274 . T C 1012.66 PASS AO=108;DP=109;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0367213;FXX=0.0270246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.341;QD=37.506;RBI=0.0394256;REFB=0.0198021;REVB=0.0143502;RO=1;SAF=51;SAR=57;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00825505;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000178807;OID=.;OPOS=31024274;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:109:108:1:0:108:108:57:51:0:1:57:51:0:0 chr20 31025163 . A G 762.79 PASS AO=83;DP=88;FAO=83;FDP=85;FR=.;FRO=2;FSAF=49;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00653084;FXX=0.034087;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.9975;QD=35.8962;RBI=0.0172951;REFB=-0.147338;REVB=-0.0160146;RO=0;SAF=47;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.514282;TYPE=snp;VARB=0.000170787;OID=.;OPOS=31025163;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:88:85:0:2:83:83:36:47:0:0:34:49:0:2 chr20 31025535 . A G 1323.84 PASS AO=138;DP=157;FAO=141;FDP=143;FR=.;FRO=2;FSAF=85;FSAR=56;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0131234;FXX=0.153837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.888;QD=37.0306;RBI=0.0148785;REFB=-0.110028;REVB=0.0070106;RO=1;SAF=84;SAR=54;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00872256;STB=0.501501;TYPE=snp;VARB=0.0005552;OID=.;OPOS=31025535;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:157:143:1:2:138:141:54:84:0:1:56:85:1:1 chr20 31291625 . A G 152.96 PASS AO=30;DP=53;FAO=30;FDP=53;FR=.;FRO=23;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=0.0142081;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.0508;QD=11.5438;RBI=0.0296011;REFB=-0.0148047;REVB=0.0259684;RO=22;SAF=18;SAR=12;SRF=16;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104162;STB=0.564475;TYPE=snp;VARB=0.00927989;OID=.;OPOS=31291625;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:53:53:22:23:30:30:12:18:16:6:12:18:17:6 chr20 31466534 . C T 376.63 PASS AO=78;DP=141;FAO=78;FDP=141;FR=.;FRO=63;FSAF=37;FSAR=41;FSRF=28;FSRR=35;FWDB=0.00235916;FXX=0.00704176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.346;QD=10.6846;RBI=0.0414501;REFB=-0.0273246;REVB=0.0413829;RO=63;SAF=37;SAR=41;SRF=28;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0245685;STB=0.513416;TYPE=snp;VARB=0.0138822;OID=.;OPOS=31466534;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:63:63:78:78:41:37:28:35:41:37:28:35 chr20 31494382 . G A 932.83 PASS AO=95;DP=98;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276263;FXX=0.0202;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.144;QD=38.4673;RBI=0.0615179;REFB=0;REVB=0.0549658;RO=0;SAF=43;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.67486e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000998665;OID=.;OPOS=31494382;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:98:97:0:0:95:97:52:43:0:0:54:43:0:0 chr20 31505189 . C T 166.44 PASS AO=53;DP=140;FAO=53;FDP=140;FR=.;FRO=87;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=41;FSRR=46;FWDB=-0.00379386;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.122;QD=4.75545;RBI=0.0151638;REFB=-0.0109962;REVB=0.0146815;RO=87;SAF=22;SAR=31;SRF=41;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0624918;STB=0.535495;TYPE=snp;VARB=0.0193361;OID=.;OPOS=31505189;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:87:87:53:53:31:22:41:46:31:22:41:46 chr20 31518298 . A G 318.04 PASS AO=77;DP=162;FAO=78;FDP=163;FR=.;FRO=85;FSAF=49;FSAR=29;FSRF=55;FSRR=30;FWDB=-0.0136036;FXX=0.00609719;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.713;QD=7.80458;RBI=0.0139891;REFB=-0.00504385;REVB=0.0032612;RO=85;SAF=47;SAR=30;SRF=56;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0489441;STB=0.510578;TYPE=snp;VARB=0.00515618;OID=.;OPOS=31518298;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:163:85:85:77:78:30:47:56:29:29:49:55:30 chr20 31547898 . GC G 542.58 PASS AO=73;DP=96;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.326588;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.6581;QD=24.6627;RBI=0.332066;REFB=0;REVB=0.0600642;RO=2;SAF=21;SAR=52;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0.425532;SSSB=-0.0129811;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.00411829;OID=.;OPOS=31547899;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:73:87:88:88:0:34:54:0:0:48:2:21:52:1:1 chr20 31549123 . C T 81.97 PASS AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=4;FWDB=0.0149878;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.9222;QD=8.86138;RBI=0.0364933;REFB=-0.0153471;REVB=-0.0332735;RO=19;SAF=12;SAR=6;SRF=15;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132058;STB=0.574391;TYPE=snp;VARB=0.0196036;OID=.;OPOS=31549123;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:37:37:19:19:18:18:6:12:15:4:6:12:15:4 chr20 31590686 . C A 155.94 PASS AO=41;DP=95;FAO=42;FDP=98;FR=.;FRO=56;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=26;FSRR=30;FWDB=0.00423183;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.0333;QD=6.36478;RBI=0.0706814;REFB=-0.0220376;REVB=0.0705546;RO=53;SAF=17;SAR=24;SRF=26;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0772402;STB=0.534809;TYPE=snp;VARB=0.0259253;OID=.;OPOS=31590686;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:98:53:56:41:42:24:17:26:27:25:17:26:30 chr20 31596472 . A T 324.61 PASS AO=76;DP=154;FAO=76;FDP=153;FR=.;FRO=77;FSAF=41;FSAR=35;FSRF=28;FSRR=49;FWDB=-0.0108559;FXX=0.00649309;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.9547;QD=8.48656;RBI=0.0167925;REFB=-0.0147269;REVB=-0.0128116;RO=76;SAF=41;SAR=35;SRF=28;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154371;STB=0.587791;TYPE=snp;VARB=0.0132419;OID=.;OPOS=31596472;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:153:76:77:76:76:35:41:28:48:35:41:28:49 chr20 31601670 . C T 258.94 PASS AO=67;DP=148;FAO=67;FDP=147;FR=.;FRO=80;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=54;FSRR=26;FWDB=-0.0201263;FXX=0.0067563;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.1904;QD=7.04587;RBI=0.0244237;REFB=-0.0147653;REVB=-0.0138365;RO=78;SAF=33;SAR=34;SRF=54;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193781;STB=0.598999;TYPE=snp;VARB=0.0165856;OID=.;OPOS=31601670;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:147:78:80:67:67:34:33:54:24:34:33:54:26 chr20 31619500 . C T 103.14 PASS AO=23;DP=47;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=20;FWDB=0.0280276;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.006;QD=8.77819;RBI=0.0350988;REFB=-0.0211696;REVB=-0.0211277;RO=23;SAF=13;SAR=10;SRF=4;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.33998;STB=0.696276;TYPE=snp;VARB=0.0247883;OID=.;OPOS=31619500;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:47:47:23:24:23:23:10:13:4:19:10:13:4:20 chr20 31622083 . G A 1049.54 PASS AO=109;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00760738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.977;QD=38.5151;RBI=0.0500429;REFB=0;REVB=0.0494613;RO=0;SAF=29;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000173279;OID=.;OPOS=31622083;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:109:109:0:0:109:109:80:29:0:0:80:29:0:0 chr20 31624300 . C T 49.7 PASS AO=17;DP=59;FAO=19;FDP=63;FR=.;FRO=44;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=0.0215023;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.05;QD=3.1554;RBI=0.0228902;REFB=-0.00683358;REVB=0.00784926;RO=42;SAF=7;SAR=10;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187346;STB=0.62403;TYPE=snp;VARB=0.0174853;OID=.;OPOS=31624300;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:59:63:42:44:17:19:10:7:24:18:12:7:24:20 chr20 31627291 . A G 212.14 PASS AO=43;DP=87;FAO=48;FDP=92;FR=.;FRO=44;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=0.0388468;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.548;QD=9.22353;RBI=0.0391336;REFB=-0.0083712;REVB=-0.00472921;RO=44;SAF=12;SAR=31;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280569;STB=0.594441;TYPE=snp;VARB=0.00816312;OID=.;OPOS=31627291;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:92:44:44:43:48:31:12:25:19:31:17:24:20 chr20 31652292 . G A 176.33 PASS AO=44;DP=104;FAO=47;FDP=108;FR=.;FRO=61;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=18;FSRR=43;FWDB=0.0448507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.1516;QD=6.53091;RBI=0.0448518;REFB=-0.0254025;REVB=0.000308346;RO=59;SAF=20;SAR=24;SRF=17;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175004;STB=0.57705;TYPE=snp;VARB=0.0428159;OID=.;OPOS=31652292;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:108:59:61:44:47:24:20:17:42:27:20:18:43 chr20 31652596 . C T 50.75 PASS AO=14;DP=37;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=18;FWDB=0.0268376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.254;QD=5.4869;RBI=0.0301556;REFB=-0.0113888;REVB=-0.0137516;RO=23;SAF=4;SAR=10;SRF=5;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0933626;STB=0.554382;TYPE=snp;VARB=0.0143761;OID=.;OPOS=31652596;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:37:37:23:23:14:14:10:4:5:18:10:4:5:18 chr20 31656632 . C G 470.16 PASS AO=123;DP=273;FAO=125;FDP=277;FR=.;FRO=152;FSAF=54;FSAR=71;FSRF=81;FSRR=71;FWDB=0.00553356;FXX=0.0071682;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.467;QD=6.78929;RBI=0.0377866;REFB=-0.0106911;REVB=0.0373792;RO=147;SAF=53;SAR=70;SRF=80;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111734;STB=0.555547;TYPE=snp;VARB=0.0137056;OID=.;OPOS=31656632;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:273:277:147:152:123:125:70:53:80:67:71:54:81:71 chr20 31660543 . C T 329.52 PASS AO=82;DP=173;FAO=84;FDP=182;FR=.;FRO=98;FSAF=37;FSAR=47;FSRF=36;FSRR=62;FWDB=-0.00609496;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=42.9369;QD=7.24225;RBI=0.0262468;REFB=-0.0489238;REVB=0.0255293;RO=91;SAF=37;SAR=45;SRF=32;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0968304;STB=0.540317;TYPE=snp;VARB=0.0577039;OID=.;OPOS=31660543;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:182:91:98:82:84:45:37:32:59:47:37:36:62 chr20 31671663 . T C 43.48 PASS AO=11;DP=28;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.0389456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.4159;QD=6.21167;RBI=0.0395707;REFB=-0.0147336;REVB=-0.00700574;RO=17;SAF=2;SAR=9;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.298559;STB=0.680301;TYPE=snp;VARB=0.0287016;OID=.;OPOS=31671663;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:28:28:17:17:11:11:9:2:7:10:9:2:7:10 chr20 31673846 . A G 183.73 PASS AO=47;DP=104;FAO=47;FDP=104;FR=.;FRO=57;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=27;FSRR=30;FWDB=0.0156301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.088;QD=7.06652;RBI=0.0991809;REFB=-0.0287768;REVB=-0.0979416;RO=56;SAF=20;SAR=27;SRF=26;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0383212;STB=0.526763;TYPE=snp;VARB=0.0297212;OID=.;OPOS=31673846;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:56:57:47:47:27:20:26:30:27:20:27:30 chr20 31676804 . A C 819.81 PASS AO=99;DP=104;FAO=97;FDP=104;FR=.;FRO=7;FSAF=47;FSAR=50;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.0188083;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.8348;QD=31.5311;RBI=0.0604491;REFB=-0.0196589;REVB=-0.0574486;RO=5;SAF=47;SAR=52;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0478288;STB=0.515461;TYPE=snp;VARB=0.00921597;OID=.;OPOS=31676804;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:104:104:5:7:99:97:52:47:5:0:50:47:5:2 chr20 31680334 . C T 439.51 PASS AO=100;DP=195;FAO=100;FDP=195;FR=.;FRO=95;FSAF=52;FSAR=48;FSRF=43;FSRR=52;FWDB=0.0168511;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.92;QD=9.01567;RBI=0.0254624;REFB=-0.0129944;REVB=0.0190885;RO=94;SAF=52;SAR=48;SRF=43;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0552507;STB=0.53278;TYPE=snp;VARB=0.0146997;OID=.;OPOS=31680334;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:195:195:94:95:100:100:48:52:43:51:48:52:43:52 chr20 31688241 . T C 281.32 PASS AO=77;DP=177;FAO=77;FDP=177;FR=.;FRO=100;FSAF=50;FSAR=27;FSRF=34;FSRR=66;FWDB=0.00157366;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.24;QD=6.35747;RBI=0.00464672;REFB=0.00579001;REVB=-0.00437214;RO=100;SAF=50;SAR=27;SRF=34;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.309335;STB=0.672116;TYPE=snp;VARB=-0.00683319;OID=.;OPOS=31688241;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:177:100:100:77:77:27:50:34:66:27:50:34:66 chr20 31688260 . C T 261.87 PASS AO=73;DP=171;FAO=73;FDP=171;FR=.;FRO=98;FSAF=44;FSAR=29;FSRF=29;FSRR=69;FWDB=0.0487151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.2404;QD=6.12564;RBI=0.0531057;REFB=-0.00166095;REVB=0.0211434;RO=98;SAF=44;SAR=29;SRF=29;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.307088;STB=0.670666;TYPE=snp;VARB=0.00287718;OID=.;OPOS=31688260;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:171:171:98:98:73:73:29:44:29:69:29:44:29:69 chr20 31768363 . C T 144.38 PASS AO=36;DP=89;FAO=39;FDP=90;FR=.;FRO=51;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=16;FSRR=35;FWDB=0.025827;FXX=0.0322546;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.121;QD=6.41686;RBI=0.0263886;REFB=-0.0147333;REVB=-0.00541527;RO=51;SAF=11;SAR=25;SRF=16;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00991786;STB=0.512599;TYPE=snp;VARB=0.0249141;OID=.;OPOS=31768363;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:90:51:51:36:39:25:11:16:35:26:13:16:35 chr20 31812923 . G A 1999.03 PASS AO=211;DP=212;FAO=211;FDP=211;FR=.;FRO=0;FSAF=112;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0120283;FXX=0.00471676;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.776;QD=37.8963;RBI=0.0592455;REFB=-0.01199;REVB=0.0580116;RO=1;SAF=112;SAR=99;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00478782;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.89958e-05;OID=.;OPOS=31812923;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:212:211:1:0:211:211:99:112:0:1:99:112:0:0 chr20 31830955 . T C 1381.89 PASS AO=151;DP=155;FAO=151;FDP=154;FR=.;FRO=3;FSAF=55;FSAR=96;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0793527;FXX=0.0064512;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.8367;QD=35.8933;RBI=0.0914978;REFB=-0.0781886;REVB=-0.0455522;RO=3;SAF=56;SAR=95;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0117018;STB=0.513273;TYPE=snp;VARB=0.000557685;OID=.;OPOS=31830955;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:155:154:3:3:151:151:95:56:2:1:96:55:3:0 chr20 31876681 . A G 79.65 PASS AO=21;DP=53;FAO=22;FDP=55;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=-0.0474235;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.703;QD=5.79238;RBI=0.0558484;REFB=-0.0185417;REVB=-0.0294965;RO=32;SAF=9;SAR=12;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.057938;STB=0.528472;TYPE=snp;VARB=0.032646;OID=.;OPOS=31876681;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:53:55:32:33:21:22:12:9:12:20:13:9:12:21 chr20 31981849 . T C 78.13 PASS AO=24;DP=65;FAO=24;FDP=65;FR=.;FRO=41;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=-0.0210441;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.148;QD=4.80813;RBI=0.0259044;REFB=-0.006805;REVB=0.0151058;RO=41;SAF=12;SAR=12;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0932572;STB=0.553802;TYPE=snp;VARB=0.0127807;OID=.;OPOS=31981849;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:65:65:41:41:24:24:12:12:24:17:12:12:24:17 chr20 32264159 . GC G 61.51 PASS AO=16;DP=63;FAO=32;FDP=60;FR=.;FRO=28;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.0135113;FXX=0.0476115;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.64101;QD=4.10065;RBI=0.103133;REFB=-0.11033;REVB=0.102244;RO=41;SAF=12;SAR=4;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.400993;STB=0.51265;TYPE=del;VARB=0.148352;OID=.;OPOS=32264160;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:16:62:32:60:28:18:14:15:13:25:41:12:4:17:24 chr20 32307988 . GC G 62.73 PASS AO=8;DP=18;FAO=12;FDP=16;FR=.;FRO=4;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.269999;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=19.6944;QD=15.6831;RBI=0.272923;REFB=-0.0161571;REVB=-0.0398425;RO=4;SAF=7;SAR=1;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0.403509;SSSB=0.567155;STB=0.699649;TYPE=del;VARB=-0.044399;OID=.;OPOS=32307989;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:8:16:12:16:4:9:3:0:4:8:4:7:1:0:4 chr20 32341220 . AC A 44.6 PASS AO=10;DP=16;FAO=10;FDP=16;FR=.;FRO=6;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.113998;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=18.5105;QD=11.151;RBI=0.114075;REFB=-0.0917505;REVB=-0.00420337;RO=6;SAF=7;SAR=3;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0.47561;SSSB=0.348751;STB=0.699599;TYPE=del;VARB=0.0809876;OID=.;OPOS=32341221;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:10:16:10:16:6:7:3:1:5:15:6:7:3:1:5 chr20 32345134 . AG A 50.61 PASS AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=25;FR=.;FRO=11;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=0.139376;FXX=0.0384468;HRUN=4;LEN=1;MLLD=16.6144;QD=8.09748;RBI=0.186388;REFB=-0.031661;REVB=0.123753;RO=10;SAF=12;SAR=2;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.542162;STB=0.824499;TYPE=del;VARB=0.0647831;OID=.;OPOS=32345135;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:14:26:14:25:11:12:2:2:9:29:10:12:2:2:8 chr20 32664866 . G A 37.86 PASS AO=10;DP=27;FAO=10;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.0299505;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.752;QD=5.60865;RBI=0.0362112;REFB=-0.00124036;REVB=-0.0203524;RO=17;SAF=5;SAR=5;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155187;STB=0.592414;TYPE=snp;VARB=0.0036912;OID=.;OPOS=32664866;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:27:27:17:17:10:10:5:5:6:11:5:5:6:11 chr20 32972053 . TGCA T 85.31 PASS AO=26;DP=70;FAO=26;FDP=70;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=27;FWDB=-0.00847885;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=283.33;QD=4.87512;RBI=0.00952523;REFB=-0.0038027;REVB=-0.00434039;RO=38;SAF=16;SAR=10;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253548;STB=0.641975;TYPE=del;VARB=0.00792081;OID=.;OPOS=32972054;OREF=GCA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:26:67:26:70:44:16:10:17:27:85:38:16:10:14:24 chr20 33097718 . A AT 83.2 PASS AO=77;DP=202;FAO=99;FDP=194;FR=.;FRO=95;FSAF=51;FSAR=48;FSRF=47;FSRR=48;FWDB=-0.089317;FXX=0.00512794;HRUN=7;LEN=1;MLLD=6.37303;QD=1.71537;RBI=0.275063;REFB=-0.0808033;REVB=-0.260158;RO=92;SAF=39;SAR=38;SRF=48;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149552;STB=0.509998;TYPE=ins;VARB=0.0374852;OID=.;OPOS=33097719;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:77:202:99:194:95:51:48:47:48:83:92:39:38:48:44 chr20 33104592 . G C 188.72 PASS AO=38;DP=69;FAO=38;FDP=69;FR=.;FRO=31;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.0139341;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.1326;QD=10.94;RBI=0.106718;REFB=-0.0130965;REVB=0.105805;RO=31;SAF=18;SAR=20;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0869128;STB=0.54792;TYPE=snp;VARB=0.0124348;OID=.;OPOS=33104592;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:31:31:38:38:20:18:18:13:20:18:18:13 chr20 33337751 . T C 1532.29 PASS AO=160;DP=165;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0440137;FXX=0.0181807;HRUN=3;LEN=1;MLLD=75.8199;QD=37.8342;RBI=0.0511791;REFB=0;REVB=0.0261169;RO=1;SAF=79;SAR=81;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00583813;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.20328e-05;OID=.;OPOS=33337751;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:165:162:1:0:160:162:81:79:0:1:83:79:0:0 chr20 33370005 . A G 354.23 PASS AO=103;DP=244;FAO=103;FDP=245;FR=.;FRO=142;FSAF=40;FSAR=63;FSRF=66;FSRR=76;FWDB=0.0214121;FXX=0.00406488;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2417;QD=5.78326;RBI=0.0381508;REFB=0.0033365;REVB=-0.0315754;RO=138;SAF=40;SAR=63;SRF=64;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0798554;STB=0.545668;TYPE=snp;VARB=-0.022132;OID=.;OPOS=33370005;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:245:138:142:103:103:63:40:64:74:63:40:66:76 chr20 33470694 . C T 478.36 PASS AO=131;DP=294;FAO=131;FDP=297;FR=.;FRO=166;FSAF=47;FSAR=84;FSRF=41;FSRR=125;FWDB=-0.0252926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.435;QD=6.4426;RBI=0.0255011;REFB=-0.011497;REVB=0.00325426;RO=163;SAF=47;SAR=84;SRF=38;SRR=125;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143651;STB=0.570597;TYPE=snp;VARB=0.0155807;OID=.;OPOS=33470694;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:294:297:163:166:131:131:84:47:38:125:84:47:41:125 chr20 33572941 . A G 51.06 PASS AO=6;DP=11;FAO=7;FDP=10;FR=.;FRO=3;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0393159;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.9541;QD=20.4254;RBI=0.097163;REFB=0.0158804;REVB=-0.0888533;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517191;TYPE=snp;VARB=-0.00540401;OID=.;OPOS=33572941;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:6:10:0:3:6:7:2:4:0:0:2:5:2:1 chr20 33574765 . T C 99.1 PASS AO=25;DP=57;FAO=25;FDP=57;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=23;FWDB=-0.0191435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.6717;QD=6.95455;RBI=0.0395255;REFB=-0.0364647;REVB=-0.0345803;RO=32;SAF=10;SAR=15;SRF=9;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12651;STB=0.571374;TYPE=snp;VARB=0.0268928;OID=.;OPOS=33574765;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:57:57:32:32:25:25:15:10:9:23:15:10:9:23 chr20 33578251 . A G 206.8 PASS AO=52;DP=113;FAO=52;FDP=113;FR=.;FRO=61;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=23;FSRR=38;FWDB=-0.0317569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.314;QD=7.32043;RBI=0.0540568;REFB=-0.0086687;REVB=-0.0437452;RO=60;SAF=21;SAR=31;SRF=23;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0205957;STB=0.515103;TYPE=snp;VARB=0.0112804;OID=.;OPOS=33578251;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:60:61:52:52:31:21:23:37:31:21:23:38 chr20 33578899 . T C 748.28 PASS AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0125422;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.694;QD=38.3735;RBI=0.0125441;REFB=0;REVB=0.000220575;RO=0;SAF=31;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.51952e-05;OID=.;OPOS=33578899;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:78:78:0:0:78:78:47:31:0:0:47:31:0:0 chr20 33581180 . G A 92.55 PASS AO=19;DP=38;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.0241275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.9371;QD=9.74196;RBI=0.0485549;REFB=-0.0332396;REVB=0.0421359;RO=19;SAF=8;SAR=11;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0936717;STB=0.523786;TYPE=snp;VARB=0.0320419;OID=.;OPOS=33581180;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:38:38:19:18:19:20:11:8:10:9:11:9:9:9 chr20 33581955 . G A 304.52 PASS AO=64;DP=118;FAO=64;FDP=118;FR=.;FRO=54;FSAF=25;FSAR=39;FSRF=27;FSRR=27;FWDB=-0.0373572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.184;QD=10.3227;RBI=0.0805071;REFB=-0.0242405;REVB=0.0713151;RO=54;SAF=25;SAR=39;SRF=27;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0936259;STB=0.55137;TYPE=snp;VARB=0.0219765;OID=.;OPOS=33581955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:54:54:64:64:39:25:27:27:39:25:27:27 chr20 33583331 . A G 86.74 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0046483;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.7012;QD=38.553;RBI=0.0762725;REFB=0;REVB=-0.0761307;RO=0;SAF=8;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00587066;OID=.;OPOS=33583331;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:8:0:0:1:8:0:0 chr20 33584289 . C T 48.8 PASS AO=8;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.00267278;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.805;QD=15.0164;RBI=0.0216719;REFB=-0.0160035;REVB=0.0215065;RO=5;SAF=1;SAR=7;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.428999;STB=0.755986;TYPE=snp;VARB=0.0165752;OID=.;OPOS=33584289;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:13:13:5:5:8:8:7:1:3:2:7:1:3:2 chr20 33586193 . C T 154.51 PASS AO=22;DP=30;FAO=22;FDP=30;FR=.;FRO=8;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0126468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.393;QD=20.6019;RBI=0.0294091;REFB=-0.0348311;REVB=0.0265509;RO=7;SAF=13;SAR=9;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.056951;STB=0.509425;TYPE=snp;VARB=0.0315975;OID=.;OPOS=33586193;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:30:30:7:8:22:22:9:13:5:2:9:13:5:3 chr20 33587198 . G C 31 PASS AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0476846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.6227;QD=13.7793;RBI=0.0483532;REFB=0.00234636;REVB=-0.00801278;RO=4;SAF=3;SAR=2;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0744193;STB=0.54527;TYPE=snp;VARB=-0.0105079;OID=.;OPOS=33587198;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:9:9:4:4:5:5:2:3:2:2:2:3:2:2 chr20 33657126 . G A 1911.99 PASS AO=198;DP=198;FAO=199;FDP=199;FR=.;FRO=0;FSAF=114;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00896994;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.5168;QD=38.432;RBI=0.0529327;REFB=0;REVB=0.0521671;RO=0;SAF=113;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.40639e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.75824e-05;OID=.;OPOS=33657126;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:198:199:0:0:198:199:85:113:0:0:85:114:0:0 chr20 33703607 . C T 165.74 PASS AO=48;DP=118;FAO=48;FDP=118;FR=.;FRO=70;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=28;FSRR=42;FWDB=0.00414416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.442;QD=5.61814;RBI=0.0196412;REFB=-0.00440106;REVB=-0.019199;RO=69;SAF=21;SAR=27;SRF=27;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0494799;STB=0.522718;TYPE=snp;VARB=0.00538796;OID=.;OPOS=33703607;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:69:70:48:48:27:21:27:42:27:21:28:42 chr20 33969530 . C T 1021.58 PASS AO=112;DP=115;FAO=112;FDP=115;FR=.;FRO=3;FSAF=41;FSAR=71;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.040905;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=96.2862;QD=35.5334;RBI=0.0496601;REFB=-0.136441;REVB=-0.0281586;RO=0;SAF=41;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508408;TYPE=snp;VARB=0.000538615;OID=.;OPOS=33969530;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:115:115:0:3:112:112:71:41:0:0:71:41:2:1 chr20 33971914 . C T 1162.51 PASS AO=103;DP=103;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0107231;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7344;QD=38.115;RBI=0.0474994;REFB=0;REVB=-0.0462732;RO=0;SAF=41;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000374731;OID=.;OPOS=33971914;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:103:122:0:0:103:122:62:41:0:0:63:59:0:0 chr20 33974163 . T A 210.67 PASS AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00333536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.211;QD=36.6383;RBI=0.0442579;REFB=0;REVB=0.044132;RO=0;SAF=5;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000578056;OID=.;OPOS=33974163;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:0:0:23:23:18:5:0:0:18:5:0:0 chr20 34089740 . G A 153.81 PASS AO=48;DP=125;FAO=48;FDP=125;FR=.;FRO=77;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=44;FSRR=33;FWDB=-0.0139825;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.8171;QD=4.92201;RBI=0.0529942;REFB=-0.00426129;REVB=0.0511163;RO=77;SAF=19;SAR=29;SRF=44;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190267;STB=0.607942;TYPE=snp;VARB=0.00498265;OID=.;OPOS=34089740;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:77:77:48:48:29:19:44:33:29:19:44:33 chr20 34144107 . T C 730.32 PASS AO=77;DP=79;FAO=78;FDP=79;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0391792;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=220.02;QD=36.9784;RBI=0.0423671;REFB=-0.0779751;REVB=0.0161236;RO=0;SAF=24;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.08692e-08;STB=0.504672;TYPE=snp;VARB=2.84643e-05;OID=.;OPOS=34144107;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:79:79:0:1:77:78:53:24:0:0:53:25:0:1 chr20 34164422 . T C 2940.08 PASS AO=306;DP=307;FAO=306;FDP=306;FR=.;FRO=0;FSAF=112;FSAR=194;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0579611;FXX=0.00325722;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8801;QD=38.4324;RBI=0.0580123;REFB=0;REVB=-0.00243561;RO=1;SAF=112;SAR=194;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00423947;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000198836;OID=.;OPOS=34164422;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:307:306:1:0:306:306:194:112:1:0:194:112:0:0 chr20 34167382 . G A 50.19 PASS AO=7;DP=52;FAO=17;FDP=47;FR=.,HEALED;FRO=30;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.0538137;FXX=0.040808;HRUN=5;LEN=1;MLLD=202.273;QD=4.27123;RBI=0.0954182;REFB=0.0099364;REVB=-0.0787954;RO=22;SAF=6;SAR=1;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.499735;STB=0.617207;TYPE=snp;VARB=-0.0288014;OID=.;OPOS=34167382;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:38:47:22:30:7:17:1:6:10:12:11:6:16:14 chr20 34170035 . C G 336.83 PASS AO=42;DP=50;FAO=45;FDP=52;FR=.;FRO=7;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0374225;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.467;QD=25.9101;RBI=0.0489879;REFB=-0.1021;REVB=0.0316128;RO=8;SAF=18;SAR=24;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0938938;STB=0.536569;TYPE=snp;VARB=0.00549574;OID=.;OPOS=34170035;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:50:52:8:7:42:45:24:18:1:7:27:18:1:6 chr20 34170316 . C A 279.24 PASS AO=30;DP=33;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0197372;FXX=0.0908816;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.651;QD=37.2314;RBI=0.0221277;REFB=0;REVB=0.010004;RO=0;SAF=26;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.9955e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000903309;OID=.;OPOS=34170316;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:33:30:0:0:30:30:4:26:0:0:4:26:0:0 chr20 34173119 . TG T 310.77 PASS AO=38;DP=51;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0844644;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.5418;QD=24.8613;RBI=0.38204;REFB=0;REVB=0.372586;RO=7;SAF=7;SAR=31;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0.369369;SSSB=0.0948559;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0139555;OID=.;OPOS=34173120;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:38:50:50:50:0:9:41:0:0:28:7:7:31:0:7 chr20 34173178 . A G 76.41 PASS AO=12;DP=18;FAO=12;FDP=18;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0700221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.006;QD=16.9809;RBI=0.0709992;REFB=0.0118378;REVB=-0.0117385;RO=5;SAF=2;SAR=10;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0305306;STB=0.588073;TYPE=snp;VARB=-0.0104388;OID=.;OPOS=34173178;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:18:18:5:6:12:12:10:2:1:4:10:2:2:4 chr20 34179907 . C T 2100.91 PASS AO=219;DP=219;FAO=219;FDP=219;FR=.;FRO=0;FSAF=134;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0284256;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6132;QD=38.3727;RBI=0.0414953;REFB=0;REVB=-0.0302298;RO=0;SAF=134;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000154672;OID=.;OPOS=34179907;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:219:219:0:0:219:219:85:134:0:0:85:134:0:0 chr20 34186953 . T C 181.72 PASS AO=31;DP=49;FAO=31;FDP=49;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=22;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0230273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.6726;QD=14.8344;RBI=0.0250959;REFB=-0.0861333;REVB=0.00997747;RO=18;SAF=9;SAR=22;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117946;STB=0.564911;TYPE=snp;VARB=0.0647831;OID=.;OPOS=34186953;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:49:49:18:18:31:31:22:9:8:10:22:9:8:10 chr20 34242949 . G T 491.24 PASS AO=178;DP=464;FAO=157;FDP=400;FR=.;FRO=243;FSAF=65;FSAR=92;FSRF=91;FSRR=152;FWDB=-0.0551917;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9046;QD=4.91235;RBI=0.0658623;REFB=0.0142486;REVB=0.0359404;RO=286;SAF=72;SAR=106;SRF=114;SRR=172;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00672399;STB=0.524954;TYPE=snp;VARB=-0.0256386;OID=.;OPOS=34242949;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:464:400:286:243:178:157:106:72:114:172:92:65:91:152 chr20 34793995 . A C 167.64 PASS AO=45;DP=102;FAO=45;FDP=106;FR=.;FRO=61;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=38;FWDB=-0.00978898;FXX=0.0275204;HRUN=5;LEN=1;MLLD=267.245;QD=6.32585;RBI=0.0128206;REFB=-0.00483439;REVB=-0.00827911;RO=56;SAF=24;SAR=21;SRF=22;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138461;STB=0.589225;TYPE=snp;VARB=0.005609;OID=.;OPOS=34793995;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:106:56:61:45:45:21:24:22:34:21:24:23:38 chr20 35399454 . AG A 663.89 PASS AO=72;DP=104;FAO=101;FDP=103;FR=.;FRO=2;FSAF=72;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0147571;FXX=0.0282992;HRUN=3;LEN=1;MLLD=17.6637;QD=25.7822;RBI=0.014786;REFB=0.0121794;REVB=0.000924349;RO=6;SAF=47;SAR=25;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0.281325;SSSB=0.0242445;STB=0.516663;TYPE=del;VARB=-0.000647198;OID=.;OPOS=35399455;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:72:92:101:103:2:72:29:0:2:43:6:47:25:3:3 chr20 35414905 . G T 149.39 PASS AO=30;DP=58;FAO=31;FDP=58;FR=.;FRO=27;FSAF=25;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.00816754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.5264;QD=10.3031;RBI=0.0442508;REFB=-0.0323362;REVB=0.0434905;RO=26;SAF=25;SAR=5;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260141;STB=0.633287;TYPE=snp;VARB=0.0281965;OID=.;OPOS=35414905;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:26:27:30:31:5:25:16:10:6:25:16:11 chr20 35710453 . T C 150.62 PASS AO=38;DP=85;FAO=38;FDP=84;FR=.;FRO=46;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=10;FSRR=36;FWDB=-0.0384274;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4309;QD=7.17252;RBI=0.0391906;REFB=-0.0106183;REVB=-0.00769662;RO=46;SAF=13;SAR=25;SRF=10;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143179;STB=0.579639;TYPE=snp;VARB=0.0100191;OID=.;OPOS=35710453;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:84:46:46:38:38:25:13:10:36:25:13:10:36 chr20 35740794 . T C 318.55 PASS AO=89;DP=207;FAO=89;FDP=207;FR=.;FRO=118;FSAF=29;FSAR=60;FSRF=57;FSRR=61;FWDB=0.00633232;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.0995;QD=6.15563;RBI=0.0112045;REFB=0.00397103;REVB=0.00924355;RO=110;SAF=29;SAR=60;SRF=53;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164829;STB=0.595202;TYPE=snp;VARB=-0.0104369;OID=.;OPOS=35740794;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:207:207:110:118:89:89:60:29:53:57:60:29:57:61 chr20 35766337 . A G 253.93 PASS AO=76;DP=198;FAO=79;FDP=201;FR=.;FRO=122;FSAF=64;FSAR=15;FSRF=73;FSRR=49;FWDB=-0.0259827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.601;QD=5.05324;RBI=0.0269457;REFB=-0.00762738;REVB=-0.00713958;RO=122;SAF=62;SAR=14;SRF=73;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.303636;STB=0.665861;TYPE=snp;VARB=0.0111278;OID=.;OPOS=35766337;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:198:201:122:122:76:79:14:62:73:49:15:64:73:49 chr20 35769592 . T C 1288.71 PASS AO=148;DP=157;FAO=148;FDP=157;FR=.;FRO=9;FSAF=71;FSAR=77;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.0188345;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=47.4652;QD=32.8333;RBI=0.064679;REFB=-0.183511;REVB=0.061876;RO=0;SAF=71;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504352;TYPE=snp;VARB=0.0100748;OID=.;OPOS=35769592;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:157:157:0:9:148:148:77:71:0:0:77:71:5:4 chr20 35769647 . G T 259.71 PASS AO=48;DP=144;FAO=61;FDP=138;FR=.,HEALED;FRO=71;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=28;FSRR=43;FWDB=0.0463432;FXX=0.00719373;HRUN=3;LEN=1;MLLD=31.5623;QD=7.52794;RBI=0.104805;REFB=-0.0440656;REVB=0.094002;RO=53;SAF=25;SAR=23;SRF=25;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0463338;STB=0.543872;TYPE=snp;VARB=0.0620517;OID=.;OPOS=35769647;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:138:53:71:48:61:23:25:25:28:32:29:28:43 chr20 35783494 . T C 182.92 PASS AO=60;DP=161;FAO=60;FDP=161;FR=.;FRO=101;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=64;FSRR=37;FWDB=0.032811;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9066;QD=4.5446;RBI=0.0574363;REFB=0.00792675;REVB=0.0471419;RO=101;SAF=32;SAR=28;SRF=64;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112621;STB=0.563738;TYPE=snp;VARB=-0.0119362;OID=.;OPOS=35783494;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:161:101:101:60:60:28:32:64:37:28:32:64:37 chr20 35796541 . T C 403.12 PASS AO=86;DP=166;FAO=89;FDP=167;FR=.;FRO=78;FSAF=42;FSAR=47;FSRF=30;FSRR=48;FWDB=0.000968708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.2192;QD=9.65544;RBI=0.0603872;REFB=-0.00899076;REVB=0.0603794;RO=77;SAF=42;SAR=44;SRF=30;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0854752;STB=0.541081;TYPE=snp;VARB=0.00888882;OID=.;OPOS=35796541;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:167:77:78:86:89:44:42:30:47:47:42:30:48 chr20 35865052 . TC T 664.29 PASS AO=23;DP=125;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.27245;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=10.3935;QD=21.0884;RBI=0.272677;REFB=0;REVB=-0.0111139;RO=101;SAF=17;SAR=6;SRF=34;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.483363;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00533201;OID=.;OPOS=35865053;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:23:125:126:126:0:55:71:0:0:71:101:17:6:34:67 chr20 35865054 . C T 929.38 PASS AO=88;DP=121;FAO=116;FDP=126;FR=.;FRO=10;FSAF=52;FSAR=64;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.150461;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5549;QD=29.5042;RBI=0.150972;REFB=-0.0636754;REVB=-0.0124141;RO=31;SAF=24;SAR=64;SRF=24;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.26654;STB=0.511923;TYPE=snp;VARB=0.026036;OID=.;OPOS=35865054;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:121:126:31:10:88:116:64:24:24:7:64:52:3:7 chr20 35945238 . C G 153.48 PASS AO=41;DP=98;FAO=42;FDP=100;FR=.;FRO=58;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=43;FSRR=15;FWDB=-0.011237;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.2053;QD=6.13935;RBI=0.0169743;REFB=0.00460888;REVB=-0.0127223;RO=57;SAF=26;SAR=15;SRF=43;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140216;STB=0.577976;TYPE=snp;VARB=-0.00523388;OID=.;OPOS=35945238;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:100:57:58:41:42:15:26:43:14:16:26:43:15 chr20 36030939 . G C 734.26 PASS AO=80;DP=81;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0423382;FXX=0.0121936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.34;QD=36.2599;RBI=0.0597059;REFB=-0.0195444;REVB=0.0420984;RO=1;SAF=38;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122965;STB=0.506023;TYPE=snp;VARB=0.000752234;OID=.;OPOS=36030939;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:81:81:1:1:80:80:42:38:1:0:41:39:0:1 chr20 36032893 . C T 241.86 PASS AO=48;DP=84;FAO=48;FDP=84;FR=.;FRO=36;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=-0.0124426;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=133.557;QD=11.517;RBI=0.0142238;REFB=-0.0184138;REVB=0.00689185;RO=33;SAF=20;SAR=28;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.028867;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0174684;OID=.;OPOS=36032893;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:33:36:48:48:28:20:15:18:28:20:15:21 chr20 36146148 . T C 2339.78 PASS AO=246;DP=249;FAO=248;FDP=248;FR=.;FRO=0;FSAF=136;FSAR=112;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0170323;FXX=0.0040159;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.287;QD=37.7385;RBI=0.0195633;REFB=-0.0735599;REVB=-0.00962421;RO=1;SAF=135;SAR=111;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00351781;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000175444;OID=.;OPOS=36146148;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:96:249:248:1:0:246:248:111:135:1:0:112:136:0:0 chr20 36603780 . T C 144.05 PASS AO=36;DP=80;FAO=36;FDP=80;FR=.;FRO=44;FSAF=7;FSAR=29;FSRF=15;FSRR=29;FWDB=0.0242941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.414;QD=7.20242;RBI=0.0321652;REFB=-0.0349591;REVB=-0.0210808;RO=44;SAF=7;SAR=29;SRF=15;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195652;STB=0.611043;TYPE=snp;VARB=0.056181;OID=.;OPOS=36603780;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:44:44:36:36:29:7:15:29:29:7:15:29 chr20 36603807 . C T 580.18 PASS AO=61;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161696;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.167;QD=37.4308;RBI=0.0171696;REFB=0;REVB=0.00577406;RO=0;SAF=16;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.31616e-05;OID=.;OPOS=36603807;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:62:62:0:0:61:62:45:16:0:0:45:17:0:0 chr20 36718247 . C G 344.99 PASS AO=75;DP=142;FAO=75;FDP=142;FR=.;FRO=67;FSAF=33;FSAR=42;FSRF=24;FSRR=43;FWDB=-0.00486609;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=71.7647;QD=9.7181;RBI=0.00888913;REFB=-0.0135099;REVB=0.00743894;RO=67;SAF=33;SAR=42;SRF=24;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0721668;STB=0.539516;TYPE=snp;VARB=0.0123905;OID=.;OPOS=36718247;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:142:67:67:75:75:42:33:24:43:42:33:24:43 chr20 36761057 . C T 383.51 PASS AO=72;DP=120;FAO=72;FDP=120;FR=.;FRO=48;FSAF=35;FSAR=37;FSRF=36;FSRR=12;FWDB=0.0130268;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.952;QD=12.7837;RBI=0.0131401;REFB=-0.00511548;REVB=-0.00172225;RO=47;SAF=35;SAR=37;SRF=35;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187617;STB=0.604993;TYPE=snp;VARB=0.00375702;OID=.;OPOS=36761057;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:47:48:72:72:37:35:35:12:37:35:36:12 chr20 36841756 . T C 508.51 PASS AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0330418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.2;QD=37.6675;RBI=0.0446112;REFB=0;REVB=0.0299733;RO=0;SAF=11;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000341964;OID=.;OPOS=36841756;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:54:54:0:0:54:54:43:11:0:0:43:11:0:0 chr20 36841914 . G A 357.1 PASS AO=37;DP=39;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00814979;FXX=0.0256345;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.919;QD=37.5896;RBI=0.0192304;REFB=0;REVB=0.017418;RO=0;SAF=11;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00129565;OID=.;OPOS=36841914;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:39:38:0:0:37:38:26:11:0:0:27:11:0:0 chr20 36845738 . C T 423.53 PASS AO=43;DP=43;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00157101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.282;QD=37.6473;RBI=0.0285919;REFB=0;REVB=0.0285487;RO=0;SAF=22;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000133592;OID=.;OPOS=36845738;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:43:45:0:0:43:45:21:22:0:0:21:24:0:0 chr20 36869516 . C A 226.75 PASS AO=44;DP=79;FAO=45;FDP=79;FR=.;FRO=34;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=8;FWDB=-0.00172423;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.02;QD=11.4808;RBI=0.00172883;REFB=-0.0149681;REVB=0.000126092;RO=34;SAF=24;SAR=20;SRF=26;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179405;STB=0.601332;TYPE=snp;VARB=0.0194821;OID=.;OPOS=36869516;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:34:34:44:45:20:24:26:8:21:24:26:8 chr20 36870122 . T G 187.99 PASS AO=33;DP=65;FAO=39;FDP=71;FR=.;FRO=32;FSAF=29;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=9;FWDB=-0.0089794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.691;QD=10.5911;RBI=0.0641526;REFB=0.0133308;REVB=0.0635211;RO=32;SAF=29;SAR=4;SRF=23;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.254834;STB=0.514465;TYPE=snp;VARB=-0.0113435;OID=.;OPOS=36870122;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:71:32:32:33:39:4:29:23:9:10:29:23:9 chr20 36919758 . A G 20.91 PASS AO=7;DP=26;FAO=7;FDP=26;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.0329109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.859;QD=3.21694;RBI=0.0348648;REFB=0.00440216;REVB=-0.0115078;RO=17;SAF=3;SAR=4;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112877;STB=0.571225;TYPE=snp;VARB=-0.00800048;OID=.;OPOS=36919758;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:26:26:17:19:7:7:4:3:9:8:4:3:10:9 chr20 36932660 . C T 687.94 PASS AO=76;DP=79;FAO=76;FDP=79;FR=.;FRO=3;FSAF=42;FSAR=34;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0724891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.0471;QD=34.8322;RBI=0.0881822;REFB=-0.179322;REVB=0.0502138;RO=3;SAF=42;SAR=34;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0326047;STB=0.517237;TYPE=snp;VARB=0.0066745;OID=.;OPOS=36932660;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:79:79:3:3:76:76:34:42:3:0:34:42:3:0 chr20 36932676 . G C 748.24 PASS AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.002836;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=267.83;QD=38.3712;RBI=0.00805689;REFB=0;REVB=-0.00754126;RO=0;SAF=42;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43944e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.50089e-05;OID=.;OPOS=36932676;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:78:78:0:0:78:78:36:42:0:0:36:42:0:0 chr20 36989381 . G A 1508.66 PASS AO=160;DP=161;FAO=160;FDP=160;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142921;FXX=0.0123449;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.498;QD=37.7165;RBI=0.0166604;REFB=-0.0330012;REVB=-0.00856171;RO=1;SAF=82;SAR=78;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00606121;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000226521;OID=.;OPOS=36989381;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:161:160:1:0:160:160:78:82:0:1:78:82:0:0 chr20 36989410 . A G 328.58 PASS AO=82;DP=172;FAO=82;FDP=174;FR=.;FRO=92;FSAF=27;FSAR=55;FSRF=46;FSRR=46;FWDB=-0.0373618;FXX=0.00571396;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.6221;QD=7.55357;RBI=0.0383154;REFB=-0.0283294;REVB=0.00849486;RO=90;SAF=27;SAR=55;SRF=44;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160226;STB=0.595497;TYPE=snp;VARB=0.0310304;OID=.;OPOS=36989410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:174:90:92:82:82:55:27:44:46:55:27:46:46 chr20 37002661 . G A 123.54 PASS AO=36;DP=91;FAO=36;FDP=91;FR=.;FRO=55;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=28;FWDB=0.00351171;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.441;QD=5.43033;RBI=0.00775503;REFB=0.00248656;REVB=0.00691436;RO=55;SAF=20;SAR=16;SRF=27;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0689348;STB=0.539194;TYPE=snp;VARB=-0.00533978;OID=.;OPOS=37002661;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:55:55:36:36:16:20:27:28:16:20:27:28 chr20 37005536 . T C 1315.57 PASS AO=104;DP=130;FAO=136;FDP=137;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=38;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.140537;FXX=0.00724585;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.227;QD=38.4109;RBI=0.140639;REFB=0;REVB=-0.00536873;RO=0;SAF=6;SAR=98;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00658612;OID=.;OPOS=37005536;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:127:137:0:0:104:136:98:6:0:0:98:38:0:0 chr20 37062583 . T C 328.19 PASS AO=68;DP=123;FAO=68;FDP=123;FR=.;FRO=55;FSAF=28;FSAR=40;FSRF=26;FSRR=29;FWDB=-0.00308998;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.337;QD=10.6727;RBI=0.0179743;REFB=-0.00316866;REVB=-0.0177067;RO=54;SAF=28;SAR=40;SRF=26;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.057569;STB=0.527851;TYPE=snp;VARB=0.00219122;OID=.;OPOS=37062583;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:123:54:55:68:68:40:28:26:28:40:28:26:29 chr20 37070737 . C T 147.61 PASS AO=40;DP=95;FAO=40;FDP=94;FR=.;FRO=54;FSAF=13;FSAR=27;FSRF=23;FSRR=31;FWDB=-0.0113068;FXX=0.0105252;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.6751;QD=6.28123;RBI=0.0134448;REFB=-0.0124696;REVB=-0.00727453;RO=52;SAF=13;SAR=27;SRF=23;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127163;STB=0.563119;TYPE=snp;VARB=0.0263728;OID=.;OPOS=37070737;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:94:52:54:40:40:27:13:23:29:27:13:23:31 chr20 37203813 . C T 1358.62 PASS AO=141;DP=143;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0420197;FXX=0.0137922;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.2819;QD=38.0035;RBI=0.0429943;REFB=0;REVB=-0.00910278;RO=0;SAF=51;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58937e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000276692;OID=.;OPOS=37203813;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:143:143:0:0:141:143:90:51:0:0:91:52:0:0 chr20 37257590 . C G 258.93 PASS AO=76;DP=199;FAO=80;FDP=202;FR=.;FRO=122;FSAF=46;FSAR=34;FSRF=67;FSRR=55;FWDB=0.0112659;FXX=0.00980344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.396;QD=5.12724;RBI=0.0118552;REFB=0.0127579;REVB=0.0036911;RO=122;SAF=43;SAR=33;SRF=67;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0183901;STB=0.515873;TYPE=snp;VARB=-0.0187946;OID=.;OPOS=37257590;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:199:202:122:122:76:80:33:43:67:55:34:46:67:55 chr20 37277271 . C T 95.87 PASS AO=28;DP=79;FAO=29;FDP=77;FR=.;FRO=48;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=0.00225745;FXX=0.0374953;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.66;QD=4.98012;RBI=0.00658694;REFB=0.0164761;REVB=-0.00618803;RO=51;SAF=18;SAR=10;SRF=22;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.236728;STB=0.625141;TYPE=snp;VARB=-0.0249584;OID=.;OPOS=37277271;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:79:77:51:48:28:29:10:18:22:29:10:19:22:26 chr20 37279376 . TGACGA T 392.66 PASS AO=79;DP=175;FAO=83;FDP=153;FR=.;FRO=70;FSAF=52;FSAR=31;FSRF=26;FSRR=44;FWDB=0.0221544;FXX=0.0192295;HRUN=1;LEN=5;MLLD=238.921;QD=10.2655;RBI=0.0336761;REFB=-0.0300359;REVB=-0.0253626;RO=65;SAF=50;SAR=29;SRF=25;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207178;STB=0.617256;TYPE=del;VARB=0.0219507;OID=.;OPOS=37279377;OREF=GACGA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:79:154:83:153:70:52:31:26:44:99:65:50:29:25:40 chr20 37390174 . T C 199.94 PASS AO=39;DP=73;FAO=41;FDP=73;FR=.;FRO=32;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=11;FWDB=-0.0111133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.751;QD=10.9554;RBI=0.0555078;REFB=-0.00286122;REVB=0.0543839;RO=31;SAF=22;SAR=17;SRF=21;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0940116;STB=0.553123;TYPE=snp;VARB=0.00274377;OID=.;OPOS=37390174;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:31:32:39:41:17:22:21:10:19:22:21:11 chr20 37390255 . G GTC 441.67 PASS AO=98;DP=195;FAO=101;FDP=199;FR=.;FRO=98;FSAF=55;FSAR=46;FSRF=25;FSRR=73;FWDB=0.0168725;FXX=0.00499975;HRUN=1;LEN=2;MLLD=277.292;QD=8.87772;RBI=0.0168833;REFB=-0.00402564;REVB=0.00060553;RO=96;SAF=55;SAR=43;SRF=25;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.266577;STB=0.640072;TYPE=ins;VARB=0.00311905;OID=.;OPOS=37390256;OREF=-;OALT=TC;OMAPALT=GTC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:98:195:101:199:98:55:46:25:73:99:96:55:43:25:71 chr20 37396120 . A G 183.05 PASS AO=52;DP=126;FAO=52;FDP=125;FR=.;FRO=73;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=26;FSRR=47;FWDB=-0.0048805;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.33;QD=5.85754;RBI=0.00995614;REFB=0.00783198;REVB=-0.00867787;RO=73;SAF=24;SAR=28;SRF=26;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111427;STB=0.562477;TYPE=snp;VARB=-0.0130801;OID=.;OPOS=37396120;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:125:73:73:52:52:28:24:26:47:28:24:26:47 chr20 37501507 . T C 575.04 PASS AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0145662;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.935;QD=37.7076;RBI=0.0694371;REFB=0;REVB=0.0678921;RO=0;SAF=35;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000136262;OID=.;OPOS=37501507;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:62:61:0:0:61:61:26:35:0:0:26:35:0:0 chr20 37534642 . C A 126.23 PASS AO=37;DP=100;FAO=38;FDP=100;FR=.;FRO=62;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=41;FSRR=21;FWDB=0.0509373;FXX=0.0825612;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.0977;QD=5.04925;RBI=0.0537653;REFB=-0.0106653;REVB=0.0172074;RO=61;SAF=22;SAR=15;SRF=41;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0896531;STB=0.553211;TYPE=snp;VARB=0.0172284;OID=.;OPOS=37534642;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:61:62:37:38:15:22:41:20:16:22:41:21 chr20 37534665 . C T 1211.62 PASS AO=132;DP=135;FAO=132;FDP=135;FR=.;FRO=3;FSAF=79;FSAR=53;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0376194;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.568;QD=35.8999;RBI=0.0442224;REFB=0.0237978;REVB=0.0232465;RO=3;SAF=79;SAR=53;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116174;STB=0.506114;TYPE=snp;VARB=-2.55567e-05;OID=.;OPOS=37534665;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:135:135:3:3:132:132:53:79:1:2:53:79:1:2 chr20 37547374 . G A 689.87 PASS AO=62;DP=62;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00665861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.44;QD=37.8009;RBI=0.00797369;REFB=0;REVB=-0.00438664;RO=0;SAF=7;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.19382e-06;OID=.;OPOS=37547374;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:62:73:0:0:62:73:55:7:0:0:55:18:0:0 chr20 37555116 . G C 86.76 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0630582;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.068;QD=38.5593;RBI=0.0649065;REFB=0;REVB=0.0153793;RO=0;SAF=3;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000806243;OID=.;OPOS=37555116;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:6:3:0:0:6:3:0:0 chr20 37570725 . C T 2060.85 PASS AO=196;DP=196;FAO=220;FDP=220;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=136;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230306;FXX=0.0090086;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.87;QD=37.47;RBI=0.0230333;REFB=0;REVB=0.000355141;RO=0;SAF=71;SAR=125;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00106399;OID=.;OPOS=37570725;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:196:220:0:0:196:220:125:71:0:0:136:84:0:0 chr20 37581437 . A G 1311.01 PASS AO=137;DP=138;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0828345;FXX=0.0142847;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.073;QD=38.0004;RBI=0.0905222;REFB=-0.0795052;REVB=-0.0365064;RO=1;SAF=69;SAR=68;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00684033;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00104385;OID=.;OPOS=37581437;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:138:138:1:0:137:138:68:69:1:0:69:69:0:0 chr20 37601243 . A G 1092.97 PASS AO=115;DP=115;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0279346;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.725;QD=38.0162;RBI=0.0296821;REFB=0;REVB=0.010034;RO=0;SAF=44;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.35954e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.857e-05;OID=.;OPOS=37601243;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:115:115:0:0:115:115:71:44:0:0:70:45:0:0 chr20 37977912 . C T 168.06 PASS AO=50;DP=125;FAO=50;FDP=125;FR=.;FRO=75;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=42;FSRR=33;FWDB=0.0254723;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.5468;QD=5.37801;RBI=0.0323206;REFB=-0.00132171;REVB=-0.0198943;RO=75;SAF=21;SAR=29;SRF=42;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148515;STB=0.583859;TYPE=snp;VARB=0.00223222;OID=.;OPOS=37977912;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:75:75:50:50:29:21:42:33:29:21:42:33 chr20 37977945 . T C 1124.01 PASS AO=117;DP=117;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.024892;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.977;QD=38.4277;RBI=0.0249041;REFB=0;REVB=-0.000775274;RO=0;SAF=60;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.97593e-05;OID=.;OPOS=37977945;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:117:117:0:0:117:117:57:60:0:0:57:60:0:0 chr20 37981504 . C T 3014.22 PASS AO=317;DP=320;FAO=318;FDP=318;FR=.;FRO=0;FSAF=161;FSAR=157;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0177182;FXX=0.0093455;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.418;QD=37.9148;RBI=0.0274785;REFB=-0.0202521;REVB=0.0210031;RO=1;SAF=161;SAR=156;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00295365;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.35475e-05;OID=.;OPOS=37981504;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:320:318:1:0:317:318:156:161:1:0:157:161:0:0 chr20 39609426 . C T 2119.16 PASS AO=225;DP=230;FAO=228;FDP=228;FR=.;FRO=0;FSAF=147;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247593;FXX=0.00869527;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.0844;QD=37.1783;RBI=0.028118;REFB=-0.133317;REVB=0.0133266;RO=4;SAF=144;SAR=81;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0130499;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00244779;OID=.;OPOS=39609426;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:230:228:4:0:225:228:81:144:4:0:81:147:0:0 chr20 39652976 . C T 387.36 PASS AO=83;DP=155;FAO=83;FDP=154;FR=.;FRO=71;FSAF=50;FSAR=33;FSRF=37;FSRR=34;FWDB=-0.00934015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.902;QD=10.0612;RBI=0.0236112;REFB=-0.0174972;REVB=-0.0216852;RO=72;SAF=50;SAR=33;SRF=37;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0769883;STB=0.538489;TYPE=snp;VARB=0.0149254;OID=.;OPOS=39652976;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:154:72:71:83:83:33:50:37:35:33:50:37:34 chr20 39750391 . AG A 1005.45 PASS AO=129;DP=156;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0252773;FXX=0.00662208;HRUN=2;LEN=1;MLLD=17.373;QD=26.812;RBI=0.151925;REFB=-0.000385705;REVB=0.149807;RO=10;SAF=34;SAR=95;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00637681;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00263126;OID=.;OPOS=39750392;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:129:150:150:150:0:47:103:0:0:78:10:34:95:3:7 chr20 39797465 . T C 43.43 PASS AO=16;DP=53;FAO=16;FDP=53;FR=.;FRO=37;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=25;FWDB=-0.0470678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.625;QD=3.27794;RBI=0.052676;REFB=-0.0120093;REVB=-0.0236513;RO=37;SAF=6;SAR=10;SRF=12;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0643404;STB=0.538415;TYPE=snp;VARB=0.0297245;OID=.;OPOS=39797465;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:53:53:37:37:16:16:10:6:12:25:10:6:12:25 chr20 40162026 . GA G 71.12 PASS AO=33;DP=100;FAO=46;FDP=96;FR=.;FRO=50;FSAF=29;FSAR=17;FSRF=28;FSRR=22;FWDB=-0.128082;FXX=0.039996;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.4445;QD=2.96354;RBI=0.131522;REFB=-0.113477;REVB=-0.0298863;RO=49;SAF=20;SAR=13;SRF=28;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0.482759;SSSB=0.0377219;STB=0.538554;TYPE=del;VARB=0.132195;OID=.;OPOS=40162027;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:33:90:46:96:50:29:17:28:22:71:49:20:13:28:21 chr20 40701456 . G A 1434.11 PASS AO=152;DP=153;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00869232;FXX=0.0129862;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.145;QD=37.7398;RBI=0.0203407;REFB=0.0163242;REVB=0.0183899;RO=1;SAF=47;SAR=105;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00450921;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.65943e-06;OID=.;OPOS=40701456;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:153:152:1:0:152:152:105:47:0:1:105:47:0:0 chr20 40702071 . G A 531.11 PASS AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.342;QD=37.9362;RBI=0.0147742;REFB=0;REVB=-0.00922196;RO=0;SAF=15;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.83848e-06;OID=.;OPOS=40702071;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:56:56:0:0:56:56:41:15:0:0:41:15:0:0 chr20 40710643 . C T 356.96 PASS AO=91;DP=197;FAO=91;FDP=197;FR=.;FRO=106;FSAF=52;FSAR=39;FSRF=50;FSRR=56;FWDB=0.0109161;FXX=0.00505025;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.957;QD=7.24792;RBI=0.0281738;REFB=0.0017749;REVB=-0.0259731;RO=101;SAF=52;SAR=39;SRF=48;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0920946;STB=0.553924;TYPE=snp;VARB=-0.00180549;OID=.;OPOS=40710643;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:197:101:106:91:91:39:52:48:53:39:52:50:56 chr20 40714479 . G A 78.63 PASS AO=28;DP=89;FAO=29;FDP=89;FR=.;FRO=60;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=27;FSRR=33;FWDB=0.00889319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.185;QD=3.53394;RBI=0.0170754;REFB=-0.0144541;REVB=-0.0145767;RO=60;SAF=15;SAR=13;SRF=27;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0995031;STB=0.568293;TYPE=snp;VARB=0.0366612;OID=.;OPOS=40714479;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:89:89:60:60:28:29:13:15:27:33:13:16:27:33 chr20 40877358 . G C 164.06 PASS AO=39;DP=85;FAO=40;FDP=86;FR=.;FRO=46;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=26;FWDB=0.00927122;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.183;QD=7.63046;RBI=0.00927129;REFB=-0.0124708;REVB=-3.50631e-05;RO=42;SAF=19;SAR=20;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0102296;STB=0.534866;TYPE=snp;VARB=0.0160333;OID=.;OPOS=40877358;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:86:42:46:39:40:20:19:20:22:20:20:20:26 chr20 41306600 . A G 437.2 PASS AO=106;DP=218;FAO=106;FDP=218;FR=.;FRO=112;FSAF=61;FSAR=45;FSRF=66;FSRR=46;FWDB=0.0155995;FXX=0.004566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.172;QD=8.02199;RBI=0.0176211;REFB=-0.00437165;REVB=0.00819503;RO=111;SAF=61;SAR=45;SRF=66;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0182476;STB=0.507277;TYPE=snp;VARB=0.0048879;OID=.;OPOS=41306600;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:218:218:111:112:106:106:45:61:66:45:45:61:66:46 chr20 42034149 . C T 380.2 PASS AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0366582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.5732;QD=37.0929;RBI=0.049672;REFB=0;REVB=-0.0335185;RO=0;SAF=12;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00366879;OID=.;OPOS=42034149;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:41:41:0:0:41:41:29:12:0:0:29:12:0:0 chr20 42034196 . T C 293.77 PASS AO=31;DP=32;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0524046;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.8157;QD=34.5614;RBI=0.0525441;REFB=-0.0642743;REVB=-0.0038262;RO=0;SAF=12;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.47712e-08;STB=0.519988;TYPE=snp;VARB=0.00370978;OID=.;OPOS=42034196;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:32:34:0:1:31:33:19:12:0:0:21:12:1:0 chr20 42089511 . T C 1786.22 PASS AO=167;DP=172;FAO=190;FDP=190;FR=.;FRO=0;FSAF=102;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.942;QD=37.6045;RBI=0.0197679;REFB=0;REVB=0.00936766;RO=0;SAF=87;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03409e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000188313;OID=.;OPOS=42089511;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:172:190:0:0:167:190:80:87:0:0:88:102:0:0 chr20 42089977 . G T 89.3 PASS AO=8;DP=8;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0724034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.8031;QD=35.7215;RBI=0.0724034;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=8;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.72539e-05;OID=.;OPOS=42089977;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:10:0:0:8:10:0:8:0:0:0:10:0:0 chr20 42194989 . T A 30.5 PASS AO=12;DP=44;FAO=12;FDP=44;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=26;FSRR=6;FWDB=-0.0037139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.044;QD=2.77249;RBI=0.00765985;REFB=-0.00682569;REVB=-0.00669927;RO=32;SAF=9;SAR=3;SRF=26;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106194;STB=0.564417;TYPE=snp;VARB=0.0160713;OID=.;OPOS=42194989;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:44:44:32:32:12:12:3:9:26:6:3:9:26:6 chr20 42196550 . T G 292.95 PASS AO=63;DP=119;FAO=63;FDP=119;FR=.;FRO=56;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=24;FSRR=32;FWDB=-0.0365908;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.288;QD=9.84707;RBI=0.0514163;REFB=-0.00811333;REVB=-0.0361213;RO=55;SAF=30;SAR=33;SRF=23;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0495109;STB=0.522501;TYPE=snp;VARB=0.00869484;OID=.;OPOS=42196550;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:119:55:56:63:63:33:30:23:32:33:30:24:32 chr20 42199704 . GGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT GGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT,GGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG 79.07 PASS AO=5,2;DP=32;FAO=8,0;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=8,0;FSAR=0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0894614,0.0539784;FXX=0.110988;HRUN=1,1;LEN=4,5;MLLD=85.9676,61.4814;QD=39.5329;RBI=0.0894614,0.0539784;REFB=0,0;REVB=0,0;RO=0;SAF=5,2;SAR=0,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.00420327,0;OID=.,.;OPOS=42199705,42199738;OREF=GTGT,TGTGT;OALT=-,-;OMAPALT=GGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT,GGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:5,2:8:8,0:8:0:8,0:0,0:0:0:4:0:5,2:0,0:0:0 chr20 42225114 . G A 881.25 PASS AO=89;DP=90;FAO=95;FDP=96;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00637648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.933;QD=36.7189;RBI=0.0418258;REFB=-0.00382731;REVB=0.0413368;RO=1;SAF=49;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00957431;STB=0.504949;TYPE=snp;VARB=8.43731e-05;OID=.;OPOS=42225114;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:90:96:1:1:89:95:40:49:1:0:45:50:1:0 chr20 42310509 . T C 536.05 PASS AO=38;DP=54;FAO=56;FDP=56;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=19;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0655138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.294;QD=38.2892;RBI=0.0791405;REFB=0;REVB=0.0443978;RO=0;SAF=5;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000568238;OID=.;OPOS=42310509;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:57:56:0:0:38:56:33:5:0:0:37:19:0:0 chr20 42328639 . T C 1337.09 PASS AO=138;DP=141;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00278411;FXX=0.0136977;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.0907;QD=37.1413;RBI=0.0465851;REFB=-0.0549344;REVB=0.0465018;RO=2;SAF=57;SAR=81;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0115933;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000345791;OID=.;OPOS=42328639;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:141:144:2:0:138:144:81:57:0:2:85:59:0:0 chr20 42694558 . C CCCG 14.8 PASS AO=2;DP=12;FAO=3;FDP=8;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=4;LEN=3;MLLD=201.371;QD=7.40046;RBI=0.0181359;REFB=-0.0257943;REVB=0.0181359;RO=9;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.0645252;OID=.;OPOS=42694559;OREF=-;OALT=CCG;OMAPALT=CCCG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:2:12:3:8:5:0:3:0:5:14:9:0:2:0:9 chr20 42694570 . A G 10.22 PASS AO=2;DP=9;FAO=2;FDP=9;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7412;QD=4.5413;RBI=0.0817396;REFB=0.00409339;REVB=-0.0817396;RO=7;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.027739;OID=.;OPOS=42694570;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:7:7:2:2:2:0:0:7:2:0:0:7 chr20 42694573 . C A 10.22 PASS AO=2;DP=9;FAO=2;FDP=9;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=171.954;QD=4.54133;RBI=0.00431469;REFB=0.0184782;REVB=-0.00431469;RO=7;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0167709;OID=.;OPOS=42694573;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:7:7:2:2:2:0:0:7:2:0:0:7 chr20 42694574 . T C 10.22 PASS AO=2;DP=9;FAO=2;FDP=9;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.418;QD=4.5413;RBI=0.00436258;REFB=0.00339628;REVB=0.00436258;RO=7;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0116272;OID=.;OPOS=42694574;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:7:7:2:2:2:0:0:7:2:0:0:7 chr20 42815190 . G A 101.73 PASS AO=24;DP=52;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=4;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=27;FWDB=-0.00131067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.118;QD=7.82516;RBI=0.0186983;REFB=0.00014774;REVB=0.0186523;RO=28;SAF=4;SAR=20;SRF=1;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.277969;STB=0.652681;TYPE=snp;VARB=-0.000163848;OID=.;OPOS=42815190;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:28:28:24:24:20:4:1:27:20:4:1:27 chr20 42893259 . C G 14.05 PASS AO=3;DP=9;FAO=3;FDP=9;FR=.;FRO=6;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=24.8857;QD=6.24368;RBI=0.0570492;REFB=-0.0532865;REVB=-0.0570492;RO=6;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.103894;OID=.;OPOS=42893259;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:9:9:6:6:3:3:3:0:0:6:3:0:0:6 chr20 43036794 . AC A 451.55 PASS AO=61;DP=84;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.047885;FXX=0.0240935;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.2248;QD=22.299;RBI=0.383109;REFB=-0.0210763;REVB=0.380105;RO=14;SAF=47;SAR=14;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0.490566;SSSB=0.209132;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0151409;OID=.;OPOS=43036795;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:61:83:81:81:0:56:25:0:0:35:14:47:14:4:10 chr20 43059211 . A C 261.04 PASS AO=41;DP=68;FAO=47;FDP=75;FR=.;FRO=28;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.0143325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.226;QD=13.922;RBI=0.0785609;REFB=-0.0326551;REVB=0.0772424;RO=27;SAF=22;SAR=19;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0409883;STB=0.538532;TYPE=snp;VARB=0.0192323;OID=.;OPOS=43059211;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:68:75:27:28:41:47:19:22:16:11:25:22:16:12 chr20 43089819 . G A 193.87 PASS AO=43;DP=84;FAO=43;FDP=84;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=33;FSRF=28;FSRR=13;FWDB=-0.00569162;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7515;QD=9.2318;RBI=0.0134887;REFB=-0.00487976;REVB=0.0122291;RO=41;SAF=10;SAR=33;SRF=28;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.416453;STB=0.731509;TYPE=snp;VARB=0.00646667;OID=.;OPOS=43089819;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:41:41:43:43:33:10:28:13:33:10:28:13 chr20 43118017 . G A 211.1 PASS AO=65;DP=165;FAO=65;FDP=165;FR=.;FRO=100;FSAF=24;FSAR=41;FSRF=57;FSRR=43;FWDB=-0.034811;FXX=0.00602373;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.989;QD=5.11761;RBI=0.0368816;REFB=-0.0263322;REVB=-0.0121837;RO=100;SAF=24;SAR=41;SRF=57;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216671;STB=0.622222;TYPE=snp;VARB=0.0290348;OID=.;OPOS=43118017;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:165:100:100:65:65:41:24:57:43:41:24:57:43 chr20 43123028 . G A 262.63 PASS AO=81;DP=316;FAO=91;FDP=263;FR=.;FRO=172;FSAF=53;FSAR=38;FSRF=65;FSRR=107;FWDB=0.0027628;FXX=0.188266;HRUN=4;LEN=1;MLLD=178.12;QD=3.99429;RBI=0.0174025;REFB=-0.0142277;REVB=-0.0171818;RO=150;SAF=51;SAR=30;SRF=57;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280445;STB=0.631495;TYPE=snp;VARB=0.0408077;OID=.;OPOS=43123028;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:258:263:150:172:81:91:30:51:57:93:38:53:65:107 chr20 43264927 . C T 858.99 PASS AO=91;DP=92;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023589;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.009;QD=36.9459;RBI=0.0421528;REFB=0;REVB=0.0349345;RO=1;SAF=61;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0155365;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000165981;OID=.;OPOS=43264927;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:92:93:1:0:91:93:30:61:0:1:32:61:0:0 chr20 43379370 . A G 10.3 PASS AO=2;DP=8;FAO=2;FDP=8;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.0639597;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.2776;QD=5.1483;RBI=0.0639597;REFB=-0.00510616;REVB=0;RO=6;SAF=2;SAR=0;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00304282;OID=.;OPOS=43379370;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:8:6:6:2:2:0:2:6:0:0:2:6:0 chr20 43530234 . A C 58.73 PASS AO=18;DP=51;FAO=18;FDP=51;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=-0.00145854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.2817;QD=4.60596;RBI=0.0296783;REFB=-0.0340443;REVB=-0.0296424;RO=32;SAF=14;SAR=4;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206182;STB=0.615245;TYPE=snp;VARB=0.045772;OID=.;OPOS=43530234;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:51:51:32:33:18:18:4:14:20:12:4:14:21:12 chr20 43536807 . G A 17.8 PASS AO=15;DP=47;FAO=10;FDP=43;FR=.;FRO=33;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=0.00681444;FXX=0.104145;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.671;QD=1.65596;RBI=0.00926936;REFB=-0.000210557;REVB=0.00628366;RO=30;SAF=7;SAR=8;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11177;STB=0.763709;TYPE=snp;VARB=0.000746049;OID=.;OPOS=43536807;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:47:43:30:33:15:10:8:7:17:13:7:3:22:11 chr20 43629135 . G A 223.22 PASS AO=64;DP=159;FAO=65;FDP=159;FR=.;FRO=94;FSAF=41;FSAR=24;FSRF=55;FSRR=39;FWDB=0.0279162;FXX=0.0124216;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.4055;QD=5.61554;RBI=0.0607055;REFB=-0.0184693;REVB=-0.0539058;RO=85;SAF=40;SAR=24;SRF=55;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.024181;STB=0.528536;TYPE=snp;VARB=0.0341679;OID=.;OPOS=43629135;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:159:85:94:64:65:24:40:55:30:24:41:55:39 chr20 43708297 . T G 2453.7 PASS AO=273;DP=283;FAO=273;FDP=283;FR=.;FRO=10;FSAF=82;FSAR=191;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.00643536;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=237.43;QD=34.6813;RBI=0.0214022;REFB=-0.0551255;REVB=-0.0204118;RO=7;SAF=82;SAR=191;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00724228;STB=0.508336;TYPE=snp;VARB=0.000221729;OID=.;OPOS=43708297;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:283:283:7:10:273:273:191:82:3:4:191:82:5:5 chr20 43723627 . T C 139.87 PASS AO=19;DP=74;FAO=21;FDP=71;FR=.,HEALED;FRO=33;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=25;FWDB=0.0593082;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.8547;QD=7.87995;RBI=0.0598475;REFB=-0.0502979;REVB=-0.00801625;RO=26;SAF=7;SAR=12;SRF=4;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.254072;STB=0.593668;TYPE=snp;VARB=0.048908;OID=.;OPOS=43723627;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:70:71:26:33:19:21:12:7:4:22:13:8:8:25 chr20 43926573 . C T 61.36 PASS AO=17;DP=41;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=0.0816844;FXX=0.0243843;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.8129;QD=6.13567;RBI=0.0924426;REFB=-0.00772717;REVB=-0.0432816;RO=24;SAF=3;SAR=14;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223199;STB=0.62157;TYPE=snp;VARB=0.0151614;OID=.;OPOS=43926573;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:41:40:24:24:17:16:14:3:8:16:13:3:8:16 chr20 43995880 . T G 467.33 PASS AO=91;DP=155;FAO=91;FDP=155;FR=.;FRO=64;FSAF=30;FSAR=61;FSRF=28;FSRR=36;FWDB=0.0136778;FXX=0.00640985;HRUN=3;LEN=1;MLLD=232.381;QD=12.06;RBI=0.038287;REFB=-0.00997641;REVB=-0.0357605;RO=63;SAF=30;SAR=61;SRF=28;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0942255;STB=0.548686;TYPE=snp;VARB=0.00760485;OID=.;OPOS=43995880;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:155:155:63:64:91:91:61:30:28:35:61:30:28:36 chr20 43996012 . G T 179.77 PASS AO=46;DP=104;FAO=46;FDP=102;FR=.;FRO=56;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=29;FSRR=27;FWDB=-0.0154337;FXX=0.0192289;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.7652;QD=7.04998;RBI=0.0372962;REFB=-0.0080613;REVB=0.033953;RO=56;SAF=25;SAR=21;SRF=29;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0252786;STB=0.514133;TYPE=snp;VARB=0.0127913;OID=.;OPOS=43996012;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:102:56:56:46:46:21:25:29:27:21:25:29:27 chr20 43996132 . C T 187.24 PASS AO=46;DP=99;FAO=46;FDP=99;FR=.;FRO=53;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=31;FWDB=0.01451;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=240.429;QD=7.56515;RBI=0.014984;REFB=-0.0183825;REVB=-0.00373894;RO=53;SAF=26;SAR=20;SRF=22;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143604;STB=0.580018;TYPE=snp;VARB=0.0174634;OID=.;OPOS=43996132;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:53:53:46:46:20:26:22:31:20:26:22:31 chr20 43996466 . C T 301.08 PASS AO=68;DP=134;FAO=68;FDP=133;FR=.;FRO=65;FSAF=37;FSAR=31;FSRF=21;FSRR=44;FWDB=0.0106612;FXX=0.00746213;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.27;QD=9.05497;RBI=0.0111336;REFB=0.010783;REVB=-0.00320863;RO=65;SAF=37;SAR=31;SRF=21;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194552;STB=0.606792;TYPE=snp;VARB=-0.0092717;OID=.;OPOS=43996466;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:133:65:65:68:68:31:37:21:44:31:37:21:44 chr20 44004155 . CATT C 104.6 PASS AO=26;DP=98;FAO=32;FDP=83;FR=.;FRO=51;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=42;FWDB=-0.0283138;FXX=0.0879024;HRUN=1;LEN=3;MLLD=233.782;QD=5.04083;RBI=0.0284971;REFB=-0.00100354;REVB=0.00322751;RO=33;SAF=11;SAR=15;SRF=5;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.293361;STB=0.669766;TYPE=del;VARB=0.00171072;OID=.;OPOS=44004156;OREF=ATT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:26:72:32:83:51:14:18:9:42:99:33:11:15:5:28 chr20 44037021 . TG T 221.91 PASS AO=28;DP=44;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.344164;FXX=0.0444346;HRUN=4;LEN=1;MLLD=11.9413;QD=20.6426;RBI=0.379013;REFB=-0.00495501;REVB=-0.158753;RO=8;SAF=13;SAR=15;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116473;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00812007;OID=.;OPOS=44037022;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:28:42:43:43:0:20:23:0:0:18:8:13:15:6:2 chr20 44038600 . C A 11.14 PASS AO=6;DP=30;FAO=6;FDP=31;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=25;FSRR=0;FWDB=-0.00769075;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2849;QD=1.43687;RBI=0.00769075;REFB=-0.0783505;REVB=0;RO=24;SAF=6;SAR=0;SRF=24;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.206155;OID=.;OPOS=44038600;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:30:31:24:25:6:6:0:6:24:0:0:6:25:0 chr20 44052992 . G A 867.7 PASS AO=90;DP=94;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00976748;FXX=0.0421008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.51;QD=38.1408;RBI=0.032522;REFB=0;REVB=0.0310206;RO=0;SAF=40;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.21981e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000100663;OID=.;OPOS=44052992;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:94:91:0:0:90:91:50:40:0:0:50:41:0:0 chr20 44054349 . T C 1193.2 PASS AO=125;DP=125;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.024011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.464;QD=38.1825;RBI=0.0272646;REFB=0;REVB=-0.0129164;RO=0;SAF=54;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.48324e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.68844e-05;OID=.;OPOS=44054349;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:125:125:0:0:125:125:71:54:0:0:71:54:0:0 chr20 44141331 . A G 871.58 PASS AO=106;DP=118;FAO=107;FDP=119;FR=.;FRO=12;FSAF=43;FSAR=64;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=0.0362643;FXX=0.0403193;HRUN=5;LEN=1;MLLD=109.68;QD=29.2966;RBI=0.0471824;REFB=-0.179739;REVB=-0.0301842;RO=11;SAF=42;SAR=64;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0574793;STB=0.524905;TYPE=snp;VARB=0.00264908;OID=.;OPOS=44141331;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:118:119:11:12:106:107:64:42:1:10:64:43:2:10 chr20 44174423 . G A 1985.59 PASS AO=230;DP=246;FAO=231;FDP=246;FR=.;FRO=15;FSAF=84;FSAR=147;FSRF=1;FSRR=14;FWDB=0.0254053;FXX=0.00404842;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.185;QD=32.286;RBI=0.0272268;REFB=-0.0446318;REVB=0.00979133;RO=16;SAF=84;SAR=146;SRF=1;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0408517;STB=0.519772;TYPE=snp;VARB=0.000365908;OID=.;OPOS=44174423;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:246:246:16:15:230:231:146:84:1:15:147:84:1:14 chr20 44184375 . T C 1482.47 PASS AO=157;DP=159;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171532;FXX=0.0124216;HRUN=3;LEN=1;MLLD=80.5145;QD=37.2948;RBI=0.0331071;REFB=-0.0308629;REVB=-0.0283169;RO=2;SAF=82;SAR=75;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00053459;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000216273;OID=.;OPOS=44184375;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:159:159:2:0:157:159:75:82:1:1:75:84:0:0 chr20 44188489 . A C 1070.52 PASS AO=119;DP=123;FAO=119;FDP=123;FR=.;FRO=4;FSAF=62;FSAR=57;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0031484;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.815;QD=34.8135;RBI=0.00606065;REFB=0.0454371;REVB=0.00517871;RO=4;SAF=62;SAR=57;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0296573;STB=0.515622;TYPE=snp;VARB=-0.000360235;OID=.;OPOS=44188489;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:123:123:4:4:119:119:57:62:4:0:57:62:4:0 chr20 44378577 . T C 1141.15 PASS AO=114;DP=114;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0414129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.961;QD=37.4148;RBI=0.0495632;REFB=0;REVB=0.0272302;RO=0;SAF=62;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000693016;OID=.;OPOS=44378577;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:114:122:0:0:114:122:52:62:0:0:54:68:0:0 chr20 44417643 . A G 927.44 PASS AO=94;DP=99;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0989824;FXX=0.019998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.7749;QD=37.8546;RBI=0.0990188;REFB=0;REVB=0.00268458;RO=0;SAF=42;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00786499;OID=.;OPOS=44417643;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:99:98:0:0:94:98:52:42:0:0:52:46:0:0 chr20 44417675 . G C 896.17 PASS AO=94;DP=96;FAO=101;FDP=103;FR=.;FRO=2;FSAF=45;FSAR=56;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0185972;FXX=0.0190458;HRUN=4;LEN=1;MLLD=79.3461;QD=34.8027;RBI=0.0270487;REFB=-0.0925729;REVB=0.0196412;RO=2;SAF=45;SAR=49;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000841791;STB=0.50107;TYPE=snp;VARB=0.00305173;OID=.;OPOS=44417675;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:96:103:2:2:94:101:49:45:1:1:56:45:1:1 chr20 44418564 . A G 1120.96 PASS AO=117;DP=117;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.895;QD=38.3236;RBI=0.0170094;REFB=0;REVB=0.00471776;RO=0;SAF=61;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.44317e-05;OID=.;OPOS=44418564;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:117:117:0:0:117:117:56:61:0:0:56:61:0:0 chr20 44452697 . C A 420.86 PASS AO=50;DP=54;FAO=50;FDP=54;FR=.;FRO=4;FSAF=15;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.052245;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.556;QD=31.1744;RBI=0.0656525;REFB=-0.189103;REVB=0.039758;RO=0;SAF=15;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.87758e-08;STB=0.527016;TYPE=snp;VARB=0.00309232;OID=.;OPOS=44452697;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:54:54:0:4:50:50:35:15:0:0:35:15:0:4 chr20 44463079 . CG C 69.92 PASS AO=12;DP=15;FAO=13;FDP=16;FR=.;FRO=3;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.199302;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=16.084;QD=17.4803;RBI=0.374697;REFB=-0.0293969;REVB=0.317295;RO=4;SAF=5;SAR=7;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0378887;STB=0.55437;TYPE=del;VARB=0.0633594;OID=.;OPOS=44463080;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:12:16:13:16:3:5:8:2:1:5:4:5:7:2:2 chr20 44469290 . G A 107.82 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0120416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.41;QD=35.9384;RBI=0.0413963;REFB=0;REVB=0.0396063;RO=0;SAF=9;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000318697;OID=.;OPOS=44469290;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:3:9:0:0:3:9:0:0 chr20 44470676 . T C 385.29 PASS AO=36;DP=36;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0457932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.055;QD=38.5294;RBI=0.0457989;REFB=0;REVB=0.000720105;RO=0;SAF=21;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000134638;OID=.;OPOS=44470676;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:36:40:0:0:36:40:15:21:0:0:16:24:0:0 chr20 44470923 . C T 276.94 PASS AO=57;DP=103;FAO=57;FDP=103;FR=.;FRO=46;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=20;FSRR=26;FWDB=-0.0194826;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=276.182;QD=10.7549;RBI=0.0205029;REFB=-0.00480475;REVB=-0.00638726;RO=46;SAF=32;SAR=25;SRF=20;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103269;STB=0.556597;TYPE=snp;VARB=0.00434622;OID=.;OPOS=44470923;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:46:46:57:57:25:32:20:26:25:32:20:26 chr20 44472163 . C T 674.77 PASS AO=67;DP=67;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0666506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.608;QD=38.558;RBI=0.0702151;REFB=0;REVB=0.0220875;RO=0;SAF=32;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.62221e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000482015;OID=.;OPOS=44472163;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:67:70:0:0:67:70:35:32:0:0:36:34:0:0 chr20 44501458 . A G 460.28 PASS AO=50;DP=55;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189753;FXX=0.0908926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.434;QD=36.8223;RBI=0.0337655;REFB=-0.0336697;REVB=0.0279293;RO=0;SAF=23;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000522863;OID=.;OPOS=44501458;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:55:50:0:0:50:50:27:23:0:0:27:23:0:0 chr20 44505973 . T C 574.58 PASS AO=60;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0310325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.139;QD=37.6773;RBI=0.0322795;REFB=0;REVB=0.00888533;RO=0;SAF=35;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.89445e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.87396e-05;OID=.;OPOS=44505973;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:60:61:0:0:60:61:25:35:0:0:26:35:0:0 chr20 44506418 . G A 1588.54 PASS AO=167;DP=168;FAO=167;FDP=167;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00804202;FXX=0.00595203;HRUN=3;LEN=1;MLLD=193.075;QD=38.0489;RBI=0.0190459;REFB=-0.081523;REVB=0.0172647;RO=0;SAF=89;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.04195e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.56817e-05;OID=.;OPOS=44506418;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:168:167:0:0:167:167:78:89:0:0:78:89:0:0 chr20 44511627 . C T 678.64 PASS AO=128;DP=215;FAO=132;FDP=223;FR=.;FRO=91;FSAF=36;FSAR=96;FSRF=28;FSRR=63;FWDB=0.00231641;FXX=0.00446409;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.333;QD=12.1729;RBI=0.00729638;REFB=-0.0103368;REVB=0.00691892;RO=85;SAF=37;SAR=91;SRF=27;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0253314;STB=0.517692;TYPE=snp;VARB=0.00627277;OID=.;OPOS=44511627;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:223:85:91:128:132:91:37:27:58:96:36:28:63 chr20 44512638 . G T 331.05 PASS AO=61;DP=100;FAO=62;FDP=101;FR=.;FRO=39;FSAF=27;FSAR=35;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=0.046708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.159;QD=13.111;RBI=0.0469604;REFB=-0.0490415;REVB=0.00486225;RO=39;SAF=26;SAR=35;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117567;STB=0.559623;TYPE=snp;VARB=0.0277783;OID=.;OPOS=44512638;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:101:39:39:61:62:35:26:23:16:35:27:23:16 chr20 44512792 . CTG C 811.4 PASS AO=84;DP=86;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00981848;FXX=0.0229859;HRUN=1;LEN=2;MLLD=256.296;QD=38.1834;RBI=0.0509;REFB=0;REVB=-0.0499441;RO=0;SAF=33;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.09613e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-9.16533e-05;OID=.;OPOS=44512793;OREF=TG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:84:85:85:85:0:35:50:0:0:38:0:33:51:0:0 chr20 44513289 . T C 813.88 PASS AO=86;DP=87;FAO=87;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0383754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7596;QD=36.9946;RBI=0.0931862;REFB=-0.0870708;REVB=0.0849176;RO=0;SAF=36;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504949;TYPE=snp;VARB=0.00204071;OID=.;OPOS=44513289;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:87:88:0:1:86:87:50:36:0:0:50:37:0:1 chr20 44513357 . G A 1376.15 PASS AO=120;DP=148;FAO=142;FDP=146;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=52;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0273836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.065;QD=37.7026;RBI=0.0294208;REFB=0;REVB=0.0107576;RO=0;SAF=49;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.03829e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00223232;OID=.;OPOS=44513357;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:146:146:0:0:120:142:71:49:0:0:90:52:0:0 chr20 44523547 . G A 417.78 PASS AO=44;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0543685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.932;QD=37.1356;RBI=0.0572629;REFB=0;REVB=0.0179753;RO=1;SAF=20;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229092;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000343452;OID=.;OPOS=44523547;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:45:45:1:0:44:45:24:20:1:0:24:21:0:0 chr20 44596207 . C G 1178.2 PASS AO=119;DP=119;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0545187;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.242;QD=38.0066;RBI=0.0581096;REFB=0;REVB=-0.0201104;RO=0;SAF=54;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.18159e-05;OID=.;OPOS=44596207;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:119:124:0:0:119:124:65:54:0:0:69:55:0:0 chr20 44596545 . G A 138.82 PASS AO=20;DP=30;FAO=21;FDP=30;FR=.;FRO=9;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=-0.014848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.674;QD=18.5093;RBI=0.0290473;REFB=0.0137348;REVB=0.0249656;RO=9;SAF=11;SAR=9;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13157;STB=0.564297;TYPE=snp;VARB=-0.00362693;OID=.;OPOS=44596545;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:30:30:9:9:20:21:9:11:7:2:9:12:7:2 chr20 44642406 . G C 459.52 PASS AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0657842;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.5405;QD=38.2929;RBI=0.0665271;REFB=0;REVB=-0.00991383;RO=0;SAF=20;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.56477e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00123124;OID=.;OPOS=44642406;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:48:48:0:0:48:48:28:20:0:0:28:20:0:0 chr20 44642833 . A C 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.106736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=306.872;QD=33.022;RBI=0.11118;REFB=0;REVB=0.0311184;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00158824;OID=.;OPOS=44642833;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:4:2:0:0:4:2:0:0 chr20 44645010 . C T 1223.18 PASS AO=126;DP=130;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023471;FXX=0.0303007;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.228;QD=38.2242;RBI=0.0403268;REFB=0;REVB=0.0327928;RO=0;SAF=54;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000100423;OID=.;OPOS=44645010;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:130:128:0:0:126:128:72:54:0:0:72:56:0:0 chr20 44678348 . G A 758.87 PASS AO=81;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00956229;FXX=0.0574647;HRUN=4;LEN=1;MLLD=154.187;QD=37.0181;RBI=0.0207364;REFB=0;REVB=0.0184;RO=1;SAF=50;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00937721;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000811028;OID=.;OPOS=44678348;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:82:82:1:0:81:82:31:50:1:0:31:51:0:0 chr20 44680412 . C T 576.36 PASS AO=72;DP=91;FAO=72;FDP=82;FR=.;FRO=10;FSAF=47;FSAR=25;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0115574;FXX=0.0988902;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.452;QD=28.1152;RBI=0.0213217;REFB=-0.0406208;REVB=0.0179176;RO=9;SAF=47;SAR=25;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0472917;STB=0.52029;TYPE=snp;VARB=0.00374413;OID=.;OPOS=44680412;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:91:82:9:10:72:72:25:47:4:5:25:47:5:5 chr20 44688665 . G A 2673.46 PASS AO=253;DP=263;FAO=298;FDP=298;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=212;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0457089;FXX=0.0197362;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.667;QD=35.8854;RBI=0.0938251;REFB=-0.0987818;REVB=0.0819381;RO=7;SAF=69;SAR=184;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0370782;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00407917;OID=.;OPOS=44688665;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:263:298:7:0:253:298:184:69:6:1:212:86:0:0 chr20 44688730 . G A 1975.27 PASS AO=208;DP=209;FAO=208;FDP=208;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=167;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00689604;FXX=0.0234731;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.2475;QD=37.9859;RBI=0.0127318;REFB=-0.0200568;REVB=0.0107025;RO=1;SAF=41;SAR=167;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00284423;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000706521;OID=.;OPOS=44688730;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:87:209:208:1:0:208:208:167:41:0:1:167:41:0:0 chr20 44994696 . A G 370.18 PASS AO=103;DP=238;FAO=103;FDP=238;FR=.;FRO=135;FSAF=56;FSAR=47;FSRF=56;FSRR=79;FWDB=-0.00552805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.388;QD=6.22145;RBI=0.0236749;REFB=-0.00902753;REVB=0.0230204;RO=134;SAF=56;SAR=47;SRF=55;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134812;STB=0.572713;TYPE=snp;VARB=0.0127505;OID=.;OPOS=44994696;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:238:238:134:135:103:103:47:56:55:79:47:56:56:79 chr20 44996182 . A G 459.5 PASS AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.119772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.021;QD=38.2914;RBI=0.122634;REFB=0;REVB=0.0263416;RO=0;SAF=13;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.61818e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000445405;OID=.;OPOS=44996182;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:48:48:0:0:48:48:35:13:0:0:35:13:0:0 chr20 44999028 . T C 229.59 PASS AO=51;DP=109;FAO=53;FDP=107;FR=.;FRO=54;FSAF=23;FSAR=30;FSRF=33;FSRR=21;FWDB=-0.0302812;FXX=0.0360328;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.825;QD=8.58264;RBI=0.0307591;REFB=-0.023946;REVB=0.00540097;RO=53;SAF=22;SAR=29;SRF=32;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157772;STB=0.588821;TYPE=snp;VARB=0.0182773;OID=.;OPOS=44999028;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:107:53:54:51:53:29:22:32:21:30:23:33:21 chr20 45085437 . C CTTT 1548.72 PASS AO=144;DP=197;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=113;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00710681;FXX=0.151825;HRUN=0;LEN=3;MLLD=217.936;QD=38.24;RBI=0.0336229;REFB=0;REVB=-0.0328633;RO=6;SAF=108;SAR=36;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00848093;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-5.60665e-05;OID=.;OPOS=45085438;OREF=-;OALT=TTT;OMAPALT=CTTT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:144:197:162:162:0:113:49:0:0:74:6:108:36:5:1 chr20 45131665 . T C 192.56 PASS AO=54;DP=130;FAO=54;FDP=128;FR=.;FRO=74;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=44;FSRR=30;FWDB=-0.0140301;FXX=0.0153834;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.294;QD=6.01735;RBI=0.0150411;REFB=-0.0172786;REVB=0.0054214;RO=73;SAF=28;SAR=26;SRF=43;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0726518;STB=0.54417;TYPE=snp;VARB=0.0265397;OID=.;OPOS=45131665;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:128:73:74:54:54:26:28:43:30:26:28:44:30 chr20 45204266 . G A 635.98 PASS AO=57;DP=72;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0866321;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.5462;QD=35.8296;RBI=0.091741;REFB=0.0282031;REVB=0.0301878;RO=0;SAF=43;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.51351;TYPE=snp;VARB=-0.00116221;OID=.;OPOS=45204266;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:58:71:0:1:57:70:14:43:0:0:18:52:0:1 chr20 45242269 . G C 189.44 PASS AO=52;DP=122;FAO=52;FDP=122;FR=.;FRO=70;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=39;FSRR=31;FWDB=0.0161648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.215;QD=6.21104;RBI=0.0169024;REFB=-0.00851255;REVB=0.0049389;RO=69;SAF=26;SAR=26;SRF=38;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0516058;STB=0.532774;TYPE=snp;VARB=0.00957819;OID=.;OPOS=45242269;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:69:70:52:52:26:26:38:31:26:26:39:31 chr20 45817255 . A C 2799.53 PASS AO=293;DP=296;FAO=293;FDP=293;FR=.;FRO=0;FSAF=175;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00612961;FXX=0.016778;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.7445;QD=38.2188;RBI=0.0530674;REFB=-0.0163901;REVB=0.0527122;RO=1;SAF=175;SAR=118;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00402437;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.09967e-05;OID=.;OPOS=45817255;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:296:293:1:0:293:293:118:175:0:1:118:175:0:0 chr20 45839078 . C T 468.54 PASS AO=43;DP=46;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.155014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.03;QD=36.7482;RBI=0.155181;REFB=0;REVB=0.00719722;RO=0;SAF=24;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.34601e-05;OID=.;OPOS=45839078;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:46:51:0:0:43:51:19:24:0:0:22:29:0:0 chr20 45853037 . A G 58.9 PASS AO=21;DP=65;FAO=21;FDP=65;FR=.;FRO=44;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=29;FWDB=0.0147563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.631;QD=3.6245;RBI=0.0167511;REFB=-0.0126762;REVB=0.00792771;RO=44;SAF=11;SAR=10;SRF=15;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209608;STB=0.62253;TYPE=snp;VARB=0.0233418;OID=.;OPOS=45853037;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:65:65:44:44:21:21:10:11:15:29:10:11:15:29 chr20 46264888 . G C 302.22 PASS AO=61;DP=113;FAO=63;FDP=114;FR=.;FRO=51;FSAF=45;FSAR=18;FSRF=30;FSRR=21;FWDB=0.0332648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.5443;QD=10.6043;RBI=0.0454396;REFB=-0.0328008;REVB=0.0309549;RO=51;SAF=44;SAR=17;SRF=30;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128313;STB=0.565196;TYPE=snp;VARB=0.0475135;OID=.;OPOS=46264888;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:114:51:51:61:63:17:44:30:21:18:45:30:21 chr20 46294864 . A G 37.05 PASS AO=15;DP=56;FAO=15;FDP=54;FR=.;FRO=39;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=-0.00622716;FXX=0.0181785;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.366;QD=2.74427;RBI=0.012018;REFB=-0.0464208;REVB=0.0102788;RO=37;SAF=2;SAR=13;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.550074;STB=0.81667;TYPE=snp;VARB=0.0205356;OID=.;OPOS=46294864;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:56:54:37:39:15:15:13:2:21:16:13:2:20:19 chr20 46365571 . A G 381.28 PASS AO=77;DP=139;FAO=78;FDP=140;FR=.;FRO=62;FSAF=30;FSAR=48;FSRF=34;FSRR=28;FWDB=-0.00212814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.761;QD=10.8938;RBI=0.00922899;REFB=-0.0308651;REVB=-0.00898027;RO=59;SAF=30;SAR=47;SRF=34;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150297;STB=0.573972;TYPE=snp;VARB=0.0216535;OID=.;OPOS=46365571;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:140:59:62:77:78:47:30:34:25:48:30:34:28 chr20 46365636 . C T 260.02 PASS AO=57;DP=111;FAO=58;FDP=113;FR=.;FRO=55;FSAF=20;FSAR=38;FSRF=21;FSRR=34;FWDB=0.044203;FXX=0.0423693;HRUN=4;LEN=1;MLLD=62.5036;QD=9.20422;RBI=0.0663497;REFB=-0.00687668;REVB=-0.0494811;RO=54;SAF=20;SAR=37;SRF=21;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0363359;STB=0.519673;TYPE=snp;VARB=0.00669987;OID=.;OPOS=46365636;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:113:54:55:57:58:37:20:21:33:38:20:21:34 chr20 47241618 . A G 209.11 PASS AO=40;DP=69;FAO=40;FDP=69;FR=.;FRO=29;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=-0.00520386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.028;QD=12.1226;RBI=0.0105673;REFB=0.00141781;REVB=-0.00919718;RO=28;SAF=23;SAR=17;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0526008;STB=0.519752;TYPE=snp;VARB=-0.00138105;OID=.;OPOS=47241618;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:28:29:40:40:17:23:18:10:17:23:18:11 chr20 47253150 . T C 134.45 PASS AO=19;DP=24;FAO=19;FDP=24;FR=.;FRO=5;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0163745;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.764;QD=22.4082;RBI=0.0168914;REFB=-0.00102327;REVB=0.00414667;RO=5;SAF=6;SAR=13;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267318;STB=0.6469;TYPE=snp;VARB=0.00445955;OID=.;OPOS=47253150;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:24:24:5:5:19:19:13:6:5:0:13:6:5:0 chr20 47258763 . C T 323.75 PASS AO=81;DP=172;FAO=80;FDP=170;FR=.;FRO=90;FSAF=40;FSAR=40;FSRF=39;FSRR=51;FWDB=0.0015446;FXX=0.01734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.46;QD=7.61755;RBI=0.0197679;REFB=-0.0143576;REVB=-0.0197074;RO=91;SAF=39;SAR=42;SRF=39;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0507927;STB=0.535285;TYPE=snp;VARB=0.0164203;OID=.;OPOS=47258763;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:170:91:90:81:80:42:39:39:52:40:40:39:51 chr20 47261017 . T C 125.23 PASS AO=32;DP=75;FAO=33;FDP=76;FR=.;FRO=43;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=-0.00690047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.366;QD=6.59116;RBI=0.0138694;REFB=0.00300422;REVB=-0.012031;RO=43;SAF=18;SAR=14;SRF=19;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122052;STB=0.558437;TYPE=snp;VARB=-0.00509972;OID=.;OPOS=47261017;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:76:43:43:32:33:14:18:19:24:15:18:19:24 chr20 47267480 . A G 48.23 PASS AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=0.0404777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2875;QD=7.71748;RBI=0.0446497;REFB=-0.0185171;REVB=-0.0188453;RO=14;SAF=4;SAR=7;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164026;STB=0.594883;TYPE=snp;VARB=0.0241421;OID=.;OPOS=47267480;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:25:25:14:14:11:11:7:4:3:11:7:4:3:11 chr20 47267940 . G A 236.75 PASS AO=39;DP=58;FAO=39;FDP=58;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=29;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=0.00449705;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.8795;QD=16.3279;RBI=0.0184528;REFB=-0.0172114;REVB=-0.0178965;RO=19;SAF=10;SAR=29;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.284963;STB=0.655765;TYPE=snp;VARB=0.00769249;OID=.;OPOS=47267940;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:58:58:19:19:39:39:29:10:13:6:29:10:13:6 chr20 47269233 . C G 168.78 PASS AO=48;DP=117;FAO=48;FDP=116;FR=.;FRO=68;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=28;FSRR=40;FWDB=-0.00997485;FXX=0.00854628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.7291;QD=5.82014;RBI=0.0779444;REFB=-0.0156057;REVB=0.0773035;RO=68;SAF=21;SAR=27;SRF=28;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0273214;STB=0.515378;TYPE=snp;VARB=0.0263505;OID=.;OPOS=47269233;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:116:68:68:48:48:27:21:28:40:27:21:28:40 chr20 47273726 . C T 179.21 PASS AO=40;DP=80;FAO=40;FDP=80;FR=.;FRO=40;FSAF=27;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=0.0176211;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.636;QD=8.96024;RBI=0.0468332;REFB=-0.015812;REVB=-0.0433917;RO=38;SAF=27;SAR=13;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140318;STB=0.593161;TYPE=snp;VARB=0.0197306;OID=.;OPOS=47273726;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:38:40:40:40:13:27:20:18:13:27:20:20 chr20 47626847 . T C 142.85 PASS AO=43;DP=100;FAO=43;FDP=110;FR=.;FRO=67;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=41;FSRR=26;FWDB=-0.0200007;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.992;QD=5.19448;RBI=0.0955176;REFB=-0.0130228;REVB=-0.0934001;RO=57;SAF=23;SAR=20;SRF=41;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191944;STB=0.547455;TYPE=snp;VARB=0.0173885;OID=.;OPOS=47626847;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:110:57:67:43:43:20:23:41:16:20:23:41:26 chr20 47682761 . C T 259.35 PASS AO=74;DP=176;FAO=74;FDP=176;FR=.;FRO=102;FSAF=45;FSAR=29;FSRF=38;FSRR=64;FWDB=0.000610325;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.7434;QD=5.89422;RBI=0.00646687;REFB=-0.00659019;REVB=-0.006438;RO=102;SAF=45;SAR=29;SRF=38;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.241396;STB=0.634825;TYPE=snp;VARB=0.00886203;OID=.;OPOS=47682761;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:176:102:102:74:74:29:45:38:64:29:45:38:64 chr20 47685320 . G C 186.51 PASS AO=55;DP=142;FAO=56;FDP=141;FR=.;FRO=85;FSAF=16;FSAR=40;FSRF=26;FSRR=59;FWDB=0.0231808;FXX=0.013985;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.9765;QD=5.29095;RBI=0.0236216;REFB=-0.014615;REVB=-0.00454236;RO=84;SAF=15;SAR=40;SRF=26;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0482621;STB=0.514701;TYPE=snp;VARB=0.023333;OID=.;OPOS=47685320;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:141:84:85:55:56:40:15:26:58:40:16:26:59 chr20 47841660 . G T 378.66 PASS AO=120;DP=303;FAO=120;FDP=305;FR=.;FRO=185;FSAF=53;FSAR=67;FSRF=70;FSRR=115;FWDB=-0.0151849;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.686;QD=4.96601;RBI=0.0172453;REFB=-0.0122292;REVB=-0.00817432;RO=183;SAF=53;SAR=67;SRF=69;SRR=114;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0713273;STB=0.539268;TYPE=snp;VARB=0.0180985;OID=.;OPOS=47841660;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:303:305:183:185:120:120:67:53:69:114:67:53:70:115 chr20 47850182 . C T 1261.07 PASS AO=129;DP=130;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0927459;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.1851;QD=37.9269;RBI=0.0955789;REFB=0;REVB=-0.0230983;RO=1;SAF=58;SAR=71;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00812329;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000371418;OID=.;OPOS=47850182;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:130:133:1:0:129:133:71:58:1:0:71:62:0:0 chr20 47855655 . G T 214.02 PASS AO=51;DP=106;FAO=51;FDP=106;FR=.;FRO=55;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=25;FSRR=30;FWDB=0.000100283;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.566;QD=8.07622;RBI=0.00832305;REFB=-0.00948145;REVB=0.00832244;RO=52;SAF=24;SAR=27;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00930625;STB=0.508358;TYPE=snp;VARB=0.0101491;OID=.;OPOS=47855655;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:106:52:55:51:51:27:24:25:27:27:24:25:30 chr20 47859217 . G A 113.43 PASS AO=49;DP=157;FAO=49;FDP=161;FR=.;FRO=112;FSAF=37;FSAR=12;FSRF=86;FSRR=26;FWDB=0.00524301;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=160.368;QD=2.81819;RBI=0.055509;REFB=0.0020319;REVB=-0.0552608;RO=107;SAF=37;SAR=12;SRF=86;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0820328;STB=0.512139;TYPE=snp;VARB=-0.00423658;OID=.;OPOS=47859217;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:161:107:112:49:49:12:37:86:21:12:37:86:26 chr20 47862450 . T C 827.5 PASS AO=91;DP=96;FAO=93;FDP=97;FR=.;FRO=4;FSAF=39;FSAR=54;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.00637957;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.136;QD=34.1237;RBI=0.00788561;REFB=-0.123769;REVB=0.00463507;RO=4;SAF=37;SAR=54;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00770306;STB=0.50341;TYPE=snp;VARB=0.00103607;OID=.;OPOS=47862450;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:96:97:4:4:91:93:54:37:2:2:54:39:2:2 chr20 47863282 . G C 383.89 PASS AO=122;DP=314;FAO=122;FDP=311;FR=.;FRO=189;FSAF=67;FSAR=55;FSRF=95;FSRR=94;FWDB=0.0186502;FXX=0.00955384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.782;QD=4.93749;RBI=0.027134;REFB=-0.00402646;REVB=0.0197085;RO=188;SAF=67;SAR=55;SRF=94;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0533435;STB=0.528392;TYPE=snp;VARB=0.00536021;OID=.;OPOS=47863282;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:314:311:188:189:122:122:55:67:94:94:55:67:95:94 chr20 47865372 . G A 1441.58 PASS AO=148;DP=151;FAO=151;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=122;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0264669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.046;QD=38.1874;RBI=0.0328263;REFB=0;REVB=0.0194182;RO=0;SAF=29;SAR=119;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.05433e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.83777e-05;OID=.;OPOS=47865372;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:151:151:0:0:148:151:119:29:0:0:122:29:0:0 chr20 47865509 . G A 668.98 PASS AO=72;DP=77;FAO=75;FDP=79;FR=.;FRO=4;FSAF=25;FSAR=50;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.00383737;FXX=0.0124984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.597;QD=33.8726;RBI=0.0172413;REFB=-0.0455177;REVB=0.0168088;RO=3;SAF=25;SAR=47;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0263892;STB=0.523358;TYPE=snp;VARB=0.000660853;OID=.;OPOS=47865509;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:77:79:3:4:72:75:47:25:2:1:50:25:3:1 chr20 47865784 . C T 719.1 PASS AO=159;DP=301;FAO=159;FDP=301;FR=.;FRO=142;FSAF=64;FSAR=95;FSRF=61;FSRR=81;FWDB=-0.00820518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.942;QD=9.55609;RBI=0.0172107;REFB=0.00501115;REVB=-0.0151289;RO=142;SAF=64;SAR=95;SRF=61;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0241893;STB=0.513201;TYPE=snp;VARB=-0.00485014;OID=.;OPOS=47865784;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:301:301:142:142:159:159:95:64:61:81:95:64:61:81 chr20 47872377 . C G 1249.81 PASS AO=129;DP=131;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.344;QD=38.1621;RBI=0.0272146;REFB=0;REVB=-0.0223509;RO=0;SAF=72;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.81688e-05;OID=.;OPOS=47872377;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:131:131:0:0:129:131:57:72:0:0:57:74:0:0 chr20 47874005 . A G 157.83 PASS AO=31;DP=68;FAO=49;FDP=128;FR=.;FRO=79;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=37;FSRR=42;FWDB=-0.0219979;FXX=0.00775134;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.746;QD=4.93205;RBI=0.0309659;REFB=-0.0102222;REVB=0.0217941;RO=37;SAF=16;SAR=15;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0762307;STB=0.513241;TYPE=snp;VARB=0.0216771;OID=.;OPOS=47874005;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:128:37:79:31:49:15:16:22:15:25:24:37:42 chr20 47886684 . G A 1968.38 PASS AO=205;DP=207;FAO=205;FDP=205;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=125;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0422006;FXX=0.00966137;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.958;QD=38.4073;RBI=0.0422006;REFB=0;REVB=5.30795e-05;RO=0;SAF=80;SAR=125;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.23399e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000103535;OID=.;OPOS=47886684;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:207:205:0:0:205:205:125:80:0:0:125:80:0:0 chr20 48120777 . G A 175.9 PASS AO=44;DP=97;FAO=44;FDP=96;FR=.;FRO=52;FSAF=11;FSAR=33;FSRF=13;FSRR=39;FWDB=-0.0628618;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.5095;QD=7.32925;RBI=0.0629858;REFB=-0.0118183;REVB=-0.00395094;RO=44;SAF=11;SAR=33;SRF=11;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0121903;OID=.;OPOS=48120777;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:96:44:52:44:44:33:11:11:33:33:11:13:39 chr20 48122140 . G A 543.76 PASS AO=95;DP=143;FAO=95;FDP=146;FR=.;FRO=51;FSAF=12;FSAR=83;FSRF=8;FSRR=43;FWDB=0.000534189;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.684;QD=14.8974;RBI=0.0123882;REFB=-0.0038843;REVB=-0.0123766;RO=48;SAF=12;SAR=83;SRF=8;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0543139;STB=0.523324;TYPE=snp;VARB=0.00217486;OID=.;OPOS=48122140;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:146:48:51:95:95:83:12:8:40:83:12:8:43 chr20 48129706 . G T 277.08 PASS AO=50;DP=83;FAO=51;FDP=82;FR=.;FRO=31;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=21;FSRR=10;FWDB=-0.00507943;FXX=0.0238067;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.07;QD=13.5163;RBI=0.0444256;REFB=-0.00860513;REVB=0.0441343;RO=30;SAF=17;SAR=33;SRF=21;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251709;STB=0.624405;TYPE=snp;VARB=0.0104124;OID=.;OPOS=48129706;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:82:30:31:50:51:33:17:21:9:33:18:21:10 chr20 48257149 . C T 926.82 PASS AO=98;DP=99;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0583209;FXX=0.0101;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6377;QD=37.8295;RBI=0.0586716;REFB=0.0223143;REVB=-0.00640551;RO=1;SAF=42;SAR=56;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00839512;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00079085;OID=.;OPOS=48257149;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:99:98:1:0:98:98:56:42:0:1:56:42:0:0 chr20 48411429 . A T 68.19 PASS AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00500979;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=47.8601;QD=30.3077;RBI=0.0895116;REFB=0.0459914;REVB=0.0893712;RO=1;SAF=4;SAR=4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0978599;STB=0.555418;TYPE=snp;VARB=-0.00179657;OID=.;OPOS=48411429;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:9:9:1:1:8:8:4:4:1:0:4:4:1:0 chr20 48491258 . T G 1010 PASS AO=108;DP=110;FAO=108;FDP=110;FR=.;FRO=2;FSAF=45;FSAR=63;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.000713408;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=219.607;QD=36.7273;RBI=0.0265066;REFB=-0.0291878;REVB=0.026497;RO=2;SAF=45;SAR=63;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00295606;STB=0.501557;TYPE=snp;VARB=0.000138811;OID=.;OPOS=48491258;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:110:110:2:2:108:108:63:45:1:1:63:45:1:1 chr20 48522585 . G A 304.43 PASS AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0523479;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.737;QD=34.792;RBI=0.0552206;REFB=-0.0204681;REVB=0.0175787;RO=1;SAF=21;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0346006;STB=0.518508;TYPE=snp;VARB=0.00138561;OID=.;OPOS=48522585;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:35:35:1:1:34:34:13:21:0:1:13:21:0:1 chr20 48524827 . A G 483.94 PASS AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00235784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.935;QD=35.8473;RBI=0.00299549;REFB=-0.0493551;REVB=0.00184758;RO=1;SAF=24;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192259;STB=0.5102;TYPE=snp;VARB=0.00486795;OID=.;OPOS=48524827;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:54:54:1:1:53:53:29:24:1:0:29:24:1:0 chr20 48569026 . C T 208.56 PASS AO=36;DP=62;FAO=39;FDP=65;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=27;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0196113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.813;QD=12.8341;RBI=0.022902;REFB=-0.0200515;REVB=0.0118279;RO=23;SAF=12;SAR=24;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0786426;STB=0.568385;TYPE=snp;VARB=0.0118803;OID=.;OPOS=48569026;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:62:65:23:26:36:39:24:12:10:13:27:12:12:14 chr20 48569240 . TG T 1995.07 PASS AO=242;DP=275;FAO=258;FDP=258;FR=.;FRO=0;FSAF=131;FSAR=127;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.045353;FXX=0.054943;HRUN=2;LEN=1;MLLD=25.1831;QD=30.9312;RBI=0.05072;REFB=0;REVB=-0.0227075;RO=18;SAF=124;SAR=118;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0349786;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.000466743;OID=.;OPOS=48569241;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:242:273:258:258:0:131:127:0:0:99:18:124:118:14:4 chr20 48569278 . T C 2644.02 PASS AO=284;DP=290;FAO=285;FDP=290;FR=.;FRO=5;FSAF=172;FSAR=113;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.00576155;FXX=0.00343631;HRUN=3;LEN=1;MLLD=117.676;QD=36.4692;RBI=0.0203049;REFB=-0.122422;REVB=0.0194703;RO=5;SAF=171;SAR=113;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00694518;STB=0.50366;TYPE=snp;VARB=0.000397432;OID=.;OPOS=48569278;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:87:290:290:5:5:284:285:113:171:2:3:113:172:2:3 chr20 48713049 . G A 547.75 PASS AO=61;DP=65;FAO=61;FDP=63;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0101369;FXX=0.0307645;HRUN=5;LEN=1;MLLD=217.31;QD=34.7778;RBI=0.0101429;REFB=-0.056151;REVB=0.000350596;RO=1;SAF=38;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200789;STB=0.504145;TYPE=snp;VARB=0.000136712;OID=.;OPOS=48713049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:65:63:1:2:61:61:23:38:0:1:23:38:1:1 chr20 48746189 . C T 259.33 PASS AO=56;DP=115;FAO=59;FDP=117;FR=.;FRO=58;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=17;FSRR=41;FWDB=0.0710396;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.932;QD=8.86602;RBI=0.0712406;REFB=-0.0214767;REVB=0.00534678;RO=57;SAF=24;SAR=32;SRF=17;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124147;STB=0.567644;TYPE=snp;VARB=0.0255961;OID=.;OPOS=48746189;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:117:57:58:56:59:32:24:17:40:34:25:17:41 chr20 49196284 . C T 208.93 PASS AO=41;DP=71;FAO=41;FDP=72;FR=.;FRO=31;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=4;FSRR=27;FWDB=0.0197371;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=190.033;QD=11.607;RBI=0.0243133;REFB=-0.0025631;REVB=0.0141979;RO=28;SAF=21;SAR=20;SRF=3;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.300312;STB=0.663681;TYPE=snp;VARB=0.00257054;OID=.;OPOS=49196284;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:72:28:31:41:41:20:21:3:25:20:21:4:27 chr20 49197873 . C T 263.19 PASS AO=51;DP=129;FAO=63;FDP=131;FR=.;FRO=68;FSAF=13;FSAR=50;FSRF=20;FSRR=48;FWDB=0.000417127;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=190.964;QD=8.03632;RBI=0.00664595;REFB=-0.00250021;REVB=-0.00663284;RO=39;SAF=12;SAR=39;SRF=12;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0757689;STB=0.564274;TYPE=snp;VARB=0.00192737;OID=.;OPOS=49197873;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:131:39:68:51:63:39:12:12:27:50:13:20:48 chr20 49214156 . A G 468.31 PASS AO=43;DP=44;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0620574;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.87;QD=38.229;RBI=0.0755642;REFB=0;REVB=-0.0431141;RO=0;SAF=14;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.13233e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.55211e-05;OID=.;OPOS=49214156;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:44:49:0:0:43:49:29:14:0:0:30:19:0:0 chr20 49307687 . G A 22.51 PASS AO=5;DP=14;FAO=5;FDP=14;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.0280854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.648;QD=6.4317;RBI=0.028152;REFB=-0.0125244;REVB=0.00193603;RO=9;SAF=2;SAR=3;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.371228;STB=0.72893;TYPE=snp;VARB=0.0145919;OID=.;OPOS=49307687;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:14:14:9:9:5:5:3:2:7:2:3:2:7:2 chr20 49367076 . T G 460.4 PASS AO=146;DP=373;FAO=147;FDP=374;FR=.;FRO=227;FSAF=61;FSAR=86;FSRF=101;FSRR=126;FWDB=0.0092666;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=110.443;QD=4.92409;RBI=0.0116212;REFB=-0.0096212;REVB=0.00701307;RO=227;SAF=61;SAR=85;SRF=101;SRR=126;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0300677;STB=0.51861;TYPE=snp;VARB=0.0187829;OID=.;OPOS=49367076;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:373:374:227:227:146:147:85:61:101:126:86:61:101:126 chr20 49367435 . T G 358.84 PASS AO=65;DP=116;FAO=71;FDP=122;FR=.;FRO=51;FSAF=32;FSAR=39;FSRF=27;FSRR=24;FWDB=0.00410531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.317;QD=11.7654;RBI=0.0288737;REFB=-0.00760343;REVB=0.0285804;RO=50;SAF=29;SAR=36;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0748629;STB=0.533;TYPE=snp;VARB=0.00638446;OID=.;OPOS=49367435;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:122:50:51:65:71:36:29:27:23:39:32:27:24 chr20 49369006 . A G 3175.64 PASS AO=339;DP=347;FAO=340;FDP=340;FR=.;FRO=0;FSAF=141;FSAR=199;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00100444;FXX=0.0201723;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.7711;QD=37.3604;RBI=0.0377992;REFB=-0.168857;REVB=0.0377859;RO=4;SAF=141;SAR=198;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00380141;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000827486;OID=.;OPOS=49369006;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:347:340:4:0:339:340:198:141:1:3:199:141:0:0 chr20 49369074 . AGT A 680.27 PASS AO=145;DP=303;FAO=153;FDP=291;FR=.;FRO=138;FSAF=63;FSAR=90;FSRF=51;FSRR=87;FWDB=-0.0119777;FXX=0.0202013;HRUN=1;LEN=2;MLLD=117.952;QD=9.35076;RBI=0.021293;REFB=-0.0228144;REVB=-0.0176047;RO=133;SAF=61;SAR=84;SRF=51;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0336552;STB=0.520804;TYPE=del;VARB=0.018596;OID=.;OPOS=49369075;OREF=GT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:145:294:153:291:138:63:90:51:87:99:133:61:84:51:82 chr20 49620783 . G T 747.9 PASS AO=78;DP=79;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=53;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0725241;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.275;QD=37.3948;RBI=0.076597;REFB=-0.0989723;REVB=0.0246447;RO=0;SAF=26;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509432;TYPE=snp;VARB=0.000667828;OID=.;OPOS=49620783;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:79:80:0:1:78:79:52:26:0:0:53:26:1:0 chr20 50092027 . T G 271.57 PASS AO=79;DP=201;FAO=83;FDP=206;FR=.;FRO=123;FSAF=41;FSAR=42;FSRF=62;FSRR=61;FWDB=0.0077564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.107;QD=5.27321;RBI=0.00844793;REFB=-0.00502547;REVB=-0.00334751;RO=122;SAF=41;SAR=38;SRF=62;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116437;STB=0.506023;TYPE=snp;VARB=0.00657941;OID=.;OPOS=50092027;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:206:122:123:79:83:38:41:62:60:42:41:62:61 chr20 50133431 . G A 124.68 PASS AO=27;DP=53;FAO=27;FDP=53;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=0.000165312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.526;QD=9.40976;RBI=0.0194424;REFB=0.0113854;REVB=0.0194417;RO=26;SAF=14;SAR=13;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0854773;STB=0.547718;TYPE=snp;VARB=-0.00785165;OID=.;OPOS=50133431;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:53:26:26:27:27:13:14:16:10:13:14:16:10 chr20 50140627 . G C 75.34 PASS AO=19;DP=49;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=7;FWDB=-0.0478144;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.033;QD=6.15042;RBI=0.0485335;REFB=0.00649469;REVB=0.00832362;RO=29;SAF=11;SAR=8;SRF=22;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201866;STB=0.601676;TYPE=snp;VARB=-0.00678892;OID=.;OPOS=50140627;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:49:49:29:29:19:20:8:11:22:7:8:12:22:7 chr20 50158973 . GC G 54.32 PASS AO=19;DP=47;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.367605;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.5325;QD=5.17359;RBI=0.368939;REFB=-0.0765185;REVB=0.0313376;RO=21;SAF=2;SAR=17;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.487119;STB=0.728716;TYPE=del;VARB=0.158674;OID=.;OPOS=50158974;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:19:41:21:42:21:3:18:10:11:35:21:2:17:10:11 chr20 50217620 . A G 1472.18 PASS AO=155;DP=157;FAO=156;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165095;FXX=0.00636902;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.5942;QD=37.7482;RBI=0.0580187;REFB=-0.0545458;REVB=0.0556202;RO=0;SAF=68;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000469804;OID=.;OPOS=50217620;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:157:156:0:0:155:156:87:68:0:0:88:68:0:0 chr20 50287736 . C T 327.99 PASS AO=84;DP=191;FAO=89;FDP=196;FR=.;FRO=107;FSAF=51;FSAR=38;FSRF=51;FSRR=56;FWDB=0.0099549;FXX=0.0150746;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.46;QD=6.69363;RBI=0.0924336;REFB=0.00470659;REVB=0.091896;RO=106;SAF=49;SAR=35;SRF=51;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103342;STB=0.552929;TYPE=snp;VARB=-0.00571861;OID=.;OPOS=50287736;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:191:196:106:107:84:89:35:49:51:55:38:51:51:56 chr20 50287790 . A G 317.73 PASS AO=87;DP=201;FAO=87;FDP=200;FR=.;FRO=113;FSAF=50;FSAR=37;FSRF=47;FSRR=66;FWDB=-0.0428438;FXX=0.00497488;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9366;QD=6.35466;RBI=0.0439165;REFB=-0.00996182;REVB=0.00964734;RO=113;SAF=50;SAR=37;SRF=47;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160447;STB=0.589292;TYPE=snp;VARB=0.0111105;OID=.;OPOS=50287790;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:200:113:113:87:87:37:50:47:66:37:50:47:66 chr20 50400679 . A T 235.2 PASS AO=62;DP=139;FAO=62;FDP=140;FR=.;FRO=78;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=36;FSRR=42;FWDB=-0.0208793;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.819;QD=6.71995;RBI=0.0216635;REFB=-0.00802934;REVB=0.00577618;RO=77;SAF=28;SAR=34;SRF=36;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159372;STB=0.505574;TYPE=snp;VARB=0.00980719;OID=.;OPOS=50400679;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:140:77:78:62:62:34:28:36:41:34:28:36:42 chr20 50407162 . T C 808.54 PASS AO=84;DP=84;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0477187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.338;QD=38.0489;RBI=0.0498421;REFB=0;REVB=-0.0143931;RO=0;SAF=54;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00016445;OID=.;OPOS=50407162;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:84:85:0:0:84:85:30:54:0:0:30:55:0:0 chr20 50407502 . A C 739.49 PASS AO=69;DP=70;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172527;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.184;QD=38.4152;RBI=0.0252692;REFB=0;REVB=-0.0184628;RO=0;SAF=37;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.24449e-05;OID=.;OPOS=50407502;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:70:77:0:0:69:77:32:37:0:0:32:45:0:0 chr20 50408482 . A G 437.99 PASS AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0119296;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.806;QD=38.0865;RBI=0.0158633;REFB=0;REVB=-0.0104561;RO=0;SAF=37;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.83101e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000147991;OID=.;OPOS=50408482;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:47:46:0:0:46:46:9:37:0:0:9:37:0:0 chr20 51218359 . C T 566.38 PASS AO=134;DP=270;FAO=134;FDP=270;FR=.;FRO=136;FSAF=55;FSAR=79;FSRF=57;FSRR=79;FWDB=-0.0056774;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=223.305;QD=8.39081;RBI=0.0100798;REFB=-0.0026959;REVB=0.00832883;RO=136;SAF=55;SAR=79;SRF=57;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00820593;STB=0.504504;TYPE=snp;VARB=0.0025915;OID=.;OPOS=51218359;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:270:270:136:136:134:134:79:55:57:79:79:55:57:79 chr20 51870849 . T C 389.59 PASS AO=119;DP=298;FAO=120;FDP=298;FR=.;FRO=178;FSAF=40;FSAR=80;FSRF=81;FSRR=97;FWDB=0.017818;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=93.2681;QD=5.22941;RBI=0.0201843;REFB=0.000222262;REVB=-0.00948278;RO=177;SAF=39;SAR=80;SRF=81;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147882;STB=0.577552;TYPE=snp;VARB=-0.000853127;OID=.;OPOS=51870849;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:298:298:177:178:119:120:80:39:81:96:80:40:81:97 chr20 51872286 . GC G 518 PASS AO=60;DP=86;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0567402;FXX=0.0246883;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.3236;QD=26.2276;RBI=0.259773;REFB=0;REVB=0.2535;RO=13;SAF=25;SAR=35;SRF=2;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0.539233;SSSB=0.0917083;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00417999;OID=.;OPOS=51872287;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:60:79:79:79:0:33:46:0:0:49:13:25:35:2:11 chr20 52105972 . C T 202.2 PASS AO=64;DP=166;FAO=64;FDP=166;FR=.;FRO=102;FSAF=34;FSAR=30;FSRF=61;FSRR=41;FWDB=0.00278153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.0286;QD=4.87237;RBI=0.0179233;REFB=0.00531187;REVB=0.0177062;RO=101;SAF=34;SAR=30;SRF=60;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0687337;STB=0.541401;TYPE=snp;VARB=-0.0128058;OID=.;OPOS=52105972;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:166:101:102:64:64:30:34:60:41:30:34:61:41 chr20 52184384 . T A 319.96 PASS AO=55;DP=102;FAO=82;FDP=129;FR=.;FRO=47;FSAF=28;FSAR=54;FSRF=31;FSRR=16;FWDB=0.0175535;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=20.15;QD=9.92119;RBI=0.0236696;REFB=-0.163533;REVB=0.0158784;RO=47;SAF=20;SAR=35;SRF=28;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19757;STB=0.619092;TYPE=snp;VARB=0.0432024;OID=.;OPOS=52184384;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:102:129:47:47:55:82:35:20:28:19:54:28:31:16 chr20 52645166 . A G 1201.06 PASS AO=115;DP=117;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.8593;QD=38.1289;RBI=0.0959351;REFB=0;REVB=-0.0953541;RO=0;SAF=54;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18616e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000255699;OID=.;OPOS=52645166;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:117:126:0:0:115:126:61:54:0:0:63:63:0:0 chr20 52674615 . A G 1046.01 PASS AO=89;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=66;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0533752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.399;QD=38.3858;RBI=0.0562649;REFB=0;REVB=0.0177995;RO=0;SAF=64;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00128891;OID=.;OPOS=52674615;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:109:109:0:0:89:109:25:64:0:0:43:66:0:0 chr20 52675188 . G T 741.53 PASS AO=77;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0221655;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6886;QD=38.0274;RBI=0.0241993;REFB=0;REVB=0.00971073;RO=0;SAF=35;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.24925e-05;OID=.;OPOS=52675188;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:78:78:0:0:77:78:42:35:0:0:42:36:0:0 chr20 52771261 . G A 126.2 PASS AO=40;DP=108;FAO=40;FDP=107;FR=.;FRO=67;FSAF=11;FSAR=29;FSRF=24;FSRR=43;FWDB=-0.109345;FXX=0.0183469;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.3598;QD=4.71784;RBI=0.114579;REFB=0.00722775;REVB=-0.0342318;RO=64;SAF=11;SAR=29;SRF=22;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.088549;STB=0.561672;TYPE=snp;VARB=-0.0151588;OID=.;OPOS=52771261;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:107:64:67:40:40:29:11:22:42:29:11:24:43 chr20 52786219 . G A 228.5 PASS AO=66;DP=159;FAO=66;FDP=160;FR=.;FRO=94;FSAF=26;FSAR=40;FSRF=36;FSRR=58;FWDB=-0.00185654;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.15;QD=5.71239;RBI=0.00351278;REFB=-0.00639124;REVB=0.0029821;RO=93;SAF=26;SAR=40;SRF=35;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0193102;STB=0.50676;TYPE=snp;VARB=0.0123709;OID=.;OPOS=52786219;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:160:93:94:66:66:40:26:35:58:40:26:36:58 chr20 53205120 . T A 488.63 PASS AO=101;DP=181;FAO=101;FDP=181;FR=.;FRO=80;FSAF=73;FSAR=28;FSRF=56;FSRR=24;FWDB=0.00453456;FXX=0.0054942;HRUN=4;LEN=1;MLLD=91.1842;QD=10.7985;RBI=0.0151436;REFB=-0.0249481;REVB=-0.0144488;RO=79;SAF=73;SAR=28;SRF=55;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0263498;STB=0.512417;TYPE=snp;VARB=0.0211746;OID=.;OPOS=53205120;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:181:79:80:101:101:28:73:55:24:28:73:56:24 chr20 54935242 . A T 167.66 PASS AO=36;DP=67;FAO=35;FDP=66;FR=.;FRO=31;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.0474515;FXX=0.0294074;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.895;QD=10.1612;RBI=0.0485915;REFB=0.00733305;REVB=-0.0104639;RO=28;SAF=24;SAR=12;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140629;STB=0.616445;TYPE=snp;VARB=-0.00863089;OID=.;OPOS=54935242;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:66:28:31:36:35:12:24:14:14:11:24:14:17 chr20 54941124 . T C 230.29 PASS AO=46;DP=143;FAO=70;FDP=166;FR=.;FRO=96;FSAF=27;FSAR=43;FSRF=49;FSRR=47;FWDB=0.0777282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.274;QD=5.54913;RBI=0.0781267;REFB=-0.00262422;REVB=0.00788067;RO=93;SAF=6;SAR=40;SRF=47;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.516775;STB=0.573513;TYPE=snp;VARB=0.00372555;OID=.;OPOS=54941124;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:166:93:96:46:70:40:6:47:46:43:27:49:47 chr20 54941140 . C T 480.92 PASS AO=111;DP=217;FAO=111;FDP=220;FR=.;FRO=109;FSAF=43;FSAR=68;FSRF=47;FSRR=62;FWDB=0.0522663;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.46;QD=8.74393;RBI=0.0660527;REFB=-0.0063885;REVB=-0.040388;RO=106;SAF=43;SAR=68;SRF=47;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0518635;STB=0.522626;TYPE=snp;VARB=0.00559594;OID=.;OPOS=54941140;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:217:220:106:109:111:111:68:43:47:59:68:43:47:62 chr20 54944791 . C G 252 PASS AO=60;DP=116;FAO=58;FDP=116;FR=.;FRO=58;FSAF=41;FSAR=17;FSRF=37;FSRR=21;FWDB=0.0121733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.426;QD=8.68949;RBI=0.0134955;REFB=-0.0087176;REVB=0.00582588;RO=56;SAF=43;SAR=17;SRF=35;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0941597;STB=0.540208;TYPE=snp;VARB=0.00906066;OID=.;OPOS=54944791;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:116:56:58:60:58:17:43:35:21:17:41:37:21 chr20 54961463 . T C 1815.94 PASS AO=189;DP=191;FAO=192;FDP=192;FR=.;FRO=0;FSAF=113;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00869873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.9374;QD=37.8321;RBI=0.0386648;REFB=0;REVB=0.0376736;RO=0;SAF=112;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000347928;OID=.;OPOS=54961463;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:191:192:0:0:189:192:77:112:0:0:79:113:0:0 chr20 54961541 . A T 291.03 PASS AO=62;DP=112;FAO=61;FDP=112;FR=.;FRO=51;FSAF=43;FSAR=18;FSRF=43;FSRR=8;FWDB=-0.074791;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.8352;QD=10.394;RBI=0.0825553;REFB=-0.0178685;REVB=0.0349527;RO=50;SAF=44;SAR=18;SRF=42;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13799;STB=0.580621;TYPE=snp;VARB=0.0140505;OID=.;OPOS=54961541;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:50:51:62:61:18:44:42:8:18:43:43:8 chr20 55012318 . G A 299.52 PASS AO=66;DP=128;FAO=66;FDP=127;FR=.;FRO=61;FSAF=39;FSAR=27;FSRF=40;FSRR=21;FWDB=0.00689391;FXX=0.0155027;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.7232;QD=9.43354;RBI=0.0251306;REFB=-0.00692841;REVB=0.0241665;RO=59;SAF=39;SAR=27;SRF=38;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.047749;STB=0.532575;TYPE=snp;VARB=0.00594979;OID=.;OPOS=55012318;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:128:127:59:61:66:66:27:39:38:21:27:39:40:21 chr20 55070268 . A T 197.34 PASS AO=47;DP=98;FAO=47;FDP=98;FR=.;FRO=51;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=0.0286003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.972;QD=8.05457;RBI=0.0348953;REFB=-0.0202753;REVB=-0.0199925;RO=51;SAF=21;SAR=26;SRF=24;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.022447;STB=0.512478;TYPE=snp;VARB=0.0244697;OID=.;OPOS=55070268;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:51:51:47:47:26:21:24:27:26:21:24:27 chr20 55072472 . A G 18.01 PASS AO=8;DP=53;FAO=15;FDP=60;FR=.;FRO=45;FSAF=1;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=39;FWDB=0.0373676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.32;QD=1.20077;RBI=0.0383884;REFB=-0.0194806;REVB=0.00879357;RO=35;SAF=2;SAR=6;SRF=2;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.442855;STB=0.648762;TYPE=snp;VARB=0.0866278;OID=.;OPOS=55072472;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:53:60:35:45:8:15:6:2:2:33:14:1:6:39 chr20 55088404 . A G 260.37 PASS AO=50;DP=86;FAO=50;FDP=85;FR=.;FRO=35;FSAF=40;FSAR=10;FSRF=30;FSRR=5;FWDB=0.0049364;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.82;QD=12.2527;RBI=0.0162857;REFB=-0.029485;REVB=-0.0155195;RO=35;SAF=40;SAR=10;SRF=30;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0706491;STB=0.538447;TYPE=snp;VARB=0.0260656;OID=.;OPOS=55088404;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:85:35:35:50:50:10:40:30:5:10:40:30:5 chr20 55108617 . C A 48.9 PASS AO=33;DP=145;FAO=33;FDP=145;FR=.;FRO=112;FSAF=7;FSAR=26;FSRF=62;FSRR=50;FWDB=-0.0154412;FXX=0.00684885;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.948;QD=1.34885;RBI=0.0221252;REFB=-0.0140339;REVB=0.015846;RO=111;SAF=7;SAR=26;SRF=62;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.445558;STB=0.771113;TYPE=snp;VARB=0.039277;OID=.;OPOS=55108617;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:145:145:111:112:33:33:26:7:62:49:26:7:62:50 chr20 55111371 . G A 616.89 PASS AO=122;DP=217;FAO=125;FDP=220;FR=.;FRO=95;FSAF=55;FSAR=70;FSRF=33;FSRR=62;FWDB=0.00999302;FXX=0.00452468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.613;QD=11.2162;RBI=0.0150609;REFB=-0.0262184;REVB=0.0112681;RO=92;SAF=54;SAR=68;SRF=30;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0947252;STB=0.540977;TYPE=snp;VARB=0.0195105;OID=.;OPOS=55111371;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:217:220:92:95:122:125:68:54:30:62:70:55:33:62 chr20 55263544 . AGT A 467.19 PASS AO=47;DP=52;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0165854;FXX=0.0384541;HRUN=1;LEN=2;MLLD=295.504;QD=37.3754;RBI=0.0386294;REFB=0;REVB=0.0348878;RO=0;SAF=14;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=7.78116e-05;OID=.;OPOS=55263545;OREF=GT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:47:50:50:50:0:14:36:0:0:22:0:14:33:0:0 chr20 55263662 . T G 531.41 PASS AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0145397;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.5427;QD=37.9575;RBI=0.0406241;REFB=0;REVB=-0.037933;RO=0;SAF=31;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000604031;OID=.;OPOS=55263662;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:56:56:0:0:56:56:25:31:0:0:25:31:0:0 chr20 55748206 . G A 72.89 PASS AO=19;DP=47;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=8;FWDB=-0.0276056;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.5511;QD=6.33846;RBI=0.0520123;REFB=0.0111541;REVB=0.0440818;RO=27;SAF=9;SAR=10;SRF=19;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233552;STB=0.633352;TYPE=snp;VARB=-0.0163275;OID=.;OPOS=55748206;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:47:46:27:27:19:19:10:9:19:8:10:9:19:8 chr20 55800937 . C T 577 PASS AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.768;QD=37.8358;RBI=0.019546;REFB=0;REVB=-0.00338892;RO=0;SAF=28;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.35457e-05;OID=.;OPOS=55800937;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:61:61:0:0:61:61:33:28:0:0:33:28:0:0 chr20 55910542 . T G 314.04 PASS AO=86;DP=193;FAO=86;FDP=197;FR=.;FRO=111;FSAF=28;FSAR=58;FSRF=36;FSRR=75;FWDB=0.017284;FXX=0.00505025;HRUN=4;LEN=1;MLLD=67.4759;QD=6.37637;RBI=0.0786963;REFB=-0.0190429;REVB=-0.0767748;RO=106;SAF=28;SAR=58;SRF=35;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00520179;STB=0.500807;TYPE=snp;VARB=0.0169923;OID=.;OPOS=55910542;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:197:106:111:86:86:58:28:35:71:58:28:36:75 chr20 56063955 . G C 144.1 PASS AO=36;DP=82;FAO=36;FDP=80;FR=.;FRO=44;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=29;FWDB=0.00477144;FXX=0.0243873;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.0767;QD=7.20489;RBI=0.00596582;REFB=-0.0325542;REVB=0.00358111;RO=44;SAF=15;SAR=21;SRF=15;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0775862;STB=0.543455;TYPE=snp;VARB=0.0248255;OID=.;OPOS=56063955;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:80:44:44:36:36:21:15:15:29:21:15:15:29 chr20 56071399 . C T 29.39 PASS AO=9;DP=33;FAO=10;FDP=34;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=0.147994;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.4536;QD=3.45706;RBI=0.154449;REFB=-0.0224044;REVB=0.0441841;RO=24;SAF=6;SAR=3;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.373424;STB=0.746725;TYPE=snp;VARB=0.068622;OID=.;OPOS=56071399;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:33:34:24:24:9:10:3:6:8:16:3:7:8:16 chr20 56071416 . C A 19.1 PASS AO=7;DP=28;FAO=7;FDP=28;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.158132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.404;QD=2.72913;RBI=0.159461;REFB=-0.00421601;REVB=-0.0205458;RO=21;SAF=4;SAR=3;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.272656;STB=0.672809;TYPE=snp;VARB=0.0150552;OID=.;OPOS=56071416;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:28:28:21:21:7:7:3:4:7:14:3:4:7:14 chr20 56098733 . T C 796.13 PASS AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00178717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.862;QD=37.9108;RBI=0.0482466;REFB=0;REVB=0.0482135;RO=0;SAF=58;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.45543e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000235978;OID=.;OPOS=56098733;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:84:84:0:0:84:84:26:58:0:0:26:58:0:0 chr20 56099114 . C G 351.11 PASS AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0107282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.549;QD=37.9575;RBI=0.0156223;REFB=0;REVB=0.0113561;RO=0;SAF=20;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71161e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.35916e-06;OID=.;OPOS=56099114;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:37:37:0:0:37:37:17:20:0:0:17:20:0:0 chr20 56136536 . A G 1055.16 PASS AO=78;DP=119;FAO=117;FDP=117;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=40;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00863071;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.444;QD=36.0738;RBI=0.0236916;REFB=0;REVB=-0.0220636;RO=0;SAF=35;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.91087e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00023529;OID=.;OPOS=56136536;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:114:117:0:0:78:117:43:35:0:0:77:40:0:0 chr20 56136537 . C G 86.36 PASS AO=36;DP=118;FAO=36;FDP=118;FR=.;FRO=82;FSAF=2;FSAR=34;FSRF=38;FSRR=44;FWDB=-0.0180113;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=86.36;QD=2.92756;RBI=0.0198691;REFB=-0.0881823;REVB=-0.00838898;RO=82;SAF=2;SAR=34;SRF=38;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.653397;STB=0.896821;TYPE=snp;VARB=0.0446747;OID=.;OPOS=56136537;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:118:118:82:82:36:36:34:2:38:44:34:2:38:44 chr20 56137798 . G A 522.26 PASS AO=57;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0264597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.9081;QD=35.4077;RBI=0.0294467;REFB=-0.168537;REVB=0.0129227;RO=2;SAF=31;SAR=26;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0349001;STB=0.509088;TYPE=snp;VARB=0.00270508;OID=.;OPOS=56137798;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:59:59:2:1:57:58:26:31:0:2:27:31:0:1 chr20 56137807 . A G 561.22 PASS AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0504861;FXX=0.0169463;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.213;QD=38.7047;RBI=0.0689681;REFB=0;REVB=0.0469867;RO=0;SAF=28;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000285957;OID=.;OPOS=56137807;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:58:58:0:0:58:58:30:28:0:0:30:28:0:0 chr20 56137834 . A G 455.46 PASS AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0228188;FXX=0.059988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.4756;QD=38.7621;RBI=0.0309036;REFB=0;REVB=-0.0208407;RO=0;SAF=20;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000554743;OID=.;OPOS=56137834;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:48:47:0:0:47:47:27:20:0:0:27:20:0:0 chr20 56137895 . G C 292.5 PASS AO=32;DP=34;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00307351;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5913;QD=35.4545;RBI=0.0279966;REFB=0;REVB=-0.0278274;RO=1;SAF=11;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0405505;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00487714;OID=.;OPOS=56137895;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:34:33:1:0:32:33:21:11:1:0:21:12:0:0 chr20 56138621 . A G 167.93 PASS AO=47;DP=113;FAO=48;FDP=115;FR=.;FRO=67;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=39;FSRR=28;FWDB=0.0104389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.656;QD=5.841;RBI=0.0151891;REFB=-0.0142905;REVB=0.0110334;RO=66;SAF=25;SAR=22;SRF=39;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0617568;STB=0.5238;TYPE=snp;VARB=0.0176977;OID=.;OPOS=56138621;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:115:66:67:47:48:22:25:39:27:22:26:39:28 chr20 56139403 . T C 153.49 PASS AO=60;DP=182;FAO=60;FDP=182;FR=.;FRO=122;FSAF=24;FSAR=36;FSRF=53;FSRR=69;FWDB=0.00709656;FXX=0.00546418;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.958;QD=3.3734;RBI=0.00740561;REFB=-0.00836678;REVB=0.00211702;RO=122;SAF=24;SAR=36;SRF=53;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0413135;STB=0.523802;TYPE=snp;VARB=0.0198933;OID=.;OPOS=56139403;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:182:122:122:60:60:36:24:53:69:36:24:53:69 chr20 56179422 . C A 61.42 PASS AO=11;DP=20;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-5.92251e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.888;QD=12.2846;RBI=0.00264891;REFB=0.013836;REVB=-0.00264825;RO=9;SAF=5;SAR=6;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164705;STB=0.594426;TYPE=snp;VARB=-0.00502059;OID=.;OPOS=56179422;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:20:20:9:9:11:11:6:5:6:3:6:5:6:3 chr20 56182296 . A C 323.18 PASS AO=69;DP=131;FAO=70;FDP=132;FR=.;FRO=62;FSAF=34;FSAR=36;FSRF=36;FSRR=26;FWDB=0.0414846;FXX=0.00751823;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.752;QD=9.79321;RBI=0.0417178;REFB=-0.0141683;REVB=0.00440546;RO=62;SAF=33;SAR=36;SRF=36;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0880907;STB=0.544499;TYPE=snp;VARB=0.0105215;OID=.;OPOS=56182296;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:132:62:62:69:70:36:33:36:26:36:34:36:26 chr20 56186884 . T C 303.59 PASS AO=31;DP=32;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0504632;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.0421;QD=36.7988;RBI=0.092312;REFB=0;REVB=0.077298;RO=0;SAF=4;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00166946;OID=.;OPOS=56186884;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:32:33:0:0:31:33:27:4:0:0:27:6:0:0 chr20 56190634 . C T 89.29 PASS AO=25;DP=66;FAO=26;FDP=67;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=15;FWDB=0.0119764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.537;QD=5.33101;RBI=0.0120633;REFB=-0.000218776;REVB=0.00144575;RO=40;SAF=13;SAR=12;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140804;STB=0.559396;TYPE=snp;VARB=0.000383033;OID=.;OPOS=56190634;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:66:67:40:41:25:26:12:13:26:14:12:14:26:15 chr20 56227532 . T C 11.68 PASS AO=3;DP=13;FAO=3;FDP=13;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.0287518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3594;QD=3.59352;RBI=0.085936;REFB=-0.0246238;REVB=0.0809836;RO=10;SAF=1;SAR=2;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.37802;STB=0.760371;TYPE=snp;VARB=0.0374264;OID=.;OPOS=56227532;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:13:13:10:10:3:3:2:1:7:3:2:1:7:3 chr20 56793557 . AG A 231.88 PASS AO=29;DP=45;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.100419;FXX=0.0666519;HRUN=4;LEN=1;MLLD=13.5224;QD=22.0839;RBI=0.324867;REFB=-0.0682661;REVB=0.308957;RO=9;SAF=11;SAR=18;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0.545455;SSSB=0.0742704;STB=0.518509;TYPE=del;VARB=0.0413124;OID=.;OPOS=56793558;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:29:45:41:42:1:13:28:1:0:16:9:11:18:2:7 chr20 56793706 . G A 197.85 PASS AO=40;DP=72;FAO=40;FDP=72;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=30;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=-0.0443128;FXX=0.0136968;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.875;QD=10.9918;RBI=0.0445207;REFB=-0.0121187;REVB=0.00429754;RO=32;SAF=10;SAR=30;SRF=11;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0951365;STB=0.552604;TYPE=snp;VARB=0.0113958;OID=.;OPOS=56793706;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:32:32:40:40:30:10:11:21:30:10:11:21 chr20 56793764 . G A 100.73 PASS AO=26;DP=61;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=9;FSRR=26;FWDB=-0.0319356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.914;QD=6.60552;RBI=0.0329262;REFB=-0.0304777;REVB=-0.00801612;RO=35;SAF=9;SAR=17;SRF=9;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103352;STB=0.558399;TYPE=snp;VARB=0.0153864;OID=.;OPOS=56793764;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:35:35:26:26:17:9:9:26:17:9:9:26 chr20 56807969 . A G 358.33 PASS AO=83;DP=173;FAO=83;FDP=165;FR=.;FRO=82;FSAF=46;FSAR=37;FSRF=53;FSRR=29;FWDB=0.0298198;FXX=0.0462401;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.954;QD=8.68686;RBI=0.0453997;REFB=-0.00584599;REVB=0.0342332;RO=78;SAF=46;SAR=37;SRF=50;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0783535;STB=0.546787;TYPE=snp;VARB=0.00397719;OID=.;OPOS=56807969;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:165:78:82:83:83:37:46:50:28:37:46:53:29 chr20 56820880 . C T 115.6 PASS AO=30;DP=76;FAO=32;FDP=78;FR=.;FRO=46;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=31;FSRR=15;FWDB=0.0143432;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.545;QD=5.92808;RBI=0.0203713;REFB=-0.0163798;REVB=-0.014466;RO=46;SAF=20;SAR=10;SRF=31;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00867311;STB=0.509253;TYPE=snp;VARB=0.0251292;OID=.;OPOS=56820880;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:78:46:46:30:32:10:20:31:15:10:22:31:15 chr20 56821127 . A G 270.6 PASS AO=67;DP=138;FAO=65;FDP=136;FR=.;FRO=71;FSAF=27;FSAR=38;FSRF=25;FSRR=46;FWDB=-0.00914245;FXX=0.0144917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.5256;QD=7.95876;RBI=0.0447592;REFB=-0.00807732;REVB=-0.0438155;RO=69;SAF=29;SAR=38;SRF=24;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0806374;STB=0.534391;TYPE=snp;VARB=0.0100223;OID=.;OPOS=56821127;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:136:69:71:67:65:38:29:24:45:38:27:25:46 chr20 56822536 . G A 122.51 PASS AO=25;DP=50;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.0355715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.8507;QD=9.60892;RBI=0.0436289;REFB=0.00213973;REVB=0.0252615;RO=25;SAF=6;SAR=19;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173971;STB=0.603688;TYPE=snp;VARB=-0.00108456;OID=.;OPOS=56822536;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:51:25:25:25:26:19:6:10:15:20:6:10:15 chr20 56942082 . A T 1001.05 PASS AO=244;DP=456;FAO=216;FDP=399;FR=.;FRO=183;FSAF=107;FSAR=109;FSRF=81;FSRR=102;FWDB=-0.0179253;FXX=0.00249994;HRUN=4;LEN=1;MLLD=231.181;QD=10.0356;RBI=0.0192501;REFB=0.0020216;REVB=-0.00701785;RO=211;SAF=117;SAR=127;SRF=92;SRR=119;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0372019;STB=0.524203;TYPE=snp;VARB=-0.00188487;OID=.;OPOS=56942082;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:456:399:211:183:244:216:127:117:92:119:109:107:81:102 chr20 56942312 . C T 791.81 PASS AO=272;DP=558;FAO=194;FDP=400;FR=.;FRO=206;FSAF=67;FSAR=127;FSRF=87;FSRR=119;FWDB=0.0165343;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.568;QD=7.91809;RBI=0.0205949;REFB=-0.0144157;REVB=-0.0122787;RO=285;SAF=100;SAR=172;SRF=123;SRR=162;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0629354;STB=0.54267;TYPE=snp;VARB=0.0156366;OID=.;OPOS=56942312;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:558:400:285:206:272:194:172:100:123:162:127:67:87:119 chr20 56942520 . G A 253.04 PASS AO=52;DP=100;FAO=55;FDP=102;FR=.;FRO=47;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=20;FSRR=27;FWDB=0.0404023;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.4417;QD=9.92325;RBI=0.0420742;REFB=-0.0094861;REVB=-0.0117426;RO=46;SAF=28;SAR=24;SRF=20;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0882586;STB=0.538448;TYPE=snp;VARB=0.00831537;OID=.;OPOS=56942520;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:102:46:47:52:55:24:28:20:26:27:28:20:27 chr20 56942557 . A G 309.6 PASS AO=63;DP=111;FAO=63;FDP=112;FR=.;FRO=49;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=20;FSRR=29;FWDB=0.00127212;FXX=0.00884877;HRUN=3;LEN=1;MLLD=115.255;QD=11.0572;RBI=0.00175755;REFB=-0.0268727;REVB=-0.00121272;RO=48;SAF=30;SAR=33;SRF=19;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0639863;STB=0.529905;TYPE=snp;VARB=0.0169296;OID=.;OPOS=56942557;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:112:48:49:63:63:33:30:19:29:33:30:20:29 chr20 57045667 . T C 1015.23 PASS AO=91;DP=100;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0228554;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9325;QD=35.622;RBI=0.060739;REFB=-0.0474175;REVB=0.0562749;RO=2;SAF=21;SAR=70;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0133511;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00147236;OID=.;OPOS=57045667;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:100:114:2:0:91:114:70:21:0:2:92:22:0:0 chr20 57045765 . A G 296.82 PASS AO=30;DP=30;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.150696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.353;QD=37.1027;RBI=0.150991;REFB=0;REVB=0.00944167;RO=0;SAF=4;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.9955e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00128967;OID=.;OPOS=57045765;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:30:32:0:0:30:32:26:4:0:0:27:5:0:0 chr20 57244493 . G A 509.88 PASS AO=53;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0533228;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.384;QD=37.769;RBI=0.0533614;REFB=0;REVB=-0.00202978;RO=0;SAF=23;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.72004e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000683007;OID=.;OPOS=57244493;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:54:54:0:0:53:54:30:23:0:0:30:24:0:0 chr20 57251997 . T TTAA 221.85 PASS AO=45;DP=103;FAO=52;FDP=106;FR=.;FRO=54;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=29;FSRR=25;FWDB=-0.0157657;FXX=0;HRUN=2;LEN=3;MLLD=255.694;QD=8.37178;RBI=0.0159957;REFB=-0.00779532;REVB=0.00270304;RO=56;SAF=21;SAR=24;SRF=28;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0330631;STB=0.528633;TYPE=ins;VARB=0.00875227;OID=.;OPOS=57251998;OREF=-;OALT=TAA;OMAPALT=TTAA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:45:103:52:106:54:25:27:29:25:99:56:21:24:28:28 chr20 57266134 . G A 248.6 PASS AO=73;DP=179;FAO=73;FDP=178;FR=.;FRO=105;FSAF=14;FSAR=59;FSRF=21;FSRR=84;FWDB=0.0281875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.784;QD=5.58652;RBI=0.0309927;REFB=-0.00735635;REVB=0.0128847;RO=105;SAF=14;SAR=59;SRF=20;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00221626;STB=0.507743;TYPE=snp;VARB=0.0108115;OID=.;OPOS=57266134;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:178:105:105:73:73:59:14:20:85:59:14:21:84 chr20 57268867 . C A 105.91 PASS AO=22;DP=43;FAO=22;FDP=43;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=18;FSRF=2;FSRR=19;FWDB=-0.0224271;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.303;QD=9.85211;RBI=0.0228838;REFB=-0.0480051;REVB=0.00454907;RO=20;SAF=4;SAR=18;SRF=2;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12867;STB=0.578062;TYPE=snp;VARB=0.04425;OID=.;OPOS=57268867;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:43:43:20:21:22:22:18:4:2:18:18:4:2:19 chr20 57269495 . G A 51.83 PASS AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0313649;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.339;QD=10.3669;RBI=0.0442764;REFB=-0.00538681;REVB=0.0312513;RO=10;SAF=5;SAR=5;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0858363;STB=0.549901;TYPE=snp;VARB=0.00508286;OID=.;OPOS=57269495;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:20:20:10:10:10:10:5:5:4:6:5:5:4:6 chr20 57269591 . C T 77.36 PASS AO=17;DP=35;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0319154;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.922;QD=8.84145;RBI=0.0322473;REFB=-0.0100454;REVB=-0.00461435;RO=18;SAF=5;SAR=12;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150899;STB=0.58636;TYPE=snp;VARB=0.0112887;OID=.;OPOS=57269591;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:35:35:18:18:17:17:12:5:8:10:12:5:8:10 chr20 57273776 . GC G 218.22 PASS AO=29;DP=36;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.34716;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.3588;QD=23.5916;RBI=0.348545;REFB=0.0267631;REVB=-0.0310338;RO=7;SAF=10;SAR=19;SRF=6;SRR=1;SSEN=0.647059;SSEP=0;SSSB=-0.190101;STB=0.512188;TYPE=del;VARB=0.0163454;OID=.;OPOS=57273777;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:29:36:36:37:1:16:20:0:1:15:7:10:19:6:1 chr20 57280575 . T C 1491.45 PASS AO=153;DP=155;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00907126;FXX=0.0251557;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.0032;QD=38.4889;RBI=0.0930574;REFB=0;REVB=0.0926142;RO=0;SAF=71;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6227e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000201457;OID=.;OPOS=57280575;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:155:155:0:0:153:155:82:71:0:0:84:71:0:0 chr20 57290347 . C G 175.29 PASS AO=44;DP=94;FAO=43;FDP=93;FR=.;FRO=50;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=32;FSRR=18;FWDB=0.00131887;FXX=0.0106372;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.0509;QD=7.5395;RBI=0.0182837;REFB=-0.0151268;REVB=0.0182361;RO=48;SAF=24;SAR=20;SRF=30;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0758568;STB=0.557218;TYPE=snp;VARB=0.0263356;OID=.;OPOS=57290347;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:93:48:50:44:43:20:24:30:18:20:23:32:18 chr20 57415812 . T A 113.41 PASS AO=26;DP=62;FAO=29;FDP=64;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=-0.0529963;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.8729;QD=7.08783;RBI=0.0663318;REFB=-0.0234047;REVB=-0.0398911;RO=35;SAF=13;SAR=13;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101043;STB=0.51091;TYPE=snp;VARB=0.0293819;OID=.;OPOS=57415812;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:64:35:35:26:29:13:13:21:14:13:16:20:15 chr20 57478807 . C T 485.89 PASS AO=110;DP=223;FAO=113;FDP=224;FR=.;FRO=111;FSAF=53;FSAR=60;FSRF=44;FSRR=67;FWDB=-0.0456604;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.465;QD=8.67663;RBI=0.0467685;REFB=0.00793859;REVB=-0.0101204;RO=113;SAF=50;SAR=60;SRF=47;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0360335;STB=0.536286;TYPE=snp;VARB=-0.00897315;OID=.;OPOS=57478807;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:223:224:113:111:110:113:60:50:47:66:60:53:44:67 chr20 57571763 . A G 1583.77 PASS AO=146;DP=146;FAO=166;FDP=166;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314756;FXX=0.00598767;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.301;QD=38.1632;RBI=0.0510207;REFB=0;REVB=-0.0401547;RO=0;SAF=42;SAR=104;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.82523e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.09854e-05;OID=.;OPOS=57571763;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:146:166:0:0:146:166:104:42:0:0:104:62:0:0 chr20 57572675 . A G 1180.16 PASS AO=122;DP=126;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106303;FXX=0.0236202;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.286;QD=38.0697;RBI=0.0280922;REFB=0;REVB=0.0260033;RO=0;SAF=84;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.2916e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.30964e-05;OID=.;OPOS=57572675;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:126:124:0:0:122:124:38:84:0:0:40:84:0:0 chr20 57599016 . T G 571.73 PASS AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111474;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.3124;QD=38.761;RBI=0.0158271;REFB=0;REVB=-0.0112353;RO=0;SAF=30;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000214613;OID=.;OPOS=57599016;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:60:59:0:0:59:59:29:30:0:0:29:30:0:0 chr20 57610059 . C A 54.23 PASS AO=20;DP=64;FAO=20;FDP=64;FR=.;FRO=44;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=29;FSRR=15;FWDB=-0.00705638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.427;QD=3.3891;RBI=0.0450208;REFB=-0.00415498;REVB=0.0444643;RO=44;SAF=12;SAR=8;SRF=29;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0728894;STB=0.543004;TYPE=snp;VARB=0.0157724;OID=.;OPOS=57610059;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:64:64:44:44:20:20:8:12:29:15:8:12:29:15 chr20 57612390 . C G 1267.03 PASS AO=133;DP=133;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.0335;QD=38.106;RBI=0.0366638;REFB=0;REVB=0.0306158;RO=0;SAF=42;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.50634e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000187266;OID=.;OPOS=57612390;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:133:133:0:0:133:133:91:42:0:0:91:42:0:0 chr20 57767043 . G C 21.51 PASS AO=4;DP=11;FAO=5;FDP=13;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.0608627;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=36.8946;QD=6.6177;RBI=0.0638812;REFB=-0.0908304;REVB=-0.0194047;RO=7;SAF=2;SAR=2;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0699385;STB=0.562247;TYPE=snp;VARB=0.139671;OID=.;OPOS=57767043;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:11:13:7:8:4:5:2:2:4:3:3:2:4:4 chr20 57768399 . T C 70.31 PASS AO=14;DP=30;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.0138031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.829;QD=8.27128;RBI=0.0138152;REFB=-0.0178547;REVB=0.000577107;RO=15;SAF=6;SAR=8;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211805;STB=0.624844;TYPE=snp;VARB=0.0230869;OID=.;OPOS=57768399;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:30:34:15:18:14:16:8:6:10:5:10:6:11:7 chr20 57769030 . AC A 117.03 PASS AO=12;DP=28;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.169595;FXX=0.0908678;HRUN=4;LEN=1;MLLD=12.7645;QD=23.4057;RBI=0.210901;REFB=0.00342075;REVB=0.125366;RO=2;SAF=3;SAR=9;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0.514563;SSSB=-0.0812822;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00611141;OID=.;OPOS=57769031;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:12:18:20:20:0:8:12:0:0:9:2:3:9:1:1 chr20 57829301 . T C 185.56 PASS AO=38;DP=73;FAO=39;FDP=73;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.0262229;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.9629;QD=10.1678;RBI=0.0291022;REFB=-0.0510008;REVB=-0.0126213;RO=34;SAF=18;SAR=20;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0475298;STB=0.531629;TYPE=snp;VARB=0.0390843;OID=.;OPOS=57829301;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:34:34:38:39:20:18:18:16:21:18:18:16 chr20 58523103 . AG A,AA 390.33 PASS AO=9,26;DP=37;FAO=5,37;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=0,13;FSAR=5,24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0866019,0.0810421;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=191.304,190.98;QD=37.1744;RBI=0.0887864,0.0829772;REFB=0,0;REVB=-0.0195737,-0.0178155;RO=0;SAF=5,5;SAR=4,21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.0253342,0.0117115;OID=.,.;OPOS=58523104,58523104;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:9,26:35:5,37:42:0:0,13:5,24:0:0:8:0:5,5:4,21:0:0 chr20 60293919 . C A 1786.38 PASS AO=194;DP=200;FAO=194;FDP=199;FR=.;FRO=5;FSAF=89;FSAR=105;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0546256;FXX=0.00499975;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.0872;QD=35.9071;RBI=0.0737249;REFB=0.024434;REVB=0.0495117;RO=5;SAF=89;SAR=105;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00679599;STB=0.50357;TYPE=snp;VARB=5.82097e-05;OID=.;OPOS=60293919;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:200:199:5:5:194:194:105:89:3:2:105:89:3:2 chr20 60294279 . A G 218.07 PASS AO=39;DP=63;FAO=40;FDP=64;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=30;FSRF=19;FSRR=5;FWDB=0.0169049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5461;QD=13.6293;RBI=0.0306343;REFB=-0.0137146;REVB=0.0255477;RO=24;SAF=10;SAR=29;SRF=19;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.386639;STB=0.713004;TYPE=snp;VARB=0.00883765;OID=.;OPOS=60294279;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:63:64:24:24:39:40:29:10:19:5:30:10:19:5 chr20 60485627 . C T 298.2 PASS AO=70;DP=136;FAO=70;FDP=142;FR=.;FRO=72;FSAF=29;FSAR=41;FSRF=21;FSRR=51;FWDB=0.00689796;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=202.446;QD=8.39999;RBI=0.0122632;REFB=-0.0310917;REVB=0.0101392;RO=66;SAF=29;SAR=41;SRF=19;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117869;STB=0.565476;TYPE=snp;VARB=0.033632;OID=.;OPOS=60485627;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:142:66:72:70:70:41:29:19:47:41:29:21:51 chr20 60572663 . C A 1197.7 PASS AO=130;DP=134;FAO=131;FDP=133;FR=.;FRO=2;FSAF=72;FSAR=59;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0379406;FXX=0.0148137;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.9851;QD=36.0212;RBI=0.0981034;REFB=-0.128518;REVB=0.0904698;RO=2;SAF=71;SAR=59;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.013198;STB=0.500753;TYPE=snp;VARB=0.00156229;OID=.;OPOS=60572663;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:134:133:2:2:130:131:59:71:2:0:59:72:1:1 chr20 60712511 . A G 277.99 PASS AO=66;DP=135;FAO=66;FDP=135;FR=.;FRO=69;FSAF=23;FSAR=43;FSRF=39;FSRR=30;FWDB=-0.0109099;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.705;QD=8.23685;RBI=0.01236;REFB=-0.0151194;REVB=0.00580883;RO=66;SAF=23;SAR=43;SRF=36;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184091;STB=0.613544;TYPE=snp;VARB=0.0152401;OID=.;OPOS=60712511;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:66:69:66:66:43:23:36:30:43:23:39:30 chr20 60713311 . G A 115.54 PASS AO=37;DP=104;FAO=38;FDP=104;FR=.;FRO=66;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=32;FSRR=34;FWDB=-0.0273384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.2402;QD=4.44378;RBI=0.0516431;REFB=0.00104346;REVB=0.0438135;RO=66;SAF=14;SAR=23;SRF=32;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121739;STB=0.57616;TYPE=snp;VARB=-0.00137173;OID=.;OPOS=60713311;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:66:66:37:38:23:14:32:34:24:14:32:34 chr20 60713332 . A G 777.58 PASS AO=77;DP=77;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0614973;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.6279;QD=37.9306;RBI=0.0731948;REFB=0;REVB=-0.0396933;RO=0;SAF=21;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.42054e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000147198;OID=.;OPOS=60713332;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:77:82:0:0:77:82:56:21:0:0:57:25:0:0 chr20 60737908 . G A 119.05 PASS AO=24;DP=44;FAO=24;FDP=44;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.00524782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.3241;QD=10.8231;RBI=0.0387393;REFB=-0.0158811;REVB=0.0383822;RO=19;SAF=11;SAR=13;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0298626;STB=0.526798;TYPE=snp;VARB=0.0151574;OID=.;OPOS=60737908;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:44:44:19:20:24:24:13:11:8:11:13:11:8:12 chr20 60756622 . TTAAGAA T 56 PASS AO=50;DP=201;FAO=52;FDP=177;FR=.;FRO=125;FSAF=19;FSAR=33;FSRF=52;FSRR=73;FWDB=0.00703858;FXX=0.00561766;HRUN=2;LEN=6;MLLD=263.523;QD=1.26563;RBI=0.00992922;REFB=-0.00279457;REVB=-0.00700341;RO=123;SAF=18;SAR=32;SRF=51;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0699969;STB=0.537741;TYPE=del;VARB=0.00670055;OID=.;OPOS=60756623;OREF=TAAGAA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:50:178:52:177:125:19:33:52:73:56:123:18:32:51:72 chr20 60768497 . C T 190.44 PASS AO=39;DP=80;FAO=43;FDP=84;FR=.;FRO=41;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=0.0155731;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.776;QD=9.06839;RBI=0.0167894;REFB=-0.0110239;REVB=0.00627408;RO=41;SAF=16;SAR=23;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00415841;STB=0.524835;TYPE=snp;VARB=0.0126276;OID=.;OPOS=60768497;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:84:41:41:39:43:23:16:17:24:23:20:17:24 chr20 60791404 . C T 100.21 PASS AO=20;DP=37;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=2;FSRR=15;FWDB=0.0232537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.1885;QD=10.8333;RBI=0.0406815;REFB=-0.0139863;REVB=0.0333804;RO=17;SAF=5;SAR=15;SRF=2;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158992;STB=0.588157;TYPE=snp;VARB=0.0106073;OID=.;OPOS=60791404;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:37:37:17:17:20:20:15:5:2:15:15:5:2:15 chr20 60831300 . G A 952.93 PASS AO=104;DP=107;FAO=104;FDP=107;FR=.;FRO=3;FSAF=43;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.00855388;FXX=0.0092584;HRUN=4;LEN=1;MLLD=146.809;QD=35.6237;RBI=0.0382606;REFB=-0.0904068;REVB=0.0372921;RO=3;SAF=43;SAR=61;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0227634;STB=0.511998;TYPE=snp;VARB=0.000781133;OID=.;OPOS=60831300;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:107:107:3:3:104:104:61:43:0:3:61:43:0:3 chr20 60881330 . G A 1160.94 PASS AO=118;DP=118;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0041992;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.035;QD=38.0635;RBI=0.0150182;REFB=0;REVB=-0.0144192;RO=0;SAF=66;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.05954e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.9111e-06;OID=.;OPOS=60881330;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:55:118:122:0:0:118:122:52:66:0:0:56:66:0:0 chr20 60881780 . T C 392.41 PASS AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0177068;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.1403;QD=37.3721;RBI=0.0295695;REFB=0;REVB=0.0236818;RO=0;SAF=23;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.82649e-05;OID=.;OPOS=60881780;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:42:42:0:0:42:42:19:23:0:0:19:23:0:0 chr20 60892450 . C T 100.2 PASS AO=27;DP=65;FAO=27;FDP=65;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=0.0753048;FXX=0.0298463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.466;QD=6.16588;RBI=0.0753086;REFB=-0.00821167;REVB=0.000759832;RO=38;SAF=12;SAR=15;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0799782;STB=0.545421;TYPE=snp;VARB=0.0196847;OID=.;OPOS=60892450;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:38:38:27:27:15:12:14:24:15:12:14:24 chr20 60892526 . A G 607.08 PASS AO=50;DP=70;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000888384;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.044;QD=37.9423;RBI=0.0226178;REFB=0;REVB=0.0226004;RO=0;SAF=28;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.15703e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000131833;OID=.;OPOS=60892526;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:51:64:0:0:50:64:22:28:0:0:27:37:0:0 chr20 60895697 . C T 24.39 PASS AO=5;DP=15;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=0.0693366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.625;QD=6.09836;RBI=0.0797507;REFB=-0.00378121;REVB=-0.0394031;RO=9;SAF=4;SAR=1;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.548753;STB=0.864277;TYPE=snp;VARB=0.0309639;OID=.;OPOS=60895697;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:15:16:9:10:5:6:1:4:2:7:1:5:2:8 chr20 60897487 . C T 37.72 PASS AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=9;FWDB=-0.0159801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.781;QD=8.38161;RBI=0.0422495;REFB=-0.00289389;REVB=-0.0391108;RO=8;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.354424;STB=0.624738;TYPE=snp;VARB=0.0277429;OID=.;OPOS=60897487;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:18:18:8:10:8:8:6:2:0:8:6:2:1:9 chr20 60897488 . G A 46 PASS AO=7;DP=15;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.00845423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.0014;QD=10.8233;RBI=0.0516932;REFB=-0.0334319;REVB=0.0509972;RO=6;SAF=0;SAR=7;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.758609;STB=0.631235;TYPE=snp;VARB=0.105324;OID=.;OPOS=60897488;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:15:17:6:8:7:9:7:0:2:4:8:1:2:6 chr20 60897772 . T C 42.21 PASS AO=11;DP=29;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=-0.0954113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.571;QD=5.82154;RBI=0.102276;REFB=-0.0385662;REVB=-0.0368386;RO=14;SAF=10;SAR=1;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.616468;STB=0.902472;TYPE=snp;VARB=0.048951;OID=.;OPOS=60897772;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:29:29:14:18:11:11:1:10:5:9:1:10:5:13 chr20 60899182 . C T 28.07 PASS AO=11;DP=34;FAO=10;FDP=33;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=-0.0449958;FXX=0.0571265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.265;QD=3.40182;RBI=0.0549129;REFB=-0.0309324;REVB=-0.0314771;RO=21;SAF=6;SAR=5;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13622;STB=0.636111;TYPE=snp;VARB=0.0994276;OID=.;OPOS=60899182;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:34:33:21:23:11:10:5:6:14:7:5:5:16:7 chr20 60899206 . C T 144.33 PASS AO=25;DP=44;FAO=26;FDP=42;FR=.;FRO=16;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.0372546;FXX=0.0454442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.8886;QD=13.7459;RBI=0.0377431;REFB=-0.0577118;REVB=0.00605298;RO=17;SAF=17;SAR=8;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0745561;STB=0.512039;TYPE=snp;VARB=0.0368825;OID=.;OPOS=60899206;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:44:42:17:16:25:26:8:17:10:7:9:17:10:6 chr20 60900481 . A G 591.88 PASS AO=60;DP=66;FAO=67;FDP=70;FR=.;FRO=3;FSAF=20;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0118219;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.0951;QD=33.8217;RBI=0.0306039;REFB=0.0234456;REVB=-0.0282284;RO=4;SAF=16;SAR=44;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0344813;STB=0.501779;TYPE=snp;VARB=-0.0102255;OID=.;OPOS=60900481;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:66:70:4:3:60:67:44:16:2:2:47:20:1:2 chr20 60900579 . C A 580.66 PASS AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00694422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.7199;QD=38.7105;RBI=0.0200684;REFB=0;REVB=0.0188286;RO=0;SAF=12;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000224756;OID=.;OPOS=60900579;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:60:60:0:0:60:60:48:12:0:0:48:12:0:0 chr20 60901986 . G A 146.8 PASS AO=33;DP=69;FAO=33;FDP=67;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=24;FSRF=8;FSRR=26;FWDB=0.033991;FXX=0.0289813;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.242;QD=8.76422;RBI=0.0340551;REFB=-0.0110254;REVB=0.00208775;RO=34;SAF=9;SAR=24;SRF=8;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0439474;STB=0.524461;TYPE=snp;VARB=0.0123174;OID=.;OPOS=60901986;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:67:34:34:33:33:24:9:8:26:24:9:8:26 chr20 60902389 . G A 98.27 PASS AO=23;DP=49;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=3;FSRR=24;FWDB=-0.00530657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.676;QD=7.86181;RBI=0.0211403;REFB=-0.0362552;REVB=-0.0204634;RO=26;SAF=6;SAR=17;SRF=3;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198886;STB=0.616455;TYPE=snp;VARB=0.0264324;OID=.;OPOS=60902389;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:49:50:26:27:23:23:17:6:3:23:17:6:3:24 chr20 60903419 . C T 139.96 PASS AO=19;DP=23;FAO=19;FDP=23;FR=.;FRO=4;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.062339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.042;QD=24.3406;RBI=0.0783526;REFB=-0.0518181;REVB=0.0474655;RO=4;SAF=9;SAR=10;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166336;STB=0.590815;TYPE=snp;VARB=0.00659558;OID=.;OPOS=60903419;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:23:23:4:4:19:19:10:9:4:0:10:9:4:0 chr20 60904853 . T C 74.61 PASS AO=11;DP=23;FAO=13;FDP=22;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=-0.0278512;FXX=0.119952;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.966;QD=13.5663;RBI=0.0280439;REFB=0.00218592;REVB=-0.00328159;RO=8;SAF=2;SAR=9;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.524378;STB=0.692011;TYPE=snp;VARB=-0.0028934;OID=.;OPOS=60904853;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:23:22:8:9:11:13:9:2:7:1:9:4:7:2 chr20 60904854 . G C 31.37 PASS AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=27;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=14;FWDB=0.100437;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=70.1559;QD=4.64681;RBI=0.101005;REFB=-0.0259536;REVB=0.0106979;RO=16;SAF=8;SAR=1;SRF=2;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.719508;STB=0.908264;TYPE=snp;VARB=0.0590205;OID=.;OPOS=60904854;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:25:27:16:18:9:9:1:8:2:14:1:8:4:14 chr20 60905878 . A G 73.84 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0595026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.2674;QD=36.9197;RBI=0.0750116;REFB=0;REVB=-0.0456747;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000550686;OID=.;OPOS=60905878;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:5:3:0:0:5:3:0:0 chr20 60907446 . T C 674.55 PASS AO=74;DP=76;FAO=74;FDP=76;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0578523;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.284;QD=35.5028;RBI=0.0817921;REFB=-0.152584;REVB=0.0578192;RO=0;SAF=38;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.79579e-08;STB=0.51351;TYPE=snp;VARB=0.000867016;OID=.;OPOS=60907446;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:76:76:0:2:74:74:36:38:0:0:36:38:0:2 chr20 60907675 . G A 210.68 PASS AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0585596;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.8028;QD=36.6392;RBI=0.0909795;REFB=0;REVB=0.0696279;RO=0;SAF=17;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.9951e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00243823;OID=.;OPOS=60907675;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:0:0:23:23:6:17:0:0:6:17:0:0 chr20 60909060 . A G 87.04 PASS AO=8;DP=8;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0315112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.763;QD=38.6841;RBI=0.0321662;REFB=0;REVB=0.00645846;RO=0;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000176466;OID=.;OPOS=60909060;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:9:0:0:8:9:4:4:0:0:5:4:0:0 chr20 60911958 . G A 53.45 PASS AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=-0.0616161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.673;QD=11.2518;RBI=0.0651809;REFB=-0.0244286;REVB=0.0212603;RO=9;SAF=2;SAR=8;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0276935;STB=0.516096;TYPE=snp;VARB=0.00552644;OID=.;OPOS=60911958;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:19:19:9:9:10:10:8:2:2:7:8:2:2:7 chr20 60912683 . T C 423.59 PASS AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0377062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.986;QD=37.6527;RBI=0.102805;REFB=0;REVB=-0.0956405;RO=0;SAF=29;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.49331e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00143008;OID=.;OPOS=60912683;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:45:45:0:0:45:45:16:29:0:0:16:29:0:0 chr20 60913127 . A G 31.59 PASS AO=4;DP=11;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.00730561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.848;QD=9.71859;RBI=0.0461311;REFB=-0.0361626;REVB=0.0455489;RO=7;SAF=1;SAR=3;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158242;STB=0.523732;TYPE=snp;VARB=0.0132801;OID=.;OPOS=60913127;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:11:13:7:7:4:6:3:1:1:6:5:1:1:6 chr20 60917294 . G A 114.73 PASS AO=19;DP=30;FAO=19;FDP=30;FR=.;FRO=11;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=1;FWDB=-0.0607317;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.873;QD=15.2976;RBI=0.0680935;REFB=-0.00205536;REVB=-0.0307957;RO=11;SAF=11;SAR=8;SRF=10;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234693;STB=0.629091;TYPE=snp;VARB=-0.00234977;OID=.;OPOS=60917294;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:30:30:11:11:19:19:8:11:10:1:8:11:10:1 chr20 60920624 . A G 208.31 PASS AO=41;DP=68;FAO=39;FDP=66;FR=.;FRO=27;FSAF=34;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.0043765;FXX=0.0294074;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.91;QD=12.6246;RBI=0.00448276;REFB=-0.00318338;REVB=0.000970285;RO=26;SAF=36;SAR=5;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.377205;STB=0.702184;TYPE=snp;VARB=0.0018391;OID=.;OPOS=60920624;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:68:66:26:27:41:39:5:36:14:12:5:34:15:12 chr20 60920887 . G A 72.94 PASS AO=14;DP=23;FAO=14;FDP=26;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=0.00204327;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.3827;QD=11.2209;RBI=0.17283;REFB=-0.0440296;REVB=-0.172818;RO=9;SAF=7;SAR=7;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193534;STB=0.653647;TYPE=snp;VARB=0.0214551;OID=.;OPOS=60920887;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:23:26:9:12:14:14:7:7:2:7:7:7:2:10 chr20 60921643 . T C 83.86 PASS AO=10;DP=12;FAO=10;FDP=11;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0131406;FXX=0.153728;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.3539;QD=30.495;RBI=0.110256;REFB=-0.128354;REVB=-0.10947;RO=1;SAF=9;SAR=1;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.290714;STB=0.666259;TYPE=snp;VARB=0.00869172;OID=.;OPOS=60921643;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:12:11:1:1:10:10:1:9:0:1:1:9:0:1 chr20 60927349 . C T 318.15 PASS AO=36;DP=38;FAO=36;FDP=38;FR=.;FRO=2;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.000142313;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.904;QD=33.4895;RBI=0.0257041;REFB=-0.0470208;REVB=0.0257037;RO=2;SAF=16;SAR=20;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0549698;STB=0.529395;TYPE=snp;VARB=0.00303904;OID=.;OPOS=60927349;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:38:38:2:2:36:36:20:16:2:0:20:16:2:0 chr20 60927412 . G A 65.02 PASS AO=12;DP=23;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.021303;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.634;QD=10.4039;RBI=0.0306013;REFB=-0.0493769;REVB=0.0219686;RO=11;SAF=2;SAR=10;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.387892;STB=0.720916;TYPE=snp;VARB=0.0454615;OID=.;OPOS=60927412;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:23:25:11:12:12:13:10:2:6:5:11:2:6:6 chr20 60966318 . G T 255.03 PASS AO=25;DP=25;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.124775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.592;QD=37.782;RBI=0.130176;REFB=0;REVB=0.0371072;RO=0;SAF=10;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00156188;OID=.;OPOS=60966318;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:25:27:0:0:25:27:15:10:0:0:15:12:0:0 chr20 60968596 . A G 877.36 PASS AO=92;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0292828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.762;QD=37.7358;RBI=0.0310721;REFB=0;REVB=0.010392;RO=0;SAF=60;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.44018e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.43632e-05;OID=.;OPOS=60968596;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:93:93:0:0:92:93:32:60:0:0:33:60:0:0 chr20 60986019 . A C 52.89 PASS AO=16;DP=45;FAO=16;FDP=45;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=22;FWDB=0.0103185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.66;QD=4.70112;RBI=0.0320853;REFB=-0.0165665;REVB=-0.0303808;RO=29;SAF=6;SAR=10;SRF=7;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165552;STB=0.596163;TYPE=snp;VARB=0.0288408;OID=.;OPOS=60986019;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:45:45:29:29:16:16:10:6:7:22:10:6:7:22 chr20 61039958 . T C 127.09 PASS AO=30;DP=67;FAO=30;FDP=64;FR=.;FRO=34;FSAF=5;FSAR=25;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=-0.0199585;FXX=0.0447694;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.451;QD=7.94338;RBI=0.0201268;REFB=-0.00179359;REVB=0.00259701;RO=27;SAF=5;SAR=25;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.285475;STB=0.64383;TYPE=snp;VARB=0.00197106;OID=.;OPOS=61039958;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:64:27:34:30:30:25:5:11:16:25:5:12:22 chr20 61040453 . C G 610.68 PASS AO=65;DP=65;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00679201;FXX=0.0302984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.922;QD=38.1676;RBI=0.068404;REFB=0;REVB=0.068066;RO=0;SAF=60;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30982e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00021155;OID=.;OPOS=61040453;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:65:64:0:0:65:64:5:60:0:0:5:59:0:0 chr20 61040951 . C T 304.25 PASS AO=33;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.134175;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.9091;QD=34.771;RBI=0.135192;REFB=-0.0723803;REVB=0.016546;RO=2;SAF=10;SAR=23;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0389142;STB=0.510198;TYPE=snp;VARB=0.0193442;OID=.;OPOS=61040951;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:35:35:2:1:33:34:23:10:0:2:24:10:0:1 chr20 61048549 . G A 77.25 PASS AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.020031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.4597;QD=7.72497;RBI=0.0255141;REFB=-0.0183685;REVB=-0.0158028;RO=22;SAF=9;SAR=9;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131387;STB=0.574919;TYPE=snp;VARB=0.0152261;OID=.;OPOS=61048549;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:40:40:22:22:18:18:9:9:8:14:9:9:8:14 chr20 61143487 . T C 190.28 PASS AO=33;DP=66;FAO=40;FDP=73;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.00295949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.401;QD=10.4264;RBI=0.0160244;REFB=-0.0162847;REVB=0.0157488;RO=33;SAF=10;SAR=23;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203993;STB=0.541156;TYPE=snp;VARB=0.0133858;OID=.;OPOS=61143487;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:73:33:33:33:40:23:10:17:16:23:17:17:16 chr20 61162228 . C T 105.69 PASS AO=14;DP=17;FAO=14;FDP=17;FR=.;FRO=3;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.010299;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=124.311;QD=24.8676;RBI=0.0114778;REFB=-0.0198824;REVB=0.00506669;RO=3;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129617;STB=0.571332;TYPE=snp;VARB=0.00120677;OID=.;OPOS=61162228;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:17:17:3:3:14:14:9:5:0:3:9:5:0:3 chr20 61162267 . T C 86.76 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.796;QD=38.5593;RBI=0.0450492;REFB=0;REVB=0.034637;RO=0;SAF=2;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00147572;OID=.;OPOS=61162267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:7:2:0:0:7:2:0:0 chr20 61167883 . G A 25.12 PASS AO=6;DP=26;FAO=8;FDP=28;FR=.;FRO=20;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=16;FWDB=0.00940534;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.544;QD=3.58922;RBI=0.0348523;REFB=-0.0193712;REVB=-0.0335592;RO=19;SAF=1;SAR=5;SRF=3;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0185824;STB=0.549882;TYPE=snp;VARB=0.0484365;OID=.;OPOS=61167883;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:26:28:19:20:6:8:5:1:3:16:6:2:4:16 chr20 61288038 . G A 149.92 PASS AO=16;DP=17;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0520727;FXX=0.0587889;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.847;QD=37.4811;RBI=0.103661;REFB=0;REVB=0.0896324;RO=0;SAF=10;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00190656;OID=.;OPOS=61288038;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:17:16:0:0:16:16:6:10:0:0:6:10:0:0 chr20 61288355 . G T 101.91 PASS AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0316907;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=42.6218;QD=37.0594;RBI=0.0925226;REFB=0;REVB=-0.086926;RO=0;SAF=2;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00361349;OID=.;OPOS=61288355;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:11:11:9:2:0:0:9:2:0:0 chr20 61326380 . C T 677.12 PASS AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112916;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=174.791;QD=38.6924;RBI=0.0114245;REFB=0;REVB=-0.00173739;RO=0;SAF=50;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.89904e-05;OID=.;OPOS=61326380;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:70:70:0:0:70:70:20:50:0:0:20:50:0:0 chr20 61386231 . C T 68.41 PASS AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.012079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.233;QD=8.55076;RBI=0.0170643;REFB=-0.0395387;REVB=0.0120535;RO=17;SAF=7;SAR=8;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00364105;STB=0.502089;TYPE=snp;VARB=0.02933;OID=.;OPOS=61386231;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:32:32:17:17:15:15:8:7:8:9:8:7:8:9 chr20 61391367 . C A 23.41 PASS AO=11;DP=48;FAO=11;FDP=48;FR=.;FRO=37;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=28;FWDB=-0.00176854;FXX=0.12725;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.168;QD=1.95071;RBI=0.00390561;REFB=-0.0136256;REVB=-0.00348225;RO=36;SAF=8;SAR=3;SRF=8;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.558838;STB=0.828948;TYPE=snp;VARB=0.0294708;OID=.;OPOS=61391367;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:48:48:36:37:11:11:3:8:8:28:3:8:9:28 chr20 61445097 . G A 98.89 PASS AO=22;DP=47;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=0.0288409;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.8059;QD=8.41584;RBI=0.0312944;REFB=-0.0252799;REVB=-0.0121468;RO=23;SAF=10;SAR=12;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181292;STB=0.596182;TYPE=snp;VARB=0.0220376;OID=.;OPOS=61445097;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:47:47:23:24:22:23:12:10:6:17:12:11:7:17 chr20 61457190 . C T 326.4 PASS AO=63;DP=109;FAO=65;FDP=114;FR=.;FRO=49;FSAF=10;FSAR=55;FSRF=4;FSRR=45;FWDB=0.0857579;FXX=0.0086949;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.9143;QD=11.4525;RBI=0.0857893;REFB=-0.0122988;REVB=0.00232031;RO=46;SAF=8;SAR=55;SRF=3;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119089;STB=0.564954;TYPE=snp;VARB=0.0311756;OID=.;OPOS=61457190;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:114:46:49:63:65:55:8:3:43:55:10:4:45 chr20 61461010 . C T 137.32 PASS AO=28;DP=50;FAO=28;FDP=52;FR=.;FRO=24;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.00330874;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=182.217;QD=10.5631;RBI=0.0169649;REFB=-0.0237244;REVB=-0.0166391;RO=22;SAF=17;SAR=11;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0871115;STB=0.569782;TYPE=snp;VARB=0.0147878;OID=.;OPOS=61461010;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:52:22:24:28:28:11:17:11:11:11:17:11:13 chr20 61468571 . T C 289.77 PASS AO=87;DP=229;FAO=91;FDP=231;FR=.;FRO=140;FSAF=54;FSAR=37;FSRF=78;FSRR=62;FWDB=0.000154321;FXX=0.0170206;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.377;QD=5.0177;RBI=0.00305249;REFB=-0.00647193;REVB=0.00304858;RO=138;SAF=52;SAR=35;SRF=78;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0364393;STB=0.522576;TYPE=snp;VARB=0.0112466;OID=.;OPOS=61468571;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:229:231:138:140:87:91:35:52:78:60:37:54:78:62 chr20 61472386 . A G 400.34 PASS AO=115;DP=272;FAO=115;FDP=272;FR=.;FRO=157;FSAF=48;FSAR=67;FSRF=94;FSRR=63;FWDB=0.0339923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.958;QD=5.8874;RBI=0.0340364;REFB=-0.0236831;REVB=-0.00173211;RO=157;SAF=48;SAR=67;SRF=94;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186621;STB=0.603892;TYPE=snp;VARB=0.0274285;OID=.;OPOS=61472386;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:272:272:157:157:115:115:67:48:94:63:67:48:94:63 chr20 61472546 . A ACATCT 339.3 PASS AO=105;DP=285;FAO=109;FDP=280;FR=.;FRO=171;FSAF=47;FSAR=62;FSRF=65;FSRR=106;FWDB=-0.0178968;FXX=0.014084;HRUN=1;LEN=5;MLLD=273.353;QD=4.84719;RBI=0.0182182;REFB=-0.00181948;REVB=-0.00340692;RO=171;SAF=46;SAR=59;SRF=64;SRR=107;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0720998;STB=0.53207;TYPE=ins;VARB=0.00267485;OID=.;OPOS=61472547;OREF=-;OALT=CATCT;OMAPALT=ACATCT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:105:285:109:280:171:47:62:65:106:99:171:46:59:64:107 chr20 61472596 . G A 414.11 PASS AO=106;DP=232;FAO=106;FDP=229;FR=.;FRO=123;FSAF=49;FSAR=57;FSRF=52;FSRR=71;FWDB=0.000516215;FXX=0.0129305;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.307;QD=7.23327;RBI=0.00429172;REFB=-0.00960733;REVB=0.00426056;RO=121;SAF=49;SAR=57;SRF=51;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0397136;STB=0.521403;TYPE=snp;VARB=0.0159167;OID=.;OPOS=61472596;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:229:121:123:106:106:57:49:51:70:57:49:52:71 chr20 61488785 . T C 199.5 PASS AO=51;DP=114;FAO=52;FDP=114;FR=.;FRO=62;FSAF=43;FSAR=9;FSRF=45;FSRR=17;FWDB=0.00812843;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.807;QD=6.99995;RBI=0.0287768;REFB=-0.0121956;REVB=0.027605;RO=62;SAF=42;SAR=9;SRF=45;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146224;STB=0.585304;TYPE=snp;VARB=0.0178644;OID=.;OPOS=61488785;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:62:62:51:52:9:42:45:17:9:43:45:17 chr20 61512606 . T C 195.16 PASS AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.635;QD=37.1732;RBI=0.00153717;REFB=0;REVB=0.00153717;RO=0;SAF=0;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.29996e-05;OID=.;OPOS=61512606;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:21:21:0:0:21:21:21:0:0:0:21:0:0:0 chr20 61528074 . T C 532 PASS AO=58;DP=60;FAO=58;FDP=60;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0743495;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.023;QD=35.4665;RBI=0.092243;REFB=0.0198116;REVB=0.0545978;RO=0;SAF=25;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.514701;TYPE=snp;VARB=0.000203158;OID=.;OPOS=61528074;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:60:60:0:2:58:58:33:25:0:0:33:25:0:2 chr20 61528271 . C T 73.84 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0259709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3103;QD=36.9197;RBI=0.0354702;REFB=0;REVB=0.0241588;RO=0;SAF=7;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.78849e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000170392;OID=.;OPOS=61528271;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:7:0:0:1:7:0:0 chr20 61576777 . A G 732.83 PASS AO=79;DP=83;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0161331;FXX=0.0361402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.436;QD=36.6417;RBI=0.0180044;REFB=-0.0587808;REVB=0.00799248;RO=1;SAF=52;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00901803;STB=0.504761;TYPE=snp;VARB=2.12022e-05;OID=.;OPOS=61576777;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:83:80:1:1:79:79:27:52:1:0:27:52:1:0 chr20 61577275 . T C 351.1 PASS AO=34;DP=34;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0453128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.978;QD=37.9566;RBI=0.0503392;REFB=0;REVB=0.0219269;RO=0;SAF=2;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000393333;OID=.;OPOS=61577275;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:34:37:0:0:34:37:32:2:0:0:32:5:0:0 chr20 61588159 . A G 471.78 PASS AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00745555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.2733;QD=38.5123;RBI=0.0357217;REFB=0;REVB=0.034935;RO=0;SAF=27;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30731e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000293103;OID=.;OPOS=61588159;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:49:49:0:0:49:49:22:27:0:0:22:27:0:0 chr20 61594679 . A G 388.32 PASS AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0330121;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.016;QD=38.832;RBI=0.0364321;REFB=0;REVB=0.015411;RO=0;SAF=13;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.04532e-05;OID=.;OPOS=61594679;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:40:40:0:0:40:40:27:13:0:0:27:13:0:0 chr20 61597946 . CTTA CTA,CT,CTAC 382.97 PASS AO=25,7,10;DP=45;FAO=43,0,0;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=9,0,0;FSAR=34,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0733369,-0.0669826,0.269674;FXX=0;HRUN=2,2,2;LEN=1,2,2;MLLD=21.4376,95.555,11.0892;QD=35.6251;RBI=0.109895,0.0675283,0.295549;REFB=0,0,0;REVB=0.0818457,-0.00856761,-0.120934;RO=0;SAF=3,6,0;SAR=22,1,10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=4.65945e-08,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=del,del,mnp;VARB=-0.000527015,0,0.0498678;OID=.,.,.;OPOS=61597947,61597948,61597948;OREF=T,TA,TA;OALT=-,-,AC;OMAPALT=CTA,CT,CTAC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:25,7,10:42:43,0,0:43:0:9,0,0:34,0,0:0:0:19:0:3,6,0:22,1,10:0:0 chr20 61834092 . G A 154.26 PASS AO=34;DP=67;FAO=34;FDP=67;FR=.;FRO=33;FSAF=26;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=24;FWDB=-0.00127706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.9478;QD=9.20946;RBI=0.0351147;REFB=-0.0121066;REVB=-0.0350915;RO=33;SAF=26;SAR=8;SRF=9;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.444903;STB=0.748052;TYPE=snp;VARB=0.0198877;OID=.;OPOS=61834092;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:33:33:34:34:8:26:9:24:8:26:9:24 chr20 61834695 . G A 497.89 PASS AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0346004;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.8546;QD=37.5767;RBI=0.0493568;REFB=0;REVB=0.035198;RO=0;SAF=32;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.00761e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000815881;OID=.;OPOS=61834695;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:52:53:0:0:52:53:20:32:0:0:21:32:0:0 chr20 61867454 . A G 23.37 PASS AO=4;DP=12;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=-0.0548289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=44.9609;QD=6.67764;RBI=0.0548289;REFB=-0.0531135;REVB=0;RO=8;SAF=4;SAR=0;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0340312;OID=.;OPOS=61867454;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:12:14:8:8:4:6:0:4:8:0:0:6:8:0 chr20 61869607 . C A 99.74 PASS AO=9;DP=9;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0772618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.767;QD=39.8962;RBI=0.124492;REFB=0;REVB=0.0976165;RO=0;SAF=7;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0016806;OID=.;OPOS=61869607;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:10:0:0:9:10:2:7:0:0:3:7:0:0 chr20 61869826 . C T 151.07 PASS AO=41;DP=96;FAO=41;FDP=96;FR=.;FRO=55;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=36;FSRR=19;FWDB=0.0507251;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.9344;QD=6.29459;RBI=0.0573817;REFB=-0.0155287;REVB=0.0268258;RO=55;SAF=25;SAR=16;SRF=36;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0485305;STB=0.527269;TYPE=snp;VARB=0.0264293;OID=.;OPOS=61869826;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:55:55:41:41:16:25:36:19:16:25:36:19 chr20 61869956 . G A 65.85 PASS AO=20;DP=59;FAO=21;FDP=60;FR=.;FRO=39;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=-0.00198837;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.494;QD=4.38996;RBI=0.00741216;REFB=-0.0127498;REVB=0.00714049;RO=39;SAF=6;SAR=14;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166725;STB=0.608357;TYPE=snp;VARB=0.0277735;OID=.;OPOS=61869956;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:59:60:39:39:20:21:14:6:17:22:15:6:17:22 chr20 61870727 . G C 22.75 PASS AO=4;DP=8;FAO=4;FDP=8;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0343323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.892;QD=11.3733;RBI=0.0823294;REFB=0.0100283;REVB=-0.0748293;RO=4;SAF=2;SAR=2;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.418587;STB=0.749055;TYPE=snp;VARB=-0.0116628;OID=.;OPOS=61870727;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:8:8:4:4:4:4:2:2:4:0:2:2:4:0 chr20 61872811 . G A 101.93 PASS AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.208865;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.821;QD=37.0639;RBI=0.208865;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=11;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00729696;OID=.;OPOS=61872811;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:11:11:0:11:0:0:0:11:0:0 chr20 61881296 . A G 58.33 PASS AO=22;DP=71;FAO=22;FDP=71;FR=.;FRO=49;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=-0.0237706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.0304;QD=3.28625;RBI=0.0662765;REFB=-0.0111306;REVB=-0.0618671;RO=49;SAF=10;SAR=12;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00655176;STB=0.503872;TYPE=snp;VARB=0.0311335;OID=.;OPOS=61881296;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:71:71:49:49:22:22:12:10:22:27:12:10:22:27 chr20 61912715 . T C 54.27 PASS AO=9;DP=15;FAO=10;FDP=17;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0333183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.335;QD=12.7704;RBI=0.0364755;REFB=-0.0060446;REVB=-0.0148443;RO=6;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.331835;STB=0.615175;TYPE=snp;VARB=0.00710597;OID=.;OPOS=61912715;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:15:17:6:7:9:10:5:4:0:6:6:4:1:6 chr20 61938900 . C T 87.72 PASS AO=8;DP=28;FAO=16;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=12;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.010057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.14;QD=12.5314;RBI=0.0249183;REFB=-0.0140734;REVB=0.0227987;RO=8;SAF=8;SAR=0;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.743774;STB=0.53567;TYPE=snp;VARB=0.065062;OID=.;OPOS=61938900;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:20:28:8:12:8:16:0:8:7:1:8:8:7:5 chr20 61941747 . A G 265.45 PASS AO=25;DP=25;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.5742;QD=37.9216;RBI=0.100753;REFB=0;REVB=0.100131;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000723813;OID=.;OPOS=61941747;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:25:28:0:0:25:28:13:12:0:0:16:12:0:0 chr20 61956782 . T C 306.66 PASS AO=24;DP=35;FAO=33;FDP=33;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=2;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.331507;FXX=0.0571265;HRUN=2;LEN=1;MLLD=35.9111;QD=37.1708;RBI=0.337747;REFB=0;REVB=0.064627;RO=0;SAF=0;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0100811;OID=.;OPOS=61956782;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:33:33:0:0:24:33:24:0:0:0:31:2:0:0 chr20 61981104 . C T 17.39 PASS AO=4;DP=13;FAO=4;FDP=13;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=-0.0280623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.722;QD=5.35045;RBI=0.0298468;REFB=-0.00416883;REVB=0.0101655;RO=9;SAF=1;SAR=3;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0398812;STB=0.526188;TYPE=snp;VARB=0.0234813;OID=.;OPOS=61981104;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:13:13:9:9:4:4:3:1:2:7:3:1:2:7 chr20 61981506 . C G 10.18 PASS AO=2;DP=9;FAO=2;FDP=9;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=0.142801;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=39.5474;QD=4.5256;RBI=0.142801;REFB=-0.00298205;REVB=0;RO=7;SAF=2;SAR=0;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.041506;OID=.;OPOS=61981506;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:7:7:2:2:0:2:7:0:0:2:7:0 chr20 61981536 . A G 107.82 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=4.39798e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.8494;QD=35.9383;RBI=4.39798e-05;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=12;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.57999e-06;OID=.;OPOS=61981536;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:0:12:0:0:0:12:0:0 chr20 61982085 . A G 787.6 PASS AO=81;DP=82;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0267176;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.9204;QD=37.9564;RBI=0.0356551;REFB=0;REVB=-0.0236105;RO=0;SAF=37;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.89334e-05;OID=.;OPOS=61982085;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:82:83:0:0:81:83:44:37:0:0:46:37:0:0 chr20 61982124 . A G 275.32 PASS AO=55;DP=97;FAO=55;FDP=97;FR=.;FRO=42;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=0.016134;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.842;QD=11.3532;RBI=0.0167184;REFB=-0.0334427;REVB=0.00438138;RO=42;SAF=30;SAR=25;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0361133;STB=0.519767;TYPE=snp;VARB=0.0321691;OID=.;OPOS=61982124;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:42:42:55:55:25:30:21:21:25:30:21:21 chr20 61986863 . C G 90.53 PASS AO=26;DP=66;FAO=26;FDP=66;FR=.;FRO=40;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=-0.0342045;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=198.782;QD=5.48674;RBI=0.0344389;REFB=-0.00873654;REVB=0.00401094;RO=40;SAF=13;SAR=13;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105939;STB=0.56056;TYPE=snp;VARB=0.0110711;OID=.;OPOS=61986863;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:66:66:40:40:26:26:13:13:24:16:13:13:24:16 chr20 61986949 . T C 64.47 PASS AO=12;DP=22;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.0144745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.041;QD=11.7226;RBI=0.0371531;REFB=-0.0439242;REVB=0.0342176;RO=10;SAF=3;SAR=9;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.371805;STB=0.713914;TYPE=snp;VARB=0.0348181;OID=.;OPOS=61986949;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:22:22:10:10:12:12:9:3:7:3:9:3:7:3 chr20 61990939 . G A 14.14 PASS AO=6;DP=33;FAO=7;FDP=34;FR=.;FRO=27;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=-0.0305107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.4255;QD=1.66335;RBI=0.031022;REFB=-0.00740134;REVB=0.0056093;RO=27;SAF=1;SAR=5;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.257563;STB=0.713566;TYPE=snp;VARB=0.0697354;OID=.;OPOS=61990939;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:33:34:27:27:6:7:5:1:9:18:6:1:9:18 chr20 62126185 . A G 461.17 PASS AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135109;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.5688;QD=38.4312;RBI=0.052921;REFB=0;REVB=-0.0511672;RO=0;SAF=34;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000546964;OID=.;OPOS=62126185;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:49:48:0:0:48:48:14:34:0:0:14:34:0:0 chr20 62172219 . G A 82.21 PASS AO=21;DP=50;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=-0.00214044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.335;QD=6.57653;RBI=0.0378517;REFB=-0.0252825;REVB=0.0377912;RO=27;SAF=5;SAR=16;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160798;STB=0.578234;TYPE=snp;VARB=0.0430642;OID=.;OPOS=62172219;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:50:50:27:29:21:21:16:5:10:17:16:5:10:19 chr20 62173562 . G T 70.44 PASS AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.0506126;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.848;QD=7.22455;RBI=0.0599563;REFB=-0.00372462;REVB=0.0321422;RO=22;SAF=7;SAR=10;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00270738;STB=0.501556;TYPE=snp;VARB=0.00701073;OID=.;OPOS=62173562;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:39:39:22:22:17:17:10:7:9:13:10:7:9:13 chr20 62174724 . G A 57.96 PASS AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=0.0117147;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.5019;QD=7.72816;RBI=0.028777;REFB=-0.0306502;REVB=0.0262847;RO=17;SAF=7;SAR=6;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228757;STB=0.631394;TYPE=snp;VARB=0.045397;OID=.;OPOS=62174724;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:30:30:17:17:13:13:6:7:13:4:6:7:13:4 chr20 62187187 . T C 407.77 PASS AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00852818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.604;QD=37.07;RBI=0.0122965;REFB=0;REVB=0.00885859;RO=0;SAF=23;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00110276;OID=.;OPOS=62187187;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:43:44:0:0:43:44:20:23:0:0:20:24:0:0 chr20 62187439 . T C 86.76 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0180342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.108;QD=38.5592;RBI=0.0409701;REFB=0;REVB=-0.0367874;RO=0;SAF=3;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00135318;OID=.;OPOS=62187439;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:6:3:0:0:6:3:0:0 chr20 62191321 . A G 125.83 PASS AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.9432;QD=35.9504;RBI=0.0211669;REFB=0;REVB=0.0162931;RO=0;SAF=4;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.63386e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000638721;OID=.;OPOS=62191321;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:14:14:0:0:14:14:10:4:0:0:10:4:0:0 chr20 62192042 . GC G 48.71 PASS AO=9;DP=17;FAO=12;FDP=17;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.113161;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.8293;QD=11.4613;RBI=0.170485;REFB=-0.0464853;REVB=0.127514;RO=6;SAF=4;SAR=5;SRF=5;SRR=1;SSEN=0.465116;SSEP=0;SSSB=-0.265094;STB=0.666405;TYPE=del;VARB=0.0409643;OID=.;OPOS=62192043;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:9:17:12:17:5:5:7:5:0:12:6:4:5:5:1 chr20 62194510 . T C 199.3 PASS AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0722419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.008;QD=33.2161;RBI=0.0728179;REFB=-0.160701;REVB=-0.00914036;RO=1;SAF=14;SAR=9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0486633;STB=0.526293;TYPE=snp;VARB=0.00963303;OID=.;OPOS=62194510;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:24:24:1:1:23:23:9:14:0:1:9:14:0:1 chr20 62195087 . A G 316.55 PASS AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00222223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.246;QD=37.2411;RBI=0.0518051;REFB=0;REVB=0.0517575;RO=0;SAF=14;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48532e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000124022;OID=.;OPOS=62195087;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:34:0:0:34:34:20:14:0:0:20:14:0:0 chr20 62195726 . G A 106.8 PASS AO=13;DP=14;FAO=13;FDP=14;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0236343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.084;QD=30.5141;RBI=0.087889;REFB=-0.081351;REVB=0.0846516;RO=1;SAF=7;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0603742;STB=0.533282;TYPE=snp;VARB=0.00466168;OID=.;OPOS=62195726;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:14:14:1:1:13:13:6:7:1:0:6:7:1:0 chr20 62196807 . T C 290.01 PASS AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0219719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.131;QD=37.4204;RBI=0.0616586;REFB=0;REVB=0.0576109;RO=0;SAF=9;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.15349e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000738249;OID=.;OPOS=62196807;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:31:31:0:0:31:31:22:9:0:0:22:9:0:0 chr20 62196884 . A G 296.8 PASS AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.43;QD=37.0996;RBI=0.0470818;REFB=0;REVB=-0.041031;RO=0;SAF=12;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000161101;OID=.;OPOS=62196884;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:32:32:0:0:32:32:20:12:0:0:20:12:0:0 chr20 62221610 . T C 47.92 PASS AO=15;DP=44;FAO=15;FDP=44;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=-0.0054472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.647;QD=4.35637;RBI=0.0664578;REFB=-0.00978336;REVB=-0.0662342;RO=29;SAF=11;SAR=4;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.424267;STB=0.750415;TYPE=snp;VARB=0.0288725;OID=.;OPOS=62221610;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:44:44:29:29:15:15:4:11:10:19:4:11:10:19 chr20 62227081 . A G 107.93 PASS AO=21;DP=38;FAO=21;FDP=38;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.0160076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.7002;QD=11.3614;RBI=0.0175067;REFB=-0.0527741;REVB=-0.00708804;RO=17;SAF=10;SAR=11;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0425242;STB=0.523787;TYPE=snp;VARB=0.0230756;OID=.;OPOS=62227081;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:38:38:17:17:21:21:11:10:9:8:11:10:9:8 chr20 62236148 . T C 619.38 PASS AO=55;DP=66;FAO=65;FDP=65;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=29;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.443;QD=38.1157;RBI=0.149585;REFB=0;REVB=0.148763;RO=0;SAF=29;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.40922e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00048039;OID=.;OPOS=62236148;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:67:65:0:0:55:65:26:29:0:0:36:29:0:0 chr20 62309554 . C T 913.93 PASS AO=66;DP=108;FAO=102;FDP=106;FR=.;FRO=4;FSAF=45;FSAR=57;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0086667;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=172.224;QD=34.4878;RBI=0.0146828;REFB=-0.0259454;REVB=0.0118522;RO=0;SAF=14;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511782;TYPE=snp;VARB=0.000134402;OID=.;OPOS=62309554;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:67:106:0:4:66:102:52:14:0:0:57:45:3:1 chr20 62319464 . T C 216.6 PASS AO=22;DP=22;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0256184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.653;QD=36.0995;RBI=0.17661;REFB=0;REVB=0.174743;RO=0;SAF=22;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00322205;OID=.;OPOS=62319464;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:22:24:0:0:22:24:0:22:0:0:1:23:0:0 chr20 62320968 . T C 232.5 PASS AO=25;DP=26;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0135224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.478;QD=34.4443;RBI=0.0214101;REFB=-0.113696;REVB=0.0165994;RO=0;SAF=7;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512811;TYPE=snp;VARB=0.00158389;OID=.;OPOS=62320968;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:26:27:0:1:25:26:18:7:0:0:19:7:0:1 chr20 62321655 . G A 330.38 PASS AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0312685;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.948;QD=37.7582;RBI=0.0601301;REFB=0;REVB=0.0513606;RO=0;SAF=22;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.39865e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000307301;OID=.;OPOS=62321655;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:35:35:0:0:35:35:13:22:0:0:13:22:0:0 chr20 62322288 . T C 243.55 PASS AO=20;DP=27;FAO=26;FDP=26;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0739685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.843;QD=37.469;RBI=0.0833074;REFB=0;REVB=0.0383247;RO=0;SAF=3;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00117864;OID=.;OPOS=62322288;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:27:26:0:0:20:26:17:3:0:0:19:7:0:0 chr20 62326110 . A C 84.75 PASS AO=21;DP=47;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.0227777;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.3454;QD=7.0623;RBI=0.0866883;REFB=0.00777858;REVB=-0.0836423;RO=25;SAF=6;SAR=15;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.344284;STB=0.696779;TYPE=snp;VARB=-0.0254787;OID=.;OPOS=62326110;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:47:48:25:27:21:21:15:6:16:9:15:6:17:10 chr20 62326889 . GC G 41.86 PASS AO=7;DP=18;FAO=11;FDP=16;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.37105;FXX=0.0587889;HRUN=4;LEN=1;MLLD=12.4031;QD=10.4644;RBI=0.397817;REFB=-0.0108032;REVB=0.143457;RO=7;SAF=2;SAR=5;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0.336343;SSSB=-0.252798;STB=0.576329;TYPE=del;VARB=0.103108;OID=.;OPOS=62326890;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:7:17:11:16:5:4:7:3:2:11:7:2:5:4:3 chr20 62328267 . C T 51.79 PASS AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=-0.0403146;FXX=0.062461;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.3251;QD=13.8104;RBI=0.0561124;REFB=-0.0187902;REVB=-0.0390299;RO=6;SAF=3;SAR=6;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137772;STB=0.578784;TYPE=snp;VARB=0.0440411;OID=.;OPOS=62328267;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:16:15:6:6:9:9:6:3:1:5:6:3:1:5 chr20 62328375 . A G 243.17 PASS AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.447;QD=37.4114;RBI=0.0244503;REFB=0;REVB=-0.0110852;RO=0;SAF=12;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.98015e-05;OID=.;OPOS=62328375;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:26:26:0:0:26:26:14:12:0:0:14:12:0:0 chr20 62328453 . T C 59 PASS AO=8;DP=11;FAO=8;FDP=11;FR=.;FRO=3;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0513202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.939;QD=21.4539;RBI=0.0541282;REFB=-0.03148;REVB=0.0172074;RO=3;SAF=5;SAR=3;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141139;STB=0.581188;TYPE=snp;VARB=0.0156778;OID=.;OPOS=62328453;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:11:11:3:3:8:8:3:5:1:2:3:5:1:2 chr20 62328829 . C G 99.49 PASS AO=17;DP=27;FAO=17;FDP=27;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0157548;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=157.239;QD=14.7398;RBI=0.0157549;REFB=-0.0291883;REVB=5.33777e-05;RO=8;SAF=5;SAR=12;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0545239;STB=0.502615;TYPE=snp;VARB=0.0107828;OID=.;OPOS=62328829;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:27:27:8:10:17:17:12:5:3:5:12:5:3:7 chr20 62331989 . T G 80.12 PASS AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=13;FWDB=-0.143667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4606;QD=10.3385;RBI=0.145272;REFB=-0.00894038;REVB=-0.0215391;RO=15;SAF=3;SAR=13;SRF=2;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0805619;STB=0.545401;TYPE=snp;VARB=0.00681145;OID=.;OPOS=62331989;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:31:31:15:15:16:16:13:3:2:13:13:3:2:13 chr20 62332638 . A AC 309.34 PASS AO=31;DP=103;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.108582;FXX=0.4848;HRUN=2;LEN=1;MLLD=14.5964;QD=24.2618;RBI=0.208943;REFB=-0.0102647;REVB=-0.178514;RO=64;SAF=3;SAR=28;SRF=27;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.517838;STB=0.507689;TYPE=ins;VARB=0.00597785;OID=.;OPOS=62332639;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:31:103:50:51:1:18:32:0:1:25:64:3:28:27:37 chr20 62332641 . T C 267.06 PASS AO=57;DP=101;FAO=56;FDP=103;FR=.;FRO=47;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=4;FSRR=43;FWDB=0.0799378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.055;QD=10.3711;RBI=0.0829186;REFB=-0.00893546;REVB=0.0220327;RO=43;SAF=27;SAR=30;SRF=3;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.328358;STB=0.683729;TYPE=snp;VARB=0.0162481;OID=.;OPOS=62332641;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:103:43:47:57:56:30:27:3:40:29:27:4:43 chr20 62332679 . C T 245.45 PASS AO=51;DP=96;FAO=52;FDP=97;FR=.;FRO=45;FSAF=19;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=44;FWDB=0.0410714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.4501;QD=10.1216;RBI=0.0469149;REFB=-0.0493926;REVB=0.0226747;RO=45;SAF=18;SAR=33;SRF=1;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.349653;STB=0.689063;TYPE=snp;VARB=0.0303078;OID=.;OPOS=62332679;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:97:45:45:51:52:33:18:1:44:33:19:1:44 chr20 62340115 . C G 267.1 PASS AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0128251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.533;QD=38.1573;RBI=0.0298291;REFB=0;REVB=0.0269313;RO=0;SAF=5;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000103187;OID=.;OPOS=62340115;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:27:28:0:0:27:28:22:5:0:0:23:5:0:0 chr20 62369647 . G A 31.58 PASS AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.00657773;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=291.07;QD=9.71619;RBI=0.0329428;REFB=-0.00841729;REVB=-0.0322794;RO=6;SAF=5;SAR=1;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.550714;STB=0.852542;TYPE=snp;VARB=0.0146672;OID=.;OPOS=62369647;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:12:13:6:7:6:6:1:5:1:5:1:5:1:6 chr20 62372813 . G A 263.28 PASS AO=31;DP=33;FAO=31;FDP=33;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.022244;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.641;QD=31.9123;RBI=0.0230559;REFB=0.00694457;REVB=0.00606435;RO=1;SAF=6;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0183034;STB=0.528682;TYPE=snp;VARB=-0.000648228;OID=.;OPOS=62372813;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:33:33:1:2:31:31:25:6:0:1:25:6:1:1 chr20 62378349 . C T 40.83 PASS AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.0995947;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.7152;QD=6.53237;RBI=0.100186;REFB=-0.0256481;REVB=-0.0108706;RO=15;SAF=5;SAR=5;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101015;STB=0.559882;TYPE=snp;VARB=0.0616317;OID=.;OPOS=62378349;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:25:25:15:15:10:10:5:5:9:6:5:5:9:6 chr20 62378364 . C T 48.24 PASS AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=0.0435603;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.126;QD=7.71878;RBI=0.0436348;REFB=-0.0105779;REVB=-0.00254979;RO=14;SAF=5;SAR=6;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.245576;STB=0.642612;TYPE=snp;VARB=0.0149546;OID=.;OPOS=62378364;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:25:25:14:14:11:11:6:5:10:4:6:5:10:4 chr20 62407104 . C T 122.62 PASS AO=25;DP=50;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=0.0177875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.059;QD=9.61707;RBI=0.0212234;REFB=-0.0258841;REVB=-0.0115774;RO=25;SAF=8;SAR=17;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.514275;TYPE=snp;VARB=0.0183806;OID=.;OPOS=62407104;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:51:25:25:25:26:17:8:8:17:17:9:8:17 chr20 62474836 . TG T 108.91 PASS AO=19;DP=25;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0249803;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=10.7171;QD=18.1519;RBI=0.0558615;REFB=-0.0122194;REVB=0.0499649;RO=2;SAF=3;SAR=16;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0.432526;SSSB=-0.103086;STB=0.513502;TYPE=del;VARB=0.00711234;OID=.;OPOS=62474837;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:19:23:23:24:1:5:18:0:1:6:2:3:16:1:1 chr20 62576030 . GC G 643.78 PASS AO=90;DP=113;FAO=106;FDP=107;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.251158;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=15.2142;QD=24.0665;RBI=0.275854;REFB=-0.0550569;REVB=-0.114082;RO=12;SAF=30;SAR=60;SRF=11;SRR=1;SSEN=0.451456;SSEP=0;SSSB=-0.138243;STB=0.503999;TYPE=del;VARB=0.0143491;OID=.;OPOS=62576031;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:90:107:106:107:1:44:62:0:1:45:12:30:60:11:1 chr20 62595169 . A G 218.84 PASS AO=55;DP=119;FAO=55;FDP=120;FR=.;FRO=65;FSAF=12;FSAR=43;FSRF=26;FSRR=39;FWDB=0.00389835;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=242.222;QD=7.29473;RBI=0.00614771;REFB=-0.00640063;REVB=0.00475364;RO=64;SAF=12;SAR=43;SRF=26;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226098;STB=0.624091;TYPE=snp;VARB=0.00621485;OID=.;OPOS=62595169;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:120:64:65:55:55:43:12:26:38:43:12:26:39 chr20 62597694 . T G 88.75 PASS AO=33;DP=100;FAO=33;FDP=101;FR=.;FRO=68;FSAF=24;FSAR=9;FSRF=30;FSRR=38;FWDB=0.0136616;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=257.478;QD=3.51504;RBI=0.0234736;REFB=-0.00178134;REVB=-0.0190885;RO=67;SAF=24;SAR=9;SRF=30;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.332948;STB=0.698761;TYPE=snp;VARB=0.00408114;OID=.;OPOS=62597694;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:100:101:67:68:33:33:9:24:30:37:9:24:30:38 chr20 62714783 . C G 1339.31 PASS AO=135;DP=135;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00953609;FXX=0.00694396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.612;QD=37.4632;RBI=0.0232986;REFB=0;REVB=0.0212577;RO=0;SAF=22;SAR=113;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.2338e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00138221;OID=.;OPOS=62714783;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:135:143:0:0:135:143:113:22:0:0:120:23:0:0 chr20 62729431 . C T 86.08 PASS AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.016096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.559;QD=9.83765;RBI=0.0250791;REFB=-0.0243967;REVB=0.0192323;RO=16;SAF=2;SAR=16;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.364493;STB=0.734373;TYPE=snp;VARB=0.0321533;OID=.;OPOS=62729431;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:34:35:16:17:18:18:16:2:6:10:16:2:7:10 chr20 62737318 . G A 163.42 PASS AO=27;DP=41;FAO=27;FDP=41;FR=.;FRO=14;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=0.00363316;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=249.264;QD=15.9431;RBI=0.0151346;REFB=-0.0514052;REVB=0.0146921;RO=14;SAF=18;SAR=9;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.033762;STB=0.518505;TYPE=snp;VARB=0.0225878;OID=.;OPOS=62737318;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:41:41:14:14:27:27:9:18:10:4:9:18:10:4 chr20 62737537 . C A 241.69 PASS AO=40;DP=64;FAO=43;FDP=67;FR=.;FRO=24;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.0178817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.107;QD=14.4292;RBI=0.0281076;REFB=-0.0332879;REVB=-0.021686;RO=24;SAF=26;SAR=14;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0187293;STB=0.507644;TYPE=snp;VARB=0.0526605;OID=.;OPOS=62737537;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:64:67:24:24:40:43:14:26:15:9:17:26:15:9 chr20 62737568 . T C 186.93 PASS AO=33;DP=61;FAO=37;FDP=65;FR=.;FRO=28;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.000180453;FXX=0.0298463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.963;QD=11.5035;RBI=0.00481995;REFB=-0.0499542;REVB=0.00481657;RO=27;SAF=17;SAR=16;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.063197;STB=0.501694;TYPE=snp;VARB=0.0298735;OID=.;OPOS=62737568;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:65:27:28:33:37:16:17:16:11:16:21:16:12 chr20 62738311 . G A 102.62 PASS AO=33;DP=94;FAO=34;FDP=95;FR=.;FRO=61;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=33;FWDB=0.0106325;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.01;QD=4.32075;RBI=0.0194165;REFB=-0.00495645;REVB=0.0162465;RO=60;SAF=13;SAR=20;SRF=27;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0645843;STB=0.550833;TYPE=snp;VARB=0.00955055;OID=.;OPOS=62738311;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:95:60:61:33:34:20:13:27:33:21:13:28:33 chr20 62871232 . C T 145.27 PASS AO=40;DP=95;FAO=40;FDP=95;FR=.;FRO=55;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=25;FSRR=30;FWDB=0.00354769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.117;QD=6.11645;RBI=0.00409208;REFB=-0.0113703;REVB=-0.00203938;RO=55;SAF=14;SAR=26;SRF=25;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113087;STB=0.563927;TYPE=snp;VARB=0.015988;OID=.;OPOS=62871232;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:55:55:40:40:26:14:25:30:26:14:25:30 chr20 62872106 . G T 93.63 PASS AO=23;DP=54;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=7;FWDB=0.0250399;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.1661;QD=6.93525;RBI=0.046367;REFB=-0.0257159;REVB=-0.0390244;RO=31;SAF=10;SAR=13;SRF=24;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.334275;STB=0.667546;TYPE=snp;VARB=0.0305925;OID=.;OPOS=62872106;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:54:54:31:30:23:24:13:10:24:7:13:11:23:7 chr20 62959184 . T C 33.67 PASS AO=7;DP=17;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.0618334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=44.4464;QD=7.9224;RBI=0.0724311;REFB=-0.0580801;REVB=0.0377212;RO=10;SAF=1;SAR=6;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.558176;STB=0.841088;TYPE=snp;VARB=0.0735578;OID=.;OPOS=62959184;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:33:17:17:10:10:7:7:6:1:7:3:6:1:7:3 chr21 9907271 . A G 1333.49 PASS AO=214;DP=307;FAO=221;FDP=314;FR=.;FRO=93;FSAF=115;FSAR=106;FSRF=47;FSRR=46;FWDB=-0.0423956;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.8347;QD=16.9872;RBI=0.0643386;REFB=-0.0422579;REVB=-0.0483949;RO=93;SAF=115;SAR=99;SRF=47;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0182134;STB=0.504444;TYPE=snp;VARB=0.0203695;OID=.;OPOS=9907271;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:307:314:93:93:214:221:99:115:47:46:106:115:47:46 chr21 9907302 . C T 37.95 PASS AO=62;DP=367;FAO=62;FDP=366;FR=.;FRO=304;FSAF=24;FSAR=38;FSRF=144;FSRR=160;FWDB=-0.011603;FXX=0.00272472;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.043;QD=0.414753;RBI=0.0287048;REFB=-0.00809642;REVB=-0.0262552;RO=304;SAF=24;SAR=38;SRF=144;SRR=160;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11405;STB=0.573252;TYPE=snp;VARB=0.0364815;OID=.;OPOS=9907302;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:367:366:304:304:62:62:38:24:144:160:38:24:144:160 chr21 9907322 . G T 42.61 PASS AO=64;DP=368;FAO=64;FDP=367;FR=.;FRO=303;FSAF=24;FSAR=40;FSRF=145;FSRR=158;FWDB=0.00799858;FXX=0.00271732;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.5026;QD=0.464401;RBI=0.0185237;REFB=0.00384269;REVB=0.0167078;RO=303;SAF=24;SAR=40;SRF=145;SRR=158;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136562;STB=0.587186;TYPE=snp;VARB=-0.024234;OID=.;OPOS=9907322;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:368:367:303:303:64:64:40:24:145:158:40:24:145:158 chr21 9907340 . A G 476.18 PASS AO=143;DP=342;FAO=141;FDP=340;FR=.;FRO=199;FSAF=62;FSAR=79;FSRF=92;FSRR=107;FWDB=-0.00286667;FXX=0.00293247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.114;QD=5.60208;RBI=0.0176048;REFB=-0.0134821;REVB=-0.0173699;RO=196;SAF=62;SAR=81;SRF=91;SRR=105;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0323076;STB=0.513375;TYPE=snp;VARB=0.019805;OID=.;OPOS=9907340;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:342:340:196:199:143:141:81:62:91:105:79:62:92:107 chr21 9907345 . C T 463.83 PASS AO=138;DP=327;FAO=138;FDP=334;FR=.;FRO=196;FSAF=58;FSAR=80;FSRF=88;FSRR=108;FWDB=0.00924362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.639;QD=5.55485;RBI=0.0262187;REFB=-0.0166085;REVB=-0.0245352;RO=180;SAF=58;SAR=80;SRF=86;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0594522;STB=0.517178;TYPE=snp;VARB=0.0219721;OID=.;OPOS=9907345;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:327:334:180:196:138:138:80:58:86:94:80:58:88:108 chr21 9907375 . T C 1344.87 PASS AO=211;DP=293;FAO=211;FDP=290;FR=.;FRO=79;FSAF=94;FSAR=117;FSRF=35;FSRR=44;FWDB=0.00580348;FXX=0.0102386;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.8428;QD=18.5499;RBI=0.0292501;REFB=0.0109799;REVB=-0.0286686;RO=78;SAF=93;SAR=118;SRF=34;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00249697;STB=0.500678;TYPE=snp;VARB=-0.00392465;OID=.;OPOS=9907375;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:293:290:78:79:211:211:118:93:34:44:117:94:35:44 chr21 9907384 . G A 1342.82 PASS AO=207;DP=284;FAO=208;FDP=283;FR=.;FRO=75;FSAF=88;FSAR=120;FSRF=34;FSRR=41;FWDB=0.0129916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.305;QD=18.9798;RBI=0.0173167;REFB=-0.0408399;REVB=0.0114493;RO=75;SAF=88;SAR=119;SRF=34;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0143671;STB=0.508191;TYPE=snp;VARB=0.00833357;OID=.;OPOS=9907384;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:284:283:75:75:207:208:119:88:34:41:120:88:34:41 chr21 9907397 . C T 1225.04 PASS AO=191;DP=263;FAO=191;FDP=262;FR=.;FRO=71;FSAF=77;FSAR=114;FSRF=33;FSRR=38;FWDB=0.024039;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.1121;QD=18.7029;RBI=0.0240391;REFB=-0.023105;REVB=-7.44443e-05;RO=70;SAF=77;SAR=114;SRF=33;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.035413;STB=0.51724;TYPE=snp;VARB=0.0193108;OID=.;OPOS=9907397;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:263:262:70:71:191:191:114:77:33:37:114:77:33:38 chr21 9907416 . C T 409.48 PASS AO=103;DP=221;FAO=103;FDP=220;FR=.;FRO=117;FSAF=30;FSAR=73;FSRF=39;FSRR=78;FWDB=-0.0150359;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=135.889;QD=7.4451;RBI=0.0191714;REFB=-0.0255453;REVB=0.0118939;RO=118;SAF=30;SAR=73;SRF=39;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0448804;STB=0.526492;TYPE=snp;VARB=0.0215021;OID=.;OPOS=9907416;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:220:118:117:103:103:73:30:39:79:73:30:39:78 chr21 9907419 . A G 111.59 PASS AO=58;DP=213;FAO=58;FDP=211;FR=.;FRO=153;FSAF=15;FSAR=43;FSRF=46;FSRR=107;FWDB=-0.0397086;FXX=0.00471676;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.268;QD=2.11542;RBI=0.0419156;REFB=-0.0200408;REVB=-0.0134219;RO=151;SAF=15;SAR=43;SRF=43;SRR=108;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0407195;STB=0.538258;TYPE=snp;VARB=0.0430106;OID=.;OPOS=9907419;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:213:211:151:153:58:58:43:15:43:108:43:15:46:107 chr21 9907422 . G A 100.72 PASS AO=54;DP=202;FAO=54;FDP=201;FR=.;FRO=147;FSAF=15;FSAR=39;FSRF=41;FSRR=106;FWDB=0.00581766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5169;QD=2.00427;RBI=0.0229247;REFB=-0.0172118;REVB=0.0221743;RO=146;SAF=15;SAR=39;SRF=39;SRR=107;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0165442;STB=0.501032;TYPE=snp;VARB=0.0353501;OID=.;OPOS=9907422;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:201:146:147:54:54:39:15:39:107:39:15:41:106 chr21 9907503 . C A 88.48 PASS AO=13;DP=19;FAO=13;FDP=18;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0060281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.808;QD=19.662;RBI=0.0154378;REFB=0.00701918;REVB=0.0142123;RO=6;SAF=2;SAR=11;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194202;STB=0.592469;TYPE=snp;VARB=-0.00304107;OID=.;OPOS=9907503;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:19:18:6:5:13:13:11:2:0:6:11:2:0:5 chr21 9907529 . G A 14.36 PASS AO=3;DP=10;FAO=3;FDP=10;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=40.704;QD=5.74374;RBI=0.115368;REFB=0.0587361;REVB=0.115368;RO=7;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.103038;OID=.;OPOS=9907529;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:10:10:7:7:3:3:3:0:0:7:3:0:0:7 chr21 9908330 . A G 845.92 PASS AO=108;DP=124;FAO=108;FDP=124;FR=.;FRO=16;FSAF=44;FSAR=64;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=0.0101205;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.336;QD=27.2877;RBI=0.016766;REFB=-0.00439096;REVB=-0.0133668;RO=16;SAF=44;SAR=64;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0849085;STB=0.545004;TYPE=snp;VARB=0.00105427;OID=.;OPOS=9908330;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:124:124:16:16:108:108:64:44:12:4:64:44:12:4 chr21 9908331 . C G 570.88 PASS AO=89;DP=124;FAO=89;FDP=123;FR=.;FRO=34;FSAF=39;FSAR=50;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.00629323;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.903;QD=18.5651;RBI=0.00657005;REFB=-0.020651;REVB=0.00188703;RO=34;SAF=39;SAR=50;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0322204;STB=0.517269;TYPE=snp;VARB=0.00638252;OID=.;OPOS=9908331;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:124:123:34:34:89:89:50:39:17:17:50:39:17:17 chr21 9909078 . G A 109.52 PASS AO=40;DP=122;FAO=41;FDP=122;FR=.;FRO=81;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=47;FSRR=34;FWDB=-0.0274211;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.304;QD=3.5909;RBI=0.0607302;REFB=-0.0173036;REVB=0.0541871;RO=81;SAF=23;SAR=17;SRF=47;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00621444;STB=0.513023;TYPE=snp;VARB=0.0523436;OID=.;OPOS=9909078;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:81:81:40:41:17:23:47:34:18:23:47:34 chr21 9909080 . G A 113.68 PASS AO=42;DP=126;FAO=42;FDP=125;FR=.;FRO=83;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=47;FSRR=36;FWDB=-0.00681494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.702;QD=3.63777;RBI=0.0333212;REFB=-0.0298216;REVB=0.0326169;RO=83;SAF=24;SAR=18;SRF=47;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00605548;STB=0.503495;TYPE=snp;VARB=0.0489308;OID=.;OPOS=9909080;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:125:83:83:42:42:18:24:47:36:18:24:47:36 chr21 9909121 . C T 53.59 PASS AO=38;DP=166;FAO=38;FDP=168;FR=.;FRO=130;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=67;FSRR=63;FWDB=-0.00166989;FXX=0.00591681;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.861;QD=1.27603;RBI=0.0179291;REFB=-0.0101536;REVB=0.0178512;RO=125;SAF=21;SAR=17;SRF=68;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0109867;STB=0.528952;TYPE=snp;VARB=0.0415699;OID=.;OPOS=9909121;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:166:168:125:130:38:38:17:21:68:57:17:21:67:63 chr21 9909176 . C A 637.95 PASS AO=97;DP=137;FAO=101;FDP=139;FR=.;FRO=38;FSAF=41;FSAR=60;FSRF=28;FSRR=10;FWDB=0.0326262;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.7947;QD=18.3581;RBI=0.0368179;REFB=-0.00447528;REVB=-0.0170612;RO=37;SAF=40;SAR=57;SRF=28;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177112;STB=0.590567;TYPE=snp;VARB=0.00200284;OID=.;OPOS=9909176;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:137:139:37:38:97:101:57:40:28:9:60:41:28:10 chr21 9909179 . C A 153.1 PASS AO=37;DP=116;FAO=49;FDP=130;FR=.;FRO=81;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=40;FSRR=41;FWDB=0.00280672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.738;QD=4.71061;RBI=0.028316;REFB=-0.0113348;REVB=0.0281765;RO=77;SAF=13;SAR=24;SRF=40;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199164;STB=0.51525;TYPE=snp;VARB=0.0170257;OID=.;OPOS=9909179;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:130:77:81:37:49:24:13:40:37:26:23:40:41 chr21 9909208 . C T 90.25 PASS AO=27;DP=84;FAO=31;FDP=90;FR=.;FRO=59;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=37;FWDB=0.0563016;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.105;QD=4.01127;RBI=0.0585127;REFB=-0.014272;REVB=-0.0159333;RO=56;SAF=14;SAR=13;SRF=22;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14473;STB=0.633719;TYPE=snp;VARB=0.0598033;OID=.;OPOS=9909208;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:84:90:56:59:27:31:13:14:22:34:13:18:22:37 chr21 9909218 . G A 78.79 PASS AO=26;DP=72;FAO=26;FDP=74;FR=.;FRO=48;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=34;FWDB=-0.00236816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.9721;QD=4.25917;RBI=0.0191554;REFB=-0.0322551;REVB=0.0190084;RO=46;SAF=12;SAR=14;SRF=14;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178791;STB=0.612685;TYPE=snp;VARB=0.050092;OID=.;OPOS=9909218;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:72:74:46:48:26:26:14:12:14:32:14:12:14:34 chr21 9909219 . T C 87.06 PASS AO=27;DP=72;FAO=27;FDP=74;FR=.;FRO=47;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=34;FWDB=0.0104366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.865;QD=4.70608;RBI=0.0214549;REFB=-0.0117518;REVB=0.0187454;RO=45;SAF=13;SAR=14;SRF=13;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21321;STB=0.631489;TYPE=snp;VARB=0.0122871;OID=.;OPOS=9909219;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:72:74:45:47:27:27:14:13:13:32:14:13:13:34 chr21 10862599 . C T 3677.85 PASS AO=444;DP=457;FAO=393;FDP=393;FR=.;FRO=0;FSAF=176;FSAR=217;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0225852;FXX=0.0174996;HRUN=4;LEN=1;MLLD=183.99;QD=37.4335;RBI=0.0379585;REFB=-0.118129;REVB=0.0305083;RO=9;SAF=196;SAR=248;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000115435;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000245637;OID=.;OPOS=10862599;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:457:393:9:0:444:393:248:196:4:5:217:176:0:0 chr21 10862618 . T C 3751.46 PASS AO=462;DP=469;FAO=393;FDP=393;FR=.;FRO=0;FSAF=176;FSAR=217;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00442176;FXX=0.0174996;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.976;QD=38.1828;RBI=0.030705;REFB=-0.0350431;REVB=0.030385;RO=0;SAF=201;SAR=261;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.49642e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.3055e-06;OID=.;OPOS=10862618;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:469:393:0:0:462:393:261:201:0:0:217:176:0:0 chr21 10862846 . A T 1863.35 PASS AO=195;DP=196;FAO=195;FDP=195;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00473562;FXX=0.00510178;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.562;QD=38.2226;RBI=0.0163715;REFB=0;REVB=-0.0156716;RO=0;SAF=74;SAR=121;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.72594e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.62502e-05;OID=.;OPOS=10862846;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:196:195:0:0:195:195:121:74:0:0:120:75:0:0 chr21 10862853 . G A 1145.21 PASS AO=161;DP=201;FAO=161;FDP=201;FR=.;FRO=40;FSAF=67;FSAR=94;FSRF=13;FSRR=27;FWDB=-0.0102015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.9434;QD=22.7902;RBI=0.0109027;REFB=0.00404132;REVB=-0.00384705;RO=40;SAF=67;SAR=94;SRF=13;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0353915;STB=0.518779;TYPE=snp;VARB=-0.0012678;OID=.;OPOS=10862853;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:201:201:40:40:161:161:94:67:13:27:94:67:13:27 chr21 10862874 . A G 1878.69 PASS AO=196;DP=196;FAO=196;FDP=196;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0580319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9985;QD=38.3407;RBI=0.0583218;REFB=0;REVB=0.00580748;RO=0;SAF=91;SAR=105;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.42894e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000236691;OID=.;OPOS=10862874;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:89:196:196:0:0:196:196:105:91:0:0:105:91:0:0 chr21 10862947 . G A 1937.16 PASS AO=197;DP=197;FAO=203;FDP=203;FR=.;FRO=0;FSAF=126;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0303168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.16;QD=38.1706;RBI=0.0425845;REFB=0;REVB=0.0299055;RO=0;SAF=123;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.64964e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.36176e-05;OID=.;OPOS=10862947;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:92:197:203:0:0:197:203:74:123:0:0:77:126:0:0 chr21 10909712 . C T 57.02 PASS AO=37;DP=158;FAO=37;FDP=157;FR=.;FRO=120;FSAF=9;FSAR=28;FSRF=33;FSRR=87;FWDB=0.00315733;FXX=0.00632871;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.8939;QD=1.45277;RBI=0.0102402;REFB=0.00549688;REVB=-0.00974131;RO=121;SAF=9;SAR=28;SRF=33;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0486493;STB=0.531868;TYPE=snp;VARB=-0.0182205;OID=.;OPOS=10909712;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:158:157:121:120:37:37:28:9:33:88:28:9:33:87 chr21 10910311 . T G 388.18 PASS AO=90;DP=180;FAO=90;FDP=180;FR=.;FRO=90;FSAF=43;FSAR=47;FSRF=37;FSRR=53;FWDB=0.00512122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.331;QD=8.62621;RBI=0.0125774;REFB=-0.00705248;REVB=0.0114876;RO=88;SAF=43;SAR=47;SRF=37;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0518336;STB=0.533491;TYPE=snp;VARB=0.00992253;OID=.;OPOS=10910311;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:180:88:90:90:90:47:43:37:51:47:43:37:53 chr21 10910347 . A G 811.6 PASS AO=126;DP=178;FAO=129;FDP=181;FR=.;FRO=52;FSAF=60;FSAR=69;FSRF=17;FSRR=35;FWDB=0.00528183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.6086;QD=17.9358;RBI=0.02811;REFB=-0.00175899;REVB=-0.0276094;RO=50;SAF=59;SAR=67;SRF=16;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0795364;STB=0.540113;TYPE=snp;VARB=0.000490343;OID=.;OPOS=10910347;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:181:50:52:126:129:67:59:16:34:69:60:17:35 chr21 10920098 . T C 1324.51 PASS AO=146;DP=151;FAO=146;FDP=150;FR=.;FRO=4;FSAF=111;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.00399577;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=192.62;QD=35.3202;RBI=0.0233018;REFB=-0.103609;REVB=0.0229566;RO=4;SAF=111;SAR=35;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0513017;STB=0.527023;TYPE=snp;VARB=9.31895e-05;OID=.;OPOS=10920098;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:151:150:4:4:146:146:35:111:0:4:35:111:0:4 chr21 11029596 . AC A 125.66 PASS AO=134;DP=345;FAO=122;FDP=340;FR=.;FRO=218;FSAF=108;FSAR=14;FSRF=106;FSRR=112;FWDB=-0.104804;FXX=0.0116276;HRUN=2;LEN=1;MLLD=16.6913;QD=1.47839;RBI=0.126341;REFB=-0.0989283;REVB=-0.0705565;RO=189;SAF=120;SAR=14;SRF=84;SRR=105;SSEN=0;SSEP=0.227959;SSSB=0.586856;STB=0.8195;TYPE=del;VARB=0.096809;OID=.;OPOS=11029597;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:134:339:122:340:218:108:14:106:112:99:189:120:14:84:105 chr21 11029616 . G T 493.62 PASS AO=151;DP=357;FAO=148;FDP=359;FR=.;FRO=211;FSAF=83;FSAR=65;FSRF=146;FSRR=65;FWDB=-0.00227883;FXX=0.00828706;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.8235;QD=5.49994;RBI=0.0159886;REFB=0.0146312;REVB=0.0158254;RO=206;SAF=84;SAR=67;SRF=145;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158887;STB=0.579737;TYPE=snp;VARB=-0.024454;OID=.;OPOS=11029616;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:357:359:206:211:151:148:67:84:145:61:65:83:146:65 chr21 11029624 . C T 173.01 PASS AO=98;DP=355;FAO=97;FDP=359;FR=.;FRO=262;FSAF=60;FSAR=37;FSRF=169;FSRR=93;FWDB=0.000990622;FXX=0.0027777;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.239;QD=1.92763;RBI=0.0649156;REFB=-0.0045663;REVB=-0.064908;RO=254;SAF=60;SAR=38;SRF=167;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0597725;STB=0.520674;TYPE=snp;VARB=0.00872569;OID=.;OPOS=11029624;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:355:359:254:262:98:97:38:60:167:87:37:60:169:93 chr21 11029630 . GC G 186.94 PASS AO=93;DP=350;FAO=96;FDP=338;FR=.;FRO=242;FSAF=60;FSAR=36;FSRF=148;FSRR=94;FWDB=0.0145674;FXX=0.0259359;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.289;QD=2.21228;RBI=0.0318424;REFB=0.00119759;REVB=0.0283148;RO=246;SAF=59;SAR=34;SRF=151;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0271546;STB=0.510202;TYPE=del;VARB=-0.00468326;OID=.;OPOS=11029631;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:93:349:96:338:242:60:36:148:94:99:246:59:34:151:95 chr21 11029679 . C G 395.73 PASS AO=133;DP=357;FAO=134;FDP=357;FR=.;FRO=223;FSAF=65;FSAR=69;FSRF=117;FSRR=106;FWDB=-0.00641218;FXX=0.00557088;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.987;QD=4.4339;RBI=0.0120965;REFB=-0.00483272;REVB=-0.0102571;RO=221;SAF=65;SAR=68;SRF=114;SRR=107;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0300299;STB=0.524711;TYPE=snp;VARB=0.00858612;OID=.;OPOS=11029679;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:357:357:221:223:133:134:68:65:114:107:69:65:117:106 chr21 11038796 . T C 89.22 PASS AO=114;DP=555;FAO=84;FDP=400;FR=.;FRO=316;FSAF=36;FSAR=48;FSRF=152;FSRR=164;FWDB=-0.0218657;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=247.333;QD=0.892249;RBI=0.0319268;REFB=-0.00537723;REVB=-0.023264;RO=439;SAF=49;SAR=65;SRF=211;SRR=228;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0662078;STB=0.541777;TYPE=snp;VARB=0.0189531;OID=.;OPOS=11038796;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:555:400:439:316:114:84:65:49:211:228:48:36:152:164 chr21 11038843 . G C 1098.53 PASS AO=244;DP=433;FAO=225;FDP=397;FR=.;FRO=172;FSAF=113;FSAR=112;FSRF=78;FSRR=94;FWDB=0.0877329;FXX=0.00749981;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.6182;QD=11.0683;RBI=0.095492;REFB=-0.0496047;REVB=0.0377049;RO=185;SAF=124;SAR=120;SRF=84;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0430894;STB=0.521109;TYPE=snp;VARB=0.0505933;OID=.;OPOS=11038843;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:433:397:185:172:244:225:120:124:84:101:112:113:78:94 chr21 11057855 . A T 1052.45 PASS AO=175;DP=255;FAO=175;FDP=255;FR=.;FRO=80;FSAF=85;FSAR=90;FSRF=44;FSRR=36;FWDB=-0.00884682;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.57;QD=16.5089;RBI=0.0125304;REFB=-0.0168738;REVB=0.00887389;RO=79;SAF=85;SAR=90;SRF=44;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0413777;STB=0.520159;TYPE=snp;VARB=0.00942529;OID=.;OPOS=11057855;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:255:255:79:80:175:175:90:85:44:35:90:85:44:36 chr21 11057888 . T A 231.9 PASS AO=92;DP=275;FAO=93;FDP=280;FR=.;FRO=187;FSAF=36;FSAR=57;FSRF=102;FSRR=85;FWDB=-0.0207929;FXX=0.00355859;HRUN=3;LEN=1;MLLD=153.456;QD=3.31281;RBI=0.0217429;REFB=-0.00845395;REVB=0.00635653;RO=183;SAF=36;SAR=56;SRF=98;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168489;STB=0.60608;TYPE=snp;VARB=0.0143901;OID=.;OPOS=11057888;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:275:280:183:187:92:93:56:36:98:85:57:36:102:85 chr21 11057929 . T C 29.82 PASS AO=41;DP=238;FAO=41;FDP=237;FR=.;FRO=196;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=80;FSRR=116;FWDB=0.00556096;FXX=0.0042015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.096;QD=0.503342;RBI=0.0203775;REFB=-0.00270824;REVB=0.019604;RO=196;SAF=18;SAR=23;SRF=80;SRR=116;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0407315;STB=0.52606;TYPE=snp;VARB=0.00729767;OID=.;OPOS=11057929;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:238:237:196:196:41:41:23:18:80:116:23:18:80:116 chr21 11058226 . G C 522.73 PASS AO=192;DP=469;FAO=161;FDP=399;FR=.;FRO=238;FSAF=101;FSAR=60;FSRF=111;FSRR=127;FWDB=0.00118954;FXX=0.00249994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.427;QD=5.24038;RBI=0.00238487;REFB=-0.000620377;REVB=0.00206703;RO=275;SAF=122;SAR=70;SRF=120;SRR=155;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212186;STB=0.597545;TYPE=snp;VARB=0.00110565;OID=.;OPOS=11058226;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:469:399:275:238:192:161:70:122:120:155:60:101:111:127 chr21 11097608 . C T 86.42 PASS AO=32;DP=96;FAO=32;FDP=96;FR=.;FRO=64;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=31;FSRR=33;FWDB=-0.00199947;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.1385;QD=3.601;RBI=0.018175;REFB=-0.0347474;REVB=0.0180647;RO=64;SAF=13;SAR=19;SRF=31;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0909782;STB=0.552877;TYPE=snp;VARB=0.0753544;OID=.;OPOS=11097608;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:96:96:64:64:32:32:19:13:31:33:19:13:31:33 chr21 11098674 . T C 351.11 PASS AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0333363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.601;QD=37.9583;RBI=0.0336369;REFB=0;REVB=0.00448639;RO=0;SAF=21;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.7558e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000162695;OID=.;OPOS=11098674;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:37:37:0:0:37:37:16:21:0:0:16:21:0:0 chr21 11098723 . T C 198.77 PASS AO=39;DP=69;FAO=39;FDP=69;FR=.;FRO=30;FSAF=1;FSAR=38;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=-0.0451967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.827;QD=11.523;RBI=0.0489835;REFB=-0.0284115;REVB=-0.0188849;RO=30;SAF=1;SAR=38;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.691753;STB=0.897876;TYPE=snp;VARB=0.0379781;OID=.;OPOS=11098723;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:30:30:39:39:38:1:12:18:38:1:12:18 chr21 11098732 . C T 182.84 PASS AO=37;DP=67;FAO=37;FDP=67;FR=.;FRO=30;FSAF=1;FSAR=36;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=0.010172;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.824;QD=10.9158;RBI=0.0284856;REFB=-0.0492883;REVB=0.0266076;RO=30;SAF=1;SAR=36;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.669802;STB=0.88675;TYPE=snp;VARB=0.0219318;OID=.;OPOS=11098732;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:30:30:37:37:36:1:11:19:36:1:11:19 chr21 11098756 . C A 213.03 PASS AO=46;DP=75;FAO=43;FDP=75;FR=.;FRO=32;FSAF=5;FSAR=38;FSRF=8;FSRR=24;FWDB=0.0316175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.6002;QD=11.3616;RBI=0.0406772;REFB=-0.0296369;REVB=0.0255925;RO=27;SAF=5;SAR=41;SRF=8;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252947;STB=0.614367;TYPE=snp;VARB=0.0364968;OID=.;OPOS=11098756;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:27:32:46:43:41:5:8:19:38:5:8:24 chr21 11098763 . C T 273.16 PASS AO=49;DP=78;FAO=49;FDP=78;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=44;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=-0.024579;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.137;QD=14.0084;RBI=0.0486995;REFB=-0.0827251;REVB=0.0420418;RO=28;SAF=5;SAR=44;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.32587;STB=0.676835;TYPE=snp;VARB=0.0702357;OID=.;OPOS=11098763;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:78:78:28:29:49:49:44:5:10:18:44:5:10:19 chr21 14419915 . A G 424.83 PASS AO=311;DP=816;FAO=147;FDP=398;FR=.;FRO=251;FSAF=81;FSAR=66;FSRF=141;FSRR=110;FWDB=0.00266272;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.176;QD=4.26965;RBI=0.0518461;REFB=-0.00925645;REVB=0.0517777;RO=502;SAF=164;SAR=147;SRF=289;SRR=213;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0536341;STB=0.506848;TYPE=snp;VARB=0.0180486;OID=.;OPOS=14419915;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:816:398:502:251:311:147:147:164:289:213:66:81:141:110 chr21 14420005 . A G 494.98 PASS AO=321;DP=816;FAO=156;FDP=393;FR=.;FRO=237;FSAF=70;FSAR=86;FSRF=117;FSRR=120;FWDB=0.0205895;FXX=0.0174996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.443;QD=5.038;RBI=0.0253374;REFB=-0.00330608;REVB=-0.0147668;RO=482;SAF=150;SAR=171;SRF=230;SRR=252;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106715;STB=0.527241;TYPE=snp;VARB=0.00487042;OID=.;OPOS=14420005;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:816:393:482:237:321:156:171:150:230:252:86:70:117:120 chr21 14743720 . C A 11.18 PASS AO=3;DP=20;FAO=4;FDP=20;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.0238795;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.588;QD=2.23572;RBI=0.0339126;REFB=-0.0194933;REVB=-0.0240798;RO=16;SAF=1;SAR=2;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.248148;STB=0.549753;TYPE=snp;VARB=0.122104;OID=.;OPOS=14743720;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:20:20:16:16:3:4:2:1:9:7:2:2:9:7 chr21 14743754 . C T 15.41 PASS AO=9;DP=45;FAO=9;FDP=45;FR=.;FRO=36;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=23;FSRR=13;FWDB=0.0398171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1018;QD=1.36964;RBI=0.11147;REFB=-0.0181097;REVB=0.104116;RO=35;SAF=5;SAR=4;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0915289;STB=0.568381;TYPE=snp;VARB=0.0487438;OID=.;OPOS=14743754;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:45:45:35:36:9:9:4:5:22:13:4:5:23:13 chr21 14743785 . A G 11.87 PASS AO=8;DP=46;FAO=8;FDP=46;FR=.;FRO=38;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=0.0225708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.176;QD=1.03193;RBI=0.0243237;REFB=-0.0153414;REVB=0.00906653;RO=38;SAF=4;SAR=4;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12884;STB=0.586746;TYPE=snp;VARB=0.0542838;OID=.;OPOS=14743785;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:46:46:38:38:8:8:4:4:23:15:4:4:23:15 chr21 14743801 . T C 10.96 PASS AO=8;DP=48;FAO=8;FDP=48;FR=.;FRO=40;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=25;FSRR=15;FWDB=-0.0397081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.2333;QD=0.913047;RBI=0.10399;REFB=0.00242279;REVB=-0.0961107;RO=39;SAF=4;SAR=4;SRF=24;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141522;STB=0.603918;TYPE=snp;VARB=-0.0147633;OID=.;OPOS=14743801;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:48:48:39:40:8:8:4:4:24:15:4:4:25:15 chr21 14743804 . G A 10.95 PASS AO=8;DP=48;FAO=8;FDP=48;FR=.;FRO=40;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=25;FSRR=15;FWDB=0.0636802;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1968;QD=0.912912;RBI=0.0834505;REFB=0.00199982;REVB=0.0539335;RO=40;SAF=4;SAR=4;SRF=25;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153626;STB=0.603918;TYPE=snp;VARB=0.00195549;OID=.;OPOS=14743804;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:48:48:40:40:8:8:4:4:25:15:4:4:25:15 chr21 14778721 . A T 183.01 PASS AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.7395;QD=38.5281;RBI=0.0209785;REFB=0;REVB=0.0128647;RO=0;SAF=12;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000800912;OID=.;OPOS=14778721;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:19:19:0:0:19:19:7:12:0:0:7:12:0:0 chr21 14982716 . T C 23.17 PASS AO=9;DP=35;FAO=9;FDP=35;FR=.;FRO=26;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=21;FWDB=-0.0132172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.006;QD=2.64767;RBI=0.0191159;REFB=-0.000225137;REVB=0.0138103;RO=26;SAF=2;SAR=7;SRF=5;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0531841;STB=0.533262;TYPE=snp;VARB=0.00162109;OID=.;OPOS=14982716;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:35:35:26:26:9:9:7:2:5:21:7:2:5:21 chr21 14987811 . C T 342.07 PASS AO=87;DP=187;FAO=87;FDP=187;FR=.;FRO=100;FSAF=46;FSAR=41;FSRF=61;FSRR=39;FWDB=-0.0373231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.4712;QD=7.31704;RBI=0.0534103;REFB=-0.0108075;REVB=-0.0382053;RO=98;SAF=46;SAR=41;SRF=60;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0807681;STB=0.543811;TYPE=snp;VARB=0.0122796;OID=.;OPOS=14987811;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:187:98:100:87:87:41:46:60:38:41:46:61:39 chr21 14987871 . G T 209.17 PASS AO=43;DP=87;FAO=45;FDP=86;FR=.;FRO=41;FSAF=30;FSAR=15;FSRF=32;FSRR=9;FWDB=-0.00451015;FXX=0.0227247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.025;QD=9.72873;RBI=0.0595975;REFB=-0.0288288;REVB=0.0594266;RO=43;SAF=29;SAR=14;SRF=34;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125878;STB=0.56361;TYPE=snp;VARB=0.0322131;OID=.;OPOS=14987871;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:86:43:41:43:45:14:29:34:9:15:30:32:9 chr21 15456997 . G A 1401.25 PASS AO=145;DP=145;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000549744;FXX=0.00680226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.168;QD=38.3905;RBI=0.0308987;REFB=0;REVB=0.0308938;RO=0;SAF=92;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.32207e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.33632e-05;OID=.;OPOS=15456997;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:145:146:0:0:145:146:53:92:0:0:55:91:0:0 chr21 15457018 . G A 1348.22 PASS AO=139;DP=140;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0147118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.194;QD=38.5207;RBI=0.0276479;REFB=0;REVB=0.0234087;RO=0;SAF=82;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000332013;OID=.;OPOS=15457018;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:140:140:0:0:139:140:57:82:0:0:58:82:0:0 chr21 15457029 . T C 1255.63 PASS AO=133;DP=136;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00525074;FXX=0.0220572;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.266;QD=37.7633;RBI=0.0188971;REFB=0.0208662;REVB=-0.018153;RO=1;SAF=74;SAR=59;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00638035;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.83888e-05;OID=.;OPOS=15457029;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:136:133:1:0:133:133:59:74:1:0:59:74:0:0 chr21 15457293 . T G 30.53 PASS AO=13;DP=45;FAO=12;FDP=44;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=0.0573996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.632;QD=2.77527;RBI=0.0584605;REFB=0.004271;REVB=-0.011087;RO=32;SAF=12;SAR=1;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.621015;STB=0.8832;TYPE=snp;VARB=-0.00680699;OID=.;OPOS=15457293;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:45:44:32:32:13:12:1:12:15:17:1:11:15:17 chr21 15457297 . C G 34.81 PASS AO=14;DP=46;FAO=13;FDP=45;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=1;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=0.0050058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.7469;QD=3.09402;RBI=0.037729;REFB=0.0229975;REVB=-0.0373955;RO=32;SAF=13;SAR=1;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.633378;STB=0.888198;TYPE=snp;VARB=-0.0424378;OID=.;OPOS=15457297;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:46:45:32:32:14:13:1:13:15:17:1:12:15:17 chr21 15457318 . T G 130.95 PASS AO=35;DP=79;FAO=34;FDP=78;FR=.;FRO=44;FSAF=32;FSAR=2;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=0.0495854;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.0615;QD=6.71523;RBI=0.0608753;REFB=-0.0201507;REVB=-0.0353142;RO=44;SAF=33;SAR=2;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.650145;STB=0.876426;TYPE=snp;VARB=0.0229183;OID=.;OPOS=15457318;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:78:44:44:35:34:2:33:22:22:2:32:22:22 chr21 15457339 . T G 357.23 PASS AO=71;DP=122;FAO=70;FDP=121;FR=.;FRO=51;FSAF=68;FSAR=2;FSRF=25;FSRR=26;FWDB=0.00181949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.4961;QD=11.8092;RBI=0.0134436;REFB=-0.0465819;REVB=0.0133199;RO=51;SAF=69;SAR=2;SRF=25;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.728364;STB=0.910835;TYPE=snp;VARB=0.0315232;OID=.;OPOS=15457339;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:121:51:51:71:70:2:69:25:26:2:68:25:26 chr21 15457350 . T C 294.96 PASS AO=63;DP=130;FAO=62;FDP=115;FR=.;FRO=53;FSAF=60;FSAR=2;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=-0.00379853;FXX=0.108519;HRUN=3;LEN=1;MLLD=211.137;QD=10.2595;RBI=0.01127;REFB=-0.00303343;REVB=-0.0106106;RO=52;SAF=61;SAR=2;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.724915;STB=0.909856;TYPE=snp;VARB=0.0112987;OID=.;OPOS=15457350;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:115:52:53:63:62:2:61:25:27:2:60:26:27 chr21 15457351 . A G 291.55 PASS AO=63;DP=132;FAO=62;FDP=116;FR=.;FRO=54;FSAF=60;FSAR=2;FSRF=27;FSRR=27;FWDB=0.00369993;FXX=0.114495;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.829;QD=10.0534;RBI=0.0287727;REFB=-0.00577601;REVB=-0.0285339;RO=51;SAF=61;SAR=2;SRF=26;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.712258;STB=0.908905;TYPE=snp;VARB=0.0177468;OID=.;OPOS=15457351;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:116:51:54:63:62:2:61:26:25:2:60:27:27 chr21 15457374 . G C 425.22 PASS AO=86;DP=150;FAO=85;FDP=149;FR=.;FRO=64;FSAF=83;FSAR=2;FSRF=31;FSRR=33;FWDB=-4.08241e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.732;QD=11.4152;RBI=0.029463;REFB=-0.013201;REVB=0.029463;RO=63;SAF=84;SAR=2;SRF=30;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.758717;STB=0.92708;TYPE=snp;VARB=0.00933589;OID=.;OPOS=15457374;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:149:63:64:86:85:2:84:30:33:2:83:31:33 chr21 15457399 . G C 396.25 PASS AO=82;DP=146;FAO=81;FDP=144;FR=.;FRO=63;FSAF=79;FSAR=2;FSRF=30;FSRR=33;FWDB=0.00567043;FXX=0.00689608;HRUN=4;LEN=1;MLLD=220.342;QD=11.0069;RBI=0.0131624;REFB=-0.0197763;REVB=0.0118784;RO=64;SAF=80;SAR=2;SRF=31;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.754104;STB=0.926768;TYPE=snp;VARB=0.012836;OID=.;OPOS=15457399;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:144:64:63:82:81:2:80:31:33:2:79:30:33 chr21 15457410 . C G 344.02 PASS AO=75;DP=140;FAO=74;FDP=139;FR=.;FRO=65;FSAF=70;FSAR=4;FSRF=33;FSRR=32;FWDB=0.0141765;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1874;QD=9.8997;RBI=0.029408;REFB=-0.0138646;REVB=-0.0257654;RO=64;SAF=71;SAR=4;SRF=32;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.640265;STB=0.859351;TYPE=snp;VARB=0.0134831;OID=.;OPOS=15457410;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:139:64:65:75:74:4:71:32:32:4:70:33:32 chr21 15457434 . G A 11.5 PASS AO=12;DP=72;FAO=12;FDP=73;FR=.;FRO=61;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=30;FSRR=31;FWDB=-0.0558092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.139;QD=0.630095;RBI=0.05779;REFB=-0.00559423;REVB=0.0150004;RO=60;SAF=9;SAR=3;SRF=29;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.338992;STB=0.723021;TYPE=snp;VARB=0.078974;OID=.;OPOS=15457434;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:72:73:60:61:12:12:3:9:29:31:3:9:30:31 chr21 15457463 . CACACACAGT C 504.06 PASS AO=50;DP=56;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0283618;FXX=0.036357;HRUN=1;LEN=9;MLLD=246.022;QD=38.0422;RBI=0.0350297;REFB=0;REVB=0.0205594;RO=0;SAF=24;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.10374e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.000161399;OID=.;OPOS=15457464;OREF=ACACACAGT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:50:52:53:53:0:27:26:0:0:24:0:24:26:0:0 chr21 15481365 . G T 1757.63 PASS AO=183;DP=183;FAO=184;FDP=184;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243151;FXX=0.00540511;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.472;QD=38.2094;RBI=0.0267623;REFB=0;REVB=0.0111803;RO=0;SAF=63;SAR=120;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.59313e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000226592;OID=.;OPOS=15481365;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:183:184:0:0:183:184:120:63:0:0:120:64:0:0 chr21 15516976 . T A 1044.81 PASS AO=112;DP=116;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00585102;FXX=0.0588186;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.437;QD=37.3146;RBI=0.0392489;REFB=-0.14031;REVB=0.0388104;RO=1;SAF=57;SAR=55;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00825711;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.69054e-05;OID=.;OPOS=15516976;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:116:112:1:0:112:112:55:57:1:0:55:57:0:0 chr21 15558346 . G A 446.3 PASS AO=98;DP=196;FAO=102;FDP=198;FR=.;FRO=96;FSAF=38;FSAR=64;FSRF=51;FSRR=45;FWDB=0.0121681;FXX=0.00502487;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.864;QD=9.01616;RBI=0.0142032;REFB=-0.0176846;REVB=-0.00732588;RO=94;SAF=36;SAR=62;SRF=49;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141427;STB=0.578964;TYPE=snp;VARB=0.0110692;OID=.;OPOS=15558346;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:198:94:96:98:102:62:36:49:45:64:38:51:45 chr21 15596772 . T G 418.97 PASS AO=82;DP=141;FAO=82;FDP=141;FR=.;FRO=59;FSAF=44;FSAR=38;FSRF=25;FSRR=34;FWDB=0.0172574;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8508;QD=11.8856;RBI=0.0265341;REFB=0.00925808;REVB=-0.0201554;RO=59;SAF=44;SAR=38;SRF=25;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0866786;STB=0.547139;TYPE=snp;VARB=-0.00767642;OID=.;OPOS=15596772;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:59:59:82:82:38:44:25:34:38:44:25:34 chr21 15599466 . A G 108.67 PASS AO=62;DP=208;FAO=58;FDP=208;FR=.;FRO=150;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=72;FSRR=78;FWDB=-0.0462297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=45.5033;QD=2.08979;RBI=0.0668353;REFB=-0.0496334;REVB=-0.0482677;RO=143;SAF=32;SAR=30;SRF=67;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.057028;STB=0.514418;TYPE=snp;VARB=0.0948875;OID=.;OPOS=15599466;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:208:208:143:150:62:58:30:32:67:76:29:29:72:78 chr21 15646397 . A G 476.51 PASS AO=46;DP=46;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0468543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.257;QD=37.3737;RBI=0.0637424;REFB=0;REVB=0.0432177;RO=0;SAF=38;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.19647e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000220024;OID=.;OPOS=15646397;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:46:51:0:0:46:51:8:38:0:0:10:41:0:0 chr21 15671844 . G A 734.34 PASS AO=171;DP=342;FAO=172;FDP=342;FR=.;FRO=170;FSAF=91;FSAR=81;FSRF=87;FSRR=83;FWDB=0.0311155;FXX=0.00291537;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.9765;QD=8.58873;RBI=0.0312523;REFB=-0.00245571;REVB=0.00292135;RO=168;SAF=90;SAR=81;SRF=86;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.013071;STB=0.508621;TYPE=snp;VARB=0.00200705;OID=.;OPOS=15671844;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:342:342:168:170:171:172:81:90:86:82:81:91:87:83 chr21 15954593 . G A 2357.85 PASS AO=240;DP=242;FAO=253;FDP=253;FR=.;FRO=0;FSAF=138;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0397332;FXX=0.0117183;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.9695;QD=37.2783;RBI=0.048876;REFB=-0.0341675;REVB=-0.0284629;RO=2;SAF=130;SAR=110;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00727547;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000472607;OID=.;OPOS=15954593;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:242:253:2:0:240:253:110:130:2:0:115:138:0:0 chr21 15954660 . T C 2904.42 PASS AO=326;DP=342;FAO=327;FDP=340;FR=.;FRO=13;FSAF=143;FSAR=184;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.000693921;FXX=0.00584778;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.133;QD=34.1696;RBI=0.0584766;REFB=-0.0144199;REVB=-0.0584725;RO=10;SAF=143;SAR=183;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0035315;STB=0.509881;TYPE=snp;VARB=0.000320616;OID=.;OPOS=15954660;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:342:340:10:13:326:327:183:143:5:5:184:143:9:4 chr21 15964920 . C G 237.26 PASS AO=60;DP=131;FAO=60;FDP=131;FR=.;FRO=71;FSAF=19;FSAR=41;FSRF=31;FSRR=40;FWDB=0.00492678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.779;QD=7.24443;RBI=0.0162854;REFB=-0.00506749;REVB=-0.0155223;RO=69;SAF=19;SAR=41;SRF=30;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124273;STB=0.571165;TYPE=snp;VARB=0.0045363;OID=.;OPOS=15964920;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:69:71:60:60:41:19:30:39:41:19:31:40 chr21 15974409 . T C 1306.46 PASS AO=145;DP=151;FAO=145;FDP=150;FR=.;FRO=5;FSAF=77;FSAR=68;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0138214;FXX=0.00662208;HRUN=4;LEN=1;MLLD=243.782;QD=34.839;RBI=0.0262312;REFB=-0.0441639;REVB=0.0222945;RO=5;SAF=77;SAR=68;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0043859;STB=0.502308;TYPE=snp;VARB=-5.2672e-05;OID=.;OPOS=15974409;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:151:150:5:5:145:145:68:77:3:2:68:77:3:2 chr21 15984982 . C A 148.05 PASS AO=45;DP=120;FAO=46;FDP=120;FR=.;FRO=74;FSAF=16;FSAR=30;FSRF=51;FSRR=23;FWDB=0.0184306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.5586;QD=4.935;RBI=0.0312788;REFB=-0.00570062;REVB=0.0252721;RO=74;SAF=15;SAR=30;SRF=51;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.377286;STB=0.703205;TYPE=snp;VARB=0.00997133;OID=.;OPOS=15984982;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:74:74:45:46:30:15:51:23:30:16:51:23 chr21 16335469 . T C 576.91 PASS AO=146;DP=307;FAO=145;FDP=306;FR=.;FRO=161;FSAF=70;FSAR=75;FSRF=82;FSRR=79;FWDB=0.0110487;FXX=0.00325722;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.1891;QD=7.54136;RBI=0.0195041;REFB=-0.0152561;REVB=0.0160728;RO=159;SAF=70;SAR=76;SRF=81;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0284137;STB=0.513975;TYPE=snp;VARB=0.0183351;OID=.;OPOS=16335469;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:307:306:159:161:146:145:76:70:81:78:75:70:82:79 chr21 16335515 . C T 1247.9 PASS AO=168;DP=372;FAO=173;FDP=357;FR=.,HEALED;FRO=115;FSAF=77;FSAR=96;FSRF=15;FSRR=100;FWDB=0.029309;FXX=0.00557088;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.5028;QD=13.982;RBI=0.0619555;REFB=-0.0623923;REVB=-0.0545845;RO=106;SAF=72;SAR=96;SRF=13;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233572;STB=0.630817;TYPE=snp;VARB=0.0505099;OID=.;OPOS=16335515;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:357:357:106:115:168:173:96:72:13:93:96:77:15:100 chr21 16340289 . C T 1088.75 PASS AO=111;DP=114;FAO=121;FDP=124;FR=.;FRO=3;FSAF=42;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0189344;FXX=0.0158718;HRUN=4;LEN=1;MLLD=104.76;QD=35.1209;RBI=0.0193209;REFB=-0.0932287;REVB=-0.00384525;RO=3;SAF=33;SAR=78;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0179083;STB=0.509315;TYPE=snp;VARB=0.00428707;OID=.;OPOS=16340289;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:114:124:3:3:111:121:78:33:0:3:79:42:0:3 chr21 16424469 . C T 192.02 PASS AO=56;DP=141;FAO=57;FDP=142;FR=.;FRO=85;FSAF=39;FSAR=18;FSRF=35;FSRR=50;FWDB=0.00579846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.73;QD=5.40896;RBI=0.0228998;REFB=-0.0205607;REVB=-0.0221535;RO=84;SAF=38;SAR=18;SRF=34;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.293919;STB=0.665604;TYPE=snp;VARB=0.017713;OID=.;OPOS=16424469;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:142:84:85:56:57:18:38:34:50:18:39:35:50 chr21 16424644 . G A 65.16 PASS AO=10;DP=48;FAO=19;FDP=47;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=0.144282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.806;QD=5.5453;RBI=0.144454;REFB=-0.013744;REVB=-0.00703592;RO=24;SAF=5;SAR=5;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192848;STB=0.728264;TYPE=snp;VARB=0.053153;OID=.;OPOS=16424644;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:38:47:24:28:10:19:5:5:8:16:5:14:10:18 chr21 16986637 . G A 273.58 PASS AO=51;DP=87;FAO=52;FDP=88;FR=.;FRO=36;FSAF=38;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.0488985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.975;QD=12.4354;RBI=0.050488;REFB=-0.0140216;REVB=-0.0125688;RO=36;SAF=37;SAR=14;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192849;STB=0.607956;TYPE=snp;VARB=0.0218044;OID=.;OPOS=16986637;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:88:36:36:51:52:14:37:18:18:14:38:18:18 chr21 17203785 . A T 244.16 PASS AO=84;DP=234;FAO=85;FDP=234;FR=.;FRO=149;FSAF=50;FSAR=35;FSRF=73;FSRR=76;FWDB=0.0147547;FXX=0.00847422;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.968;QD=4.17369;RBI=0.0183245;REFB=0.000232461;REVB=0.0108667;RO=148;SAF=50;SAR=34;SRF=73;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115846;STB=0.563151;TYPE=snp;VARB=-0.000325648;OID=.;OPOS=17203785;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:234:234:148:149:84:85:34:50:73:75:35:50:73:76 chr21 17251556 . C A 547.12 PASS AO=134;DP=309;FAO=146;FDP=319;FR=.;FRO=173;FSAF=34;FSAR=112;FSRF=67;FSRR=106;FWDB=0.0168182;FXX=0.0123835;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.179;QD=6.8604;RBI=0.0438881;REFB=-0.0304412;REVB=0.0405378;RO=173;SAF=34;SAR=100;SRF=66;SRR=107;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155644;STB=0.604129;TYPE=snp;VARB=0.042318;OID=.;OPOS=17251556;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:309:319:173:173:134:146:100:34:66:107:112:34:67:106 chr21 19161403 . A G 1706.3 PASS AO=182;DP=188;FAO=187;FDP=187;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0266932;FXX=0.00531887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.9377;QD=36.4983;RBI=0.0379925;REFB=-0.0765383;REVB=0.0270352;RO=3;SAF=71;SAR=111;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0196873;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000953287;OID=.;OPOS=19161403;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:188:187:3:0:182:187:111:71:3:0:111:76:0:0 chr21 19163391 . GAACTC G 100.55 PASS AO=57;DP=170;FAO=58;FDP=159;FR=.;FRO=101;FSAF=32;FSAR=26;FSRF=48;FSRR=53;FWDB=0.00945789;FXX=0.0124216;HRUN=2;LEN=5;MLLD=236.293;QD=2.52958;RBI=0.0098193;REFB=-0.0101946;REVB=-0.00263949;RO=94;SAF=32;SAR=25;SRF=44;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102463;STB=0.548594;TYPE=del;VARB=0.0182977;OID=.;OPOS=19163392;OREF=AACTC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:57:158:58:159:101:32:26:48:53:99:94:32:25:44:50 chr21 19169155 . G C 407.27 PASS AO=95;DP=196;FAO=97;FDP=196;FR=.;FRO=99;FSAF=58;FSAR=39;FSRF=57;FSRR=42;FWDB=0.00019283;FXX=0.00507588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.5078;QD=8.3117;RBI=0.00445109;REFB=-0.0238467;REVB=0.00444691;RO=98;SAF=57;SAR=38;SRF=55;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0369321;STB=0.511595;TYPE=snp;VARB=0.0126766;OID=.;OPOS=19169155;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:196:98:99:95:97:38:57:55:43:39:58:57:42 chr21 19642285 . G T 396.54 PASS AO=114;DP=269;FAO=114;FDP=269;FR=.;FRO=155;FSAF=63;FSAR=51;FSRF=81;FSRR=74;FWDB=0.000595146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.616;QD=5.89645;RBI=0.0194826;REFB=-0.0177437;REVB=-0.0194735;RO=151;SAF=63;SAR=51;SRF=80;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0235709;STB=0.517442;TYPE=snp;VARB=0.0254113;OID=.;OPOS=19642285;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:269:269:151:155:114:114:51:63:80:71:51:63:81:74 chr21 19651357 . A G 299.78 PASS AO=77;DP=170;FAO=77;FDP=169;FR=.;FRO=92;FSAF=27;FSAR=50;FSRF=23;FSRR=69;FWDB=-0.00372907;FXX=0.00588201;HRUN=3;LEN=1;MLLD=139.634;QD=7.09534;RBI=0.00411757;REFB=-0.00662846;REVB=-0.00174597;RO=88;SAF=27;SAR=50;SRF=23;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.097822;STB=0.562386;TYPE=snp;VARB=0.00863441;OID=.;OPOS=19651357;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:169:88:92:77:77:50:27:23:65:50:27:23:69 chr21 19666910 . A G 160.35 PASS AO=43;DP=104;FAO=44;FDP=104;FR=.;FRO=60;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=27;FSRR=33;FWDB=-0.0466057;FXX=0.0714222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.172;QD=6.16725;RBI=0.0466832;REFB=-0.0123169;REVB=0.00268783;RO=59;SAF=18;SAR=25;SRF=27;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0408244;STB=0.524182;TYPE=snp;VARB=0.0160583;OID=.;OPOS=19666910;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:59:60:43:44:25:18:27:32:26:18:27:33 chr21 19670118 . G A 302.89 PASS AO=69;DP=136;FAO=69;FDP=136;FR=.;FRO=67;FSAF=22;FSAR=47;FSRF=34;FSRR=33;FWDB=0.0149626;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=165.249;QD=8.90857;RBI=0.0247286;REFB=0.00528461;REVB=-0.0196882;RO=65;SAF=22;SAR=47;SRF=33;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177535;STB=0.599242;TYPE=snp;VARB=-0.00641859;OID=.;OPOS=19670118;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:65:67:69:69:47:22:33:32:47:22:34:33 chr21 19713821 . C T 767.84 PASS AO=214;DP=450;FAO=191;FDP=399;FR=.;FRO=208;FSAF=80;FSAR=111;FSRF=97;FSRR=111;FWDB=-0.0184055;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.7618;QD=7.69763;RBI=0.0246672;REFB=-0.0146006;REVB=-0.0164228;RO=234;SAF=85;SAR=129;SRF=108;SRR=126;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0628966;STB=0.52522;TYPE=snp;VARB=0.0120133;OID=.;OPOS=19713821;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:450:399:234:208:214:191:129:85:108:126:111:80:97:111 chr21 19756040 . C G 312.08 PASS AO=76;DP=159;FAO=76;FDP=159;FR=.;FRO=83;FSAF=23;FSAR=53;FSRF=36;FSRR=47;FWDB=0.0144073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2602;QD=7.85111;RBI=0.0144335;REFB=-0.0227466;REVB=-0.000868046;RO=82;SAF=23;SAR=53;SRF=35;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129838;STB=0.576172;TYPE=snp;VARB=0.0369756;OID=.;OPOS=19756040;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:159:82:83:76:76:53:23:35:47:53:23:36:47 chr21 21728991 . C A 1098.45 PASS AO=123;DP=131;FAO=123;FDP=128;FR=.;FRO=5;FSAF=60;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.00997219;FXX=0.022899;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.0875;QD=34.3264;RBI=0.0211222;REFB=-0.0615741;REVB=0.01862;RO=5;SAF=60;SAR=63;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0362194;STB=0.519081;TYPE=snp;VARB=0.002849;OID=.;OPOS=21728991;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:131:128:5:5:123:123:63:60:0:5:63:60:0:5 chr21 24804558 . T C 116.66 PASS AO=41;DP=118;FAO=41;FDP=118;FR=.;FRO=77;FSAF=5;FSAR=36;FSRF=39;FSRR=38;FWDB=0.0235402;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.594;QD=3.95456;RBI=0.0255409;REFB=-0.00310847;REVB=0.0099095;RO=74;SAF=5;SAR=36;SRF=39;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.542078;STB=0.810469;TYPE=snp;VARB=0.012942;OID=.;OPOS=24804558;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:74:77:41:41:36:5:39:35:36:5:39:38 chr21 24804562 . G A 108.88 PASS AO=40;DP=120;FAO=40;FDP=120;FR=.;FRO=80;FSAF=4;FSAR=36;FSRF=41;FSRR=39;FWDB=-0.0746648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.06;QD=3.62946;RBI=0.0753466;REFB=-0.0104262;REVB=-0.0101132;RO=79;SAF=4;SAR=36;SRF=41;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.584732;STB=0.843549;TYPE=snp;VARB=0.016484;OID=.;OPOS=24804562;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:79:80:40:40:36:4:41:38:36:4:41:39 chr21 26965148 . G A 1570.16 PASS AO=167;DP=170;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=100;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00952354;FXX=0.0289001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.169;QD=37.3847;RBI=0.0206963;REFB=-0.0142683;REVB=-0.018375;RO=0;SAF=99;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.34435e-05;OID=.;OPOS=26965148;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:170:168:0:0:167:168:68:99:0:0:68:100:0:0 chr21 26965205 . T C 1855.26 PASS AO=184;DP=184;FAO=194;FDP=194;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.172;QD=38.2527;RBI=0.0423588;REFB=0;REVB=0.0390387;RO=0;SAF=93;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.77877e-05;OID=.;OPOS=26965205;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:184:194:0:0:184:194:91:93:0:0:101:93:0:0 chr21 26969703 . T C 889.08 PASS AO=95;DP=99;FAO=100;FDP=103;FR=.;FRO=3;FSAF=54;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0518101;FXX=0.00961446;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.6654;QD=34.5273;RBI=0.0565122;REFB=-0.182678;REVB=-0.0225687;RO=3;SAF=49;SAR=46;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0105908;STB=0.506051;TYPE=snp;VARB=0.00543519;OID=.;OPOS=26969703;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:99:103:3:3:95:100:46:49:1:2:46:54:1:2 chr21 26976250 . A G 166.26 PASS AO=37;DP=76;FAO=38;FDP=77;FR=.;FRO=39;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=0.00544463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.162;QD=8.63693;RBI=0.00811059;REFB=-0.000200698;REVB=-0.00601146;RO=39;SAF=14;SAR=23;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126785;STB=0.560943;TYPE=snp;VARB=0.000186512;OID=.;OPOS=26976250;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:77:39:39:37:38:23:14:20:19:23:15:20:19 chr21 26978950 . A G 901.81 PASS AO=94;DP=99;FAO=98;FDP=99;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=70;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.172922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.363;QD=36.4366;RBI=0.174328;REFB=-0.148553;REVB=-0.0220976;RO=4;SAF=24;SAR=70;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0727152;STB=0.50877;TYPE=snp;VARB=0.00229604;OID=.;OPOS=26978950;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:99:99:4:1:94:98:70:24:4:0:70:28:1:0 chr21 28212760 . G A 380.84 PASS AO=33;DP=160;FAO=90;FDP=152;FR=.,HEALED;FRO=62;FSAF=60;FSAR=30;FSRF=29;FSRR=33;FWDB=0.011737;FXX=0.00653552;HRUN=4;LEN=1;MLLD=232.551;QD=10.0221;RBI=0.0298671;REFB=-0.0297498;REVB=0.0274643;RO=56;SAF=4;SAR=29;SRF=26;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.488021;STB=0.586027;TYPE=snp;VARB=0.0721315;OID=.;OPOS=28212760;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:152:56:62:33:90:29:4:26:30:30:60:29:33 chr21 28215826 . C CACA 895.93 PASS AO=97;DP=107;FAO=96;FDP=97;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.000104287;FXX=0.0582468;HRUN=1;LEN=3;MLLD=226.859;QD=36.9455;RBI=0.0500176;REFB=-0.141807;REVB=0.0500175;RO=7;SAF=49;SAR=48;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00975234;STB=0.505375;TYPE=ins;VARB=0.00049498;OID=.;OPOS=28215827;OREF=-;OALT=ACA;OMAPALT=CACA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:97:107:96:97:1:50:46:0:1:36:7:49:48:3:4 chr21 28215836 . GC G 908.02 PASS AO=111;DP=122;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0416353;FXX=0.0245881;HRUN=2;LEN=1;MLLD=23.9477;QD=30.5215;RBI=0.19626;REFB=0;REVB=-0.191793;RO=0;SAF=47;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.00269639;OID=.;OPOS=28215837;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:111:122:119:119:0:49:70:0:0:82:0:47:64:0:0 chr21 28216038 . C A 364.15 PASS AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00261798;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.365;QD=36.4148;RBI=0.0110833;REFB=-0.10014;REVB=-0.0107697;RO=1;SAF=15;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0302234;STB=0.516121;TYPE=snp;VARB=0.000631825;OID=.;OPOS=28216038;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:40:40:1:1:39:39:24:15:1:0:24:15:1:0 chr21 28216059 . A G 365.53 PASS AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113135;FXX=0.0487686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.328;QD=37.4908;RBI=0.0249118;REFB=0;REVB=0.0221947;RO=0;SAF=15;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000450129;OID=.;OPOS=28216059;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:39:39:0:0:39:39:24:15:0:0:24:15:0:0 chr21 28216066 . C T 435.31 PASS AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170032;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=102.923;QD=37.8534;RBI=0.0311323;REFB=0;REVB=0.026079;RO=0;SAF=19;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000293844;OID=.;OPOS=28216066;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:46:46:0:0:46:46:27:19:0:0:27:19:0:0 chr21 28216595 . C G 1223.24 PASS AO=120;DP=126;FAO=139;FDP=145;FR=.;FRO=6;FSAF=37;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.247838;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.5833;QD=33.7446;RBI=0.248951;REFB=-0.0441456;REVB=-0.02352;RO=6;SAF=21;SAR=99;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0279195;STB=0.514284;TYPE=snp;VARB=0.00289875;OID=.;OPOS=28216595;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:126:145:6:6:120:139:99:21:0:6:102:37:0:6 chr21 28216674 . G C 388.32 PASS AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00157663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.2137;QD=38.8318;RBI=0.0402608;REFB=0;REVB=0.0402299;RO=0;SAF=7;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.64961e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000369093;OID=.;OPOS=28216674;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:39:40:0:0:39:40:32:7:0:0:32:8:0:0 chr21 28216692 . G T 297.4 PASS AO=31;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0265529;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.909;QD=37.1751;RBI=0.0273485;REFB=0;REVB=0.00654885;RO=0;SAF=4;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000119826;OID=.;OPOS=28216692;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:31:32:0:0:31:32:27:4:0:0:27:5:0:0 chr21 28296324 . A G 168.87 PASS AO=57;DP=157;FAO=58;FDP=158;FR=.;FRO=100;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=53;FSRR=47;FWDB=-0.0198581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.191;QD=4.27521;RBI=0.0426997;REFB=-0.0175056;REVB=0.037801;RO=98;SAF=26;SAR=31;SRF=51;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0714527;STB=0.551706;TYPE=snp;VARB=0.031819;OID=.;OPOS=28296324;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:158:98:100:57:58:31:26:51:47:32:26:53:47 chr21 28302355 . A G 482.26 PASS AO=94;DP=217;FAO=116;FDP=237;FR=.;FRO=121;FSAF=44;FSAR=72;FSRF=40;FSRR=81;FWDB=0.0592702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.049;QD=8.13943;RBI=0.060235;REFB=-0.031307;REVB=-0.0107378;RO=108;SAF=33;SAR=61;SRF=27;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111647;STB=0.526756;TYPE=snp;VARB=0.0329916;OID=.;OPOS=28302355;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:217:237:108:121:94:116:61:33:27:81:72:44:40:81 chr21 28305212 . C T 48.03 PASS AO=19;DP=116;FAO=26;FDP=103;FR=.,HEALED;FRO=77;FSAF=20;FSAR=6;FSRF=38;FSRR=39;FWDB=-0.030945;FXX=0.112059;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.1147;QD=1.86525;RBI=0.0501336;REFB=-0.0156487;REVB=-0.0394435;RO=72;SAF=19;SAR=0;SRF=34;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.767304;STB=0.720974;TYPE=snp;VARB=0.0472363;OID=.;OPOS=28305212;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:114:103:72:77:19:26:0:19:34:38:6:20:38:39 chr21 28326276 . G A 366.13 PASS AO=96;DP=212;FAO=96;FDP=212;FR=.;FRO=116;FSAF=48;FSAR=48;FSRF=72;FSRR=44;FWDB=0.00434724;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=219.175;QD=6.90809;RBI=0.00936045;REFB=-0.0229751;REVB=-0.00828973;RO=116;SAF=48;SAR=48;SRF=72;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119308;STB=0.566024;TYPE=snp;VARB=0.0205975;OID=.;OPOS=28326276;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:212:116:116:96:96:48:48:72:44:48:48:72:44 chr21 30250555 . T C 1239.38 PASS AO=139;DP=146;FAO=139;FDP=145;FR=.;FRO=6;FSAF=68;FSAR=71;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.00761841;FXX=0.00684885;HRUN=4;LEN=1;MLLD=237.519;QD=34.1898;RBI=0.011329;REFB=0.0305276;REVB=0.00838492;RO=5;SAF=68;SAR=71;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00730904;STB=0.507343;TYPE=snp;VARB=-0.000458347;OID=.;OPOS=30250555;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:146:145:5:6:139:139:71:68:3:2:71:68:4:2 chr21 30250615 . T C 1213.68 PASS AO=130;DP=131;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000627925;FXX=0.015266;HRUN=5;LEN=1;MLLD=214.353;QD=37.6336;RBI=0.00541315;REFB=-0.0389884;REVB=-0.0053766;RO=1;SAF=47;SAR=83;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0100039;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.72264e-06;OID=.;OPOS=30250615;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:131:129:1:0:130:129:83:47:1:0:82:47:0:0 chr21 30257560 . C G 1051.61 PASS AO=112;DP=114;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189356;FXX=0.00877116;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.6954;QD=37.2253;RBI=0.0455315;REFB=-0.0588418;REVB=0.0414072;RO=1;SAF=21;SAR=91;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00518979;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00053973;OID=.;OPOS=30257560;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:114:113:1:0:112:113:91:21:0:1:92:21:0:0 chr21 30257566 . GTT GT,GTC 972.03 PASS AO=19,81;DP=108;FAO=19,88;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=2,19;FSAR=17,69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.157297,-0.106305;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=25.4441,44.1757;QD=36.3376;RBI=0.157665,0.113142;REFB=0,0;REVB=-0.0107656,-0.0387339;RO=0;SAF=2,19;SAR=17,62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.41729e-08,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0438491,-0.0123729;OID=.,.;OPOS=30257567,30257568;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=GT,GTC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:19,81:103:19,88:107:0:2,19:17,69:0:0:16:0:2,19:17,62:0:0 chr21 30332911 . C T 487.26 PASS AO=100;DP=174;FAO=100;FDP=179;FR=.;FRO=79;FSAF=50;FSAR=50;FSRF=35;FSRR=44;FWDB=0.0155648;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=117.109;QD=10.8886;RBI=0.0158584;REFB=-0.0150366;REVB=-0.00303748;RO=74;SAF=50;SAR=50;SRF=30;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0740401;STB=0.525135;TYPE=snp;VARB=0.011672;OID=.;OPOS=30332911;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:179:74:79:100:100:50:50:30:44:50:50:35:44 chr21 30341891 . A G 224.68 PASS AO=61;DP=141;FAO=61;FDP=141;FR=.;FRO=80;FSAF=34;FSAR=27;FSRF=46;FSRR=34;FWDB=0.00782185;FXX=0.00704176;HRUN=3;LEN=1;MLLD=200.407;QD=6.37376;RBI=0.00815702;REFB=-0.00924932;REVB=-0.00231423;RO=79;SAF=34;SAR=27;SRF=46;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0255738;STB=0.510153;TYPE=snp;VARB=0.0120833;OID=.;OPOS=30341891;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:79:80:61:61:27:34:46:33:27:34:46:34 chr21 30408670 . A T 126.31 PASS AO=168;DP=315;FAO=23;FDP=39;FR=.;FRO=16;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.00537455;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.277;QD=12.955;RBI=0.00954256;REFB=-0.0282761;REVB=-0.00788509;RO=147;SAF=89;SAR=79;SRF=56;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126923;STB=0.591566;TYPE=snp;VARB=0.0200189;OID=.;OPOS=30408670;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:315:39:147:16:168:23:79:89:56:91:8:15:7:9 chr21 30414835 . GT G 395.11 PASS AO=58;DP=98;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.330709;FXX=0.0104156;HRUN=4;LEN=1;MLLD=9.52765;QD=16.636;RBI=0.333303;REFB=0.083286;REVB=0.0415078;RO=27;SAF=20;SAR=38;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00749824;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0574456;OID=.;OPOS=30414836;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:58:96:95:95:0:32:63:0:0:27:27:20:38:9:18 chr21 30511691 . G A 126.94 PASS AO=32;DP=72;FAO=32;FDP=72;FR=.;FRO=40;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=-0.0328831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.639;QD=7.0522;RBI=0.0337548;REFB=-0.0111085;REVB=-0.0076218;RO=39;SAF=11;SAR=21;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0699851;STB=0.533877;TYPE=snp;VARB=0.0148027;OID=.;OPOS=30511691;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:39:40:32:32:21:11:16:23:21:11:16:24 chr21 30552839 . A G 1631.25 PASS AO=174;DP=175;FAO=171;FDP=171;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00900669;FXX=0.0228558;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.578;QD=38.1579;RBI=0.0099697;REFB=0;REVB=-0.00427487;RO=0;SAF=87;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000481153;OID=.;OPOS=30552839;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:175:171:0:0:174:171:87:87:0:0:87:84:0:0 chr21 30552877 . T C 1642.27 PASS AO=171;DP=171;FAO=172;FDP=172;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.537;QD=38.1923;RBI=0.0320073;REFB=0;REVB=0.0282995;RO=0;SAF=88;SAR=83;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.96384e-05;OID=.;OPOS=30552877;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:171:172:0:0:171:172:83:88:0:0:83:89:0:0 chr21 30714776 . T C 324.97 PASS AO=86;DP=199;FAO=88;FDP=199;FR=.;FRO=111;FSAF=47;FSAR=41;FSRF=58;FSRR=53;FWDB=0.00374995;FXX=0.00499975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.353;QD=6.53197;RBI=0.128348;REFB=-0.0192342;REVB=0.128293;RO=112;SAF=47;SAR=39;SRF=58;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0292543;STB=0.506476;TYPE=snp;VARB=0.0271536;OID=.;OPOS=30714776;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:199:199:112:111:86:88:39:47:58:54:41:47:58:53 chr21 30717151 . C T 202.33 PASS AO=69;DP=189;FAO=69;FDP=189;FR=.;FRO=120;FSAF=29;FSAR=40;FSRF=59;FSRR=61;FWDB=-0.0111488;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=204.301;QD=4.28212;RBI=0.0314336;REFB=0.00701664;REVB=-0.0293901;RO=120;SAF=29;SAR=40;SRF=59;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0805837;STB=0.545808;TYPE=snp;VARB=-0.0157808;OID=.;OPOS=30717151;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:189:120:120:69:69:40:29:59:61:40:29:59:61 chr21 30718201 . G A 144.07 PASS AO=44;DP=123;FAO=47;FDP=126;FR=.;FRO=79;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=49;FSRR=30;FWDB=0.0316798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.006;QD=4.57373;RBI=0.0373847;REFB=-0.0148862;REVB=0.0198496;RO=79;SAF=25;SAR=19;SRF=49;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0601598;STB=0.542898;TYPE=snp;VARB=0.0252939;OID=.;OPOS=30718201;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:126:79:79:44:47:19:25:49:30:21:26:49:30 chr21 30830393 . T G 476.32 PASS AO=171;DP=442;FAO=155;FDP=399;FR=.;FRO=244;FSAF=58;FSAR=97;FSRF=105;FSRR=139;FWDB=-0.0138431;FXX=0.00249994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.961;QD=4.77517;RBI=0.0333684;REFB=-0.00215082;REVB=-0.0303614;RO=271;SAF=66;SAR=105;SRF=118;SRR=153;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0561209;STB=0.53598;TYPE=snp;VARB=0.00238409;OID=.;OPOS=30830393;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:442:399:271:244:171:155:105:66:118:153:97:58:105:139 chr21 30969901 . T C 177.96 PASS AO=46;DP=103;FAO=46;FDP=103;FR=.;FRO=57;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=29;FSRR=28;FWDB=-0.0436914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.0876;QD=6.91092;RBI=0.0441499;REFB=-0.022911;REVB=0.00634631;RO=57;SAF=27;SAR=19;SRF=29;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0784305;STB=0.543916;TYPE=snp;VARB=0.0238117;OID=.;OPOS=30969901;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:57:57:46:46:19:27:29:28:19:27:29:28 chr21 30970005 . C G 172.12 PASS AO=47;DP=115;FAO=47;FDP=110;FR=.;FRO=63;FSAF=10;FSAR=37;FSRF=14;FSRR=49;FWDB=0.0379286;FXX=0.0517197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.9533;QD=6.25882;RBI=0.0384165;REFB=-0.0141992;REVB=0.006103;RO=58;SAF=10;SAR=37;SRF=9;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0903945;STB=0.508006;TYPE=snp;VARB=0.0280383;OID=.;OPOS=30970005;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:110:58:63:47:47:37:10:9:49:37:10:14:49 chr21 31538692 . C T 93.66 PASS AO=22;DP=65;FAO=25;FDP=60;FR=.;FRO=35;FSAF=20;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=-0.0173543;FXX=0.0624902;HRUN=3;LEN=1;MLLD=137.459;QD=6.24392;RBI=0.0470133;REFB=-0.0201697;REVB=-0.043693;RO=19;SAF=20;SAR=2;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.456728;STB=0.753407;TYPE=snp;VARB=0.0211398;OID=.;OPOS=31538692;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:93:60:60:19:35:22:25:2:20:11:8:5:20:14:21 chr21 31655212 . A C 2334.87 PASS AO=226;DP=226;FAO=250;FDP=250;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=158;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0102053;FXX=0.0118572;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.756;QD=37.3579;RBI=0.0531763;REFB=-0.00530279;REVB=0.0521878;RO=0;SAF=88;SAR=138;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00135405;OID=.;OPOS=31655212;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:226:250:0:0:226:250:138:88:0:0:158:92:0:0 chr21 31709691 . G A 602.2 PASS AO=128;DP=234;FAO=128;FDP=234;FR=.;FRO=106;FSAF=46;FSAR=82;FSRF=47;FSRR=59;FWDB=-0.0104991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.973;QD=10.2939;RBI=0.0236056;REFB=-0.0178638;REVB=0.0211422;RO=104;SAF=46;SAR=82;SRF=46;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0724126;STB=0.540385;TYPE=snp;VARB=0.013211;OID=.;OPOS=31709691;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:234:234:104:106:128:128:82:46:46:58:82:46:47:59 chr21 31744127 . A T 295.04 PASS AO=63;DP=118;FAO=63;FDP=118;FR=.;FRO=55;FSAF=29;FSAR=34;FSRF=21;FSRR=34;FWDB=-0.013325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.096;QD=10.0015;RBI=0.0149706;REFB=-0.0185275;REVB=-0.00682369;RO=55;SAF=29;SAR=34;SRF=21;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0675274;STB=0.537025;TYPE=snp;VARB=0.0303418;OID=.;OPOS=31744127;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:55:55:63:63:34:29:21:34:34:29:21:34 chr21 31802768 . G A 887.93 PASS AO=92;DP=94;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0163199;FXX=0.0312467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.7338;QD=38.1904;RBI=0.0241243;REFB=0;REVB=0.0177663;RO=0;SAF=27;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.95165e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00185361;OID=.;OPOS=31802768;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:94:93:0:0:92:93:65:27:0:0:66:27:0:0 chr21 31803159 . T C 307.69 PASS AO=38;DP=44;FAO=41;FDP=46;FR=.;FRO=5;FSAF=8;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.0603213;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=41.9553;QD=26.7555;RBI=0.086201;REFB=-0.186995;REVB=-0.0615788;RO=6;SAF=6;SAR=32;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00417627;STB=0.535195;TYPE=snp;VARB=0.0228226;OID=.;OPOS=31803159;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:44:46:6:5:38:41:32:6:1:5:33:8:0:5 chr21 31803210 . C T 158.92 PASS AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0260199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.546;QD=37.393;RBI=0.0281553;REFB=0;REVB=-0.0107557;RO=0;SAF=3;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53656e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000491651;OID=.;OPOS=31803210;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:17:17:0:0:17:17:14:3:0:0:14:3:0:0 chr21 31812772 . C A 1459.49 PASS AO=153;DP=153;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0574641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.625;QD=38.1565;RBI=0.0591283;REFB=0;REVB=0.0139296;RO=0;SAF=59;SAR=94;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.31675e-05;OID=.;OPOS=31812772;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:153:153:0:0:153:153:94:59:0:0:94:59:0:0 chr21 31859677 . G A 1747.14 PASS AO=158;DP=159;FAO=185;FDP=185;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0976746;FXX=0.00537606;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.713;QD=37.7759;RBI=0.100143;REFB=0;REVB=0.0220991;RO=0;SAF=78;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.38159e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00142365;OID=.;OPOS=31859677;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:159:185:0:0:158:185:80:78:0:0:88:97:0:0 chr21 31869286 . T C 1974.93 PASS AO=206;DP=206;FAO=206;FDP=206;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=124;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00322609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.61;QD=38.3482;RBI=0.0250578;REFB=0;REVB=0.0248493;RO=0;SAF=82;SAR=124;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.07411e-05;OID=.;OPOS=31869286;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:206:206:0:0:206:206:124:82:0:0:124:82:0:0 chr21 31913981 . AG A 1194.68 PASS AO=112;DP=129;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0405408;FXX=0.0579668;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.914;QD=36.7594;RBI=0.0408377;REFB=-0.024586;REVB=0.00491547;RO=1;SAF=69;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00683193;STB=0.5;TYPE=del;VARB=4.16447e-05;OID=.;OPOS=31913982;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:112:126:130:130:0:81:49:0:0:44:1:69:43:1:0 chr21 31914000 . T A 1496.91 PASS AO=134;DP=140;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.002779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.028;QD=38.1377;RBI=0.0108621;REFB=0;REVB=-0.0105006;RO=0;SAF=82;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.01993e-05;OID=.;OPOS=31914000;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:140:157:0:0:134:157:52:82:0:0:54:103:0:0 chr21 31964916 . A C 311.94 PASS AO=33;DP=35;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0645764;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.0053;QD=36.6992;RBI=0.0655969;REFB=0;REVB=0.0115256;RO=1;SAF=10;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0444293;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00109302;OID=.;OPOS=31964916;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:35:34:1:0:33:34:23:10:1:0:23:11:0:0 chr21 31973516 . T A 2204.52 PASS AO=229;DP=229;FAO=229;FDP=229;FR=.;FRO=0;FSAF=189;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00393457;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.984;QD=38.5069;RBI=0.0174891;REFB=0;REVB=0.0170408;RO=0;SAF=189;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.60697e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.9279e-05;OID=.;OPOS=31973516;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:229:229:0:0:229:229:40:189:0:0:40:189:0:0 chr21 32201969 . GA G 2044.56 PASS AO=250;DP=280;FAO=261;FDP=261;FR=.;FRO=0;FSAF=106;FSAR=155;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0520983;FXX=0.0577596;HRUN=2;LEN=1;MLLD=28.2809;QD=31.3343;RBI=0.0530519;REFB=0;REVB=-0.0100137;RO=1;SAF=102;SAR=148;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00321007;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.000442414;OID=.;OPOS=32201970;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:250:277:261:261:0:106:155:0:0:99:1:102:148:0:1 chr21 32253513 . A T 303.6 PASS AO=66;DP=126;FAO=66;FDP=126;FR=.;FRO=60;FSAF=32;FSAR=34;FSRF=26;FSRR=34;FWDB=-0.0182835;FXX=0.0156238;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.51;QD=9.63798;RBI=0.0187555;REFB=-0.0271469;REVB=0.00418147;RO=58;SAF=31;SAR=35;SRF=25;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0331526;STB=0.524583;TYPE=snp;VARB=0.0205591;OID=.;OPOS=32253513;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:126:58:60:66:66:35:31:25:33:34:32:26:34 chr21 32493031 . A G 2150.64 PASS AO=215;DP=216;FAO=229;FDP=229;FR=.;FRO=0;FSAF=112;FSAR=117;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0532087;FXX=0.00865763;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.1741;QD=37.5657;RBI=0.0639306;REFB=0;REVB=-0.0354394;RO=0;SAF=100;SAR=115;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.68361e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0019351;OID=.;OPOS=32493031;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:216:229:0:0:215:229:115:100:0:0:117:112:0:0 chr21 32499473 . A G 769.08 PASS AO=80;DP=80;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.04899;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=138.29;QD=37.9791;RBI=0.0498553;REFB=0;REVB=0.00924825;RO=0;SAF=32;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000162356;OID=.;OPOS=32499473;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:80:81:0:0:80:81:48:32:0:0:49:32:0:0 chr21 33044448 . T C 11.68 PASS AO=3;DP=13;FAO=3;FDP=13;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=-0.0061299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.374;QD=3.59406;RBI=0.054611;REFB=-0.00493464;REVB=-0.0542658;RO=10;SAF=2;SAR=1;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.477992;STB=0.816578;TYPE=snp;VARB=0.0247407;OID=.;OPOS=33044448;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:13:13:10:10:3:3:1:2:2:8:1:2:2:8 chr21 33057331 . G A 11.39 PASS AO=2;DP=8;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.00211971;FXX=0.124844;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.4043;QD=6.50827;RBI=0.00211971;REFB=0.0503445;REVB=0;RO=5;SAF=2;SAR=0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00070367;OID=.;OPOS=33057331;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:8:7:5:5:2:2:0:2:5:0:0:2:5:0 chr21 33068962 . T C 71.08 PASS AO=19;DP=53;FAO=20;FDP=52;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=22;FWDB=-0.0101779;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.701;QD=5.46766;RBI=0.0133056;REFB=-0.0338426;REVB=0.00857026;RO=30;SAF=7;SAR=12;SRF=8;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120594;STB=0.557322;TYPE=snp;VARB=0.0455392;OID=.;OPOS=33068962;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:53:52:30:32:19:20:12:7:8:22:12:8:10:22 chr21 33368188 . T C 1221.93 PASS AO=129;DP=130;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0372575;FXX=0.00763301;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.464;QD=37.5978;RBI=0.0494695;REFB=0.0276446;REVB=0.032544;RO=0;SAF=68;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000240119;OID=.;OPOS=33368188;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:130:130:0:0:129:130:61:68:0:0:62:68:0:0 chr21 33370900 . T C 543.13 PASS AO=58;DP=62;FAO=61;FDP=63;FR=.;FRO=2;FSAF=42;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0244954;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.1907;QD=34.4843;RBI=0.092532;REFB=0.0032392;REVB=0.0892309;RO=4;SAF=40;SAR=18;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0085919;STB=0.506938;TYPE=snp;VARB=0.000133889;OID=.;OPOS=33370900;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:62:63:4:2:58:61:18:40:3:1:19:42:1:1 chr21 33372749 . T C 3157.61 PASS AO=310;DP=322;FAO=352;FDP=352;FR=.;FRO=0;FSAF=197;FSAR=155;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.090517;FXX=0.0140052;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.53;QD=35.8819;RBI=0.0910383;REFB=-0.0859996;REVB=0.00972924;RO=5;SAF=167;SAR=143;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00186662;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000488376;OID=.;OPOS=33372749;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:322:352:5:0:310:352:143:167:3:2:155:197:0:0 chr21 33374318 . C T 869.64 PASS AO=197;DP=197;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.065;QD=38.6506;RBI=0.0169442;REFB=0;REVB=-0.00122596;RO=0;SAF=92;SAR=105;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.38106e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.41215e-05;OID=.;OPOS=33374318;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:197:90:0:0:197:90:105:92:0:0:48:42:0:0 chr21 33694224 . C G 252.61 PASS AO=52;DP=93;FAO=52;FDP=93;FR=.;FRO=41;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=0.0698714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.0283;QD=10.8647;RBI=0.0760206;REFB=-0.00482177;REVB=-0.0299521;RO=37;SAF=28;SAR=24;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0431178;STB=0.512395;TYPE=snp;VARB=0.00399788;OID=.;OPOS=33694224;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:37:41:52:52:24:28:22:15:23:29:24:17 chr21 33714964 . C CCA 10.3 PASS AO=2;DP=9;FAO=2;FDP=8;FR=.;FRO=6;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=252.443;QD=5.1483;RBI=0.012648;REFB=-0.00949982;REVB=-0.012648;RO=7;SAF=0;SAR=2;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.50628;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00952715;OID=.;OPOS=33714965;OREF=-;OALT=CA;OMAPALT=CCA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:2:9:2:8:6:0:2:0:6:10:7:0:2:1:6 chr21 33714967 . G A,C 10.21 PASS AO=6,2;DP=8;FAO=0,2;FDP=8;FR=.;FRO=6;FSAF=0,0;FSAR=0,2;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0,0;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=271.715,84.9303;QD=5.10604;RBI=0.014675,0.015378;REFB=-0.0104534,-0.0303983;REVB=-0.014675,-0.015378;RO=0;SAF=0,0;SAR=6,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=snp,snp;VARB=0,0.0620332;OID=.,.;OPOS=33714967,33714967;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/2:10:8:8:0:6:6,2:0,2:6,2:0,0:0:0:0,2:0,0:0:6 chr21 33714970 . C A 10.3 PASS AO=2;DP=8;FAO=2;FDP=8;FR=.;FRO=6;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=246.185;QD=5.14829;RBI=0.00649685;REFB=-0.00779814;REVB=0.00649685;RO=6;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0108546;OID=.;OPOS=33714970;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:8:6:6:2:2:2:0:0:6:2:0:0:6 chr21 33714972 . A G 10.3 PASS AO=2;DP=8;FAO=2;FDP=8;FR=.;FRO=6;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.5702;QD=5.1483;RBI=0.0147537;REFB=-0.00908827;REVB=0.0147537;RO=6;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0383669;OID=.;OPOS=33714972;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:8:6:6:2:2:2:0:0:6:2:0:0:6 chr21 33714976 . T TA 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=322.756;QD=33.022;RBI=0.00883584;REFB=0;REVB=-0.00883584;RO=0;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-7.07234e-05;OID=.;OPOS=33714977;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:6:6:6:6:0:0:6:0:0:4:0:0:6:0:0 chr21 33719695 . C T 110.9 PASS AO=22;DP=41;FAO=22;FDP=41;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=0.0188702;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.6701;QD=10.8198;RBI=0.04153;REFB=0.000574164;REVB=0.0369953;RO=18;SAF=10;SAR=12;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169473;STB=0.60517;TYPE=snp;VARB=-0.00157632;OID=.;OPOS=33719695;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:82:41:41:18:19:22:22:12:10:12:6:12:10:13:6 chr21 33749533 . A C 405.4 PASS AO=102;DP=217;FAO=102;FDP=217;FR=.;FRO=115;FSAF=48;FSAR=54;FSRF=52;FSRR=63;FWDB=0.00485958;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.871;QD=7.47289;RBI=0.00486345;REFB=-0.0153319;REVB=0.000193924;RO=115;SAF=48;SAR=54;SRF=52;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177515;STB=0.509802;TYPE=snp;VARB=0.0186742;OID=.;OPOS=33749533;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:217:217:115:115:102:102:54:48:52:63:54:48:52:63 chr21 33755763 . G A 108.14 PASS AO=33;DP=90;FAO=35;FDP=95;FR=.;FRO=60;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=27;FSRR=33;FWDB=-0.0164226;FXX=0.0104156;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.3032;QD=4.55306;RBI=0.0208192;REFB=0.0299846;REVB=-0.0127959;RO=57;SAF=15;SAR=18;SRF=27;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0212319;STB=0.504546;TYPE=snp;VARB=-0.0576184;OID=.;OPOS=33755763;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:95:57:60:33:35:18:15:27:30:19:16:27:33 chr21 33840208 . A G 404.87 PASS AO=122;DP=300;FAO=123;FDP=303;FR=.;FRO=180;FSAF=41;FSAR=82;FSRF=64;FSRR=116;FWDB=-0.00492536;FXX=0.00328937;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.277;QD=5.34484;RBI=0.0124645;REFB=-0.0147044;REVB=-0.0114501;RO=177;SAF=40;SAR=82;SRF=61;SRR=116;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0199671;STB=0.514703;TYPE=snp;VARB=0.0244224;OID=.;OPOS=33840208;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:300:303:177:180:122:123:82:40:61:116:82:41:64:116 chr21 33887130 . C CA 652.97 PASS AO=17;DP=96;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.13776;FXX=0.052626;HRUN=0;LEN=1;MLLD=71.1005;QD=29.0207;RBI=0.141826;REFB=0;REVB=0.0337142;RO=74;SAF=2;SAR=15;SRF=33;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.485833;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-0.00020791;OID=.;OPOS=33887131;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:17:96:90:90:0:33:57:0:0:35:74:2:15:33:41 chr21 33887131 . G A 891.84 PASS AO=73;DP=95;FAO=94;FDP=94;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=34;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0639686;FXX=0.0105252;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.6781;QD=37.9506;RBI=0.0699228;REFB=0;REVB=0.0282348;RO=0;SAF=32;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000193177;OID=.;OPOS=33887131;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:95:94:0:0:73:94:41:32:0:0:60:34:0:0 chr21 33951068 . T C 821.15 PASS AO=200;DP=408;FAO=197;FDP=399;FR=.;FRO=202;FSAF=83;FSAR=114;FSRF=77;FSRR=125;FWDB=-0.00540371;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.653;QD=8.23207;RBI=0.0220893;REFB=-0.00182222;REVB=0.0214181;RO=204;SAF=84;SAR=116;SRF=80;SRR=124;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0264663;STB=0.520969;TYPE=snp;VARB=0.00192312;OID=.;OPOS=33951068;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:408:399:204:202:200:197:116:84:80:124:114:83:77:125 chr21 33956579 . T C 152.46 PASS AO=34;DP=80;FAO=37;FDP=80;FR=.;FRO=43;FSAF=8;FSAR=29;FSRF=6;FSRR=37;FWDB=-0.0134953;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=64.0209;QD=7.62284;RBI=0.0318569;REFB=-0.0236653;REVB=-0.0288573;RO=45;SAF=5;SAR=29;SRF=8;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0585634;STB=0.565278;TYPE=snp;VARB=0.0482824;OID=.;OPOS=33956579;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:45:43:34:37:29:5:8:37:29:8:6:37 chr21 34003928 . A AAGTATT 70.16 PASS AO=29;DP=110;FAO=29;FDP=96;FR=.;FRO=67;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=45;FSRR=22;FWDB=-0.00951225;FXX=0.102794;HRUN=4;LEN=6;MLLD=257.163;QD=2.92354;RBI=0.0184265;REFB=-0.00594171;REVB=-0.0157814;RO=71;SAF=15;SAR=14;SRF=47;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176287;STB=0.608625;TYPE=ins;VARB=0.0125427;OID=.;OPOS=34003929;OREF=-;OALT=AGTATT;OMAPALT=AAGTATT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:29:110:29:96:67:15:14:45:22:70:71:15:14:47:24 chr21 34014192 . G A 278.42 PASS AO=60;DP=120;FAO=62;FDP=121;FR=.;FRO=59;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=25;FSRR=34;FWDB=-0.0109321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.343;QD=9.20388;RBI=0.014052;REFB=-0.0180346;REVB=0.00882881;RO=59;SAF=27;SAR=33;SRF=25;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239112;STB=0.513757;TYPE=snp;VARB=0.0092636;OID=.;OPOS=34014192;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:121:59:59:60:62:33:27:25:34:34:28:25:34 chr21 34014283 . C A 308.05 PASS AO=69;DP=160;FAO=79;FDP=170;FR=.;FRO=91;FSAF=27;FSAR=52;FSRF=51;FSRR=40;FWDB=0.0184451;FXX=0.00584761;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.819;QD=7.24811;RBI=0.0185526;REFB=-0.014129;REVB=-0.00199513;RO=89;SAF=25;SAR=44;SRF=50;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203987;STB=0.620152;TYPE=snp;VARB=0.0182051;OID=.;OPOS=34014283;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:170:89:91:69:79:44:25:50:39:52:27:51:40 chr21 34059352 . T C 326.58 PASS AO=75;DP=148;FAO=75;FDP=148;FR=.;FRO=73;FSAF=35;FSAR=40;FSRF=25;FSRR=48;FWDB=-0.0199093;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=209.469;QD=8.82649;RBI=0.0253842;REFB=-0.0169011;REVB=-0.0157472;RO=72;SAF=35;SAR=40;SRF=25;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107904;STB=0.562028;TYPE=snp;VARB=0.0178075;OID=.;OPOS=34059352;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:72:73:75:75:40:35:25:47:40:35:25:48 chr21 34163742 . A G 3736.2 PASS AO=523;DP=535;FAO=395;FDP=395;FR=.;FRO=0;FSAF=133;FSAR=262;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.063313;FXX=0.0124997;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.314;QD=37.8349;RBI=0.0768636;REFB=-0.119818;REVB=0.0435831;RO=8;SAF=173;SAR=350;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0135476;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000344438;OID=.;OPOS=34163742;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:535:395:8:0:523:395:350:173:6:2:262:133:0:0 chr21 34166190 . A T 2423.42 PASS AO=259;DP=268;FAO=273;FDP=281;FR=.;FRO=8;FSAF=160;FSAR=113;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0548113;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.8338;QD=34.497;RBI=0.113022;REFB=-0.0444559;REVB=0.098842;RO=9;SAF=151;SAR=108;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0018051;STB=0.506179;TYPE=snp;VARB=0.00153398;OID=.;OPOS=34166190;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:268:281:9:8:259:273:108:151:5:4:113:160:3:5 chr21 34166343 . C T 1352.6 PASS AO=175;DP=197;FAO=173;FDP=199;FR=.;FRO=26;FSAF=92;FSAR=81;FSRF=5;FSRR=21;FWDB=0.0747442;FXX=0.00499975;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5093;QD=27.1879;RBI=0.0750631;REFB=-0.0297042;REVB=-0.00691179;RO=22;SAF=94;SAR=81;SRF=2;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0942296;STB=0.544279;TYPE=snp;VARB=0.0329811;OID=.;OPOS=34166343;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:197:199:22:26:175:173:81:94:2:20:81:92:5:21 chr21 34169317 . C CT 422.66 PASS AO=51;DP=57;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188593;FXX=0.0526223;HRUN=0;LEN=1;MLLD=136.491;QD=31.3078;RBI=0.0436592;REFB=0;REVB=0.0393758;RO=2;SAF=22;SAR=29;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0313711;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.000209405;OID=.;OPOS=34169318;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:51:57:54:54:0:24:30:0:0:38:2:22:29:0:2 chr21 34399401 . A G 193.7 PASS AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0222593;FXX=0.0454339;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.76;QD=36.8942;RBI=0.0242917;REFB=0;REVB=0.00972676;RO=0;SAF=3;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000384444;OID=.;OPOS=34399401;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:21:21:0:0:21:21:18:3:0:0:18:3:0:0 chr21 34400463 . C A 159.58 PASS AO=40;DP=86;FAO=40;FDP=88;FR=.;FRO=48;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=-0.00181962;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=270.519;QD=7.2535;RBI=0.00181962;REFB=-0.00835913;REVB=-1.72265e-06;RO=45;SAF=15;SAR=25;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0687792;STB=0.535696;TYPE=snp;VARB=0.00928752;OID=.;OPOS=34400463;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:88:45:48:40:40:25:15:20:25:25:15:21:27 chr21 34400779 . T C 111.03 PASS AO=29;DP=78;FAO=32;FDP=79;FR=.;FRO=47;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=31;FWDB=-0.000278872;FXX=0.0246883;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.462;QD=5.62163;RBI=0.00174391;REFB=0.00660901;REVB=-0.00172147;RO=49;SAF=13;SAR=16;SRF=16;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137344;STB=0.559507;TYPE=snp;VARB=-0.0117843;OID=.;OPOS=34400779;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:79:49:47:29:32:16:13:16:33:18:14:16:31 chr21 34444475 . A G 96.01 PASS AO=25;DP=59;FAO=25;FDP=59;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.0290601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.076;QD=6.50912;RBI=0.0400088;REFB=-0.0103136;REVB=-0.0274994;RO=34;SAF=14;SAR=11;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0610413;STB=0.534761;TYPE=snp;VARB=0.00845479;OID=.;OPOS=34444475;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:59:59:34:34:25:25:11:14:17:17:11:14:17:17 chr21 34640788 . A G 283.2 PASS AO=66;DP=131;FAO=66;FDP=133;FR=.;FRO=67;FSAF=26;FSAR=40;FSRF=15;FSRR=52;FWDB=-0.00093243;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=99.5887;QD=8.51717;RBI=0.0351054;REFB=-0.0238356;REVB=-0.035093;RO=65;SAF=26;SAR=40;SRF=15;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1605;STB=0.593228;TYPE=snp;VARB=0.0159566;OID=.;OPOS=34640788;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:133:65:67:66:66:40:26:15:50:40:26:15:52 chr21 34666376 . A G 552.32 PASS AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0518933;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.8756;QD=36.2177;RBI=0.0819771;REFB=-0.00596017;REVB=-0.0634613;RO=1;SAF=35;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0185022;STB=0.509801;TYPE=snp;VARB=-0.0010462;OID=.;OPOS=34666376;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:61:61:1:1:60:60:25:35:0:1:25:35:0:1 chr21 34668747 . A G 234.94 PASS AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00464918;FXX=0.0384468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.3383;QD=37.5907;RBI=0.0336257;REFB=0;REVB=-0.0333028;RO=0;SAF=20;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00112968;OID=.;OPOS=34668747;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:26:25:0:0:25:25:5:20:0:0:5:20:0:0 chr21 34715699 . G C 352.04 PASS AO=120;DP=327;FAO=121;FDP=326;FR=.;FRO=205;FSAF=55;FSAR=66;FSRF=92;FSRR=113;FWDB=-0.0148266;FXX=0.0121208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.4759;QD=4.31945;RBI=0.0294312;REFB=-0.0171315;REVB=0.0254238;RO=203;SAF=55;SAR=65;SRF=90;SRR=113;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0168259;STB=0.503657;TYPE=snp;VARB=0.0283773;OID=.;OPOS=34715699;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:327:326:203:205:120:121:65:55:90:113:66:55:92:113 chr21 34821570 . G A 171.53 PASS AO=41;DP=93;FAO=44;FDP=96;FR=.;FRO=52;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=-0.000483245;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.551;QD=7.14724;RBI=0.00456795;REFB=-0.0144092;REVB=0.00454232;RO=52;SAF=25;SAR=16;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130459;STB=0.547597;TYPE=snp;VARB=0.0213323;OID=.;OPOS=34821570;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:96:52:52:41:44:16:25:25:27:19:25:25:27 chr21 34821807 . C T 224.86 PASS AO=43;DP=73;FAO=43;FDP=73;FR=.;FRO=30;FSAF=5;FSAR=38;FSRF=9;FSRR=21;FWDB=0.12486;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.133;QD=12.3211;RBI=0.127956;REFB=-0.0189845;REVB=-0.0279782;RO=30;SAF=5;SAR=38;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.257514;STB=0.64321;TYPE=snp;VARB=0.0152885;OID=.;OPOS=34821807;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:73:30:30:43:43:38:5:9:21:38:5:9:21 chr21 34822150 . T A 270.61 PASS AO=68;DP=161;FAO=74;FDP=166;FR=.;FRO=92;FSAF=46;FSAR=28;FSRF=52;FSRR=40;FWDB=0.0449145;FXX=0.00598767;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.6067;QD=6.52065;RBI=0.0464448;REFB=-0.0239139;REVB=0.011824;RO=93;SAF=42;SAR=26;SRF=52;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0627706;STB=0.532689;TYPE=snp;VARB=0.0319375;OID=.;OPOS=34822150;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:166:93:92:68:74:26:42:52:41:28:46:52:40 chr21 34822452 . T C 395.31 PASS AO=40;DP=43;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00157637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.817;QD=35.1385;RBI=0.177896;REFB=0;REVB=0.177889;RO=3;SAF=22;SAR=18;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0719708;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00337192;OID=.;OPOS=34822452;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:43:45:3:0:40:45:18:22:0:3:21:24:0:0 chr21 34860749 . CAATTA C 217.11 PASS AO=78;DP=209;FAO=80;FDP=168;FR=.;FRO=88;FSAF=37;FSAR=43;FSRF=51;FSRR=37;FWDB=-0.0160075;FXX=0.124993;HRUN=2;LEN=5;MLLD=192.938;QD=5.16938;RBI=0.0200222;REFB=0.00420706;REVB=0.012027;RO=66;SAF=35;SAR=43;SRF=37;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.093719;STB=0.561076;TYPE=del;VARB=-0.00638139;OID=.;OPOS=34860750;OREF=AATTA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:78:170:80:168:88:37:43:51:37:99:66:35:43:37:29 chr21 34870990 . G A 412.23 PASS AO=110;DP=245;FAO=110;FDP=245;FR=.;FRO=135;FSAF=57;FSAR=53;FSRF=49;FSRR=86;FWDB=-0.0125868;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.463;QD=6.73035;RBI=0.0139683;REFB=-0.0136036;REVB=-0.00605682;RO=135;SAF=57;SAR=53;SRF=49;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153881;STB=0.585097;TYPE=snp;VARB=0.0196577;OID=.;OPOS=34870990;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:245:245:135:135:110:110:53:57:49:86:53:57:49:86 chr21 34883618 . T C 242.86 PASS AO=50;DP=98;FAO=52;FDP=99;FR=.;FRO=47;FSAF=4;FSAR=48;FSRF=6;FSRR=41;FWDB=0.0195821;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.6455;QD=9.8127;RBI=0.0445309;REFB=0.00235087;REVB=0.0399942;RO=44;SAF=3;SAR=47;SRF=5;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166569;STB=0.574131;TYPE=snp;VARB=-0.000642903;OID=.;OPOS=34883618;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:99:44:47:50:52:47:3:5:39:48:4:6:41 chr21 34897113 . C T 3141.02 PASS AO=330;DP=333;FAO=330;FDP=330;FR=.;FRO=0;FSAF=197;FSAR=133;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00272343;FXX=0.00900874;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.922;QD=38.073;RBI=0.00420208;REFB=-0.000720442;REVB=0.00320007;RO=1;SAF=197;SAR=133;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0024156;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.79081e-05;OID=.;OPOS=34897113;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:333:330:1:0:330:330:133:197:1:0:133:197:0:0 chr21 34924243 . T C 443.65 PASS AO=116;DP=253;FAO=116;FDP=253;FR=.;FRO=137;FSAF=38;FSAR=78;FSRF=51;FSRR=86;FWDB=-0.0260854;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.458;QD=7.01419;RBI=0.0317917;REFB=0.00844995;REVB=0.0181733;RO=137;SAF=38;SAR=78;SRF=51;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0486449;STB=0.526942;TYPE=snp;VARB=-0.00726971;OID=.;OPOS=34924243;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:253:253:137:137:116:116:78:38:51:86:78:38:51:86 chr21 34925142 . C T 1192.38 PASS AO=122;DP=122;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0478122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.53;QD=38.1561;RBI=0.0522683;REFB=0;REVB=-0.0211178;RO=0;SAF=62;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.64881e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.23362e-05;OID=.;OPOS=34925142;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:122:125:0:0:122:125:60:62:0:0:60:65:0:0 chr21 34925689 . G A 246.87 PASS AO=58;DP=125;FAO=60;FDP=127;FR=.;FRO=67;FSAF=35;FSAR=25;FSRF=32;FSRR=35;FWDB=0.0203519;FXX=0.0155027;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.82;QD=7.77541;RBI=0.0211582;REFB=-0.0228712;REVB=-0.00578563;RO=65;SAF=33;SAR=25;SRF=32;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.073506;STB=0.556273;TYPE=snp;VARB=0.0238329;OID=.;OPOS=34925689;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:127:65:67:58:60:25:33:32:33:25:35:32:35 chr21 34926260 . C T 2777.92 PASS AO=288;DP=289;FAO=289;FDP=289;FR=.;FRO=0;FSAF=130;FSAR=159;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0287701;FXX=0.00344816;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.765;QD=38.4487;RBI=0.0295739;REFB=0;REVB=-0.00684837;RO=0;SAF=130;SAR=158;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.72076e-06;OID=.;OPOS=34926260;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:289:289:0:0:288:289:158:130:0:0:159:130:0:0 chr21 34948684 . G GA 1483.98 PASS AO=173;DP=222;FAO=215;FDP=215;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=117;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.224048;FXX=0.0227262;HRUN=1;LEN=1;MLLD=16.3411;QD=27.6089;RBI=0.226511;REFB=0.0674292;REVB=-0.0333125;RO=44;SAF=65;SAR=108;SRF=33;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146348;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.003955;OID=.;OPOS=34948685;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:173:222:215:215:0:98:117:0:0:99:44:65:108:33:11 chr21 34948696 . GAC GC,G 1954.43 PASS AO=126,75;DP=229;FAO=206,2;FDP=208;FR=.;FRO=0;FSAF=81,2;FSAR=125,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.151541,0.130328;FXX=0.018867;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=70.4903,55.0941;QD=37.5851;RBI=0.157245,0.138423;REFB=0,0;REVB=-0.0419684,-0.0466436;RO=0;SAF=12,71;SAR=114,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.84242e-08,4.57276e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.00146591,-0.0292799;OID=.,.;OPOS=34948697,34948697;OREF=A,AC;OALT=-,-;OMAPALT=GC,G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:126,75:210:206,2:208:0:81,2:125,0:0:0:42:0:12,71:114,4:0:0 chr21 34968503 . A G 469.22 PASS AO=101;DP=188;FAO=101;FDP=188;FR=.;FRO=87;FSAF=47;FSAR=54;FSRF=38;FSRR=49;FWDB=0.00388734;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.65;QD=9.98334;RBI=0.00413179;REFB=-0.0154427;REVB=-0.0014001;RO=87;SAF=47;SAR=54;SRF=38;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0243615;STB=0.513305;TYPE=snp;VARB=0.00712331;OID=.;OPOS=34968503;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:188:188:87:87:101:101:54:47:38:49:54:47:38:49 chr21 35013507 . C T 96.56 PASS AO=25;DP=59;FAO=25;FDP=59;FR=.;FRO=34;FSAF=2;FSAR=23;FSRF=6;FSRR=28;FWDB=0.0425107;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.2699;QD=6.5463;RBI=0.0431123;REFB=0.0123085;REVB=-0.00717722;RO=33;SAF=2;SAR=23;SRF=5;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19324;STB=0.643218;TYPE=snp;VARB=-0.0301277;OID=.;OPOS=35013507;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:59:59:33:34:25:25:23:2:5:28:23:2:6:28 chr21 35201947 . C T 439.92 PASS AO=98;DP=184;FAO=97;FDP=184;FR=.;FRO=87;FSAF=52;FSAR=45;FSRF=41;FSRR=46;FWDB=0.00350022;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.0443;QD=9.56337;RBI=0.0283272;REFB=0.0180673;REVB=0.0281102;RO=86;SAF=53;SAR=45;SRF=40;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0647542;STB=0.530665;TYPE=snp;VARB=-0.0178208;OID=.;OPOS=35201947;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:184:86:87:98:97:45:53:40:46:45:52:41:46 chr21 35237608 . T C 117.13 PASS AO=19;DP=29;FAO=19;FDP=29;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.00565094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.358;QD=16.1559;RBI=0.0274344;REFB=-0.00531259;REVB=-0.0268461;RO=9;SAF=6;SAR=13;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0117176;STB=0.506323;TYPE=snp;VARB=0.00119206;OID=.;OPOS=35237608;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:29:29:9:10:19:19:13:6:3:6:13:6:3:7 chr21 35260481 . T C 145.45 PASS AO=49;DP=135;FAO=49;FDP=135;FR=.;FRO=86;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=33;FSRR=53;FWDB=0.0327658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.5327;QD=4.30958;RBI=0.0338752;REFB=0.00779605;REVB=-0.00859832;RO=86;SAF=23;SAR=26;SRF=33;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0968184;STB=0.555126;TYPE=snp;VARB=-0.00969688;OID=.;OPOS=35260481;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:135:86:86:49:49:26:23:33:53:26:23:33:53 chr21 35275955 . G A 786.07 PASS AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.882;QD=37.8828;RBI=0.0324606;REFB=0;REVB=0.0297172;RO=0;SAF=31;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000142443;OID=.;OPOS=35275955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:83:83:0:0:83:83:52:31:0:0:52:31:0:0 chr21 35281393 . A G 385.06 PASS AO=85;DP=176;FAO=90;FDP=180;FR=.;FRO=90;FSAF=69;FSAR=21;FSRF=63;FSRR=27;FWDB=0.0247141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.563;QD=8.55692;RBI=0.0249692;REFB=-0.00829333;REVB=0.00355961;RO=89;SAF=65;SAR=20;SRF=62;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0831483;STB=0.544368;TYPE=snp;VARB=0.00945748;OID=.;OPOS=35281393;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:180:89:90:85:90:20:65:62:27:21:69:63:27 chr21 35284683 . A G 293 PASS AO=86;DP=209;FAO=86;FDP=209;FR=.;FRO=123;FSAF=44;FSAR=42;FSRF=26;FSRR=97;FWDB=0.0114873;FXX=0.00476168;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.846;QD=5.6077;RBI=0.012521;REFB=-0.00654631;REVB=0.00498186;RO=123;SAF=44;SAR=42;SRF=26;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.317066;STB=0.675317;TYPE=snp;VARB=0.0128055;OID=.;OPOS=35284683;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:209:123:123:86:86:42:44:26:97:42:44:26:97 chr21 35467645 . A G 3102.21 PASS AO=340;DP=349;FAO=341;FDP=351;FR=.;FRO=10;FSAF=167;FSAR=174;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.0848385;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.59;QD=35.3528;RBI=0.0862112;REFB=-0.143031;REVB=-0.0153235;RO=7;SAF=167;SAR=173;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140788;STB=0.503142;TYPE=snp;VARB=0.00110245;OID=.;OPOS=35467645;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:75:349:351:7:10:340:341:173:167:6:1:174:167:6:4 chr21 35469193 . C A 746.29 PASS AO=82;DP=84;FAO=82;FDP=84;FR=.;FRO=2;FSAF=70;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.010044;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1321;QD=35.5374;RBI=0.0106839;REFB=-0.0245962;REVB=0.00364197;RO=2;SAF=70;SAR=12;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0726153;STB=0.538452;TYPE=snp;VARB=0.00396376;OID=.;OPOS=35469193;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:84:84:2:2:82:82:12:70:0:2:12:70:0:2 chr21 35469708 . G GA 646.5 PASS AO=99;DP=168;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.226063;FXX=0.0181807;HRUN=6;LEN=1;MLLD=7.97555;QD=15.963;RBI=0.291581;REFB=0.0244736;REVB=-0.184161;RO=33;SAF=53;SAR=46;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.062062;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00337185;OID=.;OPOS=35469709;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:99:168:162:162:0:78:84:0:0:52:33:53:46:22:11 chr21 35469726 . G GT 1275.87 PASS AO=153;DP=178;FAO=167;FDP=167;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0568576;FXX=0.0402276;HRUN=1;LEN=1;MLLD=23.1232;QD=30.5598;RBI=0.0593223;REFB=0;REVB=0.0169217;RO=20;SAF=85;SAR=68;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0452879;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-0.000140648;OID=.;OPOS=35469727;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:153:178:167:167:0:90:77:0:0:99:20:85:68:7:13 chr21 35469852 . C A 1280.91 PASS AO=150;DP=158;FAO=147;FDP=156;FR=.;FRO=9;FSAF=66;FSAR=81;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.0499815;FXX=0.0126574;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.8738;QD=32.8438;RBI=0.0554465;REFB=-0.0825407;REVB=0.0240034;RO=7;SAF=67;SAR=83;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0138092;STB=0.513254;TYPE=snp;VARB=0.0199155;OID=.;OPOS=35469852;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:158:156:7:9:150:147:83:67:2:5:81:66:2:7 chr21 35470042 . G T 903.93 PASS AO=50;DP=98;FAO=96;FDP=96;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=49;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00748281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.418;QD=37.6636;RBI=0.0212956;REFB=0;REVB=-0.0199377;RO=0;SAF=32;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0010365;OID=.;OPOS=35470042;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:66:96:0:0:50:96:18:32:0:0:47:49:0:0 chr21 35470210 . T G 847.48 PASS AO=101;DP=111;FAO=101;FDP=110;FR=.;FRO=9;FSAF=49;FSAR=52;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=0.00999272;FXX=0.0090082;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.614;QD=30.8173;RBI=0.020132;REFB=-0.036123;REVB=-0.0174769;RO=9;SAF=49;SAR=52;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0624118;STB=0.532991;TYPE=snp;VARB=0.00146713;OID=.;OPOS=35470210;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:111:110:9:9:101:101:52:49:8:1:52:49:8:1 chr21 35470213 . C A 846.79 PASS AO=102;DP=111;FAO=103;FDP=111;FR=.;FRO=8;FSAF=54;FSAR=49;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=0.137121;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.0366;QD=30.5149;RBI=0.137229;REFB=-0.191039;REVB=0.00545064;RO=9;SAF=53;SAR=49;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0568701;STB=0.525395;TYPE=snp;VARB=0.0237543;OID=.;OPOS=35470213;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:111:111:9:8:102:103:49:53:8:1:49:54:7:1 chr21 35477486 . C T 85.3 PASS AO=26;DP=69;FAO=26;FDP=70;FR=.;FRO=44;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=27;FSRR=17;FWDB=-0.0760621;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8331;QD=4.87404;RBI=0.0778438;REFB=-0.0117594;REVB=-0.0165593;RO=43;SAF=6;SAR=20;SRF=27;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.438853;STB=0.748103;TYPE=snp;VARB=0.0192912;OID=.;OPOS=35477486;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:69:70:43:44:26:26:20:6:27:16:20:6:27:17 chr21 35821821 . T C 49.28 PASS AO=21;DP=74;FAO=21;FDP=74;FR=.;FRO=53;FSAF=2;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=28;FWDB=-0.0342435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.84;QD=2.66398;RBI=0.0383495;REFB=-0.0143958;REVB=0.0172647;RO=53;SAF=2;SAR=19;SRF=25;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.558644;STB=0.84475;TYPE=snp;VARB=0.0370867;OID=.;OPOS=35821821;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:74:74:53:53:21:21:19:2:25:28:19:2:25:28 chr21 35890232 . G A 251.63 PASS AO=88;DP=242;FAO=88;FDP=243;FR=.;FRO=155;FSAF=45;FSAR=43;FSRF=86;FSRR=69;FWDB=-0.00489184;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.607;QD=4.14204;RBI=0.0159358;REFB=0.00115167;REVB=0.0151664;RO=154;SAF=45;SAR=43;SRF=85;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0456343;STB=0.527774;TYPE=snp;VARB=-0.00212416;OID=.;OPOS=35890232;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:242:243:154:155:88:88:43:45:85:69:43:45:86:69 chr21 35893642 . A G 39.78 PASS AO=11;DP=31;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.00648777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.226;QD=5.13278;RBI=0.111427;REFB=-0.0306343;REVB=-0.111238;RO=20;SAF=7;SAR=4;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0416209;STB=0.524954;TYPE=snp;VARB=0.0409079;OID=.;OPOS=35893642;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:31:31:20:20:11:11:4:7:12:8:4:7:12:8 chr21 36080290 . C T 204.52 PASS AO=57;DP=145;FAO=62;FDP=151;FR=.;FRO=89;FSAF=29;FSAR=33;FSRF=31;FSRR=58;FWDB=0.0435778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.598;QD=5.41764;RBI=0.0437801;REFB=-0.00970488;REVB=-0.00420305;RO=86;SAF=24;SAR=33;SRF=29;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0934711;STB=0.571313;TYPE=snp;VARB=0.0148007;OID=.;OPOS=36080290;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:151:86:89:57:62:33:24:29:57:33:29:31:58 chr21 36411119 . G T 36.46 PASS AO=16;DP=59;FAO=16;FDP=59;FR=.;FRO=43;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=39;FWDB=0.0158176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.142;QD=2.47169;RBI=0.0179422;REFB=-0.0364379;REVB=-0.00846922;RO=43;SAF=7;SAR=9;SRF=4;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.476525;STB=0.772189;TYPE=snp;VARB=0.0327916;OID=.;OPOS=36411119;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:59:59:43:43:16:16:9:7:4:39:9:7:4:39 chr21 37093109 . T C 226.7 PASS AO=52;DP=104;FAO=52;FDP=104;FR=.;FRO=52;FSAF=20;FSAR=32;FSRF=22;FSRR=30;FWDB=0.0208603;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.25;QD=8.71937;RBI=0.0210444;REFB=0.00828879;REVB=0.00277784;RO=52;SAF=20;SAR=32;SRF=22;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0363458;STB=0.520116;TYPE=snp;VARB=-0.0124704;OID=.;OPOS=37093109;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:52:52:52:52:32:20:22:30:32:20:22:30 chr21 37263460 . C T 297.56 PASS AO=78;DP=173;FAO=78;FDP=173;FR=.;FRO=95;FSAF=40;FSAR=38;FSRF=39;FSRR=56;FWDB=-0.00887009;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.632;QD=6.88005;RBI=0.0163318;REFB=0.00673704;REVB=-0.0137131;RO=94;SAF=40;SAR=38;SRF=38;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106699;STB=0.556034;TYPE=snp;VARB=-0.00928348;OID=.;OPOS=37263460;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:173:94:95:78:78:38:40:38:56:38:40:39:56 chr21 37429679 . G C 316.55 PASS AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0834206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.4728;QD=37.2408;RBI=0.0885032;REFB=0;REVB=-0.0295606;RO=0;SAF=14;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48532e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000822136;OID=.;OPOS=37429679;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:34:0:0:34:34:20:14:0:0:20:14:0:0 chr21 37443480 . T G 171.29 PASS AO=51;DP=129;FAO=51;FDP=128;FR=.;FRO=77;FSAF=14;FSAR=37;FSRF=13;FSRR=64;FWDB=-0.011513;FXX=0.00775134;HRUN=5;LEN=1;MLLD=209.608;QD=5.35272;RBI=0.0115206;REFB=-0.00683083;REVB=-0.000418411;RO=77;SAF=14;SAR=37;SRF=13;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153953;STB=0.585962;TYPE=snp;VARB=0.0112664;OID=.;OPOS=37443480;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:128:77:77:51:51:37:14:13:64:37:14:13:64 chr21 37445039 . G A 95.16 PASS AO=23;DP=53;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.00363404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.662;QD=7.04902;RBI=0.0142511;REFB=-0.00093215;REVB=0.01378;RO=29;SAF=17;SAR=6;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174528;STB=0.619458;TYPE=snp;VARB=0.00145861;OID=.;OPOS=37445039;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:95:53:54:29:30:23:24:6:17:17:12:6:18:17:13 chr21 37507745 . C T 351.38 PASS AO=36;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00687117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.107;QD=37.9868;RBI=0.0487376;REFB=0;REVB=0.0482508;RO=0;SAF=21;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000230247;OID=.;OPOS=37507745;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:36:37:0:0:36:37:15:21:0:0:16:21:0:0 chr21 37507769 . C T 80.26 PASS AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0593474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.47;QD=8.44804;RBI=0.06566;REFB=0.000728082;REVB=-0.0280914;RO=20;SAF=10;SAR=8;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00519108;STB=0.502955;TYPE=snp;VARB=-0.0014117;OID=.;OPOS=37507769;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:38:38:20:20:18:18:8:10:11:9:8:10:11:9 chr21 37609571 . T C 136.09 PASS AO=37;DP=88;FAO=37;FDP=88;FR=.;FRO=51;FSAF=10;FSAR=27;FSRF=16;FSRR=35;FWDB=-0.112095;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9655;QD=6.18579;RBI=0.114146;REFB=-0.00462605;REVB=-0.0215384;RO=51;SAF=10;SAR=27;SRF=16;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0547319;STB=0.530996;TYPE=snp;VARB=0.00402673;OID=.;OPOS=37609571;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:51:51:37:37:27:10:16:35:27:10:16:35 chr21 37617630 . T G 385.46 PASS AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0110357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.094;QD=37.6055;RBI=0.0164652;REFB=0;REVB=-0.0122195;RO=0;SAF=23;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.08201e-05;OID=.;OPOS=37617630;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:41:41:0:0:41:41:18:23:0:0:18:23:0:0 chr21 37617724 . C A 137.14 PASS AO=24;DP=39;FAO=24;FDP=39;FR=.;FRO=15;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.0120599;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=230.937;QD=14.0653;RBI=0.0158303;REFB=-0.00511712;REVB=0.0102545;RO=15;SAF=14;SAR=10;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127923;STB=0.570756;TYPE=snp;VARB=0.00289066;OID=.;OPOS=37617724;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:39:39:15:15:24:24:10:14:6:9:10:14:6:9 chr21 37692589 . A T 74 PASS AO=12;DP=19;FAO=12;FDP=19;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0504866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.037;QD=15.5784;RBI=0.0504995;REFB=0.0225598;REVB=0.00114304;RO=7;SAF=3;SAR=9;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14113;STB=0.580502;TYPE=snp;VARB=-0.0102814;OID=.;OPOS=37692589;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:19:19:7:7:12:12:9:3:3:4:9:3:3:4 chr21 37833307 . C T 121.97 PASS AO=32;DP=73;FAO=32;FDP=74;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=0.0217453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.6087;QD=6.59291;RBI=0.0221915;REFB=-0.024374;REVB=0.00442806;RO=41;SAF=11;SAR=21;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149985;STB=0.579131;TYPE=snp;VARB=0.0528839;OID=.;OPOS=37833307;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:73:74:41:42:32:32:21:11:20:21:21:11:20:22 chr21 37833751 . G A 268.73 PASS AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.01223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.608;QD=35.8304;RBI=0.203247;REFB=-0.0564439;REVB=0.202879;RO=1;SAF=23;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.01983;STB=0.510631;TYPE=snp;VARB=0.00698692;OID=.;OPOS=37833751;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:30:30:1:1:29:29:6:23:1:0:6:23:1:0 chr21 37833983 . G A 39.46 PASS AO=6;DP=9;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0204861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.453;QD=15.7836;RBI=0.0269273;REFB=-0.0399623;REVB=-0.0174757;RO=3;SAF=1;SAR=5;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146968;STB=0.555356;TYPE=snp;VARB=0.0213401;OID=.;OPOS=37833983;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:9:10:3:4:6:6:5:1:1:2:5:1:1:3 chr21 38117040 . G A 358.22 PASS AO=87;DP=182;FAO=88;FDP=183;FR=.;FRO=95;FSAF=41;FSAR=47;FSRF=46;FSRR=49;FWDB=0.00285633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.179;QD=7.82994;RBI=0.0629309;REFB=-0.0277913;REVB=0.062866;RO=91;SAF=40;SAR=47;SRF=44;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0221218;STB=0.509531;TYPE=snp;VARB=0.0267889;OID=.;OPOS=38117040;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:182:183:91:95:87:88:47:40:44:47:47:41:46:49 chr21 38117308 . C A 173.47 PASS AO=42;DP=90;FAO=42;FDP=90;FR=.;FRO=48;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=30;FWDB=-0.0261977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.216;QD=7.70978;RBI=0.0266077;REFB=-0.00159004;REVB=-0.00465317;RO=48;SAF=21;SAR=21;SRF=18;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119623;STB=0.566635;TYPE=snp;VARB=0.00158703;OID=.;OPOS=38117308;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:90:90:48:48:42:42:21:21:18:30:21:21:18:30 chr21 38117505 . C T 23 PASS AO=6;DP=21;FAO=6;FDP=22;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.014443;FXX=0.0832986;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.5323;QD=4.1811;RBI=0.0243536;REFB=-0.0730537;REVB=-0.0196086;RO=15;SAF=5;SAR=1;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166455;STB=0.651596;TYPE=snp;VARB=0.079926;OID=.;OPOS=38117505;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:21:22:15:16:6:6:1:5:11:4:1:5:11:5 chr21 38118089 . G C 183.82 PASS AO=42;DP=84;FAO=42;FDP=84;FR=.;FRO=42;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=16;FSRR=26;FWDB=-0.0261453;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.836;QD=8.75323;RBI=0.0332634;REFB=-0.0278824;REVB=-0.0205641;RO=42;SAF=17;SAR=25;SRF=16;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0223712;STB=0.512405;TYPE=snp;VARB=0.0311309;OID=.;OPOS=38118089;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:42:42:42:42:25:17:16:26:25:17:16:26 chr21 38444863 . C T 1421.14 PASS AO=147;DP=147;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0409075;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.044;QD=38.4091;RBI=0.0514345;REFB=0;REVB=0.0311783;RO=0;SAF=59;SAR=88;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000140546;OID=.;OPOS=38444863;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:147:148:0:0:147:148:88:59:0:0:89:59:0:0 chr21 38444890 . A G 156.54 PASS AO=40;DP=97;FAO=43;FDP=101;FR=.;FRO=58;FSAF=14;FSAR=29;FSRF=28;FSRR=30;FWDB=-0.0166911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.435;QD=6.19966;RBI=0.0175566;REFB=-0.0259488;REVB=0.00544434;RO=57;SAF=14;SAR=26;SRF=27;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134469;STB=0.595844;TYPE=snp;VARB=0.0268109;OID=.;OPOS=38444890;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:101:57:58:40:43:26:14:27:30:29:14:28:30 chr21 38468958 . A G 480.58 PASS AO=99;DP=178;FAO=99;FDP=177;FR=.;FRO=78;FSAF=46;FSAR=53;FSRF=28;FSRR=50;FWDB=-0.073493;FXX=0.00561766;HRUN=4;LEN=1;MLLD=115.039;QD=10.8607;RBI=0.07436;REFB=-0.0015195;REVB=0.0113223;RO=78;SAF=46;SAR=53;SRF=28;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0865933;STB=0.547104;TYPE=snp;VARB=0.00137617;OID=.;OPOS=38468958;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:178:177:78:78:99:99:53:46:28:50:53:46:28:50 chr21 38495270 . A AT 1065.34 PASS AO=139;DP=173;FAO=156;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.24775;FXX=0.0429422;HRUN=1;LEN=1;MLLD=19.572;QD=27.3164;RBI=0.250661;REFB=-0.0405998;REVB=0.0380905;RO=15;SAF=45;SAR=94;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0834708;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00422328;OID=.;OPOS=38495271;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:139:173:156:156:0:58:98:0:0:80:15:45:94:11:4 chr21 38512956 . A G 234.48 PASS AO=67;DP=161;FAO=67;FDP=161;FR=.;FRO=94;FSAF=30;FSAR=37;FSRF=34;FSRR=60;FWDB=-0.0051883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.01;QD=5.82552;RBI=0.0110252;REFB=0.0101036;REVB=0.00972817;RO=94;SAF=30;SAR=37;SRF=34;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0917806;STB=0.55133;TYPE=snp;VARB=-0.00957024;OID=.;OPOS=38512956;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:161:94:94:67:67:37:30:34:60:37:30:34:60 chr21 38525356 . T C 382.52 PASS AO=124;DP=326;FAO=124;FDP=321;FR=.;FRO=197;FSAF=38;FSAR=86;FSRF=77;FSRR=120;FWDB=0.0200346;FXX=0.015337;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.527;QD=4.76664;RBI=0.0200763;REFB=-0.00796732;REVB=-0.00129347;RO=192;SAF=38;SAR=86;SRF=75;SRR=117;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102054;STB=0.55818;TYPE=snp;VARB=0.00658756;OID=.;OPOS=38525356;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:326:321:192:197:124:124:86:38:75:117:86:38:77:120 chr21 38528987 . G A 226.86 PASS AO=58;DP=129;FAO=59;FDP=130;FR=.;FRO=71;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=48;FSRR=23;FWDB=-0.0103993;FXX=0.00763301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.105;QD=6.98037;RBI=0.0105216;REFB=-0.00664557;REVB=0.00159946;RO=67;SAF=31;SAR=27;SRF=47;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164551;STB=0.583152;TYPE=snp;VARB=0.0132404;OID=.;OPOS=38528987;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:130:67:71:58:59:27:31:47:20:28:31:48:23 chr21 38532058 . TG T 1532.79 PASS AO=192;DP=208;FAO=199;FDP=199;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0250875;FXX=0.0197035;HRUN=2;LEN=1;MLLD=26.0182;QD=30.8098;RBI=0.0413393;REFB=0;REVB=0.0328565;RO=0;SAF=84;SAR=108;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.66363e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.000513152;OID=.;OPOS=38532059;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:192:202:199:199:0:90:109:0:0:99:0:84:108:0:0 chr21 38532068 . G GA 1384.92 PASS AO=165;DP=197;FAO=184;FDP=184;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.233945;FXX=0.0160419;HRUN=2;LEN=1;MLLD=21.8882;QD=30.107;RBI=0.294091;REFB=0;REVB=0.178211;RO=28;SAF=74;SAR=91;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0535494;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00339686;OID=.;OPOS=38532069;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:165:197:184:184:0:82:102:0:0:99:28:74:91:18:10 chr21 38539844 . G A 188.49 PASS AO=38;DP=80;FAO=40;FDP=73;FR=.;FRO=33;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.0572813;FXX=0.0874891;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.959;QD=10.3281;RBI=0.057418;REFB=0.000908355;REVB=-0.00396013;RO=31;SAF=19;SAR=19;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.013131;STB=0.504459;TYPE=snp;VARB=-0.000907484;OID=.;OPOS=38539844;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:73:31:33:38:40:19:19:15:16:19:21:17:16 chr21 38563725 . G A 626.6 PASS AO=126;DP=234;FAO=135;FDP=247;FR=.;FRO=112;FSAF=30;FSAR=105;FSRF=31;FSRR=81;FWDB=-0.0110796;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.9862;QD=10.1473;RBI=0.0218188;REFB=0.000707791;REVB=0.0187963;RO=108;SAF=29;SAR=97;SRF=31;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0651062;STB=0.534413;TYPE=snp;VARB=1.39622e-05;OID=.;OPOS=38563725;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:234:247:108:112:126:135:97:29:31:77:105:30:31:81 chr21 38568009 . G C 255.84 PASS AO=84;DP=183;FAO=79;FDP=175;FR=.;FRO=96;FSAF=36;FSAR=43;FSRF=42;FSRR=54;FWDB=0.0549815;FXX=0.0437135;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.7215;QD=5.84767;RBI=0.0681763;REFB=-0.0483835;REVB=0.0403119;RO=98;SAF=41;SAR=43;SRF=44;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0380809;STB=0.510076;TYPE=snp;VARB=0.0786386;OID=.;OPOS=38568009;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:175:98:96:84:79:43:41:44:54:43:36:42:54 chr21 38568308 . C T 86.29 PASS AO=21;DP=47;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=0.0178146;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.2677;QD=7.34369;RBI=0.0178859;REFB=0.0155998;REVB=-0.00159556;RO=26;SAF=10;SAR=11;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205219;STB=0.615913;TYPE=snp;VARB=-0.0250684;OID=.;OPOS=38568308;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:47:47:26:26:21:21:11:10:7:19:11:10:7:19 chr21 38587916 . A G 313.15 PASS AO=62;DP=113;FAO=64;FDP=114;FR=.;FRO=50;FSAF=41;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=-0.00702586;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7029;QD=10.9876;RBI=0.0503468;REFB=-0.0219176;REVB=0.0498541;RO=49;SAF=41;SAR=21;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17866;STB=0.590649;TYPE=snp;VARB=0.0121175;OID=.;OPOS=38587916;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:114:49:50:62:64:21:41:22:27:23:41:22:28 chr21 38885442 . A G 989.31 PASS AO=103;DP=103;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0375826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.572;QD=38.0503;RBI=0.0479988;REFB=0;REVB=-0.0298568;RO=0;SAF=95;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000101529;OID=.;OPOS=38885442;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:103:104:0:0:103:104:8:95:0:0:9:95:0:0 chr21 38997701 . G A 368.46 PASS AO=51;DP=237;FAO=98;FDP=218;FR=.;FRO=120;FSAF=48;FSAR=50;FSRF=59;FSRR=61;FWDB=-0.0184239;FXX=0.0090905;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.293;QD=6.76068;RBI=0.0196373;REFB=-0.00161346;REVB=-0.00679588;RO=89;SAF=42;SAR=9;SRF=50;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.360336;STB=0.50103;TYPE=snp;VARB=0.00152614;OID=.;OPOS=38997701;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:218:89:120:51:98:9:42:50:39:50:48:59:61 chr21 39086965 . T C 721.27 PASS AO=75;DP=78;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0367048;FXX=0.0384566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.212;QD=38.4677;RBI=0.0370349;REFB=0;REVB=0.00493375;RO=0;SAF=15;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.2283e-06;OID=.;OPOS=39086965;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:78:75:0:0:75:75:60:15:0:0:60:15:0:0 chr21 39213020 . G A 158.05 PASS AO=46;DP=116;FAO=47;FDP=119;FR=.;FRO=72;FSAF=12;FSAR=35;FSRF=32;FSRR=40;FWDB=-0.0170673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.1838;QD=5.31263;RBI=0.01901;REFB=0.000920037;REVB=-0.00837184;RO=70;SAF=11;SAR=35;SRF=30;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236188;STB=0.631088;TYPE=snp;VARB=-0.00193429;OID=.;OPOS=39213020;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:119:70:72:46:47:35:11:30:40:35:12:32:40 chr21 39671476 . G A 774.56 PASS AO=161;DP=292;FAO=161;FDP=288;FR=.;FRO=127;FSAF=81;FSAR=80;FSRF=63;FSRR=64;FWDB=0.00684383;FXX=0.0136982;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.051;QD=10.7577;RBI=0.0124416;REFB=-0.00112052;REVB=0.0103902;RO=127;SAF=81;SAR=80;SRF=63;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00571715;STB=0.503105;TYPE=snp;VARB=0.000906499;OID=.;OPOS=39671476;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:292:288:127:127:161:161:80:81:63:64:80:81:63:64 chr21 39672624 . C G 293.27 PASS AO=64;DP=122;FAO=64;FDP=122;FR=.;FRO=58;FSAF=43;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=32;FWDB=-0.00786514;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.715;QD=9.61529;RBI=0.00867269;REFB=-0.00804169;REVB=-0.00365449;RO=58;SAF=43;SAR=21;SRF=26;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201982;STB=0.611284;TYPE=snp;VARB=0.0043966;OID=.;OPOS=39672624;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:122:58:58:64:64:21:43:26:32:21:43:26:32 chr21 39673299 . C T 304.22 PASS AO=67;DP=129;FAO=67;FDP=129;FR=.;FRO=62;FSAF=15;FSAR=52;FSRF=23;FSRR=39;FWDB=0.00584135;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.407;QD=9.43314;RBI=0.00584238;REFB=-0.0106616;REVB=0.000109729;RO=61;SAF=15;SAR=52;SRF=23;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170088;STB=0.59141;TYPE=snp;VARB=0.012337;OID=.;OPOS=39673299;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:61:62:67:67:52:15:23:38:52:15:23:39 chr21 39870310 . G A 479.1 PASS AO=52;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00925477;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.073;QD=37.5761;RBI=0.0290619;REFB=0;REVB=0.0275489;RO=0;SAF=23;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.84538e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.74428e-05;OID=.;OPOS=39870310;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:52:51:0:0:52:51:29:23:0:0:28:23:0:0 chr21 40191431 . T G 1805.17 PASS AO=187;DP=197;FAO=188;FDP=188;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0264042;FXX=0.045683;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.851;QD=38.4078;RBI=0.0264099;REFB=0;REVB=0.000549709;RO=0;SAF=90;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.31731e-05;OID=.;OPOS=40191431;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:197:188:0:0:187:188:97:90:0:0:98:90:0:0 chr21 40191638 . A G 1086.58 PASS AO=118;DP=124;FAO=121;FDP=123;FR=.;FRO=2;FSAF=58;FSAR=63;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0191902;FXX=0.0159987;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.717;QD=35.3358;RBI=0.0195489;REFB=-0.15942;REVB=-0.00372737;RO=2;SAF=55;SAR=63;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0169556;STB=0.508473;TYPE=snp;VARB=0.000824582;OID=.;OPOS=40191638;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:124:123:2:2:118:121:63:55:2:0:63:58:2:0 chr21 40195277 . T A 3673.01 PASS AO=473;DP=478;FAO=393;FDP=393;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=308;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00311783;FXX=0.0174996;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.5052;QD=37.3843;RBI=0.0360753;REFB=-0.0367487;REVB=0.0359403;RO=4;SAF=107;SAR=366;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00518865;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000425916;OID=.;OPOS=40195277;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:478:393:4:0:473:393:366:107:0:4:308:85:0:0 chr21 40196125 . G C 169.1 PASS AO=44;DP=98;FAO=44;FDP=100;FR=.;FRO=56;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=17;FSRR=39;FWDB=0.00908611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.4228;QD=6.76382;RBI=0.0338177;REFB=-0.00956703;REVB=-0.0325742;RO=53;SAF=21;SAR=23;SRF=16;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174046;STB=0.598303;TYPE=snp;VARB=0.0168249;OID=.;OPOS=40196125;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:100:53:56:44:44:23:21:16:37:23:21:17:39 chr21 40549466 . T C 488.05 PASS AO=126;DP=280;FAO=128;FDP=281;FR=.;FRO=153;FSAF=61;FSAR=67;FSRF=70;FSRR=83;FWDB=-0.0067749;FXX=0.00706689;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.5;QD=6.94734;RBI=0.00915559;REFB=-0.0143326;REVB=-0.00615837;RO=146;SAF=60;SAR=66;SRF=70;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00317633;STB=0.510402;TYPE=snp;VARB=0.0216373;OID=.;OPOS=40549466;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:280:281:146:153:126:128:66:60:70:76:67:61:70:83 chr21 40552307 . A G 343.95 PASS AO=99;DP=227;FAO=97;FDP=226;FR=.;FRO=129;FSAF=49;FSAR=48;FSRF=48;FSRR=81;FWDB=0.0127531;FXX=0.00877155;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.334;QD=6.08759;RBI=0.0130044;REFB=-0.00898232;REVB=-0.00254456;RO=126;SAF=51;SAR=48;SRF=46;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150929;STB=0.575825;TYPE=snp;VARB=0.0133371;OID=.;OPOS=40552307;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:227:226:126:129:99:97:48:51:46:80:48:49:48:81 chr21 40567716 . C G 361.5 PASS AO=80;DP=153;FAO=80;FDP=153;FR=.;FRO=73;FSAF=42;FSAR=38;FSRF=25;FSRR=48;FWDB=-0.000798463;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.774;QD=9.45102;RBI=0.0273227;REFB=0.00830884;REVB=-0.027311;RO=72;SAF=42;SAR=38;SRF=25;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152952;STB=0.586533;TYPE=snp;VARB=-0.00701036;OID=.;OPOS=40567716;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:153:72:73:80:80:38:42:25:47:38:42:25:48 chr21 40569280 . A G 248.39 PASS AO=64;DP=142;FAO=64;FDP=141;FR=.;FRO=77;FSAF=22;FSAR=42;FSRF=27;FSRR=50;FWDB=0.0115793;FXX=0.00704176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4233;QD=7.04643;RBI=0.0363777;REFB=-0.0228571;REVB=0.0344856;RO=74;SAF=22;SAR=42;SRF=27;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0224014;STB=0.504163;TYPE=snp;VARB=0.0282554;OID=.;OPOS=40569280;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:141:74:77:64:64:42:22:27:47:42:22:27:50 chr21 40571246 . A G 2673.51 PASS AO=254;DP=255;FAO=281;FDP=281;FR=.;FRO=0;FSAF=141;FSAR=140;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0103876;FXX=0.0140346;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.843;QD=38.057;RBI=0.0338566;REFB=0;REVB=0.0322237;RO=0;SAF=140;SAR=114;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.31703e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.59869e-05;OID=.;OPOS=40571246;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:255:281:0:0:254:281:114:140:0:0:140:141:0:0 chr21 40574305 . A G 348.4 PASS AO=94;DP=215;FAO=95;FDP=216;FR=.;FRO=121;FSAF=64;FSAR=31;FSRF=67;FSRR=54;FWDB=-0.0142752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.661;QD=6.45189;RBI=0.0145207;REFB=-0.0109245;REVB=-0.00265913;RO=121;SAF=63;SAR=31;SRF=67;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126506;STB=0.572556;TYPE=snp;VARB=0.0190263;OID=.;OPOS=40574305;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:215:216:121:121:94:95:31:63:67:54:31:64:67:54 chr21 40584598 . C T 1231.54 PASS AO=130;DP=132;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0681369;FXX=0.0150365;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.4795;QD=37.6042;RBI=0.0763072;REFB=0.0538365;REVB=-0.0343534;RO=1;SAF=54;SAR=76;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00621273;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00119024;OID=.;OPOS=40584598;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:132:131:1:0:130:131:76:54:0:1:76:55:0:0 chr21 40652142 . G A 555.35 PASS AO=115;DP=206;FAO=115;FDP=206;FR=.;FRO=91;FSAF=41;FSAR=74;FSRF=37;FSRR=54;FWDB=-0.068181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.7901;QD=10.7836;RBI=0.0684528;REFB=-0.0212836;REVB=0.00609446;RO=91;SAF=41;SAR=74;SRF=37;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0436411;STB=0.523771;TYPE=snp;VARB=0.0163952;OID=.;OPOS=40652142;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:206:206:91:91:115:115:74:41:37:54:74:41:37:54 chr21 40670460 . G C 729.95 PASS AO=173;DP=348;FAO=174;FDP=351;FR=.;FRO=177;FSAF=72;FSAR=102;FSRF=92;FSRR=85;FWDB=0.00718584;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.407;QD=8.31846;RBI=0.033773;REFB=-0.00351445;REVB=-0.0329997;RO=174;SAF=72;SAR=101;SRF=92;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103893;STB=0.554048;TYPE=snp;VARB=0.00377521;OID=.;OPOS=40670460;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:348:351:174:177:173:174:101:72:92:82:102:72:92:85 chr21 40686020 . C T 125.38 PASS AO=26;DP=50;FAO=26;FDP=50;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.011211;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.849;QD=10.0304;RBI=0.0112113;REFB=0.00122749;REVB=-7.71861e-05;RO=23;SAF=13;SAR=13;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128245;STB=0.57994;TYPE=snp;VARB=-0.00176825;OID=.;OPOS=40686020;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:50:23:24:26:26:13:13:8:15:13:13:8:16 chr21 40686078 . G C 128.51 PASS AO=28;DP=54;FAO=28;FDP=55;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=0.0239701;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.193;QD=9.34608;RBI=0.0291711;REFB=-0.0240874;REVB=-0.016625;RO=26;SAF=12;SAR=16;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108648;STB=0.548353;TYPE=snp;VARB=0.0220916;OID=.;OPOS=40686078;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:55:26:27:28:28:16:12:8:18:16:12:9:18 chr21 40686327 . T C 95.25 PASS AO=19;DP=35;FAO=19;FDP=35;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=0.00389815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.124;QD=10.8856;RBI=0.0205354;REFB=-0.0372461;REVB=-0.020162;RO=16;SAF=7;SAR=12;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167198;STB=0.59313;TYPE=snp;VARB=0.042287;OID=.;OPOS=40686327;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:35:35:16:16:19:19:12:7:3:13:12:7:3:13 chr21 40769290 . A G 108.2 PASS AO=40;DP=120;FAO=40;FDP=120;FR=.;FRO=80;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=34;FSRR=46;FWDB=0.0269817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.424;QD=3.6065;RBI=0.027079;REFB=0.00718589;REVB=0.00229323;RO=78;SAF=17;SAR=23;SRF=32;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0173323;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00890892;OID=.;OPOS=40769290;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:120:78:80:40:40:23:17:32:46:23:17:34:46 chr21 40800371 . C T 146.12 PASS AO=25;DP=40;FAO=25;FDP=40;FR=.;FRO=15;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0136466;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.97;QD=14.612;RBI=0.0195199;REFB=-0.0678456;REVB=-0.0139569;RO=14;SAF=14;SAR=11;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00755934;STB=0.510113;TYPE=snp;VARB=0.0197451;OID=.;OPOS=40800371;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:40:40:14:15:25:25:11:14:8:6:11:14:8:7 chr21 40823902 . C G 185.92 PASS AO=38;DP=68;FAO=38;FDP=70;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=-0.0106022;FXX=0.0140825;HRUN=4;LEN=1;MLLD=126.568;QD=10.6241;RBI=0.0592001;REFB=-0.0272195;REVB=-0.058243;RO=29;SAF=18;SAR=20;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0882739;STB=0.554694;TYPE=snp;VARB=0.0436046;OID=.;OPOS=40823902;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:70:29:32:38:38:20:18:17:12:20:18:19:13 chr21 40823981 . G A 1444.43 PASS AO=144;DP=147;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162557;FXX=0.0129862;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.52;QD=38.0112;RBI=0.059135;REFB=0;REVB=0.0568568;RO=0;SAF=81;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=8.25873e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.63672e-05;OID=.;OPOS=40823981;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:68:147:152:0:0:144:152:63:81:0:0:70:82:0:0 chr21 40871810 . T C 249.48 PASS AO=78;DP=204;FAO=79;FDP=204;FR=.;FRO=125;FSAF=45;FSAR=34;FSRF=61;FSRR=64;FWDB=-0.00168861;FXX=0.0511604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.8407;QD=4.89185;RBI=0.0175131;REFB=-0.0212816;REVB=0.0174315;RO=103;SAF=45;SAR=33;SRF=43;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162008;STB=0.550274;TYPE=snp;VARB=0.0302031;OID=.;OPOS=40871810;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:204:103:125:78:79:33:45:43:60:34:45:61:64 chr21 40883671 . G GAGA 119.88 PASS AO=45;DP=139;FAO=45;FDP=135;FR=.;FRO=90;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=42;FSRR=48;FWDB=-0.0106762;FXX=0.0217376;HRUN=1;LEN=3;MLLD=200.076;QD=3.55211;RBI=0.0133851;REFB=-0.00178379;REVB=-0.00807351;RO=91;SAF=23;SAR=22;SRF=42;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0573787;STB=0.529592;TYPE=ins;VARB=0.00292432;OID=.;OPOS=40883672;OREF=-;OALT=AGA;OMAPALT=GAGA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:45:139:45:135:90:23:22:42:48:99:91:23:22:42:49 chr21 40969826 . G C 1136.88 PASS AO=114;DP=114;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0391231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.429;QD=38.2144;RBI=0.0537124;REFB=0;REVB=0.0368022;RO=0;SAF=39;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5875e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000171901;OID=.;OPOS=40969826;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:114:119:0:0:114:119:75:39:0:0:75:44:0:0 chr21 41032740 . T C 670.08 PASS AO=69;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00473189;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.077;QD=37.7509;RBI=0.00475384;REFB=0;REVB=-0.000456378;RO=0;SAF=39;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.97357e-06;OID=.;OPOS=41032740;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:71:71:0:0:69:71:30:39:0:0:31:40:0:0 chr21 41032804 . G A 1028.41 PASS AO=108;DP=109;FAO=113;FDP=116;FR=.;FRO=3;FSAF=69;FSAR=44;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.00215667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.0848;QD=35.4625;RBI=0.150394;REFB=0.0678408;REVB=0.150378;RO=1;SAF=70;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00673338;STB=0.510636;TYPE=snp;VARB=-0.00142966;OID=.;OPOS=41032804;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:109:116:1:3:108:113:38:70:1:0:44:69:3:0 chr21 41034215 . G A 1125.29 PASS AO=118;DP=119;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00781568;FXX=0.0163921;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.199;QD=37.5096;RBI=0.0169826;REFB=-0.00985052;REVB=0.0150773;RO=1;SAF=65;SAR=53;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00887722;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.93039e-05;OID=.;OPOS=41034215;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:119:120:1:0:118:120:53:65:0:1:55:65:0:0 chr21 41137507 . G C 154.91 PASS AO=50;DP=131;FAO=50;FDP=131;FR=.;FRO=81;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=38;FSRR=43;FWDB=0.0117402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.8168;QD=4.73001;RBI=0.0319748;REFB=-0.00113049;REVB=-0.0297415;RO=80;SAF=22;SAR=28;SRF=38;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0383091;STB=0.505678;TYPE=snp;VARB=0.00171006;OID=.;OPOS=41137507;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:80:81:50:50:28:22:38:42:27:23:38:43 chr21 41142940 . G A 179.43 PASS AO=58;DP=153;FAO=58;FDP=154;FR=.;FRO=96;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=38;FSRR=58;FWDB=0.000610402;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.479;QD=4.66046;RBI=0.0328333;REFB=0.00573359;REVB=0.0328277;RO=95;SAF=30;SAR=28;SRF=37;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139646;STB=0.575354;TYPE=snp;VARB=-0.00827601;OID=.;OPOS=41142940;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:154:95:96:58:58:28:30:37:58:28:30:38:58 chr21 41416066 . C T 129.26 PASS AO=36;DP=87;FAO=36;FDP=87;FR=.;FRO=51;FSAF=29;FSAR=7;FSRF=43;FSRR=8;FWDB=-0.0104037;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=214.331;QD=5.94301;RBI=0.0228731;REFB=-0.0100734;REVB=-0.0203701;RO=50;SAF=29;SAR=7;SRF=42;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0591115;STB=0.536722;TYPE=snp;VARB=0.0137165;OID=.;OPOS=41416066;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:87:50:51:36:36:7:29:42:8:7:29:43:8 chr21 41434841 . T C 387.98 PASS AO=109;DP=262;FAO=112;FDP=265;FR=.;FRO=153;FSAF=58;FSAR=54;FSRF=63;FSRR=90;FWDB=0.0225242;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.3868;QD=5.85635;RBI=0.0285893;REFB=-0.0107491;REVB=0.017607;RO=153;SAF=56;SAR=53;SRF=63;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106521;STB=0.561053;TYPE=snp;VARB=0.0188584;OID=.;OPOS=41434841;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:262:265:153:153:109:112:53:56:63:90:54:58:63:90 chr21 41447058 . G C 165.51 PASS AO=44;DP=97;FAO=44;FDP=102;FR=.;FRO=58;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=29;FSRR=29;FWDB=-0.0415973;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.6705;QD=6.4904;RBI=0.0689473;REFB=-0.0253984;REVB=-0.0549854;RO=53;SAF=23;SAR=21;SRF=29;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.023961;STB=0.512929;TYPE=snp;VARB=0.025634;OID=.;OPOS=41447058;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:102:53:58:44:44:21:23:29:24:21:23:29:29 chr21 41455854 . G A 601.55 PASS AO=133;DP=257;FAO=135;FDP=258;FR=.;FRO=123;FSAF=77;FSAR=58;FSRF=74;FSRR=49;FWDB=-0.0274958;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.534;QD=9.32629;RBI=0.0301368;REFB=-0.0178822;REVB=-0.0123373;RO=123;SAF=76;SAR=57;SRF=74;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0272125;STB=0.515265;TYPE=snp;VARB=0.0158028;OID=.;OPOS=41455854;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:257:258:123:123:133:135:57:76:74:49:58:77:74:49 chr21 42539569 . AC A 85.78 PASS AO=23;DP=50;FAO=27;FDP=47;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=16;FWDB=0.00660901;FXX=0.020829;HRUN=5;LEN=1;MLLD=14.2287;QD=7.30036;RBI=0.067508;REFB=0.0825825;REVB=0.0671837;RO=19;SAF=13;SAR=10;SRF=4;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.281988;STB=0.634282;TYPE=del;VARB=-0.040003;OID=.;OPOS=42539570;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:23:48:27:47:20:14:13:4:16:36:19:13:10:4:15 chr21 42551194 . T G 10.38 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.00130914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.978;QD=5.93124;RBI=0.00130914;REFB=-0.0818876;REVB=0;RO=5;SAF=2;SAR=0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00618402;OID=.;OPOS=42551194;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:5:5:2:2:0:2:5:0:0:2:5:0 chr21 42551196 . A G 10.3 PASS AO=2;DP=8;FAO=2;FDP=8;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.00948575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.006;QD=5.14833;RBI=0.00948575;REFB=-0.00876684;REVB=0;RO=6;SAF=2;SAR=0;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00203703;OID=.;OPOS=42551196;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:8:6:6:2:2:0:2:6:0:0:2:6:0 chr21 42551199 . A G 10.22 PASS AO=2;DP=9;FAO=2;FDP=9;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=-0.00697695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.652;QD=4.5413;RBI=0.00697695;REFB=-0.00253542;REVB=0;RO=7;SAF=2;SAR=0;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00110631;OID=.;OPOS=42551199;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:7:7:2:2:0:2:7:0:0:2:7:0 chr21 42551201 . T G 10.22 PASS AO=2;DP=9;FAO=2;FDP=9;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=0.000834686;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.149;QD=4.5415;RBI=0.000834686;REFB=-0.0175371;REVB=0;RO=7;SAF=2;SAR=0;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0104865;OID=.;OPOS=42551201;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:7:7:2:2:0:2:7:0:0:2:7:0 chr21 42551203 . A G 17.03 PASS AO=3;DP=9;FAO=3;FDP=8;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.012117;FXX=0.110988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.305;QD=8.51352;RBI=0.012117;REFB=0.00996466;REVB=0;RO=6;SAF=3;SAR=0;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0103485;OID=.;OPOS=42551203;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:9:8:6:5:3:3:0:3:6:0:0:3:5:0 chr21 42551433 . G A 10.5 PASS AO=2;DP=6;FAO=2;FDP=6;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.00209189;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=188.338;QD=7.00171;RBI=0.0137976;REFB=-0.027457;REVB=0.0136381;RO=4;SAF=1;SAR=1;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237547;STB=0.665181;TYPE=snp;VARB=0.0258517;OID=.;OPOS=42551433;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:4:4:2:2:1:1:3:1:1:1:3:1 chr21 42556885 . A G 259.02 PASS AO=66;DP=147;FAO=67;FDP=148;FR=.;FRO=81;FSAF=37;FSAR=30;FSRF=45;FSRR=36;FWDB=0.0605198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.7634;QD=7.00049;RBI=0.0621016;REFB=0.00532604;REVB=0.0139269;RO=80;SAF=36;SAR=30;SRF=45;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0169571;STB=0.501835;TYPE=snp;VARB=-0.00599286;OID=.;OPOS=42556885;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:148:80:81:66:67:30:36:45:35:30:37:45:36 chr21 42676201 . CT C 50.97 PASS AO=13;DP=33;FAO=20;FDP=33;FR=.;FRO=13;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0435838;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.6027;QD=6.17872;RBI=0.19727;REFB=-0.132632;REVB=-0.192395;RO=12;SAF=6;SAR=7;SRF=8;SRR=4;SSEN=0.387097;SSEP=0;SSSB=-0.170674;STB=0.514836;TYPE=del;VARB=0.101853;OID=.;OPOS=42676202;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:13:31:20:33:13:13:7:8:5:23:12:6:7:8:4 chr21 42717662 . T C 579.57 PASS AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00478852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.792;QD=36.2228;RBI=0.0313296;REFB=-0.0688363;REVB=0.0309615;RO=1;SAF=42;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111125;STB=0.50588;TYPE=snp;VARB=0.000454041;OID=.;OPOS=42717662;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:64:64:1:1:63:63:21:42:1:0:21:42:1:0 chr21 42775555 . A G 101.96 PASS AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00964713;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.75;QD=37.0753;RBI=0.0396167;REFB=0;REVB=0.0384241;RO=0;SAF=9;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00198698;OID=.;OPOS=42775555;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:11:11:2:9:0:0:2:9:0:0 chr21 42812891 . C T 459.54 PASS AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0121227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.205;QD=38.2947;RBI=0.0144301;REFB=0;REVB=-0.00782744;RO=0;SAF=31;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000101418;OID=.;OPOS=42812891;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:48:48:0:0:48:48:17:31:0:0:17:31:0:0 chr21 42817930 . G A 1110.14 PASS AO=110;DP=115;FAO=122;FDP=125;FR=.;FRO=3;FSAF=75;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0197466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.996;QD=35.5246;RBI=0.0223317;REFB=0.0669324;REVB=-0.0104296;RO=3;SAF=66;SAR=44;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0312665;STB=0.515461;TYPE=snp;VARB=0.000228819;OID=.;OPOS=42817930;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:115:125:3:3:110:122:44:66:0:3:47:75:0:3 chr21 42824733 . G A 1341 PASS AO=134;DP=134;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0865768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.106;QD=38.0425;RBI=0.0866604;REFB=0;REVB=-0.00380673;RO=0;SAF=53;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.90283e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000101171;OID=.;OPOS=42824733;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:134:141:0:0:134:141:81:53:0:0:82:59:0:0 chr21 42845383 . A G 20.82 PASS AO=8;DP=29;FAO=8;FDP=32;FR=.;FRO=24;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.0517571;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.8181;QD=2.60211;RBI=0.114225;REFB=-0.00655954;REVB=-0.101826;RO=21;SAF=2;SAR=6;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.374078;STB=0.725226;TYPE=snp;VARB=0.0296187;OID=.;OPOS=42845383;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:29:32:21:24:8:8:6:2:12:9:6:2:13:11 chr21 42848560 . CAG C 356.97 PASS AO=33;DP=39;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0173653;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=195.619;QD=37.5753;RBI=0.0223185;REFB=0;REVB=0.01402;RO=0;SAF=15;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.64315e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-1.19821e-05;OID=.;OPOS=42848561;OREF=AG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:33:36:38:38:0:17:21:0:0:17:0:15:18:0:0 chr21 42911231 . C T 298.87 PASS AO=72;DP=146;FAO=72;FDP=147;FR=.;FRO=75;FSAF=23;FSAR=49;FSRF=36;FSRR=39;FWDB=-0.00571493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.2444;QD=8.13251;RBI=0.0218961;REFB=-0.0346697;REVB=0.0211372;RO=72;SAF=23;SAR=49;SRF=34;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149405;STB=0.588174;TYPE=snp;VARB=0.0303131;OID=.;OPOS=42911231;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:147:72:75:72:72:49:23:34:38:49:23:36:39 chr21 43161022 . C T 36.56 PASS AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=0.0165477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.541;QD=6.3584;RBI=0.0165795;REFB=-0.0470789;REVB=0.00102643;RO=14;SAF=7;SAR=2;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0117403;STB=0.507027;TYPE=snp;VARB=0.0663181;OID=.;OPOS=43161022;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:23:23:14:14:9:9:2:7:11:3:2:7:11:3 chr21 43161252 . G A 63.64 PASS AO=5;DP=17;FAO=8;FDP=14;FR=.,HEALED;FRO=4;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0189032;FXX=0.124922;HRUN=4;LEN=1;MLLD=117.886;QD=18.1825;RBI=0.0399854;REFB=-0.00439348;REVB=0.0352349;RO=3;SAF=3;SAR=2;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0436878;STB=0.58313;TYPE=snp;VARB=0.00917073;OID=.;OPOS=43161252;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:12:14:3:4:5:8:2:3:2:1:4:4:3:1 chr21 43161357 . T C 208.14 PASS AO=21;DP=22;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0172842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.6608;QD=36.1979;RBI=0.0497968;REFB=0;REVB=0.046701;RO=0;SAF=0;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000582375;OID=.;OPOS=43161357;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:22:23:0:0:21:23:21:0:0:0:22:1:0:0 chr21 43161805 . G A 79.85 PASS AO=21;DP=52;FAO=21;FDP=51;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=7;FWDB=-0.0102221;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.775;QD=6.26275;RBI=0.0276461;REFB=-0.00433039;REVB=0.0256868;RO=29;SAF=11;SAR=10;SRF=22;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.244071;STB=0.645036;TYPE=snp;VARB=0.0112079;OID=.;OPOS=43161805;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:52:51:29:30:21:21:10:11:22:7:10:11:23:7 chr21 43161877 . C T 104.57 PASS AO=25;DP=54;FAO=25;FDP=54;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=0.0547022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.175;QD=7.74594;RBI=0.0553829;REFB=-0.0180865;REVB=-0.00865629;RO=29;SAF=11;SAR=14;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202393;STB=0.613946;TYPE=snp;VARB=0.0144877;OID=.;OPOS=43161877;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:29:29:25:25:14:11:19:10:14:11:19:10 chr21 43162150 . GC G,AC 536.61 PASS AO=36,41;DP=111;FAO=39,51;FDP=117;FR=.;FRO=27;FSAF=2,27;FSAR=37,24;FSRF=27;FSRR=0;FWDB=0.0183791,0.0199892;FXX=0.00847386;HRUN=3,1;LEN=1,1;MLLD=19.4789,148.606;QD=18.3457;RBI=0.155412,0.0363622;REFB=0.0519752,-0.0134964;REVB=-0.154321,0.0303751;RO=26;SAF=0,22;SAR=36,19;SRF=26;SRR=0;SSEN=0.435071,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.895407,-0.344295;STB=0.935237,0.66661;TYPE=del,snp;VARB=0.0615577,0.00871202;OID=.,.;OPOS=43162151,43162150;OREF=C,G;OALT=-,A;OMAPALT=G,AC GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:99:108:117:26:27:36,41:39,51:36,19:0,22:26:0:37,24:2,27:27:0 chr21 43219728 . A T 448.57 PASS AO=98;DP=189;FAO=103;FDP=201;FR=.;FRO=98;FSAF=51;FSAR=52;FSRF=43;FSRR=55;FWDB=0.0149976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.509;QD=8.92669;RBI=0.0390818;REFB=-0.00302525;REVB=0.0360896;RO=90;SAF=50;SAR=48;SRF=43;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0283333;STB=0.527496;TYPE=snp;VARB=0.00395833;OID=.;OPOS=43219728;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:201:90:98:98:103:48:50:43:47:52:51:43:55 chr21 43220380 . C A 168.89 PASS AO=51;DP=138;FAO=53;FDP=138;FR=.;FRO=85;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=55;FSRR=30;FWDB=0.00493578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.386;QD=4.89522;RBI=0.00829739;REFB=0.00305514;REVB=-0.0066697;RO=75;SAF=27;SAR=24;SRF=49;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132825;STB=0.562791;TYPE=snp;VARB=-0.00489639;OID=.;OPOS=43220380;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:75:85:51:53:24:27:49:26:24:29:55:30 chr21 43221483 . A G 261.82 PASS AO=25;DP=25;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0348455;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.442;QD=37.4033;RBI=0.0717342;REFB=0;REVB=0.0627024;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000354712;OID=.;OPOS=43221483;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:25:28:0:0:25:28:13:12:0:0:15:13:0:0 chr21 43221826 . T C 518.4 PASS AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0424973;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.5682;QD=36.3792;RBI=0.083757;REFB=-0.0987086;REVB=-0.0721749;RO=1;SAF=48;SAR=8;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00972467;STB=0.505153;TYPE=snp;VARB=0.000623682;OID=.;OPOS=43221826;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:57:57:1:1:56:56:8:48:1:0:8:48:1:0 chr21 43239972 . A G 406.87 PASS AO=41;DP=42;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0470755;FXX=0.041658;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.632;QD=35.3802;RBI=0.0482699;REFB=-0.114745;REVB=0.0106714;RO=0;SAF=35;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02085e-08;STB=0.506326;TYPE=snp;VARB=0.00175154;OID=.;OPOS=43239972;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:42:46:0:1:41:45:6:35:0:0:6:39:1:0 chr21 43243585 . A G 2007.7 PASS AO=205;DP=226;FAO=212;FDP=212;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=142;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0202542;FXX=0.0619442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.513;QD=37.8811;RBI=0.0474363;REFB=0;REVB=-0.0428949;RO=0;SAF=65;SAR=140;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000955486;OID=.;OPOS=43243585;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:226:212:0:0:205:212:140:65:0:0:142:70:0:0 chr21 43256252 . C T 178.2 PASS AO=58;DP=158;FAO=59;FDP=159;FR=.;FRO=100;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=46;FSRR=54;FWDB=-0.0149122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.764;QD=4.4831;RBI=0.0149361;REFB=-0.0137801;REVB=-0.000845214;RO=100;SAF=30;SAR=28;SRF=46;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0636138;STB=0.541067;TYPE=snp;VARB=0.0296273;OID=.;OPOS=43256252;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:159:100:100:58:59:28:30:46:54:28:31:46:54 chr21 43267260 . C T 902.01 PASS AO=94;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0311802;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.025;QD=37.9793;RBI=0.0312475;REFB=0;REVB=0.00204969;RO=1;SAF=55;SAR=39;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012002;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00128907;OID=.;OPOS=43267260;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:95:95:1:0:94:95:39:55:0:1:40:55:0:0 chr21 43306075 . G C 197.12 PASS AO=62;DP=160;FAO=62;FDP=161;FR=.;FRO=99;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=38;FSRR=61;FWDB=-0.000874596;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=248.29;QD=4.8975;RBI=0.00230751;REFB=-0.00264815;REVB=-0.00213534;RO=98;SAF=34;SAR=28;SRF=37;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183619;STB=0.600127;TYPE=snp;VARB=0.00406725;OID=.;OPOS=43306075;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:161:98:99:62:62:28:34:37:61:28:34:38:61 chr21 43306101 . A G 153.85 PASS AO=53;DP=145;FAO=53;FDP=146;FR=.;FRO=93;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=34;FSRR=59;FWDB=0.0417454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.81;QD=4.21509;RBI=0.0441438;REFB=-0.00153684;REVB=0.0143526;RO=85;SAF=25;SAR=28;SRF=28;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157424;STB=0.568305;TYPE=snp;VARB=0.00610104;OID=.;OPOS=43306101;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:146:85:93:53:53:28:25:28:57:28:25:34:59 chr21 43309121 . C T 163.81 PASS AO=43;DP=104;FAO=45;FDP=106;FR=.;FRO=61;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=18;FSRR=43;FWDB=-0.0172658;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=259.234;QD=6.18132;RBI=0.0173432;REFB=-0.00487388;REVB=-0.00163717;RO=61;SAF=14;SAR=29;SRF=18;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0366729;STB=0.538805;TYPE=snp;VARB=0.00969538;OID=.;OPOS=43309121;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:106:61:61:43:45:29:14:18:43:29:16:18:43 chr21 43315057 . C T 79.89 PASS AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0453848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.754;QD=31.9545;RBI=0.0453962;REFB=-0.0871295;REVB=0.00102005;RO=1;SAF=3;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0684198;STB=0.538378;TYPE=snp;VARB=0.00360834;OID=.;OPOS=43315057;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:10:10:1:1:9:9:6:3:0:1:6:3:0:1 chr21 43327856 . A G 264.94 PASS AO=32;DP=35;FAO=32;FDP=35;FR=.;FRO=3;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0167338;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=66.3452;QD=30.2791;RBI=0.0416642;REFB=-0.0331775;REVB=-0.0381561;RO=2;SAF=14;SAR=18;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00695581;STB=0.509085;TYPE=snp;VARB=0.00161756;OID=.;OPOS=43327856;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:35:35:2:3:32:32:18:14:1:1:18:14:1:2 chr21 43408317 . T TAAAGA 780.31 PASS AO=76;DP=88;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00931116;FXX=0.0119033;HRUN=3;LEN=5;MLLD=171.438;QD=37.6054;RBI=0.0303428;REFB=0;REVB=0.0288789;RO=4;SAF=36;SAR=40;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0497237;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.000249513;OID=.;OPOS=43408318;OREF=-;OALT=AAAGA;OMAPALT=TAAAGA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:76:88:83:83:0:40:43:0:0:37:4:36:40:4:0 chr21 43413731 . C T 549.97 PASS AO=121;DP=232;FAO=122;FDP=232;FR=.;FRO=110;FSAF=58;FSAR=64;FSRF=54;FSRR=56;FWDB=-0.00363554;FXX=0.00854664;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.389;QD=9.48223;RBI=0.0114134;REFB=-0.000375044;REVB=0.0108189;RO=108;SAF=58;SAR=63;SRF=52;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00185232;STB=0.50736;TYPE=snp;VARB=0.000266315;OID=.;OPOS=43413731;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:232:108:110:121:122:63:58:52:56:64:58:54:56 chr21 43504228 . T C 202.88 PASS AO=37;DP=71;FAO=42;FDP=74;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=34;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=-0.0081119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.828;QD=10.9667;RBI=0.0102626;REFB=-0.00993315;REVB=-0.00628632;RO=29;SAF=6;SAR=31;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.285532;STB=0.611452;TYPE=snp;VARB=0.00764451;OID=.;OPOS=43504228;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:74:29:32:37:42:31:6:12:17:34:8:12:20 chr21 43510427 . T C 86.84 PASS AO=19;DP=47;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=2;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=-0.109327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.7349;QD=6.81065;RBI=0.109537;REFB=-0.0290521;REVB=-0.00678336;RO=27;SAF=2;SAR=17;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.383218;STB=0.754423;TYPE=snp;VARB=0.0293857;OID=.;OPOS=43510427;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:47:51:27:29:19:22:17:2:9:18:20:2:10:19 chr21 43510437 . A C 76.86 PASS AO=20;DP=48;FAO=20;FDP=48;FR=.;FRO=28;FSAF=2;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=-0.00159473;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.6595;QD=6.4053;RBI=0.0182722;REFB=0.0191671;REVB=0.0182025;RO=28;SAF=2;SAR=18;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.384491;STB=0.727657;TYPE=snp;VARB=-0.0262808;OID=.;OPOS=43510437;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:48:48:28:28:20:20:18:2:9:19:18:2:9:19 chr21 43510514 . C G 124.48 PASS AO=27;DP=55;FAO=27;FDP=53;FR=.;FRO=26;FSAF=4;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=25;FWDB=0.00207482;FXX=0.036357;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.6722;QD=9.39486;RBI=0.00401586;REFB=0.0324107;REVB=-0.00343835;RO=26;SAF=4;SAR=23;SRF=1;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229129;STB=0.625333;TYPE=snp;VARB=-0.0414645;OID=.;OPOS=43510514;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:53:26:26:27:27:23:4:1:25:23:4:1:25 chr21 43513989 . C T 102.71 PASS AO=23;DP=46;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=0.0463446;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.6541;QD=8.93105;RBI=0.0928679;REFB=-0.0504921;REVB=0.0804775;RO=22;SAF=12;SAR=11;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141031;STB=0.587713;TYPE=snp;VARB=0.0517334;OID=.;OPOS=43513989;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:46:22:23:23:23:11:12:15:7:11:12:16:7 chr21 43522349 . T C 178.94 PASS AO=43;DP=91;FAO=43;FDP=91;FR=.;FRO=48;FSAF=3;FSAR=40;FSRF=7;FSRR=41;FWDB=-0.0345064;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.248;QD=7.86539;RBI=0.0367386;REFB=-0.0127954;REVB=0.0126108;RO=48;SAF=3;SAR=40;SRF=7;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214756;STB=0.622016;TYPE=snp;VARB=0.0143543;OID=.;OPOS=43522349;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:91:48:48:43:43:40:3:7:41:40:3:7:41 chr21 43523972 . G C 673.07 PASS AO=111;DP=306;FAO=136;FDP=290;FR=.,HEALED;FRO=131;FSAF=78;FSAR=58;FSRF=77;FSRR=54;FWDB=-0.0348778;FXX=0.0268447;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.095;QD=9.28377;RBI=0.0394746;REFB=-0.0412995;REVB=0.0184875;RO=115;SAF=54;SAR=57;SRF=66;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0807955;STB=0.507164;TYPE=snp;VARB=0.0515714;OID=.;OPOS=43523972;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:296:290:115:131:111:136:57:54:66:49:58:78:77:54 chr21 43531008 . T C 128.87 PASS AO=35;DP=85;FAO=35;FDP=83;FR=.;FRO=48;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=33;FSRR=15;FWDB=0.0074471;FXX=0.0348797;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.0174;QD=6.21072;RBI=0.00853288;REFB=-0.00378816;REVB=-0.00416543;RO=47;SAF=24;SAR=11;SRF=33;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0194996;STB=0.501198;TYPE=snp;VARB=0.00636842;OID=.;OPOS=43531008;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:83:47:48:35:35:11:24:33:14:11:24:33:15 chr21 43531632 . T C 114.87 PASS AO=27;DP=56;FAO=27;FDP=56;FR=.;FRO=29;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.0171941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.694;QD=8.2049;RBI=0.059673;REFB=-0.00252095;REVB=-0.0571422;RO=25;SAF=18;SAR=9;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0629144;STB=0.582216;TYPE=snp;VARB=0.00244436;OID=.;OPOS=43531632;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:56:56:25:29:27:27:9:18:15:10:9:18:15:14 chr21 43547788 . T C 1825.66 PASS AO=189;DP=190;FAO=191;FDP=191;FR=.;FRO=0;FSAF=128;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000357605;FXX=0.0103622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.786;QD=38.2338;RBI=0.00663486;REFB=0;REVB=0.00662522;RO=0;SAF=127;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.44777e-05;OID=.;OPOS=43547788;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:190:191:0:0:189:191:62:127:0:0:63:128:0:0 chr21 43732346 . CGG CG,C 57.23 PASS AO=8,7;DP=38;FAO=12,9;FDP=32;FR=.;FRO=11;FSAF=5,0;FSAR=7,9;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.056227,-0.0305766;FXX=0.0856898;HRUN=5,5;LEN=1,2;MLLD=11.621,18.8293;QD=7.15327;RBI=0.0665937,0.0357246;REFB=-0.0639759,-0.0340543;REVB=-0.0356825,-0.0184748;RO=10;SAF=2,0;SAR=6,7;SRF=7;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.418021,-0.796581;STB=0.604144,0.998555;TYPE=del,del;VARB=-0.0269446,0.0354125;OID=.,.;OPOS=43732347,43732347;OREF=G,GG;OALT=-,-;OMAPALT=CG,C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:8,7:32:12,9:32:11:5,0:7,9:7:4:23:10:2,0:6,7:7:3 chr21 43786512 . C T 320 PASS AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137024;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.163;QD=37.6474;RBI=0.0664489;REFB=0;REVB=0.0650208;RO=0;SAF=21;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00118706;OID=.;OPOS=43786512;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:35:34:0:0:34:34:13:21:0:0:13:21:0:0 chr21 43824106 . A G 194.65 PASS AO=52;DP=131;FAO=56;FDP=134;FR=.;FRO=78;FSAF=9;FSAR=47;FSRF=20;FSRR=58;FWDB=-0.00398271;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.181;QD=5.81046;RBI=0.015094;REFB=-0.0122776;REVB=0.0145591;RO=78;SAF=8;SAR=44;SRF=21;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196062;STB=0.590519;TYPE=snp;VARB=0.0148572;OID=.;OPOS=43824106;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:134:78:78:52:56:44:8:21:57:47:9:20:58 chr21 43829608 . GGCCC GCC,GG 861.5 PASS AO=56,23;DP=136;FAO=135,0;FDP=138;FR=.;FRO=3;FSAF=29,0;FSAR=106,0;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.316043,-0.58611;FXX=0.00719373;HRUN=4,4;LEN=2,3;MLLD=21.4776,23.4418;QD=24.9709;RBI=0.354573,0.594177;REFB=-0.123939,-0.0705401;REVB=0.160744,0.0975792;RO=33;SAF=0,23;SAR=56,0;SRF=0;SRR=33;SSEN=0.435374,0;SSEP=0,0.653846;SSSB=0,0.893257;STB=0.506976,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.0081949,0;OID=.,.;OPOS=43829609,43829610;OREF=GC,CCC;OALT=-,-;OMAPALT=GCC,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:56,23:121:135,0:138:3:29,0:106,0:0:3:52:33:0,23:56,0:0:33 chr21 43852232 . C T 317.18 PASS AO=80;DP=172;FAO=80;FDP=172;FR=.;FRO=92;FSAF=42;FSAR=38;FSRF=39;FSRR=53;FWDB=-0.000181473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.367;QD=7.37624;RBI=0.00982734;REFB=-0.0227376;REVB=-0.00982566;RO=91;SAF=42;SAR=38;SRF=39;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0924846;STB=0.5539;TYPE=snp;VARB=0.0218424;OID=.;OPOS=43852232;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:172:172:91:92:80:80:38:42:39:52:38:42:39:53 chr21 43855067 . A C 562.69 PASS AO=117;DP=210;FAO=117;FDP=211;FR=.;FRO=94;FSAF=66;FSAR=51;FSRF=42;FSRR=52;FWDB=-0.00096938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.416;QD=10.6671;RBI=0.00326892;REFB=-0.00774665;REVB=0.00312189;RO=93;SAF=66;SAR=51;SRF=42;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0918408;STB=0.552405;TYPE=snp;VARB=0.00553292;OID=.;OPOS=43855067;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:210:211:93:94:117:117:51:66:42:51:51:66:42:52 chr21 43863521 . A G 140.73 PASS AO=24;DP=39;FAO=24;FDP=38;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=13;FWDB=0.10912;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.0313;QD=14.814;RBI=0.112331;REFB=-0.0106291;REVB=-0.0266638;RO=14;SAF=5;SAR=19;SRF=1;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153628;STB=0.583879;TYPE=snp;VARB=0.00854822;OID=.;OPOS=43863521;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:39:38:14:14:24:24:19:5:1:13:19:5:1:13 chr21 43905887 . C T 552.14 PASS AO=125;DP=243;FAO=125;FDP=242;FR=.;FRO=117;FSAF=42;FSAR=83;FSRF=42;FSRR=75;FWDB=0.0175199;FXX=0.00411506;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.129;QD=9.12628;RBI=0.018227;REFB=0.00280079;REVB=-0.00502771;RO=117;SAF=42;SAR=83;SRF=42;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0225435;STB=0.512344;TYPE=snp;VARB=-0.0027295;OID=.;OPOS=43905887;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:243:242:117:117:125:125:83:42:42:75:83:42:42:75 chr21 43985955 . G A 990.32 PASS AO=104;DP=105;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0352427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.639;QD=37.3704;RBI=0.0359002;REFB=0;REVB=0.00683924;RO=1;SAF=43;SAR=61;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0109074;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000251958;OID=.;OPOS=43985955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:105:106:1:0:104:106:61:43:1:0:62:44:0:0 chr21 44180443 . C T 242.9 PASS AO=49;DP=89;FAO=50;FDP=89;FR=.;FRO=39;FSAF=34;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=0.0595315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.3364;QD=10.917;RBI=0.0601837;REFB=-0.0234352;REVB=0.00883626;RO=39;SAF=33;SAR=16;SRF=25;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0294089;STB=0.531773;TYPE=snp;VARB=0.0243797;OID=.;OPOS=44180443;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:39:39:49:50:16:33:25:14:16:34:24:15 chr21 44189166 . T C 132.99 PASS AO=43;DP=114;FAO=43;FDP=114;FR=.;FRO=71;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=61;FSRR=10;FWDB=-0.0327757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.926;QD=4.66632;RBI=0.036087;REFB=-0.0216407;REVB=0.0151005;RO=71;SAF=23;SAR=20;SRF=61;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.375704;STB=0.708783;TYPE=snp;VARB=0.025938;OID=.;OPOS=44189166;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:71:71:43:43:20:23:61:10:20:23:61:10 chr21 44189172 . A C 142.2 PASS AO=41;DP=116;FAO=45;FDP=119;FR=.;FRO=74;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=61;FSRR=13;FWDB=0.00416143;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.267;QD=4.77973;RBI=0.0270755;REFB=-0.0157129;REVB=0.0267538;RO=73;SAF=25;SAR=16;SRF=61;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.290219;STB=0.675769;TYPE=snp;VARB=0.0229165;OID=.;OPOS=44189172;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:119:73:74:41:45:16:25:61:12:20:25:61:13 chr21 44195374 . G A 35.79 PASS AO=11;DP=33;FAO=11;FDP=34;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=0.00480871;FXX=0.0810592;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.99;QD=4.21105;RBI=0.00635933;REFB=-0.000924567;REVB=0.00416141;RO=21;SAF=8;SAR=3;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0792063;STB=0.526267;TYPE=snp;VARB=-0.00285692;OID=.;OPOS=44195374;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:33:34:21:23:11:11:3:8:14:7:3:8:16:7 chr21 44371114 . T C 263.3 PASS AO=31;DP=33;FAO=31;FDP=33;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.02483;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.507;QD=31.9154;RBI=0.0294343;REFB=-0.0214193;REVB=-0.0158066;RO=2;SAF=13;SAR=18;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0664988;STB=0.535691;TYPE=snp;VARB=0.000838221;OID=.;OPOS=44371114;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:33:33:2:2:31:31:18:13:2:0:18:13:2:0 chr21 44430325 . T C 580.87 PASS AO=61;DP=61;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00461989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.202;QD=38.7245;RBI=0.00942452;REFB=0;REVB=0.00821451;RO=0;SAF=17;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.89926e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.34292e-06;OID=.;OPOS=44430325;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:61:60:0:0:61:60:44:17:0:0:43:17:0:0 chr21 44437142 . A G 640.85 PASS AO=70;DP=72;FAO=71;FDP=73;FR=.;FRO=2;FSAF=19;FSAR=52;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0151685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.7378;QD=35.1152;RBI=0.0247983;REFB=-0.0399468;REVB=0.0196181;RO=1;SAF=19;SAR=51;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0091821;STB=0.508058;TYPE=snp;VARB=0.00080213;OID=.;OPOS=44437142;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:72:73:1:2:70:71:51:19:0:1:52:19:1:1 chr21 44450404 . C T 16.54 PASS AO=14;DP=70;FAO=14;FDP=78;FR=.;FRO=64;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=52;FWDB=-0.089614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.1404;QD=0.848428;RBI=0.0920567;REFB=-0.0205016;REVB=-0.021066;RO=56;SAF=8;SAR=6;SRF=12;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.441693;STB=0.79422;TYPE=snp;VARB=0.0426136;OID=.;OPOS=44450404;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:70:78:56:64:14:14:6:8:12:44:6:8:12:52 chr21 44480616 . G A 267.06 PASS AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287609;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.0202;QD=38.152;RBI=0.0292087;REFB=0;REVB=0.00509449;RO=0;SAF=3;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.13441e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00054679;OID=.;OPOS=44480616;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:28:28:0:0:28:28:25:3:0:0:25:3:0:0 chr21 44579848 . G A 99.55 PASS AO=18;DP=31;FAO=18;FDP=31;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=16;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0324849;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.1574;QD=12.8446;RBI=0.043546;REFB=-0.00288605;REVB=0.0289998;RO=13;SAF=2;SAR=16;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.41001;STB=0.73531;TYPE=snp;VARB=0.00240413;OID=.;OPOS=44579848;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:31:31:13:13:18:18:16:2:6:7:16:2:6:7 chr21 44589215 . C T 171.58 PASS AO=41;DP=85;FAO=41;FDP=86;FR=.;FRO=45;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=0.00350459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.359;QD=7.98033;RBI=0.0382362;REFB=-0.0185412;REVB=0.0380752;RO=43;SAF=21;SAR=20;SRF=19;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0646541;STB=0.523798;TYPE=snp;VARB=0.018381;OID=.;OPOS=44589215;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:86:43:45:41:41:20:21:19:24:20:21:21:24 chr21 44592483 . T G 11.37 PASS AO=7;DP=40;FAO=7;FDP=40;FR=.;FRO=33;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=0.00418972;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=226.441;QD=1.13657;RBI=0.00670726;REFB=0.00104558;REVB=-0.0052377;RO=33;SAF=3;SAR=4;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00531918;STB=0.503639;TYPE=snp;VARB=-0.00431982;OID=.;OPOS=44592483;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:40:40:33:33:7:7:4:3:14:19:4:3:14:19 chr21 44748660 . G A 190.43 PASS AO=46;DP=97;FAO=46;FDP=97;FR=.;FRO=51;FSAF=39;FSAR=7;FSRF=28;FSRR=23;FWDB=-0.00227786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.3067;QD=7.85296;RBI=0.00717488;REFB=-0.00508733;REVB=-0.00680369;RO=50;SAF=39;SAR=7;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.383645;STB=0.713742;TYPE=snp;VARB=0.00782862;OID=.;OPOS=44748660;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:50:51:46:46:7:39:27:23:7:39:28:23 chr21 44748795 . C T 131.61 PASS AO=43;DP=119;FAO=43;FDP=118;FR=.;FRO=75;FSAF=33;FSAR=10;FSRF=35;FSRR=40;FWDB=0.0167944;FXX=0.00840265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.644;QD=4.46148;RBI=0.0169499;REFB=0.00703352;REVB=0.00229049;RO=73;SAF=33;SAR=10;SRF=33;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.372699;STB=0.708052;TYPE=snp;VARB=-0.00977081;OID=.;OPOS=44748795;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:118:73:75:43:43:10:33:33:40:10:33:35:40 chr21 44749083 . C CA 14.93 PASS AO=3;DP=10;FAO=4;FDP=10;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=0;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.0333618;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=54.2173;QD=5.97246;RBI=0.0333618;REFB=-0.0169926;REVB=0;RO=7;SAF=3;SAR=0;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.190834;OID=.;OPOS=44749084;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:3:10:4:10:6:4:0:6:0:14:7:3:0:7:0 chr21 44835508 . A G 154.58 PASS AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0145008;FXX=0.0526039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.9877;QD=34.351;RBI=0.0318942;REFB=-0.0854546;REVB=0.0284072;RO=0;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.126e-08;STB=0.529377;TYPE=snp;VARB=0.0117416;OID=.;OPOS=44835508;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:18:18:0:1:17:17:9:8:0:0:9:8:1:0 chr21 44837551 . G A 57.96 PASS AO=7;DP=11;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0191886;FXX=0.181653;HRUN=5;LEN=1;MLLD=170.885;QD=25.7584;RBI=0.0650056;REFB=-0.233252;REVB=0.062109;RO=2;SAF=6;SAR=1;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125389;STB=0.571243;TYPE=snp;VARB=0.00571151;OID=.;OPOS=44837551;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:11:9:2:2:7:7:1:6:2:0:1:6:2:0 chr21 44837555 . G A 64.45 PASS AO=8;DP=10;FAO=8;FDP=10;FR=.;FRO=2;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0753522;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=240.997;QD=25.7809;RBI=0.075532;REFB=0.092881;REVB=0.00520888;RO=2;SAF=7;SAR=1;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110633;STB=0.562356;TYPE=snp;VARB=-0.00189143;OID=.;OPOS=44837555;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:10:10:2:2:8:8:1:7:2:0:1:7:2:0 chr21 44846016 . C T 99.27 PASS AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00169931;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=293.2;QD=39.7067;RBI=0.050427;REFB=0;REVB=0.0503984;RO=0;SAF=1;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.8593e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000406657;OID=.;OPOS=44846016;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:9:1:0:0:9:1:0:0 chr21 45096206 . G A 190.68 PASS AO=51;DP=115;FAO=51;FDP=117;FR=.;FRO=66;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=39;FSRR=27;FWDB=-0.0177235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.989;QD=6.51893;RBI=0.0381477;REFB=0.00140509;REVB=0.0337806;RO=63;SAF=25;SAR=26;SRF=39;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127362;STB=0.556686;TYPE=snp;VARB=-0.00155584;OID=.;OPOS=45096206;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:117:63:66:51:51:26:25:39:24:26:25:39:27 chr21 45107518 . A G 385.45 PASS AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.635;QD=37.6046;RBI=0.013958;REFB=0;REVB=0.00598116;RO=0;SAF=17;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.2194e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.66472e-05;OID=.;OPOS=45107518;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:41:41:0:0:41:41:24:17:0:0:24:17:0:0 chr21 45157128 . G A 100.85 PASS AO=17;DP=25;FAO=17;FDP=25;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.00520039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.607;QD=16.1368;RBI=0.0233046;REFB=-0.0273379;REVB=0.0227169;RO=8;SAF=8;SAR=9;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12882;STB=0.571347;TYPE=snp;VARB=0.00704267;OID=.;OPOS=45157128;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:28:25:25:8:8:17:17:9:8:2:6:9:8:2:6 chr21 45175571 . C A 89.94 PASS AO=19;DP=36;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=3;FWDB=-0.0249029;FXX=0.0731529;HRUN=3;LEN=1;MLLD=172.254;QD=9.46691;RBI=0.0558032;REFB=-0.0286372;REVB=-0.0499384;RO=16;SAF=12;SAR=7;SRF=13;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167198;STB=0.620141;TYPE=snp;VARB=0.0328176;OID=.;OPOS=45175571;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:36:38:16:19:19:19:7:12:13:3:7:12:16:3 chr21 45181311 . G A 331.04 PASS AO=64;DP=110;FAO=64;FDP=110;FR=.;FRO=46;FSAF=41;FSAR=23;FSRF=32;FSRR=14;FWDB=-0.00586223;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.7;QD=12.0379;RBI=0.0138217;REFB=-0.0227448;REVB=-0.012517;RO=45;SAF=41;SAR=23;SRF=31;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0402325;STB=0.525336;TYPE=snp;VARB=0.0223044;OID=.;OPOS=45181311;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:45:46:64:64:23:41:31:14:23:41:32:14 chr21 45181492 . T C 216.42 PASS AO=61;DP=134;FAO=61;FDP=145;FR=.;FRO=84;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=60;FSRR=24;FWDB=-0.0392889;FXX=0.00684885;HRUN=4;LEN=1;MLLD=91.331;QD=5.97024;RBI=0.0507949;REFB=-0.0317267;REVB=-0.0321948;RO=73;SAF=31;SAR=30;SRF=52;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201671;STB=0.619854;TYPE=snp;VARB=0.0317968;OID=.;OPOS=45181492;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:145:73:84:61:61:30:31:52:21:30:31:60:24 chr21 45220787 . A G 539.21 PASS AO=56;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00225667;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.817;QD=37.8394;RBI=0.0271703;REFB=0;REVB=-0.0270764;RO=0;SAF=29;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00013382;OID=.;OPOS=45220787;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:57:57:0:0:56:57:27:29:0:0:28:29:0:0 chr21 45402820 . G A 169.33 PASS AO=43;DP=98;FAO=44;FDP=100;FR=.;FRO=56;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=20;FSRR=36;FWDB=-0.00641471;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.056;QD=6.77302;RBI=0.00873426;REFB=-0.0210658;REVB=-0.0059278;RO=52;SAF=20;SAR=23;SRF=18;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118333;STB=0.555531;TYPE=snp;VARB=0.0211684;OID=.;OPOS=45402820;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:100:52:56:43:44:23:20:18:34:24:20:20:36 chr21 45404974 . C A 46.01 PASS AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0360718;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.346;QD=10.2237;RBI=0.0422;REFB=-0.0213461;REVB=0.0219012;RO=9;SAF=4;SAR=5;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0973785;STB=0.556839;TYPE=snp;VARB=0.0509144;OID=.;OPOS=45404974;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:18:18:9:9:9:9:5:4:3:6:5:4:3:6 chr21 45528919 . G A 2394.52 PASS AO=259;DP=272;FAO=269;FDP=271;FR=.;FRO=2;FSAF=113;FSAR=156;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0234679;FXX=0.00732574;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.034;QD=35.3435;RBI=0.091566;REFB=-0.146244;REVB=0.0885076;RO=2;SAF=113;SAR=146;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00648544;STB=0.503184;TYPE=snp;VARB=0.00201658;OID=.;OPOS=45528919;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:79:272:271:2:2:259:269:146:113:0:2:156:113:0:2 chr21 45538647 . T C 471.92 PASS AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104348;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=142.882;QD=38.5241;RBI=0.0286201;REFB=0;REVB=0.02665;RO=0;SAF=20;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000139962;OID=.;OPOS=45538647;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:49:49:0:0:49:49:29:20:0:0:29:20:0:0 chr21 45538725 . C A 421.66 PASS AO=49;DP=52;FAO=49;FDP=52;FR=.;FRO=3;FSAF=16;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0575502;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=197.54;QD=32.4352;RBI=0.0575581;REFB=0.0264095;REVB=0.000955409;RO=2;SAF=16;SAR=33;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0276712;STB=0.52173;TYPE=snp;VARB=-6.89379e-05;OID=.;OPOS=45538725;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:52:52:2:3:49:49:33:16:0:2:33:16:0:3 chr21 45540919 . A G 1022.44 PASS AO=109;DP=109;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0143891;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.174;QD=37.8682;RBI=0.0252337;REFB=-0.0208687;REVB=-0.0207291;RO=0;SAF=41;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.79341e-05;OID=.;OPOS=45540919;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:109:108:0:0:109:108:68:41:0:0:68:40:0:0 chr21 45544594 . T C 1010 PASS AO=108;DP=110;FAO=108;FDP=110;FR=.;FRO=2;FSAF=57;FSAR=51;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.000929;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=204.809;QD=36.7273;RBI=0.0037903;REFB=-0.0495092;REVB=0.00367469;RO=2;SAF=57;SAR=51;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00096144;STB=0.500507;TYPE=snp;VARB=0.000621067;OID=.;OPOS=45544594;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:110:110:2:2:108:108:51:57:1:1:51:57:1:1 chr21 45553595 . GT G,GC 114.26 PASS AO=4,9;DP=13;FAO=1,12;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=1,8;FSAR=0,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019392,0.0171926;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=104.406,114.791;QD=35.1561;RBI=0.0289479,0.0282149;REFB=0,0;REVB=0.0214926,-0.0223717;RO=0;SAF=3,6;SAR=1,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.86674e-08,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0182487,0.00608442;OID=.,.;OPOS=45553596,45553596;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=G,GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:4,9:13:1,12:13:0:1,8:0,4:0:0:6:0:3,6:1,3:0:0 chr21 45565473 . C T 267.06 PASS AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.015399;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=241.596;QD=38.152;RBI=0.0261739;REFB=0;REVB=0.0211647;RO=0;SAF=5;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.39272e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.36696e-05;OID=.;OPOS=45565473;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:28:28:0:0:28:28:23:5:0:0:23:5:0:0 chr21 45648880 . C T 46.83 PASS AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=0.0127267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.651;QD=6.04263;RBI=0.0356498;REFB=0.0108543;REVB=0.0333008;RO=19;SAF=5;SAR=7;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110534;STB=0.564867;TYPE=snp;VARB=-0.0210364;OID=.;OPOS=45648880;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:31:31:19:19:12:12:7:5:6:13:7:5:6:13 chr21 45649494 . A G 125.84 PASS AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0949691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.367;QD=35.9534;RBI=0.0978372;REFB=0;REVB=-0.0235156;RO=0;SAF=3;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00223465;OID=.;OPOS=45649494;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:14:14:0:0:14:14:11:3:0:0:11:3:0:0 chr21 45649666 . G A 83.39 PASS AO=22;DP=53;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=9;FWDB=0.0414147;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=187.677;QD=6.29363;RBI=0.0415647;REFB=-0.0045996;REVB=-0.00352853;RO=30;SAF=13;SAR=9;SRF=22;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154512;STB=0.573707;TYPE=snp;VARB=0.00584038;OID=.;OPOS=45649666;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:53:53:30:31:22:22:9:13:22:8:9:13:22:9 chr21 45649778 . A G 319.73 PASS AO=86;DP=194;FAO=86;FDP=194;FR=.;FRO=108;FSAF=51;FSAR=35;FSRF=53;FSRR=55;FWDB=0.0266948;FXX=0.00512794;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.155;QD=6.59227;RBI=0.0279269;REFB=-0.0194429;REVB=-0.00820351;RO=105;SAF=52;SAR=34;SRF=50;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128902;STB=0.557702;TYPE=snp;VARB=0.0246298;OID=.;OPOS=45649778;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:194:105:108:86:86:34:52:50:55:35:51:53:55 chr21 45649848 . T C 252.18 PASS AO=66;DP=146;FAO=66;FDP=147;FR=.;FRO=81;FSAF=25;FSAR=41;FSRF=21;FSRR=60;FWDB=-0.0159931;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=188.704;QD=6.86211;RBI=0.0237183;REFB=-0.0184192;REVB=-0.0175151;RO=79;SAF=25;SAR=41;SRF=20;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136323;STB=0.572412;TYPE=snp;VARB=0.0251253;OID=.;OPOS=45649848;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:147:79:81:66:66:41:25:20:59:41:25:21:60 chr21 45656774 . C T 173.45 PASS AO=57;DP=154;FAO=57;FDP=153;FR=.;FRO=96;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=56;FSRR=40;FWDB=-0.0274926;FXX=0.00649309;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.272;QD=4.53473;RBI=0.0353002;REFB=-0.00755714;REVB=-0.0221418;RO=94;SAF=29;SAR=28;SRF=55;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0840265;STB=0.546859;TYPE=snp;VARB=0.0113983;OID=.;OPOS=45656774;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:153:94:96:57:57:28:29:55:39:28:29:56:40 chr21 45712977 . T C 63.18 PASS AO=17;DP=43;FAO=17;FDP=43;FR=.;FRO=26;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.00598907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.148;QD=5.87765;RBI=0.0161053;REFB=-0.00977768;REVB=0.0149503;RO=26;SAF=2;SAR=15;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.504972;STB=0.800294;TYPE=snp;VARB=0.0135495;OID=.;OPOS=45712977;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:43:43:26:26:17:17:15:2:13:13:15:2:13:13 chr21 45717550 . T C 198.28 PASS AO=61;DP=154;FAO=61;FDP=155;FR=.;FRO=94;FSAF=21;FSAR=40;FSRF=36;FSRR=58;FWDB=-0.0222198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.794;QD=5.11687;RBI=0.0331077;REFB=-0.0100411;REVB=0.0245438;RO=92;SAF=21;SAR=40;SRF=35;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0420393;STB=0.525579;TYPE=snp;VARB=0.0204414;OID=.;OPOS=45717550;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:155:92:94:61:61:40:21:35:57:40:21:36:58 chr21 45725715 . A G 46.83 PASS AO=13;DP=35;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=0.00833834;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.793;QD=5.35198;RBI=0.0132089;REFB=-0.0105624;REVB=-0.0102443;RO=22;SAF=8;SAR=5;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0764642;STB=0.544956;TYPE=snp;VARB=0.0184544;OID=.;OPOS=45725715;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:35:35:22:22:13:13:5:8:15:7:5:8:15:7 chr21 45725746 . C T 103.69 PASS AO=17;DP=28;FAO=18;FDP=28;FR=.;FRO=10;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.038988;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.172;QD=14.8126;RBI=0.0403466;REFB=-0.00783505;REVB=0.010382;RO=10;SAF=13;SAR=4;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.27777;STB=0.660183;TYPE=snp;VARB=0.0175522;OID=.;OPOS=45725746;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:28:28:10:10:17:18:4:13:4:6:4:14:4:6 chr21 45732116 . C T 100.82 PASS AO=22;DP=44;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=17;FWDB=0.000882267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.68;QD=9.16562;RBI=0.0055897;REFB=-0.0167952;REVB=-0.00551963;RO=22;SAF=10;SAR=12;SRF=5;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209429;STB=0.616923;TYPE=snp;VARB=0.0154714;OID=.;OPOS=45732116;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:97:44:44:22:22:22:22:12:10:5:17:12:10:5:17 chr21 45757547 . GCCCCT GCCCT,GCCC 59.45 PASS AO=23,31;DP=121;FAO=48,0;FDP=113;FR=.;FRO=65;FSAF=7,0;FSAR=41,0;FSRF=55;FSRR=10;FWDB=0.0954789,0.0191937;FXX=0.00877116;HRUN=4,4;LEN=1,2;MLLD=10.2258,76.8508;QD=2.10435;RBI=0.144713,0.0327306;REFB=-0.128582,-0.0344916;REVB=-0.108746,-0.0265121;RO=54;SAF=8,2;SAR=15,29;SRF=48;SRR=6;SSEN=0.4,0.4;SSEP=0,0;SSSB=-0.589695,-0.805882;STB=0.876709,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.166581,0;OID=.,.;OPOS=45757548,45757551;OREF=C,CT;OALT=-,-;OMAPALT=GCCCT,GCCC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:23,31:114:48,0:113:65:7,0:41,0:55:10:60:54:8,2:15,29:48:6 chr21 45844751 . A G 1064.9 PASS AO=111;DP=111;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0391336;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.784;QD=38.032;RBI=0.0524469;REFB=0;REVB=-0.0349177;RO=0;SAF=56;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.75846e-06;OID=.;OPOS=45844751;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:111:112:0:0:111:112:55:56:0:0:56:56:0:0 chr21 45878637 . A G 386.85 PASS AO=25;DP=43;FAO=41;FDP=41;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=5;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0796217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.174;QD=37.7414;RBI=0.113832;REFB=0;REVB=0.0813522;RO=0;SAF=5;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00629792;OID=.;OPOS=45878637;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:41:41:0:0:25:41:20:5:0:0:36:5:0:0 chr21 45959558 . T G 10.47 PASS AO=2;DP=6;FAO=2;FDP=6;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0349293;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2692;QD=6.97858;RBI=0.0349293;REFB=-0.0484073;REVB=0;RO=4;SAF=2;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0808335;OID=.;OPOS=45959558;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:4:4:2:2:0:2:4:0:0:2:4:0 chr21 45959559 . C A 10.48 PASS AO=2;DP=6;FAO=2;FDP=6;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0788681;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.6209;QD=6.98365;RBI=0.0788681;REFB=-0.0652961;REVB=0;RO=4;SAF=2;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.051651;OID=.;OPOS=45959559;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:4:4:2:2:0:2:4:0:0:2:4:0 chr21 45959918 . G A 101.06 PASS AO=10;DP=10;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152565;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=132.923;QD=36.75;RBI=0.0963081;REFB=0;REVB=0.095092;RO=0;SAF=10;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000787676;OID=.;OPOS=45959918;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:10:11:0:0:10:11:0:10:0:0:1:10:0:0 chr21 45970718 . C T 16.26 PASS AO=4;DP=14;FAO=4;FDP=14;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.0370425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.16;QD=4.64541;RBI=0.0501582;REFB=-0.0139944;REVB=0.0338187;RO=10;SAF=2;SAR=2;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107009;STB=0.571079;TYPE=snp;VARB=0.0593899;OID=.;OPOS=45970718;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:14:14:10:10:4:4:2:2:4:6:2:2:4:6 chr21 45971299 . T C 15.78 PASS AO=3;DP=7;FAO=3;FDP=7;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.111154;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.682;QD=9.01796;RBI=0.113408;REFB=-0.0223739;REVB=-0.0224994;RO=4;SAF=1;SAR=2;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0848588;STB=0.555201;TYPE=snp;VARB=0.0151446;OID=.;OPOS=45971299;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:7:7:4:4:3:3:2:1:1:3:2:1:1:3 chr21 45977945 . C T 38.83 PASS AO=8;DP=29;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=16;FWDB=0.0515338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.602;QD=5.01043;RBI=0.0516131;REFB=-0.0213144;REVB=0.00286087;RO=20;SAF=3;SAR=5;SRF=4;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234284;STB=0.562394;TYPE=snp;VARB=0.025422;OID=.;OPOS=45977945;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:29:31:20:20:8:11:5:3:4:16:8:3:4:16 chr21 45978587 . A G 34.49 PASS AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00732848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.8976;QD=22.9961;RBI=0.00732848;REFB=0.0254004;REVB=0;RO=1;SAF=5;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0144151;OID=.;OPOS=45978587;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:6:6:1:1:5:5:0:5:1:0:0:5:1:0 chr21 45978592 . T C 34.49 PASS AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0289477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.674;QD=22.992;RBI=0.0289477;REFB=-0.0172224;REVB=0;RO=1;SAF=5;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00226481;OID=.;OPOS=45978592;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:6:6:1:1:5:5:0:5:1:0:0:5:1:0 chr21 46011745 . C T 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0576128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.852;QD=35.0875;RBI=0.0639999;REFB=0;REVB=-0.0278701;RO=0;SAF=6;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000642639;OID=.;OPOS=46011745;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:6:0:0:1:6:0:0 chr21 46011751 . C T 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0952301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.4443;QD=33.022;RBI=0.105393;REFB=0;REVB=0.0451535;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0164044;OID=.;OPOS=46011751;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:5:0:0:1:5:0:0 chr21 46020527 . C T 221.06 PASS AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0833586;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.871;QD=34.009;RBI=0.100356;REFB=-0.117706;REVB=0.0558809;RO=1;SAF=19;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0238057;STB=0.51281;TYPE=snp;VARB=0.00360002;OID=.;OPOS=46020527;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:26:26:1:1:25:25:6:19:1:0:6:19:1:0 chr21 46021607 . A G 102.21 PASS AO=9;DP=12;FAO=11;FDP=11;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0468613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.4317;QD=37.1657;RBI=0.0562012;REFB=0;REVB=0.0310257;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00244837;OID=.;OPOS=46021607;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:9:11:5:4:0:0:5:6:0:0 chr21 46021759 . A G 835.86 PASS AO=85;DP=85;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00119613;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.183;QD=38.4305;RBI=0.00132168;REFB=0;REVB=0.000562244;RO=0;SAF=29;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.20959e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.34112e-05;OID=.;OPOS=46021759;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:85:87:0:0:85:87:56:29:0:0:56:31:0:0 chr21 46021934 . C T 676.63 PASS AO=69;DP=69;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0482733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.913;QD=38.6645;RBI=0.0558559;REFB=0;REVB=0.0280993;RO=0;SAF=29;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000245405;OID=.;OPOS=46021934;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:69:70:0:0:69:70:40:29:0:0:41:29:0:0 chr21 46021946 . C G 722.89 PASS AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00529055;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9501;QD=37.5528;RBI=0.0178702;REFB=0;REVB=-0.0170691;RO=0;SAF=27;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000154076;OID=.;OPOS=46021946;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:77:77:0:0:77:77:50:27:0:0:49:28:0:0 chr21 46021954 . CTG C 701.6 PASS AO=68;DP=77;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00740846;FXX=0.0640943;HRUN=1;LEN=2;MLLD=220.431;QD=38.4436;RBI=0.0383561;REFB=0;REVB=-0.0376339;RO=6;SAF=27;SAR=41;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0370784;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-1.57598e-05;OID=.;OPOS=46021955;OREF=TG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:68:77:73:73:0:29:44:0:0:33:6:27:41:1:5 chr21 46032094 . A G 107.81 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0821708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.231;QD=35.9371;RBI=0.0852348;REFB=0;REVB=0.0226479;RO=0;SAF=5;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00174251;OID=.;OPOS=46032094;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:7:5:0:0:7:5:0:0 chr21 46047633 . A G 10.72 PASS AO=3;DP=16;FAO=3;FDP=16;FR=.;FRO=13;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=0.0164677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.2366;QD=2.67995;RBI=0.174917;REFB=-0.0532664;REVB=-0.17414;RO=12;SAF=1;SAR=2;SRF=1;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.410589;STB=0.683263;TYPE=snp;VARB=0.233465;OID=.;OPOS=46047633;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:16:16:12:13:3:3:2:1:1:11:2:1:2:11 chr21 46047710 . T C 30.27 PASS AO=4;DP=11;FAO=4;FDP=11;FR=.,HEALED;FRO=5;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.0513882;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=241.577;QD=11.0062;RBI=0.05146;REFB=-0.0135595;REVB=-0.0027179;RO=5;SAF=1;SAR=3;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.386089;STB=0.726523;TYPE=snp;VARB=0.0069108;OID=.;OPOS=46047710;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:11:11:5:5:4:4:3:1:0:5:3:1:0:5 chr21 46057393 . T A 36.92 PASS AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.0194027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.1938;QD=13.4256;RBI=0.0381368;REFB=0.00934378;REVB=-0.0328322;RO=5;SAF=1;SAR=5;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.505365;STB=0.805371;TYPE=snp;VARB=-0.0134963;OID=.;OPOS=46057393;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:11:11:5:5:6:6:5:1:4:1:5:1:4:1 chr21 46057548 . A C 108.86 PASS AO=17;DP=23;FAO=17;FDP=24;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.020854;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.7037;QD=18.1433;RBI=0.143741;REFB=-0.0129352;REVB=-0.14222;RO=4;SAF=4;SAR=13;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214712;STB=0.660812;TYPE=snp;VARB=0.00116504;OID=.;OPOS=46057548;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:23:24:4:7:17:17:13:4:3:1:13:4:5:2 chr21 46057806 . G A 64.48 PASS AO=12;DP=22;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0465646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.746;QD=11.7238;RBI=0.0499007;REFB=-0.0327592;REVB=0.0179392;RO=10;SAF=4;SAR=8;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0579899;STB=0.533277;TYPE=snp;VARB=0.01803;OID=.;OPOS=46057806;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:22:22:10:10:12:12:8:4:4:6:8:4:4:6 chr21 46074202 . A G 15.55 PASS AO=3;DP=8;FAO=3;FDP=8;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.00189105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.758;QD=7.7751;RBI=0.00189105;REFB=0.000169608;REVB=0;RO=5;SAF=3;SAR=0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000148124;OID=.;OPOS=46074202;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:8:8:5:5:3:3:0:3:5:0:0:3:5:0 chr21 46077946 . A G 57.3 PASS AO=10;DP=17;FAO=10;FDP=17;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0438889;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7464;QD=13.4832;RBI=0.0458556;REFB=0.0121449;REVB=-0.0132853;RO=7;SAF=7;SAR=3;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207621;STB=0.620002;TYPE=snp;VARB=-0.0138208;OID=.;OPOS=46077946;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:17:17:7:7:10:10:3:7:3:4:3:7:3:4 chr21 46078220 . T C 27.77 PASS AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=11;FR=.;FRO=6;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.978;QD=10.0998;RBI=0.0171277;REFB=0.00485418;REVB=-0.0171277;RO=6;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0479133;OID=.;OPOS=46078220;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:11:11:6:6:5:5:5:0:0:6:5:0:0:6 chr21 46086377 . A G 52.69 PASS AO=11;DP=23;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0437413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.353;QD=9.16303;RBI=0.0462407;REFB=0.0177579;REVB=-0.0149965;RO=12;SAF=2;SAR=9;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.347389;STB=0.705461;TYPE=snp;VARB=-0.0139421;OID=.;OPOS=46086377;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:23:23:12:12:11:11:9:2:6:6:9:2:6:6 chr21 46086718 . G C 89.69 PASS AO=14;DP=21;FAO=14;FDP=21;FR=.;FRO=7;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.00906103;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.447;QD=17.0841;RBI=0.0120501;REFB=-0.0145406;REVB=0.00794379;RO=7;SAF=10;SAR=4;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187933;STB=0.605901;TYPE=snp;VARB=0.00326218;OID=.;OPOS=46086718;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:21:21:7:7:14:14:4:10:3:4:4:10:3:4 chr21 46086719 . A G 56.52 PASS AO=15;DP=21;FAO=12;FDP=18;FR=.;FRO=6;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0801724;FXX=0.142789;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.476;QD=12.5591;RBI=0.0893926;REFB=-0.054519;REVB=0.0395402;RO=6;SAF=11;SAR=4;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229316;STB=0.655971;TYPE=snp;VARB=0.137281;OID=.;OPOS=46086719;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:21:18:6:6:15:12:4:11:2:4:3:9:2:4 chr21 46086757 . G A 119.77 PASS AO=19;DP=28;FAO=19;FDP=28;FR=.;FRO=9;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0136937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.4916;QD=17.1096;RBI=0.0456031;REFB=-0.0326876;REVB=-0.0434986;RO=9;SAF=14;SAR=5;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195052;STB=0.608574;TYPE=snp;VARB=0.00810949;OID=.;OPOS=46086757;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:28:28:9:9:19:19:5:14:4:5:5:14:4:5 chr21 46086758 . C T 132.11 PASS AO=20;DP=28;FAO=20;FDP=28;FR=.;FRO=8;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0271241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.7904;QD=18.8722;RBI=0.0353179;REFB=-0.0520103;REVB=0.0226195;RO=8;SAF=14;SAR=6;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116643;STB=0.564449;TYPE=snp;VARB=0.0146453;OID=.;OPOS=46086758;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:28:28:8:8:20:20:6:14:4:4:6:14:4:4 chr21 46117962 . G A 16.07 PASS AO=3;DP=6;FAO=3;FDP=6;FR=.;FRO=3;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.5681;QD=10.7151;RBI=0.0368403;REFB=-0.0265881;REVB=0.0368403;RO=3;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0569104;OID=.;OPOS=46117962;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:6:6:3:3:3:3:3:0:0:3:3:0:0:3 chr21 46233863 . G C 55.86 PASS AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=23;FR=.,HEALED;FRO=12;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.0382689;FXX=0.0416493;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.833;QD=9.71532;RBI=0.039824;REFB=-0.0439999;REVB=-0.0110201;RO=8;SAF=7;SAR=4;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194374;STB=0.573634;TYPE=snp;VARB=0.00877203;OID=.;OPOS=46233863;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:23:23:8:12:11:11:4:7:3:5:4:7:6:6 chr21 46271452 . C T 772.98 PASS AO=79;DP=79;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0239693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.775;QD=38.6491;RBI=0.0278792;REFB=0;REVB=0.014238;RO=0;SAF=30;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53895e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000126592;OID=.;OPOS=46271452;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:79:80:0:0:79:80:49:30:0:0:50:30:0:0 chr21 46281675 . TCCCCA TCCCA,TCCCCAC 76.3 PASS AO=10,4;DP=24;FAO=14,5;FDP=23;FR=.;FRO=4;FSAF=8,0;FSAR=6,5;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.182343,-0.0500633;FXX=0;HRUN=4,1;LEN=1,1;MLLD=14.0593,21.6907;QD=13.2698;RBI=0.250643,0.091232;REFB=-0.0642957,-0.075139;REVB=0.171967,-0.0762689;RO=6;SAF=5,0;SAR=5,4;SRF=0;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.332953,0;STB=0.624826,0.5;TYPE=del,ins;VARB=0.0523731,0.0872344;OID=.,.;OPOS=46281676,46281681;OREF=C,-;OALT=-,C;OMAPALT=TCCCA,TCCCCAC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:10,4:22:14,5:23:4:8,0:6,5:0:4:10:6:5,0:5,4:0:6 chr21 46311813 . A G 398.58 PASS AO=43;DP=44;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0714672;FXX=0.0217344;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0775;QD=35.429;RBI=0.0748973;REFB=-0.0217327;REVB=-0.0224064;RO=1;SAF=29;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159212;STB=0.508193;TYPE=snp;VARB=0.0024173;OID=.;OPOS=46311813;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:44:45:1:1:43:44:14:29:1:0:14:30:1:0 chr21 46314907 . T A 723.72 PASS AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0510875;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.408;QD=38.0905;RBI=0.0615615;REFB=0;REVB=0.0343495;RO=0;SAF=38;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000260005;OID=.;OPOS=46314907;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:76:76:0:0:76:76:38:38:0:0:38:38:0:0 chr21 46328099 . T C 129.14 PASS AO=35;DP=86;FAO=36;FDP=87;FR=.;FRO=51;FSAF=7;FSAR=29;FSRF=18;FSRR=33;FWDB=-0.0455523;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.712;QD=5.93739;RBI=0.045644;REFB=0.00115455;REVB=-0.00289213;RO=49;SAF=6;SAR=29;SRF=17;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253459;STB=0.625462;TYPE=snp;VARB=-0.00160781;OID=.;OPOS=46328099;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:87:49:51:35:36:29:6:17:32:29:7:18:33 chr21 46330674 . C A 22.31 PASS AO=7;DP=24;FAO=7;FDP=24;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=16;FWDB=-0.0305767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.949;QD=3.71867;RBI=0.0306294;REFB=-0.0151962;REVB=0.00179548;RO=16;SAF=3;SAR=4;SRF=1;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.482514;STB=0.788964;TYPE=snp;VARB=0.0637584;OID=.;OPOS=46330674;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:24:24:16:17:7:7:4:3:1:15:4:3:1:16 chr21 46353637 . T C 237.21 PASS AO=56;DP=115;FAO=56;FDP=115;FR=.;FRO=59;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=33;FSRR=26;FWDB=-0.0139174;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.765;QD=8.25087;RBI=0.014957;REFB=0.00547258;REVB=-0.00547903;RO=55;SAF=28;SAR=28;SRF=30;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0407867;STB=0.530424;TYPE=snp;VARB=-0.00598257;OID=.;OPOS=46353637;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:55:59:56:56:28:28:30:25:28:28:33:26 chr21 46353678 . G A 180.74 PASS AO=46;DP=101;FAO=46;FDP=102;FR=.;FRO=56;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=34;FSRR=22;FWDB=0.0524579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1309;QD=7.08795;RBI=0.107813;REFB=-0.0219047;REVB=0.0941902;RO=54;SAF=19;SAR=27;SRF=32;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173153;STB=0.605797;TYPE=snp;VARB=0.0214077;OID=.;OPOS=46353678;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:102:54:56:46:46:27:19:32:22:27:19:34:22 chr21 46353949 . C G 161.24 PASS AO=38;DP=80;FAO=38;FDP=80;FR=.;FRO=42;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=27;FSRR=15;FWDB=-0.00733808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.781;QD=8.06205;RBI=0.0388367;REFB=-0.0187477;REVB=-0.0381372;RO=41;SAF=23;SAR=15;SRF=26;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.028325;STB=0.520822;TYPE=snp;VARB=0.0174816;OID=.;OPOS=46353949;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:41:42:38:38:15:23:26:15:15:23:27:15 chr21 46353985 . A G 112.26 PASS AO=31;DP=75;FAO=31;FDP=75;FR=.;FRO=44;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=-0.10434;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=39.1122;QD=5.98695;RBI=0.106601;REFB=-0.0440152;REVB=-0.02184;RO=42;SAF=22;SAR=9;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.2054;STB=0.619637;TYPE=snp;VARB=0.0378028;OID=.;OPOS=46353985;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:42:44:31:31:9:22:22:20:9:22:23:21 chr21 46354055 . A G 957.02 PASS AO=86;DP=109;FAO=104;FDP=104;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=73;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0344495;FXX=0.0280348;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.408;QD=36.8083;RBI=0.0352671;REFB=0;REVB=-0.00754976;RO=0;SAF=62;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.50399e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000494478;OID=.;OPOS=46354055;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:106:104:0:0:86:104:24:62:0:0:31:73:0:0 chr21 46354056 . C G 19.38 PASS AO=20;DP=116;FAO=20;FDP=114;FR=.;FRO=94;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=71;FSRR=23;FWDB=0.00427706;FXX=0.0172399;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.1126;QD=0.680045;RBI=0.00993914;REFB=-0.0170717;REVB=-0.00897181;RO=92;SAF=10;SAR=10;SRF=69;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.329782;STB=0.710353;TYPE=snp;VARB=0.0192028;OID=.;OPOS=46354056;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:116:114:92:94:20:20:10:10:69:23:10:10:71:23 chr21 46355710 . A G 270.4 PASS AO=60;DP=115;FAO=60;FDP=116;FR=.;FRO=56;FSAF=24;FSAR=36;FSRF=17;FSRR=39;FWDB=0.00828861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.4;QD=9.324;RBI=0.0127475;REFB=-0.0113419;REVB=-0.00968496;RO=55;SAF=24;SAR=36;SRF=17;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.084016;STB=0.549435;TYPE=snp;VARB=0.0115538;OID=.;OPOS=46355710;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:116:55:56:60:60:36:24:17:38:36:24:17:39 chr21 46572572 . A G 686.54 PASS AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0497151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.3589;QD=36.6156;RBI=0.0500858;REFB=-0.0960741;REVB=0.00608231;RO=1;SAF=55;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00852545;STB=0.504503;TYPE=snp;VARB=0.00730943;OID=.;OPOS=46572572;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:75:75:1:1:74:74:19:55:1:0:19:55:1:0 chr21 46641968 . G A 197.29 PASS AO=66;DP=224;FAO=84;FDP=249;FR=.;FRO=165;FSAF=21;FSAR=63;FSRF=58;FSRR=107;FWDB=0.0162585;FXX=0.00399984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.171;QD=3.16923;RBI=0.0190702;REFB=-0.0110262;REVB=0.00996661;RO=149;SAF=5;SAR=61;SRF=42;SRR=107;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.45195;STB=0.582289;TYPE=snp;VARB=0.0250478;OID=.;OPOS=46641968;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:224:249:149:165:66:84:61:5:42:107:63:21:58:107 chr21 46705345 . G A 123.47 PASS AO=29;DP=65;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=25;FSAR=5;FSRF=31;FSRR=4;FWDB=0.0108476;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=238.486;QD=7.59804;RBI=0.0218021;REFB=-6.47204e-05;REVB=-0.0189119;RO=34;SAF=25;SAR=4;SRF=30;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0424429;STB=0.554422;TYPE=snp;VARB=7.58538e-06;OID=.;OPOS=46705345;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:34:35:29:30:4:25:30:4:5:25:31:4 chr21 46705621 . G A 164.96 PASS AO=52;DP=130;FAO=52;FDP=138;FR=.;FRO=86;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=55;FSRR=31;FWDB=-0.0169965;FXX=0.0142847;HRUN=4;LEN=1;MLLD=96.0196;QD=4.78154;RBI=0.0377002;REFB=-0.0156923;REVB=0.0336514;RO=75;SAF=28;SAR=24;SRF=46;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0796319;STB=0.563962;TYPE=snp;VARB=0.0200114;OID=.;OPOS=46705621;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:138:75:86:52:52:24:28:46:29:24:28:55:31 chr21 46875564 . T C 488.26 PASS AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0520481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.993;QD=37.5585;RBI=0.0549368;REFB=0;REVB=0.0175799;RO=0;SAF=12;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.84608e-05;OID=.;OPOS=46875564;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:52:52:0:0:52:52:40:12:0:0:40:12:0:0 chr21 46896381 . G T 99.68 PASS AO=27;DP=64;FAO=27;FDP=65;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=27;FSRR=11;FWDB=-0.0173629;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1961;QD=6.13396;RBI=0.0710258;REFB=-0.0142455;REVB=0.0688708;RO=36;SAF=15;SAR=12;SRF=25;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144835;STB=0.593574;TYPE=snp;VARB=0.0178457;OID=.;OPOS=46896381;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:65:36:38:27:27:12:15:25:11:12:15:27:11 chr21 46899872 . C A 65.06 PASS AO=18;DP=46;FAO=18;FDP=46;FR=.;FRO=28;FSAF=17;FSAR=1;FSRF=21;FSRR=7;FWDB=0.0205467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.184;QD=5.65761;RBI=0.0544779;REFB=-0.00439112;REVB=0.0504547;RO=28;SAF=17;SAR=1;SRF=21;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.461947;STB=0.781181;TYPE=snp;VARB=0.00289896;OID=.;OPOS=46899872;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:46:46:28:28:18:18:1:17:21:7:1:17:21:7 chr21 46900410 . C T 137.11 PASS AO=28;DP=63;FAO=32;FDP=66;FR=.;FRO=34;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=0.0327889;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.6938;QD=8.30979;RBI=0.0328083;REFB=-0.0437485;REVB=0.00112938;RO=29;SAF=18;SAR=10;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210789;STB=0.642358;TYPE=snp;VARB=0.0546788;OID=.;OPOS=46900410;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:66:29:34:28:32:10:18:12:17:11:21:13:21 chr21 46902273 . A G 13.43 PASS AO=3;DP=11;FAO=3;FDP=11;FR=.;FRO=8;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.84;QD=4.88264;RBI=0.00245739;REFB=-0.0260437;REVB=-0.00245739;RO=8;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0413764;OID=.;OPOS=46902273;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:11:11:8:8:3:3:3:0:0:8:3:0:0:8 chr21 46910210 . G A 306.92 PASS AO=58;DP=139;FAO=74;FDP=152;FR=.;FRO=78;FSAF=63;FSAR=11;FSRF=54;FSRR=24;FWDB=0.0346772;FXX=0.0193536;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2205;QD=8.07673;RBI=0.0397;REFB=-0.0543615;REVB=-0.0193282;RO=72;SAF=47;SAR=11;SRF=52;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128515;STB=0.631403;TYPE=snp;VARB=0.0572201;OID=.;OPOS=46910210;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:152:72:78:58:74:11:47:52:20:11:63:54:24 chr21 46951556 . A G 266.44 PASS AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0395551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.904;QD=38.0627;RBI=0.0505183;REFB=0;REVB=-0.0314244;RO=0;SAF=20;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.41836e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000471148;OID=.;OPOS=46951556;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:27:28:0:0:27:28:7:20:0:0:8:20:0:0 chr21 46957794 . T C 388.32 PASS AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0100082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.94;QD=38.8318;RBI=0.0881437;REFB=0;REVB=0.0875737;RO=0;SAF=26;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000526182;OID=.;OPOS=46957794;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:40:40:0:0:40:40:14:26:0:0:14:26:0:0 chr21 47329352 . T C 108.24 PASS AO=14;DP=63;FAO=29;FDP=61;FR=.,HEALED;FRO=32;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=0.00612949;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.161;QD=7.09785;RBI=0.0482867;REFB=-0.00513939;REVB=-0.0478961;RO=31;SAF=9;SAR=5;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.036819;STB=0.632514;TYPE=snp;VARB=0.00976695;OID=.;OPOS=47329352;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:31:32:14:29:5:9:19:12:19:10:19:13 chr21 47329353 . G C 30.88 PASS AO=15;DP=57;FAO=15;FDP=62;FR=.;FRO=47;FSAF=1;FSAR=14;FSRF=29;FSRR=18;FWDB=0.00213783;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=166.587;QD=1.99251;RBI=0.025509;REFB=-0.0219307;REVB=-0.0254193;RO=40;SAF=1;SAR=14;SRF=29;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.738316;STB=0.928616;TYPE=snp;VARB=0.0504193;OID=.;OPOS=47329353;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:57:62:40:47:15:15:14:1:29:11:14:1:29:18 chr21 47409503 . A G 319.47 PASS AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00972657;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.81;QD=37.5843;RBI=0.0111852;REFB=0;REVB=-0.00552293;RO=0;SAF=18;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000218598;OID=.;OPOS=47409503;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:34:0:0:34:34:16:18:0:0:16:18:0:0 chr21 47417415 . C A 60.38 PASS AO=6;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.370573;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=36.6523;QD=34.5003;RBI=0.370611;REFB=0;REVB=0.0052733;RO=1;SAF=0;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.782178;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.038376;OID=.;OPOS=47417415;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:1:0:6:7:6:0:1:0:6:1:0:0 chr21 47420725 . TCG TG,T,TGG 154.79 PASS AO=4,4,9;DP=19;FAO=5,4,8;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0,8;FSAR=5,4,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0771219,0.0606074,-0.140696;FXX=0.105208;HRUN=1,1,1;LEN=1,2,1;MLLD=47.9464,36.5676,48.943;QD=36.4206;RBI=0.0775217,0.0666056,0.141566;REFB=0,0,0;REVB=0.00786336,0.0276233,-0.0156641;RO=0;SAF=0,0,8;SAR=4,4,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=del,del,snp;VARB=-0.00241468,0.0839862,0.00429689;OID=.,.,.;OPOS=47420726,47420726,47420726;OREF=C,CG,C;OALT=-,-,G;OMAPALT=TG,T,TGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/3:4,4,9:18:5,4,8:17:0:0,0,8:5,4,0:0:0:19:0:0,0,8:4,4,1:0:0 chr21 47536546 . C T 662.23 PASS AO=71;DP=73;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0548244;FXX=0.0277739;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.852;QD=37.8419;RBI=0.0598363;REFB=0;REVB=-0.0239721;RO=0;SAF=57;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.24953e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.08233e-05;OID=.;OPOS=47536546;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:73:70:0:0:71:70:14:57:0:0:13:57:0:0 chr21 47538960 . G A 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.122727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.867;QD=35.0875;RBI=0.125027;REFB=0;REVB=0.0238738;RO=0;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.27427e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00274795;OID=.;OPOS=47538960;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:5:2:0:0:5:2:0:0 chr21 47542861 . A G 380.84 PASS AO=41;DP=43;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0376166;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.4311;QD=34.6216;RBI=0.0377599;REFB=-0.0694698;REVB=0.00328603;RO=1;SAF=14;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0170644;STB=0.508471;TYPE=snp;VARB=0.00234696;OID=.;OPOS=47542861;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:43:44:1:1:41:43:27:14:0:1:29:14:0:1 chr21 47545155 . A G 289.31 PASS AO=27;DP=27;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0357405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.0191;QD=38.5742;RBI=0.0490367;REFB=0;REVB=-0.0335741;RO=0;SAF=9;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000776428;OID=.;OPOS=47545155;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:27:30:0:0:27:30:18:9:0:0:18:12:0:0 chr21 47545768 . G A 338.92 PASS AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.1275;QD=37.6576;RBI=0.0441413;REFB=0;REVB=0.0413376;RO=0;SAF=28;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000810285;OID=.;OPOS=47545768;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:36:36:0:0:36:36:8:28:0:0:8:28:0:0 chr21 47545823 . G A 437.93 PASS AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00890865;FXX=0.0212721;HRUN=3;LEN=1;MLLD=141.85;QD=38.0811;RBI=0.0148747;REFB=0;REVB=0.0119119;RO=0;SAF=34;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.12678e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.00791e-05;OID=.;OPOS=47545823;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:47:46:0:0:46:46:12:34:0:0:12:34:0:0 chr21 47545826 . C T 445.21 PASS AO=40;DP=48;FAO=47;FDP=47;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=34;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0825465;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5813;QD=37.8904;RBI=0.0855971;REFB=0;REVB=-0.0226482;RO=0;SAF=32;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000951069;OID=.;OPOS=47545826;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:48:47:0:0:40:47:8:32:0:0:13:34:0:0 chr21 47545827 . G T 10.54 PASS AO=8;DP=49;FAO=8;FDP=49;FR=.;FRO=41;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=33;FSRR=8;FWDB=-0.0332305;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.2456;QD=0.860122;RBI=0.046723;REFB=-0.0346941;REVB=0.0328446;RO=41;SAF=3;SAR=5;SRF=33;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.509451;STB=0.821356;TYPE=snp;VARB=0.0360638;OID=.;OPOS=47545827;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:49:49:41:41:8:8:5:3:33:8:5:3:33:8 chr21 47545913 . G A 116.63 PASS AO=30;DP=69;FAO=30;FDP=69;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=0.0072072;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.096;QD=6.76133;RBI=0.0102043;REFB=-0.0202427;REVB=0.00722384;RO=39;SAF=13;SAR=17;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0235699;STB=0.513318;TYPE=snp;VARB=0.0164639;OID=.;OPOS=47545913;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:69:69:39:39:30:30:17:13:16:23:17:13:16:23 chr21 47556793 . C T 157.5 PASS AO=18;DP=22;FAO=20;FDP=23;FR=.;FRO=3;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0254604;FXX=0.0416493;HRUN=3;LEN=1;MLLD=159.925;QD=27.3916;RBI=0.0260235;REFB=-0.0774664;REVB=-0.00538449;RO=1;SAF=6;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0367456;STB=0.555502;TYPE=snp;VARB=0.00185781;OID=.;OPOS=47556793;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:22:23:1:3:18:20:12:6:0:1:12:8:0:3 chr21 47571845 . C T 253.14 PASS AO=47;DP=78;FAO=47;FDP=78;FR=.;FRO=31;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=0.0181408;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.544;QD=12.9816;RBI=0.0220601;REFB=-0.0176852;REVB=-0.0125524;RO=31;SAF=25;SAR=22;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0120436;STB=0.506576;TYPE=snp;VARB=0.0140095;OID=.;OPOS=47571845;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:31:31:47:47:22:25:17:14:22:25:17:14 chr21 47581423 . C T 68.41 PASS AO=12;DP=21;FAO=12;FDP=21;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.0108158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.799;QD=13.0305;RBI=0.0286512;REFB=-0.0379998;REVB=0.0265313;RO=9;SAF=5;SAR=7;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186247;STB=0.606124;TYPE=snp;VARB=0.0179907;OID=.;OPOS=47581423;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:21:21:9:9:12:12:7:5:6:3:7:5:6:3 chr21 47581835 . C T 156.85 PASS AO=30;DP=52;FAO=30;FDP=52;FR=.;FRO=22;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=5;FWDB=0.0130637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.3022;QD=12.0657;RBI=0.0623147;REFB=0.0313799;REVB=0.06093;RO=22;SAF=19;SAR=11;SRF=17;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119472;STB=0.565673;TYPE=snp;VARB=-0.0249969;OID=.;OPOS=47581835;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:52:52:22:22:30:30:11:19:17:5:11:19:17:5 chr21 47581949 . C T 118 PASS AO=21;DP=34;FAO=21;FDP=34;FR=.;FRO=13;FSAF=1;FSAR=20;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.105155;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.8572;QD=13.8827;RBI=0.105878;REFB=-0.0153647;REVB=-0.0123517;RO=13;SAF=1;SAR=20;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.537929;STB=0.810395;TYPE=snp;VARB=0.0116764;OID=.;OPOS=47581949;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:34:34:13:13:21:21:20:1:5:8:20:1:5:8 chr21 47608580 . G A 1435.27 PASS AO=150;DP=152;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=107;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0376781;FXX=0.0192295;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.221;QD=37.5233;RBI=0.0478748;REFB=-0.0350155;REVB=0.0295357;RO=1;SAF=105;SAR=45;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0104516;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000149507;OID=.;OPOS=47608580;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:152:153:1:0:150:153:45:105:0:1:46:107:0:0 chr21 47609677 . A G 223.17 PASS AO=24;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0194761;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.2567;QD=35.7076;RBI=0.0525465;REFB=0;REVB=-0.0488038;RO=1;SAF=22;SAR=2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0206148;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00108991;OID=.;OPOS=47609677;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:25:25:1:0:24:25:2:22:1:0:2:23:0:0 chr21 47610066 . T C 676.05 PASS AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00859565;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.855;QD=37.5582;RBI=0.00863669;REFB=0;REVB=0.000840955;RO=0;SAF=28;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21139e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.38525e-05;OID=.;OPOS=47610066;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:73:72:0:0:72:72:44:28:0:0:44:28:0:0 chr21 47612466 . A G 1058.73 PASS AO=119;DP=152;FAO=139;FDP=157;FR=.;FRO=18;FSAF=91;FSAR=48;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.202526;FXX=0.0125778;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.984;QD=26.9741;RBI=0.202559;REFB=-0.0877011;REVB=0.00367251;RO=26;SAF=72;SAR=47;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00990829;STB=0.533004;TYPE=snp;VARB=0.0141382;OID=.;OPOS=47612466;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:152:157:26:18:119:139:47:72:15:11:48:91:7:11 chr21 47612471 . T C 886.05 PASS AO=109;DP=146;FAO=126;FDP=145;FR=.;FRO=19;FSAF=78;FSAR=48;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.184696;FXX=0.00684885;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.5021;QD=24.4426;RBI=0.1847;REFB=-0.132804;REVB=0.00108922;RO=32;SAF=61;SAR=48;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0283368;STB=0.534241;TYPE=snp;VARB=0.0323971;OID=.;OPOS=47612471;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:146:145:32:19:109:126:48:61:20:12:48:78:7:12 chr21 47612512 . C CTG 435.1 PASS AO=56;DP=100;FAO=62;FDP=79;FR=.;FRO=17;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=0.0303435;FXX=0.0246883;HRUN=1;LEN=2;MLLD=159.096;QD=22.0304;RBI=0.0323745;REFB=-0.00901052;REVB=-0.0112863;RO=36;SAF=31;SAR=25;SRF=25;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103847;STB=0.547406;TYPE=ins;VARB=0.00350012;OID=.;OPOS=47612513;OREF=-;OALT=TG;OMAPALT=CTG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:56:100:62:79:17:34:28:13:4:26:36:31:25:25:11 chr21 47612599 . G A 142.86 PASS AO=83;DP=312;FAO=82;FDP=312;FR=.;FRO=230;FSAF=39;FSAR=43;FSRF=123;FSRR=107;FWDB=0.00783515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.7674;QD=1.83158;RBI=0.042071;REFB=-0.0165756;REVB=-0.041335;RO=228;SAF=38;SAR=45;SRF=124;SRR=104;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106587;STB=0.543529;TYPE=snp;VARB=0.0511765;OID=.;OPOS=47612599;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:312:312:228:230:83:82:45:38:124:104:43:39:123:107 chr21 47612603 . G A 213.26 PASS AO=87;DP=292;FAO=100;FDP=312;FR=.;FRO=212;FSAF=57;FSAR=43;FSRF=106;FSRR=106;FWDB=-0.00921291;FXX=0.00952351;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.8773;QD=2.73414;RBI=0.0137746;REFB=-0.0891024;REVB=0.0102402;RO=192;SAF=51;SAR=36;SRF=91;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1341;STB=0.547855;TYPE=snp;VARB=0.212337;OID=.;OPOS=47612603;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:292:312:192:212:87:100:36:51:91:101:43:57:106:106 chr21 47612720 . A G 62 PASS AO=57;DP=258;FAO=56;FDP=270;FR=.;FRO=214;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=104;FSRR=110;FWDB=-0.0635491;FXX=0.0036899;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.2858;QD=0.91855;RBI=0.126141;REFB=-0.0467269;REVB=-0.108964;RO=201;SAF=29;SAR=28;SRF=99;SRR=102;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0207298;STB=0.539383;TYPE=snp;VARB=0.256187;OID=.;OPOS=47612720;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:258:270:201:214:57:56:28:29:99:102:26:30:104:110 chr21 47612867 . A G 316.51 PASS AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.024925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.917;QD=37.2365;RBI=0.02721;REFB=0;REVB=0.0109145;RO=0;SAF=24;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000190532;OID=.;OPOS=47612867;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:34:0:0:34:34:10:24:0:0:10:24:0:0 chr21 47613000 . A G 38.65 PASS AO=45;DP=193;FAO=39;FDP=192;FR=.;FRO=153;FSAF=29;FSAR=10;FSRF=111;FSRR=42;FWDB=0.0106406;FXX=0.00518108;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.3942;QD=0.805132;RBI=0.0118442;REFB=-0.0546051;REVB=0.0052021;RO=140;SAF=35;SAR=10;SRF=102;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0836481;STB=0.51856;TYPE=snp;VARB=0.225327;OID=.;OPOS=47613000;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:193:192:140:153:45:39:10:35:102:38:10:29:111:42 chr21 47613004 . T C 669.56 PASS AO=117;DP=181;FAO=117;FDP=180;FR=.;FRO=63;FSAF=80;FSAR=37;FSRF=50;FSRR=13;FWDB=-0.0930165;FXX=0.0163925;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9349;QD=14.8792;RBI=0.0930166;REFB=-0.150118;REVB=0.000103261;RO=61;SAF=80;SAR=37;SRF=48;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0784928;STB=0.545963;TYPE=snp;VARB=0.0610788;OID=.;OPOS=47613004;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:180:61:63:117:117:37:80:48:13:37:80:50:13 chr21 47613145 . T C 46.78 PASS AO=22;DP=67;FAO=20;FDP=67;FR=.;FRO=47;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=31;FWDB=-0.203705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.6318;QD=2.7927;RBI=0.203898;REFB=-0.0631898;REVB=0.00887033;RO=45;SAF=6;SAR=16;SRF=14;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0535186;STB=0.629778;TYPE=snp;VARB=0.116592;OID=.;OPOS=47613145;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:67:67:45:47:22:20:16:6:14:31:16:4:16:31 chr21 47613166 . G GTA 54.84 PASS AO=6;DP=14;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.100149;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=243.382;QD=27.4208;RBI=0.103792;REFB=-0.109112;REVB=0.0272592;RO=7;SAF=2;SAR=4;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.32987;STB=0.571224;TYPE=ins;VARB=0.00520242;OID=.;OPOS=47613167;OREF=-;OALT=TA;OMAPALT=GTA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:6:14:7:8:1:3:4:1:0:6:7:2:4:5:2 chr21 47613623 . C T 255.84 PASS AO=131;DP=428;FAO=125;FDP=400;FR=.;FRO=275;FSAF=51;FSAR=74;FSRF=90;FSRR=185;FWDB=0.0724693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=43.6727;QD=2.55838;RBI=0.079434;REFB=-0.074086;REVB=-0.0325263;RO=265;SAF=47;SAR=84;SRF=100;SRR=165;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0234284;STB=0.558676;TYPE=snp;VARB=0.170077;OID=.;OPOS=47613623;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:428:400:265:275:131:125:84:47:100:165:74:51:90:185 chr21 47614469 . A C 435.34 PASS AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121775;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=250.214;QD=37.8553;RBI=0.0159697;REFB=0;REVB=-0.0103314;RO=0;SAF=39;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.5712e-06;OID=.;OPOS=47614469;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:46:46:0:0:46:46:7:39:0:0:7:39:0:0 chr21 47635176 . T C 85.41 PASS AO=16;DP=31;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.018109;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.6629;QD=10.6768;RBI=0.0185717;REFB=-0.0501747;REVB=-0.00411967;RO=13;SAF=6;SAR=10;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132778;STB=0.617837;TYPE=snp;VARB=0.0178856;OID=.;OPOS=47635176;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:31:32:13:15:16:17:10:6:7:6:11:6:9:6 chr21 47635627 . C G 210.81 PASS AO=22;DP=22;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0293937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.376;QD=36.663;RBI=0.0667747;REFB=0;REVB=0.0599573;RO=0;SAF=15;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.79751e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000370595;OID=.;OPOS=47635627;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:22:23:0:0:22:23:7:15:0:0:7:16:0:0 chr21 47641794 . C T 442.94 PASS AO=101;DP=199;FAO=101;FDP=198;FR=.;FRO=97;FSAF=44;FSAR=57;FSRF=43;FSRR=54;FWDB=0.0234836;FXX=0.00502487;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3208;QD=8.94835;RBI=0.0265552;REFB=-0.00173527;REVB=-0.0123976;RO=98;SAF=44;SAR=57;SRF=44;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0121453;STB=0.503809;TYPE=snp;VARB=0.00166479;OID=.;OPOS=47641794;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:199:198:98:97:101:101:57:44:44:54:57:44:43:54 chr21 47642609 . G A 134.59 PASS AO=41;DP=110;FAO=42;FDP=111;FR=.;FRO=69;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=35;FSRR=34;FWDB=0.00393116;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.907;QD=4.85003;RBI=0.0477998;REFB=-0.00775631;REVB=-0.0476378;RO=68;SAF=13;SAR=28;SRF=35;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225187;STB=0.612445;TYPE=snp;VARB=0.0169831;OID=.;OPOS=47642609;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:111:68:69:41:42:28:13:35:33:28:14:35:34 chr21 47650362 . C T 277.7 PASS AO=54;DP=94;FAO=55;FDP=96;FR=.;FRO=41;FSAF=22;FSAR=33;FSRF=13;FSRR=28;FWDB=-0.0371555;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.314;QD=11.5707;RBI=0.0402569;REFB=-0.000885428;REVB=0.0154949;RO=40;SAF=21;SAR=33;SRF=12;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0741964;STB=0.537432;TYPE=snp;VARB=0.000634355;OID=.;OPOS=47650362;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:94:96:40:41:54:55:33:21:12:28:33:22:13:28 chr21 47703649 . G A 2063.89 PASS AO=234;DP=258;FAO=248;FDP=257;FR=.;FRO=9;FSAF=148;FSAR=100;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=0.0175729;FXX=0.00387582;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.4747;QD=32.1229;RBI=0.0657391;REFB=-0.187681;REVB=0.0633469;RO=1;SAF=148;SAR=86;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00320941;STB=0.517548;TYPE=snp;VARB=0.00451065;OID=.;OPOS=47703649;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:258:257:1:9:234:248:86:148:1:0:100:148:1:8 chr21 47704896 . G A 1699.56 PASS AO=180;DP=182;FAO=180;FDP=180;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210777;FXX=0.0109884;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.284;QD=37.7679;RBI=0.0354686;REFB=-0.0169504;REVB=0.0285264;RO=0;SAF=88;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.22177e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000106825;OID=.;OPOS=47704896;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:182:180:0:0:180:180:92:88:0:0:91:89:0:0 chr21 47773103 . C A 243.41 PASS AO=53;DP=103;FAO=53;FDP=102;FR=.;FRO=49;FSAF=37;FSAR=16;FSRF=37;FSRR=12;FWDB=-0.0251275;FXX=0.0097078;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.265;QD=9.54541;RBI=0.0271514;REFB=-0.0260117;REVB=0.0102863;RO=49;SAF=37;SAR=16;SRF=37;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0606221;STB=0.533321;TYPE=snp;VARB=0.0223048;OID=.;OPOS=47773103;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:102:49:49:53:53:16:37:37:12:16:37:37:12 chr21 47777063 . G A 1056.69 PASS AO=114;DP=116;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00316674;FXX=0.0172399;HRUN=3;LEN=1;MLLD=270.399;QD=37.077;RBI=0.00349661;REFB=-0.00808675;REVB=-0.00148257;RO=2;SAF=61;SAR=53;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0153126;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.73034e-06;OID=.;OPOS=47777063;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:116:114:2:0:114:114:53:61:2:0:53:61:0:0 chr21 47783796 . T C 220.97 PASS AO=23;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0848203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.4894;QD=36.8288;RBI=0.0855595;REFB=0;REVB=0.0112229;RO=0;SAF=9;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84921e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00167733;OID=.;OPOS=47783796;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:24:24:0:0:23:24:14:9:0:0:14:10:0:0 chr21 47786817 . C G 1434.55 PASS AO=151;DP=152;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174361;FXX=0.0558972;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.7189;QD=37.7512;RBI=0.0629507;REFB=-0.11434;REVB=0.0604878;RO=0;SAF=83;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00033914;OID=.;OPOS=47786817;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:152:152:0:0:151:152:68:83:0:0:68:84:0:0 chr21 47787002 . T C 680.28 PASS AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000951732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.123;QD=37.7932;RBI=0.0291324;REFB=0;REVB=0.0291168;RO=0;SAF=33;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.93089e-05;OID=.;OPOS=47787002;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:72:72:0:0:72:72:39:33:0:0:39:33:0:0 chr21 47811272 . C T 106.8 PASS AO=13;DP=14;FAO=13;FDP=14;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.9706;QD=30.5133;RBI=0.00965144;REFB=-0.0947252;REVB=0.00965144;RO=1;SAF=0;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00764224;OID=.;OPOS=47811272;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:14:14:1:1:13:13:13:0:0:1:13:0:0:1 chr21 47836653 . C T 27.87 PASS AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.0164262;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.1378;QD=5.5749;RBI=0.0258264;REFB=0.0134878;REVB=0.0199294;RO=13;SAF=3;SAR=4;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.272725;STB=0.666222;TYPE=snp;VARB=-0.0205799;OID=.;OPOS=47836653;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:20:20:13:13:7:7:4:3:9:4:4:3:9:4 chr21 47850484 . G C 412.44 PASS AO=27;DP=66;FAO=57;FDP=59;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0235888;FXX=0.106045;HRUN=4;LEN=1;MLLD=159.343;QD=27.9621;RBI=0.147384;REFB=-0.120547;REVB=0.145484;RO=0;SAF=26;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517851;TYPE=snp;VARB=0.00554193;OID=.;OPOS=47850484;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:30:59:0:2:27:57:1:26:0:0:30:27:2:0 chr21 47851753 . A G 401.89 PASS AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00413259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.587;QD=37.3854;RBI=0.00961725;REFB=0;REVB=-0.00868408;RO=0;SAF=15;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.13648e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.40126e-05;OID=.;OPOS=47851753;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:42:43:0:0:42:43:27:15:0:0:27:16:0:0 chr21 47863757 . A C 99.2 PASS AO=30;DP=78;FAO=30;FDP=79;FR=.;FRO=49;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=35;FWDB=-0.0292112;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.068;QD=5.02272;RBI=0.0392953;REFB=0.00249878;REVB=0.0262836;RO=48;SAF=14;SAR=16;SRF=14;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193212;STB=0.614387;TYPE=snp;VARB=-0.00420277;OID=.;OPOS=47863757;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:79:48:49:30:30:16:14:14:34:16:14:14:35 chr21 47910523 . A G 120.55 PASS AO=23;DP=41;FAO=23;FDP=41;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.0170051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.749;QD=11.7612;RBI=0.0211885;REFB=-0.0474533;REVB=-0.0126404;RO=17;SAF=14;SAR=9;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0163236;STB=0.501113;TYPE=snp;VARB=0.0234123;OID=.;OPOS=47910523;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:41:41:17:18:23:23:9:14:10:7:9:14:11:7 chr21 47945533 . GCTC G 142.54 PASS AO=38;DP=91;FAO=38;FDP=89;FR=.;FRO=51;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=28;FSRR=23;FWDB=0.00215962;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=3;MLLD=246.414;QD=6.40606;RBI=0.00653936;REFB=-0.0115646;REVB=-0.00617246;RO=50;SAF=22;SAR=16;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0602837;STB=0.517482;TYPE=del;VARB=0.0147643;OID=.;OPOS=47945534;OREF=CTC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:38:90:38:89:51:22:16:28:23:99:50:22:16:26:24 chr21 47955719 . A G 370.94 PASS AO=38;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0403794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.617;QD=38.0455;RBI=0.110213;REFB=0;REVB=0.10255;RO=0;SAF=25;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000366342;OID=.;OPOS=47955719;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:39:39:0:0:38:39:13:25:0:0:14:25:0:0 chr21 47959692 . G A 162.41 PASS AO=39;DP=77;FAO=37;FDP=75;FR=.;FRO=38;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=0.0201863;FXX=0.0259707;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.5348;QD=8.66201;RBI=0.0206778;REFB=-0.0375411;REVB=0.00448171;RO=38;SAF=22;SAR=17;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0374208;STB=0.53317;TYPE=snp;VARB=0.0385353;OID=.;OPOS=47959692;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:75:38:38:39:37:17:22:23:15:17:20:23:15 chr21 47959698 . C T 225.41 PASS AO=46;DP=84;FAO=46;FDP=83;FR=.;FRO=37;FSAF=29;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=0.00976054;FXX=0.0119033;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.622;QD=10.863;RBI=0.0356215;REFB=-0.0376844;REVB=0.0342582;RO=37;SAF=29;SAR=17;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0308834;STB=0.516984;TYPE=snp;VARB=0.0273386;OID=.;OPOS=47959698;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:83:37:37:46:46:17:29:22:15:17:29:22:15 chr21 47959731 . C G 125.61 PASS AO=35;DP=85;FAO=35;FDP=86;FR=.;FRO=51;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=31;FSRR=20;FWDB=-0.00503334;FXX=0.0444395;HRUN=4;LEN=1;MLLD=171.736;QD=5.84243;RBI=0.0101564;REFB=-0.0112167;REVB=-0.00882146;RO=49;SAF=18;SAR=17;SRF=29;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0802856;STB=0.555672;TYPE=snp;VARB=0.0119146;OID=.;OPOS=47959731;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:86:49:51:35:35:17:18:29:20:17:18:31:20 chr21 47961711 . G A 534.6 PASS AO=138;DP=298;FAO=138;FDP=298;FR=.;FRO=160;FSAF=59;FSAR=79;FSRF=65;FSRR=95;FWDB=-0.00090374;FXX=0.00334437;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2178;QD=7.1758;RBI=0.0142241;REFB=-0.0191589;REVB=-0.0141953;RO=159;SAF=59;SAR=79;SRF=64;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0249013;STB=0.511712;TYPE=snp;VARB=0.0219675;OID=.;OPOS=47961711;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:298:298:159:160:138:138:79:59:64:95:79:59:65:95 chr21 47978321 . G GC 1020.6 PASS AO=100;DP=133;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0853305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=27.4958;QD=30.9274;RBI=0.13569;REFB=0;REVB=0.105502;RO=3;SAF=62;SAR=38;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00273635;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.000254739;OID=.;OPOS=47978322;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:100:133:132:132:0:72:60:0:0:90:3:62:38:2:1 chr21 48022230 . C G 245.52 PASS AO=55;DP=108;FAO=55;FDP=108;FR=.;FRO=53;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=28;FSRR=25;FWDB=-0.0222399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.477;QD=9.09322;RBI=0.0325697;REFB=-0.00504182;REVB=-0.0237944;RO=53;SAF=28;SAR=27;SRF=28;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170911;STB=0.509431;TYPE=snp;VARB=0.00459356;OID=.;OPOS=48022230;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:53:53:55:55:27:28:28:25:27:28:28:25 chr21 48063476 . C G 329.91 PASS AO=78;DP=159;FAO=78;FDP=159;FR=.;FRO=81;FSAF=27;FSAR=51;FSRF=29;FSRR=52;FWDB=0.0274489;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.758;QD=8.2997;RBI=0.0437631;REFB=0.00292789;REVB=-0.0340847;RO=80;SAF=27;SAR=51;SRF=29;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0164826;STB=0.506651;TYPE=snp;VARB=-0.00414878;OID=.;OPOS=48063476;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:159:80:81:78:78:51:27:29:51:51:27:29:52 chr21 48084820 . C G 376.97 PASS AO=102;DP=232;FAO=103;FDP=235;FR=.;FRO=132;FSAF=47;FSAR=56;FSRF=35;FSRR=97;FWDB=-0.0416844;FXX=0.00843846;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.897;QD=6.41646;RBI=0.0420885;REFB=-0.005335;REVB=-0.00581833;RO=129;SAF=47;SAR=55;SRF=35;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196138;STB=0.610266;TYPE=snp;VARB=0.00851202;OID=.;OPOS=48084820;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:235:129:132:102:103:55:47:35:94:56:47:35:97 chr22 16287511 . G A 46.5 PASS AO=7;DP=15;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0612122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.751;QD=10.942;RBI=0.0622875;REFB=-0.0670966;REVB=-0.0115242;RO=8;SAF=4;SAR=3;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0639024;STB=0.583142;TYPE=snp;VARB=0.105824;OID=.;OPOS=16287511;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:15:17:8:8:7:9:3:4:4:4:3:6:4:4 chr22 17072483 . A G 1009.78 PASS AO=108;DP=110;FAO=108;FDP=110;FR=.;FRO=2;FSAF=67;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0142886;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.825;QD=36.7192;RBI=0.0537595;REFB=-0.0376932;REVB=-0.0518259;RO=2;SAF=67;SAR=41;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0225875;STB=0.511903;TYPE=snp;VARB=8.33405e-05;OID=.;OPOS=17072483;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:110:110:2:2:108:108:41:67:0:2:41:67:0:2 chr22 17073066 . A G 266.03 PASS AO=17;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0454606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.154;QD=38.0036;RBI=0.083599;REFB=0;REVB=0.0701579;RO=0;SAF=16;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00165852;OID=.;OPOS=17073066;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:27:28:0:0:17:27:1:16:0:0:10:17:0:0 chr22 17264565 . G T 1903 PASS AO=198;DP=198;FAO=198;FDP=198;FR=.;FRO=0;FSAF=102;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0175309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.937;QD=38.4444;RBI=0.0258349;REFB=0;REVB=0.0189766;RO=0;SAF=102;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.49785e-06;OID=.;OPOS=17264565;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:198:198:0:0:198:198:96:102:0:0:96:102:0:0 chr22 17265124 . A C 1055.51 PASS AO=111;DP=112;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00180802;FXX=0.00892777;HRUN=5;LEN=1;MLLD=238.034;QD=38.0364;RBI=0.0212535;REFB=0;REVB=0.0211764;RO=0;SAF=54;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.40739e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.3716e-05;OID=.;OPOS=17265124;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:112:111:0:0:111:111:57:54:0:0:57:54:0:0 chr22 17446157 . G T 180.22 PASS AO=34;DP=68;FAO=40;FDP=78;FR=.;FRO=38;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=26;FWDB=0.045943;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=37.6842;QD=9.24193;RBI=0.0460062;REFB=-0.0661212;REVB=-0.00241134;RO=34;SAF=15;SAR=19;SRF=11;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108876;STB=0.601096;TYPE=snp;VARB=0.077109;OID=.;OPOS=17446157;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:78:34:38:34:40:19:15:11:23:19:21:12:26 chr22 17446991 . C T 622.27 PASS AO=74;DP=78;FAO=72;FDP=75;FR=.;FRO=3;FSAF=59;FSAR=13;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.121034;FXX=0.0384566;HRUN=3;LEN=1;MLLD=38.4013;QD=33.1879;RBI=0.127847;REFB=-0.23891;REVB=0.0411775;RO=4;SAF=61;SAR=13;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0300176;STB=0.512393;TYPE=snp;VARB=0.0159612;OID=.;OPOS=17446991;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:78:75:4:3:74:72:13:61:4:0:13:59:3:0 chr22 17450929 . C T 275 PASS AO=49;DP=80;FAO=49;FDP=79;FR=.;FRO=30;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=0.0473396;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.089;QD=13.9239;RBI=0.0485368;REFB=-0.033684;REVB=0.0107137;RO=30;SAF=26;SAR=23;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0252695;STB=0.513761;TYPE=snp;VARB=0.0266054;OID=.;OPOS=17450929;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:79:30:30:49:49:23:26:17:13:23:26:17:13 chr22 17450952 . A G 169.3 PASS AO=39;DP=76;FAO=39;FDP=77;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=0.0133879;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=35.0834;QD=8.79482;RBI=0.0185344;REFB=-0.080626;REVB=-0.0128174;RO=37;SAF=19;SAR=20;SRF=14;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0959575;STB=0.545735;TYPE=snp;VARB=0.0700092;OID=.;OPOS=17450952;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:76:77:37:38:39:39:20:19:14:23:20:19:15:23 chr22 17469026 . G A 105.56 PASS AO=26;DP=58;FAO=26;FDP=58;FR=.;FRO=32;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=-0.00641101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.282;QD=7.2802;RBI=0.00887302;REFB=-0.030541;REVB=0.00613428;RO=31;SAF=6;SAR=20;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219043;STB=0.618793;TYPE=snp;VARB=0.0324671;OID=.;OPOS=17469026;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:31:32:26:26:20:6:13:18:20:6:13:19 chr22 17690409 . G A 261.98 PASS AO=61;DP=126;FAO=62;FDP=127;FR=.;FRO=65;FSAF=3;FSAR=59;FSRF=13;FSRR=52;FWDB=0.0708714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.389;QD=8.25117;RBI=0.071382;REFB=0.00915074;REVB=0.00852261;RO=64;SAF=3;SAR=58;SRF=13;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.418443;STB=0.739128;TYPE=snp;VARB=-0.00919068;OID=.;OPOS=17690409;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:127:64:65:61:62:58:3:13:51:59:3:13:52 chr22 17690430 . C G 204.23 PASS AO=51;DP=111;FAO=51;FDP=111;FR=.;FRO=60;FSAF=10;FSAR=41;FSRF=5;FSRR=55;FWDB=0.027463;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=133.268;QD=7.35953;RBI=0.0295532;REFB=-0.003761;REVB=0.0109168;RO=51;SAF=10;SAR=41;SRF=3;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230828;STB=0.609488;TYPE=snp;VARB=0.00589407;OID=.;OPOS=17690430;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:51:60:51:51:41:10:3:48:41:10:5:55 chr22 17990852 . G A 195.24 PASS AO=49;DP=110;FAO=50;FDP=111;FR=.;FRO=61;FSAF=17;FSAR=33;FSRF=25;FSRR=36;FWDB=-0.00923975;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.694;QD=7.03575;RBI=0.00928591;REFB=-0.00534578;REVB=0.000924646;RO=59;SAF=16;SAR=33;SRF=24;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0860466;STB=0.541601;TYPE=snp;VARB=0.00387346;OID=.;OPOS=17990852;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:111:59:61:49:50:33:16:24:35:33:17:25:36 chr22 18029102 . AG A 24.71 PASS AO=7;DP=24;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=-0.0688641;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=12.0779;QD=4.29797;RBI=0.326833;REFB=-0.0273705;REVB=-0.319496;RO=11;SAF=3;SAR=4;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0.355556;SSSB=-0.381916;STB=0.650906;TYPE=del;VARB=-0.0171483;OID=.;OPOS=18029103;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:7:20:11:23:12:5:6:9:3:24:11:3:4:9:2 chr22 18111431 . T C 101.57 PASS AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.0119654;FXX=0.0434688;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.996;QD=9.23331;RBI=0.0424596;REFB=-0.0107821;REVB=0.0407388;RO=22;SAF=5;SAR=17;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199395;STB=0.61329;TYPE=snp;VARB=0.0100872;OID=.;OPOS=18111431;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:45:44:22:22:22:22:17:5:9:13:17:5:9:13 chr22 18165995 . T G 159.28 PASS AO=45;DP=109;FAO=45;FDP=109;FR=.;FRO=64;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=21;FSRR=43;FWDB=-0.00673416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.482;QD=5.84512;RBI=0.0480537;REFB=-0.0291185;REVB=0.0475795;RO=64;SAF=20;SAR=25;SRF=21;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124998;STB=0.5702;TYPE=snp;VARB=0.0334829;OID=.;OPOS=18165995;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:64:64:45:45:25:20:21:43:25:20:21:43 chr22 18209613 . A G 27.59 PASS AO=10;DP=40;FAO=11;FDP=41;FR=.;FRO=30;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=23;FWDB=-0.00490408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.7431;QD=2.69131;RBI=0.0434948;REFB=-0.0019709;REVB=-0.0432174;RO=29;SAF=2;SAR=8;SRF=6;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126113;STB=0.537507;TYPE=snp;VARB=0.00327074;OID=.;OPOS=18209613;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:40:41:29:30:10:11:8:2:6:23:8:3:7:23 chr22 18209718 . C T 84.47 PASS AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.00529887;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.694;QD=9.38535;RBI=0.00647238;REFB=-0.00978326;REVB=-0.00371666;RO=18;SAF=10;SAR=8;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0499439;STB=0.528271;TYPE=snp;VARB=0.00896965;OID=.;OPOS=18209718;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:37:36:18:18:18:18:8:10:11:7:8:10:11:7 chr22 18210704 . G C 2649.34 PASS AO=249;DP=252;FAO=284;FDP=284;FR=.;FRO=0;FSAF=128;FSAR=156;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0894748;FXX=0.00350865;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.787;QD=37.3147;RBI=0.0894897;REFB=0.0530218;REVB=-0.00162864;RO=0;SAF=93;SAR=156;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00181735;OID=.;OPOS=18210704;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:252:284:0:0:249:284:156:93:0:0:156:128:0:0 chr22 18220831 . A G 22.27 PASS AO=10;DP=42;FAO=10;FDP=42;FR=.;FRO=32;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=0.00889551;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=97.8771;QD=2.1211;RBI=0.0195794;REFB=0.000424519;REVB=-0.017442;RO=32;SAF=4;SAR=6;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0839014;STB=0.55329;TYPE=snp;VARB=-0.00722059;OID=.;OPOS=18220831;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:42:42:32:32:10:10:6:4:15:17:6:4:15:17 chr22 18300240 . T C 355.35 PASS AO=87;DP=189;FAO=89;FDP=190;FR=.;FRO=101;FSAF=56;FSAR=33;FSRF=54;FSRR=47;FWDB=-0.0146079;FXX=0.00523533;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.729;QD=7.48098;RBI=0.0156717;REFB=0.00775397;REVB=-0.00567546;RO=98;SAF=55;SAR=32;SRF=52;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101327;STB=0.552392;TYPE=snp;VARB=-0.00836064;OID=.;OPOS=18300240;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:190:98:101:87:89:32:55:52:46:33:56:54:47 chr22 18300594 . G A 100.21 PASS AO=20;DP=37;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.00383266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.0576;QD=10.8336;RBI=0.12882;REFB=-0.0427139;REVB=0.128763;RO=17;SAF=8;SAR=12;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201123;STB=0.612791;TYPE=snp;VARB=0.0424268;OID=.;OPOS=18300594;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:37:37:17:17:20:20:12:8:11:6:12:8:11:6 chr22 18300879 . G A 47.15 PASS AO=7;DP=11;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0876827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.462;QD=17.1439;RBI=0.0879334;REFB=0.0496965;REVB=-0.00663458;RO=4;SAF=1;SAR=6;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.31972;STB=0.691659;TYPE=snp;VARB=-0.0217226;OID=.;OPOS=18300879;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:11:11:4:4:7:7:6:1:2:2:6:1:2:2 chr22 18300924 . A ACG 11.53 PASS AO=2;DP=10;FAO=2;FDP=8;FR=.;FRO=6;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0;FXX=0.110988;HRUN=0;LEN=2;MLLD=155.359;QD=5.76278;RBI=0.0118699;REFB=-0.00306457;REVB=-0.0118699;RO=6;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.156099;OID=.;OPOS=18300925;OREF=-;OALT=CG;OMAPALT=ACG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:2:10:2:8:6:0:2:0:6:11:6:0:2:0:6 chr22 18300941 . G C 10.38 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=7;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.149;QD=5.93124;RBI=0.00274058;REFB=-0.00609688;REVB=-0.00274058;RO=5;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0102733;OID=.;OPOS=18300941;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:5:5:2:2:2:0:0:5:2:0:0:5 chr22 18364066 . G A 394.92 PASS AO=112;DP=264;FAO=112;FDP=262;FR=.;FRO=150;FSAF=48;FSAR=64;FSRF=70;FSRR=80;FWDB=-0.0479345;FXX=0.0113203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.1;QD=6.02936;RBI=0.0498913;REFB=0.000831148;REVB=-0.0138355;RO=142;SAF=48;SAR=64;SRF=63;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154704;STB=0.52212;TYPE=snp;VARB=-0.000918954;OID=.;OPOS=18364066;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:264:262:142:150:112:112:64:48:63:79:64:48:70:80 chr22 18443500 . G A 52.71 PASS AO=15;DP=41;FAO=15;FDP=41;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.00563405;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=187.792;QD=5.14256;RBI=0.0348045;REFB=-0.00900404;REVB=-0.0343455;RO=26;SAF=10;SAR=5;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14584;STB=0.586089;TYPE=snp;VARB=0.0243155;OID=.;OPOS=18443500;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:41:41:26:26:15:15:5:10:14:12:5:10:14:12 chr22 18566288 . C G 248.22 PASS AO=60;DP=125;FAO=60;FDP=125;FR=.;FRO=65;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=41;FSRR=24;FWDB=-0.0150838;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.111;QD=7.94301;RBI=0.01524;REFB=0.00293008;REVB=-0.00217636;RO=55;SAF=30;SAR=30;SRF=31;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0553205;STB=0.567978;TYPE=snp;VARB=-0.00109799;OID=.;OPOS=18566288;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:125:55:65:60:60:30:30:31:24:30:30:41:24 chr22 18571008 . G A 190 PASS AO=46;DP=97;FAO=47;FDP=99;FR=.;FRO=52;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=28;FSRR=24;FWDB=0.0144852;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.842;QD=7.67659;RBI=0.0145685;REFB=-0.0102227;REVB=-0.00155598;RO=51;SAF=24;SAR=22;SRF=27;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00726239;STB=0.514624;TYPE=snp;VARB=0.0152634;OID=.;OPOS=18571008;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:99:51:52:46:47:22:24:27:24:23:24:28:24 chr22 18571828 . T C 166.23 PASS AO=30;DP=50;FAO=30;FDP=50;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=26;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=-0.0318939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.188;QD=13.2983;RBI=0.0371158;REFB=-0.0200693;REVB=-0.0189831;RO=20;SAF=4;SAR=26;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157901;STB=0.587874;TYPE=snp;VARB=0.0152521;OID=.;OPOS=18571828;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:50:50:20:20:30:30:26:4:5:15:26:4:5:15 chr22 18572106 . T A 122.54 PASS AO=21;DP=35;FAO=21;FDP=33;FR=.;FRO=12;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=2;FWDB=0.000658237;FXX=0.0571265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.82;QD=14.8536;RBI=0.0375094;REFB=-0.0196514;REVB=0.0375036;RO=11;SAF=12;SAR=9;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16134;STB=0.599911;TYPE=snp;VARB=0.00746651;OID=.;OPOS=18572106;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:35:33:11:12:21:21:9:12:9:2:9:12:10:2 chr22 18628715 . C T 1051.75 PASS AO=110;DP=112;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173035;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.677;QD=37.2302;RBI=0.02109;REFB=0;REVB=0.0120572;RO=1;SAF=38;SAR=72;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0123279;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000109643;OID=.;OPOS=18628715;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:112:113:1:0:110:113:72:38:1:0:73:40:0:0 chr22 18650682 . C T 365.9 PASS AO=100;DP=228;FAO=100;FDP=228;FR=.;FRO=128;FSAF=40;FSAR=60;FSRF=69;FSRR=59;FWDB=0.0122651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.307;QD=6.41924;RBI=0.0232287;REFB=-0.00311681;REVB=0.0197267;RO=128;SAF=40;SAR=60;SRF=69;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141579;STB=0.578745;TYPE=snp;VARB=0.00414725;OID=.;OPOS=18650682;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:228:228:128:128:100:100:60:40:69:59:60:40:69:59 chr22 18835221 . A G 125.84 PASS AO=12;DP=12;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00114954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.566;QD=35.9535;RBI=0.0625924;REFB=0;REVB=-0.0625819;RO=0;SAF=11;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.23983e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0004353;OID=.;OPOS=18835221;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:12:14:0:0:12:14:1:11:0:0:2:12:0:0 chr22 18870920 . C T 15.36 PASS AO=3;DP=9;FAO=3;FDP=9;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0300801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.634;QD=6.82569;RBI=0.161953;REFB=-0.00213347;REVB=0.159135;RO=6;SAF=2;SAR=1;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208152;STB=0.635588;TYPE=snp;VARB=0.0116848;OID=.;OPOS=18870920;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:9:9:6:6:3:3:1:2:5:1:1:2:5:1 chr22 18870940 . C A 15.21 PASS AO=4;DP=15;FAO=4;FDP=15;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.0237943;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.5053;QD=4.05693;RBI=0.0355126;REFB=-0.0178332;REVB=0.0263624;RO=11;SAF=3;SAR=1;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145094;STB=0.599467;TYPE=snp;VARB=0.0139218;OID=.;OPOS=18870940;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:15:15:11:11:4:4:1:3:7:4:1:3:7:4 chr22 18870956 . G A 21.5 PASS AO=6;DP=20;FAO=6;FDP=20;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0320834;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=156.587;QD=4.29962;RBI=0.032844;REFB=-0.00842272;REVB=0.00702771;RO=14;SAF=3;SAR=3;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0784305;STB=0.549835;TYPE=snp;VARB=0.0163068;OID=.;OPOS=18870956;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:20:20:14:14:6:6:3:3:8:6:3:3:8:6 chr22 18870974 . T G 39.25 PASS AO=11;DP=28;FAO=10;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.0367585;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.0887;QD=5.81462;RBI=0.0665721;REFB=-0.0195841;REVB=-0.0555036;RO=16;SAF=4;SAR=7;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201167;STB=0.683837;TYPE=snp;VARB=0.0304687;OID=.;OPOS=18870974;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:28:27:16:17:11:10:7:4:9:7:7:3:10:7 chr22 18900750 . G A 76.37 PASS AO=12;DP=23;FAO=14;FDP=23;FR=.;FRO=9;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.0268237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.0094;QD=13.2825;RBI=0.0718481;REFB=0.00440079;REVB=0.0666532;RO=9;SAF=10;SAR=2;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189337;STB=0.564005;TYPE=snp;VARB=0.000685189;OID=.;OPOS=18900750;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:23:23:9:9:12:14:2:10:6:3:3:11:6:3 chr22 18901004 . C T 173.79 PASS AO=19;DP=20;FAO=19;FDP=20;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0297091;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=131.595;QD=34.7583;RBI=0.0545242;REFB=-0.0896029;REVB=0.0457194;RO=0;SAF=7;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.533298;TYPE=snp;VARB=0.00262759;OID=.;OPOS=18901004;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:0:1:19:19:12:7:0:0:12:7:1:0 chr22 18904414 . A G 210.58 PASS AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0664221;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.0908;QD=36.6226;RBI=0.0678671;REFB=0;REVB=0.0139297;RO=0;SAF=10;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00250433;OID=.;OPOS=18904414;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:0:0:23:23:13:10:0:0:13:10:0:0 chr22 18905842 . C T 106.09 PASS AO=27;DP=62;FAO=27;FDP=62;FR=.;FRO=35;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.0556115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.7188;QD=6.84461;RBI=0.0677177;REFB=-0.014225;REVB=-0.03864;RO=35;SAF=18;SAR=9;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214936;STB=0.62213;TYPE=snp;VARB=0.0185769;OID=.;OPOS=18905842;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:35:35:27:27:9:18:16:19:9:18:16:19 chr22 18905978 . G A 114.04 PASS AO=22;DP=40;FAO=22;FDP=40;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.0245438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.901;QD=11.404;RBI=0.0316493;REFB=-0.0211428;REVB=0.0199819;RO=17;SAF=8;SAR=14;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0598506;STB=0.514838;TYPE=snp;VARB=0.0194895;OID=.;OPOS=18905978;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:40:40:17:18:22:22:14:8:5:12:14:8:6:12 chr22 18907124 . G A 32.94 PASS AO=10;DP=36;FAO=11;FDP=36;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=-0.0259683;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=165.825;QD=3.66014;RBI=0.026362;REFB=-0.00824086;REVB=-0.00453948;RO=15;SAF=7;SAR=3;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181314;STB=0.70979;TYPE=snp;VARB=0.0144261;OID=.;OPOS=18907124;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:30:36:15:25:10:11:3:7:8:7:4:7:8:17 chr22 18908875 . A G 437.47 PASS AO=39;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.158563;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7681;QD=38.0405;RBI=0.163065;REFB=0;REVB=-0.0380553;RO=0;SAF=14;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00215485;OID=.;OPOS=18908875;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:46:46:0:0:39:46:25:14:0:0:26:20:0:0 chr22 18912678 . A G 781.28 PASS AO=83;DP=83;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.0118;QD=37.2038;RBI=0.0166686;REFB=0;REVB=0.00987967;RO=0;SAF=30;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00232879;OID=.;OPOS=18912678;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:83:84:0:0:83:84:53:30:0:0:54:30:0:0 chr22 19026613 . A G 353.92 PASS AO=41;DP=43;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0325145;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.7198;QD=33.7064;RBI=0.11172;REFB=-0.160761;REVB=-0.106884;RO=1;SAF=15;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0302497;STB=0.516121;TYPE=snp;VARB=0.00290873;OID=.;OPOS=19026613;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:43:42:1:1:41:41:26:15:1:0:26:15:1:0 chr22 19032878 . T TAAAC 50 PASS AO=111;DP=195;LEN=4;RO=84;SAF=61;SAR=69;SRF=30;SRR=35;TYPE=ins;FR=.;OID=.;OPOS=19032879;OREF=-;OALT=AAAC;OMAPALT=TAAAC GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR 0/1:99:195:84:111:69:61:30:35 chr22 19034240 . A G 671.57 PASS AO=58;DP=63;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.967;QD=38.3753;RBI=0.093619;REFB=0;REVB=0.0921901;RO=0;SAF=35;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000780033;OID=.;OPOS=19034240;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:63:70:0:0:58:70:23:35:0:0:33:37:0:0 chr22 19048413 . A G 1114.22 PASS AO=115;DP=117;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0545212;FXX=0.0169477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.841;QD=38.4213;RBI=0.0686942;REFB=0;REVB=0.041789;RO=0;SAF=53;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19391e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000182218;OID=.;OPOS=19048413;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:117:116:0:0:115:116:62:53:0:0:62:54:0:0 chr22 19048436 . G A 1091.29 PASS AO=118;DP=121;FAO=119;FDP=121;FR=.;FRO=2;FSAF=55;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0660259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.597;QD=36.0757;RBI=0.0661207;REFB=-0.13954;REVB=0.00353946;RO=2;SAF=55;SAR=63;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0148378;STB=0.507691;TYPE=snp;VARB=0.000678663;OID=.;OPOS=19048436;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:121:121:2:2:118:119:63:55:0:2:64:55:0:2 chr22 19163577 . C CAT 183.26 PASS AO=42;DP=99;FAO=45;FDP=96;FR=.;FRO=51;FSAF=32;FSAR=13;FSRF=32;FSRR=19;FWDB=0.00544008;FXX=0.0204061;HRUN=0;LEN=2;MLLD=226.404;QD=7.63575;RBI=0.00577564;REFB=-0.034482;REVB=-0.00193999;RO=53;SAF=30;SAR=12;SRF=32;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125836;STB=0.5517;TYPE=ins;VARB=0.0393377;OID=.;OPOS=19163578;OREF=-;OALT=AT;OMAPALT=CAT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:42:99:45:96:51:32:13:32:19:99:53:30:12:32:21 chr22 19167385 . C A 385.6 PASS AO=69;DP=169;FAO=86;FDP=168;FR=.,HEALED;FRO=82;FSAF=24;FSAR=62;FSRF=25;FSRR=57;FWDB=0.0634543;FXX=0.00591681;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.4473;QD=9.181;RBI=0.0996713;REFB=0.0191771;REVB=-0.076863;RO=69;SAF=23;SAR=46;SRF=23;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.515436;TYPE=snp;VARB=-0.0196868;OID=.;OPOS=19167385;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:168:69:82:69:86:46:23:23:46:62:24:25:57 chr22 19167409 . T C 387.61 PASS AO=86;DP=167;FAO=87;FDP=169;FR=.;FRO=82;FSAF=27;FSAR=60;FSRF=26;FSRR=56;FWDB=-0.00484773;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.295;QD=9.17408;RBI=0.0101978;REFB=-0.0105012;REVB=-0.0089719;RO=81;SAF=27;SAR=59;SRF=25;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00546113;STB=0.503801;TYPE=snp;VARB=0.00819447;OID=.;OPOS=19167409;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:169:81:82:86:87:59:27:25:56:60:27:26:56 chr22 19167436 . G A 280.2 PASS AO=67;DP=140;FAO=68;FDP=142;FR=.;FRO=74;FSAF=25;FSAR=43;FSRF=26;FSRR=48;FWDB=-0.0138698;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.9873;QD=7.89293;RBI=0.0152744;REFB=-0.00822022;REVB=0.00639809;RO=73;SAF=24;SAR=43;SRF=26;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00209576;STB=0.509174;TYPE=snp;VARB=0.0120354;OID=.;OPOS=19167436;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:142:73:74:67:68:43:24:26:47:43:25:26:48 chr22 19172006 . T C 225.03 PASS AO=52;DP=114;FAO=55;FDP=116;FR=.;FRO=61;FSAF=36;FSAR=19;FSRF=27;FSRR=34;FWDB=-0.0265017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.432;QD=7.75961;RBI=0.0269912;REFB=-0.0330641;REVB=0.00511694;RO=57;SAF=33;SAR=19;SRF=24;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203363;STB=0.61445;TYPE=snp;VARB=0.0246709;OID=.;OPOS=19172006;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:116:57:61:52:55:19:33:24:33:19:36:27:34 chr22 19184095 . T C 217.5 PASS AO=50;DP=102;FAO=50;FDP=101;FR=.;FRO=51;FSAF=5;FSAR=45;FSRF=6;FSRR=45;FWDB=-0.0416975;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.119;QD=8.61371;RBI=0.043345;REFB=-0.0235231;REVB=0.0118365;RO=51;SAF=5;SAR=45;SRF=6;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0428198;STB=0.5238;TYPE=snp;VARB=0.0293815;OID=.;OPOS=19184095;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:101:51:51:50:50:45:5:6:45:45:5:6:45 chr22 19189003 . A AC,C 653.58 PASS AO=46,23;DP=70;FAO=70,0;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=32,0;FSAR=38,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0578558,-0.266979;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=1,1;MLLD=23.8971,6.43749;QD=37.3474;RBI=0.141032,0.26922;REFB=0,0;REVB=0.128619,0.0346624;RO=1;SAF=11,21;SAR=35,2;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0132465,0.182988;STB=0.5,0.5;TYPE=ins,snp;VARB=0.00434552,0;OID=.,.;OPOS=19189004,19189003;OREF=-,A;OALT=C,C;OMAPALT=AC,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:70:70:1:0:46,23:70,0:35,2:11,21:0:1:38,0:32,0:0:0 chr22 19197896 . T C 278.3 PASS AO=60;DP=113;FAO=60;FDP=113;FR=.;FRO=53;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=22;FSRR=31;FWDB=-0.0329076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.733;QD=9.85127;RBI=0.0346677;REFB=-0.017239;REVB=0.010906;RO=53;SAF=28;SAR=32;SRF=22;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0443758;STB=0.524368;TYPE=snp;VARB=0.0139404;OID=.;OPOS=19197896;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:53:53:60:60:32:28:22:31:32:28:22:31 chr22 19420109 . T C 29.02 PASS AO=7;DP=18;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=1;FWDB=-0.000600076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.7527;QD=6.11049;RBI=0.118763;REFB=0.00283805;REVB=0.118761;RO=11;SAF=6;SAR=1;SRF=10;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119123;STB=0.585992;TYPE=snp;VARB=0.000929748;OID=.;OPOS=19420109;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:18:19:11:12:7:7:1:6:10:1:1:6:11:1 chr22 19423250 . G A 303.51 PASS AO=66;DP=129;FAO=67;FDP=129;FR=.;FRO=62;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=34;FSRR=28;FWDB=-0.00214006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.408;QD=9.41126;RBI=0.016095;REFB=-0.0270063;REVB=-0.015952;RO=61;SAF=33;SAR=33;SRF=34;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0501298;STB=0.526819;TYPE=snp;VARB=0.0221864;OID=.;OPOS=19423250;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:61:62:66:67:33:33:34:27:34:33:34:28 chr22 19458224 . C T 44.74 PASS AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=-0.0333639;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=264.967;QD=7.78045;RBI=0.0356566;REFB=-0.0063975;REVB=0.0125796;RO=12;SAF=1;SAR=9;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.274629;STB=0.654173;TYPE=snp;VARB=0.0110098;OID=.;OPOS=19458224;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:23:23:12:13:10:10:9:1:3:9:9:1:3:10 chr22 19750773 . T C 89.24 PASS AO=31;DP=77;FAO=30;FDP=77;FR=.;FRO=47;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=-0.0712008;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=32.9847;QD=4.63594;RBI=0.15022;REFB=-0.0521694;REVB=-0.132274;RO=44;SAF=16;SAR=15;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0068241;STB=0.500869;TYPE=snp;VARB=0.0851537;OID=.;OPOS=19750773;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:77:77:44:47:31:30:15:16:23:21:14:16:25:22 chr22 19751829 . C T 88.87 PASS AO=16;DP=27;FAO=16;FDP=27;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.0143448;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.9553;QD=13.1661;RBI=0.0426297;REFB=0.00198284;REVB=0.0401438;RO=11;SAF=7;SAR=9;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143451;STB=0.580545;TYPE=snp;VARB=0.00141921;OID=.;OPOS=19751829;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:27:27:11:11:16:16:9:7:7:4:9:7:7:4 chr22 19766782 . C T 137.52 PASS AO=39;DP=95;FAO=39;FDP=95;FR=.;FRO=56;FSAF=33;FSAR=6;FSRF=43;FSRR=13;FWDB=-0.0103445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.404;QD=5.7904;RBI=0.0452859;REFB=-0.0373183;REVB=-0.0440886;RO=53;SAF=33;SAR=6;SRF=42;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0965744;STB=0.578903;TYPE=snp;VARB=0.0513428;OID=.;OPOS=19766782;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:95:53:56:39:39:6:33:42:11:6:33:43:13 chr22 19808769 . C T 418.11 PASS AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0779051;FXX=0.083316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.1614;QD=38.0101;RBI=0.133942;REFB=0;REVB=0.108955;RO=0;SAF=22;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00131354;OID=.;OPOS=19808769;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:45:44:0:0:44:44:22:22:0:0:22:22:0:0 chr22 19865687 . TGG TG,T 150.67 PASS AO=16,4;DP=24;FAO=27,1;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=12,0;FSAR=15,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.329096,0.182658;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,2;MLLD=11.9665,11.8138;QD=21.5242;RBI=0.329109,0.182692;REFB=-0.01564,-0.0174744;REVB=0.00293567,0.00353135;RO=5;SAF=5,0;SAR=11,4;SRF=4;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.220785,-0.766476;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.00667858,-0.0291167;OID=.,.;OPOS=19865688,19865688;OREF=G,GG;OALT=-,-;OMAPALT=TG,T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:16,4:25:27,1:28:0:12,0:15,1:0:0:6:5:5,0:11,4:4:1 chr22 19867771 . C T 320.42 PASS AO=76;DP=162;FAO=76;FDP=157;FR=.;FRO=81;FSAF=47;FSAR=29;FSRF=44;FSRR=37;FWDB=0.0144971;FXX=0.0710017;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.496;QD=8.16355;RBI=0.0158168;REFB=-0.0173533;REVB=0.00632503;RO=68;SAF=47;SAR=29;SRF=41;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140651;STB=0.540313;TYPE=snp;VARB=0.0184266;OID=.;OPOS=19867771;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:157:68:81:76:76:29:47:41:27:29:47:44:37 chr22 19868218 . A G 34.07 PASS AO=9;DP=26;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=-0.0459178;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.765;QD=5.45081;RBI=0.0741469;REFB=0.00782579;REVB=-0.0582179;RO=16;SAF=5;SAR=4;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.318917;STB=0.689278;TYPE=snp;VARB=-0.0201341;OID=.;OPOS=19868218;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:26:25:16:16:9:9:4:5:4:12:4:5:4:12 chr22 19868255 . AG A 20.27 PASS AO=10;DP=27;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=15;FWDB=-0.0948887;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=11.3684;QD=2.89587;RBI=0.2795;REFB=0.0554327;REVB=0.2629;RO=16;SAF=5;SAR=5;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0.52381;SSSB=0.329711;STB=0.713935;TYPE=del;VARB=-0.0578243;OID=.;OPOS=19868256;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:10:28:10:28:18:5:5:3:15:20:16:5:5:3:13 chr22 19882984 . T G 83.37 PASS AO=22;DP=53;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.0230095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.621;QD=6.29195;RBI=0.0303921;REFB=-0.0158616;REVB=-0.0198556;RO=31;SAF=7;SAR=15;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.242561;STB=0.639302;TYPE=snp;VARB=0.0276127;OID=.;OPOS=19882984;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:53:53:31:31:22:22:15:7:17:14:15:7:17:14 chr22 19906511 . G A 119.62 PASS AO=39;DP=116;FAO=42;FDP=118;FR=.;FRO=76;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=49;FSRR=27;FWDB=-0.000805091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.612;QD=4.05474;RBI=0.0286975;REFB=0.000758302;REVB=0.0286862;RO=73;SAF=21;SAR=18;SRF=46;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105716;STB=0.578611;TYPE=snp;VARB=-0.00260808;OID=.;OPOS=19906511;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:118:73:76:39:42:18:21:46:27:20:22:49:27 chr22 19907118 . G A 215.28 PASS AO=54;DP=120;FAO=55;FDP=121;FR=.;FRO=66;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=22;FSRR=44;FWDB=0.00973777;FXX=0.0162588;HRUN=3;LEN=1;MLLD=204.058;QD=7.11683;RBI=0.0274053;REFB=-0.00155092;REVB=0.0256169;RO=64;SAF=27;SAR=27;SRF=22;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152542;STB=0.586218;TYPE=snp;VARB=0.00144798;OID=.;OPOS=19907118;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:121:64:66:54:55:27:27:22:42:28:27:22:44 chr22 19921003 . T C 105.81 PASS AO=29;DP=71;FAO=29;FDP=71;FR=.;FRO=42;FSAF=3;FSAR=26;FSRF=6;FSRR=36;FWDB=-0.0884452;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.782;QD=5.96087;RBI=0.0903037;REFB=0.00667589;REVB=0.0182264;RO=42;SAF=3;SAR=26;SRF=6;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0992979;STB=0.5571;TYPE=snp;VARB=-0.0149388;OID=.;OPOS=19921003;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:42:42:29:29:26:3:6:36:26:3:6:36 chr22 19950235 . C T 651.47 PASS AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0198658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.08;QD=38.3219;RBI=0.0291631;REFB=0;REVB=0.0213504;RO=0;SAF=36;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.49594e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000106739;OID=.;OPOS=19950235;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:68:68:0:0:68:68:32:36:0:0:32:36:0:0 chr22 19951271 . G A 571.46 PASS AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0424193;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.26;QD=38.7428;RBI=0.0440662;REFB=0;REVB=0.0119346;RO=0;SAF=37;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000162586;OID=.;OPOS=19951271;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:59:59:0:0:59:59:22:37:0:0:22:37:0:0 chr22 19959473 . C T 368.89 PASS AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0946973;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.18;QD=35.1324;RBI=0.104604;REFB=-0.115782;REVB=0.0444342;RO=0;SAF=12;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50847;TYPE=snp;VARB=0.00235623;OID=.;OPOS=19959473;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:42:42:0:1:41:41:29:12:0:0:29:12:0:1 chr22 19959955 . A G 769.62 PASS AO=78;DP=78;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0310977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.374;QD=38.4811;RBI=0.0320508;REFB=0;REVB=0.00775815;RO=0;SAF=18;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000111588;OID=.;OPOS=19959955;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:78:80:0:0:78:80:60:18:0:0:62:18:0:0 chr22 19968971 . G A 43.19 PASS AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0474909;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=214.071;QD=11.5178;RBI=0.0475304;REFB=-0.00771452;REVB=-0.0019368;RO=7;SAF=3;SAR=5;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0775671;STB=0.545344;TYPE=snp;VARB=0.0114219;OID=.;OPOS=19968971;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:15:15:7:7:8:8:5:3:2:5:5:3:2:5 chr22 19969075 . A G 136.31 PASS AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.6871;QD=36.3483;RBI=0.0656334;REFB=0;REVB=-0.0643139;RO=0;SAF=7;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00144143;OID=.;OPOS=19969075;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:15:0:0:15:15:8:7:0:0:8:7:0:0 chr22 19969106 . A G 113.37 PASS AO=17;DP=23;FAO=17;FDP=23;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=-0.0327228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.683;QD=19.716;RBI=0.0668616;REFB=-0.0843233;REVB=0.0583069;RO=6;SAF=4;SAR=13;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0463034;STB=0.525518;TYPE=snp;VARB=0.027848;OID=.;OPOS=19969106;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:23:23:6:6:17:17:13:4:1:5:13:4:1:5 chr22 20040881 . AGG AG,A 583.3 PASS AO=21,24;DP=70;FAO=0,81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=0,48;FSAR=0,33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.736448,0.373077;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,2;MLLD=13.0315,23.7242;QD=28.8049;RBI=0.739116,0.37463;REFB=0,0;REVB=-0.0627395,-0.0340753;RO=3;SAF=21,3;SAR=0,21;SRF=3;SRR=0;SSEN=0.30137,0.30137;SSEP=0,0;SSSB=0,-0.303348;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.072335,0.0184608;OID=.,.;OPOS=20040882,20040882;OREF=G,GG;OALT=-,-;OMAPALT=AG,A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:21,24:67:0,81:81:0:0,48:0,33:0:0:49:3:21,3:0,21:3:0 chr22 20100162 . TGG T 133.8 PASS AO=17;DP=70;FAO=32;FDP=40;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=25;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.222213;FXX=0.0697512;HRUN=4;LEN=2;MLLD=19.6559;QD=13.3802;RBI=0.224635;REFB=-0.16406;REVB=-0.0328961;RO=3;SAF=0;SAR=17;SRF=0;SRR=3;SSEN=0.509542;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.54345;TYPE=del;VARB=0.114332;OID=.;OPOS=20100163;OREF=GG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:17:36:32:40:8:7:25:3:5:7:3:0:17:0:3 chr22 20133719 . C T 10.3 PASS AO=2;DP=8;FAO=2;FDP=8;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.0182756;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=85.0701;QD=5.14822;RBI=0.0182756;REFB=-0.00546861;REVB=0;RO=6;SAF=2;SAR=0;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0291077;OID=.;OPOS=20133719;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:8:6:6:2:2:0:2:6:0:0:2:6:0 chr22 20136263 . G A 188.24 PASS AO=21;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.171957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.561;QD=34.2254;RBI=0.193608;REFB=0;REVB=0.088966;RO=0;SAF=3;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00477585;OID=.;OPOS=20136263;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:22:22:0:0:21:22:18:3:0:0:18:4:0:0 chr22 20138099 . C G 13.03 PASS AO=5;DP=20;FAO=5;FDP=22;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=0;FSRF=17;FSRR=0;FWDB=-0.0304117;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.76;QD=2.36882;RBI=0.0304117;REFB=-0.0182066;REVB=0;RO=15;SAF=5;SAR=0;SRF=15;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.131986;OID=.;OPOS=20138099;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:20:22:15:17:5:5:0:5:15:0:0:5:17:0 chr22 20236668 . AG A 284.61 PASS AO=36;DP=47;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.235514;FXX=0.0454442;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.7183;QD=27.1055;RBI=0.2428;REFB=0;REVB=-0.0590361;RO=2;SAF=19;SAR=17;SRF=2;SRR=0;SSEN=0.565445;SSEP=0;SSSB=-0.0467499;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00922236;OID=.;OPOS=20236669;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:36:44:42:42:0:22:20:0:0:26:2:19:17:2:0 chr22 20640741 . G A 71.55 PASS AO=29;DP=94;FAO=29;FDP=95;FR=.;FRO=66;FSAF=0;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=66;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.715;QD=3.01269;RBI=0.013955;REFB=-0.0134767;REVB=0.013955;RO=65;SAF=0;SAR=29;SRF=0;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0140363;OID=.;OPOS=20640741;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:94:95:65:66:29:29:29:0:0:65:29:0:0:66 chr22 20640744 . G A 71.54 PASS AO=28;DP=93;FAO=29;FDP=95;FR=.;FRO=66;FSAF=0;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=66;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.762;QD=3.01239;RBI=0.00271525;REFB=-0.00935538;REVB=0.00271525;RO=65;SAF=0;SAR=28;SRF=0;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0734797;OID=.;OPOS=20640744;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:71:93:95:65:66:28:29:28:0:0:65:29:0:0:66 chr22 20640765 . C G 11.86 PASS AO=7;DP=39;FAO=7;FDP=39;FR=.;FRO=32;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=32;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.739;QD=1.21619;RBI=0.00755303;REFB=-0.00193442;REVB=-0.00755303;RO=32;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0152094;OID=.;OPOS=20640765;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:39:39:32:32:7:7:7:0:0:32:7:0:0:32 chr22 20640774 . GCCC GCC,GCCG 239.71 PASS AO=21,7;DP=31;FAO=23,7;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0;FSAR=23,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0,0;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=14.0459,227.318;QD=31.9617;RBI=0.184673,0.0221849;REFB=0,0;REVB=0.184673,0.0221849;RO=1;SAF=0,0;SAR=21,7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0.201342,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.068434,-0.00960037;OID=.,.;OPOS=20640775,20640777;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=GCC,GCCG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:21,7:30:23,7:30:0:0,0:23,7:0:0:17:1:0,0:21,7:0:1 chr22 20640792 . G C 10.48 PASS AO=4;DP=21;FAO=4;FDP=21;FR=.;FRO=17;FSAF=0;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=17;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=342.982;QD=1.99587;RBI=0.00877704;REFB=-0.00169217;REVB=-0.00877704;RO=17;SAF=0;SAR=4;SRF=0;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00730916;OID=.;OPOS=20640792;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:21:21:17:17:4:4:4:0:0:17:4:0:0:17 chr22 20729885 . C T 202.9 PASS AO=38;DP=67;FAO=39;FDP=68;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=29;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.0537573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.447;QD=11.9354;RBI=0.0584573;REFB=-0.0168505;REVB=-0.0229653;RO=29;SAF=9;SAR=29;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201421;STB=0.597082;TYPE=snp;VARB=0.00864554;OID=.;OPOS=20729885;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:68:29:29:38:39:29:9:13:16:29:10:13:16 chr22 20739059 . G C 204.89 PASS AO=41;DP=75;FAO=42;FDP=76;FR=.;FRO=34;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=-0.0142657;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.7532;QD=10.784;RBI=0.0422176;REFB=0.00147068;REVB=0.0397343;RO=34;SAF=21;SAR=20;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0824792;STB=0.549976;TYPE=snp;VARB=-0.000397882;OID=.;OPOS=20739059;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:76:34:34:41:42:20:21:14:20:20:22:14:20 chr22 20761063 . G A 406.82 PASS AO=65;DP=93;FAO=66;FDP=93;FR=.;FRO=27;FSAF=34;FSAR=32;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.0129244;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=41.4024;QD=17.4974;RBI=0.121105;REFB=-0.0594207;REVB=0.120413;RO=28;SAF=34;SAR=31;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012915;STB=0.500978;TYPE=snp;VARB=0.0439817;OID=.;OPOS=20761063;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:93:93:28:27:65:66:31:34:14:14:32:34:14:13 chr22 20771144 . A T 1387.44 PASS AO=145;DP=146;FAO=145;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00323383;FXX=0.00684885;HRUN=3;LEN=1;MLLD=123.077;QD=38.2742;RBI=0.0151693;REFB=0;REVB=0.0148205;RO=0;SAF=85;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.08887e-05;OID=.;OPOS=20771144;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:146:145:0:0:145:145:60:85:0:0:60:85:0:0 chr22 20784050 . T A 67.26 PASS AO=13;DP=24;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.0219106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.0145;QD=11.2104;RBI=0.029004;REFB=0.0183001;REVB=-0.0190041;RO=11;SAF=6;SAR=7;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00564475;STB=0.503221;TYPE=snp;VARB=-0.0139573;OID=.;OPOS=20784050;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:24:24:11:11:13:13:7:6:5:6:7:6:5:6 chr22 20800835 . A G 88.12 PASS AO=29;DP=81;FAO=29;FDP=82;FR=.;FRO=53;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=31;FWDB=-0.0219659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.662;QD=4.29851;RBI=0.0257836;REFB=-0.00795266;REVB=-0.0135016;RO=51;SAF=14;SAR=15;SRF=22;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.057057;STB=0.543889;TYPE=snp;VARB=0.0211761;OID=.;OPOS=20800835;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:81:82:51:53:29:29:15:14:22:29:15:14:22:31 chr22 20847472 . A T 316.01 PASS AO=72;DP=145;FAO=72;FDP=142;FR=.;FRO=70;FSAF=34;FSAR=38;FSRF=29;FSRR=41;FWDB=-0.00266601;FXX=0.0206882;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.313;QD=8.90172;RBI=0.0103617;REFB=0.00202145;REVB=-0.0100128;RO=67;SAF=34;SAR=38;SRF=28;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0479499;STB=0.528732;TYPE=snp;VARB=-0.00281738;OID=.;OPOS=20847472;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:142:67:70:72:72:38:34:28:39:38:34:29:41 chr22 20862646 . T G 289.11 PASS AO=65;DP=124;FAO=65;FDP=127;FR=.;FRO=62;FSAF=34;FSAR=31;FSRF=11;FSRR=51;FWDB=-0.0325429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.04;QD=9.10575;RBI=0.0328071;REFB=0.00764582;REVB=0.00415509;RO=59;SAF=34;SAR=31;SRF=11;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.290055;STB=0.666461;TYPE=snp;VARB=-0.0066166;OID=.;OPOS=20862646;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:127:59:62:65:65:31:34:11:48:31:34:11:51 chr22 21044848 . A T 94.54 PASS AO=22;DP=47;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=-0.0051683;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.465;QD=8.04599;RBI=0.0292345;REFB=-0.0219851;REVB=-0.028774;RO=25;SAF=11;SAR=11;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169702;STB=0.595661;TYPE=snp;VARB=0.0310769;OID=.;OPOS=21044848;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:47:47:25:25:22:22:11:11:17:8:11:11:17:8 chr22 21045398 . G T 10.27 PASS AO=6;DP=34;FAO=6;FDP=35;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.025989;FXX=0.0277701;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.826;QD=1.17357;RBI=0.0260326;REFB=-0.00806973;REVB=0.00150675;RO=28;SAF=5;SAR=1;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.53669;STB=0.854744;TYPE=snp;VARB=0.0386766;OID=.;OPOS=21045398;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:34:35:28:29:6:6:1:5:10:18:1:5:11:18 chr22 21045405 . A G 12.93 PASS AO=7;DP=37;FAO=7;FDP=37;FR=.;FRO=30;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=-0.0289212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.166;QD=1.39803;RBI=0.0289215;REFB=-0.007578;REVB=0.00012521;RO=30;SAF=5;SAR=2;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.367919;STB=0.745594;TYPE=snp;VARB=0.0568653;OID=.;OPOS=21045405;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:37:37:30:30:7:7:2:5:12:18:2:5:12:18 chr22 21066789 . A G 62.61 PASS AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=-0.0470674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.384;QD=6.422;RBI=0.0500458;REFB=-0.0092934;REVB=-0.017007;RO=21;SAF=4;SAR=12;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.376457;STB=0.739956;TYPE=snp;VARB=0.0086331;OID=.;OPOS=21066789;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:38:39:21:23:16:16:12:4:13:8:12:4:15:8 chr22 21079909 . A G 169.19 PASS AO=35;DP=65;FAO=35;FDP=65;FR=.;FRO=30;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=8;FWDB=0.0340412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.794;QD=10.4114;RBI=0.0349957;REFB=-0.0225078;REVB=-0.00811752;RO=30;SAF=20;SAR=15;SRF=22;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141465;STB=0.577939;TYPE=snp;VARB=0.0213004;OID=.;OPOS=21079909;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:65:30:30:35:35:15:20:22:8:15:20:22:8 chr22 21141300 . T C 270.76 PASS AO=74;DP=173;FAO=75;FDP=174;FR=.;FRO=99;FSAF=35;FSAR=40;FSRF=41;FSRR=58;FWDB=0.00302981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.634;QD=6.22439;RBI=0.00314448;REFB=-0.0156371;REVB=0.00084144;RO=98;SAF=35;SAR=39;SRF=41;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0561173;STB=0.530131;TYPE=snp;VARB=0.0204371;OID=.;OPOS=21141300;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:174:98:99:74:75:39:35:41:57:40:35:41:58 chr22 21167787 . G A 358.45 PASS AO=93;DP=205;FAO=94;FDP=205;FR=.;FRO=111;FSAF=58;FSAR=36;FSRF=57;FSRR=54;FWDB=-0.0388083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.897;QD=6.99409;RBI=0.0389049;REFB=-0.0102293;REVB=-0.00273957;RO=107;SAF=58;SAR=35;SRF=55;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109371;STB=0.55768;TYPE=snp;VARB=0.0116775;OID=.;OPOS=21167787;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:205:205:107:111:93:94:35:58:55:52:36:58:57:54 chr22 21213416 . A G 20.52 PASS AO=6;DP=21;FAO=6;FDP=21;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.0374831;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=283.684;QD=3.90831;RBI=0.0396409;REFB=-0.00912834;REVB=-0.0129002;RO=15;SAF=5;SAR=1;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.442109;STB=0.78843;TYPE=snp;VARB=0.0360395;OID=.;OPOS=21213416;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:21:21:15:15:6:6:1:5:7:8:1:5:7:8 chr22 21301005 . T C 967.34 PASS AO=92;DP=104;FAO=119;FDP=129;FR=.;FRO=10;FSAF=11;FSAR=108;FSRF=10;FSRR=0;FWDB=0.0283185;FXX=0.00769172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.326;QD=29.9949;RBI=0.0288389;REFB=-0.0674465;REVB=0.0054538;RO=12;SAF=0;SAR=92;SRF=12;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.903726;STB=0.656218;TYPE=snp;VARB=0.00249076;OID=.;OPOS=21301005;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:104:129:12:10:92:119:92:0:12:0:108:11:10:0 chr22 21304408 . A G 955.01 PASS AO=102;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.6554;QD=36.7311;RBI=0.0873266;REFB=-0.0432073;REVB=0.0851142;RO=0;SAF=51;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000725494;OID=.;OPOS=21304408;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:104:104:0:0:102:104:51:51:0:0:53:51:0:0 chr22 21306743 . A G 734.75 PASS AO=83;DP=87;FAO=83;FDP=87;FR=.;FRO=4;FSAF=27;FSAR=56;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0568596;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.0141;QD=33.7816;RBI=0.10328;REFB=-0.125139;REVB=0.0862197;RO=4;SAF=27;SAR=56;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00748073;STB=0.503954;TYPE=snp;VARB=0.00541968;OID=.;OPOS=21306743;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:87:87:4:4:83:83:56:27:1:3:56:27:1:3 chr22 21307712 . AAAC A 113.3 PASS AO=24;DP=69;FAO=37;FDP=64;FR=.;FRO=27;FSAF=33;FSAR=4;FSRF=26;FSRR=1;FWDB=-0.00773999;FXX=0.123271;HRUN=4;LEN=3;MLLD=106.4;QD=7.081;RBI=0.0781548;REFB=-0.0380947;REVB=0.0777706;RO=0;SAF=22;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.325513;SSEP=0;SSSB=-3.48349e-08;STB=0.588488;TYPE=del;VARB=0.0326397;OID=.;OPOS=21307713;OREF=AAC;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:24:35:37:64:27:33:4:26:1:73:0:22:2:0:0 chr22 21330787 . C T 105.04 PASS AO=19;DP=32;FAO=19;FDP=32;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=16;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=0.0462302;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=194.021;QD=13.13;RBI=0.0525335;REFB=-0.0203633;REVB=0.0249508;RO=13;SAF=3;SAR=16;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0919271;STB=0.551666;TYPE=snp;VARB=0.0160044;OID=.;OPOS=21330787;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:32:32:13:13:19:19:16:3:3:10:16:3:3:10 chr22 21331043 . A T 125.84 PASS AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0264788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.247;QD=35.9535;RBI=0.13784;REFB=0;REVB=0.135273;RO=0;SAF=7;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00230136;OID=.;OPOS=21331043;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:14:14:0:0:14:14:7:7:0:0:7:7:0:0 chr22 21335259 . C A 105.49 PASS AO=26;DP=58;FAO=26;FDP=58;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.0557934;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=181.528;QD=7.27513;RBI=0.0562252;REFB=-0.0137611;REVB=0.00695457;RO=32;SAF=7;SAR=19;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.275694;STB=0.656933;TYPE=snp;VARB=0.0139752;OID=.;OPOS=21335259;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:32:32:26:26:19:7:17:15:19:7:17:15 chr22 21335606 . C T 518.27 PASS AO=54;DP=55;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.074742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4508;QD=36.3698;RBI=0.086102;REFB=-0.081028;REVB=0.0427456;RO=1;SAF=26;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177809;STB=0.509088;TYPE=snp;VARB=0.00208467;OID=.;OPOS=21335606;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:55:57:1:1:54:56:28:26:1:0:29:27:1:0 chr22 21335611 . A G 531.51 PASS AO=55;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0246255;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=156.167;QD=37.9648;RBI=0.0246301;REFB=0;REVB=-0.000472695;RO=0;SAF=27;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4002e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.25788e-05;OID=.;OPOS=21335611;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:55:56:0:0:55:56:28:27:0:0:29:27:0:0 chr22 21354970 . C G 1162.66 PASS AO=118;DP=120;FAO=126;FDP=128;FR=.;FRO=2;FSAF=98;FSAR=28;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00165317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.058;QD=36.3331;RBI=0.0216866;REFB=-0.0522515;REVB=0.0216235;RO=1;SAF=94;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00502676;STB=0.50505;TYPE=snp;VARB=3.919e-05;OID=.;OPOS=21354970;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:120:128:1:2:118:126:24:94:1:0:28:98:2:0 chr22 21357006 . C T 53.77 PASS AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0160813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.302;QD=23.8988;RBI=0.0524016;REFB=-0.0345309;REVB=-0.0498731;RO=1;SAF=3;SAR=4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124421;STB=0.516083;TYPE=snp;VARB=0.00388332;OID=.;OPOS=21357006;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:1:2:7:7:4:3:1:0:4:3:1:1 chr22 21377301 . C A 255.68 PASS AO=64;DP=136;FAO=64;FDP=136;FR=.;FRO=72;FSAF=26;FSAR=38;FSRF=40;FSRR=32;FWDB=0.00710673;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=103.279;QD=7.51994;RBI=0.0134233;REFB=-0.0149371;REVB=-0.0113877;RO=71;SAF=26;SAR=38;SRF=39;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136595;STB=0.579458;TYPE=snp;VARB=0.0124805;OID=.;OPOS=21377301;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:71:72:64:64:38:26:39:32:38:26:40:32 chr22 21385985 . C T 30.23 PASS AO=7;DP=18;FAO=7;FDP=18;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.0908047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.5669;QD=6.7187;RBI=0.0910024;REFB=-0.0293849;REVB=0.00599661;RO=11;SAF=4;SAR=3;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1654;STB=0.599733;TYPE=snp;VARB=0.0739528;OID=.;OPOS=21385985;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:18:18:11:11:7:7:3:4:8:3:3:4:8:3 chr22 21402278 . GC G 326.23 PASS AO=45;DP=68;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.168448;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=10.6833;QD=20.0758;RBI=0.190327;REFB=0.00996129;REVB=0.0885984;RO=11;SAF=19;SAR=26;SRF=10;SRR=1;SSEN=0.286966;SSEP=0;SSSB=-0.177132;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0136644;OID=.;OPOS=21402279;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:45:65:65:65:0:37:28:0:0:28:11:19:26:10:1 chr22 21797101 . CG C,CC 75.5 PASS AO=2,4;DP=8;FAO=10,0;FDP=12;FR=.;FRO=2;FSAF=5,0;FSAR=5,0;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.165479,0.158341;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=177.659,175.334;QD=25.168;RBI=0.174372,0.167007;REFB=-0.154112,-0.136537;REVB=-0.0549727,-0.0530996;RO=2;SAF=0,1;SAR=2,3;SRF=2;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.727176,-0.407562;STB=0.583171,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.00540784,-0.0218194;OID=.,.;OPOS=21797102,21797102;OREF=G,G;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:2,4:8:10,0:12:2:5,0:5,0:2:0:8:2:0,1:2,3:2:0 chr22 21800444 . T C 652.03 PASS AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.828;QD=38.3547;RBI=0.0289573;REFB=0;REVB=0.0229651;RO=0;SAF=28;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000112513;OID=.;OPOS=21800444;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:68:68:0:0:68:68:40:28:0:0:40:28:0:0 chr22 21801588 . T A 593.88 PASS AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.519;QD=37.7068;RBI=0.0138933;REFB=0;REVB=0.00271287;RO=0;SAF=29;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.95296e-05;OID=.;OPOS=21801588;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:63:63:0:0:63:63:34:29:0:0:34:29:0:0 chr22 21822725 . T C 193.72 PASS AO=19;DP=19;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0975432;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.812;QD=38.7435;RBI=0.10023;REFB=0;REVB=0.023052;RO=0;SAF=2;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.41729e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00122208;OID=.;OPOS=21822725;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:19:20:0:0:19:20:17:2:0:0:17:3:0:0 chr22 21829507 . G A 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0209053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.237;QD=33.022;RBI=0.0458453;REFB=0;REVB=0.0408014;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000852458;OID=.;OPOS=21829507;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:4:2:0:0:4:2:0:0 chr22 21988599 . G A 86.91 PASS AO=16;DP=40;FAO=20;FDP=43;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0316836;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.7832;QD=8.08498;RBI=0.0791138;REFB=-0.0250549;REVB=0.0724923;RO=21;SAF=5;SAR=11;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.304145;STB=0.68335;TYPE=snp;VARB=0.0480387;OID=.;OPOS=21988599;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:40:43:21:23:16:20:11:5:13:8:15:5:13:10 chr22 22287862 . G A 76.86 PASS AO=12;DP=17;FAO=12;FDP=18;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.0192041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.479;QD=17.0805;RBI=0.0207685;REFB=-0.0751939;REVB=0.00790797;RO=4;SAF=3;SAR=9;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136204;STB=0.535653;TYPE=snp;VARB=0.0612637;OID=.;OPOS=22287862;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:17:18:4:6:12:12:9:3:2:2:9:3:2:4 chr22 22300282 . TC T 154.32 PASS AO=20;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.152889;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=9.40287;QD=18.7053;RBI=0.163682;REFB=-0.0167056;REVB=0.0584514;RO=3;SAF=13;SAR=7;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0.567227;SSSB=-0.00438788;STB=0.518507;TYPE=del;VARB=0.0325074;OID=.;OPOS=22300283;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:20:33:32:33:1:19:13:0:1:11:3:13:7:2:1 chr22 22312315 . C T 31.61 PASS AO=7;DP=17;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.0172864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.693;QD=7.43695;RBI=0.0177676;REFB=-0.0243567;REVB=-0.00410686;RO=10;SAF=5;SAR=2;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125396;STB=0.576693;TYPE=snp;VARB=0.0304794;OID=.;OPOS=22312315;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:17:17:10:10:7:7:2:5:6:4:2:5:6:4 chr22 22330082 . T C 172 PASS AO=44;DP=98;FAO=44;FDP=98;FR=.;FRO=54;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=34;FSRR=20;FWDB=-0.0113674;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=171.399;QD=7.02049;RBI=0.0224592;REFB=-0.0171887;REVB=-0.01937;RO=54;SAF=17;SAR=27;SRF=34;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237508;STB=0.632753;TYPE=snp;VARB=0.0187952;OID=.;OPOS=22330082;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:54:54:44:44:27:17:34:20:27:17:34:20 chr22 22453513 . C T 299.04 PASS AO=63;DP=115;FAO=63;FDP=116;FR=.;FRO=53;FSAF=23;FSAR=40;FSRF=35;FSRR=18;FWDB=0.00556976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.142;QD=10.3115;RBI=0.00557642;REFB=-0.00445275;REVB=0.000272478;RO=52;SAF=23;SAR=40;SRF=34;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.238809;STB=0.634878;TYPE=snp;VARB=0.00175531;OID=.;OPOS=22453513;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:116:52:53:63:63:40:23:34:18:40:23:35:18 chr22 22517026 . T C 1440.21 PASS AO=154;DP=156;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0125207;FXX=0.0128197;HRUN=3;LEN=1;MLLD=182.884;QD=37.4079;RBI=0.0158698;REFB=0.0283226;REVB=-0.00975102;RO=2;SAF=75;SAR=79;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0118898;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.79303e-06;OID=.;OPOS=22517026;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:156:154:2:0:154:154:79:75:0:2:79:75:0:0 chr22 22550401 . C G 713.02 PASS AO=53;DP=93;FAO=81;FDP=85;FR=.;FRO=4;FSAF=30;FSAR=51;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0364421;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=188.572;QD=33.5538;RBI=0.0472132;REFB=-0.0800404;REVB=0.0300176;RO=0;SAF=6;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.55111e-08;STB=0.531242;TYPE=snp;VARB=0.00164767;OID=.;OPOS=22550401;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:54:85:0:4:53:81:47:6:0:0:51:30:4:0 chr22 22550510 . T G 987.85 PASS AO=113;DP=122;FAO=113;FDP=119;FR=.;FRO=6;FSAF=40;FSAR=73;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.00948959;FXX=0.0245881;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.223;QD=33.2049;RBI=0.0333465;REFB=0.0055516;REVB=-0.0319678;RO=6;SAF=40;SAR=73;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0492926;STB=0.526016;TYPE=snp;VARB=-0.000532513;OID=.;OPOS=22550510;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:122:119:6:6:113:113:73:40:5:1:73:40:5:1 chr22 22556270 . T C 21.5 PASS AO=6;DP=20;FAO=6;FDP=20;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=-0.00770682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.691;QD=4.29992;RBI=0.0179278;REFB=-0.00309493;REVB=0.0161868;RO=14;SAF=3;SAR=3;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.324321;STB=0.699439;TYPE=snp;VARB=0.00442593;OID=.;OPOS=22556270;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:20:20:14:14:6:6:3:3:3:11:3:3:3:11 chr22 22556368 . C T 113.89 PASS AO=29;DP=66;FAO=29;FDP=66;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=12;FWDB=0.0363499;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.778;QD=6.90238;RBI=0.036352;REFB=-0.00347962;REVB=0.000397055;RO=37;SAF=10;SAR=19;SRF=25;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.322704;STB=0.681928;TYPE=snp;VARB=0.00985264;OID=.;OPOS=22556368;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:37:37:29:29:19:10:25:12:19:10:25:12 chr22 22569400 . AG A 337.57 PASS AO=41;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.291783;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.9892;QD=20.7738;RBI=0.38082;REFB=0.00645668;REVB=0.244717;RO=21;SAF=20;SAR=21;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0.22249;SSSB=0.126515;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.017044;OID=.;OPOS=22569401;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:41:64:65:65:0:29:36:0:0:25:21:20:21:6:15 chr22 22569448 . T A 54.72 PASS AO=22;DP=74;FAO=22;FDP=74;FR=.;FRO=52;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=27;FSRR=25;FWDB=-0.0535731;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.3716;QD=2.95778;RBI=0.0620051;REFB=-0.0189552;REVB=-0.0312179;RO=52;SAF=9;SAR=13;SRF=27;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13068;STB=0.577707;TYPE=snp;VARB=0.0430559;OID=.;OPOS=22569448;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:74:74:52:52:22:22:13:9:27:25:13:9:27:25 chr22 22569554 . C A 129.77 PASS AO=33;DP=74;FAO=33;FDP=74;FR=.;FRO=41;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=0.0272939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.1818;QD=7.01432;RBI=0.0282132;REFB=-0.0197829;REVB=0.00714337;RO=40;SAF=12;SAR=21;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0377839;STB=0.530008;TYPE=snp;VARB=0.0261845;OID=.;OPOS=22569554;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:40:41:33:33:21:12:16:24:21:12:17:24 chr22 22569640 . T G 43.92 PASS AO=12;DP=29;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.00257321;FXX=0.0344709;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.1796;QD=6.27397;RBI=0.00380015;REFB=0.0238777;REVB=-0.00279637;RO=15;SAF=8;SAR=4;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0692817;STB=0.632838;TYPE=snp;VARB=-0.0401063;OID=.;OPOS=22569640;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:29:28:15:17:12:11:4:8:9:6:3:8:9:8 chr22 22698027 . A G 1024.09 PASS AO=114;DP=120;FAO=114;FDP=119;FR=.;FRO=5;FSAF=47;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.000152429;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5192;QD=34.4231;RBI=0.0186173;REFB=-0.0112941;REVB=-0.0186167;RO=6;SAF=46;SAR=68;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.023436;STB=0.517982;TYPE=snp;VARB=0.00150989;OID=.;OPOS=22698027;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:120:119:6:5:114:114:68:46:1:5:67:47:0:5 chr22 22712467 . T G 190.43 PASS AO=46;DP=109;FAO=50;FDP=113;FR=.;FRO=63;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=42;FSRR=21;FWDB=0.0349204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.6581;QD=6.74098;RBI=0.0349206;REFB=0.00225614;REVB=-0.000109749;RO=62;SAF=25;SAR=21;SRF=41;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123089;STB=0.592884;TYPE=snp;VARB=-0.00159945;OID=.;OPOS=22712467;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:113:62:63:46:50:21:25:41:21:25:25:42:21 chr22 22724341 . A C 340.12 PASS AO=71;DP=165;FAO=86;FDP=180;FR=.;FRO=94;FSAF=37;FSAR=49;FSRF=48;FSRR=46;FWDB=0.0219165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.629;QD=7.55825;RBI=0.0230147;REFB=-0.0205711;REVB=-0.00702435;RO=94;SAF=22;SAR=49;SRF=48;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216463;STB=0.542308;TYPE=snp;VARB=0.0249554;OID=.;OPOS=22724341;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:165:180:94:94:71:86:49:22:48:46:49:37:48:46 chr22 22724394 . T C 309.53 PASS AO=52;DP=214;FAO=89;FDP=213;FR=.;FRO=124;FSAF=35;FSAR=54;FSRF=58;FSRR=66;FWDB=-0.0323471;FXX=0.027396;HRUN=4;LEN=1;MLLD=204.865;QD=5.81278;RBI=0.0329407;REFB=-0.0122808;REVB=0.00622507;RO=97;SAF=1;SAR=51;SRF=44;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.761889;STB=0.544557;TYPE=snp;VARB=0.0139442;OID=.;OPOS=22724394;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:164:213:97:124:52:89:51:1:44:53:54:35:58:66 chr22 22730359 . C T 201.03 PASS AO=53;DP=131;FAO=53;FDP=123;FR=.;FRO=70;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=29;FSRR=41;FWDB=0.0389775;FXX=0.133793;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.521;QD=6.5377;RBI=0.0407899;REFB=-0.0243809;REVB=-0.0120238;RO=61;SAF=22;SAR=31;SRF=27;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0271011;STB=0.500474;TYPE=snp;VARB=0.0202366;OID=.;OPOS=22730359;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:123:61:70:53:53:31:22:27:34:31:22:29:41 chr22 22730634 . G A 424.31 PASS AO=86;DP=152;FAO=86;FDP=152;FR=.;FRO=66;FSAF=33;FSAR=53;FSRF=19;FSRR=47;FWDB=-0.0168433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.6755;QD=11.1661;RBI=0.0273124;REFB=-0.020137;REVB=0.0215005;RO=66;SAF=33;SAR=53;SRF=19;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0826169;STB=0.544904;TYPE=snp;VARB=0.00870318;OID=.;OPOS=22730634;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:152:66:66:86:86:53:33:19:47:53:33:19:47 chr22 22782150 . G A 208.32 PASS AO=61;DP=149;FAO=61;FDP=150;FR=.;FRO=89;FSAF=23;FSAR=38;FSRF=33;FSRR=56;FWDB=-0.00430632;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.453;QD=5.55506;RBI=0.0278463;REFB=-0.0141793;REVB=-0.0275113;RO=88;SAF=23;SAR=38;SRF=33;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00229286;STB=0.503961;TYPE=snp;VARB=0.0222977;OID=.;OPOS=22782150;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:150:88:89:61:61:38:23:33:55:38:23:33:56 chr22 22842206 . T C 1242.03 PASS AO=129;DP=129;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0453558;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.178;QD=38.5126;RBI=0.0611344;REFB=0;REVB=0.040991;RO=0;SAF=68;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000201699;OID=.;OPOS=22842206;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:129:129:0:0:129:129:61:68:0:0:61:68:0:0 chr22 22842957 . T G 3467.69 PASS AO=375;DP=387;FAO=376;FDP=376;FR=.;FRO=0;FSAF=129;FSAR=247;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.016845;FXX=0.028423;HRUN=4;LEN=1;MLLD=185.602;QD=36.8903;RBI=0.0198451;REFB=-0.104271;REVB=0.0104918;RO=6;SAF=129;SAR=246;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0051829;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000123585;OID=.;OPOS=22842957;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:387:376:6:0:375:376:246:129:3:3:247:129:0:0 chr22 22843118 . C T 1808.69 PASS AO=189;DP=191;FAO=189;FDP=189;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.018776;FXX=0.0104707;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.561;QD=38.2792;RBI=0.0188999;REFB=0;REVB=0.00216048;RO=0;SAF=69;SAR=120;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.20852e-05;OID=.;OPOS=22843118;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:191:189:0:0:189:189:120:69:0:0:120:69:0:0 chr22 22868493 . G T 3843.21 PASS AO=399;DP=400;FAO=400;FDP=400;FR=.;FRO=0;FSAF=222;FSAR=178;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0126399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.1585;QD=38.4321;RBI=0.015703;REFB=0;REVB=-0.00931751;RO=1;SAF=222;SAR=177;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00214502;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.22082e-05;OID=.;OPOS=22868493;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:400:400:1:0:399:400:177:222:1:0:178:222:0:0 chr22 22868497 . G C 3686.01 PASS AO=395;DP=403;FAO=392;FDP=392;FR=.;FRO=0;FSAF=218;FSAR=174;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0128375;FXX=0.0199995;HRUN=3;LEN=1;MLLD=197.555;QD=37.6123;RBI=0.0141341;REFB=0.00676346;REVB=0.00591378;RO=5;SAF=220;SAR=175;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00104016;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.46197e-05;OID=.;OPOS=22868497;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:403:392:5:0:395:392:175:220:3:2:174:218:0:0 chr22 22868773 . G A 1064.78 PASS AO=112;DP=112;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.714;QD=38.028;RBI=0.0251305;REFB=0;REVB=0.0217065;RO=0;SAF=60;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.52656e-05;OID=.;OPOS=22868773;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:112:112:0:0:112:112:52:60:0:0:52:60:0:0 chr22 22868776 . G A 1031.08 PASS AO=110;DP=111;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00467236;FXX=0.0090082;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.963;QD=37.4937;RBI=0.0125951;REFB=-0.0470494;REVB=0.0116964;RO=1;SAF=60;SAR=50;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00939993;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000676999;OID=.;OPOS=22868776;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:111:110:1:0:110:110:50:60:0:1:50:60:0:0 chr22 22869123 . T C 3550.98 PASS AO=382;DP=390;FAO=383;FDP=390;FR=.;FRO=7;FSAF=214;FSAR=169;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0.020056;FXX=0.00255748;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.5387;QD=36.4203;RBI=0.0344301;REFB=-0.0402952;REVB=0.0279855;RO=6;SAF=214;SAR=168;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0167338;STB=0.510144;TYPE=snp;VARB=0.00130226;OID=.;OPOS=22869123;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:390:390:6:7:382:383:168:214:0:6:169:214:0:7 chr22 22869209 . C G 3340.93 PASS AO=233;DP=371;FAO=348;FDP=348;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=190;FSAR=158;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.196668;FXX=0.0169487;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.0054;QD=38.4015;RBI=0.20571;REFB=0;REVB=-0.0603191;RO=0;SAF=82;SAR=151;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.42399e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.43259e-05;OID=.;OPOS=22869209;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:348:348:0:0:233:348:151:82:0:0:158:190:0:0 chr22 22869218 . T C 2844.04 PASS AO=318;DP=335;FAO=323;FDP=337;FR=.;FRO=14;FSAF=168;FSAR=155;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=0.0852661;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.5468;QD=33.7571;RBI=0.0893337;REFB=-0.185609;REVB=0.0266495;RO=17;SAF=163;SAR=155;SRF=14;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0300884;STB=0.51106;TYPE=snp;VARB=0.00552298;OID=.;OPOS=22869218;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:335:337:17:14:318:323:155:163:14:3:155:168:11:3 chr22 22869538 . A G 1119.03 PASS AO=118;DP=119;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217682;FXX=0.00840265;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.877;QD=37.9332;RBI=0.0281858;REFB=0.0109894;REVB=0.0179049;RO=1;SAF=45;SAR=73;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00646244;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.01879e-05;OID=.;OPOS=22869538;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:119:118:1:0:118:118:73:45:0:1:73:45:0:0 chr22 22869545 . T G 1085.47 PASS AO=114;DP=114;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.048211;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.651;QD=38.0865;RBI=0.0598292;REFB=0;REVB=0.0354293;RO=0;SAF=43;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43709e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.88123e-05;OID=.;OPOS=22869545;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:114:114:0:0:114:114:71:43:0:0:71:43:0:0 chr22 22869548 . T C 925.37 PASS AO=105;DP=111;FAO=105;FDP=110;FR=.;FRO=5;FSAF=42;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.000884051;FXX=0.0178555;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.213;QD=33.6497;RBI=0.00954439;REFB=0.00478724;REVB=0.00950336;RO=5;SAF=42;SAR=63;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0361829;STB=0.51908;TYPE=snp;VARB=5.05455e-05;OID=.;OPOS=22869548;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:111:110:5:5:105:105:63:42:0:5:63:42:0:5 chr22 22869649 . G C 853.16 PASS AO=93;DP=95;FAO=93;FDP=95;FR=.;FRO=2;FSAF=51;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0242727;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.2124;QD=35.9224;RBI=0.0243314;REFB=-0.0941638;REVB=0.00168974;RO=2;SAF=51;SAR=42;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00194873;STB=0.501028;TYPE=snp;VARB=0.0012284;OID=.;OPOS=22869649;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:95:95:2:2:93:93:42:51:1:1:42:51:1:1 chr22 22869742 . C A 1338.52 PASS AO=137;DP=137;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00111059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.537;QD=38.5186;RBI=0.00763837;REFB=0;REVB=-0.0075572;RO=0;SAF=75;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.52807e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.18658e-06;OID=.;OPOS=22869742;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:137:139:0:0:137:139:62:75:0:0:63:76:0:0 chr22 22893394 . A T 119.7 PASS AO=30;DP=67;FAO=30;FDP=67;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=-0.00974198;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.646;QD=7.14627;RBI=0.00974332;REFB=-0.0100856;REVB=-0.00016173;RO=37;SAF=13;SAR=17;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0279657;STB=0.515758;TYPE=snp;VARB=0.0145681;OID=.;OPOS=22893394;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:37:37:30:30:17:13:15:22:17:13:15:22 chr22 22899234 . A G 134.04 PASS AO=37;DP=89;FAO=37;FDP=89;FR=.;FRO=52;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=36;FSRR=16;FWDB=-0.0115386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.052;QD=6.02447;RBI=0.0363116;REFB=-0.0200656;REVB=-0.0344295;RO=52;SAF=13;SAR=24;SRF=36;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.343482;STB=0.693296;TYPE=snp;VARB=0.015986;OID=.;OPOS=22899234;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:89:89:52:52:37:37:24:13:36:16:24:13:36:16 chr22 22989256 . A G 73.84 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0753017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.444;QD=36.9199;RBI=0.0754276;REFB=0;REVB=-0.00435585;RO=0;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.78849e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00136682;OID=.;OPOS=22989256;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:7:1:0:0:7:1:0:0 chr22 23029263 . T C 904.24 PASS AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.111407;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7272;QD=38.0732;RBI=0.113441;REFB=0;REVB=-0.0213851;RO=0;SAF=20;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.48433e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00109587;OID=.;OPOS=23029263;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:95:95:0:0:95:95:75:20:0:0:75:20:0:0 chr22 23029698 . T C 1080.78 PASS AO=114;DP=116;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0427787;FXX=0.0258598;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.357;QD=38.2578;RBI=0.054471;REFB=0;REVB=0.0337205;RO=0;SAF=42;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.47005e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.68679e-05;OID=.;OPOS=23029698;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:116:113:0:0:114:113:72:42:0:0:71:42:0:0 chr22 23040462 . T C 132.04 PASS AO=25;DP=43;FAO=25;FDP=43;FR=.;FRO=18;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=4;FWDB=-0.010813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.84;QD=12.2826;RBI=0.0118654;REFB=-0.025654;REVB=-0.00488548;RO=18;SAF=18;SAR=7;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0556766;STB=0.530782;TYPE=snp;VARB=0.0144762;OID=.;OPOS=23040462;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:43:43:18:18:25:25:7:18:14:4:7:18:14:4 chr22 23040767 . G T 589.79 PASS AO=112;DP=233;FAO=125;FDP=229;FR=.;FRO=104;FSAF=64;FSAR=61;FSRF=36;FSRR=68;FWDB=-0.0164764;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=135.637;QD=10.3021;RBI=0.0222452;REFB=-0.00167685;REVB=0.0149458;RO=71;SAF=53;SAR=59;SRF=7;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275938;STB=0.575079;TYPE=snp;VARB=0.00101786;OID=.;OPOS=23040767;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:229:71:104:112:125:59:53:7:64:61:64:36:68 chr22 23055421 . G A 127.08 PASS AO=33;DP=71;FAO=33;FDP=75;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=-0.0331029;FXX=0.0131562;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.458;QD=6.77758;RBI=0.038985;REFB=-0.0211524;REVB=0.0205918;RO=38;SAF=11;SAR=22;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191626;STB=0.636279;TYPE=snp;VARB=0.0301463;OID=.;OPOS=23055421;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:75:38:42:33:33:22:11:20:18:22:11:24:18 chr22 23055440 . C A 626.54 PASS AO=58;DP=59;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0638723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.014;QD=36.8551;RBI=0.067252;REFB=-0.0157794;REVB=0.0210512;RO=1;SAF=17;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0269356;STB=0.510201;TYPE=snp;VARB=0.000564135;OID=.;OPOS=23055440;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:59:68:1:1:58:67:41:17:1:0:43:24:1:0 chr22 23055533 . G A 306.24 PASS AO=72;DP=148;FAO=73;FDP=149;FR=.;FRO=76;FSAF=32;FSAR=41;FSRF=35;FSRR=41;FWDB=-0.0220614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.419;QD=8.22109;RBI=0.0233603;REFB=-0.0193573;REVB=0.00768107;RO=73;SAF=32;SAR=40;SRF=33;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00702831;STB=0.511447;TYPE=snp;VARB=0.0207538;OID=.;OPOS=23055533;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:149:73:76:72:73:40:32:33:40:41:32:35:41 chr22 23055539 . G T 330.13 PASS AO=73;DP=150;FAO=77;FDP=154;FR=.;FRO=77;FSAF=32;FSAR=45;FSRF=35;FSRR=42;FWDB=0.0763505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4238;QD=8.57484;RBI=0.0808993;REFB=-0.0225659;REVB=0.0267449;RO=77;SAF=29;SAR=44;SRF=35;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0548525;STB=0.519912;TYPE=snp;VARB=0.0258519;OID=.;OPOS=23055539;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:150:154:77:77:73:77:44:29:35:42:45:32:35:42 chr22 23077555 . T C 820.13 PASS AO=79;DP=79;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0185811;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.305;QD=38.1457;RBI=0.0256418;REFB=0;REVB=0.0176705;RO=0;SAF=29;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.26247e-06;OID=.;OPOS=23077555;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:79:86:0:0:79:86:50:29:0:0:57:29:0:0 chr22 23089941 . ACT A 374.37 PASS AO=37;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0595196;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=226.594;QD=38.3967;RBI=0.0702095;REFB=0;REVB=-0.0372396;RO=0;SAF=12;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=4.63289e-05;OID=.;OPOS=23089942;OREF=CT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:37:37:39:39:0:14:25:0:0:18:0:12:25:0:0 chr22 23101247 . G A 107.82 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0689964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.876;QD=35.9384;RBI=0.0692235;REFB=0;REVB=0.00560209;RO=0;SAF=3;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00119197;OID=.;OPOS=23101247;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:9:3:0:0:9:3:0:0 chr22 23101248 . C T 107.81 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0238094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.2844;QD=35.9368;RBI=0.0886986;REFB=0;REVB=0.0854433;RO=0;SAF=3;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00375252;OID=.;OPOS=23101248;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:9:3:0:0:9:3:0:0 chr22 23101280 . C T 147.38 PASS AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00766524;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.961;QD=36.844;RBI=0.0273327;REFB=0;REVB=0.0262359;RO=0;SAF=4;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07465e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000539251;OID=.;OPOS=23101280;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:16:16:0:0:16:16:12:4:0:0:12:4:0:0 chr22 23101301 . A G 159.08 PASS AO=15;DP=15;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00704304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.974;QD=37.4313;RBI=0.0220453;REFB=0;REVB=0.02089;RO=0;SAF=4;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33019e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000109941;OID=.;OPOS=23101301;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:15:17:0:0:15:17:11:4:0:0:13:4:0:0 chr22 23101523 . G A 504.37 PASS AO=117;DP=233;FAO=118;FDP=235;FR=.;FRO=117;FSAF=50;FSAR=68;FSRF=51;FSRR=66;FWDB=0.00596926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.269;QD=8.585;RBI=0.010977;REFB=0.00102873;REVB=-0.00921209;RO=116;SAF=50;SAR=67;SRF=51;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0113816;STB=0.50619;TYPE=snp;VARB=-0.00113795;OID=.;OPOS=23101523;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:233:235:116:117:117:118:67:50:51:65:68:50:51:66 chr22 23101559 . G T 2440.89 PASS AO=255;DP=256;FAO=256;FDP=256;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=165;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0070922;FXX=0.0038909;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.239;QD=38.1389;RBI=0.0107576;REFB=0.043063;REVB=0.00808871;RO=1;SAF=91;SAR=164;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00289805;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.2787e-06;OID=.;OPOS=23101559;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:256:256:1:0:255:256:164:91:0:1:165:91:0:0 chr22 23114327 . T C 49.45 PASS AO=10;DP=22;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=-0.0467907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.2056;QD=8.60025;RBI=0.0477615;REFB=0.00628087;REVB=0.00958087;RO=12;SAF=1;SAR=9;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.274629;STB=0.677566;TYPE=snp;VARB=-0.0100043;OID=.;OPOS=23114327;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:22:23:12:12:10:11:9:1:3:9:10:1:3:9 chr22 23114938 . C A 245.16 PASS AO=60;DP=143;FAO=66;FDP=150;FR=.;FRO=84;FSAF=35;FSAR=31;FSRF=40;FSRR=44;FWDB=0.0256724;FXX=0.0196066;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.106;QD=6.53766;RBI=0.0355376;REFB=-0.0196227;REVB=0.0245734;RO=77;SAF=30;SAR=30;SRF=38;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00653251;STB=0.530294;TYPE=snp;VARB=0.0334361;OID=.;OPOS=23114938;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:150:77:84:60:66:30:30:38:39:31:35:40:44 chr22 23115001 . A G 299.96 PASS AO=83;DP=192;FAO=83;FDP=192;FR=.;FRO=109;FSAF=30;FSAR=53;FSRF=45;FSRR=64;FWDB=-0.000612179;FXX=0.00518108;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.609;QD=6.2491;RBI=0.0327088;REFB=-0.0175447;REVB=-0.032703;RO=108;SAF=30;SAR=53;SRF=44;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0496786;STB=0.531055;TYPE=snp;VARB=0.0210928;OID=.;OPOS=23115001;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:192:108:109:83:83:53:30:44:64:53:30:45:64 chr22 23165333 . C A 31.92 PASS AO=10;DP=34;FAO=10;FDP=32;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=17;FWDB=0.0277414;FXX=0.0588062;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.308;QD=3.9894;RBI=0.0354886;REFB=-0.00712573;REVB=-0.0221326;RO=22;SAF=5;SAR=5;SRF=5;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.314542;STB=0.687177;TYPE=snp;VARB=0.0218776;OID=.;OPOS=23165333;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:34:32:22:22:10:10:5:5:5:17:5:5:5:17 chr22 23223278 . A T 197.08 PASS AO=42;DP=86;FAO=44;FDP=86;FR=.;FRO=42;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=-0.0192685;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.828;QD=9.1666;RBI=0.0263226;REFB=-0.0126368;REVB=-0.0179333;RO=40;SAF=19;SAR=23;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129468;STB=0.579521;TYPE=snp;VARB=0.0131329;OID=.;OPOS=23223278;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:40:42:42:44:23:19:24:16:25:19:25:17 chr22 23247082 . C T 662.42 PASS AO=66;DP=67;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016604;FXX=0.038956;HRUN=4;LEN=1;MLLD=60.2901;QD=35.8062;RBI=0.061561;REFB=-0.0997688;REVB=0.0592795;RO=1;SAF=52;SAR=14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0325479;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.011207;OID=.;OPOS=23247082;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:67:74:1:0:66:74:14:52:0:1:15:59:0:0 chr22 23248758 . G A 265.2 PASS AO=25;DP=25;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0819793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.087;QD=37.8861;RBI=0.0875344;REFB=0;REVB=0.0306865;RO=0;SAF=8;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000971259;OID=.;OPOS=23248758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:25:28:0:0:25:28:17:8:0:0:18:10:0:0 chr22 23256464 . G C 1767.24 PASS AO=190;DP=198;FAO=193;FDP=193;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=130;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0583044;FXX=0.0252513;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.5292;QD=36.6268;RBI=0.0584331;REFB=-0.038638;REVB=0.00387671;RO=5;SAF=61;SAR=129;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.037438;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000489223;OID=.;OPOS=23256464;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:198:193:5:0:190:193:129:61:5:0:130:63:0:0 chr22 23263602 . C T 1008.65 PASS AO=79;DP=140;FAO=131;FDP=134;FR=.;FRO=3;FSAF=71;FSAR=60;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00797391;FXX=0.0563341;HRUN=3;LEN=1;MLLD=117.073;QD=30.1091;RBI=0.0748831;REFB=-0.128901;REVB=0.0744573;RO=0;SAF=69;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76975e-08;STB=0.5047;TYPE=snp;VARB=0.0159216;OID=.;OPOS=23263602;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:79:134:0:3:79:131:10:69:0:0:60:71:1:2 chr22 23264864 . T A 165.05 PASS AO=26;DP=84;FAO=31;FDP=84;FR=.,HEALED;FRO=43;FSAF=4;FSAR=27;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=0.00436545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.569;QD=7.85946;RBI=0.0505451;REFB=-0.0401683;REVB=0.0503562;RO=42;SAF=3;SAR=23;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.539183;STB=0.78502;TYPE=snp;VARB=0.0543719;OID=.;OPOS=23264864;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:84:42:43:26:31:23:3:22:20:27:4:22:21 chr22 23438191 . C T 266.13 PASS AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0641154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.628;QD=38.0181;RBI=0.0649049;REFB=0;REVB=-0.0100925;RO=0;SAF=18;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000508199;OID=.;OPOS=23438191;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:28:28:0:0:28:28:10:18:0:0:10:18:0:0 chr22 23438522 . C CG 16.85 PASS AO=2;DP=10;FAO=4;FDP=10;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.0903313;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=15.7406;QD=6.73838;RBI=0.0913626;REFB=-0.0332751;REVB=-0.0136889;RO=7;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.749235;TYPE=ins;VARB=0.0969136;OID=.;OPOS=23438523;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:2:10:4:10:6:1:3:0:6:16:7:0:2:0:7 chr22 23466388 . G T 209.95 PASS AO=68;DP=121;FAO=56;FDP=118;FR=.;FRO=62;FSAF=33;FSAR=23;FSRF=36;FSRR=26;FWDB=0.0126011;FXX=0.0406471;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.551;QD=7.11698;RBI=0.0327119;REFB=-0.00419511;REVB=0.0301874;RO=25;SAF=40;SAR=28;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0954388;STB=0.50468;TYPE=snp;VARB=0.0071649;OID=.;OPOS=23466388;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:118:25:62:68:56:28:40:10:15:23:33:36:26 chr22 23474972 . A G 1366.36 PASS AO=143;DP=145;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00273188;FXX=0.0137922;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.344;QD=38.2198;RBI=0.0146148;REFB=0;REVB=0.0143572;RO=0;SAF=74;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.12649e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.4741e-06;OID=.;OPOS=23474972;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:145:143:0:0:143:143:69:74:0:0:69:74:0:0 chr22 23475067 . T A 153.89 PASS AO=50;DP=130;FAO=49;FDP=130;FR=.;FRO=81;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=44;FSRR=37;FWDB=-0.0211823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.846;QD=4.73493;RBI=0.0212538;REFB=0.00174618;REVB=0.00174195;RO=80;SAF=28;SAR=22;SRF=44;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.010989;STB=0.51785;TYPE=snp;VARB=-0.0022561;OID=.;OPOS=23475067;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:80:81:50:49:22:28:44:36:21:28:44:37 chr22 23482460 . A G 1229.63 PASS AO=167;DP=199;FAO=165;FDP=196;FR=.;FRO=31;FSAF=123;FSAR=42;FSRF=4;FSRR=27;FWDB=0.0145166;FXX=0.0150746;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.4167;QD=25.0945;RBI=0.024166;REFB=-0.0267414;REVB=-0.01932;RO=31;SAF=126;SAR=41;SRF=4;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219157;STB=0.614051;TYPE=snp;VARB=0.0198814;OID=.;OPOS=23482460;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:199:196:31:31:167:165:41:126:4:27:42:123:4:27 chr22 23498329 . C T 231.77 PASS AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0352276;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.562;QD=37.0832;RBI=0.0429136;REFB=0;REVB=-0.0245069;RO=0;SAF=21;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.661e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000104572;OID=.;OPOS=23498329;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:25:25:0:0:25:25:4:21:0:0:4:21:0:0 chr22 23498330 . A G 231.77 PASS AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0307324;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.167;QD=37.0834;RBI=0.0315563;REFB=0;REVB=0.00716385;RO=0;SAF=21;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.661e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000117727;OID=.;OPOS=23498330;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:25:25:0:0:25:25:4:21:0:0:4:21:0:0 chr22 23498334 . C A 147.99 PASS AO=24;DP=24;FAO=19;FDP=22;FR=.;FRO=3;FSAF=18;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0367196;FXX=0.0832986;HRUN=3;LEN=1;MLLD=242.599;QD=26.9075;RBI=0.0918359;REFB=-0.0100577;REVB=-0.0841754;RO=0;SAF=21;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.86584e-08;STB=0.538423;TYPE=snp;VARB=0.00157394;OID=.;OPOS=23498334;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:24:22:0:3:24:19:3:21:0:0:1:18:3:0 chr22 23503121 . G A 378.36 PASS AO=43;DP=45;FAO=43;FDP=45;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.036395;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.204;QD=33.6324;RBI=0.0432;REFB=-0.135408;REVB=0.0232732;RO=0;SAF=27;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517849;TYPE=snp;VARB=0.00150455;OID=.;OPOS=23503121;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:45:45:0:2:43:43:16:27:0:0:16:27:2:0 chr22 23513523 . A C 481.19 PASS AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0228885;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.006;QD=37.7405;RBI=0.0358014;REFB=0;REVB=0.0275293;RO=0;SAF=33;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-8.62909e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.4918e-05;OID=.;OPOS=23513523;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:51:51:0:0:51:51:18:33:0:0:18:33:0:0 chr22 23523630 . C A 240.8 PASS AO=25;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121657;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=250.894;QD=37.0464;RBI=0.0238467;REFB=0;REVB=0.0205101;RO=0;SAF=22;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.65945e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000106929;OID=.;OPOS=23523630;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:26:26:0:0:25:26:3:22:0:0:4:22:0:0 chr22 23524310 . GCCA GCA,GCAC 112.31 PASS AO=10,4;DP=24;FAO=18,0;FDP=23;FR=.;FRO=5;FSAF=2,0;FSAR=16,0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.151694,-0.0174456;FXX=0.0416493;HRUN=2,2;LEN=1,2;MLLD=19.8298,68.2355;QD=19.5315;RBI=0.348779,0.026682;REFB=-0.0431941,0.0258194;REVB=0.314063,0.0201886;RO=8;SAF=1,0;SAR=9,4;SRF=6;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.59481,-0.75998;STB=0.777401,0.5;TYPE=del,mnp;VARB=0.0538918,0.0207496;OID=.,.;OPOS=23524311,23524312;OREF=C,CA;OALT=-,AC;OMAPALT=GCA,GCAC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:10,4:23:18,0:23:5:2,0:16,0:5:0:13:8:1,0:9,4:6:2 chr22 23541488 . C T 1320.84 PASS AO=141;DP=144;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00541422;FXX=0.0138879;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.5734;QD=37.2067;RBI=0.0176705;REFB=0.000415223;REVB=0.0168206;RO=1;SAF=31;SAR=110;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0150882;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.3952e-05;OID=.;OPOS=23541488;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:144:142:1:0:141:142:110:31:1:0:110:32:0:0 chr22 23585132 . A G 631.46 PASS AO=64;DP=65;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0502465;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.915;QD=37.6992;RBI=0.050254;REFB=0;REVB=0.000868601;RO=1;SAF=22;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.020982;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000229959;OID=.;OPOS=23585132;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:65:67:1:0:64:67:42:22:1:0:44:23:0:0 chr22 23627369 . A G 239.85 PASS AO=52;DP=100;FAO=52;FDP=100;FR=.;FRO=48;FSAF=11;FSAR=41;FSRF=14;FSRR=34;FWDB=-0.0177859;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.708;QD=9.59386;RBI=0.0191681;REFB=-0.0157865;REVB=-0.00714686;RO=48;SAF=11;SAR=41;SRF=14;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0975185;STB=0.554032;TYPE=snp;VARB=0.0204316;OID=.;OPOS=23627369;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:48:48:52:52:41:11:14:34:41:11:14:34 chr22 23631801 . T C 226.81 PASS AO=52;DP=96;FAO=50;FDP=96;FR=.;FRO=46;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=-0.0166863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.2273;QD=9.45058;RBI=0.0659592;REFB=-0.0535163;REVB=-0.0638137;RO=38;SAF=29;SAR=23;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0166625;STB=0.501677;TYPE=snp;VARB=0.0494976;OID=.;OPOS=23631801;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:38:46:52:50:23:29:22:16:23:27:25:21 chr22 23631823 . T C 163.22 PASS AO=43;DP=100;FAO=43;FDP=99;FR=.;FRO=56;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=20;FSRR=36;FWDB=-0.0234983;FXX=0.009999;HRUN=3;LEN=1;MLLD=270.28;QD=6.59459;RBI=0.0260479;REFB=-0.00545606;REVB=-0.0112393;RO=56;SAF=18;SAR=25;SRF=20;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0644394;STB=0.536116;TYPE=snp;VARB=0.00748646;OID=.;OPOS=23631823;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:99:56:56:43:43:25:18:20:36:25:18:20:36 chr22 23632513 . A G 559.19 PASS AO=113;DP=200;FAO=114;FDP=201;FR=.;FRO=87;FSAF=61;FSAR=53;FSRF=44;FSRR=43;FWDB=0.0347771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.542;QD=11.1282;RBI=0.0349063;REFB=-0.0382423;REVB=-0.00300014;RO=87;SAF=60;SAR=53;SRF=44;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0202261;STB=0.512737;TYPE=snp;VARB=0.0263031;OID=.;OPOS=23632513;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:200:201:87:87:113:114:53:60:44:43:53:61:44:43 chr22 23915610 . A T 104.37 PASS AO=37;DP=92;FAO=33;FDP=88;FR=.;FRO=55;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=33;FWDB=0.00332531;FXX=0.0434735;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.718;QD=4.74405;RBI=0.020659;REFB=-0.0102254;REVB=-0.0203896;RO=49;SAF=15;SAR=22;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.045196;STB=0.53457;TYPE=snp;VARB=0.0172669;OID=.;OPOS=23915610;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:92:88:49:55:37:33:22:15:22:27:18:15:22:33 chr22 23962744 . T TTTC 218.99 PASS AO=54;DP=147;FAO=61;FDP=142;FR=.;FRO=81;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=12;FSRR=69;FWDB=-0.0110669;FXX=0.0138879;HRUN=3;LEN=3;MLLD=240.533;QD=6.16876;RBI=0.0152188;REFB=0.00467573;REVB=0.0104469;RO=87;SAF=25;SAR=29;SRF=14;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.347056;STB=0.677088;TYPE=ins;VARB=-0.0059387;OID=.;OPOS=23962745;OREF=-;OALT=TTC;OMAPALT=TTTC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:54:147:61:142:81:27:34:12:69:99:87:25:29:14:73 chr22 24034288 . A G 86.05 PASS AO=17;DP=34;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=3;FWDB=-0.0388443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.306;QD=9.3028;RBI=0.0995996;REFB=0.0277015;REVB=0.0917126;RO=15;SAF=10;SAR=7;SRF=15;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.389663;STB=0.652031;TYPE=snp;VARB=-0.0166923;OID=.;OPOS=24034288;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:34:37:15:18:17:19:7:10:15:0:9:10:15:3 chr22 24035970 . C T 729.5 PASS AO=81;DP=86;FAO=81;FDP=84;FR=.;FRO=3;FSAF=58;FSAR=23;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0214937;FXX=0.0232531;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.586;QD=34.7381;RBI=0.0225039;REFB=-0.0226098;REVB=0.00666681;RO=3;SAF=58;SAR=23;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0040947;STB=0.502164;TYPE=snp;VARB=0.000505365;OID=.;OPOS=24035970;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:86:84:3:3:81:81:23:58:2:1:23:58:2:1 chr22 24038847 . T C 282.17 PASS AO=16;DP=30;FAO=29;FDP=29;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0603737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.7656;QD=38.9201;RBI=0.305993;REFB=0;REVB=0.299977;RO=0;SAF=13;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.78418e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00642996;OID=.;OPOS=24038847;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:29:29:0:0:16:29:3:13:0:0:14:15:0:0 chr22 24086107 . A G 445.68 PASS AO=79;DP=124;FAO=79;FDP=123;FR=.;FRO=44;FSAF=39;FSAR=40;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=0.0196275;FXX=0.00806387;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.253;QD=14.4936;RBI=0.0662537;REFB=-0.0186759;REVB=-0.0632797;RO=44;SAF=39;SAR=40;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108557;STB=0.505866;TYPE=snp;VARB=0.00946974;OID=.;OPOS=24086107;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:124:123:44:44:79:79:40:39:21:23:40:39:21:23 chr22 24108412 . G A 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0420911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.827;QD=35.0852;RBI=0.0540021;REFB=0;REVB=0.0338315;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00440044;OID=.;OPOS=24108412;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:3:4:0:0:3:4:0:0 chr22 24143502 . C G 447.45 PASS AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0433185;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=233.049;QD=36.5261;RBI=0.0453434;REFB=-0.0173551;REVB=0.0133991;RO=0;SAF=14;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517234;TYPE=snp;VARB=0.000114692;OID=.;OPOS=24143502;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:49:49:0:1:48:48:34:14:0:0:34:14:1:0 chr22 24300633 . G C 33.16 PASS AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.070131;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=33.7609;QD=16.5802;RBI=0.0806299;REFB=-0.0810895;REVB=0.0397847;RO=2;SAF=4;SAR=1;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171367;STB=0.635921;TYPE=snp;VARB=0.0653987;OID=.;OPOS=24300633;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:8:8:2:3:5:5:1:4:2:0:1:4:3:0 chr22 24300635 . G T 34.34 PASS AO=4;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0112714;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=247.041;QD=22.8918;RBI=0.118649;REFB=-0.00364465;REVB=0.118113;RO=1;SAF=4;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.555346;TYPE=snp;VARB=0.00355693;OID=.;OPOS=24300635;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:6:6:1:1:4:5:0:4:1:0:1:4:1:0 chr22 24323227 . G A 362 PASS AO=136;DP=390;FAO=136;FDP=390;FR=.;FRO=254;FSAF=57;FSAR=79;FSRF=130;FSRR=124;FWDB=-0.00259464;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.093;QD=3.71284;RBI=0.00935319;REFB=0.00422001;REVB=0.0089861;RO=250;SAF=57;SAR=79;SRF=129;SRR=121;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111155;STB=0.560764;TYPE=snp;VARB=-0.00626387;OID=.;OPOS=24323227;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:390:390:250:254:136:136:79:57:129:121:79:57:130:124 chr22 24325062 . G A 401.36 PASS AO=57;DP=73;FAO=57;FDP=72;FR=.;FRO=15;FSAF=36;FSAR=21;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=0.0328992;FXX=0.0136968;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.139;QD=22.2978;RBI=0.0498253;REFB=-0.0252525;REVB=0.0374192;RO=15;SAF=36;SAR=21;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171403;STB=0.591895;TYPE=snp;VARB=0.00561762;OID=.;OPOS=24325062;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:73:72:15:15:57:57:21:36:3:12:21:36:3:12 chr22 24325182 . G A 254.96 PASS AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00689329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.557;QD=37.7721;RBI=0.0397431;REFB=0;REVB=0.0391408;RO=0;SAF=22;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00118176;OID=.;OPOS=24325182;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:27:27:0:0:27:27:5:22:0:0:5:22:0:0 chr22 24459438 . T C 1466.39 PASS AO=139;DP=139;FAO=156;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0606834;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.534;QD=37.5997;RBI=0.0624433;REFB=0;REVB=0.0147203;RO=0;SAF=71;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.36214e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000184536;OID=.;OPOS=24459438;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:139:156:0:0:139:156:68:71:0:0:70:86:0:0 chr22 24479178 . C T 56.03 PASS AO=21;DP=68;FAO=21;FDP=68;FR=.;FRO=47;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=32;FSRR=15;FWDB=0.0328478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.9604;QD=3.29589;RBI=0.0690358;REFB=-5.34709e-05;REVB=0.0607203;RO=46;SAF=13;SAR=8;SRF=32;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0973968;STB=0.546239;TYPE=snp;VARB=0.00421775;OID=.;OPOS=24479178;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:68:68:46:47:21:21:8:13:32:14:8:13:32:15 chr22 24621293 . T C 39.78 PASS AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.00654094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.754;QD=12.2402;RBI=0.0237321;REFB=-0.0129183;REVB=0.0228129;RO=6;SAF=5;SAR=2;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.329175;STB=0.6871;TYPE=snp;VARB=0.00651938;OID=.;OPOS=24621293;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:13:13:6:6:7:7:2:5:6:0:2:5:6:0 chr22 24622648 . T C 182.23 PASS AO=39;DP=82;FAO=43;FDP=86;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=28;FSRF=9;FSRR=34;FWDB=0.0220305;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.6718;QD=8.47573;RBI=0.0289205;REFB=-0.002235;REVB=0.0187364;RO=42;SAF=15;SAR=24;SRF=9;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176285;STB=0.58049;TYPE=snp;VARB=0.0013827;OID=.;OPOS=24622648;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:86:42:43:39:43:24:15:9:33:28:15:9:34 chr22 24628908 . G A 74.47 PASS AO=15;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.074302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.5154;QD=9.60961;RBI=0.0831958;REFB=-0.0253969;REVB=0.0374267;RO=15;SAF=8;SAR=7;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118644;STB=0.551804;TYPE=snp;VARB=0.0282939;OID=.;OPOS=24628908;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:31:31:15:15:15:16:7:8:10:5:7:9:10:5 chr22 24717850 . A G 893.1 PASS AO=91;DP=92;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.413;QD=38.0043;RBI=0.0123682;REFB=0;REVB=0.0048896;RO=0;SAF=54;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.99307e-05;OID=.;OPOS=24717850;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:92:94:0:0:91:94:37:54:0:0:39:55:0:0 chr22 24734409 . GAAAAC GAAAC,GAAAA 22.06 PASS AO=12,25;DP=85;FAO=0,25;FDP=80;FR=.;FRO=55;FSAF=0,4;FSAR=0,21;FSRF=15;FSRR=40;FWDB=-0.500222,-0.0675825;FXX=0.0243873;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=17.7885,14.2764;QD=1.10278;RBI=0.575113,0.0815111;REFB=-0.0164292,-0.145367;REVB=-0.283784,-0.0455705;RO=34;SAF=7,1;SAR=5,24;SRF=8;SRR=26;SSEN=0.376344,0;SSEP=0,0.462963;SSSB=0.405313,-0.520148;STB=0.5,0.62042;TYPE=del,del;VARB=0,0.175687;OID=.,.;OPOS=24734410,24734414;OREF=A,C;OALT=-,-;OMAPALT=GAAAC,GAAAA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:12,25:80:0,25:80:55:0,4:0,21:15:40:22:34:7,1:5,24:8:26 chr22 24761467 . G A 978.24 PASS AO=97;DP=100;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00899963;FXX=0.0186898;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.342;QD=37.2663;RBI=0.0570977;REFB=-0.0360453;REVB=0.056384;RO=0;SAF=69;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000683924;OID=.;OPOS=24761467;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:100:105:0:0:97:105:28:69:0:0:36:69:0:0 chr22 24811667 . G A 21.47 PASS AO=9;DP=37;FAO=9;FDP=37;FR=.;FRO=28;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=-0.00820066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.359;QD=2.32136;RBI=0.00920602;REFB=0.000440675;REVB=0.0041833;RO=27;SAF=4;SAR=5;SRF=8;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184833;STB=0.596072;TYPE=snp;VARB=-0.00157586;OID=.;OPOS=24811667;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:37:37:27:28:9:9:5:4:8:19:5:4:9:19 chr22 24837301 . T C 161.34 PASS AO=38;DP=79;FAO=38;FDP=80;FR=.;FRO=42;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=-0.000625896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.808;QD=8.06713;RBI=0.0671012;REFB=-0.00824813;REVB=-0.0670983;RO=41;SAF=15;SAR=23;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192728;STB=0.505492;TYPE=snp;VARB=0.009619;OID=.;OPOS=24837301;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:80:41:42:38:38:23:15:17:24:23:15:17:25 chr22 24898310 . C T 307.84 PASS AO=78;DP=170;FAO=78;FDP=169;FR=.;FRO=91;FSAF=30;FSAR=48;FSRF=30;FSRR=61;FWDB=0.0369601;FXX=0.00588201;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.2551;QD=7.28607;RBI=0.0373951;REFB=-0.0221571;REVB=-0.00568723;RO=89;SAF=30;SAR=48;SRF=30;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0489869;STB=0.531699;TYPE=snp;VARB=0.017578;OID=.;OPOS=24898310;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:169:89:91:78:78:48:30:30:59:48:30:30:61 chr22 24964128 . T C 904.53 PASS AO=93;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.039068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.086;QD=38.0855;RBI=0.0391177;REFB=0;REVB=0.00196951;RO=0;SAF=57;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.09153e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.0767e-05;OID=.;OPOS=24964128;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:95:95:0:0:93:95:36:57:0:0:37:58:0:0 chr22 25003922 . G A 32.03 PASS AO=13;DP=54;FAO=14;FDP=54;FR=.,HEALED;FRO=40;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=-0.0445546;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=88.8468;QD=2.37285;RBI=0.0668534;REFB=-0.0257262;REVB=-0.0498424;RO=30;SAF=8;SAR=5;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0968897;STB=0.65946;TYPE=snp;VARB=0.0295706;OID=.;OPOS=25003922;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:52:54:30:40:13:14:5:8:16:14:5:9:17:23 chr22 25044198 . T C 29.46 PASS AO=12;DP=45;FAO=12;FDP=45;FR=.;FRO=33;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=23;FWDB=-0.0108593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.1928;QD=2.61831;RBI=0.0333093;REFB=-0.00872965;REVB=0.0314894;RO=31;SAF=5;SAR=7;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117185;STB=0.588097;TYPE=snp;VARB=0.0209733;OID=.;OPOS=25044198;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:45:45:31:33:12:12:7:5:10:21:7:5:10:23 chr22 25145453 . C T 878.17 PASS AO=94;DP=96;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207769;FXX=0.0208312;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.5944;QD=37.3689;RBI=0.0740743;REFB=-0.0704678;REVB=0.0711008;RO=1;SAF=26;SAR=68;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0069228;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00117635;OID=.;OPOS=25145453;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:96:94:1:0:94:94:68:26:0:1:68:26:0:0 chr22 25145471 . A G 856.02 PASS AO=90;DP=91;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230372;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.637;QD=38.0453;RBI=0.0285814;REFB=0;REVB=-0.0169169;RO=0;SAF=31;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.6259e-06;OID=.;OPOS=25145471;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:91:90:0:0:90:90:59:31:0:0:59:31:0:0 chr22 25425282 . A G 50.32 PASS AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=15;FSRR=5;FWDB=-0.0196144;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.288;QD=6.09902;RBI=0.0394475;REFB=-0.00314389;REVB=-0.0342255;RO=20;SAF=11;SAR=2;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162142;STB=0.596733;TYPE=snp;VARB=0.00337866;OID=.;OPOS=25425282;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:33:33:20:20:13:13:2:11:15:5:2:11:15:5 chr22 25714110 . T C 183.14 PASS AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00979209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.785;QD=38.5548;RBI=0.0247802;REFB=0;REVB=0.0227634;RO=0;SAF=14;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000268861;OID=.;OPOS=25714110;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:19:19:0:0:19:19:5:14:0:0:5:14:0:0 chr22 25714113 . A G 182.19 PASS AO=18;DP=18;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.242;QD=38.3561;RBI=0.0451479;REFB=0;REVB=0.043324;RO=0;SAF=13;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000385147;OID=.;OPOS=25714113;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:18:19:0:0:18:19:5:13:0:0:5:14:0:0 chr22 25715923 . G A 98.34 PASS AO=33;DP=101;FAO=35;FDP=103;FR=.;FRO=68;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=30;FSRR=38;FWDB=0.017959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.845;QD=3.81895;RBI=0.0187831;REFB=-0.0133103;REVB=0.00550253;RO=66;SAF=18;SAR=15;SRF=29;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121371;STB=0.566813;TYPE=snp;VARB=0.0334202;OID=.;OPOS=25715923;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:98:101:103:66:68:33:35:15:18:29:37:16:19:30:38 chr22 25715931 . A G 79.8 PASS AO=30;DP=97;FAO=31;FDP=98;FR=.;FRO=67;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=30;FSRR=37;FWDB=0.0112361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6176;QD=3.25713;RBI=0.0187302;REFB=-0.00436391;REVB=0.0149856;RO=63;SAF=15;SAR=15;SRF=28;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0644989;STB=0.524737;TYPE=snp;VARB=0.0115056;OID=.;OPOS=25715931;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:97:98:63:67:30:31:15:15:28:35:16:15:30:37 chr22 25753321 . G A 306.08 PASS AO=62;DP=111;FAO=62;FDP=111;FR=.;FRO=49;FSAF=27;FSAR=35;FSRF=12;FSRR=37;FWDB=-0.00311678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.3501;QD=11.0299;RBI=0.0264039;REFB=-0.0201865;REVB=0.0262193;RO=49;SAF=27;SAR=35;SRF=12;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160592;STB=0.587462;TYPE=snp;VARB=0.0167326;OID=.;OPOS=25753321;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:49:49:62:62:35:27:12:37:35:27:12:37 chr22 26159289 . G A 167.63 PASS AO=42;DP=86;FAO=40;FDP=84;FR=.;FRO=44;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=33;FWDB=0.0239975;FXX=0.0232531;HRUN=5;LEN=1;MLLD=230.334;QD=7.98238;RBI=0.0240009;REFB=-0.00867361;REVB=-0.000403253;RO=40;SAF=21;SAR=21;SRF=11;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199051;STB=0.642287;TYPE=snp;VARB=0.0101773;OID=.;OPOS=26159289;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:84:40:44:42:40:21:21:11:29:19:21:11:33 chr22 26164079 . C T 121.39 PASS AO=30;DP=66;FAO=30;FDP=66;FR=.;FRO=36;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=26;FSRR=10;FWDB=0.0326082;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=117.355;QD=7.35685;RBI=0.0326454;REFB=-0.0215104;REVB=0.00155926;RO=36;SAF=16;SAR=14;SRF=26;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187465;STB=0.604872;TYPE=snp;VARB=0.020212;OID=.;OPOS=26164079;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:36:36:30:30:14:16:26:10:14:16:26:10 chr22 26166900 . G C 481.19 PASS AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.025515;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.191;QD=37.7406;RBI=0.0270017;REFB=0;REVB=0.0088363;RO=0;SAF=19;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.2152e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.61889e-05;OID=.;OPOS=26166900;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:51:51:0:0:51:51:32:19:0:0:32:19:0:0 chr22 26173661 . T C 115.68 PASS AO=11;DP=12;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0254869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.264;QD=35.5931;RBI=0.0351263;REFB=0;REVB=0.0241718;RO=0;SAF=7;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.04832e-06;OID=.;OPOS=26173661;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:12:13:0:0:11:13:4:7:0:0:4:9:0:0 chr22 26193982 . C G 92.44 PASS AO=18;DP=36;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=17;FWDB=-0.09729;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5939;QD=10.2708;RBI=0.100808;REFB=-0.034648;REVB=0.0263973;RO=18;SAF=3;SAR=15;SRF=0;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.343232;STB=0.673339;TYPE=snp;VARB=0.037231;OID=.;OPOS=26193982;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:36:36:18:17:18:19:15:3:0:18:16:3:0:17 chr22 26239850 . C A 34.79 PASS AO=13;DP=45;FAO=13;FDP=45;FR=.;FRO=32;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=30;FWDB=0.0694599;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2515;QD=3.0924;RBI=0.0750784;REFB=-0.00957779;REVB=-0.0284972;RO=32;SAF=4;SAR=9;SRF=2;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.425825;STB=0.742616;TYPE=snp;VARB=0.0268806;OID=.;OPOS=26239850;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:45:45:32:32:13:13:9:4:2:30:9:4:2:30 chr22 26695077 . G T 125.97 PASS AO=24;DP=42;FAO=24;FDP=42;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.0235076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.425;QD=11.9969;RBI=0.0511289;REFB=-0.030694;REVB=0.0454044;RO=18;SAF=9;SAR=15;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183917;STB=0.602323;TYPE=snp;VARB=0.0286742;OID=.;OPOS=26695077;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:42:42:18:18:24:24:15:9:11:7:15:9:11:7 chr22 26702015 . A C 160.75 PASS AO=34;DP=64;FAO=35;FDP=67;FR=.;FRO=32;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.0658395;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.129;QD=9.5969;RBI=0.106299;REFB=-0.0662015;REVB=-0.0834544;RO=30;SAF=23;SAR=11;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130693;STB=0.548595;TYPE=snp;VARB=0.0484492;OID=.;OPOS=26702015;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:67:30:32:34:35:11:23:16:14:12:23:18:14 chr22 26853905 . C A 516.14 PASS AO=61;DP=66;FAO=61;FDP=66;FR=.;FRO=5;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.00665143;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.871;QD=31.2812;RBI=0.0265169;REFB=0.0148493;REVB=0.0256691;RO=5;SAF=28;SAR=33;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.06633;STB=0.5352;TYPE=snp;VARB=9.0064e-05;OID=.;OPOS=26853905;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:66:66:5:5:61:61:33:28:0:5:33:28:0:5 chr22 26854441 . G A 829.82 PASS AO=89;DP=91;FAO=89;FDP=90;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0322634;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.502;QD=36.8807;RBI=0.0439058;REFB=0.0220009;REVB=0.0297791;RO=1;SAF=44;SAR=45;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0104156;STB=0.505493;TYPE=snp;VARB=-0.000306418;OID=.;OPOS=26854441;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:91:90:1:1:89:89:45:44:0:1:45:44:0:1 chr22 26859942 . C T 392.42 PASS AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00013834;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.29;QD=37.3731;RBI=0.000582314;REFB=0;REVB=0.000565643;RO=0;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.62205e-06;OID=.;OPOS=26859942;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:42:42:0:0:42:42:21:21:0:0:21:21:0:0 chr22 26860269 . G C 131.72 PASS AO=38;DP=98;FAO=39;FDP=99;FR=.;FRO=60;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=33;FSRR=27;FWDB=0.0379393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.9423;QD=5.32189;RBI=0.0472373;REFB=-0.0141976;REVB=0.0281421;RO=60;SAF=21;SAR=17;SRF=33;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0028608;STB=0.508666;TYPE=snp;VARB=0.0083031;OID=.;OPOS=26860269;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:99:60:60:38:39:17:21:33:27:17:22:33:27 chr22 26862041 . G A 252.33 PASS AO=83;DP=219;FAO=83;FDP=220;FR=.;FRO=137;FSAF=43;FSAR=40;FSRF=66;FSRR=71;FWDB=0.00135217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.3637;QD=4.58785;RBI=0.0202854;REFB=-0.00709539;REVB=-0.0202403;RO=136;SAF=43;SAR=40;SRF=65;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0440981;STB=0.522605;TYPE=snp;VARB=0.00893727;OID=.;OPOS=26862041;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:219:220:136:137:83:83:40:43:65:71:40:43:66:71 chr22 26862212 . T C 1434.43 PASS AO=141;DP=141;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0231655;FXX=0.0192295;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.773;QD=37.5015;RBI=0.0231968;REFB=0.0594554;REVB=-0.00120501;RO=0;SAF=67;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000342686;OID=.;OPOS=26862212;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:141:153:0:0:141:153:74:67:0:0:81:72:0:0 chr22 26884039 . G A 1614.64 PASS AO=197;DP=221;FAO=199;FDP=220;FR=.;FRO=21;FSAF=92;FSAR=107;FSRF=21;FSRR=0;FWDB=0.0150336;FXX=0.0178563;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.197;QD=29.3571;RBI=0.0357322;REFB=-0.0064854;REVB=0.0324157;RO=20;SAF=90;SAR=107;SRF=20;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0948627;STB=0.551214;TYPE=snp;VARB=0.00124075;OID=.;OPOS=26884039;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:221:220:20:21:197:199:107:90:20:0:107:92:21:0 chr22 26895337 . G A 613.19 PASS AO=64;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0421971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.152;QD=37.7346;RBI=0.0778233;REFB=0;REVB=0.0653902;RO=0;SAF=37;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.1743e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000398403;OID=.;OPOS=26895337;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:65:65:0:0:64:65:27:37:0:0:28:37:0:0 chr22 26932150 . G A 2024.59 PASS AO=210;DP=210;FAO=210;FDP=210;FR=.;FRO=0;FSAF=99;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0207087;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.86;QD=38.5636;RBI=0.0672777;REFB=0;REVB=-0.0640113;RO=0;SAF=99;SAR=111;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.85394e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000272783;OID=.;OPOS=26932150;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:210:210:0:0:210:210:111:99:0:0:111:99:0:0 chr22 26937327 . C G 158.11 PASS AO=13;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0510398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.788;QD=37.2013;RBI=0.0755756;REFB=0;REVB=0.0557369;RO=0;SAF=8;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60098e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00123327;OID=.;OPOS=26937327;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:17:17:0:0:13:17:5:8:0:0:8:9:0:0 chr22 27021457 . T C 84.84 PASS AO=24;DP=64;FAO=24;FDP=61;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=-0.00929322;FXX=0.0468677;HRUN=3;LEN=1;MLLD=206.308;QD=5.56323;RBI=0.0109323;REFB=-0.0170435;REVB=-0.00575777;RO=35;SAF=13;SAR=11;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0874669;STB=0.565932;TYPE=snp;VARB=0.0291279;OID=.;OPOS=27021457;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:84:64:61:35:37:24:24:11:13:16:19:11:13:16:21 chr22 28146768 . A AG 245.95 PASS AO=9;DP=46;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0264297;FXX=0.0975372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=13.1409;QD=26.589;RBI=0.126259;REFB=0;REVB=-0.123462;RO=35;SAF=2;SAR=7;SRF=11;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142035;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-0.00229242;OID=.;OPOS=28146769;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:9:46:37:37:0:8:29:0:0:24:35:2:7:11:24 chr22 28146770 . A G 44.53 PASS AO=16;DP=40;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=19;FWDB=0.0119617;FXX=0;HRUN=12;LEN=1;MLLD=19.443;QD=4.24102;RBI=0.0121897;REFB=-0.00360392;REVB=0.00234633;RO=24;SAF=5;SAR=11;SRF=5;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133721;STB=0.584819;TYPE=snp;VARB=0.0367712;OID=.;OPOS=28146770;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:40:42:24:24:16:18:11:5:5:19:12:6:5:19 chr22 28196401 . GGCC GC,G,GGC 511.17 PASS AO=13,20,16;DP=75;FAO=0,50,30;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=0,17,21;FSAR=0,33,9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0199386,-0.0332814,-0.12146;FXX=0.0243873;HRUN=5,5,6;LEN=2,3,1;MLLD=18.094,25.8462,13.9002;QD=25.5582;RBI=0.170149,0.0350952,0.351266;REFB=0,0,0;REVB=-0.168977,-0.0111364,0.329599;RO=4;SAF=2,9,15;SAR=11,11,1;SRF=0;SRR=4;SSEN=0.555556,0.555556,0.515152;SSEP=0,0,0.611111;SSSB=0.139462,0.141223,0.585361;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=del,del,del;VARB=-0.0175463,0.0593795,-0.06987;OID=.,.,.;OPOS=28196402,28196402,28196403;OREF=GC,GCC,C;OALT=-,-,-;OMAPALT=GC,G,GGC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/3:13,20,16:65:0,50,30:80:0:0,17,21:0,33,9:0:0:42:4:2,9,15:11,11,1:0:4 chr22 28316591 . T TG 536.8 PASS AO=78;DP=88;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0860652;FXX=0.0113623;HRUN=2;LEN=1;MLLD=15.1098;QD=24.6805;RBI=0.209294;REFB=0;REVB=-0.190779;RO=3;SAF=25;SAR=53;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0275263;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-0.00632196;OID=.;OPOS=28316592;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:78:88:87:87:0:26:61:0:0:50:3:25:53:2:1 chr22 28378227 . GA G 26.85 PASS AO=7;DP=20;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.000902022;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.6917;QD=5.11407;RBI=0.191561;REFB=-0.0678582;REVB=0.191559;RO=12;SAF=6;SAR=1;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.500083;STB=0.710646;TYPE=del;VARB=0.136145;OID=.;OPOS=28378228;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:7:20:10:21:11:8:2:5:6:25:12:6:1:5:7 chr22 28378472 . A G 143.54 PASS AO=31;DP=61;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=0.0192643;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.525;QD=9.41222;RBI=0.0192646;REFB=-0.00284609;REVB=0.000113116;RO=30;SAF=11;SAR=20;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103844;STB=0.557997;TYPE=snp;VARB=0.00321287;OID=.;OPOS=28378472;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:30:30:31:31:20:11:14:16:20:11:14:16 chr22 28389453 . T C 78.66 PASS AO=15;DP=35;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=-0.0141334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.969;QD=8.50429;RBI=0.0224602;REFB=-0.0291966;REVB=-0.0174559;RO=18;SAF=12;SAR=3;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105699;STB=0.541622;TYPE=snp;VARB=0.021635;OID=.;OPOS=28389453;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:35:37:18:19:15:18:3:12:13:5:6:12:14:5 chr22 28424993 . C T 292.61 PASS AO=33;DP=74;FAO=37;FDP=73;FR=.,HEALED;FRO=21;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=4;FWDB=0.037205;FXX=0.0135117;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.6546;QD=16.0336;RBI=0.074277;REFB=-0.0289978;REVB=0.0642873;RO=20;SAF=21;SAR=12;SRF=17;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167856;STB=0.583208;TYPE=snp;VARB=0.0226166;OID=.;OPOS=28424993;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:73:73:20:21:33:37:12:21:17:3:15:22:17:4 chr22 28452145 . A C 69.1 PASS AO=17;DP=35;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=14;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.00769392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.717;QD=7.89691;RBI=0.0133333;REFB=-0.00289671;REVB=0.0108894;RO=17;SAF=14;SAR=3;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.377521;STB=0.804868;TYPE=snp;VARB=0.00564242;OID=.;OPOS=28452145;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:35:35:17:19:17:16:3:14:8:9:2:14:8:11 chr22 29120604 . G A 32.04 PASS AO=8;DP=21;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0479295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.163;QD=5.82604;RBI=0.0523767;REFB=-0.0197457;REVB=-0.0211209;RO=13;SAF=4;SAR=4;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118061;STB=0.590689;TYPE=snp;VARB=0.0424458;OID=.;OPOS=29120604;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:21:22:13:14:8:8:4:4:5:8:4:4:5:9 chr22 29446611 . A C 104.28 PASS AO=22;DP=64;FAO=29;FDP=69;FR=.;FRO=40;FSAF=23;FSAR=6;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=0.0439032;FXX=0.028165;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.54;QD=6.04531;RBI=0.0467915;REFB=-0.0301874;REVB=0.0161849;RO=41;SAF=18;SAR=4;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.323737;STB=0.657023;TYPE=snp;VARB=0.0376074;OID=.;OPOS=29446611;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:64:69:41:40:22:29:4:18:24:17:6:23:23:17 chr22 29449691 . AAT A 69.83 PASS AO=16;DP=55;FAO=22;FDP=38;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.242303;FXX=0.173875;HRUN=6;LEN=2;MLLD=16.777;QD=7.35037;RBI=0.304065;REFB=0.175713;REVB=-0.183697;RO=21;SAF=8;SAR=8;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0703014;STB=0.565158;TYPE=del;VARB=-0.0885343;OID=.;OPOS=29449692;OREF=AT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:16:54:22:38:16:9:13:9:7:30:21:8:8:12:9 chr22 29450923 . A G 310.88 PASS AO=81;DP=179;FAO=81;FDP=179;FR=.;FRO=98;FSAF=35;FSAR=46;FSRF=35;FSRR=63;FWDB=0.0113122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.961;QD=6.94702;RBI=0.0185408;REFB=-0.017046;REVB=0.01469;RO=97;SAF=35;SAR=46;SRF=34;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0827966;STB=0.542278;TYPE=snp;VARB=0.0241023;OID=.;OPOS=29450923;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:179:179:97:98:81:81:46:35:34:63:46:35:35:63 chr22 29451656 . A G 16.08 PASS AO=3;DP=6;FAO=3;FDP=6;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0138275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.709;QD=10.7182;RBI=0.0315779;REFB=-0.00680787;REVB=0.0283895;RO=2;SAF=1;SAR=2;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111102;STB=0.665552;TYPE=snp;VARB=0.0133396;OID=.;OPOS=29451656;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:6:6:2:3:3:3:2:1:1:1:2:1:2:1 chr22 29453027 . A G 1213.6 PASS AO=130;DP=132;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0215208;FXX=0.00757518;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.153;QD=37.0565;RBI=0.0216041;REFB=-0.0195052;REVB=0.00189504;RO=1;SAF=50;SAR=80;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00590415;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000291314;OID=.;OPOS=29453027;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:132:131:1:0:130:131:80:50:0:1:81:50:0:0 chr22 29453142 . A G 298.49 PASS AO=58;DP=107;FAO=59;FDP=103;FR=.;FRO=44;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=15;FSRR=29;FWDB=-0.0106139;FXX=0.0373797;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.227;QD=11.5918;RBI=0.0133741;REFB=0.00229502;REVB=-0.008137;RO=39;SAF=33;SAR=25;SRF=12;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191085;STB=0.59977;TYPE=snp;VARB=-0.000908069;OID=.;OPOS=29453142;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:103:39:44:58:59:25:33:12:27:25:34:15:29 chr22 29453193 . G C 252.18 PASS AO=65;DP=144;FAO=65;FDP=143;FR=.;FRO=78;FSAF=22;FSAR=43;FSRF=39;FSRR=39;FWDB=-0.00708116;FXX=0.0137922;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.61;QD=7.05401;RBI=0.0239193;REFB=-0.0192516;REVB=-0.0228471;RO=78;SAF=22;SAR=43;SRF=39;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165829;STB=0.592471;TYPE=snp;VARB=0.0278134;OID=.;OPOS=29453193;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:143:78:78:65:65:43:22:39:39:43:22:39:39 chr22 29456733 . T C 666.53 PASS AO=193;DP=440;FAO=179;FDP=398;FR=.;FRO=219;FSAF=91;FSAR=88;FSRF=107;FSRR=112;FWDB=0.01923;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.5085;QD=6.6988;RBI=0.0196187;REFB=-0.0187635;REVB=0.00388584;RO=244;SAF=96;SAR=97;SRF=115;SRR=129;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0263295;STB=0.51089;TYPE=snp;VARB=0.0231195;OID=.;OPOS=29456733;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:440:398:244:219:193:179:97:96:115:129:88:91:107:112 chr22 29542182 . AT A 88.04 PASS AO=44;DP=127;FAO=47;FDP=122;FR=.;FRO=75;FSAF=12;FSAR=35;FSRF=14;FSRR=61;FWDB=0.0525261;FXX=0.0161277;HRUN=2;LEN=1;MLLD=23.5562;QD=2.88656;RBI=0.0559546;REFB=-0.00917084;REVB=-0.0192854;RO=71;SAF=11;SAR=33;SRF=11;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151226;STB=0.558658;TYPE=del;VARB=0.0166883;OID=.;OPOS=29542183;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:44:123:47:122:75:12:35:14:61:88:71:11:33:11:60 chr22 29542748 . C A 3319.45 PASS AO=336;DP=342;FAO=348;FDP=348;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=260;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175187;FXX=0.0113633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9435;QD=38.1547;RBI=0.0298141;REFB=0;REVB=0.0241242;RO=0;SAF=82;SAR=254;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.08319e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000270785;OID=.;OPOS=29542748;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:342:348:0:0:336:348:254:82:0:0:260:88:0:0 chr22 29656389 . G T 142.11 PASS AO=30;DP=60;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=23;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.0356443;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.011;QD=9.31892;RBI=0.0372091;REFB=-0.00931721;REVB=0.0106772;RO=30;SAF=8;SAR=22;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140496;STB=0.583699;TYPE=snp;VARB=0.0146538;OID=.;OPOS=29656389;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:61:30:30:30:31:22:8:12:18:23:8:12:18 chr22 29657356 . CG C 136.99 PASS AO=13;DP=52;FAO=26;FDP=29;FR=.;FRO=3;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0671756;FXX=0.0333222;HRUN=3;LEN=1;MLLD=17.01;QD=18.8956;RBI=0.0671937;REFB=0.0225023;REVB=0.00155978;RO=4;SAF=0;SAR=13;SRF=0;SRR=4;SSEN=0.477876;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.534858;TYPE=del;VARB=0.000704533;OID=.;OPOS=29657357;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:13:21:26:29:3:6:20:0:3:4:4:0:13:0:4 chr22 29668263 . G A 488.86 PASS AO=129;DP=293;FAO=132;FDP=293;FR=.;FRO=161;FSAF=68;FSAR=64;FSRF=88;FSRR=73;FWDB=0.000216116;FXX=0.00677943;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.375;QD=6.67392;RBI=0.0119325;REFB=-0.0098905;REVB=0.0119305;RO=159;SAF=66;SAR=63;SRF=87;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0354839;STB=0.517303;TYPE=snp;VARB=0.0105567;OID=.;OPOS=29668263;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:293:293:159:161:129:132:63:66:87:72:64:68:88:73 chr22 29704125 . C T 178.21 PASS AO=33;DP=55;FAO=33;FDP=55;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=29;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.0227041;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.164;QD=12.9609;RBI=0.0227837;REFB=-0.011092;REVB=-0.00190215;RO=22;SAF=4;SAR=29;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.342331;STB=0.691603;TYPE=snp;VARB=0.00954363;OID=.;OPOS=29704125;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:79:55:55:22:22:33:33:29:4:9:13:29:4:9:13 chr22 29707900 . G C 12.49 PASS AO=3;DP=13;FAO=3;FDP=13;FR=.,HEALED;FRO=10;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.00446196;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=32.7538;QD=3.8428;RBI=0.151482;REFB=-0.0300951;REVB=-0.151417;RO=7;SAF=2;SAR=1;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102358;STB=0.69871;TYPE=snp;VARB=0.0456403;OID=.;OPOS=29707900;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:13:13:7:10:3:3:1:2:4:3:1:2:4:6 chr22 29708649 . G A 78.32 PASS AO=29;DP=94;FAO=30;FDP=94;FR=.;FRO=64;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=16;FSRR=48;FWDB=0.0115766;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.964;QD=3.33289;RBI=0.0122403;REFB=-0.000113965;REVB=-0.00397589;RO=63;SAF=7;SAR=22;SRF=16;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0198066;STB=0.514696;TYPE=snp;VARB=0.000402788;OID=.;OPOS=29708649;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:94:94:63:64:29:30:22:7:16:47:22:8:16:48 chr22 29727866 . C T 64.53 PASS AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=14;FWDB=0.0634802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.601;QD=8.60411;RBI=0.0634815;REFB=-0.0123099;REVB=0.000404648;RO=16;SAF=1;SAR=13;SRF=2;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154694;STB=0.590759;TYPE=snp;VARB=0.00974427;OID=.;OPOS=29727866;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:30:30:16:16:14:14:13:1:2:14:13:1:2:14 chr22 29727886 . T C 100.92 PASS AO=11;DP=12;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0385428;FXX=0.153728;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.943;QD=36.6975;RBI=0.0452887;REFB=0;REVB=0.0237806;RO=0;SAF=1;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000189714;OID=.;OPOS=29727886;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:11:0:0:11:11:10:1:0:0:10:1:0:0 chr22 29746075 . AC A 602.38 PASS AO=63;DP=92;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0456189;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=17.9306;QD=26.4782;RBI=0.362015;REFB=-0.00574642;REVB=0.359129;RO=21;SAF=17;SAR=46;SRF=3;SRR=18;SSEN=0.288591;SSEP=0;SSSB=0.0781753;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00829064;OID=.;OPOS=29746076;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:63:87:91:91:0:23:68:0:0:47:21:17:46:3:18 chr22 29755888 . T C 310.61 PASS AO=76;DP=160;FAO=76;FDP=160;FR=.;FRO=84;FSAF=36;FSAR=40;FSRF=30;FSRR=54;FWDB=-0.0111626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.743;QD=7.76528;RBI=0.0138609;REFB=0.00620506;REVB=-0.00821706;RO=84;SAF=36;SAR=40;SRF=30;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111857;STB=0.561737;TYPE=snp;VARB=-0.00508293;OID=.;OPOS=29755888;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:160:84:84:76:76:40:36:30:54:40:36:30:54 chr22 29837537 . T C 256.05 PASS AO=66;DP=146;FAO=66;FDP=145;FR=.;FRO=79;FSAF=37;FSAR=29;FSRF=46;FSRR=33;FWDB=-0.0118066;FXX=0.00684885;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.008;QD=7.06336;RBI=0.0215782;REFB=-0.00678914;REVB=-0.0180617;RO=76;SAF=37;SAR=29;SRF=43;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00507621;STB=0.512015;TYPE=snp;VARB=0.00861404;OID=.;OPOS=29837537;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:145:76:79:66:66:29:37:43:33:29:37:46:33 chr22 29837566 . TTCCTCCTCAT TTCCTCCTCA,TTCCTCAT 215.74 PASS AO=26,53;DP=167;FAO=0,78;FDP=162;FR=.;FRO=84;FSAF=0,38;FSAR=0,40;FSRF=49;FSRR=35;FWDB=-0.387532,-0.0100299;FXX=0.0121944;HRUN=3,2;LEN=1,3;MLLD=17.6532,172.757;QD=5.32692;RBI=0.389237,0.0292203;REFB=-0.0975048,-0.0297833;REVB=-0.0363947,-0.027445;RO=53;SAF=26,17;SAR=0,36;SRF=20;SRR=33;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.835405,-0.0572719;STB=0.5,0.54975;TYPE=del,del;VARB=0,0.0247995;OID=.,.;OPOS=29837576,29837567;OREF=T,TCC;OALT=-,-;OMAPALT=TTCCTCCTCA,TTCCTCAT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:26,53:135:0,78:162:84:0,38:0,40:49:35:99:53:26,17:0,36:20:33 chr22 29885861 . T C 107.91 PASS AO=11;DP=11;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0268138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.634;QD=35.9697;RBI=0.0647244;REFB=0;REVB=0.058909;RO=0;SAF=1;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000762599;OID=.;OPOS=29885861;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:12:0:0:11:12:10:1:0:0:11:1:0:0 chr22 29886413 . A G 543.49 PASS AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0410479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3442;QD=38.1395;RBI=0.0524435;REFB=0;REVB=0.0326403;RO=0;SAF=25;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000764505;OID=.;OPOS=29886413;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:57:57:0:0:57:57:32:25:0:0:32:25:0:0 chr22 29886893 . G T 736.12 PASS AO=81;DP=83;FAO=81;FDP=83;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=63;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0161713;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.285;QD=35.4754;RBI=0.0208194;REFB=-0.0713049;REVB=-0.0131125;RO=0;SAF=18;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.526309;TYPE=snp;VARB=0.00113477;OID=.;OPOS=29886893;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:83:83:0:2:81:81:63:18:0:0:63:18:2:0 chr22 29904519 . T C 395.39 PASS AO=95;DP=197;FAO=96;FDP=199;FR=.;FRO=103;FSAF=42;FSAR=54;FSRF=41;FSRR=62;FWDB=0.00184164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.003;QD=7.94749;RBI=0.0138533;REFB=-0.00989346;REVB=0.0137303;RO=101;SAF=42;SAR=53;SRF=41;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0344382;STB=0.520842;TYPE=snp;VARB=0.011688;OID=.;OPOS=29904519;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:199:101:103:95:96:53:42:41:60:54:42:41:62 chr22 29913272 . C T 291.79 PASS AO=88;DP=214;FAO=88;FDP=217;FR=.;FRO=129;FSAF=39;FSAR=49;FSRF=52;FSRR=77;FWDB=-0.00224372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.138;QD=5.37854;RBI=0.00273189;REFB=-0.00857982;REVB=0.00155851;RO=125;SAF=39;SAR=49;SRF=52;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0289962;STB=0.524266;TYPE=snp;VARB=0.00911316;OID=.;OPOS=29913272;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:217:125:129:88:88:49:39:52:73:49:39:52:77 chr22 29957570 . G A 368.8 PASS AO=81;DP=160;FAO=84;FDP=163;FR=.;FRO=79;FSAF=45;FSAR=39;FSRF=41;FSRR=38;FWDB=0.0133173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.24;QD=9.05043;RBI=0.0142386;REFB=-0.0134415;REVB=0.00503857;RO=77;SAF=43;SAR=38;SRF=40;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101294;STB=0.508137;TYPE=snp;VARB=0.0117063;OID=.;OPOS=29957570;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:160:163:77:79:81:84:38:43:40:37:39:45:41:38 chr22 29960335 . A G 447.17 PASS AO=108;DP=228;FAO=110;FDP=230;FR=.;FRO=120;FSAF=37;FSAR=73;FSRF=44;FSRR=76;FWDB=0.0138549;FXX=0.00432882;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.042;QD=7.77693;RBI=0.0178658;REFB=-0.0131475;REVB=-0.0112796;RO=118;SAF=36;SAR=72;SRF=44;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0414386;STB=0.517501;TYPE=snp;VARB=0.0162806;OID=.;OPOS=29960335;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:228:230:118:120:108:110:72:36:44:74:73:37:44:76 chr22 30306797 . T G 168.37 PASS AO=44;DP=104;FAO=46;FDP=108;FR=.;FRO=62;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=34;FSRR=28;FWDB=0.0122547;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.666;QD=6.23574;RBI=0.0148125;REFB=-7.22099e-05;REVB=-0.00832064;RO=53;SAF=20;SAR=24;SRF=29;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0904084;STB=0.540175;TYPE=snp;VARB=3.39325e-05;OID=.;OPOS=30306797;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:108:53:62:44:46:24:20:29:24:24:22:34:28 chr22 30421879 . T C 401.43 PASS AO=112;DP=255;FAO=112;FDP=256;FR=.;FRO=144;FSAF=73;FSAR=39;FSRF=94;FSRR=50;FWDB=-0.00722646;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.1589;QD=6.27231;RBI=0.0581579;REFB=-0.00615051;REVB=-0.0577071;RO=136;SAF=73;SAR=39;SRF=92;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0271881;STB=0.500615;TYPE=snp;VARB=0.00676738;OID=.;OPOS=30421879;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:255:256:136:144:112:112:39:73:92:44:39:73:94:50 chr22 30423460 . C T 319.52 PASS AO=79;DP=168;FAO=79;FDP=167;FR=.;FRO=88;FSAF=50;FSAR=29;FSRF=52;FSRR=36;FWDB=0.0127529;FXX=0.00595203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.152;QD=7.65323;RBI=0.01435;REFB=0.0151354;REVB=-0.0065792;RO=87;SAF=50;SAR=29;SRF=52;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.035506;STB=0.523512;TYPE=snp;VARB=-0.0187101;OID=.;OPOS=30423460;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:167:87:88:79:79:29:50:52:35:29:50:52:36 chr22 30638664 . C T 147.48 PASS AO=37;DP=82;FAO=37;FDP=82;FR=.;FRO=45;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=31;FWDB=0.0367405;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.9489;QD=7.19415;RBI=0.041766;REFB=-0.00483777;REVB=-0.0198628;RO=45;SAF=16;SAR=21;SRF=14;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123579;STB=0.569047;TYPE=snp;VARB=0.0145513;OID=.;OPOS=30638664;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:45:45:37:37:21:16:14:31:21:16:14:31 chr22 30681257 . C G 134.76 PASS AO=13;DP=13;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0303995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.367;QD=35.9367;RBI=0.0346608;REFB=0;REVB=0.0166505;RO=0;SAF=10;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000168051;OID=.;OPOS=30681257;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:13:15:0:0:13:15:3:10:0:0:3:12:0:0 chr22 30683105 . G A 211.18 PASS AO=31;DP=48;FAO=35;FDP=52;FR=.;FRO=17;FSAF=27;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.0205394;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.424;QD=16.2445;RBI=0.0808739;REFB=-0.037746;REVB=0.0782223;RO=17;SAF=26;SAR=5;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19367;STB=0.55422;TYPE=snp;VARB=0.020202;OID=.;OPOS=30683105;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:48:52:17:17:31:35:5:26:11:6:8:27:11:6 chr22 30714683 . CA C,CC 808.73 PASS AO=52,27;DP=82;FAO=84,0;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=29,0;FSAR=55,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0840454,-0.138285;FXX=0.0232531;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=140.482,123.987;QD=38.511;RBI=0.135273,0.167624;REFB=0,0;REVB=0.105996,0.0947364;RO=0;SAF=1,26;SAR=51,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.000172278,0;OID=.,.;OPOS=30714684,30714684;OREF=A,A;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:52,27:79:84,0:84:0:29,0:55,0:0:0:38:0:1,26:51,1:0:0 chr22 30737771 . G T 212.8 PASS AO=52;DP=110;FAO=52;FDP=111;FR=.;FRO=59;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=37;FSRR=22;FWDB=-0.00235115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.4707;QD=7.66852;RBI=0.00405043;REFB=-0.0265185;REVB=-0.0032982;RO=58;SAF=21;SAR=31;SRF=36;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20442;STB=0.617612;TYPE=snp;VARB=0.0301997;OID=.;OPOS=30737771;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:111:58:59:52:52:31:21:36:22:31:21:37:22 chr22 30766466 . C T 154.4 PASS AO=30;DP=48;FAO=29;FDP=48;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=27;FSRF=3;FSRR=16;FWDB=-0.0373231;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.8755;QD=12.8667;RBI=0.0641366;REFB=-0.0356934;REVB=0.0521584;RO=16;SAF=3;SAR=27;SRF=2;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0422947;STB=0.61077;TYPE=snp;VARB=0.0342252;OID=.;OPOS=30766466;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:48:48:16:19:30:29:27:3:2:14:27:2:3:16 chr22 30770603 . T A 1691.53 PASS AO=178;DP=183;FAO=179;FDP=179;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0116624;FXX=0.0478698;HRUN=4;LEN=1;MLLD=229.396;QD=37.7994;RBI=0.0218732;REFB=-0.0629691;REVB=0.0185048;RO=2;SAF=73;SAR=105;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00898067;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000466605;OID=.;OPOS=30770603;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:183:179:2:0:178:179:105:73:0:2:106:73:0:0 chr22 30771554 . T G 627.92 PASS AO=65;DP=65;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0774065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.1686;QD=38.0558;RBI=0.117136;REFB=0;REVB=-0.0879147;RO=0;SAF=7;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.08399e-05;OID=.;OPOS=30771554;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:65:66:0:0:65:66:58:7:0:0:58:8:0:0 chr22 30782089 . A G 130.93 PASS AO=37;DP=93;FAO=38;FDP=95;FR=.;FRO=57;FSAF=12;FSAR=26;FSRF=18;FSRR=39;FWDB=0.00220365;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0338;QD=5.51267;RBI=0.0673927;REFB=0.000309084;REVB=-0.0673567;RO=56;SAF=11;SAR=26;SRF=18;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0301371;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00213487;OID=.;OPOS=30782089;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:95:56:57:37:38:26:11:18:38:26:12:18:39 chr22 30793137 . G A 34.46 PASS AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0145428;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.3029;QD=22.9703;RBI=0.0571785;REFB=-0.000324901;REVB=0.0552982;RO=1;SAF=1;SAR=4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0951258;STB=0.555346;TYPE=snp;VARB=0.00676661;OID=.;OPOS=30793137;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:6:6:1:1:5:5:4:1:0:1:4:1:0:1 chr22 30819752 . C T 88.49 PASS AO=27;DP=73;FAO=27;FDP=73;FR=.;FRO=46;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=-0.0335643;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.4425;QD=4.84855;RBI=0.0341428;REFB=-0.0213854;REVB=-0.00625815;RO=44;SAF=15;SAR=12;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10878;STB=0.548744;TYPE=snp;VARB=0.0300931;OID=.;OPOS=30819752;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:73:73:44:46:27:27:12:15:20:24:12:15:22:24 chr22 30823196 . T C 83.37 PASS AO=22;DP=53;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=-0.0213707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.0459;QD=6.29245;RBI=0.0219298;REFB=-0.016669;REVB=-0.00492024;RO=30;SAF=17;SAR=5;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.425579;STB=0.751976;TYPE=snp;VARB=0.0132831;OID=.;OPOS=30823196;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:53:53:30:31:22:22:5:17:11:19:5:17:11:20 chr22 30857373 . A C 735.97 PASS AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.047476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.183;QD=38.2324;RBI=0.0476448;REFB=0;REVB=-0.0040077;RO=0;SAF=44;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.58027e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000256107;OID=.;OPOS=30857373;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:77:77:0:0:77:77:33:44:0:0:33:44:0:0 chr22 30857448 . A G 704.66 PASS AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00719702;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.839;QD=38.0898;RBI=0.0128621;REFB=0;REVB=0.0106601;RO=0;SAF=46;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000316592;OID=.;OPOS=30857448;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:74:74:0:0:74:74:28:46:0:0:28:46:0:0 chr22 30860830 . C T 324.24 PASS AO=65;DP=114;FAO=65;FDP=114;FR=.;FRO=49;FSAF=40;FSAR=25;FSRF=20;FSRR=29;FWDB=0.0472843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.6691;QD=11.3769;RBI=0.0561579;REFB=0.0018762;REVB=-0.0302969;RO=49;SAF=40;SAR=25;SRF=20;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164968;STB=0.590136;TYPE=snp;VARB=-0.00132369;OID=.;OPOS=30860830;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:49:49:65:65:25:40:20:29:25:40:20:29 chr22 30862400 . T A 1474.79 PASS AO=132;DP=132;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00307482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.198;QD=38.0592;RBI=0.00534691;REFB=0;REVB=0.00437435;RO=0;SAF=38;SAR=94;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.92958e-06;OID=.;OPOS=30862400;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:132:155:0:0:132:155:94:38:0:0:94:61:0:0 chr22 30864610 . A G 258.36 PASS AO=64;DP=136;FAO=64;FDP=136;FR=.;FRO=72;FSAF=25;FSAR=39;FSRF=35;FSRR=37;FWDB=0.0284655;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.398;QD=7.59869;RBI=0.0374116;REFB=-0.00865973;REVB=-0.0242763;RO=71;SAF=25;SAR=39;SRF=35;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0993918;STB=0.55187;TYPE=snp;VARB=0.00861053;OID=.;OPOS=30864610;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:136:71:72:64:64:39:25:35:36:39:25:35:37 chr22 30864792 . C T 18.44 PASS AO=11;DP=54;FAO=11;FDP=54;FR=.;FRO=43;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=27;FWDB=0.0302356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.2995;QD=1.36618;RBI=0.0329123;REFB=-0.010405;REVB=0.0130012;RO=43;SAF=3;SAR=8;SRF=16;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139405;STB=0.591265;TYPE=snp;VARB=0.0137006;OID=.;OPOS=30864792;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:54:54:43:43:11:11:8:3:16:27:8:3:16:27 chr22 30864817 . A G 390.19 PASS AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0353961;FXX=0.0454442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.5962;QD=37.1612;RBI=0.060739;REFB=0;REVB=0.0493593;RO=0;SAF=11;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.72514e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00440423;OID=.;OPOS=30864817;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:42:42:0:0:42:42:31:11:0:0:31:11:0:0 chr22 30921371 . T C 88.04 PASS AO=21;DP=46;FAO=21;FDP=46;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.0111072;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.9595;QD=7.65589;RBI=0.0574822;REFB=-0.00839;REVB=-0.0563989;RO=25;SAF=16;SAR=5;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.368754;STB=0.710899;TYPE=snp;VARB=0.00687191;OID=.;OPOS=30921371;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:46:46:25:25:21:21:5:16:10:15:5:16:10:15 chr22 30934816 . T C 262.16 PASS AO=67;DP=146;FAO=67;FDP=146;FR=.;FRO=79;FSAF=25;FSAR=42;FSRF=37;FSRR=42;FWDB=-0.00127387;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.9905;QD=7.18243;RBI=0.00401046;REFB=0.0107067;REVB=0.00380277;RO=74;SAF=25;SAR=42;SRF=37;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123795;STB=0.553555;TYPE=snp;VARB=-0.0107629;OID=.;OPOS=30934816;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:146:146:74:79:67:67:42:25:37:37:42:25:37:42 chr22 30934887 . G A 214.42 PASS AO=52;DP=110;FAO=52;FDP=110;FR=.;FRO=58;FSAF=18;FSAR=34;FSRF=25;FSRR=33;FWDB=-0.0875174;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.4386;QD=7.79714;RBI=0.133572;REFB=-0.0401096;REVB=0.100907;RO=56;SAF=18;SAR=34;SRF=24;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0824821;STB=0.547957;TYPE=snp;VARB=0.0437921;OID=.;OPOS=30934887;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:110:56:58:52:52:34:18:24:32:34:18:25:33 chr22 30953295 . C T 46.83 PASS AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=15;FWDB=0.0513049;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.887;QD=6.043;RBI=0.056141;REFB=-0.0344903;REVB=0.0227951;RO=19;SAF=6;SAR=6;SRF=4;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.306025;STB=0.677161;TYPE=snp;VARB=0.0283988;OID=.;OPOS=30953295;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:31:31:19:19:12:12:6:6:4:15:6:6:4:15 chr22 30977353 . T A 88.83 PASS AO=23;DP=54;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=-0.0241594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.082;QD=6.58029;RBI=0.0250825;REFB=-0.00318623;REVB=0.00674178;RO=31;SAF=10;SAR=13;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0830272;STB=0.547223;TYPE=snp;VARB=0.00416231;OID=.;OPOS=30977353;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:54:54:31:31:23:23:13:10:11:20:13:10:11:20 chr22 31010462 . C T 268.08 PASS AO=58;DP=108;FAO=58;FDP=107;FR=.;FRO=49;FSAF=23;FSAR=35;FSRF=18;FSRR=31;FWDB=0.054447;FXX=0.0092584;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.4767;QD=10.0217;RBI=0.0751423;REFB=-0.0312351;REVB=0.0517869;RO=49;SAF=23;SAR=35;SRF=18;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0256165;STB=0.514049;TYPE=snp;VARB=0.0360985;OID=.;OPOS=31010462;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:107:49:49:58:58:35:23:18:31:35:23:18:31 chr22 31011610 . G C 673.07 PASS AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.028033;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.562;QD=37.9192;RBI=0.0331109;REFB=0;REVB=0.0176204;RO=0;SAF=37;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.12261e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.32058e-06;OID=.;OPOS=31011610;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:71:71:0:0:71:71:34:37:0:0:34:37:0:0 chr22 31013419 . C T 127.86 PASS AO=31;DP=75;FAO=33;FDP=75;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=14;FSRR=28;FWDB=0.0374287;FXX=0.0259707;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.732;QD=6.81929;RBI=0.0428008;REFB=-0.0072647;REVB=0.0207606;RO=43;SAF=10;SAR=21;SRF=15;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0303538;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0103638;OID=.;OPOS=31013419;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:43:42:31:33:21:10:15:28:22:11:14:28 chr22 31032881 . G A 76.13 PASS AO=15;DP=30;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=13;FWDB=-0.0116594;FXX=0.0333222;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.393;QD=10.5002;RBI=0.0118217;REFB=-0.00199532;REVB=-0.00195223;RO=14;SAF=3;SAR=12;SRF=1;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196428;STB=0.609632;TYPE=snp;VARB=0.00251354;OID=.;OPOS=31032881;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:30:29:14:14:15:15:12:3:1:13:12:3:1:13 chr22 31032920 . A G 183.14 PASS AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0365491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.643;QD=38.5548;RBI=0.0380932;REFB=0;REVB=0.0107355;RO=0;SAF=5;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000411625;OID=.;OPOS=31032920;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:19:19:0:0:19:19:14:5:0:0:14:5:0:0 chr22 31043677 . C T 167.09 PASS AO=34;DP=63;FAO=34;FDP=62;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=6;FSRR=22;FWDB=0.0179837;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.662;QD=10.7802;RBI=0.0197332;REFB=-0.0185349;REVB=0.00812332;RO=28;SAF=12;SAR=22;SRF=6;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129856;STB=0.571389;TYPE=snp;VARB=0.0173923;OID=.;OPOS=31043677;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:62:28:28:34:34:22:12:6:22:22:12:6:22 chr22 31060029 . G C 10.22 PASS AO=2;DP=9;FAO=2;FDP=9;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0484;QD=4.5413;RBI=0.0481538;REFB=-0.00855758;REVB=-0.0481538;RO=7;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0134113;OID=.;OPOS=31060029;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:7:7:2:2:2:0:0:7:2:0:0:7 chr22 31090229 . GC G 228.36 PASS AO=30;DP=38;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00131714;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=18.08;QD=26.8659;RBI=0.114136;REFB=-0.00522536;REVB=-0.114129;RO=2;SAF=15;SAR=15;SRF=2;SRR=0;SSEN=0.228763;SSEP=0;SSSB=-0.0581794;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.0039389;OID=.;OPOS=31090230;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:30:34:34:34:0:18:16:0:0:18:2:15:15:2:0 chr22 31091154 . G A 65.36 PASS AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0327864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.523;QD=14.5244;RBI=0.100782;REFB=-0.0058189;REVB=0.0952995;RO=7;SAF=8;SAR=3;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.224559;STB=0.628965;TYPE=snp;VARB=0.00405164;OID=.;OPOS=31091154;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:18:18:7:7:11:11:3:8:3:4:3:8:3:4 chr22 31266546 . T C 520.07 PASS AO=53;DP=54;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.409;QD=37.8234;RBI=0.0492119;REFB=0;REVB=0.0427893;RO=0;SAF=32;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.81969e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000257096;OID=.;OPOS=31266546;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:54:55:0:0:53:55:21:32:0:0:21:34:0:0 chr22 31302125 . C G 51.57 PASS AO=6;DP=10;FAO=7;FDP=10;FR=.,HEALED;FRO=3;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0461729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.1102;QD=20.6278;RBI=0.188057;REFB=-0.0527812;REVB=0.1823;RO=2;SAF=6;SAR=0;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.599755;TYPE=snp;VARB=0.0374994;OID=.;OPOS=31302125;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:10:10:2:3:6:7:0:6:2:0:1:6:3:0 chr22 31302233 . T C 129.53 PASS AO=9;DP=29;FAO=12;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=8;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.0717386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.579;QD=18.504;RBI=0.0718258;REFB=-0.0262197;REVB=-0.00353886;RO=8;SAF=1;SAR=8;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0275003;STB=0.571319;TYPE=snp;VARB=0.0453785;OID=.;OPOS=31302233;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:28:28:8:8:9:12:8:1:1:7:9:3:1:7 chr22 31303606 . GT G 43.52 PASS AO=57;DP=300;FAO=75;FDP=244;FR=.;FRO=169;FSAF=57;FSAR=18;FSRF=120;FSRR=49;FWDB=0.00614325;FXX=0.17567;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.5656;QD=0.713523;RBI=0.0672377;REFB=-0.0350253;REVB=-0.0669565;RO=151;SAF=45;SAR=12;SRF=106;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144053;STB=0.545169;TYPE=del;VARB=-0.00622703;OID=.;OPOS=31303607;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:57:281:75:244:169:57:18:120:49:43:151:45:12:106:45 chr22 31303683 . C T 567.8 PASS AO=146;DP=348;FAO=150;FDP=329;FR=.;FRO=179;FSAF=79;FSAR=71;FSRF=89;FSRR=90;FWDB=0.0499841;FXX=0.0706195;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.051;QD=6.90333;RBI=0.0524214;REFB=-0.0489795;REVB=0.0157985;RO=157;SAF=77;SAR=69;SRF=77;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0348424;STB=0.516044;TYPE=snp;VARB=0.0344698;OID=.;OPOS=31303683;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:348:329:157:179:146:150:69:77:77:80:71:79:89:90 chr22 31333631 . T C 241.19 PASS AO=70;DP=176;FAO=71;FDP=175;FR=.;FRO=104;FSAF=41;FSAR=30;FSRF=56;FSRR=48;FWDB=-0.015001;FXX=0.0591366;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.527;QD=5.51291;RBI=0.0504202;REFB=-0.00963779;REVB=-0.048137;RO=90;SAF=41;SAR=29;SRF=51;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0197089;STB=0.523569;TYPE=snp;VARB=0.0179651;OID=.;OPOS=31333631;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:175:90:104:70:71:29:41:51:39:30:41:56:48 chr22 31354653 . G A 167.54 PASS AO=39;DP=81;FAO=39;FDP=81;FR=.;FRO=42;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=0.000380551;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=273.153;QD=8.27361;RBI=0.0128929;REFB=-0.00750721;REVB=-0.0128873;RO=42;SAF=19;SAR=20;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119262;STB=0.506646;TYPE=snp;VARB=0.00767902;OID=.;OPOS=31354653;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:81:42:42:39:39:20:19:21:21:20:19:21:21 chr22 31456006 . C T 2276.09 PASS AO=238;DP=240;FAO=238;FDP=238;FR=.;FRO=0;FSAF=139;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00259728;FXX=0.00833299;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.151;QD=38.2536;RBI=0.0320303;REFB=-0.0425931;REVB=0.0319249;RO=0;SAF=139;SAR=99;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0815e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00013871;OID=.;OPOS=31456006;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:240:238:0:0:238:238:99:139:0:0:99:139:0:0 chr22 31489575 . G A 173.77 PASS AO=19;DP=20;FAO=19;FDP=20;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0049287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.096;QD=34.7544;RBI=0.0290861;REFB=-0.00880469;REVB=-0.0286654;RO=1;SAF=15;SAR=4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101694;STB=0.555494;TYPE=snp;VARB=-0.000317282;OID=.;OPOS=31489575;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:20:20:1:1:19:19:4:15:0:1:4:15:0:1 chr22 31491295 . G C 397.81 PASS AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.032635;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.042;QD=36.1641;RBI=0.0345115;REFB=0;REVB=0.0112249;RO=0;SAF=22;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00760814;OID=.;OPOS=31491295;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:44:44:0:0:44:44:22:22:0:0:22:22:0:0 chr22 31521850 . A C 49.53 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.543;QD=33.022;RBI=0.00276896;REFB=0;REVB=-0.00276896;RO=0;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.37425e-05;OID=.;OPOS=31521850;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:6:0:0:0:6:0:0:0 chr22 31529463 . C A 332.85 PASS AO=73;DP=140;FAO=73;FDP=140;FR=.;FRO=67;FSAF=33;FSAR=40;FSRF=17;FSRR=50;FWDB=-0.0161723;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.71;QD=9.51;RBI=0.0169273;REFB=0.00109388;REVB=0.00499912;RO=66;SAF=33;SAR=40;SRF=17;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173719;STB=0.59756;TYPE=snp;VARB=-0.00086579;OID=.;OPOS=31529463;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:66:67:73:73:40:33:17:49:40:33:17:50 chr22 31533796 . G C 259.25 PASS AO=54;DP=100;FAO=54;FDP=100;FR=.;FRO=46;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=33;FSRR=13;FWDB=-0.0414274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.261;QD=10.3699;RBI=0.0467988;REFB=0.00193832;REVB=0.0217691;RO=46;SAF=30;SAR=24;SRF=33;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139984;STB=0.576632;TYPE=snp;VARB=-0.00160509;OID=.;OPOS=31533796;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:100:100:46:46:54:54:24:30:33:13:24:30:33:13 chr22 31533967 . G A 212.21 PASS AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0493208;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.35;QD=36.906;RBI=0.0675199;REFB=0;REVB=0.0461129;RO=0;SAF=8;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00121927;OID=.;OPOS=31533967;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:24:23:0:0:23:23:15:8:0:0:15:8:0:0 chr22 31535991 . GCCTC GCTC,GCCTG 162.79 PASS AO=7,12;DP=30;FAO=8,16;FDP=28;FR=.;FRO=4;FSAF=0,10;FSAR=8,6;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.214933,-0.0502428;FXX=0.0344709;HRUN=2,3;LEN=1,1;MLLD=17.2949,103.338;QD=23.255;RBI=0.256899,0.0603444;REFB=0.0227632,0.0722907;REVB=0.140715,0.0334232;RO=4;SAF=0,6;SAR=7,6;SRF=3;SRR=1;SSEN=0.318777,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.799165,-0.111553;STB=0.998329,0.583236;TYPE=del,snp;VARB=0.127862,-0.0478522;OID=.,.;OPOS=31535992,31535995;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=GCTC,GCCTG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:7,12:26:8,16:28:4:0,10:8,6:4:0:28:4:0,6:7,6:3:1 chr22 31536133 . A C 339.4 PASS AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0269094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.0331;QD=37.7107;RBI=0.0483123;REFB=0;REVB=0.0401244;RO=0;SAF=14;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.27896e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000746234;OID=.;OPOS=31536133;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:35:36:0:0:35:36:21:14:0:0:22:14:0:0 chr22 31556103 . A G 2372.07 PASS AO=244;DP=246;FAO=247;FDP=247;FR=.;FRO=0;FSAF=106;FSAR=141;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00285563;FXX=0.00803181;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.629;QD=38.414;RBI=0.0199901;REFB=0;REVB=-0.0197851;RO=0;SAF=104;SAR=140;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.82615e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000231745;OID=.;OPOS=31556103;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:246:247:0:0:244:247:140:104:0:0:141:106:0:0 chr22 31602187 . C T 101.96 PASS AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.07122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.862;QD=37.0753;RBI=0.0739209;REFB=0;REVB=-0.0197994;RO=0;SAF=2;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00122602;OID=.;OPOS=31602187;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:11:11:9:2:0:0:9:2:0:0 chr22 31602641 . G C 172 PASS AO=44;DP=98;FAO=44;FDP=98;FR=.;FRO=54;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=23;FSRR=31;FWDB=-0.0609958;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.4249;QD=7.02034;RBI=0.0625412;REFB=0.0096081;REVB=0.0138173;RO=54;SAF=15;SAR=29;SRF=23;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0898965;STB=0.550426;TYPE=snp;VARB=-0.0180592;OID=.;OPOS=31602641;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:54:54:44:44:29:15:23:31:29:15:23:31 chr22 31621792 . G A 225.05 PASS AO=61;DP=141;FAO=61;FDP=141;FR=.;FRO=80;FSAF=17;FSAR=44;FSRF=44;FSRR=36;FWDB=0.014168;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.969;QD=6.3843;RBI=0.0283398;REFB=-0.0173651;REVB=0.024544;RO=80;SAF=17;SAR=44;SRF=44;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.291366;STB=0.663643;TYPE=snp;VARB=0.0190246;OID=.;OPOS=31621792;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:141:80:80:61:61:44:17:44:36:44:17:44:36 chr22 31644614 . C T 39.78 PASS AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.0171624;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=129.42;QD=12.2401;RBI=0.0358764;REFB=-0.00352995;REVB=0.031505;RO=6;SAF=2;SAR=5;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.414385;STB=0.744007;TYPE=snp;VARB=0.00522543;OID=.;OPOS=31644614;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:13:13:6:6:7:7:5:2:5:1:5:2:5:1 chr22 31663842 . C G 1274.92 PASS AO=135;DP=136;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0253244;FXX=0.0073524;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.154;QD=37.7755;RBI=0.028431;REFB=-0.0428724;REVB=-0.0129226;RO=1;SAF=54;SAR=81;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0087215;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.57687e-05;OID=.;OPOS=31663842;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:136:135:1:0:135:135:81:54:1:0:81:54:0:0 chr22 31673111 . A G 42.52 PASS AO=11;DP=43;FAO=15;FDP=47;FR=.;FRO=32;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=-0.00636626;FXX=0.059988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.907;QD=3.61845;RBI=0.0204296;REFB=0.00117558;REVB=0.0194123;RO=30;SAF=4;SAR=7;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00385343;STB=0.608966;TYPE=snp;VARB=0.00458253;OID=.;OPOS=31673111;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:43:47:30:32:11:15:7:4:11:19:11:4:13:19 chr22 31673116 . A G 67.09 PASS AO=19;DP=51;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=-0.016969;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.511;QD=5.36707;RBI=0.0171453;REFB=-0.00627346;REVB=-0.00245233;RO=32;SAF=4;SAR=15;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.25778;STB=0.65873;TYPE=snp;VARB=0.00978706;OID=.;OPOS=31673116;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:51:50:32:31:19:19:15:4:13:19:15:4:13:18 chr22 31679110 . G C 436.61 PASS AO=51;DP=56;FAO=52;FDP=56;FR=.;FRO=4;FSAF=34;FSAR=18;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0121945;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.386;QD=31.1861;RBI=0.140666;REFB=-0.217356;REVB=0.140137;RO=2;SAF=34;SAR=17;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0132474;STB=0.507619;TYPE=snp;VARB=0.00300337;OID=.;OPOS=31679110;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:56:56:2:4:51:52:17:34:1:1:18:34:3:1 chr22 31685256 . C G 302.77 PASS AO=65;DP=121;FAO=65;FDP=122;FR=.;FRO=57;FSAF=32;FSAR=33;FSRF=21;FSRR=36;FWDB=0.00123743;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.442;QD=9.9268;RBI=0.00214104;REFB=-0.00572881;REVB=-0.00174723;RO=56;SAF=32;SAR=33;SRF=21;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.099276;STB=0.557981;TYPE=snp;VARB=0.00666535;OID=.;OPOS=31685256;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:122:56:57:65:65:33:32:21:35:33:32:21:36 chr22 31722886 . T G 146.69 PASS AO=28;DP=50;FAO=28;FDP=50;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=21;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.0319004;FXX=0.019604;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.789;QD=11.735;RBI=0.0322578;REFB=-0.00927539;REVB=0.00478856;RO=22;SAF=7;SAR=21;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152932;STB=0.585301;TYPE=snp;VARB=0.00529847;OID=.;OPOS=31722886;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:50:50:22:22:28:28:21:7:9:13:21:7:9:13 chr22 31740734 . GC G 21.42 PASS AO=9;DP=31;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.276229;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.3668;QD=2.85583;RBI=0.367414;REFB=-0.0744529;REVB=-0.242261;RO=15;SAF=1;SAR=8;SRF=8;SRR=7;SSEN=0.316667;SSEP=0;SSSB=-0.528187;STB=0.634375;TYPE=del;VARB=0.0969357;OID=.;OPOS=31740735;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:9:28:12:30:18:3:9:8:10:21:15:1:8:8:7 chr22 31743210 . GC G 196.39 PASS AO=23;DP=30;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.265325;FXX=0.0344709;HRUN=4;LEN=1;MLLD=17.1817;QD=28.0553;RBI=0.372655;REFB=0;REVB=0.261677;RO=6;SAF=6;SAR=17;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110361;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0258745;OID=.;OPOS=31743211;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:23:30:28:28:0:8:20:0:0:18:6:6:17:3:3 chr22 31744072 . G A 689.99 PASS AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00369725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.213;QD=37.8075;RBI=0.0134766;REFB=0;REVB=0.0129595;RO=0;SAF=26;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.2476e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.08052e-05;OID=.;OPOS=31744072;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:73:73:0:0:73:73:47:26:0:0:47:26:0:0 chr22 31838085 . G A 535.07 PASS AO=135;DP=284;FAO=135;FDP=286;FR=.;FRO=151;FSAF=75;FSAR=60;FSRF=70;FSRR=81;FWDB=-0.0198986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.658;QD=7.48344;RBI=0.0201428;REFB=-0.00681816;REVB=0.003127;RO=148;SAF=75;SAR=60;SRF=70;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0786268;STB=0.548631;TYPE=snp;VARB=0.00733162;OID=.;OPOS=31838085;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:284:286:148:151:135:135:60:75:70:78:60:75:70:81 chr22 31849381 . G T 10.19 PASS AO=3;DP=15;FAO=3;FDP=15;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0096383;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.7928;QD=2.71854;RBI=0.0100565;REFB=0.0593253;REVB=0.00286978;RO=12;SAF=1;SAR=2;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184075;STB=0.635441;TYPE=snp;VARB=-0.0185102;OID=.;OPOS=31849381;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:15:15:12:12:3:3:2:1:6:6:2:1:6:6 chr22 31946282 . T C 274.99 PASS AO=68;DP=145;FAO=68;FDP=144;FR=.;FRO=76;FSAF=22;FSAR=46;FSRF=27;FSRR=49;FWDB=-0.0372607;FXX=0.00689608;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.597;QD=7.63849;RBI=0.038057;REFB=-0.0172117;REVB=0.00774451;RO=75;SAF=22;SAR=46;SRF=26;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.024766;STB=0.518871;TYPE=snp;VARB=0.0205595;OID=.;OPOS=31946282;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:144:75:76:68:68:46:22:26:49:46:22:27:49 chr22 31971258 . T C 121.37 PASS AO=25;DP=47;FAO=25;FDP=47;FR=.;FRO=22;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.0280009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.6112;QD=10.3296;RBI=0.0280193;REFB=-0.0498249;REVB=-0.00101657;RO=21;SAF=18;SAR=7;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0526104;STB=0.54652;TYPE=snp;VARB=0.0427659;OID=.;OPOS=31971258;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:47:47:21:22:25:25:7:18:14:7:7:18:14:8 chr22 31976299 . T C 185.03 PASS AO=48;DP=109;FAO=48;FDP=108;FR=.;FRO=60;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=33;FSRR=27;FWDB=-0.00379587;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.149;QD=6.85287;RBI=0.0255642;REFB=-0.00846865;REVB=-0.0252809;RO=61;SAF=17;SAR=31;SRF=33;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190913;STB=0.611152;TYPE=snp;VARB=0.00931696;OID=.;OPOS=31976299;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:108:61:60:48:48:31:17:33:28:31:17:33:27 chr22 31998612 . G A 117.87 PASS AO=31;DP=67;FAO=30;FDP=68;FR=.;FRO=38;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=27;FSRR=11;FWDB=-0.033421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.283;QD=6.9334;RBI=0.0928745;REFB=-0.00470077;REVB=0.0866528;RO=36;SAF=18;SAR=13;SRF=26;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143336;STB=0.565996;TYPE=snp;VARB=0.0168139;OID=.;OPOS=31998612;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:68:36:38:31:30:13:18:26:10:12:18:27:11 chr22 32011225 . T C 29.77 PASS AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0957129;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.3747;QD=9.15963;RBI=0.143041;REFB=-0.0175498;REVB=-0.1063;RO=6;SAF=1;SAR=5;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.345446;STB=0.688929;TYPE=snp;VARB=-0.00567126;OID=.;OPOS=32011225;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:12:13:6:7:6:6:5:1:3:3:5:1:3:4 chr22 32015450 . T G 153.5 PASS AO=39;DP=86;FAO=39;FDP=87;FR=.;FRO=48;FSAF=31;FSAR=8;FSRF=42;FSRR=6;FWDB=-0.0437578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.6176;QD=7.05754;RBI=0.0447294;REFB=-0.0124717;REVB=-0.00927195;RO=47;SAF=31;SAR=8;SRF=41;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126717;STB=0.57364;TYPE=snp;VARB=0.00731094;OID=.;OPOS=32015450;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:87:47:48:39:39:8:31:41:6:8:31:42:6 chr22 32108345 . C T 199.66 PASS AO=47;DP=95;FAO=47;FDP=97;FR=.;FRO=50;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=30;FSRR=20;FWDB=0.0135035;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.771;QD=8.23325;RBI=0.0271643;REFB=-0.0102617;REVB=0.0235702;RO=45;SAF=26;SAR=21;SRF=27;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0421039;STB=0.524521;TYPE=snp;VARB=0.0100529;OID=.;OPOS=32108345;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:97:45:50:47:47:21:26:27:18:21:26:30:20 chr22 32108838 . A G 241.13 PASS AO=60;DP=129;FAO=60;FDP=129;FR=.;FRO=69;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=48;FSRR=21;FWDB=-0.0851254;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=129.123;QD=7.47702;RBI=0.0851324;REFB=-0.0168349;REVB=-0.00109768;RO=69;SAF=31;SAR=29;SRF=48;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174353;STB=0.596429;TYPE=snp;VARB=0.0121181;OID=.;OPOS=32108838;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:69:69:60:60:29:31:48:21:29:31:48:21 chr22 32109927 . C T 290.27 PASS AO=70;DP=145;FAO=70;FDP=145;FR=.;FRO=75;FSAF=37;FSAR=33;FSRF=35;FSRR=40;FWDB=0.0219986;FXX=0.00684885;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.1862;QD=8.00733;RBI=0.0241972;REFB=-0.0177999;REVB=-0.0100779;RO=73;SAF=37;SAR=33;SRF=35;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.045421;STB=0.531998;TYPE=snp;VARB=0.0159013;OID=.;OPOS=32109927;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:73:75:70:70:33:37:35:38:33:37:35:40 chr22 32110163 . G A 187.6 PASS AO=45;DP=148;FAO=62;FDP=165;FR=.;FRO=103;FSAF=36;FSAR=26;FSRF=50;FSRR=53;FWDB=-0.0180943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.4725;QD=4.54788;RBI=0.0184929;REFB=-0.00316957;REVB=-0.00381884;RO=102;SAF=21;SAR=24;SRF=50;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0280485;STB=0.559823;TYPE=snp;VARB=0.00490063;OID=.;OPOS=32110163;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:165:102:103:45:62:24:21:50:52:26:36:50:53 chr22 32112461 . T C 282.16 PASS AO=61;DP=115;FAO=61;FDP=115;FR=.;FRO=54;FSAF=39;FSAR=22;FSRF=26;FSRR=28;FWDB=-0.011109;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.649;QD=9.81427;RBI=0.0226843;REFB=0.00530759;REVB=0.0197779;RO=54;SAF=39;SAR=22;SRF=26;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139731;STB=0.576897;TYPE=snp;VARB=-0.00586687;OID=.;OPOS=32112461;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:54:54:61:61:22:39:26:28:22:39:26:28 chr22 32211374 . T C 74.61 PASS AO=35;DP=72;FAO=28;FDP=70;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=0.0281997;FXX=0.0908973;HRUN=22;LEN=1;MLLD=99.7813;QD=4.26343;RBI=0.0282013;REFB=0.0164523;REVB=-0.00029729;RO=37;SAF=18;SAR=17;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0993563;STB=0.607066;TYPE=snp;VARB=-0.0334715;OID=.;OPOS=32211374;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:72:70:37:42:35:28:17:18:23:14:17:11:24:18 chr22 32334058 . T C 220.57 PASS AO=78;DP=218;FAO=78;FDP=218;FR=.;FRO=140;FSAF=27;FSAR=51;FSRF=67;FSRR=73;FWDB=0.0199069;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.499;QD=4.04714;RBI=0.0249435;REFB=-0.0112851;REVB=0.0150297;RO=139;SAF=27;SAR=51;SRF=66;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151195;STB=0.588776;TYPE=snp;VARB=0.0160858;OID=.;OPOS=32334058;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:218:218:139:140:78:78:51:27:66:73:51:27:67:73 chr22 32341479 . C T 209.72 PASS AO=48;DP=108;FAO=52;FDP=112;FR=.;FRO=60;FSAF=34;FSAR=18;FSRF=47;FSRR=13;FWDB=0.0213948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.7183;QD=7.4901;RBI=0.034548;REFB=-0.0399547;REVB=0.0271261;RO=59;SAF=34;SAR=14;SRF=47;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111535;STB=0.580385;TYPE=snp;VARB=0.0445983;OID=.;OPOS=32341479;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:112:59:60:48:52:14:34:47:12:18:34:47:13 chr22 32377135 . T C 651.21 PASS AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0277057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.642;QD=37.2123;RBI=0.093759;REFB=-0.0723547;REVB=0.0895721;RO=0;SAF=34;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50704;TYPE=snp;VARB=0.000896359;OID=.;OPOS=32377135;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:70:70:0:1:69:69:35:34:0:0:35:34:0:1 chr22 32546946 . C T 57.04 PASS AO=23;DP=77;FAO=23;FDP=77;FR=.;FRO=54;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=30;FSRR=24;FWDB=0.00050151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.603;QD=2.96334;RBI=0.0326497;REFB=-0.00241298;REVB=-0.0326459;RO=54;SAF=6;SAR=17;SRF=30;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.357724;STB=0.713096;TYPE=snp;VARB=0.00569129;OID=.;OPOS=32546946;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:77:77:54:54:23:23:17:6:30:24:17:6:30:24 chr22 32547012 . G A 64.27 PASS AO=19;DP=54;FAO=20;FDP=56;FR=.;FRO=36;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.0225769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.894;QD=4.59098;RBI=0.0291377;REFB=-0.00258097;REVB=0.0184198;RO=34;SAF=5;SAR=14;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219089;STB=0.642704;TYPE=snp;VARB=0.00792333;OID=.;OPOS=32547012;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:54:56:34:36:19:20:14:5:15:19:15:5:16:20 chr22 32554985 . A G 81.88 PASS AO=26;DP=73;FAO=26;FDP=72;FR=.;FRO=46;FSAF=23;FSAR=3;FSRF=32;FSRR=14;FWDB=-0.0314022;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.961;QD=4.54861;RBI=0.0701976;REFB=-0.0170223;REVB=-0.0627822;RO=45;SAF=23;SAR=3;SRF=32;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.320707;STB=0.703047;TYPE=snp;VARB=0.0359609;OID=.;OPOS=32554985;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:73:72:45:46:26:26:3:23:32:13:3:23:32:14 chr22 32587023 . C G 230.63 PASS AO=101;DP=325;FAO=101;FDP=324;FR=.;FRO=223;FSAF=35;FSAR=66;FSRF=107;FSRR=116;FWDB=0.00454023;FXX=0.00307683;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.1175;QD=2.84733;RBI=0.0499478;REFB=-0.00168907;REVB=-0.049741;RO=220;SAF=35;SAR=66;SRF=106;SRR=114;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1666;STB=0.595331;TYPE=snp;VARB=0.00472947;OID=.;OPOS=32587023;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:325:324:220:223:101:101:66:35:106:114:66:35:107:116 chr22 32587027 . G C 228.25 PASS AO=101;DP=319;FAO=101;FDP=325;FR=.;FRO=224;FSAF=35;FSAR=66;FSRF=107;FSRR=117;FWDB=-0.00815836;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.158;QD=2.8092;RBI=0.0654311;REFB=-0.00422729;REVB=-0.0649205;RO=218;SAF=35;SAR=66;SRF=107;SRR=111;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176683;STB=0.59401;TYPE=snp;VARB=0.0133687;OID=.;OPOS=32587027;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:319:325:218:224:101:101:66:35:107:111:66:35:107:117 chr22 32589034 . T C 413.77 PASS AO=118;DP=279;FAO=118;FDP=277;FR=.;FRO=159;FSAF=50;FSAR=68;FSRF=74;FSRR=85;FWDB=0.0018077;FXX=0.0071682;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.434;QD=5.97496;RBI=0.0115309;REFB=-0.00286651;REVB=0.0113884;RO=159;SAF=50;SAR=68;SRF=74;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0436404;STB=0.524309;TYPE=snp;VARB=0.00344922;OID=.;OPOS=32589034;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:279:277:159:159:118:118:68:50:74:85:68:50:74:85 chr22 32590449 . G A 280.96 PASS AO=67;DP=140;FAO=67;FDP=139;FR=.;FRO=72;FSAF=25;FSAR=42;FSRF=19;FSRR=53;FWDB=0.00338068;FXX=0.0211253;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.7138;QD=8.08529;RBI=0.0459993;REFB=-0.0336253;REVB=0.0458749;RO=66;SAF=25;SAR=42;SRF=14;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16307;STB=0.562379;TYPE=snp;VARB=0.0205302;OID=.;OPOS=32590449;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:139:66:72:67:67:42:25:14:52:42:25:19:53 chr22 32756744 . A G 302.28 PASS AO=98;DP=250;FAO=97;FDP=251;FR=.;FRO=154;FSAF=35;FSAR=62;FSRF=76;FSRR=78;FWDB=0.00278954;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7611;QD=4.81727;RBI=0.0226446;REFB=-0.00330166;REVB=-0.0224721;RO=152;SAF=35;SAR=63;SRF=76;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159259;STB=0.584094;TYPE=snp;VARB=0.0073168;OID=.;OPOS=32756744;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:250:251:152:154:98:97:63:35:76:76:62:35:76:78 chr22 32759025 . G C 305.59 PASS AO=75;DP=147;FAO=75;FDP=158;FR=.;FRO=83;FSAF=33;FSAR=42;FSRF=51;FSRR=32;FWDB=-0.0240866;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.16;QD=7.73633;RBI=0.0243771;REFB=-0.0420558;REVB=-0.00375274;RO=72;SAF=33;SAR=42;SRF=42;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127368;STB=0.590931;TYPE=snp;VARB=0.0446986;OID=.;OPOS=32759025;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:158:72:83:75:75:42:33:42:30:42:33:51:32 chr22 32811952 . A G 1402.88 PASS AO=152;DP=156;FAO=154;FDP=157;FR=.;FRO=3;FSAF=69;FSAR=85;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0151666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.1983;QD=35.7423;RBI=0.0196211;REFB=-0.1046;REVB=0.0124484;RO=4;SAF=69;SAR=83;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145335;STB=0.510637;TYPE=snp;VARB=0.000508413;OID=.;OPOS=32811952;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:156:157:4:3:152:154:83:69:3:1:85:69:3:0 chr22 32831711 . C G 254.29 PASS AO=53;DP=99;FAO=53;FDP=98;FR=.;FRO=45;FSAF=23;FSAR=30;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=0.00169685;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.1538;QD=10.379;RBI=0.00661998;REFB=-0.00769291;REVB=0.00639882;RO=45;SAF=23;SAR=30;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0649473;STB=0.535701;TYPE=snp;VARB=0.0106352;OID=.;OPOS=32831711;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:98:45:45:53:53:30:23:23:22:30:23:23:22 chr22 32875190 . G A 573.31 PASS AO=116;DP=204;FAO=116;FDP=203;FR=.;FRO=87;FSAF=50;FSAR=66;FSRF=35;FSRR=52;FWDB=-0.014259;FXX=0.00975562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.03;QD=11.2967;RBI=0.0146353;REFB=-0.0193451;REVB=-0.00329779;RO=87;SAF=50;SAR=66;SRF=35;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0231949;STB=0.512596;TYPE=snp;VARB=0.0152426;OID=.;OPOS=32875190;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:203:87:87:116:116:66:50:35:52:66:50:35:52 chr22 32887150 . C T 262.47 PASS AO=59;DP=134;FAO=65;FDP=138;FR=.;FRO=73;FSAF=30;FSAR=35;FSRF=41;FSRR=32;FWDB=0.00612722;FXX=0.0212751;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.994;QD=7.60773;RBI=0.0254648;REFB=-0.00759596;REVB=0.0247166;RO=75;SAF=28;SAR=31;SRF=42;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.085447;STB=0.55282;TYPE=snp;VARB=0.00753204;OID=.;OPOS=32887150;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:134:138:75:73:59:65:31:28:42:33:35:30:41:32 chr22 32909251 . G A 88.6 PASS AO=17;DP=32;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=15;FSAR=2;FSRF=13;FSRR=1;FWDB=-0.00577017;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.752;QD=11.4325;RBI=0.0071868;REFB=0.00424408;REVB=0.00428431;RO=14;SAF=15;SAR=2;SRF=13;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.097459;STB=0.554397;TYPE=snp;VARB=-0.00281071;OID=.;OPOS=32909251;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:32:31:14:14:17:17:2:15:13:1:2:15:13:1 chr22 32914231 . C T 122.46 PASS AO=24;DP=47;FAO=25;FDP=47;FR=.;FRO=22;FSAF=22;FSAR=3;FSRF=18;FSRR=4;FWDB=0.00846588;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.804;QD=10.4218;RBI=0.0471769;REFB=-0.00693097;REVB=0.046411;RO=21;SAF=22;SAR=2;SRF=17;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225437;STB=0.56199;TYPE=snp;VARB=0.00380069;OID=.;OPOS=32914231;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:47:47:21:22:24:25:2:22:17:4:3:22:18:4 chr22 32914233 . C T 131.1 PASS AO=25;DP=46;FAO=26;FDP=47;FR=.;FRO=21;FSAF=23;FSAR=3;FSRF=18;FSRR=3;FWDB=0.0161933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.996;QD=11.1578;RBI=0.0414285;REFB=-0.0105404;REVB=0.0381326;RO=21;SAF=22;SAR=3;SRF=18;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0425358;STB=0.528713;TYPE=snp;VARB=0.0114085;OID=.;OPOS=32914233;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:46:47:21:21:25:26:3:22:18:3:3:23:18:3 chr22 33402504 . C A 42.08 PASS AO=22;DP=78;FAO=21;FDP=82;FR=.;FRO=61;FSAF=20;FSAR=1;FSRF=33;FSRR=28;FWDB=-0.00111428;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.4362;QD=2.05278;RBI=0.00434902;REFB=0.000377157;REVB=-0.00420385;RO=55;SAF=21;SAR=1;SRF=31;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.654721;STB=0.915779;TYPE=snp;VARB=-0.0226408;OID=.;OPOS=33402504;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:78:82:55:61:22:21:1:21:31:24:1:20:33:28 chr22 34022284 . G A 421.01 PASS AO=84;DP=145;FAO=84;FDP=146;FR=.;FRO=62;FSAF=29;FSAR=55;FSRF=33;FSRR=29;FWDB=-0.0220764;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.1248;QD=11.5345;RBI=0.0316258;REFB=-0.017053;REVB=-0.0226456;RO=61;SAF=29;SAR=55;SRF=32;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145538;STB=0.583284;TYPE=snp;VARB=0.0169531;OID=.;OPOS=34022284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:146:61:62:84:84:55:29:32:29:55:29:33:29 chr22 35660875 . G T 1023.23 PASS AO=115;DP=121;FAO=116;FDP=121;FR=.;FRO=5;FSAF=63;FSAR=53;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0404402;FXX=0.00819605;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.9337;QD=33.8258;RBI=0.051692;REFB=-0.0586892;REVB=0.0321972;RO=4;SAF=63;SAR=52;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.013031;STB=0.510713;TYPE=snp;VARB=0.0131756;OID=.;OPOS=35660875;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:121:121:4:5:115:116:52:63:3:1:53:63:4:1 chr22 35679951 . T C 2190.21 PASS AO=231;DP=233;FAO=232;FDP=232;FR=.;FRO=0;FSAF=129;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183974;FXX=0.00429166;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.214;QD=37.7623;RBI=0.0235751;REFB=0.0116683;REVB=0.0147419;RO=1;SAF=128;SAR=103;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00370863;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.00197e-05;OID=.;OPOS=35679951;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:233:232:1:0:231:232:103:128:1:0:103:129:0:0 chr22 35742925 . T G 35.06 PASS AO=6;DP=18;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=12;FWDB=0.111764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.3;QD=7.01176;RBI=0.112134;REFB=-0.0145243;REVB=0.00909167;RO=11;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.461008;STB=0.730424;TYPE=snp;VARB=0.0347114;OID=.;OPOS=35742925;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:18:20:11:12:6:8:5:1:0:11:7:1:0:12 chr22 35743124 . G C 81.07 PASS AO=6;DP=30;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.129389;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=31.9456;QD=10.1343;RBI=0.129524;REFB=-0.0269847;REVB=-0.00592133;RO=5;SAF=4;SAR=2;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.333798;STB=0.621364;TYPE=snp;VARB=0.0325271;OID=.;OPOS=35743124;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:15:32:5:15:6:17:2:4:5:0:12:5:8:7 chr22 36007045 . G A 271.31 PASS AO=61;DP=122;FAO=62;FDP=123;FR=.;FRO=61;FSAF=20;FSAR=42;FSRF=31;FSRR=30;FWDB=0.0156929;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.848;QD=8.823;RBI=0.0327524;REFB=-0.00927614;REVB=0.0287482;RO=61;SAF=20;SAR=41;SRF=31;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172559;STB=0.597957;TYPE=snp;VARB=0.013302;OID=.;OPOS=36007045;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:122:123:61:61:61:62:41:20:31:30:42:20:31:30 chr22 36007075 . C T 265.75 PASS AO=62;DP=129;FAO=63;FDP=130;FR=.;FRO=67;FSAF=20;FSAR=43;FSRF=37;FSRR=30;FWDB=-0.0361286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.794;QD=8.17699;RBI=0.0455538;REFB=-0.00921025;REVB=-0.0277466;RO=66;SAF=20;SAR=42;SRF=37;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230073;STB=0.626652;TYPE=snp;VARB=0.00856612;OID=.;OPOS=36007075;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:130:66:67:62:63:42:20:37:29:43:20:37:30 chr22 36122930 . C T 1557.03 PASS AO=164;DP=166;FAO=164;FDP=164;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180519;FXX=0.017963;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.666;QD=37.9762;RBI=0.0182202;REFB=-0.0592986;REVB=-0.0024708;RO=0;SAF=96;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000149722;OID=.;OPOS=36122930;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:66:166:164:0:0:164:164:68:96:0:0:68:96:0:0 chr22 36124860 . C G 423.5 PASS AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00171558;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0253;QD=37.644;RBI=0.0223053;REFB=0;REVB=0.0222392;RO=0;SAF=5;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000202115;OID=.;OPOS=36124860;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:45:45:0:0:45:45:40:5:0:0:40:5:0:0 chr22 36357616 . AG A 74.24 PASS AO=19;DP=48;FAO=31;FDP=49;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=28;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.142066;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=9.9363;QD=6.06;RBI=0.217187;REFB=-0.0540987;REVB=-0.164278;RO=17;SAF=1;SAR=18;SRF=7;SRR=10;SSEN=0.431373;SSEP=0;SSSB=-0.573818;STB=0.677279;TYPE=del;VARB=0.0556651;OID=.;OPOS=36357617;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:19:45:31:49:18:3:28:6:12:27:17:1:18:7:10 chr22 36537500 . A T 703.07 PASS AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00659874;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.039;QD=38.0036;RBI=0.0346308;REFB=0;REVB=0.0339963;RO=0;SAF=56;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00012948;OID=.;OPOS=36537500;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:74:74:0:0:74:74:18:56:0:0:18:56:0:0 chr22 36545137 . A T 862.26 PASS AO=89;DP=89;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.266;QD=37.9014;RBI=0.0232557;REFB=0;REVB=0.0171612;RO=0;SAF=61;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.76588e-05;OID=.;OPOS=36545137;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:89:91:0:0:89:91:28:61:0:0:29:62:0:0 chr22 36545190 . C T 143.58 PASS AO=40;DP=95;FAO=40;FDP=96;FR=.;FRO=56;FSAF=12;FSAR=28;FSRF=26;FSRR=30;FWDB=0.0041401;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=182.701;QD=5.98268;RBI=0.0225224;REFB=-0.00296937;REVB=-0.0221386;RO=51;SAF=12;SAR=28;SRF=23;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16514;STB=0.604491;TYPE=snp;VARB=0.00287766;OID=.;OPOS=36545190;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:96:51:56:40:40:28:12:23:28:28:12:26:30 chr22 36556823 . G T 931.71 PASS AO=107;DP=113;FAO=107;FDP=113;FR=.;FRO=6;FSAF=55;FSAR=52;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0441529;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.0878;QD=32.981;RBI=0.0552417;REFB=-0.0876078;REVB=0.0331989;RO=4;SAF=55;SAR=52;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0161458;STB=0.500745;TYPE=snp;VARB=0.00616467;OID=.;OPOS=36556823;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:113:113:4:6:107:107:52:55:3:1:52:55:3:3 chr22 36573945 . A G 1164.19 PASS AO=126;DP=129;FAO=126;FDP=129;FR=.;FRO=3;FSAF=67;FSAR=59;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.01153;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=71.7078;QD=36.099;RBI=0.0588045;REFB=-0.111418;REVB=0.057663;RO=3;SAF=67;SAR=59;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0207975;STB=0.510947;TYPE=snp;VARB=0.00189406;OID=.;OPOS=36573945;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:129:129:3:3:126:126:59:67:3:0:59:67:3:0 chr22 36575664 . G A 1993.29 PASS AO=214;DP=217;FAO=214;FDP=214;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0123708;FXX=0.0316728;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.765;QD=37.2577;RBI=0.0127413;REFB=0.0173704;REVB=0.00305033;RO=3;SAF=104;SAR=110;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00402366;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000144478;OID=.;OPOS=36575664;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:217:214:3:0:214:214:110:104:1:2:110:104:0:0 chr22 36587202 . G A 107.82 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0905575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.116;QD=35.9384;RBI=0.104802;REFB=0;REVB=0.0527514;RO=0;SAF=1;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.23983e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00154348;OID=.;OPOS=36587202;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:11:1:0:0:11:1:0:0 chr22 36587223 . G C,T 152.4 PASS AO=4,11;DP=15;FAO=2,15;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=1,2;FSAR=1,13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0150869,-0.0166115;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=158.147,177.139;QD=35.8578;RBI=0.0426025,0.0523006;REFB=0,0;REVB=0.0398416,0.0495924;RO=0;SAF=1,2;SAR=3,9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.86674e-08,0;STB=0.5,0.5;TYPE=snp,snp;VARB=0.0441552,-0.00132509;OID=.,.;OPOS=36587223,36587223;OREF=G,G;OALT=C,T;OMAPALT=C,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:5:15:17:0:0:4,11:2,15:3,9:1,2:0:0:1,13:1,2:0:0 chr22 36587279 . A G 327.46 PASS AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00401809;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.2494;QD=35.4013;RBI=0.0166245;REFB=0.083692;REVB=0.0161316;RO=1;SAF=22;SAR=14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0322556;STB=0.517232;TYPE=snp;VARB=-0.005083;OID=.;OPOS=36587279;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:37:37:1:1:36:36:14:22:0:1:14:22:0:1 chr22 36587486 . A G 1687.16 PASS AO=202;DP=228;FAO=208;FDP=231;FR=.;FRO=23;FSAF=53;FSAR=155;FSRF=6;FSRR=17;FWDB=-0.0152815;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.6008;QD=29.2149;RBI=0.0252515;REFB=-0.0649224;REVB=-0.0201026;RO=22;SAF=50;SAR=152;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0062794;STB=0.500794;TYPE=snp;VARB=0.00492386;OID=.;OPOS=36587486;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:228:231:22:23:202:208:152:50:6:16:155:53:6:17 chr22 36587511 . C T 1891.1 PASS AO=198;DP=200;FAO=198;FDP=198;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=146;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00651692;FXX=0.0099995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.8677;QD=38.204;RBI=0.00662267;REFB=-0.0596998;REVB=0.00117874;RO=0;SAF=52;SAR=146;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.57474e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000223059;OID=.;OPOS=36587511;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:200:198:0:0:198:198:146:52:0:0:146:52:0:0 chr22 36587845 . A ACT 615.6 PASS AO=75;DP=89;FAO=78;FDP=88;FR=.;FRO=10;FSAF=38;FSAR=40;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.00136762;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=2;MLLD=234.035;QD=27.982;RBI=0.00977803;REFB=0.0224553;REVB=-0.00968192;RO=11;SAF=37;SAR=38;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0344145;STB=0.512817;TYPE=ins;VARB=-0.00159326;OID=.;OPOS=36587846;OREF=-;OALT=CT;OMAPALT=ACT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:75:89:78:88:10:38:40:6:4:4:11:37:38:7:4 chr22 36587952 . C T 583.73 PASS AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0505032;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.6338;QD=37.6601;RBI=0.0506549;REFB=0;REVB=-0.00391723;RO=0;SAF=16;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.50785e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000761534;OID=.;OPOS=36587952;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:62:62:0:0:62:62:46:16:0:0:46:16:0:0 chr22 36591380 . A G 869.63 PASS AO=84;DP=84;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139137;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=156.615;QD=38.6503;RBI=0.0794307;REFB=0;REVB=0.0782026;RO=0;SAF=37;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.99643e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000146628;OID=.;OPOS=36591380;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:84:90:0:0:84:90:47:37:0:0:53:37:0:0 chr22 36623731 . T C 409.81 PASS AO=43;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00577311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.114;QD=37.2551;RBI=0.0399097;REFB=0;REVB=0.0394899;RO=0;SAF=27;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000366581;OID=.;OPOS=36623731;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:44:44:0:0:43:44:16:27:0:0:16:28:0:0 chr22 36623920 . G A 480.26 PASS AO=86;DP=137;FAO=87;FDP=140;FR=.;FRO=53;FSAF=23;FSAR=64;FSRF=23;FSRR=30;FWDB=-0.0053306;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=75.6256;QD=13.7218;RBI=0.0224723;REFB=-0.0282595;REVB=0.0218309;RO=51;SAF=23;SAR=63;SRF=22;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133726;STB=0.576558;TYPE=snp;VARB=0.0249563;OID=.;OPOS=36623920;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:137:140:51:53:86:87:63:23:22:29:64:23:23:30 chr22 36661330 . G A 1240.07 PASS AO=131;DP=131;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00862373;FXX=0.0150365;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.133;QD=37.8648;RBI=0.0126473;REFB=0;REVB=0.00925121;RO=0;SAF=46;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.04934e-05;OID=.;OPOS=36661330;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:131:131:0:0:131:131:85:46:0:0:85:46:0:0 chr22 36661536 . C A 677.23 PASS AO=73;DP=75;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0342759;FXX=0.0133316;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.1931;QD=36.6071;RBI=0.0368228;REFB=-0.0768799;REVB=0.0134565;RO=1;SAF=20;SAR=53;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00884283;STB=0.504672;TYPE=snp;VARB=0.00191553;OID=.;OPOS=36661536;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:75:74:1:1:73:73:53:20:0:1:53:20:0:1 chr22 36661566 . G A 865.24 PASS AO=94;DP=96;FAO=94;FDP=96;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0147448;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.207;QD=36.0517;RBI=0.0153359;REFB=-0.0637308;REVB=-0.00421666;RO=0;SAF=35;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.06074e-08;STB=0.508332;TYPE=snp;VARB=1.57996e-05;OID=.;OPOS=36661566;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:96:96:0:2:94:94:59:35:0:0:59:35:0:2 chr22 36661646 . G A 780.4 PASS AO=84;DP=86;FAO=84;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0413021;FXX=0.0116266;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.2128;QD=36.7246;RBI=0.0671783;REFB=-0.00459131;REVB=0.0529817;RO=1;SAF=34;SAR=50;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00938023;STB=0.504949;TYPE=snp;VARB=0.000883445;OID=.;OPOS=36661646;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:86:85:1:1:84:84:50:34:0:1:50:34:0:1 chr22 36661842 . G A 722.44 PASS AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=60;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00688695;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=217.487;QD=37.0481;RBI=0.0618909;REFB=-0.046388;REVB=0.0615066;RO=1;SAF=17;SAR=60;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0270204;STB=0.514282;TYPE=snp;VARB=0.00111966;OID=.;OPOS=36661842;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:78:78:1:1:77:77:60:17:1:0:60:17:1:0 chr22 36677400 . G A 168.45 PASS AO=45;DP=106;FAO=46;FDP=107;FR=.;FRO=61;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=47;FSRR=14;FWDB=-0.0107059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.224;QD=6.29734;RBI=0.0504991;REFB=-0.0167725;REVB=0.0493513;RO=61;SAF=27;SAR=18;SRF=47;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19121;STB=0.612058;TYPE=snp;VARB=0.0239319;OID=.;OPOS=36677400;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:107:61:61:45:46:18:27:47:14:19:27:47:14 chr22 36678453 . C G 165.34 PASS AO=36;DP=70;FAO=36;FDP=70;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=5;FSRR=29;FWDB=-0.00338608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.816;QD=9.44808;RBI=0.0155785;REFB=-0.00969332;REVB=-0.015206;RO=31;SAF=11;SAR=25;SRF=3;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228818;STB=0.597537;TYPE=snp;VARB=0.0105288;OID=.;OPOS=36678453;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:31:34:36:36:25:11:3:28:25:11:5:29 chr22 36678470 . CGGGCCC CGGCCC,CGGGCCA 426.35 PASS AO=14,18;DP=61;FAO=24,33;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=1,8;FSAR=23,25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0615273,0.0107338;FXX=0.065563;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=13.4395,143.999;QD=29.9194;RBI=0.0927251,0.0110599;REFB=-0.0504476,-0.0558691;REVB=-0.069371,0.00266613;RO=2;SAF=0,6;SAR=14,12;SRF=1;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.835524,-0.0338663;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.12669,0.032125;OID=.,.;OPOS=36678471,36678476;OREF=G,C;OALT=-,A;OMAPALT=CGGCCC,CGGGCCA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:14,18:43:24,33:57:0:1,8:23,25:0:0:81:2:0,6:14,12:1:1 chr22 36684354 . T C 91.35 PASS AO=16;DP=26;FAO=16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=1;FWDB=-0.0561735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.064;QD=14.054;RBI=0.0563065;REFB=-0.00159541;REVB=0.00386824;RO=10;SAF=8;SAR=8;SRF=9;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.277055;STB=0.653672;TYPE=snp;VARB=0.000600821;OID=.;OPOS=36684354;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:26:26:10:10:16:16:8:8:9:1:8:8:9:1 chr22 36684358 . C A 73.86 PASS AO=14;DP=25;FAO=14;FDP=25;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=1;FWDB=0.000614087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.155;QD=11.8178;RBI=0.0777229;REFB=-0.00933274;REVB=0.0777204;RO=11;SAF=8;SAR=6;SRF=10;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.28381;STB=0.658341;TYPE=snp;VARB=0.0198224;OID=.;OPOS=36684358;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:25:25:11:11:14:14:6:8:10:1:6:8:10:1 chr22 36691607 . A C 655.26 PASS AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0552954;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.183;QD=38.5449;RBI=0.0599526;REFB=0;REVB=0.0231674;RO=0;SAF=58;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000262852;OID=.;OPOS=36691607;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:69:68:0:0:68:68:10:58:0:0:10:58:0:0 chr22 36702035 . GC G 24.09 PASS AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=0.082962;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.2225;QD=3.10786;RBI=0.10006;REFB=-0.147957;REVB=0.0559408;RO=18;SAF=8;SAR=5;SRF=12;SRR=6;SSEN=0.266952;SSEP=0;SSSB=-0.0547742;STB=0.531867;TYPE=del;VARB=0.163766;OID=.;OPOS=36702036;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:13:31:13:31:18:8:5:12:6:24:18:8:5:12:6 chr22 36900271 . T C 314.31 PASS AO=102;DP=270;FAO=103;FDP=271;FR=.;FRO=168;FSAF=66;FSAR=37;FSRF=97;FSRR=71;FWDB=-0.000678791;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.647;QD=4.63925;RBI=0.0183776;REFB=-0.00776236;REVB=-0.0183651;RO=168;SAF=66;SAR=36;SRF=97;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.08166;STB=0.541674;TYPE=snp;VARB=0.013776;OID=.;OPOS=36900271;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:270:271:168:168:102:103:36:66:97:71:37:66:97:71 chr22 36900806 . A G 164.64 PASS AO=36;DP=71;FAO=36;FDP=71;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=7;FSRR=28;FWDB=-0.0312158;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.8254;QD=9.27557;RBI=0.0561678;REFB=-0.00115926;REVB=-0.0466946;RO=35;SAF=15;SAR=21;SRF=7;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206901;STB=0.613977;TYPE=snp;VARB=-5.66604e-05;OID=.;OPOS=36900806;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:71:71:35:35:36:36:21:15:7:28:21:15:7:28 chr22 37163329 . C T 633.34 PASS AO=72;DP=75;FAO=71;FDP=73;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0149719;FXX=0.0266631;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.8069;QD=34.7036;RBI=0.0862744;REFB=-0.160671;REVB=0.0849654;RO=2;SAF=37;SAR=35;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000710194;STB=0.500193;TYPE=snp;VARB=0.00841786;OID=.;OPOS=37163329;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:75:73:2:2:72:71:35:37:1:1:36:35:1:1 chr22 37196971 . C A 90.46 PASS AO=22;DP=57;FAO=24;FDP=57;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.00136922;FXX=0.0338926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.505;QD=6.34775;RBI=0.00675215;REFB=-0.0170032;REVB=-0.00661186;RO=33;SAF=18;SAR=4;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.376712;STB=0.636242;TYPE=snp;VARB=0.019685;OID=.;OPOS=37196971;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:57:57:33:33:22:24:4:18:17:16:6:18:18:15 chr22 37267767 . A G 63.19 PASS AO=12;DP=25;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=-0.0372766;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.779;QD=9.72155;RBI=0.0372774;REFB=0.0127133;REVB=0.000241723;RO=13;SAF=4;SAR=8;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10868;STB=0.546694;TYPE=snp;VARB=-0.00898269;OID=.;OPOS=37267767;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:25:26:13:13:12:13:8:4:3:10:9:4:3:10 chr22 37268257 . C T 130.22 PASS AO=40;DP=104;FAO=40;FDP=104;FR=.;FRO=64;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=30;FSRR=34;FWDB=0.0130559;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=212.269;QD=5.00833;RBI=0.0178864;REFB=-0.00450523;REVB=0.0122257;RO=63;SAF=15;SAR=25;SRF=29;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0950513;STB=0.559671;TYPE=snp;VARB=0.00796329;OID=.;OPOS=37268257;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:63:64:40:40:25:15:29:34:25:15:30:34 chr22 37271882 . T C 39.75 PASS AO=11;DP=31;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=18;FWDB=-0.0390314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.377;QD=5.12864;RBI=0.041701;REFB=-0.0194298;REVB=0.0146808;RO=20;SAF=1;SAR=10;SRF=2;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0286254;STB=0.517209;TYPE=snp;VARB=0.0426946;OID=.;OPOS=37271882;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:31:31:20:20:11:11:10:1:2:18:10:1:2:18 chr22 37333794 . A G 86.74 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0273291;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.373;QD=38.5517;RBI=0.0285663;REFB=0;REVB=-0.00831575;RO=0;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000430523;OID=.;OPOS=37333794;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:4:5:0:0:4:5:0:0 chr22 37453452 . C T 207.79 PASS AO=28;DP=34;FAO=28;FDP=34;FR=.;FRO=6;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.0929175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.682;QD=24.4456;RBI=0.0930706;REFB=-0.149934;REVB=-0.00533558;RO=1;SAF=8;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0227089;STB=0.565174;TYPE=snp;VARB=0.0135091;OID=.;OPOS=37453452;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:34:34:1:6:28:28:20:8:0:1:20:8:0:6 chr22 37462926 . G A 149 PASS AO=42;DP=102;FAO=42;FDP=102;FR=.;FRO=60;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=35;FSRR=25;FWDB=0.0090097;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.028;QD=5.84294;RBI=0.017105;REFB=-0.0353383;REVB=0.0145398;RO=59;SAF=15;SAR=27;SRF=34;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228574;STB=0.633739;TYPE=snp;VARB=0.0378458;OID=.;OPOS=37462926;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:102:102:59:60:42:42:27:15:34:25:27:15:35:25 chr22 37462936 . A G 163.26 PASS AO=31;DP=87;FAO=44;FDP=100;FR=.;FRO=56;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=31;FSRR=25;FWDB=0.0107288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.518;QD=6.5303;RBI=0.0588943;REFB=-0.034364;REVB=0.0579088;RO=54;SAF=15;SAR=16;SRF=30;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0790562;STB=0.594452;TYPE=snp;VARB=0.0533866;OID=.;OPOS=37462936;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:87:100:54:56:31:44:16:15:30:24:27:17:31:25 chr22 37469591 . G A 219.04 PASS AO=40;DP=65;FAO=40;FDP=65;FR=.;FRO=25;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.00120759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.028;QD=13.4791;RBI=0.0239139;REFB=-0.0226751;REVB=0.0238834;RO=24;SAF=18;SAR=22;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00577298;STB=0.511622;TYPE=snp;VARB=0.0133279;OID=.;OPOS=37469591;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:65:65:24:25:40:40:22:18:11:13:22:18:12:13 chr22 37471290 . G A 80.26 PASS AO=20;DP=49;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=24;FWDB=0.0250847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.267;QD=6.42085;RBI=0.0333137;REFB=-0.0127813;REVB=0.0219217;RO=29;SAF=7;SAR=13;SRF=5;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219239;STB=0.612808;TYPE=snp;VARB=0.0234456;OID=.;OPOS=37471290;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:49:50:29:29:20:21:13:7:5:24:14:7:5:24 chr22 37480797 . C T 176.17 PASS AO=30;DP=46;FAO=30;FDP=46;FR=.;FRO=16;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.0130256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.7659;QD=15.319;RBI=0.0247567;REFB=-0.0285985;REVB=0.021053;RO=16;SAF=16;SAR=14;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0991466;STB=0.554217;TYPE=snp;VARB=0.0137322;OID=.;OPOS=37480797;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:46:46:16:16:30:30:14:16:11:5:14:16:11:5 chr22 37485724 . T C 90.8 PASS AO=36;DP=113;FAO=36;FDP=114;FR=.;FRO=78;FSAF=26;FSAR=10;FSRF=29;FSRR=49;FWDB=0.0193284;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.58;QD=3.18596;RBI=0.0248313;REFB=-0.00836499;REVB=-0.0155887;RO=71;SAF=26;SAR=10;SRF=29;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.363646;STB=0.735955;TYPE=snp;VARB=0.0197384;OID=.;OPOS=37485724;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:113:114:71:78:36:36:10:26:29:42:10:26:29:49 chr22 37531436 . G A 26.24 PASS AO=14;DP=62;FAO=14;FDP=61;FR=.;FRO=47;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=42;FWDB=0.0167194;FXX=0.0161264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.773;QD=1.72073;RBI=0.0264999;REFB=-0.00789345;REVB=-0.0205599;RO=47;SAF=7;SAR=7;SRF=5;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.522254;STB=0.803005;TYPE=snp;VARB=0.0197135;OID=.;OPOS=37531436;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:62:61:47:47:14:14:7:7:5:42:7:7:5:42 chr22 37580442 . A T 534.15 PASS AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0335677;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.8084;QD=38.1537;RBI=0.0363506;REFB=0;REVB=0.013949;RO=0;SAF=19;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.65905e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000529656;OID=.;OPOS=37580442;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:57:56:0:0:56:56:37:19:0:0:37:19:0:0 chr22 37581383 . C T 187.87 PASS AO=40;DP=75;FAO=40;FDP=75;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=0.0025621;FXX=0.0131562;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.4849;QD=10.0196;RBI=0.0309155;REFB=-0.0530297;REVB=-0.0308092;RO=35;SAF=15;SAR=25;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00321967;STB=0.501778;TYPE=snp;VARB=0.0303311;OID=.;OPOS=37581383;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:35:35:40:40:25:15:13:22:25:15:13:22 chr22 37602583 . G GC 90.95 PASS AO=12;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.143087;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.2005;QD=22.7375;RBI=0.170743;REFB=-0.0302547;REVB=-0.0931617;RO=2;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128507;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-0.0165836;OID=.;OPOS=37602584;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:12:16:16:16:0:8:8:0:0:8:2:6:6:0:2 chr22 37622815 . A G 80.11 PASS AO=16;DP=41;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.038604;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.878;QD=7.12057;RBI=0.0564903;REFB=-0.0214149;REVB=0.0412418;RO=25;SAF=13;SAR=3;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.361658;STB=0.57568;TYPE=snp;VARB=0.0368265;OID=.;OPOS=37622815;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:41:45:25:25:16:20:3:13:13:12:7:13:13:12 chr22 37637653 . G C 284.14 PASS AO=56;DP=98;FAO=56;FDP=98;FR=.;FRO=42;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=0.0117925;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.544;QD=11.5974;RBI=0.0123573;REFB=0.00255794;REVB=-0.00369315;RO=40;SAF=22;SAR=34;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103003;STB=0.547139;TYPE=snp;VARB=-0.00225366;OID=.;OPOS=37637653;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:40:42:56:56:34:22:21:19:34:22:21:21 chr22 37678551 . A G 126.33 PASS AO=23;DP=39;FAO=23;FDP=39;FR=.;FRO=16;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.000332605;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.158;QD=12.9571;RBI=0.0167656;REFB=-0.00576547;REVB=0.0167623;RO=15;SAF=15;SAR=8;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184998;STB=0.616335;TYPE=snp;VARB=0.00536057;OID=.;OPOS=37678551;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:39:39:15:16:23:23:8:15:6:9:8:15:6:10 chr22 37768879 . TA T 249.2 PASS AO=29;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.102354;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.6499;QD=25.5594;RBI=0.127873;REFB=0;REVB=0.0766483;RO=2;SAF=15;SAR=14;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0581366;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00686036;OID=.;OPOS=37768880;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:29:36:39:39:0:23:16:0:0:23:2:15:14:2:0 chr22 37870547 . CA C 33.88 PASS AO=5;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.012073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.23;QD=11.2932;RBI=0.0866785;REFB=-0.011673;REVB=-0.0858336;RO=6;SAF=3;SAR=2;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231195;STB=0.666171;TYPE=del;VARB=0.00956165;OID=.;OPOS=37870548;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:5:12:6:12:6:3:3:5:1:30:6:3:2:5:1 chr22 37887264 . T C 10.47 PASS AO=2;DP=6;FAO=2;FDP=6;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.00872394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.333;QD=6.97935;RBI=0.00872394;REFB=0.000348202;REVB=0;RO=4;SAF=2;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00104016;OID=.;OPOS=37887264;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:4:4:2:2:0:2:4:0:0:2:4:0 chr22 37900072 . G C 558.19 PASS AO=96;DP=145;FAO=96;FDP=145;FR=.;FRO=49;FSAF=37;FSAR=59;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=-0.00200747;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.607;QD=15.3983;RBI=0.00408991;REFB=-0.011117;REVB=-0.00356334;RO=49;SAF=37;SAR=59;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0416354;STB=0.522433;TYPE=snp;VARB=0.00532129;OID=.;OPOS=37900072;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:49:49:96:96:59:37:22:27:59:37:22:27 chr22 37900771 . A G 157.41 PASS AO=27;DP=42;FAO=27;FDP=42;FR=.;FRO=15;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.0138858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.9806;QD=14.9918;RBI=0.0588011;REFB=-0.0289673;REVB=-0.057138;RO=15;SAF=19;SAR=8;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0284363;STB=0.515646;TYPE=snp;VARB=0.00954486;OID=.;OPOS=37900771;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:42:42:15:15:27:27:8:19:10:5:8:19:10:5 chr22 37906262 . C T 236.21 PASS AO=54;DP=108;FAO=54;FDP=108;FR=.;FRO=54;FSAF=21;FSAR=33;FSRF=27;FSRR=27;FWDB=0.0353452;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.5853;QD=8.74842;RBI=0.0353664;REFB=-0.0236753;REVB=-0.00122605;RO=54;SAF=21;SAR=33;SRF=27;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102884;STB=0.556941;TYPE=snp;VARB=0.0224849;OID=.;OPOS=37906262;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:108:54:54:54:54:33:21:27:27:33:21:27:27 chr22 37906308 . GCTCCTT G 113.04 PASS AO=36;DP=118;FAO=37;FDP=105;FR=.;FRO=68;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=31;FSRR=37;FWDB=-0.049591;FXX=0.0366939;HRUN=1;LEN=6;MLLD=156.839;QD=4.30627;RBI=0.0506184;REFB=-0.00217995;REVB=-0.0101467;RO=34;SAF=13;SAR=23;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10034;STB=0.57108;TYPE=del;VARB=0.000299902;OID=.;OPOS=37906309;OREF=CTCCTT;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:36:83:37:105:68:13:24:31:37:99:34:13:23:16:18 chr22 37964299 . C G 72.38 PASS AO=19;DP=45;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=7;FWDB=-0.00270627;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=161.634;QD=6.29382;RBI=0.00381658;REFB=-0.0126671;REVB=-0.00269116;RO=26;SAF=12;SAR=7;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11142;STB=0.571358;TYPE=snp;VARB=0.0254489;OID=.;OPOS=37964299;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:45:46:26:27:19:19:7:12:19:7:7:12:20:7 chr22 38035795 . A ACGC 14.3 PASS AO=2;DP=10;FAO=3;FDP=9;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.0378662;FXX=0.0999001;HRUN=0;LEN=3;MLLD=115.676;QD=6.35745;RBI=0.0378662;REFB=-0.0178268;REVB=0;RO=6;SAF=2;SAR=0;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.169943;OID=.;OPOS=38035796;OREF=-;OALT=CGC;OMAPALT=ACGC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:2:10:3:9:6:3:0:6:0:14:6:2:0:6:0 chr22 38043444 . C A 138.32 PASS AO=12;DP=23;FAO=16;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0195113;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=308.985;QD=32.5464;RBI=0.0215284;REFB=-0.110303;REVB=0.00909846;RO=0;SAF=0;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.51722;TYPE=snp;VARB=0.000337029;OID=.;OPOS=38043444;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:13:17:0:1:12:16:12:0:0:0:14:2:0:1 chr22 38046695 . C A 105.02 PASS AO=19;DP=32;FAO=19;FDP=32;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=12;FWDB=-0.0186954;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.578;QD=13.1274;RBI=0.0266934;REFB=-0.0563403;REVB=-0.0190531;RO=12;SAF=2;SAR=17;SRF=1;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0420635;STB=0.532078;TYPE=snp;VARB=0.0216239;OID=.;OPOS=38046695;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:32:32:12:13:19:19:17:2:1:11:17:2:1:12 chr22 38051999 . C T 236.37 PASS AO=77;DP=204;FAO=78;FDP=207;FR=.;FRO=129;FSAF=28;FSAR=50;FSRF=69;FSRR=60;FWDB=0.00342664;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.368;QD=4.56757;RBI=0.0242614;REFB=-0.00962035;REVB=-0.0240182;RO=127;SAF=27;SAR=50;SRF=69;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215516;STB=0.611573;TYPE=snp;VARB=0.0150127;OID=.;OPOS=38051999;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:204:207:127:129:77:78:50:27:69:58:50:28:69:60 chr22 38062112 . C G 182.63 PASS AO=40;DP=78;FAO=40;FDP=78;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=-0.0210238;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=228.492;QD=9.36586;RBI=0.0281967;REFB=-0.00887905;REVB=-0.0187898;RO=38;SAF=14;SAR=26;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.042537;STB=0.523599;TYPE=snp;VARB=0.00791426;OID=.;OPOS=38062112;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:38:38:40:40:26:14:15:23:26:14:15:23 chr22 38065590 . GTCC G 178.76 PASS AO=37;DP=74;FAO=39;FDP=75;FR=.;FRO=36;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.00180246;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=241.544;QD=9.53387;RBI=0.010288;REFB=-0.00618284;REVB=-0.0101289;RO=31;SAF=24;SAR=13;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141829;STB=0.58382;TYPE=del;VARB=0.00485074;OID=.;OPOS=38065591;OREF=TCC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:37:72:39:75:36:25:14:17:19:99:31:24:13:15:16 chr22 38065655 . A G 123.54 PASS AO=35;DP=86;FAO=35;FDP=86;FR=.;FRO=51;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=31;FSRR=20;FWDB=-0.0388495;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.373;QD=5.74586;RBI=0.0396741;REFB=-0.00981322;REVB=0.00804704;RO=50;SAF=16;SAR=19;SRF=31;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167907;STB=0.588612;TYPE=snp;VARB=0.0184887;OID=.;OPOS=38065655;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:86:86:50:51:35:35:19:16:31:19:19:16:31:20 chr22 38074343 . C T 274.75 PASS AO=64;DP=130;FAO=64;FDP=130;FR=.;FRO=66;FSAF=30;FSAR=34;FSRF=40;FSRR=26;FWDB=0.00704402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.11;QD=8.45389;RBI=0.00709887;REFB=-0.0139516;REVB=0.000880734;RO=65;SAF=30;SAR=34;SRF=39;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119353;STB=0.569357;TYPE=snp;VARB=0.0109848;OID=.;OPOS=38074343;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:130:65:66:64:64:34:30:39:26:34:30:40:26 chr22 38074434 . G A 200.26 PASS AO=50;DP=110;FAO=50;FDP=109;FR=.;FRO=59;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=32;FSRR=27;FWDB=-0.00297794;FXX=0.00909008;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.991;QD=7.349;RBI=0.0414584;REFB=-0.0268138;REVB=0.0413513;RO=59;SAF=22;SAR=28;SRF=32;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0994632;STB=0.555452;TYPE=snp;VARB=0.0212965;OID=.;OPOS=38074434;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:109:59:59:50:50:28:22:32:27:28:22:32:27 chr22 38119213 . G A 96.2 PASS AO=28;DP=72;FAO=28;FDP=72;FR=.;FRO=44;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=32;FSRR=12;FWDB=0.0309406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.901;QD=5.34449;RBI=0.0549696;REFB=-0.0246107;REVB=-0.0454349;RO=44;SAF=20;SAR=8;SRF=32;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171336;STB=0.509797;TYPE=snp;VARB=0.0311043;OID=.;OPOS=38119213;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:72:72:44:44:28:28:8:20:32:12:8:20:32:12 chr22 38121777 . C CCG 16.39 PASS AO=3;DP=8;FAO=3;FDP=8;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=6;LEN=2;MLLD=21.4468;QD=8.19596;RBI=0.0171345;REFB=-0.0199588;REVB=0.0171345;RO=5;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.0343583;OID=.;OPOS=38121778;OREF=-;OALT=CG;OMAPALT=CCG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:3:8:3:8:5:0:3:0:5:15:5:0:3:0:5 chr22 38130472 . T C 76.53 PASS AO=23;DP=61;FAO=23;FDP=62;FR=.;FRO=39;FSAF=3;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=-0.0410589;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.498;QD=4.93711;RBI=0.0425085;REFB=-0.0182704;REVB=0.0110066;RO=38;SAF=3;SAR=20;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.491197;STB=0.785425;TYPE=snp;VARB=0.0270312;OID=.;OPOS=38130472;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:61:62:38:39:23:23:20:3:19:19:20:3:19:20 chr22 38170026 . G A 17.4 PASS AO=4;DP=13;FAO=4;FDP=13;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=0;FSRF=9;FSRR=0;FWDB=-0.0270595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.873;QD=5.35325;RBI=0.0270595;REFB=-0.00851558;REVB=0;RO=9;SAF=4;SAR=0;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0126523;OID=.;OPOS=38170026;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:13:13:9:9:4:4:0:4:9:0:0:4:9:0 chr22 38202552 . T C 278.93 PASS AO=61;DP=113;FAO=61;FDP=116;FR=.;FRO=55;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=26;FSRR=29;FWDB=-0.00760064;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.1055;QD=9.61824;RBI=0.0494683;REFB=-0.00558227;REVB=-0.0488809;RO=52;SAF=27;SAR=34;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0322751;STB=0.506536;TYPE=snp;VARB=0.00624859;OID=.;OPOS=38202552;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:116:52:55:61:61:34:27:25:27:33:28:26:29 chr22 38202642 . G T 78.45 PASS AO=25;DP=70;FAO=25;FDP=70;FR=.;FRO=45;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=27;FWDB=0.00339791;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=201.483;QD=4.48296;RBI=0.0496314;REFB=0.0093138;REVB=-0.0495149;RO=45;SAF=12;SAR=13;SRF=18;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0894001;STB=0.551683;TYPE=snp;VARB=-0.0137815;OID=.;OPOS=38202642;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:70:70:45:45:25:25:13:12:18:27:13:12:18:27 chr22 38202734 . G C 63.8 PASS AO=23;DP=76;FAO=25;FDP=78;FR=.;FRO=53;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=36;FWDB=0.00268339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.384;QD=3.27178;RBI=0.0087563;REFB=0.000921196;REVB=-0.008335;RO=53;SAF=8;SAR=15;SRF=17;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0356375;STB=0.557333;TYPE=snp;VARB=-0.00251536;OID=.;OPOS=38202734;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:76:78:53:53:23:25:15:8:17:36:15:10:17:36 chr22 38204089 . C T 112.33 PASS AO=21;DP=36;FAO=21;FDP=36;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.0307847;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.35;QD=12.4813;RBI=0.052975;REFB=-0.0301304;REVB=0.0431121;RO=15;SAF=11;SAR=10;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107809;STB=0.559944;TYPE=snp;VARB=0.0192101;OID=.;OPOS=38204089;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:36:36:15:15:21:21:10:11:10:5:10:11:10:5 chr22 38341134 . T C 1290.05 PASS AO=135;DP=136;FAO=137;FDP=139;FR=.;FRO=2;FSAF=49;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0299379;FXX=0.00714235;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.878;QD=37.1238;RBI=0.0449698;REFB=0.0469545;REVB=-0.033556;RO=1;SAF=47;SAR=88;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00537177;STB=0.505617;TYPE=snp;VARB=-0.000257262;OID=.;OPOS=38341134;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:136:139:1:2:135:137:88:47:0:1:88:49:0:2 chr22 38369976 . A G 107.82 PASS AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.189;QD=35.9384;RBI=0.0288584;REFB=0;REVB=-0.000205652;RO=0;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000245483;OID=.;OPOS=38369976;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:12:12:0:0:12:12:5:7:0:0:5:7:0:0 chr22 38382744 . CTG C 10.22 PASS AO=2;DP=10;FAO=2;FDP=9;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=-0.0242286;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=189.955;QD=4.5413;RBI=0.0242286;REFB=-0.0154769;REVB=0;RO=7;SAF=2;SAR=0;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.028446;OID=.;OPOS=38382745;OREF=TG;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:2:9:2:9:7:2:0:7:0:10:7:2:0:7:0 chr22 38474696 . A G 316.55 PASS AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.6836;QD=37.2409;RBI=0.0327957;REFB=0;REVB=-0.0244494;RO=0;SAF=3;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.40559e-05;OID=.;OPOS=38474696;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:34:0:0:34:34:31:3:0:0:31:3:0:0 chr22 38477930 . G A 136.3 PASS AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0292823;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.4133;QD=36.3467;RBI=0.0383572;REFB=0;REVB=-0.0247755;RO=0;SAF=8;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00216118;OID=.;OPOS=38477930;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:15:0:0:15:15:7:8:0:0:7:8:0:0 chr22 38503847 . C T 65.99 PASS AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=0.0121827;FXX=0.0263089;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.918;QD=7.13396;RBI=0.0122756;REFB=-0.00884083;REVB=0.0015072;RO=21;SAF=12;SAR=4;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0454472;STB=0.526282;TYPE=snp;VARB=0.0225012;OID=.;OPOS=38503847;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:38:37:21:21:16:16:4:12:15:6:4:12:15:6 chr22 38512402 . G A 296.56 PASS AO=49;DP=72;FAO=49;FDP=72;FR=.;FRO=23;FSAF=17;FSAR=32;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=0.0169079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.81;QD=16.4753;RBI=0.0205708;REFB=-0.00136507;REVB=-0.0117168;RO=23;SAF=17;SAR=32;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0279961;STB=0.515145;TYPE=snp;VARB=0.000676409;OID=.;OPOS=38512402;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:72:72:23:23:49:49:32:17:7:16:32:17:7:16 chr22 38611080 . C G 641.28 PASS AO=129;DP=228;FAO=130;FDP=229;FR=.;FRO=99;FSAF=73;FSAR=57;FSRF=48;FSRR=51;FWDB=-0.00927665;FXX=0.00865763;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.582;QD=11.2014;RBI=0.0369675;REFB=-0.0172931;REVB=0.0357846;RO=97;SAF=73;SAR=56;SRF=47;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0648133;STB=0.533382;TYPE=snp;VARB=0.0120221;OID=.;OPOS=38611080;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:228:229:97:99:129:130:56:73:47:50:57:73:48:51 chr22 38615536 . A T 192.73 PASS AO=12;DP=29;FAO=25;FDP=28;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.187583;FXX=0;HRUN=12;LEN=1;MLLD=26.0785;QD=27.5335;RBI=0.206309;REFB=-0.177799;REVB=0.0858841;RO=2;SAF=2;SAR=10;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0821516;STB=0.533308;TYPE=snp;VARB=0.0282307;OID=.;OPOS=38615536;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:16:28:2:3:12:25:10:2:0:2:21:4:0:3 chr22 38823136 . T C 231.77 PASS AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0417898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7778;QD=37.0834;RBI=0.0466118;REFB=0;REVB=0.0206462;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000521071;OID=.;OPOS=38823136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:25:25:0:0:25:25:13:12:0:0:13:12:0:0 chr22 38881701 . T A 112.99 PASS AO=18;DP=21;FAO=18;FDP=25;FR=.;FRO=7;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.0208141;FXX=0;HRUN=14;LEN=1;MLLD=136.644;QD=18.0783;RBI=0.0495492;REFB=0.00234859;REVB=-0.0449655;RO=3;SAF=15;SAR=3;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.073705;STB=0.555489;TYPE=snp;VARB=-0.000418333;OID=.;OPOS=38881701;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:21:25:3:7:18:18:3:15:2:1:3:15:5:2 chr22 38881703 . T A 41.37 PASS AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=3;FWDB=-0.0335631;FXX=0;HRUN=14;LEN=1;MLLD=135.068;QD=6.61852;RBI=0.055503;REFB=-0.0125046;REVB=-0.0442052;RO=12;SAF=8;SAR=2;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0684722;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00373368;OID=.;OPOS=38881703;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:22:25:12:15:10:10:2:8:9:3:2:8:12:3 chr22 38881705 . T A 49.69 PASS AO=12;DP=27;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=-0.0313287;FXX=0;HRUN=14;LEN=1;MLLD=104.492;QD=6.85433;RBI=0.0480788;REFB=-0.0518707;REVB=0.0364703;RO=15;SAF=9;SAR=3;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0989856;STB=0.533276;TYPE=snp;VARB=0.00916611;OID=.;OPOS=38881705;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:27:29:15:17:12:12:3:9:10:5:3:9:12:5 chr22 39125549 . C T 254.97 PASS AO=57;DP=119;FAO=61;FDP=126;FR=.;FRO=65;FSAF=22;FSAR=39;FSRF=22;FSRR=43;FWDB=0.0666918;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.2161;QD=8.09426;RBI=0.0725161;REFB=-0.0415835;REVB=0.0284742;RO=61;SAF=22;SAR=35;SRF=21;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0415155;STB=0.512496;TYPE=snp;VARB=0.0481306;OID=.;OPOS=39125549;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:119:126:61:65:57:61:35:22:21:40:39:22:22:43 chr22 39141722 . GC G 708.73 PASS AO=91;DP=137;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0631403;FXX=0.0592549;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.5501;QD=22.3223;RBI=0.311067;REFB=0.00671128;REVB=0.304592;RO=30;SAF=49;SAR=42;SRF=11;SRR=19;SSEN=0.505976;SSEP=0;SSSB=0.0796132;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0110455;OID=.;OPOS=39141723;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:91:134:127:127:0:64:63:0:0:50:30:49:42:11:19 chr22 39178701 . A G 118.83 PASS AO=31;DP=72;FAO=31;FDP=72;FR=.;FRO=41;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=28;FSRR=13;FWDB=0.00353242;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.6964;QD=6.60183;RBI=0.0109716;REFB=-0.0181948;REVB=-0.0103874;RO=41;SAF=21;SAR=10;SRF=28;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00635963;STB=0.503595;TYPE=snp;VARB=0.0253678;OID=.;OPOS=39178701;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:72:41:41:31:31:10:21:28:13:10:21:28:13 chr22 39218737 . GC G 52.74 PASS AO=13;DP=26;FAO=17;FDP=26;FR=.;FRO=9;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=0.128604;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.1457;QD=8.11336;RBI=0.303412;REFB=-0.103455;REVB=0.274809;RO=12;SAF=10;SAR=3;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.022323;STB=0.596755;TYPE=del;VARB=0.112172;OID=.;OPOS=39218738;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:13:26:17:26:9:11:6:8:1:20:12:10:3:9:3 chr22 39222652 . G A 107.41 PASS AO=29;DP=70;FAO=29;FDP=70;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=34;FSRR=7;FWDB=0.0197555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.323;QD=6.13777;RBI=0.0263498;REFB=-0.0391074;REVB=-0.0174365;RO=41;SAF=19;SAR=10;SRF=34;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216607;STB=0.621263;TYPE=snp;VARB=0.0523912;OID=.;OPOS=39222652;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:41:41:29:29:10:19:34:7:10:19:34:7 chr22 39381826 . A G 1099.23 PASS AO=115;DP=116;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0368085;FXX=0.00861995;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.839;QD=38.2342;RBI=0.0411474;REFB=0;REVB=0.0183914;RO=0;SAF=32;SAR=83;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.38114e-05;OID=.;OPOS=39381826;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:116:115:0:0:115:115:83:32:0:0:83:32:0:0 chr22 39381935 . C T 342.7 PASS AO=70;DP=126;FAO=70;FDP=125;FR=.;FRO=55;FSAF=23;FSAR=47;FSRF=13;FSRR=42;FWDB=0.010935;FXX=0.00793588;HRUN=3;LEN=1;MLLD=127.006;QD=10.9665;RBI=0.0176148;REFB=0.00748949;REVB=0.0138096;RO=55;SAF=23;SAR=47;SRF=13;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.08718;STB=0.54746;TYPE=snp;VARB=-0.00501709;OID=.;OPOS=39381935;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:125:55:55:70:70:47:23:13:42:47:23:13:42 chr22 39381999 . T C 1036.73 PASS AO=107;DP=107;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0538043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.361;QD=38.3972;RBI=0.0616221;REFB=0;REVB=-0.0300397;RO=0;SAF=30;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.2715e-05;OID=.;OPOS=39381999;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:107:108:0:0:107:108:77:30:0:0:77:31:0:0 chr22 39382079 . C A 915.09 PASS AO=90;DP=91;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0120323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.457;QD=38.1286;RBI=0.0139381;REFB=0;REVB=0.00703522;RO=0;SAF=18;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.25742e-05;OID=.;OPOS=39382079;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:91:96:0:0:90:96:72:18:0:0:77:19:0:0 chr22 39387558 . C T 259.64 PASS AO=65;DP=140;FAO=65;FDP=140;FR=.;FRO=75;FSAF=28;FSAR=37;FSRF=30;FSRR=45;FWDB=0.010067;FXX=0.0070917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.8851;QD=7.41825;RBI=0.0206477;REFB=-0.00322886;REVB=0.0180273;RO=75;SAF=28;SAR=37;SRF=30;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0304272;STB=0.516879;TYPE=snp;VARB=0.0015113;OID=.;OPOS=39387558;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:140:75:75:65:65:37:28:30:45:37:28:30:45 chr22 39388207 . G A 10.3 PASS AO=2;DP=8;FAO=2;FDP=8;FR=.;FRO=6;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.3219;QD=5.1483;RBI=0.0144966;REFB=-0.0228455;REVB=0.0144966;RO=6;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0569549;OID=.;OPOS=39388207;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:8:8:6:6:2:2:2:0:0:6:2:0:0:6 chr22 39440149 . C T 20.5 PASS AO=6;DP=20;FAO=6;FDP=21;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.00401006;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=63.8822;QD=3.90434;RBI=0.0263583;REFB=-0.00755522;REVB=-0.0260514;RO=14;SAF=4;SAR=2;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260867;STB=0.644671;TYPE=snp;VARB=0.0306155;OID=.;OPOS=39440149;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:20:21:14:15:6:6:2:4:6:8:2:4:7:8 chr22 39441096 . G T 196.4 PASS AO=69;DP=193;FAO=69;FDP=193;FR=.;FRO=124;FSAF=30;FSAR=39;FSRF=66;FSRR=58;FWDB=0.00629448;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.104;QD=4.07041;RBI=0.0176229;REFB=-0.012623;REVB=0.0164604;RO=121;SAF=30;SAR=39;SRF=65;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114715;STB=0.562651;TYPE=snp;VARB=0.0183027;OID=.;OPOS=39441096;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:193:193:121:124:69:69:39:30:65:56:39:30:66:58 chr22 39441203 . C T 368.14 PASS AO=80;DP=153;FAO=81;FDP=154;FR=.;FRO=73;FSAF=18;FSAR=63;FSRF=20;FSRR=53;FWDB=0.0247337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.105;QD=9.56209;RBI=0.0326237;REFB=-0.00675222;REVB=-0.0212733;RO=72;SAF=18;SAR=62;SRF=20;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0627015;STB=0.534128;TYPE=snp;VARB=0.0051092;OID=.;OPOS=39441203;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:154:72:73:80:81:62:18:20:52:63:18:20:53 chr22 39445554 . G A 379.86 PASS AO=83;DP=158;FAO=84;FDP=159;FR=.;FRO=75;FSAF=41;FSAR=43;FSRF=28;FSRR=47;FWDB=0.0102877;FXX=0.0185174;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.036;QD=9.55632;RBI=0.0167135;REFB=-0.0105651;REVB=-0.0131721;RO=73;SAF=40;SAR=43;SRF=26;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108235;STB=0.554291;TYPE=snp;VARB=0.0113855;OID=.;OPOS=39445554;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:158:159:73:75:83:84:43:40:26:47:43:41:28:47 chr22 39496322 . TAAC T 339.11 PASS AO=132;DP=301;FAO=134;FDP=290;FR=.;FRO=156;FSAF=60;FSAR=74;FSRF=80;FSRR=76;FWDB=0.00744677;FXX=0.00684908;HRUN=2;LEN=3;MLLD=256.13;QD=4.67735;RBI=0.0102113;REFB=-0.00601666;REVB=0.0069868;RO=130;SAF=58;SAR=74;SRF=60;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0202827;STB=0.535119;TYPE=del;VARB=0.00674933;OID=.;OPOS=39496323;OREF=AAC;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:132:270:134:290:156:60:74:80:76:99:130:58:74:60:70 chr22 39496336 . G T 623.29 PASS AO=137;DP=264;FAO=139;FDP=266;FR=.;FRO=127;FSAF=61;FSAR=78;FSRF=63;FSRR=64;FWDB=0.0270033;FXX=0.011152;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.837;QD=9.37272;RBI=0.0302107;REFB=-0.0353078;REVB=0.0135464;RO=123;SAF=59;SAR=78;SRF=60;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.050072;STB=0.52754;TYPE=snp;VARB=0.0163128;OID=.;OPOS=39496336;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:264:266:123:127:137:139:78:59:60:63:78:61:63:64 chr22 39496412 . G C 465.12 PASS AO=90;DP=161;FAO=90;FDP=153;FR=.;FRO=63;FSAF=38;FSAR=52;FSRF=38;FSRR=25;FWDB=-0.0431696;FXX=0.0496864;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.619;QD=12.1601;RBI=0.0434987;REFB=-0.0357177;REVB=0.00534011;RO=71;SAF=38;SAR=52;SRF=46;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181437;STB=0.574569;TYPE=snp;VARB=0.0267434;OID=.;OPOS=39496412;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:161:153:71:63:90:90:52:38:46:25:52:38:38:25 chr22 39497404 . G C 521.21 PASS AO=73;DP=196;FAO=77;FDP=189;FR=.,HEALED;FRO=71;FSAF=30;FSAR=47;FSRF=13;FSRR=58;FWDB=0.005944;FXX=0.0156242;HRUN=3;LEN=1;MLLD=222.645;QD=11.0309;RBI=0.00677678;REFB=-0.012777;REVB=0.00325478;RO=66;SAF=26;SAR=47;SRF=10;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207552;STB=0.609141;TYPE=snp;VARB=0.00770582;OID=.;OPOS=39497404;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:189:66:71:73:77:47:26:10:56:47:30:13:58 chr22 39497452 . A G 74.64 PASS AO=29;DP=92;FAO=30;FDP=94;FR=.;FRO=64;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=32;FSRR=32;FWDB=-0.0305115;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.4769;QD=3.17617;RBI=0.0414515;REFB=0.00247609;REVB=-0.0280585;RO=62;SAF=7;SAR=22;SRF=30;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.309392;STB=0.670612;TYPE=snp;VARB=-0.00343276;OID=.;OPOS=39497452;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:92:94:62:64:29:30:22:7:30:32:22:8:32:32 chr22 39497454 . G C 85.87 PASS AO=32;DP=78;FAO=30;FDP=91;FR=.;FRO=61;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=31;FSRR=30;FWDB=-0.155782;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=96.2574;QD=3.7745;RBI=0.155962;REFB=-0.0221399;REVB=0.00748863;RO=46;SAF=10;SAR=22;SRF=16;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0418374;STB=0.673348;TYPE=snp;VARB=0.0363823;OID=.;OPOS=39497454;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:78:91:46:61:32:30:22:10:16:30:22:8:31:30 chr22 39497509 . A G 316.47 PASS AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0380086;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.0097;QD=37.2321;RBI=0.0382155;REFB=0;REVB=-0.00397126;RO=0;SAF=10;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000841997;OID=.;OPOS=39497509;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:34:34:0:0:34:34:24:10:0:0:24:10:0:0 chr22 39498038 . G C 143.39 PASS AO=31;DP=59;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=25;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=-0.00138999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.092;QD=9.40253;RBI=0.0309798;REFB=-0.0353141;REVB=0.0309486;RO=28;SAF=6;SAR=25;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192088;STB=0.596946;TYPE=snp;VARB=0.0275326;OID=.;OPOS=39498038;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:61:28:30:31:31:25:6:10:18:25:6:10:20 chr22 39499653 . C T 91.41 PASS AO=30;DP=84;FAO=30;FDP=84;FR=.;FRO=54;FSAF=6;FSAR=24;FSRF=9;FSRR=45;FWDB=-0.0139589;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=180.972;QD=4.35263;RBI=0.0152348;REFB=-0.0016919;REVB=0.00610326;RO=54;SAF=6;SAR=24;SRF=9;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.060809;STB=0.534862;TYPE=snp;VARB=0.00549411;OID=.;OPOS=39499653;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:84:84:54:54:30:30:24:6:9:45:24:6:9:45 chr22 39657004 . C T 112.5 PASS AO=32;DP=80;FAO=32;FDP=80;FR=.;FRO=48;FSAF=7;FSAR=25;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=0.00607084;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.038;QD=5.6251;RBI=0.00621289;REFB=-0.001269;REVB=0.00132095;RO=47;SAF=7;SAR=25;SRF=22;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.303282;STB=0.669939;TYPE=snp;VARB=0.00248713;OID=.;OPOS=39657004;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:47:48:32:32:25:7:22:25:25:7:22:26 chr22 39712936 . G A 125.92 PASS AO=38;DP=101;FAO=39;FDP=100;FR=.;FRO=61;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=34;FSRR=27;FWDB=0.0160057;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.359;QD=5.03676;RBI=0.0212105;REFB=-0.0136465;REVB=0.0139177;RO=59;SAF=14;SAR=24;SRF=33;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205676;STB=0.605819;TYPE=snp;VARB=0.0223438;OID=.;OPOS=39712936;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:100:59:61:38:39:24:14:33:26:24:15:34:27 chr22 39712981 . A G 680.27 PASS AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00356656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.552;QD=37.7926;RBI=0.0136963;REFB=0;REVB=0.0132238;RO=0;SAF=30;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1178e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.20231e-05;OID=.;OPOS=39712981;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:72:72:0:0:72:72:42:30:0:0:42:30:0:0 chr22 39714490 . C T 108.95 PASS AO=24;DP=52;FAO=25;FDP=52;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.0207719;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.785;QD=8.38094;RBI=0.0334864;REFB=-0.011178;REVB=0.0262653;RO=28;SAF=11;SAR=13;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0736317;STB=0.559952;TYPE=snp;VARB=0.016624;OID=.;OPOS=39714490;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:52:52:28:27:24:25:13:11:15:13:14:11:15:12 chr22 39770597 . A G 12.57 PASS AO=4;DP=17;FAO=4;FDP=18;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=0.0384216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.875;QD=2.79324;RBI=0.0678084;REFB=-0.0206784;REVB=-0.0558727;RO=13;SAF=3;SAR=1;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.531518;STB=0.855782;TYPE=snp;VARB=0.0532205;OID=.;OPOS=39770597;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:17:18:13:14:4:4:1:3:3:10:1:3:3:11 chr22 39781585 . C T 523.01 PASS AO=131;DP=276;FAO=131;FDP=276;FR=.;FRO=145;FSAF=66;FSAR=65;FSRF=66;FSRR=79;FWDB=-0.0467396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.0993;QD=7.57991;RBI=0.0475958;REFB=-0.0286496;REVB=0.00898754;RO=145;SAF=66;SAR=65;SRF=66;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0463737;STB=0.525544;TYPE=snp;VARB=0.0301805;OID=.;OPOS=39781585;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:276:276:145:145:131:131:65:66:66:79:65:66:66:79 chr22 39813759 . T G 116.91 PASS AO=30;DP=67;FAO=30;FDP=69;FR=.;FRO=39;FSAF=3;FSAR=27;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=-0.0118418;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.521;QD=6.77748;RBI=0.0156357;REFB=-0.00361708;REVB=-0.0102102;RO=37;SAF=3;SAR=27;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.544627;STB=0.807912;TYPE=snp;VARB=0.00372639;OID=.;OPOS=39813759;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:69:37:39:30:30:27:3:19:18:27:3:19:20 chr22 39884847 . G C 65.88 PASS AO=10;DP=14;FAO=10;FDP=14;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0111618;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.366;QD=18.8228;RBI=0.0361128;REFB=-0.0278617;REVB=-0.0343445;RO=3;SAF=4;SAR=6;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0285311;STB=0.529352;TYPE=snp;VARB=0.0163564;OID=.;OPOS=39884847;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:14:14:3:4:10:10:6:4:1:2:6:4:2:2 chr22 39907368 . G A 23.24 PASS AO=7;DP=24;FAO=7;FDP=24;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=0.0599307;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.089;QD=3.87252;RBI=0.0624421;REFB=-0.0136298;REVB=0.0175309;RO=15;SAF=4;SAR=3;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108749;STB=0.555401;TYPE=snp;VARB=0.0253112;OID=.;OPOS=39907368;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:24:24:15:17:7:7:3:4:10:5:3:4:11:6 chr22 39910060 . C T 15.78 PASS AO=3;DP=7;FAO=3;FDP=7;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=190.701;QD=9.01797;RBI=0.0115921;REFB=0.00361133;REVB=-0.0115921;RO=4;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00913134;OID=.;OPOS=39910060;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:7:7:4:4:3:3:3:0:0:4:3:0:0:4 chr22 39966856 . C T 180.76 PASS AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0211094;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1755;QD=32.8646;RBI=0.0911693;REFB=-0.0461272;REVB=0.0886918;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.526291;TYPE=snp;VARB=0.00673613;OID=.;OPOS=39966856;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:22:22:0:1:21:21:9:12:0:0:9:12:0:1 chr22 40054948 . T C 86.75 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0709677;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.4259;QD=38.5574;RBI=0.0798102;REFB=0;REVB=0.0365137;RO=0;SAF=8;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00160501;OID=.;OPOS=40054948;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:8:0:0:1:8:0:0 chr22 40057273 . T C 607.01 PASS AO=64;DP=66;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0411142;FXX=0.0302984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.7373;QD=37.938;RBI=0.0502242;REFB=0;REVB=0.0288461;RO=0;SAF=47;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.23474e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000649024;OID=.;OPOS=40057273;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:29:66:64:0:0:64:64:17:47:0:0:18:46:0:0 chr22 40283427 . A G 113.54 PASS AO=29;DP=67;FAO=29;FDP=66;FR=.;FRO=37;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=24;FSRR=13;FWDB=0.0260668;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2947;QD=6.88117;RBI=0.0281608;REFB=-0.017243;REVB=0.0106559;RO=37;SAF=20;SAR=9;SRF=24;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0464335;STB=0.526297;TYPE=snp;VARB=0.0224964;OID=.;OPOS=40283427;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:66:37:37:29:29:9:20:24:13:9:20:24:13 chr22 40574170 . T A 707.72 PASS AO=108;DP=134;FAO=109;FDP=134;FR=.;FRO=25;FSAF=54;FSAR=55;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.104492;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=37.8034;QD=21.1259;RBI=0.105629;REFB=-0.0705029;REVB=-0.0154551;RO=13;SAF=52;SAR=56;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0115778;STB=0.517805;TYPE=snp;VARB=0.0559446;OID=.;OPOS=40574170;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:134:134:13:25:108:109:56:52:7:6:55:54:10:15 chr22 40673999 . C T 1365.85 PASS AO=132;DP=136;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0867464;FXX=0.00671096;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.5152;QD=36.9149;RBI=0.121459;REFB=-0.100091;REVB=0.0850138;RO=4;SAF=71;SAR=61;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119299;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00411864;OID=.;OPOS=40673999;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:136:148:4:0:132:148:61:71:3:1:66:82:0:0 chr22 40719736 . G C 63.99 PASS AO=13;DP=23;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=12;FSAR=0;FSRF=10;FSRR=0;FWDB=-0.0112589;FXX=0.0434594;HRUN=6;LEN=1;MLLD=270.307;QD=11.6337;RBI=0.0112589;REFB=0.00246878;REVB=0;RO=10;SAF=13;SAR=0;SRF=10;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00213988;OID=.;OPOS=40719736;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:23:22:10:10:13:12:0:13:10:0:0:12:10:0 chr22 40720704 . A G 3191.9 PASS AO=349;DP=357;FAO=349;FDP=357;FR=.;FRO=8;FSAF=205;FSAR=144;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=-0.0296697;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.973;QD=35.7636;RBI=0.0583593;REFB=-0.00985537;REVB=-0.0502545;RO=8;SAF=205;SAR=144;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0182505;STB=0.509569;TYPE=snp;VARB=5.55238e-06;OID=.;OPOS=40720704;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:88:357:357:8:8:349:349:144:205:8:0:144:205:8:0 chr22 40722745 . A G 810.46 PASS AO=91;DP=95;FAO=91;FDP=95;FR=.;FRO=4;FSAF=72;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0262716;FXX=0.0104156;HRUN=3;LEN=1;MLLD=135.398;QD=34.1246;RBI=0.028555;REFB=-0.0506956;REVB=0.0111889;RO=4;SAF=72;SAR=19;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0899209;STB=0.547608;TYPE=snp;VARB=0.000909548;OID=.;OPOS=40722745;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:95:95:4:4:91:91:19:72:0:4:19:72:0:4 chr22 40726749 . C T 2068.98 PASS AO=220;DP=223;FAO=220;FDP=220;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=135;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182099;FXX=0.0134523;HRUN=2;LEN=1;MLLD=244.339;QD=37.6178;RBI=0.0217457;REFB=-0.0841741;REVB=-0.0118858;RO=2;SAF=85;SAR=135;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00700604;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.13462e-05;OID=.;OPOS=40726749;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:82:223:220:2:0:220:220:135:85:0:2:135:85:0:0 chr22 40726762 . A G 1799.91 PASS AO=198;DP=202;FAO=197;FDP=202;FR=.;FRO=5;FSAF=80;FSAR=117;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0455164;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.2505;QD=35.6417;RBI=0.0516071;REFB=0.0342278;REVB=-0.0243218;RO=3;SAF=81;SAR=117;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00222774;STB=0.504965;TYPE=snp;VARB=-0.00276687;OID=.;OPOS=40726762;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:202:202:3:5:198:197:117:81:1:2:117:80:3:2 chr22 40731777 . G A 73.96 PASS AO=46;DP=119;FAO=33;FDP=114;FR=.;FRO=81;FSAF=31;FSAR=2;FSRF=47;FSRR=34;FWDB=0.00981177;FXX=0.0499958;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.181;QD=2.59493;RBI=0.0329149;REFB=-0.000156152;REVB=0.0314185;RO=65;SAF=31;SAR=15;SRF=45;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0219492;STB=0.877066;TYPE=snp;VARB=0.000759898;OID=.;OPOS=40731777;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:73:119:114:65:81:46:33:15:31:45:20:2:31:47:34 chr22 40803112 . C T 101.87 PASS AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=30;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0538505;FXX=0.117612;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.673;QD=13.5826;RBI=0.0624184;REFB=-0.0394609;REVB=0.0315623;RO=12;SAF=7;SAR=11;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0207715;STB=0.511615;TYPE=snp;VARB=0.0244452;OID=.;OPOS=40803112;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:47:34:30:12:12:18:18:11:7:5:7:11:7:5:7 chr22 40803186 . G T 379.52 PASS AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0410279;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.5092;QD=35.3037;RBI=0.055442;REFB=-0.112396;REVB=0.0372899;RO=1;SAF=21;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218287;STB=0.511622;TYPE=snp;VARB=0.00461115;OID=.;OPOS=40803186;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:43:43:1:1:42:42:21:21:1:0:21:21:1:0 chr22 40808676 . A T 355.08 PASS AO=82;DP=162;FAO=82;FDP=163;FR=.;FRO=81;FSAF=51;FSAR=31;FSRF=30;FSRR=51;FWDB=0.00344887;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.7185;QD=8.7136;RBI=0.0475733;REFB=-0.0194067;REVB=-0.0474482;RO=80;SAF=51;SAR=31;SRF=30;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221776;STB=0.624802;TYPE=snp;VARB=0.0166358;OID=.;OPOS=40808676;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:163:80:81:82:82:31:51:30:50:31:51:30:51 chr22 41075543 . A G 15.45 PASS AO=3;DP=7;FAO=3;FDP=9;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.027746;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.1523;QD=6.86488;RBI=0.0354602;REFB=-0.0936999;REVB=-0.0220814;RO=4;SAF=2;SAR=1;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0848588;STB=0.635588;TYPE=snp;VARB=0.0276399;OID=.;OPOS=41075543;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:7:9:4:6:3:3:1:2:3:1:1:2:5:1 chr22 41175202 . C T 80.55 PASS AO=26;DP=73;FAO=26;FDP=73;FR=.;FRO=47;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=9;FSRR=38;FWDB=-0.00510564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.7478;QD=4.41356;RBI=0.00891608;REFB=0.0126861;REVB=-0.00730951;RO=46;SAF=9;SAR=17;SRF=9;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199528;STB=0.617898;TYPE=snp;VARB=-0.0200904;OID=.;OPOS=41175202;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:80:73:73:46:47:26:26:17:9:9:37:17:9:9:38 chr22 41195082 . G A 250.05 PASS AO=57;DP=114;FAO=57;FDP=113;FR=.;FRO=56;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=33;FSRR=23;FWDB=-0.0401002;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.006;QD=8.85117;RBI=0.0452534;REFB=-0.00367851;REVB=0.0209724;RO=55;SAF=28;SAR=29;SRF=33;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0967377;STB=0.54851;TYPE=snp;VARB=0.00315237;OID=.;OPOS=41195082;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:113:55:56:57:57:29:28:33:22:29:28:33:23 chr22 41548008 . A G 2238.87 PASS AO=233;DP=236;FAO=236;FDP=236;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=138;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260251;FXX=0.0288054;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.88;QD=37.9469;RBI=0.0261342;REFB=0;REVB=-0.00238585;RO=1;SAF=95;SAR=138;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00499002;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000240222;OID=.;OPOS=41548008;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:236:236:1:0:233:236:138:95:1:0:138:98:0:0 chr22 41551039 . T A 1451.86 PASS AO=181;DP=206;FAO=183;FDP=207;FR=.;FRO=24;FSAF=31;FSAR=152;FSRF=22;FSRR=2;FWDB=0.00848363;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=135.858;QD=28.0553;RBI=0.0131457;REFB=-0.138667;REVB=0.0100418;RO=22;SAF=30;SAR=151;SRF=20;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229507;STB=0.627888;TYPE=snp;VARB=0.00395783;OID=.;OPOS=41551039;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:206:207:22:24:181:183:151:30:20:2:152:31:22:2 chr22 41574969 . TGTA T 447.37 PASS AO=47;DP=68;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00527672;FXX=0.196689;HRUN=1;LEN=3;MLLD=292.251;QD=36.5203;RBI=0.00536944;REFB=0.00766698;REVB=-0.000993585;RO=0;SAF=6;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.19087e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-1.2052e-05;OID=.;OPOS=41574970;OREF=GTA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:47:51:49:49:0:8:41:0:0:16:0:6:41:0:0 chr22 41604343 . AGGC AGC,AGGG 94.57 PASS AO=2,8;DP=10;FAO=2,8;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=1,8;FSAR=1,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0323563,-0.0195993;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=1,1;MLLD=21.899,134.256;QD=37.8285;RBI=0.107796,0.0929712;REFB=0,0;REVB=0.102825,-0.0908819;RO=0;SAF=1,8;SAR=1,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0.302763,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.113657,0.00360037;OID=.,.;OPOS=41604344,41604346;OREF=G,C;OALT=-,G;OMAPALT=AGC,AGGG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:2,8:10:2,8:10:0:1,8:1,0:0:0:9:0:1,8:1,0:0:0 chr22 41604399 . G A 351.08 PASS AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.024756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.9428;QD=37.9542;RBI=0.0312413;REFB=0;REVB=-0.0190567;RO=0;SAF=16;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.7558e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00076603;OID=.;OPOS=41604399;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:37:37:0:0:37:37:21:16:0:0:21:16:0:0 chr22 41613188 . C T 583.66 PASS AO=63;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0547661;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=139.46;QD=35.9172;RBI=0.0599254;REFB=-0.0921246;REVB=0.0243255;RO=2;SAF=30;SAR=33;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0304411;STB=0.507934;TYPE=snp;VARB=0.00100692;OID=.;OPOS=41613188;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:65:65:2:1:63:64:33:30:2:0:33:31:1:0 chr22 41617318 . G C 1708.24 PASS AO=179;DP=181;FAO=182;FDP=182;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=108;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00634034;FXX=0.0162153;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.675;QD=37.5437;RBI=0.0178111;REFB=-0.0160143;REVB=-0.0166444;RO=2;SAF=74;SAR=105;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126907;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.66586e-05;OID=.;OPOS=41617318;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:181:182:2:0:179:182:105:74:2:0:108:74:0:0 chr22 41645757 . C G 86.75 PASS AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00105021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.1344;QD=38.5576;RBI=0.00350682;REFB=0;REVB=-0.00334587;RO=0;SAF=3;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.21736e-05;OID=.;OPOS=41645757;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:9:0:0:9:9:6:3:0:0:6:3:0:0 chr22 41726053 . G A 131.26 PASS AO=25;DP=46;FAO=26;FDP=47;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.112235;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.1485;QD=11.1711;RBI=0.114151;REFB=0.0380392;REVB=0.0208249;RO=21;SAF=6;SAR=19;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227845;STB=0.605917;TYPE=snp;VARB=-0.0257581;OID=.;OPOS=41726053;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:46:47:21:21:25:26:19:6:10:11:19:7:10:11 chr22 41752747 . G A 163.87 PASS AO=28;DP=43;FAO=28;FDP=43;FR=.;FRO=15;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=13;FWDB=0.0454608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.413;QD=15.2437;RBI=0.133839;REFB=-0.0142862;REVB=0.125882;RO=14;SAF=14;SAR=14;SRF=1;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.262461;STB=0.627822;TYPE=snp;VARB=0.00491259;OID=.;OPOS=41752747;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:43:43:14:15:28:28:14:14:1:13:14:14:2:13 chr22 41790179 . G A 579.15 PASS AO=126;DP=236;FAO=126;FDP=235;FR=.;FRO=109;FSAF=42;FSAR=84;FSRF=41;FSRR=68;FWDB=-0.00356429;FXX=0.00423711;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.027;QD=9.85778;RBI=0.00376215;REFB=-0.00394573;REVB=-0.001204;RO=108;SAF=42;SAR=84;SRF=40;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0347767;STB=0.522009;TYPE=snp;VARB=0.0041841;OID=.;OPOS=41790179;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:236:235:108:109:126:126:84:42:40:68:84:42:41:68 chr22 41829794 . C G 1056.46 PASS AO=111;DP=112;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.012962;FXX=0.0176975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.508;QD=38.0705;RBI=0.0129677;REFB=0;REVB=-0.000384869;RO=0;SAF=44;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.13259e-05;OID=.;OPOS=41829794;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:112:111:0:0:111:111:67:44:0:0:67:44:0:0 chr22 41833116 . C T 555.6 PASS AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0405416;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.857;QD=37.0403;RBI=0.0406732;REFB=-0.101853;REVB=-0.00326961;RO=1;SAF=26;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.017801;STB=0.509431;TYPE=snp;VARB=0.000638781;OID=.;OPOS=41833116;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:60:60:1:1:59:59:33:26:1:0:33:26:1:0 chr22 41911525 . C T 88.48 PASS AO=13;DP=18;FAO=13;FDP=18;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0886898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.056;QD=19.6622;RBI=0.0887014;REFB=0.00666158;REVB=0.00143625;RO=5;SAF=1;SAR=12;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.35687;STB=0.705476;TYPE=snp;VARB=-0.00116583;OID=.;OPOS=41911525;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:18:18:5:5:13:13:12:1:2:3:12:1:2:3 chr22 42059768 . G T 533.64 PASS AO=61;DP=133;FAO=62;FDP=128;FR=.,HEALED;FRO=34;FSAF=23;FSAR=39;FSRF=33;FSRR=1;FWDB=0.0517961;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=77.1385;QD=16.6762;RBI=0.0518276;REFB=0.0109972;REVB=0.00180582;RO=34;SAF=23;SAR=38;SRF=33;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.377511;STB=0.703547;TYPE=snp;VARB=0.0195908;OID=.;OPOS=42059768;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:128:128:34:34:61:62:38:23:33:1:39:23:33:1 chr22 42089623 . T C 965.61 PASS AO=95;DP=96;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0284085;FXX=0.0818107;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.869;QD=38.2421;RBI=0.0638126;REFB=0;REVB=0.0571402;RO=0;SAF=28;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00100592;OID=.;OPOS=42089623;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:96:101:0:0:95:101:67:28:0:0:69:32:0:0 chr22 42089624 . G C 11.54 PASS AO=17;DP=112;FAO=17;FDP=112;FR=.;FRO=95;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=69;FWDB=-0.0154573;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.3413;QD=0.41201;RBI=0.0249996;REFB=-0.0439166;REVB=0.0196481;RO=95;SAF=6;SAR=11;SRF=26;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116162;STB=0.576839;TYPE=snp;VARB=0.048224;OID=.;OPOS=42089624;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:112:112:95:95:17:17:11:6:26:69:11:6:26:69 chr22 42118046 . T TA 39.19 PASS AO=20;DP=69;FAO=37;FDP=65;FR=.;FRO=28;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.0587442;FXX=0.0441112;HRUN=8;LEN=1;MLLD=5.64707;QD=2.41156;RBI=0.139072;REFB=-0.0665013;REVB=0.126056;RO=35;SAF=11;SAR=9;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0392169;STB=0.56956;TYPE=ins;VARB=0.0934597;OID=.;OPOS=42118047;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:20:69:37:65:28:23:14:13:15:31:35:11:9:18:17 chr22 42159229 . G T 664.02 PASS AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0366175;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.5997;QD=37.9439;RBI=0.0543773;REFB=0;REVB=0.0402001;RO=0;SAF=18;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000612703;OID=.;OPOS=42159229;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:71:70:0:0:70:70:52:18:0:0:52:18:0:0 chr22 42336172 . G A 211.7 PASS AO=50;DP=103;FAO=50;FDP=103;FR=.;FRO=53;FSAF=17;FSAR=33;FSRF=19;FSRR=34;FWDB=0.0065795;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.408;QD=8.22136;RBI=0.0343017;REFB=-0.00600189;REVB=0.0336647;RO=53;SAF=17;SAR=33;SRF=19;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0189606;STB=0.510524;TYPE=snp;VARB=0.00761481;OID=.;OPOS=42336172;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:53:53:50:50:33:17:19:34:33:17:19:34 chr22 42354389 . A C 342.09 PASS AO=67;DP=115;FAO=67;FDP=115;FR=.;FRO=48;FSAF=23;FSAR=44;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=0.0266452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.372;QD=11.8988;RBI=0.0430177;REFB=0.00981011;REVB=-0.0337722;RO=46;SAF=23;SAR=44;SRF=26;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172804;STB=0.5868;TYPE=snp;VARB=-0.00933306;OID=.;OPOS=42354389;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:46:48:67:67:44:23:26:20:44:23:26:22 chr22 42416056 . A G 313.08 PASS AO=72;DP=143;FAO=72;FDP=143;FR=.;FRO=71;FSAF=19;FSAR=53;FSRF=21;FSRR=50;FWDB=0.00528211;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.538;QD=8.7574;RBI=0.0122006;REFB=0.00374974;REVB=0.0109979;RO=68;SAF=19;SAR=53;SRF=21;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0496585;STB=0.519985;TYPE=snp;VARB=-0.00499698;OID=.;OPOS=42416056;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:68:71:72:72:53:19:21:47:53:19:21:50 chr22 42423110 . G C 113.52 PASS AO=38;DP=107;FAO=38;FDP=106;FR=.;FRO=68;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=29;FSRR=39;FWDB=0.000993508;FXX=0.00934492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.782;QD=4.28386;RBI=0.0190399;REFB=-0.00069973;REVB=-0.019014;RO=68;SAF=15;SAR=23;SRF=29;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0367413;STB=0.521101;TYPE=snp;VARB=0.00162314;OID=.;OPOS=42423110;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:106:68:68:38:38:23:15:29:39:23:15:29:39 chr22 42428727 . A T 395.15 PASS AO=126;DP=318;FAO=127;FDP=326;FR=.;FRO=199;FSAF=51;FSAR=76;FSRF=83;FSRR=116;FWDB=-0.0452953;FXX=0.00305801;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.4872;QD=4.84851;RBI=0.0550722;REFB=-0.022043;REVB=-0.0313253;RO=191;SAF=51;SAR=75;SRF=82;SRR=109;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0272217;STB=0.50981;TYPE=snp;VARB=0.0276216;OID=.;OPOS=42428727;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:318:326:191:199:126:127:75:51:82:109:76:51:83:116 chr22 42463814 . C T 137.83 PASS AO=25;DP=49;FAO=27;FDP=49;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0333172;FXX=0.039208;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.015;QD=11.2512;RBI=0.0340507;REFB=-0.0130133;REVB=0.00702957;RO=21;SAF=14;SAR=11;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0689383;STB=0.52868;TYPE=snp;VARB=0.0145502;OID=.;OPOS=42463814;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:49:49:21:22:25:27:11:14:10:11:13:14:10:12 chr22 42473603 . C T 59.43 PASS AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=-0.00355828;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.994;QD=6.60351;RBI=0.0278788;REFB=-0.0273422;REVB=-0.0276508;RO=21;SAF=5;SAR=10;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.055143;STB=0.531873;TYPE=snp;VARB=0.0286504;OID=.;OPOS=42473603;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:36:36:21:21:15:15:10:5:6:15:10:5:6:15 chr22 42473860 . C G 86.69 PASS AO=16;DP=28;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=1;FWDB=0.00773379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.55;QD=12.3837;RBI=0.0237143;REFB=-0.0147033;REVB=0.0224177;RO=12;SAF=13;SAR=3;SRF=11;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144875;STB=0.580556;TYPE=snp;VARB=0.01339;OID=.;OPOS=42473860;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:28:28:12:12:16:16:3:13:11:1:3:13:11:1 chr22 42474138 . C G 106.9 PASS AO=23;DP=50;FAO=24;FDP=49;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.0148859;FXX=0.019996;HRUN=3;LEN=1;MLLD=244.951;QD=8.7267;RBI=0.0148886;REFB=-0.00447207;REVB=0.000284665;RO=25;SAF=9;SAR=14;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0465511;STB=0.53473;TYPE=snp;VARB=0.00451508;OID=.;OPOS=42474138;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:50:49:25:25:23:24:14:9:11:14:15:9:11:14 chr22 42474396 . C T 340.34 PASS AO=16;DP=40;FAO=36;FDP=36;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=36;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.320606;FXX=0.0270197;HRUN=3;LEN=1;MLLD=89.805;QD=37.8153;RBI=0.320612;REFB=0;REVB=0.00200849;RO=9;SAF=16;SAR=0;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00391827;OID=.;OPOS=42474396;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:40:36:9:0:16:36:0:16:9:0:0:36:0:0 chr22 42474676 . A ATTCTGC 157.49 PASS AO=40;DP=105;FAO=44;FDP=102;FR=.;FRO=58;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=27;FSRR=31;FWDB=-0.0160222;FXX=0.0285687;HRUN=2;LEN=6;MLLD=273.347;QD=6.17613;RBI=0.0160735;REFB=-0.0127824;REVB=0.00128229;RO=56;SAF=14;SAR=26;SRF=25;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105281;STB=0.560493;TYPE=ins;VARB=0.0138844;OID=.;OPOS=42474677;OREF=-;OALT=TTCTGC;OMAPALT=ATTCTGC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:40:105:44:102:58:16:28:27:31:99:56:14:26:25:31 chr22 42486723 . G A 83.56 PASS AO=23;DP=61;FAO=24;FDP=62;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=-0.00818368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.463;QD=5.39119;RBI=0.0173746;REFB=-0.00985952;REVB=0.0153266;RO=38;SAF=14;SAR=9;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146989;STB=0.594183;TYPE=snp;VARB=0.0237639;OID=.;OPOS=42486723;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:61:62:38:38:23:24:9:14:18:20:9:15:18:20 chr22 42522613 . G C 177.35 PASS AO=31;DP=50;FAO=31;FDP=50;FR=.;FRO=19;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.00939645;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=190.66;QD=14.1879;RBI=0.0204476;REFB=-0.00484716;REVB=0.0181607;RO=17;SAF=20;SAR=11;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156219;STB=0.56829;TYPE=snp;VARB=0.00237062;OID=.;OPOS=42522613;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:66:50:50:17:19:31:31:11:20:7:10:11:20:9:10 chr22 42523943 . A G 65.54 PASS AO=16;DP=37;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.0132612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.397;QD=7.08518;RBI=0.027929;REFB=-0.0320356;REVB=-0.0245798;RO=21;SAF=8;SAR=8;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0703014;STB=0.54049;TYPE=snp;VARB=0.0165544;OID=.;OPOS=42523943;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:37:37:21:21:16:16:8:8:12:9:8:8:12:9 chr22 42524795 . A G 44.11 PASS AO=11;DP=36;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=5;FWDB=-0.0796718;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.0991;QD=4.76851;RBI=0.184568;REFB=0.0154166;REVB=-0.166486;RO=25;SAF=6;SAR=5;SRF=20;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.31111;STB=0.627733;TYPE=snp;VARB=-0.0413381;OID=.;OPOS=42524795;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:36:37:25:24:11:13:5:6:20:5:5:8:19:5 chr22 42525132 . G C 22.3 PASS AO=4;DP=9;FAO=4;FDP=9;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0442428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.254;QD=9.91249;RBI=0.0444782;REFB=-0.0156768;REVB=0.00456986;RO=5;SAF=1;SAR=3;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15474;STB=0.599465;TYPE=snp;VARB=0.00649391;OID=.;OPOS=42525132;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:9:9:5:5:4:4:3:1:2:3:3:1:2:3 chr22 42537196 . T C 103.54 PASS AO=41;DP=139;FAO=43;FDP=139;FR=.;FRO=96;FSAF=27;FSAR=16;FSRF=59;FSRR=37;FWDB=-0.00256854;FXX=0.0141834;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.557;QD=2.97945;RBI=0.0442763;REFB=-0.0023031;REVB=-0.0442017;RO=92;SAF=27;SAR=14;SRF=57;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0502797;STB=0.509792;TYPE=snp;VARB=0.00626354;OID=.;OPOS=42537196;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:92:96:41:43:14:27:57:35:16:27:59:37 chr22 42537404 . G C 178.95 PASS AO=46;DP=83;FAO=45;FDP=83;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=0.0184326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.9417;QD=8.62427;RBI=0.0331243;REFB=-0.0173739;REVB=0.0275219;RO=37;SAF=18;SAR=28;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0571578;STB=0.545636;TYPE=snp;VARB=0.0241688;OID=.;OPOS=42537404;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:83:37:38:46:45:28:18:17:20:28:17:18:20 chr22 42537597 . A G 94.86 PASS AO=21;DP=42;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.00344286;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.846;QD=8.8245;RBI=0.0508585;REFB=-0.0158329;REVB=0.0507419;RO=21;SAF=13;SAR=8;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129307;STB=0.562582;TYPE=snp;VARB=0.0128593;OID=.;OPOS=42537597;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:42:43:21:22:21:21:8:13:10:11:8:13:11:11 chr22 42538029 . A G 235.09 PASS AO=41;DP=63;FAO=41;FDP=63;FR=.;FRO=22;FSAF=3;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=21;FWDB=-0.0447568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.538;QD=14.9266;RBI=0.0458673;REFB=-0.0193536;REVB=-0.010032;RO=22;SAF=3;SAR=38;SRF=1;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0701315;STB=0.537977;TYPE=snp;VARB=0.00824263;OID=.;OPOS=42538029;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:63:63:22:22:41:41:38:3:1:21:38:3:1:21 chr22 42538876 . A T 49.46 PASS AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0621886;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9447;QD=32.976;RBI=0.0659928;REFB=0;REVB=0.0220823;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00691382;OID=.;OPOS=42538876;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:5:0:0:1:5:0:0 chr22 42783070 . G A 32.08 PASS AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=-0.0186082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.475;QD=5.83246;RBI=0.0227489;REFB=-0.0200153;REVB=0.0130863;RO=14;SAF=2;SAR=6;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0515286;STB=0.531174;TYPE=snp;VARB=0.0328146;OID=.;OPOS=42783070;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:22:22:14:14:8:8:6:2:3:11:6:2:3:11 chr22 42793873 . A G 129.8 PASS AO=31;DP=66;FAO=31;FDP=66;FR=.;FRO=35;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=-0.00951455;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.968;QD=7.86681;RBI=0.0179707;REFB=-0.00694921;REVB=0.0152453;RO=35;SAF=18;SAR=13;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00892328;STB=0.505007;TYPE=snp;VARB=0.00708974;OID=.;OPOS=42793873;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:66:66:35:35:31:31:13:18:20:15:13:18:20:15 chr22 42912029 . G T 215.5 PASS AO=32;DP=46;FAO=34;FDP=49;FR=.;FRO=15;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.120886;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.9773;QD=17.5916;RBI=0.132898;REFB=-0.0819723;REVB=0.055213;RO=14;SAF=13;SAR=19;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0285996;STB=0.533723;TYPE=snp;VARB=0.0404556;OID=.;OPOS=42912029;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:46:49:14:15:32:34:19:13:5:9:19:15:5:10 chr22 42912136 . G T 101.47 PASS AO=25;DP=58;FAO=25;FDP=56;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=0.0173631;FXX=0.0344768;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.78;QD=7.24808;RBI=0.024856;REFB=-0.0194086;REVB=-0.017786;RO=31;SAF=17;SAR=8;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.317506;STB=0.679856;TYPE=snp;VARB=0.025137;OID=.;OPOS=42912136;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:56:31:31:25:25:8:17:11:20:8:17:11:20 chr22 42961277 . T C 113.83 PASS AO=22;DP=40;FAO=22;FDP=40;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.00658486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.1773;QD=11.3826;RBI=0.0168184;REFB=-0.0117514;REVB=-0.0154757;RO=18;SAF=6;SAR=16;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159072;STB=0.589388;TYPE=snp;VARB=0.0129257;OID=.;OPOS=42961277;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:77:40:40:18:18:22:22:16:6:8:10:16:6:8:10 chr22 42961298 . T A 112.48 PASS AO=16;DP=31;FAO=21;FDP=36;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.0151812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.2;QD=12.4973;RBI=0.0157391;REFB=-0.0237758;REVB=-0.00415358;RO=14;SAF=5;SAR=11;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.041916;STB=0.551673;TYPE=snp;VARB=0.0122138;OID=.;OPOS=42961298;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:31:36:14:15:16:21:11:5:5:9:16:5:5:10 chr22 42965169 . A AG 180.3 PASS AO=34;DP=84;FAO=41;FDP=79;FR=.;FRO=38;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=0.0102862;FXX=0.0595167;HRUN=0;LEN=1;MLLD=160.657;QD=9.12909;RBI=0.0103105;REFB=-0.00896954;REVB=0.000706903;RO=39;SAF=19;SAR=15;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0928379;STB=0.542854;TYPE=ins;VARB=0.0179235;OID=.;OPOS=42965170;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:34:84:41:79:38:22:19:17:21:99:39:19:15:18:21 chr22 42981890 . G A 184.86 PASS AO=31;DP=47;FAO=31;FDP=47;FR=.;FRO=16;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.00748381;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.609;QD=15.733;RBI=0.0101708;REFB=-0.00287254;REVB=0.00688747;RO=16;SAF=20;SAR=11;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.095443;STB=0.552291;TYPE=snp;VARB=0.00449416;OID=.;OPOS=42981890;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:47:47:16:16:31:31:11:20:8:8:11:20:8:8 chr22 43010817 . G A 130.7 PASS AO=24;DP=41;FAO=24;FDP=41;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=-0.0210671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.062;QD=12.7509;RBI=0.0356396;REFB=-0.0375856;REVB=0.0287465;RO=15;SAF=9;SAR=15;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0823801;STB=0.536394;TYPE=snp;VARB=0.0249053;OID=.;OPOS=43010817;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:41:41:15:17:24:24:15:9:4:11:15:9:5:12 chr22 43032742 . C T 155.24 PASS AO=16;DP=37;FAO=25;FDP=37;FR=.,HEALED;FRO=12;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0299401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.8793;QD=16.783;RBI=0.0307558;REFB=-0.0102856;REVB=0.00703637;RO=5;SAF=16;SAR=0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.552386;TYPE=snp;VARB=0.0114741;OID=.;OPOS=43032742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:29:37:5:12:16:25:0:16:5:0:7:18:7:5 chr22 43088989 . GC G 176.44 PASS AO=17;DP=32;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.164899;FXX=0.0344709;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.8005;QD=25.2053;RBI=0.397169;REFB=0;REVB=0.361319;RO=8;SAF=9;SAR=8;SRF=2;SRR=6;SSEN=0.318584;SSEP=0;SSSB=0.160005;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0363652;OID=.;OPOS=43088990;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:17:29:28:28:0:13:15:0:0:17:8:9:8:2:6 chr22 43089055 . G C 40.08 PASS AO=5;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.,HEALED;FRO=9;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.0815835;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=29.8045;QD=9.43173;RBI=0.362493;REFB=0.00142588;REVB=-0.353193;RO=3;SAF=4;SAR=1;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116878;STB=0.646722;TYPE=snp;VARB=-0.0354453;OID=.;OPOS=43089055;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:14:17:3:9:5:8:1:4:2:1:4:4:2:7 chr22 43195147 . A G 450.31 PASS AO=48;DP=50;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00266562;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.5619;QD=36.7599;RBI=0.00488072;REFB=-0.0741076;REVB=-0.00408851;RO=0;SAF=23;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5098;TYPE=snp;VARB=0.0012005;OID=.;OPOS=43195147;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:50:49:0:1:48:48:25:23:0:0:25:23:0:1 chr22 43203137 . C T 484.04 PASS AO=52;DP=55;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156078;FXX=0.0181785;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.417;QD=35.8549;RBI=0.0931154;REFB=-0.10153;REVB=0.091798;RO=2;SAF=38;SAR=14;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0626402;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00121425;OID=.;OPOS=43203137;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:55:54:2:0:52:54:14:38:0:2:16:38:0:0 chr22 43206950 . A C 1523.22 PASS AO=167;DP=172;FAO=168;FDP=171;FR=.;FRO=3;FSAF=77;FSAR=91;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0247879;FXX=0.00581362;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.8196;QD=35.6309;RBI=0.0555484;REFB=-0.0374857;REVB=0.049711;RO=4;SAF=75;SAR=92;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0135083;STB=0.503678;TYPE=snp;VARB=0.00378927;OID=.;OPOS=43206950;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:172:171:4:3:167:168:92:75:3:1:91:77:2:1 chr22 43278220 . C T 726.82 PASS AO=80;DP=82;FAO=80;FDP=82;FR=.;FRO=2;FSAF=48;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00548358;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=168.807;QD=35.4546;RBI=0.00892299;REFB=-0.123282;REVB=0.00703919;RO=1;SAF=48;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145648;STB=0.502537;TYPE=snp;VARB=0.000616267;OID=.;OPOS=43278220;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:82:82:1:2:80:80:32:48:0:1:32:48:1:1 chr22 43289473 . G A 231.61 PASS AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00249325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.5182;QD=37.0582;RBI=0.0218514;REFB=0;REVB=-0.0217087;RO=0;SAF=1;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.20334e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000706301;OID=.;OPOS=43289473;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:25:25:0:0:25:25:24:1:0:0:24:1:0:0 chr22 43435812 . C T 96.39 PASS AO=22;DP=46;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.0154613;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=132.117;QD=8.38191;RBI=0.0240518;REFB=-0.0314441;REVB=0.0184238;RO=20;SAF=7;SAR=15;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0306732;STB=0.579324;TYPE=snp;VARB=0.0263429;OID=.;OPOS=43435812;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:46:46:20:24:22:22:15:7:7:13:15:7:11:13 chr22 43455432 . G A 252 PASS AO=64;DP=139;FAO=64;FDP=140;FR=.;FRO=76;FSAF=28;FSAR=36;FSRF=36;FSRR=40;FWDB=-0.0232586;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.44;QD=7.19988;RBI=0.0235027;REFB=-0.0379903;REVB=-0.00337895;RO=74;SAF=28;SAR=36;SRF=34;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0214696;STB=0.519849;TYPE=snp;VARB=0.0501133;OID=.;OPOS=43455432;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:140:74:76:64:64:36:28:34:40:36:28:36:40 chr22 43455531 . C T 358.8 PASS AO=66;DP=117;FAO=69;FDP=117;FR=.;FRO=48;FSAF=26;FSAR=43;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=0.137772;FXX=0.00847386;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.9928;QD=12.2665;RBI=0.137882;REFB=-0.0310763;REVB=-0.00550332;RO=50;SAF=23;SAR=43;SRF=24;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10992;STB=0.526157;TYPE=snp;VARB=0.0358227;OID=.;OPOS=43455531;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:117:50:48:66:69:43:23:24:26:43:26:21:27 chr22 43459846 . G A 370.51 PASS AO=101;DP=227;FAO=100;FDP=226;FR=.;FRO=126;FSAF=31;FSAR=69;FSRF=41;FSRR=85;FWDB=-0.0323946;FXX=0.00877155;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.94;QD=6.55763;RBI=0.0340298;REFB=0.00672837;REVB=-0.0104218;RO=126;SAF=33;SAR=68;SRF=41;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00151891;STB=0.509955;TYPE=snp;VARB=-0.00903282;OID=.;OPOS=43459846;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:227:226:126:126:101:100:68:33:41:85:69:31:41:85 chr22 43466217 . A G 78.56 PASS AO=24;DP=68;FAO=25;FDP=69;FR=.;FRO=44;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=-0.0311247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.578;QD=4.55414;RBI=0.0337005;REFB=-0.0228361;REVB=-0.0129218;RO=43;SAF=10;SAR=14;SRF=19;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0284884;STB=0.520941;TYPE=snp;VARB=0.0395633;OID=.;OPOS=43466217;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:68:69:43:44:24:25:14:10:19:24:15:10:19:25 chr22 43466247 . G C 74.09 PASS AO=18;DP=54;FAO=22;FDP=57;FR=.;FRO=35;FSAF=4;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=24;FWDB=0.00851823;FXX=0.0338926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.072;QD=5.19954;RBI=0.0280671;REFB=-0.0165536;REVB=0.0267432;RO=29;SAF=1;SAR=17;SRF=5;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.351193;STB=0.616321;TYPE=snp;VARB=0.0185705;OID=.;OPOS=43466247;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:54:57:29:35:18:22:17:1:5:24:18:4:11:24 chr22 43558926 . A G 49.44 PASS AO=14;DP=38;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=6;FWDB=-0.0708723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.2895;QD=5.20377;RBI=0.102553;REFB=-0.0140277;REVB=-0.0741227;RO=23;SAF=3;SAR=11;SRF=18;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.565071;STB=0.818723;TYPE=snp;VARB=0.02389;OID=.;OPOS=43558926;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:49:38:38:23:24:14:14:11:3:18:5:11:3:18:6 chr22 43565855 . C T 126.71 PASS AO=37;DP=93;FAO=37;FDP=93;FR=.;FRO=56;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=31;FWDB=-0.0218812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.115;QD=5.45002;RBI=0.0305747;REFB=-0.00872743;REVB=-0.0213547;RO=55;SAF=18;SAR=19;SRF=24;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.052962;STB=0.524157;TYPE=snp;VARB=0.0218768;OID=.;OPOS=43565855;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:93:93:55:56:37:37:19:18:24:31:19:18:25:31 chr22 43572354 . C T 91.09 PASS AO=11;DP=15;FAO=13;FDP=16;FR=.;FRO=3;FSAF=12;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0280014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5249;QD=22.7714;RBI=0.170787;REFB=-0.0248884;REVB=0.168476;RO=3;SAF=11;SAR=0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.555477;TYPE=snp;VARB=0.00449935;OID=.;OPOS=43572354;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:9:15:16:3:3:11:13:0:11:3:0:1:12:3:0 chr22 43606143 . C T 693.36 PASS AO=72;DP=74;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0422807;FXX=0.0266631;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.5464;QD=37.9922;RBI=0.0672718;REFB=0;REVB=0.0523244;RO=0;SAF=31;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000690083;OID=.;OPOS=43606143;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:74:73:0:0:72:73:41:31:0:0:42:31:0:0 chr22 43610207 . A G 556.42 PASS AO=55;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0452082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.0867;QD=38.3738;RBI=0.0807612;REFB=0;REVB=0.0669223;RO=0;SAF=44;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00133028;OID=.;OPOS=43610207;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:57:58:0:0:55:58:11:44:0:0:13:45:0:0 chr22 43619200 . G A 121.12 PASS AO=28;DP=59;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=7;FSRR=24;FWDB=0.0244184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.3576;QD=8.21176;RBI=0.0837207;REFB=-0.0336596;REVB=0.0800806;RO=30;SAF=10;SAR=18;SRF=6;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167585;STB=0.57846;TYPE=snp;VARB=0.0381666;OID=.;OPOS=43619200;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:59:59:30:31:28:28:18:10:6:24:18:10:7:24 chr22 43936219 . C T 108.19 PASS AO=37;DP=106;FAO=37;FDP=105;FR=.;FRO=68;FSAF=11;FSAR=26;FSRF=32;FSRR=36;FWDB=0.0459333;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.684;QD=4.12144;RBI=0.0463851;REFB=-0.0100786;REVB=-0.00645846;RO=69;SAF=11;SAR=26;SRF=33;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218355;STB=0.621043;TYPE=snp;VARB=0.017678;OID=.;OPOS=43936219;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:105:69:68:37:37:26:11:33:36:26:11:32:36 chr22 43976396 . G A 322.51 PASS AO=81;DP=177;FAO=82;FDP=177;FR=.;FRO=95;FSAF=26;FSAR=56;FSRF=61;FSRR=34;FWDB=0.0104186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.179;QD=7.28842;RBI=0.0237779;REFB=-0.00518036;REVB=0.0213738;RO=95;SAF=25;SAR=56;SRF=61;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.32723;STB=0.675498;TYPE=snp;VARB=0.00781833;OID=.;OPOS=43976396;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:177:95:95:81:82:56:25:61:34:56:26:61:34 chr22 44079645 . T C 217.1 PASS AO=58;DP=133;FAO=59;FDP=134;FR=.;FRO=75;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=48;FSRR=27;FWDB=-0.000264993;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.668;QD=6.48056;RBI=0.0357714;REFB=-0.00130953;REVB=0.0357705;RO=73;SAF=32;SAR=26;SRF=48;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108378;STB=0.555537;TYPE=snp;VARB=0.00203277;OID=.;OPOS=44079645;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:134:73:75:58:59:26:32:48:25:27:32:48:27 chr22 44083442 . T C 1057.4 PASS AO=114;DP=118;FAO=116;FDP=120;FR=.;FRO=4;FSAF=51;FSAR=65;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0032648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.592;QD=35.2466;RBI=0.03712;REFB=-0.00190291;REVB=0.0369762;RO=4;SAF=50;SAR=64;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0364784;STB=0.518865;TYPE=snp;VARB=0.000131813;OID=.;OPOS=44083442;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:118:120:4:4:114:116:64:50:4:0:65:51:4:0 chr22 44112845 . C T 2646.02 PASS AO=276;DP=276;FAO=276;FDP=276;FR=.;FRO=0;FSAF=133;FSAR=143;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.051131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.9835;QD=38.3481;RBI=0.0512816;REFB=0;REVB=-0.00392754;RO=0;SAF=133;SAR=143;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46501e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.3882e-05;OID=.;OPOS=44112845;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:276:276:0:0:276:276:143:133:0:0:143:133:0:0 chr22 44221565 . C CAATA 167.3 PASS AO=56;DP=177;FAO=60;FDP=171;FR=.;FRO=111;FSAF=37;FSAR=23;FSRF=63;FSRR=48;FWDB=-0.000741725;FXX=0.0552456;HRUN=2;LEN=4;MLLD=239.615;QD=3.91353;RBI=0.00673481;REFB=0.00346537;REVB=-0.00669385;RO=105;SAF=35;SAR=21;SRF=61;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0526249;STB=0.533173;TYPE=ins;VARB=-0.00614177;OID=.;OPOS=44221566;OREF=-;OALT=AATA;OMAPALT=CAATA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:56:177:60:171:111:37:23:63:48:99:105:35:21:61:44 chr22 44333040 . G A 61.09 PASS AO=11;DP=23;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0499564;FXX=0.0416493;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.78;QD=10.6243;RBI=0.101538;REFB=-0.0241958;REVB=0.0883987;RO=11;SAF=6;SAR=5;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.521703;TYPE=snp;VARB=0.0124109;OID=.;OPOS=44333040;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:23:23:11:11:11:12:5:6:6:5:6:6:6:5 chr22 44342116 . A G 104.86 PASS AO=24;DP=55;FAO=27;FDP=57;FR=.;FRO=30;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=8.44322e-06;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.109;QD=7.35836;RBI=0.0080378;REFB=-0.00861313;REVB=0.00803779;RO=30;SAF=15;SAR=9;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22015;STB=0.581336;TYPE=snp;VARB=0.0109126;OID=.;OPOS=44342116;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:55:57:30:30:24:27:9:15:12:18:12:15:12:18 chr22 44379822 . T C 142.75 PASS AO=48;DP=139;FAO=48;FDP=134;FR=.;FRO=86;FSAF=31;FSAR=17;FSRF=41;FSRR=45;FWDB=-0.00350137;FXX=0.0359686;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.635;QD=4.26108;RBI=0.00422787;REFB=-0.00545013;REVB=0.00236966;RO=73;SAF=31;SAR=17;SRF=35;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181855;STB=0.610888;TYPE=snp;VARB=0.00777248;OID=.;OPOS=44379822;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:134:73:86:48:48:17:31:35:38:17:31:41:45 chr22 44379838 . A G 102.57 PASS AO=43;DP=139;FAO=43;FDP=141;FR=.;FRO=98;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=37;FSRR=61;FWDB=0.00386981;FXX=0.00704176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.105;QD=2.90986;RBI=0.0056308;REFB=-0.0083216;REVB=-0.00409029;RO=95;SAF=23;SAR=20;SRF=34;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207919;STB=0.608179;TYPE=snp;VARB=0.0148083;OID=.;OPOS=44379838;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:141:95:98:43:43:20:23:34:61:20:23:37:61 chr22 44395451 . T C 109.36 PASS AO=25;DP=53;FAO=25;FDP=52;FR=.;FRO=27;FSAF=19;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.00886514;FXX=0.0370302;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.2147;QD=8.41259;RBI=0.0386882;REFB=-0.0144903;REVB=0.0376588;RO=22;SAF=20;SAR=5;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22879;STB=0.605913;TYPE=snp;VARB=0.0235566;OID=.;OPOS=44395451;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:53:52:22:27:25:25:5:20:13:9:6:19:16:11 chr22 44489868 . T C 165.04 PASS AO=40;DP=85;FAO=40;FDP=85;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=32;FWDB=-0.0461167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.0612;QD=7.76671;RBI=0.0606483;REFB=0.00418232;REVB=-0.0393886;RO=44;SAF=18;SAR=22;SRF=12;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17233;STB=0.587624;TYPE=snp;VARB=-0.00578903;OID=.;OPOS=44489868;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:85:85:44:45:40:40:22:18:12:32:22:18:13:32 chr22 44489896 . T C 89.39 PASS AO=26;DP=68;FAO=26;FDP=67;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=33;FWDB=-0.0099126;FXX=0.0147037;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.577;QD=5.33655;RBI=0.010595;REFB=-0.000231819;REVB=0.00374084;RO=41;SAF=10;SAR=16;SRF=8;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229711;STB=0.629732;TYPE=snp;VARB=0.000633533;OID=.;OPOS=44489896;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:89:68:67:41:41:26:26:16:10:8:33:16:10:8:33 chr22 44546582 . A G 220.78 PASS AO=52;DP=111;FAO=54;FDP=113;FR=.;FRO=59;FSAF=19;FSAR=35;FSRF=23;FSRR=36;FWDB=-0.00317265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.513;QD=7.81539;RBI=0.00432268;REFB=-0.0116254;REVB=0.00293595;RO=59;SAF=19;SAR=33;SRF=23;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0249757;STB=0.521453;TYPE=snp;VARB=0.0178831;OID=.;OPOS=44546582;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:113:59:59:52:54:33:19:23:36:35:19:23:36 chr22 44582499 . T C 526.41 PASS AO=54;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.028626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.1647;QD=37.6007;RBI=0.041795;REFB=0;REVB=0.0304528;RO=0;SAF=5;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000353758;OID=.;OPOS=44582499;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:55:56:0:0:54:56:49:5:0:0:49:7:0:0 chr22 44594584 . C G 307.6 PASS AO=78;DP=170;FAO=78;FDP=169;FR=.;FRO=91;FSAF=38;FSAR=40;FSRF=52;FSRR=39;FWDB=0.0016903;FXX=0.00588201;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.833;QD=7.2805;RBI=0.0128187;REFB=0.0014585;REVB=0.0127068;RO=91;SAF=38;SAR=40;SRF=52;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0817257;STB=0.545278;TYPE=snp;VARB=-0.00168901;OID=.;OPOS=44594584;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:169:91:91:78:78:40:38:52:39:40:38:52:39 chr22 44602229 . A C 56.07 PASS AO=23;DP=78;FAO=23;FDP=78;FR=.;FRO=55;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=32;FSRR=23;FWDB=-0.00651398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.768;QD=2.87516;RBI=0.0187004;REFB=-0.00954563;REVB=-0.0175292;RO=50;SAF=17;SAR=6;SRF=30;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185596;STB=0.626312;TYPE=snp;VARB=0.0199906;OID=.;OPOS=44602229;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:78:78:50:55:23:23:6:17:30:20:6:17:32:23 chr22 44761797 . T A 181.82 PASS AO=49;DP=99;FAO=49;FDP=114;FR=.;FRO=65;FSAF=35;FSAR=14;FSRF=39;FSRR=26;FWDB=0.0384121;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.134;QD=6.37967;RBI=0.0538111;REFB=-0.0371642;REVB=-0.0376848;RO=50;SAF=35;SAR=14;SRF=39;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0763209;STB=0.574681;TYPE=snp;VARB=0.0445048;OID=.;OPOS=44761797;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:114:50:65:49:49:14:35:39:11:14:35:39:26 chr22 44893375 . TG T 88.21 PASS AO=21;DP=30;FAO=22;FDP=30;FR=.;FRO=8;FSAF=19;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0631029;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.6734;QD=11.761;RBI=0.124061;REFB=-0.135629;REVB=0.106814;RO=9;SAF=18;SAR=3;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0.487603;SSSB=0.261467;STB=0.658247;TYPE=del;VARB=0.0943999;OID=.;OPOS=44893376;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:21:30:22:30:8:19:3:4:4:11:9:18:3:5:4 chr22 44965320 . G A 823.48 PASS AO=97;DP=102;FAO=96;FDP=102;FR=.;FRO=6;FSAF=49;FSAR=47;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0258807;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.7364;QD=32.2934;RBI=0.0635104;REFB=-0.0902644;REVB=0.057998;RO=5;SAF=50;SAR=47;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00785673;STB=0.509197;TYPE=snp;VARB=0.0066144;OID=.;OPOS=44965320;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:102:102:5:6:97:96:47:50:3:2:47:49:4:2 chr22 45075738 . T C 78.95 PASS AO=20;DP=46;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.00382957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.706;QD=6.71941;RBI=0.0116297;REFB=-0.0216133;REVB=0.0109811;RO=24;SAF=7;SAR=13;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263231;STB=0.659461;TYPE=snp;VARB=0.0103881;OID=.;OPOS=45075738;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:46:47:24:27:20:20:13:7:15:9:13:7:17:10 chr22 45126775 . T C 133.75 PASS AO=38;DP=96;FAO=38;FDP=94;FR=.;FRO=56;FSAF=7;FSAR=31;FSRF=6;FSRR=50;FWDB=-0.0279649;FXX=0.0208312;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.2115;QD=5.69153;RBI=0.0719524;REFB=0.00442527;REVB=0.0662957;RO=55;SAF=7;SAR=31;SRF=5;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186726;STB=0.584497;TYPE=snp;VARB=-0.00189948;OID=.;OPOS=45126775;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:94:55:56:38:38:31:7:5:50:31:7:6:50 chr22 45126779 . GC G 600.16 PASS AO=74;DP=95;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.344913;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.4189;QD=25.5386;RBI=0.391224;REFB=0;REVB=0.184639;RO=14;SAF=7;SAR=67;SRF=4;SRR=10;SSEN=0.422576;SSEP=0;SSSB=-0.144675;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0104078;OID=.;OPOS=45126780;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:74:94:94:94:0:14:80:0:0:52:14:7:67:4:10 chr22 45128232 . T C 224.61 PASS AO=42;DP=81;FAO=48;FDP=91;FR=.;FRO=43;FSAF=6;FSAR=42;FSRF=13;FSRR=30;FWDB=-0.00606851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.2148;QD=9.87297;RBI=0.010815;REFB=-0.0147288;REVB=0.008952;RO=39;SAF=6;SAR=36;SRF=11;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204187;STB=0.648708;TYPE=snp;VARB=0.0135274;OID=.;OPOS=45128232;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:81:91:39:43:42:48:36:6:11:28:42:6:13:30 chr22 45132831 . G A 84.22 PASS AO=17;DP=30;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.0157868;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.419;QD=11.6159;RBI=0.0338565;REFB=-0.0100809;REVB=0.0299506;RO=13;SAF=3;SAR=14;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226441;STB=0.689856;TYPE=snp;VARB=0.0171946;OID=.;OPOS=45132831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:30:29:13:13:17:16:14:3:5:8:14:2:5:8 chr22 45182456 . G A 56.29 PASS AO=18;DP=51;FAO=18;FDP=51;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=-0.000868378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.3107;QD=4.41467;RBI=0.0207071;REFB=-0.0170394;REVB=0.0206889;RO=33;SAF=10;SAR=8;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242207;STB=0.640877;TYPE=snp;VARB=0.0217955;OID=.;OPOS=45182456;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:51:51:33:33:18:18:8:10:11:22:8:10:11:22 chr22 45198009 . A G 403.69 PASS AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0570365;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.1251;QD=37.5524;RBI=0.120589;REFB=0;REVB=-0.106248;RO=0;SAF=20;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00140296;OID=.;OPOS=45198009;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:43:43:0:0:43:43:23:20:0:0:23:20:0:0 chr22 45244930 . C T 178.27 PASS AO=36;DP=80;FAO=39;FDP=77;FR=.;FRO=38;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=5;FSRR=33;FWDB=0.124083;FXX=0.0493766;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.567;QD=9.26101;RBI=0.124214;REFB=-0.0164084;REVB=0.00571623;RO=38;SAF=15;SAR=21;SRF=5;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.28852;STB=0.667967;TYPE=snp;VARB=0.0216675;OID=.;OPOS=45244930;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:77:38:38:36:39:21:15:5:33:21:18:5:33 chr22 45277909 . A G 143.56 PASS AO=39;DP=95;FAO=40;FDP=96;FR=.;FRO=56;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=32;FSRR=24;FWDB=0.00732855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.966;QD=5.98183;RBI=0.0250194;REFB=-0.00979885;REVB=0.023922;RO=53;SAF=21;SAR=18;SRF=32;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0675903;STB=0.527212;TYPE=snp;VARB=0.0159111;OID=.;OPOS=45277909;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:95:96:53:56:39:40:18:21:32:21:19:21:32:24 chr22 45278065 . A T 598.82 PASS AO=124;DP=228;FAO=129;FDP=239;FR=.;FRO=110;FSAF=71;FSAR=58;FSRF=59;FSRR=51;FWDB=-0.000849127;FXX=0.00416649;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8489;QD=10.022;RBI=0.00181164;REFB=-0.0336954;REVB=0.00160032;RO=104;SAF=71;SAR=53;SRF=59;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00450396;STB=0.506511;TYPE=snp;VARB=0.0263366;OID=.;OPOS=45278065;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:228:239:104:110:124:129:53:71:59:45:58:71:59:51 chr22 45278187 . A T 231.56 PASS AO=62;DP=147;FAO=64;FDP=149;FR=.;FRO=85;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=37;FSRR=48;FWDB=-0.00298016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.914;QD=6.21649;RBI=0.00772253;REFB=-0.00585559;REVB=-0.00712433;RO=85;SAF=32;SAR=30;SRF=37;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0832836;STB=0.536901;TYPE=snp;VARB=0.00752295;OID=.;OPOS=45278187;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:149:85:85:62:64:30:32:37:48:32:32:37:48 chr22 45579422 . A G 279.39 PASS AO=71;DP=145;FAO=67;FDP=141;FR=.;FRO=74;FSAF=20;FSAR=47;FSRF=29;FSRR=45;FWDB=-0.0181723;FXX=0.0275843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.417;QD=7.92582;RBI=0.0183508;REFB=-0.00525042;REVB=0.00255346;RO=74;SAF=24;SAR=47;SRF=29;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0544527;STB=0.55586;TYPE=snp;VARB=0.00576933;OID=.;OPOS=45579422;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:141:74:74:71:67:47:24:29:45:47:20:29:45 chr22 45580572 . G T 48.96 PASS AO=22;DP=65;FAO=22;FDP=64;FR=.;FRO=42;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=0.0249458;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.928;QD=3.06024;RBI=0.0377317;REFB=-0.0212197;REVB=0.0283089;RO=43;SAF=6;SAR=16;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185535;STB=0.599253;TYPE=snp;VARB=0.0331471;OID=.;OPOS=45580572;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:65:64:43:42:22:22:16:6:18:25:16:6:17:25 chr22 45580573 . C T 53.54 PASS AO=22;DP=64;FAO=22;FDP=64;FR=.;FRO=42;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=0.0218722;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.811;QD=3.34646;RBI=0.0467688;REFB=-0.030824;REVB=0.0413391;RO=42;SAF=6;SAR=16;SRF=17;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168646;STB=0.599253;TYPE=snp;VARB=0.031095;OID=.;OPOS=45580573;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:53:64:64:42:42:22:22:16:6:17:25:16:6:17:25 chr22 45580836 . G C 180.38 PASS AO=56;DP=145;FAO=56;FDP=144;FR=.;FRO=88;FSAF=11;FSAR=45;FSRF=20;FSRR=68;FWDB=-0.00361308;FXX=0.00689608;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.875;QD=5.01052;RBI=0.00674858;REFB=0.0109108;REVB=-0.00569991;RO=88;SAF=11;SAR=45;SRF=20;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0507316;STB=0.528799;TYPE=snp;VARB=-0.0161701;OID=.;OPOS=45580836;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:144:88:88:56:56:45:11:20:68:45:11:20:68 chr22 45583740 . G C 74.99 PASS AO=32;DP=109;FAO=32;FDP=108;FR=.;FRO=76;FSAF=9;FSAR=23;FSRF=26;FSRR=50;FWDB=0.015587;FXX=0.0181802;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.4718;QD=2.77734;RBI=0.0164238;REFB=-0.0189994;REVB=-0.00517551;RO=72;SAF=9;SAR=23;SRF=25;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0912617;STB=0.550583;TYPE=snp;VARB=0.0310705;OID=.;OPOS=45583740;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:109:108:72:76:32:32:23:9:25:47:23:9:26:50 chr22 45583803 . A G 125.88 PASS AO=42;DP=117;FAO=42;FDP=116;FR=.;FRO=74;FSAF=10;FSAR=32;FSRF=24;FSRR=50;FWDB=0.00671867;FXX=0.00854628;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.958;QD=4.34052;RBI=0.00858245;REFB=-0.0199551;REVB=-0.00534022;RO=73;SAF=10;SAR=32;SRF=23;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109245;STB=0.570195;TYPE=snp;VARB=0.034268;OID=.;OPOS=45583803;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:116:73:74:42:42:32:10:23:50:32:10:24:50 chr22 45583898 . A G 175.3 PASS AO=39;DP=77;FAO=39;FDP=77;FR=.;FRO=38;FSAF=3;FSAR=36;FSRF=11;FSRR=27;FWDB=-0.0344419;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.629;QD=9.1067;RBI=0.0351153;REFB=-0.00303546;REVB=0.00684439;RO=38;SAF=3;SAR=36;SRF=11;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.397888;STB=0.727122;TYPE=snp;VARB=0.00284797;OID=.;OPOS=45583898;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:77:38:38:39:39:36:3:11:27:36:3:11:27 chr22 45683246 . C T 246.85 PASS AO=34;DP=62;FAO=46;FDP=73;FR=.;FRO=27;FSAF=4;FSAR=42;FSRF=7;FSRR=20;FWDB=0.102445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.0291;QD=13.5258;RBI=0.110285;REFB=-0.0343012;REVB=0.0408373;RO=27;SAF=1;SAR=33;SRF=7;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.575398;STB=0.650625;TYPE=snp;VARB=0.0245639;OID=.;OPOS=45683246;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:88:62:73:27:27:34:46:33:1:7:20:42:4:7:20 chr22 45683304 . G C 164.6 PASS AO=27;DP=47;FAO=30;FDP=50;FR=.;FRO=20;FSAF=1;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=19;FWDB=-0.0490962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.43;QD=13.168;RBI=0.0491123;REFB=-0.009101;REVB=0.00125746;RO=20;SAF=1;SAR=26;SRF=1;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0646771;STB=0.547135;TYPE=snp;VARB=0.00664764;OID=.;OPOS=45683304;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:74:47:50:20:20:27:30:26:1:1:19:29:1:1:19 chr22 45685002 . A G 138.8 PASS AO=26;DP=44;FAO=26;FDP=44;FR=.;FRO=18;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.008145;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.334;QD=12.6185;RBI=0.0140431;REFB=-0.00371405;REVB=-0.0114397;RO=18;SAF=15;SAR=11;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17887;STB=0.598883;TYPE=snp;VARB=0.00259832;OID=.;OPOS=45685002;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:68:44:44:18:18:26:26:11:15:6:12:11:15:6:12 chr22 45691594 . A G 538.71 PASS AO=52;DP=52;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139848;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.864;QD=37.1521;RBI=0.016327;REFB=0;REVB=-0.00842594;RO=0;SAF=20;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.00761e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00236184;OID=.;OPOS=45691594;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:52:58:0:0:52:58:32:20:0:0:38:20:0:0 chr22 45718041 . A G 2529.62 PASS AO=277;DP=288;FAO=278;FDP=278;FR=.;FRO=0;FSAF=120;FSAR=158;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314176;FXX=0.034721;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.629;QD=36.3974;RBI=0.0353058;REFB=-0.0304348;REVB=0.016107;RO=7;SAF=119;SAR=158;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.027218;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.97419e-05;OID=.;OPOS=45718041;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:288:278:7:0:277:278:158:119:7:0:158:120:0:0 chr22 45723807 . G C 1120.85 PASS AO=117;DP=117;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0304618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.054;QD=38.3198;RBI=0.0628124;REFB=0;REVB=-0.0549316;RO=0;SAF=57;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000157448;OID=.;OPOS=45723807;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:117:117:0:0:117:117:60:57:0:0:60:57:0:0 chr22 45723842 . G A 624.5 PASS AO=69;DP=71;FAO=69;FDP=71;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0260013;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=226.015;QD=35.1828;RBI=0.0367081;REFB=-0.00410632;REVB=-0.0259117;RO=2;SAF=34;SAR=35;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0262456;STB=0.513885;TYPE=snp;VARB=1.06257e-05;OID=.;OPOS=45723842;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:71:71:2:2:69:69:35:34:0:2:35:34:0:2 chr22 45723947 . A G 282.52 PASS AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0523272;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.048;QD=38.968;RBI=0.0595912;REFB=0;REVB=0.0285127;RO=0;SAF=20;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000127709;OID=.;OPOS=45723947;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:30:29:0:0:29:29:9:20:0:0:9:20:0:0 chr22 45728370 . G A 2683.46 PASS AO=283;DP=286;FAO=286;FDP=286;FR=.;FRO=0;FSAF=150;FSAR=136;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0395727;FXX=0.0034842;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.087;QD=37.5309;RBI=0.045609;REFB=0;REVB=0.0226757;RO=1;SAF=149;SAR=134;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0031898;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000687131;OID=.;OPOS=45728370;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:286:286:1:0:283:286:134:149:1:0:136:150:0:0 chr22 45767391 . C T 808.31 PASS AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00695106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.955;QD=38.0382;RBI=0.0430322;REFB=0;REVB=0.0424671;RO=0;SAF=60;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.47492e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000205412;OID=.;OPOS=45767391;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:85:85:0:0:85:85:25:60:0:0:25:60:0:0 chr22 45767455 . A G 488.25 PASS AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0533284;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.1801;QD=37.5577;RBI=0.0589716;REFB=0;REVB=0.0251741;RO=0;SAF=40;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000510849;OID=.;OPOS=45767455;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:52:52:0:0:52:52:12:40:0:0:12:40:0:0 chr22 45782903 . T C 2107.09 PASS AO=223;DP=226;FAO=224;FDP=224;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=151;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0481934;FXX=0.00884917;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.201;QD=37.6266;RBI=0.0567855;REFB=-0.113197;REVB=-0.030033;RO=2;SAF=73;SAR=150;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00331609;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000177389;OID=.;OPOS=45782903;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:226:224:2:0:223:224:150:73:1:1:151:73:0:0 chr22 45789642 . A C 1103.2 PASS AO=119;DP=122;FAO=119;FDP=121;FR=.;FRO=2;FSAF=64;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0192998;FXX=0.00819605;HRUN=3;LEN=1;MLLD=88.0643;QD=36.4693;RBI=0.0525679;REFB=-0.123516;REVB=0.0488969;RO=0;SAF=64;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.98352e-08;STB=0.508927;TYPE=snp;VARB=0.00195125;OID=.;OPOS=45789642;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:122:121:0:2:119:119:55:64:0:0:55:64:0:2 chr22 45810278 . A AC,C 1254.72 PASS AO=88,36;DP=150;FAO=149,0;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=61,0;FSAR=88,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.303522,-0.117613;FXX=0.0132442;HRUN=1,3;LEN=1,1;MLLD=20.7316,7.1689;QD=33.6836;RBI=0.309626,0.123151;REFB=0,0;REVB=-0.0611804,-0.036515;RO=21;SAF=11,35;SAR=77,1;SRF=14;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.325928,0.614929;STB=0.5,0.5;TYPE=ins,snp;VARB=0.00450307,0;OID=.,.;OPOS=45810279,45810278;OREF=-,A;OALT=C,C;OMAPALT=AC,C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:150:149:21:0:88,36:149,0:77,1:11,35:14:7:88,0:61,0:0:0 chr22 45813687 . G A 1638.38 PASS AO=168;DP=168;FAO=170;FDP=170;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=117;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.1393;QD=38.5501;RBI=0.0107004;REFB=0;REVB=0.00284264;RO=0;SAF=52;SAR=116;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.98103e-05;OID=.;OPOS=45813687;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:168:170:0:0:168:170:116:52:0:0:117:53:0:0 chr22 45821887 . G A 296.8 PASS AO=31;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207974;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.927;QD=37.0999;RBI=0.0278706;REFB=0;REVB=0.0185536;RO=0;SAF=15;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000327744;OID=.;OPOS=45821887;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:31:32:0:0:31:32:16:15:0:0:17:15:0:0 chr22 45821909 . C T 274.99 PASS AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0466519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.603;QD=34.3731;RBI=0.057746;REFB=-0.128839;REVB=0.0340323;RO=1;SAF=17;SAR=14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0321576;STB=0.51723;TYPE=snp;VARB=0.00261839;OID=.;OPOS=45821909;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:32:32:1:1:31:31:14:17:0:1:14:17:0:1 chr22 45821935 . G A 272.8 PASS AO=18;DP=30;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0389881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.9136;QD=37.6275;RBI=0.126251;REFB=0;REVB=0.12008;RO=0;SAF=8;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00370812;OID=.;OPOS=45821935;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:19:29:0:0:18:29:10:8:0:0:11:18:0:0 chr22 45826880 . G A 403.42 PASS AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0616203;FXX=0.0227221;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.501;QD=37.5277;RBI=0.075331;REFB=0;REVB=0.0433323;RO=0;SAF=18;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.65211e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000516666;OID=.;OPOS=45826880;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:44:43:0:0:43:43:25:18:0:0:25:18:0:0 chr22 45898117 . T C 56.38 PASS AO=19;DP=57;FAO=19;FDP=57;FR=.;FRO=38;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=27;FWDB=-0.00354789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.305;QD=3.95614;RBI=0.0265386;REFB=-0.0340176;REVB=0.0263003;RO=38;SAF=6;SAR=13;SRF=11;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.03506;STB=0.520586;TYPE=snp;VARB=0.0122756;OID=.;OPOS=45898117;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:57:57:38:38:19:19:13:6:11:27:13:6:11:27 chr22 45898130 . A T 45.66 PASS AO=17;DP=57;FAO=17;FDP=56;FR=.;FRO=39;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=31;FWDB=-0.00660125;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.16;QD=3.2617;RBI=0.0211288;REFB=-0.0374466;REVB=-0.0200711;RO=40;SAF=5;SAR=12;SRF=9;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103377;STB=0.579429;TYPE=snp;VARB=0.0223104;OID=.;OPOS=45898130;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:57:56:40:39:17:17:12:5:9:31:12:5:8:31 chr22 45923827 . A G 1687.21 PASS AO=175;DP=176;FAO=177;FDP=177;FR=.;FRO=0;FSAF=117;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.04595;FXX=0.027471;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.066;QD=38.129;RBI=0.0459522;REFB=0;REVB=-0.000447324;RO=0;SAF=114;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00132008;OID=.;OPOS=45923827;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:80:176:177:0:0:175:177:61:114:0:0:60:117:0:0 chr22 45937149 . C T 286.78 PASS AO=77;DP=194;FAO=83;FDP=198;FR=.;FRO=115;FSAF=30;FSAR=53;FSRF=35;FSRR=80;FWDB=0.0644188;FXX=0.0149246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.408;QD=5.79351;RBI=0.0656031;REFB=-0.0197762;REVB=-0.0124091;RO=100;SAF=26;SAR=51;SRF=29;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0551961;STB=0.536642;TYPE=snp;VARB=0.0278574;OID=.;OPOS=45937149;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:198:100:115:77:83:51:26:29:71:53:30:35:80 chr22 46156446 . G A 113.48 PASS AO=29;DP=63;FAO=28;FDP=62;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=-0.015117;FXX=0.0158705;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.294;QD=7.3213;RBI=0.018809;REFB=0.0129038;REVB=0.0111918;RO=34;SAF=17;SAR=12;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00200401;STB=0.509427;TYPE=snp;VARB=-0.015668;OID=.;OPOS=46156446;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:62:34:34:29:28:12:17:20:14:12:16:20:14 chr22 46202925 . A G 283.82 PASS AO=68;DP=143;FAO=69;FDP=144;FR=.;FRO=75;FSAF=27;FSAR=42;FSRF=29;FSRR=46;FWDB=0.016863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.689;QD=7.88394;RBI=0.017782;REFB=-0.0051946;REVB=0.00564246;RO=75;SAF=26;SAR=42;SRF=29;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00431943;STB=0.502537;TYPE=snp;VARB=0.00575324;OID=.;OPOS=46202925;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:144:75:75:68:69:42:26:29:46:42:27:29:46 chr22 46402714 . A G 127.59 PASS AO=22;DP=44;FAO=23;FDP=43;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=15;FWDB=0.00252894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.677;QD=11.8687;RBI=0.0137939;REFB=-0.0172545;REVB=0.01356;RO=7;SAF=11;SAR=11;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0314866;STB=0.6386;TYPE=snp;VARB=0.0144642;OID=.;OPOS=46402714;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:75:41:43:7:18:22:23:11:11:3:4:12:11:3:15 chr22 46487011 . G A 190.53 PASS AO=46;DP=97;FAO=46;FDP=97;FR=.;FRO=51;FSAF=13;FSAR=33;FSRF=20;FSRR=31;FWDB=0.00775224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.281;QD=7.85699;RBI=0.0749231;REFB=-0.00655816;REVB=0.074521;RO=51;SAF=13;SAR=33;SRF=20;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119628;STB=0.566862;TYPE=snp;VARB=0.00914506;OID=.;OPOS=46487011;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:51:51:46:46:33:13:20:31:33:13:20:31 chr22 46493852 . C T 330.62 PASS AO=34;DP=34;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0453962;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6068;QD=37.7849;RBI=0.0642092;REFB=0;REVB=0.0454093;RO=0;SAF=15;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40663e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000588523;OID=.;OPOS=46493852;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:34:35:0:0:34:35:19:15:0:0:19:16:0:0 chr22 46499120 . G C 577.05 PASS AO=56;DP=56;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.104628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3272;QD=37.8394;RBI=0.104629;REFB=0;REVB=-0.000327652;RO=0;SAF=2;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00115016;OID=.;OPOS=46499120;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:56:61:0:0:56:61:54:2:0:0:59:2:0:0 chr22 46501355 . G T 392.38 PASS AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0784564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.5754;QD=37.3693;RBI=0.114551;REFB=0;REVB=0.0834658;RO=0;SAF=34;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.67012e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00210005;OID=.;OPOS=46501355;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:42:42:0:0:42:42:8:34:0:0:8:34:0:0 chr22 46501373 . A G 91.35 PASS AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=23;FSRR=4;FWDB=-0.0144334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.61;QD=7.45707;RBI=0.0169639;REFB=-0.00804545;REVB=0.00891356;RO=27;SAF=15;SAR=7;SRF=23;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.209285;STB=0.617077;TYPE=snp;VARB=0.011935;OID=.;OPOS=46501373;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:91:49:49:27:27:22:22:7:15:23:4:7:15:23:4 chr22 46501426 . A G 180.37 PASS AO=31;DP=48;FAO=31;FDP=48;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=22;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.0186304;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=125.283;QD=15.0305;RBI=0.025209;REFB=-0.00275993;REVB=0.0169823;RO=15;SAF=9;SAR=22;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162156;STB=0.594531;TYPE=snp;VARB=0.000904716;OID=.;OPOS=46501426;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:48:48:15:17:31:31:22:9:8:7:22:9:9:8 chr22 46669946 . A G 96.38 PASS AO=22;DP=46;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=5;FWDB=-0.0168919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.306;QD=8.38122;RBI=0.0418082;REFB=-0.0218878;REVB=0.0382438;RO=24;SAF=8;SAR=14;SRF=19;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.380235;STB=0.713028;TYPE=snp;VARB=0.0444453;OID=.;OPOS=46669946;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:96:46:46:24:24:22:22:14:8:19:5:14:8:19:5 chr22 46677607 . T C 721.45 PASS AO=78;DP=81;FAO=81;FDP=84;FR=.;FRO=3;FSAF=8;FSAR=73;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0246182;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.353;QD=34.355;RBI=0.053345;REFB=-0.0900369;REVB=0.0473248;RO=3;SAF=7;SAR=71;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0498362;STB=0.522667;TYPE=snp;VARB=0.0061;OID=.;OPOS=46677607;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:81:84:3:3:78:81:71:7:1:2:73:8:1:2 chr22 46685453 . GC G 119.09 PASS AO=14;DP=24;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00482755;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.3595;QD=20.7108;RBI=0.355989;REFB=-0.0530838;REVB=0.355957;RO=8;SAF=5;SAR=9;SRF=1;SRR=7;SSEN=0.372913;SSEP=0;SSSB=0.174041;STB=0.545411;TYPE=del;VARB=0.0404552;OID=.;OPOS=46685454;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:14:23:22:23:1:5:17:1:0:6:8:5:9:1:7 chr22 46722400 . T C 194.11 PASS AO=19;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0317088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.265;QD=38.8212;RBI=0.035658;REFB=0;REVB=0.0163109;RO=0;SAF=13;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.851e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000508467;OID=.;OPOS=46722400;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:20:20:0:0:19:20:6:13:0:0:6:14:0:0 chr22 46929692 . A G 105.75 PASS AO=27;DP=63;FAO=27;FDP=62;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=25;FWDB=0.0582743;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.6864;QD=6.82231;RBI=0.0671033;REFB=-0.0307947;REVB=-0.0332711;RO=35;SAF=15;SAR=12;SRF=10;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.264784;STB=0.649019;TYPE=snp;VARB=0.0348645;OID=.;OPOS=46929692;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:62:35:35:27:27:12:15:10:25:12:15:10:25 chr22 46931077 . G C 39.45 PASS AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.0138549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.289;QD=7.17297;RBI=0.0174587;REFB=-0.00495773;REVB=0.010623;RO=13;SAF=4;SAR=5;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0604717;STB=0.536003;TYPE=snp;VARB=0.0127663;OID=.;OPOS=46931077;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:22:22:13:13:9:9:5:4:5:8:5:4:5:8 chr22 46931402 . G C 57.53 PASS AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.0335097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.697;QD=7.9353;RBI=0.0433859;REFB=-0.0187079;REVB=-0.0275579;RO=16;SAF=7;SAR=6;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0230345;STB=0.513348;TYPE=snp;VARB=0.0293772;OID=.;OPOS=46931402;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:29:29:16:16:13:13:6:7:9:7:6:7:9:7 chr22 46931793 . G C 56.2 PASS AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=12;FWDB=-0.0379857;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.398;QD=8.99206;RBI=0.0388537;REFB=-0.0150166;REVB=-0.00816681;RO=13;SAF=5;SAR=7;SRF=1;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.343285;STB=0.693172;TYPE=snp;VARB=0.0194739;OID=.;OPOS=46931793;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:25:25:13:13:12:12:7:5:1:12:7:5:1:12 chr22 46931838 . G A 43.48 PASS AO=11;DP=28;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=15;FWDB=0.0482609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.6;QD=6.21198;RBI=0.0502775;REFB=-0.0104099;REVB=0.0140965;RO=17;SAF=4;SAR=7;SRF=2;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.308067;STB=0.676666;TYPE=snp;VARB=0.0197713;OID=.;OPOS=46931838;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:28:28:17:17:11:11:7:4:2:15:7:4:2:15 chr22 47058992 . T C 751.19 PASS AO=81;DP=91;FAO=82;FDP=84;FR=.;FRO=2;FSAF=51;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0158391;FXX=0.0769146;HRUN=3;LEN=1;MLLD=69.9404;QD=35.7708;RBI=0.0254222;REFB=-0.107586;REVB=-0.019885;RO=1;SAF=51;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0155208;STB=0.503082;TYPE=snp;VARB=0.00162256;OID=.;OPOS=47058992;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:91:84:1:2:81:82:30:51:0:1:31:51:1:1 chr22 47075462 . C T 1101.46 PASS AO=114;DP=115;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105674;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.864;QD=38.3116;RBI=0.0869702;REFB=0;REVB=-0.0863258;RO=0;SAF=76;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000185527;OID=.;OPOS=47075462;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:115:115:0:0:114:115:38:76:0:0:38:77:0:0 chr22 47086006 . C T 10.75 PASS AO=13;DP=86;FAO=13;FDP=86;FR=.;FRO=73;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=18;FSRR=55;FWDB=-0.0254615;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=195.003;QD=0.500037;RBI=0.0306727;REFB=-0.00288367;REVB=0.0171035;RO=73;SAF=11;SAR=2;SRF=18;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.656751;STB=0.914862;TYPE=snp;VARB=0.0247932;OID=.;OPOS=47086006;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:86:86:73:73:13:13:2:11:18:55:2:11:18:55 chr22 47087670 . G A 287.31 PASS AO=61;DP=117;FAO=62;FDP=118;FR=.;FRO=56;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=22;FSRR=34;FWDB=0.00797118;FXX=0.0166653;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.242;QD=9.73932;RBI=0.0194525;REFB=-0.0188026;REVB=0.0177443;RO=54;SAF=28;SAR=33;SRF=21;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0607135;STB=0.528293;TYPE=snp;VARB=0.0157384;OID=.;OPOS=47087670;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:118:54:56:61:62:33:28:21:33:34:28:22:34 chr22 47311404 . A T 1021.92 PASS AO=109;DP=111;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229504;FXX=0.0180164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.075;QD=37.5018;RBI=0.0338869;REFB=-0.0187256;REVB=0.024932;RO=0;SAF=59;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000166254;OID=.;OPOS=47311404;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:111:109:0:0:109:109:50:59:0:0:50:59:0:0 chr22 47569571 . G C 95.8 PASS AO=10;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.146248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.1839;QD=34.8357;RBI=0.146298;REFB=0;REVB=-0.00383398;RO=1;SAF=9;SAR=1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0471711;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0114141;OID=.;OPOS=47569571;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:1:0:10:11:1:9:1:0:1:10:0:0 chr22 47857537 . T C 549.2 PASS AO=153;DP=352;FAO=153;FDP=351;FR=.;FRO=198;FSAF=71;FSAR=82;FSRF=105;FSRR=93;FWDB=0.00300298;FXX=0.00284083;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.774;QD=6.25865;RBI=0.00683133;REFB=-0.00089135;REVB=0.00613589;RO=195;SAF=71;SAR=82;SRF=102;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0596821;STB=0.53736;TYPE=snp;VARB=0.000858484;OID=.;OPOS=47857537;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:352:351:195:198:153:153:82:71:102:93:82:71:105:93 chr22 47857551 . T G 458.06 PASS AO=134;DP=326;FAO=136;FDP=329;FR=.;FRO=193;FSAF=60;FSAR=76;FSRF=97;FSRR=96;FWDB=-0.0303861;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5027;QD=5.56917;RBI=0.0353559;REFB=0.00155951;REVB=-0.0180756;RO=192;SAF=58;SAR=76;SRF=96;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0713414;STB=0.536216;TYPE=snp;VARB=-0.00276571;OID=.;OPOS=47857551;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:326:329:192:193:134:136:76:58:96:96:76:60:97:96 chr22 47857576 . A G 344.76 PASS AO=116;DP=309;FAO=116;FDP=309;FR=.;FRO=193;FSAF=41;FSAR=75;FSRF=98;FSRR=95;FWDB=-0.0199556;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=252.162;QD=4.46289;RBI=0.0200727;REFB=-0.0116886;REVB=0.00216486;RO=192;SAF=41;SAR=75;SRF=98;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178232;STB=0.599293;TYPE=snp;VARB=0.0224235;OID=.;OPOS=47857576;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:309:309:192:193:116:116:75:41:98:94:75:41:98:95 chr22 48023241 . G T 1535.15 PASS AO=159;DP=160;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130773;FXX=0.00624961;HRUN=3;LEN=1;MLLD=202.666;QD=38.6201;RBI=0.0144448;REFB=0;REVB=-0.00613476;RO=0;SAF=92;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.42359e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.9029e-05;OID=.;OPOS=48023241;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:160:159:0:0:159:159:67:92:0:0:67:92:0:0 chr22 48940553 . T C 556.49 PASS AO=61;DP=61;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0523276;FXX=0.0491723;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.465;QD=38.3788;RBI=0.0536452;REFB=0;REVB=0.0118167;RO=0;SAF=40;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000329512;OID=.;OPOS=48940553;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:61:58:0:0:61:58:21:40:0:0:21:37:0:0 chr22 48940644 . C T 787.47 PASS AO=82;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276269;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.8238;QD=37.9503;RBI=0.0386515;REFB=0;REVB=0.0270313;RO=0;SAF=48;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000233331;OID=.;OPOS=48940644;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:83:83:0:0:82:83:34:48:0:0:35:48:0:0 chr22 49145928 . C A 101.4 PASS AO=16;DP=23;FAO=16;FDP=23;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.0695;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.0018;QD=17.6345;RBI=0.0710839;REFB=0.0170819;REVB=0.0149218;RO=7;SAF=6;SAR=10;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0529375;STB=0.529376;TYPE=snp;VARB=-0.0104901;OID=.;OPOS=49145928;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:23:23:7:7:16:16:10:6:2:5:10:6:2:5 chr22 50017234 . A G 135.86 PASS AO=30;DP=60;FAO=30;FDP=61;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=23;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=-0.0124031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.191;QD=8.90905;RBI=0.0247329;REFB=-0.0415935;REVB=0.0213981;RO=29;SAF=7;SAR=23;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126086;STB=0.559329;TYPE=snp;VARB=0.0374068;OID=.;OPOS=50017234;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:60:61:29:31:30:30:23:7:10:19:23:7:10:21 chr22 50018045 . G A 54.48 PASS AO=2;DP=20;FAO=11;FDP=19;FR=.,HEALED;FRO=8;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.00329821;FXX=0.049975;HRUN=4;LEN=1;MLLD=100.524;QD=11.4685;RBI=0.231568;REFB=-0.0291496;REVB=-0.231544;RO=6;SAF=0;SAR=2;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.719959;STB=0.512173;TYPE=snp;VARB=0.0754748;OID=.;OPOS=50018045;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:11:19:6:8:2:11:2:0:5:1:3:8:6:2 chr22 50018497 . G A 413.28 PASS AO=88;DP=163;FAO=89;FDP=162;FR=.;FRO=73;FSAF=39;FSAR=50;FSRF=33;FSRR=40;FWDB=0.0824787;FXX=0.00613459;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.7718;QD=10.2045;RBI=0.0830773;REFB=-0.002805;REVB=-0.00995542;RO=73;SAF=37;SAR=51;SRF=33;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0267783;STB=0.506328;TYPE=snp;VARB=0.00371075;OID=.;OPOS=50018497;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:162:73:73:88:89:51:37:33:40:50:39:33:40 chr22 50277790 . C T 147.06 PASS AO=27;DP=48;FAO=28;FDP=49;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=26;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=0.0313309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.293;QD=12.0047;RBI=0.0412495;REFB=-0.0151801;REVB=-0.0268308;RO=21;SAF=2;SAR=25;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.375342;STB=0.71704;TYPE=snp;VARB=0.0112124;OID=.;OPOS=50277790;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:83:48:49:21:21:27:28:25:2:6:15:26:2:6:15 chr22 50277835 . T C 375.71 PASS AO=38;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0889541;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.179;QD=38.534;RBI=0.0890162;REFB=0;REVB=-0.00332411;RO=0;SAF=11;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000473097;OID=.;OPOS=50277835;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:38:39:0:0:38:39:27:11:0:0:28:11:0:0 chr22 50277883 . A G 452.37 PASS AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0935552;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9141;QD=38.4996;RBI=0.0945396;REFB=0;REVB=0.0136073;RO=0;SAF=23;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00186013;OID=.;OPOS=50277883;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:48:47:0:0:47:47:24:23:0:0:24:23:0:0 chr22 50278438 . A G 402.21 PASS AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.318;QD=37.4145;RBI=0.0365058;REFB=0;REVB=-0.0331487;RO=0;SAF=22;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.84274e-05;OID=.;OPOS=50278438;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:42:43:0:0:42:43:20:22:0:0:21:22:0:0 chr22 50278568 . A G 335.52 PASS AO=32;DP=33;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0566165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.27;QD=37.2797;RBI=0.0629245;REFB=0;REVB=0.0274602;RO=0;SAF=7;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00125528;OID=.;OPOS=50278568;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:33:36:0:0:32:36:25:7:0:0:28:8:0:0 chr22 50278642 . C T 346.21 PASS AO=36;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.119678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.6547;QD=37.4277;RBI=0.122598;REFB=0;REVB=0.0266;RO=1;SAF=13;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0346393;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00205717;OID=.;OPOS=50278642;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:37:37:1:0:36:37:23:13:1:0:23:14:0:0 chr22 50280136 . T C 552.82 PASS AO=59;DP=59;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0708047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.216;QD=36.8548;RBI=0.0717175;REFB=0;REVB=0.0114061;RO=0;SAF=19;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.7823e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000420746;OID=.;OPOS=50280136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:59:60:0:0:59:60:40:19:0:0:41:19:0:0 chr22 50281917 . A G 1597.44 PASS AO=179;DP=187;FAO=179;FDP=187;FR=.;FRO=8;FSAF=101;FSAR=78;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=0.00171353;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=262.056;QD=34.1698;RBI=0.00610985;REFB=-0.170498;REVB=-0.00586464;RO=4;SAF=101;SAR=78;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184771;STB=0.513563;TYPE=snp;VARB=0.000385313;OID=.;OPOS=50281917;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:187:187:4:8:179:179:78:101:4:0:78:101:7:1 chr22 50356685 . CG C 51.11 PASS AO=11;DP=34;FAO=18;FDP=28;FR=.;FRO=10;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.0409892;FXX=0.096743;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.8947;QD=7.30098;RBI=0.217907;REFB=-0.0437245;REVB=0.214017;RO=14;SAF=10;SAR=1;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.484979;STB=0.513499;TYPE=del;VARB=0.0845602;OID=.;OPOS=50356686;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:11:30:18:28:10:12:6:7:3:21:14:10:1:8:6 chr22 50356693 . T C 288.98 PASS AO=19;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0418456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.394;QD=38.5304;RBI=0.0502323;REFB=0;REVB=0.0277889;RO=0;SAF=9;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33753e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000814201;OID=.;OPOS=50356693;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:27:30:0:0:19:30:10:9:0:0:10:20:0:0 chr22 50435480 . A G 35.94 PASS AO=13;DP=44;FAO=13;FDP=44;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=23;FSRR=8;FWDB=-0.0803224;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=38.5045;QD=3.26738;RBI=0.118988;REFB=-0.00722607;REVB=-0.0877867;RO=30;SAF=9;SAR=4;SRF=22;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0572372;STB=0.54231;TYPE=snp;VARB=0.00659108;OID=.;OPOS=50435480;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:44:44:30:31:13:13:4:9:22:8:4:9:23:8 chr22 50468933 . G T 43.04 PASS AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=0.0301904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.59;QD=8.60864;RBI=0.048831;REFB=-0.0224089;REVB=-0.0383797;RO=11;SAF=8;SAR=1;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.656245;STB=0.888024;TYPE=snp;VARB=0.010984;OID=.;OPOS=50468933;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:20:20:11:11:9:9:1:8:2:9:1:8:2:9 chr22 50480108 . C T 135.85 PASS AO=29;DP=65;FAO=32;FDP=67;FR=.;FRO=35;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=0.104128;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.7837;QD=8.11067;RBI=0.154025;REFB=0.0285659;REVB=0.113496;RO=36;SAF=18;SAR=11;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0384514;STB=0.547612;TYPE=snp;VARB=-0.0261103;OID=.;OPOS=50480108;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:65:67:36:35:29:32:11:18:21:15:11:21:20:15 chr22 50493062 . T C 237.97 PASS AO=64;DP=144;FAO=63;FDP=143;FR=.;FRO=80;FSAF=32;FSAR=31;FSRF=46;FSRR=34;FWDB=-0.0238636;FXX=0.0137922;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.964;QD=6.65638;RBI=0.0239105;REFB=-0.00509273;REVB=-0.0014973;RO=80;SAF=34;SAR=30;SRF=46;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0439259;STB=0.53756;TYPE=snp;VARB=0.00489169;OID=.;OPOS=50493062;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:144:143:80:80:64:63:30:34:46:34:31:32:46:34 chr22 50546788 . G C 141.88 PASS AO=40;DP=97;FAO=40;FDP=97;FR=.;FRO=57;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=26;FSRR=31;FWDB=-0.0263971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.885;QD=5.85064;RBI=0.0268332;REFB=0.00302972;REVB=0.00481843;RO=57;SAF=14;SAR=26;SRF=26;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116156;STB=0.565799;TYPE=snp;VARB=-0.00666319;OID=.;OPOS=50546788;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:97:57:57:40:40:26:14:26:31:26:14:26:31 chr22 50546797 . T C 112.29 PASS AO=35;DP=98;FAO=36;FDP=98;FR=.;FRO=62;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=26;FSRR=36;FWDB=0.0101491;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.323;QD=4.58317;RBI=0.0155276;REFB=-0.00141733;REVB=0.0117517;RO=62;SAF=13;SAR=22;SRF=26;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0560504;STB=0.53904;TYPE=snp;VARB=0.00181338;OID=.;OPOS=50546797;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:98:62:62:35:36:22:13:26:36:23:13:26:36 chr22 50547247 . A G 2214.61 PASS AO=236;DP=241;FAO=237;FDP=237;FR=.;FRO=0;FSAF=110;FSAR=127;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0283333;FXX=0.0165968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.943;QD=37.3774;RBI=0.0424033;REFB=-0.0619811;REVB=0.0315479;RO=2;SAF=109;SAR=127;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00866342;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000112947;OID=.;OPOS=50547247;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:241:237:2:0:236:237:127:109:2:0:127:110:0:0 chr22 50555619 . C T 3143.01 PASS AO=325;DP=328;FAO=337;FDP=337;FR=.;FRO=0;FSAF=158;FSAR=179;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0244799;FXX=0.0117299;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.313;QD=37.3057;RBI=0.0298101;REFB=-0.0334108;REVB=0.0170112;RO=2;SAF=145;SAR=180;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00653379;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000194295;OID=.;OPOS=50555619;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:328:337:2:0:325:337:180:145:2:0:179:158:0:0 chr22 50582626 . A G 243.49 PASS AO=50;DP=97;FAO=52;FDP=98;FR=.;FRO=46;FSAF=18;FSAR=34;FSRF=20;FSRR=26;FWDB=-0.00712508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.427;QD=9.93819;RBI=0.0405619;REFB=-0.0330414;REVB=-0.0399312;RO=44;SAF=17;SAR=33;SRF=18;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0638294;STB=0.54467;TYPE=snp;VARB=0.0251942;OID=.;OPOS=50582626;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:98:44:46:50:52:33:17:18:26:34:18:20:26 chr22 50588131 . C T 190.88 PASS AO=44;DP=91;FAO=45;FDP=93;FR=.;FRO=48;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=17;FSRR=31;FWDB=0.0403479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.292;QD=8.20969;RBI=0.0470982;REFB=-0.0501025;REVB=-0.0242959;RO=47;SAF=16;SAR=28;SRF=17;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0019417;STB=0.500782;TYPE=snp;VARB=0.0427922;OID=.;OPOS=50588131;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:91:93:47:48:44:45:28:16:17:30:29:16:17:31 chr22 50617408 . C G 29.48 PASS AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0835375;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.9221;QD=11.7912;RBI=0.164021;REFB=-0.0258886;REVB=-0.141154;RO=4;SAF=4;SAR=1;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.268008;STB=0.726279;TYPE=snp;VARB=0.0142707;OID=.;OPOS=50617408;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:9:10:4:5:5:5:1:4:2:2:1:4:2:3 chr22 50617594 . GC G 39.8 PASS AO=5;DP=14;FAO=13;FDP=17;FR=.;FRO=4;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.130937;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=9.93961;QD=9.36475;RBI=0.206225;REFB=-0.0815374;REVB=-0.159325;RO=6;SAF=5;SAR=0;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.716421;STB=0.550382;TYPE=del;VARB=0.0698279;OID=.;OPOS=50617595;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:5:14:13:17:4:7:6:3:1:9:6:5:0:4:2 chr22 50637597 . G C 147.11 PASS AO=35;DP=74;FAO=35;FDP=74;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=-0.0346733;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.91;QD=7.9521;RBI=0.035083;REFB=0.00108318;REVB=-0.00534598;RO=39;SAF=18;SAR=17;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0255296;STB=0.514278;TYPE=snp;VARB=-0.000961551;OID=.;OPOS=50637597;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:74:74:39:39:35:35:17:18:19:20:17:18:19:20 chr22 50646936 . G C 495.31 PASS AO=57;DP=57;FAO=55;FDP=57;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0156935;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.1883;QD=34.7585;RBI=0.0376888;REFB=0.0241904;REVB=0.034266;RO=0;SAF=29;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517851;TYPE=snp;VARB=-0.00115704;OID=.;OPOS=50646936;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:57:57:0:2:57:55:28:29:0:0:28:27:2:0 chr22 50656428 . G A 59.04 PASS AO=13;DP=28;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.00307408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.2241;QD=8.43447;RBI=0.0206577;REFB=0.0120012;REVB=0.0204277;RO=15;SAF=5;SAR=8;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139734;STB=0.580879;TYPE=snp;VARB=-0.00332228;OID=.;OPOS=50656428;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:58:28:28:15:15:13:13:8:5:8:7:8:5:8:7 chr22 50657010 . C G 280.64 PASS AO=28;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.180703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.32;QD=37.4183;RBI=0.185296;REFB=0;REVB=0.0410004;RO=1;SAF=9;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0489106;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00283689;OID=.;OPOS=50657010;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:29:30:1:0:28:30:19:9:1:0:20:10:0:0 chr22 50658424 . T C 228.85 PASS AO=44;DP=75;FAO=44;FDP=75;FR=.;FRO=31;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.0443625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.1151;QD=12.2052;RBI=0.0453185;REFB=-0.0212765;REVB=0.00925935;RO=29;SAF=19;SAR=25;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0374821;STB=0.535152;TYPE=snp;VARB=0.01428;OID=.;OPOS=50658424;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:75:75:29:31:44:44:25:19:14:15:25:19:16:15 chr22 50664612 . A G 769.66 PASS AO=84;DP=86;FAO=84;FDP=86;FR=.;FRO=2;FSAF=41;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0188179;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.1455;QD=35.7981;RBI=0.0229269;REFB=-0.0570455;REVB=0.013097;RO=2;SAF=41;SAR=43;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000524556;STB=0.500277;TYPE=snp;VARB=-4.07383e-05;OID=.;OPOS=50664612;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:86:86:2:2:84:84:43:41:1:1:43:41:1:1 chr22 50678620 . G C 19.97 PASS AO=7;DP=27;FAO=7;FDP=27;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.0102512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.8531;QD=2.95908;RBI=0.0112163;REFB=-0.0268908;REVB=-0.00455185;RO=20;SAF=4;SAR=3;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0338709;STB=0.521678;TYPE=snp;VARB=0.0388529;OID=.;OPOS=50678620;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:27:27:20:20:7:7:3:4:12:8:3:4:12:8 chr22 50684256 . T C 25.37 PASS AO=8;DP=27;FAO=8;FDP=27;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.119621;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.4965;QD=3.75818;RBI=0.120782;REFB=0.00024504;REVB=-0.016708;RO=19;SAF=4;SAR=4;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0296329;STB=0.518472;TYPE=snp;VARB=-0.0135381;OID=.;OPOS=50684256;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:27:27:19:19:8:8:4:4:9:10:4:4:9:10 chr22 50684747 . C T 106.2 PASS AO=27;DP=62;FAO=27;FDP=62;FR=.;FRO=35;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.012887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.3284;QD=6.85151;RBI=0.037232;REFB=-0.021446;REVB=-0.0349305;RO=35;SAF=18;SAR=9;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131306;STB=0.574656;TYPE=snp;VARB=0.0277004;OID=.;OPOS=50684747;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:62:62:35:35:27:27:9:18:19:16:9:18:19:16 chr22 50686830 . G A 126.22 PASS AO=21;DP=32;FAO=21;FDP=32;FR=.;FRO=11;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.00477197;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=218.019;QD=15.7776;RBI=0.0110361;REFB=-0.022659;REVB=-0.00995105;RO=11;SAF=11;SAR=10;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.01349;STB=0.507456;TYPE=snp;VARB=0.00858962;OID=.;OPOS=50686830;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:32:32:11:11:21:21:10:11:6:5:10:11:6:5 chr22 50687178 . C T 193.81 PASS AO=38;DP=63;FAO=38;FDP=67;FR=.;FRO=29;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=7;FWDB=0.0204753;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=109.66;QD=11.5707;RBI=0.0256165;REFB=-0.0416947;REVB=0.0153938;RO=25;SAF=22;SAR=16;SRF=18;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106935;STB=0.581777;TYPE=snp;VARB=0.0168829;OID=.;OPOS=50687178;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:63:67:25:29:38:38:16:22:18:7:16:22:22:7 chr22 50687328 . C A 86.67 PASS AO=15;DP=24;FAO=15;FDP=24;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.0490508;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.5603;QD=14.4458;RBI=0.0582038;REFB=-0.0271768;REVB=0.0313322;RO=9;SAF=1;SAR=14;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.288614;STB=0.666387;TYPE=snp;VARB=0.0116235;OID=.;OPOS=50687328;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:24:24:9:9:15:15:14:1:2:7:14:1:2:7 chr22 50687595 . A G 31.01 PASS AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.2482;QD=13.7803;RBI=0.0141452;REFB=0.0528266;REVB=-0.0141452;RO=4;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.048557;OID=.;OPOS=50687595;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:9:9:4:4:5:5:5:0:0:4:5:0:0:4 chr22 50688292 . T C 16.55 PASS AO=7;DP=31;FAO=7;FDP=31;FR=.;FRO=24;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.0634509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6725;QD=2.13547;RBI=0.0771209;REFB=-0.0151678;REVB=-0.0438363;RO=24;SAF=1;SAR=6;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.352404;STB=0.739936;TYPE=snp;VARB=0.0808387;OID=.;OPOS=50688292;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:31:31:24:24:7:7:6:1:9:15:6:1:9:15 chr22 50688348 . A G 508.51 PASS AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0271552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.4518;QD=37.6675;RBI=0.0453454;REFB=0;REVB=-0.0363152;RO=0;SAF=25;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000510981;OID=.;OPOS=50688348;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:54:54:0:0:54:54:29:25:0:0:29:25:0:0 chr22 50693538 . G A 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00565633;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=268.44;QD=35.0875;RBI=0.00565633;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=7;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.67886e-05;OID=.;OPOS=50693538;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:0:7:0:0:0:7:0:0 chr22 50693554 . A G 86.76 PASS AO=8;DP=8;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0221071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.858;QD=38.5582;RBI=0.0221071;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=8;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000215501;OID=.;OPOS=50693554;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:9:0:0:8:9:0:8:0:0:0:9:0:0 chr22 50693889 . G A 27.58 PASS AO=8;DP=25;FAO=8;FDP=26;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.00614181;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.7673;QD=4.24364;RBI=0.0837214;REFB=-0.0381771;REVB=0.0834958;RO=17;SAF=5;SAR=3;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232376;STB=0.624688;TYPE=snp;VARB=0.0961318;OID=.;OPOS=50693889;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:25:26:17:18:8:8:3:5:7:10:3:5:8:10 chr22 50694297 . A G 125.84 PASS AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0148847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.838;QD=35.9535;RBI=0.0150835;REFB=0;REVB=0.00244106;RO=0;SAF=8;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.03375e-05;OID=.;OPOS=50694297;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:14:14:0:0:14:14:6:8:0:0:6:8:0:0 chr22 50696662 . C T 43.11 PASS AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.11003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.3215;QD=8.6213;RBI=0.111882;REFB=-0.034611;REVB=0.0202705;RO=10;SAF=6;SAR=3;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0650008;STB=0.571265;TYPE=snp;VARB=0.0565028;OID=.;OPOS=50696662;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:20:20:10:11:9:9:3:6:6:4:3:6:6:5 chr22 50704661 . T C 476.31 PASS AO=48;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0256464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.0702;QD=38.1047;RBI=0.0362302;REFB=0;REVB=-0.0255908;RO=0;SAF=9;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000911783;OID=.;OPOS=50704661;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:50:50:0:0:48:50:39:9:0:0:40:10:0:0 chr22 50705059 . A G 494.99 PASS AO=50;DP=51;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0488412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.763;QD=37.358;RBI=0.0488547;REFB=0;REVB=-0.00114999;RO=0;SAF=11;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.98453e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000149529;OID=.;OPOS=50705059;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:51:53:0:0:50:53:39:11:0:0:39:14:0:0 chr22 50705304 . C T 109.99 PASS AO=21;DP=36;FAO=21;FDP=37;FR=.;FRO=16;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.0104973;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.106;QD=11.8909;RBI=0.0538701;REFB=0.0263827;REVB=0.0528374;RO=15;SAF=11;SAR=10;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0426929;STB=0.53724;TYPE=snp;VARB=-0.0139543;OID=.;OPOS=50705304;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:36:37:15:16:21:21:10:11:7:8:10:11:7:9 chr22 50705466 . A G 99.2 PASS AO=10;DP=16;FAO=11;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00301506;FXX=0.249844;HRUN=4;LEN=1;MLLD=152.201;QD=33.0651;RBI=0.0245254;REFB=-0.033502;REVB=0.0243393;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.538392;TYPE=snp;VARB=0.00299124;OID=.;OPOS=50705466;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:11:12:0:1:10:11:5:5:0:0:5:6:1:0 chr22 50706041 . C T 10.21 PASS AO=2;DP=9;FAO=2;FDP=9;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.385;QD=4.5392;RBI=0.0486886;REFB=-0.029081;REVB=0.0486886;RO=7;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0949205;OID=.;OPOS=50706041;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:7:7:2:2:2:0:0:7:2:0:0:7 chr22 50713866 . G C 68.22 PASS AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0221926;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.834;QD=30.3221;RBI=0.0273101;REFB=-0.0962373;REVB=0.0159163;RO=1;SAF=4;SAR=4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0978599;STB=0.555418;TYPE=snp;VARB=0.00334136;OID=.;OPOS=50713866;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:9:9:1:1:8:8:4:4:1:0:4:4:1:0 chr22 50714394 . TGGGGGGT TGGGGGTG 11.48 PASS AO=3;DP=10;FAO=3;FDP=11;FR=.,HEALED;FRO=8;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0310421;FXX=0;HRUN=6;LEN=2;MLLD=17.7296;QD=4.17458;RBI=0.180874;REFB=-0.0640146;REVB=-0.17819;RO=4;SAF=1;SAR=2;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.541115;STB=0.704562;TYPE=mnp;VARB=0.116677;OID=.;OPOS=50714400;OREF=GT;OALT=TG;OMAPALT=TGGGGGTG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:3:10:3:11:8:1:2:5:3:10:4:1:2:4:0 chr22 50716167 . G A 99.33 PASS AO=17;DP=34;FAO=21;FDP=38;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.0446726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.834;QD=10.4562;RBI=0.058136;REFB=-0.0556072;REVB=0.0372042;RO=17;SAF=8;SAR=9;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104816;STB=0.534851;TYPE=snp;VARB=0.0421281;OID=.;OPOS=50716167;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:34:38:17:17:17:21:9:8:6:11:12:9:6:11 chr22 50719251 . A G 124.29 PASS AO=23;DP=40;FAO=23;FDP=40;FR=.;FRO=17;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=0.000971064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.909;QD=12.4288;RBI=0.0490855;REFB=-0.0117548;REVB=-0.0490759;RO=17;SAF=18;SAR=5;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0812719;STB=0.545413;TYPE=snp;VARB=0.0092546;OID=.;OPOS=50719251;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:40:40:17:17:23:23:5:18:12:5:5:18:12:5 chr22 50720622 . C T 36.46 PASS AO=15;DP=58;FAO=16;FDP=60;FR=.;FRO=44;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=30;FSRR=14;FWDB=0.0109472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.8894;QD=2.43059;RBI=0.0149526;REFB=-0.0309175;REVB=0.0101853;RO=43;SAF=9;SAR=6;SRF=29;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0963677;STB=0.545399;TYPE=snp;VARB=0.069369;OID=.;OPOS=50720622;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:58:60:43:44:15:16:6:9:29:14:6:10:30:14 chr22 50728062 . T C 52.52 PASS AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=0.0111869;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.564;QD=7.78046;RBI=0.0114936;REFB=-0.00556493;REVB=-0.00263757;RO=14;SAF=1;SAR=11;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.37043;STB=0.713831;TYPE=snp;VARB=0.00489963;OID=.;OPOS=50728062;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:26:27:14:15:12:12:11:1:4:10:11:1:4:11 chr22 50728530 . G C 104.87 PASS AO=20;DP=35;FAO=20;FDP=35;FR=.;FRO=15;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.0126637;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.142;QD=11.9854;RBI=0.0283506;REFB=-0.0237619;REVB=-0.0253651;RO=15;SAF=13;SAR=7;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146377;STB=0.582006;TYPE=snp;VARB=0.01387;OID=.;OPOS=50728530;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:61:35:35:15:15:20:20:7:13:7:8:7:13:7:8 chr22 50728640 . AG A 210.98 PASS AO=28;DP=41;FAO=38;FDP=42;FR=.;FRO=4;FSAF=31;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.101715;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=17.3423;QD=20.093;RBI=0.376902;REFB=-0.0812901;REVB=0.362918;RO=11;SAF=25;SAR=3;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0.333333;SSSB=0.328635;STB=0.510283;TYPE=del;VARB=0.0399033;OID=.;OPOS=50728641;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:28:40:38:42:4:31:7:3:1:6:11:25:3:6:5 chr22 50750835 . G A 42.34 PASS AO=12;DP=33;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.076411;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.4811;QD=4.57686;RBI=0.0823057;REFB=-0.0363817;REVB=0.0305873;RO=21;SAF=5;SAR=7;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11507;STB=0.627903;TYPE=snp;VARB=0.0375711;OID=.;OPOS=50750835;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:33:37:21:24:12:13:7:5:11:10:8:5:14:10 chr22 50754512 . C T 153.97 PASS AO=28;DP=46;FAO=28;FDP=46;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.0574368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.9037;QD=13.3886;RBI=0.06331;REFB=-0.0471611;REVB=-0.0266303;RO=18;SAF=13;SAR=15;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.094236;STB=0.55185;TYPE=snp;VARB=0.0599301;OID=.;OPOS=50754512;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:65:46:46:18:18:28:28:15:13:6:12:15:13:6:12 chr22 50754648 . T C 77.35 PASS AO=17;DP=35;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0399877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.55;QD=8.83996;RBI=0.0405606;REFB=-0.0129508;REVB=0.00679295;RO=18;SAF=8;SAR=9;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0237188;STB=0.513498;TYPE=snp;VARB=0.0109853;OID=.;OPOS=50754648;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:35:35:18:18:17:17:9:8:8:10:9:8:8:10 chr22 50757470 . T C 216.05 PASS AO=47;DP=98;FAO=51;FDP=100;FR=.;FRO=49;FSAF=11;FSAR=40;FSRF=21;FSRR=28;FWDB=-0.0694688;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.077;QD=8.64208;RBI=0.0694764;REFB=-0.0280718;REVB=-0.00102709;RO=50;SAF=8;SAR=39;SRF=21;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.311033;STB=0.631107;TYPE=snp;VARB=0.0293374;OID=.;OPOS=50757470;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:100:50:49:47:51:39:8:21:29:40:11:21:28 chr22 50809687 . T C 196.94 PASS AO=52;DP=121;FAO=53;FDP=122;FR=.;FRO=69;FSAF=45;FSAR=8;FSRF=48;FSRR=21;FWDB=-0.0213382;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.5446;QD=6.457;RBI=0.0308107;REFB=-0.0241656;REVB=0.0222256;RO=68;SAF=44;SAR=8;SRF=47;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240381;STB=0.636837;TYPE=snp;VARB=0.0287691;OID=.;OPOS=50809687;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:122:68:69:52:53:8:44:47:21:8:45:48:21 chr22 50877166 . G C 192.75 PASS AO=9;DP=25;FAO=21;FDP=23;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.075945;FXX=0.079968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.104;QD=33.5218;RBI=0.0804427;REFB=0.064278;REVB=0.0265217;RO=0;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.515137;TYPE=snp;VARB=0.001081;OID=.;OPOS=50877166;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:25:23:0:1:9:21:4:5:0:0:5:16:1:0 chr22 50885775 . A G 220.48 PASS AO=23;DP=23;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0540826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.207;QD=36.7471;RBI=0.0638366;REFB=0;REVB=0.0339145;RO=0;SAF=3;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00018239;OID=.;OPOS=50885775;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:23:24:0:0:23:24:20:3:0:0:21:3:0:0 chr22 50926765 . GCCCCA GCCTCA,GCCCCG 149.36 PASS AO=13,6;DP=30;FAO=15,6;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=4;FSAF=6,0;FSAR=9,6;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0346674,-0.0486959;FXX=0;HRUN=4,1;LEN=1,1;MLLD=134.946,155.723;QD=21.3369;RBI=0.036204,0.0491639;REFB=-0.105423,-0.0410789;REVB=-0.0104354,-0.0067675;RO=1;SAF=4,0;SAR=9,6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.047723,0;STB=0.590796,0.5;TYPE=snp,snp;VARB=0.0169132,0.02137;OID=.,.;OPOS=50926768,50926770;OREF=C,A;OALT=T,G;OMAPALT=GCCTCA,GCCCCG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:13,6:26:15,6:28:4:6,0:9,6:0:4:20:1:4,0:9,6:0:1 chr22 50927469 . TG T 64.93 PASS AO=10;DP=15;FAO=14;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0994649;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.152;QD=17.3137;RBI=0.276109;REFB=-0.0502755;REVB=0.257572;RO=4;SAF=8;SAR=2;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0.315336;SSSB=0.329371;STB=0.545388;TYPE=del;VARB=0.0623962;OID=.;OPOS=50927470;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:10:14:14:15:1:9:5:0:1:4:4:8:2:1:3 chr22 50941864 . TG T 194.89 PASS AO=24;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0918374;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=9.6055;QD=16.2405;RBI=0.313262;REFB=-0.0514189;REVB=0.299498;RO=14;SAF=16;SAR=8;SRF=2;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.34397;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0296422;OID=.;OPOS=50941865;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:24:44:48:48:0:20:28:0:0:12:14:16:8:2:12 chr22 50941985 . T C 305.82 PASS AO=32;DP=32;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.030008;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0693;QD=37.0688;RBI=0.0397733;REFB=0;REVB=-0.0261043;RO=0;SAF=6;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00118212;OID=.;OPOS=50941985;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:32:33:0:0:32:33:26:6:0:0:26:7:0:0 chr22 50943004 . C A 73.61 PASS AO=12;DP=23;FAO=14;FDP=25;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=1;FWDB=-0.00651326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.278;QD=11.7769;RBI=0.0456959;REFB=-0.037208;REVB=0.0452293;RO=11;SAF=8;SAR=4;SRF=10;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253613;STB=0.658341;TYPE=snp;VARB=0.027838;OID=.;OPOS=50943004;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:23:25:11:11:12:14:4:8:10:1:6:8:10:1 chr22 50943010 . G A 73.91 PASS AO=12;DP=23;FAO=14;FDP=25;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=1;FWDB=0.00171345;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.673;QD=11.8256;RBI=0.0918686;REFB=-0.0107943;REVB=0.0918526;RO=11;SAF=8;SAR=4;SRF=10;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253613;STB=0.658341;TYPE=snp;VARB=0.0100767;OID=.;OPOS=50943010;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:48:23:25:11:11:12:14:4:8:10:1:6:8:10:1 chr22 50943232 . G A 55.26 PASS AO=10;DP=18;FAO=10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.00648215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.604;QD=12.2792;RBI=0.00696068;REFB=-0.0218147;REVB=0.0025363;RO=8;SAF=4;SAR=6;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0201161;STB=0.511605;TYPE=snp;VARB=0.0219815;OID=.;OPOS=50943232;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:37:18:18:8:8:10:10:6:4:3:5:6:4:3:5 chr22 50944128 . G A 19.52 PASS AO=6;DP=22;FAO=6;FDP=22;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.0151979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.564;QD=3.54877;RBI=0.0454343;REFB=-0.0148979;REVB=-0.0428171;RO=16;SAF=5;SAR=1;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.361337;STB=0.739833;TYPE=snp;VARB=0.0466353;OID=.;OPOS=50944128;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:22:22:16:16:6:6:1:5:9:7:1:5:9:7 chr22 50944163 . G A 20.91 PASS AO=7;DP=26;FAO=7;FDP=26;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0288278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.645;QD=3.21711;RBI=0.0341036;REFB=-0.0214813;REVB=-0.0182214;RO=19;SAF=3;SAR=4;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0520582;STB=0.533238;TYPE=snp;VARB=0.0660763;OID=.;OPOS=50944163;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:26:26:19:19:7:7:4:3:9:10:4:3:9:10 chr22 50945255 . CA C,CG 116.97 PASS AO=3,9;DP=14;FAO=2,11;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=1,4;FSAR=1,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0455886,0.000193001;FXX=0.0713776;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=46.0258,53.8672;QD=35.991;RBI=0.0577242,0.0128493;REFB=0,0;REVB=0.0354086,0.0128479;RO=0;SAF=0,5;SAR=3,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.065568,0.0376607;OID=.,.;OPOS=50945256,50945256;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:3,9:13:2,11:13:0:1,4:1,7:0:0:7:0:0,5:3,4:0:0 chr22 50962208 . T G 173.99 PASS AO=53;DP=131;FAO=52;FDP=131;FR=.;FRO=79;FSAF=39;FSAR=13;FSRF=69;FSRR=10;FWDB=0.00559192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.61;QD=5.31262;RBI=0.0521216;REFB=-0.00558476;REVB=-0.0518208;RO=78;SAF=39;SAR=14;SRF=69;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230706;STB=0.610133;TYPE=snp;VARB=0.00904056;OID=.;OPOS=50962208;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:78:79:53:52:14:39:69:9:13:39:69:10 chr22 50962782 . C G 44.89 PASS AO=10;DP=26;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=0;FWDB=0.0415585;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.5239;QD=6.65019;RBI=0.0746651;REFB=-0.012043;REVB=0.0620303;RO=16;SAF=6;SAR=4;SRF=16;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.511061;STB=0.766362;TYPE=snp;VARB=0.0235443;OID=.;OPOS=50962782;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:26:27:16:16:10:11:4:6:16:0:4:7:16:0 chr22 50965990 . C G 173.95 PASS AO=51;DP=129;FAO=52;FDP=129;FR=.;FRO=77;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=22;FSRR=55;FWDB=0.02019;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.409;QD=5.39372;RBI=0.0328225;REFB=-0.0198573;REVB=-0.0258782;RO=73;SAF=25;SAR=26;SRF=22;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199515;STB=0.617614;TYPE=snp;VARB=0.0236885;OID=.;OPOS=50965990;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:129:129:73:77:51:52:26:25:22:51:27:25:22:55 chr22 50987843 . C T 223.69 PASS AO=50;DP=99;FAO=50;FDP=99;FR=.;FRO=49;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=16;FSRR=33;FWDB=0.0123818;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151;QD=9.03805;RBI=0.0291627;REFB=-0.0383656;REVB=0.0264037;RO=49;SAF=26;SAR=24;SRF=16;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172559;STB=0.595144;TYPE=snp;VARB=0.0323347;OID=.;OPOS=50987843;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:99:49:49:50:50:24:26:16:33:24:26:16:33 chr22 50989197 . C T 438.26 PASS AO=106;DP=216;FAO=105;FDP=215;FR=.;FRO=110;FSAF=33;FSAR=72;FSRF=34;FSRR=76;FWDB=0.0128555;FXX=0.00462942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.989;QD=8.15368;RBI=0.0340551;REFB=-0.0166267;REVB=-0.0315355;RO=109;SAF=34;SAR=72;SRF=33;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192005;STB=0.50309;TYPE=snp;VARB=0.0150331;OID=.;OPOS=50989197;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:216:215:109:110:106:105:72:34:33:76:72:33:34:76 chr22 51009953 . C T 60.74 PASS AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=0.0843914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.3587;QD=8.99786;RBI=0.0929245;REFB=-0.00194392;REVB=0.0388978;RO=14;SAF=10;SAR=3;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0211741;STB=0.512177;TYPE=snp;VARB=0.00506321;OID=.;OPOS=51009953;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:60:27:27:14:14:13:13:3:10:11:3:3:10:11:3 chr22 51043278 . G A 21.13 PASS AO=5;DP=15;FAO=5;FDP=15;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.00867925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.526;QD=5.63523;RBI=0.0089757;REFB=-0.0344147;REVB=0.00228776;RO=10;SAF=2;SAR=3;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0502189;OID=.;OPOS=51043278;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:15:15:10:10:5:5:3:2:4:6:3:2:4:6 chr22 51160066 . G A 15.33 PASS AO=4;DP=15;FAO=4;FDP=15;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=0;FSRF=11;FSRR=0;FWDB=0.0330017;FXX=0.062461;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.7697;QD=4.08765;RBI=0.0330017;REFB=-0.130208;REVB=0;RO=11;SAF=4;SAR=0;SRF=11;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0366328;OID=.;OPOS=51160066;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:15:15:11:11:4:4:0:4:11:0:0:4:11:0 chrX 200860 . T C 265.29 PASS AO=32;DP=117;FAO=59;FDP=107;FR=.,HEALED;FRO=47;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=38;FSRR=9;FWDB=-0.0605799;FXX=0.0932124;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.8076;QD=9.91734;RBI=0.080309;REFB=-0.161479;REVB=0.052722;RO=40;SAF=31;SAR=1;SRF=38;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129412;STB=0.608897;TYPE=snp;VARB=0.0751781;OID=.;OPOS=200860;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:107:40:47:32:59:1:31:38:2:25:34:38:9 chrX 207362 . C T 105.51 PASS AO=37;DP=106;FAO=37;FDP=107;FR=.;FRO=70;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=45;FWDB=0.0368459;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.515;QD=3.9442;RBI=0.0379426;REFB=-0.0154693;REVB=-0.00905661;RO=69;SAF=14;SAR=23;SRF=25;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0194073;STB=0.514865;TYPE=snp;VARB=0.0282857;OID=.;OPOS=207362;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:107:69:70:37:37:23:14:25:44:23:14:25:45 chrX 228879 . G C 42.71 PASS AO=58;DP=326;FAO=58;FDP=324;FR=.;FRO=266;FSAF=18;FSAR=40;FSRF=250;FSRR=16;FWDB=-0.00818026;FXX=0.00613478;HRUN=4;LEN=1;MLLD=156.865;QD=0.527314;RBI=0.0352089;REFB=-0.0101822;REVB=0.0342454;RO=266;SAF=18;SAR=40;SRF=250;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.737518;STB=0.913986;TYPE=snp;VARB=0.0341847;OID=.;OPOS=228879;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:326:324:266:266:58:58:40:18:250:16:40:18:250:16 chrX 228892 . C A 277.21 PASS AO=65;DP=130;FAO=64;FDP=128;FR=.;FRO=64;FSAF=50;FSAR=14;FSRF=63;FSRR=1;FWDB=-0.0212916;FXX=0.0153834;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.2388;QD=8.66281;RBI=0.0554922;REFB=-0.0699966;REVB=0.051245;RO=63;SAF=51;SAR=14;SRF=62;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.323863;STB=0.678347;TYPE=snp;VARB=0.0780316;OID=.;OPOS=228892;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:130:128:63:64:65:64:14:51:62:1:14:50:63:1 chrX 228934 . A G 41.57 PASS AO=45;DP=225;FAO=45;FDP=235;FR=.;FRO=190;FSAF=39;FSAR=6;FSRF=93;FSRR=97;FWDB=-0.0158365;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=78.1934;QD=0.707556;RBI=0.143398;REFB=-0.0143738;REVB=-0.142521;RO=179;SAF=39;SAR=6;SRF=86;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.533932;STB=0.835148;TYPE=snp;VARB=0.0667996;OID=.;OPOS=228934;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:225:235:179:190:45:45:6:39:86:93:6:39:93:97 chrX 228940 . A G 72.43 PASS AO=50;DP=228;FAO=54;FDP=233;FR=.;FRO=179;FSAF=44;FSAR=10;FSRF=92;FSRR=87;FWDB=-0.0516266;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.1408;QD=1.24337;RBI=0.0628346;REFB=-0.0184555;REVB=-0.0358173;RO=178;SAF=45;SAR=5;SRF=89;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.580212;STB=0.758247;TYPE=snp;VARB=0.0658196;OID=.;OPOS=228940;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:228:233:178:179:50:54:5:45:89:89:10:44:92:87 chrX 228976 . G C 44.93 PASS AO=50;DP=262;FAO=50;FDP=262;FR=.;FRO=212;FSAF=31;FSAR=19;FSRF=162;FSRR=50;FWDB=-0.0227171;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=164.849;QD=0.68595;RBI=0.0308081;REFB=-0.0118218;REVB=0.0208104;RO=209;SAF=31;SAR=19;SRF=160;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217285;STB=0.631542;TYPE=snp;VARB=0.047263;OID=.;OPOS=228976;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:44:262:262:209:212:50:50:19:31:160:49:19:31:162:50 chrX 295132 . T C 100.81 PASS AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0303848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.0628;QD=36.6572;RBI=0.0331335;REFB=0;REVB=0.0132134;RO=0;SAF=5;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00230853;OID=.;OPOS=295132;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:11:11:0:0:11:11:6:5:0:0:6:5:0:0 chrX 295231 . A G 61.4 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0653047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.393;QD=35.0874;RBI=0.0658286;REFB=0;REVB=-0.00828847;RO=0;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.27427e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00131142;OID=.;OPOS=295231;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:5:2:0:0:5:2:0:0 chrX 299360 . G A 220.87 PASS AO=12;DP=25;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00168525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.5;QD=36.811;RBI=0.018293;REFB=0;REVB=-0.0182152;RO=0;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00018549;OID=.;OPOS=299360;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:12:24:0:0:12:24:8:4:0:0:8:16:0:0 chrX 299362 . A G 187.31 PASS AO=24;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.144092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.967;QD=31.2189;RBI=0.150526;REFB=0.0372731;REVB=-0.0435377;RO=0;SAF=16;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.533304;TYPE=snp;VARB=0.0038379;OID=.;OPOS=299362;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:24:24:0:1:24:23:8:16:0:0:7:16:0:1 chrX 299591 . A G 818.1 PASS AO=85;DP=86;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00541932;FXX=0.0449388;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.219;QD=38.4988;RBI=0.020806;REFB=0;REVB=-0.0200878;RO=0;SAF=48;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000481608;OID=.;OPOS=299591;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:86:85:0:0:85:85:37:48:0:0:39:46:0:0 chrX 305984 . G A 292.01 PASS AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0132906;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.7599;QD=38.935;RBI=0.0192891;REFB=0;REVB=-0.0139795;RO=0;SAF=3;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.84607e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000446792;OID=.;OPOS=305984;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:30:30:0:0:30:30:27:3:0:0:27:3:0:0 chrX 306056 . G A 149.75 PASS AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0163494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.2813;QD=33.2773;RBI=0.0218081;REFB=-0.00737871;REVB=0.0144323;RO=0;SAF=5;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.545399;TYPE=snp;VARB=0.00667425;OID=.;OPOS=306056;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:18:18:0:1:17:17:12:5:0:0:12:5:1:0 chrX 322161 . A G 2061.46 PASS AO=215;DP=216;FAO=215;FDP=215;FR=.;FRO=0;FSAF=137;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00355098;FXX=0.00462942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.501;QD=38.3528;RBI=0.0186544;REFB=0;REVB=0.0183133;RO=0;SAF=137;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.96421e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.83342e-05;OID=.;OPOS=322161;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:97:216:215:0:0:215:215:78:137:0:0:78:137:0:0 chrX 322257 . G A 3679.21 PASS AO=433;DP=441;FAO=396;FDP=396;FR=.;FRO=0;FSAF=234;FSAR=162;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00221845;FXX=0.00999975;HRUN=4;LEN=1;MLLD=140.175;QD=37.1637;RBI=0.0436489;REFB=-0.0843677;REVB=0.0435925;RO=7;SAF=253;SAR=180;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000402056;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000165104;OID=.;OPOS=322257;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:441:396:7:0:433:396:180:253:4:3:162:234:0:0 chrX 591695 . C T 329.25 PASS AO=74;DP=149;FAO=74;FDP=145;FR=.;FRO=71;FSAF=42;FSAR=32;FSRF=43;FSRR=28;FWDB=0.0283066;FXX=0.0268438;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5301;QD=9.08274;RBI=0.040287;REFB=0.00978098;REVB=0.0286667;RO=68;SAF=42;SAR=32;SRF=43;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0581091;STB=0.519079;TYPE=snp;VARB=-0.0105514;OID=.;OPOS=591695;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:145:68:71:74:74:32:42:43:25:32:42:43:28 chrX 606325 . G A 3822.66 PASS AO=563;DP=564;FAO=397;FDP=397;FR=.;FRO=0;FSAF=137;FSAR=260;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0199941;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.628;QD=38.5155;RBI=0.0291944;REFB=0;REVB=0.0212732;RO=1;SAF=199;SAR=364;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00131023;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000391709;OID=.;OPOS=606325;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:564:397:1:0:563:397:364:199:0:1:260:137:0:0 chrX 612146 . AG A,AA 663.95 PASS AO=13,53;DP=72;FAO=20,52;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=4,18;FSAR=16,34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0158724,0.0147962;FXX=0.0136968;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=156.31,158.366;QD=36.8863;RBI=0.0165108,0.0153185;REFB=0,0;REVB=-0.00454664,-0.00396595;RO=0;SAF=2,18;SAR=11,35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.00896894,0.0122803;OID=.,.;OPOS=612147,612147;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:13,53:67:20,52:72:0:4,18:16,34:0:0:15:0:2,18:11,35:0:0 chrX 1331495 . G C 237.77 PASS AO=74;DP=190;FAO=75;FDP=191;FR=.;FRO=116;FSAF=14;FSAR=61;FSRF=34;FSRR=82;FWDB=5.91141e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3911;QD=4.97949;RBI=0.0188632;REFB=-0.000595889;REVB=0.0188631;RO=116;SAF=13;SAR=61;SRF=34;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186843;STB=0.593887;TYPE=snp;VARB=0.00137248;OID=.;OPOS=1331495;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:191:116:116:74:75:61:13:34:82:61:14:34:82 chrX 1422868 . G A 3760.97 PASS AO=719;DP=727;FAO=396;FDP=396;FR=.;FRO=0;FSAF=183;FSAR=213;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00351317;FXX=0.00999975;HRUN=3;LEN=1;MLLD=127.576;QD=37.9896;RBI=0.0173328;REFB=-0.0268799;REVB=0.016973;RO=8;SAF=324;SAR=395;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00691656;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.49589e-06;OID=.;OPOS=1422868;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:727:396:8:0:719:396:395:324:1:7:213:183:0:0 chrX 1460679 . G C 384.26 PASS AO=79;DP=145;FAO=80;FDP=145;FR=.;FRO=65;FSAF=46;FSAR=34;FSRF=29;FSRR=36;FWDB=-0.00882209;FXX=0.0136045;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.123;QD=10.6003;RBI=0.0314103;REFB=-0.0157668;REVB=-0.030146;RO=61;SAF=45;SAR=34;SRF=26;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114756;STB=0.558044;TYPE=snp;VARB=0.0142891;OID=.;OPOS=1460679;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:145:145:61:65:79:80:34:45:26:35:34:46:29:36 chrX 1460740 . A G 1300.68 PASS AO=141;DP=145;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00477985;FXX=0.0275843;HRUN=6;LEN=1;MLLD=220.136;QD=36.8987;RBI=0.0125898;REFB=-0.128227;REVB=0.0116472;RO=3;SAF=62;SAR=79;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0091086;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.8172e-05;OID=.;OPOS=1460740;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:145:141:3:0:141:141:79:62:2:1:79:62:0:0 chrX 1467404 . A C 777.93 PASS AO=161;DP=361;FAO=195;FDP=395;FR=.;FRO=200;FSAF=49;FSAR=146;FSRF=58;FSRR=142;FWDB=0.0552734;FXX=0.00503766;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.097;QD=7.87773;RBI=0.0557641;REFB=-0.00898673;REVB=-0.00738157;RO=194;SAF=20;SAR=141;SRF=58;SRR=136;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.293405;STB=0.525389;TYPE=snp;VARB=0.0088982;OID=.;OPOS=1467404;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:361:395:194:200:161:195:141:20:58:136:146:49:58:142 chrX 1508324 . G A 249.67 PASS AO=57;DP=120;FAO=61;FDP=125;FR=.;FRO=64;FSAF=18;FSAR=43;FSRF=24;FSRR=40;FWDB=0.000630125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.479;QD=7.98945;RBI=0.0680854;REFB=-0.0142188;REVB=0.0680825;RO=55;SAF=17;SAR=40;SRF=24;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13729;STB=0.547257;TYPE=snp;VARB=0.0202772;OID=.;OPOS=1508324;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:120:125:55:64:57:61:40:17:24:31:43:18:24:40 chrX 1537002 . C G 1531.5 PASS AO=165;DP=169;FAO=168;FDP=169;FR=.;FRO=1;FSAF=92;FSAR=76;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00720523;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.0626;QD=36.2485;RBI=0.0290226;REFB=-0.0821641;REVB=-0.028114;RO=2;SAF=92;SAR=73;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0128574;STB=0.502702;TYPE=snp;VARB=0.00302662;OID=.;OPOS=1537002;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:169:169:2:1:165:168:73:92:0:2:76:92:1:0 chrX 1546792 . G A 78.84 PASS AO=9;DP=11;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0101062;FXX=0.28551;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.272;QD=31.5351;RBI=0.0786462;REFB=-0.101578;REVB=0.0779941;RO=0;SAF=3;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.538378;TYPE=snp;VARB=0.00299706;OID=.;OPOS=1546792;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:11:10:0:1:9:9:6:3:0:0:6:3:0:1 chrX 1546876 . A G 508.49 PASS AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00547763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.25;QD=37.6659;RBI=0.0625001;REFB=0;REVB=-0.0622596;RO=0;SAF=30;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000221232;OID=.;OPOS=1546876;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:24:54:54:0:0:54:54:24:30:0:0:24:30:0:0 chrX 1551173 . G A 101.44 PASS AO=30;DP=79;FAO=30;FDP=78;FR=.;FRO=48;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=35;FWDB=-0.0194742;FXX=0.0249969;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9273;QD=5.2019;RBI=0.0577662;REFB=-0.000501569;REVB=0.0543847;RO=46;SAF=11;SAR=19;SRF=12;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12622;STB=0.565673;TYPE=snp;VARB=0.00243886;OID=.;OPOS=1551173;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:78:46:48:30:30:19:11:12:34:19:11:13:35 chrX 1557993 . G C 555.15 PASS AO=141;DP=301;FAO=141;FDP=301;FR=.;FRO=160;FSAF=73;FSAR=68;FSRF=76;FSRR=84;FWDB=-0.03278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.538;QD=7.37734;RBI=0.03278;REFB=-0.0252105;REVB=1.54884e-05;RO=159;SAF=73;SAR=68;SRF=75;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0442381;STB=0.522703;TYPE=snp;VARB=0.0266697;OID=.;OPOS=1557993;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:301:301:159:160:141:141:68:73:75:84:68:73:76:84 chrX 1713021 . C T 475.3 PASS AO=129;DP=306;FAO=135;FDP=315;FR=.;FRO=180;FSAF=51;FSAR=84;FSRF=83;FSRR=97;FWDB=-0.015748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.4845;QD=6.0355;RBI=0.0226883;REFB=-0.0202444;REVB=-0.0163327;RO=177;SAF=51;SAR=78;SRF=83;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0783471;STB=0.549414;TYPE=snp;VARB=0.0270662;OID=.;OPOS=1713021;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:306:315:177:180:129:135:78:51:83:94:84:51:83:97 chrX 1718360 . G A 205.64 PASS AO=22;DP=25;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118526;FXX=0.119952;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.661;QD=37.3882;RBI=0.030224;REFB=0;REVB=0.027803;RO=0;SAF=13;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2029e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.64483e-05;OID=.;OPOS=1718360;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:25:22:0:0:22:22:9:13:0:0:9:13:0:0 chrX 2139186 . C T 495.24 PASS AO=148;DP=367;FAO=150;FDP=367;FR=.;FRO=217;FSAF=90;FSAR=60;FSRF=113;FSRR=104;FWDB=0.0152141;FXX=0.0160854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.3113;QD=5.39769;RBI=0.0155309;REFB=0.0121033;REVB=0.00312121;RO=209;SAF=89;SAR=59;SRF=111;SRR=98;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0755243;STB=0.547878;TYPE=snp;VARB=-0.0141848;OID=.;OPOS=2139186;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:367:367:209:217:148:150:59:89:111:98:60:90:113:104 chrX 2139200 . T C 3277.99 PASS AO=341;DP=356;FAO=341;FDP=341;FR=.;FRO=0;FSAF=188;FSAR=153;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0225565;FXX=0.0421336;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.285;QD=38.4515;RBI=0.0225725;REFB=0;REVB=-0.000850411;RO=0;SAF=188;SAR=153;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.91387e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.95957e-06;OID=.;OPOS=2139200;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:356:341:0:0:341:341:153:188:0:0:153:188:0:0 chrX 2161129 . C G 372.37 PASS AO=94;DP=221;FAO=101;FDP=224;FR=.;FRO=123;FSAF=46;FSAR=55;FSRF=52;FSRR=71;FWDB=0.0371462;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.474;QD=6.64952;RBI=0.0401537;REFB=-0.029961;REVB=0.0152472;RO=126;SAF=40;SAR=54;SRF=55;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0115064;STB=0.518144;TYPE=snp;VARB=0.039042;OID=.;OPOS=2161129;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:224:126:123:94:101:54:40:55:71:55:46:52:71 chrX 2408437 . G A 688.82 PASS AO=74;DP=79;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=60;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0357012;FXX=0.0253133;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.727;QD=35.7826;RBI=0.101744;REFB=-0.0364796;REVB=0.0952742;RO=2;SAF=60;SAR=14;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0629042;STB=0.515147;TYPE=snp;VARB=0.000730972;OID=.;OPOS=2408437;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:79:77:2:1:74:76:14:60:0:2:16:60:0:1 chrX 2609983 . T C 259.75 PASS AO=29;DP=31;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00325815;FXX=0.0322477;HRUN=3;LEN=1;MLLD=66.5075;QD=34.6334;RBI=0.0314261;REFB=-0.104118;REVB=-0.0312568;RO=1;SAF=12;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.037234;STB=0.519986;TYPE=snp;VARB=0.00160207;OID=.;OPOS=2609983;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:31:30:1:1:29:29:17:12:1:0:17:12:1:0 chrX 2632482 . C T 703.82 PASS AO=276;DP=597;FAO=184;FDP=400;FR=.;FRO=216;FSAF=64;FSAR=120;FSRF=82;FSRR=134;FWDB=0.00330536;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.202;QD=7.03817;RBI=0.0142323;REFB=-0.0159886;REVB=0.0138432;RO=319;SAF=92;SAR=184;SRF=120;SRR=199;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0460841;STB=0.518709;TYPE=snp;VARB=0.0155588;OID=.;OPOS=2632482;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:597:400:319:216:276:184:184:92:120:199:120:64:82:134 chrX 2644386 . GA G 21.34 PASS AO=22;DP=88;FAO=24;FDP=83;FR=.;FRO=59;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=41;FWDB=-0.0362301;FXX=0.0235266;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.4929;QD=1.0283;RBI=0.0423515;REFB=-0.067375;REVB=0.0219323;RO=55;SAF=9;SAR=13;SRF=18;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103987;STB=0.611654;TYPE=del;VARB=0.105115;OID=.;OPOS=2644387;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:22:84:24:83:59:11:13:18:41:21:55:9:13:18:37 chrX 2645366 . G C 671.68 PASS AO=466;DP=1032;FAO=179;FDP=397;FR=.;FRO=218;FSAF=61;FSAR=118;FSRF=81;FSRR=137;FWDB=-0.0014708;FXX=0.00749981;HRUN=3;LEN=1;MLLD=118.104;QD=6.76751;RBI=0.00148524;REFB=-0.0130184;REVB=0.000206651;RO=561;SAF=167;SAR=299;SRF=231;SRR=330;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0564672;STB=0.518583;TYPE=snp;VARB=0.0177342;OID=.;OPOS=2645366;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:1032:397:561:218:466:179:299:167:231:330:118:61:81:137 chrX 2692756 . G A 343.72 PASS AO=73;DP=162;FAO=83;FDP=172;FR=.;FRO=89;FSAF=57;FSAR=26;FSRF=48;FSRR=41;FWDB=0.0150905;FXX=0.0114936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.169;QD=7.99355;RBI=0.0192857;REFB=-0.00912009;REVB=0.0120089;RO=87;SAF=52;SAR=21;SRF=47;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186465;STB=0.583122;TYPE=snp;VARB=0.00933395;OID=.;OPOS=2692756;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:172:87:89:73:83:21:52:47:40:26:57:48:41 chrX 2700157 . G A 542.8 PASS AO=136;DP=286;FAO=136;FDP=285;FR=.;FRO=149;FSAF=43;FSAR=93;FSRF=59;FSRR=90;FWDB=0.00277562;FXX=0.00349638;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.0887;QD=7.6183;RBI=0.0402943;REFB=0.00411855;REVB=-0.0401986;RO=149;SAF=43;SAR=93;SRF=59;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0843969;STB=0.546579;TYPE=snp;VARB=-0.00445714;OID=.;OPOS=2700157;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:286:285:149:149:136:136:93:43:59:90:93:43:59:90 chrX 2715425 . A G 626.88 PASS AO=64;DP=65;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0614534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.572;QD=36.8752;RBI=0.0870282;REFB=-0.102151;REVB=0.061623;RO=1;SAF=41;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200902;STB=0.509801;TYPE=snp;VARB=0.00558628;OID=.;OPOS=2715425;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:65:68:1:1:64:67:23:41:0:1:25:42:0:1 chrX 2724760 . T C 2378.48 PASS AO=131;DP=250;FAO=245;FDP=246;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=118;FSAR=127;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0693298;FXX=0.0159994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.92;QD=38.6745;RBI=0.122445;REFB=0;REVB=0.100927;RO=0;SAF=52;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00102328;OID=.;OPOS=2724760;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:247:246:0:0:131:245:79:52:0:0:127:118:0:0 chrX 2732450 . GA G 21.35 PASS AO=51;DP=208;FAO=48;FDP=194;FR=.;FRO=146;FSAF=3;FSAR=45;FSRF=64;FSRR=82;FWDB=-0.0399942;FXX=0.020201;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.0432;QD=0.440213;RBI=0.0883112;REFB=-0.0614111;REVB=-0.0787359;RO=126;SAF=3;SAR=48;SRF=57;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.642846;STB=0.887609;TYPE=del;VARB=0.0275843;OID=.;OPOS=2732451;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:51:197:48:194:146:3:45:64:82:21:126:3:48:57:69 chrX 2748253 . G C 581.42 PASS AO=59;DP=60;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.031419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.895;QD=36.3387;RBI=0.0574696;REFB=-0.081666;REVB=0.0481207;RO=0;SAF=30;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507244;TYPE=snp;VARB=0.000616376;OID=.;OPOS=2748253;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:60:64:0:1:59:63:29:30:0:0:29:34:1:0 chrX 2777985 . C T 3789.38 PASS AO=387;DP=391;FAO=396;FDP=396;FR=.;FRO=0;FSAF=149;FSAR=247;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0284733;FXX=0.00999975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.921;QD=38.2766;RBI=0.0284761;REFB=-0.020548;REVB=0.000400607;RO=1;SAF=166;SAR=221;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00286627;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.31013e-05;OID=.;OPOS=2777985;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:391:396:1:0:387:396:221:166:1:0:247:149:0:0 chrX 2779570 . A G 2376.53 PASS AO=250;DP=251;FAO=250;FDP=250;FR=.;FRO=0;FSAF=102;FSAR=148;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127845;FXX=0.00398391;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.389;QD=38.0244;RBI=0.0662455;REFB=-0.0607967;REVB=-0.0650001;RO=1;SAF=102;SAR=148;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00465035;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00012189;OID=.;OPOS=2779570;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:251:250:1:0:250:250:148:102:1:0:148:102:0:0 chrX 2832742 . G C 2452.59 PASS AO=257;DP=258;FAO=257;FDP=257;FR=.;FRO=0;FSAF=131;FSAR=126;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0044686;FXX=0.00387582;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8345;QD=38.1726;RBI=0.0119165;REFB=-0.0517994;REVB=0.0110469;RO=1;SAF=131;SAR=126;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0037685;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000160152;OID=.;OPOS=2832742;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:258:257:1:0:257:257:126:131:0:1:126:131:0:0 chrX 2836037 . G C 127.41 PASS AO=42;DP=113;FAO=42;FDP=113;FR=.;FRO=71;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=28;FSRR=43;FWDB=-0.0264343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.897;QD=4.50998;RBI=0.030325;REFB=-0.00586917;REVB=-0.0148606;RO=71;SAF=18;SAR=24;SRF=28;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0387163;STB=0.522067;TYPE=snp;VARB=0.0140521;OID=.;OPOS=2836037;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:113:113:71:71:42:42:24:18:28:43:24:18:28:43 chrX 2942109 . T C 417.92 PASS AO=102;DP=213;FAO=103;FDP=215;FR=.;FRO=112;FSAF=55;FSAR=48;FSRF=42;FSRR=70;FWDB=-0.0437904;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.0118;QD=7.77521;RBI=0.0441785;REFB=0.0187751;REVB=0.00584293;RO=111;SAF=55;SAR=47;SRF=42;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151139;STB=0.582256;TYPE=snp;VARB=-0.0177947;OID=.;OPOS=2942109;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:213:215:111:112:102:103:47:55:42:69:48:55:42:70 chrX 3002687 . A G 20.85 PASS AO=8;DP=32;FAO=8;FDP=32;FR=.;FRO=24;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=0.0137058;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.1004;QD=2.60632;RBI=0.0368361;REFB=0.0154856;REVB=0.0341914;RO=24;SAF=3;SAR=5;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.05323;STB=0.533815;TYPE=snp;VARB=-0.0422905;OID=.;OPOS=3002687;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:32:32:24:24:8:8:5:3:8:16:5:3:8:16 chrX 3226691 . G T 359.41 PASS AO=115;DP=299;FAO=116;FDP=300;FR=.;FRO=184;FSAF=54;FSAR=62;FSRF=62;FSRR=122;FWDB=0.0359598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.754;QD=4.79214;RBI=0.0375308;REFB=-0.00905335;REVB=-0.0107449;RO=184;SAF=53;SAR=62;SRF=62;SRR=122;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13857;STB=0.580089;TYPE=snp;VARB=0.0149257;OID=.;OPOS=3226691;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:299:300:184:184:115:116:62:53:62:122:62:54:62:122 chrX 3227552 . T C 780.37 PASS AO=282;DP=577;FAO=192;FDP=396;FR=.;FRO=204;FSAF=92;FSAR=100;FSRF=71;FSRR=133;FWDB=-0.00836352;FXX=0.00999975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.136;QD=7.88251;RBI=0.00947486;REFB=-0.00698949;REVB=-0.00445248;RO=287;SAF=130;SAR=152;SRF=93;SRR=194;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128713;STB=0.568045;TYPE=snp;VARB=0.00677433;OID=.;OPOS=3227552;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:577:396:287:204:282:192:152:130:93:194:100:92:71:133 chrX 3228096 . C T 262.84 PASS AO=50;DP=84;FAO=50;FDP=84;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=40;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=0.0179637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.646;QD=12.516;RBI=0.0184397;REFB=-0.0146705;REVB=0.00416258;RO=34;SAF=10;SAR=40;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.209467;STB=0.615334;TYPE=snp;VARB=0.0100882;OID=.;OPOS=3228096;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:34:34:50:50:40:10:14:20:40:10:14:20 chrX 3228144 . C G 207.73 PASS AO=43;DP=80;FAO=43;FDP=80;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=28;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.0168429;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.647;QD=10.3864;RBI=0.0320438;REFB=-0.018702;REVB=-0.0272602;RO=37;SAF=15;SAR=28;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0985074;STB=0.55443;TYPE=snp;VARB=0.00903909;OID=.;OPOS=3228144;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:80:80:37:37:43:43:28:15:17:20:28:15:17:20 chrX 3228411 . G A 19.14 PASS AO=8;DP=34;FAO=8;FDP=34;FR=.;FRO=26;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.00617482;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.791;QD=2.25234;RBI=0.00619567;REFB=-0.019015;REVB=0.000507796;RO=26;SAF=2;SAR=6;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136355;STB=0.589049;TYPE=snp;VARB=0.0221599;OID=.;OPOS=3228411;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:34:34:26:26:8:8:6:2:9:17:6:2:9:17 chrX 3228420 . C T 29.53 PASS AO=10;DP=34;FAO=10;FDP=34;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=0.0324115;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.673;QD=3.47455;RBI=0.0324391;REFB=0.00242385;REVB=0.00133734;RO=24;SAF=4;SAR=6;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0815562;STB=0.549903;TYPE=snp;VARB=-0.00319316;OID=.;OPOS=3228420;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:34:34:24:24:10:10:6:4:8:16:6:4:8:16 chrX 3228675 . C T 587.38 PASS AO=142;DP=287;FAO=143;FDP=292;FR=.;FRO=149;FSAF=75;FSAR=68;FSRF=79;FSRR=70;FWDB=0.00645441;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.2454;QD=8.04628;RBI=0.0320923;REFB=-0.00480852;REVB=0.0314365;RO=145;SAF=74;SAR=68;SRF=75;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00358247;STB=0.502929;TYPE=snp;VARB=0.0072382;OID=.;OPOS=3228675;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:287:292:145:149:142:143:68:74:75:70:68:75:79:70 chrX 3228711 . G A 710.74 PASS AO=161;DP=311;FAO=162;FDP=314;FR=.;FRO=152;FSAF=82;FSAR=80;FSRF=74;FSRR=78;FWDB=0.00894994;FXX=0.00632891;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.9548;QD=9.05403;RBI=0.0272139;REFB=-0.0247136;REVB=0.0257001;RO=148;SAF=81;SAR=80;SRF=71;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.020498;STB=0.509356;TYPE=snp;VARB=0.0234526;OID=.;OPOS=3228711;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:311:314:148:152:161:162:80:81:71:77:80:82:74:78 chrX 3235724 . C T 692.21 PASS AO=166;DP=337;FAO=166;FDP=336;FR=.;FRO=170;FSAF=101;FSAR=65;FSRF=107;FSRR=63;FWDB=-0.000606194;FXX=0.00296727;HRUN=3;LEN=1;MLLD=258.418;QD=8.24064;RBI=0.00279505;REFB=0.000966477;REVB=-0.00272852;RO=170;SAF=101;SAR=65;SRF=107;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0204148;STB=0.51119;TYPE=snp;VARB=-0.000944306;OID=.;OPOS=3235724;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:337:336:170:170:166:166:65:101:107:63:65:101:107:63 chrX 3236028 . C T 780.4 PASS AO=195;DP=410;FAO=193;FDP=400;FR=.;FRO=207;FSAF=68;FSAR=125;FSRF=97;FSRR=110;FWDB=0.070009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.9829;QD=7.80402;RBI=0.077104;REFB=-0.0215289;REVB=0.0323074;RO=212;SAF=70;SAR=125;SRF=102;SRR=110;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120848;STB=0.563441;TYPE=snp;VARB=0.0217424;OID=.;OPOS=3236028;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:410:400:212:207:195:193:125:70:102:110:125:68:97:110 chrX 3239336 . G A 1033.29 PASS AO=213;DP=387;FAO=218;FDP=392;FR=.;FRO=174;FSAF=78;FSAR=140;FSRF=71;FSRR=103;FWDB=0.0443428;FXX=0.00254446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.384;QD=10.5438;RBI=0.0465236;REFB=0.00290382;REVB=0.0140771;RO=174;SAF=74;SAR=139;SRF=71;SRR=103;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0542725;STB=0.523934;TYPE=snp;VARB=-0.00119187;OID=.;OPOS=3239336;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:387:392:174:174:213:218:139:74:71:103:140:78:71:103 chrX 3239545 . C T 358.6 PASS AO=86;DP=180;FAO=87;FDP=181;FR=.;FRO=94;FSAF=27;FSAR=60;FSRF=37;FSRR=57;FWDB=0.0844411;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.8209;QD=7.92491;RBI=0.0855134;REFB=-0.00130449;REVB=-0.0134997;RO=94;SAF=26;SAR=60;SRF=37;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0976307;STB=0.548638;TYPE=snp;VARB=0.00145237;OID=.;OPOS=3239545;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:181:94:94:86:87:60:26:37:57:60:27:37:57 chrX 3239979 . G A 266.99 PASS AO=58;DP=111;FAO=58;FDP=111;FR=.;FRO=53;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=30;FSRR=23;FWDB=-0.00253172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.231;QD=9.62124;RBI=0.0100618;REFB=-0.0215233;REVB=-0.0097381;RO=53;SAF=27;SAR=31;SRF=30;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0870444;STB=0.54789;TYPE=snp;VARB=0.0220543;OID=.;OPOS=3239979;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:111:53:53:58:58:31:27:30:23:31:27:30:23 chrX 3241256 . T C 496.15 PASS AO=115;DP=231;FAO=116;FDP=231;FR=.;FRO=115;FSAF=79;FSAR=37;FSRF=61;FSRR=54;FWDB=0.0132753;FXX=0.00431016;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.7821;QD=8.59135;RBI=0.0200556;REFB=-0.0148621;REVB=0.0150331;RO=115;SAF=79;SAR=36;SRF=61;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154647;STB=0.581197;TYPE=snp;VARB=0.0384194;OID=.;OPOS=3241256;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:231:231:115:115:115:116:36:79:61:54:37:79:61:54 chrX 3241317 . T C 478.56 PASS AO=125;DP=298;FAO=128;FDP=287;FR=.;FRO=159;FSAF=64;FSAR=64;FSRF=90;FSRR=69;FWDB=-0.00698067;FXX=0.0620895;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.029;QD=6.6699;RBI=0.041273;REFB=0.00622758;REVB=0.0406783;RO=143;SAF=64;SAR=61;SRF=82;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0595368;STB=0.53658;TYPE=snp;VARB=-0.00661153;OID=.;OPOS=3241317;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:298:287:143:159:125:128:61:64:82:61:64:64:90:69 chrX 3592725 . G A 2600.01 PASS AO=293;DP=307;FAO=293;FDP=307;FR=.;FRO=14;FSAF=169;FSAR=124;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0113265;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=216.781;QD=33.8764;RBI=0.0635475;REFB=-0.104371;REVB=0.06253;RO=13;SAF=169;SAR=124;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00317417;STB=0.503582;TYPE=snp;VARB=0.000504478;OID=.;OPOS=3592725;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:42:307:307:13:14:293:293:124:169:7:6:124:169:7:7 chrX 3736489 . C T 818.79 PASS AO=86;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0664542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.868;QD=36.3907;RBI=0.0670482;REFB=-0.0783553;REVB=-0.00890515;RO=3;SAF=45;SAR=41;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0305383;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00201007;OID=.;OPOS=3736489;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:90:90:3:0:86:90:41:45:3:0:42:48:0:0 chrX 3747372 . C T 395.92 PASS AO=108;DP=245;FAO=108;FDP=245;FR=.;FRO=137;FSAF=60;FSAR=48;FSRF=51;FSRR=86;FWDB=0.00706696;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.047;QD=6.46393;RBI=0.00851147;REFB=0.00368589;REVB=0.00474376;RO=137;SAF=60;SAR=48;SRF=51;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182999;STB=0.601418;TYPE=snp;VARB=-0.00367224;OID=.;OPOS=3747372;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:245:245:137:137:108:108:48:60:51:86:48:60:51:86 chrX 5810090 . A G 446.96 PASS AO=93;DP=173;FAO=94;FDP=173;FR=.;FRO=79;FSAF=37;FSAR=57;FSRF=27;FSRR=52;FWDB=0.0184774;FXX=0.0388867;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.9911;QD=10.3343;RBI=0.0208145;REFB=-0.0794002;REVB=0.00958279;RO=79;SAF=36;SAR=57;SRF=28;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0291612;STB=0.525057;TYPE=snp;VARB=0.0452251;OID=.;OPOS=5810090;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:173:173:79:79:93:94:57:36:28:51:57:37:27:52 chrX 6451864 . C T 56.31 PASS AO=7;DP=8;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0293038;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.6225;QD=28.1527;RBI=0.0335043;REFB=-0.0420017;REVB=-0.0162427;RO=1;SAF=1;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.2842;STB=0.666107;TYPE=snp;VARB=0.00296813;OID=.;OPOS=6451864;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:8:8:1:1:7:7:6:1:1:0:6:1:1:0 chrX 7811974 . A G 16.26 PASS AO=4;DP=14;FAO=4;FDP=14;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=0;FSRF=10;FSRR=0;FWDB=-0.0463656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.0168;QD=4.64577;RBI=0.0463656;REFB=-0.0171847;REVB=0;RO=10;SAF=4;SAR=0;SRF=10;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0420482;OID=.;OPOS=7811974;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:14:14:10:10:4:4:0:4:10:0:0:4:10:0 chrX 7812017 . C T 91.42 PASS AO=12;DP=14;FAO=12;FDP=14;FR=.;FRO=2;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00694425;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.535;QD=26.1189;RBI=0.058947;REFB=-0.129421;REVB=0.0585365;RO=1;SAF=8;SAR=4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0531285;STB=0.555467;TYPE=snp;VARB=0.00752141;OID=.;OPOS=7812017;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:14:14:1:2:12:12:4:8:1:0:4:8:2:0 chrX 7812052 . G A 153.58 PASS AO=17;DP=19;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0555453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.7368;QD=32.3317;RBI=0.0563804;REFB=0.0575716;REVB=-0.00966807;RO=2;SAF=5;SAR=12;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151605;STB=0.538418;TYPE=snp;VARB=-0.000792316;OID=.;OPOS=7812052;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:19:19:2:1:17:18:12:5:2:0:12:6:1:0 chrX 8138080 . G C 459.76 PASS AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0156992;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.269;QD=36.7804;RBI=0.0311796;REFB=-0.000849275;REVB=-0.0269389;RO=1;SAF=37;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125523;STB=0.506664;TYPE=snp;VARB=-0.000402127;OID=.;OPOS=8138080;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:50:50:1:1:49:49:12:37:1:0:12:37:1:0 chrX 8138160 . T C 364.26 PASS AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0450225;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3997;QD=34.6913;RBI=0.0531446;REFB=-0.150063;REVB=-0.028237;RO=1;SAF=32;SAR=9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0492942;STB=0.526303;TYPE=snp;VARB=0.00547563;OID=.;OPOS=8138160;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:42:42:1:1:41:41:9:32:0:1:9:32:0:1 chrX 8138165 . C G 315.32 PASS AO=33;DP=35;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0354752;FXX=0.0526177;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.4259;QD=35.0356;RBI=0.040943;REFB=-0.0479148;REVB=0.0204411;RO=0;SAF=25;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.529394;TYPE=snp;VARB=0.00245077;OID=.;OPOS=8138165;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:35:36:0:1:33:35:8:25:0:0:8:27:0:1 chrX 8138171 . T C 235.72 PASS AO=34;DP=35;FAO=33;FDP=35;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.148259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.525;QD=26.9398;RBI=0.167288;REFB=-0.0326188;REVB=0.077488;RO=1;SAF=26;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0548779;STB=0.56246;TYPE=snp;VARB=0.0249138;OID=.;OPOS=8138171;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:35:35:1:2:34:33:8:26:0:1:7:26:0:2 chrX 8138182 . A G 285.71 PASS AO=16;DP=35;FAO=32;FDP=33;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=24;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0637493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.828;QD=34.6316;RBI=0.0775381;REFB=-0.0319422;REVB=-0.0441383;RO=1;SAF=11;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0828326;STB=0.529393;TYPE=snp;VARB=0.00264941;OID=.;OPOS=8138182;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:30:33:1:1:16:32:5:11:0:1:8:24:0:1 chrX 8497510 . C T 550.31 PASS AO=383;DP=955;FAO=163;FDP=393;FR=.;FRO=230;FSAF=65;FSAR=98;FSRF=83;FSRR=147;FWDB=-0.00730861;FXX=0.0174996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.289;QD=5.60109;RBI=0.0110034;REFB=-0.0189828;REVB=-0.00822556;RO=555;SAF=147;SAR=236;SRF=213;SRR=342;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17047e-05;STB=0.523347;TYPE=snp;VARB=0.0262088;OID=.;OPOS=8497510;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:955:393:555:230:383:163:236:147:213:342:98:65:83:147 chrX 8503641 . G A 260.43 PASS AO=67;DP=147;FAO=67;FDP=147;FR=.;FRO=80;FSAF=66;FSAR=1;FSRF=76;FSRR=4;FWDB=0.0246773;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6451;QD=7.08663;RBI=0.0259674;REFB=0.0193519;REVB=0.00808305;RO=80;SAF=66;SAR=1;SRF=76;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.345314;STB=0.699071;TYPE=snp;VARB=-0.0230059;OID=.;OPOS=8503641;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:147:80:80:67:67:1:66:76:4:1:66:76:4 chrX 8504833 . C T 678.35 PASS AO=164;DP=334;FAO=164;FDP=334;FR=.;FRO=170;FSAF=90;FSAR=74;FSRF=78;FSRR=92;FWDB=-0.0202135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2284;QD=8.1239;RBI=0.077883;REFB=-0.0124402;REVB=-0.0752142;RO=169;SAF=90;SAR=74;SRF=77;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0861958;STB=0.545808;TYPE=snp;VARB=0.0132173;OID=.;OPOS=8504833;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:334:334:169:170:164:164:74:90:77:92:74:90:78:92 chrX 8763290 . T C 13.43 PASS AO=3;DP=11;FAO=3;FDP=11;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=0.00832232;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.9825;QD=4.88263;RBI=0.00832232;REFB=0.0379192;REVB=0;RO=8;SAF=3;SAR=0;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0805315;OID=.;OPOS=8763290;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:11:11:8:8:3:3:0:3:8:0:0:3:8:0 chrX 9369866 . C G 108.65 PASS AO=21;DP=43;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=0.00618366;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.849;QD=9.87693;RBI=0.0303197;REFB=-0.000316151;REVB=0.0296824;RO=22;SAF=16;SAR=5;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0937805;STB=0.516115;TYPE=snp;VARB=0.000508723;OID=.;OPOS=9369866;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:92:43:44:22:21:21:23:5:16:15:7:7:16:14:7 chrX 9687676 . G A 21.63 PASS AO=21;DP=137;FAO=22;FDP=128;FR=.,HEALED;FRO=106;FSAF=1;FSAR=21;FSRF=49;FSRR=57;FWDB=-0.00292047;FXX=0.022899;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.546;QD=0.676088;RBI=0.0468665;REFB=0.000121834;REVB=-0.0467755;RO=41;SAF=1;SAR=20;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.650035;STB=0.930386;TYPE=snp;VARB=0.00153089;OID=.;OPOS=9687676;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:126:128:41:106:21:22:20:1:18:23:21:1:49:57 chrX 9859098 . A G 2136.83 PASS AO=220;DP=225;FAO=222;FDP=222;FR=.;FRO=0;FSAF=113;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00697835;FXX=0.0347811;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.767;QD=38.5015;RBI=0.0129991;REFB=0;REVB=-0.0109672;RO=0;SAF=112;SAR=108;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.50294e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000162758;OID=.;OPOS=9859098;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:225:222:0:0:220:222:108:112:0:0:109:113:0:0 chrX 10202343 . C T 213.8 PASS AO=51;DP=103;FAO=51;FDP=103;FR=.;FRO=52;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=0.0073391;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.18;QD=8.30274;RBI=0.0221466;REFB=-0.0154227;REVB=-0.0208952;RO=51;SAF=27;SAR=24;SRF=25;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0354689;STB=0.524562;TYPE=snp;VARB=0.019702;OID=.;OPOS=10202343;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:103:103:51:52:51:51:24:27:25:26:24:27:25:27 chrX 10204812 . A G 1345.8 PASS AO=141;DP=141;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00346942;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3306;QD=38.1786;RBI=0.0381535;REFB=0;REVB=-0.0379954;RO=0;SAF=62;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000195806;OID=.;OPOS=10204812;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:141:141:0:0:141:141:79:62:0:0:79:62:0:0 chrX 12924826 . A G 576.57 PASS AO=135;DP=270;FAO=135;FDP=270;FR=.;FRO=135;FSAF=106;FSAR=29;FSRF=80;FSRR=55;FWDB=0.0150564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.052;QD=8.54182;RBI=0.0262786;REFB=0.0042759;REVB=0.0215377;RO=131;SAF=106;SAR=29;SRF=80;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201455;STB=0.622725;TYPE=snp;VARB=-0.00366084;OID=.;OPOS=12924826;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:270:270:131:135:135:135:29:106:80:51:29:106:80:55 chrX 12937513 . C T 277.7 PASS AO=62;DP=125;FAO=62;FDP=121;FR=.;FRO=59;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=40;FSRR=19;FWDB=0.0068362;FXX=0.0396794;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.317;QD=9.18009;RBI=0.0317282;REFB=0.00991701;REVB=-0.030983;RO=56;SAF=34;SAR=28;SRF=40;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147355;STB=0.564557;TYPE=snp;VARB=-0.00772813;OID=.;OPOS=12937513;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:121:56:59:62:62:28:34:40:16:28:34:40:19 chrX 12937804 . C T 827.57 PASS AO=272;DP=524;FAO=198;FDP=400;FR=.;FRO=202;FSAF=96;FSAR=102;FSRF=101;FSRR=101;FWDB=-0.0243165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.0287;QD=8.27567;RBI=0.0254169;REFB=-0.00134668;REVB=0.00739784;RO=243;SAF=130;SAR=142;SRF=132;SRR=111;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0565162;STB=0.507654;TYPE=snp;VARB=0.00189165;OID=.;OPOS=12937804;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:524:400:243:202:272:198:142:130:132:111:102:96:101:101 chrX 12939112 . G C 700.07 PASS AO=227;DP=484;FAO=183;FDP=398;FR=.;FRO=215;FSAF=101;FSAR=82;FSRF=122;FSRR=93;FWDB=0.0321311;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5074;QD=7.03591;RBI=0.0321546;REFB=-0.0110431;REVB=-0.00122914;RO=254;SAF=126;SAR=101;SRF=141;SRR=113;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.05755e-05;STB=0.508494;TYPE=snp;VARB=0.0136447;OID=.;OPOS=12939112;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:484:398:254:215:227:183:101:126:141:113:82:101:122:93 chrX 12939412 . C A 449.3 PASS AO=108;DP=234;FAO=113;FDP=239;FR=.;FRO=126;FSAF=69;FSAR=44;FSRF=66;FSRR=60;FWDB=-0.00642309;FXX=0.00416649;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.858;QD=7.51965;RBI=0.0161881;REFB=0.00312669;REVB=-0.0148593;RO=122;SAF=65;SAR=43;SRF=65;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0680908;STB=0.54711;TYPE=snp;VARB=-0.00311476;OID=.;OPOS=12939412;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:234:239:122:126:108:113:43:65:65:57:44:69:66:60 chrX 12939928 . T C 849.63 PASS AO=53;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00520919;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.998;QD=38.6195;RBI=0.0252532;REFB=0;REVB=0.0247101;RO=0;SAF=29;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.3101e-05;OID=.;OPOS=12939928;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:58:88:0:0:53:88:24:29:0:0:54:34:0:0 chrX 13337059 . C T 2768.39 PASS AO=295;DP=299;FAO=295;FDP=295;FR=.;FRO=0;FSAF=145;FSAR=150;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170745;FXX=0.0133775;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.309;QD=37.5375;RBI=0.0238252;REFB=0.0879702;REVB=-0.0166162;RO=4;SAF=145;SAR=150;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125453;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.94593e-07;OID=.;OPOS=13337059;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:299:295:4:0:295:295:150:145:0:4:150:145:0:0 chrX 13337115 . C T 805.22 PASS AO=174;DP=320;FAO=173;FDP=319;FR=.;FRO=146;FSAF=79;FSAR=94;FSRF=74;FSRR=72;FWDB=0.00285485;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.754;QD=10.0967;RBI=0.00408018;REFB=-0.01625;REVB=0.00291508;RO=146;SAF=79;SAR=95;SRF=74;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0444635;STB=0.523055;TYPE=snp;VARB=0.0143344;OID=.;OPOS=13337115;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:320:319:146:146:174:173:95:79:74:72:94:79:74:72 chrX 13758375 . G A 240.6 PASS AO=70;DP=175;FAO=71;FDP=174;FR=.;FRO=103;FSAF=18;FSAR=53;FSRF=28;FSRR=75;FWDB=-0.0290474;FXX=0.00571396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.413;QD=5.53093;RBI=0.0292632;REFB=-0.00994188;REVB=0.00354719;RO=102;SAF=17;SAR=53;SRF=27;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0307476;STB=0.514125;TYPE=snp;VARB=0.0107468;OID=.;OPOS=13758375;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:175:174:102:103:70:71:53:17:27:75:53:18:28:75 chrX 13771576 . A G 242.96 PASS AO=126;DP=381;FAO=123;FDP=393;FR=.;FRO=270;FSAF=105;FSAR=18;FSRF=106;FSRR=164;FWDB=-0.0731345;FXX=0.0174996;HRUN=4;LEN=1;MLLD=26.8799;QD=2.4729;RBI=0.0779037;REFB=-0.0677539;REVB=-0.0268392;RO=249;SAF=105;SAR=21;SRF=84;SRR=165;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.579574;STB=0.834149;TYPE=snp;VARB=0.0843542;OID=.;OPOS=13771576;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:381:393:249:270:126:123:21:105:84:165:18:105:106:164 chrX 14627144 . T C 279.9 PASS AO=69;DP=153;FAO=71;FDP=153;FR=.;FRO=82;FSAF=35;FSAR=36;FSRF=37;FSRR=45;FWDB=-0.0104075;FXX=0.00649309;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.24;QD=7.3176;RBI=0.0205244;REFB=-0.0123965;REVB=0.01769;RO=83;SAF=35;SAR=34;SRF=37;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0603408;STB=0.522382;TYPE=snp;VARB=0.014181;OID=.;OPOS=14627144;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:153:83:82:69:71:34:35:37:46:36:35:37:45 chrX 15301624 . G C 503.66 PASS AO=124;DP=261;FAO=125;FDP=262;FR=.;FRO=137;FSAF=78;FSAR=47;FSRF=97;FSRR=40;FWDB=0.0164475;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.9021;QD=7.68948;RBI=0.016496;REFB=-0.0259737;REVB=0.00126311;RO=137;SAF=78;SAR=46;SRF=97;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0827331;STB=0.547924;TYPE=snp;VARB=0.0271066;OID=.;OPOS=15301624;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:261:262:137:137:124:125:46:78:97:40:47:78:97:40 chrX 15332558 . A G 849.32 PASS AO=193;DP=374;FAO=194;FDP=374;FR=.;FRO=180;FSAF=106;FSAR=88;FSRF=66;FSRR=114;FWDB=-0.0191941;FXX=0.0026666;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.7805;QD=9.08366;RBI=0.0306899;REFB=-0.0198588;REVB=0.023947;RO=179;SAF=105;SAR=88;SRF=65;SRR=114;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158454;STB=0.585851;TYPE=snp;VARB=0.0197551;OID=.;OPOS=15332558;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:374:374:179:180:193:194:88:105:65:114:88:106:66:114 chrX 15349998 . G A 484.64 PASS AO=95;DP=159;FAO=94;FDP=160;FR=.;FRO=66;FSAF=46;FSAR=48;FSRF=40;FSRR=26;FWDB=0.0206236;FXX=0.00621079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.1684;QD=12.1159;RBI=0.0220042;REFB=-0.0109206;REVB=-0.00767169;RO=64;SAF=47;SAR=48;SRF=39;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0850596;STB=0.548051;TYPE=snp;VARB=0.00599012;OID=.;OPOS=15349998;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:160:64:66:95:94:48:47:39:25:48:46:40:26 chrX 15415583 . C T 749.27 PASS AO=266;DP=551;FAO=189;FDP=399;FR=.;FRO=210;FSAF=101;FSAR=88;FSRF=94;FSRR=116;FWDB=-0.0647632;FXX=0.00249994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2514;QD=7.51149;RBI=0.0773756;REFB=0.0232771;REVB=0.0423404;RO=283;SAF=136;SAR=130;SRF=125;SRR=158;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0653467;STB=0.545594;TYPE=snp;VARB=-0.0265283;OID=.;OPOS=15415583;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:551:399:283:210:266:189:130:136:125:158:88:101:94:116 chrX 15838366 . C T 672.85 PASS AO=196;DP=433;FAO=180;FDP=399;FR=.;FRO=219;FSAF=92;FSAR=88;FSRF=96;FSRR=123;FWDB=-0.0169176;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.875;QD=6.74532;RBI=0.0173123;REFB=0.00584109;REVB=0.00367555;RO=236;SAF=99;SAR=97;SRF=104;SRR=132;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0637226;STB=0.539878;TYPE=snp;VARB=-0.00754754;OID=.;OPOS=15838366;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:433:399:236:219:196:180:97:99:104:132:88:92:96:123 chrX 16168467 . T C 373.71 PASS AO=98;DP=216;FAO=98;FDP=216;FR=.;FRO=118;FSAF=43;FSAR=55;FSRF=56;FSRR=62;FWDB=0.00409626;FXX=0.00460808;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.312;QD=6.92054;RBI=0.00921544;REFB=-0.0138304;REVB=-0.00825499;RO=117;SAF=43;SAR=55;SRF=57;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0479352;STB=0.519755;TYPE=snp;VARB=0.0168413;OID=.;OPOS=16168467;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:216:216:117:118:98:98:55:43:57:60:55:43:56:62 chrX 16168677 . T C 616.02 PASS AO=137;DP=259;FAO=137;FDP=261;FR=.;FRO=124;FSAF=57;FSAR=80;FSRF=68;FSRR=56;FWDB=-0.0119959;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.4331;QD=9.44092;RBI=0.0120403;REFB=0.00604218;REVB=-0.00103285;RO=121;SAF=57;SAR=80;SRF=68;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126002;STB=0.563307;TYPE=snp;VARB=-0.00591569;OID=.;OPOS=16168677;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:259:261:121:124:137:137:80:57:68:53:80:57:68:56 chrX 16847765 . A G 498.16 PASS AO=124;DP=263;FAO=125;FDP=264;FR=.;FRO=139;FSAF=73;FSAR=52;FSRF=81;FSRR=58;FWDB=0.0137501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.822;QD=7.54789;RBI=0.0153871;REFB=-0.00265907;REVB=-0.00690622;RO=138;SAF=73;SAR=51;SRF=81;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00172868;STB=0.500686;TYPE=snp;VARB=0.00354429;OID=.;OPOS=16847765;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:263:264:138:139:124:125:51:73:81:57:52:73:81:58 chrX 16859628 . G A 947.79 PASS AO=206;DP=383;FAO=206;FDP=382;FR=.;FRO=176;FSAF=101;FSAR=105;FSRF=102;FSRR=74;FWDB=0.0240726;FXX=0.0052082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.988;QD=9.92453;RBI=0.0241448;REFB=0.00480361;REVB=0.00186616;RO=177;SAF=101;SAR=105;SRF=103;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.077742;STB=0.541068;TYPE=snp;VARB=-0.00378729;OID=.;OPOS=16859628;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:383:382:177:176:206:206:105:101:103:74:105:101:102:74 chrX 16860134 . T C 315.7 PASS AO=65;DP=117;FAO=68;FDP=128;FR=.;FRO=60;FSAF=14;FSAR=54;FSRF=14;FSRR=46;FWDB=-0.0417733;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.2237;QD=9.86551;RBI=0.0419064;REFB=0.000940758;REVB=-0.00333748;RO=52;SAF=14;SAR=51;SRF=14;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0620057;STB=0.519225;TYPE=snp;VARB=-0.00210807;OID=.;OPOS=16860134;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:128:52:60:65:68:51:14:14:38:54:14:14:46 chrX 16887655 . C T 345.42 PASS AO=82;DP=174;FAO=85;FDP=175;FR=.;FRO=90;FSAF=23;FSAR=62;FSRF=47;FSRR=43;FWDB=0.083725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.9025;QD=7.8954;RBI=0.0838708;REFB=-0.0391854;REVB=-0.00494259;RO=90;SAF=21;SAR=61;SRF=48;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.288752;STB=0.642452;TYPE=snp;VARB=0.0318747;OID=.;OPOS=16887655;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:175:90:90:82:85:61:21:48:42:62:23:47:43 chrX 17166219 . C T 3747.65 PASS AO=384;DP=386;FAO=389;FDP=389;FR=.;FRO=0;FSAF=195;FSAR=194;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00466356;FXX=0.00256404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.239;QD=38.5362;RBI=0.0112024;REFB=0;REVB=-0.0101856;RO=0;SAF=193;SAR=191;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.96874e-05;OID=.;OPOS=17166219;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:386:389:0:0:384:389:191:193:0:0:194:195:0:0 chrX 17171300 . A G 737.86 PASS AO=156;DP=275;FAO=154;FDP=275;FR=.;FRO=121;FSAF=76;FSAR=78;FSRF=67;FSRR=54;FWDB=0.0274389;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=41.8119;QD=10.7326;RBI=0.0362649;REFB=-0.0316321;REVB=0.0237118;RO=116;SAF=77;SAR=79;SRF=66;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.059257;STB=0.526476;TYPE=snp;VARB=0.0220524;OID=.;OPOS=17171300;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:275:275:116:121:156:154:79:77:66:50:78:76:67:54 chrX 17705850 . C CT 2089.05 PASS AO=265;DP=301;FAO=285;FDP=285;FR=.;FRO=0;FSAF=111;FSAR=174;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0686994;FXX=0.0206178;HRUN=2;LEN=1;MLLD=20.7443;QD=29.32;RBI=0.068773;REFB=-0.00862581;REVB=0.00318013;RO=16;SAF=103;SAR=162;SRF=13;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0477432;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00115709;OID=.;OPOS=17705851;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:265:301:285:285:0:111:174:0:0:99:16:103:162:13:3 chrX 17819376 . AT A,AC 398.47 PASS AO=18,27;DP=49;FAO=32,12;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=15,0;FSAR=17,12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.25135,-0.293956;FXX=0.0222173;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=51.785,45.4383;QD=36.2249;RBI=0.251609,0.301641;REFB=0,0;REVB=0.0114022,0.067656;RO=0;SAF=0,15;SAR=18,12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.00157755,-0.0250146;OID=.,.;OPOS=17819377,17819377;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=A,AC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:18,27:46:32,12:44:0:15,0:17,12:0:0:30:0:0,15:18,12:0:0 chrX 17819460 . A G 10.19 PASS AO=2;DP=9;FAO=2;FDP=9;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=0.0106984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.913;QD=4.52722;RBI=0.0106984;REFB=-0.032538;REVB=0;RO=5;SAF=2;SAR=0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.013387;OID=.;OPOS=17819460;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:9:9:5:7:2:2:0:2:5:0:0:2:7:0 chrX 19041592 . C T 868.97 PASS AO=352;DP=695;FAO=202;FDP=398;FR=.;FRO=196;FSAF=56;FSAR=146;FSRF=78;FSRR=118;FWDB=0.000567354;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.909;QD=8.73337;RBI=0.0140839;REFB=-0.00587711;REVB=-0.0140725;RO=335;SAF=112;SAR=240;SRF=140;SRR=195;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.098469;STB=0.569575;TYPE=snp;VARB=0.00549687;OID=.;OPOS=19041592;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:695:398:335:196:352:202:240:112:140:195:146:56:78:118 chrX 19482476 . C T 1365.12 PASS AO=140;DP=144;FAO=145;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.172057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.414;QD=37.6585;RBI=0.173023;REFB=0;REVB=0.0182572;RO=4;SAF=37;SAR=103;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0324067;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000557461;OID=.;OPOS=19482476;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:64:144:145:4:0:140:145:103:37:3:1:105:40:0:0 chrX 19955434 . T C 925.37 PASS AO=195;DP=354;FAO=195;FDP=352;FR=.;FRO=157;FSAF=114;FSAR=81;FSRF=127;FSRR=30;FWDB=-0.00642345;FXX=0.00845047;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.179;QD=10.5156;RBI=0.0341392;REFB=-0.000969921;REVB=0.0335294;RO=153;SAF=114;SAR=81;SRF=123;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190387;STB=0.606703;TYPE=snp;VARB=0.000993858;OID=.;OPOS=19955434;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:354:352:153:157:195:195:81:114:123:30:81:114:127:30 chrX 20030564 . GC G 2034.49 PASS AO=240;DP=314;FAO=313;FDP=313;FR=.;FRO=0;FSAF=158;FSAR=155;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.211444;FXX=0.00949337;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.0251;QD=25.9999;RBI=0.297534;REFB=0;REVB=0.209328;RO=43;SAF=120;SAR=120;SRF=22;SRR=21;SSEN=0.243017;SSEP=0;SSSB=-0.00334291;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00303035;OID=.;OPOS=20030565;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:240:308:313:313:0:158:155:0:0:99:43:120:120:22:21 chrX 20071046 . T C 658.5 PASS AO=154;DP=311;FAO=154;FDP=307;FR=.;FRO=153;FSAF=72;FSAR=82;FSRF=69;FSRR=84;FWDB=-0.00210369;FXX=0.0128613;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.321;QD=8.57977;RBI=0.0203734;REFB=-0.00352289;REVB=0.0202645;RO=150;SAF=72;SAR=82;SRF=67;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0189116;STB=0.508292;TYPE=snp;VARB=0.00348626;OID=.;OPOS=20071046;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:311:307:150:153:154:154:82:72:67:83:82:72:69:84 chrX 20144405 . G A 59.09 PASS AO=19;DP=57;FAO=19;FDP=55;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.00360547;FXX=0.0350816;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.548;QD=4.29742;RBI=0.0247452;REFB=-0.0093439;REVB=0.0244812;RO=37;SAF=13;SAR=6;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230281;STB=0.659985;TYPE=snp;VARB=0.0158541;OID=.;OPOS=20144405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:59:57:55:37:36:19:19:6:13:18:19:6:13:16:20 chrX 20204461 . G T 576.17 PASS AO=132;DP=259;FAO=132;FDP=259;FR=.;FRO=127;FSAF=42;FSAR=90;FSRF=47;FSRR=80;FWDB=-0.0122298;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=160.597;QD=8.89834;RBI=0.0140074;REFB=0.00720177;REVB=-0.00682925;RO=127;SAF=42;SAR=90;SRF=47;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0523424;STB=0.528708;TYPE=snp;VARB=-0.00762932;OID=.;OPOS=20204461;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:259:259:127:127:132:132:90:42:47:80:90:42:47:80 chrX 21996117 . TG T 1402.45 PASS AO=181;DP=283;FAO=276;FDP=276;FR=.;FRO=0;FSAF=123;FSAR=153;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0164943;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.2264;QD=20.3253;RBI=0.354468;REFB=-0.0203;REVB=0.354084;RO=62;SAF=77;SAR=104;SRF=17;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0.369369;SSSB=0.0750325;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00788285;OID=.;OPOS=21996118;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:181:275:276:276:0:123:153:0:0:99:62:77:104:17:45 chrX 22291606 . C A 324.88 PASS AO=75;DP=152;FAO=76;FDP=153;FR=.;FRO=77;FSAF=49;FSAR=27;FSRF=39;FSRR=38;FWDB=0.0164595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.133;QD=8.49354;RBI=0.0194008;REFB=-0.0031304;REVB=0.0102703;RO=77;SAF=49;SAR=26;SRF=39;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141415;STB=0.572719;TYPE=snp;VARB=0.0031674;OID=.;OPOS=22291606;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:153:77:77:75:76:26:49:39:38:27:49:39:38 chrX 22291732 . C T 824.11 PASS AO=192;DP=384;FAO=196;FDP=390;FR=.;FRO=194;FSAF=88;FSAR=108;FSRF=82;FSRR=112;FWDB=0.0519151;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.4819;QD=8.45239;RBI=0.0531958;REFB=0.00787093;REVB=-0.0116024;RO=192;SAF=88;SAR=104;SRF=82;SRR=110;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.028818;STB=0.513254;TYPE=snp;VARB=-0.00798031;OID=.;OPOS=22291732;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:384:390:192:194:192:196:104:88:82:110:108:88:82:112 chrX 23019317 . G T 1338.25 PASS AO=138;DP=138;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0096532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.623;QD=38.5109;RBI=0.0117709;REFB=0;REVB=0.00673566;RO=0;SAF=63;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.65913e-06;OID=.;OPOS=23019317;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:138:139:0:0:138:139:75:63:0:0:76:63:0:0 chrX 23019346 . G T 1429.22 PASS AO=152;DP=154;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222512;FXX=0.0256394;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.8604;QD=37.6112;RBI=0.022722;REFB=0.0322684;REVB=-0.00460152;RO=1;SAF=70;SAR=82;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00576599;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.33885e-05;OID=.;OPOS=23019346;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:58:154:152:1:0:152:152:82:70:0:1:82:70:0:0 chrX 23858452 . G A 777.62 PASS AO=231;DP=489;FAO=192;FDP=398;FR=.;FRO=206;FSAF=81;FSAR=111;FSRF=107;FSRR=99;FWDB=0.0171178;FXX=0.00499988;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.8364;QD=7.81527;RBI=0.0684088;REFB=0.00130771;REVB=-0.0662325;RO=253;SAF=99;SAR=132;SRF=130;SRR=123;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0817149;STB=0.550921;TYPE=snp;VARB=-0.00202659;OID=.;OPOS=23858452;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:489:398:253:206:231:192:132:99:130:123:111:81:107:99 chrX 23925834 . A T 148.49 PASS AO=34;DP=70;FAO=34;FDP=70;FR=.;FRO=36;FSAF=27;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.00425266;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.9141;QD=8.48522;RBI=0.0169132;REFB=-0.0229505;REVB=-0.0163699;RO=29;SAF=27;SAR=7;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253955;STB=0.707633;TYPE=snp;VARB=0.0363593;OID=.;OPOS=23925834;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:70:70:29:36:34:34:7:27:16:13:7:27:16:20 chrX 23928489 . C T 740.12 PASS AO=169;DP=336;FAO=172;FDP=340;FR=.;FRO=168;FSAF=54;FSAR=118;FSRF=63;FSRR=105;FWDB=-0.0015461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.0637;QD=8.70728;RBI=0.00747762;REFB=-0.0223753;REVB=-0.00731603;RO=167;SAF=52;SAR=117;SRF=62;SRR=105;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0656985;STB=0.534119;TYPE=snp;VARB=0.0152757;OID=.;OPOS=23928489;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:336:340:167:168:169:172:117:52:62:105:118:54:63:105 chrX 24073761 . C T 2416.09 PASS AO=255;DP=258;FAO=255;FDP=255;FR=.;FRO=0;FSAF=159;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0267442;FXX=0.0116275;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.552;QD=37.8994;RBI=0.031251;REFB=0.018979;REVB=0.016167;RO=1;SAF=159;SAR=96;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00298893;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.17199e-05;OID=.;OPOS=24073761;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:97:258:255:1:0:255:255:96:159:1:0:96:159:0:0 chrX 24095043 . C T 178.64 PASS AO=32;DP=99;FAO=50;FDP=106;FR=.;FRO=56;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=18;FSRR=38;FWDB=-0.00446999;FXX=0.0940091;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.948;QD=6.74094;RBI=0.014402;REFB=0.00822765;REVB=0.0136908;RO=42;SAF=18;SAR=14;SRF=14;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.227225;STB=0.594303;TYPE=snp;VARB=-0.00915726;OID=.;OPOS=24095043;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:106:42:56:32:50:14:18:14:28:25:25:18:38 chrX 24232095 . C T 3668.5 PASS AO=491;DP=502;FAO=392;FDP=392;FR=.;FRO=0;FSAF=154;FSAR=238;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0237427;FXX=0.0199995;HRUN=2;LEN=1;MLLD=244.132;QD=37.4337;RBI=0.0265509;REFB=0.00947822;REVB=0.0118843;RO=8;SAF=190;SAR=301;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00364177;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.18194e-05;OID=.;OPOS=24232095;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:502:392:8:0:491:392:301:190:4:4:238:154:0:0 chrX 24232211 . TGTA T 406.03 PASS AO=108;DP=287;FAO=114;FDP=264;FR=.;FRO=150;FSAF=56;FSAR=58;FSRF=58;FSRR=92;FWDB=-0.0205884;FXX=0.0149248;HRUN=1;LEN=3;MLLD=174.697;QD=6.15194;RBI=0.0224016;REFB=-0.017613;REVB=-0.00882898;RO=148;SAF=51;SAR=57;SRF=55;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105516;STB=0.559542;TYPE=del;VARB=0.0248039;OID=.;OPOS=24232212;OREF=GTA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:108:265:114:264:150:56:58:58:92:99:148:51:57:55:93 chrX 24382893 . GT G 25.19 PASS AO=10;DP=35;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.0181249;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=17.9112;QD=3.59834;RBI=0.107175;REFB=-0.0376764;REVB=-0.105631;RO=16;SAF=1;SAR=9;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.483663;STB=0.781906;TYPE=del;VARB=0.0550831;OID=.;OPOS=24382894;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:10:27:10:28:18:1:9:7:11:25:16:1:9:7:9 chrX 24578227 . A G 630 PASS AO=323;DP=739;FAO=174;FDP=395;FR=.;FRO=221;FSAF=110;FSAR=64;FSRF=124;FSRR=97;FWDB=-0.0050689;FXX=0.0124997;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.275;QD=6.37973;RBI=0.0276021;REFB=-0.0173811;REVB=-0.0271327;RO=406;SAF=201;SAR=122;SRF=236;SRR=170;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0434077;STB=0.541817;TYPE=snp;VARB=0.0207115;OID=.;OPOS=24578227;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:739:395:406:221:323:174:122:201:236:170:64:110:124:97 chrX 24578270 . C T 881.69 PASS AO=307;DP=591;FAO=203;FDP=395;FR=.;FRO=192;FSAF=96;FSAR=107;FSRF=99;FSRR=93;FWDB=-0.0131519;FXX=0.0124997;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8229;QD=8.92853;RBI=0.015058;REFB=-0.00607069;REVB=0.00733285;RO=277;SAF=144;SAR=163;SRF=155;SRR=122;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0787302;STB=0.520777;TYPE=snp;VARB=0.00717995;OID=.;OPOS=24578270;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:591:395:277:192:307:203:163:144:155:122:107:96:99:93 chrX 24578803 . C T 212.72 PASS AO=66;DP=169;FAO=66;FDP=169;FR=.;FRO=103;FSAF=32;FSAR=34;FSRF=57;FSRR=46;FWDB=0.0264712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.419;QD=5.0348;RBI=0.0319179;REFB=0.0170705;REVB=0.0178333;RO=103;SAF=32;SAR=34;SRF=57;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0739428;STB=0.541699;TYPE=snp;VARB=-0.0249645;OID=.;OPOS=24578803;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:169:169:103:103:66:66:34:32:57:46:34:32:57:46 chrX 24751958 . T C 3571.34 PASS AO=367;DP=367;FAO=373;FDP=373;FR=.;FRO=0;FSAF=127;FSAR=246;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0142013;FXX=0.00267373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.003;QD=38.2986;RBI=0.0177592;REFB=0;REVB=0.0106637;RO=0;SAF=126;SAR=241;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.60452e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.00091e-05;OID=.;OPOS=24751958;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:367:373:0:0:367:373:241:126:0:0:246:127:0:0 chrX 26157220 . C T 2711.79 PASS AO=287;DP=290;FAO=287;FDP=287;FR=.;FRO=0;FSAF=183;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010239;FXX=0.0103445;HRUN=4;LEN=1;MLLD=223.682;QD=37.795;RBI=0.0107653;REFB=-0.0302192;REVB=-0.00332464;RO=2;SAF=183;SAR=104;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00908102;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00013754;OID=.;OPOS=26157220;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:290:287:2:0:287:287:104:183:0:2:104:183:0:0 chrX 26157792 . C T 1465.99 PASS AO=165;DP=173;FAO=166;FDP=174;FR=.;FRO=8;FSAF=90;FSAR=76;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=0.0011414;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.249;QD=33.7009;RBI=0.0102676;REFB=-0.0213454;REVB=0.010204;RO=7;SAF=89;SAR=76;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0247846;STB=0.515451;TYPE=snp;VARB=0.000410012;OID=.;OPOS=26157792;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:25:173:174:7:8:165:166:76:89:6:1:76:90:7:1 chrX 26158032 . G A 890.24 PASS AO=197;DP=377;FAO=199;FDP=377;FR=.;FRO=178;FSAF=124;FSAR=75;FSRF=99;FSRR=79;FWDB=-0.0141848;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0913;QD=9.44548;RBI=0.0152509;REFB=0.00325112;REVB=0.00560195;RO=180;SAF=123;SAR=74;SRF=100;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0630233;STB=0.533092;TYPE=snp;VARB=-0.0028763;OID=.;OPOS=26158032;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:377:377:180:178:197:199:74:123:100:80:75:124:99:79 chrX 26212251 . C T 14.99 PASS AO=12;DP=58;FAO=12;FDP=58;FR=.;FRO=46;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=0.00793609;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.1044;QD=1.03409;RBI=0.0347685;REFB=-0.0228877;REVB=-0.0338506;RO=45;SAF=9;SAR=3;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.333394;STB=0.708728;TYPE=snp;VARB=0.207466;OID=.;OPOS=26212251;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:14:58:58:45:46:12:12:3:9:22:23:3:9:23:23 chrX 26213219 . T C 1330.13 PASS AO=142;DP=145;FAO=144;FDP=147;FR=.;FRO=3;FSAF=50;FSAR=94;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0439985;FXX=0.0134219;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.1998;QD=36.194;RBI=0.0485491;REFB=-0.105866;REVB=0.020522;RO=3;SAF=50;SAR=92;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0276715;STB=0.514561;TYPE=snp;VARB=0.000756086;OID=.;OPOS=26213219;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:145:147:3:3:142:144:92:50:3:0:94:50:3:0 chrX 26213364 . T TTTGTC 1251.84 PASS AO=145;DP=225;FAO=170;FDP=202;FR=.;FRO=32;FSAF=64;FSAR=106;FSRF=6;FSRR=26;FWDB=0.0206902;FXX=0.0691212;HRUN=4;LEN=5;MLLD=241.91;QD=24.7889;RBI=0.0304073;REFB=-0.0469988;REVB=0.0222826;RO=43;SAF=53;SAR=92;SRF=13;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.029535;STB=0.532389;TYPE=ins;VARB=0.0100005;OID=.;OPOS=26213365;OREF=-;OALT=TTGTC;OMAPALT=TTTGTC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:145:225:170:202:32:64:106:6:26:18:43:53:92:13:30 chrX 26808285 . T G 681.32 PASS AO=236;DP=519;FAO=181;FDP=398;FR=.;FRO=217;FSAF=124;FSAR=57;FSRF=137;FSRR=80;FWDB=-0.00403288;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.42;QD=6.8474;RBI=0.00432518;REFB=-0.00328861;REVB=0.00156302;RO=277;SAF=161;SAR=75;SRF=174;SRR=103;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0594828;STB=0.53312;TYPE=snp;VARB=0.00353243;OID=.;OPOS=26808285;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:519:398:277:217:236:181:75:161:174:103:57:124:137:80 chrX 27479339 . A G 2127.55 PASS AO=221;DP=222;FAO=223;FDP=223;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=189;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0221398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.171;QD=38.1623;RBI=0.0249455;REFB=0;REVB=0.0114938;RO=0;SAF=34;SAR=187;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3323e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.39009e-05;OID=.;OPOS=27479339;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:222:223:0:0:221:223:187:34:0:0:189:34:0:0 chrX 27839572 . T C 416.96 PASS AO=137;DP=342;FAO=133;FDP=339;FR=.;FRO=206;FSAF=41;FSAR=92;FSRF=73;FSRR=133;FWDB=-0.0736193;FXX=0.00877167;HRUN=4;LEN=1;MLLD=39.0808;QD=4.91993;RBI=0.159128;REFB=0.0111208;REVB=-0.141074;RO=203;SAF=45;SAR=92;SRF=70;SRR=133;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0196269;STB=0.53203;TYPE=snp;VARB=-0.0169368;OID=.;OPOS=27839572;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:342:339:203:206:137:133:92:45:70:133:92:41:73:133 chrX 27839617 . G A 486.81 PASS AO=143;DP=346;FAO=144;FDP=345;FR=.;FRO=201;FSAF=53;FSAR=91;FSRF=65;FSRR=136;FWDB=-0.00970914;FXX=0.00289009;HRUN=3;LEN=1;MLLD=216.324;QD=5.64412;RBI=0.0127263;REFB=-0.0086729;REVB=0.00822753;RO=200;SAF=53;SAR=90;SRF=65;SRR=135;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0520213;STB=0.52839;TYPE=snp;VARB=0.0137612;OID=.;OPOS=27839617;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:346:345:200:201:143:144:90:53:65:135:91:53:65:136 chrX 27840405 . G A 377.76 PASS AO=115;DP=286;FAO=115;FDP=284;FR=.;FRO=169;FSAF=56;FSAR=59;FSRF=74;FSRR=95;FWDB=0.00755484;FXX=0.00699276;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.396;QD=5.32061;RBI=0.00756517;REFB=-0.014808;REVB=-0.000395318;RO=168;SAF=56;SAR=59;SRF=74;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.049445;STB=0.52927;TYPE=snp;VARB=0.0191942;OID=.;OPOS=27840405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:286:284:168:169:115:115:59:56:74:94:59:56:74:95 chrX 30236878 . G A 964.22 PASS AO=209;DP=388;FAO=209;FDP=388;FR=.;FRO=179;FSAF=84;FSAR=125;FSRF=83;FSRR=96;FWDB=-0.0603289;FXX=0.00257063;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1139;QD=9.94038;RBI=0.0626414;REFB=0.0133719;REVB=0.0168631;RO=179;SAF=84;SAR=125;SRF=84;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0586091;STB=0.529296;TYPE=snp;VARB=-0.0131679;OID=.;OPOS=30236878;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:388:388:179:179:209:209:125:84:84:95:125:84:83:96 chrX 30236913 . G A 947.67 PASS AO=181;DP=300;FAO=183;FDP=304;FR=.;FRO=121;FSAF=59;FSAR=124;FSRF=18;FSRR=103;FWDB=-0.025843;FXX=0.00327858;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.64;QD=12.4693;RBI=0.0298086;REFB=-0.0215897;REVB=0.0148557;RO=118;SAF=58;SAR=123;SRF=17;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158034;STB=0.583794;TYPE=snp;VARB=0.020964;OID=.;OPOS=30236913;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:300:304:118:121:181:183:123:58:17:101:124:59:18:103 chrX 30237003 . C T 393.46 PASS AO=94;DP=192;FAO=94;FDP=192;FR=.;FRO=98;FSAF=30;FSAR=64;FSRF=13;FSRR=85;FWDB=0.00843904;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.936;QD=8.19709;RBI=0.00879057;REFB=-0.0190005;REVB=0.00246105;RO=98;SAF=30;SAR=64;SRF=13;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.2186;STB=0.61892;TYPE=snp;VARB=0.015366;OID=.;OPOS=30237003;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:192:98:98:94:94:64:30:13:85:64:30:13:85 chrX 30238026 . G A 565.94 PASS AO=138;DP=281;FAO=137;FDP=281;FR=.;FRO=144;FSAF=40;FSAR=97;FSRF=53;FSRR=91;FWDB=-0.0213838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3965;QD=8.05612;RBI=0.0218221;REFB=-0.00798045;REVB=0.00435192;RO=143;SAF=41;SAR=97;SRF=52;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0712787;STB=0.545365;TYPE=snp;VARB=0.011174;OID=.;OPOS=30238026;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:281:281:143:144:138:137:97:41:52:91:97:40:53:91 chrX 30238090 . T G 583.45 PASS AO=127;DP=256;FAO=133;FDP=259;FR=.;FRO=126;FSAF=62;FSAR=71;FSRF=69;FSRR=57;FWDB=-0.0080054;FXX=0.00766254;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.658;QD=9.01081;RBI=0.012383;REFB=-0.00172139;REVB=0.00944735;RO=127;SAF=59;SAR=68;SRF=70;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0788504;STB=0.539589;TYPE=snp;VARB=0.00180197;OID=.;OPOS=30238090;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:256:259:127:126:127:133:68:59:70:57:71:62:69:57 chrX 30254376 . T C 423.51 PASS AO=107;DP=228;FAO=107;FDP=228;FR=.;FRO=121;FSAF=50;FSAR=57;FSRF=57;FSRR=64;FWDB=0.00916453;FXX=0.00436662;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.336;QD=7.43004;RBI=0.0111433;REFB=-0.00970555;REVB=0.00633906;RO=120;SAF=51;SAR=56;SRF=56;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00957223;STB=0.502016;TYPE=snp;VARB=0.0119441;OID=.;OPOS=30254376;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:228:228:120:121:107:107:56:51:56:64:57:50:57:64 chrX 30255520 . C T 596.54 PASS AO=219;DP=545;FAO=171;FDP=398;FR=.;FRO=227;FSAF=63;FSAR=108;FSRF=89;FSRR=138;FWDB=-0.00709404;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.544;QD=5.99542;RBI=0.00911604;REFB=-0.0154792;REVB=0.0057251;RO=316;SAF=79;SAR=140;SRF=120;SRR=196;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0216845;STB=0.514381;TYPE=snp;VARB=0.0217166;OID=.;OPOS=30255520;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:545:398:316:227:219:171:140:79:120:196:108:63:89:138 chrX 30261002 . A G 474.09 PASS AO=109;DP=217;FAO=110;FDP=216;FR=.;FRO=106;FSAF=51;FSAR=59;FSRF=36;FSRR=70;FWDB=0.0117213;FXX=0.00460808;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.057;QD=8.77947;RBI=0.016241;REFB=-0.0212732;REVB=0.0112419;RO=106;SAF=50;SAR=59;SRF=36;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109058;STB=0.561721;TYPE=snp;VARB=0.0190937;OID=.;OPOS=30261002;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:217:216:106:106:109:110:59:50:36:70:59:51:36:70 chrX 30261158 . G C 130.18 PASS AO=43;DP=125;FAO=45;FDP=127;FR=.;FRO=82;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=37;FSRR=45;FWDB=-0.00465523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.859;QD=4.10013;RBI=0.0272246;REFB=-0.00578504;REVB=0.0268237;RO=82;SAF=20;SAR=23;SRF=37;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0159407;STB=0.510027;TYPE=snp;VARB=0.0121578;OID=.;OPOS=30261158;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:125:127:82:82:43:45:23:20:37:45:24:21:37:45 chrX 30269887 . T A 804.42 PASS AO=197;DP=404;FAO=195;FDP=398;FR=.;FRO=203;FSAF=96;FSAR=99;FSRF=97;FSRR=106;FWDB=-0.0104029;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.518;QD=8.08462;RBI=0.010416;REFB=-0.00976283;REVB=-0.000522287;RO=205;SAF=97;SAR=100;SRF=100;SRR=105;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00426052;STB=0.507386;TYPE=snp;VARB=0.0136854;OID=.;OPOS=30269887;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:404:398:205:203:197:195:100:97:100:105:99:96:97:106 chrX 30577846 . A C 275.79 PASS AO=87;DP=216;FAO=88;FDP=228;FR=.;FRO=140;FSAF=45;FSAR=43;FSRF=66;FSRR=74;FWDB=-0.0405957;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.084;QD=4.83837;RBI=0.0412302;REFB=-0.0323075;REVB=0.00720519;RO=129;SAF=44;SAR=43;SRF=56;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0762333;STB=0.524501;TYPE=snp;VARB=0.0432292;OID=.;OPOS=30577846;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:216:228:129:140:87:88:43:44:56:73:43:45:66:74 chrX 30715827 . C T 3760.97 PASS AO=403;DP=408;FAO=396;FDP=396;FR=.;FRO=0;FSAF=177;FSAR=219;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00380621;FXX=0.00999975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.591;QD=37.9896;RBI=0.00837244;REFB=0.0133771;REVB=0.00745724;RO=5;SAF=182;SAR=221;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00594358;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.2098e-05;OID=.;OPOS=30715827;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:408:396:5:0:403:396:221:182:1:4:219:177:0:0 chrX 30848956 . G C 157 PASS AO=55;DP=162;FAO=55;FDP=156;FR=.;FRO=101;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=67;FSRR=34;FWDB=-0.00373761;FXX=0.0370348;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.049;QD=4.02561;RBI=0.022135;REFB=-0.00351057;REVB=0.0218171;RO=99;SAF=26;SAR=29;SRF=66;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217326;STB=0.622103;TYPE=snp;VARB=0.00867978;OID=.;OPOS=30848956;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:156:99:101:55:55:29:26:66:33:29:26:67:34 chrX 30872602 . A G 2572.68 PASS AO=269;DP=272;FAO=270;FDP=270;FR=.;FRO=0;FSAF=142;FSAR=128;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0268998;FXX=0.0181812;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.039;QD=38.1138;RBI=0.0407273;REFB=-0.0437176;REVB=0.0305796;RO=1;SAF=141;SAR=128;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00371042;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000449728;OID=.;OPOS=30872602;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:272:270:1:0:269:270:128:141:0:1:128:142:0:0 chrX 31496350 . C T 2528.59 PASS AO=266;DP=270;FAO=266;FDP=266;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=163;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0430547;FXX=0.0148143;HRUN=3;LEN=1;MLLD=268.423;QD=38.0238;RBI=0.0442895;REFB=-0.114728;REVB=0.0103851;RO=1;SAF=103;SAR=163;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00460635;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.87238e-05;OID=.;OPOS=31496350;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:270:266:1:0:266:266:163:103:1:0:163:103:0:0 chrX 32503194 . T C 350.68 PASS AO=61;DP=204;FAO=55;FDP=199;FR=.,HEALED;FRO=100;FSAF=34;FSAR=21;FSRF=57;FSRR=43;FWDB=-0.0149395;FXX=0.0148508;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.7519;QD=7.0488;RBI=0.0383422;REFB=-0.0414081;REVB=-0.0353119;RO=94;SAF=35;SAR=26;SRF=57;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0360656;STB=0.532408;TYPE=snp;VARB=0.0836637;OID=.;OPOS=32503194;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:202:199:94:100:61:55:26:35:57:37:21:34:57:43 chrX 34674970 . C G 53.9 PASS AO=13;DP=50;FAO=18;FDP=50;FR=.,HEALED;FRO=32;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=0.0213792;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.3029;QD=4.31168;RBI=0.038248;REFB=-0.00402594;REVB=-0.031715;RO=16;SAF=9;SAR=4;SRF=16;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.425376;STB=0.552452;TYPE=snp;VARB=0.00826596;OID=.;OPOS=34674970;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:54:45:50:16:32:13:18:4:9:16:0:7:11:17:15 chrX 35969297 . G A 634.81 PASS AO=155;DP=322;FAO=156;FDP=321;FR=.;FRO=165;FSAF=64;FSAR=92;FSRF=74;FSRR=91;FWDB=-0.0282899;FXX=0.00619176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9818;QD=7.91041;RBI=0.0286156;REFB=-0.00902832;REVB=-0.00430456;RO=157;SAF=64;SAR=91;SRF=68;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0190571;STB=0.520155;TYPE=snp;VARB=0.00979768;OID=.;OPOS=35969297;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:322:321:157:165:155:156:91:64:68:89:92:64:74:91 chrX 35988996 . T C 608.14 PASS AO=191;DP=455;FAO=171;FDP=395;FR=.;FRO=224;FSAF=76;FSAR=95;FSRF=108;FSRR=116;FWDB=-0.00702352;FXX=0.0124997;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.426;QD=6.15834;RBI=0.00704519;REFB=-0.0239843;REVB=0.000552215;RO=215;SAF=83;SAR=108;SRF=91;SRR=124;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0110789;STB=0.521539;TYPE=snp;VARB=0.0324745;OID=.;OPOS=35988996;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:455:395:215:224:191:171:108:83:91:124:95:76:108:116 chrX 35993454 . C T 218.15 PASS AO=86;DP=254;FAO=86;FDP=258;FR=.;FRO=172;FSAF=32;FSAR=54;FSRF=78;FSRR=94;FWDB=-0.00415717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.2912;QD=3.38214;RBI=0.00992545;REFB=-0.0136381;REVB=-0.0090129;RO=168;SAF=32;SAR=54;SRF=78;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110171;STB=0.556375;TYPE=snp;VARB=0.021502;OID=.;OPOS=35993454;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:254:258:168:172:86:86:54:32:78:90:54:32:78:94 chrX 36007614 . T G 582.25 PASS AO=159;DP=359;FAO=159;FDP=359;FR=.;FRO=200;FSAF=74;FSAR=85;FSRF=89;FSRR=111;FWDB=-0.0258342;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.8631;QD=6.48749;RBI=0.0458634;REFB=-0.0114212;REVB=0.0378952;RO=196;SAF=74;SAR=85;SRF=88;SRR=108;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0164952;STB=0.511441;TYPE=snp;VARB=0.0139371;OID=.;OPOS=36007614;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:359:359:196:200:159:159:85:74:88:108:85:74:89:111 chrX 36057261 . A G 552.04 PASS AO=154;DP=353;FAO=154;FDP=353;FR=.;FRO=199;FSAF=69;FSAR=85;FSRF=82;FSRR=117;FWDB=0.0219388;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.923;QD=6.25538;RBI=0.0231243;REFB=-0.0114091;REVB=0.00730896;RO=199;SAF=69;SAR=85;SRF=82;SRR=117;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0371531;STB=0.520596;TYPE=snp;VARB=0.0145212;OID=.;OPOS=36057261;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:353:353:199:199:154:154:85:69:82:117:85:69:82:117 chrX 36162684 . C CTG 535.58 PASS AO=135;DP=299;FAO=136;FDP=291;FR=.;FRO=155;FSAF=66;FSAR=70;FSRF=102;FSRR=53;FWDB=0.0181017;FXX=0.0234891;HRUN=1;LEN=2;MLLD=209.204;QD=7.36197;RBI=0.0304162;REFB=-0.02273;REVB=-0.0244433;RO=154;SAF=66;SAR=69;SRF=102;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167398;STB=0.591596;TYPE=ins;VARB=0.0311177;OID=.;OPOS=36162685;OREF=-;OALT=TG;OMAPALT=CTG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:135:299:136:291:155:66:70:102:53:99:154:66:69:102:52 chrX 36371719 . T A 1569.64 PASS AO=171;DP=175;FAO=171;FDP=171;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0520236;FXX=0.0228558;HRUN=3;LEN=1;MLLD=240.834;QD=36.7168;RBI=0.0520578;REFB=0.00668085;REVB=-0.00188665;RO=3;SAF=66;SAR=105;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00182232;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.85045e-05;OID=.;OPOS=36371719;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:46:175:171:3:0:171:171:105:66:1:2:105:66:0:0 chrX 36385156 . A G 1816.77 PASS AO=225;DP=250;FAO=225;FDP=252;FR=.;FRO=27;FSAF=152;FSAR=73;FSRF=3;FSRR=24;FWDB=0.0335931;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.578;QD=28.8377;RBI=0.036951;REFB=-0.00693029;REVB=0.0153907;RO=24;SAF=152;SAR=73;SRF=3;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110015;STB=0.565787;TYPE=snp;VARB=0.00077447;OID=.;OPOS=36385156;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:250:252:24:27:225:225:73:152:3:21:73:152:3:24 chrX 36403036 . A G 3787.29 PASS AO=751;DP=756;FAO=395;FDP=395;FR=.;FRO=0;FSAF=174;FSAR=221;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0069801;FXX=0.0124997;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.143;QD=38.3524;RBI=0.0082801;REFB=0.0160607;REVB=-0.00445402;RO=1;SAF=332;SAR=419;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00113881;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.62884e-06;OID=.;OPOS=36403036;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:756:395:1:0:751:395:419:332:0:1:221:174:0:0 chrX 37027035 . G A 102.42 PASS AO=28;DP=67;FAO=28;FDP=68;FR=.;FRO=40;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=-0.00162279;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=256.282;QD=6.02462;RBI=0.00407158;REFB=-0.00182498;REVB=-0.00373421;RO=39;SAF=8;SAR=20;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.273091;STB=0.650112;TYPE=snp;VARB=0.00218415;OID=.;OPOS=37027035;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:68:39:40:28:28:20:8:21:18:20:8:21:19 chrX 37027959 . C G 12.58 PASS AO=13;DP=39;FAO=9;FDP=39;FR=.;FRO=30;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=22;FSRR=8;FWDB=-0.034217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=33.5393;QD=1.28987;RBI=0.0557593;REFB=-0.0543588;REVB=-0.0440261;RO=26;SAF=7;SAR=6;SRF=20;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.270293;STB=0.642575;TYPE=snp;VARB=0.30452;OID=.;OPOS=37027959;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:39:39:26:30:13:9:6:7:20:6:4:5:22:8 chrX 37431597 . G T 121.4 PASS AO=25;DP=47;FAO=25;FDP=47;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.00350793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.357;QD=10.3319;RBI=0.00804965;REFB=-0.0491111;REVB=-0.00724509;RO=21;SAF=6;SAR=19;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.266614;STB=0.66265;TYPE=snp;VARB=0.0396616;OID=.;OPOS=37431597;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:47:47:21:22:25:25:19:6:11:10:19:6:12:10 chrX 37850263 . C T 622.21 PASS AO=138;DP=268;FAO=140;FDP=270;FR=.;FRO=130;FSAF=77;FSAR=63;FSRF=46;FSRR=84;FWDB=0.00372207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.3968;QD=9.21797;RBI=0.0196182;REFB=-0.0079904;REVB=0.0192619;RO=128;SAF=75;SAR=63;SRF=44;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174479;STB=0.593599;TYPE=snp;VARB=0.00886886;OID=.;OPOS=37850263;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:268:270:128:130:138:140:63:75:44:84:63:77:46:84 chrX 37883167 . AAAGT A 520.78 PASS AO=223;DP=572;FAO=187;FDP=371;FR=.;FRO=184;FSAF=101;FSAR=86;FSRF=56;FSRR=128;FWDB=0.0142696;FXX=0.0724982;HRUN=4;LEN=4;MLLD=225.322;QD=5.61487;RBI=0.0145633;REFB=-0.00559589;REVB=-0.00291016;RO=226;SAF=120;SAR=103;SRF=67;SRR=159;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220097;STB=0.615491;TYPE=del;VARB=0.0057589;OID=.;OPOS=37883168;OREF=AAGT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:223:518:187:371:184:101:86:56:128:99:226:120:103:67:159 chrX 38144988 . C T 100.71 PASS AO=26;DP=61;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.020899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.465;QD=6.60374;RBI=0.0209808;REFB=-0.00598735;REVB=0.00185053;RO=35;SAF=13;SAR=13;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0432477;STB=0.524571;TYPE=snp;VARB=0.0141396;OID=.;OPOS=38144988;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:35:35:26:26:13:13:19:16:13:13:19:16 chrX 38145033 . G A 67.18 PASS AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.0399863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.2148;QD=7.46449;RBI=0.0445423;REFB=-0.00711664;REVB=0.0196242;RO=19;SAF=8;SAR=8;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124711;STB=0.583232;TYPE=snp;VARB=0.0109982;OID=.;OPOS=38145033;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:67:36:36:19:20:16:16:8:8:12:7:8:8:13:7 chrX 38146029 . C T 52.67 PASS AO=14;DP=35;FAO=14;FDP=35;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=17;FSRR=4;FWDB=0.059244;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1785;QD=6.01933;RBI=0.0660447;REFB=-0.00920128;REVB=0.02919;RO=21;SAF=11;SAR=3;SRF=17;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0373098;STB=0.521709;TYPE=snp;VARB=0.0238486;OID=.;OPOS=38146029;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:52:35:35:21:21:14:14:3:11:17:4:3:11:17:4 chrX 38146601 . G A 62.52 PASS AO=22;DP=67;FAO=22;FDP=67;FR=.;FRO=45;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=28;FSRR=17;FWDB=-0.00602471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.391;QD=3.73264;RBI=0.0191787;REFB=-0.00754138;REVB=0.0182078;RO=45;SAF=13;SAR=9;SRF=28;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0373713;STB=0.521904;TYPE=snp;VARB=0.0175938;OID=.;OPOS=38146601;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:62:67:67:45:45:22:22:9:13:28:17:9:13:28:17 chrX 38147170 . C T 778.75 PASS AO=103;DP=259;FAO=149;FDP=248;FR=.;FRO=99;FSAF=56;FSAR=93;FSRF=26;FSRR=73;FWDB=-0.0106157;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=277.834;QD=12.5604;RBI=0.0192017;REFB=-0.00474659;REVB=0.0160004;RO=60;SAF=22;SAR=81;SRF=8;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0861299;STB=0.549338;TYPE=snp;VARB=0.00307027;OID=.;OPOS=38147170;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:189:248:60:99:103:149:81:22:8:52:93:56:26:73 chrX 38150201 . T C 872.41 PASS AO=450;DP=903;FAO=203;FDP=400;FR=.;FRO=197;FSAF=95;FSAR=108;FSRF=101;FSRR=96;FWDB=-0.0555593;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.3971;QD=8.72409;RBI=0.0904565;REFB=0.0117516;REVB=-0.0713831;RO=443;SAF=213;SAR=237;SRF=223;SRR=220;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0273368;STB=0.522046;TYPE=snp;VARB=-0.0121269;OID=.;OPOS=38150201;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:903:400:443:197:450:203:237:213:223:220:108:95:101:96 chrX 38156660 . T C 654.68 PASS AO=399;DP=834;FAO=178;FDP=400;FR=.;FRO=222;FSAF=70;FSAR=108;FSRF=84;FSRR=138;FWDB=-0.0323163;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.8933;QD=6.54683;RBI=0.0324358;REFB=-0.0144874;REVB=0.00278194;RO=434;SAF=141;SAR=258;SRF=180;SRR=254;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0624044;STB=0.508684;TYPE=snp;VARB=0.0143844;OID=.;OPOS=38156660;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:834:400:434:222:399:178:258:141:180:254:108:70:84:138 chrX 38156677 . C T 518.84 PASS AO=347;DP=754;FAO=160;FDP=397;FR=.;FRO=237;FSAF=47;FSAR=113;FSRF=109;FSRR=128;FWDB=-0.000492587;FXX=0.00749981;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5096;QD=5.22757;RBI=0.0144061;REFB=-0.000127382;REVB=0.0143977;RO=399;SAF=109;SAR=238;SRF=161;SRR=238;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0966032;STB=0.608793;TYPE=snp;VARB=0.000170682;OID=.;OPOS=38156677;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:754:397:399:237:347:160:238:109:161:238:113:47:109:128 chrX 38157623 . C A 599.06 PASS AO=151;DP=320;FAO=151;FDP=320;FR=.;FRO=169;FSAF=87;FSAR=64;FSRF=74;FSRR=95;FWDB=0.000868906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.045;QD=7.48828;RBI=0.00982603;REFB=-0.00307591;REVB=0.00978753;RO=167;SAF=87;SAR=64;SRF=73;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132728;STB=0.573094;TYPE=snp;VARB=0.00329399;OID=.;OPOS=38157623;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:320:320:167:169:151:151:64:87:73:94:64:87:74:95 chrX 38158290 . C T 416.83 PASS AO=259;DP=542;FAO=115;FDP=263;FR=.;FRO=148;FSAF=59;FSAR=56;FSRF=104;FSRR=44;FWDB=0.0296383;FXX=0.00378774;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.011;QD=6.33962;RBI=0.0296838;REFB=-0.0100895;REVB=0.00164209;RO=281;SAF=146;SAR=113;SRF=170;SRR=111;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0400198;STB=0.607382;TYPE=snp;VARB=0.00664487;OID=.;OPOS=38158290;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:542:263:281:148:259:115:113:146:170:111:56:59:104:44 chrX 38547862 . G A 2196.1 PASS AO=236;DP=243;FAO=241;FDP=247;FR=.;FRO=6;FSAF=25;FSAR=216;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0296174;FXX=0.0040321;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.891;QD=35.5644;RBI=0.0338958;REFB=-0.0784639;REVB=0.0164844;RO=7;SAF=24;SAR=212;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0269718;STB=0.504084;TYPE=snp;VARB=0.000937253;OID=.;OPOS=38547862;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:59:243:247:7:6:236:241:212:24:2:5:216:25:1:5 chrX 39933339 . A G 175.32 PASS AO=57;DP=153;FAO=57;FDP=153;FR=.;FRO=96;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=44;FSRR=52;FWDB=0.00260397;FXX=0.00649309;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.344;QD=4.58345;RBI=0.00513355;REFB=-0.00902937;REVB=0.0044241;RO=88;SAF=30;SAR=27;SRF=41;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0648296;STB=0.542568;TYPE=snp;VARB=0.0152126;OID=.;OPOS=39933339;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:153:88:96:57:57:27:30:41:47:27:30:44:52 chrX 41204952 . C T 277.68 PASS AO=60;DP=116;FAO=61;FDP=117;FR=.;FRO=56;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=32;FSRR=24;FWDB=-0.00309296;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=275.714;QD=9.49339;RBI=0.0168345;REFB=-0.00657562;REVB=-0.016548;RO=56;SAF=29;SAR=31;SRF=32;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0771221;STB=0.538061;TYPE=snp;VARB=0.00614845;OID=.;OPOS=41204952;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:116:117:56:56:60:61:31:29:32:24:31:30:32:24 chrX 41556195 . A T 1350.43 PASS AO=146;DP=151;FAO=147;FDP=150;FR=.;FRO=3;FSAF=84;FSAR=63;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0207593;FXX=0.00662208;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.631;QD=36.0116;RBI=0.021561;REFB=-0.121642;REVB=0.00582471;RO=3;SAF=83;SAR=63;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0168766;STB=0.501945;TYPE=snp;VARB=0.000321578;OID=.;OPOS=41556195;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:151:150:3:3:146:147:63:83:3:0:63:84:2:1 chrX 41587218 . T C 3514.52 PASS AO=466;DP=498;FAO=368;FDP=368;FR=.;FRO=0;FSAF=167;FSAR=201;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021817;FXX=0.079998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.821;QD=38.2013;RBI=0.0564226;REFB=-0.0357016;REVB=0.0520339;RO=1;SAF=221;SAR=245;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00215537;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000229319;OID=.;OPOS=41587218;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:498:368:1:0:466:368:245:221:1:0:201:167:0:0 chrX 41587569 . C G 2560.06 PASS AO=267;DP=267;FAO=267;FDP=267;FR=.;FRO=0;FSAF=167;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0404813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.774;QD=38.3529;RBI=0.0807082;REFB=0;REVB=0.0698217;RO=0;SAF=167;SAR=100;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.3984e-05;OID=.;OPOS=41587569;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:267:267:0:0:267:267:100:167:0:0:100:167:0:0 chrX 41588169 . T C 3814.98 PASS AO=396;DP=401;FAO=398;FDP=398;FR=.;FRO=0;FSAF=239;FSAR=159;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00861882;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.281;QD=38.3415;RBI=0.0794255;REFB=0.00636954;REVB=0.0789564;RO=2;SAF=262;SAR=134;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00362913;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.37637e-06;OID=.;OPOS=41588169;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:401:398:2:0:396:398:134:262:2:0:159:239:0:0 chrX 43591036 . G T 3740.16 PASS AO=452;DP=457;FAO=396;FDP=396;FR=.;FRO=0;FSAF=166;FSAR=230;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0201663;FXX=0.00999975;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.237;QD=37.7794;RBI=0.0212268;REFB=-0.0656294;REVB=0.00662559;RO=2;SAF=190;SAR=262;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000687332;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000250554;OID=.;OPOS=43591036;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:457:396:2:0:452:396:262:190:1:1:230:166:0:0 chrX 43603391 . T C 1634.56 PASS AO=171;DP=171;FAO=171;FDP=171;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0297514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.262;QD=38.2354;RBI=0.0489046;REFB=0;REVB=0.0388138;RO=0;SAF=79;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.03733e-05;OID=.;OPOS=43603391;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:77:171:171:0:0:171:171:92:79:0:0:92:79:0:0 chrX 44938563 . G A 238.59 PASS AO=82;DP=224;FAO=82;FDP=224;FR=.;FRO=142;FSAF=30;FSAR=52;FSRF=63;FSRR=79;FWDB=0.0182132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.015;QD=4.26056;RBI=0.019118;REFB=-0.00929144;REVB=0.00581174;RO=141;SAF=30;SAR=52;SRF=63;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.094317;STB=0.551664;TYPE=snp;VARB=0.013792;OID=.;OPOS=44938563;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:224:224:141:142:82:82:52:30:63:78:52:30:63:79 chrX 45051111 . C T 2092.15 PASS AO=195;DP=195;FAO=221;FDP=221;FR=.;FRO=0;FSAF=131;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.629;QD=37.8669;RBI=0.0809008;REFB=0;REVB=0.0789615;RO=0;SAF=129;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000135309;OID=.;OPOS=45051111;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:195:221:0:0:195:221:66:129:0:0:90:131:0:0 chrX 46472826 . G A 251.39 PASS AO=73;DP=176;FAO=73;FDP=176;FR=.;FRO=103;FSAF=32;FSAR=41;FSRF=44;FSRR=59;FWDB=-0.0545494;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.016;QD=5.71328;RBI=0.0550114;REFB=-0.00592889;REVB=-0.00711477;RO=102;SAF=32;SAR=41;SRF=43;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177887;STB=0.506648;TYPE=snp;VARB=0.0073045;OID=.;OPOS=46472826;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:176:176:102:103:73:73:41:32:43:59:41:32:44:59 chrX 46618321 . C G 56.86 PASS AO=20;DP=62;FAO=20;FDP=62;FR=.;FRO=42;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=35;FWDB=-0.0272454;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.0572;QD=3.66859;RBI=0.0789248;REFB=0.00746256;REVB=-0.074073;RO=42;SAF=5;SAR=15;SRF=7;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139976;STB=0.581322;TYPE=snp;VARB=-0.0304908;OID=.;OPOS=46618321;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:62:62:42:42:20:20:15:5:7:35:15:5:7:35 chrX 46740032 . G A 3366.18 PASS AO=361;DP=368;FAO=363;FDP=363;FR=.;FRO=0;FSAF=114;FSAR=249;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134405;FXX=0.0162597;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.142;QD=37.0929;RBI=0.0202976;REFB=0.0514896;REVB=0.01521;RO=7;SAF=113;SAR=248;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0286362;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.04072e-05;OID=.;OPOS=46740032;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:368:363:7:0:361:363:248:113:7:0:249:114:0:0 chrX 46913728 . AG A 1243.03 PASS AO=167;DP=236;FAO=222;FDP=222;FR=.;FRO=0;FSAF=121;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.105139;FXX=0.0176983;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.095;QD=22.397;RBI=0.392976;REFB=0.00104397;REVB=0.37865;RO=45;SAF=100;SAR=67;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0.243056;SSSB=0.107807;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00816974;OID=.;OPOS=46913729;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:167:222:222:222:0:121:101:0:0:95:45:100:67:15:30 chrX 46920599 . C A 282.8 PASS AO=106;DP=306;FAO=106;FDP=305;FR=.;FRO=199;FSAF=44;FSAR=62;FSRF=82;FSRR=117;FWDB=-0.00358617;FXX=0.00326787;HRUN=4;LEN=1;MLLD=231.021;QD=3.70882;RBI=0.00850325;REFB=-0.00181387;REVB=-0.00771003;RO=199;SAF=44;SAR=62;SRF=82;SRR=117;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00358346;STB=0.502039;TYPE=snp;VARB=0.00301522;OID=.;OPOS=46920599;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:306:305:199:199:106:106:62:44:82:117:62:44:82:117 chrX 46949254 . C A 523.75 PASS AO=130;DP=281;FAO=133;FDP=284;FR=.;FRO=151;FSAF=53;FSAR=80;FSRF=50;FSRR=101;FWDB=-0.000987552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.112;QD=7.37679;RBI=0.0195274;REFB=-0.00865758;REVB=0.0195024;RO=149;SAF=53;SAR=77;SRF=49;SRR=100;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0804423;STB=0.53793;TYPE=snp;VARB=0.00789439;OID=.;OPOS=46949254;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:281:284:149:151:130:133:77:53:49:100:80:53:50:101 chrX 47039612 . AG A 323.8 PASS AO=34;DP=51;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.346354;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=15.8226;QD=26.4327;RBI=0.383911;REFB=-0.0442592;REVB=0.165609;RO=11;SAF=16;SAR=18;SRF=10;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0.319864;SSSB=-0.19656;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0236055;OID=.;OPOS=47039613;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:34:49:49:49:0:28:21:0:0:25:11:16:18:10:1 chrX 47041224 . C T 283.85 PASS AO=70;DP=147;FAO=70;FDP=147;FR=.;FRO=77;FSAF=24;FSAR=46;FSRF=31;FSRR=46;FWDB=0.0170417;FXX=0.0067563;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.9084;QD=7.72367;RBI=0.0845094;REFB=-0.015779;REVB=0.0827733;RO=74;SAF=24;SAR=46;SRF=30;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0630239;STB=0.533971;TYPE=snp;VARB=0.0162462;OID=.;OPOS=47041224;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:147:147:74:77:70:70:46:24:30:44:46:24:31:46 chrX 47057647 . A G 1210.6 PASS AO=123;DP=124;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0171443;FXX=0.0156238;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.81;QD=38.4317;RBI=0.0201232;REFB=0;REVB=0.0105364;RO=0;SAF=61;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.55703e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.75647e-05;OID=.;OPOS=47057647;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:124:126:0:0:123:126:62:61:0:0:65:61:0:0 chrX 47062534 . G A 2021.65 PASS AO=209;DP=212;FAO=212;FDP=212;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0255341;FXX=0.0139528;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9455;QD=38.1443;RBI=0.100168;REFB=0;REVB=0.0968591;RO=1;SAF=102;SAR=107;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00443138;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000372637;OID=.;OPOS=47062534;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:96:212:212:1:0:209:212:107:102:0:1:109:103:0:0 chrX 47343254 . C T 2516.06 PASS AO=264;DP=266;FAO=264;FDP=264;FR=.;FRO=0;FSAF=139;FSAR=125;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00899034;FXX=0.00751851;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.208;QD=38.1221;RBI=0.0176924;REFB=0.0130147;REVB=0.0152379;RO=1;SAF=139;SAR=125;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00341772;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.22228e-05;OID=.;OPOS=47343254;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:266:264:1:0:264:264:125:139:1:0:125:139:0:0 chrX 47344173 . TA AT 10.45 PASS AO=2;DP=12;FAO=2;FDP=11;FR=.,HEALED;FRO=9;FSAF=1;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.155438;FXX=0.153728;HRUN=1;LEN=2;MLLD=12.3469;QD=3.79869;RBI=0.157583;REFB=0.00902899;REVB=-0.025913;RO=3;SAF=2;SAR=0;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.74993;STB=0.635105;TYPE=mnp;VARB=-0.0845023;OID=.;OPOS=47344173;OREF=TA;OALT=AT;OMAPALT=AT GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:11:11:3:9:2:2:0:2:0:3:1:1:3:6 chrX 47444879 . G C 598.19 PASS AO=88;DP=89;FAO=76;FDP=88;FR=.;FRO=12;FSAF=62;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=0;FWDB=-0.002714;FXX=0.0112347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.4711;QD=27.1904;RBI=0.0712308;REFB=0.0256555;REVB=0.0711791;RO=0;SAF=74;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.544107;TYPE=snp;VARB=-0.0463097;OID=.;OPOS=47444879;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:7:89:88:0:12:88:76:14:74:0:0:14:62:12:0 chrX 47444985 . T C 805.74 PASS AO=86;DP=87;FAO=86;FDP=87;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0304505;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=211.51;QD=37.0454;RBI=0.0308357;REFB=-0.125912;REVB=0.00485893;RO=0;SAF=23;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5983e-08;STB=0.503936;TYPE=snp;VARB=0.000259016;OID=.;OPOS=47444985;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:87:87:0:1:86:86:63:23:0:0:63:23:0:1 chrX 47445286 . A G 1971.93 PASS AO=206;DP=213;FAO=206;FDP=206;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=172;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00734357;FXX=0.0328623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.4549;QD=38.2899;RBI=0.00738893;REFB=0;REVB=0.00081753;RO=0;SAF=34;SAR=172;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.62022e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.66591e-05;OID=.;OPOS=47445286;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:213:206:0:0:206:206:172:34:0:0:172:34:0:0 chrX 47466361 . A G 1258.98 PASS AO=132;DP=134;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185269;FXX=0.0149243;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.74;QD=38.1509;RBI=0.0190939;REFB=0;REVB=-0.00461831;RO=0;SAF=67;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.83182e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.17728e-06;OID=.;OPOS=47466361;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:134:132:0:0:132:132:65:67:0:0:65:67:0:0 chrX 47483800 . G A 1184.89 PASS AO=124;DP=127;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0360385;FXX=0.0234357;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.062;QD=37.9166;RBI=0.0376178;REFB=-0.0496222;REVB=0.0107853;RO=2;SAF=51;SAR=73;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012838;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00016781;OID=.;OPOS=47483800;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:127:125:2:0:124:125:73:51:0:2:74:51:0:0 chrX 47487912 . T TG 989.1 PASS AO=119;DP=142;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0517089;FXX=0.0359686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=19.9354;QD=29.5254;RBI=0.0887903;REFB=0;REVB=-0.0721796;RO=13;SAF=61;SAR=58;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00482079;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00103415;OID=.;OPOS=47487913;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:119:142:134:134:0:70:64:0:0:86:13:61:58:7:6 chrX 47487916 . T A 1322.59 PASS AO=136;DP=136;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00924101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.887;QD=38.3361;RBI=0.0666677;REFB=0;REVB=-0.0660242;RO=0;SAF=70;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.03317e-05;OID=.;OPOS=47487916;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:136:138:0:0:136:138:66:70:0:0:68:70:0:0 chrX 47695547 . T C 849.81 PASS AO=337;DP=629;FAO=200;FDP=397;FR=.;FRO=197;FSAF=152;FSAR=48;FSRF=128;FSRR=69;FWDB=-0.0355893;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.4744;QD=8.56232;RBI=0.0404477;REFB=-0.0382358;REVB=0.0192202;RO=278;SAF=258;SAR=79;SRF=188;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0974268;STB=0.569555;TYPE=snp;VARB=0.0428078;OID=.;OPOS=47695547;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:629:397:278:197:337:200:79:258:188:90:48:152:128:69 chrX 47695742 . CT C 241.21 PASS AO=74;DP=203;FAO=95;FDP=197;FR=.;FRO=102;FSAF=34;FSAR=61;FSRF=53;FSRR=49;FWDB=-0.0968758;FXX=0.0149993;HRUN=2;LEN=1;MLLD=22.0429;QD=4.89764;RBI=0.109406;REFB=-0.0131653;REVB=-0.0508405;RO=97;SAF=27;SAR=47;SRF=50;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157026;STB=0.586585;TYPE=del;VARB=0.00942028;OID=.;OPOS=47695743;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:74:193:95:197:102:34:61:53:49:99:97:27:47:50:47 chrX 47705674 . C T 261.83 PASS AO=79;DP=199;FAO=81;FDP=204;FR=.;FRO=123;FSAF=39;FSAR=42;FSRF=68;FSRR=55;FWDB=0.00666405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.541;QD=5.13393;RBI=0.00891501;REFB=-0.0149764;REVB=0.00592182;RO=118;SAF=37;SAR=42;SRF=67;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105717;STB=0.54294;TYPE=snp;VARB=0.0203205;OID=.;OPOS=47705674;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:199:204:118:123:79:81:42:37:67:51:42:39:68:55 chrX 48049666 . C T 2005.23 PASS AO=203;DP=203;FAO=209;FDP=209;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=175;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0241237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.4285;QD=38.3777;RBI=0.0327633;REFB=0;REVB=0.0221694;RO=0;SAF=33;SAR=170;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000260123;OID=.;OPOS=48049666;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:94:203:209:0:0:203:209:170:33:0:0:175:34:0:0 chrX 48054740 . C G 1428.77 PASS AO=153;DP=155;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00301949;FXX=0.0129024;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.164;QD=37.3534;RBI=0.0278013;REFB=-0.0625295;REVB=0.0276369;RO=2;SAF=68;SAR=85;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0110603;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.71603e-05;OID=.;OPOS=48054740;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:155:153:2:0:153:153:85:68:0:2:85:68:0:0 chrX 48125798 . T C 407.44 PASS AO=95;DP=190;FAO=95;FDP=190;FR=.;FRO=95;FSAF=23;FSAR=72;FSRF=38;FSRR=57;FWDB=0.032307;FXX=0.00523533;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.3779;QD=8.57773;RBI=0.032989;REFB=-0.0054381;REVB=0.00667323;RO=94;SAF=23;SAR=72;SRF=38;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178469;STB=0.596798;TYPE=snp;VARB=0.0109222;OID=.;OPOS=48125798;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:190:190:94:95:95:95:72:23:38:56:72:23:38:57 chrX 48156264 . G A 243.71 PASS AO=70;DP=167;FAO=70;FDP=168;FR=.;FRO=98;FSAF=36;FSAR=34;FSRF=56;FSRR=42;FWDB=0.00109075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.992;QD=5.8026;RBI=0.0276701;REFB=0.012215;REVB=0.0276486;RO=95;SAF=36;SAR=34;SRF=53;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0450036;STB=0.533415;TYPE=snp;VARB=-0.0149732;OID=.;OPOS=48156264;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:168:95:98:70:70:34:36:53:42:34:36:56:42 chrX 48161189 . A G 197.06 PASS AO=58;DP=143;FAO=58;FDP=143;FR=.;FRO=85;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=43;FSRR=42;FWDB=-0.0181259;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.9697;QD=5.51222;RBI=0.018126;REFB=0.0159841;REVB=8.38931e-05;RO=85;SAF=27;SAR=31;SRF=43;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0426684;STB=0.52402;TYPE=snp;VARB=-0.0260099;OID=.;OPOS=48161189;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:143:85:85:58:58:31:27:43:42:31:27:43:42 chrX 48163105 . A G 383.92 PASS AO=99;DP=216;FAO=99;FDP=215;FR=.;FRO=116;FSAF=35;FSAR=64;FSRF=40;FSRR=76;FWDB=-0.0141601;FXX=0.00462942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.737;QD=7.14265;RBI=0.0196569;REFB=-0.0295606;REVB=-0.013634;RO=116;SAF=35;SAR=64;SRF=40;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00931566;STB=0.505154;TYPE=snp;VARB=0.029618;OID=.;OPOS=48163105;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:216:215:116:116:99:99:64:35:40:76:64:35:40:76 chrX 48163717 . C T 570.23 PASS AO=131;DP=258;FAO=131;FDP=257;FR=.;FRO=126;FSAF=57;FSAR=74;FSRF=59;FSRR=67;FWDB=0.00391095;FXX=0.00387582;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.369;QD=8.87517;RBI=0.0113294;REFB=-0.0222842;REVB=0.0106329;RO=121;SAF=57;SAR=74;SRF=59;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0465509;STB=0.516453;TYPE=snp;VARB=0.0233639;OID=.;OPOS=48163717;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:258:257:121:126:131:131:74:57:59:62:74:57:59:67 chrX 48317386 . A G 217.69 PASS AO=84;DP=253;FAO=85;FDP=254;FR=.;FRO=169;FSAF=36;FSAR=49;FSRF=55;FSRR=114;FWDB=0.0384548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.2125;QD=3.42818;RBI=0.0414075;REFB=-0.011899;REVB=-0.015356;RO=168;SAF=35;SAR=49;SRF=55;SRR=113;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109561;STB=0.568204;TYPE=snp;VARB=0.0240233;OID=.;OPOS=48317386;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:253:254:168:169:84:85:49:35:55:113:49:36:55:114 chrX 48368338 . AGGC AGC,AG 406.21 PASS AO=34,11;DP=62;FAO=59,0;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=33,0;FSAR=26,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.294906,0.235893;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,2;MLLD=17.7194,31.7242;QD=27.5395;RBI=0.298017,0.302095;REFB=-0.0346023,-0.0475012;REVB=0.0429494,-0.188721;RO=7;SAF=20,0;SAR=14,11;SRF=7;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0.376019,0.376019;SSSB=-0.138622,-0.851555;STB=0.5,0.5;TYPE=del,del;VARB=0.0109542,0;OID=.,.;OPOS=48368339,48368340;OREF=G,GC;OALT=-,-;OMAPALT=AGC,AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:34,11:55:59,0:59:0:33,0:26,0:0:0:33:7:20,0:14,11:7:0 chrX 48435928 . C T 1108.06 PASS AO=116;DP=116;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104952;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.218;QD=38.2091;RBI=0.0211255;REFB=0;REVB=0.018334;RO=0;SAF=50;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18089e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.57203e-05;OID=.;OPOS=48435928;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:52:116:116:0:0:116:116:66:50:0:0:66:50:0:0 chrX 48460314 . A G 2084.62 PASS AO=220;DP=222;FAO=221;FDP=221;FR=.;FRO=0;FSAF=128;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142148;FXX=0.017777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.885;QD=37.7307;RBI=0.0217344;REFB=-0.0259141;REVB=-0.0164416;RO=2;SAF=127;SAR=93;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101349;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.11673e-05;OID=.;OPOS=48460314;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:82:222:221:2:0:220:221:93:127:0:2:93:128:0:0 chrX 48751471 . A G 78.05 PASS AO=20;DP=51;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=24;FSRR=7;FWDB=-0.00316957;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.677;QD=6.00349;RBI=0.0512594;REFB=-0.0281721;REVB=0.0511613;RO=31;SAF=14;SAR=6;SRF=24;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0977955;STB=0.545413;TYPE=snp;VARB=0.0386139;OID=.;OPOS=48751471;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:51:52:31:31:20:21:6:14:24:7:6:15:24:7 chrX 48759204 . C T 358.56 PASS AO=80;DP=154;FAO=80;FDP=154;FR=.;FRO=74;FSAF=25;FSAR=55;FSRF=25;FSRR=49;FWDB=0.00879433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.2767;QD=9.31316;RBI=0.0138305;REFB=-0.0273778;REVB=0.0106744;RO=74;SAF=25;SAR=55;SRF=25;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0255193;STB=0.514015;TYPE=snp;VARB=0.0224613;OID=.;OPOS=48759204;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:154:74:74:80:80:55:25:25:49:55:25:25:49 chrX 48847497 . T C 319.48 PASS AO=82;DP=201;FAO=91;FDP=211;FR=.;FRO=120;FSAF=76;FSAR=15;FSRF=84;FSRR=36;FWDB=-0.0278175;FXX=0.00938923;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.2458;QD=6.0565;RBI=0.0317668;REFB=0.0020079;REVB=0.0153401;RO=119;SAF=69;SAR=13;SRF=83;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230525;STB=0.617562;TYPE=snp;VARB=-0.00542567;OID=.;OPOS=48847497;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:211:119:120:82:91:13:69:83:36:15:76:84:36 chrX 48888074 . T C 453.67 PASS AO=124;DP=283;FAO=124;FDP=281;FR=.;FRO=157;FSAF=60;FSAR=64;FSRF=84;FSRR=73;FWDB=-0.00315147;FXX=0.010563;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.674;QD=6.45796;RBI=0.013396;REFB=-0.00882682;REVB=-0.01302;RO=157;SAF=60;SAR=64;SRF=84;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0514868;STB=0.528557;TYPE=snp;VARB=0.0120025;OID=.;OPOS=48888074;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:283:281:157:157:124:124:64:60:84:73:64:60:84:73 chrX 49021256 . A G 2564.77 PASS AO=267;DP=267;FAO=267;FDP=267;FR=.;FRO=0;FSAF=107;FSAR=160;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0117535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.155;QD=38.4235;RBI=0.0156738;REFB=0;REVB=0.0103693;RO=0;SAF=107;SAR=160;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.95891e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.05913e-07;OID=.;OPOS=49021256;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:267:267:0:0:267:267:160:107:0:0:160:107:0:0 chrX 49021537 . G C 2195.84 PASS AO=227;DP=228;FAO=231;FDP=231;FR=.;FRO=0;FSAF=139;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0200875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.8985;QD=38.0233;RBI=0.0382819;REFB=0;REVB=0.0325882;RO=0;SAF=136;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.42477e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000140103;OID=.;OPOS=49021537;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:228:231:0:0:227:231:91:136:0:0:92:139:0:0 chrX 49022700 . T C 296.76 PASS AO=30;DP=30;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0502748;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.586;QD=37.0944;RBI=0.0645015;REFB=0;REVB=0.040409;RO=0;SAF=17;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.63861e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.02017e-05;OID=.;OPOS=49022700;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:30:32:0:0:30:32:13:17:0:0:13:19:0:0 chrX 49071964 . A G 113.22 PASS AO=26;DP=54;FAO=26;FDP=54;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.00551699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.47;QD=8.38695;RBI=0.0352541;REFB=-0.0239061;REVB=0.0348198;RO=25;SAF=11;SAR=15;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15448;STB=0.576864;TYPE=snp;VARB=0.0285127;OID=.;OPOS=49071964;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:54:54:25:28:26:26:15:11:15:10:15:11:16:12 chrX 49081291 . G A 249.17 PASS AO=52;DP=99;FAO=52;FDP=97;FR=.;FRO=45;FSAF=38;FSAR=14;FSRF=38;FSRR=7;FWDB=-0.0159406;FXX=0.0490148;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.547;QD=10.2752;RBI=0.0790363;REFB=-0.0363324;REVB=0.0774121;RO=43;SAF=38;SAR=14;SRF=36;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118893;STB=0.571403;TYPE=snp;VARB=0.0306706;OID=.;OPOS=49081291;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:99:97:43:45:52:52:14:38:36:7:14:38:38:7 chrX 49082499 . C T 121.42 PASS AO=37;DP=96;FAO=37;FDP=96;FR=.;FRO=59;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=33;FWDB=0.0402488;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.967;QD=5.05898;RBI=0.0506149;REFB=-0.0200213;REVB=-0.0306905;RO=57;SAF=20;SAR=17;SRF=24;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126891;STB=0.561134;TYPE=snp;VARB=0.0535944;OID=.;OPOS=49082499;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:96:96:57:59:37:37:17:20:24:33:17:20:26:33 chrX 49103224 . G A 274.59 PASS AO=37;DP=50;FAO=41;FDP=54;FR=.;FRO=13;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.0589503;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.457;QD=20.3396;RBI=0.0658862;REFB=-0.0433398;REVB=0.0294253;RO=13;SAF=23;SAR=14;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00318025;STB=0.504852;TYPE=snp;VARB=0.014328;OID=.;OPOS=49103224;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:50:54:13:13:37:41:14:23:8:5:15:26:8:5 chrX 49369636 . C A 32.04 PASS AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=-0.0184222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.3912;QD=5.82591;RBI=0.0579523;REFB=-0.00787635;REVB=0.0549462;RO=14;SAF=1;SAR=7;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.274278;STB=0.672562;TYPE=snp;VARB=0.0184392;OID=.;OPOS=49369636;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:32:22:22:14:14:8:8:7:1:4:10:7:1:4:10 chrX 49710052 . G GC 238.12 PASS AO=34;DP=51;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.197641;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=13.6727;QD=20.7059;RBI=0.209665;REFB=-0.00820493;REVB=-0.0699831;RO=15;SAF=11;SAR=23;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202645;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00644783;OID=.;OPOS=49710053;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:34:51:46:46:0:18:28:0:0:15:15:11:23:10:5 chrX 49767832 . A G 717.79 PASS AO=77;DP=81;FAO=79;FDP=81;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00891269;FXX=0.0121936;HRUN=6;LEN=1;MLLD=222.67;QD=35.4463;RBI=0.0184939;REFB=-0.00934116;REVB=-0.0162046;RO=2;SAF=39;SAR=38;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0242558;STB=0.512192;TYPE=snp;VARB=1.37224e-05;OID=.;OPOS=49767832;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:81:81:2:2:77:79:38:39:0:2:40:39:0:2 chrX 49767835 . A G 712.32 PASS AO=76;DP=78;FAO=77;FDP=79;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=39;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0467929;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=230.087;QD=36.0667;RBI=0.0471255;REFB=-0.151137;REVB=-0.00558955;RO=2;SAF=38;SAR=38;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0242528;STB=0.512817;TYPE=snp;VARB=0.000477347;OID=.;OPOS=49767835;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:78:79:2:2:76:77:38:38:2:0:39:38:2:0 chrX 50121146 . A AG 1501.54 PASS AO=181;DP=220;FAO=203;FDP=203;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=114;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.264434;FXX=0.0287068;HRUN=1;LEN=1;MLLD=23.4073;QD=29.587;RBI=0.265774;REFB=0;REVB=-0.0266526;RO=33;SAF=72;SAR=109;SRF=25;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106832;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00184115;OID=.;OPOS=50121147;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:181:220:203:203:0:89:114:0:0:99:33:72:109:25:8 chrX 50146570 . C T 166.14 PASS AO=48;DP=118;FAO=48;FDP=118;FR=.;FRO=70;FSAF=10;FSAR=38;FSRF=40;FSRR=30;FWDB=-0.0276529;FXX=0.00840265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7715;QD=5.63184;RBI=0.0311326;REFB=-0.0407308;REVB=0.0143024;RO=66;SAF=10;SAR=38;SRF=37;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.4004;STB=0.736328;TYPE=snp;VARB=0.0228998;OID=.;OPOS=50146570;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:66:70:48:48:38:10:37:29:38:10:40:30 chrX 52825546 . C G 2702.61 PASS AO=289;DP=297;FAO=293;FDP=297;FR=.;FRO=4;FSAF=156;FSAR=137;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0248031;FXX=0.00668874;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.8844;QD=36.3988;RBI=0.0287301;REFB=-0.123258;REVB=0.0144991;RO=5;SAF=156;SAR=133;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00455946;STB=0.500438;TYPE=snp;VARB=0.00142189;OID=.;OPOS=52825546;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:87:297:297:5:4:289:293:133:156:2:3:137:156:2:2 chrX 52891619 . GT G 94.63 PASS AO=102;DP=313;FAO=99;FDP=303;FR=.;FRO=204;FSAF=56;FSAR=43;FSRF=89;FSRR=115;FWDB=-0.0212278;FXX=0.00655716;HRUN=4;LEN=1;MLLD=13.8761;QD=1.24927;RBI=0.0240737;REFB=-0.0358321;REVB=0.0113544;RO=188;SAF=55;SAR=47;SRF=87;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0870361;STB=0.586603;TYPE=del;VARB=0.0696541;OID=.;OPOS=52891620;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:102:313:99:303:204:56:43:89:115:94:188:55:47:87:101 chrX 52891645 . A G 291.67 PASS AO=107;DP=310;FAO=107;FDP=304;FR=.;FRO=197;FSAF=56;FSAR=51;FSRF=87;FSRR=110;FWDB=0.022362;FXX=0.0161807;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.924;QD=3.83779;RBI=0.0357592;REFB=-0.0100294;REVB=-0.0279045;RO=189;SAF=56;SAR=51;SRF=86;SRR=103;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0768829;STB=0.552814;TYPE=snp;VARB=0.0157404;OID=.;OPOS=52891645;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:310:304:189:197:107:107:51:56:86:103:51:56:87:110 chrX 52891653 . C T 290.59 PASS AO=114;DP=303;FAO=106;FDP=300;FR=.;FRO=194;FSAF=53;FSAR=53;FSRF=91;FSRR=103;FWDB=-0.00665947;FXX=0.0066223;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.7852;QD=3.87456;RBI=0.0163428;REFB=0.0095404;REVB=0.0149244;RO=189;SAF=61;SAR=53;SRF=86;SRR=103;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0883887;STB=0.519996;TYPE=snp;VARB=-0.0239121;OID=.;OPOS=52891653;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:303:300:189:194:114:106:53:61:86:103:53:53:91:103 chrX 53264116 . TG T 237.9 PASS AO=30;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.156739;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=16.1749;QD=27.1888;RBI=0.230643;REFB=0;REVB=0.169201;RO=3;SAF=14;SAR=16;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0.508475;SSSB=-0.0338575;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0153516;OID=.;OPOS=53264117;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:30:35:35:35:0:17:18:0:0:22:3:14:16:2:1 chrX 53457622 . T C 1508.18 PASS AO=155;DP=157;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00154074;FXX=0.0125778;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.346;QD=38.4249;RBI=0.0169354;REFB=0;REVB=0.0168652;RO=0;SAF=50;SAR=105;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.01816e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.92197e-05;OID=.;OPOS=53457622;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:157:157:0:0:155:157:105:50:0:0:107:50:0:0 chrX 53563589 . A G 1972.57 PASS AO=208;DP=213;FAO=208;FDP=208;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=133;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0674239;FXX=0.0234731;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.617;QD=37.9341;RBI=0.0794487;REFB=-0.0988723;REVB=-0.0420251;RO=1;SAF=75;SAR=133;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00630891;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.58761e-06;OID=.;OPOS=53563589;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:213:208:1:0:208:208:133:75:1:0:133:75:0:0 chrX 53641647 . T C 470.54 PASS AO=119;DP=254;FAO=119;FDP=253;FR=.;FRO=134;FSAF=37;FSAR=82;FSRF=52;FSRR=82;FWDB=0.00612452;FXX=0.00393685;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.892;QD=7.4394;RBI=0.0061454;REFB=-0.0253829;REVB=-0.000506162;RO=133;SAF=37;SAR=82;SRF=52;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0859432;STB=0.546004;TYPE=snp;VARB=0.0278722;OID=.;OPOS=53641647;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:254:253:133:134:119:119:82:37:52:81:82:37:52:82 chrX 53652838 . G A 71.75 PASS AO=12;DP=21;FAO=12;FDP=20;FR=.;FRO=8;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0124801;FXX=0.0475964;HRUN=4;LEN=1;MLLD=129.916;QD=14.3504;RBI=0.021875;REFB=-0.0117972;REVB=0.0179656;RO=8;SAF=10;SAR=2;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216214;STB=0.624765;TYPE=snp;VARB=0.0118011;OID=.;OPOS=53652838;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:21:20:8:8:12:12:2:10:5:3:2:10:5:3 chrX 53652846 . G T 331.94 PASS AO=41;DP=46;FAO=41;FDP=46;FR=.;FRO=5;FSAF=34;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0195032;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=242.261;QD=28.864;RBI=0.019507;REFB=-0.00452572;REVB=-0.00038675;RO=4;SAF=34;SAR=7;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150991;STB=0.574285;TYPE=snp;VARB=0.000108632;OID=.;OPOS=53652846;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:46:46:4:5:41:41:7:34:1:3:7:34:2:3 chrX 53652852 . T G 717.87 PASS AO=69;DP=69;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00924595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.39;QD=37.7827;RBI=0.0405698;REFB=0;REVB=0.0395022;RO=0;SAF=59;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000186034;OID=.;OPOS=53652852;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:69:76:0:0:69:76:10:59:0:0:13:63:0:0 chrX 53659047 . C T 525.36 PASS AO=238;DP=570;FAO=159;FDP=388;FR=.;FRO=229;FSAF=53;FSAR=106;FSRF=49;FSRR=180;FWDB=0.0343213;FXX=0.0299992;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.9201;QD=5.41603;RBI=0.0358164;REFB=-0.0130037;REVB=-0.0102402;RO=297;SAF=78;SAR=160;SRF=65;SRR=232;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131052;STB=0.583664;TYPE=snp;VARB=0.0224813;OID=.;OPOS=53659047;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:570:388:297:229:238:159:160:78:65:232:106:53:49:180 chrX 54112185 . C T 212.36 PASS AO=29;DP=75;FAO=49;FDP=100;FR=.;FRO=51;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=21;FSRR=30;FWDB=-0.00882379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.5701;QD=8.49448;RBI=0.086225;REFB=-0.0340135;REVB=-0.0857723;RO=41;SAF=21;SAR=8;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.262015;STB=0.519247;TYPE=snp;VARB=0.0341444;OID=.;OPOS=54112185;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:77:100:41:51:29:49:8:21:20:21:27:22:21:30 chrX 54360006 . G C 206.51 PASS AO=64;DP=167;FAO=65;FDP=168;FR=.;FRO=103;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=53;FSRR=50;FWDB=0.00853502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.943;QD=4.91681;RBI=0.0139171;REFB=-0.0313389;REVB=0.0109927;RO=102;SAF=32;SAR=32;SRF=53;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.021313;STB=0.504213;TYPE=snp;VARB=0.0226144;OID=.;OPOS=54360006;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:168:102:103:64:65:32:32:53:49:32:33:53:50 chrX 54836361 . A G 303.29 PASS AO=78;DP=170;FAO=78;FDP=171;FR=.;FRO=93;FSAF=35;FSAR=43;FSRF=31;FSRR=62;FWDB=-0.00255114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.505;QD=7.09456;RBI=0.0218116;REFB=-0.0154949;REVB=-0.0216618;RO=84;SAF=35;SAR=43;SRF=28;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111112;STB=0.56424;TYPE=snp;VARB=0.0201413;OID=.;OPOS=54836361;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:170:171:84:93:78:78:43:35:28:56:43:35:31:62 chrX 54836505 . A G 70.48 PASS AO=26;DP=81;FAO=26;FDP=81;FR=.;FRO=55;FSAF=26;FSAR=0;FSRF=55;FSRR=0;FWDB=0.00619414;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=286.901;QD=3.48031;RBI=0.00619414;REFB=-0.0111122;REVB=0;RO=55;SAF=26;SAR=0;SRF=55;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0336344;OID=.;OPOS=54836505;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:81:81:55:55:26:26:0:26:55:0:0:26:55:0 chrX 54837338 . GCC GC,GCT 1010.85 PASS AO=34,111;DP=187;FAO=37,107;FDP=159;FR=.;FRO=15;FSAF=2,42;FSAR=35,65;FSRF=13;FSRR=2;FWDB=0.0435337,0.0117554;FXX=0.0245384;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=14.48,226.468;QD=25.4302;RBI=0.0544962,0.0126185;REFB=-0.150983,-0.039361;REVB=-0.0327819,-0.00458649;RO=18;SAF=1,45;SAR=33,66;SRF=17;SRR=1;SSEN=0.425393,0;SSEP=0.362069,0;SSSB=-0.797229,-0.142893;STB=0.876192,0.559544;TYPE=del,snp;VARB=0.0418171,0.00723252;OID=.,.;OPOS=54837339,54837340;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=GC,GCT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:34,111:173:37,107:159:15:2,42:35,65:13:2:63:18:1,45:33,66:17:1 chrX 54838077 . C T 283.59 PASS AO=77;DP=177;FAO=77;FDP=176;FR=.;FRO=99;FSAF=59;FSAR=18;FSRF=64;FSRR=35;FWDB=0.0288863;FXX=0.0056494;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.7406;QD=6.44525;RBI=0.0384551;REFB=-0.00606798;REVB=0.0253846;RO=96;SAF=59;SAR=18;SRF=62;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151425;STB=0.585447;TYPE=snp;VARB=0.0105022;OID=.;OPOS=54838077;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:177:176:96:99:77:77:18:59:62:34:18:59:64:35 chrX 54949813 . C T 987.02 PASS AO=205;DP=376;FAO=209;FDP=380;FR=.;FRO=171;FSAF=89;FSAR=120;FSRF=86;FSRR=85;FWDB=0.0435605;FXX=0.0026246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.9481;QD=10.3897;RBI=0.0467415;REFB=-0.0128745;REVB=0.0169484;RO=169;SAF=85;SAR=120;SRF=85;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0745519;STB=0.535097;TYPE=snp;VARB=0.0103915;OID=.;OPOS=54949813;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:376:380:169:171:205:209:120:85:85:84:120:89:86:85 chrX 54952989 . CCT C 243.21 PASS AO=66;DP=128;FAO=67;FDP=116;FR=.;FRO=49;FSAF=25;FSAR=42;FSRF=14;FSRR=35;FWDB=-0.0462244;FXX=0;HRUN=3;LEN=2;MLLD=204.253;QD=8.38646;RBI=0.0467605;REFB=0.00270635;REVB=0.00706028;RO=50;SAF=24;SAR=42;SRF=14;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0730344;STB=0.540263;TYPE=del;VARB=-0.00176466;OID=.;OPOS=54952990;OREF=CT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:66:116:67:116:49:25:42:14:35:99:50:24:42:14:36 chrX 54955851 . T C 16.37 PASS AO=18;DP=108;FAO=18;FDP=109;FR=.;FRO=91;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=58;FSRR=33;FWDB=-0.0507526;FXX=0.0267833;HRUN=4;LEN=1;MLLD=158.983;QD=0.600639;RBI=0.0514349;REFB=-0.0135886;REVB=-0.00835004;RO=79;SAF=10;SAR=8;SRF=47;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0508439;STB=0.570155;TYPE=snp;VARB=0.0605104;OID=.;OPOS=54955851;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:108:109:79:91:18:18:8:10:47:32:8:10:58:33 chrX 54975524 . A T 97.82 PASS AO=15;DP=49;FAO=24;FDP=55;FR=.,HEALED;FRO=30;FSAF=22;FSAR=2;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=0.00099149;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.84;QD=7.11383;RBI=0.00203726;REFB=-0.0484664;REVB=0.00177971;RO=12;SAF=13;SAR=2;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.457576;STB=0.776876;TYPE=snp;VARB=0.0316885;OID=.;OPOS=54975524;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:47:55:12:30:15:24:2:13:5:7:2:22:19:11 chrX 55116466 . C G 2705.88 PASS AO=286;DP=289;FAO=286;FDP=286;FR=.;FRO=0;FSAF=124;FSAR=162;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137757;FXX=0.0069442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.6765;QD=37.8444;RBI=0.0178316;REFB=-0.0398972;REVB=0.0113225;RO=0;SAF=124;SAR=162;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.22862e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00024132;OID=.;OPOS=55116466;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:289:286:0:0:286:286:162:124:0:0:162:124:0:0 chrX 55172537 . G A 1994.66 PASS AO=406;DP=539;FAO=300;FDP=399;FR=.;FRO=99;FSAF=150;FSAR=150;FSRF=59;FSRR=40;FWDB=0.0180377;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.4955;QD=19.9966;RBI=0.0557092;REFB=-0.0288677;REVB=-0.0527082;RO=132;SAF=202;SAR=204;SRF=74;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0291321;STB=0.523808;TYPE=snp;VARB=0.0117027;OID=.;OPOS=55172537;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:539:399:132:99:406:300:204:202:74:58:150:150:59:40 chrX 55172630 . G A 43.8 PASS AO=160;DP=857;FAO=69;FDP=400;FR=.;FRO=331;FSAF=50;FSAR=19;FSRF=189;FSRR=142;FWDB=-0.000568452;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=80.0712;QD=0.437952;RBI=0.0652566;REFB=0.0013067;REVB=0.0652542;RO=697;SAF=106;SAR=54;SRF=377;SRR=320;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164397;STB=0.639303;TYPE=snp;VARB=-0.00398709;OID=.;OPOS=55172630;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:857:400:697:331:160:69:54:106:377:320:19:50:189:142 chrX 55172645 . C T 1261.62 PASS AO=341;DP=871;FAO=242;FDP=370;FR=.,HEALED;FRO=128;FSAF=160;FSAR=82;FSRF=69;FSRR=59;FWDB=0.00640209;FXX=0.0749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.6868;QD=13.6392;RBI=0.00667032;REFB=-0.0103373;REVB=0.00187254;RO=274;SAF=295;SAR=46;SRF=138;SRR=136;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.417024;STB=0.545741;TYPE=snp;VARB=0.00787635;OID=.;OPOS=55172645;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:829:370:274:128:341:242:46:295:138:136:82:160:69:59 chrX 55172675 . C T 15.56 PASS AO=134;DP=879;FAO=55;FDP=400;FR=.;FRO=345;FSAF=38;FSAR=17;FSRF=204;FSRR=141;FWDB=0.0428946;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.4107;QD=0.155576;RBI=0.0510512;REFB=-0.00105652;REVB=-0.0276817;RO=726;SAF=86;SAR=48;SRF=417;SRR=309;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.091701;STB=0.593363;TYPE=snp;VARB=0.00772296;OID=.;OPOS=55172675;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:879:400:726:345:134:55:48:86:417:309:17:38:204:141 chrX 55172687 . T C 729.88 PASS AO=562;DP=837;FAO=187;FDP=400;FR=.;FRO=213;FSAF=121;FSAR=66;FSRF=129;FSRR=84;FWDB=0.0300781;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.0982;QD=7.29879;RBI=0.0328933;REFB=0.0148046;REVB=0.0133146;RO=273;SAF=379;SAR=183;SRF=128;SRR=145;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135594;STB=0.523807;TYPE=snp;VARB=-0.0162421;OID=.;OPOS=55172687;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:837:400:273:213:562:187:183:379:128:145:66:121:129:84 chrX 55172708 . T G 1493.57 PASS AO=485;DP=744;FAO=262;FDP=399;FR=.;FRO=137;FSAF=212;FSAR=50;FSRF=55;FSRR=82;FWDB=0.0167323;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.007;QD=14.9731;RBI=0.0322558;REFB=-0.00501181;REVB=-0.0275766;RO=258;SAF=373;SAR=112;SRF=120;SRR=138;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237796;STB=0.677006;TYPE=snp;VARB=0.0041044;OID=.;OPOS=55172708;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:744:399:258:137:485:262:112:373:120:138:50:212:55:82 chrX 55172716 . C T 51.61 PASS AO=131;DP=718;FAO=72;FDP=400;FR=.;FRO=328;FSAF=53;FSAR=19;FSRF=220;FSRR=108;FWDB=-0.0115069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.217;QD=0.516149;RBI=0.0115672;REFB=-0.00263504;REVB=0.00117939;RO=582;SAF=100;SAR=31;SRF=392;SRR=190;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144204;STB=0.564757;TYPE=snp;VARB=0.0111842;OID=.;OPOS=55172716;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:51:718:400:582:328:131:72:31:100:392:190:19:53:220:108 chrX 55185568 . A G 638.01 PASS AO=182;DP=412;FAO=176;FDP=400;FR=.;FRO=224;FSAF=46;FSAR=130;FSRF=126;FSRR=98;FWDB=0.0137338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.87;QD=6.38012;RBI=0.0138344;REFB=-0.00143098;REVB=0.00166584;RO=229;SAF=49;SAR=133;SRF=128;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.310107;STB=0.68069;TYPE=snp;VARB=0.000854052;OID=.;OPOS=55185568;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:412:400:229:224:182:176:133:49:128:101:130:46:126:98 chrX 55185656 . C A 27.79 PASS AO=68;DP=444;FAO=62;FDP=400;FR=.;FRO=338;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=165;FSRR=173;FWDB=-0.00797126;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.418;QD=0.277934;RBI=0.0143724;REFB=-0.00653836;REVB=0.0119593;RO=356;SAF=31;SAR=37;SRF=178;SRR=178;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0572426;STB=0.530982;TYPE=snp;VARB=0.0259721;OID=.;OPOS=55185656;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:444:400:356:338:68:62:37:31:178:178:34:28:165:173 chrX 55247030 . C G 1539.32 PASS AO=163;DP=164;FAO=163;FDP=163;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0197734;FXX=0.00609719;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.491;QD=37.7748;RBI=0.0199668;REFB=0.0244088;REVB=-0.00277236;RO=1;SAF=56;SAR=107;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00442683;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00195043;OID=.;OPOS=55247030;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:164:163:1:0:163:163:107:56:0:1:107:56:0:0 chrX 55287031 . T G 809.84 PASS AO=675;DP=1456;FAO=193;FDP=389;FR=.;FRO=196;FSAF=83;FSAR=110;FSRF=85;FSRR=111;FWDB=0.00485188;FXX=0.0274993;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.2454;QD=8.32741;RBI=0.0212038;REFB=-0.0418922;REVB=0.0206412;RO=743;SAF=299;SAR=376;SRF=335;SRR=408;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00765187;STB=0.50186;TYPE=snp;VARB=0.0344832;OID=.;OPOS=55287031;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:1456:389:743:196:675:193:376:299:335:408:110:83:85:111 chrX 55289774 . T C 2020.35 PASS AO=211;DP=212;FAO=213;FDP=213;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=181;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00494486;FXX=0.00467268;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.558;QD=37.9409;RBI=0.00817685;REFB=-0.0238133;REVB=0.00651224;RO=0;SAF=32;SAR=179;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.14041e-06;OID=.;OPOS=55289774;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:87:212:213:0:0:211:213:179:32:0:0:181:32:0:0 chrX 55479299 . G A 280.12 PASS AO=125;DP=340;FAO=122;FDP=391;FR=.;FRO=269;FSAF=14;FSAR=108;FSRF=152;FSRR=117;FWDB=-0.0770284;FXX=0.0224994;HRUN=5;LEN=1;MLLD=68.2447;QD=2.86563;RBI=0.0791253;REFB=-0.0267761;REVB=0.0180952;RO=183;SAF=13;SAR=112;SRF=80;SRR=103;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.503522;STB=0.850491;TYPE=snp;VARB=0.0458124;OID=.;OPOS=55479299;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:340:391:183:269:125:122:112:13:80:103:108:14:152:117 chrX 55514818 . C T 182.07 PASS AO=54;DP=131;FAO=53;FDP=131;FR=.;FRO=78;FSAF=16;FSAR=37;FSRF=35;FSRR=43;FWDB=0.066097;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.4359;QD=5.55925;RBI=0.0662572;REFB=0.000459351;REVB=-0.00460429;RO=76;SAF=17;SAR=37;SRF=33;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135217;STB=0.595794;TYPE=snp;VARB=0.00122459;OID=.;OPOS=55514818;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:76:78:54:53:37:17:33:43:37:16:35:43 chrX 55651001 . T C 1275.47 PASS AO=132;DP=132;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0333272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.9184;QD=38.0736;RBI=0.0389763;REFB=0;REVB=0.0202101;RO=0;SAF=58;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.90274e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.17511e-05;OID=.;OPOS=55651001;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:132:134:0:0:132:134:74:58:0:0:76:58:0:0 chrX 57163183 . G A 72.27 PASS AO=5;DP=17;FAO=11;FDP=16;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0.0587889;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.321;QD=18.0679;RBI=0.0317169;REFB=-0.0237514;REVB=0.0317169;RO=4;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00521629;OID=.;OPOS=57163183;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:11:16:4:5:5:11:5:0:0:4:11:0:0:5 chrX 57313357 . T C 516.51 PASS AO=134;DP=302;FAO=138;FDP=301;FR=.;FRO=163;FSAF=58;FSAR=80;FSRF=82;FSRR=81;FWDB=-0.00937007;FXX=0.0290313;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.4491;QD=6.86393;RBI=0.0434824;REFB=-0.0401278;REVB=-0.0424609;RO=158;SAF=58;SAR=76;SRF=79;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0662878;STB=0.545324;TYPE=snp;VARB=0.0525034;OID=.;OPOS=57313357;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:302:301:158:163:134:138:76:58:79:79:80:58:82:81 chrX 57405163 . T C 2795.19 PASS AO=289;DP=290;FAO=290;FDP=290;FR=.;FRO=0;FSAF=114;FSAR=176;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0720952;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.855;QD=38.5544;RBI=0.0738292;REFB=0;REVB=0.0159069;RO=0;SAF=113;SAR=176;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.27149e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.60202e-05;OID=.;OPOS=57405163;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:290:290:0:0:289:290:176:113:0:0:176:114:0:0 chrX 57475132 . T C 359.28 PASS AO=88;DP=229;FAO=104;FDP=243;FR=.;FRO=139;FSAF=46;FSAR=58;FSRF=62;FSRR=77;FWDB=-0.0386603;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=40.5245;QD=5.91413;RBI=0.0985169;REFB=-0.0181363;REVB=0.0906143;RO=141;SAF=42;SAR=46;SRF=63;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0334073;STB=0.502164;TYPE=snp;VARB=0.0247641;OID=.;OPOS=57475132;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:229:243:141:139:88:104:46:42:63:78:58:46:62:77 chrX 57619648 . G T 1161.16 PASS AO=123;DP=127;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018536;FXX=0.0236202;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.673;QD=37.4566;RBI=0.0348506;REFB=-0.0359134;REVB=0.0295124;RO=2;SAF=62;SAR=61;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.01532;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.33117e-05;OID=.;OPOS=57619648;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:47:127:124:2:0:123:124:61:62:0:2:62:62:0:0 chrX 57622607 . G A 276.12 PASS AO=101;DP=241;FAO=84;FDP=211;FR=.;FRO=127;FSAF=32;FSAR=52;FSRF=59;FSRR=68;FWDB=0.0143521;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=179.163;QD=5.23442;RBI=0.0151342;REFB=0.000873545;REVB=0.00480193;RO=138;SAF=43;SAR=58;SRF=66;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0550482;STB=0.552017;TYPE=snp;VARB=-0.00114038;OID=.;OPOS=57622607;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:241:211:138:127:101:84:58:43:66:72:52:32:59:68 chrX 63405334 . A C 10.78 PASS AO=4;DP=10;FAO=3;FDP=11;FR=.;FRO=8;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.617;QD=3.92075;RBI=0.0177253;REFB=-0.0141997;REVB=0.0177253;RO=6;SAF=0;SAR=4;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0235365;OID=.;OPOS=63405334;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:10:11:6:8:4:3:4:0:0:6:3:0:0:8 chrX 65382685 . T C 1780.43 PASS AO=187;DP=190;FAO=188;FDP=188;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=181;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0153674;FXX=0.015706;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6635;QD=37.8815;RBI=0.0231008;REFB=-0.0295059;REVB=0.0172478;RO=1;SAF=7;SAR=180;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00263829;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000388566;OID=.;OPOS=65382685;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:190:188:1:0:187:188:180:7:0:1:181:7:0:0 chrX 65423377 . G A 264.52 PASS AO=70;DP=157;FAO=70;FDP=157;FR=.;FRO=87;FSAF=46;FSAR=24;FSRF=60;FSRR=27;FWDB=-0.00115702;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.861;QD=6.73947;RBI=0.0230553;REFB=5.24761e-05;REVB=0.0230262;RO=87;SAF=46;SAR=24;SRF=60;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0364123;STB=0.52024;TYPE=snp;VARB=-1.44524e-06;OID=.;OPOS=65423377;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:157:157:87:87:70:70:24:46:60:27:24:46:60:27 chrX 65822607 . T C 3828.29 PASS AO=572;DP=574;FAO=398;FDP=398;FR=.;FRO=0;FSAF=197;FSAR=201;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0170432;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.772;QD=38.4753;RBI=0.0564554;REFB=0;REVB=-0.0538214;RO=0;SAF=277;SAR=295;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.17466e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.9714e-05;OID=.;OPOS=65822607;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:574:398:0:0:572:398:295:277:0:0:201:197:0:0 chrX 65824986 . C T 3201.88 PASS AO=334;DP=335;FAO=336;FDP=336;FR=.;FRO=0;FSAF=137;FSAR=199;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0281019;FXX=0.00296727;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.748;QD=38.1176;RBI=0.0336089;REFB=-0.0413853;REVB=0.0184347;RO=0;SAF=137;SAR=197;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.15096e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.03815e-06;OID=.;OPOS=65824986;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:335:336:0:0:334:336:197:137:0:0:199:137:0:0 chrX 67321920 . C T 397.23 PASS AO=57;DP=164;FAO=89;FDP=172;FR=.;FRO=83;FSAF=28;FSAR=61;FSRF=21;FSRR=62;FWDB=0.0113293;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.1277;QD=9.23797;RBI=0.0127163;REFB=-0.0481837;REVB=-0.00577498;RO=69;SAF=26;SAR=31;SRF=18;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198416;STB=0.535357;TYPE=snp;VARB=0.0366842;OID=.;OPOS=67321920;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:136:172:69:83:57:89:31:26:18:51:61:28:21:62 chrX 67652748 . C T 450.39 PASS AO=109;DP=224;FAO=109;FDP=224;FR=.;FRO=115;FSAF=70;FSAR=39;FSRF=62;FSRR=53;FWDB=0.016706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.8406;QD=8.0426;RBI=0.0404111;REFB=-0.0238019;REVB=0.0367963;RO=114;SAF=70;SAR=39;SRF=61;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10453;STB=0.555737;TYPE=snp;VARB=0.0201209;OID=.;OPOS=67652748;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:224:224:114:115:109:109:39:70:61:53:39:70:62:53 chrX 67674212 . T A 143.78 PASS AO=54;DP=98;FAO=77;FDP=169;FR=.;FRO=92;FSAF=18;FSAR=59;FSRF=17;FSRR=75;FWDB=-0.0328862;FXX=0.0116952;HRUN=7;LEN=1;MLLD=13.8277;QD=3.40295;RBI=0.0427868;REFB=-0.15797;REVB=-0.0273716;RO=44;SAF=0;SAR=54;SRF=18;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.862654;STB=0.538744;TYPE=snp;VARB=0.162129;OID=.;OPOS=67674212;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:169:44:92:54:77:54:0:18:26:59:18:17:75 chrX 67937976 . G A 122.56 PASS AO=28;DP=58;FAO=28;FDP=58;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.0173141;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=156.562;QD=8.45246;RBI=0.0175678;REFB=-0.0240706;REVB=0.00297491;RO=30;SAF=10;SAR=18;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0423586;STB=0.523792;TYPE=snp;VARB=0.0279361;OID=.;OPOS=67937976;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:58:58:30:30:28:28:18:10:12:18:18:10:12:18 chrX 68381787 . C T 228.72 PASS AO=46;DP=83;FAO=47;FDP=87;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=31;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=0.019395;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.4506;QD=10.5158;RBI=0.0207779;REFB=-0.0180839;REVB=0.00745357;RO=37;SAF=16;SAR=30;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0736133;STB=0.529902;TYPE=snp;VARB=0.0171443;OID=.;OPOS=68381787;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:83:87:37:40:46:47:30:16:16:21:31:16:16:24 chrX 68382836 . G A 688.81 PASS AO=196;DP=434;FAO=182;FDP=397;FR=.;FRO=215;FSAF=87;FSAR=95;FSRF=99;FSRR=116;FWDB=0.000778909;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.9509;QD=6.94017;RBI=0.0291243;REFB=-0.009184;REVB=0.0291139;RO=230;SAF=93;SAR=103;SRF=107;SRR=123;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00910642;STB=0.509533;TYPE=snp;VARB=0.0109523;OID=.;OPOS=68382836;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:434:397:230:215:196:182:103:93:107:123:95:87:99:116 chrX 68725198 . TG T 96.16 PASS AO=10;DP=18;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.366342;FXX=0.117578;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.4811;QD=25.6432;RBI=0.395353;REFB=0;REVB=0.148653;RO=2;SAF=3;SAR=7;SRF=2;SRR=0;SSEN=0.25018;SSEP=0;SSSB=-0.220927;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.058532;OID=.;OPOS=68725199;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:10:17:15:15:0:6:9:0:0:9:2:3:7:2:0 chrX 68749643 . TG T 92.96 PASS AO=26;DP=61;FAO=34;FDP=55;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=26;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=-0.069407;FXX=0.017854;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.7545;QD=6.76042;RBI=0.0722712;REFB=-0.0697329;REVB=-0.0201444;RO=21;SAF=6;SAR=20;SRF=4;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0.435897;SSSB=0.046992;STB=0.525996;TYPE=del;VARB=0.0846244;OID=.;OPOS=68749644;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:26:56:34:55:21:8:26:6:15:27:21:6:20:4:17 chrX 69250308 . C T 1770.6 PASS AO=184;DP=184;FAO=185;FDP=185;FR=.;FRO=0;FSAF=109;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0470041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.1424;QD=38.2832;RBI=0.0630653;REFB=0;REVB=0.0420457;RO=0;SAF=109;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000205018;OID=.;OPOS=69250308;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:184:185:0:0:184:185:75:109:0:0:76:109:0:0 chrX 69441863 . G A 333.93 PASS AO=77;DP=153;FAO=77;FDP=153;FR=.;FRO=76;FSAF=43;FSAR=34;FSRF=42;FSRR=34;FWDB=-0.0024318;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=215.311;QD=8.73029;RBI=0.00570769;REFB=-0.00779596;REVB=-0.00516373;RO=76;SAF=43;SAR=34;SRF=42;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00531153;STB=0.502923;TYPE=snp;VARB=0.00898024;OID=.;OPOS=69441863;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:153:153:76:76:77:77:34:43:42:34:34:43:42:34 chrX 69441921 . C T 469.06 PASS AO=100;DP=184;FAO=100;FDP=184;FR=.;FRO=84;FSAF=61;FSAR=39;FSRF=40;FSRR=44;FWDB=-0.00425338;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.438;QD=10.197;RBI=0.0171169;REFB=-0.00526886;REVB=-0.01658;RO=84;SAF=61;SAR=39;SRF=40;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114243;STB=0.562418;TYPE=snp;VARB=0.00434732;OID=.;OPOS=69441921;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:184:184:84:84:100:100:39:61:40:44:39:61:40:44 chrX 69442129 . A G 29.05 PASS AO=7;DP=19;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=11;FWDB=-0.0229464;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.691;QD=6.11541;RBI=0.0262753;REFB=-0.00942652;REVB=-0.0128005;RO=11;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.462391;STB=0.68046;TYPE=snp;VARB=0.0322782;OID=.;OPOS=69442129;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:19:19:11:12:7:7:5:2:0:11:5:2:1:11 chrX 69510335 . C T 324.97 PASS AO=56;DP=89;FAO=56;FDP=86;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=45;FSRF=6;FSRR=24;FWDB=0.0470855;FXX=0.0337041;HRUN=3;LEN=1;MLLD=116.683;QD=15.1147;RBI=0.0547185;REFB=-0.0374177;REVB=0.0278761;RO=25;SAF=11;SAR=45;SRF=3;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0727399;STB=0.501968;TYPE=snp;VARB=0.0171629;OID=.;OPOS=69510335;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:90:89:86:25:30:56:56:45:11:3:22:45:11:6:24 chrX 69645230 . C T 347.57 PASS AO=72;DP=154;FAO=83;FDP=162;FR=.;FRO=79;FSAF=28;FSAR=55;FSRF=31;FSRR=48;FWDB=0.0122909;FXX=0.0121944;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.532;QD=8.58197;RBI=0.0207812;REFB=-0.0249053;REVB=0.0167569;RO=76;SAF=26;SAR=46;SRF=25;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0327606;STB=0.529443;TYPE=snp;VARB=0.0208525;OID=.;OPOS=69645230;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:154:162:76:79:72:83:46:26:25:51:55:28:31:48 chrX 69647169 . T C 76.56 PASS AO=21;DP=61;FAO=23;FDP=61;FR=.;FRO=38;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=28;FWDB=-0.0019933;FXX=0.061529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.9732;QD=5.02054;RBI=0.0176765;REFB=-0.0120727;REVB=0.0175638;RO=36;SAF=6;SAR=15;SRF=9;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.048915;STB=0.501843;TYPE=snp;VARB=0.0366817;OID=.;OPOS=69647169;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:61:61:36:38:21:23:15:6:9:27:17:6:10:28 chrX 69652762 . A G 2164.99 PASS AO=225;DP=227;FAO=227;FDP=227;FR=.;FRO=0;FSAF=113;FSAR=114;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0229747;FXX=0.00873324;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0779;QD=38.1497;RBI=0.0597178;REFB=0.0355319;REVB=-0.0551215;RO=2;SAF=111;SAR=114;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000111971;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000862744;OID=.;OPOS=69652762;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:94:227:227:2:0:225:227:114:111:1:1:114:113:0:0 chrX 69668463 . A G 101.78 PASS AO=36;DP=108;FAO=38;FDP=110;FR=.;FRO=72;FSAF=7;FSAR=31;FSRF=46;FSRR=26;FWDB=-0.0607495;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.412;QD=3.70107;RBI=0.0607941;REFB=-0.00932906;REVB=0.00232692;RO=70;SAF=4;SAR=32;SRF=46;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.648606;STB=0.804439;TYPE=snp;VARB=0.0238283;OID=.;OPOS=69668463;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:108:110:70:72:36:38:32:4:46:24:31:7:46:26 chrX 69749852 . A G 939.54 PASS AO=97;DP=97;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0652427;FXX=0.0188661;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.7824;QD=36.1361;RBI=0.0805269;REFB=0.0404729;REVB=-0.0472013;RO=0;SAF=26;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.66521e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00460992;OID=.;OPOS=69749852;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:97:104:0:0:97:104:71:26:0:0:72:32:0:0 chrX 69774517 . A T 2644.75 PASS AO=303;DP=323;FAO=304;FDP=321;FR=.;FRO=17;FSAF=166;FSAR=138;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=0.00298898;FXX=0.00619176;HRUN=4;LEN=1;MLLD=103.392;QD=32.9564;RBI=0.00345971;REFB=-0.0665165;REVB=-0.0017423;RO=1;SAF=166;SAR=137;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00286468;STB=0.516547;TYPE=snp;VARB=0.00146321;OID=.;OPOS=69774517;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:323:321:1:17:303:304:137:166:1:0:138:166:4:13 chrX 70066017 . ACAT A 407.2 PASS AO=79;DP=139;FAO=79;FDP=134;FR=.;FRO=55;FSAF=23;FSAR=56;FSRF=25;FSRR=30;FWDB=-0.00291697;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=3;MLLD=266.797;QD=12.1551;RBI=0.00309965;REFB=-0.0133106;REVB=0.0010484;RO=55;SAF=23;SAR=56;SRF=25;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139448;STB=0.576062;TYPE=del;VARB=0.00896002;OID=.;OPOS=70066018;OREF=CAT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:79:134:79:134:55:23:56:25:30:99:55:23:56:25:30 chrX 70146398 . A G 3729.05 PASS AO=498;DP=505;FAO=397;FDP=397;FR=.;FRO=0;FSAF=172;FSAR=225;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.043018;FXX=0.00749981;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.297;QD=37.5722;RBI=0.0465848;REFB=-0.0492898;REVB=0.0178773;RO=5;SAF=220;SAR=278;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00304302;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000149282;OID=.;OPOS=70146398;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:505:397:5:0:498:397:278:220:3:2:225:172:0:0 chrX 70146475 . G C 687.6 PASS AO=191;DP=419;FAO=182;FDP=400;FR=.;FRO=218;FSAF=60;FSAR=122;FSRF=88;FSRR=130;FWDB=-0.0362566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.19;QD=6.87603;RBI=0.0367414;REFB=-0.0077242;REVB=0.00594921;RO=228;SAF=62;SAR=129;SRF=92;SRR=136;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0855444;STB=0.544244;TYPE=snp;VARB=0.00964665;OID=.;OPOS=70146475;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:419:400:228:218:191:182:129:62:92:136:122:60:88:130 chrX 70357574 . AG A 1846.53 PASS AO=232;DP=284;FAO=272;FDP=272;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=188;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.128842;FXX=0.0109087;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.4362;QD=27.1548;RBI=0.257095;REFB=0.00161147;REVB=0.222481;RO=28;SAF=72;SAR=160;SRF=5;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0.350515;SSSB=0.0318619;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00314134;OID=.;OPOS=70357575;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:232:271:272:272:0:84:188:0:0:99:28:72:160:5:23 chrX 70389634 . GC G 80.84 PASS AO=45;DP=103;FAO=48;FDP=93;FR=.;FRO=45;FSAF=12;FSAR=36;FSRF=11;FSRR=34;FWDB=0.00488776;FXX=0.0412329;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.0763;QD=3.47689;RBI=0.0591341;REFB=-0.1319;REVB=-0.0589318;RO=39;SAF=12;SAR=33;SRF=9;SRR=30;SSEN=0.52;SSEP=0;SSSB=0.0395045;STB=0.503596;TYPE=del;VARB=0.140607;OID=.;OPOS=70389635;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:45:96:48:93:45:12:36:11:34:80:39:12:33:9:30 chrX 70472853 . GC G 193.34 PASS AO=68;DP=189;FAO=110;FDP=165;FR=.;FRO=55;FSAF=56;FSAR=54;FSRF=24;FSRR=31;FWDB=0.300086;FXX=0.0517212;HRUN=7;LEN=1;MLLD=6.92022;QD=4.68703;RBI=0.30073;REFB=0.035562;REVB=-0.019663;RO=61;SAF=25;SAR=43;SRF=27;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0679693;STB=0.524225;TYPE=del;VARB=0.0935607;OID=.;OPOS=70472854;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:68:168:110:165:55:56:54:24:31:31:61:25:43:27:34 chrX 70836830 . GGGC G 306.56 PASS AO=9;DP=63;FAO=54;FDP=56;FR=.;FRO=2;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.276739;FXX=0.151492;HRUN=5;LEN=3;MLLD=20.6704;QD=21.8974;RBI=0.290091;REFB=-0.113063;REVB=-0.0869968;RO=11;SAF=1;SAR=8;SRF=1;SRR=10;SSEN=0.375;SSEP=0;SSSB=0.0499989;STB=0.519993;TYPE=del;VARB=0.0367417;OID=.;OPOS=70836831;OREF=GGC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:9:52:54:56:2:30:24:0:2:17:11:1:8:1:10 chrX 71349753 . G A 136.21 PASS AO=35;DP=79;FAO=35;FDP=79;FR=.;FRO=44;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=40;FSRR=4;FWDB=0.0127463;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=82.356;QD=6.89694;RBI=0.0155058;REFB=-0.0388285;REVB=0.00882959;RO=37;SAF=24;SAR=11;SRF=34;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.283302;STB=0.66158;TYPE=snp;VARB=0.0212014;OID=.;OPOS=71349753;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:79:37:44:35:35:11:24:34:3:11:24:40:4 chrX 71349774 . T C 217.98 PASS AO=37;DP=82;FAO=52;FDP=96;FR=.;FRO=44;FSAF=36;FSAR=16;FSRF=38;FSRR=6;FWDB=-0.00601613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.8947;QD=9.08267;RBI=0.0831947;REFB=-0.00869148;REVB=0.0829769;RO=43;SAF=36;SAR=1;SRF=37;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.468858;STB=0.599156;TYPE=snp;VARB=0.0199295;OID=.;OPOS=71349774;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:96:43:44:37:52:1:36:37:6:16:36:38:6 chrX 71351443 . A G 57.92 PASS AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=22;FWDB=0.107091;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.879;QD=6.26119;RBI=0.110463;REFB=0.0109526;REVB=0.0270869;RO=21;SAF=2;SAR=13;SRF=0;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.407155;STB=0.728984;TYPE=snp;VARB=-0.0148663;OID=.;OPOS=71351443;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:57:36:37:21:22:15:15:13:2:0:21:13:2:0:22 chrX 71354523 . G A 420.39 PASS AO=100;DP=200;FAO=99;FDP=200;FR=.;FRO=101;FSAF=53;FSAR=46;FSRF=50;FSRR=51;FWDB=-0.0112321;FXX=0.0099005;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.309;QD=8.40774;RBI=0.0154135;REFB=-0.0378113;REVB=0.0105554;RO=93;SAF=53;SAR=47;SRF=44;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0500352;STB=0.520393;TYPE=snp;VARB=0.0344017;OID=.;OPOS=71354523;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:200:200:93:101:100:99:47:53:44:49:46:53:50:51 chrX 71360100 . C T 348.26 PASS AO=92;DP=194;FAO=92;FDP=204;FR=.;FRO=112;FSAF=47;FSAR=45;FSRF=48;FSRR=64;FWDB=-0.0284419;FXX=0.00487781;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.072;QD=6.82863;RBI=0.0345846;REFB=-0.0109926;REVB=0.0196762;RO=98;SAF=47;SAR=45;SRF=36;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134123;STB=0.545106;TYPE=snp;VARB=0.0150519;OID=.;OPOS=71360100;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:194:204:98:112:92:92:45:47:36:62:45:47:48:64 chrX 71360865 . C T 523.67 PASS AO=119;DP=234;FAO=122;FDP=239;FR=.;FRO=117;FSAF=72;FSAR=50;FSRF=64;FSRR=53;FWDB=0.024808;FXX=0.0164602;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.376;QD=8.76439;RBI=0.0248643;REFB=-0.0157299;REVB=0.00167318;RO=114;SAF=72;SAR=47;SRF=61;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0643228;STB=0.521662;TYPE=snp;VARB=0.0175401;OID=.;OPOS=71360865;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:234:239:114:117:119:122:47:72:61:53:50:72:64:53 chrX 71363415 . C T 1318.41 PASS AO=146;DP=153;FAO=147;FDP=151;FR=.;FRO=4;FSAF=47;FSAR=100;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0195166;FXX=0.013071;HRUN=4;LEN=1;MLLD=176.972;QD=34.9247;RBI=0.0213334;REFB=-0.0857216;REVB=0.00861468;RO=4;SAF=46;SAR=100;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0252742;STB=0.505467;TYPE=snp;VARB=6.99514e-05;OID=.;OPOS=71363415;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:153:151:4:4:146:147:100:46:3:1:100:47:2:2 chrX 71379702 . T C 184.86 PASS AO=42;DP=84;FAO=42;FDP=84;FR=.;FRO=42;FSAF=32;FSAR=10;FSRF=33;FSRR=9;FWDB=0.00724899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.989;QD=8.80267;RBI=0.029039;REFB=-0.00640849;REVB=0.0281196;RO=42;SAF=32;SAR=10;SRF=33;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0301278;STB=0.516685;TYPE=snp;VARB=0.00591378;OID=.;OPOS=71379702;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:84:84:42:42:42:42:10:32:33:9:10:32:33:9 chrX 71379853 . C T 751.35 PASS AO=157;DP=292;FAO=161;FDP=297;FR=.;FRO=136;FSAF=81;FSAR=80;FSRF=77;FSRR=59;FWDB=0.0184053;FXX=0.00668874;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.556;QD=10.1193;RBI=0.0189927;REFB=-0.0128306;REVB=0.00468698;RO=133;SAF=81;SAR=76;SRF=77;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0532489;STB=0.528889;TYPE=snp;VARB=0.0127175;OID=.;OPOS=71379853;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:292:297:133:136:157:161:76:81:77:56:80:81:77:59 chrX 71401607 . G A 2677.75 PASS AO=286;DP=289;FAO=286;FDP=286;FR=.;FRO=0;FSAF=137;FSAR=149;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0483204;FXX=0.0205472;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.139;QD=37.4511;RBI=0.0496781;REFB=-0.0427135;REVB=0.0115348;RO=3;SAF=137;SAR=149;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0103262;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.75688e-05;OID=.;OPOS=71401607;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:289:286:3:0:286:286:149:137:3:0:149:137:0:0 chrX 71401614 . C A 2674.25 PASS AO=279;DP=280;FAO=279;FDP=279;FR=.;FRO=0;FSAF=134;FSAR=145;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00319542;FXX=0.00711718;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.928;QD=38.3405;RBI=0.00446379;REFB=0;REVB=0.00311684;RO=0;SAF=134;SAR=145;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.37095e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-9.30298e-06;OID=.;OPOS=71401614;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:280:279:0:0:279:279:145:134:0:0:145:134:0:0 chrX 71406301 . T C 970.96 PASS AO=209;DP=421;FAO=214;FDP=394;FR=.;FRO=180;FSAF=103;FSAR=111;FSRF=119;FSRR=61;FWDB=0.00323725;FXX=0.0149996;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.9007;QD=9.85749;RBI=0.0725749;REFB=-0.0585561;REVB=0.0725027;RO=201;SAF=91;SAR=118;SRF=133;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200918;STB=0.581748;TYPE=snp;VARB=0.0540581;OID=.;OPOS=71406301;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:421:394:201:180:209:214:118:91:133:68:111:103:119:61 chrX 71417349 . T C 869.86 PASS AO=192;DP=364;FAO=193;FDP=363;FR=.;FRO=170;FSAF=81;FSAR=112;FSRF=66;FSRR=104;FWDB=0.0296223;FXX=0.00274718;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.181;QD=9.58523;RBI=0.0338961;REFB=-0.0108759;REVB=0.0164763;RO=169;SAF=81;SAR=111;SRF=65;SRR=104;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0330168;STB=0.515193;TYPE=snp;VARB=0.0109172;OID=.;OPOS=71417349;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:364:363:169:170:192:193:111:81:65:104:112:81:66:104 chrX 71418669 . C A 111.68 PASS AO=29;DP=67;FAO=29;FDP=67;FR=.;FRO=38;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=29;FSRR=9;FWDB=-0.0218609;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=271.004;QD=6.66761;RBI=0.0253772;REFB=-0.0115738;REVB=0.0128881;RO=38;SAF=16;SAR=13;SRF=29;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22174;STB=0.624254;TYPE=snp;VARB=0.0127943;OID=.;OPOS=71418669;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:67:67:38:38:29:29:13:16:29:9:13:16:29:9 chrX 71493691 . C T 736.36 PASS AO=378;DP=795;FAO=188;FDP=399;FR=.;FRO=211;FSAF=95;FSAR=93;FSRF=97;FSRR=114;FWDB=0.00381968;FXX=0.00249994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.004;QD=7.38205;RBI=0.0194643;REFB=-0.023234;REVB=0.0190859;RO=382;SAF=179;SAR=199;SRF=179;SRR=203;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00457227;STB=0.524104;TYPE=snp;VARB=0.0245047;OID=.;OPOS=71493691;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:795:399:382:211:378:188:199:179:179:203:93:95:97:114 chrX 71518799 . G T 1227.66 PASS AO=136;DP=141;FAO=137;FDP=141;FR=.;FRO=4;FSAF=26;FSAR=111;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0162137;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.924;QD=34.8271;RBI=0.0309638;REFB=-0.00534715;REVB=0.0263793;RO=5;SAF=26;SAR=110;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000960099;STB=0.502768;TYPE=snp;VARB=0.000304922;OID=.;OPOS=71518799;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:141:141:5:4:136:137:110:26:1:4:111:26:1:3 chrX 71521867 . G C 1193.18 PASS AO=125;DP=125;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.011136;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.4109;QD=38.1818;RBI=0.0121918;REFB=0;REVB=0.00496291;RO=0;SAF=44;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.89864e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.78623e-05;OID=.;OPOS=71521867;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:125:125:0:0:125:125:81:44:0:0:81:44:0:0 chrX 71522726 . GC G 1724.17 PASS AO=213;DP=273;FAO=256;FDP=256;FR=.;FRO=0;FSAF=141;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.132982;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=16.8222;QD=26.9402;RBI=0.29567;REFB=0;REVB=0.264076;RO=27;SAF=117;SAR=96;SRF=10;SRR=17;SSEN=0.302763;SSEP=0;SSSB=0.038373;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00286459;OID=.;OPOS=71522727;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:213:254:256:256:0:141:115:0:0:99:27:117:96:10:17 chrX 71549512 . G C 418.24 PASS AO=124;DP=300;FAO=124;FDP=300;FR=.;FRO=176;FSAF=23;FSAR=101;FSRF=77;FSRR=99;FWDB=-0.0156305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8836;QD=5.57652;RBI=0.0437113;REFB=-0.00771698;REVB=-0.0408212;RO=175;SAF=23;SAR=101;SRF=76;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.327058;STB=0.687041;TYPE=snp;VARB=0.0135053;OID=.;OPOS=71549512;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:300:300:175:176:124:124:101:23:76:99:101:23:77:99 chrX 73063911 . T C 812.22 PASS AO=86;DP=87;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0126633;FXX=0.0337041;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.9831;QD=37.7776;RBI=0.0818723;REFB=0.0842307;REVB=0.0808871;RO=1;SAF=62;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00758154;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000129978;OID=.;OPOS=73063911;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:87:86:1:0:86:86:24:62:1:0:24:62:0:0 chrX 73462520 . T C 1715.67 PASS AO=179;DP=182;FAO=180;FDP=180;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141556;FXX=0.0322563;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.943;QD=38.1261;RBI=0.0749294;REFB=0;REVB=0.0735801;RO=0;SAF=75;SAR=104;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000217697;OID=.;OPOS=73462520;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:182:180:0:0:179:180:104:75:0:0:105:75:0:0 chrX 74494470 . T G 1461.22 PASS AO=135;DP=135;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0831613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.492;QD=37.7088;RBI=0.0836564;REFB=0;REVB=0.00908829;RO=0;SAF=58;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.71349e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000431381;OID=.;OPOS=74494470;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:135:155:0:0:135:155:77:58:0:0:79:76:0:0 chrX 74511202 . G C 2144.59 PASS AO=228;DP=236;FAO=228;FDP=228;FR=.;FRO=0;FSAF=117;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0289361;FXX=0.042015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.2341;QD=37.6244;RBI=0.0289361;REFB=-0.0500359;REVB=-4.35657e-05;RO=2;SAF=118;SAR=110;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000291085;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000551949;OID=.;OPOS=74511202;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:85:236:228:2:0:228:228:110:118:1:1:111:117:0:0 chrX 76939108 . TC T 46.48 PASS AO=26;DP=53;FAO=25;FDP=54;FR=.;FRO=29;FSAF=2;FSAR=23;FSRF=5;FSRR=24;FWDB=-0.014912;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=13.4291;QD=3.44293;RBI=0.0530877;REFB=-0.123797;REVB=-0.0509503;RO=26;SAF=1;SAR=25;SRF=5;SRR=21;SSEN=0.492754;SSEP=0;SSSB=-0.453024;STB=0.631247;TYPE=del;VARB=0.113098;OID=.;OPOS=76939109;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:26:52:25:54:29:2:23:5:24:46:26:1:25:5:21 chrX 77298857 . G A 1493.81 PASS AO=156;DP=156;FAO=156;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=100;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00213403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.613;QD=38.3029;RBI=0.026882;REFB=0;REVB=0.0267971;RO=0;SAF=100;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.34788e-05;OID=.;OPOS=77298857;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:70:156:156:0:0:156:156:56:100:0:0:56:100:0:0 chrX 77528317 . G A 2416.05 PASS AO=252;DP=252;FAO=253;FDP=253;FR=.;FRO=0;FSAF=118;FSAR=135;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0275061;FXX=0.00784283;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.046;QD=38.1984;RBI=0.0275251;REFB=0;REVB=-0.00102161;RO=0;SAF=117;SAR=135;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.34053e-06;OID=.;OPOS=77528317;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:252:253:0:0:252:253:135:117:0:0:135:118:0:0 chrX 78011737 . T C 1934.13 PASS AO=207;DP=208;FAO=209;FDP=209;FR=.;FRO=0;FSAF=109;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0653705;FXX=0.00476168;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.8945;QD=37.0168;RBI=0.0755894;REFB=0;REVB=0.0379533;RO=0;SAF=108;SAR=99;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00285418;OID=.;OPOS=78011737;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:208:209:0:0:207:209:99:108:0:0:100:109:0:0 chrX 78012578 . A AT 361.57 PASS AO=34;DP=206;FAO=89;FDP=168;FR=.;FRO=79;FSAF=51;FSAR=38;FSRF=56;FSRR=23;FWDB=0.0253081;FXX=0.0769189;HRUN=0;LEN=1;MLLD=200.564;QD=8.6087;RBI=0.0787412;REFB=0.0166485;REVB=-0.0745632;RO=168;SAF=28;SAR=6;SRF=93;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.388954;STB=0.566518;TYPE=ins;VARB=-0.0194594;OID=.;OPOS=78012579;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:34:206:89:168:79:51:38:56:23:99:168:28:6:93:75 chrX 78012579 . A T 94.31 PASS AO=55;DP=204;FAO=53;FDP=202;FR=.;FRO=149;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=96;FSRR=53;FWDB=0.00250587;FXX=0.00980344;HRUN=12;LEN=1;MLLD=196.726;QD=1.86756;RBI=0.0160523;REFB=0.00379332;REVB=-0.0158555;RO=149;SAF=24;SAR=31;SRF=96;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.25307;STB=0.664308;TYPE=snp;VARB=-0.0103465;OID=.;OPOS=78012579;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:94:204:202:149:149:55:53:31:24:96:53:31:22:96:53 chrX 78426988 . T C 2792.63 PASS AO=282;DP=283;FAO=295;FDP=295;FR=.;FRO=0;FSAF=166;FSAR=129;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0411188;FXX=0.0133775;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.942;QD=37.8662;RBI=0.0411748;REFB=-0.0558557;REVB=0.00214668;RO=1;SAF=157;SAR=125;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0030277;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000202217;OID=.;OPOS=78426988;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:283:295:1:0:282:295:125:157:1:0:129:166:0:0 chrX 78618948 . G A 1292.48 PASS AO=315;DP=646;FAO=185;FDP=395;FR=.,HEALED;FRO=125;FSAF=90;FSAR=95;FSRF=11;FSRR=114;FWDB=-0.00509888;FXX=0.0124997;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.9572;QD=13.0884;RBI=0.0307681;REFB=-0.0628034;REVB=-0.0303427;RO=183;SAF=156;SAR=159;SRF=17;SRR=166;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.277746;STB=0.662192;TYPE=snp;VARB=0.00625307;OID=.;OPOS=78618948;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:639:395:183:125:315:185:159:156:17:166:95:90:11:114 chrX 79281202 . G A 742.85 PASS AO=179;DP=394;FAO=189;FDP=398;FR=.;FRO=209;FSAF=47;FSAR=142;FSRF=89;FSRR=120;FWDB=0.0271476;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.464;QD=7.4658;RBI=0.0278743;REFB=-0.00936925;REVB=0.00632332;RO=215;SAF=40;SAR=139;SRF=94;SRR=121;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.25437;STB=0.610624;TYPE=snp;VARB=0.0106448;OID=.;OPOS=79281202;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:394:398:215:209:179:189:139:40:94:121:142:47:89:120 chrX 79698593 . C G 1127.86 PASS AO=110;DP=113;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0725808;FXX=0.0245881;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.2068;QD=37.9113;RBI=0.123721;REFB=0;REVB=0.100195;RO=0;SAF=45;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.58497e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00128233;OID=.;OPOS=79698593;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:113:119:0:0:110:119:65:45:0:0:74:45:0:0 chrX 79931831 . CGTGT C 1246.32 PASS AO=102;DP=193;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0390732;FXX=0.225421;HRUN=1;LEN=4;MLLD=183.076;QD=37.2035;RBI=0.0390823;REFB=0;REVB=-0.000843359;RO=0;SAF=32;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.67392e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=-0.000603312;OID=.;OPOS=79931832;OREF=GTGT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:102:126:134:134:0:43:91:0:0:60:0:32:70:0:0 chrX 79943569 . T C 3710.06 PASS AO=536;DP=545;FAO=398;FDP=398;FR=.;FRO=0;FSAF=199;FSAR=199;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0744734;FXX=0.00499988;HRUN=3;LEN=1;MLLD=39.9684;QD=37.287;RBI=0.0768013;REFB=-0.0477393;REVB=0.0187658;RO=9;SAF=232;SAR=304;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00749803;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000658462;OID=.;OPOS=79943569;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:545:398:9:0:536:398:304:232:6:3:199:199:0:0 chrX 79989018 . C G 574.11 PASS AO=107;DP=201;FAO=113;FDP=194;FR=.;FRO=81;FSAF=33;FSAR=80;FSRF=37;FSRR=44;FWDB=0.0314246;FXX=0.0443328;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.882;QD=11.8372;RBI=0.0324476;REFB=-0.00899225;REVB=-0.00808322;RO=77;SAF=30;SAR=77;SRF=36;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164055;STB=0.577782;TYPE=snp;VARB=0.00537255;OID=.;OPOS=79989018;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:194:77:81:107:113:77:30:36:41:80:33:37:44 chrX 80191990 . G C 582.48 PASS AO=154;DP=338;FAO=154;FDP=339;FR=.;FRO=185;FSAF=67;FSAR=87;FSRF=99;FSRR=86;FWDB=-0.00687306;FXX=0.00877167;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.765;QD=6.87296;RBI=0.0147254;REFB=-0.00706393;REVB=-0.013023;RO=184;SAF=67;SAR=87;SRF=98;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0963743;STB=0.55475;TYPE=snp;VARB=0.00635507;OID=.;OPOS=80191990;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:338:339:184:185:154:154:87:67:98:86:87:67:99:86 chrX 83128179 . C G 204.03 PASS AO=50;DP=117;FAO=50;FDP=109;FR=.;FRO=59;FSAF=16;FSAR=34;FSRF=21;FSRR=38;FWDB=0.0234731;FXX=0.0762647;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.343;QD=7.48719;RBI=0.0259086;REFB=-0.0188522;REVB=-0.0109668;RO=50;SAF=16;SAR=34;SRF=15;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0209452;STB=0.521983;TYPE=snp;VARB=0.0171842;OID=.;OPOS=83128179;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:117:109:50:59:50:50:34:16:15:35:34:16:21:38 chrX 84189813 . A G 37.17 PASS AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=296.476;QD=10.6201;RBI=0.00473771;REFB=-0.00823758;REVB=-0.00473771;RO=7;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0075388;OID=.;OPOS=84189813;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:14:14:7:7:7:7:7:0:0:7:7:0:0:7 chrX 84309333 . CCT C 80.7 PASS AO=50;DP=204;FAO=64;FDP=172;FR=.;FRO=108;FSAF=18;FSAR=46;FSRF=28;FSRR=80;FWDB=0.183202;FXX=0.060106;HRUN=7;LEN=2;MLLD=14.4664;QD=1.87666;RBI=0.209605;REFB=-0.00813125;REVB=-0.101839;RO=91;SAF=10;SAR=40;SRF=27;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150977;STB=0.51733;TYPE=del;VARB=0.0478025;OID=.;OPOS=84309334;OREF=CT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:50:198:64:172:108:18:46:28:80:80:91:10:40:27:64 chrX 84350010 . A G 1174.31 PASS AO=128;DP=131;FAO=128;FDP=131;FR=.;FRO=3;FSAF=47;FSAR=81;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0211937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.9928;QD=35.8567;RBI=0.0238638;REFB=-0.145116;REVB=0.0109685;RO=2;SAF=47;SAR=81;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00417219;STB=0.507349;TYPE=snp;VARB=0.00158398;OID=.;OPOS=84350010;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:131:131:2:3:128:128:81:47:1:1:81:47:2:1 chrX 84358864 . C T 2381.76 PASS AO=252;DP=255;FAO=253;FDP=253;FR=.;FRO=0;FSAF=113;FSAR=140;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0165785;FXX=0.00784283;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.806;QD=37.6562;RBI=0.0204995;REFB=-0.0261191;REVB=0.0120575;RO=2;SAF=113;SAR=139;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000782704;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.62644e-05;OID=.;OPOS=84358864;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:96:255:253:2:0:252:253:139:113:1:1:140:113:0:0 chrX 84363140 . A G 3805.88 PASS AO=475;DP=481;FAO=395;FDP=395;FR=.;FRO=0;FSAF=177;FSAR=218;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0131233;FXX=0.0124997;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.6725;QD=38.5405;RBI=0.020809;REFB=0;REVB=0.0161491;RO=0;SAF=205;SAR=270;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07908e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.26265e-05;OID=.;OPOS=84363140;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:481:395:0:0:475:395:270:205:0:0:218:177:0:0 chrX 84534383 . A C 2445.58 PASS AO=141;DP=352;FAO=289;FDP=302;FR=.,HEALED;FRO=13;FSAF=157;FSAR=132;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=0.0268173;FXX=0.0382153;HRUN=10;LEN=1;MLLD=138.538;QD=32.3918;RBI=0.177479;REFB=-0.0595571;REVB=0.175441;RO=10;SAF=76;SAR=65;SRF=1;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0552253;STB=0.516839;TYPE=snp;VARB=0.000130498;OID=.;OPOS=84534383;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:36:245:302:10:13:141:289:65:76:1:9:132:157:2:11 chrX 84563135 . T A 521.43 PASS AO=333;DP=775;FAO=161;FDP=397;FR=.;FRO=236;FSAF=53;FSAR=108;FSRF=110;FSRR=126;FWDB=0.00502769;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.039;QD=5.25367;RBI=0.0113147;REFB=-0.0117803;REVB=-0.0101363;RO=437;SAF=115;SAR=218;SRF=205;SRR=232;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133497;STB=0.586672;TYPE=snp;VARB=0.0176971;OID=.;OPOS=84563135;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:775:397:437:236:333:161:218:115:205:232:108:53:110:126 chrX 86887244 . C T 2016.19 PASS AO=211;DP=216;FAO=212;FDP=212;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=128;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0315353;FXX=0.0185177;HRUN=2;LEN=1;MLLD=277.345;QD=38.0413;RBI=0.0349066;REFB=0.0756562;REVB=0.0149664;RO=0;SAF=84;SAR=127;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000100467;OID=.;OPOS=86887244;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:87:216:212:0:0:211:212:127:84:0:0:128:84:0:0 chrX 88008423 . A C 2855.66 PASS AO=299;DP=303;FAO=302;FDP=302;FR=.;FRO=0;FSAF=171;FSAR=131;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0211659;FXX=0.00330022;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.552;QD=37.8234;RBI=0.0606215;REFB=0;REVB=0.0568064;RO=3;SAF=170;SAR=129;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00453884;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000416763;OID=.;OPOS=88008423;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:303:302:3:0:299:302:129:170:1:2:131:171:0:0 chrX 88009322 . A G 3488.46 PASS AO=423;DP=439;FAO=386;FDP=399;FR=.;FRO=13;FSAF=193;FSAR=193;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.000628938;FXX=0.00249994;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.166;QD=34.972;RBI=0.000630377;REFB=-0.0912644;REVB=-4.25699e-05;RO=8;SAF=216;SAR=207;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00923245;STB=0.506265;TYPE=snp;VARB=0.000142746;OID=.;OPOS=88009322;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:439:399:8:13:423:386:207:216:2:6:193:193:4:9 chrX 88009687 . CCAGA C 85.29 PASS AO=77;DP=295;FAO=82;FDP=279;FR=.;FRO=197;FSAF=42;FSAR=40;FSRF=102;FSRR=95;FWDB=0.0050386;FXX=0.0141338;HRUN=2;LEN=4;MLLD=280.767;QD=1.22279;RBI=0.00564261;REFB=-0.00127342;REVB=0.00253999;RO=201;SAF=39;SAR=38;SRF=105;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0195764;STB=0.503936;TYPE=del;VARB=0.00300692;OID=.;OPOS=88009688;OREF=CAGA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:77:285:82:279:197:42:40:102:95:85:201:39:38:105:96 chrX 88009700 . T C 189.59 PASS AO=85;DP=296;FAO=90;FDP=301;FR=.;FRO=211;FSAF=43;FSAR=47;FSRF=107;FSRR=104;FWDB=-0.00630694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.689;QD=2.51942;RBI=0.0109988;REFB=0.00196507;REVB=-0.0090109;RO=209;SAF=39;SAR=46;SRF=107;SRR=102;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0647769;STB=0.52056;TYPE=snp;VARB=-0.00522867;OID=.;OPOS=88009700;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:296:301:209:211:85:90:46:39:107:102:47:43:107:104 chrX 89177109 . G C 141.02 PASS AO=44;DP=115;FAO=44;FDP=115;FR=.;FRO=71;FSAF=38;FSAR=6;FSRF=53;FSRR=18;FWDB=-0.0455533;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.4156;QD=4.90508;RBI=0.0593208;REFB=0.0103648;REVB=-0.0379981;RO=71;SAF=38;SAR=6;SRF=53;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216896;STB=0.625449;TYPE=snp;VARB=-0.0221535;OID=.;OPOS=89177109;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:115:115:71:71:44:44:6:38:53:18:6:38:53:18 chrX 89177673 . G A 1266.98 PASS AO=131;DP=131;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0202649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.551;QD=38.1046;RBI=0.0248403;REFB=0;REVB=-0.0143657;RO=0;SAF=61;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.92737e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.23412e-05;OID=.;OPOS=89177673;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:60:131:133:0:0:131:133:70:61:0:0:72:61:0:0 chrX 90693458 . A T 244.78 PASS AO=247;DP=683;FAO=119;FDP=400;FR=.;FRO=281;FSAF=56;FSAR=63;FSRF=107;FSRR=174;FWDB=0.0138553;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.6279;QD=2.44778;RBI=0.0138623;REFB=-0.00336607;REVB=0.000437913;RO=368;SAF=119;SAR=128;SRF=143;SRR=225;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100607;STB=0.563772;TYPE=snp;VARB=0.0303204;OID=.;OPOS=90693458;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:683:400:368:281:247:119:128:119:143:225:63:56:107:174 chrX 91585410 . A G 30.85 PASS AO=11;DP=38;FAO=11;FDP=38;FR=.;FRO=27;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.00794614;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=203.712;QD=3.24715;RBI=0.0299746;REFB=-0.00207339;REVB=-0.0289022;RO=27;SAF=5;SAR=6;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0554208;STB=0.533919;TYPE=snp;VARB=0.00490208;OID=.;OPOS=91585410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:38:38:27:27:11:11:6:5:11:16:6:5:11:16 chrX 91874217 . C G 596.19 PASS AO=126;DP=252;FAO=133;FDP=248;FR=.;FRO=115;FSAF=55;FSAR=78;FSRF=62;FSRR=53;FWDB=0.0205566;FXX=0.0158724;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.336;QD=9.61603;RBI=0.0205628;REFB=-0.00912231;REVB=-0.000507974;RO=109;SAF=48;SAR=78;SRF=56;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11593;STB=0.558806;TYPE=snp;VARB=0.00833472;OID=.;OPOS=91874217;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:252:248:109:115:126:133:78:48:56:53:78:55:62:53 chrX 92543421 . T C 493.3 PASS AO=196;DP=499;FAO=157;FDP=399;FR=.;FRO=242;FSAF=32;FSAR=125;FSRF=64;FSRR=178;FWDB=-0.0463464;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.476;QD=4.94535;RBI=0.0524729;REFB=-0.0175682;REVB=0.0246053;RO=296;SAF=38;SAR=158;SRF=73;SRR=223;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0849948;STB=0.55309;TYPE=snp;VARB=0.0283442;OID=.;OPOS=92543421;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:499:399:296:242:196:157:158:38:73:223:125:32:64:178 chrX 92927634 . G C 391.89 PASS AO=101;DP=219;FAO=101;FDP=220;FR=.;FRO=119;FSAF=45;FSAR=56;FSRF=58;FSRR=61;FWDB=0.00862743;FXX=0.00452468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.041;QD=7.12523;RBI=0.00952207;REFB=0.000663292;REVB=-0.00402954;RO=114;SAF=45;SAR=56;SRF=56;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0441257;STB=0.522791;TYPE=snp;VARB=-0.000828591;OID=.;OPOS=92927634;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:219:220:114:119:101:101:56:45:56:58:56:45:58:61 chrX 93258871 . A G 766.28 PASS AO=175;DP=342;FAO=176;FDP=343;FR=.;FRO=167;FSAF=88;FSAR=88;FSRF=76;FSRR=91;FWDB=-0.00670429;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.598;QD=8.93624;RBI=0.0189442;REFB=-0.0216526;REVB=0.0177183;RO=165;SAF=87;SAR=88;SRF=75;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0378428;STB=0.521863;TYPE=snp;VARB=0.0198896;OID=.;OPOS=93258871;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:342:343:165:167:175:176:88:87:75:90:88:88:76:91 chrX 99355146 . C T 339.05 PASS AO=80;DP=163;FAO=80;FDP=162;FR=.;FRO=82;FSAF=25;FSAR=55;FSRF=30;FSRR=52;FWDB=0.0461462;FXX=0.00613459;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.983;QD=8.3717;RBI=0.0485854;REFB=0.00914708;REVB=0.0152009;RO=82;SAF=25;SAR=55;SRF=30;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0556052;STB=0.530694;TYPE=snp;VARB=-0.00909971;OID=.;OPOS=99355146;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:162:82:82:80:80:55:25:30:52:55:25:30:52 chrX 99661969 . G A 396.37 PASS AO=84;DP=163;FAO=87;FDP=165;FR=.;FRO=78;FSAF=33;FSAR=54;FSRF=36;FSRR=42;FWDB=-0.011349;FXX=0.00602373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.848;QD=9.60898;RBI=0.0605415;REFB=-0.00623844;REVB=0.0594683;RO=79;SAF=33;SAR=51;SRF=37;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0686668;STB=0.540461;TYPE=snp;VARB=0.00608955;OID=.;OPOS=99661969;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:163:165:79:78:84:87:51:33:37:42:54:33:36:42 chrX 99849017 . G A 1074.34 PASS AO=113;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00313991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.365;QD=38.0299;RBI=0.00589371;REFB=0;REVB=-0.00498766;RO=0;SAF=41;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.55408e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-3.2382e-06;OID=.;OPOS=99849017;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:113:113:0:0:113:113:72:41:0:0:72:41:0:0 chrX 99941705 . T C 1388.08 PASS AO=151;DP=155;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123713;FXX=0.0193536;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.9249;QD=36.5284;RBI=0.052343;REFB=-0.18221;REVB=0.0508601;RO=2;SAF=77;SAR=74;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000247122;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00203046;OID=.;OPOS=99941705;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:45:155:152:2:0:151:152:74:77:1:1:75:77:0:0 chrX 100168592 . T C 432.51 PASS AO=113;DP=252;FAO=113;FDP=248;FR=.;FRO=135;FSAF=59;FSAR=54;FSRF=51;FSRR=84;FWDB=0.0134707;FXX=0.0158724;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.577;QD=6.97594;RBI=0.0499382;REFB=0.0185133;REVB=-0.0480871;RO=132;SAF=59;SAR=54;SRF=50;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139221;STB=0.578171;TYPE=snp;VARB=-0.0211116;OID=.;OPOS=100168592;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:252:248:132:135:113:113:54:59:50:82:54:59:51:84 chrX 100243459 . G T 3543.43 PASS AO=368;DP=370;FAO=370;FDP=370;FR=.;FRO=0;FSAF=155;FSAR=215;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0347126;FXX=0.00804268;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.773;QD=38.3074;RBI=0.0447975;REFB=0;REVB=0.028317;RO=0;SAF=155;SAR=213;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.75076e-05;OID=.;OPOS=100243459;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:370:370:0:0:368:370:213:155:0:0:215:155:0:0 chrX 100245606 . A G 1522.6 PASS AO=158;DP=158;FAO=158;FDP=158;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0481305;FXX=0.00628891;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.274;QD=38.5468;RBI=0.0579666;REFB=0;REVB=0.0323045;RO=0;SAF=95;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000151399;OID=.;OPOS=100245606;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:158:158:0:0:158:158:63:95:0:0:63:95:0:0 chrX 100490933 . G C 737.11 PASS AO=174;DP=351;FAO=175;FDP=351;FR=.;FRO=176;FSAF=85;FSAR=90;FSRF=91;FSRR=85;FWDB=0.00018645;FXX=0.00284083;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.9734;QD=8.40007;RBI=0.0136704;REFB=-0.0293188;REVB=-0.0136691;RO=175;SAF=85;SAR=89;SRF=91;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0288157;STB=0.515707;TYPE=snp;VARB=0.0299669;OID=.;OPOS=100490933;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:351:351:175:176:174:175:89:85:91:84:90:85:91:85 chrX 100517135 . T C 568.51 PASS AO=168;DP=401;FAO=167;FDP=399;FR=.;FRO=232;FSAF=78;FSAR=89;FSRF=104;FSRR=128;FWDB=-0.000744909;FXX=0.00249994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.969;QD=5.69933;RBI=0.00407465;REFB=-0.00212811;REVB=-0.00400598;RO=232;SAF=78;SAR=90;SRF=104;SRR=128;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0167949;STB=0.510988;TYPE=snp;VARB=0.00266048;OID=.;OPOS=100517135;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:401:399:232:232:168:167:90:78:104:128:89:78:104:128 chrX 100518165 . T C 306.81 PASS AO=107;DP=295;FAO=107;FDP=293;FR=.;FRO=186;FSAF=43;FSAR=64;FSRF=88;FSRR=98;FWDB=0.00304849;FXX=0.0101348;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.887;QD=4.18855;RBI=0.01777;REFB=-0.00257196;REVB=0.0175066;RO=185;SAF=43;SAR=64;SRF=88;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0842414;STB=0.54618;TYPE=snp;VARB=0.00505997;OID=.;OPOS=100518165;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:295:293:185:186:107:107:64:43:88:97:64:43:88:98 chrX 100532621 . T C 439.27 PASS AO=115;DP=258;FAO=117;FDP=260;FR=.;FRO=143;FSAF=71;FSAR=46;FSRF=72;FSRR=71;FWDB=-0.013933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.541;QD=6.75792;RBI=0.0293796;REFB=-0.0196742;REVB=0.0258656;RO=141;SAF=71;SAR=44;SRF=71;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115974;STB=0.558069;TYPE=snp;VARB=0.0234609;OID=.;OPOS=100532621;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:258:260:141:143:115:117:44:71:71:70:46:71:72:71 chrX 100547933 . A G 2336.62 PASS AO=263;DP=267;FAO=257;FDP=265;FR=.;FRO=8;FSAF=93;FSAR=164;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=-0.0204698;FXX=0.00749036;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.6373;QD=35.2698;RBI=0.048097;REFB=-0.0207555;REVB=-0.0435237;RO=4;SAF=93;SAR=170;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0110838;STB=0.511904;TYPE=snp;VARB=0.00244922;OID=.;OPOS=100547933;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:56:267:265:4:8:263:257:170:93:0:4:164:93:0:8 chrX 100645475 . G A 365.35 PASS AO=93;DP=201;FAO=93;FDP=201;FR=.;FRO=108;FSAF=37;FSAR=56;FSRF=45;FSRR=63;FWDB=0.000985492;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.782;QD=7.27059;RBI=0.0142965;REFB=-0.00579006;REVB=0.0142625;RO=107;SAF=37;SAR=56;SRF=44;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0134422;STB=0.510504;TYPE=snp;VARB=0.00606778;OID=.;OPOS=100645475;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:201:201:107:108:93:93:56:37:44:63:56:37:45:63 chrX 100743037 . C T 277.88 PASS AO=95;DP=269;FAO=98;FDP=270;FR=.;FRO=172;FSAF=57;FSAR=41;FSRF=95;FSRR=77;FWDB=-0.0144932;FXX=0.0036899;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.169;QD=4.11678;RBI=0.0165741;REFB=-0.0111898;REVB=-0.00804036;RO=171;SAF=54;SAR=41;SRF=95;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0148023;STB=0.519058;TYPE=snp;VARB=0.0234771;OID=.;OPOS=100743037;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:269:270:171:172:95:98:41:54:95:76:41:57:95:77 chrX 100743826 . A G 421.3 PASS AO=70;DP=135;FAO=86;FDP=152;FR=.,HEALED;FRO=66;FSAF=51;FSAR=35;FSRF=43;FSRR=23;FWDB=0.0209164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.378;QD=11.087;RBI=0.0448919;REFB=-0.0182507;REVB=0.0397214;RO=43;SAF=50;SAR=20;SRF=40;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205178;STB=0.526562;TYPE=snp;VARB=0.00966723;OID=.;OPOS=100743826;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:152:43:66:70:86:20:50:40:3:35:51:43:23 chrX 100745825 . T C 29.66 PASS AO=12;DP=42;FAO=11;FDP=41;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=23;FSRR=7;FWDB=-0.0253161;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.581;QD=2.89394;RBI=0.0253695;REFB=-0.0119316;REVB=-0.00164539;RO=28;SAF=7;SAR=5;SRF=21;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20909;STB=0.667939;TYPE=snp;VARB=0.0393507;OID=.;OPOS=100745825;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:29:42:41:28:30:12:11:5:7:21:7:5:6:23:7 chrX 100746059 . C T 13.22 PASS AO=16;DP=77;FAO=15;FDP=81;FR=.;FRO=66;FSAF=1;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=55;FWDB=0.0353005;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=36.0468;QD=0.652876;RBI=0.0364275;REFB=-0.0420151;REVB=-0.00899103;RO=61;SAF=1;SAR=15;SRF=11;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.346107;STB=0.7085;TYPE=snp;VARB=0.138255;OID=.;OPOS=100746059;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:77:81:61:66:16:15:15:1:11:50:14:1:11:55 chrX 100746138 . C T 12.12 PASS AO=12;DP=72;FAO=12;FDP=73;FR=.;FRO=61;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=22;FSRR=39;FWDB=0.0379301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.318;QD=0.664211;RBI=0.0408165;REFB=-0.0413306;REVB=-0.0150763;RO=59;SAF=9;SAR=3;SRF=21;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.46598;STB=0.80209;TYPE=snp;VARB=0.166916;OID=.;OPOS=100746138;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:72:73:59:61:12:12:3:9:21:38:3:9:22:39 chrX 100746169 . G A 16.77 PASS AO=10;DP=43;FAO=9;FDP=43;FR=.;FRO=34;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=-0.0862108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3504;QD=1.55975;RBI=0.088684;REFB=-0.0259116;REVB=-0.0207978;RO=31;SAF=6;SAR=4;SRF=20;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0572573;STB=0.574309;TYPE=snp;VARB=0.176074;OID=.;OPOS=100746169;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:43:43:31:34:10:9:4:6:20:11:4:5:22:12 chrX 100748078 . A G 1147.88 PASS AO=120;DP=121;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00517308;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.0345;QD=37.9464;RBI=0.00589738;REFB=0;REVB=-0.00283168;RO=0;SAF=103;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.99932e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000100597;OID=.;OPOS=100748078;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:54:121:121:0:0:120:121:17:103:0:0:18:103:0:0 chrX 100749585 . C T 63.76 PASS AO=19;DP=50;FAO=19;FDP=52;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=-0.00104471;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.0914;QD=4.90499;RBI=0.00334683;REFB=-0.0119932;REVB=0.0031796;RO=31;SAF=11;SAR=8;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0374753;STB=0.537776;TYPE=snp;VARB=0.0311363;OID=.;OPOS=100749585;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:63:50:52:31:33:19:19:8:11:19:12:8:11:21:12 chrX 100911066 . C T 170.66 PASS AO=51;DP=123;FAO=51;FDP=125;FR=.;FRO=74;FSAF=40;FSAR=11;FSRF=41;FSRR=33;FWDB=-0.0128937;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.9513;QD=5.4611;RBI=0.0194333;REFB=-0.0221317;REVB=-0.0145398;RO=72;SAF=39;SAR=12;SRF=40;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253798;STB=0.66383;TYPE=snp;VARB=0.0169747;OID=.;OPOS=100911066;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:123:125:72:74:51:51:12:39:40:32:11:40:41:33 chrX 101138792 . T C 2040.19 PASS AO=216;DP=217;FAO=213;FDP=213;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00129138;FXX=0.0229347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.043;QD=38.3134;RBI=0.0375487;REFB=0;REVB=0.0375265;RO=0;SAF=100;SAR=116;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.65203e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00100174;OID=.;OPOS=101138792;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:97:217:213:0:0:216:213:116:100:0:0:118:95:0:0 chrX 101266339 . A G 526.25 PASS AO=159;DP=395;FAO=161;FDP=397;FR=.;FRO=236;FSAF=75;FSAR=86;FSRF=123;FSRR=113;FWDB=-0.00853317;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.868;QD=5.3023;RBI=0.00938251;REFB=-0.00206395;REVB=0.00390085;RO=233;SAF=73;SAR=86;SRF=123;SRR=110;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0731814;STB=0.532904;TYPE=snp;VARB=0.00298297;OID=.;OPOS=101266339;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:395:397:233:236:159:161:86:73:123:110:86:75:123:113 chrX 101395780 . T TG 616.85 PASS AO=77;DP=131;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.343846;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=9.42566;QD=19.8985;RBI=0.374044;REFB=0;REVB=-0.147235;RO=39;SAF=32;SAR=45;SRF=30;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.2181;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00318381;OID=.;OPOS=101395781;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:77:131:124:124:0:68:56:0:0:55:39:32:45:30:9 chrX 101396211 . G A 102.5 PASS AO=28;DP=68;FAO=28;FDP=68;FR=.;FRO=40;FSAF=23;FSAR=5;FSRF=27;FSRR=13;FWDB=-0.0202846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.5796;QD=6.02946;RBI=0.0249479;REFB=-0.0207752;REVB=0.0145235;RO=37;SAF=23;SAR=5;SRF=24;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.239677;STB=0.623395;TYPE=snp;VARB=0.0583597;OID=.;OPOS=101396211;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:37:40:28:28:5:23:24:13:5:23:27:13 chrX 101912116 . GC G 1051.61 PASS AO=126;DP=164;FAO=160;FDP=160;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.223258;FXX=0.0123449;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.0769;QD=26.2903;RBI=0.371944;REFB=-0.0185277;REVB=0.297486;RO=30;SAF=93;SAR=33;SRF=9;SRR=21;SSEN=0.384615;SSEP=0;SSSB=0.185102;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00660505;OID=.;OPOS=101912117;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:126:162:160:160:0:103:57:0:0:91:30:93:33:9:21 chrX 101913628 . AAT A 207.15 PASS AO=71;DP=333;FAO=123;FDP=266;FR=.;FRO=143;FSAF=17;FSAR=106;FSRF=61;FSRR=82;FWDB=0.0634025;FXX=0.11333;HRUN=5;LEN=2;MLLD=19.2047;QD=3.11498;RBI=0.091335;REFB=-0.114042;REVB=-0.0657435;RO=176;SAF=8;SAR=63;SRF=71;SRR=105;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.47704;STB=0.721172;TYPE=del;VARB=0.155968;OID=.;OPOS=101913629;OREF=AT;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:71:327:123:266:143:17:106:61:82:99:176:8:63:71:105 chrX 102471531 . G T 485.35 PASS AO=140;DP=331;FAO=140;FDP=331;FR=.;FRO=191;FSAF=99;FSAR=41;FSRF=151;FSRR=40;FWDB=0.00286341;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=240.197;QD=5.86519;RBI=0.00497311;REFB=0.000381689;REVB=0.00406603;RO=189;SAF=99;SAR=41;SRF=150;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114225;STB=0.561052;TYPE=snp;VARB=-0.000502799;OID=.;OPOS=102471531;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:331:331:189:191:140:140:41:99:150:39:41:99:151:40 chrX 102564583 . A G 164.13 PASS AO=65;DP=196;FAO=65;FDP=198;FR=.;FRO=133;FSAF=24;FSAR=41;FSRF=70;FSRR=63;FWDB=-0.0349091;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.503;QD=3.31582;RBI=0.0349103;REFB=-0.0078553;REVB=-0.000291936;RO=131;SAF=24;SAR=41;SRF=70;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193831;STB=0.606896;TYPE=snp;VARB=0.0134856;OID=.;OPOS=102564583;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:196:198:131:133:65:65:41:24:70:61:41:24:70:63 chrX 102755551 . T A 342.89 PASS AO=83;DP=180;FAO=86;FDP=183;FR=.;FRO=97;FSAF=33;FSAR=53;FSRF=48;FSRR=49;FWDB=-0.0171342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.7643;QD=7.49483;RBI=0.0175472;REFB=-0.0215869;REVB=-0.00378469;RO=96;SAF=30;SAR=53;SRF=47;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128804;STB=0.560503;TYPE=snp;VARB=0.0106585;OID=.;OPOS=102755551;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:183:96:97:83:86:53:30:47:49:53:33:48:49 chrX 102842041 . T C 449.05 PASS AO=105;DP=213;FAO=105;FDP=210;FR=.;FRO=105;FSAF=67;FSAR=38;FSRF=69;FSRR=36;FWDB=-0.0112144;FXX=0.0140838;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.507;QD=8.55335;RBI=0.0187438;REFB=-0.018006;REVB=0.0150189;RO=105;SAF=67;SAR=38;SRF=69;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0188858;STB=0.510367;TYPE=snp;VARB=0.020944;OID=.;OPOS=102842041;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:213:210:105:105:105:105:38:67:69:36:38:67:69:36 chrX 102978806 . G C 563.59 PASS AO=122;DP=231;FAO=123;FDP=230;FR=.;FRO=107;FSAF=68;FSAR=55;FSRF=50;FSRR=57;FWDB=-0.00192116;FXX=0.012875;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.039;QD=9.80151;RBI=0.0350815;REFB=-0.0231415;REVB=0.0350289;RO=105;SAF=68;SAR=54;SRF=48;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.085171;STB=0.539906;TYPE=snp;VARB=0.0215722;OID=.;OPOS=102978806;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:231:230:105:107:122:123:54:68:48:57:55:68:50:57 chrX 102979486 . T C 1434.52 PASS AO=149;DP=149;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00712048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.965;QD=38.5107;RBI=0.00903965;REFB=0;REVB=0.00556903;RO=0;SAF=104;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.50494e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.54701e-06;OID=.;OPOS=102979486;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:149:149:0:0:149:149:45:104:0:0:45:104:0:0 chrX 103042882 . T C 550.04 PASS AO=148;DP=333;FAO=149;FDP=334;FR=.;FRO=185;FSAF=55;FSAR=94;FSRF=60;FSRR=125;FWDB=0.0047843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.501;QD=6.58735;RBI=0.0048205;REFB=-0.0226389;REVB=-0.00058965;RO=185;SAF=54;SAR=94;SRF=60;SRR=125;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0445159;STB=0.527015;TYPE=snp;VARB=0.026652;OID=.;OPOS=103042882;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:333:334:185:185:148:149:94:54:60:125:94:55:60:125 chrX 103046526 . TG T 1423.44 PASS AO=197;DP=223;FAO=214;FDP=214;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0696807;FXX=0.0316728;HRUN=5;LEN=1;MLLD=14.9854;QD=26.6063;RBI=0.22437;REFB=0.0027986;REVB=0.213276;RO=25;SAF=104;SAR=93;SRF=2;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0953714;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00309193;OID=.;OPOS=103046527;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:197:223:214:214:0:105:109:0:0:99:25:104:93:2:23 chrX 103267865 . C T 695.64 PASS AO=76;DP=83;FAO=77;FDP=79;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0686406;FXX=0.048187;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.1996;QD=35.2221;RBI=0.0697155;REFB=-0.0868836;REVB=0.0121948;RO=3;SAF=42;SAR=34;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00828689;STB=0.501499;TYPE=snp;VARB=0.00140455;OID=.;OPOS=103267865;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:83:79:3:2:76:77:34:42:2:1:34:43:1:1 chrX 103268333 . G A 181.68 PASS AO=40;DP=82;FAO=41;FDP=82;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=28;FSRF=15;FSRR=26;FWDB=-0.0239837;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.619;QD=8.86245;RBI=0.0250673;REFB=-0.000692952;REVB=-0.00729035;RO=41;SAF=13;SAR=27;SRF=15;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0416271;STB=0.527577;TYPE=snp;VARB=0.000383716;OID=.;OPOS=103268333;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:82:82:41:41:40:41:27:13:15:26:28:13:15:26 chrX 103294760 . C T 86.69 PASS AO=28;DP=79;FAO=28;FDP=78;FR=.;FRO=50;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=21;FWDB=0.0281683;FXX=0.0126566;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.511;QD=4.44587;RBI=0.0328483;REFB=-0.00897171;REVB=0.0168985;RO=49;SAF=13;SAR=15;SRF=28;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117776;STB=0.573718;TYPE=snp;VARB=0.0211347;OID=.;OPOS=103294760;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:86:79:78:49:50:28:28:15:13:28:21:15:13:29:21 chrX 104464276 . CA C 270.71 PASS AO=33;DP=34;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131146;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=28.5243;QD=30.9383;RBI=0.032183;REFB=0;REVB=0.0293897;RO=0;SAF=5;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.47732e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00184896;OID=.;OPOS=104464277;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:33:34:35:35:0:5:30:0:0:24:0:5:28:0:0 chrX 104464281 . TC T 254.71 PASS AO=32;DP=35;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0855742;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=23.6069;QD=30.8739;RBI=0.20022;REFB=0;REVB=0.181011;RO=0;SAF=5;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.30137;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0112462;OID=.;OPOS=104464282;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:32:33:33:33:0:5:28:0:0:23:0:5:27:0:0 chrX 105150508 . TA T 47.99 PASS AO=83;DP=359;FAO=82;FDP=312;FR=.;FRO=230;FSAF=42;FSAR=40;FSRF=124;FSRR=106;FWDB=-0.00728452;FXX=0.0796437;HRUN=6;LEN=1;MLLD=8.30845;QD=0.615224;RBI=0.237067;REFB=-0.0269254;REVB=-0.236955;RO=176;SAF=53;SAR=30;SRF=90;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0.33042;SSSB=0.154177;STB=0.519882;TYPE=del;VARB=-0.095766;OID=.;OPOS=105150509;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:83:338:82:312:230:42:40:124:106:47:176:53:30:90:86 chrX 105152282 . G A 931.08 PASS AO=249;DP=485;FAO=209;FDP=400;FR=.;FRO=191;FSAF=55;FSAR=154;FSRF=71;FSRR=120;FWDB=-0.000274413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.163;QD=9.3108;RBI=0.00487531;REFB=-0.00285462;REVB=-0.00486758;RO=234;SAF=69;SAR=180;SRF=86;SRR=148;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0952155;STB=0.562853;TYPE=snp;VARB=0.00234541;OID=.;OPOS=105152282;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:485:400:234:191:249:209:180:69:86:148:154:55:71:120 chrX 105153001 . A G 698.13 PASS AO=76;DP=78;FAO=76;FDP=78;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0923955;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.7116;QD=35.8014;RBI=0.0938738;REFB=0.0242076;REVB=0.0165938;RO=1;SAF=6;SAR=70;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0067139;STB=0.50704;TYPE=snp;VARB=0.000796016;OID=.;OPOS=105153001;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:21:78:78:1:2:76:76:70:6:0:1:70:6:0:2 chrX 106016268 . A T 623.6 PASS AO=171;DP=386;FAO=171;FDP=386;FR=.;FRO=215;FSAF=107;FSAR=64;FSRF=132;FSRR=83;FWDB=0.00687412;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.9536;QD=6.46219;RBI=0.0159252;REFB=-0.00307;REVB=0.0143651;RO=215;SAF=107;SAR=64;SRF=132;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125987;STB=0.506977;TYPE=snp;VARB=0.00319012;OID=.;OPOS=106016268;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:386:386:215:215:171:171:64:107:132:83:64:107:132:83 chrX 106200202 . G A 926.25 PASS AO=273;DP=511;FAO=208;FDP=398;FR=.;FRO=190;FSAF=94;FSAR=114;FSRF=93;FSRR=97;FWDB=-0.00729527;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.533;QD=9.30903;RBI=0.0132685;REFB=0.00861592;REVB=-0.0110829;RO=236;SAF=123;SAR=150;SRF=117;SRR=119;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0387547;STB=0.518029;TYPE=snp;VARB=-0.0121112;OID=.;OPOS=106200202;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:511:398:236:190:273:208:150:123:117:119:114:94:93:97 chrX 106221389 . T C 213.88 PASS AO=60;DP=143;FAO=62;FDP=151;FR=.;FRO=89;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=38;FSRR=51;FWDB=-0.0182918;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.632;QD=5.66568;RBI=0.0183282;REFB=-0.039713;REVB=0.00115522;RO=82;SAF=24;SAR=36;SRF=33;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00261543;STB=0.504598;TYPE=snp;VARB=0.0543713;OID=.;OPOS=106221389;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:143:151:82:89:60:62:36:24:33:49:36:26:38:51 chrX 106313508 . G A 539.87 PASS AO=186;DP=447;FAO=164;FDP=400;FR=.;FRO=236;FSAF=82;FSAR=82;FSRF=116;FSRR=120;FWDB=-0.0163249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.6846;QD=5.39868;RBI=0.0692829;REFB=-0.00399494;REVB=-0.0673321;RO=259;SAF=95;SAR=91;SRF=128;SRR=131;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.017301;STB=0.504999;TYPE=snp;VARB=0.007178;OID=.;OPOS=106313508;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:447:400:259:236:186:164:91:95:128:131:82:82:116:120 chrX 106396402 . A G 232.09 PASS AO=55;DP=114;FAO=55;FDP=114;FR=.;FRO=59;FSAF=14;FSAR=41;FSRF=22;FSRR=37;FWDB=-0.00303585;FXX=0.0172399;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.379;QD=8.14332;RBI=0.0145983;REFB=-0.0143156;REVB=0.0142791;RO=58;SAF=14;SAR=41;SRF=22;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13985;STB=0.574738;TYPE=snp;VARB=0.0170241;OID=.;OPOS=106396402;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:114:58:59:55:55:41:14:22:36:41:14:22:37 chrX 106396455 . A G 345.12 PASS AO=68;DP=118;FAO=68;FDP=118;FR=.;FRO=50;FSAF=26;FSAR=42;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=0.00951586;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.446;QD=11.699;RBI=0.0207;REFB=-0.01556;REVB=0.0183831;RO=49;SAF=26;SAR=42;SRF=23;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0694567;STB=0.542903;TYPE=snp;VARB=0.0120085;OID=.;OPOS=106396455;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:118:118:49:50:68:68:42:26:23:26:42:26:24:26 chrX 107413851 . T C 850.17 PASS AO=249;DP=498;FAO=200;FDP=398;FR=.;FRO=198;FSAF=101;FSAR=99;FSRF=73;FSRR=125;FWDB=0.00210109;FXX=0.00499988;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.066;QD=8.54438;RBI=0.00338675;REFB=-0.000928258;REVB=-0.00265622;RO=248;SAF=125;SAR=124;SRF=91;SRR=157;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123337;STB=0.567722;TYPE=snp;VARB=0.000953488;OID=.;OPOS=107413851;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:498:398:248:198:249:200:124:125:91:157:99:101:73:125 chrX 107418906 . A G 2536.25 PASS AO=270;DP=274;FAO=270;FDP=270;FR=.;FRO=0;FSAF=119;FSAR=151;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167718;FXX=0.014598;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.704;QD=37.574;RBI=0.0578418;REFB=-0.204368;REVB=0.0553569;RO=1;SAF=119;SAR=151;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00398991;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00138073;OID=.;OPOS=107418906;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:98:274:270:1:0:270:270:151:119:1:0:151:119:0:0 chrX 107433688 . A G 3727.17 PASS AO=399;DP=408;FAO=396;FDP=396;FR=.;FRO=0;FSAF=153;FSAR=243;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0734811;FXX=0.00999975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.114;QD=37.6481;RBI=0.0746905;REFB=0.0465561;REVB=-0.0133865;RO=4;SAF=146;SAR=253;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00273455;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.77614e-05;OID=.;OPOS=107433688;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:408:396:4:0:399:396:253:146:2:2:243:153:0:0 chrX 107437848 . G C 2142.05 PASS AO=230;DP=238;FAO=231;FDP=231;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=143;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0253059;FXX=0.0294105;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.635;QD=37.0918;RBI=0.0257026;REFB=-0.00835168;REVB=0.0044987;RO=4;SAF=88;SAR=142;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.013232;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.10372e-06;OID=.;OPOS=107437848;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:69:238:231:4:0:230:231:142:88:0:4:143:88:0:0 chrX 107976940 . G C 441.57 PASS AO=116;DP=244;FAO=116;FDP=255;FR=.;FRO=139;FSAF=71;FSAR=45;FSRF=88;FSRR=51;FWDB=-0.0487539;FXX=0.0116275;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.4965;QD=6.92661;RBI=0.0544767;REFB=-0.00233811;REVB=0.0243056;RO=126;SAF=71;SAR=45;SRF=79;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149008;STB=0.51213;TYPE=snp;VARB=-0.000237031;OID=.;OPOS=107976940;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:255:126:139:116:116:45:71:79:47:45:71:88:51 chrX 107979512 . C T 180.68 PASS AO=53;DP=133;FAO=53;FDP=131;FR=.;FRO=78;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=31;FSRR=47;FWDB=0.0299601;FXX=0.0150365;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.501;QD=5.51696;RBI=0.0301072;REFB=-0.0237292;REVB=-0.00297298;RO=78;SAF=26;SAR=27;SRF=31;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0987446;STB=0.555567;TYPE=snp;VARB=0.0344064;OID=.;OPOS=107979512;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:133:131:78:78:53:53:27:26:31:47:27:26:31:47 chrX 107979515 . C T 194.36 PASS AO=55;DP=132;FAO=55;FDP=132;FR=.;FRO=77;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=31;FSRR=46;FWDB=-0.00279022;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.924;QD=5.88969;RBI=0.00290516;REFB=-0.0224605;REVB=0.000809102;RO=75;SAF=26;SAR=29;SRF=29;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0893818;STB=0.541201;TYPE=snp;VARB=0.0533672;OID=.;OPOS=107979515;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:132:132:75:77:55:55:29:26:29:46:29:26:31:46 chrX 108297375 . T C 3595.91 PASS AO=657;DP=676;FAO=391;FDP=391;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=329;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113135;FXX=0.0224994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3675;QD=36.7868;RBI=0.0127204;REFB=-0.017679;REVB=-0.00581484;RO=14;SAF=110;SAR=547;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0379842;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000114671;OID=.;OPOS=108297375;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:676:391:14:0:657:391:547:110:10:4:329:62:0:0 chrX 108297445 . A G 3625.81 PASS AO=840;DP=854;FAO=392;FDP=392;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=295;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0215908;FXX=0.0199995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.407;QD=36.9981;RBI=0.043198;REFB=0.0154749;REVB=-0.0374153;RO=13;SAF=240;SAR=600;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0144005;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-4.27875e-05;OID=.;OPOS=108297445;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:854:392:13:0:840:392:600:240:9:4:295:97:0:0 chrX 108297500 . G C 3635.81 PASS AO=675;DP=688;FAO=392;FDP=400;FR=.;FRO=8;FSAF=102;FSAR=290;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0311284;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.911;QD=36.3581;RBI=0.0414826;REFB=-0.0264703;REVB=0.0274195;RO=13;SAF=173;SAR=502;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0168381;STB=0.506191;TYPE=snp;VARB=0.000282794;OID=.;OPOS=108297500;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:688:400:13:8:675:392:502:173:8:5:290:102:4:4 chrX 108297573 . A G 944.48 PASS AO=107;DP=122;FAO=111;FDP=119;FR=.;FRO=8;FSAF=28;FSAR=83;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0393755;FXX=0.0629872;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.442;QD=31.7473;RBI=0.0416742;REFB=-0.0752617;REVB=-0.0136497;RO=7;SAF=27;SAR=80;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0478802;STB=0.521599;TYPE=snp;VARB=0.00183557;OID=.;OPOS=108297573;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:122:119:7:8:107:111:80:27:4:3:83:28:4:4 chrX 108297602 . T C 256.64 PASS AO=23;DP=33;FAO=29;FDP=30;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.073141;FXX=0.0624805;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.134;QD=34.2182;RBI=0.0764537;REFB=0.028222;REVB=0.022261;RO=1;SAF=1;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0205913;STB=0.51162;TYPE=snp;VARB=-0.00181924;OID=.;OPOS=108297602;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:32:30:1:1:23:29:22:1:0:1:21:8:0:1 chrX 108297641 . G A 266.94 PASS AO=29;DP=31;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0164078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.0523;QD=33.3672;RBI=0.0557337;REFB=0.00225234;REVB=0.0532638;RO=1;SAF=2;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.016949;STB=0.508469;TYPE=snp;VARB=0.00307259;OID=.;OPOS=108297641;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:31:32:1:1:29:31:27:2:0:1:29:2:0:1 chrX 108297699 . T C 154.73 PASS AO=13;DP=15;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0569562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.4392;QD=36.4077;RBI=0.0876581;REFB=0;REVB=0.0666328;RO=0;SAF=1;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.00075e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0013717;OID=.;OPOS=108297699;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:17:0:0:13:17:12:1:0:0:16:1:0:0 chrX 108297702 . A C,G 153.76 PASS AO=4,13;DP=17;FAO=2,15;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=0,1;FSAR=2,14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0388872,0.0629954;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=83.1962,104.454;QD=36.1776;RBI=0.0403081,0.0641214;REFB=0,0;REVB=0.010608,0.0119638;RO=0;SAF=0,1;SAR=4,12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.00075e-08;STB=0.5,0.5;TYPE=snp,snp;VARB=0.0130355,-0.000929885;OID=.,.;OPOS=108297702,108297702;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:6:17:17:0:0:4,13:2,15:4,12:0,1:0:0:2,14:0,1:0:0 chrX 108297713 . T C 73.84 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0118164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.862;QD=36.9199;RBI=0.0354368;REFB=0;REVB=0.0334087;RO=0;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.78849e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000116433;OID=.;OPOS=108297713;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:7:1:0:0:7:1:0:0 chrX 108297832 . A G 23.32 PASS AO=4;DP=7;FAO=4;FDP=7;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=0;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0208897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.233;QD=13.3257;RBI=0.0208897;REFB=-0.00540523;REVB=0;RO=3;SAF=4;SAR=0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0173879;OID=.;OPOS=108297832;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:7:7:3:3:4:4:0:4:3:0:0:4:3:0 chrX 108708516 . C T 1280.78 PASS AO=146;DP=347;FAO=182;FDP=336;FR=.,HEALED;FRO=101;FSAF=88;FSAR=94;FSRF=9;FSRR=92;FWDB=-0.00561678;FXX=0.0088493;HRUN=3;LEN=1;MLLD=152.834;QD=15.2474;RBI=0.0744776;REFB=0.027438;REVB=-0.0742655;RO=97;SAF=84;SAR=62;SRF=7;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.360612;STB=0.642221;TYPE=snp;VARB=-0.000455799;OID=.;OPOS=108708516;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:300:336:97:101:146:182:62:84:7:90:94:88:9:92 chrX 108977865 . G A 386.49 PASS AO=107;DP=256;FAO=111;FDP=262;FR=.;FRO=151;FSAF=48;FSAR=63;FSRF=63;FSRR=88;FWDB=0.0271494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.941;QD=5.90055;RBI=0.0276369;REFB=-0.0120539;REVB=-0.00516787;RO=149;SAF=46;SAR=61;SRF=61;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218985;STB=0.508951;TYPE=snp;VARB=0.0172594;OID=.;OPOS=108977865;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:256:262:149:151:107:111:61:46:61:88:63:48:63:88 chrX 109439634 . T G 77.08 PASS AO=11;DP=33;FAO=15;FDP=27;FR=.,HEALED;FRO=12;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=4.37661e-05;FXX=0.0999667;HRUN=10;LEN=1;MLLD=189.565;QD=11.4195;RBI=0.00691597;REFB=0.00231693;REVB=-0.00691583;RO=17;SAF=6;SAR=5;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0444202;STB=0.514832;TYPE=snp;VARB=-0.0012779;OID=.;OPOS=109439634;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:55:33:27:17:12:11:15:5:6:10:7:8:7:6:6 chrX 110951495 . GA G 20.4 PASS AO=40;DP=179;FAO=45;FDP=171;FR=.;FRO=126;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=47;FSRR=79;FWDB=-0.0607897;FXX=0.00581362;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.0223;QD=0.477092;RBI=0.0952235;REFB=-0.0424676;REVB=0.0732948;RO=112;SAF=18;SAR=22;SRF=43;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0835147;STB=0.537575;TYPE=del;VARB=0.0399434;OID=.;OPOS=110951496;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:40:171:45:171:126:19:26:47:79:20:112:18:22:43:69 chrX 111698036 . T C 2328.87 PASS AO=229;DP=238;FAO=250;FDP=250;FR=.;FRO=0;FSAF=105;FSAR=145;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0306491;FXX=0.0310065;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.0657;QD=37.2619;RBI=0.111317;REFB=-0.0891619;REVB=0.107014;RO=6;SAF=103;SAR=126;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0188002;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00311028;OID=.;OPOS=111698036;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:94:238:250:6:0:229:250:126:103:5:1:145:105:0:0 chrX 111698440 . G T 152.05 PASS AO=49;DP=131;FAO=49;FDP=131;FR=.;FRO=82;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=59;FSRR=23;FWDB=-0.0106647;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.582;QD=4.64285;RBI=0.0297387;REFB=0.00102016;REVB=-0.0277607;RO=81;SAF=25;SAR=24;SRF=59;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.242868;STB=0.631727;TYPE=snp;VARB=-0.00299529;OID=.;OPOS=111698440;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:131:131:81:82:49:49:24:25:59:22:24:25:59:23 chrX 111698463 . C T 172.18 PASS AO=50;DP=126;FAO=51;FDP=127;FR=.;FRO=76;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=49;FSRR=27;FWDB=0.0321824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.599;QD=5.4231;RBI=0.0324967;REFB=-0.0202673;REVB=-0.00450936;RO=75;SAF=23;SAR=27;SRF=49;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203672;STB=0.614403;TYPE=snp;VARB=0.022044;OID=.;OPOS=111698463;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:126:127:75:76:50:51:27:23:49:26:28:23:49:27 chrX 111698613 . T C 424 PASS AO=94;DP=181;FAO=95;FDP=183;FR=.;FRO=88;FSAF=52;FSAR=43;FSRF=36;FSRR=52;FWDB=-0.0614867;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.184;QD=9.26764;RBI=0.0615564;REFB=-0.00832017;REVB=0.00292781;RO=87;SAF=52;SAR=42;SRF=36;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121925;STB=0.56624;TYPE=snp;VARB=0.00817959;OID=.;OPOS=111698613;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:181:183:87:88:94:95:42:52:36:51:43:52:36:52 chrX 111699028 . T C 359.95 PASS AO=75;DP=140;FAO=76;FDP=139;FR=.;FRO=63;FSAF=28;FSAR=48;FSRF=30;FSRR=33;FWDB=-0.00684874;FXX=0.00714235;HRUN=3;LEN=1;MLLD=213.918;QD=10.3582;RBI=0.00886364;REFB=-0.00678181;REVB=-0.00562663;RO=63;SAF=27;SAR=48;SRF=30;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101717;STB=0.551055;TYPE=snp;VARB=0.00363618;OID=.;OPOS=111699028;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:140:139:63:63:75:76:48:27:30:33:48:28:30:33 chrX 111699344 . AC A 100.24 PASS AO=42;DP=102;FAO=43;FDP=101;FR=.;FRO=58;FSAF=13;FSAR=30;FSRF=13;FSRR=45;FWDB=-0.02193;FXX=0.00980296;HRUN=2;LEN=1;MLLD=28.8433;QD=3.9697;RBI=0.0522476;REFB=-0.044271;REVB=-0.0474224;RO=56;SAF=13;SAR=29;SRF=11;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143872;STB=0.555531;TYPE=del;VARB=0.0544094;OID=.;OPOS=111699345;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:42:102:43:101:58:13:30:13:45:99:56:13:29:11:45 chrX 111700104 . G T 249.3 PASS AO=72;DP=183;FAO=78;FDP=189;FR=.;FRO=111;FSAF=43;FSAR=35;FSRF=61;FSRR=50;FWDB=0.00452962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.582;QD=5.27622;RBI=0.0300296;REFB=-0.019417;REVB=0.029686;RO=107;SAF=40;SAR=32;SRF=58;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145045;STB=0.501028;TYPE=snp;VARB=0.0212961;OID=.;OPOS=111700104;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:183:189:107:111:72:78:32:40:58:49:35:43:61:50 chrX 111700105 . C T 244.51 PASS AO=77;DP=187;FAO=78;FDP=189;FR=.;FRO=111;FSAF=43;FSAR=35;FSRF=61;FSRR=50;FWDB=0.0153263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.672;QD=5.17477;RBI=0.0318287;REFB=-0.0216421;REVB=0.0278958;RO=106;SAF=43;SAR=34;SRF=58;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0118146;STB=0.501028;TYPE=snp;VARB=0.0293239;OID=.;OPOS=111700105;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:187:189:106:111:77:78:34:43:58:48:35:43:61:50 chrX 113193211 . A T 917.33 PASS AO=100;DP=102;FAO=100;FDP=102;FR=.;FRO=2;FSAF=85;FSAR=15;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00416694;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.081;QD=35.9735;RBI=0.0073917;REFB=-0.0583172;REVB=0.00610522;RO=1;SAF=85;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00554935;STB=0.505813;TYPE=snp;VARB=0.000690595;OID=.;OPOS=113193211;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:30:102:102:1:2:100:100:15:85:1:0:15:85:2:0 chrX 113219823 . C T 1040.16 PASS AO=106;DP=108;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0268032;FXX=0.0176975;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.058;QD=37.4833;RBI=0.033772;REFB=-0.0608378;REVB=-0.020546;RO=0;SAF=30;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.59566e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000205759;OID=.;OPOS=113219823;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:43:108:111:0:0:106:111:76:30:0:0:76:35:0:0 chrX 114424192 . AG A 1729.23 PASS AO=234;DP=294;FAO=277;FDP=277;FR=.;FRO=0;FSAF=155;FSAR=122;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0959677;FXX=0.0314674;HRUN=2;LEN=1;MLLD=15.4288;QD=24.9709;RBI=0.197327;REFB=-0.0219222;REVB=0.172419;RO=30;SAF=139;SAR=95;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0.302763;SSSB=0.0575394;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00419532;OID=.;OPOS=114424193;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:234:292:277:277:0:155:122:0:0:99:30:139:95:10:20 chrX 114424584 . T C 15.77 PASS AO=3;DP=7;FAO=3;FDP=7;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0253168;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2455;QD=9.01045;RBI=0.0253168;REFB=-0.0293932;REVB=0;RO=4;SAF=3;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0384966;OID=.;OPOS=114424584;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:7:7:4:4:3:3:0:3:4:0:0:3:4:0 chrX 114425400 . G A 138.41 PASS AO=19;DP=26;FAO=21;FDP=26;FR=.;FRO=5;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.119073;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.521;QD=21.2933;RBI=0.125345;REFB=-0.0939497;REVB=0.0391538;RO=7;SAF=8;SAR=11;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143169;STB=0.523787;TYPE=snp;VARB=0.0273285;OID=.;OPOS=114425400;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:26:26:7:5:19:21:11:8:5:2:11:10:3:2 chrX 114425976 . G A 15.11 PASS AO=5;DP=21;FAO=5;FDP=21;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.0349786;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.947;QD=2.87725;RBI=0.035575;REFB=-0.0291973;REVB=-0.0064868;RO=16;SAF=2;SAR=3;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0437048;STB=0.529293;TYPE=snp;VARB=0.0399903;OID=.;OPOS=114425976;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:21:21:16:16:5:5:3:2:7:9:3:2:7:9 chrX 114426171 . C T 29.42 PASS AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0780479;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.76;QD=11.7692;RBI=0.116146;REFB=-0.00529102;REVB=-0.0860136;RO=5;SAF=4;SAR=1;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.596316;STB=0.855915;TYPE=snp;VARB=0.00521452;OID=.;OPOS=114426171;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:10:10:5:5:5:5:1:4:0:5:1:4:0:5 chrX 114426917 . C T 302.35 PASS AO=30;DP=31;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0790087;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.009;QD=36.649;RBI=0.117704;REFB=0;REVB=0.087246;RO=0;SAF=20;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000813876;OID=.;OPOS=114426917;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:15:31:33:0:0:30:33:10:20:0:0:11:22:0:0 chrX 115304824 . G T 393.82 PASS AO=114;DP=275;FAO=115;FDP=276;FR=.;FRO=161;FSAF=56;FSAR=59;FSRF=69;FSRR=92;FWDB=0.00976689;FXX=0.00360998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.871;QD=5.70752;RBI=0.0244176;REFB=-0.016291;REVB=0.0223792;RO=157;SAF=55;SAR=59;SRF=68;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0514502;STB=0.534136;TYPE=snp;VARB=0.0174224;OID=.;OPOS=115304824;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:275:276:157:161:114:115:59:55:68:89:59:56:69:92 chrX 115304830 . A G 361.94 PASS AO=110;DP=275;FAO=111;FDP=276;FR=.;FRO=165;FSAF=54;FSAR=57;FSRF=72;FSRR=93;FWDB=-0.0202165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.589;QD=5.24546;RBI=0.0293091;REFB=-0.0112658;REVB=0.0212207;RO=163;SAF=54;SAR=56;SRF=72;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0525337;STB=0.53003;TYPE=snp;VARB=0.0106694;OID=.;OPOS=115304830;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:275:276:163:165:110:111:56:54:72:91:57:54:72:93 chrX 115305126 . A C 279.09 PASS AO=85;DP=212;FAO=85;FDP=212;FR=.;FRO=127;FSAF=33;FSAR=52;FSRF=61;FSRR=66;FWDB=-0.0281147;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=151.528;QD=5.26588;RBI=0.0291913;REFB=0.0089288;REVB=0.00785464;RO=116;SAF=33;SAR=52;SRF=55;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0911729;STB=0.55658;TYPE=snp;VARB=-0.01324;OID=.;OPOS=115305126;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:212:212:116:127:85:85:52:33:55:61:52:33:61:66 chrX 115590299 . C G 640.11 PASS AO=142;DP=280;FAO=147;FDP=285;FR=.;FRO=138;FSAF=72;FSAR=75;FSRF=43;FSRR=95;FWDB=-0.0281468;FXX=0.0104163;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.8569;QD=8.98401;RBI=0.0437001;REFB=-0.0276487;REVB=-0.0334284;RO=136;SAF=69;SAR=73;SRF=43;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152963;STB=0.586617;TYPE=snp;VARB=0.0287017;OID=.;OPOS=115590299;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:280:285:136:138:142:147:73:69:43:93:75:72:43:95 chrX 117521338 . G A 415.36 PASS AO=129;DP=320;FAO=128;FDP=319;FR=.;FRO=191;FSAF=56;FSAR=72;FSRF=84;FSRR=107;FWDB=0.000290218;FXX=0.0031249;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.2271;QD=5.20832;RBI=0.0429558;REFB=-0.0154435;REVB=-0.0429548;RO=191;SAF=56;SAR=73;SRF=84;SRR=107;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00616188;STB=0.501393;TYPE=snp;VARB=0.0311713;OID=.;OPOS=117521338;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:320:319:191:191:129:128:73:56:84:107:72:56:84:107 chrX 117528056 . G A 344.36 PASS AO=105;DP=261;FAO=105;FDP=261;FR=.;FRO=156;FSAF=42;FSAR=63;FSRF=59;FSRR=97;FWDB=-0.00923396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.0547;QD=5.27749;RBI=0.0806578;REFB=-0.0103896;REVB=0.0801275;RO=156;SAF=42;SAR=63;SRF=59;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0243624;STB=0.513641;TYPE=snp;VARB=0.0192324;OID=.;OPOS=117528056;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:261:261:156:156:105:105:63:42:59:97:63:42:59:97 chrX 117528142 . C T 299.96 PASS AO=92;DP=240;FAO=94;FDP=239;FR=.;FRO=145;FSAF=39;FSAR=55;FSRF=52;FSRR=93;FWDB=0.0196697;FXX=0.00416649;HRUN=2;LEN=1;MLLD=246.094;QD=5.02032;RBI=0.0221552;REFB=0.00848763;REVB=-0.010196;RO=145;SAF=39;SAR=53;SRF=52;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0737088;STB=0.535578;TYPE=snp;VARB=-0.013602;OID=.;OPOS=117528142;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:240:239:145:145:92:94:53:39:52:93:55:39:52:93 chrX 117566782 . C T 415.55 PASS AO=120;DP=290;FAO=122;FDP=292;FR=.;FRO=170;FSAF=89;FSAR=33;FSRF=105;FSRR=65;FWDB=-0.0270321;FXX=0.00341285;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.062;QD=5.69253;RBI=0.100094;REFB=-0.00722365;REVB=-0.0963742;RO=170;SAF=88;SAR=32;SRF=105;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142858;STB=0.576686;TYPE=snp;VARB=0.0106548;OID=.;OPOS=117566782;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:290:292:170:170:120:122:32:88:105:65:33:89:105:65 chrX 117817086 . G A 637.77 PASS AO=206;DP=452;FAO=176;FDP=400;FR=.;FRO=224;FSAF=83;FSAR=93;FSRF=90;FSRR=134;FWDB=-0.0427399;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.139;QD=6.37766;RBI=0.0429223;REFB=-0.0270099;REVB=-0.00395249;RO=246;SAF=95;SAR=111;SRF=105;SRR=141;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0341811;STB=0.539389;TYPE=snp;VARB=0.0403253;OID=.;OPOS=117817086;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:452:400:246:224:206:176:111:95:105:141:93:83:90:134 chrX 117938928 . G A 492.1 PASS AO=125;DP=273;FAO=127;FDP=275;FR=.;FRO=148;FSAF=44;FSAR=83;FSRF=40;FSRR=108;FWDB=0.00061854;FXX=0.0350865;HRUN=3;LEN=1;MLLD=199.709;QD=7.15775;RBI=0.00943845;REFB=-0.0185143;REVB=-0.00941816;RO=145;SAF=42;SAR=83;SRF=39;SRR=106;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0752517;STB=0.546559;TYPE=snp;VARB=0.0186363;OID=.;OPOS=117938928;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:273:275:145:148:125:127:83:42:39:106:83:44:40:108 chrX 118108785 . T C 236.7 PASS AO=51;DP=98;FAO=52;FDP=101;FR=.;FRO=49;FSAF=33;FSAR=19;FSRF=33;FSRR=16;FWDB=-0.0182812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.061;QD=9.37433;RBI=0.0220328;REFB=-0.0362446;REVB=-0.012298;RO=45;SAF=32;SAR=19;SRF=31;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0569207;STB=0.52054;TYPE=snp;VARB=0.0292785;OID=.;OPOS=118108785;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:98:101:45:49:51:52:19:32:31:14:19:33:33:16 chrX 118145915 . GC G 1569.36 PASS AO=206;DP=268;FAO=247;FDP=247;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=172;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.329501;FXX=0.00803181;HRUN=2;LEN=1;MLLD=15.3683;QD=25.4147;RBI=0.34531;REFB=-0.00680148;REVB=0.103287;RO=27;SAF=48;SAR=158;SRF=18;SRR=9;SSEN=0.268635;SSEP=0;SSSB=-0.123543;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00431992;OID=.;OPOS=118145916;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:206:249:247:247:0:75:172:0:0:99:27:48:158:18:9 chrX 118146810 . C T 2156.65 PASS AO=229;DP=232;FAO=229;FDP=229;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=125;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00691545;FXX=0.0171666;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.265;QD=37.6708;RBI=0.0257488;REFB=-0.0413803;REVB=0.0248028;RO=2;SAF=104;SAR=125;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00907483;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000217914;OID=.;OPOS=118146810;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:232:229:2:0:229:229:125:104:2:0:125:104:0:0 chrX 118281538 . C A 2348.64 PASS AO=240;DP=245;FAO=252;FDP=252;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=157;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0227764;FXX=0.0156244;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.6242;QD=37.28;RBI=0.0916889;REFB=-0.00546898;REVB=0.0888149;RO=4;SAF=94;SAR=146;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0117118;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000485886;OID=.;OPOS=118281538;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:86:245:252:4:0:240:252:146:94:3:1:157:95:0:0 chrX 118587003 . C T 2395.65 PASS AO=247;DP=270;FAO=259;FDP=259;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=205;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.03612;FXX=0.0407392;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.682;QD=36.9984;RBI=0.0363953;REFB=0.0165258;REVB=0.00446797;RO=1;SAF=43;SAR=204;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00233103;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00055586;OID=.;OPOS=118587003;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:95:270:259:1:0:247:259:204:43:0:1:205:54:0:0 chrX 118587321 . A G 1065.04 PASS AO=111;DP=112;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0686827;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.8535;QD=38.0373;RBI=0.0758926;REFB=0;REVB=0.0322857;RO=0;SAF=52;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41849e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000514811;OID=.;OPOS=118587321;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:51:112:112:0:0:111:112:59:52:0:0:59:53:0:0 chrX 118603844 . T G 2587.17 PASS AO=283;DP=291;FAO=283;FDP=283;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=205;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00833484;FXX=0.0308209;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.098;QD=36.5678;RBI=0.0351195;REFB=0.0639502;REVB=-0.0341162;RO=8;SAF=78;SAR=205;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00168179;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000181754;OID=.;OPOS=118603844;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:71:291:283:8:0:283:283:205:78:2:6:205:78:0:0 chrX 118604436 . T C 2221.98 PASS AO=237;DP=241;FAO=238;FDP=238;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=143;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0125506;FXX=0.0124476;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.181;QD=37.3443;RBI=0.018322;REFB=-0.065241;REVB=0.0133483;RO=2;SAF=94;SAR=143;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0100308;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000143678;OID=.;OPOS=118604436;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:241:238:2:0:237:238:143:94:2:0:143:95:0:0 chrX 118678364 . G A 3522.54 PASS AO=318;DP=319;FAO=370;FDP=370;FR=.;FRO=0;FSAF=182;FSAR=188;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214316;FXX=0.0106949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.685;QD=38.0815;RBI=0.026046;REFB=0;REVB=0.0148012;RO=0;SAF=142;SAR=176;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=9.11979e-05;OID=.;OPOS=118678364;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:319:370:0:0:318:370:176:142:0:0:188:182:0:0 chrX 118699320 . A G 3230.66 PASS AO=326;DP=326;FAO=337;FDP=337;FR=.;FRO=0;FSAF=147;FSAR=190;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013086;FXX=0.00295849;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.946;QD=38.3461;RBI=0.0184372;REFB=0;REVB=0.012988;RO=0;SAF=145;SAR=181;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.23975e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.59821e-05;OID=.;OPOS=118699320;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:326:337:0:0:326:337:181:145:0:0:190:147:0:0 chrX 118893413 . T C 574.52 PASS AO=60;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0269716;FXX=0.031741;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.565;QD=37.6735;RBI=0.0449182;REFB=0;REVB=0.035919;RO=0;SAF=22;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000571778;OID=.;OPOS=118893413;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:61:61:0:0:60:61:38:22:0:0:38:23:0:0 chrX 119065893 . G A 388.62 PASS AO=120;DP=299;FAO=120;FDP=300;FR=.;FRO=180;FSAF=69;FSAR=51;FSRF=122;FSRR=58;FWDB=-0.0313531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.569;QD=5.18156;RBI=0.0420056;REFB=-0.0313691;REVB=0.0279544;RO=179;SAF=69;SAR=51;SRF=121;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112925;STB=0.564293;TYPE=snp;VARB=0.0308775;OID=.;OPOS=119065893;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:299:300:179:180:120:120:51:69:121:58:51:69:122:58 chrX 119387833 . C CTGA 792.55 PASS AO=89;DP=165;FAO=104;FDP=122;FR=.;FRO=18;FSAF=58;FSAR=46;FSRF=15;FSRR=3;FWDB=0.00995638;FXX=0.0686971;HRUN=1;LEN=3;MLLD=201.893;QD=25.9852;RBI=0.0352332;REFB=-0.0113674;REVB=0.0337971;RO=68;SAF=46;SAR=43;SRF=45;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116044;STB=0.541605;TYPE=ins;VARB=0.00122767;OID=.;OPOS=119387834;OREF=-;OALT=TGA;OMAPALT=CTGA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:89:165:104:122:18:58:46:15:3:10:68:46:43:45:23 chrX 119389966 . C T 1464.4 PASS AO=147;DP=150;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0232386;FXX=0.00632871;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.853;QD=37.3095;RBI=0.0375014;REFB=-0.0647674;REVB=0.0294334;RO=1;SAF=44;SAR=103;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106852;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000280359;OID=.;OPOS=119389966;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:150:157:1:0:147:157:103:44:1:0:105:52:0:0 chrX 119390465 . A G 796.61 PASS AO=77;DP=82;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0350326;FXX=0.0744602;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.003;QD=36.6256;RBI=0.0353129;REFB=0;REVB=0.00444055;RO=0;SAF=37;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00194766;OID=.;OPOS=119390465;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:82:87:0:0:77:87:40:37:0:0:41:46:0:0 chrX 119390665 . A T 129.32 PASS AO=42;DP=114;FAO=45;FDP=130;FR=.;FRO=85;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=53;FSRR=32;FWDB=-0.00441798;FXX=0.0441144;HRUN=6;LEN=1;MLLD=176.43;QD=3.97914;RBI=0.0308053;REFB=0.00440235;REVB=-0.0304868;RO=66;SAF=26;SAR=16;SRF=49;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147398;STB=0.500909;TYPE=snp;VARB=-0.0092183;OID=.;OPOS=119390665;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:114:130:66:85:42:45:16:26:49:17:17:28:53:32 chrX 119391880 . G A 1420.85 PASS AO=146;DP=146;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.2035;QD=38.4015;RBI=0.0331162;REFB=0;REVB=-0.0270698;RO=0;SAF=60;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.53457e-05;OID=.;OPOS=119391880;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:146:148:0:0:146:148:86:60:0:0:87:61:0:0 chrX 119576455 . G A 434.9 PASS AO=116;DP=260;FAO=116;FDP=259;FR=.;FRO=143;FSAF=58;FSAR=58;FSRF=78;FSRR=65;FWDB=0.00519906;FXX=0.00384601;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.133;QD=6.71662;RBI=0.0058705;REFB=-0.00431011;REVB=-0.00272627;RO=143;SAF=58;SAR=58;SRF=78;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0452887;STB=0.525092;TYPE=snp;VARB=0.00509652;OID=.;OPOS=119576455;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:260:259:143:143:116:116:58:58:78:65:58:58:78:65 chrX 119590533 . T A 653.17 PASS AO=587;DP=1269;FAO=178;FDP=400;FR=.;FRO=222;FSAF=144;FSAR=34;FSRF=162;FSRR=60;FWDB=0.0332536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.2344;QD=6.53167;RBI=0.0795183;REFB=-0.0318992;REVB=0.0722313;RO=669;SAF=454;SAR=133;SRF=490;SRR=179;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0546809;STB=0.565406;TYPE=snp;VARB=0.0450013;OID=.;OPOS=119590533;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:1269:400:669:222:587:178:133:454:490:179:34:144:162:60 chrX 122318386 . A AG 2547.53 PASS AO=265;DP=273;FAO=268;FDP=268;FR=.;FRO=0;FSAF=146;FSAR=122;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147265;FXX=0.0110697;HRUN=0;LEN=1;MLLD=266.032;QD=38.0229;RBI=0.017649;REFB=-0.0210244;REVB=-0.00972717;RO=3;SAF=145;SAR=120;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00976053;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-4.02537e-05;OID=.;OPOS=122318387;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:265:273:268:268:0:146:122:0:0:99:3:145:120:3:0 chrX 122336600 . T TG 1305.16 PASS AO=168;DP=207;FAO=201;FDP=201;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=136;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0821734;FXX=0.00495025;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.4449;QD=25.9733;RBI=0.133684;REFB=0.0129077;REVB=0.105446;RO=27;SAF=56;SAR=112;SRF=8;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0109542;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.000496076;OID=.;OPOS=122336601;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:168:207:201:201:0:65:136:0:0:99:27:56:112:8:19 chrX 122537277 . T C 114.26 PASS AO=45;DP=141;FAO=45;FDP=140;FR=.;FRO=95;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=45;FSRR=50;FWDB=-0.0314544;FXX=0.0070917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.7588;QD=3.26463;RBI=0.0435156;REFB=-0.0063513;REVB=-0.0300703;RO=95;SAF=26;SAR=19;SRF=45;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122069;STB=0.570761;TYPE=snp;VARB=0.0131434;OID=.;OPOS=122537277;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:141:140:95:95:45:45:19:26:45:50:19:26:45:50 chrX 123041043 . A G 549.27 PASS AO=126;DP=252;FAO=129;FDP=257;FR=.;FRO=128;FSAF=42;FSAR=87;FSRF=64;FSRR=64;FWDB=0.0137705;FXX=0.00772171;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.36;QD=8.54893;RBI=0.0203708;REFB=-0.0114514;REVB=0.0150115;RO=124;SAF=44;SAR=82;SRF=61;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135365;STB=0.592506;TYPE=snp;VARB=0.0109156;OID=.;OPOS=123041043;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:252:257:124:128:126:129:82:44:61:63:87:42:64:64 chrX 123042424 . G A 790.68 PASS AO=366;DP=719;FAO=193;FDP=397;FR=.;FRO=204;FSAF=89;FSAR=104;FSRF=121;FSRR=83;FWDB=-0.0146579;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.96;QD=7.96653;RBI=0.015557;REFB=0.00293756;REVB=-0.00521201;RO=344;SAF=171;SAR=195;SRF=203;SRR=141;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108894;STB=0.567516;TYPE=snp;VARB=-0.00281725;OID=.;OPOS=123042424;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:719:397:344:204:366:193:195:171:203:141:104:89:121:83 chrX 123042707 . T C 859.3 PASS AO=711;DP=1429;FAO=201;FDP=397;FR=.;FRO=196;FSAF=86;FSAR=115;FSRF=81;FSRR=115;FWDB=0.0151609;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.812;QD=8.65793;RBI=0.0157073;REFB=0.00251233;REVB=0.00410679;RO=707;SAF=309;SAR=402;SRF=303;SRR=404;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00560595;STB=0.507374;TYPE=snp;VARB=-0.00272391;OID=.;OPOS=123042707;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:1429:397:707:196:711:201:402:309:303:404:115:86:81:115 chrX 123043324 . TGTATA T 242.45 PASS AO=96;DP=351;FAO=100;FDP=306;FR=.;FRO=206;FSAF=33;FSAR=67;FSRF=64;FSRR=142;FWDB=0.0037379;FXX=0.0783109;HRUN=1;LEN=5;MLLD=224.724;QD=3.16931;RBI=0.0110449;REFB=-0.00918962;REVB=0.0103932;RO=206;SAF=30;SAR=66;SRF=67;SRR=139;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0174179;STB=0.514852;TYPE=del;VARB=0.0183634;OID=.;OPOS=123043325;OREF=GTATA;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:96:323:100:306:206:33:67:64:142:99:206:30:66:67:139 chrX 123514006 . G A 797.4 PASS AO=187;DP=374;FAO=187;FDP=371;FR=.;FRO=184;FSAF=87;FSAR=100;FSRF=78;FSRR=106;FWDB=0.00893072;FXX=0.00802118;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.994;QD=8.59733;RBI=0.00899921;REFB=-0.015814;REVB=-0.00110814;RO=184;SAF=87;SAR=100;SRF=78;SRR=106;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0377562;STB=0.520653;TYPE=snp;VARB=0.0142719;OID=.;OPOS=123514006;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:374:371:184:184:187:187:100:87:78:106:100:87:78:106 chrX 123540315 . G T 161.75 PASS AO=52;DP=138;FAO=52;FDP=138;FR=.;FRO=86;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=38;FSRR=48;FWDB=-0.0255204;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.1781;QD=4.68841;RBI=0.0535694;REFB=-0.00527021;REVB=0.0470998;RO=86;SAF=26;SAR=26;SRF=38;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.063811;STB=0.536218;TYPE=snp;VARB=0.00981979;OID=.;OPOS=123540315;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:138:138:86:86:52:52:26:26:38:48:26:26:38:48 chrX 123554646 . T C 193.39 PASS AO=35;DP=57;FAO=35;FDP=57;FR=.;FRO=22;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=-0.0289724;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=137.68;QD=13.5715;RBI=0.0320752;REFB=-0.0180924;REVB=0.013763;RO=20;SAF=15;SAR=20;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0538097;STB=0.544017;TYPE=snp;VARB=0.00854524;OID=.;OPOS=123554646;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:76:57:57:20:22:35:35:20:15:7:13:20:15:7:15 chrX 124455463 . GA G,GG 156.93 PASS AO=9,8;DP=34;FAO=19,7;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=3,2;FSAR=16,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.156063,0.149723;FXX=0.0370233;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=13.5031,14.6643;QD=24.1427;RBI=0.452643,0.292834;REFB=-0.0230866,-0.0207016;REVB=0.424888,0.251664;RO=7;SAF=3,2;SAR=6,6;SRF=0;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.327286,0.32619;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=0.0798357,-0.0109182;OID=.,.;OPOS=124455464,124455464;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:9,8:27:19,7:26:0:3,2:16,5:0:0:21:7:3,2:6,6:0:7 chrX 124455591 . C G 17.6 PASS AO=7;DP=28;FAO=7;FDP=28;FR=.;FRO=21;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=16;FWDB=-0.0286213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.4939;QD=2.51488;RBI=0.0392345;REFB=-0.0211392;REVB=-0.0268359;RO=21;SAF=1;SAR=6;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181071;STB=0.620297;TYPE=snp;VARB=0.227199;OID=.;OPOS=124455591;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:28:28:21:21:7:7:6:1:5:16:6:1:5:16 chrX 124456082 . T G 14.96 PASS AO=3;DP=20;FAO=3;FDP=15;FR=.,HEALED;FRO=11;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=0.0244087;FXX=0.117578;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.399;QD=3.98948;RBI=0.0244097;REFB=0.00188863;REVB=0.000220455;RO=8;SAF=2;SAR=1;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.413961;STB=0.831744;TYPE=snp;VARB=0.126035;OID=.;OPOS=124456082;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:15:15:8:11:3:3:1:2:2:6:1:2:2:9 chrX 125955428 . G A 508.36 PASS AO=272;DP=656;FAO=160;FDP=400;FR=.;FRO=240;FSAF=86;FSAR=74;FSRF=149;FSRR=91;FWDB=0.00148374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.276;QD=5.08364;RBI=0.0713276;REFB=-0.0152993;REVB=0.0713122;RO=377;SAF=146;SAR=126;SRF=234;SRR=143;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0889911;STB=0.550659;TYPE=snp;VARB=0.0250554;OID=.;OPOS=125955428;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:656:400:377:240:272:160:126:146:234:143:74:86:149:91 chrX 129054446 . G A 136.68 PASS AO=42;DP=109;FAO=42;FDP=109;FR=.;FRO=67;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=40;FSRR=27;FWDB=-0.0216808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.448;QD=5.01563;RBI=0.0306602;REFB=-0.00292586;REVB=0.0216794;RO=67;SAF=23;SAR=19;SRF=40;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0542613;STB=0.530806;TYPE=snp;VARB=0.00422276;OID=.;OPOS=129054446;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:67:67:42:42:19:23:40:27:19:23:40:27 chrX 129147079 . T C 404.53 PASS AO=48;DP=53;FAO=52;FDP=56;FR=.;FRO=4;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0346818;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.1836;QD=28.895;RBI=0.14;REFB=-0.0585374;REVB=0.135636;RO=3;SAF=27;SAR=21;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0117099;STB=0.512707;TYPE=snp;VARB=0.0178733;OID=.;OPOS=129147079;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:53:56:3:4:48:52:21:27:2:1:22:30:3:1 chrX 129201013 . GC G 592.26 PASS AO=95;DP=173;FAO=170;FDP=170;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.246177;FXX=0.01734;HRUN=4;LEN=1;MLLD=8.73884;QD=13.9354;RBI=0.370328;REFB=0.0102402;REVB=0.276657;RO=51;SAF=40;SAR=55;SRF=22;SRR=29;SSEN=0.453271;SSEP=0;SSSB=-0.00684772;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0216816;OID=.;OPOS=129201014;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:95:163:170:170:0:69:101:0:0:27:51:40:55:22:29 chrX 129201179 . C T 252.56 PASS AO=52;DP=97;FAO=52;FDP=95;FR=.;FRO=43;FSAF=32;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=0.0327726;FXX=0.0206164;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.175;QD=10.6341;RBI=0.0331484;REFB=-0.0164362;REVB=0.00497749;RO=42;SAF=32;SAR=20;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154198;STB=0.57987;TYPE=snp;VARB=0.0100705;OID=.;OPOS=129201179;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:95:42:43:52:52:20:32:18:24:20:32:19:24 chrX 129283520 . A G 2698.12 PASS AO=279;DP=279;FAO=280;FDP=280;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=189;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0337887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.812;QD=38.5446;RBI=0.0356044;REFB=0;REVB=-0.0112249;RO=0;SAF=90;SAR=189;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.77208e-05;OID=.;OPOS=129283520;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:279:280:0:0:279:280:189:90:0:0:189:91:0:0 chrX 129318678 . A G 143.93 PASS AO=38;DP=88;FAO=38;FDP=88;FR=.;FRO=50;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=36;FSRR=14;FWDB=-0.0227816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.4056;QD=6.54241;RBI=0.0286395;REFB=-0.0152355;REVB=0.0173557;RO=50;SAF=18;SAR=20;SRF=36;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247266;STB=0.63823;TYPE=snp;VARB=0.0150352;OID=.;OPOS=129318678;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:88:88:50:50:38:38:20:18:36:14:20:18:36:14 chrX 129338766 . G A 3018.21 PASS AO=316;DP=317;FAO=316;FDP=316;FR=.;FRO=0;FSAF=152;FSAR=164;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0219723;FXX=0.00315447;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.942;QD=38.2052;RBI=0.0271863;REFB=-0.0380033;REVB=-0.0160098;RO=1;SAF=152;SAR=164;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00289979;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.47548e-05;OID=.;OPOS=129338766;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:317:316:1:0:316:316:164:152:0:1:164:152:0:0 chrX 129349295 . T G 1784.12 PASS AO=208;DP=227;FAO=208;FDP=223;FR=.;FRO=15;FSAF=87;FSAR=121;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0111563;FXX=0.0176204;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.414;QD=32.0021;RBI=0.0111905;REFB=-0.0321072;REVB=0.000873874;RO=13;SAF=87;SAR=121;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00496617;STB=0.501263;TYPE=snp;VARB=0.00104889;OID=.;OPOS=129349295;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:227:223:13:15:208:208:121:87:6:7:121:87:6:9 chrX 129519491 . G A 72.67 PASS AO=20;DP=51;FAO=20;FDP=51;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.0206897;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=263.186;QD=5.69942;RBI=0.0302608;REFB=-0.00736408;REVB=-0.0220829;RO=31;SAF=10;SAR=10;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0849329;STB=0.548971;TYPE=snp;VARB=0.0111566;OID=.;OPOS=129519491;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:72:51:51:31:31:20:20:10:10:18:13:10:10:18:13 chrX 129546351 . GA G 35.13 PASS AO=11;DP=56;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.310114;FXX=0.0555453;HRUN=8;LEN=1;MLLD=6.69529;QD=2.7553;RBI=0.320349;REFB=-0.0529814;REVB=-0.0803308;RO=18;SAF=6;SAR=5;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0475298;STB=0.548982;TYPE=del;VARB=0.0835796;OID=.;OPOS=129546352;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:11:45:26:51:25:13:13:10:15:31:18:6:5:9:9 chrX 130223137 . G A 1968.66 PASS AO=198;DP=198;FAO=205;FDP=205;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0292911;FXX=0.0144224;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.828;QD=38.4129;RBI=0.0329582;REFB=0;REVB=0.0151086;RO=0;SAF=91;SAR=107;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000175435;OID=.;OPOS=130223137;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:198:205:0:0:198:205:107:91:0:0:115:90:0:0 chrX 130416958 . C T 3760.99 PASS AO=480;DP=483;FAO=399;FDP=399;FR=.;FRO=0;FSAF=176;FSAR=223;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.109833;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.6441;QD=37.7042;RBI=0.109834;REFB=-0.0295683;REVB=0.000347581;RO=2;SAF=198;SAR=282;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00337391;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00034922;OID=.;OPOS=130416958;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:483:399:2:0:480:399:282:198:0:2:223:176:0:0 chrX 130420006 . T C 1966.56 PASS AO=204;DP=205;FAO=205;FDP=205;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00930296;FXX=0.00485413;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.552;QD=38.3719;RBI=0.0255802;REFB=0;REVB=0.0238286;RO=0;SAF=97;SAR=107;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.07916e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000204722;OID=.;OPOS=130420006;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:93:205:205:0:0:204:205:107:97:0:0:107:98:0:0 chrX 130420415 . T C 1400.39 PASS AO=157;DP=162;FAO=157;FDP=162;FR=.;FRO=5;FSAF=84;FSAR=73;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.115646;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.1707;QD=34.5776;RBI=0.11646;REFB=0.0534074;REVB=0.0137434;RO=5;SAF=84;SAR=73;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0274742;STB=0.514449;TYPE=snp;VARB=-0.00225746;OID=.;OPOS=130420415;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:162:162:5:5:157:157:73:84:5:0:73:84:5:0 chrX 130678467 . A G 2400.8 PASS AO=250;DP=253;FAO=251;FDP=251;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=171;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0298365;FXX=0.00790483;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.808;QD=38.2598;RBI=0.0315473;REFB=0;REVB=-0.0102478;RO=0;SAF=80;SAR=170;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.1194e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.3862e-05;OID=.;OPOS=130678467;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:253:251:0:0:250:251:170:80:0:0:171:80:0:0 chrX 130678596 . C G 1012.54 PASS AO=105;DP=105;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0862651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4718;QD=38.209;RBI=0.0869341;REFB=0;REVB=0.0107637;RO=0;SAF=17;SAR=88;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.50135e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00068897;OID=.;OPOS=130678596;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:48:105:106:0:0:105:106:88:17:0:0:88:18:0:0 chrX 130678844 . A C 1019.82 PASS AO=107;DP=109;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0795677;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.201;QD=37.0845;RBI=0.0801253;REFB=-0.00975025;REVB=-0.00943572;RO=1;SAF=41;SAR=66;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114351;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000152494;OID=.;OPOS=130678844;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:109:110:1:0:107:110:66:41:1:0:66:44:0:0 chrX 131189505 . C T 2837.8 PASS AO=302;DP=303;FAO=300;FDP=300;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=240;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0933878;FXX=0.00990066;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8248;QD=37.8373;RBI=0.100373;REFB=0.0400046;REVB=-0.0367907;RO=1;SAF=61;SAR=241;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00197503;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00121464;OID=.;OPOS=131189505;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:303:300:1:0:302:300:241:61:0:1:240:60:0:0 chrX 131212512 . A G 577.08 PASS AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132834;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.584;QD=37.8415;RBI=0.0152044;REFB=0;REVB=0.0073976;RO=0;SAF=46;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.7396e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.77326e-05;OID=.;OPOS=131212512;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:27:61:61:0:0:61:61:15:46:0:0:15:46:0:0 chrX 131212642 . C T 542.22 PASS AO=111;DP=197;FAO=111;FDP=197;FR=.;FRO=86;FSAF=75;FSAR=36;FSRF=51;FSRR=35;FWDB=-0.0108869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.681;QD=11.0095;RBI=0.0146997;REFB=-0.0132717;REVB=0.00987701;RO=85;SAF=75;SAR=36;SRF=51;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0669698;STB=0.539999;TYPE=snp;VARB=0.0116238;OID=.;OPOS=131212642;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:197:197:85:86:111:111:36:75:51:34:36:75:51:35 chrX 131212944 . A G 348.34 PASS AO=75;DP=142;FAO=76;FDP=143;FR=.;FRO=67;FSAF=27;FSAR=49;FSRF=34;FSRR=33;FWDB=0.001574;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.326;QD=9.74375;RBI=0.017955;REFB=-0.0039104;REVB=0.0178859;RO=65;SAF=26;SAR=49;SRF=33;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143061;STB=0.574456;TYPE=snp;VARB=0.00342357;OID=.;OPOS=131212944;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:142:143:65:67:75:76:49:26:33:32:49:27:34:33 chrX 131518737 . C T 697.97 PASS AO=147;DP=271;FAO=148;FDP=269;FR=.;FRO=121;FSAF=50;FSAR=98;FSRF=35;FSRR=86;FWDB=-0.027064;FXX=0.0073798;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.332;QD=10.3788;RBI=0.0284598;REFB=-0.0386522;REVB=-0.00880355;RO=120;SAF=49;SAR=98;SRF=34;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0473372;STB=0.524811;TYPE=snp;VARB=0.033981;OID=.;OPOS=131518737;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:271:269:120:121:147:148:98:49:34:86:98:50:35:86 chrX 132161673 . C T 205.02 PASS AO=74;DP=210;FAO=74;FDP=210;FR=.;FRO=136;FSAF=33;FSAR=41;FSRF=67;FSRR=69;FWDB=-0.035997;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.8079;QD=3.9052;RBI=0.0368397;REFB=0.00294319;REVB=0.00783446;RO=133;SAF=34;SAR=40;SRF=65;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0331468;STB=0.530393;TYPE=snp;VARB=-0.00910205;OID=.;OPOS=132161673;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:210:210:133:136:74:74:40:34:65:68:41:33:67:69 chrX 132351703 . C A 233.56 PASS AO=57;DP=121;FAO=57;FDP=121;FR=.;FRO=64;FSAF=20;FSAR=37;FSRF=26;FSRR=38;FWDB=-0.00491501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.1281;QD=7.72104;RBI=0.0658513;REFB=-0.0109015;REVB=0.0656676;RO=64;SAF=20;SAR=37;SRF=26;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0567086;STB=0.531532;TYPE=snp;VARB=0.0130906;OID=.;OPOS=132351703;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:121:121:64:64:57:57:37:20:26:38:37:20:26:38 chrX 132352230 . C G 721.57 PASS AO=199;DP=428;FAO=186;FDP=400;FR=.;FRO=214;FSAF=130;FSAR=56;FSRF=138;FSRR=76;FWDB=0.0256936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.5164;QD=7.2157;RBI=0.0262618;REFB=-0.0111089;REVB=-0.00543318;RO=228;SAF=137;SAR=62;SRF=150;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0339859;STB=0.533446;TYPE=snp;VARB=0.0125467;OID=.;OPOS=132352230;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:428:400:228:214:199:186:62:137:150:78:56:130:138:76 chrX 133379551 . C T 3072.7 PASS AO=313;DP=313;FAO=321;FDP=321;FR=.;FRO=0;FSAF=118;FSAR=203;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173787;FXX=0.00310549;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.917;QD=38.289;RBI=0.0250626;REFB=0;REVB=0.0180587;RO=0;SAF=118;SAR=195;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.38899e-05;OID=.;OPOS=133379551;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:313:321:0:0:313:321:195:118:0:0:203:118:0:0 chrX 133379622 . A G 592.55 PASS AO=155;DP=342;FAO=155;FDP=338;FR=.;FRO=183;FSAF=64;FSAR=91;FSRF=91;FSRR=92;FWDB=0.00875925;FXX=0.0116956;HRUN=3;LEN=1;MLLD=126.453;QD=7.01245;RBI=0.0104939;REFB=-0.0182937;REVB=-0.00577897;RO=178;SAF=64;SAR=91;SRF=89;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.085569;STB=0.546339;TYPE=snp;VARB=0.0265776;OID=.;OPOS=133379622;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:342:338:178:183:155:155:91:64:89:89:91:64:91:92 chrX 133983272 . A C 1058.33 PASS AO=393;DP=735;FAO=222;FDP=399;FR=.;FRO=177;FSAF=53;FSAR=169;FSRF=52;FSRR=125;FWDB=0.00565241;FXX=0.00249994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.4041;QD=10.6098;RBI=0.0525402;REFB=-0.0268939;REVB=0.0522352;RO=339;SAF=98;SAR=295;SRF=105;SRR=234;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0660717;STB=0.532448;TYPE=snp;VARB=0.0244016;OID=.;OPOS=133983272;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:735:399:339:177:393:222:295:98:105:234:169:53:52:125 chrX 133988253 . A G 344.15 PASS AO=101;DP=244;FAO=102;FDP=250;FR=.;FRO=148;FSAF=41;FSAR=61;FSRF=66;FSRR=82;FWDB=-0.00839056;FXX=0.0118572;HRUN=3;LEN=1;MLLD=61.3249;QD=5.50647;RBI=0.011455;REFB=-0.0189512;REVB=0.00779844;RO=142;SAF=40;SAR=61;SRF=66;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.073779;STB=0.52679;TYPE=snp;VARB=0.0240156;OID=.;OPOS=133988253;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:250:142:148:101:102:61:40:66:76:61:41:66:82 chrX 134022943 . A G 260.27 PASS AO=153;DP=519;FAO=121;FDP=399;FR=.;FRO=278;FSAF=74;FSAR=47;FSRF=148;FSRR=130;FWDB=-0.00727248;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.053;QD=2.6092;RBI=0.00892607;REFB=-0.0032657;REVB=0.00517549;RO=364;SAF=93;SAR=60;SRF=200;SRR=164;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0729351;STB=0.556594;TYPE=snp;VARB=0.00784668;OID=.;OPOS=134022943;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:519:399:364:278:153:121:60:93:200:164:47:74:148:130 chrX 134052377 . T C 81.71 PASS AO=22;DP=70;FAO=28;FDP=75;FR=.;FRO=47;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=0.000109447;FXX=0.0384566;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.3174;QD=4.35765;RBI=0.0189133;REFB=-0.0493964;REVB=0.0189129;RO=48;SAF=10;SAR=12;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100939;STB=0.519986;TYPE=snp;VARB=0.0925587;OID=.;OPOS=134052377;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:81:70:75:48:47:22:28:12:10:26:22:14:14:25:22 chrX 134155904 . G T 267.81 PASS AO=29;DP=30;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0711745;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.346;QD=34.5562;RBI=0.0812688;REFB=-0.0715054;REVB=0.0392277;RO=0;SAF=9;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.51162;TYPE=snp;VARB=0.00201397;OID=.;OPOS=134155904;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:30:31:0:1:29:30:20:9:0:0:21:9:0:1 chrX 134155953 . A G 106.38 PASS AO=11;DP=13;FAO=13;FDP=14;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.171548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.24;QD=30.3947;RBI=0.186127;REFB=-0.0313962;REVB=0.0722132;RO=1;SAF=2;SAR=9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0473806;STB=0.526276;TYPE=snp;VARB=0.00667215;OID=.;OPOS=134155953;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:14:14:1:1:11:13:9:2:0:1:9:4:0:1 chrX 134156121 . G C 215.13 PASS AO=19;DP=23;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.286589;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=31.7637;QD=34.4211;RBI=0.313084;REFB=0;REVB=-0.126048;RO=3;SAF=5;SAR=14;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210047;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00647807;OID=.;OPOS=134156121;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:25:3:0:19:25:14:5:3:0:14:11:0:0 chrX 134185997 . T A 1536.83 PASS AO=160;DP=160;FAO=161;FDP=161;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0168245;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.435;QD=38.182;RBI=0.0474403;REFB=0;REVB=0.0443568;RO=0;SAF=74;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.31629e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.54457e-05;OID=.;OPOS=134185997;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:73:160:161:0:0:160:161:86:74:0:0:87:74:0:0 chrX 134421168 . C T 1759.12 PASS AO=184;DP=184;FAO=184;FDP=184;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=129;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.119;QD=38.2417;RBI=0.0156795;REFB=0;REVB=-0.0116516;RO=0;SAF=55;SAR=129;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.9601e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-2.71942e-05;OID=.;OPOS=134421168;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:184:184:0:0:184:184:129:55:0:0:129:55:0:0 chrX 134713855 . G A 224.48 PASS AO=66;DP=162;FAO=66;FDP=162;FR=.;FRO=96;FSAF=44;FSAR=22;FSRF=43;FSRR=53;FWDB=0.00224505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.091;QD=5.54277;RBI=0.0139585;REFB=-0.00980525;REVB=-0.0137768;RO=94;SAF=44;SAR=22;SRF=43;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225025;STB=0.63287;TYPE=snp;VARB=0.0138371;OID=.;OPOS=134713855;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:162:94:96:66:66:22:44:43:51:22:44:43:53 chrX 134807790 . A G 267.06 PASS AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0224651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8118;QD=38.1513;RBI=0.0465676;REFB=0;REVB=0.0407904;RO=0;SAF=16;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00042303;OID=.;OPOS=134807790;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:28:28:0:0:28:28:12:16:0:0:12:16:0:0 chrX 134807815 . C A 295.17 PASS AO=30;DP=30;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00268469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.993;QD=36.8967;RBI=0.0145529;REFB=0;REVB=0.0143031;RO=0;SAF=17;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.63861e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.93121e-05;OID=.;OPOS=134807815;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:14:30:32:0:0:30:32:13:17:0:0:14:18:0:0 chrX 134948034 . A G 978.76 PASS AO=105;DP=108;FAO=105;FDP=107;FR=.;FRO=2;FSAF=54;FSAR=51;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0397008;FXX=0.0183469;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.268;QD=36.589;RBI=0.0530778;REFB=-0.0897575;REVB=-0.0352292;RO=2;SAF=54;SAR=51;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.01725;STB=0.509089;TYPE=snp;VARB=3.64726e-06;OID=.;OPOS=134948034;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:108:107:2:2:105:105:51:54:2:0:51:54:2:0 chrX 135044834 . T C 698.28 PASS AO=144;DP=256;FAO=144;FDP=256;FR=.;FRO=112;FSAF=50;FSAR=94;FSRF=44;FSRR=68;FWDB=-0.022211;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.9413;QD=10.9105;RBI=0.0225596;REFB=-0.02342;REVB=-0.00395078;RO=112;SAF=50;SAR=94;SRF=44;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0399609;STB=0.521726;TYPE=snp;VARB=0.014545;OID=.;OPOS=135044834;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:256:256:112:112:144:144:94:50:44:68:94:50:44:68 chrX 135092619 . GC G 1180.04 PASS AO=123;DP=176;FAO=172;FDP=172;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.178311;FXX=0.0114936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=19.2738;QD=27.4428;RBI=0.386279;REFB=-0.000175811;REVB=0.34266;RO=38;SAF=53;SAR=70;SRF=0;SRR=38;SSEN=0.234653;SSEP=0;SSSB=0.201149;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00363978;OID=.;OPOS=135092620;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:123:169:172:172:0:59:113:0:0:95:38:53:70:0:38 chrX 135307049 . G A 697.59 PASS AO=86;DP=96;FAO=87;FDP=96;FR=.;FRO=9;FSAF=26;FSAR=61;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0838558;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.5515;QD=29.0663;RBI=0.0874428;REFB=-0.000581907;REVB=0.0247878;RO=8;SAF=25;SAR=61;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0163018;STB=0.516071;TYPE=snp;VARB=0.00423991;OID=.;OPOS=135307049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:96:96:8:9:86:87:61:25:3:5:61:26:4:5 chrX 135310785 . T C 3473.25 PASS AO=477;DP=494;FAO=388;FDP=388;FR=.;FRO=0;FSAF=216;FSAR=172;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00353187;FXX=0.0299992;HRUN=3;LEN=1;MLLD=142.86;QD=35.8067;RBI=0.00872396;REFB=-0.149038;REVB=0.00797705;RO=5;SAF=271;SAR=206;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114442;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000113005;OID=.;OPOS=135310785;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:494:388:5:0:477:388:206:271:0:5:172:216:0:0 chrX 135313034 . T G 2432.96 PASS AO=265;DP=273;FAO=265;FDP=265;FR=.;FRO=0;FSAF=132;FSAR=133;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011481;FXX=0.029303;HRUN=4;LEN=1;MLLD=209.276;QD=36.7239;RBI=0.0178036;REFB=-0.114883;REVB=0.0136072;RO=2;SAF=132;SAR=133;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.6916e-05;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.65693e-05;OID=.;OPOS=135313034;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:273:265:2:0:265:265:133:132:1:1:133:132:0:0 chrX 135961587 . G T 183.79 PASS AO=61;DP=221;FAO=79;FDP=241;FR=.;FRO=162;FSAF=41;FSAR=38;FSRF=78;FSRR=84;FWDB=0.0152305;FXX=0.00823011;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.555;QD=3.0504;RBI=0.0162536;REFB=-0.000718201;REVB=0.00567567;RO=78;SAF=26;SAR=35;SRF=37;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0490105;STB=0.525193;TYPE=snp;VARB=0.0014699;OID=.;OPOS=135961587;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:241:78:162:61:79:35:26:37:41:38:41:78:84 chrX 138067202 . A G 719.89 PASS AO=173;DP=358;FAO=175;FDP=358;FR=.;FRO=183;FSAF=114;FSAR=61;FSRF=102;FSRR=81;FWDB=-0.0133271;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4222;QD=8.04346;RBI=0.0301772;REFB=0.0201149;REVB=-0.027075;RO=184;SAF=112;SAR=61;SRF=104;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0820654;STB=0.551281;TYPE=snp;VARB=-0.0272447;OID=.;OPOS=138067202;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:358:358:184:183:173:175:61:112:104:80:61:114:102:81 chrX 138679712 . T A 3804.85 PASS AO=394;DP=396;FAO=397;FDP=397;FR=.;FRO=0;FSAF=184;FSAR=213;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0218106;FXX=0.00749981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.362;QD=38.336;RBI=0.028038;REFB=0.00169557;REVB=-0.017619;RO=1;SAF=184;SAR=210;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0022672;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.17604e-06;OID=.;OPOS=138679712;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:396:397:1:0:394:397:210:184:0:1:213:184:0:0 chrX 138774209 . C T 2023.25 PASS AO=177;DP=177;FAO=212;FDP=212;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=171;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.085;QD=38.1746;RBI=0.0500846;REFB=0;REVB=0.0488542;RO=0;SAF=38;SAR=139;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.32334e-05;OID=.;OPOS=138774209;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:96:177:212:0:0:177:212:139:38:0:0:171:41:0:0 chrX 138811003 . G A 2395.83 PASS AO=247;DP=247;FAO=249;FDP=249;FR=.;FRO=0;FSAF=131;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0369586;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.0862;QD=38.4873;RBI=0.0684345;REFB=0;REVB=0.0575964;RO=0;SAF=131;SAR=116;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=5.36268e-05;OID=.;OPOS=138811003;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:247:249:0:0:247:249:116:131:0:0:118:131:0:0 chrX 138897130 . A C 2687.27 PASS AO=256;DP=257;FAO=280;FDP=280;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=228;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.111213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3298;QD=38.3896;RBI=0.113651;REFB=0;REVB=-0.0234128;RO=1;SAF=28;SAR=228;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0167164;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000264384;OID=.;OPOS=138897130;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:257:280:1:0:256:280:228:28:1:0:228:52:0:0 chrX 139099828 . T A 1232.64 PASS AO=157;DP=180;FAO=158;FDP=181;FR=.;FRO=23;FSAF=63;FSAR=95;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.0244584;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.9566;QD=27.2407;RBI=0.0244653;REFB=-0.0021016;REVB=0.00058481;RO=20;SAF=64;SAR=93;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0530973;STB=0.527508;TYPE=snp;VARB=0.00227274;OID=.;OPOS=139099828;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:180:181:20:23:157:158:93:64:13:7:95:63:14:9 chrX 139858438 . TCGG T 265.94 PASS AO=62;DP=156;FAO=69;FDP=150;FR=.;FRO=81;FSAF=36;FSAR=33;FSRF=41;FSRR=40;FWDB=-0.00957519;FXX=0.0196066;HRUN=1;LEN=3;MLLD=253.946;QD=7.09172;RBI=0.00966485;REFB=-0.0161409;REVB=0.00131339;RO=74;SAF=34;SAR=28;SRF=39;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0210334;STB=0.508413;TYPE=del;VARB=0.0167347;OID=.;OPOS=139858439;OREF=CGG;OALT=-;OMAPALT=T GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:62:149:69:150:81:36:33:41:40:99:74:34:28:39:35 chrX 140008385 . G T 812.24 PASS AO=377;DP=756;FAO=196;FDP=399;FR=.;FRO=203;FSAF=41;FSAR=155;FSRF=73;FSRR=130;FWDB=0.00603323;FXX=0.00249994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.43;QD=8.14277;RBI=0.0449693;REFB=-0.0298574;REVB=-0.0445627;RO=378;SAF=99;SAR=278;SRF=130;SRR=248;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0912805;STB=0.60193;TYPE=snp;VARB=0.0292869;OID=.;OPOS=140008385;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:756:399:378:203:377:196:278:99:130:248:155:41:73:130 chrX 140270418 . T C 341.16 PASS AO=35;DP=39;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0384954;FXX=0.0769034;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.304;QD=37.9065;RBI=0.0696496;REFB=0;REVB=0.0580446;RO=0;SAF=19;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1382e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000549243;OID=.;OPOS=140270418;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:16:39:36:0:0:35:36:16:19:0:0:17:19:0:0 chrX 140335818 . C T 31.12 PASS AO=4;DP=8;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0355874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.069;QD=13.8305;RBI=0.0401519;REFB=0.0297878;REVB=-0.0185933;RO=4;SAF=2;SAR=2;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.418587;STB=0.699373;TYPE=snp;VARB=-0.0274056;OID=.;OPOS=140335818;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:21:8:9:4:4:4:5:2:2:4:0:2:3:4:0 chrX 140335820 . T G 24.11 PASS AO=4;DP=8;FAO=4;FDP=8;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0271826;FXX=0.110988;HRUN=7;LEN=1;MLLD=73.4005;QD=12.0527;RBI=0.0471015;REFB=-0.00982967;REVB=-0.0384663;RO=3;SAF=2;SAR=2;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.357477;STB=0.749055;TYPE=snp;VARB=0.00759072;OID=.;OPOS=140335820;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:8:8:3:4:4:4:2:2:3:0:2:2:4:0 chrX 140785714 . C G 45.37 PASS AO=70;DP=407;FAO=70;FDP=400;FR=.;FRO=330;FSAF=28;FSAR=42;FSRF=114;FSRR=216;FWDB=-0.00265949;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.282;QD=0.453666;RBI=0.0148388;REFB=0.00105071;REVB=0.0145985;RO=336;SAF=28;SAR=42;SRF=115;SRR=221;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0801585;STB=0.547757;TYPE=snp;VARB=-0.00785168;OID=.;OPOS=140785714;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:45:407:400:336:330:70:70:42:28:115:221:42:28:114:216 chrX 140785739 . A C 112.95 PASS AO=101;DP=462;FAO=90;FDP=397;FR=.;FRO=307;FSAF=37;FSAR=53;FSRF=108;FSRR=199;FWDB=0.00504332;FXX=0.00749981;HRUN=3;LEN=1;MLLD=193.82;QD=1.13807;RBI=0.00782266;REFB=-0.00416981;REVB=-0.00597987;RO=360;SAF=41;SAR=60;SRF=128;SRR=232;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0684235;STB=0.54817;TYPE=snp;VARB=0.0155991;OID=.;OPOS=140785739;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:462:397:360:307:101:90:60:41:128:232:53:37:108:199 chrX 140785741 . A C 105.02 PASS AO=102;DP=472;FAO=88;FDP=397;FR=.;FRO=309;FSAF=36;FSAR=52;FSRF=102;FSRR=207;FWDB=0.00737096;FXX=0.00749981;HRUN=3;LEN=1;MLLD=106.149;QD=1.05818;RBI=0.0173847;REFB=0.000602723;REVB=-0.0157447;RO=366;SAF=40;SAR=62;SRF=127;SRR=239;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.062121;STB=0.565077;TYPE=snp;VARB=-0.00192028;OID=.;OPOS=140785741;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:472:397:366:309:102:88:62:40:127:239:52:36:102:207 chrX 140983064 . G A 3562.81 PASS AO=370;DP=381;FAO=385;FDP=385;FR=.;FRO=0;FSAF=222;FSAR=163;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0421598;FXX=0.00773176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.611;QD=37.0162;RBI=0.0654688;REFB=-0.0873923;REVB=0.050087;RO=7;SAF=210;SAR=160;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104626;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000662972;OID=.;OPOS=140983064;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:381:385:7:0:370:385:160:210:6:1:163:222:0:0 chrX 140983127 . G A 3831.48 PASS AO=509;DP=513;FAO=399;FDP=399;FR=.;FRO=0;FSAF=205;FSAR=194;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0402198;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.345;QD=38.4108;RBI=0.0465075;REFB=0;REVB=0.023352;RO=0;SAF=253;SAR=256;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.26439e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.51168e-05;OID=.;OPOS=140983127;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:513:399:0:0:509:399:256:253:0:0:194:205:0:0 chrX 140993642 . C T 416.12 PASS AO=141;DP=411;FAO=147;FDP=395;FR=.;FRO=248;FSAF=70;FSAR=77;FSRF=131;FSRR=117;FWDB=0.000466227;FXX=0.0124997;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.374;QD=4.21392;RBI=0.0154253;REFB=-0.021309;REVB=-0.0154182;RO=263;SAF=63;SAR=78;SRF=137;SRR=126;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0850056;STB=0.532638;TYPE=snp;VARB=0.0504472;OID=.;OPOS=140993642;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:411:395:263:248:141:147:78:63:137:126:77:70:131:117 chrX 140993674 . G C 128.09 PASS AO=64;DP=277;FAO=79;FDP=292;FR=.;FRO=213;FSAF=57;FSAR=22;FSRF=98;FSRR=115;FWDB=-0.0164028;FXX=0.0168344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2909;QD=1.75468;RBI=0.0232038;REFB=-0.0220734;REVB=0.0164123;RO=206;SAF=46;SAR=18;SRF=93;SRR=113;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.342332;STB=0.696;TYPE=snp;VARB=0.0915858;OID=.;OPOS=140993674;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:277:292:206:213:64:79:18:46:93:113:22:57:98:115 chrX 140993676 . T A 43.81 PASS AO=56;DP=295;FAO=55;FDP=294;FR=.;FRO=239;FSAF=41;FSAR=14;FSRF=118;FSRR=121;FWDB=-0.0194481;FXX=0.00338972;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.6498;QD=0.596113;RBI=0.0220751;REFB=-0.0221202;REVB=0.0104442;RO=237;SAF=41;SAR=15;SRF=117;SRR=120;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.317654;STB=0.713101;TYPE=snp;VARB=0.0933739;OID=.;OPOS=140993676;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:295:294:237:239:56:55:15:41:117:120:14:41:118:121 chrX 140993716 . G T 30.99 PASS AO=63;DP=226;FAO=43;FDP=244;FR=.;FRO=201;FSAF=6;FSAR=37;FSRF=115;FSRR=86;FWDB=-0.161809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.4363;QD=0.508081;RBI=0.164542;REFB=-0.0199716;REVB=-0.0298649;RO=155;SAF=24;SAR=39;SRF=70;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0885832;STB=0.858318;TYPE=snp;VARB=0.271053;OID=.;OPOS=140993716;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:226:244:155:201:63:43:39:24:70:85:37:6:115:86 chrX 140993852 . C G 133.35 PASS AO=76;DP=288;FAO=76;FDP=285;FR=.;FRO=209;FSAF=10;FSAR=66;FSRF=80;FSRR=129;FWDB=-0.00959248;FXX=0.0104163;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2712;QD=1.87152;RBI=0.0163146;REFB=-0.00913888;REVB=-0.0131966;RO=208;SAF=10;SAR=66;SRF=80;SRR=128;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.41805;STB=0.752773;TYPE=snp;VARB=0.0278256;OID=.;OPOS=140993852;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:288:285:208:209:76:76:66:10:80:128:66:10:80:129 chrX 140993859 . T A 50.74 PASS AO=50;DP=261;FAO=52;FDP=264;FR=.;FRO=212;FSAF=7;FSAR=45;FSRF=87;FSRR=125;FWDB=0.00919031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.374;QD=0.768798;RBI=0.0107575;REFB=-0.00414733;REVB=-0.00559116;RO=209;SAF=5;SAR=45;SRF=86;SRR=123;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.506875;STB=0.780317;TYPE=snp;VARB=0.0283152;OID=.;OPOS=140993859;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:50:261:264:209:212:50:52:45:5:86:123:45:7:87:125 chrX 140993864 . T C 19.47 PASS AO=39;DP=255;FAO=39;FDP=255;FR=.;FRO=216;FSAF=2;FSAR=37;FSRF=94;FSRR=122;FWDB=-0.0123929;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=222.184;QD=0.305405;RBI=0.0275456;REFB=-0.00194706;REVB=-0.0246003;RO=215;SAF=2;SAR=37;SRF=93;SRR=122;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.602778;STB=0.917571;TYPE=snp;VARB=0.0102187;OID=.;OPOS=140993864;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:255:255:215:216:39:39:37:2:93:122:37:2:94:122 chrX 140993875 . G C 39.96 PASS AO=48;DP=232;FAO=40;FDP=221;FR=.;FRO=181;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=55;FSRR=126;FWDB=-0.0110914;FXX=0.0635566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.033;QD=0.723218;RBI=0.0113701;REFB=-0.00613785;REVB=-0.00250209;RO=164;SAF=31;SAR=17;SRF=52;SRR=112;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.400239;STB=0.712583;TYPE=snp;VARB=0.0340921;OID=.;OPOS=140993875;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:39:232:221:164:181:48:40:17:31:52:112:17:23:55:126 chrX 140993912 . C T 702.65 PASS AO=144;DP=244;FAO=146;FDP=254;FR=.;FRO=108;FSAF=84;FSAR=62;FSRF=58;FSRR=50;FWDB=-0.00415811;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.2856;QD=11.0654;RBI=0.0729016;REFB=-0.079901;REVB=-0.0727829;RO=100;SAF=82;SAR=62;SRF=58;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00815911;STB=0.51658;TYPE=snp;VARB=0.0659338;OID=.;OPOS=140993912;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:244:254:100:108:144:146:62:82:58:42:62:84:58:50 chrX 140993980 . G C 297.41 PASS AO=40;DP=79;FAO=58;FDP=93;FR=.;FRO=35;FSAF=47;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=24;FWDB=0.121946;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.047;QD=12.7916;RBI=0.122219;REFB=-0.081153;REVB=0.00816795;RO=23;SAF=30;SAR=10;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182185;STB=0.720459;TYPE=snp;VARB=0.0613679;OID=.;OPOS=140993980;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:79:93:23:35:40:58:10:30:12:11:11:47:11:24 chrX 140993989 . T C 64.75 PASS AO=34;DP=105;FAO=30;FDP=105;FR=.;FRO=75;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=39;FSRR=36;FWDB=-0.0521024;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.847;QD=2.46653;RBI=0.084605;REFB=-0.0236478;REVB=-0.0666584;RO=65;SAF=23;SAR=11;SRF=30;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249657;STB=0.609197;TYPE=snp;VARB=0.111968;OID=.;OPOS=140993989;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:64:105:105:65:75:34:30:11:23:30:35:10:20:39:36 chrX 140994031 . G C 16.49 PASS AO=15;DP=85;FAO=15;FDP=85;FR=.;FRO=70;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=38;FSRR=32;FWDB=-0.0935309;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.767;QD=0.775904;RBI=0.109575;REFB=-0.0259776;REVB=-0.0570851;RO=67;SAF=12;SAR=3;SRF=38;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.32911;STB=0.7365;TYPE=snp;VARB=0.120585;OID=.;OPOS=140994031;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:85:85:67:70:15:15:3:12:38:29:3:12:38:32 chrX 140994171 . C G 155.98 PASS AO=44;DP=107;FAO=44;FDP=106;FR=.;FRO=62;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=37;FSRR=25;FWDB=0.0293953;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.0272;QD=5.88591;RBI=0.0857013;REFB=-0.046628;REVB=-0.0805024;RO=56;SAF=18;SAR=26;SRF=37;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247487;STB=0.60898;TYPE=snp;VARB=0.0664889;OID=.;OPOS=140994171;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:107:106:56:62:44:44:26:18:37:19:26:18:37:25 chrX 140996364 . G A 452.39 PASS AO=110;DP=232;FAO=112;FDP=234;FR=.;FRO=122;FSAF=62;FSAR=50;FSRF=51;FSRR=71;FWDB=-0.0126156;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.148;QD=7.73317;RBI=0.0408365;REFB=-0.0108441;REVB=0.038839;RO=121;SAF=60;SAR=50;SRF=51;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117392;STB=0.570395;TYPE=snp;VARB=0.0133555;OID=.;OPOS=140996364;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:234:121:122:110:112:50:60:51:70:50:62:51:71 chrX 141290865 . C T 2455.66 PASS AO=256;DP=259;FAO=257;FDP=257;FR=.;FRO=0;FSAF=131;FSAR=126;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00193998;FXX=0.00772171;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.8881;QD=38.2204;RBI=0.0477228;REFB=-0.0329554;REVB=-0.0476834;RO=1;SAF=131;SAR=125;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00362526;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000117277;OID=.;OPOS=141290865;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:259:257:1:0:256:257:125:131:1:0:126:131:0:0 chrX 142517782 . C T 209.04 PASS AO=50;DP=104;FAO=50;FDP=104;FR=.;FRO=54;FSAF=37;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=31;FWDB=-0.00116072;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=253.532;QD=8.03986;RBI=0.0176382;REFB=-0.000719203;REVB=0.0176;RO=54;SAF=37;SAR=13;SRF=23;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.315331;STB=0.676005;TYPE=snp;VARB=0.000732147;OID=.;OPOS=142517782;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:104:104:54:54:50:50:13:37:23:31:13:37:23:31 chrX 142716114 . G A 478.28 PASS AO=140;DP=334;FAO=140;FDP=334;FR=.;FRO=194;FSAF=60;FSAR=80;FSRF=79;FSRR=115;FWDB=0.00760614;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=259.13;QD=5.72784;RBI=0.00791293;REFB=-0.00779685;REVB=-0.002182;RO=192;SAF=60;SAR=80;SRF=77;SRR=115;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0293407;STB=0.512706;TYPE=snp;VARB=0.0100863;OID=.;OPOS=142716114;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:334:334:192:194:140:140:80:60:77:115:80:60:79:115 chrX 142795225 . G A 114.15 PASS AO=35;DP=106;FAO=36;FDP=93;FR=.;FRO=57;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=39;FWDB=0.0128809;FXX=0.12263;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.784;QD=4.90978;RBI=0.0199298;REFB=-0.0236696;REVB=-0.0152078;RO=48;SAF=13;SAR=22;SRF=17;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0190223;STB=0.530596;TYPE=snp;VARB=0.0541883;OID=.;OPOS=142795225;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:106:93:48:57:35:36:22:13:17:31:23:13:18:39 chrX 142967468 . T G 264.51 PASS AO=73;DP=167;FAO=73;FDP=170;FR=.;FRO=97;FSAF=14;FSAR=59;FSRF=33;FSRR=64;FWDB=-0.0325766;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=77.0953;QD=6.2238;RBI=0.0405054;REFB=-0.0276483;REVB=-0.0240718;RO=94;SAF=14;SAR=59;SRF=33;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217688;STB=0.616872;TYPE=snp;VARB=0.0293663;OID=.;OPOS=142967468;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:167:170:94:97:73:73:59:14:33:61:59:14:33:64 chrX 142968007 . CTTTATTTTAT CTTTATTTTA,CTTTAT 114.04 PASS AO=13,20;DP=125;FAO=15,34;FDP=83;FR=.;FRO=34;FSAF=8,31;FSAR=7,3;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.0910615,-0.00259551;FXX=0.0879024;HRUN=7,4;LEN=1,5;MLLD=6.63305,192.45;QD=5.49605;RBI=0.0950558,0.0388982;REFB=-0.0883822,-0.00649177;REVB=-0.0272655,0.0388115;RO=20;SAF=10,19;SAR=3,1;SRF=13;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.154361,0.551998;STB=0.502729,0.800048;TYPE=del,del;VARB=0.1745,-0.00475144;OID=.,.;OPOS=142968017,142968008;OREF=T,TTTAT;OALT=-,-;OMAPALT=CTTTATTTTA,CTTTAT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/2:13,20:75:15,34:83:34:8,31:7,3:18:16:84:20:10,19:3,1:13:7 chrX 142968082 . A C 339.75 PASS AO=87;DP=192;FAO=88;FDP=191;FR=.;FRO=103;FSAF=41;FSAR=47;FSRF=37;FSRR=66;FWDB=-0.00626528;FXX=0.00520806;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.564;QD=7.11522;RBI=0.0133974;REFB=0.00586427;REVB=0.0118422;RO=104;SAF=40;SAR=47;SRF=38;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0942311;STB=0.558247;TYPE=snp;VARB=-0.00714887;OID=.;OPOS=142968082;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:192:191:104:103:87:88:47:40:38:66:47:41:37:66 chrX 144904252 . G A 338.32 PASS AO=73;DP=135;FAO=73;FDP=138;FR=.;FRO=65;FSAF=58;FSAR=15;FSRF=42;FSRR=23;FWDB=-0.00277784;FXX=0.028167;HRUN=5;LEN=1;MLLD=128.141;QD=9.8063;RBI=0.00305601;REFB=0.00189187;REVB=0.00127389;RO=61;SAF=58;SAR=15;SRF=40;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157586;STB=0.595004;TYPE=snp;VARB=-0.00192276;OID=.;OPOS=144904252;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:135:138:61:65:73:73:15:58:40:21:15:58:42:23 chrX 144904882 . T C 649.15 PASS AO=64;DP=64;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.407;QD=38.1851;RBI=0.0281155;REFB=0;REVB=-0.0134267;RO=0;SAF=14;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.89373e-05;OID=.;OPOS=144904882;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:31:64:68:0:0:64:68:50:14:0:0:51:17:0:0 chrX 144906710 . C T 13.93 PASS AO=11;DP=62;FAO=11;FDP=60;FR=.;FRO=49;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=33;FWDB=0.0175066;FXX=0.142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.038;QD=0.928676;RBI=0.020592;REFB=0.00410049;REVB=0.010842;RO=49;SAF=3;SAR=8;SRF=13;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116678;STB=0.797441;TYPE=snp;VARB=-0.019345;OID=.;OPOS=144906710;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:62:60:49:49:11:11:8:3:13:36:10:1:16:33 chrX 144910142 . G A 681.87 PASS AO=184;DP=405;FAO=181;FDP=399;FR=.;FRO=218;FSAF=51;FSAR=130;FSRF=64;FSRR=154;FWDB=-0.0073858;FXX=0.00249994;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.015;QD=6.83577;RBI=0.00743194;REFB=-0.00391803;REVB=-0.000826824;RO=219;SAF=49;SAR=135;SRF=67;SRR=152;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0485624;STB=0.507915;TYPE=snp;VARB=0.00429679;OID=.;OPOS=144910142;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:405:399:219:218:184:181:135:49:67:152:130:51:64:154 chrX 144910936 . C T 1605.5 PASS AO=164;DP=164;FAO=167;FDP=167;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.036111;FXX=0.00595203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.76;QD=38.4551;RBI=0.0361414;REFB=0;REVB=-0.00148246;RO=0;SAF=46;SAR=118;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.21376e-05;OID=.;OPOS=144910936;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:76:164:167:0:0:164:167:118:46:0:0:119:48:0:0 chrX 147014960 . C T 3557.98 PASS AO=463;DP=479;FAO=390;FDP=400;FR=.;FRO=10;FSAF=138;FSAR=252;FSRF=1;FSRR=9;FWDB=0.0310766;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.5856;QD=35.5798;RBI=0.0379201;REFB=-0.0599616;REVB=-0.0217297;RO=15;SAF=159;SAR=304;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000668927;STB=0.506967;TYPE=snp;VARB=0.00110406;OID=.;OPOS=147014960;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:94:479:400:15:10:463:390:304:159:5:10:252:138:1:9 chrX 147800748 . A G 257.48 PASS AO=74;DP=180;FAO=74;FDP=178;FR=.;FRO=104;FSAF=39;FSAR=35;FSRF=51;FSRR=53;FWDB=0.0539038;FXX=0.0111105;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.3779;QD=5.78596;RBI=0.054268;REFB=0.00742974;REVB=0.00627699;RO=102;SAF=39;SAR=35;SRF=51;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0280236;STB=0.521416;TYPE=snp;VARB=-0.0114336;OID=.;OPOS=147800748;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:180:178:102:104:74:74:35:39:51:51:35:39:51:53 chrX 147903704 . C T 756.16 PASS AO=201;DP=420;FAO=190;FDP=400;FR=.;FRO=210;FSAF=105;FSAR=85;FSRF=106;FSRR=104;FWDB=-0.00591047;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.959;QD=7.56163;RBI=0.0098748;REFB=0.000433188;REVB=-0.00791063;RO=219;SAF=112;SAR=89;SRF=109;SRR=110;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0567775;STB=0.525275;TYPE=snp;VARB=-0.000463151;OID=.;OPOS=147903704;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:420:400:219:210:201:190:89:112:109:110:85:105:106:104 chrX 147903927 . C T 1582.26 PASS AO=168;DP=171;FAO=171;FDP=171;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=143;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0791736;FXX=0.00581362;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.87;QD=37.0118;RBI=0.0823823;REFB=-0.0743934;REVB=0.022768;RO=2;SAF=27;SAR=141;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0339469;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000206539;OID=.;OPOS=147903927;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:171:171:2:0:168:171:141:27:2:0:143:28:0:0 chrX 148577970 . C G 12.56 PASS AO=23;DP=74;FAO=12;FDP=74;FR=.;FRO=62;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=43;FSRR=19;FWDB=-0.0476115;FXX=0.0133316;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.1385;QD=0.678825;RBI=0.0892974;REFB=-0.00254219;REVB=-0.0755458;RO=42;SAF=21;SAR=2;SRF=25;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.518515;STB=0.559218;TYPE=snp;VARB=0.0153019;OID=.;OPOS=148577970;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:12:74:74:42:62:23:12:2:21:25:17:3:9:43:19 chrX 148582549 . G A 171.65 PASS AO=46;DP=110;FAO=47;FDP=111;FR=.;FRO=64;FSAF=11;FSAR=36;FSRF=35;FSRR=29;FWDB=-0.0134914;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.955;QD=6.18552;RBI=0.0137974;REFB=-0.00104452;REVB=-0.00288948;RO=64;SAF=11;SAR=35;SRF=35;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.345122;STB=0.698349;TYPE=snp;VARB=0.00131985;OID=.;OPOS=148582549;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:110:111:64:64:46:47:35:11:35:29:36:11:35:29 chrX 148627383 . GA G,GG 157.07 PASS AO=11,5;DP=19;FAO=17,0;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=14,0;FSAR=3,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.030521,-0.090261;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=87.1768,74.7496;QD=36.9569;RBI=0.0953333,0.1578;REFB=0,0;REVB=-0.0903156,-0.129437;RO=0;SAF=11,2;SAR=0,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=del,snp;VARB=-0.00307302,0;OID=.,.;OPOS=148627384,148627384;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:11,5:17:17,0:17:0:14,0:3,0:0:0:8:0:11,2:0,3:0:0 chrX 148628490 . A T 1379.6 PASS AO=126;DP=127;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.038593;FXX=0.0266649;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.622;QD=37.7972;RBI=0.101604;REFB=0;REVB=0.0939893;RO=1;SAF=50;SAR=76;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00940821;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000478026;OID=.;OPOS=148628490;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:127:146:1:0:126:146:76:50:1:0:81:65:0:0 chrX 148797348 . C T 191.32 PASS AO=50;DP=210;FAO=72;FDP=211;FR=.;FRO=139;FSAF=36;FSAR=36;FSRF=78;FSRR=61;FWDB=0.0354234;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.0751;QD=3.62694;RBI=0.0438754;REFB=-0.0363526;REVB=-0.025889;RO=104;SAF=15;SAR=35;SRF=51;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234619;STB=0.540273;TYPE=snp;VARB=0.0602496;OID=.;OPOS=148797348;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:186:211:104:139:50:72:35:15:51:53:36:36:78:61 chrX 148798223 . T C 354.68 PASS AO=83;DP=174;FAO=84;FDP=171;FR=.;FRO=87;FSAF=72;FSAR=12;FSRF=65;FSRR=22;FWDB=-0.00713958;FXX=0.0172404;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.953;QD=8.29651;RBI=0.0630253;REFB=-0.0154361;REVB=-0.0626196;RO=85;SAF=71;SAR=12;SRF=64;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163895;STB=0.598214;TYPE=snp;VARB=0.014047;OID=.;OPOS=148798223;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:174:171:85:87:83:84:12:71:64:21:12:72:65:22 chrX 149013727 . A G 844.45 PASS AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00724718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.598;QD=38.3842;RBI=0.0186169;REFB=0;REVB=0.0171483;RO=0;SAF=58;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=7.15093e-05;OID=.;OPOS=149013727;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:88:88:0:0:88:88:30:58:0:0:30:58:0:0 chrX 149680554 . C T 1515.74 PASS AO=171;DP=189;FAO=182;FDP=192;FR=.;FRO=10;FSAF=56;FSAR=126;FSRF=0;FSRR=10;FWDB=0.109916;FXX=0.00518108;HRUN=4;LEN=1;MLLD=50.0922;QD=31.5779;RBI=0.163094;REFB=-0.253281;REVB=0.120492;RO=18;SAF=52;SAR=119;SRF=2;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.041914;STB=0.519082;TYPE=snp;VARB=0.0196245;OID=.;OPOS=149680554;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:189:192:18:10:171:182:119:52:2:16:126:56:0:10 chrX 149826503 . G A 1286.59 PASS AO=134;DP=134;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.05248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.9323;QD=38.1213;RBI=0.0533465;REFB=0;REVB=0.00957634;RO=0;SAF=43;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000187854;OID=.;OPOS=149826503;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:61:134:135:0:0:134:135:91:43:0:0:92:43:0:0 chrX 149931106 . C T 633.45 PASS AO=77;DP=85;FAO=77;FDP=85;FR=.;FRO=8;FSAF=41;FSAR=36;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0641194;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.649;QD=29.8093;RBI=0.0667914;REFB=-0.029961;REVB=0.0187029;RO=8;SAF=41;SAR=36;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0280076;STB=0.514851;TYPE=snp;VARB=0.00358012;OID=.;OPOS=149931106;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:85:85:8:8:77:77:36:41:3:5:36:41:3:5 chrX 149933341 . T C 2875 PASS AO=309;DP=314;FAO=309;FDP=309;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=216;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0256318;FXX=0.0159231;HRUN=3;LEN=1;MLLD=254.423;QD=37.2168;RBI=0.0321636;REFB=-0.100858;REVB=0.0194295;RO=4;SAF=93;SAR=216;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200675;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000334835;OID=.;OPOS=149933341;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:97:314:309:4:0:309:309:216:93:4:0:216:93:0:0 chrX 150349649 . A G 143.24 PASS AO=23;DP=56;FAO=30;FDP=57;FR=.;FRO=27;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=9;FWDB=0.00788877;FXX=0.0338926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.777;QD=10.0521;RBI=0.0193877;REFB=-0.0231022;REVB=-0.0177102;RO=13;SAF=10;SAR=13;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118003;STB=0.548822;TYPE=snp;VARB=0.0286906;OID=.;OPOS=150349649;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:46:57:13:27:23:30:13:10:8:5:13:17:18:9 chrX 150349871 . A G 117.07 PASS AO=28;DP=61;FAO=28;FDP=61;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=26;FWDB=0.0743179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.273;QD=7.67687;RBI=0.0743724;REFB=-0.00279344;REVB=0.00284798;RO=33;SAF=17;SAR=11;SRF=7;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.366064;STB=0.704234;TYPE=snp;VARB=0.0095531;OID=.;OPOS=150349871;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:61:61:33:33:28:28:11:17:7:26:11:17:7:26 chrX 150565330 . G C 233.5 PASS AO=58;DP=127;FAO=59;FDP=127;FR=.;FRO=68;FSAF=12;FSAR=47;FSRF=19;FSRR=49;FWDB=0.00437885;FXX=0.00781189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.6099;QD=7.35438;RBI=0.0520863;REFB=-0.0337645;REVB=0.0519019;RO=69;SAF=11;SAR=47;SRF=20;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142111;STB=0.55843;TYPE=snp;VARB=0.0483633;OID=.;OPOS=150565330;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:127:127:69:68:58:59:47:11:20:49:47:12:19:49 chrX 150840185 . T C 2937.97 PASS AO=320;DP=330;FAO=322;FDP=331;FR=.;FRO=9;FSAF=154;FSAR=168;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.030337;FXX=0.00301196;HRUN=3;LEN=1;MLLD=217.382;QD=35.5041;RBI=0.0303397;REFB=-0.221148;REVB=-0.00040214;RO=7;SAF=153;SAR=167;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00381463;STB=0.500921;TYPE=snp;VARB=0.000631278;OID=.;OPOS=150840185;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:330:331:7:9:320:322:167:153:4:3:168:154:4:5 chrX 150869267 . A G 796.69 PASS AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168833;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.032;QD=37.9376;RBI=0.0170313;REFB=0;REVB=0.00224036;RO=0;SAF=57;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.38583e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.35505e-05;OID=.;OPOS=150869267;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:84:84:0:0:84:84:27:57:0:0:27:57:0:0 chrX 151092220 . A G 193.06 PASS AO=50;DP=112;FAO=50;FDP=112;FR=.;FRO=62;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=36;FSRR=26;FWDB=-0.0292579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.1;QD=6.89509;RBI=0.0727399;REFB=-0.000882685;REVB=-0.0665963;RO=62;SAF=29;SAR=21;SRF=36;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00065574;STB=0.500366;TYPE=snp;VARB=2.61397e-05;OID=.;OPOS=151092220;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:112:112:62:62:50:50:21:29:36:26:21:29:36:26 chrX 151092653 . G A 267.39 PASS AO=72;DP=166;FAO=72;FDP=164;FR=.;FRO=92;FSAF=28;FSAR=44;FSRF=51;FSRR=41;FWDB=-0.0056762;FXX=0.0238081;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.3227;QD=6.52179;RBI=0.0119686;REFB=0.00151742;REVB=0.010537;RO=91;SAF=28;SAR=44;SRF=51;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172981;STB=0.593553;TYPE=snp;VARB=-0.00325977;OID=.;OPOS=151092653;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:164:91:92:72:72:44:28:51:40:44:28:51:41 chrX 151125971 . A G 333.1 PASS AO=172;DP=346;FAO=83;FDP=176;FR=.;FRO=93;FSAF=22;FSAR=61;FSRF=24;FSRR=69;FWDB=-0.00193518;FXX=0.0056494;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.7981;QD=7.57033;RBI=0.00687954;REFB=-0.0126749;REVB=0.00660176;RO=172;SAF=66;SAR=106;SRF=56;SRR=116;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0569996;STB=0.504764;TYPE=snp;VARB=0.0240386;OID=.;OPOS=151125971;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:346:176:172:93:172:83:106:66:56:116:61:22:24:69 chrX 151129822 . G A 408.53 PASS AO=109;DP=243;FAO=109;FDP=243;FR=.;FRO=134;FSAF=27;FSAR=82;FSRF=45;FSRR=89;FWDB=-0.0185832;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.784;QD=6.72481;RBI=0.0188718;REFB=-0.00395515;REVB=-0.00328748;RO=134;SAF=27;SAR=82;SRF=45;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10978;STB=0.561152;TYPE=snp;VARB=0.00679353;OID=.;OPOS=151129822;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:243:243:134:134:109:109:82:27:45:89:82:27:45:89 chrX 151138179 . A C 2574.37 PASS AO=269;DP=270;FAO=269;FDP=269;FR=.;FRO=0;FSAF=113;FSAR=156;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00989484;FXX=0.00370357;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.6569;QD=38.2806;RBI=0.0444981;REFB=-0.0310293;REVB=0.043384;RO=0;SAF=113;SAR=156;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000194511;OID=.;OPOS=151138179;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:270:269:0:0:269:269:156:113:0:0:156:113:0:0 chrX 151303393 . C T 1367.64 PASS AO=143;DP=143;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00560637;FXX=0.0137922;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.215;QD=38.2556;RBI=0.0185037;REFB=0;REVB=0.017634;RO=0;SAF=55;SAR=88;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000123898;OID=.;OPOS=151303393;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:65:143:143:0:0:143:143:88:55:0:0:89:54:0:0 chrX 151303596 . C T 882.66 PASS AO=89;DP=89;FAO=96;FDP=97;FR=.;FRO=1;FSAF=63;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0130744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.644;QD=36.3984;RBI=0.013206;REFB=-0.0120126;REVB=0.00185921;RO=0;SAF=60;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.99908e-08;STB=0.503936;TYPE=snp;VARB=0.00043482;OID=.;OPOS=151303596;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:35:89:97:0:1:89:96:29:60:0:0:33:63:1:0 chrX 151899913 . T C 1907.99 PASS AO=188;DP=188;FAO=201;FDP=201;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0165337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.654;QD=37.9699;RBI=0.0184313;REFB=0;REVB=-0.00814573;RO=0;SAF=95;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000147032;OID=.;OPOS=151899913;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:90:188:201:0:0:188:201:93:95:0:0:103:98:0:0 chrX 151904488 . C A 2580.55 PASS AO=277;DP=284;FAO=279;FDP=279;FR=.;FRO=0;FSAF=151;FSAR=128;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124821;FXX=0.017605;HRUN=3;LEN=1;MLLD=202.156;QD=36.9971;RBI=0.0343739;REFB=-0.026609;REVB=0.0320275;RO=5;SAF=151;SAR=126;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0117464;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.33929e-05;OID=.;OPOS=151904488;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:84:284:279:5:0:277:279:126:151:1:4:128:151:0:0 chrX 152018832 . T G 1844.97 PASS AO=139;DP=197;FAO=194;FDP=194;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=111;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0158054;FXX=0.00512794;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.711;QD=38.0405;RBI=0.107946;REFB=0;REVB=0.106783;RO=0;SAF=90;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.77561e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00045387;OID=.;OPOS=152018832;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:87:195:194:0:0:139:194:49:90:0:0:83:111:0:0 chrX 152083006 . G C 147.19 PASS AO=52;DP=148;FAO=52;FDP=148;FR=.;FRO=96;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=56;FSRR=40;FWDB=-0.00894041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.4813;QD=3.97819;RBI=0.0255464;REFB=-0.0125199;REVB=0.0239309;RO=96;SAF=21;SAR=31;SRF=56;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202015;STB=0.615479;TYPE=snp;VARB=0.0218321;OID=.;OPOS=152083006;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:148:96:96:52:52:31:21:56:40:31:21:56:40 chrX 152083012 . G A 142.24 PASS AO=52;DP=152;FAO=52;FDP=152;FR=.;FRO=100;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=60;FSRR=40;FWDB=0.041908;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.222;QD=3.74305;RBI=0.0438403;REFB=0.00348822;REVB=-0.0128722;RO=100;SAF=21;SAR=31;SRF=60;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222386;STB=0.627388;TYPE=snp;VARB=-0.00614983;OID=.;OPOS=152083012;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:152:100:100:52:52:31:21:60:40:31:21:60:40 chrX 152083059 . G A 159.31 PASS AO=54;DP=149;FAO=54;FDP=149;FR=.;FRO=95;FSAF=20;FSAR=34;FSRF=59;FSRR=36;FWDB=0.0230316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.0574;QD=4.27676;RBI=0.0354791;REFB=-0.0177183;REVB=0.0269873;RO=95;SAF=20;SAR=34;SRF=59;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.276599;STB=0.657309;TYPE=snp;VARB=0.0418377;OID=.;OPOS=152083059;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:149:149:95:95:54:54:34:20:59:36:34:20:59:36 chrX 152083089 . T G 78.78 PASS AO=34;DP=130;FAO=38;FDP=136;FR=.;FRO=98;FSAF=9;FSAR=29;FSRF=61;FSRR=37;FWDB=-0.0540363;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=201.443;QD=2.31719;RBI=0.0543713;REFB=-0.00332938;REVB=0.00602629;RO=95;SAF=9;SAR=25;SRF=60;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.43992;STB=0.773486;TYPE=snp;VARB=0.00742179;OID=.;OPOS=152083089;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:78:130:136:95:98:34:38:25:9:60:35:29:9:61:37 chrX 152226542 . T C 1120.96 PASS AO=117;DP=117;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00259856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.822;QD=38.3235;RBI=0.0274905;REFB=0;REVB=0.0273674;RO=0;SAF=65;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.10611e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.41e-05;OID=.;OPOS=152226542;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:53:117:117:0:0:117:117:52:65:0:0:52:65:0:0 chrX 152228332 . A G 870.83 PASS AO=84;DP=84;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0490555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5554;QD=38.7036;RBI=0.0822465;REFB=0;REVB=0.0660155;RO=0;SAF=45;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.93822e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00010172;OID=.;OPOS=152228332;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:41:84:90:0:0:84:90:39:45:0:0:45:45:0:0 chrX 152228523 . T C 73.95 PASS AO=7;DP=7;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00348014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.8203;QD=36.9728;RBI=0.119329;REFB=0;REVB=0.119278;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00291963;OID=.;OPOS=152228523;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:8:0:0:7:8:4:3:0:0:5:3:0:0 chrX 152228776 . C T 281.47 PASS AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0219388;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.647;QD=37.5299;RBI=0.0219976;REFB=0;REVB=0.00160772;RO=0;SAF=8;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-7.33344e-05;OID=.;OPOS=152228776;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:30:30:0:0:30:30:22:8:0:0:22:8:0:0 chrX 152228778 . T G 237.21 PASS AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0492807;FXX=0.0344709;HRUN=4;LEN=1;MLLD=47.997;QD=33.8879;RBI=0.112143;REFB=-0.123232;REVB=-0.100735;RO=0;SAF=6;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.14057e-08;STB=0.512186;TYPE=snp;VARB=0.00810085;OID=.;OPOS=152228778;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:26:28:0:1:26:27:20:6:0:0:20:7:0:1 chrX 152609665 . GCCT GCT,GCC,GCCC 1749.62 PASS AO=47,37,74;DP=229;FAO=108,111,0;FDP=219;FR=.;FRO=0;FSAF=57,52,0;FSAR=51,59,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.81729,0.0591093,-0.235049;FXX=0.00904936;HRUN=2,1,1;LEN=1,1,1;MLLD=17.7816,62.0069,62.9083;QD=31.9565;RBI=0.822596,0.0605816,0.236432;REFB=-0.0876191,0.00248183,0.0148714;REVB=0.0932886,-0.0132752,-0.0255381;RO=52;SAF=5,3,48;SAR=42,34,26;SRF=49;SRR=3;SSEN=0.439744,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.741898,-0.79323,-0.268657;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=del,del,snp;VARB=0.0211511,-0.0304004,0.069936;OID=.,.,.;OPOS=152609666,152609668,152609668;OREF=C,T,T;OALT=-,-,C;OMAPALT=GCT,GCC,GCCC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/2:47,37,74:218:108,111,0:219:0:57,52,0:51,59,0:0:0:99:52:5,3,48:42,34,26:49:3 chrX 152610224 . CGTGACCTCT C 271.2 PASS AO=57;DP=132;FAO=60;FDP=114;FR=.;FRO=54;FSAF=17;FSAR=43;FSRF=21;FSRR=33;FWDB=-0.00738772;FXX=0;HRUN=1;LEN=9;MLLD=317.651;QD=9.51588;RBI=0.00808627;REFB=-0.0188557;REVB=-0.00328776;RO=47;SAF=16;SAR=41;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118372;STB=0.558421;TYPE=del;VARB=0.015659;OID=.;OPOS=152610225;OREF=GTGACCTCT;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:57:111:60:114:54:17:43:21:33:99:47:16:41:19:28 chrX 152610985 . T C 505.3 PASS AO=113;DP=221;FAO=115;FDP=223;FR=.;FRO=108;FSAF=103;FSAR=12;FSRF=87;FSRR=21;FWDB=0.00170439;FXX=0.00446409;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.732;QD=9.06365;RBI=0.00258049;REFB=-0.0409226;REVB=-0.00193751;RO=107;SAF=101;SAR=12;SRF=86;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1761;STB=0.598501;TYPE=snp;VARB=0.0324252;OID=.;OPOS=152610985;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:221:223:107:108:113:115:12:101:86:21:12:103:87:21 chrX 152613112 . C T 40.26 PASS AO=12;DP=35;FAO=12;FDP=35;FR=.;FRO=23;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.0588299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.946;QD=4.60065;RBI=0.059597;REFB=-0.0141274;REVB=0.00953138;RO=23;SAF=3;SAR=9;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130528;STB=0.578808;TYPE=snp;VARB=0.019241;OID=.;OPOS=152613112;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:35:35:23:23:12:12:9:3:8:15:9:3:8:15 chrX 152613702 . A G 802.92 PASS AO=332;DP=662;FAO=195;FDP=399;FR=.;FRO=204;FSAF=66;FSAR=129;FSRF=108;FSRR=96;FWDB=-0.00698665;FXX=0.00249994;HRUN=3;LEN=1;MLLD=233.066;QD=8.04936;RBI=0.0116203;REFB=-0.00850963;REVB=-0.00928534;RO=329;SAF=126;SAR=206;SRF=172;SRR=157;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133499;STB=0.601823;TYPE=snp;VARB=0.00795361;OID=.;OPOS=152613702;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:662:399:329:204:332:195:206:126:172:157:129:66:108:96 chrX 152613756 . C G 496.53 PASS AO=221;DP=547;FAO=157;FDP=397;FR=.;FRO=240;FSAF=81;FSAR=76;FSRF=98;FSRR=142;FWDB=0.0556966;FXX=0.00749981;HRUN=6;LEN=1;MLLD=33.4496;QD=5.00278;RBI=0.0710233;REFB=-0.0275455;REVB=0.0440704;RO=292;SAF=121;SAR=100;SRF=117;SRR=175;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149838;STB=0.564831;TYPE=snp;VARB=0.0377312;OID=.;OPOS=152613756;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:547:397:292:240:221:157:100:121:117:175:76:81:98:142 chrX 152616741 . A T 397.1 PASS AO=87;DP=162;FAO=86;FDP=161;FR=.;FRO=75;FSAF=30;FSAR=56;FSRF=41;FSRR=34;FWDB=-0.00967966;FXX=0.0122692;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.8714;QD=9.8659;RBI=0.0099607;REFB=-0.00622849;REVB=0.00234941;RO=74;SAF=31;SAR=56;SRF=41;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171134;STB=0.595544;TYPE=snp;VARB=0.00426102;OID=.;OPOS=152616741;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:162:161:74:75:87:86:56:31:41:33:56:30:41:34 chrX 152616952 . A G 646.85 PASS AO=68;DP=152;FAO=157;FDP=321;FR=.;FRO=164;FSAF=59;FSAR=98;FSRF=85;FSRR=79;FWDB=0.00271667;FXX=0.00619176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.26;QD=8.06044;RBI=0.0033486;REFB=-0.00646263;REVB=-0.00195777;RO=82;SAF=23;SAR=45;SRF=39;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14266;STB=0.5747;TYPE=snp;VARB=0.00649655;OID=.;OPOS=152616952;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:152:321:82:164:68:157:45:23:39:43:98:59:85:79 chrX 152735959 . C T 22.51 PASS AO=5;DP=14;FAO=5;FDP=14;FR=.;FRO=9;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.2438;QD=6.43142;RBI=0.0145795;REFB=0.0061221;REVB=-0.0145795;RO=8;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0124628;OID=.;OPOS=152735959;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:14:14:8:9:5:5:5:0:0:8:5:0:0:9 chrX 152736332 . C G 11.46 PASS AO=2;DP=13;FAO=2;FDP=13;FR=.,HEALED;FRO=9;FSAF=2;FSAR=0;FSRF=9;FSRR=0;FWDB=-0.0268866;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.5715;QD=3.52538;RBI=0.0268866;REFB=-0.0295744;REVB=0;RO=9;SAF=2;SAR=0;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0162577;OID=.;OPOS=152736332;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:8:13:13:9:9:2:2:0:2:9:0:0:2:9:0 chrX 152770230 . G A 383.83 PASS AO=91;DP=185;FAO=91;FDP=187;FR=.;FRO=96;FSAF=32;FSAR=59;FSRF=37;FSRR=59;FWDB=0.00600849;FXX=0.0209413;HRUN=3;LEN=1;MLLD=181.714;QD=8.21033;RBI=0.0118382;REFB=-0.00874595;REVB=0.0102001;RO=94;SAF=32;SAR=59;SRF=37;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0418344;STB=0.518793;TYPE=snp;VARB=0.0109342;OID=.;OPOS=152770230;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:185:187:94:96:91:91:59:32:37:57:59:32:37:59 chrX 152771509 . C T 349.61 PASS AO=93;DP=209;FAO=93;FDP=209;FR=.;FRO=116;FSAF=33;FSAR=60;FSRF=30;FSRR=86;FWDB=-0.0178764;FXX=0.0412825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.436;QD=6.69118;RBI=0.0181514;REFB=-0.0306477;REVB=-0.00314796;RO=97;SAF=33;SAR=60;SRF=26;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0907065;STB=0.560351;TYPE=snp;VARB=0.0336732;OID=.;OPOS=152771509;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:209:209:97:116:93:93:60:33:26:71:60:33:30:86 chrX 152815089 . A G 766.13 PASS AO=65;DP=80;FAO=78;FDP=81;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=14;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.128036;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.457;QD=37.8335;RBI=0.129552;REFB=0;REVB=-0.0197609;RO=1;SAF=1;SAR=64;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.309542;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00124321;OID=.;OPOS=152815089;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:79:81:1:0:65:78:64:1:1:0:64:14:0:0 chrX 152823728 . G C 164.58 PASS AO=53;DP=166;FAO=60;FDP=173;FR=.;FRO=113;FSAF=19;FSAR=41;FSRF=52;FSRR=61;FWDB=0.0504707;FXX=0.0114279;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.8195;QD=3.80542;RBI=0.107398;REFB=-0.0429636;REVB=0.0948002;RO=112;SAF=19;SAR=34;SRF=52;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128877;STB=0.600295;TYPE=snp;VARB=0.0706853;OID=.;OPOS=152823728;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:166:173:112:113:53:60:34:19:52:60:41:19:52:61 chrX 152846544 . T TG 127.13 PASS AO=13;DP=68;FAO=33;FDP=55;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=4;FSRR=18;FWDB=0.0379625;FXX=0.0677851;HRUN=0;LEN=1;MLLD=171.993;QD=9.24564;RBI=0.045094;REFB=0.0491513;REVB=-0.0243376;RO=50;SAF=2;SAR=11;SRF=15;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.256734;STB=0.582043;TYPE=ins;VARB=-0.0176081;OID=.;OPOS=152846545;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:13:68:33:55:22:12:21:4:18:52:50:2:11:15:35 chrX 152846545 . T G 42.61 PASS AO=20;DP=67;FAO=18;FDP=66;FR=.;FRO=48;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=35;FWDB=0.035048;FXX=0.0149231;HRUN=15;LEN=1;MLLD=126.203;QD=2.58238;RBI=0.0358388;REFB=0.0403283;REVB=-0.0074868;RO=45;SAF=7;SAR=13;SRF=10;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176551;STB=0.506322;TYPE=snp;VARB=-0.0388616;OID=.;OPOS=152846545;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:67:66:45:48:20:18:13:7:10:35:13:5:13:35 chrX 152909047 . G C 35.65 PASS AO=8;DP=28;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=0.183959;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=36.2458;QD=4.59977;RBI=0.215245;REFB=-0.0340207;REVB=0.111756;RO=20;SAF=5;SAR=3;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.409998;STB=0.685413;TYPE=snp;VARB=0.104126;OID=.;OPOS=152909047;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:28:31:20:20:8:11:3:5:5:15:5:6:5:15 chrX 152957656 . C CA 57.03 PASS AO=18;DP=44;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=-0.0107229;FXX=0.0888691;HRUN=1;LEN=1;MLLD=23.7607;QD=5.56402;RBI=0.0937958;REFB=0.00858039;REVB=0.0931808;RO=22;SAF=13;SAR=5;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.388185;STB=0.727031;TYPE=ins;VARB=-0.00659459;OID=.;OPOS=152957657;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:18:44:19:41:22:14:5:7:15:56:22:13:5:7:15 chrX 152989467 . T TTG 92.29 PASS AO=33;DP=115;FAO=36;FDP=112;FR=.;FRO=76;FSAF=5;FSAR=31;FSRF=17;FSRR=59;FWDB=-0.0170555;FXX=0.00884877;HRUN=2;LEN=2;MLLD=190.748;QD=3.29595;RBI=0.0171391;REFB=5.31883e-05;REVB=-0.00169015;RO=80;SAF=4;SAR=29;SRF=21;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.285022;STB=0.602409;TYPE=ins;VARB=-0.00114813;OID=.;OPOS=152989468;OREF=-;OALT=TG;OMAPALT=TTG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:33:115:36:112:76:5:31:17:59:92:80:4:29:21:59 chrX 152989470 . C A 87.09 PASS AO=36;DP=110;FAO=35;FDP=111;FR=.;FRO=76;FSAF=5;FSAR=30;FSRF=16;FSRR=60;FWDB=0.0109962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.8;QD=3.13832;RBI=0.0152982;REFB=-0.0061676;REVB=0.0106356;RO=74;SAF=5;SAR=31;SRF=16;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159253;STB=0.583281;TYPE=snp;VARB=0.0173474;OID=.;OPOS=152989470;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:87:110:111:74:76:36:35:31:5:16:58:30:5:16:60 chrX 153005605 . G A 486.52 PASS AO=113;DP=232;FAO=114;FDP=229;FR=.;FRO=115;FSAF=65;FSAR=49;FSRF=61;FSRR=54;FWDB=0.0439699;FXX=0.0418393;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.591;QD=8.49812;RBI=0.0544986;REFB=-0.00202293;REVB=0.0321985;RO=110;SAF=65;SAR=48;SRF=59;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0355323;STB=0.520239;TYPE=snp;VARB=0.00214661;OID=.;OPOS=153005605;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:232:229:110:115:113:114:48:65:59:51:49:65:61:54 chrX 153009197 . G C 60.36 PASS AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.65;QD=34.4915;RBI=0.0460673;REFB=0;REVB=0.0460673;RO=0;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00138617;OID=.;OPOS=153009197;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:7:7:0:0:7:7:7:0:0:0:7:0:0:0 chrX 153010066 . C T 134.58 PASS AO=16;DP=19;FAO=16;FDP=18;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0312018;FXX=0.0526039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.7142;QD=29.9066;RBI=0.0726464;REFB=0.0218479;REVB=0.0656044;RO=2;SAF=4;SAR=12;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181062;STB=0.599866;TYPE=snp;VARB=0.000223277;OID=.;OPOS=153010066;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:19:18:2:2:16:16:12:4:2:0:12:4:2:0 chrX 153010083 . G A 43.04 PASS AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.010582;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.0576;QD=8.60821;RBI=0.0141086;REFB=-0.0218216;REVB=0.00933126;RO=11;SAF=2;SAR=7;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166665;STB=0.59976;TYPE=snp;VARB=0.0219303;OID=.;OPOS=153010083;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:42:20:20:11:11:9:9:7:2:4:7:7:2:4:7 chrX 153034711 . AG A 387.61 PASS AO=45;DP=62;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.264861;FXX=0.0476115;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.42;QD=25.8406;RBI=0.281281;REFB=0;REVB=-0.0946989;RO=3;SAF=1;SAR=44;SRF=2;SRR=1;SSEN=0.681818;SSEP=0;SSSB=-0.449026;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.00551969;OID=.;OPOS=153034712;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:45:59:60:60:0:9:51:0:0:36:3:1:44:2:1 chrX 153038374 . GGC G 228.82 PASS AO=16;DP=68;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.124267;FXX=0;HRUN=4;LEN=2;MLLD=12.8726;QD=17.2691;RBI=0.332582;REFB=-0.088912;REVB=0.308495;RO=14;SAF=1;SAR=15;SRF=1;SRR=13;SSEN=0.441379;SSEP=0;SSSB=-0.0303026;STB=0.506664;TYPE=del;VARB=0.0200668;OID=.;OPOS=153038375;OREF=GC;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:16:55:52:53:1:15:37:0:1:14:14:1:15:1:13 chrX 153038385 . AG A 26.17 PASS AO=21;DP=70;FAO=24;FDP=64;FR=.;FRO=40;FSAF=4;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=26;FWDB=0.0890259;FXX=0.0447694;HRUN=5;LEN=1;MLLD=9.15777;QD=1.63577;RBI=0.093573;REFB=-0.0764587;REVB=-0.0288148;RO=37;SAF=3;SAR=18;SRF=13;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.328161;STB=0.661611;TYPE=del;VARB=0.148172;OID=.;OPOS=153038386;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:21:67:24:64:40:4:20:14:26:26:37:3:18:13:24 chrX 153039502 . G C 283.25 PASS AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0379967;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=108.283;QD=34.3332;RBI=0.0428703;REFB=-0.113195;REVB=0.0198523;RO=1;SAF=5;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0169852;STB=0.509085;TYPE=snp;VARB=0.00171995;OID=.;OPOS=153039502;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:33:33:1:1:32:32:27:5:0:1:27:5:0:1 chrX 153041544 . T C 231.77 PASS AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0445411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.391;QD=37.083;RBI=0.0511461;REFB=0;REVB=0.02514;RO=0;SAF=11;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99383e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000708643;OID=.;OPOS=153041544;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:25:25:0:0:25:25:14:11:0:0:14:11:0:0 chrX 153042690 . AG A 40.47 PASS AO=19;DP=54;FAO=30;FDP=52;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0622503;FXX=0.0545355;HRUN=8;LEN=1;MLLD=6.1693;QD=3.11287;RBI=0.088675;REFB=-0.0758432;REVB=0.0631519;RO=21;SAF=8;SAR=11;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00710901;STB=0.539163;TYPE=del;VARB=0.125995;OID=.;OPOS=153042691;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:19:50:30:52:22:11:19:10:12:25:21:8:11:9:12 chrX 153045812 . C T 1233.67 PASS AO=135;DP=144;FAO=137;FDP=141;FR=.;FRO=4;FSAF=74;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0355452;FXX=0.0208319;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.959;QD=34.9977;RBI=0.0411947;REFB=-0.183877;REVB=0.0208217;RO=4;SAF=73;SAR=62;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0296792;STB=0.515382;TYPE=snp;VARB=0.000963573;OID=.;OPOS=153045812;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:34:144:141:4:4:135:137:62:73:0:4:63:74:0:4 chrX 153048655 . CCA C,CC,CCC 170.69 PASS AO=3,5,10;DP=18;FAO=0,18,0;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0,0;FSAR=0,18,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0,0,0;FXX=0;HRUN=8,1,1;LEN=2,1,1;MLLD=244.255,245.177,243.436;QD=37.9315;RBI=0.0564001,0.0558756,0.0545896;REFB=0,0,0;REVB=-0.0564001,-0.0558756,-0.0545896;RO=0;SAF=0,0,0;SAR=3,5,10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;TYPE=del,del,snp;VARB=0.029941,-0.00348552,-0.0776958;OID=.,.,.;OPOS=153048656,153048657,153048657;OREF=CA,A,A;OALT=-,-,C;OMAPALT=C,CC,CCC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 2/2:3,5,10:18:0,18,0:18:0:0,0,0:0,18,0:0:0:7:0:0,0,0:3,5,10:0:0 chrX 153049535 . A G 360.41 PASS AO=34;DP=36;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0386038;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.456;QD=35.1623;RBI=0.0424914;REFB=0;REVB=0.0177557;RO=0;SAF=5;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000137264;OID=.;OPOS=153049535;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:36:41:0:0:34:41:29:5:0:0:33:8:0:0 chrX 153050984 . G A 1446.79 PASS AO=152;DP=155;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.047681;FXX=0.0128197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.1188;QD=37.579;RBI=0.0483017;REFB=-0.0778594;REVB=-0.00771878;RO=1;SAF=51;SAR=101;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00923512;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00159185;OID=.;OPOS=153050984;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:62:155:154:1:0:152:154:101:51:1:0:101:53:0:0 chrX 153051907 . G A 470.06 PASS AO=53;DP=56;FAO=54;FDP=56;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00104996;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=135.247;QD=33.5754;RBI=0.0789493;REFB=-0.109566;REVB=0.0789424;RO=3;SAF=29;SAR=24;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0553236;STB=0.519224;TYPE=snp;VARB=0.00157697;OID=.;OPOS=153051907;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:12:56:56:3:2:53:54:24:29:0:3:25:29:0:2 chrX 153069166 . AG A 241.54 PASS AO=36;DP=50;FAO=41;FDP=45;FR=.;FRO=4;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0586468;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.3744;QD=21.4703;RBI=0.0713936;REFB=-0.0577191;REVB=-0.0407137;RO=5;SAF=15;SAR=21;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0.299652;SSSB=0.00389696;STB=0.515144;TYPE=del;VARB=0.0182513;OID=.;OPOS=153069167;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:36:44:41:45:4:17:24:1:3:10:5:15:21:2:3 chrX 153073319 . G A 2215.37 PASS AO=240;DP=247;FAO=244;FDP=248;FR=.;FRO=4;FSAF=143;FSAR=101;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0229306;FXX=0.0040159;HRUN=3;LEN=1;MLLD=101.255;QD=35.7317;RBI=0.0438558;REFB=-0.0151678;REVB=0.0373835;RO=7;SAF=142;SAR=98;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0249398;STB=0.505575;TYPE=snp;VARB=0.000120499;OID=.;OPOS=153073319;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:63:247:248:7:4:240:244:98:142:1:6:101:143:1:3 chrX 153133887 . GGGGC G 50 PASS AO=30;DP=147;LEN=4;RO=117;SAF=49;SAR=52;SRF=21;SRR=25;TYPE=del;FR=.;OID=.;OPOS=153133888;OREF=GGGC;OALT=-;OMAPALT=G GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR 0/1:99:147:117:30:52:49:21:25 chrX 153149708 . G GC 982.61 PASS AO=108;DP=141;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000372219;FXX=0.0223864;HRUN=0;LEN=1;MLLD=195.928;QD=30.0033;RBI=0.0306967;REFB=-0.0821161;REVB=0.0306944;RO=16;SAF=52;SAR=56;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0719256;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.000413997;OID=.;OPOS=153149709;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:108:141:131:131:0:60:71:0:0:78:16:52:56:3:13 chrX 153149715 . C G 1105.71 PASS AO=118;DP=120;FAO=118;FDP=120;FR=.;FRO=2;FSAF=58;FSAR=60;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00890231;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.745;QD=36.8571;RBI=0.012493;REFB=-0.0292177;REVB=-0.00876498;RO=1;SAF=58;SAR=60;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00811878;STB=0.508473;TYPE=snp;VARB=0.000516219;OID=.;OPOS=153149715;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:120:120:1:2:118:118:60:58:1:0:60:58:2:0 chrX 153176254 . A G 157.78 PASS AO=36;DP=72;FAO=36;FDP=73;FR=.;FRO=37;FSAF=3;FSAR=33;FSRF=4;FSRR=33;FWDB=-0.0274721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.976;QD=8.64542;RBI=0.0319314;REFB=-0.0208301;REVB=0.0162757;RO=36;SAF=3;SAR=33;SRF=4;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0753844;STB=0.538439;TYPE=snp;VARB=0.0282566;OID=.;OPOS=153176254;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:72:73:36:37:36:36:33:3:4:32:33:3:4:33 chrX 153178459 . G GC 376.52 PASS AO=54;DP=77;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.160888;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.3674;QD=20.0813;RBI=0.295059;REFB=0;REVB=0.247336;RO=18;SAF=37;SAR=17;SRF=15;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0826716;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=0.00670645;OID=.;OPOS=153178460;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:54:77:75:75:0:55:20:0:0:34:18:37:17:15:3 chrX 153215839 . G A 126.52 PASS AO=31;DP=68;FAO=31;FDP=68;FR=.;FRO=37;FSAF=25;FSAR=6;FSRF=31;FSRR=6;FWDB=-0.00973815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.995;QD=7.44235;RBI=0.0690403;REFB=-0.0267683;REVB=0.0683501;RO=37;SAF=25;SAR=6;SRF=31;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0504908;STB=0.528284;TYPE=snp;VARB=0.0331559;OID=.;OPOS=153215839;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:68:68:37:37:31:31:6:25:31:6:6:25:31:6 chrX 153217121 . C T 94.93 PASS AO=16;DP=26;FAO=16;FDP=25;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0057434;FXX=0.0384468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.75;QD=15.1895;RBI=0.00574742;REFB=-0.0332294;REVB=0.000214978;RO=7;SAF=9;SAR=7;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150637;STB=0.54266;TYPE=snp;VARB=0.0216588;OID=.;OPOS=153217121;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:34:26:25:7:9:16:16:7:9:2:5:7:9:4:5 chrX 153278829 . G A 1037.23 PASS AO=103;DP=107;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0402479;FXX=0.0438558;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.39;QD=38.0635;RBI=0.0656708;REFB=0;REVB=0.0518918;RO=0;SAF=52;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000416224;OID=.;OPOS=153278829;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:50:107:109:0:0:103:109:51:52:0:0:59:50:0:0 chrX 153284192 . A G 2062.34 PASS AO=240;DP=257;FAO=240;FDP=257;FR=.;FRO=17;FSAF=121;FSAR=119;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.00069129;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=232.495;QD=32.0987;RBI=0.00106765;REFB=-0.00166201;REVB=-0.000813625;RO=17;SAF=121;SAR=119;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0264091;STB=0.513891;TYPE=snp;VARB=0.000147334;OID=.;OPOS=153284192;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:18:257:257:17:17:240:240:119:121:5:12:119:121:5:12 chrX 153284483 . G A 647.55 PASS AO=76;DP=83;FAO=78;FDP=83;FR=.;FRO=5;FSAF=36;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0895072;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.1311;QD=31.207;RBI=0.147616;REFB=-0.129511;REVB=0.117384;RO=1;SAF=35;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114027;STB=0.528083;TYPE=snp;VARB=0.00998442;OID=.;OPOS=153284483;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:8:83:83:1:5:76:78:41:35:0:1:42:36:0:5 chrX 153292180 . T C 679.72 PASS AO=64;DP=64;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00960576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.071;QD=37.7625;RBI=0.0142024;REFB=0;REVB=0.0104612;RO=0;SAF=50;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=3.09719e-06;OID=.;OPOS=153292180;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:64:72:0:0:64:72:14:50:0:0:15:57:0:0 chrX 153295473 . T TG 38.77 PASS AO=11;DP=57;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=0.0958516;FXX=0.0476077;HRUN=5;LEN=1;MLLD=13.8518;QD=3.87653;RBI=0.135403;REFB=-0.107863;REVB=-0.0956367;RO=44;SAF=8;SAR=3;SRF=28;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128624;STB=0.570287;TYPE=ins;VARB=0.145716;OID=.;OPOS=153295474;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:11:57:18:40:22:14:4:15:7:38:44:8:3:28:16 chrX 153539543 . GC G 58.7 PASS AO=57;DP=160;FAO=50;FDP=150;FR=.;FRO=100;FSAF=8;FSAR=42;FSRF=58;FSRR=42;FWDB=-0.0854789;FXX=0.00662208;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.9004;QD=1.56543;RBI=0.0861238;REFB=-0.0606095;REVB=-0.0105202;RO=90;SAF=14;SAR=43;SRF=50;SRR=40;SSEN=0.381757;SSEP=0;SSSB=-0.35683;STB=0.804747;TYPE=del;VARB=0.093212;OID=.;OPOS=153539544;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:57:151:50:150:100:8:42:58:42:58:90:14:43:50:40 chrX 153609617 . C T 56.7 PASS AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=23;FWDB=-0.00329853;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.915;QD=5.96814;RBI=0.00419196;REFB=-0.0262689;REVB=0.00258694;RO=21;SAF=3;SAR=12;SRF=0;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.424735;STB=0.744488;TYPE=snp;VARB=0.0214843;OID=.;OPOS=153609617;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:56:36:38:21:23:15:15:12:3:0:21:12:3:0:23 chrX 153629155 . A G 1370.52 PASS AO=145;DP=146;FAO=145;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147931;FXX=0.00684885;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.645;QD=37.8075;RBI=0.0307357;REFB=0.0160683;REVB=-0.0269415;RO=1;SAF=79;SAR=66;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00715104;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.47516e-05;OID=.;OPOS=153629155;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:57:146:145:1:0:145:145:66:79:0:1:66:79:0:0 chrX 153631911 . C T 228.5 PASS AO=61;DP=139;FAO=61;FDP=139;FR=.;FRO=78;FSAF=18;FSAR=43;FSRF=19;FSRR=59;FWDB=0.024035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.763;QD=6.57546;RBI=0.0240364;REFB=-0.0134955;REVB=0.000265484;RO=78;SAF=18;SAR=43;SRF=19;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0642305;STB=0.535734;TYPE=snp;VARB=0.017802;OID=.;OPOS=153631911;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:139:139:78:78:61:61:43:18:19:59:43:18:19:59 chrX 153633359 . G C 1374.75 PASS AO=153;DP=159;FAO=151;FDP=156;FR=.;FRO=5;FSAF=71;FSAR=80;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.00143411;FXX=0.0188667;HRUN=5;LEN=1;MLLD=179.13;QD=35.2499;RBI=0.0107252;REFB=-0.0469882;REVB=0.0106289;RO=5;SAF=73;SAR=80;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00464958;STB=0.502258;TYPE=snp;VARB=3.12327e-05;OID=.;OPOS=153633359;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:33:159:156:5:5:153:151:80:73:2:3:80:71:2:3 chrX 153642445 . AT A 40.31 PASS AO=100;DP=307;FAO=82;FDP=297;FR=.;FRO=215;FSAF=47;FSAR=35;FSRF=169;FSRR=46;FWDB=-0.0434158;FXX=0.0165557;HRUN=5;LEN=1;MLLD=8.59871;QD=0.542931;RBI=0.202738;REFB=-0.100555;REVB=-0.198034;RO=163;SAF=58;SAR=42;SRF=137;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.316341;STB=0.665049;TYPE=del;VARB=0.00606338;OID=.;OPOS=153642446;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:100:300:82:297:215:47:35:169:46:40:163:58:42:137:26 chrX 153689923 . AG A 420.66 PASS AO=24;DP=82;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0428826;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.6956;QD=21.8522;RBI=0.364373;REFB=-0.0447746;REVB=0.36184;RO=20;SAF=16;SAR=8;SRF=3;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0.281852;SSSB=0.405018;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.0194647;OID=.;OPOS=153689924;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:24:47:77:77:0:19:58:0:0:32:20:16:8:3:17 chrX 153693811 . C T 497.85 PASS AO=117;DP=262;FAO=127;FDP=271;FR=.;FRO=144;FSAF=60;FSAR=67;FSRF=66;FSRR=78;FWDB=0.000567955;FXX=0.00732574;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.73;QD=7.34831;RBI=0.0160602;REFB=-0.0118939;REVB=0.0160501;RO=145;SAF=58;SAR=59;SRF=66;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0405115;STB=0.507524;TYPE=snp;VARB=0.0127128;OID=.;OPOS=153693811;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:262:271:145:144:117:127:59:58:66:79:67:60:66:78 chrX 153694334 . C G 103.7 PASS AO=21;DP=40;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=1;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=19;FWDB=0.0412907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.4316;QD=10.3695;RBI=0.0426165;REFB=-0.0394028;REVB=0.0105474;RO=19;SAF=1;SAR=20;SRF=0;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.296468;STB=0.660908;TYPE=snp;VARB=0.0535739;OID=.;OPOS=153694334;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:85:40:40:19:19:21:21:20:1:0:19:20:1:0:19 chrX 153695908 . G T 199.68 PASS AO=48;DP=97;FAO=48;FDP=101;FR=.;FRO=53;FSAF=37;FSAR=11;FSRF=33;FSRR=20;FWDB=-0.0237717;FXX=0.00980296;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.68;QD=7.9082;RBI=0.0238078;REFB=-0.039373;REVB=0.00131109;RO=49;SAF=37;SAR=11;SRF=32;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138296;STB=0.598287;TYPE=snp;VARB=0.0358283;OID=.;OPOS=153695908;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:97:101:49:53:48:48:11:37:32:17:11:37:33:20 chrX 153696247 . G C 177.99 PASS AO=17;DP=51;FAO=32;FDP=52;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=2;FSAR=30;FSRF=3;FSRR=17;FWDB=-0.0429089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.0722;QD=13.6917;RBI=0.14368;REFB=-0.115906;REVB=0.137123;RO=20;SAF=2;SAR=15;SRF=3;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.068596;STB=0.614669;TYPE=snp;VARB=0.108121;OID=.;OPOS=153696247;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:70:52:52:20:20:17:32:15:2:3:17:30:2:3:17 chrX 153880830 . A C 110.25 PASS AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=4;FSRR=20;FWDB=-0.0748405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.72;QD=9.18708;RBI=0.0748853;REFB=-0.00997717;REVB=-0.00258957;RO=22;SAF=9;SAR=15;SRF=4;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186871;STB=0.617559;TYPE=snp;VARB=0.0143417;OID=.;OPOS=153880830;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:48:48:22:24:24:24:15:9:4:18:15:9:4:20 chrX 153881525 . G C 41.3 PASS AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=11;FWDB=-0.0536688;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.3463;QD=7.86689;RBI=0.106914;REFB=-0.046202;REVB=-0.0924677;RO=12;SAF=2;SAR=7;SRF=1;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.227889;STB=0.63134;TYPE=snp;VARB=0.0482471;OID=.;OPOS=153881525;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:41:21:21:12:12:9:9:7:2:1:11:7:2:1:11 chrX 153940861 . G A 365.06 PASS AO=82;DP=159;FAO=82;FDP=160;FR=.;FRO=78;FSAF=40;FSAR=42;FSRF=36;FSRR=42;FWDB=0.0083103;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=229.782;QD=9.12656;RBI=0.0201102;REFB=-0.0147266;REVB=-0.0183128;RO=76;SAF=40;SAR=42;SRF=35;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239427;STB=0.512817;TYPE=snp;VARB=0.012979;OID=.;OPOS=153940861;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:159:160:76:78:82:82:42:40:35:41:42:40:36:42 chrX 153994596 . G T 2619.9 PASS AO=276;DP=281;FAO=278;FDP=278;FR=.;FRO=0;FSAF=123;FSAR=155;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00441103;FXX=0.0106758;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.406;QD=37.6965;RBI=0.0161088;REFB=-0.0300625;REVB=0.0154931;RO=0;SAF=123;SAR=153;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00042877;OID=.;OPOS=153994596;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:281:278:0:0:276:278:153:123:0:0:155:123:0:0 chrX 154020114 . C A 405.33 PASS AO=88;DP=168;FAO=88;FDP=166;FR=.;FRO=78;FSAF=12;FSAR=76;FSRF=12;FSRR=66;FWDB=-0.0446864;FXX=0.0119041;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.461;QD=9.76699;RBI=0.0469728;REFB=-0.0156065;REVB=-0.0144765;RO=78;SAF=12;SAR=76;SRF=12;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0309967;STB=0.517003;TYPE=snp;VARB=0.0100486;OID=.;OPOS=154020114;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:168:166:78:78:88:88:76:12:12:66:76:12:12:66 chrX 154158285 . G C 835.36 PASS AO=152;DP=296;FAO=186;FDP=330;FR=.;FRO=144;FSAF=42;FSAR=144;FSRF=46;FSRR=98;FWDB=0.029609;FXX=0.00302106;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4608;QD=10.1255;RBI=0.0468598;REFB=-0.036096;REVB=0.0363201;RO=142;SAF=30;SAR=122;SRF=45;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14909;STB=0.554907;TYPE=snp;VARB=0.0220264;OID=.;OPOS=154158285;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:296:330:142:144:152:186:122:30:45:97:144:42:46:98 chrX 154456747 . A G 1183.44 PASS AO=132;DP=137;FAO=132;FDP=137;FR=.;FRO=5;FSAF=62;FSAR=70;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0257938;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=121.924;QD=34.553;RBI=0.0344938;REFB=-0.107235;REVB=-0.0229019;RO=2;SAF=62;SAR=70;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0133849;STB=0.50989;TYPE=snp;VARB=0.000807144;OID=.;OPOS=154456747;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:28:137:137:2:5:132:132:70:62:0:2:70:62:1:4 chrX 155004437 . G T 423.67 PASS AO=72;DP=109;FAO=72;FDP=109;FR=.;FRO=37;FSAF=32;FSAR=40;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.00251907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.4707;QD=15.5475;RBI=0.0273934;REFB=0.00627902;REVB=-0.0272773;RO=36;SAF=32;SAR=40;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0688904;STB=0.532778;TYPE=snp;VARB=-0.00466171;OID=.;OPOS=155004437;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:109:109:36:37:72:72:40:32:20:16:40:32:20:17 chrX 155005254 . C T 1879.95 PASS AO=192;DP=192;FAO=197;FDP=197;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.070596;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.5904;QD=38.1716;RBI=0.0707977;REFB=0;REVB=0.00534116;RO=0;SAF=75;SAR=117;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.82147e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000679899;OID=.;OPOS=155005254;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:89:192:197:0:0:192:197:117:75:0:0:118:79:0:0 chrX 155006050 . C T 947.53 PASS AO=102;DP=103;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0379291;FXX=0.0097078;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7472;QD=37.158;RBI=0.0410526;REFB=0.00701553;REVB=-0.0157066;RO=1;SAF=53;SAR=49;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00886831;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000331838;OID=.;OPOS=155006050;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:103:102:1:0:102:102:49:53:1:0:49:53:0:0 chrX 155006982 . A T 1029.22 PASS AO=106;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.146163;FXX=0.0270246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.1718;QD=38.1192;RBI=0.148521;REFB=0;REVB=0.0263611;RO=0;SAF=58;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00202317;OID=.;OPOS=155006982;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:49:108:108:0:0:106:108:48:58:0:0:50:58:0:0 chrX 155007278 . G A 242.39 PASS AO=46;DP=78;FAO=46;FDP=78;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=34;FSRF=7;FSRR=25;FWDB=0.02065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.935;QD=12.4301;RBI=0.0251348;REFB=-0.0338925;REVB=0.0143295;RO=32;SAF=12;SAR=34;SRF=7;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0419167;STB=0.522885;TYPE=snp;VARB=0.0187191;OID=.;OPOS=155007278;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:78:78:32:32:46:46:34:12:7:25:34:12:7:25 chrX 155008583 . G A 381.92 PASS AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0334268;FXX=0.0434688;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.871;QD=34.72;RBI=0.040419;REFB=-0.142559;REVB=0.0227231;RO=0;SAF=19;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512189;TYPE=snp;VARB=0.00274618;OID=.;OPOS=155008583;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:11:42:44:0:1:42:43:23:19:0:0:23:20:1:0 chrX 155008671 . G A 1114.42 PASS AO=120;DP=123;FAO=121;FDP=123;FR=.;FRO=2;FSAF=55;FSAR=66;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00422636;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.204;QD=36.2414;RBI=0.0447044;REFB=-0.0957631;REVB=0.0445042;RO=3;SAF=55;SAR=65;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00583217;STB=0.500745;TYPE=snp;VARB=0.000963032;OID=.;OPOS=155008671;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:39:123:123:3:2:120:121:65:55:1:2:66:55:1:1 chrX 155009102 . G A 392.42 PASS AO=194;DP=194;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.135108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.313;QD=37.3735;RBI=0.135445;REFB=0;REVB=0.00954987;RO=0;SAF=76;SAR=118;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000315153;OID=.;OPOS=155009102;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:19:194:42:0:0:194:42:118:76:0:0:39:3:0:0 chrX 155009225 . C T 679.68 PASS AO=76;DP=76;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000378022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.209;QD=37.7601;RBI=0.0109119;REFB=0;REVB=0.0109054;RO=0;SAF=26;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99741e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.0768e-05;OID=.;OPOS=155009225;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:32:76:72:0:0:76:72:50:26:0:0:46:26:0:0 chrX 155009661 . A C 121.86 PASS AO=36;DP=111;FAO=41;FDP=116;FR=.;FRO=75;FSAF=11;FSAR=30;FSRF=30;FSRR=45;FWDB=0.014659;FXX=0.0491763;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.473;QD=4.20198;RBI=0.016514;REFB=0.0042842;REVB=-0.00760428;RO=75;SAF=7;SAR=29;SRF=30;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.295209;STB=0.598489;TYPE=snp;VARB=-0.00594457;OID=.;OPOS=155009661;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:111:116:75:75:36:41:29:7:30:45:30:11:30:45 chrX 155009829 . C T 1357.57 PASS AO=149;DP=153;FAO=149;FDP=153;FR=.;FRO=4;FSAF=93;FSAR=56;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.00481411;FXX=0.00649309;HRUN=3;LEN=1;MLLD=228.64;QD=35.492;RBI=0.00914117;REFB=0.00318483;REVB=-0.0077708;RO=4;SAF=93;SAR=56;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00656395;STB=0.503453;TYPE=snp;VARB=-3.48656e-05;OID=.;OPOS=155009829;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:153:153:4:4:149:149:56:93:2:2:56:93:2:2 chrX 155009856 . T C 309.3 PASS AO=72;DP=148;FAO=73;FDP=149;FR=.;FRO=76;FSAF=48;FSAR=25;FSRF=46;FSRR=30;FWDB=-0.00141624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.352;QD=8.30325;RBI=0.00154403;REFB=-0.00098356;REVB=0.000615063;RO=76;SAF=47;SAR=25;SRF=46;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0478695;STB=0.52905;TYPE=snp;VARB=0.00125619;OID=.;OPOS=155009856;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:148:149:76:76:72:73:25:47:46:30:25:48:46:30 chrX 155010062 . G A 956.44 PASS AO=101;DP=104;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104205;FXX=0.0285687;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.511;QD=37.5073;RBI=0.0144874;REFB=-0.0322914;REVB=0.0100647;RO=1;SAF=54;SAR=47;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0087051;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000109473;OID=.;OPOS=155010062;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:38:104:102:1:0:101:102:47:54:1:0:47:55:0:0 chrX 155010077 . G A 856.95 PASS AO=87;DP=87;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0259997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.849;QD=38.5144;RBI=0.0350514;REFB=0;REVB=0.0235079;RO=0;SAF=46;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.18362e-05;OID=.;OPOS=155010077;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:40:87:89:0:0:87:89:41:46:0:0:42:47:0:0 chrX 155010308 . G A 1758.75 PASS AO=184;DP=184;FAO=184;FDP=184;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0476921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.9367;QD=38.2337;RBI=0.0500037;REFB=0;REVB=-0.0150277;RO=0;SAF=83;SAR=101;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000148043;OID=.;OPOS=155010308;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:83:184:184:0:0:184:184:101:83:0:0:101:83:0:0 chrX 155011012 . T C 438.93 PASS AO=93;DP=214;FAO=111;FDP=231;FR=.;FRO=120;FSAF=44;FSAR=67;FSRF=51;FSRR=69;FWDB=0.0209914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.535;QD=7.60055;RBI=0.0456539;REFB=-0.0266922;REVB=0.0405418;RO=116;SAF=35;SAR=58;SRF=48;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0393888;STB=0.515424;TYPE=snp;VARB=0.0289269;OID=.;OPOS=155011012;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:214:231:116:120:93:111:58:35:48:68:67:44:51:69 chrX 155011216 . T A 457.62 PASS AO=47;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0197158;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.876;QD=38.1351;RBI=0.0254508;REFB=0;REVB=0.0160943;RO=0;SAF=29;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000979347;OID=.;OPOS=155011216;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:22:48:48:0:0:47:48:18:29:0:0:18:30:0:0 chrX 155011276 . C T 508.24 PASS AO=58;DP=61;FAO=58;FDP=61;FR=.;FRO=3;FSAF=39;FSAR=19;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.00393219;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=196.489;QD=33.3272;RBI=0.0315018;REFB=0.0506188;REVB=-0.0312554;RO=1;SAF=39;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119441;STB=0.518512;TYPE=snp;VARB=-0.000349922;OID=.;OPOS=155011276;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:61:61:1:3:58:58:19:39:1:0:19:39:3:0 chrX 155011472 . T A 846.88 PASS AO=96;DP=107;FAO=101;FDP=106;FR=.;FRO=5;FSAF=61;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.00811729;FXX=0.0535666;HRUN=4;LEN=1;MLLD=155.733;QD=31.9577;RBI=0.0103228;REFB=-0.117058;REVB=0.00637725;RO=4;SAF=61;SAR=35;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0312208;STB=0.519748;TYPE=snp;VARB=0.00057919;OID=.;OPOS=155011472;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:13:107:106:4:5:96:101:35:61:1:3:40:61:1:4 chrX 155253904 . C G 61.95 PASS AO=9;DP=14;FAO=10;FDP=14;FR=.;FRO=4;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0169067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.776;QD=17.7009;RBI=0.020067;REFB=0.0210995;REVB=0.0108096;RO=4;SAF=6;SAR=3;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0966199;STB=0.529352;TYPE=snp;VARB=-0.00798366;OID=.;OPOS=155253904;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:16:14:14:4:4:9:10:3:6:2:2:4:6:2:2 chrX 155254689 . C T 31.15 PASS AO=9;DP=27;FAO=9;FDP=27;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.0321853;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=132.12;QD=4.61411;RBI=0.0338646;REFB=0.00348996;REVB=-0.0105319;RO=17;SAF=7;SAR=2;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.356588;STB=0.705928;TYPE=snp;VARB=-0.00700428;OID=.;OPOS=155254689;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:27:27:17:18:9:9:2:7:8:9:2:7:9:9 chrY 5491186 . C T 210.66 PASS AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00976206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.9904;QD=36.6361;RBI=0.0896892;REFB=0;REVB=0.0891563;RO=0;SAF=1;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.47154e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00207028;OID=.;OPOS=5491186;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:10:23:23:0:0:23:23:22:1:0:0:22:1:0:0 chrY 9930510 . C T 16.08 PASS AO=3;DP=6;FAO=3;FDP=6;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.104583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.3956;QD=10.7182;RBI=0.10982;REFB=0.0191508;REVB=0.0335085;RO=3;SAF=2;SAR=1;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.483116;STB=0.798389;TYPE=snp;VARB=0.00519977;OID=.;OPOS=9930510;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:6:6:3:3:3:3:1:2:0:3:1:2:0:3 chrY 10034868 . A G 11.68 PASS AO=3;DP=14;FAO=3;FDP=13;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=1;FWDB=0.0361222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.445;QD=3.59405;RBI=0.0365585;REFB=-0.0156625;REVB=-0.00563152;RO=11;SAF=2;SAR=1;SRF=10;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.386651;STB=0.732273;TYPE=snp;VARB=0.0586833;OID=.;OPOS=10034868;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:14:13:11:10:3:3:1:2:10:1:1:2:9:1 chrY 10034885 . A T 11.68 PASS AO=3;DP=14;FAO=3;FDP=13;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=1;FWDB=-0.0296687;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.2063;QD=3.59453;RBI=0.0941348;REFB=-0.0220758;REVB=-0.0893371;RO=11;SAF=2;SAR=1;SRF=10;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.386651;STB=0.732273;TYPE=snp;VARB=0.0088975;OID=.;OPOS=10034885;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:14:13:11:10:3:3:1:2:10:1:1:2:9:1 chrY 10034888 . C G 70.18 PASS AO=11;DP=14;FAO=10;FDP=13;FR=.;FRO=3;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0253956;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3857;QD=21.5924;RBI=0.0371452;REFB=-0.0258489;REVB=-0.0271077;RO=3;SAF=10;SAR=1;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21804;STB=0.620405;TYPE=snp;VARB=0.00548679;OID=.;OPOS=10034888;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:14:13:3:3:11:10:1:10:2:1:1:9:2:1 chrY 10034941 . C A 73.84 PASS AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00480746;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.938;QD=36.9199;RBI=0.0244989;REFB=0;REVB=0.0240226;RO=0;SAF=7;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.78849e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000401356;OID=.;OPOS=10034941;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:7:0:0:1:7:0:0 chrY 10034954 . A G 73.43 PASS AO=7;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0367275;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=69.9538;QD=36.7147;RBI=0.1685;REFB=0;REVB=0.164449;RO=1;SAF=6;SAR=1;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.2842;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.015514;OID=.;OPOS=10034954;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:8:1:0:7:8:1:6:0:1:2:6:0:0 chrY 10035086 . T G 22.97 PASS AO=3;DP=7;FAO=4;FDP=8;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0211424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.365;QD=11.4856;RBI=0.0311328;REFB=-0.0103215;REVB=0.0228529;RO=4;SAF=3;SAR=0;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.782218;STB=0.831939;TYPE=snp;VARB=0.0183183;OID=.;OPOS=10035086;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:19:7:8:4:4:3:4:0:3:0:4:1:3:0:4 chrY 10035449 . G C 44.33 PASS AO=5;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.251534;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=36.0402;QD=25.3305;RBI=0.251536;REFB=-0.134043;REVB=0.00094105;RO=1;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.54531;TYPE=snp;VARB=0.0622595;OID=.;OPOS=10035449;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:7:7:1:1:5:6:5:0:0:1:5:1:0:1 chrY 10035487 . A G 24.08 PASS AO=4;DP=6;FAO=4;FDP=6;FR=.;FRO=2;FSAF=0;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.6342;QD=16.0537;RBI=0.0108181;REFB=-0.0647271;REVB=0.0108181;RO=2;SAF=0;SAR=4;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0367724;OID=.;OPOS=10035487;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:6:6:2:2:4:4:4:0:0:2:4:0:0:2 chrY 10035915 . T A 49.53 PASS AO=8;DP=8;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0669585;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.653;QD=33.022;RBI=0.0683158;REFB=0;REVB=0.0135501;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00172796;OID=.;OPOS=10035915;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:8:6:0:0:8:6:5:3:0:0:4:2:0:0 chrY 10036057 . G A 291.93 PASS AO=37;DP=43;FAO=36;FDP=40;FR=.;FRO=4;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.00845954;FXX=0.0476077;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.649;QD=29.1925;RBI=0.0517239;REFB=-0.0560787;REVB=0.0510275;RO=3;SAF=19;SAR=18;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.025247;STB=0.527762;TYPE=snp;VARB=0.00186294;OID=.;OPOS=10036057;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:43:40:3:4:37:36:18:19:1:2:17:19:1:3 chrY 10036058 . T C 349.65 PASS AO=38;DP=43;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=5.83337e-05;FXX=0.119019;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.3489;QD=37.8;RBI=0.0294494;REFB=0;REVB=-0.0294493;RO=0;SAF=19;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00121719;OID=.;OPOS=10036058;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:17:43:37:0:0:38:37:19:19:0:0:18:19:0:0 chrY 10036088 . A G 2539.58 PASS AO=263;DP=263;FAO=265;FDP=265;FR=.;FRO=0;FSAF=146;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00891909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.093;QD=38.3333;RBI=0.0154034;REFB=0;REVB=0.0125584;RO=0;SAF=146;SAR=117;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.9693e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=1.77745e-06;OID=.;OPOS=10036088;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:263:265:0:0:263:265:117:146:0:0:119:146:0:0 chrY 10036105 . T C 3353.69 PASS AO=362;DP=370;FAO=363;FDP=363;FR=.;FRO=0;FSAF=244;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0442284;FXX=0.00274718;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.0025;QD=36.9553;RBI=0.0478073;REFB=-0.0189097;REVB=0.018149;RO=1;SAF=245;SAR=117;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00194368;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000457111;OID=.;OPOS=10036105;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:370:363:1:0:362:363:117:245:1:0:119:244:0:0 chrY 10036107 . T C 3459.2 PASS AO=366;DP=375;FAO=361;FDP=361;FR=.;FRO=0;FSAF=247;FSAR=114;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021587;FXX=0.0216796;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.967;QD=38.3291;RBI=0.0307956;REFB=-0.0421442;REVB=0.021963;RO=0;SAF=249;SAR=117;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.84162e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-1.08952e-06;OID=.;OPOS=10036107;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:375:361:0:0:366:361:117:249:0:0:114:247:0:0 chrY 10036132 . T C 3795.14 PASS AO=415;DP=418;FAO=398;FDP=398;FR=.;FRO=0;FSAF=280;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0148999;FXX=0.00499988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.6656;QD=38.1421;RBI=0.113226;REFB=-0.0934689;REVB=0.112242;RO=0;SAF=290;SAR=125;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0005002;OID=.;OPOS=10036132;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:418:398:0:0:415:398:125:290:0:0:118:280:0:0 chrY 10036156 . G C 3371.43 PASS AO=383;DP=398;FAO=376;FDP=390;FR=.;FRO=14;FSAF=277;FSAR=99;FSRF=1;FSRR=13;FWDB=0.0209428;FXX=0.00255748;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.117;QD=34.5788;RBI=0.0295823;REFB=-0.180457;REVB=0.0208929;RO=9;SAF=280;SAR=103;SRF=1;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0339263;STB=0.529906;TYPE=snp;VARB=0.00154922;OID=.;OPOS=10036156;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:67:398:390:9:14:383:376:103:280:1:8:99:277:1:13 chrY 10036164 . T C 3716 PASS AO=395;DP=396;FAO=388;FDP=388;FR=.;FRO=0;FSAF=277;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0075189;FXX=0.00257063;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.487;QD=38.3093;RBI=0.0100106;REFB=0.00707511;REVB=-0.00660902;RO=1;SAF=280;SAR=115;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00413175;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.69611e-06;OID=.;OPOS=10036164;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:396:388:1:0:395:388:115:280:0:1:111:277:0:0 chrY 10036171 . A G 3707.64 PASS AO=393;DP=393;FAO=386;FDP=386;FR=.;FRO=0;FSAF=277;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00350557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.457;QD=38.4212;RBI=0.00411744;REFB=0;REVB=0.00215969;RO=0;SAF=280;SAR=113;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.38106e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.58157e-06;OID=.;OPOS=10036171;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:393:386:0:0:393:386:113:280:0:0:109:277:0:0 chrY 10036189 . C CCGTT 3579.68 PASS AO=373;DP=390;FAO=377;FDP=377;FR=.;FRO=0;FSAF=276;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149268;FXX=0.0156654;HRUN=2;LEN=4;MLLD=188.059;QD=37.9807;RBI=0.0164805;REFB=-0.0462443;REVB=-0.0069854;RO=3;SAF=272;SAR=101;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00120518;STB=0.5;TYPE=ins;VARB=-2.91532e-05;OID=.;OPOS=10036190;OREF=-;OALT=CGTT;OMAPALT=CCGTT GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:373:390:377:377:0:276:101:0:0:99:3:272:101:2:1 chrY 10036204 . T C 3266.58 PASS AO=369;DP=383;FAO=363;FDP=375;FR=.;FRO=12;FSAF=273;FSAR=90;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=-0.0220612;FXX=0.0026595;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.5379;QD=34.8436;RBI=0.0315458;REFB=-0.140674;REVB=0.0225487;RO=11;SAF=275;SAR=94;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0208899;STB=0.517645;TYPE=snp;VARB=0.00335348;OID=.;OPOS=10036204;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:72:383:375:11:12:369:363:94:275:5:6:90:273:4:8 chrY 10036229 . T C 2847.95 PASS AO=305;DP=310;FAO=299;FDP=299;FR=.;FRO=0;FSAF=223;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0517397;FXX=0.0132009;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.14;QD=38.0997;RBI=0.0517581;REFB=-0.0419146;REVB=0.00137843;RO=0;SAF=225;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-6.33955e-05;OID=.;OPOS=10036229;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:99:310:299:0:0:305:299:80:225:0:0:76:223:0:0 chrY 10036233 . G C 2560.73 PASS AO=281;DP=290;FAO=282;FDP=287;FR=.;FRO=5;FSAF=216;FSAR=66;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.025868;FXX=0.0034721;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.844;QD=35.6896;RBI=0.0270802;REFB=-0.153697;REVB=0.00801138;RO=9;SAF=211;SAR=70;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00212718;STB=0.504014;TYPE=snp;VARB=0.00119285;OID=.;OPOS=10036233;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:78:290:287:9:5:281:282:70:211:7:2:66:216:3:2 chrY 10036269 . A G 350.38 PASS AO=46;DP=53;FAO=43;FDP=49;FR=.;FRO=6;FSAF=33;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.0112742;FXX=0.019996;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.572;QD=28.6026;RBI=0.0131422;REFB=0.0454757;REVB=0.00675353;RO=6;SAF=35;SAR=11;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19955;STB=0.615327;TYPE=snp;VARB=-0.000801704;OID=.;OPOS=10036269;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:53:49:6:6:46:43:11:35:0:6:10:33:0:6 chrY 10036277 . A G 101.33 PASS AO=16;DP=22;FAO=15;FDP=21;FR=.;FRO=6;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=-0.0108897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.725;QD=19.3011;RBI=0.0443451;REFB=0.00361736;REVB=0.0429872;RO=6;SAF=8;SAR=8;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.24748;STB=0.636198;TYPE=snp;VARB=-0.000134544;OID=.;OPOS=10036277;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:20:22:21:6:6:16:15:8:8:0:6:8:7:0:6 chrY 10036280 . A G 195.16 PASS AO=22;DP=22;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0107046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.557;QD=37.1733;RBI=0.0234838;REFB=0;REVB=0.0209022;RO=0;SAF=8;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=4.33407e-05;OID=.;OPOS=10036280;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:22:21:0:0:22:21:14:8:0:0:14:7:0:0 chrY 10036419 . A G 33.04 PASS AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.100391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.0805;QD=18.8792;RBI=0.11152;REFB=0.062116;REVB=-0.0485621;RO=2;SAF=2;SAR=3;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212944;STB=0.62455;TYPE=snp;VARB=-0.00730976;OID=.;OPOS=10036419;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:7:7:2:2:5:5:3:2:0:2:3:2:0:2 chrY 10036431 . T C 37.01 PASS AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0502756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.611;QD=13.4571;RBI=0.0535309;REFB=-0.0010981;REVB=0.0183826;RO=5;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.391876;STB=0.726669;TYPE=snp;VARB=0.00131542;OID=.;OPOS=10036431;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:26:11:11:5:5:6:6:3:3:0:5:3:3:0:5 chrY 10036438 . CA C,CC,TA 86.32 PASS AO=3,4,4;DP=12;FAO=1,6,4;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=1,2,0;FSAR=0,4,4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.108357,0.0941874,-0.0467057;FXX=0;HRUN=1,1,1;LEN=1,1,1;MLLD=178.781,192.668,33.9967;QD=28.7717;RBI=0.108377,0.094191,0.0467117;REFB=-0.156159,-0.134716,-0.0655327;REVB=-0.00206385,0.000821082,0.000747907;RO=0;SAF=2,1,0;SAR=1,3,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,-4.86674e-08,0;STB=0.989913,0.555378,0.5;TYPE=del,snp,snp;VARB=0.0249255,0.0256677,-0.00565172;OID=.,.,.;OPOS=10036439,10036439,10036438;OREF=A,A,C;OALT=-,C,T;OMAPALT=C,CC,TA GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 2/3:21:12:12:0:1:3,4,4:1,6,4:1,3,4:2,1,0:0:0:0,4,4:1,2,0:0:1 chrY 10036445 . G C 55.21 PASS AO=9;DP=14;FAO=9;FDP=14;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.0490347;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.5086;QD=15.7754;RBI=0.0490686;REFB=-0.0351996;REVB=0.0018228;RO=5;SAF=3;SAR=6;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.261101;STB=0.646785;TYPE=snp;VARB=0.014581;OID=.;OPOS=10036445;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:22:14:14:5:5:9:9:6:3:0:5:6:3:0:5 chrY 10036453 . T G 61.17 PASS AO=7;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.,HEALED;FRO=5;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.00886053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.083;QD=16.3128;RBI=0.0111198;REFB=-0.023737;REVB=0.00671873;RO=5;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.394184;STB=0.666348;TYPE=snp;VARB=0.0233623;OID=.;OPOS=10036453;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:23:15:15:5:5:7:9:3:4:0:5:5:4:0:5 chrY 10036483 . T C 87.77 PASS AO=11;DP=13;FAO=12;FDP=14;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0683977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.542;QD=25.0764;RBI=0.0747875;REFB=-0.0404364;REVB=0.0302479;RO=2;SAF=2;SAR=9;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.29369;STB=0.624776;TYPE=snp;VARB=0.00606225;OID=.;OPOS=10036483;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:6:13:14:2:2:11:12:9:2:2:0:9:3:2:0 chrY 10036486 . C G 94.05 PASS AO=13;DP=13;FAO=11;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0112094;FXX=0.142755;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.497;QD=31.3489;RBI=0.0814344;REFB=-0.110231;REVB=0.0806592;RO=0;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60098e-08;STB=0.599799;TYPE=snp;VARB=0.0128101;OID=.;OPOS=10036486;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:4:13:12:0:1:13:11:8:5:0:0:9:2:1:0 chrY 10036512 . G A 34.04 PASS AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.0584033;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.9966;QD=11.3456;RBI=0.0589946;REFB=0.0166792;REVB=0.00833177;RO=6;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.633322;STB=0.873904;TYPE=snp;VARB=-0.00790825;OID=.;OPOS=10036512;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:31:12:12:6:6:6:6:1:5:0:6:1:5:0:6 chrY 10036530 . A G 115.77 PASS AO=16;DP=20;FAO=16;FDP=21;FR=.;FRO=5;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.047432;FXX=0.0454339;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.717;QD=22.0515;RBI=0.0480936;REFB=-0.044742;REVB=-0.00794978;RO=4;SAF=6;SAR=10;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151898;STB=0.545399;TYPE=snp;VARB=0.00400026;OID=.;OPOS=10036530;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:20:21:4:5:16:16:10:6:0:4:10:6:1:4 chrY 10036545 . T C 145.32 PASS AO=26;DP=35;FAO=23;FDP=33;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=9;FWDB=0.00448394;FXX=0.0571265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.788;QD=17.615;RBI=0.0153292;REFB=0.00597915;REVB=-0.0146587;RO=7;SAF=8;SAR=18;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150668;STB=0.577496;TYPE=snp;VARB=-0.00101644;OID=.;OPOS=10036545;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:35:33:7:10:26:23:18:8:0:7:16:7:1:9 chrY 10036549 . A C 169.27 PASS AO=26;DP=36;FAO=26;FDP=36;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0297106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.85;QD=18.8077;RBI=0.0358562;REFB=-0.0393761;REVB=0.0200736;RO=10;SAF=7;SAR=19;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.019656;STB=0.510744;TYPE=snp;VARB=0.0253898;OID=.;OPOS=10036549;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:36:36:10:10:26:26:19:7:3:7:19:7:3:7 chrY 10036561 . T C 94.33 PASS AO=18;DP=34;FAO=19;FDP=35;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=15;FWDB=-0.0320871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.491;QD=10.7804;RBI=0.0320971;REFB=-0.00111783;REVB=0.00080298;RO=15;SAF=7;SAR=11;SRF=1;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.299301;STB=0.663016;TYPE=snp;VARB=0.000292946;OID=.;OPOS=10036561;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:69:34:35:15:16:18:19:11:7:1:14:12:7:1:15 chrY 10036586 . T C 164.43 PASS AO=25;DP=34;FAO=25;FDP=34;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=0.00160468;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.754;QD=19.345;RBI=0.0198456;REFB=-0.0172126;REVB=-0.0197806;RO=9;SAF=8;SAR=17;SRF=0;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193284;STB=0.604577;TYPE=snp;VARB=0.0318596;OID=.;OPOS=10036586;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:34:34:9:9:25:25:17:8:0:9:17:8:0:9 chrY 10036600 . C CG 41.73 PASS AO=9;DP=24;FAO=10;FDP=17;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0215815;FXX=0.260756;HRUN=3;LEN=1;MLLD=18.3253;QD=9.81914;RBI=0.101598;REFB=-0.0220359;REVB=0.0992798;RO=13;SAF=4;SAR=5;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223548;STB=0.549903;TYPE=ins;VARB=0.03609;OID=.;OPOS=10036601;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 0/1:9:24:10:17:7:4:6:2:5:22:13:4:5:3:10 chrY 10036606 . A G 46.86 PASS AO=11;DP=23;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=0.0257438;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.205;QD=8.51988;RBI=0.0257669;REFB=-0.00791219;REVB=-0.0010896;RO=12;SAF=4;SAR=7;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20624;STB=0.639755;TYPE=snp;VARB=0.00449511;OID=.;OPOS=10036606;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:46:23:22:12:12:11:10:7:4:2:10:6:4:2:10 chrY 10036613 . T G 43.56 PASS AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=12;FWDB=0.0871698;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.354;QD=7.26051;RBI=0.0885138;REFB=-0.00956248;REVB=-0.0153662;RO=14;SAF=4;SAR=6;SRF=2;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.288616;STB=0.666388;TYPE=snp;VARB=0.0232666;OID=.;OPOS=10036613;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:43:24:24:14:14:10:10:6:4:2:12:6:4:2:12 chrY 10036621 . T C 180.76 PASS AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0300459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.441;QD=32.8655;RBI=0.0342964;REFB=-0.0169966;REVB=0.0165375;RO=1;SAF=5;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0279913;STB=0.515137;TYPE=snp;VARB=0.000890726;OID=.;OPOS=10036621;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:5:22:22:1:1:21:21:16:5:0:1:16:5:0:1 chrY 10036627 . A G 38.76 PASS AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=12;FWDB=0.0151605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.0962;QD=7.04753;RBI=0.0591575;REFB=-0.0867486;REVB=-0.0571819;RO=13;SAF=4;SAR=5;SRF=1;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.403276;STB=0.730797;TYPE=snp;VARB=0.0579231;OID=.;OPOS=10036627;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:38:22:22:13:13:9:9:5:4:1:12:5:4:1:12 chrY 10036638 . A G 24.38 PASS AO=6;DP=20;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=13;FWDB=-0.0248049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.116;QD=4.6438;RBI=0.036079;REFB=-0.0225868;REVB=-0.0261994;RO=12;SAF=4;SAR=2;SRF=1;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.572745;STB=0.809527;TYPE=snp;VARB=0.0318877;OID=.;OPOS=10036638;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:20:21:12:14:6:7:2:4:1:11:3:4:1:13 chrY 10036642 . G A 11.13 PASS AO=4;DP=20;FAO=4;FDP=20;FR=.;FRO=16;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=0.0179378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.524;QD=2.22517;RBI=0.0443229;REFB=0.00132574;REVB=-0.0405309;RO=15;SAF=1;SAR=3;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0806035;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0220212;OID=.;OPOS=10036642;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:20:20:15:16:4:4:3:1:3:12:3:1:4:12 chrY 10037768 . T C 744.44 PASS AO=109;DP=138;FAO=106;FDP=134;FR=.;FRO=28;FSAF=60;FSAR=46;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.000802163;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=265.646;QD=22.2221;RBI=0.0197706;REFB=-0.0183362;REVB=0.0197543;RO=29;SAF=61;SAR=48;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0169318;STB=0.506437;TYPE=snp;VARB=0.00329178;OID=.;OPOS=10037768;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:35:138:134:29:28:109:106:48:61:15:14:46:60:15:13 chrY 10037786 . G A 17.83 PASS AO=27;DP=165;FAO=26;FDP=162;FR=.;FRO=136;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=79;FSRR=57;FWDB=0.00098478;FXX=0.0121944;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.192;QD=0.440249;RBI=0.0193763;REFB=-0.000535584;REVB=-0.0193513;RO=137;SAF=13;SAR=14;SRF=80;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131092;STB=0.56785;TYPE=snp;VARB=0.0023868;OID=.;OPOS=10037786;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:17:165:162:137:136:27:26:14:13:80:57:13:13:79:57 chrY 10037791 . C G 954.91 PASS AO=138;DP=177;FAO=136;FDP=171;FR=.;FRO=35;FSAF=83;FSAR=53;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.00146382;FXX=0.01156;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.263;QD=22.3371;RBI=0.0139772;REFB=-0.0366899;REVB=0.0139004;RO=36;SAF=83;SAR=55;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0737639;STB=0.538428;TYPE=snp;VARB=0.00755632;OID=.;OPOS=10037791;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:40:177:171:36:35:138:136:55:83:15:21:53:83:15:20 chrY 10037797 . T C 1048.13 PASS AO=148;DP=184;FAO=145;FDP=180;FR=.;FRO=35;FSAF=90;FSAR=55;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=0.00844513;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.624;QD=23.2917;RBI=0.0141822;REFB=-0.006018;REVB=-0.0113936;RO=36;SAF=91;SAR=57;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0756166;STB=0.538917;TYPE=snp;VARB=0.00181277;OID=.;OPOS=10037797;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:36:184:180:36:35:148:145:57:91:15:21:55:90:15:20 chrY 10037807 . T C 1184.37 PASS AO=153;DP=191;FAO=162;FDP=198;FR=.;FRO=36;FSAF=96;FSAR=66;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.0627749;FXX=0.00502487;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.883;QD=23.9268;RBI=0.0628373;REFB=-0.0210065;REVB=0.00279854;RO=37;SAF=85;SAR=68;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0355338;STB=0.522471;TYPE=snp;VARB=0.008969;OID=.;OPOS=10037807;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:30:191:198:37:36:153:162:68:85:17:20:66:96:17:19 chrY 10037819 . T C 1179.3 PASS AO=164;DP=205;FAO=160;FDP=194;FR=.;FRO=34;FSAF=92;FSAR=68;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=0.0112745;FXX=0.0348241;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.6781;QD=24.3155;RBI=0.0775671;REFB=-0.0735339;REVB=0.0767433;RO=35;SAF=93;SAR=71;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0559871;STB=0.529008;TYPE=snp;VARB=0.0183702;OID=.;OPOS=10037819;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:205:194:35:34:164:160:71:93:14:21:68:92:14:20 chrY 10037877 . G GC 606.73 PASS AO=89;DP=161;FAO=124;FDP=129;FR=.;FRO=5;FSAF=59;FSAR=65;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.060766;FXX=0.0785658;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.9014;QD=18.8134;RBI=0.253096;REFB=-0.0593704;REVB=0.245693;RO=64;SAF=44;SAR=45;SRF=36;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0523952;STB=0.512578;TYPE=ins;VARB=0.0274299;OID=.;OPOS=10037878;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:89:161:124:129:5:59:65:4:1:25:64:44:45:36:28 chrY 10037892 . A G 687.24 PASS AO=44;DP=105;FAO=86;FDP=96;FR=.,HEALED;FRO=10;FSAF=39;FSAR=47;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=0.1313;FXX=0.0679546;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.188;QD=28.6351;RBI=0.132574;REFB=-0.0423345;REVB=-0.0183383;RO=11;SAF=1;SAR=43;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.488927;STB=0.526762;TYPE=snp;VARB=0.00543451;OID=.;OPOS=10037892;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:3:87:96:11:10:44:86:43:1:3:8:47:39:2:8 chrY 10037899 . T C 650.76 PASS AO=79;DP=90;FAO=82;FDP=93;FR=.;FRO=11;FSAF=38;FSAR=44;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=0.0174186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.8812;QD=27.9897;RBI=0.0178134;REFB=-0.0434823;REVB=-0.00372954;RO=11;SAF=32;SAR=47;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0318149;STB=0.522746;TYPE=snp;VARB=0.00392918;OID=.;OPOS=10037899;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:5:90:93:11:11:79:82:47:32:3:8:44:38:3:8 chrY 10037912 . T G 488.26 PASS AO=50;DP=50;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0239275;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=129.321;QD=37.5588;RBI=0.0264057;REFB=0;REVB=-0.0111685;RO=0;SAF=13;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.32377e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.72712e-05;OID=.;OPOS=10037912;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:23:50:52:0:0:50:52:37:13:0:0:36:16:0:0 chrY 10037914 . T C 423.68 PASS AO=43;DP=43;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186229;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.801;QD=37.6605;RBI=0.0490316;REFB=0;REVB=0.0453573;RO=0;SAF=13;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000290417;OID=.;OPOS=10037914;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:20:43:45:0:0:43:45:30:13:0:0:29:16:0:0 chrY 13262837 . A G 86.76 PASS AO=5;DP=8;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0474814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.732;QD=38.5585;RBI=0.0693072;REFB=0;REVB=-0.0504877;RO=0;SAF=2;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-8.0222e-05;OID=.;OPOS=13262837;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:5:9:0:0:5:9:3:2:0:0:4:5:0:0 chrY 13262843 . G A 36.92 PASS AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0149931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.892;QD=13.4269;RBI=0.0619737;REFB=0.0163128;REVB=0.0601328;RO=5;SAF=4;SAR=2;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207272;STB=0.624573;TYPE=snp;VARB=-0.0158204;OID=.;OPOS=13262843;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:27:11:11:5:5:6:6:2:4:2:3:2:4:2:3 chrY 13262908 . C G 183.13 PASS AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208623;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=150.036;QD=38.5544;RBI=0.0212101;REFB=0;REVB=-0.00382572;RO=0;SAF=17;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.41729e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000196073;OID=.;OPOS=13262908;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:9:19:19:0:0:19:19:2:17:0:0:2:17:0:0 chrY 13263067 . A C 99.47 PASS AO=2;DP=9;FAO=10;FDP=10;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0546871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.18;QD=39.7862;RBI=0.106637;REFB=0;REVB=0.0915464;RO=0;SAF=1;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00210224;OID=.;OPOS=13263067;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:9:10:0:0:2:10:1:1:0:0:4:6:0:0 chrY 13263091 . G A 99.26 PASS AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0368592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.291;QD=39.7041;RBI=0.0707085;REFB=0;REVB=0.0603415;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00268599;OID=.;OPOS=13263091;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:4:10:10:0:0:10:10:5:5:0:0:5:5:0:0 chrY 13524639 . C T 43.05 PASS AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0635091;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.2145;QD=14.3494;RBI=0.132744;REFB=-0.00959679;REVB=0.116566;RO=5;SAF=6;SAR=1;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0763028;STB=0.545316;TYPE=snp;VARB=0.02133;OID=.;OPOS=13524639;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:25:12:12:5:5:7:7:1:6:4:1:1:6:4:1 chrY 13524664 . C A 24.11 PASS AO=5;DP=13;FAO=5;FDP=13;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=-0.0137629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.285;QD=7.41864;RBI=0.0141227;REFB=-0.039129;REVB=-0.00316773;RO=7;SAF=4;SAR=1;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112423;STB=0.545263;TYPE=snp;VARB=0.0464071;OID=.;OPOS=13524664;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:24:13:13:7:8:5:5:1:4:5:2:1:4:6:2 chrY 13524719 . C T 17.23 PASS AO=3;DP=7;FAO=3;FDP=7;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.000155505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.8442;QD=9.84705;RBI=0.0913995;REFB=-0.0194045;REVB=0.0913994;RO=4;SAF=1;SAR=2;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.348651;STB=0.725852;TYPE=snp;VARB=0.0630568;OID=.;OPOS=13524719;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:15:7:7:4:4:3:3:2:1:3:1:2:1:3:1 chrY 21152524 . T G 65.53 PASS AO=7;DP=8;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166951;FXX=0.124844;HRUN=14;LEN=1;MLLD=322.862;QD=37.4473;RBI=0.0166951;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=7;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00012861;OID=.;OPOS=21152524;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:3:8:7:0:0:7:7:0:7:0:0:0:7:0:0 chrY 21152662 . CAA C 762.57 PASS AO=88;DP=103;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0685522;FXX=0.049995;HRUN=4;LEN=2;MLLD=42.7179;QD=32.1081;RBI=0.0695089;REFB=0;REVB=-0.0114927;RO=0;SAF=40;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.43431e-08;STB=0.5;TYPE=del;VARB=0.000657094;OID=.;OPOS=21152663;OREF=AA;OALT=-;OMAPALT=C GT:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR 1/1:88:96:95:95:0:42:53:0:0:66:0:40:48:0:0 chrY 21152701 . G T 821.96 PASS AO=90;DP=92;FAO=90;FDP=92;FR=.;FRO=2;FSAF=42;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0114243;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.393;QD=35.7376;RBI=0.0143766;REFB=-0.0425706;REVB=0.00872769;RO=2;SAF=42;SAR=48;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00137914;STB=0.500728;TYPE=snp;VARB=0.00099532;OID=.;OPOS=21152701;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:26:92:92:2:2:90:90:48:42:1:1:48:42:1:1 chrY 21152719 . T C 779.57 PASS AO=81;DP=81;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029187;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.638;QD=38.0279;RBI=0.0345044;REFB=0;REVB=0.018403;RO=0;SAF=34;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.25769e-08;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=6.74704e-05;OID=.;OPOS=21152719;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:37:81:82:0:0:81:82:47:34:0:0:47:35:0:0 chrY 21153609 . T C 1719.44 PASS AO=178;DP=178;FAO=178;FDP=178;FR=.;FRO=0;FSAF=116;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0454313;FXX=0.0111105;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.5596;QD=38.6392;RBI=0.0503142;REFB=0;REVB=0.0216221;RO=0;SAF=116;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=8.61261e-06;OID=.;OPOS=21153609;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:81:178:178:0:0:178:178:62:116:0:0:62:116:0:0 chrY 21154426 . G A 194.37 PASS AO=47;DP=101;FAO=47;FDP=100;FR=.;FRO=53;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=33;FSRR=20;FWDB=0.00710155;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.285;QD=7.77459;RBI=0.00716764;REFB=-0.00516477;REVB=0.000971148;RO=50;SAF=22;SAR=25;SRF=33;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177027;STB=0.581361;TYPE=snp;VARB=0.00717432;OID=.;OPOS=21154426;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:99:101:100:50:53:47:47:25:22:33:17:25:22:33:20 chrY 21154466 . T A 940.75 PASS AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0024403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.565;QD=38.3981;RBI=0.00271981;REFB=0;REVB=-0.00120096;RO=0;SAF=46;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=2.22814e-06;OID=.;OPOS=21154466;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:44:98:98:0:0:98:98:52:46:0:0:52:46:0:0 chrY 21154529 . G A 136.31 PASS AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.785;QD=36.3484;RBI=0.0430324;REFB=0;REVB=0.0430324;RO=0;SAF=0;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000553225;OID=.;OPOS=21154529;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:7:15:15:0:0:15:15:15:0:0:0:15:0:0:0 chrY 21154530 . C A 10.89 PASS AO=3;DP=14;FAO=3;FDP=14;FR=.;FRO=11;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=11;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.091;QD=3.11201;RBI=0.0207411;REFB=0.00577997;REVB=-0.0207411;RO=11;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0302142;OID=.;OPOS=21154530;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:10:14:14:11:11:3:3:3:0:0:11:3:0:0:11 chrY 21154531 . G A 125.84 PASS AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.187;QD=35.9534;RBI=0.00797905;REFB=0;REVB=-0.00797905;RO=0;SAF=0;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=-5.5523e-05;OID=.;OPOS=21154531;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/1:6:14:14:0:0:14:14:14:0:0:0:14:0:0:0 chrY 21154533 . G A 52.73 PASS AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=12;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0.142755;HRUN=3;LEN=1;MLLD=131.682;QD=17.5779;RBI=0.00718675;REFB=-0.052589;REVB=0.00718675;RO=4;SAF=0;SAR=8;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.016817;OID=.;OPOS=21154533;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:18:14:12:4:4:8:8:8:0:0:4:8:0:0:4 chrY 21154534 . G A 13.68 PASS AO=3;DP=12;FAO=3;FDP=11;FR=.;FRO=8;FSAF=0;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0;FXX=0.0832639;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.727;QD=4.97284;RBI=0.00848042;REFB=-0.00797528;REVB=0.00848042;RO=8;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00168056;OID=.;OPOS=21154534;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:13:12:11:8:8:3:3:3:0:0:8:3:0:0:8 chrY 21154535 . G A,T 89.55 PASS AO=8,4;DP=12;FAO=8,4;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0;FSAR=8,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0,0;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=113.092,90.2476;QD=29.8514;RBI=0.0398901,0.0570142;REFB=0,0;REVB=0.0398901,0.0570142;RO=0;SAF=0,0;SAR=8,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;TYPE=snp,snp;VARB=0.0259712,0.00106748;OID=.,.;OPOS=21154535,21154535;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 1/2:18:12:12:0:0:8,4:8,4:8,4:0,0:0:0:8,4:0,0:0:0 chrY 21154538 . G C 11.74 PASS AO=2;DP=7;FAO=2;FDP=6;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0.142653;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.773;QD=7.82413;RBI=0.00847248;REFB=-0.00159862;REVB=0.00847248;RO=4;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0349984;OID=.;OPOS=21154538;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR 0/1:11:7:6:4:4:2:2:2:0:0:4:2:0:0:4